QIAGEN® QIAseq® ソリューション
分子バーコード技術を利用したライブラリー調製

Sample to Insight分子バーコードを用いた QIAGEN NGS ソリューションをご存知ですか？
QIAGEN NGS パネルに用いられている分子バーコード（Unique Molecular Indexes: UMI）の技術は、偽陽性の排除と高い定量性を提供することにより、より正確な DNA および RNA 解析を実現することができます。

分子バーコードによるデジタル RNA-seq: 正確な発現解析

QIAseq Targeted RNA Panels では分子バーコードにより、PCR Duplicate や増幅バイアスの影響を取り除くことで、遺伝子発現プロファイルが実際と同じ状態で維持されます。最終的にそれぞれの転写産物の相対量は、ターゲットリードに紐づいたそれぞれの分子バーコードの数によって決定されることで、増幅バイアスがなく、より正確な発現解析が可能となります。

Results(No. of transcripts and ratio)

PCR duplicates/ Molecular
Reads barcodes
Sample A

cDNA
Synthesis

Sample B

Molecular
BarcodingmRNA

Enrichment
Amplification
cDNA

分子バーコードによるデジタル DNA-seq

RNAseqSample A Sample B Ratio
Original Sample

4

1

4:1

QIAseq quantification(Based on molecularbarcodes)

4

1

4:1

Traditional RNAseq
quantification(based on reads)

12

6

2:1

WT

PCR によるターゲットエンリッチメント前の 1 分子の DNA に

Mutant
MB attachment

分子バーコードを付加します。この付加した分子バーコード

Amplification

により、PCR 増幅によって生じた偽陽性を排除することができます。採用している分子バーコードは、ランダムな 12 塩基の組み合わせで、4 12 ＝ 16,777,216 通りにもなります。

2

False variant is present in somefragments carrying the same MB

True variant is present in all
fragments carrying the same MB

QIAseq Solution 02/2019

LNA® 技術による高度な NGS 解析

LNA オリゴヌクレオチドは、高親和性 RNA の誘導体であり、二本鎖を形成したとき、その融解温度（ Tm） を 2 ～ 8℃上昇させ、長さや類似性に関わらず相補鎖に対して、高い特異性と親和性を持つことができます。QIAseq 製品では、QIAseq UPX 3’
Transcriptome Kits や QIAseq miRNA Library Kits などで、LNA 技術を採用しています。

With LNA ✔

0

0

0

P

GeneGlobe®
分子バーコードを搭載している QIAseq 製品は、raw data を GeneGlobe Data Analysis Center のクラウドにアップロードするだ

けでＮＧＳデータ解析が可能です。変異解析用のパイプラインでは、リードのフィルターやマッピング、アライメントに続き、分子

バーコード毎の変異のコールをエクセルフォーマットでレポートします。また、いくつかの RNA 関連製品では、一次リード

マッピングだけではなく、遺伝子発現差の解析などの二次解析もサポートします。

QIAseq Solution 02/2019

3

RNA 関連製品

1 ステップで簡便にリボソーム RNA とグロビン mRNA を除去
QIAseq FastSelect RNA Removal Kits

• 簡便さ – トータル RNA 断片化および cDNA 合成時に統合された 1 ステップの除去工程• 汎用性 – QIAGEN、Illumina®、NEB®、KAPA® RNA stranded library kits に対応• 柔軟性 – 1 ng から 1 µg までのインタクトな高品質 RNA、FFPE RNA または分解した RNA に対応

• 効率 – わずか 20 分でリボソーム RNA やグロビン mRNA を確実に除去• カスタム – RNA 転写産物ごとにカスタマイズが可能（カスタム製品は 1,536 サンプル分）
製品名

内容

Product no.

Cat. no.

QIAseq FastSelect RNA Removal Kit

Human, cytolpasmic & mitochondrial rRNA

333180

THS-001Z

QIAseq FastSelect RNA Removal Kit

Mouse, cytolpasmic & mitochondrial rRNA

333180

TMM-001Z

QIAseq FastSelect RNA Removal Kit

Rat, cytolpasmic & mitochondrial rRNA

333180

TRN-001Z

QIAseq FastSelect RNA Removal Kit

Human globin RNA

333180

THS-002Z

QIAseq FastSelect RNA Removal Kit

Mouse globin RNA

333180

TMM-002Z

QIAseq FastSelect RNA Removal Kit

Rat globin RNA

333180

TRN-002Z

QIAseq FastSelect Multi-RNA Removal Kit

Human complete rRNA & globin mRNA

333280

THS-201Z

QIAseq FastSelect Multi-RNA Removal Kit

Mouse complete rRNA & globin mRNA

333280

TMM-201Z

QIAseq FastSelect Multi-RNA Removal Kit

Rat complete rRNA & globin mRNA

333280

TRN-201Z

上記製品はいずれも、24、96、384サンプルの容量を提供

ストランド特異的ライブラリー調製で、より正確な遺伝子発現解析、新規の融合遺伝子探索、転写
産物 SNV/Variant 同定
QIAseq Stranded RNA Library Kits

Illumina platform• CleanStart ™プロトコールによる Hi-Fidelity PCR 増幅とコンタミネーション防止• 迅速で簡単なプロトコールで新鮮なサンプルおよび FFPE サンプルに対応• 従来法のストランド特異的ライブラリー調製で必要なアクチノマイシン D および dUTP
分解の工程が不要• プレート入りのデュアルバーコードアダプターと精製用の QIAseq 磁気ビーズが同梱• mRNA 濃縮またはトータル RNA に最適化済みのプロトコール
製品名Cat. no.

QIAseq Stranded Total RNA Lib Kit (24)*180743

QIAseq Stranded Total RNA Lib Kit (96)*180745

QIAseq Stranded mRNA Select Kit (24)*180773

QIAseq Stranded mRNA Select Kit (96)*180775

QIAseq CleanStart PCR Kit (100)180795* アダプターと精製用 QIAseq 磁気ビーズを同梱

4

QIAseq Solutions 02/2019

RNA 関連製品

簡便かつ定量性の高い高精度なmiRNA解析
QIAseq miRNA Library Kit

Illumina platform

分子バーコード対応

ThermoFisher platform• 1 ng の RNA から調製可能• ゲル抽出不要なワークフロー• 分子バーコードによる miRNA の正確な定量• GeneGlobe によるクラウドベースのフリーのデータ解析ツールを提供• 血清や血漿用にも最適化済み
Verification of Seq results with qPCR
Fold Regulation (Log2)1086

QIAseq miRNA

Supplier 1

Supplier 2

4
2
0

miRNA

–2

miRNA
AD

–4

miRNA
AD

–6
–8
–10
QIAseq (NGS)

ゲルサイズ選択不要なケミストリー

一般的に、小さいサイズの miRNA ライブラリーとアダプターダイ
マーを分けるには、手間のかかるゲル抽出が必要である。また、ゲル抽出をしても、アダプターダイマーや miRNA 以外の RNA のコンタミを完全に除去することは困難である。上図は、他社製品と比較して、QIAseq miRNA Library Kit では、miRNA 分子に特異的なライブラリー調製ができていることを示している。

miScript (qPCR)

qPCR による NGS データのバリデーション

QIAseq miRNA Library Kit は、UMI を付加することで、PCR 増幅とシークエンシング由来のバイアスを除去可能であり、qPCR と同等の高い定量性を示すことができた。高い定量性のあるシークエ
ンシング結果は、qPCR とも高い相関性のあるバリデーション試験を可能にする。

製品名

Cat. no.

QIAseq miRNA Library Kit (12)331502

QIAseq miRNA Library Kit (96)331505

QIAseq miRNA NGS 12 Index IL (12)*331592

QIAseq miRNA NGS 48 Index IL (96)*331595

QIAseq miRNA NGS 96 Index IL (96) *331565

QIAseq miRNA NGS 12 Index TF (12) †QIAseq miRNA NGS 48 Index TF (96) †331582331585* Illumina シークエンサー用のアダプターおよびインデックス†
ThermoFisher シークエンサー用のアダプターおよびインデックス

QIAseq Solutions 02/2019

5

RNA 関連製品

微量の RNA からハイスループット 3’ トランスクリプトーム解析を実現
QIAseq UPX 3’ Transcriptome Kits

Illumina platform

分子バーコード対応• 1 ～ 100 個の細胞または 10 pg ～ 1 ng の精製 RNA から開始
• LNA 技術を採用して、精度、特異度、感度を向上• 分子バーコード（ UMI）による増幅バイアスの除去• セル ID とサンプル ID により、最大 18,432 サンプルの転写産物を同時にシークエンス
解析可能• GeneGlobe によるクラウドベースのフリーのデータ解析ツールを提供

Cell ID Cell ID

RNA AAAA
cDNA Poly-T UMI Cell ID

RNA AAAA
cDNA Oligo-dT

UMI Cell ID

RNA

Cell IDAAAAAAAAAAAA
Oligo-dT

Cell ID

UMI Cell ID

QIAseq UPX 3’ Transcriptome Kits のワークフロー

ライブラリー調製は、96 ウェルもしくは 384 ウェルプレート中で、LNA 技術搭載のオリゴ dT プライマーを用いたポリ A 逆転写をするところから始まる。逆転写の際に、分子バーコードやセル ID が同時に取り込まれる。セル ID は各ウェル毎に異なるため、同一プレート内のサンプルは、逆転写後 1 チューブにまとめられてライブラリー

調製が可能となる。最終的なライブラリー増幅の際には、プレート ID に相当するインデックスが組み込まれる。
最終的に、セル ID とプレート ID の掛け算で、ウルトラマルチプレックスを実現する。

製品名

Cat. no.

QIAseq UPX 3' Transcriptome Kit (96)333088QIAseq UPX 3' Transcriptome Kit (96-M)

333089QIAseq UPX 3' Transcriptome Kit (384)333090

QIAseq UPX 3' Trans. 12-Index (48)*333074

QIAseq UPX 3' Trans. 48-Index (192)†333075* Illumina シークエンサー用のアダプターと 12 種類のインデックス 48 サンプル用†

6

Illumina シークエンサー用のアダプターと 48 種類のインデックス 192 サンプル用

QIAseq Solutions 02/2019

RNA 関連製品

シングルセルレベルでの微量 RNA のターゲット解析
QIAseq UPX 3’ Targeted RNA Panels

Illumina platform

分子バーコード対応• 希望の 12 ～ 1000 遺伝子までを自由にご選択いただき、パネルをカスタムで作製• 最大 147,456 サンプルを同時にシークエンス解析可能

製品名

Product no.

Cat. no.

QIAseq UPX 3’ Targeted RNA Panel (96)*333041

Varies

QIAseq UPX 3’ Targeted RNA Panel (96-M)*

333042

Varies

QIAseq UPX 3’ Targeted RNA Panel (384)*

333043

Varies

QIAseq UPX 3’ Targeted RNA 12 Index (48)333044

QIAseq UPX 3’ Targeted 96 index A (384)333051

QIAseq UPX 3’ Targeted 96 index B (384)333052

QIAseq UPX 3’ Targeted 96 index C (384)333053

QIAseq UPX 3’ Targeted 96 index D (384)333054* 遺伝子数により価格が異なります。

シングルセル発現解析

QIAseq FX Single Cell RNA Library Kits

Illumina platform• 真核生物由来のシングルセルや 10 pg からの RNA に対応• mRNA や lncRNA など多様な RNA 由来のライブラリー調製• PCR フリーでバイアスを最小限にしたワークフロー• シングルセルからのトランスクリプトーム増幅からライブラリー調製までわずか
5.5 時間で完了

製品名

Cat. no.

QIAseq FX Single Cell RNA Library Kit (24)*180733

QIAseq FX Single Cell RNA Library Kit (96)*180735* アダプター同梱

QIAseq Solutions 02/2019

7

RNA 関連製品

mRNA および lncRNA 用のターゲット発現解析
QIAseq Targeted RNA Panels

Illumina platform

ThermoFisher platform

分子バーコード対応• 分子バーコード技術による新鮮なあるいは FFPE サンプルからの正確なターゲット発
現解析• ヒトおよびマウスに対応• cDNA もしくは最小 25 ng の RNA から測定可能• GeneGlobe によるクラウドベースのフリーのデータ解析ツールを提供
製品名Cat. no.

Human Angiogenesis & Endothelial Cell Biology

RHS-001Z

Human Apoptosis & Cell Death

RHS-002Z

Human Cancer Transcriptome

RHS-003Z

Human Extracellular Matrix & Cell Adhesion Molecules

RHS-004Z

Human Inflammation & Immunity Transcriptome

RHS-005Z

Human Molecular Toxicology Transcriptome

RHS-006Z

Human Signal Transduction PathwayFinder

RHS-007Z

Human Stem Cell & Differentiation Markers

RHS-008Z

Panel 製品（ 12 サンプルおよび 96 サンプル用）*

Human Immuno-Oncology

RHS-009Z

Mouse Angiogenesis & Endothelial Cell Biology

RMM-001Z

Mouse Apoptosis & Cell Death

RMM-002Z

Mouse Cancer Transcriptome

RMM-003Z

Mouse Extracellular Matrix & Cell Adhesion Molecules

RMM-004Z

Mouse Inflammation & Immunity Transcriptome

RMM-005Z

Mouse Molecular Toxicology Transcriptome

RMM-006Z

Mouse Signal Transduction PathwayFinder

RMM-007Z

Mouse Stem Cell & Differentiation Markers

RMM-008Z

Mouse Immuno-Oncology

RMM-009Z

Index 製品

QIAseq Targeted RNA 12-Index I (48)†333114

QIAseq Targeted RNA 96-Index I (384)333117

QIAseq Targeted RNA 96-Index HT I (384)†

333127

QIAseq Targeted RNA 12-Index L (48)333214

QIAseq Targeted RNA 96-Index HT L (384)‡

333217†‡* カスタム対応が可能（別紙価格表参照）†
Illumina シークエンサー用アダプターおよびインデックス‡
ThermoFisher 用アダプターおよびインデックス

8

QIAseq Solutions 02/2019

RNA 関連製品

融合遺伝子解析

QIAseq Targeted RNAscan Panels

Illumina platform

ThermoFisher platform

分子バーコード対応• 既知の融合遺伝子や片側未知の融合遺伝子の検出に対応• 分子バーコードによる正確かつ低頻度の融合遺伝子検出が可能• GeneGlobe によるクラウドベースのフリーのデータ解析ツールを提供
製品名Cat. no.

Human Leukemia Panel*

FHS-001Z

Human Solid Tumor Panel*

FHS-002Z

Human Lung Cancer Panel*

FHS-003Z

Human Oncology Panel*

FHS-3001Z

QIAseq 12-Index I (48)†
QIAseq 96-Index I Set A (384)†

333714

QIAseq 96-Index I Set B (384)†

333737

QIAseq 96-Index I Set C (384)†

333747

QIAseq 96-Index I Set D (384)333757

QIAseq 12-Index L (48)‡333764

QIAseq 96-Index L (384)‡

333777333727†* パネル製品は 12 サンプル用と 96 サンプル用、カスタム対応が可能（別紙価格表参照）†
Illumina シークエンサー用アダプターおよびインデックス‡
ThermoFisher 用アダプターおよびインデックス

免疫レパトア解析 : T- 細胞受容体の RNA-seq
QIAseq Immune Repertoire RNA Library Kit

Illumina platform

分子バーコード対応• 分子バーコード（ UMI）による正確な定量とシークエンス解析• 単一ライブラリーからアルファ、ベータ、ガンマ、デルタ鎖全て解析可能• ヒトまたはマウスサンプルに対応• GeneGlobe によるクラウドベースのフリーのデータ解析ツールを提供• QIAseq サンプルインデックスで最大 384 サンプルまでマルチプレックス可能（別途注文）
製品名

Product no.

Cat. no.

Human TCR Panel, ver. Z, QIAseq Immune Repertoire RNA Library Kit*

333705

IMHS-001Z

Mouse TCR Panel, ver. Z, QIAseq Immune Repertoire RNA Library Kit*

333705IMMM-001Z

QIAseq 12-Index I (48) †333714

QIAseq 96-Index I Set A (384) †333727

QIAseq 96-Index I Set B (384) †333737

QIAseq 96-Index I Set C (384) †333747

QIAseq 96-Index I Set D (384)333757†* 12 サンプル用と 96 サンプル用あり†
Illumina シークエンサー用のアダプターおよびインデックス

QIAseq Solutions 02/2019

9

RNA 関連製品（セレクションガイド）

QIAseq RNA 関連製品一覧

Si

ng
le
ce
1–
ll
–
10
10
ng
0
ce
10
RN
lls
–1
A
;1
00
0–
0
m
10
n
RN
g
00
R
A
N
pg
A
ln
RN
cR
A
N
A
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N
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PE l RN incl
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(IL
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(T
m
F)
on
ap
pl
ica
tio
ns

RNA ライブラリー調製用 QIAseq Kits

Input sample
and amount

Target RNA

QIAseq UPX
3’ Targeted
RNA Panel••

QIAseq
UPX 3’
Transcriptome
Kits

•

•

QIAseqImmuneRepertoire
RNA Library
Kit (TCR Panel)• •QIAseqStrandedmRNA SelectKit•* • •

QIAseqStranded Total
RNA Library
Kit•

QIAseqmiRNA Library
Kit

• •

QIAseqTargeted RNA
Panels• • • •†

QIAseqTargeted
RNAscanPanels
QIAseq FXSingle Cell
RNA Library
Kit

• • •

Molecular
Index

Included withlibrary lot

•

•

•

•

No

Human
Mouse

IL

ハイスループット 3’・
ターゲット遺伝子発現

•

•

•

No

Human
Mouse
MonkeyIL

ハイスループット 3'・
トランスクリプトーム
解析

•

No

Human
Mouse

IL

クロノタイプ同定のための T- 細胞受容体 CDR3
領域の定量と同定

•

Yes

Any

IL

mRNA 濃縮による遺伝子
発現およびアイソフォーム
検出

•

•

•

•

•

• •

•

rRNA/ 遺伝子の globin
depleted RNA/lncRNA
発現、RNA アイソフォー
ム、SNVs 用 . メタトラン
スクリプトミクス対応

•

Yes

Any

IL

•

•

No

Any

IL/TF

miRNA, piRNA
同定と定量

• • •

•

•

No

Human
Mouse

IL/TF

mRNA/lncRNA 遺伝子
発現

• •

•

•

No

Human

IL/TF 融合遺伝子解析

Yes

Any

• •

• •
•

Library
type

•

•

IL

遺伝子発現、RNA アイ
ソフォーム検出* 1～10 ngの濃縮されたmRNA： 通常は100 ngのトータルRNAから始めて、キットに含まれているmRNA濃縮プロトコールを使用することで達成できます。
†

10

1～10 ngの除去RNA： 通常、
100 ngのトータルRNAから始めて、
リボソームRNAとグロビンRNAを除去することで達成されます（血液からのアプリケーション用）。

QIAseq Solutions 02/2019

DNA 関連製品

分子バーコードを用いた正確な変異解析
QIAseq Targeted DNA Panels

Illumina platform

ThermoFisher platform

分子バーコード対応• 分子バーコードによる PCR duplicate や偽陽性排除が可能• 低頻度変異検出対応パネル• ヒトサンプル由来の FFPE や遊離 DNA などの微量サンプルに最適化• 高 GC 領域でのカバレッジを最大化するための buffer テクノロジー• GeneGlobe によるクラウドベースのフリーのデータ解析ツールを提供
製品名Cat. no.

Human Breast Cancer Panel

DHS-001Z

Human Colorectal Cancer Panel

DHS-002Z

Human Myeloid Neoplasms Panel

DHS-003Z

Human Lung Cancer Panel

DHS-005Z

Human Actionable Solid Tumor Panel

DHS-101Z

Human BRCA1 and BRCA2 Panel

DHS-102Z

Human BRCA1 and BRCA2 Plus Panel

DHS-103Z

Human Pharmacogenomics Panel

DHS-104Z

Human Mitochondria Panel

DHS-105Z

Human Inherited Disease Panel

DHS-3011Z

Human Comprehensive Cancer Panel

DHS-3501Z

Human Tumor Mutational Burden Panel

DHS-6600Z

Panel 製品（ 12 サンプルおよび 96 サンプル用）*

Index 製品

QIAseq 12-Index I (48)†333714

QIAseq 96-Index I Set A (384)†333727

QIAseq 96-Index I Set B (384)†

333737†

QIAseq 96-Index I Set C (384)333747

QIAseq 96-Index I Set D (384)†

333757

QIAseq 12-Index L (48)333764

QIAseq 96-Index L (384)‡

333777‡* カスタム対応が可能（別紙価格表参照）†
Illumina シークエンサー用アダプターおよびインデックス‡
ThermoFisher 用アダプターおよびインデックス

QIAseq Solutions 02/201911

DNA 関連製品

ターゲット DNA 解析前の FFPE サンプルの品質チェック
QIAseq DNA QuantiMIZE Kit• アレイまたは個々のチューブに分注された 2 つの qPCR アッセイを提供• PCR で増幅可能な DNA の定量と定性• ターゲット濃縮条件の最適化
製品名

Product no.

Cat. no.

QIAseq DNA QuantiMIZE Array Kit

333404

DNQA-002

QIAseq DNA QuantiMIZE Assay Kit

333414

DNQC-100YNGS ライブラリーの定量

QIAseq Library Quant System• 即使用可能でプレデザイン済みのアレイフォーマットに分注済みの段階希釈した DNA
スタンダード• ライブラリー濃度の自動計算• 簡単なプロトコール、高い感度、幅広いダイナミックレンジ• Illumina および Ion Torrent/Proton プラットフォームで使用可能• 幅広い種類の qPCR 装置で使用可能
製品名

Product no.

Cat. no.

QIAseq Library Quant Array Kit

333304

QSIL-003

QIAseq Library Quant Array Kit

333304

QSIL-3003

QIAseq Library Quant Array Kit

333304

QSIT-003

QIAseq Library Quant Array Kit

333304

QSIT-3003

QIAseq Library Quant Assay Kit

333314

QSTF-ILZ

QIAseq Library Quant Assay Kit

333314

QSTF-ITZ* 各社サーマルサイクラーに応じた製品をご用意

12

QIAseq Solutions 02/2019

DNA 関連製品

全ゲノム解析またはハイブリキャプチャー用のライブラリー調製
Genome Coverage , 100 ng Input
QIAseq FX DNA Library Kit

Normalized coverage

Illumina platform2• 酵素法による簡便なゲノムライブラリー調製試薬1• バイアスを最小限に、均一なカバレッジを取得可能• 1 ng ～ 1 µg までの幅広いインプット DNA0.5量に対応• 96 ウェルフォーマットへの対応可能
0
1.5

0

Genome Coverage , 100 ng Input

20

QIAseq FX

4060
GC % over 100 bp regions

80

100

GC 含量によるバイアスの無い断片化

Genome Coverage, 1 ng Input

Normalized coverage

QIAseq FX DNA Library Kit は、超音波断片化法と同Normalized coverage2

等の GC バイアスの無い断片化が可能である。

2

1.5

1.5

QIAseq FX

1

1

0.5

0.5

0

0
0

20

40
60
GC % over 100 bp regions

80

100

A：100 ng の gDNA の 場法（ 黒 色 ） と同 等 に GC ％ に 依 ら な い 均 一 な

カバレッジが得られ、N 社の酵素法では高 GC％にカバレッジが偏っていた。
0

20

40
60
GC % over 100 bp regions

QIAGEN QIAseq FX

Genome Coverage, 1 ng Input

80

100

N 社 ̶ 酵素法

超音波断片化 + 標準的なライブラリー作製試薬

Normalized coverage

I 社 ̶ 酵素法

2

製品名

1.5

QIAseq FX DNA Library Kit (24)*
QIAseq FX DNA Library Kit (96)*80

QIAGEN QIAseq FX

N 社 ̶ 酵素法

60
GC % over 100 bp regions

FX DNA Library Kit（青色）と超音波断片化法（黒色）ではバイアスの無いカバレッッジが得られた。一方、I

社の酵素法では、GC 含量 30％周辺にカバレッジが偏っていることを示している。

1804730.5* 0アダプター同梱
20
40

B：1 ng の gDNA の場合、A の結果と同様に QIAseq

Cat. no.

QIAseq FX

10

合、QIAseq FX

DNA Library Kit（ 青 色 ） は 超 音 波 断 片 化

QIAseq FX

180475100

超音波断片化 + 標準的なライブラリー作製試薬

ライブラリー調製I 社 ̶ 酵素法

QIAseq FX Single Cell DNA Library Kits

Illumina platform• シングルセルや超微量 DNA からの全ゲノム増幅からライブラリー調製までのワークフロー• わずか 4 時間で完結する PCR フリーのケミストリー• 微量サンプルからの染色体異常、コピー数多型解析に最適
製品名

Cat. no.

QIAseq FX Single Cell DNA Library Kit (24)*180713

QIAseq FX Single Cell DNA Library Kit (96)*180715* アダプター同梱

QIAseq Solutions 02/201913

DNA 関連製品

ライブラリー調製

QIAseq Ultralow Input Library Kit

Illumina platform• 超高効率なケミストリーで 10 pg のゲノムからライブラリー調製可能• 遊離 DNA や ChIP-seq のアプリケーションに最適
Library yield from low sample inputs
Yield (nM)
40

QIAseq Ultralow Input Library Kit

35

Supplier K

30

Supplier I

Supplier N
Supplier S

25
20
15
10
5
0

0.1 ng0.01 ng
Sample input amount

製品名

サンプルインプット量に依存しない高い収量と一定した変換効率
少量のサンプルインプットから得たライブラ
リー収量の市販キット間での比較。QIAseq
Ultralow Input Library Kit は 0.1 ng 以 下 のDNA インプット量で他社のキットに比べてより高いライブラリー収量である。

Cat. no.
180492

QIAseq Ultralow Input Library Kit (12)180495

QIAseq Ultralow Input Library Kit (96)*†GeneRead Adapter I Set A 12-plex (144)180985

GeneRead Adapter I Set B 12-plex (144)†

180986* 96 サンプル用にはアダプターが同梱†

Illumina シークエンサー用のアダプターとインデックス

ライブラリー調製

QIAseq 1-Step Amplicon DNA Library Kit

Illumina platform• マルチプレックス PCR 産物からわずか 30 分でライブラリー調製可能• 16S rRNA マイクロバイオロジーのプロファイリングに最適• 室温、1 ステップで自動化に最適
製品名

Cat. no.

QIAseq 1-Step Amplicon DNA Library Kit (12)180412

QIAseq 1-Step Amplicon DNA Library Kit (96)*180415†

GeneRead Adapter I Set A 12-plex (144)180985†

GeneRead Adapter I Set B 12-plex (144)180986* 96 サンプル用にはアダプターが同梱†

14

Illumina シークエンサー用のアダプターとインデックス

QIAseq Solutions 02/2019

DNA 関連製品

微生物のプロファイリング
QIAseq 16S/ITS Panels

Illumina platform• 細菌の 16S rRNA の可変領域や真菌の ITS 領域解析用のライブラリー試薬• フェイズプライマーにより、PhiX 添加なしで高精度なリード• ウルトラクリーン製品により、コンタミによるバックグランドを最小限に• わずか 1 pg の DNA から対応可能
QIAseq 16S/ITS Region Panels

QIAseq 16S/ITS Region Panels は、16S rRNA の可変領域や真菌の ITS 領

域解析領域の中から、1, 2 または 3 か所を選択してお求めください。価格は、選んだ領域数によって異なります。

Unphased

QIAseq 16S/ITS Screening Panel

QIAseq 16S/ITS Screening Panel では、より解像度良く菌のプロファイリング

をするために、16S rRNA の可変領域や真菌の ITS 領域解析領域の全体を対PhasedR2: Cycle1

R1: Cycle1

R1: Cycle1

R2: Cycle1

A

C

A

C

A

C

A

C

G

T

G

T

G

T

G

T

象としています。

Unphased

塩基の多様性とクオリティスコアを高めるためフェイズプライマーを採用した QIAseq 16S/ITS Panels

Ａ データにより、フェイズプライマーを使用しないと 1 サイクル目の read 1 (R1) で、塩基の偏りが生じることが示されている。一方、フェイズプライマーを用いている Ｂ では、塩基の偏りのないことから、フェイズプライマーが均一な塩基の検出に大きく寄与できることを示す。また、C における塩基の偏りや低いデータ品質が、フェイズプライマーにより大幅に改善されたことが D で確認された。

PhasedQuality distribution

Base distribution

Base distribution

Read 1

Read 1

Read 2

Read 2

Quality distribution

Relative abundance (%)
16

可変領域のパネルスクリーニングにより、安定した菌のプロファイリングを提供

QIAseq 16S/ITS Screening Panel を使用して、ATCC
20 サンプルでライブラリー作製し、検出できる菌種の種類を確認した。Streptococcus mutans に特化してデータを確認した例であり、赤い矢印で示した領域でのみ S. mutans. を分類することができることを示す。

12
8
4
0

V1V2
Expected (genus)

製品名

V2V3

V3V4

V4V5

Expected species

Observed (genus)

V5V7

V7V9

Observed species

Product no.

Cat. no.

QIAseq 16S/ITS Region Panel (24)333842varies

QIAseq 16S/ITS Region Panel (96)333845varies

QIAseq 16S/ITS Screening Panel (24)333812

QIAseq 16S/ITS Screening Panel (96)333815

QIAseq 16S/ITS 24-Index I (96)*333822

QIAseq 16S/ITS 96-Index I (384)*

333825

QIAseq 16S/ITS 384-Index I (1536)*

333827

QIAseq 16S/ITS Smart Control (10)333832* イルミナシークエンサー用のアダプターおよびインデックス

QIAseq Solutions 02/2019

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参考文献
QIAseq miRNA Library Kit
1.

Coenen-Stass, A.M.L. et al. (2018) Evaluation of methodologies for microRNA biomarker detection by next generation sequencing. RNA Biol. 1133–1145.

2.

Ransey, et al. (2017) Comparative analysis of LIN28-RNA binding sites identified at single nucleotide resolution. RNA Biol. 14,1756-1765.

3.

Zhou, Y. et al. (2018) Exosomes from Endothelial Progenitor Cells Improve the Outcome of a Murine Model of Sepsis. Mol. Ther. 26, 1375-1384.

4.

Janaszak-Jasiecka, A. et al. (2018) eNOS expression and NO release during hypoxia is inhibited by miR- 200b in human endothelial cells. Angiogenesis. 21, 711-724.

QIAseq Targeted RNA Panels
5.

Kaur, S., Elkahloun, AG., Singh, SP., Arakelyan, A., Roberts, DD. (2018) A function-blocking CD47 antibody modulates extracellular vesicle-mediated intercellular signaling between breast
carcinoma cells and endothelial cells. J Cell Commun Signal.12, 157-170.

6.

Bilal, MY., Dambaeva, S., Kwak-Kim, J., Gilman-Sachs, A., Beaman, KD. (2017) A Role for Iodide and Thyroglobulin in Modulating the Function of Human Immune Cells. Front Immunol. 8,1573.

7.

Delker, DA., et al. (2018) Chemoprevention with Cyclooxygenase and Epidermal Growth Factor Receptor Inhibitors in Familial Adenomatous Polyposis Patients: mRNA Signatures of Duodenal Neoplasia. Cancer Prev Res (Phila). 11, 4-15.

8.

Dobbs, et al. (2017) Monocyte dysregulation and systemic inflammation during pediatric falciparum malaria. JCI Insight. 2, pii: 95352.

9.

Sahay, B., et al. (2018) Induction of Interleukin 10 by Borrelia burgdorferi Is Regulated by the Action of CD14-Dependent p38 Mitogen-Activated Protein Kinase and cAMP-Mediated Chromatin Remodeling. Infect Immun. 86, pii: e00781-17.

QIAseq Targeted DNA Panels
10. Hu, Y. et al. (2018) False positive plasma genotyping due to clonal hematopoiesis. Clin. Canres. 24, 4437-4443.
11. Yoshimura, K. et al. (2018) Heterogeneous MET gene copy number and EGFR mutation elicit discordant responses to crizotinib between primary and metastatic lesions in erlotinib-resistantlung adenocarcinoma. Lung Cancer. 124, 317-319.
QIAseq FX DNA Library Kit
12. Yoshikawa, N., Nagata, N. (2017) Eighteen SSR Markers for the Japanese Clawed Salamander, Onychodactylus japonicus, and Cross-amplification in its Congeners - Current Herpetology, jstage. jst.go.jp.
13. Hosokawa, M., Nishikawa, Y., Kogawa, M., Takeyama, H. (2017) Massively parallel whole genome amplification for single-cell sequencing using droplet microfluidics. Sci Rep. 7, 5199.
14. Mekata, H. et al. (2018) Molecular epidemiological survey and phylogenetic analysis of bovine influenza D virus in Japan. Transbound Emerg Dis. 65, e355-360.
15. Lavoie, JM. et al. Precision Oncology Targeted Error-Suppressed Detection of Circulating Paternal DNA to Establish a Diagnosis of Gestational Trophoblastic Neoplasm. Journal of ClinicalOncology
16. Harrison, RL., Rowley, DL., Mowery, JD., Bauchan, GR., Burand, JP. (2017) The Operophtera brumata Nucleopolyhedrovirus (OpbuNPV) Represents an Early, Divergent Lineage within Genus
Alphabaculovirus. Viruses. 9, 307.
QIAseq FX Single Cell DNA Library Kit
17. Trevino, SG. et al. (2017) High-Resolution Single-Cell Sequencing of Malaria Parasites. Genome Biol Evol. 9, 3373-3383.
QIAseq Ultralow Input Library Kit
18. Hołówka, J., Trojanowski, D., Ginda, K., Wojtaś, B., Gielniewski, B., Jakimowicz, D. (2017) HupB Is a Bacterial Nucleoid-Associated Protein with an Indispensable Eukaryotic-Like Tail. MBio.
8, 01272-17
19. Uner, OE., Ulrich, BC., Hubbard, GB.(2018) Potential of Aqueous Humor as a Surrogate Tumor Biopsy for Retinoblastoma. JAMA Ophthalmol. 136, 597-598.

MicroRNA (miRNA)

mall (short)
rt interfering RNA (siRNA)rt)

NGSソリューションに関する詳細は、www.qiagen.com/QIAseq-NGS-solutions をご覧ください。

記載のQIAGEN製品は研究用です。疾病の診断、治療または予防の目的には使用することはできません。最新のライセンス情報および製品ごとの免責事項に関しては、ウェブ
Signal recognition particle RNA (SRP RNA)

tochondria

サイトwww.qiagen.comの“Trademarks and Disclaimers”をご覧ください。QIAGENキットのHandbookおよびUser
Manualはwww.qiagen.comから入手可能です。
RISC

Trademarks: QIAGEN®, Sample to Insight®, QIAseq®, CleanStart™, GeneGlobe®, LNA® (QIAGEN Group);(Roche Group); NEB® (New England Biolabs, Inc.). 本文に記載の会社名
Illumina® (Illumina, Inc.); KAPA® Pre-miRNATransfer RNA (tRNA)

販売店

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Ribosomes