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情報・システム研究機構ブックレット

S CI E N CE
0 07- 012

僕らはゲノムでできている。
大学共同利用機関法人
情報・システム研究機構

『サイエンスリポート』について『サイエンスリポート（ https://sr.rois.ac.jp/ ）』は、大学共同利用機関法人情報・システム研究機構が運営するウェブサイトです。

2016 年 12 月公開以来、当機構の大学共同利用機関法人としての役割を踏まえ、自機構のみならず他機構および広く大学・研究機関等の話題を採り上げ、
広く一般・マスコミの方々へ向けて、学術の成果や取り組みに関する情報を提供しています。

その中心的なコンテンツとして、ウェブサイトと同名の連載記事を定期的に（月 1 回程度）掲載し、継続的に新しい記事を追加しています。
先端的な取り組みをわかりやすく紹介し、人々の疑問に科学者コミュニティが答えるような構成で、学術の役割と活動を広くご紹介しています。

本書は、その記事が身近にお手にとれるよう、冊子にまとめました。

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目 次

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『サイエンスリポート』について

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Science Repor t 007

微生物のゲノムから何がわかる？
答える人 | 黒川顕教授
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Science Repor t 008

ヒトゲノムの読み取り技術で医療が変わる？
答える人 | 鈴木穣教授
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Science Repor t 009

ゲノムはどんな意 味を持つのだろう？
答える人 | 小原雄治特任教授
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Science Repor t 010

生物学とデータベースの関係は？
答える人 | 五斗進教授
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Science Repor t 011

植物ゲノムは暮らしのどこに役に立つ？
答える人 | 田畑哲之所長
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Science Repor t 012

チンパンジーゲノムから何がわかったか？
答える人 | 松沢哲郎特別教授・藤山秋佐夫特任教授
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大学共同利用機関法人 情報・システム研究機構について
機構長

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藤井良一

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2003 年のヒトゲノム解 読で力を発揮した米国の生物学者クレイグ・ベンターの次の狙いは、海洋細菌群だった。翌 2004 年、航海から戻った彼は 120 万個もの新 規 遺伝子を発表して、世界を驚かせた。このように微 生物のゲノム解析を通じて、その微生物が棲む環境についての情 報を一挙に得る方法を「メタゲノム解析」という。微生物を実験室で培養する従来法と違って、採取して

微生物の
ゲノムから

きた微生物群をそのまま読み込んでゲノム配列を決めるのが、大きな特 徴だ。
地 球 環 境やヒトの体内環 境は多くの微生物によって維持されているため、これら微生物群の把握には医療、創薬、環境、農業、建築など幅広い応用への期待がかかる。ゲノムを読む「次世代シーケンサー」の急速な発達を背景に発展しつつあるメタゲノミクス─そこから今、何を知ることができるのだろうか。
（写真は調査地のひとつ、鹿児島県にある霧島温泉。撮影：黒川顕）何がわかる？
答える人

黒川 顕 教授［国立遺伝学研究所］
国立遺伝学研究所教授、先端ゲノミクス推進センター
センター長。2014 年より新学術領域「冥王代生命学の創成」領域代表者。東北大学卒、大阪大学大学院
後期博士課程修了。奈良先端科学技術大学院大学准教授、東京工業大学教授などを経て、2016 年より現職。2004 年、日本で初めての本格的なメタゲノム解析に着手し、日本人13人の腸内細菌群のメタゲノム解析結果を公開。このメタゲノム解析手法を、土壌や温泉水など他の環境に応用した、微生物集団の変化の過程を探る研究などで知られる。ちなみに修士課程までは地質学・プレートテクトニクスが専門。

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そもそもゲノムって何だろう？
ゲノムとは、DNA（デオキシリボ核酸）でできた物 質である。なかでもATGC（アデニン、チミン、グアニン、シトシン）の 4 つの塩基は、生物それぞれに固有の配列を持 つ。ちなみにヒトゲノムは約 30 億 塩基 、これまでに見つかった一番 小さ
いゲノムはカルソネラ・ルディアイという寄生性の微 生物で 15 万 9662 塩 基 、こちらは文字数にしておよそ朝刊１部ぐらいに相当するそうだ。一方でゲノムとは、生物の全 遺伝 情 報を指す。 ATGC の塩基 配列の 3 つの塩基の組み合わせは「コドン」あるいは「遺伝暗 号」等と呼ばれ 、20 種 類のアミノ酸のいずれかに対応している。遺伝暗号は DNA からmRNA へ「転写」され 、続いてmRNA が「翻訳 」されてタンパク質が合成される。この DNA からタンパク質合成までの一 連の流れは、全生物に共通の原 理となっている。「ゲノムは物 質とデータの橋渡し役 」と
国立遺伝学研究所の黒川顕教授は言う。

写真は多摩川の下流付近。多摩川水系は、東京都の水道水源の約 20 ％をまかなう。
ここでの微生物ゲノム解析は「学生たちががんばった成果」と黒川教授。

微生物は裏切らない生物である
ゲノムのおもしろいところは、小さな微 生物から人類まで、客 観的なデータで全生物の遺伝 情 報を決 定できることだ。しかも「 ATGCというたった 4 つの化学 物
質の並び方に、さまざまな意 味が畳み込まれている」。つまりメタゲノム解 析は、
その解 析 結 果を多次 元 的に読 み解き、あるいは他のデータと連 携することで、さまざまな情 報が引き出せるデータの宝庫なのだ。例えば、黒川教 授が挑 戦してきた微生物群のひとつに腸内微生物がある。「昨日と今日とで、私たちのおな
かの様 子は違いますよね。でも腸内環 境のゲノム情 報を調べれば、体温を測り忘れても、腸内の温 度を知ることができます。 pH（水素イオン指数）や湿度などの衛生データも把握できる。さらに時系列に沿ってデータをとることで、環境にどのような変化が起きたかも分かります」。しかし病院で 1日がかりで検査してきたようなデータが、なぜ微 生物から得られるのだろうか？「それは、微 生物 群 集は 環 境に対して一意に決まる、言わば 裏切らない生物だからです。その生物に聞けば、人為の及ばない、客観的な観察データが得られます」。また土壌を調べ

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るのにも微 生 物 が 貢 献 する。「奥多 摩 湖 から羽 田空
港まで、多 摩 川 138 キロの川沿いの 微 生物 群 集を調べました。するとこのデータに、例えば人口分布や犯罪率といった流 域周辺の社会環境のデータを組み合わせることで、今度は地域環境を評価することができる。われわれは微 生物の群 集 構 造を見るだけで、周辺環境が推定できる技術を作り上げています」。実に、
微 生物メタゲノムの多層的な性質そのものが、さまざ
まな他 分 野 や異 業 種との 連 携を可能にしているのである。「メタゲノムの本質は、たぶんそこなんです」と黒川教授は言う。

僕らの細胞も微生物と共存している
このようなデータ連携の基盤となるのが、微生物の種類や数と環 境をひも付けるデータベースだ。現在、世界で 約 17 万サンプル の 情 報が 公 開されており、黒 川教 授の研究室では、これを集めて微 生物環 境を俯 瞰できる「微 生物 GPS」を構 築しているという。「僕らは地 球 上の微 生物の全てのカタログを持っているので、これを使えば、微 生 物 がこういう群 集 ならどういう環境であるかが、だいぶ見えてきます」。さらに解析の処
理能力次第では、環境全体にあるゲノムを洗いざらい

長野県白馬村にある白馬八方温泉は蛇紋

決 めていく「ホロゲノム」も強 力な手 法だという。「僕岩体を貫く温泉であり、水温50度で水素含

らヒトの 細 胞も微 生物もゲノムでできており、共 存し示すことから、冥王代地球に類似した環境合って生きている。そこでヒトゲノム、微 生物 一匹一であると考えられている。この 地下 600m

匹のゲノム、環境データとしてのメタゲノムの全部を調べ、全 体を1 つのシステムとして捉えて、ゲノムレベル

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有量が極めて高く強アルカリ性（pH11）をの蛇紋岩熱水に存在する微生物群集をメ
タゲノム解析することで、原始的な代謝システムが見えてきている。 写真：黒川顕

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ゲノム解 析の学術連携を推進「先端ゲノミクス推進センター」

で解いていこうという試みも始まりつつあります」。

地球環境を理 解して生命の起源に迫る
先 端ゲノミクス推 進
生命 現象を考えるには、その環 境を知らなければならない ─ 黒川教 授はこのセンターは、次 世代

考えを発展させ、46 億年前から 40 億年前にあたる「冥王代」の地 球 環 境を推定型シーケンシングがし、生命の起 源に迫る研究にも取り組 んでいる。「なぜ生命 科 学 者が生命の起生み出す大量のゲノ源を考えられないかといったら、当 時どんな 地 球 環 境 であったかを知らないか

ムデ ータの 最 先 端らです」そこで地質学者、地球化学者、生命科学者、惑星科学者を集め、議論をの研究基盤を大学・進めていったところ、「当時の海は pH ゼロの強酸で、岩石等が全 部溶け込んだ

研 究 者コミュニティ

ドロドロの溶 鉱 炉のような、たとえ生命が 誕 生したとしても持続的には生きられに提 供し、他のゲノない過酷な環境であり、生命を育む母なる海、といった生易しいものではなかっム 研 究 機 関との 共た」ことがわかってきた。原始大陸上の間欠泉のような場所で、強い放射能を受同利用・共同研究をけて猛 烈なスピードで化学反応が進 展し、生命を形作るさまざまな物 質が造り進めているセンター

出され 、やがて生命になった─ そんな過程が「科学的な証拠付きで見えてきまだ。日本に19 ある大した」。それでもまだ、わからないところがある。「なぜゲノムが 遺 伝 暗 号という学共同利用機関のひとつ、国立遺伝学研究所（静岡県三島市）内に情報を担うようになったのか。それは依然として、謎です」と黒川教授は言う。

2011年10 月に設立された。設立以来、他の研究機関と連携した共同

公開日：2017/06/12

研究により、先端的ゲノム科学の研究の成果を挙げている他、大学等からの大規模シーケンシングや情報解析の要請にも随時応える。

黒川教授が代表を務める新学術領域では、科学的知見に基づいて、生命の誕生をCGやアニメーションで再現した映像YouTube チャンネル「全地球史アトラス」も公開している。
◉日本語版

https://www.youtube.com/c/冥王代生命学の創成◉英語版

https://www.youtube.com/
channel/UCCToEEPlF7ur1m0efQTHG4g

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生物をその生物たらしめている塩基配列を、全遺伝情報すなわちゲノムという。現在、このゲノム情 報の読み取りと解 析に広く使われているのが「次 世代シーケンサー」と呼ばれる装置だ。人類最初のヒトゲノム解読では莫大な時間と予算が投じられたが、その後シーケンサーは目覚ましい発 達を遂げ、より速く、より正確に、より安くゲノムを読み取り、解析できるようになった。
今や膨大な数のヒトゲノムが解 読され 、データベース等に登録され 、そのよ
うなビッグデータを駆使するゲノム科学が、人類の医療、健康、環境、開発、サービスなどに、いよいよ具体的に応用される段階に入っている。シーケン
サーが読み取り、解析する情報は、医療をはじめとする応用分野を、これか

ヒトゲノムのらどのように変えていくのだろうか。

読み取り技術で答える人

医療が変わる？

鈴木 穣 教授［東京大学］
東京大学大学院新領域創成科学研究科 教授。1994
年東京大学卒、1999 年同大学博士課程修了（学術博士）。1999 年理化学研究所ゲノムサイエンスセン
ター リサーチアソシエイト、2000 年東京大学医科学研究所ゲノム構造解析分野 助手を経て、2004 年
現所属 准教授。恩師である菅野純夫東京大学教授とともに 25 年以上にわたりトランスクリプトームに注目した研究を展開。ヒトゲノムの変異がどのよ
うにがん、免疫、神経疾患等の表現型を示すのか、
システムレベルでの解明に取り組む。

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先端医療を病院だけでなくジャングルでも。

ゲノム固有の突然変異を識 別して、がんと闘う

次世代シーケンサーは、米国企業などが世界的に市場を寡占していることから、読み取ることから一歩 進んで、ゲノム情 報を入力、そこから形成されるものを出

ゲノム科学の基盤技術を担うだけでなく、「結果の承認 、追実験といった実際的力として、その間にあるコード化／解読のシステムを解明し、予測や制御を行おな手順を画一化する効果を生んでいる」と東京大学の鈴木穣教授は言う。「よいうという研究にも期待がかかる。 DNA 上の遺伝情 報は 1 個体共通だが、DNA か面も悪い面もある。次のステップをどう展開するかが重要です」。そのひとつとしらタンパク質合成情 報を読み取った「 mRNA」階層の遺伝 情 報は体内の組 織ごて鈴木教授が取り組むのが、特に発展途上国における現地＝オンサイトでのゲノとに、また外部からの影響に呼応して同一個体内でも遺伝情報が異なる。長年ム診断だ。コンパクトなシーケンサーを用いて、高熱を発症した患者の血液をそにわたり、この mRNA 階層の遺伝情報（トランスクリプトーム）を研究してきた鈴の場で採 取し、高速でゲノム解 析する。マラリア、デング熱等が見つかれば、そ木教授は、がんに注目する。「がんは、突然変異によってトランスクリプトームをの場で治療につなげることができるほか、ゲノム診 断では、同じ病原体でも薬に変化させる疾病なんですね。ゲノムに変異が起こったら、遺伝子発現にどう影響効果がある／ないタイプの判別や、予想外の感染源でも発見できるといった優位

するか、それを正常に近づけようとする薬 剤に対してどういう変異が起こるか等点がある。そこで熱 帯の屋外のような医療・衛生設備のない場所でも迅速に結を調 べることができます」。 もちろん、実 際 の 治 療 に役 立てたいという思いは、果が出せるポータブルな装置を実現しようと、一連の技術開発を行っているとい大きな動 機だ。「がんは患者によって、言い 換えればゲノムによって、原因や 経う。「自宅で糞便などから個人のゲノムを採 取して健 康診 断したり、野 外 調査で過が非常に多様で、例えば肺がんだけでも世界に 500 とも1,000 とも言われる種

新しい生物 種を判定したり、ウナギなど食品の産地偽装から髪の毛で個人を特類があります。ある人に効いた薬が、別の人に効くかどうかは、なかなか言えな定する犯罪捜査まで、応用範囲は意外にも広い」と鈴木教授。特に空港など「水い。まさに 1 人 1 人にストーリーがあり、そのような個別の突 然変異に最 適な治際」における検疫チェックは、ゲノム診断が大いに役立つ可能性があるそうだ。

療が行えるとよいわけです」。

ポータブルゲノム診断のデモ機はまさに「手のひらサイズ」。鈴木教授が手にしている細胞ひとつひとつを選り分けて読み取る、シングルセル分離解析機。

基盤を専用の読み取り機にセットすれば、パソコンで読み取ることができる。

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方法を工夫して創薬をスピードアップ

次世代シーケンサーを操作する様子。研究員左手の下にある黒い部分の中に試料をセットし、画面操作で読み取りを開始する。

そのような 治 療 を 実 現 するためにも、さまざまな工夫が必要だ。鈴木研究室
では、ラボでの実 験とともにコンピューター・シミュレーションによって 実測と予 測を掛 け 合 わせる手 法 の 開 発も手がける。また、特にがん治療で問題となるのが、仮に 99 ％のがん細胞を殺すことができても、残りのたった 1％

鈴木教授が手にしているのは、シングルセル分離解析

大学共同利用機関を中心にゲノム解 析を支援
「先進ゲノム支援 」

機用のトレイ。トレイは微細な区画に仕切られており、の抗 がん剤耐 性 細胞こそが、再発を引機械にかけるとその1つ1つに各細胞が分離され、遺伝

き起 こすという点 だ。「その 1 ％ はどれ

子情報を読み取ることができる。

文部科 学省科 学研究費助成

なのか、ターゲットとなる細 胞を高 精度に検出し、ゲノムを読み出し、さらにそ事 業の新 学 術 領 域研究『学 術の結果をシミュレーションなどに反映していかなければならない」。一方、近年 、研 究 支 援 基 盤 形 成』先 進ゲノ

患者の持 つ免疫力を活 性化させてがんを攻 撃する新しい治療 薬「免疫チェック

ム解析研究推進プラットフォー

ポイント阻害剤 」が注目を集めているが、この薬の評価でも「どの免疫細胞が有ム「先進ゲノム支援 」は、「科 研

効なのか、細胞一個一個について見ていく必要がある」と鈴木教授は言う。

費」に 採 択された 研 究を対 象に、最先端のゲノム解析及び情シングルセル技術と次世代シーケンサーを駆使して

報 解 析技 術を提 供する研究事業である。大 学 共同 利 用 機 関

１つ１つの細胞を分離・分析する技 術をシングルセル技 術という。次 世代シーである国 立 遺 伝 学 研 究 所（静ケンサーの試 料の前処理のひとつとして、一般に、対象となる組 織をすりつぶし

岡県三島市）を中核機関として、てから機 械にかけるが、がんの場 合、解 析したいのは細 胞の「かたまり」ではな

多くの大学・研究機関が参加し、ネットワークを形成しており、旧事業い。「シングルセル技 術で細胞 1 個 1 個を取り出し、次 世代シーケンサーで読みの「ゲノム支援 」以来、分野横断的な研究成果を挙げている点にも特出しと解 析を行う研究開発を、現在大腸がんを対象に、がん研究所細胞生物部

色がある。支援活動を通じて、生命科学の最先端研究の推進、そしの八 尾良司部長と共同で研究を進めています。これは、科 研費の研究者をゲノてゲノム解析の高度化や解析技術の発展に取り組んでいる。

ム解 析で支 援する「先 進ゲノム支 援 」で行っているもので、大 腸がんがどのような細 胞 組 成を持ち、中でもがんの根 源にあたるような細 胞 がどう発 生し、突 然◉先進ゲノム支援ホームページ

https://www.genome-sci.jp/

変異を示すのかが追って明らかになるはずです」。
公開日：2017/07/10

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人間ひとりひとりや多種多様な生物種のゲノムが、ますます高速かつ大量に読み取られ 、公開される時代になってきた。ゲノムはまさに生命 科学のビッグデータであると同時に、ゲノムが決まるということは、人間 個人や生物 種を識別できることを意味する。ヒトとチンパンジーの塩基配列の違いがたった1.23 ％であるとか、これまでの進化の系統樹が書き替えられるといった新しい知見は、まさにゲノム解 析の賜物と言えるだろう。ゲノムによってさまざ
まな科学的仮説が検証できることから、ゲノムそのものを対象としない研究においても、ますますゲノム解 析が要請されるようになっている。─ ゲノム
解析が必要な研究は、どう進められているのだろうか。

ゲノムはどんな意味を持つのだろう？

答える人

小原雄治 特任教授［国立遺伝学研究所］
国立遺伝学研究所 特任教授、ライフサイエンス統
合データベースセンター（DBCLS）センター長、新学術 領域研究「先進ゲノム支援」研究支援代表者。

1974 年京都大学理学部 卒、1988 年英国ケンブリ
ッジMRC分子生物学研究所客員研究員等を経て、1996 年より国立 遺伝学 研究 所 教 授、2004 〜2012
年 所長を務める。分子生物学の発展を背景に、生物の表現型とゲノムを結ぶメカニズムを追求する遺伝学の発展に尽力。また研究の発展には、これらのデータの収集・共有が必須であることから、統合
データベースの構築・整備に注力する。

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イノベーションは 5 年に 2 回起こる

ゲノムという研究分野を全体として支援する

ゲノムを研 究 するゲノミクスの 分 野は、国 際 的にも競 争が激しい分 野だ。研究

このようなゲノム研 究の展 開 に対 応 するためには、個 々のラボで 対 応 するよりを支える技 術 的 な 発 展も目覚ましく、国 立 遺 伝 学 研 究 所 小 原 雄 治 特 任 教 授

も、規 模 的にもまとまって専 門 性の高い 機 能を提 供し、装置のアップデートも（ DBCLSセンター長）によれば、「 5 年の間に 2 回ぐらい、イノベーションが起こ

集中的に行えるような体 制を組むことが 望ましい。そこで、我 が 国の学 術 研 究る」という。ゲノムを読み取るために広く使われる世界 標準的な装置にも変 遷がの中心的な競争的研究資 金である「科 研費」に採択された研究を対象とした公あり、「新しいマシンが利用可能になるが早いか、即対応していかなければなら

募 により、その ゲノム 解 析 の 部 分ない」。それはつまり、ラボでどんな実験を行い、どんな試 料を用意し、どんなを支 援 する 研 究 事 業 が 始 まった。

解 析を行うか、という研究の一 連のプロセスが 再 検 討されなければならないこ「 2000 年 に 科 研 費 の 特 定 領 域 研とを意味し、しかも各段階に高度な専門性が要求されるという。一方で、ゲノム究に支 援 班ができたのが最初です。

を必要とする研究領域は拡張の一途だ。「昨日までゲノムなんて関係なかった研

その 機 能 が 新 学 術 領 域 研 究「ゲノ究者が解析したいというケースが増えている」と、小原特任教授。「環境、医学、

ム支 援」となり、さらにリソースや農学などの分 野が多いですね。例えば土や川の微 生物を調べたら、ゲノム解 析

技 術をもっと分 野 横 断 的に提 供でによって面白いことが分かってくる。医学では病 気 遺伝 子はもちろん腸 内 細菌

きるよう組み替えられ 、大学共同利など、農学では品 種改 良のために、栽 培植物のゲノムを調べたい……」など、さ用 機 関である国立 遺 伝 学 研 究 所を

まざまな要 望があるという。シングルセルのゲノム解 析（ Science Repor t 008

中核機関とした、現在の体制につながっています」。小原特任教授は現在、その参照）も急増しているそうだ。

新 学 術 領 域研究「先 進ゲノム支 援」で、研究支 援 代表者を務める。個々の大学等では整備・維持が困難な最新の設備・技術を常に整備し、国際競争の激しい

川や土壌の微生物を対象としたゲノム解析は、要望の多い分野のひとつ。

最先端研究のゲノム解析を担うなど、メンバーとともに支援依頼者の要望に応えてきた。「新しい装置を試す中で、ゲノムを読み取るラボの技 術もどんどん上がっている。またビッグデータ解 析ができる情 報系の研究者達が実データを扱うことで、情報解析のスキルが向上していく。支援を依頼した研究室の学生が 1 週間ぐらい滞 在して、オンザジョブトレーニングを行う─と、さまざまなかたちでの好 循環を目指しています」。

ライフサイエンスのデータベースの重要性
ところでゲノムは元 来、個人を識 別する生体 情 報という、個人情 報 保 護や研究
倫 理の観 点からも慎 重な取り扱いを要する特 殊なデータである。一方、ビッグ

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データでもあることから「やっぱり集めたほうが 勝ち」という側 面もある。小原

生物種を越えて検索できるようなデータベース」を目指す。「そのた特 任教 授は言う─「米国だけでなく、例えば中国などにも大規模なゲノムセンタ

めにはすべてのゲノムが 読まれ 、比 較ゲノム解 析ができている必要

ーがあり、解 析サービスも行っています。当然ながら、データはサービスの提供がある」と川 本 准 教 授。遺 伝 子に横のつながりができれば、例え側に集まる。ここに、日本が学術としてデータを持たなければならない理由があば 植 物では、稲・小麦・大 麦などの単子葉の植 物で、成 功した育ります」。またデータは関 連づけられていないと活用できない。「例えば 医学な種を他の種 でも成 功させようという時などに威 力を発 揮する。まら、ゲノムとエピジェネティクス、あるいは医療 記 録との関連づけなどが必 要でた動 物では特に「ヒトの疾 患の解 明に伝 統 的に使われてきたマウす。『僕らはゲノムでできている』のだけど、ゲノムだけでは決まっていない。生きスやラットだけでなく、ゼブラフィッシュやショウジョウバエなどの物も含めその内外全 部のゲノムを取得・解 析する分 野を「ホロゲノム」と言いま

モデル 生 物を用い、そのシンプルな 型を活 かして、ヒトの 稀 少疾

すが、そのように見ていくと、実際には寄生されていたり、腸 内には細 菌がいた

患の病 態 解 明を加 速させることができるのでは」と期 待がかかる。

りといった環 境を含めて生き物は成 立しているんですね。するとどこまでが「僕NBRPを通じて「例えば臨床の研究者とショウジョウバエの研究者ら」なのか、生きていくための単位が変わっていく可能性がある。生命とは何か、のマッチングなどのお役に立てれば」と川本准教授は言う。

個と種はどこで区別されるのかといった根源的な問いに答えられる日も来るので

このほか NBRP は、生 態 系に関わる分布や 環 境などの「生物 多 様はないでしょうか」。

性情 報」を集めようという国際的なネットワーク「 GBIF（地 球 規模

公開日：2017/08/10

生物多様性情報機構）http://www.gbif.jp/v2/」の日本ノードとし原核生物からヒトまで「ナショナルバイオリソースプロジェクト」ても活 動しており、「ある地 域 で どんな生 物 が生 息しているかといった データ を登録いただいています。最近では屋久島のクモや近 畿で営巣するツバメの調 査などの 例がある」という。また自身、

ライフサイエンスの基盤となる、研究開

遺 伝 医 療 分 野 の 研 究 者経 験も持 つ川 本 准 教 授は「いかにデータ

発 の材 料としての動 物、植 物、酵 母 やベースが 賢くても、それをどう使ってもらうかという問 題 意 識は常大 腸 菌などの 微 生物 等をバイオリソーにある」という。 特 にスという。ナショナルバイオリソースプ

今後の個別化医療へ

ロジェクト（ NBRP、プログラムスーパー

向 けて「患 者 さんなど

バイザー：小原雄治）は、我が国としてエンドユーザのニーズ

重 要 なバイオリソースを 全 国 の NBRPに、シス テム としてど中核的拠点
（現在 30）で収集・保存・提供 するプロジェクトだ。 この 総 合 窓 口＆情 報センター機能を担う国立 遺伝学のように応えられるか」

http://www.nbrp.jp/
NBRPのリソースを利用した研究論といったオープンサイ

文は、現在およそ2 万 8,000 本にも及ぶ。

研 究 所 系 統 生物 研 究センターの川本

ナショナルバイオリソースプロジェクト（NBRP）を担当
する、国立遺伝学研究所川本祥子准教授。

エンス的な視点も採り入れていく予定だ。

祥子准教 授は、本年度から前任者を引き継いで、「生物が違うと、同じ遺 伝 子名でも意 味 が 違うといったように言 葉 や文化 が 違う。

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実験や観察で得られた個々ばらばらなデータを統合して、みんなで使えるよ
うにする、というのは科 学者の大きな夢のひとつだろう。学術のビッグデー
タが公開され 、研究コミュニティが自由に利用できると、科学の発展が加速する。そこで学術データを標準化し、統 合化しようとする動きが、世界的に進められている。そのためにはまずデータが公開される必要があるが、学術データのオープン化は、世界的にも特にヒトゲノムの公開で加速してきた経緯がある。生物の圧倒的に多様な世界を統 合するために、実際にどんなふうにデータが収集・整理され 、どう役立てられているのだろうか。 21 世紀の生物学とデータベースの切っても切れない関係をのぞいてみよう。

生物学とデータベースの関係は？

答える人

五斗 進 教授［ライフサイエンス統合データベースセンター（ DBCLS）］
情報・システム研究機構 データサイエンス共同利用基盤施設 ライフサイエンス統合データベースセ
ンター（DBCLS）教 授（写 真 右）。1989 年九 州 大
学工学 部 情 報 工学 科、1994 年、博 士（工学）（九
州 大 学）。1995 年、京 都大 学 化 学 研 究 所 の 金久實教授らとバイオインフォマティクス・データベース「 KEGG」発足に参加、2017 年より現職。大量のゲノム情 報を整 理して解 析する「バイオインフォマ
ティクス」を専門とする。写真左は、片山俊明特任
助教（DBCLS）。今年 10 年目を迎えるライフサイエ
ンスデータの標準化に関わる合宿形式の国際会議「 BioHackathon」を担う。

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生物学のデータベースは百科 事 典を目指す

遺伝子とその機能の関連を他の生物種と比較する

ゲノム 解 析を 始 めとするデ ー タや 論 文として 発 表された 文 献 情 報 等 が 集 め

KEGGは、ゲノムや遺伝子と、それがどう機能するか─ つまり代謝経路やシグナられた 生 物 学 の データベースは、日々の 新しい 発 見 によって改 訂・編 纂されル伝達の経路等の「パスウェイ」を結び付けるデータベースだ。「ヒトゲノムを含める 巨 大 な 百 科 事 典（ Encyclopedia）のようなものだ。 その 名 の 通 り「 Kyotoて何千、何万種類という生物種のゲノムが決まってくると、その中にどんな遺伝子

Enc yclopedia of Genes and Genomes（ KEGG）ht tp: //w w w.genome.jp/があるかが分かりますね。その遺伝 子が例えば代 謝系の中のどこで 働いている

kegg/」は、京都大学の化学研究所で約 20 年の歴史を持つゲノムと遺伝子のデかという流れ図を、KEGG では「パスウェイマップ」で表示します」。生物 種ごとのータベースである。発足から研究開発に取り組んできた、現在ライフサイエンス

遺伝子と機能・反応プロセスの結びつきが分かるだけでなく、それぞれの機能を、

統合データベースセンター（ DBCLS）の五斗進教授は「当時は、塩基配列やアミ他の生物種はどのように持っているかも見ることが出来るという。「海洋や土壌等

ノ酸 配列といった文字データがあり、一方教科 書 等を見ると、代 謝経 路 やシグの環 境から採ったメタゲノム情 報も集めているので、生物種間の関係を、機能のナル 伝達系の図が 書いてあるといった状況でした。この文字列と図がつながる

相互的な関係から見るといった新しい利用方法にも期待しています」。

といいなということで、ちょうど広まってきたウェブ上で実 現しようということになりました」と振り返る。

データベースとデータベースを横断的に利用する
現在日本国内には、KEGG のパスウェイデータの他にも東北大学のヒトゲノム、かずさDNA 研究所の植物ゲノムを始め、さまざまなデータベースが公開されている。
そこで DBCLSでは 微 生 物、真 核 生 物、霊 長 類、鳥 類、魚 類、植 物 など 数 多 の

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データベースを横断 的かつシームレスに利用できるようなデータの標準化と統 合化を進めている。
「データをRDFと呼ばれる形式にして、セマンティック・ウェブの10 周年を迎えた「 BioHackathon」

技術に基づいたデータの統 合をするための仕組みを構築しています。この形式では、例えば 遺伝 子 Aと疾 患 Bは関 係があるというだけでなくて、どんなタイプの関係 があるのか、AとB のつなぎ方も指 定して検 索できるので、探しているものが 発
見しやすく、その後の解 析・解 釈も効率化します」。医療や生物の研究者が検索するだけでなく、開発用のインターフェースを提 供してバイオインフォマティシャン
が自分でアプリケーションを作って解析したり、データサイエンティストがデータベ
ースそのものから情報を取り出して大量のデータから知識発見したりと、利用階層に合わせて活用できるよう公開されているという。

統 合化・標準化が進む
ゲノム医療のためのデータ群
DBCLSでは、ライフサイエンスデータの統合化と標準化に関わる具体的な機会として、合宿形式の国際会議「 BioHackathon」を年 1回開催している。10 年にわた
りこの会議をとりまとめる片山俊明特 任 助教によれば「近年 特にヒトの病気の原

DBCLS が 提 供 するサービスのひとつ「 TogoGenome」を解 説 する因をゲノム変異から調べるといった、医療データベースの統合を推進している」とい

片 山 特 任 助 教。BioHackathon 2017 については「 10 周 年 なので、う。また今回のBioHackathonでは、世界的にも新しい動きの 1 つ「ゲノムグラフ」

今までの活動を総 括するため、シンポジウムの日程を2 日間にしましも議論になりそうだ。
「ヒトゲノムは個体ごとにほんの少しずつ違いがあるので、こた」とのこと。また「今年大きく変わったのは、日本医療 研究開発機

れまではその違いを別途管理し、後で参照できるようにしていました。これに代わ構（ AMED）を始め医療・創薬関係の参加者が増えていること。今まって、膨大な数のゲノムを束ねて、違いも一括して扱おうという手法がゲノムグラフ

での 10 年間はデータベース統 合の基 礎 技 術に注力してきましたが、です。束ねた中から日本人だけに注目する使い方もできるので効果が 高められる

これからはゲノムと健 康 に関 わる国 際 連 携「 Global Alliance for

はず」と片山助教。ゲノムグラフから治療や投薬など一連の過程を標準化する「パGenomics & Health」などの課 題を踏まえ、いっそう国際的な標準

イプライン」の開発も重要だ。
「ゲノムを全 部束ねたグラフを使って、疾 患や人種化に関わっていく」という。9月 9 〜10 日、JSTサイエンスプラザ（東京

ごとのサブセットを同じパイプラインで解析できるようにすれば、みんなが共通の

都千代田区）にてシンポジウムを、11〜16 日ホテル大観（岩手県）に最 新技 術を利用できる」。このような作 業過程を記述する言 語「 CWL（Commonて合宿形式の会議を開催。

Workflow Language）」に関する開発も今回のBioHackathonのテーマだという。
国際連携による標準化がいっそう進展しそうだ。

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公開日：2017/09/11

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地球上の多様な生命活動の中で食物連鎖のてっぺんにいるのがヒトとすれば、植物は底辺を担う。しかも植物には光合成という重要な働きがあり、植物なしには、その上にいる動物もみんな生き延びることができない。光合成過程で重要な役割を担っているのが、シアノバクテリア（ラン藻）である。生物や地球環境の進化を考える上でも重要なこの生物は、1996 年、世界で4 番目に全ゲノムが明らかにされた。解読に成功したのは、日本の研究所 ─ 公益財団法人かずさDNA研究所である。千葉県にあるこの研究所は、特に植物ゲノムの研究やデータベースで知られ、シアノバクテリア解読以降も研究機関・大学との共同研究や産学連携によりシロイヌナズナ、トマト、ハクサイ、ユーカリ、食用イチゴ、カーネ

植物ゲノムはーション、ダイコン、サツマイモ、ソバ、ラッカセイ祖先種、イチジク、サクランボ「佐藤錦」等のゲノム解読を次々に共同発表してきた。野菜や果物が多く含まれていることからもわかるように、植物のゲノムは農業や食物を通じて私たちの生活に直接関わるほか、地球温暖化による環境変化に適応するためにも欠かすこ

暮らしのどこにとができない。今回は、そんな植物ゲノムの世界をのぞいてみることにしよう。

答える人

役に立つ？

田畑哲之 所長［かずさ DNA 研究所］
かずさ DNA 研究所所長。1977年神戸大学理学部生物学科卒業、1979 年京都大学大学院 理学研究科
博士前期課程修了、1983 年理学博士（京都大学）。

1982年米国カリフォルニア大学博士研究員、1985年
京都大学化学研究所助手等を経て、1994 年かずさ

DNA 研究所主席研究員、2013 年より現職。1996 年のシアノバクテリア（ラン藻）ゲノム解読では、中心的役割を果たした。1997年東京テクノフォーラム21ゴー
ルドメダル賞、2001年日本植物生理学会特別賞、同年 Kumho Science International Award 等を受賞。

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植物ゲノムは長くて遺伝子が 詰まっている
総じて植物ゲノムは動 物に比べて長く、遺伝子も多いのだそうだ。
「ゲノムには遺伝子を成すひと続きの部分と、遺伝子と遺伝子の間をつないでいるだけでタンパ
ク質の合成にあずからない部分とがありますが、植物ゲノムは遺伝子の部分が多く、全体的にも長い特徴があります。動物と違って動くことができない植物は、特に環 境耐 性に関する遺伝子をたくさん持っているんですね。一方動 物は、どちらかと言うと遺伝子が少なめで、つなぎ方を変えて変 化に対 応する傾向があり、戦略も対照的」と言うのは、かずさDNA 研究所の田畑哲之所長だ。さらに「倍数 性といって、人を含め動物の多くは母親と父親の 2 系統から遺伝子が伝えられる2 倍体ですが、例えば植物である小麦は 6 倍体で、A・B・Dという似ているけれども少しずつ異なる 3 種類のゲノムを2 セット併せ持っています。私たちが食べるパンもこの 6 倍体の小麦でできているんですね」。しかし植物だと、なぜゲノムが増えてしまうのだろうか？「細胞分裂時等に起こる何らかの異変が原因でしょうが、動物に起こると、生き延びることができません。しかし植物は比較的それを許容する。また人の影響も大きくて、雑種強勢といって雑種になると勢いが強くなる現象があるのかずさDNA 研究所は、緑豊かな千葉県木更津市のかずさアカデミアパーク内にある。

ですが、ゲノムの倍加によっても植物体が大きくなることが知られています。このような「変異 種」が人為的に選抜され、作物として現在まで生き残ってきたと考えら

び付けることに、われわれは何とか挑 戦しなければいけない。そこで、そもそもれます」。ちなみにサツマイモは 6 倍体 、イチゴは 8 倍体と長く、また、より複雑だ。

フィールドを科 学的にどう取り扱うかについての方法 論を作り、次にその解 析の「ゲノムを読み取ってもなかなか区別できないので、作物のゲノム解 析は実はすご手法を作る。さらにその結果として植物にどんな変化が生じたかを評価する、と

く難しいんです」。

いう3 つの課 題を立てて、研究を進めています」。この挑戦は現在 CREST 研究プ
ログラム「環境変動に対する植物の頑健性の解明と応用に向けた基盤技術の創

植物のゲノミクスを実際の畑に活かす出」の中で推進されているそうだ。「ヒトゲノムが治療や創薬へ活かすステージに入っているように、植物もやはり社会実装のほうへ向かわなければならない。そ田畑所長が 植物ゲノムに取り組んでいるのには、いくつかの理由がある。「作 物

こにある大きな困難を何とかクリアするのが、研究所の課 題でもあるし、日本のを使った育種技術を誰がやるのか」という問題意識もその一つだ。「植物の研究

課 題でもあると考えています。特に近年は環境変動が激しく、東南アジアの害虫はこれまでどちらかというと実 験 室の中で、実 験 材 料として確 立された「モデルや病気が、九州周辺にまで北上してきていることがあります。新しい抵抗力を備植物」を使って行われ 、栽培の現場とは結び付いていませんでした。精密にコンえた品種を育てるためには、すぐにも育種スピードを速めなければなりません」。

トロールされた環境と、いつ雨が降るやら病気が来るやら分からない環境を、つなぎようがなかったんですね。しかしフィールドで取ったデータとゲノミクスを結

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ムではあるのですが、仮にデータに同じ部分があっても、環 境も違えば、他の遺伝子も違うので、異なる機能を発 現するかもしれません。ゲノムという基盤の上に、生物学がどんな理 解を積み増せるのかが勝負」と田畑所長は言う。このよ
うな観点から、田畑所長は、ゲノム解 析で生命 科学の進展を支援する「ゲノム支援（ 2010 〜 2014 年度）」の共同研究にも参加してきた。植物ゲノムの成果が、いよいよ実際の社会に活かされるステージへ向けて、科学者の挑戦が続いている。
公開日：2017/10/10

植物約 250 万種を検索「ナショナルバイオリソースプロジェクト」
シ ロ イヌナ ズ ナ、イネ、コ ム
ギ、オ オム ギ、広 義 キ ク 属 、
ア サ ガ オ、ミヤコグ サ・ダイ
研究所では植物ゲノムの他、個別化医療に関連して稀少性疾患のゲノム解析の受け入れも行っているという。画
面背景に見えるのは千葉県の公式キャラクター「チーバくん」。

ズ、トマト、藻 類等の植物は 、国が 戦 略 的に整 備することがゲノムは今後ますます社会に活かされるべき重要なものとして、「ナショナルバイオリソースプロジェクト

このような問題に立ち向かえるようになったのには、ゲノミクスという科学そのも（ NBRP ）」（ S cience Repor tのの発展が大きく寄 与している。学生時 代、生物学を専 攻していた田畑所長は0 09 参照）に登録されている。

「いつになったら生物 全 体が分かるんだろう、とずっと考えていた」と振り返る。

研 究 開 発 に 不 可 欠 な「モ デ「当時は個々の現象や個々の遺伝子に関する理 解を1 つ 1 つ積み上げるのが生物

ル 生 物 」であるこれらの 植 物学でした。ゲノミクスが登場して、まず網羅的なリストを作り、そのリストから全は 、その収 集・保 存・提 供が行われているほか、植物 約 250 万 種

体 の理 解 へ向かうような新しい 研究分 野をもたらしました。それがデータ駆 動（ 2017 年 10 月 10 日現在）の情 報はウェブ上でも検索できる。画面型サイエンスとしての今日のゲノミクスだと言えるでしょう」。例えば、タンパク質は 、イネのデータベース。

の相互関 係や、代 謝によって生 成される物 質、その化学 変 化といったものを全ゲノム総当たり的に調 べる。かずさDNA 研究 所では、このような解 析に用いらイネ（稲）データベース：Or yzabase（ 代表機関：国立遺伝学研究所）

れる「オーミクス解析」を備えたデータベースの拡充も行っているという。ただ難

https://shigen.nig.ac.jp/rice/or yzabase/

しいのは、仮にデータがうまく合っても、それがそのまま生物 学の答えではないという点だ。「ゲノムデータは他の科学とも連携できるような共通のプラットホー

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答える人

松沢哲郎 特別教授

チンパンジーゲノム［京都大学高等研究院］
京都大学高等研究院・特別教授、京都大学霊長類研究所・兼任教授、理学博士（京都大学）。1974 年、京都大学文学部哲学科卒業。1977 年11月から「アからイ・プロジェクト」とよばれるチンパンジーの心の研究を始め、野生チンパンジーの生態調査も行う。チンパンジーの研究を通じて人間の心や行動の進化的起源を探り、「比較認知科学」とよばれる新しい研究領域を開拓した。

何がわかったか？
藤山秋佐夫 特任教授
［国立遺伝学研究所］
情報・システム研究機構データサイエンス共同利用2017 年 10 月 30 日、京都大学において、松沢哲郎 京都大学高等研究院副院

基盤施設施設長、国立遺伝学研究所特任教授、理長・特別教授、郷康広 自然科学研究機構新分野創成センター特任准教授、学博士（名古屋大学）。大阪大学医学部、大阪大学

藤山秋佐夫 情報・システム研究機構国立遺伝学研究所特任教授が出席し細胞工学センター、コールドスプリングハーバー研
究所、シカゴ大学を経て、1989 年国立遺伝学研究て記者発表が行われた。京都大学霊長類研究所のチンパンジーであるアキ

所助 教 授、2002 年国立情 報学 研究 所 教 授、2008

ラ（父）、アイ（母）、アユム（息子）のゲノムを大規模に解析して、親子１世代で年国立遺伝学研究所教授を経て、2016 年より施設

起こるゲノム変異を明らかにしたという研究報告だ。約 30 億塩基対あるチン長。専門はゲノム生物学。ヒトゲノム、チンパンジー

パンジーのゲノムのうち、1 億 塩 基対あたり平均 1.48 個の「新 規１塩 基 突 然

ゲノムの比較解析等で知られる。

変異 」が生じていたというのだが……ではそこから、何がわかるのだろうか？

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なぜチンパンジーゲノムなのか？
今回のゲノム解 析の源となるチンパンジーの体毛や血 液は、愛 知県犬山市にある京都大 学 霊 長 類 研究 所で採 取されたものだ。霊 長 研は、世界 的にも著名な
霊長類学の総合的研究拠点であり、松沢哲郎特別教授は1977 年 、ここで暮らす「アイ」という名のチンパンジーに出会い、以来 40 年にわたって「チンパンジーの心」を研究してきた。2000 年 4 月 24 日、そのアイが 23 歳（推定）で出産したのが、息子のアユムである。松沢哲郎著『おかあさんになったアイ（講談社学術文庫）』には、出産直後のアユムの「手足がだらりと垂れ下がって」いたため心 配された様子等が 詳しく記されている。「僕らは学習行動を通じて、チンパンジー達の心の中に、生まれてから蓄 積していく知 識のような部分を研究してきました。氷山にたとえれば、海 上に浮いている僕らの 研 究に対して、海 面 下にある見えない部分を大きく担っているのがゲノムです。なかでもゲノムの中の遺伝子の働きが詳細に分かってくると、もっとはっきりと氷山全体が見えてくるのではないかという期待があります」と松沢教 授は言う。「たとえば 攻撃 性が 高いという性格はア

ヒトとチンパンジーのゲノムを比較する

ンドロゲンという男性ホルモンと関わっていますが、アンドロゲン受容体の遺伝
子は既に特定されています。では今度は攻撃性を抑制する遺伝子はどこか……

一方、藤山秋佐夫特任教授は、ヒトゲノム計画に参加していた2003 年頃から、チンというふうにして、今後どんどん研究が進んでいくものと考えています」。

パンジーゲノムに注目してきた。
「進化的に最もヒトに近いチンパンジーを調べ、ヒトゲノムと比較することで、共通の祖先からそれぞれが進化するために重要な役割を果たした遺伝 情 報を明らかにすることができます。またチンパンジーとヒトではかかる感染症もほとんど共通であることなどから、チンパンジーゲノムの解明が、ヒト疾患の新たな治療法の開発にも役立つと期待されています」。藤山教 授らはす
でにヒトゲノムの 21 番染色体と、これに対応するチンパンジーのゲノムの 22 番染色体を決定・比較する成果等を挙げてきた。
「 2004 年の研究では、共通の祖先からヒトとチンパンジーが分岐したのが 600 万年前、1 世代の長さを20 年と仮定してシミュレーションを行い、突然変異の確率を計算しました」と藤山教授は言う。2004
年のある日、その共同研究のために藤山教 授が犬山を訪ねた日のことを、松沢教
授はよく覚えているという。
「 100 人来て 99人までアイちゃんはどれですかって聞く
んだけど、藤山先生だけ、雄のチンパンジーの「ゴンはどれですか？」（笑）─ 2004

松沢哲郎教授（右）と藤山秋佐夫教授（左）、京都大学にて。

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年の段階で、すでにチンパンジーゲノムについて道をつけていた」と振り返る。

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賢馬ハンス 100 年のギャップを越えてところで、霊長類をもう少し広く眺めると、その周りにはさまざまな哺乳類がいる。
松沢教授は近年「馬」を対象として、新たな氷山に挑みつつあるという。「哺乳類は 6,600 万年前の恐 竜が 死に絶えた世界に、急 速に適 応・放 散しました。哺 乳類の共通祖 先は夜行 性の小型のネズミに似た生き物だったと言われます。他の多くの哺 乳 類もこれと同じように地 上性であり、このように地 上に満ち満ちた哺乳類を考える時、ピットフォールのように、誰も馬の研究をしていない」。一方、多くの哺乳類に反して、霊長類は樹上という道を選んだ。「チンパンジーを見てもニホンザルを見ても、四肢はすべて手のかたちをしています。四つ足 動物が木に登って、4 つの手になった。さらにヒトは、樹上から地上へと戻った非常にユニークな哺乳類であり、人間になって初めて足ができたと考えることで、6,600 万年前から今までの霊長類の歴史が、ひもとけるようになる。ここでもゲノムは、旅の友なんです」と、松沢教授は言う。チンパンジーの時と同様に馬においても、実験と野外の研究を並行して行う計画だ。
公開日：2017/11/16

親子トリオのゲノム解析で何がわかる？
今回の成 果はまず、ヒトゲノムではすでに進められている1 個 体ごとの遺伝 情 報「パーソナルゲノム」を、チンパンジーを対 象として「親 子トリオ」と呼 ばれる父・母・子のセットで解 析している点で注目に値する。そしてヒトを含めたパーソナ
ルゲノム研究としても未踏の 4500 〜 5700 億 塩基対もの大規模データを使い、1原因の1つは、クレバー・ハンスという馬の影響だと松沢教授は見る。
「 19 世紀末から20 世紀初頭にかけて、世代にかかる実時間を計算に入れた高精度な解析であることが特徴だ。これに計算問題などに答える馬がより「進化の駆 動力である1 世代に生じる新 規 1 塩基突然変異は 1 億 塩基対あた

登場して、その後トリックだ

り平均 1.48 個で、これまでにヒトで報告された値（ 0.96 〜 1.2 個）より高く、その75 ％が父親（精子）由来であることが明らかになった」と郷康広特任准教授は説明する。つまり、親 から子へ遺伝 情 報が受け継がれる際に、どんなエラーがど46

馬の 研 究が 進まなかった

ったことが判明したんです。
このため、その 後100 年 にわたって研究が止まってしまった。たくさんの人が馬に関心を持っているのに、ギ

れだけ起こり、ゲノムが変化したのかが詳しく確かめられたのである。「親子トリャンブルや乗馬など命令す

オから一 歩 進 んで、3 世代や、兄 弟のゲノム等が 調 べられれば、より詳しいこと

ることにばかり使って、馬ががわかってくるはず」と藤山教授は言う。

かになっていない」。

何を考えているのかが明ら

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大学共同利用機関法人
情報・システム研究機構について

平成 16 年 、すでに大学共同利用機関として活動していた国立極地研究所、国立
情 報学 研究 所、統 計 数 理 研究 所、国立 遺伝 学 研究 所の 4 研究 所が 結集し、大学共同利用機関法 人情 報・システム研究 機 構が 誕 生しました。全国の大 学等の研究者コミュニティと連携して、極域科学、情報学、統計数理、遺伝学についての国際水準の総合研究を推進する中核的研究機関を担うとともに、21 世紀の重要な課 題である生命、地 球、人間、社会など複雑な現象に関する問題を、情報とシステムという視 点から捉え直すことによって、新たな研究パラダイムの構築及び新分野の開拓を目指しています。
平成 28 年度、当機 構は 4 研究所に「横串」を貫く組 織改革を行い、「データサイエンス共同利用基盤施設 」を設置しました。これにより、データ共有支援、データ解析支援、データサイエンティスト育成の取り組みを一層強化し、社会のイ
ノベーションにつながるデータ駆動型科学の発展を推進しています。そして研究者コミュニティの要請に応える共同利用・共同研究により、大学等における研究の発展に貢献するとともに、産業界との連携や、市民が参加するオープンサイエ
ンスも進めています。また総合研究大学院大学の基盤機関として、もうひとつの重要な使命である人材育成にも取り組んでいます。

情 報・システム研究 機 構は、各 研究所の学理の追究に基づき、データサイエン
ス時 代の新しい研究パラダイム構築を通じて、現代の課 題 解決 や超スマート社
会構築等の社会の要請に応えてまいります。皆 様の一層のご支援、ご協力を心よりお願いいたします。
機構長

藤井良一
2018 年 3 月

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『情報・システム研究機構ブックレット』について
本機構は、新たな研究パラダイムの構築と新分野の開拓を推進し、また大学共同利用機関法人として、大学等の研究の発展に貢献しています。
『情報・システム研究機構ブックレット』は、その研究と貢献をわかりやすく紹介していく、シリーズ小冊子です。

情報・システム研究機構ブックレット2

SCIENCE REPORT 007-012
僕らはゲノムでできている。

著

者

大学共同利用機関法人 情報・システム研究機構

監

修

藤山秋佐夫（情報・システム研究機構
データサイエンス共同利用基盤施設 施設長）

取材・文

池谷瑠絵（情報・システム研究機構 URA 広報）写

飯島雄二（ Science Repor t007-012 ）、黒川顕（ p8）

真ブックデザイン発行

hata design

大学共同利用機関法人 情報・システム研究機構〒 105-0001

東京都港区虎ノ門 4 丁目 3 番 13 号

ヒューリック神谷町ビル 2 階TEL：03-6402-6200

FA X：03-34 31-3070

http://www.rois.ac.jp/
発行日2018 年 3 月 26 日

©Inter-University Research Institute Corporation
Research Organization of Information and Systems
ISBN978-4-909638-07-6 C0345

Printed in Japan