Vol. 22, No. 6 (2022)

日本蛋白質科学会ニュースレター

第 22 回日本蛋白質科学会年会（つくば）学生口頭発表賞受賞者コラム
2022 年 7 月 12 日
本年度第 22 回日本蛋白質科学会年会（つくば）におけるおける補体系の活性化を抑制する役割をもちますが、CFH に学生口頭発表賞受賞者の方から原稿をいただきましたのでこ対する自己抗体は自己細胞上での補体の過剰活性化を引き起こにお知らせします（演題番号順）。

こし、重篤な疾患 aHUS の原因となります。しかし、抗 CFH自己抗体は不明な点が多く、分子レベルでの解析はほとんど日本蛋白質科学会 役員会なされておりませんでした。本研究においては、結晶構造解
析と溶血試験から、取得した VHH 抗体が自己抗体と類似した特徴を持つことを示し、その阻害機構を明らかにしました。

SO1-04 仲 絢香（神戸大学）
この度は学生口頭発表賞を頂くことがでさらに物理化学的手法と MD シミュレーションに基づいてき、大変嬉しく思います。この場をお借りしVHH が持つユニークな分子認識機構と特徴的なエピトープて審査員の先生方をはじめとした学会関係の挙動を解明しています。本研究の成果は JBC に掲載されて者の皆様に心より感謝申し上げます。

おり、抗 CFH 自己抗体の 1 つのモデルを提示するものと考えております。

口頭発表では、ABC トランスポーター
BhuUV-T の二重スピンラベル ESR 分光受賞を励みにこれからも研究に努め、蛋白質科学、蛋白質法による構造変化の解析について報告させ工学、そして生命現象の解明に貢献していきたいと思います。て頂きました。ABC トランスポーターは ATP 依存的な膜輸送を行う膜タンパク質です。本研究では、基質のヘムが紫外・可視光領域に吸収を持つことで基質移動を追跡できる、ヘムインポーターの BhuUV-T の構造変化を解析することにより、基質移動と構造変化の相関関係を調べることを目標としております。ペリプラズム側・細胞質側のそれぞれに部位特異的にスピンラベルを化学修飾し、その運動性やそれを取り巻く環境の極性の変化を調べると、ペリプラズムに遊離するヘムを BhuUV に運搬してくる BhuT、あるいは ATP の結合により BhuUV の構造変化が誘起されることが分かりました。
今後は 2 つのスピンラベルの間の距離を測定することで詳細な構造を明らかにしたいと考えています。
最後となりますが、日々研究のご指導をいただいております木村先生、共同研究の先生方、研究室の皆様に感謝申し上げます。

SO2-05 赤坂 浩明（東京大学）
この度は学生口頭発表賞を頂き、大変嬉しく思います。今回の受賞を励みに、今後もSO1-06 横尾 尚典（東京大学）研究活動に勤しんでいく所存です。

この度は第 22 回日本蛋白質科学会に私が研究しているリゾホスファジン酸て学生口頭発表賞を頂くことができ、大変（LPA）受容体は G タンパク質共役型受容光栄に思っております。審査員の先生方を体（GPCR）の一種で、アゴニスト（作動薬）はじめとした学会関係者の皆様、指導頂きと結合すると活性型構造へと変化し、細胞ました先生方にこの場をお借りして感謝内の三量体 G タンパク質と結合、活性化することで細胞内へ申し上げます。とシグナルを伝達します。

今回の発表におきましては、補体抑制補本研究でクライオ電子顕微鏡を用いた単粒子解析によって、因子 CFH に対する自己抗体と同様の特徴を持つ VHH 抗体

作動薬と結合した活性型 LPA1 と三量体 G タンパク質（Gi）の機能解析について報告させて頂きました。CFH は細胞上に1Vol. 22, No. 6 (2022)

日本蛋白質科学会ニュースレターとの複合体構造を取得しました。これにより、作動薬の認識ADAR2 による RNA 認識・編集機構は不明のままでした。

様式を明らかにするとともに、作動薬によって受容体が活性

本研究では、REPAIR 法に利用される Cas13–ADAR2 複型状態へと変化する機序を解明しました。また、受容体と G合体の立体構造を、クライオ電子顕微鏡を用いた単粒子構造タンパク質との結合における揺らぎを確認し、そのダイナミ解析により決定し、その RNA 認識・編集機構を明らかにしクスも示しました。本研究により、薬剤と受容体との相互作ました。今後は構造情報に基づく分子改変を行い、より優れ用を詳細に理解することができ、LPA1 を標的とする薬剤のた RNA 編集ツールの開発を目指したいと考えています。

開発へ貢献が大いに期待されます。

今回、学生口頭発表賞として本研究を評価して頂いたこと最後になりますが、いつもご指導いただいております濡木は励みになりました。本研究の経験を基に、今後は RNA 編教授、志甫谷助教ならびに濡木研究室の皆様に、この場をお集酵素についての研究を展開していきたいと考えています。

借りして心から御礼申し上げます。

最後に、本研究を行うにあたりご指導いただいた西増教授をはじめとする西増研究室の方々に心より感謝申し上げます。

SO2-10 石川 潤一郎（東京大学）
SO3-02 工藤 玄己（筑波大学）

この度は第 22 回日本蛋白質科学会年会
にて学生口頭発表賞を頂き大変光栄に思い

この度は第 22 回日本蛋白質科学会年会ます。審査員の先生方をはじめ学会関係者

学生口頭発表賞に選出いただき、誠にありの皆様には、この場をお借りして心よりおがとうございます。審査員の方々はじめ年礼申し上げます。

会の現地開催にご尽力いただいた学会関係

RNA 編集は新しい遺伝子改変技術とし者のみなさまに、この場をお借りして心よて注目されています。中でも、近年報告されり感謝申し上げます。

た REPAIR 法（RNA Editing for Programmable A-to-

今回の発表では蛋白質の結合部位形状予I Replacement）は RNA 切断活性を消失させた Cas13 と測における高精度化について報告させていただきました。結

脱アミノ化酵素 ADAR2 の融合タンパク質 Cas13–ADAR2

合部位自体は従来の方法でも高い精度で予測できる一方で、を用いることにより、標的となる RNA 中の特定のアデニンその詳細な形状等の予測は未だに十分ではありません。本研をイノシン（グアニンとして翻訳される）に編集することが究では探索ソフトウェアの予測ポケットに着目し、より明確できます。REPAIR 法は G→A 変異に起因する遺伝子疾患のな結合部位形状に補正する手法を開発しました。また、ヒッ治療への応用が期待されていますが、その一方で、Cas13–ト化合物を持つ複合体構造にこの補正手法を適用することで、リード化合物として適切な形状を予測可能であることを確認しました。
我々の開発した結合部位予測の形状補正手法は、構造解析の発達や AlphaFold2 の登場により Structure-based
drug design が台頭する現代において、非常に有用であると考えています。開発したツールは今後公開予定のため、幅広い分野の研究者の皆さまにご使用いただけますと幸いです。
最後に、日々研究のご指導をいただいております広川貴次教授をはじめ、計算科学研究センター・重田育照教授、医学医療系・吉野龍ノ介助教、研究室の皆さま方に厚く御礼申し上げます。

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日本蛋白質科学会ニュースレターるものとして期待されます。

SO4-01 山口 祐希（大阪大学）
この度は学生口頭発表賞を頂き、大変嬉

最後に、本研究を行うにあたり日頃よりご指導頂きました

しく、光栄に思っております。このような宮本先生、川上先生、および多大なるご支援を賜りました共

状況の中、学会の開催に尽力してくださっ同研究者の先生方に、この場をお借りして改めて感謝申し上た学会関係者の皆様、そして審査員の皆様げます。に心より感謝申し上げます。
抗体は血液中に多く存在する蛋白質で、SO5-02 武井 梓穂（北海道大学）

生体内に侵入したウイルスなどの抗原を認識し、それらを排除する重要な役割を果たしています。抗体

この度は、第 23 回日本蛋白質科学会年は抗原と結合した後に免疫細胞上の受容体と結合することで会におきまして、このような栄誉ある賞を免疫エフェクター機能を誘導しますが、抗体と抗原の結合と、頂戴し大変光栄に思っております。

抗体と受容体との結合の関連性は明らかにされていませんで日々の研究活動を熱心にご指導していたした。本研究では、バイオレイヤー干渉法や水素/重水素交換だいている尾瀬教授、姚名誉教授へこの場質量分析法、クロスリンク質量分析法といった速度論的およをお借りして深くお礼を申し上げます。まび構造生物学的な手法を組み合わせることで、抗原は抗体にた、夢中で研究に打ち込むことを応援して結合すると、抗体の受容体との結合に関与する領域に構造変くれている母と父、そして日々切磋琢磨し合う構造生物化学化を引き起こし、その構造変化を介して抗体の免疫エフェク研究室のメンバーの皆様にも感謝を申し上げます。

ター機能を調節している可能性があることを明らかにしまし乳がんは日本人女性の癌部位別罹患数の 1 位であり、現代た。

日本において非常に深刻な疾患の一つです。乳がんの新規治

この賞をいただいたことを励みに、これからも精一杯研究療法開発のためにもがんの増悪化メカニズムを理解することに励んでまいります。

は重要と考え、乳がん特異的なキナーゼに関する研究に取り最後になりましたが、本研究を行うにあたりご指導を賜り組んでおります。本会では、乳がんで特異的に発現するキナました内山進教授ならびに研究室の皆様、共同研究者の皆様

ーゼと、キナーゼの活性制御に関わるアダプター分子の活性にこの場をお借りして、厚く御礼申し上げます。

解析並びに相互作用解析についての研究結果をご報告させていただきました。
新型コロナウイルスの蔓延と共に始まった研究生活でした

SO4-08 大原 直也（慶應義塾大学）

ので、オンサイトでの学会参加は本会が初めてでした。人前

この度は第 22 回日本蛋白質科学会年会で発表をさせていただく緊張感と、直接質問を受ける高揚感におきまして学生口頭発表賞に選出いただはとても刺激的でした。また、さまざまな先生や学生と出会いたこと、大変光栄に思います。審査員のうことができ、技術面・学術面だけでなく、多角的に研究を先生方をはじめ、大会関係者の皆様に御礼考えることができるとても良い経験となりました。オンサイ申し上げます。

トでの学会開催に尽力してくださった全ての関係者の皆様に感謝を申し上げます。

本会では、以前に設計・構築された人工この喜びを励みに、興味深い生命現象をとことん掘り下げ、タンパク質超分子 TIP60 を題材に、その多量体形成を外部刺激によって誘導可能にすることを目指しサイエンスを楽しむ学生生活にしたいです。本当にありがとたさらなる設計について報告しました。

うございました。

TIP60 のモノマーは、5 量体ドメインと 2 量体ドメインを有しており、通常それぞれのドメインでの自発的な会合により、ウイルスキャプシドのようなタンパク質ケージを形成します。
今回私は、5 量体形成に重要なタンパク質間相互作用を、金属イオンの配位結合で置き換えることを試みました。結果として、設計した変異体の一つが、アルカリ土類金属の添加によりケージ構造を形成することを明らかにしました。これ
らの成果は、タンパク質ケージの会合状態をアルカリ土類金属により制御した初めての例であり、今後の設計指針を与え
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日本蛋白質科学会ニュースレターの分子機構解明に貢献できるよう、日々精進して参りたいと

SO7-07 川越 聡一郎（北海道大学）

思います。

第 22 回蛋白質科学会年会において学生口頭発表賞を授与いただき、大変光栄に思います。
学会関係者のみなさまと、日頃から多大

SO8-03 濱口 紀江（千葉大学）

なるご支援をいただいております、北大・構造化学研究室の石森浩一郎先生、徳島大・この度は、第 22 回日本蛋白質科学会年

分子生命科学分野の齋尾智英先生をはじめ会におきまして学生口頭発表賞に選出いたとした本研究の関係者のみなさまに、この場をお借りして心だき、大変光栄に思います。

より感謝申し上げます。

P 糖タンパク質（P-gp）は多剤排出トラ

生物は細胞死誘導とストレス適応を、ストレスレベルに応ンスポーターで、非常に幅広い構造の化合じて巧みに制御することで、個体としての恒常性を維持して物を認識し輸送することから薬物動態に深います。Heat shock factor-1（Hsf1）は、ストレスを感知く関与しています。

して多量体化し、分子シャペロンの転写促進により細胞を保林グループの研究で、SARS-CoV-2 の 3CL protease 阻護する一方、強いストレス下ではゲル状の液滴を細胞内で形害剤である YH-53 が、この P 糖タンパク質に基質として認成し、このゲル状液滴への相転移はアポトーシスを誘導しま識され、細胞外に排出されることで薬効が低下していることす。つまり、Hsf1 はストレスに応じて、細胞保護とアポトーが報告されていました。すでに YH-53 と 3CL protese のシスという相反する効果をもたらしますが、その詳細な機構共結晶構造が報告され、YH-53 の改変可能領域が分かっていは未解明でした。

ることから、P-gp における YH-53 の結合様式が得られれ

そこで、in vitro 及び培養細胞中での Hsf1 液滴の形状と流ば、3CL protease の阻害能は維持したまま、P-gp に排出動性を評価し、Hsf1 は酸化環境下で相転移することを明らかされない薬剤の設計が可能になるのではと考え、YH-53 が結にしました。さらに、この酸化的相転移は、ジスルフィド結合した P-gp の立体構造決定を行いました。今後は構造情報合を介した Hsf1 の高次多量体化による、より高密度な液滴をもとに、薬剤のデザインを提案していきたいと考えており形成により引き起こされることを、屈折率イメージングとます。

SEC-MALS により示しました。これらの結果は、Hsf1 がレ最後となりましたが、学会関係者の皆様、日頃からご指導

ドックスバランスを細胞内のストレスレベルとして感知し、をいただいている村田武士教授をはじめとする生体構造化学

酸化的相転移により細胞運命を制御することを示唆していま研究室の皆様、共同研究者の先生方に心より感謝申し上げます。

す。

今回の賞を励みに、今後もタンパク質恒常性管理システム

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日本蛋白質科学会ニュースレター

SO8-10 山田 等仁（京都産業大学）

SO9-07 橋本 聡（広島大学）

この度は学生口頭発表賞を頂けたこと

この度は第 22 回日本蛋白質科学会にを大変光栄に思います。日頃よりお世話にて学生口頭発表賞をいただけたことを大なっております指導教員の津下英明先生、変光栄に思います。まずはこの場をお借り日本女子大学の吉田徹先生をはじめ大阪大して、学会関係者の皆様、日頃からご指導学蛋白質研究所の川本晃大先生、加藤貴之いただいている松尾光一准教授をはじめ、先生にこの場を借りて感謝申し上げます。

放射光科学研究センター（HiSOR）の皆様

二成分毒素は細胞に重篤な影響を与えるに厚く御礼申し上げます。

酵素成分と、それを細胞に送り込む膜孔の二つの蛋白質から生体膜に相互作用し機能を発現する膜結合タンパク質は、なる細菌毒素です。酵素成分が膜孔を透過するためにはその試料調製、測定の困難さからその機能の解明はいまだ不十分構造を失う必要がありますが、この機構は明らかにされていであるのが現状です。当研究室の放射光を光源とする真空紫ない状況でした。まず我々はウェルシュ菌が産生する二成分外円二色性分光（VUVCD）装置は、スペクトルから二次構造毒素の構造解析を行い、複合体中において酵素成分の N 末端の含量、本数、位置解析を可能とし、これまで多くの膜結合がアンフォールドされることを見出し、昨年の年会の若手奨タンパク質の構造解析に応用されてきました。

励賞演題にて発表を行わせて頂きました。今年は続編となる、本研究では VUVCD 装置に時間分解セルを組み込み、タンディフィシル菌の二成分毒素（CDT）の酵素成分・膜孔複合パク質–生体膜相互作用の動的構造観測を実現する新しい研体の構造解析について発表を行いました。今回の研究から、究手法の開発を行っています。口頭発表ではモデルタンパク

上記の構造変化の動的な過程を連続的に捉えたとも思われる質である β ラクトグロブリンとリゾリン脂質との相互作用結果を得ることができました。これによって二成分毒素の膜過程の時間分解観測について報告いたしました。天然状態、透過機構解明にさらに迫ることができたと考えています。

中間状態、膜結合状態といった構造変化経路を見出し、それ二成分毒素の膜透過機構について知見が重なることで、膜ぞれの二次構造情報算出に成功しました。

を介した細胞内への様々な分子のインジェクションの開発な

本研究は HiSOR だから実現できる他に例のないチャレンどの応用が期待されます。今後も楽しく面白い研究を続けてジだと考えております。恵まれた研究環境に感謝し、引き続いきたいと考えております。

きタンパク質の動的構造理解に向けて果敢に挑み続けていきます。

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編集責任者：

胡桃坂 仁志（東京大学）
前仲 勝実（北海道大学）

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