(57)【要約】  本明細書中に記載されるのは、エボラウイルス感染の予防および処置用の組成物および方法である。本発明の特定の実施形態において、本明細書中に記載されるものと実質的に類似のモノクローナル抗体、およびその親和性成熟変異体は、単独で、または組み合わせて、患者においてエボラウイルスの複数種に対して治療効力をもたらす。【特許請求の範囲】
【請求項１】
エボラの処置用の組成物であって：
ｉ．配列番号１２と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域、およびその親和性成熟変異体；ならびに配列番号１４と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域、およびその親和性成熟変異体を含む第１のモノクローナル抗体または抗原結合フラグメント；ならびに
ｉｉ．薬学的に許容される賦形剤またはキャリア
の治療的に有効な組合せを含む組成物。
【請求項２】
前記第１のモノクローナル抗体は、フリボウイルス糖タンパク質の少なくとも２種に結合する、請求項１に記載の組成物。
【請求項３】
前記第１のモノクローナル抗体または抗原結合フラグメントは、主に単一のグリコフォームを含む、請求項１に記載の組成物。
【請求項４】
前記主に単一のグリコフォームは、ＧｎＧｎ、Ｇ１／Ｇ２、およびＮａＮａのうちの１つである、請求項３に記載の組成物。
【請求項５】
前記主に単一のグリコフォームは実質的に、フコースおよびキシロースの少なくとも１つを欠いている、請求項３に記載の組成物。
【請求項６】
エボラの処置用の組成物であって：
ｉｉ．
ａ．配列番号１５と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域、およびその親和性成熟変異体；ならびに配列番号１８と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域、およびその親和性成熟変異体を含むモノクローナル抗体または抗原結合フラグメント；
ｂ．配列番号２１と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域、およびその親和性成熟変異体；ならびに配列番号２３と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域、およびその親和性成熟変異体を含むモノクローナル抗体または抗原結合フラグメント；
ｃ．配列番号２９と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域、およびその親和性成熟変異体；ならびに配列番号３１と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域、およびその親和性成熟変異体を含むモノクローナル抗体または抗原結合フラグメント；
ｄ．配列番号３３と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域、およびその親和性成熟変異体；ならびに配列番号３５と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域、およびその親和性成熟変異体を含むモノクローナル抗体または抗原結合フラグメント；
ｅ．配列番号１１と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域、およびその親和性成熟変異体；ならびに配列番号１３と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域、およびその親和性成熟変異体を含むモノクローナル抗体または抗原結合フラグメント
からなるリストから選択される第１のモノクローナル抗体または抗原結合フラグメント；ならびに
ｉｉｉ．薬学的に許容される賦形剤またはキャリア
の治療的に有効な組合せを含み；
ｉｖ．前記第１のモノクローナル抗体または抗原結合フラグメントは、フリボウイルス糖タンパク質の少なくとも２種に結合する、組成物。
【請求項７】
前記第１のモノクローナル抗体または抗原結合フラグメントは、主に単一のグリコフォームを含む、請求項６に記載の組成物。
【請求項８】
前記主に単一のグリコフォームは、ＧｎＧｎ、Ｇ１／Ｇ２、およびＮａＮａのうちの１つである、請求項７に記載の組成物。
【請求項９】
前記主に単一のグリコフォームは実質的に、フコースおよびキシロースの少なくとも１つを欠いている、請求項７に記載の組成物。
【請求項１０】
エボラの処置用の組成物であって：
ｉｉ．
ａ．配列番号１２と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域、およびその親和性成熟変異体；ならびに配列番号１４と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域、およびその親和性成熟変異体を含むモノクローナル抗体または抗原結合フラグメント；
ｇ．配列番号１５と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域、およびその親和性成熟変異体；ならびに配列番号１８と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域、およびその親和性成熟変異体を含むモノクローナル抗体または抗原結合フラグメント；
ｈ．配列番号２１と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域、およびその親和性成熟変異体；ならびに配列番号２３と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域、およびその親和性成熟変異体を含むモノクローナル抗体または抗原結合フラグメント；
ｉ．配列番号２９と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域、およびその親和性成熟変異体；ならびに配列番号３１と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域、およびその親和性成熟変異体を含むモノクローナル抗体または抗原結合フラグメント；
ｊ．配列番号３３と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域、およびその親和性成熟変異体；ならびに配列番号３５と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域、およびその親和性成熟変異体を含むモノクローナル抗体または抗原結合フラグメント；
ｋ．配列番号１１と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域、およびその親和性成熟変異体；ならびに配列番号１３と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域、およびその親和性成熟変異体を含むモノクローナル抗体または抗原結合フラグメント
からなるリストから選択される第１のモノクローナル抗体または抗原結合フラグメント；
ｉｉｉ．第２のモノクローナル抗体または抗原結合フラグメントであって、エボラ糖タンパク質に結合する第２のモノクローナル抗体または抗原結合フラグメント；ならびに
ｉｖ．薬学的に許容される賦形剤またはキャリア
の治療的に有効な組合せを含む、組成物。
【請求項１１】
前記第１のモノクローナル抗体または抗原結合フラグメントおよび前記第２の抗体または抗原結合フラグメントの少なくとも１つが、主に単一のグリコフォームを含む、請求項１０に記載の組成物。
【請求項１２】
前記主に単一のグリコフォームは、ＧｎＧｎ、Ｇ１／Ｇ２、およびＮａＮａのうちの１つである、請求項１１に記載の組成物。
【請求項１３】
前記主に単一のグリコフォームは実質的に、フコースおよびキシロースの少なくとも１つを欠いている、請求項１１に記載の組成物。
【請求項１４】
前記治療的に有効な組合せはさらに、エボラ糖タンパク質に結合する第３のモノクローナル抗体または抗原結合フラグメントを含む、請求項１０に記載の組成物。
【請求項１５】
前記第１のモノクローナル抗体または抗原結合フラグメントは、配列番号１２と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域、およびその親和性成熟変異体；ならびに配列番号１４と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域、およびその親和性成熟変異体を含み；前記第２のモノクローナル抗体または抗原結合フラグメントは、配列番号１５と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域、およびその親和性成熟変異体；ならびに配列番号１８と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域、およびその親和性成熟変異体を含む、請求項１０に記載の組成物。
【請求項１６】
前記治療的に有効な組合せはさらに、第３のモノクローナル抗体または抗原結合フラグメントを含み、前記第３の抗体または抗原結合フラグメントは、配列番号２１と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域、およびその親和性成熟変異体；ならびに配列番号２３と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域、およびその親和性成熟変異体を含む、請求項１５に記載の組成物。
【請求項１７】
患者におけるエボラ感染症の複数の種を処置する方法であって：
ｉ．エボラ処置を必要とする患者を同定することと；
ｉｉ．前記患者に、
ａ．第１のモノクローナル抗体または抗原結合フラグメントであって：
ｉ．配列番号１２と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域、およびその親和性成熟変異体；ならびに配列番号１４と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域、およびその親和性成熟変異体を含むモノクローナル抗体または抗原結合フラグメント；
ｉｉ．配列番号１５と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域、およびその親和性成熟変異体；ならびに配列番号１８と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域、およびその親和性成熟変異体を含むモノクローナル抗体または抗原結合フラグメント；
ｉｉｉ．配列番号２１と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域、およびその親和性成熟変異体；ならびに配列番号２３と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域、およびその親和性成熟変異体を含むモノクローナル抗体または抗原結合フラグメント；
ｉｖ．配列番号２９と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域、およびその親和性成熟変異体；ならびに配列番号３１と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域、およびその親和性成熟変異体を含むモノクローナル抗体または抗原結合フラグメント；
ｖ．配列番号３３と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域、およびその親和性成熟変異体；ならびに配列番号３５と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域、およびその親和性成熟変異体を含むモノクローナル抗体または抗原結合フラグメント；
ｖｉ．配列番号１１と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域、およびその親和性成熟変異体；ならびに配列番号１３と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域、およびその親和性成熟変異体を含むモノクローナル抗体または抗原結合フラグメント
からなるリストから選択される第１のモノクローナル抗体または抗原結合フラグメント；ならびに
ｂ．薬学的に許容される賦形剤またはキャリア
の組合せを含む治療有効量の組成物を投与することと
を含む方法。
【請求項１８】
前記患者は哺乳類である、請求項１７に記載の方法。
【請求項１９】
前記第１のモノクローナル抗体または抗原結合フラグメントは、主に単一のグリコフォームを含む、請求項１７に記載の方法。
【請求項２０】
前記主に単一のグリコフォームは実質的に、フコースおよびキシロースの少なくとも１つを欠いている、請求項１９に記載の方法。
【請求項２１】
エボラの処置用の組成物であって：
ｉｉ．
ａ．配列番号５３に記載のアミノ酸配列を含むＣＤＲ１、配列番号５４に記載のアミノ酸配列を含むＣＤＲ２、および配列番号５５に記載のアミノ酸配列を含むＣＤＲ３を含む重鎖可変領域と少なくとも９０％同一の重鎖可変領域、ならびにその親和性成熟変異体；ならびに配列番号５６に記載のアミノ酸配列を含むＣＤＲ１、配列番号５７に記載のアミノ酸配列を含むＣＤＲ２、および配列番号５８に記載のアミノ酸配列を含むＣＤＲ３を含む軽鎖可変領域と少なくとも９０％同一の軽鎖可変領域、ならびにその親和性成熟変異体を含むモノクローナル抗体または抗原結合フラグメント；
ｂ．配列番号４１に記載のアミノ酸配列を含むＣＤＲ１、配列番号４２に記載のアミノ酸配列を含むＣＤＲ２、および配列番号４３に記載のアミノ酸配列を含むＣＤＲ３を含む重鎖可変領域と少なくとも９０％同一の重鎖可変領域、ならびにその親和性成熟変異体；ならびに配列番号４４に記載のアミノ酸配列を含むＣＤＲ１、配列番号４５に記載のアミノ酸配列を含むＣＤＲ２、および配列番号４６に記載のアミノ酸配列を含むＣＤＲ３を含む軽鎖可変領域と少なくとも９０％同一の軽鎖可変領域、ならびにその親和性成熟変異体を含むモノクローナル抗体または抗原結合フラグメント；
ｃ．配列番号４７に記載のアミノ酸配列を含むＣＤＲ１、配列番号４８に記載のアミノ酸配列を含むＣＤＲ２、および配列番号４９に記載のアミノ酸配列を含むＣＤＲ３を含む重鎖可変領域と少なくとも９０％同一の重鎖可変領域、ならびにその親和性成熟変異体；ならびに配列番号５０に記載のアミノ酸配列を含むＣＤＲ１、配列番号５１に記載のアミノ酸配列を含むＣＤＲ２、および配列番号５２に記載のアミノ酸配列を含むＣＤＲ３を含む軽鎖可変領域と少なくとも９０％同一の軽鎖可変領域、ならびにその親和性成熟変異体を含むモノクローナル抗体または抗原結合フラグメント；
ｄ．配列番号５９に記載のアミノ酸配列を含むＣＤＲ１、配列番号６０に記載のアミノ酸配列を含むＣＤＲ２、および配列番号６１に記載のアミノ酸配列を含むＣＤＲ３を含む重鎖可変領域と少なくとも９０％同一の重鎖可変領域、ならびにその親和性成熟変異体；ならびに配列番号６２に記載のアミノ酸配列を含むＣＤＲ１、配列番号６３に記載のアミノ酸配列を含むＣＤＲ２、および配列番号６４に記載のアミノ酸配列を含むＣＤＲ３を含む軽鎖可変領域と少なくとも９０％同一の軽鎖可変領域、ならびにその親和性成熟変異体を含むモノクローナル抗体または抗原結合フラグメント；
ｅ．配列番号６５に記載のアミノ酸配列を含むＣＤＲ１、配列番号６６に記載のアミノ酸配列を含むＣＤＲ２、および配列番号６７に記載のアミノ酸配列を含むＣＤＲ３を含む重鎖可変領域と少なくとも９０％同一の重鎖可変領域、ならびにその親和性成熟変異体；ならびに配列番号６８に記載のアミノ酸配列を含むＣＤＲ１、配列番号６９に記載のアミノ酸配列を含むＣＤＲ２、および配列番号７０に記載のアミノ酸配列を含むＣＤＲ３を含む軽鎖可変領域と少なくとも９０％同一の軽鎖可変領域、ならびにその親和性成熟変異体を含むモノクローナル抗体または抗原結合フラグメント；
ｆ．配列番号７１に記載のアミノ酸配列を含むＣＤＲ１、配列番号７２に記載のアミノ酸配列を含むＣＤＲ２、および配列番号７３に記載のアミノ酸配列を含むＣＤＲ３を含む重鎖可変領域と少なくとも９０％同一の重鎖可変領域、ならびにその親和性成熟変異体；ならびに配列番号７４に記載のアミノ酸配列を含むＣＤＲ１、配列番号７５に記載のアミノ酸配列を含むＣＤＲ２、および配列番号７６に記載のアミノ酸配列を含むＣＤＲ３を含む軽鎖可変領域と少なくとも９０％同一の軽鎖可変領域、ならびにその親和性成熟変異体を含むモノクローナル抗体または抗原結合フラグメント
からなるリストから選択される第１のモノクローナル抗体または抗原結合フラグメント；ならびに
ｉｉｉ．薬学的に許容される賦形剤またはキャリア
の治療的に有効な組合せ
を含む組成物。
【請求項２２】
第２のモノクローナル抗体または抗原結合フラグメントをさらに含み、前記第２のモノクローナル抗体または抗原結合フラグメントは、エボラ糖タンパク質に結合する、請求項２１に記載の組成物。
【請求項２３】
前記第１のモノクローナル抗体は、フリボウイルス糖タンパク質の少なくとも２種に結合する、請求項２１に記載の組成物。
【請求項２４】
前記第１のモノクローナル抗体または抗原結合フラグメントは、主に単一のグリコフォームを含む、請求項２１に記載の組成物。
【請求項２５】
前記主に単一のグリコフォームは、ＧｎＧｎ、Ｇ１／Ｇ２、およびＮａＮａのうちの１つである、請求項２４に記載の組成物。
【請求項２６】
前記主に単一のグリコフォームは実質的に、フコースおよびキシロースの少なくとも１つを欠いている、請求項２４に記載の組成物。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
特許協力条約（ＰＣＴ）特許出願
連邦政府による資金提供を受けた研究に関する陳述
本発明は、ＮＩＨによる認可第Ｕ１９  ＡＩ１０９７６２号、およびＤＴＲＡによる認可第ＨＤＴＲＡ−１３−Ｃ−００１８号の政府支援を受けてなされた。政府は、本発明において、一定の権利を有する。
【０００２】
先行出願の情報
本出願は、２０１７年２月１７日出願の米国仮特許出願第６２／４６０，２００号明細書、および２０１８年２月１７日出願の米国特許出願第１５／８９８，５２４号明細書の利益を主張する。
【背景技術】
【０００３】
エボラウイルスは、ヒトおよび非ヒト霊長類（ＮＨＰ）に感染するフィロウイルス（Ｆｉｌｏｖｉｒｉｄａｅ）科のメンバーであり、出血熱を引き起こし、死亡率は最大９０％である。エボラウイルスとして、エボラウイルス（ＥＢＯＶ）、スーダンウイルス（ＳＵＤＶ）、ブンディブギョウイルス（ＢＤＢＶ）、レストンウイルス（ＲＥＳＴＶ）、およびタイフォレストウイルス（ＴＡＦＶ）が挙げられ、これらは出血熱の病原体である［１、２］。エボラウイルスの概要を、Ｂｕｒｋ，ｅｔ  ａｌ．，Ｎｅｇｌｅｃｔｅｄ  Ｆｉｌｏｖｉｒｕｓｅｓ．ＦＥＭＳ  Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌｏｇｙ  Ｒｅｖｉｅｗｓ，４０，４９４−５１９（Ｍａｙ，２０１６）内に見出すことができる。そしてウイルス間の差異は、十分に特徴付けられており、かつ当該技術において周知である。１９６７年から２０１３年の間に、主に中央アフリカにおいて、３１件のフィロウイルス病のアウトブレイクが発生し、約２，０００の症例が確認された。これら３１件のアウトブレイクのうち、１６件はＥＢＯＶが原因であった。前例のない２０１３年から２０１６年のエボラウイルス病の流行により、最初の１４ヶ月で２７，０００を超える症例と、１１，１００人の死者が出た。現在、フィロウイルス用の承認された処置またはワクチンはなく、ほとんどの先進的な実験的処置は、ＥＢＯＶのみに焦点を当てている。他のフィロウイルスが大規模なアウトブレイクを引き起こしたことを考えると、広く保護的な処置オプションが緊急に必要とされる。
【０００４】
いくつかの研究により、動物への致死用量のＥＢＯＶの実験的接種後に、フィロウイルス糖タンパク質（ＧＰ）特異的中和抗体（ｎＡｂ）が死亡率を低下させ得ることが示されている［３〜９］。当該中和抗体の主要な標的であるフィロウイルス表面ＧＰは、３つの高度にグリコシル化されたＧＰ１−ＧＰ２ヘテロダイマーで構成されたトリマーである。ＧＰ１サブユニットは、さらにベース、ヘッド、グリカンキャップ、およびムチン様ドメインに分割され得る［１０］。ウイルス侵入中、ムチン様ドメインおよびグリカンキャップは、細胞膜上に存在する複数の宿主付着因子への結合を媒介する。ウイルスがマクロピノサイトーシス［１１、１２］によって宿主細胞に侵入した後、ＧＰは、宿主のプロテアーゼによって切断されて、ムチン様ドメインおよびグリカンキャップを含む、ＧＰ１サブユニットの質量の約８０％が除去される［１３、１４］。エンドソーム内でのＧＰの切断後、ＧＰ上の受容体結合部位が曝露されてから、ＧＰ１ヘッドが、その受容体であるニーマンピックＣ１（ＮＰＣ１）タンパク質に結合することができる［１３、１５、１６］。ＧＰのその後の立体構造変化により、ウイルス膜とエンドソーム膜間の融合が促進される。切断されたＧＰ種（以下、ＧＰＣＬ）によるＮＰＣ１の認識が、１つ以上の知られていない宿主シグナルと共に、ＧＰリフォールディング、およびそれに結合する膜融合反応をトリガーすると提唱されている。エンドソームＧＰ→ＧＰＣＬ切断は、ＧＰ−ＮＰＣ１結合の前提条件であるので、フィロウイルスの侵入に不可欠である。
【０００５】
グリカンキャップおよびムチン様ドメイン上のグリカンの高密度クラスタリングはおそらく、ＥＢＯＶ  ＧＰの表面の多くを、体液性免疫監視から保護して、ＥＢＯＶ  ＧＰタンパク質上に、ｎＡｂがグリカンによる干渉なしに結合し得る部位を少数しか残さない［１７］。フィロウイルス感染に対する体液性応答に関する知識のほとんどは、ＥＢＯＶ  ＧＰを認識するマウスＡｂの研究に由来してきた。当該研究から、マウス中和Ａｂは、上部の高度にグリコシル化されたドメインまたは下部の領域（ＧＰ１ベース）（ウイルス膜と宿主膜との融合を駆動する再配置が起こる場）において曝露されたペプチドを選択的に標的とすることが明らかとなっている［１８］。融合中におそらく再配置する膜近位外部領域（ｍｅｍｂｒａｎｅ  ｐｒｏｘｉｍａｌ  ｅｘｔｅｒｎａｌ  ｒｅｇｉｏｎ：ＭＰＥＲ）サブドメインのタンパク質特性を標的とするＡｂは、同定されていない。最初に報告されたヒトＥＢＯＶ  ＧＰ特異的モノクローナル抗体（ｍＡｂ）であるＫＺ５２は、生存者から得られた骨髄ＲＮＡから構築されたファージディスプレイライブラリから得られた［１９］。ＫＺ５２は、ＧＰのベースの部位に結合して、ＥＢＯＶを中和する。これはおそらく、ＧＰ→ＧＰＣＬ切断をブロックし、かつ／またはウイルス膜とエンドソーム膜との融合に必要とされる立体構造変化を阻害することによるものである［１０］。また、一部のマウスＡｂが、エボラウイルスＧＰのベース領域に結合することが報告されている［２０、２１］。
【０００６】
最も分岐したエボラウイルス種（ＥＢＯＶおよびＳＵＤＶ）は、５６％のＧＰ配列同一性を示す。フィロウイルスＧＰ間の配列同一性は、受容体結合領域（ＲＢＲ）内［２３］、そしてＧＰ２内で最も高く、共有エピトープがこれらのドメイン内に存在する可能性があることを示唆している。げっ歯類および非ヒト霊長類（ＮＨＰ）において保護効力があるＥＢＯＶ  ＧＰに対するいくつかのｍＡｂが報告されている［３、５〜９、２４、２５］。中和抗体はまた、最近開発されたげっ歯類モデルにおいて効力があったＳＵＤＶについて記載されている［２０、２６］。しかしながら、これらの抗体は、ＫＺ５２と同じエピトープに結合し、そしてＫＺ５２と同様に、ウイルス種特異的であり、交差中和特性も交差保護特性も欠いている。
【発明の概要】
【０００７】
本明細書中に記載さるのは、インビトロおよびインビボの双方でエボラウイルスを中和することができるいくつかのｍＡｂである。驚くべきことに、開示されるヒト抗体は、全エボラウイルス（ｐａｎ−ｅｂｏｌａｖｉｒｕｓ）交差反応性および交差中和活性を有するので、エボラウイルスの知られている全ての種に結合してこれらを中和することができる。
【０００８】
本発明の第１の態様によれば、患者においてエボラウイルスに結合してこれを中和することができる新規なモノクローナル抗体が提供される。本発明の特定の実施形態において、前記モノクローナル抗体は、少なくとも２つの異なる種に属するエボラウイルス由来のＧＰタンパク質に結合することによって、ウイルス粒子の感染性を中和し、または感染細胞を標的として破壊する。
【０００９】
本発明の第２の態様によれば、以下の重鎖ＣＤＲ３アミノ酸配列および軽鎖ＣＤＲ３アミノ酸配列を含むモノクローナル抗体が提供される：
【００１０】
ｍＡｂ  ＰＥ−８７−ｈｅａｖｙ  ＣＤＲ３：配列番号１；ｍＡｂ  ＰＥ−８７−ｌｉｇｈｔ  ＣＤＲ３：配列番号２
【００１１】
ｍＡｂ  ＰＥ−２４−ｈｅａｖｙ  ＣＤＲ３：配列番号３；ｍＡｂ  ＰＥ−２４−ｌｉｇｈｔ  ＣＤＲ３：配列番号４
【００１２】
ｍＡｂ  ＰＥ−４７−ｈｅａｖｙ  ＣＤＲ３：配列番号５；ｍＡｂ  ＰＥ−４７−ｌｉｇｈｔ  ＣＤＲ３：配列番号６
【００１３】
ｍＡｂ  ＰＥ−１６−ｈｅａｖｙ  ＣＤＲ３：配列番号７；ｍＡｂ  ＰＥ−１６−ｌｉｇｈｔ  ＣＤＲ３：配列番号８
【００１４】
ｍＡｂ  ＰＥ−０５−ｈｅａｖｙ  ＣＤＲ３：配列番号９；ｍＡｂ  ＰＥ−０５−ｌｉｇｈｔ  ＣＤＲ３：配列番号１０
【００１５】
一実施形態において、ＰＥ−８７重鎖ＣＤＲ３およびＰＥ−２４重鎖ＣＤＲ３内の重要な残基は、Ｄ９５、Ｗ９９、およびＹ１００Ｃ（Ｋａｂａｔナンバリング）である。
【００１６】
本発明の別の実施形態において、フィロウイルス感染の生存者の末梢Ｂ細胞から、（以下の）方法に記載されるようにして単離された抗体は、ＶＨ領域ヌクレオチド配列およびＶＬ領域ヌクレオチド配列が、結合能力の増強をｍＡｂにもたらす修飾Ｖ領域アミノ酸をコードするように修飾されている。以下を含む、組換え抗体を調製する方法が提供される：以下からなる群から選択されるヌクレオチド配列を用意することと
【００１７】
ＰＥ−２４、ＰＥ−８７、ＰＥ−４７、ＰＥ−１６、ＰＥ−６４、およびＰＥ−０５のＶＨヌクレオチドおよびＶＬヌクレオチド；
【００１８】
前記核酸配列を、前記ペプチドの抗原結合を損なうことなく、前記核酸配列によってコードされるアミノ酸残基の少なくとも１つ〜約３０個未満が変更または欠失されるように修飾することと；前記修飾ヌクレオチド配列を発現させ、かつ回収すること。
【００１９】
さらに他の実施形態において、本明細書中に記載されるモノクローナル抗体のあらゆる免疫反応性フラグメントが、当該技術において知られている手段を用いて、例えば、酵素分解または好都合の制限酵素を用いてネステッド欠失（ｎｅｓｔｅｄ  ｄｅｌｅｔｉｏｎｓ）を調製することによって、調製される。
【００２０】
本発明の別の態様は、開示されるｍＡｂ配列の修飾変異体を提供することであり、当該配列は、ｍＡｂの治療有効性を増大させるように親和性成熟（ａｆｆｉｎｉｔｙ  ｍａｔｕｒｅｄ）しており、またはそれ以外では突然変異している。
【００２１】
ゆえに、本発明の一実施形態は、エボラの処置用の組成物であって：配列番号１２と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域、およびその親和性成熟変異体；ならびに配列番号１４と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域、およびその親和性成熟変異体を含む第１のモノクローナル抗体または抗原結合フラグメント；ならびに薬学的に許容される賦形剤またはキャリアの治療的に有効な組合せを含む組成物を提供することである。
【００２２】
本発明の別の実施形態は、前記第１のモノクローナル抗体が、フリボウイルス（Ｆｌｉｖｏｖｉｒｕｓ）糖タンパク質の少なくとも２種に結合する組成物を提供することである。
【００２３】
本発明のさらに別の実施形態は、第１のモノクローナル抗体または抗原結合フラグメントが、主に単一のグリコフォームを含む組成物を提供することである。
【００２４】
本発明のさらに別の実施形態は、主に単一のグリコフォームが、ＧｎＧｎ、Ｇ１／Ｇ２、およびＮａＮａの１つである組成物を提供することである。
【００２５】
本発明のさらに別の実施形態は、主に単一のグリコフォームが、フコースおよびキシロースの少なくとも１つを実質的に欠く組成物を提供することである。
【００２６】
本発明の第２の実施形態は、エボラの処置用の組成物を提供することであり、当該組成物は：
ａ．配列番号１５と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域、およびその親和性成熟変異体；ならびに配列番号１８と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域、およびその親和性成熟変異体を含むモノクローナル抗体または抗原結合フラグメント；
ｂ．配列番号２１と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域、およびその親和性成熟変異体；ならびに配列番号２３と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域、およびその親和性成熟変異体を含むモノクローナル抗体または抗原結合フラグメント；
ｃ．配列番号２９と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域、およびその親和性成熟変異体；ならびに配列番号３１と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域、およびその親和性成熟変異体を含むモノクローナル抗体または抗原結合フラグメント；
ｄ．配列番号３３と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域、およびその親和性成熟変異体；ならびに配列番号３５と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域、およびその親和性成熟変異体を含むモノクローナル抗体または抗原結合フラグメント；
ｅ．配列番号１１と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域、およびその親和性成熟変異体；ならびに配列番号１３と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域、およびその親和性成熟変異体を含むモノクローナル抗体または抗原結合フラグメント
からなるリストから選択される第１のモノクローナル抗体または抗原結合フラグメント；ならびに薬学的に許容される賦形剤またはキャリアの治療的に有効な組合せを含み；前記第１のモノクローナル抗体または抗原結合フラグメントは、フリボウイルス糖タンパク質の少なくとも２種に結合する。
【００２７】
本発明の別の実施形態は、第１のモノクローナル抗体または抗原結合フラグメントが、主に単一のグリコフォームを含む組成物を提供することである。
【００２８】
本発明のさらに別の実施形態は、主に単一のグリコフォームが、ＧｎＧｎ、Ｇ１／Ｇ２、およびＮａＮａの１つである組成物を提供することである。
【００２９】
本発明のさらに別の実施形態は、主に単一のグリコフォームが、フコースおよびキシロースの少なくとも１つを実質的に欠く組成物を提供することである。
【００３０】
本発明の第３の実施形態は、エボラの処置用の組成物を提供することであり、当該組成物は：
ａ．配列番号１２と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域、およびその親和性成熟変異体；ならびに配列番号１４と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域、およびその親和性成熟変異体を含むモノクローナル抗体または抗原結合フラグメント；
ｂ．配列番号１５と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域、およびその親和性成熟変異体；ならびに配列番号１８と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域、およびその親和性成熟変異体を含むモノクローナル抗体または抗原結合フラグメント；
ｃ．配列番号２１と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域、およびその親和性成熟変異体；ならびに配列番号２３と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域、およびその親和性成熟変異体を含むモノクローナル抗体または抗原結合フラグメント；
ｄ．配列番号２９と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域、およびその親和性成熟変異体；ならびに配列番号３１と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域、およびその親和性成熟変異体を含むモノクローナル抗体または抗原結合フラグメント；
ｅ．配列番号３３と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域、およびその親和性成熟変異体；ならびに配列番号３５と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域、およびその親和性成熟変異体を含むモノクローナル抗体または抗原結合フラグメント；
ｆ．配列番号１１と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域、およびその親和性成熟変異体；ならびに配列番号１３と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域、およびその親和性成熟変異体を含むモノクローナル抗体または抗原結合フラグメント
からなるリストから選択される第１のモノクローナル抗体または抗原結合フラグメント；第２のモノクローナル抗体または抗原結合フラグメントであって、エボラ糖タンパク質に結合する第２のモノクローナル抗体または抗原結合フラグメント；ならびに薬学的に許容される賦形剤またはキャリアの治療的に有効な組合せを含む。
【００３１】
本発明の別の実施形態は、第１のモノクローナル抗体または抗原結合フラグメントおよび第２の抗体または抗原結合フラグメントの少なくとも１つが、主に単一のグリコフォームを含む組成物を提供することである。
【００３２】
本発明のさらに別の実施形態は、主に単一のグリコフォームが、ＧｎＧｎ、Ｇ１／Ｇ２、およびＮａＮａの１つである組成物を提供することである。
【００３３】
本発明のさらに別の実施形態は、主に単一のグリコフォームが、フコースおよびキシロースの少なくとも１つを実質的に欠く組成物を提供することである。
【００３４】
本発明のさらに別の実施形態は、前記治療的に有効な組合せがさらに、エボラ糖タンパク質に結合する第３のモノクローナル抗体または抗原結合フラグメントを含む組成物を提供することである。
【００３５】
本発明のさらに別の実施形態は、前記第１のモノクローナル抗体または抗原結合フラグメントが、配列番号１２と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域、およびその親和性成熟変異体；ならびに配列番号１４と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域、およびその親和性成熟変異体を含み；前記第２のモノクローナル抗体または抗原結合フラグメントが、配列番号１５と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域、およびその親和性成熟変異体；ならびに配列番号１８と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域、およびその親和性成熟変異体を含む、組成物を提供することである。
【００３６】
本発明のさらに別の実施形態は、前記治療的に有効な組合せがさらに、第３のモノクローナル抗体または抗原結合フラグメントであって、配列番号２１と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域、およびその親和性成熟変異体；ならびに配列番号２３と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域、およびその親和性成熟変異体を含む第３の抗体または抗原結合フラグメントを含む、組成物を提供することである。
【００３７】
本発明の第４の実施形態は、患者におけるフリボウイルス感染症の少なくとも１種を処置する方法であって：処置を必要とする患者を同定することと；当該患者に、第１のモノクローナル抗体または抗原結合フラグメントであって：
ｉ．配列番号１２と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域、およびその親和性成熟変異体；ならびに配列番号１４と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域、およびその親和性成熟変異体を含むモノクローナル抗体または抗原結合フラグメント；
ｉｉ．配列番号１５と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域、およびその親和性成熟変異体；ならびに配列番号１８と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域、およびその親和性成熟変異体を含むモノクローナル抗体または抗原結合フラグメント；
ｉｉｉ．配列番号２１と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域、およびその親和性成熟変異体；ならびに配列番号２３と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域、およびその親和性成熟変異体を含むモノクローナル抗体または抗原結合フラグメント；
ｉｖ．配列番号２９と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域、およびその親和性成熟変異体；ならびに配列番号３１と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域、およびその親和性成熟変異体を含むモノクローナル抗体または抗原結合フラグメント；
ｖ．配列番号３３と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域、およびその親和性成熟変異体；ならびに配列番号３５と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域、およびその親和性成熟変異体を含むモノクローナル抗体または抗原結合フラグメント；
ｖｉ．配列番号１１と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域、およびその親和性成熟変異体；ならびに配列番号１３と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域、およびその親和性成熟変異体を含むモノクローナル抗体または抗原結合フラグメント
からなるリストから選択される第１のモノクローナル抗体または抗原結合フラグメント；ならびに薬学的に許容される賦形剤またはキャリアの組合せを含む治療有効量の組成物を投与することと
を含む方法を提供する。
【００３８】
本発明の別の実施形態は、患者が哺乳類である方法を提供することである。
【００３９】
本発明のさらに別の実施形態は、第１のモノクローナル抗体または抗原結合フラグメントが、主に単一のグリコフォームを含む方法を提供することである。
【００４０】
本発明のさらに別の実施形態は、主に単一のグリコフォームが、フコースおよびキシロースの少なくとも１つを実質的に欠く方法を提供することである。
【００４１】
本発明の第５の実施形態は、エボラの処置用の組成物であって：
ａ．配列番号５３に記載のアミノ酸配列を含むＣＤＲ１、配列番号５４に記載のアミノ酸配列を含むＣＤＲ２、および配列番号５５に記載のアミノ酸配列を含むＣＤＲ３を含む重鎖可変領域と少なくとも９０％同一の重鎖可変領域、ならびにその親和性成熟変異体；ならびに配列番号５６に記載のアミノ酸配列を含むＣＤＲ１、配列番号５７に記載のアミノ酸配列を含むＣＤＲ２、および配列番号５８に記載のアミノ酸配列を含むＣＤＲ３を含む軽鎖可変領域と少なくとも９０％同一の軽鎖可変領域、ならびにその親和性成熟変異体を含むモノクローナル抗体または抗原結合フラグメント；
ｂ．配列番号４１に記載のアミノ酸配列を含むＣＤＲ１、配列番号４２に記載のアミノ酸配列を含むＣＤＲ２、および配列番号４３に記載のアミノ酸配列を含むＣＤＲ３を含む重鎖可変領域と少なくとも９０％同一の重鎖可変領域、ならびにその親和性成熟変異体；ならびに配列番号４４に記載のアミノ酸配列を含むＣＤＲ１、配列番号４５に記載のアミノ酸配列を含むＣＤＲ２、および配列番号４６に記載のアミノ酸配列を含むＣＤＲ３を含む軽鎖可変領域と少なくとも９０％同一の軽鎖可変領域、ならびにその親和性成熟変異体を含むモノクローナル抗体または抗原結合フラグメント；
ｃ．配列番号４７に記載のアミノ酸配列を含むＣＤＲ１、配列番号４８に記載のアミノ酸配列を含むＣＤＲ２、および配列番号４９に記載のアミノ酸配列を含むＣＤＲ３を含む重鎖可変領域と少なくとも９０％同一の重鎖可変領域、ならびにその親和性成熟変異体；ならびに配列番号５０に記載のアミノ酸配列を含むＣＤＲ１、配列番号５１に記載のアミノ酸配列を含むＣＤＲ２、および配列番号５２に記載のアミノ酸配列を含むＣＤＲ３を含む軽鎖可変領域と少なくとも９０％同一の軽鎖可変領域、ならびにその親和性成熟変異体を含むモノクローナル抗体または抗原結合フラグメント；
ｄ．配列番号５９に記載のアミノ酸配列を含むＣＤＲ１、配列番号６０に記載のアミノ酸配列を含むＣＤＲ２、および配列番号６１に記載のアミノ酸配列を含むＣＤＲ３を含む重鎖可変領域と少なくとも９０％同一の重鎖可変領域、ならびにその親和性成熟変異体；ならびに配列番号６２に記載のアミノ酸配列を含むＣＤＲ１、配列番号６３に記載のアミノ酸配列を含むＣＤＲ２、および配列番号６４に記載のアミノ酸配列を含むＣＤＲ３を含む軽鎖可変領域と少なくとも９０％同一の軽鎖可変領域、ならびにその親和性成熟変異体を含むモノクローナル抗体または抗原結合フラグメント；
ｅ．配列番号６５に記載のアミノ酸配列を含むＣＤＲ１、配列番号６６に記載のアミノ酸配列を含むＣＤＲ２、および配列番号６７に記載のアミノ酸配列を含むＣＤＲ３を含む重鎖可変領域と少なくとも９０％同一の重鎖可変領域、ならびにその親和性成熟変異体；ならびに配列番号６８に記載のアミノ酸配列を含むＣＤＲ１、配列番号６９に記載のアミノ酸配列を含むＣＤＲ２、および配列番号７０に記載のアミノ酸配列を含むＣＤＲ３を含む軽鎖可変領域と少なくとも９０％同一の軽鎖可変領域、ならびにその親和性成熟変異体を含むモノクローナル抗体または抗原結合フラグメント；
ｆ．配列番号７１に記載のアミノ酸配列を含むＣＤＲ１、配列番号７２に記載のアミノ酸配列を含むＣＤＲ２、および配列番号７３に記載のアミノ酸配列を含むＣＤＲ３を含む重鎖可変領域と少なくとも９０％同一の重鎖可変領域、ならびにその親和性成熟変異体；ならびに配列番号７４に記載のアミノ酸配列を含むＣＤＲ１、配列番号７５に記載のアミノ酸配列を含むＣＤＲ２、および配列番号７６に記載のアミノ酸配列を含むＣＤＲ３を含む軽鎖可変領域と少なくとも９０％同一の軽鎖可変領域、ならびにその親和性成熟変異体を含むモノクローナル抗体または抗原結合フラグメント
からなるリストから選択される第１のモノクローナル抗体または抗原結合フラグメント；ならびに薬学的に許容される賦形剤またはキャリアの治療的に有効な組合せを含む組成物を提供することである。
【００４２】
本発明の別の実施形態は、第２のモノクローナル抗体または抗原結合フラグメントであって、エボラ糖タンパク質に結合する第２のモノクローナル抗体または抗原結合フラグメントをさらに含む組成物を提供することである。
【００４３】
本発明のさらに別の実施形態は、前記第１のモノクローナル抗体が、フリボウイルス糖タンパク質の少なくとも２種に結合する組成物を提供することである。
【００４４】
本発明のさらに別の実施形態は、第１のモノクローナル抗体または抗原結合フラグメントが、主に単一のグリコフォームを含む組成物を提供することである。
【００４５】
本発明のさらに別の実施形態は、主に単一のグリコフォームが、ＧｎＧｎ、Ｇ１／Ｇ２、およびＮａＮａの１つである組成物を提供することである。
【００４６】
本発明のさらに別の実施形態は、主に単一のグリコフォームが、フコースおよびキシロースの少なくとも１つを実質的に欠く組成物を提供することである。
【００４７】
本発明のこれらの実施形態および他の実施形態は、以下の説明および添付の図面と併せて考慮すると、よりよく認識かつ理解されるであろう。しかしながら、以下の説明は、本発明の種々の実施形態およびそれらの多数の具体的な詳細を示しているが、限定ではなく例示として与えられていると理解されるべきである。本発明の精神から逸脱することなく、本発明の範囲内で多くの置換、修正、追加、および／または再配置を行うことができ、そして本発明は、そのような全ての置換、修正、追加、および／または再配置を含む。
【図面の簡単な説明】
【００４８】
表１．抗エボラｍＡｂのＣＤＲを含むアミノ酸残基。
【００４９】
【図１】本発明の一実施形態の親和性成熟変異体についての中和曲線を示す。
【００５０】
【図２】本発明のモノクローナル抗体の種々の実施形態の、ＥＢＯＶ−ＧＰ上の結合部位を示す。
【００５１】
【図３】本発明の２つのモノクローナル抗体に対するエスケープ突然変異耐性をもたらす突然変異の位置を示す。
【００５２】
【図４】エスケープ突然変異体に対して実行した中和アッセイを示す。
【００５３】
【図５】本発明の特定の実施形態で処置したエボラウイルス感染モルモットについての生存データを示す。
【００５４】
【図６】本発明の特定の実施形態で処置したエボラウイルス感染モルモット由来の免疫系応答データを示す。
【００５５】
【図７】本発明の特定の実施形態で処置したエボラウイルス感染モルモットについての生存データを示す。
【００５６】
【図８】本発明の特定の実施形態で処置したエボラウイルス感染モルモットについての生存データを示す。
【００５７】
【図９】本発明の特定の実施形態で処置したエボラウイルス感染モルモットについての生存データを示す。
【００５８】
【図１０】本発明の特定の実施形態で処置したエボラウイルス感染非ヒト霊長類についての生存データを示す。
【００５９】
【図１１】本発明の特定の実施形態で処置したエボラウイルス感染非ヒト霊長類についての生存データを示す。
【００６０】
【図１２】本発明の特定の実施形態で処置したエボラウイルス感染非ヒト霊長類についての生存データを示す。
【００６１】
【図１３】様々な生成方法を用いて作成した本発明の特定の実施形態についての中和曲線を示す。
【００６２】
表２は、末梢Ｂ細胞からの抗ＧＰ抗体単離の効率を示す。
【００６３】
表３は、様々なエボラウイルス種に対する候補全エボラウイルスｍＡｂの交差反応性を示す。反応性を、ＥＬＩＳＡによって測定した。
【００６４】
表４は、候補全エボラウイルスｍＡｂのインビトロ中和活性および親和性を示す。
【００６５】
表５は、ＥＢＯＶに感染させ、その後上記のモノクローナル抗体で処置したマウスが、ＰＢＳで処置したマウスと比較して、生存率の増大を示したことを示す。
【００６６】
表６は、交差中和ヒトｍＡｂによるｒＶＳＶ−ＧＰ中和の概要である。
【００６７】
表７は、交差中和ヒトｍＡｂによる真正の（ａｕｔｈｅｎｔｉｃ）エボラウイルス中和の概要である。
【００６８】
表８は、示した突然変異をＣＤＲ−Ｈ３ループ内に有する成熟ＰＥ−８７によるＥＢＯＶ  ＧＰ  ＴＭの認識についてのＫＤ値を、ＢＬＩによって判定したことを示す。９５％の信頼区間を、各結合定数について報告する。示した突然変異をＣＤＲ−Ｈ３ループ内に有する成熟ＰＥ−８７による、エボラウイルスＧＰを有するｒＶＳＶの中和についてのＩＣ５０値。
【００６９】
表９は、ＥＢＯＶまたはＳＵＤＶによる感作誘発（ｃｈａｌｌｅｎｇｅ）後のマウスのｍＡｂ保護を示す。
【発明を実施するための形態】
【００７０】
別に定義されない限り、本明細書中で用いられる技術用語および科学用語は全て、本発明が属する当該技術の当業者によって一般に理解されるのと同じ意味を有する。本明細書中に記載される方法および材料と類似の、または同等のあらゆる方法および材料が、本発明の実行または試験に用いられ得るが、好ましい方法および材料が、次に記載される。先で、そして以下で言及される刊行物は全て、参照によって本明細書に組み込まれる。
【００７１】
定義：
本明細書中で用いられる「中和抗体」（ＮＡｂ）は、形成されたウイルス粒子を破壊することができ、あるいはウイルス粒子の形成を阻害し、またはウイルス粒子による哺乳類細胞への結合、もしくはウイルス粒子による哺乳類細胞の感染を予防することができる抗体、例えばモノクローナル抗体を指す。本明細書中で用いられる「診断抗体」または「検出抗体」（“ｄｅｔｅｃｔｉｏｎ  ａｎｔｉｂｏｄｙ”  ｏｒ  “ｄｅｔｅｃｔｉｎｇ  ａｎｔｉｂｏｄｙ”）は、サンプル内の抗原性標的の存在を検出することができる抗体、例えばモノクローナル抗体を指す。当業者によって理解されるように、そのような診断抗体は、好ましくは、その抗原性標的に対して高い特異性を有する。本明細書中で用いられる「ヒト抗体」は、ヒトのＢ細胞から、または直接、血清抗体の配列から単離された抗体を指す。
【００７２】
「治療的に有効な」処置は、所望の効果をもたらすことができる処置を指す。そのような効果として、以下に限定されないが、生存率の向上、症状の存在または重症度の軽減、回復までの時間の短縮、および初期感染の予防が挙げられる。ｍＡｂの「治療的に有効な」並べ換え（ｐｅｒｍｕｔａｔｉｏｎ）は、患者データのルーチンの分析によって検出可能な様式で、上記の特性のいずれかを強化し得る。特定の実施形態において、そのような治療的に有効な突然変異として、ｍＡｂの安定性、溶解性、または生成を向上させる突然変異が挙げられ、ｍＡｂ配列のフレームワーク領域に対する突然変異が挙げられる。
【００７３】
本明細書中で用いられる「免疫反応性フラグメント」は、この文脈において、標的抗原に対する許容可能な程度またはパーセンテージの結合活性を保持する野生型抗体または親抗体と比較して、長さが短縮された抗体フラグメントを指す。当業者によって理解されるように、許容可能な程度は、意図される用途によって決まることとなる。
【００７４】
本明細書で用いられるｍＡｂは、少なくとも２種、好ましくはそれ以上のエボラウイルス種に結合することができるならば、「全エボラ」結合特性がある。
【００７５】
基本的な抗体構造単位は、テトラマーを含むことが知られている。各テトラマーは、ポリペプチド鎖の２つの同一ペアで構成されており、各ペアは、１つの「軽」鎖（約２５ｋＤａ）および１つの「重」鎖（約５０〜７０ｋＤａ）を有する。各鎖のアミノ末端部分には、主に抗原認識を担う約１００〜１１０またはそれ以上のアミノ酸の可変領域が含まれる。各鎖のカルボキシ末端部分は、主にエフェクタ機能を担う定常領域を定義する。
【００７６】
軽鎖は、カッパおよびラムダに分類される。重鎖は、ガンマ、ミュー、アルファ、デルタ、またはイプシロンに分類され、そして抗体のアイソタイプをそれぞれ、ＩｇＧ、ＩｇＭ、ＩｇＡ、ＩｇＤ、およびＩｇＥと定義する。各アイソタイプ内には、ＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３、ＩｇＧ４等のサブタイプが存在し得る。軽鎖および重鎖内で、可変領域および定常領域は、約１２個またはそれ以上のアミノ酸の「Ｊ」領域によって結合され、重鎖もまた、約３個またはそれ以上のアミノ酸の「Ｄ」領域を含む。定常領域の特定の同一性、アイソタイプ、またはサブタイプは、本発明に影響を与えない。各軽／重鎖ペアの可変領域は、抗体結合部位を形成する。
【００７７】
ゆえに、無傷抗体は、２つの結合部位を有する。鎖は全て、相補性決定領域またはＣＤＲとも呼ばれる３つの超可変領域が結合した、比較的保存されたフレームワーク領域（ＦＲ）の同じ一般的な構造を示す。各ペアの２つの鎖由来のＣＤＲは、特定のエピトープへの結合を可能にするように、フレームワーク領域によってアラインされている。Ｎ末端からＣ末端まで、軽鎖および重鎖の双方が、ドメインＦＲ１、ＣＤＲ１、ＦＲ２、ＣＤＲ２、ＦＲ３、ＣＤＲ３、およびＦＲ４を含む。各ドメインへのアミノ酸の割当ては、周知の取決め［Ｋａｂａｔ「Ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ  ｏｆ  Ｐｒｏｔｅｉｎｓ  ｏｆ  Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｉｃａｌ  Ｉｎｔｅｒｅｓｔ」Ｎａｔｉｏｎａｌ  Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅｓ  ｏｆ  Ｈｅａｌｔｈ，Ｂｅｔｈｅｓｄａ，Ｍｄ．ｓ  １９８７  ａｎｄ  １９９１；Ｃｈｏｔｈｉａ，ｅｔ  ａｌ．，Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．１９６：９０１−９１７（１９８７）；Ｃｈｏｔｈｉａ  ｅｔ  ａｌ．，Ｎａｔｕｒｅ  ３４２：８７８−８８３（１９８９）］に従う。
【００７８】
本発明の別の実施形態において、主に単一のグリコフォームを含有するモノクローナル抗体の糖鎖操作（ｇｌｙｃｏｅｎｇｉｎｅｅｒｅｄ）変異体が提供される。このグリカンは、ＧｎＧｎ（ＧｌｃＮＡｃ２−Ｍａｎ３−ＧｌｃＮＡｃ２）、モノまたはジガラクトシル化（Ｇａｌ（１／２）−ＧｌｃＮＡｃ２−Ｍａｎ３−ＧｌｃＮＡｃ２）（以下、モノガラクトシル化＝「Ｇ１」、ジガラクトシル化＝「Ｇ２」、および任意の割合での２つの組合せ＝「Ｇ１／Ｇ２」）、モノまたはジシアル化（ＮａＮａ（１，２）−Ｇａｌ（１／２）−ＧｌｃＮＡｃ２−Ｍａｎ３−ＧｌｃＮＡｃ２）（フコースもキシロースもほとんど、または全く含有しない）であり得る。主に単一のグリコフォームは、抗体溶液中に存在する全てのグリコフォームの半分超（例えば、５０％、６０％、７０％、８０％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％超）を表すあらゆるグリコフォームである。
【００７９】
ＲＡＭＰシステムは、抗体、抗体フラグメント、イディオタイプワクチン、酵素、およびサイトカインの糖鎖工学に用いられている。Ｍａｐｐ（５、６）およびその他（７、８）によって、ＲＡＭＰシステムにおいて多数の抗体が生成されてきた。これらは主にＩｇＧであるが、ＩｇＭ（９、１０）が挙げられる他のアイソタイプが糖鎖操作されてきた。糖鎖工学はまた、ＲＡＭＰシステムにおいて、ヒト酵素にも拡張されてきた（１１、１２）。ＲＡＭＰシステムは、アグロバクテリウム（Ａｇｒｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）属感染から収穫および精製までのターンアラウンドタイムが迅速であるので（１３）、患者固有のイディオタイプワクチンが、非ホジキンリンパ腫について、臨床試験に用いられている（７）。
【００８０】
糖鎖工学について、ｍＡｂ  ｃＤＮＡを含有する組換えアグロバクテリウム（Ａｇｒｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）属が、Ｎ．ベンサミアーナ（Ｎ．ｂｅｎｔｈａｍｉａｎａ）の感染に、適切なグリコシル化アグロバクテリア（Ａｇｒｏｂａｃｔｅｒｉａ）と併用されて、所望のグリカンプロファイルがもたらされる。野生型グリカン（すなわち、天然の、植物がもたらすグリコシル化）について、野生型Ｎ．ベンサミアーナ（Ｎ．ｂｅｎｔｈａｍｉａｎａ）に、抗Ｍ２ｅ  ｃＤＮＡを含有するアグロバクテリウム（Ａｇｒｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）属のみが接種される。ＧｎＧｎグリカンについて、同アグロバクテリウム（Ａｇｒｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）属が、フコシルもキシロシルトランスフェラーゼもほとんどまたは全く含有しない植物（ＸＦ植物）に接種するのに用いられる。ガラクトシル化グリカンについて、ＸＦ植物に、ｍＡｂ  ｃＤＮＡを含有するアグロバクテリウム（Ａｇｒｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）属、およびバイナリアグロバクテリウム（Ａｇｒｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）属ベクターに含有されるβ−１，４−ガラクトシルトランスフェラーゼ発現用のｃＤＮＡを含有するアグロバクテリウム（Ａｇｒｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）属が接種されて、ＴＭＶベクターおよびＰＶＸベクターとの組換えが回避される（１４）。シアル化グリカンについて、６つの追加遺伝子がバイナリベクター内に導入されて、哺乳類のシアル酸生合成経路が再構成される。当該遺伝子は、ＵＤＰ−Ｎ−アセチルグルコサミン２−エピメラーゼ／Ｎ−アセチルマンノサミンキナーゼ、Ｎ−アセチルノイラミン酸ホスファートシンターゼ、ＣＭＰ−Ｎ−アセチルノイラミン酸シンセターゼ、ＣＭＰ−ＮｅｕＡｃトランスポータ、β−１，４−ガラクトシルトランスフェラーゼ、およびα２，６−シアリルトランスフェラーゼ（１４）である。
【００８１】
Ｎ−グリコシダーゼＦ（ＰＮＧａｓｅ  Ｆ）による消化、およびその後の遊離グリカンの誘導体化によるＮ−結合グリカンの放出に関与する糖鎖操作ｍＡｂの糖分析が、アントラニル酸（２−ＡＡ）により達成される。２−ＡＡ誘導体化オリゴ糖は、順相ＨＰＬＣを介して、あらゆる過剰試薬から分離される。カラムは、２−ＡＡ標識グルコースホモポリマーおよびグリカン標準で較正される。試験サンプルおよび２−ＡＡ標識グリカン標準は、蛍光分析で検出される。グリコフォームは、グルコース単位（ＧＵ）値を、２−ＡＡ標識グリカン標準の値と比較することによって、または理論ＧＵ値と比較することによって、割り当てられる（１５）。グリカン構造の確認は、ＬＣ／ＭＳで達成されてきた。
【００８２】
ＲＡＭＰシステムは、種々の糖鎖操作ｍＡＢおよび野生型ｍＡＢを生成する効果的な方法である一方、他の発現システムが、同じ結果を達成するのに用いられ得ることが認識されよう。例えば、哺乳類細胞株（例えば、ＣＨＯまたはＮＳＯ細胞［Ｄａｖｉｅｓ，Ｊ．，Ｊｉａｎｇ，Ｌ．，Ｐａｎ，Ｌ．Ｚ．，ＬａＢａｒｒｅ，Ｍ．Ｊ．，Ａｎｄｅｒｓｏｎ，Ｄ．，ａｎｄ  Ｒｅｆｆ，Ｍ．２００１．Ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ  ｏｆ  ＧｎＴＩＩＩ  ｉｎ  ａ  ｒｅｃｏｍｂｉｎａｎｔ  ａｎｔｉ−ＣＤ２０  ＣＨＯ  ｐｒｏｄｕｃｔｉｏｎ  ｃｅｌｌ  ｌｉｎｅ：Ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ  ｏｆ  ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ  ｗｉｔｈ  ａｌｔｅｒｅｄ  ｇｌｙｃｏｆｏｒｍｓ  ｌｅａｄｓ  ｔｏ  ａｎ  ｉｎｃｒｅａｓｅ  ｉｎ  ＡＤＣＣ  ｔｈｒｏｕｇｈ  ｈｉｇｈｅｒ  ａｆｆｉｎｉｔｙ  ｆｏｒ  ＦＣｙＲＩＩＩ．Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ  Ｂｉｏｅｎｇ  ７４：２８８−２９４］）、酵母細胞（例えばピキア・パストリス（Ｐｉｃｈｉａ  ｐａｓｔｏｒｉｓ）［Ｇｅｒｎｇｒｏｓｓ  Ｔ．Ｐｒｏｄｕｃｔｉｏｎ  ｏｆ  ｃｏｍｐｌｅｘ  ｈｕｍａｎ  ｇｌｙｃｏｐｒｏｔｅｉｎｓ  ｉｎ  ｙｅａｓｔ．Ａｄｖ  Ｅｘｐ  Ｍｅｄ  Ｂｉｏｌ．２００５；５６４］）、および細菌細胞（例えば大腸菌（Ｅ．Ｃｏｌｉ））が、そのようなｍＡＢを生成するのに用いられている。
【００８３】
本明細書に記載されるのは、ＰＥ−２４、ＰＥ−８７、ＰＥ−４７、ＰＥ−１６、ＰＥ−６４、およびＰＥ−０５と呼ばれるｍＡｂであり、これらは驚くべきことに、全エボラ中和特性を示した。本発明の好ましい抗体は、言及されるアミノ酸配列と十分に同一のアミノ酸配列を有するｍＡｂを含む。「十分に同一の」によって意図されるのは、当該技術において知られているアラインメントプログラムの１つを用いて、参照配列と比較して、少なくとも約６０％または６５％の配列同一性、約７０％または７５％の配列同一性、約８０％または８５％の配列同一性、約９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、またはそれ以上の配列同一性を有するアミノ酸配列である。
【００８４】
以下の配列は、ｍＡｂ  ＰＥ−４７を生じさせるための、ｍＡｂ  ＰＥ−６４  ＶＨおよびＶＬアミノ酸に対するアミノ酸修飾を示す（修飾は太字で示され、ＣＤＲ配列には下線が引かれている）。
【００８５】
ｍＡｂ  ＰＥ−６４  ＶＨアミノ酸：配列番号１１
ＥＶＱＬＶＥＳＧＧＧＬＶＫＰＧＧＳＬＲＬＳＣＡＡＳＧＦＴＦＳＮＡＷＭＳＷＶＲＱＡＰＧＫＧＬＥＷＶＧＲＩＫＳＫＴＤＧＧＴＩＤＹＡＡＰＶＫＧＲＦＴＩＳＲＤＤＳＫＮＴＶＹＬＱＭＴＳＬＫＴＥＤＴＡＶＹＹＣＴＴＹＴＥＤＭＲＹＦＤＷＬＬＲＧＧＥＴＦＤＹＷＧＱＧＴＬＶＴＶＳＳ
【００８６】
ｍＡｂ  ＰＥ−４７  ＶＨアミノ酸：配列番号１２
ＥＶＱＬＶＥＳＧＧＧＬＶＫＰＧＧＳＬＲＬＳＣＡＡＳＧＦＴＦＳＮＡＷＭＳＷＶＲＱＡＰＧＥＧＬＥＷＶＧＲＩＫＳＫＴＤＧＧＴＩＤＹＡＡＰＶＫＧＲＦＴＩＳＲＤＤＳＫＮＴＶＹＬＱＭＴＳＬＫＴＥＤＴＡＶＹＹＣＴＴＹＴＥＤＭＱＹＦＤＷＬＬＲＧＧＥＴＦＤＹＷＧＱＧＴＬＶＴＶＳＳ
【００８７】
ｍＡｂ  ＰＥ−６４  ＶＬアミノ酸：配列番号１３
ＤＩＲＬＴＱＳＰＳＳＬＳＡＳＶＧＤＲＶＴＩＴＣＲＡＳＨＹＩＳＴＹＬＮＷＹＱＱＫＰＧＫＡＰＫＬＬＩＹＡＡＳＮＬＱＳＧＶＰＳＲＦＳＧＳＧＦＧＴＤＦＳＬＴＩＳＳＬＱＰＥＤＦＡＴＹＨＣＱＱＳＹＳＴＰＧＲＹＴＦＧＱＧＴＫＶＥＩＫ
【００８８】
ｍＡｂ  ＰＥ−４７  ＶＬアミノ酸：配列番号１４
ＤＩＱＭＴＱＳＰＳＳＬＳＡＳＶＧＤＲＶＴＩＴＣＲＡＳＱＹＩＳＴＹＬＮＷＹＱＱＫＰＧＫＡＰＫＬＬＩＹＡＡＹＮＬＱＳＧＶＰＳＲＦＳＧＳＧＳＧＴＤＦＴＬＴＩＳＳＬＱＰＥＤＦＡＴＹＹＣＱＱＳＹＳＴＰＧＲＹＴＦＧＱＧＴＫＶＥＩＫ
【００８９】
以下に示される抗体は、西アフリカにおける２０１４年のエボラウイルスのアウトブレイクの生存者の末梢Ｂ細胞から単離された（ＣＤＲアミノ酸が、表１に開示されている）。
【００９０】
ＰＥ−８７  ＶＨアミノ酸：配列番号１５
【００９１】
ＰＥ−８７  ＶＨヌクレオチド：配列番号１６
【００９２】
代替のＰＥ−８７  ＶＨアミノ酸配列は、以下の通りである：配列番号１７（変更は、太字および下線で示されている）
【００９３】
ＥＶＱＬＶＥＳＧＧＧＬＶＱＰＧＧＳＬＲＶＳＣＡＡＳＧＦＴＦＳＳＹＡＭＳＷＶＲＱＡＰＧＫＧＬＥＷＶＳＡＩＳＧＬＧＧＳＴＹＹＡＤＳＶＫＧＲＦＴＩＳＲＤＮＳＫＮＴＬＹＬＱＭＮＳＬＲＡＥＤＴＡＶＹＹＣＡＫＤＨＲＶＷＡＡＧＹＨＦＤＹＷＧＱＧＴＬＶＴＶＳＳ
【００９４】
ＰＥ−８７  ＶＬアミノ酸：配列番号１８
【００９５】
ＰＥ−８７  ＶＬヌクレオチド：配列番号１９
【００９６】
代替のＰＥ−８７  ＶＬアミノ酸配列は、以下の通りである：配列番号２０（変更は、太字および下線で示されている）
【００９７】
ＤＩＱＭＴＱＳＰＳＴＬＳＡＳＶＧＤＲＶＴＩＴＣＲＡＳＱＳＩＳＳＷＬＡＷＹＱＱＫＰＧＥＡＰＫＬＬＩＳＤＡＳＳＬＥＳＧＶＰＳＲＦＳＧＳＧＳＧＴＥＦＴＬＴＩＳＳＬＱＰＤＤＦＡＴＹＹＣＱＱＹＹＳＳＰＴＦＧＧＧＴＫＶＥＩＫ
【００９８】
ＰＥ−２４  ＶＨアミノ酸：配列番号２１
【００９９】
ＰＥ−２４  ＶＨヌクレオチド：配列番号２２
【０１００】
ＰＥ−２４  ＶＬアミノ酸：配列番号２３
【０１０１】
ＰＥ−２４  ＶＬヌクレオチド：配列番号２４
【０１０２】
ＰＥ−４７  ＶＨアミノ酸：配列番号２５
【０１０３】
ＰＥ−４７  ＶＨヌクレオチド：配列番号２６
【０１０４】
ＰＥ−４７  ＶＬアミノ酸：配列番号２７
【０１０５】
ＰＥ−４７  ＶＬヌクレオチド：配列番号２８
【０１０６】
ＰＥ−１６  ＶＨアミノ酸：配列番号２９
【０１０７】
ＰＥ−１６  ＶＨヌクレオチド：配列番号３０
【０１０８】
ＰＥ−１６  ＶＬアミノ酸：配列番号３１
【０１０９】
ＰＥ−１６  ＶＬヌクレオチド：配列番号３２
【０１１０】
ＰＥ−０５  ＶＨアミノ酸：配列番号３３
【０１１１】
ＰＥ−０５  ＶＨヌクレオチド：配列番号３４
【０１１２】
ＰＥ−０５  ＶＬアミノ酸：配列番号３５
【０１１３】
ＰＥ−０５  ＶＬヌクレオチド：配列番号３６
【０１１４】
ＰＥ−６４  ＶＨアミノ酸：配列番号３７
【０１１５】
ＰＥ−６４  ＶＨヌクレオチド：配列番号３８
【０１１６】
ＰＥ−６４  ＶＬアミノ酸：配列番号３９
【０１１７】
ＰＥ−６４  ＶＬヌクレオチド：配列番号４０
【表１】
2020508990.tif 000002
【０１１８】
本発明の特定の実施形態において、先のｍＡｂ配列は、親和性成熟して、結合が増強し、またはそれ以外では抗体の治療効力が向上している。一実施形態において、軽鎖多様化プロトコルを介して、そしてその後、以下に記載される重鎖および軽鎖の可変領域中への多様性の導入によって、抗体の最適化を実行した。
【０１１９】
ＣＤＲＬ１およびＣＤＲＬ２の選択：単一抗体のＣＤＲＬ３を、１×１０８の多様性のＣＤＲＬ１変異体およびＣＤＲＬ２変異体を有する既製のライブラリ中に組み換えて、１ラウンドのＭＡＣＳおよび４ラウンドのＦＡＣＳによる選択を実行した。各ＦＡＣＳラウンドについて、滴定量のエボラウイルスＧＰ（例えばＳＵＤＶ  ＧＰ）を用いてライブラリに親和性圧力をかけて（ａｆｆｉｎｉｔｙ  ｐｒｅｓｓｕｒｅｄ）、ソーティングを実行して、所望の特性を備えた母集団を得た。
【０１２０】
ＶＨ  Ｍｕｔの選択：エラープローンＰＣＲ（ｅｒｒｏｒ  ｐｒｏｎｅ  ＰＣＲ）を介して、重鎖可変領域（ＶＨ）に変異を誘発した。次に、この変異誘発したＶＨおよび重鎖の発現ベクターを、親の軽鎖プラスミドを既に含有する酵母中に形質転換することによって、ライブラリを作成した。２ラウンドのＦＡＣＳソーティングを用いて、以前のサイクルと同様の選択を実行した。各ＦＡＣＳラウンドについて、滴定量のスーダンＧＰを用いてライブラリに親和性圧力をかけて、ソーティングを実行して、所望の特性を備えた母集団を得た。
【０１２１】
ＡＤＩ−２３７７４（ＰＥ−４７）は、最も向上したＨＣ（ＶＨ  ｍｕｔ選択由来）を、最も向上したＬＣ（Ｌ１／Ｌ２選択由来）と組み合わせることによって生じた。
【０１２２】
図１は、親（ＰＥ−６４）、最良のＶＨ突然変異体、最良のＶＬ突然変異体、および最良のＶＨ／ＶＬ突然変異体（ＰＥ−４７）の中和能の増強を示している。
【０１２３】
当業者であれば、本明細書中に記載されるｍＡｂ配列の所望の特性を迅速かつ効率的に向上させるのに、親和性成熟のこれらの、または代替の方法が用いられ得ること、そして当該技術を用いて開発された潜在的なあらゆる変異体が、所望の特性を備えているかを同定するのに、ルーチンの分析ツールが用いられ得ることが明らかであろう。
【０１２４】
本抗体は、エボラ糖タンパク質に対する親和性および結合力が高く、このことは、特定の実施形態において、当該抗体が、エボラウイルス感染症の個人に投与される治療薬として、エボラウイルス感染を予防するための予防薬として、または高感度の診断ツールとして用いられ得ることを意味する。特に、ＰＥ−８７およびＰＥ−４７が、ＧＰ→ＧＰＣＬ切断および受容体係合（ｒｅｃｅｐｔｏｒ  ｅｎｇａｇｅｍｅｎｔ）に続く工程にて主に作用することを発見した。エンドソームで生じたＧＰＣＬ種（単独、またはＮＰＣ１との複合体）は、当該ｍＡｂの推定最終標的である。驚くべきことに、ＧＰＣＬへのＧＰ切断により、ＰＥ−６４、ＰＥ−８７、およびＰＥ−４７の抗ウイルス力が、５０〜２００倍増強した。併せて、これらの結果は、エンドサイトーシス経路の深部で生じる切断されたＧＰ種を標的として中和する能力において、広く中和するｍＡｂ  ＰＥ−８７およびＰＥ−４７が、前述の単一特異的ｍＡｂ（ＫＺ５２、ｃ２Ｇ４、および４Ｇ７）と異なることを示唆している。逆に、後者のｍＡｂは、ＧＰ→ＧＰＣＬ切断工程にて、かつ／または当該工程前に主に作用するようである。ＰＥ−６４は、二重の挙動を示し、膜融合工程にて、または当該工程の近くで、上流でＧＰ切断をブロックし、かつ下流で１つ以上のＧＰＣＬ様種を標的にするように作用し得る。致死的エボラウイルス感作誘発の３つの小動物モデルにおいて、これらの広く中和するヒトｍＡｂの保護効力を評価した。最初に、野生型（ＷＴ）ＢＡＬＢ／ｃマウスを、マウス適応ＥＢＯＶ（ＥＢＯＶ−ＭＡ）に曝してから、感染後２日目にて各ｍＡｂの単回用量（３００μｇ／動物）を投与した。交差中和ｍＡｂが、このストリンジェントな後曝露セッティングにおいて、ＥＢＯＶから高度に（≧８０％）保護的であり、ｍＡｂ処置動物では体重減少がほとんど、または全く見られなかった。
【０１２５】
図２は、広く中和するエボラウイルスｍＡｂの陰性染色ＥＭの再構築を示している。抗原表面および対応する注目の構造領域を示すエボラウイルスＧＰの構造（ＰＤＢ  ＩＤ：５ＪＱ３に基づく）。無秩序な（ｄｉｓｏｒｄｅｒｅｄ）ムチンドメイン（破線）、ＧＰ１、ＧＰ２、融合ループ、グリカンキャップイン、ＣＨＲ２領域、およびＮ５６３結合グリカン。上面図および側面図は、ＥＢＯＶ  ＧＰと複合したＰＥ−８７、ＰＥ−４７、ＰＥ−２４、およびＰＥ−１６（濃い灰色で示す）のＦａｂモデルの陰性染色ＥＭ  ３Ｄ再構築について示す。
次に、ＳＵＤＶ感作誘発用のＩ型インターフェロンα／β受容体欠損マウスモデルにおけるＮＡｂを評価した。マウスを、ＷＴ  ＳＵＤＶに曝してから、感染後１日目および３日目に、各ＮＡｂを投薬した（３００μｇ／動物／用量）。全エボラウイルスｍＡｂ  ＰＥ−８７およびＰＥ−４７は、ＰＢＳ対照群と比較して、≧９５％の生存率および大幅な体重減少をもたらした。対照的に、双方とも弱いＳＵＤＶ中和剤であるＰＥ−１６およびＰＥ−６４は、ＳＵＤＶからの保護をほとんど、または全く実現しなかった。
【０１２６】
最後に、ＢＤＢＶ感作誘発用に唯一記載された非ＮＨＰモデルである飼育フェレットにおける、２つの全エボラウイルスヒトｍＡｂであるＰＥ−８７およびＰＥ−４７の抗ＢＤＢＶ効力を試験した。動物は、各ＮＡｂの２用量を受けた（感作誘発後３日目および６日目に、動物１頭あたりそれぞれ１５ｍｇおよび１０ｍｇ）。以前に観察されたように、ＢＤＢＶ感染は、一様に致死的であり、ＰＢＳ処置動物は、感作誘発後８〜１０日の間に死亡した。対照的に、双方のｍＡｂは、高い有意水準の生存をもたらした（ＰＥ−８７について４頭中３頭；ＰＥ−２４について４頭中２頭）。さらに、ピークウイルス血症レベルは、ｍＡｂ処置および生存結果と相関しており、生存動物において観察されたウイルス力価は、感染により死亡した動物と比較してより低く（ｐ＜０．００１）、そしてｍＡｂ処置動物では、ＰＢＳ処置対照と比較してより低かった（ｐ＜０．００１）。また、ウイルス血症は、ＰＥ−４７を受けた動物と比較して、ＰＥ−８７を受けた動物においてより低い傾向があったが、この差異は、統計的有意性に達しなかった。要するに、発明者らの発見は、全エボラウイルスｍＡｂであるＰＥ−８７およびＰＥ−４７が、ヒトにおける致死的疾患のアウトブレイクに現在関連する３つの分岐したエボラウイルスによる感作誘発からの曝露後保護をもたらすことができることを示している。
【０１２７】
本発明の別の実施形態において、本発明のｍＡｂは、エボラウイルス感作誘発の非ヒト霊長類モデルに対して完全な保護を実現することが示された。ＥＢＯＶウイルスの致死的感作誘発への曝露の４日後、アカゲザルの一群を、１用量のＮＡｂカクテル（ＰＥ−８７およびＰＥ−４７をそれぞれ２５ｍｇ／ｋｇ含む）または２用量の同ＮＡｂカクテル（一方は、感染後４日目に５０ｍｇ／ｋｇのＮＡｂを含み、もう一方は、感染後７日目に２５ｍｇ／ｋｇのＮＡｂを含んだ）のいずれかで処置した。以前に観察されたように、ＥＢＯＶ感染は、一様に致死的であり、ＰＢＳ処置動物は全て、感染後７日目までに死亡した。対照的に、ＮＡｂ処置群由来の全ての動物は生存し、ｑＲＴ−ＰＣＲを介してアッセイした場合、初期処置の１０日後の処置群の血中に、検出可能なウイルスＲＮＡは存在しなかった。
【０１２８】
ＰＥ−８７およびＰＥ−４７のＮＡｂカクテル（本明細書でＭＢＰ１３４とも呼ぶ）を、以下のようにさらに試験した。最初に、ＭＢＰ１３４の個々の成分に耐性のあるエスケープ突然変異体を生成した。エスケープ突然変異体の選択を、試験抗体の存在下でのｒＶＳＶ−ＧＰ粒子の連続継代によって実行した。手短に言えば、ウイルスの連続３倍希釈液を、中和アッセイに由来するＩＣ９０値に対応する抗体の濃度と１時間プレインキュベートしてから、１２ウェルプレート中のＶｅｒｏ細胞のコンフルエントな単層に、二反復で加えた。感染を完了まで進行させて（目による＞９０％の細胞死）、ウイルス接種原の最高希釈（すなわち最小量）を受けた感染ウェルから上清を収穫した。先のウイルス含有上清による抗体選択下での３連続の継代後、継代４由来の上清を、ウイルス中和エスケープについて試験した。耐性が明らかであれば、個々のウイルスクローンをＶｅｒｏ細胞上でプラーク精製して、そのＧＰ遺伝子配列を、以前に記載されるようにして（Ｗｏｎｇ  ｅｔ  ａｌ．，２０１０）決定した。
【０１２９】
図３は、ＰＥ−４７（ＭＢＰ０４７）およびＰＥ−８７（ＭＢＰ０８７）のそれぞれに最も耐性のある２つのエスケープ突然変異体について、ウイルス糖タンパク質の３次元構造内のｒＶＳＶ−ＧＰに対する突然変異、およびその相対位置を示す。すなわち、ＰＥ−８７エスケープ突然変異体は、Ｇ５２８Ｅ置換を含有した一方、ＰＥ−４７エスケープ突然変異体は、Ｎ５１４Ｄ置換を含有した。
【０１３０】
図４は、上述のエスケープ突然変異体および野生型ＳＵＤＶウイルスの、濃度ＰＥ−４７およびＰＥ−８７に対する用量応答曲線を示す。重要なのは、マルチｍＡｂカクテルの効力に関して、一方のｍＡｂに対する耐性をもたらしたエスケープ突然変異は、他方のｍＡｂによって中和を大幅に増強したことである。したがって、本発明の特定の実施形態において、ウイルス耐性発現のリスクを有意に引き下げる複数の抗体の組合せが提供される。
【０１３１】
上記のように、実質的に単一のグリカンを含み、かつフコースを欠く抗体は、患者において効力の増強を示す。脱フコシル化（ａｆｕｃｏｓｙｌａｔｅｄ）ＭＢＰ１３４が哺乳類において効力を増大させるかを判定するために、カクテルのフコシル化バージョンおよび脱フコシル化バージョンを用いて、致死用量のＥＢＯＶによる感作誘発を行ったモルモットを処置した。モルモットは全て、ベンダーの説明の通り、健康で免疫力があった。モルモットは全て、薬物未経験かつ実験未経験であった。動物を、食物および水の消費について毎日監視して、種のガイドラインに従って環境エンリッチメントを施した。動物のクリーニングを１週あたり３回完了した（ケージおよび床敷材の完全な交換を含んだ）。動物を、ＩＶＣ  Ａｌｔｅｒｎａｔｉｖｅ  Ｄｅｓｉｇｎ由来の大きな靴箱ケージ内で、ケージあたり２〜３頭を飼育した。各ユニットを、ＨＥＰＡブロワーシステムで換気する。４〜６週齢の雌ハートレーモルモット（２５０〜３００ｇ）を実験群にランダムに割り当てて、１ｍＬのＤＭＥＭ中１０００×ＬＤ５０のモルモット適応ＥＢＯＶ／ＭａｙｉｎｇａでＩＰを介して感作誘発を行った。ＭＢＰ１３４または脱フコシル化ＭＢＰ１３４−Ｎのいずれかを、指定の時点および用量にて、６頭のモルモット／群（ｎ＝６）にＩＰ投与した。４頭／群（ｎ＝４）の対照モルモットにＰＢＳ処置を施した。動物を、疾患の臨床徴候、生存、および体重変化について、１５〜１６日間観察した一方、生存をさらに１２日間監視した。
【０１３２】
図５は、種々の用量での脱フコシル化対フコシル化ＭＢＰ１３４の生存曲線を示す。脱フコシル化カクテルは、試験した最低投薬量でも、劇的に向上した生存を示した。さらに、動物から採取した血液は、図６に示すように、脱フコシル化したＰＥ−４７およびＰＥ−８７による処置に応答して、フコシル化対応物、ならびに他の抗ＥＢＯＶ  ｍＡｂであるｃ１３Ｃ６（これも脱フコシル化した）および２Ｇ１２と比較して、免疫反応が有意に増大したことを示した。ゆえに、本発明の特定の実施形態において、フコースを実質的に欠くモノクローナル抗体が提供される。
【０１３３】
エボラウイルスの複数の株を中和する脱フコシル化ＭＢＰ１３４の能力を判定するために、致死用量のＳＵＤＶに感染させたモルモットの用量ダウン研究を実施した。図７に示すように、感染の３日後、そして４日後に処置した動物は、１００％の生存率であった一方、５ｄｐｉでの処置でも生存率は劇的に増大した。より低い用量のＭＢＰ１３４が４ｄｐｉにて効果的であるか、そしてより高い用量が、５ｄｐｉにて投与した場合に生存率を上げるかを判定するために、更なる試験を実施した。図８に示すように、４ｄｐｉにて投与したＭＢＰ１３４の用量引下げは、処置した動物の生存率を、完全ではないが優れたものにした。さらに、５ｄｐｉにて投与した用量を２倍にすると、感染した動物は全て生存した。本発明の特定の実施形態において、感染後のより後の日のモノクローナル抗体の投薬量の増大により、宿主動物は、感染に関連するウイルス負荷の増大を克服することができる。
ゆえに、本発明の特定の実施形態において、患者は、有効用量のモノクローナル抗体またはモノクローナル抗体の組合せで処置される。有効用量として、以下に限定されないが、０．０１ｍｇ／ｋｇ、０．０５ｍｇ／ｋｇ、０．１ｍｇ／ｋｇ、０．２５ｍｇ／ｋｇ、０．５ｍｇ／ｋｇ、０．７５ｍｇ／ｋｇ、１ｍｇ／ｋｇ、２ｍｇ／ｋｇ、５ｍｇ／ｋｇ、１０ｍｇ／ｋｇ、２５ｍｇ／ｋｇ、５０ｍｇ／ｋｇ、および１００ｍｇ／ｋｇが挙げられる。
【０１３４】
本明細書中で開示されるモノクローナル抗体の、哺乳類において複数の株のエボラウイルスから保護する能力をさらに調査するために、雌フェレットに種々の株のエボラウイルスを感染させて、様々な投薬量のＭＢＰ１３４で処置した。体重０．７５〜１ｋｇの雌フェレットを、研究毎にケージあたり２〜３頭飼育した。全ての手順に先立って、ケタミン−アセプロマジン−キシラジンカクテルを筋肉内注射によって、フェレットに麻酔をかけた。感作誘発に先立って、識別および体温監視のために、トランスポンダチップ（Ｂｉｏ−Ｍｅｄｉｃ  Ｄａｔａ  Ｓｙｓｔｅｍｓ）を皮下に埋め込んだ。致死用量の１０００プラーク形成単位（ＰＦＵ）のＺＥＢＯＶ株Ｋｉｋｗｉｔ、ＳＥＢＯＶ株Ｇｕｌｕ、またはＢＤＢＶにより、鼻腔内で対象に感作誘発を行って、図９に示す時間および投薬量でＭＢＰ１３４−Ｎで処置した。図９に示すように、２または３ｄｐｉおよび５または６ｄｐｉでの１５ｍｇの２用量が、感染した哺乳類に完全な生存をもたらすのに十分であった。さらに、ここで説明した結果は、先で考察した結果と組み合わせて、ＭＢＰ１３４カクテルが哺乳類におけるエボラウイルスの多くの異なる染色からの保護をもたらすことを示している。
【０１３５】
この保護が霊長類に及ぶかを判定するために、アカゲザルに致死用量のＥＢＯＶ／Ｋｉｋｗｉｔを感染させて、本発明のモノクローナル抗体で処置した。１，０００ＰＦＵのＥＢＯＶ／Ｋｉｋｗｉｔの筋肉内注射（ＩＭ）によって、ＵＴＭＢのアカゲザルに感作誘発を行った。２つの処置群（ｎ＝４／群）を、感染後４日目の２５ｍｇ／ｋｇ単回用量のＭＢＰ１３４−Ｎで、または感染後４日目（５０ｍｇ／ｋｇ）、そして感染後７日目（２５ｍｇ／ｋｇ）の２用量のＭＢＰ１３４−Ｎで処置した。対照動物（ｎ＝２）を、ＰＢＳで処置した。全てのアカゲザルに身体検査を行って、ウイルス感作誘発時；そして感作誘発後４、７、１０、１４、２１、２８日目に採血した。動物を含む実験に関する州および連邦の法令および規制に従う、ＵＴＭＢ  Ｉｎｓｔｉｔｕｔｉｏｎａｌ  Ｂｉｏｓａｆｅｔｙ  Ｃｏｍｍｉｔｔｅｅによる、ＵＴＭＢ  Ｉｎｓｔｉｔｕｔｉｏｎａｌ  Ａｎｉｍａｌ  Ｃａｒｅ  ａｎｄ  Ｕｓｅ  Ｃｏｍｍｉｔｔｅｅ（ＩＡＣＵＣ）により承認された内部フィロウイルススコアリングプロトコルにより、疾患の進行について、アカゲザルを毎日監視して、スコアを付けた。ベースラインから測定したスコアリング変化として、姿勢／活動レベル；態度／行動；食物および水の摂取；体重；呼吸；ならびに目に見える発疹、出血、斑状出血、または皮膚の紅潮等の疾患の徴候が挙げられ、スコアが増大すると安楽死させた。図１０に示すように、処置した霊長類は全て、エボラウイルスの致死的感作誘発に対して生存した。
【０１３６】
図１１に示すように、本発明の抗体によって霊長類にもたらされる保護は、エボラウイルスの複数の株に及ぶ。ＭＢＰ１３４の単回用量であっても、アカゲザルにおけるＳＵＤＶ／Ｎｚａ−ＢｏｎｉｆａｃｅおよびＳＵＤＶ／Ｇｕｌｕの双方の致死的感作誘発から保護するのに十分である。
【０１３７】
さらに、本発明のモノクローナル抗体は、霊長類の様々な種において、エボラウイルス感作誘発からの保護を実現する。１，０００ＰＦＵのＢＤＢＶ（２００７０６２９１ウガンダ分離株、Ｖｅｒｏ  Ｅ６パッセージ２）の筋肉内注射（ＩＭ）によって、ＵＴＭＢのカニクイザルに感作誘発を行った。ＩＶ注入を介した感染後７日目の２５ｍｇ／ｋｇ単回用量のＭＢＰ１３４（ＣＨＯＫ１−ＡＦ由来）で、１つの処置群（ｎ＝６）を処置した。対照動物（ｎ＝３）は未処置であった。全ての動物に身体検査を行って、ウイルス感作誘発時；そして感作誘発後４、７、１０、１４、２１、そして２８日目（または安楽死の時点）に採血した。ＵＴＭＢ  Ｉｎｓｔｉｔｕｔｉｏｎａｌ  Ａｎｉｍａｌ  Ｃａｒｅ  ａｎｄ  Ｕｓｅ  Ｃｏｍｍｉｔｔｅｅによって承認された内部フィロウイルススコアリングプロトコルにより、全ての動物を毎日監視して、疾患の進行についてスコアを付けた。ベースラインから測定したスコアリング変化として、姿勢／活動レベル；態度／行動；食物摂取；呼吸；および目に見える発疹、出血、斑状出血、または皮膚の紅潮等の疾患の徴候が挙げられた。≧９のスコアは、動物が安楽死の基準を満たしていることを示した。図１２に示すように、感染後１週間の遅いＭＢＰ１３４の単回用量でも、優れた保護をもたらすのに十分である。
【０１３８】
本明細書中に開示されるモノクローナル抗体の生成方法論を最適化するために、植物またはＣＨＯ細胞において生成されるＰＥ−８７およびＰＥ−４７の、エボラウイルスの多数の株を中和する能力を試験した。図１３に示すように、植物ベースのシステムおよびＣＨＯベースのシステムの双方において生成したモノクローナル抗体は、同様の中和特性を有する。したがって、これらの、または当該技術において知られている他のシステムを用いて、本発明のモノクローナル抗体を生成することができる。
【０１３９】
本明細書中で考察されるように、上記抗体はいずれも、出血熱の疑いがある、または出血熱を発症する危険性のある個体に受動免疫をもたらす、治療有効量の前記抗体を含む医薬品に製剤化され得ることに留意されたい。医薬製剤は、適切な賦形剤またはキャリアを含んでよい。例えば、Ｒｅｍｉｎｇｔｏｎ：Ｔｈｅ  Ｓｃｉｅｎｃｅ  ａｎｄ  Ｐｒａｃｔｉｃｅ  ｏｆ  Ｐｈａｒｍａｃｙ，１９９５，Ｇｅｎｎａｒｏ編参照。当業者に明らかなように、総投薬量は、個体の体重、健康状態、および状況、ならびに抗体の効力に従って変動することとなる。以上、本発明の好ましい実施形態について説明したが、この中で種々の修正がなされてよいことが認識かつ理解され、添付の特許請求の範囲は、本発明の精神および範囲に含まれ得るそのような修正を全て網羅することが意図されている。
【０１４０】
材料および方法１
ヒト対象
健康な成人ボランティアからＢ細胞を単離して、以前の予防接種または感染から誘発された抗体を同定するプロトコルのＩｎｓｔｉｔｕｔｉｏｎａｌ  Ｒｅｖｉｅｗ  Ｂｏａｒｄ（ＩＲＢ）承認後に、ヒト血液サンプルを収集した。サンプル収集に先立って完了した自己申告アンケートに記録された予防接種および感染歴に基づいて、適格な対象を決定した。患者がＥＢＯＶ感染症と診断されてから３ヶ月後に、末梢血単核細胞を、２０１４  ＥＢＯＶアウトブレイクの生存者から得た。
【０１４１】
Ｂ細胞および血漿の単離
約８５ｍｌの全血を、８．５ｍｌ  ＡＣＤ  Ｓｏｌｕｔｉｏｎ  Ａ  Ｖａｃｕｔａｉｎｅｒ（登録商標）静脈採血管（Ｂｅｃｔｏｎ  Ｄｉｃｋｉｎｓｏｎ）内に、メーカーのプロトコルに従って収集した。血液を室温にて５０ｍｌコニカルチューブ中に移して分配してから、血液２１ｍｌあたり３００μｌのＲｏｓｅｔｔｅＳｅｐ（商標）ヒトＢ細胞濃縮カクテル（ＳｔｅｍＣｅｌｌ  Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ）を加えて、反転混合して、室温にて２０分間インキュベートした。ハンクス液（ＨＢＳＳ）で総量を５０ｍｌにして、Ｆｉｃｏｌｌ−Ｐａｑｕｅ  Ｐｌｕｓ（ＧＥ  Ｈｅａｌｔｈｃａｒｅ）上に、メーカーのプロトコルに従って重ねて、遠心分離した。Ｂ細胞層を密度勾配からピペットによって取り出して、ＨＢＳＳ中で２回、４００×ｇでの遠心分離によって洗浄して、ＦＢＳ（Ｌｉｆｅ  Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ）および凍結保護培地（Ｌｏｎｚａ）の１：１混合物中に６．５×１０６細胞／ｍｌにて凍結して、液体窒素下で保存した。血漿を、密度勾配の最上層から収集して、使用するまで−８０℃にて保存した。
【表２】
2020508990.tif 000003
【０１４２】
抗ＥＢＯＶ  ＧＰ血漿ＥＬＩＳＡ
ＰＢＳ中に希釈した１μｇ／ｍｌのＥＢＯＶ  ｒＧＰΔＴＭ（ＩＢＴ  ＢｉｏＳｃｉｅｎｃｅｓ）で、高結合ＥＬＩＳＡプレートを４℃にて一晩コーティングした。洗浄後、ウェルを、ＰＢＳ中１％ＢＳＡ、および０．０５％Ｔｗｅｅｎ−２０で、室温にて２時間ブロックした。ウェルを洗浄して、ヒト血漿の連続希釈液（ブロッキングバッファ中に希釈した）を加えて、室温にて１．５時間インキュベートした。陽性対照および陰性対照として、ｍＡｂ  ＫＺ５２（ＩＢＴ  ＢｉｏＳｃｉｅｎｃｅｓ）または無関係のヒトｍＡｂの連続希釈液を、適切なウェルにそれぞれ加えた。洗浄後、ＨＲＰ結合ロバ抗ヒトＩｇＧ（Ｊａｃｋｓｏｎ  ＩｍｍｕｎｏＲｅｓｅａｒｃｈ）またはＨＲＰ結合ヤギ抗ヒトＩｇＡ（Ｓｏｕｔｈｅｒｎ  Ｂｉｏｔｅｃｈ）二次抗体を、適切なウェル内で、室温にて１．２５時間インキュベートした。ウェルを２回洗浄して、ＳｕｒｅＢｌｕｅ  ＴＭＢ基質（ＫＰＬ）で発色させた。反応を１Ｍ  ＨＣｌで停止して、ＥＭａｘ  Ｍｉｃｒｏｐｌａｔｅ  Ｒｅａｄｅｒ（Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｄｅｖｉｃｅｓ）でウェルを４５０ｎｍの波長にて読んだ。ブランクを超える読取り値を与える最高の血清希釈を算出することによって、血漿エンドポイント力価を判定した（３標準偏差を含む）。
【０１４３】
単回のＢ細胞ソーティング
精製Ｂ細胞を、抗ヒトＩｇＭ（ＢＶ６０５）、ＩｇＤ（ＢＶ６０５）、ＩｇＧ（ＢＶ４２１）、ＣＤ８（ＡＰＣ−Ｃｙ７）、ＣＤ１４（ＡＦ７００）、ＣＤ１９（ＰｅｒＣＰ−Ｃｙ５．５）、ＣＤ２０（ＰｅｒＣＰ−Ｃｙ５．５）、およびビオチン化ＥＢＯＶ  ＧＰΔＴＭを用いて染色した。ビオチン化ＧＰΔＴＭを、５０ｎＭの濃度にて用いて、ストレプトアビジン−ＡＰＣ（Ｌｉｆｅ  Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ）を１：５００の希釈にて用いて、検出した。単一細胞を、ＭｏＦｌｏサイトメータ（Ｂｅｃｋｍａｎ−Ｃｏｕｌｔｅｒ）で、２０μｌ／ウェルの溶解バッファ［５μｌの５Ｘ  ｆｉｒｓｔ  ｓｔｒａｎｄ  ｃＤＮＡバッファ（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ）、０．５μｌ  ＲＮａｓｅＯＵＴ（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ）、１．２５μｌジチオトレイトール（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ）、０．６２５μｌ  ＮＰ−４０（Ｎｅｗ  Ｅｎｇｌａｎｄ  Ｂｉｏｌａｂｓ）、および１２．６μｌ  ｄＨ２Ｏ］を含有する９６ウェルＰＣＲプレート（ＢｉｏＲａｄ）中にソートした。プレートを直ぐにドライアイス上で凍結してから、−８０℃にて保存した。
【０１４４】
抗体可変遺伝子の増幅およびクローニング
単一Ｂ細胞ＰＣＲを、基本的に以前に記載されているように実行した［２７］。手短に言えば、ＩｇＨ、Ｉｇλ、およびＩｇκ可変遺伝子転写産物を、ＩｇＧに特異的なプライマーのカクテルを用いたＲＴ−ＰＣＲおよびネステッドＰＣＲ反応によって増幅した［２７］。ＰＣＲの第２ラウンドに用いたプライマーは、出芽酵母（Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ  ｃｅｒｅｖｉｓｉａｅ）中への相同組換えによるクローニングを可能にするために、切断された発現ベクターに対して５’および３’相同性の４０塩基対を含有した［２８］。ＰＣＲ産物を、化学的形質転換のための酢酸リチウム法を用いて、出芽酵母（Ｓ．ｃｅｒｅｖｉｓｉａｅ）中にクローニングした［２９］。各形質転換反応には、２０μｌの未精製重鎖および軽鎖ＰＣＲ産物、ならびに２００ｎｇの切断重鎖および軽鎖プラスミドを含有させた。個々の酵母コロニーを、配列決定およびダウンストリーム特性評価用に選んだ。
【０１４５】
抗体およびＦａｂフラグメントの発現および精製
結合実験、競合アッセイ、中和アッセイ、および構造研究に用いた抗体を、２４ウェルプレート内で増殖させた出芽酵母（Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ  ｃｅｒｅｖｉｓｉａｅ）培養体内で発現させた。増殖の６日後、酵母細胞培養体の上清を遠心分離によって収穫して、精製にかけた。保護実験に用いるＩｇＧを、ＨＥＫ２９３細胞中への重鎖および軽鎖プラスミドの一過性同時トランスフェクションによって発現させた。トランスフェクションの１日前に、ＨＥＫ２９３細胞を２．０〜２．５×１０６細胞／ｍｌにて継代した。トランスフェクションの日に、細胞を４００ｇにて５分間の遠心分離によってペレット化して、細胞ペレットを、４×１０６細胞／ｍｌの密度にてフレッシュなＦｒｅｅＳｔｙｌｅ  Ｆ１７培地中に再懸濁させて、インキュベータに戻した。最初に、プラスミドＤＮＡ調製物をＦｒｅｅＳｔｙｌｅ  Ｆ１７培地中に希釈することによって（培養体１ｍｌあたり１．３３μｇの総プラスミドＤＮＡ）、トランスフェクション混合物を調製した。次に、トランスフェクション剤であるＰＥＩｐｒｏ（商標）（Ｐｏｌｙｐｌｕｓ  Ｔｒａｎｓｆｅｃｔｉｏｎ、Ｉｌｌｋｉｒｃｈ、Ｆｒａｎｃｅ）を、１：２のＤＮＡ対ＰＥＩ比に希釈したＤＮＡに加えて、混合物を室温にて１０分間インキュベートした。次に、トランスフェクション混合物を、培養体に加えた。トランスフェクションの６日後に、培養体を、それぞれ２０００×ｇにて５分間の２ラウンドの遠心分離によって収穫して、清澄化された調整培地を抗体精製に供した。プロテインＡアガロース（ＧＥ  Ｈｅａｌｔｈｃａｒｅ  Ｌｉｆｅ  ＳｃｉｅｎｃｅｓのＭａｂＳｅｌｅｃｔ  ＳｕＲｅ（商標））に通させることによって、細胞上清を精製した。結合した抗体を、ＰＢＳで洗浄して、２００ｍＭ酢酸／５０ｍＭ  ＮａＣｌ  ｐＨ３．５で、１／８容量の２Ｍ  Ｈｅｐｅｓ  ｐＨ８．０中に溶出して、ＰＢＳ  ｐＨ７．０にバッファ交換した。ＩｇＧをパパインで３０℃にて２時間消化することによって、Ｆａｂを生じさせた。ヨードアセトアミドの添加によって消化を終了させて、ＦａｂおよびＦｃ混合物をプロテインＡアガロースに通させて、Ｆｃフラグメントおよび未消化ＩｇＧを除去した。次に、プロテインＡ樹脂のフロースルーを、ＣａｐｔｕｒｅＳｅｌｅｃｔ（商標）ＩｇＧ−ＣＨ１アフィニティ樹脂（ＴｈｅｒｍｏＦｉｓｃｈｅｒ  Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ）に通させて、２００ｍＭ酢酸／５０ｍＭ  ＮａＣｌ  ｐＨ３．５で、１／８容量の２Ｍ  Ｈｅｐｅｓ  ｐＨ８．０中に溶出した。次に、Ｆａｂフラグメントを、ＰＢＳ  ｐＨ７．０にバッファ交換した。
【０１４６】
ＥＢＯＶ  ＧＰの発現および精製
ムチン様ドメインを含有する組換えＥＢＯＶ  ＧＰエクトドメイン（ＥＢＯＶ  ＧＰΔＴＭ）、またはムチン様ドメインの残基３１２〜４６３を欠く組換えＥＢＯＶ  ＧＰエクトドメイン（ＥＢＯＶ  ＧＰΔｍｕｃ）を、以前に記載されているように生成した［１０、３０］。
【０１４７】
ＥＢＯＶ  ＧＰΔＴＭビオチン化
ＥＺ−Ｌｉｎｋ（商標）Ｓｕｌｆｏ−ＮＨＳ−ＬＣ−Ｂｉｏｔｉｎ（Ｌｉｆｅ  Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ）を用いてＥＢＯＶ  ＧＰΔＴＭをビオチン化してから、Ｚｅｂａ（商標）Ｓｐｉｎ  Ｄｅｓａｌｔｉｎｇ  Ｃｏｌｕｍｎ（Ｌｉｆｅ  Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ）による脱塩工程を行った。
【０１４８】
バイオレイヤーインターフェロメトリ結合分析
様々なＧＰ抗原へのＩｇＧの結合を、ＦｏｒｔｅＢｉｏ  Ｏｃｔｅｔ  ＨＴＸ機器（Ｐａｌｌ  Ｌｉｆｅ  Ｓｃｉｅｎｃｅｓ）を用いたＢＬＩ測定によって判定した。高スループットＫＤスクリーニング用に、ＩｇＧを、ＡＨＱセンサ（Ｐａｌｌ  Ｌｉｆｅ  Ｓｃｉｅｎｃｅｓ）上に固定して、結合工程用の０．１％ＢＳＡを含有するＰＢＳ（ＰＢＳＦ）中１００ｎＭ抗原に曝してから、ＰＢＳＦバッファ中で解離工程を行った。ＦｏｒｔｅＢｉｏ  Ｄａｔａ  Ａｎａｌｙｓｉｓ  Ｓｏｆｔｗａｒｅ  ７を用いて、データを分析した。データを、１：１の結合モデルに適合させて、結合解離速度を算出し、そして比率ｋｄ／ｋａを用いて、ＫＤを算出した。
【０１４９】
抗ＧＰ  ｍＡｂ  ＥＬＩＳＡ
ＥＬＩＳＡプレートを、４μｇ／ｍＬ  ＥＢＯＶ  ＧＰ抗原を含有する５０μｌのＰＢＳで、室温にて１時間コーティングした。洗浄後、ウェルを、３％ＢＳＡで、室温にて１時間ブロックした。ブロッキング溶液を除去した後、ｍＡｂを、０．２μｇ／ｍｌの濃度にてプレートに加えて、室温にて１時間インキュベートした。洗浄後、結合を、抗ヒトＨＲＰ結合二次抗体およびＴＭＢ基質により検出した。光学密度を、４５０ｎｍにて読んだ。
【表３】
2020508990.tif 000004
【０１５０】
抗体競合アッセイ
抗体競合アッセイを、基本的に以前に記載されているように実行した［３１］。ＧＰΔｍｕｃへの酵母表面発現抗ＧＰ  ＩｇＧの結合を阻害する対照抗ＥＢＯＶ  ＧＰ  Ｆａｂの能力によって、抗体の競合を測定した。５０ｎＭビオチン化ＧＰΔｍｕｃを、１μＭの競合体Ｆａｂと室温にて３０分間プレインキュベートしてから、酵母発現抗ＧＰ  ＩｇＧの懸濁液に加えた。ＰＢＳＦで洗浄することによって、非結合抗原を除去した。洗浄後、１：５００希釈のストレプトアビジンＡｌｅｘａ  Ｆｌｕｏｒ  ６３３（Ｌｉｆｅ  Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ）を用いて、結合抗原を検出して、ＢＤ  ＦＡＣＳ  Ｃａｎｔｏ  ＩＩを用いたフローサイトメトリによって分析した。結果を、抗原のみの対照と比較した、競合体Ｆａｂの存在下での抗原結合の低下の倍数として表す。
【０１５１】
中和アッセイ
ウイルス特異的中和抗体の応答を、基本的に以前に記載されているように滴定した［３２］。手短に言えば、血漿または抗体を、５％熱不活化胎仔ウシ血清（Ｇｉｂｃｏ−Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ、Ｇａｉｔｈｅｒｓｂｕｒｇ、ＭＤ）、１Ｘ  Ａｎｔｉ−Ａｎｔｉ（Ｇｉｂｃｏ−Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ、Ｇａｉｔｈｅｒｓｂｕｒｇ、ＭＤ）を含有するＭｉｎｉｍａｌ  Ｅｓｓｅｎｔｉａｌ  Ｍｅｄｉｕｍ（Ｃｏｒｎｉｎｇ  Ｃｅｌｌｇｒｏ、Ｍａｎａｓｓａｓ、ＶＡ）（完全ＭＥＭ）中に連続希釈して、ウイルスと３７°Ｃにて１時間インキュベートした。インキュベーション後、抗体−ウイルスまたは血漿−ウイルス混合物を、９０〜９５％のＶｅｒｏ  Ｅ６細胞のコンフルエントな単層を含有する６ウェルプレートに二反復で加えた。プレートを１５分毎にゆるやかに揺らしながら３７℃にて１時間インキュベートした。インキュベーション後、ウェルを、補充ＥＢＭＥ培地中０．５％アガロース、１０％熱不活化胎仔ウシ血清（Ｇｉｂｃｏ−Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ、Ｇａｉｔｈｅｒｓｂｕｒｇ、ＭＤ）、２Ｘ  Ａｎｔｉ−Ａｎｔｉ（Ｇｉｂｃｏ−Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ、Ｇａｉｔｈｅｒｓｂｕｒｇ、ＭＤ）でオーバーレイして、プレートを３７℃、５％ＣＯ２にて７日間インキュベートした。７日目に、細胞を、４〜５％ニュートラルレッドを含有する、先のように調製した第２のオーバーレイの添加によって染色した。プレートを、３７℃、５％ＣＯ２にて１８〜２４時間インキュベートした。エンドポイント力価を、対照ウェル内で観察されたプラーク数よりも５０％以上または８０％以上低下した（ＰＲＮＴ５０、ＰＲＮＴ８０）最高希釈と判断した。検出のアッセイ限界を、この方法によって、５プラーク形成単位（ｐ．ｆ．ｕ．）／ｍｌと算出した。
【表４】
2020508990.tif 000005
【０１５２】
単粒子電子顕微鏡
全てのＥＭ研究について、上記のＥＢＯＶ  ＧＰΔＴＭ構築体を用いた。上記のようにＦａｂを生成して、ＥＢＯＶ  ＧＰΔＴＭトリマーと、１：１０の比率で４℃にて一晩インキュベートした。次に、複合体を、炭素コーティングした銅メッシュグリッド上に堆積させて、１％ギ酸ウラニルで染色した。自動画像取得ソフトウェアＬｅｇｉｎｏｎ［３３］を用いて、Ｔｅｃｎａｉ  Ｆ１２顕微鏡でサンプルを画像化した。画像を、５２，０００×の倍率にて収集して、Ｔｉｅｔｚ  ４Ｋ  ＣＭＯＳ検出器を用いて、２．０５Ａの標本レベルの最終ピクセルサイズが得られた。画像が、Ａｐｐｉｏｎデータベースに自動的にアップロードされて、この中で加工処理した［３４］。個々の複合体を、ＤｏｇＰｉｃｋｅｒ［３５］を用いて生の画像から抽出して、２でビン分割して（ｂｉｎｎｅｄ  ｂｙ  ２）、スタックに配置した。次に、スタックを、ＭＲＡ／ＭＳＡ［ＰＭＩＤ  １４５７２４７４］を用いる参照なし２次元分類にかけた。Ｆａｂ−ＥＢＯＶΔＴＭ複合体に応答しなかったクラス平均を、その後の全ての分析から除去した。２Ｄクラス平均のサブセットを用いて、ＥＭＡＮ２［３６］内の共通線を用いて初期モデルを作成した。次に、生の粒子スタックを、ＥＭＡＮ２を用いて初期モデルに対して洗練して、最終的な３Ｄボリュームを生じさせた。ＵＣＳＦキメラを、モデリングおよび図の生成に用いた［３７］。
【０１５３】
マウスにおけるＥＢＯＶ感作誘発研究
アメリカ陸軍感染症医学研究所（Ｕ．Ｓ．Ａｒｍｙ  Ｍｅｄｉｃａｌ  Ｒｅｓｅａｒｃｈ  Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅ  ｏｆ  Ｉｎｆｅｃｔｉｏｕｓ  Ｄｉｓｅａｓｅｓ：ＵＳＡＭＲＩＩＤ）にて、段階的に年月を経た（ｐｒｏｇｒｅｓｓｉｖｅｌｙ  ｏｌｄｅｒ）哺乳マウスにおけるＥＢＯＶ（ザイール）の連続継代によって、致死マウス適応ＥＢＯＶマウスモデルを開発した［３８］。６〜８週齢の雌ＢＡＬＢ／ｃマウスを、Ｃｈａｒｌｅｓ  Ｒｉｖｅｒ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙから購入した。到着して直ぐに、マウスを動物バイオセーフティレベル４の収容エリア内のマイクロアイソレータケージ内に収容して、食事と水を不断給餌した。０日目に、マウスに１００ｐ．ｆ．ｕのマウス適合ＥＢＯＶを腹腔内（ｉ．ｐ．）感染させた。感染の２日後、マウスの群（群あたり１０マウス）を、抗体の単回用量（１００μｇ）によりｉ．ｐ．処置した。陰性対照マウスにはＰＢＳを投与した。感染後２８日間、マウスを毎日（疾患の臨床徴候があれば、１日２回）監視した。群の体重を、感染後０〜１４日目に、そして２１日目と２８日目に測定した。ＧｒａｐｈＰａｄ  ＰＲＩＳＭ  ５内のログランク検定を用いて、生存率を比較した。Ｐ値が０．０５未満の場合、生存率の差異を有意とみなした。Ａｎｉｍａｌ  Ｗｅｌｆａｒｅ  Ａｃｔ、ＰＨＳ  Ｐｏｌｉｃｙ、ならびに動物および動物を含む実験に関する他の連邦制定法および規制に準拠して、ＩＡＣＵＣが承認したプロトコル下で研究を実施した。本研究を実施した施設は、国際実験動物ケア評価認証協会（Ａｓｓｏｃｉａｔｉｏｎ  ｆｏｒ  Ａｓｓｅｓｓｍｅｎｔ  ａｎｄ  Ａｃｃｒｅｄｉｔａｔｉｏｎ  ｏｆ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ａｎｉｍａｌ  Ｃａｒｅ，Ｉｎｔｅｒｎａｔｉｏｎａｌ）によって認定されており、２０１１年、国立研究評議会（Ｎａｔｉｏｎａｌ  Ｒｅｓｅａｒｃｈ  Ｃｏｕｎｃｉｌ）のＧｕｉｄｅ  ｆｏｒ  ｔｈｅ  Ｃａｒｅ  ａｎｄ  Ｕｓｅ  ｏｆ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ａｎｉｍａｌｓに定められた原則を厳守した。
【表５】
2020508990.tif 000006
【０１５４】
マウスにおけるＳＵＤＶ感作誘発研究
４〜５週齢のＩＦＮａ／ｂＲ  ＫＯマウスに、ＳＵＤＶ（１０００ｐｆｕ）をＩ．Ｐ．接種することとする。実験群を、感染後１日目と４日目に、示す用量のｍＡｂ（０．３ｍｌ容量）で処置することとする。対照マウスを、実験マウスと同じスケジュールでＩ．Ｐ．ビヒクル制御（０．３ｍｌ容量）することとする。瀕死状態については、マウスを毎日２１日間観察することとする。瀕死状態のマウスは、安楽死の基準（スコアシート）を満たせば直ぐに安楽死させることとする（ＩＡＷ  ＳＯＰ  ＡＣ−１１−０７）。
【表６】
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【表７】
2020508990.tif 000008
【０１５５】
材料および方法２
細胞
Ｖｅｒｏアフリカミドリザル細胞および２９３Ｔヒト胎児腎線維芽細胞を、１０％ウシ胎児血清（Ａｔｌａｎｔａ  Ｂｉｏｌｏｇｉｃａｌｓ）、１％ＧｌｕｔａＭＡＸ（Ｔｈｅｒｍｏ  Ｆｉｓｈｅｒ）、および１％ペニシリン−ストレプトマイシン（Ｔｈｅｒｍｏ  Ｆｉｓｈｅｒ）を補充した高グルコースダルベッコ改変イーグル培地（ＤＭＥＭ；Ｔｈｅｒｍｏ  Ｆｉｓｈｅｒ）中で維持した。細胞を、加湿した３７℃、５％ＣＯ２インキュベータ内で維持した。
【０１５６】
水疱性口内炎ウイルス（ＶＳＶ）組換え体および偽型
第１の位置においてｅＧＦＰを発現し、かつ、ＶＳＶ  Ｇの代わりに、ＥＢＯＶ／Ｍａｙｉｎｇａ（ＥＢＯＶ／Ｈ．ｓａｐ−ｔｃ／ＣＯＤ／７６／Ｙａｍｂｕｋｕ−Ｍａｙｉｎｇａ）、ＥＢＯＶ／Ｍａｋｏｎａ（ＥＢＯＶ／Ｈ．ｓａｐ−ｒｅｃ／ＬＢＲ／１４／Ｍａｋｏｎａ−Ｌ２０１４）、ＢＤＢＶ（ＢＤＢＶ／Ｈ．ｓａｐ／ＵＧＡ／０７／Ｂｕｔ−８１１２５０）、ＳＵＤＶ／Ｂｏｎｅｆａｃｅ（ＳＵＤＶ／Ｃ．ｐｏｒ−ｌａｂ／ＳＳＤ／７６／Ｂｏｎｅｆａｃｅ）、ＲＥＳＴＶ（ＲＥＳＴＶ／Ｍ．ｆａｓ−ｔｃ／ＵＳＡ／８９／Ｐｈｉ８９−ＡＺ−１４３５）、およびＬＬＯＶ（ＬＬＯＶ／Ｍ．ｓｃｈ−ｗｔ／ＥＳＰ／０３／Ａｓｔｕｒｉａｓ−Ｂａｔ８６）由来の代表的なＧＰタンパク質をコードする組換え水疱性口内炎インディアナウイルス（ｒＶＳＶ）が、以前に記載されている［１〜３］。ＴＡＦＶ（ＴＡＦＶ／Ｈ．ｓａｐ−ｔｃ／ＣＩＶ／９４／ＣＤＣ８０７２１２）およびＭＡＲＶ（ＭＡＲＶ／Ｈ．ｓａｐ−ｔｃ／ＫＥＮ／８０／Ｍｔ．Ｅｌｇｏｎ−Ｍｕｓｏｋｅ）由来のｅＧＦＰタンパク質およびＧＰタンパク質を有するＶＳＶ偽型を、［４］に記載されるように生じさせた。
【０１５７】
切断されたＶＳＶ−ＧＰ粒子およびＧＰ  ＴＭ外部ドメインタンパク質の生成
いくつかの実験において、ＧＰＣＬを有する切断したウイルス粒子を、最初に、以前に記載されるように［１］、サーモリシン（２００μｇ／ｍＬ、ｐＨ７．５、３７℃、１時間；Ｓｉｇｍａ−Ａｌｄｒｉｃｈ）または組換えヒトカテプシンＬ（ＣａｔＬ、２ｎｇ／μＬ、ｐＨ５．５、３７℃、１時間；Ｒ＆Ｄ  Ｓｙｓｔｅｍｓ）とのインキュベーションによって生じさせた。氷上への取出しおよびホスホラミドン（１ｍＭ）またはＥ−６４（１０μＭ）の添加によって反応を停止させて、ウイルス粒子を感染性アッセイに直ちに用いた。組換え可溶性ＧＰΔＴＭタンパク質［５］もまた、基本的に上記の通りであった。
【０１５８】
ＶＳＶ感染性測定および中和アッセイ
ウイルス感染性を、感染後１２〜１４時間にてＣｅｌｌＩｎｓｉｇｈｔ  ＣＸ５イメージャ（Ｔｈｅｒｍｏ  Ｆｉｓｈｅｒ）を用いて、ｅＧＦＰ＋細胞（感染単位；ＩＵ）の自動カウントによって測定した。ｍＡｂ中和実験について、予め滴定した量のＶＳＶ−ＧＰ粒子（ＭＯＩ≒１ＩＵ／細胞）を、試験ｍＡｂの濃度を増大させながら室温にて１時間インキュベートしてから、９６ウェルプレート内のコンフルエントな細胞単層に加えた。ウイルス中和データを、非線形回帰分析にかけて、ＥＣ５０値（４パラメータ、可変勾配シグモイド用量反応式；ＧｒａｐｈＰａｄ  Ｐｒｉｓｍ）を導き出した。
【表８】
2020508990.tif 000009
【０１５９】
認証されたフィロウイルスおよびマイクロ中和アッセイ
認証されたフィロウイルスＥＢＯＶ／「Ｚａｉｒｅ  １９９５」（ＥＢＯＶ／Ｈ．ｓａｐ−ｔｃ／ＣＯＤ／９５／Ｋｉｋ−９５１０６２１）［６］、マウス適合ＥＢＯＶ／Ｍａｙｉｎｇａ（ＥＢＯＶ−ＭＡ）［７］、ＳＵＤＶ／Ｂｏｎｅｆａｃｅ−ＵＳＡＭＲＩＩＤ１１１８０８、およびＢＤＢＶ／２００７０６２９１［８］を、本研究に用いた。抗体を、示した濃度に培地中で希釈して、ウイルスと１時間インキュベートした。Ｖｅｒｏ  Ｅ６細胞を、０．２（ＥＢＯＶ、ＢＤＢＶ）または０．５（ＳＵＤＶ）プラーク形成単位（ＰＦＵ）／細胞のＭＯＩにて、抗体／ウイルス接種原に１時間曝した。次に、抗体／ウイルス接種原を除去して、フレッシュな培地を加えた。感染後４８時間にて、細胞を固定して、感染細胞を免疫染色して、［３］に記載されるような自動蛍光顕微鏡によって定量化した。
【表９】
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【０１６０】
ｍＡｂの生成
ヒトＥＢＯＶ疾患生存者由来の組換えｍＡｂ、ならびにＰＥ−８７の生殖系列復帰型（ＩＧＬ）ｍＡｂ構築体およびＷＴ：ＩＧＬキメラを、出芽酵母（Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ  ｃｅｒｅｖｉｓｉａｅ）内で発現させて、以前に記載されるように［５］、プロテインＡアフィニティクロマトグラフィによって細胞上清から精製した。他の組換えｍＡｂを、一過性トランスフェクションによって２９３Ｆ細胞内で生じさせて、以前に記載されるように［３］、プロテインＡアフィニティクロマトグラフィによって精製した。
【０１６１】
ＧＰ：ｍＡｂ結合用のＥＬＩＳＡ
ＧＰ交差反応性ｍＡｂを同定するために、ＥＢＯＶ、ＢＤＢＶ、およびＳＵＤＶ  ＧＰを有するｒＶＳＶの基準化した量を、４℃にてプレート上にコーティングした。次に、プレートを、３％ウシ血清アルブミンを含有するＰＢＳ（ＰＢＳＡ）でブロックして、試験抗体の希釈液（５、５０ｎＭ）とインキュベートした。西洋ワサビペルオキシダーゼ（Ｓａｎｔａ  Ｃｒｕｚ  Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ）に結合した抗ヒトＩｇＧおよびＵｌｔｒａ−ＴＭＢ比色基質（Ｔｈｅｒｍｏ  Ｆｉｓｈｅｒ）により、結合Ａｂを検出した。インキュベーションは全て、３７℃にて１時間実行した。
【０１６２】
ＮＰＣ１へのＧＰ／ｍＡｂ結合用の競合ＥＬＩＳＡ
ｒＶＳＶ−ＥＢＯＶ  ＧＰ粒子のウイルス脂質エンベロープを、［２］に記載されるように、機能スペーサ脂質構築体（ＦＳＬビオチン）（Ｓｉｇｍａ−Ａｌｄｒｉｃｈ）を用いて、ｐＨ７．５かつ３７℃にて１時間、ビオチンで標識した。ＧＰＣＬを有するビオチン化ウイルス粒子を、サーモリシンとのインキュベーションによって生成してから、組換えストレプトアビジン（０．６５μｇ／ｍＬ；Ｓｉｇｍａ−Ａｌｄｒｉｃｈ）でプレコーティングした高結合９６ウェルＥＬＩＳＡプレート上に捕捉させた。次に、プレートを、ＰＢＳＡでブロックして、試験ｍＡｂの段階希釈液とインキュベートした。次に、洗浄したプレートを、予め滴定した濃度の可溶性ＦＬＡＧエピトープタグ付きＮＰＣ１ドメインＣ（ＮＰＣ１−Ｃ）タンパク質［９］とインキュベートして、結合したＮＰＣ１−Ｃを、西洋ワサビペルオキシダーゼに結合した抗ＦＬＡＧ抗体（Ｓｉｇｍａ−Ａｌｄｒｉｃｈ）により検出した。インキュベーションは全て、３７℃にて１時間実行した。
【０１６３】
ＧＰ切断のｍＡｂ阻害を検出するためのＥＬＩＳＡおよびイムノブロット
ＣａｔＬによる首尾良いＧＰ→ＧＰＣＬ切断用のプロキシとして、ＥＢＯＶ  ＧＰＣＬ中のＮＰＣ１結合部位の曝露を用いた。上記のようにビオチン化したｒＶＳＶ−ＥＢＯＶ  ＧＰ粒子を、試験ｍＡｂおよび無関係なヒトＩｇＧの混合物（５０、２５０、または１０００ｎＭの試験ｍＡｂ；反応あたり１０００ｎＭの総ＩｇＧ）と、ｐＨ５．５、３７℃にて１時間プレインキュベートした。次に、反応物を、ＣａｔＬ（４ｎｇ／μＬ、３７℃、３０分間）とインキュベートした。次に、反応を、Ｅ−６４で停止させて、ＰＢＳで中性ｐＨに再調整して、ストレプトアビジンコーティングしたＥＬＩＳＡプレート上に捕捉させた。ＮＰＣ１−Ｃ結合を、先のように測定した。
【０１６４】
最高濃度の試験ｍＡｂで処理したサンプルもまた、ウエスタンブロッティングにかけた。切断したＧＰ１種を、西洋ワサビペルオキシダーゼに直接結合したｈ２１Ｄ１０  ｍＡｂ（Ｄｒ．Ｊａｖａｄ  Ａｍａｎからの寄贈）とのイムノブロッティングによって検出した。
【０１６５】
ウイルス中和エスケープ突然変異体の選択
エスケープ突然変異体の選択を、試験ｍＡｂの存在下でのｒＶＳＶ−ＧＰ粒子の連続継代によって実行した。手短に言えば、ウイルスの連続３倍希釈液を、中和アッセイに由来するＩＣ９０値に対応するｍＡｂの濃度とプレインキュベートしてから、１２ウェルプレート中のＶｅｒｏ細胞のコンフルエントな単層に、二反復で加えた。感染を完了まで進行させて（目による＞９０％の細胞死）、ウイルス接種原の最高希釈（すなわち最小量）を受けた感染ウェルから上清を収穫した。先のウイルス含有上清によるｍＡｂ選択下での３連続の継代後、継代４由来の上清を、ウイルス中和エスケープについて試験した。耐性が明らかであれば、個々のウイルスクローンをＶｅｒｏ細胞上でプラーク精製して、そのＧＰ遺伝子配列を、以前に記載されるようにして［１］決定した。以下のエスケープ突然変異体選択を実行した：ｒＶＳＶ−ＥＢＯＶ  ＧＰ／ＭａｋｏｎａによるＰＥ−１６、ｒＶＳＶ−ＳＵＤＶ  ＧＰ／ＢｏｎｅｆａｃｅによるＰＥ−２４、ｒＶＳＶ−ＥＢＯＶ／ＭａｙｉｎｇａによるＰＥ−０５、およびｒＶＳＶ−ＢＤＢＶΔＭｕｃによるＰＥ−６４。
【０１６６】
単粒子電子顕微鏡
抗体ＦａｂおよびＥＢＯＶ  ＧＰ  ＴＭ外部ドメインタンパク質を、以前に記載されるように［５］調製して、１０：１（Ｆａｂ：ＧＰ）の比率で４℃にて一晩インキュベートした。次に、複合体を、炭素コーティングした銅メッシュグリッド上に堆積させて、１％ギ酸ウラニルで染色した。自動画像取得ソフトウェアＬｅｇｉｎｏｎ［１０］を用いて、Ｔｅｃｎａｉ  Ｆ１２顕微鏡でサンプルを画像化した。画像を、Ｔｉｅｔｚ  ４Ｋ  ＣＭＯＳ検出器により５２，０００×の倍率にて収集して、標本レベルにて２．０５Åの最終ピクセルサイズが生じた。画像が、Ａｐｐｉｏｎデータベースに自動的にアップロードされて、この中で加工処理した［１１］。個々の複合体を、ＤｏＧ  Ｐｉｃｋｅｒ［１２］を用いて生の画像から抽出して、２でビン分割して、スタックに配置した。次に、スタックを、ＭＲＡ／ＭＳＡ［１３］を用いる参照なし２Ｄ分類にかけた。Ｆａｂ：ＥＢＯＶ  ＧＰ  ＴＭ複合体に応答しなかったクラス平均を、その後の全ての分析から除去した。２Ｄクラス平均のサブセットを用いて、ＥＭＡＮ２［１４］内の共通線を用いて初期モデルを作成した。次に、生の粒子スタックを、ＥＭＡＮ２を用いて初期モデルに対して洗練して、最終的な３Ｄボリュームを生じさせた。ＵＣＳＦキメラを、モデリングおよび図の生成に用いた［１５］。
【０１６７】
生体層干渉法（ＢＬＩ）によるＧＰ：ｍＡｂ動的結合分析
ＯｃｔｅｔＲｅｄ（商標）システム（ＦｏｒｔｅＢｉｏ、Ｐａｌｌ  ＬＬＣ）を用いて、種々の形態のＥＢＯＶ  ＧＰに対する様々なＩｇＧの結合特性を判定した。抗ヒトＦｃ（ＡＨＣ）捕捉センサ（ＦｏｒｔｅＢｉｏ）を、１×カイネティクスバッファ（０．００２％Ｔｗｅｅｎ−２０および１ｍｇ／ｍＬのＢＳＡを補充したＰＢＳ）中２５ｍｇ／ｍＬでの初期ｍＡｂローディングに用いた。ＧＰへの結合を、ＥＢＯＶ  ＧＰ  ＴＭまたはＧＰＣＬの２倍連続希釈の全体にわたって実行した。ベースライン工程および解離工程を、機器メーカーの推奨事項に従って、１×カイネティクスバッファ中で実行した。ｐＨ５．５での結合の分析について、ＰＢＳベースの１×カイネティクスバッファの代わりに、１×ｐＨ５．５カイネティクスバッファ（５０ｍＭクエン酸ナトリウム二水和物［ｐＨ５．５］、１５０ｍＭ塩化ナトリウム、０．００２％Ｔｗｅｅｎ−２０、および１ｍｇ／ｍＬ  ＢＳＡ）を全ての工程に用いた。全ての反応速度実験について、１：１結合モデルに適合するグローバルデータを用いて、ｋｏｎ（結合速度定数）、ｋｏｆｆ（解離速度定数）、およびＫＤ（平衡解離定数）の値を推定した。
【表１０】
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【０１６８】
マウスにおけるＥＢＯＶおよびＳＵＤＶ感作誘発研究
１０〜１２週齢の雌ＢＡＬＢ／ｃマウス（Ｊａｃｋｓｏｎ  Ｌａｂｓ）に、腹腔内（ｉ．ｐ．）経路を介してＥＢＯＶ−ＭＡ（１００ＰＦＵ；約３，０００ＬＤ５０）により感作誘発を行った。感作誘発の２日後に、マウスをＰＢＳビヒクルまたは３００μｇの各ｍＡｂ（０．３ｍＬ用量、≒１５ｍｇ  ｍＡｂ／ｋｇ）でｉ．ｐ．処置した。動物を、病気および致死の臨床徴候について、毎日観察した。マウスが疾患の徴候を示していた間、毎日の観察を、最低でも１日２回に増やした。瀕死状態のマウスを、ＩＡＣＵＣ承認基準に基づいて、人道的に安楽死させた。
【０１６９】
６〜８週齢の雄および雌の１型ＩＦＮ  α／β受容体ノックアウトマウス（１型ＩＦＮα／β  Ｒ／）（Ｊａｃｋｓｏｎ  Ｌａｂｓ）に、ＷＴ  ＳＵＤＶ（１０００ＰＦＵ  ｉ．ｐ．）で感作誘発を行った。動物を、感作誘発の１および４日後に、ＰＢＳビヒクルまたは１用量あたり３００μｇ（≒１５ｍｇ  ｍＡｂ／ｋｇ）でｉ．ｐ．処置して、先のように監視して安楽死させた。
【表１１】
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【０１７０】
フェレットにおけるＢＤＢＶ感作誘発研究
６ヶ月齢の雌フェレット（Ｍｕｓｔｅｌａ  ｐｕｔｏｒｉｕｓ  ｆｕｒｏ）に、以前に記載されるように［１６］、筋肉内（ｉ．ｍ．）経路を介して、ＷＴ  ＢＤＢＶ（ＢＤＢＶ／Ｈ．ｓａｐ−ｔｃ／ＵＧＡ／０７／Ｂｕｔａｌｙａ−８１１２５０；０．５ｍＬ容量中１０００  ＴＣＩＤ５０）で感作誘発を行った。動物を、感作誘発の３および６日後に、ＰＢＳビヒクルまたは各ｍＡｂ（２ｍＬ容量／用量）の１５ｍｇ（３日目）および１０ｍｇ（６日目）でｉ．ｐ．処置した。加えて、感染後０、３、６、１０、１４、２１、２８日目に、各動物から１ｍＬの血液を採取して、ウイルス負荷を判定して、完全な血球数を測定して、生化学マーカーを評価した。実験の過程で、疾患の徴候について、動物を１日２回監視した。
【０１７１】
動物の権利保護に関する陳述
Ａｎｉｍａｌ  Ｗｅｌｆａｒｅ  Ａｃｔ、ＰＨＳ  Ｐｏｌｉｃｙ、ならびに動物および動物を含む実験に関する他の適用可能な連邦制定法および規制に準拠して、ＩＡＣＵＣが承認したプロトコル下でマウス感作誘発研究を実施した。本研究を実施した施設（ＵＳＡＭＲＩＩＤ）は、国際実験動物ケア評価認証協会（ＡＡＡＬＡＣ）によって認定されており、２０１１年、国立研究評議会（Ｎａｔｉｏｎａｌ  Ｒｅｓｅａｒｃｈ  Ｃｏｕｎｃｉｌ）のＧｕｉｄｅ  ｆｏｒ  ｔｈｅ  Ｃａｒｅ  ａｎｄ  Ｕｓｅ  ｏｆ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ａｎｉｍａｌｓに定められた原則を厳守した。
【０１７２】
フェレットの感作誘発研究は、Ｃａｎａｄｉａｎ  Ｃｏｕｎｃｉｌ  ｏｎ  Ａｎｉｍａｌ  Ｃａｒｅ（ＣＣＡＣ）のガイドラインに従って、Ｗｉｎｎｉｐｅｇ，ＣａｎａｄａのＣａｎａｄｉａｎ  Ｓｃｉｅｎｃｅ  Ｃｅｎｔｒｅ  ｆｏｒ  Ｈｕｍａｎ  ａｎｄ  Ａｎｉｍａｌ  Ｈｅａｌｔｈ（ＣＳＣＨＡＨ）のＡｎｉｍａｌ  Ｃａｒｅ  Ｃｏｍｍｉｔｔｅｅ（ＡＣＣ）によって承認された。
【０１７３】
統計分析
用量応答中和曲線を、非線形回帰分析によってロジスティック方程式に適合させた。抽出したＩＣ５０パラメータについての９５％信頼区間（９５％ＣＩ）を、正規性の仮定（ａｓｓｕｍｐｔｉｏｎ  ｏｆ  ｎｏｒｍａｌｉｔｙ）の下で推定した。生存曲線の分析を、Ｍａｎｔｅｌ−Ｃｏｘ（ログランク）検定で実行した。ウイルス力価の統計的比較を、対応のないｔ検定で実行した。試験レベル（アルファ）を、全ての統計的検定について０．０５とした。全ての分析を、ＧｒａｐｈＰａｄ  Ｐｒｉｓｍで実行した。
【０１７４】
材料および方法２に関する参考文献
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【０１７５】
背景技術、概要、材料および方法１に関する参考文献
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【図１】
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【図２】
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【図３】
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【図４】
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【図５】
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【図６】
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【図７】
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【図８】
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【図９】
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【図１０】
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【図１１】
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【図１２】
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【図１３】
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【配列表】
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【国際調査報告】
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