【手続補正書】
【提出日】平成29年5月9日(2017.5.9)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
ラビリンチュラ類微生物を珪藻と共に培地中で培養することを含む、ラビリンチュラ類微生物の培養方法。
【請求項２】
ラビリンチュラ類微生物が、アプラノキトリウム属、オブロンギキトリウム属、シゾチトリウム属、トラウストキトリウム属、オーランチオキトリウム属、unidentified thraustochytrid 1 (UT1)、unidentified thraustochytrid 2a (UT2a)、及びunidentified thraustochytrid 3c (UT3c)からなる群から選択される属の微生物である、請求項１に記載の方法。
【請求項３】
ラビリンチュラ類微生物が、受託番号ＦＥＲＭ  Ｐ−２２３１３で表されるアプラノキトリウム属微生物、および受託番号ＦＥＲＭ  Ｐ−２２３１４で表されるアプラノキトリウム属微生物からなる群から選択される少なくとも１種の微生物またはその変異体を含む、請求項１または２に記載の方法。
【請求項４】
珪藻が、スケレトネマ科の珪藻である、請求項１〜３のいずれか１項に記載の方法。
【請求項５】
培地が、ビタミン類以外の有機物を含有しない培地である、請求項１〜４のいずれか１項に記載の方法。
【請求項６】
培養が開放系で行われる、請求項１〜５のいずれか１項に記載の方法。
【請求項７】
請求項１〜６のいずれか１項に記載の方法を行うことにより、ラビリンチュラ類微生物に目的化合物を産生させた後、目的化合物を回収することを含む、目的化合物の製造方法。
【請求項８】
目的化合物が、ドコサヘキサエン酸、エイコペンタエン酸、及びドコサペンタエン酸からなる群から選択されるものである、請求項７に記載の方法。
【請求項９】
請求項１〜６のいずれか１項に記載の方法により培養物を得ることを含む、培養物の製造方法。
【請求項１０】
培養物がドコサヘキサエン酸及びエイコペンタエン酸を含む、請求項９に記載の方法。
【請求項１１】
受託番号ＦＥＲＭ  Ｐ−２２３１３で表されるアプラノキトリウム属微生物、および受託番号ＦＥＲＭ  Ｐ−２２３１４で表されるアプラノキトリウム属微生物からなる群から選択される微生物またはその変異体。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０００８
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０００８】
本発明は即ち、以下の通りである。
［１］ラビリンチュラ類微生物を珪藻と共に培地中で培養することを含む、ラビリンチュラ類微生物の培養方法。
［２］ラビリンチュラ類微生物が、アプラノキトリウム属、オブロンギキトリウム属、シゾチトリウム属、トラウストキトリウム属、オーランチオキトリウム属、unidentified thraustochytrid 1 (UT1)、unidentified thraustochytrid 2a (UT2a)、及びunidentified thraustochytrid 3c (UT3c)からなる群から選択される属の微生物である、上記［１］に記載の方法。
［３］ラビリンチュラ類微生物が、受託番号ＦＥＲＭ  Ｐ−２２３１３で表されるアプラノキトリウム属微生物、および受託番号ＦＥＲＭ  Ｐ−２２３１４で表されるアプラノキトリウム属微生物からなる群から選択される少なくとも１種の微生物またはその変異体を含む、上記［１］または［２］に記載の方法。
［４］珪藻が、スケレトネマ科の珪藻である、上記［１］〜［３］のいずれかに記載の方法。
［５］培地が、ビタミン類以外の有機物を含有しない培地である、上記［１］〜［４］のいずれかに記載の方法。
［６］培養が開放系で行われる、上記［１］〜［５］のいずれかに記載の方法。
［７］上記［１］〜［６］のいずれかに記載の方法を行うことにより、ラビリンチュラ類微生物に目的化合物を産生させた後、目的化合物を回収することを含む、目的化合物の製造方法。
［８］目的化合物が、ドコサヘキサエン酸、エイコペンタエン酸、及びドコサペンタエン酸からなる群から選択されるものである、上記［７］に記載の方法。
［９］上記［１］〜［６］のいずれかに記載の方法により培養物を得ることを含む、培養物の製造方法。
［１０］培養物がドコサヘキサエン酸及びエイコペンタエン酸を含む、上記［９］に記載の方法。
［１１］受託番号ＦＥＲＭ  Ｐ−２２３１３で表されるアプラノキトリウム属微生物、および受託番号ＦＥＲＭ  Ｐ−２２３１４で表されるアプラノキトリウム属微生物からなる群から選択される微生物またはその変異体。
【手続補正３】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００１３
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００１３】
本発明の培養方法において使用し得る具体的なラビリンチュラ株としては、例えば以下の寄託された株が挙げられるが、これらに限定されるものではない：Labyrinthula sp. AN-1565、Labyrinthula sp. N8、Labyrinthula sp. N12、Labyrinthula sp. L59、Labyrinthula sp. L72、Aplanochytrium kerguelense KMPB N-BA-107、Aplanochytrium sp. PR24-1、Aplanochytrium sp. SEK602、Aplanochytrium sp. SEK717、Aurantiochytrium immobile N1-27、Aurantiochytrium immobile 08-047-01yD1 (SEK605)、Aurantiochytrium limacinum IFO 32693、Aurantiochytrium mangrovei RCC 893、Aurantiochytrium sp. KH105、Aurantiochytrium sp. BURABG162、Aurantiochytrium sp. NBRC 103268、Aurantiochytrium sp. NBRC 103269、Aurantiochytrium sp. NBRC 102990、Aurantiochytrium sp. NBRC 102614、Aurantiochytrium sp. N1-27、Oblongichytrium multirudimentale KMPB N-BA-107、Oblongichytrium minutum KMPB N-BA-77、Oblongichytrium sp. NBRC 102618、Oblongichytrium sp. 1b 1110-15S-01m (SEK710)、Schizochytrium aggregatum ATCC 28209、Schizochytrium sp. NBRC 102617、Schizochytrium sp. NBRC 102615、Schizochytrium sp. NBRC 102616、Schizochytrium sp. KK17-3、Thraustochytrium kinnei KMPB 1694d、Thraustochytrium kinnei 261-01m (SEK618)、Thraustochytrium aureum ATCC 34304、Thraustochytrium striatum ATCC 24473、Thraustochytrium aggregatum KMPB N-BA-110、Thraustochytrium pachydermum KMPB N-BA-114、Thraustochytrium sp. C9G、Sicyoidochytrium minutum SEK 354、Sicyoidochytrium minutum NBRC 102979、Sicyoidochytrium minutum NBRC 102975、Ulkenia amoeboidea NBRC 104106、Ulkenia visurgensis BURAAA 141、Ulkenia visurgensis ATCC 28208、Ulkenia profunda KMPB N 3077、Ulkenia profunda BUTRBG 111、Parietichytrium sarkarianum NBRC 104108、Parietichytrium sarkarianum SEK 364、Parietichytrium sp. NBRC 102964、Parietichytrium sp. F3-1、Botryochytrium radiatum #16、Botryochytrium radiatum NBRC 104107、Botryochytrium sp. BUTRBC 143、Botryochytrium sp. #29、unidentified thraustochytrium 1 155-02m (SEK691)、unidentified thraustochytrium 2a 310-08m (SEK694)、unidentified thraustochytrium 3c 1107-15S-04m (SEK702)。上記のAplanochytrium sp. SEK602、およびAplanochytrium sp. SEK717は、本発明者らが見出したアプラノキトリウム属の新規株であり、それぞれ受託番号ＦＥＲＭ  Ｐ−２２３１３（寄託日：２０１６年９月２日）および受託番号ＦＥＲＭ  Ｐ−２２３１４（寄託日：２０１６年９月２日）として、千葉県木更津市かずさ鎌足２−５−８、独立行政法人製品評価技術基盤機構特許生物寄託センター（ＩＰＯＤ）に寄託されている。
【手続補正４】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００３２
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００３２】
（微生物）
本発明はまた、本発明の培養方法のために有用な新規のラビリンチュラ類微生物（以下、本発明の微生物ともいう。）を提供する。該微生物は、本明細書においてAplanochytrium sp. SEK602およびAplanochytrium sp. SEK717と呼称されるアプラノキトリウム属微生物であり、これらはそれぞれ受託番号ＦＥＲＭ  Ｐ−２２３１３（寄託日：２０１６年９月２日）および受託番号ＦＥＲＭ  Ｐ−２２３１４（寄託日：２０１６年９月２日）として、千葉県木更津市かずさ鎌足２−５−８、独立行政法人製品評価技術基盤機構特許生物寄託センター（ＩＰＯＤ）に寄託されている。
【手続補正５】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００５２
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００５２】
なお、表３に記載のAplanochytrium sp.の株であるSEK602、SEK717、1209-15S-01m、および1209-15B-01mはいずれも、本発明者らにより見出された新規株である。SEK602株およびSEK717株は、それぞれ受託番号ＦＥＲＭ  Ｐ−２２３１３（寄託日：２０１６年９月２日）および受託番号ＦＥＲＭ  Ｐ−２２３１４（寄託日：２０１６年９月２日）として、千葉県木更津市かずさ鎌足２−５−８、独立行政法人製品評価技術基盤機構特許生物寄託センター（ＩＰＯＤ）に寄託されている。