(57)【要約】  本明細書に記載されるのは、少なくとも１つの第１のポリペプチドと少なくとも１つの第２のポリペプチドを含むヘテロダイマーであって、ここで第１のポリペプチドと第２のポリペプチドは界面で出会い、第１のポリペプチドの界面は、第２のポリペプチドの界面にある設計された腔に配置することができる設計された隆起を含み；および、（ｉ）第１のポリペプチドは、ＭＨＣクラスＩＩα１ドメイン、ＭＨＣクラスＩＩα２ドメイン、またはそれらの組み合わせを含み；および、第２のポリペプチドは、ＭＨＣクラスＩＩβ１ドメイン、ＭＨＣクラスＩＩβ２ドメイン、またはそれらの組み合わせを含み；または、（ｉｉ）第１のポリペプチドは、ＭＨＣクラスＩＩβ１ドメイン、ＭＨＣクラスＩＩβ２ドメイン、またはそれらの組み合わせを含み；および、第２のポリペプチドは、ＭＨＣクラスＩＩα１ドメイン、ＭＨＣクラスＩＩα２ドメイン、またはそれらの組み合わせを含む。【選択図】図３
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【特許請求の範囲】
【請求項１】
少なくとも１つの第１のポリペプチドと少なくとも１つの第２のポリペプチドを含む単離されたヘテロダイマーであって、ここで第１のポリペプチドと第２のポリペプチドは界面で出会い、第１のポリペプチドの界面は、第２のポリペプチドの界面にある設計された腔に配置することができる設計された隆起を含み；および、
（ｉ）第１のポリペプチドは、ＭＨＣクラスＩＩα１ドメイン、ＭＨＣクラスＩＩα２ドメイン、またはそれらの組み合わせを含み；および、第２のポリペプチドは、ＭＨＣクラスＩＩβ１ドメイン、ＭＨＣクラスＩＩβ２ドメイン、またはそれらの組み合わせを含み；または、
（ｉｉ）第１のポリペプチドは、ＭＨＣクラスＩＩβ１ドメイン、ＭＨＣクラスＩＩβ２ドメイン、またはそれらの組み合わせを含み；および、第２のポリペプチドは、ＭＨＣクラスＩＩα１ドメイン、ＭＨＣクラスＩＩα２ドメイン、またはそれらの組み合わせを含む、
単離されたヘテロダイマー。
【請求項２】
隆起は１つ以上の非天然のアミノ酸残基を含む、請求項１に記載の単離されたヘテロダイマー。
【請求項３】
隆起は、フェニルアラニン、アルギニン、チロシン、トリプトファン、およびシステインから選択される１つ以上のアミノ酸を含む、請求項１または２に記載の単離されたヘテロダイマー。
【請求項４】
単離されたヘテロダイマーの第１または第２のポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：５３に記載のアミノ酸配列と少なくとも８０％同一であるアミノ酸配列を含む、請求項１から３のいずれか１つに記載の単離されたヘテロダイマー。
【請求項５】
単離されたヘテロダイマーの第１または第２のポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：５４に記載のアミノ酸配列と少なくとも８０％同一であるアミノ酸配列を含む、請求項４に記載の単離されたヘテロダイマー。
【請求項６】
単離されたヘテロダイマーの第１または第２のポリペプチドはＣＨ３ドメインを含み、およびＣＨ３ドメインは、Ｓ３５４Ｃ、Ｔ３６６Ｗ、およびＳ３５４ＣとＴ３６６Ｗの両方（ＥＵの番号付け）から成るリストから選択される少なくとも１つの突然変異を含む、請求項１に記載の単離されたヘテロダイマー。
【請求項７】
腔は非天然のアミノ酸残基を含む、請求項１に記載の単離されたヘテロダイマー。
【請求項８】
腔は、アラニン、セリン、トレオニン、バリン、およびシステインから選択される１つ以上のアミノ酸を含む、請求項１または７に記載の単離されたヘテロダイマー。
【請求項９】
単離されたヘテロダイマーの第１または第２のポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：５１に記載のアミノ酸配列と少なくとも８０％同一であるアミノ酸配列を含む、請求項１、７、または８のいずれか１つに記載の単離されたヘテロダイマー。
【請求項１０】
単離されたヘテロダイマーの第１または第２のポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：５２に記載のアミノ酸配列と少なくとも８０％同一であるアミノ酸配列を含む、請求項９に記載の単離されたヘテロダイマー。
【請求項１１】
単離されたヘテロダイマーの第１または第２のポリペプチドはＣＨ３ドメインを含み、およびＣＨ３ドメインは、Ｙ３４９Ｃ、Ｔ３６６Ｓ、Ｌ３６８Ａ、Ｙ４０７Ｖ（ＥＵの番号付け）、およびそれらの組み合わせから成るリストから選択される少なくとも１つの突然変異を含む、請求項１に記載の単離されたヘテロダイマー。
【請求項１２】
第１のポリペプチドまたは第２のポリペプチドの一方または両方は、異種の二量体化ドメインを含まない、請求項１から１１のいずれか１つに記載の単離されたヘテロダイマー。
【請求項１３】
第１のポリペプチドまたは第２のポリペプチドの一方または両方は、ロイシンジッパーを含まない、請求項１から１１のいずれか１つに記載の単離されたヘテロダイマー。
【請求項１４】
第１のポリペプチドまたは第２のポリペプチドの一方または両方は、部位特異性のビオチン化部位を含まない、請求項１から１１のいずれか１つに記載の単離されたヘテロダイマー。
【請求項１５】
自己免疫疾患関連の抗原をさらに含む、請求項１から１４のいずれか１つに記載の単離されたヘテロダイマー。
【請求項１６】
自己免疫疾患関連の抗原は、少なくとも１１のアミノ酸の長さのポリペプチドを含む、請求項１５に記載の単離されたヘテロダイマー。
【請求項１７】
自己免疫疾患関連の抗原は、柔軟なリンカーによってＭＨＣクラスＩＩα１ドメインまたはＭＨＣクラスＩＩβ１ドメインに結合される、請求項１５または１６に記載の単離されたヘテロダイマー。
【請求項１８】
抗原は、抗原ペプチドに関連するシステインアミノ酸と、ＭＨＣクラスＩＩα１ドメインまたはＭＨＣクラスＩＩβ１ドメインのシステインアミノ酸との間に形成されたジスルフィド結合によって、ＭＨＣクラスＩＩα１ドメインまたはＭＨＣクラスＩＩβ１ドメインに共有結合で結合される、請求項１５から１７のいずれか１つに記載の単離されたヘテロダイマー。
【請求項１９】
ＭＨＣクラスＩＩα１ドメインまたはＭＨＣクラスＩＩβ１ドメインのシステインアミノ酸は、ＭＨＣクラスＩＩ結合溝の一部を形成する残基の１０アミノ酸内にある、請求項１８に記載の単離されたヘテロダイマー。
【請求項２０】
ＭＨＣクラスＩＩα１ドメインまたはＭＨＣクラスＩＩβ１ドメインのシステイン残基は、ＭＨＣクラスＩＩ結合溝の一部を形成する残基の３アミノ酸内にある、請求項１９に記載の単離されたヘテロダイマー。
【請求項２１】
ＭＨＣクラスＩＩα１ドメインまたはＭＨＣクラスＩＩβ１ドメインのシステインアミノ酸は、ＭＨＣクラスＩＩα１ドメインまたはＭＨＣクラスＩＩβ１ドメインの天然の配列に導入されている、請求項１８から２０のいずれか１つに記載の単離されたヘテロダイマー。
【請求項２２】
自己免疫疾患を診断された、または自己免疫疾患を患っている疑いのある個体の処置に使用するための、請求項１から２１のいずれか１つに記載の単離されたヘテロダイマー。
【請求項２３】
請求項１から２１のいずれか１つに記載の第１または第２のポリペプチドをコードするポリヌクレオチド。
【請求項２４】
請求項２３に記載のポリヌクレオチドの配列を含む宿主細胞。
【請求項２５】
ポリヌクレオチドはゲノムに安定的に統合される、請求項２４に記載の宿主細胞。
【請求項２６】
少なくとも１つのヘテロダイマーは、ヘテロダイマー・ナノ粒子結合体を形成するためにナノ粒子に結合され、ここでナノ粒子は非リポソームであり、および／またはソリッドコアを有する、請求項１から２１のいずれか１つに記載の単離されたヘテロダイマー。
【請求項２７】
ソリッドコアは、金、鉄、または酸化鉄のコアである、請求項２６に記載のヘテロダイマー・ナノ粒子結合体。
【請求項２８】
ソリッドコアの直径は１００ナノメートル未満である、請求項２６または２７に記載のヘテロダイマー・ナノ粒子結合体。
【請求項２９】
少なくとも１つのヘテロダイマーはナノ粒子に共有結合で連結される、請求項２６から２８のいずれか１つに記載のヘテロダイマー・ナノ粒子結合体。
【請求項３０】
少なくとも１つのヘテロダイマーは、ポリエチレングリコール（ＰＥＧ）を含むリンカーによってナノ粒子に共有結合で連結される、請求項２９に記載のヘテロダイマー・ナノ粒子結合体。
【請求項３１】
ポリエチレングリコールはマレイミドで官能化される、請求項３０に記載のヘテロダイマー・ナノ粒子結合体。
【請求項３２】
ポリエチレングリコールは５ｋＤ未満である、請求項３１に記載のヘテロダイマー・ナノ粒子結合体。
【請求項３３】
請求項２６から３２のいずれか１つに記載のヘテロダイマー・ナノ粒子結合体、および医薬賦形剤、安定剤または希釈剤を含む医薬組成物。
【請求項３４】
自己免疫疾患または炎症性疾病を処置する方法に使用するための、請求項２６から３２のいずれか１つに記載のヘテロダイマー・ナノ粒子結合体、または請求項３３に記載の医薬組成物。
【請求項３５】
自己免疫疾患または炎症性疾病を処置する方法であって、該方法は、請求項２６から３２のいずれか１つに記載のヘテロダイマー・ナノ粒子結合体、または請求項３３に記載の医薬組成物を個体に投与する工程を含む、方法。
【請求項３６】
第１のポリペプチドと第２のポリペプチドを含むヘテロダイマーを調製する方法であって、ここで第１のポリペプチドと第２のポリペプチドは界面で出会い、第１のポリペプチドの界面は、第２のポリペプチドの界面にある設計された腔に配置することができる設計された隆起を含み；および、
（ｉ）第１のポリペプチドは、ＭＨＣクラスＩＩα１ドメイン、ＭＨＣクラスＩＩα２ドメイン、またはそれらの組み合わせを含み；および、第２のポリペプチドは、ＭＨＣクラスＩＩβ１ドメイン、ＭＨＣクラスＩＩβ２ドメイン、またはそれらの組み合わせを含み；または、
（ｉｉ）第１のポリペプチドは、ＭＨＣクラスＩＩβ１ドメイン、ＭＨＣクラスＩＩβ２ドメイン、またはそれらの組み合わせを含み；および、第２のポリペプチドは、ＭＨＣクラスＩＩα１ドメイン、ＭＨＣクラスＩＩα２ドメイン、またはそれらの組み合わせを含み；
該方法は、
（ｉｉｉ）界面を含む第１のポリペプチドと第２のポリペプチドをコードする核酸を含む宿主細胞を培養する工程であって、ここで第１のポリペプチドの界面をコードする核酸は、隆起をコードするために第１のポリペプチドの元々の界面をコードする核酸から変質しており、または第２のポリペプチドの界面をコードする核酸は、腔をコードするために第２のポリペプチドの元々の界面をコードする核酸から変質しており、またはその両方であり、および第１のポリペプチドと第２のポリペプチドが発現するように培養が行われる、工程；および、
（ｉｖ）宿主細胞の培養からヘテロダイマーを回収して精製する工程、
を含む、方法。
【請求項３７】
第１のポリペプチドと第２のポリペプチドを含むヘテロダイマーを調製する方法であって、ここで第１のポリペプチドと第２のポリペプチドは界面で出会い、第１のポリペプチドの界面は、第２のポリペプチドの界面にある設計された腔に配置することができる設計された隆起を含み；および、
（ｉ）第１のポリペプチドは、ＭＨＣクラスＩＩα１ドメイン、ＭＨＣクラスＩＩα２ドメイン、またはそれらの組み合わせを含み；および、第２のポリペプチドは、ＭＨＣクラスＩＩβ１ドメイン、ＭＨＣクラスＩＩβ２ドメイン、またはそれらの組み合わせを含み；または、
（ｉｉ）第１のポリペプチドは、ＭＨＣクラスＩＩβ１ドメイン、ＭＨＣクラスＩＩβ２ドメイン、またはそれらの組み合わせを含み；および、第２のポリペプチドは、ＭＨＣクラスＩＩα１ドメイン、ＭＨＣクラスＩＩα２ドメイン、またはそれらの組み合わせを含み；
該方法は、
（ｉｉｉ）第１のポリペプチドをコードする核酸を含む第１の宿主細胞を培養する工程；
（ｉｖ）第２のポリペプチドをコードする核酸を含む第２の宿主細胞を培養する工程；
（ｖ）宿主細胞培養から第１および第２のポリペプチドを回収する工程；および、
（ｖｉ）第１と第２のポリペプチドを一緒にインキュベートすることによってヘテロダイマーを形成する工程、
を含み、ここで第１のポリペプチドの界面をコードする核酸は、隆起をコードするために第１のポリペプチドの元々の界面をコードする核酸から変質しており、または第２のポリペプチドの界面をコードする核酸は、腔をコードするために第２のポリペプチドの元々の界面をコードする核酸から変質しており、またはその両方である、方法。
【請求項３８】
第１のポリペプチドと第２のポリペプチドをコードする核酸は、宿主細胞のゲノムへと安定して統合される、請求項３６または３７に記載の方法。
【請求項３９】
宿主細胞はチャイニーズハムスター卵巣（ＣＨＯ）細胞を含む、請求項３６に記載の方法。
【請求項４０】
第１と第２の宿主細胞はチャイニーズハムスター卵巣（ＣＨＯ）細胞を含む、請求項３７に記載の方法。
【請求項４１】
単一または複数の宿主細胞培養からポリペプチドを回収する工程は、液体クロマトグラフィーカラムにヘテロダイマーを含む液体を適用する工程を含む、請求項３６から４０のいずれか１つに記載の方法。
【請求項４２】
液体クロマトグラフィーカラムは、タンパク質Ａ、タンパク質Ｇ、タンパク質Ｌ、またはそれらの任意の組み合わせを含む、請求項４１に記載の方法。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
＜関連出願への相互参照＞
本出願は、２０１６年１１月９日に出願された、米国仮特許出願第６２／４１９，９４７の優先権の利益を主張するものであり、この出願はその全体が引用により本明細書に組み込まれる。
【０００２】
＜配列表＞
本出願は、ＡＳＣＩＩフォーマットで電子的に提出され、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる配列表を含んでいる。２０１７年１０月３１日に作成された前記ＡＳＣＩＩのコピーは、４２３６３−７１１＿６０１＿ＳＬ．ｔｘｔというファイル名であり、２４２，３６９バイトのサイズである。
【背景技術】
【０００３】
主要組織適合抗原（ＭＨＣ）クラスＩＩ分子は通常、抗原提示細胞に見られ、免疫反応の調節を助ける同族のＣＤ４＋Ｔ細胞に抗原を提示する。ＭＨＣクラスII分子は、アルファ鎖とベータ鎖の二量体化によって形成され、アルファ鎖とベータ鎖によって形成された結合溝において関係するポリペプチド抗原の存在下で安定している。しかしながら、インビトロの設計システムでのＭＨＣクラスＩＩの生成は、ポリペプチドの存在下においてさえも、タンパク質ヘテロダイマーの内因性の不安定性ゆえに困難である。
【発明の概要】
【０００４】
本明細書に開示されるのは、単離され精製された抗原−ＭＨＣヘテロダイマー、およびその効果的な作成方法である。ヘテロダイマーは、生成と単離の容易さを促進するように設計される。単離されたヘテロダイマーの生成を増加させるために多くの方法が使用される。まず、アルファ鎖とベータ鎖は共に、ＩｇＧ重鎖部分に個別に融合され、次にＩｇＧはノブ・イン・ホールの構造（ｋｎｏｂ−ｉｎ−ｈｏｌｅ  ａｒｃｈｉｔｅｃｔｕｒｅ）で設計される（アルファ鎖またはベータ鎖のＩｇＧの１つがノブを含み、アルファ鎖またはベータ鎖のＩｇＧのもう一方がホールを含む）。いくつかの例では、ヘテロダイマーは、抗原とＭＨＣクラスＩＩ結合溝の残基との間のシステイン捕捉（ｃｙｓｔｅｉｎｅ  ｔｒａｐ）によってさらに安定させることができる。システイン捕捉を使用するために、抗原は、結合溝に近接するＭＨＣ分子のアルファ鎖またはベータ鎖上の設計されたシステインとのジスルフィド結合を形成する、内因性または設計されたシステインを含むことができる。このシステイン捕捉はさらに、ペプチドＭＨＣ分子の安定性を高めることができる。偶然にも、ノブ・イン・ホールの構造は、事前に使用された異種の二量体化ドメインのない状態で機能することがわかっている。実際、異種の二量体化ドメインはヘテロダイマーの形成にとって有害であることがわかった。
【０００５】
一態様において、本明細書で提供されるのは、少なくとも１つの第１のポリペプチドと少なくとも１つの第２のポリペプチドを含む単離されたヘテロダイマーであって、ここで第１のポリペプチドと第２のポリペプチドは界面で出会い、第１のポリペプチドの界面は、第２のポリペプチドの界面にある設計された腔に配置することができる設計された隆起を含み；および（ｉ）第１のポリペプチドは、ＭＨＣクラスＩＩα１ドメイン、ＭＨＣクラスＩＩα２ドメイン、またはそれらの組み合わせを含み；および第２のポリペプチドは、ＭＨＣクラスＩＩβ１ドメイン、ＭＨＣクラスＩＩβ２ドメイン、またはそれらの組み合わせを含み；または（ｉｉ）第１のポリペプチドは、ＭＨＣクラスＩＩβ１ドメイン、ＭＨＣクラスＩＩβ２ドメイン、またはそれらの組み合わせを含み；および第２のポリペプチドは、ＭＨＣクラスＩＩα１ドメイン、ＭＨＣクラスＩＩα２ドメイン、またはそれらの組み合わせを含む。いくつかの実施形態では、隆起は、１つ以上の非天然のアミノ酸残基を含む。いくつかの実施形態では、隆起は、１つ以上の天然のアミノ酸残基を含む。いくつかの実施形態では、隆起は、フェニルアラニン、アルギニン、チロシン、トリプトファン、およびシステインから選択される１つ以上のアミノ酸を含む。いくつかの実施形態では、隆起はアルギニン残基を含む。いくつかの実施形態では、隆起はフェニルアラニン残基を含む。いくつかの実施形態では、隆起はチロシン残基を含む。いくつかの実施形態では、隆起はトリプトファン残基を含む。いくつかの実施形態では、隆起はシステイン残基を含む。いくつかの実施形態では、隆起は、システイン残基とトリプトファン残基を含む。いくつかの実施形態では、腔は非天然のアミノ酸残基を含む。いくつかの実施形態では、腔は天然のアミノ酸残基を含む。いくつかの実施形態では、腔は、アラニン、セリン、トレオニン、バリン、およびシステインから選択される１つ以上のアミノ酸を含む。いくつかの実施形態では、腔はアラニン残基を含む。いくつかの実施形態では、腔はセリン残基を含む。いくつかの実施形態では、腔はトレオニン残基を含む。
【０００６】
いくつかの実施形態では、腔はバリン残基を含む。いくつかの実施形態では、腔はシステイン残基を含む。いくつかの実施形態において、腔はシステイン残基、セリン残基、アラニン残基、およびバリン残基を含む。いくつかの実施形態において、第１のポリペプチドと第２のポリペプチドは、抗体のＣＨ３ドメインを介して接する。いくつかの実施形態では、ＣＨ３ドメインはＩｇＧからのものである。いくつかの実施形態では、ＩｇＧはＩｇＧ１サブタイプである。いくつかの実施形態では、第１のポリペプチドおよび／または第２のポリペプチドは、Ｃ−末端システイン残基をさらに含む。いくつかの実施形態において、第１のポリペプチドおよび／または第２のポリペプチドは、ビオチン化部位をさらに含む。いくつかの実施形態において、第１のポリペプチドおよび／または第２のポリペプチドは、Ｓｔｒｅｐ  ｔａｇをさらに含む。いくつかの実施形態において、単離されたヘテロダイマーは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１によってコードされる少なくとも１つのポリペプチドを含む。いくつかの実施形態において、単離されたヘテロダイマーは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２によってコードされる少なくとも１つのポリペプチドを含む。いくつかの実施形態において、単離されたヘテロダイマーは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：３によってコードされる少なくとも１つのポリペプチドを含む。いくつかの実施形態において、単離されたヘテロダイマーは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：４によってコードされる少なくとも１つのポリペプチドを含む。いくつかの実施形態において、単離されたヘテロダイマーは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：５−８のいずれか１つによってコードされる少なくとも１つのポリペプチドを含む。いくつかの実施形態において、単離されたヘテロダイマーは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１−２６、６４、または６５のいずれか１つを含むＤＮＡ塩基配列によってコードされる少なくとも１つのポリペプチドを含む。いくつかの実施形態において、単離されたヘテロダイマーは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２７−６３のいずれか１つのアミノ酸配列を含む少なくとも１つのポリペプチド、またはそれらのフラグメントを含む。
【０００７】
他の態様において、本明細書で提供されるのは、本明細書に記載される２つ以上の単離されたヘテロダイマーを含む多量体である。いくつかの実施形態では、多量体はアビジンをさらに含む。
【０００８】
いくつかの実施形態では、２つ以上のヘテロダイマーの各々はアビジンに結合される。いくつかの実施形態では、多量体はポリマー骨格をさらに含み、ここで２つ以上のヘテロダイマーの各々はポリマー骨格に結合される。いくつかの実施形態において、ポリマー骨格は、デキストランまたはポリエチレングリコール（ＰＥＧ）である。
【０００９】
他の態様において、本明細書で提供されるのは、ＭＨＣクラスＩＩα１ドメイン、ＭＨＣクラスＩＩα２ドメイン、またはそれらの組み合わせ；および少なくとも１つの設計された隆起、を含むポリペプチドである。いくつかの実施形態において、少なくとも１つの設計された隆起は、ＭＨＣクラスＩＩα１ドメインまたはＭＨＣクラスＩＩα２ドメインには位置しない。いくつかの実施形態において、設計された隆起は、ポリペプチドに融合した抗体ＣＨ３ドメインに位置する。いくつかの実施形態において、ポリペプチドは、設計された隆起を伴うＭＨＣクラスＩＩα２ドメインとＣＨ３ドメインの間に位置する抗体ＣＨ２ドメインを随意に含む。特定の実施形態では、ポリペプチドは抗体ＣＨ３ドメインを含み、および抗体ＣＨ３ドメインは、Ｓ３５４Ｃ、Ｔ３６６Ｗ、およびＳ３５４ＣとＴ３６６Ｗの両方（ＥＵの番号付け）から成るリストから選択される少なくとも１つの突然変異を含む。
【００１０】
他の態様において、本明細書で提供されるのは、ＭＨＣクラスＩＩβ１ドメイン、ＭＨＣクラスＩＩβ２ドメイン、またはそれらの組み合わせ；および少なくとも１つの設計された隆起、を含むポリペプチドである。いくつかの実施形態において、少なくとも１つの設計された隆起は、ＭＨＣクラスＩＩβ１ドメインまたはＭＨＣクラスＩＩβ２ドメインには位置しない。いくつかの実施形態において、設計された隆起は、ポリペプチドに融合した抗体ＣＨ３ドメインに位置する。いくつかの実施形態において、ポリペプチドは、設計された隆起を伴うＭＨＣクラスＩＩβ２ドメインとＣＨ３ドメインの間に位置する抗体ＣＨ２ドメインを随意に含む。特定の実施形態では、ポリペプチドは抗体ＣＨ３ドメインを含み、および抗体ＣＨ３ドメインは、Ｓ３５４Ｃ、Ｔ３６６Ｗ、およびＳ３５４ＣとＴ３６６Ｗの両方（ＥＵの番号付け）から成るリストから選択される少なくとも１つの突然変異を含む。
【００１１】
いくつかの実施形態では、隆起は、１つ以上の非天然のアミノ酸残基を含む。いくつかの実施形態では、隆起は、１つ以上の天然のアミノ酸残基を含む。いくつかの実施形態では、隆起は、フェニルアラニン、アルギニン、チロシン、トリプトファン、およびシステインから選択される１つ以上のアミノ酸を含む。いくつかの実施形態では、隆起はアルギニン残基を含む。いくつかの実施形態では、隆起はフェニルアラニン残基を含む。いくつかの実施形態では、隆起はチロシン残基を含む。いくつかの実施形態では、隆起はトリプトファン残基を含む。いくつかの実施形態では、隆起はシステイン残基を含む。いくつかの実施形態では、隆起は、システイン残基とトリプトファン残基を含む。
【００１２】
他の態様において、本明細書で提供されるのは、ＭＨＣクラスＩＩα１ドメイン、ＭＨＣクラスＩＩα２ドメイン、またはそれらの組み合わせ；および少なくとも１つの設計された腔、を含むポリペプチドである。いくつかの実施形態において、少なくとも１つの設計された腔は、ＭＨＣクラスＩＩα１ドメインまたはＭＨＣクラスＩＩα２ドメインには位置しない。いくつかの実施形態において、設計された腔は、ポリペプチドに融合した抗体ＣＨ３ドメインに位置する。いくつかの実施形態において、ポリペプチドは、設計された腔を伴うＭＨＣクラスＩＩα２ドメインとＣＨ３ドメインの間に位置する抗体ＣＨ２ドメインを随意に含む。特定の実施形態では、ポリペプチドは抗体ＣＨ３ドメインを含み、および抗体ＣＨ３ドメインは、Ｙ３４９Ｃ、Ｔ３６６Ｓ、Ｌ３６８Ａ、Ｙ４０７Ｖ（ＥＵの番号付け）、およびそれらの組み合わせから成るリストから選択される少なくとも１つの突然変異を含む。
【００１３】
他の態様において、本明細書で提供されるのは、ＭＨＣクラスＩＩβ１ドメイン、ＭＨＣクラスＩＩβ２ドメイン、またはそれらの組み合わせ；および少なくとも１つの設計された腔、を含むポリペプチドである。いくつかの実施形態において、少なくとも１つの設計された腔は、ＭＨＣクラスＩＩβ１ドメインまたはＭＨＣクラスＩＩβ２ドメインには位置しない。いくつかの実施形態において、設計された腔は、ポリペプチドに融合した抗体ＣＨ３ドメインに位置する。いくつかの実施形態において、ポリペプチドは、設計された腔を伴うＭＨＣクラスＩＩβ２ドメインとＣＨ３ドメインの間に位置する抗体ＣＨ２ドメインを随意に含む。特定の実施形態では、ポリペプチドは抗体ＣＨ３ドメインを含み、および抗体ＣＨ３ドメインは、Ｙ３４９Ｃ、Ｔ３６６Ｓ、Ｌ３６８Ａ、Ｙ４０７Ｖ（ＥＵの番号付け）、およびそれらの組み合わせから成るリストから選択される少なくとも１つの突然変異を含む。
【００１４】
いくつかの実施形態では、腔は非天然のアミノ酸残基を含む。いくつかの実施形態では、腔は天然のアミノ酸残基を含む。いくつかの実施形態では、腔は、アラニン、セリン、トレオニン、バリン、およびシステインから選択される１つ以上のアミノ酸を含む。いくつかの実施形態では、腔はアラニン残基を含む。いくつかの実施形態では、腔はセリン残基を含む。いくつかの実施形態では、腔はトレオニン残基を含む。いくつかの実施形態では、腔はバリン残基を含む。いくつかの実施形態では、腔はシステイン残基を含む。いくつかの実施形態において、腔はシステイン残基、セリン残基、アラニン残基、およびバリン残基を含む。
【００１５】
いくつかの実施形態において、隆起はＣＨ３抗体定常ドメインに位置する。いくつかの実施形態において、腔はＣＨ３抗体定常ドメインに設置する。いくつかの実施形態では、ポリペプチドはＣ−末端システイン残基をさらに含む。
【００１６】
他の態様において、本明細書で提供されるのは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１−２６、６４、または６５のいずれか１つを含むＤＮＡ塩基配列によってコードされるポリペプチドである。
【００１７】
他の態様において、本明細書で提供されるのは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ２７−６３のいずれか１つのアミノ酸配列を含むポリペプチド、またはそのフラグメントである。
【００１８】
他の態様において、本明細書で提供されるのは、本明細書に記載される少なくとも１つのヘテロダイマー；およびナノ粒子を含むヘテロダイマー・ナノ粒子結合体であって、ここでナノ粒子は非リポソームであり、および／またはソリッドコアを有する。いくつかの実施形態では、ソリッドコアは金のコアまたは酸化鉄のコアである。いくつかの実施形態において、少なくとも１つのヘテロダイマーは、ナノ粒子に共有結合または非共有結合で連結される。いくつかの実施形態において、少なくとも１つのヘテロダイマーは、リンカーによってナノ粒子に共有結合で連結される。いくつかの実施形態において、リンカーはポリエチレングリコールを含む。
【００１９】
他の態様において、本明細書で提供されるのは、第１のポリペプチドと第２のポリペプチドを含むヘテロダイマーを調製する方法であって、ここで第１のポリペプチドと第２のポリペプチドは界面で出会い、第１のポリペプチドの界面は、第２のポリペプチドの界面にある設計された腔に配置することができる設計された隆起を含み；および（ｉ）第１のポリペプチドは、ＭＨＣクラスＩＩα１ドメイン、ＭＨＣクラスＩＩα２ドメイン、またはそれらの組み合わせを含み；および第２のポリペプチドは、ＭＨＣクラスＩＩβ１ドメイン、ＭＨＣクラスＩＩβ２ドメイン、またはそれらの組み合わせを含み；または（ｉｉ）第１のポリペプチドは、ＭＨＣクラスＩＩβ１ドメイン、ＭＨＣクラスＩＩβ２ドメイン、またはそれらの組み合わせを含み；および第２のポリペプチドは、ＭＨＣクラスＩＩα１ドメイン、ＭＨＣクラスＩＩα２ドメイン、またはそれらの組み合わせを含み；該方法は、（ａ）界面を含む第１のポリペプチドと第２のポリペプチドをコードする核酸を含む宿主細胞を培養する工程であって、ここで第１のポリペプチドの界面をコードする核酸は、隆起をコードするために第１のポリペプチドの初期界面をコードする核酸から変質しており、または第２のポリペプチドの界面をコードする核酸は、腔をコードするために第２のポリペプチドの初期界面をコードする核酸から変質しており、またはその両方であり、および第１のポリペプチドと第２のポリペプチドが発現するように培養が行われる、工程；および（ｂ）宿主細胞の培養からヘテロダイマーを回収する工程、を含む。
【００２０】
いくつかの実施形態において、第１のポリペプチドをコードする核酸は、隆起をコードするために初期核酸から変質しており、および第２のポリペプチドをコードする核酸は、腔をコードするために初期核酸から変質している。
【００２１】
いくつかの実施形態において、工程（ａ）に先行して、第１のポリペプチドの界面から初期アミノ酸残基をコードする１つ以上の核酸の各々が、移入アミノ酸残基をコードする核酸と置き換えられる工程があり、ここで隆起は１つ以上の移入残基を含む。いくつかの実施形態では、移入残基は、フェニルアラニン、アルギニン、チロシン、トリプトファン、およびシステインから選択される。いくつかの実施形態では、移入残基はアルギニンである。いくつかの実施形態では、移入残基はフェニルアラニンである。
【００２２】
いくつかの実施形態では、移入残基はチロシンである。いくつかの実施形態では、移入残基はトリプトファンである。いくつかの実施形態では、移入残基はシステインである。
【００２３】
いくつかの実施形態において、工程（ａ）に先行して、第２のポリペプチドの界面において初期アミノ酸残基をコードする１つ以上の核酸の各々が、移入アミノ酸残基をコードする核酸と置き換えられる工程があり、ここで腔は１つ以上の移入残基を含む。いくつかの実施形態では、移入残基は、システイン、アラニン、セリン、トレオニン、またはバリンからから選択される。いくつかの実施形態では、移入残基はシステインである。いくつかの実施形態では、移入残基はアラニンである。いくつかの実施形態では、移入残基はセリンである。いくつかの実施形態では、移入残基はトレオニンである。いくつかの実施形態では、移入残基はバリンである。
【００２４】
いくつかの実施形態において、第１のポリペプチドと第２のポリペプチドの各々は抗体定常ドメインを含む。いくつかの実施形態において、抗体定常ドメインはＣＨ３ドメインである。いくつかの実施形態では、抗体定常ドメインはＩｇＧからのものである。いくつかの実施形態では、ＩｇＧはヒトＩｇＧ１である。いくつかの実施形態において、抗体定常ドメインはＣＨ２とＣＨ３ドメインである。特定の実施形態では、ＣＨ３は設計された隆起（ノブ）または腔（ホール）をさらに含む。
【００２５】
他の態様において、本明細書で提供されるのは、本明細書に記載される少なくとも１つのヘテロダイマーをナノ粒子に連結する工程を含む、ヘテロダイマー・ナノ粒子結合体を調製する方法であって、ここでナノ粒子は非リポソームであり、および／またはソリッドコアを有する。いくつかの実施形態では、ソリッドコアは金のコアまたは酸化鉄のコアである。いくつかの実施形態において、連結する工程は、少なくとも１つのヘテロダイマーをナノ粒子に共有結合または非共有結合で連結する工程を含む。いくつかの実施形態において、連結する工程は、リンカーを介して少なくとも１つのヘテロダイマーをナノ粒子に共有結合で連結する工程を含む。いくつかの実施形態において、リンカーはポリエチレングリコールを含む。
【００２６】
別の態様において、本明細書に記載されるのは、少なくとも１つの第１のポリペプチドと少なくとも１つの第２のポリペプチドを含む単離されたヘテロダイマーであって、ここで第１のポリペプチドと第２のポリペプチドは界面で出会い、第１のポリペプチドの界面は、第２のポリペプチドの界面にある設計された腔に配置することができる設計された隆起を含み；および（ｉ）第１のポリペプチドは、ＭＨＣクラスＩＩα１ドメイン、ＭＨＣクラスＩＩα２ドメイン、またはそれらの組み合わせを含み；および第２のポリペプチドは、ＭＨＣクラスＩＩβ１ドメイン、ＭＨＣクラスＩＩβ２ドメイン、またはそれらの組み合わせを含み；または（ｉｉ）第１のポリペプチドは、ＭＨＣクラスＩＩβ１ドメイン、ＭＨＣクラスＩＩβ２ドメイン、またはそれらの組み合わせを含み；および第２のポリペプチドは、ＭＨＣクラスＩＩα１ドメイン、ＭＨＣクラスＩＩα２ドメイン、またはそれらの組み合わせを含む。特定の実施形態では、隆起は、１つ以上の非天然のアミノ酸残基を含む。特定の実施形態では、隆起は、フェニルアラニン、アルギニン、チロシン、トリプトファン、およびシステインから選択される１つ以上のアミノ酸を含む。特定の実施形態では、単離されたヘテロダイマーの第１または第２のポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：５３に記載のアミノ酸配列と少なくとも８０％同一であるアミノ酸配列を含む。特定の実施形態では、単離されたヘテロダイマーの第１または第２のポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：５４に記載のアミノ酸配列と少なくとも８０％同一であるアミノ酸配列を含む。特定の実施形態では、単離されたヘテロダイマーの第１または第２のポリペプチドはＣＨ３ドメインを含み、およびＣＨ３ドメインは、Ｓ３５４Ｃ、Ｔ３６６Ｗ、およびＳ３５４ＣとＴ３６６Ｗの両方（ＥＵの番号付け）から成るリストから選択される少なくとも１つの突然変異を含む。特定の実施形態では、腔は非天然のアミノ酸残基を含む。特定の実施形態では、腔は、アラニン、セリン、トレオニン、バリン、およびシステインから選択される１つ以上のアミノ酸を含む。特定の実施形態では、単離されたヘテロダイマーの第１または第２のポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：５１に記載のアミノ酸配列と少なくとも８０％同一であるアミノ酸配列を含む。特定の実施形態では、単離されたヘテロダイマーの第１または第２のポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：５２に記載のアミノ酸配列と少なくとも８０％同一であるアミノ酸配列を含む。特定の実施形態では、単離されたヘテロダイマーの第１または第２のポリペプチドはＣＨ３ドメインを含み、およびＣＨ３ドメインは、Ｙ３４９Ｃ、Ｔ３６６Ｓ、Ｌ３６８Ａ、Ｙ４０７Ｖ（ＥＵの番号付け）、およびそれらの組み合わせから成るリストから選択される少なくとも１つの突然変異を含む。
【００２７】
特定の実施形態では、第１のポリペプチドまたは第２のポリペプチドの一方または両方は、異種の二量体化ドメインを含まない。特定の実施形態では、第１のポリペプチドまたは第２のポリペプチドの一方または両方は、ロイシンジッパーを含まない。特定の実施形態では、第１のポリペプチドまたは第２のポリペプチドの一方または両方は、部位特異的なビオチン化部位を含まない。特定の実施形態では、単離されたヘテロダイマーは自己免疫疾患関連の抗原をさらに含む。特定の実施形態では、自己免疫疾患関連の抗原は、少なくとも１１のアミノ酸の長さのポリペプチドを含む。特定の実施形態では、自己免疫疾患関連の抗原は、柔軟なリンカーによってＭＨＣクラスＩＩα１ドメインまたはＭＨＣクラスＩＩβ１ドメインに結合される。特定の実施形態では、抗原は、抗原ペプチドに関連するシステインアミノ酸と、ＭＨＣクラスＩＩα１ドメインまたはＭＨＣクラスＩＩβ１ドメインのシステインアミノ酸との間に形成されたジスルフィド結合によって、ＭＨＣクラスＩＩα１ドメインまたはＭＨＣクラスＩＩβ１ドメインに共有結合で連結される。特定の実施形態では、ＭＨＣクラスＩＩα１ドメインまたはＭＨＣクラスＩＩβ１ドメインのシステインアミノ酸は、ＭＨＣクラスＩＩ結合溝の一部を形成する残基の１０アミノ酸内にある。特定の実施形態では、ＭＨＣクラスＩＩα１ドメインまたはＭＨＣクラスＩＩβ１ドメインのシステイン残基は、ＭＨＣクラスＩＩ結合溝の一部を形成する残基の３アミノ酸内にある。特定の実施形態では、ＭＨＣクラスＩＩα１ドメインまたはＭＨＣクラスＩＩβ１ドメインのシステインアミノ酸は、ＭＨＣクラスＩＩα１ドメインまたはＭＨＣクラスＩＩβ１ドメインの天然の配列に導入されている。特定の実施形態では、単離されたヘテロダイマーは、自己免疫疾患と診断された、またはその疑いのある個体を処置するのに使用される。特定の実施形態では、単離されたヘテロダイマーは、本明細書に記載の第１または第２のポリペプチドをコードするポリヌクレオチドによってコードされる。特定の実施形態では、宿主細胞はポリヌクレオチドを含む。特定の実施形態では、ポリヌクレオチドは、ゲノムに安定して統合される。特定の実施形態では、少なくとも１つのヘテロダイマーは、ヘテロダイマー・ナノ粒子結合体を形成するためにナノ粒子に連結され、ここでナノ粒子は非リポソームであり、および／またはソリッドコアを有する。特定の実施形態では、ソリッドコアは金、鉄、または酸化鉄のコアである。特定の実施形態では、ソリッドコアの直径は１００ナノメートル未満である。特定の実施形態では、少なくとも１つのヘテロダイマーは、ナノ粒子に共有結合で連結される。特定の実施形態では、少なくとも１つのヘテロダイマーは、ポリエチレングリコール（ＰＥＧ）を含むリンカーによってナノ粒子に共有結合で連結される。特定の実施形態では、ポリエチレングリコールはマレイミドで官能化される。特定の実施形態では、ポリエチレングリコールは５ｋＤ未満である。特定の実施形態では、ヘテロダイマー・ナノ粒子結合体を含む医薬組成物は、医薬用の賦形剤、安定剤または希釈剤を用いて作られる。特定の実施形態では、単離されたヘテロダイマーまたは��薬組成物は、自己免疫疾患または炎症性疾患を処置する方法で使用するためのものである。特定の実施形態では、自己免疫疾患または炎症性疾患を処置する方法は、単離されたヘテロダイマー・ナノ粒子結合体または医薬組成物を個体に投与する工程を含む。
【００２８】
他の態様において、本明細書に記載されるのは、第１のポリペプチドと第２のポリペプチドを含むヘテロダイマーを調製する方法であって、ここで第１のポリペプチドと第２のポリペプチドは界面で出会い、第１のポリペプチドの界面は、第２のポリペプチドの界面にある設計された腔に配置することができる設計された隆起を含み；および（ｉ）第１のポリペプチドは、ＭＨＣクラスＩＩα１ドメイン、ＭＨＣクラスＩＩα２ドメイン、またはそれらの組み合わせを含み；および第２のポリペプチドは、ＭＨＣクラスＩＩβ１ドメイン、ＭＨＣクラスＩＩβ２ドメイン、またはそれらの組み合わせを含み；または（ｉｉ）第１のポリペプチドは、ＭＨＣクラスＩＩβ１ドメイン、ＭＨＣクラスＩＩβ２ドメイン、またはそれらの組み合わせを含み；および第２のポリペプチドは、ＭＨＣクラスＩＩα１ドメイン、ＭＨＣクラスＩＩα２ドメイン、またはそれらの組み合わせを含み；該方法は、（ａ）界面を含む第１のポリペプチドと第２のポリペプチドをコードする核酸を含む宿主細胞を培養する工程であって、ここで第１のポリペプチドの界面をコードする核酸は、隆起をコードするために第１のポリペプチドの初期界面をコードする核酸から変質しており、または第２のポリペプチドの界面をコードする核酸は、腔をコードするために第２のポリペプチドの初期界面をコードする核酸から変質しており、またはその両方であり、および第１のポリペプチドと第２のポリペプチドが発現するように培養が行われる、工程；および（ｂ）宿主細胞の培養からヘテロダイマーを回収する工程、を含む。特定の実施形態では、第１のポリペプチドと第２のポリペプチドをコードする核酸は、宿主細胞のゲノムへと安定して統合される。特定の実施形態では、宿主細胞はチャイニーズハムスター卵巣（ＣＨＯ）細胞を含む。特定の実施形態では、１つの宿主細胞培養または複数の宿主細胞培養からヘテロダイマーを回収する工程は、液体クロマトグラフィーカラムにヘテロダイマーを含む液体を適用する工程を含む。特定の実施形態では、液体クロマトグラフィーカラムは、タンパク質Ａ、タンパク質Ｇ、タンパク質Ｌ、またはそれらの組み合わせを含む。
【００２９】
他の態様において、本明細書に記載されるのは、第１のポリペプチドと第２のポリペプチドを含むヘテロダイマーを調製する方法であって、ここで第１のポリペプチドと第２のポリペプチドは界面で出会い、第１のポリペプチドの界面は、第２のポリペプチドの界面にある設計された腔に配置することができる設計された隆起を含み；および（ｉ）第１のポリペプチドは、ＭＨＣクラスＩＩα１ドメイン、ＭＨＣクラスＩＩα２ドメイン、またはそれらの組み合わせを含み；および第２のポリペプチドは、ＭＨＣクラスＩＩβ１ドメイン、ＭＨＣクラスＩＩβ２ドメイン、またはそれらの組み合わせを含み；または（ｉｉ）第１のポリペプチドは、ＭＨＣクラスＩＩβ１ドメイン、ＭＨＣクラスＩＩβ２ドメイン、またはそれらの組み合わせを含み；および第２のポリペプチドは、ＭＨＣクラスＩＩα１ドメイン、ＭＨＣクラスＩＩα２ドメイン、またはそれらの組み合わせを含み；該方法は、（ａ）第１のポリペプチドをコードする核酸を含む第１の宿主細胞を培養する工程；（ｂ）第２のポリペプチドをコードする核酸を含む第２の宿主細胞を培養する工程；（ｃ）宿主細胞培養からポリペプチドを回収する工程；および（ｄ）第１と第２のポリペプチドを一緒にインキュベートすることによってヘテロダイマーを形成する工程、を含み、ここで第１のポリペプチドの界面をコードする核酸は、隆起をコードするために第１のポリペプチドの初期界面をコードする核酸から変質しており、または第２のポリペプチドの界面をコードする核酸は、腔をコードするために第２のポリペプチドの初期界面をコードする核酸から変質しており、またはその両方である。特定の実施形態では、第１のポリペプチドと第２のポリペプチドをコードする核酸は、宿主細胞のゲノムへと安定して統合される。特定の実施形態では、第１と第２の宿主細胞はチャイニーズハムスター卵巣（ＣＨＯ）細胞を含む。特定の実施形態では、該方法は、１つの宿主細胞培養または複数の宿主細胞培養からヘテロダイマーまたはポリペプチドを回収する工程をさらに含み、液体クロマトグラフィーカラムにヘテロダイマーまたはポリペプチドを含む液体を適用する工程を含む。特定の実施形態では、液体クロマトグラフィーカラムは、タンパク質Ａ、タンパク質Ｇ、タンパク質Ｌ、またはそれらの組み合わせを含む。
【００３０】
一態様において、本明細書で提供されるのは、少なくとも１つの第１のポリペプチドと少なくとも１つの第２のポリペプチドを含む単離されたヘテロダイマーであって、ここで第１のポリペプチドと第２のポリペプチドは界面で出会い、第１のポリペプチドの界面は、第２のポリペプチドの界面にある設計された腔に配置することができる設計された隆起を含み；および（ｉ）第１のポリペプチドはＭＨＣクラスＩＩα１ドメイン、ＭＨＣクラスＩＩα２ドメイン、ＩｇＧ  ＣＨ２ドメイン、およびＩｇＧ  ＣＨ３ドメインを含み、ここで隆起は、Ｓ３５４ＣとＴ３６６Ｗ（ＥＵの番号付け）に対応するＩｇＧ  ＣＨ３ドメインの突然変異によって形成され；および（ｉｉ）第２のポリペプチドは、ＭＨＣクラスＩＩβ１ドメイン、ＭＨＣクラスＩＩβ２ドメイン、ＩｇＧ  ＣＨ２ドメイン、およびＩｇＧ  ＣＨ３ドメインを含み、ここで腔は、Ｙ３４９Ｃ、Ｔ３６６Ｓ、Ｌ３６８Ａ、およびＹ４０７Ｖ（ＥＵの番号付け）に対応するＩｇＧ  ＣＨ３ドメインの突然変異によって形成される。
【００３１】
一態様において、本明細書で提供されるのは、少なくとも１つの第１のポリペプチドと少なくとも１つの第２のポリペプチドを含む単離されたヘテロダイマーであって、ここで第１のポリペプチドと第２のポリペプチドは界面で出会い、第１のポリペプチドの界面は、第２のポリペプチドの界面にある設計された腔に配置することができる設計された隆起を含み；および（ｉ）第１のポリペプチドはＭＨＣクラスＩＩβ１ドメイン、ＭＨＣクラスＩＩβ２ドメイン、ＩｇＧ  ＣＨ２ドメイン、およびＩｇＧ  ＣＨ３ドメインを含み、ここで隆起は、Ｓ３５４ＣとＴ３６６Ｗ（ＥＵの番号付け）に対応するＩｇＧ  ＣＨ３ドメインの突然変異によって形成され；および（ｉｉ）第２のポリペプチドは、ＭＨＣクラスＩＩα１ドメイン、ＭＨＣクラスＩＩα２ドメイン、ＩｇＧ  ＣＨ２ドメイン、およびＩｇＧ  ＣＨ３ドメインを含み、ここで腔は、Ｙ３４９Ｃ、Ｔ３６６Ｓ、Ｌ３６８Ａ、およびＹ４０７Ｖ（ＥＵの番号付け）に対応するＩｇＧ  ＣＨ３ドメインの突然変異によって形成される。
【図面の簡単な説明】
【００３２】
【図１Ａ】線形化された形態でレンチウイルスベクターを示す。
【図１Ｂ】円形でレンチウイルスベクターを示す。
【図２】ロイシンジッパーを使用したｐＭＨＣエンジニアリングの例を示す。
【図３】ノブ・イン・ホールのｐＭＨＣ設計（ロイシンジッパー有りと無し）の概略を示す。
【図４Ａ】ＢＤＣ２．５ｍｉ／ＩＡｇ７のノブ・イン・ホールのｐＭＨＣをコードするレンチウイルスで形質導入されたＣＨＯ細胞におけるｅＧＦＰ発現のフローサイトメトリー分析を示す。ロイシンジッパー有り（左）またはロイシンジッパー無し（右）。
【図４Ｂ】ロイシンジッパーのない、ノブ・イン・ホールベースのｐＭＨＣを発現するＣＨＯ細胞からの培養上清のＧタンパク質アフィニティークロマトグラフィー溶出像を示す。
【図４Ｃ】ロイシンジッパーのある、ノブ・イン・ホールベースのｐＭＨＣを発現するＣＨＯ細胞からの培養上清のＧタンパク質アフィニティークロマトグラフィー溶出像を示す。
【図５】天然の（左）、および変質した（右）ＳＤＳ−ＰＡＧＥによる、ジッパーのないノブ・イン・ホールベースのｐＭＨＣの電気泳動易動度を示す。
【図６】従来のｐＭＨＣモノマー（左パネル）で作られた四量体を使用したＢＤＣ２．５−ＣＤ４＋Ｔ細胞像、またはジッパーのないノブ・イン・ホールベースの設計（中パネルと右パネル）の染色を示す。
【図７】ジッパーのないＢＤＣ２．５ｍｉ／ＩＡｇ７ ノブ・イン・ホールのｐＭＨＣと結合した、ＰＦＭナノ粒子の未変性（左）、および変性（右）のＳＤＳ−ＰＡＧＥゲル画像を示す。
【図８】２．５ｍｉ／ＩＡｇ７ジッパーなしのノブ・イン・ホールのナノ粒子（左）またはジッパーのある従来のノブ・イン・ホールをベースとしない２．５ｍｉ／Ａｇ７ナノ粒子（右）で処置されたマウスからのＴ細胞反応を示す。マウスを１０回の投与で処置し（５週間、毎週２投与）、その後に脾臓のＴ細胞を単離し、２．５ｍｉ／ＩＡｇ７四量体の陽性と陰性のフラクションに選別し、抗ＣＤ３／抗ＣＤ２８ｍＡｂでコーティングされたビーズを用いて刺激した。処置に対して陽性または陰性の四量体からのＴＲ１細胞関連転写の存在について、ｍＲＮＡのアッセイを行った。
【図９Ａ】図８のように処置されたマウスから単離されたＴ細胞からのサイトカイン放出を示す。２．５ｍｉ／ＩＡｇ７−ジッパー無しのノブ・イン・ホールのナノ粒子（Ａ）、またはジッパーのある従来のノブ・イン・ホールベースではない２．５ｍｉ／Ａｇ７ナノ粒子（Ｂ）のいずれかでマウスを処置した。
【図９Ｂ】図８のように処置されたマウスから単離されたＴ細胞からのサイトカイン放出を示す。２．５ｍｉ／ＩＡｇ７−ジッパー無しのノブ・イン・ホールのナノ粒子（Ａ）、またはジッパーのある従来のノブ・イン・ホールベースではない２．５ｍｉ／Ａｇ７ナノ粒子（Ｂ）のいずれかでマウスを処置した。
【図１０】ＢＤＣ−ＰＥＧビオチンタンパク質のモノ−Ｑ精製プロフィールを示す。フラクションＮｏ．１９−３８を、ビオチンスクリーニングＥＬＩＳＡとＳＤＳ  ＰＡＧＥ分析のために回収した。
【図１１】モノ−Ｑ精製されたフラクションのＳＤＳ−ＰＡＧＥ像を示す。レーンは、各ＦＰＬＣフラクションの数で標識されている。２０μＬの各フラクションをゲルに載せた。
【図１２】フラクション２２−２５（レーン５−９）のウェスタンブロット分析を示し、これは、アルファ鎖内でビオチン化配列を運び、およびＢｉｒＡ酵素（レーン１）を使用してビオチン化されたＢＤＣ２．５ｍｉ／ＩＡｇ７  ｐＭＨＣモノマーと比較して、ｐＭＨＣモノマーのアルファ鎖にもっぱらビオチンが存在することを示す。フラクション＃２５−２９をプールし、ｐＭＨＣ四量体を調製するために使用した。レーン１１−１７はフラクション３０−３６を示す。
【図１３】ＢＤＣ２．５ｍｉ／Ｉ−Ａｇ７−マレイミド−ＰＥＧ２ビオチンを使用して生成された四量体で染色されたＢＤＣ２．５−ＣＤ４＋Ｔ細胞のフローサイトメトリー像を示す。
【図１４Ａ】ＦＰＬＣ溶出像を示す。
【図１４Ｂ】ＦＰＬＣ溶出像を示す。
【図１４Ｃ】図１４Ａと図１４Ｂに示される溶出フラクションのＳＤＳ−ＰＡＧＥ分析を示す。
【図１４Ｄ】図１４Ａと図１４Ｂに示される溶出フラクションのＳＤＳ−ＰＡＧＥ分析を示す。
【図１５Ａ】ＩＧＲＰ１３−２５ポリペプチドと複合したＤＲに特異的なＴＣＲを発現するＧＦＰ標識されたＪＵＲＭＡ細胞のフローサイトメトリーを示す。細胞株のみを示す。
【図１５Ｂ】ＩＧＲＰ１３−２５ポリペプチドと複合したＤＲに特異的なＴＣＲを発現するＧＦＰ標識されたＪＵＲＭＡ細胞のフローサイトメトリーを示す。標準的なロイシンジッパー二量体化技術によって作られたＰＥ標識ＤＲ３  ＩＧＲＰ１３−２５でインキュベートされた細胞株を示す。
【図１５Ｃ】ＩＧＲＰ１３−２５ポリペプチドと複合したＤＲに特異的なＴＣＲを発現するＧＦＰ標識されたＪＵＲＭＡ細胞のフローサイトメトリーを示す。ロイシンジッパーのない、ノブ・イン・ホールのｃｙｓ捕捉二量体化技術を使用して作られたＰＥ標識ＤＲ３  ＩＧＲＰ１３−２５でインキュベートされた細胞株を示す。
【図１５Ｄ】ＩＧＲＰ１３−２５ポリペプチドと複合したＤＲに特異的なＴＣＲを発現するＧＦＰ標識されたＪＵＲＭＡ細胞のフローサイトメトリーを示す。無関係のＰＥ標識ＭＨＣクラスＩＩヘテロダイマーでインキュベートされた細胞株を示す。
【図１６Ａ】ナノペプチドに結合したＩＧＲＰ１３−２５ポリペプチドと複合したＤＲに特異的なＴＣＲを発現するＪＵＲＭＡ細胞の刺激を示す。
【図１６Ｂ】ナノペプチドに結合したＩＧＲＰ１３−２５ポリペプチドと複合したＤＲに特異的なＴＣＲを発現するＪＵＲＭＡ細胞の刺激を示す。
【発明を実施するための形態】
【００３３】
様々な実施形態が以下に記載される。特定の実施形態は、完全な記述として、または本明細書で論じられたより広い態様に対する制限として意図されているわけではないことに留意すべきである。特定の実施形態と併せて記載される一態様は、必ずしもその実施形態に限定されず、他の実施形態と共に実施することが可能である。
【００３４】
一態様において、本明細書で提供されるのは、少なくとも１つの第１のポリペプチドと少なくとも１つの第２のポリペプチドを含む単離されたヘテロダイマーであって、ここで第１のポリペプチドと第２のポリペプチドは界面で出会い、第１のポリペプチドの界面は、第２のポリペプチドの界面にある設計された腔に配置することができる設計された隆起を含み；および（ｉ）第１のポリペプチドは、ＭＨＣクラスＩＩα１ドメイン、ＭＨＣクラスＩＩα２ドメイン、またはそれらの組み合わせを含み；および第２のポリペプチドは、ＭＨＣクラスＩＩβ１ドメイン、ＭＨＣクラスＩＩβ２ドメイン、またはそれらの組み合わせを含み；または（ｉｉ）第１のポリペプチドは、ＭＨＣクラスＩＩβ１ドメイン、ＭＨＣクラスＩＩβ２ドメイン、またはそれらの組み合わせを含み；および第２のポリペプチドは、ＭＨＣクラスＩＩα１ドメイン、ＭＨＣクラスＩＩα２ドメイン、またはそれらの組み合わせを含む。第１のポリペプチドと第２のポリペプチドのいずれか、または両方が、ポリペプチドに融合した抗体ＣＨ３ドメインを含み得る。随意に、第１のポリペプチドと第２のポリペプチドのいずれか、または両方が、ＭＨＣ（α鎖またはβ鎖）とＣＨ３ドメインとの間に位置する抗体ＣＨ２ドメインを含む。特定の実施形態では、第１のポリペプチドは抗体ＣＨ３ドメインを含み、および抗体ＣＨ３ドメインは、Ｓ３５４Ｃ、Ｔ３６６Ｗ、およびＳ３５４ＣとＴ３６６Ｗの両方（ＥＵの番号付け）から成るリストから選択される少なくとも１つの突然変異を含む。特定の実施形態では、第２のポリペプチドは抗体ＣＨ３ドメインを含み、および抗体ＣＨ３ドメインは、Ｙ３４９Ｃ、Ｔ３６６Ｓ、Ｌ３６８Ａ、Ｙ４０７Ｖ（ＥＵの番号付け）、およびそれらの組み合わせから成るリストから選択される少なくとも１つの突然変異を含む。さらなる実施形態では、単離されたヘテロダイマーは、自己免疫または炎症性疾患に関連するペプチドを含み、随意に第１または第２のポリペプチドのいずれかに共有結合される。随意に、自己免疫または炎症性疾患に関連するペプチドは、システイン捕捉を生成するために第１または第２のポリペプチドのいずれかにおいてシステイン残基と相互作用するシステイン残基を含む。
【００３５】
一態様では、ヘテロダイマーの１つのポリペプチドは、ＭＨＣクラスＩＩα１ドメイン、ＭＨＣクラスＩＩα２ドメイン、またはそれらの組み合わせを含み；および少なくとも１つの設計された隆起を含むポリペプチドである。いくつかの実施形態において、少なくとも１つの設計された隆起は、ＭＨＣクラスＩＩα１ドメインまたはＭＨＣクラスＩＩα２ドメインには位置しない。いくつかの実施形態において、設計された隆起は、ポリペプチドに融合した抗体ＣＨ３ドメインに位置する。いくつかの実施形態において、ポリペプチドは、設計された隆起を伴うＭＨＣクラスＩＩα２ドメインとＣＨ３ドメインの間に位置する抗体ＣＨ２ドメインを随意に含む。特定の実施形態では、ポリペプチドは抗体ＣＨ３ドメインを含み、および抗体ＣＨ３ドメインは、Ｓ３５４Ｃ、Ｔ３６６Ｗ、およびＳ３５４ＣとＴ３６６Ｗの両方（ＥＵの番号付け）から成るリストから選択される少なくとも１つの突然変異を含む。さらなる実施形態では、ポリペプチドは自己免疫または炎症性疾患に関連するペプチドを含む。随意に、自己免疫または炎症性疾患に関連するペプチドは、システイン捕捉を生成するためにＭＨＣ  α１またはβ１のドメインのいずれかにおいてシステイン残基と相互作用するシステイン残基を含む。
【００３６】
一態様では、ヘテロダイマーの１つのポリペプチドは、ＭＨＣクラスＩＩβ１ドメイン、ＭＨＣクラスＩＩβ２ドメイン、またはそれらの組み合わせを含み；および少なくとも１つの設計された隆起を含むポリペプチドである。いくつかの実施形態において、少なくとも１つの設計された隆起は、ＭＨＣクラスＩＩβ１ドメインまたはＭＨＣクラスＩＩβ２ドメインには位置しない。いくつかの実施形態において、設計された隆起は、ポリペプチドに融合した抗体ＣＨ３ドメインに位置する。いくつかの実施形態において、ポリペプチドは、設計された隆起を伴うＭＨＣクラスＩＩβ２ドメインとＣＨ３ドメインの間に位置する抗体ＣＨ２ドメインを随意に含む。特定の実施形態では、ポリペプチドは抗体ＣＨ３ドメインを含み、および抗体ＣＨ３ドメインは、Ｓ３５４Ｃ、Ｔ３６６Ｗ、およびＳ３５４ＣとＴ３６６Ｗの両方（ＥＵの番号付け）から成るリストから選択される少なくとも１つの突然変異を含む。さらなる実施形態では、ポリペプチドは自己免疫または炎症性疾患に関連するペプチドを含む。随意に、自己免疫または炎症性疾患に関連するペプチドは、システイン捕捉を生成するためにＭＨＣ  α１またはβ１のドメインのいずれかにおいてシステイン残基と相互作用するシステイン残基を含む。
【００３７】
一態様では、ヘテロダイマーの１つのポリペプチドは、ＭＨＣクラスＩＩα１ドメイン、ＭＨＣクラスＩＩα２ドメイン、またはそれらの組み合わせを含み；および少なくとも１つの設計された腔を含むポリペプチドである。いくつかの実施形態において、少なくとも１つの設計された腔は、ＭＨＣクラスＩＩα１ドメインまたはＭＨＣクラスＩＩα２ドメインには位置しない。いくつかの実施形態において、設計された腔は、ポリペプチドに融合した抗体ＣＨ３ドメインに位置する。いくつかの実施形態において、ポリペプチドは、設計された腔を伴うＭＨＣクラスＩＩα２ドメインとＣＨ３ドメインの間に位置する抗体ＣＨ２ドメインを随意に含む。特定の実施形態では、ポリペプチドは抗体ＣＨ３ドメインを含み、および抗体ＣＨ３ドメインは、Ｙ３４９Ｃ、Ｔ３６６Ｓ、Ｌ３６８Ａ、Ｙ４０７Ｖ（ＥＵの番号付け）、およびそれらの組み合わせから成るリストから選択される少なくとも１つの突然変異を含む。さらなる実施形態では、ポリペプチドは自己免疫または炎症性疾患に関連するペプチドを含む。随意に、自己免疫または炎症性疾患に関連するペプチドは、システイン捕捉を生成するためにＭＨＣ  α１またはβ１のドメインのいずれかにおいてシステイン残基と相互作用するシステイン残基を含む。
【００３８】
一態様では、ヘテロダイマーの１つのポリペプチドは、ＭＨＣクラスＩＩβ１ドメイン、ＭＨＣクラスＩＩβ２ドメイン、またはそれらの組み合わせを含み；および少なくとも１つの設計された腔を含むポリペプチドである。いくつかの実施形態において、少なくとも１つの設計された腔は、ＭＨＣクラスＩＩβ１ドメインまたはＭＨＣクラスＩＩβ２ドメインには位置しない。いくつかの実施形態において、設計された腔は、ポリペプチドに融合した抗体ＣＨ３ドメインに位置する。いくつかの実施形態において、ポリペプチドは、設計された腔を伴うＭＨＣクラスＩＩβ２ドメインとＣＨ３ドメインの間に位置する抗体ＣＨ２ドメインを随意に含む。特定の実施形態では、ポリペプチドは抗体ＣＨ３ドメインを含み、および抗体ＣＨ３ドメインは、Ｙ３４９Ｃ、Ｔ３６６Ｓ、Ｌ３６８Ａ、Ｙ４０７Ｖ（ＥＵの番号付け）、およびそれらの組み合わせから成るリストから選択される少なくとも１つの突然変異を含む。さらなる実施形態では、ポリペプチドは自己免疫または炎症性疾患に関連するペプチドを含む。随意に、自己免疫または炎症性疾患に関連するペプチドは、システイン捕捉を生成するためにＭＨＣ  α１またはβ１のドメインのいずれかにおいてシステイン残基と相互作用するシステイン残基を含む。
【００３９】
本明細書で使用されるように、「約」は当業者によって理解され、それが使用される文脈に応じてある程度まで変動する。当業者にとって明確ではない該用語の使用がなされる場合、それが使用される文脈を考慮して、「約」は特定の用語の最大±１０％を意味する。
【００４０】
用語「ａ」と「ａｎ」と「ｔｈｅ」の使用、および要素を記述する文脈（特に以下の特許請求の範囲の文脈）における類似の指示物は、本明細書で別記されない限り、または文脈により明らかに矛盾しない限り、単数と複数の両方を包含すると解釈される。本明細書の数値範囲の列挙は、本明細書で別記されない限り、その範囲内にある各個別の値を個別に示す簡略表記法の役割を意図しているだけであり、各個別の値は、それらが個別に本明細書で列挙されたかのように本明細書に組み込まれる。本明細書で別記されない限り、または文脈によって明確に否定されない限り、本明細書に記載されるすべての方法は、任意の適切な順序で実行され得る。本明細書に提供されるあらゆる例または典型的な用語（例えば「など（ｓｕｃｈ  ａｓ）」）の使用は、実施形態をより良く例示するように意図されているにすぎず、別記されない限り、特許請求の範囲を限定するものではない。本明細書内のいずれの用語も、請求されていない要素を必須のものとして指示すると解釈されるべきでない。
【００４１】
本明細書で使用されるように、「ヘテロダイマー」は第１のポリペプチドと第２のポリペプチドを含む分子を指し、ここで第２のポリペプチドはアミノ酸配列において、少なくとも１つのアミノ酸残基だけ第１のポリペプチドとは異なる。「多量体」は、２つ以上のヘテロダイマーを含む、または本明細書に開示される４つ以上のポリペプチドを含む分子を指す。
【００４２】
本明細書で使用されるように、「個体」は「被験体」と同義である。個体は疾患を診断され得る。個体は、疾患の少なくとも１つの症状を示していることに基づいて特定の疾患を有する、前記疾患の家族歴を有する、前記疾患の明らかな（ｄｅｆｉｎｅ）リスクに関連する遺伝子型を有する、または個体を疾患のリスクにさらすであろうレベルの、またはそのレベル付近の１つまたは表現型の「臨床試験」測定値を有することが疑われ得る。個体は、ウマ、ネコ、イヌ、ブタ、ウシ、ヤギ、またはヒツジ等の哺乳動物であり得る。個体は、特定の例ではヒトであり得る。
【００４３】
本明細書で使用されるように、「ポリペプチド」は概して、約１０より多くのアミノ酸を有するペプチドとタンパク質を指す。
【００４４】
本明細書で使用されるように、「第１のポリペプチド」は第２のポリペプチドに関連付けられるポリペプチドである。第１と第２のポリペプチドは「界面」（以下で定義）で出会う。界面に加えて、第１のポリペプチドは、「結合ドメイン」（例えばリガンド結合ドメイン）等の１つ以上の追加のドメイン、またはＣＨ２とＣＨ１とＣＬドメインを含む抗体定常ドメイン（またはそれらの一部）を含んでもよい。いくつかの実施形態において、第１のポリペプチドは、抗体に由来する少なくとも１つのドメインを含む。さらなる実施形態では、ドメインは有利に、抗体のＣＨ３ドメイン等の定常ドメインである。またさらなる実施形態では、ドメインは、第１のポリペプチドの界面を形成する。
【００４５】
本明細書で使用されるように、「第２のポリペプチド」は「界面」を介して第１のポリペプチドに関連付けられるポリペプチドである。界面に加えて、第２のポリペプチドは、「結合ドメイン」（例えばリガンド結合ドメイン）等の１つ以上の追加のドメイン、またはＣＨ２とＣＨ１とＣＬドメインを含む抗体定常ドメイン（またはそれらの一部）を含んでもよい。いくつかの実施形態において、第２のポリペプチドは、抗体に由来する少なくとも１つのドメインを含む。さらなる実施形態では、ドメインは有利に、抗体のＣＨ３ドメイン等の定常領域である。またさらなる実施形態では、ドメインは、第２のポリペプチドの界面を形成する。
【００４６】
本明細書で使用されるように、「結合ドメイン」は、対象の分子（例えば抗原）に選択的に結合する要因となるポリペプチドの領域を含む。
【００４７】
本明細書で使用されるように、「結合溝」は、ＭＨＣクラスＩＩα１ドメインとＭＨＣクラスＩＩβ２ドメインとの間に形成されたＭＨＣクラスＩＩヘテロダイマーに存在する、分子のポケットまたはくぼみを指す。これは、抗原と相互作用するＭＨＣクラスＩＩヘテロダイマーの部分である。抗原は概してポリペプチド抗原であるが、脂質部分、グリコール部分または糖脂質部分によってさらに修飾され得る。結合溝を作る残基は多形性を示し、および異なるＨＬＡ対立遺伝子間の抗原結合における違いを説明する。ＭＨＣクラスＩＩ分子の結合溝の重要な特徴は、溝の端部が開いており、結合溝の片側または両側を越えて抗原が伸長するのを可能にすることである。
【００４８】
本明細書で使用されるように、「界面」は、第２のポリペプチドの界面の１つ以上の「接触」アミノ酸残基と相互作用する第１のポリペプチドの「接触」アミノ酸残基を含む。いくつかの実施形態において、界面は、免疫グロブリンのＣＨ３ドメインを含む。さらなる実施形態では、免疫グロブリンはＩｇＧ抗体に由来する。ＩｇＧ抗体はＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３またはＩｇＧ４アイソタイプであり得る。またさらなる実施形態では、免疫グロブリンはヒトＩｇＧ１抗体に由来する。
【００４９】
本明細書で使用されるように、「隆起」は、第１のポリペプチドの界面から突き出し、したがってヘテロダイマーを安定させるために隣接する界面（すなわち第２のポリペプチドの界面）にある代償性の腔に配置可能であり、それによって例えばホモダイマー形成よりもヘテロダイマー形成を有利にする、少なくとも１つのアミノ酸側鎖を指す。隆起は、初期界面に存在してもよく、または合成され導入されてもよい（例えば、界面をコードする核酸を変質させることによって）。「設計された隆起」は合成され導入される。いくつかの実施形態において、第１のポリペプチドの界面をコードする核酸は、隆起をコードするために変質している。これを達成するために、第１のポリペプチドの界面の少なくとも１つの「初期」アミノ酸残基をコードする核酸は、初期アミノ酸残基よりも大きな側鎖量を有する少なくとも１つの「移入」核酸残基をコードする核酸で置き換えられる。複数の初期残基および対応する移入残基が存在し得ることが理解されよう。いくつかの実施形態において、置き換えられる初期残基の数の上限は、第１のポリペプチドの界面の残基の総数である。いくつかの実施形態において、隆起の形成のための移入残基は、概して、天然のアミノ酸残基である。いくつかの実施形態において、移入残基は、アルギニン（Ｒ）、システイン（Ｃ）、フェニルアラニン（Ｆ）、チロシン（Ｙ）、およびトリプトファン（Ｗ）から選択される。いくつかの実施形態において、移入残基は、アルギニン（Ｒ）、フェニルアラニン（Ｆ）、チロシン（Ｙ）、およびトリプトファン（Ｗ）から選択される。いくつかの実施形態では、移入残基はトリプトファンとチロシンである。いくつかの実施形態では、移入残基はトリプトファンとシステインである。いくつかの実施形態において、隆起の形成のための初期残基は、アラニン、アスパラギン、アスパラギン酸、グリシン、セリン、トレオニン、またはバリン等の、小さな側鎖量を有する。いくつかの実施形態において、セリン残基はシステインと置き換えられ、およびトレオニン残基はトリプトファンと置き換えられる。いくつかの実施形態において、位置３５４のセリンは、隆起の一部または全体を形成するために、他のアミノ酸残基と置き換えられる。いくつかの実施形態において、位置３６６のトレオニンは、隆起の一部または全体を形成するために、他のアミノ酸残基と置き換えられる。さらなる実施形態では、アミノ酸置換はＳ３５４ＣとＴ３６６Ｗ（ＥＵの番号付け）を含む。すべての番号付けは、Ｅｄｅｌｍａｎ，Ｇｅｒａｌｄ  Ｍ．ｅｔ  ａｌ．ＰＮＡＳ  ６３（１）（１９６９）：７８−８５に従う。
【００５０】
本明細書で使用されるように、「腔」は、第２のポリペプチドの界面から奥に引っ込んでおり、したがって第１のポリペプチドの隣接する界面上の対応する隆起を収容する、少なくとも１つのアミノ酸側鎖を指す。腔は、初期界面に存在してもよく、または合成され導入されてもよい（例えば、界面をコードする核酸を変質させることによって）。「設計された腔」は合成され導入される。いくつかの実施形態において、第２のポリペプチドの界面をコードする核酸は、腔をコードするために変質している。これを達成するために、第２のポリペプチドの界面の少なくとも１つの「初期」アミノ酸残基をコードする核酸は、初期アミノ酸残基よりも小さな側鎖量を有する少なくとも１つの「移入」核酸残基をコードするＤＮＡで置き換えられる。複数の初期残基および対応する移入残基が存在し得ることが理解されよう。置き換えられる初期残基の数の上限は、第２のポリペプチドの界面の残基の総数である。いくつかの実施形態において、腔の形成のための移入残基は、通常は天然のアミノ酸残基である。いくつかの実施形態において、移入残基は、アラニン（Ａ）、システイン（Ｃ）、セリン（Ｓ）、トレオニン（Ｔ）、およびバリン（Ｖ）から選択される。いくつかの実施形態において、移入残基は、アラニン（Ａ）、セリン（Ｓ）、トレオニン（Ｔ）、およびバリン（Ｖ）から選択される。いくつかの実施形態において、移入残基は、アラニン（Ａ）、システイン（Ｃ）、セリン（Ｓ）、およびバリン（Ｖ）から選択される。いくつかの実施形態において、移入残基はセリン、アラニンまたはトレオニンである。いくつかの実施形態において、移入残基は、アラニン（Ａ）、システイン（Ｃ）、セリン（Ｓ）、およびバリン（Ｖ）である。いくつかの実施形態において、位置３４９のチロシンは、腔の一部または全体を形成するために、他のアミノ酸残基と置き換えられる。いくつかの実施形態において、位置３６６のトレオニンは、腔の一部または全体を形成するために、他のアミノ酸残基と置き換えられる。いくつかの実施形態において、位置３６８のロイシンは、腔の一部または全体を形成するために、他のアミノ酸残基と置き換えられる。いくつかの実施形態において、位置４０７のチロシンは、腔の一部または全体を形成するために、他のアミノ酸残基と置き換えられる。いくつかの実施形態において、隆起の形成のための初期残基は、チロシン、アルギニン、フェニルアラニンまたはトリプトファン等の、大きな側鎖量を有する。他の実施形態では、初期残基はチロシン、トレオニン、およびロイシンから選択される。いくつかの実施形態において、１つ以上のチロシン残基はシステインまたはバリンと置き換えられ、トレオニン残基はセリンと置き換えられ、およびロイシン残基はアラニンと置き換えられる。さらなる実施形態では、アミノ酸置換はＹ３４９Ｃ、Ｔ３６６Ｓ、Ｌ３６８Ａ、およびＹ４０７Ｖ（ＥＵの番号付け）を含む。すべての番号付けは、Ｅｄｅｌｍａｎ，Ｇｅｒａｌｄ  Ｍ．ｅｔ  ａｌ．ＰＮＡＳ  ６３（１）（１９６９）：７８−８５に従う。
【００５１】
本明細書で使用されるように、「初期」アミノ酸残基は、初期残基より小さいまたは大きい側鎖量を有し得る「移入」残基によって置き換えられるものである。移入アミノ酸残基は、天然または非天然のアミノ酸残基であってもよいが、前者が好ましい。「天然の」アミノ酸残基は、遺伝子コードによってコードされた残基である。「非天然の」アミノ酸残基は、遺伝子コードによってコードされないが、ポリペプチド鎖の隣接するアミノ酸残基を共有結合することができる残基を意味する。非天然のアミノ酸残基の例は、ノルロイシン、オルニチン、ノルバリン、ホモセリン、および例えばＥｌｌｍａｎ  ｅｔ  ａｌ．，Ｍｅｔｈ．Ｅｎｚｙｍ．２０２：３０１−３３６（１９９１）に記載されるもの等の他のアミノ酸残基類似体である。そのような非天然のアミノ酸残基を生成するために、Ｎｏｒｅｎ  ｅｔ  ａｌ．Ｓｃｉｅｎｃｅ  ２４４：１８２（１９８９）およびＥｌｌｍａｎ  ｅｔ  ａｌ．，ｓｕｐｒａの手順を使用することができる。手短に言えば、これは、非天然のアミノ酸残基とサプレッサーｔＲＮＡを化学的に活性化し、その後にＲＮＡのインビトロ転写と翻訳を行うことを含む。本発明の方法は、少なくとも１つの初期アミノ酸残基を置き換える工程を含むが、複数の初期残基が置き換えられてもよい。通常は、第１または第２のポリペプチドの界面にある全残基だけが、置き換えられている初期アミノ酸残基を含む。置き換えのための好ましい初期残基は、「埋められている」。「埋められている」は、残基が溶媒に実質的に到達できないことを意味する。特定の実施形態では、移入残基はジスルフィド結合の酸化または誤対合を妨げるシステインではない。
【００５２】
隆起は腔に「配置することができ」、それは第１のポリペプチドと第２のポリペプチドの界面上の隆起と腔のそれぞれの空間的な位置、および隆起と腔のサイズが、界面における第１と第２のポリペプチドの正常な関連性を大幅に乱すことなく、隆起が腔に配置可能であるようなものであることを意味する。限定されないがＣｙｓ、Ｔｙｒ、Ｐｈｅ、およびＴｒｐ等の１つ以上のアミノ酸を含む隆起が、典型的には界面の軸から垂直に伸びず、かつ好ましい構造を有しているため、対応する腔を有する隆起の配列は、Ｘ線結晶学または核磁気共鳴（ＮＭＲ）によって得られるもの等の三次元構造に基づいた隆起／腔のペアのモデル化に依拠する。これは当技術分野で広く容認された技術を使用して達成することができる。
【００５３】
「初期核酸」は、隆起または腔をコードするために「変質させる」（すなわち遺伝子的に設計または変異させる）ことができる対象のポリペプチドをコードする核酸である。初期核酸または開始核酸は天然の核酸であってもよく、または先の変化を受ける核酸を含んでもよい（例えばヒト化抗体フラグメント）。「変質させる」は、初期核酸が、対象のアミノ酸残基をコードする少なくとも１つのコドンにおいて挿入、欠失、または置換によって変異していることを意味する。通常、初期残基をコードするコドンは、移入残基をコードするコドンにより置き換えられる。このようにＤＮＡを遺伝子組換えするための技術は、Ｍｕｔａｇｅｎｅｓｉｓ：ａ  Ｐｒａｃｔｉｃａｌ  Ａｐｐｒｏａｃｈ，Ｍ．Ｊ．ＭｃＰｈｅｒｓｏｎ，Ｅｄ．，（ＩＲＬ  Ｐｒｅｓｓ，Ｏｘｆｏｒｄ，ＵＫ．（１９９１））で調査され、および例えば、部位特異的突然変異誘発、カセット式変異誘発、およびポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）突然変異誘発を含む。
【００５４】
隆起または腔は、合成手段によって、例えば組換え技術、インビトロペプチド合成、前記の非天然のアミノ酸残基を導入するための技術、ペプチドの酵素結合または化学結合、またはこれらの技術のいくつかの組み合わせによって、第１または第２のポリペプチドに「導入する」ことができる。したがって、「導入される」隆起または腔は、「非天然」または「ノンネイティブ」であり、これは自然界または初期ポリペプチド（例えばヒト化モノクローナル抗体）にそれが存在しないことを意味する。
【００５５】
むしろ、隆起を形成するための移入アミノ酸残基は、比較的少数の「回転異性体」（例えば約３〜６）を有する。「回転異性体」はアミノ酸側鎖の精力的に有利な配座である。様々なアミノ酸残基の回転異性体の数は、Ｐｏｎｄｅｒｓ  ａｎｄ  Ｒｉｃｈａｒｄｓ，Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．１９３：７７５−７９１（１９８７）で調査されている。
【００５６】
本明細書で使用されるように、「ノブ・イン・ホール（ｋｎｏｂ−ｉｎ−ｈｏｌｅまたはｋｎｏｂ−ｉｎｔｏ−ｈｏｌｅ）」は、第１のポリペプチドの界面に隆起（または「ノブ」）を、および第２のポリペプチドの界面に対応する腔（「ホール」）を要し、それによって隆起を腔に配置することができ、ヘテロダイマー形成が促進される、ポリペプチド構造を指す。隆起は、第１のポリペプチドの界面からの小さなアミノ酸側鎖をより大きな側鎖（例えばフェニルアラニンまたはチロシン）と置き換えることによって構築され得る。大きなアミノ酸側鎖をより小さなアミノ酸側鎖（例えばアラニンまたはトレオニン）と置き換えることによって、隆起と同一または類似のサイズの腔が、第２のポリペプチドの界面に作られ得る。隆起と腔は、当業者が慣例的な方法を使用して、ポリペプチドをコードする核酸を変質させることによって、またはペプチド合成等の合成手段によって、作ることができる。いくつかの実施形態では、第１のポリペプチドの界面は、第１のポリペプチドのＦｃドメイン上に位置し、および第２のポリペプチドの界面は、第２のポリペプチドのＦｃドメイン上に位置する。ノブ・イン・ホールのあるヘテロダイマーとその調製および使用の方法は、米国特許第５，７３１，１６８号；５，８０７，７０６号；５，８２１，３３３号；７，６４２，２２８号；７，６９５，９３６号；８，２１６，８０５号；および８，６７９，７８５号、およびＭｅｒｃｈａｎｔ  ｅｔ  ａｌ．，Ｎａｔｕｒｅ  Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ，１９９８，１６：６７７−６８１に開示され、それらの全体が参照により本明細書に組み込まれる。
【００５７】
本明細書で使用されるように、「単離された」ヘテロダイマーは、その生来の細胞培養環境の構成要素から識別されて分離され、および／または回収されたヘテロダイマーを意味する。その自然環境の汚染物質成分は、ヘテロダイマーの診断的使用または治療的使用に干渉する物質であり、酵素、ホルモン、および他のタンパク質溶質または非タンパク質溶質を含み得る。好ましい実施形態では、ヘテロダイマーは、（１）ローリー法によって決定されるタンパク質の９５重量％より多く、および最も好ましくは９９重量％より多くまで、（２）スピニングカップシーケネイター（ｓｐｉｎｎｉｎｇ  ｃｕｐ  ｓｅｑｕｅｎａｔｏｒ）を使用して、Ｎ末端または内部のアミノ酸配列の少なくとも１５残基を得るのに十分な程度まで、または（３）クマシーブルーまたはシルバーの染色を使用して、還元または非還元条件下でＳＤＳ−ＰＡＧＥにより均質に、精製される。
【００５８】
本明細書の「ナノスフェア」、「ＮＰ」、または「ナノ粒子」は、被験体、細胞標本、または組織標本に適切に単回または複数回投与される小さな分離した粒子を意味する。特定の実施形態では、本明細書で使用される用語「ナノ粒子」は、ナノ粒子コアのまわりのいかなる層をも含む。特定の実施形態では、ナノ粒子は実質的に球形である。特定の実施形態では、ナノ粒子はリポソームまたはウイルス粒子ではない。さらなる実施形態では、ナノ粒子は、任意の適切な物質、例えば固体、ソリッドコア、金属、デンドリマー、ポリマーミセル、金属酸化物、タンパク質またはフラグメント、またはそれらの組み合わせから成る。用語「実質的に球状の」は、本明細書で使用されるように、粒子の形状が約１０％より多く球体から逸脱していないことを意味する。本開示の様々な既知の抗原またはペプチドの複合体は、粒子に適用され得る。本開示のナノ粒子は、約１ｎｍから約１μｍ、約１ｎｍから約５００ｎｍ、または代替的に約１ｎｍから約１００ｎｍ、または代替的に約１ｎｍから約５０ｎｍ、または代替的に約５ｎｍから約１００ｎｍの範囲のサイズであり、およびいくつかの態様では、複数のナノ粒子を意図している場合には、複数の粒子の平均または中間の直径が参照される。より小さなナノサイズ粒子は、例えばより大きな粒子を水溶液に沈殿させることができる分画プロセスによって得ることができる。溶液の上部はその後、当業者に既知の方法で回収される。この上部は、より小さなサイズ粒子で富化される。該プロセスは、望ましいサイズが生成されるまで繰り返すことができる。用語「ナノ構造体」は、約１μｍより小さな構造を記載するために一般に使用される。
【００５９】
抗原−ＭＨＣ−ナノ粒子複合体（「ＮＰ複合体」または「複合体」、またはｐＭＨＣ−ＮＰまたは「ナノ粒子複合体」）は、ペプチド、炭水化物、脂質、またはナノ粒子コア等の、表面上の抗原分子またはタンパク質（すなわち自己ペプチドまたは自己抗原）の他の抗原部分、フラグメント、またはエピトープの、フラグメントまたはエピトープの提示を指す。
【００６０】
「ナノ粒子コア」は、層またはコーティングを含む、または含まないナノ粒子基質である。ナノ粒子複合体は、コアに連結された少なくとも抗原−ＭＨＣ複合体を有するコアを含む。
【００６１】
「密度」は、ナノ粒子あたりのｐＭＨＣを指す場合、リンカーも含むことができる外層の有る、または外層の無いナノ粒子コアの表面積として算出される。表面積は、使用される構成物の利用可能な全表面積である。一態様では、ＰＥＧリンカーが使用される場合、これは、ナノ粒子の利用可能な全表面積の表面積を適宜、増加させる約２０ｎｍ２のナノ粒子によって、ナノ粒子コアの直径の合計を増加させることができる。言いかえれば、それは、ｐＭＨＣ、共刺激分子、および／またはサイトカインの１つ以上の付加のない、ナノ粒子の最終的な表面積である。
【００６２】
本明細書で使用される「抗原」は、被験体の免疫反応、または免疫細胞、好ましくはＴ細胞またはＢ細胞の拡張を誘発することができる分子のすべて、一部、フラグメント、またはセグメントを指す。
【００６３】
本明細書で使用されるように、用語「疾患関連の」抗原は、選択された疾患を処置するために選択された抗原またはそのフラグメントを指し、およびその疾患プロセスに関与する。例えば、糖尿病関連の抗原は、提示された時に糖尿病を処置する役目を果たす免疫反応を生み出す抗原またはそのフラグメントであり；したがって、そのような効果を生み出す糖尿病関連の抗原は、糖尿病を処置するために選択される。多発性硬化症（ＭＳ）関連の抗原は、ＭＳを処置するために選択される。糖尿病関連の抗原は、ＭＳを処置するためには選択されないだろう。同様に、自己免疫関連の抗原は、自己免疫疾患に関連する抗原であり、自己免疫以外の障害または疾患、例えば癌の処置用には選択されないだろう。非限定的で典型的な疾患関連の抗原が本明細書に開示され、さらにそのような抗原は、文献に記載されている技術、メカニズム、および方法に基づいて、特定の疾患に関して判定され得る。
【００６４】
＜ＭＨＣクラスＩＩヘテロダイマー、およびノブ・イン・ホールの構造＞
ＭＨＣクラスＩＩ分子の発現は困難であり、なぜなら膜貫通性および細胞質のドメインを欠いた分泌されたＭＨＣクラスＩＩα鎖とβ鎖は、ペプチドリガンドの存在下においてさえも、安定したヘテロダイマーを形成しないからである。ＭＨＣクラスＩＩα鎖とβ鎖の細胞膜貫通領域は、恐らくは２つのα−螺旋形膜貫通性セグメントの相互作用によって、αβヘテロダイマーの適切なアセンブリを促進する。
【００６５】
現在、最先端技術は、ロイシンジッパーを使用した、ｐＭＨＣ四量体を生成するための組換えｐＭＨＣクラスＩＩ分子の生成である。これは、ＮＩＨ四量体設備とｐＭＨＣ四量体の商用サプライヤーにもあてはまる。
【００６６】
しかしながらこのアプローチはそれ自体に、疾患関連のｐＭＨＣクラスＩＩナノ粒子化合物の精製のためのｐＭＨＣクラスＩＩモノマーを構築するプラットホームとしての限界がある：１）ｐＭＨＣ−ナノ粒子で処置された個体において、ｊｕｎ／ｆｏｓ配列が「外来」と認識され、したがって免疫原であるかもしれないという可能性、これは可能性として、特に連続投与後に治療活性を制限し得る；２）親和性分離タグがｐＭＨＣ複合体に導入されない場合、真核細胞培養（すなわちチャイニーズハムスター卵巣−ＣＨＯ−）上清からのｐＭＨＣ複合体のクロマトグラフィー分離は困難である；および、３）アフィニティータグはまた、ＦＬＡＧまたは６ｘＨＩＳ等のアフィニティータグの抗原性ゆえに問題である。抗原性の可能性と、異なるタンパク質の精製におけるそれらの可能性のある広範な使用ゆえに、これらのタグはヒト治療の用途には好まれない。不運にも、これらのタンパク質へのアフィニティータグの付加は、抗薬物抗体（ＡＤＡ）の生成を引き起こし得る。
【００６７】
一態様において、本明細書で提供されるのは、少なくとも１つの第１のポリペプチドと少なくとも１つの第２のポリペプチドを含む単離されたヘテロダイマーであって、ここで第１のポリペプチドと第２のポリペプチドは界面で出会い、第１のポリペプチドの界面は、第２のポリペプチドの界面にある設計された腔に配置することができる設計された隆起を含み；および（ｉ）第１のポリペプチドは、ＭＨＣクラスＩＩα１ドメイン、ＭＨＣクラスＩＩα２ドメイン、またはそれらの組み合わせを含み；および第２のポリペプチドは、ＭＨＣクラスＩＩβ１ドメイン、ＭＨＣクラスＩＩβ２ドメイン、またはそれらの組み合わせを含み；または（ｉｉ）第１のポリペプチドは、ＭＨＣクラスＩＩβ１ドメイン、ＭＨＣクラスＩＩβ２ドメイン、またはそれらの組み合わせを含み；および第２のポリペプチドは、ＭＨＣクラスＩＩα１ドメイン、ＭＨＣクラスＩＩα２ドメイン、またはそれらの組み合わせを含む。
【００６８】
他の態様において、本明細書で提供されるのは、第１のポリペプチドと第２のポリペプチドを含む単離されたヘテロダイマーであって、ここで第１のポリペプチドと第２のポリペプチドは界面で出会い、第１のポリペプチドの界面は、第２のポリペプチドの界面にある設計された腔に配置することができる設計された隆起を含み；および（ｉ）第１のポリペプチドは、ＭＨＣクラスＩＩα１ドメイン、ＭＨＣクラスＩＩα２ドメイン、またはそれらの組み合わせを含み；および第２のポリペプチドは、ＭＨＣクラスＩＩβ１ドメイン、ＭＨＣクラスＩＩβ２ドメイン、またはそれらの組み合わせを含み；または（ｉｉ）第１のポリペプチドは、ＭＨＣクラスＩＩβ１ドメイン、ＭＨＣクラスＩＩβ２ドメイン、またはそれらの組み合わせを含み；および第２のポリペプチドは、ＭＨＣクラスＩＩα１ドメイン、ＭＨＣクラスＩＩα２ドメイン、またはそれらの組み合わせを含む。
【００６９】
他の態様において、本明細書で提供されるのは、第１のポリペプチドと第２のポリペプチドを含む単離されたヘテロダイマーであって、ここで第１のポリペプチドと第２のポリペプチドは界面で出会い、第１のポリペプチドの界面は、第２のポリペプチドの界面にある設計された腔に配置することができる設計された隆起を含み；および（ｉ）第１のポリペプチドは、ＭＨＣクラスＩＩα１ドメインおよびＭＨＣクラスＩＩα２ドメインを含み；および第２のポリペプチドは、ＭＨＣクラスＩＩβ１ドメインおよびＭＨＣクラスＩＩβ２ドメインを含み；または（ｉｉ）第１のポリペプチドは、ＭＨＣクラスＩＩβ１ドメインおよびＭＨＣクラスＩＩβ２ドメインを含み；および第２のポリペプチドは、ＭＨＣクラスＩＩα１ドメインおよびＭＨＣクラスＩＩα２ドメインを含む。
【００７０】
いくつかの実施形態において、第１のポリペプチドと第２のポリペプチドは各々が、抗体のＣＨ３ドメインを含み、かつＣＨ３ドメインを介して接する。いくつかの実施形態において、第１のポリペプチドと第２のポリペプチドは各々が抗体のＣＨ２ドメインを含み、かつＣＨ２ドメインを介して接する。いくつかの実施形態において、第１のポリペプチドと第２のポリペプチドは各々が、抗体のＣＨ２ドメインとＣＨ３ドメインを含み、かつＣＨ２ドメインと、ＣＨ３ドメイン、またはそれらの組み合わせを介して接する。いくつかの実施形態において、第１のポリペプチドと第２のポリペプチドは各々が、抗体のＣＨ２ドメインとＣＨ３ドメインを含み、かつＣＨ３ドメインを介して接する。いくつかの実施形態では、ＣＨ３ドメインはＩｇＧからのものである。いくつかの実施形態では、ＣＨ２ドメインはＩｇＧからのものである。ＩｇＧ抗体はＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３またはＩｇＧ４サブタイプであり得る。いくつかの実施形態では、ＩｇＧはＩｇＧ１サブタイプである。
【００７１】
いくつかの実施形態では、第１のポリペプチドおよび／または第２のポリペプチドは、Ｃ−末端システイン残基をさらに含む。いくつかの実施形態では、第１のポリペプチドと第２のポリペプチドは、Ｃ−末端システイン残基をさらに含む。いくつかの実施形態では、第１のポリペプチドまたは第２のポリペプチドは、Ｃ−末端システイン残基をさらに含む。いくつかの実施形態では、第１のポリペプチドはＣ−末端システイン残基をさらに含む。いくつかの実施形態では、第２のポリペプチドはＣ−末端システイン残基をさらに含む。
【００７２】
ＢｉｒＡを介したｐＭＨＣのビオチン化は、ストレプトアビジンを使用した、四量体化に適したビオチン化ｐＭＨＣモノマーを生成するために慣例的に使用される技術である。そのようなｐＭＨＣ四量体とその高位派生物（五量体、デキストラマー、または他の多量体）は、生体サンプル中の抗原特異性Ｔ細胞の頻度を列挙することができる試薬として有用である。いくつかの実施形態において、第１のポリペプチドおよび／または第２のポリペプチドは、ビオチン化部位をさらに含む。いくつかの実施形態において、第１のポリペプチドおよび第２のポリペプチドは、ビオチン化部位をさらに含む。いくつかの実施形態において、第１のポリペプチドまたは第２のポリペプチドは、ビオチン化部位をさらに含む。いくつかの実施形態では、第１のポリペプチドはビオチン化部位をさらに含む。いくつかの実施形態では、第２のポリペプチドはビオチン化部位をさらに含む。
【００７３】
いくつかの実施形態において、第１のポリペプチドおよび／または第２のポリペプチドは、Ｓｔｒｅｐ  ｔａｇをさらに含む。いくつかの実施形態において、第１のポリペプチドおよび第２のポリペプチドは、Ｓｔｒｅｐ  ｔａｇをさらに含む。いくつかの実施形態において、第１のポリペプチドまたは第２のポリペプチドは、Ｓｔｒｅｐ  ｔａｇをさらに含む。いくつかの実施形態では、第１のポリペプチドはＳｔｒｅｐ  ｔａｇをさらに含む。いくつかの実施形態では、第２のポリペプチドはＳｔｒｅｐ  ｔａｇをさらに含む。
【００７４】
いくつかの実施形態において、単離されたヘテロダイマーはロイシンジッパーさらに含む。いくつかの実施形態において、第１のポリペプチドは、Ｃ−Ｊｕｎフラグメントを含み、および第２のポリペプチドはＣ−Ｆｏｓフラグメントを含む。いくつかの実施形態では、単離されたヘテロダイマーはロイシンジッパーを含まない。
【００７５】
いくつかの実施形態において、単離されたヘテロダイマーは、ビオチン分子またはエピトープ／アフィニティー／精製タグ（例えばｃ−Ｍｙｃ、ＦＬＡＧ、Ｖ５、ポリヒスチジン、６ｘＨＩＳ等）を付着させるために、ＢｉｒＡ酵素が標的とするビオチン化配列等の、免疫反応の標的であり得る外来のタンパク質配列を欠いている。しばしばＭＨＣ二量体は、異種の二量体化ドメインを使用して生成される。いくつかの例は、ロイシンジッパー（Ｆｏｓ／Ｊｕｎ、Ａｃｉｄ−ｐ１／Ｂａｓｅ−ｐ１、またはＧＣＮ４二量体）、Ｃｏｌｉｃｉｎ  Ｅ９／Ｅ９  ＤＮａｓｅ免疫タンパク質二量体、またはＫｖ１．２  Ｔ１ドメイン二量体を含む。いくつかの実施形態において、単離されたヘテロダイマーには、ノブ・イン・ホールの構造以外の二量体化ドメインがない。いくつかの実施形態において、単離されたヘテロダイマーにはロイシンジッパー二量体化ドメインがない。いくつかの実施形態において、単離されたヘテロダイマーにはｃ−ＦＯＳ／ｃ−ＪＵＮ二量体化ドメインがない。
【００７６】
特定の実施形態では、ヘテロダイマーのＭＨＣクラスＩＩα１ドメイン、ＭＨＣクラスＩＩα２ドメイン、ＭＨＣクラスＩＩβ１ドメイン、およびＭＨＣクラスＩＩβ２ドメインは、ＨＬＡ−ＤＲ、ＨＬＡ−ＤＱまたはＨＬＡ−ＤＰ等のヒト白血球抗原（ＨＬＡ）分子に由来する。特定の実施形態では、ＭＨＣクラスＩＩα１ドメインとＭＨＣクラスＩＩα２ドメインは、ＤＲＡ、ＤＱＡ１またはＤＰＡ１に由来する。特定の実施形態では、ＭＨＣクラスＩＩα１ドメインまたはＭＨＣクラスＩＩα２ドメインは、ＤＲＡ、ＤＱＡ１またはＤＰＡ１に由来する。特定の実施形態では、ＭＨＣクラスＩＩβ１ドメインとＭＨＣクラスＩＩβ２は、ＨＬＡ−ＤＲＢ１、ＨＬＡ−ＤＲＢ３、ＨＬＡ−ＤＲＢ４、ＨＬＡ−ＤＲＢ５、ＨＬＡ−ＤＱＢ１またはＨＬＡ−ＤＰＢ１に由来する。特定の実施形態では、ＭＨＣクラスＩＩβ１ドメインまたはＭＨＣクラスＩＩβ２は、ＨＬＡ−ＤＲＢ１、ＨＬＡ−ＤＲＢ３、ＨＬＡ−ＤＲＢ４、ＨＬＡ−ＤＲＢ５、ＨＬＡ−ＤＱＢ１またはＨＬＡ−ＤＰＢ１に由来する。
【００７７】
いくつかの実施形態において、２つ以上のポリペプチドが、多量体を形成するためにポリマー骨格を介して互いに共有結合で連結される。いくつかの実施形態では、ポリマー骨格はデキストランまたはポリエチレングリコールである。いくつかの実施形態では、ヘテロダイマー内のポリペプチドの各々はポリマー骨格に付けられている。いくつかの実施形態では、ヘテロダイマー内のポリペプチドの各々は、各ポリペプチド上の末端システイン残基を介してポリマー骨格に付けられる。いくつかの実施形態では、ヘテロダイマー内のポリペプチドの各々は、各ポリペプチド上のビオチン化部位を介してポリマー骨格に付けられる。
【００７８】
いくつかの実施形態において、２つ以上のポリペプチドが、多量体を形成するためにアビジンを介して互いに共有結合で連結される。
【００７９】
＜抗原＞
特定の実施形態では、本明細書に記載されるヘテロダイマーは抗原をさらに含む。特定の実施形態では、抗原は、少なくとも１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、２９、３０、またはより多くのアミノ酸の長さであり、および特定の実施形態では５０、６０、７０、８０、９０、または１００アミノ酸より長くないポリペプチド抗原である。特定の実施形態では、抗原は疾患に関連する抗原である。特定の実施形態では、抗原は自己免疫疾患に関連する抗原である。特定の実施形態では、抗原は炎症性疾患に関連する抗原である。本明細書に記載される抗原は、ＭＨＣクラスＩＩαまたはＭＨＣクラスＩＩβポリペプチドのＮ−末端につながれる。特定の実施形態では、抗原は柔軟なペプチドリンカーによって結合される。リンカーは、例えばポリペプチドリンカーでもよく、およびグリシンとセリンを含むことができる。
【００８０】
特定の実施形態では、抗原は自己免疫に関連する抗原である。特定の実施形態では、自己免疫に関連する抗原は、Ｉ型糖尿病、多発性硬化症、セリアック病、原発性胆汁性肝硬変、自己免疫性肝炎、原発性硬化性胆管炎、天疱瘡、落葉性天疱瘡、尋常性天疱瘡、視神経脊髄炎スペクトル障害、関節炎（慢性関節リウマチを含む）、アレルギー性喘息、炎症性大腸疾患（クローン病と潰瘍性大腸炎を含む）、全身性エリテマトーデス、アテローム動脈硬化症、慢性閉塞性肺疾患、気腫、乾癬、自己免疫性肝炎、ブドウ膜炎、シェーグレン症候群、強皮症、抗リン脂質抗体症候群、ＡＮＣＡ関連の脈管炎、またはスティッフマン症候群に関連する抗原である。さらなる態様では、疾患に関連する抗原は、腫瘍または癌に関連する抗原である。特定の実施形態では、自己免疫に関連する抗原は、Ｉ型糖尿病関連の抗原である。特定の実施形態では、自己免疫に関連する抗原は、多発性硬化症関連の抗原である。特定の実施形態では、自己免疫に関連する抗原は、慢性関節リウマチ関連の抗原である。特定の実施形態では、自己免疫に関連する抗原は、クローン病関連の抗原である。特定の実施形態では、自己免疫に関連する抗原は、潰瘍性大腸炎疾患関連の抗原である。特定の実施形態では、自己免疫に関連する抗原は、セリアック病関連の抗原である。特定の実施形態では、自己免疫に関連する抗原は、肝胆汁性自己免疫疾患関連の抗原である。特定の実施形態では、肝胆汁性自己免疫疾患に関連する抗原は、原発性胆汁性肝硬変、自己免疫性肝炎または原発性硬化性胆管炎の疾患に関連する抗原である。特定の実施形態では、抗原は胃腸管の病原菌に由来する。特定の実施形態では、胃腸管の病原菌に由来する抗原は、フラゲリン、Ｆｌａ−２、Ｆｌａ−Ｘ、ＹＩＤＸ（ｕｎｃｈａｒａｃｔｅｒｉｚｅｄ  Ｅ．ｃｏｌｉ  ｐｒｏｔｅｉｎ）、またはバクテロイデス属インテグラーゼである。特定の実施形態では、抗原は食物抗原である。特定の実施形態では、食物抗原はグリアジンである。特定の実施形態では、食物抗原はオボアルブミンである。特定の実施形態では、食物抗原はピーナッツ由来の抗原である。
【００８１】
＜システイン捕捉＞
システイン捕捉は、本明細書に記載されるヘテロダイマーを安定させるために利用することができる。システイン捕捉は、結合されていないポリペプチドパートナーからの共有結合で連結されたポリペプチド複合体の形成を含む。いくつかの実施形態では、システイン捕捉は、安定したポリペプチド複合体を形成するために、ポリペプチドパートナーの相互作用界面内の戦略的に選択された位置にシステインを導入することを含む。いくつかの実施形態では、システイン捕捉は、特定の配座を有利にし、かつ解離を防ぐために、ポリペプチド複合体を安定させてもよい。システイン捕捉はまた、ジスルフィド捕捉、およびジスルフィド架橋とも呼ばれる。システイン捕捉の方法と応用の例は、Ｋｕｆａｒｅｖａ，ｅｔ  ａｌ．，Ｍｅｔｈｏｄｓ  Ｅｎｚｙｍｏｌ．５７０：３８９−４２０（２０１６）で調査されている。ＭＨＣの文脈では、システインは、ＭＨＣクラスＩＩ二量体の結合溝と関連することが既知の、または疑われるポリペプチドに設計される。システインはその後、結合溝またはその近くへと設計され、そうすると、ポリペプチドが結合溝と関連する場合に、結合溝システインは近くに入ってポリペプチドシステインとジスルフィド結合を形成することができる。
【００８２】
システイン捕捉の使用のために、ヘテロダイマーを構築するポリペプチドへと２つのシステインを設計する必要がある。第１のシステインは、ＭＨＣクラスＩＩ結合溝内またはその近くにある「結合溝システイン」である。結合溝システインは、１、２、３、４、５、６、７、８、９または１０以内の結合溝のアミノ酸であり得る。システインは、アルファ鎖またはベータ鎖のいずれか、および結合溝のＮまたはＣ−末端のいずれかに位置し得る。第２のシステインは、結合溝に関連する抗原ポリペプチド内またはその近くの「ポリペプチドシステイン」である。ポリペプチドシステインは、１、２、３、４、５、６、７、８、９または１０以内の抗原ポリペプチドであり得る。ポリペプチドシステインは、抗原ポリペプチドのＮ−末端またはＣ−末端のいずれかに存在し得る。通常、抗原ポリペプチドは柔軟なリンカーによってアルファ鎖またはベータ鎖のいずれかにつながれ、およびシステインはリンカーと抗原ポリペプチドの間に配置される。いくつかの実施形態において、ポリペプチド鎖の配置は、抗原ポリペプチド−ポリペプチド−システイン−リンカー−ＭＨＣクラスＩＩα１ドメイン、ＭＨＣクラスＩＩα２ドメインである。いくつかの実施形態において、ポリペプチド鎖の配置は、抗原ポリペプチド−ポリペプチド−システイン−リンカー−ＭＨＣクラスＩＩβ１ドメイン、ＭＨＣクラスＩＩβ２ドメインである。いくつかの実施形態において、ポリペプチド鎖の配置は、ポリペプチドシステイン−抗原ポリペプチド−リンカー−ＭＨＣクラスＩＩα１ドメイン、ＭＨＣクラスＩＩα２ドメインである。いくつかの実施形態において、ポリペプチド鎖の配置は、ポリペプチドシステイン−抗原ポリペプチド−リンカー−ＭＨＣクラスＩＩβ１ドメイン、ＭＨＣクラスＩＩβ２ドメインである。これらのＭＨＣクラスＩＩポリペプチドは、１つのポリペプチド上に設計されたノブを有するＣＨ２およびＣＨ３ドメインと、他のポリペプチド上の設計されたホールを有するＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含むことができる。特定の例では、抗原ポリペプチドは、システイン残基を加える必要をなくす、天然のシステインを含み得る。
【００８３】
いくつかの実施形態では、本明細書に記載されるヘテロダイマーのポリペプチドは、システインを導入するために１つ以上の突然変異を含む。いくつかの実施形態では、突然変異はＭＨＣクラスＩＩアルファ鎖にある場合もある。いくつかの実施形態では、突然変異はＭＨＣクラスＩＩベータ鎖にある場合もある。いくつかの実施形態では、突然変異はＭＨＣクラスＩＩα１ドメインにある場合もある。いくつかの実施形態では、突然変異はＭＨＣクラスＩＩβ１ドメインにある場合もある。いくつかの実施形態では、突然変異は、アルファ鎖とベータ鎖の一方または両方の、ＭＨＣクラスＩＩα１鎖とβ１鎖の間に形成された結合溝の近くにある場合もある。いくつかの実施形態では、突然変異は、結合溝に関係するポリペプチド抗原にある場合もある。いくつかの実施形態では、突然変異は、結合溝と関係する抗原ポリペプチドのＮ−末端にある場合もある。いくつかの実施形態では、突然変異は、結合溝と関係する抗原ポリペプチドのＣ−末端にある場合もある。いくつかの実施形態において、システイン捕捉は、ＭＨＣ結合溝と協同する抗原ペプチドのＮ−末端におけるシステイン残基と、ＭＨＣクラスＩＩアルファ鎖に配置された結合溝のＮ−末端における残基との間に形成されてもよい。いくつかの実施形態において、システイン捕捉は、ＭＨＣ結合溝と協同する抗原ペプチドのＮ−末端におけるシステイン残基と、ＭＨＣクラスＩＩアルファ鎖に配置された結合溝のＣ−末端における残基との間に形成されてもよい。いくつかの実施形態において、システイン捕捉は、ＭＨＣ結合溝と協同する抗原ペプチドのＣ−末端におけるシステイン残基と、ＭＨＣクラスＩＩアルファ鎖に配置された結合溝のＮ−末端における残基との間に形成されてもよい。いくつかの実施形態において、システイン捕捉は、ＭＨＣ結合溝と協同する抗原ペプチドのＣ−末端におけるシステイン残基と、ＭＨＣクラスＩＩアルファ鎖に配置された結合溝のＣ−末端における残基との間に形成されてもよい。いくつかの実施形態において、システイン捕捉は、ＭＨＣ結合溝と協同する抗原ペプチドのＮ−末端におけるシステイン残基と、ＭＨＣクラスＩＩベータ鎖に配置された結合溝のＮ−末端における残基との間に形成されてもよい。いくつかの実施形態において、システイン捕捉は、ＭＨＣ結合溝と協同する抗原ペプチドのＮ−末端におけるシステイン残基と、ＭＨＣクラスＩＩベータ鎖に配置された結合溝のＣ−末端における残基との間に形成されてもよい。いくつかの実施形態において、システイン捕捉は、ＭＨＣ結合溝と協同する抗原ペプチドのＣ−末端におけるシステイン残基と、ＭＨＣクラスＩＩベータ鎖に配置された結合溝のＮ−末端における残基との間に形成されてもよい。いくつかの実施形態において、システイン捕捉は、ＭＨＣ結合溝と協同する抗原ペプチドのＣ−末端におけるシステイン残基と、ＭＨＣクラスＩＩベータ鎖に配置された結合溝のＣ−末端における残基との間に形成されてもよい。いくつかの実施形態では、突然変異は結合コアポリペプチドにある場合もある。いくつかの実施形態では、突然変異は、アミノ酸残基とシステインの置き換えを含む。いくつかの実施形態では、突然変異は、他の残基を伴うフレ���ムへのシステイン残基の追加を含む。
【００８４】
システイン捕捉を含むポリペプチドの非限定的な例として、限定されないが、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：６０と６１に記載されるポリペプチドがあげられる。いくつかの実施形態において、システイン捕捉のためのポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：６０と６１のいずれか１つに記載のポリペプチドと、少なくとも８０、８１、８２、８３、８４、８５、８６、８７、８８、８９、９０、９１、９２、９３、９４、９５、９６、９７、９８または９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態において、システインへの突然変異は、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：６２と６３に記載されるポリペプチドの１つ以上の残基に存在し得る。いくつかの実施形態において、システイン捕捉のためのポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：６２と６３のいずれか１つに記載のポリペプチドと、少なくとも８０、８１、８２、８３、８４、８５、８６、８７、８８、８９、９０、９１、９２、９３、９４、９５、９６、９７、９８または９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態において、システインへの突然変異は、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：６２と６３に記載されるポリペプチドの１つ以上の残基に存在し得る。
【００８５】
＜ヘテロダイマー・ナノ粒子結合体＞
他の態様において、本明細書で提供されるのは、本明細書に記載される少なくとも１つのヘテロダイマーとナノ粒子を含むヘテロダイマー・ナノ粒子結合体であって、ここでナノ粒子は非リポソームであり、および／またはソリッドコアを有する。特定の実施形態では、ソリッドコアは金属または金属酸化物であり得る。特定の実施形態では、ソリッドコアは鉄、酸化鉄または金であり得る。ソリッドコアは、密度が約２．０ｇ／ｃｍ３、約３．０ｇ／ｃｍ３、約４．０ｇ／ｃｍ３、約５．０ｇ／ｃｍ３、約６．０ｇ／ｃｍ３、または約７．０ｇ／ｃｍ３より大きくなるように、高密度のコアであり得る。特定の実施形態では、ソリッドコアの密度は、約４．０ｇ／ｃｍ３から約８．０ｇ／ｃｍ３である。特定の実施形態では、ソリッドコアの密度は、約５．０ｇ／ｃｍ３から約８．０ｇ／ｃｍ３である。特定の実施形態では、ソリッドコアの密度は、約５．０ｇ／ｃｍ３から約７．０ｇ／ｃｍ３である。特定の実施形態では、ソリッドコアの密度は、約５．０ｇ／ｃｍ３から約６．０ｇ／ｃｍ３である。
【００８６】
他の態様において、本明細書で提供されるのは、本明細書に記載される少なくとも１つのヘテロダイマーとナノ粒子を含むヘテロダイマー・ナノ粒子結合体であって、ここでナノ粒子は非リポソームであり、および酸化鉄コアを有する。
【００８７】
他の態様において、本明細書で提供されるのは、本明細書に記載される少なくとも１つのヘテロダイマーとナノ粒子を含むヘテロダイマー・ナノ粒子結合体であって、ここでナノ粒子は非リポソームであり、および金のコアを有する。
【００８８】
他の態様において、本明細書で提供されるのは、本明細書に記載される少なくとも１つのヘテロダイマーとナノ粒子を含むヘテロダイマー・ナノ粒子結合体であって、ここでナノ粒子は非リポソームであり、および酸化鉄コアを有し；および少なくとも１つのヘテロダイマーは、リンカーによってナノ粒子に共有結合で連結される。
【００８９】
他の態様において、本明細書で提供されるのは、本明細書に記載される少なくとも１つのヘテロダイマーとナノ粒子を含むヘテロダイマー・ナノ粒子結合体であって、ここでナノ粒子は非リポソームであり、および酸化鉄コアを有し；および少なくとも１つのヘテロダイマーは、ポリペプチドグリコールを含むリンカーによってナノ粒子に共有結合で連結される。いくつかの実施形態において、ヘテロダイマー・ナノ粒子結合体は、本明細書に記載される少なくとも１つのヘテロダイマーとナノ粒子を含み、ここでナノ粒子は非リポソームであり、および酸化鉄コアを有し；および、少なくとも１つのヘテロダイマーは、５００ダルトン未満の分子量を有するポリエチレングリコールを含むリンカーによって、ナノ粒子に共有結合で連結される。いくつかの実施形態では、ポリエチレングリコールは、１ｋＤ、２ｋＤ、３ｋＤ、４ｋＤ、５ｋＤ、６ｋＤ、７ｋＤ、８ｋＤ、９ｋＤ、または１０ｋＤ未満の分子量を有する。いくつかの実施形態では、ポリエチレングリコールはマレイミドで官能化される。いくつかの実施形態では、ポリエチレングリコールは、約１ｋＤから約５ｋＤ、約２ｋＤから約５ｋＤ、約３ｋＤから約５ｋＤの分子量を有する。いくつかの実施形態では、ポリエチレングリコールはマレイミドで官能化される。特定の実施形態では、ソリッドコアに接するリンカーの末端は、ソリッドコアに埋め込まれている。
【００９０】
いくつかの態様では、ナノ粒子のコアは、約１ｎｍから約１００ｎｍ；約１ｎｍから約７５ｎｍ；約１ｎｍから約５０ｎｍ；約１ｎｍから約２５ｎｍ；約１ｎｍから約２５ｎｍ；約５ｎｍから約１００ｎｍ；約５ｎｍから約５０ｎｍ；または約５ｎｍから約２５ｎｍ、または約１５ｎｍから約２５ｎｍ、または約５ｎｍから約２０ｎｍの群から選択される直径を有する。いくつかの実施形態では、ナノ粒子コアは、直径が約２５ｎｍから約６０ｎｍ、約２５ｎｍから約５０ｎｍ、約２０ｎｍから約４０ｎｍ、約１５ｎｍから約５０ｎｍ、約１５ｎｍから約４０ｎｍ、約１５ｎｍから約３５ｎｍ、約１５ｎｍから約３０ｎｍ、または約１５ｎｍから約２５ｎｍ、代替的に約１５ｎｍ、約２０ｎｍ、約２５ｎｍ、約３０ｎｍ、約３５ｎｍ、または約４０ｎｍの直径を有する。
【００９１】
いくつかの態様では、ナノ粒子コアあたりのｐＭＨＣの数（本明細書において、ナノ粒子複合体の「原子価」と呼ばれる）は、約１のｐＭＨＣ複合体 対 約１のナノ粒子コアから、約６０００のｐＭＨＣ複合体 対 約１のナノ粒子コア、代替的に約１０：１から約６０００：１、代替的に約１１：１から約６０００：１、代替的に約１２：１から約６０００：１、代替的に少なくとも２：１、代替的に少なくとも８：１、代替的に少なくとも９：１、代替的に少なくとも１０：１、代替的に少なくとも１１：１、または代替的に少なくとも１２：１の範囲であり得る。いくつかの実施形態では、ナノ粒子コアあたりのｐＭＨＣの数は、約１０：１から約６０００：１、約２０：１から約５５００：１、代替的に約１０：１から約５０００：１、代替的に約１０：１から約４０００：１、代替的に約１０：１から約３５００：１、代替的に約１０：１から約３０００：１、代替的に約１０：１から約２５００：１、代替的に約１０：１から約２０００：１、代替的に約１０：１から約１５００：１、代替的に約１０：１から１０００：１、代替的に約１０：１から約５００：１、代替的に約１０：１から約１００：１、代替的に約２０：１から約５０：１、代替的に約２５：１から約６０：１；代替的に約３０：１から約５０：１、代替的に約３５：１から約４５：１、または代替的に約４０：１である。いくつかの実施形態では、ナノ粒子のコアあたりのｐＭＨＣ数は、約１０：１から約１００：１、約１０：１から約１１０：１、約１０：１から約１２０：１、約１０：１から約１３０：１、約１０：１から約１４０：１、約１０：１から約１５０：１、または約１０：１から約１６０：１である。いくつかの実施形態では、ナノ粒子のコアあたりのｐＭＨＣ数は、約３０：１から約１００：１、約３０：１から約１１０：１、約３０：１から約１２０：１、約３０：１から約１３０：１、約３０：１から約１４０：１、約３０：１から約１５０：１、または約３０：１から約１６０：１である。いくつかの実施形態では、ナノ粒子のコアあたりのｐＭＨＣ数は、約３２：１から約１００：１、約３２：１から約１１０：１、約３２：１から約１２０：１、約３２：１から約１３０：１、約３２：１から約１４０：１、約３２：１から約１５０：１、または約３２：１から約１６０：１である。
【００９２】
いくつかの態様では、ナノ粒子のコアは、本明細書で「密度」とも呼ばれる、コアの表面積当たりの規定された結合価を有する。これらの態様では、ナノ粒子あたりのｐＭＨＣ密度は、ナノ粒子のコアの表面積の約０．０２５ｐＭＨＣ／１００ｎｍ２から約１００ｐＭＨＣ／１００ｎｍ２、代替的に約０．４０６ｐＭＨＣ／１００ｎｍ２から約５０ｐＭＨＣ／１００ｎｍ２、または代替的に約０．０５ｐＭＨＣ／１００ｎｍ２から約２５ｐＭＨＣ／１００ｎｍ２である。特定の態様では、ナノ粒子あたりのｐＭＨＣ密度は、約０．４ｐＭＨＣ／１００ｎｍ２から約２５ｐＭＨＣ／１００ｎｍ２、約０．４ｐＭＨＣ／１００ｎｍ２から約２０ｐＭＨＣ／１００ｎｍ２、約０．４ｐＭＨＣ／１００ｎｍ２から約１５ｐＭＨＣ／１００ｎｍ２、約０．４ｐＭＨＣ／１００ｎｍ２から約１４ｐＭＨＣ／１００ｎｍ２、約０．４ｐＭＨＣ／１００ｎｍ２から約１３ｐＭＨＣ／１００ｎｍ２、約０．４ｐＭＨＣ／１００ｎｍ２から約１２ｐＭＨＣ／１００ｎｍ２、約０．４ｐＭＨＣ／１００ｎｍ２から約１１．６ｐＭＨＣ／１００ｎｍ２、約０．４ｐＭＨＣ／１００ｎｍ２から約１１．５ｐＭＨＣ／１００ｎｍ２、約０．４ｐＭＨＣ／１００ｎｍ２から約１１ｐＭＨＣ／１００ｎｍ２、約０．４ｐＭＨＣ／１００ｎｍ２から約１０ｐＭＨＣ／１００ｎｍ２、約０．４ｐＭＨＣ／１００ｎｍ２から約９ｐＭＨＣ／１００ｎｍ２、約０．４ｐＭＨＣ／１００ｎｍ２から約８ｐＭＨＣ／１００ｎｍ２、約０．４ｐＭＨＣ／１００ｎｍ２から約７ｐＭＨＣ／１００ｎｍ２、約０．４ｐＭＨＣ／１００ｎｍ２から約６ｐＭＨＣ／１００ｎｍ２、約０．４ｐＭＨＣ／１００ｎｍ２から約５ｐＭＨＣ／１００ｎｍ２、約０．４ｐＭＨＣ／１００ｎｍ２から約４ｐＭＨＣ／１００ｎｍ２、約０．４ｐＭＨＣ／１００ｎｍ２から約３ｐＭＨＣ／１００ｎｍ２、約０．４ｐＭＨＣ／１００ｎｍ２から約２．５ｐＭＨＣ／１００ｎｍ２、約０．４ｐＭＨＣ／１００ｎｍ２から約２ｐＭＨＣ／１００ｎｍ２、または約０．４ｐＭＨＣ／１００ｎｍ２から約１．５ｐＭＨＣ／１００ｎｍ２である。
【００９３】
他の実施形態では、ナノ粒子は、約０．２２ｐＭＨＣ／１００ｎｍ２から約１０ｐＭＨＣ／１００ｎｍ２、約０．２２ｐＭＨＣ／１００ｎｍ２から約９ｐＭＨＣ／１００ｎｍ２、約０．２２ｐＭＨＣ／１００ｎｍ２から約８ｐＭＨＣ／１００ｎｍ２、約０．２２ｐＭＨＣ／１００ｎｍ２から約７ｐＭＨＣ／１００ｎｍ２、約０．２２ｐＭＨＣ／１００ｎｍ２から約６ｐＭＨＣ／１００ｎｍ２、約０．２２ｐＭＨＣ／１００ｎｍ２から約５ｐＭＨＣ／１００ｎｍ２、約０．２２ｐＭＨＣ／１００ｎｍ２から約４ｐＭＨＣ／１００ｎｍ２、約０．２２ｐＭＨＣ／１００ｎｍ２から約３ｐＭＨＣ／１００ｎｍ２、約０．２２ｐＭＨＣ／１００ｎｍ２から約２ｐＭＨＣ／１００ｎｍ２、または約０．２２ｐＭＨＣ／１００ｎｍ２から約１．５ｐＭＨＣ／１００ｎｍ２のｐＭＨＣ密度を有し得る。いくつかの態様では、ナノ粒子は、約０．２２ｐＭＨＣ／１００ｎｍ２から約１０ｐＭＨＣ／１００ｎｍ２、０．２４ｐＭＨＣ／１００ｎｍ２から約９ｐＭＨＣ／１００ｎｍ２、約０．２６ｐＭＨＣ／１００ｎｍ２から約８ｐＭＨＣ／１００ｎｍ２、約０．２８ｐＭＨＣ／１００ｎｍ２から約７ｐＭＨＣ／１００ｎｍ２、約０．２４ｐＭＨＣ／１００ｎｍ２から約４ｐＭＨＣ／１００ｎｍ２、約０．５ｐＭＨＣ／１００ｎｍ２から約３ｐＭＨＣ／１００ｎｍ２、または約０．６ｐＭＨＣ／１００ｎｍ２から約１．５ｐＭＨＣ／１００ｎｍ２のｐＭＨＣ密度を有する。さらなる態様では、ナノ粒子は、約０．４ｐＭＨＣ／１００ｎｍ２から約１．３ｐＭＨＣ／１００ｎｍ２、代替的に約０．５ｐＭＨＣ／１００ｎｍ２から約０．９ｐＭＨＣ／１００ｎｍ２、または代替的に約０．６ｐＭＨＣ／１００ｎｍ２から約０．８ｐＭＨＣ／１００ｎｍ２のｐＭＨＣ密度を有する。
【００９４】
いくつかの実施形態では、ナノ粒子は、約０．１、０．２、０．３、０．４、０．５、０．６、０．７、０．８、０．９、１．０、１．１、１．２、１．３、１．４、１．５、１．６、１．７、１．８、１．９、２．０、２．１、２．２、２．３、２．４、２．５、２．６、２．７、２．８、２．９、３．０、３．１、３．２、３．３、３．４、３．５、３．６、３．７、３．８、３．９、４．０、４．１、４．２、４．３、４．４、４．５、４．６、４．７、４．８、５．９、６．０、６．１、６．２、６．３、６．４、６．５、６．６、６．７、６．８、６．９、７．０、７．１、７．２、７．３、７．４、７．５、７．６、７．７、７．８、７．９、８．０、８．１、８．２、８．３、８．４、８．５、８．６、８．７、８．８、８．９、９．０、９．１、９．２、９．３、９．４、９．５、９．６、９．７、９．８、９．９、１０．０、１０．１、１０．２、１０．３、１０．４、１０．５、１０．６、１０．７、１０．８、１０．９、１１．０、１１．１、１１．２、１１．３、１１．４、１１．５、１１．６、１１．７、１１．８、１１．９、または１２．０ｐＭＨＣ／１００ｎｍ２のｐＭＨＣ密度を有し得る。特定の実施形態では、ナノ粒子は、約０．４ｐＭＨＣ／１００ｎｍ２から約１．５ｐＭＨＣ／１００ｎｍ２、０．４ｐＭＨＣ／１００ｎｍ２から約２．５ｐＭＨＣ／１００ｎｍ２、約０．４ｐＭＨＣ／１００ｎｍ２から約６ｐＭＨＣ／１００ｎｍ２、または約０．４ｐＭＨＣ／１００ｎｍ２から約１２ｐＭＨＣ／１００ｎｍ２のｐＭＨＣ密度を有し得る。
【００９５】
さらに他の態様では、ナノ粒子は、本明細書で規定されるように、約０．４ｐＭＨＣ／１００ｎｍ２から約１．３ｐＭＨＣ／１００ｎｍ２、代替的に約０．５ｐＭＨＣ／１００ｎｍ２から約０．９ｐＭＨＣ／１００ｎｍ２、または代替的に約０．６ｐＭＨＣ／１００ｎｍ２から約０．８ｐＭＨＣ／１００ｎｍ２のｐＭＨＣ密度を有し、さらにナノ粒子のコアは、約２５ｎｍから約６０ｎｍ、約２５から約５０ｎｍ、約２０から約４０ｎｍ、約１５ｎｍから約５０ｎｍ、約１５ｎｍから約４０ｎｍ、約１５ｎｍから約３５ｎｍ、約１５ｎｍから約３０ｎｍ、約１５ｎｍから約２５ｎｍ、代替的に約１５ｎｍ、約２０ｎｍ、約２５ｎｍ、約３０ｎｍ、約３５ｎｍ、または約４０ｎｍ、または約５０ｎｍの直径を有する。
【００９６】
＜共刺激分子成分＞
特定の態様では、ＮＰは、少なくとも１つの共刺激分子をさらに含む、または代替的にそれらを主成分とする、あるはそれらからのみ成る。共刺激分子は、ナイーブＴ細胞を、特異抗原を有する細胞に対する免疫反応をもたらすことができる抗原特異的なＴ細胞へと活性化する働きをする二次シグナルをインビボで生成する分子である。本開示は、そのような特異的な共刺激分子に限定されない。様々な共刺激分子が当該技術分野で周知である。共刺激分子のいくつかの非限定的な例は、４−ＩＢＢＬ、ＯＸ４０Ｌ、ＣＤ４０、ＩＬ−１５／ＩＬ−１５Ｒａ、ＣＤ２８、ＣＤ８０、ＣＤ８６、ＣＤ３０Ｌ、およびＩＣＯＳＬである。１つの特異的な共刺激分子のみが１つのナノ粒子に結合され、または様々な共刺激分子が同じナノ粒子に結合され得る。特定の実施形態では、共刺激分子は、Ｔ細胞上の共刺激受容体を刺激することができる、抗体等のタンパク質である。この場合、抗体は、抗原特異的な方法でナイーブＴ細胞を活性化し、かつ免疫反応を誘発するのに必要とされる共刺激シグナルを誘発することができる。付加的にまたは代替的に、本明細書で使用される用語「共刺激分子」はまた、天然の共刺激シグナル伝達分子、例えばＣＤ２８の共刺激反応をもたらす抗ＣＤ２８またはＣＤ２８リガンドに対するアゴニスト作用を有することによって、共刺激シグナルを生成することができる因子を指し得る。
【００９７】
特定の実施形態では、本開示の共刺激分子は、以下の分子のいずれか１つ以上であり得る：Ｂ７−１／ＣＤ８０、ＢＴＬＡ、Ｂ７−２／ＣＤ８６、ＣＤ２８、Ｂ７−Ｈ１／ＰＤ−Ｌ１、ＣＴＬＡ−４、Ｂ７−Ｈ２、Ｇｉ２４／ＶＩＳＴＡ／Ｂ７−Ｈ５、Ｂ７−Ｈ３、ＩＣＯＳ、Ｂ７−Ｈ４、ＰＤ−１、Ｂ７−Ｈ６、ＰＤ−Ｌ２／Ｂ７−ＤＣ、Ｂ７−Ｈ７、ＰＤＣＤ６、ＬＩＬＲＡ３／ＣＤ８５ｅ、ＬＩＬＲＢ２／ＣＤ８５ｄ／ＩＬＴ４、ＬＩＬＲＡ４／ＣＤ８５ｇ／ＩＬＴ７、ＬＩＬＲＢ３／ＣＤ８５ａ／ＩＬＴ５、ＬＩＬＲＢ１／ＣＤ８５ｊ／ＩＬＴ２、ＬＩＬＲＢ４／ＣＤ８５ｋ／ＩＬＴ３、４−１ＢＢ／ＴＮＦＲＳＦ９／ＣＤ１３７、ＧＩＴＲリガンド／ＴＮＦＳＦ１８、４−１ＢＢリガンド／ＴＮＦＳＦ９、ＨＶＥＭ／ＴＮＦＲＳＦ１４、ＢＡＦＦ／ＢＬｙＳ／ＴＮＦＳＦ１３Ｂ、ＬＩＧＨＴ／ＴＮＦＳＦ１４、ＢＡＦＦＲ／ＴＮＦＲＳＦ１３Ｃ、リンフォトキシン−α／ＴＮＦ−β、ＣＤ２７／ＴＮＦＲＳＦ７、ＯＸ４０／ＴＮＦＲＳＦ４、ＣＤ２７リガンド／ＴＮＦＳＦ７、ＯＸ４０リガンド／ＴＮＦＳＦ４、ＣＤ３０／ＴＮＦＲＳＦ８、ＲＥＬＴ／ＴＮＦＲＳＦ１９Ｌ、ＣＤ３０リガンド／ＴＮＦＳＦ８、ＴＡＣＩ／ＴＮＦＲＳＦ１３Ｂ、ＣＤ４０／ＴＮＦＲＳＦ５、ＴＬ１Ａ／ＴＮＦＳＦ１５、ＣＤ４０リガンド／ＴＮＦＳＦ５、ＴＮＦ−α、ＤＲ３／ＴＮＦＲＳＦ２５、ＴＮＦＲＩＩ／ＴＮＦＲＳＦ１Ｂ、ＧＩＴＲ／ＴＮＦＲＳＦ１８、２Ｂ４／ＣＤ２４４／ＳＬＡＭＦ４、ＣＤ８４／ＳＬＡＭＦ５、ＢＬＡＭＥ／ＳＬＡＭＦ８、ＣＤ２２９／ＳＬＡＭＦ３、ＣＤ２、ＣＲＡＣＣ／ＳＬＡＭＦ７、ＣＤ２Ｆ−１０／ＳＬＡＭＦ９、ＮＴＢ−Ａ／ＳＬＡＭＦ６、ＣＤ４８／ＳＬＡＭＦ２、ＳＬＡＭ／ＣＤ１５０、ＣＤ５８／ＬＦＡ−３、ＣＤ７、ＤＰＰＩＶ／ＣＤ２６、ＣＤ９６、ＥｐｈＢ６、ＣＤ１６０、インテグリンα４β１、ＣＤ２００、インテグリンα４β７／ＬＰＡＭ−１、ＣＤ３００ａ／ＬＭＩＲ１、ＬＡＧ−３、ＣＲＴＡＭ、ＴＩＭ−１／ＫＩＭ−１／ＨＡＶＣＲ、ＤＡＰ１２、ＴＩＭ−４、デクチン−１／ＣＬＥＣ７Ａ、ＴＳＬＰＲ、ＩＣＯＳＬ、および／またはそれらの生物学的同等物。
【００９８】
共刺激分子は、ｐＭＨＣ複合体と同じ方法でナノ粒子に結合され得る。本開示の一実施形態では、共刺激分子および抗原／ＭＨＣ複合体は、ナノ粒子に別々に結合される。本開示の別の実施形態では、共刺激分子およびｐＭＨＣ複合体は、まず一緒に複合され、その後にナノ粒子に複合される。複数の共刺激分子は、ナノ粒子に結合されてもよく、これらは同じ共刺激分子の複数の分子、または複数の異なる共刺激分子であり得る。典型的に、ナノ粒子にポリペプチド複合体が加えられて、ナノ粒子当たり約１対６０００の分子、または代替的に少なくとも約または多くても約０．１、０．５、１、１０、１００、５００、１０００、２０００、３０００、４０００、５０００、６０００、またはそれ以上：１、および典型的に約０．１：１から約５０：１の範囲の、共刺激分子の数：ナノ粒子の数の比率を有する、吸着または結合されたポリペプチド複合体を有するナノ粒子が産出される。別の態様では、共刺激分子 対 ｐＭＨＣ複合体の比率は、約０．１、０．５、１、２、５、１０、５０、またはそれ以上：１であり得、好ましくは１：１、１：２、１：９、１：１０、１：１００、２：１、９：１、１０：１、または１００：１の共刺激分子：ｐＭＨＣ複合体の比率が得られる。同様に、ナノ粒子表面積に対する共刺激分子の密度は、ｐＭＨＣ複合体と同じ相対式に従って計算され得る。特定の実施形態では、ナノ粒子の単位表面積当たりの共刺激分子の密度は、約０．００２２共刺激分子／１００ｎｍ２から約１３．２６共刺激分子／１００ｎｍ２の間である。いくつかの実施形態では、共刺激分子の密度範囲は、ｐＭＨＣ複合体に関する密度範囲と同じ、または異なっている場合もある。
【００９９】
いくつかの実施形態において、ナノ粒子は１つ以上の共刺激分子を含み、かつｐＭＨＣ複合体を含まず、ナノ粒子は、約０．２共刺激分子／１００ｎｍ２から約６．５共刺激分子／１００ｎｍ２、約０．２共刺激分子／１００ｎｍ２から約６共刺激分子／１００ｎｍ２、約０．２共刺激分子／１００ｎｍ２から約５．８共刺激分子／１００ｎｍ２、約０．２共刺激分子／１００ｎｍ２から約５．７５共刺激分子／１００ｎｍ２、約０．２共刺激分子／１００ｎｍ２から約５．５共刺激分子／１００ｎｍ２、約０．２共刺激分子／１００ｎｍ２から約５共刺激分子／１００ｎｍ２、約０．２共刺激分子／１００ｎｍ２から約４．５共刺激分子／１００ｎｍ２、約０．２共刺激分子／１００ｎｍ２から約４共刺激分子／１００ｎｍ２、約０．２共刺激分子／１００ｎｍ２から約３．５共刺激分子／１００ｎｍ２、約０．２共刺激分子／１００ｎｍ２から約３共刺激分子／１００ｎｍ２、約０．２共刺激分子／１００ｎｍ２から約２．５共刺激分子／１００ｎｍ２、約０．２共刺激分子／１００ｎｍ２から約２共刺激分子／１００ｎｍ２、約０．２共刺激分子１００ｎｍ２から約１．５共刺激分子／１００ｎｍ２、約０．２共刺激分子１００ｎｍ２から約１．２５共刺激分子／１００ｎｍ２、約０．２共刺激分子／１００ｎｍ２から約１共刺激分子／１００ｎｍ２、または約０．２共刺激分子／１００ｎｍ２から約０．７５共刺激分子／１００ｎｍ２の共刺激分子密度を有する。
【０１００】
別の態様では、ナノ粒子は、約０．１１共刺激分子／１００ｎｍ２から約５共刺激分子／１００ｎｍ２、または約０．１１共刺激分子／１００ｎｍ２から約４．５共刺激分子／１００ｎｍ２、または約０．１１共刺激分子／１００ｎｍ２から約４共刺激分子／１００ｎｍ２、または約０．１１共刺激分子／１００ｎｍ２から約３．５共刺激分子／１００ｎｍ２、約０．１１共刺激分子／１００ｎｍ２から約３共刺激分子／１００ｎｍ２、約０．１１共刺激分子／１００ｎｍ２から約２．５共刺激分子／１００ｎｍ２、約０．１１共刺激分子／１００ｎｍ２から約２共刺激分子／１００ｎｍ２、約０．１１共刺激分子／１００ｎｍ２から約１．５共刺激分子／１００ｎｍ２、約０．１１共刺激分子／１００ｎｍ２から約１共刺激分子／１００ｎｍ２、または約０．１１共刺激分子／１００ｎｍ２から約０．７５共刺激分子／１００ｎｍ２の共刺激分子密度を有し得る。いくつかの態様では、ナノ粒子コアは、約０．１１共刺激分子／１００ｎｍ２から約５共刺激分子／１００ｎｍ２、または０．１２共刺激分子／１００ｎｍ２から約４．５共刺激分子／１００ｎｍ２、または約０．１３共刺激分子／１００ｎｍ２から約４共刺激分子／１００ｎｍ２、または約０．１４共刺激分子１００ｎｍ２から約３．５共刺激分子／１００ｎｍ２、約０．１２共刺激分子／１００ｎｍ２から約２共刺激分子／１００ｎｍ２、約０．２５共刺激分子／１００ｎｍ２から約１．５共刺激分子／１００ｎｍ２、または約０．３共刺激分子／１００ｎｍ２から約０．７５共刺激分子／１００ｎｍ２の共刺激分子密度を有する。さらなる態様では、ナノ粒子コアは、約０．２共刺激分子／１００ｎｍ２から約０．６５共刺激分子／１００ｎｍ２、代替的に約０．２５共刺激分子／１００ｎｍ２から約０．４５共刺激分子／１００ｎｍ２、または代替的に約０．３共刺激分子／１００ｎｍ２から約０．４共刺激分子／１００ｎｍ２の共刺激分子密度を有する。
【０１０１】
いくつかの実施形態では、ナノ粒子はｐＭＨＣ複合体および１つ以上の共刺激分子を含み、ナノ粒子は、約０．４共刺激分子／１００ｎｍ２から約１３共刺激分子／１００ｎｍ２、約０．４共刺激分子／１００ｎｍ２から約１２共刺激分子／１００ｎｍ２、約０．４共刺激分子／１００ｎｍ２から約１１．６共刺激分子／１００ｎｍ２、約０．４共刺激分子／１００ｎｍ２から約１１．５共刺激分子／１００ｎｍ２、約０．４共刺激分子／１００ｎｍ２から約１１共刺激分子／１００ｎｍ２、約０．４共刺激分子／１００ｎｍ２から約１０共刺激分子／１００ｎｍ２、約０．４共刺激分子／１００ｎｍ２から約９共刺激分子／１００ｎｍ２、約０．４共刺激分子／１００ｎｍ２から約８共刺激分子／１００ｎｍ２、約０．４共刺激分子／１００ｎｍ２から約７共刺激分子／１００ｎｍ２、約０．４共刺激分子／１００ｎｍ２から約６共刺激分子／１００ｎｍ２、または約０．４共刺激分子／１００ｎｍ２から約５共刺激分子／１００ｎｍ２、約０．４共刺激分子／１００ｎｍ２から約４共刺激分子／１００ｎｍ２、約０．４共刺激分子／１００ｎｍ２から約３共刺激分子／１００ｎｍ２、約０．４共刺激分子／１００ｎｍ２から約２．５共刺激分子／１００ｎｍ２、約０．４共刺激分子／１００ｎｍ２から約２共刺激分子／１００ｎｍ２、または約０．４共刺激分子／１００ｎｍ２から約１．５共刺激分子／１００ｎｍ２の共刺激密度を有する。
【０１０２】
一態様では、ナノ粒子は、約０．２２共刺激分子／１００ｎｍ２から約１０共刺激分子／１００ｎｍ２、約０．２２共刺激分子／１００ｎｍ２から約９共刺激分子／１００ｎｍ２、約０．２２共刺激分子／１００ｎｍ２から約８共刺激分子／１００ｎｍ２、約０．２２共刺激分子／１００ｎｍ２から約７共刺激分子／１００ｎｍ２、約０．２２共刺激分子／１００ｎｍ２から約６共刺激分子／１００ｎｍ２、約０．２２共刺激分子／１００ｎｍ２から約５共刺激分子／１００ｎｍ２、約０．２２共刺激分子／１００ｎｍ２から約４共刺激分子／１００ｎｍ２、約０．２２共刺激分子／１００ｎｍ２から約３共刺激分子／１００ｎｍ２、約０．２２共刺激分子／１００ｎｍ２から約２共刺激分子／１００ｎｍ２、または約０．２２共刺激分子／１００ｎｍ２から約１．５共刺激分子／１００ｎｍ２の共刺激密度を有する。いくつかの態様では、ナノ粒子コアは、約０．２２共刺激分子／１００ｎｍ２から約１０共刺激分子／１００ｎｍ２、０．２４共刺激分子／１００ｎｍ２から約９共刺激分子／１００ｎｍ２、約０．２６共刺激分子／１００ｎｍ２から約８共刺激分子／１００ｎｍ２、約０．２８共刺激分子／１００ｎｍ２から約７共刺激分子／１００ｎｍ２、約０．２４共刺激分子／１００ｎｍ２から約４共刺激分子／１００ｎｍ２、約０．５共刺激分子／１００ｎｍ２から約３共刺激分子／１００ｎｍ２、または約０．６共刺激分子／１００ｎｍ２から約１．５共刺激分子／１００ｎｍ２の共刺激分子密度を有する。さらなる態様では、ナノ粒子は、約０．４共刺激分子／１００ｎｍ２から約１．３共刺激分子／１００ｎｍ２、代替的に約０．５共刺激分子／１００ｎｍ２から約０．９共刺激分子／１００ｎｍ２、または代替的に約０．６共刺激分子／１００ｎｍ２から約０．８共刺激分子／１００ｎｍ２の共刺激分子密度を有する。
【０１０３】
一態様では、ナノ粒子は共刺激分子を含み、ペプチド−ＭＨＣ成分を含まない。特定の実施形態では、この共刺激分子ナノ粒子複合体は、ナノ粒子ペプチド−ＭＨＣ複合体と混合されて組成物を形成し、該組成物は２つの異なるナノ粒子集団を含み、その一方は共刺激分子のみを含み、もう一方はペプチドＭＨＣのみを含む。これらの２つの集団は、ナノ粒子を含む共刺激分子とナノ粒子を含むペプチドＭＨＣの比率が１：１、１：２、１：３、１：４、１：５、１：６、１：７、１：８または１：９、またはナノ粒子を含むペプチド−ＭＨＣとナノ粒子を含む共刺激分子の比率が１：１、１：２、１：３、１：４、１：５、１：６、１：７、１：８、または１：９を含む任意の適切な比率で混合可能である。
【０１０４】
＜サイトカイン＞
特定の態様では、ＮＰは、少なくとも１つのサイトカイン分子をさらに含む、代替的に実質的に成る、またはさらにはそれから成る。本明細書で使用されるように、用語「サイトカイン」は、分子および細胞のレベルで身体内の広範囲の生体プロセスを調節するためのシグナル伝達分子として作用する、免疫系で様々な細胞によって分泌される低分子量タンパク質を包含する。「サイトカイン」は、リンホカイン、インターロイキン、またはケモカインのクラス内にある個々の免疫調節タンパク質を含む。
【０１０５】
非限定的な例が本明細書に開示され、例えば、ＩＬ−１ＡおよびＩＬ−１Ｂは、ヒトインターロイキン１（ＩＬ−１）ファミリーの２つの別個のメンバーである。成熟したＩＬ−１Ａは１８ｋＤａタンパク質であり、線維芽細胞活性化因子（ＦＡＦ）、リンパ球活性化因子（ＬＡＦ）、Ｂ細胞活性化因子（ＢＡＦ）、白血球内因性伝達物質（ＬＥＭ）等としても知られている。ＩＬ−４は、Ｔヘルパー−２（Ｔｈ２）細胞分化を誘発するサイトカインであり、ＩＬ−１３と類似の機能を有する。ＩＬ−５は、Ｔｈ２細胞およびマスト細胞によって生成される。それは、Ｂ細胞成長を刺激し、かつ免疫グロブリン分泌を増加させるように作用する。それはまた好酸球活性化に関係している。ＩＬ−６は、炎症促進性または抗炎症性のサイトカインのいずれかとして作用することができるインターロイキンである。それはＴ細胞およびマクロファージによって分泌されて、外傷または炎症につながる他の組織損傷に対する免疫反応を刺激する。ＩＬ−６はまた、筋収縮に応じて筋肉から生成される。ＩＬ−８は、マクロファージ、および上皮細胞と内皮細胞などの他の細胞タイプによって生成されるケモカインであり、先天性免疫系反応において免疫反応の重要な伝達物質として作用する。ＩＬ−１２は、ナイーブＴ細胞のＴヘルパー（Ｔｈ１またはＴｈ２）細胞への分化に関係している。ヘテロダイマーサイトカインとして、ＩＬ−１２は、２つの別々の遺伝子、ＩＬ−１２Ａ（ｐ３５）およびＩＬ−１２Ｂ（ｐ４０）によってコードされた２つのサブユニットが、タンパク質合成後に二量化した後に形成される。ＩＬ−１２ｐ７０は、このヘテロダイマー組成物を示唆している。多くの細胞タイプ、特にＴｈ２細胞によって分泌されたサイトカインであるＩＬ−１３は、アレルギー性の炎症および疾患の重要な伝達物質である。ＩＬ−１７は、Ｔヘルパー細胞によって生成されたサイトカインであり、ＩＬ−２３によって誘発され、その結果、遅延型反応における破壊的な組織損傷につながる。ＩＬ−１７は、細胞外病原体による免疫系の侵入に反応し、病原体の細胞マトリックスの破壊を誘発する炎症促進性サイトカインとして機能する。ＩＰ−１０、すなわちインターフェロンガンマ誘発性のタンパク質１０は、Ｃ−Ｘ−Ｃモチーフケモカイン１０（ＣＸＣＬ１０）または小誘導性サイトカイン（ｓｍａｌｌ−ｉｎｄｕｃｉｂｌｅ  ｃｙｔｏｋｉｎｅ）Ｂ１０としても知られている。ＣＸＣケモカインファミリーに属する小さなサイトカインとして、ＩＰ−１０は、ＩＦＮ−γに応じていくつかの細胞タイプ（単球、内皮細胞および線維芽細胞を含む）によって分泌される。マクロファージ炎症タンパク質（ＭＩＰ）は、ケモカインのファミリーに属している。ヒトのＭＩＰ、ＭＩＰ−１αおよびＭＩＰ−１βの２つの主要な形態が存在し、これらはそれぞれ、ケモカイン（Ｃ−Ｃモチーフ）リガンド３（ＣＣＬ３）およびＣＣＬ４としても知られている。両者は、菌体内毒素による刺激後にマクロファージによって生成される。コロニー刺激因子３（ＣＳＦ３）としても知られている果粒球コロニー刺激因子（Ｇ−ＣＳＦまたはＧＣＳＦ）は、コロニー刺激因子ホルモンである。Ｇ−ＣＳＦは、糖タンパク質、増殖因子、および骨���を刺激して顆粒球および幹細胞を生成するために多くの異なる組織によって生成されるサイトカインである。Ｇ−ＣＳＦはまた、好中球前駆体および成熟した好中球の生存、増殖、分化、および機能を刺激する。上皮増殖因子またはＥＧＦは、高親和性を有してその受容体ＥＧＦＲに結合することによって、細胞成長、増殖、および分化の調節に重要な役割を果たす増殖因子である。血管内皮細胞増殖因子（ＶＥＧＦ）は、脈管形成（胚循環系のデノボ形成）および血管新生（先在する脈管構造からの血管の成長）の両方に関係している重要なシグナル伝達タンパク質である増殖因子のファミリーである。
【０１０６】
サイトカインは、ｐＭＨＣ複合体と同じ方法でナノ粒子に結合され得る。本開示の一実施形態では、サイトカインおよびｐＭＨＣ複合体は、ナノ粒子に別々に結合される。本開示の別の実施形態では、サイトカインまたはサイトカイン分子とｐＭＨＣ複合体は、最初に一緒に複合され、その後にナノ粒子に複合される。複数のサイトカインがナノ粒子に結合され得る；これらは、同じサイトカインまたは異なるサイトカインの複数のサイトカインであり得る。
【０１０７】
いくつかの実施形態では、サイトカインは抗サイトカイン抗体に複合されて、サイトカイン／抗サイトカイン抗体複合体を形成し、その複合体は続いてナノ粒子に複合される。いくつかの実施形態では、サイトカイン／抗サイトカイン抗体複合体は、限定されないがＩＬ−２／抗ＩＬ−２複合体を含む。ＩＬ−２／抗ＩＬ−２複合体は、アゴニスト特性またはアンタゴニスト特性を有することができる。
【０１０８】
いくつかの実施形態では、サイトカインはサイトカイン受容体に複合されて、サイトカイン／サイトカイン受容体複合体が形成され、その複合体は次にナノ粒子に複合される。いくつかの実施形態では、サイトカイン／サイトカイン受容体複合体は、限定されないが、ＩＬ１５／ＩＬ−１５Ｒａおよび／またはＩＬ−１／ＩＬ−２Ｒａを含む。いくつかの実施形態では、ＩＬ１５／ＩＬ−１５Ｒａ複合体は、Ｔ細胞共刺激分子として機能することができる。
【０１０９】
典型的には、ナノ粒子にポリペプチド複合体が加えられて、ナノ粒子当たり約１対５９９９の分子、または代替的に少なくとも約または多くても約０．１、０．５、１、１０、１００、５００、１０００、２０００、３０００、４０００、５０００、６０００またはそれ以上：１、および例えば約０．１：１から約５０：１の範囲の、サイトカインの数：ナノ粒子の数の比率を有する、吸着または結合されたポリペプチド複合体を有するナノ粒子が産出される。他の態様では、サイトカインと抗原／ＭＨＣ複合体の比率は、約０．１、０．５、１、２、５、１０、５０またはそれ以上：１であり得、好ましくは１：１、１：２、１：９、１：１０、１：１００、２：１、９：１、１０：１、または１００：１のサイトカイン：抗原／ＭＨＣ複合体の比率が得られる。同様に、ナノ粒子表面積に対するサイトカインの密度は、抗原／ＭＨＣ複合体と同じ相対式に従って計算され得る。特定の実施形態では、ナノ粒子の単位表面積当たりのサイトカインの密度は、約０．００２２サイトカイン／１００ｎｍ２から約１３．２６サイトカイン／１００ｎｍ２までの間である。いくつかの実施形態では、サイトカインの密度範囲は、抗原／ＭＨＣ複合体に対する密度範囲と同じ、または異なる場合もある。
【０１１０】
一態様では、ナノ粒子はサイトカイン分子を含み、ペプチド−ＭＨＣ成分を含まない。特定の実施形態では、このサイトカイン分子ナノ粒子複合体は、ナノ粒子ペプチド−ＭＨＣ複合体と混合されて組成物を形成し、該組成物は２つの異なるナノ粒子集団を含み、その一方はサイトカイン分子のみを含み、もう一方はペプチドＭＨＣのみを含む。これらの２つの集団は、ナノ粒子を含むサイトカイン分子とナノ粒子を含むペプチドＭＨＣの比率が１：１、１：２、１：３、１：４、１：５、１：６、１：７、１：８または１：９、またはナノ粒子を含むペプチド−ＭＨＣとナノ粒子を含むサイトカイン分子の比率が１：１、１：２、１：３、１：４、１：５、１：６、１：７、１：８、または１：９を含む任意の適切な比率で混合可能である。
【０１１１】
＜ＮＰ合成＞
ナノ粒子は、共刺激分子、ｐＭＨＣ複合体、および／またはサイトカインを含む水相を接触させることによって形成される場合もあり、およびポリマーと水層には続いて非水性相の蒸発が行われて、米国特許第４，５８９，３３０号または第４，８１８，５４２号に教示されるように、水相からの粒子の癒合を引き起こす。そのような調製のための特定のポリマーは、以下を含む天然または合成のコポリマーまたはポリマーである：ゼラチン、寒天、デンプン、アラビノガラクタン、アルブミン、コラーゲン、ポリグリコール酸、ポリ乳酸、グリコリド−Ｌ（−）ラクチドポリ（イプシロン−カプロラクトン）、ポリ（イプシロン−カプロラクトン−ＣＯ−乳酸）、ポリ（イプシロン−カプロラクトン−ＣＯ−グリコール酸）、ポリ（β−ヒロドキシ酪酸）、ポリ（エチレンオキシド）、ポリエチレン、ポリ（アルキル−２−シアノアクリレート）、ポリ（ヒドロキシエチルメタクリル酸塩）、ポリアミド、ポリ（アミノ酸）、ポリ（２−ヒドロキシエチルＤＬ−アスパルトアミド）、ポリ（エステル尿素）、ポリ（Ｌ−フェニルアラニン／エチレングリコール／１，６−ジイソシアナトヘキサン）、およびポリ（メタクリル酸メチル）。特に、特定のポリマーは、ポリグリコール酸、ポリ乳酸、グリコリド−Ｌ（−）ラクチドポリ（イプシロン−カプロラクトン）、ポリ（イプシロン−カプロラクトン−ＣＯ−乳酸）、およびポリ（イプシロン−カプロラクトン−ＣＯ−グリコール酸）等のポリエステルである。ポリマーを溶解するのに有用な溶媒として、水、ヘキサフルオロイソプロパノール、塩化メチレン、テトラヒドロフラン、ヘキサン、ベンゼン、またはヘキサフルオロアセトンセスキ水和物があげられる。
【０１１２】
金のナノ粒子（ＧＮＰ）は、記載のようにクエン酸ナトリウムとの塩化金の化学的還元を使用して合成される（Ｐｅｒｒａｕｌｔ，Ｓ．Ｄ．ｅｔ  ａｌ．（２００９）Ｎａｎｏ  Ｌｅｔｔ  ９：１９０９−１９１５）。手短に言えば、１％のＨＡｕＣｌ４（Ｓｉｇｍａ  Ａｌｄｒｉｃｈ）を２ｍＬ、強い撹拌下で１００ｍＬのＨ２Ｏに加え、そして溶液をオイルバスで加熱する。６（１４ｎｍのＧＮＰ）または２ｍＬ（４０ｎｍのＧＮＰ）の１％Ｎａクエン酸塩を、沸騰したＨＡｕＣｌ４溶液に加え、それをさらに１０分間撹拌し、次に室温に冷まさす。ＧＮＰは、ＭＨＣの受容体として−ＣＯＯＨまたは−ＮＨ２基で官能化された１μｍｏｌのチオール−ＰＥＧリンカー（Ｎａｎｏｃｓ、ＭＡ）の付加によって安定化される。ＰＥＧ化ＧＮＰを洗浄して遊離したチオール−ＰＥＧを除去し、濃縮し、そしてさらなる分析のために水に保存する。ＮＰ密度を分光光度法により判定し、ベールの法則に従って算出する。
【０１１３】
ＳＦＰシリーズ酸化鉄ＮＰ（ＳＦＰ  ＩＯＮＰ）はまた、界面活性剤、次にペグ化によって与えられた水性緩衝液中の溶媒の存在下で、有機溶媒中での酢酸鉄の熱分解によって生成することができる（Ｘｉｅ，Ｊ．ｅｔ  ａｌ．（２００７）Ａｄｖ  Ｍａｔｅｒ  １９：３１６３；Ｘｉｅ，Ｊ．ｅｔ  ａｌ．（２００６）Ｐｕｒｅ  Ａｐｐｌ．Ｃｈｅｍ．７８：１００３−１０１４；Ｘｕ，Ｃ．ｅｔ  ａｌ．（２００７）Ｐｏｌｙｍｅｒ  Ｉｎｔｅｒｎａｔｉｏｎａｌ  ５６：８２１−８２６）。手短に言えば、２ｍＭｏｌのＦｅ（ａｃａｃ）３（Ｓｉｇｍａ  Ａｌｄｒｉｃｈ，Ｏａｋｖｉｌｌｅ，ＯＮ）を、１０ｍＬのベンジルエーテルとオレイルアミンの混合物に溶解し、窒素ブランケットの保護下で、還流で１時間、１００℃に、次に２時間、３００℃に加熱する。合成されたＮＰを、エタノールの付加によって沈殿させ、およびヘキサンに再懸濁する。ＩＯＮＰのペグ化のために、１００ｍｇの異なる３．５ｋＤａのＤＰＡ−ＰＥＧリンカー（ＪｅｎＫｅｍ  Ｔｅｃｈ  ＵＳＡ）を、ＣＨＣｌ３とＨＣＯＮ（ＣＨ３）２の混合物（ジメチルホルムアミド（ＤＭＦ））に溶解する。次に、ＮＰ溶液（２０ｍｇのＦｅ）をＤＰＡ−ＰＥＧ溶液に加え、室温で４時間、撹拌する。ＰＥＧ化ＳＦＰ  ＮＰを、ヘキサンの付加によって一晩沈殿させ、次に水に再懸濁した。微量の集団を高速遠心分離（２０，０００ｘｇ、３０分）によって除去し、および単分散のＳＦＰ  ＮＰをさらなる特性評価とｐＭＨＣ結合のために水に保存する。ＩＯＮＰ生成物中の鉄の濃度は、２Ｎ  ＨＣＬにおいてＡ４１０で分光光度法によって判定される。ＳＦＰ  ＮＰの分子構造と直径（Ｆｅ３Ｏ４；８±１ｎｍの直径）に基づいて（Ｘｉｅ，Ｊ．ｅｔ  ａｌ．（２００７）Ａｄｖ  Ｍａｔｅｒ  １９：３１６３；Ｘｉｅ，Ｊ．ｅｔ  ａｌ．（２００６）Ｐｕｒｅ  Ａｐｐｌ．Ｃｈｅｍ．７８：１００３−１０１４）、出願人は、１ｍｇの鉄を含むＳＦＰ溶液が５×１０１４  ＮＰを含むと推測する。
【０１１４】
ナノ粒子もまた、ナノ粒子前駆体を熱で分解するか、熱することによって作ることができる。一実施形態において、ナノ粒子は金属または金属酸化物ナノ粒子である。一実施形態において、ナノ粒子は酸化鉄ナノ粒子である。一実施形態において、ナノ粒子は金ナノ粒子である。一実施形態において、本技術に従って調製されたナノ粒子が本明細書に提供される。一実施形態において、鉄アセチルアセトネートの熱分解反応を含む、酸化鉄ナノ粒子を作る方法が本明細書に提供される。一実施形態では、得られた酸化鉄ナノ粒子は水溶性である。一態様では、酸化鉄ナノ粒子はタンパク質結合に適している。一実施形態では、該方法は単一工程の熱分解反応を含む。
【０１１５】
一態様では、熱分解は、官能化されたＰＥＧ分子の存在下において生じる。
【０１１６】
一態様では、熱分解は、鉄アセチルアセトネートの加熱を含む。一実施形態では、熱分解は、官能化されたＰＥＧ分子の存在下における鉄アセチルアセトネートの加熱を含む。一実施形態では、熱分解は、ベンジルエーテルと官能化されたＰＥＧ分子の存在下における鉄アセチルアセトネートの加熱を含む。
【０１１７】
理論に縛られることなく、一実施形態では、官能化されたＰＥＧ分子は、還元試薬と界面活性剤として使用される。本明細書に提供されるナノ粒子を作る方法は、従来方法を単純化して改良するが、粒子を水溶性にするためのＰＥＧ分子による従来方法は、置き換えの困難な、または完全には置き換えられない界面活性剤を使用する。従来より、界面活性剤は高価であり（例えばリン脂質）、または毒性である場合もある（例えばオレイン酸またはオレイルアミン）。他の態様では、理論に縛られることなく、ナノ粒子を作る方法は、従来の界面活性剤を使用する必要を回避し、それによって高度の分子純度と水溶解度を達成する。
【０１１８】
一実施形態において、熱分解は、鉄アセチルアセトネートとベンジルエーテルを含み、および本明細書で使用される以外の界面活性剤の欠如下で起こる。
【０１１９】
一実施形態において、熱分解のための温度は、約８０℃から約３００℃、または約８０℃から約２００℃、または約８０℃から約１５０℃、または約１００℃から約２５０℃、または約１００℃から約２００℃、または約１５０℃から約２５０℃、または約１５０℃から約２５０℃である。一実施形態において、熱分解は約１〜約２時間で生じる。
【０１２０】
一実施形態において、酸化鉄ナノ粒子を作る方法は、Ｍｉｌｔｅｎｙｉ  Ｂｉｏｔｅｃ  ＬＳマグネットカラムを使用する等による精製工程を含む。
【０１２１】
一実施形態では、ナノ粒子は、検出可能な分解または凝集なく、リン酸緩衝食塩水（ＰＢＳ）中で約４℃で安定している。一実施形態では、ナノ粒子は少なくとも６ヶ月間安定している。
【０１２２】
一態様において、本明細書で提供されるのは、ナノ粒子複合体を作る方法であって、該方法はｐＭＨＣを本明細書で提供される酸化鉄ナノ粒子に接触させる工程を含む。理論に縛られることなく、ｐＭＨＣはそのカルボキシ末端でシステインをコードし、それは、約６．２ｐＨ〜約６．５ｐＨで、約１２〜約１４時間、官能化ＰＥＧのマレイミド基と反応することができる。
【０１２３】
一実施形態において、ナノ粒子複合体を作る方法は、Ｍｉｌｔｅｎｙｉ  Ｂｉｏｔｅｃ  ＬＳマグネットカラムを使用する等による精製工程を含む。
【０１２４】
＜疾患関連の抗原＞
ｐＭＨＣ−ＮＰのｐＭＨＣ複合体は、処置される疾患に基づいて使用のために選択される。例えば、糖尿病関連の抗原は、抗原が疾患プロセスの誘因またはその病態形成における中心的存在ではなく、提示されたときに糖尿病を処置する働きをする免疫反応を生成する場合であっても、その自己免疫性疾患において標的とされた細胞、組織または器官に発現される、および自己免疫反応によって引き起こされた細胞、組織または器官の損傷に際して免疫系に暴露される抗原またはそのフラグメントであり、したがってこの定義を満たす糖尿病関連の抗原は、糖尿病を処置するために選択される。ＭＳ関連の抗原は、ＭＳを処置するために選択される。糖尿病関連の抗原は、ＭＳを処置するためには選択されないだろう。癌関連または腫瘍関連の抗原は、癌および／または腫瘍を処置するだろう。非限定的で典型的な疾患関連の抗原が本明細書に開示され、さらにそのような抗原は、文献に十分に記載されている技術、メカニズム、および方法に基づいて、特定の疾患に関して判定され得る。
【０１２５】
特定の態様では、抗原−ＭＨＣ複合体に含まれる疾患関連の抗原は、自己免疫性疾患関連の抗原、炎症関連の抗原、またはアレルギー性疾患関連の抗原から選択される。さらなる態様において、免疫性炎関連の抗原は、以下の群から選択される１つ以上である：喘息関連の抗原、糖尿病関連の抗原、前糖尿病関連の抗原、多発性硬化症関連の抗原、アレルギー性喘息関連の抗原、原発性胆汁性肝硬変関連の抗原、硬変関連の抗原、視神経脊髄炎スペクトル障害（デビック病、ＮＭＯ）関連の抗原、自己免疫性脳炎関連の抗原、自己抗体を媒介とした神経性症候群関連の抗原、スティッフマン症候群関連の抗原、傍腫瘍性疾患関連の抗原、中枢および末梢の神経系の他の疾患関連の抗原、尋常性天疱瘡関連の抗原、炎症性腸疾患（ＩＢＤ）関連の抗原、クローン病関連の抗原、潰瘍性大腸炎関連の抗原、関節炎関連の抗原、関節リウマチ関連の抗原、全身性エリテマトーデス（ＳＬＥ）関連の抗原、セリアック病関連の抗原、乾癬関連の抗原円形脱毛症関連の抗原、後天性血小板減少性紫斑病関連の抗原、自己免疫性心筋症関連の抗原、特発性拡張型心筋症（ＩＤＣＭ）関連の抗原、重症筋無力症関連の抗原、ブドウ膜炎関連の抗原、強直性脊椎炎関連の抗原、グレーヴス病関連の抗原、橋本甲状腺炎関連の抗原、免疫介在性ミオパチー関連の抗原、抗リン脂質抗体症候群（ＡＮＣＡ＋）関連の抗原、アテローム性動脈硬化症関連の抗原、強皮症関連の抗原、自己免疫性肝炎関連の抗原、皮膚筋炎関連の抗原、慢性閉塞性肺疾患関連の抗原、脊髄損傷関連の抗原、外傷関連の抗原、タバコによって誘発される肺の破壊に関連する抗原、慢性閉塞性肺疾患（ＣＯＰＤ）関連の抗原、肺気腫関連の抗原、硬化性胆管炎関連の抗原、末梢神経障害関連の抗原、ナルコレプシー関連の抗原、グッドパスチャー症候群関連の抗原、川崎病関連の抗原、自己免疫性ブドウ膜炎関連の抗原、大腸炎関連の抗原、気腫関連の抗原、天疱瘡関連の抗原、落葉性天疱瘡関連の抗原、関節炎関連の抗原、シェーグレン症候群関連の抗原、ＡＮＣＡを関係する脈管炎関連の抗原、原発性硬化性胆管炎関連の抗原、ＡＮＣＡ関連の脈管炎関連の抗原、原発性硬化性胆管炎関連の抗原）、脂肪組織炎症／ＩＩ型糖尿病関連の抗原、または肥満関連の脂肪組織炎症／インスリン抵抗性関連の抗原。
【０１２６】
特定の態様では、疾患関連の抗原は、以下の群の１つ以上に由来する：ＰＰＩ、ＩＧＲＰ、ＧＡＤ、ペリフェリン、ａＧｌｉａ、ＰＤＣ−Ｅ２、インスリン、ＤＧ１ＥＣ２、ＤＧ３、ＡＱＰ４、ＰＬＰ、ＭＯＧ、ＭＢＰ、ＣＩＩ、ＤＥＲＰ１、ＤＥＲＰ２、ＯＶＡ、ＢａｃＩｎｔ、ＣＢｉｒ、Ｆｌａ−Ｘ、Ｆｌａ−２、ＹＩＤＸ、ＡＣｈＲ、甲状腺ペルオキシダーゼ、甲状腺受容体、リン脂質抗原、Ｈ４、Ｈ２Ｂ、Ｈ１、ＤＮＡ、ＡｐｏＢ、ＡｐｏＥ、ＮＭＤＡＲ、電位開口型カリウムチャネル、エラスチン、アレスチン、ＰＥＲＭ＿ＨＵＭＡＮミエロペルオキシダーゼ、ＰＲＴＮ３＿ＨＵＭＡＮミエロブラスチン、ＣＰ２Ｄ６＿ＨＵＭＡＮシトクロムＰ４５０  ２Ｄ６、ＳＰＣＳ＿ＨＵＭＡＮ  Ｏ−ホスホセリル−ｔＲＮＡ（Ｓｅｃ）セレニウムトランスフェラーゼ、ＣＡＭＰ＿ＨＵＭＡＮカテリシジン抗菌ペプチド、ＤＮＡトポイソメラーゼＩ、ＣＥＮＰ−Ｃ、ＡＰＯＨ＿ＨＵＭＡＮベータ−２−糖タンパク質１、ＲＯ６０＿ＨＵＭＡＮ  ６０ｋＤａ  ＳＳ−Ａ／Ｒｏリボ核タンパク質、ＬＡ＿ＨＵＭＡＮ  Ｌｕｐｕｓ  Ｌａタンパク質、ＩＲＢＰ、ミオシン、ＣＤ１ｄ結合脂質抗原、Ｃａｐ１８、ＣＰ２Ｄ６、ＳＰＣＳ、ＲＯ６０、ＲＯ５２、ＬＡ、ＡＰＯＨ、ＭＰＯ、ＰＲＴＮ３、またはＨＳＰ。
【０１２７】
いくつかの実施形態では、疾患関連の抗原は以下の通りである：
ａ）糖尿病関連の抗原であり、以下の群の１つ以上から選択される抗原に由来する抗原：プレプロインスリン（ＰＰＩ）、島特異的なグルコース−６−ホスファターゼ（ＩＧＲＰ）、グルタミン酸デカルボキシラーゼ（ＧＡＤ）、島細胞自己抗原−２（ＩＣＡ２）、インスリン、プロインスリン、またはそれら各々のフラグメントまたは同等物；
ｂ）多発性硬化症関連の抗原であり、以下の群の１つ以上から選択される抗原に由来する抗原：ミエリン塩基性タンパク質、ミエリン関連の糖タンパク質、ミエリンオリゴデンドロサイトタンパク質、プロテオリピドタンパク質、オリゴデンドロサイトミエリンオリゴタンパク質、ミエリン関連のオリゴデンドロサイト塩基性タンパク質、オリゴデンドロサイト特異性タンパク質、熱ショックタンパク質、オリゴデンドロサイト特異性タンパク質、ＮＯＧＯ  Ａ、糖タンパク質Ｐｏ、末梢ミエリンタンパク質２２、２’３’−環状ヌクレオチド３’−ホスホジエステラーゼ、またはそれら各々のフラグメントまたは同等物；
ｃ）セリアック病関連の抗原であり、グリアジンまたはフラグメント、あるいはそれらの同等物に由来する抗原；
ｄ）原発性胆汁性肝硬変関連の抗原であり、ＰＤＣ−Ｅ２、またはそれらのフラグメントまたは同等物に由来する抗原；
ｅ）落葉性天疱瘡の抗原および／または尋常性天疱瘡関連の抗原であり、以下の群の１つ以上から選択される抗原に由来する抗原：ＤＧ１、ＤＧ３、またはそれら各々のフラグメントまたは同等物；
ｆ）視神経脊髄炎スペクトル障害関連の抗原であり、ＡＱＰ４またはそのフラグメントまたは同等物に由来する抗原；
ｇ）関節炎関連の抗原であり、以下の群の１つ以上から選択される抗原に由来する抗原：熱ショックタンパク質、免疫グロブリン結合タンパク質、ヘテロ核ＲＮＰ、アネキシンＶ、カルパスタチン、ＩＩ型コラーゲン、グルコース−６−リン酸イソメラーゼ、伸長因子ヒト軟骨ｇｐ３９、マンノース結合レクチン、シトルリン化ビメンチン、ＩＩ型コラーゲン、フィブリノゲン、アルファエノラーゼ、抗カルバミル化タンパク質（抗ＣａｒＰ）、ＩＶ型ペプチジルアルギニンデイミナーゼ（ＰＡＤ４）、ＢＲＡＦ、フィブリノゲンガンマ鎖、インター−アルファ−トリプシン阻害剤重鎖Ｈ１、α１アンチトリプシン、血漿プロテアーゼＣ１阻害剤、ゲルゾリン、アルファ１−Ｂ糖タンパク質、セルロプラスミン、インタ−−アルファ−トリプシン阻害剤重鎖Ｈ４、補体因子Ｈ、α２マクログロブリン、血清アミロイド、Ｃ反応性タンパク質、血清アルブミン、フィブロゲン（ｆｉｂｒｏｇｅｎ）ベータ鎖、セロトランスフェリン（ｓｅｒｏｔｒａｎｓｆｅｒｉｎ）、α２−ＨＳ糖タンパク質、ビメンチン、補体Ｃ３、またはそれら各々のフラグメントまたは同等物；
ｈ）アレルギー性喘息関連の抗原であり、以下の群の１つ以上から選択される抗原に由来する抗原：ＤＥＲＰ１、ＤＥＲＰ２、またはそれら各々のフラグメントまたは同等物；
ｉ）炎症性腸疾患関連の抗原であり、以下の群の１つ以上から選択される抗原に由来する抗原：フラゲリン（Ｆｌａｇｅｌｉｎ）、Ｆｌａ−２、Ｆｌａ−Ｘ、ＹＩＤＸ、バクテロイデスインテグラーゼ、またはそれら各々のフラグメントまたは同等物；
ｊ）全身性エリテマトーデス関連の抗原であり、以下の群の１つ以上から選択される抗原に由来する抗原：二本鎖（ｄｓ）ＤＮＡ、リボ核タンパク質（ＲＮＰ）、Ｓｍｉｔｈ（Ｓｍ）、シェーグレン症候群関連の抗原Ａ（ＳＳ−Ａ）／Ｒｏ、シェーグレン症候群関連の抗原Ｂ（ＳＳ−Ｂ）／Ｌａ、ＲＯ６０、ＲＯ５２、ヒストン、またはそれら各々のフラグメントまたは同等物；
ｋ）アテローム性動脈硬化症関連の抗原であり、以下の群の１つ以上から選択される抗原に由来する抗原：ＡｐｏＢ、ＡｐｏＥ、またはそれら各々のフラグメントまたは同等物；
ｌ）ＣＯＰＤ関連の抗原および／または気腫関連の抗原であり、エラスチンまたはそれらのフラグメントまたは同等物に由来する抗原：
ｍ）乾癬関連の抗原であり、以下の群の１つ以上から選択される抗原に由来する抗原：Ｃａｐ１８、ＡＤＭＴＳＬ５、ＡＴＬ５、またはそれら各々のフラグメントまたは同等物；
ｎ）自己免疫性肝炎関連の抗原であり、以下の群の１つ以上から選択される抗原に由来する抗原：ＣＹＰ２Ｄ６、ＳＬＡ、またはそれら各々のフラグメントまたは同等物；
ｏ）ブドウ膜炎関連の抗原であり、アレスチンまたはそのフラグメントまたは同等物；
ｐ）シェーグレン症候群関連の抗原であり、以下の群の１つ以上から選択される抗原に由来する抗原：（ＳＳＡ）／Ｒｏ、（ＳＳ−Ｂ）／Ｌａ、ＭＲ３、ＲＯ６０、ＲＯ５２、またはそれら各々のフラグメントまたは同等物；
ｑ）強皮症関連の抗原であり、以下の群の１つ以上から選択される抗原に由来する抗原：ＣＥＮＰ−Ｃ、ＴＯＰ  １、ＲＮＡポリメラーゼＩＩＩ、またはそれら各々のフラグメントまたは同等物；
ｒ）抗リン脂質抗体症候群関連の抗原であり、ＡＰＯＨまたはそのフラグメントまたは同等物に由来する抗原；
ｓ）ＡＮＣＡ関連の脈管炎関連の抗原であり、以下の群の１つ以上から選択される抗原に由来する抗原：ＭＰＯ、ＰＲＴＮ３、またはそれら各々のフラグメントまたは同等物；あるいは
ｔ）スティッフマン症候群に関連する抗原であり、ＧＡＤまたはそのフラグメントまたは同等物に由来する抗原。
【０１２８】
＜糖尿病関連の抗原＞
糖尿病関連の抗原は、限定されないが、ＰＰＩ、ＩＧＲＰ、ＧＡＤ、島細胞自己抗原−２（ＩＣＡ２）、および／またはインスリンに由来する抗原を含む。自己反応性の糖尿病関連の抗原ペプチドは、限定されないが、米国特許出願公開第２００５／０２０２０３２号に開示されたペプチドおよびタンパク質（これはその全体が引用によっても本明細書に組み込まれる）に加えて、以下の表１に表記される抗原ペプチドの他に、それら各々の同等物および／または組み合わせを含む。
【０１２９】
【表１】
2020500015.tif 000003
【０１３０】
＜ＭＳ関連の抗原＞
本開示の抗原は、多発性硬化症に関連する抗原を含む。そのような抗原は、例えば、米国特許出願公開第２０１２／００７７６８６号に開示された抗原、およびミエリン塩基性タンパク質に由来する抗原、ミエリン関連の糖タンパク質、ミエリンオリゴデンドロサイトタンパク質、プロテオリピドタンパク質、オリゴデンドロサイトミエリンオリゴタンパク質、ミエリン関連のオリゴデンドロサイト塩基性タンパク質、オリゴデンドロサイト特異性タンパク質、熱ショックタンパク質、オリゴデンドロサイト特異的なタンパク質ＮＯＧＯ  Ａ、糖タンパク質Ｐｏ、末梢ミエリンタンパク質２２、または２’３’−環状ヌクレオチド３’−ホスホジエステラーゼを含む。特定の実施形態では、抗原は、ミエリンオリゴデンドロサイト糖タンパク質（ＭＯＧ）に由来する。
【０１３１】
またさらなる態様では、ＭＳおよびＭＳ関連の障害の処置のためのペプチド抗原は、限定されないが、表２に表記されるものとともに、それら各々の同等物および／または組み合わせを含む。
【０１３２】
【表２】
2020500015.tif 000004
【０１３３】
＜セリアック病（ＣＤ）関連の抗原＞
セリアック病関連の抗原は、限定されないが、グリアジンに由来する抗原を含む。いくつかの実施形態では、グリアジンの非限定的な種類は、アルファ／ベータのグリアジン、γ−グリアジン、またはω−グリアジンを含む。他の非限定的で典型的なセリアック病関連の抗原は、表３に表記される抗原と共に、それら各々の同等物および／または組み合わせを含む。
【０１３４】
【表３】
2020500015.tif 000005
【０１３５】
＜原発性胆汁性肝硬変（ＰＢＣ）関連の抗原＞
原発性胆汁性肝硬変関連の抗原は、限定されないが、ＰＤＣ−Ｅ２に由来する抗原を含む。典型的な抗原の非限定的な例は、表４に表記される抗原と共に、それら各々の同等物および／または組み合わせを含む。
【０１３６】
【表４】
2020500015.tif 000006
【０１３７】
＜落葉性天疱瘡（ＰＦ）および尋常性天疱瘡（ＰＶ）関連の抗原＞
ＰＦおよびＰＶ関連の抗原は、限定されないが、デスモグレイン３（ＤＧ３）および／またはデスモグレイン１（ＤＧ１）に由来する抗原を含む。非限定的な例は、表５に表記される抗原と共に、それら各々の同等物および／または組み合わせを含む。
【０１３８】
【表５】
2020500015.tif 000007
【０１３９】
＜視神経脊髄炎スペクトル障害（ＮＭＯ）関連の抗原＞
ＮＭＯ関連の抗原は、限定されないが、ＡＱＰ４またはアクアポリン４に由来する抗原を含む。非限定的な例は、表６に表記されるもの、およびそれら各々の同等物および／または組み合わせを含む。
【０１４０】
【表６】
2020500015.tif 000008
【０１４１】
＜関節炎関連の抗原＞
関節炎関連の抗原は、限定されないが、熱ショックタンパク質、免疫グロブリン結合タンパク質、ヘテロ核ＲＮＰ、アネキシンＶ、カルパスタチン、ＩＩ型コラーゲン、グルコース−６−リン酸イソメラーゼ、伸長因子ヒト軟骨ｇｐ３９、マンノース結合レクチン、シトルリン化ビメンチン、ＩＩ型コラーゲン、フィブリノゲン、アルファエノラーゼ、抗カルバミル化タンパク質（抗ＣａｒＰ）、ＩＶ型ペプチジルアルギニンデイミナーゼ（ＰＡＤ４）、ＢＲＡＦ、フィブリノゲンガンマ鎖、インター−アルファ−トリプシン阻害剤重鎖Ｈ１、α１−アンチトリプシン、血漿プロテアーゼＣ１阻害剤、ゲルゾリン、アルファ１−Ｂ糖タンパク質、セルロプラスミン、インター−アルファ−トリプシン阻害剤重鎖Ｈ４、補体因子Ｈ、α２マクログロブリン、血清アミロイド、Ｃ反応性タンパク質、血清アルブミン、フィブロゲンベータ鎖、セロトランスフェリン、α２−ＨＳ糖タンパク質、ビメンチン、補体Ｃ３、またはそれら各々のフラグメントまたは同等物に由来する抗原を含む。
【０１４２】
＜アレルギー性喘息関連の抗原＞
アレルギー性喘息関連の抗原は、限定されないが、ＤＥＲＰ１およびＤＥＲＰ２に由来する抗原を含む。非限定的な例は、表７に表記される抗原と共に、それら各々の同等物および／または組み合わせを含む。
【０１４３】
【表７】
2020500015.tif 000009
【０１４４】
＜炎症性腸疾患関連の抗原＞
炎症性腸疾患関連の抗原は、限定されないが、クローン病関連の抗原および潰瘍性大腸炎関連の抗原を含む。いくつかの実施形態では、炎症性腸疾患関連の抗原は、限定されないが、バクテロイデスインテグラーゼ、フラゲリン、フラジェリン２（Ｆｌａ−２／Ｆｌａ−Ｘ）、または特徴づけられていない大腸菌タンパク質（ＹＩＤＸ）に由来する抗原を含む。非限定的な例は、表８に表記される抗原と共に、それら各々の同等物および／または組み合わせを含む。
【０１４５】
【表８】
2020500015.tif 000010
【０１４６】
＜全身性エリテマトーデス（ＳＬＥ）関連の抗原＞
ＳＬＥに関連する抗原は、限定されないが、Ｈ４、Ｈ２Ｂ、Ｈ１’、ｄｓＤＮＡ、ＲＮＰ、スミス（Ｓｍ）、シェーグレン症候群関連の抗原（ＳＳＡ）／Ｒｏ、シェーグレン症候群関連の抗原Ｂ（ＳＳ−Ｂ）／Ｌａ、および／またはヒストンに由来する抗原を含む。いくつかの実施形態では、ＳＳ−Ａは、限定されないがＲＯ６０とＲＯ５２を含む。いくつかの実施形態では、ヒストンは、限定されないがＨ４、Ｈ２Ｂ、Ｈ１’を含む。非限定的な例は、表９に表記される抗原と共に、それら各々の同等物および／または組み合わせを含む。
【０１４７】
【表９】
2020500015.tif 000011
【０１４８】
＜アテローム動脈硬化症関連の抗原＞
アテローム動脈硬化症関連の抗原は、限定されないが、アポリポタンパク質Ｂ（ＡｐｏＢ）またはアポリポタンパク質Ｅ（ＡｐｏＥ）に由来し得る。非限定的な例は、表１０に表記される抗原と共に、それら各々の同等物および／または組み合わせも含む。
【０１４９】
【表１０】
2020500015.tif 000012
【０１５０】
＜慢性閉塞性肺疾患（ＣＯＰＤ）−および／または気腫関連の抗原＞
ＣＯＰＤおよび／または気腫に関連する抗原は、限定されないがエラスチン由来のものを含む。非限定的な例は、表１１に表記されるもの、およびそれら各々の同等物および／または組み合わせを含む。
【０１５１】
【表１１】
2020500015.tif 000013
【０１５２】
＜乾癬関連の抗原＞
乾癬関連の抗原は、限定されないが、以下の表１２に開示されるもの、およびそれらの同等物と組み合わせを含む。非限定的で典型的な乾癬関連の抗原は、ヒトアダムス様タンパク質５（ａｄａｍｉｓ−ｌｉｋｅ  ｐｒｏｔｅｉｎ  ５、ＡＴＬ５）、カテリシジン抗菌性ペプチド（ＣＡＰ１８）、および／または、ＡＤＡＭＴＳ様タンパク質５（ＡＤＭＴＳＬ５）に由来し得る。
【０１５３】
【表１２】
2020500015.tif 000014
【０１５４】
＜自己免疫性肝炎に関連する抗原＞
自己免疫性肝炎に関連する抗原は、限定されないが、以下の表１３に開示されるもの、およびそれらの同等物と組み合わせを含む。他の非限定的で典型的な自己免疫性肝炎に関連する抗原は、ミクロソームのシトクロムＰ４５０ＩＩＤ６（ＣＹＰ２Ｄ６）および／または可溶性肝臓抗原（ＳＬＡ）に由来し得る。
【０１５５】
【表１３】
2020500015.tif 000015
【０１５６】
＜ブドウ膜炎関連の抗原＞
ブドウ膜炎関連の抗原は、限定されないが、以下の表１４に開示されるもの、およびそれらの同等物と組み合わせを含む。他の非限定的で典型的なブドウ膜炎関連の抗原は、アレスチン、ヒトレチナールＳ抗原、および／または光受容体間レチノイド結合タンパク質に由来し得る。
【０１５７】
【表１４】
2020500015.tif 000016
【０１５８】
＜シェーグレン症候群関連の抗原＞
シェーグレン症候群関連の抗原は、限定されないが、以下の表５に開示されるもの、およびそれらの同等物と組み合わせを含む。他の非限定的な典型的シェーグレン症候群関連の抗原は、（ＳＳ−Ａ）／Ｒｏ、（ＳＳ−Ｂ）／Ｌａ、ＲＯ６０、ＲＯ５２、および／またはムスカリン性受容体３（ＭＲ３）に由来し得る。
【０１５９】
【表１５】
2020500015.tif 000017
【０１６０】
＜強皮症関連の抗原＞
強皮症関連の抗原は、限定されないが、以下の表１６に開示されるもの、およびそれらの同等物と組み合わせを含む。非限定的で典型的な強皮症関連の抗原は、セントロメア自己抗原動原体タンパク質Ｃ（ＣＥＮＰ−Ｃ）、ＤＮＡトポイソメラーゼＩ（ＴＯＰ１）、および／またはＲＮＡポリメラーゼＩＩＩに由来し得る。
【０１６１】
【表１６】
2020500015.tif 000018
【０１６２】
＜抗リン脂質抗体症候群関連の抗原＞
抗リン脂質抗体症候群関連の抗原は、限定されないが以下の表１７に開示されるものと共に、それらの同等物および／または組み合わせとを含む。非限定的で典型的な抗リン脂質抗体症候群関連の抗原は、β２糖タンパク質１（ＢＧ２Ｐ１またはＡＰＯＨ）に由来し得る。
【０１６３】
【表１７】
2020500015.tif 000019
【０１６４】
＜ＡＮＣＡ関連の脈管炎関連の抗原＞
ＡＮＣＡ関連の脈管炎関連の抗原は、限定されないが以下の表１８に開示されるものと共に、それらの同等物および／または組み合わせとを含む。非限定的で典型的なＡＮＣＡ関連の脈管炎関連の抗原は、ミエロペルオキシダーゼ（ＭＰＯ）、プロテイナーゼ（ＰＲＴＮ３）または細菌性の透過性増強因子（ＢＰＩ）に由来し得る。
【０１６５】
【表１８】
2020500015.tif 000020
【０１６６】
＜スティッフマン症候群関連の抗原＞
スティッフマン症候群関連の抗原は、限定されないが、以下の表１４に開示されるもの、およびそれらの同等物と組み合わせを含む。非限定的で典型的なスティッフマン症候群関連の抗原は、グルタミン酸デカルボキシラーゼ（ＧＡＤ）に由来し得る。いくつかの実施形態では、ＧＡＤは限定されないがＧＡＤ６５を含む。
【０１６７】
【表１９】
2020500015.tif 000021
【０１６８】
本開示の組成物において、組成物中にｍｌあたり全部で約０．００１ｍｇから約１０ｍｇのタンパク質が存在することが熟慮される。したがって、組成物中のタンパク質の濃度は、約、少なくとも約、または多くとも約０．００１、０．０１０、０．０５０、０．１、０．２、０．３、０．４、０．５、０．６、０．７、０．８、０．９、１．０、１．５、２．０、２．５、３．０、３．５、４．０、４．５、５．０、５．５、６．０、６．５、７．０、７．５、８．０、８．５、９．０、９．５、１０．０、５０、１００μｇ／ｍｌまたはｍｇ／ｍｌ、またはそれ以上（または推論可能な任意の範囲）であり得る。約、少なくとも約、または多くとも約１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、２９、３０、３１、３２、３３、３４、３５、３６、３７、３８、３９、４０、４１、４２、４３、４４、４５、４６、４７、４８、４９、５０、５１、５２、５３、５４、５５、５６、５７、５８、５９、６０、６１、６２、６３、６４、６５、６６、６７、６８、６９、７０、７１、７２、７３、７４、７５、７６、７７、７８、７９、８０、８１、８２、８３、８４、８５、８６、８７、８８、８９、９０、９１、９２、９３、９４、９５、９６、９７、９８、９９または１００％のこれは、ペプチド／ＭＨＣ／ナノ粒子複合体であり得る。
【０１６９】
本開示は、自己免疫反応または癌に関係した疾患または疾病の発症に対する診断、処置または予防的治療をもたらすために、ペプチド／ＭＨＣ／ナノ粒子複合体の投与を熟考する。
【０１７０】
加えて、参照により本明細書に組み込まれる米国特許第４，５５４，１０１号（Ｈｏｐｐ）は、親水性に基づいた一次アミノ酸配列からのエピトープの識別と調製を教授する。Ｈｏｐｐに開示された方法によって、当業者は、アミノ酸配列内から可能性のあるエピトープを識別し、そしてその免疫原性を確認することができる。多数の科学刊行物もまた、アミノ酸配列の分析からの二次構造の予測とエピトープの識別に専念してきた（Ｃｈｏｕ  ＆Ｆａｓｍａｎ，１９７４ａ，ｂ；１９７８ａ，ｂ；１９７９）。望ましい場合には、米国特許第４，５５４，１０１号のＨｏｐｐの教示を補足するために、これらのいずれかを使用してもよい。
【０１７１】
＜他の抗原成分＞
ペプチド以外の分子は、ＭＨＣ分子を伴う複合体で抗原または抗原フラグメントとして使用することができる。そのような分子として、限定されないが、炭水化物、脂質、および小分子等があげられる。炭水化物は、様々な細胞の外側表面の主要成分である。特定の炭水化物は、分化の異なる段階を特徴とし、しばしばこれらの炭水化物は特定の抗体によって認識される。別個の炭水化物の発現は、特定の細胞型に限定することができる。子宮内膜と血清抗原に対する自己抗体反応は、子宮内膜症の一般的な特徴であることが示されてきた。炭水化物エピトープに特異的な、２−Ｈｅｒｅｍａｎｓ  Ｓｃｈｍｉｄｔ糖タンパク質と炭酸脱水酵素を含む、多くのあらかじめ特定された抗原に対する、子宮内膜症における血清自己抗体反応が記載されてきた。
【０１７２】
＜非限定的で典型的な抗原−ＭＨＣ複合体＞
特定の実施形態では、抗原とＭＨＣの特定の組み合わせは、特定の疾患の処置のために最適化され得る。非限定的な例として、限定されないが以下の例があげられる。
【０１７３】
I型糖尿病の処置については、ｐＭＨＣ複合体の抗原は以下の群の抗原に由来し得る：ＰＰＩ７６−９０（Ｋ８８Ｓ）、ＩＧＲＰ１３−２５、ＧＡＤ５５５−５６７、ＧＡＤ５５５−５６７（５５７Ｉ）、ＩＧＲＰ２３−３５、Ｂ２４−Ｃ３６、ＰＰＩ７６−９０、またはそれら各々のフラグメントあるいは同等物、およびｐＭＨＣ複合体のＭＨＣは、以下の群のポリペプチドのすべてまたは一部を含む：ＨＬＡ−ＤＲＢ１＊０４０１／ＤＲＡ、ＨＬＡ−ＤＲＢ１＊０３０１／ＤＲＡ、またはそれら各々のフラグメントあるいは同等物。
【０１７４】
いくつかの実施形態において、ｐＭＨＣ複合体の抗原は：
ａ）糖尿病関連の抗原であり、以下の群の１つ以上から選択される抗原に由来する抗原：プレプロインスリン（ＰＰＩ）、島特異的なグルコース−６−ホスファターゼ（ＩＧＲＰ）、グルタミン酸デカルボキシラーゼ（ＧＡＤ）、島細胞自己抗原−２（ＩＣＡ２）、インスリン、プロインスリン、またはそれら各々のフラグメントまたは同等物；
ｂ）多発性硬化症関連の抗原であり、以下の群の１つ以上から選択される抗原に由来する抗原：ミエリン塩基性タンパク質、ミエリン関連の糖タンパク質、ミエリンオリゴデンドロサイトタンパク質、プロテオリピドタンパク質、オリゴデンドロサイトミエリンオリゴタンパク質、ミエリン関連のオリゴデンドロサイト塩基性タンパク質、オリゴデンドロサイト特異的なタンパク質、熱ショックタンパク質、オリゴデンドロサイト特異的なタンパク質、ＮＯＧＯ  Ａ、糖タンパク質Ｐｏ、末梢ミエリンタンパク質、２’３’−環状ヌクレオチド３’−ホスホジエステラーゼ２２、またはそれら各々のフラグメントまたは同等物；
ｃ）セリアック病関連の抗原であり、グリアジン、またはそのフラグメントあるいは同等物に由来する抗原；
ｄ）原発性胆汁性肝硬変関連の抗原であり、ＰＤＣ−Ｅ２、またはそれらのフラグメントまたは同等物に由来する抗原；
ｅ）落葉性天疱瘡の抗原および／または尋常性天疱瘡関連の抗原であり、以下の群の１つ以上から選択される抗原に由来する抗原：ＤＧ１、ＤＧ３、またはそれら各々のフラグメントまたは同等物；
ｆ）視神経脊髄炎スペクトル障害関連の抗原であり、ＡＱＰ４またはそのフラグメントまたは同等物に由来する抗原；
ｇ）関節炎関連の抗原であり、以下の群の１つ以上から選択される抗原に由来する抗原：熱ショックタンパク質、免疫グロブリン結合タンパク質、ヘテロ核ＲＮＰ、アネキシンＶ、カルパスタチン、ＩＩ型コラーゲン、グルコース−６−リン酸イソメラーゼ、伸長因子ヒト軟骨ｇｐ３９、マンノース結合レクチン、シトルリン化ビメンチン、ＩＩ型コラーゲン、フィブリノゲン、アルファエノラーゼ、抗カルバミル化タンパク質（抗ＣａｒＰ）、ＩＶ型ペプチジルアルギニンデイミナーゼ（ＰＡＤ４）、ＢＲＡＦ、フィブリノゲンガンマ鎖、インター−アルファ−トリプシン阻害剤重鎖Ｈ１、α１アンチトリプシン、血漿プロテアーゼＣ１阻害剤、ゲルゾリン、アルファ１−Ｂ糖タンパク質、セルロプラスミン、インタ−−アルファ−トリプシン阻害剤重鎖Ｈ４、補体因子Ｈ、α２マクログロブリン、血清アミロイド、Ｃ反応性タンパク質、血清アルブミン、フィブロゲン（ｆｉｂｒｏｇｅｎ）ベータ鎖、セロトランスフェリン（ｓｅｒｏｔｒａｎｓｆｅｒｉｎ）、α２−ＨＳ糖タンパク質、ビメンチン、補体Ｃ３、またはそれら各々のフラグメントまたは同等物；
ｈ）アレルギー性喘息関連の抗原であり、以下の群の１つ以上から選択される抗原に由来する抗原：ＤＥＲＰ１、ＤＥＲＰ２、またはそれら各々のフラグメントまたは同等物；
ｉ）炎症性腸疾患関連の抗原であり、以下の群の１つ以上から選択される抗原に由来する抗原：フラゲリン（Ｆｌａｇｅｌｉｎ）、Ｆｌａ−２、Ｆｌａ−Ｘ、ＹＩＤＸ、バクテロイデスインテグラーゼ、またはそれら各々のフラグメントまたは同等物；
ｊ）全身性エリテマトーデス関連の抗原であり、以下の群の１つ以上から選択される抗原に由来する抗原：二本鎖（ｄｓ）ＤＮＡ、リボ核タンパク質（ＲＮＰ）、Ｓｍｉｔｈ（Ｓｍ）、シェーグレン症候群関連の抗原Ａ（ＳＳ−Ａ）／Ｒｏ、シェーグレン症候群関連の抗原Ｂ（ＳＳ−Ｂ）／Ｌａ、ＲＯ６０、ＲＯ５２、ヒストン、またはそれら各々のフラグメントまたは同等物；
ｋ）アテローム性動脈硬化症関連の抗原であり、以下の群の１つ以上から選択される抗原に由来する抗原：ＡｐｏＢ、ＡｐｏＥ、またはそれら各々のフラグメントまたは同等物；
ｌ）ＣＯＰＤ関連の抗原および／または気腫関連の抗原であり、エラスチンまたはそれらのフラグメントまたは同等物に由来する抗原：
ｍ）乾癬関連の抗原であり、以下の群の１つ以上から選択される抗原に由来する抗原：Ｃａｐ１８、ＡＤＭＴＳＬ５、ＡＴＬ５、またはそれら各々のフラグメントまたは同等物；
ｎ）自己免疫性肝炎関連の抗原であり、以下の群の１つ以上から選択される抗原に由来する抗原：ＣＹＰ２Ｄ６、ＳＬＡ、またはそれら各々のフラグメントまたは同等物；
ｏ）ブドウ膜炎関連の抗原であり、アレスチンまたはそのフラグメントまたは同等物；
ｐ）シェーグレン症候群関連の抗原であり、以下の群の１つ以上から選択される抗原に由来する抗原：（ＳＳＡ）／Ｒｏ、（ＳＳ−Ｂ）／Ｌａ、ＭＲ３、ＲＯ６０、ＲＯ５２、またはそれら各々のフラグメントまたは同等物；
ｑ）強皮症関連の抗原であり、以下の群の１つ以上から選択される抗原に由来する抗原：ＣＥＮＰ−Ｃ、ＴＯＰ  １、ＲＮＡポリメラーゼＩＩＩ、またはそれら各々のフラグメントまたは同等物；
ｒ）抗リン脂質抗体症候群関連の抗原であり、ＡＰＯＨまたはそのフラグメントまたは同等物に由来する抗原；
ｓ）ＡＮＣＡ関連の脈管炎関連の抗原であり、以下の群の１つ以上から選択される抗原に由来する抗原：ＭＰＯ、ＰＲＴＮ３、またはそれら各々のフラグメントまたは同等物；あるいは
ｔ）スティッフマン症候群関連の抗原であり、ＧＡＤまたはそのフラグメントまたは同等物に由来する抗原。
【０１７５】
いくつかの実施形態において、ｐＭＨＣ複合体のＭＨＣタンパク質は、古典的ＭＨＣクラスＩタンパク質、非古典的ＭＨＣクラスＩタンパク質、古典的ＭＨＣクラスＩＩタンパク質、非古典的ＭＨＣクラスＩＩタンパク質、ＭＨＣ二量体（Ｆｃ融合）、ＭＨＣ四量体、またはＭＨＣタンパク質の高分子形のすべてまたは一部を含み、ここでＭＨＣタンパク質は随意に、ノブ・イン・ホールをベースにしたＭＨＣ−アルファ−Ｆｃ／ＭＨＣ−ベータ−Ｆｃヘテロダイマーまたは多量体を含む。
【０１７６】
いくつかの実施形態において、ｐＭＨＣ複合体のＭＨＣタンパク質は、以下の群のポリペプチドのすべてまたは一部を含む：ＨＬＡ  ＤＲ、ＨＬＡ  ＤＱ、ＨＬＡ  ＤＰ、ＨＬＡ−Ａ、ＨＬＡ−Ｂ、ＨＬＡ−Ｃ、ＨＬＡ−Ｅ、ＨＬＡ−Ｆ、ＨＬＡＧ、ＣＤ１ｄ、またはそれら各々のフラグメントあるいは同等物。
【０１７７】
いくつかの実施形態において、ｐＭＨＣ複合体のＭＨＣタンパク質は、以下の群のポリペプチドのすべてまたは一部を含む：ＨＬＡ−ＤＲ、ＨＬＡ−ＤＱ、ＨＬＡ−ＤＰ、またはそれら各々のフラグメントあるいは同等物。
【０１７８】
いくつかの実施形態において、ｐＭＨＣ複合体のＭＨＣタンパク質は、以下の群のポリペプチドのすべてまたは一部を含む：ＨＬＡ−ＤＲＢ１／ＤＲＡ、ＨＬＡ−ＤＲＢ３／ＤＲＡ、ＨＬＡ−ＤＲＢ４／ＤＲＡ、ＨＬＡ−ＤＲＢ５／ＤＲＡ、ＨＬＡ−ＤＱＡ１／ＨＬＡ−ＤＱＢ１、ＨＬＡ−ＤＰＢ１／ＨＬＡ−ＤＰＡ１、またはそれら各々のフラグメントまたは同等物。
【０１７９】
特定の態様では、ｐＭＨＣ複合体は以下を含む：
ａ）糖尿病関連の抗原であり、以下の群の１つ以上から選択される抗原に由来する抗原：ｈＩｎｓＢ１０−１８、ｈＩＧＲＰ２２８−２３６、ｈＩＧＲＰ２６５−２７３、ＩＧＲＰ２０６−２１４、ｈＩＧＲＰ２０６−２１４、ＮＲＰ−Ａ７、ＮＲＰ−Ｉ４、ＮＲＰ−Ｖ７、ＹＡＩ／Ｄｂ、ＩＮＳ  Ｂ１５−２３、ＰＰＩ７６−９０（Ｋ８８Ｓ）、ＩＧＲＰ１３−２５、ＧＡＤ５５５−５６７、ＧＡＤ５５５−５６７（５５７Ｉ）、ＩＧＲＰ２３−３５、Ｂ２４−Ｃ３６、ＰＰＩ７６−９０、ＩＮＳ−Ｉ９、ＴＵＭ、Ｇ６Ｐａｓｅ、Ｐｒｏ−ｉｎｓｕｌｉｎＬ２−１０、Ｐｒｏ−ｉｎｓｕｌｉｎＬ３−１１、Ｐｒｏ−ｉｎｓｕｌｉｎＬ６−１４、Ｐｒｏ−ｉｎｓｕｌｉｎＢ５−１４、Ｐｒｏ−ｉｎｓｕｌｉｎＢ１０−１８、Ｐｒｏ−ｉｎｓｕｌｉｎＢ１４−２２、Ｐｒｏ−ｉｎｓｕｌｉｎＢ１５−２４、Ｐｒｏ−ｉｎｓｕｌｉｎＢ１７−２５、Ｐｒｏ−ｉｎｓｕｌｉｎＢ１８−２７、Ｐｒｏ−ｉｎｓｕｌｉｎＢ２０−２７、Ｐｒｏ−ｉｎｓｕｌｉｎＢ２１−２９、Ｐｒｏ−ｉｎｓｕｌｉｎＢ２５−Ｃ１、Ｐｒｏ−ｉｎｓｕｌｉｎＢ２７−Ｃ５、Ｐｒｏ−ｉｎｓｕｌｉｎＣ２０−２８、Ｐｒｏ−ｉｎｓｕｌｉｎＣ２５−３３、Ｐｒｏ−ｉｎｓｕｌｉｎＣ２９−Ａ５、Ｐｒｏ−ｉｎｓｕｌｉｎＡ１−１０、Ｐｒｏ−ｉｎｓｕｌｉｎＡ２−１０、Ｐｒｏ−ｉｎｓｕｌｉｎＡ１２−２０、またはそれら各々のフラグメントあるいは同等物；
ｂ）多発性硬化症関連の抗原であり、以下の群の１つ以上から選択される抗原に由来する抗原：ＭＯＧ３５−５５、ＭＯＧ３６−５５、ＭＡＧ２８７−２９５、ＭＡＧ５０９−５１７、ＭＡＧ５５６−５６４、ＭＢＰ１１０−１１８、ＭＯＧ１１４−１２２、ＭＯＧ１６６−１７５、ＭＯＧ１７２−１８０、ＭＯＧ１７９−１８８、ＭＯＧ１８８−１９６、ＭＯＧ１８１−１８９、ＭＯＧ２０５−２１４、ＰＬＰ８０−８８、ＭＡＧ２８７−２９５、ＭＡＧ５０９−５１７、ＭＡＧ５５６−５６４、ＭＯＧ９７−１０９、ＭＯＧ９７−１０９（Ｅ１０７Ｓ）、ＭＢＰ８９−１０１、ＰＬＰ１７５−１９２、ＰＬＰ９４−１０８、ＭＢＰ８６−９８、ＰＬＰ５４−６８、ＰＬＰ２４９−２６３、ＭＯＧ１５６−１７０、ＭＯＧ２０１−２１５、ＭＯＧ３８−５２、ＭＯＧ２０３−２１７、ＰＬＰ２５０−２６４、ＭＰＢ１３−３２、ＭＰＢ８３−９９、ＭＰＢ１１１−１２９、ＭＰＢ１４６−１７０、ＭＯＧ２２３−２３７、ＭＯＧ６−２０、ＰＬＰ８８−１０２、ＰＬＰ１３９−１５４、またはそれら各々のフラグメントあるいは同等物；
ｃ）セリアック病関連の抗原であり、以下の群の１つ以上から選択される抗原に由来する抗原：ａＧｌｉａ５７−６８、ａＧｌｉａ６２−７２、ａＧｌｉａ２１７−２２９、またはそれら各々のフラグメントあるいは同等物；
ｄ）原発性胆汁性肝硬変関連の抗原であり、以下の群の１つ以上から選択される抗原に由来する抗原：ＰＤＣ−Ｅ２１２２−１３５、ＰＤＣ−Ｅ２２４９−２６２、ＰＤＣ−Ｅ２２４９−２６３、ＰＤＣ−Ｅ２６２９−６４３、ＰＤＣ−Ｅ２７２−８６、ＰＤＣ−Ｅ２３５３−３６７、ＰＤＣ−Ｅ２４２２−４３６、ＰＤＣ−Ｅ２６２９−６４３、ＰＤＣ−Ｅ２８０−９４、ＰＤＣ−Ｅ２３５３−３６７、ＰＤＣ−Ｅ２５３５−５４９、またはそれら各々のフラグメントあるいは同等物；
ｅ）落葉性天疱瘡関連の抗原および／または尋常性天疱瘡関連の抗原であり、以下の群の１つ以上から選択される抗原に由来する抗原：ＤＧ１２１６−２２９、ＤＧ３９７−１１１、ＤＧ３２５１−２６５、ＤＧ３４４１−４５５、ＤＧ３３５１−３６５、ＤＧ３４５３−４６７、ＤＧ３５４０−５５４、ＤＧ３２８０−２９４、ＤＧ３３２６−３４０、ＤＧ３３６７−３８１、ＤＧ３１３−２７、ＤＧ３３２３−３３７、ＤＧ３４３８−４５２、ＤＧ１４８−６２、ＤＧ１２０６−２２２、ＤＧ１３６３−３７７、ＤＧ１３−１７、ＤＧ１１９２−２０６、ＤＧ１３２６−３４０、ＤＧ１１−１５、ＤＧ１３５−４９、ＤＧ１３２５−３３９、またはそれら各々のフラグメントあるいは同等物；
ｆ）視神経脊髄炎スペクトル障害関連の抗原であり、以下の群の１つ以上から選択される抗原に由来する抗原：ＡＱＰ４１２９−１４３、ＡＱＰ４２８４−２９８、ＡＱＰ４６３−７６、ＡＱＰ４１２９−１４３、ＡＱＰ４３９−５３、またはそれら各々のフラグメントあるいは同等物；
ｇ）アレルギー性喘息関連の抗原であり、以下の群の１つ以上から選択される抗原に由来する抗原：ＤＥＲＰ１１６−３０、ＤＥＲＰ１１７１−１８５、ＤＥＲＰ１１１０−１２４、ＤＥＲＰ−２２６−４０、ＤＥＲＰ−２１０７−１２１、またはそれら各々のフラグメントあるいは同等物；
ｈ）炎症性腸疾患関連の抗原であり、以下の群の１つ以上から選択される抗原に由来する抗原：バクテロイデスインテグラーゼ抗原１８３−１９７、バクテロイデスインテグラーゼ抗原１４６−１６０、バクテロイデスインテグラーゼ抗原１７５−１８９、バクテロイデスインテグラーゼ抗原１−１５、バクテロイデスインテグラーゼ抗原１８３−１９７、バクテロイデスインテグラーゼ抗原３０−４４、バクテロイデスインテグラーゼ抗原７０−８４、バクテロイデスインテグラーゼ抗原３３７−３５１、バクテロイデスインテグラーゼ抗原１７１−１８５、バクテロイデスインテグラーゼ抗原４−１８、バクテロイデスインテグラーゼ抗原２５６−２７０、Ｆｌａ−２／Ｆｌａ−Ｘ３６６−３８０、Ｆｌａ−２／Ｆｌａ−Ｘ１６４−１７８、Ｆｌａ−２／Ｆｌａ−Ｘ２６１−２７５、Ｆｌａ−２／Ｆｌａ−Ｘ１−１５、Ｆｌａ−２／Ｆｌａ−Ｘ５１−６５、Ｆｌａ−２／Ｆｌａ−Ｘ２６９−２８３、Ｆｌａ−２／Ｆｌａ−Ｘ４−１８、Ｆｌａ−２／Ｆｌａ−Ｘ２７１−２８５、ＹＩＤＸ７８−９２、ＹＩＤＸ９３−１０７、ＹＩＤＸ９８−１１２、ＹＩＤＸ２３−３７、ＹＩＤＸ７８−９２、ＹＩＤＸ１９５−２０９、ＹＩＤＸ２２−３６、ＹＩＤＸ８０−９４、ＹＩＤＸ１０１−１１５、またはそれら各々のフラグメントあるいは同等物；
ｉ）全身性エリテマトーデス関連の抗原であり、以下の群の１つ以上から選択される抗原に由来する抗原：Ｈ４７１−９４、Ｈ４７４−８８、Ｈ４７６−９０、Ｈ４７５−８９、Ｈ４７８−９２、Ｈ４８０−９４、Ｈ２Ｂ１０−２４、Ｈ２Ｂ１６−３０、Ｈ１’２２−４２、Ｈ１’２７−４１、またはそれら各々のフラグメントあるいは同等物；
ｊ）アテローム性動脈硬化症関連の抗原であり、以下の群の１つ以上から選択される抗原に由来する抗原：ＡｐｏＢ３５０１−３５１６、ＡｐｏＢ１９５２−１９６６、ＡｐｏＢ９７８−９９３、ＡｐｏＢ３４９８−３５１３、ＡｐｏＢ２１０Ａ、ＡｐｏＢ２１０Ｂ、ＡｐｏＢ２１０Ｃ、またはそれら各々のフラグメントあるいは同等物；
ｋ）ＣＯＰＤ関連の抗原および／または気腫関連の抗原であり、以下の群の１つ以上から選択される抗原に由来する抗原：エラスチン８９−１０３、エラスチン６９８−７１２、エラスチン８−２２、エラスチン９４−１０８、エラスチン１３−２７、エラスチン６９５−７０９、エラスチン５６３−５７７、エラスチン５５８−５７２、エラスチン６９８−７１２、エラスチン５６６−５８０、エラスチン６４５−６５９、またはそれら各々のフラグメントあるいは同等物；
ｌ）乾癬関連の抗原であり、以下の群の１つ以上から選択される抗原に由来する抗原：Ｃａｐ１８６４−７８、Ｃａｐ１８３４−４８、Ｃａｐ１８４７−６１、Ｃａｐ１８１５１−１６５、Ｃａｐ１８１４９−１６３、Ｃａｐ１８１５２−１６６、Ｃａｐ１８１３１−１４５、Ｃａｐ１８２４−３８、ＡＤＭＴＳＬ５２４５−２５９、ＡＤＭＴＳＬ５２６７−２８１、ＡＤＭＴＳＬ５３７２−３８６、ＡＤＭＴＳＬ５２８９−３０３、ＡＤＭＴＳＬ５３９６−４１０、ＡＤＭＴＳＬ５４３３−４４７、ＡＤＭＴＳＬ５１４２−１５６、ＡＤＭＴＳＬ５２３６−２５０、ＡＤＭＴＳＬ５３０１−３１５、ＡＤＭＴＳＬ５２０３−２１７、ＡＤＭＴＳＬ５４０４−４１８、またはそれら各々のフラグメントあるいは同等物；
ｍ）自己免疫性肝炎関連の抗原であり、以下の群の１つ以上から選択される抗原に由来する抗原：（ＣＹＰ２Ｄ６）１９３−２０７、ＣＹＰ２Ｄ６７６−９０、ＣＹＰ２Ｄ６２９３−３０７、ＣＹＰ２Ｄ６３１３−３３２、ＣＹＰ２Ｄ６３９３−４１２、ＣＹＰ２Ｄ６１９９−２１３、ＣＹＰ２Ｄ６４５０−４６４、ＣＹＰ２Ｄ６３０１−３１５、ＣＹＰ２Ｄ６４５２−４６６、ＣＹＰ２Ｄ６５９−７３、ＣＹＰ２Ｄ６１３０−１４４、ＣＹＰ２Ｄ６１９３−２１２、ＣＹＰ２Ｄ６３０５−３２４、ＣＹＰ２Ｄ６１３１−１４５、ＣＹＰ２Ｄ６２１６−２３０、ＣＹＰ２Ｄ６２３８−２５２、ＣＹＰ２Ｄ６１９９−２１３、ＣＹＰ２Ｄ６２３５−２５２、ＣＹＰ２Ｄ６２９３−３０７、ＣＹＰ２Ｄ６３８１−３９５、ＣＹＰ２Ｄ６４２９−４４３、ＳＬＡ３３４−３４８、ＳＬＡ１９６−２１０、ＳＬＡ１１５−１２９、ＳＬＡ３７３−３８６、ＳＬＡ１８６−１９７、ＳＬＡ３１７−３３１、ＳＬＡ１７１−１８５、ＳＬＡ４１７−４３１、ＳＬＡ３５９−３７３、ＳＬＡ２１５−２２９、ＳＬＡ１１１−１２５、ＳＬＡ１１０−１２４、ＳＬＡ２９９−３１３、ＳＬＡ３４２−３５６、ＳＬＡ４９−６３、ＳＬＡ１１９−１３３、ＳＬＡ２６０−２７４、ＳＬＡ２６−４０、ＳＬＡ８６−１００、ＳＬＡ３３１−３４５、またはそれら各々のフラグメントあるいは同等物；
ｎ）ブドウ膜炎関連の抗原であり、以下の群の１つ以上から選択される抗原に由来する抗原：アレスチン１９９−２１３、アレスチン７７−９１、アレスチン２５０−２６４、アレスチン１７２−１８６、アレスチン３５４−３６８、アレスチン２３９−２５３、アレスチン１０２−１１６、アレスチン５９−７３、アレスチン２８０−２９４、アレスチン２９１−３０６、アレスチン１９５−２０９、アレスチン２００−２１４、またはそれら各々のフラグメントあるいは同等物；
ｏ）シェーグレン症候群関連の抗原であり、以下の群の１つ以上から選択される抗原に由来する抗原：ＲＯ６０１２７−１４１、ＲＯ６０５２３−５３７、ＲＯ６０２４３−２５７、ＲＯ６０４８４−４９８、ＲＯ６０３４７−３６１、ＲＯ６０３６９−３８３、ＲＯ６０４２６−４４０、ＲＯ６０２６７−２８１、ＲＯ６０１７８−１９２、ＲＯ６０３５８−３７２、ＲＯ６０２２１−２３５、ＲＯ６０３１８−３３２、ＲＯ６０４０７−４２１、ＲＯ６０４５９−４７３、ＲＯ６０５１−６５、ＲＯ６０３１２−３２６、ＬＡ２４１−２５５、ＬＡ１０１−１１５、ＬＡ１５３−１６７、ＬＡ１７８−１９２、ＬＡ１９−３３、ＬＡ３７−５１、ＬＡ１３３−１４７、ＬＡ５０−６４、ＬＡ３２−４６、ＬＡ１５３−１６７、ＬＡ８３−９７、ＬＡ１３６−１５０、ＬＡ２９７−３１１、ＬＡ５９−７３、ＬＡ１５１−１６５、ＬＡ８６−１００、ＬＡ１５４−１６８、またはそれら各々のフラグメントあるいは同等物；
ｐ）強皮症関連の抗原であり、以下の群の１つ以上から選択される抗原に由来する抗原：ＴＯＰ１３４６−３６０、ＴＯＰ１４２０−４３４、ＴＯＰ１７５０−７６４、ＴＯＰ１４１９−４３３、ＴＯＰ１５９１−６０５、ＴＯＰ１６９５−７０９、ＴＯＰ１３０５−３１９、ＴＯＰ１３４６−３６０、ＴＯＰ１４１９−４３３、ＴＯＰ１４２５−４３９、ＴＯＰ１６１４−６２８、ＣＥＮＰ−Ｃ２９７−３１１、ＣＥＮＰ−Ｃ８５７−８７１、ＣＥＮＰ−Ｃ８８７−９０１、ＣＥＮＰ−Ｃ２１２−２２６、ＣＥＮＰ−Ｃ６４３−６５７、ＣＥＮＰ−Ｃ８３２−８４６、ＣＥＮＰ−Ｃ１６７−１８１、ＣＥＮＰ−Ｃ２４６−２６０、ＣＥＮＰ−Ｃ８４６−８６０、ＣＥＮＰ−Ｃ１４９−１６３、ＣＥＮＰ−Ｃ８３３−８４７、ＣＥＮＰ−Ｃ８４７−８６１、またはそれら各々のフラグメントあるいは同等物；
ｑ）抗リン脂質抗体症候群関連の抗原であり、以下の群の１つ以上から選択される抗原に由来する抗原：ＡＰＯＨ２３５−２４９、ＡＰＯＨ３０６−３２０、ＡＰＯＨ２３７−２５１、ＡＰＯＨ２９５−３０９、ＡＰＯＨ２８−４２、ＡＰＯＨ１７３−１８７、ＡＰＯＨ２６４−２７８、ＡＰＯＨ２９５−３０９、ＡＰＯＨ４９−６３、ＡＰＯＨ２６９−２８３、ＡＰＯＨ２９５−３０９、ＡＰＯＨ３２１−３５５、ＡＰＯＨ３２２−３３６、ＡＰＯＨ３２４−３３８、またはそれら各々のフラグメントあるいは同等物；
ｒ）ＡＮＣＡ関連の脈管炎関連の抗原であり、以下の群の１つ以上から選択される抗原に由来する抗原：ＭＰＯ５０６−５２０、ＭＰＯ３０２−３１６、ＭＰＯ７−２１、ＭＰＯ６８９−７０３、ＭＰＯ２４８−２６２、ＭＰＯ４４４−４５８、ＭＰＯ５１３−５２７、ＭＰＯ９７−１１１、ＭＰＯ６１６−６３０、ＭＰＯ４６２−４７６、ＭＰＯ６１７−６３１、ＭＰＯ７１４−７２８、ＰＲＴＮ３４４−５８、ＰＲＴＮ３２３４−２４８、ＰＲＴＮ３５９−７３、ＰＲＴＮ３１１７−１３１、ＰＲＴＮ３１６４−１７８、ＰＲＴＮ３７１−８５、ＰＲＴＮ３２４１−２５５、ＰＲＴＮ３５９−７３、ＰＲＴＮ３１８３−１９７、ＰＲＴＮ３６２−７６、ＰＲＴＮ３１１８−１３２、ＰＲＴＮ３２３９−２５３、またはそれら各々のフラグメントあるいは同等物；または
ｓ）スティッフマン症候群関連の抗原であり、以下の群の１つ以上から選択される抗原に由来する抗原：ＧＡＤ２１２−２２６、ＧＡＤ５５５−５６９、ＧＡＤ２９７−３１１、またはそれら各々のフラグメントまたは同等物。
【０１８０】
特定の態様では、ｐＭＨＣ複合体は以下を含む：
ａ）糖尿病関連の抗原であり、以下の群の１つ以上から選択される抗原に由来する抗原：ｈＩｎｓＢ１０−１８、ｈＩＧＲＰ２２８−２３６、ｈＩＧＲＰ２６５−２７３、ＩＧＲＰ２０６−２１４、ｈＩＧＲＰ２０６−２１４、ＮＲＰ−Ａ７、ＮＲＰ−Ｉ４、ＮＲＰ−Ｖ７、ＹＡＩ／Ｄｂ、ＩＮＳ  Ｂ１５−２３、ＰＰＩ７６−９０（Ｋ８８Ｓ）、ＩＧＲＰ１３−２５、ＧＡＤ５５５−５６７、ＧＡＤ５５５−５６７（５５７Ｉ）、ＩＧＲＰ２３−３５、Ｂ２４−Ｃ３６、ＰＰＩ７６−９０、ＩＮＳ−Ｉ９、ＴＵＭ、Ｇ６Ｐａｓｅ、Ｐｒｏ−ｉｎｓｕｌｉｎＬ２−１０、Ｐｒｏ−ｉｎｓｕｌｉｎＬ３−１１、Ｐｒｏ−ｉｎｓｕｌｉｎＬ６−１４、Ｐｒｏ−ｉｎｓｕｌｉｎＢ５−１４、Ｐｒｏ−ｉｎｓｕｌｉｎＢ１０−１８、Ｐｒｏ−ｉｎｓｕｌｉｎＢ１４−２２、Ｐｒｏ−ｉｎｓｕｌｉｎＢ１５−２４、Ｐｒｏ−ｉｎｓｕｌｉｎＢ１７−２５、Ｐｒｏ−ｉｎｓｕｌｉｎＢ１８−２７、Ｐｒｏ−ｉｎｓｕｌｉｎＢ２０−２７、Ｐｒｏ−ｉｎｓｕｌｉｎＢ２１−２９、Ｐｒｏ−ｉｎｓｕｌｉｎＢ２５−Ｃ１、Ｐｒｏ−ｉｎｓｕｌｉｎＢ２７−Ｃ５、Ｐｒｏ−ｉｎｓｕｌｉｎＣ２０−２８、Ｐｒｏ−ｉｎｓｕｌｉｎＣ２５−３３、Ｐｒｏ−ｉｎｓｕｌｉｎＣ２９−Ａ５、Ｐｒｏ−ｉｎｓｕｌｉｎＡ１−１０、Ｐｒｏ−ｉｎｓｕｌｉｎＡ２−１０、Ｐｒｏ−ｉｎｓｕｌｉｎＡ１２−２０、またはそれら各々のフラグメントあるいは同等物、およびｐＭＨＣ複合体のＭＨＣタンパク質は、ＨＬＤ−ＤＲのすべてまたは一部、またはそのフラグメントあるいは同等物を含む；
ｂ）多発性硬化症関連の抗原であり、以下の群の１つ以上から選択される抗原に由来する抗原：ＭＯＧ３５−５５、ＭＯＧ３６−５５、ＭＡＧ２８７−２９５、ＭＡＧ５０９−５１７、ＭＡＧ５５６−５６４、ＭＢＰ１１０−１１８、ＭＯＧ１１４−１２２、ＭＯＧ１６６−１７５、ＭＯＧ１７２−１８０、ＭＯＧ１７９−１８８、ＭＯＧ１８８−１９６、ＭＯＧ１８１−１８９、ＭＯＧ２０５−２１４、ＰＬＰ８０−８８、ＭＡＧ２８７−２９５、ＭＡＧ５０９−５１７、ＭＡＧ５５６−５６４、ＭＯＧ９７−１０９、ＭＯＧ９７−１０９（Ｅ１０７Ｓ）、ＭＢＰ８９−１０１、ＰＬＰ１７５−１９２、ＰＬＰ９４−１０８、ＭＢＰ８６−９８、ＰＬＰ５４−６８、ＰＬＰ２４９−２６３、ＭＯＧ１５６−１７０、ＭＯＧ２０１−２１５、ＭＯＧ３８−５２、ＭＯＧ２０３−２１７、ＰＬＰ２５０−２６４、ＭＰＢ１３−３２、ＭＰＢ８３−９９、ＭＰＢ１１１−１２９、ＭＰＢ１４６−１７０、ＭＯＧ２２３−２３７、ＭＯＧ６−２０、ＰＬＰ８８−１０２、ＰＬＰ１３９−１５４、またはそれら各々のフラグメントあるいは同等物、およびｐＭＨＣ複合体のＭＨＣタンパク質はＨＬＡ−ＤＲのすべてまたは一部、またはそのフラグメントあるいは同等物を含む；
ｃ）セリアック病関連の抗原であり、以下の群の１つ以上から選択される抗原に由来する抗原：ａＧｌｉａ５７−６８、ａＧｌｉａ６２−７２、ａＧｌｉａ２１７−２２９、またはそれら各々のフラグメントあるいは同等物、およびｐＭＨＣ複合体のＭＨＣタンパク質はＨＬＡ−ＤＱのすべてまたは一部、またはそのフラグメントあるいは同等物を含む；
ｄ）原発性胆汁性肝硬変関連の抗原であり、以下の群の１つ以上から選択される抗原に由来する抗原：ＰＤＣ−Ｅ２１２２−１３５、ＰＤＣ−Ｅ２２４９−２６２、ＰＤＣ−Ｅ２２４９−２６３、ＰＤＣ−Ｅ２６２９−６４３、ＰＤＣ−Ｅ２７２−８６、ＰＤＣ−Ｅ２３５３−３６７、ＰＤＣ−Ｅ２４２２−４３６、ＰＤＣ−Ｅ２６２９−６４３、ＰＤＣ−Ｅ２８０−９４、ＰＤＣ−Ｅ２３５３−３６７、ＰＤＣ−Ｅ２５３５−５４９、またはそれら各々のフラグメントあるいは同等物、およびｐＭＨＣ複合体のＭＨＣタンパク質はＨＬＡ−ＤＲのすべてまたは一部、またはそのフラグメントあるいは同等物を含む；
ｅ）落葉性天疱瘡関連の抗原および／または尋常性天疱瘡関連の抗原であり、以下の群の１つ以上から選択される抗原に由来する抗原：ＤＧ１２１６−２２９、ＤＧ３９７−１１１、ＤＧ３２５１−２６５、ＤＧ３４４１−４５５，ＤＧ３３５１−３６５、ＤＧ３４５３−４６７、ＤＧ３５４０−５５４、ＤＧ３２８０−２９４、ＤＧ３３２６−３４０、ＤＧ３３６７−３８１、ＤＧ３１３−２７、ＤＧ３３２３−３３７、ＤＧ３４３８−４５２、ＤＧ１４８−６２、ＤＧ１２０６−２２２、ＤＧ１３６３−３７７、ＤＧ１３−１７、ＤＧ１１９２−２０６、ＤＧ１３２６−３４０、ＤＧ１１−１５、ＤＧ１３５−４９、ＤＧ１３２５−３３９、またはそれら各々のフラグメントあるいは同等物、およびｐＭＨＣ複合体のＭＨＣタンパク質はＨＬＡ−ＤＲのすべてまたは一部、またはそのフラグメントあるいは同等物を含む；
ｆ）視神経脊髄炎スペクトル障害関連の抗原であり、以下の群の１つ以上から選択される抗原に由来する抗原：ＡＱＰ４１２９−１４３、ＡＱＰ４２８４−２９８、ＡＱＰ４６３−７６、ＡＱＰ４１２９−１４３、ＡＱＰ４３９−５３、またはそれら各々のフラグメントあるいは同等物、およびｐＭＨＣ複合体のＭＨＣタンパク質はＨＬＡ−ＤＲのすべてまたは一部、またはそのフラグメントあるいは同等物を含む；
ｇ）アレルギー性喘息関連の抗原であり、以下の群の１つ以上から選択される抗原に由来する抗原：ＤＥＲＰ１１６−３０、ＤＥＲＰ１１７１−１８５、ＤＥＲＰ１１１０−１２４、ＤＥＲＰ−２２６−４０、ＤＥＲＰ−２１０７−１２１、またはそれら各々のフラグメントあるいは同等物、およびｐＭＨＣ複合体のＭＨＣタンパク質は、以下の群のポリペプチドのすべてまたは一部を含む：ＨＬＡ−ＤＲ、ＨＬＡ−ＤＰ、またはそれら各々のフラグメントまたは同等物；
ｈ）炎症性腸疾患関連の抗原であり、以下の群の１つ以上から選択される抗原に由来する抗原：バクテロイデスインテグラーゼ抗原１８３−１９７、バクテロイデスインテグラーゼ抗原１４６−１６０、バクテロイデスインテグラーゼ抗原１７５−１８９、バクテロイデスインテグラーゼ抗原１−１５、バクテロイデスインテグラーゼ抗原１８３−１９７、バクテロイデスインテグラーゼ抗原３０−４４、バクテロイデスインテグラーゼ抗原７０−８４、バクテロイデスインテグラーゼ抗原３３７−３５１、バクテロイデスインテグラーゼ抗原１７１−１８５、バクテロイデスインテグラーゼ抗原４−１８、バクテロイデスインテグラーゼ抗原２５６−２７０、Ｆｌａ−２／Ｆｌａ−Ｘ３６６−３８０、Ｆｌａ−２／Ｆｌａ−Ｘ１６４−１７８、Ｆｌａ−２／Ｆｌａ−Ｘ２６１−２７５、Ｆｌａ−２／Ｆｌａ−Ｘ１−１５、Ｆｌａ−２／Ｆｌａ−Ｘ５１−６５、Ｆｌａ−２／Ｆｌａ−Ｘ２６９−２８３、Ｆｌａ−２／Ｆｌａ−Ｘ４−１８、Ｆｌａ−２／Ｆｌａ−Ｘ２７１−２８５、ＹＩＤＸ７８−９２、ＹＩＤＸ９３−１０７、ＹＩＤＸ９８−１１２、ＹＩＤＸ２３−３７、ＹＩＤＸ７８−９２、ＹＩＤＸ１９５−２０９、ＹＩＤＸ２２−３６、ＹＩＤＸ８０−９４、ＹＩＤＸ１０１−１１５、またはそれら各々のフラグメントあるいは同等物、およびｐＭＨＣ複合体のＭＨＣタンパク質はＨＬＡ−ＤＲのすべてまたは一部、またはそのフラグメントあるいは同等物を含む；
ｉ）全身性エリテマトーデス関連の抗原であり、以下の群の１つ以上から選択される抗原に由来する抗原：Ｈ４７１−９４、Ｈ４７４−８８、Ｈ４７６−９０、Ｈ４７５−８９、Ｈ４７８−９２、Ｈ４８０−９４、Ｈ２Ｂ１０−２４、Ｈ２Ｂ１６−３０、Ｈ１’２２−４２、Ｈ１’２７−４１、またはそれら各々のフラグメントあるいは同等物、およびｐＭＨＣ複合体のＭＨＣタンパク質は、以下の群のポリペプチドのすべてまたは一部を含む：Ｉ−Ａｄ、ＨＬＡ−ＤＲ、またはそれら各々のフラグメントまたは同等物；
ｊ）アテローム性動脈硬化症関連の抗原であり、以下の群の１つ以上から選択される抗原に由来する抗原：ＡｐｏＢ３５０１−３５１６、ＡｐｏＢ１９５２−１９６６、ＡｐｏＢ９７８−９９３、ＡｐｏＢ３４９８−３５１３、ＡｐｏＢ２１０Ａ、ＡｐｏＢ２１０Ｂ、ＡｐｏＢ２１０Ｃ、またはそれら各々のフラグメントあるいは同等物、およびｐＭＨＣ複合体のＭＨＣタンパク質はＩ−Ａｂのすべてまたは一部、またはそのフラグメントあるいは同等物を含む；
ｋ）ＣＯＰＤ関連の抗原および／または気腫関連の抗原であり、以下の群の１つ以上から選択される抗原に由来する抗原：エラスチン８９−１０３、エラスチン６９８−７１２、エラスチン８−２２、エラスチン９４−１０８、エラスチン１３−２７、エラスチン６９５−７０９、エラスチン５６３−５７７、エラスチン５５８−５７２、エラスチン６９８−７１２、エラスチン５６６−５８０、エラスチン６４５−６５９、またはそれら各々のフラグメントあるいは同等物、およびｐＭＨＣ複合体のＭＨＣタンパク質はＨＬＡ−ＤＲのすべてまたは一部、またはそのフラグメントあるいは同等物を含む；
ｌ）乾癬関連の抗原であり、以下の群の１つ以上から選択される抗原に由来する抗原：Ｃａｐ１８６４−７８、Ｃａｐ１８３４−４８、Ｃａｐ１８４７−６１、Ｃａｐ１８１５１−１６５、Ｃａｐ１８１４９−１６３、Ｃａｐ１８１５２−１６６、Ｃａｐ１８１３１−１４５、Ｃａｐ１８２４−３８、ＡＤＭＴＳＬ５２４５−２５９、ＡＤＭＴＳＬ５２６７−２８１、ＡＤＭＴＳＬ５３７２−３８６、ＡＤＭＴＳＬ５２８９−３０３、ＡＤＭＴＳＬ５３９６−４１０、ＡＤＭＴＳＬ５４３３−４４７、ＡＤＭＴＳＬ５１４２−１５６、ＡＤＭＴＳＬ５２３６−２５０、ＡＤＭＴＳＬ５３０１−３１５、ＡＤＭＴＳＬ５２０３−２１７、ＡＤＭＴＳＬ５４０４−４１８、またはそれら各々のフラグメントあるいは同等物、およびｐＭＨＣ複合体のＭＨＣタンパク質はＨＬＡ−ＤＲのすべてまたは一部、またはそのフラグメントあるいは同等物を含む；
ｍ）自己免疫性肝炎関連の抗原であり、以下の群の１つ以上から選択される抗原に由来する抗原：ＣＹＰ２Ｄ６１９３−２０７、ＣＹＰ２Ｄ６７６−９０、ＣＹＰ２Ｄ６２９３−３０７、ＣＹＰ２Ｄ６３１３−３３２、ＣＹＰ２Ｄ６３９３−４１２、ＣＹＰ２Ｄ６１９９−２１３、ＣＹＰ２Ｄ６４５０−４６４、ＣＹＰ２Ｄ６３０１−３１５、ＣＹＰ２Ｄ６４５２−４６６、ＣＹＰ２Ｄ６５９−７３、ＣＹＰ２Ｄ６１３０−１４４、ＣＹＰ２Ｄ６１９３−２１２、ＣＹＰ２Ｄ６３０５−３２４、ＣＹＰ２Ｄ６１３１−１４５、ＣＹＰ２Ｄ６２１６−２３０、ＣＹＰ２Ｄ６２３８−２５２、ＣＹＰ２Ｄ６１９９−２１３、ＣＹＰ２Ｄ６２３５−２５２、ＣＹＰ２Ｄ６２９３−３０７、ＣＹＰ２Ｄ６３８１−３９５、ＣＹＰ２Ｄ６４２９−４４３、ＳＬＡ３３４−３４８、ＳＬＡ１９６−２１０、ＳＬＡ１１５−１２９、ＳＬＡ３７３−３８６、ＳＬＡ１８６−１９７、ＳＬＡ３１７−３３１、ＳＬＡ１７１−１８５、ＳＬＡ４１７−４３１、ＳＬＡ３５９−３７３、ＳＬＡ２１５−２２９、ＳＬＡ１１１−１２５、ＳＬＡ１１０−１２４、ＳＬＡ２９９−３１３、ＳＬＡ３４２−３５６、ＳＬＡ４９−６３、ＳＬＡ１１９−１３３、ＳＬＡ２６０−２７４、ＳＬＡ２６−４０、ＳＬＡ８６−１００、ＳＬＡ３３１−３４５、またはそれら各々のフラグメントあるいは同等物、およびｐＭＨＣ複合体のＭＨＣタンパク質はＨＬＡ−ＤＲのすべてまたは一部、またはそのフラグメントあるいは同等物を含む；
ｎ）ブドウ膜炎関連の抗原であり、以下の群の１つ以上から選択される抗原に由来する抗原：アレスチン１９９−２１３、アレスチン７７−９１、アレスチン２５０−２６４、アレスチン１７２−１８６、アレスチン３５４−３６８、アレスチン２３９−２５３、アレスチン１０２−１１６、アレスチン５９−７３、アレスチン２８０−２９４、アレスチン２９１−３０６、アレスチン１９５−２０９、アレスチン２００−２１４、またはそれら各々のフラグメントあるいは同等物、およびｐＭＨＣ複合体のＭＨＣタンパク質はＨＬＡ−ＤＲのすべてまたは一部、またはそのフラグメントあるいは同等物を含む；
ｏ）シェーグレン症候群関連の抗原であり、以下の群の１つ以上から選択される抗原に由来する抗原：ＲＯ６０１２７−１４１、ＲＯ６０５２３−５３７、ＲＯ６０２４３−２５７、ＲＯ６０４８４−４９８、ＲＯ６０３４７−３６１、ＲＯ６０３６９−３８３、ＲＯ６０４２６−４４０、ＲＯ６０２６７−２８１、ＲＯ６０１７８−１９２、ＲＯ６０３５８−３７２、ＲＯ６０２２１−２３５、ＲＯ６０３１８−３３２、ＲＯ６０４０７−４２１、ＲＯ６０４５９−４７３、ＲＯ６０５１−６５、ＲＯ６０３１２−３２６、ＬＡ２４１−２５５、ＬＡ１０１−１１５、ＬＡ１５３−１６７、ＬＡ１７８−１９２、ＬＡ１９−３３、ＬＡ３７−５１、ＬＡ１３３−１４７、ＬＡ５０−６４、ＬＡ３２−４６、ＬＡ１５３−１６７、ＬＡ８３−９７、ＬＡ１３６−１５０、ＬＡ２９７−３１１、ＬＡ５９−７３、ＬＡ１５１−１６５、ＬＡ８６−１００、ＬＡ１５４−１６８、またはそれら各々のフラグメントあるいは同等物、およびｐＭＨＣ複合体のＭＨＣタンパク質は、その群のポリペプチドのすべてまたは一部を含む：ＨＬＡ−ＤＲ、ＨＬＡ−ＤＰ、またはそれら各々のフラグメントまたは同等物；
ｐ）強皮症関連の抗原であり、以下の群の１つ以上から選択される抗原に由来する抗原：ＴＯＰ１３４６−３６０、ＴＯＰ１４２０−４３４、ＴＯＰ１７５０−７６４、ＴＯＰ１４１９−４３３、ＴＯＰ１５９１−６０５、ＴＯＰ１６９５−７０９、ＴＯＰ１３０５−３１９、ＴＯＰ１３４６−３６０、ＴＯＰ１４１９−４３３、ＴＯＰ１４２５−４３９、ＴＯＰ１６１４−６２８、ＣＥＮＰ−Ｃ２９７−３１１、ＣＥＮＰ−Ｃ８５７−８７１、ＣＥＮＰ−Ｃ８８７−９０１、ＣＥＮＰ−Ｃ２１２−２２６、ＣＥＮＰ−Ｃ６４３−６５７、ＣＥＮＰ−Ｃ８３２−８４６、ＣＥＮＰ−Ｃ１６７−１８１、ＣＥＮＰ−Ｃ２４６−２６０、ＣＥＮＰ−Ｃ８４６−８６０、ＣＥＮＰ−Ｃ１４９−１６３、ＣＥＮＰ−Ｃ８３３−８４７、ＣＥＮＰ−Ｃ８４７−８６１、またはそれら各々のフラグメントあるいは同等物、およびｐＭＨＣ複合体のＭＨＣタンパク質は、ＨＬＡ−ＤＲまたはそのフラグメントあるいは同等物のすべてまたは一部を含む；
ｑ）抗リン脂質抗体症候群関連の抗原であり、以下の群の１つ以上から選択される抗原に由来する抗原：ＡＰＯＨ２３５−２４９、ＡＰＯＨ３０６−３２０、ＡＰＯＨ２３７−２５１、ＡＰＯＨ２９５−３０９、ＡＰＯＨ２８−４２、ＡＰＯＨ１７３−１８７、ＡＰＯＨ２６４−２７８、ＡＰＯＨ２９５−３０９、ＡＰＯＨ４９−６３、ＡＰＯＨ２６９−２８３、ＡＰＯＨ２９５−３０９、ＡＰＯＨ３２１−３５５、ＡＰＯＨ３２２−３３６、ＡＰＯＨ３２４−３３８、またはそれら各々のフラグメントあるいは同等物、およびｐＭＨＣ複合体のＭＨＣタンパク質はＨＬＡ−ＤＲのすべてまたは一部、またはそのフラグメントあるいは同等物を含む；
ｒ）ＡＮＣＡ関連の脈管炎関連の抗原であり、以下の群の１つ以上から選択される抗原に由来する抗原：ＭＰＯ５０６−５２０、ＭＰＯ３０２−３１６、ＭＰＯ７−２１、ＭＰＯ６８９−７０３、ＭＰＯ２４８−２６２、ＭＰＯ４４４−４５８、ＭＰＯ５１３−５２７、ＭＰＯ９７−１１１、ＭＰＯ６１６−６３０、ＭＰＯ４６２−４７６、ＭＰＯ６１７−６３１、ＭＰＯ７１４−７２８、ＰＲＴＮ３４４−５８、ＰＲＴＮ３２３４−２４８、ＰＲＴＮ３５９−７３、ＰＲＴＮ３１１７−１３１、ＰＲＴＮ３１６４−１７８、ＰＲＴＮ３７１−８５、ＰＲＴＮ３２４１−２５５、ＰＲＴＮ３５９−７３、ＰＲＴＮ３１８３−１９７、ＰＲＴＮ３６２−７６、ＰＲＴＮ３１１８−１３２、ＰＲＴＮ３２３９−２５３、またはそれら各々のフラグメントあるいは同等物、およびｐＭＨＣ複合体のＭＨＣタンパク質はＨＬＡ−ＤＲのすべてまたは一部、またはそのフラグメントあるいは同等物を含む；または
ｓ）スティッフマン症候群関連の抗原であり、以下の群の１つ以上から選択される抗原に由来する抗原：ＧＡＤ２１２−２２６、ＧＡＤ５５５−５６９、ＧＡＤ２９７−３１１、およびｐＭＨＣ複合体のＭＨＣタンパク質は、以下の群のポリペプチドのすべてまたは一部を含む：ＨＬＡ−ＤＲ、ＨＬＡ−ＤＱ、またはそれら各々のフラグメントまたは同等物。
【０１８１】
特定の態様では、ｐＭＨＣ複合体は以下の処置のためのものである：
ａ）Ｉ型糖尿病、およびｐＭＨＣ複合体は以下の群から選択される：ＰＰＩ７６−９０（Ｋ８８Ｓ）−ＨＬＡ−ＤＲＢ１＊０４０１／ＤＲＡ、ＩＧＲＰ１３−２５−ＨＬＡ−ＤＲＢ１＊０３０１／ＤＲＡ、ＧＡＤ５５５−５６７−ＨＬＡ−ＤＲＢ１＊０４０１／ＤＲＡ、ＧＡＤ５５５−５６７（５５７Ｉ）−ＨＬＡ−ＤＲＢ１＊０４０１／ＤＲＡ、ＩＧＲＰ２３−３５−ＨＬＡ−ＤＲＢ１＊０４０１／ＤＲＡ、Ｂ２４−Ｃ３６−ＨＬＡ−ＤＲＢ１＊０３０１／ＤＲＡ、またはＰＰＩ７６−９０−ＨＬＡ−ＤＲＢ１＊０４０１／ＤＲＡ；
ｂ）多発性硬化症、およびｐＭＨＣ複合体は以下の群から選択される：ＭＢＰ８６−９８−ＨＬＡ−ＤＲＢ１＊１５０１／ＤＲＡ、ＭＢＰ８９−１０１−ＨＬＡ−ＤＲＢ５＊０１０１／ＤＲＡ、ＭＯＧ３８−５２−ＨＬＡ−ＤＲＢ４＊０１０１／ＤＲＡ、ＭＯＧ９７−１０９（Ｅ１０７Ｓ）−ＨＬＡ−ＤＲＢ１＊０４０１／ＤＲＡ、ＭＯＧ２０３−２１７−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０１０１／ＤＲＡ、ＰＬＰ５４−６８−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０１０１／ＤＲＡ、ＰＬＰ９４−１０８−ＨＬＡ−ＤＲＢ１＊０３０１／ＤＲＡ、ＰＬＰ２５０−２６４−ＨＬＡ−ＤＲＢ４＊０１０１／ＤＲＡ、ＭＰＢ１３−３２−ＨＬＡ−ＤＲＢ５＊０１０１／ＤＲＡ、ＭＰＢ８３−９９−ＨＬＡ−ＤＲＢ５＊０１０１／ＤＲＡ、ＭＰＢ１１１−１２９−ＨＬＡ−ＤＲＢ５＊０１０１／ＤＲＡ、ＭＰＢ１４６−１７０−ＨＬＡ−ＤＲＢ５＊０１０１／ＤＲＡ、ＭＯＧ２２３−２３７−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０２０２／ＤＲＡ、ＭＯＧ６−２０−ＨＬＡ−ＤＲＢ５＊０１０１／ＤＲＡ、ＰＬＰ８８−１０２−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０２０２／ＤＲＡ、またはＰＬＰ１３９−１５４−ＨＬＡ−ＤＲＢ５＊０１０１／ＤＲＡ；
ｃ）セリアック病、およびｐＭＨＣ複合体は以下の群から選択される：ａＧｌｉａ５７−６８−ＨＬＡ−ＤＱＡ１＊０５０１／ＨＬＡ−ＤＱＢ１＊０２０１、ａＧｌｉａ６２−７２−ＨＬＡ−ＤＱＡ１＊０５０１／ＨＬＡ−ＤＱＢ１＊０２０１、ａＧｌｉａ２１７−２２９−ＨＬＡ−ＤＱＡ１＊０５０１／ＨＬＡ−ＤＱＢ１＊０３０２、またはａＧｌｉａ２１７−２２９−ＨＬＡ−ＤＱＡ１＊０３／ＨＬＡ−ＤＱＢ１＊０３０２；
ｄ）原発性胆汁性肝硬変、およびｐＭＨＣ複合体は以下の群から選択される：ＰＤＣ−Ｅ２１２２−１３５−ＨＬＡ−ＤＲＢ４＊０１０１／ＤＲＡ、ＰＤＣ−Ｅ２２４９−２６２−ＨＬＡ−ＤＲＢ４＊０１０１／ＤＲＡ、ＰＤＣ−Ｅ２２４９−２６３−ＨＬＡ−ＤＲＢ１＊０８０１／ＤＲＡ、ＰＤＣ−Ｅ２６２９−６４３−ＨＬＡ−ＤＲＢ１＊０８０１／ＤＲＡ、ＰＤＣ−Ｅ２７２−８６−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０２０２／ＤＲＡ、ＰＤＣ−Ｅ２３５３−３６７−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０２０２／ＤＲＡ、ＰＤＣ−Ｅ２４２２−４３６−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０２０２／ＤＲＡ、ＰＤＣ−Ｅ２６２９−６４３−ＨＬＡ−ＤＲＢ４＊０１０１／ＤＲＡ、ＰＤＣ−Ｅ２８０−９４−ＨＬＡ−ＤＲＢ５＊０１０１／ＤＲＡ、ＰＤＣ−Ｅ２３５３−３６７−ＨＬＡ−ＤＲＢ５＊０１０１／ＤＲＡ、またはＰＤＣ−Ｅ２５３５−５４９−ＨＬＡ−ＤＲＢ５＊０１０１／ＤＲＡ、ｍＰＤＣ−Ｅ２１６６−１８１−Ｉ−Ａｇ７、またはｍＰＤＣ−Ｅ２８２−９６−Ｉ−Ａｇ７；
ｅ）落葉性天疱瘡および／または尋常性天疱瘡、およびｐＭＨＣ複合体は以下の群から選択される：ＤＧ１２１６−２２９−ＨＬＡ−ＤＲＢ１＊０１０１／ＤＲＡ、ＤＧ１２１６−２２９−ＨＬＡ−ＤＲＢ１＊０１０２／ＤＲＡ、ＤＧ３９７−１１１−ＨＬＡ−ＤＲＢ１＊０４０２／ＤＲＡ、ＤＧ３２５１−２６５−ＨＬＡ−ＤＲＢ１＊０４０２／ＤＲＡ、ＤＧ３２５１−２６５−ＨＬＡ−ＤＲＢ１＊０４０１／ＤＲＡ、ＤＧ３４４１−４５５−ＨＬＡ−ＤＲＢ１＊０４０２／ＤＲＡ、ＤＧ３３５１−３６５−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０２０２／ＤＲＡ、ＤＧ３４５３−４６７−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０２０２／ＤＲＡ、ＤＧ３５４０−５５４−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０２０２／ＤＲＡ、ＤＧ３２８０−２９４−ＨＬＡ−ＤＲＢ４＊０１０１／ＤＲＡ、ＤＧ３３２６−３４０−ＨＬＡ−ＤＲＢ４＊０１０１／ＤＲＡ、ＤＧ３３６７−３８１−ＨＬＡ−ＤＲＢ４＊０１０１／ＤＲＡ、ＤＧ３１３−２７−ＨＬＡ−ＤＲＢ５＊０１０１／ＤＲＡ、ＤＧ３３２３−３３７−ＨＬＡ−ＤＲＢ５＊０１０１／ＤＲＡ、ＤＧ３４３８−４５２−ＨＬＡ−ＤＲＢ５＊０１０１／ＤＲＡ、ＤＧ１４８−６２−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０２０２／ＤＲＡ、ＤＧ１２０６−２２２−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０２０２／ＤＲＡ、ＤＧ１３６３−３７７−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０２０２／ＤＲＡ、ＤＧ１３−１７−ＨＬＡ−ＤＲＢ４＊０１０１／ＤＲＡ、ＤＧ１１９２−２０６−ＨＬＡ−ＤＲＢ４＊０１０１／ＤＲＡ、ＤＧ１３２６−３４０−ＨＬＡ−ＤＲＢ４＊０１０１／ＤＲＡ、ＤＧ１１−１５−ＨＬＡ−ＤＲＢ５＊０１０１／ＤＲＡ、ＤＧ１３５−４９−ＨＬＡ−ＤＲＢ５＊０１０１／ＤＲＡ、またはＤＧ１３２５−３３９−ＨＬＡ−ＤＲＢ５＊０１０１／ＤＲＡ；
ｆ）視神経脊髄炎スペクトル障害、およびｐＭＨＣ複合体は以下の群から選択される：ＡＱＰ４１２９−１４３−ＨＬＡ−ＤＲＢ１＊０１０１／ＤＲＡ、ＡＱＰ４２８４−２９８−ＨＬＡ−ＤＲＢ１＊０３０１／ＤＲＡ、ＡＱＰ４６３−７６−ＨＬＡ−ＤＲＢ１＊０３０１／ＤＲＡ、ＡＱＰ４１２９−１４３−ＨＬＡ−ＤＲＢ１＊０４０１／ＤＲＡ、またはＡＱＰ４３９−５３−ＨＬＡ−ＤＲＢ１＊１５０１／ＤＲＡ；
ｇ）アレルギー性喘息、およびｐＭＨＣ複合体は以下の群から選択される：ＤＥＲＰ−１１６−３０＊ＨＬＡ−ＤＲＢ１＊０１０１／ＤＲＡ、ＤＥＲＰ−１１６−３０−ＨＬＡ−ＤＲＢ１＊１５０１／ＤＲＡ、ＤＥＲＰ１１７１−１８５−ＨＬＡ−ＤＲＢ１＊１５０１／ＤＲＡ、ＤＥＲＰ−１１１０−１２４−ＨＬＡ−ＤＰＢ１＊０４０１／ＤＲＡ、ＤＥＲＰ−２２６−４０−ＨＬＡ−ＤＲＢ１＊０１０１／ＤＲＡ；ＤＥＲＰ−２２６−４０−ＨＬＡ−ＤＲＢ１＊１５０１／ＤＲＡ、またはＤＥＲＰ−２１０７−１２１−ＨＬＡ−ＤＲＢ１＊０３０１／ＤＲＡ；
ｈ）炎症性大腸疾患、およびｐＭＨＣ複合体は以下の群から選択される：バクテロイデスインテグラーゼ抗原１８３−１９７−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０１０１／ＤＲＡ、バクテロイデスインテグラーゼ抗原１４６−１６０−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０１０１／ＤＲＡ、バクテロイデスインテグラーゼ抗原１７５−１８９−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０１０１／ＤＲＡ、バクテロイデスインテグラーゼ抗原１−１５−ＨＬＡ−ＤＲＢ５＊０１０１／ＤＲＡ、バクテロイデスインテグラーゼ抗原１８３−１９７−ＨＬＡ−ＤＲＢ５＊０１０１／ＤＲＡ、バクテロイデスインテグラーゼ抗原１８３−１９７−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０１０１／ＤＲＡ、バクテロイデスインテグラーゼ抗原３０−４４−ＨＬＡ−ＤＲＢ５＊０１０１／ＤＲＡ、バクテロイデスインテグラーゼ抗原７０−８４−ＨＬＡ−ＤＲＢ４＊０１０１／ＤＲＡ、バクテロイデスインテグラーゼ抗原３３７−３５１−ＨＬＡ−ＤＲＢ４＊０１０１／ＤＲＡ、バクテロイデスインテグラーゼ抗原１７１−１８５−ＨＬＡ−ＤＲＢ４＊０１０１／ＤＲＡ、バクテロイデスインテグラーゼ抗原４−１８−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０２０２／ＤＲＡ、バクテロイデスインテグラーゼ抗原１７１−１８５−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０２０２／ＤＲＡ、バクテロイデスインテグラーゼ抗原２５６−２７０−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０２０２／ＤＲＡ、Ｆｌａ−２／Ｆｌａ−Ｘ３６６−３８０−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０１０１／ＤＲＡ、Ｆｌａ−２／Ｆｌａ−Ｘ１６４−１７８−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０１０１／ＤＲＡ、Ｆｌａ−２／Ｆｌａ−Ｘ２６１−２７５−ＨＬＡ−ＤＲＢ５＊０１０１／ＤＲＡ、Ｆｌａ−２／Ｆｌａ−Ｘ１−１５−ＨＬＡ−ＤＲＢ５＊０１０１／ＤＲＡ、Ｆｌａ−２／Ｆｌａ−Ｘ５１−６５−ＨＬＡ−ＤＲＢ４＊０１０１／ＤＲＡ、Ｆｌａ−２／Ｆｌａ−Ｘ２６９−２８３−ＨＬＡ−ＤＲＢ４＊０１０１／ＤＲＡ、Ｆｌａ−２／Ｆｌａ−Ｘ４−１８−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０２０２／ＤＲＡ、Ｆｌａ−２／Ｆｌａ−Ｘ２６１−２７５−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０２０２／ＤＲＡ、Ｆｌａ−２／Ｆｌａ−Ｘ２７１−２８５−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０２０２／ＤＲＡ、ＹＩＤＸ７８−９２−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０１０１／ＤＲＡ、ＹＩＤＸ７８−９２−ＨＬＡ−ＤＲＢ４＊０１０１／ＤＲＡ、ＹＩＤＸ９３−１０７−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０１０１／ＤＲＡ、ＹＩＤＸ９８−１１２−ＨＬＡ−ＤＲＢ５＊０１０１／ＤＲＡ、ＹＩＤＸ２３−３７−ＨＬＡ−ＤＲＢ５＊０１０１／ＤＲＡ、ＹＩＤＸ７８−９２−ＨＬＡ−ＤＲＢ４＊０１０１／ＤＲＡ、ＹＩＤＸ１９５−２０９−ＨＬＡ−ＤＲＢ４＊０１０１／ＤＲＡ、ＹＩＤＸ２２−３６−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０２０２／ＤＲＡ、ＹＩＤＸ８０−９４−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０２０２／ＤＲＡ、またはＹＩＤＸ１０１−１１５−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０２０２／ＤＲＡ；
ｉ）ＣＯＰＤおよび／または気腫、およびｐＭＨＣ複合体は以下の群から選択される：エラスチン８９−１０３−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０１０１／ＤＲＡ、エラスチン６９８−７１２−ＨＬＡ−ＤＲＢ５＊０１０１／ＤＲＡ、エラスチン８−２２−ＨＬＡ−ＤＲＢ５＊０１０１／ＤＲＡ、エラスチン９４−１０８−ＨＬＡ−ＤＲＢ５＊０１０１／ＤＲＡ、エラスチン１３−２７−ＨＬＡ−ＤＲＢ４＊０１０１／ＤＲＡ、エラスチン６９５−７０９−ＨＬＡ−ＤＲＢ４＊０１０１／ＤＲＡ、エラスチン５６３−５７７−ＨＬＡ−ＤＲＢ４＊０１０１／ＤＲＡ、エラスチン５５８−５７２−ＨＬＡ−ＤＲＢ４＊０１０１／ＤＲＡ、エラスチン６９８−７１２−ＨＬＡ−ＤＲＢ５＊０１０１／ＤＲＡ、エラスチン５６６−５８０−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０２０２／ＤＲＡ、またはエラスチン６４５−６５９−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０２０２／ＤＲＡ；
ｊ）乾癬、およびｐＭＨＣ複合体は以下の群から選択される：Ｃａｐ１８６４−７８−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０１０１／ＤＲＡ、Ｃａｐ１８３４−４８−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０１０１／ＤＲＡ、Ｃａｐ１８４７−６１−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０１０１／ＤＲＡ、Ｃａｐ１８１５１−１６５−ＨＬＡ−ＤＲＢ４＊０１０１／ＤＲＡ、Ｃａｐ１８１４９−１６３−ＨＬＡ−ＤＲＢ５＊０１０１／ＤＲＡ、Ｃａｐ１８１５２−１６６−ＨＬＡ−ＤＲＢ５＊０１０１／ＤＲＡ、Ｃａｐ１８１３１−１４５−ＨＬＡ−ＤＲＢ５＊０１０１／ＤＲＡ、Ｃａｐ１８２４−３８−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０２０２／ＤＲＡ、ＡＤＭＴＳＬ５２４５−２５９−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０１０１／ＤＲＡ、ＡＤＭＴＳＬ５２６７−２８１−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０１０１／ＤＲＡ、ＡＤＭＴＳＬ５３７２−３８６−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０１０１／ＤＲＡ、ＡＤＭＴＳＬ５２８９−３０３−ＨＬＡ−ＤＲＢ４＊０１０１／ＤＲＡ、ＡＤＭＴＳＬ５３９６−４１０−ＨＬＡ−ＤＲＢ４＊０１０１／ＤＲＡ、ＡＤＭＴＳＬ５４３３−４４７−ＨＬＡ−ＤＲＢ４＊０１０１／ＤＲＡ、ＡＤＭＴＳＬ５１４２−１５６−ＨＬＡ−ＤＲＢ５＊０１０１／ＤＲＡ、ＡＤＭＴＳＬ５２３６−２５０−ＨＬＡ−ＤＲＢ５＊０１０１／ＤＲＡ、ＡＤＭＴＳＬ５３０１−３１５−ＨＬＡ−ＤＲＢ５＊０１０１／ＤＲＡ、ＡＤＭＴＳＬ５２０３−２１７−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０２０２／ＤＲＡ、ＡＤＭＴＳＬ５４０４−４１８−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０２０２／ＤＲＡ、またはＡＤＭＴＳＬ５４３３−４４７−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０２０２／ＤＲＡ；
ｋ）自己免疫性肝炎、およびｐＭＨＣ複合体は以下の群から選択される：ＣＹＰ２Ｄ６１９３−２０７−ＨＬＡ−ＤＲＢ１＊０３０１／ＤＲＡ、ＣＹＰ２Ｄ６７６−９０−ＨＬＡ−ＤＲＢ１＊０３０１／ＤＲＡ、ＣＹＰ２Ｄ６２９３−３０７−ＨＬＡ−ＤＲＢ１＊０３０１／ＤＲＡ、ＣＹＰ２Ｄ６３１３−３３２−ＨＬＡ−ＤＲＢ１＊０３０１／ＤＲＡ、ＣＹＰ２Ｄ６３９３−４１２−ＨＬＡ−ＤＲＢ１＊０３０１／ＤＲＡ、ＣＹＰ２Ｄ６１９９−２１３−ＨＬＡ−ＤＲＢ１＊０４０１／ＤＲＡ、ＣＹＰ２Ｄ６４５０−４６４−ＨＬＡ−ＤＲＢ１＊０４０１／ＤＲＡ、ＣＹＰ２Ｄ６３０１−３１５−ＨＬＡ−ＤＲＢ１＊０４０１／ＤＲＡ、ＣＹＰ２Ｄ６４５２−４６６−ＨＬＡ−ＤＲＢ１＊０７０１／ＤＲＡ、ＣＹＰ２Ｄ６５９−７３−ＨＬＡ−ＤＲＢ１＊０７０１／ＤＲＡ、ＣＹＰ２Ｄ６１３０−１４４−ＨＬＡ−ＤＲＢ１＊０７０１／ＤＲＡ、ＣＹＰ２Ｄ６１９３−２１２−ＨＬＡ−ＤＲＢ１＊０７０１／ＤＲＡ、ＣＹＰ２Ｄ６３０５−３２４−ＨＬＡ−ＤＲＢ１＊０７０１／ＤＲＡ、ＣＹＰ２Ｄ６１３１−１４５−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０２０２／ＤＲＡ、ＣＹＰ２Ｄ６２１６−２３０−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０２０２／ＤＲＡ、ＣＹＰ２Ｄ６２３８−２５２−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０２０２／ＤＲＡ、ＣＹＰ２Ｄ６１９９−２１３−ＨＬＡ−ＤＲＢ４＊０１０１／ＤＲＡ、ＣＹＰ２Ｄ６２３５−２５２−ＨＬＡ−ＤＲＢ４＊０１０１／ＤＲＡ、ＣＹＰ２Ｄ６２９３−３０７−ＨＬＡ−ＤＲＢ４＊０１０１／ＤＲＡ、ＣＹＰ２Ｄ６２３８−２５２−ＨＬＡ−ＤＲＢ５＊０１０１／ＤＲＡ、ＣＹＰ２Ｄ６３８１−３９５−ＨＬＡ−ＤＲＢ５＊０１０１／ＤＲＡ、ＣＹＰ２Ｄ６４２９−４４３−ＨＬＡ−ＤＲＢ５＊０１０１／ＤＲＡ、ＳＬＡ３３４−３４８−ＨＬＡ−ＤＲＢ１＊０３０１／ＤＲＡ、ＳＬＡ１９６−２１０−ＨＬＡ−ＤＲＢ１＊０３０１／ＤＲＡ、ＳＬＡ１１５−１２９−ＨＬＡ−ＤＲＢ１＊０３０１／ＤＲＡ、ＳＬＡ３７３−３８６−ＨＬＡ−ＤＲＢ１＊０３０１／ＤＲＡ、ＳＬＡ１８６−１９７−ＨＬＡ−ＤＲＢ１＊０３０１／ＤＲＡ、ＳＬＡ３１７−３３１−ＨＬＡ−ＤＲＢ１＊０４０１／ＤＲＡ、ＳＬＡ１７１−１８５−ＨＬＡ−ＤＲＢ１＊０４０１／ＤＲＡ、ＳＬＡ４１７−４３１−ＨＬＡ−ＤＲＢ１＊０４０１／ＤＲＡ、ＳＬＡ３５９−３７３−ＨＬＡ−ＤＲＢ１＊０７０１／ＤＲＡ、ＳＬＡ２１５−２２９−ＨＬＡ−ＤＲＢ１＊０７０１／ＤＲＡ、ＳＬＡ１１１−１２５−ＨＬＡ−ＤＲＢ１＊０７０１／ＤＲＡ、ＳＬＡ１１０−１２４−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０２０２／ＤＲＡ、ＳＬＡ２９９−３１３−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０２０２／ＤＲＡ、ＳＬＡ３４２−３５６−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０２０２／ＤＲＡ、ＳＬＡ４９−６３−ＨＬＡ−ＤＲＢ４＊０１０１／ＤＲＡ、ＳＬＡ１１９−１３３−ＨＬＡ−ＤＲＢ４＊０１０１／ＤＲＡ、ＳＬＡ２６０−２７４−ＨＬＡ−ＤＲＢ４＊０１０１／ＤＲＡ、ＳＬＡ２６−４０−ＨＬＡ−ＤＲＢ５＊０１０１／ＤＲＡ、ＳＬＡ８６−１００−ＨＬＡ−ＤＲＢ５＊０１０１／ＤＲＡ、またはＳＬＡ３３１−３４５−ＨＬＡ−ＤＲＢ５＊０１０１／ＤＲＡ；
ｌ）ブドウ膜炎、およびｐＭＨＣ複合体は以下の群から選択される：アレスチン１９９−２１３−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０１０１／ＤＲＡ、アレスチン７７−９１−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０１０１／ＤＲＡ、アレスチン２５０−２６４−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０１０１／ＤＲＡアレスチン１７２−１８６−ＨＬＡ−ＤＲＢ４＊０１０１／ＤＲＡ、アレスチン３５４−３６８−ＨＬＡ−ＤＲＢ４＊０１０１／ＤＲＡ、アレスチン２３９−２５３−ＨＬＡ−ＤＲＢ４＊０１０１／ＤＲＡ、アレスチン１０２−１１６−ＨＬＡ−ＤＲＢ５＊０１０１／ＤＲＡ、アレスチン５９−７３−ＨＬＡ−ＤＲＢ５＊０１０１、アレスチン２８０−２９４−ＨＬＡ−ＤＲＢ５＊０１０１、アレスチン２９１−３０６−ＨＬＡ−ＤＲＢ１＊０３０１／ＤＲＡ、アレスチン１９５−２０９−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０２０２／ＤＲＡ、アレスチン１９９−２１３−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０２０２／ＤＲＡ、またはアレスチン２００−２１４−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０２０２／ＤＲＡ；
ｍ）Ｊｏｒｇｅｎ症候群、およびｐＭＨＣ複合体は以下の群から選択される：ＲＯ６０１２７−１４１−ＨＬＡ−ＤＲＢ１＊０３０１／ＤＲＡ、ＲＯ６０５２３−５３７−ＨＬＡ−ＤＲＢ１＊０３０１／ＤＲＡ、ＲＯ６０２４３−２５７−ＨＬＡ−ＤＲＢ１＊０３０１／ＤＲＡ、ＲＯ６０４８４−４９８−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０１０１／ＤＲＡ、ＲＯ６０３４７−３６１−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０１０１／ＤＲＡ、ＲＯ６０３６９−３８３−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０１０１／ＤＲＡ、ＲＯ６０４２６−４４０−ＨＬＡ−ＤＲＢ４＊０１０１／ＤＲＡ、ＲＯ６０２６７−２８１−ＨＬＡ−ＤＲＢ４＊０１０１／ＤＲＡ、ＲＯ６０１７８−１９２−ＨＬＡ−ＤＲＢ４＊０１０１／ＤＲＡ、ＲＯ６０３５８−３７２−ＨＬＡ−ＤＲＢ５＊０１０１／ＤＲＡ、ＲＯ６０３５８−３７２−ＨＬＡ−ＤＲＢ４＊０１０１／ＤＲＡ、ＲＯ６０２２１−２３５−ＨＬＡ−ＤＲＢ５＊０１０１／ＤＲＡ、ＲＯ６０２２１−２３５−ＨＬＡ−ＤＲＢ４＊０１０１／ＤＲＡ、ＲＯ６０３１８−３３２−ＨＬＡ−ＤＲＢ５＊０１０１／ＤＲＡ、ＲＯ６０３１８−３３２−ＨＬＡ−ＤＲＢ４＊０１０１／ＤＲＡ、ＲＯ６０４０７−４２１−ＨＬＡ−ＤＲＢ４＊０１０１／ＤＲＡ、ＲＯ６０４０７−４２１−ＨＬＡ−ＤＱＡ１＊０５０１／ＨＬＡ−ＤＱＢ１＊０２０１、ＲＯ６０４５９−４７３−ＨＬＡ−ＤＲＢ４＊０１０１／ＤＲＡ、ＲＯ６０４５９−４７３−ＨＬＡ−ＤＱＡ１＊０５０１／ＨＬＡ−ＤＱＢ１＊０２０１、ＲＯ６０３１８−３３２−ＨＬＡ−ＤＱＡ１＊０５０１／ＨＬＡ−ＤＱＢ１＊０２０１、ＲＯ６０５１−６５−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０２０２／ＤＲＡ、ＲＯ６０３１２−３２６−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０２０２／ＤＲＡ、ＲＯ６０３４７−３６１−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０２０２／ＤＲＡ、ＬＡ２４１−２５５−ＨＬＡ−ＤＲＢ１＊０３０１／ＤＲＡ、ＬＡ１０１−１１５−ＨＬＡ−ＤＲＢ１＊０３０１／ＤＲＡ、ＬＡ１５３−１６７−ＨＬＡ−ＤＲＢ１＊０３０１／ＤＲＡ、ＬＡ１７８−１９２−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０１０１／ＤＲＡ、ＬＡ１９−３３−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０１０１／ＤＲＡ、ＬＡ３７−５１−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０１０１／ＤＲＡ、ＬＡ１３３−１４７−ＨＬＡ−ＤＲＢ４＊０１０１／ＤＲＡ、ＬＡ５０−６４−ＨＬＡ−ＤＲＢ４＊０１０１／ＤＲＡ、ＬＡ３２−４６−ＨＬＡ−ＤＲＢ４＊０１０１／ＤＲＡ、ＬＡ１５３−１６７−ＨＬＡ−ＤＲＢ５＊０１０１／ＤＲＡ、ＬＡ８３−９７−ＨＬＡ−ＤＲＢ５＊０１０１／ＤＲＡ、ＬＡ１３６−１５０−ＨＬＡ−ＤＲＢ５＊０１０１／ＤＲＡ、ＬＡ２９７−３１１−ＨＬＡ−ＤＱＡ１＊０５０１／ＨＬＡ−ＤＱＢ１＊０２０１、ＬＡ５９−７３−ＨＬＡ−ＤＱＡ１＊０５０１／ＨＬＡ−ＤＱＢ１＊０２０１、ＬＡ５９−７３−ＨＬＡ−ＤＲＢ４＊０１０１／ＤＲＡ、ＬＡ１５１−１６５−ＨＬＡ−ＤＱＡ１＊０５０１／ＨＬＡ−ＤＱＢ１＊０２０１、ＬＡ１５１−１６５−ＨＬＡ−ＤＲＢ４＊０１０１／ＤＲＡ、ＬＡ２９７−３１１−ＨＬＡ−ＤＲＢ４＊０１０１／ＤＲＡ、ＬＡ５０−６４−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０２０２／ＤＲＡ、ＬＡ８６−１００−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０２０２／ＤＲＡ、またはＬＡ１５４−１６８−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０２０２／ＤＲＡ；
ｎ）強皮症、およびｐＭＨＣ複合体は以下の群から選択される：ＴＯＰ１３４６−３６０−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０１０１／ＤＲＡ、ＴＯＰ１４２０−４３４−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０１０１／ＤＲＡ、ＴＯＰ１７５０−７６４−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０１０１／ＤＲＡ、ＴＯＰ１４１９−４３３−ＨＬＡ−ＤＲＢ４＊０１０１／ＤＲＡ、ＴＯＰ１５９１−６０５−ＨＬＡ−ＤＲＢ４＊０１０１／ＤＲＡ、ＴＯＰ１６９５−７０９−ＨＬＡ−ＤＲＢ４＊０１０１／ＤＲＡ、ＴＯＰ１３０５−３１９−ＨＬＡ−ＤＲＢ５＊０１０１／ＤＲＡ、ＴＯＰ１３４６−３６０−ＨＬＡ−ＤＲＢ５＊０１０１／ＤＲＡ、ＴＯＰ１４１９−４３３−ＨＬＡ−ＤＲＢ５＊０１０１／ＤＲＡ、ＴＯＰ１４２０−４３４−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０２０２／ＤＲＡ、ＴＯＰ１４２５−４３９−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０２０２／ＤＲＡ、ＴＯＰ１６１４−６２８−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０２０２／ＤＲＡ、ＣＥＮＰ−Ｃ２９７−３１１−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０１０１／ＤＲＡ、ＣＥＮＰ−Ｃ８５７−８７１−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０１０１／ＤＲＡ、ＣＥＮＰ−Ｃ８８７−９０１−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０１０１／ＤＲＡ、ＣＥＮＰ−Ｃ２１２−２２６−ＨＬＡ−ＤＲＢ４＊０１０１／ＤＲＡ、ＣＥＮＰ−Ｃ６４３−６５７−ＨＬＡ−ＤＲＢ４＊０１０１／ＤＲＡ、ＣＥＮＰ−Ｃ８３２−８４６−ＨＬＡ−ＤＲＢ４＊０１０１／ＤＲＡ、ＣＥＮＰ−Ｃ１６７−１８１−ＨＬＡ−ＤＲＢ５＊０１０１／ＤＲＡ、ＣＥＮＰ−Ｃ２４６−２６０−ＨＬＡ−ＤＲＢ５＊０１０１／ＤＲＡ、ＣＥＮＰ−Ｃ８４６−８６０−ＨＬＡ−ＤＲＢ５＊０１０１／ＤＲＡ、ＣＥＮＰ−Ｃ１４９−１６３−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０２０２／ＤＲＡ、ＣＥＮＰ−Ｃ８３３−８４７−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０２０２／ＤＲＡ、またはＣＥＮＰ−Ｃ８４７−８６１−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０２０２／ＤＲＡ；
ｏ）抗リン脂質抗体症候群、およびｐＭＨＣ複合体は以下の群から選択される：ＡＰＯＨ２３５−２４９−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０１０１／ＤＲＡ、ＡＰＯＨ３０６−３２０−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０１０１／ＤＲＡ、ＡＰＯＨ２３７−２５１−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０１０１／ＤＲＡ、ＡＰＯＨ２９５−３０９−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０１０１／ＤＲＡ、ＡＰＯＨ２８−４２−ＨＬＡ−ＤＲＢ４＊０１０１／ＤＲＡ、ＡＰＯＨ１７３−１８７−ＨＬＡ−ＤＲＢ４＊０１０１／ＤＲＡ、ＡＰＯＨ２６４−２７８−ＨＬＡ−ＤＲＢ４＊０１０１／ＤＲＡ、ＡＰＯＨ２９５−３０９−ＨＬＡ−ＤＲＢ４＊０１０１／ＤＲＡ、ＡＰＯＨ４９−６３−ＨＬＡ−ＤＲＢ５＊０１０１／ＤＲＡ、ＡＰＯＨ２６９−２８３−ＨＬＡ−ＤＲＢ５＊０１０１／ＤＲＡ、ＡＰＯＨ２９５−３０９−ＨＬＡ−ＤＲＢ５＊０１０１／ＤＲＡ、ＡＰＯＨ３２１−３５５−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０２０２／ＤＲＡ、ＡＰＯＨ３２２−３３６−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０２０２／ＤＲＡ、またはＡＰＯＨ３２４−３３８−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０２０２／ＤＲＡ；
ｐ）ＡＮＣＡ関連の脈管炎、およびｐＭＨＣ複合体は以下の群から選択される：ＭＰＯ５０６−５２０−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０１０１／ＤＲＡ、ＭＰＯ３０２−３１６−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０１０１／ＤＲＡ、ＭＰＯ７−２１−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０１０１／ＤＲＡ、ＭＰＯ６８９−７０３−ＨＬＡ−ＤＲＢ４＊０１０１／ＤＲＡ、ＭＰＯ２４８−２６２−ＨＬＡ−ＤＲＢ４＊０１０１／ＤＲＡ、ＭＰＯ４４４−４５８−ＨＬＡ−ＤＲＢ４＊０１０１／ＤＲＡ、ＭＰＯ５１３−５２７−ＨＬＡ−ＤＲＢ５＊０１０１／ＤＲＡ、ＭＰＯ９７−１１１−ＨＬＡ−ＤＲＢ５＊０１０１／ＤＲＡ、ＭＰＯ６１６−６３０−ＨＬＡ−ＤＲＢ５＊０１０１／ＤＲＡ、ＭＰＯ４６２−４７６−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０２０２／ＤＲＡ、ＭＰＯ６１７−６３１−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０２０２／ＤＲＡ、ＭＰＯ７１４−７２８−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０２０２／ＤＲＡ、ＰＲＴＮ３４４−５８−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０１０１／ＤＲＡ、ＰＲＴＮ３２３４−２４８−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０１０１／ＤＲＡ、ＰＲＴＮ３５９−７３−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０１０１／ＤＲＡ、ＰＲＴＮ３５９−７３−ＨＬＡ−ＤＲＢ５＊０１０１／ＤＲＡ、ＰＲＴＮ３１１７−１３１−ＨＬＡ−ＤＲＢ４＊０１０１／ＤＲＡ、ＰＲＴＮ３１６４−１７８−ＨＬＡ−ＤＲＢ４＊０１０１／ＤＲＡ、ＰＲＴＮ３７１−８５−ＨＬＡ−ＤＲＢ４＊０１０１／ＤＲＡ、ＰＲＴＮ３２４１−２５５−ＨＬＡ−ＤＲＢ５＊０１０１／ＤＲＡ、ＰＲＴＮ３１８３−１９７−ＨＬＡ−ＤＲＢ５＊０１０１／ＤＲＡ、ＰＲＴＮ３６２−７６−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０２０２／ＤＲＡ、ＰＲＴＮ３１１８−１３２−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０２０２／ＤＲＡ、またはＰＲＴＮ３２３９−２５３−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０２０２／ＤＲＡ；または、
ｑ）スティッフマン症候群、およびｐＭＨＣ複合体は以下の群から選択される：ＧＡＤ２１２−２２６−ＨＬＡ−ＤＲＢ１＊０８０１／ＤＲＡ、ＧＡＤ５５５−５６９−ＨＬＡ−ＤＲＢ１＊０８０１／ＤＲＡ、またはＧＡＤ２９７−３１１−ＨＬＡ−ＤＲＢ１＊０３０１／ＤＲＡ。
【０１８２】
いくつかの態様では、ｐＭＨＣ複合体は以下の処置のためのものである：
ａ）Ｉ型糖尿病、およびｐＭＨＣ複合体は以下の群から選択される：ＰＰＩ７６−９０（Ｋ８８Ｓ）−ＨＬＡ−ＤＲＢ１＊０４０１／ＤＲＡ、ＩＧＲＰ１３−２５−ＨＬＡ−ＤＲＢ１＊０３０１／ＤＲＡ、ＧＡＤ５５５−５６７−ＨＬＡ−ＤＲＢ１＊０４０１／ＤＲＡ、ＧＡＤ５５５−５６７（５５７Ｉ）−ＨＬＡ−ＤＲＢ１＊０４０１／ＤＲＡ、ＩＧＲＰ２３−３５−ＨＬＡ−ＤＲＢ１＊０４０１／ＤＲＡ、またはＰＰＩ７６−９０−ＨＬＡ−ＤＲＢ１＊０４０１／ＤＲＡ；
ｂ）多発性硬化症、およびｐＭＨＣ複合体は以下の群から選択される：ＭＢＰ８６−９８−ＨＬＡ−ＤＲＢ１＊１５０１／ＤＲＡ、ＭＢＰ８９−１０１−ＨＬＡ−ＤＲＢ５＊０１０１／ＤＲＡ、ＭＯＧ３８−５２−ＨＬＡ−ＤＲＢ４＊０１０１／ＤＲＡ、ＭＯＧ９７−１０９（Ｅ１０７Ｓ）−ＨＬＡ−ＤＲＢ１＊０４０１／ＤＲＡ、ＭＯＧ２０３−２１７−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０１０１／ＤＲＡ、ＰＬＰ５４−６８−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０１０１／ＤＲＡ、ＰＬＰ９４−１０８−ＨＬＡ−ＤＲＢ１＊０３０１／ＤＲＡ、ＰＬＰ２５０−２６４−ＨＬＡ−ＤＲＢ４＊０１０１／ＤＲＡ、ＭＰＢ１３−３２−ＨＬＡ−ＤＲＢ５＊０１０１／ＤＲＡ、ＭＰＢ８３−９９−ＨＬＡ−ＤＲＢ５＊０１０１／ＤＲＡ、ＭＰＢ１１１−１２９−ＨＬＡ−ＤＲＢ５＊０１０１／ＤＲＡ、ＭＰＢ１４６−１７０−ＨＬＡ−ＤＲＢ５＊０１０１／ＤＲＡ、ＭＯＧ２２３−２３７−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０２０２／ＤＲＡ、ＭＯＧ６−２０−ＨＬＡ−ＤＲＢ５＊０１０１／ＤＲＡ、ＰＬＰ８８−１０２−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０２０２／ＤＲＡ、またはＰＬＰ１３９−１５４−ＨＬＡ−ＤＲＢ５＊０１０１／ＤＲＡ；
ｃ）セリアック病、およびｐＭＨＣ複合体は以下の群から選択される：ａＧｌｉａ５７−６８−ＨＬＡ−ＤＱＡ１＊０５０１／ＨＬＡ−ＤＱＢ１＊０２０１、ａＧｌｉａ６２−７２−ＨＬＡ−ＤＱＡ１＊０５０１／ＨＬＡ−ＤＱＢ１＊０２０１、またはａＧｌｉａ２１７−２２９−ＨＬＡ−ＤＱＡ１＊０５０１／ＨＬＡ−ＤＱＢ１＊０３０２；
ｄ）原発性胆汁性肝硬変、およびｐＭＨＣ複合体は以下の群から選択される：ＰＤＣ−Ｅ２１２２−１３５−ＨＬＡ−ＤＲＢ４＊０１０１／ＤＲＡ、ＰＤＣ−Ｅ２２４９−２６２−ＨＬＡ−ＤＲＢ４＊０１０１／ＤＲＡ、ＰＤＣ−Ｅ２２４９−２６３−ＨＬＡ−ＤＲＢ１＊０８０１／ＤＲＡ、ＰＤＣ−Ｅ２６２９−６４３−ＨＬＡ−ＤＲＢ１＊０８０１／ＤＲＡ、ＰＤＣ−Ｅ２７２−８６−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０２０２／ＤＲＡ、ＰＤＣ−Ｅ２３５３−３６７−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０２０２／ＤＲＡ、ＰＤＣ−Ｅ２４２２−４３６−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０２０２／ＤＲＡ、ＰＤＣ−Ｅ２６２９−６４３−ＨＬＡ−ＤＲＢ４＊０１０１／ＤＲＡ、ＰＤＣ−Ｅ２８０−９４−ＨＬＡ−ＤＲＢ５＊０１０１／ＤＲＡ、ＰＤＣ−Ｅ２３５３−３６７−ＨＬＡ−ＤＲＢ５＊０１０１／ＤＲＡ、またはＰＤＣ−Ｅ２５３５−５４９−ＨＬＡ−ＤＲＢ５＊０１０１／ＤＲＡ；
ｅ）落葉性天疱瘡および／または尋常性天疱瘡、およびｐＭＨＣ複合体は、以下の群から選択される：ＤＧ１２１６−２２９−ＨＬＡ−ＤＲＢ１＊０１０１／ＤＲＡ、ＤＧ３９７−１１１−ＨＬＡ−ＤＲＢ１＊０４０２／ＤＲＡ、ＤＧ３２５１−２６５−ＨＬＡ−ＤＲＢ１＊０４０１／ＤＲＡ、ＤＧ３４４１−４５５−ＨＬＡ−ＤＲＢ１＊０４０２／ＤＲＡ、ＤＧ３３５１−３６５−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０２０２／ＤＲＡ、ＤＧ３４５３−４６７−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０２０２／ＤＲＡ、ＤＧ３５４０−５５４−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０２０２／ＤＲＡ、ＤＧ３２８０−２９４−ＨＬＡ−ＤＲＢ４＊０１０１／ＤＲＡ、ＤＧ３３２６−３４０−ＨＬＡ−ＤＲＢ４＊０１０１／ＤＲＡ、ＤＧ３３６７−３８１−ＨＬＡ−ＤＲＢ４＊０１０１／ＤＲＡ、ＤＧ３１３−２７−ＨＬＡ−ＤＲＢ５＊０１０１／ＤＲＡ、ＤＧ３３２３−３３７−ＨＬＡ−ＤＲＢ５＊０１０１／ＤＲＡ、ＤＧ３４３８−４５２−ＨＬＡ−ＤＲＢ５＊０１０１／ＤＲＡ、ＤＧ１４８−６２−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０２０２／ＤＲＡ、ＤＧ１２０６−２２２−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０２０２／ＤＲＡ、ＤＧ１３６３−３７７−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０２０２／ＤＲＡ、ＤＧ１３−１７−ＨＬＡ−ＤＲＢ４＊０１０１／ＤＲＡ、ＤＧ１１９２−２０６−ＨＬＡ−ＤＲＢ４＊０１０１／ＤＲＡ、ＤＧ１３２６−３４０−ＨＬＡ−ＤＲＢ４＊０１０１／ＤＲＡ、ＤＧ１１−１５−ＨＬＡ−ＤＲＢ５＊０１０１／ＤＲＡ、ＤＧ１３５−４９−ＨＬＡ−ＤＲＢ５＊０１０１／ＤＲＡ、またはＤＧ１３２５−３３９−ＨＬＡ−ＤＲＢ５＊０１０１／ＤＲＡ；
ｆ）視神経脊髄炎スペクトル障害、およびｐＭＨＣ複合体は以下の群から選択される：ＡＱＰ４２８４−２９８−ＨＬＡ−ＤＲＢ１＊０３０１／ＤＲＡ、ＡＱＰ４６３−７６−ＨＬＡ−ＤＲＢ１＊０３０１／ＤＲＡ、ＡＱＰ４１２９−１４３−ＨＬＡ−ＤＲＢ１＊０４０１／ＤＲＡ、またはＡＱＰ４３９−５３−ＨＬＡ−ＤＲＢ１＊１５０１／ＤＲＡ；
ｇ）アレルギー性喘息、およびｐＭＨＣ複合体は以下の群から選択される：ＤＥＲＰ−１１６−３０−ＨＬＡ−ＤＲＢ１＊０１０１／ＤＲＡ、ＤＥＲＰ−１１６−３０−ＨＬＡ−ＤＲＢ１＊１５０１／ＤＲＡ、ＤＥＲＰ１１７１−１８５＊ＨＬＡ−ＤＲＢ１＊１５０１／ＤＲＡ、ＤＥＲＰ−１１１０−１２４−ＨＬＡ−ＤＰＢ１＊０４０１／ＤＲＡ、ＤＥＲＰ−２２６−４０−ＨＬＡ−ＤＲＢ１＊０１０１／ＤＲＡ；ＤＥＲＰ−２２６−４０−ＨＬＡ−ＤＲＢ１＊１５０１／ＤＲＡ、またはＤＥＲＰ−２１０７−１２１−ＨＬＡ−ＤＲＢ１＊０３０１／ＤＲＡ；
ｈ）炎症性大腸疾患、およびｐＭＨＣ複合体は以下の群から選択される：バクテロイデスインテグラーゼ抗原１−１５−ＨＬＡ−ＤＲＢ５＊０１０１／ＤＲＡ、バクテロイデスインテグラーゼ抗原１８３−１９７−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０１０１／ＤＲＡ、バクテロイデスインテグラーゼ抗原７０−８４−ＨＬＡ−ＤＲＢ４＊０１０１／ＤＲＡ、バクテロイデスインテグラーゼ抗原４−１８−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０２０２／ＤＲＡ、バクテロイデスインテグラーゼ抗原１７１−１８５−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０２０２／ＤＲＡ、バクテロイデスインテグラーゼ抗原２５６−２７０−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０２０２／ＤＲＡ、Ｆｌａ−２／Ｆｌａ−Ｘ３６６−３８０−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０１０１／ＤＲＡ、Ｆｌａ−２／Ｆｌａ−Ｘ２６１−２７５−ＨＬＡ−ＤＲＢ５＊０１０１／ＤＲＡ、Ｆｌａ−２／Ｆｌａ−Ｘ５１−６５−ＨＬＡ−ＤＲＢ４＊０１０１／ＤＲＡ、Ｆｌａ−２／Ｆｌａ−Ｘ４−１８−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０２０２／ＤＲＡ、Ｆｌａ−２／Ｆｌａ−Ｘ２６１−２７５−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０２０２／ＤＲＡ、Ｆｌａ−２／Ｆｌａ−Ｘ２７１−２８５−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０２０２／ＤＲＡ、ＹＩＤＸ７８−９２−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０１０１／ＤＲＡ、ＹＩＤＸ７８−９２−ＨＬＡ−ＤＲＢ４＊０１０１／ＤＲＡ、ＹＩＤＸ９８−１１２−ＨＬＡ−ＤＲＢ５＊０１０１／ＤＲＡ、ＹＩＤＸ２２−３６−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０２０２／ＤＲＡ、ＹＩＤＸ８０−９４−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０２０２／ＤＲＡ、またはＹＩＤＸ１０１−１１５−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０２０２／ＤＲＡ；
ｉ）気腫、およびｐＭＨＣ複合体は以下の群から選択される：ｅｌａｓｔｉｎ８９−１０３−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０１０１／ＤＲＡ、ｅｌａｓｔｉｎ６９８−７１２−ＨＬＡ−ＤＲＢ５＊０１０１／ＤＲＡ、ｅｌａｓｔｉｎ５５８−５７２−ＨＬＡ−ＤＲＢ４＊０１０１／ＤＲＡ、ｅｌａｓｔｉｎ５６６−５８０−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０２０２／ＤＲＡ、またはｅｌａｓｔｉｎ６４５−６５９−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０２０２／ＤＲＡ；
ｊ）乾癬、およびｐＭＨＣ複合体は以下の群から選択される：Ｃａｐ１８６４−７８−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０１０１／ＤＲＡ、Ｃａｐ１８３４−４８−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０１０１／ＤＲＡ、Ｃａｐ１８４７−６１−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０１０１／ＤＲＡ、Ｃａｐ１８１５１−１６５−ＨＬＡ−ＤＲＢ４＊０１０１／ＤＲＡ、Ｃａｐ１８１４９−１６３−ＨＬＡ−ＤＲＢ５＊０１０１／ＤＲＡ、Ｃａｐ１８１５２−１６６−ＨＬＡ−ＤＲＢ５＊０１０１／ＤＲＡ、Ｃａｐ１８１３１−１４５−ＨＬＡ−ＤＲＢ５＊０１０１／ＤＲＡ、Ｃａｐ１８２４−３８−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０２０２／ＤＲＡ、ＡＤＭＴＳＬ５２４５−２５９−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０１０１／ＤＲＡ、ＡＤＭＴＳＬ５２６７−２８１−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０１０１／ＤＲＡ、ＡＤＭＴＳＬ５３７２−３８６−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０１０１／ＤＲＡ、ＡＤＭＴＳＬ５２８９−３０３−ＨＬＡ−ＤＲＢ４＊０１０１／ＤＲＡ、ＡＤＭＴＳＬ５３９６−４１０−ＨＬＡ−ＤＲＢ４＊０１０１／ＤＲＡ、ＡＤＭＴＳＬ５４３３−４４７−ＨＬＡ−ＤＲＢ４＊０１０１／ＤＲＡ、ＡＤＭＴＳＬ５１４２−１５６−ＨＬＡ−ＤＲＢ５＊０１０１／ＤＲＡ、ＡＤＭＴＳＬ５２３６−２５０−ＨＬＡ−ＤＲＢ５＊０１０１／ＤＲＡ、ＡＤＭＴＳＬ５３０１−３１５−ＨＬＡ−ＤＲＢ５＊０１０１／ＤＲＡ、ＡＤＭＴＳＬ５２０３−２１７−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０２０２／ＤＲＡ、ＡＤＭＴＳＬ５４０４−４１８−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０２０２／ＤＲＡ、またはＡＤＭＴＳＬ５４３３−４４７−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０２０２／ＤＲＡ；
ｋ）自己免疫性肝炎、およびｐＭＨＣ複合体は以下の群から選択される：ＣＹＰ２Ｄ６１９３−２０７−ＨＬＡ−ＤＲＢ１＊０３０１／ＤＲＡ、ＣＹＰ２Ｄ６７６−９０−ＨＬＡ−ＤＲＢ１＊０３０１／ＤＲＡ、ＣＹＰ２Ｄ６２９３−３０７−ＨＬＡ−ＤＲＢ１＊０３０１／ＤＲＡ、ＣＹＰ２Ｄ６３１３−３３２−ＨＬＡ−ＤＲＢ１＊０３０１／ＤＲＡ、ＣＹＰ２Ｄ６３９３−４１２−ＨＬＡ−ＤＲＢ１＊０３０１／ＤＲＡ、ＣＹＰ２Ｄ６１９９−２１３−ＨＬＡ−ＤＲＢ１＊０４０１／ＤＲＡ、ＣＹＰ２Ｄ６４５０−４６４−ＨＬＡ−ＤＲＢ１＊０４０１／ＤＲＡ、ＣＹＰ２Ｄ６３０１−３１５−ＨＬＡ−ＤＲＢ１＊０４０１／ＤＲＡ、ＣＹＰ２Ｄ６４５２−４６６−ＨＬＡ−ＤＲＢ１＊０７０１／ＤＲＡ、ＣＹＰ２Ｄ６５９−７３−ＨＬＡ−ＤＲＢ１＊０７０１／ＤＲＡ、ＣＹＰ２Ｄ６１３０−１４４−ＨＬＡ−ＤＲＢ１＊０７０１／ＤＲＡ、ＣＹＰ２Ｄ６１９３−２１２−ＨＬＡ−ＤＲＢ１＊０７０１／ＤＲＡ、ＣＹＰ２Ｄ６３０５−３２４−ＨＬＡ−ＤＲＢ１＊０７０１／ＤＲＡ、ＣＹＰ２Ｄ６１３１−１４５−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０２０２／ＤＲＡ、ＣＹＰ２Ｄ６２１６−２３０−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０２０２／ＤＲＡ、ＣＹＰ２Ｄ６２３８−２５２−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０２０２／ＤＲＡ、ＣＹＰ２Ｄ６１９９−２１３−ＨＬＡ−ＤＲＢ４＊０１０１／ＤＲＡ、ＣＹＰ２Ｄ６２３５−２５２−ＨＬＡ−ＤＲＢ４＊０１０１／ＤＲＡ、ＣＹＰ２Ｄ６２９３−３０７−ＨＬＡ−ＤＲＢ４＊０１０１／ＤＲＡ、ＣＹＰ２Ｄ６２３８−２５２−ＨＬＡ−ＤＲＢ５＊０１０１／ＤＲＡ、ＣＹＰ２Ｄ６３８１−３９５−ＨＬＡ−ＤＲＢ５＊０１０１／ＤＲＡ、ＣＹＰ２Ｄ６４２９−４４３−ＨＬＡ−ＤＲＢ５＊０１０１／ＤＲＡ、ＳＬＡ３３４−３４８−ＨＬＡ−ＤＲＢ１＊０３０１／ＤＲＡ、ＳＬＡ１９６−２１０−ＨＬＡ−ＤＲＢ１＊０３０１／ＤＲＡ、ＳＬＡ１１５−１２９−ＨＬＡ−ＤＲＢ１＊０３０１／ＤＲＡ、ＳＬＡ３７３−３８６−ＨＬＡ−ＤＲＢ１＊０３０１／ＤＲＡ、ＳＬＡ１８６−１９７−ＨＬＡ−ＤＲＢ１＊０３０１／ＤＲＡ、ＳＬＡ３１７−３３１−ＨＬＡ−ＤＲＢ１＊０４０１／ＤＲＡ、ＳＬＡ１７１−１８５−ＨＬＡ−ＤＲＢ１＊０４０１／ＤＲＡ、ＳＬＡ４１７−４３１−ＨＬＡ−ＤＲＢ１＊０４０１／ＤＲＡ、ＳＬＡ３５９−３７３−ＨＬＡ−ＤＲＢ１＊０７０１／ＤＲＡ、ＳＬＡ２１５−２２９−ＨＬＡ−ＤＲＢ１＊０７０１／ＤＲＡ、ＳＬＡ１１１−１２５−ＨＬＡ−ＤＲＢ１＊０７０１／ＤＲＡ、ＳＬＡ１１０−１２４−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０２０２／ＤＲＡ、ＳＬＡ２９９−３１３−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０２０２／ＤＲＡ、ＳＬＡ３４２−３５６−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０２０２／ＤＲＡ、ＳＬＡ４９−６３−ＨＬＡ−ＤＲＢ４＊０１０１／ＤＲＡ、ＳＬＡ１１９−１３３−ＨＬＡ−ＤＲＢ４＊０１０１／ＤＲＡ、ＳＬＡ２６０−２７４−ＨＬＡ−ＤＲＢ４＊０１０１／ＤＲＡ、ＳＬＡ２６−４０−ＨＬＡ−ＤＲＢ５＊０１０１／ＤＲＡ、ＳＬＡ８６−１００−ＨＬＡ−ＤＲＢ５＊０１０１／ＤＲＡ、またはＳＬＡ３３１−３４５−ＨＬＡ−ＤＲＢ５＊０１０１／ＤＲＡ；
ｌ）ブドウ膜炎、およびｐＭＨＣ複合体は以下の群から選択される：ａｒｒｅｓｔｉｎ１９９−２１３−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０１０１／ＤＲＡ、ａｒｒｅｓｔｉｎ７７−９１−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０１０１／ＤＲＡ、ａｒｒｅｓｔｉｎ２５０−２６４−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０１０１／ＤＲＡ、ａｒｒｅｓｔｉｎ１７２−１８６−ＨＬＡ−ＤＲＢ４＊０１０１／ＤＲＡ、ａｒｒｅｓｔｉｎ３５４−３６８−ＨＬＡ−ＤＲＢ４＊０１０１／ＤＲＡ、ａｒｒｅｓｔｉｎ２３９−２５３−ＨＬＡ−ＤＲＢ４＊０１０１／ＤＲＡ、ａｒｒｅｓｔｉｎ１０２−１１６−ＨＬＡ−ＤＲＢ５＊０１０１／ＤＲＡ、ａｒｒｅｓｔｉｎ５９−７３−ＨＬＡ−ＤＲＢ５＊０１０１、ａｒｒｅｓｔｉｎ２８０−２９４−ＨＬＡ−ＤＲＢ５＊０１０１、ａｒｒｅｓｔｉｎ２９１−３０６−ＨＬＡ−ＤＲＢ１＊０３０１／ＤＲＡ、ａｒｒｅｓｔｉｎ１９５−２０９−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０２０２／ＤＲＡ、ａｒｒｅｓｔｉｎ１９９−２１３−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０２０２／ＤＲＡ、またはａｒｒｅｓｔｉｎ２００−２１４−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０２０２／ＤＲＡ；
ｍ）Ｊｏｒｇｅｎ症候群、およびｐＭＨＣ複合体は以下の群から選択される：ＲＯ６０１２７−１４１−ＨＬＡ−ＤＲＢ１＊０３０１／ＤＲＡ、ＲＯ６０５２３−５３７−ＨＬＡ−ＤＲＢ１＊０３０１／ＤＲＡ、ＲＯ６０２４３−２５７−ＨＬＡ−ＤＲＢ１＊０３０１／ＤＲＡ、ＲＯ６０４８４−４９８−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０１０１／ＤＲＡ、ＲＯ６０３４７−３６１−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０１０１／ＤＲＡ、ＲＯ６０３６９−３８３−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０１０１／ＤＲＡ、ＲＯ６０４２６−４４０−ＨＬＡ−ＤＲＢ４＊０１０１／ＤＲＡ、ＲＯ６０２６７−２８１−ＨＬＡ−ＤＲＢ４＊０１０１／ＤＲＡ、ＲＯ６０１７８−１９２−ＨＬＡ−ＤＲＢ４＊０１０１／ＤＲＡ、ＲＯ６０３５８−３７２−ＨＬＡ−ＤＲＢ５＊０１０１／ＤＲＡ、ＲＯ６０２２１−２３５−ＨＬＡ−ＤＲＢ５＊０１０１／ＤＲＡ、ＲＯ６０３１８−３３２−ＨＬＡ−ＤＲＢ５＊０１０１／ＤＲＡ、ＲＯ６０５１−６５−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０２０２／ＤＲＡ、ＲＯ６０３１２−３２６−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０２０２／ＤＲＡ、ＲＯ６０３４７−３６１−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０２０２／ＤＲＡ、ＬＡ２４１−２５５−ＨＬＡ−ＤＲＢ１＊０３０１／ＤＲＡ、ＬＡ１０１−１１５−ＨＬＡ−ＤＲＢ１＊０３０１／ＤＲＡ、ＬＡ１５３−１６７−ＨＬＡ−ＤＲＢ１＊０３０１／ＤＲＡ、ＬＡ１７８−１９２−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０１０１／ＤＲＡ、ＬＡ１９−３３−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０１０１／ＤＲＡ、ＬＡ３７−５１−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０１０１／ＤＲＡ、ＬＡ１３３−１４７−ＨＬＡ−ＤＲＢ４＊０１０１／ＤＲＡ、ＬＡ５０−６４−ＨＬＡ−ＤＲＢ４＊０１０１／ＤＲＡ、ＬＡ３２−４６−ＨＬＡ−ＤＲＢ４＊０１０１／ＤＲＡ、ＬＡ１５３−１６７−ＨＬＡ−ＤＲＢ５＊０１０１／ＤＲＡ、ＬＡ８３−９７−ＨＬＡ−ＤＲＢ５＊０１０１／ＤＲＡ、ＬＡ１３６−１５０−ＨＬＡ−ＤＲＢ５＊０１０１／ＤＲＡ、ＬＡ５０−６４−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０２０２／ＤＲＡ、ＬＡ８６−１００−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０２０２／ＤＲＡ、またはＬＡ１５４−１６８−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０２０２／ＤＲＡ；
ｎ）強皮症、およびｐＭＨＣ複合体は以下の群から選択される：ＴＯＰ１３４６−３６０−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０１０１／ＤＲＡ、ＴＯＰ１４２０−４３４−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０１０１／ＤＲＡ、ＴＯＰ１７５０−７６４−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０１０１／ＤＲＡ、ＴＯＰ１４１９−４３３−ＨＬＡ−ＤＲＢ４＊０１０１／ＤＲＡ、ＴＯＰ１５９１−６０５−ＨＬＡ−ＤＲＢ４＊０１０１／ＤＲＡ、ＴＯＰ１６９５−７０９−ＨＬＡ−ＤＲＢ４＊０１０１／ＤＲＡ、ＴＯＰ１３０５−３１９−ＨＬＡ−ＤＲＢ５＊０１０１／ＤＲＡ、ＴＯＰ１３４６−３６０−ＨＬＡ−ＤＲＢ５＊０１０１／ＤＲＡ、ＴＯＰ１４１９−４３３−ＨＬＡ−ＤＲＢ５＊０１０１／ＤＲＡ、ＴＯＰ１４２０−４３４−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０２０２／ＤＲＡ、ＴＯＰ１４２５−４３９−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０２０２／ＤＲＡ、ＴＯＰ１６１４−６２８−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０２０２／ＤＲＡ、ＣＥＮＰ−Ｃ２９７−３１１−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０１０１／ＤＲＡ、ＣＥＮＰ−Ｃ８５７−８７１−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０１０１、ＣＥＮＰ−Ｃ８８７−９０１−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０１０１、ＣＥＮＰ−Ｃ２１２−２２６−ＨＬＡ−ＤＲＢ４＊０１０１／ＤＲＡ、ＣＥＮＰ−Ｃ６４３−６５７−ＨＬＡ−ＤＲＢ４＊０１０１／ＤＲＡ、ＣＥＮＰ−Ｃ８３２−８４６−ＨＬＡ−ＤＲＢ４＊０１０１／ＤＲＡ、ＣＥＮＰ−Ｃ１６７−１８１−ＨＬＡ−ＤＲＢ５＊０１０１／ＤＲＡ、ＣＥＮＰ−Ｃ２４６−２６０−ＨＬＡ−ＤＲＢ５＊０１０１／ＤＲＡ、ＣＥＮＰ−Ｃ８４６−８６０−ＨＬＡ−ＤＲＢ５＊０１０１／ＤＲＡ、ＣＥＮＰ−Ｃ１４９−１６３−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０２０２／ＤＲＡ、ＣＥＮＰ−Ｃ８３３−８４７−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０２０２／ＤＲＡ、またはＣＥＮＰ−Ｃ８４７−８６１−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０２０２／ＤＲＡ；
ｏ）抗リン脂質抗体症候群、およびｐＭＨＣ複合体は以下の群から選択される：ＡＰＯＨ２３５−２４９−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０１０１／ＤＲＡ、ＡＰＯＨ３０６−３２０−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０１０１／ＤＲＡ、ＡＰＯＨ２３７−２５１−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０１０１／ＤＲＡ、ＡＰＯＨ２９５−３０９−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０１０１／ＤＲＡ、ＡＰＯＨ２８−４２−ＨＬＡ−ＤＲＢ４＊０１０１／ＤＲＡ、ＡＰＯＨ１７３−１８７−ＨＬＡ−ＤＲＢ４＊０１０１／ＤＲＡ、ＡＰＯＨ２６４−２７８−ＨＬＡ−ＤＲＢ４＊０１０１／ＤＲＡ、ＡＰＯＨ２９５−３０９−ＨＬＡ−ＤＲＢ４＊０１０１／ＤＲＡ、ＡＰＯＨ４９−６３−ＨＬＡ−ＤＲＢ５＊０１０１／ＤＲＡ、ＡＰＯＨ２６９−２８３−ＨＬＡ−ＤＲＢ５＊０１０１／ＤＲＡ、ＡＰＯＨ２９５−３０９−ＨＬＡ−ＤＲＢ５＊０１０１／ＤＲＡ、ＡＰＯＨ３２１−３５５−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０２０２／ＤＲＡ、ＡＰＯＨ３２２−３３６−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０２０２／ＤＲＡ、またはＡＰＯＨ３２４−３３８−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０２０２／ＤＲＡ；
ｐ）ＡＮＣＡ関連の脈管炎、およびｐＭＨＣ複合体は以下の群から選択される：ＭＰＯ５０６−５２０−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０１０１／ＤＲＡ、ＭＰＯ３０２−３１６−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０１０１／ＤＲＡ、ＭＰＯ７−２１−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０１０１／ＤＲＡ、ＭＰＯ６８９−７０３−ＨＬＡ−ＤＲＢ４＊０１０１／ＤＲＡ、ＭＰＯ２４８−２６２−ＨＬＡ−ＤＲＢ４＊０１０１／ＤＲＡ、ＭＰＯ４４４−４５８−ＨＬＡ−ＤＲＢ４＊０１０１／ＤＲＡ、ＭＰＯ５１３−５２７−ＨＬＡ−ＤＲＢ５＊０１０１／ＤＲＡ、ＭＰＯ９７−１１１−ＨＬＡ−ＤＲＢ５＊０１０１／ＤＲＡ、ＭＰＯ６１６−６３０−ＨＬＡ−ＤＲＢ５＊０１０１／ＤＲＡ、ＭＰＯ４６２−４７６−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０２０２／ＤＲＡ、ＭＰＯ６１７−６３１−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０２０２／ＤＲＡ、ＭＰＯ７１４−７２８−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０２０２／ＤＲＡ、ＰＲＴＮ３４４−５８−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０１０１／ＤＲＡ、ＰＲＴＮ３２３４−２４８−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０１０１／ＤＲＡ、ＰＲＴＮ３５９−７３−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０１０１／ＤＲＡ、ＰＲＴＮ３５９−７３−ＨＬＡ−ＤＲＢ５＊０１０１／ＤＲＡ、ＰＲＴＮ３１１７−１３１−ＨＬＡ−ＤＲＢ４＊０１０１／ＤＲＡ、ＰＲＴＮ３１６４−１７８−ＨＬＡ−ＤＲＢ４＊０１０１／ＤＲＡ、ＰＲＴＮ３７１−８５−ＨＬＡ−ＤＲＢ４＊０１０１／ＤＲＡ、ＰＲＴＮ３２４１−２５５−ＨＬＡ−ＤＲＢ５＊０１０１／ＤＲＡ、ＰＲＴＮ３１８３−１９７−ＨＬＡ−ＤＲＢ５＊０１０１／ＤＲＡ、ＰＲＴＮ３６２−７６−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０２０２／ＤＲＡ、ＰＲＴＮ３１１８−１３２−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０２０２／ＤＲＡ、またはＰＲＴＮ３２３９−２５３−ＨＬＡ−ＤＲＢ３＊０２０２／ＤＲＡ；または、
ｑ）スティッフマン症候群、およびｐＭＨＣ複合体は以下の群から選択される：ＧＡＤ２１２−２２６−ＨＬＡ−ＤＲＢ１＊０８０１／ＤＲＡ、ＧＡＤ５５５−５６９−ＨＬＡ−ＤＲＢ１＊０８０１／ＤＲＡ、またはＧＡＤ２９７−３１１−ＨＬＡ−ＤＲＢ１＊０３０１／ＤＲＡ。
【０１８３】
ｐＭＨＣ／ＮＰ複合体に連結される共刺激分子（単数または複数）の選択もまた、同様に最適化されてもよく、および分化または拡張を必要とする免疫細胞集団の性質に多くを依存する。例えば、Ｔ調節性細胞集団の拡張または分化を意図する場合、関連する組み合わせは、限定されないが、ＩＬ１５−ＩＬ１５Ｒａ、ＩＬ−２、ＩＬ−１０、ＩＬ−３５、ＩＣＯＳ−Ｌ、ＩＬ２／抗ＩＬ２  ｍＡｂ複合体、ＴＧＦ−β、ＩＬ−２１、ＩＴＥまたはＩＣＯＳＬ等の共刺激分子とサイトカインを含み得る。対照的に、特定の種類の癌を有する等の特定の実施形態において、Ｔ調節性表現型の拡張および／または分化は望ましい反応でない場合もある。したがって、代替的な共刺激分子およびサイトカインは、特定の処置に最適化される。
【０１８４】
＜ポリペプチド＞
他の態様において、本明細書で提供されるのは、ＭＨＣクラスＩＩα１ドメイン、ＭＨＣクラスＩＩα２ドメイン、またはそれらの組み合わせ；および少なくとも設計された隆起を含むポリペプチドである。いくつかの実施形態では、ＭＨＣクラスＩＩα１ドメインとＭＨＣクラスＩＩα２ドメインは、ＨＬＡ−ＤＲ、ＨＬＡ−ＤＱまたはＨＬＡ−ＤＰ等のヒト白血球抗原（ＨＬＡ）分子に由来する。特定の実施形態では、ＭＨＣクラスＩＩα１ドメインとＭＨＣクラスＩＩα２ドメインは、ＤＲＡ、ＤＱＡ１またはＤＰＡ１に由来する。いくつかの実施形態では、ＭＨＣクラスＩＩα１ドメインまたはＭＨＣクラスＩＩα２ドメインは、ＤＲＡ、ＤＱＡ１またはＤＰＡ１に由来する。
【０１８５】
他の態様において、本明細書で提供されるのは、ＭＨＣクラスＩＩβ１ドメイン、ＭＨＣクラスＩＩβ２ドメイン、またはそれらの組み合わせ；および少なくとも設計された隆起を含むポリペプチドである。いくつかの実施形態では、ＭＨＣクラスＩＩβ１ドメインとＭＨＣクラスＩＩβ２ドメインは、ＨＬＡ−ＤＲ、ＨＬＡ−ＤＱまたはＨＬＡ−ＤＰ等のヒト白血球抗原（ＨＬＡ）分子に由来する。特定の実施形態では、ＭＨＣクラスＩＩβ１ドメインとＭＨＣクラスＩＩβ２は、ＨＬＡ−ＤＲＢ１、ＨＬＡ−ＤＲＢ３、ＨＬＡ−ＤＲＢ４、ＨＬＡ−ＤＲＢ５、ＨＬＡ−ＤＱＢ１またはＨＬＡ−ＤＰＢ１に由来する。いくつかの実施形態において、ＭＨＣクラスＩＩβ１ドメインまたはＭＨＣクラスＩＩβ２は、ＨＬＡ−ＤＲＢ１、ＨＬＡ−ＤＲＢ３、ＨＬＡ−ＤＲＢ４、ＨＬＡ−ＤＲＢ５、ＨＬＡ−ＤＱＢ１またはＨＬＡ−ＤＰＢ１に由来する。
【０１８６】
他の態様において、本明細書で提供されるのは、ＭＨＣクラスＩＩα１ドメイン、ＭＨＣクラスＩＩα２ドメイン、またはそれらの組み合わせ；および少なくとも１つの設計された腔を含むポリペプチドである。
【０１８７】
他の態様において、本明細書で提供されるのは、ＭＨＣクラスＩＩβ１ドメイン、ＭＨＣクラスＩＩβ２ドメイン、またはそれらの組み合わせ；および少なくとも１つの設計された腔を含むポリペプチドである。
【０１８８】
他の態様において、本明細書で提供されるのは、ＭＨＣクラスＩＩα１ドメインおよびＭＨＣクラスＩＩα２ドメイン；および少なくとも設計された隆起を含むポリペプチドである。
【０１８９】
他の態様において、本明細書で提供されるのは、ＭＨＣクラスＩＩβ１ドメインおよびＭＨＣクラスＩＩβ２ドメイン；および少なくとも設計された隆起を含むポリペプチドである。
【０１９０】
他の態様において、本明細書で提供されるのは、ＭＨＣクラスＩＩα１ドメインおよびＭＨＣクラスＩＩα２ドメイン；および少なくとも１つの設計された腔を含むポリペプチドである。
【０１９１】
他の態様において、本明細書で提供されるのは、ＭＨＣクラスＩＩβ１ドメインおよびＭＨＣクラスＩＩβ２ドメイン；および少なくとも１つの設計された腔を含むポリペプチドである。
【０１９２】
いくつかの実施形態では、ポリペプチドはＣ−末端システイン残基をさらに含む。いくつかの実施形態では、ポリペプチドはビオチン化部位をさらに含む。いくつかの実施形態では、ポリペプチドはＳｔｒｅｐ  ｔａｇをさらに含む。
【０１９３】
いくつかの実施形態において、本明細書に記載のポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１−２６、６４、または６５のいずれか１つを含むＤＮＡ塩基配列によってコードされる。いくつかの実施形態において、ポリペプチドはＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１を含むＤＮＡ塩基配列によってコードされる。いくつかの実施形態において、ポリペプチドはＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２を含むＤＮＡ塩基配列によってコードされる。いくつかの実施形態において、ポリペプチドはＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：３を含むＤＮＡ塩基配列によってコードされる。いくつかの実施形態において、ポリペプチドはＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：４を含むＤＮＡ塩基配列によってコードされる。いくつかの実施形態において、ポリペプチドはＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２５を含むＤＮＡ塩基配列によってコードされる。いくつかの実施形態において、ポリペプチドはＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２６を含むＤＮＡ塩基配列によってコードされる。
【０１９４】
いくつかの実施形態において、本明細書で提供されるポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１−８のいずれか１つによってコードされる。いくつかの実施形態において、ポリペプチドはＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１によってコードされる。いくつかの実施形態において、ポリペプチドはＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２によってコードされる。いくつかの実施形態において、ポリペプチドはＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：３によってコードされる。いくつかの実施形態において、ポリペプチドはＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：４によってコードされる。いくつかの実施形態において、本明細書で提供されるポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：５−６のいずれか１つによってコードされる。いくつかの実施形態において、本明細書で提供されるポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１−８のいずれか１つによってコードされる。
【０１９５】
いくつかの実施形態では、ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１−２６、６４または６５のいずれか１つと少なくとも８０％の同一性を有するＤＮＡ塩基配列を含むＤＮＡ塩基配列によってコードされる。これは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１−８のいずれか１つとの、少なくとも８１、８２、８３、８４、８５、８６、８７、８８、８９、９０、９１、９２、９３、９４、９５、９６、９７、９８、または９９％の同一性を含む。いくつかの実施形態において、ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１−２６、６４、または６５のいずれか１つと、少なくとも８０、８１、８２、８３、８４、８５、８６、８７、８８、８９、９０、９１、９２、９３、９４、９５、９６、９７、９８または９９％の同一性を有するＤＮＡ塩基配列を含むＤＮＡ塩基配列によってコードされる。いくつかの実施形態において、ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１と、少なくとも８０、８１、８２、８３、８４、８５、８６、８７、８８、８９、９０、９１、９２、９３、９４、９５、９６、９７、９８または９９％の同一性を有するＤＮＡ塩基配列を含むＤＮＡ塩基配列によってコードされる。いくつかの実施形態において、ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２と、少なくとも８０、８１、８２、８３、８４、８５、８６、８７、８８、８９、９０、９１、９２、９３、９４、９５、９６、９７、９８または９９％の同一性を有するＤＮＡ塩基配列を含むＤＮＡ塩基配列によってコードされる。いくつかの実施形態において、ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：３と、少なくとも８０、８１、８２、８３、８４、８５、８６、８７、８８、８９、９０、９１、９２、９３、９４、９５、９６、９７、９８または９９％の同一性を有するＤＮＡ塩基配列を含むＤＮＡ塩基配列によってコードされる。いくつかの実施形態において、ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：４と、少なくとも８０、８１、８２、８３、８４、８５、８６、８７、８８、８９、９０、９１、９２、９３、９４、９５、９６、９７、９８または９９％の同一性を有するＤＮＡ塩基配列を含むＤＮＡ塩基配列によってコードされる。いくつかの実施形態において、ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：５−６のいずれか１つと、少なくとも８０、８１、８２、８３、８４、８５、８６、８７、８８、８９、９０、９１、９２、９３、９４、９５、９６、９７、９８または９９％の同一性を有するＤＮＡ塩基配列を含むＤＮＡ塩基配列によってコードされる。いくつかの実施形態において、ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：５−８のいずれか１つと、少なくとも８０、８１、８２、８３、８４、８５、８６、８７、８８、８９、９０、９１、９２、９３、９４、９５、９６、９７、９８または９９％の同一性を有するＤＮＡ塩基配列を含むＤＮＡ塩基配列によってコードされる。
【０１９６】
いくつかの実施形態では、ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１−２６、６４または６５のいずれか１つと少なくとも８５％の同一性を有するＤＮＡ塩基配列を含むＤＮＡ塩基配列によってコードされる。いくつかの実施形態では、ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１と少なくとも８５％の同一性を有するＤＮＡ塩基配列を含むＤＮＡ塩基配列によってコードされる。いくつかの実施形態では、ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２と少なくとも８５％の同一性を有するＤＮＡ塩基配列を含むＤＮＡ塩基配列によってコードされる。いくつかの実施形態では、ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：３と少なくとも８５％の同一性を有するＤＮＡ塩基配列を含むＤＮＡ塩基配列によってコードされる。いくつかの実施形態では、ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：４と少なくとも８５％の同一性を有するＤＮＡ塩基配列を含むＤＮＡ塩基配列によってコードされる。いくつかの実施形態では、ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：５−６のいずれか１つと少なくとも８５％の同一性を有するＤＮＡ塩基配列を含むＤＮＡ塩基配列によってコードされる。いくつかの実施形態では、ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：５−８のいずれか１つと少なくとも８５％の同一性を有するＤＮＡ塩基配列を含むＤＮＡ塩基配列によってコードされる。
【０１９７】
いくつかの実施形態では、ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：５−８のいずれか１つと少なくとも９０％の同一性を有するＤＮＡ塩基配列を含むＤＮＡ塩基配列によってコードされる。いくつかの実施形態では、ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１と少なくとも９０％の同一性を有するＤＮＡ塩基配列を含むＤＮＡ塩基配列によってコードされる。いくつかの実施形態では、ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２と少なくとも９０％の同一性を有するＤＮＡ塩基配列を含むＤＮＡ塩基配列によってコードされる。いくつかの実施形態では、ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：３と少なくとも９０％の同一性を有するＤＮＡ塩基配列を含むＤＮＡ塩基配列によってコードされる。いくつかの実施形態では、ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：４と少なくとも９０％の同一性を有するＤＮＡ塩基配列を含むＤＮＡ塩基配列によってコードされる。いくつかの実施形態では、ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：５−６のいずれか１つと少なくとも９０％の同一性を有するＤＮＡ塩基配列を含むＤＮＡ塩基配列によってコードされる。いくつかの実施形態では、ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：５−８のいずれか１つと少なくとも９０％の同一性を有するＤＮＡ塩基配列を含むＤＮＡ塩基配列によってコードされる。
【０１９８】
いくつかの実施形態では、ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１−２６、６４または６５のいずれか１つと少なくとも９５％の同一性を有するＤＮＡ塩基配列を含むＤＮＡ塩基配列によってコードされる。いくつかの実施形態では、ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１と少なくとも９５％の同一性を有するＤＮＡ塩基配列を含むＤＮＡ塩基配列によってコードされる。いくつかの実施形態では、ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２と少なくとも９５％の同一性を有するＤＮＡ塩基配列を含むＤＮＡ塩基配列によってコードされる。いくつかの実施形態では、ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：３と少なくとも９５％の同一性を有するＤＮＡ塩基配列を含むＤＮＡ塩基配列によってコードされる。いくつかの実施形態では、ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：４と少なくとも９５％の同一性を有するＤＮＡ塩基配列を含むＤＮＡ塩基配列によってコードされる。いくつかの実施形態では、ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：５−６のいずれか１つと少なくとも９５％の同一性を有するＤＮＡ塩基配列を含むＤＮＡ塩基配列によってコードされる。いくつかの実施形態では、ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：５−８のいずれか１つと少なくとも９５％の同一性を有するＤＮＡ塩基配列を含むＤＮＡ塩基配列によってコードされる。
【０１９９】
いくつかの実施形態において、本明細書で提供されるポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２７−６３のいずれか１つのアミノ酸配列、またはそれらのフラグメントを含むポリペプチドである。いくつかの実施形態において、ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：３５−５０のアミノ酸配列、またはそれらのフラグメントを含む。いくつかの実施形態において、ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：５１のアミノ酸配列、またはそれらのフラグメントを含む。いくつかの実施形態において、ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：５２のアミノ酸配列、またはそれらのフラグメントを含む。いくつかの実施形態において、ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：５３のアミノ酸配列、またはそれらのフラグメントを含む。いくつかの実施形態において、ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：５４のアミノ酸配列、またはそれらのフラグメントを含む。いくつかの実施形態において、ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：５５−５９のアミノ酸配列、またはそれらのフラグメントを含む。本明細書で使用されるように、アミノ酸配列またはポリペプチドの「フラグメント」は、少なくとも５つのアミノ酸を含む。いくつかの実施形態において、フラグメントは、ＭＨＣクラスＩＩα１ドメイン、ＭＨＣクラスＩＩα２ドメイン、またはそれらの組み合わせを含む。いくつかの実施形態において、フラグメントは、ＭＨＣクラスＩＩα１ドメイン、ＭＨＣクラスＩＩα２ドメイン、本明細書に記載の設計された隆起、またはそれらの組み合わせを含む。いくつかの実施形態において、フラグメントは、ＭＨＣクラスＩＩα１ドメイン、ＭＨＣクラスＩＩα２ドメイン、本明細書に記載の設計された腔、またはそれらの組み合わせを含む。いくつかの実施形態において、フラグメントは、ＭＨＣクラスＩＩβ１ドメイン、ＭＨＣクラスＩＩβ２ドメイン、本明細書に記載の設計された隆起、またはそれらの組み合わせを含む。いくつかの実施形態において、フラグメントは、ＭＨＣクラスＩＩβ１ドメイン、ＭＨＣクラスＩＩβ２ドメイン、本明細書に記載の設計された腔、またはそれらの組み合わせを含む。
【０２００】
いくつかの実施形態において、フラグメントは、ＭＨＣクラスＩＩα１ドメイン、ＭＨＣクラスＩＩα２ドメイン、および本明細書に記載の設計された隆起を含む。いくつかの実施形態において、フラグメントは、ＭＨＣクラスＩＩα１ドメイン、ＭＨＣクラスＩＩα２ドメイン、および本明細書に記載の設計された腔を含む。いくつかの実施形態において、フラグメントは、ＭＨＣクラスＩＩβ１ドメイン、ＭＨＣクラスＩＩβ２ドメイン、および本明細書に記載の設計された隆起を含む。いくつかの実施形態において、フラグメントは、ＭＨＣクラスＩＩβ１ドメイン、ＭＨＣクラスＩＩβ２ドメイン、および本明細書に記載の設計された腔を含む。
【０２０１】
いくつかの実施形態において、本明細書に記載のポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２７−６３のいずれか１つのアミノ酸配列と少なくとも８０％の同一性を有するアミノ酸配列、またはそれらのフラグメントを含む。これは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２７−６３のいずれか１つとの、少なくとも８１、８２、８３、８４、８５、８６、８７、８８、８９、９０、９１、９２、９３、９４、９５、９６、９７、９８、または９９％の同一性を含む。いくつかの実施形態において、ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：３５−５０のいずれか１つのアミノ酸配列と、少なくとも８０、８１、８２、８３、８４、８５、８６、８７、８８、８９、９０、９１、９２、９３、９４、９５、９６、９７、９８または９９％の同一性を有するアミノ酸配列、またはそれらのフラグメントを含む。いくつかの実施形態において、ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：５１のアミノ酸配列と、少なくとも８０、８１、８２、８３、８４、８５、８６、８７、８８、８９、９０、９１、９２、９３、９４、９５、９６、９７、９８または９９％の同一性を有するアミノ酸配列、またはそれらのフラグメントを含む。いくつかの実施形態において、ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：５２のアミノ酸配列と、少なくとも８０、８１、８２、８３、８４、８５、８６、８７、８８、８９、９０、９１、９２、９３、９４、９５、９６、９７、９８または９９％の同一性を有するアミノ酸配列、またはそれらのフラグメントを含む。いくつかの実施形態において、ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：５３のアミノ酸配列と、少なくとも８０、８１、８２、８３、８４、８５、８６、８７、８８、８９、９０、９１、９２、９３、９４、９５、９６、９７、９８または９９％の同一性を有するアミノ酸配列、またはそれらのフラグメントを含む。いくつかの実施形態において、ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：５４のアミノ酸配列と、少なくとも８０、８１、８２、８３、８４、８５、８６、８７、８８、８９、９０、９１、９２、９３、９４、９５、９６、９７、９８または９９％の同一性を有するアミノ酸配列、またはそれらのフラグメントを含む。いくつかの実施形態において、本明細書で提供されるポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：５５−５９のいずれか１つのアミノ酸配列と、少なくとも８０、８１、８２、８３、８４、８５、８６、８７、８８、８９、９０、９１、９２、９３、９４、９５、９６、９７、９８または９９％の同一性を有するアミノ酸配列、またはそれらのフラグメントを含む。
【０２０２】
いくつかの実施形態において、本明細書で提供されるポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２７−６３のいずれか１つのアミノ酸配列と少なくとも８５％の同一性を有するアミノ酸配列、またはそれらのフラグメントを含む。いくつかの実施形態において、本明細書で提供されるポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：３５−５０のいずれか１つのアミノ酸配列と少なくとも８５％の同一性を有するアミノ酸配列、またはそれらのフラグメントを含む。いくつかの実施形態において、ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：５１のアミノ酸配列と少なくとも８５％の同一性を有するアミノ酸配列、またはそれらのフラグメントを含む。いくつかの実施形態において、ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：５２のアミノ酸配列と少なくとも８５％の同一性を有するアミノ酸配列、またはそれらのフラグメントを含む。いくつかの実施形態において、ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：５３のアミノ酸配列と少なくとも８５％の同一性を有するアミノ酸配列、またはそれらのフラグメントを含む。いくつかの実施形態において、ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：５４のアミノ酸配列と少なくとも８５％の同一性を有するアミノ酸配列、またはそれらのフラグメントを含む。いくつかの実施形態において、本明細書で提供されるポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：５５−５９のいずれか１つのアミノ酸配列と少なくとも８５％の同一性を有するアミノ酸配列、またはそれらのフラグメントを含む。
【０２０３】
いくつかの実施形態において、本明細書で提供されるポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２７−６３のいずれか１つのアミノ酸配列と少なくとも９０％の同一性を有するアミノ酸配列、またはそれらのフラグメントを含む。いくつかの実施形態において、本明細書で提供されるポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：３５−５０のいずれか１つのアミノ酸配列と少なくとも９０％の同一性を有するアミノ酸配列、またはそれらのフラグメントを含む。いくつかの実施形態において、ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：５１のアミノ酸配列と少なくとも９０％の同一性を有するアミノ酸配列、またはそれらのフラグメントを含む。いくつかの実施形態において、ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：５２のアミノ酸配列と少なくとも９０％の同一性を有するアミノ酸配列、またはそれらのフラグメントを含む。いくつかの実施形態において、ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：５３のアミノ酸配列と少なくとも９０％の同一性を有するアミノ酸配列、またはそれらのフラグメントを含む。いくつかの実施形態において、ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：５４のアミノ酸配列と少なくとも９０％の同一性を有するアミノ酸配列、またはそれらのフラグメントを含む。いくつかの実施形態において、本明細書で提供されるポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：５５−５９のいずれか１つのアミノ酸配列と少なくとも９０％の同一性を有するアミノ酸配列、またはそれらのフラグメントを含む。
【０２０４】
いくつかの実施形態において、本明細書で提供されるポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２７−６３のいずれか１つのアミノ酸配列と少なくとも９５％の同一性を有するアミノ酸配列、またはそれらのフラグメントを含む。いくつかの実施形態において、本明細書で提供されるポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：３５−５０のいずれか１つのアミノ酸配列と少なくとも９５％の同一性を有するアミノ酸配列、またはそれらのフラグメントを含む。いくつかの実施形態において、ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：５１のアミノ酸配列と少なくとも９５％の同一性を有するアミノ酸配列、またはそれらのフラグメントを含む。いくつかの実施形態において、ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：５２のアミノ酸配列と少なくとも９５％の同一性を有するアミノ酸配列、またはそれらのフラグメントを含む。いくつかの実施形態において、ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：５３のアミノ酸配列と少なくとも９５％の同一性を有するアミノ酸配列、またはそれらのフラグメントを含む。いくつかの実施形態において、ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：５４のアミノ酸配列と少なくとも９５％の同一性を有するアミノ酸配列、またはそれらのフラグメントを含む。いくつかの実施形態において、本明細書で提供されるポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：５５−５９のいずれか１つのアミノ酸配列と少なくとも９５％の同一性を有するアミノ酸配列、またはそれらのフラグメントを含む。
【０２０５】
いくつかの実施形態において、本明細書で提供されるポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：６０−６１のいずれか１つのアミノ酸配列、またはそれらのフラグメントを含むポリペプチドである。いくつかの実施形態において、ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：６０−６１のいずれか１つのアミノ酸配列と、少なくとも８０、８１、８２、８３、８４、８５、８６、８７、８８、８９、９０、９１、９２、９３、９４、９５、９６、９７、９８または９９％の同一性を有するアミノ酸配列、またはそれらのフラグメントを含む。
【０２０６】
いくつかの実施形態において、本明細書に記載される４つ以上のポリペプチドが、多量体を形成するためにポリマー骨格に共有結合で付けられる。いくつかの実施形態では、ポリマー骨格はデキストランまたはポリエチレングリコールである。いくつかの実施形態では、ポリペプチドの各々は、各ポリペプチド上の末端システイン残基を介してポリマー骨格に付けられる。いくつかの実施形態では、ポリペプチドの各々は、各ポリペプチド上のビオチン化部位を介してポリマー骨格に付けられる。
【０２０７】
いくつかの実施形態において、４つ以上のポリペプチドが、多量体を形成するためにアビジンに共有結合で付けられる。
【０２０８】
＜隆起および／または腔＞
いくつかの実施形態では、ポリペプチドは設計された隆起を含む。いくつかの実施形態では、隆起は１つ以上の非天然のアミノ酸残基を含む。いくつかの実施形態では、隆起は１つ以上の天然のアミノ酸残基を含む。いくつかの実施形態では、隆起は、フェニルアラニン、アルギニン、チロシン、トリプトファン、およびシステインから選択される１つ以上のアミノ酸を含む。いくつかの実施形態では、隆起はフェニルアラニン残基を含む。いくつかの実施形態では、隆起はアルギニン残基を含む。いくつかの実施形態では、隆起はチロシン残基を含む。いくつかの実施形態では、隆起はトリプトファン残基を含む。いくつかの実施形態では、隆起はシステイン残基を含む。いくつかの実施形態では、隆起は、システイン残基とトリプトファン残基を含む。
【０２０９】
いくつかの実施形態では、ポリペプチドは設計された腔を含む。いくつかの実施形態では、腔は１つ以上の非天然のアミノ酸残基を含む。いくつかの実施形態では、腔は１つ以上の天然のアミノ酸残基を含む。いくつかの実施形態では、腔は、アラニン、セリン、トレオニン、バリン、およびシステインから選択される１つ以上のアミノ酸を含む。いくつかの実施形態では、腔はアラニン残基を含む。いくつかの実施形態では、腔はセリン残基を含む。いくつかの実施形態では、腔はトレオニン残基を含む。いくつかの実施形態では、腔はバリン残基を含む。いくつかの実施形態では、腔はシステイン残基を含む。いくつかの実施形態において、腔はシステイン残基、セリン残基、アラニン残基、およびバリン残基を含む。
【０２１０】
いくつかの実施形態において、隆起または腔は、ポリペプチド上のＭＨＣクラスＩＩドメインにはない。いくつかの実施形態において、隆起または腔は、ポリペプチド上のＣＨ３抗体の定常ドメインに位置する。いくつかの実施形態において、隆起はポリペプチド上のＣＨ３抗体の定常ドメインに位置する。いくつかの実施形態において、腔はポリペプチド上のＣＨ３抗体の定常ドメインに位置する。
【０２１１】
特定の実施形態では、腔は、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２５に記載のヌクレオチド配列と少なくとも８０％の同一性を有するヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、腔は、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２５に記載のヌクレオチド配列と少なくとも８５％の同一性を有するヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、腔は、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２５に記載のヌクレオチド配列と少なくとも９０％の同一性を有するヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、腔は、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２５に記載のヌクレオチド配列と少なくとも９５％の同一性を有するヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、腔は、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２５に記載のヌクレオチド配列と少なくとも９８％の同一性を有するヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、腔は、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２５に記載のヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施形態において、腔は、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２５に記載のヌクレオチド配列と、少なくとも８１、８２、８３、８４、８５、８６、８７、８８、８９、９０、９１、９２、９３、９４、９５、９６、９７、９８、または９９％の同一性を有するヌクレオチド配列を含む。
【０２１２】
特定の実施形態では、腔は、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：５１に記載のアミノ酸配列と少なくとも８０％の同一性を有するアミノ酸配列を含む。特定の実施形態では、腔は、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：５１に記載のアミノ酸配列と少なくとも８５％の同一性を有するアミノ酸配列を含む。特定の実施形態では、腔は、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：５１に記載のアミノ酸配列と少なくとも９０％の同一性を有するアミノ酸配列を含む。特定の実施形態では、腔は、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：５１に記載のアミノ酸配列と少なくとも９５％の同一性を有するアミノ酸配列を含む。特定の実施形態では、腔は、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：５１に記載のアミノ酸配列と少なくとも９８％の同一性を有するアミノ酸配列を含む。特定の実施形態では、腔は、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：５１に記載のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態において、腔は、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：５１に記載のアミノ酸配列と、少なくとも８１、８２、８３、８４、８５、８６、８７、８８、８９、９０、９１、９２、９３、９４、９５、９６、９７、９８、または９９％の同一性を有するヌクレオチド配列を含む。
【０２１３】
特定の実施形態では、腔は、免疫グロブリン分子のＣＨ２またはＣＨ３ドメインの中へ設計される。特定の実施形態では、腔は、免疫グロブリン分子のＣＨ３ドメインの中へと設計される。特定の実施形態では、腔は、免疫グロブリン分子のＣＨ３ドメインの中へと設計され、およびＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：５２に記載のアミノ酸配列と少なくとも８０％の同一性を有するアミノ酸配列を含む。特定の実施形態では、腔は、免疫グロブリン分子のＣＨ３ドメインの中へと設計され、およびＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：５２に記載のアミノ酸配列と少なくとも９０％の同一性を有するアミノ酸配列を含む。特定の実施形態では、腔は、免疫グロブリン分子のＣＨ３ドメインの中へと設計され、およびＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：５２に記載のアミノ酸配列と少なくとも９５％の同一性を有するアミノ酸配列を含む。特定の実施形態では、腔は、免疫グロブリン分子のＣＨ３ドメインの中へと設計され、およびＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：５２に記載のアミノ酸配列と少なくとも９８％の同一性を有するアミノ酸配列を含む。特定の実施形態では、腔は、免疫グロブリン分子のＣＨ３ドメインの中へと設計され、およびＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：５２に記載のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態において、腔は、免疫グロブリン分子のＣＨ３ドメインの中へと設計され、およびＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：５２に記載のアミノ酸配列と、少なくとも８１、８２、８３、８４、８５、８６、８７、８８、８９、９０、９１、９２、９３、９４、９５、９６、９７、９８、または９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含む。
【０２１４】
特定の実施形態では、隆起は、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２６に記載のヌクレオチド配列と少なくとも８０％の同一性を有するヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、隆起は、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２６に記載のヌクレオチド配列と少なくとも８０％の同一性を有するヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、隆起は、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２６に記載のヌクレオチド配列と少なくとも９０％の同一性を有するヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、隆起は、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２６に記載のヌクレオチド配列と少なくとも９５％の同一性を有するヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、隆起は、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２６に記載のヌクレオチド配列と少なくとも９８％の同一性を有するヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、隆起は、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２６に記載のヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施形態では、隆起は、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２６に記載のヌクレオチド配列と、少なくとも８１、８２、８３、８４、８５、８６、８７、８８、８９、９０、９１、９２、９３、９４、９５、９６、９７、９８、または９９％の同一性を有するヌクレオチド配列を含む。
【０２１５】
特定の実施形態では、隆起は、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：５３に記載のアミノ酸配列と少なくとも８０％の同一性を有するアミノ酸配列を含む。特定の実施形態では、隆起は、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：５３に記載のアミノ酸配列と少なくとも８０％の同一性を有するアミノ酸配列を含む。特定の実施形態では、隆起は、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：５３に記載のアミノ酸配列と少なくとも９０％の同一性を有するアミノ酸配列を含む。特定の実施形態では、隆起は、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：５３に記載のアミノ酸配列と少なくとも９５％の同一性を有するアミノ酸配列を含む。特定の実施形態では、隆起は、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：５３に記載のアミノ酸配列と少なくとも９８％の同一性を有するアミノ酸配列を含む。特定の実施形態では、隆起は、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：５３に記載のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態において、隆起は、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：５３に記載のアミノ酸配列と、少なくとも８１、８２、８３、８４、８５、８６、８７、８８、８９、９０、９１、９２、９３、９４、９５、９６、９７、９８、または９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含む。
【０２１６】
特定の実施形態では、隆起は、免疫グロブリン分子のＣＨ２またはＣＨ３ドメインの中へと設計される。特定の実施形態では、隆起は、免疫グロブリン分子のＣＨ３ドメインの中へと設計される。特定の実施形態では、隆起は、免疫グロブリン分子のＣＨ３ドメインの中へと設計され、およびＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：５４に記載のアミノ酸配列と少なくとも８０％の同一性を有するアミノ酸配列を含む。特定の実施形態では、隆起は、免疫グロブリン分子のＣＨ３ドメインの中へと設計され、およびＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：５４に記載のアミノ酸配列と少なくとも９０％の同一性を有するアミノ酸配列を含む。特定の実施形態では、隆起は、免疫グロブリン分子のＣＨ３ドメインの中へと設計され、およびＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：５４に記載のアミノ酸配列と少なくとも９５％の同一性を有するアミノ酸配列を含む。特定の実施形態では、隆起は、免疫グロブリン分子のＣＨ３ドメインの中へと設計され、およびＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：５４に記載のアミノ酸配列と少なくとも９８％の同一性を有するアミノ酸配列を含む。特定の実施形態では、隆起は、免疫グロブリン分子のＣＨ３ドメインの中へと設計され、およびＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：５４に記載のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態において、隆起は、免疫グロブリン分子のＣＨ３ドメインの中へと設計され、およびＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：５４に記載のアミノ酸配列と、少なくとも８１、８２、８３、８４、８５、８６、８７、８８、８９、９０、９１、９２、９３、９４、９５、９６、９７、９８、または９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含む。
【０２１７】
隆起と腔は、ＭＨＣクラスＩＩアルファまたはベータのドメインいずれかに融合されたＩｇＧ１のＣＨ３ドメインにおける特定の突然変異によって設計することができる。特定の実施形態では、隆起は、ＩｇＧ１分子のＣＨ３領域におけるＳ３５４Ｃ突然変異（ＥＵの抗体番号付けスキーム）を含む。特定の実施形態では、隆起は、ＩｇＧ１分子のＣＨ３領域におけるＴ３６６Ｗ突然変異（ＥＵの抗体番号付けスキーム）を含む。特定の実施形態では、隆起は、ＩｇＧ１分子のＣＨ３領域におけるＳ３５４ＣおよびＴ３６６Ｗ突然変異（ＥＵの抗体番号付けスキーム）を含む。特定の実施形態では、隆起は、ＩｇＧ１分子のＣＨ３領域におけるＳ３５４ＣおよびＴ３６６Ｗ突然変異（ＥＵの抗体番号付けスキーム）を含む。特定の実施形態では、隆起は、ＩｇＧ１分子のＣＨ３領域におけるＳ３５４ＣおよびＴ３６６Ｗ突然変異（ＥＵの抗体番号付けスキーム）から成る。特定の実施形態では、腔は、ＩｇＧ１分子のＣＨ３領域におけるＹ３４９Ｃ突然変異（ＥＵの抗体番号付けスキーム）を含む。特定の実施形態では、腔は、ＩｇＧ１分子のＣＨ３領域におけるＴ３６６Ｓ突然変異（ＥＵの抗体番号付けスキーム）を含む。特定の実施形態では、腔は、ＩｇＧ１分子のＣＨ３領域におけるＬ３６８Ａ突然変異（ＥＵの抗体番号付けスキーム）を含む。特定の実施形態では、腔は、ＩｇＧ１分子のＣＨ３領域におけるＹ４０７Ｖ突然変異（ＥＵの抗体番号付けスキーム）を含む。特定の実施形態では、腔は、ＩｇＧ１分子のＣＨ３領域におけるＹ３４９Ｃ、Ｔ３６６Ｓ、Ｌ３６８Ａ、およびＹ４０７Ｖ突然変異（ＥＵの抗体番号付けスキーム）を含む。特定の実施形態では、腔は、ＩｇＧ１分子のＣＨ３領域におけるＹ３４９Ｃ、Ｔ３６６Ｓ、Ｌ３６８Ａ、およびＹ４０７Ｖ突然変異（ＥＵの抗体番号付けスキーム）から成る。
【０２１８】
一実施形態において、単離されたヘテロダイマーは、少なくとも１つの第１のポリペプチドと少なくとも１つの第２のポリペプチドを含み、ここで第１のポリペプチドと第２のポリペプチドは界面で出会い、第１のポリペプチドの界面は、第２のポリペプチドの界面にある設計された腔に配置することができる設計された隆起を含み；および（ｉ）第１のポリペプチドはＭＨＣクラスＩＩα１ドメイン、ＭＨＣクラスＩＩα２ドメイン、ＩｇＧ  ＣＨ２ドメイン、およびＩｇＧ  ＣＨ３ドメインを含み、ここで隆起はＩｇＧ  ＣＨ３ドメインの突然変異によって形成され、および（ｉｉ）第２のポリペプチドは、ＭＨＣクラスＩＩβ１ドメイン、ＭＨＣクラスＩＩβ２ドメイン、ＩｇＧ  ＣＨ２ドメイン、およびＩｇＧ  ＣＨ３ドメインを含み、ここで腔はＩｇＧ  ＣＨ３ドメインの突然変異によって形成される。
【０２１９】
一実施形態において、単離されたヘテロダイマーは、少なくとも１つの第１のポリペプチドと少なくとも１つの第２のポリペプチドを含み、ここで第１のポリペプチドと第２のポリペプチドは界面で出会い、第１のポリペプチドの界面は、第２のポリペプチドの界面にある設計された腔に配置することができる設計された隆起を含み；および（ｉ）第１のポリペプチドはＭＨＣクラスＩＩβドメイン、ＭＨＣクラスＩＩβ２ドメイン、ＩｇＧ  ＣＨ２ドメイン、およびＩｇＧ  ＣＨ３ドメインを含み、ここで隆起はＩｇＧ  ＣＨ３ドメインの突然変異によって形成され；および（ｉｉ）第２のポリペプチドは、ＭＨＣクラスＩＩα１ドメイン、ＭＨＣクラスＩＩα２ドメイン、ＩｇＧ  ＣＨ２ドメイン、およびＩｇＧ  ＣＨ３ドメインを含み、ここで腔はＩｇＧ  ＣＨ３ドメインの突然変異によって形成される。
【０２２０】
一実施形態において、単離されたヘテロダイマーは、少なくとも１つの第１のポリペプチドと少なくとも１つの第２のポリペプチドを含み、ここで第１のポリペプチドと第２のポリペプチドは界面で出会い、第１のポリペプチドの界面は、第２のポリペプチドの界面にある設計された腔に配置することができる設計された隆起を含み；および（ｉ）第１のポリペプチドはＭＨＣクラスＩＩα１ドメイン、ＭＨＣクラスＩＩα２ドメイン、ＩｇＧ  ＣＨ２ドメイン、およびＩｇＧ  ＣＨ３ドメインを含み、ここで隆起はＳ３５４ＣとＴ３６６Ｗ（ＥＵの番号付け）に対応するＩｇＧ  ＣＨ３ドメインの突然変異によって形成され；および（ｉｉ）第２のポリペプチドは、ＭＨＣクラスＩＩβ１ドメイン、ＭＨＣクラスＩＩβ２ドメイン、ＩｇＧ  ＣＨ２ドメイン、およびＩｇＧ  ＣＨ３ドメインを含み、ここで腔はＹ３４９Ｃ、Ｔ３６６Ｓ、Ｌ３６８Ａ、およびＹ４０７Ｖ（ＥＵの番号付け）に対応するＩｇＧ  ＣＨ３ドメインの突然変異によって形成される。
【０２２１】
一実施形態において、単離されたヘテロダイマーは、少なくとも１つの第１のポリペプチドと少なくとも１つの第２のポリペプチドを含み、ここで第１のポリペプチドと第２のポリペプチドは界面で出会い、第１のポリペプチドの界面は、第２のポリペプチドの界面にある設計された腔に配置することができる設計された隆起を含み；および（ｉ）第１のポリペプチドはＭＨＣクラスＩＩβ１ドメイン、ＭＨＣクラスＩＩβ２ドメイン、ＩｇＧ  ＣＨ２ドメイン、およびＩｇＧ  ＣＨ３ドメインを含み、ここで隆起はＳ３５４ＣとＴ３６６Ｗ（ＥＵの番号付け）に対応するＩｇＧ  ＣＨ３ドメインの突然変異によって形成され；および（ｉｉ）第２のポリペプチドは、ＭＨＣクラスＩＩα１ドメイン、ＭＨＣクラスＩＩα２ドメイン、ＩｇＧ  ＣＨ２ドメイン、およびＩｇＧ  ＣＨ３ドメインを含み、ここで腔はＹ３４９Ｃ、Ｔ３６６Ｓ、Ｌ３６８Ａ、およびＹ４０７Ｖ（ＥＵの番号付け）に対応するＩｇＧ  ＣＨ３ドメインの突然変異によって形成される。
【０２２２】
一実施形態において、単離されたヘテロダイマーは、少なくとも１つの第１のポリペプチドと少なくとも１つの第２のポリペプチドを含み、ここで第１のポリペプチドと第２のポリペプチドは界面で出会い、第１のポリペプチドの界面は、第２のポリペプチドの界面にある設計された腔に配置することができる設計された隆起を含み；および（ｉ）第１のポリペプチドはＭＨＣクラスＩＩα１ドメイン、ＭＨＣクラスＩＩα２ドメイン、ＩｇＧ  ＣＨ２ドメイン、およびＩｇＧ  ＣＨ３ドメインから成り、ここで隆起はＩｇＧ  ＣＨ３ドメインの突然変異によって形成され、および（ｉｉ）第２のポリペプチドは、ＭＨＣクラスＩＩβ１ドメイン、ＭＨＣクラスＩＩβ２ドメイン、ＩｇＧ  ＣＨ２ドメイン、およびＩｇＧ  ＣＨ３ドメインから成り、ここで腔はＩｇＧ  ＣＨ３ドメインの突然変異によって形成される。
【０２２３】
一実施形態において、単離されたヘテロダイマーは、少なくとも１つの第１のポリペプチドと少なくとも１つの第２のポリペプチドを含み、ここで第１のポリペプチドと第２のポリペプチドは界面で出会い、第１のポリペプチドの界面は、第２のポリペプチドの界面にある設計された腔に配置することができる設計された隆起を含み；および（ｉ）第１のポリペプチドはＭＨＣクラスＩＩβドメイン、ＭＨＣクラスＩＩβ２ドメイン、ＩｇＧ  ＣＨ２ドメイン、およびＩｇＧ  ＣＨ３ドメインから成り、ここで隆起はＩｇＧ  ＣＨ３ドメインの突然変異によって形成され；および（ｉｉ）第２のポリペプチドは、ＭＨＣクラスＩＩα１ドメイン、ＭＨＣクラスＩＩα２ドメイン、ＩｇＧ  ＣＨ２ドメイン、およびＩｇＧ  ＣＨ３ドメインから成り、ここで腔はＩｇＧ  ＣＨ３ドメインの突然変異によって形成される。
【０２２４】
一実施形態において、単離されたヘテロダイマーは、少なくとも１つの第１のポリペプチドと少なくとも１つの第２のポリペプチドを含み、ここで第１のポリペプチドと第２のポリペプチドは界面で出会い、第１のポリペプチドの界面は、第２のポリペプチドの界面にある設計された腔に配置することができる設計された隆起を含み；および（ｉ）第１のポリペプチドはＭＨＣクラスＩＩα１ドメイン、ＭＨＣクラスＩＩα２ドメイン、ＩｇＧ  ＣＨ２ドメイン、およびＩｇＧ  ＣＨ３ドメインから成り、ここで隆起はＳ３５４ＣとＴ３６６Ｗ（ＥＵの番号付け）に対応するＩｇＧ  ＣＨ３ドメインの突然変異によって形成され；および（ｉｉ）第２のポリペプチドは、ＭＨＣクラスＩＩβ１ドメイン、ＭＨＣクラスＩＩβ２ドメイン、ＩｇＧ  ＣＨ２ドメイン、およびＩｇＧ  ＣＨ３ドメインから成り、ここで腔はＹ３４９Ｃ、Ｔ３６６Ｓ、Ｌ３６８Ａ、およびＹ４０７Ｖ（ＥＵの番号付け）に対応するＩｇＧ  ＣＨ３ドメインの突然変異によって形成される。
【０２２５】
一実施形態において、単離されたヘテロダイマーは、少なくとも１つの第１のポリペプチドと少なくとも１つの第２のポリペプチドを含み、ここで第１のポリペプチドと第２のポリペプチドは界面で出会い、第１のポリペプチドの界面は、第２のポリペプチドの界面にある設計された腔に配置することができる設計された隆起を含み；および（ｉ）第１のポリペプチドはＭＨＣクラスＩＩβ１ドメイン、ＭＨＣクラスＩＩβ２ドメイン、ＩｇＧ  ＣＨ２ドメイン、およびＩｇＧ  ＣＨ３ドメインから成り、ここで隆起はＳ３５４ＣとＴ３６６Ｗ（ＥＵの番号付け）に対応するＩｇＧ  ＣＨ３ドメインの突然変異によって形成され；および（ｉｉ）第２のポリペプチドは、ＭＨＣクラスＩＩα１ドメイン、ＭＨＣクラスＩＩα２ドメイン、ＩｇＧ  ＣＨ２ドメイン、およびＩｇＧ  ＣＨ３ドメインから成り、ここで腔はＹ３４９Ｃ、Ｔ３６６Ｓ、Ｌ３６８Ａ、およびＹ４０７Ｖ（ＥＵの番号付け）に対応するＩｇＧ  ＣＨ３ドメインの突然変異によって形成される。
【０２２６】
＜調製法＞
他の態様では、本明細書に記載のヘテロダイマーを調製する方法が本明細書で提供される。本開示は、ヘテロダイマーを生成する方法を熟慮し、ここでヘテロダイマーは、ＭＨＣクラスＩＩα１ドメインとＭＨＣクラスＩＩα２ドメインを含む第１の最初のポリペプチドと、ＭＨＣクラスＩＩβ１ドメインとＭＨＣクラスＩＩβ２ドメインを含む第２のポリペプチドを含む。いくつかの実施形態において、各ポリペプチドはＣＨ２とＣＨ３のドメインをさらに含む。いくつかの実施形態において、ＣＨ３ドメインは設計されたノブ（隆起）または設計されたホール（腔）のいずれかをさらに含む。ノブがＭＨＣクラスＩＩα１とα２ドメインを含むポリペプチドに関係している場合、ホールはＭＨＣクラスＩＩβ１とβ２ドメインを含むポリペプチドに関係している。この構造は、ＭＨＣクラスＩＩβ１とβ２ドメインを含むポリペプチドに関係するノブと、ＭＨＣクラスＩＩα１とα２ドメインを含むポリペプチドに関係するホールに切り替えられてもよい。ヘテロダイマーはまた、ＭＨＣクラスＩＩアルファ鎖とベータ鎖の間に形成された結合溝で関係する免疫学的に関連のあるポリペプチドを含む。ポリペプチドは、柔軟なアミノ酸リンカーによって関係付けられた第１または第２のポリペプチド鎖のいずれかの一部であってもよい。
【０２２７】
いくつかの実施形態において、ヘテロダイマーのポリペプチドは、真核細胞株に導入されるポリヌクレオチドによってコードされる。特定の実施形態では、真核生物の細胞株は哺乳動物細胞株である。特定の実施形態では、真核生物の細胞株はＣＨＯ細胞株（チャイニーズハムスター卵巣）である。ポリヌクレオチドは、ウイルス（レトロウイルスまたはレンチウイルス）の形質導入等の当技術分野で既知の方法によって、またはゲノムに統合されたポリヌクレオチドのコピーを含む安定した細胞株を生成することによって、導入されてもよい。発現後、ヘテロダイマーは細胞へとアセンブルされ、そして培地に分泌される。この段階において、培地は少なくとも１つのさらなる精製工程を受ける。特定の実施形態では、この精製工程は、遠心分離、超遠心分離、透析、ろ過、クロマトグラフィーまたはカラムクロマトグラフィーのいずれか１つ以上を含む。特定の実施形態では、ポリペプチドがヒト免疫グロブリンのＣＨ２とＣＨ３ドメインを含むため、クロマトグラフィー工程は、タンパク質Ａ、タンパク質Ｇ、タンパク質Ｌ、またはそれらの任意の組み合わせを使用するアフィニティークロマトグラフィーを含む。特定の実施形態では、クロマトグラフィー工程は、タンパク質Ａを使用するアフィニティークロマトグラフィーを含む。特定の実施形態では、クロマトグラフィー工程は、タンパク質Ｇを使用するアフィニティークロマトグラフィーを含む。特定の実施形態では、クロマトグラフィー工程は、タンパク質Ａ／Ｇを使用するアフィニティークロマトグラフィーを含む。特定の実施形態では、クロマトグラフィー工程は、タンパク質Ａを使用するアフィニティークロマトグラフィーから成る。特定の実施形態では、クロマトグラフィー工程は、タンパク質Ｇを使用するアフィニティークロマトグラフィーから成る。特定の実施形態では、クロマトグラフィー工程は、タンパク質Ａ／Ｇを使用するアフィニティークロマトグラフィーから成る。特定の実施形態では、クロマトグラフィー工程は、タンパク質Ａ、タンパク質Ｇ、タンパク質Ｌ、またはそれらの組み合わせ以外のアフィニティー試薬を利用しない（これは、脱塩またはサイズ排除クロマトグラフィー等の非アフィニティーベースのクロマトグラフィー工程を含まない）。
【０２２８】
いくつかの実施形態において、本明細書で提供されるのは、第１のポリペプチドと第２のポリペプチドを含むヘテロダイマーを調製する方法であって、ここで第１のポリペプチドと第２のポリペプチドは界面で出会い、第１のポリペプチドの界面は、第２のポリペプチドの界面にある設計された腔に配置することができる設計された隆起を含み；および（ｉ）第１のポリペプチドは、ＭＨＣクラスＩＩα１ドメイン、ＭＨＣクラスＩＩα２ドメイン、またはそれらの組み合わせを含み；および第２のポリペプチドは、ＭＨＣクラスＩＩβ１ドメイン、ＭＨＣクラスＩＩβ２ドメイン、またはそれらの組み合わせを含み；または（ｉｉ）第１のポリペプチドは、ＭＨＣクラスＩＩβ１ドメイン、ＭＨＣクラスＩＩβ２ドメイン、またはそれらの組み合わせを含み；および第２のポリペプチドは、ＭＨＣクラスＩＩα１ドメイン、ＭＨＣクラスＩＩα２ドメイン、またはそれらの組み合わせを含み；該方法は、（ａ）界面を含む第１のポリペプチドと第２のポリペプチドをコードする核酸を含む宿主細胞を培養する工程であって、ここで第１のポリペプチドの界面をコードする核酸は、隆起をコードするために第１のポリペプチドの初期界面をコードする核酸から変質しており、または第２のポリペプチドの界面をコードする核酸は、腔をコードするために第２のポリペプチドの初期界面をコードする核酸から変質しており、またはその両方であり、および第１のポリペプチドと第２のポリペプチドが発現するように培養が行われる、工程；および（ｂ）宿主細胞の培養からヘテロダイマーを回収する工程、を含む。いくつかの実施形態において、第１のポリペプチドをコードする核酸は、隆起をコードするために初期核酸から変質しており、および第２のポリペプチドをコードする核酸は、腔をコードするために初期核酸から変質している。いくつかの実施形態において、工程（ａ）に先行して、第１のポリペプチドの界面から初期アミノ酸残基をコードする１つ以上の核酸の各々が、移入アミノ酸残基をコードする核酸と置き換えられる工程があり、ここで隆起は１つ以上の移入残基を含む。さらなる実施形態では、１つ以上の移入残基は、初期アミノ酸残基よりも大きな側鎖量を有している。いくつかの実施形態において、工程（ａ）に先行して、第２のポリペプチドの界面において初期アミノ酸残基をコードする１つ以上の核酸の各々が、移入アミノ酸残基をコードする核酸と置き換えられる工程があり、ここで腔は１つ以上の移入残基を含む。さらなる実施形態では、１つ以上の移入残基は、初期アミノ酸残基よりも小さな側鎖量を有している。
【０２２９】
いくつかの実施形態では、移入残基は、フェニルアラニン、アルギニン、チロシン、トリプトファン、アラニン、セリン、チロシン、バリン、およびシステインから選択される。いくつかの実施形態では、移入残基はアルギニンである。いくつかの実施形態では、移入残基はフェニルアラニンである。いくつかの実施形態では、移入残基はチロシンである。いくつかの実施形態では、移入残基はトリプトファンである。いくつかの実施形態では、移入残基はアラニンである。いくつかの実施形態では、移入残基はセリンである。いくつかの実施形態では、移入残基はトレオニンである。いくつかの実施形態では、移入残基はバリンである。いくつかの実施形態では、移入残基はシステインではない。いくつかの実施形態では、移入残基はシステインである。いくつかの実施形態では、移入残基はシステインとトリプトファンである。いくつかの実施形態において、移入残基はシステイン、セリン、アラニン、およびバリンである。
【０２３０】
他の態様では、本明細書に記載のヘテロダイマー・ナノ粒子結合体を調製する方法が本明細書で提供される。いくつかの実施形態では、該方法は、本明細書に記載される少なくとも１つのヘテロダイマーをナノ粒子に結合する工程を含み、ここでナノ粒子は非リポソームであり、および／またはソリッドコアを有する。いくつかの実施形態では、該方法は、本明細書に記載される少なくとも１つのヘテロダイマーをナノ粒子に結合する工程を含み、ここでナノ粒子は非リポソームであり、およびソリッドコアを有する。いくつかの実施形態では、該方法は、本明細書に記載される少なくとも１つのヘテロダイマーをナノ粒子に結合する工程を含み、ここでナノ粒子は非リポソームであり、またはソリッドコアを有する。いくつかの実施形態では、該方法は、本明細書に記載される少なくとも１つのヘテロダイマーをナノ粒子に結合する工程を含み、ここでナノ粒子は非リポソームであり、および金のソリッドコアを有する。いくつかの実施形態では、該方法は、本明細書に記載される少なくとも１つのヘテロダイマーをナノ粒子に結合する工程を含み、ここでナノ粒子は非リポソームであり、および酸化鉄のソリッドコアを有する。いくつかの実施形態では、該方法は、本明細書に記載される少なくとも１つのヘテロダイマーをナノ粒子に結合する工程を含み、ここでナノ粒子は非リポソームであり、および酸のソリッドコアを有し；および結合する工程は、リンカーを介して少なくとも１つのヘテロダイマーをナノ粒子に共有結合で結合する工程を含む。
【０２３１】
＜疾患を処置する方法＞
他の態様において、本明細書に提供されるのは、組成物を使用して疾患を処置する方法であって、組成物は、本明細書に開示されるヘテロダイマーおよび／または本明細書に開示されるヘテロダイマー・ナノ粒子結合体から成り、または実質的に成る。いくつかの実施形態では、疾患は、自己免疫の疾患また障害である。
【０２３２】
本開示の単離されたヘテロダイマーまたは単離されたヘテロダイマー・ナノ粒子複合体は、自己反応性Ｔ細胞をＴ調節性細胞またはＴＲ１細胞に再プログラムする／分化させるのに有用である。特定の実施形態では、ＴＲ１細胞はＩＬ−１０を発現する。特定の実施形態では、ＴＲ１細胞はＩＬ−１０を分泌する。特定の実施形態では、ＴＲ１細胞はＣＤ４９ｂを発現する。特定の実施形態では、ＴＲ１細胞はＬＡＧ−３を発現する。これらの表現型の特性を有するＴ細胞は、個体の炎症性疾患または自己免疫疾患を処置するのに有用である。
【０２３３】
「自己免疫の疾患または障害」は、個体自身の組織または器官から生じ、かつそれらに向けられる疾患または障害、またはそれらの発現、またはそれらの結果として生じる症状を含む。一実施形態では、それは、正常な体組織または抗原と反応するＴ細胞の産出に起因し、またはそれによって悪化する症状を指す。自己免疫の疾患または障害の例として、限定されないが以下があげられる：関節炎（急性関節炎、慢性関節リウマチ、痛風または痛風性関節炎等の関節リウマチ、急性痛風性関節炎、急性免疫性関節炎、慢性炎症性関節炎、変性関節炎、コラーゲン誘発関節炎ＩＩ型、感染性関節炎、ライム関節炎、増殖性関節炎、乾癬性関節炎、スティル病、脊椎関節炎、および若年性慢性関節リウマチ、変形性関節症、慢性進行性関節炎、変形関節炎、原発性慢性多発性関節炎、反応性関節炎、および強直性脊椎炎）、炎症性過増殖性皮膚病、乾癬（プラーク乾癬、滴状乾癬、膿胞性乾癬、および爪の乾癬等）、アトピー（枯草熱およびジョブ症候群等のアトピー性疾患を含む）、皮膚炎（接触皮膚炎、慢性接触皮膚炎、剥脱性皮膚炎、アレルギー性皮膚炎、アレルギー性接触皮膚炎、疱疹状皮膚炎、貨幣状皮膚炎、脂漏性皮膚炎、非特異性皮膚炎、一次刺激性接触皮膚炎、アトピー性皮膚炎を含む）、Ｘ連鎖高ＩｇＭ症候群、アレルギー性眼内炎症疾患、じんましん（慢性の自己免疫性じんましんを含む、慢性アレルギー性蕁麻疹および慢性特発性じんましん等）、筋炎、多発性筋炎／皮膚筋炎、若年性皮膚筋炎、中毒性表皮壊死症、強皮症（全身性強皮症を含む）、硬化症（全身性硬化等）；視神経脊髄型（ｓｐｉｎｏ−ｏｐｔｉｃａｌ）ＭＳ、一次性進行型ＭＳ（ＰＰＭＳ）、およびと再発寛解型ＭＳ（ＲＲＭＳ）等の多発性硬化症（ＭＳ）；進行性全身性硬化症、アテローム動脈硬化症、動脈硬化症、多発性硬化症（ｓｃｌｅｒｏｓｉｓ  ｄｉｓｓｅｍｉｎａｔａ）、および失調性硬化症、視神経脊髄炎スペクトル障害（ＮＭＯ、デビック病またはデビック症候群としても知られる）、炎症性大腸疾患（ＩＢＤ）（例えばクローン病）；自己免疫媒介の胃腸疾患；潰瘍性大腸炎、潰瘍性結腸炎、微視的な大腸炎、コラーゲン蓄積大腸炎、ポリープ様大腸炎、壊死性腸炎、および全層性大腸炎等の大腸炎；および自己免疫性炎症性大腸疾患）、腸炎症、壊疽性膿皮症、結節性紅斑、原発性硬化性胆管炎、呼吸窮迫症候群（急性呼吸窮迫症候群（ＡＲＤＳ）を含む）、脳膜炎、ブドウ膜全体または一部の炎症、虹彩炎、脈絡膜炎、自己免疫性の血液学的疾患、リウマチ様脊椎炎、リューマチ性滑膜炎、遺伝性血管浮腫、脳膜炎でのような脳神経損傷、妊娠疱疹、妊娠性類天疱瘡、陰嚢の掻痒、自己免疫性早発卵巣不全、自己免疫性疾患による突然の聴力損失、アナフィラキシーとアレルギーとアトピー性鼻炎等のＩｇＥを媒介とした疾患、ラスムッセン脳炎と辺縁系脳炎および／または脳幹脳炎等の脳炎、ブドウ膜炎（前部ブドウ膜炎、急性前部虹彩炎、肉芽腫性ブドウ膜炎、非肉芽腫性ブドウ膜炎、水晶体抗原性ブドウ膜炎、後部ブドウ膜炎、または自己免疫性ブドウ膜炎等）、ネフローゼ症候群を伴う／伴わない糸球体腎炎（ＧＮ）（一次性ＧＮ、免疫媒介ＧＮ、膜性ＧＮ（膜性腎症）、特発性膜性ＧＮ、または特発性膜性腎���、膜性または膜性増殖性ＧＮ（ＭＰＧＮ）、Ｉ型とＩＩ型を含む、および急速に進行するＧＮ、または増殖性腎炎等の、慢性または急性の糸球体腎炎）自己免疫性多内分泌腺症候群、形質細胞限局性亀頭炎を含む亀頭炎、亀頭包皮炎、遠心性環状紅斑、色素異常性固定性紅斑、紅斑多形、環状肉芽腫、光沢苔癬、硬化性委縮性苔癬、ビダール苔癬、棘状苔癬、扁平苔癬、層状魚鱗癬、表皮剥離性角質増殖症、前癌性角化症、壊疽性膿皮症、アレルギー性疾患と反応、アレルギー反応、湿疹（アレルギー性またはアトピー性の湿疹、皮脂欠乏性湿疹、異汗性湿疹、および汗疱を含む）、喘息（気管支喘息、気管支ぜん息、および自己免疫性喘息等）、Ｔ細胞の浸潤と慢性的な炎症反応を含む疾患、妊娠中の胎児のＡ−Ｂ−Ｏ型血液等の異種抗原に対する免疫反応、慢性的な肺性炎症性疾患、自己免疫性心筋炎、白血球接着不全、狼瘡（狼瘡腎炎、狼瘡脳炎、小児性狼瘡、非腎狼瘡、腎外狼瘡、円板状狼瘡、および円板状紅斑性狼瘡、脱毛症狼瘡、皮膚のＳＬＥまたは亜急性の皮膚のＳＬＥ等の全身性エリテマトーデス（ＳＬＥ）、新生児狼瘡症候群（ＮＬＥ）、および播種状エリテマトーデスを含む）、Ｉ型糖尿病、ＩＩ糖尿病、および成人潜在性自己免疫糖尿病（または１．５型糖尿病）。さらに、以下に関連する免疫反応が熟慮される：サイトカインとＴリンパ球によって媒介される急性および遅延型の過敏症、サルコイドーシス、肉芽腫症（リンパ腫様肉芽腫症、ウェゲナー肉芽腫症、または顆粒球減少症を含む）、脈管炎（脈管炎、大型血管炎（リウマチ性多発生筋痛と巨細胞（高安）動脈炎を含む）、中型血管炎（川崎病と結節性多発性動脈炎／結節性動脈周囲炎を含む）、顕微鏡的多発動脈炎、免疫性脈管炎（ｉｍｍｕｎｏｖａｓｃｕｌｉｔｉｓ）、ＣＮＳ脈管炎、皮膚の脈管炎、過敏症脈管炎、全身性壊死性脈管炎等の壊死性脈管炎、およびＡＮＣＡ関連脈管炎（チャーグ・ストラウス脈管炎または症候群（ＣＳＳ）、およびＡＮＣＡ関連小型血管炎等）、側頭動脈炎、再生不良性貧血、自己免疫性再生不良性貧血、クームス陽性貧血、ダイアモンド・ブラックファン貧血、溶血性貧血、自己免疫性溶血性貧血（ＡＩＨＡ）を含む免疫性溶血性貧血、アジソン病、自己免疫性白血球減少症、汎血球減少症、白血球減少症、白血球漏出を含む疾患、ＣＮＳ炎症性疾患、アルツハイマー病、パーキンソン病、多臓器外傷症候群（敗血症、外傷または出血に付随して起こるもの等）、抗原抗体複合体を媒介とした疾患、抗糸球体基底膜疾患、抗リン脂質抗体症候群、抗リン脂質抗体症候群、アレルギー性神経炎、ベーチェット病／症候群、キャッスルマン症候群、グッドパスチャー症候群、レイノー病、シェーグレン症候群、スティーブンス・ジョンソン症候群、水疱性類天疱瘡および皮膚類天疱瘡等の類天疱瘡、天疱瘡（尋常性天疱瘡、落葉状天疱瘡、粘膜類天疱瘡、および紅斑性天疱瘡を含む）、自己免疫性多内分泌障害、ライター病または症候群、熱傷、子癇前症、免疫複合体性腎炎等の免疫複合体障害、抗体媒介性腎炎、多発性神経障害、ＩｇＭ多発性神経障害またはＩｇＭ媒介性神経障害等の慢性神経障害、慢性または急性のＩＴＰを含む特発性血小板減少性紫斑病（ＩＴＰ）等の自己免疫性または免疫媒介血小板���少症、後天性血小板減少性紫斑病、特発性強膜炎等の強膜炎、上鞏膜炎、自己免疫性精巣炎と卵巣炎を含む睾丸と卵巣の自己免疫疾患、原発性甲状腺機能低下症、副甲状腺機能低下症、自己免疫性内分泌疾患（甲状腺炎（自己免疫性甲状腺炎、橋本病、慢性甲状腺炎（橋本甲状腺炎）または亜急性甲状腺炎を含む）、自己免疫性甲状腺疾患、原発性甲状腺機能低下症、あるいはグレーヴス病）、自己免疫性多発内分泌腺症候群（または多内分泌障害症候群）等の多腺性症候群、ランバート−イートン筋無力症候群またはイートン・ランバート症候群等の神経腫瘍随伴症候を含む腫瘍随伴症候群、スティッフマンまたはスティッフパーソン症候群、アレルギー性脳脊髄炎または脳脊髄炎アレルギーおよび実験的アレルギー性脳脊髄炎（ＥＡＥ）等の脳脊髄炎、胸腺腫関連の重症筋無力症、小脳変性症、神経ミオトニー、眼球クローヌスまたは眼球クローヌスミオクローヌス症候群（ＯＭＳ）等の重症筋無力症、感覚性ニューロパチー、多巣性運動ニューロパチー、シーハン症候群、自己免疫性肝炎、慢性肝炎、ルポイド肝炎、巨細胞性肝炎、慢性活動性肝炎または自己免疫性の慢性活動性肝炎、リンパ性間質肺炎（ＬＩＰ）、閉塞性細気管支炎（非移植）ｖｓ  ＮＳＩＰ、ギラン・バレー症候群、ベルガー病（ＩｇＡ腎症）、特発性ＩｇＡ腎症、線状ＩｇＡ皮膚病、急性熱性好中球性皮膚症、角層下膿疱症、一過性棘融解性皮膚症、原発性胆汁性肝硬変と肺線維症等の硬変、自己免疫性腸疾患症候群、セリアック病または小児脂肪便症、セリアック病（グルテン性腸症）、難治性スプルー、特発性スプルー、クリオグロブリン血症、筋萎縮性側索硬化症（ＡＬＳ；ルー・ゲーリッグ病）、冠動脈疾患、自己免疫性の内耳疾患（ＡＩＥＤ）等の自己免疫性の耳疾患、自己免疫性難聴、難治性または再発性または再発性多発性軟骨炎等の多発性軟骨炎、肺胞タンパク症、コーガン症候群／非梅毒性間質性炎症、ベル麻痺、スウィート病／症候群、自己免疫性酒き、帯状ヘルペス関連の痛み、アミロイドーシス、非癌性リンパ球増加症、一次性リンパ球増加症、これはモノクローナルＢ細胞リンパ球増加症を含む（例えば、意義不明の良性単クローン性免疫グロブリン血および単一クローン性高ガンモパシー、ＭＧＵＳ）、末梢神経障害、腫瘍随伴症候、チャネル病、例えば癲癇、片頭痛、不整脈、筋疾患、難聴、失明、周期性麻痺、ＣＮＳのチャネル病、自閉症、炎症性筋疾患、状もしくは分節状または巣状糸球体硬化症（ＦＳＧＳ）、内分泌性眼障害、網膜ブドウ膜炎、脈絡網膜炎、自己免疫性肝臓障害、結合組織炎、多内分泌腺不全、シュミット症候群、副腎炎、胃萎縮、初老期痴呆、自己免疫性脱髄症および慢性炎症性脱髄性多発ニューロパチー等の脱髄症、ドレスラー症候群、円形脱毛症（ａｌｏｐｅｃｉａ  ｇｒｅａｔａ）、全脱毛症、ＣＲＥＳＴ症候群（石灰沈着症、レーノー現象、食道蠕動運動低下、強指症、および毛細血管拡張症）、雄雌自己免疫性不妊症（例えば抗精子抗体による）、混合結合組織病、シャーガス病、リウマチ熱、反復流産、農夫肺、多形性紅斑、心術後症候群、クッシング症候群、鳥飼育者肺、アレルギー性肉芽腫性脈管炎、良性リンパ球性血管炎、アルポート症候群、アレルギー性肺胞炎と線維化性肺胞炎等の歯槽骨炎、間質性肺疾患、輸血反応、ハンセン病、マラリア、リーシュマニア症等の寄生生物症、キパノソミアシス（ｋｙｐａｎｏｓｏｍｉａｓｉｓ）、住血吸虫症、回虫症、アスペルギルス症、サンプター症候群、キャプラン症候群、デング熱、心内膜炎、心内膜心筋線維症、びまん性間質性肺線維症、間質性肺線維症、肺線維症、特発性肺線維症、嚢胞性繊維症、眼内炎、持続性隆起性紅斑、胎児赤芽球症、好酸球性筋膜炎、シュルマン症候群、フェルティ症候群、フィラリア症、慢性毛様体炎等の毛様体炎、異時性毛様体炎（ｈｅｔｅｒｏｃｈｒｏｎｉｃ  ｃｙｃｌｉｔｉｓ）、虹彩毛様体炎（急性または慢性）、またはフックス毛様体炎、ヘノッホ−シェーンライン紫斑病、ヒト免疫不全ウイルス（ＨＩＶ）感染、ＳＣＩＤ、後天性免疫不全症候群（ＡＩＤＳ）、エコーウイルス感染症、敗血症、内毒素血症、膵炎、甲状腺中毒症、パルボウイルス感染症、風疹ウイルス感染症、ワクチン注射後の症候群、先天性風疹感染、エプスタイン・バーウイルス感染、耳下腺炎、エバンズ症候群、自己免疫性生殖腺疾患、シドナム舞踏病、連鎖球菌感染後の腎炎、閉塞性血栓性血管炎、甲状腺中毒、脊髄癆、脈絡膜炎、巨細胞多発性筋痛、慢性過敏性肺炎、乾性角結膜炎、流行性角結膜炎、特発性腎炎症候群、微小病変症、良性家族性および虚血再潅流障害、移植器官再灌流、網膜自己免疫、関節炎、気管支炎、慢性閉塞性気道／肺疾患、珪肺症、アフタ、アフタ性口内炎、動脈硬化性障害、アスペルニオゲニーズ（ａｓｐｅｒｎｉｏｇｅｎｅｓｅ）、自己免疫性溶血、ベック病、クリオグロブリン血症、デュピュイトラン拘縮、水晶体過敏性眼内炎（ｅｎｄｏｐｈｔｈａｌｍｉａ  ｐｈａｃｏａｎａｐｈｙｌａｃｔｉｃａ）、アレルギー性腸炎、癩性結節性紅斑、特発顔面神経麻痺、慢性疲労症候群、リウマチ熱、ハマン・リッチ病、感音難聴（ｓｅｎｓｏｎｅｕｒａｌ  ｈｅａｒｉｎｇ  ｌｏｓｓ）、血色素尿症発作（ｈａｅｍｏｇｌｏｂｉｎｕｒｉａ  ｐａｒｏｘｙｓｍａｔｉｃａ）、性機能低下症、回腸炎レジオナリス、白血球減少症、単核細胞増加症感染（ｍｏｎｏｎｕｃｌｅｏｓｉｓ  ｉｎｆｅｃｔｉｏｓａ）、横移動脊髄炎、原発性特発性粘液水腫、ネフローゼ交感神経眼炎（ｏｐｈｔｈａｌｍｉａ  ｓｙｍｐｈａｔｉｃａ）、精巣炎肉芽腫症、膵炎、急性多発性神経根炎、壊疽性膿皮症、ケルヴァン甲状腺炎、後天性脾臓萎縮、非悪性胸腺腫、白斑
、毒素ショック症候群、食中毒、Ｔ細胞の浸潤を伴う疾患、白血球接着不全、サイトカインとＴリンパ球により媒介される急性および遅延型過敏症に関連する免疫反応、白血球漏出を含む疾患、多臓器外傷症候群、抗原抗体複合体媒介性疾患、抗糸球体基底膜疾患、アレルギー性神経炎、自己免疫性多内分泌障害、卵巣炎、原発性粘液水腫、自己免疫性萎縮性胃炎、交感性眼炎、リウマチ病、混合結合組織病、ネフローゼ症候群、膵島炎、多内分泌腺性機能不全、自己免疫性多発内分泌腺症候群Ｉ型、成人発症型特発性副甲状腺機能低下症（ＡＯＩＨ）、拡張型心筋症等の心筋症、後天性表皮水疱症（ＥＢＡ）、血色素症、心筋炎、ネフローゼ症候群、原発性硬化性胆管炎、化膿性または非化膿性副鼻腔炎、急性または慢性副鼻腔炎、節骨、前額面、上顎骨または楔形の副鼻腔炎、好酸球増加症、肺浸潤好酸球増加症、好酸球増加・筋痛症候群、レフラー症候群、慢性好酸球性肺炎、熱帯性好酸球増多性肺疾患、気管支肺炎アスペルギルス症、アスエルギローム、または好酸球を含む肉芽腫等の好酸球関連の障害、アナフィラキシー、血清反応陰性脊椎関節炎、多腺性自己免疫症候群、硬化性胆管炎、強膜、上鞏膜、慢性粘膜皮膚カンジダ症、ブラットン症候群、一過性乳児低ガンマグロブリン血症、ウィスコット−アルドリッチ症候群、運動失調末梢血管拡張症候群、脈管拡張、膠原病関連の自己免疫疾患、リウマチ、神経系疾患、リンパ節炎、血圧反応の減少、血管機能障害、組織傷害、心臓血管の虚血、痛覚過敏、腎虚血、脳虚血、および血管新生を伴う疾患、アレルギー性過敏症障害、糸球体腎炎、再潅流傷害、虚血性再潅流障害、心筋または他の組織の再潅流傷害、リンパ腫気管気管支炎、炎症性皮膚病、急性炎症性成分を伴う皮膚病、多臓器不全、水疱性疾患、腎皮質部壊死、急性化膿性髄膜炎または他の中枢神経系炎症性疾患、眼・眼窩炎症性疾患、顆粒球輸血関連症候群、サイトカイン誘発毒性、ナルコレプシー、急性の重篤な炎症、慢性難治性炎症、腎盂炎、動脈内過形成、消化性潰瘍、弁膜炎、気腫、円形脱毛症、脂肪組織炎症／糖尿病ＩＩ型、肥満関連の脂肪組織炎症／インスリン抵抗性、および子宮内膜症。
【０２３４】
いくつかの実施形態において、自己免疫の障害または疾患は、限定されないが、Ｉ型およびＩＩ型糖尿病、前糖尿病、移植拒絶反応、多発性硬化症、多発性硬化症関連の障害、早発卵巣不全、強皮症、シェーグレン病／症候群、狼瘡、白斑、脱毛症（はげ）、多腺性機能不全、グレーヴス病、甲状腺機能低下症、多発性筋炎、天疱瘡、クローン病、大腸炎、自己免疫性肝炎、下垂体機能不全症、心筋炎、アジソン病、自己免疫皮膚疾患、ブドウ膜炎、悪性貧血、副甲状腺機能低下症、および／または慢性関節リウマチを含み得る。対象となる他の徴候は、限定されないが、喘息、アレルギー性喘息、原発性胆汁性肝硬変、硬変、視神経脊髄炎スペクトル障害（デビック病、視神経脊髄型多発性硬化症（ＯＳＭＳ））、尋常性天疱瘡、炎症性大腸疾患（ＩＢＤ）、関節炎、関節リウマチ、全身性エリテマトーデス（ＳＬＥ）、セリアック病、乾癬、自己免疫性心筋症、特発性拡張型心筋症（ＩＤＣＭ）、重症筋無力症、ブドウ膜炎、強直性脊椎炎、免疫媒介性筋疾患、前立腺癌、抗リン脂質抗体症候群（ＡＮＣＡ＋）、アテローム動脈硬化症、皮膚筋炎、慢性閉塞性肺疾患（ＣＯＰＤ）、気腫、脊髄損傷、外傷性傷害、タバコにより誘発された肺の破壊、ＡＮＣＡ関連の脈管炎、乾癬、硬化性胆管炎、原発性硬化性胆管炎、および中枢神経系と末梢神経系の疾患を含む。
【０２３５】
いくつかの実施形態では、自己免疫の障害または疾患は、限定されないが、Ｉ型糖尿病、多発性硬化症、セリアック病、原発性胆汁性肝硬変、天疱瘡、落葉性天疱瘡、尋常性天疱瘡、視神経脊髄炎スペクトル障害、関節炎（慢性関節リウマチを含む）、アレルギー性喘息、炎症性大腸疾患（クローン病と潰瘍性大腸炎を含む）、全身性エリテマトーデス、アテローム動脈硬化症、慢性閉塞性肺疾患、気腫、乾癬、自己免疫性肝炎、ブドウ膜炎、シェーグレン症候群、強皮症、抗リン脂質抗体症候群、ＡＮＣＡ関連の脈管炎、およびスティッフマン症候群を含み得る。さらなる態様では、疾患に関連する抗原は、腫瘍または癌に関連する抗原である。
【０２３６】
特定の実施形態では、本開示の単離されたヘテロダイマーまたは単離されたヘテロダイマー・ナノ粒子複合体は、１つ以上の薬学的に許容可能な添加剤、担体、および賦形剤を含む医薬組成物に含まれている。特定の実施形態では、本開示の単離されたヘテロダイマーまたは単離されたヘテロダイマー・ナノ粒子複合体は、無菌液に懸濁されて投与される。特定の実施形態では、溶液は０．９％のＮａＣｌを含む。特定の実施形態では、溶液はさらに以下の１つ以上を含む：緩衝液、例えば酢酸塩、クエン酸塩、ヒスチジン、琥珀酸塩、リン酸塩、重炭酸ソーダ、およびヒドロキシメチルアミノメタン（Ｔｒｉｓ）；界面活性剤、例えばポリソルベート８０（Ｔｗｅｅｎ  ８０）、ポリソルベート２０（Ｔｗｅｅｎ  ２０）、およびポロキサマー１８８；ポリオール／二糖類／多糖類、例えばグルコース、デキストロース、マンノース、マンニトール、ソルビトール、スクロース、トレハロース、およびデキストラン４０；アミノ酸、例えばグリシンまたはアルギニン；酸化防止剤、例えばアスコルビン酸、メチオニン；またはキレート剤、例えばＥＧＴＡ、ＥＧＴＡ。特定の実施形態では、本開示の単離されたヘテロダイマーまたは単離されたヘテロダイマー・ナノ粒子複合体は、凍結乾燥されて出荷／保管され、および投与前に元に戻される。特定の実施形態では、凍結乾燥された単離されたヘテロダイマーまたは単離されたヘテロダイマー・ナノ粒子複合体の製剤は、マンニトール、ソルビトール、スクロース、トレハロースまたはデキストラン４０等の充填剤を含む。凍結乾燥された製剤は、ガラスで構成されたバイアルに入れることができる。単離されたヘテロダイマーまたは単離されたヘテロダイマー・ナノ粒子複合体は、製剤された時、元に戻されているかどうかに関わらず、特定のｐＨ、一般的には７．０未満で緩衝可能である。特定の実施形態では、ｐＨは、４．５〜６．５、４．５〜６．０、４．５〜５．５、４．５〜５．０、または５．０〜６．０であり得る。特定の実施形態では、単離されたヘテロダイマーまたは単離されたヘテロダイマー・ナノ粒子複合体は、静脈内注射用に調剤することができる。特定の実施形態では、単離されたヘテロダイマーまたは単離されたヘテロダイマー・ナノ粒子複合体は、経口摂取用に調剤することができる。特定の実施形態では、単離されたヘテロダイマーまたは単離されたヘテロダイマー・ナノ粒子複合体は、非経口投与、筋肉内注射、または組織内注射用に調剤することができる。特定の実施形態では、単離されたヘテロダイマーまたは単離されたヘテロダイマー・ナノ粒子複合体は、免疫反応を増加／減少させるよう意図された、免疫アジュバントまたは他の化合物またはポリペプチドなしで調剤および／または投与が可能である。
【０２３７】
他の態様では、本明細書に提供されるのは、免疫細胞、好ましくはＴ細胞の集団を検出および／またはモニタリングする方法であって、該方法は標識された抗原・ＭＨＣ複合体を投与する工程を含み、ここで被験体は本明細書に開示されるヘテロダイマーおよび／または本明細書に開示されるヘテロダイマー・ナノ粒子結合体を受け取る。
【０２３８】
特定の態様では、本明細書に開示されるのは、本明細書に開示されるヘテロダイマーおよび／または本明細書に開示されるヘテロダイマー・ナノ粒子結合体を受け取った被験体において、抗原特異的な方法でＴＲ１細胞および／またはエフェクターＴ細胞の集団を検出するための方法である。該方法は、多量体の複合体を形成するために標識されたｐＭＨＣの有効量を有するＴＲ１細胞を含む疑いのあるサンプルを接触させる工程、その結果としてＴＲ１細胞の集団を検出する工程を含み、代替的にそれらの工程から成り、またはさらにはそれらの工程から実質的に成る。いくつかの実施形態において、該方法は、標識された多量体の複合体を使用してＴ細胞集団を染色する工程をさらに含み、さらに代替的にその工程から成り、またはさらにはその工程から実質的に成る。いくつかの実施形態において、ＴＲ１細胞の集団を検出する工程は、多量体の複合体を検出するためにフローサイトメトリーを含む。いくつかの実施形態において、該方法はさらに、被験体に複合体または組成物を投与する工程をさらに含み、代替的にその工程から成り、またはさらにはその工程から実質的に成る。
【０２３９】
特定の態様では、本明細書に開示されるのは、本明細書に開示されるヘテロダイマーおよび／または本明細書に開示されるヘテロダイマー・ナノ粒子結合体を受け取った被験体において、抗原特異的な方法でＴＲ１細胞および／またはエフェクターＴ細胞の集団を検出するための方法である。該方法は、以下のアッセイのいずれか１つを含み、代替的にそれらから成り、またはさらにはそれから実質的に成る：サイトカインＥＬＩＳＰＯＴアッセイ、多量体誘導エピトープ分析、または多量体プルダウンアッセイ。いくつかの実施形態において、該方法は、本明細書に開示されるヘテロダイマーおよび／または本明細書に開示されるヘテロダイマー・ナノ粒子結合体を投与する工程をさらに含み、代替的にさらにその工程から成り、またはさらにはその工程から実質的に成る。
【０２４０】
他の態様において、本明細書に提供されるのは、抗原特異性ＴＲ１および／またはエフェクターＴ細胞の集団の発現を被験体においてモニタリングする方法である。該方法は、以下の工程を含み、代替的に以下の工程から成り、またはさらには以下の工程から実質的に成る：ａ）本明細書に開示されるヘテロダイマーおよび／または本明細書に開示されるヘテロダイマー・ナノ粒子結合体の有効量を被験体に投与する工程であって、ここで疾患に関連するｐＭＨＣ複合体の抗原は、抗原特異性ＴＲ１および／またはエフェクターＴ細胞を拡張するために選択されている、工程；ｂ）集団を含む疑いのある被験体から適切なサンプルを単離する工程；ｃ）多量体の複合体を形成するために標識されたｐＭＨＣ複合体の有効量を有するサンプルを接触させ、および多量体の複合体を検出する工程；およびｄ）集団内の抗原特異性ＴＲ１および／またはエフェクターＴ細胞の数を定量化する工程。いくつかの実施形態において、該方法は、多量体の複合体を染色する工程をさらに含み、さらに代替的にその工程から成り、またはさらにはその工程から実質的に成る。いくつかの実施形態において、抗原特異性ＴＲ１および／またはエフェクターＴ細胞の数を定量化する工程は、フローサイトメトリーおよび／またはＥＬＩＳＡを含む。いくつかの実施形態において、該方法は、本明細書に開示されるヘテロダイマーおよび／または本明細書に開示されるヘテロダイマー・ナノ粒子結合体を投与する工程をさらに含み、代替的にさらにその工程から成り、またはさらにはその工程から実質的に成る。
【０２４１】
実施可能な多くの種類のイムノアッセイが存在する。本開示に包含されるイムノアッセイとして、限定されないが、米国特許第４，３６７，１１０号（二重モノクローナル抗体サンドイッチアッセイ）と米国特許第４，４５２，９０１号（ウェスタンブロット）に記載されるものがあげられる。他のアッセイは、インビトロとインビボ両方の、標識されたリガンドの免疫沈降および免疫細胞化学を含む。
【０２４２】
循環する抗原特異性免疫細胞の数を定量化する１つの方法は、四量体アッセイである。このアッセイでは、特定のエピトープが、蛍光性標識されたＭＨＣ分子の合成多重結合形態に結合される。免疫細胞は、ＭＨＣ分子に結合した短いペプチドの形状の抗原を認識するため、適切なＴ細胞レセプターを有する細胞は、標識された四量体に結合し、およびフローサイトメトリーによって定量化することができる。この方法は、ＥＬＩＳＰＯＴアッセイよりも時間がかからないが、多量体アッセイは機能ではなく結合のみを測定する。特定の抗原を結合するすべての細胞が、必ずしも活性化されるわけではない。しかしながら、ＥＬＩＳＰＯＴ、多量体、および細胞毒性アッセイの間の相関が実証されている。
【０２４３】
イムノアッセイは一般的には結合アッセイである。様々な種類の酸素免疫測定法（ＥＬＩＳＡ）、放射免疫検定（ＲＩＡ）、またはＬｕｍｉｎｅｘ（商標）技術等のビーズベースのアッセイを含む特定のイムノアッセイが、本技術分野で既知である。さらに、組織セクションを使用する免疫組織化学的検出が有用である。
【０２４４】
ＥＬＩＳＡの１つの例では、抗体または抗原を、ポリスチレンマイクロタイタープレートのウェル、ディップスティック、またはカラム支持体等の、選択された面上に固定する。次に、臨床サンプル等の望ましい抗原または抗体を含む疑いのある試験組成物を加える。結合させて洗浄し、非特異性結合免疫複合体を除去した後に、結合抗原または抗体を検出してもよい。検出は一般的に、検出可能な標識に結合された所望の抗原または抗体に特異的な他の抗体の付加によって達成される。この種のＥＬＩＳＡは「サンドイッチＥＬＩＳＡ」として知られている。検出はまた、望ましい抗原に特異的な第２の抗体の付加、その後、第２の抗体に結合親和性があり検出可能な標識に結合されている第３の抗体の付加によって達成され得る。ＥＬＩＳＡ技術のバリエーションは当業者に既知である。
【０２４５】
競合ＥＬＩＳＡもまた可能であり、ここで試験サンプルは、既知の量の標識された抗原または抗体と結合するために競合する。未知のサンプルにおける反応的な種の量は、コーティングされたウェルでのインキュベーション前またはその最中に、既知の標識された種と混合することによって判定される。サンプル中の反応的な種の存在は、ウェルに結合するのに利用可能な標識された種の量を減らし、したがって最終信号を減らすように作用する。
【０２４６】
使用されるフォーマットに関係なく、ＥＬＩＳＡは、コーティング、インキュベーションまたは結合、非特異性結合種を除去するための洗浄、および結合免疫複合体の検出等の、特定の特徴を共通して有する。
【０２４７】
抗原または抗体はまた、プレート、ビーズ、ディップスティック、膜、またはカラムマトリックスの形状等の固形支持体に連結されてもよく、および分析されるサンプルは、固定された抗原または抗体に適用される。抗原または抗体のいずれかでプレートをコーティングする際、一般的に、抗原または抗体の溶液を用いてプレートのウェルを一晩または所定期間、インキュベートする。次にプレートのウェルを洗浄して、不完全に吸収された物質を除去する。ウェルの残りの利用可能な面を、その後、試験抗血清に関して抗原性的に中性の非特異タンパク質でコーティングする。これらは、ウシ血清アルブミン（ＢＳＡ）、カゼイン、および粉ミルク液を含む。コーティングは、固定面上の非特異性吸着点の遮断を可能にし、したがって面上への抗血清の非特異性結合によって引き起こされる要因を減らす。
【０２４８】
ＥＬＩＳＡでは、直接的な手順ではなく、二次的または三次的な検出手段を使用する方が慣習的である。したがって、ウェルへの抗原または抗体の結合、要因を減らすための非反応的物質でのコーティング、および非結合物質の除去のための洗浄後、免疫複合体（抗原／抗体）形成を可能にするのに効果的な条件下で、試験される臨床サンプルまたは生体サンプルに固定面を接触させる。次に、免疫複合体の検出は、標識された第２の結合リガンドまたは抗体、または標識された第３の抗体または第３の結合リガンドと共に第２の結合リガンドまたは抗体を必要とする。
【０２４９】
付加的に、フローサイトメトリーは、細胞表面マーカーに従って特定の細胞サブタイプを検出し、定量化するために使用されてもよい。フローサイトメトリーによる検出と定量化の一般的手段には、ＣＤ４＋Ｔ細胞等の選択のために、各免疫細胞サブタイプに特異的な細胞表面マーカーに結合する蛍光性標識ビーズ、例えばＣＤ４特異性ビーズの使用が含まれる。
【０２５０】
本明細書に記載される組成物は、従来のように非経口での注入によって、例えば静脈内に、皮下に、または筋肉内に投与されてもよい。静脈内投与される組成物は、安定剤、賦形剤、および保存剤を含んでもよい。ｐＭＨＣ−ナノ粒子組成物は、無菌食塩水、緩衝食塩水、またはリン酸緩衝食塩水に懸濁されてもよい。代替的に、特定の実施形態では、静脈内製剤は、デキストロース、グルコース、マンニトール、ｐＨ緩衝液、または炭酸水素ナトリウムを含む。他の投与方法に適したさらなる製剤として、経口製剤があげられる。経口製剤は、例えば薬事グレードのマンニトール、ラクトース、デンプン、ステアリン酸マグネシウム、サッカリンナトリウム、セルロース、炭酸マグネシウム等の、通常使用される賦形剤を含む。これらの組成物は、溶液、懸濁液、錠剤、丸剤、カプセル剤、徐放性製剤、または粉末剤の形態をしており、および約１０％から約９５％、好ましくは約２５％から約７０％の有効成分を含む。被験体の免疫状態を調整する抗原−ＭＨＣ−ナノ粒子複合体を含む水性組成物の調製は、本開示に照らして当業者の知るところとなるだろう。特定の実施形態では、組成物は吸入されてもよい（例えば米国特許第６，６５１，６５５号、これはその全体が参照により具体的に組み込まれる）。一実施形態では、抗原−ヘテロダイマー−ナノ粒子複合体（すなわち抗原−ｐＭＨＣ−ＮＰ複合体）は全身投与される。特定の実施形態では、本明細書に記載のｐＭＨＣ−ＮＰ複合体、または本明細書に記載のｐＭＨＣ−ＮＰ複合体を複数含む組成物が、静脈内投与される。
【実施例】
【０２５１】
＜実施例１：ロイシンジッパーを有するペプチド−ＭＨＣ（ｐＭＨＣ）複合体の発現＞
ＣＨＯ−Ｓ細胞中でｐＭＨＣ複合体を発現させるために、ｐＭＨＣ複合体をコードするＤＮＡフラグメント（異なる構成、図２を参照）を、ｐＬＶ／ＣＭＶ−ＧＷレンチウイルス発現ベクターへとクローニングする（図１Ａと１Ｂ）。ｐＭＨＣ複合体のアルファ鎖とベータ鎖の両方が単一のＯＲＦによってコードされ、２つの別個の鎖がＰ２Ａリボソームの飛び越し配列によって分離され（図２、一番上）、または２つの別個の鎖が２つの異なるベクターにおいてクローニングされる（図２、一番下）かのいずれかである。ｐＭＨＣ−コードフラグメントは、ＩＲＥＳ−ＥＧＦＰカセットの上流にクローニングされる。発現したベータ鎖生成物は、リーダー配列、エピトープ配列、ＧＳリンカー、続いてベータ鎖の細胞外ドメインとＣ−Ｊｕｎフラグメント（４０  ａ．ａ．）から成る。発現した鎖は、リーダー配列、アルファ鎖の細胞外ドメイン、Ｃ−ｆｏｓフラグメント（４０  ａ．ａ．）、ＢｉｒＡビオチン化部位（１４  ａ．ａ．）、および６Ｘヒスチジンおよび／またはＣ−末端を有するＳｔｒｅｐ  ｔａｇを含む。好ましいベクター設計（図２、一番下）は、別個の個別のプラスミド上の両方の鎖をコードする。
【０２５２】
＜実施例２：ノブ・イン・ホールに基づいたｐＭＨＣ異種ダイマー化＞
以下の実験は、安全性、有効性、および調節性の属性の改善された、ヒトでの臨床用途のための、およびそのような臨床用途に必要な大量の精製に適用可能であるｐＭＨＣヘテロダイマーを開発する試みを記載する。エピトープタグは抗薬物抗体の生成をもたらし得るため、標準エピトープタグ（例えばＦＬＡＧ、６ｘＨＩＳ）を含む現在の生物学的薬物は、臨床的な見地からは好まれない。これは、異なる薬物が同じタグを運ぶ、または同じ薬物が続く投与を必要とする場合に、特に関係する。例えば、エピトープタグＸを使用して精製された薬物Ａを患者に注入すると、結果としてエピトープタグＸに対する免疫反応を引き起こし得るが、そうすると、同じ薬物または同じエピトープタグを有する異なる薬物の続く投与は、薬物Ａの最初の投与によって生成された抗体反応により中和される。エピトープタグなしでの精製は、可溶性ＭＨＣクラスＩＩα−βヘテロダイマーのインビトロでの単離に問題を引き起こす。これは、ＭＨＣポリペプチドのクロマトグラフィー分離技術が、大量の高純度タンパク質の精製を許容しないためである。
【０２５３】
したがって、ａ）ＣＨＯ細胞からの分泌が向上し；ｂ）精製タグを使用する必要なく；およびｃ）配列にビオチン化タグを導入する必要なく、四量体生成のためのモノマーのビオチン化を可能にする、組換えｐＭＨＣの精製を促進する組換えＭＨＣクラスＩＩ分子を開発することが探求された。最初に、タンパク質Ａまたはタンパク質Ｇアフィニティークロマトグラフィーを使用して、ヘテロ二量体化ロイシンジッパーを運ぶが、ヒトＩｇＧ１  Ｆｃの「ノブ・イン・ホールのある」バージョンに融合し、培養上清からの精製に適用可能な組換えｐＭＨＣヘテロダイマーを作る、安定したＭＨＣクラスＩＩヘテロダイマーを生成することが探求された。対照として、ロイシンジッパーのないバージョン（図３の右側に示される）を生成し、不安定なｐＭＨＣヘテロダイマーを生成すると予想した。上記の実施例１に記載される構成物（図１Ａ、１Ｂ、および２）を発現させるために選び、ここでＭＨＣ複合体のアルファ鎖とベータ鎖は、Ｐ２Ａリボソームの飛び越し配列によって分離された２つの別個の鎖をコードする単一のＯＲＦによってコードされる。ＢｉｒＡビオチン化部位（１４  ａ．ａ．）（従来の酵素ベースのビオチン化用）、６ＸヒスチジンとＳｔｒｅｐ  ｔａｇ（必要が生じた場合に、さらに調製の純度を改善する）、およびＣ−末端システイン（マレイミド官能化ナノ粒子への結合を可能にする）もまた含まれた。しかしながら、ビオチン化部位、６Ｘヒスチジン、およびストレプトアビジンタグの存在は任意であり、ヘテロダイマーがタンパク質Ａ／Ｇ／Ｌを使用して精製可能であるように省くこともできることに留意すべきである。
【０２５４】
手短に言えば、ロイシンジッパーの有る、または無いマウスＢＤＣ２．５ｍｉ／ＩＡｇ７またはヒトＩＧＲＰ１３−２５／ＤＲＢ１＊０３０１  ｐＭＨＣクラスＩＩアルファ鎖を、ポリペプチド「ノブ」を含むように修飾されたヒトＩｇＧ１のＦｃ領域に拘束した。同様に、ペプチド−ＭＨＣベータ鎖構成物（ロイシンジッパー有り、および無し）を、ポリペプチド「ホール」を含むように修飾されたヒトＩｇＧ１のＦｃ領域に拘束した。ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯＳ：１−８と２７−３４は、対応するｐＭＨＣ−コードカセットのＤＮＡとアミノ酸配列をそれぞれ提供する。
【０２５５】
これらのｐＭＨＣ構成物を発現させるために、ｐＭＨＣ遺伝子を含むプラスミドをまず、ＨＩＶウイルスのコアをコードするプラスミドと共に２９３Ｔ細胞にトランスフェクトし、ウイルスパッケージングのためにタンパク質を包む。次に、パッケージングされたウイルス粒子を使用して、ＣＨＯ−Ｓ細胞を形質導入した。最高レベルのｅＧＦＰを示す、形質導入されたＣＨＯ−Ｓ細胞を、その後、ＦＡＣＳセルソーティングによって選択した。ＥＧＦＰの高い細胞をさらに拡張し、補完し、その後にｐＭＨＣ生成物の細胞株として使用した。
【０２５６】
Ｃ−Ｊｕｎ／Ｃ−Ｆｏｓロイシンジッパーの有る、またはＣ−Ｊｕｎ／Ｃ−Ｆｏｓロイシンジッパーのない、マウスＢＤＣ２．５ｍｉ／ＩＡｇ７コード構成物に労力を集中した。対応する細胞株での高レベルのｅＧＦＰ（フローサイトメトリーによって測定）によって記録されるように、構成物で形質導入された両方のＣＨＯ細胞株が遺伝子組換えＲＮＡを発現した。図４Ａは、それぞれ陰性対照ＣＨＯ細胞（４０１）（４０３）と比較した、Ｃ−Ｊｕｎ／Ｃ−Ｆｏｓロイシンジッパーの有る（４０２）、またはＣ−Ｊｕｎ／Ｃ−Ｆｏｓロイシンジッパーのない（４０４）、ＢＤＣ２．５ｍｉ／ＩＡｇ７コード構成物で形質導入されたＣＨＯ細胞を示す。ＣＨＯ−Ｓ細胞からの上清を濃縮し、透析を使用して除去した。濃縮培地中のｐＭＨＣを、タンパク質Ｇベースのアフィニティークロマトグラフィーに暴露し、酸性ｐＨで溶出した。図４Ｃは、驚いたことに、ＲＮＡメッセージを発現するにも関わらず、ロイシンジッパーを含むｐＭＨＣのノブ・イン・ホールを発現するＣＨＯ細胞株は、極めて低レベルのｐＭＨＣを生成した。タンパク質Ｇ溶出像からのピーク（４０６）を参照されたい（図４Ｃ）。図４Ｂで示されるように、最も予期しなかったことは、ジッパーのないｐＭＨＣノブ・イン・ホールを発現する細胞株が、豊富な量のタンパク質Ｇ結合物質を発現したことである。タンパク質Ｇ溶出像からのピーク（４０５）を参照されたい（図４Ｂ）。
【０２５７】
タンパク質Ｇアフィニティークロマトグラフィーによって回収されたジッパーのないｐＭＨＣ物質を定量化し、天然のおよび変質したＳＤＳ−ＰＡＧＥでの電気泳動を使用してその純度について分析した。図５は、タンパク質Ｇアフィニティークロマトグラフィーによって回収されたジッパーのないｐＭＨＣ物質が非還元条件での単一バンドとして作用し（マーカーの左）、および予期されたように、これらの分子種は、変質したＳＤＳ−ＰＡＧＥにおいて３つの別個のバンドとして作用し、パターンは、従来のＣ−Ｊｕｎ／Ｃ−Ｆｏｓロイシンジッパーベースの構成物を使用して発現させたｐＭＨＣで見られるものに著しく類似することを示す。非還元条件での単一バンドについては（５０１）と（５０２）を、および変性条件での３つのバンドについては（５０３）を参照されたい（図５）。
【０２５８】
＜実施例３：同族のＴ細胞へのｐＭＨＣ複合体の結合＞
同族のＴ細胞に特異的に結合する精製されたジッパーのないｐＭＨＣ複合体の能力を試験するために、精製された複合体をインビトロでビオチン化し、その後に陰イオン交換クロマトグラフィーによって精製した。ビオチン化されたフラクションをプールし、透析し、蛍光色素を結合したストレプトアビジンを使用してｐＭＨＣ四量体を調製するために使用した。次に、同族のＴ細胞にインビトロで特異的に結合するそれらの能力に関して、これらの試薬を試験した。ＢＤＣ２．５ｍｉ特異性Ｔ細胞レセプターを発現する遺伝子導入マウスからの脾臓のＣＤ４＋Ｔ細胞を使用したが、ほとんどのＣＤ４＋Ｔ細胞は同じ抗原特異性を共有する（高度なポリクローナル抗原ＴＣＲレパートリーを有することとは対照的）。陽性対照として、図２に記載されるＣ−Ｊｕｎ／Ｃ−Ｆｏｓロイシンジッパーベースの構成物を使用して発現させたｐＭＨＣモノマーを使用して生成された四量体を使用した。図６に示されるように、ジッパーのないノブ・イン・ホールのｐＭＨＣベースの四量体は、ジッパーの有る非ＦＣ融合結合体と本質的に同様に作用し、この新規なアプローチの実行可能性を実証した。
【０２５９】
＜実施例４：マレイミド官能化ナノ粒子へのジッパーのないｐＭＨＣの結合＞
このｐＭＨＣのジッパーのないバージョンが、そのＣ−末端の遊離したシステインを介してマレイミド官能化ナノ粒子に生産的に連結することができるかを確認するために、ＰＦ−Ｍａｌナノ粒子を精製したタンパク質でインキュベートし、その後にＭｉｌｔｅｎｙｉ−Ｂｉｏｔｅｃ磁気カラムを使用して、遊離したｐＭＨＣから結合体を生成して取り出した。図７の左のパネルは、遊離したｐＭＨＣ（Ｎ１レーン：６μｇでの２．５ｍｉ−ノブ・イン・ホール）対 ｐＭＨＣ結合ナノ粒子（Ｎ２レーン：６．４μＬで２．５ｍｉ−ノブ・イン・ホール−ＰＦＭ−０３１７１６、およびＮ３レーン：３．２μＬでの２．５ｍｉ−ノブ・イン・ホール−ＰＦＭ−０３１７１６）の天然ゲルの画像を示す。図は、調製においてほとんどのｐＭＨＣがナノ粒子に結合し、それらはゲルに入らないことを示す。図７の右パネルはＳＤＳ−ＰＡＧＥゲルの画像を示し、ここで同じ調製が変性条件下で実行され（１０％のＳＤＳ−ＰＡＧＥ）、ナノ粒子表面からｐＭＨＣを分離させた。レーン１はタンパク質階層を含み、およびレーン２は、６μｇで２．５ｍｉのノブ・イン・ホールを含んだ。レーン３は、６．４μＬで２．５ｍｉのノブ・イン・ホールのＰＦＭ−０３１７１６を含み、およびレーン４は、３．２μＬで２．５ｍｉのノブ・イン・ホールのＰＦＭ−０３１７１６を含んだ。画像は、ジッパーのないｐＭＨＣの両方の鎖がナノ粒子表面に生産的に結合されることを明示する。ｐＭＨＣ原子価の定量化は、各ナノ粒子上に４２ｐＭＨＣ、従来のジッパーのないｐＭＨＣモノマーで得られたものに匹敵する原子価があることを示した。
【０２６０】
＜実施例５：ジッパーのないｐＭＨＣナノ粒子を使用した自己調節性Ｔ細胞の拡張＞
インビボで同族の自己調節性ＣＤ４＋Ｔ細胞（Ｔ−制御性１型、ＴＲ１）の形成と拡張を引き起こす、ジッパーのないノブ・イン・ホールのｐＭＨＣでコーティングされたナノ粒子の能力は、そのジッパーの付いた従来のｐＭＨＣ（ノブ・イン・ホールなし）の相当物の場合のように、確認された。図８に示されるように、この化合物での処置に反応してインビボで拡張した同族の（四量体＋）ＣＤ４＋Ｔ細胞は、定量的リアルタイムＰＣＲによって判定されるように、それらの非同族の（四量体陰性）相当物と比較して、ＴＲ１関連ｍＲＮＡマーカーを発現した。図９Ａと図９Ｂは、これと一致して、インビボで拡張された（四量体＋）ＣＤ４＋Ｔ細胞が、それらの四量体の陰性相当物とは異なって、エクスビボでの抗ＣＤ３と抗ＣＤ２８ｍＡｂｓでの刺激に際してＴＲ１関連サイトカインを分泌したこと示す。したがって、これらのジッパーのないノブ・イン・ホールベースのｐＭＨＣヘテロダイマーは、ジッパーのある従来のｐＭＨＣのそれに類似する生物学的活性を有する。
【０２６１】
＜実施例６：ビオチン化（ＢｉｒＡ）タグを欠くジッパーのないｐＭＨＣヘテロダイマーの部位特異的ビオチン化＞
治療目的のために生成されたｐＭＨＣは、ビオチン分子を付けるためにＢｉｒＡ酵素によって標的とされるビオチン化配列等の、免疫反応性の標的であり得る外来性のタンパク質配列を欠く必要がある。ＢｉｒＡを介したｐＭＨＣのビオチン化は、ストレプトアビジンを使用し、四量体化に適したビオチン化ｐＭＨＣモノマーを生成するために、慣例的に使用される技術である。そのようなｐＭＨＣ四量体とその高位派生物（五量体、デキストラマー等、まとめて「多量体」として定義される）は、生体サンプル中の抗原特異性Ｔ細胞の頻度を列挙することができる試薬として有用である。ここで、ビオチン化タグなしｐＭＨＣモノマーからのｐＭＨＣ多量体の生成を可能にし、したがって治療目的のために生成されたｐＭＨＣモノマーの使用（例えばナノ粒子経由で送達）によってそれらの診断による派生物を生成するのを可能にする方法が、以下に記載される。
【０２６２】
これは、マレイミドで官能化されたビオイン結合ポリエチレングリコール（ＰＥＧ）スペーサーを介した、ＢＤＣ２．５ｍｉ／ＩＡｇ７モノマーのカルボキシ末端システインへの単一のビオチン分子の連結によって達成された。手短に言えば、異なる長さのｐＭＨＣおよびビオチン−ＰＥＧ−マレイミドリンカーを一晩インキュベートし、次に１２〜１４のｋＤ分子量の分画膜を通して広範に透析して、遊離したビオチン−ＰＥＧ−マレイミドを除去した。結果として得られた混合物をモノ−Ｑカラム上の陰イオン交換クロマトグラフィーに暴露し（図１０）、ＥＬＩＳＡによりビオチン化ｐＭＨＣ分子を含む溶出されたフラクションを特定した。図１０の（１００１）におけるピークＵＶ吸収度を参照せよ。次に、陽性フラクションを、ＳＤＳ−ＰＡＧＥゲルの変性に関して分析した。図１１に示されるように、フラクション２５、２７、２８、２９、３０、３１、３２、３３、および３４は、ビオチン化ｐＭＨＣの最高濃度を含んでいた。図１２に示されるように、ＭＨＣアルファ鎖に関するウェスタンブロットは、フラクション２５、２７、２８、２９、３０、３１、３２、３３、および３４がビオチン化ＭＨＣヘテロダイマーを含んだことを確証した。これらのフラクションに含まれていたｐＭＨＣ分子をその後、バッファ交換し、蛍光結合したストレプトアビジンを使用してｐＭＨＣ四量体を生成するために使用した。そのようなｐＭＨＣ四量体を次に、フローサイトメトリーを使用して、ＢＤＣ２．５Ｔ細胞レセプターの遺伝子組換えＣＤ４＋Ｔ細胞に結合するそれらの能力に関して試験した（図１３）。
【０２６３】
様々な長さのＰＥＧを用いた最初の実験は失敗だった。驚いたことに、２つのＰＥＧユニットのみを含む低分子量ビオチン−ＰＥＧ−マレイミドを使用する実験は、好成績をもたらし、少量の遊離した非結合ビオチン−ＰＥＧ−マレイミド分子の存在でさえも、四量体形成に干渉するのに十分であることを示唆した。
【０２６４】
＜実施例７：熱分解によるＰＥＧ化Ｆｅナノ粒子（ＮＰ）の合成（ＰＦＭ）＞
合成用の物質は、鉄（ＩＩＩ）アセチルアセトネート｛Ｆｅ（ａｃａｃ）３，Ｆｅ（Ｃ５Ｈ７Ｏ２）３｝、Ｍ．Ｗ．３５３．１７（Ｓｉｇｍａ−Ａｌｄｒｉｃｈ，Ｃａｔ＃５１７００３−５０Ｇ）；ベンジルエーテル｛（Ｃ６Ｈ５ＣＨ２）２Ｏ｝、Ｍ．Ｗ．１９８．２６（Ｓｉｇｍａ−Ａｌｄｒｉｃｈ，Ｃａｔ＃１０８０１４−１ＫＧ）；ヘキサン、ＣＨ３（ＣＨ２）４ＣＨ３、Ｍ．Ｗ．８６．１８（Ｓｉｇｍａ−Ａｌｄｒｉｃｈ，Ｃａｔ＃３４８５９−１Ｌ）；ＦｅＣｌ３．６Ｈ２Ｏ、Ｍ．Ｗ．２７０．３（Ｓｉｇｍａ−Ａｌｄｒｉｃｈ，Ｃａｔ＃４４９４４−５０Ｇ）；ｍＰＥＧ２０００−マレイミド（ＪｅｎＫｅｍ  Ｔｅｃｈ  ＵＳＡ，Ｃａｔ＃Ａ３２１４−１０）；
【０２６５】
【化１】
2020500015.tif 000022
半球ファブリック加熱マントル、５０ｍＬ（Ｓａｆｅｔｙ  Ｅｍｐｏｒｉｕｍ，ｌａｂ  ａｎｄ  ｓａｆｅｔｙ  ｓｕｐｐｌｉｅｓ，Ｉｔｅｍ＃：２０３１０）；ＤｉｇｉＴｒｉｌ  ＩＩ出力制御（Ｓａｆｅｔｙ  Ｅｍｐｏｒｉｕｍ，ｌａｂ  ａｎｄ  ｓａｆｅｔｙ  ｓｕｐｐｌｉｅｓ，Ｉｔｅｍ＃：２００１０）；５０ｍＬの円底の煮沸フラスコ（ＶＷＲ，Ｃａｔ＃８９０９１−４６４，２４／４０  Ｊｏｉｎｔ）；螺旋形のコンデンサ（ＶＷＲ，Ｃａｔ＃８９０５３−９３２，２４／４０  Ｊｏｉｎｔ）；スイングローターを備えたデスクトップ遠心分離機（Ｂｅｃｋｍａｎ  Ｃｏｕｌｔｅｒ，Ａｌｌｅｇｒａ  ２５Ｒ  ｃｅｎｔｒｉｆｕｇｅ）；ＳＳ５ローターを備えた高速遠心分離機（Ｓｏｒｖａｌｌ  ＲＣ−６  Ｐｌｕｓ，Ｔｈｅｒｍｏ  Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ）；ＳＳ５ローター用のアダプターを備えた３０ｍＬのガラス遠心分離管（Ｃｏｒｅｘ，Ｎｏ．８４４５）；ＬＳカラムと磁石（Ｍｉｌｔｅｎｙｉ  Ｂｉｏｔｅｃｈ，Ｃａｔ＃１３０−０４２−０４１）；透過電子顕微鏡（Ｈ７６５０、日立）；ＴＨＥＲＭＯＭＩＸＥＲ（登録商標）（Ｅｐｐｅｎｄｏｒｆ、２４ウェル）；分光光度計（ＵＶ−２５５０、ＳＨＩＭＡＤＺＵ）；および分光光度法用の微量キュベット（１００μＬ）を含んでいた。
【０２６６】
反応プロトコル：５０ｍＬの煮沸フラスコを、撹拌プレート上の加熱マントルに固定する。加熱マントルをＤｉｇｉＴｒｉｌ  ＩＩ出力制御につなぐ。ＰＥＧ２０００−マレイミド（１．５ｇ）を、煮沸フラスコに加える。温度を８０℃に設定し、ＰＥＧ物質が完全に解けるまでＰＥＧ物質を熱する。ベンジルエーテル（３．５ｍＬ）とＦｅ（ａｃａｃ）３（３５３ｍｇ）を、撹拌しながら煮沸フラスコに加える。混合物を１時間、１１０℃で脱水する。螺旋形のコンデンサを煮沸フラスコに取り付ける。混合物を２６０℃に加熱する。混合物の色が暗褐色から黒色に変わる。混合物を徐々に室温に冷ます前に、混合物の温度を還流で２時間、２６０℃に保つ。エンドトキシンを含まない水（２０ｍＬ）を混合物に加える。混合物を１本の５０ｍＬの円錐管に移し、２分間、活発に攪拌する。混合物を、ベンチトップサイズの遠心分離機を使用して２０分間、４，０００ｒｐｍで遠心分離にかける。ペレットを棄てる。ヘキサン（１５ｍＬ）を混合物に加えて、混合物を２分間、活発に攪拌する。混合物を、ベンチトップサイズの遠心分離機を使用して１０分間、４，０００ｒｐｍで遠心分離にかける。各チューブから黒い水性フラクション（粗製のフラクション）を回収し、５０ｍＬの円錐管に移す。ヘキサン洗浄を３回繰り返す。黒い溶液を、２本の３０ｍＬのガラス遠心分離管に移す。各チューブを、高速遠心分離機を使用して２０分間、２０，０００ｒｐｍで遠心分離にかける。黒い溶液を５０ｍＬの円錐管に移し、ペレットを棄てる。黒い溶液を、ＬＳカラムを使用して精製する（例えば、黒い溶液（２−３ｍＬ）を精製のために装填し、カラムに溶液を通して排水し、そしてカラムを５ｍＬの水で３回洗浄する）。清潔な５０ｍＬの円錐管の中に、ＬＳカラムに保持されたＮＰを押し入れることによって、精製されたＰＦＭ  ＮＰを回収する。ＰＦＭ  ＮＰ溶液を、０．４５μｍ、０．２μｍ、および０．１μｍの孔径の一連のシリンジフィルタデバイスに通すことによって殺菌する。
【０２６７】
生成物の特性評価：
１．粒子径と単分散：
１ａ．個々のＰＦＭ  ＮＰの酸化鉄コアサイズ：透過型電子顕微鏡（ＴＥＭ）分析。
【０２６８】
ＴＥＭ分析用のサンプル調製：ＰＦＭ  ＮＰ溶液（２０μＬ）を水（４０μＬ）に希釈し、希釈したＰＦＭ  ＮＰ（１０μＬ）溶液を、ポリビニルのホルムバール（Ｅｌｅｃｔｒｏｎ  Ｍｉｃｒｏｓｃｏｐｙ  Ｓｃｉｅｎｃｅｓ，カタログ＃  ＦＦ３００−Ｃｕ）またはカーボンフィルム（Ｅｌｅｃｔｒｏｎ  Ｍｉｃｒｏｓｃｏｐｙ  Ｓｃｉｅｎｃｅｓ，カタログ＃  ＣＦ３００−Ｃｕ）で覆われた銅グリッドの面に落とす。残りの溶液を濾紙で除去する。
【０２６９】
ＴＥＭ分析を、１０，０００Ｘから４０，０００Ｘの倍率で、Ｈ７６５０（日立）を使用して行なう。３０〜５０のＰＦＭ  ＮＰのサイズを測地して、平均サイズを得る（平均ＰＦＭ  ＮＰコアサイズは、１８−２０ｎｍであると予測される）。
【０２７０】
１ｂ．ＰＦＭ  ＮＰの流体力学的サイズ：動的光散乱（ＤＬＳ）分析。
ＰＦＭ  ＮＰ溶液（２０μＬ）をＤＬＳキュベット中の１ｍＬの水で希釈し、Ｚｅｔａ  ＮａｎｏＳｉｚｅｒユニット（Ｍｅｌｖｅｒｎ，ＵＫ）を使用して検査し、溶液中のＰＦＭ  ＮＰのＤＬＳサイズを判定する。〜４５−５０ｎｍの単一ピークが予測される。
【０２７１】
２．Ｆｅ濃度（分光光度分析）：
２ａ．Ｆｅ濃度基準：
【０２７２】
２ｍｇのＦｅ／ｍＬ標準溶液を、脱イオン化されたＨ２Ｏ（５ｍＬ）にＦｅＣｌ３．６Ｈ２Ｏ（４８．３ｍｇ）を溶解することによって調製する。標準溶液（２０μＬ）をミクロチューブ１の６Ｎ  ＨＣｌ（４００μＬ）に加える。ミクロチューブ１からの希釈された標準液（２００μＬ）を、２００のμＬの６Ｎ  ＨＣｌを含むミクロチューブ２に移す。ミクロチューブ２からの希釈された標準溶液（２００μＬ）を、６Ｎ  ＨＣｌ（２００μＬ）を含むミクロチューブ３に移す。希釈をさらに４回、繰り返す。
【０２７３】
２ｂ．サンプル溶液：
【０２７４】
ＰＦＭ  ＮＰ溶液（２０μＬ）をミクロチューブＳ１の６Ｎ  ＨＣｌ（４００μＬ）に加えて混ぜ合わせる。ミクロチューブＳ１からの希釈されたＰＦＭ  ＮＰ溶液（２００μＬ）を、６Ｎ  ＨＣｌ（２００μＬ）を含むミクロチューブＳ２に移す。ミクロチューブＳ２からの希釈されたＰＦＭ  ＮＰ溶液（２００μＬ）を、６Ｎ  ＨＣｌ（２００μＬ）を含むミクロチューブＳ３に移す。ＰＦＭ  ＮＰ溶液の希釈をさらに３回、繰り返す。
【０２７５】
２ｃ．サンプル加熱：
【０２７６】
連続的に希釈されたＦｅ標準溶液とＰＦＭ  ＮＰ溶液を含むミクロチューブを６０℃で３０分間、加熱し、次に室温に冷ます。
【０２７７】
２ｄ．分光光度法：
【０２７８】
Ａ４１０（λ＝４１０ｎｍ）でのＦｅ標準溶液とＰＦＭ  ＮＰ溶液の吸収は、微量キュベット（１００μＬ）を有する分光光度計を使用して測定される。
【０２７９】
２ｅ．計算：
【０２８０】
標準曲線をプロットする。ＰＦＭ  ＮＰ溶液のＦｅ濃度を計算する。
【０２８１】
３．表面電荷と化学作用
３ａ．ＰＦＭ  ＮＰの表面電荷：ゼータ電位の測定。
【０２８２】
ＰＦＭ  ＮＰ溶液（１００μＬ）を毛細管細胞において脱イオン水（１ｍＬ）で希釈する。ＰＦＭ  ＮＰのゼータ電位を、Ｚｅｔａ  ＮａｎｏＳｉｚｅｒユニット（Ｍｅｌｖｅｒｎ，ＵＫ）を使用して判定する。
【０２８３】
３ｂ．官能基を露出している面の分析：フーリエ変換赤外線（ＦＴ−ＩＲ）分光分析。
【０２８４】
対照サンプル：ｍＰＥＧ−Ｍａｌサンプルを、ＡＴＲ（減衰全反射）プレートに配置する。
【０２８５】
ＰＦＭ  ＮＰサンプル：ＰＦＭ  ＮＰ溶液（１０μＬ）を、ＡＴＲプレート上に落として風乾する。
【０２８６】
ＦＴ−ＩＲ分析：ＰＦＭ−ＮＰ面上に固定された対照のＰＥＧとＰＥＧのＦＴ−ＩＲスペクトルを、ＡＴＲ（減衰した全反射）モードで、Ｎｉｃｏｌｅｔ  ＦＴ−ＩＲ分光光度計により生成する。スペクトルの各々を、４ｃｍ−１のスペクトル分解で、２５６のスキャンの平均として記録する。
【０２８７】
＜実施例８：ｐＭＨＣ−ナノ粒子結合体（ｐＭＨＣ−ＰＦＭ）の調製＞
合成用の物質は、リン酸塩緩衝液食塩水（ＰＢＳ）、ｐＨ７．２−７．４；２００ｍＭのリン酸緩衝液、ｐＨ６．２；ＰＢＳ中のｐＭＨＣ−Ｃｙｓタンパク質（１−６ｍｇ／ｍＬ、１つのシステイン残基を分子設計によってｐＭＨＣアルファ鎖のＣ末端に加える）；１Ｍの塩化ナトリウム溶液；０．５ＭのＥＤＴＡ溶液、ｐＨ８．０；ＰＦＭ  ＮＰ溶液（１−３ｍｇ  Ｆｅ／ｍＬ）；ＬＳカラムと磁石（Ｍｉｌｔｅｎｙｉ  Ｂｉｏｔｅｃｈ，Ｃａｔ＃１３０−０４２−０４１）；透過型電子顕微鏡（Ｈ７６５０、日立）；ＴＨＥＲＭＯＭＩＸＥＲ（登録商標）（Ｅｐｐｅｎｄｏｒｆ、２４ウェル）；分光光度計（ＵＶ−２５５０、ＳＨＩＭＡＤＺＵ）；および分光光度法用の微量キュベット（１００μＬ）を含んでいた。
【０２８８】
結合反応プロトコル：ｐＭＨＣ−ｃｙｓタンパク質（Ｍ．Ｗ．〜５５ＫＤ）とＰＦＭ  ＮＰ（１８−２０ｎｍ、約１×１０１４  ＮＰ／ｍｇ  Ｆｅ）を、４０ｍＭ、ｐＨ６．２、１５０ｍＭのＮａＣｌと２ｍＭのＥＤＴＡを含むリン酸塩緩衝液中で、１００：１のモル比で混ぜ合わせる。反応溶液（１〜５ｍｇのＦｅ相当のＰＦＭ  ＮＰを含む）の全体積は１０ｍＬである。４０−５０％の回収率が、ｐＭＨＣタンパク質とＰＦＭ−ＮＰの両方に対して期待される。リン酸緩衝液、ｐＨ６．２（２．０ｍＬ）を１５本ｍＬの円錐管に加える。０．５ＭのＥＤＴＡ溶液（０．０４ｍＬ）を加え、１Ｍの塩化ナトリウム溶液を加えて１５０ｍＭでの最終濃度に合わせる。水を加えて、大量のタンパク質とＰＦＭのＮＰ溶液を含む最終反応物の体積を最大１０ｍＬにする。ｐＭＨＣタンパク質（３ｍｇ）を加える。反応物を、緩やかに振とうさせながら室温で一晩、インキュベートする。反応溶液を５０ｍＬの円錐管に移し、ＰＢＳ（３０ｍＬ）を加える。反応溶液を緩やかに振とうさせながら室温で３０分間、インキュベートする。反応溶液を、ＬＳカラムを使用して精製する（例えば、反応溶液（５ｍＬ）を精製のために装填し、カラムに溶液を通して排水し、そしてカラムを５ｍＬのＰＭＳで３回洗浄する）。１５ｍＬの円錐管の中に、ＬＳカラムに保持されたＮＰを押し入れることによって、精製されたＰＦＭ  ＮＰを回収する。精製されたｐＭＨＣ−ＰＦＭ  ＮＰ溶液を、０．４５μｍの孔径を有するシリンジフィルタデバイスに通すことによって殺菌する。ｐＭＨＣ−ＰＦＭ  ＮＰ溶液を４℃で保存する。
【０２８９】
生成物：ＰＢＳ（ｐＨ７．４）中の〜５０ｐＭＨＣ／ＮＰのｐＭＨＣ原子価を有するｐＭＨＣ−ＰＦＭ  ＮＰ。
【０２９０】
＜実施例９：ビオチン−ＰＥＧ−マレイミドを有するｐＭＨＣモノマーのビオチン化＞
ビオチン化反応
タンパク質（後部に遊離したシステインを有するクラスＩＩ  ｐＭＨＣ）（５．０ｍｇ）を、２ｍＭのＥＤＴＡを用いて、ｐＨ６．２（２．０ｍＬ）の４０ｍＭのリン酸塩緩衝液に溶解する。ＰＢＳ（１９０μＬ）をＥＺ−リンク−マレイミド−ＰＥＧ２−ビオチン（２．０ｍｇ）に加えて、２０ｍＭの原液を作る（Ｔｈｅｒｍｏ  Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ：カタログ＃２１９０２ＢＩＤ，Ｄｅｓｃｒｉｐｔｉｏｎ：ＥＺ−Ｌｉｎｋ（登録商標）Ｍａｌｅｉｍｉｄｅ−ＰＥＧ２−Ｂｉｏｔｉｎ，Ｎｏ−Ｗｅｉｇｈ（商標）Ｆｏｒｍａｔ，８×２ｍｇ）（これは毎回、新しく準備される）。原液（７８．１２μＬ）をタンパク質溶液に素早く加えた（これは、タンパク質に２０倍過剰のＭａｌ−ＰＥＧ２−ビオチンを供給する）。反応チューブをアルミホイルで覆って光から保護し、緩やかな振とう条件下で、室温で一晩、インキュベートした。過剰なＭａｌ−ＰＥＧ２−ビオチンを、少なくとも５回、１０ＫＤのアミコンウルトラ遠心式デバイス（Ｍｉｌｌｉｐｏｒｅ：カタログ＃  ＵＦＣ８０１０２４）を使用して、２０ｍＭのトリス、ｐＨ８．０との緩衝液の交換を行なうことによって、除去した。過剰なＭａｌ−ＰＥＧ２−ビオチンの除去を確実にするために、タンパク質溶液を一晩、２０ｍＭのトリス、ｐＨ８．０で、１２−１４ＫＤ分画膜（Ｓｐｅｃｔｒａ／ＰｏｒＲ：カタログ＃１３２６７８）を使用して透析する（過剰なＭａｌ−ＰＥＧ２−ビオチンの混入は、精製とビオチン特異性スクリーニングＥＬＩＳＡに干渉する場合もある）。タンパク質サンプルをモノ−Ｑ精製のために回収する。
【０２９１】
精製−モノ−Ｑ  ＩＥＸクロマトグラフィー
ラインＡを緩衝液Ａ［２０ｍＭのトリス、ｐＨ８．０］に入れ、およびラインＢを緩衝液Ｂ［２０ｍＭのトリス＋４００ｍＭのＮａＣｌ］に入れる。ｄｄＨ２Ｏ（１０−２０ｍＬ）をサンプルループに注入し、ほぼ〜０．５ｍＬを、サンプルループを洗い流すために手動で注入する。モノ−Ｑカラムと流量制限アダプター（ＦＲ９０２）をＦＰＬＣに取り付ける。カラムを緩衝液Ａで平衡させる。タンパク質ビオチン化反応混合物の体積は、２０ｍＭのトリス、ｐＨ８．０で５−１０ｍＬに増加する。混合物をスーパー・ループ（ＩＮＶ−９００）にシリンジで注入する。サンプルを注入してカラムに結合させ、未結合のタンパク質を押し流し、および結合タンパク質を緩衝液Ｂのグラジエントで溶出する。クロマトグラムピークに関係するすべての溶出フラクションを回収する。各作業後に、メーカーのプロトコルに従って、０．５ｍＬ／分の流速でカラムを洗浄し、最小２ｍＬの２Ｍ  ＮａＣｌ、４ｍＬの１Ｍ  ＮａＯＨ、および２ｍＬの２Ｍ  ＮａＣｌで再度、洗浄する。ベースラインが安定するまで、カラムを水で洗浄する（最低２ｍＬ）。必要であればカラムを清浄のために逆さまにする。ラインＡとＢを２０％のエタノールに入れ、ＰｕｍｐＷａｓｈを行い、その後に保管用のカラムの洗浄のために水洗する。次に、カラムと流量制限を取り除き、サンプルループから残余タンパク質を浄化する。
【０２９２】
ビオチン化モノマーの特定のためのＥＬＩＳＡ
複製して、ウェルにつきＰＢＳで合計１００μｌまで回収した２−２０μＬ（ピーク強度に依存）の各溶出フラクションで、ＥＬＩＳＡプレートをコーティングする。プレートを１−２時間、３７℃でインキュベートする。陽性対照は、１：２００希釈の抗マウスＫｄビオチンである。陰性対照はＰＢＳである。プレートを、ＰＢＳ中の１５０μＬ、０．０５％のＴｗｅｅｎ−２０で３回、洗浄する。１００μＬのＨＲＰ−Ｅｘｔｒａｖｉｄｉｎ（Ｓｉｇｍａ：カタログ＃Ｅ２８８６−１ＭＬ）を、ブロッキングバッファに１：２０００希釈（１％のＢＳＡ、ＰＢＳ中の０．０２％のＮａＮ３）で、ウェルごとに加えて、プレートを３０分間、室温でインキュベートする。プレートを、ＰＢＳ中の１５０μＬ、０．０５％のＴｗｅｅｎ−２０で３回、洗浄する。あらかじめ暖めたＴＭＢ基質（１００μＬ）をウェルごとに加え、（色変化に応じて）プレートを暗やみで室温で１５−３０分間インキュベートする。２ＮのＨ２ＳＯ４（５０μＬ）をウェルごとに加えて反応を停止させる。プレートをＯＤ４５０−５７０ｎｍで評価する。陰性対照は、〜０．００５のＯＤ４５０−５７０ｎｍであるべきである。陽性対照は、〜３のＯＤ４５０−５７０ｎｍであるべきである。良好な陽性サンプルは、２〜３のＯＤ４５０−５７０ｎｍ読み取りを有する。
【０２９３】
ビオチン化モノマーの識別のためのＳＤＳ  ＰＡＧＥとウェスタンブロット
モノ−Ｑ精製のフラクションの各々にＳＤＳ  ＰＡＧＥを行い（ピーク強度に応じて、１０−２０μＬ／ウェル）、所望の横縞模様を有するタンパク質フラクションを特定する。ウェスタンブロット分析のために：他のＳＤＳ  ＰＡＧＥを、ウェルあたり２μｇの各フラクションで実行する。ゲルを１５分間、転写バッファでインキュベートする（転写バッファ：２５ｍＭのトリス、１９０ｍＭのグリシン、２０％のメタノール、ｐＨ８．３）。転写サンドイッチをアセンブルし、１５分間、１８Ｖの定電圧で転写する。膜を１時間、ブロッキングバッファでインキュベートする（ブロッキングバッファ：ｐＨ７．５の１５０ｍＭの塩化ナトリウムを有する、２０ｍＭのトリス緩衝液中の３％のＢＳＡ）。膜を室温で１時間、ＨＲＰ−Ｅｘｔｒａｖｉｄｉｎ（ブロッキングバッファに１：２０００で希釈）でインキュベートする。膜をＴＢＳＴで５回洗浄する（ＴＢＳＴ：２０ｍＭのトリス、１５０ｍＭのＮａＣｌ、０．１％のＴｗｅｅｎ２０、ｐＨ７．５）。化学発光基質を加えることによって画像を得る（Ｔｈｅｒｍｏ  Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ：カタログ＃３４０８７）（アルファ鎖の位置での単一バンドが期待される）。
【０２９４】
ビオチン化モノマーの回収
ＥＬＩＳＡ、ＳＤＳ  ＰＡＧＥ、およびウェスタンブロット分析に応じて、所望のフラクションをプールし、ＰＢＳへのバッファ交換を、１０ＫＤのアミコンウルトラ遠心式デバイスを使用して行なう。ビオチン化モノマーの濃度をブラッドフォード法によって測定し、透明なラベルの付いたいくつかのチューブに等分する。
【０２９５】
同族のＣＤ４＋Ｔ細胞を染色するためにストレプトアビジン−ＰＥを使用してｐＭＨＣ四量体を調製するが、これはおそらく、過剰である遊離した未結合のビオチン−ＰＥＧ−マレイミド分子が適切に除去されず、したがって四量体形成に干渉するためである。物質を−８０℃で保存する。
【０２９６】
＜実施例１０：Ｃｙｓ捕捉されたロイシンジッパーのないノブ・イン・ホールのｐＭＨＣヘテロダイマーは、ｐＭＨＣヘテロダイマーを安定させる＞
ノブ・イン・ホールの構造は、いくつかのペプチドＭＨＣクラスＩＩヘテロダイマーにとって十分である。しかしながら、いくつかのヘテロダイマーはさらなる安定化を必要とする。ＩＧＲＰ１３−２５ポリペプチドとの複合体中のＨＬＡ  ＤＲ３ヘテロダイマーは、図１４ＡのＦＰＬＣ（１４０１）像での溶出ピークの欠如、および図１４Ｃに示される溶出フラクションのＳＤＳ−ＰＡＧＥゲルによって示されるように、ノブ・イン・ホールで構成されてロイシンジッパーのない場合に、発現に失敗した。ホール−βドメイン（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：６１）にＩＧＲＰポリペプチドを連結するスペーサー間のＩＧＲＰ１３−２５のＣ末端にシステインを導入し、ノブ−αドメイン（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：６０）で発現させた時、安定したヘテロダイマーを形成することができた。図１４Ｂの溶出ピーク、および図１４ＤのＳＤＳ−ＰＡＧＥを参照せよ。
【０２９７】
＜実施例１１：ＩＧＲＰ１３−２５／ＤＲ３  ｐＭＨＣヘテロダイマーは同族のＴＣＲを発現する細胞株に結合する＞
次に、Ｔ細胞レセプターを結合する、ｃｙｓ捕捉された、ジッパーのない、ノブ・イン・ホールのＩＧＲＰ１３−２５ｐＭＨＣ−ＤＲ３ヘテロダイマーの能力を試験した。これについては、ＩＧＲＰ１３−２５ｐＭＨＣ−ＤＲ３に特異的なヒトＴ細胞レセプターからα鎖とβ鎖を発現するリポーター細胞株を使用した。
【０２９８】
ＩＧＲＰ−ＴＣＲをコードするレトロウイルスでの、ＪＵＲＭＡ−ｈＣＤ４細胞株の形質導入プロトコル
ＧＰ＋ＥｎｖＡＭ１２パッケージング細胞株の生成。我々は、ｇａｇ／ｐｏｌとＶＳＶパッケージング構成物と共に、ＩＧＲＰ−ＴＣＲとＧＦＰリポーターを発現するレトロウイルスと２９３Ｔ細胞をトランスフェクトした。３日後に、ＶＳＶ−偽型強化上清を採取し、等分し、凍結した。これらのアリコートを使用して、Ｓｐｉｎ  Ｉｉｎｆｅｃｔｉｏｎ法（２７００ｒｐｍ  １時間）によって両指向性パッケージング細胞株ＧＰ＋ｅｎｖＡｍ１２（ＡＴＣＣ  ＣＲＬ−９６４１）を形質導入した。５回のＳｐｉｎ  Ｉｎｆｅｃｔｉｏｎ法の後、形質導入されたＧＰ＋ｅｎｖＡｍ１２を、必要に応じてＧＦＰの発癌に関して選別した。
【０２９９】
ＩＧＲＰ−ＴＣＲをコードするレトロウイルスでの、ＪＵＲＭＡ−ｈＣＤ４細胞株の形質導入
３００万の形質導入され、選別されたＧＰ＋ｅｎｖＡｍ１２を、３ｍｌの最終体積で６ウェルプレートのウェルごとに平板培養した。翌日、１００，０００のＪＵＲＭＡ−ｈＣＤ４を、８ｕｇ／ｍｌのポリブレンを補った３ｍｌの最終体積で、あらかじめ平板培養され形質導入されたＧＰ＋ｅｎｖＡｍ１２と共培養した。この共培養を、２日または３日おきに培地を変えながら２週間、保全した。共培養の後、ＪＵＲＭＡ−ｈＣＤ４細胞を採取し、フローサイトメトリーによって分析し、高い遺伝子組換え発現に関して選別した。次に細胞を、ＰＥ標識ヘテロダイマーで染色した。図１５Ａは、陰性対照として未染色細胞を示し、図１５Ｄは無関係の四量体で染色された細胞を示し、図１５Ｂは、ｃｙｓ捕捉とロイシンジッパー技術を使用して発現させたヘテロダイマーから作られた四量体での染色を表し、図１５Ｃは、ロイシンジッパーのない、ｃｙｓ捕捉とノブ・イン・ホールの技術を使用して発現されたヘテロダイマーから作られた四量体を表す。いずれかの技術を使用して作られたヘテロダイマー間の染色は堅調だった。これらのデータは、ジッパーのない、ｃｙｓ捕捉されたノブ・イン・ホールの技術を使用して作られたヘテロダイマーがＴ細胞レセプターを結合することができることを実証する。
【０３００】
＜実施例１２．ＩＧＲＰ１３−２５／ＤＲ３ ノブ・イン・ホールのｐＭＨＣヘテロダイマーは、インビトロでレポーター細胞株を刺激する＞
Ｔ細胞信号を刺激するために酸化鉄ナノ粒子に付けられた時の、ｃｙｓ捕捉された、ノブ・イン・ホールのある安定したヘテロダイマーの能力を、ＮＦＡＴプロモーターの制御下で、ヒトＩＧＲＰ１３−２５  ＴＣＲを発現するＪｕｒｍａ細胞およびルシフェラーゼを使用して試験した。図１６Ａと図１６Ｂに示されるこれらの結果は、ｃｙｓ捕捉、ノブ・イン・ホールのある安定したヘテロダイマーが、酸化鉄ナノ粒子に取り付けられた時に、Ｔ細胞シグナリングを誘発可能であることを示す。
【０３０１】
特定の実施形態が例示され記載されてきたが、以下の特許請求の範囲に規定されるそのより広い態様の技術から逸脱することなく、当業者による変更と修正が可能であることを理解すべきである。
【０３０２】
本明細書に例示される実施形態は、本明細書に具体的には開示されない要素や限定がなくとも適切に実施され得る。したがって例えば、用語「含む（ｃｏｍｐｒｉｓｉｎｇ）」、「含む（ｉｎｃｌｕｄｉｎｇ）」、「含む（ｃｏｎｔａｉｎｉｎｇ）」等は、広く、限定なく読み取るべきである。付加的に、本明細書において使用される用語と表現は、限定ではなく記述の用語として使用され、およびそのような用語と表現の使用に、示され記載される特徴またはそれらの一部の同等物を除外する意図はなく、様々な修正が請求される技術の範囲内で可能であることが認識される。付加的に、フレーズ「実質的に成る」は、具体的に列挙された要素と、請求される技術の基本的かつ新規な特性に実質的に影響を与えない追加の要素を含むことが理解されるだろう。用語「から成る」は、規定されていないすべての要素を排除する。
【０３０３】
本開示は、本出願に記載される特定の実施形態の観点に限定されはしない。当業者に明白であろうように、その精神と範囲から逸脱することなく、多くの修正と変形が可能である。本開示の範囲内にある機能的に同等の方法と組成物は、本明細書に列挙されたものに加えて、前述の記述から当業者に明白になるだろう。そのような修正と変更は、添付の特許請求の範囲内にあることが意図される。本開示は、そのような特許請求の範囲に権利が与えられる同等物の全範囲と共に、添付の特許請求の範囲の用語によってのみ限定される。本明細書で使用される用語が、特定の実施形態を記載する目的のためだけのものであり、限定を意図していないことも理解されるべきである。
【０３０４】
加えて、本開示の特徴または態様がマーカッシュ群の観点から記載されている場合、当業者は、本開示がまた、マーカッシュ群の任意の個々のメンバーまたはメンバーのサブグループの観点から記載されていることを認識するであろう。
【０３０５】
当業者によって理解されるであろうように、任意のまたはすべての目的のために、とりわけ文書での記述を提供するという点において、本明細書に開示されるすべての範囲は、任意のまたはすべての可能なサブ範囲、およびそれらのサブ範囲の組み合わせを包含する。表記された範囲はいずれも、十分に記載されており、かつ同じ範囲を少なくとも半分、３分の１、４分の１、５分の１、１０分の１等に分けることができると、容易に認識され得る。非限定的な例として、本明細書で論じられる各範囲は、下３分の１、真ん中３分の１、および上３分の１等に容易に分けることができる。さらに当業者によって理解されるであろうように、「最大」、「少なくとも」、「より多い」、「未満」等のすべての用語は、列挙された数を含み、および上記されたサブ範囲へと後々に分けることができる範囲を指す。最後に、当業者によって理解されるであろうように、範囲は個々の構成員の各々を包含する。
【０３０６】
全ての刊行物、特許出願、発行された特許、および本明細書で言及される他の文書は、個々の刊行物、特許出願、発行された特許、または他の文書の各々が、その全体が参照により組み込まれるよう具体的かつ個別に指示されているかのごとく、参照により本明細書に組み込まれる。参照により組み込まれたテキストに含まれる定義は、本開示の定義と矛盾するならば排除される。
【図１Ａ】
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【図１Ｂ】
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【図２】
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【図３】
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【図４Ａ】
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【図４Ｂ】
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【図４Ｃ】
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【図５】
2020500015.tif 000030
【図６】
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【図７】
2020500015.tif 000032
【図８】
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【図９Ａ】
2020500015.tif 000034
【図９Ｂ】
2020500015.tif 000035
【図１０】
2020500015.tif 000036
【図１１】
2020500015.tif 000037
【図１２】
2020500015.tif 000038
【図１３】
2020500015.tif 000039
【図１４Ａ】
2020500015.tif 000040
【図１４Ｂ】
2020500015.tif 000041
【図１４Ｃ】
2020500015.tif 000042
【図１４Ｄ】
2020500015.tif 000043
【図１５Ａ】
2020500015.tif 000044
【図１５Ｂ】
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【図１５Ｃ】
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【図１５Ｄ】
2020500015.tif 000047
【図１６Ａ】
2020500015.tif 000048
【図１６Ｂ】
2020500015.tif 000049
【配列表】
2020500015000001.app
【国際調査報告】
2020500015.tif 000050
2020500015.tif 000051
2020500015.tif 000052