【手続補正書】
【提出日】平成29年9月4日(2017.9.4)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
被験体における発癌タンパク質の存在を検出する方法であって、
被験体から回収した試料から微小胞を単離する工程と、
前記微小胞における前記発癌タンパク質の存在を検出する工程と、を含む方法であって、前記発癌タンパク質は正常細胞を癌細胞に形質転換することができ、かつ、前記試料中の前記発癌タンパク質の存在は、前記被験体が癌を有する可能性がある指標となる、方法。
【請求項２】
被験体における癌を特徴付けするための方法であって、
被験体から回収した試料から微小胞を単離する工程と、
前記微小胞における発癌タンパク質の存在を検出する工程と、
前記発癌タンパク質のタンパク質組成を分析する工程とを含む、方法。
【請求項３】
被験体における癌の進行をモニタリングするための方法であって、
ａ）第１の時点で癌を有する被験体から回収した第１の試料から微小胞を単離する工程と、前記第１の試料から得た前記微小胞における発癌タンパク質を測定する工程と、
ｂ）第２の時点で癌を有する前記被験体から回収した第２の試料から微小胞を単離する工程であって、前記第２の時点は前記第１の時点の後に生じる工程と、前記第２の試料から得た前記微小胞における前記発癌タンパク質を測定する工程と、を含み、
前記第１の試料から得た前記微小胞における前記発癌タンパク質の量と比較した前記第２の試料から得た前記微小胞における前記発癌タンパク質の量の変化が、前記癌の進行の指標である、方法。
【請求項４】
抗癌治療の治療効果をモニタリングするための方法であって、当該方法は、
ａ）第１の時点で癌を有する被験体から回収した第１の試料から微小胞を単離する工程と、前記第１の試料から得た前記微小胞における発癌タンパク質を測定する工程と、
ｂ）第２の時点で癌を有する前記被験体から回収した第２の試料から微小胞を単離する工程であって、前記第２の時点は前記第１の時点の後に生じる工程と、前記第２の試料から得た前記微小胞における前記発癌タンパク質を測定する工程と、を含み、
前記第１の試料から得た前記微小胞における前記発癌タンパク質の量と比較して前記第２の試料から得た前記微小胞における前記発癌タンパク質の量の減少または変化がないことが、抗癌治療の治療効果を示す、方法。
【請求項５】
前記癌は、乳癌、神経膠腫、大腸癌、肺癌、小細胞肺癌、胃癌、肝臓癌、血液癌、骨肉腫、膵臓癌、皮膚癌、頭部癌もしくは頸部癌、皮膚黒色腫もしくは眼球内黒色腫、子宮肉腫、卵巣癌、直腸癌もしくは結腸直腸癌、肛門癌、結腸癌、卵管癌、子宮内膜癌、子宮頸癌、外陰癌、扁平上皮癌、膣癌、ホジキン病、非ホジキンリンパ腫、食道癌、小腸癌、内分泌癌、甲状腺癌、副甲状腺癌、副腎癌、軟部組織腫瘍、尿道癌、陰茎癌、前立腺癌、慢性白血病もしくは急性白血病、リンパ球性リンパ腫、膀胱癌、腎臓癌、尿道癌、腎細胞癌、腎盂癌、ＣＮＳ腫瘍、神経膠腫、星状細胞腫、多形性膠芽腫、原発性ＣＮＳリンパ腫、骨髄腫、脳幹神経膠腫、下垂体腺腫、ぶどう膜黒色腫、精巣癌、口腔癌、咽頭癌、小児腫瘍、白血病、神経芽細胞腫、網膜芽細胞腫、神経膠腫、横紋筋肉腫および肉腫からなる群より選択される、請求項２〜４のいずれか１項に記載の方法。
【請求項６】
前記発癌タンパク質は、ＥＧＦＲｖＩＩＩ、ＥＧＦＲ、ＨＥＲ−２、ＨＥＲ−３およびＨＥＲ−４からなる群より選択される、請求項１〜５のいずれか１項に記載の方法。
【請求項７】
前記発癌タンパク質は、ＭＥＴ、ｃＫｉｔ、ＰＤＧＦＲ、Ｗｎｔ、βカテニン、Ｋ−ｒａｓ、Ｈ−ｒａｓ、Ｎ−ｒａｓ、Ｒａｆ、Ｎ−ｍｙｃ、ｃ−ｍｙｃ、ＩＧＦＲ、ＰＩ３Ｋ、Ａｋｔ、ＢＲＣＡ１、ＢＲＣＡ２、ＰＴＥＮ、ならびにＶＥＧＦＲ−２、ＶＥＧＦＲ−１、Ｔｉｅ−２、ＴＥＭ−１およびＣＤ２７６からなる群より選択される癌関連細胞の受容体からなる群より選択される、請求項１〜５のいずれか１項に記載の方法。
【請求項８】
前記発癌または受容体タンパク質のリン酸化状態を測定する工程をさらに含む、請求項１〜７のいずれか１項に記載の方法。
【請求項９】
前記第１の試料から得た前記微小胞における前記発癌タンパク質の量と比較した前記第２の試料から得た前記微小胞における前記発癌タンパク質の量の増加は、前記癌が増殖を進行しているか、または継続していることを示す、請求項３〜８のいずれか１項に記載の方法。
【請求項１０】
前記第１の試料から得た前記微小胞における前記発癌タンパク質の量と比較した前記第２の試料から得た前記微小胞における前記発癌タンパク質の量の減少は、前記癌が退行していることを示す、請求項３〜８のいずれか１項に記載の方法。
【請求項１１】
前記第１の試料から得た前記微小胞における前記発癌タンパク質の量と比較して前記第２の試料から得た前記微小胞における前記発癌タンパク質の量の変化がないことは、前記癌が進行していないことを示す、請求項３〜８のいずれか１項に記載の方法。
【請求項１２】
前記被験体は抗癌治療を受けている、請求項１〜１１のいずれか１項に記載の方法。
【請求項１３】
前記第１の時点は前記被験体が抗癌治療を受ける前に生じ、前記第２の時点は前記被験体が前記抗癌治療を受けた後に生じる、請求項３、４及び９〜１１のいずれか１項に記載の方法。
【請求項１４】
前記試料は体液である、請求項１〜１３のいずれか１項に記載の方法。
【請求項１５】
前記体液は、血液、リンパ液、尿、脳脊髄液、腹水、唾液、洗浄液、精液、腺分泌物、滲出液、嚢胞および糞便の内容物からなる群より選択される、請求項１４に記載の方法。
【請求項１６】
少なくとも２つの発癌タンパク質は、前記微小胞において検出される、請求項１〜１５のいずれか１項に記載の方法。
【請求項１７】
前記微小胞は、超遠心分離法、免疫沈降または精密濾過法によって単離される、請求項１〜１６のいずれか１項に記載の方法。
【請求項１８】
前記微小胞における前記発癌タンパク質の存在は、免疫ブロット法、免疫沈降、ＥＬＩＳＡ、ＲＩＡ、フローサイトメトリー、電子顕微鏡法または質量分析法によって検出または測定される、請求項１〜１７のいずれか１項に記載の方法。
【請求項１９】
前記微小胞は、アネキシンＶでコーティングしたウェルを用いるＥＬＩＳＡによって検出または測定される、請求項１〜１７のいずれか１項に記載の方法。
【請求項２０】
前記抗癌治療は、外科手術、放射線治療、化学療法、標的癌治療、またはそれらの組み合わせである、請求項１２に記載の方法。
【請求項２１】
前記標的癌治療は、低分子、モノクローナル抗体、癌ワクチン、アンチセンス、ｓｉＲＮＡ、アプタマー、遺伝子治療およびそれらの組み合わせからなる群より選択される、請求項２０に記載の方法。
【請求項２２】
被験体の試料中の癌の予後を診断または決定するための少なくとも１つの抗体の使用であって、前記少なくとも１つの抗体は、微小胞に存在する発癌タンパク質に結合する、使用。
【請求項２３】
前記癌は、乳癌、神経膠腫、大腸癌、肺癌、小細胞肺癌、胃癌、肝臓癌、血液癌、骨肉腫、膵臓癌、皮膚癌、頭部癌もしくは頸部癌、皮膚黒色腫もしくは眼球内黒色腫、子宮肉腫、卵巣癌、直腸癌もしくは結腸直腸癌、肛門癌、結腸癌、卵管癌、子宮内膜癌、子宮頸癌、外陰癌、扁平上皮癌、膣癌、ホジキン病、非ホジキンリンパ腫、食道癌、小腸癌、内分泌癌、甲状腺癌、副甲状腺癌、副腎癌、軟部組織腫瘍、尿道癌、陰茎癌、前立腺癌、慢性白血病もしくは急性白血病、リンパ球性リンパ腫、膀胱癌、腎臓癌、尿道癌、腎細胞癌、腎盂癌、ＣＮＳ腫瘍、神経膠腫、星状細胞腫、多形性膠芽腫、原発性ＣＮＳリンパ腫、骨髄腫、脳幹神経膠腫、下垂体腺腫、ぶどう膜黒色腫、精巣癌、口腔癌、咽頭癌、小児腫瘍、白血病、神経芽細胞腫、網膜芽細胞腫、神経膠腫、横紋筋肉腫および肉腫からなる群より選択される、請求項２２に記載の使用。
【請求項２４】
前記発癌タンパク質は、ＥＧＦＲｖＩＩＩ、ＥＧＦＲ、ＨＥＲ−２、ＨＥＲ−３およびＨＥＲ−４からなる群より選択される、請求項２２または２３に記載の使用。
【請求項２５】
前記発癌タンパク質は、ＭＥＴ、ｃＫｉｔ、ＰＤＧＦＲ、Ｗｎｔ、βカテニン、Ｋ−ｒａｓ、Ｈ−ｒａｓ、Ｎ−ｒａｓ、Ｒａｆ、Ｎ−ｍｙｃ、ｃ−ｍｙｃ、ＩＧＦＲ、ＰＩ３Ｋ、Ａｋｔ、ＢＲＣＡ１、ＢＲＣＡ２、ＰＴＥＮ、ならびにＶＥＧＦＲ−２、ＶＥＧＦＲ−１、Ｔｉｅ−２、ＴＥＭ−１およびＣＤ２７６からなる群より選択される癌関連細胞の受容体からなる群より選択される、請求項２２または２３に記載の使用。
【請求項２６】
前記試料は体液である、請求項２２〜２５のいずれか１項に記載の使用。
【請求項２７】
前記体液は、血液、尿、脳脊髄液、腹水、唾液、洗浄液、精液、腺分泌物、滲出液、および糞便からなる群より選択される、請求項２６に記載の使用。
【請求項２８】
前記少なくとも１つの抗体は、リン酸化型特異的抗体である、請求項２２〜２７のいずれか１項に記載の使用。