被子植物における科のコンセプト変更とその対応
ーAPG体系への移行に関して」伊藤 元己（東京大学）

本日の内容・APG体系とは？
・なぜAPG体系か？
・APG体系で何が変わるか？
・どのような対応が必要か？

APG体系とは？
Angiosperm Phylogeny Group (APG)
による、被子植物の分子系統樹に基づく分類体系
各分類群には単系統群のみを採用
2009年に第３版が出版
APG III. 2009. An update of the Angiosperm Phylogeny Group
classification for the orders and families of flowering plants: APG III.
Botanical Journal of the Linnean Society 161: 105‒121.

被子植物の系統
基部被子植物

単子葉殖物

真正双子葉植物
バラ類

アンボレラ

スイレン類

ITA

モクレン類

キンポウゲ類

単子葉性

マメ類

アオイ類

三溝性の花粉

キク類
シソ類

キキョウ類

Figure 1. The APG III (2009) tree showing relationships of the orders of the angiosperms overlaid with the classification
proposed here. The other groups of land plants are not shown.

PHYLOGENETIC CLASSIFICATION OF LAND PLANTS 125
ｩ 2009 The Linnean Society of London, Botanical Journal of the Linnean Society, 2009, 161, 122–127

なぜAPG体系か？
系統関係を反映した体系- 他の研究分野の基盤となる分類体系が必要
2度の改訂の結果、APG III (2010)でほぼ安定した。
- 単子葉植物の整理- 所属不明の植物の解明

なぜAPG体系か？
多様な生命情報の基盤としての分類体系

NCBI Taxonomy (GeneBank)

Encyclopedia Of Life

これまで使われてきた被子植物の分類体系
エングラー体系
モクマオウ科（Casuarinaceae)
から始まる
保育社

原色日本植物図鑑

クロンキスト体系
モクレン科（Magnoliaceae）
から始まる

この両者は科の配列順序は異なるが、科の範囲はほぼ同じ

平凡社

日本の野生植物

APG体系で何が変わるか？
・慣れ親しんだ科が分解
ユリ科
ユキノシタ科
ゴマノハグサ科 etc.
・他の科に統合
カエデ科
トチノキ科
フジウツギ科

etc.

旧ユリ科の分解
古典的ユリ科の定義
・子房上位・合生心皮

原始的特徴でまとめられた群APG IIIのユリ目とキジカクシ目
Liliales Perleb (1826)

Asparagales Link (1829)

Alstroemeriaceae Dumort. (1829), nom.
cons.
(including Luzuriagaceae Lotsy)
Campynemataceae Dumort. (1829)
Colchicaceae DC. (1804), nom. cons.
Corsiaceae Becc. (1878), nom. cons.
Liliaceae Juss. (1789), nom. cons.
Melanthiaceae Batsch ex Borkh. (1797),
nom. cons.
Petermanniaceae Hutch. (1934), nom.
cons.
Philesiaceae Dumort. (1829), nom. cons.
Ripogonaceae Conran & Clifford (1985)
Smilacaceae Vent. (1799), nom. cons.

Amaryllidaceae J.St.-Hil., nom. cons. (including
Agapanthaceae F.Voigt, Alliaceae Borkh., nom. cons.)
Asparagaceae Juss. (1789), nom. cons. (including
Agavaceae Dumort., nom. cons., Aphyllanthaceae
Burnett, Hesperocallidaceae Traub, Hyacinthaceae
Batsch ex Borkh., Laxmanniaceae Bubani, Ruscaceae
M.Roem., nom. cons., Themidaceae Salisb.)Asteliaceae Dumort. (1829)
Blandfordiaceae R.Dahlgren & Clifford (1985)
Boryaceae M.W.Chase, Rudall & Conran (1997)
Doryanthaceae R.Dahlgren & Clifford (1985)
Hypoxidaceae R.Br. (1814), nom. cons.
Iridaceae Juss. (1789), nom. cons.
Ixioliriaceae Nakai (1943)
Lanariaceae R.Dahlgren & A.E.van Wyk (1988)
Orchidaceae Juss. (1789), nom. cons.
Tecophilaeaceae Leyb. (1862), nom. cons.
Xanthorrhoeaceae Dumort. (1829), nom. cons.
(including Asphodelaceae Juss. and Hemerocallidaceae
R.Br.)
Xeronemataceae M.W.Chase, Rudall & M.F.Fay (2000)

キスゲ属 Hemerocallis
エングラー
Liliales - Liliaceae
ユリ科
クロンキストLiliales - Liliaceae
ユリ科
APG I

Asparagales - Hemerocallidaceae
キスゲ科

APG II

Asparagales - Xanthorrhoeaceae(or Hemerocallidaceae)
ススキノキ科あるいはキスゲ科

APG III

Asparagales - Xanthorrhoeaceae
ススキノキ科

ネギ属 Allium
エングラー
Liliales - Liliaceae
クロンキスト Liliales - Liliaceae

ユリ科
ユリ科

APG I

Asparagales - Alliaceae ネギ科

APG II

Asparagales - Alliaceae ネギ科

APG III

Asparagales - Amaryllidaceae
ヒガンバナ科ギボウシ属 Hosta
Liliales - Liliaceae

ユリ科

クロンキスト Liliales - Liliaceae

ユリ科

エングラー

APG I

Asparagales - Agavaceae
リュウゼツラン科

APG II

Asparagales - Agavaceae
リュウゼツラン科

APG III

Asparagales - Asparagaceae
クサスギカズラ科

ゴマノハグサ科 -> オオバコ科* Antirrhinum キンギョソウ属* Bacopa ウキアゼナ属* Digitalis ジギタリス属* Dopatrium アブノメ属* Ellisiophyllum キクガラクサ属* Gratiola オオアブノメ属* Lagotis ウルップソウ属* Limnophila シソクサ属* Limosella キタミソウ属* Linaria ウンラン属* Lindernia アゼナ属
* Nemesia ネメシア属* Russelia ハナチョウジ属* Penstemon イワブクロ属* Scoparia セイタカカナビキソウ属* Veronica クワガタソウ属* Veronicastrum クガイソウ属
ゴマノハグサ科からハマウツボ科*コゴメグサ属 Euphrasia*ヤマウツボ属 Lathraea*ママコナ属 Melampyrum*シオガマギク属 Pedicularis*コシオガマ属 Phtheirospermum etc.
ゴマノハグサ科からカルセオラリア科* Calceolaria キンチャクソウ属
ゴマノハグサ科からキリ科* Paulownia キリ属
ゴマノハグサ科に統合* フジウツギ科* ハマジンチョウ科

ゴマノハグサ科 -> オオバコ科
Antirrhinum キンギョソウ属
Bacopa ウキアゼナ属
Digitalis ジギタリス属
Dopatrium アブノメ属
Ellisiophyllum キクガラクサ属
Gratiola オオアブノメ属
Lagotis ウルップソウ属
Limnophila シソクサ属
Limosella キタミソウ属
Linaria ウンラン属
Lindernia アゼナ属
Nemesia ネメシア属
Russelia ハナチョウジ属
Penstemon イワブクロ属
Scoparia セイタカカナビキソウ属
Veronica クワガタソウ属
Veronicastrum クガイソウ属

オオバコ

オオバコ科

オオバコ

オオイヌノフグリ

キンギョソウ

ジギタリス

クガイソウ

ヤマクワガタゴマノハグサ科からハマウツボ科

コゴメグサ属 Euphrasia
ヤマウツボ属 Lathraea
ママコナ属 Melampyrum
シオガマギク属 Pedicularis
コシオガマ属 Phtheirospermum etc.

シオガマギク属

ハマウツボ科

ハマウツボ

ヨツバシオガマ

ママコナ

ミヤマココメグサゴマノハグサ科から独立、統合

ゴマノハグサ科からカルセオラリア科* Calceolaria キンチャクソウ属
ゴマノハグサ科からキリ科* Paulownia キリ属

キンチャクソウ

ゴマノハグサ科に統合* フジウツギ科* ハマジンチョウ科

キリフジウツギハマジンチョウ

その他の統合される科
カエデ科
トチノキ科

ムクロジ科

ムクロジイロハモミジ

ランブータントチノキ

どのような対応が必要か？

• だれでも容易にAPG体系が参照可能にする• 新旧体系間の対応関係が参照可能にする• 科名などを用いるときに、どの体系に基づいているかを明記する

国際プロジェクトのデータベース• 生物名データベース• Catalog of Life
http://www.catalogueoflife.org/• 種情報データベース• Encyclopedia of Life
http://www.eol.org/

日本語のオンライン・データベースが必要種名を扱う場合にはあまり影響はない？
参照システムがあれば、種名から高次分類体系の検索が可能
ーどんな体系にも適用可能
特に日本は比較的安定した和名が使用可能（種名リストが科名順に列んでいると参照に手間取る）

種名を扱う場合にはあまり影響はない？
ノコンギク
Aster microcephalus (Miq.) Franch. et Sav. var. ovatus (Franch. etSav.) Soejima et Mot.Ito
Aster ageratoides Turcz. subsp. ovatus (Franch. et Sav.) Kitam.
Aster ageratoides Turcz. var. ovatus (Franch. et Sav.) Nakai
Aster ageratoides Turcz. var. ovatus (Franch. et Sav.) Nakai f.
albovariegatus Kitam.
Aster ovatus (Franch. et Sav.) Mot.Ito et Soejima var. ovatus

GBIFデータポータルサイトの和名-学名辞書

新旧の対照表があれば問題ないか？

• 科名のみではどのコンセプトであるか不明• 名前を使うときには誰のコンセプトであるかを明記していない場合が多い。

APG体系普及への取り組み• 日本植物分類学会（植物データベース委員会）• APGIII体系の科の和名および日本産被子植物の所属をまとめている• 3月（総会時）にドラフト公表• 9月に公表• GBIF日本ポータルの和名-学名辞書• 環境省の次期絶滅危惧植物リスト（Red List）に採用予定

APGIII体系に残された問題点
所属不明分類群
Apodanthaceae Takhtajan [three genera]
Cynomoriaceae Endl. ex Lindl. (1833), nom. cons.
Gumillea Ruiz & Pav.
Petenaea Lundell (possibly Malvales)
Nicobariodendron (see Simmons, 2004; possiblyCelastraceae)

Cynomoriaceae

The phylogenetic position of Cynomorium (Cynomoriaceae) has been
determined, and it's with Saxifragales, not Balanophoraceae! See
paper by Nickrent et al. (2005) in BMC Evolutionary Biology.

Discovery of the photosynthetic relatives of the"Maltese mushroom" Cynomorium
Daniel L Nickrent1* , Joshua P Der1 and Frank E Anderson2
BMC Evolutionary Biology 2005, 5:38

ご静聴ありがとうございました
謝辞（敬称略）
文部科学省・NBRP
神保宇嗣・倉島治・宇津木望・加藤俊英
永益英敏・藤井伸二・米倉浩司・梶田忠・戸部博・田村実