大学共同利用機関法人

情報・システム研究機構
要覧
新領域融合研究センター
国立極地研究所

Transdisciplinary ResearchIntegration Center

National Institute ofPolar Research

国立情報学研究所

国立遺伝学研究所

National Institute ofInformatics

National Institute ofGenetics

統計数理研究所
ライフサイエンス
統合データベース
センター

The Institute of
Statistical Mathematics

Database Center forLife Science

Inter-University Research Institute Corporation

Research Organization of Information and Systemsごあいさつ大学共同利用機関の法人化にあたり、本機構は単に似た研究機関を集めるのではなく、未来の学術研究の方向を見据えて、むしろ相補的な研究所が連携協力する組織として発足しました。早いもので既に法人化
後 4 年が経過し、中期計画の総括と評価をする時期となりました。幸いに、機構法人の設立理念の理解も浸透し、研究所間及び大学との交流も深まり、中期計画達成の見通しも見えてきたように思われます。特に第二年度から中央に設立した新領域融合研究センターの活動が本格化し、これまでのような一研究所のみでは実現が困難であった境界領域の研究活動が活発化したことは、法人化したからこそ可能となった発展です。
さらに2007 年度からは、ライフサイエンス統合データベースセンターを設立し、大学共同利用機関という特性を生かして、これからの生命科学研究の基盤として重要なデータベースの統合化の役割を担います。わが国の学術研究の環境はあいかわらず厳しいですが、各研究所の活動の高度化をはかるとともに、法人化の機会をとらえて新しい研究領域を開拓しようとするわれわれの活動をご理解いただき、今後とも皆様のご支援ご鞭撻をお願い致します。
機構長

堀田 凱樹

役員／経営協議会

1
2

教育研究評議会

3

機構の理念／沿革
機構の組織

所員／決算

4

総合研究大学院大学との連携

4

新領域融合研究センター

5

ライフサイエンス統合データベースセンター

5

国立極地研究所

6

国立情報学研究所
統計数理研究所

78

国立遺伝学研究所

9

機構の理念
生命、環境、情報など、21世紀の人間の変容に

さらに、複雑なシステムに関する情報学的研究

関わる重要課題の解決には、従来の学問領域の枠の方法論、データベースやネットワークの高度利にとらわれない研究への取り組みが必要となって用に関する研究開発と事業を通して、学術研究にいます。

関わる国内外の諸機関に対して、研究の機動的、情報・システム研究機構は、4 研究所が連携することにより、生命、地球、環境、社会などに関わ効果的展開を支援するための情報基盤を提供することも大きな使命です。

る複雑な問題を情報とシステムという視点から総このように、情報・システム研究機構において合的に捉え、実験・観測による多種・大量のデーは、各研究所が従来から進めてきた大学共同利用

タの産生とそこからの情報の抽出、真理の発見、機関としての研究の充実発展に加え、これまでのデータベースの構築とその活用法の開発などの諸研究所の枠を超えた先端的な融合研究を新たな課題に関して、分野の枠を超えた融合的な研究と構想の下に推進していこうとしています。

新分野の開拓を図るものです。また、その成果と新たな研究領域に対する研究基盤を広く共同利用に供することを目的としています。

沿革
情報・システム研究機構 設立
Research Organization of Information and Systems

国立極地研究所
National Institute of Polar Research

1973

国立情報学研究所

2000

National Institute of Informatics

統計数理研究所
The Institute of Statistical Mathematics

2008

2004
1944

1985

国立遺伝学研究所
National Institute of Genetics

1949

1984
研究所の設立大学共同利用機関として設置

情報・システム研究機構 2008

1

■役 員

平成20．4．
1現在

機構長

堀田凱樹

情報・システム研究機構長

理事

坂内正夫

情報・システム研究機構 国立情報学研究所長

理事

北川源四郎

情報・システム研究機構 統計数理研究所長

理事

小原雄治

情報・システム研究機構 国立遺伝学研究所長

理事（非常勤）

安西祐一郎

慶應義塾長

監

事（非常勤）

辻井潤一

東京大学大学院情報理工学系研究科 教授

監

事（非常勤）

鈴木清

鈴木公認会計士事務所■ 経営協議会
青木利晴

株式会社ＮＴＴデータ 相談役

甘利俊一

理化学研究所 脳科学総合研究センター 特別顧問

荒木徹

京都大学 名誉教授

石井紫郎

東京大学 名誉教授

尾池和夫

京都大学長

大﨑仁人間文化研究機構長特別顧問

郷通子

佐々木

お茶の水女子大学長

元

日本電気株式会社 代表取締役会長

杉村隆

国立がんセンター 名誉総長

平山善吉

日本文理大学 客員教授

松原謙一

株式会社ＤNＡチップ研究所

堀田凱樹

情報・システム研究機構長

坂内正夫

情報・システム研究機構 理事

北川源四郎

情報・システム研究機構 理事

小原雄治

情報・システム研究機構 理事

安西祐一郎

情報・システム研究機構 理事（非常勤）藤井理行

国立極地研究所長

白石和行

国立極地研究所 副所長

東倉洋一

国立情報学研究所 副所長

田村義保

統計数理研究所 副所長

五條堀孝

国立遺伝学研究所 副所長

髙野2

平成20．4．
1現在

茂

情報・システム研究機構 2008

代表取締役社長

情報・システム研究機構 事務局長

機構長選考会議

監 事（非常勤）2名

理 事 4名以内

役員会

機 構 長

常勤3名 非常勤1名（機構長、理事で構成）

経営協議会

教育研究評議会

研究所長会議総合企画室

知的財産本部

総務課

国立極地研究所所長

国立情報学研究所

運営会議

所長

運営会議

統計数理研究所
所長

財務課

事 務 局

施設課

国立遺伝学研究所

運営会議

所長

運営会議

研究系施設等

研究系施設等

研究系施設等

研究系施設等

管理部

総務部

管理部

管理部

企画課

ライフサイエンス
統合データベースセンター

新領域融合研究センタ−■ 教育研究評議会

平成20．4．
1現在

有川

節夫

九州大学 理事・副学長

小川智子

岩手看護短期大学 副学長

小池勲夫

琉球大学 監事

佐和隆光

立命館大学大学院政策科学研究科 教授

関口睦夫

福岡歯科大学 客員教授

田中英彦

情報セキュリティ大学院大学 情報セキュリティ研究科長

廣津千尋

明星大学 教授

本堂武夫

北海道大学 理事・副学長

堀田凱樹

情報・システム研究機構長

坂内正夫

情報・システム研究機構 理事

北川

源四郎

情報・システム研究機構 理事

小原雄治

情報・システム研究機構 理事

安西祐一郎

情報・システム研究機構 理事（非常勤）藤井理行

国立極地研究所長

佐藤夏雄

国立極地研究所 副所長

安達淳

国立情報学研究所 学術基盤推進部長樋口知之

統計数理研究所 副所長

城石俊彦

国立遺伝学研究所 系統生物研究センター長

情報・システム研究機構 20083

所員・決算■所 員

機

平成20．6．
1現在

機

関構

本所

長

研究教育職員

技術職員

部

事務職員
21

国立極地研究所

149

23

25

国立情報学研究所

(1)

74

1051

統計数理研究所

(1)

48

11

14

国立遺伝学研究所

(1)

57

15

18

ライフサイエンス統合データベースセンター

1※所長の( )は理事が兼務する者を示す。

■ 決 算 （平成19年度）[ 単位：千円 ]●運営費交付金対象事業費●

大学院教育経費

218,392●

受託研究費

2,901,255

●

受託事業費

772,304●

寄81,752●

科学研究費補助金

1,674,882

受託事業費

●

施設整備費

4,675,067

受託研究費合30,483,469

附

20,159,816

金

計

施設整備費
科学研究費
補助金寄附金
運営費交付金対象
事業費

大学院教育経費※金額については、項目毎に千円未満を四捨五入しているため、合計額とは一致しない。

総合研究大学院大学との連携

4「総合研究大学院大学」は、学問諸分野で先端と発見の実現、及びリスクと不確実性の管理など的な研究を行っている大学共同利用機関の高度でを研究する「統計科学専攻」、世界規模の高度情優れた研究環境を活用して教育を行うユニークな報社会の実現に向けて、情報科学、情報工学を基大 学 院 大 学です。情 報・システム研 究 機 構では、盤としつつ、人文社会科学をもカバーし、情報学それぞれの研究所が専門分野の最先端研究の現の基礎・応用・実用の研究・教育を国際的に行う場における教育と研究を行うために、総合研究大「情報学専攻」、生命メカニズムの解明に向けて、学院大学の専攻を担当しています。それらは、南整備された DNA データベースや数多くの実験生

極と北極に代表される極域での自然環境とそこで物系等などの遺伝資源を活用して幅広く生命科学生起する諸現象をグローバルな視点で広く研究す研究を行う「遺伝学専攻」など、各研究所の特色る「極域科学専攻」、複雑な対象、氾濫する情報とを生かした専攻となっており、5 年一貫制の教育・不確実性のもと、データによる合理的な推論、予測研究を行っています。

情報・システム研究機構 2008

新領域融合研究センター

Transdisciplinary Research Integration Center

生命の新しいパラダイムの創造をめざし、融合研究を推進します。
新領域融合研究センターは、「これまでの大学共同を推進しています。

利用機関の活動をさらに発展させるとともに、新分野それらは、①氷床コアの微生物や極限環境生物シスの創造をめざす」という当機構の基本的な方針の実現

テムの解析を行う「地球生命システムの環境・遺伝基を目指すものであります。

盤 の 解 明とモデ ル 化・予 測に向 けた 研 究」、②大 規 模

新領域融合研究センターでは、国立極地研究所、国データの解析・分類・知識獲得につながる「分野横断立遺伝学研究所において得られる多種大量の地球科型融合研究のための情報空間・情報基盤の構築」、③予学、生命科学のデータ及び知見を、統計数理研究所で測と発見のためのモデリング技術の開発を指向する「機研究開発される統計数理のモデリング・計算技術及び能と帰納：情報化時代に目指す科学的推論の形」、④生

国立情報学研究所において研究開発される情報技術、物多様性の謎に立ち向かう「統計・情報技術を駆使し情報基盤と結合し、地球と生命システムの研究分野にたゲノム多型と表現型多様性の連関解析システムの開おいて新しいパラダイムの創造を目指して、融合研究発」です。の推進と情報基盤の開発を行います。
現在、生命・地球環境・情報の 3 本の柱のもとに、「新領域融合プロジェクト」と称する4 つの大型プロジェクト

また、「新しいパラダイムの創造」に相応しい挑戦的で萌芽的な融合研究の推進にも注力し、将来の「新領域融合プロジェクト」の育成を目指しています。

ライフサイエンス 統合データベースセンター
Database Center for Life Science

サイエンス発展のための知的情報基盤を構築します。
ライフサイエンス統合データベースセンターは、我が技術、ライフサイエンスデータベースの 3 つの分野の国のライフサイエンス関係データベースの利便性の向上

専門家からなる研究運営委員会と常勤の研究者チームを図ることを目的に、既存知識を俯瞰することを可能とからなる組織の構築、（2）上記戦略に基づいた、統合し、新たな知識体系の確立に資するための、データベー

データベ ースとそれを実 現するための 情 報 技 術 の 開ス統合化を推進する中核組織として設立されました。

発、及びその成果の一般への速やかな提供、（3）統合

ライフサイエンス統合データベースセンターでは、データベースの開発と運用を支援するための、ポータライフサイエンスやバイオ産業に従事する研究者や技ルサイトの構築と運用、大小のプロジェクトで構築され術者が、いわゆるゲノムプロジェクトやポストゲノムプたデータベースの受け入れと運用及び人材の育成、をロジェクトの成果、及びこれまでに構築、開発されてき行います。

た多様なデータベースや解析ツールをストレスなく利

ライフサイエンス統合データベースセンターが提供

用して、より高度な研究開発を効率よく推進できる環するサービスにより、産業界を含めたライフサイエンス境（統合データベース）を実現するために、（1）我が国分野の研究開発を一層効率的に推進すると同時に、将におけるライフサイエンス関連データベース整備戦略

来のライフサイエンスの大連合の核となる新しいパラの立案と実行評価のための、ライフサイエンス、情報ダイムの構築を目指します。
情報・システム研究機構 2008

5

国立極地研究所

National Institute of Polar Research

極から地球システムを探求します。
国立極地研究所は、極地に関する科学の総合研究及び極地観測を行うことを目的に 1973 年に設置され た 大 学 共 同 利 用 機 関 で す。南 極、北 極 にお ける
フィールド観測を基盤に、資・試料の分析、データの解析、モデリングを通じ地球科学、環境科学、太陽系地球科学、宇宙・惑星科学、生物科学などを包含した先進的総合地球システム科学を共同研究として推進しています。
一方、文部科学省におかれた南極地域観測統合推進本部が推進する南極地域観測事業について、学術研究観測、設営等の役割を担うとともに、北極域においては、観測施設の運営、野外調査支援、情報発信及び国際対応などの面で、共同利用の役割を果たしています。

極域科学は地球システムの科学

極域は宇宙への窓

南極、北極を中心とした極域の自然は、宇宙空間から、磁夜空を彩るオーロラは太陽風と地球磁気圏との相互作用

気圏、電離圏、大気圏、雪氷圏、海洋圏、地圏、生物圏を通の産物であり、その振る舞いは磁気圏・電離圏のプラズマ物して相互につながりをもち、密接に関連し、それ自体が一つ理過程や太陽風エネルギー流入過程を知る貴重な手がかりの大きな自然系を構成しています。極域科学は、こうした自になっています。

然系に関わる幅広い研究分野の基礎に立ち、物理的、化学的、さらに南極域は、惑星物質である隕石や宇宙塵を効率よく生物的諸過程とその相互作用を地球システムの一環として究採集できること、また宇宙線やミリ波電波が地球大気の阻害明することを目的としています。

を受けにくく観測で き ること から、極地からみた地球規模環境変化

宇宙や惑星を観巨大な南極氷床や北極域の氷河、海氷など雪氷圏は地球測 す る 窓 として、の冷源域として大気大循環に影響を与え、また地球規模海洋宇宙・惑星研究の循 環を左 右するなど、地 球 の 気 候を支 配する重 要な要 因で重要拠点となってす。このため、地球環境の変動に対して、フィードバック作用います。などを通じて極域の環境変化が増幅して現れること、人為的影響の少なく地球のバックグラウンド状態を知ることができること、極限環境下の生態系のふるまいを通して生命と環境に関する新しい視点を開拓できること、さらに、雪氷圏の中に過去の地球の気候・環境が記録されていることから、極域で南極から探る地球史

観 測 す ること は

南 極 大 陸 の 一 部には、約 38 億 年 前 の 地 球 上で最 古に属地球規模の環境する岩石が分布しています。5 億年前のゴンドワナ大陸形成変 動を知るのににいたる変遷とその後の分裂過程、4 千万年前にさかのぼる最適なのです。

南極氷床の形成につながる現在の南極プレートの性質を探る上で絶好のフィールドです。形成された氷床のその後の変動は、それに伴う海水準変動、地殻変動として現在の地球変動に影響を及ぼしています。
「南極から探る地球史」の視点は、地球内部や地球表面の諸現象を46 億年 という長 い 時 間 スケールにわたって解明することにあります。

6

情報・システム研究機構 2008

国立情報学研究所

National Institute of Informatics

業を車の両輪として、情報学による未来価値を創成します。
国立情報学研究所は、情報学という新しい学問分野での「未来価値創成」を目指すわが国唯一の学術総合研究所として、ネットワーク、ソフトウェア、コンテンツなどの情報関連分野の新しい理論・方法論から応用展開までの研究開発を総合的に推進しています。また、大学共同利用機関として、学術コミュニティ全体の研究・教育活動に不可欠な最先端学術情報基盤（サイバー・サイエンス・インフラストラクチャ：ＣＳＩ）の構築を進めるとともに、全国の大学や研究機関はもとより民間企業や様々な社会活動との連携・協力を重視した運営を行っています。

情報学の総合的な研究・教育の展開

最先端学術情報基盤を推進する事業「情 報 学」は、計 算 機 科 学や 情 報 工 学だけでなく、人 文・国立情報学研究所では、最先端学術情報基盤（ＣＳＩ）の形社会科学や生命科学の領域も包含する新しい学問分野です。

成・運用を推進しています。CSI は、ネットワーク、コンテンツ、

国立情報学研究所では、４研究系、7 研究施設（センター）、研究グリッド、認証などで構成されています。これらを全国の研究開発連携本部及び連携研究部門を設置し、未来価値を大学などと連携・協力して企画・運営する学術情報ネットワー

創成する情報学研究、社会・公共貢献、融合の情報処理、産学クと学術コンテンツの２つの運営・連携本部、システムの開

官民の連携、国際的な研究・事業活動を指向した情報学研究

発・運用業務を行う学術基盤推進部、及び、研究者の参加やを進めています。

研究成果の導入を促進するセンターを置き、研究組織と一体となって学術コミュニティへの貢献に務めています。

未来価値創成自然科学から人文・社会科学にわたる広範な情報学研究の長 期 的 視 野に立った推 進と体 系 化による学 問 形 成を目指して、情報学による未来価値（理論・方法論から応用展開）を創成し、情報学の発展に貢献します。

社会・公共貢献
学術・文化・教育・出版・環境及び地域・ＮＰＯなどの社会・公共活動の発信や活性化のためのコンテンツの形成・検索・利用を効果的に実現するプラットフォームやポータルの形成に加えて、社会、人文、制度の調和形成を進めます。

大学院教育・人材育成
総合研究大学院大学複合科学研究科の情報学専攻として、情報学分野の人材の中長期的な質的・量的拡大を目指した研究者・技術者を養成するとともに、産と学をつなぐ技術者の養成拠点を設置し、戦略的人材を育成しています。
情報・システム研究機構 20087

統計数理研究所

The Institute of Statistical Mathematics

基づく合理的推論の仕組みの研究を推進します。
予測や発見など「データから情報を取り出す」ことはPrediction andKnowledge Discovery

StatisticalModeling

人間が行っている知的活動の根幹に関わる営みです。
情報環境の発達に伴って、現代社会には膨大なデータが利用可能な形で蓄積されつつあります。統計数理研
究所は、生命、環境、社会、経済なども対象とした広義の科学技術の分野において必須となる「データに基づData Science

く合理的推論の仕組み」の研究を推進し、現代社会におけるデータ解析の要請に応えようとしています。
Risk Analysis

予測と知識発見、不確実性のモデリングとリスクの解析、データの設計と調査、計算推論、基礎数理、統計資源などに関する方法及び理論を、我が国の科学技術の現場の問題を解決する中から研究開発しています。
分野横断的な広がりをもって、所外の研究者及び実務家との共同研究が多数進行中です。

Mathematical Analysis
and Statistical Inference

基幹的研究組織の構成

ResearchInnovation

戦略的研究組織等の構成● モデリング研究系● 予測発見戦略研究センター

多数の要因が複雑に関連した、時間的・空間的に変動する複雑なシステムが生み出す大量のデータから有用な情報現象や知的な情報処理のモデル化、及びモデルに基づくを抽出し利用する「予測と発見」のためのモデリングや推統計的推論の方法に関する研究

論アルゴリズムなどの 研 究 及び統 計ソフトウェアの 開 発を、ゲノム科学や地球・宇宙科学等の実質科学の具体的● データ科学研究系

課題の解決に即して行っています。

不確実性と情報の不完全性に対処するためのデータ設計と調査、分析の方法及び計算機の高度利用に基づくデー● リスク解析戦略研究センター
社会・経済のグローバル化に伴って増大した不確実性とリタ解析法に関する研究

スクの問題に科学的に対応するための、リスク解析に関す● 数理・推論研究系

るプロジェクト研究を推進するとともに、リスク解析に関す統計基礎理論、統計的学習理論の構築、及び統計的推論る研究ネットワークを構築して、社会の安心と安全に貢献に必要な最適化、計算アルゴリズムの理論と基礎数理にすることを目指します。

関する研究● 新機軸創発センター■ 非可聴つぶやき声NAMによる個人認証の研究（モデリング研究系）■ 品質工学における統計的方法論の研究（データ科学研究系）

社会及び学術研究の新しい潮流を見据え、萌芽的なものも含めて自由な発想に基づく研究プロジェクトを推進する
ことにより、統計数理における新機軸の確立を目指します。

■ 状態空間モデリングのための計算手法の研究（数理・推論研究系）

8

情報・システム研究機構 2008

■ シミュレーション計算と巨大データセットの解析を一 体化する研究（予測発見戦略研究センター）■ 温室効果ガス観測技術衛星で測定されるデータの導出精度評価の研究（リスク解析戦略研究センター）■ 社会調査情報の統合化の研究（新機軸創発センター）

国立遺伝学研究所

National Institute of Genetics

ゲノムから生命システム解明を目指します。
国立遺伝学研究所は DNA 二重ラセン発見の 4 年前にあたる1949 年（昭和 24 年）に創設されました。
以来 60 年近い歴史は生命科学の爆発的進展と重なり、数々の優れた研究業績を輩出してきました。
生命は複雑なシステムですが、それを解き明かす上で遺伝学の手法や考え方は非常に強力です。それは生命がゲノム DNA 上に書き込まれた遺伝情報に発生・分化・行動の研究

進化・多様性の研究

細胞機能の研究

ゲノム・大量情報の研究基づいて出来上がっており、生命科学の根幹が遺伝学だからです。現在、本研究所では５研究系、６研究センター、実験圃場において 39 の研究グループが以下の領域で先端的な研究を進めています。
また、生 命 科 学 の 将 来を担う人 材を育 成するた
め、総合研究大学院大学生命科学研究科遺伝学専攻を担当しています。

細胞機能の研究

ゲノム・大量情報の研究

細胞増殖は生命の基本です。ゲノム DNA の複製、修復、ゲノム科学の特徴は、生物の全遺伝情報の収集と情報処分配、細胞分裂の機構、細胞周期制御さらには転写の機構に理（インフォマティクス）による意味抽出です。DNA シーケ

ついての研究が進んでいます。タンパク質の移動や分解調節

ンシングセンターでは重要な生物種のゲノム配列や遺伝子配の研究、そしてナノバイオロジーや１分子イメージングの技列を次々と決定しています。体系的な遺伝子発現解析や機能術開発が進められています。

解析からの遺伝子ネットワークを抽出、さらに生命システムのモデル化・シミュレーションの研究が続きます。

発生・分化・行動の研究
受精卵が発生し器官・個体を作り上げる過程を目的に適っ生命科学を先導する研究事業

た様々なモデル生物を用いて研究しています。細胞の運命決DDBJ（日 本 DNA デ ータバンク）事 業 は、日 米 欧 3 極 体定、形態形成、神経回路形成さらには行動などの遺伝子制御

制 の 拠 点として DNA 情 報 の 収 集・提 供を行っています。生のメカニズムも重要な研究テーマです。エピジェネティクス

物遺伝資源（バイオリソース）事業は、わが国の中核として学制御も最近のトピックスです。

術研究用の生物系統等の開発・収集・維持・配布とデータベース化を行っています。いずれも、学術研究を支える重要な知進化・多様性の研究的基盤整備です。

複雑な生命システムは長い年月の進化を経て出来上がりました。進化とはゲノムの変化と選択の繰り返しです。ヒトを含む現存の様々な生物ゲノムを比較することにより進化をたどる研究が行われています。多様性からゲノム機能を解析する研究も進められています。

生物遺伝資源DDBJ/NIG/ROIS

GenBank/
NCBI/NLM

EMBL/EBIDDBJ (DNA Data Bank of Japan)

生命科学を先導する研究

情報・システム研究機構 20089

［機構本部所在地］〒105-0001
東京都港区虎ノ門 4- 3 -13 神谷町セントラルプレイス2F
TEL（03）6402-6200
http://www.rois.ac.jp/［機構所属研究所］

国立極地研究所
National Institute of Polar Research〒173- 8515 東京都板橋区加賀 1- 9 -10
TEL（03）3962-4712http://www.nipr.ac.jp/

国立情報学研究所
National Institute of Informatics〒101- 8430 東京都千代田区一ツ橋 2-1-2
TEL（03）4212-2000
http://www.nii.ac.jp/

統計数理研究所
The Institute of Statistical Mathematics〒106-8569 東京都港区南麻布 4-6-7
TEL（03）3446-1501
http://www.ism.ac.jp/

国立遺伝学研究所
National Institute of Genetics〒411-8540 静岡県三島市谷田 1111
TEL（055）981- 6707
http://www.nig.ac.jp/［機構所属センター］

新領域融合研究センター
Transdisciplinary Research Integration Center

http://www.rois.ac.jp/tric/

ライフサイエンス統合データベースセンター
Database Center for Life Science

http://dbcls.rois.ac.jp/