腫瘍組織の相同組換え修復欠損（HRD）を検出しPARP阻害剤の投与可否の判定を補助します
卵巣癌
乳癌

高度管理医療機器
販売名：MyChoice診断システム
一般的名称：体細胞遺伝子変異解析プログラム（抗悪性腫瘍薬適応判定用）
承認番号：30200BZI00022000

腫瘍組織の相同組換え修復欠損を検出しPARP 阻害剤の投与可否の判断を補助します1

MyChoice®診断システムとは

MyChoice診断システムは、PARP 阻害薬のオラパリブ（製品名：リムパーザ）およびニラパリブ（製品名：
ゼジューラ）の投与可否判断に用いられ、相同組換え修復欠損（Homologous Recombination Deficiency:HRD）を検出するための、次世代シークエンシングベースのコンパニオン診断プログラムです。卵巣癌患者を対象とします。
固定処理した腫瘍検体より取得されたゲノムDNAを用い、❶ ゲノム不安定性の状態（Genomic Instability

Status：GIS）の評 価と、❷ 生 殖 細 胞 系列および 体 細 胞 系列のBRCA1 / BRCA2 遺伝 子のバリアントと大規模な再 構成（ Large Rearrangement：LR ）の 検 出・分 類 の両 方により相 同 組 換 え修 復 欠 損（ HRD）を評価します。GISは、HRDに関連する3つのバイオマーカーであるヘテロ接合性の消失（Loss of
Heterozygosity：以下、LOH）、テロメアアレル不均 衡（ Telomeric Allelic Imbalance：以下、TAI）、大規模な状態遷移（Large-scale State Transition：以下、LST ）のアルゴリズム的測定を介して評価し、スコア化されます。

1

相同組換え修復欠損（HRD）の評価項目
相同組換え修復欠損（HRD）の評価項目
1 腫瘍ゲノム不安定性の状態（GIS）

LOH

ヘテロ接合性の消失

LOH
ノム不安定性の状態
（GIS）
❶●腫瘍ゲ
ゲノム全体に渡る
LOH、TAI、LSTを包括的に評価
ヘテロ接合性の消失

TAI

LST

テロメアアレル不均衡

大規模な状態遷移

テロメアアレル不均衡

大規模な状態遷移

TAI

LST

ゲノム全体に渡るLOH、TAI、LSTを包括的に評価

GI スコアLOH❷

2/

バリアント状態

BRCA1/BRCA2 バリアント状態
腫瘍組織から抽出したゲノムDNA中の

TAI

シークエンスバリアント
シークエンスバリアント

LST
大規模遺伝子再構成
大規模遺伝子再構成の生殖細胞系列および体細胞変異を検出・分類●留意事項
腫瘍組織から抽出したゲ
ノム
中のの生殖細胞系列および体細胞変異を検出・分類：生殖細胞系列か、体細胞系列の変異かの区別はできません。
/

DNA

BRCA1 BRCA2

留意事項：生殖細胞系列の変異と、体細胞の変異の区別はできません。

●❶ LOH、TAIおよびLSTの集計量解析に基づいて、ゲノム不安定性（GI）スコアが算出されます。バリデートされたカットオフ値により、検査報告書には GIS が陽性（42以上）または陰性として報告されます。
1

LOH、TAIおよびLSTの集計量解析に基づいて、ゲノム不安定性（GI）スコアが算出されます。バリデートされた●❷ 固定処理した患者の腫瘍検体（ホルマリン固定パラフィン包埋検体FFPE）より検出されたバリアントを、myChoice診断システム
カットオフ値により、検査報告書にはGISが陽性（42以上）または陰性として報告されます。
により解析し、の各バリアントは、ミリアドのバリアント分類データベースに格納された分類済みバリアントのリストと照合、またはミリアド独自の分析手法を用いて、「病的変異あり（DELETERIOUS）
または病的変異疑い（SUSPECTED
2 固定処理した患者の腫瘍検体（ホルマリン固定パラフィン包埋検体：
FFPE）より検出されたバリアントを、
DELETERIOUS）」、「臨床的意義が不明なバリアント
（VUS）
」
、
「病的変異なし（NEGATIVE）」に分類され、これらのバリアント
分類の情報が検 査 結 果 として 報 告 さ析し、れ ま す。検 査 報 告 書 に は「病
的 変 異 あり（DELETERIOUS）
または 病 的 変 異 疑 い診断システムにより解の各バリアントは、
ミリアドのバリアント分類
MyChoice
BRCA1 / BRCA2（SUSPECTED DELETERIOUS）」と「臨床的意義が不明のバリアント（VUS）」の分類のいずれかが報告され、遺伝子多型の可能
データベースに格納された分 類 済みバリアントのリストと照合、またはミリアド独自の分析手法を用いて、性や遺伝子多型として分類されたバリアントは「病的変異なし（NEGATIVE）」
として報告されます。

「病的変異あり（DELETERIOUS）または病的変異疑い（SUSPECTED DELETERIOUS）」、「 臨 床 的 意 義が不 明 な バリアント（ VUS）」、「病的変異なし（NEGATIVE）」に分類され、これらのバリアント分類の情報が検査結果として報告されます。検査報告書には「病的変異あり（DELETERIOUS）または病的変異疑い（SUSPECTED DELETERIOUS）」と「臨床的意義が不明のバリアント（VUS）」の分類のいずれかが報告され、遺伝子多型の可能性や遺伝子多型として分類されたバリアントは「病的変異なし（NEGATIVE）」として報告されます。

2

腫瘍組織の相同組換え修復欠損を検出しPARP 阻害剤の投与可否の判断を補助します2

卵巣癌におけるMyChoice®診断システムによるHRD検査の意義について癌が発症するためには、父方と母方からそれぞれ受け継いだ癌抑制遺伝子の両方に変化またはバリアントが生じる必要があります。遺伝性乳癌または卵巣癌の場合、BRCA1/ BRCA2 遺伝子の最初のバリアントは遺伝的に受け継がれていますが、もう一方の正常なBRCA1/ BRCA2 遺伝子により正常な DNA 修復が行われます。
しかし、体 細 胞（ 腫 瘍 細 胞 ）で の 突 然 変 異やエピジェネティックな修飾（ DNA のメチル 化によって生じる
遺伝子サイレンシングなど）により正常であったBRCA1/ BRCA2 遺伝子も不活化されると（ヘテロ接合性の消失：LOH）、細胞は正確性では劣る別の DNA修復機構に依存せざるを得なくなるため、エラーが蓄積します。
相同組換え修復の主役となるBRCA1/ BRCA2 遺伝子の病的バリアントによって相同組換え修復機構が破綻した結果、ゲノム不安定化を引き起こし、最終的に癌化のリスクを高めると考えられています。

BRCA1/ BRCA2遺伝子の生殖細胞系列（遺伝性）バリアントまたは体細胞（腫瘍）バリアントを有する卵巣癌
患者は、PARP 阻害薬により効果が得られることが示されています1-3。最近の研究では、患者の腫瘍におけるBRCA1/ BRCA2遺伝子の状態に加えて、HRDに関連するバイオマーカーであるLOH、TAIおよびLSTにより
ゲノム不安定性の状態を評価することによって、HRD は PARP 阻害薬投与後の PFS 延長に関連する因子であることが示されています4-6 。PAOLA-1試験（後述）では､BRCA1/ BRCA2バリアント保持者に加え、さらに20 ％近くが HRD 陽性であり7、これは卵巣癌患者の約50 ％がPARP阻害薬に反応すると特定できることを意味します。

PAOLA-1試験におけるHRD陽性の割合7

29%

34%

HRD 陰性HRD陽性/
遺伝子変異陽性の判定

19%

18%

HRD不明※※内訳： HRD 検査の中止/失敗 15% 、HRD 欠測（検体未送付）3%

3

HRD陽性/
ゲノム不安定性の状態による判定

48%

HRD陽性

卵巣は骨盤内臓器であるために腫瘍が発生しても初期の段階では自覚症状に乏しく、40 〜50 ％の症例が診断時に予後不良なⅢ・Ⅳ期症例です8, 9。進行例における治療成績の向上が卵巣癌治療の重要な課題となっており、相同組換え修復経路に着目した治療法が期待されてきました。
武田薬品工業株式会社のPARP阻害剤ニラパリブトシル酸塩水和物（以下、ニラパリブ、製品名：ゼジューラ）は、2020 年 9月に「①卵巣癌における初回化学療法後の維持療法、②白金系抗悪性腫瘍剤感受性の再発卵巣癌における維持療法、③白金系抗 悪性 腫 瘍剤感 受性の相同 組 換え修復 欠損を有する再発 卵巣 癌」を適 応 症として国 内承 認を取 得しています。同月、腫 瘍における相 同 組 換え修 復 欠 損（ HRD）の 状 態を判 定して、ニラパリブが適応となる再発卵巣癌患者を選別するために、MyChoice 診断システムが承認されました。
この承認にあたり示されたQUADRA 試験10は、3レジメン以上の化学療法歴を有する再発性、高異型度上皮性
卵巣癌、卵管癌、または原発性 腹 膜癌患者を対 象に、ニラパリブの 安 全 性および 有効性を評価した第Ⅱ相、非盲検、単群多施設共同試験であり、HRD 陽性の被験者はMyChoice 診断システムの解析結果に基づいて
事 前に判定されました。本 試 験は主要評 価 項目を達 成し、主要解 析対 象 集 団（3 または 4 レジメン以 上の化 学 療法歴、HRD 陽性、白金製剤感受性、および PARP 阻害剤未 治療 の患者（ n=47 ））において、奏 効 率。
（ORR）は27.7％（95％ CI：15.6 〜42.6、片側p 値=0.00053）でした7, 10（表１）
表１ QUADRA（ニラパリブ単群試験）7, 10
主要評価項目ORR（95％CI）

ニラパリブ群

n=47

27.7%

（15.6〜42.6）

アストラゼネカ社のPARP阻害剤オラパリブ（製品名：リムパーザ）は、2018年1月に「白金系抗悪性腫瘍剤感受性の再発卵巣癌における維持療法」について国内適応承認を取得、2019 年 6月には「BRCA 遺伝子変異陽性の卵巣癌における初回化学 療 法 後の維持 療 法 」、2020 年 12 月に「相同 組 換え修復 欠損を有する卵巣 癌におけるベバシズマブ（遺伝子組換え）を含む初回化学療法後の維持療法」の適応拡大が承認されました。
「BRCA 遺伝子変異陽性の卵巣癌における初回化学療法後の維持療法」および
MyChoice診断システムは、「相同組換え修復欠損を有する卵巣癌におけるベバシズマブ（遺伝子組換え）を含む初回化学療法後の維持療法」を適応症としたオラパリブの投与可否判断補助として、追加承認されました。

4

腫瘍組織の相同組換え修復欠損を検出しPARP 阻害剤の投与可否の判断を補助します

BRCA1/ BRCA2 遺伝子変異陽性卵巣癌におけるオラパリブの有効性は、SOLO1試験 11で示されています。
SOLO1試験は、白金製剤を含む初回化学療法に対して奏効を示し、BRCA1/ BRCA2のいずれかに「病的変異」
または「病的変異疑い」に分類される変異を有する、
進行高異型度上皮性卵巣癌（原発性腹膜癌および/ または卵管癌）の患者を対象に、オラパリブによる単独維持療法の有効性を検討した第Ⅲ相、二重盲検、プラセボ
対 照 多施 設 共 同 試 験 です。本 試 験 では主 要 評 価 項目である無 増 悪 生存 期 間（ PFS）の 延 長を 達 成し、
オラパリブ 群はプラセボ群に比 較し、病 勢 進 行または死亡のリスクが 70 ％低下することが示されました（ハザード比：0.30、95％ CI：0.23〜 0.41、p＜0.001）7, 11（表2）。
表2 SOLO1（プラセボ比較対照試験）7, 11
オラパリブ群

プラセボ群

未到達

13.8ヵ月n=260

PFS中央値
ハザード比（95％CI）

n=131

0.30

（0.23〜0.41）

SOLO1 試 験では、患者の血液検体から抽出されたDNA 中の生殖細胞系列でのBRCA1 / BRCA2 遺伝子
バリアントが評価されました。一方で、SOLO1試験に登録された患者より採取された利用可能な残余腫瘍検体より抽出した DNA 中 の 腫 瘍BRCA1 / BRCA2 遺 伝 子バリアント の 検 査 が MyChoice 診 断 システムにより行 わ れ、292 例の患者のうち、28 4 例（ 97.2 ％）が腫瘍BRCA1 / BRCA2 遺伝子バリアント陽性であることが示されました7。バリアント分類の更新や検査手法の違いなどによる差異はありますが、相関性が高く、これらの結果に基づきMyChoice診断システムの臨床的有用性が示されました。

5

HRD陽性の進行卵巣癌に対する、ベバシズマブを含む初回治療後の維持療法としてのオラパリブ/ベバシズマブ
併用療 法の有効性は、PAOLA-1 試験7, 12におけるサブグル ープ解 析で示されています。PAOLA-1試験は進行卵巣癌と診断され、標準治療である白金製剤/タキサン製剤併用化学療法とベバシズマブ（化学療法との併用および維持療法）による治療を受けた、高 異 型 度 漿 液 性 または 類 内 膜 卵 巣 癌 、卵 管 癌 または原 発 性
腹膜 癌患者を対 象として、オラパリブ/ベバシズマブ併用 療 法 の 有 効 性と安 全 性をプラセボ /ベバシズ マブ
併用療法と比較した、無作為化第Ⅲ相、二重盲検、プラセボ対照多施設共同試 験です。本試験は主要評価項目
である PFS の延長を達成し（ハザード比：0.59、95 ％ CI：0.49 〜 0.72、p＜0.001）、そのサブグループ（ハザード比：0.33、解析によればHRD 陽性患者でオラパリブのベネフィットが得られることが 示されました

95％CI：0.25〜0.45）。一方で、HRD陰性患者のサブグループにおいてはハザード比1.00（95%CI：0.75〜1.35）であり、PFSの延長効果は認められませんでした7, 12。
全解析対象集団およびMyChoice診断システムにより定義されたサブグループにおける有効性の比較7

PAOLA-1 試験では、MyChoice HRD plus 研究用検査によりHRD 状態が判定されましたが、同試験のDNA を MyChoice 診断システムによる検査にて探索的解析 7を行ったところ、その結果に一貫性があり、MyChoice診断システムの有用性が示されました（表3）。
表3 PAOLA-1試験における臨床成績（プラセボ比較対照試験）7
主要解析

探索的解析 注

全解析対象集団ハザード比（95％CI）

HRD状態陰性

オラパリブ/
ベバシズマブ群

プラセボ /
ベバシズマブ群

オラパリブ/
ベバシズマブ群

プラセボ /
ベバシズマブ群

オラパリブ/
ベバシズマブ群

プラセボ /
ベバシズマブ群

22.1ヵ月16.6ヵ月39.3ヵ月17.7ヵ月16.6ヵ月16.2ヵ月

n=537

PFS中央値

HRD状態陽性＊

0.59

n=269

（0.49〜0.72）

n=251

n=125

0.35

（0.26〜0.48）

n=180

n=87

1.00

（0.75〜1.34）＊HRD 状態陽性の定義：MyChoice診断システムにおいて、GIスコアのカットオフ値42 以上かつ/または腫瘍のBRCA 遺伝子バリアント陽性。
注：文献 12（本文中サブグループ解析）で示されている結果は、myChoice HRD plus 研究用検査により判定した HRD 状態での解析結果であり、
表 3 の MyChoice 診断システムによる探索的解析結果とは完全には一致しないが、一貫性がみられる。

6

腫瘍組織の相同組換え修復欠損を検出しPARP 阻害剤の投与可否の判断を補助します

3

検査の使用目的

MyChoice診断システムは、腫瘍組織から抽出したゲノムDNAのゲノム不安定性の状態（GIS）の評価により相同組換え修復欠損（HRD）を検出し、また、腫瘍組織から抽出したゲノムDNA中のBRCA1 またはBRCA2
遺伝子バリアントを検出し、PARP阻害剤の卵巣癌患者への適応を判定するための補助に用いられます。
留意事項：MyChoice診断システムは、ニラパリブまたはオラパリブの卵巣癌患者への適応を判定するための補助を目的に承認されています。本検査は遺伝性乳癌卵巣癌症候群（HBOC）検査の目的には使用できません。

4

保険適用についてD006-23 遺伝子相同組換え修復欠損検査 32,200点
留意事項

1. 別に厚生労働大臣が定める施設基準を満たす保険医療機関において行われる場合に算定する。
2. 遺伝子相同組換え修復欠損検査は、卵巣癌患者の腫瘍組織を検体とし、抗悪性腫瘍剤による治療法の選択を目的として、次世代シーケンシングにより、相同組換え修復欠損の評価を行った場合に、患者１人につき１回に限り算定する。

7

5

検査結果について

MyChoice診断システムは、腫瘍細胞におけるゲノム不安定性状態の解析、およびBRCA1 / BRCA2 遺伝 子の解 析で構成される検 査です。各解 析で結果が判定され、2 つの解 析結果の 組み合わせにより、
MyChoice 診断システムの検査結果（HRD 状態）が判定されます。ゲノム不安定性の状態が陽性であり、かつ/またはBRCA1 / BRCA2 遺伝子で病的変異または病的変異疑いがある場合、HRD陽性と定義されます。

ゲノム不安定性の状態（GIS）の解析

BRCA1 / BRCA2
遺伝子の解析

GIスコア

判定

バリアント分類

カットオフ値以上

POSITIVE

陽性

病的変異

カットオフ値未満

陰性

NEGATIVE

病的変異
疑い

判定

MyChoice®

診断システムHRD状態の判定

陽性

POSITIVE

臨床的に意義のある陽性（POSITIVE）

バリアント

臨床的意義不明のバリアント（VUS）
遺伝子多型の可能性

陰性（NEGATIVE）

陰性

NEGATIVE
病的変異なし遺伝子多型

ゲノム不安定の状態

BRCA1 / BRCA2 遺伝子の解析

HRD状態の判定

陽性

陽性

陽性

陰性

陽性

陽性

陽性

陰性

陽性

陰性

陰性

陰性

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腫瘍組織の相同組換え修復欠損を検出しPARP 阻害剤の投与可否の判断を補助します

検査技術情報6

MyChoice診断システムでは、次世代シークエンシング（NGS）を利用し、固定された卵巣腫瘍検体より抽出したゲノム DNA を解 析します。BRCA1 / BRCA2 シークエンシングバリアントおよび大 規模 再 構成（ LR ）バリアントを同定し、さらに同検体におけるゲノム不安定性の状態（GIS）を評価します。
次世代シークエンシング：製造元より提供されるまたは推奨されるプロトコールに従って、検体を分析します。
得られたシークエンスデータは、イルミナソフトウェアを用いてBCL（バイナリ）からQSEQ（テキスト）形式に変換します。
シークエンシングバリアントおよび LR バリアント検出：Burrows-Wheeler Transformation（BWT ）アルゴリズ ムを 用 いて、トリミングした シー クエ ンスリード を BRCA 1 お よび BRCA 2 遺 伝 子 の 標的
シークエンスにマッピングします。Needleman-Wunschアルゴリズムを実装した JAlign オープンソース
ソフトウェアを用いて、マッピングしたリードをBRCA1 およびBRCA2 遺伝子の標的シークエンスと一致させます。BRCA1 および BRCA 2 遺 伝 子 の 野 生 型シー クエンスと 比 較して、推 定 的シー クエンシング
バリアントを同 定します。また、BRCA1 およびBRCA2 遺伝子の正規化塩基およびエクソンのカバレッジを算出し、LR バリアントを検出します。

GIスコア：GIスコアはHRD に関連する 3つのバイオマーカーであるLOH、TAI、LSTにより算出されます。
GIスコアが定義したカットオフ値以上の場合、陽性結果となります。
• LOH：ヘテロ接合性の消失は、片方の親アレル＊の消失につながります。15Mb を超えるLOH 領域は、
相同組換え経路の欠陥と正の相関性を示します 13 。単一アレルの存在をカウントします。

GI スコアの 一 部として使 用されるLOH の計算は、Abkevichらが考察した方法 13 をミリアドが実施したものです。
＊アレル（=対立遺伝子）：相同染色体上の対になっている遺伝子同士•T A I：染色体のテロメア末端まで広がるアレル不均衡は、乳癌および卵巣癌で認められるゲノム異常の一種であることが示されています 14 。テロメア領域の1：1 アレル比の不均衡をカウントします。
GIスコアの一部として使用されるテロメアアレル不均衡の計算は、Birkbakらが考察した方法14をミリアドが実施したものです。

• L ST：大規模な状態遷移とは、10Mb以上の隣接領域間の染色体切断です。異常と正常なゲノムの領域間、または 2つの異なる異常な領域間の遷移点をカウントします。腫瘍ゲノムにおけるLSTの推定は、Popovaらの方法15をミリアドが実施したものです。

9

7
腫瘍タイプ

治療について治療

適応

バイオマーカー

①卵巣癌における初回化学療法後の維持療法
ゼジューラ（ニラパリブ）②白金系抗悪性腫瘍剤感受性の再発卵巣癌における維持療法① ②においてはなし③白金系抗悪性腫瘍剤感受性の相同組換え修復欠損を有する③においてのみHRD 陽性

再発卵巣癌
卵巣癌
①白金系抗悪性腫瘍剤感受性の再発卵巣癌における維持療法
リムパーザ（オラパリブ）②BRCA 遺伝子変異陽性の卵巣癌における初回化学療法後の維持療法③ 相同組換え修復欠損を有する卵巣癌におけるベバシズマブ（遺伝子組換え）を含む初回化学療法後の維持療法①においてはなし②においては病的バリアントのBRCA1/ BRCA2 遺伝子③においてはHRD 陽性＊適応に関する詳細は、各医薬品の最新の添付文書をご確認ください。薬剤の適応については、学会のガイドラインをご確認ください。

8

関連情報および学会について

卵巣癌患者に対する、コンパニオン診断検査に関連するガイドラインについては、以下の関連学会をご参照
ください。
専門学会

日本婦人科腫瘍学会

ウェブサイトURL

https://jsgo.or.jp/

10

参考文献

1. Ledermann J, et al. Olaparib maintenance therapy in patients with platinum-sensitive relapsed serous
ovarian cancer: a preplanned retrospective analysis of outcomes by BRCA status in a randomised phase 2
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〒163-0455 東京都新宿区西新宿2丁目1番1号
新宿三井ビルディング55階

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