(57)【要約】ＭＥＴに結合する抗体および二重特異的抗原結合分子ならびにその使用方法が本明細書で提供される。二重特異的抗原結合分子は、第１の抗原結合ドメインおよび第２の抗原結合ドメインを含み、第１の抗原結合ドメインおよび第２の抗原結合ドメインは、ヒトＭＥＴの細胞外ドメインの２つの異なる（好ましくは重複しない）エピトープに結合する。二重特異的抗原結合分子は、ヒトＭＥＴとそのリガンドＨＧＦとの間の相互作用を遮断することができる。二重特異的抗原結合分子は、例えば、望まれないＭＥＴアゴニスト活性を発揮する傾向のある、二重特異的分子の抗原結合ドメインのうちの１つのみを含む一価抗原結合分子と比較して、最小限のＭＥＴアゴニスト活性を示すことができるか、またはＭＥＴアゴニスト活性を全く示すことができない。【特許請求の範囲】
【請求項１】
第１の抗原結合ドメイン（Ｄ１）と；
第２の抗原結合ドメイン（Ｄ２）と
を含み、
Ｄ１がヒトＭＥＴの第１のエピトープに特異的に結合し；
Ｄ２がヒトＭＥＴの第２のエピトープに特異的に結合する、二重特異的抗原結合分子。
【請求項２】
Ｄ１およびＤ２が、ヒトＭＥＴに対する結合について互いに競合しない、請求項１に記載の二重特異的抗原結合分子。
【請求項３】
ヒトＭＥＴとＨＧＦの間の相互作用を遮断することができる、請求項１または２に記載の二重特異的抗原結合分子。
【請求項４】
細胞ベースのＭＥＴ活性レポーターアッセイにおいて最小限のアゴニスト活性を示す、請求項３に記載の二重特異的抗原結合分子。
【請求項５】
細胞ベースのＭＥＴ活性レポーターアッセイにおいてＭＥＴアゴニスト活性を示さない、請求項３に記載の二重特異的抗原結合分子。
【請求項６】
細胞ベースのＭＥＴ活性レポーターアッセイにおいて、Ｄ１またはＤ２のみを含む一価抗原結合分子のＭＥＴアゴニスト活性の１０％未満である程度のＭＥＴアゴニスト活性を示す、請求項４に記載の二重特異的抗原結合分子。
【請求項７】
細胞表面に発現するＭＥＴの分解を促進する、請求項１〜６のいずれか１項に記載の二重特異的抗原結合分子。
【請求項８】
ＭＥＴの遺伝的改変を有する腫瘍の成長を阻害する、請求項１〜７のいずれか１項に記載の二重特異的抗原結合分子。
【請求項９】
ＭＥＴの遺伝的改変を有する腫瘍の腫瘍退縮を促進する、請求項１〜７のいずれか１項に記載の二重特異的抗原結合分子。
【請求項１０】
成長がオートクリンＨＧＦシグナル伝達によって駆動される腫瘍の成長を阻害する、請求項１〜９のいずれか１項に記載の二重特異的抗原結合分子。
【請求項１１】
成長がオートクリンＨＧＦシグナル伝達によって駆動される腫瘍の腫瘍退縮を促進する、請求項１〜９のいずれか１項に記載の二重特異的抗原結合分子。
【請求項１２】
Ｄ１が、配列番号５８のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域（ＨＣＶＲ）内の３つの重鎖相補性決定領域（ＨＣＤＲ１、ＨＣＤＲ２、およびＨＣＤＲ３）と、配列番号１３８のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域（ＬＣＶＲ）内の３つの軽鎖相補性決定領域（ＬＣＤＲ１、ＬＣＤＲ２、およびＬＣＤＲ３）とを含む、請求項１〜１１のいずれか１項に記載の二重特異的抗原結合分子。
【請求項１３】
ＨＣＤＲ１が、配列番号６０のアミノ酸配列またはそれと少なくとも９５％同一であるアミノ酸配列を含み；ＨＣＤＲ２が、配列番号６２のアミノ酸配列またはそれと少なくとも９５％同一であるアミノ酸配列を含み；ＨＣＤＲ３が、配列番号６４のアミノ酸配列またはそれと少なくとも９５％同一であるアミノ酸配列を含み；ＬＣＤＲ１が、配列番号１４０のアミノ酸配列またはそれと少なくとも９５％同一であるアミノ酸配列を含み；ＬＣＤＲ２が、配列番号１４２のアミノ酸配列またはそれと少なくとも９５％同一であるアミノ酸配列を含み；ＬＣＤＲ３が、配列番号１４４のアミノ酸配列またはそれと少なくとも９５％同一であるアミノ酸配列を含む、請求項１２に記載の二重特異的抗原結合分子。
【請求項１４】
ＨＣＤＲ１が配列番号６０のアミノ酸配列を含み；ＨＣＤＲ２が配列番号６２のアミノ酸配列を含み；ＨＣＤＲ３が配列番号６４のアミノ酸配列を含み；ＬＣＤＲ１が配列番号１４０のアミノ酸配列を含み；ＬＣＤＲ２が配列番号１４２のアミノ酸配列を含み；ＬＣＤＲ３が配列番号１４４のアミノ酸配列を含む、請求項１３に記載の二重特異的抗原結合分子。
【請求項１５】
配列番号５８のアミノ酸配列またはそれと少なくとも９５％同一であるアミノ酸配列を含むＨＣＶＲと；配列番号１３８のアミノ酸配列またはそれと少なくとも９５％同一であるアミノ酸配列を含むＬＣＶＲとを含む、請求項１３に記載の二重特異的抗原結合分子。
【請求項１６】
配列番号５８のアミノ酸配列を含むＨＣＶＲと；配列番号１３８のアミノ酸配列を含むＬＣＶＲとを含む、請求項１５に記載の二重特異的抗原結合分子。
【請求項１７】
Ｄ２が、配列番号８２のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域（ＨＣＶＲ）内の３つの重鎖相補性決定領域（ＨＣＤＲ１、ＨＣＤＲ２、およびＨＣＤＲ３）と、配列番号１３８のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域（ＬＣＶＲ）内の３つの軽鎖相補性決定領域（ＬＣＤＲ１、ＬＣＤＲ２、およびＬＣＤＲ３）とを含む、請求項１〜１６のいずれか１項に記載の二重特異的抗原結合分子。
【請求項１８】
ＨＣＤＲ１が、配列番号８４のアミノ酸配列またはそれと少なくとも９５％同一であるアミノ酸配列を含み；ＨＣＤＲ２が、配列番号８６のアミノ酸配列またはそれと少なくとも９５％同一であるアミノ酸配列を含み；ＨＣＤＲ３が、配列番号８８のアミノ酸配列またはそれと少なくとも９５％同一であるアミノ酸配列を含み；ＬＣＤＲ１が、配列番号１４０のアミノ酸配列またはそれと少なくとも９５％同一であるアミノ酸配列を含み；ＬＣＤＲ２が、配列番号１４２のアミノ酸配列またはそれと少なくとも９５％同一であるアミノ酸配列を含み；ＬＣＤＲ３が、配列番号１４４のアミノ酸配列またはそれと少なくとも９５％同一であるアミノ酸配列を含む、請求項１７に記載の二重特異的抗原結合分子。
【請求項１９】
ＨＣＤＲ１が配列番号８４のアミノ酸配列を含み；ＨＣＤＲ２が配列番号８６のアミノ酸配列を含み；ＨＣＤＲ３が配列番号８８のアミノ酸配列を含み；ＬＣＤＲ１が配列番号１４０のアミノ酸配列を含み；ＬＣＤＲ２が配列番号１４２のアミノ酸配列を含み；ＬＣＤＲ３が配列番号１４４のアミノ酸配列を含む、請求項１８に記載の二重特異的抗原結合分子。
【請求項２０】
配列番号８２のアミノ酸配列またはそれと少なくとも９５％同一であるアミノ酸配列を含むＨＣＶＲと；配列番号１３８のアミノ酸配列またはそれと少なくとも９５％同一であるアミノ酸配列を含むＬＣＶＲとを含む、請求項１８に記載の二重特異的抗原結合分子。
【請求項２１】
配列番号８２のアミノ酸配列を含むＨＣＶＲと；配列番号１３８のアミノ酸配列を含むＬＣＶＲとを含む、請求項２０に記載の二重特異的抗原結合分子。
【請求項２２】
ヒトＭＥＴの前記第１のエピトープが、配列番号１５５のアミノ酸１９２〜２０４を含む、請求項１に記載の二重特異的抗原結合分子。
【請求項２３】
ヒトＭＥＴの前記第２のエピトープが、配列番号１５５のアミノ酸３０５〜３１５およびアミノ酸４２１〜４５５を含む、請求項１に記載の二重特異的抗原結合分子。
【請求項２４】
ヒトＭＥＴの前記第１のエピトープが、配列番号１５５のアミノ酸１９２〜２０４を含み、ヒトＭＥＴの前記第２のエピトープが、配列番号１５５のアミノ酸３０５〜３１５およびアミノ酸４２１〜４５５を含む、請求項１に記載の二重特異的抗原結合分子。
【請求項２５】
細胞毒素にコンジュゲートされている、請求項１に記載の二重特異的抗原結合分子。
【請求項２６】
前記細胞毒素が、生物毒素、化学療法剤、および放射性同位元素からなる群から選択される、請求項２５に記載の二重特異的抗原結合分子。
【請求項２７】
前記細胞毒素が、メイタンシノイド、アウリスタチン、デュオカルマイシン、２２５Ａｃ、２２７Ｔｈ、およびその任意の誘導体からなる群から選択される、請求項２５に記載の二重特異的抗原結合分子。
【請求項２８】
リンカーを介して細胞傷害剤にコンジュゲートされている、請求項１に記載の二重特異的抗原結合分子。
【請求項２９】
前記細胞傷害剤がメイタンシノイドである、請求項２８に記載の二重特異的抗原結合分子。
【請求項３０】
配列番号１８または５８のＤ１−ＨＣＶＲアミノ酸配列内のＣＤＲと、配列番号８２のＤ２−ＨＣＶＲアミノ酸配列内のＣＤＲとを含む、請求項２９に記載の二重特異的抗原結合分子。
【請求項３１】
前記メイタンシノイドが、
【化８１】
2020509027.tif 000124
であり、式中、
【化８２】
2020509027.tif 000125
が、前記リンカーに対する結合である、請求項３０に記載の二重特異的抗原結合分子。
【請求項３２】
前記リンカーが、
【化８３】
2020509027.tif 000126
であり、式中、
【化８４】
2020509027.tif 000127
で示される結合が、前記二重特異的抗原結合分子に対する結合を表し、
【化８５】
2020509027.tif 000128
で示される結合が、前記メイタンシノイドに対する結合を表す、請求項３１に記載の二重特異的抗原結合分子。
【請求項３３】
前記メイタンシノイドが、
【化８６】
2020509027.tif 000129
であり、式中、
【化８７】
2020509027.tif 000130
が、前記リンカーに対する結合である、請求項２９に記載の二重特異的抗原結合分子。
【請求項３４】
前記リンカーが、
【化８８】
2020509027.tif 000131
であり、式中、
【化８９】
2020509027.tif 000132
で示される結合が、前記二重特異的抗原結合分子に対する結合を表し、
【化９０】
2020509027.tif 000133
で示される結合が、前記メイタンシノイドに対する結合を表す、請求項３３に記載の二重特異的抗原結合分子。
【請求項３５】
請求項１に記載の二重特異的抗原結合分子と、薬学的に許容されるキャリアとを含む医薬組成物。
【請求項３６】
ＭＥＴの遺伝的改変を有する腫瘍および／または成長がオートクリンＨＧＦシグナル伝達によって駆動される腫瘍に罹患している対象におけるがんを処置する方法であって、該対象に請求項１〜３４のいずれか１項に記載の二重特異的抗原結合分子を投与することを含む、方法。
【請求項３７】
前記がんが、非小細胞肺がん（ＮＳＣＬＣ）、胃がん、結腸直腸がん、および頭頸部がんからなる群から選択される、請求項３６に記載の方法。
【請求項３８】
前記対象に第２の抗がん治療剤を投与することをさらに含む、請求項３６に記載の方法。
【請求項３９】
対象におけるがんを処置する、腫瘍成長を低下させる、および／または腫瘍退縮を引き起こす方法であって、それを必要とする対象に、二重特異的抗原結合分子と細胞毒素とを含む抗体−薬物コンジュゲート（ＡＤＣ）を投与することを含み、前記二重特異的抗原結合分子が、
第１の抗原結合ドメイン（Ｄ１）と；
第２の抗原結合ドメイン（Ｄ２）と
を含み、
Ｄ１がヒトＭＥＴの第１のエピトープに特異的に結合し；
Ｄ２がヒトＭＥＴの第２のエピトープに特異的に結合する、方法。
【請求項４０】
Ｄ１が、配列番号１８または５８のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域（ＨＣＶＲ）内の３つの重鎖相補性決定領域（ＨＣＤＲ１、ＨＣＤＲ２、およびＨＣＤＲ３）と、配列番号１３８のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域（ＬＣＶＲ）内の３つの軽鎖相補性決定領域（ＬＣＤＲ１、ＬＣＤＲ２、およびＬＣＤＲ３）とを含む、請求項３９に記載の方法。
【請求項４１】
Ｄ２が、配列番号８２のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域（ＨＣＶＲ）内の３つの重鎖相補性決定領域（ＨＣＤＲ１、ＨＣＤＲ２、およびＨＣＤＲ３）と、配列番号１３８のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域（ＬＣＶＲ）内の３つの軽鎖相補性決定領域（ＬＣＤＲ１、ＬＣＤＲ２、およびＬＣＤＲ３）とを含む、請求項３９に記載の方法。
【請求項４２】
ヒトＭＥＴの前記第１のエピトープが、配列番号１５５のアミノ酸１９２〜２０４を含む、請求項３９に記載の二重特異的抗原結合分子。
【請求項４３】
ヒトＭＥＴの前記第２のエピトープが、配列番号１５５のアミノ酸３０５〜３１５およびアミノ酸４２１〜４５５を含む、請求項３９に記載の二重特異的抗原結合分子。
【請求項４４】
ヒトＭＥＴの前記第１のエピトープが、配列番号１５５のアミノ酸１９２〜２０４を含み、ヒトＭＥＴの前記第２のエピトープが、配列番号１５５のアミノ酸３０５〜３１５およびアミノ酸４２１〜４５５を含む、請求項３９に記載の二重特異的抗原結合分子。
【請求項４５】
前記細胞毒素が、生物毒素、化学療法剤、および放射性同位元素からなる群から選択される、請求項３９に記載の方法。
【請求項４６】
前記細胞毒素が、メイタンシノイド、アウリスタチン、トメイマイシン、デュオカルマイシン、２２５Ａｃ、２２７Ｔｈ、およびその任意の誘導体からなる群から選択される、請求項３９に記載の方法。
【請求項４７】
前記二重特異的抗原結合分子が、配列番号５８のＤ１−ＨＣＶＲアミノ酸配列内のＣＤＲと、配列番号８２のＤ２−ＨＣＶＲアミノ酸配列内のＣＤＲとを含む、請求項３９に記載の方法。
【請求項４８】
前記細胞毒素が、リンカーを介して前記二重特異的抗原結合分子にコンジュゲートされており、該細胞毒素が、
【化９１】
2020509027.tif 000134
であり、式中、
【化９２】
2020509027.tif 000135
がリンカーに対する結合である、請求項４６に記載の方法。
【請求項４９】
前記リンカーが、
【化９３】
2020509027.tif 000136
であり、
式中、
【化９４】
2020509027.tif 000137
で示される結合が、前記二重特異的抗原結合分子に対する結合を表し、
【化９５】
2020509027.tif 000138
で示される結合が、前記細胞毒素に対する結合を表す、請求項４８に記載の方法。
【請求項５０】
前記細胞毒素が、リンカーを介して前記二重特異的抗原結合分子にコンジュゲートされており、該細胞毒素が、
【化９６】
2020509027.tif 000139
であり、式中、
【化９７】
2020509027.tif 000140
が、該リンカーに対する結合である、請求項４２に記載の方法。
【請求項５１】
前記リンカーが、
【化９８】
2020509027.tif 000141
であり、式中、
【化９９】
2020509027.tif 000142
で示される結合が、前記二重特異的抗原結合分子に対する結合を表し、
【化１００】
2020509027.tif 000143
で示される結合が、前記細胞毒素に対する結合を表す、請求項４２に記載の方法。
【請求項５２】
抗体−薬物コンジュゲートを調製するための方法であって、抗ＭＥＴ抗体またはＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗原結合タンパク質を、以下の式Ａ１：
【化１０１】
2020509027.tif 000144
を有する化合物および水性希釈剤と接触させるステップを含む、方法。
【請求項５３】
前記抗ＭＥＴ抗体が、配列番号８２／１３８のＨＣＶＲ／ＬＣＶＲアミノ酸配列対内のＣＤＲを含む、請求項５２４に記載の方法。
【請求項５４】
前記ＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗原結合タンパク質が、配列番号５８のＤ１−ＨＣＶＲアミノ酸配列内のＣＤＲと、配列番号８２のＤ２−ＨＣＶＲアミノ酸配列内のＣＤＲとを含む、請求項５２に記載の方法。
【請求項５５】
前記ＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗原結合タンパク質が、配列番号１８のＤ１−ＨＣＶＲアミノ酸配列内のＣＤＲと、配列番号８２のＤ２−ＨＣＶＲアミノ酸配列内のＣＤＲとを含む、請求項５２に記載の方法。
【請求項５６】
式Ａ１の前記化合物が、化学量論的に過剰に存在する、請求項５２に記載の方法。
【請求項５７】
式Ａ１の前記化合物が、式Ａ２もしくはＡ３
【化１０２】
2020509027.tif 000145
【化１０３】
2020509027.tif 000146
の化合物、またはその混合物を含む、請求項５２に記載の方法。
【請求項５８】
式Ａ２の前記化合物がステレオマー的に純粋である、請求項５２に記載の方法。
【請求項５９】
式Ａ３の前記化合物がステレオマー的に純粋である、請求項５２に記載の方法。
【請求項６０】
Ａ１またはＡ２の前記化合物が、５０％を超える、７０％を超える、９０％を超える、または９５％を超えるジアステレオマー過剰で存在する、請求項５２に記載の方法。
【請求項６１】
式Ａ１の前記化合物が、シリカゲルおよび希釈剤の存在下で、式（ａ）の化合物
【化１０４】
2020509027.tif 000147
を、式（ｂ）の化合物
【化１０５】
2020509027.tif 000148
と接触させることによって調製される、請求項５２に記載の方法。
【請求項６２】
シリカゲルおよび希釈剤の存在下で、
（ｉ）式（ａ）の化合物：
【化１０６】
2020509027.tif 000149
を式（ｂ）の化合物：
【化１０７】
2020509027.tif 000150
と接触させて、中間体を合成し、
（ｉｉ）抗ＭＥＴ抗体またはＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗原結合タンパク質を該中間体および水性希釈剤と接触させる
プロセスによって調製される、抗体−薬物コンジュゲート。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
本発明は、肝細胞成長因子受容体（ｃ−ＭｅｔまたはＭＥＴ）に特異的に結合し、ＭＥＴシグナル伝達を調節する抗体、二重特異的抗体、およびそれらの抗原結合断片、ならびにそのような抗体の抗体−薬物コンジュゲート、ならびにそれらの使用方法に関する。
配列表
【０００２】
配列表の公式なコピーは、２０１７年１１月６日に作成された、約１３６キロバイトのサイズの、１０３１６ＷＯ０１＿Ｓｅｑｕｅｎｃｅ＿Ｌｉｓｔｉｎｇ＿ＳＴ２５＿２０１７＿１１＿０６．ＴＸＴというファイル名で、ＡＳＣＩＩ形式の配列表としてＥＦＳ−Ｗｅｂを介して本明細書と同時に電子的に提出される。このＡＳＣＩＩ形式の文書に含まれる配列表は本明細書の一部であり、その全体が参照により本明細書に組み込まれる。
【背景技術】
【０００３】
肝細胞成長因子（ＨＧＦ）（別名、細胞分散因子［ＳＦ］）は、ＨＧＦ受容体（ＨＧＦＲ）との相互作用によりその活性を発揮するヘテロ二量体のパラクリン成長因子である。ＨＧＦＲは、ｃ−Ｍｅｔ癌遺伝子の産物であり、ＭＥＴとしてもまた公知である。ＭＥＴは、ジスルフィド架橋を介して細胞外アルファ鎖に連結した膜貫通ベータ鎖からなる受容体チロシンキナーゼである。ＨＧＦのＭＥＴへの結合は、ＭＥＴのキナーゼ触媒活性を活性化し、ベータ鎖のＴｙｒ１２３４およびＴｙｒ１２３５のリン酸化をもたらし、続いて下流のシグナル伝達経路の活性化をもたらす。
【０００４】
ＭＥＴおよび／またはＨＧＦの過剰発現、活性化、または増幅は、非小細胞肺癌（ＮＳＣＬＣ）、胃癌、卵巣癌、膵臓癌、甲状腺癌、乳癌、頭頸部癌、結腸癌および腎臓癌に関与することが示されている（ＳｉｅｒｒａおよびＴｓａｏ、Ｔｈｅｒ．  Ａｄｖ．  Ｍｅｄ．  Ｏｎｃｏｌ．、３巻（１号補遺）：Ｓ２１〜Ｓ３５頁、２０１１年）。ＭＥＴ増幅は、ＮＳＣＬＣおよび食道胃悪性腫瘍における腫瘍形成の主な駆動因子であると考えられている。さらに、ＭＥＴのエクソン１４欠失という結果をもたらす変異は、ＮＳＣＬＣのサブセットにおける腫瘍形成駆動因子として記載されている。ＭＥＴ遺伝子増幅を有する腫瘍細胞株は、成長および生存について、ＭＥＴに強く依存している。前臨床データは、ＮＳＣＬＣ、結腸直腸がん、頭頸部扁平上皮癌（ＨＮＳＣＣ）などの複数の腫瘍の型における標的治療に対する耐性において、ＭＥＴシグナル伝達が関与しているとしている。
前臨床と最近の臨床結果の両方が、これらの遺伝的改変を有する腫瘍がＭＥＴ阻害剤に応答することを示し、ＭＥＴをがんの推進因子であると確認している。様々な一価のＭＥＴ遮断抗体は、様々ながんの処置のための臨床開発中にある（米国特許第５，６８６，２９２号；米国特許第５，６４６，０３６号；米国特許第６，０９９，８４１号；米国特許第７，４７６，７２４号；米国特許第９，２６０，５３１号；および米国特許第９，３２８，１７３号；ならびに米国特許出願公開第２０１４／０３４９３１０号、および米国特許出願公開第２００５／０２３３９６０号を参照されたい）。それらの抗体には、オナルツズマブ（ＭｅｔＭａｂ）およびエミベツズマブ（ｅｍｉｂｅｔｕｚｕｍａｂ）が含まれる（Ｘｉａｎｇら、Ｃｌｉｎ．  Ｃａｎｃｅｒ  Ｒｅｓ．１９巻（１８号）：５０６８〜７８頁、２０１３年、およびＲｏｓｅｎら、Ｃｌｉｎ．  Ｃａｎｃｅｒ  Ｒｅｓ．２０１６年１０月１０日刊行、ｄｏｉ：  １０．１１５８／１０７８−０４３２．ＣＣＲ−１６−１４１８）。これらの抗体のいくつかは、リガンド依存性ＭＥＴシグナル伝達を遮断するが、リガンド非依存性ＭＥＴ活性化の遮断についてはそれほど効果的ではない。
【先行技術文献】
【特許文献】
【０００５】
【特許文献１】米国特許第５，６８６，２９２号明細書
【特許文献２】米国特許第５，６４６，０３６号明細書
【特許文献３】米国特許第６，０９９，８４１号明細書
【特許文献４】米国特許第７，４７６，７２４号明細書
【特許文献５】米国特許第９，２６０，５３１号明細書
【特許文献６】米国特許第９，３２８，１７３号明細書
【特許文献７】米国特許出願公開第２０１４／０３４９３１０号明細書
【特許文献８】米国特許出願公開第２００５／０２３３９６０号明細書
【非特許文献】
【０００６】
【非特許文献１】ＳｉｅｒｒａおよびＴｓａｏ、Ｔｈｅｒ．  Ａｄｖ．  Ｍｅｄ．  Ｏｎｃｏｌ．、３巻（１号補遺）：Ｓ２１〜Ｓ３５頁、２０１１年
【非特許文献２】Ｘｉａｎｇら、Ｃｌｉｎ．  Ｃａｎｃｅｒ  Ｒｅｓ．１９巻（１８号）：５０６８〜７８頁、２０１３年
【非特許文献３】Ｒｏｓｅｎら、Ｃｌｉｎ．  Ｃａｎｃｅｒ  Ｒｅｓ．２０１６年１０月１０日刊行、ｄｏｉ：  １０．１１５８／１０７８−０４３２．ＣＣＲ−１６−１４１８
【発明の概要】
【課題を解決するための手段】
【０００７】
リガンド依存性とリガンド非依存性の両方のＭＥＴシグナル伝達を強力に遮断する改善された抗がん薬に対する重大な未だ満たされていない医学的必要性が依然として存在する。
ヒトｃ−Ｍｅｔ受容体タンパク質（ＭＥＴ×ＭＥＴ）に結合する、抗体、抗体の抗原結合断片、二価単一特異的抗体の組み合わせ、および二重特異的抗体が本明細書で提供される。抗体は、ＭＥＴを発現する腫瘍細胞の標的化にとりわけ有用である。抗ＭＥＴ抗体およびその抗原結合ポーションは、非修飾型で単独で使用しても、抗体−薬物コンジュゲートまたは二重特異的抗体の一部として含まれていてもよい。
【０００８】
他の実施形態は、以下の詳細な説明を再吟味することから明らかになる。
【図面の簡単な説明】
【０００９】
【図１】図１は、本明細書で開示される、２７２の例示的なＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗体の構成成分を図示するマトリックスである。マトリックスの各々の番号付き細胞は、「Ｄ１」抗原結合ドメインおよび「Ｄ２］抗原結合ドメインを含む特有の二重特異的抗体を同定し、Ｄ１抗原結合ドメインは、免疫グロブリン可変ドメイン（ＨＣＶＲ／ＬＣＶＲアミノ酸配列対）またはＹ軸に沿って列挙される対応する抗ＭＥＴ抗体由来のＣＤＲを含み、Ｄ２抗原結合ドメインは、免疫グロブリン可変ドメイン（ＨＣＶＲ／ＬＣＶＲアミノ酸配列対）またはＸ軸に沿って列挙される対応する抗ＭＥＴ抗体由来のＣＤＲを含む。
【００１０】
【図２】図２は、ＳＲＥ−ルシフェラーゼレポーター遺伝子構築物を含有するＨＥＫ２９３Ｔ細胞における、抗体に誘導されるＭＥＴ経路の活性化、またはＨＧＦに誘導される経路の活性化の抗体による遮断を評価するために使用されるルシフェラーゼベースのレポーターアッセイの概略図である。
【００１１】
【図３】図３Ａ〜Ｂは、１リットル当たりの対数モルでの抗体濃度の関数としての、ＳＲＥ−ルシフェラーゼ発現を表す相対光度単位（ＲＬＵ）を示す折れ線グラフである。黒四角（■）は、親二価単一特異的抗体Ｈ４Ｈ１３３０６Ｐ２を表し、黒いピラミッド形（▲）は、親二価単一特異的抗体Ｈ４Ｈ１３３１２Ｐ２を表し、黒丸（●）は、一価抗体を表し、黒い菱形（◆）は、アイソタイプ対照を表し、黒い逆ピラミッド形（▼）は、リガンドなしを表す。図３Ａは、ＨＧＦリガンドを有さない抗体単独を示す。図３Ｂは、抗体プラスＨＧＦリガンドを示す。
【００１２】
【図４】図４Ａ〜Ｂは、１リットル当たりの対数モルでの抗体濃度の関数としての、ＳＲＥ−ルシフェラーゼ発現を表す相対光度単位（ＲＬＵ）を示す折れ線グラフである。黒四角（■）は、抗ＭＥＴ一価抗体を表し、黒丸（●）は、ＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗体を表し、黒い菱形（◆）は、親抗体Ｈ４Ｈ１３３１２Ｐ２を表す。図４Ａは、ＨＧＦリガンドを有さない抗体単独を示す。図４Ｂは、抗体プラスＨＧＦリガンドを示す。
【００１３】
【図５】図５は、ヒト二価単一特異的抗ＭＥＴ抗体１〜１８、対照抗体、および抗ＭＥＴ一価抗体による処置の関数としての、ＭＥＴ増幅胃がんＳＮＵ５細胞の相対的細胞成長を示す棒グラフである。比較の目的のために、抗体８（横座標）は、親抗体Ｈ４Ｈ１３３０６Ｐ２であり、抗体１１（横座標）は、親抗体Ｈ４Ｈ１３３１２Ｐ２である。
【００１４】
【図６】図６Ａ〜Ｂは、ＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗体、対照抗体、および抗ＭＥＴ一価抗体による処置の関数としてのＭＥＴ増幅細胞の相対的細胞成長を示す棒グラフを含有する。図６Ａは、対照抗体、０．１、１、および１０μｇ／ｍＬの一価抗体、ならびに０．１、１、および１０μｇ／ｍＬのＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗体による処置の関数としての、ＳＮＵ５細胞の相対的成長を示す。図６Ｂは、対照抗体、ならびに０．１、および１μｇ／ｍＬのＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗体による処置の関数としての、ＥＢＣ−１細胞の相対的成長を示す。
【００１５】
【図７】図７Ａ〜Ｂは、対照抗体、およびＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗体による処置後のＨｓ７４６Ｔ細胞から抽出したｐＭＥＴ（リン酸化ＭＥＴ）、ＭＥＴ、ｐＥｒｋ（リン酸化Ｅｒｋ）、およびチューブリン（ローディング対照のため）（図７Ａ）、ならびに０、２、および６時間のＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗体による処置後のＨｓ７４６Ｔ細胞におけるＭＥＴ（およびローディング対照としてのチューブリン）の発現（図７Ｂ）のイムノブロットを示す。
【００１６】
【図８】図８は、対照抗体、ＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗体、抗ＭＥＴ単一特異的二価親抗体１、抗ＭＥＴ単一特異的二価親抗体２、および親抗体１と２の組み合わせによる処置後のＨｓ７４６Ｔ細胞から抽出したｐＭＥＴ、ＭＥＴ、ｐＥｒｋ、およびチューブリン（ローディング対照のため）のイムノブロットを示す。
【００１７】
【図９】図９は、２、６、および１８時間の、対照抗体およびＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗体による処置後のＨｓ７４６Ｔ細胞における、ＭＥＴ（およびローディング対照としてのチューブリン）の発現のイムノブロットを示す。
【００１８】
【図１０】図１０Ａ〜Ｂは、対照抗体、およびＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗体による処置後のＳＮＵ５細胞から抽出したｐＭＥＴ、ＭＥＴ、ｐＥｒｋ、およびチューブリン（ローディング対照のため）（図１０Ａ）、ならびに対照抗体および抗ＭＥＴ一価抗体による処置後のＳＮＵ５細胞におけるＭＥＴ（およびローディング対照としてのチューブリン）の発現（図１０Ｂ）のイムノブロットを示す。
【００１９】
【図１１】図１１は、対照抗体およびＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗体による処置後のＥＢＣ−１細胞から抽出したｐＭＥＴ、ＭＥＴ、ｐＥｒｋ、およびチューブリン（ローディング対照のため）のイムノブロットを示す。
【００２０】
【図１２】図１２は、対照抗体（黒四角■）、ＭＥＴ一価抗体（黒丸●）、またはＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗体（黒い菱形◆）により処置した動物における、ＥＢＣ−１細胞の移植後の日数での時間の関数としての、立方ミリメートルでのＥＢＣ−１腫瘍体積における変化を示す折れ線グラフである。
【００２１】
【図１３】図１３Ａ〜Ｂは、ＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗体、対照抗体、および抗ＭＥＴ一価抗体による処置の関数としてのＭＥＴ増幅細胞の相対的細胞成長を示す棒グラフを含有する。図１３Ａは、対照抗体、ＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗体、ＭＥＴ×ＭＥＴ親単一特異的抗体１、ＭＥＴ×ＭＥＴ親単一特異的抗体２、および親抗体１と２の組み合わせによる処置の関数としてのＨｓ７４６Ｔ細胞の相対的成長を示す。図１３Ｂは、対照抗体、１、１０、および２５μｇ／ｍＬの一価抗体、ならびに１、１０、および２５μｇ／ｍＬのＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗体による処置の関数としての、Ｈｓ７４６Ｔ細胞の相対的成長を示す。
【００２２】
【図１４】図１４は、対照抗体（Ｃ）、ＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗体（ＭＭ）、ＭＥＴ×ＭＥＴ親単一特異的抗体１（Ｍ１）、ＭＥＴ×ＭＥＴ親単一特異的抗体２（Ｍ２）、親抗体１と２の組み合わせ（Ｍ１Ｍ２）、およびＭＥＴアゴニスト肝細胞成長因子（ＨＧＦ）による処置の関数としての、ＮＣＩ−Ｈ５９６細胞の相対的細胞成長を示す棒グラフである。
【００２３】
【図１５】図１５は、対照抗体（黒四角■）、ＭＥＴ一価抗体（黒丸●）、またはＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗体（黒い菱形◆）により処置した動物における、Ｈｓ７４６Ｔ細胞の移植後の日数での時間の関数としての、立方ミリメートルでのＨｓ７４６Ｔ腫瘍体積における変化を示す折れ線グラフである。
【００２４】
【図１６Ａ】図１６Ａは、対照抗体（黒四角■）、１ｍｇ／ｍＬのＭＥＴ一価抗体（黒丸●）、１０ｍｇ／ｍＬのＭＥＴ一価抗体（白丸○）、１ｍｇ／ｍＬのＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗体（黒い菱形◆）、または１０ｍｇ／ｍＬのＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗体（白い菱形◇）により処置した動物における、ＳＮＵ５細胞の移植後の日数での時間の関数としての、立方ミリメートルでのＳＮＵ５腫瘍体積の変化を示す折れ線グラフである。
【００２５】
【図１６Ｂ】図１６Ｂは、対照抗体、１０ｍｇ／ｋｇの抗ＭＥＴ一価抗体、および１０ｍｇ／ｋｇのＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗体による処置後のマウス異種移植片モデルから取り出されたＳＮＵ５腫瘍から抽出されたｐＭＥＴ、ＭＥＴ、およびチューブリン（ローディング対照）のイムノブロットである。
【００２６】
【図１７】図１７は、対照抗体（黒四角■）、ＭＥＴ一価抗体（黒丸●）、またはＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗体（黒い菱形◆）により処置した動物における、Ｕ８７−ＭＧ細胞の移植後の日数での時間の関数としての、立方ミリメートルでのＵ８７−ＭＧ腫瘍体積における変化を示す折れ線グラフである。
【００２７】
【図１８】図１８は、対照抗体（黒四角■）、ＭＥＴ一価抗体（黒丸●）、またはＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗体（白い菱形◇）により処置した動物における、Ｕ１１８−ＭＧ細胞の移植後の日数での時間の関数としての、立方ミリメートルでのＵ１１８−ＭＧ腫瘍体積における変化を示す折れ線グラフである。
【００２８】
【図１９】図１９は、メイタンシノイド６の合成を図示する概略図である。
【００２９】
【図２０】図２０は、メイタンシノイド中間体１の合成を図示する概略図である。
【発明を実施するための形態】
【００３０】
本発明について記載する前に、記載されている特定の方法および実験条件は変動し得るため、本発明が、係る方法および条件に限定されないことを理解されたい。本発明の範囲は、添付の特許請求の範囲によってのみ限定されることから、本明細書において使用されている用語法が、単に特定の実施形態を説明するためのものであり、限定を企図しないことも理解されたい。
【００３１】
他に断りがなければ、本明細書において使用されているあらゆる技術および科学用語は、本発明が属する分野における当業者によって一般に理解されているものと同じ意味を有する。本明細書において、用語「約」は、特定の列挙されている数値に関連して使用されている場合、値が、列挙されている値から１％以下で変動し得ることを意味する。例えば、本明細書において、表現「約１００」は、９９および１０１ならびにその間のあらゆる値（例えば、９９．１、９９．２、９９．３、９９．４等）を含む。
【００３２】
本発明の実施または検査において、本明細書に記載されている方法および材料と類似または同等のいかなる方法および材料を使用してもよいが、好ましい方法および材料を次に説明する。本明細書に言及されているあらゆる特許、出願および非特許刊行物は、それらの全体が参照により本明細書に組み入れられる。
ＭＥＴタンパク質
【００３３】
本明細書において使用される場合、「ＭＥＴ」、「ｃ−Ｍｅｔ」などの表現は、（１）配列番号１４５に表記されているような、および／もしくは、アイソフォーム「ａ」のプロセシングされていないプレプロタンパク質を表すＮＣＢＩ受託番号ＮＭ＿００１１２７５００．２に表記されているようなアミノ酸配列を有するアミノ酸配列、（２）配列番号１４６に表記されているような、および／もしくは、アイソフォーム「ｂ」のプロセシングされていないプレプロタンパク質を表すＮＣＢＩ受託番号ＮＭ＿０００２３６．２に表記されているようなアミノ酸配列を有するアミノ酸配列、（３）配列番号１４７に表記されているような、および／もしくは、アイソフォーム「ｃ」のプロセシングされていないプレプロタンパク質を表すＮＣＢＩ受託番号ＮＭ＿００１３１１３３０．１に表記されているようなアミノ酸配列を有するアミノ酸配列、ならびに／または（３）３つ全てのアイソフォームによって共有される細胞質アルファサブユニット（配列番号１４８）と膜貫通ベータサブユニット（それぞれ、アイソフォームａ、ｂ、およびｃの配列番号１４９、１５０、もしくは１５１）とを含む成熟タンパク質を含む、ヒト膜貫通受容体チロシンキナーゼを指す。「ＭＥＴ」という表現は、単量体のＭＥＴ分子と多量体のＭＥＴ分子との両方を含む。本明細書において使用される場合、「単量体ヒトＭＥＴ」という表現は、多量体形成ドメインをいっさい含有しないか、または有さない、通常の条件下で、別のＭＥＴ分子と直接の物理的接続なしに単一のＭＥＴ分子として存在する、ＭＥＴタンパク質またはそのポーションを意味する。例示的な単量体ＭＥＴ分子は、配列番号１５２のアミノ酸配列を含む、本明細書において「ｈＭＥＴ．ｍｍｈ」と呼ばれる分子である（例えば、本明細書の実施例３を参照されたい）。本明細書において使用される場合、「二量体ヒトＭＥＴ」という表現は、リンカー、共有結合、非共有結合を介して、または抗体Ｆｃドメインなどの多量体形成ドメインを介して互いに接続した２つのＭＥＴ分子を含む構築物を意味する。例示的な二量体ＭＥＴ分子は、配列番号１５３のアミノ酸配列を含む、本明細書において「ｈＭＥＴ．ｍＦｃ」と呼ばれる分子である（例えば、本明細書の実施例３を参照されたい）。
【００３４】
本明細書におけるタンパク質、ポリペプチド、およびタンパク質断片への全ての言及は、非ヒト種由来であると明確に指定されていない限り、それぞれのタンパク質、ポリペプチドまたはタンパク質断片のヒトバージョンを指すことを意図している。したがって、「ＭＥＴ」という表現は、非ヒト種由来、例えば「マウスＭＥＴ」、「サルＭＥＴ」などであると指定されていない限り、ヒトＭＥＴを意味する。
【００３５】
本明細書において使用される場合、「細胞表面に発現するＭＥＴ」という表現は、ＭＥＴタンパク質の少なくともポーションが細胞膜の細胞外側に露出し、抗体の抗原結合ポーションに接近可能であるようにｉｎ  ｖｉｔｒｏまたはｉｎ  ｖｉｖｏで細胞の表面に発現している、１つもしくは複数のＭＥＴタンパク質、またはその細胞外ドメインを意味する。「細胞表面に発現するＭＥＴ」は、通常ＭＥＴタンパク質を発現する細胞の表面に発現するＭＥＴタンパク質を含み得るか、またはそれからなり得る。代替的に、「細胞表面に発現するＭＥＴ」は、通常、その表面にヒトＭＥＴを発現していないが、その表面にＭＥＴを発現するよう人工的に操作された細胞の表面に発現するＭＥＴタンパク質を含み得るか、またはそれからなり得る。
抗ＭＥＴ抗体およびその抗原結合断片
【００３６】
一態様によると、抗ＭＥＴ抗体（例えば、単一特異的抗ＭＥＴ抗体）が提供される。この態様による例示的な抗ＭＥＴ抗体は、本明細書で表１および２に列挙される。表１は、例示的な抗ＭＥＴ抗体の重鎖可変領域（ＨＣＶＲ）、軽鎖可変領域（ＬＣＶＲ）、重鎖相補性決定領域（ＨＣＤＲ１、ＨＣＤＲ２およびＨＣＤＲ３）および軽鎖相補性決定領域（ＬＣＤＲ１、ＬＣＤＲ２およびＬＣＤＲ３）のアミノ酸配列識別子を表記し、これから本明細書に開示される二重特異的抗原結合分子（本明細書において二重特異的抗原結合タンパク質と互換可能に使用される）が誘導され得る。表２は、例示的な抗ＭＥＴ抗体のＨＣＶＲ、ＬＣＶＲ、ＨＣＤＲ１、ＨＣＤＲ２、ＨＣＤＲ３、ＬＣＤＲ１、ＬＣＤＲ２およびＬＣＤＲ３の核酸配列識別子を表記する。
【００３７】
ＭＥＴに特異的に結合し、細胞におけるＭＥＴシグナル伝達経路を刺激する（例えば、活性化する）抗体またはその抗原結合断片、ならびに、ＭＥＴシグナル伝達の活性化が有益であるかまたは治療上有用であろう治療の場におけるそのような抗体の使用もまた本明細書で提供される。そのようなアゴニスト抗ＭＥＴ抗体の非限定的な例には、本明細書において「Ｈ４Ｈ１４６３６Ｄ」と呼ばれる抗体、ならびに、重鎖ＣＤＲおよび軽鎖ＣＤＲ（配列番号２８、３０、３２、１４０、１４２、１４４）ならびに／またはその重鎖可変ドメインおよび軽鎖可変ドメイン（配列番号２６／１３８）を含む抗体およびその抗原結合断片が含まれる。
【００３８】
表１に列挙されているＨＣＶＲアミノ酸配列またはそれと少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％もしくは少なくとも９９％配列同一性を有するその実質的に同様の配列のいずれかから選択されるアミノ酸配列を含む重鎖ＨＣＶＲを含む、ＭＥＴに特異的に結合する抗体またはその抗原結合断片が本明細書において提供される。
【００３９】
表１に列挙されているＬＣＶＲアミノ酸配列またはそれと少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％もしくは少なくとも９９％配列同一性を有するその実質的に同様の配列のいずれかから選択されるアミノ酸配列を含むＬＣＶＲを含む、ＭＥＴに特異的に結合する抗体またはその抗原結合断片が本明細書において提供される。
【００４０】
本明細書では、表１に列挙される任意のＬＣＶＲアミノ酸配列と対形成する表１に列挙される任意のＨＣＶＲアミノ酸配列を含む、ＨＣＶＲおよびＬＣＶＲアミノ酸配列対（ＨＣＶＲ／ＬＣＶＲ）を含む、ＭＥＴに特異的に結合する抗体またはその抗原結合断片が提供される。ある特定の実施形態によると、抗体またはその抗原結合断片は、表１に列挙される任意の例示的な抗ＭＥＴ抗体の範囲内に含有されるＨＣＶＲ／ＬＣＶＲアミノ酸配列対を含む。ある特定の実施形態では、ＨＣＶＲ／ＬＣＶＲアミノ酸配列対は、配列番号２／１３８、１０／１３８、１８／１３８、２６／１３８、３４／１３８、４２／１３８、５０／１３８、５８／１３８、６６／１３８、７４／１３８、８２／１３８、９０／１３８、９８／１３８、１０６／１３８、１１４／１３８、１２２／１３８および１３０／１３８からなる群から選択される。
【００４１】
表１に列挙されているＨＣＤＲ１アミノ酸配列または少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％もしくは少なくとも９９％配列同一性を有するその実質的に同様の配列のいずれかから選択されるアミノ酸配列を含む重鎖ＣＤＲ１（ＨＣＤＲ１）を含む、ＭＥＴに特異的に結合する抗体またはその抗原結合断片も提供される。
【００４２】
表１に列挙されているＨＣＤＲ２アミノ酸配列または少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％もしくは少なくとも９９％配列同一性を有するその実質的に同様の配列のいずれかから選択されるアミノ酸配列を含む重鎖ＣＤＲ２（ＨＣＤＲ２）を含む、ＭＥＴに特異的に結合する抗体またはその抗原結合断片も提供される。
【００４３】
表１に列挙されているＨＣＤＲ３アミノ酸配列または少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％もしくは少なくとも９９％配列同一性を有するその実質的に同様の配列のいずれかから選択されるアミノ酸配列を含む重鎖ＣＤＲ３（ＨＣＤＲ３）を含む、ＭＥＴに特異的に結合する抗体またはその抗原結合断片も提供される。
【００４４】
表１に列挙されているＬＣＤＲ１アミノ酸配列または少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％もしくは少なくとも９９％配列同一性を有するその実質的に同様の配列のいずれかから選択されるアミノ酸配列を含む軽鎖ＣＤＲ１（ＬＣＤＲ１）を含む、ＭＥＴに特異的に結合する抗体またはその抗原結合断片も提供される。
【００４５】
表１に列挙される任意のＬＣＤＲ１アミノ酸配列と対形成する表１に列挙される任意のＨＣＤＲ１アミノ酸配列を含む、ＨＣＤＲ１およびＬＣＤＲ１アミノ酸配列対（ＨＣＤＲ１／ＬＣＤＲ１）を含む、ＭＥＴに特異的に結合する抗体またはその抗原結合断片もまた提供される。ある特定の実施形態によると、抗体またはその抗原結合断片は、表１に列挙される任意の例示的な抗ＭＥＴ抗体の範囲内に含有されるＨＣＤＲ３／ＬＣＤＲ３アミノ酸配列対を含む。ある特定の実施形態では、ＨＣＤＲ１／ＬＣＤＲ１アミノ酸配列対は、配列番号４／１４０、１２／１４０、２０／１４０、２８／１４０、３６／１４０、４４／１４０、５２／１４０、６０／１４０、６８／１４０、７６／１４０、８４／１４０、９２／１４０、１００／１４０、１０８／１４０、１１６／１４０、１２４／１４０、および１３２／１４０からなる群から選択される。
【００４６】
表１に列挙されているＬＣＤＲ２アミノ酸配列または少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％もしくは少なくとも９９％配列同一性を有するその実質的に同様の配列のいずれかから選択されるアミノ酸配列を含む軽鎖ＣＤＲ２（ＬＣＤＲ２）を含む、ＭＥＴに特異的に結合する抗体またはその抗原結合断片も提供される。
【００４７】
表１に列挙される任意のＬＣＤＲ２アミノ酸配列と対形成する表１に列挙される任意のＨＣＤＲ２アミノ酸配列を含む、ＨＣＤＲ２およびＬＣＤＲ２アミノ酸配列対（ＨＣＤＲ２／ＬＣＤＲ２）を含む、ＭＥＴに特異的に結合する抗体またはその抗原結合断片もまた提供される。ある特定の実施形態によると、抗体またはその抗原結合断片は、表１に列挙される任意の例示的な抗ＭＥＴ抗体の範囲内に含有されるＨＣＤＲ２／ＬＣＤＲ２アミノ酸配列対を含む。ある特定の実施形態では、ＨＣＤＲ２／ＬＣＤＲ２アミノ酸配列対は、配列番号６／１４２、１４／１４２、２２／１４２、３０／１４２、３８／１４２、４６／１４２、５４／１４２、６２／１４２、７０／１４２、７８／１４２、８６／１４２、９４／１４２、１０２／１４２、１１０／１４２、１１８／１４２、１２６／１４２および１３４／１４２からなる群から選択される。
【００４８】
表１に列挙されているＬＣＤＲ３アミノ酸配列または少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％もしくは少なくとも９９％配列同一性を有するその実質的に同様の配列のいずれかから選択されるアミノ酸配列を含む軽鎖ＣＤＲ３（ＬＣＤＲ３）を含む、ＭＥＴに特異的に結合する抗体またはその抗原結合断片も提供される。
【００４９】
本明細書では、表１に列挙される任意のＬＣＤＲ３アミノ酸配列と対形成する表１に列挙される任意のＨＣＤＲ３アミノ酸配列を含む、ＨＣＤＲ３およびＬＣＤＲ３アミノ酸配列対（ＨＣＤＲ３／ＬＣＤＲ３）を含む、ＭＥＴに特異的に結合する抗体またはその抗原結合断片もまた提供される。ある特定の実施形態によると、抗体またはその抗原結合断片は、表１に列挙される任意の例示的な抗ＭＥＴ抗体の範囲内に含有されるＨＣＤＲ３／ＬＣＤＲ３アミノ酸配列対を含む。ある特定の実施形態では、ＨＣＤＲ３／ＬＣＤＲ３アミノ酸配列対は、配列番号８／１４４、１６／１４４、２４／１４４、３２／１４４、４０／１４４、４８／１４４、５６／１４４、６４／１４４、７２／１４４、８０／１４４、８８／１４４、９６／１４４、１０４／１４４、１１２／１４４、１２０／１４４、１２８／１４４および１３６／１４４からなる群から選択される。
【００５０】
本明細書では、表１に列挙されている例示的な抗ＭＥＴ抗体のいずれか内に含有される６個のＣＤＲ（すなわち、ＨＣＤＲ１−ＨＣＤＲ２−ＨＣＤＲ３−ＬＣＤＲ１−ＬＣＤＲ２−ＬＣＤＲ３）のセットを含むＭＥＴに特異的に結合する抗体またはその抗原結合断片も提供される。ある特定の実施形態では、ＨＣＤＲ１−ＨＣＤＲ２−ＨＣＤＲ３−ＬＣＤＲ１−ＬＣＤＲ２−ＬＣＤＲ３アミノ酸配列セットは、配列番号４−６−８−１４０−１４２−１４４、１２−１４−１６−１４０−１４２−１４４、２０−２２−２４−１４０−１４２−１４４、２８−３０−３２−１４０−１４２−１４４、３６−３８−４０−１４０−１４２−１４４、４４−４４−４８−１４０−１４２−１４４、５２−５４−５６−１４０−１４２−１４４、６０−６２−６４−１４０−１４２−１４４、６８−７０−７２−１４０−１４２−１４４、７６−７８−８０−１４０−１４２−１４４、８４−８６−８８−１４０−１４２−１４４、９２−９４−９６−１４０−１４２−１４４、１００−１０２−１０４−１４０−１４２−１４４、１０８−１１０−１１２−１４０−１４２−１４４、１１６−１１８−１２０−１４０−１４２−１４４、１２４−１２６−１２８−１４０−１４２−１４４および１３２−１３４−１３６−１４０−１４２−１４４からなる群より選択される。
【００５１】
関連する実施形態では、ＭＥＴに特異的に結合する抗体またはその抗原結合断片は、表１に列挙されている例示的な抗ＭＥＴ抗体のいずれかによって定義されるＨＣＶＲ／ＬＣＶＲアミノ酸配列ペア内に含有される６個のＣＤＲ（すなわち、ＨＣＤＲ１−ＨＣＤＲ２−ＨＣＤＲ３−ＬＣＤＲ１−ＬＣＤＲ２−ＬＣＤＲ３）のセットを含む。例えば、ＭＥＴに特異的に結合する抗体またはその抗原結合断片は、配列番号４−６−８−１４０−１４２−１４４、１２−１４−１６−１４０−１４２−１４４、２０−２２−２４−１４０−１４２−１４４、２８−３０−３２−１４０−１４２−１４４、３６−３８−４０−１４０−１４２−１４４、４４−４４−４８−１４０−１４２−１４４、５２−５４−５６−１４０−１４２−１４４、６０−６２−６４−１４０−１４２−１４４、６８−７０−７２−１４０−１４２−１４４、７６−７８−８０−１４０−１４２−１４４、８４−８６−８８−１４０−１４２−１４４、９２−９４−９６−１４０−１４２−１４４、１００−１０２−１０４−１４０−１４２−１４４、１０８−１１０−１１２−１４０−１４２−１４４、１１６−１１８−１２０−１４０−１４２−１４４、１２４−１２６−１２８−１４０−１４２−１４４および１３２−１３４−１３６−１４０−１４２−１４４からなる群より選択されるＨＣＶＲ／ＬＣＶＲアミノ酸配列ペア内に含有されるＨＣＤＲ１−ＨＣＤＲ２−ＨＣＤＲ３−ＬＣＤＲ１−ＬＣＤＲ２−ＬＣＤＲ３アミノ酸配列セットを含む。
【００５２】
ＨＣＶＲおよびＬＣＶＲアミノ酸配列内のＣＤＲを同定するための方法および技法は、本技術分野において周知のものであり、本明細書に開示されている規定のＨＣＶＲおよび／またはＬＣＶＲアミノ酸配列内のＣＤＲの同定に使用することができる。ＣＤＲの境界の同定に使用することのできる例示的な慣例として、例えば、Ｋａｂａｔ定義、Ｃｈｏｔｈｉａ定義およびＡｂＭ定義が挙げられる。一般用語において、Ｋａｂａｔ定義は、配列可変性に基づき、Ｃｈｏｔｈｉａ定義は、構造的ループ領域の位置に基づき、ＡｂＭ定義は、ＫａｂａｔとＣｈｏｔｈｉａアプローチの折衷である。例えば、Ｋａｂａｔ、「Ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ  ｏｆ  Ｐｒｏｔｅｉｎｓ  ｏｆ  Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｉｃａｌ  Ｉｎｔｅｒｅｓｔ」、Ｎａｔｉｏｎａｌ  Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅｓ  ｏｆ  Ｈｅａｌｔｈ，  Ｂｅｔｈｅｓｄａ，  Ｍｄ．（１９９１年）；Ａｌ−Ｌａｚｉｋａｎｉら、Ｊ．  Ｍｏｌ．  Ｂｉｏｌ．２７３巻：９２７〜９４８頁（１９９７年）；およびＭａｒｔｉｎら、Ｐｒｏｃ．  Ｎａｔｌ．  Ａｃａｄ．  Ｓｃｉ．  ＵＳＡ  ８６巻：９２６８〜９２７２頁（１９８９年）を参照されたい。抗体内のＣＤＲ配列を同定するために、公開データベースを利用することもできる。
【００５３】
抗ＭＥＴ抗体またはそのポーションをコードする核酸分子も本明細書に提供される。例えば、本発明は、表１に列挙されているＨＣＶＲアミノ酸配列のいずれかをコードする核酸分子を提供する；ある特定の実施形態では、核酸分子は、表２に列挙されているＨＣＶＲ核酸配列またはそれに対し少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％もしくは少なくとも９９％配列同一性を有するその実質的に同様の配列のいずれかから選択されるポリヌクレオチド配列を含む。
【００５４】
表１に列挙されているＬＣＶＲアミノ酸配列のいずれかをコードする核酸分子も提供され；ある特定の実施形態では、核酸分子は、表２に列挙されているＬＣＶＲ核酸配列またはそれに対し少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％もしくは少なくとも９９％配列同一性を有するその実質的に同様の配列のいずれかから選択されるポリヌクレオチド配列を含む。
【００５５】
表１に列挙されているＨＣＤＲ１アミノ酸配列のいずれかをコードする核酸分子も提供され；ある特定の実施形態では、核酸分子は、表２に列挙されているＨＣＤＲ１核酸配列またはそれに対し少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％もしくは少なくとも９９％配列同一性を有するその実質的に同様の配列のいずれかから選択されるポリヌクレオチド配列を含む。
【００５６】
表１に列挙されているＨＣＤＲ２アミノ酸配列のいずれかをコードする核酸分子も提供され；ある特定の実施形態では、核酸分子は、表２に列挙されているＨＣＤＲ２核酸配列またはそれに対し少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％もしくは少なくとも９９％配列同一性を有するその実質的に同様の配列のいずれかから選択されるポリヌクレオチド配列を含む。
【００５７】
表１に列挙されているＨＣＤＲ３アミノ酸配列のいずれかをコードする核酸分子も提供され；ある特定の実施形態では、核酸分子は、表２に列挙されているＨＣＤＲ３核酸配列またはそれに対し少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％もしくは少なくとも９９％配列同一性を有するその実質的に同様の配列のいずれかから選択されるポリヌクレオチド配列を含む。
【００５８】
表１に列挙されているＬＣＤＲ１アミノ酸配列のいずれかをコードする核酸分子も提供され；ある特定の実施形態では、核酸分子は、表２に列挙されているＬＣＤＲ１核酸配列またはそれに対し少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％もしくは少なくとも９９％配列同一性を有するその実質的に同様の配列のいずれかから選択されるポリヌクレオチド配列を含む。
【００５９】
表１に列挙されているＬＣＤＲ２アミノ酸配列のいずれかをコードする核酸分子も提供され；ある特定の実施形態では、核酸分子は、表２に列挙されているＬＣＤＲ２核酸配列またはそれに対し少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％もしくは少なくとも９９％配列同一性を有するその実質的に同様の配列のいずれかから選択されるポリヌクレオチド配列を含む。
【００６０】
表１に列挙されているＬＣＤＲ３アミノ酸配列のいずれかをコードする核酸分子も提供され；ある特定の実施形態では、核酸分子は、表２に列挙されているＬＣＤＲ３核酸配列またはそれに対し少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％もしくは少なくとも９９％配列同一性を有するその実質的に同様の配列のいずれかから選択されるポリヌクレオチド配列を含む。
【００６１】
ＨＣＶＲをコードする核酸分子であって、前記ＨＣＶＲが、３個のＣＤＲのセット（すなわち、ＨＣＤＲ１−ＨＣＤＲ２−ＨＣＤＲ３）を含み、前記ＨＣＤＲ１−ＨＣＤＲ２−ＨＣＤＲ３アミノ酸配列セットが、表１に列挙されている例示的な抗ＭＥＴ抗体のいずれかによって定義される核酸分子も提供される。
【００６２】
ＬＣＶＲをコードする核酸分子であって、前記ＬＣＶＲが、３個のＣＤＲのセット（すなわち、ＬＣＤＲ１−ＬＣＤＲ２−ＬＣＤＲ３）を含み、前記ＬＣＤＲ１−ＬＣＤＲ２−ＬＣＤＲ３アミノ酸配列セットが、表１に列挙されている例示的な抗ＭＥＴ抗体のいずれかによって定義される核酸分子も提供される。
【００６３】
ＨＣＶＲおよびＬＣＶＲの両方をコードする核酸分子であって、前記ＨＣＶＲが、表１に列挙されているＨＣＶＲアミノ酸配列のいずれかのアミノ酸配列を含み、前記ＬＣＶＲが、表１に列挙されているＬＣＶＲアミノ酸配列のいずれかのアミノ酸配列を含む核酸分子も提供される。ある特定の実施形態では、核酸分子は、表２に列挙されているＨＣＶＲ核酸配列またはそれに対し少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％もしくは少なくとも９９％配列同一性を有するその実質的に同様の配列のいずれかから選択されるポリヌクレオチド配列と、表２に列挙されているＬＣＶＲ核酸配列またはそれに対し少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％もしくは少なくとも９９％配列同一性を有するその実質的に同様の配列のいずれかから選択されるポリヌクレオチド配列とを含む。本態様に係るある特定の実施形態では、核酸分子は、ＨＣＶＲおよびＬＣＶＲをコードし、前記ＨＣＶＲおよびＬＣＶＲは両者共に、表１に列挙されている同じ抗ＭＥＴ抗体に由来する。
【００６４】
抗ＭＥＴ抗体の重または軽鎖可変領域を含むポリペプチドを発現することができる組換え発現ベクターも本明細書に提供される。例えば、組換え発現ベクターは、上記の核酸分子、すなわち、表１に表記されているＨＣＶＲ、ＬＣＶＲおよび／またはＣＤＲ配列のいずれかをコードする核酸分子のいずれかを含む。係るベクターが導入された宿主細胞と共に、前記抗体または抗体断片の産生を可能にする条件下で前記宿主細胞を培養し、このようにして産生された前記抗体および抗体断片を回収することにより前記抗体またはそのポーションを産生する方法も、本開示の範囲内に含まれる。
【００６５】
修飾されたグリコシル化パターンを有する抗ＭＥＴ抗体が本明細書に提供される。一部の実施形態では、望ましくないグリコシル化部位を除去するための修飾、あるいは例えば、抗体依存性細胞性細胞傷害（ＡＤＣＣ）機能を増加させるために、オリゴ糖鎖に存在するフコース部分を欠く抗体が有用となることもある（Ｓｈｉｅｌｄら（２００２年）ＪＢＣ  ２７７巻：２６７３３頁を参照）。他の適用では、補体依存性細胞傷害（ＣＤＣ）を修飾するために、ガラクトシル化の修飾を行うことができる。
ＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗原結合分子
【００６６】
本発明者らは、ＭＥＴに対するＨＧＦの結合を遮断するある特定の単一特異的抗ＭＥＴ抗原結合分子がＭＥＴシグナル伝達を強力に活性化する傾向があること（治療用分子にとって望ましくない結果）を観察した。しかしながら、本発明者らは、驚くべきことに、ＭＥＴタンパク質細胞外ドメインの２つの別々のエピトープに同時に結合する二重特異的抗原結合分子が、ＭＥＴに対するリガンドの結合を遮断するのに有効であるが、ＭＥＴシグナル伝達のアゴニズムをほとんど引き起こさないということを発見した。
【００６７】
したがって、第１の抗原結合ドメイン（本明細書において「Ｄ１」とも呼ばれる）および第２の抗原結合ドメイン（本明細書において「Ｄ２」とも呼ばれる）を含む、二重特異的抗原結合分子が本明細書で提供される。二重特異的抗原結合分子による２つの別々のＭＥＴエピトープに対する同時結合は、ＭＥＴシグナル伝達の最小限の活性化で効果的なリガンドの遮断をもたらす。
【００６８】
ヒトＭＥＴの第１のエピトープに特異的に結合する第１の抗原結合ドメイン（Ｄ１）と、ヒトＭＥＴの第２のエピトープに特異的に結合する第２の抗原結合ドメイン（Ｄ２）とを含む二重特異的抗原結合分子は、本明細書において「ＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗体」、「ＭＥＴ×ＭＥＴ」、または他の関連する用語で呼ばれ得る。一部の実施形態では、ヒトＭＥＴの第１のエピトープは、配列番号１５５のアミノ酸１９２〜２０４を含む。一部の実施形態では、ヒトＭＥＴの第２のエピトープは、配列番号１５５のアミノ酸３０５〜３１５およびアミノ酸４２１〜４５５を含む。一部の実施形態では、ヒトＭＥＴの第１のエピトープは、配列番号１５５のアミノ酸１９２〜２０４を含み、ヒトＭＥＴの第２のエピトープは、配列番号１５５のアミノ酸３０５〜３１５およびアミノ酸４２１〜４５５を含む。
【００６９】
ある特定の実施形態では、ＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗体のＤ１およびＤ２ドメインは、互いに非競合的である。ＭＥＴに対する結合について、Ｄ１とＤ２の間で非競合的であることは、Ｄ１およびＤ２が由来するそれぞれの単一特異的抗原結合タンパク質が、ヒトＭＥＴに対する結合について互いに競合しないことを意味する。例示的な抗原結合タンパク質の競合アッセイは、本技術分野で公知であり、その非限定的な例は、本明細書の他の所に記載される。
【００７０】
ある特定の実施形態では、本明細書の他の所に記載されるように、Ｄ１およびＤ２は、ＭＥＴ上の異なる（例えば、重複しないか、または部分的に重複する）エピトープに結合する。
【００７１】
ＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗原結合分子は、２つの別々の単一特異的抗ＭＥＴ抗体の抗原結合ドメインを使用して構築し得る。例えば、一群のモノクローナル単一特異的抗ＭＥＴ抗体は、本技術分野で公知の標準的な方法を使用して作製し得る。このようにして作製された個々の抗体は、ＭＥＴタンパク質に対する交差競合について互いに対してペアワイズで試験され得る。２つの異なる抗ＭＥＴ抗体が、ＭＥＴに同時に結合することができる（すなわち、互いに競合しない）場合、第１の抗ＭＥＴ抗体由来の抗原結合ドメインと、第２の、非競合抗ＭＥＴ抗体由来の抗原結合ドメインは、本開示に従って、単一のＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗体へと操作することができる。
【００７２】
本開示によると、二重特異的抗原結合分子は、単一の多機能ポリペプチドであり得るか、またはそれは、互いに共有結合によりもしくは非共有結合により会合している２つもしくはそれよりも多いポリペプチドの多量体複合体であり得る。本開示によって実証されるように、ＭＥＴ分子の２つの別々の、非同一のエピトープに同時に結合する能力を有する任意の抗原結合構築物は、二重特異的抗原結合分子とみなされる。本明細書で記載される任意の二重特異的抗原結合分子またはその改変体は、当業者に公知であるような、標準的な分子生物学的技法（例えば、組換えＤＮＡおよびタンパク質発現技術）を使用して構築し得る。
抗原結合ドメイン
【００７３】
本開示の二重特異的抗原結合分子は、２つの別々の抗原結合ドメイン（Ｄ１およびＤ２）を含む。本明細書において使用される場合、「抗原結合ドメイン」という表現は、目的の特定の抗原（例えば、ヒトＭＥＴ）に特異的に結合することのできる、任意のペプチド、ポリペプチド、核酸分子、スキャフォールド型分子、ペプチドディスプレイ分子、またはポリペプチド含有構築物を意味する。本明細書において使用される場合、「特異的に結合する」などの用語は、抗原結合ドメインが、特定の抗原と、５００ｐＭまたはそれよりも小さい解離定数（ＫＤ）によって特徴付けられる複合体を形成し、通常の試験条件下で他の無関係の抗原に結合しないことを意味する。「無関係の抗原」は、互いに９５％未満のアミノ酸同一性を有するタンパク質、ペプチド、またはポリペプチドである。
【００７４】
本開示に関連して使用され得る抗原結合ドメインの例示的なカテゴリーには、抗体、抗体の抗原結合ポーション、特定の抗原と特異的に相互作用するペプチド（例えば、ペプチボディ）、特定の抗原と特異的に相互作用する受容体分子、特定の抗原に特異的に結合する受容体のリガンド結合ポーションを含むタンパク質、抗原結合スキャフォールド（例えば、ＤＡＲＰｉｎ、ＨＥＡＴ反復タンパク質、ＡＲＭ反復タンパク質、テトラトリコペプチド反復タンパク質、および天然に存在する反復タンパク質に基づく他のスキャフォールドなど［例えば、ＢｏｅｒｓｍａおよびＰｌｕｃｋｔｈｕｎ、２０１１年、Ｃｕｒｒ．  Ｏｐｉｎ．  Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．２２巻：８４９〜８５７頁、ならびにそこで引用される参考文献を参照されたい］）、ならびにアプタマーまたはそのポーションが含まれる。
【００７５】
２つの分子が互いに特異的に結合するかどうかを決定するための方法は、本技術分野で周知であり、例えば、平衡透析、表面プラズモン共鳴などを含む。例えば、本開示に関連して使用されるとき、抗原結合ドメインは、表面プラズモン共鳴アッセイで測定されるとき、約５００ｐＭ未満、約４００ｐＭ未満、約３００ｐＭ未満、約２００ｐＭ未満、約１００ｐＭ未満、約９０ｐＭ未満、約８０ｐＭ未満、約７０ｐＭ未満、約６０ｐＭ未満、約５０ｐＭ未満、約４０ｐＭ未満、約３０ｐＭ未満、約２０ｐＭ未満、約１０ｐＭ未満、約５ｐＭ未満、約４ｐＭ未満、約２ｐＭ未満、約１ｐＭ未満、約０．５ｐＭ未満、約０．２ｐＭ未満、約０．１ｐＭ未満、または約０．０５ｐＭ未満のＫＤで、特定の抗原（例えば、標的分子［Ｔ］または内在性エフェクタータンパク質［Ｅ］）またはそのポーションに結合するポリペプチドを含む。
【００７６】
本明細書において使用される場合、「表面プラズモン共鳴」という用語は、例えば、ＢＩＡｃｏｒｅ（商標）システム（Ｂｉａｃｏｒｅ  Ｌｉｆｅ  Ｓｃｉｅｎｃｅｓ  ｄｉｖｉｓｉｏｎ  ｏｆ  ＧＥ  Ｈｅａｌｔｈｃａｒｅ、Ｐｉｓｃａｔａｗａｙ、ＮＪ）を使用して、バイオセンサーマトリックス内のタンパク質濃度の変化を検出することによってリアルタイムの相互作用の分析を可能にする、光学現象を指す。
【００７７】
本明細書において使用される場合、「ＫＤ」という用語は、特定のタンパク質−タンパク質相互作用（例えば、抗体−抗原相互作用）の平衡解離定数を意味する。別段示されない限り、本明細書で開示されるＫＤ値は、２５℃で表面プラズモン共鳴アッセイによって決定されるＫＤ値を指す。
【００７８】
上に示すように「抗体結合ドメイン」（Ｄ１および／またはＤ２）は、本明細書において、抗体または抗体の抗原結合断片を含んでもよいし、これからなってもよい。用語「抗体」は、本明細書において、特定の抗原（例えば、ヒトＭＥＴ）に特異的に結合するまたはこれと相互作用する、少なくとも１個の相補性決定領域（ＣＤＲ）を含むいずれかの抗原結合分子または分子複合体を意味する。用語「抗体」は、ジスルフィド結合によって相互接続された２本の重（Ｈ）鎖および２本の軽（Ｌ）鎖である４本のポリペプチド鎖を含む免疫グロブリン分子、ならびにその多量体（例えば、ＩｇＭ）を含む。各重鎖は、重鎖可変領域（本明細書において、ＨＣＶＲまたはＶＨと省略）および重鎖定常領域を含む。重鎖定常領域は、３個のドメイン、ＣＨ１、ＣＨ２およびＣＨ３を含む。各軽鎖は、軽鎖可変領域（本明細書において、ＬＣＶＲまたはＶＬと省略）および軽鎖定常領域を含む。軽鎖定常領域は、１個のドメイン（ＣＬ１）を含む。ＶＨおよびＶＬ領域は、フレームワーク領域（ＦＲ）と命名されたより保存された領域が散在する、相補性決定領域（ＣＤＲ）と命名された超可変性の領域にさらに細分することができる。各ＶＨおよびＶＬは、アミノ末端からカルボキシ末端へと、次の順序：ＦＲ１、ＣＤＲ１、ＦＲ２、ＣＤＲ２、ＦＲ３、ＣＤＲ３、ＦＲ４に配置された、３個のＣＤＲおよび４個のＦＲで構成されている。異なる実施形態では、本明細書に提供される抗体（またはその抗原結合ポーション）のＦＲは、ヒト生殖系列配列と同一であっても、あるいは天然にまたは人為的に修飾されていてもよい。アミノ酸コンセンサス配列は、２種またはそれを超えるＣＤＲの対比（ｓｉｄｅ−ｂｙ−ｓｉｄｅ）解析に基づき定義することができる。
【００７９】
本明細書に提供される二重特異的抗原結合分子のＤ１および／またはＤ２成分は、完全抗体分子の抗原結合断片を含んでもよいし、これからなってもよい。用語、抗体の「抗原結合ポーション」、抗体の「抗原結合断片」その他は、本明細書において、抗原に特異的に結合して複合体を形成する、いずれかの天然に存在する、酵素により得ることができる、合成のまたは遺伝子改変されたポリペプチドまたは糖タンパク質を含む。抗体の抗原結合断片は、例えば、タンパク質分解による消化または抗体可変ドメインおよび必要に応じて抗体定常ドメインをコードするＤＮＡの操作および発現を含む組換え遺伝子操作技法等、いずれかの適した標準技法を使用して、完全抗体分子から得られ得る。係るＤＮＡは、公知であるおよび／または例えば、商業的供給源、ＤＮＡライブラリー（例えば、ファージ抗体ライブラリーを含む）から容易に入手することができる、または合成することができる。ＤＮＡを配列決定し、化学的にまたは分子生物学的技法を使用することにより操作して、例えば、適した構成へと１種または複数の可変および／または定常ドメインを配置する、あるいはコドンを導入する、システイン残基を作出する、アミノ酸を修飾、付加または欠失させること等ができる。
【００８０】
抗原結合断片の非限定例として、（ｉ）Ｆａｂ断片；（ｉｉ）Ｆ（ａｂ’）２断片；（ｉｉｉ）Ｆｄ断片；（ｉｖ）Ｆｖ断片；（ｖ）単鎖Ｆｖ（ｓｃＦｖ）分子；（ｖｉ）ｄＡｂ断片；および（ｖｉｉ）抗体の超可変領域を模倣するアミノ酸残基からなる最小認識単位（例えば、ＣＤＲ３ペプチド等、単離された相補性決定領域（ＣＤＲ））または制約されたＦＲ３−ＣＤＲ３−ＦＲ４ペプチドが挙げられる。ドメイン特異的抗体、単一ドメイン抗体、ドメイン欠失抗体、キメラ抗体、ＣＤＲ移植抗体、ダイアボディ、トリアボディ、テトラボディ、ミニボディ、ナノボディ（例えば、一価ナノボディ、二価ナノボディ等）、小モジュラー免疫医薬（ｓｍａｌｌ  ｍｏｄｕｌａｒ  ｉｍｍｕｎｏｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ）（ＳＭＩＰ）およびサメ可変ＩｇＮＡＲドメイン等、他の操作された分子も、本明細書における表現「抗原結合断片」の内に包含される。
【００８１】
抗体の抗原結合断片は、典型的に、少なくとも１個の可変ドメインを含むであろう。可変ドメインは、いかなるサイズまたはアミノ酸組成のものであってもよく、一般に、１個または複数のフレームワーク配列に隣接するまたはこれとインフレームの少なくとも１個のＣＤＲを含むであろう。ＶＬドメインと会合するＶＨドメインを有する抗原結合断片において、ＶＨおよびＶＬドメインは、いずれか適した配置において互いに対して位置することができる。例えば、可変領域は、二量体となり、ＶＨ−ＶＨ、ＶＨ−ＶＬまたはＶＬ−ＶＬ二量体を含有することができる。あるいは、抗体の抗原結合断片は、単量体ＶＨまたはＶＬドメインを含有することができる。
【００８２】
ある特定の実施形態では、抗体の抗原結合断片は、少なくとも１個の定常ドメインに共有結合により連結された少なくとも１個の可変ドメインを含有することができる。本開示の抗体の抗原結合断片内に見出すことができる可変および定常ドメインの非限定的な例示的構成として、以下が挙げられる：（ｉ）ＶＨ−ＣＨ１；（ｉｉ）ＶＨ−ＣＨ２；（ｉｉｉ）ＶＨ−ＣＨ３；（ｉｖ）ＶＨ−ＣＨ１−ＣＨ２；（ｖ）ＶＨ−ＣＨ１−ＣＨ２−ＣＨ３；（ｖｉ）ＶＨ−ＣＨ２−ＣＨ３；（ｖｉｉ）ＶＨ−ＣＬ；（ｖｉｉｉ）ＶＬ−ＣＨ１；（ｉｘ）ＶＬ−ＣＨ２；（ｘ）ＶＬ−ＣＨ３；（ｘｉ）ＶＬ−ＣＨ１−ＣＨ２；（ｘｉｉ）ＶＬ−ＣＨ１−ＣＨ２−ＣＨ３；（ｘｉｉｉ）ＶＬ−ＣＨ２−ＣＨ３；および（ｘｉｖ）ＶＬ−ＣＬ。上に列挙する例示的構成のいずれかを含む、可変および定常ドメインのいずれかの構成において、可変および定常ドメインは、互いに直接的に連結されていても、完全または部分的ヒンジまたはリンカー領域により連結されていてもよい。ヒンジ領域は、少なくとも２個（例えば、５、１０、１５、２０、４０、６０個以上）のアミノ酸からなることができ、これにより、単一ポリペプチド分子における隣接する可変および／または定常ドメインの間に可撓性または半可撓性連結がもたらされる。さらに、抗原結合断片は、互いにおよび／または１個または複数の単量体ＶＨまたはＶＬドメインと非共有結合的に会合した（例えば、ジスルフィド結合（複数可）により）、上に列挙する可変および定常ドメイン構成のうちいずれかのホモ二量体またはヘテロ二量体（または他の多量体）を含むことができる。
【００８３】
本明細書で提供される二重特異的抗原結合分子は、ヒト抗体および／もしくは組換えヒト抗体、またはその断片を含み得るか、またはそれからなり得る。用語「ヒト抗体」は、本明細書において、ヒト生殖系列免疫グロブリン配列に由来する可変および定常領域を有する抗体を含む。それでも、ヒト抗体は、例えば、ＣＤＲ、特にＣＤＲ３において、ヒト生殖系列免疫グロブリン配列にコードされないアミノ酸残基を含むことができる（例えば、ｉｎ  ｖｉｔｒｏにおけるランダムもしくは部位特異的変異誘発またはｉｎ  ｖｉｖｏにおける体細胞変異によって導入された変異）。しかし、用語「ヒト抗体」は、本明細書において、マウス等、別の哺乳動物種の生殖系列に由来するＣＤＲ配列が、ヒトフレームワーク配列に移植された抗体を含むようには企図されていない。
【００８４】
本開示の二重特異的抗原結合分子は、組換えヒト抗体またはその抗原結合断片を含み得るか、またはそれからなり得る。用語「組換えヒト抗体」は、本明細書において、宿主細胞にトランスフェクトされた組換え発現ベクターを使用して発現された抗体（さらに後述する）、組換えコンビナトリアルヒト抗体ライブラリーから単離された抗体（さらに後述する）、ヒト免疫グロブリン遺伝子のトランスジェニックである動物（例えば、マウス）から単離された抗体（例えば、Ｔａｙｌｏｒら（１９９２年）Ｎｕｃｌ．  Ａｃｉｄｓ  Ｒｅｓ．２０巻：６２８７〜６２９５頁を参照）、または他のＤＮＡ配列へのヒト免疫グロブリン遺伝子配列のスプライシングに関与する他のいずれかの手段によって調製、発現、作出もしくは単離された抗体等、組換え手段によって調製、発現、作出または単離されたあらゆるヒト抗体を含むよう企図されている。係る組換えヒト抗体は、ヒト生殖系列免疫グロブリン配列に由来する可変および定常領域を有する。しかし、ある特定の実施形態では、係る組換えヒト抗体は、ｉｎ  ｖｉｔｒｏ変異誘発（または、ヒトＩｇ配列のトランスジェニックである動物が使用される場合は、ｉｎ  ｖｉｖｏ体細胞変異誘発）に付され、これにより、組換え抗体のＶＨおよびＶＬ領域のアミノ酸配列は、ヒト生殖系列ＶＨおよびＶＬ配列に由来し、これに関係するが、ｉｎ  ｖｉｖｏにおけるヒト抗体生殖系列レパートリー内に天然には存在しなくてよい配列となる。
【００８５】
二重特異的抗体を作製するための方法は、本技術分野で公知であり、本明細書で開示される二重特異的抗原結合分子を構築するのに使用し得る。本開示の文脈において使用することのできる例示的な二重特異的フォーマットとして、例えば、ｓｃＦｖに基づくまたはダイアボディ二重特異的フォーマット、ＩｇＧ−ｓｃＦｖ融合体、二重可変ドメイン（ＤＶＤ）−Ｉｇ、クアドローマ、ノブイントゥーホール（ｋｎｏｂｓ−ｉｎｔｏ−ｈｏｌｅｓ）、共通軽鎖（例えば、ノブイントゥーホールを有する共通軽鎖等）、ＣｒｏｓｓＭａｂ、ＣｒｏｓｓＦａｂ、（ＳＥＥＤ）ボディ、ロイシンジッパー、デュオボディ（Ｄｕｏｂｏｄｙ）、ＩｇＧ１／ＩｇＧ２、二重作用Ｆａｂ（ＤＡＦ）−ＩｇＧおよびＭａｂ２二重特異的フォーマットが挙げられるがこれらに限定されない（例えば、前述のフォーマットの総説に関して、Ｋｌｅｉｎら、２０１２年、ｍＡｂｓ  ４巻：６号、１〜１１頁およびこれに引用されている参考文献を参照）。
【００８６】
本明細書で提供されるＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗原結合分子に含まれ得る例示的な抗原結合ドメイン（Ｄ１およびＤ２）には、本明細書で開示される任意の抗ＭＥＴ抗体に由来する抗原結合ドメインが含まれる。例えば、本開示は、表１に列挙されているＨＣＶＲアミノ酸配列またはそれに対し少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％もしくは少なくとも９９％配列同一性を有するその実質的に同様の配列のいずれかから選択されるアミノ酸配列を含むＨＣＶＲを含む、Ｄ１またはＤ２抗原結合ドメインを含むＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗原結合分子を含む。
【００８７】
本明細書では、表１に列挙されているＬＣＶＲアミノ酸配列またはそれに対し少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％もしくは少なくとも９９％配列同一性を有するその実質的に同様の配列のいずれかから選択されるアミノ酸配列を含むＬＣＶＲを含む、Ｄ１またはＤ２抗原結合ドメインを含むＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗原結合分子も提供される。
【００８８】
本明細書では、表１に列挙されているＬＣＶＲアミノ酸配列のいずれかとペアを組んだ表１に列挙されているＨＣＶＲアミノ酸配列のいずれかを含むＨＣＶＲおよびＬＣＶＲアミノ酸配列ペア（ＨＣＶＲ／ＬＣＶＲ）を含む、Ｄ１またはＤ２抗原結合ドメインを含むＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗原結合分子が提供される。ある特定の実施形態によると、本発明は、表１に列挙されている例示的な抗ＭＥＴ抗体のいずれかの内に含有されるＨＣＶＲ／ＬＣＶＲアミノ酸配列ペアを含む、Ｄ１またはＤ２抗原結合ドメインを含むＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗原結合分子を提供する。
【００８９】
本明細書では、表１に列挙されているＨＣＤＲ１アミノ酸配列またはそれに対し少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％もしくは少なくとも９９％配列同一性を有するその実質的に同様の配列のいずれかから選択されるアミノ酸配列を含む重鎖ＣＤＲ１（ＨＣＤＲ１）を含む、Ｄ１またはＤ２抗原結合ドメインを含むＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗原結合分子も提供される。
【００９０】
表１に列挙されているＨＣＤＲ２アミノ酸配列またはそれに対し少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％もしくは少なくとも９９％配列同一性を有するその実質的に同様の配列のいずれかから選択されるアミノ酸配列を含む重鎖ＣＤＲ２（ＨＣＤＲ２）を含む、Ｄ１またはＤ２抗原結合ドメインを含むＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗原結合分子も提供される。
【００９１】
表１に列挙されているＨＣＤＲ３アミノ酸配列またはそれに対し少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％もしくは少なくとも９９％配列同一性を有するその実質的に同様の配列のいずれかから選択されるアミノ酸配列を含む重鎖ＣＤＲ３（ＨＣＤＲ３）を含む、Ｄ１またはＤ２抗原結合ドメインを含むＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗原結合分子も提供される。
【００９２】
表１に列挙されているＬＣＤＲ１アミノ酸配列またはそれに対し少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％もしくは少なくとも９９％配列同一性を有するその実質的に同様の配列のいずれかから選択されるアミノ酸配列を含む軽鎖ＣＤＲ１（ＬＣＤＲ１）を含む、Ｄ１またはＤ２抗原結合ドメインを含むＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗原結合分子も提供される。
【００９３】
表１に列挙されているＬＣＤＲ２アミノ酸配列またはそれに対し少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％もしくは少なくとも９９％配列同一性を有するその実質的に同様の配列のいずれかから選択されるアミノ酸配列を含む軽鎖ＣＤＲ２（ＬＣＤＲ２）を含む、Ｄ１またはＤ２抗原結合ドメインを含むＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗原結合分子も提供される。
【００９４】
表１に列挙されているＬＣＤＲ３アミノ酸配列またはそれに対し少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％もしくは少なくとも９９％配列同一性を有するその実質的に同様の配列のいずれかから選択されるアミノ酸配列を含む軽鎖ＣＤＲ３（ＬＣＤＲ３）を含む、Ｄ１またはＤ２抗原結合ドメインを含むＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗原結合分子も提供される。
【００９５】
表１に列挙されているＬＣＤＲ３アミノ酸配列のいずれかとペアを組んだ表１に列挙されているＨＣＤＲ３アミノ酸配列のいずれかを含むＨＣＤＲ３およびＬＣＤＲ３アミノ酸配列ペア（ＨＣＤＲ３／ＬＣＤＲ３）を含む、Ｄ１またはＤ２抗原結合ドメインを含むＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗原結合分子も提供される。ある特定の実施形態によると、本開示は、表１に列挙されている例示的な抗ＭＥＴ抗体のいずれかの内に含有されるＨＣＤＲ３／ＬＣＤＲ３アミノ酸配列ペアを含む、抗体またはその抗原結合断片も提供される。
【００９６】
表１に列挙される任意の例示的な抗ＭＥＴ抗体の範囲内に含有される、６つのＣＤＲのセット（すなわち、ＨＣＤＲ１−ＨＣＤＲ２−ＨＣＤＲ３−ＬＣＤＲ１−ＬＣＤＲ２−ＬＣＤＲ３）を含む、Ｄ１またはＤ２の抗原結合ドメインを含む、ＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗原結合分子もまた提供される。
【００９７】
関連する実施形態では、本開示は、表１に列挙される任意の例示的な抗ＭＥＴ抗体によって定義されるＨＣＶＲ／ＬＣＶＲアミノ酸配列対の範囲内に含有される、６つのＣＤＲのセット（すなわち、ＨＣＤＲ１−ＨＣＤＲ２−ＨＣＤＲ３−ＬＣＤＲ１−ＬＣＤＲ２−ＬＣＤＲ３）を含む、Ｄ１またはＤ２の抗原結合ドメインを含む、ＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗原結合分子を提供する。
【００９８】
本明細書で提供されるＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗原結合分子は、表１の任意の抗ＭＥＴ抗体に由来するＤ１抗原結合ドメイン、および表１の任意の他の抗ＭＥＴ抗体に由来するＤ２抗原結合ドメインを含み得る。本開示のＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗体の非限定的な例は、図１に示される。図１は、２７２の例示的なＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗体の構成成分を図示するマトリックスである。マトリックスの各々の番号付き細胞（１〜２７２で付番）は、「Ｄ１」抗原結合ドメインおよび「Ｄ２］抗原結合ドメインを含む特有の二重特異的抗体を同定し、Ｄ１抗原結合ドメインは、免疫グロブリン可変ドメイン（ＨＣＶＲ／ＬＣＶＲアミノ酸配列対）またはＹ軸に沿って列挙される対応する抗ＭＥＴ抗体由来のＣＤＲを含み、Ｄ２抗原結合ドメインは、免疫グロブリン可変ドメイン（ＨＣＶＲ／ＬＣＶＲアミノ酸配列対）またはＸ軸に沿って列挙される対応する抗ＭＥＴ抗体由来のＣＤＲを含む。したがって、例えば、マトリックスに示されるＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗原結合分子「番号１０」は、例示的な抗ＭＥＴ抗体Ｈ４Ｈ１３２９０Ｐ２に由来する、ＨＣＶＲ／ＬＣＶＲ対または６−ＣＤＲセットを含むＤ１抗原結合ドメインと、例示的な抗ＭＥＴ抗体Ｈ４Ｈ１３３２１Ｐ２に由来するＨＣＶＲ／ＬＣＶＲ対または６−ＣＤＲセットを含むＤ２抗原結合ドメインとを含む。本明細書で提供されるＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗体のさらなる例は、本明細書の実施例４に記載される。
【００９９】
非限定的な例示的例として、本開示は、Ｄ１抗原結合ドメインおよびＤ２抗原結合ドメインを含むＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗原結合分子を含み、Ｄ１抗原結合ドメインは、配列番号５８／１３８のＨＣＶＲ／ＬＣＶＲアミノ酸配列対、または配列番号６０−６２−６４−１４０−１４２−１４４を含む重鎖ＣＤＲと軽鎖ＣＤＲとのセット（ＨＣＤＲ１−ＨＣＤＲ２−ＨＣＤＲ３−ＬＣＤＲ１−ＬＣＤＲ２−ＬＣＤＲ３）を含み、Ｄ２抗原結合ドメインは、配列番号８２／１３８のＨＣＶＲ／ＬＣＶＲアミノ酸配列対、または配列番号８４−８６−８８−１４０−１４２−１４４を含む重鎖ＣＤＲと軽鎖ＣＤＲとのセット（ＨＣＤＲ１−ＨＣＤＲ２−ＨＣＤＲ３−ＬＣＤＲ１−ＬＣＤＲ２−ＬＣＤＲ３）を含む。これらの配列特徴を有する例示的なＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗体は、Ｈ４Ｈ１３３０６Ｐ２由来のＤ１およびＨ４Ｈ１３３１２Ｐ２由来のＤ２を含む、Ｈ４Ｈ１４６３９Ｄと名付けられ、二重特異的抗体１２２番とも呼ばれる、二重特異的抗体である（本明細書の実施例４、表５を参照されたい）。
【０１００】
さらなる非限定的な例示的例として、本開示は、Ｄ１抗原結合ドメインおよびＤ２抗原結合ドメインを含むＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗原結合分子を含み、Ｄ１抗原結合ドメインは、配列番号１８／１３８のＨＣＶＲ／ＬＣＶＲアミノ酸配列対、または配列番号２０−２２−２４−１４０−１４２−１４４を含む重鎖ＣＤＲと軽鎖ＣＤＲとのセット（ＨＣＤＲ１−ＨＣＤＲ２−ＨＣＤＲ３−ＬＣＤＲ１−ＬＣＤＲ２−ＬＣＤＲ３）を含み、Ｄ２抗原結合ドメインは、配列番号８２／１３８のＨＣＶＲ／ＬＣＶＲアミノ酸配列対、または配列番号８４−８６−８８−１４０−１４２−１４４を含む重鎖ＣＤＲと軽鎖ＣＤＲとのセット（ＨＣＤＲ１−ＨＣＤＲ２−ＨＣＤＲ３−ＬＣＤＲ１−ＬＣＤＲ２−ＬＣＤＲ３）を含む。これらの配列特徴を有する例示的なＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗体は、Ｈ４Ｈ１３２９５Ｐ２由来のＤ１およびＨ４Ｈ１３３１２Ｐ２由来のＤ２を含む、Ｈ４Ｈ１４６３５Ｄと名付けられ、二重特異的抗体４２番とも呼ばれる、二重特異的抗体である（本明細書の実施例４、表５を参照されたい）。
多量体形成構成成分
【０１０１】
ある特定の実施形態では、本明細書で提供される二重特異的抗原結合分子は、１つまたは複数の多量体形成構成成分も含み得る。多量体形成構成成分は、抗原結合ドメイン（Ｄ１とＤ２）間の会合を維持するよう機能し得る。本明細書において使用される場合、「多量体形成構成成分」は、同一または類似の構造または構成の第２の多量体形成構成成分と会合する能力を有する任意の高分子、タンパク質、ポリペプチド、ペプチド、またはアミノ酸である。例えば、多量体形成構成成分は、免疫グロブリンＣＨ３ドメインを含むポリペプチドであり得る。多量体形成構成成分の非限定的な例は、免疫グロブリンのＦｃポーション、例えば、アイソタイプＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３、およびＩｇＧ４、ならびに各アイソタイプ群内の任意のアロタイプから選択されるＩｇＧのＦｃドメインである。ある特定の実施形態では、多量体形成構成成分は、Ｆｃ断片、または少なくとも１つのシステイン残基を含有する１〜約２００のアミノ酸長のアミノ酸配列である。他の実施形態では、多量体形成構成成分はシステイン残基、または短いシステイン含有ペプチドである。他の多量体形成ドメインは、ロイシンジッパー、ヘリックスループモチーフ、またはコイルドコイルモチーフを含むか、またはそれらからなるペプチドまたはポリペプチドを含む。
【０１０２】
ある特定の実施形態では、本明細書で提供される二重特異的抗原結合分子は、２つの多量体形成ドメインＭ１およびＭ２を含み、Ｄ１はＭ１に結合し、Ｄ２はＭ２に結合し、Ｍ１のＭ２との会合が、Ｄ１とＤ２との単一の二重特異的抗原結合分子となるような互いの物理的な連結を促進する。ある特定の実施形態では、Ｍ１とＭ２とは互いに同一である。例えば、Ｍ１は特定のアミノ酸配列を有するＦｃドメインであり得、Ｍ２は、Ｍ１と同一のアミノ酸配列を有するＦｃドメインである。代替的に、Ｍ１とＭ２とは、１つまたは複数のアミノ酸位置において互いに異なり得る。例えば、Ｍ１は、第１の免疫グロブリン（Ｉｇ）ＣＨ３ドメインを含み得、Ｍ２は、第２のＩｇ  ＣＨ３ドメインを含み得、第１のＩｇ  ＣＨ３ドメインおよび第２のＩｇ  ＣＨ３ドメインは、少なくとも１つのアミノ酸で互いに異なり、少なくとも１つのアミノ酸の差異が、同一のＭ１配列およびＭ２配列を有する基準構築物と比較して、プロテインＡに対する標的の構築物の結合を低下させる。一実施形態では、Ｍ１のＩｇ  ＣＨ３ドメインは、プロテインＡに結合し、Ｍ２のＩｇ  ＣＨ３ドメインは、Ｈ９５Ｒ修飾（ＩＭＧＴエクソン付番による；ＥＵ付番によるとＨ４３５Ｒ）などの、プロテインＡの結合を低下させるか、または無効にする変異を含有する。Ｍ２のＣＨ３は、Ｙ９６Ｆ修飾（ＩＭＧＴによる；ＥＵによるとＹ４３６Ｆ）をさらに含み得る。Ｍ２のＣＨ３内に見出され得るさらなる修飾には、ＩｇＧ１  Ｆｃドメインの場合には、Ｄ１６Ｅ、Ｌ１８Ｍ、Ｎ４４Ｓ、Ｋ５２Ｎ、Ｖ５７Ｍ、およびＶ８２Ｉ（ＩＭＧＴによる；ＥＵによるとＤ３５６Ｅ、Ｌ３５８Ｍ、Ｎ３８４Ｓ、Ｋ３９２Ｎ、Ｖ３９７Ｍ、およびＶ４２２Ｉ）；ＩｇＧ２  Ｆｃドメインの場合には、Ｎ４４Ｓ、Ｋ５２Ｎ、およびＶ８２Ｉ（ＩＭＧＴによる；ＥＵによるとＮ３８４Ｓ、Ｋ３９２Ｎ、およびＶ４２２Ｉ）；ならびにＩｇＧ４  Ｆｃドメインの場合には、Ｑ１５Ｒ、Ｎ４４Ｓ、Ｋ５２Ｎ、Ｖ５７Ｍ、Ｒ６９Ｋ、Ｅ７９Ｑ、およびＶ８２Ｉ（ＩＭＧＴによる；ＥＵによるとＱ３５５Ｒ、Ｎ３８４Ｓ、Ｋ３９２Ｎ、Ｖ３９７Ｍ、Ｒ４０９Ｋ、Ｅ４１９Ｑ、およびＶ４２２Ｉ）が含まれる。
【０１０３】
本開示の二重特異的抗原結合分子は、「単離されて」いてもよい。本明細書において使用される場合、「単離された二重特異的抗原結合分子」は、その自然環境の少なくとも１種の構成成分から同定および分離および／または回収された二重特異的抗原結合分子を意味する。例えば、生物の少なくとも１個の構成成分からまたは抗体が産生される組織もしくは細胞から分離または取り出された二重特異的抗体は、本開示の目的のための「単離された二重特異的抗体」である。単離された二重特異的抗原結合分子は、組換え細胞内のｉｎ  ｓｉｔｕにおける分子も含む。単離された二重特異的抗原結合分子は、少なくとも１種の精製または単離ステップに付された分子である。ある特定の実施形態によると、単離された二重特異的抗原結合分子は、他の細胞材料および／または化学物質を実質的に含まなくてよい。
【０１０４】
本明細書に開示される二重特異的抗原結合分子またはその抗原結合ドメイン（Ｄ１および／またはＤ２）は、この抗原結合タンパク質または抗原結合ドメインが得られた相当する生殖系列配列と比較して、重および軽鎖可変ドメインのフレームワークおよび／またはＣＤＲ領域に１個または複数のアミノ酸置換、挿入および／または欠失を含むことができる。係る変異は、本明細書に開示されているアミノ酸配列を、例えば、公開抗体配列データベースから入手できる生殖系列配列と比較することによって容易に確認することができる。本開示は、本明細書に開示されているアミノ酸配列のいずれかに由来する本明細書に記載の二重特異的抗原結合分子またはその抗原結合ドメイン（Ｄ１および／またはＤ２）を含み、１個または複数のフレームワークおよび／またはＣＤＲ領域内の１個または複数のアミノ酸は、抗体が由来する生殖系列配列の相当する残基（複数可）へと、または別のヒト生殖系列配列の相当する残基（複数可）へと、または相当する生殖系列残基（複数可）の保存的アミノ酸置換へと変異されている（係る配列変化は、本明細書において、「生殖系列変異」とまとめて称される）。
【０１０５】
当業者であれば、本明細書に開示されている重および軽鎖可変領域配列から始めて、１個または複数の個々の生殖系列変異またはその組み合わせを含む多数の二重特異的抗原結合分子またはその抗原結合ドメイン（Ｄ１および／またはＤ２）を容易に産生することができる。ある特定の実施形態では、ＶＨおよび／またはＶＬドメイン内のフレームワークおよび／またはＣＤＲ残基の全てが、抗体が由来する本来の生殖系列配列に見出される残基へと逆変異されている。他の実施形態では、ある特定の残基のみが、例えば、ＦＲ１の最初の８アミノ酸の内もしくはＦＲ４の最後の８アミノ酸の内に見出される変異された残基のみまたはＣＤＲ１、ＣＤＲ２もしくはＣＤＲ３の内に見出される変異された残基のみが、本来の生殖系列配列へと逆変異されている。他の実施形態では、フレームワークおよび／またはＣＤＲ残基（複数可）のうち１個または複数が、異なる生殖系列配列（すなわち、抗体が本来由来する生殖系列配列とは異なる生殖系列配列）の相当する残基（複数可）へと変異されている。
【０１０６】
さらに、本開示の二重特異的抗原結合分子またはその抗原結合ドメイン（Ｄ１および／またはＤ２）は、フレームワークおよび／またはＣＤＲ領域内の２個以上の生殖系列変異のいかなる組み合わせを含有することもできる、例えば、ある特定の個々の残基は、特定の生殖系列配列の相当する残基へと変異されるが、本来の生殖系列配列とは異なるある特定の他の残基は、維持される、あるいは異なる生殖系列配列の相当する残基へと変異される。１個または複数の生殖系列変異を含有する二重特異的抗原結合分子またはその抗原結合ドメイン（Ｄ１および／またはＤ２）を得たら、結合特異性の向上、結合親和性の増加、アンタゴニストまたはアゴニスト性の生物学的特性の向上または増強（場合による）、免疫原性の低下等、１種または複数の所望の特性に関して容易に検査することができる。このような一般的な様式で得られる二重特異的抗原結合分子またはその抗原結合ドメイン（Ｄ１および／またはＤ２）は、本開示の範囲内に包含される。
改変体
【０１０７】
本開示はまた、本明細書に開示されるＨＣＶＲ、ＬＣＶＲ、および／またはＣＤＲのアミノ酸配列のうちの任意のものの改変体を含む、抗ＭＥＴ抗体および二重特異的抗原結合分子を含む。本態様内に含まれる例示的な改変体は、１つまたは複数の保存的置換を有する、本明細書に開示されるＨＣＶＲ、ＬＣＶＲ、および／またはＣＤＲのアミノ酸配列のうちの任意のものの改変体を含む。例えば、本開示は、本明細書の表１に示されているＨＣＶＲ、ＬＣＶＲおよび／またはＣＤＲアミノ酸配列のいずれかと比べて、例えば、１０個以下、８個以下、６個以下、４個以下等の保存的アミノ酸置換を有するＨＣＶＲ、ＬＣＶＲおよび／またはＣＤＲアミノ酸配列を有する抗ＭＥＴ抗体およびＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗原結合分子を含む。
【０１０８】
本開示のこの態様内に含まれる例示的な改変体はまた、本明細書に開示される、ＨＣＶＲ、ＬＣＶＲおよび／またはＣＤＲのアミノ酸配列のうちの任意のものと実質的な配列同一性を有する改変体を含む。アミノ酸配列の文脈において本明細書で使用する場合、用語「実質的同一性」または「実質的に同一の」は、２種のアミノ酸配列が、デフォルトギャップ重量を使用してプログラムＧＡＰまたはＢＥＳＴＦＩＴ等により最適に整列されたときに、少なくとも９５％、９８％または９９％配列同一性を共有することを意味する。ある特定の実施形態では、同一ではない残基ポジションは、保存的アミノ酸置換により異なる。「保存的アミノ酸置換」は、アミノ酸残基が、類似の化学的特性（例えば、電荷または疎水性）を有する側鎖（Ｒ基）を有する別のアミノ酸残基により置換される置換である。一般に、保存的アミノ酸置換は、タンパク質の機能特性を実質的に変化させないであろう。２種以上のアミノ酸配列が、保存的置換により互いに異なる場合、パーセント配列同一性または類似性の程度は、置換の保存的性質を補正するために上向きに調整することができる。この調整を行うための手段は、当業者に周知のものである。例えば、参考として本明細書に援用されるＰｅａｒｓｏｎ（１９９４年）Ｍｅｔｈｏｄｓ  Ｍｏｌ．  Ｂｉｏｌ．２４巻：３０７〜３３１頁を参照のこと。類似の化学的特性を有する側鎖を有するアミノ酸の群の例として、（１）脂肪族側鎖：グリシン、アラニン、バリン、ロイシンおよびイソロイシン；（２）脂肪族−ヒドロキシル側鎖：セリンおよびスレオニン；（３）アミド含有側鎖：アスパラギンおよびグルタミン；（４）芳香族側鎖：フェニルアラニン、チロシンおよびトリプトファン；（５）塩基性側鎖：リジン、アルギニンおよびヒスチジン；（６）酸性側鎖：アスパラギン酸およびグルタミン酸、ならびに（７）硫黄含有側鎖がシステインおよびメチオニンであることが挙げられる。好ましい保存的アミノ酸置換群は、バリン−ロイシン−イソロイシン、フェニルアラニン−チロシン、リジン−アルギニン、アラニン−バリン、グルタミン酸−アスパラギン酸およびアスパラギン−グルタミンである。あるいは、保存的置き換えは、参考として本明細書に援用されるＧｏｎｎｅｔら、（１９９２年）Ｓｃｉｅｎｃｅ  ２５６巻：１４４３〜１４４５頁に開示されているＰＡＭ２５０対数尤度マトリックスにおいて正の値を有するいずれかの変化である。「中程度に保存的」置き換えは、ＰＡＭ２５０対数尤度マトリックスにおいて負ではない値を有するいずれかの変化である。
【０１０９】
２種の異なるアミノ酸配列間の配列同一性とも称されるポリペプチドの配列類似性は、典型的には、配列解析ソフトウェアを使用して測定される。配列解析ソフトウェアは、保存的アミノ酸置換を含む様々な置換、欠失および他の修飾に割り当てられた類似性の尺度を使用して類似の配列を一致させる。例えば、ＧＣＧソフトウェアは、デフォルトパラメータにより使用して、異なる生物種由来の相同ポリペプチド等、密接に関係したポリペプチドの間、あるいは野生型タンパク質とその変異タンパク質との間の配列相同性または配列同一性を決定することのできるＧａｐおよびＢｅｓｔｆｉｔ等のプログラムを含有する。例えば、ＧＣＧバージョン６．１を参照されたい。ポリペプチド配列は、デフォルトまたは推奨されるパラメータを用いてＦＡＳＴＡを使用して比較することもできる。ＧＣＧバージョン６．１におけるプログラムＦＡＳＴＡ（例えば、ＦＡＳＴＡ２およびＦＡＳＴＡ３）は、アライメントならびに問い合わせおよび検索配列間の最良の重複の領域のパーセント配列同一性を提供する（Ｐｅａｒｓｏｎ（２０００年）上記参照）。本明細書に提供される配列を、異なる生物由来の多数の配列を含有するデータベースと比較する際の別の好ましいアルゴリズムは、デフォルトパラメータを使用したコンピュータプログラムＢＬＡＳＴ、特にＢＬＡＳＴＰまたはＴＢＬＡＳＴＮである。例えば、それぞれ参考として本明細書に援用されるＡｌｔｓｃｈｕｌら、（１９９０年）Ｊ．  Ｍｏｌ．  Ｂｉｏｌ．２１５巻：４０３  ４１０頁およびＡｌｔｓｃｈｕｌら、（１９９７年）Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄｓ  Ｒｅｓ．２５巻：３３８９  ４０２頁を参照のこと。
Ｆｃ改変体を含む抗ＭＥＴ抗体およびＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗原結合分子
【０１１０】
本明細書に提供されるある特定の実施形態によると、例えば、中性ｐＨと比較して酸性ｐＨにおいて、ＦｃＲｎ受容体への抗体結合を増強または減弱化する１個または複数の変異を含むＦｃドメインを含む、抗ＭＥＴ抗体およびＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗原結合分子が提供される。例えば、本開示は、ＦｃドメインのＣＨ２またはＣＨ３領域に変異を含む抗ＭＥＴ抗体およびＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗原結合分子を含み、前記変異（複数可）は、酸性環境（例えば、ｐＨが約５．５〜約６．０に及ぶエンドソーム）におけるＦｃＲｎに対するＦｃドメインの親和性を増加させる。係る変異は、動物に投与される際に、抗体の血清半減期の増加をもたらすことができる。係るＦｃ修飾の非限定例として、例えば、２５０（例えば、ＥまたはＱ）；２５０および４２８（例えば、ＬまたはＦ）；２５２（例えば、Ｌ／Ｙ／Ｆ／ＷまたはＴ）、２５４（例えば、ＳまたはＴ）および２５６（例えば、Ｓ／Ｒ／Ｑ／Ｅ／ＤまたはＴ）位における修飾；または４２８および／もしくは４３３（例えば、Ｈ／Ｌ／Ｒ／Ｓ／Ｐ／ＱまたはＫ）および／もしくは４３４（例えば、Ｈ／ＦまたはＹ）位における修飾；または２５０および／もしくは４２８位における修飾；または３０７もしくは３０８（例えば、３０８Ｆ、Ｖ３０８Ｆ）および４３４位における修飾が挙げられる。一実施形態では、修飾は、４２８Ｌ（例えば、Ｍ４２８Ｌ）および４３４Ｓ（例えば、Ｎ４３４Ｓ）修飾；４２８Ｌ、２５９Ｉ（例えば、Ｖ２５９Ｉ）および３０８Ｆ（例えば、Ｖ３０８Ｆ）修飾；４３３Ｋ（例えば、Ｈ４３３Ｋ）および４３４（例えば、４３４Ｙ）修飾；２５２、２５４および２５６（例えば、２５２Ｙ、２５４Ｔおよび２５６Ｅ）修飾；２５０Ｑおよび４２８Ｌ修飾（例えば、Ｔ２５０ＱおよびＭ４２８Ｌ）；ならびに３０７および／または３０８修飾（例えば、３０８Ｆまたは３０８Ｐ）を含む。
【０１１１】
例えば、本開示は、２５０Ｑおよび２４８Ｌ（例えば、Ｔ２５０ＱおよびＭ２４８Ｌ）；２５２Ｙ、２５４Ｔおよび２５６Ｅ（例えば、Ｍ２５２Ｙ、Ｓ２５４ＴおよびＴ２５６Ｅ）；４２８Ｌおよび４３４Ｓ（例えば、Ｍ４２８ＬおよびＮ４３４Ｓ）；ならびに４３３Ｋおよび４３４Ｆ（例えば、Ｈ４３３ＫおよびＮ４３４Ｆ）からなる群より選択される変異の１種または複数のペアまたは群を含むＦｃドメインを含む抗ＭＥＴ抗体またはＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗原結合分子を含む。前述のＦｃドメイン変異および本明細書に開示されている抗体可変ドメイン内の他の変異のあらゆる可能な組み合わせは、本開示の範囲内であるとみなされる。
本明細書で提供される抗原結合分子の生物学的特徴
【０１１２】
単量体ヒトＭＥＴに高親和性で結合する抗体およびその抗原結合断片が本明細書で提供される。例えば、本開示は、例えば、本明細書中の実施例３で定義されるアッセイフォーマットまたは実質的に同様のアッセイを使用して、２５℃または３７℃で表面プラズモン共鳴によって測定されるとき、約２３０ｎＭ未満のＫＤで単量体ヒトＭＥＴ（例えばｈＭＥＴ．ｍｍｈ）に結合する抗ＭＥＴ抗体を含む。ある特定の実施形態によると、例えば、本明細書中の実施例３で定義されるアッセイフォーマットまたは実質的に同様のアッセイを使用して、表面プラズモン共鳴によって測定されるとき、３７℃で約２３０ｎＭ未満、約２００ｎＭ未満、約１５０ｎＭ未満、約１００ｎＭ未満、約５０ｎＭ未満、約２５ｎＭ未満、約２０ｎＭ未満、約１０ｎＭ未満、約８ｎＭ未満、約６ｎＭ未満、約５ｎＭ未満、約４ｎＭ未満、または約３ｎＭ未満のＫＤで単量体ヒトＭＥＴに結合する抗ＭＥＴ抗体が提供される。
【０１１３】
本開示はまた、例えば、本明細書中の実施例３で定義されるアッセイフォーマットまたは実質的に同様のアッセイを使用して、２５℃または３７℃で表面プラズモン共鳴によって測定されるとき、約１分を超える解離半減期（ｔ１／２）で、単量体ヒトＭＥＴ（例えばｈＭＥＴ．ｍｍｈ）に結合する抗体およびその抗原結合断片を含む。ある特定の実施形態によると、例えば、本明細書中の実施例３で定義されるアッセイフォーマットまたは実質的に同様のアッセイを使用して、表面プラズモン共鳴によって測定されるとき、３７℃で約１分を超える、約２分を超える、約４分を超える、約６分を超える、約８分を超える、約１０分を超える、約１２分を超える、約１４分を超える、約１６分を超える、約１８分を超える、もしくは約２０分を超える、またはそれよりも長いｔ１／２で、単量体ヒトＭＥＴに結合する抗ＭＥＴ抗体が提供される。
【０１１４】
高親和性で二量体ヒトＭＥＴ（例えばｈＭＥＴ．ｍＦｃ）に結合する抗体およびその抗原結合断片が本明細書で提供される。例えば、本開示は、例えば、本明細書中の実施例３で定義されるアッセイフォーマットまたは実質的に同様のアッセイを使用して、２５℃または３７℃で表面プラズモン共鳴によって測定されるとき、約３ｎＭ未満のＫＤで二量体ヒトＭＥＴに結合する抗ＭＥＴ抗体を含む。ある特定の実施形態によると、例えば、本明細書中の実施例３で定義されるアッセイフォーマットまたは実質的に同様のアッセイを使用して、表面プラズモン共鳴によって測定されるとき、３７℃で約３ｎＭ未満、約２ｎＭ未満、約１ｎＭ未満、約０．９ｎＭ未満、約０．８ｎＭ未満、約０．７ｎＭ未満、約０．６ｎＭ未満、約０．５ｎＭ未満、約０．４ｎＭ未満、約０．３ｎＭ未満、または約０．２５ｎＭ未満のＫＤで二量体ヒトＭＥＴに結合する抗ＭＥＴ抗体が提供される。
【０１１５】
例えば、本明細書中の実施例３で定義されるアッセイフォーマットまたは実質的に同様のアッセイを使用して、２５℃または３７℃で表面プラズモン共鳴によって測定されるとき、約４分を超える解離半減期（ｔ１／２）で、二量体ヒトＭＥＴ（例えばｈＭＥＴ．ｍＦｃ）に結合する抗体およびその抗原結合断片もまた本明細書で提供される。ある特定の実施形態によると、例えば、本明細書中の実施例３で定義されるアッセイフォーマットまたは実質的に同様のアッセイを使用して、表面プラズモン共鳴によって測定されるとき、３７℃で約４分を超える、約５分を超える、約１０分を超える、約２０分を超える、約３０分を超える、約４０分を超える、約５０分を超える、約６０分を超える、約７０分を超える、約８０分を超える、約９０分を超える、約１００分を超える、約１０５分を超える、またはより長いｔ１／２で、二量体ヒトＭＥＴに結合する抗ＭＥＴ抗体が提供される。
【０１１６】
例えば、本明細書中の実施例５で定義されるアッセイフォーマットまたは実質的に同様のアッセイを使用して、２５℃または３７℃で表面プラズモン共鳴によって測定されるとき、約１０分を超える解離半減期（ｔ１／２）で、二量体ヒトＭＥＴ（例えばｈＭＥＴ．ｍＦｃ）に結合するＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗原結合タンパク質もまた本明細書で提供される。特定のある実施形態によると、例えば、本明細書中の実施例５で定義されるアッセイフォーマットまたは実質的に同様のアッセイを使用して、表面プラズモン共鳴によって測定されるとき、３７℃で約１０分を超える、約２０分を超える、約３０分を超える、約４０分を超える、約５０分を超える、約６０分を超える、約７０分を超える、約８０分を超える、約９０分を超える、約１００分を超える、約２００分を超える、約３００分を超える、約４００分を超える、約５００分を超える、約６００分を超える、約７００分を超える、約８００分を超える、約９００分を超える、約１０００分を超える、約１１００分を超える、またはより長いｔ１／２で二量体ヒトＭＥＴに結合するＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗原結合タンパク質が提供される。
【０１１７】
例えば、ｉｎ  ｖｉｔｒｏリガンド結合アッセイにおいて、ＨＧＦとＭＥＴの間の相互作用を遮断する抗ＭＥＴ抗体およびＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗原結合タンパク質もまた本明細書で提供される。本明細書で提供されるある特定の実施形態によると、ヒトＭＥＴを発現する細胞に対するＨＧＦの結合を遮断し、ＨＧＦシグナル伝達の不在下で最小のＭＥＴ活性化を誘導するか、またはそれを全く誘導しない、ＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗原結合タンパク質が提供される。例えば、本開示は、細胞ベースのＭＥＴ活性レポーターアッセイにおいて、Ｄ１またはＤ２のみを含む単一特異的抗体を使用する同等の活性レポーターアッセイにおいて観察されるＭＥＴアゴニスト活性の５０％未満、４０％未満、３０％未満、２０％未満、１０％未満、５％未満、３％未満、２％未満、または１％未満である程度のＭＥＴアゴニスト活性を示すＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗原結合タンパク質を提供する。
【０１１８】
本開示の抗体および抗原結合タンパク質は、１つもしくは複数の前述の生物学的特徴、またはそれらの任意の組み合わせを有し得る。抗体の生物学的特徴の前述の列挙は、網羅的であることを意図しない。本明細書で提供される抗体の他の生物学的特徴は、本明細書の実施例を含む本開示の再吟味から、当業者には明らかである。
抗体−薬物コンジュゲート（ＡＤＣ）
【０１１９】
細胞傷害性薬剤、化学療法薬または放射性同位体等、治療部分にコンジュゲートされた抗ＭＥＴ抗体またはＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗原結合タンパク質を含む抗体−薬物コンジュゲート（ＡＤＣ）が本明細書に提供される。
【０１２０】
細胞傷害性薬剤は、チューブリン相互作用薬剤およびＤＮＡ損傷剤を含むがこれらに限定されない、細胞の成長、生存率または繁殖に有害な任意の薬剤を含む。本開示の本態様に従って抗ＭＥＴ抗体にコンジュゲートすることができる適した細胞傷害性薬剤および化学療法剤の例として、例えば、１−（２クロロエチル）−１，２−ジメタンスルホニルヒドラジド、１，８−ジヒドロキシ−ビシクロ［７．３．１］トリデカ−４，９−ジエン−２，６−ジイン−１３−オン、１−デヒドロテストステロン、５−フルオロウラシル、６−メルカプトプリン、６−チオグアニン、９−アミノカンプトテシン、アクチノマイシンＤ、アマニチン、アミノプテリン、アングイジン（ａｎｇｕｉｄｉｎｅ）、アントラサイクリン、アントラマイシン（ＡＭＣ）、アウリスタチン、ブレオマイシン、ブスルファン、酪酸、カリチアマイシン（例えば、カリチアマイシンγ１）、カンプトテシン、カルミノマイシン（ｃａｒｍｉｎｏｍｙｃｉｎ）、カルムスチン、セマドチン、シスプラチン、コルヒチン（ｃｏｌｃｈｉｃｉｎ）、コンブレタスタチン、シクロホスファミド、シタラビン、サイトカラシンＢ、ダクチノマイシン、ダウノルビシン、ダカルバジン（ｄｅｃａｒｂａｚｉｎｅ）、ジアセトキシペンチルドキソルビシン、ジブロモマンニトール、ジヒドロキシアントラシンジオン、ジソラゾール（ｄｉｓｏｒａｚｏｌｅ）、ドラスタチン（例えば、ドラスタチン１０）、ドキソルビシン、デュオカルマイシン、エキノマイシン、エリュテロビン、エメチン、エポチロン、エスペラミシン、エストラムスチン、エチジウムブロマイド、エトポシド、フルオロウラシル、ゲルダナマイシン、グラミシジンＤ、グルココルチコイド、イリノテカン、キネシンスピンドルタンパク質（ＫＳＰ）阻害剤、レプトマイシン、ロイロシン（ｌｅｕｒｏｓｉｎｅ）、リドカイン、ロムスチン（ＣＣＮＵ）、メイタンシノイド、メクロレタミン、メルファラン、メルカプトプリン（ｍｅｒｃａｔｏｐｕｒｉｎｅ）、メトプテリン、メトトレキセート、ミスラマイシン、マイトマイシン、ミトキサントロン、Ｎ８−アセチルスペルミジン、ポドフィロトキシン、プロカイン、プロプラノロール、プテリジン、ピューロマイシン、ピロロベンゾジアゼピン（ＰＢＤ）、リゾキシン、ストレプトゾトシン、タリソマイシン（ｔａｌｌｙｓｏｍｙｃｉｎ）、タキソール、テニポシド（ｔｅｎｏｐｏｓｉｄｅ）、テトラカイン、チオテパ（ｔｈｉｏｅｐａ）、クロラムブシル、トメイマイシン（ｔｏｍａｙｍｙｃｉｎ）、トポテカン、ツブリシン（ｔｕｂｕｌｙｓｉｎ）、ビンブラスチン、ビンクリスチン、ビンデシン、ビノレルビンおよび前述のいずれかの誘導体が挙げられる。ある特定の実施形態によると、抗ＭＥＴ抗体にコンジュゲートされる細胞傷害性薬剤は、ＤＭ１もしくはＤＭ４等のメイタンシノイド、トメイマイシン誘導体またはドラスタチン誘導体である。る特定の実施形態によると、抗ＭＥＴ抗体にコンジュゲートされる細胞傷害剤は、アウリスタチン、例えばＭＭＡＥ、ＭＭＡＦ、またはそれらの誘導体である。本技術分野で公知の他の細胞傷害性薬剤は、本開示の範囲内であるとみなされ、例えば、リシン、Ｃ．ｄｉｆｆｉｃｉｌｅ毒素、シュード���ナス外毒素、リシン、ジフテリア毒素、ボツリヌス毒素、ブリオジン（ｂｒｙｏｄｉｎ）、サポリン、ヨウシュヤマゴボウ毒素（すなわち、ファイトラッカトキシン（ｐｈｙｔｏｌａｃｃａｔｏｘｉｎ）およびファイトラッキゲニン（ｐｈｙｔｏｌａｃｃｉｇｅｎｉｎ））等のタンパク質毒素、およびＳａｐｒａら、Ｐｈａｒｍａｃｏｌ．  ＆  Ｔｈｅｒａｐｅｕｔｉｃｓ、２０１３年、１３８巻：４５２〜４６９頁に表記されているもの等のその他を含む。
【０１２１】
ある特定の実施形態では、細胞傷害剤はメイタンシノイド、例えばメイタンシンの誘導体である。適切なメイタンシノイドには、ＤＭ１、ＤＭ４、またはそれらの誘導体、立体異性体、もしくはアイソトポログが含まれる。適切なメイタンシノイドにはまた、参照によりその全体が本明細書に組み込まれるＷＯ２０１４／１４５０９０Ａ１、ＷＯ２０１５／０３１３９６Ａ１、ＵＳ２０１６／０３７５１４７Ａ１、およびＵＳ２０１７／０２０９５９１Ａ１に開示されるものが含まれるがこれらには限定されない。
【０１２２】
一部の実施形態では、メイタンシノイドは以下の構造：
【化１】
2020509027.tif 000002
を有し、式中、Ａは、必要に応じて置換されているアリーレンまたはヘテロアリーレンである。
【０１２３】
一部の実施形態では、メイタンシノイドは以下の構造：
【化２】
2020509027.tif 000003
を有し、式中、Ａは、必要に応じて置換されているアリーレンまたはヘテロアリーレンである。
【０１２４】
一部の実施形態では、メイタンシノイドは以下の構造：
【化３】
2020509027.tif 000004
を有し、式中、ｎは１〜１２の整数であり、Ｒ１はアルキルである。
【０１２５】
一部の実施形態では、メイタンシノイドは
【化４−１】
2020509027.tif 000005
【化４−２】
2020509027.tif 000006
【化４−３】
2020509027.tif 000007
【化４−４】
2020509027.tif 000008
である。
【０１２６】
一部の実施形態では、メイタンシノイドは
【化５】
2020509027.tif 000009
である。
【０１２７】
一部の実施形態では、メイタンシノイドは
【化６】
2020509027.tif 000010
である。
【０１２８】
１種または複数の放射性核種にコンジュゲートされた抗ＭＥＴ抗体を含む抗体−放射性核種コンジュゲート（ＡＲＣ）も本明細書に提供される。本開示の本態様の文脈において使用することができる例示的な放射性核種として、例えば、２２５Ａｃ、２１２Ｂｉ、２１３Ｂｉ、１３１Ｉ、１８６Ｒｅ、２２７Ｔｈ、２２２Ｒｎ、２２３Ｒａ、２２４Ｒａおよび９０Ｙが挙げられるがこれらに限定されない。
【０１２９】
本明細書に提供されるある特定の実施形態では、リンカー分子を介して細胞傷害性薬剤（例えば、上に開示されている細胞傷害性薬剤のいずれか）にコンジュゲートされた抗ＭＥＴ抗体またはＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗原結合タンパク質を含むＡＤＣが提供される。リンカーは、本明細書に記載される抗体または抗原結合タンパク質を、治療用部分、例えば細胞傷害剤と連結、接続、または結合する任意の基または部分である。適切なリンカーは、例えば、Ａｎｔｉｂｏｄｙ−Ｄｒｕｇ  Ｃｏｎｊｕｇａｔｅｓ  ａｎｄ  Ｉｍｍｕｎｏｔｏｘｉｎｓ；Ｐｈｉｌｌｉｐｓ，  Ｇ．  Ｌ．編集、Ｓｐｒｉｎｇｅｒ  Ｖｅｒｌａｇ：Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ、２０１３年；Ａｎｔｉｂｏｄｙ−Ｄｒｕｇ  Ｃｏｎｊｕｇａｔｅｓ；Ｄｕｃｒｙ，  Ｌ．編集；Ｈｕｍａｎａ  Ｐｒｅｓｓ、２０１３年；Ａｎｔｉｂｏｄｙ−Ｄｒｕｇ  Ｃｏｎｊｕｇａｔｅｓ；Ｗａｎｇ，  Ｊ．、Ｓｈｅｎ，  Ｗ．−Ｃ．、およびＺａｒｏ，  Ｊ．  Ｌ．編集；Ｓｐｒｉｎｇｅｒ  Ｉｎｔｅｒｎａｔｉｏｎａｌ  Ｐｕｂｌｉｓｈｉｎｇ、２０１５年に見出すことができ、各々の内容は、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。一般的に、本明細書に記載される抗体コンジュゲートのための適切な結合剤リンカーは、抗体の循環半減期を利用するのに十分安定であり、同時に、抗原媒介によるコンジュゲートの内在化後にそのペイロードを放出することができるものである。リンカーは、切断可能または切断不可能であり得る。切断可能なリンカーは、内在化に続いて、細胞内代謝、例えば、加水分解、還元、または酵素反応による切断によって切断されるリンカーを含む。切断不可能なリンカーは、内在化に続いて、抗体のリソソーム分解を介して、結合したペイロードを放出するリンカーを含む。適切なリンカーは、酸に不安定なリンカー、加水分解に不安定なリンカー、酵素的に切断可能なリンカー、還元に不安定なリンカー、自壊性リンカー、および切断不可能なリンカーを含むが、これらに限定されない。適切なリンカーはまた、ペプチド、グルクロニド、スクシンイミド−チオエーテル、ポリエチレングリコール（ＰＥＧ）単位、ヒドラゾン、マル−カプロイル単位（ｍａｌ−ｃａｐｒｏｙｌ  ｕｎｉｔ）、ジペプチド単位、バリン−シトルリン単位、およびパラ−アミノベンジル（ＰＡＢ）単位であるか、またはそれらを含むものを含むが、これらに限定されない。
【０１３０】
本技術分野で公知のいかなるリンカー分子またはリンカー技術を使用して、本開示のＡＤＣを作出または構築してもよい。ある特定の実施形態では、リンカーは、切断可能リンカーである。他の実施形態によると、リンカーは、切断不能リンカーである。本開示の文脈において使用することができる例示的なリンカーは、例えば、ＭＣ（６−マレイミドカプロイル）、ＭＰ（マレイミドプロパノイル）、ｖａｌ−ｃｉｔ（バリン−シトルリン）、ｖａｌ−ａｌａ（バリン−アラニン）、プロテアーゼ切断可能リンカーにおけるジペプチド部位、ａｌａ−ｐｈｅ（アラニン−フェニルアラニン）、プロテアーゼ切断可能リンカーにおけるジペプチド部位、ＰＡＢ（ｐ−アミノベンジルオキシカルボニル）、ＳＰＰ（Ｎ−スクシンイミジル４−（２−ピリジルチオ）ペンタノエート）、ＳＭＣＣ（Ｎ−スクシンイミジル４−（Ｎ−マレイミドメチル）シクロヘキサン−１カルボキシレート）、ＳＩＡＢ（Ｎ−スクシンイミジル（４−ヨード−アセチル）アミノベンゾエート）ならびにこれらの改変体および組み合わせを含む、またはこれらからなるリンカーを含む。本開示の文脈において使用することができるリンカーの追加的な例は、例えば、それらの内容全体が参照により本明細書に組み入れられる、ＵＳ７，７５４，６８１およびＤｕｃｒｙ、Ｂｉｏｃｏｎｊｕｇａｔｅ  Ｃｈｅｍ．、２０１０年、２１巻：５〜１３頁ならびにこれらに引用されている参考文献に提供されている。
【０１３１】
ある特定の実施形態では、リンカーは生理学的条件下で安定である。ある特定の実施形態では、リンカーは切断可能であり、例えば、酵素の存在下でまたは特定のｐＨ範囲もしくは値で少なくともペイロードポーションを放出することができる。一部の実施形態では、リンカーは酵素切断可能な部分を含む。例示的な酵素切断可能な部分には、ペプチド結合、エステル結合、ヒドラゾン、およびジスルフィド連結（ｄｉｓｕｌｆｉｄｅ  ｌｉｎｋａｇｅ）が含まれるが、これらに限定されない。一部の実施形態では、リンカーはカテプシン切断可能なリンカーを含む。
【０１３２】
一部の実施形態では、リンカーは切断不可能な部分を含む。
【０１３３】
適切なリンカーはまた、単一の結合剤、例えば抗体の２つのシステイン残基に化学的に結合しているものを含むが、これらに限定されない。このようなリンカーは、コンジュゲーションプロセスの結果として妨害される抗体のジスルフィド結合を模倣するのに役立ち得る。
【０１３４】
一部の実施形態では、リンカーは、１つまたは複数のアミノ酸を含む。適切なアミノ酸には、天然、非天然、標準、非標準、タンパク質構成性、非タンパク質構成性、およびＬ−またはＤ−α−アミノ酸が含まれる。一部の実施形態では、リンカーは、アラニン、バリン、グリシン、ロイシン、イソロイシン、メチオニン、トリプトファン、フェニルアラニン、プロリン、セリン、トレオニン、システイン、チロシン、アスパラギン、グルタミン、アスパラギン酸、グルタミン酸、リシン、アルギニン、ヒスチジン、もしくはシトルリン、それらの誘導体、またはそれらの組み合わせを含む。ある特定の実施形態では、アミノ酸の１つまたは複数の側鎖は、以下に記載される側鎖基に連結している。一部の実施形態では、リンカーはバリンおよびシトルリンを含む。一部の実施形態では、リンカーは、リシン、バリン、およびシトルリンを含む。一部の実施形態では、リンカーは、リシン、バリン、およびアラニンを含む。一部の実施形態では、リンカーは、バリンおよびアラニンを含む。
【０１３５】
一部の実施形態では、リンカーは自壊性基を含む。自壊性基は、当業者に公知の任意のそのような基であり得る。特定の実施形態では、自壊性基は、ｐ−アミノベンジル（ＰＡＢ）、またはその誘導体である。有用な誘導体には、ｐ−アミノベンジルオキシカルボニル（ＰＡＢＣ）が含まれる。当業者は、自壊性基が、ペイロードからリンカーの残りの原子を放出する化学反応を起こすことができることを認識する。
【０１３６】
一部の実施形態では、リンカーは
【化７】
2020509027.tif 000011
であり、式中、
【化８】
2020509027.tif 000012
は、抗体または抗原結合タンパク質（例えば、リシン残基を介する）に対する結合であり、
【化９】
2020509027.tif 000013
は、細胞傷害剤（例えば、ＤＭ１）に対する結合である。一部の実施形態では、リンカーは、
【化１０】
2020509027.tif 000014
であり、式中、
【化１１】
2020509027.tif 000015
は、抗体または抗原結合タンパク質（例えば、リシン残基を介する）に対する結合であり、
【化１２】
2020509027.tif 000016
は、細胞傷害剤（例えば、ＤＭ１）に対する結合である。ある特定の実施形態では、リンカーは、
【化１３】
2020509027.tif 000017
である。
【０１３７】
ある特定の実施形態では、リンカーは、
【化１４】
2020509027.tif 000018
である。
【０１３８】
一部の実施形態では、リンカーは、マレイミジルメチル−４−トランス−シクロヘキサンカルボキシスクシネート：
【化１５】
2020509027.tif 000019
に由来する。
【０１３９】
一部の実施形態では、リンカーは
【化１６】
2020509027.tif 000020
であり、式中、
【化１７】
2020509027.tif 000021
は、抗体または抗原結合タンパク質（例えば、リシン残基を介する）に対する結合であり、
【化１８】
2020509027.tif 000022
は、細胞傷害剤（例えば、以下の式：
【化１９】
2020509027.tif 000023
を有する化合物）に対する結合である。
【０１４０】
本開示は、リンカーが、抗体または抗原結合分子内の特定のアミノ酸における結合により抗ＭＥＴ抗体またはＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗原結合タンパク質を薬物または細胞毒に接続するＡＤＣを含む。本態様の文脈において使用することができる例示的なアミノ酸結合は、例えば、リジン（例えば、ＵＳ５，２０８，０２０；ＵＳ２０１０／０１２９３１４；Ｈｏｌｌａｎｄｅｒら、Ｂｉｏｃｏｎｊｕｇａｔｅ  Ｃｈｅｍ．、２００８年、１９巻：３５８〜３６１頁；ＷＯ２００５／０８９８０８；ＵＳ５，７１４，５８６；ＵＳ２０１３／０１０１５４６；およびＵＳ２０１２／０５８５５９２を参照）、システイン（例えば、ＵＳ２００７／０２５８９８７；ＷＯ２０１３／０５５９９３；ＷＯ２０１３／０５５９９０；ＷＯ２０１３／０５３８７３；ＷＯ２０１３／０５３８７２；ＷＯ２０１１／１３０５９８；ＵＳ２０１３／０１０１５４６；およびＵＳ７，７５０，１１６を参照）、セレノシステイン（例えば、ＷＯ２００８／１２２０３９；およびＨｏｆｅｒら、Ｐｒｏｃ．  Ｎａｔｌ．  Ａｃａｄ．  Ｓｃｉ．、ＵＳＡ、２００８年、１０５巻：１２４５１〜１２４５６頁を参照）、ホルミルグリシン（例えば、Ｃａｒｒｉｃｏら、Ｎａｔ．  Ｃｈｅｍ．  Ｂｉｏｌ．、２００７年、３巻：３２１〜３２２頁；Ａｇａｒｗａｌら、Ｐｒｏｃ．  Ｎａｔｌ．  Ａｃａｄ．  Ｓｃｉ．、ＵＳＡ、２０１３年、１１０巻：４６〜５１頁およびＲａｂｕｋａら、Ｎａｔ．  Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ、２０１２年、１０巻：１０５２〜１０６７頁を参照）、非天然アミノ酸（例えば、ＷＯ２０１３／０６８８７４およびＷＯ２０１２／１６６５５９を参照）および酸性アミノ酸（例えば、ＷＯ２０１２／０５９８２を参照）を含む。リンカーは、炭水化物（例えば、ＵＳ２００８／０３０５４９７、ＷＯ２０１４／０６５６６１およびＲｙａｎら、Ｆｏｏｄ  ＆  Ａｇｒｉｃｕｌｔｕｒｅ  Ｉｍｍｕｎｏｌ．、２００１年、１３巻：１２７〜１３０頁を参照）およびジスルフィドリンカー（例えば、ＷＯ２０１３／０８５９２５、ＷＯ２０１０／０１０３２４、ＷＯ２０１１／０１８６１１およびＳｈａｕｎａｋら、Ｎａｔ．  Ｃｈｅｍ．  Ｂｉｏｌ．、２００６年、２巻：３１２〜３１３頁を参照）への結合により、抗原結合タンパク質にコンジュゲートすることもできる。部位特異的コンジュゲーション技法もまた、抗体または抗原結合タンパク質の特定の残基への直接コンジュゲーションに使用することができる（例えば、Ｓｃｈｕｍａｃｈｅｒら、Ｊ  Ｃｌｉｎ  Ｉｍｍｕｎｏｌ（２０１６年）３６巻（補遺１）：１００頁を参照されたい）。部位特異的コンジュゲーション技法には、トランスグルタミナーゼを介したグルタミンコンジュゲーション（例えば、Ｓｃｈｉｂｌｉ、Ａｎｇｅｗ  Ｃｈｅｍｉｅ  Ｉｎｔｅｒ  Ｅｄ．２０１０年、４９巻、９９９５頁を参照されたい）が含まれるが、これらに限定されない。
【０１４１】
ある特定の実施形態によると、本開示は、本明細書に記載されている抗ＭＥＴ抗体またはＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗原結合タンパク質が、これによりその開示全体が参照により本明細書に組み入れられる国際特許公開ＷＯ２０１４／１４５０９０に表記されているリンカー−薬物組成物（例えば、本明細書において「Ｍ００２６」とも称され、以下に描示される、化合物「７」）にコンジュゲートされたＡＤＣを提供する。
【化２０】
2020509027.tif 000024
【０１４２】
本明細書に開示される単一特異的抗ＭＥＴ抗体およびＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗体を含む抗体−薬物コンジュゲートであって、該抗ＭＥＴ抗体またはＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗体が細胞傷害剤にコンジュゲートされている、抗体−薬物コンジュゲートもまた本明細書で提供される。ある特定の実施形態では、細胞傷害剤は、メイタンシノイドである。ある特定の実施形態では、メイタンシノイドは、以下の式：
【化２１】
2020509027.tif 000025
を有する化合物であり、式中、ｎは１〜１２の整数であり、Ｒ１はアルキルである。ある特定の実施形態では、メイタンシノイドは、
【化２２】
2020509027.tif 000026
である。ある特定の実施形態では、細胞傷害剤は、メイタンシノイドであり、メイタンシノイドは、切断不可能なリンカーを介して抗体に共有結合により結合している。ある特定の実施形態では、細胞傷害剤は、メイタンシノイドであり、メイタンシノイドは、切断可能なリンカーを介して抗体に共有結合により結合している。
【０１４３】
一実施形態では、抗体は、
【化２３】
2020509027.tif 000027
にコンジュゲートされており、
式中、
【化２４】
2020509027.tif 000028
は、抗体に対する結合である。
【０１４４】
一実施形態では、抗体は、
【化２５】
2020509027.tif 000029
にコンジュゲートされており、
式中、
【化２６】
2020509027.tif 000030
は、抗体に対する結合である。
【０１４５】
一実施形態では、抗体は、
【化２７】
2020509027.tif 000031
にコンジュゲートされており、式中、
【化２８】
2020509027.tif 000032
は、抗体に対する結合である。
【０１４６】
一実施形態では、抗体は、
【化２９】
2020509027.tif 000033
にコンジュゲートされており、
式中、
【化３０】
2020509027.tif 000034
は、抗体に対する結合である。
【０１４７】
一部の実施形態では、コンジュゲートは以下の構造：
Ａｂ−［Ｌ−Ｐａｙ］ｎ
を有し、
式中、
Ａｂは、本明細書で記載される抗ＭＥＴ抗体またはＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗原結合タンパク質であり；
Ｌは、リンカーであり；
Ｐａｙは、細胞傷害剤であり；
ｎは、１〜１０の整数である。
【０１４８】
一部の実施形態では、Ａｂは、配列番号８２／１３８のＨＣＶＲ／ＬＣＶＲアミノ酸配列対内のＣＤＲを含む抗ＭＥＴ抗体である。一部の実施形態では、Ａｂは、配列番号８２のＨＣＶＲアミノ酸配列と、配列番号１３８のＬＣＶＲアミノ酸配列とを含む、抗ＭＥＴ抗体である。
【０１４９】
一部の実施形態では、Ａｂは、配列番号５８のＤ１−ＨＣＶＲアミノ酸配列内のＣＤＲと、配列番号８２のＤ２−ＨＣＶＲアミノ酸配列内のＣＤＲとを含む、ＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗原結合タンパク質である。一部の態様では、ＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗原結合タンパク質は、配列番号１３８のＬＣＶＲアミノ酸配列内のＣＤＲをさらに含む。一部の実施形態では、Ａｂは、配列番号５８のＤ１−ＨＣＶＲアミノ酸配列と、配列番号８２のＤ２−ＨＣＶＲアミノ酸配列とを含む、ＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗原結合タンパク質である。一部の態様では、ＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗原結合タンパク質は、配列番号１３８のＬＣＶＲアミノ酸配列をさらに含む。
【０１５０】
一部の実施形態では、Ａｂは、配列番号１８のＤ１−ＨＣＶＲアミノ酸配列内のＣＤＲと、配列番号８２のＤ２−ＨＣＶＲアミノ酸配列内のＣＤＲとを含む、ＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗原結合タンパク質である。一部の態様では、ＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗原結合タンパク質は、配列番号１３８のＬＣＶＲアミノ酸配列内のＣＤＲをさらに含む。一部の実施形態では、Ａｂは、配列番号１８のＤ１−ＨＣＶＲアミノ酸配列と、配列番号８２のＤ２−ＨＣＶＲアミノ酸配列とを含む、ＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗原結合タンパク質である。
【０１５１】
一部の実施形態では、Ｌは切断可能なリンカーである。一部の実施形態では、切断不可能なリンカーである。一部の実施形態では、Ｌはジペプチドを含む。一部の実施形態では、ＬはＰＡＢ部分を含む。
【０１５２】
一部の実施形態では、Ｌは、以下の構造：
【化３１】
2020509027.tif 000035
を有する部分を含む。
【０１５３】
一部の実施形態では、Ｌは、以下の構造：
【化３２】
2020509027.tif 000036
を有する部分を含む。
【０１５４】
一部の実施形態では、Ｌは、以下の構造：
【化３３】
2020509027.tif 000037
を有する部分を含む。
【０１５５】
一部の実施形態では、Ｌは、以下の構造：
【化３４】
2020509027.tif 000038
を有する部分を含む。
【０１５６】
一部の実施形態では、Ｐａｙはメイタンシノイドである。
【０１５７】
一部の実施形態では、Ｐａｙは、
【化３５】
2020509027.tif 000039
であり、式中、Ｒ１はアルキルである。
【０１５８】
一部の実施形態では、Ｐａｙは、
【化３６】
2020509027.tif 000040
である。
【０１５９】
一部の実施形態では、Ｐａｙは、
【化３７】
2020509027.tif 000041
である。
【０１６０】
一部の実施形態では、ｎは、２〜５の整数である。
【０１６１】
一部の実施形態では、−Ｌ−Ｐａｙは、
【化３８】
2020509027.tif 000042
であり、
式中、
【化３９】
2020509027.tif 000043
は、抗体に対する結合である。
【０１６２】
一部の実施形態では、−Ｌ−Ｐａｙは、
【化４０】
2020509027.tif 000044
であり、式中、
【化４１】
2020509027.tif 000045
は、抗体に対する結合である。
【０１６３】
一部の実施形態では、−Ｌ−Ｐａｙは、
【化４２】
2020509027.tif 000046
であり、式中、
【化４３】
2020509027.tif 000047
は、抗体に対する結合である。
【０１６４】
一部の実施形態では、−Ｌ−Ｐａｙは、
【化４４】
2020509027.tif 000048
であり、
式中、
【化４５】
2020509027.tif 000049
は、抗体に対する結合である。
【０１６５】
一部の実施形態では、コンジュゲートは、以下の構造：
Ａｂ−［Ｌ−Ｐａｙ］ｎ
を有し、式中、
Ａｂは、配列番号８２のＨＣＶＲアミノ酸配列と、配列番号１３８のＬＣＶＲアミノ酸配列とを含む、抗ＭＥＴ抗体であり；
Ｌ−Ｐａｙは、
【化４６】
2020509027.tif 000050
であり、式中、
【化４７】
2020509027.tif 000051
は、抗体に対する結合であり；ｎは、２〜５の整数である。
【０１６６】
一部の実施形態では、コンジュゲートは、以下の構造：
Ａｂ−［Ｌ−Ｐａｙ］ｎ
を有し、式中、
Ａｂは、配列番号８２のＨＣＶＲアミノ酸配列と、配列番号１３８のＬＣＶＲアミノ酸配列とを含む、抗ＭＥＴ抗体であり；
Ｌ−Ｐａｙは、
【化４８】
2020509027.tif 000052
であり、式中、
【化４９】
2020509027.tif 000053
は、抗体に対する結合であり；ｎは、２〜５の整数である。
【０１６７】
一部の実施形態では、コンジュゲートは、以下の構造：
Ａｂ−［Ｌ−Ｐａｙ］ｎ
を有し、式中、
Ａｂは、配列番号８２のＨＣＶＲアミノ酸配列と、配列番号１３８のＬＣＶＲアミノ酸配列とを含む、抗ＭＥＴ抗体であり；
Ｌ−Ｐａｙは、
【化５０】
2020509027.tif 000054
であり、式中、
【化５１】
2020509027.tif 000055
は、抗体に対する結合であり；ｎは、２〜５の整数である。
【０１６８】
一部の実施形態では、コンジュゲートは、以下の構造：
Ａｂ−［Ｌ−Ｐａｙ］ｎ
を有し、式中、
Ａｂは、配列番号８２のＨＣＶＲアミノ酸配列と、配列番号１３８のＬＣＶＲアミノ酸配列とを含む、抗ＭＥＴ抗体であり；
Ｌ−Ｐａｙは、
【化５２】
2020509027.tif 000056
であり、式中、
【化５３】
2020509027.tif 000057
は、抗体に対する結合であり；ｎは、２〜５の整数である。
【０１６９】
一部の実施形態では、コンジュゲートは、以下の構造：
Ａｂ−［Ｌ−Ｐａｙ］ｎ
を有し、式中、
Ａｂは、配列番号５８のＤ１−ＨＣＶＲアミノ酸配列と、配列番号８２のＤ２−ＨＣＶＲアミノ酸配列とを含む、ＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗原結合タンパク質であり；
Ｌ−Ｐａｙは、
【化５４】
2020509027.tif 000058
であり、式中、
【化５５】
2020509027.tif 000059
は、抗原結合タンパク質に対する結合であり；ｎは、２〜５の整数である。
【０１７０】
一部の実施形態では、コンジュゲートは、以下の構造：
Ａｂ−［Ｌ−Ｐａｙ］ｎ
を有し、式中、
Ａｂは、配列番号５８のＤ１−ＨＣＶＲアミノ酸配列と、配列番号８２のＤ２−ＨＣＶＲアミノ酸配列とを含む、ＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗原結合タンパク質であり；
Ｌ−Ｐａｙは、
【化５６】
2020509027.tif 000060
であり、式中、
【化５７】
2020509027.tif 000061
は、抗原結合タンパク質に対する結合であり；ｎは、２〜５の整数である。
【０１７１】
一部の実施形態では、コンジュゲートは、以下の構造：
Ａｂ−［Ｌ−Ｐａｙ］ｎ
を有し、式中、
Ａｂは、配列番号５８のＤ１−ＨＣＶＲアミノ酸配列と、配列番号８２のＤ２−ＨＣＶＲアミノ酸配列とを含む、ＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗原結合タンパク質であり；
Ｌ−Ｐａｙは、
【化５８】
2020509027.tif 000062
であり、式中、
【化５９】
2020509027.tif 000063
は、抗原結合タンパク質に対する結合であり；ｎは、２〜５の整数である。
【０１７２】
一部の実施形態では、コンジュゲートは、以下の構造：
Ａｂ−［Ｌ−Ｐａｙ］ｎ
を有し、式中、
Ａｂは、配列番号５８のＤ１−ＨＣＶＲアミノ酸配列と、配列番号８２のＤ２−ＨＣＶＲアミノ酸配列とを含む、ＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗原結合タンパク質であり；
Ｌ−Ｐａｙは、
【化６０】
2020509027.tif 000064
であり、式中、
【化６１】
2020509027.tif 000065
は、抗原結合タンパク質に対する結合であり；ｎは、２〜５の整数である。
【０１７３】
一部の実施形態では、コンジュゲートは、以下の構造：
Ａｂ−［Ｌ−Ｐａｙ］ｎ
を有し、式中、
Ａｂは、配列番号１８のＤ１−ＨＣＶＲアミノ酸配列と、配列番号８２のＤ２−ＨＣＶＲアミノ酸配列とを含む、ＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗原結合タンパク質であり；
Ｌ−Ｐａｙは、
【化６２】
2020509027.tif 000066
であり、式中、
【化６３】
2020509027.tif 000067
は、抗原結合タンパク質に対する結合であり；ｎは、２〜５の整数である。
【０１７４】
一部の実施形態では、コンジュゲートは、以下の構造：
Ａｂ−［Ｌ−Ｐａｙ］ｎ
を有し、式中、
Ａｂは、配列番号１８のＤ１−ＨＣＶＲアミノ酸配列と、配列番号８２のＤ２−ＨＣＶＲアミノ酸配列とを含む、ＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗原結合タンパク質であり；
Ｌ−Ｐａｙは、
【化６４】
2020509027.tif 000068
であり、式中、
【化６５】
2020509027.tif 000069
は、抗原結合タンパク質に対する結合であり；ｎは、２〜５の整数である。
【０１７５】
一部の実施形態では、コンジュゲートは、以下の構造：
Ａｂ−［Ｌ−Ｐａｙ］ｎ
を有し、式中、
Ａｂは、配列番号１８のＤ１−ＨＣＶＲアミノ酸配列と、配列番号８２のＤ２−ＨＣＶＲアミノ酸配列とを含む、ＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗原結合タンパク質であり；
Ｌ−Ｐａｙは、
【化６６】
2020509027.tif 000070
であり、式中、
【化６７】
2020509027.tif 000071
は、抗原結合タンパク質に対する結合であり；ｎは、２〜５の整数である。
【０１７６】
一部の実施形態では、コンジュゲートは、以下の構造：
Ａｂ−［Ｌ−Ｐａｙ］ｎ
を有し、式中、
Ａｂは、配列番号１８のＤ１−ＨＣＶＲアミノ酸配列と、配列番号８２のＤ２−ＨＣＶＲアミノ酸配列とを含む、ＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗原結合タンパク質であり；
Ｌ−Ｐａｙは、
【化６８】
2020509027.tif 000072
であり、式中、
【化６９】
2020509027.tif 000073
は、抗原結合タンパク質に対する結合であり；ｎは、２〜５の整数である。
【０１７７】
本明細書で記載される抗体薬物コンジュゲートは、当業者に公知のコンジュゲーション条件を使用して調製することができる（例えば、参照によりその全体が本明細書に組み込まれるＤｏｒｏｎｉｎａら、Ｎａｔｕｒｅ  Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ、２００３年、２１巻、７号、７７８頁を参照されたい）。一部の実施形態では、抗ＭＥＴ抗体またはＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗原結合タンパク質の抗体薬物コンジュゲートは、本明細書に記載される抗ＭＥＴ抗体またはＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗原結合タンパク質を、所望のリンカーおよび細胞傷害剤を含む化合物と接触させることによって調製され、ここで、該リンカーは、抗体または抗原結合タンパク質と、例えば、抗体または抗原結合タンパク質の所望の残基において反応性である部分を有する。
【０１７８】
一部の実施形態では、抗体−薬物コンジュゲートを調製するためのプロセスであって、本明細書に記載される抗ＭＥＴ抗体またはＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗原結合タンパク質を、以下の式Ａ１：
【化７０】
2020509027.tif 000074
を有する化合物および水性希釈剤と接触させるステップを含む、プロセスが本明細書で提供される。
【０１７９】
一部の実施形態では、式Ａ１の化合物が、化学量論的に過剰に存在する。一部の実施形態では、式Ａ１の化合物が、５〜６倍、化学量論的に過剰に存在する。一部の実施形態では、水性希釈剤は、ＨＥＰＥＳを含む。一部の実施形態では、水性希釈剤は、ＤＭＡを含む。
【０１８０】
一部の実施形態では、式Ａ１の化合物は、式Ａ２またはＡ３：
【化７１】
2020509027.tif 000075
【化７２】
2020509027.tif 000076
の化合物である。
【０１８１】
一部の実施形態では、式Ａ２の化合物は、ステレオマー的に（ｓｔｅｒｅｏｍｅｒｉｃａｌｌｙ）純粋なＡ３である。一部の実施形態では、式Ａ１の化合物は、式Ａ１またはＡ２の化合物を含み、ここで、Ａ１またはＡ２の化合物は、５０％を超えるジアステレオマー過剰で存在する。ある特定の実施形態では、ジアステレオマー過剰は７０％を超える。ある特定の実施形態では、ジアステレオマー過剰は９０％を超える。ある特定の実施形態では、ジアステレオマー過剰は９５％を超える。
【０１８２】
「ジアステレオマー過剰」という用語は、組成物中の残存するジアステレオマーと比較したときの所望の単一のジアステレオマーのモル分率の間の差を指す。ジアステレオマー過剰は以下のように計算される：（単一のジアステレオマーの量）−（他のジアステレオマーの量）／１。例えば、９０％の１、および１０％の２、３、４、またはその混合物を含有する組成物は、８０％［（９０−１０）／１］のジアステレオマー過剰を有する。９５％の１、および５％の２、３、４、またはその混合物を含有する組成物は、９０％［（９５−５）／１］のジアステレオマー過剰を有する。９９％の１、および１％の２、３、４、またはその混合物を含有する組成物は、９８％［（９９−１）／１］のジアステレオマー過剰を有する。ジアステレオマー過剰は、１、２、３、または４のうちのいずれか１つについて、同様に計算することができる。
【０１８３】
一部の実施形態では、式Ａ１の化合物は、シリカゲルおよび希釈剤の存在下で、式（ａ）の化合物：
【化７３】
2020509027.tif 000077
を式（ｂ）の化合物
【化７４】
2020509027.tif 000078
と接触させることによって調製される。一部の実施形態では、希釈剤は、有機溶媒および水を含む。
【０１８４】
本明細書では、シリカゲルおよび希釈剤の存在下で、
（ｉ）式（ａ）の化合物：
【化７５】
2020509027.tif 000079
を式（ｂ）の化合物：
【化７６】
2020509027.tif 000080
と接触させて、中間体を合成し、
（ｉｉ）本明細書に記載される抗ＭＥＴ抗体またはＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗原結合タンパク質を該中間体および水性希釈剤と接触させる
プロセスによって調製される産物もまた提供される。
【０１８５】
一部の実施形態では、抗体−薬物コンジュゲートを調製するためのプロセスであって、本明細書に記載される抗ＭＥＴ抗体またはＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗原結合タンパク質を、以下の式Ｂ：
【化７７】
2020509027.tif 000081
（式中、ＬＧは脱離基である）を有する化合物および水性希釈剤と接触させるステップを含む、プロセスが本明細書で提供される。
【０１８６】
一部の実施形態では、式Ｂの化合物が、化学量論的に過剰に存在する。一部の実施形態では、式Ｂの化合物が、５〜６倍、化学量論的に過剰に存在する。一部の実施形態では、水性希釈剤は、ＨＥＰＥＳを含む。一部の実施形態では、水性希釈剤は、ＤＭＡを含む。一部の実施形態では、−Ｃ（Ｏ）−ＬＧはエステル、例えば、ＮＨＳまたはトリフルオロフェニルエステルである。
【０１８７】
一部の実施形態では、式Ｂの化合物は、式Ｂ１：
【化７８】
2020509027.tif 000082
の化合物である。
【０１８８】
一部の実施形態では、式Ｂ１の化合物は、式Ｃの化合物：
【化７９】
2020509027.tif 000083
を、ペプチドカップリング試薬であるＮ−ヒドロキシスクシンイミド（ＮＨＳ）、および有機希釈剤と接触させることによって調製される。適切なペプチドカップリング試薬は、求核剤との反応のためにカルボン酸部分を活性化する、すなわちカルボン酸部分を反応性にするものを含む。ある特定の実施形態では、ペプチドカップリング試薬は、Ｎ−（３−ジメチルアミノプロピル）−Ｎ’−エチルカルボジイミド塩酸塩（ＥＤＣ）である。一部の実施形態では、有機溶媒はジクロロメタンである。
【０１８９】
一部の実施形態では、式Ｃの化合物は、式Ｄの化合物：
【化８０】
2020509027.tif 000084
を、アジピン酸、ペプチドカップリング剤、および有機溶媒と接触させることによって調製される。ある特定の実施形態では、ペプチドカップリング剤は、２−エトキシ−１−エトキシカルボニル−１，２−ジヒドロキノリン（ＥＥＤＱ）である。ある特定の実施形態では、有機溶媒はジクロロメタンを含む。化合物Ｄは、ＷＯ２０１４／１４５０９０に記載されるように調製できる。
エピトープマッピングおよび関連技術
【０１９０】
抗体および抗原結合ドメインが結合するエピトープは、ＭＥＴタンパク質の３個またはそれを超える（例えば、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０個またはそれを超える）アミノ酸の単一の近接配列からなることができる。あるいは、関連のエピトープは、ＭＥＴの複数の非近接アミノ酸（またはアミノ酸配列）からなることができる。一部の実施形態では、エピトープは、ＭＥＴのリガンド結合ドメインにまたはその付近に位置する。他の実施形態では、エピトープは、ＭＥＴのリガンド結合ドメインの外側に、例えば、係るエピトープに結合される場合、抗体が、ＭＥＴへのＨＧＦ結合に干渉しないＭＥＴの表面における位置に位置する。
【０１９１】
本明細書の他の所に記載されるように、ＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗原結合分子の個々の抗原結合ドメイン（Ｄ１およびＤ２）は、互いに対して異なるエピトープ、または重複しないエピトープ、または部分的に重複するエピトープに結合し得る。本明細書において使用される場合、「部分的に重複するエピトープ」は、本技術分野で公知の任意のエピトープマッピング方法論（例えば、Ｘ線結晶解析、アラニンスキャン変異誘発、水素／重水素交換［ＨＤＸ］、ドメインスワッピングなど）によって決定されるとき、第１および第２のエピトープが、５未満、４未満、３未満、または１つのみの共通のアミノ酸を共有することを意味する。Ｄ１およびＤ２ドメインは、互いに非競合的であり得る。例えば、ある特定の実施形態では、特定のＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗原結合分子のＤ１ドメインによるＭＥＴ上のそのエピトープに対する結合は、ＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗原結合分子のＤ２ドメインによるＭＥＴ上のそのエピトープに対する結合を阻害しない（または最小限にのみ阻害する）。Ｄ１およびＤ２構成成分のそれぞれのエピトープの重複しない（または多くても、部分的に重複する）性質のために、ＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗原結合分子は、細胞表面上の単一のＭＥＴ分子に結合することができる。
【０１９２】
当業者に公知の様々な技法は、本開示の抗体および抗原結合ドメインが相互作用するＭＥＴ上のエピトープを決定するのに使用することができる。特定の抗体または抗原結合ドメインのエピトープまたは結合ドメインを決定するのに使用することのできる例示的な技法には、例えば、点変異誘発（例えば、アラニンスキャン変異誘発、アルギニンスキャン変異誘発など）、ペプチドブロット分析（Ｒｅｉｎｅｋｅ、２００４年、Ｍｅｔｈｏｄｓ  Ｍｏｌ  Ｂｉｏｌ、２４８巻：４４３〜４６３頁）、プロテアーゼ保護、およびペプチド切断分析が含まれる。加えて、抗原のエピトープ切除、エピトープ抽出および化学修飾等の方法を用いることができる（Ｔｏｍｅｒ、２０００年、Ｐｒｏｔｅｉｎ  Ｓｃｉｅｎｃｅ  ９巻：４８７〜４９６頁）。抗体が相互作用するポリペプチド内のアミノ酸を同定するために使用することのできる別の方法は、質量分析により検出される水素／重水素交換である。一般用語において、水素／重水素交換方法は、目的のタンパク質を重水素標識するステップと、続いて抗体を重水素標識タンパク質に結合させるステップを含む。次に、タンパク質／抗体複合体を水に移して、抗体によって保護された残基（重水素標識されたままになる）を除く全残基において水素−重水素交換を行わせる。抗体の解離後に、標的タンパク質を、プロテアーゼ切断および質量分析による解析に付し、これにより、抗体が相互作用する特異的なアミノ酸に相当する重水素標識残基を明らかにする。例えば、Ｅｈｒｉｎｇ（１９９９年）Ａｎａｌｙｔｉｃａｌ  Ｂｉｏｃｈｅｍｉｓｔｒｙ  ２６７巻（２号）：２５２〜２５９頁；ＥｎｇｅｎおよびＳｍｉｔｈ（２００１年）Ａｎａｌ．  Ｃｈｅｍ．７３巻：２５６Ａ〜２６５Ａ頁を参照されたい。Ｘ線結晶構造解析もまた、抗体が相互作用するポリペプチド内のアミノ酸を同定するのに使用することができる。
【０１９３】
さらに、本明細書に記載されている特異的な例示的な抗体または抗原結合ドメイン（例えば、本明細書における表１に表記されているアミノ酸配列のいずれかを含む抗体）のいずれかと同じエピトープに結合する抗ＭＥＴ抗体（二重特異的抗体を含む）が本明細書に提供される。同様に、ＭＥＴへの結合に関して、本明細書に記載されている特異的な例示的な抗体（例えば、本明細書における表１に表記されているアミノ酸配列のいずれかを含む抗体）のいずれかと競合する抗ＭＥＴ抗体も本明細書に提供される。一部の実施形態では、抗ＭＥＴ抗体が結合するヒトＭＥＴエピトープは、配列番号１５５のアミノ酸１９２〜２０４、アミノ酸３０５〜３１５および／またはアミノ酸４２１〜４５５を含む。一部の実施形態では、ヒトＭＥＴの第１のエピトープは、配列番号１５５のアミノ酸１９２〜２０４を含み、ヒトＭＥＴの第２のエピトープは、配列番号１５５のアミノ酸３０５〜３１５およびアミノ酸４２１〜４５５を含む。
【０１９４】
本技術分野で公知かつ本明細書で例証されている慣用的な方法を使用することにより、抗体が、参照抗ＭＥＴ抗体と同じエピトープに結合するか、またはこれと結合に関して競合するか容易に決定することができる。例えば、被験抗体が、本明細書に提供される参照抗ＭＥＴ抗体と同じエピトープに結合するか決定するために、参照抗体を、ＭＥＴタンパク質に結合させる。次に、ＭＥＴ分子に結合する被験抗体の能力を評価する。被験抗体が、参照抗ＭＥＴ抗体との飽和結合後にＭＥＴに結合することができる場合、被験抗体が、参照抗ＭＥＴ抗体とは異なるエピトープに結合すると結論付けることができる。他方では、被験抗体が、参照抗ＭＥＴ抗体との飽和結合後にＭＥＴ分子に結合できない場合、被験抗体は、参照抗ＭＥＴ抗体によって結合されるエピトープと同じエピトープに結合し得る。続いて、追加の慣用的な実験法（例えば、ペプチド変異および結合解析）を実行して、観察された被験抗体の結合の欠如が、実際に、参照抗体と同じエピトープへの結合によるものであるか、あるいは立体的遮断（または別の現象）が、観察される結合の欠如の原因であるかを確認することができる。この種の実験は、ＥＬＩＳＡ、ＲＩＡ、Ｂｉａｃｏｒｅ、フローサイトメトリーまたは本技術分野で利用できる他のいずれかの定量的もしくは定性的抗体結合アッセイを使用して行うことができる。ある特定の実施形態に従って、例えば、１、５、１０、２０または１００倍過剰な一方の抗体が、競合的結合アッセイ（例えば、Ｊｕｎｇｈａｎｓら、Ｃａｎｃｅｒ  Ｒｅｓ．１９９０年：５０巻：１４９５〜１５０２頁を参照）において測定される通り、他方の結合を少なくとも５０％、ただし好ましくは７５％、９０％さらには９９％阻害する場合、２種の抗体は、同じ（または重複する）エピトープに結合する。あるいは、一方の抗体の結合を低下または排除する抗原における基本的にあらゆるアミノ酸変異が、他方の結合を低下または排除する場合、２種の抗体は、同じエピトープに結合すると考慮される。一方の抗体の結合を低下または排除するアミノ酸変異のサブセットのみが、他方の結合を低下または排除する場合、２種の抗体は、「重複するエピトープ」を有すると考慮される。
【０１９５】
抗体が、参照抗ＭＥＴ抗体と結合に関して競合（または結合に関して交差競合）するか否か決定するために、２種の配向性において上に記載されている結合手法を行う：第１の配向性において、参照抗体を、飽和条件下でＭＥＴタンパク質に結合させ、続いてＭＥＴ分子への被験抗体の結合を評価する。第２の配向性において、被験抗体を、飽和条件下でＭＥＴ分子に結合させ、続いてＭＥＴ分子への参照抗体の結合を評価する。両方の配向性において、第１の（飽和）抗体のみが、ＭＥＴ分子に結合することができる場合、被験抗体および参照抗体が、ＭＥＴへの結合に関して競合すると結論付けられる。当業者によって認められる通り、参照抗体と結合に関して競合する抗体は、参照抗体と同じエピトープに必ずしも結合しないが、重複するまたは隣接するエピトープに結合することにより、参照抗体の結合を立体的に遮断することができる。
【０１９６】
ヒト抗体の調製
本明細書に提供される抗ＭＥＴ抗体およびＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗体は、完全ヒト抗体となり得る。完全ヒトモノクローナル抗体を含むモノクローナル抗体を生成するための方法は、本技術分野で公知である。いずれかの係る公知の方法を本開示の文脈において使用して、ヒトＭＥＴに特異的に結合するヒト抗体を作製することができる。
【０１９７】
例えばＶＥＬＯＣＩＭＭＵＮＥ（商標）技術、または完全ヒトモノクローナル抗体を生成するための他のいずれかの同様の公知の方法を使用して、ヒト可変領域およびマウス定常領域を有する、ＭＥＴに対する高親和性キメラ抗体が、最初に単離される。後述する実験セクションにおける通り、抗体は、親和性、リガンド遮断活性、選択性、エピトープ等を含む望ましい特徴に関して特徴付けされ、選択される。必要に応じて、マウス定常領域を、所望のヒト定常領域、例えば、野生型または修飾型ＩｇＧ１またはＩｇＧ４と置き換えて、完全ヒト抗ＭＥＴ抗体を生成する。選択される定常領域は、特定の用途に応じて変動し得るが、高親和性抗原結合および標的特異性特徴は、可変領域に属する。ある特定の事例において、完全ヒト抗ＭＥＴ抗体は、抗原陽性Ｂ細胞から直接的に単離される。
【０１９８】
生物学的同等物
本明細書に提供される抗ＭＥＴ抗体および抗体断片は、記載されている抗体のアミノ酸配列から変動するがヒトＭＥＴに結合する能力を保持するアミノ酸配列を有するタンパク質を包含する。係る改変体抗体および抗体断片は、親配列と比較してアミノ酸の１個または複数の付加、欠失または置換を含むが、記載されている抗体の生物学的活性と基本的に同等な生物学的活性を示す。同様に、本開示の抗ＭＥＴ抗体をコードするＤＮＡ配列は、開示されている配列と比較してヌクレオチドの１個または複数の付加、欠失または置換を含むが、本開示の抗ＭＥＴ抗体または抗体断片と基本的に生物学的に同等である抗ＭＥＴ抗体または抗体断片をコードする配列を包含する。係る改変体アミノ酸およびＤＮＡ配列の例は、上記で検討されている。
【０１９９】
２種の抗原結合タンパク質または抗体が、例えば、同じモル濃度の用量にて類似の実験条件下、単一用量（ｄｏｅｓ）または複数用量のいずれかで投与された際に、その吸収の速度および程度が有意差を示さない薬学的同等物または薬学的代替物である場合、両者は生物学的に同等であるとみなされる。いくつかの抗体が、その吸収の程度において同等であるが、その吸収速度においては同等ではない場合において、これら抗体は、同等物または薬学的代替物であるとみなされ、そして係る吸収速度における差が意図的であり、標識において反映され、例えば慢性使用における有効な体内薬物濃度の到達に必須ではなく、試験される特定の薬物製品にとって医学的に無意味であるとみなされるため、これらが生物学的に同等であると依然としてみなされ得る。
【０２００】
一実施形態では、２種の抗原結合タンパク質は、その安全性、純度および効力において臨床的に有意義な差がない場合、生物学的に同等である。
【０２０１】
一実施形態では、参照産物および生物学的産物の間で切り替えない継続的療法と比較して、免疫原性の臨床的に有意な変化または有効性の減弱化を含む有害効果のリスクにおいて増大が予想されずに、患者に対して、参照産物および生物学的産物の間でこのような切り替えを１回または複数回行うことができる場合、２種の抗原結合タンパク質は、生物学的に同等である。
【０２０２】
一実施形態では、２種の抗原結合タンパク質が両者共に、使用条件（単数または複数）に対し共通の作用機序（単数または複数）によって、係る機序が公知の程度まで作用する場合、２種の抗原結合タンパク質は、生物学的に同等である。
【０２０３】
生物学的同等性は、ｉｎ  ｖｉｖｏおよびｉｎ  ｖｉｔｒｏ方法によって示すことができる。生物学的同等性の測定は、例えば、（ａ）時間の関数として血液、血漿、血清または他の生体液における抗体またはその代謝物の濃度を測定する、ヒトまたは他の哺乳動物におけるｉｎ  ｖｉｖｏ検査；（ｂ）ヒトｉｎ  ｖｉｖｏバイオアベイラビリティデータと相関され、これを合理的に予測するｉｎ  ｖｉｔｒｏ検査；（ｃ）時間の関数として抗体（またはその標的）の適切な急性薬理学的効果を測定する、ヒトまたは他の哺乳動物におけるｉｎ  ｖｉｖｏ検査；および（ｄ）抗体の安全性、有効性またはバイオアベイラビリティまたは生物学的同等性を確立する十分に制御された臨床治験における検査を含む。
【０２０４】
本明細書に提供される抗ＭＥＴ抗体の生物学的に同等な改変体は、例えば、残基もしくは配列の様々な置換を行うことによりまたは生物学的活性に必要とされない末端もしくは内部残基もしくは配列を欠失させることにより、構築することができる。例えば、生物学的活性に必須ではないシステイン残基を欠失または他のアミノ酸と置き換えて、復元における不要なまたは不正確な分子内ジスルフィド架橋の形成を防止することができる。他の文脈において、生物学的に同等な抗体は、抗体のグリコシル化特徴を修飾するアミノ酸変化、例えば、グリコシル化を排除または除去する変異を含む抗ＭＥＴ抗体改変体を含むことができる。
【０２０５】
種選択性および種交差反応性
本開示は、ある特定の実施形態によると、ヒトＭＥＴに結合するが、他の種由来のＭＥＴには結合しない抗ＭＥＴ抗体（および抗ＭＥＴ抗原結合ドメインを含む抗原結合分子）を提供する。本開示は、ヒトＭＥＴおよび１種または複数の非ヒト種に由来するＭＥＴに結合する抗ＭＥＴ抗体（および抗ＭＥＴ抗原結合ドメインを含む抗原結合分子）も含む。例えば、抗ＭＥＴ抗体および抗原結合分子は、ヒトＭＥＴに結合することができ、場合により、マウス、ラット、モルモット、ハムスター、スナネズミ、ブタ、ネコ、イヌ、ウサギ、ヤギ、ヒツジ、ウシ、ウマ、ラクダ、カニクイザル（ｃｙｎｏｍｏｌｏｇｏｕｓ）、マーモセット、アカゲザルまたはチンパンジーのＭＥＴのうち１種または複数に結合しても結合しなくてもよい。ある特定の例示的な実施形態によると、ヒトＭＥＴおよびカニクイザル（例えば、Ｍａｃａｃａ  ｆａｓｃｉｃｕｌａｒｉｓ）ＭＥＴに特異的に結合する抗ＭＥＴ抗体および抗原結合分子が提供される。他の抗ＭＥＴ抗体および抗原結合分子は、ヒトＭＥＴに結合するが、カニクイザルＭＥＴには結合しない、またはごく弱く結合する。
多特異的抗体
【０２０６】
本明細書の他の所に記載されるように、本開示は、２つの異なる抗原結合ドメインを含む二重特異的抗原結合分子であって、第１の抗原結合ドメイン（Ｄ１）は、ＭＥＴ上の第１のエピトープに結合し、第２の抗原結合ドメイン（Ｄ２）は、ＭＥＴ上の第２のエピトープに結合する、二重特異的抗原結合分子を提供する。ある特定の実施形態では、Ｄ１ドメインおよびＤ２ドメインが結合するＭＥＴ上の第１のエピトープおよび第２のエピトープは異なるか、または重複しないか、または部分的に重複する。この態様によると、Ｄ１ドメインは、本明細書の表１に表記されるようなＨＣＶＲ／ＬＣＶＲまたはＣＤＲのアミノ酸配列のうちの任意のものを含み得、Ｄ２ドメインは、本明細書の表１に表記されるようなＨＣＶＲ／ＬＣＶＲまたはＣＤＲのアミノ酸配列のうちの任意の他のものを含み得る（Ｄ１ドメインの結合特異性が、Ｄ２ドメインの結合特異性と異なる限り、および／またはＤ１が得られた抗原結合タンパク質が、ＭＥＴに対する結合について、Ｄ２が得られた抗原結合タンパク質と競合しない限り）。一部の実施形態では、抗ＭＥＴ抗体が結合するヒトＭＥＴエピトープは、配列番号１５５のアミノ酸１９２〜２０４、アミノ酸３０５〜３１５および／またはアミノ酸４２１〜４５５を含む。一一部の実施形態では、ヒトＭＥＴの第１のエピトープは、配列番号１５５のアミノ酸１９２〜２０４を含み、ヒトＭＥＴの第２のエピトープは、配列番号１５５のアミノ酸３０５〜３１５およびアミノ酸４２１〜４５５を含む。
【０２０７】
本開示の別の局面によると、二重特異的抗体の一方のアームがヒトＭＥＴに結合し、二重特異的抗体の他方のアームがＭＥＴ以外の第２の抗原に特異的な従来の二重特異的抗体も提供される。ＭＥＴ結合アームは、本明細書における表１に表記されているＨＣＶＲ／ＬＣＶＲまたはＣＤＲアミノ酸配列のいずれかを含むことができる。ある特定の実施形態では、ＭＥＴ結合アームは、ヒトＭＥＴに結合し、ＭＥＴへのＨＧＦ結合を遮断する。他の実施形態では、ＭＥＴ結合アームは、ヒトＭＥＴに結合するが、ＭＥＴへのＨＧＦ結合を遮断しない。
【０２０８】
本開示の文脈において使用することのできる例示的な二重特異的抗体フォーマットは、第１の免疫グロブリン（Ｉｇ）ＣＨ３ドメインおよび第２のＩｇ  ＣＨ３ドメインの使用であって、第１および第２のＩｇ  ＣＨ３ドメインが、互いに少なくとも１個のアミノ酸が異なり、少なくとも１個のアミノ酸の差異が、アミノ酸の差異を欠く二重特異的抗体と比較してプロテインＡへの二重特異的抗体の結合を低下させる使用を含む。一実施形態では、第１のＩｇ  ＣＨ３ドメインは、プロテインＡに結合し、第２のＩｇ  ＣＨ３ドメインは、Ｈ９５Ｒ修飾（ＩＭＧＴエクソンナンバリングによる；ＥＵナンバリングによるＨ４３５Ｒ）等、プロテインＡ結合を低下または消失させる変異を含有する。第２のＣＨ３は、Ｙ９６Ｆ修飾（ＩＭＧＴによる；ＥＵによるＹ４３６Ｆ）をさらに含むことができる。第２のＣＨ３内に見出すことのできるさらなる修飾は、ＩｇＧ１抗体の場合、Ｄ１６Ｅ、Ｌ１８Ｍ、Ｎ４４Ｓ、Ｋ５２Ｎ、Ｖ５７ＭおよびＶ８２Ｉ（ＩＭＧＴによる；ＥＵによるＤ３５６Ｅ、Ｌ３５８Ｍ、Ｎ３８４Ｓ、Ｋ３９２Ｎ、Ｖ３９７ＭおよびＶ４２２Ｉ）；ＩｇＧ２抗体の場合、Ｎ４４Ｓ、Ｋ５２ＮおよびＶ８２Ｉ（ＩＭＧＴ；ＥＵによるＮ３８４Ｓ、Ｋ３９２ＮおよびＶ４２２Ｉ）；ならびにＩｇＧ４抗体の場合、Ｑ１５Ｒ、Ｎ４４Ｓ、Ｋ５２Ｎ、Ｖ５７Ｍ、Ｒ６９Ｋ、Ｅ７９ＱおよびＶ８２Ｉ（ＩＭＧＴによる；ＥＵによるＱ３５５Ｒ、Ｎ３８４Ｓ、Ｋ３９２Ｎ、Ｖ３９７Ｍ、Ｒ４０９Ｋ、Ｅ４１９ＱおよびＶ４２２Ｉ）を含む。上に記載されている二重特異的抗体フォーマットにおける変種は、本開示の範囲内であるとみなされる。
【０２０９】
本開示の文脈において使用することのできる他の例示的な二重特異的フォーマットとして、例えば、ｓｃＦｖに基づくまたはダイアボディ二重特異的フォーマット、ＩｇＧ−ｓｃＦｖ融合体、二重可変ドメイン（ＤＶＤ）−Ｉｇ、クアドローマ、ノブイントゥーホール（ｋｎｏｂｓ−ｉｎｔｏ−ｈｏｌｅｓ）、共通軽鎖（例えば、ノブイントゥーホールを有する共通軽鎖等）、ＣｒｏｓｓＭａｂ、ＣｒｏｓｓＦａｂ、（ＳＥＥＤ）ボディ、ロイシンジッパー、デュオボディ（Ｄｕｏｂｏｄｙ）、ＩｇＧ１／ＩｇＧ２、二重作用Ｆａｂ（ＤＡＦ）−ＩｇＧおよびＭａｂ２二重特異的フォーマットが挙げられるがこれらに限定されない（例えば、前述のフォーマットの総説に関して、Ｋｌｅｉｎら、２０１２年、ｍＡｂｓ  ４巻：６号、１〜１１頁およびこれに引用されている参考文献を参照）。二重特異的抗体は、ペプチド／核酸コンジュゲーションを使用して構築することもでき、例えば、直交性の化学反応性を有する非天然アミノ酸を使用して、部位特異的抗体−オリゴヌクレオチドコンジュゲートを生成すると、これは、特定された組成、結合価および幾何学を有する多量体の複合体へと自己集合する（例えば、Ｋａｚａｎｅら、Ｊ．  Ａｍ．  Ｃｈｅｍ．  Ｓｏｃ．［Ｅｐｕｂ：２０１２年１２月４日］を参照）。
【０２１０】
治療製剤および投与
本発明の抗ＭＥＴ抗体またはＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗原結合分子を含む薬学的組成物が本明細書に提供される。薬学的組成物は、適したキャリア、賦形剤および移動、送達、耐性その他の向上をもたらす他の薬剤と共に製剤化され得る。
抗体の治療的使用
【０２１１】
抗ＭＥＴ抗体またはＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗原結合分子（例えば、本明細書の表１に表記されるＨＣＶＲ／ＬＣＶＲもしくはＣＤＲの配列のうちの任意のものを含む抗ＭＥＴ、または本明細書の表５に表記されるようなＤ１およびＤ２構成成分のうちの任意のものを含むＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗原結合分子）を含む治療用組成物を、投与することを必要とする対象に投与することを含む方法が本明細書で提供される。治療用組成物は、本明細書に開示される抗ＭＥＴ抗体またはＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗原結合分子のうちの任意のものと、薬学的に許容されるキャリアまたは希釈剤とを含み得る。
【０２１２】
抗ＭＥＴ抗体およびＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗原結合分子は、ＭＥＴ発現、シグナル伝達または活性に関連するまたはこれに媒介される、あるいはＭＥＴおよびＨＧＦの間の相互作用を遮断すること、またはＭＥＴ活性および／またはシグナリングを他の仕方で阻害すること、および／または受容体内部移行を促進すること、および／または細胞表面受容体数を減少させることによって処置できるいずれかの疾患または障害の処置、予防および／または改善にとりわけ有用である。
【０２１３】
例えば、本開示の抗ＭＥＴ抗体およびＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗原結合分子は、ＭＥＴを発現する（または過剰発現する）腫瘍の処置に有用である。例えば、抗ＭＥＴ抗体またはＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗原結合分子を使用して、脳および髄膜、口腔咽頭部、肺および気管支樹、胃腸管、雄性および雌性生殖器管、筋肉、骨、皮膚および付属器、結合組織、脾臓、免疫系、造血性細胞および骨髄、肝臓および尿路ならびに眼等の特殊な感覚器官に生じる原発性および／または転移性腫瘍を処置することができる。ある特定の実施形態では、抗ＭＥＴ抗体およびＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗原結合分子は、以下のがんの１つまたは複数を処置するのに使用される：急性骨髄性白血病、成人Ｔ細胞白血病、星状細胞腫、膀胱がん、乳がん、子宮頸がん、胆管癌、慢性骨髄性白血病、結腸直腸がん、子宮内膜がん、食道がん、胃がん（例えば、ＭＥＴ増幅を有する胃がん）、神経膠芽腫（ｇｌｉｏｂｌａｓｔｏｍａｔａ）、頭頸部がん（例えば、頭頸部扁平上皮癌［ＨＮＳＣＣ］）、カポジ肉腫、腎臓がん、平滑筋肉腫、肝臓がん、肺がん（例えば、非小細胞肺がん［ＮＳＣＬＣ］）、リンパ腫、悪性神経膠腫、悪性中皮腫、黒色腫、中皮腫、ＭＦＨ／線維肉腫、多発性骨髄腫、上咽頭がん、骨肉腫、卵巣がん、膵臓癌、前立腺がん、腎細胞癌、横紋筋肉腫、小細胞肺がん、滑膜肉腫、甲状腺がん、およびウィルムス腫瘍。
【０２１４】
本明細書に記載されている処置方法の文脈において、抗ＭＥＴ抗体およびＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗原結合分子は、単独療法として（すなわち、唯一の治療剤として）、または１種もしくは複数の追加的な治療剤と組み合わせて（その例は、本明細書の他の箇所に記載されている）投与することができる。
【０２１５】
併用療法および製剤
１種または複数の追加的な治療的に活性な構成成分と組み合わせた本明細書に記載されている抗ＭＥＴ抗体およびＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗原結合分子のいずれかを含む組成物および治療製剤、ならびにそれを必要とする被験体に係る組み合わせを投与することを含む処置方法が提供される。
【０２１６】
抗ＭＥＴ抗体およびＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗原結合分子は、ＭＥＴアンタゴニスト（例えば、抗ＭＥＴ抗体［例えば、オナルツズマブ、エミベツズマブ、およびＨ４Ｈ１４６３９Ｄ］またはＭＥＴの小分子阻害剤）、ＥＧＦＲアンタゴニスト（例えば、抗ＥＧＦＲ抗体［例えば、セツキシマブまたはパニツムマブ］またはＥＧＦＲの小分子阻害剤［例えば、ゲフィチニブまたはエルロチニブ］）、Ｈｅｒ２／ＥｒｂＢ２、ＥｒｂＢ３またはＥｒｂＢ４等、別のＥＧＦＲファミリーメンバーのアンタゴニスト（例えば、抗ＥｒｂＢ２［例えば、トラスツズマブまたはＴ−ＤＭ１｛ＫＡＤＣＹＬＡ（登録商標）｝］、抗ＥｒｂＢ３もしくは抗ＥｒｂＢ４抗体、またはＥｒｂＢ２、ＥｒｂＢ３もしくはＥｒｂＢ４活性の小分子阻害剤）、ＥＧＦＲｖＩＩＩアンタゴニスト（ａｎａｇｏｎｉｓｔ）（例えば、抗ＥＧＦＲｖＩＩＩ抗体）、ＩＧＦ１Ｒアンタゴニスト（例えば、抗ＩＧＦ１Ｒ抗体）、Ｂ−ｒａｆ阻害剤（例えば、ベムラフェニブ、ソラフェニブ、ＧＤＣ−０８７９、ＰＬＸ−４７２０）、ＰＤＧＦＲ−α阻害剤（例えば、抗ＰＤＧＦＲ−α抗体）、ＰＤＧＦＲ−β阻害剤（例えば、抗ＰＤＧＦＲ−β抗体または例えば、イマチニブメシレートもしくはスニチニブマレート等の小分子キナーゼ阻害剤）、ＰＤＧＦリガンド阻害剤（例えば、抗ＰＤＧＦ−Ａ、−Ｂ、−Ｃまたは−Ｄ抗体、アプタマー、ｓｉＲＮＡ等）、ＶＥＧＦアンタゴニスト（例えば、アフリベルセプト等、ＶＥＧＦトラップ、例えば、ＵＳ７，０８７，４１１を参照（本明細書において、「ＶＥＧＦ阻害性融合タンパク質」とも称される）、抗ＶＥＧＦ抗体（例えば、ベバシズマブ）、ＶＥＧＦ受容体の小分子キナーゼ阻害剤（例えば、スニチニブ、ソラフェニブまたはパゾパニブ））、ＤＬＬ４アンタゴニスト（例えば、ＲＥＧＮ４２１等、ＵＳ２００９／０１４２３５４に開示されている抗ＤＬＬ４抗体）、Ａｎｇ２アンタゴニスト（例えば、Ｈ１Ｈ６８５Ｐ等、ＵＳ２０１１／００２７２８６に開示されている抗Ａｎｇ２抗体）、ＦＯＬＨ１アンタゴニスト（例えば、抗ＦＯＬＨ１抗体）、ＳＴＥＡＰ１またはＳＴＥＡＰ２アンタゴニスト（例えば、抗ＳＴＥＡＰ１抗体または抗ＳＴＥＡＰ２抗体）、ＴＭＰＲＳＳ２アンタゴニスト（例えば、抗ＴＭＰＲＳＳ２抗体）、ＭＳＬＮアンタゴニスト（例えば、抗ＭＳＬＮ抗体）、ＣＡ９アンタゴニスト（例えば、抗ＣＡ９抗体）、ウロプラキンアンタゴニスト（例えば、抗ウロプラキン［例えば、抗ＵＰＫ３Ａ］抗体）、ＭＵＣ１６アンタゴニスト（例えば、抗ＭＵＣ１６抗体）、Ｔｎ抗原アンタゴニスト（例えば、抗Ｔｎ抗体）、ＣＬＥＣ１２Ａアンタゴニスト（例えば、抗ＣＬＥＣ１２Ａ抗体）、ＴＮＦＲＳＦ１７アンタゴニスト（例えば、抗ＴＮＦＲＳＦ１７抗体）、ＬＧＲ５アンタゴニスト（例えば、抗ＬＧＲ５抗体）、一価ＣＤ２０アンタゴニスト（例えば、リツキシマブ等、一価抗ＣＤ２０抗体）、ＣＤ２０×ＣＤ３二重特異的抗体、ＰＤ−１遮断剤（例えば、抗ＰＤ−１抗体、例えば、ペムブロリズマブまたはニボルマブ）等からなる群より選択される１種または複数の追加的な治療的に活性な構成成分（複数可）と同時製剤化することができるおよび／またはこれらと組み合わせて投与することができる。本明細書に提供される抗体と組み合わせて有益に投与することができる他の薬剤は、例えば、タモキシフェン、アロマターゼ阻害剤、ならびに小分子サイトカイン阻害剤およびＩＬ−１、ＩＬ−２、ＩＬ−３、ＩＬ−４、ＩＬ−５、ＩＬ−６、ＩＬ−８、ＩＬ−９、ＩＬ−１１、ＩＬ−１２、ＩＬ−１３、ＩＬ−１７、ＩＬ−１８等のサイトカインまたはこれらそれぞれの受容体に結合する抗体を含むサイトカイン阻害剤を含む。
【０２１７】
例示的には、抗ＰＤ−１抗体などのＰＤ−１阻害剤を、本明細書に記載されるような抗Ｍｅｔ抗体−薬物と組み合わせることができる。標的患者集団は、具体的には、ｃ−Ｍｅｔを発現する非小細胞肺がんを有する患者などの、ｃ−Ｍｅｔ変異を過剰発現する腫瘍を有する患者を含む。
【０２１８】
１種または複数の化学療法剤と組み合わせた、本明細書に記載されている抗ＭＥＴ抗体およびＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗原結合分子のいずれかを含む組成物および治療製剤が本明細書に提供される。化学療法剤の例として、チオテパおよびシクロホスファミド（ｃｙｃｌｏｓｐｈｏｓｐｈａｍｉｄｅ）（Ｃｙｔｏｘａｎ（商標））等、アルキル化剤；ブスルファン、インプロスルファンおよびピポスルファン（ｐｉｐｏｓｕｌｆａｎ）等、スルホン酸アルキル；ベンゾドパ（ｂｅｎｚｏｄｏｐａ）、カルボコン、メツレドパ（ｍｅｔｕｒｅｄｏｐａ）およびウレドパ（ｕｒｅｄｏｐａ）等、アジリジン；アルトレタミン、トリエチレンメラミン、トリエチレンホスホラミド、トリエチレンチオホスホラミド（ｔｒｉｅｔｈｙｌｅｎｅｔｈｉｏｐｈｏｓｐｈａｏｒａｍｉｄｅ）およびトリメチロールメラミン（ｔｒｉｍｅｔｈｙｌｏｌｏｍｅｌａｍｉｎｅ）を含むエチレンイミンおよびメチラメラミン（ｍｅｔｈｙｌａｍｅｌａｍｉｎｅ）；クロラムブシル、クロルナファジン（ｃｈｌｏｒｎａｐｈａｚｉｎｅ）、コロホスファミド（ｃｈｏｌｏｐｈｏｓｐｈａｍｉｄｅ）、エストラムスチン、イホスファミド、メクロレタミン、メクロレタミンオキシド塩酸塩、メルファラン、ノブエンビキン（ｎｏｖｅｍｂｉｃｈｉｎ）、フェネステリン（ｐｈｅｎｅｓｔｅｒｉｎｅ）、プレドニムスチン、トロホスファミド、ウラシルマスタード等、ナイトロジェンマスタード；カルムスチン、クロロゾトシン、ホテムスチン、ロムスチン、ニムスチン、ラニムスチン等、ニトロソウレア（ｎｉｔｒｏｓｕｒｅａ）；アクラシノマイシン、アクチノマイシン、オースラマイシン、アザセリン、ブレオマイシン、カクチノマイシン、カリチアマイシン、カラビシン、カルミノマイシン、カルジノフィリン、クロモマイシン、ダクチノマイシン、ダウノルビシン、デトルビシン、６−ジアゾ−５−オキソ−Ｌ−ノルロイシン、ドキソルビシン、エピルビシン、エソルビシン、イダルビシン、マルセロマイシン（ｍａｒｃｅｌｌｏｍｙｃｉｎ）、マイトマイシン、ミコフェノール酸、ノガラマイシン、オリボマイシン、ペプロマイシン、ポトフィロマイシン（ｐｏｔｆｉｒｏｍｙｃｉｎ）、ピューロマイシン、クエラマイシン（ｑｕｅｌａｍｙｃｉｎ）、ロドルビシン（ｒｏｄｏｒｕｂｉｃｉｎ）、ストレプトニグリン、ストレプトゾシン、ツベルシジン、ウベニメクス、ジノスタチン、ゾルビシン等、抗生物質；メトトレキセートおよび５−フルオロウラシル（５−ＦＵ）等、代謝拮抗薬；デノプテリン、メトトレキセート、プテロプテリン、トリメトレキセート等、葉酸アナログ；フルダラビン、６−メルカプトプリン、チアミプリン（ｔｈｉａｍｉｐｒｉｎｅ）、チオグアニン等、プリンアナログ；アンシタビン、アザシチジン、６−アザウリジン、カルモフール、シタラビン、ジデオキシウリジン、ドキシフルリジン、エノシタビン、フロクスウリジン等、ピリミジンアナログ；カルステロン（ｃａｌｕｓｔｅｒｏｎｅ）、ドロモスタノロンプロピオネート、エピチオスタノール、メピチオスタン、テストラクトン等、アンドロゲン；アミノグルテチミド、ミトタン、トリロスタン等、抗副腎薬（ａｎｔｉ−ａｄｒｅｎａｌ）；フロリン酸等、���酸補充薬；アセグラトン；アルドホスファミドグリコシド（ａｌｄｏｐｈｏｓｐｈａｍｉｄｅ  ｇｌｙｃｏｓｉｄｅ）；アミノレブリン酸；アムサクリン；ベストラブシル（ｂｅｓｔｒａｂｕｃｉｌ）；ビスアントレン（ｂｉｓａｎｔｒｅｎｅ）；エダトレキセート（ｅｄａｔｒａｘａｔｅ）；デフォファミン（ｄｅｆｏｆａｍｉｎｅ）；デメコルチン；ジアジコン；エルフォルニチン（ｅｌｆｏｒｎｉｔｈｉｎｅ）；エリプチニウムアセテート（ｅｌｌｉｐｔｉｎｉｕｍ  ａｃｅｔａｔｅ）；エトグルシド；硝酸ガリウム；ヒドロキシウレア；レンチナン；ロニダミン；ミトグアゾン；ミトキサントロン；モピダモール；ニトラクリン；ペントスタチン；フェナメット（ｐｈｅｎａｍｅｔ）；ピラルビシン；ポドフィリン酸；２−エチルヒドラジド；プロカルバジン；ＰＳＫ（商標）；ラゾキサン；シゾフィラン；スピロゲルマニウム；テヌアゾン酸；トリアジコン；２，２’，２’’−トリクロロトリエチルアミン；ウレタン；ビンデシン；ダカルバジン；マンノムスチン；ミトブロニトール；ミトラクトール；ピポブロマン；ガシトシン（ｇａｃｙｔｏｓｉｎｅ）；アラビノシド（「Ａｒａ−Ｃ」）；シクロホスファミド；チオテパ；タキサン、例えば、パクリタキセル（Ｔａｘｏｌ（商標）、Ｂｒｉｓｔｏｌ−Ｍｙｅｒｓ  Ｓｑｕｉｂｂ  Ｏｎｃｏｌｏｇｙ、Ｐｒｉｎｃｅｔｏｎ、Ｎ．Ｊ．）およびドセタキセル（Ｔａｘｏｔｅｒｅ（商標）；Ａｖｅｎｔｉｓ  Ａｎｔｏｎｙ、Ｆｒａｎｃｅ）；クロラムブシル；ゲムシタビン；６−チオグアニン；メルカプトプリン；メトトレキセート；シスプラチンおよびカルボプラチン等、白金アナログ；ビンブラスチン；白金；エトポシド（ＶＰ−１６）；イホスファミド；マイトマイシンＣ；ミトキサントロン；ビンクリスチン；ビノレルビン；ナベルビン；ノバントロン；テニポシド；ダウノマイシン；アミノプテリン；ゼローダ；イバンドロネート；ＣＰＴ−１１；トポイソメラーゼ阻害剤ＲＦＳ  ２０００；ジフルオロメチルオルニチン（ＤＭＦＯ）；レチノイン酸；エスペラミシン；カペシタビン；ならびに上記のいずれかの薬学的に許容される塩、酸または誘導体が挙げられる。この定義には、例えば、タモキシフェン、ラロキシフェン、アロマターゼ阻害４（５）−イミダゾール、４−ヒドロキシタモキシフェン、トリオキシフェン（ｔｒｉｏｘｉｆｅｎｅ）、ケオキシフェン（ｋｅｏｘｉｆｅｎｅ）、ＬＹ  １１７０１８、オナプリストン（ｏｎａｐｒｉｓｔｏｎｅ）およびトレミフェン（フェアストン）を含む抗エストロゲン剤；ならびにフルタミド、ニルタミド、ビカルタミド、リュープロリドおよびゴセレリン等、抗アンドロゲン剤；ならびに上記のいずれかの薬学的に許容される塩、酸または誘導体等、腫瘍におけるホルモン作用を調節または阻害するように作用する抗ホルモン剤も含まれる。
【０２１９】
抗ＭＥＴ抗体およびＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗原結合分子は、抗ウイルス薬、抗生物質、鎮痛薬、コルチコステロイド、ステロイド、酸素、抗酸化剤、ＣＯＸ阻害剤、心保護薬（ｃａｒｄｉｏｐｒｏｔｅｃｔａｎｔ）、金属キレート剤、ＩＦＮ−ガンマおよび／またはＮＳＡＩＤと組み合わせて投与および／または同時製剤化することもできる。
【０２２０】
追加的な治療的に活性な構成成分（複数可）、例えば、上に列挙されている薬剤またはその誘導体のいずれかは、抗ＭＥＴ抗体またはＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗原結合分子の投与の直前に、それと同時発生的に、またはその直後に投与することができる；（本開示の目的のため、係る投与レジメンは、追加的な治療的に活性な構成成分「と組み合わせた」抗体の投与とみなされる）。本開示は、抗ＭＥＴ抗体またはＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗原結合分子が、本明細書の他の箇所に記載されている追加的な治療的に活性な構成成分（複数可）のうち１種または複数と同時製剤化された薬学的組成物を含む。
【０２２１】
投与レジメン
ある特定の実施形態によると、抗ＭＥＴ抗体またはＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗原結合分子（または抗ＭＥＴ抗体またはＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗原結合分子および本明細書に言及されている追加的な治療的に活性な薬剤のいずれかの組み合わせを含む薬学的組成物）の複数用量は、規定の時間経過にわたって被験体に投与することができる。本態様に係る方法は、本明細書に提供される抗ＭＥＴ抗体またはＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗原結合分子の複数用量を被験体に逐次的に投与することを含む。本明細書において、「逐次的に投与する」は、抗体の各用量が、異なる時点で、例えば、所定の間隔（例えば、数時間、数日間、数週間または数ヶ月間）によって隔てられた異なる日に被験体に投与されることを意味する。本開示は、抗ＭＥＴ抗体またはＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗原結合分子の単一の初回用量、続いて抗ＭＥＴ抗体またはＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗原結合分子の１または複数の二次用量と、必要に応じて、続いて抗ＭＥＴ抗体またはＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗原結合分子の１または複数の三次用量を患者に逐次的に投与することを含む方法を含む。
【０２２２】
用語「初回用量」、「二次用量」および「三次用量」は、抗ＭＥＴ抗体またはＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗原結合分子の投与の時系列を指す。よって、「初回用量」は、処置レジメンの初めに投与される用量であり（「ベースライン用量」とも称される）；「二次用量」は、初回用量の後に投与される用量であり；「三次用量」は、二次用量の後に投与される用量である。初回、二次および三次用量は全て、同じ量の抗ＭＥＴ抗体またはＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗原結合分子を含有することができるが、一般に、投与頻度の観点から互いに異なっていてもよい。しかし、ある特定の実施形態では、初回、二次および／または三次用量に含有されている抗体の量は、処置過程において互いに変動する（例えば、適宜、上方または下方に調整される）。ある特定の実施形態では、処置レジメンの初めに「負荷用量」として２以上の（例えば、２、３、４または５）用量が投与され、続いてより少ない頻度で投与されるその後の用量（例えば、「維持用量」）が投与される。
【０２２３】
抗体の診断的使用
本開示の抗ＭＥＴ抗体またはＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗原結合分子を使用して、例えば、診断目的で、試料におけるＭＥＴまたはＭＥＴ発現細胞を検出および／または測定することもできる。例えば、抗ＭＥＴ抗体またはその断片を使用して、ＭＥＴの異常発現（例えば、過剰発現、過小発現、発現の欠如等）によって特徴付けられる状態または疾患を診断することができる。ＭＥＴの例示的な診断アッセイは、例えば、患者から得られた試料を本発明の抗ＭＥＴ抗体またはＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗原結合分子と接触させるステップを含むことができ、抗体は、検出可能な標識またはレポーター分子で標識されている。あるいは、未標識の抗ＭＥＴ抗体またはＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗原結合分子は、それ自体が検出可能に標識されている二次抗体と組み合わせて診断適用において使用することができる。検出可能な標識またはレポーター分子は、３Ｈ、１４Ｃ、３２Ｐ、３５Ｓもしくは１２５Ｉ等、放射性同位元素；フルオレセインもしくはローダミン等、蛍光もしくは化学発光部分；またはアルカリホスファターゼ、ベータ−ガラクトシダーゼ、西洋わさびペルオキシダーゼもしくはルシフェラーゼ等、酵素となり得る。試料におけるＭＥＴの検出または測定に使用することのできる特異的な例示的アッセイとして、酵素結合免疫吸着アッセイ（ＥＬＩＳＡ）、ラジオイムノアッセイ（ＲＩＡ）、イムノ−ＰＥＴ（例えば、８９Ｚｒ、６４Ｃｕ等），および蛍光標識細胞分取（ＦＡＣＳ）が挙げられる。
【０２２４】
本開示に係るＭＥＴ診断アッセイにおいて使用することのできる試料は、患者から得ることができるいずれかの組織または流体試料を含む。一般に、健康な患者（例えば、異常なＭＥＴのレベルまたは活性に関連する疾患または状態に罹患していない患者）から得られる特定の試料におけるＭＥＴのレベルを測定して、ＭＥＴのベースラインまたは標準レベルを最初に確立するであろう。続いて、ＭＥＴのこのベースラインレベルは、ＭＥＴ関連疾患または状態を有すると疑われる個体から得られる試料において測定されたＭＥＴのレベルに対して比較することができる。
【実施例】
【０２２５】
次の実施例は、本明細書に提供される方法および組成物を作製および使用する方法の完全な開示および説明を当業者に提供できるように示されており、本発明者らが自身の発明として考慮する範囲の限定を企図しない。使用された数（例えば、量、温度等）に対する正確度を確保するための努力をしたが、一部の実験誤差および偏差が考慮されるべきである。他に断りがなければ、部は重量部であり、分子量は、平均分子量であり、温度はセ氏温度であり、圧力は大気圧またはその近辺である。
（実施例１）
抗ＭＥＴ抗体の生成
【０２２６】
ヒト免疫グロブリン重鎖可変領域およびカッパー軽鎖可変領域をコードするＤＮＡを含む遺伝子操作されたマウスを、ヒトＦｃに融合した組換えヒトＭＥＴ細胞外ドメインを含む免疫原（Ｒ＆Ｄ  Ｓｙｓｔｅｍｓ、カタログ＃３５８−ＭＴ、Ｍｉｎｎｅａｐｏｌｉｓ、ＭＮ）で免疫することにより、抗ＭＥＴ抗体を得た。免役に使用したマウスは、「ユニバーサル軽鎖」を発現する。すなわち、このマウスで産生される抗体は、異なる重鎖可変領域を有するが、本質的に同一の軽鎖可変ドメインを有する。
【０２２７】
ＭＥＴ特異的イムノアッセイにより抗体免疫応答をモニターした。所望の免疫応答が達成されたら、脾細胞を収集し、マウス骨髄腫細胞と融合してその生存能を保ち、ハイブリドーマ細胞株を形成した。ハイブリドーマ細胞株をスクリーニングおよび選択して、ＭＥＴ特異的抗体を産生する細胞株を同定した。この技法を使用して、数種類の抗ＭＥＴキメラ抗体（すなわち、ヒト可変ドメインおよびマウス定常ドメインを保有する抗体）を得た。加えて、ＵＳ２００７／０２８０９４５Ａ１に記載されている通り、数種類の完全ヒト抗ＭＥＴ抗体を、骨髄腫細胞へ融合することなく抗原陽性Ｂ細胞から直接的に単離した。
【０２２８】
本実施例の方法に従って生成された例示的な抗ＭＥＴ抗体、およびそこから構築した二重特異的抗体の特定の生物学的特性を、下に記す実施例において詳細に説明する。
（実施例２）重および軽鎖可変領域アミノ酸および核酸配列
【０２２９】
表１は、本明細書に記載される、選択された抗ＭＥＴ抗体の重鎖可変領域および軽鎖可変領域およびＣＤＲのアミノ酸配列識別子を表記する。（上記のように、実施例１で生成される全ての抗体は、同一の軽鎖可変領域を有し、したがって、同様に同一の軽鎖ＣＤＲ配列を有する。）対応する核酸配列識別子を表２に表記する。
【表１】
2020509027.tif 000085
【表２】
2020509027.tif 000086
【０２３０】
抗体は典型的には、本明細書において、次の命名法に従って参照される：表１および２に示す通り、Ｆｃ接頭語（例えば、「Ｈ４Ｈ」等）と、続く数的識別子（例えば、「１３２９０」、「１３２９１」、「１３２９５」等）と、続く「Ｐ２」接尾語。よって、この命名法に従って、抗体は、本明細書において、例えば、「Ｈ４Ｈ１３２９０Ｐ２」、「Ｈ４Ｈ１３２９１Ｐ２」、「Ｈ４Ｈ１３２９５Ｐ２」等と称することができる。本明細書に使用されている抗体名称における接頭語は、抗体の特定のＦｃ領域アイソタイプを示す。特に、「Ｈ４Ｈ」抗体は、ヒトＩｇＧ４  Ｆｃを有する（全ての可変領域は、抗体名称における最初の「Ｈ」によって表示される通り、完全にヒトのものである）。当業者であれば認められる通り、特定のＦｃアイソタイプを有する抗体は、異なるＦｃアイソタイプを有する抗体に変換することができるが（例えば、マウスＩｇＧ４  Ｆｃを有する抗体は、ヒトＩｇＧ１を有する抗体に変換することができる等）、いずれにせよ、可変ドメイン（ＣＤＲを含む）（これは表１および２に示す数的識別子によって示される）は、同じままであり、結合特性は、Ｆｃドメインの性質にかかわらず、同一または実質的に同様であると予想される。
（実施例３）
ヒトモノクローナル抗ＭＥＴ（単一特異的）抗体の表面プラズモン共鳴に由来する結合親和性および動力学定数
【０２３１】
ヒト抗ＭＥＴ抗体の結合親和性および動力学定数は、表面プラズモン共鳴（Ｂｉａｃｏｒｅ  ４０００またはＴ−２００）によって、３７℃で決定された。この実施例で試験された抗Ｍｅｔ抗体は、ＭＥＴの二価単一特異的結合剤であった。ヒトＩｇＧ４として発現する抗体（「Ｈ４Ｈ」と呼ばれる）は、マウスモノクローナル抗ヒトＦｃ抗体（ＧＥ、ＢＲ−１００８−３９）とのアミンカップリングによって誘導体化されたＣＭ４またはＣＭ５  Ｂｉａｃｏｒｅセンサー表面上に捕捉された。様々な濃度の可溶性の単量体（ヒト（ｈ）Ｍｅｔ．ｍｍｈ；配列番号１５２；ｍａｃａｃａ  ｆａｓｃｉｃｕｌａｒｉｓ（ｍｆ）Ｍｅｔ．ｍｍｈ；配列番号１５４）または二量体（ｈＭｅｔ．ｍＦｃ；配列番号１５３）のＭｅｔタンパク質が、３０または５０μＬ／分の流速で、抗ＭＥＴ抗体の捕捉された表面上に注入された。捕捉されたモノクローナル抗体に対するｈＭＥＴ．ｍｍｈまたはｈＭＥＴ．ｍＦｃの会合は、４分間または５分間モニターし、ＨＢＳ−ＥＴ（０．０１Ｍ  ＨＥＰＥＳ  ｐＨ  ７．４、０．１５Ｍ  ＮａＣｌ、３ｍＭ  ＥＤＴＡ、０．０５％ｖ／ｖ界面活性剤Ｐ２０）またはＰＢＳ−Ｐ（０．０１Ｍリン酸ナトリウムｐＨ  ７．４、０．１５Ｍ  ＮａＣｌ、０．０５％  ｖ／ｖ界面活性剤Ｐ２０）ランニング緩衝液中のｈＭＥＴ．ｍｍｈまたはｈＭＥＴ．ｍＦｃの解離は、１０分間モニターした。
【０２３２】
動力学的結合速度定数（ｋａ）および解離速度定数（ｋｄ）は、Ｓｃｒｕｂｂｅｒ  ２．０ｃ曲線フィッティングソフトウェアを使用してリアルタイムセンサーグラムを１：１結合モデルにフィッティングすることにより決定した。結合解離平衡定数（ＫＤ）および解離半減期（ｔ１／２）は、以下のように動力学的速度定数から計算した：
【数１】
2020509027.tif 000087
【０２３３】
単量体および二量体のＭｅｔタンパク質に対する単一特異的抗Ｍｅｔ抗体の結合動力学的パラメーターを以下の表３に示す。
【表３−１】
2020509027.tif 000088
【表３−２】
2020509027.tif 000089
【０２３４】
表３に示されるように、いくつかの抗体は、ヒトおよびサルのＭＥＴタンパク質に対する高親和性結合を示した。
（実施例４）
抗Ｍｅｔ抗体はＭＥＴ受容体上の別個のエピトープに結合する
【０２３５】
２つの抗Ｍｅｔ抗体が、ＭＥＴ上のそれらのそれぞれのエピトープへの結合について互いに競合し得るかどうかを評価するために、ＯＣＴＥＴ（登録商標）ＨＴＸバイオセンサー（ＦｏｒｔｅＢｉｏ  Ｃｏｒｐ．、Ｍｅｎｌｏ  Ｐａｒｋ、ＣＡ）におけるリアルタイム無標識バイオレイヤー干渉法（ＢＬＩ）を使用して、結合競合アッセイを実施した。
【０２３６】
手短に述べると、およそ０．２５ｎＭの、Ｃ末端ｍｙｃ−ｍｙｃ−ヘキサヒスチジンタグを有して発現するヒトＭＥＴ細胞外ドメイン（ｈＭｅｔ．ｍｍｈ）は、ｈＭＥＴ．ｍｍｈの２０μｇ／ｍＬ溶液を含有するウェルに５分間、抗ペンタＨｉｓ抗体をコートしたＯＣＴＥＴ（登録商標）バイオセンサー（ＦｏｒｔｅＢｉｏ  Ｃｏｒｐ．、＃１８−５０７９）を浸すことによって、最初に該バイオセンサーに捕捉された。次いで、抗原を捕捉したバイオセンサーは、第１の抗ＭＥＴモノクローナル抗体（以下、ｍＡｂ−１と呼ぶ）の５０μｇ／ｍＬ溶液を含有するウェルに５分間浸漬することによって、ｍＡｂ−１で飽和させた。次いで、バイオセンサーは、第２の抗ＭＥＴモノクローナル抗体（以下、ｍＡｂ−２と呼ぶ）の５０μｇ／ｍＬ溶液を含有するウェルに３分間浸した。全てのバイオセンサーは、実験の各ステップ間で、ＯＣＴＥＴ（登録商標）ＨＥＰＥＳ緩衝食塩水−ＥＤＴＡポリソルベート２０（ＨＢＳ−ＥＰ）緩衝液中で洗浄した。実験の過程の間、リアルタイムの結合応答をモニターし、各ステップの終わりの結合応答を記録した。ｍＡｂ−１と予め複合体形成した抗ＭＥＴに対するｍＡｂ−２の結合の応答を比較し、５０％阻害閾値を使用して異なる抗ＭＥＴモノクローナル抗体の競合的／非競合的挙動を決定した。表４は、結合の順序とは無関係に、双方向で競合する抗体の関係を明確に定義している。
【表４】
2020509027.tif 000090
（実施例５）
ＭＥＴの異なるエピトープに特異的な２つの異なる抗原結合ドメインを有する二重特異的抗体の構築
【０２３７】
この実施例は、２つの異なる抗原結合ドメイン（Ｄ１およびＤ２）を含む二重特異的抗体の構築を記載し、ここで、Ｄ１とＤ２とは、異なる抗ＭＥＴ抗体に由来し、結果として、ＭＥＴ細胞外ドメインの別々のエピトープに結合する。
【０２３８】
この実施例の二重特異的抗体を構築するのに使用される個々の抗ＭＥＴ抗原結合ドメインは、本明細書の実施例１〜３に記載される様々な二価単一特異的抗ＭＥＴ抗体に由来した。本明細書に記載される全ての抗ＭＥＴ抗体は、同一の（「共通の」）軽鎖（配列番号１３８の軽鎖可変領域［ＬＣＶＲ］アミノ酸配列と、配列番号１４０、１４２、および１４４の軽鎖ＣＤＲ［ＬＣＤＲ１、ＬＣＤＲ２、およびＬＣＤＲ３］アミノ酸配列とを含む）を含む。さらに、この実施例に例示される全ての二重特異的抗体は、例示的な抗ＭＥＴ抗体Ｈ４Ｈ１３３１２Ｐ２に由来する「Ｄ２」アームを含有する。したがって、この実施例に記載される全ての二重特異的抗体の両方の抗原結合ドメイン（Ｄ１およびＤ２）は、この共通の軽鎖可変領域を含み、全てのＤ２結合アームは、Ｈ４Ｈ１３３１２Ｐ２に由来する重鎖可変領域を含むが、二重特異的抗体は、それらのＤ１重鎖可変領域（ＨＣＶＲ）および重鎖ＣＤＲ（ＨＣＤＲ）に関して互いに異なる。この実施例の二重特異的抗体の構成成分は、表５に要約される。
【表５】
2020509027.tif 000091
（実施例６）
ＭＥＴ×ＭＥＴヒト二重特異的モノクローナル抗体の表面プラズモン共鳴に由来する結合親和性および動力学定数
【０２３９】
本明細書の実施例４に従って構築したＭＥＴ×ＭＥＴヒト二重特異的抗体の結合親和性および動力学定数は、表面プラズモン共鳴（Ｂｉａｃｏｒｅ  ４０００またはＴ−２００）によって、３７℃で決定された。ヒトＩｇＧ４として発現する二重特異的抗体（「Ｈ４Ｈ」と呼ばれる）は、マウスモノクローナル抗ヒトＦｃ抗体（ＧＥ、ＢＲ−１００８−３９）とのアミンカップリングによって誘導体化されたＣＭ４またはＣＭ５  Ｂｉａｃｏｒｅセンサー表面上に捕捉された。様々な濃度の可溶性の単量体ＭＥＴタンパク質（ｈＭｅｔ．ｍｍｈ；配列番号１５２）のＭｅｔタンパク質が、３０または５０μＬ／分の流速で、抗ＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗体の捕捉された表面上に注入された。捕捉された二重特異的抗体に対する分析物の会合は、４分間または５分間モニターし、ＨＢＳ−ＥＴ（０．０１Ｍ  ＨＥＰＥＳ  ｐＨ  ７．４、０．１５Ｍ  ＮａＣｌ、３ｍＭ  ＥＤＴＡ、０．０５％ｖ／ｖ界面活性剤Ｐ２０）またはＰＢＳ−Ｐ（０．０１Ｍリン酸ナトリウムｐＨ  ７．４、０．１５Ｍ  ＮａＣｌ、０．０５％  ｖ／ｖ界面活性剤Ｐ２０）ランニング緩衝液中の分析物の解離は、１０分間モニターした。
【０２４０】
動力学的結合速度定数（ｋａ）および解離速度定数（ｋｄ）は、実施例３に記載されるように決定した。
【０２４１】
単量体のＭｅｔタンパク質（ｈＭＥＴ．ｍｍｈ）に対する二重特異的抗Ｍｅｔ抗体の結合動力学的パラメーターを表６に示す。
【表６】
2020509027.tif 000092
【０２４２】
表６に示されるように、本明細書に記載される二重特異的「ＭＥＴ×ＭＥＴ」抗体は、１１５５分を超えるまでのＴ１／２値を示した。
【０２４３】
表７に示されるように、二重特異的抗体Ｈ４Ｈ１４６３９Ｄの解離速度は、その親抗体、Ｈ４Ｈ１３３０６Ｐ２およびＨ４Ｈ１３３１２Ｐ２の各々の解離速度よりも有意に低い。
【表７】
2020509027.tif 000093
（実施例７）
抗Ｍｅｔ抗体は、ＳＲＥ−ルシフェラーゼレポーターバイオアッセイにおいて、ＨＧＦ媒介Ｍｅｔ活性化を遮断する
【０２４４】
抗ＭＥＴ抗体の肝細胞成長因子（ＨＧＦ）媒介ＭＥＴ活性化を遮断する能力は、ルシフェラーゼベースのレポーターアッセイにおいて調べられた。成長因子ＨＧＦは、その受容体ｃ−Ｍｅｔ（ＭＥＴ）の細胞外ドメインに結合し、急速なホモ二量体化を引き起こし、いくつかの下流のシグナル伝達カスケードを活性化する。この実施例で試験された抗ＭＥＴ抗体は、ＭＥＴの二価単一特異的結合剤、または二重特異的抗体の各々のアームが、ＭＥＴ上の異なる別個のエピトープに結合する抗ＭＥＴ「二重特異性」であった。
【０２４５】
操作された細胞ベースのルシフェラーゼレポーターアッセイ（図２）を使用して、ＭＥＴシグナル伝達を活性化する抗ＭＥＴ抗体の能力（図３、パネルＡ；表８、列３および４）、およびＭＥＴのリガンド媒介活性化を遮断する抗ＭＥＴ抗体の能力（図３、パネルＢ；表８列１および２）を決定した。手短に述べると、ＣＩＧＮＡＬ（商標）Ｌｅｎｔｉ  ＳＲＥ  Ｒｅｐｏｒｔｅｒ（ｌｕｃ）キット（ＳＡＢｉｏｓｃｉｅｎｃｅｓ、Ｈｉｌｄｅｎ、ＤＥ）を使用して、ＨＥＫ２９３／ＳＲＥ−Ｌｕｃ細胞を生成した。ＨＥＫ２９３（ヒト胎児腎臓）細胞が、それらが内因性にｃ−Ｍｅｔを発現するので、選択された。ＨＥＫ２９３／ＳＲＥ−Ｌｕｃ細胞は、血清応答エレメント（ＳＲＥ）依存性ルシフェラーゼ（Ｌｕｃ）レポーターを安定的に組み込んだ（Ｄｉｎｔｅｒら、ＰＬｏＳ  ＯＮＥ、１０巻（２号）：ｅ０１１７７７４頁、２０１５年を参照されたい）。ＨＥＫ２９３／ＳＲＥ−Ｌｕｃ細胞は、１０％ウシ胎仔血清（ＦＢＳ）、ペニシリン／ストレプトマイシン／グルタミン、および１μｇ／ｍｌピューロマイシンを補充したＤＭＥＭで培養された。
【０２４６】
次いで、２．０×１０５のＨＥＫ２９３／ＳＲＥ−Ｌｕｃ細胞を、９６ウェルプレート中のルシフェラーゼアッセイ培地中に播種し、５％ＣＯ２中３７℃で一晩インキュベートした。肝細胞成長因子（ＨＧＦ）の用量反応曲線を、段階希釈したＨＧＦ（０．０１ｐＭ〜１．０ｎＭ）を細胞に添加し、抗体の不在下において３７℃で４〜６時間インキュベーションした後のルシフェラーゼシグナルを記録することにより作成した。抗体阻害曲線を作成するために、段階希釈した抗ヒトＭＥＴ抗体（１．１ｐＭ〜２００ｎＭ）と共に、細胞を３７℃で１時間予めインキュベートした。次いで、シグナルを記録する前に、７３ｐＭまたは１００ｐＭの濃度でのＨＧＦを、さらなる４〜６時間添加した。別個に、リガンドの不在下で、ｃ−Ｍｅｔを活性化する抗体の能力も評価した。
【０２４７】
ルシフェラーゼ活性は、ＯＮＥ−Ｇｌｏ（商標）ルシフェラーゼアッセイシステム（Ｐｒｏｍｅｇａ、Ｍａｄｉｓｏｎ、ＷＩ）を使用して検出し、放出された光をＶｉｃｔｏｒまたはＥｎｖｉｓｉｏｎルミノメーター（Ｐｅｒｋｉｎ  Ｅｌｍｅｒ、Ｓｈｅｌｔｏｎ、ＣＴ）で測定し、相対光単位（ＲＬＵ）として表した。ＥＣ５０／ＩＣ５０値は、ＧＲＡＰＨＰＡＤ  ＰＲＩＳＭ（登録商標）を使用して、１２点反応曲線にわたって４パラメーターロジスティック方程式から決定した。最も高い抗体用量について、ＨＧＦ遮断パーセントおよびＭＥＴ活性化倍率（ｍＡｂ単独）を報告した。結果を表８に示す。
【表８−１】
2020509027.tif 000094
【表８−２】
2020509027.tif 000095
【０２４８】
表８に要約されるように、大部分の抗体は、２．０ｐＭ未満〜約１．０ｎＭの範囲のＩＣ５０値で、ＳＲＥレポーターの活性化を阻害した。Ｈ４Ｈ１３３０６Ｐ２およびＨ４Ｈ１３３０９Ｐ２などのいくつかの例示的な単一特異的二価抗ＭＥＴ抗体は、それぞれ６７％および７７％の阻害パーセント値を有するＳＲＥ−ｌｕｃ活性化の強力な阻害剤であった。抗ＭＥＴ二重特異的抗体（ＭＥＴ×ＭＥＴ）は、全体としてより大きなＳＲＥ−ｌｕｃ活性化の阻害を示した。例えば、ＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗体Ｈ４Ｈ１４６３９Ｄは、９５パーセント阻害を示した。さらに、いくつかの遮断抗体は、リガンド不在下で、弱い活性化を示し、活性化応答倍率はベースラインレベルを上回る０．８〜１４．４の範囲であった。
【０２４９】
図３にも示されるように、二価単一特異的抗体Ｈ４１４１３３０６Ｐ２およびＨ４Ｈ１３３１２Ｐ２は、それぞれＨＧＦリガンドの不在下で、Ｍｅｔ経路を活性化し（パネルＡ）、また、ＭｅｔのＨＧＦによる活性化を遮断する（パネルＢ）。
【０２５０】
ＨＧＦ依存性およびＨＧＦ非依存性のＭＥＴ活性化に対する二重特異的ＭＥＴ×ＭＥＴ抗体（例えば、Ｈ４Ｈ１４６３９Ｄ）の効果はまた、ＨＥＫ２９３／ＳＲＥ−Ｌｕｃシステムを使用して評価された。ＳＲＥ駆動ルシフェラーゼ活性を、ＨＧＦ非依存性ＭＥＴアゴニズムのレベルを確かめるための様々な濃度で、ＭＥＴ抗体Ｈ４Ｈ１４６３９Ｄ（ＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗体）、一価抗ＭＥＴ抗体、およびＨ４Ｈ１４６３９Ｄ親抗体Ｈ４Ｈ１３３１２Ｐ２で処置したＨＥＫ２９３Ｔ細胞で測定した。親抗ＭＥＴ単一特異的二価抗体がＭＥＴアゴニスト活性を示したが、該一価抗体も該ＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗体もＭＥＴアゴニスト活性を示さなかった（図４、パネルＡ）。
【０２５１】
ＳＲＥ駆動ルシフェラーゼ活性を、ＨＧＦ依存性ＭＥＴアゴニズムの阻害または遮断のレベルを確かめるための様々な濃度で、ＭＥＴ抗体Ｈ４Ｈ１４６３９Ｄ（ＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗体）、一価抗ＭＥＴ抗体、およびＨ４Ｈ１４６３９Ｄ親抗体Ｈ４Ｈ１３３１２Ｐ２で処置したＨＥＫ２９３Ｔ細胞で測定した。親抗ＭＥＴ単一特異的二価抗体がいくらかのＨＧＦ遮断活性を示したが、該一価抗体と該ＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗体の両方がより大きなＨＧＦ遮断を示した（図４、パネルＢ）。
【０２５２】
ＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗体は、ＨＧＦシグナル伝達を遮断し、低いＭＥＴアゴニスト活性を示す。
（実施例８）
抗Ｍｅｔ抗体は、ＭＥＴ増幅細胞の成長を阻害する
【０２５３】
次いで、選択された抗Ｍｅｔ抗体を、ＭＥＴ増幅ＳＮＵ５細胞の成長を阻害するそれらの能力について試験した。手短に述べると、２．５×１０３のヒト胃癌（ＳＮＵ５）細胞を、１．５ｐＭ〜１００ｎＭの範囲の濃度の抗ＭＥＴ抗体の存在下で、完全成長培地に播種した。ＳＮＵ５完全成長培地は、Ｉｓｃｏｖｅの改変ダルベッコ培地、１０％ＦＢＳ、およびペニシリン／ストレプトマイシン／グルタミンを含有していた。細胞を５日間インキュベートし、ＣＥＬＬＴＩＴＥＲ−ＧＬＯ（登録商標）Ｌｕｍｉｎｅｓｃｅｎｔ  Ｃｅｌｌ  Ｖｉａｂｉｌｉｔｙアッセイキット（Ｐｒｏｍｅｇａ、Ｍａｄｉｓｏｎ、ＷＩ）を製造元の指示に従って使用して生存細胞数を決定した。
【０２５４】
表９に要約するように、Ｈ４Ｈ１３３１２Ｐ２およびＨ４Ｈ１３３２５Ｐ２などのいくつかの抗ＭＥＴ抗体は、ＳＮＵ５の成長を５０％超遮断し、全体のＩＣ５０は４４ｐＭ〜７８０ｐＭの範囲であった。
【０２５５】
図５は、様々な抗ＭＥＴ二価単一特異的抗体（すなわち従来の抗体）で処置したＳＮＵ５細胞の相対細胞成長を示す。従来のＭＥＴ抗体のサブセットは、ＳＮＵ５  ＭＥＴ増幅胃がん細胞の成長を阻害する（図５）。９６ウェルプレート中のＳＮＵ５細胞を、１０μｇ／ｍｌの各々の抗体で処置し、５日後に細胞成長を、ＡＬＡＭＡＲＢＬＵＥ（登録商標）試薬（Ｔｈｅｒｍｏ  Ｆｉｓｈｅｒ  Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ、Ｗａｌｔｈａｍ、ＭＡ）の還元によって決定した。参照によりその全体が本明細書に組み込まれる米国特許第７，８９２，５５０Ｂ２号に表記されるＭｅｔＭａｂの重鎖可変配列および軽鎖可変配列を使用して、一価ＭＥＴ抗体（図５、第２列）を生成した。従来の抗体８は、Ｈ４Ｈ１３３０６Ｐ２であり、従来の抗体１１は、Ｈ４Ｈ１３３１２Ｐ２であり、それらは、ＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗体Ｈ４Ｈ１４６３９Ｄを構築するために使用された。
【０２５６】
別の成長アッセイにおいて、ＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗体（すなわち、Ｈ４Ｈ１４６３９Ｄ）の遮断活性は、ＳＮＵ５および非小細胞肺がん（ＮＳＣＬＣ）細胞株ＥＢＣ−１（増幅したＭｅｔ遺伝子を示し、ＭＥＴを過剰発現する（Ｌｕｔｔｅｒｂａｃｈら、Ｃａｎｃｅｒ  Ｒｅｓ．６７巻（５号）：２０８１〜２０８８頁、２００７年））の両方において評価した。ＥＢＣ−１細胞のための完全成長培地は、ＭＥＭアール塩、１０％ウシ胎仔血清（ＦＢＳ）、ペニシリン／ストレプトマイシン／グルタミン、およびＭＥＭのための非必須アミノ酸を含有していた。Ｈ４Ｈ１４３６９Ｄは、ＳＲＥ−ルシフェラーゼ読み取りによる、ＭＥＴ活性の最大の阻害パーセントを示した。この実験において、３．０×１０３のＳＮＵ５細胞またはＥＢＣ−１細胞が、１５ｐＭ〜１００ｎＭの範囲の濃度でのＨ４Ｈ１４６３９Ｄの存在下で完全成長培地に播種された。細胞は５％ＣＯ２中、３７℃で３日間インキュベートされた。次いで、細胞を４％ホルムアルデヒドで固定し、３μｇ／ｍｌのＨｏｅｃｈｓｔ  ３３３４２で染色して核を標識した。ＩＭＡＧＥＸＰＲＥＳＳ（登録商標）Ｍｉｃｒｏ  ＸＬ（Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｄｅｖｉｃｅｓ、Ｓｕｎｎｙｖａｌｅ、ＣＡ）で画像を取得し、ＭＥＴＡＸＰＲＥＳＳ（登録商標）Ｉｍａｇｅ  Ａｎａｌｙｓｉｓソフトウェア（Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｄｅｖｉｃｅｓ、Ｓｕｎｎｙｖａｌｅ、ＣＡ）によって核数（ｎｕｃｌｅａｒ  ｃｏｕｎｔ）を決定した。４０ｎＭジギトニンで処理した細胞からのバックグラウンド核数を全てのウェルから差し引き、生存率を未処理対照に対するパーセンテージとして表した。ＩＣ５０値は、１０点反応曲線にわたって４パラメーターロジスティック方程式から決定した（ＧＲＡＰＨＰＡＤ  ＰＲＩＳＭ（登録商標））。ＩＣ５０値および細胞殺滅パーセントを表９に示す。
【表９】
2020509027.tif 000096
【０２５７】
以下の表１０に要約されるように、ＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗体Ｈ４Ｈ１４６３９Ｄは、ＥＢＣ−１細胞およびＳＮＵ５細胞の成長を、それぞれ、３７パーセントおよび４０パーセント阻害し、ＩＣ５０は０．８２ｎＭおよび０．３ｎＭであった。
【表１０】
2020509027.tif 000097
【０２５８】
９６ウェルプレート中のＳＮＵ５細胞（胃）を、０．１μｇ／ｍＬ、１μｇ／ｍＬ、または１０μｇ／ｍＬの、対照抗体、一価ＭＥＴ抗体、またはＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗体で処置した。５日後に細胞成長を、ＡＬＡＭＡＲＢＬＵＥ（登録商標）試薬（Ｔｈｅｒｍｏ  Ｆｉｓｈｅｒ  Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ、Ｗａｌｔｈａｍ、ＭＡ）の還元によって決定した。ＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗体は、対照抗体および一価抗体と比較して、ＳＮＵ５細胞の相対細胞成長を有意に低下させた（図６、パネルＡ）。
【０２５９】
同様に、ＥＢＣ−１細胞の成長に対するＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗体の効果が評価された。２，５００のＥＢＣ−１細胞を９６ウェルプレート中に播種し、１０％ＦＢＳを補充したダルベッコ培地中で培養した。細胞を、０．１μｇ／ｍＬまたは１μｇ／ｍＬの、対照抗体またはＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗体で処置し、続けて、３７℃、５％ＣＯ２でインキュベートした。５日後、相対細胞成長を、ＳＰＥＣＴＲＡＭＡＸ（登録商標）Ｍ３プレートリーダー（Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｄｅｖｉｃｅｓ，ＬＬＣ、Ｓｕｎｎｙｖａｌｅ、ＣＡ）において指示薬の色素ＡＬＡＭＡＲＢＬＵＥ（登録商標）のその高蛍光形態への還元を測定することによって決定した。結果を表１１および図６、パネルＢに示す。ＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗体（Ｈ４Ｈ１４６３９Ｄ）は、対照抗体と比較して、ＥＢＣ−１細胞の相対細胞成長を有意に低下させた（図６、パネルＢ）。
【０２６０】
いくつかの抗ＭＥＴ抗体、二価単一特異的抗体およびＭＥＴ×ＭＥＴ二価抗体の両方は、ＳＲＥ−Ｌｕｃ活性化の強力な阻害剤であり、Ｍｅｔ増幅およびＭＥＴ過剰発現細胞株の成長を阻害する。
【表１１】
2020509027.tif 000098
（実施例９）
ＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗体は、ＮＣＩ−Ｈ５９６  ＮＳＣＬＣ細胞において中等度かつ一過性のＭＥＴ経路活性を誘導する
【０２６１】
ヒト肺腺扁平上皮癌細胞内のＭＥＴ経路に対するＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗体の効果を、ｉｎ  ｖｉｔｒｏで評価した。
【０２６２】
２５０，０００のＮＣＩ−Ｈ５９６細胞を１２ウェルプレート中に播種し、１０％ＦＢＳを補充したＲＰＭＩ培地中で培養した。細胞を、二重で、５０ｎｇ／ｍｌの肝細胞成長因子（ＨＧＦ）または１０μｇ／ｍｌのＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗体Ｈ４Ｈ１４６３９Ｄで処置した。続いて、細胞を、５％ＣＯ２中、３７℃でインキュベートした。０、２、６、または１８時間後、細胞溶解物を調製し、タンパク質含量を正規化し、イムノブロット解析を実施した。ＭＥＴリン酸化およびＥＲＫリン酸化は、ＩｍａｇｅＪ画像処理プログラムによって定量した（Ｔ．  Ｃｏｌｌｉｎｓ、ＢｉｏＴｅｃｈｎｉｑｕｅｓ、４３巻：Ｓ２５〜Ｓ３０頁、２００７年）。リン酸化レベルをチューブリンローディング対照に対して正規化し、対照処置と比較した変化倍数として表す。結果を表１２に要約する。
【表１２】
2020509027.tif 000099
【０２６３】
ＮＣＩ−Ｈ５９６細胞のＨＧＦ処置は、２時間でピークに達しそして１８時間後に持続したＭＥＴおよびＥＲＫの強力な活性化を誘導した。中程度のＭＥＴおよびＥＲＫのリン酸化が、Ｈ４Ｈ１４６３６Ｄ二重特異的抗体処置によって検出され、これは、それぞれ１８時間または６時間までにベースラインレベルに戻った。
（実施例１０）
Ｈｓ７４６Ｔ胃がん細胞において、ＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗体は、単一特異的抗体よりも強力に、ＭＥＴ分解を誘導し、経路活性を阻害する
【０２６４】
ヒト胃癌細胞のＭＥＴ活性に対するＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗体の効果を、ｉｎ  ｖｉｔｒｏで評価した。２５０，０００のＨｓ７４６Ｔヒト胃癌細胞（Ｈ．  Ｓｍｉｔｈ、Ｊ．  Ｎａｔ’ｌ．  Ｃａｎｃｅｒ  Ｉｎｓｔ．６２巻（２号）：２２５〜２３０頁、１９７９年）を、１２ウェルプレート中に播種し、１０％ＦＢＳを補充した改変ダルベッコ培地中で培養した。細胞を、（１）５μｇ／ｍｌのｈＦｃ対照分子、（２）５μｇ／ｍｌの親二価単一特異的抗ＭＥＴ抗体Ｈ４Ｈ１３３０６Ｐ２、（３）５μｇ／ｍｌの親二価単一特異的抗ＭＥＴ抗体Ｈ４Ｈ１３３１２Ｐ２、（４）２．５μｇ／ｍＬのＨ４Ｈ１３３０６Ｐ２と２．５μｇ／ｍＬのＨ４Ｈ１３３１２Ｐ２との組み合わせ、または（５）５μｇ／ｍｌのＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗体Ｈ４Ｈ１４６３９Ｄで処置した。続いて、細胞を、５％ＣＯ２、３７℃でインキュベートした。１８時間後、細胞溶解物を調製し、タンパク質含量を正規化し、イムノブロット解析を実施した。ＭＥＴ発現、ＭＥＴリン酸化、およびＥＲＫリン酸化は、ＩｍａｇｅＪ画像処理プログラムによって定量した（Ｔ．  Ｃｏｌｌｉｎｓ、ＢｉｏＴｅｃｈｎｉｑｕｅｓ、４３巻：Ｓ２５〜Ｓ３０頁、２００７年）。結果を表１３および図７、パネルＡに要約し、それはイムノブロットの生データを示す。図７のパネルＢは、０、２、または６時間、１０μｇ／ｍｌのＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗体で処置した細胞におけるＭＥＴタンパク質発現を示す。Ｈｓ７４７Ｔ細胞における総ＭＥＴレベルは、ＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗体で処置すると経時的に低下した。ＭＥＴ増幅ヒト乳頭腺癌ＮＣＩ−Ｈ８２０細胞株（Ｂｅａｎら、「ＭＥＴ  ａｍｐｌｉｆｉｃａｔｉｏｎ  ｏｃｃｕｒｓ  ｗｉｔｈ  ｏｒ  ｗｉｔｈｏｕｔ  Ｔ７９０Ｍ  ｍｕｔａｔｉｏｎｓ  ｉｎ  ＥＧＦＲ  ｍｕｔａｎｔ  ｌｕｎｇ  ｔｕｍｏｒｓ  ｗｉｔｈ  ａｃｑｕｉｒｅｄ  ｒｅｓｉｓｔａｎｃｅ  ｔｏ  ｇｅｔｆｉｔｎｉｂ  ｏｒ  ｅｒｌｏｔｉｎｉｂ」、Ｐｒｏｃ．  Ｎａｔｌ．  Ａｃａｄ．  Ｓｃｉ．２００７年１２月２６日、１０４巻（５２号）：２０９３２〜２０９３７頁）についても同様の結果が得られた。
【表１３】
2020509027.tif 000100
【０２６５】
二重特異的抗体Ｈ４Ｈ１４６３９Ｄは、その親の従来の抗体よりも強力に、ＭＥＴ分解を誘導した。ＭＥＴとＥＲＫとの両方のリン酸化は、親抗体または親抗体の組み合わせよりも効果的に、Ｈ４Ｈ１４６３６Ｄによる処置によって阻害された。
【０２６６】
Ｈｓ７４６Ｔ胃がん細胞を、対照抗体、ＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗体Ｈ４Ｈ１４６３９Ｄ、抗ＭＥＴ親抗体Ｈ４Ｈ１３３０６Ｐ２、抗ＭＥＴ親抗体Ｈ４Ｈ１３３１２Ｐ２、および各々の抗体が１０μｇ／ｍｌの親抗体１と２との組み合わせ、または各々５μｇ／ｍｌの親抗体の組み合わせを用いて１８時間処置した。ＭＥＴ発現（ＭＥＴ）および経路活性化（ｐＭＥＴおよびｐＥｒｋ）は、示された抗体によるイムノブロッティングによって決定された（図８）。Ｈｓ７４６Ｔ胃がん細胞において、ＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗体は、その親抗体よりも効果的にＭＥＴ経路活性化を阻害する。
（実施例１１）
ＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗体は、ＮＣＩ−Ｈ５９６肺がん細胞において、単一特異的抗体よりも強力にＭＥＴ分解を誘導する
【０２６７】
ヒト肺腺扁平上皮癌細胞の肝細胞成長因子受容体（ＨＧＦＲまたはＭＥＴ）の発現レベルに対するＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗体および親二価単一特異的抗ＭＥＴ抗体の効果を評価した。２５０，０００のＮＣＩ−Ｈ５９６ヒト肺腺扁平上皮癌細胞を１２ウェルプレート中に播種し、１０％ＦＢＳを補充したＲＰＭＩ培地中で培養した。細胞を、（１）５μｇ／ｍｌのｈＦｃ対照分子、（２）５μｇ／ｍｌの親二価単一特異的抗ＭＥＴ抗体Ｈ４Ｈ１３３０６Ｐ２、（３）５μｇ／ｍｌの親二価単一特異的抗ＭＥＴ抗体Ｈ４Ｈ１３３１２Ｐ２、（４）２．５μｇ／ｍＬのＨ４Ｈ１３３０６Ｐ２と２．５μｇ／ｍＬのＨ４Ｈ１３３１２Ｐ２との組み合わせ、または（５）５μｇ／ｍｌのＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗体Ｈ４Ｈ１４６３９Ｄで処置した。続いて、細胞を、５％ＣＯ２、３７℃でインキュベートした。１８時間後、細胞溶解物を調製し、タンパク質含量を正規化し、イムノブロット解析を実施した。ＭＥＴ発現は、ＩｍａｇｅＪ画像処理プログラムによって定量した（Ｔ．  Ｃｏｌｌｉｎｓ、ＢｉｏＴｅｃｈｎｉｑｕｅｓ、４３巻：Ｓ２５〜Ｓ３０頁、２００７年）。結果を表１４に要約する。
【表１４】
2020509027.tif 000101
【０２６８】
ＮＣＩ−Ｈ５９６（ＭＥＴエクソン１４スキップ変異）肺がん細胞をまた、２、６、または１８時間、１０μｇ／ｍｌの対照またはＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗体で処置した。ＭＥＴ発現は、イムノブロッティングによって決定され（図９）、それは、処置時間の増加に伴う、ＭＥＴのＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗体誘導分解を示す。
【０２６９】
ＮＣＩ−Ｈ５９６肺がん細胞において、二重特異的抗体Ｈ４Ｈ１４６３６Ｄは、その親の従来の抗体よりも強力に、ＭＥＴ分解を誘導する。
（実施例１２）
ＳＮＵ５胃がん細胞において、ＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗体は、単一特異的抗体よりも強力に、ＭＥＴ分解を誘導し、経路活性を阻害する
【０２７０】
胃癌細胞の肝細胞成長因子受容体（ＨＧＦＲまたはＭＥＴ）の発現レベルに対する二価単一特異的抗ＭＥＴ抗体およびいくつかのＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗体の効果が評価された。ヒト胃癌ＳＮＵ５細胞を、２０％ＦＢＳプラスペニシリン−ストレプトマイシングルタミンを含有するＩｓｃｏｖｅの培地中に播種した。播種の２４時間後、細胞を、対照ｈＦｃ、抗ＭＥＴ親二価単一特異的抗体Ｈ４Ｈ１３３１２Ｐ２、またはＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗体（Ｈ４Ｈ１４６３４Ｄ、Ｈ４Ｈ１４６３５Ｄ、Ｈ４Ｈ１４６３６Ｄ、Ｈ４Ｈ１４６３７Ｄ、Ｈ４Ｈ１４６３８Ｄ、Ｈ４Ｈ１４６３９Ｄ、Ｈ４Ｈ１４６４０Ｄ、Ｈ４Ｈ１４６４１Ｄ）で１８時間処置した。次いで、細胞溶解物を調製し、ウェスタンブロッティングによって分析した。イムノブロットは、ＭＥＴおよびチューブリンをプローブした。ＭＥＴタンパク質発現レベルを定量し、チューブリンローディング対照に対して正規化した。結果を表１５および図１０、パネルＢに示す。
【表１５】
2020509027.tif 000102
【０２７１】
ＳＮＵ５がん細胞を、上記のように、１８時間、１０μｇ／ｍｌの対照抗体、またはＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗体、または一価ＭＥＴ抗体で処置した。ＭＥＴ発現（図１０、パネルＡおよびＢ）、ならびに経路活性化（すなわち、ｐＭＥＴおよびｐＥＲＫ；パネルＡ）を、示された抗体によるイムノブロッティングによって決定した。イムノブロットを図１０に示す。
【０２７２】
ＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗体によるＳＮＵ５細胞の処置は、二価単一特異的抗ＭＥＴ抗体（Ｈ４Ｈ１３３１２Ｐ２）（図１０、パネルＢ）、一価ＭＥＴ抗体、または対照ｈＦｃによる処置よりも強力にＭＥＴの分解を誘導した。ＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗体によるＳＮＵ５細胞の処置は、下流のＭＥＴ経路のエフェクターを阻害した。同様の結果は、ＭＥＴ増幅非小細胞肺がん腺癌細胞株ＮＣＩ−Ｈ１９９３（Ｋｕｂｏら、「ＭＥＴ  ｇｅｎｅ  ａｍｐｌｉｆｉｃａｔｉｏｎ  ｏｒ  ＥＧＦＲ  ｍｕｔａｔｉｏｎ  ａｃｔｉｖａｔｅ  ＭＥＴ  ｉｎ  ｌｕｎｇ  ｃａｎｃｅｒｓ  ｕｎｔｒｅａｔｅｄ  ｗｉｔｈ  ＥＧＦＲ  ｔｙｒｏｓｉｎｅ  ｋｉｎａｓｅ  ｉｎｈｉｂｉｔｏｒｓ」、Ｉｎｔ．  Ｊ．  Ｃａｎｃｅｒ、２００９年４月１５日；１２４巻（８号）：１７７８〜１７８４頁）について得られた。
（実施例１３）
ＥＢＣ−１細胞においてＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗体は、単一特異的抗体よりも強力に、ＭＥＴ分解を誘導し、経路活性を阻害し、腫瘍成長を阻害する
【０２７３】
上記のように、ＭＥＴ増幅ヒト肺扁平上皮癌ＥＢＣ−１細胞（Ｌｕｔｔｅｒｂａｃｈら、「Ｌｕｎｇ  ｃａｎｃｅｒ  ｃｅｌｌ  ｌｉｎｅｓ  ｈａｒｂｏｒｉｎｇ  ＭＥＴ  ｇｅｎｅ  ａｍｐｌｉｆｉｃａｔｉｏｎ  ａｒｅ  ｄｅｐｅｎｄｅｎｔ  ｏｎ  Ｍｅｔ  ｆｏｒ  ｇｒｏｗｔｈ  ａｎｄ  ｓｕｒｖｉｖａｌ」、Ｃａｎｃｅｒ  Ｒｅｓ．２００７年３月１日；６７巻（５号）：２０８１〜８頁）を、１８時間、対照抗体または１０μｇ／ｍｌのＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗体で処置した。ＭＥＴ発現ならびにｐＭＥＴおよびｐＥｒｋ発現によって確認されたＭＥＴ経路活性化は、示された抗体によるイムノブロッティングによって決定された。イムノブロットを図１１に示す。
【０２７４】
ＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗体による、ＭＥＴ遺伝子増幅を有するＥＢＣ−１細胞の処置は、対照抗体による処置よりも強力なＭＥＴの分解を誘導した。ＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗体によるＥＢＣ−１細胞の処置は、ＭＥＴ経路の下流のエフェクターを阻害した。
【０２７５】
別の実験では、５００万のＥＢＣ−１細胞を、Ｃ．Ｂ．−１７  ＳＣＩＤマウスの側腹部に皮下移植した。腫瘍体積がおよそ１５０ｍｍ３に達すると、マウスを無作為に６匹の群に分け、週に２回、２５ｍｇ／ｋｇの対照抗体または２５ｍｇ／ｋｇのＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗体Ｈ４Ｈ１４６３９Ｄで処置した。腫瘍成長を移植後３０日間モニターし、経時的に各々の実験群について、腫瘍体積（ｍｍ３）を測定した。結果を表１６および図１２に示し、それは、ＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗体が、ＥＢＣ−１腫瘍の成長を有意に阻害することを示す。
【表１６】
2020509027.tif 000103
（実施例１４）
ＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗体は、単一特異的抗体よりも強力にＨｓ７４６Ｔ胃がん細胞のｉｎ  ｖｉｔｒｏ成長を阻害する
【０２７６】
ヒト胃癌細胞の成長に対するＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗体の効果を、ｉｎ  ｖｉｔｒｏで評価した。２，５００のＨｓ７４６Ｔヒト胃癌細胞（Ｈ．  Ｓｍｉｔｈ、Ｊ．  Ｎａｔ’ｌ．  Ｃａｎｃｅｒ  Ｉｎｓｔ．６２巻（２号）：２２５〜２３０頁、１９７９年）を、９６ウェルプレート中に播種し、１０％ＦＢＳを補充した改変ダルベッコ培地中で培養した。細胞を、（１）５μｇ／ｍｌの個々の二価単一特異的抗ＭＥＴ抗体（Ｈ４Ｈ１３３０６Ｐ２またはＨ４Ｈ１３３１２Ｐ２）、（２）各々２．５μｇ／ｍｌの２つの二価単一特異的抗ＭＥＴ親抗体（Ｈ４Ｈ１３３０６Ｐ２とＨ４Ｈ１３３１２Ｐ２）の組み合わせ、または（３）Ｈ４Ｈ１３３０６Ｐ２由来の一方の結合アームとＨ４Ｈ１３３１２Ｐ２由来の他方の結合アームとを含有する５μｇ／ｍｌの二重特異的抗体（Ｈ４Ｈ１４６３９Ｄ）で処置した。続いて、細胞を、５％ＣＯ２、３７℃でインキュベートした。５日後、相対細胞成長を、ＳＰＥＣＴＲＡＭＡＸ（登録商標）Ｍ３プレートリーダー（Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｄｅｖｉｃｅｓ、Ｓｕｎｎｙｖａｌｅ、ＣＡ）において指示薬の色素ＡＬＡＭＡＲ  ＢＬＵＥ（登録商標）（ＴｈｅｒｍｏＦｉｓｃｈｅｒ  Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ、Ｗａｌｔｈａｍ、ＭＡ）のその高蛍光形態への還元を測定することによって決定した。増加する蛍光は細胞成長と相関する。表１７は、対照（処置なし）Ｈｓ７４６Ｔ細胞成長に対して正規化した各々の抗体の処置についての相対Ｈｓ７４６Ｔ細胞成長を示す。二重特異的抗体Ｈ４Ｈ１４６３９Ｄは、その親単一特異的抗体の個別または組み合わせたものよりも強力にＨｓ７４６Ｔ細胞の増殖を阻害する。
【表１７】
2020509027.tif 000104
【０２７７】
Ｈｓ７４６Ｔ胃がん細胞を、対照抗体、ＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗体Ｈ４Ｈ１４６３９Ｄ、抗ＭＥＴ親抗体Ｈ４Ｈ１３３０６Ｐ２、抗ＭＥＴ親抗体Ｈ４Ｈ１３３１２Ｐ２、および各々の抗体が２μｇ／ｍｌの親抗体１と２との組み合わせを用いて処置した。５日後に、ＡＬＡＭＡＲ  ＢＬＵＥ（登録商標）試薬の還元によって細胞成長が決定された（図１３、パネルＡ）。Ｈｓ７４６Ｔ胃がん細胞において、ＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗体は、親抗体単独または組み合わせよりも細胞成長を阻害し、その親抗体よりも効果的にＭＥＴ経路活性化を阻害した。
【０２７８】
９６ウェルプレート中のＨｓ７４６Ｔ胃がん細胞を、２５μｇ／ｍＬの対照抗体、１μｇ／ｍＬ、１０μｇ／ｍＬ、もしくは２５μｇ／ｍＬの一価ＭＥＴ抗体、または１μｇ／ｍＬ、１０μｇ／ｍＬ、もしくは２５μｇ／ｍＬのＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗体で処置した。５日後に、Ｈｓ７４６Ｔ胃がん細胞成長は、ＡＬＡＭＡＲＢＬＵＥ（登録商標）試薬の還元によって決定された（図１３、パネルＢ）。ＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗体はＭＥＴ増幅細胞の成長を強力に阻害する。
（実施例１５）
ＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗体は、ｉｎ  ｖｉｔｒｏでＮＣＩ−Ｈ５９６肺がん細胞の成長を誘導しない
【０２７９】
ヒト非小細胞肺がん（ＮＳＣＬＣ）細胞（ＮＣＩ−Ｈ５９６）の成長に対するＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗体の効果を、ｉｎ  ｖｉｔｒｏで評価した。１０，０００のＮＣＩ−Ｈ５９６肺腺扁平上皮癌細胞（Ｎａｉｒら、Ｊ．  Ｎａｔ’ｌ．  Ｃａｎｃｅｒ  Ｉｎｓｔ．８６巻（５号）：３７８〜３８３頁、１９９４年）を、９６ウェルプレート中の、１％ウシ胎仔血清（ＦＢＳ）を補充した培地中の０．６６％の寒天層の上に播種した。細胞を、０．３％アガロースを含む１％ＦＢＳを補充したＲＰＭＩ  １６４０培地中で培養した。細胞を、（１）５μｇ／ｍｌの個々の親二価単一特異的抗ＭＥＴ抗体（Ｈ４Ｈ１３３０６Ｐ２またはＨ４Ｈ１３３１２Ｐ２）、（２）各々２．５μｇ／ｍｌの２つの親二価単一特異的抗ＭＥＴ抗体（Ｈ４Ｈ１３３０６Ｐ２とＨ４Ｈ１３３１２Ｐ２）の組み合わせ、（３）Ｈ４Ｈ１３３０６Ｐ２由来の一方の結合アームとＨ４Ｈ１３３１２Ｐ２由来の他方の結合アームとを含有する５μｇ／ｍｌの二重特異的抗体（Ｈ４Ｈ１４６３９Ｄ）、または（４）１００ｎｇ／ｍＬの肝細胞成長因子（ＨＧＦ）で処置した。続いて、細胞を、５％ＣＯ２、３７℃でインキュベートした。２週間後、相対細胞成長を、ＳＰＥＣＴＲＡＭＡＸ（登録商標）Ｍ３プレートリーダー（Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｄｅｖｉｃｅｓ、Ｓｕｎｎｙｖａｌｅ、ＣＡ）において指示薬の色素ＡＬＡＭＡＲ  ＢＬＵＥ（登録商標）（Ｔｈｅｒｍｏ  Ｆｉｓｃｈｅｒ  Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ、Ｗａｌｔｈａｍ、ＭＡ）のその高蛍光形態への還元を測定することによって決定した。増加する蛍光は細胞成長と相関する。表１８および図１４は、対照（処置なし）ＮＣＩ−Ｈ５９６細胞成長に対して正規化した各々の抗体の処置についての相対ＮＣＩ−Ｈ５９６細胞成長を示す。ＨＧＦによるＮＣＩ−Ｈ５９６肺がん細胞の処置は、軟寒天中での強力な成長誘導をもたらした。ＭＥＴ×ＭＥＴ（図１４でＭＭ）二重特異的抗体Ｈ４Ｈ１４６３９Ｄは、対照処置細胞と比べて、成長を有意に変更させなかった。細胞成長の中程度の誘導は、各々の親二価単一特異的抗体Ｈ４Ｈ１３３０６Ｐ２（Ｍ１）またはＨ４Ｈ１３３１２Ｐ２（Ｍ２）の個別または組み合わせ（Ｈ４Ｈ１３３０６Ｐ２とＨ４Ｈ１３３１２Ｐ２）（Ｍ１Ｍ２）で観察された。
【表１８】
2020509027.tif 000105
（実施例１６）
ＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗体は、単一特異的抗体よりも強力にＳＮＵ５胃がん細胞のｉｎ  ｖｉｔｒｏ成長を阻害する
【０２８０】
ヒト胃癌細胞の成長に対するＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗体の効果を、ｉｎ  ｖｉｔｒｏで評価した。２，５００のＳＮＵ５ヒト胃癌細胞（ＫｕおよびＰａｒｋ、Ｃａｎｃｅｒ  Ｒｅｓ．  Ｔｒｅａｔ．３７巻（１号）：１〜１９頁、２００５年）を９６ウェルプレート中に播種し、２０％ＦＢＳを補充したＩｓｃｏｖｅの改変ダルベッコ培地中で培養した。細胞を、（１）５μｇ／ｍｌの個々の二価単一特異的抗ＭＥＴ抗体（Ｈ４Ｈ１３３０６Ｐ２またはＨ４Ｈ１３３１２Ｐ２）、（２）各々２．５μｇ／ｍｌの２つの二価単一特異的抗ＭＥＴ抗体（Ｈ４Ｈ１３３０６Ｐ２とＨ４Ｈ１３３１２Ｐ２）の組み合わせ、または（３）Ｈ４Ｈ１３３０６Ｐ２由来の一方の結合アームとＨ４Ｈ１３３１２Ｐ２由来の他方の結合アームとを含有する５μｇ／ｍｌの二重特異的抗体（Ｈ４Ｈ１４６３９Ｄ）で処置した。続いて、細胞を、５％ＣＯ２、３７℃でインキュベートした。５日後、相対細胞成長を、ＳＰＥＣＴＲＡＭＡＸ（登録商標）Ｍ３プレートリーダー（Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｄｅｖｉｃｅｓ、Ｓｕｎｎｙｖａｌｅ、ＣＡ）において指示薬の色素ＡＬＡＭＡＲ  ＢＬＵＥ（登録商標）（Ｔｈｅｒｍｏ  Ｆｉｓｃｈｅｒ  Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ、Ｗａｌｔｈａｍ、ＭＡ）のその高蛍光形態への還元を測定することによって決定した。増加する蛍光は細胞成長と相関する。表１９は、対照（処置なし）ＳＮＵ５細胞成長に対して正規化した各々の抗体の処置についての相対ＳＮＵ５細胞成長を示す。二重特異的抗体Ｈ４Ｈ１４６３９Ｄは、その親単一特異的抗体よりも強力にＳＮＵ５細胞の増殖を阻害する。
【表１９】
2020509027.tif 000106
（実施例１７）
ＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗体は、Ｈｓ７４６Ｔ腫瘍異種移植片の退縮を誘導する
【０２８１】
免役不全マウスモデルにおいて、ヒト胃癌腫瘍に対するＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗体の効果を評価した。３００万のＨｓ７４６Ｔヒト胃癌細胞を、ＣＢ−１７  ＳＣＩＤマウス（Ｂａｎｃｒｏｆｔら、Ｊ．  Ｉｍｍｕｎｏｌ．１３７巻（１号）：４〜９頁、１９８６年）の側腹部に皮下移植した。腫瘍体積がおよそ２００ｍｍ３に達すると、マウスを無作為に６匹の群に分け、週に２回、２５ｍｇ／ｋｇの対照抗体または２５ｍｇ／ｋｇのＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗体（Ｈ４Ｈ１４６３９Ｄ）で処置した。対照処置腫瘍がプロトコールのサイズ限界に達したときである移植後１６日間、対照群について腫瘍成長をモニターした。Ｈ４Ｈ１４６３９処置群について、移植後３０日間腫瘍成長をモニターした。
【０２８２】
ＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗体による腫瘍の処置は、処置の開始時と比べて、２１日間にわたって腫瘍サイズの退縮を誘導した。対照処置腫瘍は、１６日間の成長にわたって約１２倍の体積の平均増加を示した（表２０）。ＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗体によるＨｓ７４６Ｔ腫瘍退縮を示す経時的な腫瘍体積を図１５に示す。
【表２０】
2020509027.tif 000107
（実施例１８）
ＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗体は、ＳＮＵ５腫瘍異種移植片の退縮を誘導する
【０２８３】
免役不全マウスモデルにおいて、ヒト胃癌腫瘍に対するＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗体の効果を評価した。１０００万のＳＮＵ５ヒト胃癌細胞をＣＢ−１７  ＳＣＩＤマウスの側腹部に皮下移植した。腫瘍体積がおよそ５００ｍｍ３に達すると、マウスを無作為に５匹の群に分け、週に２回、１０ｍｇ／ｋｇの対照抗体または１ｍｇ／ｋｇもしくは１０ｍｇ／ｋｇのいずれかでのＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗体（Ｈ４Ｈ１４６３９Ｄ）で処置した。対照処置腫瘍がプロトコールのサイズ限界に達したときである移植後８１日間、腫瘍成長をモニターした。
【０２８４】
１ｍｇ／ｋｇまたは１０ｍｇ／ｋｇのＭＥＴ×ＭＥＴ抗体で処置したマウスの腫瘍は、それぞれ約９５％または約９８％のサイズの平均減少を明らかに示した。対照処置腫瘍は、処置の開始から約１２倍の体積の平均増加を示した（表２１）。
【表２１】
2020509027.tif 000108
【０２８５】
皮下移植したＳＮＵ５腫瘍を、週に２回、対照抗体、１ｍｇ／ｋｇもしくは１０ｍｇ／ｋｇの一価ＭＥＴ抗体、または１ｍｇ／ｋｇもしくは１０ｍｇ／ｋｇのＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗体で処置した。ＭＥＴ増幅ＳＮＵ５腫瘍の強力かつ持続した退縮（すなわち、腫瘍体積の減少）は、ＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗体で処置したマウスにおいて経時的に観察された（図１６、パネルＡ）。試験終了後の腫瘍からタンパク質を抽出し、ＭＥＴ発現およびＭＥＴリン酸化（ｐＭＥＴ発現）によって示される経路活性化をイムノブロッティングによって決定した。ＭＥＴ×ＭＥＴ処置マウス（腫瘍）は、対照と比較してＭＥＴおよびｐＭＥＴ発現の減少を示した（図１６、パネルＢ）。ＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗体は、ＭＥＴ増幅を有する腫瘍の強力な阻害剤である。
（実施例１９）
ＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗体は、Ｕ８７−ＭＧ腫瘍異種移植片の退縮を誘導する
【０２８６】
免役不全マウスモデルにおいて、ヒト神経膠芽腫腫瘍に対するＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗体の効果を評価した。５００万のＵ８７−ＭＧヒト神経膠芽腫細胞（ＶｏｒｄｅｒｍａｒｋおよびＢｒｏｗｎ、Ｉｎｔ．  Ｊ．  Ｒａｄｉａｔｉｏｎ  Ｂｉｏｌ．５６巻（４号）：１１８４〜１１９３頁、２００３年）をＣＢ−１７  ＳＣＩＤマウスの側腹部に皮下移植した。Ｕ８７−ＭＧ神経膠芽腫異種移植片モデルは、オートクリンＨＧＦシグナル伝達によって駆動される。腫瘍体積がおよそ１００ｍｍ３に達すると、マウスを無作為に６匹の群に分け、対照抗体またはＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗体（Ｈ４Ｈ１４６３９Ｄ）で処置した。２５ｍｇ／ｋｇの抗体（対照またはＭＥＴ×ＭＥＴ）を、週に２回各々のマウスに投与した。対照処置腫瘍がプロトコールのサイズ限界に達したときである移植後２９日間、腫瘍成長をモニターした。
【０２８７】
ＭＥＴ×ＭＥＴ抗体で処置したマウスの腫瘍は、約３８％というサイズにおける平均減少を実証したが、一方で、対照処置腫瘍は、２９日間の成長にわたって約１９倍の体積の平均増加を示した（表２２）。ＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗体によるＵ８７−ＭＧ腫瘍退縮を示す経時的な腫瘍体積を図１７に示す。
【表２２】
2020509027.tif 000109
（実施例２０）
ＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗体は、Ｕ１１８−ＭＧ腫瘍異種移植片の成長を阻害する
【０２８８】
免役不全マウスモデルにおいて、ヒト神経膠芽腫腫瘍に対するＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗体の効果を評価した。Ｕ１１８−ＭＧ神経膠芽腫異種移植片モデルは、オートクリンＨＧＦシグナル伝達によって駆動される。５００万のＵ１１８−ＭＧヒト神経膠芽腫細胞（Ｏｌｏｐａｄｅら、Ｃａｎｃｅｒ  Ｒｅｓｅａｒｃｈ、５２巻：２５２３〜２５２９頁、１９９２年）を、ＣＢ−１７  ＳＣＩＤマウスの側腹部に皮下移植した。腫瘍体積がおよそ１００ｍｍ３に達すると、マウスを無作為に６匹の群に分け、対照抗体またはＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗体（Ｈ４Ｈ１４６３９Ｄ）で処置した。２５ｍｇ／ｋｇの抗体（対照またはＭＥＴ×ＭＥＴ）を、週に２回各々のマウスに投与した。腫瘍成長を、移植後７２日間モニターした。
【０２８９】
ＭＥＴ抗体は、７２日の期間にわたって、腫瘍成長を９９％阻害した（表２３）。
【表２３】
2020509027.tif 000110
【０２９０】
別の実験では、マウス内に皮下移植したＵ１１８−ＭＧ神経膠芽腫腫瘍は、週に２回、２５ｍｇ／ｋｇの対照抗体、一価ＭＥＴ抗体、またはＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗体で処置した。腫瘍体積（ｍｍ３）を、経時的に、各々の実験群について測定した。結果を図１８に示し、それは、ＭＥＴ×ＭＥＴ二重特異的抗体が、Ｕ１１８−ＭＧ腫瘍の成長を阻害することを示す。
（実施例２１）
メイタンシノイド合成
【０２９１】
メイタンシン３−Ｎ−メチル−Ｌ−アラニン−Ｎ−Ｍｅ−ベータ−アラニン−カルバミル−（ｐ−アミノ）ベンジル−シトルリン−バリン−アジポイル−スクシネート（図２０において化合物１）を、以下に記載するように、化合物２（図１９）から合成した。
【０２９２】
メイタンシン３−Ｎ−メチル−Ｌ−アラニン−Ｆｍｏｃ−Ｎ−Ｍｅ−ベータ−アラニン（化合物３、図１９）。Ｄｅｓ−アセチル−メイタンシン（化合物２、図１９、０．４３３ｇ、０．６６６ｍｍｏｌ）、Ｆｍｏｃ−Ｎ−Ｍｅ−ベータ−Ａｌａ（０．４３４ｇ、１．３３ｍｍｏｌ）、およびＨＡＴＵ（０．７５７ｇ、１．９９ｍｍｏｌ）を乾燥フラスコに量り入れ、無水ＤＭＦ（９ｍＬ）に溶解し、４−メチルモルホリン（０．３００ｍＬ、２．７３ｍｍｏｌ）で処理した。フラスコをゴム製のセプタムで密封し、アルゴンでパージし、反応物を周囲温度で撹拌した。３日後、混合物を蒸発させて油状物とし、アセトニトリルと水に溶解し、２７５ｇのＣ１８シリカカラム（２０分かけて水中３０〜９０％のアセトニトリル、両方の相に０．０５％酢酸）でのフラッシュクロマトグラフィーにより精製した。生成物画分の凍結乾燥により表題化合物を白色の固体として得た。粗製物を８０ｇのシリカゲルカラム（１７分かけてＥｔＯＡｃ〜５：５：１  ＥｔＯＡｃ：ＤＣＭ：ＭｅＯＨ）で精製した。純粋な画分を合わせ、蒸発させ、真空下で一晩乾燥させて、表題化合物を白色の固体として得た（０．４２４ｇ、６６％）。ＭＳ（ＥＳＩ，ポジティブ）：Ｃ５１Ｈ６１ＣｌＮ４Ｏ１２の計算値、９５６．４；実測値９５６．９（Ｍ＋Ｈ）、９７９．０（Ｍ＋Ｎａ）、９３９．０（Ｍ−Ｈ２Ｏ＋Ｈ）。
【０２９３】
Ｎ−ｔｅｒｔ−ブトキシカルボニル−Ｎ−メチル−ベータ−アラニンスクシネートエステル（化合物４、図１９）。表題化合物は市販のＢｏｃ−Ｎ−Ｍｅ−ベータ−Ａｌａ−ＯＨから本技術分野で周知の方法によって調製した（参照：Ｗｉｄｄｉｓｏｎら、Ｊ．  Ｍｅｄ．  Ｃｈｅｍ、２００６年、４９巻（１４号）、４４０１頁）。１Ｈ  ＮＭＲ  （３００  ＭＨｚ，  ＣＤＣｌ３）：  δ  ３．６２  （ｂｍ，  ２Ｈ），  ２．８８  （ｍ，  ９Ｈ），  １．４７  （ｓ，  ９Ｈ）．
【０２９４】
メイタンシン３−Ｎ−メチル−Ｌ−アラニン−Ｂｏｃ−Ｎ−Ｍｅ−ベータ−アラニン（化合物５、図１９）。方法Ａ：先行するステップの生成物（化合物４、図１９、０．４５３ｇ、１．５１ｍｍｏｌ）およびｄｅｓ−アセチル−メイタンシン（化合物２、図１９、０．３０４ｇ、０．４６８ｍｍｏｌ）を、３：１アセトニトリル：水（８ｍＬ）に溶解し、１ＭのＮａＨＣＯ３水溶液（０．５ｍＬ）で処理し、周囲温度で１８時間撹拌した。ＴＬＣによる決定により反応が完了したとき、次いで、ブラインと共に１０分間撹拌し、酢酸エチル（ＥｔＯＡｃ）で３回抽出した。次いで、合わせた有機層をＮａ２ＳＯ４で乾燥し、濾過し、そして濾液を濃縮し、真空下で金色のシロップになるまで乾燥し、それを２０ｇシリカゲルカートリッジでのフラッシュカラムクロマトグラフィー（１５分かけてＥｔＯＡｃ中０〜１０％ＭｅＯＨ）により精製し、表題化合物を白色の固体として得た（０．０８４ｇ、４３％）。ＭＳ（ＥＳＩ，ポジティブ）：Ｃ４１Ｈ５９ＣｌＮ４Ｏ１２の計算値、８３４．４；実測値８３５．２（Ｍ＋Ｈ）、８５７．２（Ｍ＋Ｎａ）、８１７．４（Ｍ−Ｈ２Ｏ＋Ｈ）。
【０２９５】
方法Ｂ：Ｂｏｃ−Ｎ−Ｍｅ−ベータ−Ａｌａ−ＯＨ（０．２９４ｇ、１．４５ｍｍｏｌ）を無水ＤＭＦ（５ｍＬ）に溶解し、ペンタフルオロフェニルジフェニルホスフィネート（ＦＤＰＰ、０．５５５ｇ、１．４４ｍｍｏｌ）で処理し、反応物を周囲温度で３０分間撹拌した。次いで、混合物を、無水ＤＭＦ（７ｍＬ）中のｄｅｓ−アセチル−メイタンシン（化合物２、図１９、０．４６２ｇ、０．７１１ｍｍｏｌ）およびジイソプロピルエチルアミン（ＤＩＥＡ、０．２５０ｍＬ、１．４４ｍｍｏｌ）の混合物を含有するより大きなフラスコに移し、フラスコをゴム製のセプタムで密封し、アルゴンでパージし、反応物を周囲温度で再び撹拌した。２４時間後、反応物を真空下で油状物に濃縮し、酢酸エチル（ＥｔＯＡｃ、２ｍＬ）に溶解し、４０ｇシリカゲルカートリッジ（１５分かけてＥｔＯＡｃ〜５：５：１  ＥｔＯＡｃ／ＤＣＭ／ＭｅＯＨ）で精製し、表題化合物を淡黄色の固体として得た（０．４６８ｇ、７９％）。ＭＳ（ＥＳＩ，ポジティブ）：Ｃ４１Ｈ５９ＣｌＮ４Ｏ１２の計算値、８３４．４；実測値８５７．２（Ｍ＋Ｎａ）、８１７．２（Ｍ−Ｈ２Ｏ＋Ｈ）。
【０２９６】
メイタンシン３−Ｎ−メチル−Ｌ−アラニン−Ｎ−Ｍｅ−ベータ−アラニン（化合物６、図１９）。方法Ａ：メイタンシンＮ−Ｍｅ−Ｌ−Ａｌａ−Ｂｏｃ−Ｎ−Ｍｅ−ベータ−Ａｌａ（化合物５、図１９、０．４６４ｇ、０．５５５ｍｍｏｌ）を、アセトニトリル／水／トリフルオロ酢酸の３：１：１混合物（７ｍＬ）に溶解し、フラスコをゴム製のセプタムで密封し、アルゴンでパージし、反応物を周囲温度で２４時間撹拌し、次いで、蓋をして−２０℃で３日間保存した。粗反応混合物を２時間周囲温度に温め、真空下で短時間濃縮し、１００ｇのＣ１８  ＲｅｄｉＳｅｐ  Ｇｏｌｄカラム（２５分かけて水中２０〜８０％アセトニトリル、両方の溶媒中に０．１％ＴＦＡ）で精製し、合わせた純粋な画分を周囲温度で部分的に蒸発させ、ドライアイス浴中で凍結させ、凍結乾燥させて表題化合物を淡黄色の固体として得た（０．２９５ｇ、６３％）。ＭＳ（ＥＳＩ，ポジティブ）：Ｃ３６Ｈ５１ＣｌＮ４Ｏ１０の計算値、７３４．３；実測値７３５．７（Ｍ＋Ｈ）、１４７１．３（２Ｍ＋Ｈ）。
【０２９７】
方法Ｂ：メイタンシンＮ−Ｍｅ−Ｌ−Ａｌａ−Ｆｍｏｃ−ベータ−Ａｌａ（化合物３、図１９、０．４２２ｇ、０．４４１ｍｍｏｌ）を、ＤＭＦ中５％ピペリジン（６．００ｍＬ、３．０４ｍｍｏｌ）に溶解し、反応フラスコをゴム製のセプタムで密封し、アルゴンでパージし、混合物を周囲温度で撹拌した。３時間後にＬＣＭＳにより反応が完了したので、それを真空下で濃縮し、密封し、−２０℃で一晩保存した。粗生成物を周囲温度に温め、アセトニトリルおよび１０％酢酸水溶液（各々３ｍＬ）で処理し、２７５ｇのＣ１８シリカカラムでのフラッシュクロマトグラフィー（２０分かけて水中１０〜９０％アセトニトリル、両方の溶媒中に０．０５％酢酸）により精製した。生成物画分の凍結乾燥により表題化合物を白色の固体として得た。固体を乾燥ジエチルエーテルで３回粉砕し、濾過し、固体をＤＣＭでフリットから洗い流し、濾液を蒸発させ、真空下で乾燥させて、表題化合物を白色の固体として得た（０．３１１ｇ、８９％）。ＭＳ（ＥＳＩ，ポジティブ）：Ｃ３６Ｈ５１ＣｌＮ４Ｏ１０の計算値、７３４．３；実測値７３５．０（Ｍ＋Ｈ）。
【０２９８】
メイタンシン３−Ｎ−メチル−Ｌ−アラニン−Ｎ−Ｍｅ−ベータ−アラニン−カルバミル−（ｐ−アミノ）ベンジル−シトルリン−バリン−Ｆｍｏｃ（化合物７、図２０）。ステップ１：先行するステップの生成物（化合物６、図１９、０．３１０ｇ、０．３９０ｍｍｏｌ）、１−ヒドロキシ−７−アザベンゾトリアゾール（ＨＯＡＴ、０．１６４ｇ、１．２０ｍｍｏｌ）、重炭酸ナトリウム（０．１３８ｇ、１．６４ｍｍｏｌ）、およびＦｍｏｃ−バリン−シトルリン−（ｐ−アミノ）ベンジル−（ｐ−ニトロフェニル）カーボネート（０．５９５ｇ、０．７７６ｍｍｏｌ、本技術分野で公知の方法により調製、参照：Ｇａｎｇｗａｒら、米国特許第７，７１４，０１６Ｂ２号）を、無水ＤＭＦ（１０ｍＬ）に溶解し、反応フラスコをゴム製のセプタムで密封し、アルゴンでパージし、混合物を周囲温度で撹拌した。２４時間後、反応物を真空下で約２〜３ｍＬまで部分的に蒸発させ、１０％酢酸水溶液および水（各々約１ｍＬ）で処理し、アセトニトリル（約６ｍＬ）に溶解し、２７５ｇのＣ１８シリカカラムでのフラッシュクロマトグラフィー（２０分かけて水中３０〜９０％アセトニトリル、両方の溶媒中に０．０５％酢酸）によって精製した。部分蒸発、凍結、および凍結乾燥により表題化合物を白色の固体として得た（０．３６２ｇ、６８％）。ＭＳ（ＥＳＩ，ポジティブ）：Ｃ７０Ｈ８８ＣｌＮ９Ｏ１７の計算値、１３６１．６；実測値１３６２．１（Ｍ＋Ｈ）、１３８４．１（Ｍ＋Ｎａ）、１３４４．１（Ｍ−Ｈ２Ｏ＋Ｈ）。
【０２９９】
ステップ２：先行するステップの生成物（０．３６０ｇ、０．２６４ｍｍｏｌ）をＤＭＦ中の５％ピペリジン（７ｍＬ）に溶解し、反応フラスコをゴム製のセプタムで密封し、アルゴンでパージし、混合物を周囲温度で撹拌した。３時間後、反応物を真空下で蒸発させ、残渣を１０％酢酸水溶液（２ｍＬ）で処理し、アセトニトリル（４ｍＬ）に溶解し、２７５ｇのＣ１８シリカカラムでのフラッシュクロマトグラフィー（２０分かけて水中１０〜７０％アセトニトリル、両方の溶媒中に０．０５％酢酸）によって精製した。純粋な画分を合わせ、−２０℃で一晩保存し、２５〜３０℃で、真空下で部分的に蒸発させ、ドライアイス上で凍結させ、６日間凍結乾燥させて表題化合物を淡黄色の固体として得た（０．３０３ｇ、９５％）。ＭＳ（ＥＳＩ，ポジティブ）：Ｃ１５Ｈ７８ＣｌＮ９Ｏ１５の計算値、１１３９．５；実測値１１４０．１（Ｍ＋Ｈ）、１１６２．０（Ｍ＋Ｎａ）。
【０３００】
メイタンシン３−Ｎ−メチル−Ｌ−アラニン−Ｎ−Ｍｅ−ベータ−アラニン−カルバミル−（ｐ−アミノ）ベンジル−シトルリン−バリン−アジピン酸（化合物８、図２０）。先行するステップの生成物（化合物７、図２０、０．２０５ｇ、０．１７１ｍｍｏｌ）、アジピン酸（０．２５８ｇ、１．７７ｍｍｏｌ）、および２−エトキシ−１−エトキシカルボニル−１，２−ジヒドロキノリン（ＥＥＤＱ、０．２１５ｇ、０．８６９ｍｍｏｌ）を乾燥ＤＣＭ（１０ｍＬ）および無水メタノール（５ｍＬ）に溶解し、反応フラスコをゴム製のセプタムで密封し、アルゴンでパージし、混合物を周囲温度で撹拌した。２１時間後、反応物を真空下で蒸発させ、残渣を数ｍＬのアセトニトリル／水に溶解し、１５０ｇのＣ１８シリカカラムでのフラッシュクロマトグラフィー（１７分かけて水中２０〜８０％アセトニトリル、両方の溶媒中に０．０５％酢酸）によって精製した。純粋な画分の部分蒸発、凍結、および１８時間の凍結乾燥により、表題化合物を白色の固体として得た（０．１４０ｇ、６５％）。ＭＳ（ＥＳＩ，ポジティブ）：Ｃ６１Ｈ８６ＣｌＮ９Ｏ１８の計算値、１２６７．６；実測値１２６８．９（Ｍ＋Ｈ）、１２９０．９（Ｍ＋Ｎａ）。
【０３０１】
メイタンシン３−Ｎ−メチル−Ｌ−アラニン−Ｎ−Ｍｅ−ベータ−アラニン−カルバミル−（ｐ−アミノ）ベンジル−シトルリン−バリン−アジポイル−スクシネート（化合物１、図２０）。先行するステップの生成物（化合物８、図２０、０．０６１ｇ、０．０４８ｍｍｏｌ）、Ｎ−ヒドロキシスクシンイミド（０．０６３ｇ、０．５５ｍｍｏｌ）、およびＮ−（３−ジメチルアミノプロピル）−Ｎ’−エチルカルボジイミド塩酸塩（ＥＤＣ−ＨＣｌ、０．０７１ｇ、０．３７ｍｍｏｌ）を乾燥ＤＣＭ（７ｍＬ）に溶解し、反応フラスコをゴム製のセプタムで密封し、アルゴンでパージし、混合物を周囲温度で撹拌した。５日後、反応物を真空下で蒸発させ、残渣を数ｍＬのアセトニトリル／水に溶解し、１００ｇのＣ１８シリカカラムでのフラッシュクロマトグラフィー（１５分かけて水中３０〜９０％アセトニトリル、両方の溶媒中に０．０５％酢酸）によって精製した。最も純な生成物画分の部分蒸発、凍結、および１８時間の凍結乾燥により、表題化合物を白色の固体として得た（０．０４４ｇ、６７％）。ＭＳ（ＥＳＩ，ポジティブ）：Ｃ６５Ｈ８９ＣｌＮ１０Ｏ２０の計算値、１３６４．６；実測値１３６５．７（Ｍ＋Ｈ）、１３８７．７（Ｍ＋Ｎａ）、１３４７．７（Ｍ−Ｈ２Ｏ＋Ｈ）。１Ｈ−ＮＭＲ  （５００  ＭＨｚ；  ＣＤＣｌ３）：  δ  ７．５６  （ｄ，  Ｊ  ＝  ８．３  Ｈｚ，  ２Ｈ），  ７．２０  （ｄ，  Ｊ  ＝  ８．７  Ｈｚ，  １Ｈ），  ６．８０  （ｓ，  １Ｈ），  ６．７１  （ｍ，  １Ｈ），  ６．６２  （ｄ，  Ｊ  ＝  １０．０  Ｈｚ，  １Ｈ），  ６．３９  （ｄｄ，  Ｊ  ＝  １５．１，  １１．３  Ｈｚ，  １Ｈ），  ５．６８  （ｄｄ，  Ｊ  ＝  １５．３，  ９．１  Ｈｚ，  １Ｈ），  ５．３８−５．３２  （ｍ，  １Ｈ），  ５．０３  （ｔ，  Ｊ  ＝  １５．１  Ｈｚ，  １Ｈ），  ４．８８  （ｄ，  Ｊ  ＝  １２．３  Ｈｚ，  １Ｈ），  ４．７３  （ｄ，  Ｊ  ＝  １１．３  Ｈｚ，  １Ｈ），  ４．６１  （ｄｄ，  Ｊ  ＝  ９．１，  ３．６  Ｈｚ，  １Ｈ），  ４．２６  （ｄ，  Ｊ  ＝  ７．０  Ｈｚ，  １Ｈ），  ４．１７  （ｔ，  Ｊ  ＝  ７．１  Ｈｚ，  １Ｈ），  ３．９５  （ｓ，  ３Ｈ），  ３．６１  （ｄ，  Ｊ  ＝  １１．７  Ｈｚ，  １Ｈ），  ３．５７  （ｄ，  Ｊ  ＝  １２．４  Ｈｚ，  １Ｈ），  ３．４６  （ｄ，  Ｊ  ＝  ９．１  Ｈｚ，  ２Ｈ），  ３．３３  （ｓ，  ３Ｈ），  ３．２７  （ｔ，  Ｊ  ＝  ６．９  Ｈｚ，  １Ｈ），  ３．１７−３．０７  （ｍ，  ５Ｈ），  ２．９７  （ｄｄ，  Ｊ  ＝  １６．６，  ９．９  Ｈｚ，  １Ｈ），  ２．８８  （ｄ，  Ｊ  ＝  １１．７  Ｈｚ，  ３Ｈ），  ２．８４  （ｓ，  ４Ｈ），  ２．７７  （ｓ，  ２Ｈ），  ２．６６  （ｓ，  ２Ｈ），  ２．６２  （ｔ，  Ｊ  ＝  ４．８  Ｈｚ，  ２Ｈ），  ２．５６  （ｄ，  Ｊ  ＝  １３．１  Ｈｚ，  １Ｈ），  ２．３２  （ｔ，  Ｊ  ＝  ６．６  Ｈｚ，  ２Ｈ），  ２．１５  （ｄ，  Ｊ  ＝  １４．０  Ｈｚ，  １Ｈ），  ２．１０  （ｑ，  Ｊ  ＝  ６．８  Ｈｚ，  １Ｈ），  １．９２  （ｓ，  ４Ｈ），  １．７５  （ｍ，  ５Ｈ），  １．６１  （ｓ，  ３Ｈ），  １．５２  （ｓ，  ３Ｈ），  １．２７  （ｄ，  Ｊ  ＝  ６．３  Ｈｚ，  ３Ｈ），  １．２２  （ｄｔ，  Ｊ  ＝  １２．７，  ６．３  Ｈｚ，  ６Ｈ），  ０．９５  （ｔ，  ���  ＝  ５．９  Ｈｚ，  ７Ｈ），  ０．７８  （ｓ，  ３Ｈ）．
【０３０２】
その全体が参照により本明細書に組み込まれる、ＷＯ２０１５／０３１３９６（例えば、実施例２、段落［００１０６］）に記載されている手順に基づいて、ＤＭ１を単一のジアステレオマーとして合成した。
（実施例２２）
抗体コンジュゲーションおよびコンジュゲートの特徴付け
【０３０３】
抗体コンジュゲーション
【０３０４】
５０ｍＭのＨＥＰＥＳ、１５０ｍＭのＮａＣｌ、ｐＨ８．０、および１０〜１５％（ｖ／ｖ）ＤＭＡ中の抗体（Ｈ４Ｈ１４６３９Ｄ、Ｈ４Ｈ１３３１２Ｐ、Ｈ４Ｈ１４６３５Ｄ、およびアイソタイプ対照；１０〜２０ｍｇ／ｍｌ）を、周囲温度で２時間、５〜６倍過剰量の、実施例２１に記載されるように調製したＳＭＣＣ−ＤＭ１ジアステレオマー（メイタンシノイドＡ）、またはメイタンシン３−Ｎ−メチル−Ｌ−アラニン−Ｎ−Ｍｅ−ベータ−アラニン−カルバミル−（ｐ−アミノ）ベンジル−シトルリン−バリン−アジポイル−スクシネート（化合物１、図２０）（メイタンシノイドＢ）とコンジュゲートした。コンジュゲートをサイズ排除クロマトグラフィーまたは徹底的な限外濾過によって精製し、滅菌濾過した。タンパク質濃度はＵＶスペクトル分析により決定した。サイズ排除ＨＰＬＣにより、使用した全てのコンジュゲートが９０％より多い単量体であることを立証し、ＲＰ−ＨＰＬＣにより非コンジュゲートリンカーペイロードが１％未満であることを立証した。全てのコンジュゲートした抗体は、リンカーペイロードローディング値について、Ｈａｍｂｌｅｔｔら（Ａｍｅｒｉｃａｎ  Ａｓｓｏｃｉａｔｉｏｎ  ｆｏｒ  Ｃａｎｃｅｒ  Ｒｅｓｅａｒｃｈ．２００４年１０月１５日；１０巻（２０号）：７０６３〜７０頁）に従って、ＵＶによって、および／または天然対コンジュゲートしたものの質量差によって分析した。ペイロード対抗体比は表２４に報告されている。
【表２４】
2020509027.tif 000111
液体クロマトグラフィー−質量分析によるコンジュゲートの特徴付け
【０３０５】
抗体上のリンカーペイロードのローディングを決定するために、コンジュゲートを脱グリコシル化し、ＬＣ−ＭＳによって分析した。
【０３０６】
アッセイのために、５０μｇのコンジュゲートをｍｉｌｌｉ−Ｑ水で最終濃度１ｍｇ／ｍＬに希釈した。１０μＬのＰＮＧａｓｅ  Ｆ溶液［ＰＮＧａｓｅ  Ｆ溶液を、１５０μＬのＰＮＧａｓｅ  Ｆストック（Ｎｅｗ  Ｅｎｇｌａｎｄ  Ｂｉｏｌａｂｓ、カタログ番号Ｐ０７０４Ｌ）および８５０μＬのｍｉｌｌｉ−Ｑ水を添加することによって調製し、十分に混合した］を希釈したコンジュゲート溶液に添加し、次いで、３７℃で一晩インキュベートした。各試料５μＬの注入をＬＣ−ＭＳ（Ｗａｔｅｒｓ  Ｓｙｎａｔ  Ｇ２−Ｓｉ）に行い、２５分かけて０．１ｍＬ／分の勾配移動相２０〜４０％で溶出した（移動相Ａ：Ｈ２Ｏ中０．１％ｖ／ｖ  ＦＡ；移動相Ｂ：アセトニトリル中０．１％ｖ／ｖ  ＦＡ）。ＬＣ分離は、８０℃のＷａｔｅｒｓ  Ａｃｑｕｉｔｙ  ＢＥＨ  Ｃ４カラム（１．０×５０ｍＭ、１．７μＭ）で達成した。
【０３０７】
質量分析スペクトルを、Ｍａｓｓｌｙｎｘソフトウェアを使用してデコンボリューションし、薬物対抗体比（ＤＡＲ）を以下の式を使用して計算した：
１．分布ピーク強度（ＰＩ）による薬物（Ｄｎ）の相対パーセンテージ（％）：
【数２】
2020509027.tif 000112
（ｎ＝０、１、２、３、…、ｉ）
２．平均ＤＡＲの計算：
【数３】
2020509027.tif 000113
（実施例２３）
コンジュゲートされたヒトモノクローナル抗ＭＥＴ（単一特異的および二重特異的）抗体の表面プラズモン共鳴に由来する結合親和性および動力学定数
【０３０８】
ＭＣＣ−ＤＭ１ジアステレオマー（メイタンシノイドＡ）またはメイタンシン３−Ｎ−メチル−Ｌ−アラニン−Ｎ−Ｍｅ−ベータ−アラニン−カルバミル−（ｐ−アミノ）ベンジル−シトルリン−バリン−アジポイル−スクシネート（化合物１、図２０）（メイタンシノイドＢ）のいずれかとコンジュゲートした抗ＭＥＴ抗体に対するＭＥＴ結合の平衡解離定数（ＫＤ値）は、Ｂｉａｃｏｒｅ  ２０００装置でリアルタイム表面プラズモン共鳴バイオセンサーアッセイを使用して決定した。Ｂｉａｃｏｒｅセンサー表面は、抗ＭＥＴ  ＡＤＣおよびヒト定常領域を含んで発現した親非修飾抗体を捕捉するための、モノクローナルマウス抗ヒトＦｃ抗体（ＧＥ  Ｈｅａｌｔｈｃａｒｅ、＃ＢＲ−１００８−３９）とのアミンカップリングによって誘導体化された。Ｂｉａｃｏｒｅ結合試験は、ＨＥＰＥＳ緩衝食塩水（ＨＢＳ）−ＥＰランニング緩衝液（０．０１ＭのＨＥＰＥＳ  ｐＨ  ７．４、０．１５ＭのＮａＣｌ、３ｍＭのＥＤＴＡ、０．０５％ｖ／ｖ界面活性剤Ｐ２０）中で実施した。Ｃ末端ｍｙｃ−ｍｙｃ−ヘキサヒスチジンタグを発現しているヒトＭＥＴ（ｈＭＥＴ−ｍｍｈ）を、実験室内で調製した。ＨＢＳ−ＥＰランニング緩衝液中で調製した（３０ｎＭ〜１．１ｎＭの範囲）の異なる濃度（３倍希釈）のｈＭＥＴ−ｍｍｈを、抗ＭＥＴ  ＡＤＣまたは抗体捕捉表面上に、４０μＬ／分の流速で注入した。捕捉されたＡＤＣおよびモノクローナル抗体のそれぞれに対するｈＭＥＴ−ｍｍｈの会合を４分間モニターした。続いて、ｈＭＥＴ−ｍｍｈ解離をＨＢＳ−ＥＰランニング緩衝液中で６分間モニターした。抗ヒトＦｃ表面を、２０ｍＭのＨ３ＰＯ４の短時間の注入によって再生した。全ての結合動力学実験は２５℃で実施した。
【０３０９】
動力学的結合速度定数（ｋａ）および解離速度定数（ｋｄ）は、Ｓｃｒｕｂｂｅｒ  ２．０ｃ曲線フィッティングソフトウェアを使用してリアルタイムセンサーグラムを１：１結合モデルにフィッティングすることにより決定した。全てのセンサーグラムは、対応する分析物センサーグラムからバッファー注入センサーグラムシグナルを差し引くことによって二重に参照され、それによって捕捉表面からの抗体の解離によって引き起こされたアーチファクトを除去した。結合解離平衡定数（ＫＤ）および解離半減期（ｔ１／２）は、以下のように動力学的速度定数から計算した：
【数４】
2020509027.tif 000114
【０３１０】
メイタンシノイドＡまたはメイタンシノイドＢとコンジュゲートした抗Ｍｅｔ単一特異的抗体および二重特異的抗体についての結合動力学的パラメーター（ｂｉｎｄｉｎｇ  ｋｉｎｅｔｉｃ  ｐａｒａｍｅｔｅｒ）を下記の表２５に示し、いくつかの実験は二重で実施した。
【表２５】
2020509027.tif 000115
（実施例２４）
抗ＭＥＴ抗体薬物コンジュゲート（ＡＤＣ）のｉｎ  ｖｉｔｒｏでの効力
【０３１１】
本明細書に記載される抗ＭＥＴ抗体薬物コンジュゲート（ＡＤＣ）の相対細胞殺滅効力を決定するために、細胞殺滅アッセイを、様々なレベルの内因性ＭＥＴを発現する複数の細胞株に対して実施した。ＥＢＣ−１（Ｒｉｋｅｎ  Ｃｅｌｌ  Ｂａｎｋ；＃ＲＢＲＣ−ＲＣＢ１９６５）、ＭＫＮ−４５（ＪＣＲＢ；＃ＪＣＲＢ０２５４）、ＮＣＩ−Ｈ１９９３（ＡＴＣＣ；＃ＣＲＬ−５９０９）、およびＪ．ＲＴ３（ＡＴＣＣ；＃ＴＩＢ−１５３）細胞株は、ＲＰＭＩ＋１０％ＦＢＳ＋１×ペニシリン／ストレプトマイシン／Ｌ−グルタミン（Ｐ／Ｓ／Ｇ）中で維持され、ＳＮＵ−５（ＡＴＣＣ；＃ＣＲＬ−５９７３）は、Ｉｓｃｏｖｅ＋１０％ＦＢＳ＋１×Ｐ／Ｓ／Ｇ中で維持され、Ｈｓ７４６ｔ（ＡＴＣＣ；＃ＨＴＢ−１３５）およびＨＥＫ２９３（ＡＴＣＣ；＃００３０４１）は、ＤＭＥ＋１０％ＦＢＳ＋１×Ｐ／Ｓ／Ｇ中で維持され、ＭＤＡ−ＭＢ−２３１（ＡＴＣＣ；＃ＨＴＢ−２６）は、リーボウィッツＬ−１５＋１０％ＦＢＳ＋１×Ｐ／Ｓ／Ｇ＋１×非必須アミノ酸（ＮＥＡＡ）中でＣＯ２なしで維持され、Ｕ８７ＭＧ（ＡＴＣＣ；＃ＨＴＢ−１４）は、ＭＥＭアール塩＋１５％ＦＢＳ＋１×Ｐ／Ｓ／Ｇ＋１×ＮＥＡＡ中で維持され、Ｔ４７Ｄ（ＡＴＣＣ；＃ＨＴＢ−１３３）は、ＲＰＭ１  １６４０＋１０％ＦＢＳ＋１×Ｐ／Ｓ／Ｇ＋１０ｍＭのＨＥＰＥＳ＋１ｍＭのピルビン酸ナトリウム＋１０μｇ／ｍｌのウシインスリン中で維持され、Ａ５４９（ＡＴＣＣ；＃ＣＣＬ−１８５）は、Ｋａｉｇｈｎの栄養素混合物Ｆ−１２（ＨＡＭ  Ｆ−１２Ｋ）＋１０％ＦＢＳ＋１×Ｐ／Ｓ／Ｇ中で維持された。
【０３１２】
最初に、抗ＭＥＴ抗体の相対的結合を、フローサイトメトリーによって細胞株のパネル全体にわたって、コンジュゲートしていないＨ４Ｈ１４６３５Ｄ、Ｈ４Ｈ１４６３９ＤおよびＨ４Ｈ１３３１２Ｐ２抗体を使用して評価した。手短に述べると、１×１０６の細胞を、ＰＢＳ＋２％ＦＢＳ（ＦＡＣＳ緩衝液）中で、１０μｇ／ｍｌのＨ４Ｈ１４６３５Ｄ、Ｈ４Ｈ１４６３９Ｄ、Ｈ４Ｈ１３３１２Ｐ２、またはアイソタイプ対照抗体（ＲＥＧＮ１９４５）と共に氷上で３０分間インキュベートした。ＦＡＣＳ緩衝液で１回洗浄した後、細胞を１０μｇ／ｍｌのＡｌｅｘａ６４７コンジュゲート抗ヒト二次抗体（Ｊａｃｋｓｏｎ  ＩｍｍｕｎｏＲｅｓｅａｒｃｈ、＃１０９−６０６−１７０）と共に氷上で３０分間インキュベートした。ＦＡＣＳ緩衝液でさらに１回洗浄した後、試料をＣｙｔｏｆｉｘ（ＢＤ  Ｂｉｏｓｃｉｅｎｃｅｓ、＃５５４６５５）で固定し、ＦＡＣＳ緩衝液で濾過し、ｉＱｕｅフローサイトメーター（Ｉｎｔｅｌｉｃｙｔｅ）で実施した。平均蛍光強度（ＭＦＩ）データは、ＦｌｏｗＪｏソフトウェア（ＦｌｏｗＪｏ  ＬＬＣ）を使用して決定した。ＦＡＣＳ結合は、アイソタイプ対照レベルを上回るＭＦＩ結合の倍数として表し、結果を表２６に要約する。３つの抗Ｍｅｔ抗体の相対的結合は各細胞株で同程度であり、そしてアイソタイプ対照より４４７倍〜７倍の範囲であった。試験した３つの抗ＭＥＴ抗体のいずれの検出可能な結合も、Ｔ４７Ｄ、ＨＥＫ２９３、またはＪ．ＲＴ３細胞で観察されなかった。
【０３１３】
抗ＭＥＴ  ＡＤＣのｉｎ  ｖｉｔｒｏ細胞毒性を測定するために、ＡＤＣによる３日間または６日間の処理後の核数を評価した。手短に述べると、細胞を、７５０〜３０００細胞／ウェルで９６ウェルコラーゲンコートプレート（Ｇｒｅｉｎｅｒ、ＶＷＲ；＃８２０５０−８１２）中の完全成長培地中に播種し、５％ＣＯ２中、３７°Ｃで一晩成長させた。細胞生存率曲線については、段階希釈したＡＤＣ、コンジュゲートしていない抗体、または遊離ペイロードを１００ｎＭ〜０．０１ｎＭ（毒素濃度に基づく）の範囲の最終濃度で細胞に添加し、５％ＣＯ２中に３７℃で３〜６日間インキュベートした。続いて細胞を４％ホルムアルデヒドで固定して３μｇ／ｍｌのＨｏｅｃｈｓｔ  ３３３４２核染色（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ、＃Ｈ３５７０）で処理した。ＩｍａｇｅＸｐｒｅｓｓ  ｍｉｃｒｏ  ＸＬ（Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｄｅｖｉｃｅｓ、Ｓｕｎｎｙｖａｌｅ、ＣＡ）で画像を取得し、ＭｅｔａＸｐｒｅｓｓ  ｉｍａｇｅ  ａｎａｌｙｓｉｓソフトウェア（Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｄｅｖｉｃｅｓ、Ｓｕｎｎｙｖａｌｅ、ＣＡ）によって核数を決定した。４０ｎＭのジギトニンで処理した細胞からのバックグラウンド核数を全てのウェルから差し引き、生存率を未処理対照に対するパーセンテージとして表した。ＩＣ５０値は、１０点反応曲線にわたって４パラメーターロジスティック方程式から決定した（ＧｒａｐｈＰａｄ  Ｐｒｉｓｍ）。各用量反応曲線についての未処理の条件も分析に含まれ、最低用量として表す。ＩＣ５０値および細胞殺滅パーセントを表２７および２８に示す。
【０３１４】
表２７に要約するように、抗ＭＥＴ抗体−薬物コンジュゲートＨ４Ｈ１４６３９Ｄ−メイタンシノイドＡは、Ｍｅｔ増幅ＥＢＣ−１、ＳＮＵ−５、ＭＫＮ−４５、ＮＣＩ−Ｈ１９９３、およびＨｓ７４６ｔ細胞バックグラウンドにおいて細胞生存率を０．３５ｎＭ〜０．９６ｎＭの範囲のＩＣ５０値で特異的に減少させた。殺滅された細胞のパーセンテージ（最大殺滅％）は、７３％〜１００％の範囲であった。Ｈ４Ｈ１４６３９Ｄ−メイタンシノイドＡはまた、１３．９１ｎＭのＩＣ５０値で、８４％のＡ５４９細胞を特異的に殺滅した。Ｈ４Ｈ１４６３９Ｄ−メイタンシノイドＡのＩＣ５０値は、低発現（ＭＤＡ−ＭＢ−２３１およびＵ８７ＭＧ）、および非発現（Ｔ４７Ｄ、ＨＥＫ２９３、およびＪ．ＲＴ３）細胞株において３７ｎＭより大きかった。同様にコンジュゲートしたアイソタイプ対照抗体は、３５ｎＭより大きいＩＣ５０値で全ての細胞株を殺滅した。ＤＭ１のメチルジスルフィドバージョン（ＭｅＳ−ＤＭ１）は、試験した全ての株を０．０７ｎＭ〜２．８６ｎＭの範囲のＩＣ５０値で殺滅した。
【０３１５】
別の実験では、３つの抗Ｍｅｔ抗体（Ｈ４Ｈ１４６３９Ｄ、Ｈ４Ｈ１４６３５Ｄ、およびＨ４Ｈ１３３１２Ｐ２）をメイタンシノイドＡまたはメイタンシノイドＢのメイタンシノイドペイロードにコンジュゲートし、６日間の処理後にｉｎ  ｖｉｔｒｏ細胞毒性をＥＢＣ−１、Ｈｓ７４６ｔ、Ａ５４９、およびＴ４７Ｄ細胞で評価した。表２８に要約するように、全ての抗Ｍｅｔ抗体−薬物コンジュゲートは、ＥＢＣ−１細胞で１０ｐＭ、Ｈｓ７４６ｔ細胞で０．８２ｎＭ、およびＡ５４９細胞で３．５ｎＭという低いＩＣ５０値で、Ｍｅｔ陽性細胞の細胞生存率を強力かつ特異的に減少させた。殺滅した細胞のパーセンテージは、ＥＢＣ−１細胞で９５％より大きく、Ｈｓ７４６ｔ細胞で８６％より大きく、そしてＡ５４９細胞で７２％より大きかった。Ｔ４７Ｄ細胞（Ｍｅｔ陰性）は、抗Ｍｅｔ  ＡＤＣによって特異的に殺滅されなかった。同様にコンジュゲートしたアイソタイプ対照抗体は、試験した細胞株全てにおいて、ＥＢＣ−１細胞で５ｎＭより大きい、Ｈｓ７４６ｔ細胞で３３ｎＭより大きい、Ａ５４９およびＴ４７Ｄ細胞で９０ｎＭより大きいＩＣ５０値で細胞生存率を減少させた。コンジュゲートしていないＨ４Ｈ１４６３９Ｄは、ＥＢＣ−１、Ｈｓ７４６ｔ、およびＡ５４９細胞において細胞生存率を減少させたが、コンジュゲート抗体よりも低いパーセンテージであった。コンジュゲートしていないＨ４Ｈ１４６３５ＤおよびＨ４Ｈ１３３１２Ｐ２は、試験した細胞株のいずれにおいても生存率にほとんどまたは全く影響を及ぼさなかった。ＤＭ１のメチルジスルフィドバージョン（ＭｅＳ−ＤＭ１）は、試験した全ての株を０．１２ｎＭ〜１．３９ｎＭの範囲のＩＣ５０値で殺滅した。対照的に、Ｍ２４（メイタンシノイドＢから放出されたペイロード）は、１００ｎＭより大きいＩＣ５０で細胞を殺滅した。
【表２６】
2020509027.tif 000116
【表２７】
2020509027.tif 000117
【表２８】
2020509027.tif 000118
（実施例２５）
胃がん細胞に対するｉｎ  ｖｉｖｏでの有効性
【０３１６】
３００万のＨｓ７４６Ｔ胃がん細胞を、Ｃ．Ｂ．−１７  ＳＣＩＤマウスの側腹部に皮下移植した。腫瘍体積がおよそ１５０ｍｍ３に達すると、マウスを無作為に６匹の群に分け、１０ｍｇ／ｋｇの対照抗体ＲＥＧＮ１９４５−メイタンシノイドＢもしくはＲＥＧＮ１９４５−メイタンシノイドＡ、または３もしくは１０ｍｇ／ｋｇのＨ４Ｈ１４６３９Ｄ−メイタンシノイドＡ、もしくはＨ４Ｈ１４６３９Ｄ−メイタンシノイドＢで処置した。全ての抗体を週に１回の頻度で３回投与した。腫瘍成長を、移植後３７日間モニターした。
【０３１７】
免疫不全マウスにおけるヒト腫瘍異種移植片の成長に対するＨ４Ｈ１４６３９Ｄ−メイタンシノイドＡまたはＨ４Ｈ１４６３９Ｄ−メイタンシノイドＢの効果を評価し、結果を表２９に示す。対照抗体ＲＥＧＮ１９４５−メイタンシノイドＢまたはＲＥＧＮ１９４５−メイタンシノイドＡで処置した腫瘍は、２０日以内にプロトコールのサイズ限界に達するまで成長した。３ｍｇ／ｋｇのＨ４Ｈ１４６３９Ｄ−メイタンシノイドＡで処置した腫瘍は、２７日以内にプロトコールのサイズ限界に達するまで成長した。３ｍｇ／ｋｇのＨ４Ｈ１４６３９Ｄ−メイタンシノイドＢで処置した腫瘍の成長は実験期間中阻害された。１０ｍｇ／ｋｇのＨ４Ｈ１４６３９Ｄ−メイタンシノイドＡまたはＨ４Ｈ１４６３９Ｄ−メイタンシノイドＢによる腫瘍の処置は、処置の開始時と比較して腫瘍サイズの退縮を誘導した。
【表２９】
2020509027.tif 000119
（実施例２６）
肺がん細胞に対するｉｎ  ｖｉｖｏでの有効性
【０３１８】
５００万のＥＢＣ１肺がん細胞を、Ｃ．Ｂ．−１７  ＳＣＩＤマウスの側腹部に皮下移植した。腫瘍体積がおよそ１７０ｍｍ３に達すると、マウスを無作為に６匹の群に分け、１５ｍｇ／ｋｇの対照抗体ＲＥＧＮ１９４５−メイタンシノイドＢ、または２．５、５、１０、もしくは１５ｍｇ／ｋｇのＨ４Ｈ１４６３９Ｄ−メイタンシノイドＢで処置した。抗体を週に１回の頻度で２回投与した。腫瘍成長を、移植後７３日間モニターした。
【０３１９】
免疫不全マウスにおけるヒト腫瘍異種移植片の成長に対するＨ４Ｈ１４６３９Ｄの効果を評価した。対照抗体ＲＥＧＮ１９４５−メイタンシノイドＢで処置した腫瘍は、２４日以内にプロトコールのサイズ限界に到達するまで成長した（ＩＡＣＵＣプロトコールは、直径２ｃｍを超えるおよそ１５００ｍｍ３の腫瘍を有する動物の屠殺を要求する）。２．５、５、１０、または１５ｍｇ／ｋｇのＨ４Ｈ１４６３９Ｄ−メイタンシノイドＢによる腫瘍の処置は、処置の開始時と比較して腫瘍サイズの退縮を誘導した。結果を表３０に示す。
【表３０】
2020509027.tif 000120
（実施例２６）
患者由来のＮＳＣＬＣ腫瘍に対するｉｎ  ｖｉｖｏでの有効性
【０３２０】
Ｍｅｔ発現ＮＳＣＬＣであるＣＴＧ−０１６５患者由来腫瘍をｎｕ／ｎｕヌードマウスの側腹部に皮下移植した。腫瘍体積がおよそ１５０ｍｍ３に達すると、マウスを無作為に６匹の群に分け、１０ｍｇ／ｋｇの対照抗体ＲＥＧＮ１９４５−メイタンシノイドＢもしくはＲＥＧＮ１９４５−メイタンシノイドＡ、または３もしくは１０ｍｇ／ｋｇのＨ４Ｈ１４６３９Ｄ−メイタンシノイドＡ、もしくはＨ４Ｈ１４６３９Ｄ−メイタンシノイドＢで処置した。全ての抗体を週に１回の頻度で３回投与した。腫瘍成長を、移植後６１日間モニターした。
【０３２１】
免疫不全マウスにおけるヒト腫瘍異種移植片の成長に対するＨ４Ｈ１４６３９Ｄ−メイタンシノイドＡまたはＨ４Ｈ１４６３９Ｄ−メイタンシノイドＢの効果を評価した。対照抗体ＲＥＧＮ１９４５−メイタンシノイドＡまたはＲＥＧＮ１９４５−メイタンシノイドＢで処置した腫瘍は、２７日以内にプロトコールのサイズ限界に達するまで成長した。３ｍｇ／ｋｇのＨ４Ｈ１４６３９Ｄ−メイタンシノイドＡまたはＨ４Ｈ１４６３９Ｄ−メイタンシノイドＢで処置した腫瘍の成長は２７日間阻害された。１０ｍｇ／ｋｇのＨ４Ｈ１４６３９Ｄ−メイタンシノイドＡまたはＨ４Ｈ１４６３９Ｄ−メイタンシノイドＢによる腫瘍の処置は、処置の開始時と比較して腫瘍サイズの退縮を誘導した。データを表３１に提供する。
【表３１】
2020509027.tif 000121
（実施例２７）
ヒトＭＥＴに対する抗Ｍｅｔ抗体Ｈ４Ｈ１３３１２Ｐ２、Ｈ４Ｈ１３３０６Ｐ２およびＨ４Ｈ１４６３９Ｄの結合の、水素／重水素（Ｈ／Ｄ）交換に基づくエピトープマッピング
【０３２２】
抗Ｍｅｔ抗体Ｈ４Ｈ１３３１２Ｐ２、Ｈ４Ｈ１３３０６Ｐ２、およびＨ４Ｈ１４６３９Ｄと相互作用する、ヒト肝細胞成長因子受容体外部ドメイン（配列番号１５５：ｍｙｃ−ｍｙｃ−ヘキサヒスチジン（．ｍｍｈ）タグと共に発現したヒトＭｅｔアイソフォーム１（Ｕｎｉｐｒｏｔ  ＩＤ：Ｐ０８５８１）、以下ｈＭｅｔと呼ぶ）の特異的な領域を決定するための実験を行った。Ｈ４Ｈ１３３１２Ｐ２およびＨ４Ｈ１３３０６Ｐ２は二価単一特異的抗Ｍｅｔ抗体であり；Ｈ４Ｈ１４６３９Ｄは、各々それぞれＨ４Ｈ１３３１２Ｐ２およびＨ４Ｈ１３３０６Ｐ２に由来する、Ｍｅｔ上の別個のエピトープに結合する２本の重鎖およびユニバーサル軽鎖を含む二重特異的抗体である。（実施例５を参照されたい）。
【０３２３】
質量分析法を使用した水素／重水素（Ｈ／Ｄ）交換エピトープマッピング（ＨＤＸ−ＭＳ）を利用して、上記の抗体の結合エピトープを決定した。ＨＤＸ方法の一般的な説明は、例えば、Ｅｈｒｉｎｇ（１９９９年）Ａｎａｌｙｔｉｃａｌ  Ｂｉｏｃｈｅｍｉｓｔｒｙ、２６７巻（２号）：２５２〜２５９頁；ならびにＥｎｇｅｎおよびＳｍｉｔｈ（２００１年）Ａｎａｌ．  Ｃｈｅｍ．７３巻：２５６Ａ〜２６５Ａ頁に記載されている。
実験手順
【０３２４】
ＨＤＸによるｈＭＥＴ上の抗Ｍｅｔ抗体Ｈ４Ｈ１３３１２Ｐ２、Ｈ４Ｈ１３３０６Ｐ２およびＨ４Ｈ１４６３９Ｄの結合エピトープ（複数可）をマッピングするために、個々の抗体をＮＨＳ活性化Ｓｅｐｈａｒｏｓｅ  ４  Ｆａｓｔ  Ｆｌｏｗビーズ（ＧＥ  Ｈｅａｌｔｈｃａｒｅ、Ｐｉｔｔｓｂｕｒｇｈ、ＰＡ）に別々に共有結合により結合させた。抗Ｍｅｔ抗体の結合エピトープを確認するために、以下に記載されるように、「抗原上（Ｏｎ−Ａｎｔｉｇｅｎ）」および「複合体上（Ｏｎ−Ｃｏｍｐｌｅｘ）」の２つの方法を利用した。
【０３２５】
「抗原上」実験条件において、ｈＭＥＴは、Ｄ２Ｏでに調製したＰＢＳ緩衝液中で、５．０分間または１０．０分間重水素化した。重水素化抗原を、短時間のインキュベーションによってＨ４Ｈ１３３１２Ｐ２またはＨ４Ｈ１３３０６Ｐ２抗体ビーズに結合させ、次いで、氷冷低ｐＨクエンチ緩衝液によってビーズから溶出した。溶出した試料を、統合型のオンラインペプチド消化、トラッピング、９．０分の液体クロマトグラフィー（ＬＣ）分離、およびＳｙｎａｐｔ  Ｇ２−Ｓｉ  ＭＳデータ取得からなるＷａｔｅｒｓ  Ｈ／ＤＸ−ＭＳシステムに手動でロードした。
【０３２６】
「複合体上」実験条件において、ｈＭＥＴを、最初にＨ４Ｈ１３３１２Ｐ２またはＨ４Ｈ１３３０６Ｐ２ビーズに結合させ、次いで、Ｄ２Ｏで調製したＰＢＳ緩衝液中で、インキュベーションにより５．０分間または１０．０分間重水素化した。重水素化ｈＭＥＴを溶出し、そして上記のようにＷａｔｅｒｓ  Ｈ／ＤＸ−ＭＳシステムにより分析した。
【０３２７】
ｈＭＥＴからの消化性ペプチドの同定のために、重水素化されていない試料からのＬＣ−ＭＳＥデータを処理し、Ｗａｔｅｒｓ  ＰｒｏｔｅｉｎＬｙｎｘ  Ｇｌｏｂａｌ  Ｓｅｒｖｅｒ（ＰＬＧＳ）ソフトウェアを使用してヒトＭＥＴに対して検索した。同定されたペプチドをＤｙｎａｍＸ  ３．０ソフトウェアにインポートし、次の２つの基準でフィルタリングした：１）アミノ酸あたりの最小積は０．３；２）複製ファイルの閾値は３．０。その後、ＤｙｎａｍＸ  ３．０ソフトウェアは、５分間と１０分間の重水素化の両方の時点にわたって、同定された各ペプチドの「抗原上」と「複合体上」との間の重水素取り込み差を自動的に計算した。重心値計算のためにＤｙｎａｍＸソフトウェアによってピックアップされた各ペプチドの個々の同位体ピークもまた、重水素取り込み計算の正確さを確実にするために手動で調べられた。
【０３２８】
一般に、０．２を上回る重水素化についてのデルタ値は、特異的結合エピトープを決定するためのカットオフ点として使用された。
結果
【０３２９】
Ｈ４Ｈ１３３１２Ｐ２抗体ビーズを使用したとき、９．０分のＬＣ−ＭＳＥデータ取得と併用したＷａｔｅｒｓ  Ｅｎｚｙｍａｔｅ（商標）ＢＥＨペプシンカラム（２．１  ｘ  ３０  ｍｍ，  ５  μｍ）によるオンラインペプシン消化を使用して、ヒトＭＥＴから全部で１６２個の消化性ペプチドを、「抗原上」と「複合体上」との両方の実験における追跡可能な重水素取り込みによって、再現可能に同定した。これらのペプチドは、５５．７％の配列のカバー率を表す。これら全てのペプチドのうちで、抗原単独の重水素化（「抗原上」）と比較して、Ｈ４Ｈ１３３１２Ｐ２結合の際（「複合体上」）、５個のみが重水素取り込み（ｄｅｕｔｅｒａｔｉｏｎ  ｕｐｔａｋｅ）が有意に減少したことが見出された。両方の実験条件下でのこれら５個のペプチドの重心値を、表３２に記した。これらの５個のペプチドによってカバーされる残基１９２〜２０４に対応する領域を、ＨＤＸデータに基づいて抗体Ｈ４Ｈ１３３１２Ｐ２に対する結合エピトープとして定義した。
【表３２】
2020509027.tif 000122
【０３３０】
Ｈ４Ｈ１３３０６Ｐ２抗体ビーズを使用して実施されたＨＤＸ実験について、ｈＭＥＴ由来の全部で９８個の消化性ペプチドが、「抗原上」と「複合体上」との両方の実験における追跡可能な重水素取り込みによって、再現可能に同定された。これらの９８個のペプチドは、５２．１％の配列のカバー率を表す。これら全てのペプチドのうちで、抗原単独の重水素化（「抗原上」）と比較して、Ｈ４Ｈ１３３０６Ｐ２結合の際（「複合体上」）、１２個が、重水素取り込みが有意に減少したことが観察された。両方の実験条件下でのこれら１２個のペプチドの重心値を、表３３に記した。これらのペプチドによってカバーされる残基３０５〜３１５および残基４２１〜４５５に対応する領域は、ＨＤＸデータに基づいて抗体Ｈ４Ｈ１３３０６Ｐ２に対する結合エピトープとして定義した。
【表３３】
2020509027.tif 000123
【０３３１】
上に概説されたのと同一の方法論を使用して、二重特異的抗Ｍｅｔ抗体Ｈ４Ｈ１４６３９Ｄについての結合エピトープを決定した。この方法論によって決定されたｈＭＥＴ上のＨ４Ｈ１４６３９Ｄの結合エピトープは、親抗体について決定されたエピトープに対応する。
【０３３２】
抗Ｍｅｔ抗体Ｈ４Ｈ１３３１２Ｐ２の結合エピトープ：配列番号１５５のアミノ酸１９２〜２０４：ＶＲＲＬＫＥＴＫＤＧＦＭＦ（配列番号１５６）。
【０３３３】
抗Ｍｅｔ抗体Ｈ４Ｈ１３３０６Ｐ２の結合エピトープ：配列番号１５５のアミノ酸３０５〜３１５：ＬＡＲＱＩＧＡＳＬＮＤ（配列番号１５７）および配列番号１５５のアミノ酸４２１〜４５５：ＦＩＫＧＤＬＴＩＡＮＬＧＴＳＥＧＲＦＭＱＶＶＶＳＲＳＧＰＳＴＰＨＶＮＦ（配列番号１５８）。
【０３３４】
本発明は、本明細書に記載されている具体的な実施形態による範囲内に限定されるべきではない。実際に、本発明の様々な修正が、本明細書に記載されているものに加えて、前述の記載および添付の図面から、当業者には明らかになるであろう。係る修正は、添付の特許請求の範囲内に収まることを企図する。
【図１】
2020509027.tif 000151
【図２】
2020509027.tif 000152
【図３】
2020509027.tif 000153
【図４】
2020509027.tif 000154
【図５】
2020509027.tif 000155
【図６】
2020509027.tif 000156
【図７】
2020509027.tif 000157
【図８】
2020509027.tif 000158
【図９】
2020509027.tif 000159
【図１０】
2020509027.tif 000160
【図１１】
2020509027.tif 000161
【図１２】
2020509027.tif 000162
【図１３】
2020509027.tif 000163
【図１４】
2020509027.tif 000164
【図１５】
2020509027.tif 000165
【図１６Ａ】
2020509027.tif 000166
【図１６Ｂ】
2020509027.tif 000167
【図１７】
2020509027.tif 000168
【図１８】
2020509027.tif 000169
【図１９】
2020509027.tif 000170
【図２０】
2020509027.tif 000171
【配列表】
2020509027000001.app
【国際調査報告】
2020509027.tif 000172
2020509027.tif 000173
2020509027.tif 000174
2020509027.tif 000175
2020509027.tif 000176
2020509027.tif 000177
2020509027.tif 000178