(57)【要約】  本開示は、免疫の増強を必要とする患者において、ＰＤ−１、ＴＩＭ−３、およびＬＡＧ−３の２つまたは全てを、これらの標的に対して特異的な抗体を使用して標的とする併用治療に関する。同様に、治療に有用な組成物も本開示に含まれる。治療はがんなどの疾患を処置するために有用である。【特許請求の範囲】
【請求項１】
１２８１９．１５３８４、１２７４８．１５３８１、１２７４８．１６１２４、１２８６５．１５３７７、１２８９２．１５３７８、１２７９６．１５３７６、１２７７７．１５３８２、１２７６０．１５３７５および１３１１２．１５３８０からなる群から選択される抗体と、ヒトＰＤ−１に対する結合に関して競合するか、または該抗体と同じヒトＰＤ−１のエピトープに結合する抗ＰＤ−１抗体またはその抗原結合部分；ならびに
抗ＴＩＭ−３抗体もしくはその抗原結合部分、または抗ＬＡＧ−３抗体もしくはその抗原結合部分
を患者に投与することを含む、それを必要とするヒト患者において免疫を増強する方法。
【請求項２】
抗ＰＤ−１抗体またはその抗原結合部分、抗ＴＩＭ−３抗体またはその抗原結合部分、および抗ＬＡＧ−３抗体またはその抗原結合部分を投与することを含む、請求項１に記載の方法。
【請求項３】
抗ＰＤ−１抗体が、
ａ）配列番号３８８の残基Ｖ６４、Ｌ１２８、Ｐ１３０、Ｋ１３１、およびＡ１３２；
ｂ）配列番号３８８の残基Ｖ４４およびＴ１４５；
ｃ）配列番号３８８の残基Ｋ１３１およびＥ１３６；または
ｄ）配列番号３８８の残基Ｖ４４およびＴ１４５
を含むヒトＰＤ−１のエピトープに結合する、請求項１または２に記載の方法。
【請求項４】
抗ＰＤ−１抗体が、
ａ）配列番号３８８の残基５６〜６４、６９〜９０、および１２２〜１４０；
ｂ）配列番号３８８の残基６９〜９０および１２２〜１４０；
ｃ）配列番号３８８の残基６９〜７５；
ｄ）配列番号３８８の残基１３６〜１４０；または
ｅ）配列番号３８８の残基６９〜７５および１３６〜１４０
を含むヒトＰＤ−１のエピトープに結合する、請求項１または２に記載の方法。
【請求項５】
抗ＰＤ−１抗体が、以下の特性：
ａ）７５０ｐＭまたはそれ未満のＫＤでヒトＰＤ−１に結合すること；
ｂ）７ｎＭまたはそれ未満のＫＤでカニクイザルＰＤ−１に結合すること；
ｃ）１ｎＭまたはそれ未満のＫＤでマウスＰＤ−１に結合すること；
ｄ）ラットＰＤ−１に結合しないこと；
ｅ）ブドウ球菌エンテロトキシンＢ（ＳＥＢ）全血アッセイにおいてＩＬ−２分泌を増加させること；
ｆ）一方向性混合リンパ球反応アッセイにおいてＩＦＮ−γ分泌を増加させること；
ｇ）フローサイトメトリー競合アッセイにおいて１０ｐｇ／ｍＬの濃度でＰＤ−１とＰＤ−Ｌ１との相互作用を少なくとも６０％阻害すること；
ｈ）バイオレイヤー干渉法による分析によって決定した場合に１０ｐｇ／ｍＬの濃度でＰＤ−Ｌ１およびＰＤ−Ｌ２のＰＤ−１に対する結合を少なくとも９０％遮断すること；ならびに
ｉ）インビボで腫瘍増殖を阻害すること
のうちの少なくとも１つを有する、請求項１〜４のいずれか一項に記載の方法。
【請求項６】
抗ＰＤ−１抗体の重鎖相補性決定領域（Ｈ−ＣＤＲ）１〜３および軽鎖相補性決定領域（Ｌ−ＣＤＲ）１〜３が、
ａ）それぞれ、配列番号２２８〜２３３；
ｂ）それぞれ、配列番号２３８〜２４３；
ｃ）それぞれ、配列番号２４８〜２５３；
ｄ）それぞれ、配列番号２５８〜２６３；
ｅ）それぞれ、配列番号２６８〜２７３；
ｆ）それぞれ、配列番号２７８〜２８３；
ｇ）それぞれ、配列番号２８８〜２９３；または
ｈ）それぞれ、配列番号２９８〜３０３
のアミノ酸配列を含む、請求項１〜５のいずれか一項に記載の方法。
【請求項７】
抗ＰＤ−１抗体の重鎖可変ドメイン（ＶＨ）および軽鎖可変ドメイン（ＶＬ）が、
ａ）それぞれ、配列番号２２６および２２７；
ｂ）それぞれ、配列番号２３６および２３７；
ｃ）それぞれ、配列番号２３６および３９２；
ｄ）それぞれ、配列番号２４６および２４７；
ｅ）それぞれ、配列番号２５６および２５７；
ｆ）それぞれ、配列番号２６６および２６７；
ｇ）それぞれ、配列番号２７６および２７７；
ｈ）それぞれ、配列番号２８６および２８７；または
ｉ）それぞれ、配列番号２９６および２９７
のアミノ酸配列を含む、請求項６に記載の方法。
【請求項８】
抗ＰＤ−１抗体が、
ａ）配列番号２２６のアミノ酸配列および配列番号３７５のアミノ酸配列を含む重鎖（ＨＣ）、ならびに配列番号２２７のアミノ酸配列および配列番号３７９のアミノ酸配列を含む軽鎖（ＬＣ）；
ｂ）配列番号２３６のアミノ酸配列および配列番号３７５のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号２３７のアミノ酸配列および配列番号３７９のアミノ酸配列を含むＬＣ；
ｃ）配列番号２３６のアミノ酸配列および配列番号３７５のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号３９２のアミノ酸配列および配列番号３７９のアミノ酸配列を含むＬＣ；
ｄ）配列番号２４６のアミノ酸配列および配列番号３７５のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号２４７のアミノ酸配列および配列番号３７９のアミノ酸配列を含むＬＣ；
ｅ）配列番号２５６のアミノ酸配列および配列番号３７５のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号２５７のアミノ酸配列および配列番号３７９のアミノ酸配列を含むＬＣ；
ｆ）配列番号２６６のアミノ酸配列および配列番号３７５のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号２６７のアミノ酸配列および配列番号３７９のアミノ酸配列を含むＬＣ；
ｇ）配列番号２７６のアミノ酸配列および配列番号３７５のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号２７７のアミノ酸配列および配列番号３７９のアミノ酸配列を含むＬＣ；
ｈ）配列番号２８６のアミノ酸配列および配列番号３７５のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号２８７のアミノ酸配列および配列番号３７９のアミノ酸配列を含むＬＣ；または
ｉ）配列番号２９６のアミノ酸配列および配列番号３７５のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号２９７のアミノ酸配列および配列番号３７９のアミノ酸配列を含むＬＣ
を含む、請求項７に記載の方法。
【請求項９】
抗ＴＩＭ−３抗体が、１５０８６．１７１４５、１５０８６．１５０８６、１５０８６．１６８３７、１５０８６．１７１４４、２０１３１、２０２９３、１５１０５、１５１０７、１５１０９、１５１７４、１５１７５、１５２６０、１５２８４、１５２９９、１５３５３、１５３５４、１７２４４、１７２４５、１９３２４、１９４１６、１９５６８、２０１８５、２０３００、２０３６２、および２０６２１からなる群から選択される抗体と、ヒトＴＩＭ−３に対する結合に関して競合するか、または該抗体と同じヒトＴＩＭ−３のエピトープに結合する、請求項１〜８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１０】
抗ＴＩＭ−３抗体が、
ａ）配列番号３８９の残基Ｐ５０、Ｖ６０、Ｆ６１、Ｅ６２、Ｇ６４、Ｒ６９、Ｉ１１７、Ｍ１１８、およびＤ１２０；
ｂ）配列番号３８９の残基Ｆ６１、Ｒ６９、およびＩ１１７；または
ｃ）配列番号３８９の残基Ｐ５０、Ｆ６１、Ｅ６２、Ｉ１１７、Ｍ１１８、およびＤ１２０
を含むヒトＴＩＭ−３のエピトープに結合する、請求項１〜９のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１１】
抗ＴＩＭ−３抗体が、
ａ）配列番号３８９の残基６２〜６７；または
ｂ）配列番号３８９の残基１１４〜１１７
を含むヒトＴＩＭ−３のエピトープに結合する、請求項１〜１０のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１２】
抗ＴＩＭ−３が、以下の特性：
ａ）表面プラズモン共鳴によって測定した場合に２３ｎＭまたはそれ未満のＫＤでヒトＴＩＭ−３に結合すること；
ｂ）表面プラズモン共鳴によって測定した場合に２２ｎＭまたはそれ未満のＫＤでカニクイザルＴＩＭ−３に結合すること；
ｃ）ＥＬＩＳＡによって測定した場合に１．２ｎＭまたはそれ未満のＥＣ５０でヒトＴＩＭ−３に結合すること；
ｄ）ＥＬＩＳＡによって測定した場合に４６ｎＭまたはそれ未満のＥＣ５０でカニクイザルＴＩＭ−３に結合すること；
ｅ）一方向性混合リンパ球反応アッセイにおいてＩＦＮ−γ分泌を増加させること；
ｆ）二方向性混合リンパ球反応アッセイにおいてＩＦＮ−γ分泌を増加させること；
ｇ）一方向性混合リンパ球反応アッセイにおいてＴＮＦ−α分泌を増加させること；
ｈ）樹状細胞からのＴＮＦ−α分泌を増加させること；および
ｉ）ＴＩＭ−３とホスファチジルセリンとの相互作用を阻害すること
のうちの少なくとも１つを有する、請求項１〜１１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１３】
抗ＴＩＭ−３抗体のＨ−ＣＤＲ１〜３およびＬ−ＣＤＲ１〜３が、
ａ）それぞれ、配列番号８〜１３；
ｂ）それぞれ、配列番号１８〜２３；
ｃ）それぞれ、配列番号２８〜３３；
ｄ）それぞれ、配列番号３８〜４３；
ｅ）それぞれ、配列番号４８〜５３；
ｆ）それぞれ、配列番号５８〜６３；
ｇ）それぞれ、配列番号６８〜７３；
ｈ）それぞれ、配列番号７８〜８３；
ｉ）それぞれ、配列番号８８〜９３；
ｊ）それぞれ、配列番号９８〜１０３；
ｋ）それぞれ、配列番号１０８〜１１３；
ｌ）それぞれ、配列番号１１８〜１２３；
ｍ）それぞれ、配列番号１２８〜１３３；
ｎ）それぞれ、配列番号１３８〜１４３；
ｏ）それぞれ、配列番号１４８〜１５３；
ｐ）それぞれ、配列番号１５８〜１６３；
ｑ）それぞれ、配列番号１６８〜１７３；
ｒ）それぞれ、配列番号１７８〜１８３；
ｓ）それぞれ、配列番号１８８〜１９３；
ｔ）それぞれ、配列番号１９８〜２０３；
ｕ）それぞれ、配列番号２０８〜２１３；または
ｖ）それぞれ、配列番号２１８〜２２３
のアミノ酸配列を含む、請求項１〜１２のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１４】
抗ＴＩＭ−３抗体のＶＨおよびＶＬが、
ａ）それぞれ、配列番号７および４；
ｂ）それぞれ、配列番号３および４；
ｃ）それぞれ、配列番号１６および１７；
ｄ）それぞれ、配列番号２６および２７；
ｅ）それぞれ、配列番号３６および３７；
ｆ）それぞれ、配列番号４６および４７；
ｇ）それぞれ、配列番号５６および５７；
ｈ）それぞれ、配列番号６６および６７；
ｉ）それぞれ、配列番号７６および７７；
ｊ）それぞれ、配列番号８６および８７；
ｋ）それぞれ、配列番号９６および９７；
ｌ）それぞれ、配列番号１０６および１０７；
ｍ）それぞれ、配列番号１１６および１１７；
ｎ）それぞれ、配列番号１２６および１２７；
ｏ）それぞれ、配列番号１３６および１３７；
ｐ）それぞれ、配列番号１４６および１４７；
ｑ）それぞれ、配列番号１５６および１５７；
ｒ）それぞれ、配列番号１６６および１６７；
ｓ）それぞれ、配列番号１７６および１７７；
ｔ）それぞれ、配列番号１８６および１８７；
ｕ）それぞれ、配列番号１９６および１９７；
ｖ）それぞれ、配列番号２０６および２０７；または
ｗ）それぞれ、配列番号２１６および２１７
のアミノ酸配列を含む、請求項１３に記載の方法。
【請求項１５】
抗ＴＩＭ−３抗体が、
ａ）配列番号７のアミノ酸配列および配列番号３７４、３７５、３７６、または３７７のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号４のアミノ酸配列および配列番号３７８のアミノ酸配列を含むＬＣ；
ｂ）配列番号３のアミノ酸配列および配列番号３７４、３７５、３７６、または３７７のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号４のアミノ酸配列および配列番号３７８のアミノ酸配列を含むＬＣ；
ｃ）配列番号１６のアミノ酸配列および配列番号３７４、３７５、３７６、または３７７のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号１７のアミノ酸配列および配列番号３７８のアミノ酸配列を含むＬＣ；
ｄ）配列番号２６のアミノ酸配列および配列番号３７４、３７５、３７６、または３７７のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号２７のアミノ酸配列および配列番号３７８のアミノ酸配列を含むＬＣ；
ｅ）配列番号３６のアミノ酸配列および配列番号３７４、３７５、３７６、または３７７のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号３７のアミノ酸配列および配列番号３７８のアミノ酸配列を含むＬＣ；
ｆ）配列番号４６のアミノ酸配列および配列番号３７４、３７５、３７６、または３７７のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号４７のアミノ酸配列および配列番号３７８のアミノ酸配列を含むＨＣ；
ｇ）配列番号５６のアミノ酸配列および配列番号３７４、３７５、３７６、または３７７のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号５７のアミノ酸配列および配列番号３７８のアミノ酸配列を含むＬＣ；
ｈ）配列番号６６のアミノ酸配列および配列番号３７４、３７５、３７６、または３７７のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号６７のアミノ酸配列および配列番号３７８のアミノ酸配列を含むＬＣ；
ｉ）配列番号７６のアミノ酸配列および配列番号３７４、３７５、３７６、または３７７のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号７７のアミノ酸配列および配列番号３７８のアミノ酸配列を含むＬＣ；
ｊ）配列番号８６のアミノ酸配列および配列番号３７４、３７５、３７６、または３７７のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号８７のアミノ酸配列および配列番号３７８のアミノ酸配列を含むＬＣ；
ｋ）配列番号９６のアミノ酸配列および配列番号３７４、３７５、３７６、または３７７のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号９７のアミノ酸配列および配列番号３７８のアミノ酸配列を含むＬＣ；
ｌ）配列番号１０６のアミノ酸配列および配列番号３７４、３７５、３７６、または３７７のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号１０７のアミノ酸配列および配列番号３７８のアミノ酸配列を含むＬＣ；
ｍ）配列番号１１６のアミノ酸配列および配列番号３７４、３７５、３７６、または３７７のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号１１７のアミノ酸配列および配列番号３７８のアミノ酸配列を含むＬＣ；
ｎ）配列番号１２６のアミノ酸配列および配列番号３７４、３７５、３７６、または３７７のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号１２７のアミノ酸配列および配列番号３７８のアミノ酸配列を含むＬＣ；
ｏ）配列番号１３６のアミノ酸配列および配列番号３７４、３７５、３７６、または３７７のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号１３７のアミノ酸配列および配列番号３７８のアミノ酸配列を含むＬＣ；
ｐ）配列番号１４６のアミノ酸配列および配列番号３７４、３７５、３７６、または３７７のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号１４７のアミノ酸配列および配列番号３７８のアミノ酸配列を含むＬＣ；
ｑ）配列番号１５６のアミノ酸配列および配列番号３７４、３７５、３７６、または３７７のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号１５７のアミノ酸配列および配列番号３７８のアミノ酸配列を含むＬＣ；
ｒ）配列番号１６６のアミノ酸配列および配列番号３７４、３７５、３７６、または３７７のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号１６７のアミノ酸配列および配列番号３７８のアミノ酸配列を含むＬＣ；
ｓ）配列番号１７６のアミノ酸配列および配列番号３７４、３７５、３７６、または３７７のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号１７７のアミノ酸配列および配列番号３７８のアミノ酸配列を含むＬＣ；
ｔ）配列番号１８６のアミノ酸配列および配列番号３７４、３７５、３７６、または３７７のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号１８７のアミノ酸配列および配列番号３７８のアミノ酸配列を含むＬＣ；
ｕ）配列番号１９６のアミノ酸配列および配列番号３７４、３７５、３７６、または３７７のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号１９７のアミノ酸配列および配列番号３７８のアミノ酸配列を含むＬＣ；
ｖ）配列番号２０６のアミノ酸配列および配列番号３７４、３７５、３７６、または３７７のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号２０７のアミノ酸配列および配列番号３７８のアミノ酸配列を含むＬＣ；または
ｗ）配列番号２１６のアミノ酸配列および配列番号３７４、３７５、３７６、または３７７のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号２１７のアミノ酸配列および配列番号３７８のアミノ酸配列を含むＬＣ
を含む、請求項１４に記載の方法。
【請求項１６】
抗ＬＡＧ−３抗体が、１５５３２、１５６４６、１５７２３、１５５９５、１５４３１、１５５７２、および１５０１１からなる群から選択される抗体と、ヒトＬＡＧ−３に対する結合に関して競合するか、または該抗体と同じヒトＬＡＧ−３のエピトープに結合する、請求項１〜１５のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１７】
抗ＬＡＧ−３抗体が、
ａ）配列番号６８の残基Ｈ８５、Ｐ８６、Ａ８７、Ｐ８９、Ｓ９１、Ｗ９２、およびＧ９３；
ｂ）配列番号６８の残基Ａ４０、Ｑ４１、Ｐ４３、Ｐ４６、Ｐ４９、Ｄ５２、Ｔ６２、Ｑ６４、Ｈ６５、Ｑ６６、Ｐ６７、Ｄ６８、Ｇ９３、Ｐ９４、Ｐ９６、Ｒ９８、Ｙ９９、Ｔ１００、Ｖ１０１、Ｐ１０６、Ｇ１０７、Ｒ１１９、Ｅ１２４、Ｒ１２９、Ｇ１３０、Ｄ１３１、Ｓ１３３、Ｒ１３７、Ｐ１３８、Ｄ１４３、Ｒ１４８、およびＲ１６３；
ｃ）配列番号６８の残基Ａ４０、Ｑ４１、Ｐ４３、Ｐ４６、Ｐ４９、Ｄ５２、Ｔ６２、Ｑ６４、Ｈ６５、Ｑ６６、Ｐ６７、Ｄ６８、Ｐ９６、Ｙ９９、Ｔ１００、Ｖ１０１、Ｐ１０６、Ｇ１０７、Ｒ１１９、Ｅ１２４、Ｒ１２９、Ｇ１３０、Ｄ１３１、Ｓ１３３、Ｒ１３７、Ｐ１３８、Ｄ１４３、Ｒ１４８、およびＲ１６３；または
ｄ）配列番号６８の残基Ｇ１０７、Ｌ１０９、Ｒ１１０、およびＳ１１１
を含むヒトＬＡＧ−３のエピトープに結合する、請求項１〜１６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１８】
抗ＬＡＧ−３抗体が、
ａ）配列番号６８の残基９８〜１０５；
ｂ）配列番号６８の残基７８〜１０５および１２３〜１３１；
ｃ）配列番号６８の残基２３〜３０、４０〜６６、８８〜１０５、１２３〜１３７、および１４８〜１５２；または
ｄ）配列番号６８の残基２３〜３０、４０〜６６、９８〜１０５、１１８〜１３７、および１４８〜１６１
を含むヒトＬＡＧ−３のエピトープに結合する、請求項１から１７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１９】
抗ＬＡＧ−３抗体が、以下の特性：
ａ）フローサイトメトリー競合アッセイによって決定した場合に、２０ｐｇ／ｍＬの濃度で、Ａ３７５細胞上のヒトＭＨＣクラスＩＩに対するヒトＬＡＧ−３の結合を陰性対照抗体と比較して８５％より大きく低減させること；
ｂ）フローサイトメトリー競合アッセイによって決定した場合に、２０ｐｇ／ｍＬの濃度で、Ａ３７５細胞上のヒトＭＨＣクラスＩＩに対するヒトＬＡＧ−３の結合を陰性対照抗体と比較して３５％から８５％の間に低減させること；
ｃ）Ｊｕｒｋａｔ細胞において発現されたヒトＬＡＧ−３と、Ｒａｊｉ細胞において発現されたヒトＭＨＣクラスＩＩとの間の結合を遮断すること；
ｄ）フローサイトメトリーによって測定した場合に０．１ｎＭまたはそれ未満のＥＣ５０でヒトＬＡＧ−３に結合すること；
ｅ）フローサイトメトリーによって測定した場合に０．３ｎＭまたはそれ未満のＥＣ５０でカニクイザルＬＡＧ−３に結合すること；
ｆ）表面プラズモン共鳴によって測定した場合に３．０×１０−８またはそれ未満のＫＤでヒトＬＡＧ−３に結合すること；
ｇ）表面プラズモン共鳴によって測定した場合に１．５×１０−７またはそれ未満のＫＤでカニクイザルＬＡＧ−３に結合すること；
ｈ）表面プラズモン共鳴によって測定した場合に３．５×１０−８またはそれ未満のＫＤでマウスＬＡＧ−３に結合すること；
ｉ）ブドウ球菌エンテロトキシンＢ（ＳＥＢ）で処置したヒト末梢血単核細胞（ＰＢＭＣ）におけるＩＬ−２産生を刺激すること；
ｊ）ヒトＴ細胞におけるＬＡＧ−３の細胞レベルを低減させること；
ｋ）ヒトＴ細胞培養におけるＬＡＧ−３の可溶性レベルを低減させること；
ｌ）インビボで腫瘍増殖の退行を誘導すること；
ｍ）インビボで腫瘍増殖を遅らせること；および
ｎ）抗体２５Ｆ７−Ｌａｇ３．５と同じヒトＬＡＧ−３のエピトープに結合しないこと
のうちの少なくとも１つを有する、請求項１〜１８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２０】
抗ＬＡＧ−３抗体のＨ−ＣＤＲ１〜３およびＬ−ＣＤＲ１〜３が、
ａ）それぞれ、配列番号３１８〜３２３；
ｂ）それぞれ、配列番号３０８〜３１３；
ｃ）それぞれ、配列番号３２８〜３３３；
ｄ）それぞれ、配列番号３３８〜３４３；
ｅ）それぞれ、配列番号３４８〜３５３；
ｆ）それぞれ、配列番号３５８〜３６３；または
ｇ）それぞれ、配列番号３６８〜３７３
のアミノ酸配列を含む、請求項１〜１９のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２１】
抗ＬＡＧ−３抗体のＶＨおよびＶＬが、
ａ）それぞれ、配列番号３１６および３１７；
ｂ）それぞれ、配列番号３０６および３０７；
ｃ）それぞれ、配列番号３２６および３２７；
ｄ）それぞれ、配列番号３３６および３３７；
ｅ）それぞれ、配列番号３４６および３４７；
ｆ）それぞれ、配列番号３５６および３５７；または
ｇ）それぞれ、配列番号３６６および３６７
のアミノ酸配列を含む、請求項２０に記載の方法。
【請求項２２】
抗ＬＡＧ−３抗体が、
ａ）配列番号３１６のアミノ酸配列および配列番号３７５のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号３１７のアミノ酸配列および配列番号３７８のアミノ酸配列を含むＬＣ；
ｂ）配列番号３０６のアミノ酸配列および配列番号３７５のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号３０７のアミノ酸配列および配列番号３７８のアミノ酸配列を含むＬＣ；
ｃ）配列番号３２６のアミノ酸配列および配列番号３７５のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号３２７のアミノ酸配列および配列番号３７８のアミノ酸配列を含むＬＣ；
ｄ）配列番号３３６のアミノ酸配列および配列番号３７５のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号３３７のアミノ酸配列および配列番号３７８のアミノ酸配列を含むＬＣ；
ｅ）配列番号３４６のアミノ酸配列および配列番号３７５のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号３４７のアミノ酸配列および配列番号３７８のアミノ酸配列を含むＬＣ；
ｆ）配列番号３５６のアミノ酸配列および配列番号３７５のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号３５７のアミノ酸配列および配列番号３７８のアミノ酸配列を含むＬＣ；または
ｇ）配列番号３６６のアミノ酸配列および配列番号３７５のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号３６７のアミノ酸配列および配列番号３７９のアミノ酸配列を含むＬＣ
を含む、請求項２１に記載の方法。
【請求項２３】
ａ）そのＨ−ＣＤＲ１〜３およびＬ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ、配列番号２２８〜２３３のアミノ酸配列を含む抗ＰＤ−１抗体；ならびにそのＨ−ＣＤＲ１〜３およびＬ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ、配列番号８〜１３のアミノ酸配列を含む抗ＴＩＭ−３抗体；
ｂ）そのＶＨおよびＶＬがそれぞれ、配列番号２２６および２２７のアミノ酸配列を含む抗ＰＤ−１抗体；ならびにそのＶＨおよびＶＬがそれぞれ、配列番号７および４のアミノ酸配列を含む抗ＴＩＭ−３抗体；または
ｃ）配列番号２２６および３７５のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号２２７および３７９のアミノ酸配列を含むＬＣを含む抗ＰＤ−１抗体；ならびに配列番号７および３７７のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号４および３７８のアミノ酸配列を含むＬＣを含む抗ＴＩＭ−３抗体
を患者に投与することを含む、請求項１に記載の方法。
【請求項２４】
ａ）そのＨ−ＣＤＲ１〜３およびＬ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ、配列番号２２８〜２３３のアミノ酸配列を含む抗ＰＤ−１抗体；ならびにそのＨ−ＣＤＲ１〜３およびＬ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ、配列番号３１８〜３２３のアミノ酸配列を含む抗ＬＡＧ−３抗体；
ｂ）そのＶＨおよびＶＬがそれぞれ、配列番号２２６および２２７のアミノ酸配列を含む抗ＰＤ−１抗体；ならびにそのＶＨおよびＶＬがそれぞれ、配列番号３１６および３１７のアミノ酸配列を含む抗ＬＡＧ−３抗体；または
ｃ）配列番号２２６および３７５のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号２２７および３７９のアミノ酸配列を含むＬＣを含む抗ＰＤ−１抗体；ならびに配列番号３１６および３７５のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号３１７および３７８のアミノ酸配列を含むＬＣを含む抗ＬＡＧ−３抗体
を患者に投与することを含む、請求項１に記載の方法。
【請求項２５】
ａ）そのＨ−ＣＤＲ１〜３およびＬ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ、配列番号２２８〜２３３のアミノ酸配列を含む抗ＰＤ−１抗体；そのＨ−ＣＤＲ１〜３およびＬ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ、配列番号８〜１３のアミノ酸配列を含む抗ＴＩＭ−３抗体；ならびにそのＨ−ＣＤＲ１〜３およびＬ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ、配列番号３１８〜３２３のアミノ酸配列を含む抗ＬＡＧ−３抗体；
ｂ）そのＶＨおよびＶＬがそれぞれ、配列番号２２６および２２７のアミノ酸配列を含む抗ＰＤ−１抗体；そのＶＨおよびＶＬがそれぞれ、配列番号７および４のアミノ酸配列を含む抗ＴＩＭ−３抗体；ならびにそのＶＨおよびＶＬがそれぞれ、配列番号３１６および３１７のアミノ酸配列を含む抗ＬＡＧ−３抗体；または
ｃ）配列番号２２６および３７５のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号２２７および３７９のアミノ酸配列を含むＬＣを含む抗ＰＤ−１抗体；配列番号７および３７７のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号４および３７８のアミノ酸配列を含むＬＣを含む抗ＴＩＭ−３抗体；ならびに配列番号３１６および３７５のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号３１７および３７８のアミノ酸配列を含むＬＣを含む抗ＬＡＧ−３抗体
を患者に投与することを含む、請求項１に記載の方法。
【請求項２６】
抗体または抗原結合部分が患者に同時に投与される、請求項１〜２５のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２７】
抗体またはその抗原結合部分が、単一の医薬組成物で投与される、請求項２６に記載の方法。
【請求項２８】
抗体または抗原結合部分が患者に連続的に投与される、請求項１〜２５のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２９】
患者ががんを有する、請求項１〜２８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３０】
がんが血液悪性腫瘍である、請求項２９に記載の方法。
【請求項３１】
血液悪性腫瘍が、白血病、ホジキンリンパ腫、非ホジキンリンパ腫、または骨髄腫である、請求項３０に記載の方法。
【請求項３２】
がんが、固形腫瘍である、請求項２９に記載の方法。
【請求項３３】
がんが、黒色腫、非小細胞肺がん、膀胱がん、頭頚部扁平上皮癌、卵巣がん、結腸直腸がん、腎細胞癌、メルケル細胞癌、線維肉腫、膠肉腫、または膠芽腫である、請求項２９に記載の方法。
【請求項３４】
患者に放射線治療、または化学療法剤、抗新生物剤、および抗血管新生剤のうちの少なくとも１つを投与することをさらに含む、請求項２９〜３３のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３５】
ａ）ヒトＰＤ−１およびヒトＴＩＭ−３；
ｂ）ヒトＰＤ−１およびヒトＬＡＧ−３；または
ｃ）ヒトＰＤ−１、ヒト抗ＴＩＭ−３、およびヒトＬＡＧ−３
に特異的に結合する多特異性抗体。
【請求項３６】
請求項１および３〜８のいずれか一項に定義される抗ＰＤ−１抗体の抗原結合部分、請求項９〜１５のいずれか一項に定義される抗ＴＩＭ−３抗体の抗原結合部分、および／または請求項１６〜２２のいずれか一項に定義される抗ＬＡＧ−３抗体の抗原結合部分を含む、請求項３５に記載の多特異性抗体。
【請求項３７】
（１）請求項１および３〜８のいずれか一項に定義される抗ＰＤ−１抗体もしくはその抗原結合部分、（２）抗ＴＩＭ−３抗体もしくはその抗原結合部分、および／または抗ＬＡＧ−３抗体もしくはその抗原結合部分、ならびに（３）薬学的に許容される賦形剤を含む医薬組成物。
【請求項３８】
抗ＴＩＭ−３抗体が、請求項９〜１５のいずれか一項に定義される抗ＴＩＭ−３抗体である、請求項３７に記載の医薬組成物。
【請求項３９】
抗ＬＡＧ−３抗体が、請求項１６〜２２のいずれか一項に定義される抗ＬＡＧ−３抗体である、請求項３７または３８に記載の医薬組成物。
【請求項４０】
組成物中の抗体が等量で存在する、請求項３７〜３９のいずれか一項に記載の医薬組成物。
【請求項４１】
ａ）そのＨ−ＣＤＲ１〜３およびＬ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ、配列番号２２８〜２３３のアミノ酸配列を含む抗ＰＤ−１抗体；そのＨ−ＣＤＲ１〜３およびＬ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ、配列番号８〜１３のアミノ酸配列を含む抗ＴＩＭ−３抗体；ならびにそのＨ−ＣＤＲ１〜３およびＬ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ、配列番号３１８〜３２３のアミノ酸配列を含む抗ＬＡＧ−３抗体；
ｂ）そのＶＨおよびＶＬがそれぞれ、配列番号２２６および２２７のアミノ酸配列を含む抗ＰＤ−１抗体；そのＶＨおよびＶＬがそれぞれ、配列番号７および４のアミノ酸配列を含む抗ＴＩＭ−３抗体；ならびにそのＶＨおよびＶＬがそれぞれ、配列番号３１６および３１７のアミノ酸配列を含む抗ＬＡＧ−３抗体；または
ｃ）配列番号２２６および３７５のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号２２７および３７９のアミノ酸配列を含むＬＣを含む抗ＰＤ−１抗体；配列番号７および３７７のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号４および３７８のアミノ酸配列を含むＬＣを含む抗ＴＩＭ−３抗体；ならびに配列番号３１６および３７５のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号３１７および３７８のアミノ酸配列を含むＬＣを含む抗ＬＡＧ−３抗体
を含む、請求項３７〜４０のいずれか一項に記載の医薬組成物。
【請求項４２】
請求項１〜３４のいずれか一項に記載の方法におけるヒト患者の処置に使用するための、請求項３７〜４１のいずれか一項に記載の医薬組成物。
【請求項４３】
抗ＴＩＭ−３抗体もしくはその抗原結合部分および／または抗ＬＡＧ−３抗体もしくはその抗原結合部分と組み合わせて、それを必要とするヒト患者における免疫の増強に使用するための、請求項１および３〜８のいずれか一項に定義される抗ＰＤ−１抗体またはその抗原結合部分。
【請求項４４】
抗ＴＩＭ−３抗体が、請求項９〜１５のいずれか一項に定義される抗ＴＩＭ−３抗体である、請求項４３に記載の抗ＰＤ−１抗体またはその抗原結合部分。
【請求項４５】
抗ＬＡＧ−３抗体が、請求項１６〜２２のいずれか一項に定義される抗ＬＡＧ−３抗体である、請求項４３または４４に記載の抗ＰＤ−１抗体またはその抗原結合部分。
【請求項４６】
請求項１〜３４のいずれか一項に記載の方法におけるヒト患者の処置に使用するための、請求項１および３〜８のいずれか一項に定義される抗ＰＤ−１抗体またはその抗原結合部分。
【請求項４７】
抗ＴＩＭ−３抗体もしくはその抗原結合部分および／または抗ＬＡＧ−３抗体もしくはその抗原結合部分と組み合わせて、それを必要とするヒト患者における免疫を増強する薬剤の製造のための、抗ＰＤ−１抗体またはその抗原結合部分の使用であって、抗ＰＤ−１抗体または抗原結合部分が、請求項１および３〜８のいずれか一項に定義される通りである使用。
【請求項４８】
抗ＴＩＭ−３抗体が、請求項９〜１５のいずれか一項に定義される抗ＴＩＭ−３抗体である、請求項４７に記載の使用。
【請求項４９】
抗ＬＡＧ−３抗体が、請求項１６〜２２のいずれか一項に定義される抗ＬＡＧ−３抗体である、請求項４７または４８に記載の使用。
【請求項５０】
請求項１〜３４のいずれか一項に記載の方法におけるヒト患者を処置する薬剤の製造のための、請求項１および３〜８のいずれか一項に定義される抗ＰＤ−１抗体またはその抗原結合部分の使用。
【請求項５１】
請求項１および３〜８のいずれか一項に定義される抗ＰＤ−１抗体もしくはその抗原結合部分、ならびに抗ＴＩＭ−３抗体もしくはその抗原結合部分および／または抗ＬＡＧ−３抗体もしくはその抗原結合部分を含む製品であって、患者における免疫を増強するために適している製品。
【請求項５２】
抗ＴＩＭ−３抗体が、請求項９〜１５のいずれか一項に定義される抗ＴＩＭ−３抗体である、請求項５１に記載の製品。
【請求項５３】
抗ＬＡＧ−３抗体が、請求項１６〜２２のいずれか一項に定義される抗ＬＡＧ−３抗体である、請求項５１または５２に記載の製品。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
関連出願の相互参照
本出願は、その開示の全体が参照により本明細書に組み込まれている、２０１７年４月５日に提出された米国仮特許出願第６２／４８１，９７３号の優先権を主張する。
【０００２】
配列表
本出願は、ＡＳＣＩＩフォーマットで電子提出されており、全体が参照により本明細書に組み込まれている配列表を含む。配列表の電子コピーは、２０１８年３月２３日に作成され、名称は０２２６７５＿ＷＯ０５８＿ＳＬ．ｔｘｔであり、サイズは２３２，３６０バイトである。
【背景技術】
【０００３】
ＰＤ−１は、プログラム細胞死タンパク質１およびＣＤ２７９としても知られており、免疫グロブリンスーパーファミリーに属するアミノ酸２６８個の細胞表面受容体である。ＰＤ−１は、ＣＤ２８Ｔ細胞調節因子ファミリーのメンバーであり、Ｔ細胞、Ｂ細胞、およびマクロファージにおいて発現される。ＰＤ−１は、リガンドＰＤ−Ｌ１（Ｂ７ホモロクとしても知られる）およびＰＤ−Ｌ２（Ｂ７−ＤＣとしても知られる）に結合する。ＰＤ−１は、その構造が、細胞外ＩｇＶドメイン、膜貫通領域、および２つのリン酸化部位を含む細胞内テールを含む、Ｉ型膜タンパク質である。免疫チェックポイントタンパク質として知られるＰＤ−１は、誘導型免疫調節性受容体として機能し、例えば抗原刺激に対するＴ細胞応答の負の調節において役割を有する。
【０００４】
ＰＤ−Ｌ１は、ＰＤ−１の主なリガンドである。ＰＤ−Ｌ１がＰＤ−１に結合すると、Ｔ細胞活性を阻害し、サイトカイン産生を低減させ、およびＴ細胞増殖を抑制する。ＰＤ−Ｌ１を発現するがん細胞は、この機構を利用して、ＰＤ−Ｌ１のＰＤ−１受容体に対する結合を介してＴ細胞の抗腫瘍活性を不活化することができる。その免疫応答を調節する役割を考慮して、ＰＤ−１は、がんおよび自己免疫疾患の処置を含む免疫療法の潜在的標的として研究されている。２つの抗ＰＤ−１抗体、すなわちペンブロリズマブおよびニボルマブが、米国および欧州において特定のがんの処置に関して承認されている。
【０００５】
他の免疫チェックポイントタンパク質には、ＴＩＭ−３（Ｔ細胞免疫グロブリン・ムチンドメイン含有分子３）およびＬＡＧ−３（リンパ球活性化遺伝子３）が挙げられる。ＴＩＭ−３は、ＨＡＶＣＲ２（Ａ型肝炎ウイルス細胞受容体２）またはＣＤ３６６としても知られ、Ｔ細胞免疫グロブリン・ムチンドメインタンパク質ファミリーのメンバーである。ＴＩＭ−３は、ヒトではＨａｖｃｒ２遺伝子によってコードされ、膜遠位のＩｇＶドメインおよび膜近位のムチンドメインを有する３３ＫＤａのＩ型糖タンパク質である。これは、細胞内ドメインにＴｙｒ残基５個の保存された領域を含み、これはリガンドが結合するとリン酸化される。ＴＩＭ−３は、Ｔ細胞、樹状細胞、マクロファージ、およびナチュラルキラー（ＮＫ）細胞を含む適応免疫系および自然免疫系の両方に由来する多様な異なる細胞によって発現される。ＴＩＭ−３発現は、ナイーブＴ細胞では低いが、Ｔ細胞が活性化されると、高度にアップレギュレートされる。Ｔ細胞とは対照的に、自然の細胞、例えば樹状細胞、ＮＫ細胞、および単球は、高い基礎ＴＩＭ−３発現を有する。ＴＩＭ−３は、ガレクチン−９、ホスファチジルセリン、ＣＥＡＣＡＭ−１、およびＨＭＧＢ−１を含むいくつかの主に雑多なリガンドに会合しているが、これらのリガンドの正確な役割は現在のところ不明である。
【０００６】
ＴＩＭ−３は、チェックポイント阻害剤であると示唆されているが、ＴＩＭ−３が、例えばＰＤ−１と類似の方法でＴ細胞活性化またはサイトカイン分泌の抑制を直接媒介するという考え方の根拠となる証拠は比較的少ない。さらに、ＰＤ−１とは対照的に、ＴＩＭ−３は、自然免疫系の細胞、特に樹状細胞の調節において役割を果たすように思われる。ＴＩＭ−３に関連する機能的データの大部分およびその腫瘍免疫における役割は、様々な抗体を使用するインビボ（ｉｎ  ｖｉｖｏ）試験に由来する。これらの試験のほとんどでは、抗体の検証が不十分であるために、ＴＩＭ−３抗体の効果が、リガンド結合の阻害によって媒介されるのか、または標的に対するアゴニスト作用によって媒介されるのか明確ではない。その免疫応答調節特性を考慮して、ＴＩＭ−３は、がんおよび自己免疫疾患の処置を含む免疫療法の潜在的標的として研究されている。単一の抗ＴＩＭ−３抗体が、現在臨床開発中であるが、現在のところ、承認された抗ＴＩＭ−３抗体はない。
【０００７】
ＬＡＧ−３は、ＣＤ２２３としても知られ、免疫チェックポイント受容体として機能する免疫グロブリンスーパーファミリータンパク質である。成熟タンパク質は、４つの細胞外Ｉｇ様ドメインを有するアミノ酸５０３個のＩ型膜貫通タンパク質である。これは、活性化Ｔ細胞、制御性Ｔ（Ｔｒｅｇ）細胞、ナチュラルキラー細胞、Ｂ細胞、および形質細胞様樹状細胞を含む様々なタイプの細胞において発現されている。ＬＡＧ−３の配列データ、エクソン／イントロン構成、および染色体局在化に関する情報は、これがＣＤ４と近縁であることを示している。ＣＤ４と同様に、ＬＡＧ−３は、ＭＨＣクラスＩＩ分子に結合するが、ＣＤ４と比較するとより高い親和性で別個の部位に結合する。
【０００８】
ＬＡＧ−３は、ＣＴＬＡ−４およびＰＤ−１と類似の方法でＴ細胞の増殖、活性化、および恒常性を調節すると考えられている共刺激受容体である。リガンドが細胞外ドメインに結合すると、ＬＡＧ−３は、細胞質ドメインを介するその後のシグナル伝達を通してその効果を発揮する。ＬＡＧ−３の最もよく特徴付けられているリガンドは、ＭＨＣクラスＩＩ（ＭＨＣＩＩ）であるが、ＬＳＥＣｔｉｎを含む他のＬＡＧ−３リガンドが記載されている。ＬＡＧ−３は、古典的なＩＴＩＭまたはＩＴＳＭモチーフを有しないが、保存されたＫＩＥＥＬＥモチーフ（配列番号３９７）を有し、これはＴ細胞活性に対するその阻害効果を達成するために必須であると考えられている。ＬＡＧ−３がＴ細胞活性に影響を及ぼす正確な機序は、十分に理解されていない。ＬＡＧ−３は、活性化Ｔ細胞が細胞周期の増殖相に入るのを遮断し、その結果Ｓ期に細胞が蓄積することによって、Ｔ細胞の増大を阻害する。ＬＡＧ−３はまた、制御性Ｔ細胞の抑制性活性の増強および樹状細胞機能の調節において役割を果たすと考えられている。がん細胞は、エフェクターＴ細胞上のＬＡＧ−３に結合するＭＨＣＩＩの発現をアップレギュレートする能力を有し、このようにしてその活性を阻害し、腫瘍免疫の回避を誘導する。
【０００９】
免疫調節剤としてのＰＤ−１、ＬＡＧ−３、およびＴＩＭ−３の重要な役割を考慮すると、がんおよび免疫系のある特定の障害を処置するためにこれらの受容体を標的とする新規のおよび改善された併用治療が必要である。
【発明の概要】
【発明が解決しようとする課題】
【００１０】
本発明は、抗ＰＤ−１抗体、例えば本明細書に記載の抗体が免疫を増強する効能が、抗体を、抗ＴＩＭ−３抗体および／または抗ＬＡＧ−３抗体と組み合わせて使用すると、有意に増加するという発見に基づいている。本発明者らは、本発明の併用治療が、患者自身の抗がん免疫を活性化することによってヒト患者におけるがんを処置するために特に有効であることを見出した。抗体処置を含む現在利用可能ながんの処置と比較すると、本発明の併用治療は、優れた臨床応答を提供しうると企図される。
【課題を解決するための手段】
【００１１】
したがって、本発明は、（１）１２８１９．１５３８４、１２７４８．１５３８１、１２７４８．１６１２４、１２８６５．１５３７７、１２８９２．１５３７８、１２７９６．１５３７６、１２７７７．１５３８２、１２７６０．１５３７５および１３１１２．１５３８０からなる群から選択される抗体と、ヒトＰＤ−１に対する結合に関して競合するか、または該抗体と同じヒトＰＤ−１のエピトープに結合する抗ＰＤ−１抗体またはその抗原結合部分；ならびに（２）抗ＴＩＭ−３抗体もしくはその抗原結合部分、および／または抗ＬＡＧ−３抗体もしくはその抗原結合部分、を患者に投与することによって、がん患者などのそれを必要とするヒト患者において免疫を増強する方法を提供する。ある特定の実施形態において、方法は、抗ＰＤ−１抗体またはその抗原結合部分、抗ＴＩＭ−３抗体またはその抗原結合部分、および抗ＬＡＧ−３抗体またはその抗原結合部分を投与することを含む。
【００１２】
一部の実施形態において、抗ＰＤ−１抗体は、
ａ）配列番号３８８の残基Ｖ６４、Ｌ１２８、Ｐ１３０、Ｋ１３１、およびＡ１３２；
ｂ）配列番号３８８の残基Ｖ４４およびＴ１４５；
ｃ）配列番号３８８の残基Ｋ１３１およびＥ１３６；または
ｄ）配列番号３８８の残基Ｖ４４およびＴ１４５
を含むヒトＰＤ−１のエピトープに結合する。
【００１３】
一部の実施形態において、抗ＰＤ−１抗体は、
ａ）配列番号３８８の残基５６〜６４、６９〜９０、および１２２〜１４０；
ｂ）配列番号３８８の残基６９〜９０および１２２〜１４０；
ｃ）配列番号３８８の残基６９〜７５；
ｄ）配列番号３８８の残基１３６〜１４０；または
ｅ）配列番号３８８の残基６９〜７５および１３６〜１４０
を含むヒトＰＤ−１のエピトープに結合する。
【００１４】
一部の実施形態において、抗ＰＤ−１抗体は、以下の特性：
ａ）７５０ｐＭまたはそれ未満のＫＤでヒトＰＤ−１に結合すること；
ｂ）７ｎＭまたはそれ未満のＫＤでカニクイザルＰＤ−１に結合すること；
ｃ）１ｎＭまたはそれ未満のＫＤでマウスＰＤ−１に結合すること；
ｄ）ラットＰＤ−１に結合しないこと；
ｅ）ブドウ球菌（Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃａｌ）エンテロトキシンＢ（ＳＥＢ）全血アッセイにおいてＩＬ−２分泌を増加させること；
ｆ）一方向性混合リンパ球反応アッセイにおいてＩＦＮ−γ分泌を増加させること；
ｇ）フローサイトメトリー競合アッセイにおいて１０μｇ／ｍｌの濃度でＰＤ−１とＰＤ−Ｌ１との相互作用を少なくとも６０％阻害すること；
ｈ）バイオレイヤー干渉法による分析によって決定した場合に１０μｇ／ｍｌの濃度でＰＤ−Ｌ１およびＰＤ−Ｌ２のＰＤ−１に対する結合を少なくとも９０％遮断すること；ならびに
ｉ）インビボ（ｉｎ  ｖｉｖｏ）で腫瘍増殖を阻害すること、のうちの少なくとも１つを有する。ある特定の実施形態において、抗ＰＤ−１抗体は、前記特性の全てを有する。
【００１５】
一部の実施形態において、抗ＰＤ−１抗体の重鎖相補性決定領域（Ｈ−ＣＤＲ）１〜３および軽鎖相補性決定領域（Ｌ−ＣＤＲ）１〜３は、
ａ）それぞれ、配列番号２２８〜２３３；
ｂ）それぞれ、配列番号２３８〜２４３；
ｃ）それぞれ、配列番号２４８〜２５３；
ｄ）それぞれ、配列番号２５８〜２６３；
ｅ）それぞれ、配列番号２６８〜２７３；
ｆ）それぞれ、配列番号２７８〜２８３；
ｇ）それぞれ、配列番号２８８〜２９３；または
ｈ）それぞれ、配列番号２９８〜３０３
のアミノ酸配列を含む。
【００１６】
一部の実施形態において、抗ＰＤ−１抗体の重鎖および軽鎖可変ドメインは、
ａ）それぞれ、配列番号２２６および２２７；
ｂ）それぞれ、配列番号２３６および２３７；
ｃ）それぞれ、配列番号２３６および３９２；
ｄ）それぞれ、配列番号２４６および２４７；
ｅ）それぞれ、配列番号２５６および２５７；
ｆ）それぞれ、配列番号２６６および２６７；
ｇ）それぞれ、配列番号２７６および２７７；
ｈ）それぞれ、配列番号２８６および２８７；または
ｉ）それぞれ、配列番号２９６および２９７
のアミノ酸配列を含む。
【００１７】
一部の実施形態において、抗ＰＤ−１抗体は、
ａ）配列番号２２６のアミノ酸配列および配列番号３７５のアミノ酸配列を含む重鎖（ＨＣ）、ならびに配列番号２２７のアミノ酸配列および配列番号３７９のアミノ酸配列を含む軽鎖（ＬＣ）；
ｂ）配列番号２３６のアミノ酸配列および配列番号３７５のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号２３７のアミノ酸配列および配列番号３７９のアミノ酸配列を含むＬＣ；
ｃ）配列番号２３６のアミノ酸配列および配列番号３７５のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号３９２のアミノ酸配列および配列番号３７９のアミノ酸配列を含むＬＣ；
ｄ）配列番号２４６のアミノ酸配列および配列番号３７５のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号２４７のアミノ酸配列および配列番号３７９のアミノ酸配列を含むＬＣ；
ｅ）配列番号２５６のアミノ酸配列および配列番号３７５のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号２５７のアミノ酸配列および配列番号３７９のアミノ酸配列を含むＬＣ；
ｆ）配列番号２６６のアミノ酸配列および配列番号３７５のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号２６７のアミノ酸配列および配列番号３７９のアミノ酸配列を含むＬＣ；
ｇ）配列番号２７６のアミノ酸配列および配列番号３７５のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号２７７のアミノ酸配列および配列番号３７９のアミノ酸配列を含むＬＣ；
ｈ）配列番号２８６のアミノ酸配列および配列番号３７５のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号２８７のアミノ酸配列および配列番号３７９のアミノ酸配列を含むＬＣ；または
ｉ）配列番号２９６のアミノ酸配列および配列番号３７５のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号２９７のアミノ酸配列および配列番号３７９のアミノ酸配列を含むＬＣ
を含む。
【００１８】
一部の実施形態において、抗ＴＩＭ−３抗体は、
１５０８６．１７１４５、１５０８６．１５０８６、１５０８６．１６８３７、１５０８６．１７１４４、２０１３１、２０２９３、１５１０５、１５１０７、１５１０９、１５１７４、１５１７５、１５２６０、１５２８４、１５２９９、１５３５３、１５３５４、１７２４４、１７２４５、１９３２４、１９４１６、１９５６８、２０１８５、２０３００、２０３６２、および２０６２１からなる群から選択される抗体と、ヒトＴＩＭ−３に対する結合に関して競合するか、または該抗体と同じヒトＴＩＭ−３のエピトープに結合する。
【００１９】
一部の実施形態において、抗ＴＩＭ−３抗体は、
ａ）配列番号３８９の残基Ｐ５０、Ｖ６０、Ｆ６１、Ｅ６２、Ｇ６４、Ｒ６９、Ｉ１１７、Ｍ１１８、およびＤ１２０；
ｂ）配列番号３８９の残基Ｆ６１、Ｒ６９、およびＩ１１７；または
ｃ）配列番号３８９の残基Ｐ５０、Ｆ６１、Ｅ６２、Ｉ１１７、Ｍ１１８、およびＤ１２０
を含むヒトＴＩＭ−３のエピトープに結合する。
【００２０】
一部の実施形態において、抗ＴＩＭ−３抗体は、
ａ）配列番号３８９の残基６２〜６７；または
ｂ）配列番号３８９の残基１１４〜１１７
を含むヒトＴＩＭ−３のエピトープに結合する。
【００２１】
一部の実施形態において、抗ＴＩＭ−３抗体は、以下の特性：
ａ）表面プラズモン共鳴によって測定した場合に２３ｎＭまたはそれ未満のＫＤでヒトＴＩＭ−３に結合すること；
ｂ）表面プラズモン共鳴によって測定した場合に２２ｎＭまたはそれ未満のＫＤでカニクイザルＴＩＭ−３に結合すること；
ｃ）ＥＬＩＳＡによって測定した場合に１．２ｎＭまたはそれ未満のＥＣ５０でヒトＴＩＭ−３に結合すること；
ｄ）ＥＬＩＳＡによって測定した場合に４６ｎＭまたはそれ未満のＥＣ５０でカニクイザルＴＩＭ−３に結合すること；
ｅ）一方向性混合リンパ球反応アッセイにおいてＩＦＮ−γ分泌を増加させること；
ｆ）二方向性混合リンパ球反応アッセイにおいてＩＦＮ−γ分泌を増加させること；
ｇ）一方向性混合リンパ球反応アッセイにおいてＴＮＦ−α分泌を増加させること；
ｈ）樹状細胞からのＴＮＦ−α分泌を増加させること；および
ｉ）ＴＩＭ−３とホスファチジルセリンとの相互作用を阻害すること
のうちの少なくとも１つを有する。ある特定の実施形態において、抗ＴＩＭ−３抗体は、少なくとも特性ａ）、ｃ）、ｄ）、ｅ）、ｇ）、ｈ）、およびｉ）を有する。
【００２２】
一部の実施形態において、抗ＴＩＭ−３抗体のＨ−ＣＤＲ１〜３およびＬ−ＣＤＲ１〜３は、
ａ）それぞれ、配列番号８〜１３；
ｂ）それぞれ、配列番号１８〜２３；
ｃ）それぞれ、配列番号２８〜３３；
ｄ）それぞれ、配列番号３８〜４３；
ｅ）それぞれ、配列番号４８〜５３；
ｆ）それぞれ、配列番号５８〜６３；
ｇ）それぞれ、配列番号６８〜７３；
ｈ）それぞれ、配列番号７８〜８３；
ｉ）それぞれ、配列番号８８〜９３；
ｊ）それぞれ、配列番号９８〜１０３；
ｋ）それぞれ、配列番号１０８〜１１３；
ｌ）それぞれ、配列番号１１８〜１２３；
ｍ）それぞれ、配列番号１２８〜１３３；
ｎ）それぞれ、配列番号１３８〜１４３；
ｏ）それぞれ、配列番号１４８〜１５３；
ｐ）それぞれ、配列番号１５８〜１６３；
ｑ）それぞれ、配列番号１６８〜１７３；
ｒ）それぞれ、配列番号１７８〜１８３；
ｓ）それぞれ、配列番号１８８〜１９３；
ｔ）それぞれ、配列番号１９８〜２０３；
ｕ）それぞれ、配列番号２０８〜２１３；または
ｖ）それぞれ、配列番号２１８〜２２３
のアミノ酸配列を含む。
【００２３】
一部の実施形態において、抗ＴＩＭ−３抗体の重鎖および軽鎖可変ドメインは、
ａ）それぞれ、配列番号７および４；
ｂ）それぞれ、配列番号３および４；
ｃ）それぞれ、配列番号１６および１７；
ｄ）それぞれ、配列番号２６および２７；
ｅ）それぞれ、配列番号３６および３７；
ｆ）それぞれ、配列番号４６および４７；
ｇ）それぞれ、配列番号５６および５７；
ｈ）それぞれ、配列番号６６および６７；
ｉ）それぞれ、配列番号７６および７７；
ｊ）それぞれ、配列番号８６および８７；
ｋ）それぞれ、配列番号９６および９７；
ｌ）それぞれ、配列番号１０６および１０７；
ｍ）それぞれ、配列番号１１６および１１７；
ｎ）それぞれ、配列番号１２６および１２７；
ｏ）それぞれ、配列番号１３６および１３７；
ｐ）それぞれ、配列番号１４６および１４７；
ｑ）それぞれ、配列番号１５６および１５７；
ｒ）それぞれ、配列番号１６６および１６７；
ｓ）それぞれ、配列番号１７６および１７７；
ｔ）それぞれ、配列番号１８６および１８７；
ｕ）それぞれ、配列番号１９６および１９７；
ｖ）それぞれ、配列番号２０６および２０７；または
ｗ）それぞれ、配列番号２１６および２１７
のアミノ酸配列を含む。
【００２４】
一部の実施形態において、抗ＴＩＭ−３抗体は、
ａ）配列番号７のアミノ酸配列および配列番号３７４、３７５、３７６、または３７７のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号４のアミノ酸配列および配列番号３７８のアミノ酸配列を含むＬＣ；
ｂ）配列番号３のアミノ酸配列および配列番号３７４、３７５、３７６、または３７７のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号４のアミノ酸配列および配列番号３７８のアミノ酸配列を含むＬＣ；
ｃ）配列番号１６のアミノ酸配列および配列番号３７４、３７５、３７６、または３７７のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号１７のアミノ酸配列および配列番号３７８のアミノ酸配列を含むＬＣ；
ｄ）配列番号２６のアミノ酸配列および配列番号３７４、３７５、３７６、または３７７のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号２７のアミノ酸配列および配列番号３７８のアミノ酸配列を含むＬＣ；
ｅ）配列番号３６のアミノ酸配列および配列番号３７４、３７５、３７６、または３７７のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号３７のアミノ酸配列および配列番号３７８のアミノ酸配列を含むＬＣ；
ｆ）配列番号４６のアミノ酸配列および配列番号３７４、３７５、３７６、または３７７のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号４７のアミノ酸配列および配列番号３７８のアミノ酸配列を含むＨＣ；
ｇ）配列番号５６のアミノ酸配列および配列番号３７４、３７５、３７６、または３７７のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号５７のアミノ酸配列および配列番号３７８のアミノ酸配列を含むＬＣ；
ｈ）配列番号６６のアミノ酸配列および配列番号３７４、３７５、３７６、または３７７のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号６７のアミノ酸配列および配列番号３７８のアミノ酸配列を含むＬＣ；
ｉ）配列番号７６のアミノ酸配列および配列番号３７４、３７５、３７６、または３７７のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号７７のアミノ酸配列および配列番号３７８のアミノ酸配列を含むＬＣ；
ｊ）配列番号８６のアミノ酸配列および配列番号３７４、３７５、３７６、または３７７のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号８７のアミノ酸配列および配列番号３７８のアミノ酸配列を含むＬＣ；
ｋ）配列番号９６のアミノ酸配列および配列番号３７４、３７５、３７６、または３７７のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号９７のアミノ酸配列および配列番号３７８のアミノ酸配列を含むＬＣ；
ｌ）配列番号１０６のアミノ酸配列および配列番号３７４、３７５、３７６、または３７７のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号１０７のアミノ酸配列および配列番号３７８のアミノ酸配列を含むＬＣ；
ｍ）配列番号１１６のアミノ酸配列および配列番号３７４、３７５、３７６、または３７７のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号１１７のアミノ酸配列および配列番号３７８のアミノ酸配列を含むＬＣ；
ｎ）配列番号１２６のアミノ酸配列および配列番号３７４、３７５、３７６、または３７７のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号１２７のアミノ酸配列および配列番号３７８のアミノ酸配列を含むＬＣ；
ｏ）配列番号１３６のアミノ酸配列および配列番号３７４、３７５、３７６、または３７７のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号１３７のアミノ酸配列および配列番号３７８のアミノ酸配列を含むＬＣ；
ｐ）配列番号１４６のアミノ酸配列および配列番号３７４、３７５、３７６、または３７７のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号１４７のアミノ酸配列および配列番号３７８のアミノ酸配列を含むＬＣ；
ｑ）配列番号１５６のアミノ酸配列および配列番号３７４、３７５、３７６、または３７７のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号１５７のアミノ酸配列および配列番号３７８のアミノ酸配列を含むＬＣ；
ｒ）配列番号１６６のアミノ酸配列および配列番号３７４、３７５、３７６、または３７７のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号１６７のアミノ酸配列および配列番号３７８のアミノ酸配列を含むＬＣ；
ｓ）配列番号１７６のアミノ酸配列および配列番号３７４、３７５、３７６、または３７７のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号１７７のアミノ酸配列および配列番号３７８のアミノ酸配列を含むＬＣ；
ｔ）配列番号１８６のアミノ酸配列および配列番号３７４、３７５、３７６、または３７７のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号１８７のアミノ酸配列および配列番号３７８のアミノ酸配列を含むＬＣ；
ｕ）配列番号１９６のアミノ酸配列および配列番号３７４、３７５、３７６、または３７７のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号１９７のアミノ酸配列および配列番号３７８のアミノ酸配列を含むＬＣ；
ｖ）配列番号２０６のアミノ酸配列および配列番号３７４、３７５、３７６、または３７７のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号２０７のアミノ酸配列および配列番号３７８のアミノ酸配列を含むＬＣ；または
ｗ）配列番号２１６のアミノ酸配列および配列番号３７４、３７５、３７６、または３７７のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号２１７のアミノ酸配列および配列番号３７８のアミノ酸配列を含むＬＣ
を含む。
【００２５】
一部の実施形態において、抗ＬＡＧ−３抗体は、１５５３２、１５６４６、１５７２３、１５５９５、１５４３１、１５５７２、および１５０１１からなる群から選択される抗体と、ヒトＬＡＧ−３に対する結合に関して競合するか、または該抗体と同じヒトＬＡＧ−３のエピトープに結合する。
【００２６】
一部の実施形態において、抗ＬＡＧ−３抗体は、
ａ）配列番号６８の残基Ｈ８５、Ｐ８６、Ａ８７、Ｐ８９、Ｓ９１、Ｗ９２、およびＧ９３；
ｂ）配列番号６８の残基Ａ４０、Ｑ４１、Ｐ４３、Ｐ４６、Ｐ４９、Ｄ５２、Ｔ６２、Ｑ６４、Ｈ６５、Ｑ６６、Ｐ６７、Ｄ６８、Ｇ９３、Ｐ９４、Ｐ９６、Ｒ９８、Ｙ９９、Ｔ１００、Ｖ１０１、Ｐ１０６、Ｇ１０７、Ｒ１１９、Ｅ１２４、Ｒ１２９、Ｇ１３０、Ｄ１３１、Ｓ１３３、Ｒ１３７、Ｐ１３８、Ｄ１４３、Ｒ１４８、およびＲ１６３；
ｃ）配列番号６８の残基Ａ４０、Ｑ４１、Ｐ４３、Ｐ４６、Ｐ４９、Ｄ５２、Ｔ６２、Ｑ６４、Ｈ６５、Ｑ６６、Ｐ６７、Ｄ６８、Ｐ９６、Ｙ９９、Ｔ１００、Ｖ１０１、Ｐ１０６、Ｇ１０７、Ｒ１１９、Ｅ１２４、Ｒ１２９、Ｇ１３０、Ｄ１３１、Ｓ１３３、Ｒ１３７、Ｐ１３８、Ｄ１４３、Ｒ１４８、およびＲ１６３；または
ｄ）配列番号６８の残基Ｇ１０７、Ｌ１０９、Ｒ１１０、およびＳ１１１
を含むヒトＬＡＧ−３のエピトープに結合する。
【００２７】
一部の実施形態において、抗ＬＡＧ−３抗体は、
ａ）配列番号６８の残基９８〜１０５；
ｂ）配列番号６８の残基７８〜１０５および１２３〜１３１；
ｃ）配列番号６８の残基２３〜３０、４０〜６６、８８〜１０５、１２３〜１３７、および１４８〜１５２；または
ｄ）配列番号６８の残基２３〜３０、４０〜６６、９８〜１０５、１１８〜１３７、および１４８〜１６１
を含むヒトＬＡＧ−３のエピトープに結合する。
【００２８】
一部の実施形態において、抗ＬＡＧ−３抗体は以下の特性：
ａ）フローサイトメトリー競合アッセイによって決定した場合に、２０μｇ／ｍＬの濃度で、Ａ３７５細胞上のヒトＭＨＣクラスＩＩに対するヒトＬＡＧ−３の結合を陰性対照抗体と比較して８５％より大きく低減させること；
ｂ）フローサイトメトリー競合アッセイによって決定した場合に、２０μｇ／ｍＬの濃度で、Ａ３７５細胞上のヒトＭＨＣクラスＩＩに対するヒトＬＡＧ−３の結合を陰性対照抗体と比較して３５％から８５％の間に低減させること；
ｃ）Ｊｕｒｋａｔ細胞において発現されたヒトＬＡＧ−３と、Ｒａｊｉ細胞において発現されたヒトＭＨＣクラスＩＩとの間の結合を遮断すること；
ｄ）フローサイトメトリーによって測定した場合に０．１ｎＭまたはそれ未満のＥＣ５０でヒトＬＡＧ−３に結合すること；
ｅ）フローサイトメトリーによって測定した場合に０．３ｎＭまたはそれ未満のＥＣ５０でカニクイザルＬＡＧ−３に結合すること；
ｆ）表面プラズモン共鳴によって測定した場合に３．０×１０−８またはそれ未満のＫＤでヒトＬＡＧ−３に結合すること；
ｇ）表面プラズモン共鳴によって測定した場合に１．５×１０−７またはそれ未満のＫＤでカニクイザルＬＡＧ−３に結合すること；
ｈ）表面プラズモン共鳴によって測定した場合に３．５×１０−８またはそれ未満のＫＤでマウスＬＡＧ−３に結合すること；
ｉ）ブドウ球菌エンテロトキシンＢ（ＳＥＢ）で処置したヒト末梢血単核細胞（ＰＢＭＣ）におけるＩＬ−２産生を刺激すること；
ｊ）ヒトＴ細胞におけるＬＡＧ−３の細胞レベルを低減させること；
ｋ）ヒトＴ細胞培養におけるＬＡＧ−３の可溶性レベルを低減させること；
ｌ）インビボで腫瘍増殖の退行を誘導すること；
ｍ）インビボで腫瘍増殖を遅らせること；および
ｎ）抗体２５Ｆ７−Ｌａｇ３．５と同じヒトＬＡＧ−３のエピトープに結合しないこと
のうちの少なくとも１つを有する。ある特定の実施形態において、抗ＬＡＧ−３抗体は、少なくとも特性ａ）、ｃ）、ｄ）、ｅ）、ｆ）、ｇ）、ｉ）、ｊ）、ｋ）、ｍ）およびｎ）を有する。
【００２９】
ある特定の実施形態において、抗ＬＡＧ−３抗体のＨ−ＣＤＲ１〜３およびＬ−ＣＤＲ１〜３は、
ａ）それぞれ、配列番号３１８〜３２３；
ｂ）それぞれ、配列番号３０８〜３１３；
ｃ）それぞれ、配列番号３２８〜３３３；
ｄ）それぞれ、配列番号３３８〜３４３；
ｅ）それぞれ、配列番号３４８〜３５３；
ｆ）それぞれ、配列番号３５８〜３６３；または
ｇ）それぞれ、配列番号３６８〜３７３
のアミノ酸配列を含む。
【００３０】
一部の実施形態において、抗ＬＡＧ−３抗体の重鎖および軽鎖可変ドメインは、
ａ）それぞれ、配列番号３１６および３１７；
ｂ）それぞれ、配列番号３０６および３０７；
ｃ）それぞれ、配列番号３２６および３２７；
ｄ）それぞれ、配列番号３３６および３３７；
ｅ）それぞれ、配列番号３４６および３４７；
ｆ）それぞれ、配列番号３５６および３５７；または
ｇ）それぞれ、配列番号３６６および３６７
のアミノ酸配列を含む。
【００３１】
一部の実施形態において、抗ＬＡＧ−３抗体は、
ａ）配列番号３１６のアミノ酸配列および配列番号３７５のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号３１７のアミノ酸配列および配列番号３７８のアミノ酸配列を含むＬＣ；
ｂ）配列番号３０６のアミノ酸配列および配列番号３７５のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号３０７のアミノ酸配列および配列番号３７８のアミノ酸配列を含むＬＣ；
ｃ）配列番号３２６のアミノ酸配列および配列番号３７５のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号３２７のアミノ酸配列および配列番号３７８のアミノ酸配列を含むＬＣ；
ｄ）配列番号３３６のアミノ酸配列および配列番号３７５のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号３３７のアミノ酸配列および配列番号３７８のアミノ酸配列を含むＬＣ；
ｅ）配列番号３４６のアミノ酸配列および配列番号３７５のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号３４７のアミノ酸配列および配列番号３７８のアミノ酸配列を含むＬＣ；
ｆ）配列番号３５６のアミノ酸配列および配列番号３７５のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号３５７のアミノ酸配列および配列番号３７８のアミノ酸配列を含むＬＣ；または
ｇ）配列番号３６６のアミノ酸配列および配列番号３７５のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号３６７のアミノ酸配列および配列番号３７９のアミノ酸配列を含むＬＣ
を含む。
【００３２】
一部の実施形態において、方法は、
ａ）そのＨ−ＣＤＲ１〜３およびＬ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ、配列番号２２８〜２３３のアミノ酸配列を含む抗ＰＤ−１抗体；ならびにそのＨ−ＣＤＲ１〜３およびＬ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ、配列番号８〜１３のアミノ酸配列を含む抗ＴＩＭ−３抗体；
ｂ）そのＶＨおよびＶＬがそれぞれ、配列番号２２６および２２７のアミノ酸配列を含む抗ＰＤ−１抗体；ならびにそのＶＨおよびＶＬがそれぞれ、配列番号７および４のアミノ酸配列を含む抗ＴＩＭ−３抗体；または
ｃ）配列番号２２６および３７５のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号２２７および３７９のアミノ酸配列を含むＬＣを含む抗ＰＤ−１抗体；ならびに配列番号７および３７７のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号４および３７８のアミノ酸配列を含むＬＣを含む抗ＴＩＭ−３抗体
を患者に投与することを含む。
【００３３】
一部の実施形態において、方法は、
ａ）そのＨ−ＣＤＲ１〜３およびＬ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ、配列番号２２８〜２３３のアミノ酸配列を含む抗ＰＤ−１抗体；ならびにそのＨ−ＣＤＲ１〜３およびＬ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ、配列番号３１８〜３２３のアミノ酸配列を含む抗ＬＡＧ−３抗体；
ｂ）そのＶＨおよびＶＬがそれぞれ、配列番号２２６および２２７のアミノ酸配列を含む抗ＰＤ−１抗体；ならびにそのＶＨおよびＶＬがそれぞれ、配列番号３１６および３１７のアミノ酸配列を含む抗ＬＡＧ−３抗体；または
ｃ）配列番号２２６および３７５のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号２２７および３７９のアミノ酸配列を含むＬＣを含む抗ＰＤ−１抗体；ならびに配列番号３１６および３７５のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号３１７および３７８のアミノ酸配列を含むＬＣを含む抗ＬＡＧ−３抗体
を患者に投与することを含む。
【００３４】
一部の実施形態において、方法は、
ａ）そのＨ−ＣＤＲ１〜３およびＬ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ、配列番号２２８〜２３３のアミノ酸配列を含む抗ＰＤ−１抗体；そのＨ−ＣＤＲ１〜３およびＬ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ、配列番号８〜１３のアミノ酸配列を含む抗ＴＩＭ−３抗体；ならびにそのＨ−ＣＤＲ１〜３およびＬ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ、配列番号３１８〜３２３のアミノ酸配列を含む抗ＬＡＧ−３抗体；
ｂ）そのＶＨおよびＶＬがそれぞれ、配列番号２２６および２２７のアミノ酸配列を含む抗ＰＤ−１抗体；そのＶＨおよびＶＬがそれぞれ、配列番号７および４のアミノ酸配列を含む抗ＴＩＭ−３抗体；ならびにそのＶＨおよびＶＬがそれぞれ、配列番号３１６および３１７のアミノ酸配列を含む抗ＬＡＧ−３抗体；または
ｃ）配列番号２２６および３７５のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号２２７および３７９のアミノ酸配列を含むＬＣを含む抗ＰＤ−１抗体；配列番号７および３７７のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号４および３７８のアミノ酸配列を含むＬＣを含む抗ＴＩＭ−３抗体；ならびに配列番号３１６および３７５のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号３１７および３７８のアミノ酸配列を含むＬＣを含む抗ＬＡＧ−３抗体
を患者に投与することを含む。
【００３５】
抗体または抗原結合部分は、患者に同時に（例えば、単一の医薬組成物中で）または連続的に投与されうる。
【００３６】
本発明の治療は、がん、例えば血液悪性腫瘍（例えば、白血病、ホジキンリンパ腫、または非ホジキンリンパ腫）、または固形腫瘍を有する患者を処置するために有用である。一部の実施形態において、患者は、黒色腫、非小細胞肺がん、膀胱がん、頭頚部扁平上皮癌、卵巣がん、結腸直腸がん、腎細胞癌、メルケル細胞癌、線維肉腫、膠肉腫、または膠芽腫を有しうる。本発明の治療はさらに、放射線、または化学療法剤、抗新生物剤、および抗血管新生剤の少なくとも１つを含みうる。
【００３７】
同様に本発明において、ａ）ヒトＰＤ−１およびヒトＴＩＭ−３；ｂ）ヒトＰＤ−１およびヒトＬＡＧ−３；またはｅ）ヒトＰＤ−１、ヒト抗ＴＩＭ−３、およびヒトＬＡＧ−３に特異的に結合する多特異性（例えば、二特異性または三特異性）抗体が提供される。ある特定の実施形態において、多特異性抗体は、本明細書に記載の抗ＰＤ−１抗体の抗原結合部分、本明細書に記載の抗ＴＩＭ−３抗体の抗原結合部分、および／または本明細書に記載の抗ＬＡＧ−３抗体の抗原結合部分を含む。
【００３８】
同様に本発明において、（１）本明細書に記載の抗ＰＤ−１抗体もしくはその抗原結合部分、（２）抗ＴＩＭ−３抗体もしくはその抗原結合部分、および／または抗ＬＡＧ−３抗体もしくはその抗原結合部分、ならびに（３）薬学的に許容される賦形剤、を含む医薬組成物も提供される。抗ＴＩＭ−３抗体および抗ＬＡＧ−３抗体は、本明細書に記載の抗体から選択することができる。
【００３９】
一部の実施形態において、医薬組成物は、
ａ）そのＨ−ＣＤＲ１〜３およびＬ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ、配列番号２２８〜２３３のアミノ酸配列を含む抗ＰＤ−１抗体；そのＨ−ＣＤＲ１〜３およびＬ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ、配列番号８〜１３のアミノ酸配列を含む抗ＴＩＭ−３抗体；ならびにそのＨ−ＣＤＲ１〜３およびＬ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ、配列番号３１８〜３２３のアミノ酸配列を含む抗ＬＡＧ−３抗体；
ｂ）そのＶＨおよびＶＬがそれぞれ、配列番号２２６および２２７のアミノ酸配列を含む抗ＰＤ−１抗体；そのＶＨおよびＶＬがそれぞれ、配列番号７および４のアミノ酸配列を含む抗ＴＩＭ−３抗体；ならびにそのＶＨおよびＶＬがそれぞれ、配列番号３１６および３１７のアミノ酸配列を含む抗ＬＡＧ−３抗体；または
ｃ）配列番号２２６および３７５のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号２２７および３７９のアミノ酸配列を含むＬＣを含む抗ＰＤ−１抗体；配列番号７および３７７のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号４および３７８のアミノ酸配列を含むＬＣを含む抗ＴＩＭ−３抗体；ならびに配列番号３１６および３７５のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号３１７および３７８のアミノ酸配列を含むＬＣを含む抗ＬＡＧ−３抗体
を含む。
【００４０】
組成物中の抗体は、等量で存在してもよい。一部の実施形態において、医薬組成物は、本明細書に記載の方法においてヒト患者の処置に使用するためである。特定の実施形態において、医薬組成物は、例えばがんを処置するために、それを必要とするヒト患者における免疫の増強に使用するためである。
【００４１】
本発明はまた、本明細書に記載の処置方法において使用するための、例えば抗ＴＩＭ−３抗体もしくはその抗原結合部分および／または抗ＬＡＧ−３抗体もしくはその抗原結合部分と組み合わせて、それを必要とするヒト患者における免疫を増強するおよび／またはがんを処置するための、本明細書に記載の抗ＰＤ−１抗体またはその抗原結合部分も提供する。抗ＴＩＭ−３抗体および抗ＬＡＧ−３抗体は、本明細書に記載の抗体から選択することができる。
【００４２】
本発明はまた、本明細書に記載の方法においてヒト患者の処置に使用するための、本明細書に記載の抗ＰＤ−１抗体またはその抗原結合部分も提供する。
【００４３】
本発明はまた、例えば抗ＴＩＭ−３抗体もしくはその抗原結合部分および／または抗ＬＡＧ−３抗体もしくはその抗原結合部分と組み合わせて、それを必要とする患者（例えば、ヒト患者）における免疫を増強するおよび／またはがんを処置する薬剤を製造するための、本明細書に記載の抗ＰＤ−１抗体またはその抗原結合部分の使用も提供する。一部の実施形態において、本発明は、例えばがんを処置するために、それを必要とするヒト患者における免疫を増強する薬剤を製造するための、本明細書に記載の抗ＰＤ−１抗体もしくはその抗原結合部分、ならびに抗ＴＩＭ−３抗体もしくはその抗原結合部分、および／または抗ＬＡＧ−３抗体もしくはその抗原結合部分の使用を提供する。抗ＴＩＭ−３抗体および抗ＬＡＧ−３抗体は、本明細書に記載の抗体から選択することができる。
【００４４】
本発明はまた、本明細書に記載の方法においてヒト患者を処置する薬剤を製造するための、本明細書に記載の抗ＰＤ−１抗体またはその抗原結合部分の使用も提供する。
【００４５】
本発明はさらに、抗ＴＩＭ−３抗体もしくはその抗原結合部分および／または抗ＬＡＧ−３抗体もしくはその抗原結合部分と組み合わせて、本明細書に記載の抗ＰＤ−１抗体またはその抗原結合部分を含む製品であって、例えば本明細書に記載の処置方法において、患者（例えば、ヒト患者）における免疫を増強するおよび／またはがんを処置するために適している製品を提供する。抗ＴＩＭ−３抗体および抗ＬＡＧ−３抗体は、本明細書に記載の抗体から選択することができる。
【図面の簡単な説明】
【００４６】
【図１】図１は、一方向性ＭＬＲ（混合リンパ球反応）アッセイにおける培養５日後の、１０μｇ／ｍＬの対照抗体（ＩｇＧ１  ＬＡＬＡ、またはＩｇＧ２）、抗ＰＤ−１抗体１２８１９、抗ＴＩＭ−３抗体１５０８６．１７１４５、または抗体１２８１９および１５０８６．１７１４５の１：１比の組み合わせによる処置後の３つのドナーペア（パネルＡ〜Ｃ）におけるＩＦＮ−γレベルのパーセント増加を示す一組のグラフである。グラフ中の各々の点は、反復実験を表し、平均値を水平線で示す。
【図２】図２は、二方向性ＭＬＲアッセイにおける培養５日後の、１０μｇ／ｍＬの対照抗体（ＩｇＧ１  ＬＡＬＡまたはＩｇＧ２）、抗ＰＤ−１抗体１２８１９、抗ＴＩＭ−３抗体１５０８６．１７１４５、または抗体１２８１９および１５０８６．１７１４５の１：１比の組み合わせによる処置後の３つのドナーペア（パネルＡ〜Ｃ）におけるＩＦＮ−γレベルのパーセント増加を示す一組のグラフである。グラフ中の各々の点は、反復実験を表し、平均値を水平線で示す。
【図３】図３は、陽性対照の抗ＰＤ−１抗体１２８１９と比較した、一方向性ＭＬＲアッセイにおけるＴ細胞増殖に及ぼす抗ＴＩＭ−３抗体１５０８６．１７１４５の効果を示す一組のグラフである。抗体を最終濃度２５μｇ／ｍＬで添加し、可溶性抗ＣＤ３を添加せずに（パネルＡ）または添加して（パネルＢ）５日間インキュベート後、１μＣｉ／ウェルの３Ｈ−チミジンをさらに１８時間添加した。回収した細胞における３Ｈ−チミジン取り込みを、液体シンチレーション計数によって決定した。
【図４】図４は、１０μｇ／ｍＬの抗体と共に５日間インキュベートした単球由来樹状細胞からのＩＬ−１２ｐ４０分泌に及ぼす抗ＴＩＭ−３抗体１５０８６．１７１４５の効果を示すグラフである。細胞上清におけるＩＬ−１２ｐ４０レベルを、ＥＬＩＳＡを使用して決定した。
【図５】図５は、２５μｇ／ｍＬの抗ＴＩＭ−３抗体１５０８６．１７１４５によって２４時間処置後の単球由来樹状細胞上の選択された活性化マーカーの発現レベルを示す一組のグラフである。パネルＡは、いくつかの活性化マーカーおよび共刺激分子の遺伝子発現分析を示す。パネルＢは、ＦＡＣＳを使用したＣＤ８０およびＣｄ８６レベルの増加の検証を示す。示したヒストグラムオーバーレイは、ＣＤ１１ｃ＋樹状細胞を表し、ヒストグラムの隣の数字はＭＦＩ（平均蛍光強度）値を指す。
【図６】図６は、ヒト肺患者由来異種移植片（ＰＤＸ）モデルＬＧ１  ３０６を移植したＣＤ３４＋ヒト化ＮＳＧ−ＳＧＭ３マウスモデルにおける腫瘍増殖に及ぼすＴＩＭ−３標的化の効果を示すグラフである。マウスを抗ＴＩＭ−３抗体１５０８６．１７１４５の１０ｍｇ／ｋｇの初回用量による処置後に、５ｍｇ／ｋｇを５日毎に５回処置した。灰色の領域は処置期間を示す。データを平均値±ＳＥＭとして表す。＊＊ｐ＜０．０１。
【図７】図７は、ＳＥＢ（ブドウ球菌エンテロトキシンＢ）＋ＰＢＭＣ（末梢血単核細胞）アッセイにおいて、２つのドナーペア（パネルＡおよびＢ）に関して抗ＰＤ−１抗体１２８１９を、抗ＬＡＧ−３抗体１５５３２および／または抗ＴＩＭ−３抗体１５０８６．１７１４５と組み合わせた場合のＩＬ−２レベルに及ぼす効果の増強を示す１組のグラフである。棒グラフは、１０μｇ／ｍＬの表記の抗体または混合物およびＳＥＢによって４８時間処置したＰＢＭＣからのＩＬ−２分泌を示す。棒グラフの上の印は、対照抗体とは有意に異なる（ｐ＜０．０５）１回処置（＊）、または構成成分の単一抗体処置とは有意に異なる２つの抗体の混合物（＃）を示す。
【図８】図８は、２つの同系マウス腫瘍モデル：ＭＣ３８（結腸がん、パネルＡ）およびＡＳＢ−ＸＩＶ（肺がん、パネルＢ）における、１０ｍｇ／ｋｇの抗ＰＤ−１抗体１２８１９、抗ＬＡＧ−３抗体Ｃ９Ｂ７Ｗ（マウスＬＡＧ−３と反応性である）、または抗ＰＤ−１および抗ＬＡＧ−３抗体の組み合わせ、または媒体処置の腫瘍増殖に及ぼす効果を示す１組のグラフである。灰色の領域は処置期間を示す。データは、平均値±ＳＥＭ（平均値の標準誤差）を表す。＊＊ｐ＜０．０１、＊＊＊ｐ＜０．００１、＊＊＊＊ｐ＜０．０００１。
【図９】図９は、ＡＳＢ−ＸＩＶ同系マウス腫瘍モデルにおける、１０ｍｇ／ｋｇの抗ＰＤ−１抗体１２８１９、抗ＬＡＧ−３抗体１５０１１、または抗ＰＤ−１および抗ＬＡＧ−３抗体の組み合わせ、または媒体処置の腫瘍増殖に及ぼす効果を示すグラフである。灰色の領域は処置期間を示す。データは、平均値±ＳＥＭとして表す。＊ｐ＜０．０５、＊＊＊＊ｐ＜０．０００１。
【図１０】図１０は、２つの同系マウス腫瘍モデル：ＡＳＢ−ＸＩＶ（肺がん、パネルＡ）およびＳａ１Ｎ（線維肉腫、パネルＢ）における腫瘍増殖に及ぼす、抗ＰＤ−１抗体１２８１９、抗ＴＩＭ−３抗体５Ｄ１２、または抗ＰＤ−１および抗ＴＩＭ−３抗体の併用、または媒体処置の腫瘍増殖に及ぼす効果を示す一組のグラフである。抗体処置を、ＡＳＢ−ＸＩＶ腫瘍を有するマウスにおいて１０ｍｇ／ｋｇ／標的の用量で投与した。Ｓａ１Ｎ腫瘍を有するマウスに、抗ＰＤ−１および抗ＴＩＭ−３抗体をそれぞれ、１ｍｇ／ｋｇおよび１０ｍｇ／ｋｇで投与した。灰色の領域は処置期間を示す。データは平均値±ＳＥＭとして表す。＊＊ｐ＜０．０１、＊＊＊ｐ＜０．００１、および＊＊＊＊ｐ＜０．０００１。
【図１１】図１１は、ヒトＰＢＭＣによって再構成したマウスにヒト黒色腫細胞株Ａ３７５を移植するヒト異種移植片腫瘍モデルにおいて、１０ｍｇ／ｋｇの抗ＰＤ−１抗体１２８１９、抗ＴＩＭ−３抗体１５０８６、または抗ＰＤ−１および抗ＴＩＭ−３抗体の組み合わせ、または媒体処置の腫瘍増殖に及ぼす効果を示す１組のグラフである。１人のヒトＰＢＭＣドナーを各実験において使用し、３つのグラフは、３人の異なるドナー（パネルＡ〜Ｃ）を表す。灰色の領域は処置期間を示す。データは平均値±ＳＥＭを表す。＊ｐ＜０．０５および＊＊ｐ＜０．０１。
【図１２】図１２は、ヒトＰＢＭＣとＡ３７５黒色腫細胞の混合物を移植したＮＯＤ−ｓｃｉｄマウスにおけるパーセント生存（パネルＡ）および腫瘍増殖（パネルＢ〜Ｅ）に及ぼすＰＤ−１およびＴＩＭ−３の単一および二重標的化の効果を示す一組のグラフである。マウスを、抗ＰＤ−１抗体１２８１９、抗ＴＩＭ−３抗体１５０８６．１７１４５、または抗ＰＤ−１および抗ＴＩＭ−３抗体の組み合わせによって処置した。抗体処置を、各抗体に関して１０ｍｇ／ｋｇの用量で週に３回投与した。灰色の領域は処置期間を示す。パネルＡのデータは、各処置群において腫瘍サイズ＜４００ｍｍ３を有するマウスの経時的なパーセンテージとして表す。
【図１３】図１３は、抗ＰＤ−１抗体１２８１９、抗ＬＡＧ−３抗体Ｃ９Ｂ７Ｗ、抗ＴＩＭ−３抗体５Ｄ１２、抗ＰＤ１および抗ＬＡＧ３抗体の組み合わせ、抗ＰＤ１および抗ＴＩＭ−３抗体の組み合わせ、または「トリプルコンボ」（抗ＰＤ−１、抗ＬＡＧ−３、および抗ＴＩＭ−３抗体の組み合わせを指す）を使用した場合の、ＡＳＢ−ＸＩＶ同系腫瘍モデルにおけるパーセント生存（パネルＡ）および腫瘍増殖（パネルＢ〜Ｈ）に及ぼすＰＤ−１、ＬＡＧ−３、およびＴＩＭ−３の単一、二重、および三重標的化の効果を示す一組のグラフである。抗体処置を、各抗体に関して１０ｍｇ／ｋｇの用量で投与した。灰色の領域は処置期間を示す。
【発明を実施するための形態】
【００４７】
本発明は、これらの標的に結合する抗体を使用することによる、ヒトＰＤ−１、ヒトＴＩＭ−３、および／またはヒトＬＡＧ−３を標的とする新規併用治療および組成物を提供する。治療および組成物は、がん患者などのヒト患者における免疫系を増強するために使用することができる。特に明記しない限り、本明細書において使用される「ＰＤ−１」は、ヒトＰＤ−１を指す。ヒトＰＤ−１ポリペプチド配列は、Ｕｎｉｐｒｏｔ受託番号Ｑ１５１１６として入手可能で、本明細書において配列番号３８８として示される。特に明記していなければ、本明細書で使用される「ＴＩＭ−３」はヒトＴＩＭ−３を指す。ヒトＴＩＭ−３ポリペプチド配列は、Ｕｎｉｐｒｏｔ受託番号Ｑ８ＴＤＱ０として入手可能であり、本明細書において配列番号３８９として示す。特に明記してなければ、本明細書で使用される「ＬＡＧ−３」は、ヒトＬＡＧ−３を指す。ヒトＬＡＧ−３ポリペプチド配列は、Ｕｎｉｐｒｏｔ受託番号Ｐ１８６２７として入手可能であり、本明細書において配列番号３９０として示す。
【００４８】
本明細書において使用される用語「抗体」（Ａｂ）または「免疫グロブリン」（Ｉｇ）は、ジスルフィド結合によって相互接続される２つの重（Ｈ）鎖（約５０〜７０ｋＤａ）および２つの軽（Ｌ）鎖（約２５ｋＤａ）を含む４量体を指す。それぞれの重鎖は、重鎖可変ドメイン（ＶＨ）および重鎖定常領域（ＣＨ）からなる。それぞれの軽鎖は、軽鎖可変ドメイン（ＶＬ）および軽鎖定常領域（ＣＬ）からなる。ＶＨおよびＶＬドメインはさらに、より保存された「フレームワーク領域」（ＦＲ）と呼ばれる領域の間に存在する「相補性決定領域」（ＣＤＲ）と呼ばれる超可変領域に細分することができる。それぞれのＶＨおよびＶＬは、３つのＣＤＲ（本明細書においてＨ−ＣＤＲは重鎖からのＣＤＲを指し、Ｌ−ＣＤＲは軽鎖からのＣＤＲを指す）と、４つのＦＲとで構成され、これらはアミノ末端からカルボキシル末端に以下の順序：ＦＲ１、ＣＤＲ１、ＦＲ２、ＣＤＲ２、ＦＲ３、ＣＤＲ３、ＦＲ４で整列する。重鎖または軽鎖におけるアミノ酸番号の割付は、ＩＭＧＴ（登録商標）の定義（Lefranc et al., Dev Comp Immunol 27(1):55-77 (2003)）；またはＫａｂａｔの定義、Sequences of Proteins of Immunological Interest（National Institutes of Health, Bethesda, MD (1987 and 1991); Chothia & Lesk, J. Mol. Biol. 196:901-917 (1987)；またはChothia et al., Nature 342:878-883 (1989)に従って行われうる。特に示していなければ、本開示において言及される全ての抗体アミノ酸残基の番号は、ＩＭＧＴ（登録商標）ナンバリングスキームに従う番号である。
【００４９】
用語「組換え抗体」は、抗体をコードするヌクレオチド配列を含む細胞または細胞株から発現される抗体であって、前記ヌクレオチド配列が通常、天然では細胞に会合していない抗体である。
【００５０】
用語「単離タンパク質」、「単離ポリペプチド」、または「単離抗体」は、その起源または誘導源を理由に、（１）その天然の状態でそれが伴う天然で会合する成分に会合していない、（２）同じ種の他のタンパク質を含まない、（３）異なる種の細胞によって発現される、および／または（４）天然に存在しない、タンパク質、ポリペプチド、または抗体を指す。このため、化学合成されるか、またはそれが天然で起源とする細胞とは異なる細胞系で合成されるポリペプチドは、その天然で会合する成分から「単離」されている。タンパク質はまた、当技術分野で周知のタンパク質精製技術を使用して単離によって天然で会合する成分を実質的に含まないようにしてもよい。
【００５１】
用語「親和性」は、抗原と抗体の間の誘引力の尺度を指す。抗原に対する抗体の内因性の誘引力は、典型的に、特定の抗体−抗原相互作用の結合親和性平衡定数（ＫＤ）として表記される。抗体は、ＫＤが≦１ｍＭである場合、好ましくは≦１００ｎＭである場合、抗原に対して特異的に結合すると言われる。ＫＤ結合親和性定数は、例えば、表面プラズモン共鳴（ＳＰＲ）（Ｂｉａｃｏｒｅ（商標））またはバイオレイヤー干渉法によって、例えばＩＢＩＳ  ＴｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓのＩＢＩＳ  ＭＸ９６  ＳＰＲシステム、Ｂｉｏ−ＲａｄのＰｒｏｔｅＯｎ（商標）ＸＰＲ３６  ＳＰＲシステムもしくはＦｏｒｔｅＢｉｏのＯｃｔｅｔ（商標）システムを使用して測定することができる。
【００５２】
用語「ｋｏｆｆ」は、特定の抗体−抗原相互作用の解離速度定数を指す。ｋｏｆｆ解離速度定数は、例えば上記のシステムの１つを使用してバイオレイヤー干渉法によって測定することができる。
【００５３】
本明細書において使用される用語「エピトープ」は、抗体または二特異性結合分子などの関連分子に特異的に結合する抗原の部分（決定基）を指す。エピトープ決定基は一般的に、アミノ酸、または炭水化物、または糖側鎖などの分子の化学的に活性な表面基からなり、一般的に特異的三次元構造特徴、ならびに特異的電荷特徴を有する。エピトープは、「線状」または「コンフォメーション」でありうる。線状エピトープの場合、タンパク質（例えば、抗原）と相互作用分子（抗体など）の間の相互作用点の全てがタンパク質の一次アミノ酸配列に沿って直線上に存在する。コンフォメーションエピトープでは、相互作用点は、一次アミノ酸配列において互いに離れているタンパク質上のアミノ酸残基にわたって存在する。抗原上の所望のエピトープが決定されれば、当技術分野で周知の技術を使用してそのエピトープに対する抗体を生成することが可能である。例えば、線状エピトープに対する抗体は、例えば線状エピトープのアミノ酸残基を有するペプチドによって動物を免疫することによって、生成することができる。コンフォメーションエピトープに対する抗体は、例えば、コンフォメーションエピトープの関連するアミノ酸残基を含むミニドメインによって動物を免疫することによって生成することができる。特定のエピトープに対する抗体はまた、例えば目的の標的分子またはその関連部分によって動物を免疫すること、その後エピトープに対する結合に関してスクリーニングすることによって生成することもできる。
【００５４】
抗体が、本明細書に記載の抗体と同じエピトープに結合するか、または本明細書に記載の抗体と結合に関して競合するかは、競合アッセイ、エピトープビニング、およびアラニンスキャニングなどを含むがこれらに限定されない当技術分野で公知の方法を使用することによって決定することができる。一部の実施形態において、本明細書に記載の試験抗体および抗体は、標的タンパク質（すなわち、ＴＩＭ−３、ＰＤ−１、またはＬＡＧ−３）上の少なくとも１つの共通の残基（例えば、少なくとも２、３、４、５、６、７、８、または９個の残基）に結合する。さらなる実施形態において、標的タンパク質上の接触残基は、本明細書に記載の試験抗体と抗体の間で完全に同一である。一実施形態において、本明細書に記載の抗体を飽和条件で標的タンパク質に結合させることができ、次に試験抗体が標的タンパク質に結合する能力を測定する。試験抗体が、参照抗体と同時に標的タンパク質に結合することができる場合、試験抗体は、参照抗体とは異なるエピトープに結合する。しかし、試験抗体が、同時に標的タンパク質に結合することができない場合、試験抗体は、同じエピトープ、オーバーラップエピトープ、または本明細書に記載の抗体が結合するエピトープの近位に存在するエピトープに結合する。この実験は、例えばＥＬＩＳＡ、ＲＩＡ、ＢＩＡＣＯＲＥ（商標）、ＳＰＲ、バイオレイヤー干渉法、またはフローサイトメトリーを使用して実施することができる。抗体が別の抗体と交差競合するか否かを試験するために、上記の競合法を２つの方向で使用してもよく、すなわち公知の抗体が試験抗体を遮断するか否か、およびその逆を決定してもよい。そのような交差競合実験は、例えばＩＢＩＳ  ＭＸ９６  ＳＰＲ機器またはＯｃｔｅｔ（商標）システムを使用して実施することができる。
【００５５】
用語「キメラ抗体」は、その最も広い意味において、１つの抗体からの１つまたは複数の領域と、１つまたは複数の他の抗体からの１つまたは複数の領域とを含む抗体を指し、典型的に部分的にヒト起源であり、部分的に非ヒト起源である、すなわち部分的に非ヒト動物、例えばマウス、ラット、もしくは他の齧歯類、またはニワトリなどの鳥に由来する抗体を指す。キメラ抗体は、ヒトの抗抗体応答、例えばマウス抗体の場合のヒトの抗マウス抗体応答のリスクを低減させるために、非ヒト抗体より好ましい。典型的なキメラ抗体の例は、可変ドメイン配列がマウスであるが、定常領域配列はヒトである抗体である。キメラ抗体の場合、抗体をヒト化するために、非ヒト部分にさらなる変更を行ってもよい。本明細書に記載のキメラ抗体は、ニワトリの可変ドメイン配列とヒトの定常領域配列とを有する。
【００５６】
用語「ヒト化」は、抗体が、完全にまたは部分的に非ヒト起源（例えば、目的の抗原によるマウスもしくはニワトリの免疫からそれぞれ得たマウスもしくはニワトリ抗体、またはそのようなマウスもしくはニワトリ抗体に基づくキメラ抗体）である場合、ヒトにおける免疫応答を回避または最小限にするために、特に、重鎖および軽鎖のフレームワーク領域および定常領域における特定のアミノ酸を交換することが可能であるという事実を指す。免疫原性、およびそれによる特定の抗体に対するヒトの抗抗体応答を正確に予測することはできないが、非ヒト抗体は、ヒトにおいてヒト抗体より免疫原性である傾向がある。外来（例えば、齧歯類または鳥）の定常領域がヒト起源の配列と交換されているキメラ抗体は、一般的に、完全に外来起源の抗体より免疫原性が低いことが示されており、治療抗体における傾向は、ヒト化抗体または完全なヒト抗体の方向である。このため、キメラ抗体または他の非ヒト起源の抗体は、ヒトの抗抗体応答のリスクを低減させるためにヒト化することができる。
【００５７】
キメラ抗体に関して、ヒト化は典型的に、可変ドメイン配列のフレームワーク領域の改変を伴う。相補性決定領域（ＣＤＲ）の一部であるアミノ酸残基は、ヒト化に関連して変化しないことが最も多いが、ある特定の場合において、例えばグリコシル化部位、脱アミド部位、アスパラギン酸異性化部位、または望ましくないシステインもしくはメチオニン残基を除去するために、個々のＣＤＲアミノ酸残基を変化させることが望ましい場合がありうる。Ｎ−結合グリコシル化は、ＸがＰｒｏを除く任意のアミノ酸残基でありうるトリペプチド配列Ａｓｎ−Ｘ−ＳｅｒまたはＡｓｎ−Ｘ−Ｔｈｒ中のアスパラギン残基にオリゴ糖鎖を結合させることによって起こる。Ｎ−グリコシル化部位の除去は、好ましくは保存的置換によってＡｓｎまたはＳｅｒ／Ｔｈｒ残基のいずれかを異なる残基に突然変異させることによって行われうる。アスパラギンおよびグルタミン残基の脱アミドは、ｐＨおよび表面露出などの要因に応じて起こりうる。アスパラギン残基は、主に配列Ａｓｎ−Ｇｌｙに存在する場合、および程度は低いもののＡｓｎ−Ａｌａなどの他のジペプチド配列に存在する場合、脱アミド化を特に受けやすい。したがって、そのような脱アミド部位、特にＡｓｎ−ＧｌｙがＣＤＲ配列に存在する場合、関与している残基の１つを除去するために、典型的に保存的置換によってその部位を除去することが望ましいであろう。
【００５８】
抗体配列のヒト化のための多数の方法が当技術分野で公知である；例えば、Almagro & Fransson, Front Biosci. 13:1619-1633 (2008)による論評を参照されたい。１つの一般的に使用される方法は、ＣＤＲグラフティングであり、これは、例えばマウス由来のキメラ抗体に関して、マウス可変ドメイン遺伝子に対するヒト生殖系列遺伝子相対物の同定、およびマウスＣＤＲ配列のこのフレームワークへのグラフティングを伴う。抗体の標的抗原との相互作用の特異性は、主に重鎖および軽鎖の６個のＣＤＲに位置するアミノ酸残基に存在する。したがって、ＣＤＲ内のアミノ酸配列は、ＣＤＲの外側の配列より個々の抗体の間でかなり可変である。ＣＤＲ配列はほとんどの抗体−抗原相互作用の原因であることから、例えば異なる抗体からのフレームワーク配列に移植された特異的抗体からのＣＤＲ配列を発現する発現ベクターを構築することによって、特異的な天然起源の抗体、またはより一般的には所定のアミノ酸配列を有する任意の特異的抗体の特性を模倣する組換え抗体を発現させることが可能である。結果として、非ヒト抗体を「ヒト化」することが可能であり、それでもなお当初の抗体の結合特異性および親和性を実質的に維持することができる。ＣＤＲグラフティングは、ＫａｂａｔのＣＤＲの定義に基づきうるが、より最近の刊行物（Magdelaine-Beuzelin et al., Crit Rev.Oncol Hematol. 64:210-225 (2007))）は、ＩＭＧＴ（登録商標）の定義（the international ImMunoGeneTics information system(R), www.imgt.org）が、ヒト化の結果を改善しうることを示唆している（Lefranc et al., Dev. Comp Immunol. 27:55-77 (2003)を参照されたい）。
【００５９】
場合によっては、ＣＤＲグラフティングは、そこからＣＤＲが得られる親抗体と比較してＣＤＲ移植非ヒト抗体の結合特異性および親和性を低減させ、このように生物活性を低減させうる。親抗体の結合特異性および親和性を再確立するために、復帰突然変異（時に「フレームワーク修復」と呼ばれる）を、典型的にフレームワーク領域におけるＣＤＲ移植抗体の選択された位置に導入してもよい。可能性がある復帰突然変異の位置は、文献および抗体データベースにおいて利用可能な情報を使用して同定することができる。復帰突然変異の候補であるアミノ酸残基は典型的に、抗体分子の表面に位置する残基であり、埋もれているかまたは表面の露出の程度が低い残基は通常、変化しない。
【００６０】
ＣＤＲグラフティングおよび復帰突然変異の代替のヒト化技術は、非ヒト起源の非表面露出残基が保持されるが表面残基がヒト残基に変化する、リサーフェシングである。
【００６１】
ある特定の例において、標的エピトープに対する結合親和性を改善するために、１つまたは複数のＣＤＲアミノ酸残基を変化させることが望ましい場合がある。これは、「親和性成熟」として知られ、例えば抗体のヒト化によって、結合特異性または親和性の低減が起こり、復帰突然変異単独では結合特異性または親和性を十分に改善することが可能でない状況では、ヒト化に関連して行ってもよい。様々な親和性成熟方法、例えばBurks et al., Proc Natl Acad Sci USA, 94:412-417 (1997)によって記載されるインビトロ（ｉｎ  ｖｉｔｒｏ）のスキャニング飽和突然変異誘発法、およびWu et al., Proc Natl Acad Sci USA 95:6037-6042 (1998)の段階的インビトロ親和性成熟法が当技術分野で公知である。
【００６２】
用語「ヒト抗体」は、可変ドメインおよび定常領域配列がヒト配列に由来する抗体を指す。用語は、ヒト遺伝子に由来するが、例えば免疫原性を減少させるように、親和性を増加させるように、および／または安定性を増加させるように修飾されている配列を有する抗体を包含する。さらに、用語は、ヒト細胞の典型ではないグリコシル化を付与しうる、非ヒト細胞においてヒト由来配列を使用して組換えにより産生される抗体を包含する。用語はまた、ヒト抗体遺伝子を有するトランスジェニック非ヒト生物（例えば、ＯｍｎｉＲａｔ（登録商標）ラット）において産生される抗体も包含する。
【００６３】
本明細書において使用される抗体の「抗原結合部分」（または単に「抗体部分」）という用語は、抗原（例えば、ヒトＴＩＭ−３、ヒトＰＤ−１、もしくはヒトＬＡＧ−３またはその部分）に特異的に結合する能力を保持する、抗体の１つまたは複数の部分または断片を指す。完全長の抗体のある特定の断片が、抗体の抗原結合機能を実施することができることが示されている。用語「抗原結合部分」に包含される結合断片の例には、（ｉ）Ｆａｂ断片：ＶＬ、ＶＨ、Ｃｌ、およびＣＨ１ドメインからなる一価の断片；（ｉｉ）Ｆ（ａｂ’）２断片；ヒンジ領域でジスルフィド結合によって結合した２つのＦａｂ断片を含む二価の断片；（ｉｉｉ）ＶＨおよびＣＨ１ドメインからなるＦｄ断片；（ｉｖ）抗体のシングルアームのＶＬおよびＶＨドメインからなるＦｖ断片；（ｖ）ＶＨドメインからなるｄＡｂ断片；ならびに（ｖｉ）抗原に特異的に結合することができる単離相補性決定領域（ＣＤＲ）が挙げられる。さらに、Ｆｖ断片の２つのドメイン、ＶＬおよびＶＨは、異なる遺伝子によってコードされるが、それらを単一のタンパク質鎖として作製することができる合成リンカーによって、組換え法を使用して結合させ、ＶＬおよびＶＨドメインが対を形成して一価の分子（一本鎖Ｆｖ（ｓｃＦｖ）として知られる）を形成することができる。同様に、ＶＨおよび／またはＶＬを含む抗原結合分子も本発明に含まれる。ＶＨの場合、分子はまた、ＣＨ１、ヒンジ、ＣＨ２、またはＣＨ３領域のうちの１つまたは複数を含みうる。そのような一本鎖抗体もまた、抗体の「抗原結合部分」という用語に包含されると意図される。ダイアボディなどの一本鎖抗体の他の形態も同様に包含される。ダイアボディは、ＶＨおよびＶＬドメインが単一のポリペプチド鎖上に発現されるが、同じ鎖上の２つのドメイン間で対を形成するには短すぎるリンカーを使用することによって、別の鎖の相補性ドメインと強制的に対を形成させて、２つの抗原結合部位を作製する二価の二特異性抗体である。
【００６４】
ＦａｂおよびＦ（ａｂ’）２断片などの抗体部分は、抗体全体のパパインまたはペプシン消化などの通常の技術を使用して抗体全体から調製することができる。その上、抗体、抗体部分、およびイムノアドヘシンは、例えば本明細書に記載の標準的な組換えＤＮＡ技術を使用して得ることができる。
【００６５】
本明細書に記載の抗体のクラス（アイソタイプ）およびサブクラスは、当技術分野で公知の任意の方法によって決定することができる。一般的に、抗体のクラスおよびサブクラスは、抗体の特定のクラスおよびサブクラスに対して特異的である抗体を使用して決定することができる。そのような抗体は市販されている。クラスおよびサブクラスは、ＥＬＩＳＡおよびウェスタンブロットならびに他の技術によって決定することができる。あるいは、クラスおよびサブクラスは、抗体の重鎖および／または軽鎖の定常領域の全てまたは一部をシークエンシングすること、そのアミノ酸配列を免疫グロブリンの様々なクラスおよびサブクラスの公知のアミノ酸配列と比較すること、ならびに抗体のクラスおよびサブクラスを決定することによって決定することができる。本発明の好ましいアイソタイプはＩｇＧアイソタイプである。
【００６６】
抗体配列の所定の位置での特定のアミノ酸残基に言及する場合、例えば「３５Ｓ」との表示は、その位置および残基を指し、すなわちこの場合、セリン残基（Ｓ）が配列の３５位に存在することを示す。同様に、例えば「１３Ｑ＋３５Ｓ」との表示は、それぞれの位置における２つの残基を指す。特に明記しない限り、本開示において言及される全ての抗体アミノ酸残基の番号は、ＩＭＧＴ（登録商標）ナンバリングスキームに従う番号である。
【００６７】
抗ＰＤ−１抗体
一部の実施形態において、本明細書に開示の抗ＰＤ−１抗体は、ニワトリに由来する可変ドメインおよびヒト定常領域を有するキメラでありうるか、またはヒト化されうる。
【００６８】
本明細書において開示される抗ＰＤ−１抗体は、５桁の数字、例えば「１２８１９」または１０桁の数字、例えば「１２８１９．１５３８４」のいずれかによって言及されうる。本明細書において使用される５桁の数字は、その数字に関して示される重鎖および軽鎖ＣＤＲ１〜３配列を有する全ての抗体を指すが、１０桁の数字の使用は、特定のヒト化変異体を指す。例えば、１２８１９．１５３８４は、１２８１９抗体のＣＤＲ配列を有する特定のヒト化変異体である。５桁の数字は、例えば、ＦＲにおける一部の変化（例えば、成熟軽鎖のＮ末端で残基ＳＹを欠如する、またはＳＹの代わりに残基ＳＳを有する）を除き、同一である１０桁の変異体を包含する。これらの修飾は、抗体の機能的（例えば、抗原結合）特性を変化させない。
【００６９】
一部の実施形態において、併用治療または組成物は、抗ＰＤ−１抗体またはその抗原結合部分を含み、抗ＰＤ−１抗体は、本明細書において抗体１２８１９．１５３８４、１２７４８．１５３８１、１２７４８．１６１２４、１２８６５．１５３７７、１２８９２．１５３７８、１２７９６．１５３７６、１２７７７．１５３８２、１２７６０．１５３７５または１３１１２．１５３８０、またはこれらのいずれかの変異体であると呼ばれる抗体であり、変異体は、例えば、抗体の抗原結合特異性を失うことなく、前記抗体と比較してある特定の最少のアミノ酸変化（例えばフレームワーク領域に存在しうる、例えば、１、２、３、４、５、６、７、８、９、または１０個のアミノ酸変化）を有しうる。
【００７０】
一部の実施形態において、抗ＰＤ−１抗体は、抗体１２８１９．１５３８４、１２７４８．１５３８１、１２７４８．１６１２４、１２８６５．１５３７７、１２８９２．１５３７８、１２７９６．１５３７６、１２７７７．１５３８２、１２７６０．１５３７５および１３１１２．１５３８０のいずれか１つと、ヒトＰＤ−１に対する結合に関して競合するか、または該抗体と同じヒトＰＤ−１のエピトープに結合する。
【００７１】
一部の実施形態において、本明細書に記載の抗ＰＤ−１抗体または抗原結合部分のいずれかは、１２８６５、１２８９２、および１２７７７抗体（例えば、抗体１２８６５．１５３７７、１２８９２．１５３７８、および１２７７７．１５３８２）と、ＰＤ−１に対する結合に関して競合または交叉競合しうる。一部の実施形態において、本明細書に記載の抗ＰＤ−１抗体または抗原結合部分のいずれかは、１２８１９抗体（例えば、抗体１２８１９．１５３８４）と、ＰＤ−１に対する結合に関して競合または交叉競合しうる。一部の実施形態において、本明細書に記載の抗ＰＤ−１抗体または抗原結合部分のいずれかは、１２７６０および１３１１２抗体（例えば、抗体１２７６０．１５３７５および１３１１２．１５３８０）と、ＰＤ−１に対する結合に関して競合または交叉競合しうる。一部の実施形態において、抗体は、ＩｇＧ１またはＩｇＧ２フォーマットを有する。ある特定の実施形態において、抗体は、ＩｇＧ１フォーマットを有する。
【００７２】
一部の実施形態において、抗ＰＤ−１抗体は、その重鎖（Ｈ）ＣＤＲ１〜３および軽鎖（Ｌ）ＣＤＲ１〜３がそれぞれ、配列番号２２８〜２３３、２３８〜２４３、２４８〜２５３、２５８〜２６３、２６８〜２７３、２７８〜２８３、２８８〜２９３、または２９８〜３０３を含む抗体と、ヒトＰＤ−１に対する結合に関して競合もしくは交叉競合するか、または該抗体と同じヒトＰＤ−１のエピトープに結合する。
【００７３】
一部の実施形態において、抗ＰＤ−１抗体は、配列番号２３０、２４０、２５０、２６０、２７０、２８０、２９０、または３００のＨ−ＣＤＲ３アミノ酸配列を含むＨ−ＣＤＲ３を含む。
【００７４】
一部の実施形態において、抗ＰＤ−１抗体は、配列番号２２８〜２３０、２３８〜２４０、２４８〜２５０、２５８〜２６０、２６８〜２７０、２７８〜２８０、２８８〜２９０、または２９８〜３００のＨ−ＣＤＲ１〜３アミノ酸配列をそれぞれ含むＨ−ＣＤＲ１〜３を含む。
【００７５】
一部の実施形態において、抗ＰＤ−１抗体は、配列番号２２６、２３６、２４６、２５６、２６６、２７６、２８６、または２９６とアミノ酸配列が少なくとも９０％（例えば、少なくとも９２％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、または少なくとも９９％）同一であるＶＨを有する。
【００７６】
一部の実施形態において、抗ＰＤ−１抗体は、配列番号２２６、２３６、２４６、２５６、２６６、２７６、２８６、または２９６を含むＶＨを有する。
【００７７】
一部の実施形態において、抗ＰＤ−１抗体は、配列番号２２６、２３６、２４６、２５６、２６６、２７６、２８６、または２９６と配列が少なくとも９０％（例えば、少なくとも９２％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、または少なくとも９９％）同一であるＶＨ；および配列番号３７５と配列が少なくとも９０％（例えば、少なくとも９２％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、または少なくとも９９％）同一であるＣＨを有する。
【００７８】
一部の実施形態において、抗ＰＤ−１抗体は、配列番号２２６、２３６、２４６、２５６、２６６、２７６、２８６、または２９６のＶＨアミノ酸配列および配列番号３７５のＣＨアミノ酸配列を含むＨＣを有する。
【００７９】
一部の実施形態において、抗ＰＤ−１抗体は、配列番号２３３、２４３、２５３、２６３、２７３、２８３、２９３、または３０３のＬ−ＣＤＲ３アミノ酸配列を含むＬ−ＣＤＲ３を有する。
【００８０】
一部の実施形態において、抗ＰＤ−１抗体は、配列番号２３１〜２３３、２４１〜２４３、２５１〜２５３、２６１〜２６３、２７１〜２７３、２８１〜２８３、２９１〜２９３、または３０１〜３０３のＬ−ＣＤＲ１〜３アミノ酸配列をそれぞれ含むＬ−ＣＤＲ１〜３を含む。
【００８１】
一部の実施形態において、抗ＰＤ−１抗体は、配列番号２２７、２３７、２４７、２５７、２６７、２７７、２８７、２９７、または３９２のＶＬアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％（例えば、少なくとも９２％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、または少なくとも９９％）同一であるＶＬを有する。
【００８２】
一部の実施形態において、抗ＰＤ−１抗体は、配列番号２２７、２３７、２４７、２５７、２６７、２７７、２８７、２９７、または３９２のＶＬアミノ酸配列を含むＶＬを有する。
【００８３】
一部の実施形態において、抗ＰＤ−１抗体は、配列番号２２７、２３７、２４７、２５７、２６７、２７７、２８７、２９７、または３９２のＶＬアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％（例えば、少なくとも９２％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、または少なくとも９９％）同一であるＶＬ；および配列番号３７９と配列が少なくとも９０％（例えば、少なくとも９２％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、または少なくとも９９％）同一であるＣＬを有する。
【００８４】
一部の実施形態において、抗ＰＤ−１抗体は、配列番号２２７、２３７、２４７、２５７、２６７、２７７、２８７、２９７、または３９２のＶＬアミノ酸配列および配列番号３７９のＣＬアミノ酸配列を含むＬＣを有する。
【００８５】
一部の実施形態において、抗ＰＤ−１抗体は、上記の重鎖配列のいずれかおよび上記の軽鎖配列のいずれかを含む。
【００８６】
一部の実施形態において、抗ＰＤ−１抗体は、配列番号２３０および２３３、２４０および２４３、２５０および２５３、２６０および２６３、２７０および２７３、２８０および２８３、２９０および２９３、または３００および３０３のＨ−ＣＤＲ３およびＬ−ＣＤＲ３アミノ酸配列をそれぞれ含むＨ−ＣＤＲ３およびＬ−ＣＤＲ３を含む。
【００８７】
一部の実施形態において、抗ＰＤ−１抗体は、配列番号２２８〜２３３、２３８〜２４３、２４８〜２５３、２５８〜２６３、２６８〜２７３、２７８〜２８３、２８８〜２９３、または２９８〜３０３のＨ−ＣＤＲ１〜３およびＬ−ＣＤＲ１〜３アミノ酸配列をそれぞれ含む、Ｈ−ＣＤＲ１〜３およびＬ−ＣＤＲ１〜３配列を含む。
【００８８】
一部の実施形態において、抗ＰＤ−１抗体は、配列番号２２６、２３６、２４６、２５６、２６６、２７６、２８６、または２９６のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％（例えば、少なくとも９２％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、または少なくとも９９％）同一であるＶＨ、および配列番号２２７、２３７、２４７、２５７、２６７、２７７、２８７、２９７、または３９２のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％（例えば、少なくとも９２％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、または少なくとも９９％）同一であるＶＬを含む。
【００８９】
一部の実施形態において、抗ＰＤ−１抗体は、配列番号２２６、２３６、２４６、２５６、２６６、２７６、２８６、または２９６のアミノ酸配列を含むＶＨ、および配列番号２２７、２３７、２４７、２５７、２６７、２７７、２８７、２９７、または３９２のアミノ酸配列を含むＶＬを有する。
【００９０】
一部の実施形態において、抗ＰＤ−１抗体は、配列番号２２６、２３６、２４６、２５６、２６６、２７６、２８６、または２９６のアミノ酸配列、および配列番号３７５のアミノ酸配列を含むＨＣ；ならびに配列番号２２７、２３７、２４７、２５７、２６７、２７７、２８７、２９７、または３９２のアミノ酸配列および配列番号３７９のアミノ酸配列を含むＬＣを有する。
【００９１】
一部の実施形態において、抗ＰＤ−１抗体は、
ａ）それぞれ、配列番号２２８−２３３；
ｂ）それぞれ、配列番号２３８−２４３；
ｃ）それぞれ、配列番号２４８−２５３；
ｄ）それぞれ、配列番号２５８−２６３；
ｅ）それぞれ、配列番号２６８−２７３；
ｆ）それぞれ、配列番号２７８−２８３；
ｇ）それぞれ、配列番号２８８−２９３；または
ｈ）それぞれ、配列番号２９８−３０３
のＨ−ＣＤＲ１〜３およびＬ−ＣＤＲ１〜３アミノ酸配列を含む。
【００９２】
一部の実施形態において、抗ＰＤ−１抗体は、
ａ）それぞれ、配列番号２２６および２２７；
ｂ）それぞれ、配列番号２３６および２３７；
ｃ）それぞれ、配列番号２３６および３９２；
ｄ）それぞれ、配列番号２４６および２４７；
ｅ）それぞれ、配列番号２５６および２５７；
ｆ）それぞれ、配列番号２６６および２６７；
ｇ）それぞれ、配列番号２７６および２７７；
ｈ）それぞれ、配列番号２８６および２８７；または
ｉ）それぞれ、配列番号２９６および２９７
のアミノ酸配列を有するＶＨおよびＶＬを含む。
【００９３】
一部の実施形態において、抗ＰＤ−１抗体は、
ａ）配列番号２２６のアミノ酸配列および配列番号３７５のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号２２７のアミノ酸配列および配列番号３７９のアミノ酸配列を含むＬＣ；
ｂ）配列番号２３６のアミノ酸配列および配列番号３７５のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号２３７のアミノ酸配列および配列番号３７９のアミノ酸配列を含むＬＣ；
ｃ）配列番号２３６のアミノ酸配列および配列番号３７５のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号３９２のアミノ酸配列および配列番号３７９のアミノ酸配列を含むＬＣ；
ｄ）配列番号２４６のアミノ酸配列および配列番号３７５のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号２４７のアミノ酸配列および配列番号３７９のアミノ酸配列を含むＬＣ；
ｅ）配列番号２５６のアミノ酸配列および配列番号３７５のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号２５７のアミノ酸配列および配列番号３７９のアミノ酸配列を含むＬＣ；
ｆ）配列番号２６６のアミノ酸配列および配列番号３７５のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号２６７のアミノ酸配列および配列番号３７９のアミノ酸配列を含むＬＣ；
ｇ）配列番号２７６のアミノ酸配列および配列番号３７５のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号２７７のアミノ酸配列および配列番号３７９のアミノ酸配列を含むＬＣ；
ｈ）配列番号２８６のアミノ酸配列および配列番号３７５のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号２８７のアミノ酸配列および配列番号３７９のアミノ酸配列を含むＬＣ；または
ｉ）配列番号２９６のアミノ酸配列および配列番号３７５のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号２９７のアミノ酸配列および配列番号３７９のアミノ酸配列を含むＬＣ
を含む。
【００９４】
一部の実施形態において、抗ＰＤ−１抗体は、以下：
ａ）そのＨ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ、配列番号２２８〜２３０のアミノ酸配列を含む抗体；
ｂ）そのＶＨが配列番号２２６のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一である抗体；
ｃ）そのＶＨが配列番号２２６のアミノ酸配列を含む抗体；
ｄ）そのＨＣが配列番号２２６および３７５のアミノ酸配列を含む抗体；
ｅ）そのＬ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ、配列番号２３１〜２３３のアミノ酸配列を含む抗体；
ｆ）そのＶＬが配列番号２２７のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一である抗体；
ｇ）そのＶＬが配列番号２２７のアミノ酸配列を含む抗体；
ｈ）そのＬＣが配列番号２２７および３７９のアミノ酸配列を含む抗体；
ｉ）そのＨ−ＣＤＲ１〜３およびＬ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ、配列番号２２８〜２３３のアミノ酸配列を含む抗体；
ｊ）そのＶＨが配列番号２２６のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一であり、そのＶＬが配列番号２２７のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一である抗体；
ｋ）そのＶＨが配列番号２２６のアミノ酸配列を含み、そのＶＬが配列番号２２７のアミノ酸配列を含む抗体；ならびに
ｌ）そのＨＣが配列番号２２６のアミノ酸配列および配列番号３７５のアミノ酸配列を含み、そのＬＣが配列番号２２７および３７９のアミノ酸配列を含む抗体
からなる群から選択される。
【００９５】
一部の実施形態において、抗ＰＤ−１抗体は、以下：
ａ）そのＨ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ、配列番号２３８〜２４０のアミノ酸配列を含む抗体；
ｂ）そのＶＨが配列番号２３６のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一である抗体；
ｃ）そのＶＨが配列番号２３６のアミノ酸配列を含む抗体；
ｄ）そのＨＣが配列番号２３６および３７５のアミノ酸配列を含む抗体；
ｅ）そのＬ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ、配列番号２４１〜２４３のアミノ酸配列を含む抗体；
ｆ）そのＶＬが配列番号２３７のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一である抗体；
ｇ）そのＶＬが配列番号２３７のアミノ酸配列を含む抗体；
ｈ）そのＬＣが配列番号２３７および３７９のアミノ酸配列を含む抗体；
ｉ）そのＨ−ＣＤＲ１〜３およびＬ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ、配列番号２３８〜２４３のアミノ酸配列を含む抗体；
ｊ）そのＶＨが配列番号２３６のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一であり、そのＶＬが配列番号２３７のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一である抗体；
ｋ）そのＶＨが配列番号２３６のアミノ酸配列を含み、そのＶＬが配列番号２３７のアミノ酸配列を含む抗体；ならびに
ｌ）そのＨＣが配列番号２３６のアミノ酸配列および配列番号３７５のアミノ酸配列を含み、そのＬＣが配列番号２３７および３７９のアミノ酸配列を含む抗体
からなる群から選択される。
【００９６】
一部の実施形態において、抗ＰＤ−１抗体は、以下：
ａ）そのＨ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ、配列番号２３８〜２４０のアミノ酸配列を含む抗体；
ｂ）そのＶＨが配列番号２３６のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一である抗体；
ｃ）そのＶＨが配列番号２３６のアミノ酸配列を含む抗体；
ｄ）そのＨＣが配列番号２３６および３７５のアミノ酸配列を含む抗体；
ｅ）そのＬ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ、配列番号２４１〜２４３のアミノ酸配列を含む抗体；
ｆ）そのＶＬが配列番号３９２のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一である抗体；
ｇ）そのＶＬが配列番号３９２のアミノ酸配列を含む抗体；
ｈ）そのＬＣが配列番号３９２および３７９のアミノ酸配列を含む抗体；
ｉ）そのＨ−ＣＤＲ１〜３およびＬ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ、配列番号２３８〜２４３のアミノ酸配列を含む抗体；
ｊ）そのＶＨが配列番号２３６のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一であり、そのＶＬが配列番号３９２のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一である抗体；
ｋ）そのＶＨが配列番号２３６のアミノ酸配列を含み、そのＶＬが配列番号３９２のアミノ酸配列を含む抗体；ならびに
ｌ）そのＨＣが配列番号２３６のアミノ酸配列および配列番号３７５のアミノ酸配列を含み、そのＬＣが配列番号３９２および３７９のアミノ酸配列を含む抗体
からなる群から選択される。
【００９７】
一部の実施形態において、抗ＰＤ−１抗体は、以下：
ａ）そのＨ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ、配列番号２４８〜２５０のアミノ酸配列を含む抗体；
ｂ）そのＶＨが配列番号２４６のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一である抗体；
ｃ）そのＶＨが配列番号２４６のアミノ酸配列を含む抗体；
ｄ）そのＨＣが配列番号２４６および３７５のアミノ酸配列を含む抗体；
ｅ）そのＬ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ、配列番号２５１〜２５３のアミノ酸配列を含む抗体；
ｆ）そのＶＬが配列番号２４７のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一である抗体；
ｇ）そのＶＬが配列番号２４７のアミノ酸配列を含む抗体；
ｈ）そのＬＣが配列番号２４７および３７９のアミノ酸配列を含む抗体；
ｉ）そのＨ−ＣＤＲ１〜３およびＬ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ、配列番号２４８〜２５３のアミノ酸配列を含む抗体；
ｊ）そのＶＨが配列番号２４６のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一であり、そのＶＬが配列番号２４７のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一である抗体；
ｋ）そのＶＨが配列番号２４６のアミノ酸配列を含み、そのＶＬが配列番号２４７のアミノ酸配列を含む抗体；ならびに
ｌ）そのＨＣが配列番号２４６のアミノ酸配列および配列番号３７５のアミノ酸配列を含み、そのＬＣが配列番号２４７および３７９のアミノ酸配列を含む抗体
からなる群から選択される。
【００９８】
一部の実施形態において、抗ＰＤ−１抗体は、以下：
ａ）そのＨ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ、配列番号２５８〜２６０のアミノ酸配列を含む抗体；
ｂ）そのＶＨが配列番号２５６のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一である抗体；
ｃ）そのＶＨが配列番号２５６のアミノ酸配列を含む抗体；
ｄ）そのＨＣが配列番号２５６および３７５のアミノ酸配列を含む抗体；
ｅ）そのＬ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ、配列番号２６１〜２６３のアミノ酸配列を含む抗体；
ｆ）そのＶＬが配列番号２５７のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一である抗体；
ｇ）そのＶＬが配列番号２５７のアミノ酸配列を含む抗体；
ｈ）そのＬＣが配列番号２５７および３７９のアミノ酸配列を含む抗体；
ｉ）そのＨ−ＣＤＲ１〜３およびＬ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ、配列番号２５８〜２６３のアミノ酸配列を含む抗体；
ｊ）そのＶＨが配列番号２５６のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一であり、そのＶＬが配列番号２５７のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一である抗体；
ｋ）そのＶＨが配列番号２５６のアミノ酸配列を含み、そのＶＬが配列番号２５７のアミノ酸配列を含む抗体；ならびに
ｌ）そのＨＣが配列番号２５６のアミノ酸配列および配列番号３７５のアミノ酸配列を含み、そのＬＣが配列番号２５７および３７９のアミノ酸配列を含む抗体
からなる群から選択される。
【００９９】
一部の実施形態において、抗ＰＤ−１抗体は、以下：
ａ）そのＨ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ、配列番号２６８〜２７０のアミノ酸配列を含む抗体；
ｂ）そのＶＨが配列番号２６６のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一である抗体；
ｃ）そのＶＨが配列番号２６６のアミノ酸配列を含む抗体；
ｄ）そのＨＣが配列番号２６６および３７５のアミノ酸配列を含む抗体；
ｅ）そのＬ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ、配列番号２７１〜２７３のアミノ酸配列を含む抗体；
ｆ）そのＶＬが配列番号２６７のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一である抗体；
ｇ）そのＶＬが配列番号２６７のアミノ酸配列を含む抗体；
ｈ）そのＬＣが配列番号２６７および３７９のアミノ酸配列を含む抗体；
ｉ）そのＨ−ＣＤＲ１〜３およびＬ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ、配列番号２６８〜２７３のアミノ酸配列を含む抗体；
ｊ）そのＶＨが配列番号２６６のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一であり、そのＶＬが配列番号２６７のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一である抗体；
ｋ）そのＶＨが配列番号２６６のアミノ酸配列を含み、そのＶＬが配列番号２６７のアミノ酸配列を含む抗体；ならびに
ｌ）そのＨＣが配列番号２６６のアミノ酸配列および配列番号３７５のアミノ酸配列を含み、そのＬＣが配列番号２６７および３７９のアミノ酸配列を含む抗体
からなる群から選択される。
【０１００】
一部の実施形態において、抗ＰＤ−１抗体は、以下：
ａ）そのＨ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ、配列番号２７８〜２８０のアミノ酸配列を含む抗体；
ｂ）そのＶＨが配列番号２７６のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一である抗体；
ｃ）そのＶＨが配列番号２７６のアミノ酸配列を含む抗体；
ｄ）そのＨＣが配列番号２７６および３７５のアミノ酸配列を含む抗体；
ｅ）そのＬ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ、配列番号２８１〜２８３のアミノ酸配列を含む抗体；
ｆ）そのＶＬが配列番号２７７のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一である抗体；
ｇ）そのＶＬが配列番号２７７のアミノ酸配列を含む抗体；
ｈ）そのＬＣが配列番号２７７および３７９のアミノ酸配列を含む抗体；
ｉ）そのＨ−ＣＤＲ１〜３およびＬ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ、配列番号２７８〜２８３のアミノ酸配列を含む抗体；
ｊ）そのＶＨが配列番号２７６のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一であり、そのＶＬが配列番号２７７のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一である抗体；
ｋ）そのＶＨが配列番号２７６のアミノ酸配列を含み、そのＶＬが配列番号２７７のアミノ酸配列を含む抗体；ならびに
ｌ）そのＨＣが配列番号２７６のアミノ酸配列および配列番号３７５のアミノ酸配列を含み、そのＬＣが配列番号２７７および３７９のアミノ酸配列を含む抗体
からなる群から選択される。
【０１０１】
一部の実施形態において、抗ＰＤ−１抗体は、以下：
ａ）そのＨ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ、配列番号２８８〜２９０のアミノ酸配列を含む抗体；
ｂ）そのＶＨが配列番号２８６のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一である抗体；
ｃ）そのＶＨが配列番号２８６のアミノ酸配列を含む抗体；
ｄ）そのＨＣが配列番号２８６および３７５のアミノ酸配列を含む抗体；
ｅ）そのＬ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ、配列番号２９１〜２９３のアミノ酸配列を含む抗体；
ｆ）そのＶＬが配列番号２８７のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一である抗体；
ｇ）そのＶＬが配列番号２８７のアミノ酸配列を含む抗体；
ｈ）そのＬＣが配列番号２８７および３７９のアミノ酸配列を含む抗体；
ｉ）そのＨ−ＣＤＲ１〜３およびＬ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ、配列番号２８８〜２９３のアミノ酸配列を含む抗体；
ｊ）そのＶＨが配列番号２８６のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一であり、そのＶＬが配列番号２８７のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一である抗体；
ｋ）そのＶＨが配列番号２８６のアミノ酸配列を含み、そのＶＬが配列番号２８７のアミノ酸配列を含む抗体；ならびに
ｌ）そのＨＣが配列番号２８６のアミノ酸配列および配列番号３７５のアミノ酸配列を含み、そのＬＣが配列番号２８７および３７９のアミノ酸配列を含む抗体
からなる群から選択される。
【０１０２】
一部の実施形態において、抗ＰＤ−１抗体は、
ａ）そのＨ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ、配列番号２９８〜３００のアミノ酸配列を含む抗体；
ｂ）そのＶＨが、配列番号２９６のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一である抗体；
ｃ）そのＶＨが、配列番号２９６のアミノ酸配列を含む抗体；
ｄ）そのＨＣが、配列番号２９６および３７５のアミノ酸配列を含む抗体；
ｅ）そのＬ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ配列番号３０１〜３０３のアミノ酸配列を含む抗体；
ｆ）そのＶＬが、配列番号２９７のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一である抗体；
ｇ）そのＶＬが、配列番号２９７のアミノ酸配列を含む抗体；
ｈ）そのＬＣが、配列番号２９７および３７９のアミノ酸配列を含む抗体；
ｉ）そのＨ−ＣＤＲ１〜３およびＬ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ、配列番号２９８〜３０３のアミノ酸配列を含む抗体；
ｊ）そのＶＨが、配列番号２９６のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一であり、およびそのＶＬが、配列番号２９７のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一である抗体；
ｋ）そのＶＨが、配列番号２９６のアミノ酸配列を含み、およびそのＶＬが、配列番号２９７のアミノ酸配列を含む抗体；ならびに
ｌ）そのＨＣが、配列番号２９６のアミノ酸配列、および配列番号３７５のアミノ酸配列を含み；ならびにそのＬＣが、配列番号２９７および３７９のアミノ酸配列を含む抗体
からなる群から選択される。
【０１０３】
一部の実施形態において、本明細書に記載の任意の抗ＰＤ−１抗体または抗原結合部分は、少なくとも９００、少なくとも８５０、少なくとも８００、少なくとも７５０、少なくとも７００、少なくとも６５０、少なくとも６００、少なくとも５５０、少なくとも５００、少なくとも４５０、少なくとも４００、少なくとも３５０、少なくとも３００、少なくとも２５０、少なくとも２００、少なくとも１５０、少なくとも１００、少なくとも５０、少なくとも４０、少なくとも３０、または少なくとも２０ｐＭのＫＤでヒトＰＤ−１に結合しうる。ある特定の実施形態において、ＫＤは、表面プラズモン共鳴を使用して決定される。特定の実施形態において、抗ＰＤ−１抗体または抗原結合部分は、ニボルマブ、ペンブロリズマブ、またはその両方より高い親和性でヒトＰＤ−１に結合する。
【０１０４】
一部の実施形態において、本明細書に記載の任意の抗ＰＤ−１抗体または抗原結合部分は、少なくとも９０００、少なくとも８０００、少なくとも７０００、少なくとも６０００、少なくとも５０００、少なくとも４０００、少なくとも３０００、少なくとも２５００、少なくとも２０００、少なくとも１５００、少なくとも１０００、少なくとも９００、少なくとも８００、少なくとも７００、少なくとも６００、少なくとも５００、少なくとも４００、少なくとも３００、少なくとも２００、少なくとも１００、少なくとも７５、少なくとも５０、少なくとも２５、少なくとも２０、少なくとも１５、少なくとも１０、または少なくとも５ｐＭのＫＤでカニクイザルＰＤ−１に結合しうる。ある特定の実施形態において、ＫＤは、表面プラズモン共鳴を使用して決定される。
【０１０５】
一部の実施形態において、本明細書に記載の任意の抗ＰＤ−１抗体または抗原結合部分は、少なくとも１０００、少なくとも９５０、少なくとも９００、または少なくとも８５０ｐＭのＫＤでマウスＰＤ−１に結合しうる。ある特定の実施形態において、ＫＤは、表面プラズモン共鳴を使用して決定される。
【０１０６】
一部の実施形態において、本明細書に記載の任意の抗ＰＤ−１抗体または抗原結合部分は、フローサイトメトリー競合アッセイにおいて１０μｇ／ｍｌの濃度で、ＰＤ−１とＰＤ−Ｌ１との相互作用を、少なくとも６０％、少なくとも６５％、少なくとも７０％、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８１％、少なくとも８２％、少なくとも８３％、少なくとも８４％、少なくとも８５％、少なくとも８６％、少なくとも８７％、少なくとも８８％、少なくとも８９％、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％阻害しうる。ある特定の実施形態において、抗ＰＤ−１抗体またはその抗原結合部分は、ＰＤ−１とＰＤ−Ｌ１との相互作用を少なくとも８３％阻害しうる。
【０１０７】
一部の実施形態において、本明細書に記載の任意の抗ＰＤ−１抗体または抗原結合部分は、バイオレイヤー干渉法による分析によって決定した場合に、１０μｇ／ｍｌの濃度でＰＤ−１に対するＰＤ−Ｌ１およびＰＤ−Ｌ２の結合を、少なくとも２０％、少なくとも３０％、少なくとも４０％、少なくとも５０％、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％遮断しうる。ある特定の実施形態において、抗ＰＤ−１抗体または抗原結合部分は、ＰＤ−１に対するＰＤ−Ｌ１およびＰＤ−Ｌ２の結合を少なくとも９０％遮断する。
【０１０８】
一部の実施形態において、本明細書に記載の抗ＰＤ−１抗体または抗原結合部分は、以下の特性：
ａ）７５０ｐＭまたはそれ未満のＫＤでヒトＰＤ−１に結合すること；
ｂ）７ｎＭまたはそれ未満のＫＤでカニクイザルＰＤ−１に結合すること；
ｃ）１ｎＭまたはそれ未満のＫＤでマウスＰＤ−１に結合すること；
ｄ）ラットＰＤ−１に結合しないこと；
ｅ）ＳＥＢ全血アッセイにおいてＩＬ−２の分泌を増加させること；
ｆ）一方向性混合リンパ球反応アッセイにおいてＩＦＮ−γ分泌を増加させること；
ｇ）フローサイトメトリーアッセイにおいて１０μｇ／ｍｌの濃度でＰＤ−１とＰＤ−Ｌ１との相互作用を少なくとも６０％阻害すること；
ｈ）バイオレイヤー干渉法による分析によって決定した場合に１０μｇ／ｍｌの濃度でＰＤ−１に対するＰＤ−Ｌ１およびＰＤ−Ｌ２の結合を少なくとも９０％阻害すること；ならびに
ｉ）インビボで腫瘍の増殖を阻害すること
のうちの少なくとも１つを有する。そのような抗体の例には、１２８１９抗体（特性ａ〜ｉを有する）；１２７４８、１２８９２、および１２７７７抗体（少なくとも特性ａ、ｂ、およびｅ〜ｈを有する）；１２８６５および１２７９６抗体（少なくとも特性ａ、ｂ、ｅ、ｆ、およびｈを有する）、ならびに１２７６０および１３１１２抗体（少なくとも特性ａ、ｂ、ｅ、およびｆを有する）が挙げられるがこれらに限定されない。一部の実施形態において、抗ＰＤ−１抗体または抗原結合部分は、前記の特性の全てを有する。一部の実施形態において、抗ＰＤ−１抗体または抗原結合部分は、少なくとも特性ａ、ｂ、およびｅ〜ｈを有する。一部の実施形態において、抗ＰＤ−１抗体または抗原結合部分は、少なくとも特性ａ、ｂ、ｅ、ｆ、およびｈを有する。一部の実施形態において、抗ＰＤ−１抗体または抗原結合部分は、少なくとも特性ａ、ｂ、ｅ、およびｆを有する。
【０１０９】
一部の実施形態において、本明細書に記載の抗ＰＤ−１抗体またはその抗原結合部分は、配列番号３８８の以下の残基：Ｖ４４、Ｖ６４、Ｌ１２８、Ｐ１３０、Ｋ１３１、Ａ１３２、Ｅ１３６、およびＴ１４５のうちの少なくとも１つ（例えば、少なくとも１つ、少なくとも２つ、少なくとも３つ、少なくとも４つ、または少なくとも５つ）を含むＰＤ−１のエピトープに結合する。ある特定の実施形態において、抗体または抗原結合部分は、配列番号３８８の残基Ｖ６４、Ｌ１２８、Ｐ１３０、Ｋ１３１、およびＡ１３２を含むＰＤ−１のエピトープに結合する（１２８１９抗体、例えば抗体１２８１９．１５３８４など）。ある特定の実施形態において、抗体または抗原結合部分は、配列番号３８８の残基Ｋ１３１およびＥ１３６を含むＰＤ−１のエピトープに結合する（１２８６５抗体、例えば抗体１２８６５．１５３７７など）。ある特定の実施形態において、抗体または抗原結合部分は、配列番号３８８の残基Ｖ４４およびＴ１４５を含むＰＤ−１のエピトープに結合する（１３１１２抗体、例えば抗体１３１１２．１５３８０など）。
【０１１０】
一部の実施形態において、併用治療または組成物は、配列番号３８８のアミノ酸残基Ｋ１３１を含むＰＤ−１のエピトープに結合する抗ＰＤ−１抗体またはその抗原結合部分を含む（例えば、１２８１９または１２８６５抗体）。一部の実施形態において、エピトープは、アミノ酸残基Ｐ１３０およびＡ１３２をさらに含み、アミノ酸残基Ｖ６４およびＬ１２８をさらに含んでもよい（例えば、１２８１９抗体）。一部の実施形態において、エピトープは、アミノ酸残基Ｅ１３６をさらに含む（例えば、１２８６５抗体）。
【０１１１】
一部の実施形態において、本明細書に記載の抗ＰＤ−１抗体またはその抗原結合部分は、配列番号３８８の残基５６〜６４、６９〜９０、および／または１２２〜１４０を含むＰＤ−１のエピトープに結合する。ある特定の実施形態において、抗体または抗原結合部分は、配列番号３８８の残基６９〜９０および１２２〜１４０を含むＰＤ−１のエピトープに結合する（１２８１９および１２８６５抗体、例えば、抗体１２８１９．１５３８４および１２８６５．１５３７７など）。ある特定の実施形態において、抗体または抗原結合部分は、配列番号３８８の残基５６〜６４、６９〜９０、および１２２〜１４０を含むＰＤ−１のエピトープに結合する（例えば、１２８１９抗体）。ある特定の実施形態において、抗体または抗原結合部分は、配列番号３８８の残基６９〜９０および１２２〜１４０を含むＰＤ−１のエピトープに結合する（例えば、１２８６５抗体）。一部の実施形態において、抗体または部分は、配列番号３８８の残基６９〜７５（またはその断片、例えば１、２、３、４、５、または６残基の断片など）に結合する（１２８１９および１２８６５抗体、例えば抗体１２８１９．１５３８４および１２８６５．１５３７７など）。一部の実施形態において、抗体または部分は、配列番号３８８の残基１３６〜１４０（またはその断片、例えば１、２、３、または４残基の断片）に結合する（１２８１９および１２８６５抗体、例えば抗体１２８１９．１５３８４および１２８６５．１５３７７など）。一部の実施形態において、抗体または部分は、配列番号３８８の残基６９〜７５（またはその断片）、および残基１３６〜１４０（またはその断片）に結合する（１２８１９および１２８６５抗体、例えば抗体１２８１９．１５３８４および１２８６５．１５３７７）。上記の残基の任意の組み合わせを有するエピトープも同様に企図される。
【０１１２】
一部の実施形態において、本明細書に記載の抗ＰＤ−１抗体またはその抗原結合部分は、その全体が参照により本明細書に組み込まれている、ＰＣＴ特許公報国際公開第２０１７／０５５５４７号またはＰＣＴ特許公報欧州特許出願第２０１７／０７９６１５号に記載されている、抗ＰＤ−１抗体またはその抗原結合部分である。
【０１１３】
抗ＴＩＭ−３抗体
特定の実施形態において、本明細書に開示の抗ＴＩＭ−３抗体は、ヒトイディオタイプを有する抗体を生成することができるトランスジェニックラットから生成されたヒト抗体である。
【０１１４】
本明細書に開示の抗ＴＩＭ−３抗体は、５桁の数、例えば「２０１３１」、または１０桁の数字、例えば「１５０８６．１６８３７」のいずれかによって言及されうる。抗体１５０８６．１５０８６、１５０８６．１６８３７、１５０８６．１７１４５、１５０８６．１７１４４の場合のように、最初の５桁が同じである１０桁の数字は、同じ親抗体に由来する。そのような抗体は、同じ６個のＣＤＲを共有し、同じまたは実質的に同じ標的結合特性を有すると予想される。本明細書に提供されるタンパク質およびＤＮＡ配列から明らかであるように、１５０８６．１６８３７、１５０８６．１７１４５、および１５０８６．１７１４４変異体は、親１５０８６抗体（「１５０８６．１５０８６」）と比較してＶＨ配列に単一のアミノ酸の差を有するに過ぎず、すなわち、６位にＱではなくてＥを有するが、ＶＬアミノ酸配列は同一である。同様に、これらの変異体は、その抗体フォーマット／サブクラスが主に異なる、すなわち：
１５０８６．１５０８６：ＩｇＧ１
１５０８６．１６８３７：ＩｇＧ１  ＬＡＬＡ
１５０８６．１７１４５：ＩｇＧ２
１５０８６．１７１４４：ＩｇＧ４
であることは明白である。ＩｇＧ２およびＩｇＧ４サブクラス抗体のＶＨ配列は、ＩｇＧ１  ＬＡＬＡ変異体の配列と同じである。ＶＬ配列は、抗体サブクラスの４つ全てが同じである。
【０１１５】
一部の実施形態において、併用治療または組成物は、抗ＴＩＭ−３抗体またはその抗原結合部分を含み、抗ＴＩＭ−３抗体は、本明細書において抗体１５０８６．１７１４５、１５０８６．１５０８６、１５０８６．１６８３７、１５０８６．１７１４４、２０１３１、２０２９３、１５１０５、１５１０７、１５１０９、１５１７４、１５１７５、１５２６０、１５２８４、１５２９９、１５３５３、１５３５４、１７２４４、１７２４５、１９３２４、１９４１６、１９５６８、２０１８５、２０３００、２０３６２、もしくは２０６２１、またはこれらのいずれかの変異体と呼ばれる抗体であり、変異体は、例えば抗体の抗原結合特異性を失うことなく、前記抗体と比較してある特定の最少のアミノ酸変化（例えばフレームワーク領域に存在しうる、例えば、１、２、３、４、５、６、７、８、９、または１０個のアミノ酸変化）を含みうる。
【０１１６】
一部の実施形態において、抗ＴＩＭ−３抗体は、ＩｇＧ１フォーマットを有する抗体１５０８６．１５０８６、ＩｇＧ  ＬＡＬＡフォーマットを有する抗体１５０８６．１６８３７、ＩｇＧ２フォーマットを有する抗体１５０８６．１７１４５、またはＩｇＧ４フォーマットを有する抗体１５０８６．１７１４４と、ヒトＴＩＭ−３に対する結合に関して競合もしくは交叉競合するか、または該抗体と同じヒトＴＩＭ−３のエピトープに結合する。一部の実施形態において、抗体は、ＩｇＧ１またはＩｇＧ２フォーマットを有する。ある特定の実施形態において、抗体は、ＩｇＧ２フォーマットを有する。
【０１１７】
一部の実施形態において、抗ＴＩＭ−３抗体は、抗体２０１３１、２０２９３、１５１０５、１５１０７、１５１０９、１５１７４、１５１７５、１５２６０、１５２８４、１５２９９、１５３５３、１５３５４、１７２４４、１７２４５、１９３２４、１９４１６、１９５６８、２０１８５、２０３００、２０３６２、または２０６２１と、ヒトＴＩＭ−３に対する結合に関して競合もしくは交叉競合するか、または該抗体と同じヒトＴＩＭ−３のエピトープに結合する。一部の実施形態において、抗体は、ＩｇＧ１またはＩｇＧ２フォーマットを有する。ある特定の実施形態において、抗体は、ＩｇＧ２フォーマットを有する。
【０１１８】
一部の実施形態において、抗ＴＩＭ−３抗体は、その重鎖（Ｈ）ＣＤＲ１〜３および軽鎖（Ｌ）ＣＤＲ１〜３がそれぞれ、配列番号８〜１３、１８〜２３、２８〜３３、３８〜４３、４８〜５３、５８〜６３、６８〜７３、７８〜８３、８８〜９３、９８〜１０３、１０８〜１１３、１１８〜１２３、１２８〜１３３、１３８〜１４３、１４８〜１５３、１５８〜１６３、１６８〜１７３、１７８〜１８３、１８８〜１９３、１９８〜２０３、２０８〜２１３、または２１８〜２２３を含む抗体と、ヒトＴＩＭ−３に対する結合に関して競合もしくは交叉競合するか、または該抗体と同じヒトＴＩＭ−３のエピトープに結合する。
【０１１９】
一部の実施形態において、抗ＴＩＭ−３抗体は、配列番号１０、２０、３０、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１１０、１２０、１３０、１４０、１５０、１６０、１７０、１８０、１９０、２００、２１０、または２２０のＨ−ＣＤＲ３アミノ酸配列を含むＨ−ＣＤＲ３を含む。
【０１２０】
一部の実施形態において、抗ＴＩＭ−３抗体は、配列番号８〜１０、１８〜２０、２８〜３０、３８〜４０、４８〜５０、５８〜６０、６８〜７０、７８〜８０、８８〜９０、９８〜１００、１０８〜１１０、１１８〜１２０、１２８〜１３０、１３８〜１４０、１４８〜１５０、１５８〜１６０、１６８〜１７０、１７８〜１８０、１８８〜１９０、１９８〜２００、２０８〜２１０、または２１８〜２２０のＨ−ＣＤＲ１〜３アミノ酸配列をそれぞれ含むＨ−ＣＤＲ１〜３を含む。
【０１２１】
一部の実施形態において、抗ＴＩＭ−３抗体は、配列番号３、７、１６、２６、３６、４６、５６、６６、７６、８６、９６、１０６、１１６、１２６、１３６、１４６、１５６、１６６、１７６、１８６、１９６、２０６、または２１６とアミノ酸配列が少なくとも９０％（例えば、少なくとも９２％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、または少なくとも９９％）同一であるＶＨを有する。
【０１２２】
一部の実施形態において、抗ＴＩＭ−３抗体は、配列番号３、７、１６、２６、３６、４６、５６、６６、７６、８６、９６、１０６、１１６、１２６、１３６、１４６、１５６、１６６、１７６、１８６、１９６、２０６、または２１６を含むＶＨを有する。
【０１２３】
一部の実施形態において、抗ＴＩＭ−３抗体は、配列番号３、１６、２６、３６、４６、５６、６６、７６、８６、９６、１０６、１１６、１２６、１３６、１４６、１５６、１６６、１７６、１８６、１９６、２０６、または２１６と配列が少なくとも９０％（例えば、少なくとも９２％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、または少なくとも９９％）同一であるＶＨ；および配列番号３７４と配列が少なくとも９０％（例えば、少なくとも９２％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、または少なくとも９９％）同一であるＣＨを有する。
【０１２４】
一部の実施形態において、抗ＴＩＭ−３抗体は、配列番号３、１６、２６、３６、４６、５６、６６、７６、８６、９６、１０６、１１６、１２６、１３６、１４６、１５６、１６６、１７６、１８６、１９６、２０６、または２１６のＶＨアミノ酸配列、および配列番号３７４のＣＨアミノ酸配列を含むＨＣを有する。
【０１２５】
一部の実施形態において、抗ＴＩＭ−３抗体は、配列番号７、１６、２６、３６、４６、５６、６６、７６、８６、９６、１０６、１１６、１２６、１３６、１４６、１５６、１６６、１７６、１８６、１９６、２０６、または２１６と配列が少なくとも９０％（例えば、少なくとも９２％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、または少なくとも９９％）同一であるＶＨ；および配列番号３７５、３７６、または３７７と配列が少なくとも９０％（例えば、少なくとも９２％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、または少なくとも９９％）同一であるＣＨを有する。
【０１２６】
一部の実施形態において、抗ＴＩＭ−３抗体は、配列番号７、１６、２６、３６、４６、５６、６６、７６、８６、９６、１０６、１１６、１２６、１３６、１４６、１５６、１６６、１７６、１８６、１９６、２０６、または２１６のＶＨアミノ酸配列、および配列番号３７５、３７６、または３７７のＣＨアミノ酸配列を含むＨＣを有する。ある特定の実施形態において、ＣＨアミノ酸配列は配列番号３７７である。
【０１２７】
一部の実施形態において、抗ＴＩＭ−３抗体は、配列番号１３、２３、３３、４３、５３、６３、７３、８３、９３、１０３、１１３、１２３、１３３、１４３、１５３、１６３、１７３、１８３、１９３、２０３、２１３、または２２３のＬ−ＣＤＲ３アミノ酸配列を含むＬ−ＣＤＲ３を含む。
【０１２８】
一部の実施形態において、抗ＴＩＭ−３抗体は、配列番号１１〜１３、２１〜２３、３１〜３３、４１〜４３、５１〜５３、６１〜６３、７１〜７３、８１〜８３、９１〜９３、１０１〜１０３、１１１〜１１３、１２１〜１２３、１３１〜１３３、１４１〜１４３、１５１〜１５３、１６１〜１６３、１７１〜１７３、１８１〜１８３、１９１〜１９３、２０１〜２０３、２１１〜２１３、または２２１〜２２３のＬ−ＣＤＲ１〜３アミノ酸配列をそれぞれ含むＬ−ＣＤＲ１〜３を含む。
【０１２９】
一部の実施形態において、抗ＴＩＭ−３抗体は、配列番号４、１７、２７、３７、４７、５７、６７、７７、８７、９７、１０７、１１７、１２７、１３７、１４７、１５７、１６７、１７７、１８７、１９７、２０７、または２１７のＶＬアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％（例えば、少なくとも９２％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、または少なくとも９９％）同一であるＶＬを有する。
【０１３０】
一部の実施形態において、抗ＴＩＭ−３抗体は、配列番号４、１７、２７、３７、４７、５７、６７、７７、８７、９７、１０７、１１７、１２７、１３７、１４７、１５７、１６７、１７７、１８７、１９７、２０７、または２１７のＶＬアミノ酸配列を含むＶＬを有する。
【０１３１】
一部の実施形態において、抗ＴＩＭ−３抗体は、配列番号４、１７、２７、３７、４７、５７、６７、７７、８７、９７、１０７、１１７、１２７、１３７、１４７、１５７、１６７、１７７、１８７、１９７、２０７、または２１７のＶＬアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％（例えば、少なくとも９２％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、または少なくとも９９％）同一であるＶＬ；および配列番号３７８と配列が少なくとも９０％（例えば、少なくとも９２％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、または少なくとも９９％）同一であるＣＬを有する。
【０１３２】
一部の実施形態において、抗ＴＩＭ−３抗体は、配列番号４、１７、２７、３７、４７、５７、６７、７７、８７、９７、１０７、１１７、１２７、１３７、１４７、１５７、１６７、１７７、１８７、１９７、２０７、または２１７のＶＬアミノ酸配列、および配列番号３７８のＣＬアミノ酸配列を有するＬＣを有する。
【０１３３】
一部の実施形態において、抗ＴＩＭ−３抗体は、上記の重鎖配列のいずれかおよび上記の軽鎖配列のいずれかを含む。
【０１３４】
一部の実施形態において、抗ＴＩＭ−３抗体は、配列番号１０および１３、２０および２３、３０および３３、４０および４３、５０および５３、６０および６３、７０および７３、８０および８３、９０および９３、１００および１０３、１１０および１１３、１２０および１２３、１３０および１３３、１４０および１４３、１５０および１５３、１６０および１６３、１７０および１７３、１８０および１８３、１９０および１９３、２００および２０３、２１０および２１３、または２２０および２２３のＨ−ＣＤＲ３およびＬ−ＣＤＲ３アミノ酸配列をそれぞれ含む、Ｈ−ＣＤＲ３およびＬ−ＣＤＲ３を含む。
【０１３５】
一部の実施形態において、抗ＴＩＭ−３抗体は、配列番号８〜１３、１８〜２３、２８〜３３、３８〜４３、４８〜５３、５８〜６３、６８〜７３、７８〜８３、８８〜９３、９８〜１０３、１０８〜１１３、１１８〜１２３、１２８〜１３３、１３８〜１４３、１４８〜１５３、１５８〜１６３、１６８〜１７３、１７８〜１８３、１８８〜１９３、１９８〜２０３、２０８〜２１３、または２１８〜２２３のＨ−ＣＤＲ１〜３およびＬ−ＣＤＲ１〜３配列をそれぞれ含むＨ−ＣＤＲ１〜３およびＬ−ＣＤＲ１〜３を含む。
【０１３６】
一部の実施形態において、抗ＴＩＭ−３抗体は、配列番号３、７、１６、２６、３６、４６、５６、６６、７６、８６、９６、１０６、１１６、１２６、１３６、１４６、１５６、１６６、１７６、１８６、１９６、２０６、または２１６のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％（例えば、少なくとも９２％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、または少なくとも９９％）同一であるＶＨ、および配列番号４、１７、２７、３７、４７、５７、６７、７７、８７、９７、１０７、１１７、１２７、１３７、１４７、１５７、１６７、１７７、１８７、１９７、２０７、または２１７のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％（例えば、少なくとも９２％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、または少なくとも９９％）同一であるＶＬを有する。
【０１３７】
一部の実施形態において、抗ＴＩＭ−３抗体は、配列番号３、７、１６、２６、３６、４６、５６、６６、７６、８６、９６、１０６、１１６、１２６、１３６、１４６、１５６、１６６、１７６、１８６、１９６、２０６、または２１６のアミノ酸配列を含むＶＨ、および配列番号４、１７、２７、３７、４７、５７、６７、７７、８７、９７、１０７、１１７、１２７、１３７、１４７、１５７、１６７、１７７、１８７、１９７、２０７、または２１７のアミノ酸配列を含むＶＬを有する。
【０１３８】
一部の実施形態において、抗ＴＩＭ−３抗体は、配列番号３、７、１６、２６、３６、４６、５６、６６、７６、８６、９６、１０６、１１６、１２６、１３６、１４６、１５６、１６６、１７６、１８６、１９６、２０６、または２１６のアミノ酸配列、および配列番号３７８のアミノ酸配列を含むＨＣ；ならびに配列番号４、１７、２７、３７、４７、５７、６７、７７、８７、９７、１０７、１１７、１２７、１３７、１４７、１５７、１６７、１７７、１８７、１９７、２０７、または２１７のアミノ酸配列および配列番号３７４、３７５、３７６、または３７７のアミノ酸配列を含むＬＣを有する。
【０１３９】
一部の実施形態において、抗ＴＩＭ−３抗体は、
ａ）それぞれ、配列番号８〜１３；
ｂ）それぞれ、配列番号１８〜２３；
ｃ）それぞれ、配列番号２８〜３３；
ｄ）それぞれ、配列番号３８〜４３；
ｅ）それぞれ、配列番号４８〜５３；
ｆ）それぞれ、配列番号５８〜６３；
ｇ）それぞれ、配列番号６８〜７３；
ｈ）それぞれ、配列番号７８〜８３；
ｉ）それぞれ、配列番号８８〜９３；
ｊ）それぞれ、配列番号９８〜１０３；
ｋ）それぞれ、配列番号１０８〜１１３；
ｌ）それぞれ、配列番号１１８〜１２３；
ｍ）それぞれ、配列番号１２８〜１３３；
ｎ）それぞれ、配列番号１３８〜１４３；
ｏ）それぞれ、配列番号１４８〜１５３；
ｐ）それぞれ、配列番号１５８〜１６３；
ｑ）それぞれ、配列番号１６８〜１７３；
ｒ）それぞれ、配列番号１７８〜１８３；
ｓ）それぞれ、配列番号１８８〜１９３；
ｔ）それぞれ、配列番号１９８〜２０３；
ｕ）それぞれ、配列番号２０８〜２１３；または
ｖ）それぞれ、配列番号２１８〜２２３
のＨ−ＣＤＲ１〜３およびＬ−ＣＤＲ１〜３アミノ酸配列を含む。
【０１４０】
一部の実施形態において、抗ＴＩＭ−３抗体は、
ａ）それぞれ、配列番号７および４；
ｂ）それぞれ、配列番号３および４；
ｃ）それぞれ、配列番号１６および１７；
ｄ）それぞれ、配列番号２６および２７；
ｅ）それぞれ、配列番号３６および３７；
ｆ）それぞれ、配列番号４６および４７；
ｇ）それぞれ、配列番号５６および５７；
ｈ）それぞれ、配列番号６６および６７；
ｉ）それぞれ、配列番号７６および７７；
ｊ）それぞれ、配列番号８６および８７；
ｋ）それぞれ、配列番号９６および９７；
ｌ）それぞれ、配列番号１０６および１０７；
ｍ）それぞれ、配列番号１１６および１１７；
ｎ）それぞれ、配列番号１２６および１２７；
ｏ）それぞれ、配列番号１３６および１３７；
ｐ）それぞれ、配列番号１４６および１４７；
ｑ）それぞれ、配列番号１５６および１５７；
ｒ）それぞれ、配列番号１６６および１６７；
ｓ）それぞれ、配列番号１７６および１７７；
ｔ）それぞれ、配列番号１８６および１８７；
ｕ）それぞれ、配列番号１９６および１９７；
ｖ）それぞれ、配列番号２０６および２０７；または
ｗ）それぞれ、配列番号２１６および２１７
のアミノ酸配列を有する重鎖可変ドメインおよび軽鎖可変ドメインを含む。
【０１４１】
一部の実施形態において、抗ＴＩＭ−３抗体は、
ａ）配列番号７のアミノ酸配列および配列番号３７４、３７５、３７６、または３７７のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号４のアミノ酸配列および配列番号３７８のアミノ酸配列を含むＬＣ；
ｂ）配列番号３のアミノ酸配列および配列番号３７４、３７５、３７６、または３７７のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号４のアミノ酸配列および配列番号３７８のアミノ酸配列を含むＬＣ；
ｃ）配列番号１６のアミノ酸配列および配列番号３７４、３７５、３７６、または３７７のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号１７のアミノ酸配列および配列番号３７８のアミノ酸配列を含むＬＣ；
ｄ）配列番号２６のアミノ酸配列および配列番号３７４、３７５、３７６、または３７７のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号２７のアミノ酸配列および配列番号３７８のアミノ酸配列を含むＬＣ；
ｅ）配列番号３６のアミノ酸配列および配列番号３７４、３７５、３７６、または３７７のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号３７のアミノ酸配列および配列番号３７８のアミノ酸配列を含むＬＣ；
ｆ）配列番号４６のアミノ酸配列および配列番号３７４、３７５、３７６、または３７７のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号４７のアミノ酸配列および配列番号３７８のアミノ酸配列を含むＨＣ；
ｇ）配列番号５６のアミノ酸配列および配列番号３７４、３７５、３７６、または３７７のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号５７のアミノ酸配列および配列番号３７８のアミノ酸配列を含むＬＣ；
ｈ）配列番号６６のアミノ酸配列および配列番号３７４、３７５、３７６、または３７７のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号６７のアミノ酸配列および配列番号３７８のアミノ酸配列を含むＬＣ；
ｉ）配列番号７６のアミノ酸配列および配列番号３７４、３７５、３７６、または３７７のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号７７のアミノ酸配列および配列番号３７８のアミノ酸配列を含むＬＣ；
ｊ）配列番号８６のアミノ酸配列および配列番号３７４、３７５、３７６、または３７７のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号８７のアミノ酸配列および配列番号３７８のアミノ酸配列を含むＬＣ；
ｋ）配列番号９６のアミノ酸配列および配列番号３７４、３７５、３７６、または３７７のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号９７のアミノ酸配列および配列番号３７８のアミノ酸配列を含むＬＣ；
ｌ）配列番号１０６のアミノ酸配列および配列番号３７４、３７５、３７６、または３７７のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号１０７のアミノ酸配列および配列番号３７８のアミノ酸配列を含むＬＣ；
ｍ）配列番号１１６のアミノ酸配列および配列番号３７４、３７５、３７６、または３７７のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号１１７のアミノ酸配列および配列番号３７８のアミノ酸配列を含むＬＣ；
ｎ）配列番号１２６のアミノ酸配列および配列番号３７４、３７５、３７６、または３７７のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号１２７のアミノ酸配列および配列番号３７８のアミノ酸配列を含むＬＣ；
ｏ）配列番号１３６のアミノ酸配列および配列番号３７４、３７５、３７６、または３７７のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号１３７のアミノ酸配列および配列番号３７８のアミノ酸配列を含むＬＣ；
ｐ）配列番号１４６のアミノ酸配列および配列番号３７４、３７５、３７６、または３７７のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号１４７のアミノ酸配列および配列番号３７８のアミノ酸配列を含むＬＣ；
ｑ）配列番号１５６のアミノ酸配列および配列番号３７４、３７５、３７６、または３７７のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号１５７のアミノ酸配列および配列番号３７８のアミノ酸配列を含むＬＣ；
ｒ）配列番号１６６のアミノ酸配列および配列番号３７４、３７５、３７６、または３７７のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号１６７のアミノ酸配列および配列番号３７８のアミノ酸配列を含むＬＣ；
ｓ）配列番号１７６のアミノ酸配列および配列番号３７４、３７５、３７６、または３７７のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号１７７のアミノ酸配列および配列番号３７８のアミノ酸配列を含むＬＣ；
ｔ）配列番号１８６のアミノ酸配列および配列番号３７４、３７５、３７６、または３７７のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号１８７のアミノ酸配列および配列番号３７８のアミノ酸配列を含むＬＣ；
ｕ）配列番号１９６のアミノ酸配列および配列番号３７４、３７５、３７６、または３７７のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号１９７のアミノ酸配列および配列番号３７８のアミノ酸配列を含むＬＣ；
ｖ）配列番号２０６のアミノ酸配列および配列番号３７４、３７５、３７６、または３７７のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号２０７のアミノ酸配列および配列番号３７８のアミノ酸配列を含むＬＣ；または
ｗ）配列番号２１６のアミノ酸配列および配列番号３７４、３７５、３７６、または３７７のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号２１７のアミノ酸配列および配列番号３７８のアミノ酸配列を含むＬＣ
を含む。
【０１４２】
一部の実施形態において、抗ＴＩＭ−３抗体は、
ａ）そのＨ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ、配列番号８〜１０のアミノ酸配列を含む抗体；
ｂ）そのＶＨが、配列番号３または７のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一である抗体；
ｃ）そのＶＨが、配列番号３または７のアミノ酸配列を含む抗体；
ｄ）そのＨＣが、配列番号３および３７４のアミノ酸配列、または配列番号７のアミノ酸配列、および配列番号３７５、３７６、もしくは３７７のアミノ酸配列を含む抗体；
ｅ）そのＬ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ、配列番号１１〜１３のアミノ酸配列を含む抗体；
ｆ）そのＶＬが、配列番号４のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一である抗体；
ｇ）そのＶＬが、配列番号４のアミノ酸配列を含む抗体；
ｈ）そのＬＣが、配列番号４および３７８のアミノ酸配列を含む抗体；
ｉ）そのＨ−ＣＤＲ１〜３およびＬ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ、配列番号８〜１３のアミノ酸配列を含む抗体；
ｊ）そのＶＨが、配列番号３または７のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一であり、およびそのＶＬが、配列番号４のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一である抗体；
ｋ）そのＶＨが、配列番号３または１５のアミノ酸配列を含み、およびそのＶＬが、配列番号４のアミノ酸配列を含む抗体；ならびに
ｌ）そのＨＣが、配列番号３および３７４のアミノ酸配列、または配列番号７のアミノ酸配列、および配列番号３７５、３７６、または３７７のアミノ酸配列を含み；ならびにそのＬＣが、配列番号４および３７８のアミノ酸配列を含む抗体
からなる群から選択される。
【０１４３】
一部の実施形態において、抗ＴＩＭ−３抗体は、
ａ）そのＨ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ、配列番号１８〜２０のアミノ酸配列を含む抗体；
ｂ）そのＶＨが、配列番号１６のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一である抗体；
ｃ）そのＶＨが、配列番号１６のアミノ酸配列を含む抗体；
ｄ）そのＨＣが、配列番号１６および配列番号３７４、３７５、３７６、または３７７のアミノ酸配列を含む抗体；
ｅ）そのＬ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ配列番号２１〜２３のアミノ酸配列を含む抗体；
ｆ）そのＶＬが、配列番号１７のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一である抗体；
ｇ）そのＶＬが、配列番号１７のアミノ酸配列を含む抗体；
ｈ）そのＬＣが、配列番号１７および３７８のアミノ酸配列を含む抗体；
ｉ）そのＨ−ＣＤＲ１〜３およびＬ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ、配列番号１８〜２３のアミノ酸配列を含む抗体；
ｊ）そのＶＨが、配列番号１６のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一であり、およびそのＶＬが、配列番号１７のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一である抗体；
ｋ）そのＶＨが、配列番号１６のアミノ酸配列を含み、およびそのＶＬが、配列番号１７のアミノ酸配列を含む抗体；ならびに
ｌ）そのＨＣが、配列番号１６のアミノ酸配列、および配列番号３７４、３７５、３７６、または３７７のアミノ酸配列を含み；ならびにそのＬＣが、配列番号１７および３７８のアミノ酸配列を含む抗体
からなる群から選択される。
【０１４４】
一部の実施形態において、抗ＴＩＭ−３抗体は、
ａ）そのＨ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ、配列番号２８〜３０のアミノ酸配列を含む抗体；
ｂ）そのＶＨが、配列番号２６のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一である抗体；
ｃ）そのＶＨが、配列番号２６のアミノ酸配列を含む抗体；
ｄ）そのＨＣが、配列番号２６および配列番号３７４、３７５、３７６、または３７７のアミノ酸配列を含む抗体；
ｅ）そのＬ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ配列番号３１〜３３のアミノ酸配列を含む抗体；
ｆ）そのＶＬが、配列番号２７のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一である抗体；
ｇ）そのＶＬが、配列番号２７のアミノ酸配列を含む抗体；
ｈ）そのＬＣが、配列番号２７および３７８のアミノ酸配列を含む抗体；
ｉ）そのＨ−ＣＤＲ１〜３およびＬ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ、配列番号２８〜３３のアミノ酸配列を含む抗体；
ｊ）そのＶＨが、配列番号２６のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一であり、およびそのＶＬが、配列番号２７のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一である抗体；
ｋ）そのＶＨが、配列番号２６のアミノ酸配列を含み、およびそのＶＬが、配列番号２７のアミノ酸配列を含む抗体；ならびに
ｌ）そのＨＣが、配列番号２６のアミノ酸配列、および配列番号３７４、３７５、３７６、または３７７のアミノ酸配列を含み；ならびにそのＬＣが、配列番号２７および３７８のアミノ酸配列を含む抗体
からなる群から選択される。
【０１４５】
一部の実施形態において、抗ＴＩＭ−３抗体は、
ａ）そのＨ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ、配列番号３８〜４０のアミノ酸配列を含む抗体；
ｂ）そのＶＨが、配列番号３６のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一である抗体；
ｃ）そのＶＨが、配列番号３６のアミノ酸配列を含む抗体；
ｄ）そのＨＣが、配列番号３６および配列番号３７４、３７５、３７６、または３７７のアミノ酸配列を含む抗体；
ｅ）そのＬ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ配列番号４１〜４３のアミノ酸配列を含む抗体；
ｆ）そのＶＬが、配列番号３７のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一である抗体；
ｇ）そのＶＬが、配列番号３７のアミノ酸配列を含む抗体；
ｈ）そのＬＣが、配列番号３７および３７８のアミノ酸配列を含む抗体；
ｉ）そのＨ−ＣＤＲ１〜３およびＬ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ、配列番号３８〜４３のアミノ酸配列を含む抗体；
ｊ）そのＶＨが、配列番号３６のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一であり、およびそのＶＬが、配列番号３７のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一である抗体；
ｋ）そのＶＨが、配列番号３６のアミノ酸配列を含み、およびそのＶＬが、配列番号３７のアミノ酸配列を含む抗体；ならびに
ｌ）そのＨＣが、配列番号３６のアミノ酸配列、および配列番号３７４、３７５、３７６、または３７７のアミノ酸配列を含み；ならびにそのＬＣが、配列番号３７および３７８のアミノ酸配列を含む抗体
からなる群から選択される。
【０１４６】
一部の実施形態において、抗ＴＩＭ−３抗体は、
ａ）そのＨ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ、配列番号４８〜５０のアミノ酸配列を含む抗体；
ｂ）そのＶＨが、配列番号４６のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一である抗体；
ｃ）そのＶＨが、配列番号４６のアミノ酸配列を含む抗体；
ｄ）そのＨＣが、配列番号４６および配列番号３７４、３７５、３７６、または３７７のアミノ酸配列を含む抗体；
ｅ）そのＬ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ配列番号５１〜５３のアミノ酸配列を含む抗体；
ｆ）そのＶＬが、配列番号４７のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一である抗体；
ｇ）そのＶＬが、配列番号４７のアミノ酸配列を含む抗体；
ｈ）そのＬＣが、配列番号４７および３７８のアミノ酸配列を含む抗体；
ｉ）そのＨ−ＣＤＲ１〜３およびＬ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ、配列番号４８〜５３のアミノ酸配列を含む抗体；
ｊ）そのＶＨが、配列番号４６のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一であり、およびそのＶＬが、配列番号４７のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一である抗体；
ｋ）そのＶＨが、配列番号４６のアミノ酸配列を含み、およびそのＶＬが、配列番号４７のアミノ酸配列を含む抗体；ならびに
ｌ）そのＨＣが、配列番号４６のアミノ酸配列、および配列番号３７４、３７５、３７６、または３７７のアミノ酸配列を含み；ならびにそのＬＣが、配列番号４７および３７８のアミノ酸配列を含む抗体
からなる群から選択される。
【０１４７】
一部の実施形態において、抗ＴＩＭ−３抗体は、
ａ）そのＨ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ、配列番号５８〜６０のアミノ酸配列を含む抗体；
ｂ）そのＶＨが、配列番号５６のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一である抗体；
ｃ）そのＶＨが、配列番号５６のアミノ酸配列を含む抗体；
ｄ）そのＨＣが、配列番号５６および配列番号３７４、３７５、３７６、または３７７のアミノ酸配列を含む抗体；
ｅ）そのＬ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ配列番号６１〜６３のアミノ酸配列を含む抗体；
ｆ）そのＶＬが、配列番号５７のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一である抗体；
ｇ）そのＶＬが、配列番号５７のアミノ酸配列を含む抗体；
ｈ）そのＬＣが、配列番号５７および３７８のアミノ酸配列を含む抗体；
ｉ）そのＨ−ＣＤＲ１〜３およびＬ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ、配列番号５８〜６３のアミノ酸配列を含む抗体；
ｊ）そのＶＨが、配列番号５６のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一であり、およびそのＶＬが、配列番号５７のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一である抗体；
ｋ）そのＶＨが、配列番号５６のアミノ酸配列を含み、およびそのＶＬが、配列番号５７のアミノ酸配列を含む抗体；ならびに
ｌ）そのＨＣが、配列番号５６のアミノ酸配列、および配列番号３７４、３７５、３７６、または３７７のアミノ酸配列を含み；ならびにそのＬＣが、配列番号５７および３７８のアミノ酸配列を含む抗体
からなる群から選択される。
【０１４８】
一部の実施形態において、抗ＴＩＭ−３抗体は、
ａ）そのＨ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ、配列番号６８〜７０のアミノ酸配列を含む抗体；
ｂ）そのＶＨが、配列番号６６のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一である抗体；
ｃ）そのＶＨが、配列番号６６のアミノ酸配列を含む抗体；
ｄ）そのＨＣが、配列番号６６および配列番号３７４、３７５、３７６、または３７７のアミノ酸配列を含む抗体；
ｅ）そのＬ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ配列番号７１〜７３のアミノ酸配列を含む抗体；
ｆ）そのＶＬが、配列番号６７のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一である抗体；
ｇ）そのＶＬが、配列番号６７のアミノ酸配列を含む抗体；
ｈ）そのＬＣが、配列番号６７および３７８のアミノ酸配列を含む抗体；
ｉ）そのＨ−ＣＤＲ１〜３およびＬ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ、配列番号６８〜７３のアミノ酸配列を含む抗体；
ｊ）そのＶＨが、配列番号６６のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一であり、およびそのＶＬが、配列番号６７のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一である抗体；
ｋ）そのＶＨが、配列番号６６のアミノ酸配列を含み、およびそのＶＬが、配列番号６７のアミノ酸配列を含む抗体；ならびに
ｌ）そのＨＣが、配列番号６６のアミノ酸配列、および配列番号３７４、３７５、３７６、または３７７のアミノ酸配列を含み；ならびにそのＬＣが、配列番号６７および３７８のアミノ酸配列を含む抗体
からなる群から選択される。
【０１４９】
一部の実施形態において、抗ＴＩＭ−３抗体は、
ａ）そのＨ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ、配列番号７８〜８０のアミノ酸配列を含む抗体；
ｂ）そのＶＨが、配列番号７６のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一である抗体；
ｃ）そのＶＨが、配列番号７６のアミノ酸配列を含む抗体；
ｄ）そのＨＣが、配列番号７６および配列番号３７４、３７５、３７６、または３７７のアミノ酸配列を含む抗体；
ｅ）そのＬ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ配列番号８１〜８３のアミノ酸配列を含む抗体；
ｆ）そのＶＬが、配列番号７７のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一である抗体；
ｇ）そのＶＬが、配列番号７７のアミノ酸配列を含む抗体；
ｈ）そのＬＣが、配列番号７７および３７８のアミノ酸配列を含む抗体；
ｉ）そのＨ−ＣＤＲ１〜３およびＬ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ、配列番号７８〜８３のアミノ酸配列を含む抗体；
ｊ）そのＶＨが、配列番号７６のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一であり、およびそのＶＬが、配列番号７７のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一である抗体；
ｋ）そのＶＨが、配列番号７６のアミノ酸配列を含み、およびそのＶＬが、配列番号７７のアミノ酸配列を含む抗体；ならびに
ｌ）そのＨＣが、配列番号７６のアミノ酸配列、および配列番号３７４、３７５、３７６、または３７７のアミノ酸配列を含み；ならびにそのＬＣが、配列番号７７および３７８のアミノ酸配列を含む抗体
からなる群から選択される。
【０１５０】
一部の実施形態において、抗ＴＩＭ−３抗体は、
ａ）そのＨ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ、配列番号８８〜９０のアミノ酸配列を含む抗体；
ｂ）そのＶＨが、配列番号８６のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一である抗体；
ｃ）そのＶＨが、配列番号８６のアミノ酸配列を含む抗体；
ｄ）そのＨＣが、配列番号８６および配列番号３７４、３７５、３７６、または３７７のアミノ酸配列を含む抗体；
ｅ）そのＬ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ配列番号９１〜９３のアミノ酸配列を含む抗体；
ｆ）そのＶＬが、配列番号８７のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一である抗体；
ｇ）そのＶＬが、配列番号８７のアミノ酸配列を含む抗体；
ｈ）そのＬＣが、配列番号８７および３７８のアミノ酸配列を含む抗体；
ｉ）そのＨ−ＣＤＲ１〜３およびＬ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ、配列番号８８〜９３のアミノ酸配列を含む抗体；
ｊ）そのＶＨが、配列番号８６のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一であり、およびそのＶＬが、配列番号８７のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一である抗体；
ｋ）そのＶＨが、配列番号８６のアミノ酸配列を含み、およびそのＶＬが、配列番号８７のアミノ酸配列を含む抗体；ならびに
ｌ）そのＨＣが、配列番号８６のアミノ酸配列、および配列番号３７４、３７５、３７６、または３７７のアミノ酸配列を含み；ならびにそのＬＣが、配列番号８７および３７８のアミノ酸配列を含む抗体
からなる群から選択される。
【０１５１】
一部の実施形態において、抗ＴＩＭ−３抗体は、
ａ）そのＨ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ、配列番号９８〜１００のアミノ酸配列を含む抗体；
ｂ）そのＶＨが、配列番号９６のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一である抗体；
ｃ）そのＶＨが、配列番号９６のアミノ酸配列を含む抗体；
ｄ）そのＨＣが、配列番号９６および配列番号３７４、３７５、３７６、または３７７のアミノ酸配列を含む抗体；
ｅ）そのＬ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ配列番号１０１〜１０３のアミノ酸配列を含む抗体；
ｆ）そのＶＬが、配列番号９７のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一である抗体；
ｇ）そのＶＬが、配列番号９７のアミノ酸配列を含む抗体；
ｈ）そのＬＣが、配列番号９７および３７８のアミノ酸配列を含む抗体；
ｉ）そのＨ−ＣＤＲ１〜３およびＬ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ、配列番号９８〜１０３のアミノ酸配列を含む抗体；
ｊ）そのＶＨが、配列番号９６のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一であり、およびそのＶＬが、配列番号９７のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一である抗体；
ｋ）そのＶＨが、配列番号９６のアミノ酸配列を含み、およびそのＶＬが、配列番号９７のアミノ酸配列を含む抗体；ならびに
ｌ）そのＨＣが、配列番号９６のアミノ酸配列、および配列番号３７４、３７５、３７６、または３７７のアミノ酸配列を含み；ならびにそのＬＣが、配列番号９７および３７８のアミノ酸配列を含む抗体
からなる群から選択される。
【０１５２】
一部の実施形態において、抗ＴＩＭ−３抗体は、
ａ）そのＨ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ、配列番号１０８〜１１０のアミノ酸配列を含む抗体；
ｂ）そのＶＨが、配列番号１０６のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一である抗体；
ｃ）そのＶＨが、配列番号１０６のアミノ酸配列を含む抗体；
ｄ）そのＨＣが、配列番号１０６および配列番号３７４、３７５、３７６、または３７７のアミノ酸配列を含む抗体；
ｅ）そのＬ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ配列番号１１１〜１１３のアミノ酸配列を含む抗体；
ｆ）そのＶＬが、配列番号１０７のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一である抗体；
ｇ）そのＶＬが、配列番号１０７のアミノ酸配列を含む抗体；
ｈ）そのＬＣが、配列番号１０７および３７８のアミノ酸配列を含む抗体；
ｉ）そのＨ−ＣＤＲ１〜３およびＬ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ、配列番号１０８〜１１３のアミノ酸配列を含む抗体；
ｊ）そのＶＨが、配列番号１０６のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一であり、およびそのＶＬが、配列番号１０７のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一である抗体；
ｋ）そのＶＨが、配列番号１０６のアミノ酸配列を含み、およびそのＶＬが、配列番号１０７のアミノ酸配列を含む抗体；ならびに
ｌ）そのＨＣが、配列番号１０６のアミノ酸配列、および配列番号３７４、３７５、３７６、または３７７のアミノ酸配列を含み；ならびにそのＬＣが、配列番号１０７および３７８のアミノ酸配列を含む抗体
からなる群から選択される。
【０１５３】
一部の実施形態において、抗ＴＩＭ−３抗体は、
ａ）そのＨ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ、配列番号１１８〜１２０のアミノ酸配列を含む抗体；
ｂ）そのＶＨが、配列番号１１６のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一である抗体；
ｃ）そのＶＨが、配列番号１１６のアミノ酸配列を含む抗体；
ｄ）そのＨＣが、配列番号１１６および配列番号３７４、３７５、３７６、または３７７のアミノ酸配列を含む抗体；
ｅ）そのＬ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ配列番号１２１〜１２３のアミノ酸配列を含む抗体；
ｆ）そのＶＬが、配列番号１１７のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一である抗体；
ｇ）そのＶＬが、配列番号１１７のアミノ酸配列を含む抗体；
ｈ）そのＬＣが、配列番号１１７および３７８のアミノ酸配列を含む抗体；
ｉ）そのＨ−ＣＤＲ１〜３およびＬ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ、配列番号１１８〜１２３のアミノ酸配列を含む抗体；
ｊ）そのＶＨが、配列番号１１６のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一であり、およびそのＶＬが、配列番号１１７のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一である抗体；
ｋ）そのＶＨが、配列番号１１６のアミノ酸配列を含み、およびそのＶＬが、配列番号１１７のアミノ酸配列を含む抗体；ならびに
ｌ）そのＨＣが、配列番号１１６のアミノ酸配列、および配列番号３７４、３７５、３７６、または３７７のアミノ酸配列を含み；ならびにそのＬＣが、配列番号１１７および３７８のアミノ酸配列を含む抗体
からなる群から選択される。
【０１５４】
一部の実施形態において、抗ＴＩＭ−３抗体は、
ａ）そのＨ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ、配列番号１２８〜１３０のアミノ酸配列を含む抗体；
ｂ）そのＶＨが、配列番号１２６のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一である抗体；
ｃ）そのＶＨが、配列番号１２６のアミノ酸配列を含む抗体；
ｄ）そのＨＣが、配列番号１２６および配列番号３７４、３７５、３７６、または３７７のアミノ酸配列を含む抗体；
ｅ）そのＬ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ配列番号１３１〜１３３のアミノ酸配列を含む抗体；
ｆ）そのＶＬが、配列番号１２７のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一である抗体；
ｇ）そのＶＬが、配列番号１２７のアミノ酸配列を含む抗体；
ｈ）そのＬＣが、配列番号１２７および３７８のアミノ酸配列を含む抗体；
ｉ）そのＨ−ＣＤＲ１〜３およびＬ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ、配列番号１２８〜１３３のアミノ酸配列を含む抗体；
ｊ）そのＶＨが、配列番号１２６のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一であり、およびそのＶＬが、配列番号１２７のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一である抗体；
ｋ）そのＶＨが、配列番号１２６のアミノ酸配列を含み、およびそのＶＬが、配列番号１２７のアミノ酸配列を含む抗体；ならびに
ｌ）そのＨＣが、配列番号１２６のアミノ酸配列、および配列番号３７４、３７５、３７６、または３７７のアミノ酸配列を含み；ならびにそのＬＣが、配列番号１２７および３７８のアミノ酸配列を含む抗体
からなる群から選択される。
【０１５５】
一部の実施形態において、抗ＴＩＭ−３抗体は、
ａ）そのＨ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ、配列番号１３８〜１４０のアミノ酸配列を含む抗体；
ｂ）そのＶＨが、配列番号１３６のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一である抗体；
ｃ）そのＶＨが、配列番号１３６のアミノ酸配列を含む抗体；
ｄ）そのＨＣが、配列番号１３６および配列番号３７４、３７５、３７６、または３７７のアミノ酸配列を含む抗体；
ｅ）そのＬ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ配列番号１４１〜１４３のアミノ酸配列を含む抗体；
ｆ）そのＶＬが、配列番号１３７のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一である抗体；
ｇ）そのＶＬが、配列番号１３７のアミノ酸配列を含む抗体；
ｈ）そのＬＣが、配列番号１３７および３７８のアミノ酸配列を含む抗体；
ｉ）そのＨ−ＣＤＲ１〜３およびＬ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ、配列番号１３８〜１４３のアミノ酸配列を含む抗体；
ｊ）そのＶＨが、配列番号１３６のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一であり、およびそのＶＬが、配列番号１３７のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一である抗体；
ｋ）そのＶＨが、配列番号１３６のアミノ酸配列を含み、およびそのＶＬが、配列番号１３７のアミノ酸配列を含む抗体；ならびに
ｌ）そのＨＣが、配列番号１３６のアミノ酸配列、および配列番号３７４、３７５、３７６、または３７７のアミノ酸配列を含み；ならびにそのＬＣが、配列番号１３７および３７８のアミノ酸配列を含む抗体
からなる群から選択される。
【０１５６】
一部の実施形態において、抗ＴＩＭ−３抗体は、
ａ）そのＨ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ、配列番号１４８〜１５０のアミノ酸配列を含む抗体；
ｂ）そのＶＨが、配列番号１４６のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一である抗体；
ｃ）そのＶＨが、配列番号１４６のアミノ酸配列を含む抗体；
ｄ）そのＨＣが、配列番号１４６および配列番号３７４、３７５、３７６、または３７７のアミノ酸配列を含む抗体；
ｅ）そのＬ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ配列番号１５１〜１５３のアミノ酸配列を含む抗体；
ｆ）そのＶＬが、配列番号１４７のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一である抗体；
ｇ）そのＶＬが、配列番号１４７のアミノ酸配列を含む抗体；
ｈ）そのＬＣが、配列番号１４７および３７８のアミノ酸配列を含む抗体；
ｉ）そのＨ−ＣＤＲ１〜３およびＬ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ、配列番号１４８〜５３のアミノ酸配列を含む抗体；
ｊ）そのＶＨが、配列番号１４６のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一であり、およびそのＶＬが、配列番号１４７のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一である抗体；
ｋ）そのＶＨが、配列番号１４６のアミノ酸配列を含み、およびそのＶＬが、配列番号１４７のアミノ酸配列を含む抗体；ならびに
ｌ）そのＨＣが、配列番号１４６のアミノ酸配列、および配列番号３７４、３７５、３７６、または３７７のアミノ酸配列を含み；ならびにそのＬＣが、配列番号１４７および３７８のアミノ酸配列を含む抗体
からなる群から選択される。
【０１５７】
一部の実施形態において、抗ＴＩＭ−３抗体は、
ａ）そのＨ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ、配列番号１５８〜１６０のアミノ酸配列を含む抗体；
ｂ）そのＶＨが、配列番号１５６のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一である抗体；
ｃ）そのＶＨが、配列番号１５６のアミノ酸配列を含む抗体；
ｄ）そのＨＣが、配列番号１５６および配列番号３７４、３７５、３７６、または３７７のアミノ酸配列を含む抗体；
ｅ）そのＬ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ配列番号１６１〜１６３のアミノ酸配列を含む抗体；
ｆ）そのＶＬが、配列番号１５７のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一である抗体；
ｇ）そのＶＬが、配列番号１５７のアミノ酸配列を含む抗体；
ｈ）そのＬＣが、配列番号１５７および３７８のアミノ酸配列を含む抗体；
ｉ）そのＨ−ＣＤＲ１〜３およびＬ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ、配列番号１５８〜１６３のアミノ酸配列を含む抗体；
ｊ）そのＶＨが、配列番号１５６のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一であり、およびそのＶＬが、配列番号１５７のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一である抗体；
ｋ）そのＶＨが、配列番号１５６のアミノ酸配列を含み、およびそのＶＬが、配列番号１５７のアミノ酸配列を含む抗体；ならびに
ｌ）そのＨＣが、配列番号１５６のアミノ酸配列、および配列番号３７４、３７５、３７６、または３７７のアミノ酸配列を含み；ならびにそのＬＣが、配列番号１５７および３７８のアミノ酸配列を含む抗体
からなる群から選択される。
【０１５８】
一部の実施形態において、抗ＴＩＭ−３抗体は、
ａ）そのＨ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ、配列番号１６８〜１７０のアミノ酸配列を含む抗体；
ｂ）そのＶＨが、配列番号１６６のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一である抗体；
ｃ）そのＶＨが、配列番号１６６のアミノ酸配列を含む抗体；
ｄ）そのＨＣが、配列番号１６６および配列番号３７４、３７５、３７６、または３７７のアミノ酸配列を含む抗体；
ｅ）そのＬ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ配列番号１７１〜１７３のアミノ酸配列を含む抗体；
ｆ）そのＶＬが、配列番号１６７のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一である抗体；
ｇ）そのＶＬが、配列番号１６７のアミノ酸配列を含む抗体；
ｈ）そのＬＣが、配列番号１６７および３７８のアミノ酸配列を含む抗体；
ｉ）そのＨ−ＣＤＲ１〜３およびＬ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ、配列番号１６８〜１７３のアミノ酸配列を含む抗体；
ｊ）そのＶＨが、配列番号１６６のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一であり、およびそのＶＬが、配列番号１６７のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一である抗体；
ｋ）そのＶＨが、配列番号１６６のアミノ酸配列を含み、およびそのＶＬが、配列番号１６７のアミノ酸配列を含む抗体；ならびに
ｌ）そのＨＣが、配列番号１６６のアミノ酸配列、および配列番号３７４、３７５、３７６、または３７７のアミノ酸配列を含み；ならびにそのＬＣが、配列番号１６７および３７８のアミノ酸配列を含む抗体
からなる群から選択される。
【０１５９】
一部の実施形態において、抗ＴＩＭ−３抗体は、
ａ）そのＨ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ、配列番号１７８〜８０のアミノ酸配列を含む抗体；
ｂ）そのＶＨが、配列番号１７６のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一である抗体；
ｃ）そのＶＨが、配列番号１７６のアミノ酸配列を含む抗体；
ｄ）そのＨＣが、配列番号１７６および配列番号３７４、３７５、３７６、または３７７のアミノ酸配列を含む抗体；
ｅ）そのＬ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ配列番号１８１〜１８３のアミノ酸配列を含む抗体；
ｆ）そのＶＬが、配列番号１７７のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一である抗体；
ｇ）そのＶＬが、配列番号１７７のアミノ酸配列を含む抗体；
ｈ）そのＬＣが、配列番号１７７および３７８のアミノ酸配列を含む抗体；
ｉ）そのＨ−ＣＤＲ１〜３およびＬ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ、配列番号１７８〜１８３のアミノ酸配列を含む抗体；
ｊ）そのＶＨが、配列番号１７６のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一であり、およびそのＶＬが、配列番号１７７のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一である抗体；
ｋ）そのＶＨが、配列番号１７６のアミノ酸配列を含み、およびそのＶＬが、配列番号１７７のアミノ酸配列を含む抗体；ならびに
ｌ）そのＨＣが、配列番号１７６のアミノ酸配列、および配列番号３７４、３７５、３７６、または３７７のアミノ酸配列を含み；ならびにそのＬＣが、配列番号１７７および３７８のアミノ酸配列を含む抗体
からなる群から選択される。
【０１６０】
一部の実施形態において、抗ＴＩＭ−３抗体は、
ａ）そのＨ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ、配列番号１８８〜１９０のアミノ酸配列を含む抗体；
ｂ）そのＶＨが、配列番号１８６のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一である抗体；
ｃ）そのＶＨが、配列番号１８６のアミノ酸配列を含む抗体；
ｄ）そのＨＣが、配列番号１８６および配列番号３７４、３７５、３７６、または３７７のアミノ酸配列を含む抗体；
ｅ）そのＬ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ配列番号１９１〜１９３のアミノ酸配列を含む抗体；
ｆ）そのＶＬが、配列番号１８７のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一である抗体；
ｇ）そのＶＬが、配列番号１８７のアミノ酸配列を含む抗体；
ｈ）そのＬＣが、配列番号１８７および３７８のアミノ酸配列を含む抗体；
ｉ）そのＨ−ＣＤＲ１〜３およびＬ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ、配列番号１８８〜１９３のアミノ酸配列を含む抗体；
ｊ）そのＶＨが、配列番号１８６のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一であり、およびそのＶＬが、配列番号１８７のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一である抗体；
ｋ）そのＶＨが、配列番号１８６のアミノ酸配列を含み、およびそのＶＬが、配列番号１８７のアミノ酸配列を含む抗体；ならびに
ｌ）そのＨＣが、配列番号１８６のアミノ酸配列、および配列番号３７４、３７５、３７６、または３７７のアミノ酸配列を含み；ならびにそのＬＣが、配列番号１８７および３７８のアミノ酸配列を含む抗体
からなる群から選択される。
【０１６１】
一部の実施形態において、抗ＴＩＭ−３抗体は、
ａ）そのＨ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ、配列番号１９８〜２００のアミノ酸配列を含む抗体；
ｂ）そのＶＨが、配列番号１９６のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一である抗体；
ｃ）そのＶＨが、配列番号１９６のアミノ酸配列を含む抗体；
ｄ）そのＨＣが、配列番号１９６および配列番号３７４、３７５、３７６、または３７７のアミノ酸配列を含む抗体；
ｅ）そのＬ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ配列番号２０１〜２０３のアミノ酸配列を含む抗体；
ｆ）そのＶＬが、配列番号１９７のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一である抗体；
ｇ）そのＶＬが、配列番号１９７のアミノ酸配列を含む抗体；
ｈ）そのＬＣが、配列番号１９７および３７８のアミノ酸配列を含む抗体；
ｉ）そのＨ−ＣＤＲ１〜３およびＬ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ、配列番号１９８〜２０３のアミノ酸配列を含む抗体；
ｊ）そのＶＨが、配列番号１９６のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一であり、およびそのＶＬが、配列番号１９７のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一である抗体；
ｋ）そのＶＨが、配列番号１９６のアミノ酸配列を含み、およびそのＶＬが、配列番号１９７のアミノ酸配列を含む抗体；ならびに
ｌ）そのＨＣが、配列番号１９６のアミノ酸配列、および配列番号３７４、３７５、３７６、または３７７のアミノ酸配列を含み；ならびにそのＬＣが、配列番号１９７および３７８のアミノ酸配列を含む抗体
からなる群から選択される。
【０１６２】
一部の実施形態において、抗ＴＩＭ−３抗体は、
ａ）そのＨ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ、配列番号２０８〜２１０のアミノ酸配列を含む抗体；
ｂ）そのＶＨが、配列番号２０６のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一である抗体；
ｃ）そのＶＨが、配列番号２０６のアミノ酸配列を含む抗体；
ｄ）そのＨＣが、配列番号２０６および配列番号３７４、３７５、３７６、または３７７のアミノ酸配列を含む抗体；
ｅ）そのＬ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ配列番号２１１〜２１３のアミノ酸配列を含む抗体；
ｆ）そのＶＬが、配列番号２０７のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一である抗体；
ｇ）そのＶＬが、配列番号２０７のアミノ酸配列を含む抗体；
ｈ）そのＬＣが、配列番号２０７および３７８のアミノ酸配列を含む抗体；
ｉ）そのＨ−ＣＤＲ１〜３およびＬ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ、配列番号２０８〜２１３のアミノ酸配列を含む抗体；
ｊ）そのＶＨが、配列番号２０６のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一であり、およびそのＶＬが、配列番号２０７のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一である抗体；
ｋ）そのＶＨが、配列番号２０６のアミノ酸配列を含み、およびそのＶＬが、配列番号２０７のアミノ酸配列を含む抗体；ならびに
ｌ）そのＨＣが、配列番号２０６のアミノ酸配列、および配列番号３７４、３７５、３７６、または３７７のアミノ酸配列を含み；ならびにそのＬＣが、配列番号２０７および３７８のアミノ酸配列を含む抗体
からなる群から選択される。
【０１６３】
一部の実施形態において、抗ＴＩＭ−３抗体は、
ａ）そのＨ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ、配列番号２１８〜２２０のアミノ酸配列を含む抗体；
ｂ）そのＶＨが、配列番号２１６のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一である抗体；
ｃ）そのＶＨが、配列番号２１６のアミノ酸配列を含む抗体；
ｄ）そのＨＣが、配列番号２１６および配列番号３７４、３７５、３７６、または３７７のアミノ酸配列を含む抗体；
ｅ）そのＬ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ配列番号２２１〜２２３のアミノ酸配列を含む抗体；
ｆ）そのＶＬが、配列番号２１７のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一である抗体；
ｇ）そのＶＬが、配列番号２１７のアミノ酸配列を含む抗体；
ｈ）そのＬＣが、配列番号２１７および３７８のアミノ酸配列を含む抗体；
ｉ）そのＨ−ＣＤＲ１〜３およびＬ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ、配列番号２１８〜２２３のアミノ酸配列を含む抗体；
ｊ）そのＶＨが、配列番号２１６のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一であり、およびそのＶＬが、配列番号２１７のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一である抗体；
ｋ）そのＶＨが、配列番号２１６のアミノ酸配列を含み、およびそのＶＬが、配列番号２１７のアミノ酸配列を含む抗体；ならびに
ｌ）そのＨＣが、配列番号２１６のアミノ酸配列、および配列番号３７４、３７５、３７６、または３７７のアミノ酸配列を含み；ならびにそのＬＣが、配列番号２１７および３７８のアミノ酸配列を含む抗体
からなる群から選択される。
【０１６４】
一部の実施形態において、本明細書に記載の抗ＴＩＭ−３抗体または抗原結合部分はいずれも、ガレクチン−９、ＣＥＡＣＡＭ１、ＨＭＧＢ−１、およびホスファチジルセリンなどのリガンドのＴＩＭ−３に対する結合を阻害しうる。
【０１６５】
一部の実施形態において、本明細書に記載の抗ＴＩＭ−３抗体または抗原結合部分はいずれも、ＮＫ細胞の活性を増加させうる。一部の実施形態において、この活性はＡＤＣＣを媒介することができる。
【０１６６】
一部の実施形態において、本明細書に記載の抗ＴＩＭ−３抗体またはその抗原結合部分の投与は、樹状細胞を活性化させ、その成熟を引き起こし、それによってそのＴ細胞刺激能を引き起こすことができる。いかなる特定の理論にも拘束されたくはないが、本明細書に記載の抗ＴＩＭ−３抗体は、ＴＩＭ−３樹状細胞活性化因子として機能し、それによって樹状細胞に及ぼすその効果がＴ細胞を刺激する役割を有すると考えられる。このため、腫瘍に関連する状況では、抗ＴＩＭ−３抗体は、腫瘍関連樹状細胞の成熟および活性化を引き起こし、腫瘍特異的Ｔ細胞の活性化をもたらす。
【０１６７】
一部の実施形態において、本明細書に記載の抗ＴＩＭ−３抗体またはその抗原結合部分の投与は、Ｔ細胞を直接活性化しうる。
【０１６８】
一部の実施形態において、本明細書に記載の抗ＴＩＭ−３抗体または抗原結合部分は、以下の特性：
ａ）表面プラズモン共鳴によって測定した場合に２３ｎＭまたはそれ未満のＫＤでヒトＴＩＭ−３に結合すること；
ｂ）表面プラズモン共鳴によって測定した場合に２２ｎＭまたはそれ未満のＫＤでカニクイザルＴＩＭ−３に結合すること；
ｃ）ＥＬＩＳＡによって測定した場合に１．２ｎＭまたはそれ未満のＥＣ５０でヒトＴＩＭ−３に結合すること；
ｄ）ＥＬＩＳＡによって測定した場合に４６ｎＭまたはそれ未満のＥＣ５０でカニクイザルＴＩＭ−３に結合すること；
ｅ）一方向性混合リンパ球反応アッセイにおいてＩＦＮ−γ分泌を増加させること；
ｆ）二方向性混合リンパ球反応アッセイにおいてＩＦＮ−γ分泌を増加させること；
ｇ）一方向性混合リンパ球反応アッセイにおいてＴＮＦ−α分泌を増加させること；
ｈ）樹状細胞からのＴＮＦ−α分泌を増加させること；および
ｉ）ＴＩＭ−３とホスファチジルセリンとの相互作用を阻害すること
のうちの少なくとも１つを有する。
そのような抗体の例には、抗体１５０８６．１５０８６（少なくとも特性ａ、ｃ、ｄ、ｅ、ｇ、およびｈを有する）、抗体１５０８６．１７１４５（少なくとも特性ａ、ｃ、ｄ、ｅ、ｇ、ｈ、およびｉを有する）、抗体１５０８６．１６８３７または１５０８６．１７１４４（少なくとも特性ａ、ｃ、およびｄを有する）、抗体２０２９３または２０１３１（少なくとも特性ａ、ｂ、ｃ、ｄ、ｅ、ｆ、およびｈを有する）、抗体２０３６２（少なくとも特性ｃ、ｅ、ｆ、およびｈを有する）、および抗体１９３２４、１９４１６、１９５６８、２０１８５、２０３００、または２０６２１（少なくとも特性ｃ、ｄ、ｅ、ｆ、およびｈを有する）が挙げられるがこれらに限定されない。一部の実施形態において、抗ＴＩＭ−３抗体または抗原結合部分は、前記特性の全てを有する。一部の実施形態において、抗ＴＩＭ−３抗体または抗原結合部分は、少なくとも特性ａ、ｃ、ｄ、ｅ、ｇ、およびｈを有する。一部の実施形態において、抗ＴＩＭ−３抗体または抗原結合部分は、少なくとも特性ａ、ｃ、ｄ、ｅ、ｇ、ｈ、およびｉを有する。一部の実施形態において、抗ＴＩＭ−３抗体または抗原結合部分は、少なくとも特性ａ、ｃ、およびｄを有する。一部の実施形態において、抗ＴＩＭ−３抗体または抗原結合部分は、少なくとも特性ａ、ｂ、ｃ、ｄ、ｅ、ｆ、およびｈを有する。一部の実施形態において、抗ＴＩＭ−３抗体または抗原結合部分は、少なくとも特性ｃ、ｅ、ｆ、およびｈを有する。一部の実施形態において、抗ＴＩＭ−３抗体または抗原結合部分は、少なくとも特性ｃ、ｄ、ｅ、ｆ、およびｈを有する。
【０１６９】
一部の実施形態において、本明細書に記載の抗ＴＩＭ−３抗体またはその抗原結合部分は、配列番号３８９の以下の残基：Ｐ５０、Ｖ６０、Ｆ６１、Ｅ６２、Ｇ６４、Ｒ６９、Ｉ１１７、Ｍ１１８、およびＤ１２０のうちの少なくとも１つ（例えば、少なくとも２個、少なくとも３個、少なくとも４個、少なくとも５個、少なくとも６個、少なくとも７個、少なくとも８個、または少なくとも９個）を含むＴＩＭ−３のエピトープに結合する。ある特定の実施形態において、抗体または抗原結合部分は、配列番号３８９の残基Ｐ５０、Ｖ６０、Ｆ６１、Ｅ６２、Ｇ６４、Ｒ６９、Ｉ１１７、Ｍ１１８、およびＤ１２０を含むＴＩＭ−３のエピトープに結合する（例えば、抗体１５０８６．１５０８６、１５０８６．１６８３７、１５０８６．１７１４５、または１５０８６．１７１４４）。ある特定の実施形態において、抗体または抗原結合部分は、配列番号３８９の残基Ｆ６１、Ｒ６９、およびＩ１１７を含むＴＩＭ−３のエピトープに結合する（例えば、抗体２０２９３）。ある特定の実施形態において、抗体または抗原結合部分は、配列番号３８９の残基Ｐ５０、Ｆ６１、Ｅ６２、Ｉ１１７、Ｍ１１８、およびＤ１２０を含むＴＩＭ−３のエピトープに結合する（例えば、抗体２０１３１）。
【０１７０】
一部の実施形態において、抗ＴＩＭ−３抗体またはその抗原結合部分は、配列番号３８９のアミノ酸残基Ｆ６１およびＩ１１７を含むＴＩＭ−３のエピトープに結合する（例えば、抗体１５０８６．１５０８６、１５０８６．１６８３７、１５０８６．１７１４５、１５０８６．１７１４４、２０２９３、または２０１３１）。一部の実施形態において、エピトープは、アミノ酸残基Ｒ６９をさらに含む（例えば、抗体１５０８６．１５０８６、１５０８６．１６８３７、１５０８６．１７１４５、１５０８６．１７１４４、または２０２９３）。一部の実施形態において、エピトープは、Ｐ５０、Ｅ６２、Ｍ１１８、およびＤ１２０をさらに含み（例えば、抗体１５０８６．１５０８６、１５０８６．１６８３７、１５０８６．１７１４５、１５０８６．１７１４４、または２０１３１）、ならびにアミノ酸残基Ｖ６０およびＧ６４をさらに含みうる（例えば、抗体１５０８６．１５０８６、１５０８６．１６８３７、１５０８６．１７１４５、または１５０８６．１７１４４）。
【０１７１】
一部の実施形態において、本明細書に記載の抗ＴＩＭ−３抗体またはその抗原結合部分は、配列番号２３６の以下の残基：Ｐ５０、Ｖ６０、Ｆ６１、Ｅ６２、Ｇ６４、Ｒ６９、Ｉ１１７、Ｍ１１８、およびＤ１２０のうちの少なくとも１つ（例えば、少なくとも１個、少なくとも２個、少なくとも３個、少なくとも４個、少なくとも５個、少なくとも６個、少なくとも７個、少なくとも８個、または少なくとも９個）を含むＴＩＭ−３のエピトープに結合する。上記の残基のいずれかの組み合わせを有するエピトープが企図される。
【０１７２】
一部の実施形態において、本明細書に記載の抗ＴＩＭ−３抗体またはその抗原結合部分は、配列番号３８９の残基６２〜６７および／または１１４〜１１７を含むＴＩＭ−３のエピトープに結合する。一部の実施形態において、抗体または部分は、配列番号３８９の残基６２〜６７（またはその断片、例えば１、２、３、４、または５残基断片）に結合する（例えば，抗体１５０８６．１５０８６、１５０８６．１６８３７、１５０８６．１７１４５、１５０８６．１７１４４、および２０２９３）。一部の実施形態において、抗体または部分は、配列番号３８９の残基１１４〜１１７（またはその断片、例えば１、２、または３残基断片）に結合する（例えば、抗体２０１３１）。上記の残基のいずれかの組み合わせを有するエピトープも同様に企図される。
【０１７３】
一部の実施形態において、抗ＴＩＭ−３抗体またはその抗原結合部分は、ＡＢＴＩＭ３（ＰＣＴ特許公報国際公開第２０１５／１１７００２号による）および／またはｍＡｂ１５（ＰＣＴ特許公報国際公開第２０１６／１１１９４７号による）とＴＩＭ−３に対する結合に関して競合しない。一部の実施形態において、抗ＴＩＭ−３抗体または抗原結合部分は、ＡＢＴＩＭ３および／またはｍＡＢ１５と同じエピトープに結合しない；例えば、抗体または部分は、ＡＢＴＩＭ３および／またはｍＡｂ１５が結合しないＴＩＭ−３上の１つまたは複数の残基に結合する。
【０１７４】
一部の実施形態において、本明細書に記載の抗ＴＩＭ−３抗体またはその抗原結合部分は、その全体が参照により本明細書に組み込まれている、ＰＣＴ特許公報国際公開第２０１７／１７８４９３号に記載の抗ＴＩＭ−３抗体または抗原結合部分である。
【０１７５】
抗ＬＡＧ−３抗体
一部の実施形態において、本明細書に開示の抗ＬＡＧ−３抗体は、ヒトイディオタイプを有する抗体を生成することができるトランスジェニックラットから生成されたヒト抗体である。別の実施形態では、抗体は、フレームワーク領域がヒト化に供されている、ニワトリＣＤＲ配列とヒトフレームワーク領域とを含むニワトリ由来キメラ抗体である。
【０１７６】
本明細書に記載の新規抗ＬＡＧ−３抗体の１つの利点は、それらがＩＬ−２産生の増加によって測定されるＴ細胞の活性を増強できることである。いかなる特定の理論にも拘束されたくはないが、抗ＬＡＧ−３抗体は、ＭＨＣＩＩおよびＬＳＥＣｔｉｎなどのその推定のリガンドとＬＡＧ−３の相互作用を遮断することができると考えられる。抗体は、リガンド結合領域の遮断を介して、またはＬＡＧ−３内在化の誘導を介してこれを直接達成することができる。本明細書に記載の抗ＬＡＧ−３抗体の別の潜在的利点は、「ＬＡＬＡ」変異（Ｌ２３４Ａ／Ｌ２３５Ａ）を有する抗体における二次エフェクター機能が低レベルであることであり、これはヒトＦｃｇＲ（Ｆｃガンマ受容体）に対する有意な抗体結合を妨害し、したがってエフェクターＴ細胞の枯渇をもたらす。
【０１７７】
一部の実施形態において、併用治療または組成物は、抗ＬＡＧ−３抗体またはその抗原結合部分を含み、抗ＬＡＧ−３抗体は、本明細書において抗体１５６４６、１５５３２、１５７２３、１５５９５、１５４３１、１５５７２もしくは１５０１１、またはこれらのいずれかの変異体と呼ばれる抗体であり、変異体は、抗体の抗原結合特異性を失うことなく、前記抗体と比較してある特定の最少のアミノ酸変化（例えば、フレームワーク領域に存在しうる、例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、または１０個のアミノ酸変化）を含みうる。
【０１７８】
一部の実施形態において、抗ＬＡＧ−３抗体またはその抗原結合部分は、抗体１５６４６、１５５３２、１５７２３、１５５９５、１５４３１、１５５７２または１５０１１とヒトＬＡＧ−３に対する結合に関して競合もしくは交叉競合するか、または該抗体と同じヒトＬＡＧ−３のエピトープに結合する。一部の実施形態において、抗体は、ＩｇＧ１またはＩｇＧ２フォーマットを有する。ある特定の実施形態において、抗体は、ＩｇＧ２フォーマットを有する。
【０１７９】
一部の実施形態において、抗ＬＡＧ−３抗体は、その重鎖（Ｈ）ＣＤＲ１〜３および軽鎖（Ｌ）ＣＤＲ１〜３がそれぞれ、配列番号３０８〜３１３、３１８〜３２３、３２８〜３３３、３３８〜３４３、３４８〜３５３、３５８〜３６３、または３６８〜３７３を含む抗体と、ヒトＬＡＧ−３に対する結合に関して競合もしくは交叉競合するか、または該抗体と同じヒトＬＡＧ−３のエピトープに結合する。
【０１８０】
一部の実施形態において、抗ＬＡＧ−３抗体は、配列番号３１０、３２０、３３０、３４０、３５０、３６０、または３７０のＨ−ＣＤＲ３アミノ酸配列を含むＨ−ＣＤＲ３を含む。
【０１８１】
一部の実施形態において、抗ＬＡＧ−３抗体は、配列番号３０８〜３１０、３１８〜３２０、３２８〜３３０、３３８〜３４０、３４８〜３５０、３５８〜３６０、または３６８〜３７０のＨ〜ＣＤＲ１〜３アミノ酸配列をそれぞれ含むＨ〜ＣＤＲ１〜３を含む。
【０１８２】
一部の実施形態において、抗ＬＡＧ−３抗体は、配列番号３０６、３１６、３２６、３３６、３４６、３５６、または３６６とアミノ酸配列が少なくとも９０％（例えば、少なくとも９２％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、または少なくとも９９％）同一であるＶＨを有する。
【０１８３】
一部の実施形態において、抗ＬＡＧ−３抗体は、配列番号３０６、３１６、３２６、３３６、３４６、３５６、または３６６を含むＶＨを有する。
【０１８４】
一部の実施形態において、抗ＬＡＧ−３抗体は、配列番号３０６、３１６、３２６、３３６、３４６、３５６、または３６６と配列が少なくとも９０％（例えば、少なくとも９２％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、または少なくとも９９％）同一であるＶＨ；および配列番号３７５と配列が少なくとも９０％（例えば、少なくとも９２％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、または少なくとも９９％）同一であるＣＨを有する。
【０１８５】
一部の実施形態において、抗ＬＡＧ−３抗体は、配列番号３０６、３１６、３２６、３３６、３４６、３５６、または３６６のＶＨアミノ酸配列、および配列番号３７５のＣＨアミノ酸配列を含むＨＣを有する。
【０１８６】
一部の実施形態において、抗ＬＡＧ−３抗体は、配列番号３１３、３２３、３３３、３４３、３５３、３６３、または３７３のＬ−ＣＤＲ３アミノ酸配列を含むＬ−ＣＤＲ３を含む。
【０１８７】
一部の実施形態において、抗ＬＡＧ−３抗体は、配列番号３１１〜３１３、３２１〜３２３、３３１〜３３３、３４１〜３４３、３５１〜３５３、３６１〜３６３、または３７１〜３７３のＬ−ＣＤＲ１〜３アミノ酸配列をそれぞれ含むＬ−ＣＤＲ１〜３を含む。
【０１８８】
一部の実施形態において、抗ＬＡＧ−３抗体は、配列番号３０７、３１７、３２７、３３７、３４７、３５７、または３６７のＶＬアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％（例えば、少なくとも９２％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、または少なくとも９９％）同一であるＶＬを有する。
【０１８９】
一部の実施形態において、抗ＬＡＧ−３抗体は、配列番号３０７、３１７、３２７、３３７、３４７、３５７、または３６７のＶＬアミノ酸配列を含むＶＬを有する。
【０１９０】
一部の実施形態において、抗ＬＡＧ−３抗体は、配列番号３０７、３１７、３２７、３３７、３４７、または３５７のＶＬアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％（例えば、少なくとも９２％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、または少なくとも９９％）同一であるＶＬ；および配列番号３７８と配列が少なくとも９０％（例えば、少なくとも９２％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、または少なくとも９９％）同一であるＣＬを有する。
【０１９１】
一部の実施形態において、抗ＬＡＧ−３抗体は、配列番号３０７、３１７、３２７、３３７、３４７、または３５７のＶＬアミノ酸配列、および配列番号３７８のＣＬアミノ酸配列を含むＬＣを有する。一部の実施形態において、抗ＬＡＧ−３抗体は、配列番号３６７のＶＬアミノ酸配列、および配列番号３７９のＣＬアミノ酸配列を含むＬＣを有する。
【０１９２】
一部の実施形態において、抗ＬＡＧ−３抗体は、上記の重鎖配列のいずれか、および上記の軽鎖配列のいずれかを含む。
【０１９３】
一部の実施形態において、抗ＬＡＧ−３抗体は、配列番号３１０および３１３、３２０および３２３、３３０および３３３、３４０および３４３、３５０および３５３、３６０および３６３、または３７０および３７３のＨ−ＣＤＲ３およびＬ−ＣＤＲ３アミノ酸配列をそれぞれ含むＨ−ＣＤＲ３およびＬ−ＣＤＲ３を含む。
【０１９４】
一部の実施形態において、抗ＬＡＧ−３抗体は、配列番号３０８〜３１３、３１８〜３２３、３２８〜３３３、３３８〜３４３、３４８〜３５３、３５８〜３６３、または３６８〜３７３のＨ−ＣＤＲ１〜３およびＬ−ＣＤＲ１〜３配列をそれぞれ含むＨ−ＣＤＲ１〜３およびＬ−ＣＤＲ１〜３を含む。
【０１９５】
一部の実施形態において、抗ＬＡＧ−３抗体は、配列番号３０６、３１６、３２６、３３６、３４６、３５６、または３６６のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％（例えば、少なくとも９２％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、または少なくとも９９％）同一であるＶＨ、および配列番号３０７、３１７、３２７、３３７、３４７、３５７、または３６７のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％（例えば、少なくとも９２％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、または少なくとも９９％）同一であるＶＬを有する。
【０１９６】
一部の実施形態において、抗ＬＡＧ−３抗体は、配列番号３０６、３１６、３２６、３３６、３４６、３５６、または３６６のアミノ酸配列を含むＶＨ、および配列番号３０７、３１７、３２７、３３７、３４７、３５７、または３６７のアミノ酸配列を含むＶＬを有する。
【０１９７】
一部の実施形態において、抗ＬＡＧ−３抗体は、配列番号３０６、３１６、３２６、３３６、３４６、３５６、または３６６のアミノ酸配列、および配列番号３７５のアミノ酸配列を含むＨＣ；ならびに配列番号３０７、３１７、３２７、３３７、３４７、または３５７のアミノ酸配列、および配列番号３７８のアミノ酸配列を含むＬＣを有する。
【０１９８】
一部の実施形態において、抗ＬＡＧ−３抗体は、配列番号３０６、３１６、３２６、３３６、３４６、３５６、または３６６のアミノ酸配列、および配列番号３７５のアミノ酸配列を含むＨＣ；ならびに配列番号３６７のアミノ酸配列、および配列番号３７９のアミノ酸配列を含むＬＣを有する。
【０１９９】
一部の実施形態において、抗ＬＡＧ−３抗体は、
ａ）それぞれ、配列番号３０８〜３１３；
ｂ）それぞれ、配列番号３１８〜３２３；
ｃ）それぞれ、配列番号３２８〜３３３；
ｄ）それぞれ、配列番号３３８〜３４３；
ｅ）それぞれ、配列番号３４８〜３５３；
ｆ）それぞれ、配列番号３５８〜３６３；または
ｇ）それぞれ、配列番号３６８〜３７３
のＨ−ＣＤＲ１〜３およびＬ−ＣＤＲ１〜３アミノ酸配列を含む。
【０２００】
一部の実施形態において、抗ＬＡＧ−３抗体は、
ａ）それぞれ、配列番号３０６および３０７；
ｂ）それぞれ、配列番号３１６および３１７；
ｃ）それぞれ、配列番号３２６および３２７；
ｄ）それぞれ、配列番号３３６および３３７；
ｅ）それぞれ、配列番号３４６および３４７；
ｆ）それぞれ、配列番号３５６および３５７；または
ｇ）それぞれ、配列番号３６６および３６７
のアミノ酸配列を有する重鎖可変ドメインおよび軽鎖可変ドメインを含む。
【０２０１】
一部の実施形態において、抗ＬＡＧ−３抗体は、
ａ）配列番号３０６のアミノ酸配列および配列番号３７５のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号３０７のアミノ酸配列および配列番号３７８のアミノ酸配列を含むＬＣ；
ｂ）配列番号３１６のアミノ酸配列および配列番号３７５のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号３１７のアミノ酸配列および配列番号３７８のアミノ酸配列を含むＬＣ；
ｃ）配列番号３２６のアミノ酸配列および配列番号３７５のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号３２７のアミノ酸配列および配列番号３７８のアミノ酸配列を含むＬＣ；
ｄ）配列番号３３６のアミノ酸配列および配列番号３７５のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号３３７のアミノ酸配列および配列番号３７８のアミノ酸配列を含むＬＣ；
ｅ）配列番号３４６のアミノ酸配列および配列番号３７５のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号３４７のアミノ酸配列および配列番号３７８のアミノ酸配列を含むＬＣ；
ｆ）配列番号３５６のアミノ酸配列および配列番号３７５のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号３５７のアミノ酸配列および配列番号３７８のアミノ酸配列を含むＬＣ；または
ｇ）配列番号３６６のアミノ酸配列および配列番号３７５のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号３６７のアミノ酸配列および配列番号３７９のアミノ酸配列を含むＬＣ
を含む。
【０２０２】
一部の実施形態において、抗ＬＡＧ−３抗体は、
ａ）そのＨ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ、配列番号３０８〜３１０のアミノ酸配列を含む抗体；
ｂ）そのＶＨが、配列番号３０６のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一である抗体；
ｃ）そのＶＨが配列番号３０６のアミノ酸配列を含む抗体；
ｄ）そのＨＣが、配列番号３０６および３７５のアミノ酸配列を含む抗体；
ｅ）そのＬ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ、配列番号３１１〜３１３のアミノ酸配列を含む抗体；
ｆ）そのＶＬが、配列番号３０７のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一である抗体；
ｇ）そのＶＬが、配列番号３０７のアミノ酸配列を含む抗体；
ｈ）そのＬＣが、配列番号３０７および３７８のアミノ酸配列を含む抗体；
ｉ）そのＨ−ＣＤＲ１〜３およびＬ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ、配列番号３０８〜３１３のアミノ酸配列を含む抗体；
ｊ）そのＶＨが、配列番号３０６のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一であり、およびそのＶＬが、配列番号３０７のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一である抗体；
ｋ）そのＶＨが、配列番号３０６のアミノ酸配列を含み、およびそのＶＬが、配列番号３０７のアミノ酸配列を含む抗体；ならびに
ｌ）そのＨＣが、配列番号３０６および３７５のアミノ酸配列を含み；ならびにそのＬＣが、配列番号３０７および３７８のアミノ酸配列を含む抗体
からなる群から選択される。
【０２０３】
一部の実施形態において、抗ＬＡＧ−３抗体は、
ａ）そのＨ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ、配列番号３１８〜３２０のアミノ酸配列を含む抗体；
ｂ）そのＶＨが、配列番号３１６のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一である抗体；
ｃ）そのＶＨが配列番号３１６のアミノ酸配列を含む抗体；
ｄ）そのＨＣが、配列番号３１６および３７５のアミノ酸配列を含む抗体；
ｅ）そのＬ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ、配列番号３２１〜３２３のアミノ酸配列を含む抗体；
ｆ）そのＶＬが、配列番号３１７のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一である抗体；
ｇ）そのＶＬが、配列番号３１７のアミノ酸配列を含む抗体；
ｈ）そのＬＣが、配列番号３１７および３７８のアミノ酸配列を含む抗体；
ｉ）そのＨ−ＣＤＲ１〜３およびＬ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ、配列番号３１８〜３２３のアミノ酸配列を含む抗体；
ｊ）そのＶＨが、配列番号３１６のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一であり、およびそのＶＬが、配列番号３１７のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一である抗体；
ｋ）そのＶＨが、配列番号３１６のアミノ酸配列を含み、およびそのＶＬが、配列番号３１７のアミノ酸配列を含む抗体；ならびに
ｌ）そのＨＣが、配列番号３１６および３７５のアミノ酸配列を含み；ならびにそのＬＣが、配列番号３１７および３７８のアミノ酸配列を含む抗体
からなる群から選択される。
【０２０４】
一部の実施形態において、抗ＬＡＧ−３抗体は、
ａ）そのＨ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ、配列番号３２８〜３３０のアミノ酸配列を含む抗体；
ｂ）そのＶＨが、配列番号３２６のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一である抗体；
ｃ）そのＶＨが配列番号３２６のアミノ酸配列を含む抗体；
ｄ）そのＨＣが、配列番号３２６および３７５のアミノ酸配列を含む抗体；
ｅ）そのＬ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ、配列番号３３１〜３３３のアミノ酸配列を含む抗体；
ｆ）そのＶＬが、配列番号３２７のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一である抗体；
ｇ）そのＶＬが、配列番号３２７のアミノ酸配列を含む抗体；
ｈ）そのＬＣが、配列番号３２７および３７８のアミノ酸配列を含む抗体；
ｉ）そのＨ−ＣＤＲ１〜３およびＬ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ、配列番号３２８〜３３３のアミノ酸配列を含む抗体；
ｊ）そのＶＨが、配列番号３２６のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一であり、およびそのＶＬが、配列番号３２７のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一である抗体；
ｋ）そのＶＨが、配列番号３２６のアミノ酸配列を含み、およびそのＶＬが、配列番号３２７のアミノ酸配列を含む抗体；ならびに
ｌ）そのＨＣが、配列番号３２６および３７５のアミノ酸配列を含み；ならびにそのＬＣが、配列番号３２７および３７８のアミノ酸配列を含む抗体
からなる群から選択される。
【０２０５】
一部の実施形態において、抗ＬＡＧ−３抗体は、
ａ）そのＨ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ、配列番号３３８〜３４０のアミノ酸配列を含む抗体；
ｂ）そのＶＨが、配列番号３３６のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一である抗体；
ｃ）そのＶＨが配列番号３３６のアミノ酸配列を含む抗体；
ｄ）そのＨＣが、配列番号３３６および３７５のアミノ酸配列を含む抗体；
ｅ）そのＬ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ、配列番号３４１〜３４３のアミノ酸配列を含む抗体；
ｆ）そのＶＬが、配列番号３３７のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一である抗体；
ｇ）そのＶＬが、配列番号３３７のアミノ酸配列を含む抗体；
ｈ）そのＬＣが、配列番号３３７および３７８のアミノ酸配列を含む抗体；
ｉ）そのＨ−ＣＤＲ１〜３およびＬ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ、配列番号３３８〜３４３のアミノ酸配列を含む抗体；
ｊ）そのＶＨが、配列番号３３６のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一であり、およびそのＶＬが、配列番号３３７のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一である抗体；
ｋ）そのＶＨが、配列番号３３６のアミノ酸配列を含み、およびそのＶＬが、配列番号３３７のアミノ酸配列を含む抗体；ならびに
ｌ）そのＨＣが、配列番号３３６および３７５のアミノ酸配列を含み；ならびにそのＬＣが、配列番号３３７および３７８のアミノ酸配列を含む抗体
からなる群から選択される。
【０２０６】
一部の実施形態において、抗ＬＡＧ−３抗体は、
ａ）そのＨ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ、配列番号３４８〜３５０のアミノ酸配列を含む抗体；
ｂ）そのＶＨが、配列番号３４６のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一である抗体；
ｃ）そのＶＨが配列番号３４６のアミノ酸配列を含む抗体；
ｄ）そのＨＣが、配列番号３４６および３７５のアミノ酸配列を含む抗体；
ｅ）そのＬ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ、配列番号３５１〜３５３のアミノ酸配列を含む抗体；
ｆ）そのＶＬが、配列番号３４７のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一である抗体；
ｇ）そのＶＬが、配列番号３４７のアミノ酸配列を含む抗体；
ｈ）そのＬＣが、配列番号３４７および３７８のアミノ酸配列を含む抗体；
ｉ）そのＨ−ＣＤＲ１〜３およびＬ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ、配列番号３４８〜３５３のアミノ酸配列を含む抗体；
ｊ）そのＶＨが、配列番号３４６のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一であり、およびそのＶＬが、配列番号３４７のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一である抗体；
ｋ）そのＶＨが、配列番号３４６のアミノ酸配列を含み、およびそのＶＬが、配列番号３４７のアミノ酸配列を含む抗体；ならびに
ｌ）そのＨＣが、配列番号３４６および３７５のアミノ酸配列を含み；ならびにそのＬＣが、配列番号３４７および３７８のアミノ酸配列を含む抗体
からなる群から選択される。
【０２０７】
一部の実施形態において、抗ＬＡＧ−３抗体は、
ａ）そのＨ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ、配列番号３５８〜３６０のアミノ酸配列を含む抗体；
ｂ）そのＶＨが、配列番号３５６のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一である抗体；
ｃ）そのＶＨが配列番号３５６のアミノ酸配列を含む抗体；
ｄ）そのＨＣが、配列番号３５６および３７５のアミノ酸配列を含む抗体；
ｅ）そのＬ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ、配列番号３６１〜３６３のアミノ酸配列を含む抗体；
ｆ）そのＶＬが、配列番号３５７のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一である抗体；
ｇ）そのＶＬが、配列番号３５７のアミノ酸配列を含む抗体；
ｈ）そのＬＣが、配列番号３５７および３７８のアミノ酸配列を含む抗体；
ｉ）そのＨ−ＣＤＲ１〜３およびＬ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ、配列番号３５８〜３６３のアミノ酸配列を含む抗体；
ｊ）そのＶＨが、配列番号３５６のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一であり、およびそのＶＬが、配列番号３５７のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一である抗体；
ｋ）そのＶＨが、配列番号３５６のアミノ酸配列を含み、およびそのＶＬが、配列番号３５７のアミノ酸配列を含む抗体；ならびに
ｌ）そのＨＣが、配列番号３５６および３７５のアミノ酸配列を含み；ならびにそのＬＣが、配列番号３５７および３７８のアミノ酸配列を含む抗体
からなる群から選択される。
【０２０８】
一部の実施形態において、抗ＬＡＧ−３抗体は、
ａ）そのＨ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ、配列番号３６８〜３７０のアミノ酸配列を含む抗体；
ｂ）そのＶＨが、配列番号３６６のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一である抗体；
ｃ）そのＶＨが配列番号３６６のアミノ酸配列を含む抗体；
ｄ）そのＨＣが、配列番号３６６および３７５のアミノ酸配列を含む抗体；
ｅ）そのＬ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ、配列番号３７１〜３７３のアミノ酸配列を含む抗体；
ｆ）そのＶＬが、配列番号３６７のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一である抗体；
ｇ）そのＶＬが、配列番号３６７のアミノ酸配列を含む抗体；
ｈ）そのＬＣが、配列番号３６７および３７９のアミノ酸配列を含む抗体；
ｉ）そのＨ−ＣＤＲ１〜３およびＬ−ＣＤＲ１〜３がそれぞれ、配列番号３６８〜３７３のアミノ酸配列を含む抗体；
ｊ）そのＶＨが、配列番号３６６のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一であり、およびそのＶＬが、配列番号３６７のアミノ酸配列と配列が少なくとも９０％同一である抗体；
ｋ）そのＶＨが、配列番号３６６のアミノ酸配列を含み、およびそのＶＬが、配列番号３６７のアミノ酸配列を含む抗体；ならびに
ｌ）そのＨＣが、配列番号３６６および３７５のアミノ酸配列を含み；ならびにそのＬＣが、配列番号３６７および３７９のアミノ酸配列を含む抗体
からなる群から選択される。
【０２０９】
一部の実施形態において、本明細書に記載の抗ＬＡＧ−３抗体または抗原結合部分のいずれかは、例えば０．２ｎＭもしくはそれ未満、０．１５ｎＭもしくはそれ未満、０．１ｎＭもしくはそれ未満、０．０９ｎＭもしくはそれ未満、０．０８ｎＭもしくはそれ未満、０．０７ｎＭもしくはそれ未満、０．０６ｎＭもしくはそれ未満、０．０５ｎＭもしくはそれ未満、または０．０４ｎＭもしくはそれ未満のＥＣ５０でヒトＬＡＧ−３に結合しうる。一部の実施形態において、本明細書に記載の抗ＬＡＧ−３抗体または抗原結合部分のいずれかは、例えば０．４ｎＭもしくはそれ未満、０．３ｎＭもしくはそれ未満、０．２ｎＭもしくはそれ未満、０．１ｎＭもしくはそれ未満、０．０９ｎＭもしくはそれ未満、０．０８ｎＭもしくはそれ未満、０．０７ｎＭもしくはそれ未満、０．０６ｎＭもしくはそれ未満、０．０５ｎＭもしくはそれ未満、０．０４ｎＭもしくはそれ未満、または０．０３ｎＭもしくはそれ未満のＥＣ５０でカニクイザルＬＡＧ−３に結合しうる。特定の実施形態では、本明細書に記載の抗ＬＡＧ−３抗体または抗原結合部分のいずれかは、例えば０．１ｎＭまたはそれ未満のＥＣ５０でヒトＬＡＧ−３に結合し、および例えば０．３ｎＭまたはそれ未満のＥＣ５０でカニクイザルＬＡＧ−３に結合しうる。
【０２１０】
一部の実施形態において、本明細書に記載の抗ＬＡＧ−３抗体または抗原結合部分のいずれかは、例えば０．１ｎＭまたはそれ未満のＥＣ５０でヒトＬＡＧ−３に結合しうる。一部の実施形態において、本明細書に記載の抗ＬＡＧ−３抗体または抗原結合部分のいずれかは、例えば０．３ｎＭまたはそれ未満のＥＣ５０でカニクイザルＬＡＧ−３に結合しうる。特定の実施形態において、本明細書に記載の抗ＬＡＧ−３抗体または抗原結合部分のいずれかは、例えば０．１ｎＭまたはそれ未満のＥＣ５０でヒトＬＡＧ−３に、および例えば０．３ｎＭまたはそれ未満のＥＣ５０でカニクイザルＬＡＧ−３に結合しうる。
【０２１１】
一部の実施形態において、本明細書に記載の抗ＬＡＧ−３抗体または抗原結合部分のいずれかは、ＭＨＣクラスＩＩ（ＭＨＣＩＩ）またはＬＳＥＣｔｉｎなどのリガンドのＬＡＧ−３に対する結合を阻害しうる。例えば、２０μｇ／ｍＬの抗ＬＡＧ−３抗体または抗原結合部分は、陰性対照抗体の存在下での結合と比較して、ＭＨＣＩＩに対するＬＡＧ−３の結合を少なくとも３５％、少なくとも４０％、少なくとも４５％、少なくとも５０％、少なくとも５５％、少なくとも６０％、少なくとも６５％、少なくとも７０％、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも８９％、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％低減させうる。一実施形態において、抗ＬＡＧ−３抗体または抗原結合タンパク質は、ＭＨＣＩＩに対するＬＡＧ−３の結合を、陰性対照と比較して８５％より多く低減させうる。一実施形態において、抗ＬＡＧ−３抗体または抗原結合タンパク質は、ＭＨＣＩＩに対するＬＡＧ−３の結合を、陰性対照と比較して約２５％から９５％の間、３０％から９０％の間、または３５％から８５％の間低減させうる。
【０２１２】
一部の実施形態において、本明細書に記載の抗ＬＡＧ−３抗体または抗原結合部分のいずれかは、ＬＡＧ−３とＭＨＣクラスＩＩの間、例えば、Ｊｕｒｋａｔ細胞において発現されたヒトＬＡＧ−３とＲａｊｉ細胞において発現されたヒトＭＨＣクラスＩＩの間の結合を遮断しうる（例えば、０．１μｇ／ｍＬ、０．５μｇ／ｍＬ、１μｇ／ｍＬ、５μｇ／ｍＬ、１０μｇ／ｍＬ、２０μｇ／ｍＬ、３０μｇ／ｍＬ、４０μｇ／ｍＬ、または５０μｇ／ｍＬの濃度で）。
【０２１３】
一部の実施形態において、本明細書に記載の抗ＬＡＧ−３抗体または抗原結合部分のいずれかは、表面プラズモン共鳴によって測定した場合に、５．０×１０−８もしくはそれ未満、４．０×１０−８もしくはそれ未満、３．０×１０−８もしくはそれ未満、２．０×１０−８もしくはそれ未満、１．０×１０−８もしくはそれ未満、９．０×１０−９もしくはそれ未満、８．０×１０−９もしくはそれ未満、７．０×１０−９もしくはそれ未満、６．０×１０−９もしくはそれ未満、５．０×１０−９もしくはそれ未満、４．０×１０−９もしくはそれ未満、３．０×１０−９もしくはそれ未満、２．０×１０−９もしくはそれ未満、または１．０×１０−９もしくはそれ未満のＫＤでヒトＬＡＧ−３に結合しうる。
【０２１４】
一部の実施形態において、本明細書に記載の抗ＬＡＧ−３抗体または抗原結合部分のいずれかは、表面プラズモン共鳴によって測定した場合に、１．５×１０−７もしくはそれ未満、１．０×１０−７もしくはそれ未満、９．０×１０−８もしくはそれ未満、８．０×１０−８もしくはそれ未満、７．０×１０−８もしくはそれ未満、６．０×１０−８もしくはそれ未満、５．０×１０−８もしくはそれ未満、４．０×１０−８もしくはそれ未満、３．０×１０−８もしくはそれ未満、２．０×１０−８もしくはそれ未満、または１．０×１０−８もしくはそれ未満のＫＤでカニクイザルＬＡＧ−３に結合しうる。
【０２１５】
一部の実施形態において、本明細書に記載の抗ＬＡＧ−３抗体または抗原結合部分のいずれかは、表面プラズモン共鳴によって測定した場合に、５．０×１０−８もしくはそれ未満、４．５×１０−８もしくはそれ未満、４．０×１０−８もしくはそれ未満、３．５×１０−８もしくはそれ未満、または３．０×１０−８もしくはそれ未満のＫＤでマウスＬＡＧ−３に結合しうる。
【０２１６】
一部の実施形態において、本明細書に記載の抗ＬＡＧ−３抗体または抗原結合部分のいずれかは、例えばＳＥＢ刺激ＰＢＭＣのＩＬ−２産生を刺激しうる。
【０２１７】
一部の実施形態において、本明細書に記載の抗ＬＡＧ−３抗体または抗原結合部分のいずれかは、例えばヒトＴ細胞株（例えば、ＬＡＧ−３を過剰発現するヒトＴ細胞株）におけるＬＡＧ−３の細胞レベルおよび／または可溶性レベルを低減させうる。
【０２１８】
一部の実施形態において、本明細書に記載の抗ＬＡＧ−３抗体または抗原結合部分のいずれかは、インビボでの腫瘍増殖の退行を誘導しうる、および／または腫瘍増殖を遅らせうる。
【０２１９】
一部の実施形態において、本明細書に記載の抗ＬＡＧ−３抗体または抗原結合部分のいずれかは、抗体２５Ｆ７−Ｌａｇ３．５とは異なるヒトＬＡＧ−３のエピトープに結合しうる。
【０２２０】
一部の実施形態において、本明細書に記載の抗ＬＡＧ−３抗体または抗原結合部分のいずれかは、Ｔ細胞を活性化させ、抗腫瘍活性の増強を引き起こしうる。
【０２２１】
一部の実施形態において、本明細書に記載の抗ＬＡＧ−３抗体または抗原結合部分は、以下の特性：
ａ）フローサイトメトリー競合アッセイによって決定した場合に、２０μｇ／ｍＬの濃度で、陰性対照抗体と比較してＡ３７５細胞上のヒトＭＨＣクラスＩＩに対するヒトＬＡＧ−３の結合を８５％より大きく低減させること；
ｂ）フローサイトメトリー競合アッセイによって決定した場合に、２０μｇ／ｍＬの濃度で、陰性対照抗体と比較してＡ３７５細胞上のヒトＭＨＣクラスＩＩに対するヒトＬＡＧ−３の結合を３５％から８５％の間に低減させること；
ｃ）Ｊｕｒｋａｔ細胞において発現されたヒトＬＡＧ−３と、Ｒａｊｉ細胞において発現されたヒトＭＨＣクラスＩＩの間の結合を遮断すること；
ｄ）フローサイトメトリーによって測定した場合に０．１ｎＭまたはそれ未満のＥＣ５０でヒトＬＡＧ−３に結合すること；
ｅ）フローサイトメトリーによって測定した場合に０．３ｎＭまたはそれ未満のＥＣ５０でカニクイザルＬＡＧ−３に結合すること；
ｆ）表面プラズモン共鳴によって測定した場合に３．０×１０−８またはそれ未満のＫＤでヒトＬＡＧ−３に結合すること；
ｇ）表面プラズモン共鳴によって測定した場合に１．５×１０−７またはそれ未満のＫＤでカニクイザルＬＡＧ−３に結合すること；
ｈ）表面プラズモン共鳴によって測定した場合に３．５×１０−８またはそれ未満のＫＤでマウスＬＡＧ−３に結合すること；
ｉ）ブドウ球菌エンテロトキシンＢ（ＳＥＢ）で処置したヒト末梢血単核細胞（ＰＢＭＣ）におけるＩＬ−２産生を刺激すること；
ｊ）ヒトＴ細胞におけるＬＡＧ−３の細胞レベルを低減させること；
ｋ）ヒトＴ細胞培養におけるＬＡＧ−３の可溶性レベルを低減させること；
ｌ）インビボで腫瘍増殖の退行を誘導すること；
ｍ）インビボで腫瘍増殖を遅らせること；および
ｎ）抗体２５Ｆ７−Ｌａｇ３．５と同じヒトＬＡＧ−３のエピトープに結合しないこと
のうちの少なくとも１つを有する。そのような抗体の例には、抗体１５６４６（少なくとも特性ｂ、ｃ、ｄ、ｅ、ｉ、およびｎを有する）、抗体１５５３２（少なくとも特性ａ、ｃ、ｄ、ｅ、ｆ、ｇ、ｉ、ｊ、ｋ、ｍ、およびｎを有する）、抗体１５７２３（少なくとも特性ｂ、ｃ、ｄ、ｅ、ｉ、およびｎを有する）、抗体１５５９５（少なくとも特性ａ、ｃ、ｄ、ｅ、ｉ、およびｎを有する）、抗体１５４３１（少なくとも特性ａ、ｃ、ｄ、ｅ、ｆ、ｇ、ｉ、およびｎを有する）、抗体１５５７２（少なくとも特性ｂ、ｃ、ｄ、ｅ、ｆ、ｇ、ｉ、およびｎを有する）、ならびに抗体１５０１１（少なくとも特性ａ、ｃ、ｄ、ｅ、ｆ、ｇ、ｈ、ｉ、ｊ、ｋ、ｌ、ｍ、およびｎを有する）が挙げられるがこれらに限定されない。一部の実施形態において、本発明の抗ＴＩＭ−３抗体または抗原結合部分は、前記特性の少なくとも１３、１２、１１、１０、９、８、７、６、５、４、３、２、または１個を有する。一部の実施形態において、本発明の抗ＴＩＭ−３抗体または抗原結合部分は、少なくとも特性ｂ、ｃ、ｄ、ｅ、ｉ、およびｎ；少なくとも特性ａ、ｃ、ｄ、ｅ、ｆ、ｇ、ｉ、ｊ、ｋ、ｍ、およびｎ；少なくとも特性ａ、ｃ、ｄ、ｅ、ｉ、およびｎ；少なくとも特性ａ、ｃ、ｄ、ｅ、ｆ、ｇ、ｉ、およびｎ；少なくとも特性ｂ、ｃ、ｄ、ｅ、ｆ、ｇ、ｉ、およびｎ；または少なくとも特性ａ、ｃ、ｄ、ｅ、ｆ、ｇ、ｈ、ｉ、ｊ、ｋ、ｌ、ｍ、およびｎを有する。
【０２２２】
一部の実施形態において、本発明の抗ＬＡＧ−３抗体または抗原結合部分は、抗体１５０１１、１５５７２、および／または１５４３１とヒトＬＡＧ−３に対する結合に関して競合する。
【０２２３】
一部の実施形態において、本発明の抗ＬＡＧ−３抗体または抗原結合部分は、
ａ）配列番号６８のアミノ酸残基Ｈ８５、Ｐ８６、Ａ８７、Ｐ８９、Ｓ９１、Ｗ９２、およびＧ９３；
ｂ）配列番号６８のアミノ酸残基Ａ４０、Ｑ４１、Ｐ４３、Ｐ４６、Ｐ４９、Ｄ５２、Ｔ６２、Ｑ６４、Ｈ６５、Ｑ６６、Ｐ６７、Ｄ６８、Ｇ９３、Ｐ９４、Ｐ９６、Ｒ９８、Ｙ９９、Ｔ１００、Ｖ１０１、Ｐ１０６、Ｇ１０７、Ｒ１１９、Ｅ１２４、Ｒ１２９、Ｇ１３０、Ｄ１３１、Ｓ１３３、Ｒ１３７、Ｐ１３８、Ｄ１４３、Ｒ１４８、およびＲ１６３；
ｃ）配列番号６８のアミノ酸残基Ａ４０、Ｑ４１、Ｐ４３、Ｐ４６、Ｐ４９、Ｄ５２、Ｔ６２、Ｑ６４、Ｈ６５、Ｑ６６、Ｐ６７、Ｄ６８、Ｐ９６、Ｙ９９、Ｔ１００、Ｖ１０１、Ｐ１０６、Ｇ１０７、Ｒ１１９、Ｅ１２４、Ｒ１２９、Ｇ１３０、Ｄ１３１、Ｓ１３３、Ｒ１３７、Ｐ１３８、Ｄ１４３、Ｒ１４８、およびＲ１６３；または
ｄ）配列番号６８のアミノ酸残基Ｇ１０７、Ｌ１０９、Ｒ１１０、およびＳ１１１
を有するヒトＬＡＧ−３のエピトープに結合する。
【０２２４】
一部の実施形態において、本発明の抗ＬＡＧ−３抗体または抗原結合部分は、配列番号６８のアミノ酸残基９８〜１０５を有するエピトープに結合する。そのような抗体の例には、抗体１５５３２、１５４３１、１５５７２、および１５０１１が挙げられるがこれらに限定されない。
【０２２５】
一部の実施形態において、本発明の抗ＬＡＧ−３抗体または抗原結合部分は、
ａ）配列番号６８のアミノ酸残基７８〜１０５および１２３〜１３１；
ｂ）配列番号６８のアミノ酸残基２３〜３０、４０〜６６、８８〜１０５、１２３〜１３７、および１４８〜１５２；または
ｃ）配列番号６８のアミノ酸残基２３〜３０、４０〜６６、９８〜１０５、１１８〜１３７、および１４８〜１６１
を有するエピトープに結合する。
【０２２６】
一部の実施形態において、本明細書に記載の抗ＬＡＧ−３抗体またはその抗原結合部分は、その全体が参照により本明細書に組み込まれている、ＰＣＴ特許公報欧州特許出願第２０１７／０７６１８８号に記載の抗ＬＡＧ−３抗体または抗原結合部分である。
【０２２７】
本明細書に記載の抗体のクラスを別のクラスまたはサブクラスに変更またはスイッチしてもよい。一態様において、ＶＬまたはＶＨをコードする核酸分子を、ＣＬまたはＣＨをコードする核酸配列を含まないように当技術分野で周知の方法を使用して単離する。次に、ＶＬまたはＶＨをコードする核酸分子を、免疫グロブリン分子の異なるクラスからのＣＬまたはＣＨをコードする核酸配列に作動可能に連結させる。これは、上記のようにＣＬまたはＣＨ鎖を含むベクターまたは核酸分子を使用して行うことができる。例えば、当初ＩｇＭであった抗体を、ＩｇＧにクラススイッチしてもよい。さらに、クラススイッチングを使用して、１つのＩｇＧサブクラスを別のサブクラスに、例えばＩｇＧ１からＩｇＧ２に変換してもよい。κ軽鎖定常領域を、例えばλ軽鎖定常領域に変化させることができる。所望のＩｇアイソタイプを有する本明細書に記載の抗体を産生する好ましい方法は、抗体の重鎖をコードする核酸分子および抗体の軽鎖をコードする核酸分子を単離する工程と、重鎖の可変ドメインを得る工程と、重鎖の可変ドメインを所望のアイソタイプの重鎖の定常領域にライゲートする工程と、軽鎖およびライゲートした重鎖を細胞において発現させる工程と、所望のアイソタイプを有する抗体を収集する工程とを含む。
【０２２８】
本明細書に記載の抗体は、ＩｇＧ、ＩｇＭ、ＩｇＥ、ＩｇＡ、またはＩｇＤ分子でありうるが、典型的にはＩｇＧアイソタイプ、例えばＩｇＧサブクラスＩｇＧ１、ＩｇＧ２ａ、またはＩｇＧ２ｂ、ＩｇＧ３、またはＩｇＧ４の分子である。一実施形態において、抗体はＩｇＧ１である。別の実施形態において、抗体はＩｇＧ２である。
【０２２９】
一実施形態において、抗体は、Ｆｃ領域に少なくとも１つの突然変異を含みうる。変化したエフェクター機能を提供する多数の異なるＦｃ突然変異が公知である。例えば、多くの場合において、例えばリガンド／受容体相互作用が望ましくない場合、または抗体−薬物コンジュゲートの場合、エフェクター機能を低減または除去することが望ましい。
【０２３０】
一実施形態において、抗体は、エフェクター機能を低減させる少なくとも１つの突然変異をＦｃ領域に含む。エフェクター機能を低減させるために突然変異させることが有利であるＦｃ領域のアミノ酸位置は、アミノ酸位置がＩＭＧＴ（登録商標）ナンバリングスキームに従って符番される、２２８、２３３、２３４、および２３５位の１つまたは複数を含む。
【０２３１】
一部の実施形態において、２３４位および２３５位でのアミノ酸残基の１つまたは両方を、例えばＬｅｕからＡｌａ（Ｌ２３４Ａ／Ｌ２３５Ａ）に突然変異させてもよい。これらの突然変異は、ＩｇＧ１抗体のＦｃ領域のエフェクター機能を低減させる。さらにまたはあるいは、２２８位のアミノ酸残基を、例えばＰｒｏに突然変異させてもよい。一部の実施形態において、２３３位のアミノ酸残基を、例えばＰｒｏに突然変異させてもよく、２３４位のアミノ酸残基を例えばＶａｌに変異させてもよく、および／または２３５位のアミノ酸残基を例えばＡｌａに突然変異させてもよい。アミノ酸の位置は、ＩＭＧＴ（登録商標）ナンバリングスキームに従って符番される。
【０２３２】
一部の実施形態において、抗体がＩｇＧ４サブクラスの抗体である場合、抗体は、アミノ酸の位置がＥｕ  ＩＭＧＴ（登録商標）ナンバリングスキームに従って符番される、突然変異Ｓ２２８Ｐを含むことができ、すなわち２２８位にプロリンを有することができる。この突然変異は、望ましくないＦａｂアーム交換を低減させることが知られている（Angal et al., Mol Immunol. 30:105-8 (1993)）。
【０２３３】
ある特定の実施形態において、本明細書に記載の抗体またはその抗原結合部分は、抗体または抗体部分と１つまたは複数の他のタンパク質またはペプチドとの共有結合または非共有結合によって形成されたより大きいイムノアドヘシンの一部でありうる。そのようなイムノアドヘシンの例には、４量体ｓｃＦｖ分子を作製するためのストレプトアビジンコア領域の使用（Kipriyanov et al., Human Antibodies and Hybridomas 6:93-101 (1995))、ならびに二価のビオチン化ｓｃＦｖ分子を作製するためのシステイン残基、マーカーペプチド、およびＣ末端ポリヒスチジンタグの使用（Kipriyanov et al., Mol. Immunol. 31:1047-1058 (1994)）が挙げられる。他の例には、目的の抗原に特異的に結合するイムノアドヘシンにするために共有結合または非共有結合によって抗体からの１つまたは複数のＣＤＲを分子に組み込むことが挙げられる。そのような実施形態において、ＣＤＲを、より大きいポリペプチド鎖の一部として組み込んでもよく、別のポリペプチド鎖に共有結合させてもよく、または非共有結合によって組み込んでもよい。
【０２３４】
別の実施形態において、別のポリペプチドに連結された本明細書に記載の抗体の全てまたは一部を含む融合抗体またはイムノアドヘシンを作製してもよい。ある特定の実施形態において、抗体の可変ドメインのみがポリペプチドに連結される。ある特定の実施形態において、抗体のＶＨドメインが第一のポリペプチドに連結され、抗体のＶＬドメインが、ＶＨおよびＶＬドメインが互いに相互作用して抗原結合部位を形成することができるように、第一のポリペプチドに会合する第二のポリペプチドに連結される。別の好ましい実施形態において、ＶＨドメインは、ＶＨおよびＶＬドメインが互いに相互作用することができるようにリンカーによってＶＬドメインから分離されている（例えば、一本鎖抗体）。次に、ＶＨ−リンカー−ＶＬ抗体を目的のポリペプチドに連結する。さらに、２つ（またはそれより多く）の一本鎖抗体が互いに連結している融合抗体を作製することができる。これは、単一のポリペプチド鎖上で二価もしくは多価抗体を作製したい場合、または二特異性抗体を作製したい場合に有用である。
【０２３５】
一本鎖抗体（ｓｃＦｖ）を作製するために、ＶＨおよびＶＬをコードするＤＮＡ断片を、フレキシブルリンカーをコードする、例えばアミノ酸配列（Ｇｌｙ４−Ｓｅｒ）３（配列番号３９６）をコードする別の断片に作動可能に連結し、ＶＨおよびＶＬ配列を、ＶＬおよびＶＨドメインがフレキシブルリンカーによって結合されている連続する一本鎖タンパク質として発現させることができる。例えば、Bird et al., Science 242:423 426 (1988); Huston et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 85:5879 5883 (1988); and McCafferty et al., Nature 348:552 554 (1990)を参照されたい。一本鎖抗体は、１つのみのＶＨおよびＶＬを使用する場合には一価でありうる；２つのＶＨおよびＶＬを使用する場合には二価でありうる；または２つより多くのＶＨおよびＶＬを使用する場合には、多価でありうる。ヒトＰＤ−１、ＴＩＭ−３、またはＬＡＧ−３と、例として別の分子とに特異的に結合する二特異性または多価抗体を作製してもよい。一部の実施形態において、二特異性または多価抗体は、ＰＤ−１およびＴＩＭ−３、ＰＤ−１およびＬＡＧ−３、ＴＩＭ−３およびＬＡＧ−３、またはＰＤ−１、ＴＩＭ−３、およびＬＡＧ−３に結合しうる。
【０２３６】
他の実施形態において、抗体コード核酸分子を使用して他の修飾抗体を調製してもよい。例として、本明細書の教示に従って標準的な分子生物学技術を使用して、「カッパボディ」（Ill et al., Protein Eng. 10:949-57 (1997)）、「ミニボディ」（Martin et al., EMBO J. 13:5303-9 (1994)）、「ダイアボディ」（Holliger et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 90:6444-6448 (1993)）、または「ヤヌシン（ｊａｎｕｓｉｎ）」（Traunecker et al., EMBO J. 10:3655-3659 (1991) and Traunecker et al., Int. J. Cancer (Suppl.) 7:51-52 (1992)）を調製してもよい。
【０２３７】
本明細書に記載の抗体または抗原結合部分を、誘導体化するか、または別の分子（例えば、別のペプチドまたはタンパク質）に連結することができる。一般的に、抗体またはその部分は、抗原結合が誘導体化または標識によって有害に影響を受けないように誘導体化される。したがって、本発明の併用治療および組成物において使用されうる抗体および抗体部分は、本明細書に記載の抗体のインタクト型と修飾型の両方を含むと意図される。例えば、本明細書に記載の抗体または抗体部分を、別の抗体（例えば、二特異性抗体またはダイアボディ）、検出剤、薬剤、および／または抗体もしくは抗体部分と別の分子（ストレプトアビジンコア領域またはポリヒスチジンタグ）との会合を媒介することができるタンパク質もしくはペプチドなどの１つもしくは複数の他の分子に機能的に連結させることができる（例えば、化学カップリング、遺伝子融合、非共有結合、またはその他）。
【０２３８】
誘導体化抗体の１つのタイプは、２つ以上の抗体（同じタイプまたは異なるタイプの抗体、例えば二特異性抗体を作製するために）を架橋することによって産生される。適した架橋剤には、適切なスペーサーで隔てられた２つの別個の反応基を有するヘテロ二官能性（例えば、ｍ−マレイミドベンゾイル−Ｎ−ヒドロキシスクシンイミドエステル）またはホモ二官能性（例えば、スベリン酸ジスクシンイミジル）である架橋剤が挙げられる。そのようなリンカーは、例えばＰｉｅｒｃｅ  Ｃｈｅｍｉｃａｌ  Ｃｏｍｐａｎｙ，  Ｒｏｃｋｆｏｒｄ，Ｉｌから得ることができる。
【０２３９】
抗体はまた、ポリエチレングリコール（ＰＥＧ）、メチルもしくはエチル基、または炭水化物基などの化学基によって誘導体化することもできる。これらの基は、抗体の生物特徴を改善するために、例えば血清中半減期を増加させるために有用でありうる。
【０２４０】
本明細書に記載の抗体はまた、標識してもよい。本明細書において使用される用語「標識」または「標識された」は、抗体に別の分子を取り込むことを指す。一実施形態において、標識は検出可能マーカー、例えば放射標識アミノ酸の取り込み、または標識したアビジン（例えば、光学法または比色測定法によって検出することができる蛍光マーカーまたは酵素活性を含むストレプトアビジン）によって検出することができるビオチン化部分のポリペプチドへの結合である。別の実施形態において、標識またはマーカーは、治療的、例えば薬物コンジュゲートまたは毒素でありうる。ポリペプチドおよび糖タンパク質を標識する様々な方法が当技術分野で公知であり、使用することができる。ポリペプチドの標識の例には、放射性同位元素または放射性核種（例えば、３Ｈ、１４Ｃ、１５Ｎ、３５Ｓ、９０Ｙ、９９Ｔｃ、１１１１ｎ、１２５Ｉ、１３１１）、蛍光標識（例えば、ＦＩＴＣ、ローダミン、ランタニド燐光体）、酵素標識（例えば西洋ワサビペルオキシダーゼ、β−ガラクトシダーゼ、ルシフェラーゼ、アルカリホスファターゼ）、化学発光マーカー、ビオチニル基、二次レポーターによって認識される既定のポリペプチドエピトープ（例えば、ロイシンジッパーペア配列、二次抗体の結合部位、金属結合ドメイン、エピトープタグ）、ガドリニウムキレートなどの磁性剤、百日咳毒素などの毒素、タキソール、サイトカラシンＢ、グラミシジンＤ、エチジウムブロミド、エメチン、マイトマイシン、エトポシド、テニポシド、ビンクリスチン、ビンブラスチン、コルヒチン、ドキソルビシン、ダウノルビシン、ジヒドロキシアントラシンジオン、ミトキサントロン、ミトラマイシン、アクチノマイシンＤ、１−デヒドロテストステロン、グルココルチコイド、プロカイン、テトラカイン、リドカイン、プロプラノロール、およびピューロマイシン、ならびにそれらのアナログまたはホモログが挙げられるが、これらに限定されない。一部の実施形態において、標識は、起こりうる立体妨害を低減するために、様々な長さのスペーサーアームによって結合される。
【０２４１】
ある特定の実施形態において、本明細書に記載の抗体は、中性型（両性イオン型を含む）または陽性荷電もしくは陰性荷電種として存在しうる。一部の実施形態において、抗体を、対イオンと複合体を形成させて、薬学的に許容される塩を形成してもよい。
【０２４２】
用語「薬学的に許容される塩」は、１つまたは複数の抗体と、薬学的に許容される無機および有機の酸および塩基から誘導される１つまたは複数の対イオンとを含む複合体を指す。
【０２４３】
併用治療
本発明は、本明細書に記載の抗ＰＤ−１抗体またはその抗原結合部分のいずれか（例えば、いずれか１つ）と、本明細書に記載の抗ＴＩＭ−３抗体またはその抗原結合部分のいずれか（例えば、いずれか１つ）とを含む併用治療（例えば、組成物）を提供する。一部の実施形態において、併用治療は、本明細書に記載の抗ＰＤ−１抗体またはその抗原結合部分のいずれか（例えば、いずれか１つ）と、本明細書に記載の抗ＴＩＭ−３抗体またはその抗原結合部分のいずれか（例えば、いずれか１つ）とを含む。一部の実施形態において、併用治療は、本明細書に記載の抗ＴＩＭ−３抗体またはその抗原結合部分のいずれか（例えば、いずれか１つ）と、本明細書に記載の抗ＬＡＧ−３抗体またはその抗原結合部分のいずれか（例えば、いずれか１つ）とを含む。特定の実施形態において、併用治療は、本明細書に記載の抗ＰＤ−１抗体またはその抗原結合部分のいずれか（例えば、いずれか１つ）と、本明細書に記載の抗ＴＩＭ−３抗体またはその抗原結合部分のいずれか（例えば、いずれか１つ）と、本明細書に記載の抗ＬＡＧ−３抗体またはその抗原結合部分のいずれか（例えば、いずれか１つ）とを含む。併用治療は、前記抗体もしくは抗原結合部分を使用する処置の方法、または前記抗体もしくは抗原結合部分を含む医薬組成物の形態をとりうる。
【０２４４】
ある特定の実施形態において、本発明の併用治療または組成物は、抗ＰＤ−１抗体１２８１９および抗ＴＩＭ−３抗体１５０８６．１７１４５を含む。ある特定の実施形態において、本発明の併用治療または組成物は、抗ＰＤ−１抗体１２８１９および抗ＬＡＧ−３抗体１５５３２を含む。ある特定の実施形態において、本発明の併用治療または組成物は、抗ＰＤ−１抗体１２８１９、抗ＴＩＭ−３抗体１５０８６．１７１４５、および抗ＬＡＧ−３抗体１５５３２を含む。
【０２４５】
ある特定の実施形態において、本発明の併用治療または組成物は、
−  配列番号２２８〜２３３のＨ−ＣＤＲ１〜３およびＬ−ＣＤＲ１〜３アミノ酸配列をそれぞれ含む抗ＰＤ−１抗体もしくはその抗原結合部分；ならびに配列番号８〜１３のＨ−ＣＤＲ１〜３およびＬ−ＣＤＲ１〜３アミノ酸配列をそれぞれ含む抗ＴＩＭ−３抗体もしくはその抗原結合部分；
−  配列番号２２６および２２７のＶＨおよびＶＬアミノ酸配列をそれぞれ含む抗ＰＤ−１抗体もしくはその抗原結合部分；ならびに配列番号７および４のＶＨおよびＶＬアミノ酸配列をそれぞれ含む抗ＴＩＭ−３抗体もしくはその抗原結合部分；または
−  配列番号２２６および３７５のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号２２７および３７９のアミノ酸配列を含むＬＣを含む抗ＰＤ−１抗体；ならびに配列番号７および３７７のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号４および３７８のアミノ酸配列を含むＬＣを含む抗ＴＩＭ−３抗体
を含む。
【０２４６】
ある特定の実施形態において、本発明の併用治療または組成物は、
−  配列番号２２８〜２３３のＨ−ＣＤＲ１〜３およびＬ−ＣＤＲ１〜３アミノ酸配列をそれぞれ含む抗ＰＤ−１抗体もしくはその抗原結合部分；ならびに配列番号３１８〜３２３のＨ−ＣＤＲ１〜３およびＬ−ＣＤＲ１〜３アミノ酸配列をそれぞれ含む抗ＬＡＧ−３抗体もしくはその抗原結合部分；
−  配列番号２２６および２２７のＶＨおよびＶＬアミノ酸配列をそれぞれ含む抗ＰＤ−１抗体もしくはその抗原結合部分；ならびに配列番号３１６および３１７のＶＨおよびＶＬアミノ酸配列をそれぞれ含む抗ＬＡＧ−３抗体もしくはその抗原結合部分；または
−  配列番号２２６および３７５のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号２２７および３７９のアミノ酸配列を含むＬＣを含む抗ＰＤ−１抗体；ならびに配列番号３１６および３７５のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号３１７および３７８のアミノ酸配列を含むＬＣを含む抗ＬＡＧ−３抗体
を含む。
【０２４７】
ある特定の実施形態において、本発明の併用治療または組成物は、
−  配列番号８〜１３のＨ−ＣＤＲ１〜３およびＬ−ＣＤＲ１〜３アミノ酸配列をそれぞれ含む抗ＴＩＭ−３抗体もしくはその抗原結合部分；ならびに配列番号３１８〜３２３のＨ−ＣＤＲ１〜３およびＬ−ＣＤＲ１〜３アミノ酸配列をそれぞれ含む抗ＬＡＧ−３抗体もしくはその抗原結合部分；
−  配列番号７および４のＶＨおよびＶＬアミノ酸配列をそれぞれ含む抗ＴＩＭ−３抗体もしくはその抗原結合部分；ならびに配列番号３１６および３１７のＶＨおよびＶＬアミノ酸配列をそれぞれ含む抗ＬＡＧ−３抗体もしくはその抗原結合部分；または
−  配列番号７および３７７のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号４および３７８のアミノ酸配列を含むＬＣを含む抗ＴＩＭ−３抗体；ならびに配列番号３１６および３７５のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号３１７および３７８のアミノ酸配列を含むＬＣを含む抗ＬＡＧ−３抗体
を含む。
【０２４８】
ある特定の実施形態において、本発明の併用治療または組成物は、
−  配列番号２２８〜２３３のＨ−ＣＤＲ１〜３およびＬ−ＣＤＲ１〜３アミノ酸配列をそれぞれ含む抗ＰＤ−１抗体もしくはその抗原結合部分；配列番号８〜１３のＨ−ＣＤＲ１〜３およびＬ−ＣＤＲ１〜３アミノ酸配列をそれぞれ含む抗ＴＩＭ−３抗体もしくはその抗原結合部分；ならびに配列番号３１８〜３２３のＨ−ＣＤＲ１〜３およびＬ−ＣＤＲ１〜３アミノ酸配列を含む抗ＴＩＭ−３抗体もしくはその抗原結合部分；
−  配列番号２２６および２２７のＶＨおよびＶＬアミノ酸配列をそれぞれ含む抗ＰＤ−１抗体もしくはその抗原結合部分；配列番号７および４のＶＨおよびＶＬアミノ酸配列をそれぞれ含む抗ＴＩＭ−３抗体もしくはその抗原結合部分；ならびに配列番号３１６および３１７のＶＨおよびＶＬアミノ酸配列をそれぞれ含む抗ＬＡＧ−３抗体もしくはその抗原結合部分；または
−  配列番号２２６および３７５のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号２２７および３７９のアミノ酸配列を含むＬＣを含む抗ＰＤ−１抗体；配列番号７および３７７のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号４および３７８のアミノ酸配列を含むＬＣを含む抗ＴＩＭ−３抗体；ならびに配列番号３１６および３７５のアミノ酸配列を含むＨＣ、ならびに配列番号３１７および３７８のアミノ酸配列を含むＬＣを含む抗ＬＡＧ−３抗体
を含む。
【０２４９】
一部の実施形態において、併用治療または組成物における抗体のいずれかまたは全てはＩｇＧ、例えばＩｇＧ１またはＩｇＧ２でありうる。
【０２５０】
多特異性結合分子
さらなる態様において、本発明は、
−  本明細書に記載の抗ＰＤ−１抗体および本明細書に記載の抗ＴＩＭ−３抗体；
−  本明細書に記載の抗ＰＤ−１抗体および本明細書に記載の抗ＬＡＧ−３抗体；または
−  本明細書に記載の抗ＴＩＭ−３抗体および本明細書に記載の抗ＬＡＧ−３抗体
の結合特異性（例えば、抗原結合部分、例えば６個のＣＤＲを含む抗原結合部分を含む）を有する多特異性結合分子を提供する。一部の実施形態において、抗ＰＤ−１抗体、抗ＴＩＭ−３抗体、および／または抗ＬＡＧ−３抗体は、本明細書に記載の抗体から選択される。ある特定の実施形態において、多特異性結合分子は、本明細書に記載の抗ＰＤ−１抗体、本明細書に記載の抗ＴＩＭ−３抗体、および本明細書に記載の抗ＬＡＧ−３抗体の結合特異性を有する。多特異性結合分子は、当技術分野で公知であり、異なるタイプの多特異性結合分子の例を、本明細書において他所で示す。そのような多特異性（例えば、二特異性または三特異性）結合分子は、本発明の併用治療に包含される。
【０２５１】
さらなる態様において、本発明は、ＰＤ−１を標的とする二特異性結合分子、ＴＩＭ−３を標的とする二特異性結合分子、およびＬＡＧ−３を標的とする二特異性結合分子のうちの２つまたはそれより多くとの併用治療を提供する。ＰＤ−１、ＴＩＭ−３、またはＬＡＧ−３を標的とする二特異性結合分子は、本明細書に記載の前記抗原を標的とする抗体の結合特異性と、同じ抗原を標的とする別の抗体（例えば、本明細書に記載の別の抗体）または異なるタンパク質を標的とする抗体、例えば別の免疫チェックポイントタンパク質、がん抗原、もしくはその活性ががんなどの疾患状態を媒介する別の細胞表面分子の結合特異性とを有しうる。そのような二特異性結合分子は当技術分野で公知であり、二特異性結合分子の異なるタイプの例を本明細書において他所で示す。
【０２５２】
核酸分子およびベクター
同様に、本明細書に記載の抗ＰＤ−１、抗ＴＩＭ−３、および／または抗ＬＡＧ−３抗体またはその抗原結合部分をコードする核酸分子および配列も記載する。一部の実施形態において、異なる核酸分子が、抗ＰＤ−１抗体もしくはその抗原結合部分、抗ＴＩＭ−３抗体もしくはその抗原結合部分、または抗ＬＡＧ−３抗体もしくはその抗原結合部分の重鎖および軽鎖アミノ酸配列をコードする。他の実施形態において、同じ核酸分子が、抗ＰＤ−１抗体もしくはその抗原結合部分、抗ＴＩＭ−３抗体もしくはその抗原結合部分、または抗ＬＡＧ−３抗体もしくはその抗原結合部分の重鎖および軽鎖アミノ酸配列をコードする。
【０２５３】
ヌクレオチド配列に対する言及は、特に明記しない限り、その相補体を包含する。このため、特定の配列を有する核酸に対する言及は、その相補的配列を有するその相補鎖を包含すると理解すべきである。本明細書において言及される用語「ポリヌクレオチド」は、リボヌクレオチドもしくはデオキシヌクレオチドのいずれか、またはいずれかのタイプのヌクレオチドの修飾型である、長さが少なくとも１０塩基のヌクレオチドのポリマー型を意味する。この用語は、一本鎖および二本鎖型を含む。
【０２５４】
一部の実施形態において、ヌクレオチド配列は、本明細書に列挙した１つまたは複数のヌクレオチド配列、例えば、配列番号１、２、５、６、１４、１５、２４、２５、３４、３５、４４、４５、５４、５５、６４、６５、７４、７５、８４、８５、９４、９５、１０４、１０５、１１４、１１５、１２４、１２５、１３４、１３５、１４４、１４５、１５４、１５５、１６４、１６５、１７４、１７５、１８４、１８５、１９４、１９５、２０４、２０５、２１４、２１５、２２４、２２５、２３４、２３５、２４４、２４５、２５４、２５５、２６４、２６５、２７４、２７５、２８４、２８５、２９４、２９５、３０４、３０５、３１４、３１５、３２４、３２５、３３４、３３５、３４４、３４５、３５４、３５５、３６４、３６５または３９１からなる群から選択されるアミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列と少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、９８％、または９９％同一である。核酸配列の文脈における用語「パーセント配列同一性」は、最大に一致するように整列させた場合に２つの配列において同じである残基を指す。配列同一性比較の長さは、一続きの少なくとも約９ヌクレオチド、通常少なくとも約１８ヌクレオチド、より通常少なくとも約２４ヌクレオチド、典型的には少なくとも約２８ヌクレオチド、より典型的には少なくとも約３２ヌクレオチド、および好ましくは少なくとも約３６、４８、またはそれ超のヌクレオチドでありうる。ヌクレオチド配列同一性を測定するために使用することができる、当技術分野で公知の多数の異なるアルゴリズムが存在する。例として、ポリヌクレオチド配列を、Ｗｉｓｃｏｎｓｉｎ  Ｐａｃｋａｇｅバージョン１０．０、Ｇｅｎｅｔｉｃｓ  Ｃｏｍｐｕｔｅｒ  Ｇｒｏｕｐ（ＧＣＧ）、Ｍａｄｉｓｏｎ、Ｗｉｓｃｏｎｓｉｎにおけるプログラムである、ＦＡＳＴＡ、Ｇａｐ、またはＢｅｓｔｆｉｔを使用して比較することができる。例えば、プログラムＦＡＳＴＡ２およびＦＡＳＴＡ３を含むＦＡＳＴＡは、クエリ配列と検索配列との間の最善のオーバーラップ領域のアライメントおよびパーセント配列同一性を提供する（例えば、全体が参照により本明細書に組み込まれている、Pearson, Methods Enzymol. 183:63-98 (1990); Pearson, Methods Mol. Biol. 132:185-219 (2000); Pearson, Methods Enzymol. 266:227-258 (1996); and Pearson, J. Mol. Biol. 276:71-84 (1998)を参照されたい）。特に明記しない限り、特定のプログラムまたはアルゴリズムのデフォルトパラメータを使用する。例として、核酸配列間のパーセント配列同一性は、ＦＡＳＴＡをそのデフォルトパラメータ（ワードサイズ６およびスコア行列に関してＮＯＰＡＭファクター）で使用するか、またはＧａｐを、全体が参照により本明細書に組み込まれているＧＣＧバージョン６．１で提供されるそのデフォルトパラメータで使用して決定することができる。
【０２５５】
一部の実施形態において、核酸分子は、配列番号１、２、５、６、１４、１５、２４、２５、３４、３５、４４、４５、５４、５５、６４、６５、７４、７５、８４、８５、９４、９５、１０４、１０５、１１４、１１５、１２４、１２５、１３４、１３５、１４４、１４５、１５４、１５５、１６４、１６５、１７４、１７５、１８４、１８５、１９４、１９５、２０４、２０５、２１４、２１５、２２４、２２５、２３４、２３５、２４４、２４５、２５４、２５５、２６４、２６５、２７４、２７５、２８４、２８５、２９４、２９５、３０４、３０５、３１４、３１５、３２４、３２５、３３４、３３５、３４４、３４５、３５４、３５５、３６４、３６５または３９１からなる群から選択される１つまたは複数のヌクレオチド配列を含む。
【０２５６】
上記の実施形態のいずれかにおいて、核酸分子は単離されてもよい。本明細書に記載の抗体の重鎖および／または軽鎖またはその抗原結合部分をコードする核酸分子は、そのような抗体または部分を産生する任意の起源から単離することができる。様々な実施形態において、核酸分子は、ＰＤ−１、ＴＩＭ−３、またはＬＡＧ−３抗原によって免疫した動物から単離された、抗体を発現するＢ細胞から、またはそのようなＢ細胞から産生された不死化細胞から単離される。抗体をコードする核酸を単離する方法は当技術分野で周知である。ポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）または抗体遺伝子のｃＤＮＡクローニングに使用するためのｃＤＮＡを産生するために、ｍＲＮＡを単離および使用してもよい。ある特定の実施形態において、本明細書に記載の核酸分子は単離されるよりむしろ合成することができる。
【０２５７】
一部の実施形態において、本明細書に記載の核酸分子は、任意の起源からの重鎖定常領域をコードするヌクレオチド配列にインフレームで結合した、本明細書に記載の抗体からのＶＨドメインまたは抗原結合部分をコードするヌクレオチド配列を含みうる。同様に、本明細書に記載の核酸分子は、任意の起源からの軽鎖定常領域をコードするヌクレオチド配列にインフレームで結合した、本明細書に記載の抗体からのＶＬドメインまたは抗原結合部分をコードするヌクレオチド配列を含みうる。
【０２５８】
さらなる態様において、重（ＶＨ）および／または軽（ＶＬ）鎖の可変ドメインをコードする核酸分子を、完全長の抗体遺伝子に「変換」してもよい。一実施形態において、ＶＨまたはＶＬドメインをコードする核酸分子を、ＶＨセグメントがベクター内のＣＨセグメントに作動可能に連結され、および／またはＶＬセグメントがベクター内のＣＬセグメントに作動可能に連結されるように、重鎖定常（ＣＨ）または軽鎖定常（ＣＬ）領域を既にコードする発現ベクターにそれぞれ挿入することによって、完全長の抗体遺伝子に変換する。別の実施形態において、ＶＨおよび／またはＶＬドメインをコードする核酸分子を、標準的な分子生物学技術を使用してＶＨおよび／またはＶＬドメインをコードする核酸分子を、ＣＨおよび／またはＣＬ領域をコードする核酸分子に連結する、例えばライゲートすることによって、完全長の抗体遺伝子に変換する。次に、完全長の重鎖および／または軽鎖をコードする核酸分子を、それが導入されている細胞から発現させて、抗体を単離してもよい。
【０２５９】
核酸分子を使用して、大量の抗体を組換え発現させてもよい。核酸分子はまた、本明細書に記載のキメラ抗体、二特異性抗体、一本鎖抗体、イムノアドヘシン、ダイアボディ、突然変異抗体および抗体誘導体を産生するために使用してもよい。
【０２６０】
本明細書に記載の抗ＰＤ−１抗体もしくはその抗原結合部分、抗ＴＩＭ−３抗体もしくはその抗原結合部分、および／または抗ＬＡＧ−３抗体もしくはその抗原結合部分の鎖の一方または両方を発現するために適したベクターもまた本明細書に記載される。本明細書において使用される用語「ベクター」は、それが連結されている別の核酸を輸送することができる核酸分子を意味する。一部の実施形態において、ベクターは、プラスミド、すなわちその中に追加のＤＮＡセグメントがライゲートされうるＤＮＡの環状二本鎖小片である。一部の実施形態において、ベクターは、追加のＤＮＡセグメントがウイルスゲノムの中にライゲートされうるウイルスベクターである。一部の実施形態において、ベクターは、それが導入されている宿主細胞において自律複製することができる（例えば、細菌の複製開始点を有する細菌ベクターおよびエピソーム哺乳動物ベクター）。他の実施形態において、ベクター（例えば、非エピソーム哺乳動物ベクター）は、宿主細胞に導入されると宿主細胞のゲノムに組み込まれることができ、それによって宿主ゲノムと共に複製される。その上、特定のベクターは、それが作動可能に連結されている遺伝子の発現を指示することができる。そのようなベクターは、本明細書において「組換え発現ベクター」（または単純に「発現ベクター」）と呼ばれる。
【０２６１】
一部の実施形態において、ベクターは、本明細書に記載の抗体の重鎖、軽鎖、または重鎖および軽鎖の両方をコードする核酸分子又はその抗原結合部分を含む。一部の実施形態において、ベクターは、融合タンパク質、修飾抗体、抗体断片、およびそのプローブをコードする核酸分子を含む。
【０２６２】
一部の実施形態において、抗ＰＤ−１、抗ＴＩＭ−３、または抗ＬＡＧ−３抗体または抗原結合部分は、遺伝子が転写および翻訳制御配列などの必要な発現制御配列に作動可能に連結されるように、上記で得られた部分的または完全長の軽鎖および重鎖をコードするＤＮＡを発現ベクターに挿入することによって発現させる。発現ベクターには、プラスミド、レトロウイルス、アデノウイルス、アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）、カリフラワーモザイクウイルス、タバコモザイクウイルスなどの植物ウイルス、コスミド、ＹＡＣ、ＥＢＶ由来エピソーム等が挙げられる。抗体コード配列を、ベクター内の転写および翻訳制御配列が抗体コード配列の転写および翻訳を調節する、その意図される機能を発揮するように、ベクターにライゲートしてもよい。発現ベクターおよび発現制御配列は、使用される発現宿主細胞と適合性であるように選択されうる。抗体軽鎖コード配列および抗体重鎖コード配列を個別のベクターに挿入して、同じまたは異なる発現制御配列（例えば、プロモーター）に作動可能に連結してもよい。一実施形態において、両方のコード配列を同じ発現ベクターに挿入し、同一の発現制御配列（例えば、プロモーター）を分離するために同じ発現制御配列（例えば、共通のプロモーター）に、または異なる発現制御配列（例えば、プロモーター）に作動可能に連結してもよい。抗体コード配列を、標準的な方法（例えば、抗体遺伝子断片およびベクター上の相補的制限部位のライゲーションまたは制限部位が存在しない場合には平滑末端ライゲーション）によって発現ベクターに挿入してもよい。
【０２６３】
簡便なベクターは、任意のＶＨまたはＶＬ配列を上記のように容易に挿入して発現させることができるように工学操作されている適切な制限部位を有する、機能的に完全なヒトＣＨまたはＣＬ免疫グロブリン配列をコードするベクターである。そのようなベクターにおけるＨＣおよびＬＣコード遺伝子は、関連するｍＲＮＡを安定化することによって全体的な抗体タンパク質の収率を増加させる、イントロン配列を含み得る。イントロン配列は、ＲＮＡスプライシングが起こる場所を決定するスプライスドナーおよびスプライスアクセプター部位に隣接する。イントロン配列の位置は、抗体鎖の可変もしくは定常領域のいずれかでありうるか、または多数のイントロンを使用する場合には可変および定常領域の両方でありうる。ポリアデニル化および転写終止は、コード領域の下流のネイティブ染色体部位で起こりうる。組換え発現ベクターはまた、宿主細胞からの抗体鎖の分泌を促進するシグナルペプチドをコードしうる。抗体鎖遺伝子は、シグナルペプチドが免疫グロブリン鎖のアミノ末端にインフレームで連結されるようにベクターにおいてクローニングされうる。シグナルペプチドは、免疫グロブリンシグナルペプチドまたは異種シグナルペプチド（すなわち、非免疫グロブリンタンパク質からのシグナルペプチド）でありうる。
【０２６４】
抗体鎖遺伝子に加えて、組換え発現ベクターは、宿主細胞における抗体鎖遺伝子の発現を制御する調節配列を有しうる。調節配列の選択を含む発現ベクターの設計は、形質転換される宿主細胞の選択、所望のタンパク質の発現レベル等などの要因に依存しうることは当業者に認識されるであろう。哺乳動物宿主細胞発現にとって好ましい調節配列は、哺乳動物細胞において高レベルのタンパク質発現を指示するウイルスエレメント、例えばレトロウイルスＬＴＲ、サイトメガロウイルス（ＣＭＶ）（ＣＭＶプロモーター／エンハンサーなど）、シミアンウイルス４０（ＳＶ４０）（ＳＶ４０プロモーター／エンハンサー）、アデノウイルス（例えば、アデノウイルス主要後期プロモーター（ＡｄＭＬＰ））、ポリオーマ、ならびにネイティブ免疫グロブリンおよびアクチンプロモーターなどの強い哺乳動物プロモーターに由来するプロモーターおよび／またはエンハンサーを含む。ウイルス調節エレメントおよびその配列に関する詳しい記述に関しては、例えば、米国特許第５，１６８，０６２号、第４，５１０，２４５号、および第４，９６８，６１５号を参照されたい。プロモーターおよびベクターの記述、ならびに植物の形質転換を含む、植物において抗体を発現させる方法は、当技術分野で公知である。例えば米国特許第６，５１７，５２９号を参照されたい。細菌細胞または真菌細胞、例えば酵母細胞においてポリペプチドを発現させる方法もまた、当技術分野で周知である。
【０２６５】
抗体鎖遺伝子および調節配列に加えて、組換え発現ベクターは、宿主細胞においてベクターの複製を調節する配列（例えば、複製開始点）および選択可能マーカー遺伝子などの追加の配列を有しうる。選択可能マーカー遺伝子は、ベクターが導入されている宿主細胞の選択を容易にする（例えば、米国特許第４，３９９，２１６号、第４，６３４，６６５号、および第５，１７９，０１７号を参照されたい）。例えば、典型的に選択可能マーカー遺伝子は、Ｇ４１８、ヒグロマイシンまたはメトトレキサートなどの薬物に対する耐性を、ベクターが導入されている宿主細胞に付与する。例えば、選択可能マーカー遺伝子には、ジヒドロ葉酸レダクターゼ（ＤＨＦＲ）遺伝子（ｄｈｆｒ−宿主細胞においてメトトレキサート選択／増幅に使用するため）、ｎｅｏ遺伝子（Ｇ４１８選択のため）、およびグルタミン酸シンテターゼ遺伝子が挙げられる。
【０２６６】
本明細書において使用される用語「発現制御配列」は、それがライゲートされるコード配列の発現およびプロセシングを行うために必要であるポリヌクレオチド配列を意味する。発現制御配列には、適切な転写開始、終止、プロモーター、およびエンハンサー配列；スプライシングおよびポリアデニル化シグナルなどの効率的なＲＮＡプロセシングシグナル；細胞質ｍＲＮＡを安定化させる配列；翻訳効率を増強する配列（すなわち、コザックコンセンサス配列）；タンパク質安定性を増加させる配列；および望ましければタンパク質分泌を増加させる配列が挙げられる。そのような制御配列の性質は、宿主生物に応じて異なり、原核生物では、そのような制御配列は一般的にプロモーター、リボソーム結合部位、および転写終止配列を含み、真核生物では一般的に、そのような制御配列はプロモーターおよび転写終止配列を含む。用語「制御配列」は、その存在が発現およびプロセシングにとって必須である少なくとも全ての成分を含むと意図され、同様にその存在が有利である追加の成分、例えばリーダー配列および融合パートナー配列も含みうる。
【０２６７】
抗体および抗体組成物産生のための宿主細胞および方法
同様に、本発明の併用治療（例えば、組成物）を産生する方法も記載する。一実施形態は、抗体を発現することができる組換え宿主細胞を提供すること、前記宿主細胞を抗体の発現にとって適した条件で培養すること、および得られた抗体を単離することを含む、本明細書に記載の抗体を産生する方法に関する。そのような組換え宿主細胞におけるそのような発現によって産生された抗体を、本明細書において「組換え抗体」と呼ぶ。そのような宿主細胞の子孫細胞、そのような子孫細胞によって産生された抗体もまた記載される。
【０２６８】
本明細書において使用される用語「組換え宿主細胞」（または単に「宿主細胞」）は、組換え発現ベクターが導入されている細胞を意味する。宿主細胞は、例えば本明細書に記載の１つまたは複数のベクターを含みうる。宿主細胞は、本明細書に記載の抗ＰＤ−１、抗ＴＩＭ−３、および／もしくは抗ＬＡＧ−３抗体またはその抗原結合部分の、重鎖またはその抗原結合部分をコードするヌクレオチド配列、軽鎖またはその抗原結合部分をコードするヌクレオチド配列、またはその両方を含んでもよい。「組換え宿主細胞」および「宿主細胞」は、特定の対象細胞のみならず、そのような細胞の子孫も意味すると理解すべきである。その後の世代では、突然変異または環境の影響のいずれかにより特定の修飾が起こりうることから、そのような子孫は、実際には親細胞と同一ではないが、それでもなお本明細書において使用される用語「宿主細胞」の範囲に含まれる。
【０２６９】
抗ＰＤ−１、抗ＴＩＭ−３、および／もしくは抗ＬＡＧ−３抗体またはその抗原結合部分をコードする核酸分子およびこれらの核酸分子を含むベクターは、適した哺乳動物、植物、細菌、または酵母宿主細胞のトランスフェクションのために使用することができる。形質転換は、ポリヌクレオチドを宿主細胞に導入するための任意の公知の方法によって行うことができる。異種ポリヌクレオチドを哺乳動物細胞に導入する方法は当技術分野で周知であり、これには、デキストラン法によるトランスフェクション、リン酸カルシウム沈殿、ポリブレン法によるトランスフェクション、プロトプラスト融合、電気穿孔、ポリヌクレオチドのリポソームへの封入、およびＤＮＡの核への直接マイクロインジェクションが挙げられる。さらに、核酸分子をウイルスベクターによって哺乳動物細胞に導入してもよい。細胞を形質転換する方法は当技術分野で周知である。例えば、米国特許第４，３９９，２１６号、第４，９１２，０４０号、第４，７４０，４６１号、および第４，９５９，４５５号を参照されたい。例えばアグロバクテリウム法による形質転換、バイオリスティック形質転換、直接注入、電気穿孔、およびウイルス形質転換を含む、植物細胞を形質転換する方法は、当技術分野で周知である。細菌および酵母細胞を形質転換する方法も同様に当技術分野で周知である。
【０２７０】
発現のための宿主として利用可能な哺乳動物細胞株は当技術分野で周知であり、Ａｍｅｒｉｃａｎ  Ｔｙｐｅ  Ｃｕｌｔｕｒｅ  Ｃｏｌｌｅｃｔｉｏｎ（ＡＴＣＣ）から入手可能な多くの不死化細胞株が挙げられる。これらには、中でもチャイニーズハムスター卵巣（ＣＨＯ）細胞、ＮＳ０細胞、ＳＰ２細胞、ＨＥＫ−２９３Ｔ細胞、２９３  Ｆｒｅｅｓｔｙｌｅ細胞（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ）、ＮＩＨ−３Ｔ３細胞、ＨｅＬａ細胞、ベビーハムスター腎（ＢＨＫ）細胞、アフリカミドリザル腎細胞（ＣＯＳ）、ヒト肝細胞癌細胞（例えば、Ｈｅｐ  Ｇ２）、Ａ５４９細胞、および他の多くの細胞株が挙げられる。特に好ましい細胞株は、どの細胞株が高い発現レベルを有するかを決定することによって選択される。使用することができる他の細胞株は、昆虫細胞株、例えばＳｆ９またはＳｆ２１細胞である。抗体遺伝子をコードする組換え発現ベクターを、哺乳動物宿主細胞に導入する場合、抗体は、宿主細胞における抗体の発現を可能にするために、またはより好ましくは宿主細胞が増殖する培養培地への抗体の分泌を可能にするために十分な期間、宿主細胞を培養することによって産生される。抗体は、標準的なタンパク質精製方法を使用して、培養培地から回収することができる。植物細胞には、例えば、ニコチアナ（Ｎｉｃｏｔｉａｎａ）、シロイヌナズナ（Ａｒａｂｉｄｏｐｓｉｓ）、ウキクサ、トウモロコシ、コムギ、ジャガイモ等が挙げられる。細菌宿主細胞には、Ｅ．コリ（Ｅ．ｃｏｌｉ）およびストレプトミセス（Ｓｔｒｅｐｔｏｍｙｃｅｓ）種が挙げられる。酵母宿主細胞には、シゾサッカロミセス・ポンベ（Ｓｃｈｉｚｏｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ  ｐｏｍｂｅ）、サッカロミセス・セレビジエ（Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ  ｃｅｒｅｖｉｓｉａｅ）、およびピチア・パストリス（Ｐｉｃｈｉａ  ｐａｓｔｏｒｉｓ）が挙げられる。
【０２７１】
さらに、産生細胞株からの本明細書に記載の抗体またはその抗原結合部分の発現は、多数の公知の技術を使用して増強することができる。例えばグルタミンシンテターゼ遺伝子発現系（ＧＳ系）は、ある特定の条件下での発現を増強するための一般的なアプローチである。ＧＳ系は、全てまたは一部が、欧州特許第０２１６８４６号、第０２５６０５５号、第０３２３９９７号、および第０３３８８４１号に関連して考察されている。
【０２７２】
異なる細胞株によってまたはトランスジェニック動物において発現された抗体は、互いに異なるグリコシル化パターンを有する可能性がある。しかし、本明細書において提供される核酸分子によってコードされる、または本明細書において提供されるアミノ酸配列を含む抗体は全て、抗体のグリコシル化状態によらず、より一般的には、翻訳後修飾の有無によらず、本発明の抗体の一部である。
【０２７３】
一部の実施形態において、本発明は、抗ＰＤ−１抗体および抗ＴＩＭ−３抗体を含む抗体組成物を産生する方法であって、
−  第１の宿主細胞が本明細書に記載の抗ＰＤ−１抗体を発現することができ、および第２の宿主細胞が本明細書に記載の抗ＴＩＭ−３抗体を発現することができる、第１および第２の宿主細胞を提供すること、
−  第１および第２の宿主細胞を、抗ＰＤ−１抗体および抗ＴＩＭ−３抗体の発現にとって適した条件下で培養すること、ならびに
−  得られた抗体を単離すること
を含む方法に関する。
【０２７４】
一部の実施形態において、本発明は、抗ＰＤ−１抗体および抗ＬＡＧ−３抗体を含む抗体組成物を産生する方法であって、
−  第１の宿主細胞が本明細書に記載の抗ＰＤ−１抗体を発現することができ、および第２の宿主細胞が本明細書に記載の抗ＬＡＧ−３抗体を発現することができる、第１および第２の宿主細胞を提供すること、
−  第１および第２の宿主細胞を、抗ＰＤ−１抗体および抗ＬＡＧ−３抗体の発現にとって適した条件下で培養すること、ならびに
−  得られた抗体を単離すること
を含む方法に関する。
【０２７５】
一部の実施形態において、本発明は、抗ＴＩＭ−３抗体および抗ＬＡＧ−３抗体を含む抗体組成物を産生する方法であって、
−  第１の宿主細胞が本明細書に記載の抗ＴＩＭ−３抗体を発現することができ、および第２の宿主細胞が本明細書に記載の抗ＬＡＧ−３抗体を発現することができる、第１および第２の宿主細胞を提供すること、
−  第１および第２の宿主細胞を、抗ＴＩＭ−３抗体および抗ＬＡＧ−３抗体の発現にとって適した条件下で培養すること、ならびに
−  得られた抗体を単離すること
を含む方法に関する。
【０２７６】
一部の実施形態において、本発明は、抗ＰＤ−１抗体、抗ＴＩＭ−３抗体および抗ＬＡＧ−３抗体を含む抗体組成物を産生する方法であって、
−  第１の宿主細胞が本明細書に記載の抗ＰＤ−１抗体を発現することができ、第２の宿主細胞が本明細書に記載の抗ＴＩＭ−３抗体を発現することができ、および第３の宿主細胞が本明細書に記載の抗ＬＡＧ−３抗体を発現することができる、第１、第２、および第３の宿主細胞を提供すること、
−  第１、第２、および第３の宿主細胞を、抗ＰＤ−１抗体、抗ＴＩＭ−３抗体、および抗ＬＡＧ−３抗体の発現にとって適した条件下で培養すること、ならびに
−  得られた抗体を単離すること
を含む方法に関する。
【０２７７】
本発明の抗体組成物の産生に関して、異なる標的に対する抗体を、個別に産生してもよく、すなわち各々の抗体を個別のバイオリアクターにおいて産生してもよく、または個々の抗体を単一のバイオリアクターにおいて共に産生してもよい。抗体組成物を、１つより多くのバイオリアクターにおいて産生する場合、各バイオリアクターからの個々に精製された上清から得た抗体をプールすることによって、精製抗体組成物を得ることができる。細胞株または抗体調製物を、上流の後の時点で、または下流のプロセシングの前もしくは間に組み合わせる、複数のバイオリアクターにおけるポリクローナル抗体組成物の産生のための様々なアプローチは、ＰＣＴ公報国際公開第２００９／１２９８１４号に記載されている。
【０２７８】
単一のバイオリアクターにおいて個々の抗体を産生する場合、これは、例えばＰＣＴ公報国際公開第２００４／０６１１０４号または国際公開第２００８／１４５１３３号に記載されるように実施してもよい。国際公開第２００４／０６１１０４号に記載の方法は、個々の宿主細胞のゲノムへの抗体コード配列の部位特異的組み込みに基づくが、国際公開第２００８／１４５１３３号の方法は、単一のバイオリアクターにおいて抗体を産生するためにランダム組み込みを使用する代替アプローチを伴う。
【０２７９】
本発明の抗体組成物を調製するために適した方法に関するさらなる情報は、ＰＣＴ公報国際公開第２０１２／０５９８５７号および国際公開第２０１３／１６４６８９号に見出されうる。
【０２８０】
本発明はまた：
−  本明細書に記載の少なくとも１つの抗ＰＤ−１抗体もしくはその抗原結合部分、および本明細書に記載の少なくとも１つの抗ＴＩＭ−３抗体もしくはその抗原結合部分；
−  本明細書に記載の少なくとも１つの抗ＰＤ−１抗体もしくはその抗原結合部分、および本明細書に記載の少なくとも１つの抗ＬＡＧ−３抗体もしくはその抗原結合部分；
−  本明細書に記載の少なくとも１つの抗ＴＩＭ−３抗体もしくはその抗原結合部分、および本明細書に記載の少なくとも１つの抗ＬＡＧ−３抗体もしくはその抗原結合部分；または
−  本明細書に記載の少なくとも１つの抗ＰＤ−１抗体もしくはその抗原結合部分、本明細書に記載の少なくとも１つの抗ＴＩＭ−３抗体もしくはその抗原結合部分、および本明細書に記載の少なくとも１つの抗ＬＡＧ−３抗体もしくはその抗原結合部分
を産生するポリクローナル細胞株も提供する。
【０２８１】
本発明はまた、上記のポリクローナル細胞株を産生する方法であって、各々がポリクローナル細胞株によって産生される抗体または部分の少なくとも１つの、重鎖またはその抗原結合部分をコードするヌクレオチド配列、および軽鎖またはその抗原結合部分をコードするヌクレオチド配列を含む宿主細胞を提供することを含む方法も提供する。
【０２８２】
本発明はまた：
−  本明細書に記載の抗ＰＤ−１抗体の重鎖もしくはその抗原結合部分をコードするヌクレオチド配列、軽鎖もしくはその抗原結合部分をコードするヌクレオチド配列、または両方、および本明細書に記載の抗ＴＩＭ−３抗体の重鎖もしくはその抗原結合部分をコードするヌクレオチド配列、軽鎖もしくはその抗原結合部分をコードするヌクレオチド配列、または両方；
−  本明細書に記載の抗ＰＤ−１抗体の重鎖もしくはその抗原結合部分をコードするヌクレオチド配列、軽鎖もしくはその抗原結合部分をコードするヌクレオチド配列、または両方、および本明細書に記載の抗ＬＡＧ−３抗体の重鎖もしくはその抗原結合部分をコードするヌクレオチド配列、軽鎖もしくはその抗原結合部分をコードするヌクレオチド配列、または両方；
−  本明細書に記載の抗ＴＩＭ−３抗体の重鎖もしくはその抗原結合部分をコードするヌクレオチド配列、軽鎖もしくはその抗原結合部分をコードするヌクレオチド配列、または両方、および本明細書に記載の抗ＬＡＧ−３抗体の重鎖もしくはその抗原結合部分をコードするヌクレオチド配列、軽鎖もしくはその抗原結合部分をコードするヌクレオチド配列、または両方；または
−  本明細書に記載の抗ＰＤ−１抗体の重鎖もしくはその抗原結合部分をコードするヌクレオチド配列、軽鎖もしくはその抗原結合部分をコードするヌクレオチド配列、または両方、本明細書に記載の抗ＴＩＭ−３抗体の重鎖もしくはその抗原結合部分をコードするヌクレオチド配列、軽鎖もしくはその抗原結合部分をコードするヌクレオチド配列、または両方、および本明細書に記載の抗ＬＡＧ−３抗体の重鎖もしくはその抗原結合部分をコードするヌクレオチド配列、軽鎖もしくはその抗原結合部分をコードするヌクレオチド配列、または両方
を含む宿主細胞も提供する。
【０２８３】
医薬組成物
本発明の別の態様は、活性成分として（例えば、唯一の活性成分として）：
−  本明細書に記載の少なくとも１つの抗ＰＤ−１抗体もしくはその抗原結合部分および本明細書に記載の少なくとも１つの抗ＴＩＭ−３抗体もしくはその抗原結合部分；
−  本明細書に記載の少なくとも１つの抗ＰＤ−１抗体もしくはその抗原結合部分および本明細書に記載の少なくとも１つの抗ＬＡＧ−３抗体もしくはその抗原結合部分；
−  本明細書に記載の少なくとも１つの抗ＴＩＭ−３抗体もしくはその抗原結合部分および本明細書に記載の少なくとも１つの抗ＬＡＧ−３抗体もしくはその抗原結合部分；または
−  本明細書に記載の少なくとも１つの抗ＰＤ−１抗体もしくはその抗原結合部分、本明細書に記載の少なくとも１つの抗ＴＩＭ−３抗体もしくはその抗原結合部分、および本明細書に記載の少なくとも１つの抗ＬＡＧ−３抗体もしくはその抗原結合部分
を含む医薬組成物である。一部の態様では、医薬組成物は、多特異性結合分子（例えば、本明細書に記載の抗ＰＤ−１抗体、および本明細書に記載の抗ＴＩＭ−３もしくは抗ＬＡＧ−３抗体；または本明細書に記載の抗ＰＤ１抗体、抗ＴＩＭ−３抗体、および抗ＬＡＧ−３抗体の結合特異性を有する多特異性結合分子）を含む。
【０２８４】
一部の実施形態において、医薬組成物は、１つまたは複数の関連する細胞表面受容体、例えば１つまたは複数のがん関連受容体を標的とする１つまたは複数の追加の抗体をさらに含みうる。
【０２８５】
一部の実施形態において、医薬組成物は、ＰＤ−１、ＴＩＭ−３、および／またはＬＡＧ−３の調節によって改善する、またはその進行を遅らせる障害、疾患、または状態の改善、予防、および／または処置のために意図される。一部の実施形態において、医薬組成物は、がんの改善、予防、および／または処置のために意図される。一部の実施形態において、医薬組成物は、免疫系の活性化のために意図される。
【０２８６】
本発明の医薬組成物（または同時、連続的、もしくは個別に投与される本明細書に記載の個々の抗体もしくは部分）における抗体またはその抗原結合部分の間の比は、しばしば抗体が等量で投与される比であるが、必ずしもその必要はない。このように、抗ＰＤ−１抗体および抗ＴＩＭ−３抗体、抗ＰＤ−１抗体および抗ＬＡＧ−３抗体、または抗ＴＩＭ−３抗体および抗ＬＡＧ−３抗体を含む本発明の組成物は、前記抗体をおよそ１：１の比で含みうる。抗ＰＤ−１抗体、抗ＴＩＭ−３抗体、および抗ＬＡＧ−３抗体を含む本発明の組成物は、前記抗体をおよそ１：１：１の比（すなわち、等量で）で含みうる。しかし、個々の抗体の特徴に基づき、異なる抗体の非等量を使用することが望ましい場合がある。本発明の組成物における異なる抗体の適した比は、ＰＣＴ公報国際公開第２０１０／０４０３５６号に記載されるように決定してもよく、これは最適な効力および効能を有するコンビナトリアル薬物を得るために、コンビナトリアル薬物産物、例えばポリクローナル抗体組成物中の化合物間の最適な化学量論比を同定および選択する方法を記載している。
【０２８７】
一般的に、本明細書に記載の医薬組成物は、例えば以下に記載されるような１つまたは複数の薬学的に許容される賦形剤に関連して製剤として投与するために適している。
【０２８８】
用語「賦形剤」は、本明細書において本発明の化合物以外の任意の成分を記述するために使用される。賦形剤の選択は、特定の投与様式、溶解度および安定性に及ぼす賦形剤の効果、および投与剤形の性質などの要因に大きい程度に依存する。本明細書において使用される「薬学的に許容される賦形剤」は、生理学的に適合性であるありとあらゆる溶媒、分散培地、コーティング、抗菌剤および抗真菌剤、等張および吸収遅延剤等を含む。薬学的に許容される賦形剤のいくつかの例は、水、食塩水、リン酸緩衝食塩水、デキストロース、グリセロール、エタノール等、ならびにその組み合わせである。多くの場合、等張剤、例えば糖、多価アルコール、例えばマンニトール、ソルビトール、または塩化ナトリウムを組成物に含めることが好ましい。薬学的に許容される物質のさらなる例は、湿潤剤または微量の補助物質、例えば湿潤剤または乳化剤、抗体の貯蔵寿命または有効性を増強する保存剤または緩衝剤である。
【０２８９】
本発明の医薬組成物およびその調製方法は、当業者に容易に明らかであろう。そのような組成物およびその調製方法は、例えばRemington's Pharmaceutical Sciences, 19th Edition (Mack Publishing Company, 1995)において見出されうる。医薬組成物は好ましくは、ＧＭＰ（医薬品等の製造管理品質管理基準）に従って製造される。
【０２９０】
本発明の医薬組成物は、バルク、単一単位用量、または複数の単一単位用量として調製、梱包、または販売することができる。本明細書において使用される「単位用量」は、活性成分の既定量を含む医薬組成物の別個の量である。活性成分の量は、一般的に対象に投与される活性成分の用量に等しいか、または例えばそのような用量の２分の１または３分の１などのそのような用量の簡便な分画に等しい。
【０２９１】
当技術分野において容認されている、ペプチド、タンパク質、または抗体を投与する任意の方法を、本明細書に記載の抗体および抗原結合部分のために適切に使用することができる。
【０２９２】
本発明の医薬組成物は典型的には、非経口投与にとって適している。本明細書において使用されるように、医薬組成物の「非経口投与」は、対象の組織の物理的侵害によって特徴づけられる任意の投与経路、およびそれによって一般的に血流、筋肉、または内部臓器への直接投与がもたらされる、組織の侵害を通しての医薬組成物の投与を含む。このため、非経口投与は、組成物の注射による医薬組成物の投与、外科的切開を通しての組成物の適用、組織を貫通する非外科的創傷を通しての組成物の適用等を含むが、これらに限定されない。特に、非経口投与は、皮下、腹腔内、筋肉内、胸骨内、静脈内、動脈内、髄腔内、脳室内、尿道内、頭蓋内、腫瘍内および滑膜内の注射または注入、ならびに腎透析注入技術を含むがこれらに限定されないと企図される。局所灌流もまた企図される。特定の実施形態は、静脈内および皮下経路を含む。
【０２９３】
非経口投与にとって適した医薬組成物の製剤は典型的に、薬学的に許容される担体、例えば滅菌水または滅菌等張食塩水と組み合わせた活性成分を含む。そのような製剤は、ボーラス投与または持続的投与にとって適した剤形で調製、梱包、または販売されうる。注射可能製剤は、保存剤を含むアンプルまたは多用量容器などの単位投与剤形で調製、梱包、または販売することができる。非経口投与のための製剤には、懸濁剤、液剤、油性または水性媒体中の乳剤、パスタ剤等が挙げられるがこれらに限定されない。そのような製剤は、懸濁剤、安定化剤、または分散剤を含むがこれらに限定されない１つまたは複数の追加の成分をさらに含みうる。非経口投与のための製剤の一実施形態において、活性成分は、適した媒体（例えば、滅菌発熱物質フリー水）によって再構成した後、再構成された組成物を非経口投与するための乾燥（すなわち、粉末または顆粒）剤形で提供される。非経口投与製剤はまた、塩、炭水化物、および緩衝剤（好ましくはｐＨ３〜９）などの賦形剤を含みうる水溶液を含むが、一部の応用に関しては、それらはより適切には、滅菌の非水溶液として製剤化されうるか、または滅菌の発熱物質フリー水などの適した媒体と共に使用される乾燥剤形として製剤化されうる。例示的な非経口投与剤形には、滅菌水溶液、例えばプロピレングリコールまたはデキストロース水溶液中の溶液または懸濁液が挙げられる。そのような投与剤形は、必要に応じて適切に緩衝させることができる。有用である他の非経口投与可能な製剤は、微結晶型のまたはリポソーム調製物中の活性成分を含む製剤を含む。非経口投与のための製剤は、即時および／または調節された放出となるように製剤化することができる。放出調節製剤には、遅延、持続的、パルス、制御、標的化、およびプログラム放出が挙げられる。
【０２９４】
例えば、一態様において、滅菌注射可能溶液は、組成物の必要量を、上記で列挙した成分の１つまたは組み合わせと共に適切な溶媒に組み入れた後、必要に応じてろ過滅菌することによって調製することができる。一般的に、分散剤は、活性化合物を、基本分散培地および上記で列挙した成分からの必要な他の成分を含む滅菌媒体に組み入れることによって調製される。滅菌注射用溶液を調製するための滅菌粉末の場合、好ましい調製方法は、予めろ過滅菌されたその溶液から、活性成分に加えて任意の追加の所望の成分の粉末を生じる真空乾燥および凍結乾燥である。溶液の適切な流動性は、例えばレシチンなどのコーティングを使用することによって、分散剤の場合には必要な粒径を維持することによって、および界面活性剤を使用することによって維持することができる。注射可能組成物の持続的な吸収は、吸収を遅らせる薬剤、例えばモノステアリン酸塩およびゼラチンを組成物に含めることによって、および／または放出調節コーティング（例えば、徐放性コーティング）を使用することによってもたらすことができる。
【０２９５】
本発明の併用治療および組成物の治療的使用
一態様において、本発明の併用治療および組成物は、それを必要とする患者（例えば、ヒト）における免疫系を増強または活性化するために使用される。一部の実施形態において、患者は免疫抑制状態である。一部の実施形態において、医師は、本発明の併用治療もしくは組成物を単独で、または他の治療剤と併用して（連続的または同時に）投与することによって、患者自身の免疫系の抗がん活性を強化することができる。併用治療または組成物は、免疫細胞におけるＰＤ−１、ＴＩＭ−３、および／またはＬＡＧ−３の活性を調節し、それによって抗がん免疫の増強をもたらす。ある特定の実施形態において、本発明の併用治療および組成物は、がん、例えば皮膚、肺、腸、結腸、卵巣、脳、前立腺、腎臓、軟部組織、造血系、頭頚部、肝臓、膀胱、乳房、胃、子宮、および膵臓などの組織を起源とするがん、ならびにＰＤ−１、ＴＩＭ−３、および／もしくはＬＡＧ−３活性に依存する、および／または患者がこれらのいずれかのリガンドを発現もしくは過剰発現する任意のがんまたは他の状態の処置に使用するためである。
【０２９６】
一部の実施形態において、本発明の併用治療および組成物によって処置されるがんには、例えば、黒色腫（例えば進行黒色腫、または転移性黒色腫）、非小細胞肺がん、頭頚部扁平上皮がん、腎細胞癌、ホジキンリンパ腫、非ホジキンリンパ腫、神経膠芽腫、神経膠腫、肺扁平上皮がん、小細胞肺がん、肝細胞癌、膀胱がん、上部尿路上皮がん、食道がん、胃食道接合部がん、胃がん、肝臓がん、結腸がん、結腸直腸癌、多発性骨髄腫、肉腫、急性骨髄性白血病、慢性骨髄性白血病、骨髄異形成症候群、鼻咽頭がん、慢性リンパ球性白血病、急性リンパ芽球性白血病、小リンパ性リンパ腫、卵巣がん、胃腸癌、原発性腹腔がん、ファロピウス管がん、尿路上皮がん、ＨＴＬＶ関連Ｔ細胞白血病／リンパ腫、前立腺がん、尿生殖器がん、髄膜腫、副腎皮質がん、神経膠肉腫、線維肉腫、腎臓がん、乳がん、膵臓がん、子宮内膜がん、皮膚基底細胞がん、虫垂がん、胆管がん、唾液腺がん、進行メルケル細胞がん、びまん性大細胞Ｂリンパ腫、濾胞性リンパ腫、中皮腫、神経内分泌腫瘍、泌尿器がん、骨がん、胸部がん、呼吸器がん、腺様嚢胞癌、子宮頚がん、星細胞腫、脊索腫、神経芽腫、口腔がん、皮膚扁平上皮がん、甲状腺がん、カポジ肉腫、肛門がん、胆嚢がん、胸腺がん、子宮がん、および固形腫瘍が挙げられうる。がんは、例えば初期、中間期、進行期、または転移段階でありうる。
【０２９７】
特定の実施形態において、本発明の併用治療および組成物によって処置されるがんには、例えば黒色腫（例えば、進行黒色腫または切除不能もしくは転移性黒色腫）、非小細胞肺がん（例えば、進行非小細胞肺がん）、肺癌、頭頚部扁平上皮癌、膠芽腫（例えば、再発性膠芽腫）、膠肉腫、メルケル細胞癌、線維肉腫、卵巣がん、膀胱がん、腎細胞癌、結腸直腸がん、ホジキンリンパ腫、非ホジキンリンパ腫、白血病（例えば、急性骨髄性白血病）、血液悪性腫瘍、固形腫瘍（例えば、進行または転移性固形腫瘍）、高頻度ＭＳＩ腫瘍、ＨＰＶおよびＨＩＶ関連悪性腫瘍、ならびにＢＲＡＣ１およびＢＲＡＣ２変異を有する腫瘍が挙げられうる。
【０２９８】
ある特定の実施形態において、本発明の医薬組成物は、乾癬、全身性紅斑性狼瘡、ＭＬＳ（硬化症）、クローン病、糖尿病、および／または潰瘍性大腸炎などの免疫媒介障害の処置のために意図される。
【０２９９】
一部の実施形態において、併用治療または組成物は、例えば病原体が宿主免疫応答を阻害するウイルスおよび／または寄生虫感染症の処置に使用するためである。例えば、病原体は、例えばＨＩＶ、肝炎（Ａ、Ｂ、またはＣ型）、ヒトパピローマウイルス（ＨＰＶ）、リンパ球性脈絡髄膜炎ウイルス（ＬＣＭＶ）、アデノウイルス、フラビウイルス、エコーウイルス、ライノウイルス、コクサッキーウイルス、コモウイルス、呼吸多核体ウイルス、ムンプスウイルス、ロタウイルス、麻疹ウイルス、風疹ウイルス、パルボウイルス、ワクシニアウイルス、ヒトＴ細胞リンパ球向性ウイルス（ＨＴＬＶ）、ヒトサイトメガロウイルス（ＨＣＭＶ）、デングウイルス、軟属腫ウイルス、ポリオウイルス、狂犬病ウイルス、ジョン・カニンガム（ＪＣ）ウイルス、アルボウイルス脳炎ウイルス、サル免疫不全ウイルス（ＳＩＶ）、インフルエンザ、ヘルペス、ジアルディア、マラリア、リーシュマニア、黄色ブドウ球菌（Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ  ａｕｒｅｕｓ）、または緑膿菌（Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ  ａｅｒｕｇｉｎｏｓａ）でありうる。
【０３００】
一部の実施形態において、本発明の併用治療および組成物は、免疫不全である（例えば、化学療法剤治療または放射線治療により）、または免疫不全のリスクがある患者を処置するために使用されうる。
【０３０１】
一部の実施形態において、本発明の併用治療および組成物は、抗原特異的Ｔ細胞のエクスビボ（ｅｘ  ｖｉｖｏ）活性化および増大のために使用されうる。
【０３０２】
一部の実施形態において、患者は、ＰＤ−１、ＴＩＭ−３、および／もしくはＬＡＧ−３、またはそのリガンドのいずれかの過剰発現または過剰活性によって特徴付けられる状態（例えば、がん、または免疫障害）のために過去に処置されていてもよい。例えば患者は、ＰＤ−１、ＴＩＭ−３、および／またはＬＡＧ−３を標的とする１つまたは複数の薬物によって処置されていてもよく、前記薬物に対する耐性を獲得していてもよい。
【０３０３】
「処置する」、「処置している」、および「処置」は、生物学的障害および／またはその付随する症状の少なくとも１つを軽減または除去する方法を指す。本明細書において使用される、疾患、障害、または状態を「軽減する」ことは、疾患、障害、または状態の症状の重症度および／または発生頻度を低減させることを意味する。さらに、本明細書における「処置」という言及は、治癒、緩和、および予防的処置に対する言及を含む。
【０３０４】
「治療有効量」は、処置される障害の症状の１つまたは複数をある程度軽減する、投与される治療剤の量を指す。抗がん治療薬の治療有効量は、例えば腫瘍の縮小、生存の増加、がん細胞の消失、疾患進行の減少、転移の逆転、または医療の専門家にとって望ましい他の臨床エンドポイントをもたらしうる。
【０３０５】
一部の実施形態において、本発明の併用治療における抗体、抗原結合部分、または多特異性結合分子は、単一の組成物で投与される。他の実施形態では、抗体、抗原結合部分、または多特異性分子は、１つより多くの組成物で投与される。例えば、抗ＰＤ−１抗体、抗ＴＩＭ−３抗体、および抗ＬＡＧ−３抗体を含む併用治療は、３つ全ての抗体を含む単一の組成物、抗体の２つを含む組成物、抗体の１つを含む組成物、または各々の抗体の個別の組成物の投与を伴いうる。１つより多くの組成物の場合、組成物は、同時に、連続的に、個別に、または任意の組み合わせで投与することができる。
【０３０６】
本発明の併用治療および組成物は、単独で、または１つもしくは複数の他の薬物もしくは抗体（またはその任意の組み合わせとして）と併用して投与されうる。本発明の医薬組成物、方法、および使用は、以下に詳述するように他の活性剤と併用（同時投与）する実施形態も包含する。
【０３０７】
本明細書において、本発明の併用治療または組成物を参照して使用される、１つまたは複数の他の治療剤と「同時投与」、「同時投与される」、および「併用される」という用語は、以下：
−  そのような成分が前記患者に前記成分を実質的に同時に放出する単一の投与剤形に共に製剤化されている場合、処置を必要とする患者へのそのような併用治療（またはその成分）、または組成物と、治療剤との同時投与、
−  そのような成分が、前記患者によって実質的に同時に服用される個別の投与剤形に別々に製剤化される場合、それによって前記成分が前記患者に実質的に同時に放出される、処置を必要とする患者へのそのような併用治療（またはその成分）、または組成物と、治療剤との実質的に同時投与、
−  そのような成分が、それぞれの投与の間に有意な時間間隔で前記患者によって連続する時間で服用される個別の投与剤形に別々に製剤化される場合、それによって前記成分が前記患者に実質的に異なる時間に放出される、処置を必要とする患者へのそのような併用治療（またはその成分）、または組成物と、治療剤との連続的投与
−  そのような成分が、前記成分を制御された方法で放出する単一の投与剤形に共に製剤化される場合、それによってそれらが前記患者に同時におよび／または異なる時間に同時、連続的、および／またはオーバーラップするように放出される、処置を必要とする患者へのそのような併用治療（またはその成分）、または組成物と、治療剤との連続的投与であって、それぞれの部分が同じ経路または異なる経路のいずれかで投与されうる、投与を意味すると意図される、指す、および含む。
【０３０８】
本発明の併用治療および組成物は、追加の治療処置を行うことなく、すなわち単独の治療（すなわち単剤治療）として投与されうる。あるいは、本発明の併用治療または組成物による処置は、少なくとも１つの追加の治療処置、例えば、別の免疫刺激剤、抗がん剤、抗ウイルス剤、またはワクチン（例えば、腫瘍ワクチン）を含んでもよい。一部の実施形態において、併用治療または組成物は、がんの処置のために別の薬剤／薬物と同時投与されるまたは共に製剤化されうる。追加の治療的処置は、例えば化学療法剤、抗新生物剤、抗血管新生剤、異なる抗がん抗体、および／または放射線治療を含みうる。
【０３０９】
本発明の併用治療および組成物を、癌細胞の最終分化を誘導することが知られている薬剤と併用することによって、効果をさらに改善することができる。そのような化合物は、例えば、レチノイン酸、トランスレチノイン酸、シスレチノイン酸、フェニル酪酸塩、神経生長因子、ジメチルスルホキシド、活性型ビタミンＤ３、ペルオキシソーム増殖因子−活性化受容体ガンマ、１２−Ｏ−テトラデカノイルホルボル１３−アセテート、ヘキサメチレン−ビス−アセトアミド、トランスフォーミング増殖因子−ベータ、酪酸、環状ＡＭＰ、およびベスナリノンからなる群から選択されうる。一部の実施形態において、化合物は、レチノイン酸、フェニル酪酸塩、オールトランスレチノイン酸、および活性型ビタミンＤからなる群から選択される。
【０３１０】
本発明の併用治療または組成物と、少なくとも１つの他の薬剤（例えば、化学療法剤、抗新生物剤、または抗血管新生剤）を含む医薬品は、がん治療において同時、個別、または連続的投与のための併用処置として使用することができる。他の薬剤は、問題の特定のがんの処置にとって適した任意の薬剤、例えばアルキル化剤、例えばシスプラチン、カルボプラチン、および／またはオキサリプラチンなどの白金誘導体；植物アルカロイド、例えばパクリタキセル、ドセタキセル、および／またはイリノテカン：抗腫瘍抗生物質、例えばドキソルビシン（アドリアマイシン）、ダウノルビシン、エピルビシン、イダルビシン、ミトキサントロン、ダクチノマイシン、ブレオマイシン、アクチノマイシン、ルテオマイシン、および／またはマイトマイシン；トポテカンなどのトポイソメラーゼ阻害剤；ならびに／または抗代謝剤、例えばフルオロウラシルおよび／または他のフルオロピリミジンからなる群から選択される薬剤でありうる。一部の実施形態において、他の薬剤は、ダカルバジンまたはゲムシタビンである。
【０３１１】
本発明の併用治療または組成物はまた、ワクチン、サイトカイン、酵素阻害剤、免疫刺激化合物、およびＴ細胞治療などの他の抗がん治療と併用して使用してもよい。ワクチンの場合、これは例えば、処置されるがんに関連する１つまたは複数の抗原を含むタンパク質、ペプチド、もしくはＤＮＡワクチン、または抗原と共に樹状細胞を含むワクチンでありうる。適したサイトカインには、例えばＩＬ−２、ＩＦＮ−ガンマ、およびＧＭ−ＣＳＦが挙げられる。抗がん活性を有するタイプの酵素阻害剤の例は、インドールアミン−２，３−ジオキシゲナーゼ（ＩＤＯ）阻害剤、例えば１−メチル−Ｄ−トリプトファン（１−Ｄ−ＭＴ）である。養子Ｔ細胞治療は、自身の腫瘍を認識して攻撃する患者自身のＴ細胞を増加させるまたは操作することを伴う様々な免疫治療技術を指す。
【０３１２】
同様に、本発明の併用治療または組成物は、チロシンキナーゼ阻害剤と共に補助治療において使用されうると企図される。これらは、受容体の細胞内チロシンキナーゼドメインと相互作用し、細胞内Ｍｇ−ＡＴＰ結合部位に関して競合することによってリガンド誘発受容体リン酸化を阻害する、合成の、主にキナゾロン由来の低分子量分子である。
【０３１３】
一部の実施形態において、併用治療または組成物は、Ａ２ＡＲ、ＢＴＬＡ、Ｂ７−Ｈ３、Ｂ７−Ｈ４、ＣＴＬＡ−４、ＣＤ２７、ＣＤ２８、ＣＤ３９、ＣＤ４０、ＣＤ４７、ＣＤ５５、ＣＤ７３、ＣＤ１２２、ＣＤ１３７、ＣＤ１６０、ＣＧＥＮ−１５０４９、ＬＹ１０８、ＣＨＫ１、ＣＨＫ２、ＣＴＬＡ−３、ＣＥＡＣＡＭ（例えば、ＣＥＡＣＡＭ−１および／またはＣＥＡＣＡＭ−５）、ＧＡＬ９、ＧＩＴＲ、ＨＶＥＭ、ＩＣＯＳ、ＩＤＯ、ＫＩＲ、ＬＡＩＲ１、ＮＫＧ２Ａ、ＯＸ４０、ＰＤ−Ｌ１／ＰＤ−Ｌ２、ＬＩＬＲＢ２、ＣＭＴＭ６、ＴＩＧＩＴ、ＴＧＦＲ−ベータ、ＴＮＦＲ２、ＶＩＳＴＡおよび／または２Ｂ４の発現または活性を調節する薬剤を含むがこれらに限定されない、免疫系の活性化を媒介する別の薬剤／薬物と併用して使用することができる。ある特定の実施形態において、薬剤は、上記の分子の１つに結合する抗体またはその抗原結合断片である。特定の実施形態において、本発明の抗体もしくはその抗原結合部分、組成物、または二特異性結合分子は、ＣＴＬＡ−４阻害剤（例えば、抗ＣＴＬＡ−４抗体、例えばトレメリムマブまたはイピリムマブ）と併用して投与されうる。一実施形態では、本発明の抗体またはその抗原結合部分、組成物、または二特異性結合分子は、イピリムマブと併用して投与されうる。同様に、本発明の併用治療または組成物は、サイトカイン（例えば、ＩＬ−１、ＩＬ−２、ＩＬ−１２、ＩＬ−１５、またはＩＬ−２１）、ＥＧＦＲ阻害剤、ＶＥＧＦ阻害剤等と併用して使用されうると企図される。
【０３１４】
ある特定の態様では、本発明の併用治療および組成物は、ＰＤ−１、ＴＩＭ−３、もしくはＬＡＧ−３、またはこれらの標的のいずれかの１つもしくは複数のリガンドを標的としうるＰＤ−１、ＴＩＭ−３、ＬＡＧ−３経路の別の阻害剤と併用して投与されうる。そのような阻害剤の例には、
−  他の抗ＰＤ−１抗体、ならびにＰＤ−１リガンドおよび／または共受容体、例えばＰＤ−Ｌ１もしくはＰＤ−Ｌ２を標的とする抗体（例えば、ペンブロリズマブおよび／またはニボルマブ）；
−  他の抗ＴＩＭ−３抗体、ならびにＴＩＭ−３リガンドおよび／または共受容体、例えばガレクチン−９、ＨＭＧＢ−１、ホスファチジルセリン脂質、ＣＥＡＣＡＭ１、ＬＩＬＲＡ１〜６、もしくはＬＩＬＲＢ１〜５を標的とする抗体（例えば、ＭＧＢ４５３、ＴＳＲ−０２２、および／またはＬＹ３３２１３６７）；ならびに
−  他の抗ＬＡＧ−３抗体、ならびにＬＡＧ−３リガンドおよび／または共受容体、例えばＭＨＣＩＩ、ガレクチン−３、およびＬＳＥＣｔｉｎを標的とする抗体（例えば、ＢＭＳ−９８６０１６、ＧＳＫ２８３１７８１、ＲＥＧＮ３７６７、ＢＡＰ０５０、またはＢＡＰ０５０−ｃｈｉ、またはＬＡＧ５２５）
が挙げられる。
【０３１５】
本発明の併用治療および組成物は、本明細書に記載の処置方法において使用されうる、本明細書に記載の処置において使用するためでありうる、および／または本明細書に記載の処置のための薬剤の製造に使用するためでありうると理解される。本発明はまた、本明細書に記載の本発明の併用治療または組成物を含むキットおよび製品も提供する。
【０３１６】
用量および投与経路
本発明の併用治療および組成物は、問題の状態の処置のために有効量で、すなわち所望の結果を達成するために必要な用量および期間で投与される。治療有効量は、処置される特定の状態、患者の年齢、性別、および体重、ならびに抗体が単独処置として投与されるか、または１つもしくは複数の追加の抗がん処置と併用して投与されるかなどの要因に従って変化しうる。
【０３１７】
投与レジメンは、最適な所望の応答を提供するために調節することができる。例えば、単回ボーラスを投与してもよく、いくつかの分割用量を経時的に投与してもよく、または治療状況の緊急性に応じて用量をそれに比例して低減もしくは増加させてもよい。投与の容易さおよび用量の均一性のために非経口組成物を単位投与剤形に製剤化することは特に有利である。本明細書において使用される単位投与剤形は、それぞれの単位が、必要な薬学的担体に会合して所望の治療効果を生じるように計算された活性化合物の既定量を含む、処置される患者／対象にとって単位用量として適した物理的に個別の単位を指す。本発明の単位投与剤形の仕様は、（ａ）化学療法剤の独自の特徴、および達成される特定の治療効果または予防効果、ならびに（ｂ）個体における感受性の処置のためにそのような活性化合物を合成する当技術分野における固有の限界によって一般的に左右され、直接依存する。
【０３１８】
このため、当業者は、本明細書に提供される開示に基づいて、用量および投与レジメンが、治療の技術分野において周知の方法に従って調節されることを認識するであろう。すなわち、最大忍容量を容易に確立することができ、患者に検出可能な治療恩典を提供する有効量を、患者に検出可能な治療的恩典を提供するためにそれぞれの薬剤を投与するための時間的必要条件と同様に決定することができる。したがって、ある特定の用量および投与レジメンを本明細書において例示するが、これらの例は、本発明を実践するために患者に提供されうる用量および投与レジメンを決して制限しない。
【０３１９】
用量の値は、軽減される状態のタイプおよび重症度によって変化しうること、および単回用量または複数回用量を含みうることに注意すべきである。さらに、任意の特定の対象に関して、特定の用量レジメンを、個々の要求および組成物を投与するまたは投与を管理する人の専門的判断に応じて経時的に調節すべきであること、ならびに本明細書に記載の用量範囲は単なる例に過ぎず、具体化された併用治療の範囲または実践を制限する意図はないと理解すべきである。さらに、本発明の併用治療および組成物による投与レジメンは、疾患のタイプ、患者の年齢、体重、性別、医学的状態、状態の重症度、投与経路、および使用される特定の抗体を含む多様な要因に基づきうる。このため、投与レジメンは広く異なりうるが、標準的な方法を使用して日常的に決定することができる。例えば、毒性作用、および／または臨床検査値などの臨床効果を含みうる薬物動態または薬力学的パラメータに基づいて用量を調節してもよい。このため、本発明は、当業者によって決定される患者内の用量増加を包含する。適切な用量およびレジメンの決定は関連技術分野において周知であり、本明細書において開示される教示が提供されれば、当業者によって包含されると理解されるであろう。
【０３２０】
本発明の併用治療における抗体、または組成物の適した用量は、約０．５〜５０ｍｇ／ｋｇなどの０．１〜１００ｍｇ／ｋｇの範囲、例えば、約１〜２０ｍｇ／ｋｇであると企図される。抗体は、少なくとも０．２５ｍｇ／ｋｇ、例えば少なくとも１ｍｇ／ｋｇなどの少なくとも０．５ｍｇ／ｋｇ、例えば少なくとも２ｍｇ／ｋｇなどの少なくとも１．５ｍｇ／ｋｇ、例えば、少なくとも４ｍｇ／ｋｇなどの少なくとも３ｍｇ／ｋｇ、例えば少なくとも５ｍｇ／ｋｇ；および例えば多くても３０ｍｇ／ｋｇなどの多くても５０ｍｇ／ｋｇ、例えば多くても１５ｍｇ／ｋｇなどの多くても２０ｍｇ／ｋｇの用量で投与されうる。投与は通常、適した間隔で、例えば１週間に１回、２週間毎に１回、３週間毎に１回、または４週間毎に１回、および必要に応じて用量を適宜増加または減少させることができる責任のある医師が適切であると考える期間、繰り返される。
【０３２１】
腫瘍治療の有効量は、患者における、疾患の進行を安定化させるその能力および／または症状を軽減する能力によって、ならびに好ましくは例えば腫瘍サイズを低減させることによる疾患の進行を逆転させる能力によって測定することができる。本発明の併用治療ががんを阻害する能力は、例えば実施例に記載のインビトロアッセイによって、ならびにヒト腫瘍における効能を予測する、適した動物モデルにおいて評価することができる（例えば、実施例を参照されたい）。それぞれの特定の状況、例えば単回ボーラスとしてまたは連続注入として投与される状況において最適な治療応答を提供するために、適した投与レジメンを選択し、それぞれの場合の緊急性に応じて用量の調節が可能である。
【０３２２】
製品およびキット
本発明はまた、１２８１９．１５３８４、１２７４８．１５３８１、１２７４８．１６１２４、１２８６５．１５３７７、１２８９２．１５３７８、１２７９６．１５３７６、１２７７７．１５３８２、１２７６０．１５３７５、および１３１１２．１５３８０からなる群から選択される抗体と、ヒトＰＤ−１に対する結合に関して競合するか、または該抗体と同じヒトＰＤ−１のエピトープに結合する抗ＰＤ−１抗体；ならびに抗ＴＩＭ−３抗体または抗ＬＡＧ−３抗体を含む製品も提供する。
【０３２３】
一部の実施形態において、製品は、
−  本明細書に記載の少なくとも１つの抗ＰＤ−１抗体もしくはその抗原結合部分および本明細書に記載の少なくとも１つの抗ＴＩＭ−３抗体もしくはその抗原結合部分；
−  本明細書に記載の少なくとも１つの抗ＰＤ−１抗体もしくはその抗原結合部分および本明細書に記載の少なくとも１つの抗ＬＡＧ−３抗体もしくはその抗原結合部分；
−  本明細書に記載の少なくとも１つの抗ＴＩＭ−３抗体もしくはその抗原結合部分および本明細書に記載の少なくとも１つの抗ＬＡＧ−３抗体もしくはその抗原結合部分；または
−  本明細書に記載の少なくとも１つの抗ＰＤ−１抗体もしくはその抗原結合部分、本明細書に記載の少なくとも１つの抗ＴＩＭ−３抗体もしくはその抗原結合部分、および本明細書に記載の少なくとも１つの抗ＬＡＧ−３抗体もしくはその抗原結合部分
を含み、ならびに前記製品を製造する方法を含む。
【０３２４】
本発明はまた、１２８１９．１５３８４、１２７４８．１５３８１、１２７４８．１６１２４、１２８６５．１５３７７、１２８９２．１５３７８、１２７９６．１５３７６、１２７７７．１５３８２、１２７６０．１５３７５および１３１１２．１５３８０からなる群から選択される抗体と、ヒトＰＤ−１に対する結合に関して競合するか、または該抗体と同じヒトＰＤ−１のエピトープに結合する抗ＰＤ−１抗体；ならびに抗ＴＩＭ−３抗体または抗ＬＡＧ−３抗体を含むキットも提供する。
【０３２５】
一部の実施形態において、キットは、
−  本明細書に記載の少なくとも１つの抗ＰＤ−１抗体もしくはその抗原結合部分および本明細書に記載の少なくとも１つの抗ＴＩＭ−３抗体もしくはその抗原結合部分；
−  本明細書に記載の少なくとも１つの抗ＰＤ−１抗体もしくはその抗原結合部分および本明細書に記載の少なくとも１つの抗ＬＡＧ−３抗体もしくはその抗原結合部分；
−  本明細書に記載の少なくとも１つの抗ＴＩＭ−３抗体もしくはその抗原結合部分および本明細書に記載の少なくとも１つの抗ＬＡＧ−３抗体もしくはその抗原結合部分；または
−  本明細書に記載の少なくとも１つの抗ＰＤ−１抗体もしくはその抗原結合部分、本明細書に記載の少なくとも１つの抗ＴＩＭ−３抗体もしくはその抗原結合部分、および本明細書に記載の少なくとも１つの抗ＬＡＧ−３抗体もしくはその抗原結合部分
を含む。
【０３２６】
本明細書において特に定義していない限り、本発明に関連して使用される科学技術用語は、当業者に一般的に理解される意味を有する。例示的な方法および材料を以下に記述するが、本明細書に記載の方法および材料と類似または同等の方法および材料も同様に、本発明の実践または試験において使用することができる。矛盾する場合は、定義を含む本明細書が優先する。
【０３２７】
一般的に、本明細書に記載の細胞および組織培養、分子生物学、免疫学、微生物学、遺伝学、分析化学、合成有機化学、医化学および薬化学、ならびにタンパク質および核酸化学、ならびにハイブリダイゼーションに関連して使用される命名法およびそれらの技術は、当技術分野で周知であり、一般的に使用されるものである。酵素反応および精製技術は、当技術分野において一般的に行われるように、または本明細書に記載されるように製造元の仕様書に従って実施される。
【０３２８】
さらに、本文がそれ以外であることを明記している場合を除き、単数形は複数形を含み、複数形は単数形を含む。本明細書および実施形態を通して、用語「有する（ｈａｖｅ）」および「含む（ｃｏｍｐｒｉｓｅ）」、または「有する（ｈａｓ）」、「有する（ｈａｖｉｎｇ）」、「含む（ｃｏｍｐｒｉｓｅｓ）」、もしくは「含む（ｃｏｍｐｒｉｓｉｎｇ）」などのその変化形は、記載された整数または整数の群を含むが、他の任意の整数または整数の群を除外しないことを暗示すると理解される。
【０３２９】
本明細書において言及した刊行物および他の参考文献は全て、全体が参照により本明細書に組み込まれている。多数の文書が本明細書において引用されているが、この引用が、これらの文書のいかなるものも当技術分野における一般的知識の一部を形成すると認めたわけではない。
【０３３０】
本発明がよりよく理解されうるように、以下の実施例を説明する。これらの実施例は、単に説明目的であり、本発明の範囲をいかなるようにも制限しないと解釈すべきである。
【実施例】
【０３３１】
実施例１
一方向性ＭＬＲにおけるＰＤ−１／ＴＩＭ−３標的化の組み合わせによるインビトロ（ｉｎ  ｖｉｔｒｏ）活性の増強
本実施例は、抗ＰＤ−１抗体１２８１９および抗ＴＩＭ−３抗体１５０８６．１７１４５を使用するＰＤ−１およびＴＩＭ−３の標的化の組み合わせが、一方向性混合リンパ球反応（ＮＬＲ）アッセイにおいてＩＦＮ−γ分泌を増強することを証明する。
【０３３２】
一方向性ＭＬＲアッセイにおいて、２人の異なるヒト健康ドナーから単離した樹状細胞（ＤＣ）およびＣＤ４＋Ｔ細胞を同時培養して、アロ抗原特異的反応を誘導し、サイトカイン産生およびＴ細胞活性化／増殖を得た。樹状細胞（ＤＣ）を、２０ｎｇ／ｍｌ顆粒球−マクロファージコロニー刺激因子（ＧＭ−ＣＳＦ）および２０ｎｇ／ｍｌインターロイキン−４（ＩＬ−４）と共に６日間培養することによってＣＤ１４＋単球から分化させ、健康なヒトドナー材料の末梢血単核球細胞（ＰＢＭＣ）から単離したＣＤ１４＋Ｔ細胞と１：１０の比で混合した。表記の抗体または抗体混合物を最終濃度１０μｇ／ｍＬで添加した。抗体混合物は、抗ＰＤ−１および抗ＴＩＭ−３抗体を１：１の比で含んだ。５日間培養後、上清を回収し、ＩＦＮ−γレベルを、Ｍｅｓｏ  Ｓｃａｌｅ電子化学発光サイトカインアッセイを使用して決定した。スチューデントの対応のないｔ−検定を、統計分析のために使用し、ボンフェローニ補正を使用して多重比較を調節した。補正したｐ値＜０．０５は、統計学的に有意であると考えられる。
【０３３３】
図１は、３つの独立したドナーペアの一方向性ＭＬＲアッセイにおけるＩＦＮ−γ分泌に及ぼす抗ＰＤ−１および抗ＴＩＭ−３抗体の効果を示す。抗ＰＤ−１（１２８１９）および抗ＴＩＭ−３（１５０８６）抗体はいずれも一方向性ＭＬＲアッセイにおいて機能的であり、３つ全てのドナーペアにおいてＩＦＮ−γ分泌を増加させた。さらに、抗ＰＤ−１および抗ＴＩＭ−３抗体の組み合わせは、個々の抗体と比較してＩＦＮ−γの統計学的に有意な増加を誘導することによって活性の増強を示す。
【０３３４】
実施例２
二方向性ＭＬＲアッセイにおけるＰＤ−１／ＴＩＭ−３の標的化の組み合わせによるインビトロ活性の増強
本実施例は、抗ＰＤ−１抗体１２８１９および抗ＴＩＭ−３抗体１５０８６．１７１４５を使用するＰＤ−１およびＴＩＭ−３の標的化の組み合わせが、二方向性ＭＬＲアッセイにおいてＩＦＮ−γ分泌を増強することを証明する。
【０３３５】
二方向性ＭＬＲアッセイにおいて、２人の異なる健康なヒトドナーからのＰＢＭＣを同時培養してアロ抗原特異的反応を誘導し、サイトカイン産生およびＴ細胞活性化／増殖をもたらした。２人の異なるドナーからのＰＢＭＣを１：１の比で混合した。抗体を、最終の総抗体濃度１０μｇ／ｍＬで試験した。５日間培養後、上清を回収し、ＩＦＮ−γレベルを、Ｍｅｓｏ  Ｓｃａｌｅ電子化学発光サイトカインアッセイを使用して決定した。スチューデントの対応のないｔ−検定を統計分析のために使用し、ボンフェローニ補正を使用して多重比較を調節した。補正したｐ値＜０．０５は、統計学的に有意であると考えられる。
【０３３６】
図２は、３つの独立したヒトドナーペアの二方向性ＭＬＲアッセイにおけるＩＦＮ−γ分泌に及ぼす抗ＰＤ−１および抗ＴＩＭ−３抗体の効果を示す。抗ＰＤ−１および抗ＴＩＭ−３抗体はいずれも二方向性ＭＬＲアッセイにおいてＩＦＮ−γ分泌を増加させた。加えて、抗ＰＤ−１および抗ＴＩＭ−３抗体の組み合わせは、個々の抗体と比較するとＩＦＮ−γ分泌の増加の誘導によって活性の増強を示した。
【０３３７】
実施例３
抗ＴＩＭ−３抗体は一方向性ＭＬＲアッセイにおいてインビトロでＴ細胞増殖を誘導する
抗ＴＩＭ−３抗体１５０８６．１７１４５が、Ｔ細胞増殖を誘導する能力を、一方向性ＭＬＲアッセイにおいて調べた。抗ＴＩＭ−３抗体、ＰＤ−１に対する陽性対照抗体（１２８１９）、または陰性対照ＩｇＧ２抗体を、最終濃度２５μｇ／ｍＬで添加し、５日間インキュベートした後、１μＣｉ／ウェルの３Ｈ−チミジンをさらに１８時間添加した。細胞を回収し、３Ｈ−チミジン取り込みを、液体シンチレーション計数（ＭｉｃｒｏＢｅｔａ２）によって決定した。
【０３３８】
図３に示すように、抗ＴＩＭ−３抗体１５０８６．１７１４５は、ＣＤ４＋およびＣＤ８＋Ｔ細胞の両方の増殖を、ＰＤ−１に対する陽性対照抗体と類似の程度に誘導した（パネルＡ）。可溶性抗ＣＤ３の添加は、抗ＴＩＭ−３抗体によって誘導される増殖を増強した（パネルＢ）。
【０３３９】
実施例４
抗ＴＩＭ−３抗体は、樹状細胞からのＩＬ−１２ｐ４０分泌を誘導する
単球由来樹状細胞を、実施例１に既に記載したように健康なドナー材料から生成した。樹状細胞を、１０μｇ／ｍＬの抗ＴＩＭ−３抗体１５０８６．１７１４５もしくは陰性対照ＩｇＧ２抗体と共に５日間インキュベートしたか、または処置を行わず、上清中のＩＬ−１２ｐ４０レベルを、標準的なＥＬＩＳＡサイトカインアッセイを使用して決定した。
【０３４０】
図４に示すように、抗ＴＩＭ−３抗体１５０８６．１７１４５によるＴＩＭ−３のライゲーションによって、樹状細胞からのＩＬ−１２ｐ４０分泌の増加がもたらされた。
【０３４１】
実施例５
抗ＴＩＭ−３抗体は樹状細胞における活性化マーカーの発現を誘導する
ＴＩＭ−３を標的とする機能的な役割をさらに調べるために、単球由来樹状細胞における選択された活性化マーカーの発現レベルを、抗ＴＩＭ−３抗体１５０８６．１７１４５による処置後に決定した。
【０３４２】
樹状細胞を、２５μｇ／ｍＬの抗ＴＩＭ−３抗体によって２４時間処置し、共刺激分子の遺伝子発現を、ＮａｎｏＳｔｒｉｎｇ  Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓを使用して決定した。遺伝子発現レベルを、均一な発現を有する３０種のハウスキーピング遺伝子に対して標準化した。選択された関連遺伝子のデータを無処置対照細胞と比較した変化倍率として表す。
【０３４３】
遺伝子発現分析は、ＭＨＣ−ＩＩ（ＨＬＡ−ＤＱＢ１およびＨＬＡ−ＤＱＡ１）、ＣＤ８０およびＣＤ８６を含むいくつかの活性化マーカーおよび共刺激分子のアップレギュレーションを示した（図５、パネルＡ）。抗ＴＩＭ−３抗体１５０８６．１７１４５による処置によるＣＤ８０およびＣＤ８６の細胞表面発現の増加を、ＦＡＣＳ解析を使用して検証した（図５、パネルＢ）。示したヒストグラムオーバーレイは、ＣＤ１１ｃ＋樹状細胞を表し、ヒストグラムの隣の数字はＭＦＩ値を示す。
【０３４４】
実施例６
ヒト肺ＰＤＸ腫瘍増殖に及ぼす抗ＴＩＭ−３抗体１５０８６のインビボ効能
本実施例は、ＣＤ３４＋ヒト化ＮＳＧ−ＳＧＭ３マウスにおけるヒト肺患者由来異種移植片（ＰＤＸ）腫瘍モデルにおける抗ＴＩＭ−３抗体１５０８６．１７１４５のインビボ効能を示す。
【０３４５】
ＮＳＧ−ＳＧＭ３マウスを、臍帯血由来ＣＤ３４＋細胞を使用してヒト化し、患者由来肺腫瘍断片（ＬＧ１３０６）を右脇腹に移植した。腫瘍サイズが５０〜１５０ｍｍ３の間に達すると、マウスを無作為化し、処置を開始した。マウスに、媒体または抗ＴＩＭ−３抗体１５０８６の初回用量１０ｍｇ／ｋｇを腹腔内注射した後、５ｍｇ／ｋｇを５日毎に５回投与した。腫瘍を、キャリパーで週に３回二次元で測定し、ｍｍ３での腫瘍体積を、式：（幅）２×長さ×０．５に従って計算した。灰色の領域は処置期間を示す。ボンフェローニの多重比較を伴う二元配置ＡＮＯＶＡを適用して、腫瘍体積を各時点の処置群の間で比較した。データは、平均値±ＳＥＭとして表し、＊＊ｐ＜０．０１である。
【０３４６】
抗ＴＩＭ−３抗体１５０８６による処置は、ＣＤ３４＋ヒト化ＮＳＧ−ＳＧＭ３マウスヒト肺ＰＤＸモデルにおいて有意な腫瘍増殖阻害をもたらした（図６）。
【０３４７】
実施例７
ＰＢＭＣ＋ＳＥＢアッセイにおけるＰＤ−１／ＬＡＧ−３、ＰＤ−１／ＴＩＭ−３、またはＰＤ−１／ＴＩＭ−３／ＬＡＧ−３標的化の組み合わせの効果の増強
本実施例は、ＰＢＭＣ＋ＳＥＢ（ブドウ球菌エンテロトキシンＢ）アッセイにおける抗ＰＤ−１抗体１２８１９と抗ＬＡＧ−３抗体１５５３２または抗ＴＩＭ−３抗体１５０８６．１７１４５との組み合わせの増強効果を記載する。
【０３４８】
ＳＥＢは、ＭＨＣクラスＩＩ分子、およびＴ細胞受容体（ＴＣＲ）の特異的Ｖβ領域に結合する超抗原であり、Ｔ細胞の非特異的刺激を誘導する。これによってポリクローナルＴ細胞活性化／増殖が起こり、ＩＬ−２を含むサイトカインの放出が起こる。健康なドナーのバフィーコートから単離したヒトＰＢＭＣを、３８４ウェルプレートに播種し、無処置のままとするか、または１０ｎｇ／ｍＬのＳＥＢおよび１０μｇ／ｍＬの表記の単一抗体または抗体混合物によって処置した。抗体の組み合わせは、表記の抗体の１：１または１：１：１混合物であった。３７℃の湿潤インキュベータにおいて４８時間後、上清を採取し、ＩＬ−２  ＥＬＩＳＡキット（Ｌｉｆｅ  Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ）を使用してＩＬ−２レベルに関して分析した。データは、平均値±ＳＥＭとして表す。ボンフェローニの補正を伴うスチューデントのｔ検定を使用して、有意差を調べた。
【０３４９】
図７は、単一の抗ＰＤ−１、抗ＬＡＧ−３または抗ＴＩＭ−３抗体、２つの抗体の混合物、または３つ全ての抗体の混合物による処置後のＩＬ−２分泌の増加を示す。データから、ＩＬ−２レベルが、抗ＰＤ−１、抗ＬＡＧ−３または抗ＴＩＭ−３抗体による単一の処置によって増加するが、ＩＬ−２分泌は、抗ＰＤ−１および抗ＬＡＧ−３抗体、または抗ＰＤ−１および抗ＴＩＭ−３抗体の組み合わせによる処置によってさらに増加することが証明された。抗ＰＤ−１、抗ＬＡＧ−３、および抗ＴＩＭ−３抗体の３つの組み合わせは、２つの抗体の組み合わせのいずれかより多くのＩＬ−２分泌を増加させた。
【０３５０】
実施例８
２つの同系マウス腫瘍モデルにおける抗ＰＤ−１および抗ＬＡＧ−３抗体の組み合わせのインビボ効能の増強
本実施例は、２つの同系マウス腫瘍モデルにおける、抗ＰＤ−１抗体１２８１９と抗ＬＡＧ−３抗体Ｃ９Ｂ７Ｗ（マウスＬＡＧ−３と反応性；ＢｉｏＸｃｅｌｌ）または抗ＬＡＧ−３抗体１５０１１との組み合わせのインビボ効能を証明する。
【０３５１】
０．５ｘ１０６個のＭＣ３８（結腸癌）または５ｘ１０６個のＡＳＢ−ＸＩＶ（肺癌）細胞をそれぞれ、６〜８週齢の雌性ＢＡＬＢ／ｃＡｎＮＲｊ（ＡＳＢ−ＸＩＶ）またはＣ５７ＢＬ／６（ＭＣ３８）マウスの脇腹皮下に接種した。腫瘍を、キャリパーで２つの寸法を週に３回測定し、ｍｍ３での腫瘍体積を、式：（幅）２×長さ×０．５に従って計算した。接種後、平均腫瘍サイズが３０〜５０ｍｍ３である５日目（ＡＳＢ−ＸＩＶ）または１３日目（ＭＣ３８）に、マウスを動物１０匹の４つの群に無作為化し、処置を開始した。マウスを、媒体緩衝液、抗ＰＤ−１抗体１２８１９、抗ＬＡＧ−３抗体Ｃ９Ｂ７Ｗ、抗ＬＡＧ−３抗体１５０１１、または抗ＰＤ−１および抗ＬＡＧ−３抗体の組み合わせの腹腔内注射によって週に３回、全体で６回処置した。抗体処置は、１０ｍｇ／ｋｇ／標的の用量で投与した。ボンフェローニの多重比較検定を伴う二元配置ＡＮＯＶＡを適用して、処置群の間の各時点での腫瘍体積を比較した。統計分析は、ＧｒａｐｈＰａｄ  Ｐｒｉｓｍバージョン５．０（ＧｒａｐｈＰａｄ  Ｓｏｆｔｗａｒｅ，Ｉｎｃ．）を使用して実施した。
【０３５２】
モノクローナル抗ＰＤ−１抗体１２８１９によって処置したＭＣ３８同系腫瘍は、媒体処置腫瘍より増殖速度論が遅いものの、持続的な腫瘍増殖を示した（図８）。抗ＬＡＧ−３抗体Ｃ９Ｂ７Ｗ単独による処置の効果は観察されなかった。抗ＰＤ−１抗体および抗ＬＡＧ−３抗体の組み合わせは、抗ＰＤ−１処置と比較して腫瘍増殖阻害の増強を示し、媒体処置腫瘍と比較して有意な腫瘍増殖阻害を示した（ｐ＜０．００１）（図８）。
【０３５３】
抗ＰＤ−１抗体１２８１９によって処置したＡＳＢ−ＸＩＶ同系腫瘍は、媒体処置腫瘍と比較して遅い腫瘍増殖を示した（図８および９）。抗ＬＡＧ−３抗体Ｃ９Ｂ７Ｗ単独による処置の効果は観察されなかったが（図８）、抗ＬＡＧ−３抗体１５０１１は、媒体処置と比較して腫瘍の増殖を有意に阻害した（ｐ＜０．０５）（図９）。抗ＰＤ−１抗体および抗ＬＡＧ−３抗体Ｃ９Ｂ７Ｗを組み合わせると、媒体処置と比較して抗腫瘍効能を有意に増強した（図８）。腫瘍阻害効果の有意な増強はまた、抗ＰＤ−１抗体（ｐ＜０．０００１）または抗ＬＡＧ−３抗体（ｐ＜０．０５）による単一の処置と比較して、抗ＰＤ−１抗体および抗ＬＡＧ−３抗体１５０１１の組み合わせによって観察された（図９）。
【０３５４】
実施例９
２つの同系マウス腫瘍モデルにおける抗ＰＤ−１および抗ＴＩＭ−３抗体の組み合わせのインビボ効能の増強
本実施例は、２つの同系マウス腫瘍モデルにおける抗ＰＤ−１抗体１２８１９および抗ＴＩＭ−３抗体５Ｄ１２（マウスＴＩＭ−３と反応性；Anderson et al., Science 318:1141-43(2007)）の組み合わせのインビボ効能を証明する。
【０３５５】
０．２×１０６個のＳａ１Ｎ（線維肉腫）または５×１０６個のＡＳＢ−ＸＩＶ（肺癌）細胞をそれぞれ、６〜８週齢の雌性Ａ／Ｊ（Ｓａ１Ｎ）およびＢＡＬＢ／ｃＡｎＮＲｊ（ＡＳＢ−ＸＩＶ）マウスの脇腹に皮下接種した。腫瘍を、キャリパーで２つの寸法を週に３回測定し、ｍｍ３での腫瘍体積を、式：（幅）２×長さ×０．５に従って計算した。平均腫瘍サイズが６０〜１１０ｍｍ３に達すると、マウスを無作為化して処置を開始した。マウスを、媒体緩衝液、抗ＰＤ−１抗体１２８１９、および／または抗ＴＩＭ−３抗体５Ｄ１２の腹腔内注射によって、１回用量（Ｓａ１Ｎ）で処置したか、または週に３回、全体で６回（ＡＳＢ−ＸＩＶ）処置した。抗体処置を、ＡＳＢ−ＸＩＶ腫瘍を有するマウスにおいて１０ｍｇ／ｋｇ／標的の用量で投与した。Ｓａ１Ｎ腫瘍を有するマウスに、抗ＰＤ−１および抗ＴＩＭ−３抗体をそれぞれ、１ｍｇ／ｋｇおよび１０ｍｇ／ｋｇで投与した。ボンフェローニの多重比較検定を伴う二元配置ＡＮＯＶＡを適用して、処置群の間の各時点での腫瘍体積を比較した。統計分析は、ＧｒａｐｈＰａｄ  Ｐｒｉｓｍバージョン５．０（ＧｒａｐｈＰａｄ  Ｓｏｆｔｗａｒｅ，Ｉｎｃ．）を使用して実施した。
【０３５６】
ＡＳＢ−ＸＩＶ腫瘍細胞の接種の６日後、平均腫瘍サイズが５６ｍｍ３に達すると、マウスを動物１０匹の４つの群に無作為化し、処置を開始した。抗ＰＤ−１抗体１２８１９による処置は、腫瘍の増殖を遅らせたが、抗ＴＩＭ−３抗体５Ｄ１２による処置は、媒体処置と比較して腫瘍の増殖に効果を有しなかった。抗ＰＤ−１抗体を抗ＴＩＭ−３抗体と組み合わせることによって、いずれかの抗体による単一の処置と比較して顕著な腫瘍阻害効果が認められた（ｐ＜０．００１）（図１０）。
【０３５７】
Ｓａ１Ｎ腫瘍細胞の接種の１３日後、平均腫瘍サイズ１１０ｍｍ３で、マウスを動物１０匹の４つの群に無作為化し、抗体の単一の処置を行った。結果は、抗ＰＤ−１抗体１２８１９または抗ＴＩＭ−３抗体５Ｄ１２による単一の抗体処置によって、最初の腫瘍増殖の遅れを示した。抗腫瘍効果の増強は、単一の抗体処置と比較して抗ＰＤ−１抗体を抗ＴＩＭ−３抗体と組み合わせることによって観察された。組み合わせ処置はまた、媒体処置と比較して腫瘍増殖を有意に阻害した（ｐ＜０．０００１）（図１０）。
【０３５８】
実施例１０
ヒト異種移植片腫瘍モデルにおける抗ＰＤ−１および抗ＴＩＭ−３抗体の組み合わせのインビボ効能
本実施例は、ヒトＰＢＭＣによって再構成したマウスにＡ３７５細胞（ヒト黒色腫）を移植したヒト異種移植片腫瘍モデルにおける、抗ＰＤ−１抗体１２８１９と抗ＴＩＭ−３抗体１５０８６．１７１４５との組み合わせのインビボ効能の増強を証明する。
【０３５９】
ヒトＰＢＭＣを、ＮＯＧ（ドナー１およびドナー２）またはＮＯＧ−ＥＸＬ（ｈＧＭ−ＣＳＦ／ｈＩＬ−３−ＮＯＧ）（ドナー３）マウスに腹腔内注射した１日後、ヒトＡ３７５黒色腫細胞を皮下に移植した。ＰＢＭＣの注射日に処置を開始し、マウスを、媒体緩衝液、抗ＰＤ−１抗体１２８１９、抗ＴＩＭ−３抗体１５０８６．１７１４５、または抗ＰＤ−１および抗ＴＩＭ−３抗体の組み合わせの腹腔内注射によって週に３回、全体で６回処置した。抗体処置は、１０ｍｇ／ｋｇ／標的の用量で投与した。腫瘍を、キャリパーで週に３回二次元で測定し、ｍｍ３での腫瘍体積を、式：（幅）２×長さ×０．５に従って計算した。ボンフェローニの多重比較を伴う二元配置ＡＮＯＶＡを適用して、腫瘍体積を各時点の処置群の間で比較した。統計分析は、ＧｒａｐｈＰａｄ  Ｐｒｉｓｍバージョン５．０（ＧｒａｐｈＰａｄ  Ｓｏｆｔｗａｒｅ，Ｉｎｃ．）を使用して実施した。
【０３６０】
図１１に示すように、抗ＰＤ−１および抗ＴＩＭ−３抗体の組み合わせによる処置は、有意な（および少なくともドナー３では相乗的な）腫瘍増殖の遅れ（ｐ＜０．０５およびｐ＜０．０１）をもたらしたが、単一の抗体処置（抗ＰＤ−１または抗ＴＩＭ−３）は、媒体処置群と比較して腫瘍増殖に対して限定的な効果を示した。
【０３６１】
実施例１１
ＰＤ−１とＴＩＭ−３標的化の組み合わせは、ヒト免疫細胞および腫瘍細胞を同時移植したマウスにおいて生存の増加をもたらす
本実施例は、マウスヒト腫瘍モデルにおける抗ＰＤ−１抗体１２８１９を抗ＴＩＭ−３抗体１５０８６．１７１４５との組み合わせのインビボ効能を証明する。
【０３６２】
２×１０６個のＡ３７５（黒色腫）細胞を２×１０６個のヒトＰＢＭＣと混合し、６〜８週齢の雌性ＮＯＤ−ｓｃｉｄマウスの脇腹に皮下接種した。細胞接種時に、処置を開始した。マウスを、媒体緩衝液、抗ＰＤ−１抗体１２８１９、抗ＴＩＭ−３抗体１５０８６．１７１４５、または抗ＰＤ−１および抗ＴＩＭ−３の組み合わせの腹腔内注射によって週に３回、全体で６回処置した。抗体処置を、各抗体に関して１０ｍｇ／ｋｇの用量で投与した。腫瘍を、キャリパーで週に３回二次元で測定し、ｍｍ３での腫瘍体積を、式：（幅）２×長さ×０．５に従って計算した。
【０３６３】
生存は、腫瘍サイズ＜４００ｍｍ３を有するとして定義した。結果は、いずれかの単一抗体処置と比較して抗ＰＤ−１および抗ＴＩＭ−３抗体の二つの組み合わせによって処置したマウスにおいて生存の増加を示した（図１２、パネルＡ〜Ｅ）。
【０３６４】
実施例１２
ＰＤ−１、ＬＡＧ−３、およびＴＩＭ−３標的化の組み合わせは、同系マウス腫瘍モデルにおいて生存の増加をもたらす
本実施例は、同系マウス腫瘍モデルにおいて、抗ＰＤ−１抗体１２８１９と抗ＬＡＧ−３抗体Ｃ９Ｂ７Ｗおよび抗ＴＩＭ−３抗体５Ｄ１２との組み合わせのインビボ効能を証明する。
【０３６５】
５×１０６個のＡＳＢ−ＸＩＶ（肺癌）細胞を、６〜８週齢の雌性ＢＡＬＢ／ｃＡｎＮＲｊマウスの脇腹に皮下接種した。腫瘍を、キャリパーで週に３回二次元で測定し、ｍｍ３での腫瘍体積を、式：（幅）２×長さ×０．５に従って計算した。接種の５日後、平均腫瘍サイズが５０ｍｍ３に達した場合に、マウスを動物１０匹の７つの群に無作為化し、処置を開始した。マウスを、媒体緩衝液、抗ＰＤ−１抗体１２８１９、抗ＬＡＧ−３抗体Ｃ９Ｂ７Ｗ、抗ＴＩＭ−３抗体５Ｄ１２、または抗ＰＤ−１および抗ＬＡＧ−３の組み合わせ、抗ＰＤ−１および抗ＴＩＭ−３の組み合わせ、または抗ＰＤ−１、抗ＬＡＧ−３、および抗ＴＩＭ−３抗体の組み合わせの腹腔内注射によって週に３回、全体で６回処置した。抗体処置は、各抗体に関して１０ｍｇ／ｋｇの用量で投与した。
【０３６６】
生存は、腫瘍サイズ＜４００ｍｍ３を有するとして定義した。結果は、いずれかの単一または二つの抗体処置と比較して、抗ＰＤ−１、抗ＴＩＭ−３、および抗ＴＩＭ−３抗体の三つの組み合わせによって処置したマウスの生存の増加を示した（図１３、パネルＡ〜Ｈ））。
【０３６７】
表１：抗体配列の識別子
【表１】
2020513009.tif 000002
【０３６８】
表２：定常領域配列
【表２−１】
2020513009.tif 000003
【表２−２】
2020513009.tif 000004
【表２−３】
2020513009.tif 000005
【表２−４】
2020513009.tif 000006
【表２−５】
2020513009.tif 000007
【０３６９】
表3: 標的タンパク質配列
【表３】
2020513009.tif 000008
【０３７０】
表4: 抗TIM-3抗体の重鎖および軽鎖可変ドメインヌクレオチド配列
【表４−１】
2020513009.tif 000009
【表４−２】
2020513009.tif 000010
【表４−３】
2020513009.tif 000011
【表４−４】
2020513009.tif 000012
【表４−５】
2020513009.tif 000013
【表４−６】
2020513009.tif 000014
【０３７１】
表5: 抗TIM-3抗体の重鎖および軽鎖可変ドメインアミノ酸配列
(CDRを太字および斜体で示す)
【表５−１】
2020513009.tif 000015
【表５−２】
2020513009.tif 000016
【表５−３】
2020513009.tif 000017
【０３７２】
表6: 抗PD-1抗体の重鎖および軽鎖可変ドメインヌクレオチド配列
【表６−１】
2020513009.tif 000018
【表６−２】
2020513009.tif 000019
【表６−３】
2020513009.tif 000020
【０３７３】
表7: 抗PD-1抗体の重鎖および軽鎖可変ドメインアミノ酸配列
(CDRを太字および斜体で示す)
【表７】
2020513009.tif 000021
【０３７４】
表8: 抗LAG-3抗体の重鎖および軽鎖可変ドメインヌクレオチド配列
【表８−１】
2020513009.tif 000022
【表８−２】
2020513009.tif 000023
【０３７５】
表9: 抗LAG-3抗体の重鎖および軽鎖可変ドメインアミノ酸配列
(CDRを太字および斜体で示す)
【表９】
2020513009.tif 000024
【図１−１】
2020513009.tif 000025
【図１−２】
2020513009.tif 000026
【図２−１】
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【図２−２】
2020513009.tif 000028
【図３】
2020513009.tif 000029
【図４】
2020513009.tif 000030
【図５−１】
2020513009.tif 000031
【図５−２】
2020513009.tif 000032
【図６】
2020513009.tif 000033
【図７】
2020513009.tif 000034
【図８】
2020513009.tif 000035
【図９】
2020513009.tif 000036
【図１０】
2020513009.tif 000037
【図１１】
2020513009.tif 000038
【図１２−１】
2020513009.tif 000039
【図１２−２】
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【図１３−１】
2020513009.tif 000041
【図１３−２】
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【図１３−３】
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【配列表】
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【国際調査報告】
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2020513009.tif 000045
2020513009.tif 000046
2020513009.tif 000047
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