NBDCの紹介
2024年06月20日
JST NBDC事業推進室© 2024 国立研究開発法人科学技術振興機構 Licensed Under CC 表示 4.0 国際

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JST内におけるNBDCの位置付け

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アクセスコード「#AJACS-2024-06」「国立研究開発法人科学技術振興機構 概要」より
https://www.jst.go.jp/pr/intro/outline.pdf© 2024 国立研究開発法人科学技術振興機構 Licensed Under CC 表示 4.0 国際

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NBDCの活動

ご質問・ご意見https://www.slido.com/jp
アクセスコード「#AJACS-2024-06」

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中核的DBの整備

統合利用基盤技術の開発

基盤的ウェブサービスの提供(w/ DBCLS)(ex. アーカイブ)(DICP:統合化推進プログラム)© 2024 国立研究開発法人科学技術振興機構 Licensed Under CC 表示 4.0 国際

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NBDCの活動①

ご質問・ご意見https://www.slido.com/jp
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中核的DBの整備

統合利用基盤技術の開発

基盤的ウェブサービスの提供(w/ DBCLS)(ex. アーカイブ)(DICP:統合化推進プログラム)

分野ごとの中核的な研究データベースをファンディングを通じて整備。
研究データを効率的に利用する情報環境の構築を支援します。
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統合化推進プログラム(DICP) 運営方針

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アクセスコード「#AJACS-2024-06」「公共データ駆動型の研究スタイルは、研究の機会均等と多様性維持のための実効的な手段になりえる。

その意味においても、データ利活用環境の整備と有用事例の創出は重要」「本プログラムが求めるものは、生命科学の研究スタイル
研究総括の変革を見据え、幅広い層の利用者に向けて開かれた伊藤 隆司

データベースの構築に、高い公共心と熱意をもって取り九州大学 教授

組む提案」「2024年度 統合化推進プログラム公募要領」より抜粋・一部改変
https://biosciencedbc.jp/funding/calls/files/r06guide-togo.pdf© 2024 国立研究開発法人科学技術振興機構 Licensed Under CC 表示 4.0 国際

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採択課題一覧

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No.

タイプ

データベース

備考

研究代表者氏名

1

育成型

MIIDB-AI (仮称)

中分子相互作用

池田 和由

2

育成型

Cell IO (仮称)

１細胞トランスクリプトーム

尾崎 遼

3育成型

integMET (仮称)

メタボローム

早川 英介

4

育成型

ATTED-II

植物トランスクリプトーム

大林 武

5

育成型

Japanese Open Genome Omics Platform (仮称)

ヒトゲノム構造多型

長﨑 正朗

6

育成型

Spatial Genomics Atlas of Cells and Tissues (仮称)空間トランスクリプトーム

Vandenbon Alexis

7本格型

Japan Proteome Standard Repository/Database (jPOST)

プロテオーム石濱 泰

8本格型

Shin-MassBank

メタボローム

松田 史生

9本格型

SSBD:database

定量的生命動態画像

大浪 修一

10

本格型

INTRARED

転写制御

粕川 雄也

11

本格型

KEGG MEDICUS

パスウェイ

金久 實

12

本格型

GlyCosmos Portal

糖鎖生物学

木下 聖子

13本格型

PDBj

構造生物学

栗栖 源嗣

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本格型

Microbiome Datahub

微生物ゲノム森 宙史

ｸﾗﾘﾍﾞｲﾄ・ｱﾅﾘﾃｨｸｽ
引用栄誉賞2018

文科大臣表彰科学技術賞2020© 2024 国立研究開発法人科学技術振興機構 Licensed Under CC 表示 4.0 国際

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NBDCの活動②

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3中核的DBの整備

統合利用基盤技術の開発

基盤的ウェブサービスの提供(w/ DBCLS)(ex. アーカイブ)(DICP:統合化推進プログラム)

研究データの整理・統合、高度な利用環境の開発、アプリケーションの提供を実施。生命の統合的な理解促進および研究データの応用利用の加速を目指す。
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開発・提供されているツール

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TogoVar togovar.org
日本人バリアント情報を集約。
GEM-J、ToMMo、gnomAD、JGA等。
AlphaMissense等の疾患予測情報も。

統合TV togotv.dbcls.jp
データベース・ツールの動画マニュアル・講演・講習
動画、イラストを掲載。
dbcls.rois.ac.jp/services.html※ 本日の講義も、後日、統合TVから公開します。

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NBDCの活動

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中核的DBの整備

統合利用基盤技術の開発

基盤的ウェブサービスの提供(w/ DBCLS)(ex. アーカイブ)(DICP:統合化推進プログラム)

webサービスの提供を通じ、国内外のデータ・データベースの散逸を防ぎ、高度な統合利用を促進。
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ご質問・ご意見

Integbioデータベースカタログ

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integbio.jp/dbcatalog/

研究データベースの所在情報を調査・提供。
収録件数は国内外2,500件超。

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生命科学データベース横断検索

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dbsearch.biosciencedbc.jp

研究データベース、特許情報や文献情報を一括検索。

入力キーワードは、自動で日英・英日翻訳。
キーワードを入れ替えて何度も検索する手間なし。

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生命科学系データベース アーカイブ

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dbarchive.biosciencedbc.jp

研究データセットを NBDC が預かって公開。
1データセット当たり最大1TB までお預かり。
(超える場合は応相談)
複数バージョンを管理し、公開できます。
簡易ビューアあり (表形式データのみ)。

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NBDCの活動

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中核的DBの整備

統合利用基盤技術の開発

基盤的ウェブサービスの提供(w/ DBCLS)(ex. アーカイブ)(DICP:統合化推進プログラム)© 2024 国立研究開発法人科学技術振興機構 Licensed Under CC 表示 4.0 国際13