【手続補正書】
【提出日】平成28年12月7日(2016.12.7)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
創薬ターゲットに対して複数の化合物の中からリード化合物を抽出する方法であって、
複数の化合物に対して、化合物の複数の特性にしたがい化合物を示すシンボルを配置して散布図を作成するステップと、
散布図上の所定領域内に配置されたシンボルが示す化合物の中からリード化合物を抽出するステップと、を含み、
前記散布図において、化合物の第１及び第２の特性に基づきシンボルの配置位置が決定され、化合物の第３及び第４の特性に基づきシンボルの属性が決定された、
リード化合物の抽出方法。
【請求項２】
シンボルの属性は、シンボルに関する、色、形状、大きさ及び前記第１及び第２の特性に基づきシンボルが配置される平面に垂直な方向の位置を示す３次元座標のうちの少なくとも２つを含む、請求項１に記載のリード化合物の抽出方法。
【請求項３】
前記第１の特性は、所定の創薬ターゲットに対する化合物の選択性であり、前記第２の特性は、所定の創薬ターゲットに対する化合物の活性であり、前記第３の特性は化合物の分子量であり、前記第４の特性は化合物のリガンド効率である、
請求項１に記載のリード化合物の抽出方法。
【請求項４】
前記所定領域は、化合物の選択性及び化合物の活性の双方が所定値以上となる領域である、請求項３に記載のリード化合物の抽出方法。
【請求項５】
前記所定領域に配置されたシンボルが示す化合物のうちリガンド効率が0.3以上である化合物を抽出する、請求項４に記載のリード化合物の抽出方法。
【請求項６】
前記創薬ターゲットは、酵素、受容体または輸送体タンパク質である、請求項１ないし５のいずれかに記載のリード化合物の抽出方法。
【請求項７】
創薬ターゲットに対して複数の化合物の中からリード化合物を抽出する方法であって、
複数の化合物に対して、化合物の複数の特性にしたがい化合物を示すシンボルを配置して散布図を作成するステップと、
散布図上の所定領域内に配置されたシンボルが示す化合物の中からリード化合物を抽出するステップと、を含み、
前記散布図において、化合物の第１及び第２の特性に基づきシンボルの配置位置が決定され、
前記第１の特性は、所定の創薬ターゲットに対する化合物の選択性であり、前記第２の特性は、所定の創薬ターゲットに対する化合物の活性であり、
前記所定領域は、化合物の選択性及び化合物の活性の双方が所定値以上となる領域であり、
前記所定領域に配置されたシンボルが示す化合物のうちリガンド効率が0.3以上である化合物を抽出する、リード化合物の抽出方法。
【請求項８】
創薬ターゲットの選択方法であって、
所定の分子ターゲットについて、複数の化合物に対して、化合物の複数の特性にしたがい化合物を示すシンボルを配置して散布図を作成するステップと、
散布図上に配置されたシンボルの分布に基づいて、前記所定の分子ターゲットを創薬ターゲットとして選択するステップと、を含み、
前記散布図において、化合物の第１及び第２の特性に基づきシンボルの配置位置が決定され、化合物の第３及び第４の特性に基づきシンボルの属性が決定され、
化合物は、第３の特性に関して所定の条件で複数のグループに分類されており、
前記選択するステップは、各グループに属する化合物のシンボルの分布の変化の方向及び変化の終点に基づいて、前記所定の分子ターゲットを創薬ターゲットとして選択するか否かを決定する、
創薬ターゲットの選択方法。
【請求項９】
前記シンボルの属性は、シンボルに関する、色、形状、大きさ及び前記第１及び第２の特性に基づきシンボルが配置される平面に垂直な方向の位置を示す３次元座標のうちの少なくとも２つを含む、請求項８記載の創薬ターゲットの選択方法。
【請求項１０】
前記第１の特性は、所定の分子ターゲットに対する化合物の選択性であり、前記第２の特性は、所定の分子ターゲットに対する化合物の活性であり、前記第３の特性は化合物の分子量であり、前記第４の特性は化合物のリガンド効率である、
請求項８に記載の創薬ターゲットの選択方法。
【請求項１１】
前記複数の化合物が分子量に基づき複数のグループに分類され、
各グループに属する化合物のシンボルの分布の重心を結ぶ矢印が前記散布図上に配置された、請求項１０に記載の創薬ターゲットの選択方法。
【請求項１２】
各グループに属する化合物のシンボルの分布の重心を結ぶ矢印が、散布図上の所定領域に向かう場合に、当該分子ターゲットを創薬ターゲットとして選択する、請求項１１に記載の創薬ターゲットの選択方法。
【請求項１３】
散布図上の変化の終点となる分布についてその分布の重心の位置が、選択性が所定値以上となりかつ活性が所定値以上となる領域に含まれる場合に、当該分子ターゲットを創薬ターゲットとして選択する、請求項１２記載の創薬ターゲットの選択方法。
【請求項１４】
前記創薬ターゲットおよび／または分子ターゲットは、酵素、受容体または輸送体タンパク質である、請求項８ないし１３のいずれかに記載の創薬ターゲットの選択方法。
【請求項１５】
所定の創薬ターゲットに対する複数の化合物の特性を示す散布図を生成する散布図生成装置であって、
複数の化合物について、化合物の種々の特性に関する特性情報を取得する取得手段と、
複数の化合物について、取得した特性情報にしたがい各化合物を示すシンボルを配置して散布図を生成して出力する散布図作成手段と、
を備え、
散布図作成手段は、化合物毎に、化合物の第１及び第２の特性に基づき散布図上のシンボルの配置位置を決定し、化合物の第３及び第４の特性に基づきシンボルの属性を決定して、決定した位置及び属性に基づき化合物を示すシンボルを散布図上に配置する、
散布図生成装置。
【請求項１６】
前記シンボルの属性は、前記シンボルに関する、色、形状、大きさ及び前記第１及び第２の特性に基づきシンボルが配置される平面に垂直な方向の位置を示す３次元座標のうちの少なくとも２つを含む、請求項１５記載の散布図生成装置。
【請求項１７】
前記第１の特性は、所定の創薬ターゲットに対する化合物の選択性であり、前記第２の特性は、所定の創薬ターゲットに対する化合物の活性であり、前記第３の特性は化合物の分子量であり、前記第４の特性は化合物のリガンド効率である、
請求項１５に記載の散布図生成装置。
【請求項１８】
前記散布図作成手段は、化合物の選択性が所定値以上で、かつ、化合物の活性が所定値以上となる領域を示す情報を散布図上に配置する、請求項１７に記載の散布図生成装置。
【請求項１９】
前記領域内にシンボルが配置された化合物の中の少なくとも１つをリード化合物として抽出する抽出手段をさらに備えた、請求項１８に記載の散布図生成装置。
【請求項２０】
前記散布図作成手段は、複数の化合物を分子量に基づき複数のグループに分類し、各グループに属する化合物のシンボルの分布の重心を結ぶ矢印を前記散布図上に配置する、請求項１７に記載の散布図生成装置。
【請求項２１】
前記創薬ターゲットは、酵素、受容体または輸送体タンパク質である、請求項１５ないし２０のいずれかに記載の散布図生成装置。
【請求項２２】
コンピュータに、所定の創薬ターゲットに対する複数の化合物の特性を示す散布図を生成させるプログラムであって、
コンピュータを、
複数の化合物について、化合物の種々の特性に関する特性情報を取得する取得手段、及び
複数の化合物について、取得した特性情報にしたがい各化合物を示すシンボルを配置して散布図を生成する散布図作成手段として動作させ、
前記散布図作成手段は、化合物毎に、化合物の第１及び第２の特性に基づき散布図上のシンボルの配置位置を決定し、化合物の第３及び第４の特性に基づき、シンボルの属性を決定し、
決定した配置位置及び属性に基づき化合物を示すシンボルを散布図上に配置する、
プログラム。
【請求項２３】
少なくとも第１ないし第４の特性を有する複数のデータの傾向を二次元平面上にデータをプロットした散布図により可視化する方法であって、
第１及び第２の特性に基づき、各データを示すシンボルを配置する位置を決定し、
第３及び第４の特性に基づき、各データを示すシンボルの属性を決定し、
決定した位置及び属性に基づいて、各データを示すシンボルを散布図上に配置する、
可視化方法。
【請求項２４】
第３の特性に関して所定の条件でデータが分類されており、
分類された複数のグループに属するデータのシンボルの分布の重心を結ぶ矢印が前記散布図上に配置された、請求項２３に記載の可視化方法。
【請求項２５】
少なくとも第１ないし第３の特性を有する複数のデータの傾向を可視化する方法であって、
第１及び第２の特性に基づき、各データを示すシンボルを配置する位置を決定し、
決定した位置に基づいて、各データを示すシンボルを散布図上に配置し、
第３の特性に関して所定の条件でデータを複数のグループに分類し、分類した複数のグループに属するデータのシンボルの分布の重心を結ぶ矢印を前記散布図上に配置する、
可視化方法。
【請求項２６】
少なくとも第１ないし第４の特性を有するデータの傾向を二次元平面上にデータをプロットした散布図により可視化する装置であって、
複数のデータについて、データ毎の特性に関する特性情報を取得する取得手段と、
取得したデータの特性情報に基づいて散布図を生成する散布図生成手段と、
を備え、
散布図生成手段は、第１及び第２の特性に基づき、各データを示すシンボルを配置する位置を決定し、第３及び第４の特性に基づき、各データを示すシンボルの属性を決定し、決定した位置及び属性に基づき各データを示すシンボルを散布図上に配置する、
可視化装置。
【請求項２７】
シンボルの属性は、シンボルに関する、色、形状、大きさのうちの少なくとも２つを含む、請求項２３ないし２５のいずれかに記載の可視化方法。
【請求項２８】
シンボルの属性は、シンボルに関する、色、形状、大きさのうちの少なくとも２つを含む、請求項２６に記載の可視化装置。