(57)【要約】本明細書では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドおよび免疫調節タンパク質、ならびにそのようなタンパク質をコードする核酸が提供される。免疫調節タンパク質は、自己免疫性または炎症性状態の治療のためを含む、様々な疾患適用のための治療的有用性を提供する。そのようなタンパク質を作製および使用するための組成物および方法が提供される。2020536552.tif 000049
2020536552.tif 000002
【特許請求の範囲】
【請求項１】
ＩｇＶドメインまたはその特異的結合断片を含む変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドであって、非改変ＣＴＬＡ−４ポリペプチドまたはその特異的結合断片中に１つ以上のアミノ酸改変を含み、前記非改変ＣＴＬＡ−４と比較して増加した親和性でＩＣＯＳＬの外部ドメインに特異的に結合する、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
【請求項２】
前記非改変ＣＴＬＡ−４ポリペプチドまたはその特異的結合断片中に、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２に記載の位置に関して、６、１０、１２、１４、１５、１６、１８、１９、２０、２２、２４、２６、２７、２８、２９、３０、３３、３５、３７、３８、４１、４２、４３、４５、４６、４７、４８、５３、５４、５５、５６、５８、５９、６１、６３、６４、６５、６７、６９、７１、７２、７３、７５、７６、８２、８５、８６、８７、８９、９１、９３、９５、９６、９７、９８、９９、１０５、１０６、１０８、１１０、１１３、１１５、１１６、１１７、１１８、１１９、１２０、１２１、および１２２の中から選択される位置に対応する１つ以上のアミノ酸改変を含む、請求項１に記載の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
【請求項３】
ＩｇＶドメインまたはその特異的結合断片を含む変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドであって、非改変ＣＴＬＡ−４ポリペプチドまたはその特異的結合断片中に、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２に記載の位置に関して、６、１０、１２、１４、１５、１６、１８、１９、２０、２２、２４、２６、２７、２８、２９、３０、３３、３５、３７、３８、４１、４２、４３、４５、４６、４７、４８、５３、５４、５５、５６、５８、５９、６１、６３、６４、６５、６７、６９、７１、７２、７３、７５、７６、８２、８５、８６、８７、８９、９１、９３、９５、９６、９７、９８、９９、１０５、１０６、１０８、１１０、１１３、１１５、１１６、１１７、１１８、１１９、１２０、１２１、および１２２の中から選択される位置に対応する１つ以上のアミノ酸改変を含む、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
【請求項４】
前記アミノ酸改変が、アミノ酸置換、欠失、または挿入を含む、請求項１〜３のいずれか一項に記載の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
【請求項５】
前記非改変ＣＴＬＡ−４ポリペプチドが、哺乳動物ＣＴＬＡ−４ポリペプチドまたはその特異的結合断片である、請求項１〜４のいずれか一項に記載の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
【請求項６】
前記非改変ＣＴＬＡ−４ポリペプチドが、ヒトＣＴＬＡ−４ポリペプチドまたはその特異的結合断片である、請求項５に記載の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
【請求項７】
前記変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドが、ヒトＣＴＬＡ−４の細胞外ドメインを含み、前記１つ以上のアミノ酸改変が、前記非改変ＣＴＬＡ−４ポリペプチドの前記細胞外ドメインの１つ以上の残基中にある、請求項１〜６のいずれか一項に記載の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
【請求項８】
前記非改変ＣＴＬＡ−４ポリペプチドが、
（ｉ）ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２に記載のアミノ酸の配列、
（ｉｉ）ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２と少なくとも９５％の配列同一性を有するアミノ酸の配列、または
（ｉｉｉ）ＩｇＶドメインもしくは前記ＩｇＶドメインの特異的結合断片を含むその一部分
を含む、請求項１〜７のいずれか一項に記載の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
【請求項９】
前記非改変ＣＴＬＡ−４が、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２に記載のアミノ酸の配列を含む、請求項１〜８のいずれか一項に記載の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
【請求項１０】
前記ＩｇＶドメインの前記特異的結合断片が、少なくとも５０、６０、７０、８０、９０、１００、１１０もしくはそれ以上のアミノ酸の長さを有するか、または
前記ＩｇＶドメインの前記特異的結合断片が、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１の残基３９〜１４０として記載される前記ＩｇＶドメインの長さの少なくとも８０％である長さを含む、請求項１〜８のいずれか一項に記載の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
【請求項１１】
前記変異型ＣＴＬＡ−４が、最大１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、または２０個のアミノ酸改変、任意選択的に、アミノ酸置換、挿入、および／または欠失を含む、請求項１〜１０のいずれか一項に記載の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
【請求項１２】
ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２と少なくとも８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、または９９％の配列同一性を示すアミノ酸の配列またはその特異的結合断片を含む、請求項１〜１１のいずれか一項に記載の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
【請求項１３】
ＩＣＯＳＬ、ＣＤ８０、および／またはＣＤ８６の外部ドメインに対し、同じ外部ドメインに対する前記非改変ＣＴＬＡ−４ポリペプチドの結合と比較して増加した親和性で、特異的に結合する、請求項３〜１２のいずれか一項に記載の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
【請求項１４】
ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２に記載のヒトＣＴＬＡ−４の細胞外ドメイン中に１つ以上のアミノ酸改変を含む変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドであって、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２に記載の細胞外ドメインを含む前記ＣＴＬＡ−４と比較して増加した親和性で、ヒトＩＣＯＳＬ、ＣＤ８０、および／またはＣＤ８６の外部ドメインに特異的に結合する、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
【請求項１５】
前記１つ以上のアミノ酸改変が、
2020536552.tif 000031
、またはそれらの保存的アミノ酸置換から選択される、請求項１〜１４のいずれか一項に記載の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
【請求項１６】
2020536552.tif 000032
2020536552.tif 000033
2020536552.tif 000034
2020536552.tif 000035
の中から選択される１つ以上のアミノ酸改変を含む、請求項１〜１５のいずれか一項に記載の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
【請求項１７】
ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：４〜９７、９９〜１０４、１０６〜１５５、もしくは５７０〜６３７のうちのいずれかに記載のアミノ酸の配列、またはその特異的結合断片、あるいは
ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：４〜９７、９９〜１０４、１０６〜１５５、もしくは５７０〜６３７のうちのいずれかと少なくとも９５％の配列同一性を示し、かつ前記アミノ酸改変のうちの１つ以上を含有する、アミノ酸の配列、またはその特異的結合断片
を含む、請求項１〜１６のいずれか一項に記載の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
【請求項１８】
ＩＣＯＳＬの外部ドメインに対し、同じ外部ドメインに対する前記非改変ＣＴＬＡ−４の結合と比較して増加した親和性で、特異的に結合する、請求項３〜１７のいずれか一項に記載の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
【請求項１９】
前記１つ以上のアミノ酸改変が、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２に記載の位置に関して、１０、１２、１６、１８、１９、２６、２８、２９、３３、３５、３８、４２、４５、４７、５３、５５、５６、５８、６１、６３、６４、６５、６７、６９、７２、７６，８２、８５、８７、８９、９３、９７、９８、９９、１０５、１０６、１０８、１１０、１１３、１１６、１１７、または１２１の中から選択される位置に対応する位置にある、請求項１〜１８のいずれか一項に記載の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
【請求項２０】
前記１つ以上のアミノ酸改変が、
2020536552.tif 000036
の中から選択される、請求項１〜１９のいずれか一項に記載の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
【請求項２１】
前記１つ以上のアミノ酸改変が、
2020536552.tif 000037
、またはそれらの保存的アミノ酸置換から選択される、請求項１〜１９のいずれか一項に記載の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
【請求項２２】
前記１つ以上のアミノ酸改変が、
2020536552.tif 000038
である、請求項１〜２１のいずれか一項に記載の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。いくつかの実施形態では、前記アミノ酸置換が、
2020536552.tif 000039
である。
【請求項２３】
前記１つ以上のアミノ酸改変が、位置１２、２６、６３、９８、もしくは１０５に対応する位置に１つ以上の改変を含み、かつ／または前記１つ以上のアミノ酸改変が、Ｌ１２Ｐ、Ｌ１２Ｆ、Ａ２６Ｔ、Ｌ６３Ｐ、Ｌ９８Ｑ、もしくはＹ１０５Ｌから選択される１つ以上の改変を含む、請求項１〜２０のいずれか一項に記載の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
【請求項２４】
2020536552.tif 000040
の中から選択される１つ以上のアミノ酸改変を含む、請求項１〜２３のいずれか一項に記載の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
【請求項２５】
ＣＤ８０の外部ドメインに対し、同じ外部ドメインに対する前記非改変ＣＴＬＡ−４の結合と比較して増加した親和性で、特異的に結合する、請求項３〜１７のいずれか一項に記載の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
【請求項２６】
前記１つ以上のアミノ酸改変が、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２に記載の位置に関して、１０、１２、１６、１８、２６、２９、４２、４５、５３、５６、５８、６３、６７、７２、８２、８７、９７、９８、９９、１０５、１０８、または１２１の中から選択される位置に対応する位置にある、請求項３〜１７、および２５のいずれか一項に記載の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
【請求項２７】
前記１つ以上のアミノ酸改変が、Ｖ１０Ａ、Ｌ１２Ｆ、Ｒ１６Ｈ、Ｉ１８Ｔ、Ａ２６Ｔ、Ｇ２９Ｗ、Ｅ３３Ｖ、Ａ４２Ｖ、Ｑ４５Ｈ、Ｔ５３Ｓ、Ｍ５５Ｔ、Ｍ５６Ｋ、Ｍ５６Ｔ、Ｎ５８Ｓ、Ｌ６３Ｐ、Ｉ６７Ｎ、Ｑ８２Ｒ、Ｍ８７Ｋ、Ｍ８７Ｖ、Ｅ９７Ｑ、Ｌ９８Ｑ、Ｍ９９Ｌ、Ｙ１０５Ｌ、Ｉ１０８Ｖ、またはそれらの保存的アミノ酸置換から選択される、請求項３〜１７、２５、および２６のいずれか一項に記載の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
【請求項２８】
前記１つ以上のアミノ酸改変が、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２に記載の位置に関して、Ｖ１０Ａ、Ｌ１２Ｆ、Ｒ１６Ｈ、Ｉ１８Ｔ、Ａ２６Ｄ、Ａ２６Ｔ、Ｇ２９Ｗ、Ａ４２Ｖ、Ｑ４５Ｈ、Ｔ５３Ｓ、Ｍ５６Ｋ、Ｍ５６Ｔ、Ｎ５８Ｓ、Ｌ６３Ｐ、Ｉ６７Ｎ、Ｓ７２Ｇ、Ｑ８２Ｒ、Ｍ８７Ｋ、Ｍ８７Ｖ、Ｅ９７Ｑ、Ｌ９８Ｑ、Ｍ９９Ｌ、Ｙ１０５Ｌ、Ｉ１０８Ｖ、またはＰ１２１Ｓの中から選択される位置に対応する位置にある、請求項３〜１７、２５、および２６のいずれか一項に記載の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
【請求項２９】
前記１つ以上のアミノ酸改変が、
2020536552.tif 000041
の中から選択される、請求項３〜１７、および２５〜２８のいずれか一項に記載の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
【請求項３０】
前記１つ以上のアミノ酸改変が、
2020536552.tif 000042
の中から選択される、請求項３〜１７、および２５〜２８のいずれか一項に記載の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
【請求項３１】
前記１つ以上のアミノ酸改変が、
2020536552.tif 000043
の中から選択される、請求項３〜１７、２５〜２８、および３０のいずれか一項に記載の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
【請求項３２】
ＩＣＯＳＬおよびＣＤ８０の外部ドメインに対し、同じ外部ドメインに対する前記非改変ＣＴＬＡ−４の結合と比較して増加した親和性で、特異的に結合する、請求項１〜２９のいずれか一項に記載の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
【請求項３３】
前記１つ以上のアミノ酸改変が、Ｖ１０Ａ、Ｌ１２Ｆ、Ｒ１６Ｈ、Ｉ１８Ｔ、Ａ２６Ｔ、Ｇ２９Ｗ、Ｅ３３Ｖ、Ａ４２Ｖ、Ｑ４５Ｈ、Ｔ５３Ｓ、Ｍ５５Ｔ、Ｍ５６Ｋ、Ｎ５８Ｓ、Ｌ６３Ｐ、Ｉ６７Ｎ、Ｑ８２Ｒ、Ｍ８７Ｋ、Ｍ８７Ｖ、Ｅ９７Ｑ、Ｌ９８Ｑ、Ｍ９９Ｌ、Ｙ１０５Ｌ、Ｉ１０８Ｖ、またはそれらの保存的アミノ酸置換から選択される、請求項１〜３２のいずれか一項に記載の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
【請求項３４】
前記１つ以上のアミノ酸改変が、Ｉ１８Ｔ、Ａ２６Ｔ、Ｇ２９Ｗ、Ｅ３３Ｖ、Ｑ４５Ｈ、Ｔ５３Ｓ、Ｍ５６Ｋ、Ｎ５８Ｓ、Ｌ６３Ｐ、Ｉ６７Ｎ、Ｑ８２Ｒ、Ｍ８７Ｋ、Ｍ８７Ｖ、Ｅ９７Ｑ、Ｌ９８Ｑ、Ｍ９９Ｌ、Ｙ１０５Ｌ、Ｉ１０８Ｖから選択される、請求項１〜３３のいずれか一項に記載の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
【請求項３５】
ＣＤ８６の外部ドメインに対し、同じ外部ドメインに対する前記非改変ＣＴＬＡ−４の結合と比較して増加した親和性で、特異的に結合する、請求項３〜１７のいずれか一項に記載の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
【請求項３６】
前記１つ以上のアミノ酸改変が、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２に記載の位置に関して、１０、１２、１６、１８、２０、２６、２８、２９、３０、３３、４２、４７、５３、５５、５６、５８、５９、６１、６３、６５、６７、６９，７２、７６、８２、８５、８７、８９、９３、９６、９８、９９、１０２、１０５、１０６、１０８、１１３、１１５、１１６、１１７、または１２１の中から選択される位置に対応する位置にある、請求項３〜１７、および３５のいずれか一項に記載の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
【請求項３７】
前記１つ以上のアミノ酸改変が、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２に記載の位置に関して、
2020536552.tif 000044
の中から選択される位置に対応する位置にある、請求項３〜１７、３５、および３６のいずれか一項に記載の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
【請求項３８】
前記１つ以上のアミノ酸改変が、
2020536552.tif 000045
、またはそれらの保存的アミノ酸置換から選択される、請求項３〜１７、３５、および３６のいずれか一項に記載の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
【請求項３９】
前記１つ以上のアミノ酸改変が、
2020536552.tif 000046
2020536552.tif 000047
の中から選択される、請求項３〜１７、および３５〜３８のいずれか一項に記載の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
【請求項４０】
前記１つ以上のアミノ酸改変が、
2020536552.tif 000048
の中から選択される、請求項３〜１７、および３５〜３８のいずれか一項に記載の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
【請求項４１】
ＣＤ８０およびＣＤ８６の外部ドメインに対し、同じ外部ドメインに対する前記非改変ＣＴＬＡ−４の結合と比較して増加した親和性で、特異的に結合する、請求項３〜１７、および２５〜４０のいずれか一項に記載の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
【請求項４２】
前記１つ以上のアミノ酸改変が、Ｉ１８Ｔ、Ａ２６Ｔ、Ｇ２９Ｗ、Ｅ３３Ｖ、Ａ４２Ｖ、Ｔ５３Ｓ、Ｎ５８Ｓ、Ｌ６３Ｐ、Ｉ６７Ｎ、Ｑ８２Ｒ、Ｍ８７Ｋ、Ｍ８７Ｖ、Ｌ９８Ｑ、Ｍ９９Ｌ、Ｙ１０５Ｌ、Ｉ１０８Ｖから選択される、請求項３〜１７、および２５〜４１のいずれか一項に記載の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
【請求項４３】
ＩＣＯＳＬおよびＣＤ８６の外部ドメインに対し、同じ外部ドメインに対する前記非改変ＣＴＬＡ−４の結合と比較して増加した親和性で、特異的に結合する、請求項１〜２４、および３５〜４０のいずれか一項に記載の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
【請求項４４】
前記１つ以上のアミノ酸改変が、Ｌ１２Ｆ、Ｒ１６Ｈ、Ｉ１８Ｔ、Ｉ１８Ｖ、Ａ２６Ｔ、Ｇ２９Ｗ、Ｅ３３Ｍ、Ｅ３３Ｖ、Ａ４２Ｖ、Ｔ４７Ａ、Ｔ５３Ｓ、Ｍ５５Ｔ、Ｍ５６Ｋ、Ｍ５６Ｖ、Ｎ５８Ｄ、Ｎ５８Ｓ、Ｔ６１Ｒ、Ｌ６３Ｐ、Ｄ６５Ｇ、Ｉ６７Ｎ、Ｉ６７Ｖ、Ｔ６９Ｉ、Ｓ７２Ｇ、Ｑ７６Ｒ、Ｑ８２Ｈ、Ｑ８２Ｒ、Ｒ８５Ｇ、Ｍ８７Ｋ、Ｍ８７Ｖ、Ｔ８９Ａ、Ｔ８９Ｓ、Ｌ９８Ｑ、Ｍ９９Ｌ、Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１０６Ｉ、Ｌ１０６Ｒ、Ｉ１０８Ｆ、Ｉ１０８Ｖ、Ｑ１１３Ｈ、Ｉ１１７Ｌ、およびＰ１２１Ｓ、またはそれらの保存的アミノ酸置換から選択される、請求項１〜２４、および３５〜４０、ならびに４３のいずれか一項に記載の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
【請求項４５】
前記１つ以上のアミノ酸改変が、Ｌ１２Ｆ、Ｒ１６Ｈ、Ｉ１８Ｔ、Ｉ１８Ｖ、Ａ２６Ｔ、Ｇ２９Ｗ、Ｅ３３Ｖ、Ａ４２Ｖ、Ｔ４７Ａ、Ｔ５３Ｓ、Ｍ５５Ｔ、Ｍ５６Ｋ、Ｎ５８Ｄ、Ｎ５８Ｓ、Ｌ６３Ｐ、Ｉ６７Ｎ、Ｉ６７Ｖ、Ｓ７２Ｇ、Ｑ８２Ｈ、Ｑ８２Ｒ、Ｒ８５Ｇ、Ｍ８７Ｋ、Ｍ８７Ｖ、Ｔ８９Ａ、Ｔ８９Ｓ、Ｌ９８Ｑ、Ｍ９９Ｌ、Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１０６Ｉ、Ｌ１０６Ｒ、Ｉ１０８Ｆ、Ｉ１０８Ｖ、およびＩ１１７Ｌから選択される、請求項１〜２４、および３５〜４０、４３、および４４のいずれか一項に記載の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
【請求項４６】
ＩＣＯＳＬ、ＣＤ８０、およびＣＤ８６の外部ドメインに対し、同じ外部ドメインに対する前記非改変ＣＴＬＡ−４の結合と比較して増加した親和性で、特異的に結合する、請求項１〜４３のいずれか一項に記載の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
【請求項４７】
前記１つ以上のアミノ酸改変が、Ｌ１２Ｆ、Ｒ１６Ｈ、Ｉ１８Ｔ、Ａ２６Ｔ、Ｇ２９Ｗ、Ｅ３３Ｖ、Ａ４２Ｖ、Ｔ５３Ｓ、Ｍ５５Ｔ、Ｍ５６Ｋ、Ｎ５８Ｓ、Ｌ６３Ｐ、Ｉ６７Ｎ、Ｑ８２Ｒ、Ｍ８７Ｋ、Ｍ８７Ｖ、Ｌ９８Ｑ、Ｍ９９Ｌ、Ｙ１０５Ｌ、またはＩ１０８Ｖから選択される、請求項１〜４６のいずれか一項に記載の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
【請求項４８】
前記１つ以上のアミノ酸改変が、Ａ２６Ｔ、Ｇ２９Ｗ、Ｔ５３Ｓ、Ｍ５６Ｋ、Ｎ５８Ｓ、Ｌ６３Ｐ、Ｌ９８Ｑ、Ｍ９９Ｌ、またはＹ１０５Ｌから選択される、請求項１〜４７のいずれか一項に記載の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
【請求項４９】
前記１つ以上のアミノ酸改変が、Ｇ２９Ｗ、Ｌ６３Ｐ、Ｌ９８Ｑ、Ｍ９９Ｌ、またはＹ１０５Ｌから選択される、請求項１〜４８のいずれか一項に記載の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
【請求項５０】
前記１つ以上のアミノ酸改変が、Ｇ２９Ｗ／Ｌ６３Ｐ、Ｇ２９Ｗ／Ｌ９８Ｑ、Ｇ２９Ｗ／Ｍ９９Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ、Ｌ６３Ｐ／Ｍ９９Ｌ、Ｌ６３Ｐ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ、Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、またはＭ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌから選択される改変を含む、請求項１〜４９のいずれか一項に記載の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
【請求項５１】
前記アミノ酸改変が、Ｇ２９Ｗ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌである、請求項１〜５０のいずれか一項に記載の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
【請求項５２】
前記アミノ酸改変が、Ｇ２９Ｗ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｑ８２Ｒ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌである、請求項１〜５１のいずれか一項に記載の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
【請求項５３】
前記アミノ酸改変が、Ｌ１２Ｐ／Ｇ２９Ｗ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌである、請求項１〜５１のいずれか一項に記載の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
【請求項５４】
同じ外部ドメインに対する前記非改変ＣＴＬＡ−４の結合と比較して、増加した親和性でＩＣＯＳＬの外部ドメインに特異的に結合し、かつ減少した親和性で他方のＣＤ８０またはＣＤ８６のうちの１つ以上の外部ドメインに特異的に結合する、請求項３〜２４のいずれか一項に記載の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
【請求項５５】
前記１つ以上の外部ドメインに対する結合親和性の前記増加が、独立して、１．２倍超、１．５倍、２倍、３倍、４倍、５倍、６倍、７倍、８倍、９倍、１０倍、２０倍、３０倍、４０倍、５０倍、１００倍またはそれ以上である、請求項１および１３〜５４のいずれか一項に記載の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
【請求項５６】
前記１つ以上の外部ドメインに対する結合親和性の前記減少が、独立して、１．２倍超、１．５倍、２倍、３倍、４倍、５倍、６倍、７倍、８倍、９倍、１０倍、２０倍、３０倍、４０倍、５０倍、１００倍またはそれ以上である、請求項５４に記載の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
【請求項５７】
前記ＩｇＶドメインまたはその特異的結合断片を含む、請求項１〜５６のいずれか一項に記載の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
【請求項５８】
前記ＩｇＶドメインまたはその特異的結合断片が、前記変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドのＣＴＬＡ−４部分のみである、請求項５７に記載の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
【請求項５９】
ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１５６〜２８５、６０３〜６３５、もしくは６３７のうちのいずれかに記載のアミノ酸の配列、またはその特異的結合断片、
ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１５６〜２８５、６０３〜６３５、もしくは６３７のうちのいずれかと少なくとも９５％の配列同一性を示し、かつＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１５６〜２８５、６０３〜６３５、または６３７のうちのいずれかに記載されるそれぞれの配列番号の前記アミノ酸改変のうちの前記１つ以上を含有する、アミノ酸の配列、またはその特異的結合断片
を含む、請求項１〜５８のいずれか一項に記載の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
【請求項６０】
ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：４〜９７、９９〜１０４、１０６〜１５５、５６９〜６０２、もしくは６３６のうちのいずれかに記載の前記細胞外ドメインのアミノ酸の配列、またはその特異的結合断片、あるいは
ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：４〜９７、９９〜１０４、１０６〜１５５、５６９〜６０２、もしくは６３のうちのいずれかと少なくとも９５％の配列同一性を示し、かつＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：４〜９７、９９〜１０４、１０６〜１５５、５６９〜６０２、もしくは６３６のうちのいずれかに記載のそれぞれの配列番号の前記アミノ酸改変のうちの前記１つ以上を含有する、アミノ酸の配列
を含む、請求項１〜５７、または５９のいずれか一項に記載の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
【請求項６１】
前記ＩＣＯＳＬが、ヒトＩＣＯＳＬである、請求項１、および１３〜５９のいずれか一項に記載の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
【請求項６２】
前記ＣＤ８０が、ヒトＣＤ８０である、請求項１３〜５９のいずれか一項に記載の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
【請求項６３】
前記ＣＤ８６が、ヒトＣＤ８６である、請求項１３〜５９のいずれか一項に記載の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
【請求項６４】
可溶性タンパク質である、請求項１〜６３のいずれか一項に記載の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
【請求項６５】
前記ＣＴＬＡ−４膜貫通ドメインおよび細胞内シグナル伝達ドメインを欠いており、かつ／または細胞の表面上に発現されることができない、請求項１〜６４のいずれか一項に記載の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
【請求項６６】
多量体化ドメインに連結されている、請求項１〜６５のいずれか一項に記載の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
【請求項６７】
前記多量体化ドメインが、エフェクター機能が減少したＦｃドメインまたはその変異型である、請求項６６に記載の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
【請求項６８】
エフェクター機能が減少したＦｃドメインまたはその変異型に連結されている、請求項１〜６７のいずれか一項に記載の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
【請求項６９】
前記Ｆｃドメインが、哺乳動物、任意選択的に、ヒトであるか、または
前記変異型Ｆｃドメインが、哺乳動物、任意選択的に、ヒトである非改変Ｆｃドメインと比較して、１つ以上のアミノ酸改変を含む、
請求項６７または６８に記載の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
【請求項７０】
前記Ｆｃドメインまたはその変異型が、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：４３８〜４４２のうちのいずれかに記載のアミノ酸の配列、またはＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：４３８〜４４２のうちのいずれかと少なくとも８５％の配列同一性を示すアミノ酸の配列を含む、請求項６７〜６９のいずれか一項に記載の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
【請求項７１】
前記Ｆｃドメインが、それぞれがＥＵ番号付けによる、Ｅ２３３Ｐ、Ｌ２３４Ａ、Ｌ２３４Ｖ、Ｌ２３５Ａ、Ｌ２３５Ｅ、Ｇ２３６ｄｅｌ、Ｇ２３７Ａ、Ｓ２６７Ｋ、Ｎ２９７Ｇ、Ｖ３０２Ｃ、およびＫ４４７ｄｅｌの中から選択される１つ以上のアミノ酸改変を含む、請求項６７〜７０のいずれか一項に記載の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
【請求項７２】
前記Ｆｃドメインが、アミノ酸改変Ｌ２３４Ａ／Ｌ２３５Ｅ／Ｇ２３７Ａを含む、請求項６７〜７１のいずれか一項に記載の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
【請求項７３】
前記Ｆｃドメインが、ＥＵ番号付けによるアミノ酸改変Ｃ２２０Ｓを含む、請求項６７〜７２のいずれか一項に記載の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
【請求項７４】
リンカー、任意選択的に、Ｇ４Ｓリンカーを介して間接的に、前記多量体化ドメインまたはＦｃに連結されている、請求項６７〜７３のいずれか一項に記載の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
【請求項７５】
ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２８６〜３７９、３８１〜３８６、もしくは３８８〜４３７のうちのいずれかに記載のアミノ酸の配列、または
ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２８６〜３７９、３８１〜３８６、もしくは３８８〜４３７のうちのいずれかと少なくとも８５％の配列同一性を示すアミノ酸の配列
を含む、請求項６７〜７４のいずれか一項に記載の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
【請求項７６】
前記変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドが、膜貫通ドメインをさらに含む膜貫通免疫調節タンパク質であり、任意選択的に、前記膜貫通ドメインが、直接または間接的に、前記変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドの細胞外ドメイン（ＥＣＤ）またはその特異的結合断片に連結されている、請求項１〜６３のいずれか一項に記載の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
【請求項７７】
前記膜貫通ドメインが、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１の残基１６２〜１８２として記載されるアミノ酸の配列、またはＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１の残基１６２〜１８２と少なくとも８５％の配列同一性を示すその機能的変異型を含む、請求項７６に記載の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
【請求項７８】
細胞質ドメインをさらに含み、任意選択的に、前記細胞質ドメインが、直接または間接的に、前記膜貫通ドメインに連結されている、請求項７６または７７に記載の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
【請求項７９】
前記細胞質ドメインが、天然型ＣＴＬＡ−４細胞質ドメイン、細胞内シグナル伝達ドメインであるか、もしくはこれを含み、かつ／またはＩＴＩＭシグナル伝達モチーフを含む、請求項７８に記載の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
【請求項８０】
前記細胞質ドメインが、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１の残基１８３〜２２３として記載されるアミノ酸の配列、またはＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１の残基１８３〜２２３と少なくとも８５％の配列同一性を示すその機能的変異型を含む、請求項７８または７９の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
【請求項８１】
前記細胞質ドメインが、ＩＴＡＭシグナル伝達モチーフを含み、かつ／またはＣＤ３ゼータの細胞内シグナル伝達ドメインであるか、もしくはこれを含む、請求項７８に記載の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
【請求項８２】
細胞質シグナル伝達ドメインを含まず、かつ／または細胞上に発現されたときに細胞内シグナルを仲介することも、調節することもできない、請求項７６または７７に記載の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
【請求項８３】
インビトロ初代Ｔ細胞アッセイで、前記非改変ＣＴＬＡ−４ポリペプチドに対してＩＦＮ−ガンマ（インターフェロン−ガンマ）発現を減少させる、請求項１〜８２のいずれか一項に記載の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
【請求項８４】
脱グリコシル化されている、請求項１〜８３のいずれか一項に記載の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
【請求項８５】
直接、またはリンカーを介して間接的に、免疫グロブリンスーパーファミリー（ＩｇＳＦ）メンバーのＩｇＳＦドメインを含む第２のポリペプチドに連結されている、請求項１〜８４のいずれか一項に記載の変異型ＣＴＬＡ−４を含む、免疫調節ポリペプチド。
【請求項８６】
前記ＩｇＳＦドメインが、親和性改変ＩｇＳＦドメインであり、前記親和性改変ＩｇＳＦドメインが、前記ＩｇＳＦファミリーメンバーの非改変または野生型ＩｇＳＦドメインと比較して、１つ以上のアミノ酸改変を含む、請求項８５に記載の免疫調節タンパク質。
【請求項８７】
前記親和性改変ＩｇＳＦドメインが、その同種結合パートナーのうちの１つ以上に対し、同じ１つ以上の同種結合パートナーとの前記ＩｇＳＦファミリーメンバーの非改変または野生型ＩｇＳＦドメインの結合と比較して変化した結合を示す、請求項８６に記載の免疫調節ポリペプチド。
【請求項８８】
前記ＩｇＳＦドメインが、その同種結合パートナーのうちの１つ以上に対し、同じ１つ以上の同種結合パートナーとの非改変または野生型ＩｇＳＦドメインの結合と比較して増加した結合を示す、請求項８７に記載の免疫調節ポリペプチド。
【請求項８９】
前記変異型ＣＴＬＡ−４が、第１の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドであり、前記第２のポリペプチドの前記ＩｇＳＦドメインが、請求項１〜７５のいずれか一項に記載の第２の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドからのＩｇＳＦドメインであり、前記第１および第２の変異型ＣＴＬＡ−４が、同じであるか、または異なる、請求項８５〜８８のいずれか一項に記載の免疫調節ポリペプチド。
【請求項９０】
ＩｇＳＦファミリーメンバーのＩｇＳＦドメインまたはその親和性改変ＩｇＳＦドメインを含む第３のポリペプチドをさらに含み、前記親和性改変ＩｇＳＦドメインが、前記ＩｇＳＦファミリーメンバーの非改変または野生型ＩｇＳＦドメインと比較して、１つ以上のアミノ酸改変を含む、請求項８５〜８９のいずれか一項に記載の免疫調節タンパク質。
【請求項９１】
前記第３のポリペプチドが、前記第１および／もしくは第２のポリペプチドと同じであるか、または
前記第３のポリペプチドが、前記第１および／もしくは第２のポリペプチドとは異なる、請求項９０に記載の免疫調節タンパク質。
【請求項９２】
前記ＩｇＳＦドメインまたはその親和性改変ＩｇＳＦドメイン、任意選択的に、前記第２または第３のポリペプチドの前記ＩｇＳＦドメインまたはその親和性改変ＩｇＳＦドメインが、ＩｇＶドメインであるか、またはこれを含む、請求項８５〜９１のいずれか一項に記載の免疫調節ポリペプチド。
【請求項９３】
前記変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドが、ＩｇＶドメインであるか、またはこれを含む、請求項８５〜９２のいずれか一項に記載の免疫調節ポリペプチド。
【請求項９４】
前記変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド、または前記第２のポリペプチドのうちの少なくとも一方に連結されている多量体化ドメインをさらに含む、請求項８５〜９３のいずれか一項に記載の免疫調節タンパク質。
【請求項９５】
前記変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド、前記第２のポリペプチド、および／または前記第３のポリペプチドのうちの少なくとも１つに連結されている多量体化ドメインをさらに含む、請求項９０〜９３のいずれか一項に記載の免疫調節タンパク質。
【請求項９６】
前記多量体化ドメインが、エフェクター機能が減少したＦｃドメインまたはその変異型である、請求項９４または９５に記載の免疫調節タンパク質。
【請求項９７】
前記多量体化ドメインが、ヘテロ二量体の形成を促進する、請求項９４〜９６のいずれか一項に記載の免疫調節タンパク質。
【請求項９８】
請求項９４〜９７のいずれか一項に記載の免疫調節タンパク質を含む免疫調節タンパク質であって、前記多量体化ドメインが、第１の多量体化ドメインであり、かつ第２の多量体化ドメインと相互作用して、前記免疫調節タンパク質を含む多量体を形成する、免疫調節タンパク質。
【請求項９９】
前記免疫調節タンパク質が、第１の免疫調節タンパク質であり、第２の免疫調節タンパク質が、直接、またはリンカーを介して間接的に、前記第２の多量体化ドメインに連結され、前記多量体が、前記第１および第２の免疫調節タンパク質を含む、請求項９８に記載の免疫調節タンパク質。
【請求項１００】
前記第２の免疫調節タンパク質が、請求項９４〜９７のいずれか一項に記載の免疫調節タンパク質であり、前記多量体化ドメインが、前記第２の多量体化ドメインである、請求項９９に記載の免疫調節タンパク質。
【請求項１０１】
前記多量体化ドメインが、第１の多量体化ドメインである、請求項６６〜７５のいずれか一項に記載の第１の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドと、
前記多量体化ドメインが、第２の多量体化ドメインである、請求項６６〜７５のいずれか一項に記載の第２の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドと
を含み、
前記第１および第２の多量体化ドメインが、相互作用して、前記第１および第２の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドを含む多量体を形成する、
免疫調節タンパク質。
【請求項１０２】
前記多量体が、二量体である、請求項９８〜１０１のいずれか一項に記載の免疫調節タンパク質。
【請求項１０３】
ホモ二量体である、請求項９８〜１０２のいずれか一項に記載の免疫調節タンパク質。
【請求項１０４】
ヘテロ二量体である、請求項９８〜１０３のいずれか一項に記載の免疫調節タンパク質。
【請求項１０５】
前記第１および／または第２の多量体化ドメインが、エフェクター機能が減少したＦｃドメインまたはその変異型である、請求項９８〜１０４のいずれか一項に記載の免疫調節タンパク質。
【請求項１０６】
前記第１および第２の多量体化ドメインが、同じであるか、または異なる、請求項９８〜１０５のいずれか一項に記載の免疫調節タンパク質。
【請求項１０７】
ある部分に連結されている、請求項１〜８４のいずれか一項に記載の変異型ＣＴＬＡ−４または請求項６０８５〜１０６のいずれか一項に記載の免疫調節タンパク質
を含む、コンジュゲート。
【請求項１０８】
前記部分が、細胞の表面上の分子に特異的に結合する標的指向部分である、請求項１０７に記載のコンジュゲート。
【請求項１０９】
前記標的指向部分が、免疫細胞の表面上の分子に特異的に結合する、請求項１０８に記載のコンジュゲート。
【請求項１１０】
前記免疫細胞が、抗原提示細胞またはリンパ球である、請求項１０９に記載のコンジュゲート。
【請求項１１１】
前記標的指向部分が、炎症環境において細胞または組織に局在する、請求項１０８〜１１０のいずれか一項に記載のコンジュゲート。
【請求項１１２】
前記部分が、タンパク質、ペプチド、核酸、小分子、またはナノ粒子である、請求項１０７〜１１１のいずれか一項に記載のコンジュゲート。
【請求項１１３】
前記部分が、抗体または抗原結合断片である、請求項１０７〜１１２のいずれか一項に記載のコンジュゲート。
【請求項１１４】
二価、四価、六価、または八価である、請求項１０７〜１１３のいずれか一項に記載のコンジュゲート。
【請求項１１５】
請求項１〜８４のいずれか一項に記載の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドまたは請求項８５〜１０６のいずれか一項に記載の免疫調節タンパク質をコードする、核酸分子。
【請求項１１６】
合成核酸である、請求項１１５に記載の核酸分子。
【請求項１１７】
ｃＤＮＡである、請求項１１５または１１６に記載の核酸分子。
【請求項１１８】
請求項１１５〜１１７のいずれか一項に記載の核酸分子を含む、ベクター。
【請求項１１９】
発現ベクターである、請求項１１８に記載のベクター。
【請求項１２０】
哺乳動物発現ベクターまたはウイルスベクターである、請求項１１８または１１９に記載のベクター。
【請求項１２１】
請求項１１８〜１２０のいずれか一項に記載のベクターを含む、細胞。
【請求項１２２】
哺乳動物細胞である、請求項１２１に記載の細胞。
【請求項１２３】
ヒト細胞である、請求項１２１または１２２に記載の細胞。
【請求項１２４】
変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドまたは免疫調節タンパク質を生成する方法であって、請求項１１５〜１１７のいずれか一項に記載の核酸分子または請求項１１８〜１２０のいずれか一項に記載のベクターを、細胞中に前記タンパク質を発現する条件下で宿主細胞に導入する段階を含む、方法。
【請求項１２５】
前記変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドまたは免疫調節タンパク質を、前記細胞から単離または精製する段階をさらに含む、請求項１２４に記載の方法。
【請求項１２６】
変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドを発現する細胞を操作する方法であって、請求項１〜８４のいずれか一項に記載の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドまたは請求項８５〜１０６のいずれか一項に記載の免疫調節タンパク質をコードする核酸分子を、前記ポリペプチドが前記細胞内に発現される条件下で宿主細胞に導入する段階を含む、方法。
【請求項１２７】
請求項１〜８４のいずれか一項に記載の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド、請求項８５〜１０６のいずれか一項に記載の免疫調節タンパク質、請求項１１５〜１１７のいずれか一項に記載の核酸分子、または請求項１１８〜１２０のいずれか一項に記載のベクターを発現する、操作された細胞。
【請求項１２８】
免疫細胞である、請求項１２７に記載の操作された細胞。
【請求項１２９】
前記免疫細胞が、リンパ球である、請求項１２８に記載の操作された細胞。
【請求項１３０】
前記リンパ球が、Ｔ細胞である、請求項１２９に記載の操作された細胞。
【請求項１３１】
前記Ｔ細胞が、ＣＤ４＋および／またはＣＤ８＋Ｔ細胞である、請求項１３０に記載の操作された細胞。
【請求項１３２】
前記Ｔ細胞が、調節性Ｔ細胞（Ｔｒｅｇ）である、請求項１３０または１３１に記載の操作された細胞。
【請求項１３３】
初代細胞である、請求項１２７〜１３２のいずれか一項に記載の操作された細胞。
【請求項１３４】
哺乳動物細胞である、請求項１２７〜１３３のいずれか一項に記載の操作された細胞。
【請求項１３５】
ヒト細胞である、請求項１２７〜１３４のいずれか一項に記載の操作された細胞。
【請求項１３６】
前記ＣＴＬＡ−４ポリペプチドが、膜貫通ドメインを介して前記細胞の前記表面上に発現される、請求項１２７〜１３５のいずれか一項に記載の操作された細胞。
【請求項１３７】
前記ＣＴＬＡ−４ポリペプチドが、細胞質ドメインを含み、任意選択的に、前記細胞質ドメインが、直接または間接的に、前記膜貫通ドメインに連結されている、請求項１３６に記載の操作された細胞。
【請求項１３８】
前記細胞質ドメインが、天然型ＣＴＬＡ−４細胞質ドメイン、細胞内シグナル伝達ドメインであるか、もしくはこれらを含み、かつ／またはＩＴＩＭシグナル伝達モチーフを含む、請求項１３７に記載の操作された細胞。
【請求項１３９】
前記細胞質ドメインが、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１の残基１８３〜２２３として記載されるアミノ酸の配列、またはＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１の残基１８３〜２２３と少なくとも８５％の配列同一性を示すその機能的変異型を含む、請求項１３６〜１３８のいずれか一項に記載の操作された細胞。
【請求項１４０】
前記細胞質ドメインが、ＩＴＡＭシグナル伝達モチーフを含み、かつ／またはＣＤ３ゼータの細胞内シグナル伝達ドメインであるか、もしくはこれを含む、請求項１３６または１３７に記載の操作された細胞。
【請求項１４１】
前記ＣＴＬＡ−４ポリペプチドが、細胞質シグナル伝達ドメインを含まず、かつ／または細胞上に発現されたときに細胞内シグナルを仲介することも、調節することもできない、請求項１３６に記載の操作された細胞。
【請求項１４２】
キメラ抗原受容体（ＣＡＲ）をさらに含む、請求項１２７〜１４１のいずれか一項に記載の操作された細胞。
【請求項１４３】
操作されたＴ細胞受容体（ＴＣＲ）をさらに含む、請求項１２７〜１４１のいずれか一項に記載の操作された細胞。
【請求項１４４】
請求項１〜８４のいずれか一項に記載の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドまたは請求項８５〜１０６のいずれか一項に記載の免疫調節タンパク質をコードする核酸分子を含む、感染性病原体。
【請求項１４５】
細菌またはウイルスである、請求項１２８に記載の感染性病原体。
【請求項１４６】
請求項１〜８４のいずれか一項に記載の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド、請求項８５〜１０６のいずれか一項に記載の免疫調節タンパク質、請求項１０７〜１１４のいずれか一項に記載のコンジュゲート、請求項１２７〜１４３のいずれか一項に記載の操作された細胞、または請求項１４４もしくは１４５に記載の感染性病原体を含む、医薬組成物。
【請求項１４７】
薬学的に許容可能な賦形剤を含む、請求項１４６に記載の医薬組成物。
【請求項１４８】
無菌である、請求項１４６または１４７に記載の医薬組成物。
【請求項１４９】
請求項１４６〜１４８のいずれか一項に記載の医薬組成物をバイアルまたは容器中に含む、製造物品。
【請求項１５０】
前記バイアルまたは容器が、密閉されている、請求項１４９に記載の製造物品。
【請求項１５１】
請求項１４６〜１４８のいずれか一項に記載の医薬組成物および使用説明書を含む、キット。
【請求項１５２】
請求項１４９または１５０に記載の製造物品および使用説明書を含む、キット。
【請求項１５３】
対象における免疫反応を調節する方法であって、請求項１４６〜１４８のいずれか一項に記載の医薬組成物を、前記対象に投与する段階を含む、方法。
【請求項１５４】
対象における免疫反応を調節する方法であって、請求項１２７〜１４３のいずれか一項に記載の操作された細胞を投与する段階を含む、方法。
【請求項１５５】
前記操作された細胞が、前記対象に対して自家である、請求項１５４に記載の方法。
【請求項１５６】
前記操作された細胞が、前記対象に対して同種異系である、請求項１５４に記載の方法。
【請求項１５７】
前記免疫反応の調節が、前記対象において疾患または状態を治療する、請求項１５３〜１５６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１５８】
前記免疫反応が、低減される、請求項１５３〜１５７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１５９】
請求項１〜８１のいずれか一項に記載の変異型ポリペプチド、請求項８５〜１０６のいずれか一項に記載の免疫調節タンパク質、または請求項１２７〜１３９、１４２、および１４３のいずれか一項に記載の操作された細胞が、前記対象に対して投与される、請求項１５３〜１５８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１６０】
前記疾患または状態が、炎症性もしくは自己免疫性の疾患もしくは状態であるか、または過剰な免疫反応に関連する疾患もしくは状態である、請求項１５３〜１５９のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１６１】
前記疾患または状態が、抗好中球細胞質抗体（ＡＮＣＡ）関連血管炎、血管炎、自己免疫性皮膚疾患、移植、リウマチ性疾患、甲状腺炎、炎症性胃腸疾患、炎症性眼疾患、炎症性神経疾患、炎症性肺疾患、炎症性内分泌疾患、自己免疫性血液疾患、自己免疫性脱髄性疾患、または全身性自己免疫性障害を伴う自己免疫性疾患である、請求項１５３〜１６０のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１６２】
前記疾患または状態が、炎症性腸疾患、移植、クローン病、潰瘍性大腸炎、喘息、自己免疫性喘息、関節リウマチ、乾癬、エリテマトーデス、セリアック病、Ｉ型糖尿病、ギラン・バレー症候群、慢性炎症性脱髄性多発神経障害、グレーブス病、橋本甲状腺炎、ドケルヴァン甲状腺炎、重症筋無力症、血管炎、自己免疫性溶血性貧血、悪性貧血の自己免疫性萎縮性胃炎、自己免疫性脳脊髄炎、自己免疫性精巣炎、グッドパスチャー病、自己免疫性血小板減少症、交感性眼炎、原発性胆汁性肝硬変、慢性活動性肝炎、膜性腎症、原発性特発性粘液水腫、強皮症、慢性肝炎、アディソン病、性腺機能低下症、悪性貧血、白斑症、円形脱毛症、自己免疫性腸疾患症候群、特発性血小板紫斑病、後天性脾臓萎縮、特発性尿崩症、抗精子抗体に起因する不妊症、感覚神経性聴力喪失、シェーグレン症候群、多発性筋炎、多発性硬化症、横断性脊髄炎、失調性硬化症、天疱瘡、進行性全身性硬化症、皮膚筋炎、結節性多発動脈炎、溶血性貧血、糸球体腎炎、および特発性顔面麻痺の中から選択される、請求項１５３〜１６１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１６３】
前記免疫反応が、増加される、請求項１５３〜１５７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１６４】
請求項１２４または１２５に記載の操作された細胞が、前記対象に投与される、請求項１３７〜１４１、および１４７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１６５】
前記疾患または状態が、腫瘍または癌である、請求項１３７〜１４１、１４７、および１４８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１６６】
前記疾患または状態が、黒色腫、肺癌、膀胱癌、血液学的悪性疾患、肝臓癌、脳癌、腎臓癌、乳癌、膵臓癌、結腸直腸癌、脾臓癌、前立腺癌、精巣癌、卵巣癌、子宮癌、胃癌、筋骨格系の癌、頭頸部癌、胃腸癌、胚細胞癌、または内分泌および神経内分泌系の癌から選択される、請求項１３７〜１４１、および１４７〜１４９のいずれか一項に記載の方法。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
関連出願の相互参照
本出願は、２０１８年９月１９日に出願された、米国仮出願第６２／７３３，６１５号、２０１８年１月３日に出願された、米国仮出願第６２／６１３，３７９号、および２０１７年１０月１０日に出願された、米国仮出願第６２／５７０，６１９号に対する優先的利益を主張し、それらの各々の内容は、それらの全体が参照により本明細書に組み込まれる。
【０００２】
配列表の参照による組み込み
本出願は、電子書式での配列表とともに出願されている。配列表は、１，１３８，３００バイトのサイズである、２０１８年１０月８日に作成された、７６１６１２００２０４０ＳｅｑＬｉｓｔ．ｔｘｔと題されたファイルとして提供されている。配列表の電子書式での情報は、その全体が参照により組み込まれる。
【０００３】
分野
本開示は、変異型ＣＴＬＡ−４を含む免疫調節タンパク質、およびそのようなタンパク質をコードする核酸に関する。免疫調節タンパク質は、自己免疫性または炎症性状態の治療のためを含む、様々な疾患適用のための治療的有用性を提供する。そのようなタンパク質を作製および使用するための組成物および方法を提供する。
【背景技術】
【０００４】
背景
抗原提示細胞（ＡＰＣ）または標的細胞およびリンパ球によって、かつこれらの間に形成される免疫シナプス（ＩＳ）に生じるプロセスに干渉することによる免疫反応の調節に、医学的関心が増している。機構的に、ＩＳ内の細胞表面タンパク質は、複数のタンパク質標的の、それらが結合する単一タンパク質との協調したかつ多くは同時の相互作用を伴い得る。ＩＳの相互作用は、２つの細胞の接合と密接に関連して生じ、この構造における単一タンパク質が、同じタンパク質上のタンパク質（ｃｉｓ）、ならびに関連する細胞上のタンパク質（ｔｒａｎｓ）の両方と、おそらく同時に相互作用し得る。ＩＳを調節し得る治療薬は知られているが、改善された治療薬が必要である。そのような必要性を満たす免疫調節タンパク質を提供する。
【発明の概要】
【０００５】
概要
変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドを本明細書に提供する。いくつかの実施形態では、ＩｇＶドメインまたはその特異的結合断片を含有する変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドであって、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドが、非改変ＣＴＬＡ−４ポリペプチドまたはその特異的結合断片中に１つ以上のアミノ酸改変を含有し、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドが、非改変ＣＴＬＡ−４と比較して増加した親和性でＩＣＯＳＬの外部ドメインに特異的に結合する、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドを、本明細書に提供する。
【０００６】
提供される実施形態のうちのいずれかのうちのいくつかでは、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、非改変ＣＴＬＡ−４ポリペプチドまたはその特異的結合断片中に、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２に記載の位置に関して、６、１０、１２、１４、１５、１６、１８、１９、２０、２２、２４、２６、２７、２８、２９、３０、３３、３５、３７、３８、４１、４２、４３、４５、４６、４７、４８、５３、５４、５５、５６、５８、５９、６１、６３、６４、６５、６７、６９、７１、７２、７３、７５、７６、８２、８５、８６、８７、８９、９１、９３、９５、９６、９７、９８、９９、１０５、１０６、１０８、１１０、１１３、１１５、１１６、１１７、１１８、１１９、１２０、１２１、および１２２の中から選択される位置に対応する１つ以上のアミノ酸改変を含有する。
【０００７】
提供される実施形態のうちのいずれかのうちのいくつかでは、ＩｇＶドメインまたはその特異的結合断片を含有する変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドであって、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドが、非改変ＣＴＬＡ−４ポリペプチドまたはその特異的結合断片中に、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２に記載の位置に関して、６、１０、１２、１４、１５、１６、１８、１９、２０、２２、２４、２６、２７、２８、２９、３０、３３、３５、３７、３８、４１、４２、４３、４５、４６、４７、４８、５３、５４、５５、５６、５８、５９、６１、６３、６４、６５、６７、６９、７１、７２、７３、７５、７６、８２、８５、８６、８７、８９、９１、９３、９５、９６、９７、９８、９９、１０５、１０６、１０８、１１０、１１３、１１５、１１６、１１７、１１８、１１９、１２０、１２１、および１２２の中から選択される位置に対応する１つ以上のアミノ酸改変を含有する、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドを、本明細書に提供する。いくつかの実施形態では、アミノ酸改変は、アミノ酸置換、欠失、または挿入を含む。
【０００８】
提供される実施形態のうちのいずれかのうちのいくつかでは、非改変ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、哺乳動物ＣＴＬＡ−４ポリペプチドまたはその特異的結合断片である。いくつかの実施形態では、非改変ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、ヒトＣＴＬＡ−４ポリペプチドまたはその特異的結合断片である。いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、ヒトＣＴＬＡ−４の細胞外ドメインを含有し、１つ以上のアミノ酸改変は、非改変ＣＴＬＡ−４ポリペプチドの細胞外ドメインの１つ以上の残基中にある。
【０００９】
提供される実施形態のうちのいずれかのうちのいくつかでは、非改変ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、（ｉ）ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２に記載のアミノ酸の配列、（ｉｉ）ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２と少なくとも９５％の配列同一性を有するアミノ酸の配列、または（ｉｉｉ）ＩｇＶドメインもしくはＩｇＶドメインの特異的結合断片を含有するその一部分を含有する。いくつかの実施形態では、非改変ＣＴＬＡ−４は、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２に記載のアミノ酸の配列を含有する。
【００１０】
提供される実施形態のうちのいずれかのうちのいくつかでは、ＩｇＶドメインの特異的結合断片は、少なくとも５０、６０、７０、８０、９０、１００、１１０以上のアミノ酸長を有するか、またはＩｇＶドメインの特異的結合断片は、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１の残基３９〜１４０として記載されるＩｇＶドメインの長さの少なくとも８０％である長さを含む。
【００１１】
提供される実施形態のうちのいずれかのうちのいくつかでは、変異型ＣＴＬＡ−４は、最大１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、または２０個のアミノ酸改変、任意選択的に、アミノ酸置換、挿入、および／または欠失を含有する。
【００１２】
提供される実施形態のうちのいずれかのうちのいくつかでは、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２と少なくとも８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、もしくは９９％の配列同一性を示すアミノ酸の配列、またはその特異的結合断片を含有する。
【００１３】
提供される実施形態のうちのいずれかのうちのいくつかでは、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、ＩＣＯＳＬ、ＣＤ８０、および／またはＣＤ８６の外部ドメインに、同じ外部ドメインに対する非改変ＣＴＬＡ−４ポリペプチドの結合と比較して増加した親和性で、特異的に結合する。
【００１４】
ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２に記載のヒトＣＴＬＡ−４の細胞外ドメイン中に１つ以上のアミノ酸改変を含有する変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドであって、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドが、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２に記載の細胞外ドメインを含有するＣＴＬＡ−４と比較して増加した親和性で、ヒトＩＣＯＳＬ、ＣＤ８０、および／またはＣＤ８６の外部ドメインに特異的に結合する、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドを、本明細書に提供する。
【００１５】
提供される実施形態のうちのいずれかのうちのいくつかでは、１つ以上のアミノ酸改変は、Ａ６Ｔ、Ｖ１０Ａ、Ｌ１２Ｆ、Ｌ１２Ｈ、Ｌ１２Ｉ、Ｌ１２Ｐ、Ｓ１４Ｎ、Ｓ１５Ｐ、Ｒ１６Ｃ、Ｒ１６Ｇ、Ｒ１６Ｈ、Ｉ１８Ａ、Ｉ１８Ｆ、Ｉ１８Ｎ、Ｉ１８Ｔ、Ｉ１８Ｖ、Ａ１９Ｖ、Ｓ２０Ｎ、Ｖ２２Ａ、Ｖ２２Ｉ、Ｅ２４Ｑ、Ａ２６Ｄ、Ａ２６Ｓ、Ａ２６Ｔ、Ｓ２７Ｐ、Ｐ２８Ｌ、Ｇ２９Ｒ、Ｇ２９Ｗ、Ｋ３０Ｒ、Ｅ３３Ｍ、Ｅ３３Ｖ、Ｒ３５Ｋ、Ｔ３７Ｓ、Ｖ３８Ｉ、Ｑ４１Ｌ、Ａ４２Ｓ、Ａ４２Ｔ、Ａ４２Ｖ、Ｄ４３Ｎ、Ｑ４５Ｈ、Ｖ４６Ｅ、Ｔ４７Ａ、Ｅ４８Ｒ、Ｔ５３Ｓ、Ｙ５４Ｆ、Ｍ５５Ｒ、Ｍ５５Ｔ、Ｍ５５Ｖ、Ｍ５６Ｋ、Ｍ５６Ｌ、Ｍ５６Ｒ、Ｍ５６Ｔ、Ｍ５６Ｖ、Ｎ５８Ｄ、Ｎ５８Ｓ、Ｅ５９Ｄ、Ｅ５９Ｇ、Ｔ６１Ａ、Ｔ６１Ｉ、Ｔ６１Ｎ、Ｔ６１Ｒ、Ｔ６１Ｓ、Ｌ６３Ｈ、Ｌ６３Ｐ、Ｄ６４Ｅ、Ｄ６４Ｎ、Ｄ６４Ｖ、Ｄ６５Ｇ、Ｉ６７Ｎ、Ｉ６７Ｔ、Ｉ６７Ｖ、Ｔ６９Ａ、Ｔ６９Ｉ、Ｔ６９Ｓ、Ｔ７１Ａ、Ｔ７１Ｉ、Ｓ７２Ｇ、Ｓ７２Ｔ、Ｓ７３Ｒ、Ｎ７５Ｄ、Ｑ７６Ｒ、Ｑ８２Ｈ、Ｑ８２Ｒ、Ｒ８５Ｇ、Ａ８６Ｔ、Ｍ８７Ａ、Ｍ８７Ｋ、Ｍ８７Ｔ、Ｍ８７Ｖ、Ｔ８９Ａ、Ｔ８９Ｍ、Ｔ８９Ｓ、Ｌ９１Ｒ、Ｉ９３Ｌ、Ｉ９３Ｖ、Ｋ９５Ｒ、Ｖ９６Ｉ、Ｅ９７Ｑ、Ｌ９８Ｑ、Ｌ９８Ｒ、Ｍ９９Ｉ、Ｍ９９Ｌ、Ｐ１０２Ｌ、Ｙ１０５Ｆ、Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１０６Ｉ、Ｌ１０６Ｎ、Ｌ１０６Ｒ、Ｉ１０８Ｆ、Ｉ１０８Ｖ、Ｎ１１０Ｋ、Ｎ１１０Ｓ、Ｎ１１０Ｙ、Ｙ１１５Ｎ、Ｖ１１６Ａ、Ｉ１１７Ｅ、Ｉ１１７Ｌ、Ｉ１１７Ｍ、Ｉ１１７Ｔ、およびＰ１２１Ｓ、またはそれらの保存的アミノ酸置換から選択される。
【００１６】
提供される実施形態のうちのいずれかのうちのいくつかでは、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、Ａ６Ｔ／Ａ２６Ｔ／Ｍ５５Ｔ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｖ１０Ａ／Ｇ２９Ｗ／Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｐ１２１Ｓ、Ｖ１０Ａ／Ｌ６３Ｐ／Ｄ６４Ｖ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｖ１０Ａ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１２Ｆ／Ｒ１６Ｈ／Ｇ２９Ｗ／Ｍ５６Ｔ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１２Ｆ／Ａ２６Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｒ、Ｌ１２Ｆ／Ｋ３０Ｒ／Ｓ７２Ｇ／Ｑ８２Ｒ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１２Ｈ／Ｉ１８Ｖ／Ａ４２Ｔ／Ｍ５５Ｔ／Ｎ５８Ｄ／Ｌ９８Ｒ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ／Ｐ１２１Ｓ、Ｌ１２Ｈ／Ｅ３３Ｍ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１２Ｈ／Ｍ５５Ｔ／Ｅ５９Ｄ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ９９Ｌ、Ｌ１２Ｈ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１２Ｉ／Ｍ５５Ｔ／Ｍ５６Ｖ／Ｉ６７Ｔ／Ｍ９９Ｌ／Ｌ１０６Ｒ／Ｉ１０８Ｆ、Ｌ１２Ｐ／Ｒ１６Ｈ／Ａ２６Ｔ／Ｔ６１Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ／Ｉ１１７Ｌ、Ｌ１２Ｐ／Ｉ１８Ｔ／Ａ２６Ｔ／Ｍ５５Ｔ／Ｔ６９Ｓ／Ｓ７２Ｇ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１２Ｐ／Ａ２６Ｔ、Ｌ１２Ｐ／Ａ２６Ｔ／Ｌ６３Ｐ、Ｌ１２Ｐ／Ａ２６Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｔ８９Ｍ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１２Ｐ／Ｇ２９Ｗ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１２Ｐ／Ｇ２９Ｗ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ、Ｌ１２Ｐ／Ａ２６Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１２Ｐ／Ａ２６Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１２Ｐ／Ａ２６Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ、Ｌ１２Ｐ／Ｇ２９Ｗ／Ｄ４３Ｎ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１２Ｐ／Ｍ５６Ｖ／Ｌ６３Ｐ／Ｖ９６Ｉ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｙ１１５Ｈ、Ｌ１２Ｐ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１２Ｐ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｎ、Ｌ１２Ｐ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｎ／Ｉ１１７Ｌ、Ｓ１４Ｎ／Ｒ１６Ｃ／Ｉ１８Ｔ／Ｍ５６Ｋ／Ｔ６１Ａ／Ｌ６３Ｐ／Ａ８６Ｔ／Ｍ９９Ｌ、Ｓ１５Ｐ／Ｉ１８Ｖ／Ｍ５６Ｔ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｒ１６Ｃ／Ｇ２９Ｗ／Ｅ３３Ｖ／Ｍ５５Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｉ１８Ａ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｉ１８Ｆ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｐ１２１Ｓ、Ｉ１８Ｎ／Ａ２６Ｔ／Ｌ６３Ｈ／Ｔ８９Ａ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｉ１８Ｎ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｔ／Ｍ８７Ｔ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｎ１１０Ｓ、Ｉ１８Ｔ／Ａ２６Ｓ／Ｍ５５Ｔ／Ｍ５６Ｖ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｉ１１７Ｋ、Ｉ１８Ｔ／Ａ２６Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｉ１８Ｔ／Ａ２６Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｑ８２Ｒ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｉ１８Ｔ／Ｇ２９Ｒ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｉ１８Ｔ／Ｇ２９Ｗ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｉ１８Ｔ／Ｅ４８Ｒ／Ｌ６３Ｐ／Ｔ６９Ｓ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｎ１１０Ｙ、Ｉ１８Ｔ／Ｔ６１Ｒ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｉ１８Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｍ８７Ｋ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｉ１８Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｉ１８Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｉ１０８Ｖ、Ｉ１８Ｖ／Ａ２６Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｄ６４Ｅ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｒ／Ｎ１１０Ｋ、Ｉ１８Ｖ／Ｇ２９Ｗ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ａ１９Ｖ／Ｇ２９Ｗ／Ｒ３５Ｋ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｓ２０Ｎ／Ａ２６Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｖ２２Ａ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｐ１１９Ｈ、Ｖ２２Ｉ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｉ１１７Ｍ、Ｅ２４Ｑ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ａ２６Ｄ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ａ２６Ｔ／Ａ４２Ｖ／Ｑ４５Ｈ／Ｉ６７Ｎ／Ｍ８７Ｋ／Ｅ９７Ｑ／Ｍ９９Ｌ、Ａ２６Ｔ／Ｖ４６Ｅ／Ｌ６３Ｐ／Ｄ６５Ｇ／Ｌ９８Ｑ、Ａ２６Ｔ／Ｔ４７Ａ／Ｍ５６Ｋ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｑ８２Ｒ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ａ２６Ｔ／Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ａ２６Ｔ／Ｔ５３Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ／Ｉ１１７Ｌ、Ａ２６Ｔ／Ｙ５４Ｆ／Ｍ５６Ｋ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ａ２６Ｔ／Ｍ５５Ｒ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ａ２６Ｔ／Ｍ５５Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ａ２６Ｔ／Ｍ５５Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ａ２６Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｄ６５Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ａ２６Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｎ１１０Ｋ／Ｉ１１７Ｅ、Ａ２６Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ａ２６Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ／Ｉ１１７Ｌ、Ａ２６Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ａ２６Ｔ／Ｉ６７Ｎ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｓ２７Ｐ／Ｍ５６Ｋ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｓ７３Ｒ／Ｔ８９Ａ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｉ１１７Ｍ、Ｐ２８Ｌ／Ｅ３３Ｖ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｐ２８Ｌ／Ｅ３３Ｖ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｒ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｉ１０８Ｖ、Ｇ２９Ｗ／Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｐ１２１Ｓ、Ｇ２９Ｗ／Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｔ６１Ｎ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｌ６３Ｐ／Ｑ８２Ｈ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｉ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｔ５３Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｍ５５Ｖ／Ｅ５９Ｇ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｍ５６Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ／Ｉ１１７Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｎ５８Ｄ／Ｉ６７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｄ６４Ｎ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｔ６９Ｉ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ、Ｇ２９Ｗ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｖ、Ｇ２９Ｗ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｑ８２Ｒ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｔ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｅ５９Ｇ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｔ６１Ｉ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｌ６３Ｐ／Ｄ６５Ｇ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｌ６３Ｐ／Ｉ６７Ｖ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ、Ｇ２９Ｗ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ／Ｉ１１７Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｉ１１７Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｓ７２Ｇ／Ｑ７６Ｒ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ／Ｑ１１３Ｈ、Ｇ２９Ｗ／Ｍ８７Ｋ／Ｔ８９Ｓ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｉ１０８Ｖ／Ｉ１１７Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｍ８７Ｋ／Ｉ９３Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｅ３３Ｍ／Ａ４２Ｔ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｅ３３Ｍ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｅ３３Ｍ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｉ１０８Ｆ、Ｅ３３Ｍ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｉ１１７Ｌ、Ｅ３３Ｍ／Ｑ８２Ｈ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｅ３３Ｖ／Ａ４２Ｓ／Ｍ５５Ｔ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｔ３７Ｓ／Ｍ５６Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｖ３８Ｉ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｑ４１Ｌ／Ｙ５４Ｆ／Ｍ５６Ｋ／Ｍ９９Ｌ／Ｉ１０８Ｆ、Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｍ５５Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｔ７１Ｉ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｍ５５Ｔ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｍ５５Ｔ／Ｅ９７Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｆ、Ｍ５６Ｋ／Ｌ６３Ｐ／Ｎ７５Ｄ／Ｖ９６Ｉ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ、Ｍ５６Ｌ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ／Ｉ１１７Ｌ、Ｍ５６Ｒ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｍ５６Ｔ／Ｌ９１Ｒ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｍ５６Ｖ、Ｍ５６Ｖ／Ｅ５９Ｇ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｍ８７Ｋ／Ｉ９３Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｉ１１７Ｅ、Ｔ６１Ａ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ６３Ｐ、Ｌ６３Ｐ／Ｔ６９Ａ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｒ／Ｖ１１６Ａ、Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｍ８７Ａ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｉ９３Ｌ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ／Ｉ１１７Ｌ、Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ／Ｉ１１７Ｌ、Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｋ／Ｍ９９Ｌ／Ｌ１０６Ｒ、Ｌ６３Ｐ／Ｑ８２Ｈ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ６３Ｐ／Ｋ９５Ｒ、Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ、Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ、Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｉ１０８Ｖ、Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｉ１１７Ｍ、Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｖ１１６Ａ、Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｒ／Ｎ１１０Ｋ、Ｌ６３Ｐ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｉ１０８Ｆ、Ｉ６７Ｖ／Ｓ７２Ｇ／Ｑ８２Ｈ／Ｔ８９Ａ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｓ７２Ｇ／Ｒ８５Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ、Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｉ１１７Ｔ、Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ／Ｉ１１７Ｔ、Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ／Ｙ１１５Ｎ、Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ９８Ｒ／Ｎ１１０Ｋ、Ｔ８９Ａ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ／Ｙ１１５Ｎ／Ｅ１２０Ｄ／Ｃ１２２Ｐ／Ｄ１２４Ｐ／Ｓ１２５Ｉ／Ｄ１２６Ｐ、Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｔ７１Ａ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｄ１２４Ｉ／Ｓ１２５Ｐ／Ｄ１２６Ｔ、Ｒ１６Ｇ／Ｅ３３Ｍ／Ｎ５８Ｓ／Ｅ５９Ｇ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｅ１２０Ｄ／Ｃ１２２Ｐ／Ｄ１２４Ｐ／Ｓ１２５Ｉ／Ｄ１２６Ｐ、Ｇ２９Ｗ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｐ１２１Ｓ／Ｄ１２６Ｔ、Ｌ１２Ｈ／Ｅ３３Ｍ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｉ１８Ｔ／Ａ２６Ｔ／Ｍ５５Ｔ／Ｍ５６Ｋ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｉ１８Ｔ／Ａ２６Ｔ／Ｍ５６Ｋ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｔ５３Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ、Ｔ５３Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｙ１０５Ｌ、Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ、Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｙ１０５Ｌ、Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｎ５８Ｓ／
Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｔ５３Ｓ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｍ５６Ｋ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｅ３３Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｅ３３Ｖ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｅ３３Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ、Ｅ３３Ｖ／Ｍ９９Ｌ、Ｌ１２Ｆ／Ｒ１６Ｈ／Ｇ２９Ｗ／Ｍ５６Ｔ／Ｌ９８Ｑ、Ｌ１２Ｆ／Ｒ１６Ｈ／Ｇ２９Ｗ／Ｍ５６Ｔ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１２Ｆ／Ｒ１６Ｈ／Ｇ２９Ｗ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１２Ｆ／Ｒ１６Ｈ／Ｍ５６Ｔ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｍ５６Ｔ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１２Ｆ／Ｇ２９Ｗ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１２Ｆ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｒ１６Ｈ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｍ５６Ｔ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１２Ｆ／Ｒ１６Ｈ／Ｇ２９Ｗ／Ｍ５６Ｔ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｍ５６Ｔ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、およびＩ１８Ｔ／Ｔ６１Ｒ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｐ１０２Ｌ／Ｙ１０５Ｌの中から選択される１つ以上のアミノ酸改変を含有する。
【００１７】
提供される実施形態のうちのいずれかのうちのいくつかでは、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：４〜９７、９９〜１０４、１０６〜１５５、もしくは５７０〜６３７のうちのいずれかに記載のアミノ酸の配列、またはその特異的結合断片を含有する。いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、例えば、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２に記載の野生型または非改変ＣＴＬＡ−４と比較して、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：４〜９７、９９〜１０４、１０６〜１５５、もしくは５７０〜６３７のうちのいずれかと少なくとも９５％の配列同一性を示し、かつそれぞれのＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：のアミノ酸改変のうちの１つ以上を含有するアミノ酸の配列、またはその特異的結合断片を含有する。
【００１８】
提供される実施形態のうちのいずれかのうちのいくつかでは、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、ＩＣＯＳＬの外部ドメインに、同じ外部ドメインに対する非改変ＣＴＬＡ−４の結合と比較して増加した親和性で、特異的に結合する。
【００１９】
提供される実施形態のうちのいずれかのうちのいくつかでは、１つ以上のアミノ酸改変は、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２に記載の位置に関して、１０、１２、１６、１８、１９、２６、２８、２９、３３、３５、３８、４２、４５、４７、５３、５５、５６、５８、６１、６３、６４、６５、６７、６９、７２、７６，８２、８５、８７、８９、９３、９７、９８、９９、１０５、１０６、１０８、１１０、１１３、１１６、１１７、または１２１の中から選択される位置に対応する位置にある。いくつかの実施形態では、１つ以上のアミノ酸改変は、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２に記載の位置に関して、Ｖ１０Ａ、Ｌ１２Ｆ、Ｌ１２Ｉ、Ｌ１２Ｐ、Ｒ１６Ｈ、Ｉ１８Ｆ、Ｉ１８Ｎ、Ｉ１８Ｔ、Ｉ１８Ｖ、Ａ１９Ｖ、Ａ２６Ｔ、Ｐ２８Ｌ、Ｇ２９Ｗ、Ｅ３３Ｍ、Ｅ３３Ｖ、Ｒ３５Ｋ、Ｖ３８Ｉ、Ａ４２Ｖ、Ｑ４５Ｈ、Ｔ４７Ａ、Ｔ５３Ｓ、Ｍ５５Ｔ、Ｍ５６Ｋ、Ｍ５６Ｔ、Ｍ５６Ｖ、Ｎ５８Ｄ、Ｎ５８Ｓ、Ｔ６１Ａ、Ｔ６１Ｒ、Ｌ６３Ｈ、Ｌ６３Ｐ、Ｄ６４Ｅ、Ｄ６４Ｎ、Ｄ６４Ｖ、Ｄ６５Ｇ、Ｉ６７Ｎ、Ｉ６７Ｔ、Ｉ６７Ｖ、Ｔ６９Ａ、Ｔ６９Ｉ、Ｓ７２Ｇ、Ｑ７６Ｒ、Ｑ８２Ｈ、Ｑ８２Ｒ、Ｒ８５Ｇ、Ｍ８７Ｋ、Ｍ８７Ｔ、Ｍ８７Ｖ、Ｔ８９Ａ、Ｔ８９Ｓ、Ｉ９３Ｌ、Ｉ９３Ｖ、Ｅ９７Ｑ、Ｌ９８Ｑ、Ｍ９９Ｉ、Ｍ９９Ｌ、Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１０６Ｉ、Ｌ１０６Ｒ、Ｉ１０８Ｆ、Ｉ１０８Ｖ、Ｎ１１０Ｋ、Ｑ１１３Ｈ、Ｖ１１６Ａ、Ｉ１１７Ｌ、またはＰ１２１Ｓから選択される。
【００２０】
提供される実施形態のうちのいずれかのうちのいくつかでは、１つ以上のアミノ酸改変は、Ｖ１０Ａ、Ｌ１２Ｆ、Ｌ１２Ｉ、Ｒ１６Ｈ、Ｉ１８Ｎ、Ｉ１８Ｔ、Ｉ１８Ｖ、Ａ１９Ｖ、Ａ２６Ｔ、Ｇ２９Ｗ、Ｅ３３Ｍ、Ｅ３３Ｖ、Ｒ３５Ｋ、Ｖ３８Ｉ、Ａ４２Ｖ、Ｑ４５Ｈ、Ｔ４７Ａ、Ｔ５３Ｓ、Ｍ５５Ｔ、Ｍ５６Ｋ、Ｍ５６Ｖ、Ｎ５８Ｄ、Ｎ５８Ｓ、Ｔ６１Ａ、Ｔ６１Ｒ、Ｌ６３Ｈ、Ｌ６３Ｐ、Ｄ６４Ｅ、Ｄ６４Ｎ、Ｄ６４Ｖ、Ｄ６５Ｇ、Ｉ６７Ｎ、Ｉ６７Ｔ、Ｉ６７Ｖ、Ｔ６９Ｉ、Ｓ７２Ｇ、Ｑ７６Ｒ、Ｑ８２Ｈ、Ｑ８２Ｒ、Ｒ８５Ｇ、Ｍ８７Ｋ、Ｍ８７Ｔ、Ｍ８７Ｖ、Ｔ８９Ａ、Ｔ８９Ｓ、Ｉ９３Ｌ、Ｉ９３Ｖ、Ｅ９７Ｑ、Ｌ９８Ｑ、Ｍ９９Ｉ、Ｍ９９Ｌ、Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１０６Ｉ、Ｌ１０６Ｒ、Ｉ１０８Ｆ、Ｉ１０８Ｖ、Ｎ１１０Ｋ、Ｑ１１３Ｈ、Ｉ１１７Ｌ、およびＰ１２１Ｓ、またはそれらの保存的アミノ酸置換から選択される。
【００２１】
提供される実施形態のうちのいずれかのうちのいくつかでは、１つ以上のアミノ酸改変は、Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ／Ｉ１１７Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｍ５５Ｔ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ６３Ｐ／Ｑ８２Ｈ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｉ１８Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｔ６１Ａ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｖ３８Ｉ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｉ９３Ｌ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１２Ｉ／Ｍ５５Ｔ／Ｍ５６Ｖ／Ｉ６７Ｔ／Ｍ９９Ｌ／Ｌ１０６Ｒ／Ｉ１０８Ｆ、Ｉ１８Ｎ／Ａ２６Ｔ／Ｌ６３Ｈ／Ｔ８９Ａ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｔ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｄ６４Ｎ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｉ１８Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｍ８７Ｋ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｋ／Ｍ９９Ｌ／Ｌ１０６Ｒ、Ｌ６３Ｐ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｉ１０８Ｆ、Ｇ２９Ｗ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ａ２６Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｄ６５Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｖ１０Ａ／Ｌ６３Ｐ／Ｄ６４Ｖ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｉ１８Ｖ／Ａ２６Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｄ６４Ｅ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｒ／Ｎ１１０Ｋ、Ａ１９Ｖ／Ｇ２９Ｗ／Ｒ３５Ｋ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｔ６９Ｉ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１２Ｆ／Ｒ１６Ｈ／Ｇ２９Ｗ／Ｍ５６Ｔ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ａ２６Ｔ／Ｔ５３Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ／Ｉ１１７Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｓ７２Ｇ／Ｑ７６Ｒ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ／Ｑ１１３Ｈ、Ｇ２９Ｗ／Ｎ５８Ｄ／Ｉ６７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｉ６７Ｖ／Ｓ７２Ｇ／Ｑ８２Ｈ／Ｔ８９Ａ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｓ７２Ｇ／Ｒ８５Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ、Ａ２６Ｔ／Ｔ４７Ａ／Ｍ５６Ｋ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｑ８２Ｒ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ａ２６Ｔ／Ｍ５５Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｍ８７Ｋ／Ｉ９３Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｌ６３Ｐ／Ｑ８２Ｈ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｉ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｉ１０８Ｖ、Ａ２６Ｔ／Ａ４２Ｖ／Ｑ４５Ｈ／Ｉ６７Ｎ／Ｍ８７Ｋ／Ｅ９７Ｑ／Ｍ９９Ｌ、Ｅ３３Ｍ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｍ８７Ｋ／Ｔ８９Ｓ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｉ１０８Ｖ／Ｉ１１７Ｌ、Ｉ１８Ｔ／Ｔ６１Ｒ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｅ３３Ｍ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｉ１０８Ｆ、Ｇ２９Ｗ／Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｐ１２１Ｓ、Ｇ２９Ｗ／Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｉ１０８Ｖ、Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｉ１８Ｔ／Ａ２６Ｔ／Ｍ５５Ｔ／Ｍ５６Ｋ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｉ１８Ｔ／Ａ２６Ｔ／Ｍ５６Ｋ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｔ５３Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ、Ｔ５３Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｙ１０５Ｌ、Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｅ３３Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｅ３３Ｖ／Ｍ９９Ｌ、Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ、Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｎ５８Ｓ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｔ５３Ｓ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｍ５６Ｋ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｅ３３Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ、Ｌ１２Ｆ／Ｒ１６Ｈ／Ｇ２９Ｗ／Ｍ５６Ｔ／Ｙ１０５Ｌ、またはＬ１２Ｆ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌである。いくつかの実施形態では、アミノ酸置換は、Ｇ２９Ｗ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ６３Ｐ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｉ１０８Ｆ、Ｉ１８Ｖ／Ａ２６Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｄ６４Ｅ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｒ／Ｎ１１０Ｋ、Ｇ２９Ｗ／Ｎ５８Ｄ／Ｉ６７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｉ６７Ｖ／Ｓ７２Ｇ／Ｑ８２Ｈ／Ｔ８９Ａ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｓ７２Ｇ／Ｒ８５Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ、Ｇ２９Ｗ／Ｍ８７Ｋ／Ｉ９３Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｌ６３Ｐ／Ｑ８２Ｈ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｉ／Ｙ１０５Ｌ、Ａ２６Ｔ／Ａ４２Ｖ／Ｑ４５Ｈ／Ｉ６７Ｎ／Ｍ８７Ｋ／Ｅ９７Ｑ／Ｍ９９Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｍ８７Ｋ／Ｔ８９Ｓ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｉ１０８Ｖ／Ｉ１１７Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｉ１０８Ｖ、Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｉ１８Ｔ／Ａ２６Ｔ／Ｍ５５Ｔ／Ｍ５６Ｋ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｉ１８Ｔ／Ａ２６Ｔ／Ｍ５６Ｋ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｔ５３Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ、Ｔ５３Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｙ１０５Ｌ、Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｅ３３Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｅ３３Ｖ／Ｍ９９Ｌ、Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｎ５８Ｓ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｔ５３Ｓ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｍ５６Ｋ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｅ３３Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ、またはＬ１２Ｆ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌである。
【００２２】
提供される実施形態のうちのいずれかのうちのいくつかでは、１つ以上のアミノ酸改変は、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２に記載の位置に関して、位置１２、２６、６３、９８、もしくは１０５に対応する位置での１つ以上の改変、および／またはＬ１２Ｐ、Ｌ１２Ｆ、Ａ２６Ｔ、Ｌ６３Ｐ、Ｌ９８Ｑ、もしくはＹ１０５Ｌから選択される１つ以上の改変を含有する１つ以上のアミノ酸改変を含む。
【００２３】
提供される実施形態のうちのいずれかのうちのいくつかでは、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２に記載の位置に関して、Ｌ１２Ｐ／Ａ２６Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ａ２６Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｍ５５Ｔ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ６３Ｐ／Ｑ８２Ｈ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｉ１８Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｔ６１Ａ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｖ３８Ｉ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｉ９３Ｌ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１２Ｉ／Ｍ５５Ｔ／Ｍ５６Ｖ／Ｉ６７Ｔ／Ｍ９９Ｌ／Ｌ１０６Ｒ／Ｉ１０８Ｆ、Ｉ１８Ｎ／Ａ２６Ｔ／Ｌ６３Ｈ／Ｔ８９Ａ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｔ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｄ６４Ｎ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｉ１８Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｍ８７Ｋ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｋ／Ｍ９９Ｌ／Ｌ１０６Ｒ、Ｌ６３Ｐ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｉ１０８Ｆ、Ｇ２９Ｗ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ａ２６Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｄ６５Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｖ１０Ａ／Ｌ６３Ｐ／Ｄ６４Ｖ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｉ１８Ｖ／Ａ２６Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｄ６４Ｅ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｒ／Ｎ１１０Ｋ、Ａ１９Ｖ／Ｇ２９Ｗ／Ｒ３５Ｋ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｔ６９Ｉ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ６３Ｐ／Ｔ６９Ａ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｒ／Ｖ１１６Ａ、Ｇ２９Ｗ／Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｉ１１７Ｌ、Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ／Ｉ１１７Ｌ、Ｌ１２Ｆ／Ｒ１６Ｈ／Ｇ２９Ｗ／Ｍ５６Ｔ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ａ２６Ｔ／Ｔ５３Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ／Ｉ１１７Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｓ７２Ｇ／Ｑ７６Ｒ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ／Ｑ１１３Ｈ、Ｇ２９Ｗ／Ｎ５８Ｄ／Ｉ６７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｉ６７Ｖ／Ｓ７２Ｇ／Ｑ８２Ｈ／Ｔ８９Ａ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｓ７２Ｇ／Ｒ８５Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ、Ａ２６Ｔ／Ｔ４７Ａ／Ｍ５６Ｋ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｑ８２Ｒ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ａ２６Ｔ／Ｍ５５Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｍ８７Ｋ／Ｉ９３Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｐ２８Ｌ／Ｅ３３Ｖ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｌ６３Ｐ／Ｑ８２Ｈ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｉ／Ｙ１０５Ｌ、Ｉ１８Ｆ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｐ１２１Ｓ、Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｉ１０８Ｖ、Ａ２６Ｔ／Ａ４２Ｖ／Ｑ４５Ｈ／Ｉ６７Ｎ／Ｍ８７Ｋ／Ｅ９７Ｑ／Ｍ９９Ｌ、Ｅ３３Ｍ／Ｌ６３Ｐ��Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｍ８７Ｋ／Ｔ８９Ｓ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｉ１０８Ｖ／Ｉ１１７Ｌ、Ｉ１８Ｔ／Ｔ６１Ｒ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｅ３３Ｍ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｉ１０８Ｆ、Ｇ２９Ｗ／Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｐ１２１Ｓ、Ｇ２９Ｗ／Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、およびＧ２９Ｗ／Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｉ１０８Ｖの中から選択される１つ以上のアミノ酸改変を含有する。
【００２４】
提供される実施形態のうちのいずれかのうちのいくつかでは、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、同じ外部ドメインに対する非改変ＣＴＬＡ−４の結合と比較して増加した親和性で、ＣＤ８０の外部ドメインに特異的に結合する。いくつかの実施形態では、１つ以上のアミノ酸改変は、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２に記載の位置に関して、１０、１２、１６、１８、２６、２９、４２、４５、５３、５６、５８、６３、６７、７２、８２、８７、９７、９８、９９、１０５、１０８、または１２１の中から選択される位置に対応する位置にある。いくつかの実施形態では、１つ以上のアミノ酸改変は、Ｖ１０Ａ、Ｌ１２Ｆ、Ｒ１６Ｈ、Ｉ１８Ｔ、Ａ２６Ｔ、Ｇ２９Ｗ、Ｅ３３Ｖ、Ａ４２Ｖ、Ｑ４５Ｈ、Ｔ５３Ｓ、Ｍ５５Ｔ、Ｍ５６Ｋ、Ｍ５６Ｔ、Ｎ５８Ｓ、Ｌ６３Ｐ、Ｉ６７Ｎ、Ｑ８２Ｒ、Ｍ８７Ｋ、Ｍ８７Ｖ、Ｅ９７Ｑ、Ｌ９８Ｑ、Ｍ９９Ｌ、Ｙ１０５Ｌ、Ｉ１０８Ｖ、またはそれらの保存的アミノ酸置換から選択される。
【００２５】
提供される実施形態のうちのいずれかのうちのいくつかでは、１つ以上のアミノ酸改変は、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２に記載の位置に関して、Ｖ１０Ａ、Ｌ１２Ｆ、Ｒ１６Ｈ、Ｉ１８Ｔ、Ａ２６Ｄ、Ａ２６Ｔ、Ｇ２９Ｗ、Ａ４２Ｖ、Ｑ４５Ｈ、Ｔ５３Ｓ、Ｍ５６Ｋ、Ｍ５６Ｔ、Ｎ５８Ｓ、Ｌ６３Ｐ、Ｉ６７Ｎ、Ｓ７２Ｇ、Ｑ８２Ｒ、Ｍ８７Ｋ、Ｍ８７Ｖ、Ｅ９７Ｑ、Ｌ９８Ｑ、Ｍ９９Ｌ、Ｙ１０５Ｌ、Ｉ１０８Ｖ、またはＰ１２１Ｓの中から選択される位置に対応する位置にある。
【００２６】
提供される実施形態のうちのいずれかのうちのいくつかでは、１つ以上のアミノ酸改変は、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２に記載の位置に関して、Ｉ１８Ｔ／Ｇ２９Ｗ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ａ２６Ｄ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｑ８２Ｒ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１２Ｆ／Ｒ１６Ｈ／Ｇ２９Ｗ／Ｍ５６Ｔ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ａ２６Ｔ／Ａ４２Ｖ／Ｑ４５Ｈ／Ｉ６７Ｎ／Ｍ８７Ｋ／Ｅ９７Ｑ／Ｍ９９Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｐ１２１Ｓ、Ｇ２９Ｗ／Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｉ１０８Ｖ、およびＶ１０Ａ／Ｇ２９Ｗ／Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｐ１２１Ｓから選択される。
【００２７】
提供される実施形態のうちのいずれかのうちのいくつかでは、１つ以上のアミノ酸改変は、Ｉ１８Ｔ／Ｇ２９Ｗ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｑ８２Ｒ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１２Ｆ／Ｒ１６Ｈ／Ｇ２９Ｗ／Ｍ５６Ｔ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ａ２６Ｔ／Ａ４２Ｖ／Ｑ４５Ｈ／Ｉ６７Ｎ／Ｍ８７Ｋ／Ｅ９７Ｑ／Ｍ９９Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｐ１２１Ｓ、Ｇ２９Ｗ／Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｉ１０８Ｖ、Ｖ１０Ａ／Ｇ２９Ｗ／Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｐ１２１Ｓ、Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｉ１８Ｔ／Ａ２６Ｔ／Ｍ５５Ｔ／Ｍ５６Ｋ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｅ３３Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｅ３３Ｖ／Ｍ９９Ｌ、Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｎ５８Ｓ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｔ５３Ｓ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｍ５６Ｋ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｅ３３Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ、Ｌ１２Ｆ／Ｒ１６Ｈ／Ｇ２９Ｗ／Ｍ５６Ｔ／Ｌ９８Ｑ、Ｌ１２Ｆ／Ｒ１６Ｈ／Ｇ２９Ｗ／Ｍ５６Ｔ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１２Ｆ／Ｒ１６Ｈ／Ｇ２９Ｗ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１２Ｆ／Ｒ１６Ｈ／Ｍ５６Ｔ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｍ５６Ｔ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１２Ｆ／Ｇ２９Ｗ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１２Ｆ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｒ１６Ｈ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、またはＭ５６Ｔ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌの中から選択される。いくつかの実施形態では、１つ以上のアミノ酸改変は、Ｉ１８Ｔ／Ｇ２９Ｗ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｑ８２Ｒ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ａ２６Ｔ／Ａ４２Ｖ／Ｑ４５Ｈ／Ｉ６７Ｎ／Ｍ８７Ｋ／Ｅ９７Ｑ／Ｍ９９Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｐ１２１Ｓ、Ｇ２９Ｗ／Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｉ１０８Ｖ、Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｅ３３Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｎ５８Ｓ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、およびＥ３３Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌの中から選択される。
【００２８】
提供される実施形態のうちのいずれかのうちのいくつかでは、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、同じ外部ドメインに対する非改変ＣＴＬＡ−４の結合と比較して増加した親和性で、ＩＣＯＳＬおよびＣＤ８０の外部ドメインに特異的に結合する。いくつかの実施形態では、１つ以上のアミノ酸改変は、Ｖ１０Ａ、Ｌ１２Ｆ、Ｒ１６Ｈ、Ｉ１８Ｔ、Ａ２６Ｔ、Ｇ２９Ｗ、Ｅ３３Ｖ、Ａ４２Ｖ、Ｑ４５Ｈ、Ｔ５３Ｓ、Ｍ５５Ｔ、Ｍ５６Ｋ、Ｎ５８Ｓ、Ｌ６３Ｐ、Ｉ６７Ｎ、Ｑ８２Ｒ、Ｍ８７Ｋ、Ｍ８７Ｖ、Ｅ９７Ｑ、Ｌ９８Ｑ、Ｍ９９Ｌ、Ｙ１０５Ｌ、Ｉ１０８Ｖ、またはそれらの保存的アミノ酸置換から選択される。いくつかの実施形態では、１つ以上のアミノ酸改変は、Ｉ１８Ｔ、Ａ２６Ｔ、Ｇ２９Ｗ、Ｅ３３Ｖ、Ｑ４５Ｈ、Ｔ５３Ｓ、Ｍ５６Ｋ、Ｎ５８Ｓ、Ｌ６３Ｐ、Ｉ６７Ｎ、Ｑ８２Ｒ、Ｍ８７Ｋ、Ｍ８７Ｖ、Ｅ９７Ｑ、Ｌ９８Ｑ、Ｍ９９Ｌ、Ｙ１０５Ｌ、Ｉ１０８Ｖから選択される。
【００２９】
提供される実施形態のうちのいずれかのうちのいくつかでは、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、同じ外部ドメインに対する非改変ＣＴＬＡ−４の結合と比較して増加した親和性で、ＣＤ８６の外部ドメインに特異的に結合する。
【００３０】
提供される実施形態のうちのいずれかのうちのいくつかでは、１つ以上のアミノ酸改変は、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２に記載の位置に関して、１０、１２、１６、１８、２０、２６、２８、２９、３０、３３、４２、４７、５３、５５、５６、５８、５９、６１、６３、６５、６７、６９，７２、７６、８２、８５、８７、８９、９３、９６、９８、９９、１０２、１０５、１０６、１０８、１１３、１１５、１１６、１１７、または１２１の中から選択される位置に対応する位置にある。いくつかの実施形態では、１つ以上のアミノ酸改変は、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２に記載の位置に関して、Ｖ１０Ａ、Ｌ１２Ｆ、Ｌ１２Ｈ、Ｌ１２Ｐ、Ｒ１６Ｈ、Ｉ１８Ｔ、Ｉ１８Ｖ、Ｓ２０Ｎ、Ａ２６Ｓ、Ａ２６Ｔ、Ｐ２８Ｌ、Ｇ２９Ｒ、Ｇ２９Ｗ、Ｋ３０Ｒ、Ｅ３３Ｍ、Ｅ３３Ｖ、Ａ４２Ｓ、Ａ４２Ｔ、Ｔ４７Ａ、Ｔ５３Ｓ、Ｍ５５Ｔ、Ｍ５６Ｋ、Ｍ５６Ｒ、Ｍ５６Ｔ、Ｍ５６Ｖ、Ｎ５８Ｄ、Ｎ５８Ｓ、Ｅ５９Ｇ、Ｔ６１Ｉ、Ｔ６１Ｎ、Ｔ６１Ｒ、Ｔ６１Ｓ、Ｌ６３Ｐ、Ｄ６５Ｇ、Ｉ６７Ｎ、Ｉ６７Ｖ、Ｔ６９Ａ、Ｔ６９Ｉ、Ｓ７２Ｇ、Ｑ７６Ｒ、Ｑ８２Ｈ、Ｑ８２Ｒ、Ｒ８５Ｇ、Ｍ８７Ｋ、Ｍ８７Ｖ、Ｔ８９Ａ、Ｔ８９Ｍ、Ｔ８９Ｓ、Ｉ９３Ｖ、Ｖ９６Ｉ、Ｌ９８Ｑ、Ｌ９８Ｒ、Ｍ９９Ｌ、Ｐ１０２Ｌ、Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１０６Ｉ、Ｌ１０６Ｎ、Ｌ１０６Ｒ、Ｌ１０６Ｖ、Ｉ１０８Ｆ、Ｉ１０８Ｖ、Ｑ１１３Ｈ、Ｙ１１５Ｈ、Ｖ１１６Ａ、Ｉ１１７Ｅ、Ｉ１１７Ｌ、Ｉ１１７Ｋ、Ｉ１１７Ｔ、およびＰ１２１Ｓの中から選択される位置に対応する位置にある。
【００３１】
提供される実施形態のうちのいずれかのうちのいくつかでは、１つ以上のアミノ酸改変は、Ｌ１２Ｆ、Ｌ１２Ｈ、Ｌ１２Ｐ、Ｒ１６Ｈ、Ｉ１８Ｔ、Ｉ１８Ｖ、Ｓ２０Ｎ、Ａ２６Ｔ、Ｇ２９Ｒ、Ｇ２９Ｗ、Ｅ３３Ｍ、Ｅ３３Ｖ、Ａ４２Ｓ、Ａ４２Ｖ、Ｔ４７Ａ、Ｔ５３Ｓ、Ｍ５５Ｔ、Ｍ５６Ｋ、Ｍ５６Ｒ、Ｍ５６Ｔ、Ｍ５６Ｖ、Ｎ５８Ｄ、Ｎ５８Ｓ、Ｔ６１Ｉ、Ｔ６１Ｎ、Ｔ６１Ｒ、Ｔ６１Ｓ、Ｌ６３Ｐ、Ｄ６５Ｇ、Ｉ６７Ｎ、Ｉ６７Ｖ、Ｔ６９Ａ、Ｔ６９Ｉ、Ｓ７２Ｇ、Ｑ７６Ｒ、Ｑ８２Ｈ、Ｑ８２Ｒ、Ｒ８５Ｇ、Ｍ８７Ｋ、Ｍ８７Ｖ、Ｔ８９Ａ、Ｔ８９Ｍ、Ｔ８９Ｓ、Ｖ９６Ｉ、Ｌ９８Ｑ、Ｌ９８Ｒ、Ｍ９９Ｌ、Ｐ１０２Ｌ、Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１０６Ｉ、Ｌ１０６Ｎ、Ｌ１０６Ｒ、Ｌ１０６Ｖ、Ｉ１０８Ｆ、Ｉ１０８Ｖ、Ｑ１１３Ｈ、Ｙ１１５Ｈ、Ｖ１１６Ａ、Ｉ１１７Ｌ、Ｉ１１７Ｔ、およびＰ１２１Ｓ、またはそれらの保存的アミノ酸置換から選択される。
【００３２】
提供される実施形態のうちのいずれかのうちのいくつかでは、１つ以上のアミノ酸改変は、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２に記載の位置に関して、Ｌ１２Ｐ／Ａ２６Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｉ１８Ｔ／Ｔ６１Ｒ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｐ１０２Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１２Ｐ／Ａ２６Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｔ８９Ｍ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｐ２８Ｌ／Ｅ３３Ｖ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｒ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｉ１８Ｔ／Ｇ２９Ｒ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｉ１１７Ｔ、Ｍ５６Ｒ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ、Ａ２６Ｔ／Ｍ５５Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｅ３３Ｖ／Ａ４２Ｓ／Ｍ５５Ｔ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｑ８２Ｒ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｅ３３Ｍ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｉ１１７Ｌ、Ａ２６Ｔ／Ｉ６７Ｎ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１２Ｆ／Ａ２６Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｒ、Ｓ２０Ｎ／Ａ２６Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｔ６１Ｉ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｔ６９Ｉ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１２Ｐ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｎ、Ｌ６３Ｐ／Ｔ６９Ａ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｒ／Ｖ１１６Ａ、Ｇ２９Ｗ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｌ６３Ｐ／Ｄ６５Ｇ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｉ１８Ｖ／Ｇ２９Ｗ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ、Ｇ２９Ｗ／Ｌ６３Ｐ／Ｉ６７Ｖ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ／Ｉ１１７Ｌ、Ｌ１２Ｆ／Ｒ１６Ｈ／Ｇ２９Ｗ／Ｍ５６Ｔ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１２Ｐ／Ｇ２９Ｗ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｓ７２Ｇ／Ｑ７６Ｒ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ／Ｑ１１３Ｈ、Ｇ２９Ｗ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｖ、Ａ２６Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｎ５８Ｄ／Ｉ６７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｉ６７Ｖ／Ｓ７２Ｇ／Ｑ８２Ｈ／Ｔ８９Ａ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｓ７２Ｇ／Ｒ８５Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ、Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ａ２６Ｔ／Ｔ４７Ａ／Ｍ５６Ｋ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｑ８２Ｒ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ａ２６Ｔ／Ｍ５５Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１２Ｈ／Ｉ１８Ｖ／Ａ４��Ｔ／Ｍ５５Ｔ／Ｎ５８Ｄ／Ｌ９８Ｒ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ／Ｐ１２１Ｓ、Ｉ１８Ｔ／Ａ２６Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１２Ｆ／Ｋ３０Ｒ／Ｓ７２Ｇ／Ｑ８２Ｒ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１２Ｐ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｎ／Ｉ１１７Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｍ８７Ｋ／Ｉ９３Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｐ２８Ｌ／Ｅ３３Ｖ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｅ３３Ｍ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｍ５６Ｖ／Ｅ５９Ｇ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｍ８７Ｋ／Ｉ９３Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｉ１１７Ｅ、Ｇ２９Ｗ／Ｍ８７Ｋ／Ｔ８９Ｓ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｉ１０８Ｖ／Ｉ１１７Ｌ、Ｌ１２Ｐ／Ｍ５６Ｖ／Ｌ６３Ｐ／Ｖ９６Ｉ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｙ１１５Ｈ、Ｇ２９Ｗ／Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｔ６１Ｎ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｉ１８Ｔ／Ａ２６Ｓ／Ｍ５５Ｔ／Ｍ５６Ｖ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｉ１１７Ｋ、Ｉ１８Ｔ／Ｔ６１Ｒ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１２Ｐ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｅ３３Ｍ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｉ１０８Ｆ、Ｌ１２Ｐ／Ｒ１６Ｈ／Ａ２６Ｔ／Ｔ６１Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ／Ｉ１１７ＬＧ２９Ｗ／Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｐ１２１Ｓ、Ｇ２９Ｗ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｐ１２１Ｓ、およびＶ１０Ａ／Ｇ２９Ｗ／Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｐ１２１Ｓの中から選択される。
【００３３】
提供される実施形態のうちのいずれかのうちのいくつかでは、１つ以上のアミノ酸改変は、Ｉ１８Ｔ／Ｔ６１Ｒ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｐ１０２Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１２Ｐ／Ａ２６Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｔ８９Ｍ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｉ１８Ｔ／Ｇ２９Ｒ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｉ１１７Ｔ、Ｍ５６Ｒ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ、Ａ２６Ｔ／Ｍ５５Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｅ３３Ｖ／Ａ４２Ｓ／Ｍ５５Ｔ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｑ８２Ｒ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｅ３３Ｍ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｉ１１７Ｌ、Ａ２６Ｔ／Ｉ６７Ｎ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１２Ｆ／Ａ２６Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｒ、Ｓ２０Ｎ／Ａ２６Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｔ６１Ｉ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｔ６９Ｉ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１２Ｐ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｎ、Ｌ６３Ｐ／Ｔ６９Ａ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｒ／Ｖ１１６Ａ、Ｇ２９Ｗ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｌ６３Ｐ／Ｄ６５Ｇ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ、Ｌ１２Ｆ／Ｒ１６Ｈ／Ｇ２９Ｗ／Ｍ５６Ｔ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｓ７２Ｇ／Ｑ７６Ｒ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ／Ｑ１１３Ｈ、Ｇ２９Ｗ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｖ、Ｇ２９Ｗ／Ｎ５８Ｄ／Ｉ６７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｉ６７Ｖ／Ｓ７２Ｇ／Ｑ８２Ｈ／Ｔ８９Ａ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｓ７２Ｇ／Ｒ８５Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ、Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ａ２６Ｔ／Ｔ４７Ａ／Ｍ５６Ｋ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｑ８２Ｒ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ａ２６Ｔ／Ｍ５５Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１２Ｈ／Ｉ１８Ｖ／Ａ４２Ｔ／Ｍ５５Ｔ／Ｎ５８Ｄ／Ｌ９８Ｒ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ／Ｐ１２１Ｓ、Ｅ３３Ｍ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｍ８７Ｋ／Ｔ８９Ｓ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｉ１０８Ｖ／Ｉ１１７Ｌ、Ｌ１２Ｐ／Ｍ５６Ｖ／Ｌ６３Ｐ／Ｖ９６Ｉ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｙ１１５Ｈ、Ｇ２９Ｗ／Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｔ６１Ｎ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｉ１８Ｔ／Ｔ６１Ｒ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１２Ｐ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｅ３３Ｍ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｉ１０８Ｆ、Ｌ１２Ｐ／Ｒ１６Ｈ／Ａ２６Ｔ／Ｔ６１Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ／Ｉ１１７Ｌ、Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｎ５８Ｓ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１２Ｆ／Ｒ１６Ｈ／Ｇ２９Ｗ／Ｍ５６Ｔ／Ｌ９８Ｑ、Ｌ１２Ｆ／Ｇ２９Ｗ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、またはＬ１２Ｆ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌの中から選択される。
【００３４】
提供される実施形態のうちのいずれかのうちのいくつかでは、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、同じ外部ドメインに対する非改変ＣＴＬＡ−４の結合と比較して増加した親和性で、ＣＤ８０およびＣＤ８６の外部ドメインに特異的に結合する。いくつかの実施形態では、１つ以上のアミノ酸改変は、Ｉ１８Ｔ、Ａ２６Ｔ、Ｇ２９Ｗ、Ｅ３３Ｖ、Ａ４２Ｖ、Ｔ５３Ｓ、Ｎ５８Ｓ、Ｌ６３Ｐ、Ｉ６７Ｎ、Ｑ８２Ｒ、Ｍ８７Ｋ、Ｍ８７Ｖ、Ｌ９８Ｑ、Ｍ９９Ｌ、Ｙ１０５Ｌ、Ｉ１０８Ｖから選択される。
【００３５】
提供される実施形態のうちのいずれかのうちのいくつかでは、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、同じ外部ドメインに対する非改変ＣＴＬＡ−４の結合と比較して増加した親和性で、ＩＣＯＳＬおよびＣＤ８６の外部ドメインに特異的に結合する。
【００３６】
提供される実施形態のうちのいずれかのうちのいくつかでは、１つ以上のアミノ酸改変は、Ｌ１２Ｆ、Ｒ１６Ｈ、Ｉ１８Ｔ、Ｉ１８Ｖ、Ａ２６Ｔ、Ｇ２９Ｗ、Ｅ３３Ｍ、Ｅ３３Ｖ、Ａ４２Ｖ、Ｔ４７Ａ、Ｔ５３Ｓ、Ｍ５５Ｔ、Ｍ５６Ｋ、Ｍ５６Ｖ、Ｎ５８Ｄ、Ｎ５８Ｓ、Ｔ６１Ｒ、Ｌ６３Ｐ、Ｄ６５Ｇ、Ｉ６７Ｎ、Ｉ６７Ｖ、Ｔ６９Ｉ、Ｓ７２Ｇ、Ｑ７６Ｒ、Ｑ８２Ｈ、Ｑ８２Ｒ、Ｒ８５Ｇ、Ｍ８７Ｋ、Ｍ８７Ｖ、Ｔ８９Ａ、Ｔ８９Ｓ、Ｌ９８Ｑ、Ｍ９９Ｌ、Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１０６Ｉ、Ｌ１０６Ｒ、Ｉ１０８Ｆ、Ｉ１０８Ｖ、Ｑ１１３Ｈ、Ｉ１１７Ｌ、およびＰ１２１Ｓ、またはそれらの保存的アミノ酸置換から選択される。
【００３７】
提供される実施形態のうちのいずれかのうちのいくつかでは、１つ以上のアミノ酸改変は、Ｌ１２Ｆ、Ｒ１６Ｈ、Ｉ１８Ｔ、Ｉ１８Ｖ、Ａ２６Ｔ、Ｇ２９Ｗ、Ｅ３３Ｖ、Ａ４２Ｖ、Ｔ４７Ａ、Ｔ５３Ｓ、Ｍ５５Ｔ、Ｍ５６Ｋ、Ｎ５８Ｄ、Ｎ５８Ｓ、Ｌ６３Ｐ、Ｉ６７Ｎ、Ｉ６７Ｖ、Ｓ７２Ｇ、Ｑ８２Ｈ、Ｑ８２Ｒ、Ｒ８５Ｇ、Ｍ８７Ｋ、Ｍ８７Ｖ、Ｔ８９Ａ、Ｔ８９Ｓ、Ｌ９８Ｑ、Ｍ９９Ｌ、Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１０６Ｉ、Ｌ１０６Ｒ、Ｉ１０８Ｆ、Ｉ１０８Ｖ、およびＩ１１７Ｌから選択される。
【００３８】
提供される実施形態のうちのいずれかのうちのいくつかでは、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、同じ外部ドメインに対する非改変ＣＴＬＡ−４の結合と比較して増加した親和性で、ＩＣＯＳＬ、ＣＤ８０、およびＣＤ８６の外部ドメインに特異的に結合する。
【００３９】
提供される実施形態のうちのいずれかのうちのいくつかでは、１つ以上のアミノ酸改変は、Ｌ１２Ｆ、Ｒ１６Ｈ、Ｉ１８Ｔ、Ａ２６Ｔ、Ｇ２９Ｗ、Ｅ３３Ｖ、Ａ４２Ｖ、Ｔ５３Ｓ、Ｍ５５Ｔ、Ｍ５６Ｋ、Ｎ５８Ｓ、Ｌ６３Ｐ、Ｉ６７Ｎ、Ｑ８２Ｒ、Ｍ８７Ｋ、Ｍ８７Ｖ、Ｌ９８Ｑ、Ｍ９９Ｌ、Ｙ１０５Ｌ、またはＩ１０８Ｖから選択される。いくつかの実施形態では、１つ以上のアミノ酸改変は、Ａ２６Ｔ、Ｇ２９Ｗ、Ｔ５３Ｓ、Ｍ５６Ｋ、Ｎ５８Ｓ、Ｌ６３Ｐ、Ｌ９８Ｑ、Ｍ９９Ｌ、またはＹ１０５Ｌから選択される。いくつかの実施形態では、１つ以上のアミノ酸改変は、Ｇ２９Ｗ、Ｌ６３Ｐ、Ｌ９８Ｑ、Ｍ９９Ｌ、またはＹ１０５Ｌから選択される。いくつかの実施形態では、１つ以上のアミノ酸改変は、Ｇ２９Ｗ／Ｌ６３Ｐ、Ｇ２９Ｗ／Ｌ９８Ｑ、Ｇ２９Ｗ／Ｍ９９Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ、Ｌ６３Ｐ／Ｍ９９Ｌ、Ｌ６３Ｐ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ、Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、またはＭ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌから選択される改変を含む。いくつかの実施形態では、アミノ酸改変は、Ｇ２９Ｗ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌである。いくつかの実施形態では、アミノ酸改変は、Ｇ２９Ｗ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｑ８２Ｒ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌである。いくつかの実施形態では、アミノ酸改変は、Ｌ１２Ｐ／Ｇ２９Ｗ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌである。
【００４０】
提供される実施形態のうちのいずれかのうちのいくつかでは、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、同じ外部ドメインに対する非改変ＣＴＬＡ−４の結合と比較して、増加した親和性でＩＣＯＳＬの外部ドメインに特異的に結合し、かつ減少した親和性でＣＤ８０またはＣＤ８６の他方のうちの１つ以上の外部ドメインに特異的に結合する。
【００４１】
提供される実施形態のうちのいずれかのうちのいくつかでは、１つ以上の外部ドメインに対する結合親和性の増加は、独立して、１．２倍超、１．５倍、２倍、３倍、４倍、５倍、６倍、７倍、８倍、９倍、１０倍、２０倍、３０倍、４０倍、５０倍、１００倍またはそれ以上である。
【００４２】
提供される実施形態のうちのいずれかのうちのいくつかでは、１つ以上の外部ドメインに対する結合親和性の減少は、独立して、１．２倍、１．５倍、２倍、３倍、４倍、５倍、６倍、７倍、８倍、９倍、１０倍、２０倍、３０倍、４０倍、５０倍、１００倍またはそれ以上である。
【００４３】
提供される実施形態のうちのいずれかのうちのいくつかでは、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、ＩｇＶドメインまたはその特異的結合断片を含有する。いくつかの実施形態では、ＩｇＶドメインまたはその特異的結合断片は、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドのＣＴＬＡ−４部分のみである。いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１５６〜２８５、６０３〜６３５、もしくは６３７のうちのいずれかに記載のアミノ酸の配列、またはその特異的結合断片を含有する。いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１５６〜２８５、６０３〜６３５、もしくは６３７のうちのいずれかと少なくとも９５％の配列同一性を示すアミノ酸の配列、またはその特異的結合断片を含有し、例えば、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１５６〜２８５、６０３〜６３５、または６３７に記載の野生型または非改変ＣＴＬＡ−４と比較して、それぞれの配列番号のアミノ酸改変のうちの１つ以上を含有する。いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：４〜９７、９９〜１０４、１０６〜１５５、５６９〜６０２、もしくは６３６のうちのいずれかに記載の細胞外ドメインのアミノ酸の配列、またはその特異的結合断片、あるいはＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：４〜９７、９９〜１０４、１０６〜１５５、５６９〜６０２、もしくは６３のうちのいずれかと少なくとも９５％の配列同一性を示し、かつＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：４〜９７、９９〜１０４、１０６〜１５５、５６９〜６０２、もしくは６３６のうちのいずれかに記載のそれぞれの配列番号のアミノ酸改変のうちの１つ以上を含有するアミノ酸の配列を含有する。
【００４４】
提供される実施形態のうちのいずれかのうちのいくつかでは、ＩＣＯＳＬは、ヒトＩＣＯＳＬである。いくつかの実施形態では、ＣＤ８０は、ヒトＣＤ８０である。いくつかの実施形態では、ＣＤ８６は、ヒトＣＤ８６である。
【００４５】
いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、可溶性タンパク質である。いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、ＣＴＬＡ−４膜貫通ドメインおよび細胞内シグナル伝達ドメインを欠いており、かつ／または変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、細胞の表面上に発現されることができない。
【００４６】
提供される実施形態のうちのいずれかのうちのいくつかでは、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、多量体化ドメインに連結されている。いくつかの実施形態では、多量体化ドメインは、エフェクター機能が減少したＦｃドメインまたはその変異型である。いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、エフェクター機能が減少したＦｃドメインまたはその変異型に連結されている。いくつかの実施形態では、Ｆｃドメインは、哺乳動物、任意選択的に、ヒトであるか、または変異型Ｆｃドメインは、哺乳動物、任意選択的に、ヒトである非改変Ｆｃドメインと比較して、１つ以上のアミノ酸改変を含有する。いくつかの実施形態では、Ｆｃドメインまたはその変異型は、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：４３８〜４４２のうちのいずれかに記載のアミノ酸の配列、またはＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：４３８〜４４２のうちのいずれかと少なくとも８５％の配列同一性を示すアミノ酸の配列を含有する。いくつかの実施形態では、Ｆｃドメインは、それぞれがＥＵ番号付けによる、Ｅ２３３Ｐ、Ｌ２３４Ａ、Ｌ２３４Ｖ、Ｌ２３５Ａ、Ｌ２３５Ｅ、Ｇ２３６ｄｅｌ、Ｇ２３７Ａ、Ｓ２６７Ｋ、Ｎ２９７Ｇ、Ｖ３０２Ｃ、およびＫ４４７ｄｅｌの中から選択される１つ以上のアミノ酸改変を含有する。いくつかの実施形態では、Ｆｃドメインは、アミノ酸改変Ｌ２３４Ａ／Ｌ２３５Ｅ／Ｇ２３７Ａを含む。いくつかの実施形態では、Ｆｃドメインは、ＥＵ番号付けによるアミノ酸改変Ｃ２２０Ｓを含有する。いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、リンカー、任意選択的に、Ｇ４Ｓ（Ｇｌｙ４Ｓｅｒ）リンカーを介して間接的に、多量体化ドメインまたはＦｃに連結されている。
【００４７】
提供される実施形態のうちのいずれかのうちのいくつかでは、Ｆｃドメインに連結されている変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２８６〜３７９、３８１〜３８６、もしくは３８８〜４３７のうちのいずれかに記載のアミノ酸の配列、またはＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２８６〜３７９、３８１〜３８６、もしくは３８８〜４３７のうちのいずれかと少なくとも８５％の配列同一性を示すアミノ酸の配列を含有する。
【００４８】
提供される実施形態のうちのいずれかのうちのいくつかでは、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、膜貫通ドメインをさらに含有する膜貫通免疫調節タンパク質であり、任意選択的に、膜貫通ドメインは、直接または間接的に、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドの細胞外ドメイン（ＥＣＤ）またはその特異的結合断片に連結されている。いくつかの実施形態では、膜貫通ドメインは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１の残基１６２〜１８２と少なくとも８５％の配列同一性を示す、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１の残基１６２〜１８２として記載されるアミノ酸の配列またはその機能的変異型を含有する。
【００４９】
提供される実施形態のうちのいずれかのうちのいくつかでは、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、細胞質ドメインをさらに含有し、任意選択的に、細胞質ドメインは、膜貫通ドメインに直接または間接的に連結されている。いくつかの実施形態では、細胞質ドメインは、天然型ＣＴＬＡ−４細胞質ドメイン、細胞内シグナル伝達ドメインであるか、もしくはこれを含有し、かつ／または免疫受容体チロシンベースの抑制モチーフ（ＩＴＩＭ）シグナル伝達モチーフを含有する。いくつかの実施形態では、細胞質ドメインは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１の残基１８３〜２２３と少なくとも８５％の配列同一性を示す、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１の残基１８３〜２２３として記載されるアミノ酸の配列またはその機能的変異型を含有する。いくつかの実施形態では、細胞質ドメインは、免疫受容体チロシンベースの活性化モチーフ（ＩＴＡＭ）シグナル伝達モチーフを含有し、かつ／またはＣＤ３ゼータの細胞内シグナル伝達ドメインを含有する。
【００５０】
提供される実施形態のうちのいずれかのうちのいくつかでは、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、細胞質シグナル伝達ドメインを含有せず、かつ／または細胞上に発現されたときに細胞内シグナルを仲介することも、調節することもできない。
【００５１】
提供される実施形態のうちのいずれかのうちのいくつかでは、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、インビトロ初代Ｔ細胞アッセイで非改変ＣＴＬＡ−４ポリペプチドに対してＩＦＮ−ガンマ（インターフェロンガンマ）発現を減少させる。いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、脱グリコシル化される。
【００５２】
提供される実施形態のうちのいずれかのうちのいくつかでは、直接またはリンカーを介して間接的に、免疫グロブリンスーパーファミリー（ＩｇＳＦ）メンバーのＩｇＳＦドメインを含有する第２のポリペプチドに連結されている、提供される変異型ＣＴＬＡ−４のうちのいずれかを含有する免疫調節ポリペプチドを、本明細書に提供する。いくつかの実施形態では、ＩｇＳＦドメインは、親和性改変ＩｇＳＦドメインであり、当該親和性改変ＩｇＳＦドメインは、ＩｇＳＦファミリーメンバーの非改変または野生型ＩｇＳＦドメインと比較して、１つ以上のアミノ酸改変を含有する。場合によっては、親和性改変ＩｇＳＦドメインは、その同種結合パートナーのうちの１つ以上に対し、同じ１つ以上の同種結合パートナーとのＩｇＳＦファミリーメンバーの非改変または野生型ＩｇＳＦドメインの結合と比較して変化した結合を示す。いくつかの実施形態では、ＩｇＳＦドメインは、その同種結合パートナーのうちの１つ以上に対し、同じ１つ以上の同種結合パートナーとの非改変または野生型ＩｇＳＦドメインの結合と比較して増加した結合を示す。
【００５３】
提供される実施形態のうちのいずれかのうちのいくつかでは、変異型ＣＴＬＡ−４は、第１の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドであり、第２のポリペプチドのＩｇＳＦドメインは、第２の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドからのＩｇＳＦドメインであり、第１および第２の変異型ＣＴＬＡ−４は、同じであるか、または異なる。いくつかの態様では、免疫調節タンパク質は、ＩｇＳＦファミリーメンバーのＩｇＳＦドメインまたはその親和性改変ＩｇＳＦドメインを含有する第３のポリペプチドをさらに含有し、当該親和性改変ＩｇＳＦドメインは、ＩｇＳＦファミリーメンバーの非改変または野生型ＩｇＳＦドメインと比較して、１つ以上のアミノ酸改変を含有する。いくつかの例では、第３のポリペプチドは、第１および／もしくは第２のポリペプチドと同じであるか、または第３のポリペプチドは、第１および／もしくは第２のポリペプチドとは異なる。
【００５４】
提供される実施形態のうちのいずれかのうちのいくつかでは、任意選択的に、第２または第３のポリペプチドの、ＩｇＳＦドメインまたはその親和性改変ＩｇＳＦドメインは、ＩｇＶドメインであるか、またはこれを含む。場合によっては、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、ＩｇＶドメインであるか、またはこれを含有する。
【００５５】
提供される実施形態のうちのいずれかのうちのいくつかでは、免疫調節タンパク質は、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド、または第２のポリペプチドのうちの少なくとも一方に連結されている多量体化ドメインをさらに含有する。いくつかの態様では、免疫調節タンパク質は、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド、第２のポリペプチド、および／または第３のポリペプチドのうちの少なくとも１つに連結されている多量体化ドメインをさらに含む。場合によっては、多量体化ドメインは、エフェクター機能が減少したＦｃドメインまたはその変異型である。
【００５６】
提供される実施形態のうちのいずれかのうちのいくつかでは、多量体化ドメインは、ヘテロ二量体の形成を促進する。提供される免疫調節タンパク質のうちのいずれかを含有する免疫調節タンパク質であって、多量体化ドメインが、第１の多量体化ドメインであり、かつ第２の多量体化ドメインと相互作用して、免疫調節タンパク質を含有する多量体を形成する、免疫調節タンパク質を、本明細書に提供する。場合によっては、免疫調節タンパク質は、第１の免疫調節タンパク質であり、第２の免疫調節タンパク質は、直接またはリンカーを介して間接的に、第２の多量体化ドメインに連結され、多量体は、第１および第２の免疫調節タンパク質を含有する。いくつかの実施形態では、第２の免疫調節タンパク質は、本明細書に提供される免疫調節タンパク質であり、多量体化ドメインは、第２の多量体化ドメインである。
【００５７】
提供される実施形態のうちのいずれかのうちのいくつかでは、第１の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドであって、多量体化ドメインが、第１の多量体化ドメインである、第１の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドと、第２の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドであって、多量体化ドメインが、第２の多量体化ドメインである、第２の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドと、を含有する、免疫調節タンパク質であって、第１および第２の多量体化ドメインが、相互作用して、第１および第２の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドを含有する多量体を形成する、免疫調節タンパク質を、本明細書に提供する。いくつかの実施形態では、多量体は、二量体である。いくつかの実施形態では、免疫調節タンパク質は、ホモ二量体である。いくつかの実施形態では、免疫調節タンパク質は、ヘテロ二量体である。いくつかの実施形態では、第１および／または第２の多量体化ドメインは、エフェクター機能が減少したＦｃドメインまたはその変異型である。いくつかの実施形態では、第１および第２の多量体化ドメインは、同じであるか、または異なる。
【００５８】
提供される実施形態のうちのいずれかのうちのいくつかでは、ある部分に連結されている変異型ＣＴＬＡ−４または免疫調節タンパク質を含有するコンジュゲートを、本明細書に提供する。いくつかの実施形態では、ある部分は、細胞の表面上の分子に特異的に結合する標的指向部分である。いくつかの実施形態では、標的指向部分は、免疫細胞の表面上の分子に特異的に結合する。いくつかの実施形態では、免疫細胞は、抗原提示細胞またはリンパ球である。いくつかの実施形態では、標的指向部分は、炎症環境において細胞または組織に局在する。いくつかの実施形態では、ある部分は、タンパク質、ペプチド、核酸、小分子、またはナノ粒子である。いくつかの実施形態では、ある部分は、抗体または抗原結合断片である。いくつかの実施形態では、コンジュゲートは、二価、四価、六価、または八価である。
【００５９】
提供される実施形態のうちのいずれかのうちのいくつかでは、本明細書に提供される変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドをコードする核酸分子、または本明細書に提供される免疫調節タンパク質を、本明細書に提供する。いくつかの実施形態では、核酸分子は、合成核酸である。いくつかの実施形態では、核酸分子は、ｃＤＮＡである。
【００６０】
提供される実施形態のうちのいずれかのうちのいくつかでは、本明細書に提供される核酸分子のうちのいずれかを含有するベクターを本明細書に提供する。いくつかの実施形態では、ベクターは、発現ベクターである。いくつかの実施形態では、ベクターは、哺乳動物発現ベクターまたはウイルスベクターである。
【００６１】
提供される実施形態のうちのいずれかのうちのいくつかでは、本明細書に提供されるベクターを含有する細胞を本明細書に提供する。いくつかの実施形態では、細胞は、哺乳動物細胞である。いくつかの実施形態では、細胞は、ヒト細胞である。
【００６２】
提供される実施形態のうちのいずれかのうちのいくつかでは、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドまたは免疫調節タンパク質を生成する方法であって、本明細書に提供される核酸分子またはベクターを、細胞中にタンパク質を発現する条件下で宿主細胞に導入することを含む、方法を、本明細書に提供する。いくつかの実施形態では、本方法は、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドまたは免疫調節タンパク質を、細胞から単離または精製することをさらに含む。
【００６３】
提供される実施形態のうちのいずれかのうちのいくつかでは、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドを発現する細胞を操作する方法であって、本明細書に提供される変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドまたは免疫調節タンパク質をコードする核酸分子を、ポリペプチドが細胞中に発現される条件下で宿主細胞に導入することを含む、方法を、本明細書に提供する。
【００６４】
提供される実施形態のうちのいずれかのうちのいくつかでは、本明細書に提供される変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド、免疫調節タンパク質、核酸分子、またはベクターを発現する操作された細胞を、本明細書に提供する。いくつかの実施形態では、細胞は、免疫細胞である。いくつかの実施形態では、免疫細胞は、リンパ球である。いくつかの実施形態では、リンパ球は、Ｔ細胞である。いくつかの実施形態では、Ｔ細胞は、ＣＤ４＋および／またはＣＤ８＋Ｔ細胞である。いくつかの実施形態では、Ｔ細胞は、調節性Ｔ細胞（Ｔｒｅｇ）である。いくつかの実施形態では、操作された細胞は、初代細胞である。いくつかの実施形態では、操作された細胞は、哺乳動物細胞である。いくつかの実施形態では、操作された細胞は、ヒト細胞である。
【００６５】
提供される実施形態のうちのいずれかのうちのいくつかでは、ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、膜貫通ドメインを介して、本明細書に提供される細胞の表面上に発現される。そのような実施形態のうちのいくつかでは、ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、細胞質ドメインを含有し、任意選択的に、細胞質ドメインは、直接または間接的に、膜貫通ドメインに連結されている。いくつかの実施形態では、細胞質ドメインは、天然型ＣＴＬＡ−４細胞質ドメイン、細胞内シグナル伝達ドメイン、および／またはＩＴＩＭシグナル伝達モチーフであるか、またはこれらを含有する。いくつかの実施形態では、細胞質ドメインは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１の残基１８３〜２２３と少なくとも８５％の配列同一性を示す、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１の残基１８３〜２２３として記載されるアミノ酸の配列またはその機能的変異型を含有する。いくつかの実施形態では、細胞質ドメインは、ＩＴＡＭシグナル伝達モチーフを含有し、かつ／またはＣＤ３ゼータの細胞内シグナル伝達ドメインであるか、もしくはこれを含有する。いくつかの実施形態では、ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、細胞質シグナル伝達ドメインを含有せず、かつ／または細胞上に発現されたときに細胞内シグナルを仲介することも、調節することもできない。
【００６６】
提供される実施形態のうちのいずれかのうちのいくつかでは、操作された細胞は、キメラ抗原受容体（ＣＡＲ）をさらに含有する。いくつかの実施形態では、操作された細胞は、操作されたＴ細胞受容体（ＴＣＲ）をさらに含有する。
【００６７】
提供される実施形態のうちのいずれかのうちのいくつかでは、本明細書に提供される変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドをコードする核酸分子、または本明細書に提供される免疫調節タンパク質を含有する、感染性病原体を、本明細書に提供する。いくつかの実施形態では、感染性病原体は、細菌またはウイルスである。
【００６８】
提供される実施形態のうちのいずれかのうちのいくつかでは、本明細書に提供される変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド、本明細書に提供される免疫調節タンパク質、本明細書に提供されるコンジュゲート、本明細書に提供される操作された細胞、または本明細書に提供される感染性病原体を含有する、医薬組成ブルを、本明細書に提供する。いくつかの実施形態では、医薬組成物は、薬学的に許容可能な賦形剤を含む。いくつかの実施形態では、医薬組成物は、無菌である。
【００６９】
提供される実施形態のうちのいずれかのうちのいくつかでは、バイアルまたは容器中に本明細書に提要される医薬組成物を含有する製造物品を本明細書に提供する。いくつかの実施形態では、バイアルまたは容器は、密閉されている。
【００７０】
提供される実施形態のうちのいずれかのうちのいくつかでは、本明細書に提供される医薬組成物、および使用説明書を含有する、キットを、本明細書に提供する。いくつかの実施形態では、本明細書に提供される製造物品、および使用説明書を含有する、キットを、本明細書に提供する。
【００７１】
提供される実施形態のうちのいずれかのうちのいくつかでは、対象における免疫反応を調節する方法であって、本明細書に提供される医薬組成物を対象に投与することを含む、方法を、本明細書に提供する。いくつかの実施形態では、対象における免疫反応を調節する方法であって、本明細書に提供される操作された細胞を投与することを含む、方法を、本明細書に提供する。そのような実施形態のうちのいくつかでは、操作された細胞は、対象に対して自家である。いくつかの実施形態では、操作された細胞は、対象に対して同種異系である。いくつかの実施形態では、免疫反応の調節は、対象において疾患または状態を治療する。
【００７２】
提供される実施形態のうちのいずれかのうちのいくつかでは、免疫反応は、減少される。提供される方法のうちのいくつかの実施形態では、抑制（例えば、ＩＴＩＭ含有）細胞質シグナル伝達ドメインを含有する表面に発現される変異型ＣＴＬＡ−４を含む、本明細書に提供される変異型ポリペプチド、本明細書に提供される免疫調節タンパク質、または本明細書に提供される操作された細胞を、対象に投与する。いくつかの実施形態では、疾患または状態は、炎症性もしくは自己免疫性疾患もしくは状態であるか、または過剰な免疫反応と関連する疾患もしくは状態である。いくつかの実施形態では、疾患または状態は、抗好中球細胞質抗体（ＡＮＣＡ）関連血管炎、血管炎、自己免疫性皮膚疾患、移植、リウマチ性疾患、甲状腺炎、炎症性胃腸疾患、炎症性眼疾患、炎症性神経疾患、炎症性肺疾患、炎症性内分泌疾患、自己免疫性血液疾患、自己免疫性脱髄性疾患、または全身性自己免疫性障害を伴う自己免疫性疾患である。いくつかの実施形態では、疾患または状態は、炎症性腸疾患、移植、クローン病、潰瘍性大腸炎、喘息、自己免疫性喘息、関節リウマチ、乾癬、エリテマトーデス、セリアック病、Ｉ型糖尿病、ギラン・バレー症候群、慢性炎症性脱髄性多発神経障害、グレーブス病、橋本甲状腺炎、ドケルヴァン甲状腺炎、重症筋無力症、血管炎、自己免疫性溶血性貧血、悪性貧血の自己免疫性萎縮性胃炎、自己免疫性脳脊髄炎、自己免疫性精巣炎、グッドパスチャー病、自己免疫性血小板減少症、交感性眼炎、原発性胆汁性肝硬変、慢性活動性肝炎、膜性腎症、原発性特発性粘液水腫、強皮症、慢性肝炎、アディソン病、性腺機能低下症、悪性貧血、白斑症、円形脱毛症、自己免疫性腸疾患症候群、特発性血小板紫斑病、後天性脾臓萎縮、特発性尿崩症、抗精子抗体に起因する不妊症、感覚神経性聴力喪失、シェーグレン症候群、多発性筋炎、多発性硬化症、横断性脊髄炎、失調性硬化症、天疱瘡、進行性全身性硬化症、皮膚筋炎、結節性多発動脈炎、溶血性貧血、糸球体腎炎、および特発性顔面麻痺の中から選択される。
【００７３】
提供される方法の提供される実施形態のうちのいずれかのうちのいくつかでは、免疫反応が増加される。提供される方法のうちのいくつかの実施形態では、細胞質シグナル伝達ドメインを欠いている表面に発現される変異型ＣＴＬＡ−４、または活性化（例えば、ＩＴＡＭ含有）細胞質シグナル伝達ドメインを含有する表面に発現される変異型ＣＴＬＡ−４を発現する細胞など、本明細書に提供される操作された細胞を、対象に投与する。いくつかの実施形態では、提供される方法は、腫瘍または癌である疾患または状態を治療する。そのような実施形態のうちのいくつかでは、疾患または状態は、黒色腫、肺癌、膀胱癌、血液学的悪性疾患、肝臓癌、脳癌、腎臓癌、乳癌、膵臓癌、結腸直腸癌、脾臓癌、前立腺癌、精巣癌、卵巣癌、子宮癌、胃癌、筋骨格系の癌、頭頸部癌、胃腸癌、胚細胞癌、または内分泌および神経内分泌系の癌から選択される。
【図面の簡単な説明】
【００７４】
【図１】（１）Ｆｃ鎖に融合した変異型ＩｇＳＦドメイン（ｖＩｇＤ）、（２）抗体（Ｖ−ｍＡｂ）に連結されている変異型ＩｇＳＦドメイン（ｖＩｇＤ）を含む、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドなど、提供される変異型ＩｇＳＦドメイン分子の様々な可溶性または非細胞発現形式を図示する。ｖＩｇＤは、ＣＴＬＡ−４のＩｇＳＦスーパーファミリーメンバーのＩｇＶドメインもしくはＶドメイン（ＩｇＶ）を含有するＥＣＤ、または（３）第１の変異型ＩｇＳＦドメイン（第１のｖＩｇＤ）、および第２の変異型ＩｇＳＦドメイン（第２のｖＩｇＤ）などの第２のＩｇＳＦドメインを含有する積層分子を含み得る。
【図２】例示的な可溶性ＣＴＬＡ−４ポリペプチドの免疫調節活性を例示化する。例示的な概略では、Ｔ細胞活性化は、Ｔ細胞受容体（ＴＣＲ）ならびにＣＤ２８および／またはＩＣＯＳ共刺激受容体を通したシグナル伝達から生じる。シグナル伝達、およびＴ細胞活性化は、ＭＨＣおよび共刺激リガンドＣＤ８０（Ｂ７〜１）、ＣＤ８６（Ｂ７〜２）、および／またはＩＣＯＳＬを発現する抗原提示細胞（ＡＰＣ）によって誘発される（図２の左を参照）。示すように、提供される変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、Ｆｃに融合された変異型ＣＴＬＡ−４のＩｇＳＦドメイン（ｖＩｇＤ）によって概略で例示化されるように（ＣＴＬＡ−４のｖＩｇＤ−Ｆｃ、図２の真ん中を参照）、１つ以上の結合パートナーＩＣＯＳＬ、ＣＤ８０（Ｂ７〜１）、および／またはＣＤ８６（Ｂ７〜２）と相互作用して、Ｔ細胞ＣＤ２８およびＩＣＯＳ活性化受容体のそれらの共刺激リガンドとの結合を阻害し、それによってＴ細胞活性化、増殖、およびエフェクター機能を抑える（図２の右を参照）。
【図３】図３Ａおよび３Ｂは、Ｔ細胞の表面上の膜貫通免疫調節タンパク質（ＴＩＰ）として、変異型ＣＴＬＡ−４などのＣＴＬＡ−４の発現の実施形態を図示する。図３Ａに示すように、場合によっては、Ｔ細胞活性化は、抗原提示細胞（ＡＰＣ）上に発現されるＣＤ８０（Ｂ７〜１）およびＣＤ８６（Ｂ７〜２）共刺激分子との係合によって誘発されるＣＤ２８／ＴＣＲシグナル情報伝達によって駆動される。活性化Ｔ細胞またはＴ調節性細胞上に発現されるＣＴＬＡ−４などのＴ細胞発現ＣＴＬＡ−４は、細胞内在化を通して、細胞内区画と細胞表面との間で絶えず再利用される。ＣＴＬＡ−４はまた、ＣＤ８０（Ｂ７〜１）およびＣＤ８６（Ｂ７〜２）共刺激分子（および、場合によっては、ＩＣＯＳＬ）に結合し得る。図３Ｂに示すように、場合によっては、Ｂ７〜１およびＢ７〜２などのＴ細胞発現ＣＴＬＡ−４のそのリガンドとの結合により、Ｔ細胞が、トランス・エンドサイトーシスと称されるプロセスにおいてＡＰＣの表面から同種リガンドを除去することができる。機能的に、これにより、ＣＴＬＡ−４がＡＰＣからリガンドを「剥離」させることを可能にし、それによってＣＤ２８共刺激リガンドが、追加のＴ細胞を続いて活性化させることを防止し、よって、Ｔ細胞活性化を制限する。
【図４】変異型ＩｇＳＦドメイン（ｖＩｇＤ）が、第１のＴ細胞、例えば、ＣＡＲ（キメラ抗原受容体）Ｔ細胞などの細胞から分泌される、分泌された免疫調節タンパク質（ＳＩＰ）を図示する。例示的な実施形態では、ＳＩＰは、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドであり、結合パートナーは、抗原提示細胞によって発現され得る、共刺激リガンド（例えば、ＣＤ８０、ＣＤ８６、および／またはＩＣＯＳＬ）である。ＳＩＰのその結合パートナーとの結合時に、ＳＩＰは、共刺激リガンドの共刺激受容体（例えば、ＣＤ２８）との結合を阻害し、それによって共刺激受容体を介した活性化シグナルを阻害し、Ｔ細胞またはエフェクターＴ細胞活性化を弱体化させる。
【図５Ａ】図５Ａ〜５Ｃは、変異型ＩｇＳＦ−抗体コンジュゲート（Ｖ−Ｍａｂ）の様々な例示的な構成を図示する。図５Ａは、１つ以上の変異型ＩｇＳＦドメイン（ｖＩｇＤ）が、直接または間接的に、抗体の軽鎖のアミノ末端および／またはカルボキシル末端に連結されている、様々な構成を示す。
【図５Ｂ】図５Ａ〜５Ｃは、変異型ＩｇＳＦ−抗体コンジュゲート（Ｖ−Ｍａｂ）の様々な例示的な構成を図示する。図５Ｂは、１つ以上の変異型ＩｇＳＦドメインが、直接または間接的に、抗体の重鎖のアミノ末端および／またはカルボキシル末端に連結されている、様々な構成を示す。
【図５Ｃ】図５Ａ〜５Ｃは、変異型ＩｇＳＦ−抗体コンジュゲート（Ｖ−Ｍａｂ）の様々な例示的な構成を図示する。図５Ｃは、図５Ａに図示されるような軽鎖および５Ｂに図示されるような重鎖が、細胞中に同時発現されたときに得られたＶ−Ｍａｂ構成を図示する。
【図６Ａ】第１の変異型ＩｇＳＦドメイン（第１のｖＩｇＤ）および第２の変異型ＩｇＳＦドメイン（第２のｖＩｇＤ）などの第２のＩｇＳＦドメインを含有する積層分子の様々な例示的な構成を図示する。示すように、第１のｖＩｇＤおよび第２のＩｇＳＦドメインは、独立して、直接または間接的に、Ｆｃ領域のＮ末端またはＣ末端に連結されている。ホモ二量体Ｆｃ分子を作成するために、Ｆｃ領域は、細胞中の個々のＦｃ領域の同時発現による整合したＦｃサブユニットとホモ二量体を形成することができる領域である。ヘテロ二量体Ｆｃ分子を作成するために、個々のＦｃ領域は、変異（例えば、ＣＨ３ドメイン中の「凸と凹（ｋｎｏｂ−ｉｎｔｏ−ｈｏｌｅ）」変異）を含有し、そのため、個々のＦｃ領域が細胞中に同時発現されるホモ二量体と比較して、ヘテロ二量体の形成が好ましい。
【図６Ｂ】第１の変異型ＩｇＳＦドメイン（第１のｖＩｇＤ）、第２の変異型ＩｇＳＦドメイン（第２のｖＩｇＤ）などの第２のＩｇＳＦドメイン、および第３の変異型ＩｇＳＦドメイン（第３のｖＩｇＤ）などの第３のＩｇＳＦドメインを含有する積層分子の様々な例示的な構成を図示する。示すように、第１のｖＩｇＤ、第２のＩｇＳＦ、および第３のＩｇＳＦドメインは、独立して、直接または間接的に、Ｆｃ領域のＮ末端またはＣ末端に連結されている。ホモ二量体Ｆｃ分子を作成するために、Ｆｃ領域は、細胞中の個々のＦｃ領域の同時発現による整合したＦｃ領域とホモ二量体を形成することができる領域である。
【図７】Ｆｃに融合されたＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：９３に記載の例示的なＣＴＬＡ−４変異型（変異Ｇ２９Ｗ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｑ８２Ｒ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌを含有する）、アバタセプト、またはＦｃ対照でのコラーゲン誘発性関節炎（ＣＩＡ）モデルマウスの治療後のＣＩＡ足スコアを図示する。ＣＩＡ足スコアを、マウスごとに４つの足のうちのそれぞれの合計として判定し、１５匹のマウスのグループにわたって平均化した（平均ＣＩＡ足スコア）。
【発明を実施するための形態】
【００７５】
詳細な説明
少なくとも１つの標的結合パートナーに結合するための活性を示す、細胞傷害性Ｔリンパ球関連タンパク質４（表面抗原分類１５２またはＣＤ１５２としても知られる、ＣＴＬＡ−４）の変異型もしくは変異体、またはそれらの特異的結合断片であるか、またはこれを含む、免疫調節タンパク質を、本明細書に提供する。いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、非改変または野生型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドと比較して、１つ以上のアミノ酸改変（例えば、アミノ酸置換、欠失、または添加）を含有する。いくつかの実施形態では、１つ以上のアミノ酸改変（例えば、置換）は、非改変または野生型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドのＥＣＤ中にある。いくつかの実施形態では、１つ以上のアミノ酸改変（例えば、置換）は、非改変または野生型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドのＩｇＳＦドメイン（例えば、ＩｇＶ）中にある。いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドおよび免疫調節タンパク質は、誘導性Ｔ細胞共刺激リガンド（Ｂ７−Ｈ２、ＣＤ２７５、およびＧＬ５０としても知られる、ＩＣＯＳＬ）．に対する変化した、例えば、増加した、結合活性または親和性を示す。いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドおよび免疫調節タンパク質は、ＩＣＯＳＬ、ＣＤ８０（Ｂ７〜１とも呼ばれる）、および／またはＣＤ８６（Ｂ７〜２とも呼ばれる）に対する増加した結合活性または親和性を示す。
【００７６】
いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、可溶性である免疫調節タンパク質である。そのような分子は、膜貫通ドメインを含有せず、かつ／または細胞に膜固定されないか、もしくは細胞の表面上に発現されることができない、ＣＴＬＡ−４ポリペプチドを含む。いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４タンパク質は、細胞の表面上に発現されることができる膜貫通免疫調節タンパク質として、または細胞から分泌されることができる分泌可能な免疫調節タンパク質として提供され得る。いくつかの実施形態では、本明細書に提供される変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドおよび１つ以上の他の部分またはポリペプチドを含有するコンジュゲートまたは融合がある１つ以上の他の免疫調節タンパク質も、本明細書に提供する。
【００７７】
いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドおよび免疫調節タンパク質は、免疫反応の増加または減少など、免疫学的免疫反応を調節する。いくつかの実施形態では、本明細書に提供される変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドおよび免疫調節タンパク質は、自己免疫性症状もしくは自己免疫性疾患、または場合によっては、腫瘍学的徴候など、無調節免疫反応と関連する疾患または状態の治療のために使用され得る。
【００７８】
概して、抗原特異的Ｔ細胞活性化は、一般に、２つの別個のシグナルを必要とする。第１のシグナルは、Ｔ細胞受容体（ＴＣＲ）の、抗原提示細胞（ＡＰＣ）上に存在する主要組織適合複合体（ＭＨＣ）関連抗原との相互作用によって提供される。第２のシグナルは、ＴＣＲ係合に対して共刺激性であり、場合によっては、Ｔ細胞アポトーシスまたはアネルギーを回避することを含む、Ｔ細胞増殖、分化および／または生存のために必要である。いくつかの実施形態では、正常な生理的状態下で、Ｔ細胞媒介性免疫反応は、Ｔ細胞受容体（ＴＣＲ）による抗原認識によって開始され、共刺激（例えば、Ｔ細胞活性化）および共抑制シグナル（例えば、免疫チェックポイントタンパク質）のバランスによって調節される。免疫系は、自己免疫（すなわち、自己寛容）を防止し、免疫反応中の、例えば、病原性感染による攻撃中の過度の損傷から組織を保護するために、免疫チェックポイントに依存している。場合によっては、しかしながら、免疫系は、無調節になる可能性があり、異常な免疫反応が、正常な体の部位または組織に対して上昇される可能性があり、自己免疫性疾患もしくは状態または自己免疫性症状をもたらし得る。他の場合では、望ましくない免疫反応が、移植などの異組織に対して上昇される可能性があり、移植拒絶反応をもたらし得る。
【００７９】
ＣＴＬＡ−４は、ＴＣＲ／ＣＤ２８シグナル伝達の調節を通してＴ細胞反応を抑制する抑制ＩｇＳＦ受容体である。共刺激受容体ＣＤ２８は、共刺激リガンドＣＤ８０（Ｂ７〜１とも呼ばれる）およびＣＤ８６（Ｂ７〜２とも呼ばれる）に結合し、ＴＣＲシグナルの存在下で、ナイーブＴ細胞の活性化を促進する。共抑制受容体ＣＴＬＡ−４は、ＣＤ８０およびＣＤ８６の結合のためのＣＤ２８と競合して、Ｔ細胞活性化の負の調節を誘発する（図２）。ＣＴＬＡ−４が、ＣＤ８０および／またはＣＤ８６に結合し、その同種リガンドからのＣＤ２８を防止するとき、Ｔ細胞は、活性化シグナル伝達カスケードを効率的に伝達せず、Ｔ細胞活性化およびエフェクター機能を、排除または弱体化することができる。ＣＴＬＡ−４はまた、共刺激リガンドＣＤ８０およびＣＤ８６の、ＡＰＣなどの対向する細胞からの捕捉およびトランス・エンドサイトーシスによって抑制効果を発揮し、それによってＣＤ２８共刺激受容体に結合するためにこれらの共刺激リガンドを利用できない状態にする（図３）。Ｔ細胞受容体（ＴＣＲ）の係合は、共刺激リガンドのＣＴＬＡ−４取得を増強する（Ｈｏｕ  ｅｔ  ａｌ（２０１５）Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．，１９４（５）：２１４８−５９；Ｓｏｓｋｉｃ  ｅｔ  ａｌ．（２０１４）Ａｄｖ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．，１２４：９５−１３６；Ｑｕｒｅｓｈｉ  ｅｔ  ａｌ．（２０１１），Ｓｃｉｅｎｃｅ，３３２（６０２９）：６００−６０３）。
【００８０】
ＣＴＬＡ−４は、ＣＤ８０および／またはＣＤ８６相互作用の調節を通してＴ細胞活性化を弱体化することによって自己免疫性疾患を治療するための治療薬物として活用されている。具体的には、アバタセプトおよびベラタセプトは、それぞれ、関節リウマチおよび移植状況において使用するためのＦＤＡ承認治療薬である。アバタセプトは、抗体のＦｃ部分に融合される野生型ＣＴＬＡ−４  ＩｇＳＦドメインである。ベラタセプトは、ＣＤ８０およびＣＤ８６リガンドに対して増加した親和性を与えるための、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２に記載の野生型参照ＣＴＬＡ−４  ＥＣＤ配列の位置３１および１０６に対応する、位置３１のアラニンに対するチロシンの置換、および位置１０６のロイシンに対するグルタミン酸の置換（Ａ３１Ｙ／Ｌ１０６Ｅ）を含有するＣＴＬＡ−４  ＩｇＳＦドメインの改変された変異型である（Ｋｒｅｍｅｒ  ｅｔ  ａｌ．，Ｎ  Ｅｎｇｌ  Ｊ  Ｍｅｄ．２００３；３４９（２０）：１９０７−１９１５、Ｌａｒｓｅｎ  ｅｔ  ａｌ．，Ａｍ  Ｊ  Ｔｒａｎｓｐｌａｎｔ．２００５；５（３）：４４３−４５３）。
【００８１】
いくつかの態様では、ＩＣＯＳＬ（Ｂ７−Ｈ２とも呼ばれる）は、ＣＴＬＡ−４の結合パートナーであると報告されている（Ｙａｏ  ｅｔ  ａｌ．（２０１１）Ｉｍｍｕｎｉｔｙ，３４（５）：７２９−７４０）。ＩＣＯＳＬは、共刺激受容体ＩＣＯＳに対するリガンドである（図２）。ＣＤ２８およびＣＴＬＡ−４はまた、ＩＣＯＳＬに結合し得るが、ＩＣＯＳよりも親和性が低い可能性がある。ＣＤ８０、ＣＤ８６、およびＩＣＯＳＬは、通常、ＡＰＣ（例えば、樹状細胞）の表面上に発現される。ＩＣＯＳＬ、ＣＤ８０、および／またはＣＤ８６はまた、ＣＤ４＋およびＣＤ８＋Ｔ細胞を含む、Ｔ細胞上に発現され得る。ＣＤ８０、ＣＤ８６、および／またはＩＣＯＳＬの、共刺激受容体、ＣＤ２８、および／またはＩＣＯＳへの結合は、他の活性の中でも特に、Ｔ細胞活性化、Ｔ細胞増殖、サイトカイン生成を伴い得る免疫反応を増強する。例えば、ＩＣＯＳに結合するＩＣＯＳＬは、Ｔヘルパー細胞およびＢ細胞分化に関与する。
【００８２】
全長ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、シグナル伝達配列、細胞外ドメイン（ＥＣＤ）、膜貫通領域、および細胞質ドメインを含有する。細胞質ドメインは、細胞内シグナル伝達ドメインを含有する。例示的なヒトＣＴＬＡ−４配列は、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１に記載されている。シグナル配列の除去後、ＥＣＤは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１のアミノ酸３６〜１６１に対応するアミノ酸を含有する。例示的なヒトＣＴＬＡ−４  ＥＣＤアミノ酸配列は、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２または５６９に記載されている。ＣＴＬＡ−４のＥＣＤは、単一ＩｇＳＦドメイン（すなわち、単一ＩｇＶドメイン）を含有する。場合によっては、ＩｇＶドメインは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１のアミノ酸３９〜１４０（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２のアミノ酸４〜１０５）であるか、またはこれらを含有しない。場合によっては、ＩｇＶドメインは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１のアミノ酸３９〜１５２（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２のアミノ酸４〜１１７）であるか、またはこれらを含有する。ＩｇＶドメイン内に、ＣＤＲ１様ループ（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２のアミノ酸２７〜３４に対応する）、ＣＤＲ２様ループ（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２のアミノ酸５１〜５５に対応する）、およびＣＤＲ３様ループ（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２のアミノ酸９７〜１０４に対応する）があり、いくつかの態様では、ＣＴＬＡ−４の、そのＣＤ８０およびＣＤ８６同種リガンドとの相互作用にある役割を果たすと報告されている（Ｐｅａｃｈ  ｅｔ  ａｌ．，Ｊ．Ｅｘｐ．Ｍｅｄ．（１９９４），１８０（６）：２０４９−２０５８）。
【００８３】
ＣＤ８０、ＣＤ８６、および／またはＩＣＯＳＬに対する増加した結合親和性など、増加した結合活性を示す変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドを本明細書に提供する。提供される実施形態の中には、ＩＣＯＳＬに対する増加した親和性を示し、場合によっては、ＣＤ８０および／またはＣＤ８６に対する増加した結合親和性など、より高い結合親和性も示す、変異型ＣＴＬＡ−４分子を対象とする実施形態がある。いくつかの実施形態では、ＣＤ８０、ＣＤ８６、およびＩＣＯＳＬへの結合は、競合的であり、そのため、単一変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、一度に１つ超のリガンドに結合しない。したがって、提供される変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、ＣＤ８０、ＣＤ８６、および／またはＩＣＯＳＬに結合して、Ｔ細胞上の結合活性化受容体ＣＤ２８およびＩＣＯＳにおいて、これらのリガンドの正常な機能を調節、例えば、拮抗させることができる。
【００８４】
いくつかの態様では、Ｔ細胞反応などの免疫反応の抑制または弱体化は、望ましくない自己免疫性症状および／または移植拒絶反応を低減または防止するために望ましい可能性があるだろう。提供される実施形態の中には、自己免疫または炎症性疾患もしくは状態を治療するための、可溶性またはその細胞発現形態など、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドを使用するための方法がある。このように、いくつかの態様では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、減少したＴ細胞活性化、膨張、および／またはエフェクター機能、自己免疫性障害の弱体化の効果を有する、Ｔ細胞などに関わる望ましくない自己免疫を経験する患者に送達され得る。これらの変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドを作製および使用する方法も提供する。
【００８５】
場合によっては、様々な形式のＣＴＬＡ−４ポリペプチドを作製して、免疫反応を促進または増加することができる。例えば、エフェクター細胞上で同種結合パートナーに結合するＣＴＬＡ−４について競合する活性化細胞質シグナル伝達ドメインまたはデコイ受容体を含有する特定のＣＴＬＡ−４切り替え受容体は、免疫反応の増加など、免疫反応の促進をもたらし得る。提供される実施形態の中には、癌および腫瘍学的徴候を治療するために、活性化シグナルを誘発し、かつ／または抑制シグナルと競合することができる、特定の細胞発現形態など、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドを使用するための方法がある。
【００８６】
いくつかの実施形態では、提供される変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド、およびそのような変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドを含有する免疫調節ポリペプチド、コンジュゲート、または操作された細胞によって達成される免疫シグナル伝達の調節は、他の治療と比較して、炎症性および自己免疫性障害ならびに他の疾患および状態の治療のための利点を提供する。場合によっては、そのようなリガンド／受容体相互作用、およびその後のシグナル伝達の免疫調節効果に干渉し、これを変化させるための治療は、免疫シナプスの拘束によって課される空間定位要件ならびにサイズの限界によって限定される。いくつかの態様では、抗体薬物を含む既存の治療薬物は、これらの相互作用の調節に関わる複数の標的タンパク質と同時に相互作用することができない場合がある。追加的に、これらのリガンド／受容体相互作用のうちの１つを独立して標的化する薬物間の薬物動態学的な差は、治療の過程全体を通してそのような薬物の組み合わせの所望の血中濃度を適切に維持する際に困難を生じる可能性がある。
【００８７】
本明細書で述べられている特許、特許出願、科学論文、およびデータベースを含むすべての公報は、特許、特許出願、科学論文、またはデータベースを含む各個々の公報が、参照により組み込まれると具体的かつ個々に示されるのと同じ範囲まですべての目的のためにそれらの全体が参照により本明細書に組み込まれる。本明細書に記載の定義が、参照により本明細書に組み込まれる特許、出願、出願公開、および他の公報に記載の定義に反しているか、または別様に矛盾している場合、本明細書に記載の定義が、参照により本明細書に組み込まれる定義より優先する。
【００８８】
本明細書で使用される節の見出しは、構成の目的のためのものであり、記載される対象事項を限定するものと解釈されるべきではない。
【００８９】
Ｉ．定義
別段定義されない限り、本明細書で使用されるすべての技術用語、表記法、および他の技術的かつ科学的用語または専門用語は、請求されている対象事項が関係する当業者によって一般に理解されるものと同じ意味を有することが意図される。場合によっては、一般に理解される意味を有する用語は、明確化および／または容易な参照のために本明細書で定義され、そのような定義の本明細書への包含は、必ずしも、当該技術分野で一般に理解されるものを超える実質的な差を表すものと解釈されるべきではない。
【００９０】
本明細書全体にわたって使用される用語は、具体的な例において別様に限定されない限り、以下の通りに定義される。本明細書および添付の特許請求の範囲において使用される場合、単数形の「１つの（ａ）」、「１つの（ａｎ）」、および「その（ｔｈｅ）」は、文脈が別段明確に示さない限り、複数の参照を含む。別段定義されない限り、本明細書で使用されるすべての技術的かつ科学的用語、頭字語、および略語は、本発明が関係する当業者によって一般に理解されるものと同じ意味を有する。別段示されない限り、科学的かつ生化学的名称についての略語および記号は、ＩＵＰＡＣ−ＩＵＢ命名法によるものである。別段示されない限り、すべての数値範囲は、その範囲を定義する値ならびにその間のすべての整数値を包含する。
【００９１】
免疫グロブリンスーパーファミリードメインの文脈で使用される「親和性の改変」という用語は、親野生型または非改変（すなわち、改変された非親和性）ＩｇＳＦ制御ドメインと比較して、少なくとも１つの結合パートナー（代替的に、「カウンター構造」）との増加または減少した結合親和性または結合活性を有するような、変化したアミノ酸配列（対応する野生型親または非改変ＩｇＳＦドメインに対する）を有する哺乳動物免疫グロブリンスーパーファミリー（ＩｇＳＦ）ドメインを意味する。この文脈では、親和性改変ＣＴＬＡ−４  ＩｇＳＦドメインが含まれる。いくつかの実施形態では、親和性改変ＩｇＳＦドメインは、野生型または非改変ＩｇＳＦドメイン中に、アミノ酸置換など、１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、２９、３０個以上のアミノ酸差を含有し得る。結合親和性または結合活性の増加または減少は、フローサイトメトリーなどのよく知られている結合アッセイを使用して判定され得る（Ｌａｒｓｅｎ  ｅｔ  ａｌ．，Ａｍ  Ｊ  Ｔｒａｎｓｐｌａｎｔ，５（３）：４４３−４５３（２００５）、Ｌｉｎｓｌｅｙ  ｅｔ  ａｌ．，Ｉｍｍｕｎｉｔｙ，１（９）：７９３−８０１（１９９４）も参照されたい）。タンパク質のその結合パートナーへの結合親和性または結合活性の増加は、野生型ＩｇＳＦドメインの対照の値よりも１０％大きい値であり、いくつかの実施形態では、野生型ＩｇＳＦドメインの対照値の値よりも少なくとも２０％、３０％、４０％、５０％、１００％、２００％、３００％、５００％、１０００％、５０００％、または１００００％大きい値である。タンパク質のその結合パートナーのうちの少なくとも１つへの結合親和性または結合活性の減少は、対照の９０％以下の値であるが、野生型ＩｇＳＦドメインの対照値の１０％以下であり、いくつかの実施形態では、野生型ＩｇＳＦドメインの対照値の８０％、７０％、６０％、５０％、４０％、３０％、または２０％以下であるが、その１０％以上である。
【００９２】
親和性改変タンパク質は、アミノ酸残基の置換、添加、または欠失によって一次アミノ酸配列において変化した。「親和性改変ＩｇＳＦドメイン」という用語は、親和性改変ＩｇＳＦドメインが作成された任意の特定の出発組成物または方法についての任意の条件を課すものと解釈されるべきではない。したがって、本発明の親和性改変ＩｇＳＦドメインは、親和性改変の任意の特定のプロセスによって次に親和性改変ＩｇＳＦドメインに変形される野生型ＩｇＳＦドメインに限定されない。親和性改変ＩｇＳＦドメインポリペプチドは、野生型哺乳動物ＩｇＳＦドメイン配列情報から出発して作成され、次に、その結合パートナーとの結合のためにインシリコでモデル化され、物質の親和性改変ＩｇＳＦドメイン組成物を生じるように最終的に組み換え発現されるか、または化学的に合成され得る。代替的な例では、親和性改変ＩｇＳＦドメインは、野生型ＩｇＳＦドメインの部位特異的変異誘発によって作成され得る。したがって、親和性改変ＩｇＳＦドメインは、ある生成物を表し、必ずしも、任意の所与のプロセスによって生成される生成物を表すものではない。組み換え方法、化学合成、またはそれらのくみ合わせを含む様々な技術を用いることができる。
【００９３】
「同種異系（ａｌｌｏｇｅｎｉｃ）」または「同種（ａｌｌｏｇｅｎｅｉｃ）」という用語は、１つの生物体から取り出され、次に、同じ種の遺伝的に異質な生物体に注入または養子移入される細胞または組織を意味するように本明細書で互換的に使用される。本発明のいくつかの実施形態では、種は、ネズミまたはヒトである。
【００９４】
本明細書で使用される場合、「自家」という用語は、後に注入または養子移入される同じ生物体から取り出された細胞または組織を意味する。自家細胞または組織は、生物体から除去された天然型細胞または天然型組織ともはや遺伝的に同一でないように、例えば、組み換えＤＮＡ方法論によって変化され得る。例えば、天然型自家Ｔ細胞は、場合によっては、Ｔ細胞またはＴＩＬ（腫瘍浸潤リンパ球）の操作を伴う、膜貫通免疫調節タンパク質および／またはキメラ抗原受容体（ＣＡＲ）を発現する自家の操作された細胞になるように組み換えＤＮＡ技術によって遺伝的に操作され得る。次に、操作された細胞を、天然型Ｔ細胞を単離した患者に注入する。いくつかの実施形態では、生物体は、ヒトまたはネズミである。
【００９５】
本明細書で使用される場合、「結合親和性」および「結合活性」という用語は、特定の結合状態下で、そのカウンター構造のためのタンパク質の、それぞれの特異的結合親和性および特異的結合活性を意味する。生化学的動力学では、結合活性は、ＣＴＬＡ−４とそのカウンター構造ＩＣＯＳＬ、ＣＤ８０、および／またはＣＤ８６との間など、個々の非共有結合相互作用の複数の親和性の蓄積された強度を指す。このように、結合活性は、単一の相互作用の強度を記載する親和性とは別個のものである。親和性改変ＣＴＬＡ−４  ＩｇＳＦドメインを含有する変異型ＣＴＬＡ−４のそのカウンター構造への結合親和ａの増加または弱体化は、ＩｇＶドメインなどの天然型または野生型ＩｇＳＦドメインを含有する非改変ＣＴＬＡ−４など、非改変ＣＴＬＡ−４の結合親和性に対して判定される。結合親和性または結合活性を判定するための方法は、当該技術分野で知られている。例えば、Ｌａｒｓｅｎ  ｅｔ  ａｌ．，Ａｍ  Ｊ  Ｔｒａｎｓｐｌａｎｔ，５（３）：４４３−４５３（２００５）を参照されたい。いくつかの実施形態では、本発明の変異型ＣＴＬＡ−４（すなわち、親和性改変ＩｇＳＦドメインを含有するＣＴＬＡ−４タンパク質）は、結合アッセイにおける野生型ＣＴＬＡ−４対照よりも少なくとも１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、９０％、または１００％大きい平均蛍光強度（ＭＦＩ）値を生じる結合親和性で、フローサイトメトリーによって測定されるように、ＩＣＯＳＬ、ＣＤ８０、および／またはＣＤ８６に特異的に結合する。
【００９６】
「生物学的半減期」という用語は、その薬理学的または生理学的活性または濃度の半分を失うために、本発明の変異型ＣＴＬＡ−４を含むメ根来調節ポリペプチドなどの物質についてかかる時間量を指す。生物学的半減期は、体の特定の器官または組織における物質の排除、排泄、分解（例えば、酵素的分解／消化）、または吸収および濃度によって影響を受ける可能性がある。いくつかの実施形態では、生物学的半減期は、その定常状態レベルの半分（「血漿内半減期」）に到達するために、物質の血漿濃度に対してかかる時間を判定することによって評価することができる。本発明のポリペプチドの生物学的半減期を誘導体化および増加させるために使用され得るコンジュゲートは、当該技術分野で知られており、ポリエチレングリコール（ＰＥＧ）、ヒドロキシエチルデンプン（ＨＥＳ）、マークＸＴＥＮ（登録商標）（Ａｍｕｎｉｘ  Ｏｐｅｒａｔｉｎｇ，Ｃａｌｉｆｏｒｎｉａ，ＵＳＡ）（ＷＯ２０１３／１３０６８３を参照されたい）下で販売されている延長された組み換えペプチド、ヒト血清アルブミン（ＨＳＡ）、ウシ血清アルブミン（ＢＳＡ）、脂質（アシル化）、ポリ−Ｐｒｏ−Ａｌａ−Ｓｅｒ（ＰＡＳ）、およびポリグルタミン酸（グルタミル化）を含むが、これらに限定されない。
【００９７】
本明細書で使用される場合、「キメラ抗原受容体」または「ＣＡＲ」という用語は、少なくとも外部ドメイン、膜貫通、および外部ドメインを含む哺乳動物細胞上に発現される人工（すなわち、人造）膜貫通タンパク質を指す。任意選択的に、ＣＡＲタンパク質は、外部ドメインを膜貫通ドメインに共有的に連結する「スペーサー」を含む。スペーサーは、ペプチド結合を介して外部ドメインを膜貫通ドメインに連結するポリペプチドであることが多い。ＣＡＲは、典型的には、哺乳動物リンパ球上に発現される。いくつかの実施形態では、ＣＡＲは、Ｔ細胞または腫瘍浸潤リンパ球（ＴＩＬ）などの哺乳動物細胞上に発現される。Ｔ細胞上に発現されるＣＡＲは、「ＣＡＲ−Ｔ細胞」または「ＣＡＲ−Ｔ」として本明細書で参照される。いくつかの実施形態では、ＣＡＲ−Ｔは、Ｔヘルパー細胞、細胞傷害性Ｔ細胞、ナチュラルキラーＴ細胞、メモリーＴ細胞、調節性Ｔ細胞、またはガンマデルタＴ細胞である。例えば、養子細胞移入において、臨床的に使用される場合、患者の腫瘍または患者の他の組織に対する抗原結合特異性を有するＣＡＲ−Ｔは、典型的には、患者から得られたＴ細胞上に発現するように操作される。次に、ＣＡＲを発現する操作されたＴ細胞を、患者に注入し戻す。よって、ＣＡＲ−Ｔは、自家ＣＡＲ−Ｔでありことが多いが、同種異系ＣＡＲ−Ｔは、本発明の範囲内に含まれる。ＣＡＲの外部ドメイン（またはＥＣＤ）は、細胞表面または腫瘍特異的抗原上の免疫調節ペプチドのＥＣＤなど、生理的条件下で標的抗原に特異的に結合する、抗体またはその抗原結合断片（例えば、単鎖可変断片（ｓｃＦｖ））などの抗原結合領域を含む。特異的結合時に、イベント（すなわち、シグナル情報伝達）イベントの生化学的鎖は、ＣＡＲ−Ｔの免疫活性の調節をもたらす。したがって、例えば、ＣＡＲ−Ｔのその標的抗原への抗原結合領域による特異的結合時に、細胞傷害性、増殖、またはサイトカイン生成における変化（増加または減少）によって反映されるように、Ｔ細胞活性の免疫活性の変化をもたらし得る。ＣＡＲ−Ｔ活性化時のシグナル情報伝達は、いくつかの実施形態では、天然型哺乳動物Ｔ細胞におけるシグナル情報伝達に関わるＣＤ３−ゼータ鎖（「ＣＤ３−ｚ」）外部ドメインによって達成される。ＣＡＲ−Ｔは、Ｔ細胞の免疫調節反応をさらに調節するために、ＣＤ２８、４〜１ＢＢ、またはＯＸ４０などの複数のシグナル伝達ドメインをさらに含み得る。ＣＤ３−ｚは、Ｔ細胞受容体シグナル情報伝達に関わる免疫受容体チロシンベースの活性化モチーフ（ＩＴＡＭ）として知られる保存モチーフを含む。
【００９８】
インビトロアッセイにおいて本発明の２つ以上の変異型ＣＴＬＡ−４の存在によって誘発されるサイトカインに関して使用される場合、「集合的に」または「集合的な」という用語は、個々の変異型ＣＴＬＡ−４分子によって誘発されるサイトカイン生成に関わらず、全体的なサイトカイン発現を意味する。いくつかの実施形態では、アッセイされるサイトカインは、インビトロ初代Ｔ細胞アッセイにおけるなど、ＩＦＮ−ガンマである。
【００９９】
変異型ＣＴＬＡ−４のＩｇＳＦドメインに関してなど、ポリペプチドに関して、「結合パートナー」（「カウンター構造」と互換的に使用される）という用語は、特異的結合条件下で、参照されるポリペプチドが特異的に結合する少なくとも１つの分子（典型的には、天然型哺乳動物タンパク質）を指す。いくつかの態様では、親和性改変ＩｇＳＦドメインを含有する変異型ＣＴＬＡ−４は、対応する天然型または野生型ＣＴＬＡ−４の結合パートナーに、増加または弱体化した親和性で、特異的に結合する。「細胞表面結合パートナー」は、哺乳動物細胞表面上に発現される結合パートナーである。本明細書に提供される変異型ＣＴＬＡ−４分子の結合パートナーの例には、ＣＤ８０、ＣＤ８６、およびＩＣＯＳＬ、ならびに具体的には、ヒトＣＤ８０、ヒトＣＤ８６、およびヒトＩＣＯＳＬが含まれる。
【０１００】
本明細書で使用される場合、「コンジュゲート」、「コンジュゲーション」、またはそれらの文法的変動は、当該技術分野で知られている任意の接合または連結方法によって、別の化合物の形成をもたらす２つ以上の化合物を一緒に接合または連結することを指す。それは、２つ以上の化合物を一緒に接合または連結することによって作成される化合物も指し得る。例えば、１つ以上の化学部分またはポリペプチドに、直接または間接的に連結された変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、例示的なコンジュゲートである。そのようなコンジュゲートには、融合タンパク質、化学コンジュゲーションによって生成されるコンジュゲート、および任意の他の方法によって生成されるコンジュゲートが含まれる。
【０１０１】
本明細書で使用される場合、「競合的結合」という用語は、タンパク質が少なくとも２つの結合パートナーに特異的に結合することができるが、１つの結合パートナーの特異的結合が第２の結合パートナーの同時の結合を防止または排除するなど、抑制することを意味する。したがって、場合によっては、タンパク質が、同時に２つの結合パートナーに結合することは可能でない。概して、競合的結合剤は、特異的結合のための同じか、または重複する結合を含有するが、これは、必要条件ではない。いくつかの実施形態では、競合的結合は、第２の結合パートナーの特異的結合に起因して、タンパク質のその結合パートナーうちの１つへの特異的結合の測定可能な抑制（部分的または完全な）を引き起こす。ＥＬＩＳＡ（酵素結合免疫吸着アッセイ）アッセイなどの競合的結合を定量化するために、様々な方法が知られている。
【０１０２】
本明細書で使用される場合、「保存的アミノ酸置換」という用語は、アミノ酸残基が、同様の化学的特性（例えば、帯電または疎水性）を有する側鎖Ｒ群を有する別のアミノ酸残基によって置換されるアミノ酸置換を意味する。同様の化学的特性を有する側鎖を有するアミノ酸群の例には、１）脂肪族側鎖：グリシン、アラニン、バリン、ロイシン、およびイソロイシン、２）脂肪族ヒドロキシル側鎖：セリンおよびトレオニン、３）アミド含有側鎖：アスパラギンおよびグルタミン、４）芳香族側鎖：フェニルアラニン、チロシン、およびトリプトファン、５）塩基性側鎖：リジン、アルギニン、およびヒスチジン、６）酸性側鎖：アスパラギン酸およびグルタミン酸、ならびに７）硫黄含有側鎖：システインおよびメチオニンが含まれる。保存アミノ酸置換群は、バリン−ロイシン−イソロイシン、フェニルアラニン−チロシン、リジン−アルギニン、アラニン−バリン、グルタミン酸−アスパラギン酸、およびアスパラギン−グルタミンである。
【０１０３】
ヌクレオチドまたはアミノ酸位置が、配列表などに記載の開示されている配列におけるヌクレオチドまたはアミノ酸位置に「対応する」との記述など、タンパク質の位置に関する「に対応する」という用語は、構造的配列アラインメントに基づいて、またはＧＡＰアルゴリズムなどの標準的なアラインメントアルゴリズムを使用して、開示される配列とのアラインメント時に識別されるヌクレオチドまたはアミノ酸位置を指す。例えば、対応する残基は、本明細書に記載の構造的アラインメント方法によって、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２もしくは５６９（ＥＣＤ）に記載の、またはＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：３（ＩｇＶドメイン）に記載の野生型ＣＴＬＡ−４の配列を有する参照配列のアラインメントによって決定され得る。配列をアラインメントさせることによって、当業者は、ガイドのように、例えば、保存および同一のアミノ酸残基を使用して、対応する残基を識別することができる。
【０１０４】
本明細書で使用される場合、「減少する」または「弱体化する」または「抑える」という用語は、統計的に有意な量だけ減少することを意味する。減少は、非ゼロ対照値など、対照値のうちの少なくとも５％、１０％、１５％、２０％、２５％、３０％、３５％、４０％、４５％、５０％、５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、または１００％であり得る。
【０１０５】
哺乳動物リンパ球の免疫活性の減少という文脈において本明細書で使用される場合、「減少される」または「低減される」という用語は、未治療対照、または非改変もしくは非変異型対照を使用した治療が同じ条件下で用いられた対照などの対照と比較して、リンパ球の１つ以上の活性を減少させることを意味する。減少した活性は、統計的に有意な量などによる、細胞周期の抑制、細胞生存の低減、細胞増殖の低減、サイトカイン生成の低減、またはＴ細胞傷害性の低減のうちの１つ以上を指す可能性がある。いくつかの実施形態では、免疫活性の低減の参照は、統計的に有意な量などによる、治療の不存在下と比較して、インターフェロンガンマ（ＩＦＮ−ガンマ）生成が低減されることを意味する。いくつかの実施形態では、免疫活性は、混合リンパ球反応（ＭＬＲ）アッセイにおいて評価され得る。ＭＬＲアッセイを行う方法は、当該技術分野において知られている。Ｗａｎｇ  ｅｔ  ａｌ．，Ｃａｎｃｅｒ  Ｉｍｍｕｎｏｌ  Ｒｅｓ．（２０１４）２（９）：８４６−５６．本明細書に記載のアッセイを含む、リンパ球の活性を評価する他の方法が、当該技術分野で知られている。いくつかの実施形態では、増強は、未治療対照値または非ゼロ対照値などの対照値と比較して、少なくとも５％、１０％、１５％、２０％、２５％、３０％、３５％、４０％、４５％、５０％、６０％、７０％、８０％、９０％、または１００％減少され得る。
【０１０６】
「誘導体」または「誘導体化される」という用語は、タンパク質の治療的有用性を保持または増強しながら、生物学的半減期、生物学的利用能、免疫原性、可溶性、毒性、有効性、または効能などの特性を変化させるために、直接または間接的に、タンパク質を組成物に共有的に連結させることによるタンパク質の改変を指す。本発明の免疫調節ポリペプチドの誘導体は、本発明の範囲内であり、例えば、グリコシル化、ペグ化、脂質化、またはＦｃ融合によって行われ得る。
【０１０７】
本明細書で使用される場合、「ドメイン」（典型的には、１０〜２００個のアミノ酸残基など、３つ以上の配列、一般に、５〜７以上のアミノ酸）は、分子の他の部分とは構造的かつ／または機能的に別個であり、識別可能な、タンパク質など、または核酸をコードする分子の一部分を指す。例えば、ドメインは、１つ以上の構造的モチーフから構成されるタンパク質内の独立した折り畳み構造を形成し得、かつ／または結合活性などの機能的活性により認識される、ポリペプチド鎖のドメイン部分を含む。タンパク質は、１つの、または１つ超の別個のドメインを有し得る。例えば、ドメインは、モチーフに対する相同性など、関連するファミリーメンバーとの一次配列または構造の相同性によって識別、定義、または区別され得る。別の例では、ドメインは、結合パートナーなど、生体分子と相互作用するための能力など、その機能によって区別され得る。ドメインは、ドメインが独立して、または別の分子に融合されるドメインが、例えば、結合などの活性を行い得るように、独立して、生物学的機能または活性を示し得る。ドメインは、アミノ酸の直鎖配列またはアミノ酸の非直鎖配列であり得る。多くのポリペプチドは、複数のドメインを含有する。そのようなドメインは、知られており、当業者によって識別され得る。本明細書で例示化するために、定義が提供されるが、名称によって特定のドメインを認識するために十分当該技術分野内にあることが理解される。必要に応じて、ドメインを識別するために、適切なソフトウエアを用いることができる。
【０１０８】
本明細書で使用される場合、「外部ドメイン」という用語は、ベシクル膜の外側にある、膜貫通タンパク質などの膜タンパク質の領域を指す。外部ドメインは、リガンドまたは細胞表面受容体に特異的に結合する結合ドメインなどを介して、リガンドまたは細胞表面受容体に特異的に結合する結合ドメインを含むことが多い。細胞膜貫通タンパク質の外部ドメインは、代わりに、細胞外ドメインと称される。
【０１０９】
「有効量」または「治療的に有効な量」という用語は、生体外（患者からの細胞との接触による）または生体内に（患者への投与による）、単独（すなわち、単独療法として）または追加の治療薬との組み合わせのいずれかで投与されたときに、例えば、症状および／または疾患の原因を改善または排除することによって、疾患進行の統計的に有意な減少を生じる、タンパク質組成物または細胞組成物を含む、本発明の治療組成物の量および／または濃度を指す。有効量は、疾患もしくは障害と関連する少なくとも１つの症状または生物学的反応もしくは効果を軽減、低下、または緩和するか、疾患もしくは障害の進行を防止するか、あるいは患者の身体機能を改善する量であり得る。癌治療の場合、有効量は、養子細胞治療によって患者に投与される細胞の有効な用量または数である。いくつかの実施形態では、患者は、非ヒト霊長類またはヒト患者などの哺乳動物である。
【０１１０】
本明細書で使用される場合、「外部ドメイン」（「細胞内ドメイン」または「細胞質ドメイン」とも呼ばれる）という用語は、細胞表面膜によって画定される内部空間内に延在する、膜貫通タンパク質などのいくつかのタンパク質中に見られる領域を指す。哺乳動物細胞では、外部ドメインは、膜タンパク質の細胞膜領域である。細胞では、外部ドメインは、細胞内成分と相互作用し、シグナル情報伝達において役割を果たす場合があり、よって、場合によっては、細胞内シグナル伝達ドメインであり得る。細胞膜貫通タンパク質の外部ドメインは、代わりに、場合によっては、シグナル情報伝達を媒介するか、またはこれにおいて役割を果たす、細胞質シグナル伝達ドメインであり得る、細胞質ドメインとも称される。したがって、細胞内シグナル伝達ドメインおよび細胞質シグナル伝達ドメインという用語は、互換的に．使用される。
【０１１１】
哺乳動物リンパ球の免疫活性の増加の文脈において本明細書で使用される場合、「増強される」または「増加される」という用語は、未治療対照、または非改変または非変異型対照を使用した治療を同じ条件下で用いた対照などの対照と比較して、リンパ球の１つ以上の活性を増加させることを意味する。増加した活性は、統計的に有意な量などによって、増加した細胞生存、細胞増殖、サイトカイン生成、またはＴ細胞傷害性のうちの１つ以上であり得る。いくつかの実施形態では、増加した免疫活性の参照は、統計的に有意な量などによって、インターフェロンガンマ（ＩＦＮ−ガンマ）生成を増加させることを意味する。いくつかの実施形態では、免疫活性は、ＭＬＲアッセイにおいて評価され得る。本明細書に記載のアッセイを含む、リンパ球の活性を評価する他の方法が、当該技術分野で知られている。いくつかの実施形態では、増強は、非ゼロ対照値などの対照値よりも少なくとも１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、７５％，１００％、２００％、３００％、４００％、または５００％大きい増加であり得る。
【０１１２】
本明細書で使用される場合、「操作された細胞」という用語は、組み換えＤＮＡ方法またはウイルス情報伝達などによるヒト干渉によって遺伝的に改変された哺乳動物細胞を指す。いくつかの実施形態では、細胞は、リンパ球（例えば、Ｔ細胞、Ｂ細胞、ＮＫ細胞）などの免疫細胞、または抗原提示細胞（例えば、樹状細胞）である。細胞は、患者からの初代細胞であり得るか、または細胞株であり得る。いくつかの実施形態では、本発明の操作された細胞は、本明細書に提供される変異型ＣＴＬＡ−４を含む。いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４は、操作された細胞上に発現される膜貫通免疫調節タンパク質（以後、「ＴＩＰ」と称される）である。いくつかの実施形態では、ＴＩＰは、膜貫通ドメイン（例えば、ＣＴＬＡ−４膜貫通ドメイン）、および任意選択的に、細胞内シグナル伝達ドメインに連結されているＩｇＶドメインを含有する細胞外ドメインまたはその一部分を含有する。場合によっては、ＴＩＰは、異種細胞質シグナル伝達ドメインまたは外部ドメインを含有するキメラ受容体として形式化される。いくつかの実施形態では、操作された細胞は、本明細書に記載の免疫調節タンパク質を発現および分泌することができる。提供される操作された細胞の中には、操作されたＴ細胞受容体（ＴＣＲ）またはキメラ抗原受容体（ＣＡＲ）をさらに含有する細胞もある。
【０１１３】
本明細書で使用される場合、「操作されたＴ細胞」という用語は、組み換えＤＮＡ方法またはウイルス情報伝達方法などの人干渉によって遺伝的に改変された、Ｔヘルパー細胞、細胞傷害性Ｔ細胞（代替的に、細胞傷害性Ｔリンパ球またはＣＴＬ）、ナチュラルキラーＴ細胞、調節性Ｔ細胞、メモリーＴ細胞、またはガンマデルタＴ細胞などのＴ細胞を指す。操作されたＴ細胞は、Ｔ細胞上に発現され、かつＴ細胞上に発現された変異型ＣＴＬＡ−４が特異的に結合する操作されたＴ細胞自体、または哺乳動物細胞の免疫活性を調節するように操作される本発明の変異型ＣＴＬＡ−４膜貫通免疫調節タンパク質（ＴＩＰ）を含み得る。操作されたＴ細胞は、Ｔ細胞によって発現および／または分泌され、かつＴ細胞によって分泌されたときに、変異型ＣＴＬＡ−４が特異的に結合する操作されたＴ細胞ｉｔｓｅｌｆ、または哺乳動物細胞の免疫活性を調節するように操作される本発明の変異型ＣＴＬＡ−４分泌免疫調節タンパク質（ＳＩＰ）を含み得る。
【０１１４】
「操作されたＴ細胞受容体」または「操作されたＴＣＲ」という用語は、選択され、クローン化され、かつ／または続いて、養子免疫療法のために使用されることが多い、Ｔ細胞の集団に導入される主要組織適合複合体（ＭＨＣ）／ペプチド標的抗原に所望の親和性で特異的に結合するように操作されたＴ細胞受容体（ＴＣＲ）を指す。操作されたＴＣＲとは対照的に、ＣＡＲは、ＭＨＣ非依存的様式で標的抗原に結合するように操作される。
【０１１５】
本明細書で使用される場合、「上に発現される」という用語は、哺乳動物細胞などの細胞の表面上に発現されるタンパク質に関して使用される。したがって、タンパク質は、膜タンパク質として発現される。いくつかの実施形態では、発現されるタンパク質は、膜貫通タンパク質である。いくつかの実施形態では、タンパク質は、薬物または検出可能な標識などの小分子部分にコンジュゲートされる。細胞の表面上に発現されるタンパク質は、哺乳動物細胞上に発現される細胞表面受容体などの細胞表面タンパク質を含み得る。
【０１１６】
「半減期延長部分」という用語は、ポリペプチド融合または化学的コンジュゲートの部分であって、その部分にコンジュゲートされないタンパク質の半減期と比較して、哺乳動物血液血清中に循環するタンパク質の半減期を延長させる部分を指す。いくつかの実施形態では、半減期は、約１．２倍、１．５倍、２．０倍、３．０倍、４．０倍、５．０倍、または６．０倍よりも大きく延長される。いくつかの実施形態では、半減期は、半減期延長部分を有しないタンパク質と比較して、生体内への投与後に、６時間超、１２時間超、２４時間超、４８時間超、７２時間超、９６時間超、または１週間超、延長される。半減期は、タンパク質が、その濃度、量、または活性の半分を失うのにかかる時間量を指す。半減期は、例えば、ＥＬＩＳＡアッセイまたは活性アッセイを使用することによって判定され得る。例示的な半減期延長部分には、Ｆｃドメイン、多量体化ドメイン、ポリエチレングリコール（ＰＥＧ）、ヒドロキシエチルデンプン（ＨＥＳ）、マークＸＴＥＮ（登録商標）下で販売されている延長された組み換えペプチド（ＷＯ２０１３／１３０６８３を参照されたい）、ヒト血清アルブミン（ＨＳＡ）、ウシ血清アルブミン（ＢＳＡ）、脂質（アシル化）、およびポリ−Ｐｒｏ−Ａｌａ−Ｓｅｒ（ＰＡＳ）、ならびにポリグルタミン酸（グルタミル化）が含まれる。
【０１１７】
本明細書で使用される場合、「免疫シナプス」または「免疫シナプス」という用語は、抗原提示細胞または腫瘍細胞などのＭＨＣ  Ｉ（主要組織適合複合体クラスＩ）またはＭＨＣ  ＩＩを発現する哺乳動物細胞と、エフェクターＴ細胞またはナチュラルキラー（ＮＫ）細胞などの哺乳動物リンパ球との間の界面を意味する。
【０１１８】
免疫グロブリン分子（Ｆｃポリペプチドとも称される）のＦｃ（断片結晶化可能な）領域またはドメインは、免疫グロブリン重鎖の定常領域に大きく対応しており、抗体のエフェクター機能を含む、様々な機能に関与している。Ｆｃドメインは、免疫グロブリン分子のヒンジドメイン＋ＣＨ２およびＣＨ３ドメインのうちの一部またはすべてを含有する。Ｆｃドメインは、１つ以上のジスルフィド結合によって接合される２つのポリペプチド鎖の二量体を形成し得る。いくつかの実施形態では、Ｆｃは、エフェクター機能を促進するように、低減された（例えば、３０％超、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、９０％、またはそれ以上低減される）活性を示す変異型Ｆｃである。いくつかの実施形態では、Ｆｃ領域中のアミノ酸置換の参照は、特定の配列番号に関して記載されない限り、ＥＵ番号付けシステムによるものである。ＥＵ番号付けは、知られており、最も最近に更新されたＩＭＧＴ  Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ  Ｃｈａｒｔ（ＩＭＧＴ（登録商標）、ｔｈｅ  ｉｎｔｅｒｎａｔｉｏｎａｌ  ＩｍＭｕｎｏＧｅｎｅＴｉｃｓ  ｉｎｆｏｒｍａｔｉｏｎ  ｓｙｓｔｅｍ（登録商標）、ｈｔｔｐ：／／ｗｗｗ．ｉｍｇｔ．ｏｒｇ／ＩＭＧＴＳｃｉｅｎｔｉｆｉｃＣｈａｒｔ／Ｎｕｍｂｅｒｉｎｇ／Ｈｕ＿ＩＧＨＧｎｂｅｒ．ｈｔｍｌ（作成：２００１年５月１７日、最後の更新：２０１６年６月８日）、およびＫａｂａｔ，Ｅ．Ａ．ｅｔ  ａｌ．Ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ  ｏｆ  Ｐｒｏｔｅｉｎｓ  ｏｆ  Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｉｃａｌ  ｉｎｔｅｒｅｓｔ．５ｔｈ  ｅｄ．ＵＳ  Ｄｅｐａｒｔｍｅｎｔ  ｏｆ  Ｈｅａｌｔｈ  ａｎｄ  Ｈｕｍａｎ  Ｓｅｒｖｉｃｅｓ，ＮＩＨ  ｐｕｂｌｉｃａｔｉｏｎ  Ｎｏ．９１−３２４２（１９９１）に報告されているようなＥＵ指標に従っている。
【０１１９】
免疫調節Ｆｃ融合タンパク質などの免疫グロブリンＦｃ融合（「Ｆｃ融合」）は、免疫グロブリンのＦｃ領域に操作可能に連結されている１つ以上のポリペプチド（または１つ以上の小分子）を含む分子である。Ｆｃ融合は、例えば、抗体（エフェクター機能および薬物動態を促進する）および変異型ＣＴＬＡ−４のＦｃ領域を含み得る。免疫グロブリンＦｃ領域は、１つ以上の変異型ＣＴＬＡ−４または小分子（融合パートナー）に、間接的または直接連結され得る。様々なリンカーは、知られており、任意選択的に、Ｆｃ融合を作成するために、Ｆｃを融合パートナーに連結させるために使用され得る。同一の種のＦｃ融合を二量体化して、Ｆｃ融合ホモ二量体を形成することができるか、または非同一の種を使用して、Ｆｃ融合ヘテロ二量体を形成することができる。いくつかの実施形態では、Ｆｃは、ネズミまたはヒトＦｃなどの哺乳動物Ｆｃである。
【０１２０】
「宿主細胞」という用語は、組み換え発現ベクターによってコードされるタンパク質を発現するために使用され得る細胞を指す。宿主細胞は、原核生物、例えば、大腸菌（Ｅ．ｃｏｌｉ）であり得るか、または真核細胞、例えば、単細胞真核細胞（例えば、酵母または他の真菌類）、植物細胞（例えば、タバコまたはトマト植物細胞）、動物細胞（例えば、ヒト細胞、サル細胞、ハムスター細胞、ラット細胞、マウス細胞、または昆虫細胞）、またはハイブリドーマであり得る。宿主細胞の例は、無血清培地、またはジヒドロ葉酸還元酵素（ＤＨＦＲ）が不足しているＣＨＯ菌株ＤＸ−Ｂ１１中に成長する、野菜ＣＨＯおよび関連する細胞株などのチャイニーズハムスター卵巣（ＣＨＯ）細胞またはそれらの誘導体を含む。別の例は、ヒト胎児腎臓２９３（ＨＥＫ−２９３）細胞またはそれらの誘導体である。いくつかの実施形態では、宿主細胞は、哺乳動物細胞（例えば、ヒト細胞、サル細胞、ハムスター細胞、ラット細胞、マウス細胞、または昆虫細胞）である。
【０１２１】
本明細書で使用される場合、「免疫グロブリン」（省略して「Ｉｇ」）という用語は、５つのヒトクラスの抗体：ＩｇＡ（サブクラスＩｇＡ１およびＩｇＡ２を含む）、ＩｇＤ、ＩｇＥ、ＩｇＧ（サブクラスＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３、およびＩｇＧ４を含む）、およびＩｇＭのうちのいずれかを含む、哺乳動物免疫グロブリンタンパク質を指す。本用語はまた、抗原結合断片（Ｆａｂ）、ＶＨおよびＶＬを含有する可変断片（Ｆｖ）、１つの鎖に一緒に連結されている、ＶＨおよびＶＬを含有する単鎖可変断片（ｓｃＦｖ）、ならびにＦａｂ′、Ｆ（ａｂ）２、Ｆ（ａｂ′）２、ｄｓＦｖ二重特異性抗体、Ｆｃ、およびＦｄポリペプチド断片などの他の抗体Ｖ領域断片など、全体的もしくは部分的に合成される（例えば、組み換えまたは化学合成）か、または天然に生成されるかに関わらず、全長未満である免疫グロブリンを包含する。二重特異性抗体、ホモ二重特異性、およびヘテロ二重特異性は、本用語の意味の範囲内に含まれる。
【０１２２】
本明細書で使用される場合、「免疫グロブリンスーパーファミリー」または「ＩｇＳＦ」という用語は、細胞の認識、結合、または接着プロセスに関わる細胞表面および可溶性タンパク質の群を意味する。分子は、免疫グロブリン（すなわち、抗体）を有する共有構造的特徴に基づいて、このスーパーファミリーのメンバーとして分類され、それらはすべて、免疫グロブリンドメインまたは折り畳み構造として知られるドメインを保有する。ＩｇＳＦのメンバーは、細胞表面抗原受容体、免疫系の共受容体および共刺激分子、リンパ球への抗原提示に関わる分子、細胞接着分子、特定のサイトカイン受容体、ならびに細胞内筋肉タンパク質を含む。それらは、一般に、免疫系における役割と関連する。免疫シナプス中のタンパク質は、ＩｇＳＦのメンバーであることが多い。ＩｇＳＦはまた、機能などの共有特性に基づいて、「サブファミリー」にクラス分けされ得る。そのようなサブファミリーは、典型的には、４〜３０個のＩｇＳＦメンバーからなる。
【０１２３】
本明細書で使用される場合、「ＩｇＳＦドメイン」または「免疫グロブリンドメイン」または「Ｉｇドメイン」という用語は、ＩｇＳＦタンパク質の構造的ドメインを指す。Ｉｇドメインは、免疫グロブリン分子に因んで名付けられている。それらは、約７０〜１１０個のアミノ酸を含有し、それらのサイズおよび機能に従って分類されている。Ｉｇドメインは、逆平行ベータ鎖の２つのシートによって形成されるサンドイッチ様構造を有する、特徴的なＩｇ折り畳み構造を保有する。サンドイッチの内側上の疎水性アミノ酸間の相互作用、およびＢ鎖およびＦ鎖中のシステイン残基間に形成される高度保存ジスルフィド結合は、Ｉｇ折り畳み構造を安定化する。Ｉｇドメインの一端は、それらのリガンドの抗体の特異性にとって重要な領域を決定する相補性と呼ばれる区分を有する。Ｉｇ様ドメインは、ＩｇＶ、ＩｇＣ（ＩｇＣ１またはＩｇＣ２のいずれかであり得る）、またはＩｇＩとして（クラスに）クラス分けされ得る。大部分のＩｇドメインは、可変（ＩｇＶ）または定常（ＩｇＣ）のいずれかである。９つのベータ鎖を有するＩｇＶドメインは、概して、７つのベータ鎖を有するＩｇＣドメインよりも長い。ＩｇＳＦのいくつかのメンバーのＩｇドメインは、アミノ酸配列におけるＩｇＶドメインに類似しているが、ＩｇＣドメインと同様のサイズである。これらは、ＩｇＣ２ドメインと呼ばれるが、標準的なＩｇＣドメインは、ＩｇＣ１ドメインと呼ばれる。Ｔ細胞受容体（ＴＣＲ）鎖は、細胞外部分における２つのＩｇドメイン：Ｎ末端の１つのＩｇＶドメインおよび細胞膜に隣接する１つのＩｇＣ１ドメインを含有する。ＣＴＬＡ−４は、１つのＩｇドメイン：ＩｇＶドメインを含有する。
【０１２４】
本明細書で使用される場合、「ＩｇＳＦ種」という用語は、同一のまたは略同一の一次アミノ酸配列を有するＩｇＳＦメンバータンパク質のアンサンブルを意味する。それぞれの哺乳動物免疫グロブリンスーパーファミリー（ＩｇＳＦ）メンバーは、そのＩｇＳＦメンバーに属するすべてのＩｇＳＦ種の固有の同一性を定義する。したがって、それぞれのＩｇＳＦファミリーメンバーは、他のＩｇＳＦファミリーメンバーと比べて固有であり、したがって、特定のＩｇＳＦファミリーメンバーのそれぞれの種は、別のＩｇＳＦファミリーメンバーの種と比べて固有である。それにも関わらず、同じＩｇＳＦ種からなる分子間の変動は、グリコシル化、リン酸化、ユビキチン化、ニトロシル化、メチル化、アセチル化、および脂質化などの翻訳後の改変における差に起因して生じ得る。追加的に、遺伝子多型に起因する単一ＩｇＳＦ種内の微小な配列差は、例えば、タンパク質開裂に起因するＩｇＳＦ種の野生型切断型のように、単一ＩｇＳＦ種内で別の形態の変動を構築する。「細胞表面ＩｇＳＦ種」は、細胞、概して、哺乳動物細胞の表面上に発現されるＩｇＳＦ種である。
【０１２５】
Ｔ細胞などの哺乳動物リンパ球の文脈で本明細書で使用される場合、「免疫活性」という用語は、活性化、細胞生存、アポトーシス、細胞増殖、細胞周期抑制、サイトカイン生成（例えば、インターフェロンガンマ）、サイトカイン放出、またはＴ細胞傷害活性のうちの１つ以上を指す。場合によっては、免疫活性は、ケモカインまたはインターロイキンなどのサイトカインの細胞発現を意味し得る。免疫活性の増強または抑制を判定するためのアッセイには、培養液上清中のインターフェロンガンマサイトカインレベルを測定するＭＬＲ（混合リンパ球反応）アッセイ（Ｗａｎｇ  ｅｔ  ａｌ．，Ｃａｎｃｅｒ  Ｉｍｍｕｎｏｌ  Ｒｅｓ．２０１４  Ｓｅｐ：２（９）：８４６−５６）、ＳＥＢ（ブドウ球菌エンテロトキシンＢ）、Ｔ細胞刺激アッセイ（Ｗａｎｇ  ｅｔ  ａｌ．，Ｃａｎｃｅｒ  Ｉｍｍｕｎｏｌ  Ｒｅｓ，（２０１４）２（９）：８４６−５６）、および抗ＣＤ３Ｔ細胞刺激アッセイ（Ｌｉ  ａｎｄ  Ｋｕｒｌａｎｄｅｒ，Ｊ  Ｔｒａｎｓｌ  Ｍｅｄ，（２０１０）８：１０４）が含まれる。Ｔ細胞活性化は、ＩＦＮ−ガンマサイトカインの分泌と関連しているため、これらのインビトロヒトＴ細胞アッセイからの培養液上清中のＩＦＮ−ガンマレベルの検出は、市販のＥＬＩＳＡキット（Ｗｕ  ｅｔ  ａｌ．，Ｉｍｍｕｎｏｌ  Ｌｅｔｔ（２００８），１１７（１）：５７−６２）を使用してアッセイされ得る。免疫反応の誘発は、休止リンパ球に関する免疫活性の増加をもたらす。本明細書に提供されるような親和性改変ＩｇＳＦドメインを含有する変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドなどの免疫調節タンパク質は、いくつかの実施形態では、減少し得るか、または代替的な実施形態では、野生型ＩｇＳＦメンバーまたはＩｇＳＦドメイン対照に対する一次Ｔ細胞アッセイにおけるＩＦＮ−ガンマ（インターフェロンガンマ）発現を増加させ得る。当業者であれば、ＩＦＮ−ガンマ発現の増加を判定するために使用される一次Ｔ細胞アッセイの形式が、ＩＦＮ−ガンマ発現の減少のためにアッセイに用いられる形式とは異なり得ることを認識するであろう。
【０１２６】
一次Ｔ細胞アッセイにおいてＩＦＮ−ガンマ発現を変化させるための本発明の免疫調節タンパク質または親和性改変ＩｇＳＦドメインの能力についてのアッセイにおいて、混合リンパ球反応（ＭＬＲ）アッセイを使用し得る。便利なことに、場合によっては、本発明の親和性改変ＩｇＳＦドメインの可溶性形態を用いて、ＭＬＲにおいてＩＦＮ−ガンマ発現を増加または減少させるためのその能力を判定することができる。代替的に、同時固定化アッセイを使用し得る。同時固定化アッセイでは、抗ＣＤ３抗体によっていくつかの実施形態で提供されるＴ細胞受容体シグナルは、野生型ＩｇＳＦドメイン対照に対してＩＦＮ−ガンマ発現を増加または減少させるための能力を判定するために、変異型ＣＴＬＡ−４などの同時固定化された親和性改変ＩｇＳＦドメインと併せて使用される。変異型ＣＴＬＡ−４膜貫通免疫調節タンパク質の活性を評価することを含む、操作された細胞の免疫活性をアッセイするための方法は、当該技術分野で知られており、適切な動物モデルにおける同種移植片生着アッセイおよび抗ドナー抗体反応アッセイなど、抗原刺激後の細胞膨張または増殖の抑制または増強、一次および二次アロ刺激Ｔ細胞の抑制または増殖、および自己免疫性活性を含むが、これらに限定されない。アッセイはまた、標準的な５１クロム‐遊離アッセイ（例えば、Ｍｉｌｏｎｅ  ｅｔ  ａｌ．，Ｍｏｌ  Ｔｈｅｒ（２００９），１７（８）：１４５３−１４６４を参照されたい）もしくはフローに基づく細胞傷害性アッセイ、またはインピーダンスに基づく細胞傷害性アッセイ（Ｐｅｐｅｒ  ｅｔ  ａｌ．（２０１４），Ｊ  Ｉｍｍｕｎｏｌ  Ｍｅｔｈｏｄｓ，４０５：１９２−１９８）を含む、細胞傷害性を評価するためのアッセイを含む。
【０１２７】
「免疫調節ポリペプチド」または「免疫調節タンパク質」は、免疫活性を調節するポリペプチドまたはタンパク質分子である。「調節」または「調節すること」によって、免疫反応は、免疫活性が、増加するか、または減少するかのいずれかであることを意味する。免疫調節タンパク質は、例えば、鎖間ジスルフィド結合によって互いに共有結合される少なくとも２つのポリペプチド鎖の単鎖ポリペプチドまたは多量体（二量体またはより高次の多量体）であり得る。したがって、単量体、二量体、およびより高次の多量体ポリペプチドが、定義される用語の範囲内にある。多量体ポリペプチドは、ホモ多量体（同一のポリペプチド鎖の）またはヘテロ多量体（同一でないポリペプチド鎖の）であり得る。本発明の免疫調節タンパク質は、変異型ＣＴＬＡ−４を含む。
【０１２８】
本明細書で使用される場合、「増加」という用語は、統計的に有意な量、増加することを意味する。増加は、非ゼロ対照値などの対照値よりも少なくとも５％、１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、７５％、１００％大きい可能性がある。
【０１２９】
ＣＴＬＡ−４の「アイソフォーム」は、アミノ酸配列において異なる複数の天然に発生するＣＴＬＡ−４ポリペプチドのうちの１つである。アイソフォームは、単一遺伝子によって発現されるＲＮＡ転写物のスライス変異型の生成物、または遺伝子複製などから生じ得る機能的に類似したタンパク質を生じる、非常に類似しているが異なる遺伝子の発現生成物であり得る。本明細書で使用される場合、ＣＴＬＡ−４の「アイソフォーム」という用語はまた、異なるアレルＣＴＬＡ−４遺伝子の生成物を指す。
【０１３０】
本明細書で使用される場合、「リンパ球」という用語は、哺乳動物免疫系における白血球の３つのサブタイプのうちのいずれかを意味する。これらは、ナチュラルキラー細胞（ＮＫ細胞）（細胞媒介性細胞傷害性自然免疫において機能する）、Ｔ細胞（細胞媒介性細胞傷害性適応免疫に対して）、およびＢ細胞（体液性、抗体駆動適応免疫に対して）を含む。Ｔ細胞には、Ｔヘルパー細胞、細胞傷害性Ｔ細胞、ナチュラルキラーＴ細胞、メモリーＴ細胞、調節性Ｔ細胞、またはガンマデルタＴ細胞が含まれる。自然リンパ球系細胞（ＩＬＣ）はまた、リンパ球の定義の範囲内に含まれる。
【０１３１】
「哺乳動物」または「患者」という用語は、具体的には、ヒト、チンパンジー、アカゲザル、カニクイザル、イヌ、ネコ、マウス、またはラットのうちの少なくとも１つの参照を含む。
【０１３２】
本明細書で使用される場合、「膜タンパク質」という用語は、生理的条件下で、直接または間接的に、脂質二重層に付着されるタンパク質を意味する。膜を形成する脂質二重層は、真核（例えば、哺乳動物）細胞膜などの生物学的膜、またはリポソーム上に見られるものなどの人工（すなわち、人造）膜であり得る。膜タンパク質の脂質二重層への付着は、共有結合の方法によるか、または疎水性もしくは静電気的相互作用などの非共有相互作用の方法によるものであり得る。膜タンパク質は、内在性膜タンパク質または表在性膜タンパク質であり得る。表在性膜タンパク質である膜タンパク質は、脂質二重層に非共有的に付着されるか、または内在性膜タンパク質に非共有的に付着される。表在性膜タンパク質は、哺乳動物において生理的である条件範囲下で、表在性膜タンパク質が、脂質二重層を関連付け、かつ／またはこれから切り離すことができるように、脂質二重層への一時的付着を形成する。表在性膜タンパク質とは対照的に、内在性膜タンパク質は、哺乳動物において生理的である条件範囲下で、内在性膜タンパク質が、脂質二重層へのそれらの付着から切り離さないように、膜の脂質二重層への実質的に永久の付着を形成する。膜タンパク質は、一層の脂質二重層（単地性）の方法による膜への付着、または両層の膜（多所性）の方法による付着を形成し得る。１つのみの脂質二重層と相互作用する内在性膜タンパク質は、「内在性単地性タンパク質」である。両方の脂質二重層と相互作用する内在性膜タンパク質は、「内在性多所性タンパク質」であり、代替的に、本明細書で「膜貫通タンパク質」とも称される。
【０１３３】
哺乳動物免疫反応などの免疫反応の文脈で本明細書で使用される場合、「調節すること」または「調節する」という用語は、本発明の変異型ＣＴＬＡ−４を含む免疫調節ポリペプチドの投与の結果として、または本発明の変異型ＣＴＬＡ−４膜貫通免疫調節タンパク質などの免疫調節タンパク質を発現する操作された細胞の投与の結果として生じる、既存のまたは潜在的な免疫反応の、増加または減少などの任意の変化を指す。したがって、これは、変異型ＣＴＬＡ−４を含む免疫調節タンパク質、またはそのような免疫調節ポリペプチドを発現する細胞を投与しない場合に、生じるか、または存在する免疫反応と比較した、免疫反応の増加または減少などの変化を指す。そのような調節は、免疫細胞の免疫活性の程度または範囲の任意の誘発、活性化、抑制、または変化を含む。免疫細胞には、Ｂ細胞、Ｔ細胞、ＮＫ（ナチュラルキラー）細胞、ＮＫＴ細胞、プロフェッショナル抗原提示細胞（ＡＰＣ）、および非プロフェッショナル抗原提示細胞、ならびに炎症性細胞（好中球、マクロファージ、単球、好酸球、および好塩基球）が含まれる。
【０１３４】
調節は、既存の免疫反応、発現中の免疫反応、潜在的な免疫反応、または免疫反応を誘発するか、調節するか、これに影響を与えるか、もしくはこれに応答するための能力に対して付与される任意の変化を含む。調節は、直接または間接的であり得る。調節は、遺伝子、タンパク質および／または免疫反応の一部としての免疫細胞中の他の分子の発現および／または機能における任意の変化を含む。免疫反応の調節または免疫活性の調節には、例えば、以下：免疫細胞の排除、欠失、または隔離；自己反応性リンパ球、抗原提示細胞、または炎症性細胞などの他の細胞の機能的能力を調節し得る免疫細胞の隔離、誘発、または作成；免疫細胞における無反応状態（すなわち、アネルギー）の誘発；これらの細胞によって発現されるタンパク質のパターンを変化させることを含むがこれに限定されない免疫細胞の活性または機能の増強または抑制が含まれる。例には、サイトカイン、ケモカイン、成長因子、転写因子、キナーゼ、共刺激分子、もしくは他の細胞表面受容体、またはこれらの調節イベントの任意の組み合わせなどの特定のクラスの分子の生成および／または分泌の変化が含まれる。調節は、例えば、一次Ｔ細胞アッセイにおける野生型ＣＴＬＡ−４対照に対するＩＦＮ−ガンマ（インターフェロンガンマ）発現の変化によって評価され得る（Ｚｈａｏ  ｅｔ  ａｌ．（２０１６），Ｅｘｐ  Ｃｅｌｌ  Ｒｅｓ，３４０（１）：１３２−１３８を参照されたい）。調節は、野生型ＣＴＬＡ−４膜貫通タンパク質により操作された細胞に対して、例えば、操作された細胞の細胞傷害性活性の変化、または操作された細胞のサイトカイン分泌の変化など、操作された細胞の免疫活性の変化によって評価され得る。
【０１３５】
本明細書で使用される場合、「分子種」という用語は、同一のまたは略同一の一次アミノ酸配列を有するタンパク質のアンサンブルを意味する。それぞれの哺乳動物免疫グロブリンスーパーファミリー（ＩｇＳＦ）メンバーは、同一のまたは略同一の分子種の収集を定義する。したがって、例えば、ヒトＣＴＬＡ−４は、ＩｇＳＦメンバーであり、それぞれのヒトＣＴＬＡ−４分子は、ＣＴＬＡ−４の分子種である。同じ分子種からなる分子間の変動は、グリコシル化、リン酸化、ユビキチン化、ニトロシル化、メチル化、アセチル化、および脂質化などの翻訳後の改変の差に起因して生じ得る。追加的に、遺伝子多型に起因する単一分子種内の微小な配列差は、例えば、タンパク質開裂に起因する単一分子種の野生型切断型のように、単一分子種内で別の形態の変動を構築する。「細胞表面分子種」は、哺乳動物細胞の表面上に発現される分子種である。２つ以上の異なる種のタンパク質は、そのそれぞれが、ＩＳを形成する２つの哺乳動物細胞のうちの一方または排他的に他方上に排他的に存在し、互いに「シス」または「シス構成」であると言われている。２つの異なる種のタンパク質は、その１つ目が、ＩＳを形成する２つの哺乳動物細胞のうちの一方上に排他的に存在し、その２つ目が、ＩＳを形成する２つの哺乳動物細胞上に排他的に存在し、「トランス」または「トランス構成」であると言われている。２つの異なる種のタンパク質は、ＩＳを形成する２つの哺乳動物細胞のうちの両方上に存在し、これらの細胞上でシス構成およびトランス構成の両方である。
【０１３６】
「多量体化ドメイン」という用語は、それぞれが、同じであるか、または異なる多量体化ドメインであり得る相補的な多量体化ドメイン（例えば、第１の多量体化ドメインおよび第２の多量体化ドメイン）を含有する、１つ以上の追加のポリペプチド分子を有するポリペプチド分子の安定した相互作用を促進するアミノ酸の配列を指す。相補的な多量体化ドメイン間の相互作用、例えば、第１の多量体化ドメインと第２の多量体化ドメインとの間の相互作用は、追加のポリペプチド分子を有するポリペプチド分子の多量体を生成するように、安定したタンパク質−タンパク質相互作用を形成する。場合によっては、多量体化ドメインは、同じであり、２つのポリペプチド鎖間の安定したタンパク質−タンパク質相互作用を形成するように、それ自体と相互作用する。概して、ポリペプチドは、直接または間接的に、多量体化ドメインに接合される。例示的な多量体化ドメインには、免疫グロブリン配列またはそれらの一部分、ロイシンジッパー、疎水性領域、親水性領域、および適合可能なタンパク質−タンパク質相互作用ドメインが含まれる。多量体化ドメインは、例えば、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３、またはＩｇＧ４サブタイプ、ＩｇＡ、ＩｇＥ、ＩｇＤ、およびＩｇＭ、ならびにそれらの改変形態を含む、例えば、ＩｇＧ１からのＦｃドメインまたはその一部分などの免疫グロブリン定常領域またはドメインであり得る。
【０１３７】
「核酸」および「ポリヌクレオチド」という用語は、単一鎖形態または二本鎖形態のいずれかの核酸残基（例えば、デオキシリボヌクレオチドまたはリボヌクレオチド）のポリマーを指すために互換的に使用される。特に限定されない限り、これらの用語は、天然ヌクレオチドの既知の類似体を含有する核酸を包含し、類似の結合特性を有し、天然に発生するヌクレオチドと類似の様式で代謝される。別段指定されない限り、特定の核酸配列はまた、黙示的に、その保存的に改変された変異型（例えば、縮重コドン置換）および相補的なヌクレオチド配列、ならびに明示的に示される配列（「参照配列」）を包含する。具体的には、縮重コドン置換は、１つ以上の選択される（またはすべての）コドンの第３の位置が、混合基および／またはデオキシイノシン残基と置換される、配列を作成することによって達成され得る。核酸またはポリヌクレオチドという用語は、遺伝子によってコードされるｃＤＮＡまたはｍＲＮＡを包含する。
【０１３８】
本明細書で使用される場合、「非競合的結合」という用語は、同時に少なくとも２つの結合パートナーに特異的に結合するためのタンパク質の能力を意味する。したがって、タンパク質は、少なくとも２つの異なる結合パートナーに同時に結合することができるが、場合によっては、タンパク質が、結合パートナーのうちの１つのみに特異的に結合されるように、結合相互作用は、同じ持続時間である必要はない。いくつかの実施形態では、結合は、特異的結合条件下で生じる。いくつかの実施形態では、同時の結合は、１つの結合パートナーの結合が、第２の結合パートナーへの同時の結合を実質的に抑制しないようなものである。いくつかの実施形態では、非競合的結合は、タンパク質上の第２の結合パートナーのその結合部位への結合が、タンパク質上の第１の結合パートナーのその結合部位への結合を変位させないことを意味する。非競合的結合を評価する方法は、Ｐｅｒｅｚ  ｄｅ  ｌａ  Ｌａｓｔｒａ  ｅｔ  ａｌ．（１９９９），Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ，９６（４）：６６３−６７０に記載されている方法など、当該技術分野でよく知られている。場合によっては、非競合的相互作用では、第１の結合パートナーは、第２の結合パートナーの結合が、第１の結合パートナーの結合を直接妨げないように、第２の結合パートナーの相互作用部位と重複しない相互作用部位に特異的に結合する。したがって、第２の結合パートナーの結合による結合パートナーの結合に対するいかなる効果も、第１の結合パートナーの結合を直接妨げる以外の機構を通したものである。例えば、酵素−基質相互作用の文脈で、非競合的抑制剤は、酵素の活性部位以外の部位に結合する。非競合的結合は、第２の結合パートナーが、第１の結合パートナーの結合と重複しない相互作用部位に特異的に結合するが、第１の相互作用部位が第１の結合パートナーによって示されたときにのみ、第２の相互作用部位に結合する、非競合的結合相互作用を包含する。
【０１３９】
「医薬組成物」という用語は、哺乳動物対象、多くの場合、ヒトにおける薬学的使用に好適な組成物を指す。医薬組成物は、典型的には、有効量の活性薬剤（例えば、変異型ＣＴＬＡ−４を含む免疫調節ポリペプチド、または変異型ＣＴＬＡ−４膜貫通免疫調節タンパク質を発現する操作された細胞）、および担体、賦形剤、または希釈剤を含む。担体、賦形剤、または希釈剤は、典型的には、それぞれ、薬学的に許容可能な担体、賦形剤、または希釈剤である。
【０１４０】
「ポリペプチド」および「タンパク質」という用語は、本明細書で互換的に使用され、ペプチド結合を通して連結されている２つ以上のアミノ酸の分子鎖を指す。これらの用語は、特定の長さの生成物を指すものではない。したがって、「ペプチド」および「オリゴペプチド」は、ポリペプチドの定義内に含まれる。これらの用語は、ポリペプチド、例えば、グリコシル化、アセチル化、リン酸化など、ポリペプチドの翻訳後の改変を含む。これらの用語はまた、１つ以上のアミノ酸類似体または非標準的もしくは非天然アミノ酸が、既知のタンパク質操作技術を使用して合成され得るか、または組み換え発現され得るときに含まれる分子を含む。加えて、タンパク質は、誘導体化され得る。
【０１４１】
本明細書で使用される場合、「初代Ｔ細胞アッセイ」という用語は、インターフェロンガンマ（「ＩＦＮ−ガンマ」）発現を測定するためのインビトロアッセイを指す。様々なそのような初代Ｔ細胞アッセイが、当該技術分野で知られている。好ましい実施形態では、使用されるアッセイは、抗ＣＤ３同時固定化アッセイである。このアッセイでは、一次Ｔ細胞は、追加の組み換えタンパク質により、またはこれによらずに固定化された抗ＣＤ３によって刺激される。培養液上清は、通常、２４〜７２時間の時点で採取される。別の実施形態では、使用されるアッセイは、ＭＬＲである。このアッセイでは、一次Ｔ細胞は、同種異系ＡＰＣにより刺激される。培養液上清は、通常、２４〜７２時間の時点で採取される。ヒトＩＦＮ−ガンマレベルは、標準的なＥＬＩＳＡ技術によって培養液上清において測定される。市販のキットは、供給業者から入手可能であり、アッセイは、製造業者の推奨に従って行われる。
【０１４２】
本発明の免疫調節タンパク質をコードするなど、核酸に適用されるような「精製された」という用語は、概して、当該技術分野でよく知られている分析技術によって決定されるような他の成分（例えば、精製されたポリペプチドまたはポリヌクレオチドは、電気泳動ゲル、クロマトグラフィー溶出液、および／または密度勾配遠心分離に供される培地中に離散帯を形成する）を実質的に含まない核酸またはポリペプチドを表す。例えば、電気泳動ゲル中に本質的に１つの帯を生じさせる核酸またはポリペプチドが、「精製」される。本発明の精製された核酸またはタンパク質は、少なくとも約５０％の純度、通常、少なくとも約７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９９％以上の純度（例えば、重量パーセントまたはモルベースで）である。
【０１４３】
「組み換え」という用語は、材料（例えば、核酸またはポリペプチド）が、ヒト干渉によって人工的に（すなわち、非天然に）変化したことを示す。変化は、その天然環境または状態内の材料に対して行われ得るか、またはそこから除去され得る。例えば、「組み換え核酸」は、例えば、クローン化、親和性改変、ＤＮＡシャフリング、または他のよく知られている分子生物学的手順中に、核酸を組み換えることによって作製される核酸である。「組み換えＤＮＡ分子」は、そのような分子生物学的技術の手段によって一緒に接合されるＤＮＡのセグメントから構成される。本明細書で使用される場合、「組み換えタンパク質」または「組み換えポリペプチド」という用語は、組み換えＤＮＡ分子を使用して発現されるタンパク質分子を指す。「組み換え宿主細胞」は、組み換え核酸を含有および／もしくは発現するか、または本明細書に提供される膜貫通免疫調節タンパク質などの組み換えタンパク質をコードする核酸分子を細胞に導入することなど、遺伝子操作によって別様に変化した細胞である。真核細胞中の転写制御シグナルは、「プロモーター」および「エンハンサー」要素を含む。プロモーターおよびエンハンサーは、転写に関わる細胞タンパク質と特異的に相互作用するＤＮＡ配列の短いアレイからなる。プロモーターおよびエンハンサー要素は、酵母、昆虫、および哺乳動物細胞、ならびにウイルス中の遺伝子を含む、様々な真核生物源（類似の制御要素、すなわち、プロモーターがまた、原核生物に見られる）から単離された。特定のプロモーターおよびエンハンサーの選択は、対象となるタンパク質を発現するためにどの細胞型を使用するべきかに依存している。本明細書で使用される場合、「操作可能な組み合わせで」、「操作可能な順序で」、および「操作可能に連結された」という用語は、所与の遺伝子の転写および／または所望のタンパク質分子の合成を方向付けることができる核酸分子が生成される様式または配向での核酸配列の連結を指す。
【０１４４】
本明細書で使用される場合、「組み換え発現ベクター」という用語は、特定の宿主細胞における操作可能に連結されているコード化配列の発現のために必要な適切な所望のコード化配列および核酸配列を含有するＤＮＡ分子を指す。原核生物における発現のために必要な核酸配列には、プロモーター、任意選択的に、オペレーター配列、リボソーム結合部位、およびおそらく他の配列が含まれる。真核細胞は、プロモーター、エンハンサー、ならびに末端およびポリアデニル化シグナルを利用することが知られている。分泌シグナルペプチド配列はまた、任意選択的に、所望される場合、細胞からの融合タンパク質のより容易な単離のために、発現される融合タンパク質が組み換え宿主細胞によって分泌され得るように、組み換え融合タンパク質などの組み換えタンパク質に対するコード化配列に操作可能に連結されている、組み換え発現ベクターによってコードされ得る。本用語には、自己複製核酸構造としてのベクター、ならびに導入された宿主細胞のゲノムに組み込まれたベクターが含まれる。ベクターの中には、レンチウイルスベクターなどのウイルスベクターがある。
【０１４５】
「選択性」という用語は、対象タンパク質の異なる結合パートナーなど、別の基質に対する特異的結合と比較して、１つの結合パートナーなど、１つの基質の特異的結合に対する対象タンパク質、またはポリペプチドの選好を指す。選択性は、第１の結合パートナー（例えば、Ｋｄ１）などの対象タンパク質および第１の基質の結合活性（例えば、結合親和性）と、第２の結合パートナー（例えば、Ｋｄ２）と同じ対象タンパク質の結合活性（例えば、結合親和性）との比率として反映され得る。
【０１４６】
本明細書で使用される場合、「配列同一性」という用語は、それぞれ、ヌクレオチドまたはアミノ酸レベルでの、遺伝子またはタンパク質間の配列同一性を指す。「配列同一性」は、アミノ酸レベルでのタンパク質間の同一性の評価基準、およびヌクレオチドレベルでの核酸間の同一性の評価基準である。タンパク質配列同一性は、配列がアラインメントされたときに、それぞれの配列における所与の位置のアミノ酸配列を比較することによって決定され得る。同様に、核酸配列同一性は、配列がアラインメントされたときに、それぞれの配列における所与の位置のヌクレオチド配列を比較することによって決定され得る。比較のための配列のアラインメントについての方法は、当該技術分野でよく知られており、このような方法には、ＧＡＰ、ＢＥＳＴＦＩＴ、ＢＬＡＳＴ、ＦＡＳＴＡ、およびＴＦＡＳＴＡが含まれる。ＢＬＡＳＴアルゴリズムは、パーセント配列同一性を計算し、２つの配列間の類似性の統計的分析を行う。ＢＬＡＳＴ分析を行うためのソフトウエアは、バイオテクノロジー情報（ＮＣＢＩ）のためのナショナルセンターのウエブサイトを通して公的に入手可能である。
【０１４７】
タンパク質に関して本明細書で使用される場合、「可溶性」という用語は、タンパク質が膜タンパク質ではないことを意味する。概して、可溶性タンパク質は、ＩｇＳＦドメインまたはその特異的結合断片を含有するＩｇＳＦファミリーメンバー受容体の細胞外ドメインもしくはその一部分のみを含有するが、膜貫通ドメインを含有せず、かつ／または細胞の表面上に発現されることができない。場合によっては、タンパク質の可溶性は、直接またはリンカーを介して間接的に、場合によっては、タンパク質の安定性および／または半減期を改善することもできる、Ｆｃドメインまたは他の部分に連結または付着することによって改善され得る。いくつかの態様では、可溶性タンパク質は、Ｆｃ融合タンパク質である。
【０１４８】
ポリペプチドまたは核酸に関して本明細書で使用される場合、「種」という用語は、同一のまたは略同一の配列を有する分子のアンサンブルを意味する。同じ種であるポリペプチド間の変動は、グリコシル化、リン酸化、ユビキチン化、ニトロシル化、メチル化、アセチル化、および脂質化などの翻訳後の改変における差に起因して生じ得る。１、２、または３つ以下のアミノ酸残基によってアミノ末端またはカルボキシ末端の全長種とは異なる（またはその差をコードする）ポリペプチドのわずかに切断された配列は、単一種からなるものと考えられる。そのような微小不均一性は、製造されるタンパク質の共通の特徴である。
【０１４９】
全長野生型哺乳動物ＣＴＬＡ−４ポリペプチドまたはそのＩｇＶドメインに関して本明細書で使用される場合、「特異的結合断片」という用語は、全長ポリペプチドまたはＩｇＶドメインの部分配列を有し、かつ生体外でおよび／または生体内で、ヒトまたはネズミＩＣＯＳＬ、ＣＤ８０、またはＣＤ８６などの哺乳動物ＩＣＯＳＬ、哺乳動物ＣＤ８０、および／または哺乳動物ＣＤ８６に特異的に結合するポリペプチドを意味する。いくつかの実施形態では、特異的結合断片は、全長野生型配列またはそのＩｇＶ配列の少なくとも６０％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、または９９％の配列長さであるＣＴＬＡ−４  ＩｇＶ部分配列を含む。特異的結合断片は、本発明の変異型ＣＴＬＡ−４を形成するように配列において変化され得る。
【０１５０】
本明細書で使用される場合、「特異的に結合する」という用語は、タンパク質の親和性または結合活性が、同じタンパク質の、十分な統計的サイズのランダムペプチドもしくはポリペプチドの収集への平均的な親和性もしくは結合活性の少なくとも５倍であるか、任意選択的に、少なくとも１０、２０、３０、４０、５０、１００、２５０、もしくは５００倍であるか、またはさらに少なくとも１０００倍であるように、特異的結合条件下で、標的タンパク質に結合するためのタンパク質の能力を意味する。特異的に結合タンパク質は、単一標的分子に対して非排他的に結合する必要はないが、標的と非標的との間の構造的配座における類似性（例えば、パラログまたはオルソログ）に起因して、非標的分子に特異的に結合し得る。当業者であれば、異なる種の動物において同じ機能を有する分子（すなわち、オルソログ）、または標的分子と略同様のエピトープを有する非標的分子（例えば、パラログ）への特異的結合が可能であり、かつ固有の非標的の統計的に有効な収集（例えば、ランダムポリペプチド）に対して決定される結合の特異性を損なわないことを認識するであろう。したがって、本発明のポリペプチドは、交差反応性に起因して、標的分子の１つ超の別個の種に特異的に結合し得る。固相ＥＬＩＳＡ免疫アッセイ、ＦｏｒｔｅＢｉｏ  Ｏｃｔｅｔ（登録商標）、またはＢｉａｃｏｒｅ（登録商標）の測定値を使用して、２つのタンパク質間の特異的結合を判定することができる。概して、２つの結合タンパク質間の相互作用は、１ｘ１０−５Ｍ未満の解離定数（Ｋｄ）を有し、１ｘ１０−１２Ｍ程度に低い場合が多い。本開示の特定の実施形態では、２つの結合タンパク質間の相互作用は、約１ｘ１０−６Ｍ未満、１ｘ１０−７Ｍ、１ｘ１０−８Ｍ、１ｘ１０−９Ｍ、１ｘ１０−１０Ｍ、または１ｘ１０−１１Ｍ以下の解離定数を有する。
【０１５１】
ポリペプチドを発現する哺乳動物に関して、「表面発現」、「表面発現」、または「表面上に発現される」という用語は、ポリペプチドが膜タンパク質として発現されることを意味する。いくつかの実施形態では、膜タンパク質は、膜貫通タンパク質である。
【０１５２】
本明細書で使用される場合、例えば、合成核酸分子または合成遺伝子または合成ペプチドに関する「合成」とは、組み換え方法および／または化学合成方法によって生成される核酸分子またはポリペプチド分子を指す。
【０１５３】
本明細書で使用される場合、「標的指向部分」という用語は、本発明の変異型ＣＴＬＡ−４を含むポリペプチドに共有的または非共有的に付着されるか、またはこれを物理的に封入する組成物を指す。いくつかの実施形態では、標的指向部分は、細胞上に発現される標的分子などの標的分子に対する特異的結合親和性を有する。典型的には、標的分子は、特定の組織または細胞型上に局在している。標的指向部分には、抗体、抗原結合断片（Ｆａｂ）、ＶＨおよびＶＬを含有する可変断片（Ｆｖ）、１つの鎖に一緒に連結されたＶＨおよびＶＬを含有する単鎖可変断片（ｓｃＦｖ）、ならびにＦａｂ′、Ｆ（ａｂ）２、Ｆ（ａｂ′）２、ｄｓＦｖ二重特異性抗体、ナノボディ、可溶性受容体、受容体リガンド、親和性成熟受容体、またはリガンドなどの他の抗体Ｖ領域断片、ならびに小分子（＜５００ダルトン）組成物（例えば、特異的結合受容体組成物）が含まれる。標的指向部分はまた、本発明のポリペプチドを封入するリポソームの脂質膜に共有的または非共有的に付着され得る。
【０１５４】
本明細書で使用される場合、「膜貫通タンパク質」という用語は、哺乳動物細胞などの生物学的膜、またはリポソームなどの人工構築物中に見られる脂質二重層などの脂質二重層に実質的または完全に及ぶ膜タンパク質を意味する。膜貫通タンパク質は、脂質二重層に統合され、かつ統合が生理的条件下で熱力学的に安定している膜貫通ドメイン（「膜貫通ドメイン」）を含む。膜貫通ドメインは、概して、水性環境（例えば、サイトゾル、細胞外流体）と相互作用するタンパク質の領域に対するそれらの高い疎水性に基づいて、任意の数の市販のバイオインフォマティクスソフトウエアアプリケーションを介したそれらのアミノ酸配列から予測可能である。膜貫通ドメインは、膜に及ぶ疎水性アルファヘリックスであることが多い。膜貫通タンパク質は、脂質二重層の両層を、１回または複数回通過し得る。膜貫通タンパク質は、本明細書に記載の提供される膜貫通免疫調節タンパク質を含む。膜貫通ドメインに加えて、本発明の膜貫通免疫調節タンパク質は、外部ドメイン、およびいくつかの実施形態では、外部ドメインをさらに含む。
【０１５５】
本明細書で使用される場合、疾患または障害の「治療すること」、「治療」、または「療法」という用語は、単独で、または本明細書に記載されるような別の化合物と組み合わせてのいずれかで、本発明の治療組成物（例えば、免疫調節タンパク質または操作された細胞を含有する）の投与によって、臨床症状または診断症状のいずれかの減少、中断、または排除によって照明されるように、疾患または障害の進行を緩やかにするか、停止させるか、または逆転させることを意味する。「治療すること」、「治療」、または「療法」はまた、急性もしくは慢性疾患もしくは障害における症状の重症度の減少、または例えば、自己免疫性疾患経過の再発もしくは軽減の場合の再発率の減少、あるいは自己免疫性疾患の炎症態様の場合の炎症の減少を意味する。「治療すること」、「治療」、または「療法」はまた、炎症および／または移植拒絶反応と関連する他の症状を減少させることを意味し得る。
【０１５６】
癌の文脈で本明細書で使用される場合、癌の「治療」、または「抑制する」、「抑制すること」、もしくは「抑制」という用語は、固形腫瘍の反応評価基準（ＲＥＣＩＳＴ）、または無進行生存（ＰＦＳ）もしくは全生存（ＯＳ）の統計的に有意な増加を含むが、これらに限定されない標準的な基準によって測定されるように、腫瘍成長速度の統計的に有意な減少、腫瘍成長の中断、または腫瘍のサイズ、質量、代謝活性、もしくは体積の減少のうちの少なくとも１つを指す。
【０１５７】
本発明の文脈で使用される場合、疾患または障害の「防止すること」、「予防」、または「防止」は、疾患もしくは障害の発生もしくは発病、または疾患もしくは障害の症状のうちのいくつかもしくはすべてを防止するか、あるいは疾患もしくは障害の発病の可能性を低下させるために、単独で、または別の化合物との組み合わせでのいずれかで、本発明の免疫調節ポリペプチドまたは操作された細胞を投与することを指す。
【０１５８】
本明細書で使用される場合、「腫瘍特異的抗原」または「ＴＳＡ」という用語は、主に、哺乳動物対象の腫瘍細胞上に存在するが、一般に、哺乳動物対象の正常細胞上には見られないカウンター構造を指す。腫瘍特異的抗原は、腫瘍細胞に対して排他的である必要はないが、腫瘍特異的抗原を有する特定の哺乳動物の細胞の割合は、十分に高いか、または腫瘍の表面上の腫瘍特異的抗原のレベルは、本発明の免疫調節ポリペプチドなどの抗腫瘍治療薬によって標的化され得、かつ腫瘍の効果からの哺乳動物の防止もしくは治療を提供し得るのに十分高い。いくつかの実施形態では、腫瘍を有する哺乳動物からの細胞のランダムな統計資料では、ＴＳＡをディスプレイする細胞のうちの少なくとも５０％が、癌性である。他の実施形態では、ＴＳＡをディスプレイする細胞のうちの少なくとも６０％、７０％、８０％、８５％、９０％、９５％、または９９％が、癌性である。
【０１５９】
変異型ＣＴＬＡ−４に関して使用される場合、「変異型」（また、「改変」または変異体」）という用語は、ヒト干渉によって作成される哺乳動物（例えば、ヒトまたはネズミ）ＣＴＬＡ−４などのＣＴＬＡ−４を意味する。変異型ＣＴＬＡ−４は、非改変または野生型ＣＴＬＡ−４に対して、変化したアミノ酸配列を有するポリペプチドである。変異型ＣＴＬＡ−４は、１つ以上のアミノ酸置換、欠失、添加、またはそれらの組み合わせなどの１つ以上の改変による野生型ＣＴＬＡ−４アイソフォーム配列とは異なるポリペプチドである。本明細書の目的のために、変異型ＣＴＬＡ−４は、アミノ酸差のうちの１つ以上がＩｇＳＦドメイン（例えば、ＩｇＶドメイン）において生じる少なくとも１つの親和性改変ドメインを含有する。変異型ＣＴＬＡ−４は、アミノ酸置換など、１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、２９、３０個以上のアミノ酸差を含有し得る。変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、概して、細胞外ドメインまたはそのＩｇＳＦドメインを含有する、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１の配列、その成熟配列（シグナル配列を欠いている）、またはその一部分などの対応する野生型または非改変ＣＴＬＡ−４と少なくとも５０％、６０％、７０％、８０％、８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％以上の配列同一性を示す。いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２またはＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：３に記載の配列を含む対応する野生型または非改変ＣＴＬＡ−４と少なくとも５０％、６０％、７０％、８０％、８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％以上の配列同一性を示す。天然に発生しないアミノ酸ならびに天然に発生するアミノ酸は、許容される置換または添加の範囲内に含まれる。変異型ＣＴＬＡ−４は、任意の特定の作製方法に限定されず、例えば、デノボ化学合成、デノボ組み換えＤＮＡ技術、またはそれらの組み合わせを含む。本発明の変異型ＣＴＬＡ−４は、哺乳動物種のＩＣＯＳＬ、ＣＤ８０、および／またはＣＤ８６に特異的に結合する。いくつかの実施形態では、変化したアミノ酸配列は、野生型または非改変ＣＴＬＡ−４タンパク質と比較して、ＩＣＯＳＬ；ＣＤ８０、ＣＤ８６、ＣＤ８０、およびＣＤ８６；ＩＣＯＳＬおよびＣＤ８０；ＩＣＯＳＬおよびＣＤ８６；ならびに／またはＩＣＯＳＬ、ＣＤ８０、およびＣＤ８６に対する変化した（すなわち、増加または減少した）結合親和性または結合活性をもたらす。結合親和性または結合活性の増加または減少は、フローサイトメトリーなどのよく知られている結合アッセイを使用して判定され得る。そのようなアッセイは、Ｌａｒｓｅｎ  ｅｔ  ａｌ．，Ａｍ  Ｊ  Ｔｒａｎｓｐｌａｎｔ，５（３）：４４３−４５３（２００５）およびＬｉｎｓｌｅｙ  ｅｔ  ａｌ．，Ｉｍｍｕｎｉｔｙ，１（９）：７９３−８０１（１９９４）に記載されている。
【０１６０】
ＩＣＯＳＬ、ＣＤ８０、および／またはＣＤ８６に対する変異型ＣＴＬＡ−４結合親和性または結合活性の増加は、野生型または非改変ＣＴＬＡ−４のそれよりも少なくとも５％大きい値であり、いくつかの実施形態では、野生型または非改変ＣＴＬＡ−４対照値のそれよりも少なくとも１０％、１５％、２０％、３０％、４０％、５０％、１００％大きい。ＩＣＯＳＬ、ＣＤ８０、および／またはＣＤ８６に対するＣＴＬＡ−４結合親和性または結合活性の減少は、野生型または非改変対照値の９５％以下の値であり、いくつかの実施形態では、野生型または非改変対照値の８０％、７０％、６０％、５０％、４０％、３０％、２０％、１０％、５％以下、または検出不能な結合親和性または結合活性である。変異型ＣＴＬＡ−４は、アミノ酸残基の置換、添加、または欠失による一次アミノ酸配列において変化される。
【０１６１】
変異型ＣＴＬＡ−４の文脈での「変異型」という用語は、変異型ＣＴＬＡ−４が作成される任意の特定の出発組成物または方法に対して任意の条件を課すものと解釈されるべきではない。変異型ＣＴＬＡ−４は、例えば、野生型哺乳動物ＣＴＬＡ−４配列情報から出発して作製され得、次に、ＩＣＯＳＬ、ＣＤ８０、および／またはＣＤ８６との結合のためにインシリコでモデル化され得、最後に、本発明の変異型ＣＴＬＡ−４を生じるように組み換え発現されるか、または化学的に合成され得る。代替的な例では、変異型ＣＴＬＡ−４は、野生型ＣＴＬＡ−４の部位特異的変異誘発によって作成され得る。したがって、変異型ＣＴＬＡ−４は、組成物を表し、必ずしも、任意の所与のプロセスによって生成される生成物を表すものではない。組み換え方法、化学合成、またはそれらの組み合わせを含む様々な技術を用いることができる。
【０１６２】
核酸分子、タンパク質（例えば、ＣＴＬＡ−４）、ＩｇＳＦメンバー、宿主細胞などの生物学的材料と関連して本明細書で使用される場合、「野生型」または「天然の」または「天然型」という用語は、天然に見られ、かつヒト干渉によって改変されないものを指す。
【０１６３】
ＩＩ．変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド
ＣＴＬＡ−４結合パートナーのうちの１つ以上に対する変化した（増加または減少した）結合活性または親和性を示す変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドを、本明細書に提供する。いくつかの実施形態では、ＣＴＬＡ−４結合パートナーは、ＩＣＯＳＬ、ＣＤ８０、および／またはＣＤ８６のうちの１つ以上である。いくつかの実施形態では、ＣＴＬＡ−４結合パートナーは、ＩＣＯＳＬである。いくつかの実施形態では、ＣＴＬＡ−４の１つ以上の結合パートナーは、ＩＣＯＳＬおよびＣＤ８０またはＣＤ８６である。いくつかの実施形態では、ＣＴＬＡ−４の１つ以上の結合パートナーは、ＩＣＯＳＬ、ＣＤ８０、およびＣＤ８６である。
【０１６４】
ＣＴＬＡ−４は、免疫グロブリンドメインまたは折り畳み構造として知られるドメイン（以後、「免疫グロブリンスーパーファミリードメイン」またはＩｇＳＦドメイン）をすべて保有するタンパク質のファミリーであるタンパク質の免疫グロブリンスーパーファミリーのメンバーである。いくつかの実施形態では、他のＩｇＳＦファミリーメンバーは、シグナル調節性タンパク質（ＳＩＲＰ）ファミリー、骨髄系細胞上に発現される誘発受容体様（Ｔｒｉｇｇｅｒｉｎｇ  Ｒｅｃｅｐｔｏｒ  Ｅｘｐｒｅｓｓｅｄ  Ｏｎ  Ｍｙｅｌｏｉｄ  Ｃｅｌｌｓ  Ｌｉｋｅ）（ＴＲＥＭＬ）ファミリー、癌胎児抗原関連細胞接着分子（ＣＥＡＣＡＭ）ファミリー、シアル酸結合免疫グロブリン様レクチン（ＳＩＧＬＥＣ）ファミリー、ブチロフィリンファミリー、Ｂ７ファミリー、ＣＤ２８ファミリー、Ｖセットおよび免疫グロブリンドメイン含有（ＶＳＩＧ）ファミリー、Ｖセット膜貫通ドメイン（ＶＳＴＭ）ファミリー、主要組織適合複合体（ＭＨＣ）ファミリー、シグナル伝達リンパ球活性化分子（ＳＬＡＭ）ファミリー、白血球免疫グロブリン様受容体（ＬＩＲ）、ネクチン（Ｎｅｃ）ファミリー、ネクチン様（ＮＥＣＬ）ファミリー、ポリオウイルス受容体関連（ＰＶＲ）ファミリー、天然細胞傷害誘発受容体（ＮＣＲ）ファミリー、Ｔ細胞免疫グロブリンおよびムチン（ＴＩＭ）ファミリー、またはキラー細胞免疫グロブリン様受容体（ＫＩＲ）ファミリーからのメンバーを含む。いくつかの実施形態では、他のＩｇＳＦファミリーメンバーは、ＣＤ８０（Ｂ７〜１）、ＣＤ８６（Ｂ７〜２）、ＣＤ２７４（ＰＤ−Ｌ１、Ｂ７−Ｈ１）、ＰＤＣＤ１ＬＧ２（ＰＤ−Ｌ２、ＣＤ２７３）、ＩＣＯＳＬＧ（Ｂ７ＲＰ１、ＣＤ２７５、ＩＣＯＳＬ、Ｂ７−Ｈ２）、ＣＤ２７６（Ｂ７−Ｈ３）、ＶＴＣＮ１（Ｂ７−Ｈ４）、ＣＤ２８、ＰＤＣＤ１（ＴＩＧＩＴ）、ＩＣＯＳ、ＢＴＬＡ（ＣＤ２７２）、ＣＤ４、ＣＤ８Ａ（ＣＤ８−アルファ）、ＣＤ８Ｂ（ＣＤ８−ベータ）、ＬＡＧ３、ＨＡＶＣＲ２（ＴＩＭ−３）、ＣＥＡＣＡＭ１、ＴＩＧＩＴ、ＰＶＲ（ＣＤ１５５）、ＰＶＲＬ２（ＣＤ１１２）、ＣＤ２２６、ＣＤ２、ＣＤ１６０、ＣＤ２００、ＣＤ２００Ｒ１（ＣＤ２００Ｒ）、およびＮＣＲ３（ＮＫｐ３０）を含む。
【０１６５】
表１は、ＩｇＳＦファミリーの例示的なメンバーを要約している。表１の第１の列は、名称、および任意選択的に、その特定のＩｇＳＦメンバーに対するいくつかの可能な別名を提供する。第２の列は、ＵｎｉＰｒｏｔＫＢデータベースのタンパク質識別子、ｕｎｉｐｒｏｔ．ｏｒｇのインターネットを介してアクセス可能な公的に入手可能なデータベース、または場合によっては、ＧｅｎＢａｎｋ番号を提供する。ユニバーサルタンパク質源（ＵｎｉＰｒｏｔ）は、タンパク質配列および注釈データについての包括的供給源である。ＵｎｉＰｒｏｔデータベースは、ＵｎｉＰｒｏｔ知識ベース（ＵｎｉＰｒｏｔＫＢ）を含む。ＵｎｉＰｒｏｔは、欧州バイオインフォマティクス研究所（ＥＭＢＬ−ＥＢＩ）、ＳＩＢスイスバイオインフォマティクス研究所、およびタンパク質情報ソース（ＰＩＲ）間の共同制作であり、主にアメリカ国立衛生研究所（ＮＩＨ）からの許可によって支持されている。ＧｅｎＢａｎｋは、すべての公的に入手可能なＤＮＡ配列の注釈付きの収集である、ＮＩＨ遺伝子配列データベースである（Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄｓ  Ｒｅｓｅａｒｃｈ，２０１３  Ｊａｎ；４１（Ｄ１）：Ｄ３６−４２）。第３の列は、示されるＩｇＳＦドメインが位置する領域を提供する。領域は、ドメインが範囲を定義する残基を包含する範囲として特定される。列３はまた、特定されたＩｇＳＦ領域についてのＩｇＳＦドメインクラスを示す。列４は、示される追加のドメインが位置する領域（シグナルペプチド、Ｓ、細胞外ドメイン、Ｅ、膜貫通ドメイン、Ｔ、細胞質ドメイン、Ｃ）を提供する。ドメインの記載は、ドメインを識別または分類するために使用される方法に依存して変化し得、かつ異なる供給源とは異なって識別され得ることが理解される。表１のドメインに対応する残基の記載は、例示のみのためにあり、より長いか、またはより短い、いくつかのアミノ酸（１、２、３、または４つなど）であり得る。列５は、列挙されるＩｇＳＦメンバーのうちのいくつか、その結合パートナーのうちのいくつかについて示す。
【０１６６】
（表１）本開示によるＩｇＳＦメンバー
2020536552.tif 000003
2020536552.tif 000004
2020536552.tif 000005
2020536552.tif 000006
2020536552.tif 000007
2020536552.tif 000008
【０１６７】
いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、野生型もしくは非改変ＣＴＬＡ−４ポリペプチド、またはＩｇＤを含有する野生型もしくは非改変ＣＴＬＡ−４の一部分、またはその特異的結合断片に対する免疫グロブリンスーパーファミリー（ＩｇＳＦ）ドメイン（ＩｇＤ）において、１つ以上の置換（代替的に、「変異」または「交換」）、欠失、または添加などの１つ以上のアミノ酸改変を含有する。したがって、提供される変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、１つ以上のアミノ酸改変（例えば、置換）が、ＩｇＤ内にある、変異型ＩｇＤ（以後、「ｖＩｇＤ」と呼ばれる）であるか、またはこれを含む。
【０１６８】
いくつかの実施形態では、ＩｇＤは、ＩｇＶドメインもしくはＩｇＶドメインの特異的結合断片、またはそれらの組み合わせを含む。いくつかの実施形態では、ＩｇＤは、ＩｇＶのみ、またはＣＴＬＡ−４の全細胞外ドメイン（ＥＣＤ）であり得る。いくつかの実施形態では、ＩｇＤは、ＥＣＤの特異的結合断片を含む。表１は、ＣＴＬＡ−４のＩｇＶ領域およびＥＣＤに対応する例示的な残基を提供する。いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、アミノ酸改変（例えば、置換）のうちの少なくとも１つが、ＩｇＶドメインもしくはＥＣＤ、またはその特異的結合断片中にある、ＩｇＶドメインもしくはＥＣＤ、またはその特異的結合断片を含有する。いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、アミノ酸改変（例えば、置換）のうちの少なくとも１つが、ＩｇＶドメインまたはその特異的結合断片中にある、ＩｇＶドメインまたはその特異的結合断片を含有する。いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、アミノ酸改変（例えば、置換）のうちの少なくとも１つが、ＥＣＤまたはその特異的結合断片中にある、ＥＣＤまたはその特異的結合断片を含有する。いくつかの実施形態では、変化した結合活性または親和性により、変化したＩｇＶドメインまたはＥＣＤは、親和性改変ＩｇＳＦドメインである。
【０１６９】
いくつかの実施形態では、変異型は、非改変ＣＴＬＡ−４配列の配列に対する、もう１つのＩｇＳＦドメインにおける改変である。いくつかの実施形態では、非改変ＣＴＬＡ−４配列は、野生型ＣＴＬＡ−４である。いくつかの実施形態では、非改変または野生型ＣＴＬＡ−４は、天然型ＣＴＬＡ−４の配列、またはそのオルソログを有する。いくつかの実施形態では、非改変ＣＴＬＡ−４は、１つ以上のＩｇＳＦドメインを含有するＣＴＬＡ−４の細胞外ドメイン（ＥＣＤ）もしくはその一部分であるか、またはこれを含む（表１を参照されたい）。いくつかの実施形態では、非改変または野生型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドの細胞外ドメインは、ＩｇＶドメインまたはその特異的結合断片を含む。いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、ＩｇＶドメインもしくはその特異的結合断片を含むか、または本質的にこれからなる。いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、ＥＣＤもしくはその特異的結合断片を含むか、または本質的にこれからなる。いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４は、可溶性であり、膜貫通ドメインを欠いている。いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４は、細胞内シグナル伝達ドメインを含有し得る膜貫通ドメイン、および場合によっては、細胞質ドメインもさらに含む。
【０１７０】
いくつかの実施形態では、野生型または非改変ＣＴＬＡ−４配列は、哺乳動物ＣＴＬＡ−４配列である。いくつかの実施形態では、野生型または非改変ＣＴＬＡ−４配列は、ヒト、マウス、カニクイザル、またはラットＣＴＬＡ−４を含むが、これらに限定されない哺乳動物ＣＴＬＡ−４であり得る。いくつかの実施形態では、野生型または非改変ＣＴＬＡ−４配列は、ヒトである。
【０１７１】
いくつかの実施形態では、野生型または非改変ＣＴＬＡ−４配列は、（ｉ）シグナル配列を欠いているＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１に記載のアミノ酸の配列、もしくはその成熟形態、（ｉｉ）ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１と少なくとも８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％以上の配列同一性を示すアミノ酸の配列、もしくはその成熟形態を有するか、または（ｉｉｉ）ＩｇＶドメインもしくはＥＣＤを含有する（ｉ）もしくは（ｉｉ）の一部分、もしくはその特異的結合断片である。
【０１７２】
いくつかの実施形態では、野生型または非改変ＣＴＬＡ−４配列は、ＣＴＬＡ−４の細胞外ドメイン（ＥＣＤ）またはその一部分であるか、またはこれを含む。いくつかの実施形態では、非改変または野生型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２に記載のアミノ酸配列（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１のアミノ酸残基３６〜１６１に対応する）、またはそのオルソログを含む。場合によっては、非改変または野生型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、（ｉ）ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２に記載のアミノ酸の配列、（ｉｉ）ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２と少なくとも約８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％の配列同一性を有するアミノ酸の配列、または（ｉｉｉ）ＩｇＶドメインを含む（ｉ）もしくは（ｉｉ）の配列の特異的結合断片を含み得る。いくつかの実施形態では、野生型または非改変ＥＣＤは、ＩＣＯＳＬならびに／またはＣＤ８０および／もしくはＣＤ８６のうちの１つ以上など、１つ以上のＣＴＬＡ−４結合パートナーに結合することができる。
【０１７３】
いくつかの実施形態では、野生型または非改変ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、ＩｇＶドメイン、またはその特異的結合断片を含む。いくつかの実施形態では、野生型または非改変ＣＴＬＡ−４ポリペプチドのＩｇＶドメインは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：３に記載のアミノ酸配列（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１のアミノ酸残基３９〜１４０に対応する）、またはそのオルソログを含む。例えば、非改変または野生型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドのＩｇＶドメインは、（ｉ）ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：３に記載のアミノ酸の配列、（ｉｉ）ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：３と少なくとも約８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％の配列同一性を有するアミノ酸の配列、または（ｉｉｉ）（ｉ）もしくは（ｉｉ）の配列の特異的結合断片を含有し得る。いくつかの実施形態では、野生型または非改変ＩｇＶドメインは、ＩＣＯＳＬならびに／またはＣＤ８０および／もしくはＣＤ８６のうちの１つ以上など、１つ以上のＣＴＬＡ−４結合パートナーに結合することができる。
【０１７４】
いくつかの実施形態では、野生型または非改変ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、ＩｇＶドメインまたはＥＣＤの特異的結合断片など、ＣＴＬＡ−４の特異的結合断片を含有する。いくつかの実施形態では、特異的結合断片は、ＩＣＯＳＬに結合し得る。いくつかの実施形態では、特異的断片は、ＩＣＯＳＬおよびＣＤ８０またはＣＤ８６に結合し得る。いくつかの実施形態では、特異的断片は、ＩＣＯＳＬ、ＣＤ８０、およびＣＤ８６に結合し得る。特異的結合断片は、少なくとも６０、７０、８０、９０、または１００個のアミノ酸など、少なくとも５０個のアミノ酸のアミノ酸長を有し得る。いくつかの実施形態では、ＩｇＶドメインの特異的結合断片は、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１のアミノ酸３９〜１４０として記載されるＩｇＶドメインの長さの少なくとも約８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％であるアミノ酸配列を含有する。いくつかの実施形態では、ＥＣＤの特異的結合断片は、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１のアミノ酸３６〜１６１として記載されるＥＣＤの長さの少なくとも約８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％であるアミノ酸配列を含む。
【０１７５】
いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、１つ以上の親和性改変ＩｇＳＦドメインを含む、ＥＣＤドメインまたはその一部分を含む。いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、ＩｇＳＦドメイン（ＩｇＶ）またはＥＣＤのうちの１つ以上が、１つ以上のアミノ酸改変（例えば、置換）を含有する、ＩｇＶドメイン、もしくはＩｇＶドメイン特異的結合断片、またはＥＣＤの特異的結合断片を含み得る。いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、全長ＩｇＶドメインを含む。いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、全長ＥＣＤを含む。いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、ＩｇＶドメインの特異的結合断片を含む。いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、ＥＣＤの特異的結合断片を含む。
【０１７６】
そのような実施形態のうちのいずれかでは、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドの１つ以上のアミノ酸改変（例えば、置換）は、内部のＩｇＳＦドメインなど、ＣＴＬＡ−４ポリペプチドＥＣＤ内に位置し得る。例えば、いくつかの実施形態では、１つ以上のアミノ酸改変（例えば、置換）は、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドの細胞外ドメイン内に位置する。いくつかの実施形態では、１つ以上のアミノ酸改変（例えば、置換）は、ＩｇＶドメインまたはＩｇＶドメインの特異的結合断片内に位置する。
【０１７７】
概して、ポリペプチドのうちの様々な属性のうちのそれぞれが、以下に別々に開示されている（例えば、可溶性および膜結合ポリペプチド、ＩＣＯＳＬ、ＣＤ８０および／またはＣＤ８６についてのＣＴＬＡ−４の親和性、ポリペプチド鎖当たりの変動の数、連結されたポリペプチド鎖の数、変異型ＣＴＬＡ−４当たりのアミノ酸変化の数および性質など）。しかしながら、当業者には明らかなように、任意の特定のポリペプチドは、これらの独立した属性の組み合わせを含み得る。ＩｇＳＦドメインのドメイン構成を記載するために使用される配列番号として記載される特定の配列を含む、アミノ酸の参照は、例示の目的のためにあり、提供される実施形態の範囲を限定することを意味しないことが理解される。ポリペプチドおよびそのドメインの記載は、相同性分析および同様の分子とのアラインメントに基づいて理論的に導出されることが理解される。したがって、正確な遺伝子座は、変化する可能性があり、各タンパク質について必ずしも同じではない。それゆえ、特定のＩｇＶドメインまたはＥＣＤなどの特定のＩｇＳＦドメインは、より長いか、またはより短い、いくつかのアミノ酸（１、２、３、または４つなど）であり得る。
【０１７８】
さらに、以下に考察されるような本発明の様々な実施形態は、上記に開示されるような定義された用語の意味の範囲内で高い頻度で提供される。したがって、特定の定義で記載される実施形態は、定義された用語が、本明細書に記載の様々な態様および属性を考察する際に利用される場合に参照により組み込まれる通りに解釈されるべきである。したがって、見出し、様々な態様および実施形態提示の順序、ならびにそれぞれの独立した属性の別々の開示は、本開示の範囲に対する限定であることを意味しない。
【０１７９】
Ａ．例示的な改変
野生型または非改変ＣＴＬＡ−４ポリペプチドに含有されるＩｇＳＦまたはＥＣＤに対して、ＥＣＤ中に改変を含有する変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド、そのＩｇＳＦドメイン、またはその特異的結合断片を、本明細書に提供する。いくつかの実施形態では、少なくとも１つの改変は、ＩｇＳＦドメイン（例えば、ＩｇＶ）またはその特異的結合断片中にあり、そのため、提供される変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、少なくとも１つの親和性改変ＩｇＳＦドメイン、またはその特異的結合断片を含有する。いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、野生型または非改変ＣＴＬＡ−４ポリペプチドと比較して、ＩＣＯＳＬ、ＣＤ８０、および／またはＣＤ８６に対する変化した（増加または減少した）結合活性または親和性を示す。ＩＣＯＳＬ、ＣＤ８０、および／またはＣＤ８６は、ヒトタンパク質またはマウスタンパク質などの哺乳動物タンパク質であり得る。
【０１８０】
いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、野生型または非改変ＣＴＬＡ−４ポリペプチドと比較して、ＩＣＯＳＬ、ならびに任意選択的に、１つ以上のリガンドＣＤ８０およびＣＤ８６に対する変化した（増加または減少した）結合活性および親和性を示す。いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、例えば、固相ＥＬＩＳＡ免疫アッセイ、フローサイトメトリー、ＦｏｒｔｅＢｉｏ  Ｏｃｔｅｔ（登録商標）、またはＢｉａｃｏｒｅアッセイによって判定されるような野生型または非改変ＣＴＬＡ−４ポリペプチド対照（例えば、非改変）配列の結合親和性とは異なる、ＩＣＯＳＬ、ならびに任意選択的に、ＣＤ８０および／またはＣＤ８６に対する結合親和性を有する。いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、ＩＣＯＳＬ、ならびに任意選択的に、ＣＤ８０および／またはＣＤ８６に対する増加した結合親和性を有する。いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、野生型または非改変ＣＴＬＡ−４ポリペプチドに対して、ＩＣＯＳＬに対する増加した結合親和性、および任意選択的に、１つ以上のＣＤ８０および／またはＣＤ８６に対する減少した結合親和性を有する。
【０１８１】
いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、野生型または非改変ＣＴＬＡ−４ポリペプチドと比較して、ＣＤ８０、ならびに任意選択的に、１つ以上のリガンドＩＣＯＳＬおよびＣＤ８６に対して変化した（増加または減少した）結合活性または親和性を示す。いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、例えば、固相ＥＬＩＳＡ免疫アッセイ、フローサイトメトリー、ＦｏｒｔｅＢｉｏ  Ｏｃｔｅｔ（登録商標）、またはビアコアアッセイによって判定されるような野生型または非改変ＣＴＬＡ−４ポリペプチド対照（例えば、非改変）配列の結合親和性とは異なる、ＣＤ８０、ならびに任意選択的に、ＩＣＯＳＬおよび／またはＣＤ８６に対する結合親和性を有する。いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、ＣＤ８０、ならびに任意選択的に、ＩＣＯＳＬおよび／またはＣＤ８６に対する増加した結合親和性を有する。いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、野生型または非改変ＣＴＬＡ−４ポリペプチドに対して、ＣＤ８０に対する増加した結合親和性、ならびに任意選択的に、１つ以上のＩＣＯＳＬおよび／またはＣＤ８６に対する減少した結合親和性を有する。
【０１８２】
いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、野生型または非改変ＣＴＬＡ−４ポリペプチドと比較して、ＣＤ８６、ならびに任意選択的に、１つ以上のリガンドＩＣＯＳＬおよびＣＤ８０に対して変化した（増加または減少した）結合活性または親和性を示す。いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、例えば、固相ＥＬＩＳＡ免疫アッセイ、フローサイトメトリー、ＦｏｒｔｅＢｉｏ  Ｏｃｔｅｔ（登録商標）、またはビアコアアッセイによって判定されるような野生型または非改変ＣＴＬＡ−４ポリペプチド対照（例えば、非改変）配列の結合親和性とは異なる、ＣＤ８６、ならびに任意選択的に、ＩＣＯＳＬおよび／またはＣＤ８０に対する結合親和性を有する。いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、ＣＤ８６、任意選択的に、ＩＣＯＳＬおよび／またはＣＤ８０に対する増加した結合親和性を有する。いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、野生型または非改変ＣＴＬＡ−４ポリペプチドに対して、ＣＤ８６に対する増加した結合親和性、任意選択的に、１つ以上のＩＣＯＳＬおよび／またはＣＤ８０に対する減少した結合親和性を有する。
【０１８３】
結合パートナーのうちのそれぞれに対する結合親和性は、独立している。すなわち、いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、野生型または非改変ＣＴＬＡ−４ポリペプチドに対して、ＩＣＯＳＬ、ＣＤ８０、および／またはＣＤ８６のうちの１つ、２つ、または３つに対する増加した結合親和性、ならびにＩＣＯＳＬ、ＣＤ８０、および／またはＣＤ８６のうちの１つ、２つ、または３つに対する減少した結合親和性を有する。
【０１８４】
いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、野生型または非改変ＣＴＬＡ−４ポリペプチドに対して、ＣＤ８６に対する増加した結合親和性を有する。いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、野生型または非改変ＣＴＬＡ−４ポリペプチドに対して、ＣＤ８０に対する増加した結合親和性を有する。いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、野生型または非改変ＣＴＬＡ−４ポリペプチドに対して、ＣＤ８０およびＣＤ８６に対する増加した結合親和性を有する。いくつかの実施形態では、そのような変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドはまた、野生型または非改変ＣＴＬＡ−４ポリペプチドに対して、ＩＣＯＳＬに対する増加した結合親和性を有する。
【０１８５】
いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、野生型または非改変ＣＴＬＡ−４ポリペプチドに対して、ＩＣＯＳＬに対する増加した結合親和性を有する。いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、野生型または非改変ＣＴＬＡ−４ポリペプチドに対して、ＩＣＯＳＬに対する増加または減少した結合親和性、およびＣＤ８０に対する増加した結合親和性を有する。いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、野生型または非改変ＣＴＬＡ−４ポリペプチドに対して、ＩＣＯＳＬに対する増加または減少した結合親和性、およびＣＤ８６に対する増加した結合親和性を有する。いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、野生型または非改変ＣＴＬＡ−４ポリペプチドに対して、ＩＣＯＳＬに対する減少した結合親和性を有する。いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、野生型または非改変ＣＴＬＡ−４ポリペプチドに対して、ＩＣＯＳＬに対する増加または減少した結合親和性、およびＣＤ８０に対する減少した結合親和性を有する。いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、野生型または非改変ＣＴＬＡ−４ポリペプチドに対して、ＩＣＯＳＬに対する増加または減少した結合親和性、およびＣＤ８６に対する減少した結合親和性を有する。
【０１８６】
いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、野生型または非改変ＣＴＬＡ−４ポリペプチドに対して、ＩＣＯＳＬおよびＣＤ８０に対する増加した結合親和性を有する。いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、野生型または非改変ＣＴＬＡ−４ポリペプチドに対して、ＩＣＯＳＬに対する増加した結合親和性、およびＣＤ８０に対する減少した結合親和性を有する。いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、野生型または非改変ＣＴＬＡ−４ポリペプチドに対して、ＩＣＯＳＬおよびＣＤ８０に対する減少した結合親和性を有する。いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、野生型または非改変ＣＴＬＡ−４ポリペプチドに対して、ＩＣＯＳＬに対する減少した結合親和性、およびＣＤ８０に対する増加した結合親和性を有する。
【０１８７】
いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、野生型または非改変ＣＴＬＡ−４ポリペプチドに対して、ＩＣＯＳＬおよびＣＤ８６に対する増加した結合親和性を有する。いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、野生型または非改変ＣＴＬＡ−４ポリペプチドに対して、ＩＣＯＳＬに対する増加した結合親和性、およびＣＤ８６に対する減少した結合親和性を有する。いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、野生型または非改変ＣＴＬＡ−４ポリペプチドに対して、ＩＣＯＳＬおよびＣＤ８６に対する減少した結合親和性を有する。いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、野生型または非改変ＣＴＬＡ−４ポリペプチドに対して、ＩＣＯＳＬに対する減少した結合親和性、およびＣＤ８６に対する増加した結合親和性を有する。
【０１８８】
いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、野生型または非改変ＣＴＬＡ−４ポリペプチドに対して、ＩＣＯＳＬ、ＣＤ８０、およびＣＤ８６に対する増加した結合親和性を有する。いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、野生型または非改変ＣＴＬＡ−４ポリペプチドに対して、ＩＣＯＳＬおよびＣＤ８０に対する増加した結合親和性、ならびにＣＤ８６に対する減少した結合親和性を有する。いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、野生型または非改変ＣＴＬＡ−４ポリペプチドに対して、ＩＣＯＳＬおよびＣＤ８６に対する増加した結合親和性、ならびにＣＤ８０に対する減少した結合親和性を有する。いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、野生型または非改変ＣＴＬＡ−４ポリペプチドに対して、ＩＣＯＳＬおよびＣＤ８０に対する減少した結合親和性、ならびにＣＤ８６に対する増加した結合親和性を有する。いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、野生型または非改変ＣＴＬＡ−４ポリペプチドに対して、ＩＣＯＳＬに対する減少した結合親和性、ならびにＣＤ８０およびＣＤ８６に対する増加した結合親和性を有する。いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、野生型または非改変ＣＴＬＡ−４ポリペプチドに対して、ＩＣＯＳＬに対する増加した結合親和性、ならびにＣＤ８０およびＣＤ８６に対する減少した結合親和性を有する。いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、野生型または非改変ＣＴＬＡ−４ポリペプチドに対して、ＩＣＯＳＬ、ＣＤ８０、およびＣＤ８６に対する減少した結合親和性を有する。いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、野生型または非改変ＣＴＬＡ−４ポリペプチドに対して、ＩＣＯＳＬに対する減少した結合親和性、ならびにＣＤ８０およびＣＤ８６に対する増加した結合親和性を有する。
【０１８９】
いくつかの実施形態では、ＩＣＯＳＬ、ＣＤ８０、および／またはＣＤ８６に対して増加したか、またはより大きい結合親和性での変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、ＩＣＯＳＬ、ＣＤ８０、および／またはＣＤ８６に対して、少なくとも約１０％、１５％、２０％、２５％、３５％、または５０％など、少なくとも５％の野生型または非改変ＣＴＬＡ−４ポリペプチド対照に対する結合親和性の増加を有するであろう。いくつかの実施形態では、野生型または非改変ＣＴＬＡ−４ポリペプチドに対する結合親和性の増加は、１．２倍超、１．５倍、２倍、３倍、４倍、５倍、６倍、７倍、８倍、９倍、１０倍、２０倍、３０倍、４０倍、または５０倍である。そのような例では、野生型または非改変ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、１つ以上のアミノ酸改変（例えば、置換）を含有しないことを除いて、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドと同じ配列を有する。
【０１９０】
いくつかの実施形態では、ＩＣＳＯＬ、ＣＤ８０、および／またはＣＤ８６に対する低減または減少した結合親和性での変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、ＩＣＯＳＬ、ＣＤ８０、および／またはＣＤ８６に対して少なくとも約１０％、１５％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、９０％以上など、少なくとも５％の野生型または非改変ＣＴＬＡ−４ポリペプチド対照に対する結合親和性の減少を有するであろう。いくつかの実施形態では、野生型または非改変ＣＴＬＡ−４ポリペプチドに対する結合親和性の減少は、１．２倍、１．５倍、２倍、３倍、４倍、５倍、６倍、７倍、８倍、９倍、１０倍、２０倍、３０倍、４０倍、または５０倍超である。そのような例では、野生型または非改変ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、１つ以上のアミノ酸改変（例えば、置換）を含有しないことを除いて、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドと同じ配列を有する。
【０１９１】
いくつかの実施形態では、ＩＣＯＳＬ、ＣＤ８０、および／またはＣＤ８６に対する前述の実施形態のうちのいずれかの平衡解離定数（ＫＤ）は、１ｘ１０−５Ｍ未満、１ｘ１０−６Ｍ、１ｘ１０−７Ｍ、１ｘ１０−８Ｍ、１ｘ１０−９Ｍ、１ｘ１０−１０Ｍ、または１ｘ１０−１１Ｍ、または１ｘ１０−１２Ｍ、またはそれ以下であり得る。
【０１９２】
野生型または非改変ＣＴＬＡ−４配列は、必ずしも、本明細書に記載の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドを作成するための出発組成物として使用される必要はない。したがって、「置換」などの「改変」という用語の使用は、本発明の実施形態が、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドを作製する特定の方法に限定されることを暗示していない。変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、例えば、デノボペプチド合成によって作製することができ、よって、改変、例えば、置換のためにコードするためのコドンを変化させるという意味で、「置換」などの改変を必ずしも必要としない。この原則はまた、別様に、特定の作製方法を暗示しない、アミノ酸残基の「添加」および「欠失」という用語にまで及ぶ。変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドが設計または作成される手段は、任意の特定の方法に限定されない。しかしながら、いくつかの実施形態では、核酸をコードする野生型または非改変ＣＴＬＡ−４は、野生型または非改変ＣＴＬＡ−４遺伝子材料から変異され、所望の特異的結合親和性および／またはＩＦＮ−ガンマ発現もしくは他の機能的活性の抑制もしくは低減についてスクリーニングされる。
【０１９３】
いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、任意の数の公的に入手可能なデータベースで入手可能なタンパク質または核酸配列を利用して、デノボ合成され、続いて、スクリーニングされる。バイオテクノロジー情報のためのナショナルセンターは、そのような情報を提供しており、そのウエブサイトは、先に考察されるようなＵｎｉＰｒｏｔＫＢデータベースにあるように、インターネットを介して公的にアクセス可能である。
【０１９４】
別段記述されない限り、本開示全体を通して示されるように、アミノ酸改変は、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２に記載の非改変ＥＣＤ配列、または適用可能な場合、以下の通りのＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：５６９に記載の非改変ＥＣＤ配列の位置の番号付けに対応するアミノ酸位置番号によって指定される。
2020536552.tif 000009
【０１９５】
いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２もしくは５６９に対して提供されるアミノ酸改変、例えば、アミノ酸置換のうちのいずれか１つ以上、またはその特異的結合断片を含有する。いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：３に記載の例示的な配列など、ＩｇＶドメインまたはその特異的結合断片であるか、またはこれを含む、ポリペプチドにおいて提供されるアミノ酸改変のうちのいずれか１つ以上を含有する。
2020536552.tif 000010
【０１９６】
ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２またはＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：５６９との参照配列（例えば、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：３）のアラインメントなどによって、そのＩｇＳＦドメイン（例えば、ＩｇＶ）を含有するその一部分を含む、ＣＴＬＡ−４ポリペプチド中の改変、例えば、アミノ酸置換の対応する位置を識別することは、当業者のレベルの範囲内にある。本開示全体にわたる改変の列挙では、アミノ酸位置は、中間に示されており、対応する非改変（例えば、野生型）アミノ酸は、番号の前に列挙されており、識別された変異型アミノ酸置換は、番号の後に列挙されている。改変が、位置の欠失である場合、「ｄｅｌ」が示され、改変が、その位置での挿入である場合、「ｉｎｓ」が示される。場合によっては、挿入は、アミノ酸位置が、中間に示され、対応する非改変（例えば、野生型）アミノ酸が、番号の前後に列挙され、識別された変異型アミノ酸挿入が、非改変（例えば、野生型）アミノ酸の後に列挙されている状態で列挙されている。
【０１９７】
いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、野生型または非改変ＣＴＬＡ−４配列において、１つ以上のアミノ酸改変、例えば、置換を有する。１つ以上のアミノ酸改変、例えば、置換は、野生型または非改変ＣＴＬＡ−４配列の外部ドメイン（細胞外ドメイン）中にあり得る。いくつかの実施形態では、１つ以上のアミノ酸改変、例えば、置換は、ＩｇＶドメインまたはその特異的結合断片中にある。
【０１９８】
いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、最大１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、または２０個のアミノ酸改変、例えば、置換を有する。置換は、ＩｇＶドメインまたはＥＣＤ中にあり得る。いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、ＩｇＶドメインまたはその特異的結合断片中に、最大１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、または２０個のアミノ酸改変、例えば、置換を有する。いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、ＥＣＤまたはその特異的結合断片中に、最大１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、または２０個のアミノ酸改変、例えば、置換を有する。いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２または３のアミノ酸配列など、野生型または非改変ＣＴＬＡ−４ポリペプチドまたはその特異的結合断片と少なくとも約８５％、８６％、８６％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、または９９％の配列同一性を有する。
【０１９９】
いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、非改変ＣＴＬＡ−４またはその特異的結合断片中に、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２に記載の位置に関して、位置６、１０、１２、１４、１５、１６、１８、１９、２０、２２、２４、２６、２７、２８、２９、３０、３３、３５、３７、３８、４１、４２、４３、４５、４６、４７、４８、５３、５４、５５、５６、５８、５９、６１、６３、６４、６５、６７、６９、７１、７２、７３、７５、７６、８２、８５、８６、８７、８９、９１、９３、９５、９６、９７、９８、９９、１０５、１０６、１０８、１１０、１１３、１１５、１１６、１１７、１１８、１１９、１２０、１２１、１２２、１２４、１２５、および／または１２６に対応する１つ以上のアミノ酸改変、例えば、置換を有する。
【０２００】
いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、非改変ＣＴＬＡ−４またはその特異的結合断片中に、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２に記載の位置に関して、位置６、１０、１２、１４、１５、１６、１８、１９、２０、２２、２４、２６、２７、２８、２９、３０、３３、３５、３７、３８、４１、４２、４３、４５、４６、４７、４８、５３、５４、５５、５６、５８、５９、６１、６３、６４、６５、６７、６９、７１、７２、７３、７５、７６、８２、８５、８６、８７、８９、９１、９３、９５、９６、９７、９８、９９、１０５、１０６、１０８、１１０、１１３、１１５、１１６、１１７、１１８、１１９、１２０、１２１、および／または１２２に対応する１つ以上のアミノ酸改変、例えば、置換を有する。
【０２０１】
いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、非改変ＣＴＬＡ−４またはその特異的結合断片中に、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２に記載の位置に関して、位置１２、１８、２６、２９、３３、５３、５５、５６、５８、６３、７２、８７、９８、９９、１０５、１０６、および／または１１７に対応する１つ以上のアミノ酸改変、例えば、置換を有する。
【０２０２】
いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、非改変ＣＴＬＡ−４またはその特異的結合断片中に、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２に記載の位置に関して、位置１２、１８、２６、２９、５６、６３、７２、９８、９９、１０５、１０６、および／または１１７に対応する１つ以上のアミノ酸改変、例えば、置換を有する。
【０２０３】
いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２に記載の位置に関して、Ａ６Ｔ、Ｖ１０Ａ、Ｌ１２Ｆ、Ｌ１２Ｈ、Ｌ１２Ｉ、Ｌ１２Ｐ、Ｓ１４Ｎ、Ｓ１５Ｐ、Ｒ１６Ｃ、Ｒ１６Ｇ、Ｒ１６Ｈ、Ｉ１８Ａ、Ｉ１８Ｆ、Ｉ１８Ｎ、Ｉ１８Ｔ、Ｉ１８Ｖ、Ａ１９Ｖ、Ｓ２０Ｎ、Ｖ２２Ａ、Ｖ２２Ｉ、Ｅ２４Ｑ、Ａ２６Ｄ、Ａ２６Ｓ、Ａ２６Ｔ、Ｓ２７Ｐ、Ｐ２８Ｌ、Ｇ２９Ｒ、Ｇ２９Ｗ、Ｋ３０Ｒ、Ｅ３３Ｍ、Ｅ３３Ｖ、Ｒ３５Ｋ、Ｔ３７Ｓ、Ｖ３８Ｉ、Ｑ４１Ｌ、Ａ４２Ｓ、Ａ４２Ｔ、Ａ４２Ｖ、Ｄ４３Ｎ、Ｑ４５Ｈ、Ｖ４６Ｅ、Ｔ４７Ａ、Ｅ４８Ｒ、Ｔ５３Ｓ、Ｙ５４Ｆ、Ｍ５５Ｒ、Ｍ５５Ｔ、Ｍ５５Ｖ、Ｍ５６Ｋ、Ｍ５６Ｌ、Ｍ５６Ｒ、Ｍ５６Ｔ、Ｍ５６Ｖ、Ｎ５８Ｄ、Ｎ５８Ｓ、Ｅ５９Ｄ、Ｅ５９Ｇ、Ｔ６１Ａ、Ｔ６１Ｉ、Ｔ６１Ｎ、Ｔ６１Ｒ、Ｔ６１Ｓ、Ｌ６３Ｈ、Ｌ６３Ｐ、Ｄ６４Ｅ、Ｄ６４Ｎ、Ｄ６４Ｖ、Ｄ６５Ｇ、Ｉ６７Ｎ、Ｉ６７Ｔ、Ｉ６７Ｖ、Ｔ６９Ａ、Ｔ６９Ｉ、Ｔ６９Ｓ、Ｔ７１Ａ、Ｔ７１Ｉ、Ｓ７２Ｇ、Ｓ７２Ｔ、Ｓ７３Ｒ、Ｎ７５Ｄ、Ｑ７６Ｒ、Ｑ８２Ｈ、Ｑ８２Ｒ、Ｒ８５Ｇ、Ａ８６Ｔ、Ｍ８７Ａ、Ｍ８７Ｋ、Ｍ８７Ｔ、Ｍ８７Ｖ、Ｔ８９Ａ、Ｔ８９Ｍ、Ｔ８９Ｓ、Ｌ９１Ｒ、Ｉ９３Ｌ、Ｉ９３Ｖ、Ｋ９５Ｒ、Ｖ９６Ｉ、Ｅ９７Ｑ、Ｌ９８Ｑ、Ｌ９８Ｒ、Ｍ９９Ｉ、Ｍ９９Ｌ、Ｐ１０２Ｌ、Ｙ１０５Ｆ、Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１０６Ｉ、Ｌ１０６Ｎ、Ｌ１０６Ｒ、Ｌ１０６Ｖ、Ｉ１０８Ｆ、Ｉ１０８Ｖ、Ｎ１１０Ｋ、Ｎ１１０Ｓ、Ｎ１１０Ｙ、Ｑ１１３Ｈ、Ｙ１１５Ｈ、Ｙ１１５Ｎ、Ｖ１１６Ａ、Ｉ１１７Ｅ、Ｉ１１７Ｋ、Ｉ１１７Ｌ、Ｉ１１７Ｍ、Ｉ１１７Ｔ、Ｐ１１９Ｈ、Ｅ１２０Ｄ、Ｐ１２１Ｓ、Ｃ１２２Ｐ、Ｄ１２４Ｐ、Ｄ１２４Ｉ、Ｓ１２５Ｉ、Ｓ１２５Ｐ、Ｄ１２６Ｐ、および／もしくはＤ１２６Ｔ、またはそれらの保存的アミノ酸置換から選択される１つ以上のアミノ酸改変を有する。
【０２０４】
いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２に記載の位置に関して、Ａ６Ｔ、Ｖ１０Ａ、Ｌ１２Ｆ、Ｌ１２Ｈ、Ｌ１２Ｐ、Ｓ１４Ｎ、Ｓ１５Ｐ、Ｒ１６Ｃ、Ｒ１６Ｇ、Ｒ１６Ｈ、Ｉ１８Ａ、Ｉ１８Ｆ、Ｉ１８Ｎ、Ｉ１８Ｔ、Ｉ１８Ｖ、Ａ１９Ｖ、Ｓ２０Ｎ、Ｖ２２Ａ、Ｖ２２Ｉ、Ｅ２４Ｑ、Ａ２６Ｄ、Ａ２６Ｓ、Ａ２６Ｔ、Ｓ２７Ｐ、Ｐ２８Ｌ、Ｇ２９Ｒ、Ｇ２９Ｗ、Ｋ３０Ｒ、Ｅ３３Ｍ、Ｅ３３Ｖ、Ｒ３５Ｋ、Ｔ３７Ｓ、Ｖ３８Ｉ、Ｑ４１Ｌ、Ａ４２Ｓ、Ａ４２Ｔ、Ａ４２Ｖ、Ｄ４３Ｎ、Ｑ４５Ｈ、Ｖ４６Ｅ、Ｔ４７Ａ、Ｅ４８Ｒ、Ｔ５３Ｓ、Ｙ５４Ｆ、Ｍ５５Ｒ、Ｍ５５Ｔ、Ｍ５５Ｖ、Ｍ５６Ｋ、Ｍ５６Ｌ、Ｍ５６Ｒ、Ｍ５６Ｔ、Ｍ５６Ｖ、Ｎ５８Ｄ、Ｎ５８Ｓ、Ｅ５９Ｄ、Ｅ５９Ｇ、Ｔ６１Ａ、Ｔ６１Ｉ、Ｔ６１Ｎ、Ｔ６１Ｒ、Ｔ６１Ｓ、Ｌ６３Ｈ、Ｌ６３Ｐ、Ｄ６４Ｅ、Ｄ６４Ｎ、Ｄ６４Ｖ、Ｄ６５Ｇ、Ｉ６７Ｎ、Ｉ６７Ｔ、Ｉ６７Ｖ、Ｔ６９Ａ、Ｔ６９Ｉ、Ｔ６９Ｓ、Ｔ７１Ａ、Ｔ７１Ｉ、Ｓ７２Ｇ、Ｓ７２Ｔ、Ｓ７３Ｒ、Ｎ７５Ｄ、Ｑ７６Ｒ、Ｑ８２Ｈ、Ｑ８２Ｒ、Ｒ８５Ｇ、Ａ８６Ｔ、Ｍ８７Ａ、Ｍ８７Ｋ、Ｍ８７Ｔ、Ｍ８７Ｖ、Ｔ８９Ａ、Ｔ８９Ｍ、Ｔ８９Ｓ、Ｌ９１Ｒ、Ｉ９３Ｌ、Ｉ９３Ｖ、Ｋ９５Ｒ、Ｖ９６Ｉ、Ｅ９７Ｑ、Ｌ９８Ｑ、Ｌ９８Ｒ、Ｍ９９Ｉ、Ｍ９９Ｌ、Ｙ１０５Ｆ、Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１０６Ｉ、Ｌ１０６Ｒ、Ｉ１０８Ｆ、Ｉ１０８Ｖ、Ｎ１１０Ｋ、Ｎ１１０Ｓ、Ｎ１１０Ｙ、Ｙ１１５Ｎ、Ｖ１１６Ａ、Ｉ１１７Ｅ、Ｉ１１７Ｌ、Ｉ１１７Ｍ、および／もしくはＩ１１７Ｔ、またはそれらの保存的アミノ酸置換から選択される１つ以上のアミノ酸改変を有する。
【０２０５】
いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２に記載の位置に関して、Ｌ１２Ｆ、Ｌ１２Ｈ、Ｌ１２Ｉ、Ｌ１２Ｐ、Ｉ１８Ａ、Ｉ１８Ｆ、Ｉ１８Ｎ、Ｉ１８Ｔ、Ｉ１８Ｖ、Ａ２６Ｄ、Ａ２６Ｓ、Ａ２６Ｔ、Ｇ２９Ｒ、Ｇ２９Ｗ、Ｅ３３Ｍ、Ｅ３３Ｖ、Ｔ５３Ｓ、Ｍ５５Ｒ、Ｍ５５Ｔ、Ｍ５５Ｖ、Ｍ５６Ｋ、Ｍ５６Ｌ、Ｍ５６Ｒ、Ｍ５６Ｔ、Ｍ５６Ｖ、Ｎ５８Ｄ、Ｎ５８Ｓ、Ｌ６３Ｈ、Ｌ６３Ｐ、Ｓ７２Ｇ、Ｓ７２Ｔ、Ｍ８７Ａ、Ｍ８７Ｋ、Ｍ８７Ｔ、Ｍ８７Ｖ、Ｌ９８Ｑ、Ｌ９８Ｒ、Ｍ９９Ｉ、Ｍ９９Ｌ、Ｙ１０５Ｆ、Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１０６Ｉ、Ｌ１０６Ｎ、Ｌ１０６Ｒ、Ｌ１０６Ｖ、Ｉ１１７Ｅ、Ｉ１１７Ｋ、Ｉ１１７Ｌ、Ｉ１１７Ｍ、および／もしくはＩ１１７Ｔ、またはそれらの保存的アミノ酸置換から選択される１つ以上のアミノ酸改変を有する。いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２に記載の位置に関して、Ｉ１２Ｆ、Ｌ１２Ｐ、Ｉ１８Ｔ、Ａ２６Ｔ、Ｇ２９Ｗ、Ｔ５３Ｓ、Ｍ５５Ｔ、Ｍ５６Ｋ、Ｍ５６Ｔ、Ｎ５８Ｓ、Ｓ７２Ｇ、Ｍ９９Ｌ、Ｌ６３Ｐ、Ｌ９８Ｑ、Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１０６Ｉ、および／もしくはＩ１１７Ｌ、またはそれらの保存的アミノ酸置換から選択される１つ以上のアミノ酸改変を有する。いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２に記載の位置に関して、Ｌ１２Ｐ、Ｉ１８Ｔ、Ａ２６Ｔ、Ｇ２９Ｗ、Ｔ５３Ｓ、Ｍ５５Ｔ、Ｍ５６Ｋ、Ｎ５８Ｓ、Ｓ７２Ｇ、Ｍ９９Ｌ、Ｌ６３Ｐ、Ｌ９８Ｑ、Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１０６Ｉ、および／もしくはＩ１１７Ｌ、またはそれらの保存的アミノ酸置換から選択される１つ以上のアミノ酸改変を有する。いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２に記載の位置に関して、Ａ２６Ｔ、Ｇ２９Ｗ、Ｌ６３Ｐ、Ｓ７２Ｇ、Ｌ９８Ｑ、Ｍ９９Ｌ、Ｙ１０５Ｌ、および／もしくはＬ１０６Ｉ、またはそれらの保存的アミノ酸置換から選択される１つ以上のアミノ酸改変を有する。
【０２０６】
保存的アミノ酸置換は、野生型または非改変アミノ酸以外の置換アミノ酸として、同じクラスのアミノ酸に概要する任意のアミノ酸である。アミノ酸のクラスは、脂肪族（グリシン、アラニン、バリン、ロイシン、およびイソロイシン）、ヒドロキシルまたは硫黄含有（セリン、システイン、トレオニン、およびメチオニン）、環化（プロリン）、芳香族（フェニルアラニン、チロシン、トリプトファン）、塩基性（ヒスチジン、リジン、およびアルギニン）、ならびに酸性／アミド（アスパラギン酸、グルタミン酸、アスパラギン、およびグルタミン）である。
【０２０７】
いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、Ａ２６Ｔに対応する非改変もしくは野生型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドまたはその特異的結合断片中にアミノ酸置換を含む。いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、１つ以上のアミノ酸置換Ｇ２９Ｗ、Ｔ５３Ｓ、Ｌ６３Ｐ、Ｓ７２Ｇ、Ｌ９８Ｑ、Ｍ９９Ｌ、Ｙ１０５Ｌ、および／またはＬ１０６Ｉをさらに含有する。いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、アミノ酸置換Ａ２６Ｔ／Ｇ２９Ｗ、Ａ２６Ｔ／Ｔ５３Ｓ、Ａ２６Ｔ／Ｌ６３Ｐ、Ａ２６Ｔ／Ｓ７２Ｇ、Ａ２６Ｔ／Ｌ９８Ｑ、Ａ２６Ｔ／Ｍ９９Ｌ、Ａ２６Ｔ／Ｙ１０５Ｌ、Ａ２６Ｔ／Ｌ１０６Ｉを含有する。変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、提供される実施形態と一致して、本明細書に記載されるいずれかなど、アミノ酸改変（例えば、置換）をさらに含み得る。表２は、記載されているような、例示的なアミノ酸改変（例えば、置換）および変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドを記載する。
【０２０８】
いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、Ｇ２９Ｗに対応する非改変もしくは野生型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドまたはその特異的結合断片中にアミノ酸置換を含む。いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、１つ以上のアミノ酸置換Ａ２６Ｔ、Ｔ５３Ｓ、Ｌ６３Ｐ、Ｓ７２Ｇ、Ｌ９８Ｑ、Ｍ９９Ｌ、Ｙ１０５Ｌ、および／またはＬ１０６Ｉをさらに含有する。いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、アミノ酸置換Ａ２６Ｔ／Ｇ２９Ｗ、Ｇ２９Ｗ／Ｔ５３Ｓ、Ｇ２９Ｗ／Ｌ６３Ｐ、Ｇ２９Ｗ／Ｓ７２Ｇ、Ｇ２９Ｗ／Ｌ９８Ｑ、Ｇ２９Ｗ／Ｍ９９Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｙ１０５Ｌ、またはＧ２９Ｗ／Ｌ１０６Ｉを画乳する。変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、提供される実施形態によると、本明細書に記載されるいずれかなど、アミノ酸改変（例えば、置換）をさらに含み得る。表２は、記載されているような、例示的なアミノ酸改変（例えば、置換）および変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドを記載する。
【０２０９】
いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、Ｔ５３Ｓ．に対応する非改変もしくは野生型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドまたはその特異的結合断片中にアミノ酸置換を含む。いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、１つ以上のアミノ酸置換Ａ２６Ｔ、Ｇ２９Ｗ、Ｌ６３Ｐ、Ｓ７２Ｇ、Ｌ９８Ｑ、Ｍ９９Ｌ、Ｙ１０５Ｌ、および／またはＬ１０６Ｉをさらに含有する。いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、アミノ酸置換Ａ２６Ｔ／Ｔ５３Ｓ、Ｇ２９Ｗ／Ｔ５３Ｓ、Ｔ５３Ｓ／Ｌ６３Ｐ、Ｔ５３Ｓ／Ｓ７２Ｇ、Ｔ５３Ｓ／Ｌ９８Ｑ、Ｔ５３Ｓ／Ｍ９９Ｌ、Ｔ５３Ｓ／Ｙ１０５Ｌ、またはＴ５３Ｓ／Ｌ１０６Ｉを含有する。変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、提供される実施形態によると、本明細書に記載されるいずれかなど、アミノ酸改変（例えば、置換）をさらに含み得る。表２は、記載されているような、例示的なアミノ酸改変（例えば、置換）および変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドを記載する。
【０２１０】
いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、Ｌ６３Ｐに対応する非改変もしくは野生型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドまたはその特異的結合断片中にアミノ酸置換を含む。いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、１つ以上のアミノ酸置換Ａ２６Ｔ、Ｇ２９Ｗ、Ｔ５３Ｓ、Ｓ７２Ｇ、Ｌ９８Ｑ、Ｍ９９Ｌ、Ｙ１０５Ｌ、および／またはＬ１０６Ｉをさらに含有する。いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、アミノ酸置換Ａ２６Ｔ／Ｌ６３Ｐ、Ｇ２９Ｗ／Ｌ６３Ｐ、Ｔ５３Ｓ／Ｌ６３Ｐ、Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ、Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ、Ｌ６３Ｐ／Ｍ９９Ｌ、Ｌ６３Ｐ／Ｙ１０５Ｌ、またはＬ６３Ｐ／Ｌ１０６Ｉを含有する。変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、提供される実施形態と一致して、本明細書に記載されるいずれかなど、アミノ酸改変（例えば、置換）をさらに含み得る。表２は、記載されているような、例示的なアミノ酸改変（例えば、置換）および変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドを記載する。
【０２１１】
いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、Ｓ７２Ｇに対応する非改変もしくは野生型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドまたはその特異的結合断片中にアミノ酸置換を含む。いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、１つ以上のアミノ酸置換Ａ２６Ｔ、Ｇ２９Ｗ、Ｔ５３Ｓ、Ｌ６３Ｐ、Ｌ９８Ｑ、Ｍ９９Ｌ、Ｙ１０５Ｌ、および／またはＬ１０６Ｉをさらに含有する。いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、アミノ酸置換Ａ２６Ｔ／Ｓ７２Ｇ、Ｇ２９Ｗ／Ｓ７２Ｇ、Ｔ５３Ｓ／Ｓ７２Ｇ、Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ、Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ、Ｓ７２Ｇ／Ｍ９９Ｌ、Ｓ７２Ｇ／Ｙ１０５Ｌ、またはＳ７２Ｇ／Ｌ１０６Ｉを含有する。変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、提供される実施形態と一致して、本明細書に記載されるいずれかなど、アミノ酸改変（例えば、置換）をさらに含み得る。表２は、記載されているような、例示的なアミノ酸改変（例えば、置換）および変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドを記載する。
【０２１２】
いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、Ｌ９８Ｑに対応する非改変もしくは野生型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドまたはその特異的結合断片中にアミノ酸置換を含む。いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、１つ以上のアミノ酸置換Ａ２６Ｔ、Ｇ２９Ｗ、Ｔ５３Ｓ、Ｌ６３Ｐ、Ｓ７２Ｇ、Ｍ９９Ｌ、Ｙ１０５Ｌ、および／またはＬ１０６Ｉをさらに含有する。いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、アミノ酸置換Ａ２６Ｔ／Ｌ９８Ｑ、Ｇ２９Ｗ／Ｌ９８Ｑ、Ｔ５３Ｓ／Ｌ９８Ｑ、Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ、Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ、Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ、Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、またはＬ９８Ｑ／Ｌ１０６Ｉを含有する。変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、提供される実施形態と一致して、本明細書に記載されるいずれかなど、アミノ酸改変（例えば、置換）をさらに含み得る。表２は、記載されているような、例示的なアミノ酸改変（例えば、置換）および変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドを記載する。
【０２１３】
いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、Ｍ９９Ｌに対応する非改変もしくは野生型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドまたはその特異的結合断片中にアミノ酸置換を含む。いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、１つ以上のアミノ酸置換Ａ２６Ｔ、Ｇ２９Ｗ、Ｔ５３Ｓ、Ｌ６３Ｐ、Ｓ７２Ｇ、Ｌ９８Ｑ、Ｙ１０５Ｌ、および／またはＬ１０６Ｉをさらに含有する。いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、アミノ酸置換Ａ２６Ｔ／Ｍ９９Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｍ９９Ｌ、Ｔ５３Ｓ／Ｍ９９Ｌ、Ｌ６３Ｐ／Ｍ９９Ｌ、Ｓ７２Ｇ／Ｍ９９Ｌ、Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ、Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、またはＭ９９Ｌ／Ｌ１０６Ｉを含有する。変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、提供される実施形態と一致して、本明細書に記載されるいずれかなど、アミノ酸改変（例えば、置換）をさらに含み得る。表２は、記載されているような、例示的なアミノ酸改変（例えば、置換）および変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドを記載する。
【０２１４】
いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、Ｙ１０５Ｌに対応する非改変もしくは野生型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドまたはその特異的結合断片中にアミノ酸置換を含む。いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、１つ以上のアミノ酸置換Ａ２６Ｔ、Ｇ２９Ｗ、Ｔ５３Ｓ、Ｌ６３Ｐ、Ｓ７２Ｇ、Ｌ９８Ｑ、Ｍ９９Ｌ、および／またはＬ１０６Ｉをさらに含有する。いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、アミノ酸置換Ａ２６Ｔ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｙ１０５Ｌ、Ｔ５３Ｓ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ６３Ｐ／Ｙ１０５Ｌ、Ｓ７２Ｇ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、またはＹ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉを含有する。変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、提供される実施形態と一致して、本明細書に記載されるいずれかなど、アミノ酸改変（例えば、置換）をさらに含み得る。表２は、記載されているような、例示的なアミノ酸改変（例えば、置換）および変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドを記載する。
【０２１５】
いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、Ｌ１０６Ｉに対応する非改変もしくは野生型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドまたはその特異的結合断片中にアミノ酸置換を含む。いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、１つ以上のアミノ酸置換Ａ２６Ｔ、Ｇ２９Ｗ、Ｔ５３Ｓ、Ｌ６３Ｐ、Ｓ７２Ｇ、Ｌ９８Ｑ、Ｍ９９Ｌ、および／またはＹ１０５Ｌをさらに含有する。いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、アミノ酸置換Ａ２６Ｔ／Ｌ１０６Ｉ、Ｇ２９Ｗ／Ｌ１０６Ｉ、Ｔ５３Ｓ／Ｌ１０６Ｉ、Ｌ６３Ｐ／Ｌ１０６Ｉ、Ｓ７２Ｇ／Ｌ１０６Ｉ、Ｌ９８Ｑ／Ｌ１０６Ｉ、Ｍ９９Ｌ／Ｌ１０６Ｉ、またはＹ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉを含有する。変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、提供される実施形態と一致して、本明細書に記載されるいずれかなど、アミノ酸改変（例えば、置換）をさらに含み得る。表２は、記載されているような、例示的なアミノ酸改変（例えば、置換）および変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドを記載する。
【０２１６】
いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４は、アミノ酸置換Ｅ３３Ｖ／Ｍ９９Ｌを含有する。変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、提供される実施形態と一致して、本明細書に記載されるいずれかなど、アミノ酸改変（例えば、置換）をさらに含み得る。表２は、記載されているような、例示的なアミノ酸改変（例えば、置換）および変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドを記載する。
【０２１７】
いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、少なくとも３つのアミノ酸改変（例えば、置換）を含み、非改変もしくは野生型ＣＴＬＡ−４またはその特異的結合断片中の少なくとも３つの改変（例えば、置換）は、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２に記載の位置に関して、Ａ２６Ｔ、Ｇ２９Ｗ、Ｔ５３Ｓ、Ｌ６３Ｐ、Ｓ７２Ｇ、Ｌ９８Ｑ、Ｍ９９Ｌ、Ｙ１０５Ｌ、および／もしくはＬ１０６Ｉ、またはそれらの保存的アミノ酸置換に対応する。
【０２１８】
いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、非改変もしくは野生型ＣＴＬＡ−４またはその特異的結合断片中に、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２に記載の位置に関して、Ｇ２９Ｗ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌに対応するアミノ酸置換を含む。
【０２１９】
いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、非改変もしくは野生型ＣＴＬＡ−４またはその特異的結合断片中に、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２に記載の位置に関して、Ｇ２９Ｗ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｑ８２Ｒ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌに対応するアミノ酸置換を含む。
【０２２０】
いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、非改変もしくは野生型ＣＴＬＡ−４またはその特異的結合断片中に、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２に記載の位置に関して、Ｌ１２Ｆ／Ｒ１６Ｈ／Ｇ２９Ｗ／Ｍ５６Ｔ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌに対応するアミノ酸置換を含む。
【０２２１】
変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドが、非改変ＣＴＬＡ−４またはその特異的結合断片中に単一のアミノ酸置換を有する、いくつかの実施形態では、改変は、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２に記載の位置に関して、２７、３１、３２、３３、３５、９５、９８、１０５、１０６、または１０７に対応しない。変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドが、非改変ＣＴＬＡ−４またはその特異的結合断片中に単一のアミノ酸置換を有する、いくつかの実施形態では、改変は、Ｌ１０６Ｅではない。変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドが、非改変ＣＴＬＡ−４またはその特異的結合断片中にちょうど２つのアミノ酸置換を有する、いくつかの実施形態では、改変は、Ａ３１ＹおよびＬ１０６Ｅ（すなわち、Ａ３１Ｙ／Ｌ１０６Ｅ）ではない。
【０２２２】
いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４は、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２に記載の番号付けに関して、Ａ２６Ｅ、Ｔ３２Ｎ、Ｖ３４Ｉ、Ａ５２Ｍ、Ｇ５７Ｅ、Ｉ６７Ｆ、Ｓ６６Ｐ、および／またはＳ７２Ｆに対応する改変を含有しない。変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドが、非改変ＣＴＬＡ−４またはその特異的結合断片中に７つのアミノ酸置換を有する、いくつかの実施形態では、改変は、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２に記載の番号付けに関して、Ｔ３２Ｎ、Ｖ３４Ｉ、Ａ５２Ｍ、Ｍ５６Ｋ、Ｇ５７Ｅ、Ｓ６６Ｐ、およびＳ７２Ｆに対応する改変ではない。変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドが、非改変ＣＴＬＡ−４またはその特異的結合断片中に１０個のアミノ酸置換を有する、いくつかの実施形態では、改変は、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２に記載の番号付けに関して、Ａ２６Ｅ、Ｔ３２Ｎ、Ｖ３４Ｉ、Ａ５２Ｍ、Ｍ５６Ｋ、Ｎ５８Ｄ、Ｓ６６Ｐ、Ｉ６７Ｓ、Ｓ７２Ｆ、およびＬ１０６Ｅに対応する改変ではない。
【０２２３】
いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２に記載の番号付けに関して、Ａ６Ｔ、Ｖ１０Ａ、Ｌ１２Ｆ、Ｌ１２Ｈ、Ｌ１２Ｐ、Ｓ１４Ｎ、Ｓ１５Ｐ、Ｒ１６Ｃ、Ｒ１６Ｇ、Ｒ１６Ｈ、Ｉ１８Ａ、Ｉ１８Ｆ、Ｉ１８Ｎ、Ｉ１８Ｔ、Ｉ１８Ｖ、Ａ１９Ｖ、Ｓ２０Ｎ、Ｖ２２Ａ、Ｖ２２Ｉ、Ｅ２４Ｑ、Ａ２６Ｄ、Ａ２６Ｓ、Ａ２６Ｔ、Ｓ２７Ｐ、Ｐ２８Ｌ、Ｇ２９Ｒ、Ｇ２９Ｗ、Ｋ３０Ｒ、Ｅ３３Ｍ、Ｅ３３Ｖ、Ｒ３５Ｋ、Ｔ３７Ｓ、Ｖ３８Ｉ、Ｑ４１Ｌ、Ａ４２Ｓ、Ａ４２Ｔ、Ａ４２Ｖ、Ｄ４３Ｎ、Ｑ４５Ｈ、Ｖ４６Ｅ、Ｔ４７Ａ、Ｅ４８Ｒ、Ｔ５３Ｓ、Ｙ５４Ｆ、Ｍ５５Ｒ、Ｍ５５Ｔ、Ｍ５５Ｖ、Ｍ５６Ｋ、Ｍ５６Ｌ、Ｍ５６Ｒ、Ｍ５６Ｔ、Ｍ５６Ｖ、Ｎ５８Ｄ、Ｎ５８Ｓ、Ｅ５９Ｄ、Ｅ５９Ｇ、Ｔ６１Ａ、Ｔ６１Ｉ、Ｔ６１Ｎ、Ｔ６１Ｒ、Ｔ６１Ｓ、Ｌ６３Ｈ、Ｌ６３Ｐ、Ｄ６４Ｅ、Ｄ６４Ｎ、Ｄ６４Ｖ、Ｄ６５Ｇ、Ｉ６７Ｎ、Ｉ６７Ｔ、Ｉ６７Ｖ、Ｔ６９Ａ、Ｔ６９Ｉ、Ｔ６９Ｓ、Ｔ７１Ａ、Ｔ７１Ｉ、Ｓ７２Ｇ、Ｓ７２Ｔ、Ｓ７３Ｒ、Ｎ７５Ｄ、Ｑ７６Ｒ、Ｑ８２Ｈ、Ｑ８２Ｒ、Ｒ８５Ｇ、Ａ８６Ｔ、Ｍ８７Ａ、Ｍ８７Ｋ、Ｍ８７Ｔ、Ｍ８７Ｖ、Ｔ８９Ａ、Ｔ８９Ｍ、Ｔ８９Ｓ、Ｌ９１Ｒ、Ｉ９３Ｌ、Ｉ９３Ｖ、Ｋ９５Ｒ、Ｖ９６Ｉ、Ｅ９７Ｑ、Ｌ９８Ｑ、Ｌ９８Ｒ、Ｍ９９Ｉ、Ｍ９９Ｌ、Ｙ１０５Ｆ、Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１０６Ｉ、Ｌ１０６Ｒ、Ｉ１０８Ｆ、Ｉ１０８Ｖ、Ｎ１１０Ｋ、Ｎ１１０Ｓ、Ｎ１１０Ｙ、Ｙ１１５Ｎ、Ｖ１１６Ａ、Ｉ１１７Ｅ、Ｉ１１７Ｌ、Ｉ１１７Ｍ、およびＩ１１７Ｔの中から選択される２つ以上のアミノ酸改変を有する。いくつかの実施形態では、２つ以上のアミノ酸改変は、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２に記載の番号付けに関して、Ａ６Ｔ／Ａ２６Ｔ／Ｍ５５Ｔ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｖ１０Ａ／Ｇ２９Ｗ／Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｐ１２１Ｓ、Ｖ１０Ａ／Ｌ６３Ｐ／Ｄ６４Ｖ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｖ１０Ａ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１２Ｆ／Ｒ１６Ｈ／Ｇ２９Ｗ／Ｍ５６Ｔ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１２Ｆ／Ａ２６Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｒ、Ｌ１２Ｆ／Ｋ３０Ｒ／Ｓ７２Ｇ／Ｑ８２Ｒ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１２Ｈ／Ｉ１８Ｖ／Ａ４２Ｔ／Ｍ５５Ｔ／Ｎ５８Ｄ／Ｌ９８Ｒ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ／Ｐ１２１Ｓ、Ｌ１２Ｈ／Ｅ３３Ｍ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１２Ｈ／Ｍ５５Ｔ／Ｅ５９Ｄ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ９９Ｌ、Ｌ１２Ｈ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１２Ｉ／Ｍ５５Ｔ／Ｍ５６Ｖ／Ｉ６７Ｔ／Ｍ９９Ｌ／Ｌ１０６Ｒ／Ｉ１０８Ｆ、Ｌ１２Ｐ／Ｒ１６Ｈ／Ａ２６Ｔ／Ｔ６１Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ／Ｉ１１７Ｌ、Ｌ１２Ｐ／Ｉ１８Ｔ／Ａ２６Ｔ／Ｍ５５Ｔ／Ｔ６９Ｓ／Ｓ７２Ｇ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１２Ｐ／Ａ２６Ｔ、Ｌ１２Ｐ／Ａ２６Ｔ／Ｌ６３Ｐ、Ｌ１２Ｐ／Ａ２６Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｔ８９Ｍ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１２Ｐ／Ｇ２９Ｗ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１２Ｐ／Ｇ２９Ｗ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ、Ｌ１２Ｐ／Ａ２６Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ���Ｌ１２Ｐ／Ａ２６Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１２Ｐ／Ａ２６Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ、Ｌ１２Ｐ／Ｇ２９Ｗ／Ｄ４３Ｎ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１２Ｐ／Ｍ５６Ｖ／Ｌ６３Ｐ／Ｖ９６Ｉ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｙ１１５Ｈ、Ｌ１２Ｐ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１２Ｐ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｎ、Ｌ１２Ｐ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｎ／Ｉ１１７Ｌ、Ｓ１４Ｎ／Ｒ１６Ｃ／Ｉ１８Ｔ／Ｍ５６Ｋ／Ｔ６１Ａ／Ｌ６３Ｐ／Ａ８６Ｔ／Ｍ９９Ｌ、Ｓ１５Ｐ／Ｉ１８Ｖ／Ｍ５６Ｔ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｒ１６Ｃ／Ｇ２９Ｗ／Ｅ３３Ｖ／Ｍ５５Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｉ１８Ａ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｉ１８Ｆ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｐ１２１Ｓ、Ｉ１８Ｎ／Ａ２６Ｔ／Ｌ６３Ｈ／Ｔ８９Ａ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｉ１８Ｎ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｔ／Ｍ８７Ｔ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｎ１１０Ｓ、Ｉ１８Ｔ／Ａ２６Ｓ／Ｍ５５Ｔ／Ｍ５６Ｖ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｉ１１７Ｋ、Ｉ１８Ｔ／Ａ２６Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｉ１８Ｔ／Ａ２６Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｑ８２Ｒ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｉ１８Ｔ／Ｇ２９Ｒ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｉ１８Ｔ／Ｇ２９Ｗ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｉ１８Ｔ／Ｅ４８Ｒ／Ｌ６３Ｐ／Ｔ６９Ｓ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｎ１１０Ｙ、Ｉ１８Ｔ／Ｔ６１Ｒ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｉ１８Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｍ８７Ｋ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｉ１８Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｉ１８Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｉ１０８Ｖ、Ｉ１８Ｖ／Ａ２６Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｄ６４Ｅ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｒ／Ｎ１１０Ｋ、Ｉ１８Ｖ／Ｇ２９Ｗ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ａ１９Ｖ／Ｇ２９Ｗ／Ｒ３５Ｋ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｓ２０Ｎ／Ａ２６Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｖ２２Ａ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｐ１１９Ｈ、Ｖ２２Ｉ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｉ１１７Ｍ、Ｅ２４Ｑ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ａ２６Ｄ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ａ２６Ｔ／Ａ４２Ｖ／Ｑ４５Ｈ／Ｉ６７Ｎ／Ｍ８７Ｋ／Ｅ９７Ｑ／Ｍ９９Ｌ、Ａ２６Ｔ／Ｖ４６Ｅ／Ｌ６３Ｐ／Ｄ６５Ｇ／Ｌ９８Ｑ、Ａ２６Ｔ／Ｔ４７Ａ／Ｍ５６Ｋ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｑ８２Ｒ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ａ２６Ｔ／Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ａ２６Ｔ／Ｔ５３Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ／Ｉ１１７Ｌ、Ａ２６Ｔ／Ｙ５４Ｆ／Ｍ５６Ｋ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ａ２６Ｔ／Ｍ５５Ｒ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ａ２６Ｔ／Ｍ５５Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ａ２６Ｔ／Ｍ���５Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ａ２６Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｄ６５Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ａ２６Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｎ１１０Ｋ／Ｉ１１７Ｅ、Ａ２６Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ａ２６Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ／Ｉ１１７Ｌ、Ａ２６Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ａ２６Ｔ／Ｉ６７Ｎ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｓ２７Ｐ／Ｍ５６Ｋ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｓ７３Ｒ／Ｔ８９Ａ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｉ１１７Ｍ、Ｐ２８Ｌ／Ｅ３３Ｖ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｐ２８Ｌ／Ｅ３３Ｖ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｒ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｉ１０８Ｖ、Ｇ２９Ｗ／Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｐ１２１Ｓ、Ｇ２９Ｗ／Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｔ６１Ｎ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｌ６３Ｐ／Ｑ８２Ｈ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｉ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｔ５３Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｍ５５Ｖ／Ｅ５９Ｇ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｍ５６Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ／Ｉ１１７Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｎ５８Ｄ／Ｉ６７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｄ６４Ｎ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｔ６９Ｉ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ、Ｇ２９Ｗ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｖ、Ｇ２９Ｗ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｑ８２Ｒ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｔ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｅ５９Ｇ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｔ６１Ｉ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｌ６３Ｐ／Ｄ６５Ｇ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｌ６３Ｐ／Ｉ６７Ｖ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ、Ｇ２９Ｗ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ／Ｉ１１７Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｉ１１７Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｐ１２１Ｓ，Ｇ２９Ｗ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｓ７２Ｇ／Ｑ７６Ｒ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ／Ｑ１１３Ｈ、Ｇ２９Ｗ／Ｍ８７Ｋ／Ｔ８９Ｓ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｉ１０８���／Ｉ１１７Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｍ８７Ｋ／Ｉ９３Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｅ３３Ｍ／Ａ４２Ｔ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｅ３３Ｍ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｅ３３Ｍ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｉ１０８Ｆ、Ｅ３３Ｍ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｉ１１７Ｌ、Ｅ３３Ｍ／Ｑ８２Ｈ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｅ３３Ｖ／Ａ４２Ｓ／Ｍ５５Ｔ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｔ３７Ｓ／Ｍ５６Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｖ３８Ｉ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｑ４１Ｌ／Ｙ５４Ｆ／Ｍ５６Ｋ／Ｍ９９Ｌ／Ｉ１０８Ｆ、Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｍ５５Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｔ７１Ｉ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｍ５５Ｔ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｍ５５Ｔ／Ｅ９７Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｆ、Ｍ５６Ｋ／Ｌ６３Ｐ／Ｎ７５Ｄ／Ｖ９６Ｉ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ、Ｍ５６Ｌ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ／Ｉ１１７Ｌ、Ｍ５６Ｒ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｍ５６Ｔ／Ｌ９１Ｒ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｍ５６Ｖ／Ｅ５９Ｇ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｍ８７Ｋ／Ｉ９３Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｉ１１７Ｅ、Ｔ６１Ａ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ６３Ｐ／Ｔ６９Ａ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｒ／Ｖ１１６Ａ、Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｍ８７Ａ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｉ９３Ｌ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ／Ｉ１１７Ｌ、Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ／Ｉ１１７Ｌ、Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｋ／Ｍ９９Ｌ／Ｌ１０６Ｒ、Ｌ６３Ｐ／Ｑ８２Ｈ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ６３Ｐ／Ｋ９５Ｒ、Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ、Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ、Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｉ１０８Ｖ、Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｉ１１７Ｍ、Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／
Ｖ１１６Ａ、Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｒ／Ｎ１１０Ｋ、Ｌ６３Ｐ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｉ１０８Ｆ、Ｉ６７Ｖ／Ｓ７２Ｇ／Ｑ８２Ｈ／Ｔ８９Ａ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｓ７２Ｇ／Ｒ８５Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ、Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｉ１１７Ｔ、Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ／Ｉ１１７Ｔ、Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ／Ｙ１１５Ｎ、Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、およびＬ９８Ｒ／Ｎ１１０Ｋである。
【０２２４】
いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２に記載の番号付けに関して、Ａ６Ｔ、Ｖ１０Ａ、Ｌ１２Ｆ、Ｌ１２Ｈ、Ｌ１２Ｐ、Ｓ１４Ｎ、Ｓ１５Ｐ、Ｒ１６Ｃ、Ｒ１６Ｇ、Ｒ１６Ｈ、Ｉ１８Ａ、Ｉ１８Ｆ、Ｉ１８Ｎ、Ｉ１８Ｔ、Ｉ１８Ｖ、Ａ１９Ｖ、Ｓ２０Ｎ、Ｖ２２Ａ、Ｖ２２Ｉ、Ｅ２４Ｑ、Ａ２６Ｄ、Ａ２６Ｓ、Ａ２６Ｔ、Ｓ２７Ｐ、Ｐ２８Ｌ、Ｇ２９Ｒ、Ｇ２９Ｗ、Ｋ３０Ｒ、Ｅ３３Ｍ、Ｅ３３Ｖ、Ｒ３５Ｋ、Ｔ３７Ｓ、Ｖ３８Ｉ、Ｑ４１Ｌ、Ａ４２Ｓ、Ａ４２Ｔ、Ａ４２Ｖ、Ｄ４３Ｎ、Ｑ４５Ｈ、Ｖ４６Ｅ、Ｔ４７Ａ、Ｅ４８Ｒ、Ｔ５３Ｓ、Ｙ５４Ｆ、Ｍ５５Ｒ、Ｍ５５Ｔ、Ｍ５５Ｖ、Ｍ５６Ｋ、Ｍ５６Ｌ、Ｍ５６Ｒ、Ｍ５６Ｔ、Ｍ５６Ｖ、Ｎ５８Ｄ、Ｎ５８Ｓ、Ｅ５９Ｄ、Ｅ５９Ｇ、Ｔ６１Ａ、Ｔ６１Ｉ、Ｔ６１Ｎ、Ｔ６１Ｒ、Ｔ６１Ｓ、Ｌ６３Ｈ、Ｌ６３Ｐ、Ｄ６４Ｅ、Ｄ６４Ｎ、Ｄ６４Ｖ、Ｄ６５Ｇ、Ｉ６７Ｎ、Ｉ６７Ｔ、Ｉ６７Ｖ、Ｔ６９Ａ、Ｔ６９Ｉ、Ｔ６９Ｓ、Ｔ７１Ａ、Ｔ７１Ｉ、Ｓ７２Ｇ、Ｓ７２Ｔ、Ｓ７３Ｒ、Ｎ７５Ｄ、Ｑ７６Ｒ、Ｑ８２Ｈ、Ｑ８２Ｒ、Ｒ８５Ｇ、Ａ８６Ｔ、Ｍ８７Ａ、Ｍ８７Ｋ、Ｍ８７Ｔ、Ｍ８７Ｖ、Ｔ８９Ａ、Ｔ８９Ｍ、Ｔ８９Ｓ、Ｌ９１Ｒ、Ｉ９３Ｌ、Ｉ９３Ｖ、Ｋ９５Ｒ、Ｖ９６Ｉ、Ｅ９７Ｑ、Ｌ９８Ｑ、Ｌ９８Ｒ、Ｍ９９Ｉ、Ｍ９９Ｌ、Ｙ１０５Ｆ、Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１０６Ｉ、Ｌ１０６Ｒ、Ｉ１０８Ｆ、Ｉ１０８Ｖ、Ｎ１１０Ｋ、Ｎ１１０Ｓ、Ｎ１１０Ｙ、Ｙ１１５Ｎ、Ｖ１１６Ａ、Ｉ１１７Ｅ、Ｉ１１７Ｌ、Ｉ１１７Ｍ、Ｉ１１７Ｔ、Ｅ１２０Ｄ、Ｃ１２２Ｐ、Ｄ１２４Ｐ、Ｄ１２４Ｉ、Ｓ１２５Ｉ、Ｄ１２６Ｐ、およびＤ１２６Ｔの中から選択される２つ以上のアミノ酸改変を有する。いくつかの実施形態では、２つ以上のアミノ酸改変は、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２に記載の番号付けに関して、Ａ６Ｔ／Ａ２６Ｔ／Ｍ５５Ｔ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｖ１０Ａ／Ｇ２９Ｗ／Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｐ１２１Ｓ、Ｖ１０Ａ／Ｌ６３Ｐ／Ｄ６４Ｖ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｖ１０Ａ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１２Ｆ／Ｒ１６Ｈ／Ｇ２９Ｗ／Ｍ５６Ｔ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１２Ｆ／Ａ２６Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｒ、Ｌ１２Ｆ／Ｋ３０Ｒ／Ｓ７２Ｇ／Ｑ８２Ｒ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１２Ｈ／Ｉ１８Ｖ／Ａ４２Ｔ／Ｍ５５Ｔ／Ｎ５８Ｄ／Ｌ９８Ｒ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ／Ｐ１２１Ｓ、Ｌ１２Ｈ／Ｅ３３Ｍ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１２Ｈ／Ｍ５５Ｔ／Ｅ５９Ｄ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ９９Ｌ、Ｌ１２Ｈ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１２Ｉ／Ｍ５５Ｔ／Ｍ５６Ｖ／Ｉ６７Ｔ／Ｍ９９Ｌ／Ｌ１０６Ｒ／Ｉ１０８Ｆ、Ｌ１２Ｐ／Ｒ１６Ｈ／Ａ２６Ｔ／Ｔ６１Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ／Ｉ１１７Ｌ、Ｌ１２Ｐ／Ｉ１８Ｔ／Ａ２６Ｔ／Ｍ５５Ｔ／Ｔ６９Ｓ／Ｓ７２Ｇ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１２Ｐ／Ａ２６Ｔ、Ｌ１２Ｐ／Ａ２６Ｔ／Ｌ６３Ｐ、Ｌ１２Ｐ／Ａ２６Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｔ８９Ｍ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１２Ｐ／Ｇ２９Ｗ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１２Ｐ／Ｇ２９Ｗ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／���１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ、Ｌ１２Ｐ／Ａ２６Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１２Ｐ／Ａ２６Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１２Ｐ／Ａ２６Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ、Ｌ１２Ｐ／Ｇ２９Ｗ／Ｄ４３Ｎ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１２Ｐ／Ｍ５６Ｖ／Ｌ６３Ｐ／Ｖ９６Ｉ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｙ１１５Ｈ、Ｌ１２Ｐ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１２Ｐ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｎ、Ｌ１２Ｐ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｎ／Ｉ１１７Ｌ、Ｓ１４Ｎ／Ｒ１６Ｃ／Ｉ１８Ｔ／Ｍ５６Ｋ／Ｔ６１Ａ／Ｌ６３Ｐ／Ａ８６Ｔ／Ｍ９９Ｌ、Ｓ１５Ｐ／Ｉ１８Ｖ／Ｍ５６Ｔ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｒ１６Ｃ／Ｇ２９Ｗ／Ｅ３３Ｖ／Ｍ５５Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｉ１８Ａ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｉ１８Ｆ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｐ１２１Ｓ、Ｉ１８Ｎ／Ａ２６Ｔ／Ｌ６３Ｈ／Ｔ８９Ａ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｉ１８Ｎ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｔ／Ｍ８７Ｔ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｎ１１０Ｓ、Ｉ１８Ｔ／Ａ２６Ｓ／Ｍ５５Ｔ／Ｍ５６Ｖ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｉ１１７Ｋ、Ｉ１８Ｔ／Ａ２６Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｉ１８Ｔ／Ａ２６Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｑ８２Ｒ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｉ１８Ｔ／Ｇ２９Ｒ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｉ１８Ｔ／Ｇ２９Ｗ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｉ１８Ｔ／Ｅ４８Ｒ／Ｌ６３Ｐ／Ｔ６９Ｓ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｎ１１０Ｙ、Ｉ１８Ｔ／Ｔ６１Ｒ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｉ１８Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｍ８７Ｋ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｉ１８Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｉ１８Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｉ１０８Ｖ、Ｉ１８Ｖ／Ａ２６Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｄ６４Ｅ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｒ／Ｎ１１０Ｋ、Ｉ１８Ｖ／Ｇ２９Ｗ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ａ１９Ｖ／Ｇ２９Ｗ／Ｒ３５Ｋ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｓ２０Ｎ／Ａ２６Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｖ２２Ａ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｐ１１９Ｈ、Ｖ２２Ｉ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｉ１１７Ｍ、Ｅ２４Ｑ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ａ２６Ｄ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ａ２６Ｔ／Ａ４２Ｖ／Ｑ４５Ｈ／Ｉ６７Ｎ／Ｍ８７Ｋ／Ｅ９７Ｑ／Ｍ９９Ｌ、Ａ２６Ｔ／Ｖ４６Ｅ／Ｌ６３Ｐ／Ｄ６５Ｇ／Ｌ９８Ｑ、Ａ２６Ｔ／Ｔ４７Ａ／Ｍ５６Ｋ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｑ８２Ｒ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ａ２６Ｔ／Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ａ２６Ｔ／Ｔ５３Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ／Ｉ１１７Ｌ、Ａ２６Ｔ／Ｙ５４Ｆ／Ｍ５６Ｋ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ａ２６Ｔ／Ｍ５５Ｒ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、���２６Ｔ／Ｍ５５Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ａ２６Ｔ／Ｍ５５Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ａ２６Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｄ６５Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ａ２６Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｎ１１０Ｋ／Ｉ１１７Ｅ、Ａ２６Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ａ２６Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ／Ｉ１１７Ｌ、Ａ２６Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ａ２６Ｔ／Ｉ６７Ｎ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｓ２７Ｐ／Ｍ５６Ｋ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｓ７３Ｒ／Ｔ８９Ａ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｉ１１７Ｍ、Ｐ２８Ｌ／Ｅ３３Ｖ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｐ２８Ｌ／Ｅ３３Ｖ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｒ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｉ１０８Ｖ、Ｇ２９Ｗ／Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｐ１２１Ｓ、Ｇ２９Ｗ／Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｔ６１Ｎ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｌ６３Ｐ／Ｑ８２Ｈ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｉ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｔ５３Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｍ５５Ｖ／Ｅ５９Ｇ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｍ５６Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ／Ｉ１１７Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｎ５８Ｄ／Ｉ６７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｄ６４Ｎ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｔ６９Ｉ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ、Ｇ２９Ｗ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｖ、Ｇ２９Ｗ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｑ８２Ｒ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｔ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｅ５９Ｇ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｔ６１Ｉ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｌ６３Ｐ／Ｄ６５Ｇ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｌ６３Ｐ／Ｉ６７Ｖ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ、Ｇ２９Ｗ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ／Ｉ１１７Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｉ１１７Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｐ１２１Ｓ，Ｇ２９Ｗ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｓ７２Ｇ／Ｑ７６Ｒ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ���Ｑ１１３Ｈ、Ｇ２９Ｗ／Ｍ８７Ｋ／Ｔ８９Ｓ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｉ１０８Ｖ／Ｉ１１７Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｍ８７Ｋ／Ｉ９３Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｅ３３Ｍ／Ａ４２Ｔ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｅ３３Ｍ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｅ３３Ｍ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｉ１０８Ｆ、Ｅ３３Ｍ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｉ１１７Ｌ、Ｅ３３Ｍ／Ｑ８２Ｈ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｅ３３Ｖ／Ａ４２Ｓ／Ｍ５５Ｔ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｔ３７Ｓ／Ｍ５６Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｖ３８Ｉ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｑ４１Ｌ／Ｙ５４Ｆ／Ｍ５６Ｋ／Ｍ９９Ｌ／Ｉ１０８Ｆ、Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｍ５５Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｔ７１Ｉ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｍ５５Ｔ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｍ５５Ｔ／Ｅ９７Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｆ、Ｍ５６Ｋ／Ｌ６３Ｐ／Ｎ７５Ｄ／Ｖ９６Ｉ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ、Ｍ５６Ｌ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ／Ｉ１１７Ｌ、Ｍ５６Ｒ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｍ５６Ｔ／Ｌ９１Ｒ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｍ５６Ｖ／Ｅ５９Ｇ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｍ８７Ｋ／Ｉ９３Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｉ１１７Ｅ、Ｔ６１Ａ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ６３Ｐ／Ｔ６９Ａ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｒ／Ｖ１１６Ａ、Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｍ８７Ａ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｉ９３Ｌ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ／Ｉ１１７Ｌ、Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ／Ｉ１１７Ｌ、Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｋ／Ｍ９９Ｌ／Ｌ１０６Ｒ、Ｌ６３Ｐ／Ｑ８２Ｈ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ６３Ｐ／Ｋ９５Ｒ、Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ、Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ、Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｉ１０８Ｖ、Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ
９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｉ１１７Ｍ、Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｖ１１６Ａ、Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｒ／Ｎ１１０Ｋ、Ｌ６３Ｐ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｉ１０８Ｆ、Ｉ６７Ｖ／Ｓ７２Ｇ／Ｑ８２Ｈ／Ｔ８９Ａ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｓ７２Ｇ／Ｒ８５Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ、Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｉ１１７Ｔ、Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ／Ｉ１１７Ｔ、Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ／Ｙ１１５Ｎ、Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ９８Ｒ／Ｎ１１０Ｋ、Ｔ８９Ａ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ／Ｙ１１５Ｎ／Ｅ１２０Ｄ／Ｃ１２２Ｐ／Ｄ１２４Ｐ／Ｓ１２５Ｉ／Ｄ１２６Ｐ、Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｔ７１Ａ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｄ１２４Ｉ／Ｓ１２５Ｐ／Ｄ１２６Ｔ、Ｒ１６Ｇ／Ｅ３３Ｍ／Ｎ５８Ｓ／Ｅ５９Ｇ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｅ１２０Ｄ／Ｃ１２２Ｐ／Ｄ１２４Ｐ／Ｓ１２５Ｉ／Ｄ１２６Ｐ、Ｇ２９Ｗ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｐ１２１Ｓ／Ｄ１２６Ｔ、Ｌ１２Ｈ／Ｅ３３Ｍ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｉ１８Ｔ／Ａ２６Ｔ／Ｍ５５Ｔ／Ｍ５６Ｋ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｉ１８Ｔ／Ａ２６Ｔ／Ｍ５６Ｋ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｔ５３Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ、Ｔ５３Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｙ１０５Ｌ、Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ、Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｙ１０５Ｌ、Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｎ５８Ｓ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｔ５３Ｓ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｍ５６Ｋ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｅ３３Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｅ３３Ｖ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｅ３３Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ、Ｅ３３Ｖ／Ｍ９９Ｌ、Ｌ１２Ｆ／Ｒ１６Ｈ／Ｇ２９Ｗ／Ｍ５６Ｔ／Ｌ９８Ｑ、Ｌ１２Ｆ／Ｒ１６Ｈ／Ｇ２９Ｗ／Ｍ５６Ｔ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１２Ｆ／Ｒ１６Ｈ／Ｇ２９Ｗ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１２Ｆ／Ｒ１６Ｈ／Ｍ５６Ｔ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｍ５６Ｔ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１２Ｆ／Ｇ２９Ｗ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１２Ｆ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｒ１６Ｈ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｍ５６Ｔ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１２Ｆ／Ｒ１６Ｈ／Ｇ２９Ｗ／Ｍ５６Ｔ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、およびＧ２９Ｗ／Ｍ５６Ｔ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌである。
【０２２５】
いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、追加的に、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２または５６９に記載の位置に関して、アミノ酸改変Ｃ１２２Ｓを含む。
【０２２６】
いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、表２に列挙される置換（変異）のうちのいずれかを含む。表２はまた、野生型ＣＴＬＡ−４または例示的な変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドの細胞外ドメイン（ＥＣＤ）またはＩｇＶドメインに対する配列番号を参照することによって、例示的な配列を提供する。表２はまた、免疫グロブリンＦｃに付着した変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドの例示的な配列（ＣＴＬＡ−４  ｖＩｇＤ−Ｆｃ融合とも称される「ＣＴＬＡ−４−Ｆｃ変異型融合」などの「免疫調節Ｆｃ融合」を生じる）を提供する。そのような融合ポリペプチドを、以下にさらに記載する。示されるように、所与のドメインに対応する正確な遺伝子座または残基は、ドメインを識別または分類するために使用される方法などに応じて、変化し得る。また、場合によっては、所与のドメイン（例えば、ＩｇＶ）の隣接するＮ末端および／またはＣ末端アミノ酸はまた、発現されたときにドメインの正しい折り畳み構造を確保するために、変異型ＩｇＳＦポリペプチド中に含まれ得る。したがって、表２の配列番号の例示は、限定と解釈されるべきではないことが理解される。例えば、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドのＩｇＶドメインなどの特定のドメインは、それぞれの配列番号に記載のアミノ酸の配列よりもより長いか、またはより短い、１〜１０、例えば、１、２、３、４、５、６、または７つのアミノ酸など、より長いか、またはより短い、いくつかのアミノ酸であり得る。
【０２２７】
いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、表２に列挙される変異のうちのいずれかを含む。いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、表２に列挙される細胞外ドメイン（ＥＣＤ）配列のうちのいずれか（すなわち、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：４〜９７、９９〜１０４、または１０６〜１５５のうちのいずれか１つ）を含む。いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、表２に列挙される細胞外ドメイン（ＥＣＤ）配列のうちのいずれか（すなわち、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：４〜９７、９９〜１０４、または１０６〜１５５のうちのいずれか１つ）と少なくとも９６％の同一性、９７％の同一性、９８％の同一性、または９９％の同一性など、少なくとも９０％の同一性、少なくとも９１％の同一性、少なくとも９２％の同一性、少なくとも９３％の同一性、少なくとも９４％の同一性、少なくとも９５％の同一性を示すポリペプチド配列を含み、野生型または非改変ＣＴＬＡ−４中に存在しないそれぞれの配列番号のアミノ酸改変、例えば、置換を含有する。いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、表２に列挙される細胞外ドメイン（ＥＣＤ）配列のうちのいずれか（すなわち、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：４〜９７、９９〜１０４、または１０６〜１５５のうちのいずれか１つ）の特異的結合断片を含み、野生型または非改変ＣＴＬＡ−４中に存在しないそれぞれの配列番号のアミノ酸改変、例えば、置換のうちの１つ以上を含有する。
【０２２８】
いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、表２に列挙される変異のうちのいずれかを含む。いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、表２に列挙される細胞外ドメイン（ＥＣＤ）配列のうちのいずれか（すなわち、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：４−９７、９９〜１０４、１０６〜１５５、５７０〜６０２、または６３６のうちのいずれか１つ）を含む。いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、表２に列挙される細胞外ドメイン（ＥＣＤ）配列のうちのいずれか（すなわち、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：４〜９７、９９〜１０４、１０６〜１５５、５７０〜６０２、または６３６のうちのいずれか１つ）と少なくとも９６％の同一性、９７％の同一性、９８％の同一性、または９９％の同一性など、少なくとも９０％の同一性、少なくとも９１％の同一性、少なくとも９２％の同一性、少なくとも９３％の同一性、少なくとも９４％の同一性、少なくとも９５％の同一性を示すポリペプチド配列を含み、野生型または非改変ＣＴＬＡ−４中に存在しないそれぞれの配列番号のアミノ酸改変、例えば、置換を含有する。いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、表２に列挙される細胞外ドメイン（ＥＣＤ）配列のうちのいずれか（すなわち、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：４〜９７、９９〜１０４、１０６〜１５５、５７０〜６０２、または６３６のうちのいずれか１つ）の特異的結合断片を含み、野生型または非改変ＣＴＬＡ−４中に存在しないそれぞれの配列番号のアミノ酸改変、例えば、置換のうちの１つ以上を含有する。
【０２２９】
いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、表２に列挙されるＩｇＶ配列のうちのいずれか（すなわち、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１５６〜２８５のうちのいずれか１つ）を含む。いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、表２に列挙されるＩｇＶ配列のうちのいずれか（すなわち、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１５６〜２８５のうちのいずれか１つ）と少なくとも９６％の同一性、９７％の同一性、９８％の同一性、または９９％の同一性など、少なくとも９０％の同一性、少なくとも９１％の同一性、少なくとも９２％の同一性、少なくとも９３％の同一性、少なくとも９４％の同一性、少なくとも９５％の同一性を示すポリペプチド配列を含み、野生型または非改変ＣＴＬＡ−４中に存在しないそれぞれの配列番号のアミノ酸改変、例えば、置換を含有する。いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、表２に列挙されるＩｇＶ配列のうちのいずれか（すなわち、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１５６〜２８５のうちのいずれか１つ）の特異的結合断片を含み、野生型または非改変ＣＴＬＡ−４中に存在しないそれぞれの配列番号のアミノ酸改変、例えば、置換のうちの１つ以上を含有する。
【０２３０】
いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、表２に列挙されるＩｇＶ配列のうちのいずれか（すなわち、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１５６〜２８５、６０３〜６３５、または６３７のうちのいずれか１つ）を含む。いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、表２に列挙されるＩｇＶ配列のうちのいずれか（すなわち、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１５６〜２８５、６０３〜６３５、または６３７のうちのいずれか１つ）と少なくとも９６％の同一性、９７％の同一性、９８％の同一性、または９９％の同一性など、少なくとも９０％の同一性、少なくとも９１％の同一性、少なくとも９２％の同一性、少なくとも９３％の同一性、少なくとも９４％の同一性、少なくとも９５％の同一性を示すポリペプチド配列を含み、野生型または非改変ＣＴＬＡ−４中に存在しないそれぞれの配列番号のアミノ酸改変、例えば、置換を含有する。いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、表２に列挙されるＩｇＶ配列のうちのいずれか（すなわち、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１５６〜２８５、６０３〜６３５、または６３７のうちのいずれか１つ）の特異的結合断片を含み、野生型または非改変ＣＴＬＡ−４中に存在しないそれぞれの配列番号のアミノ酸改変、例えば、置換を含有する。
【０２３１】
（表２）例示的な変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド
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【０２３２】
いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２または３に記載の配列などを含む、野生型または非改変ＣＴＬＡ−４ポリペプチドと比較して、ＣＤ８０の外部ドメインに対する増加した結合親和性を示す。いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２または３に記載の配列などを含む、野生型または非改変ＣＴＬＡ−４ポリペプチドと比較して、ＣＤ８６の外部ドメインに対する増加した結合親和性を示す。いくつかの実施形態では、ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２または３に記載の配列などを含む、野生型または非改変ＣＴＬＡ−４と比較して、ＣＤ８０の外部ドメインおよびＣＤ８６の外部ドメインに対する増加した親和性を示す。
【０２３３】
いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２または３に記載の配列などを含む、野生型または非改変ＣＴＬＡ−４ポリペプチドと比較して、ＩＣＯＳＬの外部ドメインに対する増加した親和性を示す。いくつかの実施形態では、ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２または３に記載の配列などを含む、野生型または非改変ＣＴＬＡ−４と比較して、ＩＣＯＳＬの外部ドメインおよびＣＤ８０の外部ドメインに対する増加した親和性を示す。いくつかの実施形態では、ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２または３に記載の配列などを含む、野生型または非改変ＣＴＬＡ−４と比較して、ＩＣＯＳＬの外部ドメインおよびＣＤ８６の外部ドメインに対する増加した親和性を示す。
【０２３４】
いくつかの実施形態では、ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２または３に記載の配列などを含む、野生型または非改変ＣＴＬＡ−４と比較して、ＩＣＯＳＬの外部ドメイン、ＣＤ８０の外部ドメイン、およびＣＤ８６の外部ドメインに対する増加した親和性を示す。
【０２３５】
いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２または３に記載の配列などを含む、野生型または非改変ＣＴＬＡ−４ポリペプチドと比較して、ＣＤ８０の外部ドメインとの結合に対する増加した結合親和性を示し、ＣＤ８６および／またはＩＣＯＳＬの外部ドメインとの結合に対する減少した結合親和性を示す。いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２または３に記載の配列などを含む、野生型または非改変ＣＴＬＡ−４ポリペプチドと比較して、ＣＤ８０の外部ドメインおよびＣＤ８６の外部ドメインに対する増加した親和性を示し、ＩＣＯＳＬの外部ドメインに対する減少した親和性を示す。いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２または３に記載の配列などを含む、野生型または非改変ＣＴＬＡ−４ポリペプチドと比較して、ＣＤ８０の外部ドメインおよびＩＣＯＳＬの外部ドメインに対する増加した親和性を示し、ＣＤ８６の外部ドメインに対する減少した親和性を示す。いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２または３に記載の配列などを含む、野生型または非改変ＣＴＬＡ−４ポリペプチドと比較して、ＣＤ８０の外部ドメインに対する増加した親和性を示し、ＣＤ８６の外部ドメインおよびＩＣＯＳＬの外部ドメインに対する減少した親和性を示す。
【０２３６】
いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２または３に記載の配列などを含む、野生型または非改変ＣＴＬＡ−４ポリペプチドと比較して、ＣＤ８６の外部ドメインとの結合に対する増加した結合親和性を示し、ＣＤ８０および／またはＩＣＯＳＬの外部ドメインとの結合に対する減少した結合親和性を示す。いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２または３に記載の配列などを含む、野生型または非改変ＣＴＬＡ−４ポリペプチドと比較して、ＣＤ８６の外部ドメインおよびＣＤ８０の外部ドメインに対する増加した親和性を示し、ＩＣＯＳＬの外部ドメインに対する減少した親和性を示す。いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２または３に記載の配列などを含む、野生型または非改変ＣＴＬＡ−４ポリペプチドと比較して、ＣＤ８６の外部ドメインおよびＩＣＯＳＬの外部ドメインに対する増加した親和性を示し、ＣＤ８０の外部ドメインに対する減少した親和性を示す。いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２または３に記載の配列などを含む、野生型または非改変ＣＴＬＡ−４ポリペプチドと比較して、ＣＤ８６の外部ドメインに対する増加した親和性を示し、ＣＤ８０の外部ドメインおよびＩＣＯＳＬの外部ドメインに対する減少した親和性を示す。
【０２３７】
いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２または３に記載の配列などを含む、野生型または非改変ＣＴＬＡ−４ポリペプチドと比較して、ＩＣＯＳＬの外部ドメインとの結合に対する増加し結合親和性を示し、ＣＤ８０および／またはＣＤ８６の外部ドメインとの結合に対する減少した結合親和性を示す。いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２または３に記載の配列などを含む、野生型または非改変ＣＴＬＡ−４ポリペプチドと比較して、ＩＣＯＳＬの外部ドメインおよびＣＤ８０の外部ドメインに対する増加した親和性を示し、ＣＤ８６の外部ドメインに対する減少した親和性を示す。いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２または３に記載の配列などを含む、野生型または非改変ＣＴＬＡ−４ポリペプチドと比較して、ＩＣＯＳＬの外部ドメインおよびＣＤ８６の外部ドメインに対する増加した親和性を示し、ＣＤ８０の外部ドメインに対する減少した親和性を示す。いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドが、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２または３に記載の配列などを含む、野生型または非改変ＣＴＬＡ−４ポリペプチドと比較して、ＩＣＯＳＬの外部ドメインに対する増加した親和性を示し、ＣＤ８０の外部ドメインおよびＣＤ８６の外部ドメインに対する減少した親和性を示す。
【０２３８】
いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２または３に記載の配列などを含む、野生型または非改変ＣＴＬＡ−４ポリペプチドなど、野生型または非改変ＣＴＬＡ−４ポリペプチドと比較して、ＣＤ８０の外部ドメインに対する増加した結合親和性を示す。いくつかの実施形態では、ＣＤ８０の外部ドメインに対する増加した親和性は、ＣＤ８０の外部ドメインに対する非改変ＣＴＬＡ−４の結合親和性と比較して、１．２倍超、１．５倍、２倍、３倍、４倍、５倍、６倍、７倍、８倍、９倍、１０倍、２０倍、３０倍、４０倍、５０倍、または６０倍増加している。これらの実施形態のうちのいくつかでは、野生型または非改変ＣＴＬＡ−４ポリペプチドと比較して、ＣＤ８０に対する増加した結合親和性を示す変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、非改変または野生型ＣＴＬＡ−４の細胞外ドメインまたはそのＩｇＶドメイン中に、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２の番号付けに関して、１つ以上のアミノ酸置換Ｖ１０Ａ、Ｌ１２Ｆ、Ｒ１６Ｈ、Ｉ１８Ｔ、Ａ２６Ｔ、Ｇ２９Ｗ、Ｅ３３Ｖ、Ａ４２Ｖ、Ｑ４５Ｈ、Ｔ５３Ｓ、Ｍ５５Ｔ、Ｍ５６Ｋ、Ｍ５６Ｔ、Ｎ５８Ｓ、Ｌ６３Ｐ、Ｉ６７Ｎ、Ｑ８２Ｒ、Ｍ８７Ｋ、Ｍ８７Ｖ、Ｅ９７Ｑ、Ｌ９８Ｑ、Ｍ９９Ｌ、Ｙ１０５Ｌ、Ｉ１０８Ｖ、および／またはＰ１２１Ｓを有する。これらの実施形態のうちのいくつかでは、野生型または非改変ＣＴＬＡ−４ポリペプチドと比較して、ＣＤ８０に対する増加した親和性を示す変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、非改変または野生型ＣＴＬＡ−４の細胞外ドメインまたはそのＩｇＶドメイン中に、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２の番号付けに関して、１つ以上のアミノ酸置換Ｉ１８Ｔ、Ａ２６Ｔ、Ｇ２９Ｗ、Ｅ３３Ｖ、Ａ４２Ｖ、Ｑ４５Ｈ、Ｔ５３Ｓ、Ｍ５６Ｋ、Ｎ５８Ｓ、Ｌ６３Ｐ、Ｉ６７Ｎ、Ｑ８２Ｒ、Ｍ８７Ｋ、Ｍ８７Ｖ、Ｅ９７Ｑ、Ｌ９８Ｑ、Ｍ９９Ｌ、Ｙ１０５Ｌ、および／またはＩ１０８Ｖを有する。これらの実施形態のうちのいくつかでは、野生型または非改変ＣＴＬＡ−４ポリペプチドと比較して、ＣＤ８０に対する増加した結合親和性を示す変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、非改変または野生型ＣＴＬＡ−４の細胞外ドメインまたはそのＩｇＶドメイン中に、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２の番号付けに関して、１つ以上のアミノ酸置換Ｉ１８Ｔ、Ａ２６Ｔ、Ｇ２９Ｗ、Ａ４２Ｖ、Ｑ４５Ｈ、Ｎ５８Ｓ、Ｌ６３Ｐ、Ｉ６７Ｎ、Ｑ８２Ｒ、Ｍ８７Ｋ、Ｍ８７Ｖ、Ｌ９８Ｑ、および／またはＹ１０５Ｌを有する。これらの実施形態のうちのいくつかでは、野生型または非改変ＣＴＬＡ−４ポリペプチドと比較して、ＣＤ８０に対する増加した結合親和性を示す変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、非改変または野生型ＣＴＬＡ−４の細胞外ドメインまたはそのＩｇＶドメイン中に、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２の番号付けに関して、Ｉ１８Ｔ、Ａ２６Ｔ、Ｇ２９Ｗ、Ｎ５８Ｓ、Ｌ６３Ｐ、Ｍ８７Ｋ、Ｍ８７Ｖ、Ｌ９８Ｑおよび／またはＹ１０５Ｌの中から１つ以上のアミノ酸置換を有する。いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２または３に記載の配列を含む、野生型または非改変ＣＴＬＡ−４ポリペプチドなど、野生型または非改変ＣＴＬＡ−４ポリペプチドと比較して、ＣＤ８０の外部ドメインとの増加した結合を示す、そのようなアミノ酸置換のうちの少なくとも２、３、４、または５つを有する。いくつかの実施形態では、アミノ酸置換は、Ｉ１８Ｔ／Ｇ２９Ｗ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｑ８２Ｒ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１２Ｆ／Ｒ１６Ｈ／Ｇ２９Ｗ／Ｍ５６Ｔ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ａ２６Ｔ／Ａ４２Ｖ／Ｑ４５Ｈ／Ｉ６７Ｎ／Ｍ８７Ｋ／Ｅ９７Ｑ／Ｍ９９Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｐ１２１Ｓ、Ｇ２９Ｗ／Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｉ１０８Ｖ、Ｖ１０Ａ／Ｇ２９Ｗ／Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｐ１２１Ｓ、Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｉ１８Ｔ／Ａ２６Ｔ／Ｍ５５Ｔ／Ｍ５６Ｋ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｅ３３Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｅ３３Ｖ／Ｍ９９Ｌ、Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｎ５８Ｓ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｔ５３Ｓ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｍ５６Ｋ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｅ３３Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ、Ｌ１２Ｆ／Ｒ１６Ｈ／Ｇ２９Ｗ／Ｍ５６Ｔ／Ｌ９８Ｑ、Ｌ１２Ｆ／Ｒ１６Ｈ／Ｇ２９Ｗ／Ｍ５６Ｔ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１２Ｆ／Ｒ１６Ｈ／Ｇ２９Ｗ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１２Ｆ／Ｒ１６Ｈ／Ｍ５６Ｔ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｍ５６Ｔ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１２Ｆ／Ｇ２９Ｗ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１２Ｆ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｒ１６Ｈ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、またはＭ５６Ｔ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌである。いくつかの実施形態では、アミノ酸置換は、Ｉ１８Ｔ／Ｇ２９Ｗ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｑ８２Ｒ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ａ２６Ｔ／Ａ４２Ｖ／Ｑ４５Ｈ／Ｉ６７Ｎ／Ｍ８７Ｋ／Ｅ９７Ｑ／Ｍ９９Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｐ１２１Ｓ、Ｇ２９Ｗ／Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｉ１０８Ｖ、Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｅ３３Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｎ５８Ｓ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、またはＥ３３Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌである。いくつかの実施形態では、アミノ酸置換は、Ｉ１８Ｔ／Ｇ２９Ｗ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｑ８２Ｒ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ａ２６Ｔ／Ａ４２Ｖ／Ｑ４５Ｈ／Ｉ６７Ｎ／Ｍ８７Ｋ／Ｅ９７Ｑ／Ｍ９９Ｌ、またはＴ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｎ５８Ｓ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌである。いくつかの実施形態では、上記の置換のうちのいずれも、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２に記載のＣＴＬＡ−４細胞外ドメイン中にあり、例えば、表２に記載の例示的な配列番号を参照されたい。いくつかの実施形態では、上記の置換のうちのいずれも、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：３に記載のＣＴＬＡ−４細胞外ドメイン中にあり、例えば、表２に記載の例示的な配列番号を参照されたい。
【０２３９】
いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２または３に記載の配列などを含む、野生型または非改変ＣＴＬＡ−４ポリペプチドなど、野生型または非改変ＣＴＬＡ−４ポリペプチドと比較して、ＣＤ８６の外部ドメインに対する増加した結合親和性を示す。いくつかの実施形態では、ＣＤ８６の外部ドメインに対する増加した親和性は、ＣＤ８６の外部ドメインに対する非改変ＣＴＬＡ−４の結合親和性と比較して、１．２倍超、１．５倍、２倍、３倍、４倍、５倍、６倍、７倍、８倍、９倍、１０倍、２０倍、３０倍、４０倍、５０倍、または６０倍増加する。これらの実施形態のうちのいくつかでは、野生型または非改変ＣＴＬＡ−４ポリペプチドと比較して、ＣＤ８６に対する増加した結合親和性を示す変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、非改変または野生型ＣＴＬＡ−４の細胞外ドメインまたはそのＩｇＶドメイン中に、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２の番号付けに関して、１つ以上のアミノ酸置換Ｌ１２Ｆ、Ｌ１２Ｈ、Ｌ１２Ｐ、Ｒ１６Ｈ、Ｉ１８Ｔ、Ｉ１８Ｖ、Ｓ２０Ｎ、Ａ２６Ｔ、Ｇ２９Ｒ、Ｇ２９Ｗ、Ｅ３３Ｍ、Ｅ３３Ｖ、Ａ４２Ｓ、Ａ４２Ｖ、Ｔ４７Ａ、Ｔ５３Ｓ、Ｍ５５Ｔ、Ｍ５６Ｋ、Ｍ５６Ｒ、Ｍ５６Ｔ、Ｍ５６Ｖ、Ｎ５８Ｄ、Ｎ５８Ｓ、Ｔ６１Ｉ、Ｔ６１Ｎ、Ｔ６１Ｒ、Ｔ６１Ｓ、Ｌ６３Ｐ、Ｄ６５Ｇ、Ｉ６７Ｎ、Ｉ６７Ｖ、Ｔ６９Ａ、Ｔ６９Ｉ、Ｓ７２Ｇ、Ｑ７６Ｒ、Ｑ８２Ｈ、Ｑ８２Ｒ、Ｒ８５Ｇ、Ｍ８７Ｋ、Ｍ８７Ｖ，Ｔ８９Ａ、Ｔ８９Ｍ、Ｔ８９Ｓ、Ｖ９６Ｉ、Ｌ９８Ｑ、Ｌ９８Ｒ、Ｍ９９Ｌ、Ｐ１０２Ｌ、Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１０６Ｉ、Ｌ１０６Ｎ、Ｌ１０６Ｒ、Ｌ１０６Ｖ、Ｉ１０８Ｆ、Ｉ１０８Ｖ、Ｑ１１３Ｈ、Ｙ１１５Ｈ、Ｖ１１６Ａ、Ｉ１１７Ｌ、Ｉ１１７Ｔ、および／またはＰ１２１Ｓを有する。これらの実施形態のうちのいくつかでは、野生型または非改変ＣＴＬＡ−４ポリペプチドと比較して、ＣＤ８６に対する増加した結合親和性を示す変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、非改変または野生型ＣＴＬＡ−４の細胞外ドメインまたはそのＩｇＶドメイン中に、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２の番号付けに関して、１つ以上のアミノ酸置換Ｌ１２Ｐ、Ａ２６Ｔ、Ｍ５５Ｔ、Ｌ６３Ｐ、Ｓ７２Ｇ、Ｌ９８Ｑ、Ｍ９９Ｌ、および／またはＹ１０５Ｌを有する。いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、そのようなアミノ酸置換のうちの少なくとも２、３、４、または５つを有し、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２または３に記載の配列を含む、野生型または非改変ＣＴＬＡ−４ポリペプチドなど、野生型または非改変ＣＴＬＡ−４ポリペプチドと比較して、ＣＤ８６の外部ドメインとの増加した結合を示す。いくつかの実施形態では、アミノ酸置換は、Ｉ１８Ｔ／Ｔ６１Ｒ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｐ１０２Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１２Ｐ／Ａ２６Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｔ８９Ｍ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｉ１８Ｔ／Ｇ２９Ｒ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｉ１１７Ｔ、Ｍ５６Ｒ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ、Ａ２６Ｔ／Ｍ５５Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ��Ｙ１０５Ｌ、Ｅ３３Ｖ／Ａ４２Ｓ／Ｍ５５Ｔ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｑ８２Ｒ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｅ３３Ｍ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｉ１１７Ｌ、Ａ２６Ｔ／Ｉ６７Ｎ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１２Ｆ／Ａ２６Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｒ、Ｓ２０Ｎ／Ａ２６Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｔ６１Ｉ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｔ６９Ｉ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１２Ｐ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｎ、Ｌ６３Ｐ／Ｔ６９Ａ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｒ／Ｖ１１６Ａ、Ｇ２９Ｗ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｌ６３Ｐ／Ｄ６５Ｇ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ、Ｌ１２Ｆ／Ｒ１６Ｈ／Ｇ２９Ｗ／Ｍ５６Ｔ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｓ７２Ｇ／Ｑ７６Ｒ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ／Ｑ１１３Ｈ、Ｇ２９Ｗ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｖ、Ｇ２９Ｗ／Ｎ５８Ｄ／Ｉ６７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｉ６７Ｖ／Ｓ７２Ｇ／Ｑ８２Ｈ／Ｔ８９Ａ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｓ７２Ｇ／Ｒ８５Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ、Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ａ２６Ｔ／Ｔ４７Ａ／Ｍ５６Ｋ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｑ８２Ｒ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ａ２６Ｔ／Ｍ５５Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１２Ｈ／Ｉ１８Ｖ／Ａ４２Ｔ／Ｍ５５Ｔ／Ｎ５８Ｄ／Ｌ９８Ｒ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ／Ｐ１２１Ｓ、Ｅ３３Ｍ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｍ８７Ｋ／Ｔ８９Ｓ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｉ１０８Ｖ／Ｉ１１７Ｌ、Ｌ１２Ｐ／Ｍ５６Ｖ／Ｌ６３Ｐ／Ｖ９６Ｉ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｙ１１５Ｈ、Ｇ２９Ｗ／Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｔ６１Ｎ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｉ１８Ｔ／Ｔ６１Ｒ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１２Ｐ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｅ３３Ｍ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｉ１０８Ｆ、Ｌ１２Ｐ／Ｒ１６Ｈ／Ａ２６Ｔ／Ｔ６１Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ／Ｉ１１７Ｌ、Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｎ５８Ｓ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１２Ｆ／Ｒ１６Ｈ／Ｇ２９Ｗ／Ｍ５６Ｔ／Ｌ９８Ｑ、Ｌ１２Ｆ／Ｇ２９Ｗ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、またはＬ１２Ｆ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌである。いくつかの実施形態では、アミノ酸置換は、Ａ２６Ｔ／Ｍ５５Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、またはＬ１２Ｐ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９��Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌである。いくつかの実施形態では、上記の置換のうちのいずれも、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２に記載のＣＴＬＡ−４細胞外ドメイン中にあり、例えば、表２に記載の例示的な配列番号を参照されたい。いくつかの実施形態では、上記の置換のうちのいずれも、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：３に記載のＣＴＬＡ−４細胞外ドメイン中にあり、例えば、表２に記載の例示的な配列番号を参照されたい。
【０２４０】
いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２または３に記載の配列を含む、野生型または非改変ＣＴＬＡ−４ポリペプチドなど、野生型または非改変ＣＴＬＡ−４ポリペプチドと比較して、ＩＣＯＳＬの外部ドメインに対する増加した結合親和性を示す。いくつかの実施形態では、ＩＣＯＳＬの外部ドメインに対する増加した親和性は、ＩＣＯＳＬの外部ドメインに対する非改変ＣＴＬＡ−４の結合親和性と比較して、１．２倍超、１．５倍、２倍、３倍、４倍、５倍、６倍、７倍、８倍、９倍、１０倍、２０倍、３０倍、４０倍、５０倍、または６０倍増加する。これらの実施形態のうちのいくつかでは、野生型または非改変ＣＴＬＡ−４ポリペプチドと比較して、ＩＣＯＳＬに対する増加した結合親和性を示す変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、非改変または野生型ＣＴＬＡ−４の細胞外ドメインまたはそのＩｇＶドメイン中に、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２の番号付けに関して、１つ以上のアミノ酸置換Ｖ１０Ａ、Ｌ１２Ｆ、Ｌ１２Ｉ、Ｒ１６Ｈ、Ｉ１８Ｎ、Ｉ１８Ｔ、Ｉ１８Ｖ、Ａ１９Ｖ、Ａ２６Ｔ、Ｇ２９Ｗ、Ｅ３３Ｍ、Ｅ３３Ｖ、Ｒ３５Ｋ、Ｖ３８Ｉ、Ａ４２Ｖ、Ｑ４５Ｈ、Ｔ４７Ａ、Ｔ５３Ｓ、Ｍ５５Ｔ、Ｍ５６Ｋ、Ｍ５６Ｖ、Ｎ５８Ｄ、Ｎ５８Ｓ、Ｔ６１Ａ、Ｔ６１Ｒ、Ｌ６３Ｈ、Ｌ６３Ｐ、Ｄ６４Ｅ、Ｄ６４Ｎ、Ｄ６４Ｖ、Ｄ６５Ｇ、Ｉ６７Ｎ、Ｉ６７Ｔ、Ｉ６７Ｖ、Ｔ６９Ｉ、Ｓ７２Ｇ、Ｑ７６Ｒ、Ｑ８２Ｈ、Ｑ８２Ｒ、Ｒ８５Ｇ、Ｍ８７Ｋ、Ｍ８７Ｔ、Ｍ８７Ｖ、Ｔ８９Ａ、Ｔ８９Ｓ、Ｉ９３Ｌ、Ｉ９３Ｖ、Ｅ９７Ｑ、Ｌ９８Ｑ、Ｍ９９Ｌ、Ｍ９９Ｉ、Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１０６Ｉ、Ｌ１０６Ｒ、Ｉ１０８Ｆ、Ｉ１０８Ｖ、Ｎ１１０Ｋ、Ｑ１１３Ｈ、Ｉ１１７Ｌ、および／またはＰ１２１Ｓを有する。これらの実施形態のうちのいくつかでは、野生型または非改変ＣＴＬＡ−４ポリペプチドと比較して、ＩＣＯＳＬに対する増加した結合親和性を示す変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、非改変または野生型ＣＴＬＡ−４の細胞外ドメインまたはそのＩｇＶドメイン中に、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２の番号付けに関して、１つ以上のアミノ酸置換Ｖ１０Ａ，Ｌ１２Ｆ、Ｒ１６Ｈ、Ｉ１８Ｔ、Ｉ１８Ｖ、Ａ１９Ｖ、Ａ２６Ｔ、Ｇ２９Ｗ、Ｅ３３Ｖ、Ｒ３５Ｋ、Ａ４２Ｖ，Ｑ４５Ｈ、Ｔ４７Ａ、Ｔ５３Ｓ、Ｍ５５Ｔ、Ｍ５６Ｋ、Ｍ５６Ｔ、Ｎ５８Ｄ、Ｎ５８Ｓ、Ｌ６３Ｐ、Ｄ６４Ｅ、Ｄ６４Ｖ、Ｉ６７Ｎ、Ｉ６７Ｖ、Ｓ７２Ｇ、Ｑ８２Ｈ、Ｑ８２Ｒ、Ｒ８５Ｇ、Ｍ８７Ｋ、Ｍ８７Ｔ、Ｍ８７Ｖ、Ｔ８９Ａ、Ｔ８９Ｓ、Ｉ９３Ｖ、Ｅ９７Ｑ、Ｌ９８Ｑ、Ｍ９９Ｌ、Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１０６Ｉ、Ｌ１０６Ｒ、Ｉ１０８Ｆ、Ｉ１０８Ｖ、Ｎ１００Ｋ、および／またはＩ１１７Ｌを有する。これらの実施形態のうちのいくつかでは、野生型または非改変ＣＴＬＡ−４ポリペプチドと比較して、ＩＣＯＳＬに対する増加した結合親和性を示す変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、非改変または野生型ＣＴＬＡ−４の細胞外ドメインまたはそのＩｇＶドメイン中に、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２の番号付けに関して、１つ以上のアミノ酸置換Ｌ１２Ｆ、Ｉ１８Ｔ、Ｉ１８Ｖ、Ａ２６Ｔ、Ｇ２９Ｗ、Ｅ３３Ｖ、Ａ４２Ｖ、Ｑ４５Ｈ、Ｔ５３Ｓ、Ｍ５５Ｔ、Ｍ５６Ｋ、Ｎ５８Ｄ、Ｎ５８Ｓ、Ｌ６３Ｐ、Ｄ６４��、Ｉ６７Ｎ、Ｉ６７Ｖ、Ｓ７２Ｇ、Ｑ８２Ｈ、Ｒ８５Ｇ、Ｍ８７Ｋ、Ｍ８７Ｖ、Ｔ８９Ａ、Ｔ８９Ｓ、Ｉ９３Ｖ、Ｅ９７Ｑ、Ｌ９８Ｑ、Ｍ９９Ｉ、Ｍ９９Ｌ、Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１０６Ｉ、Ｌ１０６Ｒ、Ｉ１０８Ｆ、Ｉ１０８Ｖ、Ｎ１１０Ｋ、および／またはＮ１１７Ｌを有する。これらの実施形態のうちのいくつかでは、野生型または非改変ＣＴＬＡ−４ポリペプチドと比較して、ＩＣＯＳＬに対する増加した結合親和性を示す変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、非改変または野生型ＣＴＬＡ−４の細胞外ドメインまたはそのＩｇＶドメイン中に、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２の番号付けに関して、１つ以上のアミノ酸置換Ｉ１８Ｔ、Ａ２６Ｔ、Ｇ２９Ｗ、Ｔ５３Ｓ、Ｍ５５Ｔ、Ｍ５６Ｋ、Ｎ５８Ｓ、Ｌ６３Ｐ、Ｓ７２Ｇ、Ｌ９８Ｑ、Ｍ９９Ｌ、Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１０６Ｉ、および／またはＮ１１７Ｌを有する。いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、そのようなアミノ酸置換のうちの少なくとも２、３、４、または５を有し、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２または３に記載の配列を含む、野生型または非改変ＣＴＬＡ−４ポリペプチドなど、野生型または非改変ＣＴＬＡ−４ポリペプチドと比較して、ＩＣＯＳＬの外部ドメインとの増加した結合を示す。いくつかの実施形態では、アミノ酸置換は、Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ／Ｉ１１７Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｍ５５Ｔ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ６３Ｐ／Ｑ８２Ｈ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｉ１８Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｔ６１Ａ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｖ３８Ｉ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｉ９３Ｌ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１２Ｉ／Ｍ５５Ｔ／Ｍ５６Ｖ／Ｉ６７Ｔ／Ｍ９９Ｌ／Ｌ１０６Ｒ／Ｉ１０８Ｆ、Ｉ１８Ｎ／Ａ２６Ｔ／Ｌ６３Ｈ／Ｔ８９Ａ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｔ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｄ６４Ｎ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｉ１８Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｍ８７Ｋ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｋ／Ｍ９９Ｌ／Ｌ１０６Ｒ、Ｌ６３Ｐ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｉ１０８Ｆ、Ｇ２９Ｗ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ａ２６Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｄ６５Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｖ１０Ａ／Ｌ６３Ｐ／Ｄ６４Ｖ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｉ１８Ｖ／Ａ２６Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｄ６４Ｅ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｒ／Ｎ１１０Ｋ、Ａ１９Ｖ／Ｇ２９Ｗ／Ｒ３５Ｋ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｔ６９Ｉ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１２Ｆ／Ｒ１６Ｈ／Ｇ２９Ｗ／Ｍ５６Ｔ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ａ２６Ｔ／Ｔ５３Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ／Ｉ１１７Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｓ７２Ｇ／Ｑ７６Ｒ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ／Ｑ１１３Ｈ、Ｇ２９Ｗ／Ｎ５８Ｄ／Ｉ６７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｉ６７Ｖ／Ｓ７２Ｇ／Ｑ８２Ｈ／Ｔ８９Ａ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｓ７２Ｇ／Ｒ８５Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ、Ａ２６Ｔ／Ｔ４７Ａ／Ｍ５６Ｋ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｑ８２Ｒ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ａ２６Ｔ／Ｍ５５Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｍ８７Ｋ／Ｉ９３Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｌ６３Ｐ／Ｑ８２Ｈ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｉ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｉ１０８Ｖ、Ａ２６Ｔ／Ａ４２Ｖ／Ｑ４５Ｈ／Ｉ６７Ｎ／Ｍ８７Ｋ／Ｅ９７Ｑ／Ｍ９９Ｌ、Ｅ３３Ｍ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｍ８７Ｋ／Ｔ８９Ｓ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｉ１０８Ｖ／Ｉ１１７Ｌ、Ｉ１８Ｔ／Ｔ６１Ｒ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｅ３３Ｍ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｉ１０８Ｆ、Ｇ２９Ｗ／Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｐ１２１Ｓ、Ｇ２９Ｗ／Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｉ１０８Ｖ、Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｉ１８Ｔ／Ａ２６Ｔ／Ｍ５５Ｔ／Ｍ５６Ｋ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｉ１８Ｔ／Ａ２６Ｔ／Ｍ５６Ｋ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｔ５３Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ、Ｔ５３Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｙ１０５Ｌ、Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｅ３３Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｅ３３Ｖ／Ｍ９９Ｌ、Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ、Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｎ５８Ｓ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｔ５３Ｓ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｍ５６Ｋ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｅ３３Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ、Ｌ１２Ｆ／Ｒ１６Ｈ／Ｇ２９Ｗ／Ｍ５６Ｔ／Ｙ１０５Ｌ、またはＬ１２Ｆ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌである。いくつかの実施形態では、アミノ酸置換は、Ｇ２９Ｗ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ６３Ｐ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｉ１０８Ｆ、Ｉ１８Ｖ／Ａ２６Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｄ６４Ｅ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｒ／Ｎ１１０Ｋ、Ｇ２９Ｗ／Ｎ５８Ｄ／Ｉ６７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｉ６７Ｖ／Ｓ７２Ｇ／Ｑ８２Ｈ／Ｔ８９Ａ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｓ７２Ｇ／Ｒ８５Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ、Ｇ２９Ｗ／Ｍ８７Ｋ／Ｉ９３Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｌ６３Ｐ／Ｑ８２Ｈ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｉ／Ｙ１０５Ｌ、Ａ２６Ｔ／Ａ４２Ｖ／Ｑ４５Ｈ／Ｉ６７Ｎ／Ｍ８７Ｋ／Ｅ９７Ｑ／Ｍ９９Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｍ８７Ｋ／Ｔ８９Ｓ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｉ１０８Ｖ／Ｉ１１７Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｉ１０８Ｖ、Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｉ１８Ｔ／Ａ２６Ｔ／Ｍ５５Ｔ／Ｍ５６Ｋ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｉ１８Ｔ／Ａ２６Ｔ／Ｍ５６Ｋ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｔ５３Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ、Ｔ５３Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｙ１０５Ｌ、Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｅ３３Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｅ３３Ｖ／Ｍ９９Ｌ、Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｎ５８Ｓ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｔ５３Ｓ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｍ５６Ｋ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｅ３３Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ、またはＬ１２Ｆ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌである。いくつかの実施形態では、上記の置換のうちのいずれも、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２に記載のＣＴＬＡ−４細胞外ドメイン中にあり、例えば、表２に記載の例示的な配列番号を参照されたい。いくつかの実施形態では、上記の置換のうちのいずれも、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：３に記載のＣＴＬＡ−４細胞外ドメイン中にあり、例えば、表２に記載の例示的な配列番号を参照されたい。
【０２４１】
いくつかの実施形態では、野生型または非改変ＣＴＬＡ−４ポリペプチド中に含有されるＩｇＳＦドメインに対して、少なくとも１つの親和性改変ＩｇＳＦドメイン（例えば、ＩｇＶ）またはその特異的結合断片を有する細胞外ドメインを含有する、提供される変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、１つ以上の結合パートナーへの結合時の野生型または非改変ＣＴＬＡ−４ポリペプチドと比較して、ＣＤ８０、ＣＤ８６、および／またはＩＣＯＳＬなどのＣＴＬＡ−４の１つ以上の結合パートナーによって係合されることができる刺激受容体による、変化したシグナル伝達（例えば、シグナル伝達の減少／抑制）を示す。いくつかの態様では、刺激受容体は、Ｔ細胞の表面上に発現され、かつ細胞内シグナルに反応してサイトカインを放出することができる、ＣＤ２８またはＩＣＯＳである。いくつかの実施形態では、変化したシグナル伝達は、例えば、特定された変異型および／または野生型または非改変ＣＴＬＡ−４ポリペプチドによるインキュベーションの後にサイトカイン放出（例えば、ＩＬ−２放出またはＩＦＮ−ガンマ）を測定するアッセイによって判定されるものと同じ形式（例えば、Ｆｃ融合タンパク質）において、野生型または非改変ＣＴＬＡ−４ポリペプチド制御配列によって影響を受けるシグナル伝達とは異なる。例示的なアッセイを、実施例に記載する。場合によっては、アッセイは、混合リンパ球反応などの細胞に基づくアッセイであり、得られた読み出しまたは機能は、アッセイにおいて細胞の表面上に発現される機能的結合パートナーのシグナル伝達活性の合計である。本明細書のいずれかで考察されるように、いくつかの実施形態では、提供される変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドの形式は、活性の種類、例えば、アゴニストまたはアンタゴニストに影響を与え得る。いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、ＩｇＶドメインおよびＦｃドメインなどのなどの多量体化ドメインを含有する細胞外ドメインまたはその特異的結合断片の融合タンパク質であり、変化したシグナル伝達は、刺激受容体の活性を阻害するためのアンタゴニストアッセイに起因する。他の態様では、本形式は、刺激受容体の増加したまたはアゴニスト活性をもたらし得る。
【０２４２】
ＩＩＩ．変異型ポリペプチドの形式
本明細書に提供される変異型ＣＴＬＡ−４を含む免疫調節ポリペプチドは、可溶性タンパク質、膜結合タンパク質、または分泌タンパク質を含む、様々な方法で形式化され得る。いくつかの実施形態では、特定の形式は、所望の治療用途のために選択され得る。場合によっては、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドを含む免疫調節ポリペプチドは、ＣＤ２８および／またはＩＣＯＳの活性を、その結合パートナー（例えば、ＩＣＯＳＬ、ＣＤ８０、および／またはＣＤ８６）との結合によって拮抗または阻害し、それによって、ＣＤ２８および／またはＩＣＯＳ共刺激シグナル伝達を防止するための形式で提供される。いくつかの実施形態では、ＣＤ２８および／またはＩＣＯＳＬの拮抗作用が、例えば、自己免疫学において、免疫性を抑制するか、または抑えるために有用であり得る。いくつかの実施形態では、ＣＤ２８および／またはＩＣＯＳＬの拮抗作用が、炎症または自己免疫を治療するために有用であり得る。場合によっては、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドを含む免疫調節ポリペプチドは、ＣＴＬＡ−４抑制受容体が活性化受容体に変換される（例えば、ＩＴＡＭシグナル伝達ドメインにより）スイッチ受容体として細胞上に発現され、かつ／または細胞内シグナル伝達ドメインを有しないデコイ受容体として細胞上に発現される。いくつかの実施形態では、ＣＴＬＡ−４活性化受容体またはデコイ受容体は、癌の治療に有用であり得る。当業者であれば、１つ以上の特異的結合パートナーを拮抗、競合および／もしくは阻害するか、または１つ以上の下流シグナル伝達経路を活性化するなどのために、特定の形式の活性を容易に判定することができる。実施例を含む、そのような活性を評価するための例示的な方法を、本明細書に提供する。
【０２４３】
いくつかの態様では、例えば、Ｆｃ鎖に融合される、そのようなタンパク質が可溶性であるＣＴＬＡ−４のｖＩｇＤを含む免疫調節タンパク質を提供する。いくつかの態様では、１つ以上の追加のｖＩｇＤなどの１つ以上の追加のＩｇＳＦドメインは、本明細書に提供されるようなＣＴＬＡ−４のｖＩｇＤに連結され得る（以後、「積層」または「積層された」免疫調節タンパク質と呼ばれる）。いくつかの実施形態では、モジュール形式の提供される免疫調節タンパク質は、複数のカウンター構造（複数の同種結合パートナー）の活性を調節するために、免疫調節タンパク質を操作または作成するための可撓性を提供する。いくつかの実施形態では、そのような「積層」分子が、可溶性形式において提供され得るか、または場合によっては、膜結合または分泌タンパク質として提供され得る。いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４免疫調節タンパク質は、例えば、対象に投与された場合など、ｖＩｇＤを標的化するか、または特定の環境または細胞に局在させるために、リガンド、例えば、抗原に特異的に結合する標的化剤または部分、例えば、抗体または他の結合分子に、直接または間接的に連結されているＣＴＬＡ−４のｖＩｇＤが含有されるコンジュゲートとして提供される。いくつかの実施形態では、標的化剤、例えば、抗体または他の結合分子は、脾臓、脾臓、扁桃、リンパ管、リンパ節、咽頭扁桃、および肝臓などの白血球、リンパ球、またはリンパ組織の表面上で抗原に結合し、それによってｖＩｇＤを含有する変異型ＣＴＬＡ−４を免疫系に局在させ、例えば、免疫系内の白血球またはリンパ球の活性を調節する。
【０２４４】
いくつかの実施形態では、提供される免疫調節タンパク質は、細胞内または上に発現され、操作された細胞治療（ＥＣＴ）の一部として提供される。いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、膜結合形態で、免疫細胞（例えば、Ｔ細胞または抗原提示細胞）などの細胞上に発現され、それによって膜貫通免疫調節タンパク質（以後、「ＴＩＰ」とも呼ばれる）を提供する。いくつかの態様では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、分泌可能な形態で、免疫細胞（例えば、Ｔ細胞または抗原提示細胞）などの細胞中に発現され、それによって細胞が対象に投与されたときなどに、分泌または可溶性形態の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド（以後、「ＳＩＰ」とも呼ばれる）を生成する。いくつかの態様では、ＳＩＰは、分泌される環境（例えば、免疫微小環境）において結合パートナーと拮抗し得る。いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、対象への投与時に、細胞中のＴＩＰまたはＳＩＰとしての変異型ポリペプチドの送達または発現のために、免疫細胞（例えば、Ｔ細胞または抗原提示細胞）などの細胞に生体内で影響を与えることができる感染性病原体（例えば、ウイルスまたは細菌性病原体）中に発現される。
【０２４５】
いくつかの実施形態では、ｖＩｇＤを含有する変異型ＣＴＬＡ−４などの可溶性免疫調節ポリペプチドは、提供されるコンジュゲートのうちの任意の１つ（例えば、標的指向部分）または任意の組み合わせにそれ自体がコンジュゲートされ得るリポソーム内に封入され得る。いくつかの実施形態では、本発明の可溶性または膜結合免疫調節ポリペプチドは、脱グリコシル化される。より具体的な実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４配列は、脱グリコシル化される。さらにより具体的な実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４のＩｇＶドメインまたはＥＣＤは、脱グリコシル化される。
【０２４６】
提供される形式の非制限的な例は、図１に記載されており、以下にさらに記載される。
【０２４７】
Ａ．可溶性タンパク質
いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドを含有する免疫調節タンパク質は、可溶性タンパク質である。当業者であれば、細胞表面タンパク質が、典型的には、細胞内ドメイン、膜貫通ドメイン、および細胞外ドメイン（ＥＣＤ）を有し、そのようなタンパク質の可溶性形態は、細胞外ドメインまたはその免疫学的に活性な部分配列を使用して作製され得ることを理解するであろう。したがって、いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドを含有する免疫調節タンパク質は、膜貫通ドメインまたは膜貫通ドメインの一部分を欠いている。いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４を含有する免疫調節タンパク質は、細胞内（細胞質）ドメインまたは細胞内ドメインの一部分を欠いている。いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドを含有する免疫調節タンパク質は、ＩｇＶドメインを含有するＥＣＤドメインもしくはその一部分、またはアミノ酸改変を含有するドメインもしくはその特異的結合断片を含有するｖＩｇＤ部分のみを含有する。いくつかの態様では、そのような可溶性ポリペプチドを使用して、ＣＤ２８およびＩＣＯＳの活性を阻害および／または拮抗させ、それによって免疫反応を抑制または弱体化することができる。いくつかの実施形態では、提供されるような可溶性変異型ＣＴＬＡ−４免疫調節タンパク質（例えば、変異型ＣＴＬＡ−４−Ｆｃ）は、自己免疫または炎症の症状を治療するための方法において使用することができる。
【０２４８】
いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４を含む免疫調節ポリペプチドは、本発明の１つ以上の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドを含み得る。いくつかの実施形態では、本発明のポリペプチドは、ちょうど１、２、３、４、または５つの変異型ＣＴＬＡ−４配列を含むであろう。いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４配列のうちの少なくとも２つは、同一の変異型ＣＴＬＡ−４配列である。
【０２４９】
いくつかの実施形態では、提供される免疫調節ポリペプチドは、ＣＴＬＡ−４の２つ以上のｖＩｇＤ配列を含む。ポリペプチド鎖内の複数の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、互いに同一（すなわち、同じ種）であり得るか、または同一でない（すなわち、異なる種）変異型ＣＴＬＡ−４配列であり得る。単鎖ポリペプチド実施形態に加えて、いくつかの実施形態では、本発明のポリペプチドのうちの２、３、４つ以上が、互いに共有的または非共有的に付着され得る。したがって、単量体、二量体、およびより高次の（例えば、３、４、５以上の）多量体タンパク質を、本明細書に提供する。例えば、いくつかの実施形態では、本発明のちょうど２つのポリペプチドが、二量体を形成するように、互いに共有的または非共有的に付着され得る。いくつかの実施形態では、鎖間システインジスルフィド結合を介して、付着される。本発明の２つ以上のポリペプチドを含む組成物は、同一の種もしくは略同一の種のポリペプチド（例えば、ホモ二量体）または非同一種のポリペプチド（例えば、ヘテロ二量体）からなり得る。本発明の複数の連結されたポリペプチドを有する組成物は、上記のように、ポリペプチド鎖における本発明の１つ以上の同一または非同一の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドを有し得る。
【０２５０】
いくつかの実施形態では、免疫調節タンパク質は、免疫グロブリンＦｃに付着された変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドを含む（ＣＴＬＡ−４  ｖＩｇＤ−Ｆｃ融合とも称される「ＣＴＬＡ−４−Ｆｃ変異型融合」などの「免疫調節Ｆｃ融合」を生じる）。いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドの付着は、ＦｃのＮ末端である。いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドの付着は、ＦｃのＣ末端にある。いくつかの実施形態では、２つ以上のＣＴＬＡ−４変異型ポリペプチド（同じであるか、または異なる）は、独立して、Ｎ末端およびＣ末端に付着される。
【０２５１】
いくつかの実施形態では、Ｆｃは、ネズミまたはヒトＦｃである。いくつかの実施形態では、Ｆｃは、哺乳動物またはヒトＩｇＧｌ、ｌｇＧ２、ｌｇＧ３、もしくはｌｇＧ４のＦｃ領域である。いくつかの実施形態では、Ｆｃは、ヒトＩｇＧ１などのＩｇＧ１に由来する。いくつかの実施形態では、Ｆｃは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：５３３に記載のアミノ酸配列、またはＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：５３３と少なくとも８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％以上の配列同一性を示すアミノ酸の配列を含む。
【０２５２】
いくつかの実施形態では、Ｆｃ領域は、その正常な機能のうちの１つ以上を変化（例えば、減少）させるような１つ以上の改変を含有する。概して、Ｆｃ領域は、免疫グロブリンの主な機能である抗原結合能に加えて、補体依存的細胞傷害性（ＣＤＣ）ａｎｄ抗体依存的細胞傷害性（ＡＤＣＣ）などのエフェクター機能に関与している。追加的に、Ｆｃ領域に存在するＦｃＲｎ配列は、生体内ＦｃＲｎ受容体へのコンジュゲーションにより、生体内半減期を増加させることによって、血清中のＩｇＧレベルを調節する役割を果たす。いくつかの実施形態では、そのような機能は、提供されるＦｃ融合タンパク質とともに使用するために、Ｆｃにおいて低減または変化され得る。
【０２５３】
いくつかの実施形態では、１つ以上のアミノ酸改変は、本明細書に提供されるＣＴＬＡ−４−Ｆｃ変異型融合のＦｃ領域に導入され、それによってＦｃ領域変異型を作成し得る。いくつかの実施形態では、Ｆｃ領域変異型は、減少したエフェクター機能を有する。エフェクター機能を変化させ得るＦｃ配列への変化または変異の多くの例がある。例えば、ＷＯ２０００／０４２０７２、ＷＯ２００６／０１９４４７、ＷＯ２０１２／１２５８５０、ＷＯ２０１５／１０７０２６、ＵＳ２０１６／００１７０４１、およびＳｈｉｅｌｄｓ  ｅｔ  ａｌ．，Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．，２７６（９）：６５９１−６６０４（２００１）は、ＦｃＲへの改善または縮小された結合での例示的なＦｃ変異型を記載している。これらの公報の内容は、特に、参照により本明細書に組み込まれる。
【０２５４】
いくつかの実施形態では、提供される変異型ＣＴＬＡ−４−Ｆｃ融合は、低減されたエフェクター機能を示すＦｃ領域を含み、これにより、望ましい適用候補となっており、ＣＴＬＡ−４−Ｆｃ変異型融合の生体内での半減期は重要であるが、特定のエフェクター機能（ＣＤＣおよびＡＤＣＣなど）は、不要であるか、または有害である。生体外および／または生体内で細胞傷害性アッセイを行って、ＣＤＣおよび／またはＡＤＣＣ活性の低減／枯渇を確認することができる。例えば、Ｆｃ受容体（ＦｃＲ）結合アッセイを行って、ＣＴＬＡ−４−Ｆｃ変異型融合が、ＦｃγＲ結合を欠いている（それゆえ、ＡＤＣＣ活性を欠いている可能性が高い）が、ＦｃＲｎ結合能を保持することを確実にすることができる。ＡＤＣＣ、ＮＫ細胞を仲介するための初代細胞は、ＦｃγＲＩＩＩのみを発現し、単球は、ＦｃγＲＩ、ＦｃγＲＩＩ、およびＦｃγＲＩＩＩを発現する。造血細胞上のＦｃＲ発現は、Ｒａｖｅｔｃｈ  ａｎｄ  Ｋｉｎｅｔ，Ａｎｎｕ．Ｒｅｖ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．，９：４５７−４９２（１９９１）の４６４頁の表３に要約されている。
【０２５５】
対象となる分子のＡＤＣＣ活性を評価するためのインビトロアッセイの非限定的な例は、米国特許第５，５００，３６２号（例えば、Ｈｅｌｌｓｔｒｏｍ  ｅｔ  ａｌ．，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ，８３（１８）：７０５９−７０６３（１９８６）を参照されたい）およびＨｅｌｌｓｔｒｏｍ  ｅｔ  ａｌ．，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ，８２（５）：１４９９−１５０２（１９８５）、米国特許第５，８２１，３３７号（Ｂｒｕｇｇｅｍａｎｎ  ｅｔ  ａｌ．，Ｊ．Ｅｘｐ．Ｍｅｄ．１６６（５）：１３５１−１３６１（１９８７）を参照されたい）に記載されている。代替的に、非放射性アッセイ方法を用いることができる（例えば、フローサイトメトリーのためのＡＣＴＩ（商標）非放射性細胞傷害性アッセイ（ＣｅｌｌＴｅｃｈｎｏｌｏｇｙ，  Ｉｎｃ．Ｍｏｕｎｔａｉｎ  Ｖｉｅｗ，  Ｃａｌｉｆ．）、およびＣｙｔｏＴｏｘ９６（商標）非放射性細胞傷害性アッセイ（Ｐｒｏｍｅｇａ，  Ｍａｄｉｓｏｎ，Ｗｉｓ．）を参照されたい。そのようなアッセイのために有用なエフェクター細胞には、末梢血液単核細胞（ＰＢＭＣ）およびナチュラルキラー（ＮＫ）細胞が含まれる。代替的に、または追加的に、対象となる分子のＡＤＣＣ活性は、例えば、Ｃｌｙｎｅｓ  ｅｔ  ａｌ．，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ，９５（２）：６５２−６５６（１９９８）に開示されているものなどの動物モデルにおける生体内で評価され得る。
【０２５６】
Ｃ１ｑ結合アッセイを実行して、ＣＴＬＡ−４−Ｆｃ変異型融合が、Ｃ１ｑに結合することができず、それゆえ、ＣＤＣ活性を欠いていることを確認することもできる。例えば、ＷＯ２００６／０２９８７９およびＷＯ２００５／１００４０２におけるＣ１ｑおよびＣ３ｃ結合ＥＬＩＳＡを参照されたい。補体活性化を評価するために、ＣＤＣアッセイを行うことができる（例えば、Ｇａｚｚａｎｏ−Ｓａｎｔｏｒｏ  ｅｔ  ａｌ．，Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．Ｍｅｔｈｏｄｓ，２０２：１６３（１９９７）、Ｃｒａｇｇ  ｅｔ  ａｌ．，Ｂｌｏｏｄ，１０１（３）：１０４５−１０５２（２００３）、およびＣｒａｇｇ  ａｎｄ  Ｇｌｅｎｎｉｅ，Ｂｌｏｏｄ，１０３（７）：２７３８−２７４３（２００４）を参照されたい）。当該技術分野で知られている方法を使用して、ＦｃＲｎ結合および生体内クリアランス／半減期の決定を行うこともできる（例えば、Ｐｅｔｋｏｖａ  ｅｔ  ａｌ．，Ｉｎｔ．  Ｉｍｍｕｎｏｌ．，１８（１２）：１７５９−１７６９（２００６）を参照されたい）。
【０２５７】
エフェクター機能が低減されたＣＴＬＡ−４−Ｆｃ変異型融合には、ＥＵ番号付けによるＦｃ領域残基２３８、２６５、２６９、２７０、２９７、３２７、および３２９のうちの１つ以上の置換を有するものが含まれる（米国特許第６，７３７，０５６号）。そのようなＦｃ変異体には、残基２６５および２９７のアラニンへの置換を含む、いわゆる「ＤＡＮＡ」Ｆｃ変異体を含む、ＥＵ番号付けによるアミノ酸位置２６５、２６９、２７０、２９７、および３２７のうちの２つ以上の置換を有するＦｃ変異体が含まれる（米国特許第７，３３２，５８１号）。
【０２５８】
いくつかの実施形態では、ＣＴＬＡ−４−Ｆｃ変異型融合のＦｃ領域は、位置２３４、２３５、２３６、２３７、２３８、２３９、２７０、２９７、２９８、３２５、および３２９（ＥＵ番号付けによって示される）のアミノ酸のうちのいずれか１つ以上が、天然型Ｆｃ領域と比較して、異なるアミノ酸と置換される、Ｆｃ領域を有する。Ｆｃ領域のそのような変化は、上記に記載されている変化に限定されず、例えば、Ｓｔｏｈｌ，Ｃｕｒｒ．Ｏｐｉｎ．Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．，２０（６）：６８５−６９１（２００９）に記載される脱グリコシル化した鎖（Ｎ２９７ＡおよびＮ２９７Ｑ）、ＩｇＧ１−Ｎ２９７Ｇ、ＩｇＧ１−Ｌ２３４Ａ／Ｌ２３５Ａ、ＩｇＧ１−Ｌ２３４Ａ／Ｌ２３５Ｅ／Ｇ２３７Ａ、ＩｇＧ１−Ａ３２５Ａ／Ａ３３０Ｓ／Ｐ３３１Ｓ、ＩｇＧ１−Ｃ２２６Ｓ／Ｃ２２９Ｓ、ＩｇＧ１−Ｃ２２６Ｓ／Ｃ２２９Ｓ／Ｅ２３３Ｐ／Ｌ２３４Ｖ／Ｌ２３５Ａ、ＩｇＧ１−Ｅ２３３Ｐ／Ｌ２３４Ｖ／Ｌ２３５Ａ／Ｇ２３６ｄｅｌ／Ｓ２６７Ｋ、ＩｇＧ１−Ｌ２３４Ｆ／Ｌ２３５Ｅ／Ｐ３３１Ｓ、ＩｇＧ１−Ｓ２６７Ｅ／Ｌ３２８Ｆ、ＩｇＧ２−Ｖ２３４Ａ／Ｇ２３７Ａ、ＩｇＧ２−Ｈ２６８Ｑ／Ｖ３０９Ｌ／Ａ３３０Ｓ／Ａ３３１Ｓ、ＩｇＧ４−Ｌ２３５Ａ／Ｇ２３７Ａ／Ｅ３１８Ａ、およびＩｇＧ４−Ｌ２３６Ｅなどの変化、ＷＯ２００８／０９２１１７に記載されるＧ２３６Ｒ／Ｌ３２８Ｒ、Ｌ２３５Ｇ／Ｇ２３６Ｒ、Ｎ３２５Ａ／Ｌ３２８Ｒ、およびＮ３２５ＬＬ３２８Ｒなどの変化、位置２３３、２３４、２３５、および２３７（ＥＵ番号付けによって示される）のアミノ酸挿入、ならびにＷＯ２０００／０４２０７２に記載される部位の変化を含む。
【０２５９】
改善または縮小された結合を有する特定のＦｃ変異多が記載されている。（例えば、米国特許第６，７３７，０５６号、ＷＯ２００４／０５６３１２、ＷＯ２００６０１９４４７、およびＳｈｉｅｌｄｓ  ｅｔ  ａｌ．，Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．，２７６（９）：６５９１−６６０４（２００１）を参照されたい）。
【０２６０】
いくつかの実施形態では、半減期を改善し、かつ／または新生児Ｆｃ受容体（ＦｃＲｎ）への結合を改善する１つ以上のアミノ酸置換を含む変異型Ｆｃ領域を含むＣＴＬＡ−４−Ｆｃ変異型融合を提供する。増加した半減期およびＦｃＲｎへの改善された結合を有する抗体は、ＵＳ２００５／００１４９３４Ａ１（Ｈｉｎｔｏｎ  ｅｔ  ａｌ．）またはＷＯ２０１５１０７０２６に記載されている。こうした抗体は、Ｆｃ領域のＦｃＲｎへの結合を改善する１つ以上の置換を内部に有するＦｃ領域を含む。そのようなＦｃ変異型には、ＥＵ番号付けによるＦｃ領域残基２３８、２５６、２６５、２７２、２８６、３０３、３０５、３０７、３１１、３１２、３１７、３４０、３５６、３６０、３６２、３７６、３７８、３８０、３８２、４１３、４２４、または４３４のうちの１つ以上の置換、例えば、Ｆｃ領域残基４３４の置換を有するものが含まれる（米国特許第７，３７１，８２６号）。
【０２６１】
いくつかの実施形態では、ＣＴＬＡ−４−Ｆｃ変異型融合のＦｃ領域は、ＥＵ番号付けによる１つ以上のアミノ酸置換Ｅ３５６ＤおよびＭ３５８Ｌを含む。いくつかの実施形態では、ＣＴＬＡ−４−Ｆｃ変異型融合のＦｃ領域は、ＥＵ番号付けによる１つ以上のアミノ酸置換Ｃ２２０Ｓ、Ｃ２２６Ｓ、および／またはＣ２２９Ｓを含む。いくつかの実施形態では、ＣＴＬＡ−４変異型融合のＦｃ領域は、ＥＵ番号付けによる１つ以上のアミノ酸置換Ｒ２９２ＣおよびＶ３０２Ｃを含む。Ｆｃ領域変異型の他の例に関する、Ｄｕｎｃａｎ  ＆  Ｗｉｎｔｅｒ，Ｎａｔｕｒｅ，３３２（６１６６）：７３８−４０（１９８８）、米国特許第５，６４８，２６０号、米国特許第５，６２４，８２１号、およびＷＯ９４／２９３５１も参照されたい。
【０２６２】
いくつかの実施形態では、野生型ＩｇＧ１  Ｆｃは、ＥＵ番号付けによる位置３５６および３５８の残基Ｇｌｕ（Ｅ）およびＭｅｔ（Ｍ）を含有するアロタイプ（例えば、ｆアロタイプ）を有するＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：５３３に記載のＦｃであり得る。他の実施形態では、野生型ＩｇＧ１  Ｆｃは、例えば、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：６３８に記載されるような、位置３５６および３５８にＡｓｐ（Ｄ）およびＬｅｕ（Ｌ）を含有する残基など、ヒトＧ１ｍ１アロタイプのアミノ酸を含有する。したがって、場合によっては、本明細書に提供されるＦｃは、アロタイプＧ１  ｍ１（例えば、アルファアロタイプ）の残基を再構築するためのアミノ酸置換Ｅ３５６ＤおよびＭ３５８Ｌを含有し得る。いくつかの態様では、野生型Ｆｃは、エフェクター活性を低減させるか、またはＦｃエフェクター機能に対してＦｃを不活性にするための１つ以上のアミノ酸置換によって改変される。例示的なエフェクターレスまたは不活性変異には、本明細書に記載されるものが含まれる。本明細書に提供される構築物のＦｃに含まれ得るエフェクターレス変異の中には、ＥＵ番号付けによるＬ２３４Ａ、Ｌ２３５Ｅ、およびＧ２３７Ａがある。いくつかの実施形態では、野生型Ｆｃは、ＥＵ番号付けによる位置２２０（Ｃ２２０Ｓ）のセリン残基とのシステイン残基の交換によってなど、１つ以上のシステイン残基の除去によってさらに改変される。低減されたエフェクター機能を有する例示的な不活性Ｆｃ領域は、それぞれ、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：５３３またはＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：６３８に記載のアロタイプに基づいている、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：５２６およびＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：４３８または４３９に記載されている。いくつかの実施形態では、本明細書に提供される構築物において使用されるＦｃ領域は、Ｃ末端リジン残基をさらに欠いている可能性がある。
【０２６３】
いくつかの実施形態では、例えば、米国特許第６，１９４，５５１号、ＷＯ９９／５１６４２、およびＩｄｕｓｏｇｉｅ  ｅｔ  ａｌ．，Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．，１６４（８）：４１７８−４１８４（２０００）に記載されているように、Ｃ１ｑ結合および／または補体依存的細胞傷害性（ＣＤＣ）の縮小をもたらすＦｃ領域において、変化される。
【０２６４】
いくつかの実施形態では、１つ以上のアミノ酸改変を含む変異型Ｆｃ領域を含むＣＴＬＡ−４−Ｆｃ変異型融合であって、変異型Ｆｃ領域が、ヒトＩｇＧ１などのＩｇＧ１に由来する、ＣＴＬＡ−４−Ｆｃ変異型融合を提供する。いくつかの実施形態では、変異型Ｆｃ領域は、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：５３３に記載のアミノ酸配列に由来する。いくつかの実施形態では、Ｆｃは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：５３３の番号付け（ＥＵ番号付けによるＮ２９７Ｇに対応する）によるＮ８２Ｇである少なくとも１つのアミノ酸置換を含有する。いくつかの実施形態では、Ｆｃは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：５３３の番号付け（ＥＵ番号付けによるＲ２９２ＣまたはＶ３０２Ｃに対応する）によるＲ７７ＣまたはＶ８７Ｃである少なくとも１つのアミノ酸置換をさらに含有する。いくつかの実施形態では、変異型Ｆｃ領域は、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：５３３の番号付け（ＥＵ番号付けによるＣ２２０Ｓに対応する）によるＣ５Ｓアミノ酸改変をさらに含む。例えば、いくつかの実施形態では、変異型Ｆｃ領域は、以下のアミノ酸改変：
【０２６５】
ＥＵ番号付けによるＶ２９７Ｇ、ならびに以下のアミノ酸改変Ｃ２２０Ｓ、Ｒ２９２Ｃ、またはＶ３０２Ｃのうちの１つ以上（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：５３３に対して、Ｎ８２Ｇ、ならびに以下のアミノ酸改変Ｃ５Ｓ、Ｒ７７Ｃ、またはＶ８７Ｃのうちの１つ以上に対応する）を含み、例えば、Ｆｃ領域は、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：４４０に記載の配列を含む。いくつかの実施形態では、変異型Ｆｃ領域は、アミノ酸改変Ｃ２２０Ｓ、Ｌ２３４Ａ、Ｌ２３５Ｅ、またはＧ２３７Ａのうちの１つ以上を含み、例えば、Ｆｃ領域は、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：４４１に記載の配列を含む。いくつかの実施形態では、変異型Ｆｃ領域は、アミノ酸改変Ｃ２２０Ｓ、Ｌ２３５Ｐ、Ｌ２３４Ｖ、Ｌ２３５Ａ、Ｇ２３６ｄｅｌ、またはＳ２６７Ｋのうちの１つ以上を含み、例えば、Ｆｃ領域は、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：４４２に記載の配列を含む。いくつかの実施形態では、変異型Ｆｃは、アミノ酸改変Ｃ２２０Ｓ、Ｌ２３４Ａ、Ｌ２３５Ｅ、Ｇ２３７Ａ、Ｅ３５６Ｄ、またはＭ３５８Ｌのうちの１つ以上を含み、例えば、Ｆｃ領域は、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：４３９に記載の配列を含む。
【０２６６】
いくつかの実施形態では、Ｆｃ領域は、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：５３３に記載の野生型または非改変Ｆｃの位置２３２に対応する（ＥＵ番号付けによるＫ４４７ｄｅｌに対応する）Ｃ末端リジンを欠いている。いくつかの態様では、そのようなＦｃ領域は、追加的に、記載されているいずれかなど、１つ以上の追加の改変、例えば、アミノ酸置換を含み得る。そのようなＦｃ領域の例は、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：４３８、５２６、５２７、または５２８に記載されている。
【０２６７】
いくつかの実施形態では、変異型Ｆｃ領域を含むＣＴＬＡ−４−Ｆｃ変異型融合であって、変異型Ｆｃが、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：４３８〜４４２もしくは５２６〜５２８のうちのいずれかに記載のアミノ酸の配列、またはＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：４３８〜４４２もしくは５２６〜５２８のうちのいずれかと少なくとも８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％以上の配列同一性を示すアミノ酸の配列を含む、ＣＴＬＡ−４−Ｆｃ変異型融合を提供する。
【０２６８】
いくつかの実施形態では、Ｆｃは、ヒトＩｇＧ２などのＩｇＧ２に由来する。いくつかの実施形態では、Ｆｃは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：５２９に記載のアミノ酸配列、またはＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：５２９と少なくとも８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％以上の配列同一性を示すアミノ酸の配列を含む。
【０２６９】
いくつかの実施形態では、Ｆｃは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：５３０に記載のヒトＩｇＧ４のアミノ酸配列、またはＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：５３０と少なくとも８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％以上の配列同一性を示すアミノ酸の配列を含む。いくつかの実施形態では、ＩｇＧ４  Ｆｃは、ヒトＩｇＧ４のＣＨ３ドメインがヒトＩｇＧ１のＣＨ３ドメインと置換され、かつ抑制された集合体の形成を示す安定化されたＦｃ、ヒトＩｇＧ４のＣＨ３およびＣＨ２ドメインがそれぞれヒトＩｇＧ１のＣＨ３およびＣＨ２ドメインと置換される抗体、またはヒトＩｇＧ４のＫａｂａｔらによって提案されているＥＵ指標に示される位置４０９のアルギニンがリジンと置換され、かつ抑制された集合体の形成を示す抗体である（例えば、米国特許第８，９１１，７２６号を参照されたい）。いくつかの実施形態では、Ｆｃは、治療抗体とＦａｂアーム交換による内因性ＩｇＧ４との間の組み換えを防止するために示されているＳ２２８Ｐ変異を含有するＩｇＧ４である（例えば、Ｌａｂｒｉｊｉｎ  ｅｔ  ａｌ．（２００９），Ｎａｔ．Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．，２７（８）７６７−７１を参照されたい）。いくつかの実施形態では、Ｆｃは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：５３１に記載のＳ２２８Ｐを有するヒトＩｇＧ４に記載のアミノ酸配列、またはＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：５３１と少なくとも８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％以上の配列同一性を示すアミノ酸の配列を含む。
【０２７０】
いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、Ｆｃ配列に間接的に連結されている。いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、リンカーなどを介して間接的に、Ｆｃ配列に連結されている。いくつかの実施形態では、１つ以上の「ペプチドリンカー」が、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドおよびＦｃドメインを連結する。いくつかの実施形態では、ペプチドリンカーは、単一アミノ酸残基以上の長さであり得る。いくつかの実施形態では、ペプチドリンカーは、少なくとも１つのアミノ酸残基を有するが、２０以下、１９、１８、１７、１６、１５、１４、１３、１２、１１、１０、９、８、７、６、５、４、３、２、または１つのアミノ酸残基の長さである。いくつかの実施形態では、リンカーは、３つのアラニン（ＡＡＡ）である。いくつかの実施形態では、リンカーは（１文字アミノ酸コードにおいて）、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：５３７（２ｘＧＧＧＧＳ）またはＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：５３６（３ｘＧＧＧＧＳ）などに記載の、２、３、４、または５つの４ＧＳリンカーの反復などの、ＧＧＧＧＳ（「４ＧＳ」、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：５３５）または４ＧＳリンカーの多量体である。いくつかの実施形態では、リンカー（１文字アミノ酸コードにおいて）は、ＧＳＧＧＧＧＳ（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：５３４）である。いくつかの実施形態では、リンカーは、３つのアラニンが続く２ｘＧＧＧＧＳである（ＧＧＧＧＳＧＧＧＧＳＡＡＡ、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：５３８）。
【０２７１】
いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２８６〜３７９、３８１〜３８６、または３８８〜４３７に記載のＣＴＬＡ−４−Ｆｃ配列のうちのいずれかを含む。いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２８６〜３７９、３８１〜３８６、または３８８〜４３７に記載のＣＴＬＡ−４−Ｆｃ配列のうちのいずれかと少なくとも９６％の同一性、９７％の同一性、９８％の同一性、または９９％の同一性など、少なくとも９０％の同一性、少なくとも９１％の同一性、少なくとも９２％の同一性、少なくとも９３％の同一性、少なくとも９４％の同一性、少なくとも９５％の同一性を示すポリペプチド配列を含み、野生型または非改変ＣＴＬＡ−４中に存在しない、アミノ酸改変、例えば、置換を含有する。いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２８６〜３７９、３８１〜３８６、または３８８〜４３７に記載のＣＴＬＡ−Ｆｃ配列のうちのいずれかの特異的結合断片を含み、野生型または非改変ＣＴＬＡ−４中に存在しない、アミノ酸改変、例えば、置換を含有する。
【０２７２】
いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４−Ｆｃ融合タンパク質は、Ｆｃドメインに連結されている２つの変異型ＣＴＬＡ−４  Ｆｃポリペプチドによって形成される二量体である。いくつかの実施形態では、二量体は、２つの変異型ＣＴＬＡ−４  Ｆｃポリペプチドが同じであるホモ二量体である。いくつかの実施形態では、二量体は、２つの変異型ＣＴＬＡ−４  Ｆｃポリペプチドが異なる、ヘテロ二量体である。
【０２７３】
変異型ＣＴＬＡ−４−Ｆｃ融合タンパク質をコードする核酸分子も提供する。いくつかの実施形態では、Ｆｃ融合タンパク質の生成のために、変異型ＣＴＬＡ−４−Ｆｃ融合タンパク質をコードする核酸分子は、適切な発現ベクターに挿入される。得られた変異型ＣＴＬＡ−４−Ｆｃ融合タンパク質は、Ｆｃドメイン間の集合が、Ｆｃ部分間に形成される鎖間ジスルフィド結合によって生じる発現により変形される宿主細胞中に発現されて、二価などの二量体変異型ＣＴＬＡ−４−Ｆｃ融合タンパク質を生じ得る。
【０２７４】
得られたＦｃ融合タンパク質は、タンパク質Ａ列またはタンパク質Ｇ列にわたる親和性クロマトグラフィーによって容易に精製され得る。ヘテロ二量体の作成のために、精製のための追加の工程が必要である場合がある。例えば、異なる変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドをコードする２つの核酸が細胞に変形される場合、ヘテロ二量体の形成は、Ｆｃ−ドメインを担持する変異型ＣＴＬＡ−４分子が、ジスルフィド連結されているホモ二量体として同様に発現されるため、生物化学的に達成されなければならない。したがって、ホモ二量体は、鎖間ジスルフィドの分裂に有利であるが、鎖内ジスルフィドに影響を与えない条件下で低減され得る。場合によっては、異なる変異型ＣＴＬＡ−４  Ｆｃ単量体は、等モル量で混合され、ホモ二量体およびヘテロ二量体の混合物を形成するように酸化される。この混合物の成分は、クロマトグラフィー技術によって分離される。代替的に、この種のヘテロ二量体の形成は、以下に記載される凸と凹（ｋｎｏｂ−ｉｎｔｏ−ｈｏｌｅ）方法を使用して、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドを含有するＦｃ融合分子を遺伝的に操作し、これを発現することによってバイアスされ得る。
【０２７５】
Ｂ．追加のＩｇＳＦドメインを有する積層分子
いくつかの実施形態では、免疫調節タンパク質は、直接または間接的に、１つ以上の他の免疫グロブリンスーパーファミリー（ＩｇＳＦ）ドメイン（「積層された」免疫調節タンパク質構築物、および「ＩＩ型」免疫調節タンパク質とも呼ばれる）に連結されている、本明細書に提供される変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドのうちのいずれかを含有し得る。いくつかの態様では、これは、３つ以上など、２つ以上の同種結合パートナーに結合し、それによって免疫シナプスの複数標的化調節を提供する固有のマルチドメイン免疫調節タンパク質を作成し得る。
【０２７６】
いくつかの実施形態では、免疫調節タンパク質は、野生型ＩｇＳＦファミリーメンバーに見られない別のＩｇＳＦファミリーメンバー（例えば、哺乳動物ＩｇＳＦファミリーメンバー）の１つ以上の他の親和性改変および／または非親和性改変ＩｇＳＦドメイン配列との、変異型ＣＴＬＡ−４ドメインの組み合わせ（「非野生型組み合わせ」）および／または配列（「非野生型配列」または「非野生型順列」）を含む。いくつかの実施形態では、免疫調節タンパク質は、２、３、４、５、または６つの免疫グロブリンスーパーファミリー（ＩｇＳＦ）ドメインを含有し、ＩｇＳＦドメインのうちの少なくとも１つは、提供される記載による変異型ＣＴＬＡ−４  ＩｇＳＦドメイン（ＣＴＬＡ−４のｖＩｇＤ）である。
【０２７７】
いくつかの実施形態では、追加のＩｇＳＦドメインの配列は、野生型または非改変ＩｇＳＦドメインと比較して、１つ以上のアミノ酸改変、例えば、置換を含有する改変ＩｇＳＦドメインであり得る。いくつかの実施形態では、ＩｇＳＦドメインは、非親和性改変（例えば、野生型）であり得るか、または親和性改変であった。いくつかの実施形態では、非改変または野生型ＩｇＳＦドメインは、マウス、ラット、カニクイザル、またはヒト起源、またはそれらの組み合わせからのものであり得る。いくつかの実施形態では、追加のＩｇＳＦドメインは、表１に記載のＩｇＳＦファミリーメンバーのＩｇＳＦドメインであり得る。いくつかの実施形態では、追加のＩｇＳＦドメインは、表１に記載のＩｇＳＦファミリーメンバー中に含有されるＩｇＳＦドメインと比較して、１つ以上のアミノ酸改変、例えば、置換を含有する親和性改変ＩｇＳＦドメインであり得る。
【０２７８】
いくつかの実施形態では、追加のＩｇＳＦドメインは、シグナル調節性タンパク質（ＳＩＲＰ）ファミリー、骨髄系細胞上に発現される誘発受容体様（Ｔｒｉｇｇｅｒｉｎｇ  Ｒｅｃｅｐｔｏｒ  Ｅｘｐｒｅｓｓｅｄ  Ｏｎ  Ｍｙｅｌｏｉｄ  Ｃｅｌｌｓ  Ｌｉｋｅ）（ＴＲＥＭＬ）ファミリー、癌胎児抗原関連細胞接着分子（ＣＥＡＣＡＭ）ファミリー、シアル酸結合免疫グロブリン様レクチン（ＳＩＧＬＥＣ）ファミリー、ブチロフィリンファミリー、Ｂ７ファミリー、ＣＤ２８ファミリー、Ｖセットおよび免疫グロブリンドメイン含有（ＶＳＩＧ）ファミリー、Ｖセット膜貫通ドメイン（ＶＳＴＭ）ファミリー、主要組織適合複合体（ＭＨＣ）ファミリー、シグナル伝達リンパ球活性化分子（ＳＬＡＭ）ファミリー、白血球免疫グロブリン様受容体（ＬＩＲ）、ネクチン（Ｎｅｃ）ファミリー、ネクチン様（ＮＥＣＬ）ファミリー、ポリオウイルス受容体関連（ＰＶＲ）ファミリー、天然細胞傷害誘発受容体（ＮＣＲ）ファミリー、Ｔ細胞免疫グロブリンおよびムチン（ＴＩＭ）ファミリー、またはキラー細胞免疫グロブリン様受容体（ＫＩＲ）ファミリーから選択されるファミリーのＩｇＳＦファミリーメンバーに含有される親和性または非親和性改変ＩｇＳＦドメインである。いくつかの実施形態では、追加のＩｇＳＦドメインは、独立して、ＣＤ８０（Ｂ７−１）、ＣＤ８６（Ｂ７−２）、ＣＤ２７４（ＰＤ−Ｌ１、Ｂ７−Ｈ１）、ＰＤＣＤ１ＬＧ２（ＰＤ−Ｌ２、ＣＤ２７３）、ＩＣＯＳＬＧ（Ｂ７ＲＰ１、ＣＤ２７５、ＩＣＯＳＬ、Ｂ７−Ｈ２）、ＣＤ２７６（Ｂ７−Ｈ３）、ＶＴＣＮ１（Ｂ７−Ｈ４）、ＣＤ２８、ＣＴＬＡ４、ＰＤＣＤ１（ＴＩＧＩＴ）、ＩＣＯＳ、ＢＴＬＡ（ＣＤ２７２）、ＣＤ４、ＣＤ８Ａ（ＣＤ８−アルファ））、ＣＤ８Ｂ（ＣＤ８−ベータ）、ＬＡＧ３、ＨＡＶＣＲ２（ＴＩＭ−３）、ＣＥＡＣＡＭ１、ＴＩＧＩＴ、ＰＶＲ（ＣＤ１５５）、ＰＶＲＬ２（ＣＤ１１２）、ＣＤ２２６、ＣＤ２、ＣＤ１６０、ＣＤ２００、ＣＤ２００Ｒ１（ＣＤ２００Ｒ）、およびＮＣＲ３（ＮＫｐ３０）からなる群から選択されるＩｇＳＦタンパク質に由来する。
【０２７９】
「積層された」免疫調節タンパク質構築物に存在するそのような非親和性改変または親和性改変ＩｇＳＦドメイン（非野生型組み合わせであるか、または非野生型配列であるかに関わらず）の数は、少なくとも２、３、４、または５つであり、いくつかの実施形態では、ちょうど２、３、４、または５つのＩｇＳＦドメイン（親和性改変ＩｇＳＦドメインの数の決定は、その任意の非特異的結合断片配列および／またはその実質的に免疫学的に不活性な断片配列を無視する）である。
【０２８０】
本明細書に提供される積層された免疫調節タンパク質のいくつかの実施形態では、ＩｇＳＦドメインの数は、少なくとも２であり、親和性改変の数および非親和性改変ＩｇＳＦドメインの数は、それぞれ独立して、少なくとも０、１、２、３、４、５、または６である。したがって、親和性改変ＩｇＳＦドメインの数、および非親和性改変ＩｇＳＦドメインの数は、それぞれ（親和性改変ＩｇＳＦドメイン：非親和性改変ＩｇＳＦドメイン）、ちょうどまたは少なくとも２：０（親和性改変：野生型）、０：２、２：１、１：２、２：２、２：３、３：２、２：４、４：２、１：１、１：３、３：１、１：４、４：１、１：５、または５：１であり得る。
【０２８１】
積層された免疫調節タンパク質のいくつかの実施形態では、非親和性改変および／または親和性改変ＩｇＳＦドメインのうちの少なくとも２つは、同一のＩｇＳＦドメインである。
【０２８２】
積層された免疫調節タンパク質のいくつかの実施形態では、非親和性改変および／または親和性改変ＩｇＳＦドメインは、同一でない（すなわち、異なる）ＩｇＳＦドメインである。非同一の親和性改変ＩｇＳＦドメインは、特異的結合条件下で、異なる同種結合パートナーに特異的に結合し、操作された野生型または非改変ＩｇＳＦドメインが同じであるかどうかに関わらず、「同一でない」。したがって、例えば、免疫調節タンパク質中の少なくとも２つの非同一のＩｇＳＦドメインの非野生型組み合わせは、少なくとも１つのＩｇＳＦドメイン配列であって、その起源が１つのＣＴＬＡ−４に由来し、これに固有である配列と、第２のＩｇＳＦドメイン配列であって、その起源がＣＴＬＡ−４でない別のＩｇＳＦファミリーメンバー由来であり、これに固有である配列のうちの少なくとも１つと、を含み得、免疫調節タンパク質のＩｇＳＦドメインは、非親和性改変および／または親和性改変形態である。しかしながら、代替的な実施形態では、２つの非同一のＩｇＳＦドメインは、同じＩｇＳＦドメイン配列が起源であるが、少なくとも１つは、異なる同種結合パートナーに特異的に結合するように親和性改変である。
【０２８３】
いくつかの実施形態では、提供される免疫調節タンパク質はまた、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドの含有に加えて、表１に記載のＩｇＳＦファミリーメンバーのＩｇＤドメインなど、少なくとも１、２、３、４、５、または６つの追加の免疫グロブリンスーパーファミリー（ＩｇＳＦ）ドメインを含有する。いくつかの実施形態では、提供される免疫調節タンパク質は、少なくとも１つの追加のＩｇＳＦドメイン（例えば、第２のＩｇＳＦドメイン）を含有する。いくつかの実施形態では、提供される免疫調節タンパク質は、少なくとも２つの追加のＩｇＳＦドメイン（例えば、第２および第３のＩｇＳＦドメイン）を含有する。いくつかの実施形態では、提供される免疫調節タンパク質は、少なくとも３つの追加のＩｇＳＦドメイン（例えば、第２、第３、および第４のＩｇＳＦドメイン）を含有する。いくつかの実施形態では、提供される免疫調節タンパク質は、少なくとも４つの追加のＩｇＳＦドメイン（例えば、第２、第３、第４、および第５のＩｇＳＦドメイン）を含有する。いくつかの実施形態では、提供される免疫調節タンパク質は、少なくとも５つの追加のＩｇＳＦドメイン（例えば、第２、第３、第４、第５、および第６のＩｇＳＦドメイン）を含有する。いくつかの実施形態では、提供される免疫調節タンパク質は、少なくとも６つの追加のＩｇＳＦドメイン（例えば、第２、第３、第４、第５、第６、および第７のＩｇＳＦドメイン）を含有する。いくつかの実施形態では、免疫調節タンパク質中のＩｇＳＦドメインのうちのそれぞれは、異なっている。いくつかの実施形態では、追加のＩｇＳＦドメインのうちの少なくとも１つは、免疫調節タンパク質中の少なくとも１つの他のＩｇＳＦドメインと同じである。いくつかの実施形態では、ＩｇＳＦドメインのうちのそれぞれが、異なるＩｇＳＦファミリーメンバーからのものであるか、またはこれに由来する。いくつかの実施形態では、ＩｇＳＦドメインのうちの少なくとも２つは、同じＩｇＳＦファミリーメンバーからのものであるか、またはこれに由来する。
【０２８４】
いくつかの実施形態では、追加のＩｇＳＦドメインは、ＩｇＶドメインもしくはＩｇＣ（例えば、ＩｇＣ２）ドメイン、またはＩｇＶドメインの特異的結合断片、またはＩｇＣ（例えば、ＩｇＣ２）ドメインの特異的結合断片を含む。いくつかの実施形態では、追加のＩｇＳＦドメインは、全長ＩｇＶドメインであるか、またはこれを含む。いくつかの実施形態では、追加のＩｇＳＦドメインは、全長ＩｇＣ（例えば、ＩｇＣ２）ドメインであるか、またはこれを含む。いくつかの実施形態では、追加のＩｇＳＦドメインは、ＩｇＶドメインの特異的結合断片であるか、またはこれを含む。いくつかの実施形態では、追加のＩｇＳＦドメインは、ＩｇＣ（例えば、ＩｇＣ２）ドメインの特異的結合断片であるか、またはこれを含む。いくつかの実施形態では、免疫調節タンパク質は、単一の（同じ）ＩｇＳＦメンバーからの少なくとも２つの追加のＩｇＳＦドメインを含有する。例えば、いくつかの態様では、免疫調節タンパク質は、全長ＩｇＶドメインおよび全長ＩｇＣ（例えば、ＩｇＣ２）ドメイン、またはその特異的結合断片を含有するＩｇＳＦメンバーのＥＣＤまたはその一部分を含有する。
【０２８５】
いくつかの実施形態では、提供される免疫調節タンパク質は、少なくとも１つの追加のＩｇＳＦドメイン（例えば、第２のまたは、場合によっては、さらに第３のＩｇＳＦドメイン）を含有し、少なくとも１つの追加の、例えば、第２または第３のＩｇＳＦドメインは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１、４４３〜４６９のうちのいずれかに記載のアミノ酸の配列に含有される、野生型もしくは非改変ＩｇＳＦドメインに記載のＩｇＳＦドメイン、またはその特異的結合断片である。いくつかの実施形態では、野生型または非改変ＩｇＳＦドメインは、ＩｇＣ１またはＩｇＣ２ドメインなどのＩｇＶドメインまたはＩｇＣドメインである。
【０２８６】
いくつかの実施形態では、提供される免疫調節タンパク質はまた、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドを含有することに加えて、少なくとも１つの追加の親和性改変ＩｇＳＦドメイン（例えば、第２の、または場合によっては、第３の親和性改変ＩｇＳＦドメインなども）を含有し、少なくとも１つの追加のＩｇＳＦドメインは、表１に記載のＩｇＳＦファミリーメンバーにおけるＩｇＳＦドメインなど、野生型または非改変ＩｇＳＦドメインにおけるＩｇＳＦドメインと比較して、１つ以上のアミノ酸改変（例えば、置換、欠失、または変異）を含有するｖＩｇＤである。いくつかの実施形態では、追加の、例えば、第２または第３の親和性改変ＩｇＳＦドメインは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１、４４３〜４６９のうちのいずれかに記載のアミノ酸の配列に含有される、野生型もしくは非改変ＩｇＳＦドメインまたはその特異的結合断片と少なくとも８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％以上の配列同一性を含む。
【０２８７】
いくつかの実施形態では、野生型または非改変ＩｇＳＦドメインは、ＩｇＣ１またはＩｇＣ２ドメインなど。ＩｇＶドメインまたはＩｇＣドメインである。いくつかの実施形態では、追加の、例えば、第２または第３のＩｇＳＦドメインは、親和性改変ＩｇＶドメインおよび／またはＩｇＣドメインである。いくつかの実施形態では、１つ以上の追加のＩｇＳＦドメインは、ＩｇＶドメインおよび／もしくはＩｇＣ（例えば、ＩｇＣ２）ドメイン、またはＩｇＶドメインの特異的結合断片、および／またはＩｇＣ（例えば、ＩｇＣ２）ドメインの特異的結合断片を含有する親和性改変ＩｇＳＦドメインであり、ＩｇＶおよび／またはＩｇＣドメインは、アミノ酸改変（例えば、置換）を含有する。いくつかの実施形態では、１つ以上の追加の親和性改変ＩｇＳＦドメインは、アミノ酸改変（例えば、置換）を含有するＩｇＶドメインを含有する。いくつかの実施形態では、１つ以上の追加の親和性改変ＩｇＳＦドメインは、全長ＩｇＶドメインおよび全長ＩｇＣ（例えば、ＩｇＣ２）ドメイン、またはその特異的結合断片など、対応する非改変ＩｇＳＦファミリーメンバーのＥＣＤもしくはＥＣＤの一部分に存在するＩｇＳＦドメインを含み、ＩｇＶおよびＩｇＣのうちの一方または両方が、アミノ酸改変（例えば、置換）を含有する。
【０２８８】
いくつかの実施形態では、提供される免疫調節タンパク質は、ＣＴＬＡ−４以外の野生型または非改変ＩｇＳＦドメインのＩｇＳＦドメイン（例えば、ＩｇＶ）と比較して、１つ以上のアミノ酸置換を含有するｖＩｇＤである少なくとも１つの追加の（例えば、第２の、または場合によっては、第３のＩｇＳＦドメインなども）ＩｇＳＦドメインを含有する。
【０２８９】
いくつかの実施形態では、ＣＴＬＡ−４のｖＩｇＤおよび別のＩｇＳＦファミリーメンバーからの１つ以上の追加のＩｇＳＦドメイン（例えば、第２の変異型ＩｇＳＦドメイン）を含む２つ以上のＩｇＳＦドメインは、共有的または非共有的に連結されている。積層された免疫調節タンパク質ポリペプチド鎖における複数の非親和性改変および／または親和性改変ＩｇＳＦドメインは、互いに直接共有的に連結されている必要はない。いくつかの実施形態では、２つ以上のＩｇＳＦドメインは、直接またはリンカーなどを介して間接的に連結されている。いくつかの実施形態では、１つ以上のアミノ酸残基の干渉範囲は、間接的に、互いにＩｇＳＦドメインに共有結合する。連結は、Ｃ末端残基へのＮ末端を介してであり得る。いくつかの実施形態では、連結は、ＩｇＳＦドメインのＮ末端またはＣ末端に位置しないアミノ酸残基の側鎖を介して、連結され得る。したがって、末端または内部アミノ酸残基またはそれらの組み合わせを介して、連結され得る。
【０２９０】
いくつかの実施形態では、免疫調節タンパク質は、それぞれが、直接またはリンカーを介して間接的に連結されている少なくとも２つのＩｇＳＦドメインを含有する。いくつかの実施形態では、免疫調節タンパク質は、それぞれが直接またはリンカーを介して間接的に連結されている、少なくとも３つの免疫調節タンパク質を含有する。様々な構成を、図６Ａおよび６Ｂに示す。
【０２９１】
いくつかの実施形態では、１つ以上の「ペプチドリンカー」は、ＣＴＬＡ−４のｖＩｇＤおよび追加のＩｇＳＦドメイン（例えば、第２の変異型ＩｇＳＦドメイン）を連結する。いくつかの実施形態では、ペプチドリンカーは、単一アミノ酸残基よりも大きい長さであり得る。いくつかの実施形態では、ペプチドリンカーは、少なくとも１つのアミノ酸残基を有するが、２０以下、１９、１８、１７、１６、１５、１４、１３、１２、１１、１０、９、８、７、６、５、４、３、２、または１つのアミノ酸残基の長さである。いくつかの実施形態では、リンカーは（１文字アミノ酸コードにおいて）、２、３、４、または５つの４ＧＳリンカーの反復などの、ＧＧＧＧＳ（「４ＧＳ」、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：５３５または４ＧＳリンカーの多量体である。いくつかの実施形態では、ペプチドリンカーは、（ＧＧＧＧＳ）２（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：５３７）または（ＧＧＧＧＳ）３（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：５３６）である。いくつかの実施形態では、リンカーはまた、一連のアラニン残基のみ、または別のペプチドリンカーに加えて（４ＧＳリンカーまたはその多量体など、例えば、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：５３８を参照されたい）一連のアラニン残基を含み得る。いくつかの実施形態では、各連続するアラニン残基の数は、２、３、４、５、または６つのアラニンである。
【０２９２】
いくつかの実施形態では、非親和性改変および／または親和性改変ＩｇＳＦドメインは、第２の非親和性改変および／または親和性改変ＩｇＳＦドメインのＮ末端および／またはＣ末端に挿入される「野生型ペプチドリンカー」によって連結されている。これらのリンカーはまた、先導配列（非親和性改変または親和性改変ＩｇＳＦドメインに対するＮ末端）または末尾配列（非親和性改変または親和性改変ＩｇＳＦドメインに対するＣ末端）、およびＩｇＳＦのＩｇ折り畳み構造の構造的予測のすぐ外側に及ぶ野生型タンパク質中に存在する配列と呼ばれる。いくつかの実施形態では、「野生型リンカー」は、野生型タンパク質のアミノ酸配列において、定義されたＩｇＶドメインなど、シグナル配列の後であるが、ＩｇＳＦドメインの前に存在するアミノ酸配列である。いくつかの実施形態では、「野生型」リンカーは、野生型タンパク質のアミノ酸配列において、定義されたＩｇＶドメインのすぐ後など、ＩｇＳＦドメインのすぐ後であるが、ＩｇＣドメインの前に存在するアミノ酸配列である。これらのリンカー配列は、近接するＩｇＳＦドメインの正しい折り畳みおよび機能に寄与し得る。
【０２９３】
いくつかの実施形態では、第１のＩｇＳＦドメインのＮ末端に挿入される先導ペプチドリンカー、ならびに／または第１の非親和性改変および／もしくは親和性改変ＩｇＳＦドメインのＣ末端に挿入される末尾配列が存在する。いくつかの実施形態では、第２のＩｇＳＦドメインのＮ末端に挿入される第２の先導ペプチドリンカー、ならびに／または第２の非親和性改変および／もしくは親和性改変ＩｇＳＦドメインのＣ末端に挿入される第２の末尾配列が存在する。第１および第２の非親和性改変および／または親和性改変ＩｇＳＦドメインが同じ親タンパク質に由来し、かつ同じ配向で接続される場合、第１および第２の非親和性改変および／または親和性改変ＩｇＳＦドメイン間の野生型ペプチドリンカーは、重複されない。例えば、第１の末尾野生型ペプチドリンカーおよび第２の先導野生型ペプチドリンカーが同じである場合、ＩＩ型免疫調節タンパク質は、第１の末尾野生型ペプチドリンカーまたは第２の先導野生型ペプチドリンカーのいずれかを含まない。
【０２９４】
いくつかの実施形態では、ＩＩ型免疫調節タンパク質は、第１の非親和性改変および／または親和性改変ＩｇＳＦドメインのＮ末端に挿入される第１の先導野生型ペプチドリンカーを含み、第１の先導野生型ペプチドリンカーは、第１の非親和性改変および／または親和性改変ＩｇＳＦドメインが、親ＩｇＳＦドメインと直前のドメイン（シグナルペプチドまたはＩｇＳＦドメインなど）との間に導出される、野生型タンパク質における干渉配列からの少なくとも５つの（少なくとも約６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５個以上のうちのいずれかなどの）連続するアミノ酸を含む。いくつかの実施形態では、第１の先導野生型ペプチドリンカーは、第１の非親和性改変および／または親和性改変ＩｇＳＦドメインが、親ＩｇＳＦドメインと直前のドメイン（シグナルペプチドまたはＩｇＳＦドメインなど）との間に導出される、野生型タンパク質における全干渉配列を含む。
【０２９５】
いくつかの実施形態では、ＩＩ型免疫調節タンパク質は、第１の非親和性改変および／または親和性改変ＩｇＳＦドメインのＣ末端に挿入される第１の末尾野生型ペプチドリンカーをさらに含み、第１の末尾野生型ペプチドリンカーは、第１の非親和性改変および／または親和性改変ＩｇＳＦドメインが、親ＩｇＳＦドメインと直後のドメイン（ＩｇＳＦドメインまたは膜貫通ドメインなど）との間に導出される、野生型タンパク質における干渉配列からの少なくとも５つの（少なくとも約６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５個以上のうちのいずれかなど）連続するアミノ酸を含む。いくつかの実施形態では、第１の末尾野生型ペプチドリンカーは、第１の非親和性改変および／または親和性改変ＩｇＳＦドメインが、親ＩｇＳＦドメインと直後のドメイン（ＩｇＳＦドメインまたは膜貫通ドメインなど）との間に導出される、野生型タンパク質における全干渉配列を含む。
【０２９６】
いくつかの実施形態では、ＩＩ型免疫調節タンパク質は、第２の非親和性改変および／または親和性改変ＩｇＳＦドメインのＮ末端に挿入される第２の先導野生型ペプチドリンカーをさらに含み、第２の先導野生型ペプチドリンカーは、第２の非親和性改変および／または親和性改変ＩｇＳＦドメインが、親ＩｇＳＦドメインと直前のドメイン（シグナルペプチドまたはＩｇＳＦドメインなど）との間に導出される、野生型タンパク質における干渉配列からの少なくとも５（少なくとも約６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５個以上のうちのいずれかなど）連続するアミノ酸を含む。いくつかの実施形態では、第２の先導野生型ペプチドリンカーは、第２の非親和性改変および／または親和性改変ＩｇＳＦドメインが、親ＩｇＳＦドメインと直前のドメイン（シグナルペプチドまたはＩｇＳＦドメインなど）との間に導出される、野生型タンパク質における全干渉配列を含む。
【０２９７】
いくつかの実施形態では、ＩＩ型免疫調節タンパク質は、第２の非親和性改変および／または親和性改変ＩｇＳＦドメインのＣ末端に挿入される第２の末尾野生型ペプチドリンカーをさらに含み、第２の末尾野生型ペプチドリンカーは、第２の非親和性改変および／または親和性改変ＩｇＳＦドメインが、親ＩｇＳＦドメインと直後のドメイン（ＩｇＳＦドメインまたは膜貫通ドメインなど）との間に導出される、野生型タンパク質における干渉配列からの少なくとも５（少なくとも約６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５個以上のうちのいずれかなど）連続するアミノ酸を含む。いくつかの実施形態では、第２の末尾野生型ペプチドリンカーは、第２の非親和性改変および／または親和性改変ＩｇＳＦドメインが、親ＩｇＳＦドメインと直後のドメイン（ＩｇＳＦドメインまたは膜貫通ドメインなど）との間に導出される、野生型タンパク質における全干渉配列を含む。
【０２９８】
いくつかの実施形態では、ＣＴＬＡ−４のｖＩｇＤおよび別のＩｇＳＦファミリーメンバーからの１つ以上の追加のＩｇＳＦドメイン（例えば、第２および／または第３の変異型ＩｇＳＦドメイン）を含む、２つ以上のＩｇＳＦドメインは、Ｆｃに連結または付着され、いくつかの態様では、細胞における発現時に、二量体マルチドメイン積層免疫調節タンパク質を生成し得る、Ｆｃ融合を形成する。したがって、二量体マルチドメイン免疫調節タンパク質も提供する。
【０２９９】
いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドおよび１つ以上の追加のＩｇＳＦドメインは、独立して、直接または間接的に、Ｆｃ領域のＮ末端またはＣ末端に連結されている。いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドおよび１つ以上の追加のＩｇＳＦドメインのうちの少なくとも１つは、直接または間接的に連結され、変異型ＣＴＬＡ−４のうちの１つおよび１つ以上の追加のＩｇＳＦドメインのうちの１つはまた、直接または間接的に、Ｆｃ領域のＮ末端またはＣ末端に連結されている。いくつかの実施形態では、Ｆｃ領域のＮ末端またはＣ末端は、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドまたは１つ以上の追加のＩｇＳＦドメインに連結され、Ｆｃ領域のＮ末端またはＣ末端のうちの他方は、ＣＴＬＡ−４変異型のうちの他方または１つ以上の追加のＩｇＳＦドメインのうちのもう一方に連結されている。いくつかの実施形態では、Ｆｃへの連結は、ペプチドリンカー、例えば、上記に記載されるようなペプチドリンカーを介してである。いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４と第２のＩｇＳＦドメインとの間の連結は、ペプチドリンカー、例えば、上記に記載されるようなペプチドリンカーを介してである。いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４と１つ以上の追加のＩｇＳＦドメインとの間の連結は、ペプチドリンカー、例えば、上記に記載されるようなペプチドリンカーを介してである。いくつかの実施形態では、ＣＴＬＡ−４のｖＩｇＤ、１つ以上の追加のＩｇＳＦドメイン、およびＦｃドメインは、図６Ａおよび６Ｂに図示されるような多数の構成のうちのいずれかで一緒に連結され得る。例示的な構成を実施例に記載する。
【０３００】
いくつかの実施形態では、積層された免疫調節タンパク質は、２つの免疫調節Ｆｃ融合ポリペプチドによって形成される二量体である。積層された免疫調節タンパク質のうちのいずれかをコードする核酸分子も提供する。いくつかの実施形態では、二量体マルチドメイン積層免疫調節タンパク質は、二量体Ｆｃ融合タンパク質の作成と一致して、上記に記載されるような、積層免疫調節Ｆｃ領域ポリペプチドの発現、または場合によっては、同時発現によって細胞中に生成され得る。
【０３０１】
いくつかの実施形態では、二量体マルチドメイン積層免疫調節タンパク質は、各Ｆｃサブユニットに対して二価、各サブユニットに対して一価、または１つのサブユニットに対して二価、および他方に対して四価である。
【０３０２】
いくつかの実施形態では、二量体マルチドメイン積層免疫調節タンパク質は、ホモ二量体マルチドメイン積層Ｆｃタンパク質である。いくつかの実施形態では、二量体マルチドメイン積層免疫調節タンパク質は、第１および第２のポリペプチドが同じである、第１の積層免疫調節Ｆｃ融合ポリペプチドおよび第２の積層免疫調節Ｆｃ融合ポリペプチドを含む。
【０３０３】
いくつかの実施形態では、マルチドメイン積層分子は、変異型ＣＴＬＡ−４および第２のＩｇＳＦドメインを含有する第１のＦｃ融合ポリペプチド、ならびに変異型ＣＴＬＡ−４および第２のＩｇＳＦドメインを含有する第２のＦｃ融合ポリペプチドを含有する。いくつかの実施形態では、マルチドメイン積層分子は、変異型ＣＴＬＡ−４、第２のＩｇＳＦドメイン、および第３のＩｇＳＦドメインを含有する第１のＦｃ融合ポリペプチド、ならびに変異型ＣＴＬＡ−４、第２のＩｇＳＦドメイン、および第３のＩｇＳＦドメインを含有する第２のＦｃ融合ポリペプチドを含有する。いくつかの実施形態では、第１および／または第２の融合ポリペプチドのＦｃ部分は、上記に記載の任意のＦｃであり得る。いくつかの実施形態では、第１および第２の融合ポリペプチドのＦｃ部分または領域は、同じである。
【０３０４】
いくつかの実施形態では、マルチドメイン積層分子は、２つの異なるＦｃ融合ポリペプチド、例えば、第１および第２のＦｃポリペプチドを含むヘテロ二量体であり、少なくとも１つは、少なくとも１つの変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドを含有するＦｃ融合ポリペプチドであり、かつ／または少なくとも１つは、第２のＩｇＳＦドメイン（例えば、第２の変異型ＩｇＳＦドメイン）を含有するＦｃポリペプチドである。いくつかの実施形態では、第１または第２のＦｃ融合ポリペプチドは、第３のＩｇＳＦドメイン（例えば、第３の変異型ＩｇＳＦドメイン）をさらに含有する。いくつかの実施形態では、マルチドメイン積層分子は、変異型ＣＴＬＡ−４を含有する第１のＦｃ融合ポリペプチド、および第２のＩｇＳＦドメインを含有する第２のＦｃ融合ポリペプチドを含有し、場合によっては、第１または第２のＦｃ融合ポリペプチドは、追加的に、第３のＩｇＳＦドメインを含有する。いくつかの実施形態では、マルチドメイン積層分子は、変異型ＣＴＬＡ−４、第２のＩｇＳＦドメイン、および場合によっては、第３のＩｇＳＦドメインを含有する第１のＦｃ融合ポリペプチド、ならびに変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドまたは追加のＩｇＳＦドメインのいずれにも連結されない第２のＦｃ融合ポリペプチドを含有する。いくつかの実施形態では、第１および第２の融合ポリペプチドのＦｃ部分または領域は、同じである。いくつかの実施形態では、第１および第２の融合ポリペプチドのＦｃ部分または領域は、異なる。いくつかの実施形態では、マルチドメイン積層分子は、１、２、３、４つ以上の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド、および１、２、３、４つ以上の追加のＩｇＳＦドメインを含有する第１の融合Ｆｃポリペプチドを含有し、第１の積層Ｆｃ融合ポリペプチド中のＩｇＳＦドメインの総数は、２つ超、３、４、５、６、またはそれ以上である。そのような実施形態の一例では、第２の積層Ｆｃ融合ポリペプチドは、１、２、３、４つ以上の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドおよび１、２、３、４つ以上の追加のＩｇＳＦドメインを含有し、第２の積層Ｆｃ融合ポリペプチド中のＩｇＳＦドメインの総数は、２、３、４、５、６つよりも大きい。そのような実施形態の別の例では、第２のＦｃポリペプチドは、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドまたは追加のＩｇＳＦドメインのいずれにも連結されない。
【０３０５】
いくつかの実施形態では、ヘテロ二量体積層分子は、第１および第２のポリペプチドが異なる第１の積層免疫調節Ｆｃ融合ポリペプチドおよび第２の積層免疫調節Ｆｃ融合ポリペプチドを含有する。いくつかの実施形態では、ヘテロ二量体積層分子は、Ｆｃ領域および第１の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドおよび／または第２のＩｇＳＦドメイン（例えば、第２の変異型ＩｇＳＦドメイン）を含有する第１のＦｃポリペプチド融合、ならびにＦｃ領域および第１の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドまたは第２のＩｇＳＦドメインのうちの他方を含有する第２のＦｃポリペプチド融合を含有する。いくつかの実施形態では、ヘテロ二量体積層分子は、Ｆｃ領域および第１の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドおよび／または第２のＩｇＳＦドメイン（例えば、第２の変異型ＩｇＳＦドメイン）を含有する第１のＦｃポリペプチド融合、ならびにＦｃ領域および第１の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドおよび第２のＩｇＳＦドメインの両方（例えば、第２の変異型ＩｇＳＦドメイン）を含有するが、第１のＦｃ領域とは異なる配向または構成の第２のＦｃポリペプチド融合を含有する。いくつかの実施形態では、第１および／または第２のＦｃ融合ポリペプチドはまた、第３のＩｇＳＦドメイン（例えば、第３の変異型ＩｇＳＦドメイン）を含有する。
【０３０６】
いくつかの実施形態では、第１および第２の積層された免疫調節Ｆｃ融合ポリペプチドのうちの一方または両方のＦｃドメインは、Ｆｃ分子の界面が改変されて、ヘテロ二量体化を容易にし、かつ／または促進する改変（例えば、置換）を含む。いくつかの実施形態では、改変は、第１および第２のＦｃ含有ポリペプチドの複合体化を促進するように突起が空洞内に位置付け可能であるように、第１のＦｃポリペプチドへの突起（凸）の導入および第２のＦｃポリペプチドへの空洞（凹）の導入を含む。ポリペプチド中に突起または空洞を作成するように交換および／または改変のために標的化されたアミノ酸は、典型的には、第２のポリペプチドの界面において１つ以上のアミノ酸と相互作用または接触する界面アミノ酸である。
【０３０７】
いくつかの実施形態では、アミノ酸の配列は、Ｆｃ配列が配列のＮ末端部分である構築物に対するＦｃ配列の前に加えられる。場合によっては、アミノ酸ＨＭＳＳＶＳＡＱ（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：５３９）の配列は、Ｆｃ配列が配列のＮ末端部分である構築物に対するＦｃ配列の直前に加えられる。いくつかの実施形態では、ヘテロ二量体積層分子は、Ｆｃ領域（凸）および第１の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドおよび／または第２のＩｇＳＦドメイン（例えば、第２の変異型ＩｇＳＦドメイン）を含有する第１のＦｃポリペプチド融合、ならびにＦｃ領域（凹）、ならびに第１および第２のＦｃポリペプチド融合の両方のＦｃ領域の直前に加えられたスタッファー配列ＨＭＳＳＶＳＡＱ（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：５３９）を含有する第２のＦｃポリペプチド融合を含有する。
【０３０８】
いくつかの実施形態では、突起（凹）アミノ酸を含有するように改変された第１のポリペプチドは、第１のポリペプチドの界面から突出する少なくとも１つの側鎖を有するアミノ酸と天然型または元のアミノ酸の交換を含み、したがって、第２のポリペプチドの隣接する海面において補償的空洞（凹）に位置付け可能である。最も多くは、交換アミノ酸は、元のアミノ酸残基よりも大きい側鎖体積を有するアミノ酸である。当業者は、アミノ酸残基の特性を判定および／または評価して、突起を作成するのに理想的な交換アミノ酸であるアミノ酸を識別する方法を知っている。いくつかの実施形態では、突起の形成のための交換残基は、天然に発生するアミノ酸残基であり、例えば、アルギニン（Ｒ）、フェニルアラニン（Ｆ）、チロシン（Ｙ）、またはトリプトファン（Ｗ）を含む。いくつかの例では、交換のために識別される元の残基は、例えば、アラニン、アスパラギン、アスパラギン酸、グリシン、セリン、トレオニン、またはバリンなどの小さい側鎖を有するアミノ酸残基である。
【０３０９】
いくつかの実施形態では、空洞（凹）を含有するように改変された第２のポリペプチドは、第２のポリペプチドの界面から凹状である少なくとも１つの側鎖を有するアミノ酸と天然型または元のアミノ酸の置換を含むものを含有するため、第１のポリペプチドの界面から対応する突起を収容することができる。最も多くは、交換アミノ酸は、元のアミノ酸残基よりも小さい側鎖体積を有するアミノ酸である。当業者は、アミノ酸残基の特性を判定および／または評価して、空洞の形成に理想的な交換残基であるアミノ酸を識別する方法を知っている。概して、空洞の形成のための交換残基は、天然に発生するアミノ酸であり、例えば、アラニン（Ａ）、セリン、トレオニン（Ｔ）、およびバリン（Ｖ）を含む。いくつかの例では、交換のために識別される元のアミノ酸は、例えば、チロシン、アルギニン、フェニルアラニン、またはトリプトファンなどの大きい側鎖を有するアミノ酸である。
【０３１０】
ヒトＩｇＧ１のＣＨ３界面は、例えば、各表面からの１０９０  Å２を埋める４つの抗平行β鎖上に位置する各ドメイン上に１６個の残基を含む（例えば、Ｄｅｉｓｅｎｈｏｆｅｒ（１９８１），Ｂｉｏｃｈｅｍｉｓｔｒｙ，２０（９）：２３６１−２３７０；Ｍｉｌｌｅｒ（１９９０），Ｊ  Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．，２１６（４）：９６５−９７３；Ｒｉｄｇｗａｙ  ｅｔ  ａｌ．（１９９６），Ｐｒｏｔ．Ｅｎｇ．，９（７）：６１７−６２１、米国特許第５，７３１，１６８号を参照されたい）。突起または空洞を作成するためのＣＨ３ドメインの改変は、例えば、米国特許第５，７３１，１６８号、国際特許出願第ＷＯ９８／５０４３１号、およびＷＯ２００５／０６３８１６、ならびにＲｉｄｇｗａｙ  ｅｔ  ａｌ．（１９９６），Ｐｒｏｔ．Ｅｎｇ．，９（７）：６１７−６２１に記載されている。いくつかの例では、突起または空洞を作成するためのＣＨ３ドメインの改変は、典型的には、２つの中心抗平行β鎖上に位置する残基に対して標的化される。その目的は、作成される突起が、パートナーＣＨ３ドメインにおける補償的空洞によって収容されるよりも周囲の溶剤に突出することによって収容され得るリスクを最小限に抑えることである。
【０３１１】
いくつかの実施形態では、ヘテロ二量体分子は、「凸鎖」のＣＨ３ドメインにおけるＴ３６６Ｗ変異、および「凹鎖」のＣＨ３ドメインにおけるＴ３６６Ｓ、Ｌ３６８Ａ、Ｙ４０７Ｖ変異を含有する。場合によっては、ＣＨ３ドメイン間の追加の鎖間ジスルフィド架橋はまた、例えば、「凸」鎖または「凹」鎖のＣＨ３ドメインへのＹ３４９Ｃ変異の導入、および他の鎖のＣＨ３ドメインへのＥ３５６Ｃ変異またはＳ３５４Ｃ変異への導入によって、使用され得る（Ｍｅｒｃｈａｎｔ  ｅｔ  ａｌ．（１９９８），Ｎａｔｕｒｅ  Ｂｉｏｔｅｃｈ．，１６（７）：６７７−６８１）。いくつかの実施形態では、ヘテロ二量体分子は、２つのＣＨ３ドメインのうちの一方におけるＳ３５４Ｃ、Ｔ３６６Ｗ変異、および２つのＣＨ３ドメインのうちの他方におけるＹ３４９Ｃ、Ｔ３６６Ｓ、Ｌ３６８Ａ、Ｙ４０７Ｖ変異を含有する。いくつかの実施形態では、ヘテロ二量体分子は、２つのＣＨ３ドメインおよびＹ３４９Ｃのうちの一方におけるＥ３５６Ｃ、Ｔ３６６Ｗ変異、および２つのＣＨ３ドメインのうちの他方におけるＴ３６６Ｓ、Ｌ３６８Ａ、Ｙ４０７Ｖ変異を含む。いくつかの実施形態では、ヘテロ二量体分子は、２つのＣＨ３ドメインおよびＥ３５６Ｃのうちの一方におけるＹ３４９Ｃ、Ｔ３６６Ｗ変異、および２つのＣＨ３ドメインのうちの他方におけるＴ３６６Ｓ、Ｌ３６８Ａ、Ｙ４０７Ｖ変異を含む。いくつかの実施形態では、ヘテロ二量体分子は、２つのＣＨ３ドメインおよびＳ３５４Ｃのうちの一方におけるＹ３４９Ｃ、Ｔ３６６Ｗ変異、および２つのＣＨ３ドメインのうちの他方におけるＴ３６６Ｓ、Ｌ３６８Ａ、Ｙ４０７Ｖ変異を含む。他の凸と凹（ｋｎｏｂ−ｉｎ−ｈｏｌｅ）技術の例は、例えば、ＥＰ１８７０４５９Ａ１によって記載されるような当該技術分野において知られている。
【０３１２】
いくつかの実施形態では、ヘテロ二量体分子のＦｃ領域は、追加的に、上記に記載されるいずれかなど、１つ以上の他のＦｃ変異を含有し得る。いくつかの実施形態では、ヘテロ二量体分子は、エフェクター機能を減少させる変異を有するＦｃ領域を含有する。
【０３１３】
いくつかの実施形態では、ＣＨ３突起（凸）または空洞（凹）改変を含有するＦｃ変異型は、いずれかで積層された免疫調節ポリペプチドに接合され得るが、典型的には、融合ポリペプチドを形成するように、第１および／または第２の積層された免疫調節ポリペプチドのそのＮ末端またはＣ末端を介して、接合され得る。連結は、直接またはリンカーを介して間接的であり得る。典型的には、凸分子および凹分子は、ＣＨ３突起改変を含有するＦｃ変異型に連結されている第１の積層された免疫調節ポリペプチドの、ＣＨ３空洞改変を含有するＦｃ変異型に連結されている第２の積層された免疫調節ポリペプチドとの同時発現によって作成される。
【０３１４】
Ｃ．変異型ポリペプチドおよび免疫調節タンパク質のコンジュゲートおよび融合
いくつかの実施形態では、ＩｇＳＦファミリー（ｖＩｇＤ）のＩｇドメインの変異型を含む免疫調節タンパク質である、本明細書に提供される変異型ポリペプチドは、コンジュゲート（「ＩｇＳＦコンジュゲート」）を形成するように、直接または間接的に、別のタンパク質など、エフェクター部分などの部分とコンジュゲートまたは融合され得る。いくつかの実施形態では、付着は、例えば、ビオチン−ストレプトアビジン非共有相互作用を介して、共有または非共有であり得る。いくつかの実施形態では、前述の部分のうちのいずれか２つ以上のうちのいずれか１つまたは組み合わせが、Ｆｃまたは変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドまたは両方に付着され得る。いくつかの実施形態では、融合ポリペプチドなどの提供されるコンジュゲートは、自己免疫または炎症の症状の治療などと関連して、免疫反応を抑制または弱体化するための方法および使用において使用され得る。
【０３１５】
いくつかの実施形態では、その部分は、標的指向部分、小分子薬物（５００ダルトンモル質量未満の非ポリペプチド薬物）、毒素、細胞分裂阻害剤、細胞傷害性薬剤、免疫抑制剤、抗増殖性薬剤、診断目的に好適な放射性薬剤、治療目的のための放射性金属イオン、プロドラッグ活性化酵素、生物学的半減期を増加させる薬剤、または診断もしくは検出可能な薬剤であり得る。
【０３１６】
いくつかの実施形態では、エフェクター部分は、ある程度の治療的有用性を提供する、治療免疫抑制剤または拒絶反応抑制剤などの治療薬である。
【０３１７】
いくつかの実施形態では、エフェクター部分は、細胞表面抗原、例えば、免疫細胞または活性化免疫細胞の表面上の抗原を標的化する薬剤などの標的指向部分または薬剤である。いくつかの実施形態では、エフェクター部分は、直接または間接的のいずれかで、検出可能なシグナルを作成することができる標識である。いくつかの実施形態では、エフェクター部分は、タンパク質、ペプチド、核酸、小分子、またはナノ粒子である。
【０３１８】
いくつかの実施形態では、同じであるか、または異なり得る、１、２、３、４、５つ以上のエフェクター部分は、ＩｇＳＦコンジュゲートを形成するように、変異型ポリペプチドまたはタンパク質にコンジュゲート、連結、または融合され得る。いくつかの実施形態では、そのようなエフェクター部分は、当該技術分野で知られており、以下に記載される様々な分子生物学的または化学的コンジュゲーションおよび連結方法を使用して、変異型ポリペプチドまたは免疫調節タンパク質に付着され得る。いくつかの実施形態では、ペプチドリンカー、開裂可能なリンカー、非開裂可能なリンカー、またはコンジュゲーション反応の助けとなるリンカーなどのリンカーを使用して、エフェクター部分を変異型ポリペプチドまたは免疫調節タンパク質に連結またはコンジュゲートさせることができる。
【０３１９】
いくつかの実施形態では、ＩｇＳＦコンジュゲートは、以下の成分：（タンパク質またはポリペプチド）、（Ｌ）ｑおよび（エフェクター部分）ｍを含み、タンパク質またはポリペプチドは、記載されるような１つ以上の結合パートナーに結合することができる、記載される変異型ポリペプチドまたは免疫調節タンパク質のうちのいずれかであり、Ｌは、タンパク質またはポリペプチドを当該部分に連結させるためのリンカーであり、ｍは、少なくとも１であり、ｑは、０以上であり、得られたＩｇＳＦコンジュゲートは、１つ以上のカウンター構造リガンドに結合する。特定の実施形態では、ｍは、１〜４であり、ｑは、０〜８である。
【０３２０】
いくつかの実施形態では、細胞表面分子、例えば、変異型ポリペプチドまたは免疫調節タンパク質の特定の細胞への標的化送達のために、細胞表面分子に結合する標的化剤によりコンジュゲートされる、本明細書に提供される変異型ポリペプチドまたは免疫調節タンパク質を含むＩｇＳＦコンジュゲートを提供する。いくつかの実施形態では、標的化剤は、対象において、リンパ組織などの正常な細胞／組織、活性化免疫細胞もしくは非活性化免疫細胞などの免疫細胞、および／または炎症環境の組織上に存在する分子に局在および結合する能力を有する分子である。換言すると、ＩｇＳＦコンジュゲートは、標的化剤を含み、腫瘍細胞などの細胞上に存在するリガンドに（直接または間接的に）結合し得る。使用のために検討される本発明の標的化剤は、標的細胞または分子の成分に結合し得る、抗体、ポリペプチド、ペプチド、アプタマー、他のリガンド、またはそれらの任意の組み合わせを含む。
【０３２１】
いくつかの実施形態では、その標的化剤を通したＩｇＳＦコンジュゲートは、免疫細胞の細胞成分、炎症環境の組織、または脾臓、扁桃、リンパ管、リンパ節、咽頭扁桃、および／または肝臓組織などのリンパ組織に結合するなど局在し、それによって免疫反応の局在する細胞を調節するであろう。いくつかの実施形態では、標的化剤は、結合パートナーを保有し、かつ／または結合パートナーのための共刺激受容体を保有する近位の免疫細胞（例えば、ＮＫ細胞、単球／マクロファージ、樹状細胞、Ｔ細胞、Ｂ細胞）のシグナル伝達を変化させるようにその結合パートナーと相互作用するように、コンジュゲートされたＩｇＳＦ（例えば、ｖＩｇＤ）の免疫細胞への送達を容易にする。いくつかの実施形態では、局在する送達は、ＣＤ２８および／またはＩＣＯＳ共刺激受容体の間接的な拮抗または阻害活性媒介する。
【０３２２】
いくつかの実施形態では、標的化剤は、免疫グロブリンである。本明細書で使用される場合、「免疫グロブリン」という用語は、ポリクローナル、モノクロ―ナル、多特異性、ヒト、ヒト化、またはキメラ抗体、単鎖抗体、Ｆａｂ断片、Ｆ（ａｂ’）断片、Ｆａｂ発現ライブラリーによって生成される断片、単鎖Ｆｖ（ｓｃＦｖ）、抗イディオタイプ（抗Ｉｄ）抗体（例えば、本発明の抗体に対する抗Ｉｄ抗体を含む）、および上記のうちのいずれかのエピトープ−結合断片を含むが、これらに限定されない天然または人工の一価または多価抗体を含む。本明細書で使用される場合、「抗体」という用語は、免疫グロブリン分子および免疫グロブリン分子の免疫学的に活性な部分、例えば、抗原に免疫特異的に結合する抗原結合部位を含有する分子を指す。本発明の免疫グロブリン分子は、任意の種類（例えば、ＩｇＧ、ＩｇＥ、ＩｇＭ、ＩｇＤ、ＩｇＡ、およびＩｇＹ）、クラス（例えば、ＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３、ＩｇＧ４、ＩｇＡ１、およびＩｇＡ２）、またはサブクラスの免疫グロブリン分子からなり得る。例示的な免疫グロブリン分子は、抗ＣＤ２０、抗ＣＤ２５、または抗ＣＤ３モノクロ―ナル抗体などのＣＤ２０、ＣＤ２５、またはＣＤ３に対して方向付けられる免疫グロブリン分子を含む。他の例示的な免疫グロブリン分子は、アルファ−４インテグリンなどのインテグリン分子に対して方向付けられる免疫グロブリンを含む。
【０３２３】
本発明の抗体標的指向部分は、Ｆａｂ、Ｆａｂ’およびＦ（ａｂ’）２、Ｆｄ、単鎖Ｆｖｓ（ｓｃＦｖ）、単鎖抗体、ジスルフィド連結Ｆｖｓ（ｓｄＦｖ）、ならびにＶＬまたはＶＨドメインのいずれかを含む断片を含むが、これらに限定されない抗体断片を含む。単鎖抗体を含む抗原結合抗体断片は、可変領域を、単独でまたは以下：ヒンジ領域、ＣＨ１、ＣＨ２、およびＣＨ３ドメインの全体または一部分と組み合わせて含み得る。本発明には、可変領域の、ヒンジ領域、ＣＨ１、ＣＨ２、およびＣＨ３ドメインとの任意の組み合わせも含む、抗原結合断片も含まれる。本発明には、Ｆｃ断片、抗原Ｆｃ融合タンパク質、およびＦｃ標的指向部分コンジュゲートまたは融合生成物（Ｆｃペプチド、Ｆｃアプタマー）も含まれる。本発明の抗体標的指向部分は、鳥類および哺乳動物を含む任意の動物起源からのものであり得る。一態様では、抗体標的指向部分は、ヒト、ネズミ（例えば、マウスおよびラット）、ロバ、ヒツジ、ウサギ、ヤギ、モルモット、ラクダ、ウマ、またはニワトリである。さらに、そのような抗体は、動物抗体のヒト化バージョンであり得る。本発明の抗体標的指向部分は、単一特異性、二重特異性、三重特異性であり得るか、またはより大きい多特異性からなり得る。
【０３２４】
様々な実施形態では、抗体／標的指向部分は、例えば、ＴＣＲ複合体の結合もしくは抑制、腫瘍壊死因子（ＴＮＦ）の抑制、インターロイキンの抑制、またはＣＤ２５（ＩＬ−２ａ）の結合および抑制によって免疫細胞（例えば、ＮＫ細胞、単球／マクロファージ、樹状細胞、Ｔ細胞）の活性化および／または増殖を防止し、それによって活性化リンパ球のクローンの膨張を防止し、リンパ球生存を短縮させる。他の実施形態では、抗体／標的指向部分は、アルファ−４インテグリンまたはインテグリンベータ−３などのインテグリンの結合または抑制によって炎症組織への炎症性免疫細胞の接着を防止する。
【０３２５】
ＩｇＳＦコンジュゲートに組み込まれ得る抗体の例は、ムロモナブ−ＣＤ３、バシリキシマブ（Ｓｉｍｕｌｅｃｔ（登録商標））およびダクリズマブ（Ｚｅｎａｐａｘ（登録商標））、ナタリズマブ（ＴＹＳＡＢＲＩ（登録商標））、アブシキシマブ（ＲｅｏＰｒｏ（登録商標））、リツキシマブ（Ｒｉｔｕｘａｎ（登録商標）、ＭａｂＴｈｅｒａ（登録商標））、アレムツズマブ（Ｃａｍｐａｔｈ（登録商標）、Ｃａｍｐａｔｈ−１Ｈ（登録商標）、Ｍａｂｃａｍｐａｔｈ（登録商標））、インフリキシマブ（Ｒｅｍｉｃａｄｅ（登録商標））、グセルクマブ（Ｔｒｅｍｆｙａ（商標））、アダリムマブ（Ｈｕｍｉｒａ（登録商標））、セルトリズマブ（Ｃｉｍｚｉａ（登録商標））、ウステキヌマブ（Ｓｔｅｌａｒａ（登録商標））、セクキヌマブ（Ｃｏｓｅｎｔｙｘ（登録商標））、ブロダルマブ（Ｓｉｌｉｑ（商標））、またはトシリズマブ（Ａｃｔｅｍｒａ（登録商標））などの抗体を含むが、これらに限定されない。他の特定の標的エピトープに対する抗体はまた、従来の方法を使用して作成され得、本明細書に記載の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドのうちのいずれかとのコンジュゲートとして使用され得る。
【０３２６】
いくつかの実施形態では、ＩｇＳＦコンジュゲートは、腫瘍抗原などの細胞成分に結合し／これを標的化し得る標的化剤を含む。いくつかの態様では、細胞成分、抗原、または分子は、標的化剤のための所望の標的を意味するためにそれぞれ使用され得る。例えば、様々な実施形態では、標的化剤は、上皮成長因子受容体ファミリー、例えば、ＥｒｂＢ−２（ＨＥＲ２／ｎｅｕ）、ガングリオシド（ＧＤ２、ＧＤ３、ＧＭ１、およびＧＭ２など）、ＰＤＧＦ受容体（ＰＤＧＦ−ＲαなどのＰＤＧＦＲ）、および血管内皮成長因子受容体（ＶＥＧＦＲ）ファミリー、ＶＥＧＦファミリーを含むが、これらに限定されない成分に対して特異的であるか、またはこれに結合する。ＩｇＳＦコンジュゲートに組み込まれ得る抗体の例は、ペルツズマブ（Ｐｅｒｊｅｔａ（登録商標））、オララツマブ（Ｌａｒｔｒｕｖｏ（商標））、ジヌツキシマブ（Ｕｎｉｔｕｘｉｎ（商標））、またはラムシルマブ（Ｃｙｒａｍｚａ（登録商標））、またはその抗原結合断片などの抗体を含むが、これらに限定されない。
【０３２７】
いくつかの実施形態では、抗体標的指向部分は、Ｆｃドメインを含有する全長抗体、またはその抗原結合断片である。いくつかの実施形態では、変異型ポリペプチドまたは免疫調節タンパク質は、抗体のＦｃ部分のＮ末端へのコンジュゲーションなどによって、抗体標的指向部分のＦｃ部分にコンジュゲートされる。
【０３２８】
いくつかの実施形態では、ｖＩｇＤは、直接または間接的に、抗体の軽鎖および／または重鎖のＮ末端またはＣ末端に連結されている。いくつかの実施形態では、連結は、上記に記載されるいずれかなどのペプチドリンカーを介してであり得る。様々な構成を解釈し得る。図５Ａ〜５Ｃは、例示的な構成を図示する。いくつかの実施形態では、抗体コンジュゲートは、細胞中の抗体の重鎖および軽鎖の同時発現によって生成され得る。
【０３２９】
本発明の一態様では、標的化剤は、アプタマー分子である。例えば、いくつかの実施形態では、アプタマーは、標的化剤として機能するとして機能する核酸から構成される。様々な実施形態では、本発明のＩｇＳＦコンジュゲートは、腫瘍細胞、腫瘍血管系、および／または腫瘍微小環境上の分子に対して特異的なアプタマーを含む。いくつかの実施形態では、アプタマー自体は、標的化モジュール（配列）に加えて、生物学的に活性な配列を含み得、生物学的に活性な配列は、標的細胞に対する免疫反応を誘導し得る。換言すると、そのようなアプタマー分子は、二重用途の薬剤である。いくつかの実施形態では、本発明のＩｇＳＦコンジュゲートは、抗体へのアプタマーのコンジュゲーションを含み、アプタマーおよび抗体は、腫瘍細胞、腫瘍血管系、腫瘍微小環境、および／または免疫細胞上の別々の分子への結合に特異的である。
【０３３０】
「アプタマー」という用語は、特定の分子への特異的結合特性に基づいて選択されるＤＮＡ、ＲＮＡ、またはペプチドを含む。例えば、アプタマーは、本明細書に開示されるように、免疫細胞、リンパ組織、腫瘍細胞、腫瘍血管系、および／または腫瘍微小環境において特定の遺伝子または遺伝子生成物に結合するために選択され得、選択は、当該技術分野で知られている方法によって行われ、当業者にはよく知られている。
【０３３１】
本発明のいくつかの態様では、標的化剤は、ペプチドである。例えば、本明細書に提供される変異型ポリペプチドまたは免疫調節タンパク質は、炎症環境、免疫細胞、またはリンパ組織の成分に結合し得るペプチドにコンジュゲートされ得る。したがって、本発明のそのようなＩｇＳＦコンジュゲートは、免疫細胞の細胞成分、リンパ組織、および／または炎症性微小環境の成分に結合するペプチド標的化剤を含む。いくつかの実施形態では、標的化剤ペプチドは、インテグリンのアンタゴニストまたはアゴニストであり得る。アルファおよびベータサブユニットを含むインテグリンは、当業者によく知られている多数の種類を含む。
【０３３２】
一実施形態では、標的化剤は、Ｖｖβ３である。インテグリンＶｖβ３は、様々な細胞上に発現され、血管壁への免疫細胞の接着および炎症組織における蓄積を含み、血管からの免疫細胞の移動のための、いくつかの生物学的に関連するプロセスを媒介することが示されている。インテグリンに好適な標的化分子は、Ｖ４．βｉ（ＶＬＡ−４）、Ｖ４−Ｐ７（例えば、米国特許第６，３６５，６１９号、Ｃｈａｎｇ  ｅｔ  ａｌ，Ｂｉｏｏｒｇａｎｉｃ  ＆  Ｍｅｄｉｃｉｎａｌ  Ｃｈｅｍ  Ｌｅｔｔ，１２（２）：１５９−１６３（２００２）、Ｌｉｎ  ｅｔ  ａｌ．，Ｂｉｏｏｒｇａｎｉｃ  ＆  Ｍｅｄｉｃｉｎａｌ  Ｃｈｅｍ  Ｌｅｔｔ，１２（２）：１３３−１３６（２００２）を参照されたい）などの他のインテグリンのためのＲＧＤペプチドまたはペプチド模倣薬ならびに非ＲＧＤペプチドまたはペプチド模倣薬（例えば、米国特許第５，７６７，０７１号および同第５，７８０，４２６号を参照されたい）を含む。
【０３３３】
いくつかの実施形態では、治療薬とコンジュゲートされた、本明細書に提供される変異型ポリペプチドまたは免疫調節タンパク質を含むＩｇＳＦコンジュゲートを提供する。いくつかの実施形態では、治療薬には、例えば、プレドニゾン、デキサメタゾン、およびヒドロコルチゾンなどの糖質コルチコイド、インターロイキン１（ＩＬ−１）、ＩＬ−２、ＩＬ−３、ＩＬ−４、ＩＬ−５、ＩＬ−６、ＩＬ−８抑制剤、ＴＮＦ−アルファ抑制剤などのインターロイキン抑制剤が含まれる。いくつかの実施形態では、治療薬には、プリン類似体などの細胞分裂阻害剤または細胞分裂抑制剤、ナイトロジェンマスタード（シクロホスファミド）などのアルキル化剤、ニトロソ尿素（例えば、アラビノピラノシル−Ｎ−メチル−Ｎ−ニトロソ尿素（Ａｒａｎｏｓｅ）、カルムスチン（ＢＣＮＵ、ＢｉＣＮＵ）、クロロゾトシン、エチルニトロソ尿素（ＥＮＵ）、ホテムスチン、ロムスチン（ＣＣＮＵ）、ニムスチン、Ｎ−ニトロソ−Ｎ−メチル尿素（ＮＭＵ）、ラニムスチン（ＭＣＮＵ）、セムスチン、ストレプトゾシン（ストレプトゾトシン）、および白金化合物、葉酸類似体（例えば、メトトレキサート）、プリン類似体（例えば、アザチオプリンおよびメルカプトプリン）、ピリミジン類似体（例えば、フルオロウラシル）、またはタンパク質合成抑制剤などの代謝拮抗剤、ダクチノマイシン、アントラサイクリン、マイトマイシンＣ、ブレオマイシン、またはミスラマイシンなどの細胞傷害性抗生物質が含まれる。いくつかの実施形態では、治療薬には、シクロスポリン、タクロリムス、シロリムス、またはエベロリムスなどのイムノフィリンに対して作用する薬物が含まれる。いくつかの実施形態では、治療薬には、インターフェロン、オピオイド、ＴＮＦ結合タンパク質（例えば、エタネルセプト（Ｅｎｂｒｅｌ（登録商標）））、ミコフェノール酸などの他の免疫抑制薬、またはフィンゴリモドもしくはミリオシンなどの小さい生物学的薬剤が含まれる。
【０３３４】
いくつかの実施形態では、検出可能なシグナルを間接的または直接生成し得る標識とコンジュゲートされた、本明細書に提供される変異型ポリペプチドまたは免疫調節タンパク質を含むＩｇＳＦコンジュゲートを提供する。これらのＩｇＳＦコンジュゲートは、調査または診断用途のために使用され得る。標識は、好ましくは、直接または間接的のいずれかで、検出可能なシグナルを生成することができる。例えば、標識は、３Ｈ、１４Ｃ、３２Ｐ、３５Ｓ、１２３Ｉ、１２５Ｉ、１３１Ｉなどの放射線不透過性もしくは放射性同位体、フルオレセインイソチオシアネート、ローダミン、もしくはルシフェリンなどの蛍光性（フルオロフォア）もしくは化学発光性（発色団）化合物、アルカリホスファターゼ、β−ガラクトシダーゼ、もしくは西洋ワサビペルオキシダーゼなどの酵素、造影剤、または金属イオンであり得る。いくつかの実施形態では、標識は、シンチグラフィー研究のための放射性原子、例えば、９９Ｔｃもしくは１２３Ｉ、またはジルコニウム８９、ヨウ素１２３、ヨウ素１３１、インジウム１１１、フッ素１９、炭素１３、窒素１５、酸素１７、ガドリニウム、マンガン、もしくはイオンなどの核磁気共鳴（ＮＭＲ）撮像（磁気共鳴撮像、ＭＲＩとしても知られている）のためのスピン標識である。ジルコニウム８９は、様々な金属キレート剤に対して複合化され得、例えば、ＰＥＴ撮像（ＷＯ２０１１／０５６９８３）のために抗体にコンジュゲートされ得る。いくつかの実施形態では、ＩｇＳＦコンジュゲートは、間接的に検出可能である。例えば、ＩｇＳＦコンジュゲートに特異的であり、検出可能な標識を含有する二次抗体を使用して、ＩｇＳＦコンジュゲートを検出することができる。
【０３３５】
ＩｇＳＦコンジュゲートは、当該技術分野で知られている任意の方法を使用して調製され得る。例えば、ＷＯ２００９／０６７８００、ＷＯ２０１１／１３３８８６、および米国特許出願公開第２０１４／３２２１２９号（それらの全体が参照により本明細書に組み込まれる）を参照されたい。
【０３３６】
ＩｇＳＦコンジュゲートの変異型ポリペプチドまたは免疫調節タンパク質は、変異型ポリペプチドまたは免疫調節タンパク質が、エフェクター部分と関連し得るか、またはこれに連結され得る任意の手段によってエフェクター部分に「付着」され得る。例えば、ＩｇＳＦコンジュゲートの変異型ポリペプチドまたは免疫調節タンパク質は、化学的または組み換え手段によってエフェクター部分に付着され得る。融合またはコンジュゲートを調製するための化学的手段は、当該技術分野で知られており、これらを使用してＩｇＳＦコンジュゲートを調製することができる。コンジュゲート変異型ポリペプチドまたは免疫調節タンパク質およびエフェクター部分をコンジュゲートするために使用される方法は、変異型ポリペプチドまたは免疫調節タンパク質の、それらの１つ以上のカウンター構造リガンドに結合する能力を妨げることなく、変異型ポリペプチドまたは免疫調節タンパク質をエフェクター部分と接合させることができる必要がある。
【０３３７】
ＩｇＳＦコンジュゲートの変異型ポリペプチドまたは免疫調節タンパク質は、間接的にエフェクター部分に連結され得る。例えば、ＩｇＳＦコンジュゲートの変異型ポリペプチドまたは免疫調節タンパク質は、いくつかの種類のうちの１つのエフェクター部分を含有するリポソームに間接的に連結され得る。エフェクター部分および／または変異型ポリペプチドもしくは免疫調節タンパク質がまた、固体表面に結合され得る。
【０３３８】
いくつかの実施形態では、ＩｇＳＦコンジュゲートの変異型ポリペプチドまたは免疫調節タンパク質およびエフェクター部分は、両方ともタンパク質であり、当該技術分野でよく知られている技術を使用してコンジュゲートされ得る。２つのタンパク質をコンジュゲートし得る、入手可能な架橋剤は、数百個ある。（例えば、“Ｃｈｅｍｉｓｔｒｙ  ｏｆ  Ｐｒｏｔｅｉｎ  Ｃｏｎｊｕｇａｔｉｏｎ  ａｎｄ  Ｃｒｏｓｓｌｉｎｋｉｎｇ，”１９９１，Ｓｈａｎｓ  Ｗｏｎｇ，ＣＲＣ  Ｐｒｅｓｓ，Ａｎｎ  Ａｒｂｏｒを参照されたい）。架橋剤は、概して、変異型ポリペプチドまたは免疫調節タンパク質および／またはエフェクター部分上に得られるか、または挿入される反応性官能基に基づいて選択される。加えて、反応基がない場合、光活性化性架橋剤を使用することができる。特定の例では、変異型ポリペプチドまたは免疫調節タンパク質とエフェクター部分との間のスペーサーを含むことが望ましい場合がある。当該技術分野で知られている架橋剤には、ホモバイファンクショナル剤：グルタルアルデヒド、ジメチル脂肪イミダートおよびビス（ジアゾベンジジン）、ならびにヘテロ二機能性薬剤：ｍマレイミドベンゾイル−Ｎ−ヒドロキシスクシンイミドおよびスルホ−ｍマレイミドベンゾイル−Ｎ−ヒドロキシスクシンイミドが含まれる。
【０３３９】
いくつかの実施形態では、ＩｇＳＦコンジュゲートの変異型ポリペプチドまたは免疫調節タンパク質は、エフェクター部分の化学的付着に特異的な残基により操作され得る。当該技術分野で知られている分子の化学的付着のために使用される特定の残基には、リジンおよびシステインが含まれる。架橋剤は、変異型ポリペプチドまたは免疫調節タンパク質上に挿入され、かつエフェクター部分上で得られる官能基に基づいて選択される。
【０３４０】
ＩｇＳＦコンジュゲートはまた、組み換えＤＮＡ技術を使用して調製することができる。このような場合、変異型ポリペプチドまたは免疫調節タンパク質をコードするＤＮＡ配列は、エフェクター部分をコードするＤＮＡ配列に融合され、キメラＤＮＡ分子をもたらす。キメラＤＮＡ配列は、融合タンパク質を発現する宿主細胞にトランスフェクトされる。融合タンパク質は、細胞培養から回収され、当該技術分野で知られている技術を使用して精製され得る。
【０３４１】
変異型ポリペプチドまたは免疫調節タンパク質に対する標識であるエフェクター部分を付着させる例には、Ｈｕｎｔｅｒ  ａｎｄ  Ｇｒｅｅｎｗｏｏｄ，Ｎａｔｕｒｅ，１９４：４９５−６（１９６２）、Ｄａｖｉｄ  ａｎｄ  Ｒｅｓｉｆｅｌｄ，Ｂｉｏｃｈｅｍｉｓｔｒｙ，１３（５）：１０１４−１０２１（１９７４）、Ｐａｉｎ  ａｎｄ  Ｓｕｒｏｌｉａ，Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．Ｍｅｔｈ．，４０（２）：２１９−２３０（１９８１）、Ｎｙｇｒｅｎ（１９８２），Ｊ．Ｈｉｓｔｏｃｈｅｍ．  ａｎｄ  Ｃｙｔｏｃｈｅｍ．，３０：４０７、Ｗｅｎｓｅｌ  ａｎｄ  Ｍｅａｒｅｓ，Ｒａｄｉｏｉｍｍｕｎｏｉｍａｇｉｎｇ  Ａｎｄ  Ｒａｄｉｏｉｍｍｕｎｏｔｈｅｒａｐｙ，Ｅｌｓｅｖｉｅｒ，Ｎ．Ｙ．（１９８３）、およびＣｏｌｃｈｅｒ  ｅｔ  ａｌ．，“Ｕｓｅ  Ｏｆ  Ｍｏｎｏｃｌｏｎａｌ  Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ  Ａｓ  Ｒａｄｉｏｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌｓ  Ｆｏｒ  Ｔｈｅ  Ｌｏｃａｌｉｚａｔｉｏｎ  Ｏｆ  Ｈｕｍａｎ  Ｃａｒｃｉｎｏｍａ  Ｘｅｎｏｇｒａｆｔｓ  Ｉｎ  Ａｔｈｙｍｉｃ  Ｍｉｃｅ”，Ｍｅｔｈ．Ｅｎｚｙｍｏｌ．，１２１：８０２−１６（１９８６）に記載される方法が含まれる。
【０３４２】
放射標識または他の標識が、既知の方法でコンジュゲートに組み込まれ得る。例えば、ペプチドは、生合成され得るか、または例えば、水素の位置にフッ素１９を伴う好適なアミノ酸前駆体を使用した化学アミノ酸合成によって合成され得る。９９Ｔｃまたは１２３Ｉ、１８６Ｒｅ、１８８Ｒｅ、および１１１Ｉｎなどの標識は、ペプチド中のシステイン残基を介して付着され得る。Ｙｔｔｒｉｕｍ−９０は、リジン残基を介して付着され得る。ＩＯＤＯＧＥＮ方法（Ｆｒａｋｅｒ  ｅｔ  ａｌ．，Ｂｉｏｃｈｅｍ．Ｂｉｏｐｈｙｓ．Ｒｅｓ．Ｃｏｍｍｕｎ．，８０（４）：８４９−５７（１９７８））を使用して、ヨウ素−１２３を組み込むことができる。「免疫シンチグラフィーにおけるモノクロ―ナル抗体」（Ｃｈａｔａｌ，ＣＲＣ  Ｐｒｅｓｓ  １９８９）は、他の方法を詳細に記載している。
【０３４３】
変異型ポリペプチドまたは免疫調節タンパク質のコンジュゲートおよび細胞傷害性薬剤は、Ｎ−サクシニミジル−３−（２−ピリジルジチオ）プロピオン酸（ＳＰＤＰ）、サクシニミジル−４−（Ｎ−マレイミドメチル）シクロヘキサン−１−カルボン酸（ＳＭＣＣ）、イミノチオラン（ＩＴ）、イミドエステルの二官能性誘導体（アジプイミド酸ジメチルＨＣＩなど）、活性エステル（スベリン酸ジサクシンイミジルなど）、アルデヒド（グルタルアルデヒドなど）、ビス・アジド化合物（ビス（ｐ−アジドベンゾイル）ヘキサンジアミンなど）、ビス−ジアゾニウム誘導体（ビス−（ｐ−ジアゾニウムベンゾイル）−エチレンジアミンなど）、ジイソシアン酸（トルエン２，６−ジイソシアン酸など）、およびビス−活性フッ素化合物（１，５−ジフルオロ−２，４−ジニトロベンゼンなど）などの様々な二官能性タンパク質連結剤を使用して作製され得る。例えば、リシン抗毒素は、Ｖｉｔｅｔｔａ  ｅｔ  ａｌ．，Ｓｃｉｅｎｃｅ  ２３８：１０９８（１９８７）に記載されているように調製され得る。炭素−１４−標識化１−ｐ−イソチオシアナトベンジル−３−メチルジエチレントリアミン五酢酸（ＭＸ−ＤＴＰＡ）は、放射性ヌクレオチドの抗体へのコンジュゲーションのための例示的なキレート剤である。例えば、ＷＯ９４／１１０２６を参照されたい。リンカーは、細胞中の細胞傷害性薬物の放出を促進する「開裂可能なリンカー」であり得る。例えば、酸不安定性リンカー、ペプチダーゼ感受性リンカー、感光性リンカー、ジメチルリンカー、またはジスルフィド含有リンカー（Ｃｈａｒｉ  ｅｔ  ａｌ．，Ｃａｎｃｅｒ  Ｒｅｓ．，５２（１）：１２７−１３１（１９９２）、米国特許第５，２０８，０２０号）を使用し得る。
【０３４４】
本発明のＩｇＳＦコンジュゲートは、市販されている（例えば、Ｐｉｅｒｃｅ  Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ，Ｉｎｃ．，Ｒｏｃｋｆｏｒｄ，ＩＬ，Ｕ．Ｓ．Ａ製の）架橋剤試薬：ＢＭＰＳ、ＥＭＣＳ、ＧＭＢＳ、ＨＢＶＳ、ＬＣ−ＳＭＣＣ、ＭＢＳ、ＭＰＢＨ、ＳＢＡＰ、ＳＩＡ、ＳＩＡＢ、ＳＭＣＣ、ＳＭＰＢ、ＳＭＰＨ、スルホ−ＥＭＣＳ、スルホ−ＧＭＢＳ、スルホ−ＫＭＵＳ、スルホ−ＭＢＳ、スルホ−ＳＩＡＢ、スルホ−ＳＭＣＣ、およびスルホ−ＳＭＰＢ、ならびにＳＶＳＢ（サクシニミジル−（４−ビニルスルホン）安息香酸）を用いて調製される薬物コンジュゲートを明示的に検討しているが、これらに限定されない。２００３−２００４  Ａｐｐｌｉｃａｔｉｏｎｓ  Ｈａｎｄｂｏｏｋ  ａｎｄ  Ｃａｔａｌｏｇの４６７〜４９８頁を参照されたい。
【０３４５】
Ｄ．膜貫通および分泌可能な免疫調節タンパク質ならびに操作された細胞
免疫調節変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドを月源する操作された細胞（代替的に、「操作された細胞」）を、本明細書に提供する。いくつかの実施形態では、発現される免疫調節変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、膜貫通タンパク質であり、発現される表面である。いくつかの実施形態では、発現される免疫調節変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、細胞から発現および分泌される。
【０３４６】
１．膜貫通免疫調節タンパク質
いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４を含む免疫調節ポリペプチドは、膜結合タンパク質であり得る。以下により詳細に記載されるように、免疫調節ポリペプチドは、親和性改変ＩｇＳＦドメイン（ＩｇＶ）、膜貫通ドメイン、および任意選択的に、細胞質ドメインを含有する外部ドメインが含有される、変異型ＣＴＬＡ−４を含む膜貫通免疫調節ポリペプチドであり得る。いくつかの実施形態では、膜貫通免疫調節タンパク質は、リンパ球（例えば、Ｔ細胞またはＮＫ細胞）または抗原提示細胞の表面上など、哺乳動物細胞などのメ根来細胞の表面上に発現され得る。いくつかの実施形態では、膜貫通免疫調節タンパク質は、Ｔヘルパー細胞、細胞傷害性Ｔ細胞（代替的に、細胞傷害性Ｔリンパ球、またはＣＴＬ）、ナチュラルキラーＴ細胞、調節性Ｔ細胞、メモリーＴ細胞、またはガンマデルタＴ細胞などのＴ細胞を含む、哺乳動物Ｔ細胞の表面上に発現される。いくつかの実施形態では、哺乳動物細胞は、抗原提示細胞（ＡＰＣ）である。典型的には、しかし排他的でなく、外部ドメイン（代替的に、「細胞外ドメイン」）は、本発明の変異型ＣＴＬＡ−４の１つ以上のアミノ酸変動（例えば、アミノ酸置換）を含む。したがって、例えば、いくつかの実施形態では、膜貫通タンパク質は、本発明の変異型ＣＴＬＡ−４の１つ以上のアミノ酸置換を含む外部ドメインを含むであろう。
【０３４７】
いくつかの実施形態では、操作された細胞は、膜貫通タンパク質などの膜タンパク質であり得る膜貫通免疫調節ポリペプチド（ＴＩＰ）である変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドを発現する。典型的な実施形態では、膜タンパク質の外部ドメインは、記載されるような少なくとも１つのＩｇＳＦドメイン中に１つ以上のアミノ酸置換が含有される、本明細書に提供される変異型ＣＴＬＡ−４の細胞外ドメインまたはそのＩｇＳＦドメインを含む。本明細書に提供される膜貫通免疫調節タンパク質は、外部ドメインに連結されている膜貫通ドメインをさらに含有する。いくつかの実施形態では、膜貫通ドメインは、細胞上の細胞表面発現に対するコードされたタンパク質を生じる。いくつかの実施形態では、膜貫通ドメインは、直接外部ドメインに連結されている。いくつかの実施形態では、膜貫通ドメインは、１つ以上のリンカーまたはスペーサーを介して外部ドメインに間接的に連結されている。いくつかの実施形態では、膜貫通ドメインは、ロイシンおよびバリンなどの主に疎水性のアミノ酸残基を含有する。
【０３４８】
いくつかの実施形態では、全長膜貫通アンカードメインを使用して、ＴＩＰが、操作されたＴ細胞などの操作された細胞の表面上に発現されることを確実にし得る。便利なことに、これは、親和性改変である特定の天然型タンパク質（例えば、ＣＴＬＡ−４または他の天然型ＩｇＳＦタンパク質）であり得、天然型ＩｇＳＦタンパク質（例えば、ＣＴＬＡ−４）と同様の様式で、第１の膜近位ドメインの配列に単に融合され得るであろう。いくつかの実施形態では、膜貫通免疫調節タンパク質は、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１（表１）に記載のアミノ酸の配列に含有される膜貫通ドメインなどの対応する野生型または非改変ＩｇＳＦメンバーの膜貫通ドメインを含む。いくつかの実施形態では、膜結合型は、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１の残基１６２〜１８２に対応するなど、対応する野生型または非改変ポリペプチドの膜貫通ドメインを含む。
【０３４９】
いくつかの実施形態では、膜貫通ドメインは、天然型ＣＴＬＡ−４の膜貫通ドメインではない非天然型膜貫通ドメインである。いくつかの実施形態では、膜貫通ドメインは、膜結合されるか、または膜貫通タンパク質である別の非ＣＴＬＡ−４ファミリーメンバーポリペプチドからの膜貫通ドメインに由来する。いくつかの実施形態では、Ｔ細胞上の別のタンパク質からの膜貫通アンカードメインを使用することができる。いくつかの実施形態では、膜貫通ドメインは、ＣＤ８に由来する。いくつかの実施形態では、膜貫通ドメインは、スペーサードメインとして機能するＣＤ８の細胞外部分をさらに含有し得る。例示的なＣＤ８由来の膜貫通ドメインは、ＣＤ８膜貫通ドメインを含有するＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：５４０、５４１、もしくは５６５、またはそれらの一部分に記載されている。いくつかの実施形態では、膜貫通ドメインは、合成膜貫通ドメインである。
【０３５０】
いくつかの実施形態では、膜貫通免疫調節タンパク質は、膜貫通ドメインに連結されている、細胞質シグナル伝達ドメインなどの外部ドメインをさらに含有する。
【０３５１】
いくつかの実施形態では、細胞質シグナル伝達ドメインなどの外部ドメインは、ＩＴＩＭ（免疫受容体チロシンベースの抑制モチーフ）であるか、またはこれを含む、抑制シグナル伝達ドメインである。いくつかの実施形態では、外部ドメインまたは膜貫通免疫調節タンパク質は、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１に記載のアミノ酸の配列に含有される細胞質シグナル伝達ドメインなど、対応する野生型または非改変ＣＴＬＡ−４ポリペプチドの細胞質シグナル伝達ドメインを含む（表１を参照されたい）。いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４であるか、またはこれを含む、提供される膜貫通免疫調節タンパク質は、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：４７８と少なくとも８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、または９９％の配列同一性など、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：４７８と少なくとも８５％の配列同一性を示すアミノ酸の配列を含み、かつ本明細書に記載されるような少なくとも１つの親和性改変ＣＴＬＡ−４  ＩｇＳＦドメインを含む外部ドメイン、および膜貫通ドメインを含有する。いくつかの実施形態では、膜貫通免疫調節タンパク質は、表２に記載のいずれかを含む、記載されるようなＩｇＳＦドメイン（例えば、ＩｇＶドメイン）中に任意の１つ以上のアミノ酸置換を含有する。いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４膜貫通免疫調節タンパク質は、親和性改変ＣＴＬＡ−４外部ドメインの、１つ以上の結合パートナーへの結合時などに、抑制細胞シグナルを誘発することができる。いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４膜貫通免疫調節タンパク質は、抗原提示細胞から１つ以上の結合パートナー（ＣＤ８０、ＣＤ８６、および／またはＩＣＯＳＬ）のトランス・エンドサイトーシスを仲介し、それによってＴ細胞活性化のための共刺激シグナルの有効性を制限し、よってＴ細胞活性化を制限または弱体化することができる。いくつかの実施形態では、提供される膜貫通免疫調節タンパク質は、自己免疫または炎症の症状の治療と関連するなど、免疫反応を抑制または弱体化するための方法および使用において使用され得る。
【０３５２】
ＣＴＬＡ−４ポリペプチドが、抑制受容体から活性化受容体に切り替えされる、スイッチ受容体も、本明細書に提供する。いくつかの実施形態では、ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、親和性改変ＣＴＬＡ−４外部ドメインの、１つ以上の結合パートナーへの結合時などに、活性化細胞シグナルを誘発することができる、細胞質シグナル伝達ドメインなどの外部ドメインを含有する。いくつかの実施形態では、外部ドメインまたは細胞質シグナル伝達ドメインは、ＩＴＡＭ（免疫受容体チロシンベースの活性化モチーフ）含有シグナル伝達ドメインであるか、またはこれを含む、活性化シグナル伝達ドメインである。ＩＴＡＭは、Ｔ細胞受容体シグナル情報伝達に関わるＣＤ３−ゼータ鎖（「ＣＤ３−ｚ」）を含む、免疫細胞のシグナル情報伝達に関わるいくつかのタンパク質シグナル伝達ドメインに見られる保存モチーフである。いくつかの実施形態では、外部ドメインは、ＣＤ３−ゼータシグナル伝達ドメインを含む。いくつかの実施形態では、ＣＤ３−ゼータシグナル伝達ドメインは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：５４２に記載のアミノ酸の配列、またはＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：５４２と少なくとも８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、もしくは９９％を示し、かつＴ細胞シグナル伝達の活性を保持するアミノ酸の配列を含む。いくつかの実施形態では、外部ドメインは、Ｔ細胞の免疫調節反応をさらに調節するための共刺激シグナル伝達ドメインをさらに含み得る。いくつかの実施形態では、共刺激シグナル伝達ドメインは、ＣＤ２８、ＩＣＯＳ、４１ＢＢ、またはＯＸ４０である。いくつかの実施形態では、共刺激シグナル伝達ドメインは、ＣＤ２８または４〜１ＢＢに由来し、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：５４３〜５４６のうちのいずれかに記載のアミノ酸の配列、またはＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：５４３〜５４６と少なくとも８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、もしくは９９％を示し、かつＴ細胞共刺激シグナル伝達の活性を保持するアミノ酸の配列を含む。したがって、いくつかの実施形態では、提供されるＣＴＬＡ−４膜貫通免疫調節ポリペプチドは、親和性改変ＩｇＳＦドメインの、結合パートナーまたはカウンター構造との結合時に、Ｔ細胞シグナル伝達を刺激するＣＡＲの特徴を有するＣＡＲ関連膜貫通免疫調節タンパク質である。いくつかの実施形態では、親和性改変ＩｇＳＦドメインの、そのカウンター構造への特異的結合時に、細胞傷害性、増殖、またはサイトカイン生成の変化によって反映されるようなＴ細胞活性の免疫活性の変化をもたらし得る。いくつかの実施形態では、提供されるスイッチ（活性化）受容体は、癌の治療のための様々な腫瘍学的方法などと関連して、免疫反応を誘発または促進するための方法および使用において使用され得る。
【０３５３】
ＣＴＬＡ−４ポリペプチドが、結合パートナーへの結合時に、細胞内シグナルを誘発することができない、デコイ受容体も、本明細書に提供する。いくつかの実施形態では、膜貫通免疫調節タンパク質は、ＩＴＩＭ含有ドメインを含有する細胞内シグナル伝達ドメインを含有しないなど、細胞質シグナル伝達を仲介することができる外部ドメインを含有しない。したがって、いくつかの実施形態では、膜貫通免疫調節タンパク質は、野生型または非改変ＣＴＬＡ−４ポリペプチドのシグナル情報伝達機構を欠いており、したがって、それ自体が細胞シグナル伝達を誘発しない。いくつかの実施形態では、膜貫通免疫調節タンパク質は、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１に記載のアミノ酸の配列に含有される細胞質シグナル伝達ドメイン（表１を参照されたい）など、対応する野生型または非改変ＣＴＬＡ−４ポリペプチドの細胞内（細胞質）ドメインまたは一部分を欠いている。したがって、いくつかの実施形態では、膜貫通免疫調節タンパク質は、記載されているいずれかなど、外部ドメインおよび膜貫通ドメインのみを含有する。いくつかの実施形態では、そのようなデコイ受容体は、抑制エフェクター細胞の活性を抑制するためのＣＴＬＡ−４の能力を競合および／または排除し、それによって免疫反応の活性化を促進し得る。場合によっては、そのような提供されるデコイ受容体は、癌の治療のための様々な腫瘍学方法などに関連して、免疫反応を増加または増強するための方法および使用に使用され得る。
【０３５４】
いくつかの実施形態では、膜貫通免疫調節タンパク質は、シグナルペプチドをさらに含有し得る。いくつかの実施形態では、シグナルペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１に記載のアミノ酸の配列中に含有されるなど、野生型ＩｇＳＦメンバーの天然型シグナルペプチドである（例えば、表１を参照されたい）。
【０３５５】
このような膜貫通免疫調節タンパク質をコードする核酸分子も提供する。いくつかの実施形態では、膜貫通免疫調節タンパク質をコードする核酸分子は、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：４７８と少なくとも８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、または９９％の配列同一性を示すアミノ酸の配列をコードし、かつ記載されるような少なくとも１つの親和性改変ＩｇＳＦドメイン、膜貫通ドメイン、任意選択的に、細胞質ドメインを含む外部ドメインを含有するヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施形態では、核酸分子は、シグナルペプチドをコードするヌクレオチドの配列をさらに含み得る。いくつかの実施形態では、シグナルペプチドは、対応する野生型ＩｇＳＦメンバーの天然型シグナルペプチドである（例えば、表１を参照されたい）。
【０３５６】
２．分泌される免疫調節タンパク質および操作された細胞
いくつかの実施形態では、本明細書に記載されるようなアミノ酸変異のうちのいずれか１つ以上を含有するＣＴＬＡ−４変異型免疫調節ポリペプチドは、細胞から発現される場合など、分泌可能である。そのような変異型ＣＴＬＡ−４免疫調節タンパク質は、膜貫通ドメインを含まない。いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４免疫調節タンパク質は、半減期延長部分（Ｆｃドメインまたは多量体化ドメインなど）にコンジュゲートされない。いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４免疫調節タンパク質は、細胞の外側にドメインを得るために、抗体シグナルペプチドまたは他の効率的なシグナル配列などのシグナルペプチドを含む。免疫調節タンパク質がシグナルペプチドを含み、操作された細胞によって発現される場合、シグナルペプチドにより、免疫調節タンパク質が操作された細胞によって分泌される。概して、シグナルペプチド、またはシグナルペプチドの一部分は、分泌により免疫調節タンパク質から開裂される。免疫調節タンパク質は、核酸（発現ベクターの一部であり得る）によってコードされ得る。いくつかの実施形態では、免疫調節タンパク質は、細胞（免疫細胞、例えば、初代免疫細胞など）によって発現および分泌される。
【０３５７】
したがって、いくつかの実施形態では、シグナルペプチドをさらに含む変異型ＣＴＬＡ−４免疫調節タンパク質を提供する。いくつかの実施形態では、シグナルペプチドをコードする分泌配列に操作可能に接続される変異型ＣＴＬＡ−４免疫調節タンパク質をコードする核酸分子を、本明細書に提供する。
【０３５８】
シグナルペプチドは、細胞からの免疫調節タンパク質の分泌をシグナル伝達する免疫調節タンパク質のＮ末端上の配列である。いくつかの実施形態では、シグナルペプチドは、約５〜約４０アミノ酸長（約５〜約７、約７〜約１０、約１０〜約１５、約１５〜約２０、約２０〜約２５、または約２５〜約３０、約３０〜約３５、または約３５〜約４０アミノ酸長など）である。
【０３５９】
いくつかの実施形態では、シグナルペプチドは、対応する野生型ＣＴＬＡ−４からの天然型シグナルペプチドである（表１を参照されたい）。いくつかの実施形態では、シグナルペプチドは、非天然型シグナルペプチドである。例えば、いくつかの実施形態では、非天然型シグナルペプチドは、対応する野生型ＣＴＬＡ−４からの変異体天然型シグナルペプチドであり、１つ以上の（２、３、４、５、６、７、８、９、または１０以上など）置換、挿入、または欠失を含み得る。いくつかの実施形態では、非天然型シグナルペプチドは、野生型ＩｇＳＦファミリーメンバーと同じＩｇＳＦファミリーからのファミリーメンバーのシグナルペプチドまたはその変異体である。いくつかの実施形態では、非天然型シグナルペプチドは、野生型ＩｇＳＦファミリーメンバーとは異なるＩｇＳＦファミリーからのＩｇＳＦファミリーメンバーからのシグナルペプチドまたはその変異体である。いくつかの実施形態では、シグナルペプチドは、免疫グロブリンからのシグナルペプチド（ＩｇＧ重鎖またはＩｇＧカッパ軽鎖など）、サイトカイン（インターロイキン−２（ＩＬ−２）、またはＣＤ３３など）、血清アルブミンタンパク質（例えば、ＨＳＡまたはアルブミン）、ヒトアズロシジン前タンパク質シグナル配列、ルシフェラーゼ、トリプシノーゲン（例えば、キモトリプシノーゲンまたはトリプシノーゲン）、または細胞からタンパク質を効率的に分泌することができる他のシグナルペプチドなど、非ＩｇＳＦタンパク質ファミリーからのシグナルペプチドまたはその変異体である。例示的なシグナルペプチドは、表３に記載のいずれかを含む。
【０３６０】
（表３）例示的なシグナルペプチド
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【０３６１】
分泌可能な変異型ＣＴＬＡ−４免疫調節タンパク質のいくつかの実施形態では、免疫調節タンパク質は、発現されたときにシグナルペプチドを含み、シグナルペプチド（またはその一部分）が、分泌時に免疫調節タンパク質から開裂される。
【０３６２】
いくつかの実施形態では、操作された細胞は、細胞から分泌される変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドを発現する。いくつかの実施形態では、そのような変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、分泌のためのシグナル配列の操作可能な制御下で、免疫調節タンパク質をコードする核酸分子によってコードされる。いくつかの実施形態では、コードされる免疫調節タンパク質は、細胞から発現されたときに分泌される。いくつかの実施形態では、核酸分子によってコードされる免疫調節タンパク質は、膜貫通ドメインを含まない。いくつかの実施形態では、核酸分子によってコードされる免疫調節タンパク質は、半減期延長部分（Ｆｃドメインまたは多量体化ドメインなど）を含まない。いくつかの実施形態では、核酸分子によってコードされる免疫調節タンパク質は、シグナルペプチドを含む。いくつかの実施形態では、本発明の核酸は、免疫調節タンパク質をコードする核酸に操作可能に連結されている分泌またはシグナルペプチドをコードするヌクレオチド配列をさらに含み、それによって免疫調節タンパク質の分泌を可能にする。
【０３６３】
３．細胞および細胞の操作
提供される免疫調節ポリペプチドのうちのいずれかを発現する操作された細胞を、本明細書に提供する。いくつかの実施形態では、操作された細胞は、提供される膜貫通免疫調節ポリペプチドのうちのいずれかを、それらの表面上に発現する。いくつかの実施形態では、操作された細胞は、タンパク質の分泌に好適な条件下で、細胞から免疫調節タンパク質を発現し、かつこれを分泌する能力化あるか、または分泌することができる。いくつかの実施形態では、免疫調節タンパク質は、リンパ球（ＴＩＬ）、Ｔ細胞、もしくはＮＫ細胞に浸潤する腫瘍などのリンパ球上もしくは内に、または骨髄系細胞上に発現される。いくつかの実施形態では、操作された細胞は、抗原提示細胞（ＡＰＣ）である。いくつかの実施形態では、操作された細胞は、操作された哺乳動物Ｔ細胞または操作された哺乳動物抗原提示細胞（ＡＰＣ）である。いくつかの実施形態では、操作されたＴ細胞またはＡＰＣは、ヒトまたはネズミ細胞である。
【０３６４】
いくつかの実施形態では、操作されたＴ細胞は、調節性Ｔ細胞、Ｔヘルパー細胞、細胞傷害性Ｔ細胞（代替的に、細胞傷害性Ｔリンパ球またはＣＴＬ）、ナチュラルキラーＴ細胞、メモリーＴ細胞、またはガンマデルタＴ細胞を含むが、これらに限定されない。いくつかの実施形態では、操作されたＴ細胞は、ＣＤ４＋またはＣＤ８＋である。いくつかの態様では、操作されたＴ細胞は、活性化Ｔ細胞であり得る。いくつかの実施形態では、操作されたＴ細胞は、調節性Ｔ細胞（Ｔｒｅｇ）である。いくつかの実施形態では、操作されたＴ細胞は、ＡＰＣなどの対向する細胞からの１つ以上の結合パートナーのＣＴＬＡ−４媒介性トランス・エンドサイトーシスである。いくつかの実施形態では、操作されたＴ細胞は、非改変Ｔ細胞または非改変ＣＴＬＡ−４を発現するＴ細胞と比較して、１つ以上の結合パートナー、ＣＤ８０、ＣＤ８６、および／またはＩＣＯＳＬの増加したトランス・エンドサイトーシスを示す。
【０３６５】
いくつかの実施形態では、膜貫通免疫調節タンパク質または分泌可能な免疫調節タンパク質など、本明細書に提供される免疫調節タンパク質は、同時発現されるか、またはキメラ抗原受容体（ＣＡＲ）もしくはＴ細胞受容体（ＴＣＲ）など、組み換え受容体などの抗原結合受容体を発現する細胞へと操作される。いくつかの実施形態では、操作されたＴ細胞などの操作された細胞は、炎症性および自己免疫性障害、癌、またはウイルス感染に関連する所望の抗原を認識する。特定の実施形態では、抗原結合受容体は、腫瘍特異的抗原または腫瘍関連抗原に特異的に結合する抗原結合部分を含有する。いくつかの実施形態では、ＴＩＰタンパク質は、操作されたＴ細胞受容体細胞または操作されたキメラ抗原受容体細胞中に発現される。そのような実施形態では、操作された細胞は、ＴＩＰおよびＣＡＲまたはＴＣＲを同時発現する。いくつかの実施形態では、ＳＩＰタンパク質は、操作されたＴ細胞受容体細胞または操作されたキメラ抗原受容体細胞中に発現される。そのような実施形態では、操作された細胞は、ＳＩＰおよびＣＡＲまたはＴＣＲを同時発現する。
【０３６６】
いくつかの実施形態では、操作されたＴ細胞は、免疫細胞特異的抗原、リンパ組織関連抗原、または炎症性組織関連抗原などの抗原に特異的に結合する抗原結合ドメイン（例えば、ｓｃＦｖ）を含有するＣＡＲが発現されるＣＡＲ（キメラ抗原受容体）Ｔ細胞である。キメラ抗原受容体（ＣＡＲ）は、抗原結合ドメイン（外部ドメイン）、膜貫通ドメイン、および抗原が結合された後に、活性化シグナルを誘発するか、またはＴ細胞に仲介することができる、細胞内シグナル伝達領域（外部ドメイン）を含む、組み換え受容体である。いくつかの例では、ＣＡＲが発現細胞は、活性化ドメイン、および場合によっては、共刺激ドメインを含む、細胞内シグナル伝達に連結されている、特定の抗原、例えば、腫瘍抗原に対する特異性を有する細胞外単鎖可変断片（ｓｃＦｖ）を発現するように操作される。活性化ドメインは、例えば、ＣＤ３ゼータなどのＣＤ３、エプシロン、デルタ、ガンマなどに由来し得る。いくつかの実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、ＣＤ３ゼータシグナル伝達ドメインなどのＩＴＡＭシグナル伝達ドメインを含む。いくつかの実施形態では、ＣＡＲは、共刺激シグナル伝達ドメインをさらに含む。共刺激ドメインは、例えば、ＣＤ２８、ＯＸ−４０、４〜１ＢＢ／ＣＤ１３７、または誘導性Ｔ細胞共刺激分子（ＩＣＯＳ）に由来し得る。特定の実施形態では、ＣＡＲは、２、３、４つ以上の共刺激ドメインを有するように設計される。ＣＡＲ  ｓｃＦｖは、ＮＨＬ、ＣＬＬ、および非Ｔ細胞ＡＬＬを含むが、これらに限定されない、すべての正常なＢ細胞およびＢ細胞悪性状態を含む、Ｂ細胞系譜における細胞によって発現される膜貫通タンパク質である、例えば、ＣＤ１９などの疾患または状態と関連する細胞上に発現される抗原、例えば、腫瘍抗原を標的化するように設計され得る。実施例ＣＡＲ＋Ｔ細胞療法および構築物は、米国特許公開第２０１３／０２８７７４８号、同第２０１４／０２２７２３７号、同第２０１４／００９９３０９号、および同第２０１４／００５０７０８号にきさい記載されており、これらの参照は、それらの全体が参照により組み込まれる。いくつかの実施形態では、ＣＡＲは、抗原結合ドメインと膜貫通ドメインとの間にスペーサーをさらに含有する。
【０３６７】
いくつかの実施形態では、スペーサーおよび膜貫通ドメインは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：５４０、５４１、もしくは５６５に記載の例示的な配列、またはＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：５４０、５４１、もしくは５６５と少なくとも８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％以上の配列同一性を示すアミノ酸の配列などを有する、ＣＤ８に由来するヒンジおよび膜貫通ドメインである。いくつかの実施形態では、外部ドメインは、ＣＤ３−ゼータシグナル伝達ドメインを含む。いくつかの実施形態では、ＣＤ３−ゼータシグナル伝達ドメインは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：５４２に記載のアミノ酸の配列、またはＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：５４２と少なくとも８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、もしくは９９％以上の配列同一性を示し、かつＴ細胞シグナル伝達の活性を保持するアミノ酸の配列を含む。
【０３６８】
いくつかの実施形態では、ＣＡＲの外部ドメインは、Ｔ細胞の免疫調節反応をさらに調節するための共刺激シグナル伝達ドメインまたは領域をさらに含み得る。いくつかの実施形態では、共刺激シグナル伝達ドメインは、共刺激領域であるか、もしくはこれを含むか、またはＣＤ２８、ＩＣＯＳ、４１ＢＢ、もしくはＯＸ４０の共刺激領域に由来する。いくつかの実施形態では、共刺激シグナル伝達ドメインは、ＣＤ２８もしくは４〜１ＢＢに由来し、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：５４３〜５４６のうちのいずれかに記載のアミノ酸の配列、またはＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：５４３〜５４６と少なくとも８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、もしくは９９％以上の配列同一性を示し、かつＴ細胞共刺激シグナル伝達の活性を保持するアミノ酸の配列を含む。
【０３６９】
いくつかの実施形態では、ＣＡＲをコードする構築物は、自己開裂ペプチド配列によってＣＡＲから分離される、マーカー、例えば、検出可能なタンパク質などの第２のタンパク質をさらにコードする。いくつかの実施形態では、自己開裂ペプチド配列は、Ｆ２Ａ、Ｔ２Ａ、Ｅ２Ａ、またはＰ２Ａ自己開裂ペプチドである。Ｔ２Ａ自己開裂ペプチドの例示的な配列は、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：５６６〜５６８のうちのいずれか１つに記載されているか、またはＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：５６６〜５６８のうちのいずれかと少なくとも８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、もしくは９９％以上の配列同一性を示すアミノ酸の配列である。いくつかの実施形態では、Ｔ２Ａは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：５６７に記載のヌクレオチドの配列、またはＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：５６７のうちのいずれかと少なくとも８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、もしくは９９％以上の配列同一性を示す配列によってコードされる。いくつかの実施形態では、マーカーは、例えば、緑色蛍光タンパク質（ＧＦＰ）または青色蛍光性タンパク質（ＢＦＰ）などの蛍光性タンパク質など、検出可能なタンパク質である。蛍光性タンパク質マーカーの例示的な配列は、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：９８、１０５、３８０、もしく３８７に記載されているか、またはＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：９８、１０５、３８０、または３８７と少なくとも８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、もしくは９９％以上の配列同一性を示すアミノ酸の配列である。
【０３７０】
別の実施形態では、操作されたＴ細胞は、組み換えまたは操作されたＴＣＲを含む、ＴＣＲを保有する。いくつかの実施形態では、ＴＣＲは、天然型ＴＣＲであり得る。いくつかの実施形態では、ＴＣＲは、所定の抗原−ＭＨＣ複合体に特異的である。当業者であれば、一般に、天然型哺乳動物Ｔ細胞受容体が、抗原特異的認識および結合に関わるアルファ鎖およびベータ鎖（またはガンマ鎖およびデルタ鎖）を含むことを認識するであろう。いくつかの実施形態では、ＴＣＲは、改変された操作されたＴＣＲである。いくつかの実施形態では、操作されたＴ細胞のＴＣＲは、ＡＰＣによって提示される腫瘍関連または腫瘍特異的抗原に特異的に結合する。
【０３７１】
いくつかの実施形態では、膜貫通免疫調節ポリペプチドまたは分泌可能な免疫調節ポリペプチドなどのメ根来調節ポリペプチドは、組み換え宿主細胞に対して用いられる戦略などの様々な戦略によって、操作されたＴ細胞または操作されたＡＰＣなどの操作された細胞に組み込まれ得る。ＤＮＡ構築物を初代Ｔ細胞に導入するための様々な方法が、当該技術分野で知られている。いくつかの実施形態では、ウイルス情報伝達またはプラスミド電気穿孔を用いる。典型的な実施形態では、免疫調節タンパク質または発現ベクターをコードする核酸分子は、発現される膜貫通免疫調節タンパク質を細胞膜に、または分泌のために局在するシグナルペプチドを含む。いくつかの実施形態では、本発明の膜貫通免疫調節タンパク質をコードする核酸は、宿主哺乳動物細胞における発現を可能にする、レトロウイルスベクターなどのウイルスベクターにサブクローン化される。発現ベクターは、哺乳動物宿主細胞に導入され得、宿主細胞培養条件下で、免疫調節タンパク質が、表面上に発現されるか、または分泌される。
【０３７２】
例示的な例では、初代Ｔ細胞は、生体外で（ＣＤ４細胞またはＣＤ８細胞または両方）精製され得、抗ＣＤ３／抗ＣＤ２８被覆ビーズなどの様々なＴＣＲ／ＣＤ２８アゴニストからなる活性化プロトコルで刺激され得る。２日または３日の活性化プロセスの後、免疫調節ポリペプチドを含有する組み換え発現ベクターは、最先端のレンチウイルスまたはレトロウイルス情報伝達プロトコルまたはプラスミド電気穿孔戦略を通して初代Ｔ細胞に安定的に導入され得る。細胞は、例えば、天然型親分子および変異型ＣＴＬＡ−４を含むポリペプチドと交差反応する抗エピトープタグまたは抗体を使用したフローサイトメトリーによって、メ根来調節ポリペプチド発現のために監視され得る。免疫調節ポリペプチドを発現するＴ細胞は、抗エピトープタグ抗体による選別を通して濃縮され得るか、または本出願に依存する高発現または低発現のために濃縮され得る。
【０３７３】
免疫調節ポリペプチド発現に対して、操作されたＴ細胞は、様々な手段による適切な機能のためにアッセイされ得る。標準的なインビトロ細胞傷害性、増殖、またはサイトカインアッセイ（例えば、ＩＦＮ−ガンマ発現）を使用して、操作されたＴ細胞の機能を評価し得る。例示的な標準的終点は、抗原発現標的細胞のパーセント溶解、操作されたＴ細胞の増殖、培養液上清中のＩＦＮ−ガンマタンパク質発現である。標的細胞の溶解の増加もしくは低減、操作されたＴ細胞の増加もしくは減少、または対照構築物にわたるＩＦＮ−ガンマ発現の増加もしくは減少など、そのような入力の統計的に有意な調節をもたらす変異型ＣＴＬＡ−４  ＴＩＰを含有する操作されたＴ細胞が、そのために選択され得る。いくつかの実施形態では、対照構築物と比較して、標的細胞の溶解の低減、増殖の低減、および／もしくはＩＦＮ−ガンマ発現の低減をもたらす操作された細胞が、そのために選択され、かつ／またはＴＩＰの発現が、免疫細胞活性を弱体化することを示している。いくつかの実施形態では、対照構築物は、Ｔ細胞の表面上に発現される全長野生型または非改変ＣＴＬＡ−４などの野生型または非改変ＣＴＬＡ−４ポリペプチドである。追加的に、天然型初代または内因性などの操作されていないＴ細胞はまた、場合によっては、バイスタンダーの天然型Ｔ細胞におけるエフェクター機能を減少させるためを含む、活性を調節するために、操作されたＴ細胞などの操作された細胞上に発現される免疫調節ポリペプチド構築物の能力を測定するための同じインビトロアッセイに組み込まれ得る。ＣＤ６９、ＣＤ４４、またはＣＤ６２Ｌなどの活性化マーカーの発現は、内因性Ｔ細胞上で監視され得るであろう。場合によっては、減少、増殖、および／またはサイトカイン生成などの変化は、操作されたＴ細胞上に発現される免疫調節タンパク質の所望の活性を示し得るであろう。
【０３７４】
いくつかの態様では、トランス・エンドサイトーシス／取得アッセイを実行して、ＣＴＬＡ−４  ＴＩＰにより操作された細胞が、ＡＰＣ上のＣＤ８０、ＣＤ８６、および／またはＩＣＯＳＬのトランス・エンドサイトーシスの増強または増加など、ＡＰＣ上に発現される結合パートナーのトランス・エンドサイトーシスの増強または増加を示すかどうかを評価することができる。トランス・エンドサイトーシスを評価するためのアッセイが知られている（例えば、Ｈｏｕ  ｅｔ  ａｌ（２０１５），Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．，１９４（５）：２１４８−５９；Ｓｏｓｋｉｃ  ｅｔ  ａｌ．（２０１４），Ａｄｖ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．，１２４：９５−１３６；Ｑｕｒｅｓｈｉ  ｅｔ  ａｌ．（２０１１），Ｓｃｉｅｎｃｅ，３３２（６０２９）：６００−６０３）を参照されたい）。いくつかの態様では、ＡＰＣは、Ｔ細胞活性化を誘発または刺激するための条件下で、ＣＴＬＡ−４  ＴＩＰを発現するＴ細胞と共培養され得、免疫染色を実行して、ＡＰＣ上のＣＤ８０、ＣＤ８６、および／またはＩＣＯＳＬの細胞表面発現を評価することができる。対照構築物にわたってＡＰＣ上にＣＤ８０、ＣＤ８６、および／またはＩＣＯＳＬの統計的に有意な減少した表面免疫染色をもたらす操作された構築物が、そのために選択され得る。
【０３７５】
Ｅ．変異型ポリペプチドおよび免疫調節タンパク質を発現するための感染性病原体
本明細書に記載の分泌可能なまたは膜貫通免疫調節タンパク質を含む、ＣＴＬＡ−４  ｖＩｇＤポリペプチドなどの変異型ポリペプチドのうちのいずれかをコードする核酸を含有する感染性病原体も提供する。いくつかの実施形態では、そのような感染性病原体は、ＣＴＬＡ−４  ｖＩｇＤポリペプチドなどの本明細書に記載の変異型免疫調節ポリペプチドをコードする核酸を、対象における標的細胞、例えば、対象における免疫細胞および／または抗原提示細胞（ＡＰＣ）または腫瘍細胞に送達し得る。ベクターおよび／またはプラスミドなどのそのような感染性病原体、ならびにそのような感染性病原体を含有する組成物の作成または改変のためのそのような感染性病原体、および／または核酸に含有される核酸も提供する。
【０３７６】
いくつかの実施形態では、感染性病原体は、微生物または病原菌である。いくつかの実施形態では、感染性病原体は、ウイルスまたは細菌である。いくつかの実施形態では、感染性病原体は、ウイルスである。いくつかの実施形態では、感染性病原体は、細菌である。いくつかの実施形態では、そのような感染性病原体は、本明細書に記載の分泌可能なまたは膜貫通免疫調節タンパク質を含む、ＣＴＬＡ−４  ｖＩｇＤポリペプチドなどの変異型ポリペプチドのうちのいずれかをコードする核酸配列を送達し得る。したがって、いくつかの実施形態では、感染性病原体によって感染または接触される対象における細胞を、変異型免疫調節ポリペプチドを細胞表面上に発現するか、またはこれを分泌する状態にすることができる。いくつかの実施形態では、感染性病原体はまた、１つ以上の他の治療薬または他の治療薬をコードする核酸を、対象内の細胞および／または環境に送達することができる。いくつかの実施形態では、感染性病原体によって送達され得る他の治療薬には、サイトカインまたは他の免疫調節分子が含まれる。
【０３７７】
いくつかの実施形態では、感染性病原体、例えば、ウイルスまたは細菌は、本明細書に記載の、対象における細胞の接触および／または感染による、分泌可能なまたは膜貫通免疫調節タンパク質を含む、ＣＴＬＡ−４  ｖＩｇＤポリペプチドなどの変異型ポリペプチドのうちのいずれかをコードする核酸配列を含有し、細胞は、感染性病原体に含有される核酸配列によってコードされる、分泌可能なまたは膜貫通免疫調節タンパク質を含む、ＣＴＬＡ−４  ｖＩｇＤポリペプチドなどの変異型ポリペプチドを発現する。いくつかの実施形態では、感染性病原体は、対象に投与され得る。いくつかの実施形態では、感染性病原体は、対象からの細胞と生体外で接触され得る。
【０３７８】
いくつかの実施形態では、感染性病原体によって感染された細胞によって発現される膜貫通免疫調節タンパク質を含む、ＣＴＬＡ−４  ｖＩｇＤポリペプチドなどの変異型ポリペプチドは、膜貫通タンパク質であり、表面に発現される。いくつかの実施形態では、感染性病原体によって感染された細胞によって発現される分泌可能な免疫調節タンパク質を含む、ＣＴＬＡ−４  ｖＩｇＤポリペプチドなどの変異型ポリペプチドが、発現され、細胞から分泌される。膜貫通免疫調節タンパク質または分泌された免疫調節タンパク質は、本明細書に記載されるいずれかであり得る。
【０３７９】
いくつかの実施形態では、感染性病原体によって標的化される対象における細胞には、免疫細胞および／または抗原提示細胞（ＡＰＣ）が含まれる。いくつかの実施形態では、感染性病原体は、腫瘍微小環境（ＴＭＥ）において細胞を標的化する。いくつかの実施形態では、感染性病原体は、分泌可能なまたは膜貫通免疫調節タンパク質を含むＣＴＬＡ−４  ｖＩｇＤポリペプチドなどの変異型ポリペプチドをコードする核酸を、免疫反応および／または特定の細胞媒介性免疫反応を調節する適切な細胞（例えば、Ｔｒｅｇ細胞などのＡＰＣ上のペプチド／ＭＨＣを認識するＴ細胞）または組織（例えば、リンパ球組織）に送達する。いくつかの実施形態では、感染性病原体は、調節性Ｔ細胞（Ｔｒｅｇ）などのＴ細胞を標的化する。いくつかの実施形態では、本明細書に記載の感染性病原体によって送達される核酸分子は、特定の標的細胞、例えば、プロモーターなどの調節性要素において、変異型免疫調節ポリペプチドをコードする操作可能に連結されているコード化配列の発現に必要な適切な核酸配列を含む。
【０３８０】
いくつかの実施形態では、免疫調節ポリペプチドをコードする核酸配列を含有する感染性病原体はまた、１つ以上の追加の遺伝子生成物、例えば、サイトカイン、プロドラッグ変換酵素、細胞毒、および／または検出可能な遺伝子生成物をコードする核酸配列を含有し得る。例えば、いくつかの実施形態では、感染性病原体は、腫瘍溶解性ウイルスであり、ウイルスは、追加の治療遺伝子生成物をコードする核酸配列を含み得る（例えば、Ｋｉｒｎ  ａｎｄ  Ｔｈｏｒｎｅ（２００９），Ｎａｔ  Ｒｅｖ  Ｃａｎｃｅｒ，９（１）：６４−７１、Ｇａｒｃｉａ−Ａｒａｇｏｎｃｉｌｌｏ  ｅｔ  ａｌ．（２０１０），Ｃｕｒｒ  Ｏｐｉｎ  Ｍｏｌ  Ｔｈｅｒ，１２（４）：４０３−４１１を参照されたい、米国特許第７，５８８，７６７号、同第７，５８８，７７１号、同第７，６６２，３９８号、および同第７，７５４，２２１号、ならびに米国特許公開第２００７／０２０２５７２号、同第２００７／０２１２７２７号、同第２０１０／００６２０１６号、同第２００９／００９８５２９号、同第２００９／００５３２４４号、同第２００９／０１５５２８７号、同第２００９／０１１７０３４号、同第２０１０／０２３３０７８号、同第２００９／０１６２２８８号、同第２０１０／０１９６３２５号、同第２００９／０１３６９１７号、および同第２０１１／００６４６５０号を参照されたい。いくつかの実施形態では、追加の遺伝子生成物は、標的細胞（例えば、免疫細胞）の死をもたらし得る治療遺伝子生成物、または免疫反応を抑制するか、または抑えるか、または調節することができる遺伝子生成物（例えば、サイトカイン）であり得る。例示的な遺伝子生成物はまた、免疫調節分子、免疫チェックポイントアクチベーター、抗体、サイトカイン、成長因子、抗原、細胞傷害性遺伝子生成物、アポトーシス促進性遺伝子生成物、抗アポトーシス性遺伝子生成物、細胞マトリクス分解性遺伝子、および本明細書に記載の、または当業者に知られている他の遺伝子を含む。
【０３８１】
１．ウイルス
いくつかの実施形態では、感染性病原体は、ウイルスである。いくつかの実施形態では、感染性病原体は、特定の細胞、例えば、免疫細胞を標的化するウイルスである。いくつかの実施形態では、感染性病原体は、免疫細胞またはＴ細胞を標的化する。
【０３８２】
いくつかの実施形態では、ウイルスは、アデノウイルス（Ａｄ）、アデノ関連ウイルス（ＡＡＶ）、単純ヘルペスウイルス（ＨＳＶ）、モロニーマウス白血病ウイルス（ＭＭＬＶ）などのレトロウイルスベクター、ハイブリッドレトロウイルス（例えば、高力価ウイルス群体の生成のために最適な様々なレトロウイルスＬＴＲをそれらの５’末端上に含有し、脾臓フォーカス形成ウイルス（ＳＦＦＶ）ＬＴＲを３’末端上に含有する）、ヒト免疫不全ウイルス（ＨＩＶ−１）、ＨＩＶ−２、ウシレンチウイルス、ネコレンチウイルス、またはサルレンチウイルスなどのレンチウイルスベクター、自己不活性化ベクター（ＳＩＶ）である。
【０３８３】
いくつかの実施形態では、感染性病原体は、改変単純ヘルペスウイルスである。いくつかの実施形態では、感染性病原体は、本明細書に記載の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドなど、本明細書に記載の変異型免疫調節ポリペプチドのうちのいずれかをコードする核酸を含有するように改変された、タリモジーン・ラハーパレプベック（Ｔ−Ｖｅｃ、ＩＭＬＹＧＩＣ（商標）、またはＯｎｃｏＶｅｘ  ＧＭ−ＣＳＦとしても知られる）の改変バージョンである。いくつかの実施形態では、感染性病原体は、ＷＯ２００７／０５２０２９、ＷＯ１９９９／０３８９５５、ＵＳ２００４／００６３０９４、ＵＳ２０１４／０１５４２１６に記載される改変単純ヘルペスウイルス、またはそれらの変異型である。
【０３８４】
感染性病原体がウイルスであるいくつかの実施形態では、ウイルス粒子の屈動性は、特定の表面マーカーを発現する細胞のみが変換されるように改変される。
【０３８５】
２．細菌
いくつかの実施形態では、感染性病原体は、細菌である。例えば、いくつかの実施形態では、細菌は、本明細書に記載の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドまたは免疫調節ポリペプチドのうちのいずれかをコードする核酸を、腫瘍細胞または免疫細胞など、対象における標的細胞に送達し得る。いくつかの実施形態では、細菌は、変異型免疫調節ポリペプチドの発現および／もしくは分泌のために、かつ／または変異型免疫調節ポリペプチドの発現のための環境下で、特定の細胞を標的化するために、炎症環境など、対象内の特定の環境に対して優先的に標的化され得る。
【０３８６】
いくつかの実施形態では、細菌は、プラスミドＤＮＡの哺乳動物細胞への細菌媒介性移入（「ｂａｃｔｏｆｅｃｔｉｏｎ」とも称される）を介して核酸を細胞に送達する。例えば、いくつかの実施形態では、遺伝子材料の送達は、標的細胞への全細菌の進入を通して達成される。いくつかの実施形態では、自然発生または誘発された細菌溶解は、その後の真核細胞発現のためのプラスミドの放出をもたらし得る。いくつかの実施形態では、細菌は、非食作用性哺乳動物細胞（例えば、特定の免疫細胞または組織型）に核酸を送達し得る。いくつかの実施形態では、細菌によって送達される核酸は、発現のために対象における細胞の核に移入され得る。いくつかの実施形態では、核酸はまた、特定の宿主細胞、例えば、プロモーターまたはエンハンサーなどの調節性要素において、変異型免疫調節ポリペプチドをコードする操作可能に連結されている配列の発現のために必要な適切な核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、細菌である感染性病原体は、標的細胞の機構による翻訳のために標的細胞の細胞質に送達される予め作製された翻訳能を有するＲＮＡなどのＲＮＡの形態で、免疫調節タンパク質をコードする核酸を送達し得る。
【０３８７】
いくつかの実施形態では、細菌は、標的細胞、例えば、免疫細胞を複製および溶解し得る。いくつかの実施形態では、細菌は、標的細胞の細胞質中に核酸配列および／または遺伝子生成物を含有および／または放出し、それによって標的細胞、例えば、免疫細胞を殺傷し得る。いくつかの実施形態では、感染性病原体は、具体的には、対象における特定の環境、例えば、炎症環境において、複製し得る細菌である。例えば、いくつかの実施形態では、細菌は、具体的には、嫌気性または低酸素性微小環境において複製し得る。いくつかの実施形態では、特定の環境に存在する条件または要因、例えば、炎症環境において細胞によって生成されるアスパラギン酸、セリン、クエン酸、リボース、またはガラクトースは、環境に細菌を引き付けるための化学誘引物質として作用し得る。いくつかの実施形態では、細菌は、環境、例えば、炎症環境において、本明細書に記載される免疫調節タンパク質を発現および／または分泌し得る。
【０３８８】
いくつかの実施形態では、感染性病原体は、リステリア種、ビフィドバクテリウム種、エシェルキア種、クロストリジウム種、サルモネラ種、シゲラ種、ビブリオ種、またはエルシニア種である細菌である。いくつかの実施形態では、細菌は、リステリア菌（Ｌｉｓｔｅｒｉａ  ｍｏｎｏｃｙｔｏｇｅｎｅｓ）、ネズミチフス菌（Ｓａｌｍｏｎｅｌｌａ  ｔｙｐｈｉｍｕｒｉｕｍ）、豚コレラ菌（Ｓａｌｍｏｎｅｌｌａ  ｃｈｏｌｅｒａｅｓｕｉｓ）、大腸菌（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉ）、コレラ菌（Ｖｉｂｒｉｏ  ｃｈｏｌｅｒａ）、ウエルシュ菌（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｐｅｒｆｒｉｎｇｅｎｓ）、酪酸菌（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍ）、ノーヴィ菌（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｎｏｖｙｉ）、クロストリジウム・アセトブチリクム（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ａｃｅｔｏｂｕｔｙｌｉｃｕｍ）、ビフィドバクテリウム・インファンティス（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓ）、ビフィドバクテリウム・ロンガム（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｌｏｎｇｕｍ）、およびビフィドバクテリウム・アドレスセンティス（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ａｄｏｌｅｓｃｅｎｔｉｓ）のうちの１つ以上の中から選択される。いくつかの実施形態では、細菌は、操作された細菌である。いくつかの実施形態では、細菌は、例えば、Ｓｅｏｗ  ａｎｄ  Ｗｏｏｄ（２００９），Ｍｏｌ  Ｔｈｅｒ．，１７（５）：７６７−７７７、Ｂａｂａｎ  ｅｔ  ａｌ．（２０１０），Ｂｉｏｅｎｇ．Ｂｕｇｓ，１（６）：３８５−３９４、Ｐａｔｙａｒ  ｅｔ  ａｌ．（２０１０），Ｊ  Ｂｉｏｍｅｄ  Ｓｃｉ，１７（１）：２１、Ｔａｎｇｎｅｙ  ｅｔ  ａｌ．（２０１０），Ｂｉｏｅｎｇ．Ｂｕｇｓ，１（４）：２８４−２８７、ｖａｎ  Ｐｉｊｋｅｒｅｎ  ｅｔ  ａｌ．（２０１０），Ｈｕｍ  Ｇｅｎｅ  Ｔｈｅｒ．，２１（４）：４０５−４１６、ＷＯ２０１２／１４９３６４、ＷＯ２０１４／１９８００２、ＵＳ９１０３８３１、ＵＳ９４５３２２７、ＵＳ２０１４／０１８６４０１、ＵＳ２００４／０１４６４８８、ＵＳ２０１１／０２９３７０５、ＵＳ２０１５／０３５９９０９、およびＥＰ３０２０８１６に記載されている細菌などの操作された細菌である。細菌は、本明細書に提供される変異型免疫調節ポリペプチド、コンジュゲート、および／もしくは融合のうちのいずれかをコードする核酸配列を送達するように、かつ／または対象におけるそのような変異型免疫調節ポリペプチドを発現するように改変され得る。
【０３８９】
Ｆ．ポリペプチドまたは細胞を生成するための核酸、ベクター、および方法
本明細書に提供される変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドまたは免疫調節ポリペプチドの様々な提供される実施形態のうちのいずれかをコードする「核酸」と集合的に称される、単離または組み換え核酸を本明細書に提供する。いくつかの実施形態では、以下に記載されるすべてを含む、本明細書に提供される核酸は、本明細書に提供される変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドまたは免疫調節ポリペプチドの組み換え生成（例えば、発現）において有用である。いくつかの実施形態では、以下に記載されるすべてを含む、本明細書に提供される核酸は、操作された細胞、例えば、免疫細胞、または感染性病原体細胞などの細胞における、本明細書に提供される変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドまたは免疫調節ポリペプチドの発現において有用である。本明細書に提供される核酸は、ＲＮＡまたはＤＮＡの形態であり得、かつｍＲＮＡ、ｃＲＮＡ、組み換えまたは合成ＲＮＡおよびＤＮＡ、ならびにｃＤＮＡを含む。本明細書に提供される核酸は、典型的には、ＤＮＡ分子であり、通常、二本鎖ＤＮＡ分子である。しかしながら、本発明のヌクレオチド配列のうちのいずれかを含む、一本鎖ＤＮＡ、一本鎖ＲＮＡ、二本鎖ＲＮＡ、およびハイブリッドＤＮＡ／ＲＮＡ核酸またはそれらの組み合わせも提供する。
【０３９０】
本明細書に提供される変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドまたは免疫調節ポリペプチドの生成に有用な組み換え発現ベクターおよび組み換え宿主細胞も、本明細書に提供する。
【０３９１】
提供される核酸、または膜貫通免疫調節ポリペプチドもしくは分泌可能な免疫調節ポリペプチドのうちのいずれかなどのコードされた変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドもしくは免疫調節ポリペプチドのうちのいずれかを含有する、操作された免疫細胞などの操作された細胞も、本明細書に提供する。
【０３９２】
提供される核酸、または膜貫通免疫調節ポリペプチドもしくは分泌可能な免疫調節ポリペプチドのうちのいずれかなどのコードされた変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドもしくは免疫調節ポリペプチドのうちのいずれかを含有する、細菌もしくはウイルス細胞などの感染性病原体も、本明細書に提供する。
【０３９３】
上記に提供される実施形態のうちのいずれかでは、本明細書に提供される免疫調節ポリペプチドをコードする核酸は、組み換えＤＮＡおよびクローン化技術を使用して、細胞に導入され得る。そのために、免疫調節ポリペプチドをコードする組み換えＤＮＡ分子を調製する。そのようなＤＮＡ分子を調製する方法は、当該技術分野でよく知られている。例えば、ペプチドをコードする配列は、好適な制限酵素を使用して、ＤＮＡから切除され得るであろう。代替的に、ＤＮＡ分子は、ホスホラミダイト方法などの化学合成技術を使用して合成され得るであろう。また、これらの技術の組み合わせも使用し得るであろう。いくつかの例では、組み換えまたは合成核酸は、ポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）を通して作成され得る。いくつかの実施形態では、少なくとも１つの親和性改変ＩｇＳＦドメイン、いくつかの実施形態では、提供される記載と一致する、シグナルペプチド、膜貫通ドメイン、および／または外部ドメインを含有する１つ以上の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドをコードするＤＮＡ挿入が作成され得る。このＤＮＡ挿入は、当業者に知られているような適切な情報伝達／トランスフェクションベクターにクローン化され得る。核酸分子を含有する発現ベクターも提供する。
【０３９４】
いくつかの実施形態では、発現ベクターは、タンパク質の発現に適した条件下で、適切な細胞において免疫調節タンパク質を発現することができる。いくつかの態様では、核酸分子または発現ベクターは、適切な発現制御配列に操作可能に連結されている免疫調節タンパク質をコードするＤＮＡ分子を含む。ＤＮＡ分子がベクターに挿入される前または後のいずれかに、この操作可能な連結に影響を与える方法が、よく知られている。発現制御配列には、プロモーター、アクチベーター、エンハンサー、オペレーター、リボソーム結合部位、開始シグナル、停止シグナル、キャップシグナル、ポリアデニル化シグナル、および転写または翻訳の制御に関わる他のシグナルが含まれる。
【０３９５】
いくつかの実施形態では、免疫調節タンパク質の発現は、発現を制御または調節するために、プロモーターまたはエンハンサーによって制御される。プロモーターは、変異型ポリペプチドまたは免疫調節タンパク質をコードする核酸分子の一部分に操作可能に連結されている。いくつかの実施形態では、プロモーターは、構成的に活性なプロモーター（組織特異的構成的に活性なプロモーターまたは他の構成的プロモーターなど）である。いくつかの実施形態では、プロモーターは、特定の細胞型（例えば、Ｔ細胞）または組織に対する発現を制限するための組織または細胞特異的プロモーターである。いくつかの実施形態では、核酸分子は、組織特異的プロモーターおよびエンハンサーを含む。特定される標的組織と関連する例示的な組織特異的プロモーター、標的組織、および自己免疫性疾患を、表４に記載する。
【０３９６】
（表４）組織特異的プロモーター
2020536552.tif 000018
【０３９７】
いくつかの実施形態では、プロモーターは、誘導剤（Ｔ細胞活性化シグナルなど）または低酸素などの標的化環境の状態に反応し得る、誘導性プロモーターである。
【０３９８】
いくつかの実施形態では、核酸分子は、状態依存性プロモーターを含む。そのような実施形態では、プロモーターは、疾患関連様式で遺伝子発現を調節するために選択される。例示的な状態依存性プロモーターは、炎症中、例えば、炎症関節における低酸素条件下で集合される、転写因子ＨＩＦ−１によって媒介される１つ以上の低酸素性反応要素（ＨＲＥ）および転写を利用する低酸素遺伝子調節系を含む。いくつかの実施形態では、グルコース反応要素（ＧＲＥ）および／またはインスリン様成長因子結合タンパク質−１基本プロモーターなどのグルコースまたはインスリン反応性プロモーターまたは要素は、例えば、糖尿病などのグルコース関連障害を有する患者に使用または投与するために提供される核酸分子に含まれ得る。
【０３９９】
いくつかの実施形態では、構成的プロモーターは、変異型ポリペプチドまたは免疫調節タンパク質をコードする核酸分子に操作可能に連結されている。例示的な構成的プロモーターには、サル空胞ウイルス４０（ＳＶ４０）プロモーター、サイトメガロウイルス（ＣＭＶ）プロモーター、ユビキチンＣ（ＵｂＣ）プロモーター、およびＥＦ−１アルファ（ＥＦ１ａ）プロモーターが含まれる。いくつかの実施形態では、構成的プロモーターは、組織特異的である。例えば、いくつかの実施形態では、プロモーターは、免疫細胞、リンパ球、またはＴ細胞などの特定の組織における免疫調節タンパク質の構成的発現を可能にする。例えば、胎児タンパク質、ＤＦ３、チロシナーゼ、ＣＥＡ、サーファクタントタンパク質、およびＥｒｂＢ２プロモーターを含む、例示的な組織特異的プロモーターは、米国特許第５，９９８，２０５号に記載されている。
【０４００】
いくつかの実施形態では、誘導性プロモーターは、核酸の発現が、転写の適切な誘導物質の存在または不存在を制御することによって制御可能であるように、変異型ポリペプチドまたは免疫調節タンパク質をコードする核酸分子に操作可能に連結されている。例えば、プロモーターは、コード化ポリペプチドの発現の調節を可能にするための、公開されたテトラサイクリン調節系または他の調節可能な系（例えば、国際特許出願公開第ＷＯ０１／３０８４３号を参照されたい）などの調節プロモーターおよび転写因子発現系であり得る。例示的な調節可能なプロモーター系は、例えば、Ｃｌｏｎｔｅｃｈ（Ｐａｌｏ  Ａｌｔｏ，ＣＡ）から入手可能なＴｅｔ−Ｏｎ（およびＴｅｔ−Ｏｆｆ）系である。このプロモーター系は、ドキシサイクリンなどのテトラサイクリンまたはテトラサイクリン誘導体によって制御される導入遺伝子の発現の調節を可能にする。他の調節可能なプロモーター系が、知られている（例えば、ホルモン受容体からのものなど、リガンド結合ドメインおよび転写調節ドメインを含有する遺伝子スイッチを記載している「Ｒｅｇｕｌａｔｉｏｎ  ｏｆ  Ｇｅｎｅ  Ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ  Ｕｓｉｎｇ  Ｓｉｎｇｌｅ−Ｃｈａｉｎ，Ｍｏｎｏｍｅｒｉｃ，Ｌｉｇａｎｄ  Ｄｅｐｅｎｄｅｎｔ  Ｐｏｌｙｐｅｐｔｉｄｅ  Ｓｗｉｔｃｈｅｓ」と題された米国出願公開第２００２−０１６８７１４号を参照されたい）。テトラサイクリン系の他の例示的な誘導性プロモーターには、抑制因子（ｔｅｔＲ）、ラパマイシン、エクジソン、ミフェプリストン、およびストレプトグラミン系が含まれる。
【０４０１】
いくつかの実施形態では、プロモーターは、Ｔ細胞活性化シグナル伝達に反応可能な要素に反応する。例示の方法のみによって、いくつかの実施形態では、操作されたＴ細胞は、免疫調節タンパク質をコードする発現ベクター、および免疫調節タンパク質の発現を制御するように操作可能に連結されているプロモーターを含む。操作されたＴ細胞は、例えば、操作されたＴ細胞受容体（ＴＣＲ）またはキメラ抗原受容体（ＣＡＲ）を通したシグナル伝達、ならびにそれによる反応性プロモーターを通した免疫調節タンパク質の発現および分泌の誘発によって達成され得る。
【０４０２】
いくつかの実施形態では、誘導性プロモーターは、免疫調節タンパク質が、活性化Ｔ細胞の核内因子（ＮＦＡＴ）または活性化Ｂ細胞の核内因子カッパ軽鎖エンハンサー（ＮＦ−κＢ）に反応して発現されるように、免疫調節タンパク質をコードする核酸分子に操作可能に連結されている。例えば、いくつかの実施形態では、誘導性プロモーターは、ＮＦＡＴまたはＮＦ−κＢのための結合部位を含む。例えば、いくつかの実施形態では、プロモーターは、ＮＦＡＴもしくはＮＦ−κＢプロモーターまたはその機能的変異型である。したがって、いくつかの実施形態では、核酸は、免疫調節タンパク質の毒性を低減または排除もしながら、免疫調節タンパク質の発現を制御することも可能にする。具体的には、本発明の核酸を含む操作された免疫細胞は、細胞（例えば、細胞によって発現されるＴ細胞受容体（ＴＣＲ）またはキメラ抗原受容体（ＣＡＲ））が、抗原によって特異的に刺激され、かつ／または細胞（例えば、細胞のカルシウムシグナル伝達経路）が、例えば、酢酸ミリスチン酸ホルボール（ＰＭＡ）／イオノマイシンによって非特異的に刺激された場合のみ、免疫調節タンパク質を発現する。したがって、免疫調節タンパク質の発現、および場合によっては、分泌は、必要な時間および場所でのみ（例えば、感染性病原体、癌の存在下で、または腫瘍部位に）起こるように制御することができ、これにより、所望されない免疫調節タンパク質相互作用を減少または回避することができる。
【０４０３】
いくつかの実施形態では、本明細書に記載の免疫調節タンパク質をコードする核酸は、ＮＦＡＴプロモーター、ＮＦ−κＢプロモーター、またはそれらの機能的変異型をコードする好適なヌクレオチド配列を含む。本明細書で使用される場合、「ＮＦＡＴプロモーター」は、最小プロモーターに連結されている１つ以上のＮＦＡＴの反応可能な要素を意味する。「ＮＦ−κＢプロモーター」は、最小プロモーターに連結されている１つ以上のＮＦ−κＢ反応要素を指す。いくつかの実施形態では、遺伝子の最小プロモーターは、最小ヒトＩＬ−２プロモーターまたはＣＭＶプロモーターである。ＮＦＡＴ反応要素は、例えば、ＮＦＡＴ１、ＮＦＡＴ２、ＮＦＡＴ３、および／またはＮＦＡＴ４反応要素を含み得る。ＮＦＡＴプロモーター、ＮＦ−κＢプロモーター、またはその機能的変異型は、任意の数の結合モチーフ、例えば、少なくとも２つ、少なくとも３つ、少なくとも４つ、少なくとも５つ、または少なくとも６つ、少なくとも７つ、少なくとも８つ、少なくとも９つ、少なくとも１０個、少なくとも１１個、または最大１２個の結合モチーフを含み得る。
【０４０４】
得られた組み換え発現ベクターであって、その上にＤＮＡ分子を有する組み換え発現ベクターを使用して、適切な宿主を変形させる。当該技術分野でよく知られている方法を使用して、この変換を行うことができる。いくつかの実施形態では、本明細書に提供される核酸は、結果として生じる可溶性免疫調節ポリペプチドが、培地、宿主細胞、または宿主細胞ペリプラズムから回収されるように、免疫調節ポリペプチドをコードする核酸に操作可能に連結されている分泌またはシグナルペプチドをコードするヌクレオチド配列をさらに含む。他の実施形態では、適切な発現制御シグナルが、免疫調節ポリペプチドの膜発現を可能にするために選択される。さらに、市販のキットならびに製造請負会社を利用して、本明細書に提供される操作された細胞または組み換え宿主細胞を作製することもできる。
【０４０５】
いくつかの実施形態では、ＤＮＡ分子を有する得られた発現ベクターを使用して、適切な細胞を変形、例えば、変換する。当該技術分野でよく知られている方法を使用して、導入を行うことができる。例示的な方法には、例えば、レトロウイルスまたはレンチウイルスなどのウイルス、情報伝達、トランスポゾン、および電気穿孔などを介して、受容体をコードする核酸を移入するための方法が含まれる。いくつかの実施形態では、発現ベクターは、ウイルスベクターである。いくつかの実施形態では、核酸は、レンチウイルスまたはレトロウイルス情報伝達方法によって移入される。
【０４０６】
哺乳動物Ｔ細胞またはＡＰＣを含む、多数の公に入手可能な、よく知られている哺乳動物宿主細胞のうちのいずれかを、ポリペプチドまたは操作された細胞の調製において使用することができる。細胞の選択は、当該技術分野によって認識されるいくつかの要因に依存する。これには、例えば、選択される発現ベクターとの適合性、ＤＮＡ分子によってコードされるペプチドの毒性、変換速度、ペプチドの回収の容易さ、発現特性、生体安全性、および費用が含まれる。これらの要因のバランスは、特定のＤＮＡ配列の発現のために、すべての細胞が等しく効果的であり得るわけではないことを理解から生まれるべきものである。
【０４０７】
いくつかの実施形態では、宿主細胞は、酵母細胞中の、またはチャイニーズハムスター卵巣（ＣＨＯ）またはＨＥＫ２９３細胞などの哺乳動物細胞を含む、様々な真核細胞であり得る。いくつかの実施形態では、宿主細胞は、浮遊細胞であり、ポリペプチドは、培養された浮遊ＣＨＯ細胞、例えば、ＣＨＯ−Ｓ細胞中など、培養された懸濁液中で操作または生成される。いくつかの例では、細胞株は、ＤＧ４４およびＤＵＸＢ１１などのＤＨＦＲ（ＤＨＦＲ−）が不足しているＣＨＯ細胞株である。いくつかの実施形態では、細胞は、グルタミン合成酵素（ＧＳ）、例えば、ＣＨＯ−Ｓ細胞、ＣＨＯＫ１  ＳＶ細胞、およびＣＨＯＺＮ（（Ｒ））ＧＳ−／−細胞が不足している。いくつかの実施形態では、浮遊ＣＨＯ細胞などのＣＨＯ細胞は、ＣＨＯ−Ｓ−２Ｈ２細胞、ＣＨＯ−Ｓ−クローン１４細胞、またはＥｘｐｉＣＨＯ−Ｓ細胞であり得る。
【０４０８】
いくつかの実施形態では、宿主細胞はまた、大腸菌などの原核細胞であり得る。変形した組み換え宿主を、ポリペプチド発現条件下で培養し、次に、精製して、可溶性タンパク質を得る。所望のポリペプチドが発現されるように、組み換え宿主細胞を、従来の発酵条件下で培養し得る。そのような発酵状態は、当該技術分野でよく知られている。最後に、本明細書に提供されるポリペプチドを、硫酸アンモニウムまたはエタノール沈殿、酸抽出、アニオンまたはカチオン交換クロマトグラフィー、ホスホセルロースクロマトグラフィー、疎水性相互作用クロマトグラフィー、および親和性クロマトグラフィーを含む、当該技術分野でよく知られているいくつかの方法のうちのいずれかによって培養される組み換え細胞から回収および精製し得る。所望される場合、成熟タンパク質の完了構成時に、タンパク質リフォールディング工程を使用し得る。最後に、最終精製工程時に、高速液体クロマトグラフィー（ＨＰＬＣ）を用いることができる。
【０４０９】
いくつかの実施形態では、細胞は、操作された細胞の調製と関連して上記に記載されるいずれかなどの免疫細胞である。いくつかの実施形態では、そのような操作された細胞は、初代細胞である。いくつかの実施形態では、操作された細胞は、対象に対して自家である。いくつかの実施形態では、操作された細胞は、対象に対して同種異系である。いくつかの実施形態では、操作された細胞は、白血球搬出法などによって対象から得られ、免疫調節ポリペプチド、例えば、膜貫通免疫調節ポリペプチドまたは分泌可能な免疫調節ポリペプチドの発現のために生体外で変形される。
【０４１０】
本明細書に記載の感染性病原体中に含有される変異型免疫調節ポリペプチドのうちのいずれかをコードする核酸も提供する。いくつかの実施形態では、感染性病原体は、対象において核酸を細胞に送達し、かつ／または細胞中でコードされた変異型ポリペプチドの発現を許容する。そのような感染性病原体を作成、生成、または改変するために使用される核酸も提供する。例えば、いくつかの実施形態では、感染性病原体の作成、対象における細胞への送達、および／または対象における細胞中の変異型免疫調節ポリペプチドの発現のために、変異型免疫調節ポリペプチドをコードする核酸を含有するベクターおよび／またはプラスミドを提供する。
【０４１１】
いくつかの実施形態では、提供される核酸は、変異型免疫調節ポリペプチドをコードする核酸配列を含有する組み換えウイルスまたは細菌ベクターである。いくつかの実施形態では、組み換えベクターを使用して、変異型免疫調節ポリペプチドをコードする核酸配列を含有する感染性病原体を生成し、かつ／または標的細胞による発現のために対象において標的細胞に送達することができる。いくつかの実施形態では、組み換えベクターは、発現ベクターである。いくつかの実施形態では、組み換えベクターは、感染性病原体の作成および／または生成、ならびに標的細胞における発現のために必要な適切な配列を含む。
【０４１２】
いくつかの実施形態では、組み換えベクターは、プラスミドまたはコスミドである。本明細書に記載されるような変異型免疫調節ポリペプチドをコードする核酸配列を含有するプラスミドまたはコスミドは、当該技術分野でよく知られている標準的な技術を使用して、容易に構築される。感染性病原体の作成のために、次に、パッケージングもしくはプロデューサー細胞株または宿主細菌にトランスフェクトされ得るプラスミド形態で、ベクターまたはゲノムを構築することができる。当該技術分野で知られている組み換え技術のうちのいずれかを使用して、組み換えベクターを作製することができる。いくつかの実施形態では、ベクターは、複製および／または遺伝子の原核生物源であって、その発現により、原核生物系における伝播および／または選択に対する薬物耐性などの検出可能または選択可能なマーカーを与える原核生物源を含み得る。
【０４１３】
いくつかの実施形態では、組み換えベクターは、ウイルスベクターである。例示的な組み換えウイルスベクターには、レンチウイルスベクターゲノム、ポックスウイルスベクターゲノム、ワクチニアウイルスベクターゲノム、アデノウイルスベクターゲノム、アデノウイルス関連ウイルスベクターゲノム、ヘルペスウイルスベクターゲノム、およびアルファウイルスベクターゲノムが含まれる。ウイルスベクターは、生きた、弱体化した、複製条件的または複製不足の、非病原性（不良）、複製能を有するウイルスベクターである可能性があり、かつ／または異種遺伝子生成物、例えば、本明細書に提供される変異型免疫調節ポリペプチドを発現するように改変される。ウイルスの作成のためのベクターはまた、転写または翻訳負荷を増加または減少させる任意の方法を含む、ウイルスの弱体化を変化させるように改変され得る。
【０４１４】
使用され得る例示的なウイルスベクターには、改変ワクシニアウイルスベクター（例えば、Ｇｕｅｒｒａ  ｅｔ  ａｌ．，Ｊ．Ｖｉｒｏｌ．，８０（２）：９８５−９８（２００６）、Ｔａｒｔａｇｌｉａ  ｅｔ  ａｌ．，ＡＩＤＳ  Ｒｅｓｅａｒｃｈ  ａｎｄ  Ｈｕｍａｎ  Ｒｅｔｒｏｖｉｒｕｓｅｓ，８（８）：１４４５−４７（１９９２）、Ｇｈｅｒａｄｉ  ｅｔ  ａｌ．，Ｊ．Ｇｅｎ．Ｖｉｒｏｌ．，８６（Ｐｔ  １１）：２９２５−３６（２００５）、Ｍａｙｒ  ｅｔ  ａｌ．，Ｉｎｆｅｃｔｉｏｎ，３（１）：６−１４（１９７５）、Ｈｕ  ｅｔ  ａｌ．，Ｊ．Ｖｉｒｏｌ．，７５（２１）：１０３００−３０８（２００１）、米国特許第５，６９８，５３０号、同第６，９９８，２５２号、同第５，４４３，９６４号、同第７，２４７，６１５号、および同第７，３６８，１１６号を参照されたい）、アデノウイルスベクターまたはアデノウイルス関連ウイルスベクター（例えば、Ｍｏｌｉｎ  ｅｔ  ａｌ．，Ｊ．Ｖｉｒｏｌ．，７２（１０）：８３５８−６１（１９９８）、Ｎａｒｕｍｉ  ｅｔ  ａｌ．，ＡｍＪ．Ｒｅｓｐｉｒ．Ｃｅｌｌ  Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．，１９（６）：９３６−４１（１９９８）、Ｍｅｒｃｉｅｒ  ｅｔ  ａｌ．，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ，１０１（１６）：６１８８−９３（２００４）、米国特許第６，１４３，２９０号、同第６，５９６，５３５号、同第６，８５５，３１７号、同第６，９３６，２５７号、同第７，１２５，７１７号、同第７，３７８，０８７号、同第７，５５０，２９６号を参照されたい）、ネズミ白血病ウイルス（ＭｕＬＶ）、テナガザル白血病ウイルス（ＧａＬＶ）、エコトロピックレトロウイルス、サル免疫不全ウイルス（ＳＩＶ）、ヒト免疫不全ウイルス（ＨＩＶ）、および組み合わせに基づくものを含むレトロウイルスベクター（例えば、Ｂｕｃｈｓｃｈｅｒ  ｅｔ  ａｌ．，Ｊ．Ｖｉｒｏｌ．，６６（５）：２７３１−３９（１９９２）、Ｊｏｈａｎｎ  ｅｔ  ａｌ．，Ｊ．Ｖｉｒｏｌ．，６６（３）：１６３５−４０（１９９２）、Ｓｏｍｍｅｒｆｅｌｔ  ａｎｄ  Ｗｅｉｓｓ，Ｖｉｒｏｌｏｇｙ，１７６（１）：５８−５９（１９９０）、Ｗｉｌｓｏｎ  ｅｔ  ａｌ．，Ｊ．Ｖｉｒｏｌ．，６３（５）：２３７４−７８（１９８９）、Ｍｉｌｌｅｒ  ｅｔ  ａｌ．，Ｊ．Ｖｉｒｏｌ．，６５（５）：２２２０−２４（１９９１）、Ｍｉｌｌｅｒ  ｅｔ  ａｌ．，Ｍｏｌ．Ｃｅｌｌ  Ｂｉｏｌ．，１０（８）：４２３９−４２（１９９０）、Ｋｏｌｂｅｒｇ，ＮＩＨ  Ｒｅｓ．，４：４３−４４（１９９２）、Ｃｏｒｎｅｔｔａ  ｅｔ  ａｌ．，Ｈｕｍ．Ｇｅｎｅ  Ｔｈｅｒ．，２（３）：２１５−２１９（１９９１）を参照されたい）、ヒト免疫不全ウイルス（ＨＩＶ−１）、ＨＩＶ−２、ネコ免疫不全ウイルス（ＦＩＶ）、ウマ伝染性貧血ウイルス、サル免疫不全ウイルス（ＳＩＶ）、およびマエディ／ビスナウイルスに基づくものを含むレンチウイルスベクター（例えば、Ｐｆｅｉｆｅｒ  ａｎｄ  Ｖｅｒｍａ，  Ａｎｎｕ．Ｒｅｖ．Ｇｅｎｏｍｉｃｓ  Ｈｕｍ．Ｇｅｎｅｔ．，２：１７７−２１１（２００１）、Ｚｕｆｆｅｒｅｙ  ｅｔ  ａｌ．，Ｊ．Ｖｉｒｏｌ．，７２（１２）：９８７３−８０（１９９８）、Ｍｉｙｏｓｈｉ  ｅｔ  ａｌ．，Ｊ．��ｉｒｏｌ．，７２（１０）：８１５０−７（１９９８）、Ｐｈｉｌｐｏｔｔ  ａｎｄ  Ｔｈｒａｓｈｅｒ，  Ｈｕｍａｎ  Ｇｅｎｅ  Ｔｈｅｒａｐｙ，１８（６）：４８３−９（２００７）、Ｅｎｇｅｌｍａｎ  ｅｔ  ａｌ．，Ｊ．Ｖｉｒｏｌ．，６９（５）：２７２９−３６（１９９５）、Ｎｉｇｈｔｉｎｇａｌｅ  ｅｔ  ａｌ．，Ｍｏｌ．Ｔｈｅｒａｐｙ，１３（６）：１１２１−３２（２００６）、Ｂｒｏｗｎ  ｅｔ  ａｌ．，Ｊ．Ｖｉｒｏｌ．，７３（１１）：９０１１−２０（１９９９）、ＷＯ２００９／０７６５２４、ＷＯ２０１２／１４１９８４、ＷＯ  ２０１６／０１１０８３、ＭｃＷｉｌｌｉａｍｓ  ｅｔ  ａｌ．，Ｊ．Ｖｉｒｏｌ．，７７（２０）：１１１５０−７（２００３）、Ｐｏｗｅｌｌ  ａｎｄ  Ｌｅｖｉｎ，Ｊ．Ｖｉｒｏｌ．，７０（８）：５２８８−９６（１９９６））、もしくはそれらの任意の変異型、および／または上記に記載されるウイルスのうちのいずれかを作成するために使用され得るベクターが含まれる。いくつかの実施形態では、組み換えベクターは、パッケージング細胞株におけるＲＮＡウイルスに対する場合などのウイルスゲノムの発現を調節し得る、プロモーターまたはエンハンサー配列などの調節性配列を含み得る（例えば、米国特許第５，３８５，８３９号および同第５，１６８，０６２号を参照されたい）。
【０４１５】
いくつかの実施形態では、組み換えベクターは、発現ベクター、例えば、標的細胞、例えば、対象における細胞、例えば、腫瘍細胞、免疫細胞、および／またはＡＰＣに送達されたときにコード化される遺伝子生成物の発現を許容する発現ベクターである。いくつかの実施形態では、感染性病原体中に含有される組み換え発現ベクターは、タンパク質の発現に適した条件下で、対象における標的細胞中に免疫調節タンパク質を発現することができる。
【０４１６】
いくつかの態様では、核酸または発現ベクターは、適切な発現制御配列に操作可能に連結されている免疫調節タンパク質をコードする核酸配列を含む。免疫調節タンパク質をコードする核酸配列がベクターに挿入される前または後のいずれかに、この操作可能な連結に影響を与える方法が、よく知られている。発現制御配列には、プロモーター、アクチベーター、エンハンサー、オペレーター、リボソーム結合部位、開始シグナル、停止シグナル、キャップシグナル、ポリアデニル化シグナル、および転写または翻訳の制御に関わる他のシグナルが含まれる。プロモーターは、免疫調節タンパク質をコードする核酸配列の一部分に操作可能に連結され得る。いくつかの実施形態では、プロモーターは、標的細胞中の構成的に活性なプロモーター（組織特異的構成的に活性なプロモーターまたは他の構成的プロモーターなど）である。例えば、組み換え発現ベクターはまた、Ｂリンパ球、Ｔリンパ球、または樹状細胞特異的ＴＲＥなどのリンパ球組織特異的転写調節性要素（ＴＲＥ）を含み得る。リンパ球組織特異的ＴＲＥは、当該技術分野で知られている（例えば、Ｔｈｏｍｐｓｏｎ  ｅｔ  ａｌ．，Ｍｏｌ．Ｃｅｌｌ．Ｂｉｏｌ．，１２（３）：１０４３−５３（１９９２）、Ｔｏｄｄ  ｅｔ  ａｌ．，Ｊ．Ｅｘｐ．Ｍｅｄ．，１７７（６）：１６６３−７４（１９９３）、Ｐｅｎｉｘ  ｅｔ  ａｌ．，Ｊ．Ｅｘｐ．Ｍｅｄ．，１７８（５）：１４８３−９６（１９９３）を参照されたい）。いくつかの実施形態では、プロモーターは、誘導剤（Ｔ細胞活性化シグナルなど）に反応し得る誘導性プロモーターである。いくつかの実施形態では、対象における標的細胞、例えば、免疫細胞、炎症環境に局在する細胞、および／またはＡＰＣに送達される核酸は、上記に記載される調節性要素のうちのいずれかに操作可能に連結され得る。
【０４１７】
いくつかの実施形態では、ベクターは、細菌ベクター、例えば、細菌プラスミドまたはコスミドである。いくつかの実施形態では、細菌ベクターは、哺乳動物細胞へのプラスミドＤＮＡの細菌媒介性移入（「ｂａｃｔｏｆｅｃｔｉｏｎ」とも称される）を介して、標的細胞、例えば、免疫細胞、炎症環境に局在する細菌、および／またはＡＰＣに送達される。いくつかの実施形態では、送達される細菌ベクターはまた、プロモーター配列および／またはエンハンサー配列、または上記に記載される任意の調節性もしくは制御配列などの標的細胞における発現のための適切な発現制御配列を含有する。いくつかの実施形態では、細菌ベクターは、感染性病原体、例えば、細菌におけるコード化された変異型ポリペプチドの発現および／または分泌のための適切な発現制御配列を含有する。
【０４１８】
いくつかの実施形態では、本明細書に提供されるポリペプチドは、合成方法によっても作製され得る。固相合成は、低分子ペプチドを作製する最も費用効率の良い方法であるため、個々のペプチドを作製する好ましい技術である。例えば、よく知られている固相合成技術には、保護基、リンカー、および固相支持体の使用、ならびに特定の保護および脱保護反応状態、リンカー開裂状態、捕捉剤の使用、ならびに他の態様の固相ペプチド合成が含まれる。次に、ペプチドを、本明細書に提供されるようなポリペプチドに集合させることができる。
【０４１９】
ＩＶ．変異型ＣＴＬＡ４ポリペプチドおよび免疫調節タンパク質の活性免疫調節を評価する方法
いくつかの実施形態では、本明細書に提供される変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド（例えば、全長および／もしくは特異的結合断片もしくはコンジュゲート、その積層構築物もしくは融合、または操作された細胞）は、Ｔ細胞活性化を調節するための免疫調節活性を示す。いくつかの実施形態では、ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、野生型または非改変ＣＴＬＡ−４対照に対するＴ細胞アッセイにおいてＩＦＮ−ガンマ発現を調節する。場合によっては、ＩＦＮ−ガンマ発現の調節は、対照に対してＩＦＮ−ガンマ発現を増加または減少させ得る。特異的結合およびＩＦＮ−ガンマ発現を判定するためのアッセイは、当該技術分野でよく知られており、培養液上清中のインターフェロンガンマサイトカインレベルを測定するＭＬＲ（混合リンパ球反応）アッセイ（Ｗａｎｇ  ｅｔ  ａｌ．，Ｃａｎｃｅｒ  Ｉｍｍｕｎｏｌ  Ｒｅｓ．２０１４  Ｓｅｐ：２（９）：８４６−５６）、ＳＥＢ（ブドウ球菌エンテロトキシンＢ）Ｔ細胞刺激アッセイ（Ｗａｎｇ  ｅｔ  ａｌ．，Ｃａｎｃｅｒ  Ｉｍｍｕｎｏｌ  Ｒｅｓ．２０１４  Ｓｅｐ：２（９）：８４６−５６）、および抗ＣＤ３Ｔ細胞刺激アッセイ（Ｌｉ  ａｎｄ  Ｋｕｒｌａｎｄｅｒ，Ｊ  Ｔｒａｎｓｌ  Ｍｅｄ．２０１０：８：１０４）を含む。
【０４２０】
いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドは、野生型ＣＴＬＡ−４対照に対する初代Ｔ細胞アッセイにおいて、ＩＦＮ−ガンマ（インターフェロンガンマ）発現を、いくつかの実施形態では増加し、または代替的な実施形態では減少し得る。いくつかの実施形態では、そのような活性は、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドが、アンタゴニスト活性の形態で、またはアゴニスト活性の形態で、提供されるかどうかに依存し得る。いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドまたは免疫調節タンパク質は、ＩＣＯＳおよび／またはＣＤ２８からの共刺激シグナルを阻害するなど、共刺激受容体のアンタゴニストである。当業者であれば、ＩＦＮ−ガンマ発現の増加または減少を判定するために使用される異なる形式の初代Ｔ細胞アッセイが存在することを認識するであろう。
【０４２１】
初代Ｔ細胞アッセイでＩＦＮ−ガンマ発現を増加または減少させるための変異型ＣＴＬＡ−４の能力についてのアッセイにおいて、混合リンパ球反応（ＭＬＲ）アッセイを使用し得る。場合によっては、ＩＣＯＳＬ、ＣＤ８０、および／またはＣＤ８６に優先的または特異的に結合する可溶性形態の変異型ＣＴＬＡ−４を用いて、Ｔ細胞を拮抗させるための変異型ＣＴＬＡ−４の能力を判定し、それによってＭＬＲにおけるＩＦＮ−ガンマ発現を減少させることができる。
【０４２２】
いくつかの実施形態では、可溶性形態などのアンタゴニスト形態で提供される変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドまたは免疫調節タンパク質、例えば、変異型ＣＴＬＡ−４−Ｆｃまたは分泌可能な免疫調節タンパク質は、ＣＤ２８および／またはＩＣＯＳ共刺激受容体の活性を阻害し、それによって、アッセイにおけるＩＦＮ−ガンマの生成の減少によって観察されるように、アッセイにおけるＭＬＲ活性を減少させる。したがって、いくつかの実施形態では、ＩＣＯＳに優先的に結合する可溶性形態の変異型ＣＴＬＡ−４を用いて、Ｔ細胞中の共刺激シグナルを阻害するための変異型ＣＴＬＡ−４の能力を判定し、それによってＭＬＲにおけるＩＦＮ−ガンマ発現を減少させ得る。
【０４２３】
いくつかの実施形態では、ＩＦＮ−ガンマ発現の増加または減少を調節するための変異型ＣＴＬＡ−４の能力についてのアッセイにおいて、Ｔ細胞レポーターアッセイを使用し得る。いくつかの実施形態では、Ｔ細胞は、Ｊｕｒｋａｔ  Ｔ細胞株であるか、またはＪｕｒｋａｔ  Ｔ細胞株に由来する。レポーターアッセイでは、レポーター細胞株（例えば、Ｊｕｒｋａｔレポーター細胞）はまた、変異型ＩｇＳＦドメインポリペプチドの標的の結合パートナーである共刺激受容体を過剰発現するように作成される。例えば、変異型ＣＴＬＡ−４の場合、レポーター細胞株（例えば、Ｊｕｒｋａｔレポーター細胞）は、ＣＤ２８および／またはＩＣＯＳを過剰発現するように作成される。いくつかの実施形態では、レポーターＴ細胞はまた、レポーターに操作可能に連結されているＴ細胞活性化に反応する誘導性プロモーターを含有するレポーター構築物を含有する。いくつかの実施形態では、レポーターは、蛍光性または発光性レポーターである。いくつかの実施形態では、レポーターは、ルシフェラーゼである。いくつかの実施形態では、プロモーターは、ＣＤ３シグナル伝達に対して反応する。いくつかの実施形態では、プロモーターは、ＮＦＡＴプロモーターである。いくつかの実施形態では、プロモーターは、共刺激シグナル伝達、例えば、ＣＤ２８共刺激シグナル伝達に反応する。いくつかの実施形態では、プロモーターは、ＩＬ−２プロモーターである。
【０４２４】
レポーターアッセイの態様では、レポーター細胞株は、共刺激受容体、例えば、ＩＣＯＳＬ、ＣＤ８０、および／またはＣＤ８６の野生型リガンドを発現する抗原提示細胞（ＡＰＣ）との共インキュベーションなどによって刺激される。いくつかの実施形態では、ＡＰＣは、人工ＡＰＣである。人工ＡＰＣは、当業者によく知られている。いくつかの実施形態では、人工ＡＰＣは、Ｋ５６２、ＣＨＯ、または２９３細胞などの１つ以上の哺乳動物細胞株に由来する。
【０４２５】
いくつかの実施形態では、Ｊｕｒｋａｔレポーター細胞は、変異型ＩｇＳＦドメイン分子または免疫調節タンパク質、例えば、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドまたは免疫調節タンパク質の存在下で、共刺激リガンドを過剰発現する人工ＡＰＣと共インキュベートされる。いくつかの実施形態では、レポーター発現は、細胞の発光または蛍光を判定することによって監視される。いくつかの実施形態では、その共刺激受容体とリガンドとの間の正常な相互作用は、対照、例えば、共刺激受容体およびリガンド相互作用が存在しない対照Ｔ細胞およびＡＰＣ、例えば、ＩＣＯＳＬ、ＣＤ８０、および／またはＣＤ８６を過剰発現しないＡＰＣの共インキュベーションによるレポーター発現などと比較して、レポーターシグナルの増強または増加をもたらす。いくつかの実施形態では、本明細書に提供される変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドまたは免疫調節タンパク質は、例えば、変異型ＣＴＬＡ−４−Ｆｃとして可溶性形態で提供されたとき、または分泌可能な免疫調節タンパク質としてＡＰＣから発現されたときに、相互作用を拮抗させ、それによって変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドまたは免疫調節タンパク質の不存在と比較して、レポーターシグナルの減少をもたらす。
【０４２６】
正しい対照の使用が当業者に知られているが、前述の実施形態では、対照は、典型的には、変異型ＣＴＬＡ−４が由来または発現される同じ哺乳動物種からの野生型または天然型ＣＴＬＡ−４アイソフォームなど、非改変ＣＴＬＡ−４の使用を伴う。いくつかの実施形態では、野生型または天然型ＣＴＬＡ−４は、変異型と同じ形態または対応する形態である。例えば、変異型ＣＴＬＡ−４が、Ｆｃタンパク質に融合される変異型ＥＣＤを含有する可溶性形態である場合、対照は、Ｆｃタンパク質に融合されるＣＴＬＡ−４の野生型または天然型ＥＣＤを含有する可溶性形態である。ＩＣＯＳＬへの結合親和性および／または選択性が増加または減少するかどうかに関わらず、いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４は、ＩＦＮ−ガンマ発現を減少させ、代替的な実施形態では、野生型ＣＴＬＡ−４対照に対してＴ細胞アッセイのＩＦＮ−ガンマ発現を増加させるであろう。
【０４２７】
いくつかの実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドまたは免疫調節タンパク質は、野生型または非改変ＣＴＬＡ−４対照に対して、少なくとも５％、１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、９０％以上、ＩＦＮ−ガンマ発現（すなわち、タンパク質発現）を減少させる。他の実施形態では、変異型ＣＴＬＡ−４または免疫調節タンパク質は、野生型または非改変ＣＴＬＡ−４対照に対して、少なくとも５％、１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、９０％以上、ＩＦＮ−ガンマ発現（すなわち、タンパク質発現）を増加させる。いくつかの実施形態では、野生型ＣＴＬＡ−４対照は、典型的には、野生型ネズミＣＴＬＡ−４配列の配列から配列において変化した変異型ＣＴＬＡ−４のために使用されるようなネズミＣＴＬＡ−４である。いくつかの実施形態では、野生型ＣＴＬＡ−４対照は、典型的には、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２またはＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：３のアミノ酸の配列を含むＣＴＬＡ−４配列など、野生型ヒトＣＴＬＡ−４配列の配列から配列において変化した変異型ＣＴＬＡ−４のために使用されるようなヒトＣＴＬＡ−４である。
【０４２８】
場合によっては、提供されるような変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドまたは変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドを含有する免疫調節タンパク質の活性は、適切な動物モデルを使用して評価され得る。いくつかの実施形態では、動物モデルは、自己免疫性疾患のモデルである。自己免疫性活性の動物モデルには、遺伝子感受性遺伝子または遺伝子座を有する動物（例えば、マウス）菌株の異種交配、およびその後の疾患表現型の発現に対する動物の注意深い監視を通して作成される自己免疫性疾患ンに対する自然発生マウスモデルなどの自然発生動物モデルが含まれる。例示的な自然発生動物モデルには、１型糖尿病（Ｔ１Ｄ）様表現型を自然発生的に発症する非肥満糖尿病（ＮＯＤ）マウスモデル、および全身性エリテマトーデス（ＳＬＥ）様表現型を自然発生的に発症するＮＺＢ／Ｗ  Ｆ１マウスモデルが含まれる。自己免疫性疾患の別の例示的な動物モデルには、多発性硬化症（ＭＳ）の研究のために、自己抗原注射によって作成される実験用自己免疫性脳脊髄炎（ＥＡＥ）マウスモデルが含まれる。例示的な関節リウマチ（ＲＡ）モデルには、ヒトＴ細胞白血病ウイルスＩ型（ＨＴＬＶ−Ｉ）遺伝子導入マウスモデル、およびＩＬ−１受容体アンタゴニスト（ＩＬ−１Ｒａ）不足（ＫＯ）マウスモデルが含まれる。マウスにおけるコンカナバリンＡ（Ｃｏｎ  Ａ）誘発性肝炎は、自己免疫性肝炎に対する例示的なモデルである（Ｔｉｅｇｓ  ｅｔ  ａｌ．，１９９２，ＪＣＩ，Ｍｉｚｕｈａｒａ  Ｈ．，ＪＥＭ，１９９４，Ｔｏｙａｂｅ  Ｓ，ＪＩ，１９９７）。他の例示的な動物モデルには、移植片対宿主病（ＧＶＨＤ）マウスモデル、同系移植マウスモデル、および骨髄移植モデルが含まれる。動物モデルは、自己免疫性疾患の病理および治療を研究するために広く使用され、本明細書に提供される変異型ＣＴＬＡ４ポリペプチドの使用、投与量、および効能を評価するために使用され得る。
【０４２９】
Ｖ．医薬製剤
本明細書に記載の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド、免疫調節タンパク質、コンジュゲート、操作された細胞、または感染性病原体のうちのいずれかを含有する組成物を本明細書に提供する。医薬組成物は、薬学的に許容可能な賦形剤をさらに含み得る。例えば、医薬組成物は、例えば、組成物のｐＨ、モル浸透圧濃度、粘度、透明度、色、等張性、香り、無菌性、安定性、溶解もしくは放出速度、吸着、または浸透を改変、維持、または保存する１つ以上の賦形剤を含有し得る。いくつかの態様では、当業者は、細胞を含有する医薬組成物が、タンパク質を含有する医薬組成物とは異なり得ることを理解している。
【０４３０】
いくつかの実施形態では、医薬組成物は、粉末、カプセル、または錠剤などの固体である。例えば、医薬組成物の成分は、凍結乾燥され得る。いくつかの実施形態では、固体医薬組成物は、投与前に液体中に再構成または溶解される。
【０４３１】
いくつかの実施形態では、医薬組成物は、液体、例えば、水溶液（生理食塩水またはリンガー溶液など）に溶解された変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドである。いくつかの実施形態では、医薬組成物のｐＨは、約４．０〜約８．５（約４．０〜約５．０、約４．５〜約５．５、約５．０〜約６．０、約５．５〜約６．５、約６．０〜約７．０、約６．５〜約７．５、約７．０〜約８．０、または約７．５〜約８．５など）である。
【０４３２】
いくつかの実施形態では、医薬組成物は、薬学的に許容可能な賦形剤、例えば、充填剤、結合剤、被覆剤、保存剤、潤滑剤、香味剤、甘味剤、着色料、溶剤、緩衝剤、キレート剤、または安定剤を含む。薬学的に許容可能な充填剤の例には、セルロース、リン酸水素カルシウム、炭酸カルシウム、微結晶性セルロース、スクロース、ラクトース、グルコース、マンニトール、ソルビトール、マルトール、アルファ化デンプン、コーンスターチ、またはジャガイモデンプンが含まれる。薬学的に許容可能な結合剤の例には、ポリビニルピロリドン、デンプン、ラクトース、キシリトール、ソルビトール、マルチトール、ゼラチン、スクロース、ポリエチレングリコール、メチルセルロース、またはセルロースが含まれる。薬学的に許容可能な被覆剤の例には、ヒドロキシプロピルメチルセルロース（ＨＰＭＣ）、シェラック、トウモロコシタンパク質ゼイン、またはゼラチンが含まれる。薬学的に許容可能な崩壊剤の例には、ポリビニルピロリドン、カルボキシメチルセルロース、またはデンプングリコール酸ナトリウムが含まれる。薬学的に許容可能な潤滑剤の例には、ポリエチレングリコール、ステアリン酸マグネシウム、またはステアリン酸が含まれる。薬学的に許容可能な保存剤の例には、メチルパラベン、エチルパラベン、プロピルパラベン、安息香酸、またはソルビン酸が含まれる。薬学的に許容可能な甘味剤の例には、スクロース、サッカリン、アスパルテーム、またはソルビトールが含まれる。薬学的に許容可能な緩衝剤の例には、炭酸、クエン酸、グルコン酸、酢酸、リン酸、または酒石酸が含まれる。
【０４３３】
いくつかの実施形態では、医薬組成物は、注射可能な微粒子、生体内分解性粒子、ポリマー化合物（ポリ乳酸、ポリグリコール酸）、ビーズ、またはリポソームなどの生成物の放出を制御または維持するための薬剤をさらに含む。
【０４３４】
いくつかの実施形態では、医薬組成物は、無菌である。殺菌は、無菌濾過膜または放射線を通した濾過によって達成され得る。組成物が凍結乾燥された場合、この方法を使用した殺菌は、凍結乾燥および再構成の前または後のいずれかに実施され得る。非経口投与のための組成物は、凍結乾燥形態または溶液で保存され得る。加えて、非経口組成物は、概して、無菌アクセスポートを有する容器、例えば、皮下注射針によって穿刺可能なストッパ―を有する静脈内溶液バッグまたはバイアル内に配置される。
【０４３５】
いくつかの実施形態では、そのような膜貫通免疫調節タンパク質を発現する操作された細胞を含む、膜貫通免疫調節タンパク質を含有する医薬組成物を提供する。いくつかの実施形態では、医薬組成物および製剤には、１つ以上の任意選択的な薬学的に許容可能な担体または賦形剤が含まれる。そのような組成物は、中性緩衝食塩水、リン酸緩衝食塩水などの緩衝液；グルコース、マンノース、スクロースまたはデキストラン、マンニトールなどの炭水化物；タンパク質；ポリペプチドまたはグリシンなどのアミノ酸；抗酸化剤；ＥＤＴＡまたはグルタチオンなどのキレート剤；補助剤（例えば、水酸化アルミニウム）、および保存剤を含み得る。本発明の組成物は、好ましくは、静脈内投与のために製剤化される。
【０４３６】
いくつかの実施形態では、医薬組成物は、免疫調節変異型ポリペプチドをコードする核酸配列を含有する感染性病原体を含有する。いくつかの実施形態では、医薬組成物は、治療のために好適な対象への投与に好適な、ある用量の感染性病原体を含有する。いくつかの実施形態では、医薬組成物は、それぞれが包括的な、少なくとも約１×１０６、１×１０７、１×１０８、１×１０９、２×１０９、３×１０９、４×１０９、５×１０９ｐｆｕまたは約１×１０１０ｐｆｕなど、約１×１０５〜約１×１０１２プラーク形成単位（ｐｆｕ）、１×１０６〜１×１０１０ｐｆｕ、または１×１０７〜１×１０１０ｐｆｕの単回または複数の投与量で、ウイルスである感染性病原体を含有する。いくつかの実施形態では、医薬組成物は、少なくとも約１０６ｐｆｕ／ｍＬ、１０７ｐｆｕ／ｍＬ、１０８ｐｆｕ／ｍＬ、または１０９ｐｆｕ／ｍＬなど、約１０５〜約１０１０ｐｆｕ／ｍＬ、例えば、５×１０６〜５×１０９または１×１０７〜１×１０９ｐｆｕ／ｍＬのウイルス濃度を含有し得る。いくつかの実施形態では、医薬組成物は、それぞれが包括的な、少なくとも約約１×１０４、１×１０５、１×１０６、１×１０７、１×１０８、または１×１０９ｃｆｕなど、約１×１０３〜約１×１０９コロニー形成単位（ｃｆｕ）、１×１０４〜１×１０９ｃｆｕ、または１×１０５〜１×１０７ｃｆｕの単回または複数投与量で、最近である感染性病原体を含有する。いくつかの実施形態では、医薬組成物は、少なくとも約１０５ｃｆｕ／ｍＬ、１０６ｃｆｕ／ｍＬ、１０７ｃｆｕ／ｍＬ、または１０８ｃｆｕ／ｍＬなど、約１０３〜約１０８ｃｆｕ／ｍＬ、例えば、５×１０５〜５×１０７または１×１０６〜１×１０７ｃｆｕ／ｍＬの最近濃度を含有し得る。
【０４３７】
そのような製剤は、例えば、静脈内注入に好適な形態であり得る。薬学的に許容可能な担体は、１つの組織、器官、または体の一部分から別の組織、器官、または体の一部分への、対象となる細胞の担持または輸送に関わる薬学的に許容可能な材料、組成物、またはビヒクルであり得る。例えば、担体は、液体もしくは固体充填剤、希釈剤、賦形剤、溶剤、または封入材料、あるいはそれらのいくつかの組み合わせであり得る。担体の各成分は、製剤の他の材料と適合可能である必要があるという点で、「薬学的に許容可能」である必要がある。また、直面し得る任意の組織、器官、または体の一部分と接触するのに好適である必要があり、これは、毒性、かぶれ、アレルギー反応、免疫原性、またはその治療的有用性を角に上回る任意の他の合併症のリスクを有してはならないことを意味する。
【０４３８】
いくつかの実施形態では、医薬組成物が、対象に投与される。概して、医薬組成物の投与量および投与経路は、標準的な薬務に従って、対象のサイズおよび状態によって決定される。例えば、治療的に有効な用量は、細胞培養アッセイ、またはマウス、ラット、ウサギ、イヌ、ブタ、もしくはサルなどの動物モデルのいずれかにおいて、最初に推定され得る。動物モデルを使用して、適切な濃度範囲および投与経路を決定することもできる。次に、そのような情報を使用して、ヒトに投与するのに有用な用量および経路を決定することができる。正確な投与量は、治療を必要とする対象に関連する要因にかんがみて決定されるであろう。投与量および投与は、十分なレベルの活性化合物を提供するか、または所望の効果を維持するように調節される。考慮され得る要因には、疾患状態の重症度、対象の総体的な健康、年齢、対象の体重および性別、投与の時間および頻度、薬物の組み合わせ、反応感受性、ならびに治療に対する反応が含まれる。
【０４３９】
長時間作用型医薬組成物は、特定の製剤の半減期およびクリアランス率に応じて、３〜４日ごと、毎週、または隔週で投与され得る。投与の頻度は、使用される製剤中の分子の薬物動態学的なパラメータに依存するであろう。典型的には、組成物は、所望の効果を達成する投与量に到達するまで投与される。したがって、組成物は、単回用量として、または経時的に複数用量（同じであるか、または異なる濃度／投与量で）として、または連続注入として投与され得る。適切な投与量のさらなる精錬が、ルーチン的に行われる。適切な投与量は、適切な用量反応データの使用を通して解明され得る。Ｔ細胞活性化もしくは増殖、サイトカイン合成もしくは生成（例えば、ＴＮＦ−α、ＩＦＮ−γ、ＩＬ−２の生成）、様々活性化マーカー（例えば、ＣＤ２５、ＩＬ−２受容体）の誘発、炎症、関節腫脹もしくは圧痛、Ｃ反応性タンパク質の血清レベル、抗コラーゲン抗体生成、および／またはＴ細胞依存性抗体反応を含む、治療効果についてのいくつかのバイオマーカーまたは生理的マーカーを監視することができる。
【０４４０】
いくつかの実施形態では、医薬組成物は、経口的、経皮的、吸入による、静脈内、動脈内、筋肉内、創傷部位への直接投与、手術部位への投与、腹腔内、坐薬による、皮下、皮内、経皮的、噴霧による、胸膜内、脳室内、関節腔内、眼内、または脊髄内を含む任意の経路を通して対象に投与される。
【０４４１】
いくつかの実施形態では、医薬組成物の用量は、単回用量または反復用量である。いくつかの実施形態では、用量は、１日１回、１日２回、１日３回、または１日４回以上、対象に与えられる。いくつかの実施形態では、一週間に、約１回以上（約２回以上、約３回以上、約４回以上、約５回以上、約６回以上、または約７回以上など）の用量を与える。いくつかの実施形態では、数日、数週、数月、または数年の過程にわたって、複数用量を与える。いくつかの実施形態では、一連の治療は、約１回以上の用量（約２回以上の用量、約３回以上の用量、約４回以上の用量、約５回以上の用量、約７回以上の用量、約１０回以上の用量、約１５回以上の用量、約２５回以上の用量、約４０回以上の用量、約５０回以上の用量、または約１００回以上の用量など）である。
【０４４２】
いくつかの実施形態では、医薬組成物の投薬量は、対象の体重ｋｇ当たり約１μｇ以上のタンパク質（対象の体重ｋｇ当たり約２μｇ以上のタンパク質、対象の体重ｋｇ当たり約５μｇ以上のタンパク質、対象の体重ｋｇ当たり約１０μｇ以上のタンパク質、対象の体重ｋｇ当たり約２５μｇ以上のタンパク質、対象の体重ｋｇ当たり約５０μｇ以上のタンパク質、対象の体重ｋｇ当たり約１００μｇ以上のタンパク質、対象の体重ｋｇ当たり約２５０μｇ以上のタンパク質、対象の体重ｋｇ当たり約５００μｇ以上のタンパク質、対象の体重ｋｇ当たり約１ｍｇ以上のタンパク質、対象の体重ｋｇ当たり約２ｍｇ以上のタンパク質、または対象の体重ｋｇ当たり約５ｍｇ以上のタンパク質など）である。
【０４４３】
いくつかの実施形態では、治療量の細胞組成物を投与する。典型的には、投与されるべき本発明の組成物の正確な量は、年齢、体重、腫瘍サイズ、感染または転移の範囲、および患者（対象）の状態における個々の差を考慮して、医師が決定し得る。概して、本明細書に記載されるような操作された細胞、例えば、Ｔ細胞を含む医薬組成物が、１０５〜１０６細胞／体重ｋｇなど、１０４〜１０９細胞／体重ｋｇの投与量で（これらの範囲内のすべての整数値を含む）投与され得ること記述することができる。Ｔ細胞組成物などの操作された細胞組成物も、これらの投与量で複数回投与され得る。細胞は、免疫療法において一般に知られている注入技術（例えば、Ｒｏｓｅｎｂｅｒｇ  ｅｔ  ａｌ，Ｎｅｗ  Ｅｎｇ．Ｊ．ｏｆ  Ｍｅｄ．３１９：１６７６，１９８８を参照されたい）を使用して投与され得る。特定の患者についての最適な投与量および治療レジメンは、疾患の徴候について患者を監視することによって、医療の当業者が容易に決定することができる。
【０４４４】
本発明の治療組成物の投与が、所望されない免疫反応を仲介するか、もしくは仲介することができる免疫細胞を排除、隔離、もしくは不活性化するか、保護的免疫反応を仲介するか、もしくは仲介することができる免疫細胞を誘発、作成、もしくは活性化するか、免疫細胞の物理的もしくは機能的特性を変化させるか、またはこれらの効果の組み合わせを行うことによって免疫活性を十分に調節するかどうかを判定するための様々な手段が知られている。免疫活性の調節の測定の例には、免疫細胞集団の存在または不存在の検査（フローサイトメトリー、免疫組織化学、組織学、電子顕微鏡、ポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）を使用した）、シグナルに反応して激増または分裂するための能力または耐性を含む免疫細胞の機能的能力の測定（抗ＣＤ３抗体、抗Ｔ細胞受容体抗体、抗ＣＤ２８抗体、カルシウムイオノフォア、ペプチドまたはタンパク質抗原で荷重されたＰＭＡ（ホルボール１２ミリスチン酸１３酢酸）抗原提示細胞による刺激後の３Ｈチミジン取り込みに基づくＴ細胞増殖アッセイおよびｐｅｐｓｃａｎ分析、Ｂ細胞増殖アッセイなどを使用した）、他の細胞を殺傷または溶解させるための能力の測定（細胞傷害性Ｔ細胞アッセイなど）、サイトカイン、ケモカイン、細胞表面分子、抗体、および細胞の他の生成物の測定（例えば、フローサイトメトリー、酵素連結免疫吸着アッセイ、ウエスタンブロット分析、タンパク質マイクロアレイ分析、免疫沈降分析による）、免疫細胞または免疫細胞内のシグナル伝達経路の活性化の生化学マーカーの測定（例えば、チロシン、セリンまたはトレオニンリン酸化、ポリペプチド開裂、およびタンパク質複合体の形成または解離のウエスタンブロットおよび免疫沈降分析；タンパク質アレイ分析；ＤＮＡアレイまたはサブトラクティブハイブリダイゼーションを使用したＤＮＡ転写プロファイリング）、アポトーシス、壊死、または他の機構による細胞死の測定（例えば、アネキシンＶ染色、ＴＵＮＥＬアッセイ、ＤＮＡラダーリングを測定するためのゲル電気泳動、組織学、蛍光発生カスパーゼアッセイ、カスパーゼ基質のウエスタンブロット分析）、遺伝子、タンパク質、および免疫細胞によって生成される他の分子の測定（例えば、ノーザンブロット分析、ポリメラーゼ連鎖反応、ＤＮＡマイクロアレイ、タンパク質マイクロアレイ、二次元的ゲル電気泳動、ウエスタンブロット分析、酵素結合免疫吸着アッセイ、フローサイトメトリー）、ならびに自己免疫疾患、神経変性疾患、および例えば、多発性硬化症の場合の再発率もしくは疾患重症度の測定（当業者に既知の臨床スコアを使用した）、Ｉ型糖尿病の場合の血中グルコースの測定、または関節リウマチの場合の関節炎症の測定による自己タンパク質もしくは自己ポリペプチドを伴う他の疾患の改善などの臨床症状もしくは結果の測定（臨床スコア、追加の治療の使用のための要件、機能状態、撮像研究）が含まれるが、これらに限定されない。
【０４４５】
ＶＩ．製造物品およびキット
好適なパッケージング中に本明細書に記載の医薬組成物を含む製造物品も、本明細書に提供する。本明細書に記載の組成物のための好適なパッケージングは、当該技術分野で知られており、例えば、バイアル（密閉バイアルなど）、ベッセル、アンプル、瓶、ジャー、可撓性パッケージング（例えば、密閉マイラまたはプラスチックバッグ）などを含む。これらの製造物品は、さらに滅菌および／または密閉され得る。
【０４４６】
本明細書に記載される使用などの組成物を使用する方法についての指示をさらに含み得る、本明細書に記載の医薬組成物（または製造物品）を含むキットをさらに提供する。本明細書に記載のキットはまた、本明細書に記載の任意の方法を行うための指示を含む、他の緩衝液、希釈剤、フィルター、針、シリンジ、およびパッケージ挿入具を含む、市販のユーザの観点から望ましい他の材料を含み得る。
【０４４７】
ＶＩＩ．治療用途
本明細書に記載の医薬組成物（本明細書に記載の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド、免疫調節タンパク質、コンジュゲート、および操作された細胞を含む医薬組成物を含む）が、疾患の治療などの様々な治療用途において使用され得る。例えば、いくつかの実施形態では、医薬組成物を使用して、哺乳動物において炎症性もしくは自己免疫性障害、器官移植、癌、ウイルス感染、および／または細菌感染を治療する。医薬組成物は、疾患を治療するための免疫反応を調節し得る。
【０４４８】
そのような方法および使用は、例えば、分子もしくは操作された細胞、またはこれらを含有する組成物の、腫瘍または癌などの疾患、状態、または障害を有する対象への投与を伴う治療方法および使用を含む。いくつかの実施形態では、分子または操作された細胞は、疾患または障害の治療に影響を与える有効量で投与される。使用は、そのような方法および治療での、かつそのような治療方法を実行するための薬剤の調製における、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド、免疫調節タンパク質、コンジュゲート、操作された細胞、および感染性病原体を含有する分子の使用を含む。いくつかの実施形態では、本方法は、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド、免疫調節タンパク質、コンジュゲート、操作された細胞、および感染性病原体、またはこれらを含む組成物を、疾患または状態を有するか、または有すると疑われる対象に投与することによって実行される。いくつかの実施形態では、それによって、本方法は、対象における疾患または状態または障害を治療する。
【０４４９】
いくつかの実施形態では、提供される方法は、本明細書に記載の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド、免疫調節タンパク質、コンジュゲート、操作された細胞、および感染性病原体の治療的投与に適用可能である。免疫反応の調節の種類、例えば、所望される現象または増加に応じて指示のための形式を選択することは、提供される開示の観点において当業者のレベルの範囲内にある。
【０４５０】
いくつかの実施形態では、例えば、自己免疫性疾患、炎症、移植片拒絶、または器官移植拒絶反応の治療、防止、または弱体化において有用であり得る、免疫反応を抑制または弱体化する本明細書に提供される医薬組成物が投与される。いくつかの実施形態では、医薬組成物は、その共刺激リガンド、ＩＣＯＳＬ、ＣＤ８０、および／もしくはＣＤ８６とのその相互作用を阻害することによって共刺激受容体のアンタゴニスト活性を示し、かつ／またはＣＤ２８および／もしくはＩＣＯＳを介したシグナル伝達を抑制する形式で、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドを含有する。そのような治療用途と関連して使用するためのＣＴＬＡ−４ポリペプチドの例示的な形式には、例えば、可溶性である変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド（例えば、変異型ＣＴＬＡ−４−Ｆｃ融合タンパク質）、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドおよびＦｃ融合であるその可溶性形態を含む別のＩｇＳＦドメインの免疫調節タンパク質または「積層」、その特定のコンジュゲート、トランス・エンドサイトーシスを仲介することができる変異型ＣＴＬＡ−４を発現する操作された細胞、分泌可能な免疫調節タンパク質を発現する操作された細胞、または感染した細胞（例えば、Ｔ細胞）における分泌可能な免疫調節タンパク質の発現および分泌などのための分泌可能な免疫調節タンパク質をコードする核酸分子を含む感染性病原体が含まれる。
【０４５１】
いくつかの実施形態では、医薬組成物を使用して、免疫反応、例えば、炎症、移植片拒絶、器官移植拒絶反応を抑えることができるか、または自己免疫性疾患もしくは障害を弱体化もしくは治療することができる。炎症または自己免疫性疾患または障害を治療する方法は、炎症または自己免疫性疾患を有する対象に、本明細書に記載の医薬組成物のうちのいずれかの有効量を投与することを含み得る。有効量の医薬組成物を投与して、提供される変異型または免疫調節タンパク質などによる、免疫活性の調節に感受性のある自己免疫性疾患または障害を含む、自己免疫性疾患または障害の進行を抑制、停止、または逆転させることができる。ヒト免疫細胞は、生体内または生体外で処理され得る。ヒト患者の生体外での治療では、組織または免疫細胞を含有する流体は、体外で処理され、次に、組織または流体は、患者内に再導入される。いくつかの実施形態では、炎症または自己免疫性疾患また障害は、患者への治療組成物の投与によってヒト患者の生体内で治療される。したがって、本発明は、炎症または自己免疫性疾患または障害の進行を抑制、停止、または逆転させるための、または別様に、対照による治療に対して、免疫活性の統計的に有意な減少をもたらすための、生体外および生体内での方法を提供する。
【０４５２】
本明細書に記載の医薬組成物および治療方法によって治療され得る炎症性および自己免疫性障害には、アディソン病、アレルギー、円形脱毛症、アルツハイマー病、抗好中球細胞質抗体（ＡＮＣＡ）関連血管炎、強直性脊椎炎、抗リン脂質抗体症候群（ヒューズ症候群）、喘息、アテローム性動脈硬化、関節リウマチ、自己免疫性溶血性貧血、自己免疫性肝炎、自己免疫性内耳疾患、自己免疫性リンパ増殖性症候群、自己免疫性心筋炎、自己免疫性卵巣炎、自己免疫性精巣炎、無精子症、ベーチェット病、ベルガー病、水疱性類天疱瘡、心筋症、循環器系疾患、セリアックスプルー／セリアック病、慢性疲労免疫性機能障害症候群（ＣＦＩＤＳ）、慢性特発性心膜炎、慢性炎症性脱髄性多発神経根筋障害（ＣＩＤＰ）、慢性再発性多発性ニューロパチー（ギラン・バレー症候群）、チャーグ・ストラウス症候群（ＣＳＳ）、瘢痕性類天疱瘡、寒冷凝集素症（ＣＡＤ）、ＣＯＰＤ（慢性閉塞性肺疾患）、クレスト症候群、クローン病、皮膚炎、ヘルペス、皮膚筋炎、糖尿病、円板状ループス、湿疹、後天性表皮水疱症、本態性混合型クリオグロブリン血症、エヴァンズ症候群、眼球突出症、線維筋痛症、グッドパスチャー症候群、グレーブス病、橋本甲状腺炎、特発性血小板減少性紫斑病（ＩＴＰ）、ＩｇＡ腎障害、免疫増殖性疾患または障害、炎症性腸疾患（ＩＢＤ）、間質性肺疾患、若年性関節炎、若年性突発性関節炎（ＪＩＡ）、川崎病、ランバート・イートン筋無力症症候群、扁平苔癬、ループス腎炎、リンパ球性下垂体炎、メニエール病、ミラー・フィッシャー症候群／急性散在性脳脊髄炎、混合性結合組織病、多発性硬化症（ＭＳ）、筋肉リウマチ、筋痛性脳脊髄炎（ＭＥ）、重症筋無力症、眼炎症、落葉状天疱瘡、尋常性天疱瘡、悪性貧血、結節性多発動脈炎、多発性軟骨炎、多腺性症候群（ウィテカー症候群）、リウマチ性多発筋痛症、多発性筋炎、原発性無ガンマグロブリン血症、原発性胆汁性肝硬変／自己免疫性胆管症、乾癬、乾癬性関節炎、レイノー現象、ライター症候群／反応性関節炎、再狭窄、リウマチ熱、リウマチ性疾患、サルコイドーシス、シュミット症候群、強皮症、シェーグレン症候群、全身硬直症候群、全身性エリテマトーデス（ＳＬＥ）、全身性強皮症、高安動脈炎、側頭動脈炎／巨細胞性動脈炎、甲状腺炎、１型糖尿病、潰瘍性大腸炎、ブドウ膜炎、血管炎、白斑症、間質性腸疾患、またはヴェグナー肉芽腫症が含まれるが、これらに限定されない。いくつかの実施形態では、炎症性もしくは自己免疫性障害は、間質性腸疾患、移植、クローン病、潰瘍性大腸炎、多発性硬化症、喘息、関節リウマチ、および乾癬から選択される。
【０４５３】
いくつかの実施形態では、医薬組成物は、自己免疫性状態を調節するために投与される。例えば、免疫反応の抑制は、受容者によるドナーからの組織、細胞、または器官の移植の拒絶を抑制するための方法において有益であり得る。したがって、いくつかの実施形態では、本明細書に記載の医薬組成物を使用して、移植片対宿主疾患（ＧＶＨＤ）などの移植片関連または移植関連疾患または障害を制限または防止する。いくつかの実施形態では、医薬組成物を使用して、移植または移植片の骨髄、器官、皮膚、筋肉、神経細胞、膵島、または実質細胞の自己免疫拒絶を抑える。
【０４５４】
いくつかの実施形態では、医薬組成物は、単独療法として（すなわち、単剤として）または併用療法として（すなわち、１つ以上の追加の免疫抑制剤と組み合わせて）投与される。いくつかの実施形態では、追加の薬剤は、糖質コルチコイド（例えば、プレドニゾン、デキサメタゾン、およびヒドロコルチゾン）、Ｔ細胞および／もしくはＢ細胞の増殖に影響を与える細胞分裂阻害剤などの細胞分裂阻害剤（例えば、プリン類似体、アルキル化剤、または代謝拮抗薬）、抗体（例えば、抗ＣＤ２０、抗ＣＤ２５、または抗ＣＤ３モノクロ―ナル抗体）、シクロスポリン、タクロリムス、シロリムス、エベロリムス、インターフェロン、オピオイド、ＴＮＦ結合タンパク質、ミコフェノール酸、フィンゴリモドもしくはミリオシンなどの小さい生物学的薬剤、インターフェロンベータ−１ａ、インテグリンアゴニスト、またはインテグリンアンタゴニストなどのサイトカインである。
【０４５５】
いくつかの実施形態では、例えば、癌、ウイルス感染、または細菌感染の治療に有用であり得る、免疫反応を刺激する本明細書に提供される医薬組成物が投与される。いくつかの実施形態では、医薬組成物は、Ｔ細胞中の活性化シグナルを促進および／または強化するための活性を示す形式で変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドを含有する。そのような治療用途と関連して使用するための例示的な形式には、例えば、変異型ＣＴＬＡ４が、抑制受容体を活性化受容体に変えるＩＴＡＭ含有細胞質ドメインを有する操作されたＴ細胞上に発現される、ＣＴＬＡ−４スイッチ受容体を発現する操作された細胞が含まれる。そのような治療用途を関連して使用するための別の形式には、例えば、細胞質シグナル伝達ドメインを欠いており、かつ／またはＴ細胞中のＩＴＩＭ媒介シグナル伝達などのシグナル伝達を仲介することができないデコイ受容体として変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドを発現する操作された細胞が含まれる。
【０４５６】
いくつかの実施形態では、免疫反応を刺激する医薬組成物などの医薬組成物を使用して、哺乳動物癌細胞（ヒト癌細胞など）の成長を抑制することができる。癌を治療する方法は、本明細書に記載の医薬組成物のうちのいずれかの有効量を、癌を有する対象に投与することを含み得る。有効量の医薬組成物を投与して、提供される変異型または免疫調節タンパク質などによる、免疫活性の調節に感受性のある癌を含む、癌の進行を抑制、停止、または逆転させることができる。ヒト癌細胞は、生体内または生体外で治療され得る。ヒト患者の生体外での治療では、癌細胞を含有する組織または流体は、体外で処理され、次に、組織または流体は、患者に再導入される。いくつかの実施形態では、癌は、患者への治療組成物の投与によってヒト患者の生体内で治療される。したがって、本発明は、腫瘍の進行を抑制、停止、もしくは逆転させるための、または別様に、対照による治療に対して、無進行生存（すなわち、悪化しない癌を有する患者が生存している治療中および後の時間の長さ）もしくは全生存（「生存率」とも呼ばれる、すなわち、癌と診断されたか、または癌の治療を受けた後に特定の期間、生存している研究または治療群の人々の割合）における統計的に有意な増加をもたらすための生体内および生体外での方法を提供する。
【０４５７】
本明細書に記載の医薬組成物および治療方法によって治療され得る癌は、黒色腫、膀胱癌、血液学的悪性疾患（白血病、リンパ腫、骨髄腫）、肝臓癌、脳癌、腎臓癌、乳癌、膵臓癌（腺癌）、結腸直腸癌、肺癌（小細胞肺癌および非小細胞肺癌）、脾臓癌、癌胸腺もしくは血球の癌（すなわち、白血病）、前立腺癌、精巣癌、卵巣癌、子宮癌、胃癌、筋骨格系の癌、頭頸部癌、胃腸癌、胚細胞癌、または内分泌および神経内分泌系の癌を含むが、これらに限定されない。いくつかの実施形態では、癌は、ユーイング肉腫である。いくつかの実施形態では、癌は、黒色腫、肺癌、膀胱癌、および血液学的悪性疾患から選択される。いくつかの実施形態では、癌は、リンパ腫、リンパ性白血病、骨髄性白血病、子宮頸癌、神経芽細胞腫、または多発性骨髄腫である。
【０４５８】
いくつかの実施形態では、医薬組成物は、単独療法として（すなわち、単剤として）または併用療法として（すなわち、化学療法薬、癌ワクチン、または免疫チェックポイント抑制剤などの１つ以上の追加の抗癌剤との組み合わせで投与される。いくつかの実施形態では、医薬組成物はまた、放射線治療とともに投与され得る。本開示のいくつかの態様では、免疫チェックポイント抑制剤は、ニボルマブ、トレメリムマブ、ペンブロリズマブ、イピリムマブなどである。
【０４５９】
操作された細胞を含む組成物および本明細書に記載の方法を、養子細胞移入用途において使用され得る。いくつかの実施形態では、操作された細胞を含む細胞組成物は、例えば、哺乳動物癌の治療、または他の実施形態では、自己免疫性障害の治療に対する免疫療法手法で、例えば、免疫活性を調節するための関連する方法において使用され得る。用いられる方法は、概して、親和性改変ＩｇＳＦドメインの特異的結合および哺乳動物細胞の免疫活性の調節に対して許容可能な条件下で、哺乳動物細胞と本発明のＴＩＰを接触させる方法を含む。いくつかの実施形態では、免疫細胞（Ｔ細胞（ＣＤ８＋またはＣＤ４＋Ｔ細胞を含む）またはＡＰＣなど）は、膜タンパク質として、かつ／または本明細書に記載されるような可溶性変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド、免疫調節タンパク質、もしくはコンジュゲートとして発現するように操作される。次に、操作された細胞は、免疫活性が、哺乳動物細胞において調節され得るように、哺乳動物細胞上の親和性改変ＩｇＳＦドメインのカウンター構造への特異的結合を許容する条件下で、免疫活性の調節が所望されるＡＰＣ、第２のリンパ球、または腫瘍細胞などの哺乳動物細胞に接触され得る。細胞は、生体内または生体外で接触され得る。
【０４６０】
いくつかの実施形態では、操作された細胞は、自家細胞である。他の実施形態では、細胞は、同種異系である。いくつかの実施形態では、細胞は、それが単離された哺乳動物に再注入される自家の操作された細胞である。いくつかの実施形態では、細胞は、哺乳動物に注入される同種異系の操作された細胞である。いくつかの実施形態では、細胞は、患者血液または腫瘍から採取され、ポリペプチドを発現するように操作され（本明細書に記載の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド、免疫調節タンパク質、またはコンジュゲートなど）、インビトロ培養システムにおいて膨張され（例えば、細胞を刺激することによって）、患者に再注入されて腫瘍破壊を媒介する。いくつかの実施形態では、本方法は、ＴＩＰを発現する細胞（例えば、Ｔ細胞）が患者に注入し戻される養子細胞移入によって行われる。いくつかの実施形態では、本発明の治療組成物および方法は、リンパ腫、リンパ性白血病、骨髄性白血病、子宮頸癌、神経芽細胞腫、または多発性骨髄腫などの癌の哺乳動物患者の治療において使用される。
【０４６１】
ＶＩＩＩ．例示的な実施形態
提供される実施形態の中には、以下がある。
１．ＩｇＶドメインまたはその特異的結合断片を含む変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドであって、非改変ＣＴＬＡ−４ポリペプチドまたはその特異的結合断片中に１つ以上のアミノ酸改変を含み、非改変ＣＴＬＡ−４と比較して増加した親和性でＩＣＯＳＬの外部ドメインに特異的に結合する、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
２．非改変ＣＴＬＡ−４ポリペプチドまたはその特異的結合断片中に、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２に記載の位置に関して、６、１０、１２、１４、１５、１６、１８、１９、２０、２２、２４、２６、２７、２８、２９、３０、３３、３５、３７、３８、４１、４２、４３、４５、４６、４７、４８、５３、５４、５５、５６、５８、５９、６１、６３、６４、６５、６７、６９、７１、７２、７３、７５、７６、８２、８５、８６、８７、８９、９１、９３、９５、９６、９７、９８、９９、１０５、１０６、１０８、１１０、１１３、１１５、１１６、１１７、１１８、１１９、１２０、１２１、および１２２の中から選択される位置に対応する１つ以上のアミノ酸改変を含む、実施形態１の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
３．ＩｇＶドメインまたはその特異的結合断片を含む変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドであって、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドが、非改変ＣＴＬＡ−４ポリペプチドまたはその特異的結合断片中に、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２に記載の位置に関して、６、１０、１２、１４、１５、１６、１８、１９、２０、２２、２４、２６、２７、２８、２９、３０、３３、３５、３７、３８、４１、４２、４３、４５、４６、４７、４８、５３、５４、５５、５６、５８、５９、６１、６３、６４、６５、６７、６９、７１、７２、７３、７５、７６、８２、８５、８６、８７、８９、９１、９３、９５、９６、９７、９８、９９、１０５、１０６、１０８、１１０、１１３、１１５、１１６、１１７、１１８、１１９、１２０、１２１、および１２２の中から選択される位置に対応する１つ以上のアミノ酸改変を含む、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
４．アミノ酸改変が、アミノ酸置換、欠失、または挿入を含む、実施形態１〜３のうちのいずれかの変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
５．非改変ＣＴＬＡ−４ポリペプチドが、哺乳動物ＣＴＬＡ−４ポリペプチドまたはその特異的結合断片である、実施形態１〜４のうちのいずれかの変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
６．非改変ＣＴＬＡ−４ポリペプチドが、ヒトＣＴＬＡ−４ポリペプチドまたはその特異的結合断片である、実施形態５の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
７．変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドが、ヒトＣＴＬＡ−４の細胞外ドメインを含み、１つ以上のアミノ酸改変が、非改変ＣＴＬＡ−４ポリペプチドの細胞外ドメインの１つ以上の残基中にある、実施形態１〜６のうちのいずれかの変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
８．非改変ＣＴＬＡ−４ポリペプチドが、
（ｉ）ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２に記載のアミノ酸の配列、
（ｉｉ）ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２と少なくとも９５％の配列同一性を有するアミノ酸の配列、または
（ｉｉｉ）ＩｇＶドメインもしくはＩｇＶドメインの特異的結合断片を含むその一部分
を含む、実施形態１〜７のうちのいずれかの変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
９．非改変ＣＴＬＡ−４が、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２に記載のアミノ酸の配列を含む、実施形態１〜８のうちのいずれかの変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
１０．
ＩｇＶドメインの前記特異的結合断片が、少なくとも５０、６０、７０、８０、９０、１００、１１０もしくはそれ以上のアミノ酸の長さを有するか、または
ＩｇＶドメインの特異的結合断片が、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１の残基３９〜１４０として記載されるＩｇＶドメインの長さの少なくとも８０％である長さを含む、実施形態１〜８のうちのいずれかの変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
１１．変異型ＣＴＬＡ−４が、最大１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、または２０個のアミノ酸改変、任意選択的に、アミノ酸置換、挿入、および／または欠失を含む、実施形態１〜１０のうちのいずれかの変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
１２．ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２と少なくとも８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、または９９％の配列同一性を示すアミノ酸の配列またはその特異的結合断片を含む、実施形態１〜１１のうちのいずれかの変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
１３．ＩＣＯＳＬ、ＣＤ８０、および／またはＣＤ８６の外部ドメインに対し、同じ外部ドメインに対する非改変ＣＴＬＡ−４ポリペプチドの結合と比較して増加した親和性で、特異的に結合する、実施形態３〜１２のうちのいずれかの変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
１４．ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２に記載のヒトＣＴＬＡ−４の細胞外ドメイン中に１つ以上のアミノ酸改変を含む変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドであって、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドが、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２に記載の細胞外ドメインを含むＣＴＬＡ−４と比較して増加した親和性で、ヒトＩＣＯＳＬ、ＣＤ８０、および／またはＣＤ８６の外部ドメインに特異的に結合する、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
１５．１つ以上のアミノ酸改変が、Ａ６Ｔ、Ｖ１０Ａ、Ｌ１２Ｆ、Ｌ１２Ｈ、Ｌ１２Ｉ、Ｌ１２Ｐ、Ｓ１４Ｎ、Ｓ１５Ｐ、Ｒ１６Ｃ、Ｒ１６Ｇ、Ｒ１６Ｈ、Ｉ１８Ａ、Ｉ１８Ｆ、Ｉ１８Ｎ、Ｉ１８Ｔ、Ｉ１８Ｖ、Ａ１９Ｖ、Ｓ２０Ｎ、Ｖ２２Ａ、Ｖ２２Ｉ、Ｅ２４Ｑ、Ａ２６Ｄ、Ａ２６Ｓ、Ａ２６Ｔ、Ｓ２７Ｐ、Ｐ２８Ｌ、Ｇ２９Ｒ、Ｇ２９Ｗ、Ｋ３０Ｒ、Ｅ３３Ｍ、Ｅ３３Ｖ、Ｒ３５Ｋ、Ｔ３７Ｓ、Ｖ３８Ｉ、Ｑ４１Ｌ、Ａ４２Ｓ、Ａ４２Ｔ、Ａ４２Ｖ、Ｄ４３Ｎ、Ｑ４５Ｈ、Ｖ４６Ｅ、Ｔ４７Ａ、Ｅ４８Ｒ、Ｔ５３Ｓ、Ｙ５４Ｆ、Ｍ５５Ｒ、Ｍ５５Ｔ、Ｍ５５Ｖ、Ｍ５６Ｋ、Ｍ５６Ｌ、Ｍ５６Ｒ、Ｍ５６Ｔ、Ｍ５６Ｖ、Ｎ５８Ｄ、Ｎ５８Ｓ、Ｅ５９Ｄ、Ｅ５９Ｇ、Ｔ６１Ａ、Ｔ６１Ｉ、Ｔ６１Ｎ、Ｔ６１Ｒ、Ｔ６１Ｓ、Ｌ６３Ｈ、Ｌ６３Ｐ、Ｄ６４Ｅ、Ｄ６４Ｎ、Ｄ６４Ｖ、Ｄ６５Ｇ、Ｉ６７Ｎ、Ｉ６７Ｔ、Ｉ６７Ｖ、Ｔ６９Ａ、Ｔ６９Ｉ、Ｔ６９Ｓ、Ｔ７１Ａ、Ｔ７１Ｉ、Ｓ７２Ｇ、Ｓ７２Ｔ、Ｓ７３Ｒ、Ｎ７５Ｄ、Ｑ７６Ｒ、Ｑ８２Ｈ、Ｑ８２Ｒ、Ｒ８５Ｇ、Ａ８６Ｔ、Ｍ８７Ａ、Ｍ８７Ｋ、Ｍ８７Ｔ、Ｍ８７Ｖ、Ｔ８９Ａ、Ｔ８９Ｍ、Ｔ８９Ｓ、Ｌ９１Ｒ、Ｉ９３Ｌ、Ｉ９３Ｖ、Ｋ９５Ｒ、Ｖ９６Ｉ、Ｅ９７Ｑ、Ｌ９８Ｑ、Ｌ９８Ｒ、Ｍ９９Ｉ、Ｍ９９Ｌ、Ｐ１０２Ｌ、Ｙ１０５Ｆ、Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１０６Ｉ、Ｌ１０６Ｎ、Ｌ１０６Ｒ、Ｌ１０６Ｖ、Ｉ１０８Ｆ、Ｉ１０８Ｖ、Ｎ１１０Ｋ、Ｎ１１０Ｓ、Ｎ１１０Ｙ、Ｑ１１３Ｈ、Ｙ１１５Ｈ、Ｙ１１５Ｎ、Ｖ１１６Ａ、Ｉ１１７Ｅ、Ｉ１１７Ｌ、Ｉ１１７Ｍ、Ｉ１１７Ｔ、およびＰ１２１Ｓ、またはそれらの保存的アミノ酸置換から選択される、実施形態１〜１４のうちのいずれかの変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
１６．Ａ６Ｔ／Ａ２６Ｔ／Ｍ５５Ｔ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｖ１０Ａ／Ｇ２９Ｗ／Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｐ１２１Ｓ、Ｖ１０Ａ／Ｌ６３Ｐ／Ｄ６４Ｖ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｖ１０Ａ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１２Ｆ／Ｒ１６Ｈ／Ｇ２９Ｗ／Ｍ５６Ｔ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１２Ｆ／Ａ２６Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｒ、Ｌ１２Ｆ／Ｋ３０Ｒ／Ｓ７２Ｇ／Ｑ８２Ｒ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１２Ｈ／Ｉ１８Ｖ／Ａ４２Ｔ／Ｍ５５Ｔ／Ｎ５８Ｄ／Ｌ９８Ｒ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ／Ｐ１２１Ｓ、Ｌ１２Ｈ／Ｅ３３Ｍ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１２Ｈ／Ｍ５５Ｔ／Ｅ５９Ｄ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ９９Ｌ、Ｌ１２Ｈ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１２Ｉ／Ｍ５５Ｔ／Ｍ５６Ｖ／Ｉ６７Ｔ／Ｍ９９Ｌ／Ｌ１０６Ｒ／Ｉ１０８Ｆ、Ｌ１２Ｐ／Ｒ１６Ｈ／Ａ２６Ｔ／Ｔ６１Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ／Ｉ１１７Ｌ、Ｌ１２Ｐ／Ｉ１８Ｔ／Ａ２６Ｔ／Ｍ５５Ｔ／Ｔ６９Ｓ／Ｓ７２Ｇ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１２Ｐ／Ａ２６Ｔ、Ｌ１２Ｐ／Ａ２６Ｔ／Ｌ６３Ｐ、Ｌ１２Ｐ／Ａ２６Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｔ８９Ｍ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１２Ｐ／Ｇ２９Ｗ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１２Ｐ／Ｇ２９Ｗ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ、Ｌ１２Ｐ／Ａ２６Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１２Ｐ／Ａ２６Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１２Ｐ／Ａ２６Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ、Ｌ１２Ｐ／Ｇ２９Ｗ／Ｄ４３Ｎ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１２Ｐ／Ｍ５６Ｖ／Ｌ６３Ｐ／Ｖ９６Ｉ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｙ１１５Ｈ、Ｌ１２Ｐ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１２Ｐ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｎ、Ｌ１２Ｐ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｎ／Ｉ１１７Ｌ、Ｓ１４Ｎ／Ｒ１６Ｃ／Ｉ１８Ｔ／Ｍ５６Ｋ／Ｔ６１Ａ／Ｌ６３Ｐ／Ａ８６Ｔ／Ｍ９９Ｌ、Ｓ１５Ｐ／Ｉ１８Ｖ／Ｍ５６Ｔ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｒ１６Ｃ／Ｇ２９Ｗ／Ｅ３３Ｖ／Ｍ５５Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｉ１８Ａ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｉ１８Ｆ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｐ１２１Ｓ、Ｉ１８Ｎ／Ａ２６Ｔ／Ｌ６３Ｈ／Ｔ８９Ａ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｉ１８Ｎ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｔ／Ｍ８７Ｔ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｎ１１０Ｓ、Ｉ１８Ｔ／Ａ２６Ｓ／Ｍ５５Ｔ／Ｍ５６Ｖ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｉ１１７Ｋ、Ｉ１８Ｔ／Ａ２６Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｉ１８Ｔ／Ａ２６Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｑ８２Ｒ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｉ１８Ｔ／Ｇ２９Ｒ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｉ１８Ｔ／Ｇ２９Ｗ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｉ１８Ｔ／Ｅ４８Ｒ／Ｌ６３Ｐ／Ｔ６９Ｓ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｎ１１０Ｙ、Ｉ１８Ｔ／Ｔ６１Ｒ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｉ１８Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｍ８７Ｋ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｉ１８Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｉ１８Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｉ１０８Ｖ、Ｉ１８Ｖ／Ａ２６Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｄ６４Ｅ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｒ／Ｎ１１０Ｋ、Ｉ１８Ｖ／Ｇ２９Ｗ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ａ１９Ｖ／Ｇ２９Ｗ／Ｒ３５Ｋ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｓ２０Ｎ／Ａ２６Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｖ２２Ａ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｐ１１９Ｈ、Ｖ２２Ｉ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｉ１１７Ｍ、Ｅ２４Ｑ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ａ２６Ｄ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ａ２６Ｔ／Ａ４２Ｖ／Ｑ４５Ｈ／Ｉ６７Ｎ／Ｍ８７Ｋ／Ｅ９７Ｑ／Ｍ９９Ｌ、Ａ２６Ｔ／Ｖ４６Ｅ／Ｌ６３Ｐ／Ｄ６５Ｇ／Ｌ９８Ｑ、Ａ２６Ｔ／Ｔ４７Ａ／Ｍ５６Ｋ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｑ８２Ｒ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ａ２６Ｔ／Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ａ２６Ｔ／Ｔ５３Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ／Ｉ１１７Ｌ、Ａ２６Ｔ／Ｙ５４Ｆ／Ｍ５６Ｋ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ａ２６Ｔ／Ｍ５５Ｒ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ａ２６Ｔ／Ｍ５５Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ａ２６Ｔ／Ｍ５５Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ａ２６Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｄ６５Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ａ２６Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｎ１１０Ｋ／Ｉ１１７Ｅ、Ａ２６Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ａ２６Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ／Ｉ１１７Ｌ、Ａ２６Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ａ２６Ｔ／Ｉ６７Ｎ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｓ２７Ｐ／Ｍ５６Ｋ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｓ７３Ｒ／Ｔ８９Ａ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｉ１１７Ｍ、Ｐ２８Ｌ／Ｅ３３Ｖ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｐ２８Ｌ／Ｅ３３Ｖ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｒ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｉ１０８Ｖ、Ｇ２９Ｗ／Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｐ１２１Ｓ、Ｇ２９Ｗ／Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｔ６１Ｎ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｌ６３Ｐ／Ｑ８２Ｈ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｉ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｔ５３Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｍ５５Ｖ／Ｅ５９Ｇ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｍ５６Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ／Ｉ１１７Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｎ５８Ｄ／Ｉ６７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｄ６４Ｎ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｔ６９Ｉ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ、Ｇ２９Ｗ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｖ、Ｇ２９Ｗ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｑ８２Ｒ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｔ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｅ５９Ｇ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｔ６１Ｉ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｌ６３Ｐ／Ｄ６５Ｇ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｌ６３Ｐ／Ｉ６７Ｖ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ、Ｇ２９Ｗ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ／Ｉ１１７Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｉ１１７Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｓ７２Ｇ／Ｑ７６Ｒ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ／Ｑ１１３Ｈ、Ｇ２９Ｗ／Ｍ８７Ｋ／Ｔ８９Ｓ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｉ１０８Ｖ／Ｉ１１７Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｍ８７Ｋ／Ｉ９３Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｅ３３Ｍ／Ａ４２Ｔ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｅ３３Ｍ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｅ３３Ｍ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｉ１０８Ｆ、Ｅ３３Ｍ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｉ１１７Ｌ、Ｅ３３Ｍ／Ｑ８２Ｈ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｅ３３Ｖ／Ａ４２Ｓ／Ｍ５５Ｔ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｔ３７Ｓ／Ｍ５６Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｖ３８Ｉ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｑ４１Ｌ／Ｙ５４Ｆ／Ｍ５６Ｋ／Ｍ９９Ｌ／Ｉ１０８Ｆ、Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｍ５５Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｔ７１Ｉ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｍ５５Ｔ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｍ５５Ｔ／Ｅ９７Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｆ、Ｍ５６Ｋ／Ｌ６３Ｐ／Ｎ７５Ｄ／Ｖ９６Ｉ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ、Ｍ５６Ｌ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ／Ｉ１１７Ｌ、Ｍ５６Ｒ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｍ５６Ｔ／Ｌ９１Ｒ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｍ５６Ｖ、Ｍ５６Ｖ／Ｅ５９Ｇ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｍ８７Ｋ／Ｉ９３Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｉ１１７Ｅ、Ｔ６１Ａ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ６３Ｐ、Ｌ６３Ｐ／Ｔ６９Ａ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｒ／Ｖ１１６Ａ、Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｍ８７Ａ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｉ９３Ｌ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ／Ｉ１１７Ｌ、Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ／Ｉ１１７Ｌ、Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｋ／Ｍ９９Ｌ／Ｌ１０６Ｒ、Ｌ６３Ｐ／Ｑ８２Ｈ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ６３Ｐ／Ｋ９５Ｒ、Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ、Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ、Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｉ１０８Ｖ、Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｉ１１７Ｍ、Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｖ１１６Ａ、Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｒ／Ｎ１１０Ｋ、Ｌ６３Ｐ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｉ１０８Ｆ、Ｉ６７Ｖ／Ｓ７２Ｇ／Ｑ８２Ｈ／Ｔ８９Ａ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｓ７２Ｇ／Ｒ８５Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ、Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｉ１１７Ｔ、Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ／Ｉ１１７Ｔ、Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ／Ｙ１１５Ｎ、Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ９８Ｒ／Ｎ１１０Ｋ、Ｔ８９Ａ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ／Ｙ１１５Ｎ／Ｅ１２０Ｄ／Ｃ１２２Ｐ／Ｄ１２４Ｐ／Ｓ１２５Ｉ／Ｄ１２６Ｐ、Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｔ７１Ａ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｄ１２４Ｉ／Ｓ１２５Ｐ／Ｄ１２６Ｔ、Ｒ１６Ｇ／Ｅ３３Ｍ／Ｎ５８Ｓ／Ｅ５９Ｇ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｅ１２０Ｄ／Ｃ１２２Ｐ／Ｄ１２４Ｐ／Ｓ１２５Ｉ／Ｄ１２６Ｐ、Ｇ２９Ｗ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｐ１２１Ｓ／Ｄ１２６Ｔ、Ｌ１２Ｈ／Ｅ３３Ｍ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｉ１８Ｔ／Ａ２６Ｔ／Ｍ５５Ｔ／Ｍ５６Ｋ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｉ１８Ｔ／Ａ２６Ｔ／Ｍ５６Ｋ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｔ５３Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ、Ｔ５３Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｙ１０５Ｌ、Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ、Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｙ１０５Ｌ、Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｎ５８Ｓ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ
１０５Ｌ、Ｔ５３Ｓ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｍ５６Ｋ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｅ３３Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｅ３３Ｖ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｅ３３Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ、Ｅ３３Ｖ／Ｍ９９Ｌ、Ｌ１２Ｆ／Ｒ１６Ｈ／Ｇ２９Ｗ／Ｍ５６Ｔ／Ｌ９８Ｑ、Ｌ１２Ｆ／Ｒ１６Ｈ／Ｇ２９Ｗ／Ｍ５６Ｔ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１２Ｆ／Ｒ１６Ｈ／Ｇ２９Ｗ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１２Ｆ／Ｒ１６Ｈ／Ｍ５６Ｔ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｍ５６Ｔ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１２Ｆ／Ｇ２９Ｗ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１２Ｆ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｒ１６Ｈ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｍ５６Ｔ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１２Ｆ／Ｒ１６Ｈ／Ｇ２９Ｗ／Ｍ５６Ｔ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｍ５６Ｔ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、およびＩ１８Ｔ／Ｔ６１Ｒ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｐ１０２Ｌ／Ｙ１０５Ｌの中から選択される１つ以上のアミノ酸改変を含む、実施形態１〜１５のうちのいずれかの変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
１７．ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：４〜９７、９９〜１０４、１０６〜１５５、もしくは５７０〜６３７のうちのいずれかに記載のアミノ酸の配列、またはその特異的結合断片、あるいはＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：４〜９７、９９〜１０４、１０６〜１５５、もしくは５７０〜６３７のうちのいずれかと少なくとも９５％の配列同一性を示し、かつアミノ酸改変のうちの１つ以上を含有するアミノ酸の配列、またはその特異的結合断片を含む、実施形態１〜１６のうちのいずれかの変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
１８．変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドが、ＩＣＯＳＬの外部ドメインに対し、同じ外部ドメインに対する非改変ＣＴＬＡ−４の結合と比較して増加した親和性で、特異的に結合する、実施形態３〜１７のうちのいずれかの変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
１９．１つ以上のアミノ酸改変が、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２に記載の位置に関して、１０、１２、１６、１８、１９、２６、２８、２９、３３、３５、３８、４２、４５、４７、５３、５５、５６、５８、６１、６３、６４、６５、６７、６９、７２、７６，８２、８５、８７、８９、９３、９７、９８、９９、１０５、１０６、１０８、１１０、１１３、１１６、１１７、または１２１の中から選択される位置に対応する位置にある、実施形態１〜１８のうちのいずれかの変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
２０．１つ以上のアミノ酸改変が、Ｖ１０Ａ、Ｌ１２Ｆ、Ｌ１２Ｉ、Ｌ１２Ｐ、Ｒ１６Ｈ、Ｉ１８Ｆ、Ｉ１８Ｎ、Ｉ１８Ｔ、Ｉ１８Ｖ、Ａ１９Ｖ、Ａ２６Ｔ、Ｐ２８Ｌ、Ｇ２９Ｗ、Ｅ３３Ｍ、Ｅ３３Ｖ、Ｒ３５Ｋ、Ｖ３８Ｉ、Ａ４２Ｖ、Ｑ４５Ｈ、Ｔ４７Ａ、Ｔ５３Ｓ、Ｍ５５Ｔ、Ｍ５６Ｋ、Ｍ５６Ｔ、Ｍ５６Ｖ、Ｎ５８Ｄ、Ｎ５８Ｓ、Ｔ６１Ａ、Ｔ６１Ｒ、Ｌ６３Ｈ、Ｌ６３Ｐ、Ｄ６４Ｅ、Ｄ６４Ｎ、Ｄ６４Ｖ、Ｄ６５Ｇ、Ｉ６７Ｎ、Ｉ６７Ｔ、Ｉ６７Ｖ、Ｔ６９Ａ、Ｔ６９Ｉ、Ｓ７２Ｇ、Ｑ７６Ｒ、Ｑ８２Ｈ、Ｑ８２Ｒ、Ｒ８５Ｇ、Ｍ８７Ｋ、Ｍ８７Ｔ、Ｍ８７Ｖ、Ｔ８９Ａ、Ｔ８９Ｓ、Ｉ９３Ｌ、Ｉ９３Ｖ、Ｅ９７Ｑ、Ｌ９８Ｑ、Ｍ９９Ｉ、Ｍ９９Ｌ、Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１０６Ｉ、Ｌ１０６Ｒ、Ｉ１０８Ｆ、Ｉ１０８Ｖ、Ｎ１１０Ｋ、Ｑ１１３Ｈ、Ｖ１１６Ａ、Ｉ１１７Ｌ、およびＰ１２１Ｓの中から選択される、実施形態１〜１９のうちのいずれかの変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
２１．１つ以上のアミノ酸改変が、Ｖ１０Ａ、Ｌ１２Ｆ、Ｌ１２Ｉ、Ｒ１６Ｈ、Ｉ１８Ｎ、Ｉ１８Ｔ、Ｉ１８Ｖ、Ａ１９Ｖ、Ａ２６Ｔ、Ｇ２９Ｗ、Ｅ３３Ｍ、Ｅ３３Ｖ、Ｒ３５Ｋ、Ｖ３８Ｉ、Ａ４２Ｖ、Ｑ４５Ｈ、Ｔ４７Ａ、Ｔ５３Ｓ、Ｍ５５Ｔ、Ｍ５６Ｋ、Ｍ５６Ｖ、Ｎ５８Ｄ、Ｎ５８Ｓ、Ｔ６１Ａ、Ｔ６１Ｒ、Ｌ６３Ｈ、Ｌ６３Ｐ、Ｄ６４Ｅ、Ｄ６４Ｎ、Ｄ６４Ｖ、Ｄ６５Ｇ、Ｉ６７Ｎ、Ｉ６７Ｔ、Ｉ６７Ｖ、Ｔ６９Ｉ、Ｓ７２Ｇ、Ｑ７６Ｒ、Ｑ８２Ｈ、Ｑ８２Ｒ、Ｒ８５Ｇ、Ｍ８７Ｋ、Ｍ８７Ｔ、Ｍ８７Ｖ、Ｔ８９Ａ、Ｔ８９Ｓ、Ｉ９３Ｌ、Ｉ９３Ｖ、Ｅ９７Ｑ、Ｌ９８Ｑ、Ｍ９９Ｉ、Ｍ９９Ｌ、Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１０６Ｉ、Ｌ１０６Ｒ、Ｉ１０８Ｆ、Ｉ１０８Ｖ、Ｎ１１０Ｋ、Ｑ１１３Ｈ、Ｉ１１７Ｌ、およびＰ１２１Ｓ、またはそれらの保存的アミノ酸置換から選択される、実施形態１〜１９のうちのいずれかの変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
２２．１つ以上のアミノ酸改変が、Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ／Ｉ１１７Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｍ５５Ｔ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ６３Ｐ／Ｑ８２Ｈ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｉ１８Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｔ６１Ａ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｖ３８Ｉ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｉ９３Ｌ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１２Ｉ／Ｍ５５Ｔ／Ｍ５６Ｖ／Ｉ６７Ｔ／Ｍ９９Ｌ／Ｌ１０６Ｒ／Ｉ１０８Ｆ、Ｉ１８Ｎ／Ａ２６Ｔ／Ｌ６３Ｈ／Ｔ８９Ａ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｔ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｄ６４Ｎ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｉ１８Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｍ８７Ｋ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｋ／Ｍ９９Ｌ／Ｌ１０６Ｒ、Ｌ６３Ｐ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｉ１０８Ｆ、Ｇ２９Ｗ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ａ２６Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｄ６５Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｖ１０Ａ／Ｌ６３Ｐ／Ｄ６４Ｖ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｉ１８Ｖ／Ａ２６Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｄ６４Ｅ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｒ／Ｎ１１０Ｋ、Ａ１９Ｖ／Ｇ２９Ｗ／Ｒ３５Ｋ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｔ６９Ｉ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１２Ｆ／Ｒ１６Ｈ／Ｇ２９Ｗ／Ｍ５６Ｔ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ａ２６Ｔ／Ｔ５３Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ／Ｉ１１７Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｓ７２Ｇ／Ｑ７６Ｒ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ／Ｑ１１３Ｈ、Ｇ２９Ｗ／Ｎ５８Ｄ／Ｉ６７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｉ６７Ｖ／Ｓ７２Ｇ／Ｑ８２Ｈ／Ｔ８９Ａ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｓ７２Ｇ／Ｒ８５Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ、Ａ２６Ｔ／Ｔ４７Ａ／Ｍ５６Ｋ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｑ８２Ｒ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ａ２６Ｔ／Ｍ５５Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｍ８７Ｋ／Ｉ９３Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｌ６３Ｐ／Ｑ８２Ｈ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｉ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｉ１０８Ｖ、Ａ２６Ｔ／Ａ４２Ｖ／Ｑ４５Ｈ／Ｉ６７Ｎ／Ｍ８７Ｋ／Ｅ９７Ｑ／Ｍ９９Ｌ、Ｅ３３Ｍ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｍ８７Ｋ／Ｔ８９Ｓ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｉ１０８Ｖ／Ｉ１１７Ｌ、Ｉ１８Ｔ／Ｔ６１Ｒ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｅ３３Ｍ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｉ１０８Ｆ、Ｇ２９Ｗ／Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｐ１２１Ｓ、Ｇ２９Ｗ／Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｉ１０８Ｖ、Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｉ１８Ｔ／Ａ２６Ｔ／Ｍ５５Ｔ／Ｍ５６Ｋ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｉ１８Ｔ／Ａ２６Ｔ／Ｍ５６Ｋ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｔ５３Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ、Ｔ５３Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｙ１０５Ｌ、Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｅ３３Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｅ３３Ｖ／Ｍ９９Ｌ、Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ、Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｎ５８Ｓ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｔ５３Ｓ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｍ５６Ｋ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｅ３３Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ、Ｌ１２Ｆ／Ｒ１６Ｈ／Ｇ２９Ｗ／Ｍ５６Ｔ／Ｙ１０５Ｌ、またはＬ１２Ｆ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌである、実施形態１〜２１のうちのいずれかの変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。いくつかの実施形態では、アミノ酸置換は、Ｇ２９Ｗ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ６３Ｐ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｉ１０８Ｆ、Ｉ１８Ｖ／Ａ２６Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｄ６４Ｅ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｒ／Ｎ１１０Ｋ、Ｇ２９Ｗ／Ｎ５８Ｄ／Ｉ６７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｉ６７Ｖ／Ｓ７２Ｇ／Ｑ８２Ｈ／Ｔ８９Ａ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｓ７２Ｇ／Ｒ８５Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ、Ｇ２９Ｗ／Ｍ８７Ｋ／Ｉ９３Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｌ６３Ｐ／Ｑ８２Ｈ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｉ／Ｙ１０５Ｌ、Ａ２６Ｔ／Ａ４２Ｖ／Ｑ４５Ｈ／Ｉ６７Ｎ／Ｍ８７Ｋ／Ｅ９７Ｑ／Ｍ９９Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｍ８７Ｋ／Ｔ８９Ｓ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｉ１０８Ｖ／Ｉ１１７Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｉ１０８Ｖ、Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｉ１８Ｔ／Ａ２６Ｔ／Ｍ５５Ｔ／Ｍ５６Ｋ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｉ１８Ｔ／Ａ２６Ｔ／Ｍ５６Ｋ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｔ５３Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ、Ｔ５３Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｙ１０５Ｌ、Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｅ３３Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｅ３３Ｖ／Ｍ９９Ｌ、Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｎ５８Ｓ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｔ５３Ｓ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｍ５６Ｋ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｅ３３Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ、またはＬ１２Ｆ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌである。
２３．１つ以上のアミノ酸改変が、位置１２、２６、６３、９８、もしくは１０５に対応する位置に１つ以上の改変を含み、かつ／または１つ以上のアミノ酸改変が、Ｌ１２Ｐ、Ｌ１２Ｆ、Ａ２６Ｔ、Ｌ６３Ｐ、Ｌ９８Ｑ、もしくはＹ１０５Ｌから選択される１つ以上の改変を含む、実施形態１〜２０のうちのいずれかの変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
２４．１つ以上のアミノ酸改変が、Ｌ１２Ｐ／Ａ２６Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ａ２６Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｍ５５Ｔ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ６３Ｐ／Ｑ８２Ｈ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｉ１８Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｔ６１Ａ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｖ３８Ｉ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｉ９３Ｌ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１２Ｉ／Ｍ５５Ｔ／Ｍ５６Ｖ／Ｉ６７Ｔ／Ｍ９９Ｌ／Ｌ１０６Ｒ／Ｉ１０８Ｆ、Ｉ１８Ｎ／Ａ２６Ｔ／Ｌ６３Ｈ／Ｔ８９Ａ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｔ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｄ６４Ｎ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｉ１８Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｍ８７Ｋ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｋ／Ｍ９９Ｌ／Ｌ１０６Ｒ、Ｌ６３Ｐ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｉ１０８Ｆ、Ｇ２９Ｗ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ａ２６Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｄ６５Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｖ１０Ａ／Ｌ６３Ｐ／Ｄ６４Ｖ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｉ１８Ｖ／Ａ２６Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｄ６４Ｅ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｒ／Ｎ１１０Ｋ、Ａ１９Ｖ／Ｇ２９Ｗ／Ｒ３５Ｋ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｔ６９Ｉ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ６３Ｐ／Ｔ６９Ａ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｒ／Ｖ１１６Ａ、Ｇ２９Ｗ／Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｉ１１７Ｌ、Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ／Ｉ１１７Ｌ、Ｌ１２Ｆ／Ｒ１６Ｈ／Ｇ２９Ｗ／Ｍ５６Ｔ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ａ２６Ｔ／Ｔ５３Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ／Ｉ１１７Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｓ７２Ｇ／Ｑ７６Ｒ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ／Ｑ１１３Ｈ、Ｇ２９Ｗ／Ｎ５８Ｄ／Ｉ６７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｉ６７Ｖ／Ｓ７２Ｇ／Ｑ８２Ｈ／Ｔ８９Ａ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｓ７２Ｇ／Ｒ８５Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ、Ａ２６Ｔ／Ｔ４７Ａ／Ｍ５６Ｋ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｑ８２Ｒ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ａ２６Ｔ／Ｍ５５Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｍ８７Ｋ／Ｉ９３Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｐ２８Ｌ／Ｅ３３Ｖ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｌ６３Ｐ／Ｑ８２Ｈ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｉ／Ｙ１０５Ｌ、Ｉ１８Ｆ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｐ１２１Ｓ、Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｉ１０８Ｖ、Ａ２６Ｔ／Ａ４２Ｖ／Ｑ４５Ｈ／Ｉ６７Ｎ／Ｍ８７Ｋ／Ｅ９７Ｑ／Ｍ９９Ｌ、Ｅ３３Ｍ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｍ８７Ｋ／Ｔ８９Ｓ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｉ１０８Ｖ／Ｉ１１７Ｌ、Ｉ１８Ｔ／Ｔ６１Ｒ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｅ３３Ｍ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｉ１０８Ｆ、Ｇ２９Ｗ／Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｐ１２１Ｓ、Ｇ２９Ｗ／Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、およびＧ２９Ｗ／Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｉ１０８Ｖの中から選択される、実施形態１〜２３のうちのいずれかの変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
２５．ＣＤ８０の外部ドメインに対し、同じ外部ドメインに対する非改変ＣＴＬＡ−４の結合と比較して増加した親和性で、特異的に結合する、実施形態３〜１７のうちのいずれかの変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
２６．１つ以上のアミノ酸改変が、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２に記載の位置に関して、１０、１２、１６、１８、２６、２９、４２、４５、５３、５６、５８、６３、６７、７２、８２、８７、９７、９８、９９、１０５、１０８、または１２１の中から選択される位置に対応する位置にある、実施形態３〜１７、および２５のうちのいずれかの変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
２７．１つ以上のアミノ酸改変が、Ｖ１０Ａ、Ｌ１２Ｆ、Ｒ１６Ｈ、Ｉ１８Ｔ、Ａ２６Ｔ、Ｇ２９Ｗ、Ｅ３３Ｖ、Ａ４２Ｖ、Ｑ４５Ｈ、Ｔ５３Ｓ、Ｍ５５Ｔ、Ｍ５６Ｋ、Ｍ５６Ｔ、Ｎ５８Ｓ、Ｌ６３Ｐ、Ｉ６７Ｎ、Ｑ８２Ｒ、Ｍ８７Ｋ、Ｍ８７Ｖ、Ｅ９７Ｑ、Ｌ９８Ｑ、Ｍ９９Ｌ、Ｙ１０５Ｌ、Ｉ１０８Ｖ、またはそれらの保存的アミノ酸置換から選択される、実施形態３〜１７、２５、および２６のうちのいずれかの変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
２８．１つ以上のアミノ酸改変が、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２に記載の位置に関して、Ｖ１０Ａ、Ｌ１２Ｆ、Ｒ１６Ｈ、Ｉ１８Ｔ、Ａ２６Ｄ、Ａ２６Ｔ、Ｇ２９Ｗ、Ａ４２Ｖ、Ｑ４５Ｈ、Ｔ５３Ｓ、Ｍ５６Ｋ、Ｍ５６Ｔ、Ｎ５８Ｓ、Ｌ６３Ｐ、Ｉ６７Ｎ、Ｓ７２Ｇ、Ｑ８２Ｒ、Ｍ８７Ｋ、Ｍ８７Ｖ、Ｅ９７Ｑ、Ｌ９８Ｑ、Ｍ９９Ｌ、Ｙ１０５Ｌ、Ｉ１０８Ｖ、またはＰ１２１Ｓの中から選択される位置に対応する位置にある、実施形態３〜１７、２５、および２６のうちのいずれかの変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
２９．１つ以上のアミノ酸改変が、Ｉ１８Ｔ／Ｇ２９Ｗ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ａ２６Ｄ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｑ８２Ｒ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１２Ｆ／Ｒ１６Ｈ／Ｇ２９Ｗ／Ｍ５６Ｔ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ａ２６Ｔ／Ａ４２Ｖ／Ｑ４５Ｈ／Ｉ６７Ｎ／Ｍ８７Ｋ／Ｅ９７Ｑ／Ｍ９９Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｐ１２１Ｓ、Ｇ２９Ｗ／Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｉ１０８Ｖ、およびＶ１０Ａ／Ｇ２９Ｗ／Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｐ１２１Ｓの中から選択される、実施形態３〜１７、および２５〜２８のうちのいずれかの変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
３０．１つ以上のアミノ酸改変が、Ｉ１８Ｔ／Ｇ２９Ｗ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｑ８２Ｒ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１２Ｆ／Ｒ１６Ｈ／Ｇ２９Ｗ／Ｍ５６Ｔ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ａ２６Ｔ／Ａ４２Ｖ／Ｑ４５Ｈ／Ｉ６７Ｎ／Ｍ８７Ｋ／Ｅ９７Ｑ／Ｍ９９Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｐ１２１Ｓ、Ｇ２９Ｗ／Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｉ１０８Ｖ、Ｖ１０Ａ／Ｇ２９Ｗ／Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｐ１２１Ｓ、Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｉ１８Ｔ／Ａ２６Ｔ／Ｍ５５Ｔ／Ｍ５６Ｋ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｅ３３Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｅ３３Ｖ／Ｍ９９Ｌ、Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｎ５８Ｓ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｔ５３Ｓ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｍ５６Ｋ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｅ３３Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ、Ｌ１２Ｆ／Ｒ１６Ｈ／Ｇ２９Ｗ／Ｍ５６Ｔ／Ｌ９８Ｑ、Ｌ１２Ｆ／Ｒ１６Ｈ／Ｇ２９Ｗ／Ｍ５６Ｔ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１２Ｆ／Ｒ１６Ｈ／Ｇ２９Ｗ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１２Ｆ／Ｒ１６Ｈ／Ｍ５６Ｔ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｍ５６Ｔ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１２Ｆ／Ｇ２９Ｗ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１２Ｆ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｒ１６Ｈ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、またはＭ５６Ｔ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌの中から選択される、実施形態３〜１７、および２５〜２８のうちのいずれかの変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
３１．１つ以上のアミノ酸改変が、Ｉ１８Ｔ／Ｇ２９Ｗ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｑ８２Ｒ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ａ２６Ｔ／Ａ４２Ｖ／Ｑ４５Ｈ／Ｉ６７Ｎ／Ｍ８７Ｋ／Ｅ９７Ｑ／Ｍ９９Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｐ１２１Ｓ、Ｇ２９Ｗ／Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｉ１０８Ｖ、Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、
Ｅ３３Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｎ５８Ｓ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、およびＥ３３Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌの中から選択される、実施形態３〜１７、２５〜２８、および３０のうちのいずれかの変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
３２．ＩＣＯＳＬおよびＣＤ８０の外部ドメインに対し、同じ外部ドメインに対する非改変ＣＴＬＡ−４の結合と比較して増加した親和性で、特異的に結合する、実施形態１〜２９のうちのいずれかの変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
３３．１つ以上のアミノ酸改変が、Ｖ１０Ａ、Ｌ１２Ｆ、Ｒ１６Ｈ、Ｉ１８Ｔ、Ａ２６Ｔ、Ｇ２９Ｗ、Ｅ３３Ｖ、Ａ４２Ｖ、Ｑ４５Ｈ、Ｔ５３Ｓ、Ｍ５５Ｔ、Ｍ５６Ｋ、Ｎ５８Ｓ、Ｌ６３Ｐ、Ｉ６７Ｎ、Ｑ８２Ｒ、Ｍ８７Ｋ、Ｍ８７Ｖ、Ｅ９７Ｑ、Ｌ９８Ｑ、Ｍ９９Ｌ、Ｙ１０５Ｌ、Ｉ１０８Ｖ、またはそれらの保存的アミノ酸置換から選択される、実施形態１〜３２のうちのいずれかの変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
３４．１つ以上のアミノ酸改変が、Ｉ１８Ｔ、Ａ２６Ｔ、Ｇ２９Ｗ、Ｅ３３Ｖ、Ｑ４５Ｈ、Ｔ５３Ｓ、Ｍ５６Ｋ、Ｎ５８Ｓ、Ｌ６３Ｐ、Ｉ６７Ｎ、Ｑ８２Ｒ、Ｍ８７Ｋ、Ｍ８７Ｖ、Ｅ９７Ｑ、Ｌ９８Ｑ、Ｍ９９Ｌ、Ｙ１０５Ｌ、Ｉ１０８Ｖから選択される、実施形態１〜３３のうちのいずれかの変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
３５．ＣＤ８６の外部ドメインに対し、同じ外部ドメインに対する非改変ＣＴＬＡ−４の結合と比較して増加した親和性で、特異的に結合する、実施形態３〜１７のうちのいずれかの変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
３６．１つ以上のアミノ酸改変が、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２に記載の位置に関して、１０、１２、１６、１８、２０、２６、２８、２９、３０、３３、４２、４７、５３、５５、５６、５８、５９、６１、６３、６５、６７、６９，７２、７６、８２、８５、８７、８９、９３、９６、９８、９９、１０２、１０５、１０６、１０８、１１３、１１５、１１６、１１７、または１２１の中から選択される位置に対応する位置にある、実施形態３〜１７、および３５のうちのいずれかの変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
３７．１つ以上のアミノ酸改変が、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２に記載の位置に関して、Ｖ１０Ａ、Ｌ１２Ｆ、Ｌ１２Ｈ、Ｌ１２Ｐ、Ｒ１６Ｈ、Ｉ１８Ｔ、Ｉ１８Ｖ、Ｓ２０Ｎ、Ａ２６Ｓ、Ａ２６Ｔ、Ｐ２８Ｌ、Ｇ２９Ｒ、Ｇ２９Ｗ、Ｋ３０Ｒ、Ｅ３３Ｍ、Ｅ３３Ｖ、Ａ４２Ｓ、Ａ４２Ｔ、Ｔ４７Ａ、Ｔ５３Ｓ、Ｍ５５Ｔ、Ｍ５６Ｋ、Ｍ５６Ｒ、Ｍ５６Ｔ、Ｍ５６Ｖ、Ｎ５８Ｄ、Ｎ５８Ｓ、Ｅ５９Ｇ、Ｔ６１Ｉ、Ｔ６１Ｎ、Ｔ６１Ｒ、Ｔ６１Ｓ、Ｌ６３Ｐ、Ｄ６５Ｇ、Ｉ６７Ｎ、Ｉ６７Ｖ、Ｔ６９Ａ、Ｔ６９Ｉ、Ｓ７２Ｇ、Ｑ７６Ｒ、Ｑ８２Ｈ、Ｑ８２Ｒ、Ｒ８５Ｇ、Ｍ８７Ｋ、Ｍ８７Ｖ、Ｔ８９Ａ、Ｔ８９Ｍ、Ｔ８９Ｓ、Ｉ９３Ｖ、Ｖ９６Ｉ、Ｌ９８Ｑ、Ｌ９８Ｒ、Ｍ９９Ｌ、Ｐ１０２Ｌ、Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１０６Ｉ、Ｌ１０６Ｎ、Ｌ１０６Ｒ、Ｌ１０６Ｖ、Ｉ１０８Ｆ、Ｉ１０８Ｖ、Ｑ１１３Ｈ、Ｙ１１５Ｈ、Ｖ１１６Ａ、Ｉ１１７Ｅ、Ｉ１１７Ｌ、Ｉ１１７Ｋ、Ｉ１１７Ｔ、およびＰ１２１Ｓから選択される位置に対応する位置にある、実施形態３〜１７、３５、および３６のうちのいずれかの変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
３８．１つ以上のアミノ酸改変が、Ｌ１２Ｆ、Ｌ１２Ｈ、Ｌ１２Ｐ、Ｒ１６Ｈ、Ｉ１８Ｔ、Ｉ１８Ｖ、Ｓ２０Ｎ、Ａ２６Ｔ、Ｇ２９Ｒ、Ｇ２９Ｗ、Ｅ３３Ｍ、Ｅ３３Ｖ、Ａ４２Ｓ、Ａ４２Ｖ、Ｔ４７Ａ、Ｔ５３Ｓ、Ｍ５５Ｔ、Ｍ５６Ｋ、Ｍ５６Ｒ、Ｍ５６Ｔ、Ｍ５６Ｖ、Ｎ５８Ｄ、Ｎ５８Ｓ、Ｔ６１Ｉ、Ｔ６１Ｎ、Ｔ６１Ｒ、Ｔ６１Ｓ、Ｌ６３Ｐ、Ｄ６５Ｇ、Ｉ６７Ｎ、Ｉ６７Ｖ、Ｔ６９Ａ、Ｔ６９Ｉ、Ｓ７２Ｇ、Ｑ７６Ｒ、Ｑ８２Ｈ、Ｑ８２Ｒ、Ｒ８５Ｇ、Ｍ８７Ｋ、Ｍ８７Ｖ、Ｔ８９Ａ、Ｔ８９Ｍ、Ｔ８９Ｓ、Ｖ９６Ｉ、Ｌ９８Ｑ、Ｌ９８Ｒ、Ｍ９９Ｌ、Ｐ１０２Ｌ、Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１０６Ｉ、Ｌ１０６Ｎ、Ｌ１０６Ｒ、Ｌ１０６Ｖ、Ｉ１０８Ｆ、Ｉ１０８Ｖ、Ｑ１１３Ｈ、Ｙ１１５Ｈ、Ｖ１１６Ａ、Ｉ１１７Ｌ、Ｉ１１７Ｔ、およびＰ１２１Ｓ、またはそれらの保存的アミノ酸置換から選択される、実施形態３〜１７、３５、および３６のうちのいずれかの変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
３９．１つ以上のアミノ酸改変が、Ｌ１２Ｐ／Ａ２６Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｉ１８Ｔ／Ｔ６１Ｒ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｐ１０２Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１２Ｐ／Ａ２６Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｔ８９Ｍ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、
Ｐ２８Ｌ／Ｅ３３Ｖ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｒ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｉ１８Ｔ／Ｇ２９Ｒ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｉ１１７Ｔ、Ｍ５６Ｒ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ、Ａ２６Ｔ／Ｍ５５Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｅ３３Ｖ／Ａ４２Ｓ／Ｍ５５Ｔ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｑ８２Ｒ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｅ３３Ｍ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｉ１１７Ｌ、Ａ２６Ｔ／Ｉ６７Ｎ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１２Ｆ／Ａ２６Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｒ、Ｓ２０Ｎ／Ａ２６Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｔ６１Ｉ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｔ６９Ｉ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１２Ｐ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｎ、
Ｌ６３Ｐ／Ｔ６９Ａ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｒ／Ｖ１１６Ａ、Ｇ２９Ｗ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｌ６３Ｐ／Ｄ６５Ｇ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｉ１８Ｖ／Ｇ２９Ｗ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ、Ｇ２９Ｗ／Ｌ６３Ｐ／Ｉ６７Ｖ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ／Ｉ１１７Ｌ、Ｌ１２Ｆ／Ｒ１６Ｈ／Ｇ２９Ｗ／Ｍ５６Ｔ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１２Ｐ／Ｇ２９Ｗ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、
Ｇ２９Ｗ／Ｓ７２Ｇ／Ｑ７６Ｒ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ／Ｑ１１３Ｈ、Ｇ２９Ｗ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｖ、Ａ２６Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｎ５８Ｄ／Ｉ６７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｉ６７Ｖ／Ｓ７２Ｇ／Ｑ８２Ｈ／Ｔ８９Ａ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｓ７２Ｇ／Ｒ８５Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ、Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ａ２６Ｔ／Ｔ４７Ａ／Ｍ５６Ｋ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｑ８２Ｒ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ａ２６Ｔ／Ｍ５５Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、
Ｌ１２Ｈ／Ｉ１８Ｖ／Ａ４２Ｔ／Ｍ５５Ｔ／Ｎ５８Ｄ／Ｌ９８Ｒ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ／Ｐ１２１Ｓ、Ｉ１８Ｔ／Ａ２６Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１２Ｆ／Ｋ３０Ｒ／Ｓ７２Ｇ／Ｑ８２Ｒ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１２Ｐ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｎ／Ｉ１１７Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｍ８７Ｋ／Ｉ９３Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｐ２８Ｌ／Ｅ３３Ｖ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｅ３３Ｍ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｍ５６Ｖ／Ｅ５９Ｇ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｍ８７Ｋ／Ｉ９３Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｉ１１７Ｅ、Ｇ２９Ｗ／Ｍ８７Ｋ／Ｔ８９Ｓ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｉ１０８Ｖ／Ｉ１１７Ｌ、Ｌ１２Ｐ／Ｍ５６Ｖ／Ｌ６３Ｐ／Ｖ９６Ｉ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｙ１１５Ｈ、
Ｇ２９Ｗ／Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｔ６１Ｎ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｉ１８Ｔ／Ａ２６Ｓ／Ｍ５５Ｔ／Ｍ５６Ｖ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｉ１１７Ｋ、Ｉ１８Ｔ／Ｔ６１Ｒ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１２Ｐ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｅ３３Ｍ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｉ１０８Ｆ、Ｌ１２Ｐ／Ｒ１６Ｈ／Ａ２６Ｔ／Ｔ６１Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ／Ｉ１１７Ｌ
Ｇ２９Ｗ／Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｐ１２１Ｓ、Ｇ２９Ｗ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｐ１２１Ｓ、およびＶ１０Ａ／Ｇ２９Ｗ／Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｐ１２１Ｓの中から選択される、実施形態３〜１７、および３５〜３８のうちのいずれかの変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
４０．１つ以上のアミノ酸改変が、Ｉ１８Ｔ／Ｔ６１Ｒ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｐ１０２Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１２Ｐ／Ａ２６Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｔ８９Ｍ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｉ１８Ｔ／Ｇ２９Ｒ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｉ１１７Ｔ、Ｍ５６Ｒ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ、Ａ２６Ｔ／Ｍ５５Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｅ３３Ｖ／Ａ４２Ｓ／Ｍ５５Ｔ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｑ８２Ｒ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｅ３３Ｍ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｉ１１７Ｌ、Ａ２６Ｔ／Ｉ６７Ｎ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１２Ｆ／Ａ２６Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｒ、Ｓ２０Ｎ／Ａ２６Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｔ６１Ｉ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｔ６９Ｉ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１２Ｐ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｎ、Ｌ６３Ｐ／Ｔ６９Ａ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｒ／Ｖ１１６Ａ、Ｇ２９Ｗ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｌ６３Ｐ／Ｄ６５Ｇ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ、Ｌ１２Ｆ／Ｒ１６Ｈ／Ｇ２９Ｗ／Ｍ５６Ｔ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｓ７２Ｇ／Ｑ７６Ｒ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ／Ｑ１１３Ｈ、Ｇ２９Ｗ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｖ、Ｇ２９Ｗ／Ｎ５８Ｄ／Ｉ６７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｉ６７Ｖ／Ｓ７２Ｇ／Ｑ８２Ｈ／Ｔ８９Ａ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｓ７２Ｇ／Ｒ８５Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ、Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ａ２６Ｔ／Ｔ４７Ａ／Ｍ５６Ｋ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｑ８２Ｒ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ａ２６Ｔ／Ｍ５５Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１２Ｈ／Ｉ１８Ｖ／Ａ４２Ｔ／Ｍ５５Ｔ／Ｎ５８Ｄ／Ｌ９８Ｒ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ／Ｐ１２１Ｓ、Ｅ３３Ｍ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｍ８７Ｋ／Ｔ８９Ｓ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｉ１０８Ｖ／Ｉ１１７Ｌ、Ｌ１２Ｐ／Ｍ５６Ｖ／Ｌ６３Ｐ／Ｖ９６Ｉ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｙ１１５Ｈ、Ｇ２９Ｗ／Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｔ６１Ｎ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｉ１８Ｔ／Ｔ６１Ｒ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１２Ｐ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｅ３３Ｍ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ／Ｉ１０８Ｆ、Ｌ１２Ｐ／Ｒ１６Ｈ／Ａ２６Ｔ／Ｔ６１Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ／Ｌ１０６Ｉ／Ｉ１１７Ｌ、Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌ、Ｔ５３Ｓ／Ｍ５６Ｋ／Ｎ５８Ｓ／Ｍ８７Ｖ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１２Ｆ／Ｒ１６Ｈ／Ｇ２９Ｗ／Ｍ５６Ｔ／Ｌ９８Ｑ、Ｌ１２Ｆ／Ｇ２９Ｗ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、またはＬ１２Ｆ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌの中から選択される、実施形態３〜１７、および３５〜３８のうちのいずれかの変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
４１．ＣＤ８０およびＣＤ８６の外部ドメインに対し、同じ外部ドメインに対する非改変ＣＴＬＡ−４の結合と比較して増加した親和性で、特異的に結合する、実施形態３〜１７、および２５〜４０のうちのいずれかの変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
４２．１つ以上のアミノ酸改変が、Ｉ１８Ｔ、Ａ２６Ｔ、Ｇ２９Ｗ、Ｅ３３Ｖ、Ａ４２Ｖ、Ｔ５３Ｓ、Ｎ５８Ｓ、Ｌ６３Ｐ、Ｉ６７Ｎ、Ｑ８２Ｒ、Ｍ８７Ｋ、Ｍ８７Ｖ、Ｌ９８Ｑ、Ｍ９９Ｌ、Ｙ１０５Ｌ、Ｉ１０８Ｖから選択される、実施形態３〜１７、および２５〜４１のうちのいずれかの変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
４３．ＩＣＯＳＬおよびＣＤ８６の外部ドメインに対し、同じ外部ドメインに対する非改変ＣＴＬＡ−４の結合と比較して増加した親和性で、特異的に結合する、実施形態１〜２４、および３５〜４０のうちのいずれかの変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
４４．１つ以上のアミノ酸改変が、Ｌ１２Ｆ、Ｒ１６Ｈ、Ｉ１８Ｔ、Ｉ１８Ｖ、Ａ２６Ｔ、Ｇ２９Ｗ、Ｅ３３Ｍ、Ｅ３３Ｖ、Ａ４２Ｖ、Ｔ４７Ａ、Ｔ５３Ｓ、Ｍ５５Ｔ、Ｍ５６Ｋ、Ｍ５６Ｖ、Ｎ５８Ｄ、Ｎ５８Ｓ、Ｔ６１Ｒ、Ｌ６３Ｐ、Ｄ６５Ｇ、Ｉ６７Ｎ、Ｉ６７Ｖ、Ｔ６９Ｉ、Ｓ７２Ｇ、Ｑ７６Ｒ、Ｑ８２Ｈ、Ｑ８２Ｒ、Ｒ８５Ｇ、Ｍ８７Ｋ、Ｍ８７Ｖ、Ｔ８９Ａ、Ｔ８９Ｓ、Ｌ９８Ｑ、Ｍ９９Ｌ、Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１０６Ｉ、Ｌ１０６Ｒ、Ｉ１０８Ｆ、Ｉ１０８Ｖ、Ｑ１１３Ｈ、Ｉ１１７Ｌ、およびＰ１２１Ｓ、またはそれらの保存的アミノ酸置換から選択される、実施形態１〜２４、および３５〜４０、ならびに４３のうちのいずれかの変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
４５．１つ以上のアミノ酸改変が、Ｌ１２Ｆ、Ｒ１６Ｈ、Ｉ１８Ｔ、Ｉ１８Ｖ、Ａ２６Ｔ、Ｇ２９Ｗ、Ｅ３３Ｖ、Ａ４２Ｖ、Ｔ４７Ａ、Ｔ５３Ｓ、Ｍ５５Ｔ、Ｍ５６Ｋ、Ｎ５８Ｄ、Ｎ５８Ｓ、Ｌ６３Ｐ、Ｉ６７Ｎ、Ｉ６７Ｖ、Ｓ７２Ｇ、Ｑ８２Ｈ、Ｑ８２Ｒ、Ｒ８５Ｇ、Ｍ８７Ｋ、Ｍ８７Ｖ、Ｔ８９Ａ、Ｔ８９Ｓ、Ｌ９８Ｑ、Ｍ９９Ｌ、Ｙ１０５Ｌ、Ｌ１０６Ｉ、Ｌ１０６Ｒ、Ｉ１０８Ｆ、Ｉ１０８Ｖ、およびＩ１１７Ｌから選択される、実施形態１〜２４、および３５〜４０、４３、ならびに４４のうちのいずれかの変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
４６．ＩＣＯＳＬ、ＣＤ８０、およびＣＤ８６の外部ドメインに対し、同じ外部ドメインに対する非改変ＣＴＬＡ−４の結合と比較して増加した親和性で、特異的に結合する、実施形態１〜４３のうちのいずれかの変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
４７．１つ以上のアミノ酸改変が、Ｌ１２Ｆ、Ｒ１６Ｈ、Ｉ１８Ｔ、Ａ２６Ｔ、Ｇ２９Ｗ、Ｅ３３Ｖ、Ａ４２Ｖ、Ｔ５３Ｓ、Ｍ５５Ｔ、Ｍ５６Ｋ、Ｎ５８Ｓ、Ｌ６３Ｐ、Ｉ６７Ｎ、Ｑ８２Ｒ、Ｍ８７Ｋ、Ｍ８７Ｖ、Ｌ９８Ｑ、Ｍ９９Ｌ、Ｙ１０５Ｌ、またはＩ１０８Ｖから選択される、実施形態１〜４６のうちのいずれかの変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
４８．１つ以上のアミノ酸改変が、Ａ２６Ｔ、Ｇ２９Ｗ、Ｔ５３Ｓ、Ｍ５６Ｋ、Ｎ５８Ｓ、Ｌ６３Ｐ、Ｌ９８Ｑ、Ｍ９９Ｌ、またはＹ１０５Ｌから選択される、実施形態１〜４７のうちのいずれかの変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
４９．１つ以上のアミノ酸改変が、Ｇ２９Ｗ、Ｌ６３Ｐ、Ｌ９８Ｑ、Ｍ９９Ｌ、またはＹ１０５Ｌから選択される、実施形態１〜４８のうちのいずれかの変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
５０．１つ以上のアミノ酸改変が、Ｇ２９Ｗ／Ｌ６３Ｐ、Ｇ２９Ｗ／Ｌ９８Ｑ、Ｇ２９Ｗ／Ｍ９９Ｌ、Ｇ２９Ｗ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ、Ｌ６３Ｐ／Ｍ９９Ｌ、Ｌ６３Ｐ／Ｙ１０５Ｌ、Ｌ９８Ｑ／Ｍ９９Ｌ、Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、またはＭ９９Ｌ／Ｙ１０５Ｌから選択される改変を含む、実施形態１〜４９のうちのいずれかの変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
５１．アミノ酸改変が、Ｇ２９Ｗ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌである、実施形態１〜５０のうちのいずれかの変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
５２．アミノ酸改変が、Ｇ２９Ｗ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｑ８２Ｒ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌである、実施形態１〜５１のうちのいずれかの変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
５３．アミノ酸改変が、Ｌ１２Ｐ／Ｇ２９Ｗ／Ｌ６３Ｐ／Ｓ７２Ｇ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌである、実施形態１〜５１のうちのいずれかの変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
５４．同じ外部ドメインに対する非改変ＣＴＬＡ−４の結合と比較して、増加した親和性でＩＣＯＳＬの外部ドメインに特異的に結合し、かつ減少した親和性でＣＤ８０またはＣＤ８６の他方のうちの１つ以上の外部ドメインに特異的に結合する、実施形態３〜２４のうちのいずれかの変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
５５．１つ以上の外部ドメインに対する結合親和性の増加が、独立して、１．２倍超、１．５倍、２倍、３倍、４倍、５倍、６倍、７倍、８倍、９倍、１０倍、２０倍、３０倍、４０倍、５０倍、１００倍またはそれ以上である、実施形態１、および１３〜５４のうちのいずれかの変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
５６．１つ以上の外部ドメインに対する結合親和性の減少が、独立して、１．２倍超、１．５倍、２倍、３倍、４倍、５倍、６倍、７倍、８倍、９倍、１０倍、２０倍、３０倍、４０倍、５０倍、１００倍またはそれ以上である、実施形態５４の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
５７．ＩｇＶドメインまたはその特異的結合断片を含む、実施形態１〜５６のうちのいずれかの変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
５８．ＩｇＶドメインまたはその特異的結合断片が、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドのＣＴＬＡ−４部分のみである、実施形態５７の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
５９．ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１５６〜２８５、６０３〜６３５、もしくは６３７のうちのいずれかに記載のアミノ酸の配列、またはその特異的結合断片、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１５６〜２８５、６０３〜６３５、もしくは６３７のうちのいずれかと少なくとも９５％の配列同一性を示し、かつＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１５６〜２８５、６０３〜６３５、または６３７のうちのいずれかに記載されるそれぞれの配列番号のアミノ酸改変のうちの１つ以上を含有する、アミノ酸の配列、またはその特異的結合断片を含む、実施形態１〜５８のうちのいずれかの変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
６０．ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：４〜９７、９９〜１０４、１０６〜１５５、５６９〜６０２、もしくは６３６のうちのいずれかに記載の細胞外ドメインのアミノ酸の配列、またはその特異的結合断片、あるいはＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：４〜９７、９９〜１０４、１０６〜１５５、５６９〜６０２、もしくは６３のうちのいずれかと少なくとも９５％の配列同一性を示し、かつＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：４〜９７、９９〜１０４、１０６〜１５５、５６９〜６０２、もしくは６３６のうちのいずれかに記載のそれぞれの配列番号のアミノ酸改変のうちの１つ以上を含有する、アミノ酸の配列を含む、実施形態１〜５７、または５９のうちのいずれかの変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
６１．ＩＣＯＳＬが、ヒトＩＣＯＳＬである、実施形態１、および１３〜５９のうちのいずれかの変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
６２．ＣＤ８０が、ヒトＣＤ８０である、実施形態１３〜５９のうちのいずれかの変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
６３．ＣＤ８６が、ヒトＣＤ８６である、実施形態１３〜５９のうちのいずれかの変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
６４．可溶性タンパク質である、実施形態１〜６３のうちのいずれかの変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
６５．変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドが、ＣＴＬＡ−４膜貫通ドメインおよび細胞内シグナル伝達ドメインを欠いており、かつ／または変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドが、細胞の表面上に発現されることができない、実施形態１〜６４のうちのいずれかの変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
６６．多量体化ドメインに連結されている、実施形態１〜６５のうちのいずれかの変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
６７．多量体化ドメインが、エフェクター機能が減少したＦｃドメインまたはその変異型である、実施形態６６の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
６８．エフェクター機能が減少したＦｃドメインまたはその変異型に連結されている、実施形態１〜６７のうちのいずれかの変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
６９．
Ｆｃドメインが、哺乳動物、任意選択的に、ヒトであるか、または
変異型Ｆｃドメインが、哺乳動物、任意選択的に、ヒトである非改変Ｆｃドメインと比較して、１つ以上のアミノ酸改変を含む、実施形態６７または６８の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
７０．Ｆｃドメインまたはその変異型が、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：４３８〜４４２のうちのいずれかに記載のアミノ酸の配列、またはＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：４３８〜４４２のうちのいずれかと少なくとも８５％の配列同一性を示すアミノ酸の配列を含む、実施形態６７〜６９のうちのいずれかの変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
７１．Ｆｃドメインが、それぞれがＥＵ番号付けによる、Ｅ２３３Ｐ、Ｌ２３４Ａ、Ｌ２３４Ｖ、Ｌ２３５Ａ、Ｌ２３５Ｅ、Ｇ２３６ｄｅｌ、Ｇ２３７Ａ、Ｓ２６７Ｋ、Ｎ２９７Ｇ、Ｖ３０２Ｃ、およびＫ４４７ｄｅｌの中から選択される１つ以上のアミノ酸改変を含む、実施形態６７〜７０のうちのいずれかの変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
７２．Ｆｃドメインが、アミノ酸改変Ｌ２３４Ａ／Ｌ２３５Ｅ／Ｇ２３７Ａを含む、実施形態６７〜７１のうちのいずれかの変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
７３．Ｆｃドメインが、ＥＵ番号付けによるアミノ酸改変Ｃ２２０Ｓを含む、実施形態６７〜７２のうちのいずれかの変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
７４．リンカー、任意選択的に、Ｇ４Ｓリンカーを介して間接的に、多量体化ドメインまたはＦｃに連結されている、実施形態６７〜７３のうちのいずれかの変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
７５．ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２８６〜３７９、３８１〜３８６、もしくは３８８〜４３７のうちのいずれかに記載のアミノ酸の配列、またはＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２８６〜３７９、３８１〜３８６、もしくは３８８〜４３７のうちのいずれかと少なくとも８５％の配列同一性を示すアミノ酸の配列を含む、実施形態６７〜７４のうちのいずれかの変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
７６．変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドが、膜貫通ドメインをさらに含む膜貫通免疫調節タンパク質であり、任意選択的に、膜貫通ドメインが、直接または間接的に、変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドの細胞外ドメイン（ＥＣＤ）またはその特異的結合断片に連結されている、実施形態１〜６３のうちのいずれかの変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
７７．膜貫通ドメインが、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１の残基１６２〜１８２として記載されるアミノ酸の配列、またはＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１の残基１６２〜１８２と少なくとも８５％の配列同一性を示すその機能的変異型を含む、実施形態７６の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
７８．細胞質ドメインをさらに含み、任意選択的に、細胞質ドメインが、直接または間接的に、膜貫通ドメインに連結されている、実施形態７６または７７の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
７９．細胞質ドメインが、天然型ＣＴＬＡ−４細胞質ドメイン、細胞内シグナル伝達ドメインであるか、もしくはこれを含み、かつ／またはＩＴＩＭシグナル伝達モチーフを含む、実施形態７８の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
８０．細胞質ドメインが、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１の残基１８３〜２２３として記載されるアミノ酸の配列、またはＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１の残基１８３〜２２３と少なくとも８５％の配列同一性を示すその機能的変異型を含む、請求項７８または７９の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
８１．細胞質ドメインが、ＩＴＡＭシグナル伝達モチーフを含み、かつ／またはＣＤ３ゼータの細胞内シグナル伝達ドメインであるか、もしくはこれを含む、実施形態７８の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
８２．細胞質シグナル伝達ドメインを含まず、かつ／または細胞上に発現されたときに細胞内シグナルを仲介することも、調節することもできない、実施形態７６または７７の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
８３．インビトロ初代Ｔ細胞アッセイで、非改変ＣＴＬＡ−４ポリペプチドに対してＩＦＮ−ガンマ（インターフェロン−ガンマ）発現を減少させる、実施形態１〜８２のうちのいずれかの変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
８４．脱グリコシル化されている、実施形態１〜８３のうちのいずれかの変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド。
８５．直接、またはリンカーを介して間接的に、免疫グロブリンスーパーファミリー（ＩｇＳＦ）メンバーのＩｇＳＦドメインを含む第２のポリペプチドに連結されている、実施形態１〜８４のうちのいずれかの変異型ＣＴＬＡ−４を含む、免疫調節ポリペプチド。
８６．ＩｇＳＦドメインが、親和性改変ＩｇＳＦドメインであり、当該親和性改変ＩｇＳＦドメインが、ＩｇＳＦファミリーメンバーの非改変または野生型ＩｇＳＦドメインと比較して、１つ以上のアミノ酸改変を含む、実施形態８５の免疫調節タンパク質。
８７．親和性改変ＩｇＳＦドメインが、その同種結合パートナーのうちの１つ以上に対し、同じ１つ以上の同種結合パートナーとのＩｇＳＦファミリーメンバーの非改変または野生型ＩｇＳＦドメインの結合と比較して変化した結合を示す、実施形態８６の免疫調節ポリペプチド。
８８．ＩｇＳＦドメインが、その同種結合パートナーのうちの１つ以上に対し、同じ１つ以上の同種結合パートナーとの非改変または野生型ＩｇＳＦドメインの結合と比較して増加した結合を示す、実施形態８７の免疫調節ポリペプチド。
８９．変異型ＣＴＬＡ−４が、第１の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドであり、第２のポリペプチドのＩｇＳＦドメインが、実施形態１〜７５のうちのいずれかの第２の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドからのＩｇＳＦドメインであり、第１および第２の変異型ＣＴＬＡ−４が、同じであるか、または異なる、実施形態８５〜８８のうちのいずれかの免疫調節ポリペプチド。
９０．ＩｇＳＦファミリーメンバーのＩｇＳＦドメインまたはその親和性改変ＩｇＳＦドメインを含む第３のポリペプチドをさらに含み、当該親和性改変ＩｇＳＦドメインが、ＩｇＳＦファミリーメンバーの非改変または野生型ＩｇＳＦドメインと比較して、１つ以上のアミノ酸改変を含む、実施形態８５〜８９のうちのいずれかの免疫調節タンパク質。
９１．
第３のポリペプチドが、第１および／もしくは第２のポリペプチドと同じであるか、または
第３のポリペプチドが、第１および／または第２のポリペプチドとは異なる、実施形態９０の免疫調節タンパク質。
９２．ＩｇＳＦドメインまたはその親和性改変ＩｇＳＦドメイン、任意選択的に、第２または第３のポリペプチドのＩｇＳＦドメインまたはその親和性改変ＩｇＳＦドメインが、ＩｇＶドメインであるか、またはこれを含む、実施形態８５〜９１のうちのいずれかの免疫調節ポリペプチド。
９３．変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドが、ＩｇＶドメインであるか、またはこれを含む、実施形態８５〜９２のうちのいずれかの免疫調節ポリペプチド。
９４．変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド、または第２のポリペプチドのうちの少なくとも一方に連結されている多量体化ドメインをさらに含む、実施形態８５〜９３のうちのいずれかの免疫調節タンパク質。
９５．変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド、第２のポリペプチド、および／または第３のポリペプチドのうちの少なくとも１つに連結されている多量体化ドメインをさらに含む、実施形態９０〜９３のうちのいずれかの免疫調節タンパク質。
９６．多量体化ドメインが、エフェクター機能が減少したＦｃドメインまたはその変異型である、実施形態９４または９５の免疫調節タンパク質。
９７．多量体化ドメインが、ヘテロ二量体の形成を促進する、実施形態９４〜９６のうちのいずれかの免疫調節タンパク質。
９８．実施形態９４〜９７のうちのいずれかの免疫調節タンパク質を含む免疫調節タンパク質であって、多量体化ドメインが、第１の多量体化ドメインであり、かつ第２の多量体化ドメインと相互作用して、免疫調節タンパク質を含む多量体を形成する、免疫調節タンパク質。
９９．免疫調節タンパク質が、第１の免疫調節タンパク質であり、第２の免疫調節タンパク質が、直接、またはリンカーを介して間接的に、第２の多量体化ドメインに連結され、多量体が、前記第１および第２の免疫調節タンパク質を含む、実施形態９８の免疫調節タンパク質。
１００．第２の免疫調節タンパク質が、実施形態９４〜９７のうちのいずれかの免疫調節タンパク質であり、多量体化ドメインが、第２の多量体化ドメインである、実施形態９９の免疫調節タンパク質。
１０１．多量体化ドメインが、第１の多量体化ドメインである、実施形態６６〜７５のうちのいずれかの第１の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドと、多量体化ドメインが、第２の多量体化ドメインである、実施形態６６〜７５のうちのいずれかの第２の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドと、を含み、第１および第２の多量体化ドメインが、相互作用して、第１および第２の変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドを含む多量体を形成する、免疫調節タンパク質。
１０２．多量体が、二量体である、実施形態９８〜１０１のうちのいずれかの免疫調節タンパク質。
１０３．ホモ二量体である、実施形態９８〜１０２のうちのいずれかの免疫調節タンパク質。
１０４．ヘテロ二量体である、実施形態９８〜１０３のうちのいずれかの免疫調節タンパク質。
１０５．第１および／または第２の多量体化ドメインが、エフェクター機能が減少したＦｃドメインまたはその変異型である、実施形態９８〜１０４のうちのいずれの免疫調節タンパク質。
１０６．第１および第２の多量体化ドメインが、同じであるか、または異なる、実施形態９８〜１０５のうちのいずれかの免疫調節タンパク質。
１０７．ある部分に連結されている、実施形態１〜８４のうちのいずれかの変異型ＣＴＬＡ−４または実施形態６０８５〜１０６のうちのいずれかの免疫調節タンパク質
を含む、コンジュゲート。
１０８．ある部分が、細胞の表面上の分子に特異的に結合する標的指向部分である、実施形態１０７のコンジュゲート。
１０９．標的指向部分が、免疫細胞の表面上の分子に特異的に結合する、実施形態１０８のコンジュゲート。
１１０．免疫細胞が、抗原提示細胞またはリンパ球である、実施形態１０９のコンジュゲート。
１１１．標的指向部分が、炎症環境において細胞または組織に局在する、実施形態１０８〜１１０のうちのいずれかのコンジュゲート。
１１２．ある部分が、タンパク質、ペプチド、核酸、小分子、またはナノ粒子である、実施形態１０７〜１１１のうちのいずれかのコンジュゲート。
１１３．ある部分が、抗体または抗原結合断片である、実施形態１０７〜１１２のうちのいずれかのコンジュゲート。
１１４．二価、四価、六価、または八価である、実施形態１０７〜１１３のうちのいずれかのコンジュゲート。
１１５．実施形態１〜８４のうちのいずれかの変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドまたは実施形態８５〜１０６のうちのいずれかの免疫調節タンパク質をコードする、核酸分子。
１１６．合成核酸である、実施形態１１５の核酸分子。
１１７．ｃＤＮＡである、実施形態１１５または１１６の核酸分子。
１１８．実施形態１１５〜１１７のうちのいずれかの核酸分子を含む、ベクター。
１１９．発現ベクターである、実施形態１１８のベクター。
１２０．哺乳動物発現ベクターまたはウイルスベクターである、実施形態１１８または１１９のベクター。
１２１．実施形態１１８〜１２０のうちのいずれかのベクターを含む、細胞。
１２２．哺乳動物細胞である、実施形態１２１の細胞。
１２３．ヒト細胞である、実施形態１２１または１２２の細胞。
１２４．変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドまたは免疫調節タンパク質を生成する方法であって、実施形態１１５〜１１７のうちのいずれかの核酸分子または実施形態１１８〜１２０のうちのいずれかのベクターを、細胞中にタンパク質を発現する条件下で宿主細胞に導入する段階を含む、方法。
１２５．変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドまたは免疫調節タンパク質を、細胞から単離または精製する段階をさらに含む、実施形態１２４の方法。
１２６．変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドを発現する細胞を操作する方法であって、実施形態１〜８４のうちのいずれかの変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドをコードする核酸分子、または実施形態８５〜１０６のうちのいずれかの免疫調節タンパク質を、ポリペプチドが細胞内に発現される条件下で宿主細胞に導入する段階を含む、方法。
１２７．実施形態１〜８４のうちのいずれかの変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド、実施形態８５〜１０６のうちのいずれかの免疫調節タンパク質、実施形態１１５〜１１７のうちのいずれかの核酸分子、または実施形態１１８〜１２０のうちのいずれかのベクターを発現する、操作された細胞。
１２８．免疫細胞である、実施形態１２７の操作された細胞。
１２９．免疫細胞が、リンパ球である、実施形態１２８の操作された細胞。
１３０．リンパ球が、Ｔ細胞である、実施形態１２９の操作された細胞。
１３１．Ｔ細胞が、ＣＤ４＋および／またはＣＤ８＋Ｔ細胞である、実施形態１３０の操作された細胞。
１３２．Ｔ細胞が、調節性Ｔ細胞（Ｔｒｅｇ）である、実施形態１３０または１３１の操作された細胞。
１３３．初代細胞である、実施形態１２７〜１３２のうちのいずれかの操作された細胞。
１３４．哺乳動物細胞である、実施形態１２７〜１３３のうちのいずれかの操作された細胞。
１３５．ヒト細胞である、実施形態１２７〜１３４のうちのいずれかの操作された細胞。
１３６．ＣＴＬＡ−４ポリペプチドが、膜貫通ドメインを介して細胞の表面上に発現される、実施形態１２７〜１３５のうちのいずれかの操作された細胞。
１３７．ＣＴＬＡ−４ポリペプチドが、細胞質ドメインを含み、任意選択的に、細胞質ドメインが、直接または間接的に、膜貫通ドメインに連結されている、実施形態１３６の操作された細胞。
１３８．細胞質ドメインが、天然型ＣＴＬＡ−４細胞質ドメイン、細胞内シグナル伝達ドメインであるか、もしくはこれらを含み、かつ／またはＩＴＩＭシグナル伝達モチーフを含む、実施形態１３７の操作された細胞。
１３９．細胞質ドメインが、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１の残基１８３〜２２３として記載されるアミノ酸の配列、またはＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１の残基１８３〜２２３と少なくとも８５％の配列同一性を示すその機能的変異型を含む、実施形態１３６〜１３８のうちのいずれかの操作された細胞。
１４０．細胞質ドメインが、ＩＴＡＭシグナル伝達モチーフを含み、かつ／またはＣＤ３ゼータの細胞内シグナル伝達ドメインであるか、もしくはこれを含む、実施形態１３６または１３７の操作された細胞。
１４１．ＣＴＬＡ−４ポリペプチドが、細胞質シグナル伝達ドメインを含まず、かつ／または細胞上に発現されたときに細胞内シグナルを仲介することも、調節することもできない、実施形態１３６の操作された細胞。
１４２．キメラ抗原受容体（ＣＡＲ）をさらに含む、実施形態１２７〜１４１のうちのいずれかの操作された細胞。
１４３．操作されたＴ細胞受容体（ＴＣＲ）をさらに含む、実施形態１２７〜１４１のうちのいずれかの操作された細胞。
１４４．実施形態１〜８４のうちのいずれかの変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチドまたは実施形態８５〜１０６のうちのいずれかの免疫調節タンパク質をコードする核酸分子を含む、感染性病原体。
１４５．細菌またはウイルスである、実施形態１２８の感染性病原体。
１４６．実施形態１〜８４のうちのいずれかの変異型ＣＴＬＡ−４ポリペプチド、実施形態８５〜１０６のうちのいずれかの免疫調節タンパク質、実施形態１０７〜１１４のうちのいずれかのコンジュゲート、実施形態１２７〜１４３のうちのいずれかの操作された細胞、または実施形態１４４もしくは１４５の感染性病原体を含む、医薬組成物。
１４７．薬学的に許容可能な賦形剤を含む、実施形態１４６の医薬組成物。
１４８．無菌である、実施形態１４６または１４７の医薬組成物。
１４９．実施形態１４６〜１４８のうちのいずれかの医薬組成物をバイアルまたは容器中に含む、製造物品。
１５０．バイアルまたは容器が、密閉されている、実施形態１４９の製造物品。
１５１．実施形態１４６〜１４８のうちのいずれかの医薬組成物および使用説明書を含む、キット。
１５２．実施形態１４９または１５０の製造物品および使用説明書を含む、キット。
１５３．対象における免疫反応を調節する方法であって、実施形態１４６〜１４８のうちのいずれかの医薬組成物を、対象に投与する段階を含む、方法。
１５４．対象における免疫反応を調節する方法であって、実施形態１２７〜１４３のうちのいずれかの操作された細胞を投与する段階を含む、方法。
１５５．操作された細胞が、対象に対して自家である、実施形態１５４の方法。
１５６．操作された細胞が、対象に対して同種異系である、実施形態１５４の方法。
１５７．免疫反応の調節が、対象において疾患または状態を治療する、実施形態１５３〜１５６のうちのいずれかの方法。
１５８．免疫反応が減少される、実施形態１５３〜１５７のうちのいずれかの方法。
１５９．実施形態１〜８１のうちのいずれかの変異型ポリペプチド、実施形態８５〜１０６のうちのいずれかの免疫調節タンパク質、または実施形態１２７〜１３９、１４２、および１４３のうちのいずれかの操作された細胞が、対象に対して投与される、実施形態１５３〜１５８のうちのいずれかの方法。
１６０．疾患または状態が、炎症性もしくは自己免疫性の疾患もしくは状態であるか、または過剰な免疫反応に関連する疾患もしくは状態である、実施形態１５３〜１５９のうちのいずれかの方法。
１６１．疾患または状態が、抗好中球細胞質抗体（ＡＮＣＡ）関連血管炎、血管炎、自己免疫性皮膚疾患、移植、リウマチ性疾患、甲状腺炎、炎症性胃腸疾患、炎症性眼疾患、炎症性神経疾患、炎症性肺疾患、炎症性内分泌疾患、自己免疫性血液疾患、自己免疫性脱髄性疾患、または全身性自己免疫性障害を伴う自己免疫性疾患である、実施形態１５３〜１６０のうちのいずれかの方法。
１６２．疾患または状態が、炎症性腸疾患、移植、クローン病、潰瘍性大腸炎、喘息、自己免疫性喘息、関節リウマチ、乾癬、エリテマトーデス、セリアック病、Ｉ型糖尿病、ギラン・バレー症候群、慢性炎症性脱髄性多発神経障害、グレーブス病、橋本甲状腺炎、ドケルヴァン甲状腺炎、重症筋無力症、血管炎、自己免疫性溶血性貧血、悪性貧血の自己免疫性萎縮性胃炎、自己免疫性脳脊髄炎、自己免疫性精巣炎、グッドパスチャー病、自己免疫性血小板減少症、交感性眼炎、原発性胆汁性肝硬変、慢性活動性肝炎、膜性腎症、原発性特発性粘液水腫、強皮症、慢性肝炎、アディソン病、性腺機能低下症、悪性貧血、白斑症、円形脱毛症、自己免疫性腸疾患症候群、特発性血小板紫斑病、後天性脾臓萎縮、特発性尿崩症、抗精子抗体に起因する不妊症、感覚神経性聴力喪失、シェーグレン症候群、多発性筋炎、多発性硬化症、横断性脊髄炎、失調性硬化症、天疱瘡、進行性全身性硬化症、皮膚筋炎、結節性多発動脈炎、溶血性貧血、糸球体腎炎、および特発性顔面麻痺の中から選択される、実施形態１５３〜１６１のうちのいずれかの方法。
１６３．免疫反応が増加される、実施形態１５３〜１５７のうちのいずれかの方法。
１６４．実施形態１２４または１２５の操作された細胞が、対象に投与される、実施形態１３７〜１４１、および１４７のうちのいずれかの方法。
１６５．疾患または状態が、腫瘍または癌である、実施形態１３７〜１４１、１４７、および１４８のうちのいずれかの方法。
１６６．疾患または状態が、黒色腫、肺癌、膀胱癌、血液学的悪性疾患、肝臓癌、脳癌、腎臓癌、乳癌、膵臓癌、結腸直腸癌、脾臓癌、前立腺癌、精巣癌、卵巣癌、子宮癌、胃癌、筋骨格系の癌、頭頸部癌、胃腸癌、胚細胞癌、または内分泌および神経内分泌系の癌から選択される、実施形態１３７〜１４１、および１４７〜１４９のうちのいずれか１つの方法。
【実施例】
【０４６２】
以下の実施例は、例示的な目的のみのために含まれ、本発明の範囲を限定することを意図していない。
【０４６３】
実施例１
ＩｇＳＦドメインの変異体ＤＮＡ構築物の作成
ヒトＣＴＬＡ−４  ＩｇＳＦドメインの変異体ＤＮＡ構築物を、酵母ディスプレイライブラリーとして、酵母の表面上での翻訳および発現のために作成した。
【０４６４】
アミノ酸のランダム置換を含有するライブラリーを構築して、以下のようにＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２に記載の野生型ヒトＣＴＬＡ−４配列に基づいてＣＴＬＡ−４のＥＣＤの変異型を識別した。
2020536552.tif 000019
【０４６５】
野生型ＣＴＬＡ−４  ＥＣＤをコードするＤＮＡを、改変酵母ディスプレイベクターｐＢＹＤＳ０３（Ｌｉｆｅ  Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ，ＵＳＡ）のＢａｍＨＩ部位とＫｐｎＩ部位との間でクローン化した。変異は、ＭｎＣｌ２を補充したＧｅｎｅｍｏｒｐｈ  ＩＩキット（Ａｇｉｌｅｎｔ，ＵＳＡ）を利用するエラーが生じやすいＰＣＲを介して、かつＢａｍＨＩおよびＫｐｎＩクローン化部位を越えておよびこれらを含む、ｐＢＹＤＳ０３クローン化ベクターと４０ｂｐ重複するＥＣＤ特異的オリゴヌクレオチドを使用して、導入された。変異したＤＮＡのＰＣＲ生成物を、アガロースゲル電気泳動を介して精製し、次に、ＯｎｅＴａｑ  ２ｘＰＣＲ  Ｍａｓｔｅｒ  Ｍｉｘ（Ｎｅｗ  Ｅｎｇｌａｎｄ  Ｂｉｏｌａｂｓ，ＵＳＡ）による１００ｎｇの変異したＰＣＲ生成物を使用して、さらに増幅させた。第２のＰＣＲからの生成物を、アガロースゲル電気泳動およびＰＣＲ−Ｇｅｌ精製（Ｑｉａｇｅｎ，Ｇｅｒｍａｎｙ）を介して精製し、無菌脱イオン水に再懸濁させた。合計１２μｇのＰＣＲ生成物を、その後のそれぞれの酵母電気穿孔のために作成した。
【０４６６】
ライブラリー挿入の準備のために、ｐＢＹＤＳ０３ベクターを、ＢａｍＨＩおよびＫｐｎＩ制限酵素（Ｎｅｗ  Ｅｎｇｌａｎｄ  Ｂｉｏｌａｂｓ，ＵＳＡ）で消化させ、大きなベクター断片を、無菌の脱イオン水中にゲル精製および溶解させた。総体積５０μＬの脱イオンおよび無菌水中に４μｇの直鎖ベクターと１２μｇのライブラリーＤＮＡ挿入を混合することによって、次の工程のために電気穿孔の準備ができたＤＮＡを作成した。
【０４６７】
実施例２
酵母へのＤＮＡライブラリーの導入
実施例１で作成されたＣＴＬＡ−４ＤＮＡライブラリーを、電気穿孔を使用して、酵母に導入した。簡単に言うと、酵母菌株ＢＪ５４６４（ＡＴＣＣ．ｏｒｇ、ＡＴＣＣ番号２０８２８８）の電気穿孔能を有する細胞を調製し、本質的に記載されるような上記の工程からの電気穿孔の準備ができたＤＮＡにより、Ｇｅｎｅ  Ｐｕｌｓｅｒ  ＩＩ（Ｂｉｏｒａｄ，ＵＳＡ）上で電気穿孔した（Ｃｏｌｂｙ，Ｄ．Ｗ．ｅｔ  ａｌ．２００４  Ｍｅｔｈｏｄｓ  Ｅｎｚｙｍｏｌｏｇｙ  ３８８，３４８−３５８）。１つの例外は、変形した細胞が、改変プラスミドｐＢＹＤＳ０３によって担持されるＬＥＵ２選択可能なマーカーに適用させるように非誘発最小選択的ＳＣＤ−Ｌｅｕ培地中に成長させたことである。１リットルのＳＣＤ−Ｌｅｕ培地は、１４．７グラムのクエン酸ナトリウム、４．２９グラムのクエン酸一水和物、２０グラムのブドウ糖、６．７グラムの酵母窒素原礎培地、およびロイシンを含まない１．６グラムの酵母合成ドロップアウト培地補充物からなる。０．２２μｍのワクチンフィルターデバイスを使用して、使用前に培地をフィルター滅菌した。
【０４６８】
ライブラリーサイズは、段階希釈のＳＣＤ−Ｌｅｕ新たに回収された細胞を寒天板上に被覆し、次に、プレート当たり少なくとも５０個のコロニーを作成した被覆からの単一コロニーの数から、ライブラリーサイズを外挿することによって判定された。概して、ライブラリーサイズは、この希釈アッセイに基づいて１０Ｅ８〜１０Ｅ９の変形の範囲であった。電気穿孔培養物の残りを、ＳＣＤ−Ｌｅｕ中に飽和状態に成長させ、この培養物からの細胞を、非変形細胞の画分を最小限に抑えるために、もう一度、新たなＳＣＤ−Ｌｅｕに二次培養し（例えば、１／１００）、一晩成長させた。ライブラリーの多様性を維持するために、計算されたライブラリーサイズよりも少なくとも１０倍多い細胞を含有する種菌を使用して、この二次培養工程を実行した。第２の飽和培養物からの細胞を、１０Ｅ１０／ｍＬの密度まで無菌の２５％（重量／体積）グリセロールを含有する新たな培地中に再懸濁し、凍結して、−８０℃で保存した（凍結ライブラリー群体）。
【０４６９】
実施例３
酵母の選択
ＩＣＯＳＬおよび／またはＣＤ８６に対して、ＣＴＬＡ−４の親和性改変変異型を発現する酵母を選択した。
【０４７０】
推定されるライブラリーサイズの少なくとも１０倍に等しいいくつかの細胞を、個々のライブラリー群体から解凍し、非誘発ＳＣＤ−Ｌｅｕ培地中の１．０ｘ１０Ｅ６細胞／ｍＬに懸濁し、一晩成長させた。翌日、ライブラリーサイズの１０倍に等しいいくつかの細胞を、２０００ＲＰＭで２分間遠心分離し、誘発ＳＣＤＧ−Ｌｅｕ培地中の５．０ｘ１０Ｅ６細胞／ｍＬに再懸濁した。１リットルのＳＣＤＧ−Ｌｅｕ誘発培地は、５．４グラムのＮａ２ＨＰＯ４、８．５６グラムのＮａＨ２ＰＯ４・Ｈ２０、２０グラムのガラクトース、２．０グラムのブドウ糖、６．７グラムの酵母窒素原礎培地、および水中に溶解し、かつ０．２２μｍの膜フィルターデバイスを通して滅菌された、ロイシンを含まない１．６グラムの酵母合成ドロップアウト培地補充物からなる。培養物を、室温で１日誘発培地中に成長させ、酵母細胞表面上のライブラリータンパク質の発現を誘発した。
【０４７１】
誘発された酵母ライブラリーは、代わりにＩＣＯＳＬまたはＣＤ８６で荷重した時期ビーズを使用して４周期のビーズの選別を受け、非結合剤を低減し、ＩＣＯＳＬまたはＣＤ８６に結合する能力を有する変異型ＣＴＬＡ−４分子について濃縮した。各周期の選択の後、磁気ビーズへの結合を通して保持された酵母を、ＳＣＤ培地中の成長を通して増幅し、その後、ＳＣＤＧ培地中で一晩誘発した。予備選択の後、ラウンド１においてはＩＣＯＳＬ−Ｆｃおよびラウンド２においてはＣＤ８６−Ｆｃを使用した２ラウンドの蛍光活性化細胞選別（ＦＡＣＳ）を行い、改善された結合剤をディスプレイする酵母細胞の画分を濃縮した。本質的に、Ｍｉｌｌｅｒ  ｅｔ  ａｌ．，Ｃｕｒｒｅｎｔ  Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ  ｉｎ  Ｃｙｔｏｍｅｔｒｙ  ４．７．１−４．７．３０，Ｊｕｌｙ  ２００８に記載されるような、フローサイトメトリーによる磁気ビーズの能力および選択を実行した。
【０４７２】
この選択プロセスは、以下の試薬および器具：ヒトｒＩＣＯＳＬ．Ｆｃ（すなわち、組み換えＩＣＯＳＬ−Ｆｃ融合タンパク質）を利用し、ヒトｒＣＤ８６．Ｆｃ標的リガンドタンパク質は、Ｒ  ＆  Ｄ  Ｓｙｓｔｅｍｓ，ＵＳＡから購入した。磁気タンパク質Ａビーズは、Ｎｅｗ  Ｅｎｇｌａｎｄ  Ｂｉｏｌａｂｓ，ＵＳＡから得た。二色フローサイトメトリー選別について、Ｂｉｏ−Ｒａｄ  Ｓ３ｅ選別機を使用した。ＣＴＬＡ−４ディスプレイレベルを、Ａｌｅｘａｆｌｕｏｒ  ４８８（Ｌｉｆｅ  Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ，ＵＳＡ）で標識された抗赤血球凝集素抗体により監視した。Ｆｃ融合タンパク質、ｒＩＣＯＳＬ．Ｆｃ、またはｒＣＤ８６．Ｆｃのリガンド結合を、ＰＥコンジュゲートヒトＩｇ特異的ヤギＦａｂ（Ｊａｃｋｓｏｎ  ＩｍｍｕｎｏＲｅｓｅａｒｃｈ，ＵＳＡ）により検出した。ダブレット酵母を、前方散乱（ＦＳＣ）／側方散乱（ＳＳＣ）パラメータを使用してゲートアウトし、選別ゲートは、ＦＬ１においてより限定されたタグ発現結合を有する、ＦＬ２において検出されたより高次のリガンド結合に基づいた。
【０４７３】
フローサイトメトリー選別からの酵母出力を、より高次の特異的結合親和性についてアッセイした。選別出力酵母を、それらがコードする特定のＩｇＳＦ親和性改変ドメイン変異型を発現するように拡張および再誘発した。次に、この集団を、フローサイトメトリーによって、親野生型酵母菌株、またはビーズ出力酵母集団などの他の選択された出力と比較した。
【０４７４】
第２のラウンドのＦＡＣＳの後、出力を、段階的に希釈し、単一クローンが単離され得るようにＳＣＤ寒天上に被覆した。２８８個のコロニーを、カナマイシン、ペニシリン、およびストレプトマイシンを補充した１５０μＬのＳＣＤ培地を含有する円形底マイクロタイタープレートに選び入れた。プレートを、振とうしながら３０℃でインキュベートした。４時間成長させた後、８０μＬを新たなプレートに移入し、細胞をスピンダウンし、ＳＣＤを除去し、抗体を補充した２００μＬのＳＣＤＧ誘発培地を各ウエルに加えた後、振とうしながら室温で一晩インキュベートした。ＦＡＣＳ分析を使用して、発現についての対照として、ｒＩＣＯＳＬ−Ｆｃ、ｒＣＤ８６−Ｆｃ、および抗ＨＡ  Ｍａｂへの各クローンの結合を独立して評価した。野生型ＣＴＬＡ−４を保有する酵母の対照ウエルを、各プレート上に広げた。１６個のクローンを選択して、Ｆｃ融合構築物に再形式化し、以下に記載のように配列決定した。
【０４７５】
１６個の酵母クローンの配列分析により、変異（Ｌ１２Ｐ／Ａ２６Ｔ／Ｌ６３Ｐ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：４）の単一優性組み合わせが明らかになった。追加のクローンの多様性を作成し、結合の増強のために必要とされる最小変異を判定するために、このクローンにおける変異を、野生型配列と部分的にシャッフルした。簡単に言うと、ＥＣＤコード化領域を３分割した３対のＰＣＲプライマーを設計した。ＰＣＲプライマーは、その後のＧｉｂｓｏｎ集合クローン化を促進するために、隣接するＰＣＲ生成物との２０ｂｐの重複配列を維持した。３つのＰＣＲ生成物を、野生型Ａ１、Ｂ１、Ｃ１）および変異体鋳型（Ａ２、Ｂ２、Ｃ２）の両方から作成した。３つのＰＣＲ生成物の組み合わせ、例えば、Ａ２，Ｂ１，Ｃ１、Ａ２，Ｂ２，Ｃ１などを、改変Ｆｃ融合ベクターと混合して、Ｇｉｂｓｏｎ  Ａｓｓｅｍｂｌｙ  Ｍａｓｔｅｒｍｉｘ（Ｎｅｗ  Ｅｎｇｌａｎｄ  Ｂｉｏｌａｂｓ，ＵＳＡ）を使用してインビトロ組み換えを実行し、続いて、大腸菌株ＮＥＢ（登録商標）５アルファへの熱ショック変換のために使用した。この野生型配列とのシャフリングにより、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：５〜１１が生じた。
【０４７６】
鋳型としてＧｅｎ１選択からのクローンを使用したエラーが生じやすいＰＣＲを介して、ランダム変異の第２のライブラリーを作成した。鋳型ＤＮＡが、野生型ＣＴＬＡ−４  ＥＣＤ  ＤＮＡの代わりにＧｅｎ１クローンのプールから構成されることを除いて以前に記載されている同じプロセスを使用して、Ｇｅｎ２として記載されているこのライブラリーを構築した。クローンの複数のプールを作成するために、ｒＩＣＯＳＬ−ＦｃとｒＣＤ８６−Ｆｃとの間で変化する反復ラウンドのＦＡＣＳ選別を介して、酵母ライブラリーをスクリーニングした。前と同様に、酵母プールを、ＦＡＣＳを介した結合のために分析した。ＦＡＣＳによるｒＩＣＯＳＬ−Ｆｃ、ｒＣＤ８６−Ｆｃ、ｒＣＤ８０−Ｆｃへの結合に基づいて、いくつかのプールを、ＦｃベクターへのＰＣＲのクローン化のために選択した。その後の配列分析およびタンパク質生成を、Ｇｅｎ１について記載されているように行った。
【０４７７】
選択によって識別された選択される変異型におけるアミノ酸置換を、表２に記載する。選択される変異型ＣＴＬＡ−４  ＥＣＤを、融合タンパク質としてさらに形式化し、以下に記載のように結合および機能的活性について試験した。
【０４７８】
実施例４
Ｆｃ融合としての、様々な免疫調節タンパク質型における選択出力の再形成
選択出力を、Ｆｃ分子に融合されたＣＴＬＡ−４の親和性改変（変異型）ＥＣＤ（変異型ＥＣＤ−Ｆｃ融合分子）を含有する免疫調節タンパク質として再形式化した。
【０４７９】
最後のフローサイトメトリーＣＴＬＡ−４選別からの出力細胞を、ＳＣＤ−Ｌｅｕ培地中に末端密度まで成長させた。酵母プラスミドＤＮＡ単離キット（Ｚｙｍｏｒｅｓｅａｒｃｈ，ＵＳＡ）を使用して、各出力からのプラスミドＤＮＡを単離した。Ｆｃ融合について、選択されるＦｃ融合ベクターへのクローン化に好適な追加の制限部位を有するＰＣＲプライマーを使用して、プラスミドＤＮＡ調製物から、変異体標的ＥＣＤについてのコード化ＤＮＡをバッチ増幅させた。制限消化の後、ＰＣＲ生成物を、適切なＦｃ融合ベクターに結紮させ、その後、供給者によって方向付けられるような菌株ＸＬ１−Ｂｌｕｅ大腸菌（Ａｇｉｌｅｎｔ，ＵＳＡ）またはＮＥＢ（登録商標）５アルファ（Ｎｅｗ  Ｅｎｇｌａｎｄ  Ｂｉｏｌａｂｓ）への熱ショック変換を行った。代替的に、出力を、いずれかの端上に改変Ｆｃ融合ベクターとの４０ｂｐ重複領域を含有するプライマーによりＰＣＲ増幅し、Ｇｉｂｓｏｎ  Ａｓｓｅｍｂｌｙ  Ｍａｓｔｅｒｍｉｘ（Ｎｅｗ  Ｅｎｇｌａｎｄ  Ｂｉｏｌａｂｓ，ＵＳＡ）を使用してインビトロ組み換えを実行し、続いて、大腸菌株ＮＥＢ（登録商標）５アルファへの熱ショック変換のために使用した。例示的なＦｃ融合ベクターは、ｐＦＵＳＥ−ｈＩｇＧ１−Ｆｃ２（ＩｎｖｉｖｏＧｅｎ，ＵＳＡ）である。
【０４８０】
変換反応の希釈物を、１００μｇ／ｍＬのカルベニシリン（Ｔｅｋｎｏｖａ，ＵＳＡ）を含有するＬＢ寒天上に被覆し、選択のために単一コロニーを単離した。次に、各変換からの最大９６個のコロニーを、ＬＢ培地（ｃａｔ．＃Ｌ８１１２，Ｔｅｋｎｏｖａ，ＵＳＡ）中に３７℃で一晩、飽和状態まで９６ウエルのプレートにおいて成長させ、すべてのクローンにおける変異を識別するために、各ウエルから小分割量を、ＥＣＤ挿入のＤＮＡ配列決定のために寄託した。サービスプロバイダーによって提供されるプロトコル（Ｇｅｎｅｗｉｚ；Ｓｏｕｔｈ  Ｐｌａｉｎｆｉｅｌｄ，ＮＪ）によって、ＤＮＡ配列決定のための試料調製を実行した。ＤＮＡ配列決定のために試料を除去した後、２５％の最終グリセロール含有量に対して残りの培養物にグリセロールを加え、マスタープレートとしてさらに使用するために（以下を参照されたい）、プレートを−２０℃で保存した。代替的に、使い捨て可能な９６ウエルのレプリケーター（ＶＷＲ，ＵＳＡ）を使用して、固体寒天板に成長した液体培養物からの複製物被覆によって、ＤＮＡ配列決定のための試料を作成した。これらのプレートを、一晩インキュベートして、成長パッチを作成し、プレートを、ＤＮＡ配列決定のために、それらの仕様書に従ってＧｅｎｅｗｉｚに寄託した。
【０４８１】
Ｇｅｎｅｗｉｚにより作成されたＤＮＡ配列決定データの分析後、対象となるクローンを、マスタープレートから回収し、１００μｇ／ｍＬのカルベニシリン（Ｔｅｋｎｏｖａ，ＵＳＡ）を含有する５ｍＬの液体ＬＢ培地中に飽和状態までここに成長させ、次に、２ｍＬの各培養物を、ＰｕｒｅＹｉｅｌｄ  Ｐｌａｓｍｉｄ  Ｍｉｎｉｐｒｅｐ  Ｓｙｓｔｅｍ（Ｐｒｏｍｅｇａ，ＵＳＡ）などの標準的なキットを使用した、各クローンのおよそ１０μｇの少量調製物のプラスミドＤＮＡの調製のために使用した。対象となるクローンの識別は、概して、以下の工程を伴った。最初に、ＤＮＡ配列データファイルを、Ｇｅｎｅｗｉｚウエブサイトからダウンロードした。次に、すべての配列を、ＥＣＤコード化領域に開始時に始まるように、手動でキュレートした。Ｇｅｎｅｗｉｚ配列を処理して、Ｕｇｅｎｅソフトウエア（ｈｔｔｐ：／／ｕｇｅｎｅ．ｎｅｔ）を使用してアラインメントを作成した。
【０４８２】
次に、対象となるクローンを、以下の基準：１）同一のクローンがアラインメント中に少なくとも２回生じること、および２）変異がアラインメント中に、好ましくは別個のクローン中に少なくとも２回生じることを使用して識別した。これらの基準のうちの少なくとも１つを満たしたクローンを、最も可能性が高いのは、結合の改善に起因する選別プロセスによって濃縮した。
【０４８３】
少なくとも１つの親和性改変ドメイン（例えば、変異型ＣＴＬＡ−４  ＥＣＤ−Ｆｃ）を有するＣＴＬＡ−４のＥＣＤを含有するＦｃ融合タンパク質である組み換え免疫調節タンパク質を作成するために、コード化ＤＮＡを作成して、以下：変異型（変異体）ＥＣＤ、次に７つのアミノ酸（ＧＳＧＧＧＧＳ）のリンカー、次にＥＵ番号付けによる変異Ｌ２３４Ａ、Ｌ２３５Ｅ、およびＧ２３７Ａを含有するヒトＩｇＧ１  Ｆｃの通りにタンパク質をコードした。構築物は、システインと共有結合を形成し得る任意の抗体軽鎖を含まないため、ヒトＩｇＧ１  Ｆｃはまた、ＥＵ番号付けによる位置２２０（Ｃ２２０Ｓ）（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：５３３に記載の野生型または非改変Ｆｃを参照する位置５（Ｃ５Ｓ）に対応する）にセリン残基とのシステイン残基の交換を含有した。表２に記載の変異型を含有する例示的な変異型ＣＴＬＡ−４−ＥＣＤ−Ｆｃ融合タンパク質を、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２８６〜３７９、３８１〜３８６、および３８８〜４３７に記載する。
【０４８４】
実施例５
Ｆｃ融合の発現および精製
高スループット発現および精製によって、ＣＴＬＡ−４の変異型ＥＣＤを含有するＦｃ融合タンパク質を作成した。Ｅｘｐｉ２９３発現系（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ，ＵＳＡ）を使用した、懸濁物適合ヒト胎児腎臓（ＨＥＫ）２９３細胞から、組み換え変異型Ｆｃ融合タンパク質を生成した。１０．８μＬのＥｘｐｉＦｅｃｔａｍｉｎｅを別の２００μＬのＯｐｔｉ−ＭＥＭに別々に加えると同時に、実施例３に作成された４μｇの各プラスミドＤＮＡを、２００μＬのＯｐｔｉ−ＭＥＭ（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ，ＵＳＡ）に加えた。５分後、２００μＬのプラスミドＤＮＡを、２００μＬのＥｘｐｉＦｅｃｔａｍｉｎｅと混合して、この細胞の混合物を加える前に、追加の２０分間さらにインキュベートした。１千万個のＥｘｐｉ２９３細胞を、体積４ｍＬのＥｘｐｉ２９３培地（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ，ＵＳＡ）における、無菌の１０ｍＬ、円錐底、深い２４ウエルの成長プレート（Ｔｈｏｍｓｏｎ  Ｉｎｓｔｒｕｍｅｎｔ  Ｃｏｍｐａｎｙ，ＵＳＡの別々のウエルに分注した。プレートを、９５％の湿度および８％のＣＯ２に設定された哺乳動物細胞培養物インキュベーター中に１２０ＲＰＭで５日間振とうさせた。５日間のインキュベーションの後、細胞をペレット状にし、培養液上清を除去した。
【０４８５】
製造業者のプロトコルを使用した高スループット９６ウエルタンパク質Ａ精製キット（Ｃａｔａｌｏｇ  ｎｕｍｂｅｒ  ４５２０２，Ｌｉｆｅ  Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ，ＵＳＡ）を使用して、上清からタンパク質を精製した。得られた溶出画分を、製造業者のプロトコルを使用したＺｅｂａ  ９６ウエルのスピン脱塩プレート（Ｃａｔａｌｏｇ  ｎｕｍｂｅｒ  ８９８０７，Ｌｉｆｅ  Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ，ＵＳＡ）を使用して、ＰＢＳに緩衝液交換した。Ｎａｎｏｄｒｏｐ器具（Ｔｈｅｒｍｏ  Ｆｉｓｈｅｒ  Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ，ＵＳＡ）によって測定される２８０ｎｍの吸光度を使用して、精製されたタンパク質を定量化し、変性および低減条件下で、ＮＵＰＡＧＥプレキャストポリアクリルアミドゲル（Ｌｉｆｅ  Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ，ＵＳＡ）上に５μｇのタンパク質を装填し、続いてゲル電気泳動を行うことによって、タンパク質の純度を評価した。標準的なクーマシー染色を使用して、タンパク質をゲル中に視覚化した。
【０４８６】
実施例６
親和性成熟ＩｇＳＦドメイン含有分子の結合および活性の評価
Ｆｃ融合結合の研究を行って、結合パートナーＣＤ８０、ＣＤ８６、およびＩＣＯＳＬに対するＣＴＬＡ−４  ＥＣＤ変異型免疫調節タンパク質の特異性および親和性を評価した。ヒト一次Ｔ細胞インビトロアッセイにおける生物活性について、Ｆｃ融合変異型タンパク質をさらに特徴付けた。
【０４８７】
Ａ．細胞発現カウンター構造との結合
結合パートナーを発現する細胞を生成するために、ヒトＣＤ８０、ＣＤ８６、およびＩＣＯＳＬのうちのそれぞれに対する全長哺乳動物表面発現構築物を、ｐｃＤＮＡ３．１発現ベクター（Ｌｉｆｅ  Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ）において設計し、Ｇｅｎｓｃｒｉｐｔ，ＵＳＡから調達した。上記に記載のＥｘｐｉ２９３Ｆ一過性トランスフェクション系（Ｌｉｆｅ  Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ，ＵＳＡ）を使用して、結合研究を実行した。実験のために必要とされる細胞の数を判定し、製造業者の提案されるプロトコルを使用して、適切な３０ｍＬスケールのトランスフェクションを行った。それぞれのカウンター構造または模造の３０ｍＬのトランスフェクションについて、７５００万個のＥｘｐｉ２９３Ｆ細胞を、３０μｇの発現構築物ＤＮＡおよび１．５ｍＬの希釈されたＥｘｐｉＦｅｃｔａｍｉｎｅ２９３試薬で４８時間インキュベートし、その時点で、染色のために細胞を採取した。
【０４８８】
フローサイトメトリー分析について、２００，０００個の細胞の適切な一過性トランスフェクションまたは負の対照を、９６ウエルの円形底プレート中に被覆した。細胞をスピンダウンし、染色緩衝液（ＰＢＳ（リン酸緩衝食塩水）、１％のＢＳＡ（ウシ血清アルブミン）、および０．１％のアジ化ナトリウム）中に２０分間懸濁して、非特異的結合を阻害した。その後、細胞を、再び遠心分離し、５０μＬ中に１００ｎＭ〜１００ｐＭのＣＴＬＡ−４  ＩｇＳＦ変異型Ｆｃ融合タンパク質を含有する染色緩衝液中に懸濁した。一次染色を４５分間行い、その後、染色緩衝液中で２回細胞を洗浄した。ＣＤ８６トランスフェクションについて、３０分間インキュベートされた５０μＬの染色緩衝液中に１：１５０に希釈されたＰＥコンジュゲート抗ヒトＦｃ（Ｊａｃｋｓｏｎ  ＩｍｍｕｎｏＲｅｓｅａｒｃｈ，ＵＳＡ）により、結合したタンパク質を検出した。ＣＤ８０およびＩＣＯＳＬトランスフェクションについて、５０μＬの染色緩衝液中に１：１３０に希釈された抗ＣＴＬＡ−４抗体（Ｂｉｏｌｅｇｅｎｄ，ＵＳＡ）により、結合したタンパク質を捕捉した。３０分のインキュベーションの後、細胞を、２回洗浄し、追加の３０分のインキュベーションのために５０μＬ中に１：１５０に希釈されたＰＥコンジュゲート抗マウスＦｃ（Ｊａｃｋｓｏｎ  ＩｍｍｕｎｏＲｅｓｅａｒｃｈ，ＵＳＡ）により検出した。細胞を２回洗浄して、未結合のコンジュゲート抗体を除去し、２％のホルムアルデヒド／ＰＢＳに固定し、ＦＡＣＳｃａｎ（Ｂｅｃｔｏｎ  Ｄｉｃｋｉｎｓｏｎ，ＵＳＡ）またはＨｙｐｅｒｃｙｔフローサイトメーター（Ｉｎｔｅｌｌｉｃｙｔｅ，ＵＳＡ）上で分析した。
【０４８９】
Ｃｅｌｌ  Ｑｕｅｓｔ  Ｐｒｏソフトウエア（Ｂｅｃｔｏｎ  Ｄｉｃｋｉｎｓｏｎ，ＵＳＡ）またはＦｏｒｃｙｔｅソフトウエア（Ｉｎｔｅｌｌｉｃｙｔ，ＵＳＡ）により、それぞれのトランスフェクタントおよび負の親株について、平均蛍光強度（ＭＦＩ）を計算した。
【０４９０】
Ｂ．生物活性の特徴付け
可溶性ＣＴＬＡ−４−Ｆｃ生物活性を、ヒト混合リンパ球反応（ＭＬＲ）において試験した。Ｅｘ−Ｖｉｖｏ１５培地（Ｌｏｎｚａ，Ｓｗｉｔｚｅｒｌａｎｄ）中の５０ｎｇ／ｍＬのｒＩＬ−４（Ｒ＆Ｄ  Ｓｙｓｔｅｍｓ，ＵＳＡ）および８０ｎｇ／ｍＬのｒＧＭ−ＣＳＦ（Ｒ＆Ｄ  Ｓｙｓｔｅｍｓ，ＵＳＡ）により、７日間インビトロでＰＢＭＣ（ＢｅｎＴｅｃｈ  Ｂｉｏ，ＵＳＡ）から単離された単球を培養することによって、ヒト一次樹状細胞（ＤＣ）を作成した。３および５日目に、培地の半分を除去し、５０ｎｇ／ｍＬのｒＩＬ−４および８０ｎｇ／ｍＬのｒＧＭ−ＣＳＦを含有する新たな培地と置換した。ＤＣ成熟を完全に誘発するために、６日目に、リポ多糖（ＬＰＳ）（ＩｎｖｉｖｏＧｅｎ  Ｃｏｒｐ．，ＵＳＡ）を、１００ｎｇ／ｍＬでＤＣ培養物に加え、追加の２４時間、細胞をインキュベートした。およそ１０，０００個の成熟ＤＣおよび１００，０００個の精製された同種異系ＣＤ３＋Ｔ細胞（ＢｅｎＴｅｃｈ  Ｂｉｏ，ＵＳＡ）を、最終体積２００μｌのＥｘ−Ｖｉｖｏ１５培地における９６ウエルの円形底プレート中のＣＴＬＡ−４変異型Ｆｃ融合タンパク質および対照と同時培養した。４〜５日目に、ヒトＩＦＮガンマＤｕｏｓｅｔ  ＥＬＩＳＡキット（Ｒ＆Ｄ  Ｓｙｓｔｅｍｓ，ＵＳＡ）を使用して、培養液上清中のＩＦＮガンマ分泌を分析した。ＢｉｏＴｅｋ  Ｃｙｔａｔｉｏｎ  Ｍｕｌｔｉｍｏｄｅ  Ｍｉｃｒｏｐｌａｔｅ  Ｒｅａｄｅｒ（ＢｉｏＴｅｋ  Ｃｏｒｐ．，ＵＳＡ）上で、任意選択的な密度を測定し、ＩＦＮガンマＤｕｏｓｅｔキット（Ｒ＆Ｄ  Ｓｙｓｔｅｍｓ，ＵＳＡ）中に誘発された滴定されたｒＩＦＮ−ガンマ標準に対して定量化した。
【０４９１】
Ｃ．結果
変異型および非改変ＣＴＬＡ−４ポリペプチドについて上記に記載される結合および生物活性アッセイの結果を、表５〜７に要約する。各実験に対する非改変ＣＴＬＡ−４ポリペプチド（ΔＷＴ）の対応する結合および分泌と比較した、相対比に加えて、結合ＣＤ８０、ＣＤ８６、およびＩＣＯＳＬ（ＭＦＩ）、ならびにインターフェロンガンマ分泌についての値［ｐｇ／ｍＬ］を提供する。略０．１未満であった結合に対する相対比は、０として報告されている。加えて、変異型がインターフェロンガンマの分泌を検出不能なレベルまで抑えた変異型についてのＭＬＲデータも、０として報告されている。
【０４９２】
（表５）変異型ＣＴＬＡ−４−Ｆｃポリペプチドの結合および生物活性
2020536552.tif 000020
【０４９３】
（表６）変異型ＣＴＬＡ−４−Ｆｃポリペプチドの結合および生物活性
2020536552.tif 000021
2020536552.tif 000022
2020536552.tif 000023
【０４９４】
（表７）変異型ＣＴＬＡ−４−Ｆｃポリペプチドの結合および生物活性
2020536552.tif 000024
2020536552.tif 000025
2020536552.tif 000026
2020536552.tif 000027
2020536552.tif 000028
【０４９５】
実施例７
ＣＴＬＡ−４コンセンサス変異型の作成およびアッセイ
ＣＴＬＡ−４  ＥＣＤの追加の変異型を、改善されたＣＤ８０、ＣＤ８６、および／もしくはＩＣＯＳＬ結合を示し、ならびに／またはＭＬＲアッセイにおけるインターフェロンガンマ分泌の抑制を実証した、変異型と一般に関連する実施例１〜６に記載のスクリーンにおいて識別されるコンセンサス残基を識別することによって設計した。選択されるコンセンサス変異には、Ｉ１８Ｔ、Ａ２６Ｔ、Ｅ３３Ｖ、Ｔ５３Ｓ、Ｍ５５Ｔ、Ｍ５６Ｋ、Ｎ５８Ｓ、Ｌ６３Ｐ、Ｍ８７Ｖ、Ｌ９８Ｑ、Ｍ９９Ｌ、およびＹ１０５Ｌが含まれた。コンセンサス変異体を使用して、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２に記載の野生型配列を参照して部位特異的変異誘発によって変異型ＣＴＬＡ−４  ＥＣＤを作成し、次に、実施例４に記載されるようなＦｃ融合タンパク質として形式化した。変異型ＣＴＬＡ−４  ＥＣＤ−Ｆｃ融合を、以下に記載されるような結合および生物活性について試験した。
【０４９６】
Ａ．結合および生物活性
１．細胞発現カウンター構造への結合
同種結合パートナーを発現する細胞を生成するために、ヒトＣＤ８０、ＣＤ８６、およびＩＣＯＳＬのうちのそれぞれについての全長哺乳動物表面発現構築物を、ｐｃＤＮＡ３．１発現ベクター（Ｌｉｆｅ  Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ）中に設計し、Ｇｅｎｓｃｒｉｐｔ，ＵＳＡから調達した。上記に記載のＥｘｐｉ２９３Ｆ一過性トランスフェクション系（Ｌｉｆｅ  Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ，ＵＳＡ）を使用して、結合研究を実行した。実験のために必要とされる細胞の数を判定し、製造業者の提案されるプロトコルを使用して、適切な３０ｍＬスケールのトランスフェクションを行った。それぞれのカウンター構造または模造の３０ｍＬのトランスフェクションについて、７５００万個のＥｘｐｉ２９３Ｆ細胞を、３０μｇの発現構築物ＤＮＡおよび１．５ｍＬの希釈したＥｘｐｉＦｅｃｔａｍｉｎｅ（商標）２９３試薬で４８時間インキュベートし、その時点で、染色のために細胞を採取した。
【０４９７】
いくつかの例では、同種結合パートナーの安定した発現を有する細胞を使用した。チェイニーズハムスター卵巣細胞（ＣＨＯ）を、全長ヒトＣＤ８０、ＣＤ８６、またはＩＣＯＳＬの表面発現のためにレンチウイルスによって安定的に変換した。
【０４９８】
フローサイトメトリー分析について、２００，０００個の細胞の所与の一過性トランスフェクション、安定した細胞株、または適切な負の対照を、９６ウエルの円形底板中に被覆した。細胞をスピンダウンし、染色緩衝液（ＰＢＳ（リン酸緩衝食塩水）、１％のＢＳＡ（ウシ血清アルブミン）、および０．１％のアジ化ナトリウム）中に２０分間懸濁して、非特異的結合を阻害した。その後、細胞を、再び遠心分離し、５０μＬ中に１００ｎＭ〜１００ｐＭのＣＴＬＡ−４変異型Ｆｃ融合タンパク質または対照を含有する染色緩衝液中に懸濁した。一次染色を４５分間行い、その後、染色緩衝液中で２回細胞を洗浄した。５０μＬの染色緩衝液中に１：１５０に希釈され、３０分間インキュベートされたＰＥコンジュゲート抗ヒトＩｇＧ（Ｊａｃｋｓｏｎ  ＩｍｍｕｎｏＲｅｓｅａｒｃｈ，ＵＳＡ）により、結合したＣＴＬＡ−４を検出した。代替的に、染色緩衝液中で細胞を２回洗浄する前に、３０分間５０μＬの染色緩衝液中に１：１３０に希釈された抗ＣＴＬＡ−４抗体（Ｂｉｏｌｅｇｅｎｄ，ＵＳＡ）により、結合したＣＴＬＡ−４を検出した。次に、５０μＬの染色緩衝液中に１：１５０に希釈され、３０分間インキュベートされたＰＥコンジュゲート抗マウスＩｇＧ（Ｊａｃｋｓｏｎ  ＩｍｍｕｎｏＲｅｓｅａｒｃｈ，ＵＳＡ）により、抗ＣＴＬＡ−４抗体を検出した。
【０４９９】
最後のインキュベーションの後、細胞を２回洗浄し、未結合のコンジュゲート抗体を除去し、２％のホルムアルデヒド／ＰＢＳ中に固定し、Ｈｙｐｅｒｃｙｔ（Ｉｎｔｅｌｌｉｃｙｔｅ，ＵＳＡ）またはＬＳＲＩＩ（Ｂｅｃｔｏｎ  Ｄｉｃｋｉｎｓｏｎ，ＵＳＡ）フローサイトメーター上で分析した。
【０５００】
Ｃｅｌｌ  Ｑｕｅｓｔ  Ｐｒｏソフトウエア（Ｂｅｃｔｏｎ  Ｄｉｃｋｉｎｓｏｎ，ＵＳＡ）、ＦｌｏｗＪｏソフトウエア（ＦｌｏｗＪｏ，ＵＳＡ）、またはＦｏｒｃｙｔｅソフトウエア（Ｉｎｔｅｌｌｉｃｙｔ，ＵＳＡ）により、各試料について、平均蛍光強度（ＭＦＩ）を計算した。
【０５０１】
２．ＣＤ８６阻害バイオアッセイ
ＣＤ８６阻害バイオアッセイによって判定されるようなＣＤ８６−ＣＤ２８媒介共刺激を阻害する能力について、選択ＣＴＬＡ−４変異型Ｆｃ融合タンパク質をアッセイした。細胞表面抗ヒトＣＤ３単鎖Ｆｖ（ＯＫＴ３）およびヒトＣＤ８６を発現するようにＫ５６２細胞をレンチウイルスに変換することによって、人工抗原提示細胞（ＡＰＣ）を作成し、Ｋ５６２／ＯＫＴ３／ＣＤ８６．を生じた。ヒトＩＣＯＳの細胞外ドメインおよびヒトＣＤ２８の細胞内ドメインから構成されるキメラ受容体を発現するようにＩＬ−２−ルシフェラーゼレポーター（Ｐｒｏｍｅｇａ）を発現するＪｕｒｋａｔ細胞をレンチウイルスに変換することによって、エフェクター細胞を作成し、Ｊｕｒｋａｔ／ＩＬ−２／ＩＣＯＳ−ＣＤ２８を生じた。３００ｎＭで３３μＬ／ウエル中にＣＴＬＡ−４−Ｆｃまたは対照タンパク質を有する、２ｘ１０４細胞／ウエルでの３３μＬ／ウエルのアッセイ緩衝液（５％のＦＢＳを有するＲＰＭＩ１６４０）中に、ＡＰＣを被覆した。ＡＰＣおよびタンパク質を、室温で２０分間インキュベートし、その後、３３μＬ／ウエル中に２ｘ１０５細胞／ウエルでエフェクター細胞を加えた。プレートを、摂氏３７度に移入し、インキュベーションチャンバ内で５時間、５％のＣＯ２で加湿し、次に、除去して、１５分間室温に順応させた。１００μＬ／ウエルの細胞溶解およびルシフェラーゼ基質溶液（ＢｉｏＧｌｏ（商標）ルシフェラーゼ試薬、Ｐｒｏｍｅｇａ）を、各プレートに加え、オービタルシェーカー得上で１０分間インキュベートした。Ｃｙｔａｔｉｏｎ３撮像読み取り装置（ＢｉｏＴｅｋ  ｉｎｓｔｒｕｍｅｎｔｓ）を使用して、ウエル統合時間当たり１秒で発光を測定することによって、各試験試料について、相対発光値（ＲＬＵ）を判定した。以下の式を使用して、ＣＤ８６阻害によって媒介されるパーセント抑制を判定した。［（平均対照ＲＬＵ−実験的ＲＬＵ）／（平均対照ＲＬＵ）］ｘ１００。
【０５０２】
Ｂ．結果
結果を表８に要約する。各実験に対する非改変ＣＴＬＡ−４ポリペプチド（ΔＷＴ）の対応する結合およびＣｄ８６阻害と比較した、相対比に加えた、結合ＣＤ８０、ＣＤ８６、およびＩＣＯＳＬ（ＭＦＩ）ならびにパーセント抑制ＣＤ２８共刺激についての値を提供する。示されるように、ＣＤ８０またはＣＤ８６のいずれかとの結合の変化とは独立して、特定の変異および変異の組み合わせを、ＣＴＬＡ−４  ＥＣＤの、ＩＣＯＳＬとの結合の実質的な増加と関連付けた。場合によっては、ＣＤ８０またはＣＤ８６のうちの一方または両方への結合の増加も観察した。
【０５０３】
（表８）コンセンサス変異型ＣＴＬＡ−４−Ｆｃポリペプチドの結合および生物活性
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【０５０４】
実施例８
選択したＣＴＬＡ−４変異型の作成およびアッセイ
実施例１〜６に記載のスクリーンにおいて識別される変異型ＣＴＬＡ−４、具体的には、ＣＤ８０、ＣＤ８６、およびＩＣＯＳＬへの結合の増強ならびにインターフェロンガンマの抑制と関連付けられる、変異Ｌ１２Ｆ／Ｒ１６Ｈ／Ｇ２９Ｗ／Ｍ５６Ｔ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌを含有するＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１１６に記載の変異型からの変異により、ＣＴＬＡ−４  ＥＣＤ変異型のさらなるパネルを設計した。場合によっては、Ｓ７２Ｇは、抑制活性を有すると識別された他の上位５０個のヒットのうちの３５％超において発生するホットスポットと識別されたために含まれた。いくつかの作成された変異型について、戦略には、例えば、変異型における変異の数を低減するためのいくつかの変異（復帰型変異）の除去が含まれた。ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２に記載の野生型配列を参照して部位特異的変異誘発によって変異型ＣＴＬＡ−４  ＥＣＤを作成し、次に、実施例４に記載されるようなＦｃ融合タンパク質として形式化した。変異型ＣＴＬＡ−４  ＥＣＤ−Ｆｃ融合を、実施例７に記載されるような結合および生物活性について試験した。
【０５０５】
表９は、各実験に対する非改変ＣＴＬＡ−４ポリペプチド（ΔＷＴ）の対応する結合およびＣｄ８６阻害と比較した、相対比に加えた、結合ＣＤ８０、ＣＤ８６、およびＩＣＯＳＬ（ＭＦＩ）ならびにパーセント抑制ＣＤ２８共刺激についての値を提供する。
【０５０６】
（表９）復帰変異型CTLA-4-Fcポリペプチドの結合および生物活性
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【０５０７】
実施例９
コラーゲン誘発性関節炎の動物の研究
Ｆｃに融合された例示的なＣＴＬＡ−４  ＥＣＤ変異型（Ｇ２９Ｗ／Ｎ５８Ｓ／Ｌ６３Ｐ／Ｑ８２Ｒ／Ｌ９８Ｑ／Ｙ１０５Ｌ、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：９３）を、関節リウマチのネズミ自己免疫性モデルにおいて評価した。このモデルにおける活性を、Ｆｃに融合されたＣＴＬＡ−４の細胞外ドメインを含む融合タンパク質（商標Ｏｒｅｎｃｉａ（登録商標）下で販売されている、アバタセプト）およびＦｃのみと比較した。
【０５０８】
０日目、マウス（研究の開始時に９〜１１週齢の雄ＤＢＡ／１Ｊ）を固定し、その尻尾を洗浄して、背部静脈と側脈との間にシリンジでコラーゲン／ＣＦＡ乳剤を注射した。１８日目に、マウスに、尻尾の反対側に同様の様式で、追加抗原投与量のコラーゲン／ＩＦＡ乳剤を注射した。
【０５０９】
１８日目に、マウス（グループ当たり１５匹）は、１７０μｇの変異型ＣＴＬＡ−４  ＥＣＤ−Ｆｃもしくはアバタセプトの腹腔内（ＩＰ）注射を受けるか、または１１２μｇのＦｃ対照を受けた。ＩＰ注射を、２０、２２、および２６日目に反復した。
【０５１０】
コラーゲン／ＣＦＡ免疫付与の１６日後に開始して、コラーゲン誘発性関節炎（ＣＩＡ）の徴候について、マウスを２日ごとに監視した。０〜４のスケールでそれぞれの足についてのＣＩＡをスコア化し、ここで、「０」は、正常な足と等級付けられ、「１」は、足の上に１つの炎症および腫れた指があると等級付けられ、「２」は、足の上に１つ超の指にあるが、足全体にはない、炎症および腫れがあるか、または足全体の軽度の腫れがあると等級付けられ、「３」は、足全体に炎症および腫れがあると等級付けられ、４は、足全体に重度の炎症および腫れがあるか、または強直している（例えば、マウスが、ケージ上でワイヤを把持することができない）と等級付けられた。０〜１６のそれぞれのマウスについての総ＣＩＡスコアについて、それぞれの足についてのスコアを合計した。それぞれの治療群についての平均的な総足スコアを、図７に報告する。
【０５１１】
図７に示されるように、変異型ＣＴＬＡ−４  ＥＣＤ−Ｆｃは、ＣＩＡ疾患指標スコアによって判定されるようなＣＩＡ進行の発達の遅延によって示されるような他のグループと比較して、ＣＩＡの実質的な低減を示した。これらの結果は、臨床ベンチマークであるアバタセプト（商標Ｏｒｅｎｃｉａ（登録商標）下で販売されている）と比較して、潜在的に優れた様式で、このモデルにおける免疫反応を調節するために共刺激シグナル伝達を阻害する活性を示す変異型ＣＴＬＡ−４  ＥＣＤ−Ｆｃと整合している。
【０５１２】
本発明は、例えば、本発明の様々な態様を例示するために提供される特定の開示される実施形態に、範囲を限定することを意図していない。記載される組成物および方法に対する様々な改変が、本明細書の記載および教示から明らかになるであろう。そのような変動は、本開示の範囲および精神から逸脱することなく実施され得、本開示の範囲内に該当することが意図され得る。
【図１】
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【図２】
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【図３】
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【図４】
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【図５Ａ】
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【図５Ｂ】
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【図５Ｃ】
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【図６Ａ】
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【図６Ｂ】
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【図７】
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【配列表】
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【国際調査報告】
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