(57)【要約】  グリカンポリマーの組成物ならびにその作製方法および製造方法は、本明細書に記載されている。グリカンポリマー調製物を用いて疾患または障害を処置する方法もまた提供される。
2020513410.tif 000002
【特許請求の範囲】
【請求項１】
望ましくないレベルの代謝産物（例えば、短鎖脂肪酸（ＳＣＦＡ）（例えば、プロピオネートまたはブチレート）、アンモニア、トリメチルアミン（ＴＭＡ）、トリメチルアミンＮ−オキシド（ＴＭＡＯ）、尿毒症性溶質（例えば、ｐ−クレゾールまたはインドール）、リポ多糖類（ＬＰＳ）、または胆汁酸（例えば、二次胆汁酸））に関連する疾患または障害を有する対象を処置する方法であって、
任意選択により、グリカンポリマー調製物を、それが前記代謝産物の産生またはレベルを調節することに基づいて、選択する工程、および
前記代謝産物のレベルの調節をもたらすのに有効な量の前記グリカンポリマー調製物を投与し、それによって前記疾患または障害を処置する工程
を含む方法。
【請求項２】
望ましくないレベルの代謝産物（例えば、短鎖脂肪酸（ＳＣＦＡ）（例えば、プロピオネートまたはブチレート）、アンモニア、トリメチルアミン（ＴＭＡ）、トリメチルアミンＮ−オキシド（ＴＭＡＯ）、尿毒症性溶質（例えば、ｐ−クレゾールまたはインドール）、リポ多糖類（ＬＰＳ）、または胆汁酸（例えば、二次胆汁酸））に関連する疾患または障害を有する対象を処置する方法であって、
任意選択により、グリカンポリマー調製物が前記代謝産物の産生またはレベルを調節するという知見を取得する工程、および
前記代謝産物のレベルの調節をもたらすのに有効な量の前記グリカンポリマー調製物を投与し、それによって前記疾患または障害を処置する工程
を含む方法。
【請求項３】
前記グリカンポリマー調製物が前記代謝産物の産生またはレベルを調節するという根拠または知見に応じて、前記グリカンポリマー調製物を投与する、請求項１または２のいずれかに記載の方法。
【請求項３】
前記グリカンポリマー調製物の前記グリカンポリマー、または少なくとも２０、３０、４０、５０、６０、７０、８０、９０、９５、もしくは９９％（重量または数による）の前記グリカンポリマーが、表１に列挙された特性の１つ以上（例えば、２、３、４、５、または６つ）有し、任意選択により、
ａ．グルコース、マンノースもしくはガラクトースサブユニット、またはそれらの組み合わせ、および少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含むグリカンポリマー、
ｂ．グルコース、マンノースもしくはガラクトースサブユニット、またはそれらの組み合わせ、および少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含むグリカンポリマー、
ｃ．キシロース、アラビノース、フコースもしくはラムノースサブユニット、またはそれらの組み合わせ、および少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含むグリカンポリマー、
ｄ．キシロース、アラビノース、フコースもしくはラムノースサブユニット、またはそれらの組み合わせ、および少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含むグリカンポリマー、
ｅ．グルコースもしくはガラクトースサブユニット、またはそれらの組み合わせ、および少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含むグリカンポリマー、または
ｆ．グルコースもしくはガラクトースサブユニット、またはそれらの組み合わせ、および少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含むグリカンポリマー
から選択される、請求項１〜３のいずれかに記載の方法。
【請求項４】
前記グリカンポリマーおよび／またはグリカンポリマー調製物が、以下の特徴：
ｉ．前記グリカンポリマーが、グルコースおよび少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含み、任意選択により、前記アルファ−グリコシド結合がアルファ−１，３グリコシド結合、アルファ−１，４グリコシド結合、またはそれらの組み合わせであり、さらに任意選択により、前記調製物の平均重合度（ＤＰ）がＤＰ２〜４、ＤＰ２〜６、ＤＰ３〜１０、またはＤＰ３〜１５である；
ｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含み、任意選択により、前記ベータ−グリコシド結合が、ベータ−１，３グリコシド結合、ベータ−１，４グリコシド結合、またはそれらの組み合わせである；
ｉｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、ガラクトースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇｌｕ−ｇａｌ調製物）；
ｉｖ．前記グリカンポリマー調製物が、マンノースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇｌｕ−ｍａｎ調製物）；および
ｖ．前記グリカンポリマー調製物が、ガラクトースおよびマンノースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇｌｕ−ｇａｌ−ｍａｎ調製物）；
のうちの１つ、２つ、３つ、またはそれを超える、例えば全てを含む、請求項１〜３Ａのいずれか一項に記載の方法。
【請求項５】
前記グリカンポリマーおよび／またはグリカンポリマー調製物が、以下の特徴：
ｉ．前記グリカンポリマーが、グルコースおよび少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含み、任意選択により、前記ベータ−グリコシド結合がベータ−１，３グリコシド結合、ベータ−１，４グリコシド結合、またはそれらの組み合わせであり、さらに任意選択により、前記調製物の平均重合度（ＤＰ）がＤＰ２〜４、ＤＰ２〜６、ＤＰ３〜１０、またはＤＰ３〜１５である；
ｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含み、任意選択により、前記アルファ−グリコシド結合が、アルファ−１，３グリコシド結合、アルファ−１，４グリコシド結合またはそれらの組み合わせである；
ｉｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、ガラクトースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇｌｕ−ｇａｌ調製物）；
ｉｖ．前記グリカンポリマー調製物が、マンノースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇｌｕ−ｍａｎ調製物）；および
ｖ．前記グリカンポリマー調製物が、ガラクトースおよびマンノースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇｌｕ−ｇａｌ−ｍａｎ調製物）；
のうちの１つ、２つ、３つ、またはそれを超える、例えば全てを含む、請求項１〜３Ａのいずれか一項に記載の方法。
【請求項６】
前記グリカンポリマーおよび／またはグリカンポリマー調製物が、以下の特徴：
ｉ．前記グリカンポリマーが、ガラクトースおよび少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含み、任意選択により、前記アルファ−グリコシド結合がアルファ−１，３グリコシド結合、アルファ−１，４グリコシド結合、またはそれらの組み合わせであり、さらに任意選択により、前記調製物の平均重合度（ＤＰ）がＤＰ２〜４、ＤＰ２〜６、ＤＰ３〜１０、またはＤＰ３〜１５である；
ｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含み、任意選択により、前記ベータ−グリコシド結合が、ベータ−１，３グリコシド結合、ベータ−１，４グリコシド結合、またはそれらの組み合わせである；
ｉｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、グルコースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇａｌ−ｇｌｕ調製物）；
ｉｖ．前記グリカンポリマー調製物が、マンノースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇａｌ−ｍａｎ調製物）；および
ｖ．前記グリカンポリマー調製物が、グルコースおよびマンノースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇａｌ−ｍａｎ−ｇｌｕ調製物）；
のうちの１つ、２つ、３つ、またはそれを超える、例えば全てを含む、請求項１〜３Ａのいずれか一項に記載の方法。
【請求項７】
前記グリカンポリマーおよび／またはグリカンポリマー調製物が、以下の特徴：
ｉ．前記グリカンポリマーが、ガラクトースおよび少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含み、任意選択により、前記ベータ−グリコシド結合がベータ−１，３グリコシド結合、ベータ−１，４グリコシド結合、またはそれらの組み合わせであり、さらに任意選択により、前記調製物の平均重合度（ＤＰ）がＤＰ２〜４、ＤＰ２〜６、ＤＰ３〜１０、またはＤＰ３〜１５である；
ｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含み、任意選択により、前記アルファ−グリコシド結合が、アルファ−１，３グリコシド結合、アルファ−１，４グリコシド結合またはそれらの組み合わせである；
ｉｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、グルコースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇａｌ−ｇｌｕ調製物）；
ｉｖ．前記グリカンポリマー調製物が、マンノースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇａｌ−ｍａｎ調製物）；および
ｖ．前記グリカンポリマー調製物が、グルコースおよびマンノースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇａｌ−ｇｌｕ−ｍａｎ調製物）；
のうちの１つ、２つ、３つ、またはそれを超える、例えば全てを含む、請求項１〜３Ａのいずれか一項に記載の方法。
【請求項８】
前記グリカンポリマーおよび／またはグリカンポリマー調製物が、以下の特徴：
ｉ．前記グリカンポリマーが、マンノースおよび少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含み、任意選択により、前記アルファ−グリコシド結合がアルファ−１，３グリコシド結合、アルファ−１，４グリコシド結合、またはそれらの組み合わせであり、さらに任意選択により、前記調製物の平均重合度（ＤＰ）がＤＰ２〜４、ＤＰ２〜６、ＤＰ３〜１０、またはＤＰ３〜１５である；
ｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含み、任意選択により、前記ベータ−グリコシド結合が、ベータ−１，３グリコシド結合、ベータ−１，４グリコシド結合、またはそれらの組み合わせである；
ｉｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、ガラクトースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｍａｎ−ｇａｌ調製物）；
ｉｖ．前記グリカンポリマー調製物が、グルコースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｍａｎ−ｇｌｕ調製物）；および
ｖ．前記グリカンポリマー調製物が、ガラクトースおよびグルコースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｍａｎ−ｇａｌ−ｇｌｕ調製物）
のうちの１つ、２つ、３つ、またはそれを超える、例えば全てを含む、請求項１〜３Ａのいずれか一項に記載の方法。
【請求項９】
前記グリカンポリマーおよび／またはグリカンポリマー調製物が、以下の特徴：
ｉ．前記グリカンポリマーが、マンノースおよび少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含み、任意選択により、前記ベータ−グリコシド結合がベータ−１，３グリコシド結合、ベータ−１，４グリコシド結合、またはそれらの組み合わせであり、さらに任意選択により、前記調製物の平均重合度（ＤＰ）がＤＰ２〜４、ＤＰ２〜６、ＤＰ３〜１０、またはＤＰ３〜１５である；
ｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含み、任意選択により、前記アルファ−グリコシド結合が、アルファ−１，３グリコシド結合、アルファ−１，４グリコシド結合またはそれらの組み合わせである；
ｉｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、ガラクトースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｍａｎ−ｇａｌ調製物）；
ｉｖ．前記グリカンポリマー調製物が、グルコースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｍａｎ−ｇｌｕ調製物）；および
ｖ．前記グリカンポリマー調製物が、ガラクトースおよびグルコースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｍａｎ−ｇａｌ−ｇｌｕ調製物）
のうちの１つ、２つ、３つ、またはそれを超える、例えば全てを含む、請求項１〜３Ａのいずれか一項に記載の方法。
【請求項１０】
前記グリカンポリマーおよび／またはグリカンポリマー調製物が、以下の特徴：
ｉ．前記グリカンポリマーが、ガラクトースおよび少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含み、任意選択により、前記アルファ−グリコシド結合がアルファ−１，３グリコシド結合、アルファ−１，４グリコシド結合、またはそれらの組み合わせであり、さらに任意選択により、前記調製物の平均重合度（ＤＰ）がＤＰ２〜４、ＤＰ２〜６、ＤＰ３〜１０、またはＤＰ３〜１５である；
ｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、アルファ−１，２グリコシド結合、アルファ−１，６グリコシド結合、またはそれらの組み合わせを含むグリカンポリマーをさらに含む；
ｉｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含み、任意選択により、前記ベータ−グリコシド結合が、ベータ−１，３グリコシド結合、ベータ−１，４グリコシド結合、ベータ−１，６グリコシド結合、またはそれらの組み合わせである；
ｉｖ．前記グリカンポリマー調製物が、フコースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇａｌ−ｆｕｃ調製物）；
ｖ．前記グリカンポリマー調製物が、マンノースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇａｌ−ｍａｎ調製物）；および
ｖｉ．前記グリカンポリマー調製物が、フコースおよびマンノースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇａｌ−ｆｕｃ−ｍａｎ調製物）；
のうちの１つ、２つ、３つ、またはそれを超える、例えば全てを含む、請求項１〜３Ａのいずれか一項に記載の方法。
【請求項１１】
前記グリカンポリマーおよび／またはグリカンポリマー調製物が、以下の特徴：
ｉ．前記グリカンポリマーが、ガラクトースおよび少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含み、任意選択により、前記ベータ−グリコシド結合がベータ−１，３グリコシド結合、ベータ−１，４グリコシド結合、またはそれらの組み合わせであり、さらに任意選択により、前記調製物の平均重合度（ＤＰ）がＤＰ２〜４、ＤＰ２〜６、ＤＰ３〜１０、またはＤＰ３〜１５である；
ｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、ベータ−１，６グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含む；
ｉｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含み、任意選択により、前記アルファ−グリコシド結合が、アルファ−１，２グリコシド結合、アルファ−１，３グリコシド結合、アルファ−１，４グリコシド結合、アルファ−１，６−グリコシド結合またはそれらの組み合わせである；
ｉｖ．前記グリカンポリマー調製物が、フコースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇａｌ−ｆｕｃ調製物）；
ｖ．前記グリカンポリマー調製物が、マンノースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇａｌ−ｍａｎ調製物）；および
ｖｉ．前記グリカンポリマー調製物が、フコースおよびマンノースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇａｌ−ｆｕｃ−ｍａｎ調製物）；
のうちの１つ、２つ、３つ、またはそれを超える、例えば全てを含む、請求項１〜３Ａのいずれか一項に記載の方法。
【請求項１２】
前記グリカンポリマーおよび／またはグリカンポリマー調製物が、以下の特徴：
ｉ．前記グリカンポリマーが、フコースおよび少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含み、任意選択により、前記アルファ−グリコシド結合がアルファ−１，３グリコシド結合、アルファ−１，４グリコシド結合、またはそれらの組み合わせであり、さらに任意選択により、前記調製物の平均重合度（ＤＰ）がＤＰ２〜４、ＤＰ２〜６、ＤＰ３〜１０、またはＤＰ３〜１５である；
ｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、アルファ−１，２グリコシド結合、アルファ−１，６グリコシド結合、またはそれらの組み合わせを含むグリカンポリマーをさらに含む；
ｉｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含み、任意選択により、前記ベータ−グリコシド結合が、ベータ−１，３グリコシド結合、ベータ−１，４グリコシド結合、ベータ−１，６グリコシド結合、またはそれらの組み合わせである；
ｉｖ．前記グリカンポリマー調製物が、ガラクトースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｆｕｃ−ｇａｌ調製物）；
ｖ．前記グリカンポリマー調製物が、マンノースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｆｕｃ−ｍａｎ調製物）；および
ｖｉ．前記グリカンポリマー調製物が、ガラクトースおよびマンノースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｆｕｃ−ｇａｌ−ｍａｎ調製物）
のうちの１つ、２つ、３つ、またはそれを超える、例えば全てを含む、請求項１〜３Ａのいずれか一項に記載の方法。
【請求項１３】
前記グリカンポリマーおよび／またはグリカンポリマー調製物が、以下の特徴：
ｉ．前記グリカンポリマーが、フコースおよび少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含み、任意選択により、前記ベータ−グリコシド結合がベータ−１，３グリコシド結合、ベータ−１，４グリコシド結合、またはそれらの組み合わせであり、さらに任意選択により、前記調製物の平均重合度（ＤＰ）がＤＰ２〜４、ＤＰ２〜６、ＤＰ３〜１０、またはＤＰ３〜１である；
ｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、ベータ−１，６グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含む；
ｉｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含み、任意選択により、前記アルファ−グリコシド結合が、アルファ−１，２グリコシド結合、アルファ−１，３グリコシド結合、アルファ−１，４グリコシド結合、アルファ−１，６−グリコシド結合またはそれらの組み合わせである；
ｉｖ．前記グリカンポリマー調製物が、ガラクトースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｆｕｃ−ｇａｌ調製物）；
ｖ．前記グリカンポリマー調製物が、マンノースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｆｕｃ−ｍａｎ調製物）；および
ｖｉ．前記グリカンポリマー調製物が、ガラクトースおよびマンノースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｆｕｃ−ｇａｌ−ｍａｎ調製物）
のうちの１つ、２つ、３つ、またはそれを超える、例えば全てを含む、請求項１〜３Ａのいずれか一項に記載の方法。
【請求項１４】
前記グリカンポリマーおよび／またはグリカンポリマー調製物が、以下の特徴：
ｉ．前記グリカンポリマーが、マンノースおよび少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含み、任意選択により、前記アルファ−グリコシド結合がアルファ−１，３グリコシド結合、アルファ−１，４グリコシド結合、またはそれらの組み合わせであり、さらに任意選択により、前記調製物の平均重合度（ＤＰ）がＤＰ２〜４、ＤＰ２〜６、ＤＰ３〜１０、またはＤＰ３〜１５である；
ｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、アルファ−１，２グリコシド結合、アルファ−１，６グリコシド結合、またはそれらの組み合わせを含むグリカンポリマーをさらに含む；
ｉｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含み、任意選択により、前記ベータ−グリコシド結合が、ベータ−１，３グリコシド結合、ベータ−１，４グリコシド結合、ベータ−１，６グリコシド結合、またはそれらの組み合わせである；
ｉｖ．前記グリカンポリマー調製物が、フコースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｍａｎ−ｆｕｃ調製物）；
ｖ．前記グリカンポリマー調製物が、ガラクトースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｍａｎ−ｇａｌ調製物）；および
ｖｉ．前記グリカンポリマー調製物が、ガラクトースおよびフコースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｍａｎ−ｇａｌ−ｆｕｃ調製物）
のうちの１つ、２つ、３つ、またはそれを超える、例えば全てを含む、請求項１〜３Ａのいずれか一項に記載の方法。
【請求項１５】
前記グリカンポリマーおよび／またはグリカンポリマー調製物が、以下の特徴：
ｉ．前記グリカンポリマーが、マンノースおよび少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含み、任意選択により、前記ベータ−グリコシド結合がベータ−１，３グリコシド結合、ベータ−１，４グリコシド結合、またはそれらの組み合わせであり、さらに任意選択により、前記調製物の平均重合度（ＤＰ）がＤＰ２〜４、ＤＰ２〜６、ＤＰ３〜１０、またはＤＰ３〜１５である；
ｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、ベータ−１，６グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含む；
ｉｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含み、任意選択により、前記アルファ−グリコシド結合が、アルファ−１，２グリコシド結合、アルファ−１，３グリコシド結合、アルファ−１，４グリコシド結合、アルファ−１，６−グリコシド結合またはそれらの組み合わせである；
ｉｖ．前記グリカンポリマー調製物が、フコースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｍａｎ−ｆｕｃ調製物）；
ｖ．前記グリカンポリマー調製物が、ガラクトースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｍａｎ−ｇａｌ調製物）；および
ｖｉ．前記グリカンポリマー調製物が、ガラクトースおよびフコースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｍａｎ−ｇａｌ−ｆｕｃ調製物）
のうちの１つ、２つ、３つ、またはそれを超える、例えば全てを含む、請求項１〜３Ａのいずれか一項に記載の方法。
【請求項１６】
前記グリカンポリマーおよび／またはグリカンポリマー調製物が、以下の特徴：
ｉ．前記グリカンポリマーが、グルコース、キシロースおよびアラビノースのうちの１つ、２つ、または３つ、ならびに少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含み、任意選択により、前記アルファ−グリコシド結合がアルファ−１，３グリコシド結合、アルファ−１，４グリコシド結合、またはそれらの組み合わせであり、さらに任意選択により、前記調製物の平均重合度（ＤＰ）がＤＰ２〜４、ＤＰ２〜６、ＤＰ３〜１０、またはＤＰ３〜１５である；
ｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、アルファ−１，２グリコシド結合、アルファ−１，６グリコシド結合、またはそれらの組み合わせを含むグリカンポリマーをさらに含む；
ｉｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含み、任意選択により、前記ベータ−グリコシド結合が、ベータ−１，３グリコシド結合、ベータ−１，４グリコシド結合、ベータ−１，６グリコシド結合、またはそれらの組み合わせである；
ｉｖ．前記グリカンポリマー調製物が、グルコースを含むグリカンポリマーを含む；
ｖ．前記グリカンポリマー調製物が、キシロースを含むグリカンポリマーを含む、および
ｖｉ．前記グリカンポリマー調製物が、アラビノースを含むグリカンポリマーを含む
のうちの１つ、２つ、３つ、またはそれを超える、例えば全てを含む、請求項１〜３Ａのいずれか一項に記載の方法。
【請求項１７】
前記グリカンポリマーおよび／またはグリカンポリマー調製物が、以下の特徴：
ｉ．前記グリカンポリマーが、グルコース、キシロースおよびアラビノースのうちの１つ、２つ、または３つ、ならびに少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含み、任意選択により、前記ベータ−グリコシド結合がベータ−１，３グリコシド結合、ベータ−１，４グリコシド結合、またはそれらの組み合わせであり、さらに任意選択により、前記調製物の平均重合度（ＤＰ）がＤＰ２〜４、ＤＰ２〜６、ＤＰ３〜１０、またはＤＰ３〜１５である；
ｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、ベータ−１，６グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含む；
ｉｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含み、任意選択により、前記アルファ−グリコシド結合が、アルファ−１，２グリコシド結合、アルファ−１，３グリコシド結合、アルファ−１，４グリコシド結合、アルファ−１，６−グリコシド結合またはそれらの組み合わせである；
ｉｖ．前記グリカンポリマー調製物が、グルコースを含むグリカンポリマーを含む；
ｖ．前記グリカンポリマー調製物が、キシロースを含むグリカンポリマーを含む、および
ｖｉ．前記グリカンポリマー調製物が、アラビノースを含むグリカンポリマーを含む
のうちの１つ、２つ、３つ、またはそれを超える、例えば全てを含む、請求項１〜３Ａのいずれか一項に記載の方法。
【請求項１８】
前記グリカンポリマーおよび／またはグリカンポリマー調製物が、以下の特徴：
ｉ．前記グリカンポリマーが、グルコースおよび少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含み、任意選択により、前記アルファ−グリコシド結合がアルファ−１，３グリコシド結合であり、さらに任意選択により、前記調製物の平均重合度（ＤＰ）がＤＰ２〜４、ＤＰ２〜６、ＤＰ３〜１０、またはＤＰ３〜１５である；
ｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、アルファ−１，２グリコシド結合、アルファ−１，４グリコシド結合、アルファ−１，６グリコシド結合、またはそれらの組み合わせを含むグリカンポリマーをさらに含む；
ｉｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含む；
ｉｖ．前記グリカンポリマー調製物が、ガラクトースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇｌｕ−ｇａｌ調製物）；
ｖ．前記グリカンポリマー調製物が、アラビノースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇｌｕ−ａｒａ調製物）；
ｖｉ．前記グリカンポリマー調製物が、キシロースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇｌｕ−ｘｙｌ調製物）；および
ｖｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、ガラクトース、アラビノース、およびキシロースのうちの２つまたは３つを含むグリカンポリマーをさらに含む
のうちの１つ、２つ、３つ、またはそれを超える、例えば全てを含む、請求項１〜３Ａのいずれか一項に記載の方法。
【請求項１９】
前記グリカンポリマーおよび／またはグリカンポリマー調製物が、以下の特徴：
ｉ．前記グリカンポリマーが、ガラクトースおよび少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含み、任意選択により、前記アルファ−グリコシド結合がアルファ−１，３グリコシド結合であり、さらに任意選択により、前記調製物の平均重合度（ＤＰ）がＤＰ２〜４、ＤＰ２〜６、ＤＰ３〜１０、またはＤＰ３〜１５である；
ｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、アルファ−１，２グリコシド結合、アルファ−１，４グリコシド結合、アルファ−１，６グリコシド結合、またはそれらの組み合わせを含むグリカンポリマーをさらに含む；
ｉｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含む；
ｉｖ．前記グリカンポリマー調製物が、グルコースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇａｌ−ｇｌｕ調製物）；
ｖ．前記グリカンポリマー調製物が、アラビノースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇａｌ−ａｒａ調製物）；
ｖｉ．前記グリカンポリマー調製物が、キシロースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇａｌ−ｘｙｌ調製物）；および
ｖｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、グルコース、アラビノース、およびキシロースのうちの２つまたは３つを含むグリカンポリマーをさらに含む
のうちの１つ、２つ、３つ、またはそれを超える、例えば全てを含む、請求項１〜３Ａのいずれか一項に記載の方法。
【請求項２０】
前記グリカンポリマーおよび／またはグリカンポリマー調製物が、以下の特徴：
ｉ．前記グリカンポリマーが、キシロースおよびアラビノースのうちの１つまたは２つ、ならびに少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含み、任意選択により、前記アルファ−グリコシド結合がアルファ−１，３グリコシド結合であり、さらに任意選択により、調製物の前記平均重合度（ＤＰ）がＤＰ２〜４、ＤＰ２〜６、ＤＰ３〜１０、またはＤＰ３〜１５である；
ｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、アルファ−１，２グリコシド結合、アルファ−１，４グリコシド結合、アルファ−１，６グリコシド結合、またはそれらの組み合わせを含むグリカンポリマーをさらに含む；
ｉｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含む；
ｉｖ．前記グリカンポリマー調製物が、キシロースを含むグリカンポリマーを含む、および
ｖ．前記グリカンポリマー調製物が、アラビノースを含むグリカンポリマーを含む
のうちの１つ、２つ、３つ、またはそれを超える、例えば全てを含む、請求項１〜３Ａのいずれか一項に記載の方法。
【請求項２１】
前記グリカンポリマーおよび／またはグリカンポリマー調製物が、以下の特徴：
ｉ．前記グリカンポリマーが、アラビノースおよび少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含み、任意選択により、前記アルファ−グリコシド結合がアルファ−１，３グリコシド結合であり、さらに任意選択により、前記調製物の平均重合度（ＤＰ）がＤＰ２〜４、ＤＰ２〜６、ＤＰ３〜１０、またはＤＰ３〜１５である；
ｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含む；
ｉｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、ガラクトースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ａｒａ−ｇａｌ調製物）；
ｉｖ．前記グリカンポリマー調製物が、キシロースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ａｒａ−ｘｙｌ調製物）；および
ｖ．前記グリカンポリマー調製物が、ガラクトースおよびキシロースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ａｒａ−ｇａｌ−ｘｙｌ調製物）；
のうちの１つ、２つ、３つ、またはそれを超える、例えば全てを含む、請求項１〜３Ａのいずれか一項に記載の方法。
【請求項２２】
前記グリカンポリマーおよび／またはグリカンポリマー調製物が、以下の特徴：
ｉ．前記グリカンポリマーが、ガラクトースおよび少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含み、任意選択により、前記アルファ−グリコシド結合がアルファ−１，３グリコシド結合であり、さらに任意選択により、前記調製物の平均重合度（ＤＰ）がＤＰ２〜４、ＤＰ２〜６、ＤＰ３〜１０、またはＤＰ３〜１５である；
ｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含む；
ｉｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、アラビノースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇａｌ−ａｒａ調製物）；
ｉｖ．前記グリカンポリマー調製物が、キシロースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇａｌ−ｘｙｌ調製物）；および
ｖ．前記グリカンポリマー調製物が、アラビノースおよびキシロースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇａｌ−ａｒａ−ｘｙｌ調製物）；
のうちの１つ、２つ、３つ、またはそれを超える、例えば全てを含む、請求項１〜３Ａのいずれか一項に記載の方法。
【請求項２３】
前記グリカンポリマーおよび／またはグリカンポリマー調製物が、以下の特徴：
ｉ．前記グリカンポリマーが、キシロースおよび少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含み、任意選択により、前記アルファ−グリコシド結合がアルファ−１，３グリコシド結合であり、さらに任意選択により、前記調製物の平均重合度（ＤＰ）がＤＰ２〜４、ＤＰ２〜６、ＤＰ３〜１０、またはＤＰ３〜１５である；
ｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含む；
ｉｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、ガラクトースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｘｙｌ−ｇａｌ調製物）；
ｉｖ．前記グリカンポリマー調製物が、アラビノースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｘｙｌ−ａｒａ調製物）；および
ｖ．前記グリカンポリマー調製物が、ガラクトースおよびアラビノースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｘｙｌ−ａｒａ−ｇａｌ調製物）；
のうちの１つ、２つ、３つ、またはそれを超える、例えば全てを含む、請求項１〜３Ａのいずれか一項に記載の方法。
【請求項２４】
前記グリカンポリマーおよび／またはグリカンポリマー調製物が、以下の特徴：
ｉ．前記グリカンポリマーが、グルコースおよび少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含み、任意選択により、前記アルファ−グリコシド結合がアルファ−１，３グリコシド結合であり、さらに任意選択により、前記調製物の平均重合度（ＤＰ）がＤＰ２〜４、ＤＰ２〜６、ＤＰ３〜１０、またはＤＰ３〜１５である；
ｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含む；および
ｉｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、アラビノース、ガラクトースまたはキシロースのうちの１つ、２つ、または３つを含むグリカンポリマーをさらに含む
のうちの１つ、２つ、またはそれを超える、例えば全てを含む、請求項１〜３Ａのいずれか一項に記載の方法。
【請求項２５】
前記グリカンポリマーおよび／またはグリカンポリマー調製物が、以下の特徴：
ｉ．前記グリカンポリマーが、グルコースおよび少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含み、任意選択により、前記調製物の平均重合度（ＤＰ）がＤＰ２〜４、ＤＰ２〜６、ＤＰ３〜１０、またはＤＰ３〜１５である；
ｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、アルファ−１，２グリコシド結合、アルファ−１，３グリコシド結合、アルファ−１，４グリコシド結合、アルファ−１，６グリコシド結合、またはそれらの組み合わせを含むグリカンポリマーをさらに含む；
ｉｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含む；および
ｉｖ．前記グリカンポリマー調製物が、ガラクトース、マンノース、アラビノース、またはシアル酸のうちの１つ、２つ、３つ、または４つを含むグリカンポリマーをさらに含む
のうちの１つ、２つ、３つ、またはそれを超える、例えば全てを含む、請求項１〜３Ａのいずれか一項に記載の方法。
【請求項２６】
前記グリカンポリマーおよび／またはグリカンポリマー調製物が、以下の特徴：
ｉ．前記グリカンポリマーが、グルコースおよび少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含み、任意選択により、前記アルファ−グリコシド結合がアルファ−１，３グリコシド結合であり、さらに任意選択により、前記調製物の平均重合度（ＤＰ）がＤＰ２〜４、ＤＰ２〜６、ＤＰ３〜１０、またはＤＰ３〜１５である；
ｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含む；
ｉｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、キシロースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇｌｕ−ｘｙｌ調製物）；および
ｉｖ．前記グリカンポリマー調製物が、マンノース、アラビノース、またはガラクトースのうちの１つ、２つ、または３つを含むグリカンポリマーをさらに含む。
のうちの１つ、２つ、３つ、またはそれを超える、例えば全てを含む、請求項１〜３Ａのいずれか一項に記載の方法。
【請求項２７】
前記グリカンポリマーおよび／またはグリカンポリマー調製物が、以下の特徴：
ｉ．前記グリカンポリマーが、グルコースおよび少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含み、任意選択により、前記調製物の平均重合度（ＤＰ）がＤＰ２〜４、ＤＰ２〜６、ＤＰ３〜１０、またはＤＰ３〜１５である；
ｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含み、任意選択により、前記アルファ−グリコシド結合が、アルファ−１，３グリコシド結合である；
ｉｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含む；
ｉｖ．前記グリカンポリマー調製物が、キシロースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇｌｕ−ｘｙｌ調製物）；および
ｖ．前記グリカンポリマー調製物が、マンノース、アラビノース、またはガラクトースのうちの１つ、２つ、または３つを含むグリカンポリマーをさらに含む
のうちの１つ、２つ、３つ、またはそれを超える、例えば全てを含む、請求項１〜３Ａのいずれか一項に記載の方法。
【請求項２８】
前記グリカンポリマーおよび／またはグリカンポリマー調製物が、以下の特徴：
ｉ．前記グリカンポリマーが、キシロースおよび少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含み、任意選択により、前記アルファ−グリコシド結合がアルファ−１，３グリコシド結合であり、さらに任意選択により、前記調製物の平均重合度（ＤＰ）がＤＰ２〜４、ＤＰ２〜６、ＤＰ３〜１０、またはＤＰ３〜１５である；
ｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含む；
ｉｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、グルコースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｘｙｌ−ｇｌｕ調製物）；および
ｉｖ．前記グリカンポリマー調製物が、マンノース、アラビノース、またはガラクトースのうちの１つ、２つ、または３つを含むグリカンポリマーをさらに含む
のうちの１つ、２つ、３つ、またはそれを超える、例えば全てを含む、請求項１〜３Ａのいずれか一項に記載の方法。
【請求項２９】
前記グリカンポリマーおよび／またはグリカンポリマー調製物が、以下の特徴：
ｉ．前記グリカンポリマーが、キシロースおよび少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含み、さらに任意選択により、前記調製物の平均重合度（ＤＰ）がＤＰ２〜４、ＤＰ２〜６、ＤＰ３〜１０、またはＤＰ３〜１５である；
ｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含み、任意選択により、前記アルファ−グリコシド結合が、アルファ−１，３グリコシド結合である；
ｉｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含む；
ｉｖ．前記グリカンポリマー調製物が、グルコースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｘｙｌ−ｇｌｕ調製物）；および
ｖ．前記グリカンポリマー調製物が、マンノース、アラビノース、またはガラクトースのうちの１つ、２つ、または３つを含むグリカンポリマーをさらに含む
のうちの１つ、２つ、３つ、またはそれを超える、例えば全てを含む、請求項１〜３Ａのいずれか一項に記載の方法。
【請求項３０】
前記グリカンポリマーおよび／またはグリカンポリマー調製物が、以下の特徴：
ｉ．前記グリカンポリマーが、グルコースおよび少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含み、任意選択により、前記アルファ−グリコシド結合がアルファ−１，３グリコシド結合であり、さらに任意選択により、前記調製物の平均重合度（ＤＰ）がＤＰ２〜４、ＤＰ２〜６、ＤＰ３〜１０、またはＤＰ３〜１５である；
ｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、アルファ−１，２グリコシド結合、アルファ−１，４グリコシド結合、アルファ−１，６グリコシド結合、またはそれらの組み合わせを含むグリカンポリマーをさらに含む；
ｉｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含む；
ｉｖ．前記グリカンポリマー調製物が、キシロースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇｌｕ−ｘｙｌ調製物）；
ｖ．前記グリカンポリマー調製物が、アラビノースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇｌｕ−ａｒａ調製物）；
ｖｉ．前記グリカンポリマー調製物が、ガラクトースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇｌｕ−ｇａｌ調製物）；および
ｖｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、キシロース、アラビノース、またはガラクトースのうちの１つ、２つ、または３つを含むグリカンポリマーをさらに含む
のうちの１つ、２つ、３つ、またはそれを超える、例えば全てを含む、請求項１〜３Ａのいずれか一項に記載の方法。
【請求項３１】
前記グリカンポリマーおよび／またはグリカンポリマー調製物が、以下の特徴：
ｉ．前記グリカンポリマーが、キシロースおよび少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含み、任意選択により、前記アルファ−グリコシド結合がアルファ−１，３グリコシド結合であり、さらに任意選択により、前記調製物の平均重合度（ＤＰ）がＤＰ２〜４、ＤＰ２〜６、ＤＰ３〜１０、またはＤＰ３〜１５である；
ｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、アルファ−１，２グリコシド結合、アルファ−１，４グリコシド結合、アルファ−１，６グリコシド結合、またはそれらの組み合わせを含むグリカンポリマーをさらに含む；
ｉｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含む；
ｉｖ．前記グリカンポリマー調製物が、グルコースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｘｙｌ−ｇｌｕ調製物）；
ｖ．前記グリカンポリマー調製物が、アラビノースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｘｙｌ−ａｒａ調製物）；
ｖｉ．前記グリカンポリマー調製物が、ガラクトースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｘｙｌ−ｇａｌ調製物）；および
ｖｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、グルコース、アラビノース、またはガラクトースのうちの１つ、２つ、または３つを含むグリカンポリマーをさらに含む
のうちの１つ、２つ、３つ、またはそれを超える、例えば全てを含む、請求項１〜３Ａのいずれか一項に記載の方法。
【請求項３２】
前記グリカンポリマーおよび／またはグリカンポリマー調製物が、以下の特徴：
ｉ．前記グリカンポリマーが、アラビノースおよび少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含み、任意選択により、前記アルファ−グリコシド結合がアルファ−１，３グリコシド結合であり、さらに任意選択により、前記調製物の平均重合度（ＤＰ）がＤＰ２〜４、ＤＰ２〜６、ＤＰ３〜１０、またはＤＰ３〜１５である；
ｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、アルファ−１，２グリコシド結合、アルファ−１，４グリコシド結合、アルファ−１，６グリコシド結合、またはそれらの組み合わせを含むグリカンポリマーをさらに含む；
ｉｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含む；
ｉｖ．前記グリカンポリマー調製物が、キシロースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ａｒａ−ｘｙｌ調製物）；
ｖ．前記グリカンポリマー調製物が、グルコースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ａｒａ−ｇｌｕ調製物）；
ｖｉ．前記グリカンポリマー調製物が、ガラクトースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ａｒａ−ｇａｌ調製物）；および
ｖｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、キシロース、グルコース、またはガラクトースのうちの１つ、２つ、または３つを含むグリカンポリマーをさらに含む
のうちの１つ、２つ、３つ、またはそれを超える、例えば全てを含む、請求項１〜３Ａのいずれか一項に記載の方法。
【請求項３３】
前記グリカンポリマーおよび／またはグリカンポリマー調製物が、以下の特徴：
ｉ．グリカンポリマーが、ガラクトースおよび少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含み、任意選択により、前記アルファ−グリコシド結合がアルファ−１，３グリコシド結合であり、さらに任意選択により、前記調製物の平均重合度（ＤＰ）がＤＰ２〜４、ＤＰ２〜６、ＤＰ３〜１０、またはＤＰ３〜１５である；
ｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、アルファ−１，２グリコシド結合、アルファ−１，４グリコシド結合、アルファ−１，６グリコシド結合、またはそれらの組み合わせを含むグリカンポリマーをさらに含む；
ｉｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含む；
ｉｖ．前記グリカンポリマー調製物が、キシロースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇａｌ−ｘｙｌ調製物）；
ｖ．前記グリカンポリマー調製物が、アラビノースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇａｌ−ａｒａ調製物）；
ｖｉ．前記グリカンポリマー調製物が、グルコースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇａｌ−ｇｌｕ調製物）；および
ｖｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、キシロース、アラビノース、またはグルコースのうちの１つ、２つ、または３つを含むグリカンポリマーをさらに含む
のうちの１つ、２つ、３つ、またはそれを超える、例えば全てを含む、請求項１〜３Ａのいずれか一項に記載の方法。
【請求項３４】
前記グリカンポリマー調製物の前記グリカンポリマーの、前記グリカンポリマー、または少なくとも２０、３０、４０、５０、６０、７０、８０、９０、９５、もしくは９９％（重量または数による）の前記グリカンポリマーが、グリコシダーゼ酵素の基質である、請求項１〜３３のいずれかに記載の方法。
【請求項３５】
前記グリコシダーゼ酵素がヒト腸内微生物中に存在する、請求項３４に記載の方法。
【請求項３６】
前記ヒト腸内微生物が、グリコ分類群クラス１、ｂｕｔおよび／またはｂｕｋ遺伝子含有細菌分類群のメンバーである、請求項３５に記載の方法。
【請求項３７】
前記ヒト腸内微生物が、グリコ分類群クラス２、ｃｕｔＣ遺伝子陰性細菌分類群のメンバーである、請求項３５に記載の方法。
【請求項３８】
前記ヒト腸内微生物が、グリコ分類群クラス３、ウレアーゼ遺伝子陰性細菌分類群のメンバーである、請求項３５に記載の方法。
【請求項３９】
前記ヒト腸内微生物が、グリコ分類群クラス４、プロピオン酸キナーゼ、プロピオン酸ＣｏＡトランスフェラーゼ、プロピオン酸ＣｏＡリガーゼ、プロピオニルＣｏＡカルボキシラーゼ、メチルマロニル−ＣｏＡカルボキシトランスフェラーゼ、（Ｓ）−メチルマロニル−ＣｏＡデカルボキシラーゼ、メチルマロン酸セミアルデヒドデヒドロゲナーゼ、およびプロパナールデヒドロゲナーゼから選択される（例えば、酵素委員会（ＥＣ）番号６．４．１．３、２．１．３．１、４．１．１．４１、１．２．１．２７、２．３．３．５、１．２．１．８７、１．３．１．９５、１．３．８．７、２．３．１．５４、２．３．１．１６８、２．３．１．８、および２．３．１．２２２に対応する酵素から選択される））、１つ以上（例えば、１、２、３、４つ、またはそれを超える数（例えば、全て）を含まない）のプロピオン酸産生関連酵素を含まない、細菌分類群のメンバーである、請求項３５に記載の方法。
【請求項４０】
前記ヒト腸内微生物が、グリコ分類群クラス５、７アルファ−ヒドロキシステロイドデヒドロゲナーゼ、１２アルファ−ヒドロキシステロイドデヒドロゲナーゼ、７ベータ−ヒドロキシステロイドデヒドロゲナーゼ（ＮＡＤＰ＋）、２ベータ−ヒドロキシステロイドデヒドロゲナーゼ、３ベータ−ヒドロキシコラン酸３−デヒドロゲナーゼ（ＮＡＤ＋）、３アルファ−ヒドロキシコラン酸デヒドロゲナーゼ（ＮＡＤＰ＋）、３ベータ−ヒドロキシコラン酸３−デヒドロゲナーゼ（ＮＡＤＰ＋）、３アルファ−ヒドロキシ胆汁酸−ＣｏＡ−エステル３−デヒドロゲナーゼ、３アルファ−ヒドロキシコラン酸デヒドロゲナーゼ（ＮＡＤ＋）、胆汁酸ＣｏＡ−トランスフェラーゼ、胆汁酸７アルファ−デヒドラターゼ、および胆汁酸ＣｏＡリガーゼから選択される（例えば、酵素委員会（ＥＣ）番号１．１．１．１５９、１．１．１．１７６、１．１．１．２０１、１．１．２３８、１．１．１．３９１、１．１．３９２、１．１．３９３、１．１．３９５、１．１．１．５２、２．８．３．２５、４．２．１．１０６、および６．２．１．７に対応する酵素から選択される）、１つ以上（例えば、１、２、３、４つ、またはそれを超える数（例えば、全て）を含む）の胆汁酸産生（例えば、二次胆汁酸産生）関連酵素を含む細菌分類群のメンバーである、請求項３５に記載の方法。
【請求項４１】
前記ヒト腸内微生物が、グリコ分類群クラス６、トリプトファナーゼ（例えば、酵素委員会（ＥＣ）番号４．１．９９．１に対応する酵素）から選択される、１つ以上（例えば、１、２、３、４つ、またはそれを超える数（例えば、全て）を含まない）のインドール産生関連酵素を含まない細菌分類群のメンバーである、請求項３５に記載の方法。
【請求項４２】
前記ヒト腸内微生物が、グリコ分類群クラス７、４−ヒドロキシフェニルアセテートデカルボキシラーゼおよびアルデヒドフェレドキシンオキシドレダクターゼから選択される（例えば、酵素委員会（ＥＣ）番号４．１．１．８３、２．６．１．−、４．１．１．−、および１．２．７．５に対応する酵素から選択される）、１つ以上（例えば、１つまたは両方を含まない）のｐ−クレゾール産生関連酵素を含まない細菌分類群のメンバーである、請求項３５に記載の方法。
【請求項４３】
前記グリカンポリマーが、ＧＴ５、ＧＨ９４、ＧＨ１３サブファミリー９、ＧＨ１３サブファミリー３９、ＧＨ１３サブファミリー３６、ＧＨ１１３またはＧＨ１１２  ＣＡＺｙファミリーの１つ以上、例えば、２つ、３つ、４つ、またはそれを超える、から選択されるグリコシダーゼ酵素の基質である、請求項３４、３５、または３６に記載の方法。
【請求項４４】
前記グリカンポリマーが、ＧＴ２、ＧＴ４、ＧＴ５、ＧＴ３５、ＧＴ５１、ＧＨ１、ＧＨ２、ＧＨ３、ＧＨ４、ＧＨ１３、ＧＨ１３サブファミリー９、ＧＨ１３サブファミリー３１、ＧＨ１８、ＧＨ２３、ＧＨ２５、ＧＨ２８、ＧＨ３１、ＧＨ３２、ＧＨ３６、ＧＨ５１、ＧＨ７３、ＧＨ７７またはＧＨ９４  ＣＡＺｙファミリーの１つ以上、例えば、２つ、３つ、４つ、またはそれを超える、から選択されるグリコシダーゼ酵素の基質である、請求項３４、３５、または３６に記載の方法。
【請求項４５】
前記グリカンポリマーが、ＧＴ１１、ＧＴ１０、ＧＨ９２、ＧＨ５１、ＧＨ３５、ＧＨ２９、ＧＨ２８、ＧＨ２０、ＧＨ１３０、ＧＨ１３サブファミリー８、またはＧＨ１３サブファミリー１４  ＣＡＺｙファミリーの１つ以上、例えば、２つ、３つ、４つ、またはそれを超える、から選択されるグリコシダーゼ酵素の基質である、請求項３４、３５、または３７に記載の方法。
【請求項４６】
前記グリカンポリマーが、ＧＴ２、ＧＴ４、ＧＨ２、ＧＨ２３、ＧＨ３、ＧＴ８、ＧＴ５１、ＧＴ９、ＧＨ１、ＧＨ９２、ＧＨ７３、ＧＨ３１、ＧＨ２０、ＧＨ２８、ＧＴ２５、ＧＴ２８、ＧＴ３５、ＧＨ１８、ＧＴ０、ＧＨ１３、ＧＨ３６、ＧＨ９７、ＧＨ１０５、ＧＨ２５、ＧＨ４、ＧＨ３２、ＧＨ７８、ＧＨ２９、ＧＨ０、ＧＨ５１、ＧＴ１０、またはＧＨ７７  ＣＡＺｙファミリーの１つ以上、例えば、２つ、３つ、４つ、またはそれを超える、から選択されるグリコシダーゼ酵素の基質である、請求項３４、３５、または３７に記載の方法。
【請求項４７】
前記グリカンポリマーが、ＧＴ３、ＧＨ９７、ＧＨ４３サブファミリー２４、ＧＨ２７、ＧＨ１３３、ＧＨ１３サブファミリー８、またはＧＨ１３  ＣＡＺｙファミリーの１つ以上、例えば、２つ、３つ、４つ、またはそれを超える、から選択されるグリコシダーゼ酵素の基質である、請求項３４、３５、または３８に記載の方法。
【請求項４８】
前記グリカンポリマーが、ＧＴ２、ＧＴ４、ＧＨ２、ＧＨ２３、ＧＨ３、ＧＴ５１、ＧＨ１、ＧＴ８、ＧＨ９２、ＧＴ９、ＧＨ７３、ＧＨ３１、ＧＨ２０、ＧＨ２８、ＧＴ３５、ＧＴ２８、ＧＨ１８、ＧＨ１３、ＧＨ９７、ＧＨ２５、ＧＨ３６、ＧＨ４、ＧＨ１０５、ＧＨ３２、ＧＨ７８、ＧＨ２９、ＧＨ０、ＧＴ２５、ＧＨ５１、ＧＨ７７、ＧＨ８８、またはＧＨ２４  ＣＡＺｙファミリーの１つ以上、例えば、２つ、３つ、４つ、またはそれを超える、から選択されるグリコシダーゼ酵素の基質である、請求項３４、３５、または３８に記載の方法。
【請求項４９】
前記グリカンポリマーが、ＧＨ１３サブファミリー３、ＧＨ１３サブファミリー３０、ＧＨ３０サブファミリー２、ＧＨ３０サブファミリー５、ＧＨ４３サブファミリー２２、ＧＨ４３サブファミリー８、またはＧＨ８４  ＣＡＺｙファミリーの１つ以上、例えば、２つ、３つ、４つ、またはそれを超える、から選択されるグリコシダーゼ酵素の基質である、請求項３４、３５、または３９に記載の方法。
【請求項５０】
前記グリカンポリマーが、ＧＨ３、ＧＨ１０６、ＧＨ１０５、ＧＨ２、ＧＨ２０、ＧＨ２８、ＧＨ７６、ＧＨ９７、またはＧＨ９２  ＣＡＺｙファミリーの１つ以上、例えば、２つ、３つ、４つ、またはそれを超える、から選択されるグリコシダーゼ酵素の基質である、請求項３４、３５、または３９に記載の方法。
【請求項５１】
前記グリカンポリマーが、ＧＨ１３サブファミリー１９、ＧＨ１３サブファミリー２１、ＧＨ２３、ＧＨ３３、ＧＨ３７またはＧＨ１０４  ＣＡＺｙファミリーの１つ以上、例えば、２つ、３つ、４つ、またはそれを超える、から選択されるグリコシダーゼ酵素の基質である、請求項３４、３５、または４０に記載の方法。
【請求項５２】
前記グリカンポリマーが、ＧＨ２３、ＧＨ２４、またはＧＨ３３  ＣＡＺｙファミリーの１つ以上、例えば、２つ、３つ、４つ、またはそれを超える、から選択されるグリコシダーゼ酵素の基質である、請求項３４、３５、または４０に記載の方法。
【請求項５３】
前記グリカンポリマーが、ＧＨ１３サブファミリー２０、ＧＨ１３サブファミリー３１、ＧＨ１３サブファミリー３９、ＧＨ３９、ＧＨ４３サブファミリー１１、ＧＨ５サブファミリー４４、またはＧＨ９４  ＣＡＺｙファミリーの１つ以上、例えば、２つ、３つ、４つ、またはそれを超える、から選択されるグリコシダーゼ酵素の基質である、請求項３４、３５、または４１に記載の方法。
【請求項５４】
前記グリカンポリマーが、ＧＨ２、ＧＨ３１、ＧＨ２３、ＧＨ１３、またはＧＨ２４  ＣＡＺｙファミリーの１つ以上、例えば、２つ、３つ、４つ、またはそれを超える、から選択されるグリコシダーゼ酵素の基質である、請求項３４、３５、または４１に記載の方法。
【請求項５５】
前記グリカンポリマーが、ＧＨ１３サブファミリー３、ＧＨ１３サブファミリー３０、ＧＨ１２１、ＧＨ１５、ＧＨ４３サブファミリー２７、ＧＨ４３サブファミリー３４、またはＧＨ４３サブファミリー８  ＣＡＺｙファミリーの１つ以上、例えば、２つ、３つ、４つ、またはそれを超える、から選択されるグリコシダーゼ酵素の基質である、請求項３４、３５、または４２に記載の方法。
【請求項５６】
前記グリカンポリマーが、ＧＨ９２、ＧＨ９７、ＧＨ７６、ＧＨ２８、ＧＨ２０、ＧＨ１０５、ＧＨ２、ＧＨ５０、ＧＨ３、またはＧＨ１０６  ＣＡＺｙファミリーの１つ以上、例えば、２つ、３つ、４つ、またはそれを超える、から選択されるグリコシダーゼ酵素の基質である、請求項３４、３５、または４２に記載の方法。
【請求項５７】
グリカンポリマーを選択する工程が、それが請求項４３、４４、４５、４６、４７、４８、４９、５０、５１、５２、５３、５４、５５、または５６のいずれか一項の基質特異性を有することに基づいて選択する工程を含む、請求項１に記載の方法。
【請求項５８】
前記代謝産物が、短鎖脂肪酸（ＳＣＦＡ）（例えば、ブチレートおよび／またはプロピオネート）、アンモニア、トリメチルアミン（ＴＭＡ）、トリメチルアミンＮ−オキシド（ＴＭＡＯ）、尿毒症性溶質（例、ｐ−クレゾールまたはインドール）、または胆汁酸（例えば、二次胆汁酸）のうちの１つである、請求項１〜５７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項５９】
前記代謝産物が短鎖脂肪酸（ＳＣＦＡ）である、請求項５８に記載の方法。
【請求項６０】
前記ＳＣＦＡがアセテート、ブチレート、および／またはプロピオネートである、請求項５９に記載の方法。
【請求項６１】
前記代謝産物が、ＴＭＡおよび／またはＴＭＡＯである、請求項５８に記載の方法。
【請求項６２】
前記代謝産物が、アンモニアである、請求項５８に記載の方法。
【請求項６３】
前記代謝産物が、胆汁酸である、請求項５８に記載の方法。
【請求項６４】
前記代謝産物が、尿毒症性溶質、例えば、ｐ−クレゾールである、請求項５８に記載の方法。
【請求項６５】
前記代謝産物が、尿毒症性溶質、例えば、インドールである、請求項５８に記載の方法。
【請求項６６】
前記疾患または障害が、下痢（例えば、薬物毒性誘発性下痢、例えば、チロシンキナーゼ阻害剤または化学療法剤（例えば、ＦＯＬＦＩＲＩレジメン）の投与を含む処置レジメンにより誘発されるもの；または放射線誘発性下痢および放射線誘発性急性腸管症状）であり、任意選択により、前記ＳＣＦＡがブチレートであり、さらに任意選択により、前記ブチレートのレベルが増加する（例えば、同じ処置を受けているがグリカンポリマー調製物を投与されていない対象に対して、または前記グリカンポリマー調製物の投与前の対象におけるレベルに対して）、請求項５９または６０のいずれかに記載の方法。
【請求項６７】
前記疾患または障害が、クローン病、炎症性腸疾患、過敏性腸疾患、過敏性腸疾患−便秘（ＩＢＳ−Ｃ）、または潰瘍性大腸炎から選択され、任意選択により、前記ＳＣＦＡがブチレートである、請求項５９または６０のいずれかに記載の方法。
【請求項６８】
前記疾患または障害が、非アルコール性脂肪性肝疾患（ＮＡＦＬＤ）または非アルコール性脂肪性肝炎（ＮＡＳＨ）から選択され、任意選択により、前記ＳＣＦＡがブチレートである、請求項５９または６０のいずれかに記載の方法。
【請求項６９】
前記疾患または障害が肝性脳症であり、任意選択により、前記ＳＣＦＡがブチレートである、請求項５９または６０のいずれかに記載の方法。
【請求項７０】
前記疾患または障害がトリメチルアミン尿症（ｔｉｍｅｔｈｙｌａｍｉｎｕｒｉａ）（例えば、続発性トリメチルアミン尿症）である、請求項６１に記載の方法。
【請求項７１】
前記疾患または障害が慢性疾患（例えば、慢性腎臓病または末期腎臓病）である、請求項６１に記載の方法。
【請求項７２】
前記疾患または障害が慢性疾患（例えば、慢性心疾患、慢性心不全、慢性血管疾患）である、請求項６１に記載の方法。
【請求項７３】
前記疾患または障害が、非アルコール性脂肪性肝疾患（ＮＡＦＬＤ）または非アルコール性脂肪性肝炎（ＮＡＳＨ）のうちの１つである、請求項６１に記載の方法。
【請求項７４】
前記疾患または障害が慢性腎臓病である、請求項６２に記載の方法。
【請求項７５】
前記疾患または障害が肝硬変であり、任意選択により、最小限の肝性脳症（ＭＨＥ）を伴うものである、請求項６２に記載の方法。
【請求項７６】
前記疾患または障害が肝性脳症である、請求項６２に記載の方法。
【請求項７７】
前記疾患または障害が尿素サイクル異常症である、請求項６２に記載の方法。
【請求項７８】
前記疾患または障害がプロピオン酸血症である、請求項５９または６０のいずれかに記載の方法。
【請求項７９】
前記疾患または障害が肝硬変、アルコール性肝硬変、原発性胆汁性肝硬変、または腸不全関連肝疾患から選択される、請求項６３に記載の方法。
【請求項８０】
前記疾患または障害が、クローン病、炎症性腸疾患、過敏性腸疾患、過敏性腸疾患−便秘（ＩＢＳ−Ｃ）、または潰瘍性大腸炎から選択される、請求項６３に記載の方法。
【請求項８１】
前記疾患または障害が、非アルコール性脂肪性肝疾患（ＮＡＦＬＤ）または非アルコール性脂肪性肝炎（ＮＡＳＨ）から選択される、請求項６３に記載の方法。
【請求項８２】
前記疾患または障害が慢性腎臓病である、請求項６５に記載の方法。
【請求項８３】
前記疾患または障害が肝性脳症である、請求項６５に記載の方法。
【請求項８４】
前記疾患または障害が肝性フェニルケトン尿症である、請求項６５に記載の方法。
【請求項８５】
前記疾患または障害が慢性腎臓病である、請求項６４に記載の方法。
【請求項８６】
前記疾患または障害が肝性脳症である、請求項６４に記載の方法。
【請求項８７】
前記代謝産物レベルが、前記対象において、または前記疾患もしくは障害を有する前記対象からの適当な試料において増加する、例えば、基準、例えば、所定の基準値、処置前の前記対象におけるレベル、または健康な対照と比較して増加する、請求項６６〜８６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項８８】
前記代謝産物レベルが、前記対象、または前記疾患もしくは障害を有する前記対象からの適当な試料において減少する、例えば、基準、例えば、所定の基準値、処置前の前記対象におけるレベル、または健康な対照と比較して減少する、請求項６６〜８６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項８９】
前記代謝産物のレベル、または望ましくない前記代謝産物のレベルの症状を、例えば前記代謝産物のレベルを取得することによって、任意選択により、前記対象を処置する前（例えば、ベースラインとして）、処置中（例えば、処置成功をモニターするため）、および／または処置後（例えば、前記疾患または障害の再発を評価するため）に評価する工程をさらに含む、請求項１〜８８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項９０】
ブチレートのレベル（例えば、全身レベル、例えば、血液または糞便レベル）が、例えば前記グリカンポリマー調製物で処置していない対象と比較して、増加する（例えば、ブチレート産生（例えば、胃腸微生物による）の産生率またはレベルが増加する）、請求項４〜９、３６、４３、４４、５９、６０、６６〜６９、または８７のいずれかに記載の方法。
【請求項９１】
ＴＭＡのレベル（例えば、全身レベル、例えば、血液または糞便レベル）が、例えば前記グリカンポリマー調製物で処置していない対象と比較して、減少する（例えば、コリンからＴＭＡへの変換（例えば、胃腸微生物による）の変換率またはレベルが減少する）、請求項１０〜１７、３６、４３、４４、５９、６０、７０、または８８のいずれかに記載の方法。
【請求項９２】
アンモニアのレベル（例えば、全身レベル、例えば、血液または糞便レベル）が、例えば前記グリカンポリマー調製物で処置していない対象と比較して、減少する（例えば、尿素からアンモニアへの変換（例えば、胃腸微生物による）の変換率またはレベルが減少する）、請求項１８〜２０、３７、４５、４６、６１、７０〜７３、または８８のいずれかに記載の方法。
【請求項９３】
プロピオン酸のレベル（例えば、全身レベル、例えば、血液または糞便レベル）が、例えば前記グリカンポリマー調製物で処置していない対象と比較して、減少する（例えば、プロピオン酸産生（例えば、胃腸微生物による）の産生率またはレベルが減少する）、請求項２１〜２４、３９、４９、５０、５９、６０、７８、または８８のいずれかに記載の方法。
【請求項９４】
二次胆汁酸のレベル（例えば、全身レベル、例えば、腸または糞便レベル）が、例えば前記グリカンポリマー調製物で処置していない対象と比較して、増加する（例えば、胆汁酸から二次胆汁酸への変換（例えば、胃腸微生物による）の変換率またはレベルが増加する）、請求項２５、４０、５１、５２、６３、７９〜８１、または８７のいずれかに記載の方法。
【請求項９５】
インドールのレベル（例えば、全身レベル、例えば、糞便レベル）が、例えば前記グリカンポリマー調製物で処置していない対象と比較して、減少する（例えば、インドール産生（例えば、胃腸微生物による）の産生率またはレベルが減少する）、請求項２６〜２９、４１、５３、５４、６５、８２〜８４、または８８のいずれかに記載の方法。
【請求項９６】
ｐ−クレゾールのレベル（例えば、全身レベル）が、例えば前記グリカンポリマー調製物で処置していない対象と比較して、減少する（例えば、ｐ−クレゾールへのチロシン変換（例えば、胃腸微生物による）の変換率またはレベルが減少する）、請求項３０〜３３、４２、５５、５６、６４、８５、８６、または８８のいずれかに記載の方法。
【請求項９７】
請求項１〜９６のいずれか一項に記載の方法であって、
ａ）前記対象が望ましくないレベルの代謝産物（例えば、請求項５８〜６５のいずれかに記載の望ましくないレベルの代謝産物）を有すること、
ｂ）前記対象が疾患または障害（例えば、請求項６６〜８６のいずれか１つに記載の疾患または障害）を有すること、
ｃ）前記対象が前記腸内微生物叢のディスバイオシス（例えば、（例えば、請求項３６〜４２のいずれかに記載のクラス１、クラス２、クラス３、クラス４、クラス５、クラス６、またはクラス７細菌分類群の）誤較正レベル／相対存在度）を有すること、
ｄ）前記対象がグリカンポリマー（例えば、請求項３〜３３のいずれかに記載のグリカンポリマー）による先の処置に応答したこと、
ｅ）前記対象がディスバイオシスをもたらす処置または他の環境、例えば、抗生物質処置、または処置前の胃の手術を経験したこと、
のうちの１つ以上の知見の取得に基づいて、またはそれに応答して、処置のために対象を選択する工程をさらに含み、
任意選択により、選択基準を決定するための適当な値を取得する工程を含む、方法。
【請求項９８】
前記対象が、（ａ）〜（ｅ）のうちの任意の２つ以上の知見の取得に基づいて、またはそれに応答して、処置のために選択される、請求項９７に記載の方法。
【請求項９９】
前記対象が、（ａ）〜（ｅ）のうちの任意の３つ以上の知見の取得に基づいて、またはそれに応答して、処置のために選択される、請求項９７に記載の方法。
【請求項１００】
前記対象が、（ａ）〜（ｅ）のうちの任意の４つ以上の知見の取得に基づいて、またはそれに応答して、処置のために選択される、請求項９７に記載の方法。
【請求項１０１】
前記対象が、（ａ）〜（ｅ）のうちの全ての知見の取得に基づいて、またはそれに応答して、処置のために選択される、請求項９７に記載の方法。
【請求項１０２】
適当な値が、前記対象からの適当な生物学的試料を分析することによって取得され得る、請求項９７〜１０１のいずれかに記載の方法。
【請求項１０３】
前記試料が血液、糞便、尿、唾液、または臓器組織試料である、請求項１０２に記載の方法。
【請求項１０４】
前記代謝産物の望ましくないレベルが調節される、例えば、処置期間後、３％、５％、１０％、１５％、２０％、２５％、３０％、３５％、４０％、または５０％（例えば、基準、例えば、所定の基準値、処置前の前記対象におけるレベル、または健康な対照と比較した場合）減少する（例えば、前記対象において、または処置された前記対象から採取された適当なサンプルにおいて）、請求項１〜１０３のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１０５】
前記代謝産物の望ましくないレベルが、処置期間後、３％、５％、１０％、１５％、２０％、２５％、３０％、３５％、４０％、または５０％（例えば、基準、例えば、所定の基準値、処置前の前記対象におけるレベル、または健康な対照と比較した場合）増加する（例えば、処置された前記対象から採取された適当なサンプルにおいて）、請求項１〜１０４のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１０６】
前記処置する工程が、第２の治療剤（例えば、前記疾患または障害を処置するための、および／または前記代謝産物のレベルを調節するための、前記グリカンポリマー以外の治療剤）を投与する工程をさらに含む、請求項１〜１０５のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１０７】
前記処置する工程が、腸内微生物（例えば、ヒト腸内微生物）の調製物を投与する工程をさらに含む、請求項１〜１０６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１０８】
前記腸内微生物（例えば、ヒト腸内微生物）が、
ｉ．クラス１（例えば、ｂｕｔおよび／またはｂｕｋ遺伝子含有細菌分類群）、
ｉｉ．クラス２（例えば、ｃｕｔＣ遺伝子陰性細菌分類群）、
ｉｉｉ．クラス３（例えば、ウレアーゼ遺伝子陰性細菌分類群）、
ｉｖ．クラス４（例えば、プロピオン酸キナーゼ、プロピオン酸ＣｏＡトランスフェラーゼ、プロピオン酸ＣｏＡリガーゼ、プロピオニルＣｏＡカルボキシラーゼ、メチルマロニル−ＣｏＡカルボキシトランスフェラーゼ、（Ｓ）−メチルマロニル−ＣｏＡデカルボキシラーゼ、メチルマロン酸セミアルデヒドデヒドロゲナーゼ、およびプロパナールデヒドロゲナーゼから選択される（例えば、酵素委員会（ＥＣ）番号６．４．１．３、２．１．３．１、４．１．１．４１、１．２．１．２７、２．３．３．５、１．２．１．８７、１．３．１．９５、１．３．８．７、２．３．１．５４、２．３．１．１６８、２．３．１．８、および２．３．１．２２２に対応する酵素から選択される）、１つ以上のプロピオン酸産生関連酵素を欠く、細菌分類群）、
ｖ．クラス５（例えば、７アルファ−ヒドロキシステロイドデヒドロゲナーゼ、１２アルファ−ヒドロキシステロイドデヒドロゲナーゼ、７ベータ−ヒドロキシステロイドデヒドロゲナーゼ（ＮＡＤＰ＋）、２ベータ−ヒドロキシステロイドデヒドロゲナーゼ、３ベータ−ヒドロキシコラン酸３−デヒドロゲナーゼ（ＮＡＤ＋）、３アルファ−ヒドロキシコラン酸デヒドロゲナーゼ（ＮＡＤＰ＋）、３ベータ−ヒドロキシコラン酸３−デヒドロゲナーゼ（ＮＡＤＰ＋）、３アルファ−ヒドロキシ胆汁酸−ＣｏＡ−エステル３−デヒドロゲナーゼ、３アルファ−ヒドロキシコラン酸デヒドロゲナーゼ（ＮＡＤ＋）、胆汁酸ＣｏＡ−トランスフェラーゼ、胆汁酸７アルファ−デヒドラターゼ、および胆汁酸ＣｏＡリガーゼから選択される（例えば、酵素委員会（ＥＣ）番号１．１．１．１５９、１．１．１．１７６、１．１．１．２０１、１．１．２３８、１．１．１．３９１、１．１．３９２、１．１．３９３、１．１．３９５、１．１．１．５２、２．８．３．２５、４．２．１．１０６、および６．２．１．７に対応する酵素から選択される）、１つ以上の胆汁酸産生関連酵素を含む、細菌分類群）、
ｖｉ．クラス６（例えば、トリプトファナーゼ（例えば、酵素委員会（ＥＣ）番号４．１．９９．１に対応する酵素）から選択される、１つ以上のインドール産生関連酵素を欠く、細菌分類群）、または
ｖｉｉ．クラス７（例えば、４−ヒドロキシフェニルアセテートデカルボキシラーゼおよびアルデヒドフェレドキシンオキシドレダクターゼから選択される（例えば、酵素委員会（ＥＣ）番号４．１．１．８３、２．６．１．−、４．１．１．−、および１．２．７．５に対応する酵素から選択される）、１つ以上のｐ−クレゾール産生関連酵素を欠く、細菌分類群）
細菌分類群
である、請求項１０７に記載の方法。
【請求項１０９】
前記腸内微生物が、前記代謝産物との関係に基づいて（例えば、前記代謝産物との、その正の相関、負の相関、または相関の欠如に基づいて）選択される、請求項１０８に記載の方法。
【請求項１１０】
前記腸内微生物の前記選択が、前記腸内微生物の前記代謝産物との関係に基づいて（例えば、前記代謝産物との、その正の相関、負の相関、または相関の欠如に基づいて）、表３から腸内微生物を選択する工程を含む、請求項１０９に記載の方法。
【請求項１１１】
前記グリカンポリマーが、前記腸内微生物（例えば、ヒト腸内微生物）の基質である、請求項１０７〜１１０のいずれかに記載の方法。
【請求項１１２】
前記グリカンポリマーが、腸内微生物グリコシダーゼ酵素の基質であり、前記腸内微生物の増殖を促進する、請求項１〜１１１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１１３】
前記グリカン調製物が毎日投与される、請求項１〜１１２のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１１４】
前記グリカン調製物が単一の処置期間にわたって投与される、請求項１〜１１３のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１１５】
前記グリカン調製物が複数の処置期間にわたって投与され、例えば、間の処置期間が隣接する処置期間の一方または両方よりも長い、または間の処置期間が隣接する処置期間の一方または両方よりも短い、請求項１〜１１３のいずれかに記載の方法。
【請求項１１６】
前記グリカンポリマーが結腸または腸の微生物成分の基質である、請求項１〜１１５のいずれかに記載の方法。
【請求項１１７】
前記グリカンポリマー調製物が経口的または経直腸的に投与される、請求項１〜１１６のいずれかに記載の方法。
【請求項１１８】
対象の体内（例えば、腸（ｇｕｔ）（結腸、腸（ｉｎｔｅｓｔｉｎｅ））、血液、尿、臓器（例えば、肝臓、腎臓）、脳）における産物（例えば、短鎖脂肪酸（ＳＣＦＡ）、アンモニア、トリメチルアミン（ＴＭＡ）、トリメチルアミンＮ−オキシド（ＴＭＡＯ）、尿毒症性溶質、または胆汁酸）の産生またはレベルを調節する方法であって、産物の産生またはレベルを調節するのに十分な有効量のグリカンポリマー調製物を前記対象に投与する（例えば、経口または経直腸）工程を含み、任意選択により、前記グリカンポリマーが結腸または腸の微生物成分の基質である、方法。
【請求項１１９】
前記微生物成分が、
ａ）前記産物を産生し、例えば、それにより、前記産物のレベルまたは産生を増加させる、
ｂ）産生者分類群によって前記産物に変換される前駆産物または代替産物を産生し、例えば、それにより、前記産物のレベルまたは産生を増加させる、
ｃ）前記産物を産生しないが、前記産物の産生者分類群と競合または拮抗し（例えば、空間および／または栄養素につき競合する、または前記産生分類群に対し毒性の抗菌物質を産生する）、例えば、それにより、前記産生者分類群の相対存在度が減少し、前記産物のレベルまたは産生が減少する
、請求項１１８に記載の方法。
【請求項１２０】
前記微生物成分が表２の成分から選択される、請求項１１９に記載の方法。
【請求項１２１】
前記微生物成分が表３の菌株から選択される、請求項１１９に記載の方法。
【請求項１２２】
前記微生物成分が、表４のグリコシダーゼファミリーからのグリコシダーゼ酵素を含む成分から選択される、請求項１１９に記載の方法。
【請求項１２３】
前記微生物成分が、請求項４３〜５５のいずれか一項に記載のグリコシダーゼファミリーからのグリコシダーゼ酵素を含む成分から選択される、請求項１１９に記載の方法。
【請求項１２４】
前記産物が表３の代謝産物から選択される、請求項１１９または１２１のいずれかに記載の方法。
【請求項１２５】
前記産物がＳＣＦＡであり、前記対象が表５のＳＣＦＡの行から選択される状態を有する、請求項１１９に記載の方法。
【請求項１２６】
前記産物がアンモニアであり、前記対象が表５のアンモニアの行から選択される状態を有する、請求項１１９に記載の方法。
【請求項１２７】
前記産物がＴＭＡであり、前記対象が表５のＴＭＡの行から選択される状態を有する、請求項１１９に記載の方法。
【請求項１２８】
前記産物が胆汁酸であり、前記対象が表５の胆汁酸の行から選択される状態を有する、請求項１１９に記載の方法。
【請求項１２９】
前記産物が尿毒症性溶質（例えば、ｐ−クレゾールまたはインドール）であり、前記対象が表５のｐ−クレゾールまたはインドールの行から選択される状態を有する、請求項１１９に記載の方法。
【請求項１３０】
前記産物を調節する、例えば産生する、微生物（例えば、細菌分類群）の識別情報を取得する工程をさらに含む、請求項１１８または１１９に記載の方法。
【請求項１３１】
前記微生物成分を調節するその能力に基づいて前記グリカン調製物を選択する工程をさらに含む、請求項１１８〜１３０のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１３２】
前記グリカン調製物が前記微生物成分のグリコシダーゼ酵素の基質であり、例えば、前記微生物成分および前記産物が表３の同じ列からのものである、請求項１１８〜１３０のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１３３】
前記対象が、ヒト、例えばヒト患者である、請求項１〜１３２のいずれかに記載の方法。
【請求項１３４】
請求項１〜１３３のいずれかに記載の方法における使用のための、例えば本明細書に記載の、グリカンポリマー調製物。
【請求項１３５】
予め選択されたヒト腸内微生物（例えば、そのグリコシダーゼプロファイルのために選択された）のグリコシダーゼ酵素（例えば、ＣＡＺｙファミリー）の基質としての使用のためのグリカンポリマー調製物を選択する方法であって、
ａ）微生物の前記グリコシダーゼ（例えばＣＡＺｙファミリー）プロファイルの値を取得する工程、
ｂ）前記グリコシダーゼ（例えば、ＣＡＺｙファミリー）プロファイルに基づいて、前記微生物の基質となり得るグリカンポリマーを同定、設計、または選択する工程、
ｃ）任意選択により、
ｉ．ヒト腸内微生物（例えば、単一株、設計された株の群、または目的の前記微生物を含むエクスビボの群（例えば、糞便試料由来））のパネルを組み立てる工程
ｉｉ．微生物の前記パネルを試験グリカン調製物と接触させる工程、
ｉｉｉ．（目的の）前記ヒト腸内微生物の増殖を評価する工程、
ｄ）前記グリカンポリマー調製物を選択する工程
を含む方法。
【請求項１３６】
（ａ）が、表４のグリコシダーゼ（例えば、ＣＡＺｙファミリー）プロファイルの値を見出す工程を含む、請求項１３５に記載の方法。
【請求項１３７】
（ｂ）が、表４に見出されるグリカンポリマーを同定、設計、または選択する工程を含む、請求項１３５に記載の方法。
【請求項１３８】
（ａ）が、表４のグリコシダーゼ（例えば、ＣＡＺｙファミリー）プロファイルの値を見出すことを含み、（ｂ）が、表４に見出される、同じ列にある、例えば、（ａ）のグリコシダーゼプロファイルのグリコシダーゼ（例えば、ＣＡＺｙファミリー）の基質である、グリカンポリマーを同定、設計、または選択する工程を含む、請求項１３５に記載の方法。
【請求項１３９】
請求項１３５〜１３８のいずれかの方法によって作製または選択されたグリカン調製物。
【請求項１４０】
グリカンポリマーを含むグリカンポリマー調製物であって、例えば、前記調製物が少なくとも０．５、１、２、５、１０、５０、または１００ｋｇを含み、例えば、少なくとも純度２０、３０、４０、５０、６０、７０、８０、９０、９５または９９％であり、
ｉ）グルコース、マンノースもしくはガラクトースサブユニット、またはそれらの組み合わせ、および少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合、または
ｉｉ）グルコース、マンノースもしくはガラクトースサブユニット、またはそれらの組み合わせ、および少なくとも１つのベータ−グリコシド結合
を含み、
ｉ）ＧＴ５、ＧＨ９４、ＧＨ１３サブファミリー９、ＧＨ１３サブファミリー３９、ＧＨ１３サブファミリー３６、ＧＨ１１３またはＧＨ１１２  ＣＡＺｙファミリー、
ｉｉ）ＧＴ２、ＧＴ４、ＧＴ５、ＧＴ３５、ＧＴ５１、ＧＨ１、ＧＨ２、ＧＨ３、ＧＨ４、ＧＨ１３、ＧＨ１３サブファミリー９、ＧＨ１３サブファミリー３１、ＧＨ１８、ＧＨ２３、ＧＨ２５、ＧＨ２８、ＧＨ３１、ＧＨ３２、ＧＨ３６、ＧＨ５１、ＧＨ７３、ＧＨ７７またはＧＨ９４  ＣＡＺｙファミリー、
ｉｉｉ）ＧＴ１１、ＧＴ１０、ＧＨ９２、ＧＨ５１、ＧＨ３５、ＧＨ２９、ＧＨ２８、ＧＨ２０、ＧＨ１３０、ＧＨ１３サブファミリー８、またはＧＨ１３サブファミリー１４  ＣＡＺｙファミリー、または
ｉｖ）ＧＴ２、ＧＴ４、ＧＨ２、ＧＨ２３、ＧＨ３、ＧＴ８、ＧＴ５１、ＧＴ９、ＧＨ１、ＧＨ９２、ＧＨ７３、ＧＨ３１、ＧＨ２０、ＧＨ２８、ＧＴ２５、ＧＴ２８、ＧＴ３５、ＧＨ１８、ＧＴ０、ＧＨ１３、ＧＨ３６、ＧＨ９７、ＧＨ１０５、ＧＨ２５、ＧＨ４、ＧＨ３２、ＧＨ７８、ＧＨ２９、ＧＨ０、ＧＨ５１、ＧＴ１０、またはＧＨ７７  ＣＡＺｙファミリー
から選択される１つ以上、例えば２つ、３つ、４つ、またはそれを超える、ヒト腸内微生物グリコシダーゼ酵素の基質である、グリカンポリマー調製物。
【請求項１４１】
グリカンポリマー調製物であって、例えば、前記調製物が少なくとも約０．５、１、２、５、１０、５０、または１００ｋｇを含み、例えば、少なくとも純度２０、３０、４０、５０、６０、７０、８０、９０、９５または９９％であり、
ｉ）キシロース、アラビノース、フコースもしくはラムノースサブユニット、またはそれらの組み合わせ、および少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合、または
ｉｉ）キシロース、アラビノース、フコースもしくはラムノースサブユニット、またはそれらの組み合わせ、および少なくとも１つのベータ−グリコシド結合
を含むグリカンポリマーを含み、
ｉ）ＧＴ１１、ＧＴ１０、ＧＨ９２、ＧＨ５１、ＧＨ３５、ＧＨ２９、ＧＨ２８、ＧＨ２０、ＧＨ１３０、ＧＨ１３サブファミリー８、またはＧＨ１３サブファミリー１４  ＣＡＺｙファミリー、または
ｉｉ）ＧＴ２、ＧＴ４、ＧＨ２、ＧＨ２３、ＧＨ３、ＧＴ８、ＧＴ５１、ＧＴ９、ＧＨ１、ＧＨ９２、ＧＨ７３、ＧＨ３１、ＧＨ２０、ＧＨ２８、ＧＴ２５、ＧＴ２８、ＧＴ３５、ＧＨ１８、ＧＴ０、ＧＨ１３、ＧＨ３６、ＧＨ９７、ＧＨ１０５、ＧＨ２５、ＧＨ４、ＧＨ３２、ＧＨ７８、ＧＨ２９、ＧＨ０、ＧＨ５１、ＧＴ１０、またはＧＨ７７  ＣＡＺｙファミリー
から選択される１つ以上、例えば２つ、３つ、４つ、またはそれを超える、ヒト腸内微生物グリコシダーゼ酵素の基質である、グリカンポリマー調製物。
【請求項１４２】
グリカンポリマー調製物であって、例えば、前記調製物が少なくとも０．５、１、２、５、１０、５０、または１００ｋｇを含み、例えば、少なくとも純度２０、３０、４０、５０、６０、７０、８０、９０、９５または９９％であり、
ｉ）グルコースもしくはガラクトースサブユニット、またはそれらの組み合わせ、および少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合、または
ｉｉ）グルコースもしくはガラクトースサブユニット、またはそれらの組み合わせ、および少なくとも１つのベータ−グリコシド結合、および
を含むグリカンポリマーを含み、
ｉ）ＧＴ３、ＧＨ９７、ＧＨ４３サブファミリー２４、ＧＨ２７、ＧＨ１３３、ＧＨ１３サブファミリー８、ＧＨ１３  ＣＡＺｙファミリー、または
ｉｉ）ＧＴ２、ＧＴ４、ＧＨ２、ＧＨ２３、ＧＨ３、ＧＴ８、ＧＴ５１、ＧＴ９、ＧＨ１、ＧＨ９２、ＧＨ７３、ＧＨ３１、ＧＨ２０、ＧＨ２８、ＧＴ２５、ＧＴ２８、ＧＴ３５、ＧＨ１８、ＧＴ０、ＧＨ１３、ＧＨ３６、ＧＨ９７、ＧＨ１０５、ＧＨ２５、ＧＨ４、ＧＨ３２、ＧＨ７８、ＧＨ２９、ＧＨ０、ＧＨ５１、ＧＴ１０、ＧＨ７７、ＧＴ２、ＧＴ４、ＧＨ２、ＧＨ２３、ＧＨ３、ＧＴ５１、ＧＨ１、ＧＴ８、ＧＨ９２、ＧＴ９、ＧＨ７３、ＧＨ３１、ＧＨ２０、Ｇｈ２８、ＧＴ３５、ＧＴ２８、ＧＨ１８、ＧＨ１３、ＧＨ９７、ＧＨ２５、ＧＨ３６、ＧＨ４、ＧＨ１０５、ＧＨ３２、ＧＨ７８、ＧＨ２９、ＧＨ０、ＧＴ２５、ＧＨ５１、ＧＨ７７、ＧＨ８８、ＧＨ２４  ＣＡＺｙファミリー
から選択される１つ以上、例えば２つ、３つ、４つ、またはそれを超える、ヒト腸内微生物グリコシダーゼ酵素の基質である、グリカンポリマー調製物。
【請求項１４３】
グリカンポリマー調製物であって、例えば、前記調製物が少なくとも０．５、１、２、５、１０、５０、または１００ｋｇを含み、例えば、少なくとも純度２０、３０、４０、５０、６０、７０、８０、９０、９５または９９％であり、
アラビノース、ガラクトース、キシロース、もしくはグルコースサブユニット、またはそれらの組み合わせ、および少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合、および
を含むグリカンポリマーを含み、
ｉ）ＧＨ１３サブファミリー３、ＧＨ１３サブファミリー３０、ＧＨ３０サブファミリー２、ＧＨ３０サブファミリー５、ＧＨ４３サブファミリー２２、ＧＨ４３サブファミリー８、もしくはＧＨ８４  ＣＡＺｙファミリー、または
ｉｉ）ＧＨ３、ＧＨ１０６、ＧＨ１０５、ＧＨ２、ＧＨ２０、ＧＨ２８、ＧＨ７６、ＧＨ９７、またはＧＨ９２  ＣＡＺｙファミリー
から選択される１つ以上、例えば２つ、３つ、４つ、またはそれを超える、ヒト腸内微生物グリコシダーゼ酵素の基質である、グリカンポリマー調製物。
【請求項１４４】
グリカンポリマー調製物であって、例えば、前記調製物が少なくとも０．５、１、２、５、１０、５０、または１００ｋｇを含み、例えば、少なくとも純度２０、３０、４０、５０、６０、７０、８０、９０、９５または９９％であり、
グルコースおよび少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合、および
を含むグリカンポリマーを含み、
ｉ）ＧＨ１３サブファミリー１９、ＧＨ１３サブファミリー２１、ＧＨ２３、ＧＨ３３、ＧＨ３７もしくはＧＨ１０４  ＣＡＺｙファミリー、または
ｉｉ）ＧＨ２３、ＧＨ２４、またはＧＨ３３  ＣＡＺｙファミリー
から選択される１つ以上、例えば２つ、３つ、４つ、またはそれを超える、ヒト腸内微生物グリコシダーゼ酵素の基質である、グリカンポリマー調製物。
【請求項１４５】
グリカンポリマー調製物であって、例えば、前記調製物が少なくとも０．５、１、２、５、１０、５０、または１００ｋｇを含み、例えば、少なくとも純度２０、３０、４０、５０、６０、７０、８０、９０、９５または９９％であり、
ｉ）グルコースもしくはキシロースサブユニット、またはそれらの組み合わせ、および少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合、または
ｉｉ）グルコースもしくはキシロースサブユニット、またはそれらの組み合わせ、および少なくとも１つのベータ−グリコシド結合
を含むグリカンポリマーを含み、
ｉ）ＧＨ１３サブファミリー２０、ＧＨ１３サブファミリー３１、ＧＨ１３サブファミリー３９、ＧＨ３９、ＧＨ４３サブファミリー１１、ＧＨ５サブファミリー４４、もしくはＧＨ９４  ＣＡＺｙファミリー、または
ｉｉ）ＧＨ２、ＧＨ３１、ＧＨ２３、ＧＨ１３、またはＧＨ２４  ＣＡＺｙファミリー
から選択される１つ以上、例えば２つ、３つ、４つ、またはそれを超える、ヒト腸内微生物グリコシダーゼ酵素の基質である、グリカンポリマー調製物。
【請求項１４６】
グリカンポリマー調製物であって、例えば、前記調製物が少なくとも０．５、１、２、５、１０、５０、または１００ｋｇを含み、例えば、少なくとも純度２０、３０、４０、５０、６０、７０、８０、９０、９５または９９％であり、
グルコース、キシロース、アラビノース、もしくはガラクトースサブユニット、またはそれらの組み合わせおよび少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合
を含むグリカンポリマーを含み、
ｉ）ＧＨ１３サブファミリー３、ＧＨ１３サブファミリー３０、ＧＨ１２１、ＧＨ１５、ＧＨ４３サブファミリー２７、ＧＨ４３サブファミリー３４、もしくはＧＨ４３サブファミリー８  ＣＡＺｙファミリー、または
ｉｉ）ＧＨ９２、ＧＨ９７、ＧＨ７６、ＧＨ２８、ＧＨ２０、ＧＨ１０５、ＧＨ２、ＧＨ５０、ＧＨ３、またはＧＨ１０６  ＣＡＺｙファミリー
から選択される１つ以上、例えば２つ、３つ、４つ、またはそれを超える、ヒト腸内微生物グリコシダーゼ酵素の基質である、グリカンポリマー調製物。
【請求項１４７】
医薬組成物、医療用食品、栄養補助食品、食品成分、または治療用栄養製品として製剤化され、例えば、製剤化する工程が、前記調製物を複数の剤形または部分に分割することを含む、請求項１４０〜１４６のいずれか一項に記載のグリカン調製物。
【請求項１４８】
液体として経口投与のために製剤化された、請求項１４０〜１４７のいずれか一項に記載のグリカン調製物。
【請求項１４９】
前記液体が、飲料、シロップ、水溶液または水性懸濁液である、請求項１４８に記載のグリカン調製物。
【請求項１５０】
固体として経口投与のために製剤化された、請求項１４０〜１４７のいずれか一項に記載のグリカン調製物。
【請求項１５１】
前記固体が、錠剤、丸剤、カプセル、ロゼンジ、キャンディ、または粉末である、請求項１５０に記載のグリカン調製物。
【請求項１５２】
前記固体が、固形食品である、請求項１５０に記載のグリカン調製物。
【請求項１５３】
前記粉末が、経口投与前に水溶液中での再構成のために製剤化された、請求項１５１に記載のグリカン調製物。
【請求項１５４】
固体または液体として経直腸投与のために製剤化された、請求項１４０〜１４７のいずれか一項に記載のグリカン調製物。
【請求項１５５】
浣腸剤または坐剤として製剤化された、請求項１５４に記載のグリカン調製物。
【請求項１５６】
遅延放出または時間制御システムとして製剤化された、請求項１４０〜１５５のいずれか一項に記載のグリカン調製物。
【請求項１５７】
薬学的に許容される担体または賦形剤をさらに含む、請求項１４０〜１５６のいずれか一項に記載のグリカン調製物。
【請求項１５８】
食品的に許容される担体または賦形剤をさらに含む、請求項１４０〜１５６のいずれか一項に記載のグリカン調製物。
【請求項１５９】
第２の治療剤をさらに含む、請求項１４０〜１５８のいずれか一項に記載のグリカン調製物。
【請求項１６０】
腸内微生物（例えば、ヒト腸内微生物）の調製物をさらに含む、請求項１４０〜１５９のいずれか一項に記載のグリカン調製物。
【請求項１６１】
前記グリカンポリマーが、前記腸内微生物の基質である、請求項１６０に記載のグリカン調製物。
【請求項１６２】
前記グリカンポリマーが、腸内微生物グリコシダーゼ酵素の基質であり、前記腸内微生物の増殖を促進する、請求項１６１に記載のグリカン調製物。
【請求項１６３】
請求項１４０〜１６２のいずれか一項に記載のグリカン調製物を含む、単位剤形（ｕｎｉｔ  ｄｏｓａｇｅ  ｆｒｏｍ）。
【請求項１６４】
経腸投与、経鼻、経口、または経直腸投与、または経管栄養のために製剤化された、請求項１６３に記載の単位剤形。
【請求項１６５】
前記単位剤形、例えば、前記単位剤形の前記グリカンポリマー調製物成分が、約０．０１ｋｃａｌ〜約１ｋｃａｌ、０．１ｋｃａｌ〜５ｋｃａｌ、０．０１ｋｃａｌ〜１０ｋｃａｌ、または０．１ｋｃａｌ〜１０ｋｃａｌのカロリー値を有する、請求項１６３または１６４に記載の単位剤形。
【請求項１６６】
結腸または大腸における時限放出および／または標的放出のために製剤化された、請求項１６３〜１６５のいずれか一項に記載の単位剤形。
【請求項１６７】
請求項１４０〜１６２のいずれか一項に記載のグリカン調製物を含む、医薬組成物。
【請求項１６８】
請求項１４０〜１６２のいずれか一項に記載のグリカンポリマー調製物またはその一部をそれぞれ含む、医薬組成物のセットであって、集合的に、前記セットが少なくとも０．１、０．５、１、２、５、１０、または１００キログラムの前記調製物を含む、セット。
【請求項１６９】
請求項１４０〜１６２のいずれか一項に記載のグリカン調製物を含む、医療用食品。
【請求項１７０】
請求項１４０〜１６２のいずれか一項に記載のグリカンポリマー調製物またはその一部をそれぞれ含む、医療用食品の一部のセットであって、集合的に、前記セットが少なくとも０．１、０．５、１、２、５、１０、または１００キログラムの前記調製物を含む、セット。
【請求項１７１】
請求項１４０〜１６２のいずれか一項に記載のグリカン調製物を含む、栄養補助食品。
【請求項１７２】
請求項１４０〜１６２のいずれか一項に記載のグリカンポリマー調製物またはその一部をそれぞれ含む、栄養補助食品の一部のセットであって、集合的に、前記セットが少なくとも０．１、０．５、１、２、５、１０、または１００キログラムの前記調製物を含む、セット。
【請求項１７３】
請求項１４０〜１６２のいずれか一項に記載のグリカン調製物を含む、食品成分。
【請求項１７４】
請求項１４０〜１６２のいずれか一項に記載のグリカンポリマー調製物またはその一部をそれぞれ含む、食品成分の一部のセットであって、集合的に、前記セットが少なくとも０．１、０．５、１、２、５、１０、または１００キログラムの前記調製物を含む、セット。
【請求項１７５】
ヒト腸内微生物の調製物を提供する工程、
前記グリカンポリマーが前記ヒト腸内微生物の基質である、請求項１４０〜１６２のいずれか一項に記載のグリカンポリマー調製物を提供する工程、
前記ヒト腸内微生物を前記グリカンポリマーと組み合わせる工程
を含む、共調製物の作製方法。
【請求項１７６】
前記ヒト腸内微生物が、表２に列挙された微生物から選択される、請求項１７５に記載の方法。
【請求項１７７】
前記ヒト腸内微生物が、表３に列挙された微生物から選択される、請求項１７５に記載の方法。
【請求項１７８】
前記ヒト腸内微生物の前記ＣＡＺｙファミリープロファイルを同定する工程、および同定された前記ヒト腸内微生物の前記ＣＡＺｙファミリープロファイルに基づいて、基質であるグリカンポリマー調製物を選択する工程をさらに含む、請求項１７５〜１７７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１７９】
経口、経鼻または経直腸送達または経管栄養のための前記共調製物を製剤化する工程をさらに含む、請求項１７５〜１７８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１８０】
時限放出製剤として前記共調製物を製剤化する工程をさらに含む、請求項１７５〜１７９のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１８１】
前記調製物の放出が結腸または大腸で起こる、請求項１８０に記載の方法。
【請求項１８２】
約５０％、６０％、７０％、８０％、９０％、９５％または９８％を超える前記調製物の前記微生物が、胃の通過後（例えば結腸または大腸に到達するとき）に生存可能である、請求項１７５〜１８１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１８３】
結腸または大腸内で放出された後に、約１％、５％、１０％、１５％、２０％、２５％、３０％、４０％、５０％、６０％または７５％を超える前記調製物の前記微生物が移植する、請求項１７５〜１８２のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１８４】
前記グリカンポリマー調製物が、前記グリカンポリマーの合成のために同定された前記ＣＡＺｙファミリープロファイルから１つ以上のグリコシダーゼを選択する、グリコシダーゼ指向合成によって作製される、請求項１７５〜１８３のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１８５】
前記グリカンポリマー調製物が、同定された前記ＣＡＺｙファミリープロファイルに基づいて、非酵素ポリマー触媒を用いて合成および設計される、請求項１７５〜１８３のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１８６】
前記共調製物を医薬組成物に製剤化する工程をさらに含む、請求項１７５〜１８５のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１８７】
ヒト腸内微生物の調製物および請求項１４０〜１６２のいずれか一項に記載のグリカンポリマーの調製物を含む、シンバイオティクス共調製物。
【請求項１８８】
薬学的に許容される賦形剤または担体をさらに含む、請求項１８７に記載のシンバイオティクス共調製物。
【請求項１８９】
経鼻、経口、経胃または経直腸送達のための単位剤形として製剤化された、請求項１８７または１８８に記載のシンバイオティクス共調製物。
【請求項１９０】
胃酸による不活化から前記調製物の前記ヒト腸内微生物を保護するように製剤化された、請求項１８７〜１８９のいずれか一項に記載のシンバイオティクス共調製物。
【請求項１９１】
請求項１８７〜１９０のいずれか一項に記載のシンバイオティクス共調製物を、ヒト腸内微生物を移植するのに有効な量および時間で前記対象に投与する工程を含む、それを必要とするヒト対象の結腸または大腸に前記ヒト腸内微生物を移植する方法。
【請求項１９２】
前記ヒト対象が、腸の微生物叢のディスバイオシスを有し、例えば、そのようなディスバイオシスを引き起こす処置または曝露を受けており、例えば、前記ヒト対象が、前記処置または曝露を受けたと同定された、請求項１９１に記載の方法。
【請求項１９３】
前記ヒト対象が抗生物質処置を受けている、請求項１９１または１９２に記載の方法。
【請求項１９４】
前記ヒト対象が抗生物質処置を受けていない、請求項１９１または１９２に記載の方法。
【請求項１９５】
腸（例えば、結腸または大腸）の前記微生物叢が安定である（例えば、分類群の相対存在度において有意な変化がない）、請求項１９１〜１９４のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１９６】
腸（例えば、結腸または大腸）の前記微生物叢が不安定である（例えば、分類群の相対存在度において有意な変化がある）、請求項１９１〜１９４のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１９７】
前記移植の程度が、前記シンバイオティクス共調製物の投与前または投与後に、例えば、１６Ｓ、定量培養、またはｑＰＣＲによる、分析によって決定される、請求項１９１〜１９６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１９８】
前記移植の程度が、前記シンバイオティクス共調製物中で前記対象に投与された生物の数と、前記対象の腸から回収可能な生物の数との比較を通して、例えば定量培養またはｑＰＣＲを通して、決定される、請求項１９１〜１９７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１９９】
前記ヒト対象が表５に列挙された疾患または障害、例えば、急性嚢炎、アレルギー性疾患、ＡＩＤＳ、アテローム性動脈硬化症、喘息、アトピー性皮膚炎、自閉症スペクトラム障害、慢性機能性便秘、セリアック病、慢性萎縮性胃炎、慢性嚢炎、クロストリジウム・ディフィシル（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｄｉｆｆｉｃｉｌｅ）関連疾患（ＣＤＡＤ）、セリアック病、結腸直腸腺腫、結腸直腸癌、クローン病、嚢胞性線維症、うつ病、糖尿病（Ｉ型）、糖尿病（ＩＩ型）、下痢、湿疹、腸瘻造設、家族性地中海熱、食物過敏症、移植片対宿主病（ＧｖＨＤ）、肝性脳症、高血圧、炎症性腸疾患、過敏性腸疾患、過敏性腸疾患−便秘（ＩＢＳ−Ｃ）、肺癌、顕微鏡的大腸炎、多発性硬化症、非アルコール性脂肪肝疾患（ＮＡＦＬＤ）、非アルコール性脂肪性肝炎（ＮＡＳＨ）、肥満関連喘息、パーキンソン病（ＰＤ）、放射線誘発性急性腸管症状、赤痢、短腸症候群、脊髄損傷関連腸機能障害、全身性炎症反応症候群、全身性エリテマトーデス、または潰瘍性大腸炎を有する、請求項１９１〜１９８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２００】
前記ヒト対象が、表５に列挙された疾患または障害、例えば、アテローム性動脈硬化症、心血管疾患、ＨＩＶにおける心血管リスク、頸動脈アテローム性動脈硬化症、慢性心疾患、慢性心不全、慢性腎臓病、慢性血管疾患、結腸直腸癌、冠状動脈性心臓病、冠状動脈疾患（ＣＡＤ）、糖尿病（ＩＩ型）、末期腎臓病、ＨＩＶ、炎症性腸疾患、虚血性発作、メタボリックシンドローム、非アルコール性脂肪性肝疾患（ＮＡＦＬＤ）、肥満、放射線誘発性急性腸管症状（ＲＩＡＩＳ）、または脳卒中を有する、請求項１９１〜１９８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２０１】
前記ヒト対象が、表５に列挙された疾患または障害、例えば、慢性腎臓病、ヘリコバクター・ピロリ（Ｈｅｌｉｃｏｂａｃｔｅｒ  ｐｙｌｏｒｉ）感染症、肝性脳症、または最小限の肝性脳症（ＭＨＥ）を伴う肝硬変を有する、請求項１９１〜１９８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２０２】
本明細書に記載のグリカンポリマー調製物および微生物の調製物を含む組成物を、前記ディスバイオシスの処置に有効な量で投与する工程を含む、ディスバイオシスを有する対象を処置する方法。
【請求項２０３】
前記微生物が胞子形成微生物である、請求項２０２に記載の方法。
【請求項２０４】
前記グリカンポリマー調製物が、キシロース、アラビノース、グルコース、ガラクトースまたはそれらの組み合わせを含む、請求項２０２または２０３に記載の方法。
【請求項２０５】
前記グリカンポリマー調製物の前記グリカンポリマー、または少なくとも２０、３０、４０、５０、６０、７０、８０、９０、９５、もしくは９９％（重量または数による）の前記グリカンポリマーが、表１に列挙された特性の１つ以上（例えば、２、３、４、５、または６つ）有し、任意選択により、
ａ．キシロースもしくはアラビノースサブユニット、またはそれらの組み合わせ、および少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含むグリカンポリマー、
ｂ．キシロースもしくはアラビノースサブユニット、またはそれらの組み合わせ、および少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含むグリカンポリマー、
ｃ．ガラクトース、キシロース、もしくはアラビノースサブユニット、またはそれらの組み合わせ、および少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含むグリカンポリマー、
ｄ．ガラクトース、キシロース、もしくはアラビノースサブユニット、またはそれらの組み合わせ、および少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含むグリカンポリマー、
ｅ．グルコース、キシロース、もしくはアラビノースサブユニット、またはそれらの組み合わせ、および少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含むグリカンポリマー、
ｆ．グルコース、キシロース、もしくはアラビノースサブユニット、またはそれらの組み合わせ、および少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含むグリカンポリマー、
ｇ．キシロース、アラビノース、グルコースもしくはガラクトースサブユニット、またはそれらの組み合わせ、および少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含むグリカンポリマー、
ｈ．キシロース、アラビノース、グルコース、もしくはガラクトースサブユニット、またはそれらの組み合わせおよび少なくとも１つのベータ−グリコシド結合、またはそれらの組み合わせおよび少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含むグリカンポリマー
から選択される、請求項２０２〜２０４のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２０６】
前記グリカンポリマー調製物の前記グリカンポリマーの、前記グリカンポリマー、または少なくとも２０、３０、４０、５０、６０、７０、８０、９０、９５、もしくは９９％（重量または数による）の前記グリカンポリマーが、グリコシダーゼ酵素の基質である、請求項２０２〜２０５のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２０７】
前記グリコシダーゼ酵素が胞子形成ヒト腸内微生物中に存在する、請求項２０２〜２０６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２０８】
前記グリカンポリマーが、ＧＴ５、ＧＴ３５、ＧＴ３、ＧＨ９７、ＧＨ９５、ＧＨ９２、ＧＨ８９、ＧＨ８８、ＧＨ７８、ＧＨ７７、ＧＨ５７、ＧＨ５１、ＧＨ４３サブファミリー３４、ＧＨ４３サブファミリー２４、ＧＨ４３サブファミリー１０、ＧＨ４２、ＧＨ３６、ＧＨ３５、ＧＨ３３、ＧＨ３２、ＧＨ３１、ＧＨ３、ＧＨ２９、ＧＨ２８、ＧＨ２７、ＧＨ２４、ＧＨ２０、ＧＨ２、ＧＨ１６、ＧＨ１３３、ＧＨ１３０、ＧＨ１３サブファミリー８、ＧＨ１３サブファミリー３８、ＧＨ１３サブファミリー１４、ＧＨ１３、ＧＨ１２３、ＧＨ１１５、ＧＨ１０９、またはＧＨ１０５  ＣＡＺｙファミリーのうちの１つのグリコシダーゼ酵素の基質である、請求項２０２〜２０７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２０９】
前記微生物が、表１９、列１の微生物のいずれか１つである、請求項２０２〜２０８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２１０】
前記微生物が、表２０、列１の微生物のいずれか１つである、請求項２０２〜２０８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２１１】
前記微生物が、表２１、列１の微生物のいずれか１つである、請求項２０２〜２０８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２１２】
前記微生物が、表１９、列１の微生物のいずれか１つであり、前記グリカン調製物が、表１９、列３、表１９、列４、表１９、列５、表１９、列６、表１９、列７、表１９、列８、表１９、列９、表１９、列１０のいずれか１つである、請求項２０２〜２０８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２１３】
前記微生物が、表２０、列１の微生物のいずれか１つであり、前記グリカン調製物が、表２０、列２、表２０、列３、表２０、列４、表２０、列５、表２０、列６、表２０、列７、表２０、列８、または表２０、列９のいずれか１つである、請求項２０２〜２０８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２１４】
前記微生物が、表２１、列１の微生物のいずれか１つであり、前記グリカン調製物が、表２１、列２、表２１、列３、表２１、列４、表２１、列５、表２１、列６、表２１、列７、表２１、列８、または表２１、列９のいずれか１つである、請求項２０２〜２０８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２１５】
胞子形成微生物（例えば、胞子形成細菌分類群）のヒト腸内微生物グリコシダーゼ酵素の基質であるグリカンポリマーを含む、本明細書に記載のグリカンポリマー調製物。
【請求項２１６】
グリカンポリマー調製物であって、任意選択により、例えば、前記調製物が少なくとも約０．５、１、２、５、１０、５０、または１００ｋｇを含み、および／または、さらに任意選択により、例えば、少なくとも純度２０、３０、４０、５０、６０、７０、８０、９０、９５または９９％であり、
ａ．キシロースもしくはアラビノースサブユニット、またはそれらの組み合わせ、および少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合、
ｂ．キシロースもしくはアラビノースサブユニット、またはそれらの組み合わせ、および少なくとも１つのベータ−グリコシド結合、
ｃ．ガラクトース、キシロースもしくはアラビノースサブユニット、またはそれらの組み合わせ、および少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合、
ｄ．ガラクトース、キシロースもしくはアラビノースサブユニット、またはそれらの組み合わせ、および少なくとも１つのベータ−グリコシド結合、
ｅ．グルコース、キシロースもしくはアラビノースサブユニット、またはそれらの組み合わせ、および少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合、
ｆ．グルコース、キシロースもしくはアラビノースサブユニット、またはそれらの組み合わせ、および少なくとも１つのベータ−グリコシド結合、
ｇ．キシロース、アラビノース、グルコース、もしくはガラクトースサブユニット、またはそれらの組み合わせおよび少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合、
ｈ．キシロース、アラビノース、グルコース、もしくはガラクトースサブユニット、またはそれらの組み合わせおよび少なくとも１つのベータ−グリコシド結合、またはそれらの組み合わせおよび少なくとも１つのベータ−グリコシド結合、
を含むグリカンポリマーを含み、
ＧＴ５、ＧＴ３５、ＧＴ３、ＧＨ９７、ＧＨ９５、ＧＨ９２、ＧＨ８９、ＧＨ８８、ＧＨ７８、ＧＨ７７、ＧＨ５７、ＧＨ５１、ＧＨ４３サブファミリー３４、ＧＨ４３サブファミリー２４、ＧＨ４３サブファミリー１０、ＧＨ４２、ＧＨ３６、ＧＨ３５、ＧＨ３３、ＧＨ３２、ＧＨ３１、ＧＨ３、ＧＨ２９、ＧＨ２８、ＧＨ２７、ＧＨ２４、ＧＨ２０、ＧＨ２、ＧＨ１６、ＧＨ１３３、ＧＨ１３０、ＧＨ１３サブファミリー８、ＧＨ１３サブファミリー３８、ＧＨ１３サブファミリー１４、ＧＨ１３、ＧＨ１２３、ＧＨ１１５、ＧＨ１０９、またはＧＨ１０５  ＣＡＺｙファミリーのうちの１つのヒト腸内微生物グリコシダーゼ酵素の基質である、グリカンポリマー調製物。
【請求項２１７】
前記微生物が、表１９、列１の微生物のいずれか１つである、請求項２１５または２１６に記載のグリカンポリマー調製物。
【請求項２１８】
前記微生物が、表２０、列１の微生物のいずれか１つである、請求項２１５または２１６に記載のグリカンポリマー調製物。
【請求項２１９】
前記微生物が、表２１、列１の微生物のいずれか１つである、請求項２１５または２１６に記載のグリカンポリマー調製物。
【請求項２２０】
前記微生物が、表１９、列１の微生物のいずれか１つであり、前記グリカン調製物が、表１９、列３、表１９、列４、表１９、列５、表１９、列６、表１９、列７、表１９、列８、表１９、列９、表１９、列１０のいずれか１つである、請求項２１５〜２１９のいずれか一項に記載のグリカンポリマー調製物。
【請求項２２１】
前記微生物が、表２０、列１の微生物のいずれか１つであり、前記グリカン調製物が、表２０、列２、表２０、列３、表２０、列４、表２０、列５、表２０、列６、表２０、列７、表２０、列８、または表２０、列９のいずれか１つである、請求項２１５〜２１９のいずれか一項に記載のグリカンポリマー調製物。
【請求項２２２】
前記微生物が、表２１、列１の微生物のいずれか１つであり、前記グリカン調製物が、表２１、列２、表２１、列３、表２１、列４、表２１、列５、表２１、列６、表２１、列７、表２１、列８、または表２１、列９のいずれか１つである、請求項２１５〜２１９のいずれか一項に記載のグリカンポリマー調製物。
【請求項２２３】
胞子形成微生物（例えば、胞子形成ヒト腸内微生物）の調製物を提供する工程、
前記グリカンポリマーが前記胞子形成微生物の基質である、前記グリカンポリマー調製物（本明細書に記載）を提供する工程、
前記胞子形成微生物の前記調製物を前記グリカンポリマー調製物と組み合わせる工程、
を含む、共調製物の作製方法。
【請求項２２４】
前記グリカンポリマーが、
ａ．キシロースもしくはアラビノースサブユニット、またはそれらの組み合わせ、および少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合、
ｂ．キシロースもしくはアラビノースサブユニット、またはそれらの組み合わせ、および少なくとも１つのベータ−グリコシド結合、
ｃ．ガラクトース、キシロースもしくはアラビノースサブユニット、またはそれらの組み合わせ、および少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合、
ｄ．ガラクトース、キシロースもしくはアラビノースサブユニット、またはそれらの組み合わせ、および少なくとも１つのベータ−グリコシド結合、
ｅ．グルコース、キシロースもしくはアラビノースサブユニット、またはそれらの組み合わせ、および少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合、
ｆ．グルコース、キシロースもしくはアラビノースサブユニット、またはそれらの組み合わせ、および少なくとも１つのベータ−グリコシド結合、
ｇ．キシロース、アラビノース、グルコース、もしくはガラクトースサブユニット、またはそれらの組み合わせおよび少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合、または
ｈ．キシロース、アラビノース、グルコース、もしくはガラクトースサブユニット、またはそれらの組み合わせおよび少なくとも１つのベータ−グリコシド結合、またはそれらの組み合わせおよび少なくとも１つのベータ−グリコシド結合
のうちの１つを含む、請求項２２３に記載の方法。
【請求項２２５】
前記グリカンポリマーが、ＧＴ５、ＧＴ３５、ＧＴ３、ＧＨ９７、ＧＨ９５、ＧＨ９２、ＧＨ８９、ＧＨ８８、ＧＨ７８、ＧＨ７７、ＧＨ５７、ＧＨ５１、ＧＨ４３サブファミリー３４、ＧＨ４３サブファミリー２４、ＧＨ４３サブファミリー１０、ＧＨ４２、ＧＨ３６、ＧＨ３５、ＧＨ３３、ＧＨ３２、ＧＨ３１、ＧＨ３、ＧＨ２９、ＧＨ２８、ＧＨ２７、ＧＨ２４、ＧＨ２０、ＧＨ２、ＧＨ１６、ＧＨ１３３、ＧＨ１３０、ＧＨ１３サブファミリー８、ＧＨ１３サブファミリー３８、ＧＨ１３サブファミリー１４、ＧＨ１３、ＧＨ１２３、ＧＨ１１５、ＧＨ１０９、またはＧＨ１０５  ＣＡＺｙファミリーのうちの１つのグリコシダーゼ酵素の基質である、請求項２２３または２２４に記載の方法。
【請求項２２６】
前記微生物が、表１９、列１の微生物のいずれか１つである、請求項２２３〜２２５のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２２７】
前記微生物が、表２０、列１の微生物のいずれか１つである、請求項２２３〜２２５のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２２８】
前記微生物が、表２１、列１の微生物のいずれか１つである、請求項２２３〜２２５のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２２９】
前記微生物が、表１９、列１の微生物のいずれか１つであり、前記グリカン調製物が、表１９、列３、表１９、列４、表１９、列５、表１９、列６、表１９、列７、表１９、列８、表１９、列９、表１９、列１０のいずれか１つである、請求項２２３〜２２８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２３０】
前記微生物が、表２０、列１の微生物のいずれか１つであり、前記グリカン調製物が、表２０、列２、表２０、列３、表２０、列４、表２０、列５、表２０、列６、表２０、列７、表２０、列８、または表２０、列９のいずれか１つである、請求項２２３〜２２８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２３１】
前記微生物が、表２１、列１の微生物のいずれか１つであり、前記グリカン調製物が、表２１、列２、表２１、列３、表２１、列４、表２１、列５、表２１、列６、表２１、列７、表２１、列８、または表２１、列９のいずれか１つである、請求項２２３〜２２８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２３２】
経口、経鼻または経直腸送達または経管栄養のための前記共調製物を製剤化する工程をさらに含む、請求項２２３〜２３１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２３３】
時限放出製剤として前記共調製物を製剤化する工程をさらに含む、請求項２２３〜２３２のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２３４】
前記調製物の放出が結腸または大腸で起こる、請求項２３３に記載の方法。
【請求項２３５】
約５０％、６０％、７０％、８０％、９０％、９５％または９８％を超える前記調製物の前記微生物が、胃の通過後（例えば結腸または大腸に到達するとき）に生存可能である、請求項２２３〜２３４のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２３６】
結腸または大腸内で放出された後に、約１％、５％、１０％、１５％、２０％、２５％、３０％、４０％、５０％、６０％または７５％を超える前記調製物の前記微生物が移植する、請求項２２３〜２３５のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２３７】
前記グリカンポリマー調製物が、前記グリカンポリマーの合成のために同定された前記ＣＡＺｙファミリープロファイルから１つ以上のグリコシダーゼを選択する、グリコシダーゼ指向合成によって作製される、請求項２２３〜２３６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２３８】
前記グリカンポリマー調製物が、同定された前記ＣＡＺｙファミリープロファイルに基づいて、非酵素ポリマー触媒を用いて合成および設計される、請求項２２３〜２３７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２３９】
前記共調製物を医薬組成物に製剤化する工程をさらに含む、請求項２２３〜２３８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２４０】
ヒト腸内微生物の調製物および請求項２２３〜２３９のいずれか一項に記載のグリカンポリマーの調製物を含む、シンバイオティクス共調製物。
【請求項２４１】
薬学的に許容される賦形剤または担体をさらに含む、請求項２４０に記載のシンバイオティクス共調製物。
【請求項２４２】
経鼻、経口、経胃または経直腸送達のための単位剤形として製剤化された、請求項２４０または２４１に記載のシンバイオティクス共調製物。
【請求項２４３】
胃酸による不活化から前記調製物の前記ヒト腸内微生物を保護するように製剤化された、請求項２４０〜２４２のいずれか一項に記載のシンバイオティクス共調製物。
【請求項２４４】
請求項２４０〜２４３のいずれか一項に記載のシンバイオティクス共調製物を、前記ヒト腸内微生物を移植するのに有効な量および時間で前記対象に投与する工程を含む、それを必要とするヒト対象の結腸または大腸にヒト腸内微生物を移植する方法。
【請求項２４５】
前記ヒト対象が、腸の前記微生物叢のディスバイオシスを有し、例えば、そのようなディスバイオシスを引き起こす処置（例えば、抗菌処置、癌処置など）または曝露（例えば、細菌性病原体（例えば、Ｃ．ｄｉｆｆ．）などの病原体への曝露）を受けており、任意選択により、例えば、前記ヒト対象が、前記処置または曝露を受けたと同定された、請求項２４４に記載の方法。
【請求項２４６】
前記ヒト対象が抗生物質処置を受けている、請求項２４４または２４５に記載の方法。
【請求項２４７】
前記ヒト対象が抗生物質処置を受けていない、請求項２４４または２４５に記載の方法。
【請求項２４８】
腸（例えば、結腸または大腸）の前記微生物叢が安定である（例えば、分類群の相対存在度において有意な変化がない）、請求項２４４〜２４７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２４９】
腸（例えば、結腸または大腸）の前記微生物叢が不安定である（例えば、分類群の相対存在度において有意な変化がある）、請求項２４４〜２４７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２５０】
前記移植の程度が、シンバイオティクス共調製物の投与前または投与後に、例えば、１６Ｓ、定量培養、またはｑＰＣＲによる、分析によって決定される、請求項２４４〜２４９のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２５１】
前記移植の程度が、前記シンバイオティクス共調製物中で前記対象に投与された生物の数と、前記対象の腸から回収可能な生物の数との比較を通して、例えば定量培養またはｑＰＣＲを通して、決定される、請求項２４４〜２５０のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２５２】
本明細書に記載の任意の実施形態の方法。
【請求項２５３】
本明細書に記載の任意の実施形態の組成物。
【請求項２５４】
グリカンポリマー、例えば、ヒト腸内微生物中に存在するグリコシダーゼ酵素の基質であるグリカンポリマー、の調製物を作製する方法であって、
前記グリカンポリマーの製造に適した複数のグリカンサブユニット、例えば糖モノマーまたは糖ダイマーを提供する工程；および
前記複数のグリカンサブユニットを、グリコシダーゼ酵素分子、例えば、ヒト腸内微生物に由来するものと、前記グリカンサブユニットのグリカンポリマーへの組み込みを（例えば、縮合反応により）生じる条件下で、接触させる工程、
それにより、ヒト腸内微生物の基質であるグリカンポリマー調製物を作製する工程、を含み、任意選択により、
ｉ）前記グリカンポリマー調製物が、少なくとも約０．２５、０．５、１、５、１０、２０、５０、１００、２００、３００、４００または５００キログラムのグリカンポリマーを含む、および／または
ｉｉ）前記グリカンポリマー調製物が、少なくとも約１５％、３０％、４５％、６０％、または約７５％の収率（投入グリカンサブユニットのパーセンテージとしての重量／重量基準で決定される）で産生される
、方法。
【請求項２５５】
前記グリコシダーゼ酵素分子が由来する前記ヒト腸内微生物が、前記グリカンポリマーが基質である、前記ヒト腸内微生物と同じ分類群、例えば、門、目、ファミリー、属または種のものである、請求項２５４に記載の方法。
【請求項２５６】
前記グリコシダーゼ酵素分子が由来する前記ヒト腸内微生物が、第１の分類群、例えば、門、目、ファミリー、属または種のものであり、前記グリカンポリマーが基質である前記ヒト腸内微生物が、第２の分類群、例えば、門、目、ファミリー、属または種のものである、請求項２５４に記載の方法。
【請求項２５７】
前記グリカンポリマー調製物を、医薬組成物、医療用食品、栄養補助食品、食品成分、または治療用栄養製品に製剤化する工程をさらに含む、請求項２５４〜２５６のいずれかに記載の方法。
【請求項２５８】
前記調製物を、例えば、経口または経直腸などの経腸投与のために、または経鼻、経口または胃管栄養などの経管栄養のために、複数の部分、例えば、単位用量または製剤に分割する工程、例えば、前記調製物を少なくとも１０、１００、または１，０００の部分に分割する工程をさらに含む、請求項２５４〜２５７のいずれかに記載の方法。
【請求項２５９】
前記複数の部分が、前記部分に存在するグリカンポリマーの量に関して、重量で０．５％、１％、２％、５％、１０％、または２０％以下異なる、請求項２５８に記載の方法。
【請求項２６０】
前記調製物を賦形剤または担体と組み合わせる工程を含む、請求項２５４〜２５９のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２６１】
前記賦形剤または担体が薬学的に許容される賦形剤または担体である、請求項２６０に記載の方法。
【請求項２６２】
前記賦形剤または担体が食品である、請求項２６０に記載の方法。
【請求項２６３】
前記グリコシダーゼ酵素および前記グリコシダーゼ酵素分子が、表４（列２）、２３（列Ａ）、２４（列Ａ）、または２２（列１）から独立して選択される、請求項２５４〜２６２のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２６４】
前記グリコシダーゼ酵素をコードする前記アミノ酸配列が、配列番号１〜１２４のいずれか１つによってコードされるアミノ酸と少なくとも９５％、９７％、または９９％の配列同一性を共有する、請求項２５４〜２６３のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２６５】
前記グリコシダーゼ酵素をコードする前記アミノ酸配列が、表２３または２４の配列番号１２、１８、３１、３８、３９、４８、５６、５７、６４、６８、７２、８３、８４、９２、９３、９９、１０４、１１０、および１１７のいずれか１つによってコードされるアミノ酸と少なくとも９５％、９７％、または９９％の配列同一性を共有する、請求項２５４〜２６４のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２６６】
前記グリコシダーゼ酵素分子をコードする前記アミノ酸配列が、配列番号１〜１２４のいずれか１つによってコードされるアミノ酸と少なくとも９５％、９７％、または９９％の配列同一性を共有する、請求項２５４〜２６５のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２６７】
前記グリコシダーゼ酵素分子をコードする前記アミノ酸配列が、表２３または２４の配列番号１２、１８、３１、３８、３９、４８、５６、５７、６４、６８、７２、８３、８４、９２、９３、９９、１０４、１１０、および１１７のいずれか１つによってコードされるアミノ酸と少なくとも９５％、９７％、または９９％の配列同一性を共有する、請求項２５４〜２６６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２６８】
前記グリコシダーゼ酵素および／または前記グリコシダーゼ酵素分子がビフィドバクテリウム（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）からのもの以外である、請求項２６２〜２６７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２６９】
前記グリコシダーゼ酵素および／または前記グリコシダーゼ酵素分子がラクトバチルス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ）からのもの以外である、請求項２６２〜２６７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２７０】
前記グリコシダーゼ酵素および前記グリコシダーゼ酵素分子が、同一のヒト腸内微生物起源のものである、請求項２５４〜２６９のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２７１】
前記グリコシダーゼ酵素および前記グリコシダーゼ酵素分子が、表４（列２）、２３（列Ａ）、２４（列Ａ）、または２２（列１）から選択される、請求項２７０に記載の方法。
【請求項２７２】
前記グリコシダーゼ酵素および前記グリコシダーゼ酵素分子の前記アミノ酸配列が、少なくとも９５％、９７％、または９９％の配列同一性を共有する、請求項２５４〜２７１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２７３】
前記アミノ酸配列をコードする前記核酸配列が、配列番号１〜１２４の１つである、請求項２７２に記載の方法。
【請求項２７４】
前記アミノ酸配列をコードする前記核酸配列が、表２３または２４の配列番号１２、１８、３１、３８、３９、４８、５６、５７、６４、６８、７２、８３、８４、９２、９３、９９、１０４、１１０、および１１７の１つである、請求項２７２に記載の方法。
【請求項２７５】
前記グリコシダーゼ酵素および前記グリコシダーゼ酵素分子が、表４（列２）、２３（列Ａ）、２４（列Ａ）、または２２（列１）から選択される、請求項２７２に記載の方法。
【請求項２７６】
前記グリコシダーゼ酵素および／または前記グリコシダーゼ酵素分子がビフィドバクテリウム（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）からのもの以外である、請求項２７２〜２７５のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２７７】
前記グリコシダーゼ酵素および／または前記グリコシダーゼ酵素分子がラクトバチルス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ）からのもの以外である、請求項２７２〜２７５のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２７８】
前記グリコシダーゼ酵素および前記グリコシダーゼ酵素分子の両方が、同一のＣＡＺｙファミリー（例えば、同一のＧＨファミリー（例えば、ＧＨ１〜ＧＨ１３５の１つ以上）および／またはＧＴファミリー（例えば、ＧＴ１〜ＧＴ１０１の１つ以上）、例えば、表４（列１）、２３（列Ｃ）、２４（列Ｃ）、または２２（列１）に列挙されたもの、のものである、である、請求項２５４〜２７７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２７９】
前記ヒト腸内微生物の識別情報（例えば、分類学的、１６ｓ）、および任意選択により、そのグリコシダーゼプロファイル（例えば、ＣＡＺｙファミリープロファイル）を取得する工程を含む、請求項２５４〜２７８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２８０】
前記ヒト腸内微生物が、表２に列挙された門（列１）、綱（列２）または属（列３）の微生物分類群から選択される、請求項２５４〜２７９のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２８１】
前記ヒト腸内微生物が、表３に列挙された株（列１）または門（列２）の微生物分類群から選択される、請求項２５４〜２７９のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２８２】
前記ヒト腸内微生物が、表４、列３に列挙された属の微生物分類群から選択される、請求項２５４〜２７９のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２８３】
前記ヒト腸内微生物が、表２２、列１に列挙された微生物から選択される、請求項２５４〜２７９のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２８４】
前記ヒト腸内微生物が、表１９、列１および２に列挙された微生物分類群（胞子菌）から選択される、請求項２５４〜２７９のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２８５】
前記ヒト腸内微生物が、表２０、列１に列挙された微生物分類群（胞子菌）から選択される、請求項２５４〜２７９のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２８６】
前記ヒト腸内微生物が、表２１、列１に列挙された微生物（胞子菌）から選択される、請求項２５４〜２７９のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２８７】
前記ヒト腸内微生物が、ビフィドバクテリウム（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）以外のものである、請求項２５４〜２８６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２８８】
前記ヒト腸内微生物が、ラクトバチルス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ）以外のものである、請求項２５４〜２８７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２８９】
前記ヒト腸内微生物の識別情報、および／またはそのグリコシダーゼ遺伝子プロファイルに応答して、グリコシダーゼ酵素分子およびグリカンサブユニットのいずれかまたは両方を選択する工程を含む、請求項２７９に記載の方法。
【請求項２９０】
前記グリコシダーゼ酵素分子（例えば、単離されたグリコシダーゼ酵素分子またはグリコシダーゼ酵素分子を含む細胞抽出物）が結合基質（例えば、固体粒子の表面などの固体表面、または高ＭＷ炭素含有分子、例えば、アガロース、セルロース、などのマトリックス材料）上に配置されている、例えば、共有結合的にまたは非共有結合的に結合している、請求項２５４〜２８９のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２９１】
前記結合基質が細菌細胞以外のものである、請求項２９０に記載の方法。
【請求項２９２】
接触させる工程が、無細胞プロセスを含む、請求項２５４〜２９１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２９３】
前記ヒト腸内微生物が細菌である、請求項２５４〜２９２のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２９４】
前記調製物に関するパラメータ、例えば、物理的パラメータ、例えば、分子量、例えば、平均分子量もしくは分子量分布、グリカンサブユニット組成または純度、または生物学的特性に関するパラメータ、例えば、前記ヒト腸内微生物の増殖を調節する能力、微生物によって産生される微生物代謝産物を、例えばエクスビボアッセイにおいて、調節する能力、またはバイオマーカー、例えば、炎症もしくは免疫バイオマーカー、毒性もしくは廃棄化合物、細菌化合物）を例えば、ヒト対象において、調節する能力、の値を取得する工程をさらに含む、請求項２５４〜２９３のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２９５】
前記値を取得するためのアッセイを実行する工程を含む、請求項２９４に記載の方法。
【請求項２９６】
他者から前記値を取得する工程を含む、請求項２９４に記載の方法。
【請求項２９７】
前記値を基準値と比較して、例えば、使用、例えば治療的使用、への適合性について、前記グリカン調製物を評価する、請求項２９４〜２９６のいずれかに記載の方法。
【請求項２９８】
前記グリコシダーゼ酵素が、配列番号１〜１２４の１つ以上から選択される核酸配列によりコードされる、請求項２５４〜２９７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２９９】
前記グリコシダーゼ酵素が、配列番号１２、１８、３１、３８、３９、４８、５６、５７、６４、６８、７２、８３、８４、９２、９３、９９、１０４、１１０、および１１７の１つ以上から選択される核酸配列によりコードされる、請求項２５４〜２９８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３００】
前記グリコシダーゼ酵素分子が、配列番号１〜１２４の１つ以上から選択される核酸配列と少なくとも８０、８５、９０、９１、９２、９３、９４、９５、９６、９７、９８、９９、または１００％同一である核酸配列によってコードされる、請求項２５４〜２９９のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３０１】
前記グリコシダーゼ酵素分子が、配列番号１２、１８、３１、３８、３９、４８、５６、５７、６４、６８、７２、８３、８４、９２、９３、９９、１０４、１１０、および１１７の１つ以上から選択される核酸配列と少なくとも８０、８５、９０、９１、９２、９３、９４、９５、９６、９７、９８、９９、または１００％同一である核酸配列によってコードされる、請求項２５４〜３００のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３０２】
前記グリコシダーゼ酵素および／または前記グリコシダーゼ酵素分子がビフィドバクテリウム（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）以外のヒト腸内細菌由来である、請求項２５４〜３０１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３０３】
前記グリコシダーゼ酵素および／または前記グリコシダーゼ酵素分子がラクトバチルス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ）以外のヒト腸内細菌由来である、請求項２５４〜３０２のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３０４】
前記グリコシダーゼ酵素および／または前記グリコシダーゼ酵素分子がアルファ−ガラクトシダーゼ以外である、請求項２５４〜３０３のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３０５】
前記グリコシダーゼ酵素および／または前記グリコシダーゼ酵素分子がベータ−ガラクトシダーゼ以外である、請求項２５４〜３０４のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３０６】
前記グリコシダーゼ酵素および／または前記グリコシダーゼ酵素分子がｉ）アルファ−ガラクトシダーゼ；ｉｉ）ベータ−ガラクトシダーゼ、ｉｉｉ）アルファ−グルコシダーゼ  ｉｖ）ベータ−グルコシダーゼ、ｖ）アルファ−キシロシダーゼ、ｖｉ）ベータ−キシロシダーゼ、ｖｉｉ）アルファ−マンノシダーゼ、ｖｉｉｉ）ベータ−マンノシダーゼ、ｉｘ）アルファ−フルクトフラノシダーゼ、および／またはｘ）ベータ−フルクトフラノシダーゼ以外、またはｉ）、ｉｉ）、ｉｉｉ）、ｉｖ）、ｖ）、ｖｉ）、ｖｉｉ）、ｖｉｉｉ）、ｉｘ）、およびｘ）の任意の組み合わせ（例えば、任意の２つ、３つ、４つ、５つ、６つ、７つ、または８つ）以外である、請求項２５４〜３０５のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３０７】
グリカンサブユニットが、グルコース、ガラクトース、マンノース、フルクトース、フコース、ラムノース、キシロース、およびアラビノースから選択される糖モノマーである、請求項２５４〜３０６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３０８】
グリカン単位が、スクロース、マルトース、ゲンチビオース、ラクツロース、ラクトース、ラフィノース、メリビオース、キシロビオース、アラビノビオース、フルクトビオース、ツラノース、セロビオース、マンノビオース、ガラクトビオース、ソホロース、ラミナリビオース、およびキトビオースから選択される糖ダイマーである、請求項２５４〜３０７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３０９】
グリカン単位が、スクロース、イソマルトース、マルトース、メレジトース、ゲンチビオース、セロビオース、メリビオース、ラフィノース、ラクトース、ラクツロース、およびパラチノースから選択される糖ダイマー（例えば、表２３、列Ｅおよび２４、列Ｅに列挙されたもの）である、請求項２５４〜３０８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３１０】
グリカン単位がラクトース以外の糖ダイマーである、である、請求項２５４〜３０９のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３１１】
グリカン単位がラクツロース以外の糖ダイマーである、である、請求項２５４〜３１０のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３１２】
グリカンサブユニットのグリカンポリマーへの組み込みを生じる前記条件が、モノマーを前記グリカンポリマーに組み込むための縮合反応に適したものである、請求項２５４〜３１１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３１３】
グリカンサブユニットのグリカンポリマーへの組み込みを生じる前記条件が、ダイマー出発物質からの前記グリカンポリマーへのモノマーの組み込みを伴う、トランスグリコシル化反応（例えば、トランスガラクトシル化、トランスグルコシル化、トランスフルクトシル化）に適したものである、請求項２５４〜３１２のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３１４】
グリカンサブユニットのグリカンポリマーへの組み込みを生じる前記条件が、加水分解反応に適したものである、請求項２５４〜３１３のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３１５】
前記グリカン調製物の平均重合度（ＤＰ）が、少なくとも約ＤＰ２、少なくとも約ＤＰ３、少なくとも約ＤＰ４、または少なくともＤＰ５である、請求項２５４〜３１４のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３１６】
前記グリカン調製物の平均重合度（ＤＰ）が、約ＤＰ２〜ＤＰ４、ＤＰ２〜ＤＰ５、ＤＰ２と〜ＤＰ６、ＤＰ３〜ＤＰ５、またはＤＰ３〜ＤＰ６である、請求項２５４〜３１５のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３１７】
前記グリカン調製物の平均重合度（ＤＰ）が、約ＤＰ２〜ＤＰ８、約ＤＰ２〜ＤＰ１０、約ＤＰ３〜ＤＰ８、または約ＤＰ３〜ＤＰ１０である、請求項２５４〜３１６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３１８】
前記調製物の少なくとも５０％、６０％、７０％、８０％、９０％、９５％、または少なくとも９９％の前記グリカンポリマーが、２以上のＤＰを有する、請求項２５４〜３１７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３１９】
前記調製物の少なくとも５０％、６０％、７０％、８０％、９０％または少なくとも９５％の前記グリカンポリマーが、３以上のＤＰを有する、請求項２５４〜３１８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３２０】
前記調製物の少なくとも５０％、６０％、７０％、８０％、９０％または少なくとも９５％の前記グリカンポリマーが、約ＤＰ２〜４、ＤＰ２〜５、ＤＰ２〜６、ＤＰ２〜８、ＤＰ２〜１０、ＤＰ３〜５、ＤＰ３〜６、ＤＰ３〜８、または約ＤＰ３〜１０のＤＰを有する、請求項２５４〜３１９のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３２１】
前記調製物の前記グリカンポリマーが０の分岐度（ＤＢ）を有する、請求項２５４〜３２０のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３２２】
前記調製物の少なくとも５０％、６０％、７０％、８０％、９０％または少なくとも９５％の前記グリカンポリマーが分岐している、請求項２５４〜３２１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３２３】
前記調製物の１％、５％、１０％、２０％、３０％、４０％以下または５０％以下の前記グリカンポリマーが分岐している、請求項２５４〜３２２のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３２４】
前記調製物の前記分岐グリカンポリマーが、１つ以上（例えば、１つ、２つ、３つ、４つ、または５つ）の分岐点を含む、請求項３２２または３２３に記載の方法。
【請求項３２５】
前記調製物の前記グリカンポリマーがアルファ−グリコシド結合を含み、例えば、前記調製物の前記グリカンポリマーの前記グリコシド結合の少なくとも約９０％、９５％、９８％、９９％、または１００％がアルファ−グリコシド結合である、請求項２５４〜３２４のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３２６】
前記調製物の前記グリカンポリマーがベータ−グリコシド結合を含み、例えば、前記調製物の前記グリカンポリマーの前記グリコシド結合の少なくとも約９０％、９５％、９８％、９９％、または１００％がベータ−グリコシド結合である、請求項２５４〜３２５のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３２７】
前記調製物の前記グリカンポリマーが、アルファ−およびベータ−グリコシド結合を含む、請求項２５４〜３２６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３２８】
アルファ−対ベータ−グリコシド結合比が、１：１、１：２、１：３、１：４または１：５である、請求項３２７に記載の方法。
【請求項３２９】
ベータ−対アルファ−グリコシド結合比が、１：１、１：２、１：３、１：４または１：５である、請求項３２７に記載の方法。
【請求項３３０】
ベータ−対アルファ−グリコシド結合比が、１：４である、請求項３２７に記載の方法。
【請求項３３１】
前記調製物の前記グリカンポリマーのアルファ−対ベータ−グリコシド結合比が、０または約０．１：１〜１：５、１：１〜１：５または１：１〜１：４である、請求項２５４〜３３０のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３３２】
前記調製物の前記グリカンポリマーのベータ−対アルファ−グリコシド結合比が、０または約０．１：１〜１：５、１：１〜１：５または１：１〜１：４である、請求項２５４〜３３１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３３３】
前記グリカンポリマーが、グルコース、ガラクトース、マンノース、フルクトース、フコース、ラムノース、キシロース、および／またはアラビノースのうちの１つ以上のグリカン単位を含む、請求項２５４〜３３２のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３３４】
前記グリカンポリマーが、１，２グリコシド結合、１，３グリコシド結合、１，４グリコシド結合、１，５グリコシド結合または１，６グリコシド結合から選択される１つ以上のグリコシド結合を含む、請求項２５４〜３３３のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３３５】
前記グリカンポリマー調製物が、少なくとも２０％、３０％、４０％、５０％または少なくとも６０％（モル％）の１，４グリコシド結合を含む、請求項３３４に記載の方法。
【請求項３３６】
前記グリカンポリマー調製物が、少なくとも８０％、９０％、少なくとも９５％、または１００％（モル％）の１，４グリコシド結合を含む、請求項３３４に記載の方法。
【請求項３３７】
前記グリカンポリマー調製物が、少なくとも２０％、３０％、４０％、５０％または少なくとも６０％（モル％）の１，６グリコシド結合を含む、請求項３３４に記載の方法。
【請求項３３８】
前記グリカンポリマー調製物が、少なくとも８０％、９０％、少なくとも９５％、または１００％（モル％）の１，６グリコシド結合を含む、請求項３３４に記載の方法。
【請求項３３９】
前記グリカンポリマー調製物が、１０％以下、５％、１％以下または０％の１，２グリコシド結合を含む、請求項３３４に記載の方法。
【請求項３４０】
前記グリカンポリマー調製物が、１０％以下、５％、１％以下または０％の１，３グリコシド結合を含む、請求項３３４に記載の方法。
【請求項３４１】
前記グリカンポリマー調製物が、１０％以下、５％、１％以下または０％の１，４グリコシド結合を含む、請求項３３４に記載の方法。
【請求項３４２】
前記グリカンポリマー調製物が、１０％以下、５％、１％以下または０％の１，６グリコシド結合を含む、請求項３３４に記載の方法。
【請求項３４３】
前記グリカンポリマーがガラクトオリゴ糖（ＧＯＳ）以外である、請求項２５４〜３４２のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３４４】
前記グリカンポリマーがガラクトースホモポリマー以外である、請求項３３３に記載の方法。
【請求項３４５】
前記グリカンポリマー調製物が、９９％、９５％、９０％、８０％、７０％、６０％、５０％未満のガラクトースホモポリマーである、請求項３３３に記載の方法。
【請求項３４６】
前記調製物中の第１および第２の最も存在度の高いグリカンポリマーが、ｉ）ガラクトースホモポリマーおよび／またはｉｉ）末端グルコースを有するガラクトースポリマー以外である、請求項３３３に記載の方法。
【請求項３４７】
前記グリカンポリマーが、ｉ）フルクトオリゴ糖（ＦＯＳ）、ｉｉ）ガラクトオリゴ糖（ＧＯＳ）、ｉｉｉ）キシロオリゴ糖（ＸＯＳ）、ｉｖ）イソマルトオリゴ糖（ＩＭＯＳ）、およびｖ）グルコオリゴ糖（ＧＬＯＳ）、またはｉ）、ｉｉ）、ｉｉｉ）、ｉｖ）およびｖ）の任意の組み合わせ（１つ、２つ、３つ、４つ、または全て）以外である、請求項２５４〜３４６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３４８】
前記グリカンポリマーが、ｉ）ラクトスクロース、ｉｉ）ラクツロスクロース、ｉｉｉ）２−アルファ−グルコシルラクトース、ｉｖ）ゲンチオオリゴ糖、ｖ）ペクチンオリゴ糖、およびｖｉ）マルトシルフルクトシド、またはｉ）、ｉｉ）、ｉｉｉ）、ｉｖ）、ｖ）およびｖｉ）の任意の組み合わせ（１つ、２つ、３つ、４つ、５つ、または全て）以外である、請求項２５４〜３４７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３４９】
前記複数のグリカンサブユニットが、第１および第２のグリカンサブユニットを含み、第１および第２のグリカンサブユニットが異なる構造を有する、請求項２５４〜３４８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３５０】
前記複数のグリカンサブユニットが、第１および第２のグリカンサブユニットを含み、第１および第２のグリカンサブユニットが同一の構造を有する、請求項２５４〜３４９のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３５１】
前記グリカンポリマーが、グルコース、マンノースもしくはガラクトースサブユニット、またはそれらの組み合わせ、および少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含む、請求項２５４〜３５０のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３５２】
前記グリカンポリマーが、グルコース、マンノースもしくはガラクトースサブユニット、またはそれらの組み合わせ、および少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含む、請求項２５４〜３５１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３５３】
前記グリカンポリマーが、キシロース、アラビノース、フコースもしくはラムノースサブユニット、またはそれらの組み合わせ、および少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含む、請求項２５４〜３５２のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３５４】
前記グリカンポリマーが、キシロース、アラビノース、フコースもしくはラムノースサブユニット、またはそれらの組み合わせ、および少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含む、請求項２５４〜３５３のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３５５】
前記グリカンポリマーが、グルコースもしくはガラクトースサブユニット、またはそれらの組み合わせ、および少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含む、請求項２５４〜３５４のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３５６】
前記グリカンポリマーが、グルコースもしくはガラクトースサブユニット、またはそれらの組み合わせ、および少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含む、請求項２５４〜３５５のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３５７】
前記グリカンポリマーおよび／またはグリカンポリマー調製物が、以下の特徴：
ｉ．前記グリカンポリマーが、グルコースおよび少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含み、任意選択により、前記アルファ−グリコシド結合がアルファ−１，３グリコシド結合、アルファ−１，４グリコシド結合、またはそれらの組み合わせであり、さらに任意選択により、前記調製物の平均重合度（ＤＰ）がＤＰ２〜４、ＤＰ２〜６、ＤＰ３〜１０、またはＤＰ３〜１５である；
ｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含み、任意選択により、前記ベータ−グリコシド結合が、ベータ−１，３グリコシド結合、ベータ−１，４グリコシド結合、またはそれらの組み合わせである；
ｉｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、ガラクトースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇｌｕ−ｇａｌ調製物）；
ｉｖ．前記グリカンポリマー調製物が、マンノースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇｌｕ−ｍａｎ調製物）；および
ｖ．前記グリカンポリマー調製物が、ガラクトースおよびマンノースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇｌｕ−ｇａｌ−ｍａｎ調製物）；
のうちの１つ、２つ、３つ、またはそれを超える、例えば全てを含む、請求項２５４〜３０６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３５８】
前記グリカンポリマーおよび／またはグリカンポリマー調製物が、以下の特徴：
ｉ．前記グリカンポリマーが、グルコースおよび少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含み、任意選択により、前記ベータ−グリコシド結合がベータ−１，３グリコシド結合、ベータ−１，４グリコシド結合、またはそれらの組み合わせであり、さらに任意選択により、前記調製物の平均重合度（ＤＰ）がＤＰ２〜４、ＤＰ２〜６、ＤＰ３〜１０、またはＤＰ３〜１５である；
ｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含み、任意選択により、前記アルファ−グリコシド結合が、アルファ−１，３グリコシド結合、アルファ−１，４グリコシド結合またはそれらの組み合わせである；
ｉｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、ガラクトースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇｌｕ−ｇａｌ調製物）；
ｉｖ．前記グリカンポリマー調製物が、マンノースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇｌｕ−ｍａｎ調製物）；および
ｖ．前記グリカンポリマー調製物が、ガラクトースおよびマンノースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇｌｕ−ｇａｌ−ｍａｎ調製物）；
のうちの１つ、２つ、３つ、またはそれを超える、例えば全てを含む、請求項２５４〜３０６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３５９】
前記グリカンポリマーおよび／またはグリカンポリマー調製物が、以下の特徴：
ｉ．前記グリカンポリマーが、ガラクトースおよび少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含み、任意選択により、前記アルファ−グリコシド結合がアルファ−１，３グリコシド結合、アルファ−１，４グリコシド結合、またはそれらの組み合わせであり、さらに任意選択により、前記調製物の平均重合度（ＤＰ）がＤＰ２〜４、ＤＰ２〜６、ＤＰ３〜１０、またはＤＰ３〜１５である；
ｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含み、任意選択により、前記ベータ−グリコシド結合が、ベータ−１，３グリコシド結合、ベータ−１，４グリコシド結合、またはそれらの組み合わせである；
ｉｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、グルコースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇａｌ−ｇｌｕ調製物）；
ｉｖ．前記グリカンポリマー調製物が、マンノースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇａｌ−ｍａｎ調製物）；および
ｖ．前記グリカンポリマー調製物が、グルコースおよびマンノースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇａｌ−ｍａｎ−ｇｌｕ調製物）；
のうちの１つ、２つ、３つ、またはそれを超える、例えば全てを含む、請求項２５４〜３０６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３６０】
前記グリカンポリマーおよび／またはグリカンポリマー調製物が、以下の特徴：
ｉ．前記グリカンポリマーが、ガラクトースおよび少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含み、任意選択により、前記ベータ−グリコシド結合がベータ−１，３グリコシド結合、ベータ−１，４グリコシド結合、またはそれらの組み合わせであり、さらに任意選択により、前記調製物の平均重合度（ＤＰ）がＤＰ２〜４、ＤＰ２〜６、ＤＰ３〜１０、またはＤＰ３〜１５である；
ｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含み、任意選択により、前記アルファ−グリコシド結合が、アルファ−１，３グリコシド結合、アルファ−１，４グリコシド結合またはそれらの組み合わせである；
ｉｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、グルコースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇａｌ−ｇｌｕ調製物）；
ｉｖ．前記グリカンポリマー調製物が、マンノースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇａｌ−ｍａｎ調製物）；および
ｖ．前記グリカンポリマー調製物が、グルコースおよびマンノースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇａｌ−ｇｌｕ−ｍａｎ調製物）；
のうちの１つ、２つ、３つ、またはそれを超える、例えば全てを含む、請求項２５４〜３０６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３６１】
前記グリカンポリマーおよび／またはグリカンポリマー調製物が、以下の特徴：
ｉ．前記グリカンポリマーが、マンノースおよび少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含み、任意選択により、前記アルファ−グリコシド結合がアルファ−１，３グリコシド結合、アルファ−１，４グリコシド結合、またはそれらの組み合わせであり、さらに任意選択により、前記調製物の平均重合度（ＤＰ）がＤＰ２〜４、ＤＰ２〜６、ＤＰ３〜１０、またはＤＰ３〜１５である；
ｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含み、任意選択により、前記ベータ−グリコシド結合が、ベータ−１，３グリコシド結合、ベータ−１，４グリコシド結合、またはそれらの組み合わせである；
ｉｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、ガラクトースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｍａｎ−ｇａｌ調製物）；
ｉｖ．前記グリカンポリマー調製物が、グルコースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｍａｎ−ｇｌｕ調製物）；および
ｖ．前記グリカンポリマー調製物が、ガラクトースおよびグルコースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｍａｎ−ｇａｌ−ｇｌｕ調製物）。
のうちの１つ、２つ、３つ、またはそれを超える、例えば全てを含む、請求項２５４〜３０６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３６２】
前記グリカンポリマーおよび／またはグリカンポリマー調製物が、以下の特徴：
ｉ．前記グリカンポリマーが、マンノースおよび少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含み、任意選択により、前記ベータ−グリコシド結合がベータ−１，３グリコシド結合、ベータ−１，４グリコシド結合、またはそれらの組み合わせであり、さらに任意選択により、前記調製物の平均重合度（ＤＰ）がＤＰ２〜４、ＤＰ２〜６、ＤＰ３〜１０、またはＤＰ３〜１５である；
ｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含み、任意選択により、前記アルファ−グリコシド結合が、アルファ−１，３グリコシド結合、アルファ−１，４グリコシド結合またはそれらの組み合わせである；
ｉｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、ガラクトースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｍａｎ−ｇａｌ調製物）；
ｉｖ．前記グリカンポリマー調製物が、グルコースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｍａｎ−ｇｌｕ調製物）；および
ｖ．前記グリカンポリマー調製物が、ガラクトースおよびグルコースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｍａｎ−ｇａｌ−ｇｌｕ調製物）
のうちの１つ、２つ、３つ、またはそれを超える、例えば全てを含む、請求項２５４〜３０６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３６３】
前記グリカンポリマーおよび／またはグリカンポリマー調製物が、以下の特徴：
ｉ．前記グリカンポリマーが、ガラクトースおよび少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含み、任意選択により、前記アルファ−グリコシド結合がアルファ−１，３グリコシド結合、アルファ−１，４グリコシド結合、またはそれらの組み合わせであり、さらに任意選択により、前記調製物の平均重合度（ＤＰ）がＤＰ２〜４、ＤＰ２〜６、ＤＰ３〜１０、またはＤＰ３〜１５である；
ｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、アルファ−１，２グリコシド結合、アルファ−１，６グリコシド結合、またはそれらの組み合わせを含むグリカンポリマーをさらに含む；
ｉｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含み、任意選択により、前記ベータ−グリコシド結合が、ベータ−１，３グリコシド結合、ベータ−１，４グリコシド結合、ベータ−１，６グリコシド結合、またはそれらの組み合わせである；
ｉｖ．前記グリカンポリマー調製物が、フコースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇａｌ−ｆｕｃ調製物）；
ｖ．前記グリカンポリマー調製物が、マンノースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇａｌ−ｍａｎ調製物）；および
ｖｉ．前記グリカンポリマー調製物が、フコースおよびマンノースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇａｌ−ｆｕｃ−ｍａｎ調製物）；
のうちの１つ、２つ、３つ、またはそれを超える、例えば全てを含む、請求項２５４〜３０６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３６４】
前記グリカンポリマーおよび／またはグリカンポリマー調製物が、以下の特徴：
ｉ．前記グリカンポリマーが、ガラクトースおよび少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含み、任意選択により、前記ベータ−グリコシド結合がベータ−１，３グリコシド結合、ベータ−１，４グリコシド結合、またはそれらの組み合わせであり、さらに任意選択により、前記調製物の平均重合度（ＤＰ）がＤＰ２〜４、ＤＰ２〜６、ＤＰ３〜１０、またはＤＰ３〜１５である；
ｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、ベータ−１，６グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含む；
ｉｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含み、任意選択により、前記アルファ−グリコシド結合が、アルファ−１，２グリコシド結合、アルファ−１，３グリコシド結合、アルファ−１，４グリコシド結合、アルファ−１，６−グリコシド結合またはそれらの組み合わせである；
ｉｖ．前記グリカンポリマー調製物が、フコースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇａｌ−ｆｕｃ調製物）；
ｖ．前記グリカンポリマー調製物が、マンノースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇａｌ−ｍａｎ調製物）；および
ｖｉ．前記グリカンポリマー調製物が、フコースおよびマンノースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇａｌ−ｆｕｃ−ｍａｎ調製物）；
のうちの１つ、２つ、３つ、またはそれを超える、例えば全てを含む、請求項２５４〜３０６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３６５】
前記グリカンポリマーおよび／またはグリカンポリマー調製物が、以下の特徴：
ｉ．前記グリカンポリマーが、フコースおよび少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含み、任意選択により、前記アルファ−グリコシド結合がアルファ−１，３グリコシド結合、アルファ−１，４グリコシド結合、またはそれらの組み合わせであり、さらに任意選択により、前記調製物の平均重合度（ＤＰ）がＤＰ２〜４、ＤＰ２〜６、ＤＰ３〜１０、またはＤＰ３〜１５である；
ｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、アルファ−１，２グリコシド結合、アルファ−１，６グリコシド結合、またはそれらの組み合わせを含むグリカンポリマーをさらに含む；
ｉｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含み、任意選択により、前記ベータ−グリコシド結合が、ベータ−１，３グリコシド結合、ベータ−１，４グリコシド結合、ベータ−１，６グリコシド結合、またはそれらの組み合わせである；
ｉｖ．前記グリカンポリマー調製物が、ガラクトースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｆｕｃ−ｇａｌ調製物）；
ｖ．前記グリカンポリマー調製物が、マンノースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｆｕｃ−ｍａｎ調製物）；および
ｖｉ．前記グリカンポリマー調製物が、ガラクトースおよびマンノースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｆｕｃ−ｇａｌ−ｍａｎ調製物）
のうちの１つ、２つ、３つ、またはそれを超える、例えば全てを含む、請求項２５４〜３０６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３６６】
前記グリカンポリマーおよび／またはグリカンポリマー調製物が、以下の特徴：
ｉ．前記グリカンポリマーが、フコースおよび少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含み、任意選択により、前記ベータ−グリコシド結合がベータ−１，３グリコシド結合、ベータ−１，４グリコシド結合、またはそれらの組み合わせであり、さらに任意選択により、前記調製物の平均重合度（ＤＰ）がＤＰ２〜４、ＤＰ２〜６、ＤＰ３〜１０、またはＤＰ３〜１である；
ｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、ベータ−１，６グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含む；
ｉｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含み、任意選択により、前記アルファ−グリコシド結合が、アルファ−１，２グリコシド結合、アルファ−１，３グリコシド結合、アルファ−１，４グリコシド結合、アルファ−１，６−グリコシド結合またはそれらの組み合わせである；
ｉｖ．前記グリカンポリマー調製物が、ガラクトースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｆｕｃ−ｇａｌ調製物）；
ｖ．前記グリカンポリマー調製物が、マンノースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｆｕｃ−ｍａｎ調製物）；および
ｖｉ．前記グリカンポリマー調製物が、ガラクトースおよびマンノースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｆｕｃ−ｇａｌ−ｍａｎ調製物）
のうちの１つ、２つ、３つ、またはそれを超える、例えば全てを含む、請求項２５４〜３０６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３６７】
前記グリカンポリマーおよび／またはグリカンポリマー調製物が、以下の特徴：
ｉ．前記グリカンポリマーが、マンノースおよび少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含み、任意選択により、前記アルファ−グリコシド結合がアルファ−１，３グリコシド結合、アルファ−１，４グリコシド結合、またはそれらの組み合わせであり、さらに任意選択により、前記調製物の平均重合度（ＤＰ）がＤＰ２〜４、ＤＰ２〜６、ＤＰ３〜１０、またはＤＰ３〜１５である；
ｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、アルファ−１，２グリコシド結合、アルファ−１，６グリコシド結合、またはそれらの組み合わせを含むグリカンポリマーをさらに含む；
ｉｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含み、任意選択により、前記ベータ−グリコシド結合が、ベータ−１，３グリコシド結合、ベータ−１，４グリコシド結合、ベータ−１，６グリコシド結合、またはそれらの組み合わせである；
ｉｖ．前記グリカンポリマー調製物が、フコースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｍａｎ−ｆｕｃ調製物）；
ｖ．前記グリカンポリマー調製物が、ガラクトースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｍａｎ−ｇａｌ調製物）；および
ｖｉ．前記グリカンポリマー調製物が、ガラクトースおよびフコースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｍａｎ−ｇａｌ−ｆｕｃ調製物）
のうちの１つ、２つ、３つ、またはそれを超える、例えば全てを含む、請求項２５４〜３０６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３６８】
前記グリカンポリマーおよび／またはグリカンポリマー調製物が、以下の特徴：
ｉ．前記グリカンポリマーが、マンノースおよび少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含み、任意選択により、前記ベータ−グリコシド結合がベータ−１，３グリコシド結合、ベータ−１，４グリコシド結合、またはそれらの組み合わせであり、さらに任意選択により、前記調製物の平均重合度（ＤＰ）がＤＰ２〜４、ＤＰ２〜６、ＤＰ３〜１０、またはＤＰ３〜１５である；
ｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、ベータ−１，６グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含む；
ｉｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含み、任意選択により、前記アルファ−グリコシド結合が、アルファ−１，２グリコシド結合、アルファ−１，３グリコシド結合、アルファ−１，４グリコシド結合、アルファ−１，６−グリコシド結合またはそれらの組み合わせである；
ｉｖ．前記グリカンポリマー調製物が、フコースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｍａｎ−ｆｕｃ調製物）；
ｖ．前記グリカンポリマー調製物が、ガラクトースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｍａｎ−ｇａｌ調製物）；および
ｖｉ．前記グリカンポリマー調製物が、ガラクトースおよびフコースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｍａｎ−ｇａｌ−ｆｕｃ調製物）
のうちの１つ、２つ、３つ、またはそれを超える、例えば全てを含む、請求項２５４〜３０６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３６９】
前記グリカンポリマーおよび／またはグリカンポリマー調製物が、以下の特徴：
ｉ．前記グリカンポリマーが、グルコース、キシロースおよびアラビノースのうちの１つ、２つ、または３つ、ならびに少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含み、任意選択により、前記アルファ−グリコシド結合がアルファ−１，３グリコシド結合、アルファ−１，４グリコシド結合、またはそれらの組み合わせであり、さらに任意選択により、前記調製物の平均重合度（ＤＰ）がＤＰ２〜４、ＤＰ２〜６、ＤＰ３〜１０、またはＤＰ３〜１５である；
ｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、アルファ−１，２グリコシド結合、アルファ−１，６グリコシド結合、またはそれらの組み合わせを含むグリカンポリマーをさらに含む；
ｉｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含み、任意選択により、前記ベータ−グリコシド結合が、ベータ−１，３グリコシド結合、ベータ−１，４グリコシド結合、ベータ−１，６グリコシド結合、またはそれらの組み合わせである；
ｉｖ．前記グリカンポリマー調製物が、グルコースを含むグリカンポリマーを含む；
ｖ．前記グリカンポリマー調製物が、キシロースを含むグリカンポリマーを含む、および
ｖｉ．前記グリカンポリマー調製物が、アラビノースを含むグリカンポリマーを含む
のうちの１つ、２つ、３つ、またはそれを超える、例えば全てを含む、請求項２５４〜３０６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３７０】
前記グリカンポリマーおよび／またはグリカンポリマー調製物が、以下の特徴：
ｉ．前記グリカンポリマーが、グルコース、キシロースおよびアラビノースのうちの１つ、２つ、または３つ、ならびに少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含み、任意選択により、前記ベータ−グリコシド結合がベータ−１，３グリコシド結合、ベータ−１，４グリコシド結合、またはそれらの組み合わせであり、さらに任意選択により、前記調製物の平均重合度（ＤＰ）がＤＰ２〜４、ＤＰ２〜６、ＤＰ３〜１０、またはＤＰ３〜１５である；
ｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、ベータ−１，６グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含む；
ｉｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含み、任意選択により、前記アルファ−グリコシド結合が、アルファ−１，２グリコシド結合、アルファ−１，３グリコシド結合、アルファ−１，４グリコシド結合、アルファ−１，６−グリコシド結合またはそれらの組み合わせである；
ｉｖ．前記グリカンポリマー調製物が、グルコースを含むグリカンポリマーを含む；
ｖ．前記グリカンポリマー調製物が、キシロースを含むグリカンポリマーを含む、および
ｖｉ．前記グリカンポリマー調製物が、アラビノースを含むグリカンポリマーを含む
のうちの１つ、２つ、３つ、またはそれを超える、例えば全てを含む、請求項２５４〜３０６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３７１】
前記グリカンポリマーおよび／またはグリカンポリマー調製物が、以下の特徴：
ｉ．前記グリカンポリマーが、グルコースおよび少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含み、任意選択により、前記アルファ−グリコシド結合がアルファ−１，３グリコシド結合であり、さらに任意選択により、前記調製物の平均重合度（ＤＰ）がＤＰ２〜４、ＤＰ２〜６、ＤＰ３〜１０、またはＤＰ３〜１５である；
ｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、アルファ−１，２グリコシド結合、アルファ−１，４グリコシド結合、アルファ−１，６グリコシド結合、またはそれらの組み合わせを含むグリカンポリマーをさらに含む；
ｉｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含む；
ｉｖ．前記グリカンポリマー調製物が、ガラクトースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇｌｕ−ｇａｌ調製物）；
ｖ．前記グリカンポリマー調製物が、アラビノースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇｌｕ−ａｒａ調製物）；
ｖｉ．前記グリカンポリマー調製物が、キシロースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇｌｕ−ｘｙｌ調製物）；および
ｖｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、ガラクトース、アラビノース、およびキシロースのうちの２つまたは３つを含むグリカンポリマーをさらに含む
のうちの１つ、２つ、３つ、またはそれを超える、例えば全てを含む、請求項２５４〜３０６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３７２】
前記グリカンポリマーおよび／またはグリカンポリマー調製物が、以下の特徴：
ｉ．前記グリカンポリマーが、ガラクトースおよび少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含み、任意選択により、前記アルファ−グリコシド結合がアルファ−１，３グリコシド結合であり、さらに任意選択により、前記調製物の平均重合度（ＤＰ）がＤＰ２〜４、ＤＰ２〜６、ＤＰ３〜１０、またはＤＰ３〜１５である；
ｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、アルファ−１，２グリコシド結合、アルファ−１，４グリコシド結合、アルファ−１，６グリコシド結合、またはそれらの組み合わせを含むグリカンポリマーをさらに含む；
ｉｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含む；
ｉｖ．前記グリカンポリマー調製物が、グルコースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇａｌ−ｇｌｕ調製物）；
ｖ．前記グリカンポリマー調製物が、アラビノースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇａｌ−ａｒａ調製物）；
ｖｉ．前記グリカンポリマー調製物が、キシロースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇａｌ−ｘｙｌ調製物）；および
ｖｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、グルコース、アラビノース、またはキシロースのうちの２つまたは３つを含むグリカンポリマーをさらに含む
のうちの１つ、２つ、３つ、またはそれを超える、例えば全てを含む、請求項２５４〜３０６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３７３】
前記グリカンポリマーおよび／またはグリカンポリマー調製物が、以下の特徴：
ｉ．前記グリカンポリマーが、キシロースおよびアラビノースのうちの１つまたは２つ、ならびに少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含み、任意選択により、前記アルファ−グリコシド結合がアルファ−１，３グリコシド結合であり、さらに任意選択により、調製物の前記平均重合度（ＤＰ）がＤＰ２〜４、ＤＰ２〜６、ＤＰ３〜１０、またはＤＰ３〜１５である；
ｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、アルファ−１，２グリコシド結合、アルファ−１，４グリコシド結合、アルファ−１，６グリコシド結合、またはそれらの組み合わせを含むグリカンポリマーをさらに含む；
ｉｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含む；
ｉｖ．前記グリカンポリマー調製物が、キシロースを含むグリカンポリマーを含む、および
ｖ．前記グリカンポリマー調製物が、アラビノースを含むグリカンポリマーを含む
のうちの１つ、２つ、３つ、またはそれを超える、例えば全てを含む、請求項２５４〜３０６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３７４】
前記グリカンポリマーおよび／またはグリカンポリマー調製物が、以下の特徴：
ｉ．前記グリカンポリマーが、アラビノースおよび少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含み、任意選択により、前記アルファ−グリコシド結合がアルファ−１，３グリコシド結合であり、さらに任意選択により、前記調製物の平均重合度（ＤＰ）がＤＰ２〜４、ＤＰ２〜６、ＤＰ３〜１０、またはＤＰ３〜１５である；
ｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含む；
ｉｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、ガラクトースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ａｒａ−ｇａｌ調製物）；
ｉｖ．前記グリカンポリマー調製物が、キシロースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ａｒａ−ｘｙｌ調製物）；および
ｖ．前記グリカンポリマー調製物が、ガラクトースおよびキシロースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ａｒａ−ｇａｌ−ｘｙｌ調製物）；
のうちの１つ、２つ、３つ、またはそれを超える、例えば全てを含む、請求項２５４〜３０６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３７５】
前記グリカンポリマーおよび／またはグリカンポリマー調製物が、以下の特徴：
ｉ．前記グリカンポリマーが、ガラクトースおよび少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含み、任意選択により、前記アルファ−グリコシド結合がアルファ−１，３グリコシド結合であり、さらに任意選択により、前記調製物の平均重合度（ＤＰ）がＤＰ２〜４、ＤＰ２〜６、ＤＰ３〜１０、またはＤＰ３〜１５である；
ｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含む；
ｉｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、アラビノースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇａｌ−ａｒａ調製物）；
ｉｖ．前記グリカンポリマー調製物が、キシロースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇａｌ−ｘｙｌ調製物）；および
ｖ．前記グリカンポリマー調製物が、アラビノースおよびキシロースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇａｌ−ａｒａ−ｘｙｌ調製物）；
のうちの１つ、２つ、３つ、またはそれを超える、例えば全てを含む、請求項２５４〜３０６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３７６】
前記グリカンポリマーおよび／またはグリカンポリマー調製物が、以下の特徴：
ｉ．前記グリカンポリマーが、キシロースおよび少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含み、任意選択により、前記アルファ−グリコシド結合がアルファ−１，３グリコシド結合であり、さらに任意選択により、前記調製物の平均重合度（ＤＰ）がＤＰ２〜４、ＤＰ２〜６、ＤＰ３〜１０、またはＤＰ３〜１５である；
ｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含む；
ｉｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、ガラクトースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｘｙｌ−ｇａｌ調製物）；
ｉｖ．前記グリカンポリマー調製物が、アラビノースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｘｙｌ−ａｒａ調製物）；および
ｖ．前記グリカンポリマー調製物が、ガラクトースおよびアラビノースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｘｙｌ−ａｒａ−ｇａｌ調製物）；
のうちの１つ、２つ、３つ、またはそれを超える、例えば全てを含む、請求項２５４〜３０６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３７７】
前記グリカンポリマーおよび／またはグリカンポリマー調製物が、以下の特徴：
ｉ．前記グリカンポリマーが、グルコースおよび少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含み、任意選択により、前記アルファ−グリコシド結合がアルファ−１，３グリコシド結合であり、さらに任意選択により、前記調製物の平均重合度（ＤＰ）がＤＰ２〜４、ＤＰ２〜６、ＤＰ３〜１０、またはＤＰ３〜１５である；
ｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含む；および
ｉｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、アラビノース、ガラクトースまたはキシロースのうちの１つ、２つ、または３つを含むグリカンポリマーをさらに含む
のうちの１つ、２つ、またはそれを超える、例えば全てを含む、請求項２５４〜３０６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３７８】
前記グリカンポリマーおよび／またはグリカンポリマー調製物が、以下の特徴：
ｉ．前記グリカンポリマーが、グルコースおよび少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含み、任意選択により、前記調製物の平均重合度（ＤＰ）がＤＰ２〜４、ＤＰ２〜６、ＤＰ３〜１０、またはＤＰ３〜１５である；
ｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、アルファ−１，２グリコシド結合、アルファ−１，３グリコシド結合、アルファ−１，４グリコシド結合、アルファ−１，６グリコシド結合、またはそれらの組み合わせを含むグリカンポリマーをさらに含む；
ｉｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含む；および
ｉｖ．前記グリカンポリマー調製物が、ガラクトース、マンノース、アラビノース、またはシアル酸のうちの１つ、２つ、３つ、または４つを含むグリカンポリマーをさらに含む。
のうちの１つ、２つ、３つ、またはそれを超える、例えば全てを含む、請求項２５４〜３０６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３７９】
前記グリカンポリマーおよび／またはグリカンポリマー調製物が、以下の特徴：
ｉ．前記グリカンポリマーが、グルコースおよび少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含み、任意選択により、前記アルファ−グリコシド結合がアルファ−１，３グリコシド結合であり、さらに任意選択により、前記調製物の平均重合度（ＤＰ）がＤＰ２〜４、ＤＰ２〜６、ＤＰ３〜１０、またはＤＰ３〜１５である；
ｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含む；
ｉｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、キシロースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇｌｕ−ｘｙｌ調製物）；および
ｉｖ．前記グリカンポリマー調製物が、マンノース、アラビノース、またはガラクトースのうちの１つ、２つ、または３つを含むグリカンポリマーをさらに含む
のうちの１つ、２つ、３つ、またはそれを超える、例えば全てを含む、請求項２５４〜３０６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３８０】
前記グリカンポリマーおよび／またはグリカンポリマー調製物が、以下の特徴：
ｉ．前記グリカンポリマーが、グルコースおよび少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含み、任意選択により、前記調製物の平均重合度（ＤＰ）がＤＰ２〜４、ＤＰ２〜６、ＤＰ３〜１０、またはＤＰ３〜１５である；
ｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含み、任意選択により、前記アルファ−グリコシド結合が、アルファ−１，３グリコシド結合である；
ｉｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含む；
ｉｖ．前記グリカンポリマー調製物が、キシロースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇｌｕ−ｘｙｌ調製物）；および
ｖ．前記グリカンポリマー調製物が、マンノース、アラビノース、またはガラクトースのうちの１つ、２つ、または３つを含むグリカンポリマーをさらに含む
のうちの１つ、２つ、３つ、またはそれを超える、例えば全てを含む、請求項２５４〜３０６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３８１】
前記グリカンポリマーおよび／またはグリカンポリマー調製物が、以下の特徴：
ｉ．前記グリカンポリマーが、キシロースおよび少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含み、任意選択により、前記アルファ−グリコシド結合がアルファ−１，３グリコシド結合であり、さらに任意選択により、前記調製物の平均重合度（ＤＰ）がＤＰ２〜４、ＤＰ２〜６、ＤＰ３〜１０、またはＤＰ３〜１５である；
ｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含む；
ｉｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、グルコースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｘｙｌ−ｇｌｕ調製物）；および
ｉｖ．前記グリカンポリマー調製物が、マンノース、アラビノース、またはガラクトースのうちの１つ、２つ、または３つを含むグリカンポリマーをさらに含む
のうちの１つ、２つ、３つ、またはそれを超える、例えば全てを含む、請求項２５４〜３０６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３８２】
前記グリカンポリマーおよび／またはグリカンポリマー調製物が、以下の特徴：
ｉ．前記グリカンポリマーが、キシロースおよび少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含み、さらに任意選択により、前記調製物の平均重合度（ＤＰ）がＤＰ２〜４、ＤＰ２〜６、ＤＰ３〜１０、またはＤＰ３〜１５である；
ｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含み、任意選択により、前記アルファ−グリコシド結合が、アルファ−１，３グリコシド結合である；
ｉｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含む；
ｉｖ．前記グリカンポリマー調製物が、グルコースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｘｙｌ−ｇｌｕ調製物）；および
ｖ．前記グリカンポリマー調製物が、マンノース、アラビノース、またはガラクトースのうちの１つ、２つ、または３つを含むグリカンポリマーをさらに含む
のうちの１つ、２つ、３つ、またはそれを超える、例えば全てを含む、請求項２５４〜３０６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３８３】
前記グリカンポリマーおよび／またはグリカンポリマー調製物が、以下の特徴：
ｉ．前記グリカンポリマーが、グルコースおよび少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含み、任意選択により、前記アルファ−グリコシド結合がアルファ−１，３グリコシド結合であり、さらに任意選択により、前記調製物の平均重合度（ＤＰ）がＤＰ２〜４、ＤＰ２〜６、ＤＰ３〜１０、またはＤＰ３〜１５である；
ｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、アルファ−１，２グリコシド結合、アルファ−１，４グリコシド結合、アルファ−１，６グリコシド結合、またはそれらの組み合わせを含むグリカンポリマーをさらに含む；
ｉｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含む；
ｉｖ．前記グリカンポリマー調製物が、キシロースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇｌｕ−ｘｙｌ調製物）；
ｖ．前記グリカンポリマー調製物が、アラビノースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇｌｕ−ａｒａ調製物）；
ｖｉ．前記グリカンポリマー調製物が、ガラクトースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇｌｕ−ｇａｌ調製物）；および
ｖｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、キシロース、アラビノース、またはガラクトースのうちの１つ、２つ、または３つを含むグリカンポリマーをさらに含む
のうちの１つ、２つ、３つ、またはそれを超える、例えば全てを含む、請求項２５４〜３０６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３８４】
前記グリカンポリマーおよび／またはグリカンポリマー調製物が、以下の特徴：
ｉ．前記グリカンポリマーが、キシロースおよび少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含み、任意選択により、前記アルファ−グリコシド結合がアルファ−１，３グリコシド結合であり、さらに任意選択により、前記調製物の平均重合度（ＤＰ）がＤＰ２〜４、ＤＰ２〜６、ＤＰ３〜１０、またはＤＰ３〜１５である；
ｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、アルファ−１，２グリコシド結合、アルファ−１，４グリコシド結合、アルファ−１，６グリコシド結合、またはそれらの組み合わせを含むグリカンポリマーをさらに含む；
ｉｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含む；
ｉｖ．前記グリカンポリマー調製物が、グルコースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｘｙｌ−ｇｌｕ調製物）；
ｖ．前記グリカンポリマー調製物が、アラビノースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｘｙｌ−ａｒａ調製物）；
ｖｉ．前記グリカンポリマー調製物が、ガラクトースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｘｙｌ−ｇａｌ調製物）；および
ｖｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、グルコース、アラビノース、またはガラクトースのうちの１つ、２つ、または３つを含むグリカンポリマーをさらに含む
のうちの１つ、２つ、３つ、またはそれを超える、例えば全てを含む、請求項２５４〜３０６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３８５】
前記グリカンポリマーおよび／またはグリカンポリマー調製物が、以下の特徴：
ｉ．前記グリカンポリマーが、アラビノースおよび少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含み、任意選択により、前記アルファ−グリコシド結合がアルファ−１，３グリコシド結合であり、さらに任意選択により、前記調製物の平均重合度（ＤＰ）がＤＰ２〜４、ＤＰ２〜６、ＤＰ３〜１０、またはＤＰ３〜１５である；
ｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、アルファ−１，２グリコシド結合、アルファ−１，４グリコシド結合、アルファ−１，６グリコシド結合、またはそれらの組み合わせを含むグリカンポリマーをさらに含む；
ｉｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含む；
ｉｖ．前記グリカンポリマー調製物が、キシロースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ａｒａ−ｘｙｌ調製物）；
ｖ．前記グリカンポリマー調製物が、グルコースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ａｒａ−ｇｌｕ調製物）；
ｖｉ．前記グリカンポリマー調製物が、ガラクトースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ａｒａ−ｇａｌ調製物）；および
ｖｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、キシロース、グルコース、またはガラクトースのうちの１つ、２つ、または３つを含むグリカンポリマーをさらに含む
のうちの１つ、２つ、３つ、またはそれを超える、例えば全てを含む、請求項２５４〜３０６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３８６】
前記グリカンポリマーおよび／またはグリカンポリマー調製物が、以下の特徴：
ｉ．グリカンポリマーが、ガラクトースおよび少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含み、任意選択により、前記アルファ−グリコシド結合がアルファ−１，３グリコシド結合であり、さらに任意選択により、前記調製物の平均重合度（ＤＰ）がＤＰ２〜４、ＤＰ２〜６、ＤＰ３〜１０、またはＤＰ３〜１５である；
ｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、アルファ−１，２グリコシド結合、アルファ−１，４グリコシド結合、アルファ−１，６グリコシド結合、またはそれらの組み合わせを含むグリカンポリマーをさらに含む；
ｉｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含む；
ｉｖ．前記グリカンポリマー調製物が、キシロースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇａｌ−ｘｙｌ調製物）；
ｖ．前記グリカンポリマー調製物が、アラビノースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇａｌ−ａｒａ調製物）；
ｖｉ．前記グリカンポリマー調製物が、グルコースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇａｌ−ｇｌｕ調製物）；および
ｖｉｉ．前記グリカンポリマー調製物が、キシロース、アラビノース、またはグルコースのうちの１つ、２つ、または３つを含むグリカンポリマーをさらに含む
のうちの１つ、２つ、３つ、またはそれを超える、例えば全てを含む、請求項２５４〜３０６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３８７】
前記グリカンポリマーが、ＧＴ５、ＧＨ９４、ＧＨ１３サブファミリー９、ＧＨ１３サブファミリー３９、ＧＨ１３サブファミリー３６、ＧＨ１１３またはＧＨ１１２  ＣＡＺｙファミリーの１つ以上、例えば、２つ、３つ、４つ、またはそれを超える、から選択されるヒト腸内微生物グリコシダーゼ酵素の基質である、請求項３５１、３５２、または３５７〜３６２のいずれかに記載の方法。
【請求項３８８】
前記グリカンポリマーが、ＧＴ２、ＧＴ４、ＧＴ５、ＧＴ３５、ＧＴ５１、ＧＨ１、ＧＨ２、ＧＨ３、ＧＨ４、ＧＨ１３、ＧＨ１３サブファミリー９、ＧＨ１３サブファミリー３１、ＧＨ１８、ＧＨ２３、ＧＨ２５、ＧＨ２８、ＧＨ３１、ＧＨ３２、ＧＨ３６、ＧＨ５１、ＧＨ７３、ＧＨ７７またはＧＨ９４  ＣＡＺｙファミリーの１つ以上、例えば、２つ、３つ、４つ、またはそれを超える、から選択されるヒト腸内微生物グリコシダーゼ酵素の基質である、請求項３５１、３５２、または３５７〜３６２のいずれかに記載の方法。
【請求項３８９】
前記グリカンポリマーが、ＧＴ１１、ＧＴ１０、ＧＨ９２、ＧＨ５１、ＧＨ３５、ＧＨ２９、ＧＨ２８、ＧＨ２０、ＧＨ１３０、ＧＨ１３サブファミリー８、またはＧＨ１３サブファミリー１４  ＣＡＺｙファミリーの１つ以上、例えば、２つ、３つ、４つ、またはそれを超える、から選択されるヒト腸内微生物グリコシダーゼ酵素の基質である、請求項３５３、３５４、または３６３〜３７０のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３９０】
前記グリカンポリマーが、ＧＴ２、ＧＴ４、ＧＨ２、ＧＨ２３、ＧＨ３、ＧＴ８、ＧＴ５１、ＧＴ９、ＧＨ１、ＧＨ９２、ＧＨ７３、ＧＨ３１、ＧＨ２０、ＧＨ２８、ＧＴ２５、ＧＴ２８、ＧＴ３５、ＧＨ１８、ＧＴ０、ＧＨ１３、ＧＨ３６、ＧＨ９７、ＧＨ１０５、ＧＨ２５、ＧＨ４、ＧＨ３２、ＧＨ７８、ＧＨ２９、ＧＨ０、ＧＨ５１、ＧＴ１０、またはＧＨ７７  ＣＡＺｙファミリーの１つ以上、例えば、２つ、３つ、４つ、またはそれを超える、から選択されるヒト腸内微生物グリコシダーゼ酵素の基質である、請求項３５３、３５４、または３６３〜３７０のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３９１】
前記グリカンポリマーが、ＧＴ３、ＧＨ９７、ＧＨ４３サブファミリー２４、ＧＨ２７、ＧＨ１３３、ＧＨ１３サブファミリー８、またはＧＨ１３  ＣＡＺｙファミリーの１つ以上、例えば、２つ、３つ、４つ、またはそれを超える、から選択されるヒト腸内微生物グリコシダーゼ酵素の基質である、請求項３５５、３５６、または３７１〜３７３のいずれかに記載の方法。
【請求項３９２】
前記グリカンポリマーが、ＧＴ２、ＧＴ４、ＧＨ２、ＧＨ２３、ＧＨ３、ＧＴ８、ＧＴ５１、ＧＴ９、ＧＨ１、ＧＨ９２、ＧＨ７３、ＧＨ３１、ＧＨ２０、ＧＨ２８、ＧＴ２５、ＧＴ２８、ＧＴ３５、ＧＨ１８、ＧＴ０、ＧＨ１３、ＧＨ３６、ＧＨ９７、ＧＨ１０５、ＧＨ２５、ＧＨ４、ＧＨ３２、ＧＨ７８、ＧＨ２９、ＧＨ０、ＧＨ５１、ＧＴ１０、ＧＨ７７、ＧＴ２、ＧＴ４、ＧＨ２、ＧＨ２３、ＧＨ３、ＧＴ５１、ＧＨ１、ＧＴ８、ＧＨ９２、ＧＴ９、ＧＨ７３、ＧＨ３１、ＧＨ２０、Ｇｈ２８、ＧＴ３５、ＧＴ２８、ＧＨ１８、ＧＨ１３、ＧＨ９７、ＧＨ２５、ＧＨ３６、ＧＨ４、ＧＨ１０５、ＧＨ３２、ＧＨ７８、ＧＨ２９、ＧＨ０、ＧＴ２５、ＧＨ５１、ＧＨ７７、ＧＨ８８、またはＧＨ２４  ＣＡＺｙファミリーの１つ以上、例えば、２つ、３つ、４つ、またはそれを超える、から選択されるヒト腸内微生物グリコシダーゼ酵素の基質である、請求項３５５、３５６、または３７１〜３７３のいずれかに記載の方法。
【請求項３９３】
前記グリカンポリマーが、ＧＨ１３サブファミリー３、ＧＨ１３サブファミリー３０、ＧＨ３０サブファミリー２、ＧＨ３０サブファミリー５、ＧＨ４３サブファミリー２２、ＧＨ４３サブファミリー８、またはＧＨ８４  ＣＡＺｙファミリーの１つ以上、例えば、２つ、３つ、４つ、またはそれを超える、から選択されるヒト腸内微生物グリコシダーゼ酵素の基質である、請求項３４９、３５０、または３７４〜３７７のいずれかに記載の方法。
【請求項３９４】
前記グリカンポリマーが、ＧＨ３、ＧＨ１０６、ＧＨ１０５、ＧＨ２、ＧＨ２０、ＧＨ２８、ＧＨ７６、ＧＨ９７、またはＧＨ９２  ＣＡＺｙファミリーの１つ以上、例えば、２つ、３つ、４つ、またはそれを超える、から選択されるグリコシダーゼ酵素の基質である、請求項３４９、３５０、または３７４〜３７７のいずれかに記載の方法。
【請求項３９５】
前記グリカンポリマーが、ＧＨ１３サブファミリー１９、ＧＨ１３サブファミリー２１、ＧＨ２３、ＧＨ３３、ＧＨ３７またはＧＨ１０４  ＣＡＺｙファミリーの１つ以上、例えば、２つ、３つ、４つ、またはそれを超える、から選択されるヒト腸内微生物グリコシダーゼ酵素の基質である、請求項３４９、３５０、または３７８のいずれかに記載の方法。
【請求項３９６】
前記グリカンポリマーが、ＧＨ２３、ＧＨ２４、またはＧＨ３３  ＣＡＺｙファミリーの１つ以上、例えば、２つ、３つ、４つ、またはそれを超える、から選択されるヒト腸内微生物グリコシダーゼ酵素の基質である、請求項３４９、３５０、または３７８のいずれかに記載の方法。
【請求項３９７】
前記グリカンポリマーが、ＧＨ１３サブファミリー２０、ＧＨ１３サブファミリー３１、ＧＨ１３サブファミリー３９、ＧＨ３９、ＧＨ４３サブファミリー１１、ＧＨ５サブファミリー４４、またはＧＨ９４  ＣＡＺｙファミリーの１つ以上、例えば、２つ、３つ、４つ、またはそれを超える、から選択されるヒト腸内微生物グリコシダーゼ酵素の基質である、請求項３４９、３５０、または３７９〜３８２のいずれかに記載の方法。
【請求項３９８】
前記グリカンポリマーが、ＧＨ２、ＧＨ３１、ＧＨ２３、ＧＨ１３、またはＧＨ２４  ＣＡＺｙファミリーの１つ以上、例えば、２つ、３つ、４つ、またはそれを超える、から選択されるヒト腸内微生物グリコシダーゼ酵素の基質である、請求項３４９、３５０、または３７９〜３８２のいずれかに記載の方法。
【請求項３９９】
前記グリカンポリマーが、ＧＨ１３サブファミリー３、ＧＨ１３サブファミリー３０、ＧＨ１２１、ＧＨ１５、ＧＨ４３サブファミリー２７、ＧＨ４３サブファミリー３４、またはＧＨ４３サブファミリー８  ＣＡＺｙファミリーの１つ以上、例えば、２つ、３つ、４つ、またはそれを超える、から選択されるヒト腸内微生物グリコシダーゼ酵素の基質である、請求項３４９、３５０、または３８３〜３８６のいずれかに記載の方法。
【請求項４００】
前記グリカンポリマーが、ＧＨ９２、ＧＨ９７、ＧＨ７６、ＧＨ２８、ＧＨ２０、ＧＨ１０５、ＧＨ２、ＧＨ５０、ＧＨ３、またはＧＨ１０６  ＣＡＺｙファミリーの１つ以上、例えば、２つ、３つ、４つ、またはそれを超える、から選択されるヒト腸内微生物グリコシダーゼ酵素の基質である、請求項３４９、３５０、または３８３〜３８６に記載の方法。
【請求項４０１】
前記調製物のグリカンポリマーが、ＧＴ５、ＧＨ９４、ＧＨ１３サブファミリー９、ＧＨ１３サブファミリー３９、ＧＨ１３サブファミリー３６、ＧＨ１１３またはＧＨ１１２  ＣＡＺｙファミリーのグリコシダーゼ酵素を含むヒト腸内微生物の基質である、グリカンポリマー調製物を作製する結果となる条件下で、
複数のグルコース、マンノース、および／またはガラクトースを含有するグリカンサブユニット（例えば、モノマーまたはダイマー）を提供する工程；
前記複数のグリカンサブユニットを、ＧＴ５、ＧＨ９４、ＧＨ１３サブファミリー９、ＧＨ１３サブファミリー３９、ＧＨ１３サブファミリー３６、ＧＨ１１３またはＧＨ１１２  ＣＡＺｙファミリーのうちの１つから選択されるグリコシダーゼ酵素と接触させる工程；
を含む、グリカンポリマー調製物の作製方法。
【請求項４０２】
前記調製物のグリカンポリマーが、ＧＴ２、ＧＴ４、ＧＴ５、ＧＴ３５、ＧＴ５１、ＧＨ１、ＧＨ２、ＧＨ３、ＧＨ４、ＧＨ１３．０、ＧＨ１３．９、ＧＨ１３．３１、ＧＨ１８、ＧＨ２３、ＧＨ２５、ＧＨ２８、ＧＨ３１、ＧＨ３２、ＧＨ３６、ＧＨ５１、ＧＨ７３、ＧＨ７７、ＧＨ９４  ＣＡＺｙファミリーのグリコシダーゼ酵素を含むヒト腸内微生物の基質である、グリカンポリマー調製物を作製する結果となる条件下で、
複数のグルコース、マンノース、および／またはガラクトースを含有するグリカンサブユニット（例えば、モノマーまたはダイマー）を提供する工程；
前記複数のグリカンサブユニットを、ＧＴ２、ＧＴ４、ＧＴ５、ＧＴ３５、ＧＴ５１、ＧＨ１、ＧＨ２、ＧＨ３、ＧＨ４、ＧＨ１３．０、ＧＨ１３．９、ＧＨ１３．３１、ＧＨ１８、ＧＨ２３、ＧＨ２５、ＧＨ２８、ＧＨ３１、ＧＨ３２、ＧＨ３６、ＧＨ５１、ＧＨ７３、ＧＨ７７またはＧＨ９４  ＣＡＺｙファミリー、のうちの１つから選択されるグリコシダーゼ酵素と接触させる工程；
を含む、グリカンポリマー調製物の作製方法。
【請求項４０３】
前記調製物のグリカンポリマーが、ＧＨ１３サブファミリー３、ＧＨ１３サブファミリー３０、ＧＨ３０サブファミリー２、ＧＨ３０サブファミリー５、ＧＨ４３サブファミリー２２、ＧＨ４３サブファミリー８、またはＧＨ８４  ＣＡＺｙファミリーのグリコシダーゼ酵素を含むヒト腸内微生物の基質である、グリカンポリマー調製物を作製する結果となる条件下で、
複数のキシロース、アラビノース、ガラクトースおよび／またはグルコースを含有するグリカンサブユニット（例えば、モノマーまたはダイマー）を提供する工程；
前記複数のグリカンサブユニットを、ＧＨ１３サブファミリー３、ＧＨ１３サブファミリー３０、ＧＨ３０サブファミリー２、ＧＨ３０サブファミリー５、ＧＨ４３サブファミリー２２、ＧＨ４３サブファミリー８、またはＧＨ８４  ＣＡＺｙファミリーのうちの１つから選択されるグリコシダーゼ酵素と接触させる工程、
を含む、グリカンポリマー調製物の作製方法。
【請求項４０４】
前記調製物のグリカンポリマーが、ＧＨ３、ＧＨ１０６、ＧＨ１０５、ＧＨ２、ＧＨ２０、ＧＨ２８、ＧＨ７６、ＧＨ９７、またはＧＨ９２  ＣＡＺｙファミリーのグリコシダーゼ酵素を含むヒト腸内微生物の基質である、グリカンポリマー調製物を作製する結果となる条件下で、
複数のキシロース、アラビノース、ガラクトースおよび／またはグルコースを含有するグリカンサブユニット（例えば、モノマーまたはダイマー）を提供する工程；
前記複数のグリカンサブユニットを、ＧＨ３、ＧＨ１０６、ＧＨ１０５、ＧＨ２、ＧＨ２０、ＧＨ２８、ＧＨ７６、ＧＨ９７、またはＧＨ９２  ＣＡＺｙファミリーのうちの１つから選択されるグリコシダーゼ酵素と接触させる工程；
を含む、グリカンポリマー調製物の作製方法。
【請求項４０５】
前記調製物のグリカンポリマーが、ＧＨ１３サブファミリー１９、ＧＨ１３サブファミリー２１、ＧＨ２３、ＧＨ３３、ＧＨ３７もしくはＧＨ１０４  ＣＡＺｙファミリーのグリコシダーゼ酵素を含むヒト腸内微生物の基質である、グリカンポリマー調製物を作製する結果となる条件下で、
複数のグルコースおよび／またはシアル酸を含有するグリカンサブユニット（例えば、モノマーまたはダイマー）を提供する工程；
前記複数のグリカンサブユニットを、ＧＨ１３サブファミリー１９、ＧＨ１３サブファミリー２１、ＧＨ２３、ＧＨ３３、ＧＨ３７またはＧＨ１０４  ＣＡＺｙファミリーのうちの１つから選択されるグリコシダーゼ酵素と接触させる工程、
を含む、グリカンポリマー調製物の作製方法。
【請求項４０６】
前記調製物のグリカンポリマーが、ＧＨ２３、ＧＨ２４、またはＧＨ３３  ＣＡＺｙファミリーのグリコシダーゼ酵素を含むヒト腸内微生物の基質である、グリカンポリマー調製物を作製する結果となる条件下で、
複数のグルコースおよび／またはシアル酸を含有するグリカンサブユニット（例えば、モノマーまたはダイマー）を提供する工程；
前記複数のグリカンサブユニットを、ＧＨ２３、ＧＨ２４、またはＧＨ３３  ＣＡＺｙファミリーのうちの１つから選択されるグリコシダーゼ酵素と接触させる工程；
を含む、グリカンポリマー調製物の作製方法。
【請求項４０７】
前記調製物のグリカンポリマーが、ＧＨ１３サブファミリー２０、ＧＨ１３サブファミリー３１、ＧＨ１３サブファミリー３９、ＧＨ３９、ＧＨ４３サブファミリー１１、ＧＨ５サブファミリー４４、またはＧＨ９４  ＣＡＺｙファミリーのグリコシダーゼ酵素を含むヒト腸内微生物の基質である、グリカンポリマー調製物を作製する結果となる条件下で、
複数のグルコース、キシロース、マンノース、アラビノース、および／またはガラクトースを含有するグリカンサブユニット（例えば、モノマーまたはダイマー）を提供する工程；
前記複数のグリカンサブユニットを、ＧＨ１３サブファミリー２０、ＧＨ１３サブファミリー３１、ＧＨ１３サブファミリー３９、ＧＨ３９、ＧＨ４３サブファミリー１１、ＧＨ５サブファミリー４４、またはＧＨ９４  ＣＡＺｙファミリーのうちの１つから選択されるグリコシダーゼ酵素と接触させる工程；
を含む、グリカンポリマー調製物の作製方法。
【請求項４０８】
前記調製物のグリカンポリマーが、ＧＨ２、ＧＨ３１、ＧＨ２３、ＧＨ１３、またはＧＨ２４  ＣＡＺｙファミリーのグリコシダーゼ酵素を含むヒト腸内微生物の基質である、グリカンポリマー調製物を作製する結果となる条件下で、
複数のグルコース、キシロース、マンノース、アラビノース、および／またはガラクトースを含有するグリカンサブユニット（例えば、モノマーまたはダイマー）を提供する工程；
前記複数のグリカンサブユニットを、ＧＨ２、ＧＨ３１、ＧＨ２３、ＧＨ１３、またはＧＨ２４  ＣＡＺｙファミリーのうちの１つから選択されるグリコシダーゼ酵素と接触させる工程、
を含む、グリカンポリマー調製物の作製方法。
【請求項４０９】
前記調製物のグリカンポリマーが、ＧＨ１３サブファミリー３、ＧＨ１３サブファミリー３０、ＧＨ１２１、ＧＨ１５、ＧＨ４３サブファミリー２７、ＧＨ４３サブファミリー３４、またはＧＨ４３サブファミリー８  ＣＡＺｙファミリーのグリコシダーゼ酵素を含むヒト腸内微生物の基質である、グリカンポリマー調製物を作製する結果となる条件下で、
複数のグルコース、キシロース、アラビノース、および／またはガラクトースを含有するグリカンサブユニット（例えば、モノマーまたはダイマー）を提供する工程；
前記複数のグリカンサブユニットを、ＧＨ１３サブファミリー３、ＧＨ１３サブファミリー３０、ＧＨ１２１、ＧＨ１５、ＧＨ４３サブファミリー２７、ＧＨ４３サブファミリー３４、またはＧＨ４３サブファミリー８  ＣＡＺｙファミリーのうちの１つから選択されるグリコシダーゼ酵素と接触させる工程、
を含む、グリカンポリマー調製物の作製方法。
【請求項４１０】
前記調製物のグリカンポリマーが、ＧＨ９２、ＧＨ９７、ＧＨ７６、ＧＨ２８、ＧＨ２０、ＧＨ１０５、ＧＨ２、ＧＨ５０、ＧＨ３、またはＧＨ１０６  ＣＡＺｙファミリーのグリコシダーゼ酵素を含むヒト腸内微生物の基質である、グリカンポリマー調製物を作製する結果となる条件下で、
複数のグルコース、キシロース、アラビノース、および／またはガラクトースを含有するグリカンサブユニット（例えば、モノマーまたはダイマー）を提供する工程；
前記複数のグリカンサブユニットを、ＧＨ９２、ＧＨ９７、ＧＨ７６、ＧＨ２８、ＧＨ２０、ＧＨ１０５、ＧＨ２、ＧＨ５０、ＧＨ３、またはＧＨ１０６  ＣＡＺｙファミリーのうちの１つから選択されるグリコシダーゼ酵素と接触させる工程；
を含む、グリカンポリマー調製物の作製方法。
【請求項４１１】
前記調製物のグリカンポリマーが、ＧＴ１１、ＧＴ１０、ＧＨ９２、ＧＨ５１、ＧＨ３５、ＧＨ２９、ＧＨ２８、ＧＨ２０、ＧＨ１３０、ＧＨ１３サブファミリー８、ＧＨ１３サブファミリー１４  ＣＡＺｙファミリーのグリコシダーゼ酵素を含むヒト腸内微生物の基質である、グリカンポリマー調製物を作製する結果となる条件下で、
複数のグルコース、マンノース、および／またはガラクトースを含有するグリカンサブユニット（例えば、モノマーまたはダイマー）を提供する工程；
前記複数のグリカンサブユニットを、ＧＴ１１、ＧＴ１０、ＧＨ９２、ＧＨ５１、ＧＨ３５、ＧＨ２９、ＧＨ２８、ＧＨ２０、ＧＨ１３０、ＧＨ１３サブファミリー８、ＧＨ１３サブファミリー１４  ＣＡＺｙファミリーのうちの１つから選択されるグリコシダーゼ酵素と接触させる工程；
を含む、グリカンポリマー調製物の作製方法。
【請求項４１２】
前記調製物のグリカンポリマーが、ＧＴ２、ＧＴ４、ＧＨ２、ＧＨ２３、ＧＨ３、ＧＴ８、ＧＴ５１、ＧＴ９、ＧＨ１、ＧＨ９２、ＧＨ７３、ＧＨ３１、ＧＨ２０、ＧＨ２８、ＧＴ２５、ＧＴ２８、ＧＴ３５、ＧＨ１８、ＧＴ０、ＧＨ１３、ＧＨ３６、ＧＨ９７、ＧＨ１０５、ＧＨ２５、ＧＨ４、ＧＨ３２、ＧＨ７８、ＧＨ２９、ＧＨ０、ＧＨ５１、ＧＴ１０、ＧＨ７７  ＣＡＺｙファミリーのグリコシダーゼ酵素を含むヒト腸内微生物の基質である、グリカンポリマー調製物を作製する結果となる条件下で、
複数のグルコース、マンノース、および／またはガラクトースを含有するグリカンサブユニット（例えば、モノマーまたはダイマー）を提供する工程；
ＧＴ２、ＧＴ４、ＧＨ２、ＧＨ２３、ＧＨ３、ＧＴ８、ＧＴ５１、ＧＴ９、ＧＨ１、ＧＨ９２、ＧＨ７３、ＧＨ３１、ＧＨ２０、ＧＨ２８、ＧＴ２５、ＧＴ２８、ＧＴ３５、ＧＨ１８、ＧＴ０、ＧＨ１３、ＧＨ３６、ＧＨ９７、ＧＨ１０５、ＧＨ２５、ＧＨ４、ＧＨ３２、ＧＨ７８、ＧＨ２９、ＧＨ０、ＧＨ５１、ＧＴ１０、ＧＨ７７  ＣＡＺｙファミリーのうちの１つから選択されるグリコシダーゼ酵素と前記複数のグリカンサブユニットを接触させる工程、
を含む、グリカンポリマー調製物の作製方法。
【請求項４１３】
前記調製物のグリカンポリマーが、ＧＴ１１、ＧＴ１０、ＧＨ９２、ＧＨ５１、ＧＨ３５、ＧＨ２９、ＧＨ２８、ＧＨ２０、ＧＨ１３０、ＧＨ１３サブファミリー８、ＧＨ１３サブファミリー１４  ＣＡＺｙファミリーのグリコシダーゼ酵素を含むヒト腸内微生物の基質である、グリカンポリマー調製物を作製する結果となる条件下で、
複数のキシロース、アラビノース、フコースおよび／またはラムノースを含有するグリカンサブユニット（例えば、モノマーまたはダイマー）を提供する工程；
前記複数のグリカンサブユニットを、ＧＴ１１、ＧＴ１０、ＧＨ９２、ＧＨ５１、ＧＨ３５、ＧＨ２９、ＧＨ２８、ＧＨ２０、ＧＨ１３０、ＧＨ１３サブファミリー８、ＧＨ１３サブファミリー１４  ＣＡＺｙファミリーのうちの１つから選択されるグリコシダーゼ酵素と接触させる工程；
を含む、グリカンポリマー調製物の作製方法。
【請求項４１４】
グリカンポリマー調製物を作製する結果となる条件下、例えば、前記基質およびグリコシダーゼ酵素と同じ行の列Ｆ、Ｇ、Ｈ、Ｉ、Ｊ、Ｋ、および／またはＬの条件下で、
表２３の列Ｅの基質の複数のグリカンサブユニット、例えば、モノマーまたはダイマーを提供する工程；
基質の前記複数のグリカンサブユニットを、基質と同じ行の列Ａのグリコシダーゼ酵素と接触させる工程；
を含む、グリカンポリマー調製物の作製方法。
【請求項４１５】
前記グリカンポリマー調製物が、約２〜４または約２〜５の平均ＤＰを有する、請求項４１４に記載の方法。
【請求項４１６】
前記グリカンポリマー調製物が、少なくとも２０％、３０％、４０％、５０％または少なくとも６０％（モル％）の１，４グリコシド結合を含む、請求項４１４または４１５のいずれかに記載の方法。
【請求項４１７】
前記グリカンポリマー調製物が、少なくとも８０％、９０％、少なくとも９５％、または１００％（モル％）の１，４グリコシド結合を含む、請求項４１４または４１５のいずれかに記載の方法。
【請求項４１８】
前記グリカンポリマー調製物が、少なくとも２０％、３０％、４０％、５０％または少なくとも６０％（モル％）の１，６グリコシド結合を含む、請求項４１４または４１５のいずれかに記載の方法。
【請求項４１９】
前記グリカンポリマー調製物が、少なくとも８０％、９０％、少なくとも９５％、または１００％（モル％）の１，６グリコシド結合を含む、請求項４１４または４１５のいずれかに記載の方法。
【請求項４２０】
前記グリカンポリマー調製物が、１０％以下、５％、１％以下または０％の１，２グリコシド結合を含む、請求項４１４または４１５のいずれかに記載の方法。
【請求項４２１】
前記グリカンポリマー調製物が、１０％以下、５％、１％以下または０％の１，３グリコシド結合を含む、請求項４１４または４１５のいずれかに記載の方法。
【請求項４２２】
前記グリカンポリマー調製物が、１０％以下、５％、１％以下または０％の１，４グリコシド結合を含む、請求項４１４または４１５のいずれかに記載の方法。
【請求項４２３】
前記グリカンポリマー調製物が、１０％以下、５％、１％以下または０％の１，６グリコシド結合を含む、請求項４１４または４１５のいずれかに記載の方法。
【請求項４２４】
前記グリコシド結合分布（モル％）が、
ａ）アルファ−１，２が１０％未満、アルファ１，３が１０％未満、アルファ１，４が少なくとも３０％、アルファ１，６が少なくとも３０％、ベータ１，２が５％未満、ベータ１，３が５％未満、ベータ１，４／１，６が５％未満、
ｂ）アルファ−１，２が５％未満、アルファ１，３が５％未満、アルファ１，４が少なくとも５％、アルファ１，６が５％未満、ベータ１，２が少なくとも１％、ベータ１，３が少なくとも１％、ベータ１，４／１，６が少なくとも８５％、
ｃ）アルファ−１，２が５％未満、アルファ１，３が５％未満、アルファ１，４が５％未満、アルファ１，６が少なくとも８５％、ベータ１，２が５％未満、ベータ１，３が５％未満、ベータ１，４／１，６が５％未満、
ｄ）アルファ−１，２が１０％未満、アルファ１，３が５％未満、アルファ１，４が少なくとも１５％、アルファ１，６が少なくとも５０％、ベータ１，２が５％未満、ベータ１，３が５％未満、ベータ１，４／１，６が５％未満、
ｅ）アルファ−１，２が５％未満、アルファ１，３が５％未満、アルファ１，４が１５％未満、アルファ１，６が少なくとも８５％、ベータ１，２が５％未満、ベータ１，３が５％未満、ベータ１，４／１，６が５％未満、
ｆ）アルファ−１，２が５％未満、アルファ１，３が５％未満、アルファ１，４が５％未満、アルファ１，６が５％未満、ベータ１，２が５％未満、ベータ１，３が５％未満、ベータ１，４／１，６が少なくとも８５％、
ｇ）アルファ−１，２が５％未満、アルファ１，３が５％未満、アルファ１，４が少なくとも５０％、アルファ１，６が少なくとも５％、ベータ１，２が１０％未満、ベータ１，３が５％未満、ベータ１，４／１，６が少なくとも１０％、
のうちの１つである、請求項４１４または４１５のいずれかに記載の方法。
【請求項４２５】
前記調製物のグリカンポリマーが、ＧＴ２、ＧＴ４、ＧＨ２、ＧＨ２３、ＧＨ３、ＧＴ８、ＧＴ５１、ＧＴ９、ＧＨ１、ＧＨ９２、ＧＨ７３、ＧＨ３１、ＧＨ２０、ＧＨ２８、ＧＴ２５、ＧＴ２８、ＧＴ３５、ＧＨ１８、ＧＴ０、ＧＨ１３、ＧＨ３６、ＧＨ９７、ＧＨ１０５、ＧＨ２５、ＧＨ４、ＧＨ３２、ＧＨ７８、ＧＨ２９、ＧＨ０、ＧＨ５１、ＧＴ１０、ＧＨ７７  ＣＡＺｙファミリーのグリコシダーゼ酵素を含むヒト腸内微生物の基質である、グリカンポリマー調製物を作製する結果となる条件下で、
複数のキシロース、アラビノース、フコースおよび／またはラムノースを含有するグリカンサブユニット（例えば、モノマーまたはダイマー）を提供する工程；
ＧＴ２、ＧＴ４、ＧＨ２、ＧＨ２３、ＧＨ３、ＧＴ８、ＧＴ５１、ＧＴ９、ＧＨ１、ＧＨ９２、ＧＨ７３、ＧＨ３１、ＧＨ２０、ＧＨ２８、ＧＴ２５、ＧＴ２８、ＧＴ３５、ＧＨ１８、ＧＴ０、ＧＨ１３、ＧＨ３６、ＧＨ９７、ＧＨ１０５、ＧＨ２５、ＧＨ４、ＧＨ３２、ＧＨ７８、ＧＨ２９、ＧＨ０、ＧＨ５１、ＧＴ１０、ＧＨ７７  ＣＡＺｙファミリーのうちの１つから選択されるグリコシダーゼ酵素と前記複数のグリカンサブユニットを接触させる工程、
を含む、グリカンポリマー調製物の作製方法。
【請求項４２６】
前記調製物のグリカンポリマーが、ＧＴ３、ＧＨ９７、ＧＨ４３サブファミリー２４、ＧＨ２７、ＧＨ１３３、ＧＨ１３サブファミリー８、ＧＨ１３  ＣＡＺｙファミリーのグリコシダーゼ酵素を含むヒト腸内微生物の基質である、グリカンポリマー調製物を作製する結果となる条件下で、
複数のグルコースおよび／またはガラクトースを含有するグリカンサブユニット（例えば、モノマーまたはダイマー）を提供する工程；
前記複数のグリカンサブユニットを、ＧＴ３、ＧＨ９７、ＧＨ４３サブファミリー２４、ＧＨ２７、ＧＨ１３３、ＧＨ１３サブファミリー８、ＧＨ１３  ＣＡＺｙファミリーのうちの１つから選択されるグリコシダーゼ酵素と接触させる工程、
を含む、グリカンポリマー調製物の作製方法。
【請求項４２７】
前記調製物のグリカンポリマーが、ＧＴ２、ＧＴ４、ＧＨ２、ＧＨ２３、ＧＨ３、ＧＴ８、ＧＴ５１、ＧＴ９、ＧＨ１、ＧＨ９２、ＧＨ７３、ＧＨ３１、ＧＨ２０、ＧＨ２８、ＧＴ２５、ＧＴ２８、ＧＴ３５、ＧＨ１８、ＧＴ０、ＧＨ１３、ＧＨ３６、ＧＨ９７、ＧＨ１０５、ＧＨ２５、ＧＨ４、ＧＨ３２、ＧＨ７８、ＧＨ２９、ＧＨ０、ＧＨ５１、ＧＴ１０、ＧＨ７７、ＧＴ２、ＧＴ４、ＧＨ２、ＧＨ２３、ＧＨ３、ＧＴ５１、ＧＨ１、ＧＴ８、ＧＨ９２、ＧＴ９、ＧＨ７３、ＧＨ３１、ＧＨ２０、Ｇｈ２８、ＧＴ３５、ＧＴ２８、ＧＨ１８、ＧＨ１３、ＧＨ９７、ＧＨ２５、ＧＨ３６、ＧＨ４、ＧＨ１０５、ＧＨ３２、ＧＨ７８、ＧＨ２９、ＧＨ０、ＧＴ２５、ＧＨ５１、ＧＨ７７、ＧＨ８８、ＧＨ２４  ＣＡＺｙファミリーのグリコシダーゼ酵素を含むヒト腸内微生物の基質である、グリカンポリマー調製物を作製する結果となる条件下で、
複数のグルコースおよび／またはガラクトースを含有するグリカンサブユニット（例えば、モノマーまたはダイマー）を提供する工程；
前記複数のグリカンサブユニットを、ＧＴ２、ＧＴ４、ＧＨ２、ＧＨ２３、ＧＨ３、ＧＴ８、ＧＴ５１、ＧＴ９、ＧＨ１、ＧＨ９２、ＧＨ７３、ＧＨ３１、ＧＨ２０、ＧＨ２８、ＧＴ２５、ＧＴ２８、ＧＴ３５、ＧＨ１８、ＧＴ０、ＧＨ１３、ＧＨ３６、ＧＨ９７、ＧＨ１０５、ＧＨ２５、ＧＨ４、ＧＨ３２、ＧＨ７８、ＧＨ２９、ＧＨ０、ＧＨ５１、ＧＴ１０、ＧＨ７７、ＧＴ２、ＧＴ４、ＧＨ２、ＧＨ２３、ＧＨ３、ＧＴ５１、ＧＨ１、ＧＴ８、ＧＨ９２、ＧＴ９、ＧＨ７３、ＧＨ３１、ＧＨ２０、Ｇｈ２８、ＧＴ３５、ＧＴ２８、ＧＨ１８、ＧＨ１３、ＧＨ９７、ＧＨ２５、ＧＨ３６、ＧＨ４、ＧＨ１０５、ＧＨ３２、ＧＨ７８、ＧＨ２９、ＧＨ０、ＧＴ２５、ＧＨ５１、ＧＨ７７、ＧＨ８８、ＧＨ２４  ＣＡＺｙファミリーのうちの１つから選択されるグリコシダーゼ酵素と接触させる工程、
を含む、グリカンポリマー調製物の作製方法。
【請求項４２８】
前記グリコシダーゼ酵素または前記グリコシダーゼ酵素分子が、ＧＨ１、ＧＨ２、ＧＨ３、ＧＨ３５、ＧＨ４２、およびＧＨ５０のうちの１つ以上のもの以外である、請求項４０１〜４１３または４２５〜４２７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項４２９】
前記グリコシダーゼ酵素または前記グリコシダーゼ酵素分子が、ＧＨ３２、ＧＨ６８、ＧＨ１００のうちの１つ以上のもの以外である、請求項４０１〜４１３または４２５〜４２７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項４３０】
前記グリコシダーゼ酵素または前記グリコシダーゼ酵素分子が、ＧＨ１、ＧＨ２、ＧＨ３、ＧＨ４、ＧＨ５、ＧＨ８、ＧＨ９、ＧＨ１０、ＧＨ１１、ＧＨ１２、ＧＨ１３、ＧＨ１４、ＧＨ１６、ＧＨ２６、ＧＨ２８、ＧＨ３０、ＧＨ３１、ＧＨ３２、ＧＨ３５、ＧＨ４２、ＧＨ４３、ＧＨ４４、ＧＨ５０、ＧＨ５１、ＧＨ５７、ＧＨ６２、ＧＨ６３、ＧＨ６８、ＧＨ７０、ＧＨ９７、ＧＨ１００、ＧＨ１１６、ＧＨ１１９、ＧＨ１２２のうちの１つ以上のもの以外である、請求項４０１〜４１３または４２５〜４２７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項４３１】
本明細書に開示される方法によって、例えば、請求項２５４〜４３０のいずれかに記載の方法によって、作製される、産生可能な、または作製可能な、グリカンポリマー調製物。
【請求項４３２】
本明細書に開示される方法によって、例えば、請求項２５４〜４３０のいずれかに記載の方法によって、選択される、または選択可能な、グリカンポリマー調製物。
【請求項４３３】
医薬組成物、医療用食品、栄養補助食品、食品成分、または治療用栄養製品として製剤化された、請求項４３１に記載のグリカンポリマー調製物。
【請求項４３４】
賦形剤または担体をさらに含む、請求項４３１のグリカンポリマー調製物。
【請求項４３５】
請求項４３１〜４３４のいずれか一項に記載のグリカン調製物を含む、単位剤形。
【請求項４３６】
経腸投与、経口、経口または経直腸投与、または経管栄養のために製剤化された、請求項４３５に記載の単位剤形。
【請求項４３７】
粉末またはシロップとして製剤化された、請求項４３５または４３６のいずれかに記載の単位剤形。
【請求項４３８】
結腸または大腸における時限放出および／または標的放出のために製剤化された、請求項４３５〜４３７のいずれか一項に記載の単位剤形。
【請求項４３９】
請求項４３１〜４３４のいずれか一項に記載のグリカンポリマー調製物を含む、医薬組成物。
【請求項４４０】
請求項４３１〜４３４のいずれか一項に記載のグリカンポリマー調製物を含む、医療用食品。
【請求項４４１】
請求項４３１〜４３４のいずれか一項に記載のグリカンポリマー調製物を含む、栄養補助食品。
【請求項４４２】
請求項４３１〜４３４のいずれか一項に記載のグリカンポリマー調製物を含む、食品成分。
【請求項４４３】
請求項４３１〜４３４のいずれか一項に記載のグリカンポリマー調製物を含む、治療用栄養製品。
【請求項４４４】
本明細書に記載の、例えば、請求項２５４〜４３０のいずれか一項に記載の方法によって生成される、反応混合物であって、
少なくとも０．２５、０．５、１、５、１０、２０、５０、１００、２００、３００、４００または５００キログラムのグリカンポリマーを含むグリカンポリマー調製物を産生するのに適した量で、および／または少なくとも約１５％、３０％、４５％、６０％、または約７５％（投入グリカンサブユニットの％として重量／重量基準で決定される場合）の収率を得るのに適当な条件下で、
前記グリカンポリマーの製造に適した複数のグリカンサブユニット、例えば糖モノマーまたは糖ダイマー；および
グリコシダーゼ酵素分子（例えば、表４（列２）、表２３（列Ａ）、表２４（列Ａ）、または表２２（列１））；またはグリコ分類群（ｇｌｙｃｏｔａｘａ）クラス１、クラス２、クラス３、クラス４、クラス５、クラス６、もしくはクラス７に関連する１つ以上のグリコシダーゼ酵素）、
を含む反応混合物。
【請求項４４５】
本明細書に記載の方法、例えば、請求項２５４〜４３０のいずれかの方法、の実施に適した、請求項４４４に記載の反応混合物。
【請求項４４６】
請求項４３１に記載の調製物を、医薬組成物、医療用食品、栄養補助食品、食品成分、または治療用栄養製品に製剤化することを含む、医薬組成物、医療用食品、栄養補助食品、食品成分、または治療用栄養製品を作製する方法。
【請求項４４７】
前記調製物を、複数の部分、例えば、単位用量または製剤、例えば、少なくとも１０、１００、または少なくとも１，０００の部分、に分割する工程を含む、請求項４４６に記載の方法。
【請求項４４８】
前記調製物を賦形剤と組み合わせる工程を含む、請求項４４６に記載の方法。
【請求項４４９】
請求項４３１に記載のグリカンポリマー調製物、またはその一部。
【請求項４５０】
請求項４３１に記載のグリカンポリマー調製物の画分、例えば、分子量画分。
【請求項４５１】
前記画分が、前記グリカン調製物のものとは異なる平均ＤＰ、例えば、約３、４、または５の平均ＤＰを含む、請求項４５０に記載の分子量画分。
【請求項４５２】
請求項２５４〜４３０のいずれかに記載の方法によって作製される、または作製可能なグリカンポリマーの調製物を作製、評価、選択、分類、または提供する方法であって、
候補調製物を取得する工程；
前記調製物に関するパラメータ、例えば、物理的パラメータ、例えば、分子量、例えば、平均分子量もしくは分子量分布、グリカンサブユニット組成または純度、または生物学的特性に関するパラメータ、例えば、前記ヒト腸内微生物の増殖を調節する能力、微生物によって産生される微生物代謝産物を、例えばエクスビボアッセイにおいて、調節する能力、またはバイオマーカー、例えば、炎症もしくは免疫バイオマーカー、毒性もしくは廃棄化合物、細菌化合物）を例えば、ヒト対象において、調節する能力、の値を、例えばアッセイを実施することによって、取得する工程；および
前記値を基準値と比較する工程、
それにより、グリカンポリマーの調製物を作製、評価、選択、分類、または提供する工程
を含む方法。
【請求項４５３】
前記値を取得するためのアッセイを実行する工程を含む、請求項４５２に記載の方法。
【請求項４５４】
他者から前記値を取得する工程を含む、請求項４５２に記載の方法。
【請求項４５５】
前記値を参照値と比較して、例えば、使用への、例えばグリカンポリマーの調製物としての、適合性について、または、産物もしくは剤形、例えば本明細書に記載の産物または剤形への製剤化について、前記候補を評価する、請求項４５２〜４５４のいずれかに記載の方法。
【請求項４５６】
標的ヒト腸内微生物を調節する医薬組成物を作製する方法であって、
複数のグリカンサブユニットを提供する工程；
前記複数のグリカンサブユニットを、前記標的腸内微生物中に存在するグリコシダーゼ活性を有するグリコシダーゼ酵素組成物と、前記グリカンサブユニットのグリカンポリマーへの組み込みを生じる条件下で、接触させる工程、
任意選択により、前記グリカンポリマーを精製する工程、および
腸への投与および前記腸内微生物の調節のための医薬組成物として前記グリカンポリマーを製剤化し、それにより、前記標的ヒト腸内微生物を調節する医薬組成物を作製する工程
を含む方法。
【請求項４５７】
配列番号１〜１２４の１つ以上から選択される核酸配列と少なくとも８０、８５、９０、９１、９２、９３、９４、９５、９６、９７、９８、９９、または１００％同一である、核酸配列によってコードされるグリコシダーゼ酵素を含むグリコシダーゼ酵素分子の精製調製物であって、前記グリコシダーゼ酵素がヒト腸内微生物中に存在する、精製調製物。
【請求項４５８】
配列番号１〜１２４の１つ以上から選択される核酸配列と少なくとも８０、８５、９０、９１、９２、９３、９４、９５、９６、９７、９８、９９、または１００％同一である、核酸配列を含むベクターであって、前記核酸がヒト腸内微生物中に存在するグリコシダーゼ酵素をコードし、前記ベクターは前記グリコシダーゼ酵素を発現するために使用することができる、ベクター。
【請求項４５９】
配列番号１〜１２４の１つ以上から選択される核酸配列によりコードされるグリコシダーゼ酵素、および前記グリコシダーゼ酵素の基質、例えば、グリカンサブユニット、例えば、モノマーまたはダイマーを含み、前記基質が、例えば、縮合によって、グリカンポリマーを形成するのに十分な量で存在する、反応混合物。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
関連出願
本出願は、２０１６年１２月６日に出願された米国仮特許出願第６２／４３０８９５号、２０１７年１月１３日に出願された米国仮特許出願第６２／４４６３１６号、２０１６年１２月６日に出願された米国仮特許出願第６２／４３０８４９号に対する優先権を主張するものであり、その全内容は参照により本明細書に組み込まれる。
【背景技術】
【０００２】
ヒトの微生物叢は複雑であり、遺伝学、年齢、性別、ストレス、栄養素、および食事に応じて個体によって異なる。微生物叢は、多くの活動を行い、宿主の生理学に影響を及ぼし得る。腸内の微生物叢の調節は、共同体機能および宿主との相互作用を変化させ得る。限られた数のプロバイオティクス細菌が当該技術分野において公知であり、プロバイオティクス細菌がヒトによって摂取される場合、健康上の利益とのいくつかの関連性が文書化されている。いくつかの食品は、ヒト宿主にとって有効であると考えられる特定の細菌の増殖を促進し得る物質を含有する「プレバイオティクス」食品であると見なされる。これらの物質を用いた臨床試験の結果は、その有効性に関して矛盾しており、ヒトの健康に対するその影響は、一般的にわずかであるとして記載されている。従って、微生物叢を調節し、ヒトの健康を改善することができる新規提供が必要とされている。
【発明の概要】
【課題を解決するための手段】
【０００３】
グリカンポリマー調製物およびその組成物を用いて疾患または障害を有する対象を処置する方法が本明細書に記載される。
【０００４】
したがって、一態様では、本発明は、望ましくないレベルの代謝産物（例えば、短鎖脂肪酸（ＳＣＦＡ）（例えば、プロピオネートまたはブチレート）、アンモニア、トリメチルアミン（ＴＭＡ）、トリメチルアミンＮ−オキシド（ＴＭＡＯ）、尿毒症性溶質（例えば、ｐ−クレゾールまたはインドール）、リポ多糖類（ＬＰＳ）、または胆汁酸（例えば、二次胆汁酸））に関連する疾患または障害を有する対象を処置する方法であって、
任意選択により、グリカンポリマー調製物を、それが代謝産物の産生またはレベルを調節することに基づいて、選択する工程、および
代謝産物のレベルの調節をもたらすのに有効な量のグリカンポリマー調製物を投与し、それによって疾患または障害を処置する工程
を含む方法を対象とする。
【０００５】
別の態様では、本発明は、望ましくないレベルの代謝産物（例えば、短鎖脂肪酸（ＳＣＦＡ）（例えば、プロピオネートまたはブチレート）、アンモニア、トリメチルアミン（ＴＭＡ）、トリメチルアミンＮ−オキシド（ＴＭＡＯ）、尿毒症性溶質（例えば、ｐ−クレゾールまたはインドール）、リポ多糖類（ＬＰＳ）、または胆汁酸（例えば、二次胆汁酸））に関連する疾患または障害を有する対象を処置する方法であって、
任意選択により、グリカンポリマー調製物が代謝産物の産生またはレベルを調節するという知見を取得する工程、および
代謝産物のレベルの調節をもたらすのに有効な量のグリカンポリマー調製物を投与し、それによって疾患または障害を処置する工程
を含む方法を対象とする。
【０００６】
別の態様では、本発明は、対象の体内（例えば、腸（ｇｕｔ）（結腸、腸（ｉｎｔｅｓｔｉｎｅ））、血液、尿、臓器（例えば、肝臓、腎臓）、脳）における産物（例えば、短鎖脂肪酸（ＳＣＦＡ）、アンモニア、トリメチルアミン（ＴＭＡ）、トリメチルアミンＮ−オキシド（ＴＭＡＯ）、尿毒症性溶質、または胆汁酸）の産生またはレベルを調節する方法であって、産物の産生またはレベルを調節するのに十分な有効量のグリカンポリマー調製物を対象に投与する（例えば、経口または経直腸）工程を含み、任意選択により、グリカンポリマーが結腸または腸の微生物成分の基質である、方法を対象とする。
【０００７】
別の態様において、本発明は、予め選択されたヒト腸内微生物（例えば、そのグリコシダーゼプロファイルのために選択された）のグリコシダーゼ酵素（例えば、ＣＡＺｙファミリー）の基質としての使用のためのグリカンポリマー調製物を選択する方法であって、
ａ）微生物のグリコシダーゼ（例えばＣＡＺｙファミリー）プロファイルの値を取得する工程、
ｂ）グリコシダーゼ（例えば、ＣＡＺｙファミリー）プロファイルに基づいて、微生物の基質となり得るグリカンポリマーを同定、設計、または選択する工程、
ｃ）任意選択により、
ｉ．ヒト腸内微生物（例えば、単一株、設計された株の群、または目的の微生物を含むエクスビボの群（例えば、糞便試料由来））のパネルを組み立てる工程
ｉｉ．微生物のパネルを試験グリカン調製物と接触させる工程、
ｉｉｉ．（目的の）ヒト腸内微生物の増殖を評価する工程、
ｄ）グリカンポリマー調製物を選択する工程
を含む方法を対象とする。
【０００８】
別の態様では、本発明は、本明細書に記載の方法によって作製または選択されたグリカン調製物を対象とする。
【０００９】
別の態様では、本発明は、グリカンポリマーを含むグリカンポリマー調製物であって、例えば、調製物が少なくとも０．５、１、２、５、１０、５０、または１００ｋｇを含み、例えば、少なくとも純度２０、３０、４０、５０、６０、７０、８０、９０、９５または９９％であり、
ｉ）グルコース、マンノースもしくはガラクトースサブユニット、またはそれらの組み合わせ、および少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合、または
ｉｉ）グルコース、マンノースもしくはガラクトースサブユニット、またはそれらの組み合わせ、および少なくとも１つのベータ−グリコシド結合
を含み、
ｉ）ＧＴ５、ＧＨ９４、ＧＨ１３サブファミリー９、ＧＨ１３サブファミリー３９、ＧＨ１３サブファミリー３６、ＧＨ１１３またはＧＨ１１２  ＣＡＺｙファミリー、
ｉｉ）ＧＴ２、ＧＴ４、ＧＴ５、ＧＴ３５、ＧＴ５１、ＧＨ１、ＧＨ２、ＧＨ３、ＧＨ４、ＧＨ１３、ＧＨ１３サブファミリー９、ＧＨ１３サブファミリー３１、ＧＨ１８、ＧＨ２３、ＧＨ２５、ＧＨ２８、ＧＨ３１、ＧＨ３２、ＧＨ３６、ＧＨ５１、ＧＨ７３、ＧＨ７７またはＧＨ９４  ＣＡＺｙファミリー、
ｉｉｉ）ＧＴ１１、ＧＴ１０、ＧＨ９２、ＧＨ５１、ＧＨ３５、ＧＨ２９、ＧＨ２８、ＧＨ２０、ＧＨ１３０、ＧＨ１３サブファミリー８、またはＧＨ１３サブファミリー１４  ＣＡＺｙファミリー、または
ｉｖ）ＧＴ２、ＧＴ４、ＧＨ２、ＧＨ２３、ＧＨ３、ＧＴ８、ＧＴ５１、ＧＴ９、ＧＨ１、ＧＨ９２、ＧＨ７３、ＧＨ３１、ＧＨ２０、ＧＨ２８、ＧＴ２５、ＧＴ２８、ＧＴ３５、ＧＨ１８、ＧＴ０、ＧＨ１３、ＧＨ３６、ＧＨ９７、ＧＨ１０５、ＧＨ２５、ＧＨ４、ＧＨ３２、ＧＨ７８、ＧＨ２９、ＧＨ０、ＧＨ５１、ＧＴ１０、またはＧＨ７７  ＣＡＺｙファミリー
から選択される１つ以上、例えば２つ、３つ、４つ、またはそれを超える、ヒト腸内微生物グリコシダーゼ酵素の基質である、グリカンポリマー調製物を対象とする。
【００１０】
別の態様では、本発明は、グリカンポリマー調製物であって、例えば、調製物が少なくとも約０．５、１、２、５、１０、５０、または１００ｋｇを含み、例えば、少なくとも純度２０、３０、４０、５０、６０、７０、８０、９０、９５または９９％であり、
ｉ）キシロース、アラビノース、フコースもしくはラムノースサブユニット、またはそれらの組み合わせ、および少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合、または
ｉｉ）キシロース、アラビノース、フコースもしくはラムノースサブユニット、またはそれらの組み合わせ、および少なくとも１つのベータ−グリコシド結合
を含むグリカンポリマーを含み、
ｉ）ＧＴ１１、ＧＴ１０、ＧＨ９２、ＧＨ５１、ＧＨ３５、ＧＨ２９、ＧＨ２８、ＧＨ２０、ＧＨ１３０、ＧＨ１３サブファミリー８、またはＧＨ１３サブファミリー１４  ＣＡＺｙファミリー、または
ｉｉ）ＧＴ２、ＧＴ４、ＧＨ２、ＧＨ２３、ＧＨ３、ＧＴ８、ＧＴ５１、ＧＴ９、ＧＨ１、ＧＨ９２、ＧＨ７３、ＧＨ３１、ＧＨ２０、ＧＨ２８、ＧＴ２５、ＧＴ２８、ＧＴ３５、ＧＨ１８、ＧＴ０、ＧＨ１３、ＧＨ３６、ＧＨ９７、ＧＨ１０５、ＧＨ２５、ＧＨ４、ＧＨ３２、ＧＨ７８、ＧＨ２９、ＧＨ０、ＧＨ５１、ＧＴ１０、またはＧＨ７７  ＣＡＺｙファミリー
から選択される１つ以上、例えば２つ、３つ、４つ、またはそれを超える、ヒト腸内微生物グリコシダーゼ酵素の基質である、グリカンポリマー調製物を対象とする。
【００１１】
別の態様では、本発明は、グリカンポリマー調製物であって、例えば、調製物が少なくとも０．５、１、２、５、１０、５０、または１００ｋｇを含み、例えば、少なくとも純度２０、３０、４０、５０、６０、７０、８０、９０、９５または９９％であり、
ｉ）グルコースもしくはガラクトースサブユニット、またはそれらの組み合わせ、および少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合、または
ｉｉ）グルコースもしくはガラクトースサブユニット、またはそれらの組み合わせ、および少なくとも１つのベータ−グリコシド結合
を含むグリカンポリマーを含み、
ｉ）ＧＴ３、ＧＨ９７、ＧＨ４３サブファミリー２４、ＧＨ２７、ＧＨ１３３、ＧＨ１３サブファミリー８、ＧＨ１３  ＣＡＺｙファミリー、または
ｉｉ）ＧＴ２、ＧＴ４、ＧＨ２、ＧＨ２３、ＧＨ３、ＧＴ８、ＧＴ５１、ＧＴ９、ＧＨ１、ＧＨ９２、ＧＨ７３、ＧＨ３１、ＧＨ２０、ＧＨ２８、ＧＴ２５、ＧＴ２８、ＧＴ３５、ＧＨ１８、ＧＴ０、ＧＨ１３、ＧＨ３６、ＧＨ９７、ＧＨ１０５、ＧＨ２５、ＧＨ４、ＧＨ３２、ＧＨ７８、ＧＨ２９、ＧＨ０、ＧＨ５１、ＧＴ１０、ＧＨ７７、ＧＴ２、ＧＴ４、ＧＨ２、ＧＨ２３、ＧＨ３、ＧＴ５１、ＧＨ１、ＧＴ８、ＧＨ９２、ＧＴ９、ＧＨ７３、ＧＨ３１、ＧＨ２０、Ｇｈ２８、ＧＴ３５、ＧＴ２８、ＧＨ１８、ＧＨ１３、ＧＨ９７、ＧＨ２５、ＧＨ３６、ＧＨ４、ＧＨ１０５、ＧＨ３２、ＧＨ７８、ＧＨ２９、ＧＨ０、ＧＴ２５、ＧＨ５１、ＧＨ７７、ＧＨ８８、ＧＨ２４  ＣＡＺｙファミリー
から選択される１つ以上、例えば２つ、３つ、４つ、またはそれを超える、ヒト腸内微生物グリコシダーゼ酵素の基質である、グリカンポリマー調製物を対象とする。
【００１２】
別の態様では、本発明は、グリカンポリマー調製物であって、例えば、調製物が少なくとも０．５、１、２、５、１０、５０、または１００ｋｇを含み、例えば、少なくとも純度２０、３０、４０、５０、６０、７０、８０、９０、９５または９９％であり、
アラビノース、ガラクトース、キシロース、もしくはグルコースサブユニット、またはそれらの組み合わせ、および少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合
を含むグリカンポリマーを含み、
ｉ）ＧＨ１３サブファミリー３、ＧＨ１３サブファミリー３０、ＧＨ３０サブファミリー２、ＧＨ３０サブファミリー５、ＧＨ４３サブファミリー２２、ＧＨ４３サブファミリー８、もしくはＧＨ８４  ＣＡＺｙファミリー、または
ｉｉ）ＧＨ３、ＧＨ１０６、ＧＨ１０５、ＧＨ２、ＧＨ２０、ＧＨ２８、ＧＨ７６、ＧＨ９７、またはＧＨ９２  ＣＡＺｙファミリー
から選択される１つ以上、例えば２つ、３つ、４つ、またはそれを超える、ヒト腸内微生物グリコシダーゼ酵素の基質である、グリカンポリマー調製物を対象とする。
【００１３】
別の態様では、本発明は、グリカンポリマー調製物であって、例えば、調製物が少なくとも０．５、１、２、５、１０、５０、または１００ｋｇを含み、例えば、少なくとも純度２０、３０、４０、５０、６０、７０、８０、９０、９５または９９％であり、
グルコースおよび少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合
を含むグリカンポリマーを含み、
ｉ）ＧＨ１３サブファミリー１９、ＧＨ１３サブファミリー２１、ＧＨ２３、ＧＨ３３、ＧＨ３７もしくはＧＨ１０４  ＣＡＺｙファミリー、または
ｉｉ）ＧＨ２３、ＧＨ２４、またはＧＨ３３  ＣＡＺｙファミリー
から選択される１つ以上、例えば２つ、３つ、４つ、またはそれを超える、ヒト腸内微生物グリコシダーゼ酵素の基質である、グリカンポリマー調製物を対象とする。
【００１４】
別の態様では、本発明は、グリカンポリマー調製物であって、例えば、調製物が少なくとも０．５、１、２、５、１０、５０、または１００ｋｇを含み、例えば、少なくとも純度２０、３０、４０、５０、６０、７０、８０、９０、９５または９９％であり、
ｉ）グルコースもしくはキシロースサブユニット、またはそれらの組み合わせ、および少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合、または
ｉｉ）グルコースもしくはキシロースサブユニット、またはそれらの組み合わせ、および少なくとも１つのベータ−グリコシド結合
を含むグリカンポリマーを含み、
ｉ）ＧＨ１３サブファミリー２０、ＧＨ１３サブファミリー３１、ＧＨ１３サブファミリー３９、ＧＨ３９、ＧＨ４３サブファミリー１１、ＧＨ５サブファミリー４４、もしくはＧＨ９４  ＣＡＺｙファミリー、または
ｉｉ）ＧＨ２、ＧＨ３１、ＧＨ２３、ＧＨ１３、またはＧＨ２４  ＣＡＺｙファミリー
から選択される１つ以上、例えば２つ、３つ、４つ、またはそれを超える、ヒト腸内微生物グリコシダーゼ酵素の基質である、グリカンポリマー調製物を対象とする。
【００１５】
別の態様では、本発明は、グリカンポリマー調製物であって、例えば、調製物が少なくとも０．５、１、２、５、１０、５０、または１００ｋｇを含み、例えば、少なくとも純度２０、３０、４０、５０、６０、７０、８０、９０、９５または９９％であり、
グルコース、キシロース、アラビノース、もしくはガラクトースサブユニット、またはそれらの組み合わせおよび少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合
を含むグリカンポリマーを含み、
ｉ）ＧＨ１３サブファミリー３、ＧＨ１３サブファミリー３０、ＧＨ１２１、ＧＨ１５、ＧＨ４３サブファミリー２７、ＧＨ４３サブファミリー３４、もしくはＧＨ４３サブファミリー８  ＣＡＺｙファミリー、または
ｉｉ）ＧＨ９２、ＧＨ９７、ＧＨ７６、ＧＨ２８、ＧＨ２０、ＧＨ１０５、ＧＨ２、ＧＨ５０、ＧＨ３、またはＧＨ１０６  ＣＡＺｙファミリー
から選択される１つ以上、例えば２つ、３つ、４つ、またはそれを超える、ヒト腸内微生物グリコシダーゼ酵素の基質である、グリカンポリマー調製物を対象とする。
【００１６】
別の態様では、本発明は、本明細書に記載のグリカン調製物を含む単位剤形（ｕｎｉｔ  ｄｏｓａｇｅ  ｆｒｏｍ）を対象とする。
【００１７】
別の態様では、本発明は、本明細書に記載のグリカン調製物を含む医薬組成物を対象とする。
【００１８】
別の態様では、本発明は、本明細書に記載のグリカンポリマー調製物またはその一部をそれぞれ含む、医薬組成物のセットを対象とし、ここで、集合的に、セットは少なくとも０．１、０．５、１、２、５、１０、または１００キログラムの調製物を含む。
【００１９】
別の態様では、本発明は、本明細書に記載のグリカン調製物を含む医療用食品を対象とする。
【００２０】
別の態様では、本発明は、本明細書に記載のグリカンポリマー調製物またはその一部をそれぞれ含む、医療用食品の一部のセットを対象とし、ここで、集合的に、セットは少なくとも０．１、０．５、１、２、５、１０、または１００キログラムの調製物を含む。
【００２１】
別の態様では、本発明は、本明細書に記載のグリカン調製物を含む栄養補助食品を対象とする。
【００２２】
別の態様では、本発明は、本明細書に記載のグリカンポリマー調製物またはその一部をそれぞれ含む、栄養補助食品の一部のセットを対象とし、ここで、集合的に、セットは少なくとも０．１、０．５、１、２、５、１０、または１００キログラムの調製物を含む。
【００２３】
別の態様では、本発明は、本明細書に記載のグリカン調製物を含む食品成分を対象とする。
【００２４】
別の態様では、本発明は、本明細書に記載のグリカンポリマー調製物またはその一部をそれぞれ含む、食品成分の一部のセットを対象とし、ここで、集合的に、セットは少なくとも０．１、０．５、１、２、５、１０、または１００キログラムの調製物を含む。
【００２５】
別の態様では、本発明は、
ヒト腸内微生物の調製物を提供する工程、
グリカンポリマーがヒト腸内微生物の基質である、本明細書に記載のグリカンポリマー調製物を提供する工程、および
ヒト腸内微生物をグリカンポリマーと組み合わせる工程
を含む、共調製物を作製する方法を対象とする。
【００２６】
別の態様では、本発明は、ヒト腸内微生物の調製物および本明細書に記載のグリカンポリマーの調製物を含むシンバイオティクス共調製物を対象とする。
【００２７】
別の態様では、本発明は、本明細書に記載のシンバイオティクス共調製物を、ヒト腸内微生物を移植するのに有効な量および時間で対象に投与する工程を含む、それを必要とするヒト対象の結腸または大腸にヒト腸内微生物を移植する方法を対象とする。
【００２８】
別の態様では、本発明は、
本明細書に記載のグリカンポリマー調製物および微生物の調製物を含む組成物を、ディスバイオシスの処置に有効な量で投与する工程
を含む、ディスバイオシスを有する対象を処置する方法を対象とする。
【００２９】
別の態様では、本発明は、胞子形成微生物（例えば、胞子形成細菌分類群）のヒト腸内微生物グリコシダーゼ酵素の基質であるグリカンポリマーを含む、本明細書に記載のグリカンポリマー調製物を対象とする。
【００３０】
別の態様では、本発明は、グリカンポリマー調製物であって、任意選択により、例えば、調製物が少なくとも約０．５、１、２、５、１０、５０、または１００ｋｇを含み、および／または、さらに任意選択により、例えば、少なくとも純度２０、３０、４０、５０、６０、７０、８０、９０、９５または９９％であり、
ａ．キシロースもしくはアラビノースサブユニット、またはそれらの組み合わせ、および少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合、
ｂ．キシロースもしくはアラビノースサブユニット、またはそれらの組み合わせ、および少なくとも１つのベータ−グリコシド結合、
ｃ．ガラクトース、キシロースもしくはアラビノースサブユニット、またはそれらの組み合わせ、および少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合、
ｄ．ガラクトース、キシロースもしくはアラビノースサブユニット、またはそれらの組み合わせ、および少なくとも１つのベータ−グリコシド結合、
ｅ．グルコース、キシロースもしくはアラビノースサブユニット、またはそれらの組み合わせ、および少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合、
ｆ．グルコース、キシロースもしくはアラビノースサブユニット、またはそれらの組み合わせ、および少なくとも１つのベータ−グリコシド結合、
ｇ．キシロース、アラビノース、グルコース、もしくはガラクトースサブユニット、またはそれらの組み合わせおよび少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合、
ｈ．キシロース、アラビノース、グルコース、もしくはガラクトースサブユニット、またはそれらの組み合わせおよび少なくとも１つのベータ−グリコシド結合、またはそれらの組み合わせおよび少なくとも１つのベータ−グリコシド結合、
を含むグリカンポリマーを含み、
ＧＴ５、ＧＴ３５、ＧＴ３、ＧＨ９７、ＧＨ９５、ＧＨ９２、ＧＨ８９、ＧＨ８８、ＧＨ７８、ＧＨ７７、ＧＨ５７、ＧＨ５１、ＧＨ４３サブファミリー３４、ＧＨ４３サブファミリー２４、ＧＨ４３サブファミリー１０、ＧＨ４２、ＧＨ３６、ＧＨ３５、ＧＨ３３、ＧＨ３２、ＧＨ３１、ＧＨ３、ＧＨ２９、ＧＨ２８、ＧＨ２７、ＧＨ２４、ＧＨ２０、ＧＨ２、ＧＨ１６、ＧＨ１３３、ＧＨ１３０、ＧＨ１３サブファミリー８、ＧＨ１３サブファミリー３８、ＧＨ１３サブファミリー１４、ＧＨ１３、ＧＨ１２３、ＧＨ１１５、ＧＨ１０９、またはＧＨ１０５  ＣＡＺｙファミリーのうちの１つのヒト腸内微生物グリコシダーゼ酵素の基質である、
グリカンポリマー調製物を対象とする。
【００３１】
別の態様では、本発明は、
胞子形成微生物（例えば、胞子形成ヒト腸内微生物）の調製物を提供する工程、
グリカンポリマーが胞子形成微生物の基質である、グリカンポリマー調製物（本明細書に記載）を提供する工程、
胞子形成微生物の調製物をグリカンポリマー調製物と組み合わせる工程、
を含む、共調製物を作製する方法を対象とする。
【００３２】
別の態様では、本発明は、グリカンポリマー、例えば、ヒト腸内微生物中に存在するグリコシダーゼ酵素の基質であるグリカンポリマー、の調製物を作製する方法であって、
グリカンポリマーの製造に適した複数のグリカンサブユニット、例えば糖モノマーまたは糖ダイマーを提供する工程；および
複数のグリカンサブユニットを、グリコシダーゼ酵素分子、例えば、ヒト腸内微生物に由来するものと、グリカンサブユニットのグリカンポリマーへの組み込みを（例えば、縮合反応により）生じる条件下で、接触させる工程、
それにより、ヒト腸内微生物の基質であるグリカンポリマー調製物を作製する工程、
を含む方法であって、任意選択により、
ｉ）グリカンポリマー調製物が、少なくとも約０．２５、０．５、１、５、１０、２０、５０、１００、２００、３００、４００または５００キログラムのグリカンポリマーを含む、および／または
ｉｉ）グリカンポリマー調製物が、少なくとも約１５％、３０％、４５％、６０％、または約７５％の収率（投入グリカンサブユニットのパーセンテージとしての重量／重量基準で決定される）で産生される、
方法を対象とする。
【００３３】
別の態様では、本発明は、調製物のグリカンポリマーが、ＧＴ５、ＧＨ９４、ＧＨ１３サブファミリー９、ＧＨ１３サブファミリー３９、ＧＨ１３サブファミリー３６、ＧＨ１１３またはＧＨ１１２  ＣＡＺｙファミリーのグリコシダーゼ酵素を含むヒト腸内微生物の基質である、グリカンポリマー調製物を作製する結果となる条件下で、
複数のグルコース、マンノース、および／またはガラクトースを含有するグリカンサブユニット（例えば、モノマーまたはダイマー）を提供する工程；
複数のグリカンサブユニットを、ＧＴ５、ＧＨ９４、ＧＨ１３サブファミリー９、ＧＨ１３サブファミリー３９、ＧＨ１３サブファミリー３６、ＧＨ１１３またはＧＨ１１２  ＣＡＺｙファミリーのうちの１つから選択されるグリコシダーゼ酵素と接触させる工程；
を含む、グリカンポリマー調製物を作製する方法を対象とする。
【００３４】
別の態様では、本発明は、調製物のグリカンポリマーが、ＧＴ２、ＧＴ４、ＧＴ５、ＧＴ３５、ＧＴ５１、ＧＨ１、ＧＨ２、ＧＨ３、ＧＨ４、ＧＨ１３．０、ＧＨ１３．９、ＧＨ１３．３１、ＧＨ１８、ＧＨ２３、ＧＨ２５、ＧＨ２８、ＧＨ３１、ＧＨ３２、ＧＨ３６、ＧＨ５１、ＧＨ７３、ＧＨ７７、ＧＨ９４  ＣＡＺｙファミリーのグリコシダーゼ酵素を含むヒト腸内微生物の基質である、グリカンポリマー調製物を作製する結果となる条件下で、
複数のグルコース、マンノース、および／またはガラクトースを含有するグリカンサブユニット（例えば、モノマーまたはダイマー）を提供する工程；
複数のグリカンサブユニットを、ＧＴ２、ＧＴ４、ＧＴ５、ＧＴ３５、ＧＴ５１、ＧＨ１、ＧＨ２、ＧＨ３、ＧＨ４、ＧＨ１３．０、ＧＨ１３．９、ＧＨ１３．３１、ＧＨ１８、ＧＨ２３、ＧＨ２５、ＧＨ２８、ＧＨ３１、ＧＨ３２、ＧＨ３６、ＧＨ５１、ＧＨ７３、ＧＨ７７またはＧＨ９４  ＣＡＺｙファミリー、のうちの１つから選択されるグリコシダーゼ酵素と接触させる工程；
を含む、グリカンポリマー調製物を作製する方法を対象とする。
【００３５】
別の態様では、本発明は、調製物のグリカンポリマーが、ＧＨ１３サブファミリー３、ＧＨ１３サブファミリー３０、ＧＨ３０サブファミリー２、ＧＨ３０サブファミリー５、ＧＨ４３サブファミリー２２、ＧＨ４３サブファミリー８、またはＧＨ８４  ＣＡＺｙファミリーのグリコシダーゼ酵素を含むヒト腸内微生物の基質である、グリカンポリマー調製物を作製する結果となる条件下で、
複数のキシロース、アラビノース、ガラクトースおよび／またはグルコースを含有するグリカンサブユニット（例えば、モノマーまたはダイマー）を提供する工程；
複数のグリカンサブユニットを、ＧＨ１３サブファミリー３、ＧＨ１３サブファミリー３０、ＧＨ３０サブファミリー２、ＧＨ３０サブファミリー５、ＧＨ４３サブファミリー２２、ＧＨ４３サブファミリー８、またはＧＨ８４  ＣＡＺｙファミリーのうちの１つから選択されるグリコシダーゼ酵素と接触させる工程、
を含む、グリカンポリマー調製物を作製する方法を対象とする。
【００３６】
別の態様では、本発明は、調製物のグリカンポリマーが、ＧＨ３、ＧＨ１０６、ＧＨ１０５、ＧＨ２、ＧＨ２０、ＧＨ２８、ＧＨ７６、ＧＨ９７、またはＧＨ９２  ＣＡＺｙファミリーのグリコシダーゼ酵素を含むヒト腸内微生物の基質である、グリカンポリマー調製物を作製する結果となる条件下で、
複数のキシロース、アラビノース、ガラクトースおよび／またはグルコースを含有するグリカンサブユニット（例えば、モノマーまたはダイマー）を提供する工程；
複数のグリカンサブユニットを、ＧＨ３、ＧＨ１０６、ＧＨ１０５、ＧＨ２、ＧＨ２０、ＧＨ２８、ＧＨ７６、ＧＨ９７、またはＧＨ９２  ＣＡＺｙファミリーのうちの１つから選択されるグリコシダーゼ酵素と接触させる工程；
を含む、グリカンポリマー調製物を作製する方法を対象とする。
【００３７】
別の態様では、本発明は、調製物のグリカンポリマーが、ＧＨ１３サブファミリー１９、ＧＨ１３サブファミリー２１、ＧＨ２３、ＧＨ３３、ＧＨ３７もしくはＧＨ１０４  ＣＡＺｙファミリーのグリコシダーゼ酵素を含むヒト腸内微生物の基質である、グリカンポリマー調製物を作製する結果となる条件下で、
複数のグルコースおよび／またはシアル酸を含有するグリカンサブユニット（例えば、モノマーまたはダイマー）を提供する工程；
複数のグリカンサブユニットを、ＧＨ１３サブファミリー１９、ＧＨ１３サブファミリー２１、ＧＨ２３、ＧＨ３３、ＧＨ３７またはＧＨ１０４  ＣＡＺｙファミリーのうちの１つから選択されるグリコシダーゼ酵素と接触させる工程、
を含む、グリカンポリマー調製物を作製する方法を対象とする。
【００３８】
別の態様では、本発明は、調製物のグリカンポリマーが、ＧＨ２３、ＧＨ２４、またはＧＨ３３  ＣＡＺｙファミリーのグリコシダーゼ酵素を含むヒト腸内微生物の基質である、グリカンポリマー調製物を作製する結果となる条件下で、
複数のグルコースおよび／またはシアル酸を含有するグリカンサブユニット（例えば、モノマーまたはダイマー）を提供する工程；
複数のグリカンサブユニットを、ＧＨ２３、ＧＨ２４、またはＧＨ３３  ＣＡＺｙファミリーのうちの１つから選択されるグリコシダーゼ酵素と接触させる工程；
を含む、グリカンポリマー調製物を作製する方法を対象とする。
【００３９】
別の態様では、本発明は、調製物のグリカンポリマーが、ＧＨ１３サブファミリー２０、ＧＨ１３サブファミリー３１、ＧＨ１３サブファミリー３９、ＧＨ３９、ＧＨ４３サブファミリー１１、ＧＨ５サブファミリー４４、またはＧＨ９４  ＣＡＺｙファミリーのグリコシダーゼ酵素を含むヒト腸内微生物の基質である、グリカンポリマー調製物を作製する結果となる条件下で、
複数のグルコース、キシロース、マンノース、アラビノース、および／またはガラクトースを含有するグリカンサブユニット（例えば、モノマーまたはダイマー）を提供する工程；
複数のグリカンサブユニットを、ＧＨ１３サブファミリー２０、ＧＨ１３サブファミリー３１、ＧＨ１３サブファミリー３９、ＧＨ３９、ＧＨ４３サブファミリー１１、ＧＨ５サブファミリー４４、またはＧＨ９４  ＣＡＺｙファミリーのうちの１つから選択されるグリコシダーゼ酵素と接触させる工程；
を含む、グリカンポリマー調製物を作製する方法を対象とする。
【００４０】
別の態様では、本発明は、調製物のグリカンポリマーが、ＧＨ２、ＧＨ３１、ＧＨ２３、ＧＨ１３、またはＧＨ２４  ＣＡＺｙファミリーのグリコシダーゼ酵素を含むヒト腸内微生物の基質である、グリカンポリマー調製物を作製する結果となる条件下で、
複数のグルコース、キシロース、マンノース、アラビノース、および／またはガラクトースを含有するグリカンサブユニット（例えば、モノマーまたはダイマー）を提供する工程；
複数のグリカンサブユニットを、ＧＨ２、ＧＨ３１、ＧＨ２３、ＧＨ１３、またはＧＨ２４  ＣＡＺｙファミリーのうちの１つから選択されるグリコシダーゼ酵素と接触させる工程、
を含む、グリカンポリマー調製物を作製する方法を対象とする。
【００４１】
別の態様では、本発明は、調製物のグリカンポリマーが、ＧＨ１３サブファミリー３、ＧＨ１３サブファミリー３０、ＧＨ１２１、ＧＨ１５、ＧＨ４３サブファミリー２７、ＧＨ４３サブファミリー３４、またはＧＨ４３サブファミリー８  ＣＡＺｙファミリーのグリコシダーゼ酵素を含むヒト腸内微生物の基質である、グリカンポリマー調製物を作製する結果となる条件下で、
複数のグルコース、キシロース、アラビノース、および／またはガラクトースを含有するグリカンサブユニット（例えば、モノマーまたはダイマー）を提供する工程；
複数のグリカンサブユニットを、ＧＨ１３サブファミリー３、ＧＨ１３サブファミリー３０、ＧＨ１２１、ＧＨ１５、ＧＨ４３サブファミリー２７、ＧＨ４３サブファミリー３４、またはＧＨ４３サブファミリー８  ＣＡＺｙファミリーのうちの１つから選択されるグリコシダーゼ酵素と接触させる工程、
を含む、グリカンポリマー調製物を作製する方法を対象とする。
【００４２】
別の態様では、本発明は、調製物のグリカンポリマーが、ＧＨ９２、ＧＨ９７、ＧＨ７６、ＧＨ２８、ＧＨ２０、ＧＨ１０５、ＧＨ２、ＧＨ５０、ＧＨ３、またはＧＨ１０６  ＣＡＺｙファミリーのグリコシダーゼ酵素を含むヒト腸内微生物の基質である、グリカンポリマー調製物を作製する結果となる条件下で、
複数のグルコース、キシロース、アラビノース、および／またはガラクトースを含有するグリカンサブユニット（例えば、モノマーまたはダイマー）を提供する工程；
複数のグリカンサブユニットを、ＧＨ９２、ＧＨ９７、ＧＨ７６、ＧＨ２８、ＧＨ２０、ＧＨ１０５、ＧＨ２、ＧＨ５０、ＧＨ３、またはＧＨ１０６  ＣＡＺｙファミリーのうちの１つから選択されるグリコシダーゼ酵素と接触させる工程；
を含む、グリカンポリマー調製物を作製する方法を対象とする。
【００４３】
別の態様では、本発明は、調製物のグリカンポリマーが、ＧＴ１１、ＧＴ１０、ＧＨ９２、ＧＨ５１、ＧＨ３５、ＧＨ２９、ＧＨ２８、ＧＨ２０、ＧＨ１３０、ＧＨ１３サブファミリー８、ＧＨ１３サブファミリー１４  ＣＡＺｙファミリーのグリコシダーゼ酵素を含むヒト腸内微生物の基質である、グリカンポリマー調製物を作製する結果となる条件下で、
複数のグルコース、マンノース、および／またはガラクトースを含有するグリカンサブユニット（例えば、モノマーまたはダイマー）を提供する工程；
複数のグリカンサブユニットを、ＧＴ１１、ＧＴ１０、ＧＨ９２、ＧＨ５１、ＧＨ３５、ＧＨ２９、ＧＨ２８、ＧＨ２０、ＧＨ１３０、ＧＨ１３サブファミリー８、ＧＨ１３サブファミリー１４  ＣＡＺｙファミリーのうちの１つから選択されるグリコシダーゼ酵素と接触させる工程；
を含む、グリカンポリマー調製物を作製する方法を対象とする。
【００４４】
別の態様では、本発明は、調製物のグリカンポリマーが、ＧＴ２、ＧＴ４、ＧＨ２、ＧＨ２３、ＧＨ３、ＧＴ８、ＧＴ５１、ＧＴ９、ＧＨ１、ＧＨ９２、ＧＨ７３、ＧＨ３１、ＧＨ２０、ＧＨ２８、ＧＴ２５、ＧＴ２８、ＧＴ３５、ＧＨ１８、ＧＴ０、ＧＨ１３、ＧＨ３６、ＧＨ９７、ＧＨ１０５、ＧＨ２５、ＧＨ４、ＧＨ３２、ＧＨ７８、ＧＨ２９、ＧＨ０、ＧＨ５１、ＧＴ１０、ＧＨ７７  ＣＡＺｙファミリーのグリコシダーゼ酵素を含むヒト腸内微生物の基質である、グリカンポリマー調製物を作製する結果となる条件下で、
複数のグルコース、マンノース、および／またはガラクトースを含有するグリカンサブユニット（例えば、モノマーまたはダイマー）を提供する工程；
ＧＴ２、ＧＴ４、ＧＨ２、ＧＨ２３、ＧＨ３、ＧＴ８、ＧＴ５１、ＧＴ９、ＧＨ１、ＧＨ９２、ＧＨ７３、ＧＨ３１、ＧＨ２０、ＧＨ２８、ＧＴ２５、ＧＴ２８、ＧＴ３５、ＧＨ１８、ＧＴ０、ＧＨ１３、ＧＨ３６、ＧＨ９７、ＧＨ１０５、ＧＨ２５、ＧＨ４、ＧＨ３２、ＧＨ７８、ＧＨ２９、ＧＨ０、ＧＨ５１、ＧＴ１０、ＧＨ７７  ＣＡＺｙファミリーのうちの１つから選択されるグリコシダーゼ酵素と複数のグリカンサブユニットを接触させる工程、
を含む、グリカンポリマー調製物を作製する方法を対象とする。
【００４５】
別の態様では、本発明は、調製物のグリカンポリマーが、ＧＴ１１、ＧＴ１０、ＧＨ９２、ＧＨ５１、ＧＨ３５、ＧＨ２９、ＧＨ２８、ＧＨ２０、ＧＨ１３０、ＧＨ１３サブファミリー８、ＧＨ１３サブファミリー１４  ＣＡＺｙファミリーのグリコシダーゼ酵素を含むヒト腸内微生物の基質である、グリカンポリマー調製物を作製する結果となる条件下で、
複数のキシロース、アラビノース、フコースおよび／またはラムノースを含有するグリカンサブユニット（例えば、モノマーまたはダイマー）を提供する工程；
複数のグリカンサブユニットを、ＧＴ１１、ＧＴ１０、ＧＨ９２、ＧＨ５１、ＧＨ３５、ＧＨ２９、ＧＨ２８、ＧＨ２０、ＧＨ１３０、ＧＨ１３サブファミリー８、ＧＨ１３サブファミリー１４  ＣＡＺｙファミリーのうちの１つから選択されるグリコシダーゼ酵素と接触させる工程；
を含む、グリカンポリマー調製物を作製する方法を対象とする。
【００４６】
別の態様では、本発明は、グリカンポリマー調製物を作製する結果となる条件下、例えば、基質およびグリコシダーゼ酵素と同じ行の列Ｆ、Ｇ、Ｈ、Ｉ、Ｊ、Ｋ、および／またはＬの条件下で、
表２３の列Ｅの基質の複数のグリカンサブユニット、例えば、モノマーまたはダイマーを提供する工程；
基質の複数のグリカンサブユニットを、基質と同じ行の列Ａのグリコシダーゼ酵素と接触させる工程；
を含む、グリカンポリマー調製物を作製する方法を対象とする。
【００４７】
別の態様では、本発明は、調製物のグリカンポリマーが、ＧＴ２、ＧＴ４、ＧＨ２、ＧＨ２３、ＧＨ３、ＧＴ８、ＧＴ５１、ＧＴ９、ＧＨ１、ＧＨ９２、ＧＨ７３、ＧＨ３１、ＧＨ２０、ＧＨ２８、ＧＴ２５、ＧＴ２８、ＧＴ３５、ＧＨ１８、ＧＴ０、ＧＨ１３、ＧＨ３６、ＧＨ９７、ＧＨ１０５、ＧＨ２５、ＧＨ４、ＧＨ３２、ＧＨ７８、ＧＨ２９、ＧＨ０、ＧＨ５１、ＧＴ１０、ＧＨ７７  ＣＡＺｙファミリーのグリコシダーゼ酵素を含むヒト腸内微生物の基質である、グリカンポリマー調製物を作製する結果となる条件下で、
複数のキシロース、アラビノース、フコースおよび／またはラムノースを含有するグリカンサブユニット（例えば、モノマーまたはダイマー）を提供する工程；
ＧＴ２、ＧＴ４、ＧＨ２、ＧＨ２３、ＧＨ３、ＧＴ８、ＧＴ５１、ＧＴ９、ＧＨ１、ＧＨ９２、ＧＨ７３、ＧＨ３１、ＧＨ２０、ＧＨ２８、ＧＴ２５、ＧＴ２８、ＧＴ３５、ＧＨ１８、ＧＴ０、ＧＨ１３、ＧＨ３６、ＧＨ９７、ＧＨ１０５、ＧＨ２５、ＧＨ４、ＧＨ３２、ＧＨ７８、ＧＨ２９、ＧＨ０、ＧＨ５１、ＧＴ１０、ＧＨ７７  ＣＡＺｙファミリーのうちの１つから選択されるグリコシダーゼ酵素と複数のグリカンサブユニットを接触させる工程、
を含む、グリカンポリマー調製物を作製する方法を対象とする。
【００４８】
別の態様では、本発明は、調製物のグリカンポリマーが、ＧＴ３、ＧＨ９７、ＧＨ４３サブファミリー２４、ＧＨ２７、ＧＨ１３３、ＧＨ１３サブファミリー８、ＧＨ１３  ＣＡＺｙファミリーのグリコシダーゼ酵素を含むヒト腸内微生物の基質である、グリカンポリマー調製物を作製する結果となる条件下で、
複数のグルコースおよび／またはガラクトースを含有するグリカンサブユニット（例えば、モノマーまたはダイマー）を提供する工程；
複数のグリカンサブユニットを、ＧＴ３、ＧＨ９７、ＧＨ４３サブファミリー２４、ＧＨ２７、ＧＨ１３３、ＧＨ１３サブファミリー８、ＧＨ１３  ＣＡＺｙファミリーのうちの１つから選択されるグリコシダーゼ酵素と接触させる工程、
を含む、グリカンポリマー調製物を作製する方法を対象とする。
【００４９】
別の態様では、本発明は、調製物のグリカンポリマーが、ＧＴ２、ＧＴ４、ＧＨ２、ＧＨ２３、ＧＨ３、ＧＴ８、ＧＴ５１、ＧＴ９、ＧＨ１、ＧＨ９２、ＧＨ７３、ＧＨ３１、ＧＨ２０、ＧＨ２８、ＧＴ２５、ＧＴ２８、ＧＴ３５、ＧＨ１８、ＧＴ０、ＧＨ１３、ＧＨ３６、ＧＨ９７、ＧＨ１０５、ＧＨ２５、ＧＨ４、ＧＨ３２、ＧＨ７８、ＧＨ２９、ＧＨ０、ＧＨ５１、ＧＴ１０、ＧＨ７７、ＧＴ２、ＧＴ４、ＧＨ２、ＧＨ２３、ＧＨ３、ＧＴ５１、ＧＨ１、ＧＴ８、ＧＨ９２、ＧＴ９、ＧＨ７３、ＧＨ３１、ＧＨ２０、Ｇｈ２８、ＧＴ３５、ＧＴ２８、ＧＨ１８、ＧＨ１３、ＧＨ９７、ＧＨ２５、ＧＨ３６、ＧＨ４、ＧＨ１０５、ＧＨ３２、ＧＨ７８、ＧＨ２９、ＧＨ０、ＧＴ２５、ＧＨ５１、ＧＨ７７、ＧＨ８８、ＧＨ２４  ＣＡＺｙファミリーのグリコシダーゼ酵素を含むヒト腸内微生物の基質である、グリカンポリマー調製物を作製する結果となる条件下で、
複数のグルコースおよび／またはガラクトースを含有するグリカンサブユニット（例えば、モノマーまたはダイマー）を提供する工程；
複数のグリカンサブユニットを、ＧＴ２、ＧＴ４、ＧＨ２、ＧＨ２３、ＧＨ３、ＧＴ８、ＧＴ５１、ＧＴ９、ＧＨ１、ＧＨ９２、ＧＨ７３、ＧＨ３１、ＧＨ２０、ＧＨ２８、ＧＴ２５、ＧＴ２８、ＧＴ３５、ＧＨ１８、ＧＴ０、ＧＨ１３、ＧＨ３６、ＧＨ９７、ＧＨ１０５、ＧＨ２５、ＧＨ４、ＧＨ３２、ＧＨ７８、ＧＨ２９、ＧＨ０、ＧＨ５１、ＧＴ１０、ＧＨ７７、ＧＴ２、ＧＴ４、ＧＨ２、ＧＨ２３、ＧＨ３、ＧＴ５１、ＧＨ１、ＧＴ８、ＧＨ９２、ＧＴ９、ＧＨ７３、ＧＨ３１、ＧＨ２０、Ｇｈ２８、ＧＴ３５、ＧＴ２８、ＧＨ１８、ＧＨ１３、ＧＨ９７、ＧＨ２５、ＧＨ３６、ＧＨ４、ＧＨ１０５、ＧＨ３２、ＧＨ７８、ＧＨ２９、ＧＨ０、ＧＴ２５、ＧＨ５１、ＧＨ７７、ＧＨ８８、ＧＨ２４  ＣＡＺｙファミリーのうちの１つから選択されるグリコシダーゼ酵素と接触させる工程、
を含む、グリカンポリマー調製物を作製する方法を対象とする。
【００５０】
別の態様では、本発明は、本明細書に開示される方法によって、例えば、本明細書に記載の方法によって、作製された、産生可能な、または作製可能な、グリカンポリマー調製物を対象とする。
【００５１】
別の態様では、本発明は、本明細書に開示される方法によって、例えば、本明細書に記載の方法によって、選択された、または選択可能な、グリカンポリマー調製物を対象とする。
【００５２】
別の態様では、本発明は、本明細書に記載のグリカンポリマー調製物を含む治療用栄養製品を対象とする。
【００５３】
別の態様では、本発明は、本明細書に記載の、例えば、本明細書に記載の方法のいずれか１つによって生成される、反応混合物であって、
少なくとも０．２５、０．５、１、５、１０、２０、５０、１００、２００、３００、４００または５００キログラムのグリカンポリマーを含むグリカンポリマー調製物を産生するのに適した量で、および／または少なくとも約１５％、３０％、４５％、６０％、または約７５％（投入グリカンサブユニットの％として重量／重量基準で決定される場合）の収率を得るのに適当な条件下で、
グリカンポリマーの製造に適した複数のグリカンサブユニット、例えば糖モノマーまたは糖ダイマー；および
グリコシダーゼ酵素分子（例えば、表４（列２）、表２３（列Ａ）、表２４（列Ａ）、または表２２（列１））；またはグリコ分類群（ｇｌｙｃｏｔａｘａ）クラス１、クラス２、クラス３、クラス４、クラス５、クラス６、もしくはクラス７に関連する１つ以上のグリコシダーゼ酵素）、
を含む反応混合物を対象とする。
【００５４】
別の態様では、本発明は、本明細書に記載の調製物を、医薬組成物、医療用食品、栄養補助食品、食品成分、または治療用栄養製品に製剤化することを含む、医薬組成物、医療用食品、栄養補助食品、食品成分、または治療用栄養製品を作製する方法を対象とする。
【００５５】
別の態様では、本発明は、本明細書に記載のグリカンポリマー調製物の画分、例えば、分子量画分を対象とする。
【００５６】
別の態様では、本発明は、本明細書に記載の方法によって作製される、または作製可能なグリカンポリマーの調製物を作製、評価、選択、分類、または提供する方法であって、
候補調製物を取得する工程；
調製物に関するパラメータ、例えば、物理的パラメータ、例えば、分子量、例えば、平均分子量もしくは分子量分布、グリカンサブユニット組成または純度、または生物学的特性に関するパラメータ、例えば、ヒト腸内微生物の増殖を調節する能力、微生物によって産生される微生物代謝産物を、例えばエクスビボアッセイにおいて、調節する能力、またはバイオマーカー、例えば、炎症もしくは免疫バイオマーカー、毒性もしくは廃棄化合物、細菌化合物）を例えば、ヒト対象において、調節する能力、の値を、例えばアッセイを実施することによって、取得する工程；および
値を基準値と比較する工程、
それにより、グリカンポリマーの調製物を作製、評価、選択、分類、または提供する工程
を含む方法を対象とする。
【００５７】
別の態様では、本発明は、標的ヒト腸内微生物を調節する医薬組成物を作製する方法であって、
複数のグリカンサブユニットを提供する工程；
複数のグリカンサブユニットを、標的腸内微生物中に存在するグリコシダーゼ活性を有するグリコシダーゼ酵素組成物と、グリカンサブユニットのグリカンポリマーへの組み込みを生じる条件下で、接触させる工程、
任意選択により、グリカンポリマーを精製する工程、および
腸への投与および腸内微生物の調節のための医薬組成物としてグリカンポリマーを製剤化し、それにより、標的ヒト腸内微生物を調節する医薬組成物を作製する工程
を含む方法を対象とする。
【００５８】
別の態様では、本発明は、配列番号１〜１２４の１つ以上から選択される核酸配列と少なくとも８０、８５、９０、９１、９２、９３、９４、９５、９６、９７、９８、９９、または１００％同一である、核酸配列によってコードされるグリコシダーゼ酵素を含むグリコシダーゼ酵素分子の精製調製物であって、グリコシダーゼ酵素がヒト腸内微生物中に存在する、精製調製物を対象とする。
【００５９】
別の態様では、本発明は、配列番号１〜１２４の１つ以上から選択される核酸配列と少なくとも８０、８５、９０、９１、９２、９３、９４、９５、９６、９７、９８、９９、または１００％同一である、核酸配列を含むベクターであって、核酸がヒト腸内微生物中に存在するグリコシダーゼ酵素をコードし、ベクターはグリコシダーゼ酵素を発現するために使用することができる、ベクターを対象とする。
【００６０】
別の態様では、本発明は、
配列番号１〜１２４の１つ以上から選択される核酸配列によりコードされるグリコシダーゼ酵素、およびグリコシダーゼ酵素の基質、例えば、グリカンサブユニット、例えば、モノマーまたはダイマー
を含む反応混合物であって、基質が、例えば、縮合によって、グリカンポリマーを形成するのに十分な量で存在する、反応混合物を対象とする。
【図面の簡単な説明】
【００６１】
【図１】曲線の前縁および後縁の両方における平均分子量および１０％の最大吸収の分子量を示すｇｌｕ１００試料の１６分〜２０．５分の代表的なＳＥＣ曲線である。
【図２】アルファ−グリコシド結合およびベータ−グリコシド結合のシグナル分布を含むｇｌｕ１００試料の１Ｈ−１３Ｃ  ＨＳＱＣスペクトルの代表的なアノマー領域である。
【図３Ａ】図３Ａ〜３Ｃに、フィンガープリントピークの相加効果を示す、ｇｌｕ５０ｇａｌ５０（図３Ａ）、ｇｌｕ１００（図３Ｂ）、およびｇａｌ１００（図３Ｃ）試料の１Ｈ−１３Ｃ  ＨＳＱＣスペクトルの代表的なアノマー領域を示す。
【図３Ｂ】図３Ａ〜３Ｃに、フィンガープリントピークの相加効果を示す、ｇｌｕ５０ｇａｌ５０（図３Ａ）、ｇｌｕ１００（図３Ｂ）、およびｇａｌ１００（図３Ｃ）試料の１Ｈ−１３Ｃ  ＨＳＱＣスペクトルの代表的なアノマー領域を示す。
【図３Ｃ】図３Ａ〜３Ｃに、フィンガープリントピークの相加効果を示す、ｇｌｕ５０ｇａｌ５０（図３Ａ）、ｇｌｕ１００（図３Ｂ）、およびｇａｌ１００（図３Ｃ）試料の１Ｈ−１３Ｃ  ＨＳＱＣスペクトルの代表的なアノマー領域を示す。
【図４】既知の基準との比較によって割り当てられた位置化学の分布を示す、３つの代表的なパーメチル化および加水分解されたグリカン、ｇｌｕ５０ｇａｌ５０（図４Ａ）、ｍａｎ５２ｇｌｕ２９ｇａｌ１９（図４Ｂ）、およびｇｌｕ１００（図４Ｃ）の代表的なＧＣクロマトグラムである。
【図５】ラクトース（灰色、β−ガラクト−１，４−グルコース）と実施例２に記載のβ−ガラクトシダーゼによるラクトースの処置によって作製されたグリカン（黒）とを比較した、処理されたＳＥＣトレースを示すグラフである。
【図６】セロビオース（灰色、β−グルコ−１，４−グルコース）と実施例４に記載のβ−グルコシダーゼによるセロビオースの処置によって作製されたグリカン（黒）とを比較した、処理されたＳＥＣトレースを示すグラフである。ＤＰ２材料の最大ピーク強度のシフトは、ＤＰ２材料の平均見かけＭｗをわずかにシフトさせるアロセロビオース（例えば、β−グルコ−１，６−グルコース）の形成によって引き起こされる。
【図７】（図７Ａ）マルトビオース（灰色、α−グルコ−１，４−グルコース）と実施例５に記載のα−グルコシダーゼによるマルトビオースの処置によって作製されたグリカン（黒）とを、および（図７Ｂ）マルトビオース（灰色）と実施例９に記載の酵母発酵によって精製された実施例１８からのグリカン（黒）とを比較した、処理されたＳＥＣトレースを示すグラフである。マルトースは酵母によって消化できるが、いくつかのＤＰ２材料は、マルトース（α−グルコ−１，４−グルコース）がアロマルトース（例えば、α−グルコ−１，６−グルコース；α−グルコ−１，３−グルコース）に変換されるトランスグリコシル化によって残存し、これは酵母による消化効率がより低い。
【図８】メリビオース（灰色、α−ガラクト−１，６−グルコース）と実施例３に記載のα−ガラクトシダーゼによるメリビオースの処置によって作製されたグリカン（黒）とを比較した、処理されたＳＥＣトレースを示すグラフである。ＤＰ２材料の最大ピーク強度のシフトは、ＤＰ２材料の平均見かけＭｗをわずかにシフトさせるアロメリビオース（例えば、α−グルコ−１，４−グルコース）の形成によって引き起こされる。
【図９】β−グルコシダーゼによるグルコースの逆加水分解からの反応混合物の蛍光標識糖鎖電気泳動（ＦＡＣＥ）分析を示す画像である。レーン１は純粋なタンパク質であり、そしてレーン２〜４は、実施例７に記載されるように、それぞれトリメチルホスフェート、ジエチレングリコールジメチルエーテル、およびテトラエチレングリコールジメチルエーテル中での反応である。
【図１０】実施例８に記載されるように、３００分後にラクトースをβ−ガラクトシダーゼで処置することにより作製されたグリカンと、１２００分後にｄ−ガラクトースの存在下でラクトースをβ−ガラクトシダーゼで処置することにより作製されたグリカン（すなわち、最大でＤＰ≧３への変換）との生データＳＥＣ比較を示すグラフである。トレースは、Ｄ−ガラクトースの添加が反応を有意に遅くするが、生成物分布をＤＰ≧３オリゴ糖の量の増加に向かってシフトもすることを示す。
【図１１】さらなる分画なしに試料からモノマーを除去することを目的としたグリカンの木炭分画の結果に関する処理されたＳＥＣデータを示すグラフである。３つの曲線は、親グリカン、１％ＥｔＯＨ溶出によって親から除去されたモノマー画分（見かけピーク分子量約２００）、および５０％ＥｔＯＨ溶出によって単離された残りの画分を表す。
【図１２】実施例６に記載の基質選択的トランスグリコシル化を介したオリゴ糖合成の概略図である。各反応において、非還元末端モノマーのトランスグリコシル化に対する酵素選択性は、生成物の別個の混合物をもたらす。この図において、「Ａ」および「Ｂ」は、異なるモノマー、グリコシド結合の異なる立体化学、グリコシド結合の異なる位置化学、またはそれらの任意の組み合わせを表し得る。
【図１３】実施例１１〜１８に記載されるように、３００分後にラクトースをβ−ガラクトシダーゼで処置することにより作製されたグリカンのＳＥＣ曲線を示すグラフである。
【図１４】実施例１１〜１８に記載されるように、３００分後にラクトースをβ−グルコシダーゼで処置することにより作製されたグリカンのＳＥＣ曲線を示すグラフである。
【図１５】Ｈｕｍａｎ  Ｍｉｃｒｏｂｉｏｍｅ  Ｐｒｏｊｅｃｔからのゲノム分析において注釈および使用された全ゲノム、ならびに示された各代謝産物をコードする属別のゲノムのパーセンテージを示すチャートである。
【図１６】ブチレート産生者において有意に富化されたＣＡＺｙファミリーをコードするゲノムのパーセンテージを示すチャートである（Ｐ＜０．００１、Ｗｉｌｃｏｘ順位和、ブチレート産生者の１０％超においてＦＤＲ補正および同定）。（図１６Ａ）示されたファミリーからの少なくとも１つの酵素をコードするブチレートおよび非ブチレート産生者のパーセンテージ。（図１６Ｂ）ブチレート産生者において個々に有意に濃縮されている任意のＣＡＺｙｍｅをコードする非ブチレート産生者のパーセンテージ。
【図１７】平均遺伝子数の順に並べられた、ブチレート産生者における最も存在度の高いファミリーを示すチャートである。チャートは平均値±標準偏差を表す。
【図１８】ＴＭＡ−リアーゼ陽性ゲノムが有意に枯渇したＣＡＺｙファミリーをコードするゲノムのパーセンテージを示すチャートである（Ｐ＜０．０５、Ｗｉｌｃｏｘ順位和、ＦＤＲ補正）。（図１８Ａ）示されたファミリーからの少なくとも１つの酵素をコードするＴＭＡ−リアーゼ陽性および陰性ゲノムのパーセンテージ。（図１８Ｂ）ＴＭＡ−リアーゼ陽性ゲノムが著しく枯渇した任意のＣＡＺｙｍｅをコードするＴＭＡ−リアーゼ陽性および陰性ゲノムのパーセンテージ。
【図１９】平均遺伝子数の順に並べられた、ＴＭＡ−リアーゼ陰性ゲノムにおける最も存在度の高いファミリーを示すチャートである。チャートは平均値±標準偏差を表す。
【図２０】ウレアーゼ陽性ゲノムが有意に枯渇したＣＡＺｙファミリーをコードするゲノムのパーセンテージを示すチャートである（Ｐ＜０．０５、Ｗｉｌｃｏｘ順位和、ＦＤＲ補正）。（図２０Ａ）示されたファミリーからの少なくとも１つの酵素をコードするウレアーゼ陽性および陰性ゲノムのパーセンテージ。（図２０Ｂ）ウレアーゼ陽性ゲノムが著しく枯渇した任意のＣＡＺｙｍｅをコードするウレアーゼ陽性および陰性ゲノムのパーセンテージ。
【図２１】平均遺伝子数の順に並べられた、ウレアーゼ陰性ゲノムにおける最も存在度の高いファミリーを示すチャートである。チャートは平均値±標準偏差を表す。
【図２２】全ての２次相互作用項を許容する、グリカン組成の関数としてのＳＣＦＡ産生のＬＡＳＳＯ線形回帰モデルの結果を示すグラフである。（図２２Ａ）エクスビボモデルおよび（図２２Ｂ）定義された群からのＳＣＦＡ産生。
【図２３】炭水化物の存在下（図２３Ａ、および図２３Ｂの黒丸）、または示された炭水化物の存在下で、１８時間でグリカンポリマー調製物（例えば、Ｇｌｕ１００）を添加して（図２３Ｂ、灰色三角）、４８時間増殖させた、１５株から構成される定義された群におけるバクテロイデス・セルロリティカス（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ  ｃｅｌｌｕｌｏｌｙｔｉｃｕｓ）株の相対存在度を示すグラフである。平均相対存在度±ｓｔ．ｄｅｖが示される。
【図２４】１４株から構成される定義された群におけるバクテロイデス・セルロリティカス（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ  ｃｅｌｌｕｌｏｌｙｔｉｃｕｓ）株の相対存在度を示すグラフである。図２４Ａは、様々な炭水化物の存在下で４８時間（黒丸）、または示された炭水化物の存在下、１８時間でＢ．セルロリティカス（Ｂ．ｃｅｌｌｕｌｏｌｙｔｉｃｕｓ）を添加して（灰色三角）増殖させた、Ｂ．セルロリティカス（Ｂ．ｃｅｌｌｕｌｏｌｙｔｉｃｕｓ）の相対存在度を示す。図２４Ｂは、様々な炭水化物および１８時間で添加されたＢ．セルロリティカス（Ｂ．ｃｅｌｌｕｌｏｌｙｔｉｃｕｓ）の存在下（黒丸）、または示された炭水化物の存在下、１８時間でＢ．セルロリティカス（Ｂ．ｃｅｌｌｕｌｏｌｙｔｉｃｕｓ）を添加して、およびグリカンポリマー調製物を添加して（Ｇｌｕ、灰色三角）、１４株から構成される同一の定義された群において増殖させた、Ｂ．セルロリティカス（Ｂ．  ｃｅｌｌｕｌｏｌｙｔｉｃｕｓ）の相対存在度を示す。平均相対存在度±ｓｔ．ｄｅｖが示される。
【図２５】実施例２３においてスクリーニングされた細菌のパネルについての１６Ｓ  ｒＲＮＡ配列決定分析結果およびブチレート産生との相関関係を示すグラフである。示されるように、いくつかの分類群はブチレートレベルと高度に相関している。（図２５Ａ）クロストリジウム科（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉａｃｅａｅ）（ρ＝０．４０６  ｐ値０．００３）、（図２５Ｂ）ラクノスピラ科（Ｌａｃｈｎｏｓｐｉｒａｃｅａｅ）ロゼブリア（ｒｏｓｅｂｕｒｉａ）（ρ＝０．３３３  ｐ値０．０１８）、（図２５Ｃ）バクテロイデス・フラジリス（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ  ｆｒａｇｉｌｉｓ）（ρ＝０．４８３  ｐ値０）、（図２５Ｄ）ツリシバクター科（Ｔｕｒｉｃｉｂａｃｔｅｒａｃｅａｅ）ツリシバクター（Ｔｕｒｉｃｉｂａｃｔｅｒ）（ρ＝０．５５４  ｐ値＝０）。
【図２６−１】図２６−１および２６−２に、実施例２３においてスクリーニングされた細菌のパネルについての１６Ｓ  ｒＲＮＡ配列決定分析結果およびアセテート産生との相関関係を示すグラフを示す。エクスビボアッセイにおいて、いくつかの分類群はアセテートレベルと高度に相関している。示されるように、いくつかの分類群はアセテートレベルと高度に相関している。（図２６Ａ）クロストリジウム科（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉａｃｅａｅ）（ρ＝０．４２８  ｐ値＝０．００２）、（図２６Ｂ）バクテロイデス・ユニフォルミス（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ  ｕｎｉｆｏｒｍｉｓ）（ρ＝０．５２５  ｐ値＝０）、（図２６Ｃ）ルミノコッカス科（Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃａｃｅａｅ）オシロスピラ（Ｏｓｃｉｌｌｏｓｐｉｒａ）（ρ＝−０．７９１  ｐ値＝０）、（図２６Ｄ）バクテロイデス・オバツス（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ  ｏｖａｔｕｓ）（ρ＝０．４０５  ｐ値０．００４）、（図２６Ｅ）バクテロイデス目（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄａｌｅｓ）リケネラ科（Ｒｉｋｅｎｅｌｌａｃｅａｅ）（ρ＝−０．７３９  ｐ値＝０）、（図２６Ｆ）クロストリジウム目（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉａｌｅｓ）ルミノコッカス科（Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃａｃｅａｅ）（ρ＝−０．８３  ｐ値＝０）。
【図２６−２】図２６−１および２６−２に、実施例２３においてスクリーニングされた細菌のパネルについての１６Ｓ  ｒＲＮＡ配列決定分析結果およびアセテート産生との相関関係を示すグラフを示す。エクスビボアッセイにおいて、いくつかの分類群はアセテートレベルと高度に相関している。示されるように、いくつかの分類群はアセテートレベルと高度に相関している。（図２６Ａ）クロストリジウム科（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉａｃｅａｅ）（ρ＝０．４２８  ｐ値＝０．００２）、（図２６Ｂ）バクテロイデス・ユニフォルミス（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ  ｕｎｉｆｏｒｍｉｓ）（ρ＝０．５２５  ｐ値＝０）、（図２６Ｃ）ルミノコッカス科（Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃａｃｅａｅ）オシロスピラ（Ｏｓｃｉｌｌｏｓｐｉｒａ）（ρ＝−０．７９１  ｐ値＝０）、（図２６Ｄ）バクテロイデス・オバツス（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ  ｏｖａｔｕｓ）（ρ＝０．４０５  ｐ値０．００４）、（図２６Ｅ）バクテロイデス目（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄａｌｅｓ）リケネラ科（Ｒｉｋｅｎｅｌｌａｃｅａｅ）（ρ＝−０．７３９  ｐ値＝０）、（図２６Ｆ）クロストリジウム目（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉａｌｅｓ）ルミノコッカス科（Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃａｃｅａｅ）（ρ＝−０．８３  ｐ値＝０）。
【図２７】実施例２３においてスクリーニングされた細菌のパネルについての１６Ｓ  ｒＲＮＡ配列決定分析結果およびプロピオネート産生との相関関係を示すグラフである。示されているように、いくつかの分類群はプロピオネートレベルと高度に相関している。（図２７Ａ）バクテロイデス・オバツス（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ  ｏｖａｔｕｓ）（ρ＝０．６７８  ｐ値０）、（図２７Ｂ）ビフィドバクテリウム（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）（ρ＝−０．７８１  ｐ値＝０）、（図２７Ｃ）ルミノコッカス・ブロミイ（Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ  ｂｒｏｍｉｉ）ρ＝−０．７２  ｐ値０）、（図２７Ｄ）バクテロイデス・ユニフォルミス（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ  ｕｎｉｆｏｒｍｉｓ）（ρ＝０．５５９  ｐ値＝０）。
【図２８】各ＣＡＺｙｍｅファミリーおよびサブファミリーについて、胞子形成および非芽胞形成細菌において検出されたＣＡＺｙｍｅ遺伝子の数（平均）。遺伝子が胞子形成細菌において有意に富化され、１０％を超える胞子形成細菌ゲノムにおいて検出されたファミリーのみが示されている（Ｐ＜０．０５、Ｗｉｌｃｏｘ順位和、ＦＤＲ補正）。
【図２９】非胞子形成細菌に対して胞子菌のゲノムが有意に富化されたＣＡＺｙファミリーをコードするゲノムのパーセンテージ（Ｐ＜０．００１、Ｗｉｌｃｏｘ順位和、胞子菌の１０％超でＦＤＲ補正および同定）（Ａ）示されたファミリーからの少なくとも１つの酵素をコードする胞子形成および非胞子形成細菌のパーセンテージ。（Ｂ）胞子形成細菌が個々に有意に富化されている任意のＣＡｚｙｍｅファミリーまたはサブファミリーをコードする胞子形成および非胞子形成細菌のパーセンテージ。
【図３０−１】図３０−１〜３０−４に、代謝産物変換ゲノムが有意に富んだＣＡＺｙファミリーをコードするゲノムの割合を示すグラフ（図３０Ａ、３０Ｃ、３０Ｅ、３０Ｇ）、および平均遺伝子数の順に並べられた、代謝産物変換ゲノムにおける最も存在度の高いファミリーを示すチャート（図３０Ｂ、３０Ｄ、３０Ｆ、３０Ｈ）を示す。二次胆汁酸変換ゲノムおよび非変換ゲノム（図３０Ａ）、非インドール産生細菌において排他的にコードされたＣＡＺｙファミリーをコードするゲノム（図３０Ｃ）、ｐ−クレゾール産生ゲノムが有意に枯渇したＣＡＺｙファミリーをコードするゲノム（図３０Ｅ）、およびプロピオネート産生ゲノムが有意に枯渇したＣＡＺｙファミリーをコードするゲノム（図３０Ｇ）のパーセンテージを示す。二次胆汁酸変換ゲノム（図３０Ｂ）、インドール陰性ゲノム（図３０Ｄ）、ｐ−クレゾール陰性ゲノム（図３０Ｆ）、およびプロピオネート陰性ゲノム（図３０Ｈ）における最も存在度の高いファミリーを示すチャートが示されている。チャートは平均値±標準誤差を表す。
【図３０−２】図３０−１〜３０−４に、代謝産物変換ゲノムが有意に富んだＣＡＺｙファミリーをコードするゲノムの割合を示すグラフ（図３０Ａ、３０Ｃ、３０Ｅ、３０Ｇ）、および平均遺伝子数の順に並べられた、代謝産物変換ゲノムにおける最も存在度の高いファミリーを示すチャート（図３０Ｂ、３０Ｄ、３０Ｆ、３０Ｈ）を示す。二次胆汁酸変換ゲノムおよび非変換ゲノム（図３０Ａ）、非インドール産生細菌において排他的にコードされたＣＡＺｙファミリーをコードするゲノム（図３０Ｃ）、ｐ−クレゾール産生ゲノムが有意に枯渇したＣＡＺｙファミリーをコードするゲノム（図３０Ｅ）、およびプロピオネート産生ゲノムが有意に枯渇したＣＡＺｙファミリーをコードするゲノム（図３０Ｇ）のパーセンテージを示す。二次胆汁酸変換ゲノム（図３０Ｂ）、インドール陰性ゲノム（図３０Ｄ）、ｐ−クレゾール陰性ゲノム（図３０Ｆ）、およびプロピオネート陰性ゲノム（図３０Ｈ）における最も存在度の高いファミリーを示すチャートが示されている。チャートは平均値±標準誤差を表す。
【図３０−３】図３０−１〜３０−４に、代謝産物変換ゲノムが有意に富んだＣＡＺｙファミリーをコードするゲノムの割合を示すグラフ（図３０Ａ、３０Ｃ、３０Ｅ、３０Ｇ）、および平均遺伝子数の順に並べられた、代謝産物変換ゲノムにおける最も存在度の高いファミリーを示すチャート（図３０Ｂ、３０Ｄ、３０Ｆ、３０Ｈ）を示す。二次胆汁酸変換ゲノムおよび非変換ゲノム（図３０Ａ）、非インドール産生細菌において排他的にコードされたＣＡＺｙファミリーをコードするゲノム（図３０Ｃ）、ｐ−クレゾール産生ゲノムが有意に枯渇したＣＡＺｙファミリーをコードするゲノム（図３０Ｅ）、およびプロピオネート産生ゲノムが有意に枯渇したＣＡＺｙファミリーをコードするゲノム（図３０Ｇ）のパーセンテージを示す。二次胆汁酸変換ゲノム（図３０Ｂ）、インドール陰性ゲノム（図３０Ｄ）、ｐ−クレゾール陰性ゲノム（図３０Ｆ）、およびプロピオネート陰性ゲノム（図３０Ｈ）における最も存在度の高いファミリーを示すチャートが示されている。チャートは平均値±標準誤差を表す。
【図３０−４】図３０−１〜３０−４に、代謝産物変換ゲノムが有意に富んだＣＡＺｙファミリーをコードするゲノムの割合を示すグラフ（図３０Ａ、３０Ｃ、３０Ｅ、３０Ｇ）、および平均遺伝子数の順に並べられた、代謝産物変換ゲノムにおける最も存在度の高いファミリーを示すチャート（図３０Ｂ、３０Ｄ、３０Ｆ、３０Ｈ）を示す。二次胆汁酸変換ゲノムおよび非変換ゲノム（図３０Ａ）、非インドール産生細菌において排他的にコードされたＣＡＺｙファミリーをコードするゲノム（図３０Ｃ）、ｐ−クレゾール産生ゲノムが有意に枯渇したＣＡＺｙファミリーをコードするゲノム（図３０Ｅ）、およびプロピオネート産生ゲノムが有意に枯渇したＣＡＺｙファミリーをコードするゲノム（図３０Ｇ）のパーセンテージを示す。二次胆汁酸変換ゲノム（図３０Ｂ）、インドール陰性ゲノム（図３０Ｄ）、ｐ−クレゾール陰性ゲノム（図３０Ｆ）、およびプロピオネート陰性ゲノム（図３０Ｈ）における最も存在度の高いファミリーを示すチャートが示されている。チャートは平均値±標準誤差を表す。
【図３１】アルファ−ガラクトシダーゼおよびメリビオースまたはラフィノースのいずれかを介して合成されたアルファ−ガラクトオリゴ糖と共に、メリビオース（例えば、メリビオース−１）（図３１Ａ）またはラフィノース（例えば、ラフィノース−１）（図３１Ｂ）の存在下で増殖させた場合のエクスビボ群におけるラクノスピラ科（Ｌａｃｈｎｏｓｐｉｒａｃｅａｅ）細菌の相対存在度の増加を示すグラフである。図３１Ａは、酵素１９および２０が、ラクノスピラ科（Ｌａｃｈｎｏｓｐｉｒａｃｅａｅ）からの細菌ゲノムにコードされたアルファ−ガラクトシダーゼであることを示し、それらの分類群（メリビオース−ｅｎｚ１９−１およびメリビオース−ｅｎｚ２０−１）の、他の種に由来するアルファ−ガラクトシダーゼ（メリビオース−ｅｎｚ１６−１およびメリビオース−ｅｎｚ１７−１）（ラクノスピラ科（Ｌａｃｈｎｏｓｐｉｒａｃｅａｅ）細菌につき同様の特異的富化を示さなかった）と比較した特異的富化を示した。図３１Ｂは、酵素１９が、ラクノスピラ科（Ｌａｃｈｎｏｓｐｉｒａｃｅａｅ）からの細菌ゲノムにコードされたアルファ−ガラクトシダーゼであることを示し、それらの分類群（ラフィノース−ｅｎｚ１９−１）の、異なる種に由来するアルファ−ガラクトシダーゼ（ラフィノース−ｅｎｚ１６−１）（ラクノスピラ科（Ｌａｃｈｎｏｓｐｉｒａｃｅａｅ）細菌につき同様の特異的富化を示さなかった）と比較した特異的富化を示した。
【図３２】ラクツロース（ラクツロース−１）ならびにＧＨ４２ベータ−ガラクトシダーゼ（ｅｎｚ２３）およびラクツロース（ラクツロース−ｅｎｚ２３−１）を介して合成されたベータ−ガラクトオリゴ糖の存在下で増殖させた場合の、ビフィドバクテリウム（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）（図３２Ａ）、バクテロイデス（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ）（図３２Ｂ）、およびロゼブリア（Ｒｏｓｅｂｕｒｉａ）（図３２Ｃ）細菌のエクスビボ群における相対存在度の増加を示すグラフである。酵素２３は、ビフィドバクテリウム（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉａ）種からの細菌ゲノムにコードされるベータ−ガラクトシダーゼであり、この酵素（ラクツロース−ｅｎｚ２３−１）を用いて合成されたベータ−ガラクトオリゴ糖は、ラクツロース単独と比較して、ビフィドバクテリウム（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）、ロゼブリア（Ｒｏｓｅｂｕｒｉａ）、およびバクテロイデス（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ）の富化を示した。ＧＨ４２ベータ−ガラクトオリゴ糖は、一般的な腸内マイクロバイオーム共生体である、バクテロイデス（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ）およびファーミキューテス（Ｆｉｒｍｉｃｕｔｅ）ゲノムからのＧＨ４２グリコシダーゼの富化を示す（図３２Ｄ）。
【発明を実施するための形態】
【００６２】
本発明は、少なくとも、グリカンポリマー調製物を用いて疾患または障害（例えば、本明細書に記載のもの）を有する対象を処置する方法を特徴とする。実施形態において、グリカンポリマー調製物は、それが代謝産物（例えば、短鎖脂肪酸（ＳＦＣＡ）（例えば、プロピオネートまたはブチレート）、アンモニア、トリメチルアミン（ＴＭＡ）、トリメチルアミンＮ−オキシド（ＴＭＡＯ）、尿毒症性溶質（例えば、ｐ−クレゾールまたはインドール）、リポ多糖類（ＬＰＳ）、または胆汁酸（例えば、二次胆汁酸））の産生またはレベル（例えば、望ましくないレベル）を調節することに基づいて、選択される。代謝産物の望ましくないレベルは、高すぎてもよく、低すぎてもよい。いくつかの実施形態では、代謝産物は、対象の健康に対する所望の（例えば、有益な）効果と関連している。他の実施形態では、代謝産物は、対象の健康に対する望ましくない（例えば、有害な）効果と関連している。いくつかの実施形態では、本明細書に記載の方法は、代謝産物を増加させる工程を含む。他の実施形態では、方法は、代謝産物を減少させる工程を含む。いくつかの実施形態では、代謝産物は、微生物（例えば、細菌）代謝産物である。いくつかの実施形態では、第１の代謝産物（例えば、分類群Ａによって産生されるもの）は、第２の代謝産物（例えば、分類群Ｂによって産生されるもの）を調節するために調節される。いくつかの実施形態では、第２の代謝産物は、疾患または障害と関連している。望ましくないレベルの代謝産物は、対象の身体のどこにでも発生し得る（例えば、結腸および腸を含む胃腸管、肝臓および腎臓を含む臓器、糞便、血液、脳、神経系、心臓、尿、その他の場所）。いくつかの実施形態では、微生物叢の代謝産物産生（例えば腸内）は調節され、代謝産物のレベルに局所的な影響を与える（例えば代謝産物の局所的な減少または増加）。いくつかの実施形態では、微生物叢の代謝産物産生（例えば腸内）は調節され、代謝産物のレベルに全身的な影響を与える（例えば代謝産物の全身的な減少または増加）。いくつかの実施形態では、第１の代謝産物（例えば、代謝産物Ａ、例えば、腸内）の調節は、第２の代謝産物（例えば、代謝産物Ｂ、例えば、身体の腸以外の部位）の調節をもたらす。いくつかの実施形態では、グリカンポリマー調製物はそれを必要とする対象に投与され、ここで、グリカンポリマーは、微生物代謝産物産生者のクラスの特定のグリコシダーゼ機構のための基質（例えば好ましい基質）である。いくつかの実施形態では、グリカンポリマー調製物はそれを必要とする対象に投与され、ここで、グリカンポリマーは、微生物代謝産物の非産生者のクラスの特定のグリコシダーゼ機構のための基質（例えば好ましい基質）である。いくつかの実施形態では、代謝産物産生者と代謝産物非産生者とのバランス（例えば腸などの、身体部位における微生物分類群の相対存在度）を調節して、部位によって産生される代謝産物のレベルを調節する。いくつかの実施形態では、代謝産物レベルを調節するために産生者と非産生者とのバランスを調節することにより、代謝産物の調節異常に関連する疾患または障害を処置する。いくつかの実施形態では、対象は腸などの部位のディスバイオシスを有する。微生物代謝産物産生者または非産生者の基質（例えば、好ましい基質）であるグリカンポリマー調製物が、さらに本明細書で提供される。いくつかの実施形態では、グリカンポリマー調製物は、それぞれ、微生物分類群または代謝産物産生者または非産生者のグリコシダーゼ酵素プロファイルに合わせて調整される。すなわち、グリカンポリマーは、産生者または非産生者のゲノムに存在するグリコシダーゼの基質（例えば、好ましい基質）である。いくつかの実施形態では、グリコシダーゼは、他のクラス（例えば、非産生者）に対し、１つのクラス（例えば、代謝産物産生者）に富んでいるかまたは排他的である。調整されたグリカンポリマーの共製剤（例えば、シンバイオティクス）およびグリカンポリマーを基質として（優先的に）使用することができるグリコシダーゼレパートリー（グリコシダーゼプロファイル）を有する微生物分類群が本明細書でさらに提供される。いくつかの実施形態では、共製剤は、例えば腸などの、微生物部位における微生物分類群の移植を増加させるために使用される。
【００６３】
本明細書に記載のグリカンポリマーは、特定の腸内微生物、例えば、ヒト腸内微生物を標的とするように調整され得る。いくつかの実施形態では、グリコシドヒドロラーゼ（グリコシダーゼ）酵素は、グリカンポリマーを特定の微生物に合わせるように選択される。いくつかの実施形態では、微生物のグリコシドヒドロラーゼ（グリコシダーゼ）プロファイルが決定され、例えば、グリカンポリマーを産生するのに適した条件下でグリカンポリマー調製物を産生するように同定された１つ以上のグリコシドヒドロラーゼ（グリコシダーゼ）を（例えば、インビトロで）使用して、グリカンポリマーをそのプロファイルに合わせる。グリコシドヒドロラーゼは単離（および任意選択により、例えば適当な基質上に、固定化）することができる。いくつかの実施形態では、グリコシドヒドロラーゼは微生物（例えば、グリコシドヒドロラーゼを含む微生物抽出物）から抽出され得る。いくつかの実施形態では、それらの表面および／または細胞内にグリコシドヒドロラーゼを含む微生物細胞（例えば細菌）が使用され得る）。いくつかの実施形態では、（例えば、微生物培養物からの）グリコシドヒドロラーゼを含む上清が使用され得る。いくつかの実施形態では、特定の微生物のグリコシドヒドロラーゼ（グリコシダーゼ）プロファイルは知られていない、または決定されていないが、微生物に由来する酵素を使用して（例えば、単離、抽出、全細胞、上清形態など）本明細書に記載の方法においてグリカンポリマーを産生する。いくつかの実施形態では、本明細書に記載のように産生されたグリカンポリマー調製物は、特定の微生物（または微生物群、例えば、同等または類似のグリコシダーゼプロファイルを有する微生物群）およびそのグリコシダーゼ機構に対する特異的基質である。いくつかの実施形態では、グリカンポリマー調製物は、微生物または微生物群によって、例えば、ヒト対象の胃腸管において、特異的に発酵される（例えば、グリカンポリマーは、例えば異なるグリコシダーゼプロファイルを有する、別の微生物（または微生物群）と比較した場合、より速い速度でまたはより高度に発酵される）。いくつかの実施形態では、グリカンポリマー調製物は、特定の微生物に増殖上の利点を付与する。いくつかの実施形態では、グリカンポリマーは、微生物代謝産物、例えば、特定の微生物によって作製される代謝産物、または特定の微生物によって作製されない微生物代謝産物の産生を調節するために利用され得る。後者の場合、特定の微生物は、別の微生物、望ましくない微生物代謝産物を産生する微生物と競合する可能性があり、特定の微生物による競合の成功は、より低いレベルの微生物代謝産物をもたらす可能性がある。いくつかの実施形態では、グリカンポリマーは、移植を必要とする対象に投与される特定の微生物の対象の微生物叢（例えば、腸内細菌叢、例えば結腸内細菌叢）への移植を促進するために使用され得る。いくつかの実施形態では、グリカンポリマーは、移植部位（例えば腸）の既存の微生物叢における移植をより成功させるために、例えば空間および栄養素について、競合を成功させる、特定の微生物に増殖上の利点を付与する。
【００６４】
定義
本発明は、特定の実施形態に関して、および特定の図を参照して説明されるが、本発明はそれらに限定されず、特許請求の範囲によってのみ限定される。以下に記載される用語は、他に示されない限り、一般的にその常識で理解されるべきである。
【００６５】
微生物分類群の「存在度」は、本明細書において使用される場合、相対的な用語であり、胃腸管内の共同体等の定義された微生物生態学的地位、または宿主生物全体（例えば、疾患のヒトまたは実験動物モデル）における微生物分類群の他の分類群に対する相対的な存在を指す。
【００６６】
用語が本明細書に使用される場合、「取得する」または「取得すること」は、例えば、値または物理的実体を「直接取得すること」または「間接的に取得すること」によって、値、例えば、数値、または画像、または物理的実体（例えば試料）を入手することを指す。「直接取得すること」は、処理を行って（例えば、合成または分析方法またはプロトコルを行って）、値または物理的実体を得ることを意味する。「間接的に取得すること」とは、値または物理的実体を別の団体または供給元（例えば、物理的実体または値を直接取得した第３者研究所）から受領することを指す。値または物理的実体を直接取得することは、物理的物質の物理的変化または機械もしくはデバイスの使用を含む処理を行うことを含む。値を直接取得することの例は、ヒト対象から試料を得ることを含む。値を直接取得することは、機械もしくはデバイス、例えば、ＮＭＲ分光計を使用して、ＮＭＲスペクトルを得る処理を行うことを含む。
【００６７】
例えば、グリカンポリマーの種類に関連して、本明細書に使用される場合、「明確に区別できる」は、それが化学的および／または構造的に他と異なることを意味するものとする。例えば、２つの糖が化学的に異なる場合（例えば、フコースおよびキシロース）、または構造的に異なる場合（例えば、環状対非環状、Ｌ体対Ｄ体）、それらは「明確に区別できる」。２つの二量体が同じ２つの単量体からなるが、一方の対がアルファ−１，４結合を含み、他方の対がベータ−１，６結合を含む場合、それらは明確に区別できる。明確に区別できる実体は、当該技術分野で知られている、および／または本明細書に記載される方法によって検出することができる任意の他の適切な別個の特徴または特性を有し得る。
【００６８】
本明細書に使用される場合、「投薬レジメン」、「投与レジメン」、または「治療レジメン」は、治療目標を達成する薬物投与のモダリティである。投薬レジメンは、投与経路、単位用量、投薬頻度、または治療の長さのうちの１つ、２つ、３つ、または４つの定義を含む。
【００６９】
「ディスバイオシス」とは、正常な多様性、第１の細菌分類群の第２の細菌分類群に対する割合、および／または生態学的ネットワークの機能（例えば、代謝産物の生成）が破壊された、または不安定である、例えば、胃腸管内の微生物叢の、不均衡な状態を指す。この望ましくない、例えば、不健康な状態は、宿主対象に必須機能をもはや提供せず、それゆえに、一実施形態では、対象における健康をもはや促進しない、または望まれていない症状と関連する、微生物叢（例えば、細菌分類群）の多様性の減少もしくは増加、１つ以上の病原体もしくはパソビオントの過剰増殖、または生物学的微生物共同体へのシフトが含まれるが、これらに限定されない、多くの因子によるものであり得る。一実施形態では、代謝産物の産生は、疾患または障害の発症に寄与するように調節される。
【００７０】
組成物（例えば、医薬組成物など）または薬剤の「有効量」および「治療有効量」という用語は、組成物または薬剤の所望の効果を提供するのに十分な量を意味する。いくつかの実施形態では、医師または他の医療従事者は、適切な量および投与レジメンを決定する。有効量はまた、医学的状態の発症または再発を防ぐ組成物（例えば、医薬組成物など）または薬剤の量を指す。
【００７１】
「微生物移植」または単に「移植」とは、（例えば、本明細書に記載のシンバイオティクスの形態で、例えば、微生物分類群を対照に投与することによって）移植前にヒト対象において過少発現されるか（例えば健康な参照対象に対して）、または存在しない（例えば、検出不能である）、標的ニッチ（例えば、結腸（ｃｏｌｏｎ）または腸（ｉｎｔｅｓｔｉｎｅ）などのヒトの腸（ｇｕｔ））における微生物分類群の定着（例えば増殖）を指す。移植した微生物分類群は、一時的な期間定着し得、または微生物分類群の移植後の対象を占める微生物叢において長期安定性を示し得る。いくつかの実施形態では、移植した微生物分類群は、ディスバイオシスから健康状態へのシフトを表現する、標的ニッチでの環境シフトを誘発し得る。
【００７２】
「フラクトオリゴ糖」または「ＦＯＳ」は、これらの用語が本明細書において使用される場合、任意選択により末端グルコースを含む、以下の配列からなるフルクトースポリマーを指す：ベータ２，１、ベータ２，６、アルファ１，２およびベータ１，２グリコシド結合の１つ以上からなる（Ｆｒｕ）ｎ−Ｇｌｃ（ここで、ｎは、通常、３〜１０である）。変異体には、主鎖中のフルクトシル単位間のイヌリン型β−１，２およびレバン型β−２，６結合が含まれる。一実施形態では、ＦＯＳは、Ｍｅｙｅｒ，Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｃａｌ  Ｐｒｏｄｕｃｔｉｏｎ  ｏｆ  Ｏｌｉｇｏｓａｃｃｈａｒｉｄｅｓ−Ａｐｐｌｉｃａｔｉｏｎｓ  ｉｎ  ｔｈｅ  Ｆｏｏｄ  Ｉｎｄｕｓｔｒｙ，Ｃｈａｐｔｅｒ  ｔｗｏ，Ｆｏｏｄ  ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ  ａｎｄ  Ｉｎｄｕｓｔｒｙ，２０１５，（Ｍｅｙｅｒ  ２０１５）の参考文献８、２４、２５、６１、６７、６９、７２、１７０、または１７６〜１８６、または２１、２９、１７０、１７６、または２２２のいずれかに記載の方法によって作製され、この文献は、それぞれの参考文献と共に、参照により本明細書に組み込まれる。一実施形態では、ＦＯＳは、Ｄｉｅｚ−Ｍｕｎｉｃｉｏ  ｅｔ  ａｌ．，２０１４，Ｓｙｎｔｈｅｓｉｓ  ｏｆ  ｎｏｖｅｌ  ｂｉｏａｃｔｉｖｅ  ｌａｃｔｏｓｅ−ｄｅｒｉｖｅｄ  ｏｌｉｇｏｓａｃｃｈａｒｉｄｅｓ  ｂｙ  ｍｉｃｒｏｂｉａｌ  ｇｌｙｃｏｓｉｄｅ  ｈｙｄｒｏｌａｓｅｓ，２０１４，Ｍｉｃｒｏｂｉａｌ  Ｂｉｏｔｅｃｎｈｏｌｏｇｙ，７：３１５−３１３（Ｄｉｅｚ−Ｍｕｎｉｃｉｏ  ｅｔ  ａｌ．２０１４）において見出されるＳａｎｇｅｅｔｈａ  ｅｔ  ａｌ．２００５，２０１４に記載されているか、またはそれに記載さる方法によって作製されたＦＯＳであり、これらの文献は、それぞれの参考文献と共に、参照により本明細書に組み込まれる。一実施形態では、ＦＯＳは、Ｂ．マセランス（Ｂ．ｍａｃｅｒａｎｓ）、Ｚ．モビリス（Ｚ．ｍｏｂｉｌｉｓ）、Ｌ．ロイテリー（Ｌ．ｒｅｕｔｒｉ）、Ａ．ニガー（Ａ．ｎｉｇｅｒ）、Ａ．ヤポニクス（Ａ．ｊａｐｏｎｉｃａｓ）、Ａ．フェチダス（Ａ．ｆｏｅｔｉｄｕｓ）、Ａ．シドウイイ（Ａ．ｓｙｄｏｗｉ，ｂ）、Ａ．プルランス（Ａ．ｐｕｌｌａｎｓ）、Ｃ．プルプレア（Ｃ．ｐｕｒｐｕｒｅａ）、Ｆ．オキシスポルム（Ｆ．ｏｘｙｓｐｏｒｕｍ）、Ｐ．シトリヌム（Ｐ．ｃｉｔｒｉｎｕｍ）、Ｐ．フレクエンタンス（Ｐ．ｆｒｅｑｕｅｎｔａｎｓ）、Ｐ．スピヌロサム（Ｐ．ｓｐｉｎｕｌｏｓｕｍ）、Ｐ．ルグロサム（Ｐ．ｒｉｇｕｌｏｓｕｍ）、Ｐ．パラシティカ（Ｐ．ｐａｒａｓｉｔｉｃａ）、Ｓ．ブレビカウリス（Ｓ．ｂｒｅｖｉｃａｕｌｉｓ）、Ｓ．セレビシエ（Ｓ．ｃｅｒｅｖｉｓｉａｅ）、またはＫ．マルキシアヌス（Ｋ．ｍａｒｘｉａｎｕｓ）由来の酵素から作られる。実施形態では、ＦＯＳは、フルクトシルトランスフェラーゼ、β−フルクトフラノシダーゼ（ＥＣ  ３．２．１．２６）、イヌロスクラーゼ（ＥＣ  ２．４．１．９）、レバンスクラーゼ（ＥＣ  ２．４．１．１０）、またはエンドイヌリナーゼの酵素作用によって産生される。
【００７３】
本明細書において使用される「ガラクトオリゴ糖」または「ＧＯＳ」は、ラクトースから産生され、２〜８個のサッカリド単位を有する物質の混合物を指し、その単位の１つは末端グルコースであり、残りの単位はガラクトース、および２単位のガラクトースを含む二糖類である。一実施形態では、ＧＯＳは、β−（１，４）またはβ−（１，６）結合によって大部分が結合しているガラクトピラノシルオリゴマー（ＤＰ＝３〜８）の混合物であるが、低い割合でβ（１，２）またはβ−（１，３）結合も存在し得る。末端グルコシル残基は、β−（１，４）結合によってガラクトシル単位に結合している。
【００７４】
ＧＯＳは、比較的高濃度のラクトースにおいて、ラクトースに対するβ−ガラクトシダーゼ（ＥＣ  ３．２．１．２３）の逆作用によって合成される。一実施形態では、ＧＯＳは、ビフィドバクテリウム（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）、例えば、ビフィドバクテリウム・ロンガム（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｌｏｎｇｕｍ）、クルイベロミセス種（Ｋｌｕｙｖｅｒｏｍｙｃｅｓ  ｓｐ．）、クルイベロミセス・マルシアヌス（Ｋｌｕｙｖｅｒｏｍｙｃｅｓ  ｍａｒｘｉａｎｕｓ）、アスペルギルス種（Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ  ｓｐ．）、例えば、アスペルギルス・オリゼ（Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ  ｏｒｙｚａｅ）、大腸菌（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉ）Ｋ−１２、バチルス・サークランス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｉｒｃｕｌａｎｓ）、ラクトバチルス・ブルガリカス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｂｕｌｇａｒｉｃｕｓ）、Ｓ．シングラリス（Ｓ．ｓｉｎｇｕｌａｒｉｓ）、Ｓ．サーモフィルス（Ｓ．ｔｈｅｒｍｏｐｈｉｌｅｓ）、またはＣ．ローレンティイ（Ｃ．ｌａｕｒｅｎｔｉｉ）からのβ−ガラクトシダーゼの酵素作用によって合成される。一実施形態では、ＧＯＳは、Ｍｅｙｅｒ  ２０１５の参考文献８、１０５、または１９６〜２０６、または１０５、１２０、１９８、２０２〜２０５、または２２３〜２２７のいずれかに開示されているか、またはこれに記載された方法によって作製されたＧＯＳであり、これらの文献は、それぞれの参考文献と共に、参照により本明細書に組み込まれる。一実施形態では、ＧＯＳは、Ｄｉｅｚ−Ｍｕｎｉｃｉｏ  ｅｔ  ａｌ．，２０１４に見出されるＰａｎｅｓａｒ  ｅｔ  ａｌ．２００６またはＴｏｒｒｅｓ  ｅｔ  ａｌ  ２０１０，２０１４に記載されているか、またはこれらに記載された方法によって作製されたＧＯＳであり、これらの文献は、それぞれの参考文献と共に、参照により本明細書に組み込まれる。
【００７５】
「グルコオリゴ糖」または「ＧＬＯＳ」は、本明細書において使用される用語としては、グルコースサブユニットのポリマーを指す。ＧＬＯＳの主な結合は、（Ｇｌｃ）ｎ［α（１→２）、α（１→３）、α（１→４）、およびα（１→６）］である。一実施形態では、ＧＬＯＳはデキストランスクラーゼ（ＥＣ  ２．４．１．５）を用いて作製される。一実施形態では、細菌（Ｌ．メセンテロイデス（Ｌ．ｍｅｓｅｎｔｅｒｏｉｄｅｓ）；Ｌ．シトレウム（Ｌ．ｃｉｔｒｅｕｍ））由来の酵素を用いてＧＬＯＳを産生することができる。一実施形態では、ＧＬＯＳは、Ｄｉｅｚ−Ｍｕｎｉｃｉｏ  ｅｔ  ａｌ．，２０１４，Ｓｙｎｔｈｅｓｉｓ  ｏｆ  ｎｏｖｅｌ  ｂｉｏａｃｔｉｖｅ  ｌａｃｔｏｓｅ−ｄｅｒｉｖｅｄ  ｏｌｉｇｏｓａｃｃｈａｒｉｄｅｓ  ｂｙ  ｍｉｃｒｏｂｉａｌ  ｇｌｙｃｏｓｉｄｅ  ｈｙｄｒｏｌａｓｅｓ，２０１４，Ｍｉｃｒｏｂｉａｌ  Ｂｉｏｔｅｃｎｈｏｌｏｇｙ，７：３１５−３１３において見出されるＲｅｍａｕｄ  ｅｔ  ａｌ．，１９９２、Ｃｈｕｎｇ  ａｎｄ  Ｄａｙ，２００２またはＫｉｍ  ｅｔ  ａｌ．，２０１４のいずれかに記載されているか、またはそれに記載さる方法によって作製されたＧＬＯＳであり、これらの文献は、それぞれの参考文献と共に、参照により本明細書に組み込まれる。
【００７６】
本明細書において使用される場合、「グリカンポリマー調製物」（「グリカンポリマーの調製物」、「グリカン調製物」または「グリカンポリマー」とも称される）は、所望の効果（例えば、治療効果）を示すグリカンポリマーを含む調製物である。いくつかの実施形態では、グリカンポリマーの調製物は、１つ以上の天然に存在するオリゴ糖、例えば、グルコオリゴ糖、マンナンオリゴ糖、イヌリン、リクノース、マルトテトラオース、ニゲロテトラオース、ニストース、セセモース（ｓｅｓｅｍｏｓｅ）、スタキオース、イソマルトトリオース、ニゲロトリオース、マルトトリオース、メレジトース、マルトトリオース（ｍａｌｔｏｔｒｉｏｓｅ）、ラフィノース、ケストース、フラクトオリゴ糖、２’−フコシルラクトース、ガラクトオリゴ糖、グリコシル、イドラパリナックス、イソマルトオリゴ糖、マルトデキストリン、キシロオリゴ糖、寒天、アガロース、アルギン酸、アルグロン酸、アルファグルカン、アミロペクチン、アミロース、アラビオキシラン、ベータ−グルカン、カロース、カプシュラン（ｃａｐｓｕｌａｎ）、カラギナン、セロデキストリン、セルリン、セルロース、キチン、キチンナノフィブリル、キチン−グルカン複合体、キトサン、クリソラミナリン、カードラン、シクロデキストリン、アルファ−シクロデキストリン、デキストラン、デキストリン、ジアルデヒドデンプン、フィコール、フルクタン、フコイダン、ガラクトグルコマンナン、ガラクトマンナン、ガラクトサミノガラクタン、ゲランガム、グルカン、グルコマンナン、グルクロノキシラン、グリコカリックス、グリコーゲン、ヘミセルロース、ヒプロメロース、イコデキストリン、ケフィラン、ラミナリン、レンチナン、レバン多糖、リケニン、マンナン、粘液、天然ガム、パラミロン、ペクチン酸、ペクチン、ペンタスターチ、植物グリコーゲン、プルーラン、ポリギーナン、ポリデキストロース、ポルフィラン、プルラン、シゾフィラン（ｓｃｈｉｚｏｐｈｙｌｌａｎ）、セファロース、シニストリン、シゾフィラン（ｓｉｚｏｆｉｒａｎ）、スガマデックス、ウェランガム、キサンタンガム、キシラン、キシログルカン、ザイモサンなどを含有しない。いくつかの実施形態では、グリカンポリマーは、塩、例えば、薬学的に許容される塩として存在する。
【００７７】
本明細書において使用される場合、「グリカンサブユニット」は、本明細書で開示されるグリカン種の個々の単位、例えば、グリカン種を作る構成要素を指す。一実施形態では、グリカンサブユニットは、モノマーである。一実施形態では、グリカンサブユニットは、ダイマーである。一実施形態では、グリカンサブユニットは、単糖類である。一実施形態では、グリカンサブユニットは、二糖類である。いくつかの実施形態では、グリカンサブユニットは、炭水化物であり、糖アルコール、短鎖脂肪酸、糖酸、イミノ糖、デオキシ糖、およびアミノ糖から選択され得る。いくつかの実施形態では、グリカンサブユニットは、エリトロース、トレオース、エリトルロース、アラビノース、リキソース、リボース、キシロース、リブロース、キシルロース、アロース、アルトロース、ガラクトース、グルコース、グロース、イドース、マンノース、タロース、フルクトース、プシコース、ソルボース、タガトース、フコース、フクロース、ラムノース、マンノヘプツロース、セドヘプツロース等である。いくつかの実施形態では、グリカンサブユニットは、グルコース、ガラクトース、アラビノース、マンノース、フルクトース、キシロース、フコース、またはラムノースである。実施形態では、グリカンは、別個のグリカンサブユニット、例えば、第１および第２の単糖類、または第１および第２の二糖類を含む。実施形態では、グリカンは、別個のグリカンサブユニット、例えば、第１、第２、第３、第４、および／または第５の別個のグリカンサブユニットを含む。
【００７８】
本明細書において使用される場合、「グリコシダーゼ酵素分子」は、グリコシダーゼ酵素の活性を保持するかまたは有するポリペプチドを含み、例えば、これは、グリコシダーゼ酵素の代謝回転率の少なくとも約４０％、約５０％、約６０％、約７０％、約８０％、約９０％、約９５％、約９９％、約９９．９％を保持するかまたは有し、またはグリコシダーゼ酵素の特異性の少なくとも約４０％、約５０％、約６０％、約７０％、約８０％、約９０％、約９５％、約９９％、約９９．９％を保持するかまたは有し、またはグリコシダーゼ酵素のグリカンサブユニットに対する親和性の少なくとも約４０％、約５０％、約６０％、約７０％、約８０％、約９０％、約９５％、約９９％、約９９．９％を保持するかまたは有する。いくつかの実施形態では、グリコシダーゼ酵素分子は、グリコシダーゼ酵素の代謝回転率の少なくとも約１１０％、１２０％、１３０％、１４０％、１５０％、１６０％、１７０％、１８０％、１９０％、２００％、３００％、４００％、または５００％であるグリコシダーゼ酵素の活性を有する、またはグリコシダーゼ酵素のグリカンサブユニットに対する親和性の少なくとも１１０％、１２０％、１３０％、１４０％、１５０％、１６０％、１７０％、１８０％、１９０％、２００％、３００％、４００％、または５００％を有する、ポリペプチドを含む。いくつかの実施形態では、グリコシダーゼ酵素分子は、グリコシダーゼ酵素のフラグメント（例えば、活性フラグメント）である。いくつかの実施形態において、グリコシダーゼ酵素分子は、グリコシダーゼ酵素と比較して少なくとも１、２、３、４、５、１０、２５、５０、７５、１００またはそれを超えるアミノ酸残基で異なる。いくつかの実施形態では、グリコシダーゼ酵素分子は、グリコシダーゼ酵素と比較して少なくとも１、２、３、４、５、１０、２５、５０、７５、１００アミノ酸の突然変異（例えば、欠失、付加または置換）を含む。
【００７９】
本明細書において使用される場合、「グリコシダーゼ酵素」は、グリコシダーゼ（「グリコシドヒドロラーゼ」（ＧＨ）とも称される）、グリコシルトランスフェラーゼ（ＧＴ）およびリアーゼを含む。
【００８０】
本明細書において使用される場合、「グリコ分類群」とは、代謝（例えば、酵素）機能の有無（例えば、欠如）に従って分類された細菌性微生物（例えば、ヒト腸内微生物）を指す。いくつかの実施形態では、分類群は、ＣＡＺｙグリコシダーゼ／グリコヒドロラーゼ（ＧＨ）またはＣＡＺｙグリコシルトランスフェラーゼ（ＧＴ）酵素機能に従って分類され得る。いくつかの実施形態では、細菌分類群は、グリコ分類群クラス１、グリコ分類群クラス２、グリコ分類群クラス３、グリコ分類群クラス４、グリコ分類群クラス５、グリコ分類群クラス６、またはグリコ分類群クラス７のいずれか１つに分類され得る。いくつかの実施形態では、グリコ分類群クラス１は、ｂｕｔおよび／またはｂｕｋ遺伝子含有細菌分類群を含有する。いくつかの実施形態では、グリコ分類群クラス２は、ｃｕｔＣ遺伝子陰性細菌分類群を含有する。いくつかの実施形態では、グリコ分類群クラス３は、ウレアーゼ遺伝子陰性細菌分類群を含有する。いくつかの実施形態では、グリコ分類群クラス４は、プロピオン酸キナーゼ、プロピオン酸ＣｏＡトランスフェラーゼ、プロピオン酸ＣｏＡリガーゼ、プロピオニルＣｏＡカルボキシラーゼ、メチルマロニル−ＣｏＡカルボキシトランスフェラーゼ、（Ｓ）−メチルマロニル−ＣｏＡデカルボキシラーゼ、メチルマロン酸セミアルデヒドデヒドロゲナーゼ、およびプロパナールデヒドロゲナーゼから選択される、１つ以上のプロピオン酸産生関連酵素を除外する。いくつかの実施形態では、グリコ分類群クラス５は、７アルファ−ヒドロキシステロイドデヒドロゲナーゼ、１２アルファ−ヒドロキシステロイドデヒドロゲナーゼ、７ベータ−ヒドロキシステロイドデヒドロゲナーゼ（ＮＡＤＰ＋）、２ベータ−ヒドロキシステロイドデヒドロゲナーゼ、３ベータ−ヒドロキシコラン酸３−デヒドロゲナーゼ（ＮＡＤ＋）、３アルファ−ヒドロキシコラン酸デヒドロゲナーゼ（ＮＡＤＰ＋）、３ベータ−ヒドロキシコラン酸３−デヒドロゲナーゼ（ＮＡＤＰ＋）、３アルファ−ヒドロキシ胆汁酸−ＣｏＡ−エステル３−デヒドロゲナーゼ、３アルファ−ヒドロキシコラン酸デヒドロゲナーゼ（ＮＡＤ＋）、胆汁酸ＣｏＡ−トランスフェラーゼ、胆汁酸７アルファ−デヒドラターゼ、および胆汁酸ＣｏＡリガーゼから選択される、胆汁酸産生（例えば、二次胆汁酸産生）関連酵素を含む。いくつかの実施形態では、グリコ分類群クラス６は、１つ以上のインドール産生関連酵素（例えば、トリプトファナーゼ）を除外する。いくつかの実施形態では、グリコ分類群クラス７は、４−ヒドロキシフェニルアセテートデカルボキシラーゼおよびアルデヒドフェレドキシンオキシドレダクターゼから選択される、１つ以上のｐ−クレゾール産生関連酵素を除外する。
【００８１】
本明細書において使用される「イソマルトオリゴ糖」または「ＩＭＯＳ」は、２〜６の範囲の重合度（ＤＰ）を有する主にα−（１，６）−結合したグルコース残基を有するオリゴ糖と、パノースなどのα−（１，６）および時にα−（１，４）グリコシド結合の混合物を有するオリゴ糖との混合物を指す。一実施形態では、ＩＭＯＳは、α−（１，６）グリコシド結合によってマルトースまたはイソマルトースに結合したグルコシル残基を含む。一実施形態では、ＩＭＯＳはデンプンを原料として使用して産生される。一実施形態では、これはコーンスターチから産生され、イソマルトース、イソマルトトリオースおよびパノースからなる。一実施形態では、ＩＭＯＳは、α−アミラーゼ（ＥＣ  ３．２．１．１）およびプルラナーゼ（ＥＣ  ３．２．１．４１）を使用してデンプンが液化される固定化酵素の組み合わせを使用する酵素転移反応の産物であり、第２段階では、中間生成物は、β−アミラーゼ（ＥＣ  ３．２．１．２）およびα−グルコシダーゼ（ＥＣ  ３．２．１．２０）の両方によって処理される。ベータ−アミラーゼは最初に液化デンプンをマルトースに加水分解する。次いで、α−グルコシダーゼのトランスグルコシダーゼ活性は、α−（１，６）−およびα−（１，４）−結合グルコース残基の両方を有するオリゴ糖を含有するイソマルトオリゴ糖混合物を産生する。一実施形態では、ＩＭＯＳは、Ｍｅｙｅｒ  ２０１５の参考文献２、または２１７〜２１９、または１２、１５２、１５９、または２３６のいずれかに記載されているか、またはこれに記載された方法によって作製されたＩＭＯＳであり、これらの文献は、それぞれの参考文献と共に、参照により本明細書に組み込まれる。一実施形態では、ＩＭＯＳは、Ｄｉｅｚ−Ｍｕｎｉｃｉｏ  ｅｔ  ａｌ．，２０１４に見出されるＰａｎｅｓａｒ  ｅｔ  ａｌ．２００６またはＴｏｒｒｅｓ  ｅｔ  ａｌ  ２０１０，２０１４に記載されているか、またはこれらに記載された方法によって作製されたＩＭＯＳであり、これらの文献は、それぞれの参考文献と共に、参照により本明細書に組み込まれる。一実施形態では、ＩＭＯＳは、α−アミラーゼもしくはプルラナーゼによって、または、β−アミラーゼおよびα−グルコシダーゼの順で、デンプンの酵素的加水分解によって合成される。一実施形態では、ＩＭＯＳは、Ａ．ニガー（Ａ．ｎｉｇｅｒ）、バチルス種（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｐｐ．）、Ｂ．サブチリス（Ｂ．ｓｕｂｔｉｌｉｓ）、Ｂ．ステアロサーモフィルス（Ｂ．ｓｔｅａｒｏｔｈｅｒｍｏｐｈｉｌｕｓ）、Ｔ．マリティマ（Ｔ．ｍａｒｉｔｉｍｅ）、Ａ．カルボナリアス（Ａ．ｃａｒｂｏｎａｒｉｏｕｓ）、またはＬ．メセンテロイデス（Ｌ．ｍｅｓｅｎｔｅｒｏｉｄｅｓ）由来の酵素によって合成される。
【００８２】
本明細書に使用される場合、「単離された」または「精製された」グリカンポリマー調製物は、実質的に純粋であり、かつ混入物質がなく、例えば、病原体、酵素またはそうでなければ、望まれていない生物物質、または毒性またはそうでなければ、望まれていない有機もしくは無機化合物である。いくつかの実施形態では、純粋なまたは単離された化合物、組成物、または調製物は、微量の溶媒および／または塩を含み得る（例えば、ｗ／ｗ、ｗ／ｖ、ｖ／ｖ、またはモル％で、１０％未満、９％、８％、７％、６％、５％、４％、３％、２％、１％、０．５％未満、または０．１％）。精製された化合物または調製物は、対象となる化合物のｗ／ｗ、ｗ／ｖ、ｖ／ｖ、またはモル％で少なくとも約６０％（ｗ／ｗ、ｗ／ｖ、ｖ／ｖ、またはモル％で）、少なくとも約７５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９７％、少なくとも約９８％、または少なくとも約９９％含有する。例えば、精製された（実質的に純粋な）または単離されたグリカンポリマー調製物は、ｗ／ｗ、ｗ／ｖ、ｖ／ｖ、またはモル％で、グリカンポリマーの少なくとも８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９８％、９９％、９９．５％、９９．８％、９９．９％、または１００％であり（すなわち、いかなる溶媒、例えば、水も含まず、グリカンポリマー調製物は溶解され得る）、例えば、製造、抽出／精製および／または処理中に、それらと同時に生じる構成成分から分離される（例えば、グリカンポリマーが望ましくない化合物を実質的に含まない）ものである。純度は、任意の適切な標準方法によって、例えば、カラムクロマトグラフィー（例えば、サイズ排除クロマトグラフィー（ＳＥＣ））、薄層クロマトグラフィー（ＴＬＣ）、ガスクロマトグラフィー（ＧＣ）、高速液体クロマトグラフィー（ＨＰＬＣ）、または核磁気共鳴（ＮＭＲ）分光計によって測定され得る。精製されたまたは純度はまた、ヒト対象への投与において安全である、例えば、生存能力のある感染性または毒性薬剤を欠いている、滅菌の度合いも定義し得る。
【００８３】
本明細書に使用される「マイクロバイオーム」は、対象（例えば、ヒト対象）内および上に持続的および一時的の両方で生息する微生物群（「微生物相」）の遺伝的内容物であり、これには、真核生物、古細菌、細菌、およびウイルス（細菌ウイルス（例えば、ファージ）を含む）が含まれ、「遺伝的内容物」には、ゲノムＤＮＡ、リボソームＲＮＡおよびメッセンジャーＲＮＡ等のＲＮＡ、エピゲノム、プラスミド、および他の種類のゲノム情報のすべてが包含される。いくつかの実施形態では、マイクロバイオームは、具体的には、生態学的地位における微生物群の遺伝子内容物を指す。
【００８４】
「微生物叢」は、本明細書に使用される場合、対象（例えば、ヒト対象）内および上に（持続的および一時的に）生じる微生物群を指し、真核生物、古細菌、細菌、およびウイルス（細菌ウイルス、例えばファージを含む）が包含される。いくつかの実施形態では、微生物叢は、具体的には、生態学的地位における微生物群を指す。
【００８５】
「パソビオント」または「（日和見性）病原体」は、本明細書において使用される場合、特定の遺伝学的および／または環境的条件が対象（例えば、ヒト対象）中に存在する場合にのみ、疾患を引き起こすことが可能な共生生物を指す。
【００８６】
本明細書において使用される場合、「病原性」という用語（例えば、「病原性細菌」）は、疾患を引き起こす能力を有する物質、微生物、または条件を指す。特定の文脈において、病原体はまた、疾患または状態と関連しているが、（直接的な）原因となる関係が確立されていないか、またはまだ確立されていない、微生物（例えば、細菌）も含む。本明細書において使用される場合、「病原体」という用語は、ウイルス、寄生虫、および細菌、または対象、例えば、ヒトにおいて感染を引き起こし得るその他の病原体を指す。
【００８７】
本明細書に使用される場合、「医薬組成物」は、薬理学的活性、または疾患の緩和、治療、もしくは予防におけるその他の直接効果、および／または完成した剤形もしくはその製剤化を有する、組成物または調製物であり、かつヒトに使用されるものである。医薬組成物は、典型的には、適正製造基準（ＧＭＰ）の条件下で生成される。医薬組成物は、滅菌または非滅菌であり得る。非滅菌である場合、かかる医薬組成物は、微生物学的規格および米国薬局方（ＵＳＰ）またはヨーロッパ薬局方（ＥＰ）において記載される非滅菌薬学的製品のための基準を典型的に満たす。医薬組成物は、さらなる活性剤、例えば、さらなる治療剤をさらに含み得るか、またはそれらと共に同時投与され得る。
【００８８】
医薬組成物はまた、例えば、さらなる治療剤、ポリフェノール、プレバイオティクス物質、プロバイオティクス細菌、薬学的に許容される賦形剤、溶媒、担体、またはこれらの任意の組み合わせも含み得る。本明細書に記載の任意のグリカンポリマー調製物は、医薬組成物として製剤化され得る。
【００８９】
「対象」（場合によっては「患者」）という用語は、本明細書において使用される場合、任意のヒト対象を指す。この用語は、特定の年齢または性別を示すものではない。対象は、妊婦を含み得る。対象は、新生児（早産児、満期新生児）、１歳までの乳児、幼児（例えば、１歳〜１２歳）、十代の若者（例えば、１３〜１９歳）、成人（例えば、２０〜６４歳）、および高齢者（６５歳以上）を含み得る。対象は、農業動物、例えば、農場の動物または家畜、例えば、ウシ、ウマ、ヒツジ、ブタ、ニワトリ等を含まない。
【００９０】
「実質的減少」は、本明細書において使用される場合、（例えば、バイオマーカーまたは代謝産物に対して）、５％、１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、９０％、９５％、９７％、９８％、９９％、９９．９％、または１００％の減少である。
【００９１】
「実質的増加」は、本明細書において使用される場合、例えば、バイオマーカーまたは代謝産物に対して）、１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、９０％、１００％、１５０％、２００％、２５０％、３００％、３５０％、４００％、４５０％、５００％、５５０％、６００％、６５０％、７００％、７５０％、８００％、８５０％、９００％、９５０％、１０００％、または１０００％超の増加である。
【００９２】
グリコシダーゼ酵素および／またはグリコシダーゼ酵素分子という用語に関して本明細書において使用される場合、「基質」という用語は、グリコシダーゼ酵素分子の産物であるか、またはグリコシダーゼ酵素分子によって作製されたグリカンポリマーの構造を有するグリカンポリマーを指し、これは、グリコシダーゼ酵素、例えば、ヒト腸内微生物において発現されるグリコシダーゼの基質である。実施形態では、グリコシダーゼ酵素分子は、適切な反応条件下で、グリカンサブユニットの重合を触媒して基質を形成し、グリコシダーゼ酵素は、適切な反応条件下で、基質のグリカンサブユニット間の結合（実施形態では、グリコシダーゼ酵素分子によって形成された同じ結合）を切断する。一実施形態では、グリコシダーゼ酵素分子およびグリコシダーゼ酵素は、同一の一次アミノ酸配列を有し、例えば同じ酵素である。実施形態では、基質は以下の特性のうちの１つ以上を有する：
ｉ）基質およびグリコシダーゼ酵素の代謝回転速度が、少なくとも、グリコシダーゼ酵素の少なくとも１つの天然に存在する基質の１０、２０、３０、４０、５０、６０、７０、８０、９０、９５、または９９％である程度に、グリコシダーゼ酵素の天然に存在する基質と類似している。代謝回転速度は、例えば、単位時間当たり、例えば１分もしくは１時間当たりの切断されたグリコシド結合、または単位時間当たり、例えば１時間もしくは１分当たりのグリカンポリマーの解重合の速度、に関して表すことができる；ｉｉ）グリコシダーゼ酵素に対する結合定数が、少なくとも、グリコシダーゼ酵素の少なくとも１つの天然に存在する基質の１０、２０、３０、４０、５０、６０、７０、８０、９０、９５、または９９％であり、実施形態では、グリコシダーゼ酵素の少なくとも１つの天然に存在する基質の１、２、３、４、５、１０、５０、または１００倍以下である；およびｉｉｉ）グリコシダーゼ酵素に対する結合モチーフ、グリコシダーゼ酵素分子に対する結合モチーフ、およびグリコシダーゼ酵素の少なくとも１つの天然に存在する基質が、１つ以上の特定のグリカンサブユニット、例えば、特定の糖ダイマー、特定の糖分岐点、特定のアルファ−またはベータ配置、特定の位置化学、例えば、１，２−、１，３−、１，４−、１，５−または１，６−結合、を共有する；およびｉｖ）基質が酵素分子を発現するヒト腸内微生物の増殖または代謝を促進する。
【００９３】
「合成物質」は、本明細書において使用される場合、天然に存在しない、グリカンポリマー調製物等の人工の化合物または調製物を指す。一実施形態では、本明細書に記載の非酵素ポリマー触媒は、適当な反応条件下、例えば、反応物に添加される個々のグリカンサブユニットからオリゴマーを作製する重合反応によって、調製物のグリカンを合成するために使用される。いくつかの実施形態では、非酵素ポリマー触媒は、加水分解剤として作用し、グリコシド結合を破壊し得る。他の実施形態では、非酵素ポリマー触媒は、グリコシド結合を形成し得る。一実施形態では、本明細書に記載のグルコシダーゼ酵素分子は、適当な反応条件下、例えば、反応物に添加される個々のグリカンサブユニットからオリゴマーを作製する重合反応によって、調製物のグリカンを合成するために使用される。いくつかの実施形態では、グリコシダーゼ酵素分子は、加水分解剤として作用し、グリコシド結合を破壊し得る。他の実施形態では、グリコシダーゼ酵素分子はグリコシド結合を形成することができる。一実施形態では、固相オリゴ糖合成は、適当な反応条件下、例えば、反応物に添加される個々のグリカンサブユニットからオリゴマーを作製する重合反応によって、調製物のグリカンを合成するために使用される。合成グリカンポリマー調製物はまた、天然のオリゴ糖源または多糖源から単離されないグリカンポリマーも含み得る。グリカンポリマー調製物は天然のオリゴ糖源または多糖源から単離されないが、グリカンポリマーを作り上げるグリカンサブユニットは、本明細書に列挙されるものを含む、天然のオリゴ糖源または多糖源であり得、しばしば、それらから単離されるか、またはデノボ合成されることを理解されよう。
【００９４】
本明細書に使用される場合、「治療すること」および「治療」という用語は、症状の重症度および／または頻度の減少に影響を及ぼす、症状および／またはその根本原因を解消する、かつ／または損傷の改善もしくは修復を促進する、かつ／または特定の有害な状態、障害、もしくは疾患にかかりやすい、または状態、障害、もしくは疾患を発症するもしくはそれらを発症する危険性がある無症候性対象（例えば、ヒト対象）における有害な状態、障害、もしくは疾患を予防するための、対象（例えば、有害な状態、障害、もしくは疾患を患っている症候性の対象）への薬剤または組成物の投与を指す。
【００９５】
「治療用栄養製品」は、単独でまたは第２の療法（例えば薬物療法）と組み合わせて投与された場合に治療効果を提供する食品製品であり、第２の療法と組み合わせた場合、これは相加的または相乗的な治療効果を提供する、または第２の療法による負の効果を緩和または軽減する（例えば、副作用の軽減）。治療用栄養製品は、推奨される食事（例えば、医師または栄養士、または栄養学、ヒトの栄養における他の専門家によって）、および食事の規制（例えば、対象の病状および個々のニーズに基づく）の一部を形成する。
【００９６】
「キシロオリゴ糖」または「ＸＯＳ」は、この用語が本明細書において使用される場合、β−（１，４）によって結合されたキシロース単位の糖オリゴマーを指す。キシロース残基の数は２から１０まで変化するが、主にキシロビオース、キシロトリオースおよびキシロテトラオースからなる。アラビノフラノシル、グルコピラノシルウロン酸またはその４−Ｏ−メチル誘導体（２−もしくは３−アセチルもしくはフェノール置換基）も存在し得、分岐ＸＯＳを生じる。一実施形態では、ＸＯＳは、主に直鎖β−（１，４）−結合ＸＯＳ（主にキシロビオース、キシロトリオースおよびキシロテトラオース）、および分岐アラビノース残基を有するいくつかのオリゴ糖である。一実施形態では、ＸＯＳは、リグノセルロース材料からのβ−キシラナーゼを用いて作製される。一実施形態では、キシランは、エンド−β−１，４−キシラナーゼ（ＥＣ  ３．２．１．８）またはベータ−キシロシダーゼ（ＥＣ  ３．２．１．９）によってキシロオリゴ糖へと酵素的に加水分解される。一実施形態では、ＸＯＳは、キシランの酵素分解によって、例えば、エンド−β−１，４−キシラナーゼ、エキソ−β−１，４−キシロシダーゼ、α−グルクロノシダーゼ、α−Ｌ−アラビノフラノシダーゼ、アセチルキシランエステラーゼ、フェルラ酸エステラーゼ、またはｐ−クマル酸エステラーゼによって、作製される。一実施形態では、ＸＯＳは、Ｍｅｙｅｒ  ２０１５の参考文献１５２、１５９、１６２、１７９、２１４〜２１６、または２３２のいずれかに開示されているか、またはこれに記載された方法によって作製されたＸＯＳであり、これらの文献は、それぞれの参考文献と共に、参照により本明細書に組み込まれる。一実施形態では、ＸＯＳは、Ｄｉｅｚ−Ｍｕｎｉｃｉｏ  ｅｔ  ａｌ．，２０１４に見出されるＣａｓｃｉ  ａｎｄ  Ｒｏｓｔａｌ，２００６に記載されているか、またはこれに記載された方法によって作製されたＸＯＳであり、これらの文献は、それぞれの参考文献と共に、参照により本明細書に組み込まれる。一実施形態では、ＸＯＳは、Ｔ．リーゼイ（Ｔ．ｒｅｅｓｅｉ）、Ｔ．ハルジアナム（Ｔ．ｈａｒｚｉａｎｕ）、Ｔ．ビリデ（Ｔ．ｖｉｒｉｄｅ）、Ｔ．コニンギイ（Ｔ．ｋｏｎｉｎｇｉｉ）、Ｔ．ロンギブラキアタム（Ｔ．ｌｏｎｇｉｂｒａｃｈｉａｔｕｍ）、Ｐ．クリソスポリウム（Ｐ．ｃｈｙｒｏｓｐｏｒｉｕｍ）、Ｇ．トラベウム（Ｇ．ｔｒａｂｅｕｍ）、またはＡ．オリザエ（Ａ．ｏｒｙｚａｅ）のいずれかからのキシラナーゼによって合成される。
【００９７】
「含む」という用語が本明細書および特許請求の範囲において使用される場合、それは他の要素を排除するものではない。本発明の目的において、用語「からなる（ｃｏｎｓｉｓｔｉｎｇ  ｏｆ）」は用語「を含む（ｃｏｍｐｒｉｓｉｎｇ  ｏｆ）」の好ましい実施形態であると考えられる。以下、ある群が少なくとも一定数の実施形態を含むと定義される場合、これはまた、好ましくはこれらの実施形態のみからなる群を開示すると理解されるべきである。
【００９８】
単数名詞を指す場合に不定冠詞または定冠詞が使用されている場合、例えば、「ａ」、「ａｎ」または「ｔｈｅ」は、他に特に述べられていない限り、その名詞の複数形を含む。
【００９９】
処置または診断の方法に関する特許請求の範囲および開示は、「…における使用のための化合物、組成物、産物など」または「…のための医薬品、医薬組成物、診断用組成物などの製造における化合物、組成物、産物などの使用」と同等の実施形態および請求項の開示として見なされ、そのような化合物、組成物、産物などは、ヒトまたは動物の体で実施され得る診断方法または処置方法において使用されるべきであることを示す。したがって、実施形態または特許請求の範囲が「疾患に罹患している疑いのあるヒトまたは動物に化合物を投与することによる処置方法」を指す場合、これはまた、「疾患に罹患している疑いのあるヒトまたは動物を処置するための医薬の製造における化合物の使用」または「疾患に罹患している疑いのあるヒトまたは動物の処置における使用のための化合物」の開示であると見なされる。例として、ある量のグリカンポリマー調製物を投与することによる、望ましくないレベルの代謝産物（例えば、短鎖脂肪酸（ＳＣＦＡ）、アンモニア、トリメチルアミン（ＴＭＡ）、トリメチルアミンＮ−オキシド（ＴＭＡＯ）、尿毒症性溶質、リポ多糖類（ＬＰＳ）、または胆汁酸）に関連する疾患または障害を有する対象を処置する方法への言及は、（ｉ）望ましくないレベルの代謝産物（例えば、短鎖脂肪酸（ＳＣＦＡ）、アンモニア、トリメチルアミン（ＴＭＡ）、トリメチルアミンＮ−オキシド（ＴＭＡＯ）、尿毒症性溶質、リポ多糖類（ＬＰＳ）、または胆汁酸）に関連する疾患または障害を有する対象の処置における使用のためのグリカンポリマー調製物、または（ｉｉ）望ましくないレベルの代謝産物（例えば、短鎖脂肪酸（ＳＣＦＡ）、アンモニア、トリメチルアミン（ＴＭＡ）、トリメチルアミンＮ−オキシド（ＴＭＡＯ）、尿毒症性溶質、リポ多糖類（ＬＰＳ）、または胆汁酸）に関連する疾患または障害を有する対象を処置するための医薬の製造におけるグリカン組成物の使用の開示であると見なされる。
【０１００】
投与（例えば、グリカン組成物の）による個体または個体の集団の処置方法につき言及される場合が参照される場合は常に、そのような言及は、好ましい実施形態において、例えば、個体または集団が、そのマイクロバイオーム組成物に起因して特定の処置に対して感受性であるかどうか、成功したかどうかなどの、決定に役立ち得る、そのような処置の過程における分析的、診断的工程などを企図する。例として、ある量のグリカンポリマー調製物を投与することによる、望ましくないレベルの代謝産物（例えば、短鎖脂肪酸（ＳＣＦＡ）、アンモニア、トリメチルアミン（ＴＭＡ）、トリメチルアミンＮ−オキシド（ＴＭＡＯ）、尿毒症性溶質、リポ多糖類（ＬＰＳ））、または胆汁酸）に関連する疾患または障害を有する対象を処置する方法への言及はまた、そのような方法の開示であると見なされ、ここで、好ましい実施形態において、対象は、（ｉ）処置を開始する前に、最初に代謝物の性質およびレベルについて試験される、（ｉｉ）グリカン組成物の投与を腸内の微生物グリコシダーゼ酵素組成物に適合させるために、そのマイクロバイオームの組成について試験される、（ｉｉｉ）グリカン組成物の投与が代謝産物のレベルに及ぼす影響をモニターするために処置の過程で試験される、などである。
【０１０１】
「〜によって得ることができる」、「〜によって産生可能である」などの用語は、特許請求の範囲または実施形態がそれ自体化合物、組成物、産物などを指すこと、すなわち、化合物、組成物、産物などを、化合物、組成物、産物などの産生について記載されている方法によって得ることができる、または産生することができるが、化合物、組成物、産物などは、記載されたもの以外の方法によっても得られ得る、産生され得ることを示すために使用される。用語「によって得られる」、「によって産生される」などは、化合物、組成物、産物が、列挙された特定の方法によって得られるかまたは産生されることを示す。「〜によって得ることができる」、「〜によって産生可能な」などの用語はまた、「〜によって得ることができる」、「〜によって産生可能な」などの好ましい実施形態として、「〜によって得られる」、「〜によって産生される」などの用語も開示する。
【０１０２】
好ましい実施形態としての本開示はまた、本明細書に記載の個々の態様および実施形態をどのように組み合わせることができるかも開示することをさらに理解されたい。例えば、表３は代謝産物と門および株との間の関連性を開示しており、一方表５は代謝産物と疾患との間の関連性を開示している。したがって、当業者はこの情報を併せて検討し、例えば特定の疾患を処置するために代謝産物のレベルを低下させるために、どの微生物が影響を受けなければならないかを理解するであろう。
【０１０３】
本明細書において使用される場合、「相同性」および「配列同一性」（本明細書において互換的に使用される）は、配列（例えば、アミノ酸配列または核酸配列）が他の配列にどれほど類似するかの尺度である。２つの配列間の「相同性」または「配列同一性」（これらの用語は本明細書において互換的に用いられる）の計算は以下のようにして行われる。最適な比較の目的で、配列がアラインメントされる（例えば、最適なアラインメントのために第１および第２のアミノ酸または核酸配列の一方または両方にギャップを導入することができ、比較目的で非相同配列を無視することができる）。最適なアラインメントは、ＧＣＧソフトウェアパッケージ中のＧＡＰプログラムを使用して、ギャップペナルティ１２、ギャップ拡張ペナルティ４、およびフレームシフトギャップペナルティ５を有するＢｌｏｓｓｕｍ６２スコアリングマトリックスを用いて、最良のスコアとして決定される。次いで、対応するアミノ酸位置またはヌクレオチド位置のアミノ酸残基またはヌクレオチドが比較される。第１の配列中の位置が、第２の配列中の対応する位置と同じアミノ酸残基またはヌクレオチドで占められている場合、その分子はその位置において同一である（本明細書において使用される場合、アミノ酸または核酸の「同一性」は、アミノ酸または核酸の「相同性」と同等である）。２つの配列間の同一性パーセントは、配列が共有する同一の位置の数の関数である。
【０１０４】
グリカンポリマーの作製方法
グリカンポリマー調製物は、当該技術分野で公知の任意の方法を用いて産生され得る。
【０１０５】
グリカンポリマー組成物は、本明細書中に記載されるグリカン、食物繊維、例えば、ＦＯＳ（フルクトオリゴ糖）、その他の糖類（例えばモノマー、ダイマー、例えば、ラクツロース（ｌａｃｔｕｌｏｓｅ）など）、および糖アルコール、ならびに、任意選択により、他の成分、例えば、ポリフェノール、脂肪酸、ペプチド、微量栄養素など、例えば、国際公開第２０１６／１７２６５８号パンフレット、“ＭＩＣＲＯＢＩＯＭＥ  ＲＥＧＵＬＡＴＯＲＳ  ＡＮＤ  ＲＥＬＡＴＥＤ  ＵＳＥＳ  ＴＨＥＲＥＯＦ”に記載されるもの、および細菌などの微生物を含み得る。
【０１０６】
国際公開第２０１６／１２２８８９号パンフレット、“ＧＬＹＣＡＮ  ＴＨＥＲＡＰＥＵＴＩＣＳ  ＡＮＤ  ＲＥＬＡＴＥＤ  ＭＥＴＨＯＤＳ  ＴＨＥＲＥＯＦ”および国際公開第２０１６／１７２６５７号パンフレット“ＧＬＹＣＡＮ  ＴＨＥＲＡＰＥＵＴＩＣＳ  ＡＮＤ  ＭＥＴＨＯＤＳ  ＯＦ  ＴＲＥＡＴＭＥＮＴ”（これらは参照によりその全体が本明細書に組み込まれる）に記載されるグリカン調製物は、本明細書に記載の方法および組成物に好適である。
【０１０７】
グリカンポリマーを含む調製物は、非酵素触媒、例えば、国際公開第２０１２／１１８７６７号パンフレット、“ＰＯＬＹＭＥＲＩＣ  ＡＣＩＤ  ＣＡＴＡＬＹＳＴＳ  ＡＮＤ  ＵＳＥＳ  ＴＨＥＲＥＯＦ”に記載のポリマー触媒、または他の好適な方法によって生成することができる。他の酸触媒（例えば、固体触媒）を使用してもよい。本明細書に記載されるポリマー触媒および固体担持触媒を調製する方法は、国際公開第２０１４／０３１９５６号パンフレット、“ＰＯＬＹＭＥＲＩＣ  ＡＮＤ  ＳＯＬＩＤ−ＳＵＰＰＯＲＴＥＤ  ＣＡＴＡＬＹＳＴＳ、ＡＮＤ  ＭＥＴＨＯＤＳ  ＯＦ  ＤＩＧＥＳＴＩＮＧ  ＣＥＬＬＵＬＯＳＩＣ  ＭＡＴＥＲＩＡＬＳ  ＵＳＩＮＧ  ＳＵＣＨ  ＣＡＴＡＬＹＳＴＳ”中に見出すことができる。例えば、国際公開第２０１６／００７７７８号パンフレット、“ＯＬＩＧＯＳＡＣＣＨＡＲＩＤＥ  ＣＯＭＰＯＳＩＴＩＯＮＳ  ＡＮＤ  ＭＥＴＨＯＤＳ  ＦＯＲ  ＰＲＯＤＵＣＩＮＧ  ＴＨＥＲＥＯＦ”に記載されているような触媒を使用することによって生成されるグリカンは、本明細書に記載の方法および組成物に好適である。すべての特許出願は、その全体が参照により本明細書に組み込まれる。
【０１０８】
いくつかの実施形態では、グリカンポリマーは、固相オリゴ糖合成により、例えば、グリカン合成を達成する種々の保護基を用いて、作製される。例示的な方法は、“Ｓｏｌｉｄ−Ｐｈａｓｅ  Ｏｌｉｇｏｓａｃｃｈａｒｉｄｅ  Ｓｙｎｔｈｅｓｉｓ  ａｎｄ  Ｃｏｍｂｉｎａｔｏｒｉａｌ  Ｃａｒｂｏｈｙｄｒａｔｅ  Ｌｉｂｒａｒｉｅｓ”，Ｐｅｔｅｒ  Ｈ．Ｓｅｅｂｅｒｇｅｒ  ａｎｄ  Ｗｉｌｍ−Ｃｈｒｉｓｔｉａｎ  Ｈａａｓｅ，Ａｍｅｒｉｃａｎ  Ｃｈｅｍｉｃａｌ  Ｓｏｃｉｅｔｙ，２０００；および“Ｏｐｐｏｒｔｕｎｉｔｉｅｓ  ａｎｄ  ｃｈａｌｌｅｎｇｅｓ  ｉｎ  ｓｙｎｔｈｅｔｉｃ  ｏｌｉｇｏｓａｃｃｈａｒｉｄｅ  ａｎｄ  ｇｌｙｃｏｃｏｎｊｕｇａｔｅ  ｒｅｓｅａｒｃｈ”，Ｔｈｏｍａｓ  Ｊ．Ｂｏｌｔｊｅ  ｅｔ  ａｌ．，Ｎａｔ  Ｃｈｅｍ．２００９  Ｎｏｖｅｍｂｅｒ  １；１（８）：６１１−６２２に記載されている。
【０１０９】
いくつかの実施形態では、グリカンポリマーは、反応物に添加された個々のグリカンサブユニットからオリゴマーを生成する重合反応によってグリカンを合成するために、本明細書に記載されるような酵素触媒（例えば、単離されたまたは細菌において発現された、グリコシダーゼまたはグリコシルトランスフェラーゼ）を用いて合成され得る。例示的な方法は、“Ｓｙｎｔｈｅｓｉｓ  ａｎｄ  Ｐｕｒｉｆｉｃａｔｉｏｎ  ｏｆ  Ｇａｌａｃｔｏ−Ｏｌｉｇｏｓａｃｃｈａｒｉｄｅｓ：Ｓｔａｔｅ  ｏｆ  ｔｈｅ  Ａｒｔ”，Ｃａｒｌｏｓ  Ｖｅｒａ  ｅｔ  ａｌ．，Ｗｏｒｌｄ  Ｊ．Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌ  Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．２０１６；３２：１９７；“Ｓｙｎｔｈｅｓｉｓ  ｏｆ  Ｎｏｖｅｌ  Ｂｉｏａｃｔｉｖｅ  Ｌａｃｔｏｓｅ−Ｄｅｒｉｖｅｄ  Ｏｌｉｇｏｓａｃｃｈａｒｉｄｅｓ  ｂｙ  Ｍｉｃｒｏｂｉａｌ  Ｇｌｙｃｏｓｉｄｅ  Ｈｙｄｒｏｌａｓｅｓ”，Ｍａｒｉｎａ  Ｄｉｅｚ−Ｍｕｎｉｃｉｏ  ｅｔ  ａｌ．，Ｍｉｃｒｏｂｉａｌ  Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．２０１４；７（４），３１５−３３１；および“Ｍｅｔｈｏｄｓ  ｏｆ  Ｉｍｐｒｏｖｉｎｇ  Ｅｎｚｙｍａｔｉｃ  Ｔｒａｎｓ−Ｇｌｙｃｏｓｙｌａｔｉｏｎ  ｆｏｒ  Ｓｙｎｔｈｅｓｉｓ  ｏｆ  Ｈｕｍａｎ  Ｍｉｌｋ  Ｏｌｉｇｏｓａｃｃｈａｒｉｄｅ  Ｂｉｏｍｉｍｅｔｉｃｓ”，Ｂｉｒｇｉｔｔｅ  Ｚｅｕｎｅｒ  ｅｔ  ａｌ．，Ｊ．Ａｇｒｉｃ．Ｆｏｏｄ  Ｃｈｅｍ．２０１４，６２，９６１５−９６３１、国際公開第２００５／００３３２９号パンフレット“ＮＯＶＥＬ  ＧＡＬＡＣＴＯＯＬＩＧＯＳＡＣＣＨＡＲＩＤＥ  ＣＯＭＰＯＳＩＴＩＯＮ  ＡＮＤ  ＴＨＥ  ＰＲＥＰＡＲＡＴＩＯＮ  ＴＨＥＲＥＯＦ”に記載され、これらは全て参照により本明細書に組み込まれる。
【０１１０】
いくつかの実施形態では、グリカン調製物は、デンプンなどのグリカンポリマーおよび（本明細書に記載されるような）食物繊維などの他の繊維を使用して調製され得、１つ以上のグリカン（または繊維）特性、例えば、重合度（例えば解重合）、分岐度（例えば脱分岐）、またはグリコシド結合分布を（例えば、新しい種類のグリコシド結合の付加または既存の結合の除去によって）変化させるために、それらを触媒（例えば、酸触媒、固体またはポリマー触媒、酵素触媒）に供する。コーンシロップのための例示的な方法は、米国特許出願公開第２０１６／０００７６４２号明細書の実施例１０１に記載され、これは参照により組み込まれる。消化抵抗性デンプンの調製に使用されるものなどの、他の方法（例えば、Ｍ．Ｇ．Ｓａｊｉｌａｔａ  ｅｔ  ａｌ．，“Ｒｅｓｉｓｔａｎｔ  Ｓｔａｒｃｈ−Ａ  Ｒｅｖｉｅｗ，”  Ｃｏｍｐｒｅｈｅｎｓｉｖｅ  Ｒｅｖｉｅｗｓ  ｉｎ  Ｆｏｏｄ  Ｓｃｉｅｎｃｅ  ａｎｄ  Ｆｏｏｄ  Ｓａｆｅｔｙ−Ｖｏｌ．５，２００６、および米国特許出願公開第２００６／０２５７９７７号明細書“Ｓｌｏｗｌｙ  ｄｉｇｅｓｔｉｂｌｅ  ｓｔａｒｃｈ”に記載される）、例えば、熱処理、酵素処理、化学処理、またはそれらの組み合わせなどは、本明細書に記載のグリカン調製物を産生するために使用され得る。
【０１１１】
グリカンサブユニット
本発明は、腸内微生物（例えば、ヒト腸内細菌）の基質であるグリカンポリマーの作製方法または調製物の製造方法を特徴とする。前記方法のための出発物質は、糖モノマー（例えば、単糖）、糖ダイマー（例えば、二糖）、糖トリマー（例えば、三糖）、またはそれらの組み合わせを含むグリカンサブユニットである。
【０１１２】
出発物質は、フラノース糖またはピラノース糖を含み得る。いくつかの実施形態では、出発物質は、テトロース、ペントース、ヘキソース、またはヘプトースを含む。いくつかの実施形態では、出発物質は、グルコース、ガラクトース、アラビノース、マンノース、フルクトース、キシロース、フコース、およびラムノースを含む。グリカンサブユニット出発物質は、それらのＬ型またはＤ型、アルファまたはベータ配置、および／または該当する場合はデオキシ型、およびそれらの任意の組み合わせのいずれでもよい。
【０１１３】
本明細書に記載の方法において使用されるグリカンサブユニットは、Ｃ５単糖またはＣ６単糖などの単糖を含み得る。いくつかの実施形態では、単糖はＣ５単糖である。いくつかの実施形態では、単糖はＣ６単糖である。グリカンサブユニットは、例えばＣ５単糖またはＣ６単糖を含む二糖などの二糖を含み得る。いくつかの実施形態では、二糖はＣ５単糖を含む。いくつかの実施形態では、二糖は２つのＣ５単糖を含む。いくつかの実施形態では、二糖はＣ６単糖を含む。いくつかの実施形態では、二糖は２つのＣ６単糖を含む。いくつかの実施形態では、二糖は、Ｃ５単糖のうちの１つおよびＣ６単糖のうちの１つを含む。
【０１１４】
本明細書において使用されるグリカンサブユニット出発物質は、グリコールアルデヒド、グリセルアルデヒド、ジヒドロキシアセトン、エリトロース、トレオース、エリトルロース（ｅｒｙｔｈｕｌｏｓｅ）、アラビノース、リキソース、リボース、キシロース、リブロース、キシルロース、アロース、アルトロース、ガラクトース、グルコース、グロース、イドース、マンノース、タロース、フルクトース、プシコース、ソルボース、タガトース、フコース、フクロース、ラムノース、マンノヘプツロース、セドヘプツロース、ノイラミン酸、Ｎ−アセチルノイラミン酸、Ｎ−アセチルガラクトサミン、Ｎ−アセチルグルコサミン、フルクトサミン、ガラクトサミン、グルコサミン、ソルビトール、グリセロール、エリトリトール、トレイトール、アラビトール、キシリトール、マンニトール、ソルビトール、ガラクチトール、フシトール、および乳酸から選択される単糖類であってもよい。
【０１１５】
本明細書において使用されるグリカンサブユニット出発物質は、アカルビオシン、Ｎ−アセチルラクトサミン、アロラクトース、セロビオース、キトビオース、グラクトース−アルファ−１，３−ガラクトース、ゲンチオビオース、イソマルト、イソマルトース、イソマルツロース、コージビオース、ラクチトール、ラクトビオン酸、ラクトース、ラクツロース、ラミナリビオース、マルチトール、マルトース、マンノビオース、メリビオース、メリビウロース、ネオヘスペリドース、ニゲロース、ロビノース、ルチノース、サンブビオース、ソホロース、スクラロース、スクロース、スクロースアセテートイソブチレート、オクタアセチルスクロース、トレハロース、ツラノース、ビシアノース、およびキシロビオースから選択される二糖類またはより大きいサブユニットであってもよい。
【０１１６】
いくつかの実施形態では、グリカンサブユニットは未活性化グリカンサブユニットである。いくつかの実施形態では、グリカンサブユニットは、例えばヌクレオシド、ヌクレオチド（例えば、ＵＴＰ、ＵＤＰ、ＵＭＰ、ＧＴＰ、ＧＤＰ、ＧＭＰ、ＡＴＰ、ＡＤＰ、ＡＭＰ、ＣＴＰ、ＣＤＰ、ＣＭＰ）、またはリン酸基で活性化される、活性化グリカンサブユニットである。いくつかの実施形態では、グリカンサブユニットはＵＤＰ糖またはＵＭＰ糖である。
【０１１７】
いくつかの実施形態では、グリカンサブユニットは、アセチル基、酢酸エステル、硫酸半エステル、リン酸エステル、またはピルビル環状アセタール基と置換されるか、または誘導体化されるか、あるいは、そうでなければ、例えば、１つ以上のヒドロキシル基またはアミン基で誘導体化されている。
【０１１８】
いくつかの実施形態では、グリカンサブユニットは、アミノ糖、デオキシ糖、イミノ糖、糖酸、または糖アルコールを含む。例示的なアミノ糖は、アカルボース、Ｎ−アセチルエマンノサミン、Ｎ−アセチルムラミン酸、Ｎ−アセチルノイラミン酸、Ｎ−アセチルエタロサミヌロニン酸（ａｃｅｔｙｌｅｔａｌｏｓａｍｉｎｕｒｏｎｉｃ  ａｃｉｄ）、アラビノピラノシル−Ｎ−メチル−Ｎ−ニトロソ尿素、Ｄ−フルクトース−Ｌ−ヒスチジン、Ｎ−グリコリルノイラミン酸、ケトサミン、キダマイシン、マンノサミン、１Ｂ−メチルセレノ−Ｎ−アセチル−Ｄ−ガラクトサミン、ムラミン酸、ムラミルジペプチド、ホスホリボシールアミン、ＰＵＧＮＡｃ、シアリル−Ｌｅｗｉｓ  Ａ、シアリル−Ｌｅｗｉｓ  Ｘ、バリダマイシン、ボグリボース、Ｎ−アセチルガラクトサミン、Ｎ−アセチルグルコミサン、アスパルチルグルコサミン、バシリチオール、ダウノサミン、デソサミン、フルクトサミン、ガラクトサミン、グルコサミン、メグルミン、およびペロサミン等を含む。例示的なデオキシ糖は、１−５−アヒドログルシトール、クラジノース、コリトース、２−デオキシ−Ｄ−グルコース、３−デオキシグルカソン、デオキシリボース、ジデオキシヌクレオチド、ジギタロース、フルデオオキシグルコース、サルメントース、およびスルホキノボースを含む。例示的なイミノ糖は、カスタノスペルミン、１−デオキシノジリマイシン、イミノ糖、ミグリトール、ミグルスタット、およびスワインソニンを含む。例示的な糖酸は、Ｎ−アセチルノイラミン酸、Ｎ−アセチルタロサムヌロニン酸（ａｃｅｔｙｌｔａｌｏｓａｍｎｕｒｏｎｉｃ  ａｃｉｄ）、アルダル酸、アルドン酸、３−デオキシ−Ｄ−マンノ−オクト−２−ウロソニック酸、グルクロン酸、グルコサミンウロニック酸、グリセリン酸、Ｎ−グリコリルノイラミン酸、イズロン酸、イソサッカリン酸、パンガミン酸、シアル酸、トレオン酸、ウロソニック酸、ウロニック酸、キシロン酸、グルコン酸、アスコルビン酸、ケトデオキシオクツルソニック酸、ガラクツロン酸、ガラクトサミヌロン酸、マンヌロン酸、マンノサミヌロン酸、酒石酸、粘液酸、糖酸、乳酸、シュウ酸、コハク酸、ヘキサン酸、フマル酸、マレイン酸、酪酸、クエン酸、グルコサミン酸、リンゴ酸、スクシンアミド酸、セバシン酸、およびカプリン酸等を含む。例示的な糖アルコールは、メタノール、エチレングリコール、グリセロール、エリトリトール、トレイトール、アラビトール、リビトール、キシリトール、マンニトール、ソルビトール、ガラクチトール、イジトール、ボレミトール、フシトール、イノシトール、マルトトリイトール、マルトテトライトール、およびポリグリシトールを含む。
【０１１９】
いくつかの実施形態では、グリカンサブユニット出発物質は、例えば、塩酸塩（ｈｙｄｒｏｃｈｌｏｒａｔｅ）、ヨウ化水素酸塩（ｈｙｄｒｏｉｏｄａｔｅ）、臭化水素酸塩、リン酸塩、硫酸塩、メタンスルファート、酢酸塩、ギ酸塩、酒石酸塩、リンゴ酸塩、クエン酸塩、コハク酸塩、乳酸塩、グルコン酸塩、ピルビン酸塩、フマル酸塩、プロピオン酸塩、アスパラギン酸塩、グルタミン酸塩、安息香酸塩、アスコルビン酸塩等の塩形態（例えば、薬学的に許容される塩形態）である。
【０１２０】
本明細書に記載の方法において使用されるグリカンサブユニットは、任意に市販の公知の供給源から得てもよく、または任意の当該技術分野において公知の方法に従って産生してもよい。いくつかの実施形態では、加水分解は、本明細書に記載のグリカンを産生するのに適している構成成分の単糖類またはオリゴ糖を産生するために使用され得る。グリカン単位、例えば、単糖類等は、多くの異なる形態、例えば、配座異性体、環状形態、非環状形態、立体異性体、互変異性体、アノマー、および異性体で存在し得る。
【０１２１】
非酵素高分子触媒を用いたグリカンポリマーの作製
反応条件
いくつかの実施形態では、グリカン単位および触媒（例えば、ポリマー触媒または固体支持触媒）は、少なくとも１時間、少なくとも２時間、少なくとも３時間、少なくとも４時間、少なくとも６時間、少なくとも８時間、少なくとも１６時間、少なくとも２４時間、少なくとも３６時間、もしくは少なくとも４８時間、または１〜２４時間、２〜１２時間、３〜６時間、１〜９６時間、１２〜７２時間、もしくは１２〜４８時間反応することができる。
【０１２２】
いくつかの実施形態では、本明細書に記載の方法に従って産生される１種以上のオリゴ糖の重合度は、反応時間によって調節することができる。例えば、いくつかの実施形態では、１種以上のオリゴ糖の重合度は、反応時間を増加させることによって増加されるが、他の実施形態では、１種以上のオリゴ糖の重合度は、反応時間を減少させることによって減少される。
【０１２３】
反応温度
いくつかの実施形態では、反応温度は、約２５℃〜約１５０℃の範囲で維持される。特定の実施形態では、この温度は、約３０℃〜約１２５℃、約６０℃〜約１２０℃、約８０℃〜約１１５℃、約９０℃〜約１１０℃、約９５℃〜約１０５℃、または約１００℃〜１１０℃である。
【０１２４】
グリカン単位の量
使用された溶媒量に対して本明細書に記載の方法において使用されるグリカン単位の量は、反応率および収率に影響を及ぼし得る。使用されたグリカン単位の量は、乾燥固形含量を特徴とし得る。特定の実施形態では、乾燥固形含量は、乾燥重量基準の割合としてスラリーの総固形分を指す。いくつかの実施形態では、グリカン単位の乾燥固形含量は、約５重量％〜約９５重量％、約１０重量％〜約８０重量％、約１５重量％〜約７５重量％、または約１５重量％〜約５０重量％である。
【０１２５】
触媒の量
本明細書に記載の方法において使用される触媒の量は、例えば、グリカン単位のタイプの選択、グリカン単位の濃度、および反応条件（例えば、温度、時間、およびｐＨ）を含む、いくつかの因子に応じて異なり得る。いくつかの実施形態では、触媒のグリカン単位に対する重量比は、約０．０１ｇ／ｇ〜約５０ｇ／ｇ、約０．０１ｇ／ｇ〜約５ｇ／ｇ、約０．０５ｇ／ｇ〜約１．０ｇ／ｇ、約０．０５ｇ／ｇ〜約０．５ｇ／ｇ、約０．０５ｇ／ｇ〜約０．２ｇ／ｇ、または約０．１ｇ／ｇ〜約０．２ｇ／ｇである。
【０１２６】
溶媒
特定の実施形態では、触媒を使用する方法は、水性環境において行われる。ある適当な水性溶媒は、水であり、様々な供給源から得られ得る。一般的に、低濃度のイオン種が触媒の有効性を軽減し得るため、このようなイオン種を有する水源（例えば、ナトリウム、リン、アンモニウム、またはマグネシウムの塩）が、好ましい。水性溶媒が水であるいくつかの実施形態では、水は、少なくとも０．１メガオーム−センチメートル、少なくとも１メガオーム−センチメートル、少なくとも２メガオーム−センチメートル、少なくとも５メガオーム−センチメートル、または少なくとも１０メガオーム−センチメートルの抵抗率を有する。
【０１２７】
水分含量
さらに、本方法の脱水反応が進行するにつれて、水が、１つ以上のグリカン単位の各カップリングで産生される。特定の実施形態では、本明細書に記載の方法は、反応混合物中に存在する水の量および／または一期間にわたって水のモノマーまたは触媒に対する比率をモニタリングすることをさらに含み得る。いくつかの実施形態では、本方法は、（例えば、少なくとも約１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、９０％、９５％、９７％、９９％、または１００％のうちのいずれかを除去することによって、例えば、真空濾過によって）反応混合物において産生される水の少なくとも一部を除去することをさらに含む。しかしながら、モノマーに対する水の量は、使用される反応条件および特定の触媒に基づいて調節され得ることを理解されたい。
【０１２８】
当該技術分野において公知の任意の方法は、例えば、真空濾過、真空蒸留、加熱、および／または蒸発によって、反応混合物において水を除去するために使用され得る。いくつかの実施形態では、本方法は、反応混合物中に水を含むことを含む。
【０１２９】
いくつかの態様では、酸性およびイオン部分を有するグリカン単位および触媒を混合して、反応混合物を形成し、水が反応混合物において産生されることと、反応混合物において産生される水の少なくとも一部を除去することと、によって、オリゴ糖組成物を産生する方法が、本明細書に提供される。ある変形例において、水の少なくとも一部は、９９重量％未満、９０重量％未満、８０重量％未満、７０重量％未満、６０重量％未満、５０重量％未満、４０重量％未満、３０重量％未満、２０重量％未満、１０重量％未満、５重量％未満、または１重量％未満の反応混合物中の水分含量を維持するために除去される。
【０１３０】
いくつかの実施形態では、本明細書に記載の方法に従って産生される１種以上のオリゴ糖の重合度は、反応混合物中に存在する水の濃度を調節または制御することによって調整することができる。例えば、いくつかの実施形態では、１種以上のオリゴ糖の重合度は、水濃度を減少させることによって増加されるが、他の実施形態では、１種以上のオリゴ糖の重合度は、水濃度を増加させることによって減少される。いくつかの実施形態では、反応物の水分含量は、産生される１種以上のオリゴ糖の重合度を調整するために反応中に調整される。
【０１３１】
一例において、オーバーヘッド撹拌器およびジャケット短経路凝縮器を装備した丸底フラスコに、１つ以上のモノマー、ダイマー、トリマー、または他のオリゴ糖を、乾燥重量で１〜５０％（１〜１０％、１〜２０％、１〜３０％、１〜４０％、１〜６０％、１〜７０％）の本明細書に記載の触媒のうちの１つ以上と共に添加し得る。水または別の相溶性溶媒（０．１〜５当量、１〜５当量、１〜４当量、０．１〜４当量）は、乾燥混合物に添加され得、スラリーは、選択された丸底フラスコの輪郭にできるだけ精確に合う大きさのパドルを用いて、低速度（例えば、１０〜１００ｒｐｍ、５０〜２００ｒｐｍ、１００〜２００ｒｐｍ）で混合され得る。混合物は、１０〜１０００ｍｂａｒの真空圧下で、７０〜１８０℃（７０〜１６０℃、７５〜１６５℃、８０〜１６０℃）に加熱される。反応物は、３０分間〜６時間撹拌し、絶えず、反応物から水を取り除いてもよい。反応進行は、ＨＰＬＣによってモニタリングされ得る。処理から得られた固体塊は、約５０Ｂｒｉｘ（１００ｇの溶液当たりの糖のグラム量）の溶液を作製するのに十分な水の体積中に溶解され得る。一旦溶解が完了すると、固体触媒は、濾過によって除去され得、オリゴマー溶液は、例えば、回転蒸発によって、約５０〜７５Ｂｒｉｘまで濃縮され得る。任意選択により、有機溶媒が使用され得、水非混和性溶媒は、二相性抽出によって除去され得、水混和性溶媒は、例えば、濃縮工程と同時に回転蒸発によって除去され得る。
【０１３２】
グリコシダーゼ酵素分子を用いたグリカンポリマーの作製
反応条件
本明細書に記載の方法を用いて産生されるグリカンポリマーは、グリコシダーゼ酵素分子（例えば、ヒドロラーゼ、トランスフェラーゼ、またはリアーゼ）によって触媒されるグリコシド結合の縮合（例えば、逆加水分解）および／またはトランスグリコシル化によって産生され得る。いくつかの実施形態では、本明細書に記載の方法に従って産生されるグリカンポリマーの特性は、反応条件、例えば、反応時間、反応温度、グリカンサブユニットの濃度もしくは量、グリコシダーゼ酵素分子の濃度もしくは量、溶媒、または例えば本明細書に記載のような、さらなる処理工程、によって調節することができる。いくつかの実施形態では、本明細書に記載の方法の反応条件は、生理学的条件、例えば、５〜７．５のｐＨおよび３５℃〜６０℃の温度を反映する。いくつかの実施形態では、本明細書に記載の方法の反応条件は生理学的条件とは異なる。
【０１３３】
反応時間
いくつかの実施形態では、グリコシダーゼ酵素分子と出発物質（例えば、グリカンサブユニット）とを、少なくとも５分間、少なくとも１０分間、少なくとも１５分間、少なくとも３０分間、少なくとも１時間、少なくとも２時間、少なくとも３時間、少なくとも４時間、少なくとも６時間、少なくとも８時間、少なくとも１６時間、少なくとも２４時間、少なくとも３６時間、または少なくとも４８時間にわたり反応させる。いくつかの実施形態では、グリコシダーゼ酵素分子と出発物質（例えば、グリカンサブユニット）とを、１〜２４時間、２〜１２時間、３〜６時間、１〜９６時間、１２〜７２時間、または１２〜４８時間にわたり反応させる。いくつかの実施形態では、本明細書に記載の方法に従って産生されるグリカンポリマーの重合度（ＤＰ）は、反応時間によって調節することができる。例えば、いくつかの実施形態では、グリカンポリマーの重合度は、反応時間を増加させることによって増加されるが、他の実施形態では、グリカンポリマーの重合度は、反応時間を減少させることによって減少される。
【０１３４】
反応温度
いくつかの実施形態では、反応温度は、約４℃〜約１５０℃の範囲で維持される。特定の実施形態では、温度は、約４℃〜約３０℃、約４℃〜約１２５℃、約３０℃〜約１２５℃、約６０℃〜約１２０℃、約８０℃〜約１１５℃、約９０℃〜約１１０℃、約９５℃〜約１０５℃、または約１００℃〜１１０℃である。いくつかの実施形態では、反応温度は室温（例えば、約２５℃）である。いくつかの実施形態では、反応温度は生理学的温度（例えば、約３０℃）である。いくつかの実施形態では、反応温度は約６０℃である。
【０１３５】
いくつかの実施形態では、反応は、例えば酵素の変性を通して、温度を上昇させることによって、ある期間の後に遅くなるかまたは実質的に停止する。いくつかの実施形態では、反応は、温度を約４５℃超、約５０℃超、約６０℃超、約７０℃超、約８０℃超、約９０℃超、約１００℃超、約１１０℃超、またはそれ以上に上昇させることによって、減速または実質的に停止される。
【０１３６】
グリカンサブユニットの濃度または量
使用された溶媒量に対して本明細書に記載の方法において使用されるグリカンサブユニットの濃度または量は、反応率および収率に影響を及ぼし得る。いくつかの実施形態では、グリカンサブユニットの濃度または量は、約１０ｍｇ／ｍＬ、約２５ｍｇ／ｍＬ、約５０ｍｇ／ｍＬ、約７５ｍｇ／ｍＬ、約１００ｍｇ／ｍＬ、約２００ｍｇ／ｍＬ、３００ｍｇ／ｍＬ、約４００ｍｇ／ｍＬ、約５００ｍｇ／ｍＬ、約７５０ｍｇ／ｍＬ、約１ｇ／ｍＬ、またはそれを超える。
【０１３７】
使用されるグリカンサブユニットの量は、乾燥固形含量によって特徴付けられ得る。特定の実施形態では、乾燥固形含量は、乾燥重量基準の割合としてスラリーの総固形分を指す。いくつかの実施形態では、グリカンサブユニットの乾燥固形含量は、約５重量％〜約９５重量％、約１０重量％〜約８０重量％、約１５重量％〜約７５重量％、または約１５重量％〜約５０重量％である。
【０１３８】
グリコシダーゼ酵素分子の濃度または量
本明細書に記載の方法において使用されるグリカン酵素分子の濃度または量は、例えば、グリカンサブユニットのタイプの選択、グリカンサブユニットの濃度、および反応条件（例えば、温度、時間、およびｐＨ）を含む、いくつかの因子に応じて異なり得る。いくつかの実施形態では、グリコシダーゼ酵素分子の濃度または量は、約０．１Ｕ／ｍＬ、約０．５Ｕ／ｍＬ、約１Ｕ／ｍＬ、約５Ｕ／ｍＬ、約１０Ｕ／ｍＬ、約２５Ｕ／ｍＬ、約５０Ｕ／ｍＬ、またはそれを超える。いくつかの実施形態では、グリコシダーゼ酵素分子の濃度または量は、０．１〜５Ｕ／ｍＬ、１〜２５Ｕ／ｍＬ、または１〜５０Ｕ／ｍＬである。いくつかの実施形態では、グリコシダーゼ酵素分子のグリカンサブユニットに対する重量比は、約０．０１ｇ／ｇ〜約５０ｇ／ｇ、約０．０１ｇ／ｇ〜約５ｇ／ｇ、約０．０５ｇ／ｇ〜約１．０ｇ／ｇ、約０．０５ｇ／ｇ〜約０．５ｇ／ｇ、約０．０５ｇ／ｇ〜約０．２ｇ／ｇ、または約０．１ｇ／ｇ〜約０．２ｇ／ｇである。
【０１３９】
溶媒
いくつかの実施形態では、反応の溶媒は生体適合性溶媒である。特定の実施形態では、反応の溶媒は水性溶媒、例えば、水または水混合物である。いくつかの実施形態では、反応物の溶媒は水、または水とアセトン、エタノール、イソプロパノール、ポリエチレングリコール、ｔ−ブタノールなどの混和性溶媒または他の溶媒との混合物である。いくつかの実施形態では、反応の溶媒は有機溶媒（例えば、純粋な有機溶媒）である。
【０１４０】
例えばグリコシダーゼ酵素分子のグリカンサブユニットへの接近性を高めることによって、反応速度または全体的な反応収率を高めるために、溶媒を反応混合物に添加してもよい。例示的な溶媒としては、ＤＭＳＯおよびトルエンなどの有機溶媒が挙げられる。
【０１４１】
さらなる反応成分
反応混合物は、塩、界面活性剤、金属、キレート剤、酸、塩基、補因子、補酵素、ビタミン、アミノ酸、補欠分子族、ヌクレオシド、ヌクレオチド、またはそれらの任意の組み合わせなどのさらなる成分を含み得る。いくつかの実施形態では、反応混合物は、ＮＡＤ＋、ＮＡＤＨ、ＮＡＤＰ＋、ＮＡＤＰＨ、ＦＡＤ、ＦＡＤＨ、コエンザイムＡ、ビオチン、ピリドキサールホスフェート、またはメチルコバラミンなどの補因子または補酵素を含む。いくつかの実施形態では、追加の成分を含めることは、反応収率、酵素代謝回転速度、酵素安定性、グリカンサブユニット安定性、グリカンポリマー安定性、またはそれらの任意の組み合わせを改善する。
【０１４２】
グリコシダーゼ酵素
グリコシダーゼ酵素、例えばヒト腸内微生物中に存在するグリコシダーゼ酵素の基質であるグリカンポリマーの調製物を作製する方法が本明細書に記載される。それらの天然環境、例えば対象の腸内の腸内細菌によって発現されるものにおいて、グリコシダーゼは基質としてグリカンポリマーを使用し、例えばそれらは特定のグリカンポリマーを認識し、グリカンポリマー中のグリコシド結合を加水分解する。この加水分解は、グリカンポリマーからのモノマーまたはダイマーの遊離、グリカンポリマーの短縮、および／または脱分岐（例えば、グリカンポリマーのグリコシド分岐点の除去）をもたらし得る。グリコシダーゼ作用は、それがエネルギーに変換することができるグリカン分解産物を微生物に提供する。このプロセスはグリカン発酵と称される。多くのグリコシダーゼが特異的であり、例えば、それらは、グリカン鎖の末端（例えば、エキソグリコシダーゼ）または内部（例えば、エンドグリコシダーゼ）に認識モチーフを有し、それらは特定の糖または糖の組み合わせ（例えば、ｇｌｕ−ｇｌｕまたはｇｌｕ−ｇａｌ）を認識し得、立体化学および／または位置化学において、さらに選択的であり得る（例えば、アルファ対ベータグリコシド結合、および／または１→２対１→３対１→６結合の認識）。いくつかのグリコシダーゼ酵素はより無差別であり、より多様なグリカンポリマー基質を有する。
【０１４３】
人工的な環境において、および適当な条件下で、グリコシダーゼ酵素は、例えば縮合反応および／またはトランスグリコシル化反応によって、グリカンポリマーを産生することができる。産生されるグリカンポリマーは、インプットよりも高い重合度を有し得、分岐、ならびに立体および／または位置化学的多様性（アルファ−ベータグリコシド結合（ｂｏｎｄ）および結合（ｌｉｎｋａｇｅ）に関して）を示し得る。例示的なグリコシダーゼ酵素としては、ヒドロラーゼ、トランスフェラーゼ、またはリアーゼが挙げられる。グリコシダーゼ酵素は、その配列、サイズ、または機能などの様々な方法で特徴付けられ得る。いくつかの実施形態では、グリコシダーゼ酵素は特定の分類群からの細菌と関連している。いくつかの実施形態では、グリコシダーゼ酵素は、ゲノム情報、構造情報、生化学情報の分析に基づいた、ＣＡＺｙファミリー名称（すなわち、炭水化物活性酵素データベース（Ｃａｒｂｏｈｙｄｒａｔｅ  Ａｃｔｉｖｅ  ｅｎＺＹｍｅ  ｄａｔａｂａｓｅ）（ｈｔｔｐ：／／ｗｗｗ．ｃａｚｙ．ｏｒｇ／）によって提供されるファミリー名称）、例えばグリコシルヒドロラーゼ（ＧＨ）ファミリーまたはグリコシルトランスフェラーゼ（ＧＴ）ファミリー、を有する。いくつかの実施形態では、グリコシダーゼ酵素（例えば、天然のグリコシダーゼ酵素、例えば、腸内微生物により発現されるもの）は、グリコシダーゼ酵素分子（例えば、本明細書に記載のグリカンポリマーを作製する方法において使用されるグリコシダーゼ）である。いくつかの実施形態では、グリコシダーゼ酵素分子はグリコシダーゼ酵素と８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、９８％、９９％または１００％同一である（例えば、ＤＮＡ配列、ＲＮＡ配列またはアミノ酸配列による）。他の実施形態では、グリコシダーゼ酵素分子は、グリコシダーゼ酵素と比較して、欠失、さらなる配列、点突然変異、保存的または非保存的アミノ酸変化、コドン最適化、精製タグ、折り畳み／安定性促進突然変異などを含む。いくつかの実施形態では、グリコシダーゼ酵素は、ＧＨ  ＣＡＺＹファミリーのメンバーである。いくつかの実施形態では、グリコシダーゼ酵素は、ＧＴ  ＣＡＺＹファミリーのメンバーである。いくつかの実施形態では、グリコシダーゼ酵素分子は、本明細書に記載のものなどの１つ以上の配列（例えば、ＤＮＡ、ＲＮＡまたはアミノ酸配列）修飾を有するグリコシダーゼ酵素に関連する（またはそれから誘導体化される）。
【０１４４】
いくつかの実施形態では、グリコシダーゼ酵素またはグリコシダーゼ酵素分子は、ヒト腸内微生物中に存在する。グリコシダーゼ酵素は、微生物から単離され得る。いくつかの実施形態では、グリコシダーゼは、微生物上清中に存在するか、微生物抽出物中に存在するか、微生物細胞塊中に存在するか、または本質的純度（例えば、本質的に純粋な酵素画分）まで単離される。いくつかの実施形態では、グリコシダーゼ酵素は、ヒト腸内微生物から供給される。いくつかの実施形態では、グリコシダーゼ酵素は、酵母、真菌、または細菌から供給される。一実施形態では、グリコシダーゼ酵素は、ヒト腸内細菌などの細菌から供給される。いくつかの実施形態では、細菌分類群は、アクチノバクテリア（Ａｃｔｉｎｏｂａｃｔｅｒｉａ）、バクテロイデス（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｔｅｓ）、ファーミキューテス（Ｆｉｒｍｉｃｕｔｅｓ）、フソバクテリウム（Ｆｕｓｏｂａｃｔｅｒｉａ）、スピロヘータ（Ｓｐｉｒｏｃｈａｅｔｅｓ）、シネルギステス（Ｓｙｎｅｒｇｉｓｔｅｔｅｓ）、テネリクテス（Ｔｅｎｅｒｉｃｕｔｅｓ）、プロテオバクテリア（Ｐｒｏｔｅｏｂａｃｔｅｒｉａ）、ベルコミクロビウム（Ｖｅｒｒｕｃｏｍｉｃｒｏｂｉａ）、ユーロアーキオータ（Ｅｕｒｏａｒｃｈａｅｏｔａ）のうちの１つ、例えば、表２に記載の細菌分類群である。いくつかの実施形態では、ヒト腸内微生物は、細菌分類群アクチノバクテリア（Ａｃｔｉｎｏｂａｃｔｅｒｉａ）を有する種である。いくつかの実施形態では、ヒト腸内微生物は、細菌分類群バクテロイデス（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｔｅｓ）を有する種である。いくつかの実施形態では、ヒト腸内微生物は、細菌分類群ファーミキューテス（Ｆｉｒｍｉｃｕｔｅｓ）を有する種である。いくつかの実施形態では、ヒト腸内微生物は、細菌分類群フソバクテリウム（Ｆｕｓｏｂａｃｔｅｒｉａ）を有する種である。いくつかの実施形態では、ヒト腸内微生物は、細菌分類群スピロヘータ（Ｓｐｉｒｏｃｈａｅｔｅｓ）を有する種である。いくつかの実施形態では、ヒト腸内微生物は、細菌分類群シネルギステス（Ｓｙｎｅｒｇｉｓｔｅｔｅｓ）を有する種である。いくつかの実施形態では、ヒト腸内微生物は、細菌分類群テネリクテス（Ｔｅｎｅｒｉｃｕｔｅｓ）を有する種である。いくつかの実施形態では、ヒト腸内微生物は、細菌分類群プロテオバクテリア（Ｐｒｏｔｅｏｂａｃｔｅｒｉａ）を有する種である。いくつかの実施形態では、ヒト腸内微生物は、細菌分類群ベルコミクロビウム（Ｖｅｒｒｕｃｏｍｉｃｒｏｂｉａ）を有する種である。いくつかの実施形態では、ヒト腸内微生物は、細菌分類群ユーロアーキオータ（Ｅｕｒｏａｒｃｈａｅｏｔａ）を有する種である。いくつかの実施形態では、ヒト腸内微生物は、ビフィドバクテリウム（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）またはラクトバチルス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ）以外のものである。
【０１４５】
いくつかの実施形態では、グリカンポリマー（例えば、本明細書に記載の方法によって産生されるもの）は、特定のＣＡＺｙファミリー（例えば、グリコシルヒドロラーゼ（ＧＨ）ファミリーまたはグリコシルトランスフェラーゼ（ＧＴ）ファミリー）からの、ヒト腸内微生物グリコシダーゼ酵素の基質である。いくつかの実施形態では、グリカンポリマーは、特定のグリコシルヒドロラーゼ（ＧＨ）ファミリー（例えば、ＧＨ１〜ＧＨ１３５のうちの１つ）またはグリコシルトランスフェラーゼ（ＧＴ）ファミリー（例えば、ＧＴ１〜ＧＴ１０１のうちの１つ）からのヒト腸内微生物グリコシダーゼ酵素の基質である。いくつかの実施形態において、グリカンポリマー調製物は、特定のグリコシダーゼプロファイルを有するヒト腸内微生物のための基質であるように選択される（例えば、それは、例えば１つ以上のＣＡＺｙファミリーからの、１つ以上のグリコシダーゼ遺伝子を発現する（またはそのゲノム中に保有する））。いくつかの実施形態では、グリコシダーゼ酵素分子を本明細書に記載の方法で使用して、特定の微生物（または微生物群）中に存在するグリコシダーゼ酵素の機能のうちの１つ以上の機能を含むグリカンポリマーを産生する。いくつかの実施形態では、グリコシダーゼ酵素分子は、グルコシダーゼ酵素（例えば、腸内微生物中に存在する酵素）と同じ機能を含む。いくつかの実施形態では、グリコシダーゼ酵素分子は、グリコシダーゼ酵素と構造的類似性またはある程度の配列類似性を有する。グリコシダーゼ酵素分子は、例えば標準的なクローニング、遺伝学、タンパク質発現、タンパク質精製、またはタンパク質処理技術を使用して、当該技術分野において公知の任意の方法によって生成され得る。
【０１４６】
本明細書に記載のグリカンポリマーの作製方法に適したグリコシダーゼ酵素分子は、微生物中に存在するそれらのグリコシダーゼ酵素対応物に基づいて選択することができ、したがって、グリカンポリマーまたはその調製は調整された基質としての微生物の、グリコシダーゼ酵素に合わせて調整することができる（グリコシダーゼ酵素プロファイル）。
【０１４７】
いくつかの実施形態では、グリカンポリマー（例えば、本明細書に記載の方法によって産生されるもの）は、ＧＴ５、ＧＨ９４、ＧＨ１３．９、ＧＨ１３．３９、ＧＨ１３．３６、ＧＨ１１３．０およびＧＨ１１２  ＣＡＺｙファミリーから選択される、ヒト腸内微生物グリコシダーゼ酵素の基質である。いくつかの実施形態では、グリカンポリマーは、ＧＴ２、ＧＴ４、ＧＴ５、ＧＴ３５、ＧＴ５１、ＧＨ１、ＧＨ２、ＧＨ３、ＧＨ４、ＧＨ１３、ＧＨ１３サブファミリー９、ＧＨ１３サブファミリー３１、ＧＨ１８、ＧＨ２３、ＧＨ２５、ＧＨ２８、ＧＨ３１、ＧＨ３２、ＧＨ３６、ＧＨ５１、ＧＨ７３、ＧＨ７７およびＧＨ９４  ＣＡＺｙファミリーから選択される、ヒト腸内微生物グリコシダーゼ酵素の基質である。いくつかの実施形態では、グリカンポリマーは、ＧＴ１１、ＧＴ１０、ＧＨ９２、ＧＨ５１、ＧＨ３５、ＧＨ２９、ＧＨ２８、ＧＨ２０、ＧＨ１３０、ＧＨ１３サブファミリー８、およびＧＨ１３サブファミリー１４  ＣＡＺｙファミリーから選択される、ヒト腸内微生物グリコシダーゼ酵素の基質である。いくつかの実施形態では、グリカンポリマーは、ＧＴ２、ＧＴ４、ＧＨ２、ＧＨ２３、ＧＨ３、ＧＴ８、ＧＴ５１、ＧＴ９、ＧＨ１、ＧＨ９２、ＧＨ７３、ＧＨ３１、ＧＨ２０、ＧＨ２８、ＧＴ２５、ＧＴ２８、ＧＴ３５、ＧＨ１８、ＧＨ１３、ＧＨ３６、ＧＨ９７、ＧＨ１０５、ＧＨ２５、ＧＨ４、ＧＨ３２、ＧＨ７８、ＧＨ２９、ＧＨ５１、ＧＴ１０、およびＧＨ７７  ＣＡＺｙファミリーから選択される、ヒト腸内微生物グリコシダーゼ酵素の基質である。いくつかの実施形態では、グリカンポリマーは、ＧＴ３、ＧＨ９７、ＧＨ４３サブファミリー２４、ＧＨ２７、ＧＨ１３３、ＧＨ１３サブファミリー８、およびＧＨ１３  ＣＡＺｙファミリーから選択される、ヒト腸内微生物グリコシダーゼ酵素の基質である。いくつかの実施形態では、グリカンポリマーは、ＧＴ２、ＧＴ４、ＧＨ２、ＧＨ２３、ＧＨ３、ＧＴ５１、ＧＨ１、ＧＴ８、ＧＨ９２、ＧＴ９、ＧＨ７３、ＧＨ３１、ＧＨ２０、ＧＨ２８、ＧＴ３５、ＧＴ２８、ＧＨ１８、ＧＨ１３、ＧＨ９７、ＧＨ２５、ＧＨ３６、ＧＨ４、ＧＨ１０５、ＧＨ３２、ＧＨ７８、ＧＨ２９、ＧＴ２５、ＧＨ５１、ＧＨ７７、ＧＨ８８、ＧＨ２４  ＣＡＺｙファミリーから選択される、ヒト腸内微生物グリコシダーゼ酵素の基質である。
【０１４８】
いくつかの実施形態では、グリコシダーゼ酵素またはグリコシダーゼ酵素分子は、ＧＨ１、ＧＨ２、ＧＨ３、ＧＨ４、ＧＨ５、ＧＨ８、ＧＨ９、ＧＨ１０、ＧＨ１１、ＧＨ１２、ＧＨ１３、ＧＨ１４、ＧＨ１６、ＧＨ２６、ＧＨ２８、ＧＨ３０、ＧＨ３１、ＧＨ３２、ＧＨ３５、ＧＨ４２、ＧＨ４３、ＧＨ４４、ＧＨ５０、ＧＨ５１、ＧＨ５７、ＧＨ６２、ＧＨ６３、ＧＨ６８、ＧＨ７０、ＧＨ９７、ＧＨ１００、ＧＨ１１６、ＧＨ１１９、またはＧＨ１２２  ＣＡＺｙファミリーのうちの１つ以外のものである。
【０１４９】
いくつかの実施形態では、本明細書に記載の方法は、特定の微生物のグリコシダーゼプロファイル（例えば、ＣＡＺｙファミリー（例えば、ＧＴファミリーまたはＧＨファミリー）の）をインシリコで同定することをさらに含む。いくつかの実施形態では、グリコシダーゼプロファイルの同定は、実施例１１〜１５の方法に従って行われる。例えば、健康なヒト腸マイクロバイオームから、例えばヒトマイクロバイオームプロジェクト（Ｈｕｍａｎ  Ｍｉｃｒｏｂｉｏｍｅ  Ｐｒｏｊｅｃｔ）の一部として単離された共生細菌種の配列からの配列決定されたゲノムは、代謝産物を調節する、例えばブチレートを産生する、尿素を、ウレアーゼを通してアンモニアに変換する、またはコリンをＴＭＡに変換する、その能力につき予測され得る。
【０１５０】
いくつかの実施形態では、グリカンポリマーは、微生物代謝産物のレベルを調節する（例えば産生する）微生物（例えば、ヒト腸内微生物）中に存在するグリコシダーゼ酵素の基質である。例示的な代謝産物は、ギ酸、酢酸、プロピオン酸、酪酸、イソ酪酸、吉草酸、イソ吉草酸、アスコルビン酸、乳酸、トリプトファン、セロトニン、インドール、コハク酸、トリメチルアミン（ＴＭＡ）、ＴＭＡＯ（トリメチルアミンＮ−オキシド）、デオキシコール酸、硫酸エチルフェニル、アセチルアルデヒド、過酸化水素、アンモニア、胆汁酸、リポ多糖（ＬＰＳ）、および／またはブタンジオンを含む。いくつかの実施形態では、代謝産物は、酪酸（例えば、ブチレート）、トリメチルアミン（ＴＭＡ）またはアンモニアである。いくつかの実施形態では、代謝産物は、酪酸（例えば、ブチレート）である。いくつかの実施形態では、代謝産物は、酢酸（例えば、アセテート）である。いくつかの実施形態では、代謝産物は、プロピオン酸（例えば、プロピオネート）である。いくつかの実施形態では、代謝産物は、トリメチルアミン（ＴＭＡ）である。いくつかの実施形態では、代謝産物は、アンモニアである。いくつかの実施形態では、代謝産物は、リポ多糖（ＬＰＳ）である。いくつかの実施形態では、代謝産物は、胆汁酸（例えば、二次胆汁酸）である。いくつかの実施形態では、代謝産物の実質的増加または減少は、検出され得る。いくつかの実施形態では、グリコシダーゼ酵素またはグリコシダーゼ酵素分子は、アルファ−もしくはベータ−ガラクトシダーゼ、アルファ−もしくはベータ−グルコシダーゼ、アルファ−もしくはベータ−キシロシダーゼ、アルファ−もしくはベータ−マンノシダーゼ、またはアルファ−もしくはベータ−フルクトフラノシダーゼ以外のものである。いくつかの実施形態では、グリコシダーゼ酵素またはグリコシダーゼ酵素分子は、アルファ−またはベータ−ガラクトシダーゼ以外のものである。
【０１５１】
グリコシダーゼ酵素分子の生成方法
グリコシダーゼ酵素分子は、組換え宿主細胞における発現によって産生され得るが、インビトロ転写および翻訳ならびに化学合成などの他の方法によっても産生され得る。
【０１５２】
細胞発現のために、グリコシダーゼ酵素分子をコードする１つ以上の核酸（例えば、ｃＤＮＡまたはゲノムＤＮＡ）がクローニングまたは発現のために複製可能なベクターに挿入され得る。ベクターは、例えば、プラスミド、コスミド、ウイルスゲノム、ファージミド、ファージゲノム、または他の自律複製配列であり得る。適切なコード核酸配列は、様々な手順によってベクターに挿入され得る。例えば、適切な制限エンドヌクレアーゼ部位を操作することができる（例えばＰＣＲを用いて）。次いで、制限消化およびライゲーションを使用して、コードする核酸配列を適切な位置に挿入することができる。ベクター成分は一般的に、１つ以上の複製起点、１つ以上のマーカー遺伝子、エンハンサーエレメント、プロモーター、および転写終結配列を含む。
【０１５３】
グリコシダーゼ酵素分子は、任意選択により、シグナル配列、エピトープもしくは精製部分、または標識などの１つ以上の他の成分への融合によって、組換え的に産生されてもよい。
【０１５４】
細菌発現のために、グリコシダーゼ酵素分子はシグナル配列を伴ってまたは伴わずに産生され得る。例えば、これは、封入体または可溶性画分に蓄積するように細胞内で産生することができる。それはまた、例えば原核生物シグナル配列、例えば適切なリーダー配列の付加により、分泌され得る。発現のための例示的な細菌宿主細胞としては、任意の形質転換可能な大腸菌（Ｅ．ｃｏｌｉ）Ｋ−１２株（大腸菌（Ｅ．ｃｏｌｉ）ＢＬ２１、Ｃ６００、ＡＴＣＣ２３７２４；大腸菌（Ｅ．ｃｏｌｉ）ＨＢ１０１  ＮＲＲＬＢ−１１３７１、ＡＴＣＣ−３３６９４；大腸菌（Ｅ．ｃｏｌｉ）ＭＭ２９４  ＡＴＣＣ−３３６２５；大腸菌（Ｅ．ｃｏｌｉ）Ｗ３１１０  ＡＴＣＣ−２７３２５）、Ｂ．サブチリス（Ｂ．ｓｕｂｔｉｌｉｓ）、シュードモナス（Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ）および他のバチルス（Ｂａｃｉｌｌｉ）が挙げられる。いくつかの実施形態では、細菌宿主細胞は、タンパク質分解性分類群、例えば、内在性グリコシダーゼ酵素をほとんどまたは全く発現しない分類群から選択される。
【０１５５】
グリコシダーゼ酵素分子は、酵母宿主細胞、例えばサッカロミセス・セレビシエ（Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ  ｃｅｒｅｖｉｓｉａｅ）、シゾサッカロミセス・ポンベ（Ｓｃｈｉｚｏｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ  ｐｏｍｂｅ）、ハンゼヌラ（Ｈａｎｓｅｕｌａ）、またはピキア・パストリス（Ｐｉｃｈｉａ  ｐａｓｔｏｒｉｓ）において発現させることができる。酵母発現のために、グリコシダーゼ酵素分子はまた、細胞内でまたは分泌によって、例えば酵母インベルターゼリーダーまたはアルファ因子リーダー（サッカロミセス（Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ）およびクルイベロミセス（Ｋｌｕｙｖｅｒｏｍｙｃｅｓ）形態を含む）、または酸性ホスファターゼリーダー、またはＣ．アルビカンス（Ｃ．ａｌｂｉｃａｎｓ）グルコアミラーゼリーダー（１９９０年４月４日に公開された欧州特許第３６２，１７９号明細書）を使用して、産生することができる。
【０１５６】
発現およびクローニングベクターは両方、ベクターが１つ以上の選択された宿主細胞中で複製することを可能にする核酸配列を含有する。そのような配列は、様々な細菌、酵母、およびウイルスについて周知である。プラスミドｐＢＲ３２２からの複製起点は、大部分のグラム陰性菌に適しており、２プラスミド起源は酵母に適している。
【０１５７】
発現およびクローニングベクターは、典型的には選択遺伝子またはマーカーを含有する。典型的な選択遺伝子は、（ａ）抗生物質または他の毒素、例えば、アンピシリン、ネオマイシン、メトトレキサート、またはテトラサイクリンに対する耐性を付与するか、（ｂ）栄養要求性欠陥を補完する（サッカロミセス（Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ）中のＵＲＡ３マーカーなど）か、または（ｃ）複合培地から入手できない重要な栄養素、例えば、バチルス（Ｂａｃｉｌｌｉ）のためのＤ−アラニンラセマーゼをコードする遺伝子を供給する、タンパク質をコードする。
【０１５８】
発現およびクローニングベクターは通常、ｍＲＮＡ合成を指示するためにグリコシダーゼ酵素分子をコードする核酸配列に作動可能に連結されたプロモーターを含有する。原核生物宿主と共に使用するのに適した例示的なプロモーターとしては、β−ラクタマーゼおよびラクトースプロモーター系（Ｃｈａｎｇ  ｅｔ  ａｌ．，Ｎａｔｕｒｅ，２７５：６１５（１９７８）；Ｇｏｅｄｄｅｌ  ｅｔ  ａｌ．，Ｎａｔｕｒｅ，２８１：５４４（１９７９））アルカリホスファターゼ、トリプトファン（ｔｒｐ）プロモーター系（Ｇｏｅｄｄｅｌ，Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄｓ  Ｒｅｓ．，８：４０５７（１９８０）；欧州特許第３６，７７６号明細書）、およびｔａｃプロモーターなどのハイブリッドプロモーターが挙げられる。（ｄｅＢｏｅｒ  ｅｔ  ａｌ．，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ，８０：２１−２５（１９８３））細菌系における使用のためのプロモーターはまた、適切に配置されたシャイン・ダルガルノ配列を含有し得る。Ｔ７ポリメラーゼ系はまた、Ｔ７プロモーターの制御下に置かれた核酸コード配列の発現を駆動するためにも使用することができる。
【０１５９】
組換え細胞におけるグリコシダーゼ酵素分子の合成への適合に適したさらに他の方法、ベクター、および宿主細胞は、Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｃｌｏｎｉｎｇ：Ａ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｍａｎｕａｌ，Ｔｈｉｒｄ  Ｅｄ．，Ｓａｍｂｒｏｏｋ  ｅｔ  ａｌ．（ｅｄｓ．），Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｏｒ  Ｐｒｅｓｓ，（２００１）（ＩＳＢＮ：０８７９６９５７７３）に記載されている。
【０１６０】
一旦細胞内で発現されると、グリコシダーゼ酵素分子は、培地、封入体、または細胞溶解物から回収することができる。細胞は、凍結融解サイクル、超音波処理、機械的破壊、または細胞溶解剤（例えば、界面活性剤）などの様々な物理的または化学的手段によって破壊することができる。
【０１６１】
グリコシダーゼ酵素分子は、細胞溶解物中または細胞培地中に見出すことができる、他の細胞タンパク質またはポリペプチドから精製することができる。タンパク質精製の様々な方法が使用され得、そのような方法は当該技術分野で公知であり、例えばＤｅｕｔｓｃｈｅｒ，Ｍｅｔｈｏｄｓ  ｉｎ  Ｅｎｚｙｍｏｌｏｇｙ，１８２（１９９０）；およびＳｃｏｐｅｓ，Ｐｒｏｔｅｉｎ  Ｐｕｒｉｆｉｃａｔｉｏｎ：Ｐｒｉｎｃｉｐｌｅｓ  ａｎｄ  Ｐｒａｃｔｉｃｅ，Ｓｐｒｉｎｇｅｒ−Ｖｅｒｌａｇ，Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ（２０１０）（ＩＳＢＮ：１４４１９２８３３２）に記載される。例示的な精製手順は、イオン交換カラム上での分画、エタノール沈殿、逆相ＨＰＬＣ、シリカ上またはＤＥＡＥなどの陽イオン交換樹脂上でのクロマトグラフィー、クロマトフォーカシング、ＳＤＳ−ＰＡＧＥ、硫酸アンモニウム沈殿、例えばＳｅｐｈａｄｅｘ  Ｇ−７５を用いた、ゲル濾過、ＩｇＧなどの汚染物質を除去するためのプロテインＡ  Ｓｅｐｈａｒｏｓｅカラム、親和性カラム（例えば、タンパク質のエピトープタグ化形態を結合するための金属キレートカラム、およびグリコシダーゼ酵素に関連する任意の精製部分を結合するための様々なリガンドを有するカラム）によるものを含む。精製方法は、２つの異なるイオン交換クロマトグラフィー工程、例えば陽イオン交換クロマトグラフィーとそれに続く陰イオン交換クロマトグラフィーの組み合わせ、またはその逆を含み得る。グリコシダーゼ酵素分子は、塩および／またはｐＨ勾配を含む様々な方法、または工程によってイオン交換樹脂から溶出させることができる。いくつかの実施形態では、グリコシダーゼ酵素分子は精製部分（エピトープタグおよびアフィニティーハンドルなど）を含む。そのような部分は、親和性クロマトグラフィーに使用することができ、任意選択により、タンパク質分解切断によって除去することができる。
【０１６２】
クロマトグラフィー用のアニオン性またはカチオン性支持体を形成するために、アニオン性またはカチオン性置換基をマトリックスに結合させ得る。アニオン交換置換基には、ジエチルアミノエチル（ＤＥＡＥ）、四級アミノエチル（ＱＡＥ）および四級アミン（Ｑ）基が含まれる。カチオン性置換基には、カルボキシメチル（ＣＭ）、スルホエチル（ＳＥ）、スルホプロピル（ＳＰ）、ホスフェート（Ｐ）およびスルホネート（Ｓ）が含まれる。ＤＥ２３、ＤＥ３２、ＤＥ５２、ＣＭ−２３、ＣＭ−３２およびＣＭ−５２などのセルロースイオン交換樹脂は、Ｗｈａｔｍａｎ  Ｌｔｄ．（Ｍａｉｄｓｔｏｎｅ、Ｋｅｎｔ、Ｕ．Ｋ）から入手可能である。ＳＥＰＨＡＤＥＸ（商標）および他の架橋イオン交換体もまた公知である。例えば、ＤＥＡＥ−、ＱＡＥ−、ＣＭ−、およびＳＰ−ＳＥＰＨＡＤＥＸ（商標）ならびにＤＥＡＥ−、Ｑ−、ＣＭ−およびＳ−ＳＥＰＨＡＲＯＳＥ（商標）ならびにＳＥＰＨＡＲＯＳＥ（商標）Ｆａｓｔ  Ｆｌｏｗは、Ｐｈａｒｍａｃｉａ  ＡＢから入手可能である。ＴＯＹＯＰＥＡＲＬ  ＤＥＡＥ−６５０ＳまたはＭおよびＴＯＹＯＰＥＡＲＬ  ＣＭ−６５０ＳまたはＭなどのＤＥＡＥおよびＣＭ誘導体化エチレングリコール−メタクリレートコポリマーは、Ｔｏｓｏ  Ｈａａｓ  Ｃｏ．（Ｐｈｉｌａｄｅｌｐｈｉａ、ＰＡ、ＵＳＡ）から入手可能である。
【０１６３】
陽イオン交換表面は、共有結合した負荷電の配位子を有するイオン交換表面であり、したがって、表面と接触する溶液中の陽イオンと交換するための遊離陽イオンを有する。例示的な表面には、共有結合基がカルボキシレートまたはスルホネートであるものなどの陽イオン交換樹脂が含まれる。市販のカチオン交換樹脂には、ＣＭＣ−セルロース、ＳＰ−Ｓｅｐｈａｄｅｘ（商標）およびＦａｓｔ  Ｓ−Ｓｅｐｈａｒｏｓｅ（商標）（Ｐｈａｒｍａｃｉａ）が含まれる。
【０１６４】
陰イオン交換表面は、四級アミノ基などの共有結合した正荷電基を有するイオン交換表面である。例示的な陰イオン交換表面は、ＤＥＡＥセルロース、ＴＭＡＥ、ＱＡＥ  Ｓｅｐｈａｄｅｘ（商標）およびＦａｓｔ  Ｑ  Ｓｅｐｈａｒｏｓｅ（商標）（Ｐｈａｒｍａｃｉａ）などの陰イオン交換樹脂である。
【０１６５】
グリコシダーゼ酵素分子のための例示的な精製スキームは、深層濾過による溶解緩衝液中での大腸菌（Ｅ．ｃｏｌｉ）細胞の溶解を含む。次いで、材料を陽イオン交換クロマトグラフィー（ＣＥＸ）に供する。次いで、ＣＥＸ溶出液を陰イオン交換クロマトグラフィー（ＡＥＸ）工程において陰イオン交換媒体上に流す。ＡＥＸ  ＦＴは研磨工程に供することができる。次いで、材料を限外濾過／透析濾過によって処理して、例えば、材料を濃縮または脱塩することができる。限外濾過／透析濾過膜は、タンパク質を保持液中に保持しながら、塩などの低分子量物質を濾液に通過させるように、公称分子量カットオフ（「ＮＭＷＣＯ」）に基づいて選択され得る。例えば、所望の最終ｐＨおよび生成物の導電性に応じて、任意の緩衝溶液または滅菌水が最終の緩衝液交換工程中に使用され得る。
【０１６６】
グリコシダーゼ酵素分子は、１つ以上の保存的配列修飾を含み得る。そのような保存的修飾は、アミノ酸置換、付加および欠失を含む。修飾は、部位特異的突然変異誘発およびＰＣＲ媒介突然変異誘発などの、当該技術分野において公知の標準的な技術によって導入することができる。保存的アミノ酸置換は、アミノ酸残基が類似の側鎖を有するアミノ酸残基で置換されたものである。類似の側鎖を有するアミノ酸残基のファミリーは当該技術分野で定義されている。これらのファミリーには、塩基性側鎖（例えば、リジン、アルギニン、ヒスチジン）を有するアミノ酸、酸性側鎖（例えば、アスパラギン酸、グルタミン酸）、非荷電極性側鎖（例えば、グリシン、アスパラギン、グルタミン、セリン、トレオニン、チロシン、システイン、トリプトファン）、非極性側鎖（例えば、アラニン、バリン、ロイシン、イソロイシン、プロリン、フェニルアラニン、メチオニン）、ベータ分岐側鎖（例えば、トレオニン、バリン、イソロイシン）および芳香族側鎖（例えば、チロシン、フェニルアラニン、トリプトファン、ヒスチジン）が含まれる。したがって、グリコシダーゼ酵素内の１つ以上のアミノ酸残基を同じ側鎖ファミリーからの他のアミノ酸残基で置き換えることができ、改変グリコシダーゼ酵素分子を本明細書に記載の機能的アッセイを用いて試験することができる。
【０１６７】
さらなる処理工程
任意選択により、調製物は、さらなる処理工程を経ても良い。さらなる処理工程は、例えば、精製工程を含み得る。精製工程は、例えば、分離、希釈、濃縮、濾過、脱塩、またはイオン交換、クロマトグラフ分離、または脱色、またはこれらの任意の組み合わせを含み得る。
【０１６８】
脱色
いくつかの実施形態では、本明細書に記載の方法は、脱色工程をさらに含む。産生されるグリカンポリマーは、例えば、吸収剤、活性炭、クロマトグラフィー（例えば、イオン交換樹脂を用いる）、水素化、および／または濾過（例えば、精密濾過）による処理を含む、当該技術分野において公知の任意の方法を用いた脱色工程を経てもよい。
【０１６９】
特定の実施形態では、産生されるグリカンポリマーを、特定の温度で、特定の濃度で、および／または特定の期間にわたり、色吸収材料と接触させる。いくつかの実施形態では、グリカンポリマーと接触させる色吸収種の質量は、グリカンポリマーの質量の５０％未満、グリカンポリマーの質量の３５％未満、グリカンポリマーの質量の２０％未満、グリカンポリマーの質量の１０％未満、グリカンポリマーの質量の５％未満、グリカンポリマーの質量の２％未満、またはグリカンポリマーの質量の１％未満である。
【０１７０】
いくつかの実施形態では、グリカンポリマーを色吸収材料と接触させる。特定の実施形態では、グリカンポリマーを、１０時間未満、５時間未満、１時間未満、または３０分間未満にわたり、色吸収材料と接触させる。特定の実施形態では、グリカンポリマーは、１時間、色吸収材料と接触させる。
【０１７１】
特定の実施形態では、グリカンポリマーを、摂氏２０〜１００度、摂氏３０〜８０度、摂氏４０〜８０度、または摂氏４０〜６５度の温度で色吸収材料と接触させる。特定の実施形態では、グリカンポリマーを、摂氏５０度の温度で色吸収材料と接触させる。
【０１７２】
特定の実施形態では、色吸収材料は、活性炭である。一実施形態では、色吸収材料は、粉末活性炭である。他の実施形態では、色吸収材料は、イオン交換樹脂である。一実施形態では、色吸収材料は、塩化物形態の強塩基性陽イオン交換樹脂である。別の実施形態では、色吸収材料は、架橋ポリスチレンである。さらに別の実施形態では、色吸収材料は、架橋ポリアクリレートである。特定の実施形態では、色吸収材料は、Ａｍｂｅｒｌｉｔｅ  ＦＰＡ９１、Ａｍｂｅｒｌｉｔｅ  ＦＰＡ９８、Ｄｏｗｅｘ  ２２、Ｄｏｗｅｘ  Ｍａｒａｔｈｏｎ  ＭＳＡ、またはＤｏｗｅｘ  Ｏｐｔｉｐｏｒｅ  ＳＤ−２である。
【０１７３】
イオン交換／脱塩（脱鉱化）
いくつかの実施形態では、産生したグリカンポリマーを、塩、鉱物、および／または他のイオン種を除去するための材料と接触させる。特定の実施形態では、グリカンポリマーは、陰イオン／陽イオン交換カラム対を通って流れる。一実施形態では、陰イオン交換カラムは、水酸化物形態の弱塩基性交換樹脂を含有し、陽イオン交換カラムは、プロトン化形態の強酸性交換樹脂を含有する。
【０１７４】
分離および濃縮
いくつかの実施形態では、本明細書に記載の方法は、産生されるグリカンポリマーを単離することをさらに含む。特定の変形例では、グリカンポリマーの単離は、例えば、遠心分離、濾過（例えば、真空濾過、膜濾過）、および重力沈降を含む、当該技術分野において公知の任意の方法を用いて、グリコシダーゼ酵素分子の少なくとも一部分からグリカンポリマーの少なくとも一部分を分離することを含む。いくつかの実施形態では、グリカンポリマーの単離は、例えば、濾過（例えば、膜濾過）、クロマトグラフィー（例えば、クロマトグラフィー分画）、差異的溶解度、および遠心分離（例えば、分画遠心分離）を含む、当該技術分野において公知の任意の方法を用いて、任意の未反応の糖の少なくとも一部分からグリカンポリマーの少なくとも一部分を分離することを含む。
【０１７５】
いくつかの実施形態では、本明細書に記載の方法は、濃縮工程をさらに含む。例えば、いくつかの実施形態では、単離されたグリカンポリマーは、蒸発（例えば、真空蒸発）に供され、濃縮されたグリカンポリマー調製物を産生する。他の実施形態では、単離されたグリカンポリマーは、噴霧乾燥工程に供されてオリゴ糖粉末を産生する。特定の実施形態では、単離されたグリカンポリマーは、蒸発工程および噴霧乾燥工程の両方に供される。
【０１７６】
分画化
いくつかの実施形態では、本明細書に記載の方法は、分画化工程をさらに含む。調製され、精製されたグリカンポリマーは、その後、例えば、高速液体クロマトグラフィー、吸着／脱離（例えば低圧活性炭クロマトグラフィー）、または濾過（例えば、限外濾過または透析濾過）を含む、当該技術分野において公知の任意の方法を用いて分子量によって分離され得る。
【０１７７】
特定の実施形態では、産生されたグリカンポリマーは、炭素質の物質に吸着させ、その後、１％、５％、１０％、２０％、５０％、または１００％の濃度で水中の有機溶媒の混合物で物質を洗浄することにより画分を脱着させることによって分画化される。一実施形態では、吸着物質は、活性炭である。別の実施形態では、吸着物質は、活性炭と、体積または重量で、５％、１０％、２０％、３０％、４０％、または５０％の部分において、珪藻土またはＣｅｌｉｔｅ５４５等の増量剤の混合物である。
【０１７８】
さらなる実施形態では、産生したグリカンポリマーは、高速液体クロマトグラフィーシステムを通過させることによって分離される。特定の変形例では、産生されたグリカンポリマーは、イオン親和性クロマトグラフィー、親水性相互作用クロマトグラフィー、またはゲル透過およびゲル濾過を含むサイズ排除クロマトグラフィーによって分離される。
【０１７９】
他の実施形態では、低分子量物質は、濾過方法によって除去される。特定の変形例では、低分子量物質は、透析、限外濾過、透析濾過、または接線流濾過によって除去され得る。特定の実施形態では、濾過は、静的透析チューブ装置において行われる。他の実施形態では、濾過は、動的流れ濾過システムにおいて行われる。他の実施形態では、濾過は、遠心力駆動型濾過遠心分離において行われる。
【０１８０】
他の処理工程は、本明細書の実施例に記載されたもののいずれか１つを含み得る。いくつかの実施形態では、酵母発酵は、未反応成分、例えば、糖モノマーまたはダイマー、または糖モノマーなどの反応副生成物を除去するために使用される。
【０１８１】
グリカン調製物特性
グリカンは、国際公開第２０１６／１２２８８９号パンフレット、国際公開第２０１６／１７２６５７号パンフレット、国際公開第２０１６／００７７７８号パンフレットおよび国際公開第２０１６／１７２６５８号パンフレット（これらはそれぞれ、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる）に記載される特徴および特性の１つ以上、ならびに本明細書に記載の特徴および特性を有し得る。
【０１８２】
本明細書に記載の方法によって製造されるグリカンは、オリゴ糖を含み得る。いくつかの実施形態では、グリカンはホモオリゴ糖（または、ホモグリカン）を含み、ここで、ポリマー中のすべての単糖は同じ型である。
【０１８３】
いくつかの実施形態では、グリカンはヘテロオリゴ糖（または、ヘテログリカン）を含み、このポリマー中には複数の型の単糖が存在する。いくつかの実施形態では、グリカンは、本明細書に記載の特性のうちの１つ以上を有する。いくつかの実施形態では、グリカン調製物は、本明細書に記載のバルク特性のうちの１つ以上を有する。
【０１８４】
重合度（ＤＰ）
いくつかの実施形態では、グリカンポリマー調製物は、例えば、本明細書中に記載される方法を用いて製造されるが、それらは、多分散系であり、ある範囲の重合度を示す。
【０１８５】
任意選択により、調製物は、例えば、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、９８％、または９８％超の短い（ＤＰが約１〜２）、中等度（ＤＰが約３〜１０）、長い（ＤＰが約１１〜１８）、または非常に長い（ＤＰが＞１８）種を表すように分画してもよい。一実施形態では、約３〜１０のＤＰを有する少なくとも８５％、９０％、または少なくとも９５％の中等度の長さの種を含む多分散の分画グリカンポリマー調製物が提供される。一実施形態では、約１１〜１８のＤＰを有する少なくとも８５％、９０％、または少なくとも９５％の長尺の種を含む多分散の分画グリカンポリマー調製物が提供される。一実施形態では、約１８〜３０のＤＰを有する少なくとも８５％、９０％、または少なくとも９５％の超長尺の種を含む多分散の分画グリカンポリマー調製物が提供される。
【０１８６】
任意選択により、調製物は、例えば、調製物中に６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、９８％、または９８％超の短い（ＤＰが約１〜２）、または中等度（ＤＰが約３〜１０）のグリカンを表すように分画してもよい。代替として、または分画に加えて、小さなＤＰ画分（例えば、モノマーおよびダイマー）は、例えば、これらの糖を分解するのに適した酵母を用いて、酵素による発酵に供される。一実施形態では、約３〜１０のＤＰを有するグリカンを少なくとも８５％、９０％、または少なくとも９５％含む、多分散の分画グリカンポリマー調製物が、本明細書に記載の方法を用いて調製される。
【０１８７】
いくつかの実施形態では、グリカン調製物のグリカンポリマーの約５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、または約９７％は、少なくともＤＰ３、ＤＰ４、ＤＰ５、ＤＰ６またはＤＰ７のＤＰを有する。いくつかの実施形態では、グリカン調製物のグリカンポリマーの約５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、または約９７％は、約ＤＰ３〜約ＤＰ１０、約ＤＰ３〜約ＤＰ８、約ＤＰ３〜約ＤＰ６、約ＤＰ３〜約ＤＰ５、約ＤＰ３〜約ＤＰ４、約ＤＰ２〜約ＤＰ４、約ＤＰ２〜約ＤＰ５、約ＤＰ２〜約ＤＰ６、約ＤＰ２〜約ＤＰ８、または約ＤＰ２〜約ＤＰ１０のＤＰを有する。いくつかの実施形態では、グリカン調製物のグリカンポリマーの１％未満、２％、３％、５％、１０％、１５％、２０％、２５％、３０％、４０％、または５０％未満は、ＤＰ２以下のＤＰを有する。
【０１８８】
いくつかの実施形態では、グリカンポリマー調製物の約５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、または約９７％は、２〜２５、３〜２５、４〜２５、５〜２５、６〜２５、７〜２５、８〜２５、９〜２５、１０〜２５、２〜３０、３〜３０、４〜３０、５〜３０、６〜３０、７〜３０、８〜３０、９〜３０、または１０〜３０のＤＰを有する。一実施形態では、グリカンポリマー調製物は、少なくとも３および３０未満のグリカン単位の重合度（ＤＰ）を有する。
【０１８９】
いくつかの実施形態では、グリカンポリマー調製物の約５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、または約９７％は、５以上３０未満のグリカン単位のＤＰを有する。いくつかの実施形態では、グリカンポリマー調製物の約５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、または約９７％は、８以上３０未満のグリカン単位のＤＰを有する。いくつかの実施形態では、グリカンポリマー調製物の約５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、または約９７％は、１０以上３０未満のグリカン単位のＤＰを有する。いくつかの実施形態では、グリカンポリマー調製物の約５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、または約９７％は、３、４、５、６、７、８と１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０の間のグリカン単位のＤＰを有する。いくつかの実施形態では、グリカンポリマー調製物の約５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、または約９７％は、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９と２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、２９、３０の間のグリカン単位のＤＰを有する。いくつかの実施形態では、グリカンポリマー調製物の約５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、または約９７％は、３、４、５、６、７、８、９、１０と２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８の間のグリカン単位のＤＰを有する。
【０１９０】
本明細書に記載の方法において１つ以上のグリカン単位（例えば糖）のための変換収率は、例えば、高速液体クロマトグラフィー（ＨＰＬＣ）を含む、当該技術分野において公知の任意の適当な方法によって決定され得る。変換の平均収率は、当業者に公知の方法、例えば、サイズ排除、イオン親和性、親水性、または疎水性ケミストリーによって決定することができる。これらの方法は一般的に、適切なカラムケミストリーを備えたＨＰＬＣシステムによる材料のクロマトグラフ分離に依存している。次いで、産物からの出発物質のクロマトグラフ分離は、それらの物質の曲線下面積の直接的な比較を可能にし、これは、次いで変換のパーセント収率に変換することができる。実施例１５は、変換収率を決定するために使用することができる、特定のＩＡＣおよびＳＥＣアプローチを記載する。好ましい実施形態では、本明細書で言及される変換は、実施例１５のＳＥＣ法によって決定される。
【０１９１】
いくつかの実施形態では、１つ以上のグリカンサブユニットをグリコシダーゼ酵素分子と組み合わせた後の、ＤＰ１より大きいＤＰを有する（ＤＰ＞１）グリカンポリマーによるグリカンポリマー調製物への変換収率は、約１％、２％、３％、４％、５％、１０％、１５％、２０％、２５％、３０％、３５％、４０％、４５％、５０％、５５％、６０％、６５％、７０％、７５％以上（インプットグリカンサブユニットのパーセンテージとしての重量／重量基準で決定される）である。いくつかの実施形態では、１つ以上のグリカンサブユニットをグリコシダーゼ酵素分子と組み合わせた後の、少なくともＤＰ２のＤＰを有するグリカンポリマーによるグリカンポリマー調製物への変換収率は、約１％、２％、３％、４％、５％、１０％、１５％、２０％、２５％、３０％、３５％、４０％、４５％、５０％、５５％、６０％、６５％、７０％、７５％以上（インプットグリカンサブユニットのパーセンテージとしての重量／重量基準で決定される）である。
【０１９２】
いくつかの実施形態では、１つ以上のグリカンサブユニットをグリコシダーゼ酵素分子と組み合わせた後の、少なくともＤＰ３のＤＰを有するグリカンポリマーによるグリカンポリマー調製物への変換収率は、約１％、２％、３％、４％、５％、１０％、１５％、２０％、２５％、３０％、３５％、４０％、４５％、５０％、５５％、６０％、６５％、７０％、７５％以上（インプットグリカンサブユニットのパーセンテージとしての重量／重量基準で決定される）である。
【０１９３】
いくつかの実施形態では、１つ以上のグリカン単位を触媒と混合した後（例えば、１つ以上のグリカン単位を触媒と混合してから２、３、４、８、１２、２４、または４８時間後）の１を超えるＤＰを有するグリカンポリマー調製物に対する変換収率は、約５０％より大きい（例えば、約５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、または９８％より大きい）。いくつかの実施形態では、１つ以上のグリカン単位を触媒と混合した後（例えば、１つ以上のグリカン単位を触媒と混合してから２、３、４、８、１２、２４、または４８時間後）の２を超えるＤＰを有するグリカンポリマー調製物に対する変換収率は、３０％より大きい（例えば、３５％、４０％、４５％、５０％、５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、または９８％より大きい）。
【０１９４】
いくつかの実施形態では、グリカンポリマー調製物の約５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、または約９７％は、少なくとも２のＤＰを有する。いくつかの実施形態では、グリカンポリマー調製物の約５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、または約９７％は、少なくとも３のＤＰを有する。
【０１９５】
平均ＤＰ
いくつかの実施形態では、グリカンポリマー調製物は、約ＤＰ２、ＤＰ３、ＤＰ４、ＤＰ５、ＤＰ６、ＤＰ７、ＤＰ８、またはＤＰ９の平均重合度（平均ＤＰ）を有する。いくつかの実施形態では、グリカンポリマー調製物は、約２〜約１０、約２〜約８、約２〜約６、約２〜約４、約３〜約１０、約３〜約８、約３〜約６、または約３〜約４の平均重合度（平均ＤＰ）を有する。
【０１９６】
いくつかの実施形態では、グリカンポリマー調製物の約５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、または約９７％は、約ＤＰ５、ＤＰ６、ＤＰ７、ＤＰ８、ＤＰ９、ＤＰ１０、ＤＰ１１、またはＤＰ１２の平均重合度（平均ＤＰ）を有する。いくつかの実施形態では、グリカンポリマー調製物の平均ＤＰは、約ＤＰ５〜ＤＰ１０、約ＤＰ６〜ＤＰ１０、約ＤＰ６〜ＤＰ１２、約ＤＰ６〜ＤＰ１４、約ＤＰ８〜ＤＰ１２、約ＤＰ８〜ＤＰ１４、約ＤＰ８〜ＤＰ１６、約ＤＰ１０〜ＤＰ１６、約ＤＰ１０〜ＤＰ１８、約ＤＰ４〜ＤＰ１８、約ＤＰ６〜ＤＰ１８、または約ＤＰ８〜ＤＰ１８である。
【０１９７】
グリカンポリマー調製物の重合度（ＤＰ）の分布（または平均）は、当業者に公知の方法、例えば、平均ＤＰへの数学的変換が後続するイオン親和性クロマトグラフィー（ＩＡＣ）または分子量（ＭＷ）のサイズ排除クロマトグラフィー（ＳＥＣ）測定を使用したものによって決定することができる。これらの方法は一般的に、既知のＭＷを有する標準セットとの比較による平均ＭＷへのその分布の計算的変換が後続する、サイズ排除カラムまたはイオン親和性カラムなどの質量感度の高いカラムケミストリーを備えたＨＰＬＣシステムに基づく材料のクロマトグラフ分離に依存している。一旦平均分子量が決定されると、その値をグリカンの反復単位の平均重量で除することで、平均ＤＰが計算できる。実施例１５は、本明細書において言及されるように、平均ＤＰを決定するために使用することができる特定のＩＡＣおよびＳＥＣアプローチを記載する。好ましい実施形態では、本明細書で言及される平均ＤＰは、実施例１５のＳＥＣ法によって決定される。
【０１９８】
平均分子量
いくつかの実施形態では、調製物のグリカンポリマーの約５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、または約９７％は、約２００、２５０、３００、３５０、４００、４５０、５００、５５０、６００、６５０、７００、７５０、８００、８５０、９００、９５０、１０００、１０５０、１１００、１１５０、１２００、１２５０、１３００、１３５０、１４００、１４５０、１５００、１５５０、１６００、１６５０、１７００、１７５０、１８００ｇ／ｍｏｌで、４００、５００、６００、７００、８００、９００、１０００、１１００、１２００、１３００、１４００、１５００、１６００、１７００、１８００、１９００、２０００、２１００、２２００、２３００、２４００、２５００、２６００、２７００、２８００、２９００、３０００、３１００、３２００、３３００、３４００、３５００、３６００、３７００、３８００、３９００、４０００、４１００、４２００、４３００、４４００、４５００、４６００、４７００、４８００、４９００、および５０００ｇ／ｍｏｌ未満の平均分子量を有する。
【０１９９】
平均分子量（ＭＷ）は、当業者に公知の方法、例えばイオン親和性クロマトグラフィー（ＩＡＣ）またはサイズ排除クロマトグラフィー（ＳＥＣ）によって決定することができる。これらの方法は一般的に、既知のＭＷを有する標準セットとの比較による平均ＭＷへのその分布の計算的変換が後続する、サイズ排除カラムまたはイオン親和性カラムなどの質量感度の高いカラムケミストリーを備えたＨＰＬＣシステムに基づく材料のクロマトグラフ分離に依存している。実施例１５は、本明細書において言及されるように、平均ＭＷを決定するために使用することができる特定のＩＡＣおよびＳＥＣアプローチを記載する。好ましい実施形態では、本明細書で言及される平均ＭＷは、実施例１５のＳＥＣ法によって決定される。
【０２００】
分岐度（ＤＢ）
いくつかの実施形態では、グリカン調製物は、構造が直鎖状から分枝状まで様々である。分岐グリカンは、分岐を形成するように、アルファまたはベータグリコシド結合を介して連結している少なくとも１つのグリカンサブユニットを含み得る。分岐率または分岐度（ＤＢ）は、調製物のグリカンポリマーがグリカンポリマー中に少なくとも１つ、少なくとも２つ、少なくとも３つ、少なくとも４つ、少なくとも５つ、または少なくとも約６つの分岐点を含むように変化し得る。いくつかの実施形態では、グリカン調製物のグリカンポリマーは非分岐である（ＤＢ＝０）。
【０２０１】
いくつかの実施形態では、グリカン調製物（例えば、オリゴまたは多糖類）は、線形から高度分岐の構造に及ぶ。非分岐グリカンは、アルファ結合のみまたはベータ結合のみを含有し得る。非分岐グリカンは、少なくとも１つのアルファ結合および少なくとも１つのベータ結合を含有し得る。分岐グリカンは、アルファグリコシド結合またはベータグリコシド結合を介して結合して、分岐を形成する少なくとも１つのグリカン単位を含有し得る。分岐速度または分岐度（ＤＢ）は、変化し得、そのため、約２番目、３番目、４番目、５番目、６番目、７番目、８番目、９番目、１０番目、１５番目、２０番目、２５番目、３０番目、３５番目、４０番目、４５番目、５０番目、６０番目、または７０番目毎の単位は、少なくとも１つの分岐点を含む。例えば、動物グリコーゲンは、ほぼ１０毎の単位に分岐点を含有する。
【０２０２】
いくつかの実施形態では、グリカンポリマーの調製物が提供され、その調製物は、分岐グリカンの混合物を含み、その平均分岐度（ＤＢ、１残基あたりの分岐点）は、０、０．０１．０．０２、０．０３、０．０４、０．０５、０．０６、０．０７、０．０８、０．０９、０．１、０．２、０．３、０．４、０．５、０．６、０．７、０．８、０．９、０．９５、０．９９、１、または２である。いくつかの実施形態では、グリカンポリマーの調製物が提供され、その平均分岐度は、少なくとも０．０１、０．０５、０．１、０．２、０．３、または少なくとも０．４である。いくつかの実施形態では、グリカンポリマーの調製物が提供され、その平均分岐度は、約０．０１〜０．１、０．０１〜０．２、０．０１〜０．３、０．０１〜０．４、０．０１〜０．５、０．０１〜０．６、または約０．０１〜０．７である。いくつかの実施形態では、グリカンポリマーの調製物が提供され、その平均分岐度は、約０．０５〜０．１、０．０５〜０．２、０．０５〜０．３、０．０５〜０．４、０．０５〜０．５、０．０５〜０．６、または約０．０５〜０．７である。いくつかの実施形態では、グリカンポリマーの調製物が提供され、その平均分岐度は、０ではない。いくつかの実施形態では、グリカンポリマーの調製物が提供され、その平均分岐度は、０．１以上０．４未満でも、０．２以上０．４未満でもない。いくつかの実施形態では、グリカンポリマーの調製物は、直鎖状グリカンを含む。いくつかの実施形態では、グリカンポリマーの調製物は、分岐またはブランチオンブランチ（ｂｒａｎｃｈ−ｏｎ−ｂｒａｎｃｈ）構造を示すグリカンを含む。
【０２０３】
いくつかの実施形態では、グリカンポリマーの調製物が提供され、その平均分岐度（ＤＢ）は、０ではなく、少なくとも０．０１、０．０５、０．１、または少なくとも０．２であるか、あるいは約０．０１〜約０．２または約０．０５〜０．１の範囲である。
【０２０４】
グリカンポリマー調製物の分岐度（ＤＢ）は、当業者に公知の方法、例えば、パーメチル化分析によって決定することができる。これらの方法は一般的に、全酸加水分解および単離モノマーのＧＣ−ＭＳ分析が後続する、グリカンの遊離ヒドロキシル基の化学官能化に依存している。したがって、複数の官能化されていないヒドロキシル基を有するモノマーの画分は、複数の他の単位に結合していたポリマー単位の画分、例えば分岐画分に等しいと解釈することができる。実施例１５は、本明細書において言及されるように、ＤＢを決定するために使用することができる特定のパーメチル化アプローチを記載する。好ましい実施形態では、本明細書に記載のＤＢは、実施例１５のパーメチル化によって決定される。
【０２０５】
グリコシド結合およびグリコシド連結
グリカンポリマーの調製物中に見出される個々のグリカンサブユニット間の連結には、アルファ１−＞２、アルファ１−＞３、アルファ１−＞４、アルファ１−＞５、アルファ１−＞６、アルファ２−＞１、アルファ２−＞３、アルファ２−＞４、アルファ２−＞６、ベータ１−＞２、ベータ１−＞３、ベータ１−＞４、ベータ１−＞５、ベータ１−＞６、ベータ２−＞１、ベータ２−＞３、ベータ２−＞４、およびベータ２−＞６が含まれ得る。
【０２０６】
いくつかの実施形態では、グリカンポリマー調製物は、アルファ連結のみを含む。いくつかの実施形態では、グリカンポリマーは、ベータ連結のみを含む。いくつかの実施形態では、グリカンポリマーは、アルファ連結およびベータ連結の混合物を含む。
【０２０７】
いくつかの実施形態では、調製物中のアルファグリコシド結合：ベータグリコシド結合の比は、約１：１、２：１、３：１、４：１、または５：１である。いくつかの実施形態では、調製物中のベータグリコシド結合：アルファグリコシド結合の比は、約１：１、２：１、３：１、４：１、または５：１である。
【０２０８】
いくつかの実施形態では、調製物中のアルファグリコシド結合：ベータグリコシド結合の比は、約０．１：１、０．２：１、０．３：１、０．４：１、０．５：１、０．６：１、０．７：１、０．８：１、０．９：１、１：１、１．２：１、１．５：１、１．７：１、２：１、２．２：１、２．５：１、２．７：１、３：１、４：１、５：１、６：１、７：１、８：１、９：１、または約１０：１である。
【０２０９】
いくつかの実施形態では、グリカンポリマー調製物のグリカンポリマーは、１−＞２グリコシド結合、１−＞３グリコシド結合、１−＞４グリコシド結合、１−＞５グリコシド結合および１−＞６グリコシド結合からなる群から選択されるアルファグリコシド結合およびベータグリコシド結合の両方を含む。いくつかの実施形態では、グリカンポリマー調製物は、少なくとも２つ、または少なくとも３つの、アルファおよびベータ１−＞２グリコシド結合、アルファおよびベータ１−＞３グリコシド結合、アルファおよびベータ１−＞４グリコシド結合、アルファおよびベータ１−＞５グリコシド結合、ならびに／またはアルファおよびベータ１−＞６グリコシド結合を含む。
【０２１０】
いくつかの実施形態では、グリカン調製物のグリカンポリマーは、実質的にすべてアルファ配置またはベータ配置のグリカンサブユニットを含み、任意選択的に、それぞれ他の配置を約１％、２％、３％、４％、５％、６％、７％、８％、９％、１０％、１１％、１２％、１３％、１４％、１５％、１６％、１７％、１８％、１９％、または２０％含む。
【０２１１】
いくつかの実施形態では、グリカンポリマーの調製物は、アルファグリコシド結合を有する少なくとも１％、２％、３％、４％、５％、６％、７％、８％、９％、１０％、１５％、２０％、２５％、３０％、３５％、４０％、４５％、５０％、５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、９８％、９９％、少なくとも９９．９％、またはさらに１００％のグリカンを含む。いくつかの実施形態では、グリカンポリマーの調製物は、ベータグリコシド結合を有する少なくとも１％、２％、３％、４％、５％、６％、７％、８％、９％、１０％、１５％、２０％、２５％、３０％、３５％、４０％、４５％、５０％、５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、９８％、９９％、少なくとも９９．９％、またはさらに１００％のグリカンを含む。いくつかの実施形態では、グリコシド結合を有する少なくとも１０％、１５％、２０％、２５％、３０％、３５％、４０％、４５％、５０％、５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、または少なくとも８５％のグリカンはアルファグリコシド結合であり、グリコシド結合を有する少なくとも１０％、１５％、２０％、２５％、３０％、３５％、４０％、４５％、５０％、５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、または少なくとも８５％のグリカンはベータグリコシド結合であり、アルファグリコシド結合およびベータグリコシド結合の割合は、１００％を超えない、グリカンポリマーの調製物が提供される。
【０２１２】
いくつかの実施形態では、グリカングリコシド結合の少なくとも１％、２％、３％、４％、５％、６％、７％、８％、９％、１０％、１５％、２０％、２５％、３０％、３５％、４０％、４５％、５０％、５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、９８％、９９％、少なくとも９９．９％、またはさらに１００％は、１−＞２グリコシド結合、１−＞３グリコシド結合、１−＞４グリコシド結合、および１−＞６グリコシド結合のうちの１つ以上である、グリカンポリマーの調製物が提供される。いくつかの実施形態では、グリカングリコシド結合の各々の少なくとも１％、２％、３％、４％、５％、６％、７％、８％、９％、１０％、１５％、少なくとも２０％、または２５％は、１−＞２、１−＞３、１−＞４、および１−＞６グリコシド結合である、グリカンポリマーの調製物が提供される。任意に、グリカンポリマーの調製物は、アルファ２−＞１、アルファ２−＞３、アルファ２−＞４、アルファ２−＞６、ベータ２−＞１、ベータ２−＞３、ベータ２−＞４、およびベータ２−＞６グリコシド結合からなる群から選択されるグリカングリコシド結合の少なくとも１％、２％、３％、４％、５％、６％、７％、８％、９％、１０％、１５％、２０％、２５％、３０％、３５％、４０％、４５％、５０％、５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、または少なくとも８５％をさらに含む。
【０２１３】
いくつかの実施形態では、グリカン調製物のグリカンポリマーは、アルファ１−＞２およびアルファ１−＞３、アルファ１−＞２およびアルファ１−＞４、アルファ１−＞２およびアルファ１−＞６、アルファ１−＞２およびベータ１−＞２、アルファ１−＞２およびベータ１−＞３、アルファ１−＞２およびベータ１−＞４、アルファ１−＞２およびベータ１−＞６、アルファ１−＞３およびアルファ１−＞４、アルファ１−＞３およびアルファ１−＞６、アルファ１−＞３およびベータ１−＞２、アルファ１−＞３およびベータ１−＞３、アルファ１−＞３およびベータ１−＞４、アルファ１−＞３およびベータ１−＞６、アルファ１−＞４およびアルファ１−＞６、アルファ１−＞４およびベータ１−＞２、アルファ１−＞４およびベータ１−＞３、アルファ１−＞４およびベータ１−＞４、アルファ１−＞４およびベータ１−＞６、アルファ１−＞６およびベータ１−＞２、アルファ１−＞６およびベータ１−＞３、アルファ１−＞６およびベータ１−＞４、アルファ１−＞６およびベータ１−＞６、ベータ１−＞２およびベータ１−＞３、ベータ１−＞２およびベータ１−＞４、ベータ１−＞２およびベータ１−＞６、ベータ１−＞３およびベータ１−＞４、ベータ１−＞３およびベータ１−＞６、ならびにベータ１−＞４およびベータ１−＞６からなる群から選択される少なくとも２つのグリコシド結合を含む。
【０２１４】
グリコシド結合（ｂｏｎｄ）および結合（ｌｉｎｋａｇｅ）の分布は、当業者に公知の方法、例えば二次元核磁気共鳴分光法（２Ｄ  ＮＭＲ）によって決定することができる。これらの方法は、一般的に、所与の結合タイプに対して特徴的なピークの曲線下面積（ＡＵＣ）定量に依存する。実施例１５は、本明細書において言及されるように、グリコシド結合（ｂｏｎｄ）および結合（ｌｉｎｋａｇｅ）を決定するために使用することができる特定の２Ｄ  ＮＭＲアプローチを記載する。好ましい実施形態では、グリコシド結合（ｂｏｎｄ）および結合（ｌｉｎｋａｇｅ）は、実施例１５の２Ｄ  ＮＭＲ法を用いて決定される。
【０２１５】
Ｌ型およびＤ型
いくつかの実施形態では、少なくとも１つのグリカンサブユニットがＬ型の糖であるグリカンポリマーの調製物が提供される。いくつかの実施形態では、少なくとも１つのグリカンサブユニットがＤ型の糖であるグリカンの調製物が提供される。いくつかの実施形態では、グリカンサブユニットが天然に存在するか、またはより一般的である（例えば、Ｄ−グルコース、Ｄ−キシロース、Ｌ−アラビノース）Ｌ型またはＤ型の糖であるグリカンの調製物が提供される。
【０２１６】
いくつかの実施形態では、グリカンポリマーの調製物（例えば、オリゴ糖および多糖）は、グリカンサブユニットのＬ型およびＤ型の所望の混合物、例えば、Ｌ型対Ｄ型またはＤ型対Ｌ型が１：１、１：２、１：３、１：４、１：５などの所望の比の混合物を含む。
【０２１７】
いくつかの実施形態では、グリカンポリマーの調製物は、グリカンユニットのＬ型およびＤ型の所望の混合物、例えば、Ｌ型対Ｄ型またはＤ型対Ｌ型が１：１、１：２、１：３、１：４、１：５、１：６、１：７、１：８、１：９、１：１０、１：１２、１：１４、１：１６、１：１８、１：２０、１：２５、１：３０、１：３５、１：４０、１：４５、１：５０、１：５５、１：６０、１：６５、１：７０、１：７５、１：８０、１：８５、１：９０、１：１００、１：１５０などの所望の比の混合物を含む。
【０２１８】
いくつかの実施形態では、グリカンポリマーの調製物は、実質的にすべてＬ型またはＤ型のグリカンサブユニットを有するグリカンを含み、任意選択的に、それぞれ他の型を約１％、２％、３％、４％、５％、６％、７％、８％、９％、１０％、１１％、１２％、１３％、１４％、１５％、１６％、１７％、１８％、１９％、または２０％含む。
【０２１９】
グリカン単位の内容
いくつかの実施形態では、少なくとも１つのグリカンサブユニットが、テトロース、ペントース、ヘキソース、またはヘプトースであるグリカンポリマーの調製物が提供される。任意選択的に、グリカンポリマー調製物のグリカンの形成に関与するグリカンサブユニットは変化する。単糖グリカンサブユニットの例には、グルコース、ガラクトース、およびフルクトースなどのヘキソース、およびキシロースなどのペントースが含まれる。単糖類は、一般に、化学式：Ｃｘ（Ｈ２Ｏ）ｙ（ここで、通常、ｘ≧３である）を有する。単糖類は、それらが含有する炭素原子の数ｘによって分類することができる：例えば、ジオース（２）、トリオース（３）、テトロース（４）、ペントース（５）、ヘキソース（６）およびヘプトース（７）。単糖グリカンサブユニットは、非環式（開鎖）形態で存在し得る。同じ分子グラフを有する開鎖の単糖類は、２つ以上の立体異性体として存在し得る。単糖類はまた、カルボニル基と同じ分子のヒドロキシルのうちの１つとの間で求核付加反応を介して環状形態で存在し得る。反応物は、１個の架橋酸素原子によって閉口している炭素原子の環を形成する。これらの環状形態では、環は、通常、５個の原子（フラノース）または６個の原子（ピラノース）を有する。
【０２２０】
いくつかの実施形態では、グリカンポリマーの調製物は、異なる単糖グリカンサブユニットの所望の混合物、例えば、ジオース（２）、トリオース（３）、テトロース（４）、ペントース（５）、ヘキソース（６）、またはヘプトース（７）の混合物を含む。いくつかの実施形態では、グリカンポリマー調製物のグリカンポリマーは、ペントース（５）およびヘキソース（６）の所望の混合物を含む。
【０２２１】
いくつかの実施形態では、グリカンポリマーの調製物は、２つ、３つ、４つ、または５つの異なるグリカンサブユニットの所望の混合物、例えば、ｉ）グルコース、ガラクトース、アラビノース、マンノース、フルクトース、キシロース、フコース、およびラムノースから選択される単糖類から選択される１つ以上のグリカンサブユニット、ｉｉ）アカルビオシン、ｎ−アセチルラクトサミン、アロラクトース、セロビオース、キトビオース、ガラクトース−アルファ−１，３−ガラクトース、ゲンチオビオース、イソマルト、イソマルトース、イソマルツロース、コージビオース、ラクチトール、ラクトビオン酸、ラクトース、ラクツロース、ラミナリビオース、マルチトール、マルトース、マンノビオース、メリビオース、メリビウロース、ネオヘスペリドース、ニゲロース、ロビノース、ルチノース、サンブビオース、ソホロース、スクラロース、スクロース、スクロース酢酸イソ酪酸エステル、オクタアセチルスクロース、トレハロース、ツラノース、ビシアノース、およびキシロビオースから選択される二糖類から選択される１つ以上のグリカンサブユニット、ｉｉｉ）アカルボース、Ｎ−アセチルエマンノサミン、Ｎ−アセチルムラミン酸、Ｎ−アセチルノイラミン酸、Ｎ−アセチルエタロサミヌロニン酸（ａｃｅｔｙｌｅｔａｌｏｓａｍｉｎｕｒｏｎｉｃ  ａｃｉｄ）、アラビノピラノシル−Ｎ−メチル−Ｎ−ニトロソ尿素、Ｄ−フルクトース−Ｌ−ヒスチジン、Ｎ−グリコリルノイラミン酸、ケトサミン、キダマイシン、マンノサミン、１Ｂ−メチルセレノ−Ｎ−アセチル−Ｄ−ガラクトサミン、ムラミン酸、ムラミルジペプチド、ホスホリボシールアミン、ＰＵＧＮＡｃ、シアリル−Ｌｅｗｉｓ  Ａ、シアリル−Ｌｅｗｉｓ  Ｘ、バリダマイシン、ボグリボース、Ｎ−アセチルガラクトサミン、Ｎ−アセチルグルコミサン、アスパルチルグルコサミン、バシリチオール、ダウノサミン、デソサミン、フルクトサミン、ガラクトサミン、グルコサミン、メグルミン、およびペロサミンから選択されるアミノ糖から選択される１つ以上のグリカンサブユニット、ｉｖ）１−５−アヒドログルシトール、クラジノース、コリトース、２−デオキシ−Ｄ−グルコース、３−デオキシグルカソン、デオキシリボース、ジデオキシヌクレオチド、ジギタロース、フルデオオキシグルコース、サルメントース、およびスルホキノボースから選択されるデオキシ糖から選択される１つ以上のグリカンサブユニット；ｖ）カスタノスペルミン、１−デオキシノジリマイシン、イミノ糖、ミグリトール、ミグルスタット、およびスワインソニンから選択されるイミノ糖から選択される１つ以上のグリカンサブユニット、Ｎ−アセチルノイラミン酸、Ｎ−アセチルタロサムヌロニン酸（ａｃｅｔｙｌｔａｌｏｓａｍｎｕｒｏｎｉｃ  ａｃｉｄ）、アルダル酸、アルドン酸、３−デオキシ−Ｄ−マンノ−オクト−２−ウロソニック酸、グルクロン酸、グルコサミンウロニック酸、グリセリン酸、Ｎ−グリコリルノイラミン酸、イズロン酸、イソサッカリン酸、パンガミン酸、シアル酸、トレオン酸、ウロソニック酸、ウロニック酸、キシロン酸、グルコン酸、アスコルビン酸、ケトデオキシオクツロソニック酸、ガラクツロン酸、ガラクトサミ���ロン酸、マンヌロン酸、マンノサミヌロン酸、酒石酸、粘液酸、糖酸、乳酸、シュウ酸、コハク酸、ヘキサン酸、フマル酸、マレイン酸、酪酸、クエン酸、グルコサミン酸、リンゴ酸、スクシンアミド酸、セバシン酸、およびカプリン酸から選択される糖酸から選択される１つ以上のグリカンサブユニット、ｖｉ）ギ酸、酢酸、プロピオン酸、ブチル酸、イソブチル酸、吉草酸、およびイソ吉草酸から選択される短鎖脂肪酸から選択される１つ以上のグリカンサブユニット、ならびにｖｉｉ）メタノール、エチレングリコール、グリセロール、エリトリトール、トレイトール、アラビトール、リビトール、キシリトール、マンニトール、ソルビトール、ガラクチトール、イジトール、ボレミトール、フシトール、イノシトール、マルトトリイトール、マルトテトライトール、およびポリグリシトールから選択される糖アルコールから選択される１つ以上のグリカンサブユニットの混合物を含む。
【０２２２】
例示的なグリカンは、モノマーが構成する物質の割合を反映する１００の中からの数に従って、単量体の糖成分を表す３文字コードによって記載されている。それ故に、「ｇｌｕ１００」は、１００％のＤ−グルコース（グリカン単位）の入力から生成されるグリカンに属し、「ｇｌｕ５０ｇａｌ５０」は、５０％のＤ−グルコースおよび５０％のＤ−ガラクトース（グリカン単位）の入力から、またはあるいは、ラクトース二量体（グリカン単位）の入力から生成されるグリカンに属するものと見なす。本明細書に使用される場合、ｘｙｌ＝Ｄ−キシロース、ａｒａ＝Ｌ−アラビノース、ｇａｌ＝Ｄ−ガラクトース、ｇｌｕ＝Ｄ−グルコース、ｒｈａ＝Ｌ−ラムノース、ｆｕｃ＝Ｌ−フコース、ｍａｎ＝Ｄ−マンノース、ｓｏｒ＝Ｄ−ソルビトール、ｇｌｙ＝Ｄ−グリセロール、ｎｅｕ＝ＮＡｃ−ノイラミン酸。
【０２２３】
いくつかの実施形態では、グリカンポリマーの調製物は、上のｉ）〜ｖｉｉ）から選択される１つのグリカン単位Ａを含み、グリカン単位Ａは、１００％のグリカン単位の入力を含む。例えば、いくつかの実施形態では、グリカンポリマー調製物は、ホモグリカンｘｙｌ１００、ｒｈａ１００、ａｒａ１００、ｇａｌ１００、ｇｌｕ１００、およびｍａｎ１００から選択される。いくつかの実施形態では、グリカン調製物は、ホモグリカンｆｕｃ１００およびｆｒｕ１００から選択される。
【０２２４】
いくつかの実施形態では、グリカンポリマーの調製物は、上のｉ）〜ｖｉｉ）から独立して選択される２つのグリカン単位ＡおよびＢの混合物を含み、ＡおよびＢは、ｉ）〜ｖｉｉ）の同じかまたは異なる群から選択され得、かつＡおよびＢは、任意の所望の比率（例えば、１００％を超えない、１〜９９％のＡおよび９９〜１％のＢの範囲）で選択され得る。
【０２２５】
例えば、いくつかの実施形態では、グリカンポリマー調製物は、ヘテログリカンａｒａ５０ｇａｌ５０、ａｒａ５０ｇａｌ５０、ｘｙｌ７５ｇａｌ２５、ａｒａ８０ｘｙｌ２０、ａｒａ６０ｘｙｌ４０、ａｒａ５０ｘｙｌ５０、ｇｌｕ８０ｍａｎ２０、ｇｌｕ６０ｍａｎ４０、ｍａｎ８０ｇｌｕ２０、ｍａｎ６０ｇｌｕ４０、ｘｙｌ７５ａｒａ２５、ｇａｌ７５ｘｙｌ２５、Ｍａｎ８０ｇａｌ２０、ｇａｌ７５ｘｙｌ２５、Ｍａｎ６６ｇａｌ３３、Ｍａｎ７５ｇａｌ２５、ｇｌｕ８０ｇａｌ２０、ｇｌｕ６０ｇａｌ４０、ｇｌｕ４０ｇａｌ６０、ｇｌｕ２０ｇａｌ８０、ｇａｌ８０ｍａｎ２０、ｇａｌ６０ｍａｎ４０、ｇａｌ４０ｍａｎ６０、ｇｌｕ８０ｘｙｌ２０、ｇｌｕ６０ｘｙｌ４０、ｇｌｕ４０ｘｙｌ６０、ｇｌｕ２０ｘｙｌ８０、ｇｌｕ８０ａｒａ２０、ｇｌｕ６０ａｒａ４０、ｇｌｕ４０ａｒａ６０、ｇｌｕ２０ａｒａ８０、ｇａｌ８０ｘｙｌ２０、ｇａｌ６０ｘｙｌ４０、ｇａｌ４０ｘｙｌ６０、ｇａｌ２０ｘｙｌ８０、ｇａｌ８０ａｒａ２０、ｇａｌ６０ａｒａ４０、ｇａｌ４０ａｒａ６０、ｇａｌ２０ａｒａ８０、ｍａｎ８０ｘｙｌ２０、ｍａｎ６０ｘｙｌ４０、ｍａｎ４０ｘｙｌ６０、ｍａｎ２０ｘｙｌ８０、ｍａｎ８０ａｒａ２０、ｍａｎ６０ａｒａ４０、ｍａｎ４０ａｒａ６０、ｍａｎ２０ａｒａ８０、ｘｙｌ８０ａｒａ２０、ｘｙｌ６０ａｒａ４０、ｇｌｕ５０ｇａｌ５０、およびｍａｎ６２ｇｌｕ３８から選択される。
【０２２６】
いくつかの実施形態では、グリカンポリマーの調製物は、上のｉ）〜ｖｉｉ）から独立して選択される３つのグリカン単位Ａ、Ｂ、およびＣの混合物を含み、Ａ、Ｂ、およびＣは、ｉ）〜ｖｉｉ）の同じまたは異なる群から選択され得、Ａ、Ｂ、およびＣは、任意の所望の比率（例えば、１００％を超えない、１〜９９％のＡ、１〜９９％のＢ、および１〜９９％のＣの範囲）で選択され得る。
【０２２７】
例えば、いくつかの実施形態では、グリカンポリマー調製物は、ヘテログリカンｘｙｌ７５ｇｌｕ１２ｇａｌ１２、ｘｙｌ３３ｇｌｕ３３ｇａｌ３３、ｘｙｌ７５ｇｌｕ１２ｇａｌ１２、ｇｌｕ３３ｇａｌ３３ｆｕｃ３３、ｇｌｕ３３ｇａｌ３３ｎｍａｎ３３、ｇｌｕ３３ｇａｌ３３ｘｙｌ３３、ｇｌｕ３３ｇａｌ３３ａｒａ３３、ｇａｌ３３ｍａｎ３３ｘｙｌ３３、ｇａｌ３３ｍａｎ３３ａｒａ３３、ｍａｎ５２ｇｌｕ２９ｇａｌ１９、Ｇｌｕ３３Ｍａｎ３３Ｘｙｌ３３、Ｇｌｕ３３Ｍａｎ３３Ａｒａ３３、Ｇｌｕ３３Ｘｙｌ３３Ａｒａ３３、Ｇａｌ３３Ｍａｎ３３Ｘｙｌ３３、Ｇａｌ３３Ｍａｎ３３Ａｒａ３３、Ｇａｌ３３Ｘｙｌ３３Ａｒａ３３、Ｍａｎ３３Ｘｙｌ３３Ａｒａ３３、Ｇｌｕ９０Ｇａｌ５Ｍａｎ５、Ｇｌｕ８０Ｇａｌ１０Ｍａｎ１０、Ｇｌｕ６０Ｇａｌ２０Ｍａｎ２０、Ｇｌｕ４０Ｇａｌ３０Ｍａｎ３０、Ｇｌｕ２０Ｇａｌ４０Ｍａｎ４０、Ｇｌｕ１０Ｇａｌ４５Ｍａｎ４５、Ｇｌｕ５Ｇａｌ９０Ｍａｎ５、Ｇｌｕ１０Ｇａｌ８０Ｍａｎ１０、Ｇｌｕ２０Ｇａｌ６０Ｍａｎ２０、Ｇｌｕ３０Ｇａｌ４０Ｍａｎ３０、Ｇｌｕ４０Ｇａｌ２０Ｍａｎ４０、Ｇｌｕ４５Ｇａｌ１０Ｍａｎ４５、Ｇｌｕ５Ｇａｌ５Ｍａｎ９０、Ｇｌｕ１０Ｇａｌ１０Ｍａｎ８０、Ｇｌｕ２０Ｇａｌ２０Ｍａｎ６０、Ｇｌｕ３０Ｇａｌ３０Ｍａｎ４０、Ｇｌｕ４０Ｇａｌ４０Ｍａｎ２０、およびＧｌｕ４５Ｇａｌ４５Ｍａｎ１０から選択される。
【０２２８】
いくつかの実施形態では、グリカンポリマーの調製物は、上のｉ）〜ｖｉｉ）から独立して選択される４つのグリカン単位Ａ、Ｂ、Ｃ、およびＤの混合物を含み、Ａ、Ｂ、Ｃ、およびＤは、ｉ）〜ｖｉｉ）の同じまたは異なる群から選択され得、Ａ、Ｂ、Ｃ、およびＤは、任意の所望の比率（例えば、１００％を超えない、１〜９９％のＡ、１〜９９％のＢ、１〜９９％のＣ、および１〜９９％のＤの範囲）で選択され得る。
【０２２９】
いくつかの実施形態では、グリカンポリマーの調製物は、上のｉ）〜ｖｉｉ）から独立して選択される５つのグリカン単位Ａ、Ｂ、Ｃ、Ｄ、およびＥの混合物を含み、Ａ、Ｂ、Ｃ、Ｄ、およびＥは、ｉ）〜ｖｉｉ）の同じまたは異なる群から選択され得、Ａ、Ｂ、Ｃ、Ｄ、およびＥは、任意の所望の比率（例えば、１００％を超えない、１〜９９％のＡ、１〜９９％のＢ、１〜９９％のＣ、１〜９９％のＤ、および１〜９９％のＥの範囲）で選択され得る。
【０２３０】
いくつかの実施形態では、少なくとも１つのグリカンサブユニットが、グルコース、ガラクトース、アラビノース、マンノース、フルクトース、キシロース、フコース、およびラムノースからなる群から選択される、グリカンポリマーの調製物が提供される。
【０２３１】
いくつかの実施形態では、グリカンポリマーの調製物は、例えば、グルコースおよびガラクトース、グルコースおよびアラビノース、グルコースおよびマンノース、グルコースおよびフルクトース、グルコースおよびキシロース、グルコースおよびフコース、グルコースおよびラムノース、ガラクトースおよびアラビノース、ガラクトースおよびマンノース、ガラクトースおよびフルクトース、ガラクトースおよびキシロース、ガラクトースおよびフコース、ならびにガラクトースおよびラムノース、アラビノースおよびマンノース、アラビノースおよびフルクトース、アラビノースおよびキシロース、アラビノースおよびフコース、ならびにアラビノースおよびラムノース、マンノースおよびフルクトース、マンノースおよびキシロース、マンノースおよびフコース、ならびにマンノースおよびラムノース、フルクトースおよびキシロース、フルクトースおよびフコース、ならびにフルクトースおよびラムノース、キシロースおよびフコース、キシロースおよびラムノース、ならびにフコースおよびラムノースなどの混合物のような、２つの異なる単糖グリカンサブユニットの所望の混合物を、例えば、１：１、１：２、１：３、１：４、または１：５の比率またはそれらの逆比率で、または、１：１、１：２、１：３、１：４、１：５、１：６、１：７、１：８、１：９、１：１０、１：１２、１：１４、１：１６、１：１８、１：２０、１：２５、１：３０、１：３５、１：４０、１：４５、１：５０、１：５５、１：６０、１：６５、１：７０、１：７５、１：８０、１：８５、１：９０、または１：１００の比率またはそれらの逆比率で含む。
【０２３２】
いくつかの実施形態では、グリカンポリマーの調製物は、３つの異なる単糖グリカンサブユニットの所望の混合物、例えば、グルコース含有グリカン調製物については、グルコース、ガラクトース、およびアラビノース；グルコース、ガラクトース、およびマンノース；グルコース、ガラクトース、およびフルクトース；グルコース、ガラクトース、およびキシロース；グルコース、ガラクトース、およびフコース、グルコース、ガラクトース、およびラムノース；グルコース、アラビノース、およびマンノース；グルコース、アラビノース、およびフルクトース；グルコース、アラビノース、およびキシロース；グルコース、アラビノース、およびフコース；グルコース、アラビノース、およびラムノース；グルコース、マンノース、およびフルクトース；グルコース、マンノース、およびキシロース；グルコース、マンノース、およびフコース；グルコース、マンノース  ラムノース；グルコース、フルクトース、およびキシロース；グルコース、フルクトース、およびフコース；グルコース、フルクトース、およびラムノース；グルコース、フコース、およびラムノースなどの混合物等を、例えば、１：１：１、１：２：１、１：３：１、１：４：１、１：５：１、１：１：２、１：２：２、１：３：２、１：４：２、１：１：３、１：２：３、１：３：３、１：１：４、１：２：４、１：１：５、１：２：５等の比率、または、１：１：１、１：２：１、１：３：１、１：４：１、１：５：１、１：６：１、１：７：１、１：８：１、１：９：１、１：１０：１、１：１２：１、１：１４：１、１：１６：１、１：１８：１、１：２０：１、１：１：２、１：２：２、１：３：２、１：４：２、１：５：２、１：６：２、１：７：２、１：８：２、１：９：２、１：１０：２、１：１：３、１：２：３、１：３：３、１：４：３、１：５：３、１：６：３、１：７：３、１：８：３、１：９：３、１：１０：３、１：１：４、１：２：４、１：３：４、１：４：４、１：５：４、１：６：４、１：７：４、１：８：４、１：９：４、１：１０：４、１：１：５、１：２：５、１：３：５、１：４：５、１：５：５、１：６：５、１：７：５、１：８：５、１：９：５、１：１０：５等の比率で含む。
【０２３３】
いくつかの実施形態では、グリカンポリマーの調製物は、Ｎ−アセチルガラクトサミンまたはＮ−アセチルグルコサミンを含まない。いくつかの実施形態では、グリカンの調製物は、シアル酸を含まない。いくつかの実施形態では、グリカンポリマーの調製物は、脂質および脂肪酸を含まない。いくつかの実施形態では、グリカンポリマーの調製物は、アミノ酸を含まない。
【０２３４】
フラノ―ス：ピラノース
いくつかの実施形態では、少なくとも１つのグリカンサブユニットがフラノ―ス糖であるグリカンポリマーの調製物が提供される。いくつかの実施形態では、少なくとも１つのグリカンサブユニットがピラノース糖であるグリカンの調製物が提供される。いくつかの実施形態では、グリカンポリマーは、フラノ―ス糖およびピラノース糖の混合物を含む。いくつかの実施形態では、調製物中のフラノース糖：ピラノース糖の比率は、約０．１：１、０．２：１、０．３：１、０．４：１、０．５：１、０．６：１、０．７：１、０．８：１、０．９：１、１：１、１．２：１、１．５：１、１．７：１、２：１、２．２：１、２．５：１、２．７：１、３：１、４：１、５：１、もしくは約６：１であり、または調製物中のフラノース糖：ピラノース糖の比率は、約７：１、８：１、９：１、もしくは約１０：１である。
【０２３５】
いくつかの実施形態では、グリカンポリマーの調製物は、実質的にすべてフラノース糖またはピラノース糖を含み、任意選択的に、それぞれ他の糖を約１％、２％、３％、４％、５％、６％、７％、８％、９％、１０％、１１％、１２％、１３％、１４％、１５％、１６％、１７％、１８％、１９％、または２０％含む。
【０２３６】
いくつかの実施形態では、グリカンポリマーの調製物は、実質的にすべてピラノース糖を含み、調製物中のフラノース型のグリカン単位は約０．１％、０２％、０．５％、１％、２％、３％、４％未満、または５％未満である。いくつかの実施形態では、調製物中の単量体グリカン単位の３％、２％未満、または１％未満が、フラノース型である。
【０２３７】
塩
いくつかの実施形態では、グリカンポリマーの調製物は、例えば、塩酸塩、ヨウ化水素酸塩、臭化水素酸塩、リン酸塩、硫酸塩、メタンスルファート、酢酸塩、ギ酸塩、酒石酸塩、リンゴ酸塩、クエン酸塩、コハク酸塩、乳酸塩、グルコン酸塩、ピルビン酸塩、フマル酸塩、プロピオン酸塩、アスパラギン酸塩、グルタミン酸塩、安息香酸塩など塩の形態（例えば、薬学的に許容される塩の形態）で存在する１つのグリカンサブユニットまたは複数のグリカンサブユニットを含む。
【０２３８】
誘導体化
必要に応じて、グリカンの単糖類またはオリゴ糖グリカンサブユニットは、さらに置換または誘導体化され、例えば、ヒドロキシル基は、エーテル化またはエステル化され得る。例えば、グリカン（例えば、オリゴまたは多糖類）は、修飾サッカリド単位、例えば、ヒドロキシル基が除去される２’−デオキシリボース、ヒドロキシル基がフッ素と置換される２’−フルオロリボース、またはＮ−アセチルグルコサミン、グルコース（例えば、２’−フルオロリボース、デオキシリボース、およびヘキソース）の窒素含有形態を含有し得る。置換度（ＤＳ、１グリコシル単位当たりのヒドロキシル基の平均数）は、１、２、もしくは３、または別の好適なＤＳであり得る。いくつかの実施形態では、１％、２％、３％、４％、５％、６％、７％、８％、９％、１０％、１１％、１２％、１３％、１４％、１５％、１６％、１７％、１８％、１９％、２０％、２５％、３０％、３５％、４０％、４５％、５０％、５５％、６０％、６５％、７０％、８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％のグリカンサブユニットが、置換または誘導体化される。いくつかの実施形態では、置換度は、例えば、ある特定の割合では誘導体化されず、１のＤＳを示し、２のＤＳを示し、３のＤＳを示す、サブユニット間で変動する。任意の望ましい混合物を生成することができ、例えば、０〜９９％のサブユニットは、誘導体化されず、０〜９９％のサブユニットは、１のＤＳを示し、０〜９９％のサブユニットは、２のＤＳを示し、０〜９９％のサブユニットは、３のＤＳを示し、合計で１００％になる。置換度は、グリコシル部分に添加される置換基（モル置換（ＭＳ））のモルの平均数を調整することによって制御され得る。グリカンのオリゴ糖または多糖鎖の長さに沿った置換基の分布は、反応条件、試薬のタイプ、および置換の範囲を調整することによって制御され得る。いくつかの実施形態では、単量体のサブユニットは、酢酸エステル、硫酸半エステル、リン酸エステル、またはピルビル環状アセタール基のうちの１つ以上と置換される。
【０２３９】
溶解度
いくつかの実施形態では、調製物中のグリカンポリマーは、高溶解性である。いくつかの実施形態では、グリカンポリマー調製物は、２３℃で明らかな固化または結晶化を行わずに（最終溶解限度）、少なくとも５５Ｂｒｉｘ、６５Ｂｒｉｘ、６０Ｂｒｉｘ、６５Ｂｒｉｘ、７０Ｂｒｉｘ、７５Ｂｒｉｘ、８０Ｂｒｉｘ、または少なくとも８５Ｂｒｉｘまで濃縮され得る。いくつかの実施形態では、グリカンポリマー調製物は、２３℃で明らかな固化または結晶化を行わずに（最終溶解限度）、少なくとも約０．５ｇ／ｍｌ、１ｇ／ｍｌ、１．５ｇ／ｍｌ、２ｇ／ｍｌ、２．５ｇ／ｍｌ、３ｇ／ｍｌ、３．５ｇ／ｍｌ、または少なくとも４ｇ／ｍｌまで濃縮され得る。
【０２４０】
いくつかの実施形態では、グリカンポリマーの調製物（例えばオリゴ糖）は、分岐しており、例えば、少なくとも０．０１、０．０５、または０．１の平均ＤＢを有し、かつ、２３℃で少なくとも約７０Ｂｒｉｘ、７５Ｂｒｉｘ、８０Ｂｒｉｘ、または少なくとも約８５Ｂｒｉｘの水中に最終溶解限度を有するか、または少なくとも約１ｇ／ｍｌ、２ｇ／ｍｌ、または少なくとも約３ｇ／ｍｌである。
【０２４１】
いくつかの実施形態では、グリカンポリマーの調製物は、脱イオン水中、または好適な緩衝液中、例えば、リン酸緩衝生理食塩水、ｐＨ７．４、または類似の生理学的ｐＨ中、２０℃で、少なくとも０．００１ｇ／Ｌ、０．００５ｇ／Ｌ、０．０１ｇ／Ｌ、０．０５ｇ／Ｌ、０．１ｇ／Ｌ、０．２ｇ／Ｌ、０．３ｇ／Ｌ、０．４ｇ／Ｌ、０．５ｇ／Ｌ、０．６ｇ／Ｌ、０．７ｇ／Ｌ、０．８ｇ／Ｌ、０．９ｇ／Ｌ、１ｇ／Ｌ、５ｇ／Ｌ、１０ｇ／Ｌ、２０ｇ／Ｌ、３０ｇ／Ｌ、４０ｇ／Ｌ、５０ｇ／Ｌ、１００ｇ／Ｌ、２００ｇ／Ｌ、３００ｇ／Ｌ、４００ｇ／Ｌ、５００ｇ／Ｌ、６００ｇ／Ｌ、７００ｇ／Ｌ、８００ｇ／Ｌ、９００ｇ／Ｌ、１０００ｇ／Ｌの最終溶解限度を有する。いくつかの実施形態では、グリカンポリマーの調製物は、５０％超、６０％超、７０％超、８０％超、９０％超、９５％超、９６％超、９７％超、９８％超、９９％超、または９９．５％を超える溶解性があり、脱イオン水中、または好適な緩衝液中、例えば、リン酸緩衝生理食塩水、ｐＨ７．４、または類似の生理学的ｐＨ中、２０℃で、０．００１ｇ／Ｌ、０．００５ｇ／Ｌ、０．０１ｇ／Ｌ、０．０５ｇ／Ｌ、０．１ｇ／Ｌ、０．２ｇ／Ｌ、０．３ｇ／Ｌ、０．４ｇ／Ｌ、０．５ｇ／Ｌ、０．６ｇ／Ｌ、０．７ｇ／Ｌ、０．８ｇ／Ｌ、０．９ｇ／Ｌ、１ｇ／Ｌ、５ｇ／Ｌ、１０ｇ／Ｌ、２０ｇ／Ｌ、３０ｇ／Ｌ、４０ｇ／Ｌ、５０ｇ／Ｌ、１００ｇ／Ｌ、２００ｇ／Ｌ、３００ｇ／Ｌ、４００ｇ／Ｌ、５００ｇ／Ｌ、６００ｇ／Ｌ、７００ｇ／Ｌ、８００ｇ／Ｌ、９００ｇ／Ｌ、１０００ｇ／Ｌを超える濃度で観察される沈殿物を有しない。
【０２４２】
甘味度
いくつかの実施形態では、グリカンポリマーの調製物は、所望の甘味度を有する。例えば、スクロース（テーブルシュガー）は、プロトタイプの甘味物質である。溶液中のスクロースは、１の甘味知覚評価を有し、他の物質は、これと比較して評価される（例えば、フルクトースは、スクロースの甘味の１．７倍で評価される）。いくつかの実施形態では、グリカンポリマーの調製物の甘味は、スクロースと比較して、０．１〜５００，０００の範囲に及ぶ。いくつかの実施形態では、相対的甘味は、スクロースと比較して、０．１、０．２、０．３、０．４、０．５、０．６、０．７、０．８、０．９、１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２５、３０、３５、４０、４５、５０、５５、６０、６５、７０、８０、９０、１００、１５０、２００、２５０、３００、３５０、４００、４５０、５００、５５０、６００、６５０、７００、７５０、８００、８５０、９００、９５０、１０００、２０００、３０００、４０００、５０００、６０００、７０００、８０００、９０００、１００００、２５０００、５００００、７５０００、１０００００、１５００００、２０００００、２５００００、３０００００、３５００００、４００００、４５００００、５０００００、または５００，０００超である（スクロースが１と得点される）。いくつかの実施形態では、グリカンポリマーの調製物は、軽度に甘さ、または甘さと苦味の両方がある。
【０２４３】
いくつかの実施形態では、グリカンポリマーの調製物、例えば、実質的に、ＤＰ２＋またはＤＰ３＋である調製物（例えば、ＤＰ２＋またはＤＰ３＋の少なくとも８０％、９０％、または少なくとも９５％、または分画化された調製物）は、実質的に、甘さとして感知できず、相対的な甘味は、スクロースと比較して、約０、０．０００１、０．００１、０．００５、０．０１、０．０５、０．１、０．２、０．３、０．４、０．５、０．６、０．７または約０．８である（スクロースが１と得点される）。
【０２４４】
発酵性
いくつかの実施形態では、本明細書に開示されるグリカンポリマー調製物は、それらの発酵性を評価するためにスクリーニングされる。グリカンポリマーの発酵性は、調製物のグリカン種における加水分解性グリコシド結合の数または表現の関数である。いくつかの実施形態では、発酵性は、本明細書に記載のグリコシダーゼ酵素またはグリコシダーゼ酵素分子を用いて試験される。本明細書に記載の方法によって、例えばグリコシダーゼ酵素分子を利用することによって、産生されたグリカンポリマーは、グリコシダーゼ酵素分子に密接に関連している（例えば、高度な関連配列相同性を共有する、グリコシダーゼ酵素分子がグリコシダーゼ酵素の誘導体である、同じ起源を共有する（例えば、微生物起源、同じグリコシド官能基を共有する、グリコシドヒドロラーゼまたはグリコシドトランスフェラーゼＣＡＺｙファミリーのメンバーである、など）グリコシダーゼ酵素（例えば、ヒトの腸内微生物のもの）のための基質であると考えられる。
【０２４５】
いくつかの実施形態では、グリカンポリマー調製物の発酵性の程度は、３０分以下、２０分以下、１５分以下、１０分以下、５分以下、４分以下、３分以下、２分以下、または１分以下である。いくつかの実施形態では、グリカンポリマー調製物の消化率は、３０分以上、４５分以上、１時間以上、２時間以上、３時間以上、４時間以上、５時間以上、または１０時間以上であり、調製物のグリカンの５％、１０％、１５％、２０％、２５％、３０％、３５％、４０％、４５％、５０％、５５％、６０％、７０％、８０％、９０％、９５％、９７％、９９％が発酵され、例えば、分解され、その結果、調製物のグリカンポリマーは、標準的な方法（例えば、サイズ排除クロマトグラフィー）による平均ＤＰの減少（例えば、ＤＰ＝５からＤＰ＝４）、および／または小分子量画分（例えば、モノマー、ダイマー、トリマー）の増加（または減少）を示す。いくつかの実施形態では、グリカンポリマー調製物のグリカンポリマーは、哺乳動物酵素（例えば、アミラーゼ）によって加水分解性がある１％未満、２％、３％、４％、５％、６％、７％、８％、９％、１０％、１２％、１４％、１６％、１８％、２０％、３０％、４０％、または５０％未満の結合を含む。
【０２４６】
適当なアッセイは、（例えば、ベンチマークのグリカンに対する）比較発酵性を評価するために、または絶対消化率を評価するために使用することができる。
【０２４７】
グリカンポリマーの同定および分析
必要に応じて、グリカンポリマー調製物を特徴付けることができる。例えば、モノマー構築ブロック（例えば、単糖類またはグリカンサブユニットの組成物）、側鎖のアノマー配置、置換基の存在および位置、重合度／分子量、および結合パターンは、当該技術分野において公知の標準的な方法、例えば、メチル化分析、還元開裂、加水分解、ＧＣ−ＭＳ（ガスクロマトグラフィー質量分析法）、ＭＡＬＤＩ−ＭＳ（マトリックス支援レーザー脱離／イオン化質量分析法）、ＥＳＩ−ＭＳ（エレクトロスプレイイオン化質量分析法）、ＨＰＬＣ（紫外線または屈折率検出を有する高速液体クロマトグラフィー）、ＨＰＡＥＣ−ＰＡＤ（パルスアンペロメトリー検出を有する高性能陰イオン性交換クロマトグラフィー）、ＣＥ（キャピラリー電気泳動）、ＩＲ（赤外線）／ラマン分光法、およびＮＭＲ（核磁気共鳴）分光法技術等によって特定され得る。結晶稠度のポリマーについては、結晶構造は、例えば、固体状態のＮＭＲ、ＦＴ−ＩＲ（フーリエ変換正規外線分光法）、およびＷＡＸＳ（広角Ｘ線散乱）を用いて溶解され得る。ＤＰ、ＤＰの分布、および多分散性は、例えば、粘度測定およびＳＥＣ（ＳＥＣ−ＨＰＬＣ、高性能サイズ排除クロマトグラフィー）によって決定され得る。異種基、末端基、および置換基は、例えば、標識化を有するＳＥＣ、水性分析、ＭＡＬＤＩ−ＭＳ、ＦＴ−ＩＲ、およびＮＭＲを用いて決定され得る。グリカンのモノマー成分を同定するために、例えば、酸触媒加水分解、ＨＰＬＣ（高速液体クロマトグラフィー）またはＧＬＣ（ガス−液体クロマトグラフィー）（アルジトールアセテートへの変換後）等の方法が使用され得る。グリカン中に存在する結合を決定するために、一例では、多糖は、ＤＭＳＯ中のヨウ化メチルおよび強塩基でメチル化され、加水分解が行われ、部分的にメチル化されたアルジトールへの還元が達成され、メチル化されたアルジトールアセテートへのアセチル化が行われ、分析は、ＧＬＣ／ＭＳ（質量分析法に加えてガス−液体クロマトグラフィー）によって行われる。いくつかの実施形態では、多糖配列を決定するために、酸または酵素を用いて、部分的な脱重合が行われ、構造を決定する。多糖の可能な構造は、加水分解性オリゴマーの構造と比較され、可能な構造のうちの１つがオリゴマーを産生し得ることが決定される。アノマー構造を同定するために、一例では、無傷の多糖またはオリゴ糖の調製物は、酵素的分析に供され、例えば、それらを、例えば、β−ガラクトシダーゼまたはα−グルコシダーゼ等の特定の種類の結合に特異的である酵素と接触させ、ＮＭＲは生成物を分析するために使用され得る。
【０２４８】
例えば、グリカンポリマー調製物の分布（または平均）重合度（ＤＰ）は、例えば、１０〜１００ｍｇ／ｍＬの濃度を有する試料を、例えば、Ｇｏｍｅｚら（Ｐｕｒｉｆｉｃａｔｉｏｎ，Ｃｈａｒａｃｔｅｒｉｚａｔｉｏｎ，ａｎｄ  Ｐｒｅｂｉｏｔｉｃ  Ｐｒｏｐｅｒｔｉｅｓ  ｏｆ  Ｐｅｃｔｉｃ  Ｏｌｉｇｏｓａｃｃｈａｒｉｄｅｓ  ｆｒｏｍ  Ｏｒａｎｇｅ  Ｐｅｅｌ  Ｗａｓｔｅｓ，Ｊ  Ａｇｒｉｃ  Ｆｏｏｄ  Ｃｈｅｍ，２０１４，６２：９７６９）において記載される、７．８×３００ｍｍ  ＢｉｏＲａｄ  Ａｍｉｎｅｘ  ＨＰＸ−４２Ａカラム（または類似物）およびＲＩ検出器が装備されているＡｇｉｌｅｎｔ  １２６０  ＢｉｏＰｕｒｅ  ＨＰＬＣ（または類似物）に注入することによって測定され得る。あるいは、濃度を有する試料は、例えば、Ｈｏｌｃｋら（Ｆｅｒｕｌｏｙｌａｔｅｄ  ａｎｄ  ｎｏｎｆｅｒｕｌｏｙｌａｔｅｄ  ａｒａｂｉｎｏ−ｏｌｉｇｏｓａｃｃｈａｒｉｄｅｓ  ｆｒｏｍ  ｓｕｇａｒ  ｂｅｅｔ  ｐｅｃｔｉｎ  ｓｅｌｅｃｔｉｖｅｌｙ  ｓｔｉｍｕｌａｔｅ  ｔｈｅ  ｇｒｏｗｔｈ  ｏｆ  ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｓｐｐ．ｉｎ  ｈｕｍａｎ  ｆｅｃａｌ  ｉｎ  ｖｉｔｒｏ  ｆｅｒｍｅｎｔａｔｉｏｎｓ，Ｊｏｕｒｎａｌ  ｏｆ  Ａｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌ  ａｎｄ  Ｆｏｏｄ  Ｃｈｅｍｉｓｔｒｙ，２０１１，５９（１２），６５１１−６５１９）において記載される、４×２５０ｍｍ  Ｄｉｏｎｅｘ  ＣａｒｂｏＰａｃ  ＰＡ１カラム（または類似物）およびＰＡＤ検出器が装備されたＤｉｏｎｅｘ  ＩＣＳ５０００  ＨＰＬＣ（または類似物）に注入され得る。オリゴマーの標準溶液と比較して得られるスペクトルを積分すると、平均ＤＰの決定が可能となる。
【０２４９】
分子量の分布は、例えば、ＭＡＬＤＩ質量分析法によって測定することができる。オリゴ糖濃度は、モノマーとオリゴマーとの間の屈折の差を考慮するために標準化曲線に対して最終値を調節して、Ｍｅｔｔｌｅｒ−Ｔｏｌｅｄｏの糖用屈折計（または類似品）を用いて測定することができる。
【０２５０】
グリコシド位置化学の分布は、例えば、標準パルス配列およびＢｒｕｋｅｒ  ５００ＭＨｚ分光計を用いて、ＣＯＳＹ、ＨＭＢＣ、ＨＳＱＣ、ＤＥＰＴ、およびＴＯＣＳＹ分析を含む、様々な２Ｄ−ＮＭＲ技術によって特徴付けることができる。ピークは、既知の位置化学を有する天然に存在する多糖のスペクトルとの相関によって割り当てることができる。
【０２５１】
オリゴマーのモノマー組成物は、例えば、既知量のオリゴマーを高温で強酸に溶解し、全加水分解が生じるのに十分な時間を与える完全加水分解法によって測定され得る。次いで、個々のモノマーの濃度は、Ｈｏｌｃｋ  ｅｔ  ａｌ．に記載のように相対存在度測定を達成するために、本明細書に記載され、当該技術分野において公知のＨＰＬＣまたはＧＣ法によって測定され得る。絶対量は、臨界シグナルのうちのいずれかとの重複を阻止するために選択された公知の量の検出器に活性基準でＨＰＬＣ試料をスパイクすることによって測定され得る。
【０２５２】
任意の所与の集団における分岐度は、例えば、Ｈａｋｏｍｏｒｉ（Ｊ．Ｂｉｏｃｈｅｍ．（Ｔｏｋｙｏ），１９６４，５５，２０５）によって確立されたメチル化分析法によって測定され得る。これらのデータにより、潜在的反復単位の同定は、全加水分解、平均ＤＰ、およびメチル化分析からのデータを組み合わせ、ＤＥＰＴ  ＮＭＲスペクトルに対してそれらを比較することによって構築され得る。これらのデータに対するアノマー炭素シグナル数の相関は、例えば、Ｈａｒｄｉｎｇら（Ｃａｒｂｏｈｙｄｒ．Ｒｅｓ．２００５，３４０，１１０７）に実証されるように、規則的な反復単位が、収集されたデータを満たすために必要であるかどうかを示す。
【０２５３】
集団におけるｎの重合度（ＤＰ）（本明細書では、ＤＰ（ｎ）として示される）を有する種のモル率は、例えば、屈折率（ＲＩ）検出器を備えたＡｇｉｌｅｎｔ  １２６０  ＢｉｏＩｎｅｒｔシリーズの装置、および移動相として水を用いた当業者によく知られている様々なカラム上の高速液体クロマトグラフィー（ＨＰＬＣ）によって決定される。カラムは、対象となる種を最も単離する、ＨＩＬＩＣ、金属配位、および水性のサイズ排除クロマトグラフィーが挙げられるが、これらに限定されない、化学的性質から選択される。ＤＰ（ｎ）のモル％は、式：
％ＤＰ（ｎ）＝１００＊ＡＵＣ［ＤＰ（ｎ）］／ＡＵＣ［ＤＰ（合計）］
（式中、ＡＵＣは、既知の標準物に対する較正によって決定される、目的の種に対する曲線下面積として定義される。）によって決定され、グリコシド結合異性体のモル率（％アルファおよび％ベータ）は、当業者によく知られている様々な２Ｄ技術を用いた核磁気共鳴（ＮＭＲ）分光法によって決定される。アルファ異性体およびベータ異性体は、例えば、ＮＭＲスペクトルにおけるそれらの異なるシフトによって区別され、モル率は、次式で決定され：
グリコシド結合の％（グリコシド異性体ｎ）＝１００＊ＡＵＣ［シフト（異性体ｎ）］／ＡＵＣ［シフト（異性体アルファ＋異性体ベータ）］
（式中、ＡＵＣは、所望の異性体ｎを表すことが知られている特定のシフト値の濃度曲線下面積として定義される。）、
位置化学異性体のモル百分率は、次式を用いた類似の様式で決定される：
位置異性体の％（位置異性体ｎ）＝１００＊ＡＵＣ［シフト（位置異性体ｎ）］／ＡＵＣ［シフト（全位置異性体）］。
【０２５４】
オリゴマー集団を作製するモノマー糖の相対的割合は、例えば、オリゴマー試料の酸性消化の合計、続いて、アルジトールアセテートへの変換、続いて、公知の基準のＧＣに対して比較される得られたモノマー溶液のガスクロマトグラフ（ＧＣ）分析によって決定される。モノマー（ｎ）（ｎは任意の糖であり得る）のモル百分率は、次式によって決定される：
％（糖ｎ）＝１００＊ＡＵＣ［糖ｎ］／ＡＵＣ［全モノマー糖の合計］。
【０２５５】
いくつかの実施形態では、グリカンポリマーの調製物の溶解度は、例えば、電荷、構造（例えば、ＤＰ、分岐度）の選択、および／またはグリカン単位の誘導体化によって調節され得る。
【０２５６】
直鎖に均一に結合されたある種の糖単位からなるグリカンポリマーの調製物は、通常、グリカンが２０〜３０の重合度（ＤＰ）を有する低分子量を有する場合であっても、２３℃で不水溶性である。グリカンポリマーの溶解度は、例えば、（１−＞６）結合を導入し、グリカンにおいてグリコシド結合を変更することによって、調整することができる。Ｃ−５からＣ−６結合の周りの回転によって与えられる余分の自由度により、より高い溶液のエントロピー値を得る。２種類の糖結合を有するホモグリカンまたは２種類の糖からなるヘテログリカンは、一般的に、均一ポリマーよりも溶解性が高い。直鎖ホモグリカンのイオン化は、溶解度を付加する（例えば、ゲルの溶解度に）ことができる。溶液の粘度はしばしばグリカンの三次構造に依存する。
【０２５７】
グリカンポリマーの製剤および投与量
本明細書に記載の調製物の特徴のうちの１つ以上、２つ以上、３つ以上、または４つ以上（上の基準（ｉ）〜（ｖ）を含む）を満たすグリカンポリマー調製物を含む組成物（例えば、医薬組成物）を生成する方法も、本明細書に提供される。具体的には、方法は、グリカンポリマー調製物を提供することと、例えば、ｉ）重合度（ＤＰ）、ｉｉ）平均分岐度（ＤＢ、残基当たりの分岐点）、ｉｉｉ）アルファ−グリコシド結合対ベータ−グリコシド結合の比率、ｉｖ）グリカンサブユニットの同一性、およびｖ）グリカンサブユニットの比率を含む、調製物の１つ以上、２つ以上、または３つ以上の特徴の値を得ることと、調製物の所望のまたは既定の基準が偏差の所望の範囲内で満たされる場合、グリカンポリマー調製物を含む医薬組成物を生成することと、を含む。
【０２５８】
グリカンポリマー調製物を医薬組成物、医療用食品、または栄養補助食品に製剤化するための方法は、当該技術分野において公知であり、（ｉ）調製物を薬物生成物に製剤化する工程と、（ｉｉ）調製物をパッケージ化する工程と、（ｉｉｉ）パッケージ化した調製物にラベル付けする工程と、ならびに（ｉｖ）パッケージ化およびラベル付けされた調製物を販売する工程、または販売に供する工程、のうちの１つ以上、２つ以上、３つ以上、または４つ以上を含み得る。グリカンポリマー調製物の薬物生成物への製剤化は、当該技術分野において公知であり、（ｉ）調製物から望ましくない成分を除去する工程と、（ｉｉ）調製物の体積を減少させる工程と、（ｉｉｉ）調製物を殺菌する工程と、（ｉｖ）調製物を薬学的に許容される賦形剤または担体と混合する工程と、（ｖ）調製物を第２の薬物または薬学的薬剤と混合する工程と、（ｖｉ）調製物を、例えば、水性希釈溶液、シロップ、または固体等の適当な稠度に製剤化する工程と、（ｖｉｉ）調製物を、適当な剤形、例えば、錠剤、丸剤、またはカプセル剤に製剤化する工程、のうちの１つ以上、２つ以上、３つ以上、または４つ以上を含み得る。
【０２５９】
いくつかの実施形態では、グリカンポリマー調製物は、グリカンポリマーシロップまたは粉末のいずれかを産生するためのさらなる処理を経る。例えば、一変形例では、グリカンポリマー調製物は、濃縮されてシロップを形成する。真空蒸発装置の使用等、溶液を濃縮するための当該技術分野において公知の任意の適当な方法が、使用され得る。別の変形例では、グリカンポリマー調製物は、噴霧乾燥されて粉末を形成する。溶液を噴霧乾燥して粉末を形成するための当該技術分野において公知の任意の適当な方法が使用され得る。
【０２６０】
グリカンポリマー調製物を含む、医薬組成物、医療用食品、および栄養補助食品が、本明細書に提供される。任意選択により、グリカンポリマー調製物を含む医薬組成物、医療用食品、および栄養補助食品は、第２の薬剤、例えば、プレバイオティクス物質および／またはプロバイオティクス細菌をさらに含む。いくつかの実施形態では、グリカンポリマー調製物を含む、医薬組成物、医療用食品、および栄養補助食品は、微量栄養素をさらに含む。いくつかの実施形態では、グリカンポリマー調製物を含む、医薬組成物、医療用食品、および栄養補助食品は、プレバイオティクス物質を含有しない。いくつかの実施形態では、グリカンポリマー調製物を含む、医薬組成物、医療用食品、および栄養補助食品は、プロバイオティクス細菌を含有しない。さらに、任意選択により、グリカンポリマー調製物を含む、医薬組成物、医療用食品、および栄養補助食品は、希釈剤、結合剤、崩壊剤、分散剤、滑沢剤、流動促進剤、安定剤、界面活性剤、香味剤、および着色剤を含む、１つ以上の賦形剤または担体を含む。
【０２６１】
いくつかの実施形態では、グリカンポリマー調製物を含む、医薬組成物、医療用食品、および栄養補助食品（およびそれを含むキット）は、１つ以上の微量栄養素を含む。いくつかの実施形態では、微量栄養素は、微量元素、コリン、ビタミン、およびポリフェノールからなる群から選択される。いくつかの実施形態では、微量栄養素は、微量金属である。微量栄養素として適当な微量元素としては、ホウ素、コバルト、クロム、カルシウム、銅、フッ化物、ヨウ素、鉄、マグネシウム、マンガン、モリブデン、セレン、および亜鉛が挙げられるが、これらに限定されない。いくつかの実施形態では、微量栄養素は、ビタミンである。いくつかの実施形態では、微量栄養素は、ポリフェノールである。
【０２６２】
さらに、必要に応じて、グリカンポリマー調製物を含む医薬組成物、医療用食品、および栄養補助食品は、治療効果のある薬剤、プレバイオティクス物質、および／またはプロバイオティクス細菌を含んでもよい。あるいはまたはさらに、治療効果のある薬剤、プレバイオティクス物質、および／またはプロバイオティクス細菌は、別々に（例えば、グリカンポリマーの投与の前、それと同時に、またはその後）、グリカンポリマーの医薬組成物、医療用食品、または栄養補助食品の一部として（例えば、共製剤として）ではなく、投与されてもよい。いくつかの実施形態では、グリカンポリマーの調製物を含む医薬組成物または医療用食品または栄養補助食品は、医師または他の医療従事者によって決定され得るような、推奨された、または規定の食事、例えば、プロバイオティクスおよび／またはプレバイオティクス含有食品に富む食事と組み合わせて投与される。治療効果のある薬剤、プレバイオティクス物質、および／またはプロバイオティクス細菌は、対象の腸内のマイクロバイオームを調節するために投与されてもよい。いくつかの実施形態では、複合効果（例えば、微生物、ゲノム、または機能的変化の数または強度における）は、相加的である。他の実施形態では、複合効果（例えば、微生物、ゲノム、または機能的変化の数または強度における）は、相乗的である。
【０２６３】
いくつかの実施形態では、本明細書に記載のグリカンポリマー調製物を含む、医薬組成物、医療用食品、および栄養補助食品は、プレバイオティクス物質またはその調製物をさらに含む。
【０２６４】
いくつかの実施形態では、プレバイオティクスは、本明細書に記載のグリカンポリマー調製物を含む、医薬組成物、医療用食品、または栄養補助食品を受けている対象に投与され得る。プレバイオティクスは、消費されるときに、消化管内の限られた数の固有細菌の好ましい増殖または活性を選択的に刺激することによって宿主への有益な生理学的効果を提供し得る消化されない物質である（Ｇｉｂｓｏｎ  Ｇ  Ｒ，Ｒｏｂｅｒｆｒｏｉｄ  Ｍ  Ｂ．Ｄｉｅｔａｒｙ  ｍｏｄｕｌａｔｉｏｎ  ｏｆ  ｔｈｅ  ｈｕｍａｎ  ｃｏｌｏｎｉｃ  ｍｉｃｒｏｂｉｏｔａ：ｉｎｔｒｏｄｕｃｉｎｇ  ｔｈｅ  ｃｏｎｃｅｐｔ  ｏｆ  ｐｒｅｂｉｏｔｉｃｓ．Ｊ  Ｎｕｔｒ．１９９５  Ｊｕｎｅ；１２５（６）：１４０１−１２．）。食物繊維またはプレバイオティクスオリゴ糖（例えば、結晶性セルロース、コムギふすま、オートムギふすま、トウモロコシ繊維、ダイズ繊維、ビート繊維など）などのプレバイオティクスは、さらに、発酵可能な量の炭水化物を細菌に供給し、それらの微生物集団（例えば、乳酸菌とビフィズス菌）の消化管内のレベルを増加させることによって、腸内でのプロバイオティクス細菌および／または共生細菌の増殖を促進し得る。
【０２６５】
プレバイオティクスとしては、様々なガラクタンおよび炭水化物系ガム、例えば、オオバコ、グアー、カラギーン、ジェラン、ラクツロース、およびコンニャク等が挙げられるが、これらに限定されない。いくつかの実施形態では、プレバイオティクスは、ガラクトオリゴ糖（ＧＯＳ）、ラクツロース、ラフィノース、スタキオース、ラクトスクロース、フルクト−オリゴ糖（ＦＯＳ、例えば、オリゴフルクトースまたはオリゴフルクタン）、イヌリン、イソマルト−オリゴ糖、キシロ−オリゴ糖（ＸＯＳ）、パラチノースオリゴ糖、イソマルトースオリゴ糖（ＩＭＯＳ）、トランスガラクトシル化オリゴ糖（例えば、トランスガラクト−オリゴ糖）、トランスガラクトシル化二糖類、大豆オリゴ糖（例えば、大豆オリゴ糖）、キトサンオリゴ糖（チオセス）、ゲンチオオリゴ糖、大豆およびペクチン性オリゴ糖、グルコオリゴ糖、ペクチンオリゴ糖、パラチノース重縮合物、ジフルクトース無水物ＩＩＩ、ソルビトール、マルチトール、ラクチトール、ポリオール、ポリデキストロース、直鎖および分岐鎖デキストラン、プララン（ｐｕｌｌａｌａｎ）、ヘミセルロース、還元パラチノース、セルロース、ベータ−グルコース、ベータ−ガラクトース、ベータ−フルクトース、ベルバスコース、ガラクチノール、キシラン、イヌリン、キトサン、ベータ−グルカン、グアーガム、アラビアゴム、ペクチン、高アルギン酸ナトリウム、およびラムダカラゲナン、またはこれらの混合物のうちの１つ以上を含む。
【０２６６】
適当なプロバイオティクスの例としては、バクテロイデス（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ）、ブラウティア（Ｂｌａｕｔｉａ）、クロストリジウム（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ）、フソバクテリウム（Ｆｕｓｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）、ユウバクテリウム（Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ）、ルミノコッカス（Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ）、ペプトコッカス（Ｐｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ）、ペプトストレプトコッカス（Ｐｅｐｔｏｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ）、アッカーマンシア（Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ）、フィーカリバクテリウム（Ｆａｅｃａｌｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ）、ロゼブリア（Ｒｏｓｅｂｕｒｉａ）、プレボテーラ（Ｐｒｅｖｏｔｅｌｌａ）、ビフィドバクテリウム（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）、ラクトバチルス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ）、バチルス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ）、エンテロコッカス（Ｅｎｔｅｒｏｃｏｃｃｕｓ）、エシェリキア（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ）、ストレプトコッカス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ）、サッカロミセス（Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ）、ストレプトマイセス（Ｓｔｒｅｐｔｏｍｙｃｅｓ）の属、およびクリステンセネラ（Ｃｈｒｉｓｔｅｎｓｅｎｅｌｌａｃｅａｅ）ファミリーとして分類される生物が挙げられるが、これらに限定されない。本明細書に記載の方法および組成物に使用され得るプロバイオティクス細菌の非排他的な例には、Ｌ．アシドフィルス（Ｌ．ａｃｉｄｏｐｈｉｌｕｓ）、Ｌ．クリスパータス（Ｌ．ｃｒｉｓｐａｔｕｓ）、Ｌ．カゼイ（Ｌ．ｃａｓｅｉ）、Ｌ．ラムノーサス（Ｌ．ｒｈａｍｎｏｓｕｓ）、Ｌ．ロイテリー（Ｌ．ｒｅｕｔｅｒｉ）、Ｌ．ファーメンタム（Ｌ．ｆｅｒｍｅｎｔｕｍ）、Ｌ．プランタルム（Ｌ．ｐｌａｎｔａｒｕｍ）、Ｌ．スポロゲネス（Ｌ．ｓｐｏｒｏｇｅｎｅｓ）、およびＬ．ブルガリカス（Ｌ．ｂｕｌｇａｒｉｃｕｓ）などのラクトバチルス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ）種、ならびにＢ．ラクティス（Ｂ．ｌａｃｔｉｓ）、Ｂ．アニマ―リス（Ｂ．ａｎｉｍａｌｉｓ）、Ｂ．ビフィダム（Ｂ．ｂｉｆｉｄｕｍ）、Ｂ．ロンガム（Ｂ．ｌｏｎｇｕｍ）、Ｂ．アドレスセンティス（Ｂ．ａｄｏｌｅｓｃｅｎｔｉｓ）、およびＢ．インファンティス（Ｂ．ｉｎｆａｎｔｉｓ）などのビフィドバクテリウム（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｕｍ）種が含まれる。サッカロミセス・ブラウディ（Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ  ｂｏｕｌａｒｄｉｉ）等の酵母もまた、例えば、経口剤形または食品を介した、消化管への投与のためのプロバイオティクスとして適当である。いくつかの実施形態では、プロバイオティクス細菌分類群はビフィドバクテリウム（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）ではない。いくつかの実施形態では、プロバイオティクス細菌分類群は、ラクトバチルス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ）ではない。
【０２６７】
胃腸の微生物叢の調節に有益な細菌は、例えば、過酸化水素（Ｈ２Ｏ２）およびバクテリオシン等の、有機酸（乳酸および酢酸）を産生するまたは細胞毒性もしくは細胞増殖抑制剤を産生する（病原体の増殖を阻害するために）細菌を含み得る。バクテリオシンは、密接に関連した細菌を死滅させることができるか、またはより広域の活性を呈することができる（例えば、ナイシン）、低分子の抗菌ペプチドである。
【０２６８】
有益な細菌は、アッカーマンシア属（Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ）、アナエロフィルム属（Ａｎａｅｒｏｆｉｌｕｍ）、バクテロイデス属（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ）、ブラウティア属（Ｂｌａｕｔｉａ）、ビフィドバクテリウム属（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）、ブチリビブリオ属（Ｂｕｔｙｒｉｖｉｂｒｉｏ）、クロストリジウム属（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ）、コプロコッカス属（Ｃｏｐｒｏｃｏｃｃｕｓ）、ディアリスター属（Ｄｉａｌｉｓｔｅｒ）、ドレア属（Ｄｏｒｅａ）、フソバクテリウム属（Ｆｕｓｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）、ユウバクテリウム属（Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ）、フィーカリバクテリウム属（Ｆａｅｃａｌｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ）、ラクノスピラ属（Ｌａｃｈｎｏｓｐｉｒａ）、ラクトバチルス属（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ）、ファスコラークトバクテリウム属（Ｐｈａｓｃｏｌａｒｃｔｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）、ペプトコッカス属（Ｐｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ）、ペプトストレプトコッカス属（Ｐｅｐｔｏｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ）、プレボテーラ属（Ｐｒｅｖｏｔｅｌｌａ）、ロゼブリア属（Ｒｏｓｅｂｕｒｉａ）、ルミノコッカス属（Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ）およびストレプトコッカス属（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ）の１種以上、ならびに／またはアッカーマンシア・ムニシフィラ（Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｎｉｃｉｐｈｉｌｉａ）種、ミヌタ（ｍｉｎｕｔａ）種、クロストリジウム・コッコイデス（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｃｏｃｃｏｉｄｅｓ）種、クロストリジウム・レプツム（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｌｅｐｔｕｍ）種、クロストリジウム・シンデンス（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｓｃｉｎｄｅｎｓ）種、ディアリスター・インビサス（Ｄｉａｌｉｓｔｅｒ  ｉｎｖｉｓｕｓ）種、ユウバクテリウム・レクタル（Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｒｅｃｔａｌ）種、ユウバクテリウム・エリゲンス（Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｅｌｉｇｅｎｓ）種、フィーカリバクテリウム・プラウスニッツィイ（Ｆａｅｃａｌｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｐｒａｕｓｎｉｔｚｉｉ）種、ストレプトコッカス・サリバリウス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ  ｓａｌｉｖａｒｉｕｓ）種およびストレプトコッカス・サーモフィラス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ  ｔｈｅｒｍｏｐｈｉｌｕｓ）種の１種以上を含み得る。いくつかの実施形態では、プロバイオティクスまたは共生細菌は、表２中に列挙される細菌のうちの１つ以上を含む。
【０２６９】
本組成物またはキットを産生するために本明細書に記載のグリカンポリマーと組み合わせられ得るプレバイオティクス物質およびプロバイオティクス菌株は、標準的な方法によって任意の純度レベルで単離され得、精製は、当業者に公知の従来の手段、例えば、蒸留、再結晶、およびクロマトグラフィーによって達成することができる。本組成物に使用される栽培された細菌は、遠心分離、濾過、またはデカンテーションが含まれるが、これらに限定されない、任意の方法によって、培養ブロスから分離される。発酵ブロスから分離された細胞は、任意選択により、水、生理食塩水（０．９％  ＮａＣｌ）によって、または任意の適当な緩衝液を用いて、洗浄される。得られた湿細胞塊は、任意の適当な方法、例えば、凍結乾燥によって乾燥され得る。
【０２７０】
いくつかの実施形態では、プロバイオティクス細菌は、凍結乾燥した栄養細胞である。いくつかの実施形態では、胞子形成プロバイオティクス細菌からの胞子の調製物が使用される。
【０２７１】
一実施形態では、グリカンポリマー調製物はさらにプレバイオティクスおよびプロバイオティクスを含む。一実施形態では、医薬組成物は、生存率が部分的に弱毒化したプロバイオティクス（例えば、１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、またはそれ以上の非生存細菌を含む混合物）、または単に非生存微生物からなるプロバイオティクスを含む。本組成物は、死滅した微生物から単離され、精製された、微生物膜および／または細胞壁をさらに含み得る。必要に応じて、プロバイオティクス生物は、プロバイオティクスが生存可能である、水もしくはその他の液体または半固体培地中の培養物として、グリカンポリマー調製物に組み込むことができる。別の技法では、プロバイオティクス生物を含む凍結乾燥粉末が、混合または混成することによって粒子材料または液体または半固体材料に組み込まれ得る。
【０２７２】
いくつかの実施形態では、グリカンポリマー調製物を含む、医薬組成物、医療用食品、および栄養補助食品は、第２の治療剤またはその調製物をさらに含む。いくつかの実施形態では、治療剤は、抗生物質、抗真菌剤、抗ウイルス剤、または抗炎症剤（例えば、サイトカイン、ホルモンなど）を含む。
【０２７３】
本明細書に記載のグリカンポリマー調製物、他の治療効果のある薬剤、プレバイオティクス物質、微量栄養素、およびプロバイオティクスは、単一の医薬組成物、医療用食品、または栄養補助食品に混じり合うか、または混合され得る。他の実施形態では、それらは、別々の容器内に（および／または様々な適当な単位剤形で）含有され得るが、１つ以上のキットに一緒にパッケージ化され得る。いくつかの実施形態では、調製物または組成物は、一緒にパッケージ化されることも、一緒に配置されることもない。次いで、医師は、例えば、互いの前、それと同時に、またはその後に、調製物または組成物を一緒に投与し得る。いくつかの実施形態では、調製物または組成物は、対象において、例えば、胃腸管内の微生物叢を調節する際に相乗的に作用する。
【０２７４】
いくつかの実施形態では、グリカンポリマー組成物は、ｗ／ｗ、ｗ／ｖ、ｖ／ｖ、またはモル％で、０．１％〜１００％のグリカンポリマー調製物を含む。別の実施形態では、グリカンポリマー組成物は、ｗ／ｗ、ｗ／ｖ、ｖ／ｖ、またはモル％で、約１％、２％、３％、４％、５％、６％、７％、８％、９％、１０％、１１％、１２％、１３％、１４％、１５％、１６％、１７％、１８％、１９％、２０％、２１％、２２％、２３％、２４％、２５％、２６％、２７％、２８％、２９％、３０％、３１％、３２％、３３％、３４％、３５％、３６％、３７％、３８％、３９％、４０％、４１％、４２％、４３％、４４％、４５％、４６％、４７％、４８％、４９％、５０％、５１％、５２％、５３％、５４％、５５％、５６％、５７％、５８％、５９％、６０％、６１％、６２％、６３％、６４％、６５％、６６％、６７％、６８％、６９％、７０％、７１％、７２％、７３％、７４％、７５％、７６％、７７％、７８％、７９％、８０％、８１％、８２％、８３％、８４％、８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％、または１００％のグリカンポリマー調製物を含む。一実施形態では、グリカンポリマー組成物は、ｗ／ｗ、ｗ／ｖ、ｖ／ｖ、またはモル％で、約１〜９０％、約１０〜９０％、約２０〜９０％、約３０〜９０％、約４０〜９０％、約４０〜８０％、約４０〜７０％、約４０〜６０％、約４０〜５０％、約５０〜９０％、約５０〜８０％、約５０〜７０％、約５０〜６０％、約６０〜９０％、約６０〜８０％、約６０〜７０％、約７０〜９０％、約７０〜８０％、約７０〜９０％、約７０〜８０％、約８０〜９０％、約９０〜９６％、約９３〜９６％、約９３〜９５％、約９４〜９８％、約９３〜９９％、または約９０〜１００％のグリカンポリマー調製物を含む。
【０２７５】
グリカンポリマー調製物を含む組成物は、任意選択により、１つ以上の賦形剤または担体を含み得る。グリカンポリマー組成物は、ｗ／ｗ、ｗ／ｖ、ｖ／ｖ、またはモル％で、約１％〜約９０％の１つ以上の賦形剤または担体を含み得る。例えば、グリカンポリマー組成物は、ｗ／ｗ、ｗ／ｖ、ｖ／ｖ、またはモル％で、約１〜９０％、１〜７５％、１〜６０％、１〜５５％、１〜５０％、１〜４５％、１〜４０％、１〜２５％、１〜１５％、１〜１０％、１０〜９０％、１０〜７５％、１０〜６０％、１０〜５５％、１０〜５０％、１０〜４５％、１０〜４０％、１０〜２５％、１０〜１５％、１５〜９０％、１５〜７５％、１５〜６０％、１５〜５５％、１５〜５０％、１５〜４５％、１５〜４０％、１５〜２５％、２５〜９０％、２５〜７５％、２５〜６０％、２５〜５５％、２５〜５０％、２５〜４５％、２５〜４０％、４０〜９０％、４０〜７５％、４０〜６０％、４０〜５５％、４０〜５０％、４０〜４５％、４５〜９０％、４５〜７５％、４５〜６０％、４５〜５５％、４５〜５０％、５０〜９０％、５０〜７５％、５０〜６０％、５０〜５５％、５５〜９０％、５５〜７５％、５５〜６０％、６０〜９０％、６０〜７５％、７５〜９０％の１つ以上の賦形剤または担体を含み得る。
【０２７６】
医療用食品
医療用食品として製剤化されたグリカンポリマーの調製物もまた、本明細書において提供される。本明細書に記載のグリカンポリマー調製物はいずれも、グリカンポリマー調製物を含む医療用食品および医薬組成物として処方され得る。
【０２７７】
医療用食品は、希少医薬品法（Ｏｒｐｈａｎ  Ｄｒｕｇ  Ａｃｔ）（２１Ｕ．Ｓ．Ｃ．３６０ｅｅ（ｂ）（３））第５条（ｂ）（３）に定義されている。医療用食品は、例えば、医師による、医学的管理下で、摂取（経口摂取）または経腸投与（例えば、栄養補給／経鼻胃管）されるように処方される。それは、例えば、ディスバイオシスまたはＧＩ管疾患などの疾患または状態の特定の食事管理を目的としている。本明細書において使用される場合、医療用食品は、症状を管理し、または疾患もしくは状態のリスクを低減するために、全体的な食事の一部として医師によって単に推奨される食品は含まない。グリカンポリマーの調製物を含む医療用食品は、合成食品（例えば、経口摂取またはチューブによる経腸栄養補給による患者への部分的または全体的な栄養補給のために処方されるような処方製品および／または加工製品）であり、天然の状態で使用される天然に存在する食品ではない。
【０２７８】
いくつかの実施形態では、対象は、通常の食品または特定の栄養素を摂取し、消化し、吸収し、または代謝する能力が限られているか、または損なわれている。他の実施形態では、対象は、他の特別な医学的に決定された栄養要求を有し、通常の食事のみを変えてもその栄養管理を達成することができない。グリカンポリマーの調製物を含む医療用食品は、それを必要とする対象に、医学的管理下（これは、現在関与し進行中であってよい）で投与され、そして、通常、対象は、医療用食品の使用についての指示を受ける。医療用食品は、１つ以上の食品添加物、着色添加物、ＧＲＡＳ賦形剤、および医療用食品に適当なその他の薬剤または物質を含み得る。医療用食品調製物は、栄養的に完全な処方であっても不完全な処方であってもよい。
【０２７９】
栄養補助食品
本明細書中に記載のグリカンポリマー調製物はいずれも、例えば、本明細書中に記載される方法において使用するための、栄養補助食品として処方され得る。栄養補助食品は、１９９４年のダイエタリーサプリメント健康教育法（Ｄｉｅｔａｒｙ  Ｓｕｐｐｌｅｍｅｎｔ  Ｈｅａｌｔｈ  ａｎｄ  Ｅｄｕｃａｔｉｏｎ  Ａｃｔ）（ＤＳＨＥＡ）によって規制されている。栄養補助食品は、食事を補うことを目的とした「食事成分」を含有する経口摂取製品である。これらの製品における「食事成分」は、本明細書に記載のグリカンポリマー調製物に加えて、ビタミン、ミネラル、ハーブまたは他の植物、アミノ酸、ならびに酵素、臓器組織、腺、および代謝産物などの物質のうちの１つ以上を含み得る。栄養補助食品はまた、抽出物または濃縮物であり得、例えば、錠剤、カプセル、ソフトゲル、ゲルキャップ、液体、または粉末などの多くの形態で見出され得る。それらはまた棒などの他の形態であり得るが、その場合、そのラベル上の情報は、その製品を従来の食品、または食事の単独の品目として表してはならない。ＤＳＨＥＡは、全ての栄養補助食品が一般的な食品としてではなく、栄養補助食品としてラベル付けされることを要求する。
【０２８０】
食品成分
本明細書に記載のグリカンポリマー調製物はいずれも、例えば、本明細書に記載の方法において使用するための、食品成分または食品添加物として処方され得る。食品成分は、一般的に安全と認められる（ＧＲＡＳ）か、ＦＤＡの認可を必要とし得る。グリカンポリマー調製物は、任意の所望の食品、例えば、飲料（例えば、フルーツジュース）、乳製品（例えば、ミルク、ヨーグルト、チーズ）、シリアル（任意の穀物製品）、パン、スプレッドなどに添加することができる。
【０２８１】
本明細書に記載のグリカンポリマー調製物は、任意の好適な剤形、例えば、経鼻、経口、直腸または胃内投与用に製剤化され得る。いくつかの実施形態では、本明細書に記載されるグリカンポリマー調製物は、経腸投与用に製剤化され得る。いくつかの実施形態では、本明細書に記載されるグリカンポリマー調製物は、経管栄養（経鼻胃管、経口胃管または胃管栄養）用に製剤化され得る。本明細書に記載の剤形は、当業者に知られている方法を用いて製造することができる。
【０２８２】
剤形は、例えば、液体（洗浄／すすぎ）、ゲル、クリーム、軟膏、粉末、錠剤、丸剤、カプセル剤、保管所、使い捨てアプリケータ、または医療デバイス（例えば、シリンジ）の形態で、グリカンポリマー調製物を入れる任意の個々の容器などのパケットであってよい。例えば、グリカンポリマー調製物の単位剤形を含む容器、およびそのようなグリカンポリマーの使用説明書を含むラベルなどの製品も提供される。
【０２８３】
経口的に使用できる組成物の形態には、錠剤、ゼラチン製の押し込み型カプセル剤、ならびにゼラチンおよび可塑剤（例えば、グリセロールまたはソルビトール）製の軟質密封カプセル剤が含まれる。錠剤は、場合により１つ以上の副成分と共に、圧縮または成形によって製造することができる。圧縮錠剤は、粉末または顆粒などの自由流動形態の活性成分を、任意選択により、結合剤（例えば、ポビドン、ゼラチン、ヒドロキシプロピルメチルセルロース、不活性希釈剤、防腐剤、酸化防止剤、崩壊剤（例えば、デンプングリコール酸ナトリウム、架橋ポビドン、架橋カルボキシメチルセルロースナトリウム）、または滑沢剤、界面活性剤もしくは分散剤と混合して、好適な機械で圧縮することにより調製することができる。成形錠剤は、不活性な液体希釈剤で湿らせた粉末化合物の混合物を好適な機械で成形することによって製造することができる。錠剤は、任意選択により、コーティングまたは刻み目を付けることができ、その中の活性成分の徐放または制御放出を提供するように製剤化することができる。錠剤は、任意選択により、腸の一部（例えば、結腸、腸管下部）における放出を提供するために、腸溶コーティングを設けることができる。経口投与のためのすべての製剤は、そのような投与に好適な用量であり得る。押し込み型カプセルは、活性成分を、ラクトースなどのフィラー、澱粉などの結合剤および／またはタルクもしくはステアリン酸マグネシウムなどの滑沢剤、および任意選択により安定剤と混合して含有することができる。軟カプセル剤では、活性化合物および／または他の薬剤（例えば、プレバイオティクスまたはプロバイオティクス）は、脂肪油、流動パラフィン、または液体ポリエチレングリコールなどの好適な液体に溶解または懸濁することができる。さらに、安定剤を添加することができる。糖衣錠コアは好適なコーティングを備える。この目的のために、濃縮された糖溶液が使用され得、これは、任意選択により、アラビアゴム、タルク、ポリビニルピロリドン、カルボポールゲル、ポリエチレングリコール、または二酸化チタン、ラッカー溶液、および好適な有機溶媒または溶媒混合物を含み得る。活性化合物用量の異なる組み合わせを識別するため、または特徴付けるために、錠剤または糖衣錠コーティングに、染料または色素を添加することができる。
【０２８４】
経口使用のための製剤はまた、活性成分が不活性な固体希釈剤、例えば炭酸カルシウム、リン酸カルシウムまたはカオリンと混合される硬質ゼラチンカプセルとして、あるいは活性成分がポリエチレングリコールなどの水溶性担体、または油媒体、例えばピーナッツ油、流動パラフィンもしくはオリーブ油と混合される軟質ゼラチンカプセルとして提供され得る。
【０２８５】
一実施形態では、提供されるグリカンポリマー調製物は、ソフトゲル製剤を含む。ソフトゲルは、液体充填物を取り囲むゼラチンベースのシェルを含むことができる。シェルは、ゼラチン、可塑剤（例えば、グリセリンおよび／またはソルビトール）、改質剤、水、着色剤、酸化防止剤、または香料から作ることができる。シェルは、デンプンまたはカラゲナンで作ることができる。外層は腸溶コーティングすることができる。一実施形態では、ソフトゲル製剤は、水または油溶性充填溶液、またはゼラチン層によって覆われた組成物の懸濁液を含むことができる。
【０２８６】
経口使用のための固体製剤は、腸溶コーティングを含み得、これはグリカンポリマー調製物が消化系で吸収される位置を制御し得る。例えば、腸溶コーティングは、グリカンポリマー調製物が胃内で溶解せず、むしろ小腸に移動し、そこで溶解するように設計することができる。腸溶コーティングは、低ｐＨ（例えば、胃内など）で安定であり、より高いｐＨ（例えば、小腸内）で溶解することができる。腸溶コーティングに使用できる材料には、例えば、アルギン酸、酢酸フタル酸セルロース、プラスチック、蝋、シェラック、および脂肪酸（例えば、ステアリン酸、パルミチン酸）が含まれる。
【０２８７】
経口使用のための製剤はまた、液体剤形で提供され得る。液体調製物は例えば、水性または油性の懸濁液、溶液、エマルション、シロップまたはエリキシルの形態であり得るか、または使用前に水または他の好適なビヒクルで再構成する乾燥製品として提供され得る。このような液体調製物は、懸濁化剤、例えば、ソルビトール、メチルセルロース、グルコースシロップ、ゼラチン、ヒドロキシエチルセルロース、カルボキシメチルセルロース、ステアリン酸アルミニウムゲルまたは水素化食用脂；乳化剤、例えば、レシチン、モノオレイン酸ソルビタン、アカシアゴム；非水性ビヒクル（食用脂を含むことができる）、例えば、アーモンド油、油性エステル（グリセリン、プロピレングリコール、またはエチルアルコールなど）；保存料、例えば、ｐ−ヒドキシ安息香酸メチルもしくはｐ−ヒドキシ安息香酸プロピル、またはソルビン酸、および、必要に応じて、従来の香味剤または着色剤を含有することができる。いくつかの実施形態では、液体製剤は、例えば、溶液中水および／または懸濁形態の薬剤；ならびに、ポリエトキシル化ヒマシ油、アルコール、および／またはポリオキシエチル化モノオレイン酸ソルビタンを含むビヒクルを、香味料と共に、または香味料なしで含み得る。各剤形は、有効量のグリカンポリマーを含んでもよく、また、任意選択により、従来の賦形剤、ビヒクル、充填剤、結合剤、崩壊剤、ｐＨ調整物質、緩衝剤、溶媒、可溶化剤、甘味料、着色剤、および投与のための医薬剤形に含めることができる任意の他の不活性薬剤などの薬学的に不活性な薬剤を含んでもよい。このようなビヒクルおよび添加剤の例は、Ｒｅｍｉｎｇｔｏｎ’ｓ  Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ  Ｓｃｉｅｎｃｅｓ，１７ｔｈ  ｅｄｉｔｉｏｎ（１９８５）に見出すことができる。
【０２８８】
本明細書に提供される医薬組成物は、単位剤形または複数回投与剤形であり得る。単位剤形は、本明細書に使用される場合、それを必要とするヒトへの投与に好適な物理的に別々の単位を指す。一実施形態では、単位剤形は、パッケージ内に提供される。各単位用量は、所望の治療効果を生じさせるのに十分な所定の数量の有効成分を、他の薬学的担体または賦形剤と共に含み得る。単位剤形の例としては、アンプル、シリンジ、および個別にパッケージ化された錠剤およびカプセルが挙げられるが、これらに限定されない。単位剤形は、その一部を、またはその複数を投与することができる。複数回投与剤形は、単一の容器内に同一の単位投与剤形が複数個パッケージ化されたものであり、区分された単位剤形として投与することができる。複数回投与剤形の例としては、バイアル、錠剤もしくはカプセルの瓶、または数パイントもしくは数ガロンの瓶が挙げられるが、これらに限定されない。別の実施形態では、複数回投与剤形は、異なる薬学的活性薬剤を含む。例えば、グリカンポリマーを含む組成物を含む第１の投与エレメントと、プレバイオティクス、治療剤および／またはプロバイオティクスを含む第２の投与エレメント（これらは、改変放出形態であり得る）とを含む複数回投与剤形が提供され得る。この例では、一対の投与エレメントが単一の単位投与量を構成し得る。一実施形態では、複数の単位投与量を含み、各単位はグリカンポリマー調製物を含む組成物を含む第１の投与エレメントと、プロバイオティクス、医薬剤、プレバイオティクス、またはこれらの組み合わせを含む第２の投与エレメント（これらは、改変放出形態であり得る）とを含むキットが提供される。別の実施形態では、キットは一組の説明書をさらに含む。
【０２８９】
いくつかの実施形態では、単位剤形は、約１ｍｇ〜約１００ｇのグリカンポリマー調製物（例えば、本明細書に記載のグリカンポリマー）を含む。例えば、単位剤形は、約５０ｍｇ〜約５０ｇ、約５００ｍｇ〜約５０ｇ、約５ｇ〜約５０ｇ、約１００ｍｇ〜約１００ｇ、約１ｇ〜約１００ｇ、約１０ｇ〜約１００ｇ、約１ｇ〜約１０ｇ、約１ｇ〜約２０ｇ、約１ｇ〜約３０ｇ、約１ｇ〜約４０ｇ、約１ｇ〜約５０ｇ、約１ｇ〜約６０ｇ、約１ｇ〜約７０ｇ、約１ｇ〜約８０ｇ、約１ｇ〜約９０ｇ、約１ｇ〜約１００ｇ、約１ｇ〜約１５０ｇ、約１ｇ〜約２００ｇのグリカンポリマーを含み得る。
【０２９０】
他の実施形態では、単位剤形は、約０．００１ｍＬ〜約１０００ｍＬのグリカンポリマー（例えば、本明細書に記載のグリカンポリマー）を含む。例えば、単位剤形は、約０．００１ｍＬ〜約９５０ｍＬ、約０．００５ｍＬ〜約９００ｍＬ、約０．０１ｍＬ〜約８５０ｍＬ、約０．０５ｍＬ〜約８００ｍＬ、約０．０７５ｍＬ〜約７５０ｍＬ、約０．１ｍＬ〜約７００ｍＬ、約０．２５ｍＬ〜約６５０ｍＬ、約０．５ｍＬ〜約６００ｍＬ、約０．７５ｍＬ〜約５５０ｍＬ、約１ｍＬ〜約５００ｍＬ、約２．５ｍＬ〜約４５０ｍＬ、約５ｍＬ〜約４００ｍＬ、約７．５ｍＬ〜約３５０ｍＬ、約１０ｍＬ〜約３００ｍＬ、約１２．５ｍＬ〜約２５０ｍＬ、約１５ｍＬ〜約２００ｍＬ、約１７．５ｍＬ〜約１５０ｍＬ、約２０ｍＬ〜約１００ｍＬ、または約２５ｍＬ〜約７５ｍＬのグリカンポリマーを含む。
【０２９１】
特定の実施形態では、単位剤形は、約０．００１ｍＬ〜約１０ｍＬ、約０．００５ｍＬ〜約７．５ｍＬ、約０．０１ｍＬ〜約５ｍＬ、約０．０５ｍＬ〜約２．５ｍＬ、約０．１ｍＬ〜約１ｍＬ、約０．２５ｍＬ〜約１ｍＬ、または約０．５ｍＬ〜約１ｍＬのグリカンポリマーを含む。他の実施形態では、単位剤形は、約０．０１ｍＬ〜約１０ｍＬ、約０．０２５ｍＬ〜約７．５ｍＬ、約０．０５ｍＬ〜約５ｍＬ、または約０．１ｍＬ〜約２．５ｍＬのグリカンポリマーを含む。他の実施形態では、単位剤形は、約０．１ｍＬ〜約１０ｍＬ、約０．２５ｍＬ〜約７．５ｍＬ、約０．５ｍＬ〜約５ｍＬ、約０．５ｍＬ〜約２．５ｍＬ、または約０．５ｍＬ〜約１ｍＬのグリカンポリマーを含む。
【０２９２】
いくつかの実施形態では、単位剤形、例えば、錠剤、カプセル剤（例えば、硬カプセル剤、押し込み型カプセル剤、もしくは軟カプセル剤）、またはソフトゲル剤は、約０．１インチ〜約１．５インチ（例えば、約０．５インチおよび約１インチ）、または約５ｍｍ〜約５０ｍｍ（例えば、約１０ｍｍ〜約２５ｍｍ）の長さを有する。いくつかの実施形態では、単位剤形、例えば、錠剤、カプセル剤（例えば、硬カプセル剤、押し込み型カプセル剤、もしくは軟カプセル剤）、またはソフトゲル剤は、約０．０５インチ〜約１インチ（例えば、約０．１インチ〜約０．５インチ）、または約１ｍｍ〜約２５ｍｍ（例えば、約５ｍｍ〜約１０ｍｍ）の外径を有する。
【０２９３】
グリカンポリマーの各単位剤形は、約０．０１ｋｃａｌ〜約１０００ｋｃａｌのカロリー値を有し得る。例えば、単位剤形は、約０．０１ｋｃａｌ〜約１００ｋｃａｌ、約０．０５ｋｃａｌ〜約５０ｋｃａｌ、約０．１ｋｃａｌ〜約１０ｋｃａｌ、約０．２５ｋｃａｌ〜約２．５ｋｃａｌ、約０．５ｋｃａｌ〜約５ｋｃａｌ、約０．７５ｋｃａｌ〜約７．５ｋｃａｌ、約１ｋｃａｌ〜１０ｋｃａｌ、約５ｋｃａｌ〜約５０ｋｃａｌ、または約１０ｋｃａｌ〜約１００ｋｃａｌのカロリー値を有し得る。特定の実施形態では、グリカンポリマーの単位剤形は、１０ｋｃａｌ〜約５００ｋｃａｌのカロリー値を有する。特定の実施形態では、グリカンポリマーの単位剤形は、１ｋｃａｌ〜約１００ｋｃａｌのカロリー値を有する。特定の実施形態では、グリカンポリマーの単位剤形は、０．１ｋｃａｌ〜約１０ｋｃａｌのカロリー値を有する。
【０２９４】
さらに他の実施形態では、単位剤形は、約０．００１ｋｃａｌ〜約１０ｋｃａｌ、約０．００５ｋｃａｌ〜約１０ｋｃａｌ、約０．０１ｋｃａｌ〜約１０ｋｃａｌ、約０．０２５ｋｃａｌ〜約２５ｋｃａｌ、約０．０５ｋｃａｌ〜約５０ｋｃａｌ、約０．０７５ｋｃａｌ〜約７５ｋｃａｌ、約０．１ｋｃａｌ〜１００ｋｃａｌ、約０．２５ｋｃａｌ〜約１０ｋｃａｌ、約０．５ｋｃａｌ〜約５ｋｃａｌ、約０．２５ｋｃａｌ〜約２５ｋｃａｌ、または約０．１ｋｃａｌ〜約１ｋｃａｌのカロリー値を有し得る。
【０２９５】
グリカンポリマーの単位剤形は、水溶液（例えば、水、ミルク、ジュースなど）に溶解するように製剤化され得、飲料、シロップ、溶液、または懸濁液として経口投与される。例えば、グリカンポリマーの単位剤形は、経口投与前に水溶液に溶解するように製剤化された、キューブ、パケット、トローチ、丸薬、錠剤、カプセル、キャンディ、粉末、エリキシル、または濃縮シロップを含み得る。他の実施形態では、グリカンポリマーの単位剤形は、経口投与の際に生体内で、例えば、対象（例えば、ヒト対象）の口、胃、腸または結腸で溶解するように製剤化された、キューブ、パケット、トローチ、丸薬、錠剤、カプセル、キャンディ、粉末、エリキシル、または濃縮シロップを含み得る。
【０２９６】
いくつかの実施形態では、グリカンポリマー調製物は腸内投与される。これには、経口投与、または経口チューブもしくは経鼻チューブ（経鼻胃管、経鼻空腸管、経口胃管または経口空腸管を含む）による投与が優先的に含まれる。他の実施形態では、投与には、直腸投与（注腸、坐薬、または結腸内視鏡を含む）を含む。
【０２９７】
本明細書に記載の剤形は、当業者に知られている方法を用いて製造することができる。例えば、錠剤の製造では、例えば、高剪断造粒法、低剪断造粒法、流動床造粒法を使用して、または直接圧縮のためにブレンドすることによって、有効量のプレバイオティクスを１つ以上の賦形剤または添加剤中に均一に分散させることができる。賦形剤および添加剤としては、希釈剤、結合剤、崩壊剤、分散剤、滑沢剤、流動促進剤、安定剤、界面活性剤、接着防止剤、吸着剤、甘味料、および着色剤、またはそれらの組み合わせが含まれる。充填剤とも称される希釈剤は、圧縮のために実用的なサイズが提供されるように、錠剤の嵩を増加させるために使用することができる。希釈剤の非限定的な例には、ラクトース、セルロース、微結晶性セルロース、マンニトール、乾燥デンプン、加水分解デンプン、粉末糖、タルク、塩化ナトリウム、二酸化ケイ素、酸化チタン、リン酸二カルシウム二水和物、硫酸カルシウム、炭酸カルシウム、アルミナおよびカオリンが含まれる。結合剤は、錠剤製剤に凝集性を付与することができ、圧縮後に錠剤が無傷のままであるのを助けるために使用することができる。好適な結合剤の非限定的な例としては、デンプン（コーンスターチおよびアルファ化デンプンを含む）、ゼラチン、糖（例えば、グルコース、デキストロース、スクロース、ラクトースおよびソルビトール）、セルロース、ポリエチレングリコール、アルギン酸、デキストリン、カゼイン、メチルセルロース、蝋、天然および合成ゴム、例えば、アカシアゴム、トラガカントゴム、アルギン酸ナトリウム、アラビアゴム、キサンタンゴム、ならびにポリメタクリル酸、ポリビニルアルコール、ヒドロキシプロピルセルロース、およびポリビニルピロリドンなどの合成ポリマーが含まれる。滑沢剤はまた、錠剤の製造を容易にすることができ、その非限定的な例には、ステアリン酸マグネシウム、ステアリン酸カルシウム、ステアリン酸、ベヘン酸グリセリル、およびポリエチレングリコールが挙げられる。崩壊剤は、投与後の錠剤の崩壊を促進することができ、その非限定的な例には、デンプン、アルギン酸、例えば架橋ポリビニルピロリドンなどの架橋ポリマー、例えば、架橋ポリビニルピロリドン、クロスカルメロースナトリウム、グリコール酸デンプンカリウムまたはグリコール酸デンプンナトリウム、クレイ、セルロース（例えば、カルボキシメチルセルロース（例えば、カルボキシメチルセルロース（ＣＭＣ）、ＣＭＣ−Ｎａ、ＣＭＣ−Ｃａ））、デンプン、ゴムなどが含まれる。好適な流動促進剤の非限定的な例には、二酸化ケイ素、タルク等が含まれる。安定剤は、酸化反応を含む、薬物分解反応を阻害するまたは遅延させることができる。界面活性剤も含めることができ、陰イオン性、陽イオン性、両性、または非イオン性であり得る。例示的な甘味料には、ステビア抽出物、アスパルテーム、スクロース、アリテーム、サッカリン等が含まれ得る。必要に応じて、錠剤は、ｐＨ緩衝剤、保存料、例えば、酸化防止剤、湿潤剤、または乳化剤、可溶化剤、コーティング剤、香味剤（例えば、ミント、チェリー、アニス、モモ、アプリコット、甘草、ラズベリー、バニラ）等の非毒性補助物質も含み得る。さらなる賦形剤および添加剤には、酢酸アルミニウム、ベンジルアルコール、ブチルパラベン、ブチル化ヒドロキシトルエン、カルシウム二ナトリウムＥＤＴＡ、リン酸水素カルシウム二水和物、二塩基性リン酸カルシウム、三塩基性リン酸カルシウム、カンデリラ蝋、カルナウバ蝋、水素化ヒマシ油、塩化セチルピリジン、クエン酸、コロイド状二酸化ケイ素、コポリビドン、トウモロコシデンプン、システインＨＣｌ、ジメチコン、リン酸水素二ナトリウム、エリトロシンナトリウム、エチルセルロース、ゼラチン、グリセリン、モノオレイン酸グリセリル、モノステアリン酸グリセリル、グリシン、ＨＰＭＣフタレート（ｐｔｈａｌａｔｅ）、ヒドロキシプロピルセルロース、ヒドロキシルプロピルメチルセルロース、ヒプロメロース、赤色酸化鉄もしくは酸化第二鉄、黄色酸化鉄、酸化鉄もしくは酸化第二鉄、炭酸マグネシウム、酸化マグネシウム、ステアリン酸マグネシウム、メチオニン、メタクリル酸コポリマー、メチルパラベン、ケイ化微結晶セルロース、鉱油、リン酸、普通リン酸カルシウム、無水リン酸カルシウム、ポラキサマー４０７、ポラキサマー１８８、普通ポラキサマー、ポリエチレンオキシド、ポリオキシ１４０ステアレート、ポリソルベート８０、炭酸水素カリウム、ソルビン酸ナトリウム、ジャガイモデンプン、ポビドン、プロピレングリコール、プロピレンパラベン、プロピルパラベン、レチニルパルミテート、サッカリンナトリウム、セレン、シリカ、シリカゲル、ヒュームドシリカ、安息香酸ナトリウム、炭酸ナトリウム、クエン酸ナトリウム二水和物、クロスメロースナトリウム、ラウリン硫酸ナトリウム、メタ重亜硫酸ナトリウム、プロピオン酸ナトリウム、ナトリウムデンプン、グリコール酸ナトリウムデンプン、ステアリルフマル酸ナトリウム、ソルビン酸、ソルビトール、モノオレイン酸ソルビタン、アルファ化デンプン、コハク酸、トリアセチン、クエン酸トリエチル、植物ステアリン、ビタミンＡ、ビタミンＥ、ビタミンＣ、またはこれらの組み合わせが含まれ得る。これらの賦形剤および添加剤の量は、他の構成成分との関係、および調合および生成方法の特性に基づいて適切に選択され得る。
【０２９８】
有効量のグリカンポリマー調製物の即時放出製剤は、薬学的活性剤の迅速な放出（投与後１分〜１時間など）を可能にする賦形剤の１つ以上の組み合わせを含み得る。制御放出製剤（持続放出（ＳＲ）、長時間放出（ＥＲ、ＸＲ、またはＸＬ）、逐次継続放出（ｔｉｍｅ−ｒｅｌｅａｓｅ）もしくは時限放出（ｔｉｍｅｄ−ｒｅｌｅａｓｅ）、制御放出（ＣＲ）、または継続放出とも称される）とは、剤形が対象（例えば、ヒト対象）に投与された後の特定の所望の時点での、剤形からのグリカンポリマーの調製物の放出のことを指す。
【０２９９】
一実施形態では、制御放出剤形はその放出を開始し、その放出を長期間にわたって続ける。放出は、ほぼ即時的に開始し得るか、または持続的であり得る。放出は、一定であり得、経時的に増加または減少し得、パルス状であり得、継続的もしくは間欠的等であり得る。一実施形態では、制御放出剤形は、薬剤が長期間にわたって所望のプロファイルに従って放出される、組成物または剤形からの薬物の放出を指す。一態様では、制御放出は、放出がある期間の後に起こる所望のプロファイルに従って薬剤が放出される、組成物または剤形からの薬物の遅延放出を指す。
【０３００】
本明細書で提供される化合物の投与に好適な薬学的担体またはビヒクルには、特定の投与モードに好適であると当業者に知られているようなすべての担体が含まれる。さらに、本組成物は、所望の作用を損なわない１つ以上の構成成分、または所望の作用を補うかもしくは別の作用を有する構成成分を含むことができる。
【０３０１】
さらなる態様では、剤形は、発泡性剤形であり得る。発泡性とは、剤形が水および唾液を含む液体と混合された場合に、気体を発生させることを意味する。ある種の発泡性薬剤（または発泡性カップル）は、発泡性崩壊剤の水または口腔内の唾液との曝露に際して起こる化学反応によって気体を発生させる。この反応は、可溶性酸性源と一炭酸アルカリまたは炭酸アルカリの源との反応の結果であり得る。これらの２つの一般的化合物の反応により、水または唾液との接触に際して二酸化炭素ガスが生じる。発泡性カップルは（または、個々の酸および塩基は個別に）、早過ぎる反応を防ぐために溶媒保護コーティングまたは腸溶コーティングでコーティングすることができる。このようなカップルはまた、予め凍結乾燥した粒子（例えば、グリカンポリマー）と混合することもできる。酸源は、ヒトが摂取しても安全なものであればよく、一般に、例えば、クエン酸、酒石酸、アマリン酸、フメル酸、アジピン酸、コハク酸などの、食用酸、酸およびヒドライト制酸剤を含むことができる。炭酸塩源には、乾燥固体炭酸塩および炭酸水素塩、例えば、炭酸水素ナトリウム、炭酸ナトリウム、炭酸水素カリウムおよび炭酸カリウム、炭酸マグネシウムなどが含まれる。酸素または他のガスを発生し、ヒトが摂取しても安全である反応物も含まれる。一実施形態では、クエン酸および炭酸水素ナトリウムが使用される。
【０３０２】
別の態様では、剤形は、ロリポップまたはロゼンジ等のキャンディ形態（例えば、基材）であり得る。一実施形態では、グリカンポリマーの有効量をキャンディ基材中に分散させる。一実施形態では、キャンディ基材は、１種以上の糖（デキストロースまたはスクロース等）を含む。別の実施形態では、キャンディ基材は糖を含まない基材である。特定のキャンディ基材の選択には幅広いバリエーションがある。従来の甘味料（例えば、スクロース）、糖尿病患者の使用に適する糖アルコール（例えば、ソルビトールもしくはマンニトール）、または他の甘味料（例えば、本明細書に記載される甘味料）は、使用され得る。キャンディ基材は、非常に軟質で迅速に溶解するものでもよく、または硬質でより緩徐に溶解するものであり得る。様々な形態は、異なる状況での利点を有するであろう。
【０３０３】
有効量のグリカンポリマーを含むキャンディ塊（ｃａｎｄｙ  ｍａｓｓ）組成物は、それを必要とする対象に対して経口投与し、キャンディ塊が溶解し飲み込まれるにつれて有効量のグリカンポリマーが対象の口腔内に放出されるようにすることができる。それを必要とする対象には、ヒトの成人または子供が含まれる。
【０３０４】
本明細書に記載される剤形はまた、高圧均質化、湿式もしくは乾式ボールミル粉砕、または小粒子沈殿（例えば、ｎＧｉｍａｔ’ｓ  ＮａｎｏＳｐｒａｙ）を含むがこれらに限定されない、様々な方法によって製造される薬学的粒子の形態をとることもできる。好適な粉末製剤を作製するのに有用な他の方法は、有効成分および賦形剤の溶液を調製し、その後に沈殿、濾過、および微粉化を行うこと、またはその後に凍結乾燥による溶液の除去を行い、その後に粉末を所望の粒径に微粉化することである。一実施形態では、薬学的粒子は、３〜１０００ミクロン、例えば、最大で３、４、５、６、７、８、９、１０、２０、３０、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００、２５０、３００、３５０、４００、４５０、５００、５５０、６００、６５０、７００、７５０、８００、８５０、９００、９５０、１０００ミクロンの最終サイズを有する。別の実施形態では、薬学的粒子は、１０〜５００ミクロンの最終サイズを有する。別の実施形態では、薬学的粒子は、５０〜６００ミクロンの最終サイズを有する。別の実施形態では、薬学的粒子は、１００〜８００ミクロンの最終サイズを有する。
【０３０５】
別の態様では、本開示は、グリカンポリマー（例えば、本明細書に記載のグリカンポリマー）を提供すること；グリカンポリマーを単位剤形（例えば、本明細書に記載の単位剤形）に製剤化すること；単位剤形をパッケージ化すること；パッケージ化した包装された単位剤形にラベル付けすること、および／またはパッケージ化され、かつラベル付けされた単位剤形を販売するか、もしくは販売に供することを含む、本明細書に記載の単位剤形を作製する方法を提供する。
【０３０６】
本明細書に記載される単位剤形もまた、処理され得る。一実施形態では、この処理は、剤形を医薬組成物に処理すること、例えば、第２の構成成分、例えば、賦形剤または緩衝液で製剤化し、混合すること；より少量もしくは多量のアリコートを分割すること；容器、例えば、気密性または液密性容器に廃棄すること；パッケージ化すること；ラベルを一体化させること；異なる場所に出荷または移動すること、のうちの１つ以上を含む。一実施形態では、この処理は、分類すること、選択すること、許容もしくは廃棄すること、放出もしくは保留すること、医薬組成物に処理すること、異なる場所に出荷もしくは移動すること、製剤化すること、ラベル付けすること、パッケージ化すること、商取引に放出すること、または販売もしくは販売に供すること、所定の閾値を満たすかどうかに応じて異なること、のうちの１つ以上を含む。いくつかの実施形態では、処理した剤形は、本明細書に記載されるグリカンポリマーを含む。
【０３０７】
いくつかの実施形態では、この処理は、剤形を医薬組成物に処理すること、例えば、第２の構成成分、例えば、賦形剤または緩衝剤と製剤化し、混合すること；より少量もしくはより多量のアリコートに分割すること；容器、例えば、気密性または液密性容器に処理すること；パッケージ化すること；ラベルと関連付けること；異なる場所に出荷または移動させること、のうちの１つ以上を含む。一実施形態では、この処理は、分類すること、選択すること、許容もしくは廃棄すること、放出もしくは保留すること、医薬組成物に処理すること、異なる場所に出荷もしくは移動させること、製剤化すること、ラベル付けすること、パッケージ化すること、商取引に放出すること、または販売するかもしくは販売に供すること、決定に応じること、のうちの１つ以上を含む。
【０３０８】
別の実施形態では、グリカンポリマー調製物を含む経口剤形が提供され、経口剤形はシロップである。シロップは、約１％、５％、１０％、１５％、２０％、２５％、３０％、３５％、４０％、４５％、５０％、５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、または８５％の固体を含み得る。シロップは、約１５％、２０％、２５％、３０％、３５％、４０％、４５％、または５０％の液体、例えば、水を含み得る。固体は、グリカンポリマー調製物を含み得る。固体は、例えば、約１〜９６％、１０〜９６％、２０〜９６％、３０〜９６％、４０〜９６％、５０〜９６％、６０〜９６％、７０〜９６％、８０〜９６％、または９０〜９６％のグリカンポリマー調製物であり得る。別の実施形態では、グリカンポリマー調製物は、粘性流体として製剤化される。
【０３０９】
一実施形態では、本組成物は、発泡成分、中和成分、または水不溶性食物繊維を含む。発泡成分は、炭酸水素ナトリウム、炭酸ナトリウム、および炭酸カルシウムからなる群から選択される少なくとも１つのメンバーであり得る。一実施形態では、中和成分は、クエン酸、Ｌ−酒石酸、フマル酸、Ｌ−アスコルビン酸、ＤＬ−リンゴ酸、酢酸、乳酸、および無水クエン酸からなる群から選択される少なくとも１つのメンバーであり得る。一実施形態では、水不溶性食物繊維は、結晶性セルロース、コムギふすま、オートムギふすま、トウモロコシ繊維、ダイズ繊維、およびビート繊維からなる群から選択される少なくとも１つのメンバーであり得る。製剤は、スクロース脂肪酸エステル、粉末糖、フルーツジュース粉末、および／または香味材料を含むことができる。
【０３１０】
いくつかの実施形態では、剤形は、小腸または大腸などのＧＩ管の特定の領域においてグリカンポリマー調製物を含む医薬組成物を放出するように製剤化される。いくつかの実施形態では、剤形は、盲腸、上行結腸、横行結腸、下行結腸、Ｓ字結腸および／または直腸などのＧＩ管の特定の領域においてグリカンポリマー調製物を含む医薬組成物を放出するように製剤化される。
【０３１１】
いくつかの実施形態では、本明細書に記載のグリカンポリマー調製物のための剤形は、酵素応答性送達システムである。例えば、トリプシン応答性ポリマーは、トリプシンによって分解されるペプチドによって架橋されるヒドロゲルを使用して作製され得る。トリプシンは小腸で活性である。トリプシン応答性送達システムは、グリカンポリマー調製物の小腸への送達を標的にするために使用され得る。別の例では、アルブミンで架橋されたポリ（ビニルピロリドン）からなる酵素消化性ヒドロゲルがペプシンの存在下で分解される。
【０３１２】
いくつかの実施形態において、本明細書に記載のグリカンポリマー調製物のための剤形は、ＧＩ管の特定の部位での長期の保持を可能にする送達デバイスである。例えば、胃保持性送達システムは、胃へのグリカンポリマー調製物の長期放出を可能にする。胃保持性送達は、胃または上部小腸の細菌を調節するグリカンポリマー調製物に使用され得る。
【０３１３】
いくつかの実施形態では、本明細書に記載のグリカンポリマー調製物のための剤形は、胃の粘膜表面に付着する粘膜付着性送達システムである。それらは、通常、多数の水素結合基を有するポリマー、例えば、架橋ポリアクリル酸、カルボキシメチルセルロースナトリウム、アルギン酸ナトリウム、カラギナン、Ｃａｒｂｏｐｏｌ  ９３４Ｐ、またはチオール化ポリカルボフィルから構成される。
【０３１４】
いくつかの実施形態では、本明細書に記載のグリカンポリマー調製物のための剤形は、胃においてサイズが急速に大きくなる膨張送達システムであり、これは、幽門の通過を遅らせる。このようなシステムは、胃内で広がるシステムを含む。例えば、四面体、環、円板などの幾何学的形状は、ゼラチンカプセルに詰め込むことができる。カプセルが溶解すると、形状は広がる。このシステムは、１つ以上の侵食性ポリマー（例えば、ヒドロキシプロピルセルロース）、１種以上の非侵食性ポリマー（例えば、ポリオレフィン、ポリアミド、ポリウレタン）から構成され得る。その後、グリカンポリマーがポリマーマトリックス内に分散され得る。保持時間は、ポリマーのブレンドによって微調整することができる。あるいは、胃の酸性ｐＨで安定であるが、さらにＧＩ管に沿った中性／アルカリ性条件で溶解する弾性ポリマーから作製されたデバイスが使用され得る。このようなポリマー製剤は、デバイスが胃を出るときの腸閉塞を防止することができる。例えば、ポリ（アクリロイル６−アミノカプロン酸）（ＰＡ６ＡＣＡ）およびポリ（メタクリル酸−コ−エチルアクリレート）（ＥＵＤＲＡＧＩＴ  Ｌ  １００−５５）からなる、カルボキシル基間の水素結合によって架橋された超分子ポリマーゲルもまた使用され得る。他のシステムには、コラーゲンスポンジなどの膨潤性賦形剤が含まれる。例えば、ヒドロゲルマトリックス（例えば、膨潤性コア：ポリビニルピロリドンＸＬ、Ｃａｒｂｏｐｏｌ  ９３４Ｐ、炭酸カルシウム）は、胃で２〜５０倍に膨潤する。超多孔質ヒドロゲル複合材料は、数分で元の体積の数百倍に膨潤する。いくつかのシステム、例えば、親水性の膜に囲まれた二酸化炭素を発生する膨張可能なシステムは、膨張を達成するためにガス発生を利用する。
【０３１５】
いくつかの実施形態では、本明細書に記載のグリカンポリマー調製物のための剤形は、密度制御送達システムである。これらのシステムは、胃液中で浮遊または沈降するように設計され、これは、それらの胃からの排出を遅らせる。例えば、高密度システムは、デバイスを幽門の下、胃の底部に沈ませ、これにより胃を空にすることを回避する。他のシステムは、低密度／フローティングシステムである。そのようなデバイスは、例えば、中空チャンバ内に閉じ込められた空気を含むか、または脂肪、油、または発泡体粉末などの低密度材料を包含し得る。低密度は、例えば膨潤によって達成され得、例えば、ヒドロコロイド含有カプセルは胃液と接触すると溶解し、ヒドロコロイドが膨潤して粘液体を形成する。別のポリマーには、キトサン、アルギン酸ナトリウム、およびモノオレイン酸グリセロールマトリックスが含まれる。低密度は、ガスの発生によって達成され得る。例えば、炭酸塩、および任意選択によりクエン酸を充填した錠剤は、酸性水性媒体と接触後に二酸化炭素を発生する。発生した二酸化炭素は、ゲル化ヒドロコロイド内に捕捉され、システムを浮遊させる。ヒドロコロイドには、ヒドロキシプロピルメチルセルロースおよびＣａｒｂｏｐｏｌ  ９３４Ｐが含まれる。
【０３１６】
いくつかの実施形態では、本明細書に記載のグリカンポリマー調製物のための剤形は、小腸または大腸においてデバイスを保持するための設計を使用する。デバイスの位置特異性は、特定のトリガ方法、例えば、ｐＨ、酵素などによって提供される。これらには、粘膜接着のために設計されたシステムが含まれ、またマイクロニードルピルも含まれる。マイクロニードルピルは、ｐＨ応答性コーティングに封入された、マイクロニードルが添加された薬物リザーバを含む。ピルがＧＩ管内の所望の位置に到達し、コーティングが溶解すると、マイクロニードルが、ピルをＧＩ管の内層に付着させる。他の実施形態では、マイクロニードルピルは、クエン酸および炭酸水素ナトリウムがそれぞれ充填された２つの化学的区画からなるカプセルを含む。ピルが消化器系で溶解するにつれて、２つの物質間の障壁が侵食され、それらが混合し、糖からなるマイクロニードルをカプセルの外層を通して小腸の内層に押し込む化学反応を生じさせる。糖のニードルは、糖が吸収されるにつれて、近くの血管に送達される薬物で満たされ得る。
【０３１７】
いくつかの実施形態では、本明細書に記載のグリカンポリマー調製物のための剤形は、ｐＨ感受性ポリマーコーティングを使用する。例えば、ｐＨ依存性ポリマー（二相または三相）は、低いｐＨレベルで不溶であり得（例えば、胃における酸耐性、ｐＨ１〜２の胃において耐酸性である）、ｐＨが、例えば、十二指腸で約５．５〜６．２、上行結腸で約ｐＨ５．７、盲腸で約ｐＨ６．４、横行結腸で約ｐＨ６．６、下行結腸で約ｐＨ７．０、回腸で約ｐＨ７．２〜７．５、または遠位小腸で約ｐＨ７．５に上昇すると、溶解性が増大する。一例では、において、ＴＡＲＧＩＴ（商標）技術は、消化（ＧＩ）管におけるグリカンポリマー調製物の部位特異的送達のために使用され得る。このシステムは、末端回腸および結腸を標的にするために、射出成形デンプンカプセル上にｐＨ感受性コーティングを使用する。
【０３１８】
いくつかの実施形態では、本明細書に記載のグリカンポリマー調製物のための剤形は、遅延放出システムまたは時間制御放出システムである。このようなシステムは、通常、ｐＨ感受性および時間放出機能と組み合わせることができる腸溶コーティングを使用する。例えば、３つの構成要素：グリカンポリマー含有コア錠（急速放出機能）、プレスコーティングされた膨潤性疎水性ポリマー層（例えば、ヒドロキシプロピルセルロース層（ＨＰＣ）、および時間放出機能からなるＥＴＰ（腸溶コーティングされた時間放出プレスコート）錠剤が使用され得る。遅滞期の持続時間は、ポリマー層および腸溶コーティング層（耐酸性機能）の重量または組成によって制御することができる。
【０３１９】
いくつかの実施形態では、本明細書に記載されるグリカンポリマー調製物のための剤形は、錠剤およびカプセルのＥｕｄｒａｇｉｔ（登録商標）腸溶コーティングを使用する。他の好適な合成ポリマーには、シェラック、エチルセルロース、酢酸フタル酸セルロース、ヒドロキシプロピルメチルセルロース、ポリ酢酸ビニルフタレート、およびポリ−γ−グルタミン酸（γ−ＰＧＡ）などのポリグルタミン酸コーティングが含まれる。これらのコーティングは、粘膜接着性およびｐＨ依存性放出戦略の両方を組み合わせる。結腸標的送達を増強するために、Ｅｕｄｒａｇｉｔｓ（登録商標）は、それらが可溶性であるｐＨを変化させる種々の側鎖基組成を有するメタクリルコポリマーである。例えば、Ｅｕｄｒａｇｉｔ（登録商標）被覆システムでは、胃（例えば、ｐＨ１．４）および小腸（例えば、ｐＨ６．３）において有意な薬物放出は生じず、一方、回盲部、ｐＨ７．８で、有意な薬物放出が見られる。
【０３２０】
いくつかの実施形態では、本明細書に記載のグリカンポリマー調製物のための剤形は、多糖ベース送達システムなどの、微生物トリガーシステムである。多糖ベース送達システムは、生分解性で粘膜接着性のポリマーコーティング、例えば、キトサンおよびペクチンからなるコーティングを含む。他の好適な天然ポリマーには、例えば、グアーガム、イヌリン、シクロデキストリン、デキストラン、アミラーゼ、コンドロチン硫酸、ローカストビーンガムが含まれる。これらの送達システムは、グリカンポリマー調製物の小腸への送達を標的にするために使用され得る。グアーガム、キサンタンガム、キトサン、アルギン酸塩などの天然に存在する多糖類によるコーティングは、結腸の腸内微生物叢、例えば、キシロシダーゼ、アラビノシダーゼ、ガラクトシダーゼなどの酵素によって分解される。例えば、ＣＯＤＥＳ（商標）技術を使用して、グリカンポリマー調製物を送達することができる。このシステムは、多糖類コーティングをｐＨ感受性コーティングと組み合わせる。いくつかの実施形態では、この系は、以下の３層のポリマーコーティングでコーティングされたコア錠剤からなる：外側コーティングは、Ｅｕｄｒａｇｉｔ  Ｌから構成される。このコーティングは十二指腸で溶解し、次のコーティングを露出させる。次のコーティングは、Ｅｕｄｒａｇｉｔ  Ｅから構成される。この層は、内部コアに存在するラクツロースの放出を可能にする。ラクツロースは、Ｅｕｄｒａｇｉｔ  Ｅ層が溶解する周囲ｐＨを低下させる短鎖脂肪酸に代謝される。Ｅｕｄｒａｇｉｔ  Ｅの溶解は、グリカンポリマーの露出をもたらす。結腸に存在する細菌は、コア錠剤から放出される多糖類の分解に関与する。多糖類の分解は、錠剤を取り囲む内容物のｐＨを低下させる有機酸の形成をもたらし得る。
【０３２１】
いくつかの実施形態では、本明細書に記載のグリカンポリマー調製物のための剤形は、圧力制御送達システムである。このシステムは、小腸よりも結腸でより高い圧力に遭遇するという事実を利用する。例えば、水に不溶のエチルセルロースシステムでは、結腸の内腔内の圧力の結果として、水不溶性ポリマーカプセルの崩壊後に、グリカンポリマーの放出が生じる。放出プロフィールは、エチルセルロースの厚さ、カプセルのサイズおよび／またはカプセルの密度を変化させることによって調節することができる。
【０３２２】
いくつかの実施形態では、本明細書に記載のグリカンポリマー調製物のための剤形は、脈動性結腸標的デリバリーシステムである。例えば、このシステムは、パルシンキャップ（ｐｕｌｓｉｎｃａｐ）システムであり得る。使用されるカプセルは、グリカンポリマーの放出を制御するカプセル内に配置されるプラグを含む。膨潤性ヒドロゲル（例えば、ヒドロキシルプロピルメチルセルロース（ＨＰＭＣ）、ポリメチルメタクリレートまたはポリ酢酸ビニル）が、薬物内容物を密封する。カプセルが流体と接触すると、プラグがカプセルから押し出され、グリカンポリマーが放出される。放出プロフィールは、プラグとカプセル本体との交差する長さおよび／または交点を変化させることによって制御することができる。別のシステムはポートシステムである。カプセル本体は、半透膜に包まれる。不溶性プラグは、浸透圧活性剤およびグリカンポリマーからなる。カプセルが流体と接触すると、半透膜が流体を流入させ、カプセル本体内の圧力を高める。これにより、プラグが押し出され、グリカンポリマーが放出される。
【０３２３】
いくつかの実施形態では、本明細書に記載のグリカンポリマー調製物のための剤形は、浸透圧制御結腸標的デリバリーシステムである。例示的なシステム、ＯＲＯＳ−ＣＴは、硬ゼラチンカプセルに封入された浸透圧ユニット（５または６プッシュプルユニットまで）からなる。プッシュプルユニットは、外側の腸の不透過性膜および内側の半透膜で二層化される。プッシュプルの内部の中央部分は、薬物層およびプッシュ層からなる。グリカンポリマーは、半透膜を通して放出される。プッシュプルユニットを取り囲むカプセル本体は、投与直後に溶解する。ＧＩ管では、腸不透過性膜が水の吸収を妨げる。腸溶コーティングは、小腸（より高いｐＨ、＞７）で溶解し、水は半透膜を通ってユニットに入り、プッシュ層を膨潤させ、グリカンポリマーを外に押し出す。
【０３２４】
いくつかの実施形態では、本明細書に記載のグリカンポリマー調製物のための剤形は、回盲弁に到達する直前にグリカンポリマーを放出するために使用することができる「スマートピル」である。
【０３２５】
いくつかの実施形態では、本明細書に記載のグリカンポリマー調製物のための剤形は、直腸投与製剤である。例えば、浣腸は、液体製剤のグリカンポリマー調製物を直腸に導入する。投与される容量は、通常、１０ｍＬ未満である。坐剤は、グリカンポリマー調製物を直腸に導入する。坐薬は直腸に挿入されると溶融または溶解し、グリカンポリマーを放出する固体剤形である。坐薬製剤の一般的な賦形剤には、ココアバター、ポリエチレングリコール、および寒天が含まれる。
【０３２６】
キット
キットも企図される。例えば、キットは、単位剤形のグリカンポリマー調製物、および胃腸の障害または状態の治療におけるグリカンポリマーの使用説明書を含むパッケージ挿入物を含み得る。キットは、グリカンポリマー調製物を、それを必要としている対象（例えば、ヒト対象）による使用に好適なパッケージ化で含む。本明細書に記載の組成物のいずれも、キットの形態でパッケージ化することができる。キットは、治療の全過程または治療の過程の一部に十分な量のグリカンポリマー調製物（任意選択により、さらに、プレバイオティクス物質、プロバイオティクス細菌、および／または第２の治療剤）を含有し得る。グリカンポリマー調製物の投与量は個々にパッケージ化され得るか、またはグリカンポリマー調製物はバルクで、またはそれらの組み合わせで提供され得る。したがって、一実施形態では、キットは、好適なパッケージ化において、治療レジメンにおける投与ポイントに対応する個々の用量のグリカンポリマー調製物を提供し、この用量は１つ以上のパケットにパッケージ化される。
【０３２７】
一実施形態では、グリカンポリマー調製物は、単一の容器に、または２つ、３つ、４つ、５つ、もしくは５つを超える容器にバルクで提供され得る。例えば、各容器は、１ヶ月間実施される治療プログラムの特定の週に十分なグリカンポリマー調製物を含有し得る。複数のバルク容器が提供される場合、治療期間の全部または一部に十分なグリカンポリマー調製物を提供するために、バルク容器は好適にはまとめてパッケージ化することができる。これらの１つまたは複数の容器は、それを必要とする対象、または、例えば投与スケジュールなどの治療プロトコルを行う医師に有用な情報を示すラベルを付けることができる。
【０３２８】
グリカンポリマー調製物は、本明細書に記載されるように、プロバイオティクス細菌、プレバイオティクス物質または他の物質などの他の好適な物質と共にパッケージ化することができる。他の物質は、グリカンポリマー調製物とは別個にパッケージ化するか、またはグリカンポリマー調製物と混合するか、またはそれらの組み合わせとすることができる。したがって、一実施形態では、キットには、治療の過程または治療の過程の一部で使用することが意図されているすべての成分、例えば、グリカンポリマー調製物、および、任意選択により、緩衝剤、賦形剤など、プロバイオティクス、プレバイオティクス、またはポリマー剤を含有する剤形が含まれる。一実施形態では、グリカンポリマー調製物は、１つのパッケージまたは一組のパッケージでパッケージ化され、プロバイオティクス細菌、プレバイオティクス、および治療剤などの追加成分は、グリカンポリマー調製物とは別個にパッケージ化される。
【０３２９】
キットは、資料、例えば、取扱説明書、予想される結果、証言、説明、警告、臨床データ、医療従事者のための情報等をさらに含み得る。一実施形態では、キットは、このキットが医療従事者の指示の下でのみ使用されることを示すラベルまたは他の情報を含む。容器は、匙、シリンジ、ボトル、カップ、アプリケータ、または他の測定もしくは給仕するデバイスをさらに含み得る。
【０３３０】
細菌成分の同定
いくつかの実施形態では、本明細書に記載のグリカンポリマー調製物は、有益な細菌の増殖を増加させ、病原体の増殖を減少させ、および／または胃腸管内の（微生物）代謝産物（例えば、ＳＣＦＡ、アンモニア、ＴＭＡ／ＴＭＡＯ、胆汁酸、ＬＰＳなど）を調節するために、対象（例えば、ヒト対象）に投与される。いくつかの実施形態では、微生物共同体は、微生物共同体に対するグリカンポリマーによって健康な状態の微生物共同体へシフトする。胃腸管で生じる微生物の変化は、当該技術分野において公知であり、本明細書に記載の任意の数の方法を用いて分析することができる。
【０３３１】
グリカンポリマー調製物が胃腸管内の細菌の集団のシフトをもたらすかどうかを判定するためのある定量的な方法として、定量的ＰＣＲ（ｑＰＣＲ）が行われ得る。ゲノムＤＮＡは、製造業者の取扱説明書に従って、または当業者に公知の他の標準的な方法によって、市販のキット、例えば、Ｍｏ  Ｂｉｏ  Ｐｏｗｅｒｓｏｉｌ（登録商標）−ｈｔｐ  ９６ウェルＳｏｉｌ  ＤＮＡ単離キット（Ｍｏ  Ｂｉｏ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｉｅｓ，Ｃａｒｌｓｂａｄ，ＣＡ）、Ｍｏ  Ｂｉｏ  Ｐｏｗｅｒｓｏｉｌ（登録商標）ＤＮＡ単離キット（Ｍｏ  Ｂｉｏ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｉｅｓ，Ｃａｒｌｓｂａｄ，ＣＡ）、またはＱＩＡａｍｐ  ＤＮＡ  Ｓｔｏｏｌミニキット（ＱＩＡＧＥＮ，Ｖａｌｅｎｃｉａ，ＣＡ）を用いて試料から抽出することができる。
【０３３２】
いくつかの実施形態では、ｑＰＣＲは、ＨｏｔＭａｓｔｅｒＭｉｘ（５ＰＲＩＭＥ，Ｇａｉｔｈｅｒｓｂｕｒｇ，ＭＤ）および特定の（例えば、有益なまたは所望の）細菌に特異的なプライマーを用いて行われ得、バーコード付きのＭｉｃｒｏＡｍｐ（登録商標）Ｆａｓｔ  Ｏｐｔｉｃａｌ  ９６ウェル反応プレート（０．１ｍＬ）（Ｌｉｆｅ  Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ，Ｇｒａｎｄ  Ｉｓｌａｎｄ，ＮＹ）で行われてもよく、ＦＡＭおよびＲＯＸチャンネルで蛍光読み取りを行うＣＦＸ９６（商標）Ｒｅａｌ−Ｔｉｍｅ  Ｓｙｓｔｅｍ（ＢｉｏＲａｄ，Ｈｅｒｃｕｌｅｓ，ＣＡ）を取り付けたＢｉｏＲａｄ  Ｃ１０００（商標）Ｔｈｅｒｍａｌ  Ｃｙｃｌｅｒで行われ得る。ＦＡＭチャンネルでの各ウェルのＣｑ値は、ＣＦＸ  Ｍａｎａｇｅｒ（商標）ソフトウエアバージョン２．１によって決定される。所定の試料のＣｑ値を標準曲線から作成された線形回帰モデルに入力して、標準曲線のウェルのＣｑ値をそれらの試料の既知のｌｏｇ１０（ｃｆｕ／ｍｌ）に比較することにより、各実験試料のｌｏｇ１０（ｃｆｕ／ｍｌ）が計算される。当業者は、代替のｑＰＣＲモードを利用してもよい。
【０３３３】
いくつかの実施形態では、微生物成分は、微生物１６Ｓ小サブユニットリボソームＲＮＡ遺伝子（１６Ｓ  ｒＲＮＡ遺伝子）のＤＮＡ配列を特徴付けることによって同定される。１６Ｓ  ｒＲＮＡ遺伝子は、約１，５００のヌクレオチド長であり、一般的に、生物にわたって高度に保存されているが、ほとんどの生物の種および菌株分類群を分化するために十分なヌクレオチド多様性を宿す特異的な可変および超可変領域（Ｖ１〜Ｖ９）を含有する。細菌におけるこれらの領域は、大腸菌（Ｅ．ｃｏｌｉ）系の命名法に基づいたナンバリングを用いて、それぞれヌクレオチド６９〜９９、１３７〜２４２、４３３〜４９７、５７６〜６８２、８２２〜８７９、９８６〜１０４３、１１１７〜１１７３、１２４３〜１２９４、および１４３５〜１４６５によって定義される。（例えば、Ｂｒｏｓｉｕｓ  ｅｔ  ａｌ．，Ｃｏｍｐｌｅｔｅ  ｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅ  ｓｅｑｕｅｎｃｅ  ｏｆ  ａ  １６Ｓ  ｒｉｂｏｓｏｍａｌ  ＲＮＡ  ｇｅｎｅ  ｆｒｏｍ  Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉ，ＰＮＡＳ  ７５（１０）：４８０１−４８０５（１９７８）を参照）。
【０３３４】
微生物群衆の組成は、完全１６Ｓ  ｒＲＮＡ遺伝子、またはこの遺伝子のＶ１、Ｖ２、Ｖ３、Ｖ４、Ｖ５、Ｖ６、Ｖ７、Ｖ８、およびＶ９領域のうちの少なくとも１つの配列決定によって、またはこの遺伝子からの可変両機の任意の組み合わせ（例えば、Ｖ１〜３またはＶ３〜５）の配列決定によって推定され得る。一実施形態では、Ｖ１、Ｖ２、およびＶ３領域は、微生物叢を特徴付けるために使用される。別の実施形態では、Ｖ３、Ｖ４、およびＶ５領域は、微生物叢を特徴付けるために使用される。別の実施形態では、Ｖ４領域は、微生物叢を特徴付けるために使用される。
【０３３５】
互いに少なくとも９７％同一である配列は、操作的分類単位（ＯＴＵ）に分類される。９７％の類似性を有する配列を含むＯＴＵは、ほぼ種レベルの分類群に対応する。各ＯＴＵから少なくとも１つの代表的な配列が選択され、高度に精選された１６Ｓ  ｒＲＮＡ遺伝子配列の参照データベース（ＧｒｅｅｎｇｅｎｅｓまたはＳＩＬＶＡデータベース等）との比較によってＯＴＵに対する分類的な割り当てを得るために使用される。微生物共同体におけるＯＴＵ間の関係は、各ＯＴＵからの代表的な配列から系統樹を構築することによって推定され得る。
【０３３６】
既知の技術を用いて、完全１６Ｓ配列または１６Ｓ配列の任意の可変領域の配列を決定するために、ゲノムＤＮＡが細菌試料から抽出され、１６Ｓ  ｒＲＮＡ（完全領域または特定の可変領域）がポリメラーゼ鎖反応（ＰＣＲ）から増幅され、ＰＣＲ産物が清浄され、ヌクレオチド配列は、１６Ｓ  ｒＲＮＡ遺伝子の遺伝的組成物またはこの遺伝子の可変領域を決定するために詳細に記述される。完全な１６Ｓ配列決定が行われる場合、使用される配列決定法は、Ｓａｎｇｅｒ配列決定であり得るが、これに限定されない。Ｖ４領域等の１つ以上の可変領域が使用される場合、配列決定は、Ｓａｎｇｅｒ法を用いて、またはＩｌｌｕｍｉｎａ法等の次世代配列決定法を用いて行われ得るが、これらに限定されない。１６Ｓ  ｒＲＮＡ遺伝子の保存領域にアニールするように設計されたプライマー（例えば、Ｖ４領域の増幅のための５１５Ｆおよび８０５Ｒプライマー）は、同時に複数の微生物共同体を特徴付けることができるように固有のバーコード配列を含み得る。
【０３３７】
微生物組成を同定するための別の方法としては、ヌクレオチドマーカーまたは遺伝子、具体的には、高度の保存された遺伝子（例えば、「ハウスキーピンング」遺伝子）、もしくはこれらの組み合わせ、または全ゲノムショットガン配列（ＷＧＳ）の特徴である。定義された方法を用いて、細菌試料から抽出されたＤＮＡは、ＰＣＲを用いて増幅され、増幅した産物のヌクレオチド配列を決定するために配列決定された特定のゲノム領域を有するであろう。ＷＧＳ法では、抽出されたＤＮＡは、（３００〜約４０，０００ヌクレオチド）様々な長さの部分に断片化され、増幅することなく直接配列決定されるであろう。配列データは、Ｓａｎｇｅｒ、Ｉｌｌｕｍｉｎａ、４５４  Ｌｉｆｅ  Ｓｃｉｅｎｃｅｓ、Ｉｏｎ  Ｔｏｒｒｅｎｔ、ＡＢＩ、Ｐａｃｉｆｉｃ  Ｂｉｏｓｃｉｅｎｃｅｓ、および／またはＯｘｆｏｒｄ  Ｎａｎｏｐｏｒｅが挙げられるが、これらに限定されない、任意の配列決定技術を用いて生成することができる。
【０３３８】
１６Ｓ  ｒＲＮＡ遺伝子に加えて、所与の種または分類学的群においてマーカー遺伝子であることが公知である選択された一組の遺伝子を分析して、微生物共同体の組成を評価する。これらの遺伝子は、ＰＣＲ系スクリーニング戦略を用いて代替的にアッセイされる。例えば、様々な菌株の病原性大腸菌は、非耐熱性（ＬＴＩ、ＬＴＩＩａ、およびＬＴＩＩｂ）および耐熱性（ＳＴＩおよびＳＴＩＩ）毒素、ベロ毒素型１、２、および２ｅ（それぞれ、ＶＴ１、ＶＴ２、およびＶＴ２ｅ）、細胞毒性壊死性因子（ＣＮＦ１およびＣＮＦ２）、ａｔｔａｃｈｉｎｇ  ａｎｄ  ｅｆｆａｃｉｎｇ機序（ｅａｅＡ）、腸管凝集性機序（Ｅａｇｇ）、および侵入性機序（Ｅｉｎｖ）をコードする遺伝子を用いて区別される。マーカー遺伝子の使用により微生物共同体の分類学的組成物を決定するために使用される最適な遺伝子は、配列ベースの分類学的同定の当業者にはよく知られている。
【０３３９】
微生物の全ゲノム配列決定（ＷＧＳ）のための配列決定ライブラリーは、細菌ゲノムＤＮＡから調製され得る。ヒトまたは実験動物試料から単離されているゲノムＤＮＡについては、ＤＮＡは、任意選択により、市販のキット、例えば、ＮＥＢＮｅｘｔ  Ｍｉｃｒｏｂｉｏｍｅ  ＤＮＡ濃縮キット（Ｎｅｗ  Ｅｎｇｌａｎｄ  Ｂｉｏｌａｂｓ，Ｉｐｓｗｉｃｈ，ＭＡ）または他の濃縮キットを用いて、細菌ＤＮＡに対して濃縮され得る。配列決定ライブラリーは、製造業者の取扱説明書に従って、市販のキット、例えば、Ｎｅｘｔｅｒａ  Ｍａｔｅ−Ｐａｉｒ試料調製キット、ＴｒｕＳｅｑ  ＤＮＡ  ＰＣＲ−ＦｒｅｅもしくはＴｒｕＳｅｑ  Ｎａｎｏ  ＤＮＡ、またはＮｅｘｔｅｒａ  ＸＴ試料調製キット（Ｉｌｌｕｍｉｎａ，Ｓａｎ  Ｄｉｅｇｏ，ＣＡ）を用いてゲノムＤＮＡから調製され得る。
【０３４０】
あるいは、ライブラリーは、Ｉｌｌｕｍｉｎａ配列決定プラットフォームに適合する他のキット、例えば、ＮＥＢＮｅｘｔ  ＤＮＡライブラリー構築キット（Ｎｅｗ  Ｅｎｇｌａｎｄ  Ｂｉｏｌａｂｓ，Ｉｐｓｗｉｃｈ，ＭＡ）を用いて調製され得る。次いで、ライブラリーは、ＭｉＳｅｑ、ＨｉＳｅｑ、またはＮｅｘｔＳｅｑシ−ケンサー（Ｉｌｌｕｍｉｎａ，Ｓａｎ  Ｄｉｅｇｏ，ＣＡ）が挙げられるが、これらに限定されない、標準的な配列決定技術を用いて配列決定され得る。
【０３４１】
あるいは、全ゲノム・ショットガン・フラグメント・ライブラリーは、当該技術分野における標準的な方法を用いて調製した。例えば、ショットガン・フラグメント・ライブラリーは、ＧＳ  ＦＬＸ  Ｔｉｔａｎｉｕｍ  Ｒａｐｉｄライブラリー調製キット（４５４  Ｌｉｆｅ  Ｓｃｉｅｎｃｅｓ，Ｂｒａｎｆｏｒｄ，ＣＴ）を用いて構築し、ＧＳ  ＦＬＸ  Ｔｉｔａｎｉｕｍ  ｅｍＰＣＲキット（４５４  Ｌｉｆｅ  Ｓｃｉｅｎｃｅｓ，Ｂｒａｎｆｏｒｄ，ＣＴ）を用いて増幅し、４５４シ−ケンサー（４５４  Ｌｉｆｅ  Ｓｃｉｅｎｃｅｓ，Ｂｒａｎｆｏｒｄ，ＣＴ）上で標準的な４５４パイロ配列決定プロトコルに従って配列決定し得る。
【０３４２】
細菌ＲＮＡは、ＲｉｂｏＰｕｒｅ  Ｂａｃｔｅｒｉａｌ  ＲＮＡ精製キット（Ｌｉｆｅ  Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ，Ｃａｒｌｓｂａｄ，ＣＡ）等の市販のキットによって細菌を含む微生物培地または試料から単離され得る。細菌ＲＮＡの単離のための別の方法は、ｔＲＮＡの除去による細菌ＲＮＡの精製した試料におけるｍＲＮＡの濃縮を含み得る。
【０３４３】
あるいは、ＲＮＡは、Ｎｅｘｔｅｒａ  ＸＴ試料調製キット（Ｉｌｌｕｍｉｎａ，Ｓａｎ  Ｄｉｅｇｏ，ＣＡ）等の標準的な方法を用いて配列決定ライブラリーを生成するために使用される、ｃＤＮＡに変換され得る。
【０３４４】
核酸配列は、配列相同性および系統発生置換法または２つの戦略の組み合わせを用いて、分類学的割り当てを定義するために分析される。類似のアプローチは、タンパク質名、タンパク質機能、転写因子名、および核酸配列については任意の他の分類図解に注釈を付けるために使用される。配列相同性に基づく方法は、ＢＬＡＳＴ、ＢＬＡＳＴｘ、ｔＢＬＡＳＴｎ、ｔＢＬＡＳＴｘ、ＲＤＰ分類器、ＤＮＡｃｌｕｓｔ、ＲａｐＳｅａｒｃｈ２、ＤＩＡＭＯＮＤ、ＵＳＥＡＲＣＨ、およびＱＩＩＭＥまたはＭｏｔｈｕｒ等のこれらのアルゴリズムの様々な実装を含む。これらの方法は、読み取られた配列を参照データベースにマッピングし、最も一致するものを選択する。一般的なデータベースは、分類学的割り当てについては、ＫＥＧＧ、ＭｅｔａＣｙｃ、ＮＣＢＩ非冗長性データベース、Ｇｒｅｅｎｇｅｎｅｓ、ＲＤＰ、およびＳｉｌｖａを含む。機能的割り当てについては、読み出しは、ＣＯＧ、ＫＥＧＧ、ＢｉｏＣｙｃ、ＭｅｔａＣｙｃ、および炭水化物活性酵素（ＣＡＺｙ）データベース等の様々な機能的データベースにマッピングされる。微生物クレードは、ＭｅｔａＰｈｌＡｎを含むソフトウェアを用いて割り当てられる。
【０３４５】
微生物集団のプロテオーム解析
グリカンポリマーの調製物は、健康な状態と関連する微生物タンパク質の発現を増加させる、または病的状態と関連する微生物タンパク質の発現を減少する能力に基づいて選択され得る。微生物集団のプロテオーム分析は、当業者に公知のプロトコルに従って行われ得る（例えば、Ｃｏｒｄｗｅｌｌ，Ｅｘｐｌｏｒｉｎｇ  ａｎｄ  ｅｘｐｌｏｉｔｉｎｇ  ｂａｃｔｅｒｉａｌ  ｐｒｏｔｅｏｍｅｓ，Ｍｅｔｈｏｄｓ  ｉｎ  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｂｉｏｌｏｇｙ，２００４，２６６：１１５）。特異的に発現されたタンパク質を同定するために（例えば、グリカンポリマーによる微生物集団の処置の際にタンパク質発現の変化を同定するために）、プロテオーム分析は、例えば、Ｊｕｓｔｅら（Ｂａｃｔｅｒｉａｌ  ｐｒｏｔｅｉｎ  ｓｉｇｎａｌｓ  ａｒｅ  ａｓｓｏｃｉａｔｅｄ  ｗｉｔｈ  Ｃｒｏｈｎ’ｓ  ｄｉｓｅａｓｅ，Ｇｕｔ，２０１４，６３：１５６６）に記載されるように行われ得る。例えば、タンパク質は、２つの試料（例えば、未処置の微生物集団およびグリカンポリマーにより処置された集団）の微生物溶解物から単離される。各タンパク質試料は、標識され（例えば、蛍光色素、例えば、Ｃｙ３またはＣｙ５  ＣｙＤｙｅ  ＤＩＧＥ  Ｆｌｕｏｒ最小色素、ＧＥ  Ｈｅａｌｔｈｃａｒｅを用いて）、二次元ディファレンスゲル電気泳動（２Ｄ−ＤＩＧＥ）によって分析される。ゲルを染色し、２つの試料間で有意に異なると同定されるタンパク質スポットを切り出し、消化し、液体クロマトグラフィー−タンデム質量分析（ＬＣ−ＭＳ／ＭＳ）によって分析する。Ｘ！ＴａｎｄｅｍＰｉｐｅｌｉｎｅ（ｈｔｔｐ：／／ｐａｐｐｓｏ．ｉｎｒａ．ｆｒ／ｂｉｏｉｎｆｏ／ｘｔａｎｄｅｍｐｉｐｅｌｉｎｅ／）は、異なった形で発現したタンパク質を同定するために使用され得る。
【０３４６】
グリカンポリマーの調製物はまた、微生物産物の存在におけるそれらの効果に基づいてヒト対象への投与のために選択され得る。例えば、グリカンポリマーの調製物は、プロピオネート（プロピオン酸）、アセテート、および／またはブチレート（酪酸）等の短鎖脂肪酸を産生する細菌の増殖を誘導または促進するそれらの能力に関して選択することができる。同様に、グリカンポリマーの調製物は、乳酸を産生する細菌の増殖を誘導または促進するその能力について選択することができ、これは酸性環境を産生することによって他の細菌の増殖を調節することができ、また、ブチレートを産生する分類群によって利用される。そのような分析は、グリカンポリマーが所望の発酵産物の生成のための基質であるように、プロバイオティクス細菌をグリカンポリマーと対にするためにも使用され得る。いくつかの実施形態では、グリカンポリマーはまた、望ましくない代謝産物（例えば、アンモニア、尿毒症性溶質、ＴＭＡおよび類似のもの）を産生しない細菌分類群に対するそれらの効果に基づいて、ヒト対象への投与のために選択され得る。いくつかの実施形態では、グリカンポリマーは、望ましくない代謝産物を産生しない細菌性分類群の増殖を増大させ、それにより、望ましくない代謝産物を産生する細菌分類群を（例えば、空間および栄養素に関して）凌駕する。産生者に対する非産生者のバランスを、非産生者に有利になるようにシフトすることによって、望ましくない代謝産物の全体的なレベルを減少させることができる。いくつかの実施形態では、非産生者分類群に対するＳＣＦＡ産生者のバランスは、ＳＣＦＡ産生（例えば、ブチレート、アセテート、プロピオネート）のレベルを増加させるためにＳＣＦＡ産生者にシフトされる。いくつかの実施形態では、非産生者分類群に対するアンモニア産生者のバランスは、アンモニア産生のレベルを減少させるために非産生者（例えば、ウレアーゼ陰性細菌分類群）にシフトされる。いくつかの実施形態では、非産生者分類群に対するＴＭＡ産生者のバランスは、ＴＭＡ産生のレベルを減少させるために非産生者にシフトされる。未使用もしくは使用済みの培養培地またはヒトから収集された生物学的試料に存在する代謝産物は、本明細書に記載の方法を用いて決定され得る。質量分析法と組み合わされたガスまたは液体クロマトグラフィー、または１Ｈ−ＮＭＲ等の、試料中の代謝産物の相対濃度を決定するために使用され得、当業者に知られている不偏の方法。これらの測定は、同じ分析システムを通して標準代謝物を実行することによって検証され得る。
【０３４７】
ガスクロマトグラフィー−質量分析（ＧＣ−ＭＳ）または液体クロマトグラフィー−質量分析（ＬＣ−ＭＳ）の分析の場合、極性代謝産物および脂肪酸は、有機溶媒および水性試料の単相または二相系を用いて抽出され、誘導体化され得る（Ｆｅｎｄｔ  ｅｔ  ａｌ．，Ｒｅｄｕｃｔｉｖｅ  ｇｌｕｔａｍｉｎｅ  ｍｅｔａｂｏｌｉｓｍ  ｉｓ  ａ  ｆｕｎｃｔｉｏｎ  ｏｆ  ｔｈｅ  α−ｋｅｔｏｇｌｕｔａｒａｔｅ  ｔｏ  ｃｉｔｒａｔｅ  ｒａｔｉｏ  ｉｎ  ｃｅｌｌｓ，Ｎａｔ  Ｃｏｍｍｕｎ，２０１３，４：２２３６；Ｆｅｎｄｔ  ｅｔ  ａｌ．，Ｍｅｔｆｏｒｍｉｎ  ｄｅｃｒｅａｓｅｓ  ｇｌｕｃｏｓｅ  ｏｘｉｄａｔｉｏｎ  ａｎｄ  ｉｎｃｒｅａｓｅｓ  ｔｈｅ  ｄｅｐｅｎｄｅｎｃｙ  ｏｆ  ｐｒｏｓｔａｔｅ  ｃａｎｃｅｒ  ｃｅｌｌｓ  ｏｎ  ｒｅｄｕｃｔｉｖｅ  ｇｌｕｔａｍｉｎｅ  ｍｅｔａｂｏｌｉｓｍ，Ｃａｎｃｅｒ  Ｒｅｓ，２０１３，７３：４４２９；Ｍｅｔａｌｌｏ  ｅｔ  ａｌ．，Ｒｅｄｕｃｔｉｖｅ  ｇｌｕｔａｍｉｎｅ  ｍｅｔａｂｏｌｉｓｍ  ｂｙ  ＩＤＨ１  ｍｅｄｉａｔｅｓ  ｌｉｐｏｇｅｎｅｓｉｓ  ｕｎｄｅｒ  ｈｙｐｏｘｉａ，Ｎａｔｕｒｅ，２０１１，４８１：３８０）。極性代謝産物の誘導体化のための例示的なプロトコルは、ピリジン中の２％  塩酸メトキシルアミンを用いた代謝産物のインキュベーション、続いて、Ｎ−ｔｅｒｔ−ブチルジメチルシリル−Ｎ−メチルトリフルオロアセトアミド（ＭＴＢＳＴＦＡ）と１％  ｔｅｒｔ−ブチルジメチルクロロシラン（ｔ−ＢＤＭＣＳ）の添加によるメトキシム−ｔＢＤＭＳ誘導体の形成を含む。トリアシルグリセリドおよびリン脂質を含む非極性画分は、遊離脂肪酸に鹸化し、エステル化して、例えば、メタノール中の２％  Ｈ２ＳＯ４によるインキュベーションによって、またはメチル−８試薬（Ｔｈｅｒｍｏ  Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ）を用いることによって脂肪酸メチルエステルを形成し得る。次いで、誘導体化した試料は、標準的なＬＣ−ＭＳ法を用いたＧＣ−ＭＳ、例えば、質量分析（ＭＳ）と適合してガスクロマトグラフ（ＧＣ）上に設置されたＤＢ−３５ＭＳカラム（３０ｍ×０．２５ｍｍ内径×０．２５μｍ、Ａｇｉｌｅｎｔ  Ｊ＆Ｗ  Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ）によって分析され得る。質量アイソトポマー分布は、代謝産物イオンフラグメントを積分することによって判定され、Ｆｅｒｎａｎｄｅｚら（Ｆｅｒｎａｎｄｅｚ  ｅｔ  ａｌ．，Ｃｏｒｒｅｃｔｉｏｎ  ｏｆ  １３Ｃ  ｍａｓｓ  ｉｓｏｔｏｐｏｍｅｒ  ｄｉｓｔｒｉｂｕｔｉｏｎｓ  ｆｏｒ  ｎａｔｕｒａｌ  ｓｔａｂｌｅ  ｉｓｏｔｏｐｅ  ａｂｕｎｄａｎｃｅ，Ｊ  Ｍａｓｓ  Ｓｐｅｃｔｒｏｍ，１９９６，３１：２５５）から適合したアルゴリズム等の標準アルゴリズムを用いて天然存在度について修正され得る。液体クロマトグラフィー−質量分析（ＬＣ−ＭＳ）の場合、極性代謝産物は、ＳｅＱｕａｎｔ  ＺＩＣ−ｐＨＩＬＩＣ  Ｐｏｌｙｍｅｒｉｃカラム（２．１×１５０ｍｍ；ＥＭＤ  Ｍｉｌｌｉｐｏｒｅ）等のカラムが装備されている標準的なベンチトップＬＣ−ＭＳ／ＭＳを用いて分析され得る。分離のために使用される例示的な移動相は、特定のｐＨ値に調整された緩衝液および有機溶媒を含み得る。
【０３４８】
組み合わせて、または代わりに、抽出された試料は、１Ｈ−核磁気共鳴（１Ｈ−ＮＭＲ）によって分析され得る。試料は、任意選択により、緩衝溶液（例えば、Ｄ２Ｏ中のＮａ２ＨＰＯ４、ＮａＨ２ＰＯ４、ｐＨ７．４）の存在下で、Ｄ２Ｏ等の同位体的に濃縮された溶媒と組み合わせられ得る。試料はまた、較正および化学シフト決定のための参照基準物（例えば、５ｍＭの２，２−ジメチル−２−シラペンタン−５−スルホン酸ナトリウム塩（ＤＳＳ−ｄ６，Ｉｓｏｔｅｃ，ＵＳＡ））を補充し得る。分析の前に、溶液は、濾過または遠心分離して、いかなる堆積物または沈殿物を除去し、次いで、分析のために適当なＮＭＲチューブまたは容器（例えば、５ｍｍのＮＭＲチューブ）に移動させてもよい。１Ｈ−ＮＭＲスペクトルは、標準的なＮＭＲ分光器、例えば、５ｍｍのＱＸＩ−Ｚ  Ｃ／Ｎ／Ｐ  プローブ−ヘッド）が装備され、スペクトル積分ソフトウェア（例えば、Ｃｈｅｎｏｍｘ  ＮＭＲ  Ｓｕｉｔｅ  ７．１；Ｃｈｅｎｏｍｘ  Ｉｎｃ．，Ｅｄｍｏｎｔｏｎ，ＡＢ）で分析される、Ａｖａｎｃｅ  ＩＩ＋５００  Ｂｒｕｋｅｒ分光器（５００ＭＨｚ）（Ｂｒｕｋｅｒ，ＤＥ）において獲得され得る。（Ｄｕａｒｔｅ  ｅｔ  ａｌ．，１Ｈ−ＮＭＲ  ｐｒｏｔｏｃｏｌ  ｆｏｒ  ｅｘｏｍｅｔａｂｏｌｏｍｅ  ａｎａｌｙｓｉｓ  ｏｆ  ｃｕｌｔｕｒｅｄ  ｍａｍｍａｌｉａｎ  ｃｅｌｌｓ，Ｍｅｔｈｏｄｓ  Ｍｏｌ  Ｂｉｏｌ，２０１４：２３７−４７）。
【０３４９】
あるいは、１Ｈ−ＮＭＲは、当該技術分野において公知の他の刊行されたプロトコルに従って行われ得る（Ｃｈａｓｓａｉｎｇ  ｅｔ  ａｌ．，Ｌａｃｋ  ｏｆ  ｓｏｌｕｂｌｅ  ｆｉｂｅｒ  ｄｒｉｖｅｓ  ｄｉｅｔ−ｉｎｄｕｃｅｄ  ａｄｉｐｏｓｉｔｙ  ｉｎ  ｍｉｃｅ，Ａｍ  Ｊ  Ｐｈｙｓｉｏｌ  Ｇａｓｔｒｏｉｎｔｅｓｔ  Ｌｉｖｅｒ  Ｐｈｙｓｉｏｌ，２０１５；Ｂａｉ  ｅｔ  ａｌ．，Ｃｏｍｐａｒｉｓｏｎ  ｏｆ  Ｓｔｏｒａｇｅ  Ｃｏｎｄｉｔｉｏｎｓ  ｆｏｒ  Ｈｕｍａｎ  Ｖａｇｉｎａｌ  Ｍｉｃｒｏｂｉｏｍｅ  Ｓｔｕｄｉｅｓ，ＰＬｏＳ  ＯＮＥ，２０１２：ｅ３６９３４）。
【０３５０】
投与
いくつかの実施形態では、グリカンポリマーは、それを必要とする対象（例えば、ヒト対象）に経腸投与によって投与される。いくつかの実施形態では、グリカンポリマーは、それを必要とする対象に、経口、経鼻、経胃または経直腸投与によって投与される。いくつかの実施形態では、グリカンポリマーは、それを必要とする対象に、経管栄養によって投与される。
【０３５１】
いくつかの実施形態では、グリカンポリマーは、１つ以上の薬物処置が終了した直後（例えば、抗生物質処置が終了してから１時間、６時間、１２時間、２４時間、３６時間、４８時間、３日間、４日間、５日間、６日間、７日間、２週間、３週間、または４週間後）に、それを必要とする対象に投与される。一連の薬物処置中、グリカンポリマー調製物は、薬物処置の開始前（例えば、１、２、３、４、５、６、７日前）、薬物処置の開始日に、または抗生物質処置直後、例えば、処置から１、２、３、４、５、６、７日、もしくはそれ以上後に提供されてもよく、また任意選択により、薬物処置の持続期間の初めにのみ（例えば、短期間の間）、またはそれを通して提供されてもよく、さらに、薬物処置期間の終了後に所望の期間中（例えば、その後、１〜７日間、１〜１４日間、または１〜２１日間）継続されてもよい。いくつかの実施形態では、グリカンポリマー調製物の投与は、薬物処置と併せて１つ以上の副作用が生じる、および／または診断される（例えば、消化異常または病原体の増殖）ときに、開始または継続される。いくつかの実施形態では、ディスバイオシスを引き起こす処置剤は、薬物ではなく、放射線処置または外科手術であり、グリカンポリマー調製物はまた、本明細書に記載のように投与され得る。いくつかの実施形態では、処置期間の総数および期間は、処置に対する対象の応答に基づく。例えば、個体は、グリカンポリマー調製物による処置から１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、または１４日後に症状の軽減を経験し得る。別の例では、個体は、グリカンポリマー調製物による処置から１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２ヶ月後に症状の軽減を経験し得る。従って、処置期間は、グリカンポリマー調製物に対する個々の対象の応答および１つ以上の症状の緩和の開始によって決定される。従って、対象は、所与の用量のグリカンポリマー調製物で症状を経験する可能性があり、症状が消失するまで、対象はその用量またはより低用量にとどまることが必要である可能性がある。従って、一実施形態では、処置の期間は、開始時に決定されないが、最大用量のグリカンポリマー調製物が１日毎に達成される、または症状の所望のレベルの軽減が達成されるまで継続する。一実施形態では、処置は連続的である。
【０３５２】
一実施形態では、対象（例えば、ヒト対象）は、処置レジメン中第１の処置期間中に１用量および第２の処置期間中に第２の用量を投与され得る。例えば、対象は、グリカンポリマー調製物の１用量を１週間にわたり、および第２の用量をその後の１週間にわたり投与され得る。
【０３５３】
対象は、グリカンポリマー調製物を自己投与し得、グリカンポリマー調製物は、医療従事者、例えば、医師またはその他の資格のある医療従事者によって供給または推奨され（または処方され）、任意選択により、試験結果（例えば、対象から採取された試料からのバイオマーカーに対して得られた）ならびに／または健康の変化および処置エンドポイントは、医療従事者によってモニタリングされる。いくつかの実施形態では、グリカンポリマー調製物は医療専門家によって投与される。
【０３５４】
一実施形態では、それを必要とする対象は、グリカンポリマー調製物を用いた処置の反復過程を経ることができる。処置過程は、症状が再発するか、または望ましくないレベルまで増加した場合、反復することができる。あるいは、処置過程は、一定または所定の間隔で反復することができる。従って、処置は、約１ヶ月後、２ヶ月後、３ヶ月後、４ヶ月後、６ヶ月後、８ヶ月後、１０ヶ月後、１年後、１８ヶ月後、２年後、３年後、４年後、５年後、または５年超後、またはこれらの任意の組み合わせで反復され得る（例えば、処置は、１年後、次いで、その後２〜５年毎に反復され得る）。処置は、最初の処置において使用されるものと同じ形態（例えば、期間、投与量、投与のタイミング、追加の物質等）で反復することができ、または修正することができる。例えば、処置期間は、短縮または延長することができ、投与量は、増加または減少することができる。
【０３５５】
いくつかの実施形態では、医薬組成物は、１日１回、２回、または３回投与される。いくつかの実施形態では、医薬組成物は、１日２回投与される。いくつかの実施形態では、医薬組成物は、所定の日数（処置期間）にわたって毎日投与される。いくつかの実施形態では、処置期間は、１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、２１、２８、３５、４２、４９、５６、６３、７０、１００、２００、３００、または３６５日間である。いくつかの実施形態では、処置期間は、１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、または１２ヶ月間である。いくつかの実施形態では、処置期間は、１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２年間、または一生である。
【０３５６】
一実施形態では、胃腸疾患、障害、または状態における処置期間の全期間は、約１日〜１０年間、１日〜１年間、１日〜６ヶ月間、１日〜３ヶ月間、１日〜１ヶ月間、１日〜１週間、１日〜５日間、１日〜１０日間、１週間〜約１２週間、または約４週間〜約１０週間、または約４週間〜約８週間、または約６週間であり得る。対象（例えば、ヒト対象）は、適当な処置期間、例えば、１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、または１０超の処置期間を受けてもよい。処置期間中、対象は、任意選択により、プレバイオティクスおよび／またはプロバイオティクスを含有する食品の摂取と共に、本明細書に記載のグリカンポリマー調製物を摂取する。一実施形態では、グリカンポリマー調製物はまた、本明細書に記載の、別の物質（例えば、プロバイオティクスもしくは共生的に有益な細菌、プレバイオティクス物質、または治療剤）との併用で投与され得る。
【０３５７】
いくつかの実施形態では、グリカンポリマー調製物はまた、正常な胃腸微生物叢の増殖を妨げる抗生物質と組み合わせられ得る。典型的には、抗生物質処置の期間は、１〜１４日間、または２〜１０日間、または５〜７日間である。いくつかの実施形態では、グリカンポリマーは、１つ以上の抗生物質処置が終了した直後（例えば、抗生物質処置が終了してから１時間、６時間、１２時間、２４時間、３６時間、４８時間、３日間、４日間、５日間、６日間、７日間、２週間、３週間、または４週間後）に、それを必要とする対象に投与される。一連の抗生物質処置中、グリカンポリマー調製物は、抗生物質処置の開始時に、抗生物質処置直後、例えば、処置から１、２、３、４、５、６、７日、もしくはそれ以上の後に提供され得るか、または望ましくない病原体の胃増殖の診断の際に投与され得る。
【０３５８】
処置方法
疾患または障害を有する対象（例えば、ヒト対象）を処置するための方法が、本明細書で提供される。いくつかの実施形態では、疾患または障害は、代謝産物（例えば、短鎖脂肪酸（ＳＣＦＡ）、アンモニア、トリメチルアミン（ＴＭＡ）、トリメチルアミンＮ−オキシド（ＴＭＡＯ）、尿毒症性溶質、リポ多糖類（ＬＰＳ）、または胆汁酸）のレベル（例えば、望ましくないレベル）に関連する。方法は、いくつかの実施形態では、疾患または障害を処置するのに有効な量でグリカンポリマー調製物をヒト対象に投与することを含む。いくつかの実施形態では、グリカンポリマー調製物（例えば、本明細書に記載のもの）は、様々な疾患、障害、または状態の処置において有益である。そのような疾患、障害、または状態は、微生物叢のディスバイオシスと関連し得る。有益な微生物叢の減衰は、抗生物質、化学療法薬、および他のディスバイオシスを誘発する薬物もしくは処置（例えば、放射線処置）の使用、病原体感染、パソビオント活性、誤較正されたカロリー摂取（例えば、高脂肪、高糖質）、誤較正された（消化されない）繊維摂取（例えば、低または無繊維）、宿主因子（例えば、宿主遺伝子変化）等が挙げられるが、これらに限定されない、様々な因子（例えば、遺伝的または環境）により生じ得る。いくつかの実施形態では、疾患、障害、または状態は、胃腸の微生物叢のディスバイオシスと関連している。いくつかの実施形態では、ディスバイオシスを処置することによって、疾患、障害、または状態が処置される。胃腸の微生物叢のディスバイオシスおよび／または胃腸疾患、障害、もしくは状態と関連し得る症状としては、ガス、胸やけ、胃のむかつき、膨満感、鼓腸、下痢、腹痛、筋けいれん、吐き気、および嘔吐が挙げられるが、これらに限定されない。胃腸に関連した軽度の消化問題はまた、時々の膨満感、下痢、便秘、ガス、または胃のむかつきが含まれる。
【０３５９】
代謝産物に関連する適応症
いくつかの実施形態では、疾患または障害は、代謝産物のレベル（例えば、望ましくないレベル）に関連する。短鎖脂肪酸（ＳＣＦＡ）、アンモニア、トリメチルアミン（ＴＭＡ）、トリメチルアミンＮ−オキシド（ＴＭＡＯ）、尿毒症性溶質、リポ多糖類、または胆汁酸などの代謝産物、およびそれらを産生する細菌は、ある範囲の疾患と関連付けられている。例えば、クローン病ではブチレート産生菌のレベルの減少が報告されており（Ｔａｋａｈａｓｈｉ  ｅｔ  ａｌ．，（２０１６））、クローン病を有する患者の糞便試料では、ブチレートおよびプロピオネートのレベルが減少し、アセテートが増加すると報告されている（Ｇａｌｅｃｋａ  ｅｔ  ａｌ．，（２０１３））。ブチレートは炎症誘発性サイトカインの発現を減少させると報告されており、これはクローン病を含む炎症性腸疾患において重要な役割を果たし得る（Ｒｕｓｓｏ  Ｉ．ｅｔ  ａｌ．ＰＬｏＳ  Ｏｎｅ  ２０１２）。健康な患者集団と比較したブチレートのレベルの低下に関連する他の疾患には、潰瘍性大腸炎（Ｋｕｍａｒｉ  ｅｔ  ａｌ．，２０１３）、２型糖尿病（Ｑｉｎ  ｅｔ  ａｌ．，２０１２）、アトピー性皮膚炎（Ｓｏｎｇ  ｅｔ  ａｌ．，２０１６）、結腸直腸癌（Ｗａｎｇ  ｅｔ  ａｌ．，２０１２）およびパーキンソン病（Ｋｅｓｈａｖａｒｚｉａｎ  ｅｔ  ａｌ．，２０１５）が含まれる。ブチレート産生に、直接的または間接的に、正の相関関係を有する微生物叢の成長を支持するグリカンを個体に投与すると、インビボでのブチレートレベルが上昇し、クローン病の症状が改善または予防され得る。
【０３６０】
いくつかの実施形態では、いくつかの疾患を処置するために、１つ以上の短鎖脂肪酸の産生を減少させるグリカンを投与することもまた有益であり得る。ブチレート産生細菌は、健康な個体と比較して肥満患者において増加していると報告されており（Ｒｏｓｓ  ｅｔ  ａｌ．，２０１５）、ブチレートおよびプロピオネートは、健康な患者と比較して肥満患者の便中で増加することが見出されており（Ｐａｙｎｅ  ｅｔ  ａｌ．，２０１１）、同様に、増加したレベルのアセテートは、肥満と関連づけられている（Ｇａｏ  ｅｔ  ａｌ．，２０１４）。したがって、ブチレート、プロピオネートおよび／またはアセテートの増加と直接的または間接的に関連する微生物叢を選択的に減少させるグリカンの投与は、肥満の処置または予防に有用であり得る。比較的高レベルのアセテートに関連する他の疾患には、吸収不良症候群（Ｂａｌａ  ｅｔ  ａｌ．，２００６）、結腸直腸癌（Ｗｅｉｒ  ｅｔ  ａｌ．，（２０１３）、およびクローン病（Ｇａｌｅｃｋａ  ｅｔ  ａｌ．，２０１３）が含まれる。アセテートの増加と直接的または間接的に関連する微生物叢を選択的に減少させるための対象へのグリカンの投与は、肥満、吸収不良症候群、結腸直腸癌およびクローン病などのアセテートのレベルの上昇に関連する疾患の処置または予防に有用であり得る。
【０３６１】
いくつかの実施形態では、疾患または障害は、短鎖脂肪酸のレベル（例えば、望ましくないレベル）に関連し、例えば、急性嚢炎、アレルギー性疾患、ＡＩＤＳ、アテローム性動脈硬化症、喘息、アトピー性皮膚炎、自閉症スペクトラム障害、慢性機能性便秘、セリアック病、慢性萎縮性胃炎、慢性嚢炎、クロストリジウム・ディフィシル（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｄｉｆｆｉｃｉｌｅ）関連疾患（ＣＤＡＤ）、セリアック病、結腸直腸（ｐｃｏｌｏｒｅｃｔａｌ）腺腫、結腸直腸癌、クローン病、嚢胞性線維症、うつ病、糖尿病（Ｉ型）、糖尿病（ＩＩ型）、下痢、湿疹、腸瘻造設、家族性地中海熱、食物過敏症、移植片対宿主病（ＧｖＨＤ）、肝性脳症、高血圧、炎症性腸疾患、過敏性腸疾患、過敏性腸疾患−便秘（ＩＢＳ−Ｃ）、肺癌、顕微鏡的大腸炎、多発性硬化症、非アルコール性脂肪肝疾患（ＮＡＦＬＤ）、非アルコール性脂肪性肝炎（ＮＡＳＨ）、肥満関連喘息、パーキンソン病（ＰＤ）、放射線誘発急性腸管症状、赤痢、短腸症候群、脊髄損傷関連腸機能障害、全身性炎症反応症候群、全身性エリテマトーデス、および潰瘍性大腸炎から選択される。いくつかの実施形態では、疾患または障害を処置するためにＳＣＦＡのレベルを調節する工程を含む処置方法が提供される。
【０３６２】
いくつかの実施形態では、疾患または障害は、短鎖脂肪酸、例えば、ブチレート（下痢）のレベル（例えば、望ましくないレベル）に関連する。いくつかの実施形態では、疾患または障害は、短鎖脂肪酸、例えば、ブチレート（毒性、例えば、薬物毒性）のレベル（例えば、望ましくないレベル）に関連する。いくつかの実施形態では、下痢関連症状（例えば、薬物毒性により引き起こされるものなど）などの疾患または障害を処置するためにＳＣＦＡ、例えばブチレートのレベルを調節する工程を含む処置方法が提供される。
【０３６３】
いくつかの実施形態では、疾患または障害は、トリメチルアミンまたはトリメチルアミンＮ−オキシドのレベル（例えば、望ましくないレベル）に関連し、例えば、アテローム性動脈硬化症、心血管疾患、ＨＩＶにおける心血管リスク、頸動脈アテローム性動脈硬化症、慢性心疾患、慢性心不全、慢性腎臓病（ＣＫＤ）、慢性血管疾患、結腸直腸癌、冠状動脈性心臓病、冠状動脈疾患（ＣＡＤ）、糖尿病（ＩＩ型）、末期腎臓病、ＨＩＶ、炎症性腸疾患、虚血性発作、メタボリックシンドローム、非アルコール性脂肪性肝疾患（ＮＡＦＬＤ）、肥満、放射線誘発急性腸管症状（ＲＩＡＩＳ）、および脳卒中から選択される。いくつかの実施形態では、疾患または障害を処置するためにＴＭＡまたはＴＭＡＯのレベルを調節する工程を含む処置方法が提供される。
【０３６４】
いくつかの実施形態では、疾患または障害は、アンモニアのレベル（例えば、望ましくないレベル）に関連し、例えば、慢性腎臓病、ヘリコバクター・ピロリ（Ｈｅｌｉｃｏｂａｃｔｅｒ  ｐｙｌｏｒｉ）感染症、肝性脳症、および最小限の肝性脳症（ＭＨＥ）を伴う肝硬変から選択される。一実施形態では、アンモニアのレベル（例えば、望ましくないレベル）に関連する疾患または障害は肝性脳症（ＨＥ）である。いくつかの実施形態では、疾患または障害を処置するためにアンモニアのレベルを調節する工程を含む処置方法が提供される。
【０３６５】
いくつかの実施形態では、疾患または障害は、短胆汁酸のレベル（例えば、望ましくないレベル）に関連し、例えば、アルコール性肝硬変、アテローム性動脈硬化症、慢性嚢炎、肝硬変、結腸直腸腺腫、結腸直腸癌、結腸直腸癌（胆嚢摘出後の患者）、冠動脈疾患、クローン病、嚢胞性線維症、炎症性腸疾患、糖尿病（ＩＩ型）、腸不全関連肝疾患、過敏性腸疾患、過敏性腸疾患−便秘（ＩＢＳ−Ｃ）、吸収不良症候群、非アルコール性脂肪性肝疾患（ＮＡＦＬＤ）、非アルコール性脂肪性肝炎（ＮＡＳＨ）、肥満、肥満関連喘息、胆嚢摘出術後、原発性胆汁性肝硬変、原発性硬化性胆管炎（ＰＳＣ）、進行性家族性肝内胆汁うっ滞、逆流性食道炎、短腸症候群、スティーブン・ジョンソン症候群、潰瘍性大腸炎、および単純性憩室症から選択される。いくつかの実施形態では、疾患または障害を処置するために胆汁酸のレベルを調節する工程を含む処置方法が提供される。
【０３６６】
いくつかの実施形態では、疾患または障害は、リポ多糖類のレベル（例えば、望ましくないレベル）に関連し、例えば、アレルギー性疾患、アテローム性動脈硬化症、自閉症スペクトラム障害、自己免疫性肝炎、慢性疲労症候群（ＣＦＳ）、慢性腎臓病、慢性血管疾患、共通可変免疫不全症（ＣＶＩＤ）、クローン病、うつ病、糖尿病（ＩＩ型）、肝性脳症、Ｂ型肝炎、Ｃ型肝炎、ＨＩＶ、ＨＩＶエリート・コントローラー、腸不全関連肝疾患、過敏性腸疾患、メタボリックシンドローム、新生児壊死性腸炎（ＮＥＣ）、肥満、パーキンソン病（ＰＤ）、および潰瘍性大腸炎から選択される。いくつかの実施形態では、疾患または障害を処置するためにＬＰＳのレベルを調節する工程を含む処置方法が提供される。
【０３６７】
薬物毒性／消化異常（下痢を含む）
グリカンポリマー調製物の投与（例えば、本明細書に記載のように）を介してヒト対象における薬物誘発性または処置誘発性の症状を軽減する方法が本明細書に提供される。一実施形態では、方法は、ブチレートを含むＳＣＦＡのレベルを調節することを含む。薬物または処置によって誘発される症状は、任意の消化異常を含む。例示的な消化異常としては、体重増加、便秘、胸やけ、胃のむかつき、ガス、膨満感、鼓腸、下痢、腹痛、筋けいれん、吐き気、および嘔吐が挙げられるが、これらに限定されない。いくつかの実施形態では、消化異常は、下痢である。本方法は、ヒト対象に、薬物または処置によって誘発される１つ以上の症状を軽減させるのに有効な量でグリカンポリマー調製物調製物を含む医薬組成物を投与することを含む。一実施形態では、処置は、放射線処置である。一実施形態では、処置は、化学療法処置である。
【０３６８】
一実施形態では、グリカンポリマー調製物による処置に適していることが同定される対象（例えば、ヒト対象）は、薬物誘発性下痢、薬物誘発性便秘、薬物誘発性毒性、薬物誘発性耐性（例えば、メトホルミンに対する、化学療法、例えば、イリノテカン（カンプトサール）および／または５−フルオロウラシルなどに対する）、薬物誘発性マイクロバイオーム損傷、薬物誘発性マイクロバイオーム疾患、薬物誘発性胃腸疾患、薬物誘発性腸炎もしくは大腸炎、または類似の薬物誘発性障害、もしくは状態を有する、または有する疑いがある。
【０３６９】
いくつかの実施形態では、グリカンポリマー調製物を含む医薬組成物は、薬物の投与（または放射線処置）の前、それと同時に、またはその後に投与され、この投与は症状を誘導する。
【０３７０】
しばしば、薬物または処置誘導性症状と関連する例示的な薬物としては、抗癌剤、抗糖尿病、免疫抑制薬、抗菌薬、化学療法薬、抗精神病、プロトンポンプ阻害剤、チロシンキナーゼ阻害剤（ＴＫＩ、例えば、ダサチニブ（Ｓｐｒｙｃｅｌ）、エルロチニブ（Ｔａｒｃｅｖａ）、ゲフィチニブ（Ｉｒｅｓｓａ）、イマチニブ（Ｇｌｅｅｖｅｃ）、ラパチニブ（Ｔｙｋｅｒｂ）、ニロチニブ（Ｔａｓｉｇｎａ）、ソラフェニブ（Ｎｅｘａｖａｒ）、スニチニブ（Ｓｕｔｅｎｔ）、アファチニブ（Ｇｉｌｏｔｒｉｆ）、アレチニブ（Ａｌｅｃｅｎｓａ）、アキシチニブ（Ｉｎｌｙｔａ）、ボルテゾミブ（Ｖｅｌｃａｄｅ）、ボスチニブ（Ｂｏｓｕｌｉｆ）、カボザンチニブ（Ｃｏｍｅｔｒｉｑ、Ｃａｂｏｍｅｔｙｘ）、カルフィルゾミブ（Ｋｙｐｒｏｌｉｓ）、セリチニブ（Ｚｙｋａｄｉａ）、コビメチニブ（Ｃｏｔｅｌｌｉｃ）、クリゾチニブ（Ｘａｌｋｏｒｉ）、ダブラフェニブ（Ｔａｆｉｎｌａｒ）、ダサチニブ（Ｓｐｒｙｃｅｌ）、エルロチニブ（Ｔａｒｃｅｖａ）、ゲフィチニブ（Ｉｒｅｓｓａ）、イブルチニブ（Ｉｍｂｒｕｖｉｃａ）、イデラリシブ（Ｚｙｄｅｌｉｇ）、イマチニブ（Ｇｌｅｅｖｅｃ）、イキサゾミブ（Ｎｉｎｌａｒｏ）、ラパチニブ（Ｔｙｋｅｒｂ）、レンバチニブ（Ｌｅｎｖｉｍａ）、ニロチニブ（Ｔａｓｉｇｎａ）、ニラパリブ（Ｚｅｊｕｌａ）、オラパリブ（Ｌｙｎｐａｒｚａ）、オシメルチニブ（Ｔａｇｒｉｓｓｏ）、パルボシクリブ（Ｉｂｒａｎｃｅ）、パゾパニブ（Ｖｏｔｒｉｅｎｔ）、ペガプタニブ（Ｍａｃｕｇｅｎ）、ポナチニブ（Ｉｃｌｕｓｉｇ）、レゴラフェニブ（Ｓｔｉｖａｒｇａ）、リボシクリブ（Ｋｉｓｑａｌｉ）、ルカパリブ（Ｒｕｂｒａｃａ）、ルキソリチニブ（Ｊａｋａｆｉ）、ソニデジブ（Ｏｄｏｍｚｏ）、ソラフェニブ（Ｎｅｘａｖａｒ）、スニチニブ（Ｓｕｔｅｎｔ）、トファシチニブ（Ｘｅｌｊａｎｚ）、トラメチニブ（Ｍｅｋｉｎｉｓｔ）、バンデタニブ（Ｃａｐｒｅｌｓａ）、ベムラフェニブ（Ｚｅｌｂｏｒａｆ）、ビスモデジブ（Ｅｒｉｖｅｄｇｅ））および非ステロイド性抗炎症薬（ＮＳＡＩＤ）が挙げられるが、これらに限定されない。これらの薬物の投与は、一般的に、例えば、処置レジメン中に生じ得る、ディスバイオシスと関連する。いくつかの実施形態では、ディスバイオシスは、薬物または処置によって誘発される症状、例えば、消化異常、例えば下痢、を引き起こすか、または増幅する。いくつかの実施形態では、グリカンポリマー調製物の投与は、マイクロバイオームを調節し、そのため、薬物または処置誘導性症状が低減される（例えば、ブチレートなどのＳＣＦＡのレベルを調節することによって）。いくつかの実施形態では、グリカンポリマー調製物は、薬物処置に悪影響を及ぼすまたは負に応答し得る、あるいは薬物処置に悪影響を及ぼすまたは負に応答し得る共生細菌を補足し得る、共生細菌の増殖を促進し、かつ／または有益な微生物共同体の増殖を抑制する。いくつかの実施形態では、グリカンポリマー調製物は、ＳＣＦＡ産生細菌分類群、例えば、アセテート、プロピオネートまたはブチレート産生分類群などの増殖を促進する。
【０３７１】
消化異常の症状がグリカンポリマー調製物の投与によって減少され得る消化異常と関連する薬物の特定の例としては、シプロフロキサシン、クリンダマイシン、アモキシシリン−クラブラン酸、セフィキシム、エファロスポリン、フルオロキノロン、アジスロマイシン、クラリスロマイシン、エリスロマイシン、テトラサイクリン、アジスロマイシン、イリノテカン（カンプトサール）、５−フルオロウラシル、ロイコボリン、オキサリプラチン、ボルテゾミブ、イマチニブ、レナリドマイド、イムブルビカ、イピリムマブ、ペルツズマブ、カペシタビン、ドセタキセル、ラパチニブ、エルロチニブ、カルムスチン、エトポシド、アラシチン、メルファラン、シタラビン、ダウノルビシン、アムサクリン、ミトキサントロン、オランザピン、ラニチジン、ファモチジン、シメチジン、オメプラゾール、スクラルファート、エソメプラゾール、ナプロキセン、ジクロフェナク、インドメタシン、イブプロフェン、ケトプロフェン、ピロキシカム、セレコキシブ、ニメスリド、アスピリン、メトホルミン、パロキセチン、バルプロ酸、またはクロザピンが挙げられるが、これらに限定されない。
【０３７２】
いくつかの実施形態では、消化異常は、化学療法薬による対象（例えば、ヒト対象）の処置と関連する。一実施形態では、消化異常は、下痢である。特定の実施形態では、化学療法薬は、イリノテカン、５−フルオロウラシル、ロイコボリン、またはこれらの組み合わせである。特定の実施形態では、化学療法剤は、オキサリプラチン、ロイコボリン、５−フルオロウラシル、またはこれらの組み合わせである（例えば、ＦＯＬＦＩＲＩレジメン）。特定の実施形態では、化学療法薬は、ボルテゾミブ、イマチニブ、レナリドマイド、イムブルビカ、イピリムマブ、ペルツズマブ、カペシタビン、ドセタキセル、ラパチニブ、エルロチニブ、またはこれらの組み合わせである。いくつかの実施形態では、化学療法薬は、カルムスチン、エトポシド、アラシチン、メルファラン、またはこれらの組み合わせである。特定の実施形態では、化学療法薬は、シタラビン、ダウノルビシン、エトポシド、またはこれらの組み合わせである。特定の実施形態では、化学療法薬は、アムサクリン、シタラビン、エトポシド、またはこれらの組み合わせである。特定の実施形態では、化学療法薬は、ミトキサントロン、シタラビン、またはこれらの組み合わせである。
【０３７３】
いくつかの実施形態では、消化異常は、抗生物質による対象の処置と関連する。一実施形態では、消化異常は、下痢である。特定の実施形態では、抗生物質は、シプロフロキサシン、クリンダマイシン、アモキシシリン−クラブラン酸、セフィキシム、エファロスポリン、フルオロキノロン、アジスロマイシン、クラリスロマイシン、エリスロマイシン、テトラサイクリン、またはアジスロマイシンである。
【０３７４】
いくつかの実施形態では、消化異常は、抗精神病薬による対象の処置と関連する。一実施形態では、消化異常は、体重増加である。一実施形態では、薬物は、オランザピンである。
【０３７５】
いくつかの実施形態では、消化異常は、プロトンポンプ阻害薬による対象の処置と関連する。一実施形態では、消化異常は、下痢である。特定の実施形態では、薬物は、ラニチジン、ファモチジン、シメチジン、オメプラゾール、スクラルファート、またはエソメプラゾールである。
【０３７６】
いくつかの実施形態では、消化異常は、非ステロイド性抗炎症薬（ＮＳＡＩＤ）による対象の処置と関連する。一実施形態では、消化異常は、下痢である。特定の実施形態では、薬物は、ナプロキセン、ジクロフェナク、インドメタシン、イブプロフェン、ケトプロフェン、ピロキシカム、セレコキシブ、ニメスリド、またはアスピリンである。
【０３７７】
いくつかの実施形態では、消化異常は、メトホルミン、パロキセチン、バルプロ酸、またはクロザピンによる対象の処置と関連する。
【０３７８】
一実施形態では、１つ以上の症状の軽減は、処置レジメンに対する対象によるコンプライアンスを増大させる。一実施形態では、１つ以上の症状の軽減により、医師がより高用量の投与されるべき薬物を処方することが可能になる。このような実施形態では、基礎疾患の処置は、より有効である（例えば、症状の軽減の増大、疾患もしくは症状がない状態を達成するための短期化、または疾患もしくは症状がない状態の維持の長期化等）。
【０３７９】
慢性腎臓病（ＣＫＤ）
いくつかの実施形態では、慢性腎臓疾患（ＣＫＤ）を有する対象は、本明細書に提供される方法に従って処置され得る。ＣＫＤを有する対象は、疲労、集中力の低下、食欲不振、不眠、夜間の筋痙攣、むくんだ足および足首、皮膚発疹／そう痒、吐き気、嘔吐、口腔内の金属味、息切れ、および／または排尿増加を示し得る。ＣＫＤを含む腎臓疾患の診断は、糸球体濾過量（ＧＦＲ）、尿素およびクレアチニンの血中濃度、アルブミンの尿レベル、腎臓生検、超音波検査、および／またはＣＴスキャンの試験によって行われる。患者集団は、糖尿病性腎症によって引き起こされるＣＫＤを有する対象；高血圧によって引き起こされるＣＫＤを有する対象；多発性嚢胞腎、腎盂腎炎、または糸球体腎炎を有する対象；腎臓を損傷する薬剤の長期使用により腎臓損傷を有する対象；および糖尿病、高血圧、または腎臓疾患の家族歴等の危険因子の存在のためＣＫＤを発症する危険性がある対象を含む。
【０３８０】
肝性脳症（ＨＥ）
いくつかの実施形態では、肝性脳症（ＨＥ）を有する対象は、本明細書に提供される方法に従って処置され得る。肝性脳症は、肝臓が血液からのアンモニア等の毒性物質を除去することができない場合に生じる複数の有害な神経学的症状を含む。ＨＥを有する対象は、精神錯乱、健忘、不安神経症、または興奮状態、人格もしくは行動の急激な変化、睡眠パターンの変化、見当識障害、甘いもしくはかび臭い息、不明瞭言語、および／または運動機能の制御困難を示し得る。ＨＥの診断は、肝機能、血清アンモニア値、ＥＥＧの試験、および他の血液および神経学的試験によって行われる。患者集団は、軽度のＨＥ、重度のＨＥ、顕性ＨＥを有する対象、ＨＥの１つ以上の症状の発現を以前に経験したことがある対象、および肝臓損傷等の危険因子のためＨＥの危険性がある対象を含む。
【０３８１】
炎症性腸疾患（ＩＢＤ）／クローン病（ＣＤ）／潰瘍性大腸炎（ＵＣ）
炎症性腸疾患（ＩＢＤ）を有する対象は、腹部の痙攣および疼痛、血性であり得る下痢、排便の緊急性、便秘、吐き気、嘔吐、発熱、体重減少、食欲不振、および／または血液喪失による鉄欠乏性貧血を示し得る。ＩＢＤの症状は、症候性および無症候性疾患の交互の期間を有する炎症を生じ得る。ＩＢＤは、検便（下痢の感染原因の可能性を断ち切る、便中の微量の血液を確認する、便中カルプロテクチン等のＩＢＤと関連するバイオマーカーを定量化するために）、炎症のレベルを評価するための完全血球算定、Ｃ反応性タンパク質（ＣＲＰ）および核周囲抗好中球細胞質抗体（ｐＡＮＣＡ）を含むバイオマーカーを評価するための血液検査、バリウムＸ線、Ｓ状結腸鏡検査、大腸内視鏡検査、および内視鏡検査を含む、試験の組み合わせによって診断され得る。患者集団は、潰瘍性大腸炎（ＵＣ；結腸または大腸に限定されない）を有する対象、クローン病（ＣＤ；胃腸管のいかなる部分に影響を及ぼす）を有する対象、および異なる疾患重症度（軽度、中等度、重度）を有する対象を含む。
【０３８２】
２型糖尿病／ＮＡＳＨ／ＮＡＦＬＤ
いくつかの実施形態では、２型糖尿病を有する対象は、本明細書に提供される方法に従って処置され得る。２型糖尿病を有する対象は、霧視、末梢神経障害、排尿増加、口渇増加、疲労、空腹感増加、体重減少、または酵母感染症、膀胱感染症、腎臓感染症、皮膚感染症、もしくは他の感染症を示し得る。２型糖尿病は、高血糖もしくは高血糖危機の古典的症状を有する患者における、１２６ｍｇ／ｄＬ（７ｍＭ）以上の空腹時血漿グルコース（ＦＰＧ）、または７５ｇの経口グルコース耐性試験（ＯＧＴＴ）時の２００ｍｇ／ｄＬ（１１．１ｍＭ）以上の２時間血漿グルコース値、または２００ｍｇ／ｄＬ（１１．１ｍＭ）以上のランダム血漿グルコース、または６．５％以上のヘモグロビンＡ１ｃ（ＨｂＡ１ｃ）値を含む、米国糖尿病協会（ＡＤＡ）によって記載される基準によって診断される。患者集団は、２型糖尿病を有する成人および小児、２型糖尿病を発症する危険性がある対象（例えば、前糖尿病を有する対象または過体重である対象）、ならびに肥満、高血圧、血清トリグリセリドの上昇、および低高比重リポタンパク質（ＨＤＬ）値を含む、代謝症候群の状態と併せて２型糖尿病を有する対象を含む。
【０３８３】
いくつかの実施形態では、非アルコール性脂肪肝疾患（ＮＡＦＬＤ）および／または非アルコール性脂肪性肝炎（ＮＡＳＨ）を示す対象は、本明細書に提供される方法に従って処置され得る。非アルコール性脂肪肝疾患（ＮＡＦＬＤ）は、肝臓における脂肪の異常蓄積を特徴とする。ＮＡＦＬＤは、非アルコール性脂肪性肝炎（ＮＡＳＨ）に進行する可能性があり、これは、肝臓の炎症、線維症、および肝硬変を特徴とする。ＮＡＦＬＤを有する対象は、無症候性であり得る。ＮＡＦＬＤまたはＮＡＳＨを有する対象は、肝臓サイズの増大（健康診断時に指摘される）、疲労、体重減少、全身の脱力感、および／または右上腹部の痛みを示し得る。ＮＡＦＬＤ／ＮＡＳＨの診断は、アラニンアミノトランスフェラーゼ（ＡＬＴ）またはアスパラギン酸アミノ酸転移酵素（ＡＳＴ）の血液値の上昇、肥大肝、および特定の病理組織学的マーカー（例えば、肝生検、腹部の超音波検査、ＣＴスキャン、またはＭＲＩスキャンによる）を含む。患者集団は、ＮＡＦＬＤを有する対象、ＮＡＳＨを有する対象、ＮＡＦＬＤ／ＮＡＳＨを発症する危険性がある対象（例えば、過体重であるまたはコレステロール値の上昇を有する対象）、ならびに肥満、空腹時血漿グルコースの上昇、高血圧、血清トリグリセリドの上昇、および低高比重リポタンパク質（ＨＤＬ）値を含む、代謝症候群の状態と併せてＮＡＦＬＤ／ＮＡＳＨを有する対象を含む。
【０３８４】
肥満
いくつかの実施形態では、肥満対象は、本明細書に提供される方法に従って処置され得る。肥満は、深刻な健康上の問題であり、健康への悪影響を及ぼし得る。例えば、肥満は、平均寿命の低下、ならびに／または糖尿病、高血圧、心疾患、卒中、高コレステロール、睡眠時無呼吸、および関節炎等の健康問題を増大させ得る。肥満対象は、３０ｋｇ／ｍ２超の肥満度指数（ＢＭＩ）を示す。あるいは、肥満対象は、体脂肪率（男性で２５％超、または女性で３３％超）に基づいて分類され得る。診断はまた、空腹時脂質レベル（コレステロール、トリグリセリド）、肝機能、グルコース値、インスリン値、グリコシル化ヘモグロビン（ＨｂＡ１ｃ）、および／またはグルコース耐性の評価も含み得る。患者集団は、小児肥満、中等度の肥満、病的／重度の肥満、遺伝子的原因の肥満（プラダーウィリ症候群、バルデービードル症候群、コーエン症候群、およびＭＯＭＯ症候群）、ならびに代謝症候群の他の状態（高血圧、空腹時血漿グルコースの上昇、血清トリグリセリドの上昇、および低高比重リポタンパク質（ＨＤＬ）値）と併せた肥満を有する対象を含む。
【０３８５】
クロストリジウム・ディフィシル（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｄｉｆｆｉｃｉｌｅ）感染症（ＣＤＩ）誘発大腸炎
いくつかの実施形態では、クロストリジウム・ディフィシル（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｄｉｆｆｉｃｉｌｅ）感染症（ＣＤＩ）ＣＤＩ誘発性大腸炎を有する対象は、本明細書に提供される方法に従って処置され得る。誘発性大腸炎を有する対象は、水様性の下痢、筋けいれん、腹痛、食欲不振、倦怠感、発熱、脱水症、下腹部圧痛、および／または反跳痛を示し得る。患者の便におけるＣ．ディフィシル（Ｃ．ｄｉｆｆｉｃｉｌｅ）の存在は、便培養法、グルタミン酸脱水素酵素免疫測定法、Ｃ．ディフィシル（Ｃ．ｄｉｆｆｉｃｉｌｅ）毒素に対する遺伝子を検出するためのＰＣＲアッセイ、便細胞毒素アッセイ、またはＣ．ディフィシル（Ｃ．ｄｉｆｆｉｃｉｌｅ）毒素ＡおよびＢに対する酵素免疫測定法によって試験することができる。患者集団は、一次ＣＤＩを有する対象、再発性ＣＤＩを有する対象、ＣＤＩ関連下痢の異なる重症度（軽度、中等度、重度）を有する対象、ならびに例えば、抗生物質による処置、広域スペクトル抗生物質による処置、病院もしくは長期療養施設での居住、胃腸管の手術、結腸の疾患、脆弱化した免疫系、化学療法、高齢、腎疾患、またはプロトンポンプ阻害剤の使用などの危険因子の存在によるＣＤＩのための危険にさらされている対象が含まれる。ＣＤＩのための標準処置は、メトロニダゾール、フィダキソマイシン、またはバンコマイシンなどの抗生物質を含む。処置はまた、プロバイオティクス、糞便移植、および脱水症を予防するための液体を含み得る。疾患の消散は、下痢の軽減（例えば、３回を超える形を成さない便の２４時間の不在）および上に記載される他の症状の消散によって測定される。感染症のクリアランスは、Ｃ．ディフィシル（Ｃ．ｄｉｆｆｉｃｉｌｅ）に対する陽性便検査の不在によって確認され得る。
【０３８６】
一実施形態では、方法は、病原体のコロニー形成を予防する、処置する、その症状を緩和する、および／または初期コロニー形成もしくはコロニー形成の再発を予防するために提供される。いくつかの実施形態では、再発は、第一選択治療または標準治療の処置レジメン中またはその後に生じる。場合によっては、病原体負荷は、標準治療の際に最初に軽減し得るが、その負荷は再度増加し始め、疾患の再発を潜在的に誘発する可能性がある。いくつかの実施形態では、グリカンポリマー調製物は、再発を予防するか、または１つ以上の再発の症状を処置するために、（例えば、初期処置レジメンの開始時に、その中、またはその後に）投与され得る。いくつかの実施形態では、疾患関連の細菌、パソビオント、または病原体は、バイロフィラ・ワズウォーシア（Ｂｉｌｏｐｈｉｌａ  ｗａｄｓｗｏｒｔｈｉａ）、カンピロバクター・ジェジュニ（Ｃａｍｐｙｌｏｂａｃｔｅｒ  ｊｅｊｕｎｉ）、シトロバクター・ファーマー（Ｃｉｔｒｏｂａｃｔｅｒ  ｆａｒｍｅｒ）、クロストリジウム・ディフィシル（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｄｉｆｆｉｃｉｌｅ）、ウェルシュ菌（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｐｅｒｆｒｉｎｇｅｎｓ）、破傷風菌（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｔｅｔａｎｉ）、コリンセラ・アエロファシエンス（Ｃｏｌｌｉｎｓｅｌｌａ  ａｅｒｏｆａｃｉｅｎｓ）、Ｅｎｔｅｒｏｂａｃｔｅｒ  ｈｏｒｍａｅｃｈｅｉ（エンテロバクター・ホルメシェイ）、エンテロコッカス・フェカリス（Ｅｎｔｅｒｏｃｏｃｃｕｓ  ｆａｅｃａｌｉｓ）、エンテロコッカス・フェシウム（Ｅｎｔｅｒｏｃｏｃｃｕｓ  ｆａｅｃｉｕｍ）、大腸菌（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉ）、フゾバクテリウム・バリウム（Ｆｕｓｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｖａｒｉｕｍ）、フソバクテリウム・ヌクレアタム（Ｆｕｓｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｎｕｃｌｅａｔｕｍ）、ヘモフィルス・パラインフルエンザ（Ｈａｅｍｏｐｈｉｌｕｓ  ｐａｒａｉｎｆｌｕｅｎｚａｅ）、肺炎桿菌（Ｋｌｅｂｓｉｅｌｌａ  ｐｎｅｕｍｏｎｉａ）、ペプトストレプトコッカス・ストマティス（Ｐｅｐｔｏｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ  ｓｔｏｍａｔｉｓ）、ポルフィロモナス・アサッカロリティカ（Ｐｏｒｐｈｙｒｏｍｏｎａｓ  ａｓａｃｃｈａｒｏｌｙｔｉｃａ）、緑膿菌（Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ  ａｅｒｕｇｉｎｏｓａ）、サルモネラ・ボンゴリ（Ｓａｌｍｏｎｅｌｌａ  ｂｏｎｇｏｒｉ）、サルモネラ・エンテリック（Ｓａｌｍｏｎｅｌｌａ  ｅｎｔｅｒｉｃ）、シゲラ・ボイディ（Ｓｈｉｇｅｌｌａ  ｂｏｙｄｉｉ）、シゲラ・ジセンテリア（Ｓｈｉｇｅｌｌａ  ｄｙｓｅｎｔｅｒｉａｅ）、シゲラ・フレックスネリ（Ｓｈｉｇｅｌｌａ  ｆｌｅｘｎｅｒｉ）、シゲラ・ソネイ（Ｓｈｉｇｅｌｌａ  ｓｏｎｎｅｉ）、黄色ブドウ球菌（Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ  ａｕｒｅｕｓ）、ストレプトコッカス・インファンタリウス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ  ｉｎｆａｎｔａｒｉｕｓ）、ビブリオ・コレラ（Ｖｉｂｒｉｏ  ｃｈｏｌｅｒａ）、およびエルシニア・エンテロコリチカ（Ｙｅｒｓｉｎｉａ  ｅｎｔｅｒｏｃｏｌｉｔｉｃａ）の種からなる群から選択される。
【０３８７】
いくつかの実施形態では、疾患関連の細菌、パソビオント、または病原体は、ビロフィラ（Ｂｉｌｏｐｈｉｌａ）、カンピロバクター（Ｃａｍｐｙｌｏｂａｃｔｅｒ）、カンディダトゥス（Ｃａｎｄｉｄａｔｕｓ）、シトロバクター（Ｃｉｔｒｏｂａｃｔｅｒ）、クロストリジウム（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ）、コリンセラ（Ｃｏｌｌｉｎｓｅｌｌａ）、デスルホビブリオ（Ｄｅｓｕｌｆｏｖｉｂｒｉｏ）、エンテロバクター（Ｅｎｔｅｒｏｂａｃｔｅｒ）、エンテロコッカス（Ｅｎｔｅｒｏｃｏｃｃｕｓ）、エシェリキア（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ）、フソバクテリウム（Ｆｕｓｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）、ヘモフィルス（Ｈａｅｍｏｐｈｉｌｕｓ）、クレブシエラ（Ｋｌｅｂｓｉｅｌｌａ）、ラクノスピラ（Ｌａｃｈｎｏｓｐｉｒａｃｅａｅ）、ペプトストレプトコッカス（Ｐｅｐｔｏｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ）、ポルフィロモナス（Ｐｏｒｐｈｙｒｏｍｏｎａｓ）、ポルティエラ（Ｐｏｒｔｉｅｒａ）、プロビデンシア（Ｐｒｏｖｉｄｅｎｃｉａ）、シュードモナス（Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ）、サルモネラ（Ｓａｌｍｏｎｅｌｌａ）、シゲラ（Ｓｈｉｇｅｌｌａ）、スタフィロコッカス（Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ）、ストレプトコッカス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ）、ビブリオ（Ｖｉｂｒｉｏ）、およびエルシニア（Ｙｅｒｓｉｎｉａ）の属を含む。
【０３８８】
バンコマイシン耐性腸球菌（ＶＲＥ）のコロニー形成
いくつかの実施形態では、バンコマイシン耐性腸球菌（ＶＲＥ）のコロニー形成および感染を示す対象は、本明細書に提供される方法に従って処置され得る。エンテロコッカス（Ｅｎｔｅｒｏｃｏｃｃｕｓ）属の細菌は、腸内微生物叢の一般的なメンバーである。この属のバンコマイシン耐性メンバーである、一般に、Ｅ．フェカリス（Ｅ．ｆａｅｃａｌｉｓ）およびＥ．フェシウム（Ｅ．ｆａｅｃｉｕｍ）は、バンコマイシン耐性腸球菌（ＶＲＥ）のコロニー形成および感染を引き起こし得る。ＶＲＥによりコロニー形成した対象は、ＶＲＥ陽性の糞便試料、直腸スワブ、直腸周囲スワブ、または別の身体部位からの試料を示し得る。バンコマイシン耐性は、バンコマイシン耐性（Ｖａｎ）遺伝子オペロンを検出する、細菌培地によってまたはＰＣＲベースのアッセイによって評価され得る。コロニー形成した対象は、無症候性であり得るが、この集団は、ＶＲＥによる感染症に対する危険性が高まる。ＶＲＥ感染症を有する対象は、下痢、発熱、悪寒、尿管感染症（ＵＴＩ）、菌血症、心内膜炎、腹腔内および骨盤内感染症、呼吸器感染症、または別の身体部位での感染症を示し得る。患者集団は、ＶＲＥによりコロニー形成している対象、ＶＲＥ感染症を患っている対象、および入院、長期療養施設の居住、長期の抗生物質の使用、免疫抑制、手術、開放創、留置器具（例えば、静脈ラインもしくは導尿カテーテル）、または医療従事者としての雇用のような危険因子の存在による、ＶＲＥによるコロニー形成もしくは感染の危険性がある対象を含む。
【０３８９】
アトピー性皮膚炎（ＡＤ）
いくつかの実施形態では、アトピー性皮膚炎（ＡＤ）を有する対象は、本明細書に提供される方法に従って処置され得る。アトピー性皮膚炎（ＡＤ）を有する対象は、乾燥、痒み、および／または炎症を起こしている皮膚を呈し得る。ＡＤの診断および重症度は、ＳＣＯＲＡＤ指数（Ｏｒａｎｊｅ，Ａ．Ｐ．，ｅｔ  ａｌ．Ｂｒｉｔｉｓｈ  Ｊｏｕｒｎａｌ  ｏｆ  Ｄｅｒｍａｔｏｌｏｇｙ  １５７．４（２００７）：６４５−６４８）または湿疹面積および重症度指数（ＥＡＳＩ）スコア（Ｈａｎｉｆｉｎ  ｅｔ  ａｌ．，Ｅｘｐｅｒｉｍｅｎｔａｌ  Ｄｅｒｍａｔｏｌｏｇｙ，２００１，１０：１１）を用いることによって決定され得る。ＡＤは症候性および無症候性疾患の交互の期間を有する炎症を生じ得る。黄色ブドウ球菌は、一般に、ＡＤを有する皮膚部位上に存在し、ＩｇＥ、および炎症性またはＴｈ２サイトカインおよびケモカインを含むバイオマーカーはまた、罹患している皮膚において、または全身的に上昇し得る。患者集団は、早期ＡＤを有する乳児、小児ＡＤを有する小児、遅発性ＡＤを有する成人、ＡＤの炎症の危険性がある妊婦（「妊娠中アトピー性発疹」）、軽度、中等度、もしくは重度ＡＤの炎症を有する対象、またはＡＤを発症している危険性がある対象を含む。
【０３９０】
喘息
いくつかの実施形態では、喘息を有する対象は、本明細書に提供される方法に従って処置され得る。喘息を有する対象は、喘鳴、咳嗽、息切れ、および／または胸部圧迫感もしくは胸痛を呈し得る。これらの症状は一般的に一時的なものであり、運動またはアレルゲンへの曝露などの因子によって誘発され得る。さらに、喘息を有する小児は、再発性気管支炎、細気管支炎、または風邪による肺炎もしくは持続性の咳を示し得る。喘息の診断は、気管支拡張剤による処置の存在または不在下で、肺活量測定による肺機能試験によって確立される。患者集団は、喘息を有する乳児；小児喘息；成人発症喘息；間欠性、軽症の持続性、中等度の持続性、または重度の持続性喘息；運動誘発性喘息；アレルギー性喘息；咳型喘息；職業性喘息；夜行性喘息を有する対象；および例えば、アトピーの家族歴による、喘息を発症する危険性がある対象を含む。
【０３９１】
炎症性疾患
いくつかの実施形態では、グリカンポリマー調製物グリカンポリマー調製物の投与は、炎症を軽減する。いくつかの実施形態では、対象は、炎症性腸疾患を含む（ＩＢＤ）胃腸感染症、潰瘍性大腸炎（ＵＣ）、クローン病（ＣＤ）、小腸の特発性炎症、不確定性大腸炎、回腸嚢炎；過敏性腸症候群（ＩＢＳ）、結腸および肝臓癌、壊死性腸炎（ＮＥＣ）、腸炎、便秘、顕微鏡的大腸炎、下痢；移植片対宿主病（ＧＶＨＤ）；（食物）アレルギー；偽膜性大腸炎；消化不良または非潰瘍性消化不良；憩室症または憩室炎、虚血性大腸炎；放射線大腸炎または腸炎；コラーゲン蓄積大腸炎；胃腸炎；およびポリープを含む、疾患、障害、または状態を有する、または有する疑いがある場合、処置に適していることが同定される。
【０３９２】
一実施形態では、グリカンポリマー調製物による処置に適していることが同定される対象は、炎症性腸疾患（ＩＢＤ）、潰瘍性大腸炎（ＵＣ）、クローン病（ＣＤ）、腸炎、顕微鏡的大腸炎、または腸炎に関連する類似の疾患、障害、もしくは状態を有する、または有する疑いがある。
【０３９３】
一実施形態では、グリカンポリマー調製物による処置に適していることが同定される対象は、小腸の特発性炎症、不確定性大腸炎、回腸嚢炎、偽膜性大腸炎、虚血性大腸炎、放射線大腸炎（腸炎）、コラーゲン蓄積大腸炎、または腸炎に関連する類似の疾患、障害、もしくは状態を有する、または有する疑いがある。
【０３９４】
一実施形態では、グリカンポリマー調製物による処置に適していることが同定される対象は、胃腸炎、移植片対宿主病（ＧＶＨＤ）、または（食物）アレルギーを有する、または有する疑いがある。
【０３９５】
一実施形態では、グリカンポリマー調製物による処置に適していることが同定される対象は、過敏性腸症候群（ＩＢＳ）、便秘、下痢、消化不良、非潰瘍性消化不良、または変質した腸管通過に関連する類似の疾患、障害、もしくは状態を有する、または有する疑いがある。
【０３９６】
一実施形態では、グリカンポリマー調製物による処置に適していることが同定される対象は、結腸癌、肝臓癌、壊死性腸炎（ＮＥＣ）；憩室症または憩室炎；ポリープ、または腸の構造変化に関連する類似の疾患、障害、もしくは状態を有する、または有する疑いがある。
【０３９７】
代謝性疾患
いくつかの実施形態では、対象は、肥満、前糖尿病、ＩＩ型糖尿病、高血中コレステロール、高ＬＤＬ、高血圧、高空腹時血糖、高トリグリセリドレベル、低ＨＤＬ非アルコール性脂肪性肝疾患（ＮＡＦＬＤ）、非アルコール性脂肪性肝炎（ＮＡＳＨ）；代謝症候群；高アンモニア血症、必須栄養素欠乏、血色素症、ラクトース不耐症、グルテン不耐症；および腸性先端皮膚炎を含む、疾患、障害、または状態を有する、または有する疑いがある場合、処置に適していることが同定される。
【０３９８】
一実施形態では、グリカンポリマー調製物による処置に適していることが同定される対象は、肥満、（インスリン耐性）前糖尿病、ＩＩ型糖尿病、高空腹時血糖（高血糖）、代謝症候群、または代謝疾患の症状と関連する類似の疾患、障害、もしくは状態を有する、または有する疑いがある。
【０３９９】
一実施形態では、グリカンポリマー調製物による処置に適していることが同定される対象は、高血中コレステロール、高ＬＤＬ、高血圧（高血圧症）、高トリグリセリドレベル、低ＨＤＬ、または類似の心臓血管の危険因子を有する、または有する疑いがある。
【０４００】
一実施形態では、グリカンポリマー調製物による処置に適していることが同定される対象は、非アルコール性脂肪性肝疾患（ＮＡＦＬＤ）、非アルコール性脂肪性肝炎（ＮＡＳＨ）、高アンモニア血症、または肝臓の類似の疾患、障害、もしくは状態を有する、または有する疑いがある。
【０４０１】
一実施形態では、グリカンポリマー調製物による処置に適していることが同定される対象は、ラクトース不耐症、グルテン不耐症、または食物不耐性と関連する類似の疾患、障害、もしくは状態を有する、または有する疑いがある。
【０４０２】
一実施形態では、グリカンポリマー調製物による処置に適していることが同定される対象は、必須栄養素欠乏、血色素症、腸性先端皮膚炎、または不適当な栄場管理と関連する類似の疾患、障害、もしくは状態を有する、または有する疑いがある。
【０４０３】
一実施形態では、代謝障害を処置するために、ヒトにグリカンポリマー調製物組成物を投与することによって、それを必要とする対象における代謝障害を処置する方法が提供される。一実施形態では、代謝障害は、肥満、肥満症、インスリン耐性、糖尿病、および脂肪肝症候群から選択される。
【０４０４】
代謝障害は、異常な体重増加；エネルギー使用もしくは消費；栄養素、エネルギー源、ホルモン、もしくはその他のシグナル伝達分子に対する応答変化；または炭水化物、脂質、タンパク質、もしくは核酸の新陳代謝の変化、またはこれらの組み合わせによって引き起こされる、またはこれらを特徴とする、疾患、障害、および状態を含み得る。代謝障害の例には、インスリン耐性、インスリン感受性、脂肪肝症候群、肥満、肥満症、および糖尿病（例えば、１型糖尿病、２型糖尿病）が含まれる。一変形例では、本明細書に提供される方法は、肥満を処置する。対象における体重減少および／または体脂肪の減少を生じさせる方法で、対象の腸内の微生物叢を変化させ得るグリカンポリマー調製物組成物を用いた、処置を必要とする対象における肥満を処置するための方法が本明細書に提供される。
【０４０５】
一実施形態では、肥満症を軽減するのに有効な量でグリカンポリマー調製物組成物をヒトに投与することによって、それを必要とする対象における肥満症を軽減する方法が提供される。肥満症は、例えば、腰周囲、腰対臀部比、皮膚厚、生体電気インピーダンス、水中体重法、空気置換プレチスモグラフィー、または比重測定法を含む、当該技術分野において公知の任意の適切な方法を用いて決定され得る。
【０４０６】
一実施形態では、グルコース代謝を改善するのに有効な量でグリカンポリマー調製物組成物を対象に投与することによって、それを必要とする対象におけるグルコース代謝を改善する方法が提供される。グルコース代謝は、例えば、空腹時血糖値、空腹時インスリン値、食後の血糖値試験、経口グルコース耐性試験、静脈内グルコース耐性試験、糖化ヘモグロビン値、またはランダム血糖値試験を含む、当該技術分野において公知の任意の適切な方法を用いて決定され得る。
【０４０７】
一実施形態では、インスリン感受性を増大させるのに有効な量でグリカンポリマー調製物組成物を対象に投与することによって、ヒトにおけるインスリン感受性を増大させる方法が提供され、ここで、ヒトは、グリカンポリマー調製物の投与前のインスリン感受性およびグリカンポリマー調製物の投与後のインスリン感受性を有し、グリカンポリマー調製物の投与後のヒトのインスリン感受性は、グリカンポリマー調製物の投与前のヒトのインスリン感受性よりも高い。インスリン感受性は、例えば、空腹時血糖値、空腹時インスリン値、食後の血糖値試験、経口グルコース耐性試験、静脈内グルコース耐性試験、糖化ヘモグロビン値、またはランダム血糖値試験を含む、当該技術分野において公知の任意の適切な方法を用いて決定され得る。
【０４０８】
感染症
いくつかの実施形態では、グリカンポリマー調製物の投与は、感染を軽減する。いくつかの実施形態では、対象は、クロストリジウム・ディフィシル（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｄｉｆｆｉｃｉｌｅ）感染症（ＣＤＩ）を含む胃腸感染症；バンコマイシン耐性腸球菌（ＶＲＥ）感染症、感染性大腸炎、およびＣ．ディフィシル（Ｃ．ｄｉｆｆｉｃｉｌｅ）大腸炎；真菌症、例えば、カンジダ・アルビカンス（Ｃａｎｄｉｄａ  ａｌｂｉｃａｎｓ）感染症、カンピロバクター・ジェジュニ（Ｃａｍｐｙｌｏｂａｃｔｅｒ  ｊｅｊｕｎｉ）感染症、ヘリコバクター・ピロリ（Ｈｅｌｉｃｏｂａｃｔｅｒ  ｐｙｌｏｒｉ）感染症；下痢、例えば、クロストリジウム・ディフィシル（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｄｉｆｆｉｃｉｌｅ）関連下痢（ＣＤＡＤ）、抗生物質関連下痢（ＡＡＤ）、抗生物質誘発性下痢、旅行者下痢（ＴＤ）、小児下痢、（急性）感染性下痢、結腸および肝臓癌、アメーバ性肉芽腫；壊死性腸炎（ＮＥＣ）、および小腸細菌異常増殖（ＳＩＢＯ）；消化不良または非潰瘍性消化不良；裂肛、肛門周囲膿瘍、および痔瘻；憩室症または憩室炎；消化性潰瘍；ならびに胃腸炎を含む、疾患、障害、または状態を有する、または有する疑いがある場合、処置に適していることが同定される。
【０４０９】
一実施形態では、グリカンポリマー調製物による処置に適していることが同定される対象は、クロストリジウム・ディフィシル（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｄｉｆｆｉｃｉｌｅ）感染症（ＣＤＩ）；バンコマイシン耐性腸球菌（ＶＲＥ）感染症、感染性大腸炎、またはＣ．ディフィシル（Ｃ．ｄｉｆｆｉｃｉｌｅ）大腸炎を有する、または有する疑いがある。
【０４１０】
一実施形態では、グリカンポリマー調製物による処置に適していることが同定される対象は、真菌症、例えば、カンジダ・アルビカンス（Ｃａｎｄｉｄａ  ａｌｂｉｃａｎｓ）感染症、カンピロバクター・ジェジュニ（Ｃａｍｐｙｌｏｂａｃｔｅｒ  ｊｅｊｕｎｉ）感染症、またはヘリコバクター・ピロリ（Ｈｅｌｉｃｏｂａｃｔｅｒ  ｐｙｌｏｒｉ）感染症を有する、または有する疑いがある。
【０４１１】
いくつかの実施形態では、胃腸管感染症は、細菌またはウイルス感染症、例えば、ＶＲＥ、Ｃ．ディフィシル（Ｃ．ｄｉｆｆｉｃｉｌｅ）、大腸菌（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉ）、サルモネラ菌（Ｓａｌｍｏｎｅｌｌａ）、赤痢菌（Ｓｈｉｇｅｌｌａ）、カンピロバクター（Ｃａｍｐｙｌｏｂａｃｔｅｒ）、コレラ菌（Ｖｉｂｒｉｏ  ｃｈｏｌｅｒａ）、桿菌（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｐｅｒｆｒｉｎｇｅｓ）、セレウス菌（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）、腸炎ビブリオ菌（Ｖｉｂｒｉｏ  ｐａｒａｈｅｍｏｌｙｔｉｃｕｓ）、エルシニア・エンテロコリチカ（Ｙｅｒｓｉｎｉａ  ｅｎｔｅｒｏｃｏｌｉｔｉｃａ）、ヘリコバクター・ピロリ（Ｈｅｌｉｃｏｂａｃｔｅｒ  ｐｙｌｏｒｉ）、ロタウイルス、またはノロウイルス等による感染症である。
【０４１２】
いくつかの実施形態では、胃腸管感染症は、真菌感染症、例えば、カンジダ（Ｃａｎｄｉｄａ）、アスペルギルス（Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ）、ムコール（Ｍｕｃｏｒ）、クリプトコッカス（Ｃｒｙｐｔｏｃｏｃｃｕｓ）、ヒストプラズマ（Ｈｉｓｔｏｐｌａｓｍａ）、またはコクシジオイデス（Ｃｏｃｃｉｄｉｏｉｄｅｓ）等による感染症である。
【０４１３】
いくつかの実施形態では、胃腸管感染症は、原虫感染症、例えば、赤痢アメーバ（Ｅｎｔａｍｏｅｂａ  ｈｉｓｔｏｌｙｔｉｃａ）、ランブル鞭毛中（Ｇｉａｒｄｉａ  ｌａｍｂｌｉａ）、クリプトスポリジウム・パルバム（Ｃｒｙｐｔｏｓｐｏｒｉｄｉｕｍ  ｐａｒｖｕｍ）等による感染症である。
【０４１４】
一実施形態では、グリカンポリマー調製物による処置に適していることが同定される対象は、下痢、例えば、クロストリジウム・ディフィシル（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｄｉｆｆｉｃｉｌｅ）関連下痢（ＣＤＡＤ）、抗生物質関連下痢（ＡＡＤ）、抗生物質誘発性下痢、旅行者下痢（ＴＤ）、小児下痢、および（急性）感染性下痢を有する、または有する疑いがある。
【０４１５】
一実施形態では、グリカンポリマー調製物による処置に適していることが同定される対象は、壊死性腸炎（ＮＥＣ）；胃腸炎；小腸細菌異常増殖（ＳＩＢＯ）、または胃腸管感染症に関連する類似の疾患、障害、もしくは状態を有する、または有する疑いがある。
【０４１６】
一実施形態では、グリカンポリマー調製物による処置に適していることが同定される対象は、結腸癌、肝臓癌、アメーバ性肉芽腫；消化不良または非潰瘍性消化不良；裂肛、肛門周囲膿瘍、および痔瘻；憩室症または憩室炎；消化性潰瘍、または胃腸管の構造変化に関連する類似の疾患、障害、もしくは状態を有する、または有する疑いがある。
【０４１７】
他の疾患
いくつかの実施形態では、対象は、自己免疫性関節炎、Ｉ型糖尿病、アトピー性皮膚炎、自閉症、喘息、心臓血管疾患、慢性腎臓疾患、痛風、薬物不耐性（例えば、メトホルミンに対して）、薬物の低経口バイオアベイラビリティ、便失禁、ヒルシュスプルング病、アニスムス、仙痛、腸閉塞症、痔、および腸重積症を含む、疾患、障害、もしくは状態を有する、または罹患している疑いがある場合、処置に適していることが同定される。
【０４１８】
一実施形態では、グリカンポリマー調製物による処置に適していることが同定される対象は、自己免疫性関節炎、Ｉ型糖尿病、多発性硬化症、乾癬、または類似の自己免疫性の疾患、障害、もしくは状態を有する、または有する疑いがある。
【０４１９】
一実施形態では、グリカンポリマー調製物による処置に適していることが同定される対象は、喘息、アトピー性皮膚炎、または類似の環境に起因するアレルギーを有する疑いがある。
【０４２０】
一実施形態では、グリカンポリマー調製物による処置に適していることが同定される対象は、慢性腎臓疾患、心疾患、心臓血管疾患、または臓器不全に関連する類似の疾患、障害、もしくは状態を有する、または有する疑いがある。
【０４２１】
一実施形態では、グリカンポリマー調製物による処置に適していることが同定される対象は、自閉症、高アンモニア血症、肝性脳症、または神経学的症状に関連する類似の疾患、障害、もしくは状態を有する、または有する疑いがある。
【０４２２】
一実施形態では、グリカンポリマー調製物による処置に適していることが同定される対象は、悪液質、痛風、または類似の栄養障害を有する、または有する疑いがある。
【０４２３】
一実施形態では、グリカンポリマー調製物による処置に適していることが同定される対象は、ヒルシュスプルング病、腸閉塞症、アニスムス、腸重積症、便失禁、痔、または類似の胃腸障害を有する、または罹患している疑いがある。
【０４２４】
処置効果
いくつかの実施形態では、前記対象は、処置後に疾患または障害の少なくとも１つの症状の軽減を経験する。いくつかの実施形態では、処置後に症状の重症度の軽減を決定することができ（例えば、公知のバイオマーカーを測定することによって）、これは約３％、５％、７％、１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、９０％、９５％、または約１００％の順である。いくつかの実施形態では、本明細書に記載のように測定される症状は、グリカンポリマー調製物の投与前に症状と比較した場合、平均で約１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、９０％、９５％、または約１００％減少する。いくつかの実施形態では、症状の重症度の軽減は、処置から少なくとも約１日間、２日間、３日間、４日間、５日間、１週間、２週間、３週間、１ヶ月間、３ヶ月間、６ヶ月間、９ヶ月間、１年間、２年間、５年間、１０年間持続するか、または軽減が永続する。
【０４２５】
一実施形態では、本明細書に記載の疾患、障害、または状態の症状は、処置の中断後、少なくとも約１日間、１週間、１ヶ月間、２ヶ月間、３ヶ月間、４ヶ月間、５ヶ月間、６ヶ月間、９ヶ月間、１年間、１８ヶ月間、２年間、３年間、４年間、５年間、１０年間、または１０年間以上、対象の重症度を部分的に、実質的に、または完全に、消失させる、または低減する。別の実施形態では、本明細書に記載の疾患、障害、または状態の症状は、処置の中断後、対象の重症度を恒久的に消失させる、または低減する。
【０４２６】
いくつかの実施形態では、グリカンポリマー調製物の投与は、宿主の健康全般および／または胃腸管等の特定の生態的部位の健康を、例えば、生態的部位内の微生物共同体の１つ以上のメンバー（常在共生細菌および／または獲得した病原体もしくはパソビオント等）の増殖または存在度を調節すること（例えば、増加または減少すること）によって改善する。
【０４２７】
グリカンポリマー調製物は、有効量で対象に投与される場合、１つ以上の宿主経路を調節し得る。グリカンポリマー調製物処置は、当該技術分野において公知の方法によって決定され得る１つ以上のバイオマーカーの増加または減少をもたらし得る。研究者は、処置中のどの時点でバイオマーカーを測定すべきかを容易に決定することができ、例えば、処置前、処置中の様々な間隔で、および／または処置後である。任意の適当な試料、例えば、胃腸に特異的な試料、例えば、組織試料または生検、スワブ、胃腸管分泌物（糞／糞便試料等）等は、対象から採取され得、この試料が分析され得る。いくつかの実施形態では、バイオマーカーの実質的増加または減少が検出され得る。
【０４２８】
いくつかの実施形態では、グリカンポリマー調製物は、例えば、免疫調節能力（例えば、抗炎症性）に作用し得るブチレート、アセテート、およびプロピオネート等の短鎖脂肪酸、および宿主の健康に良い効果をもたらし得るその他の代謝産物（例えば、胆汁酸およびラクテート）の放出をもたらす、腸内微生物叢（例えば、クロストリジウム（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉａ））によって消化される。
【０４２９】
腸内のＳＣＦＡ生成に対して投与されたグリカンポリマー調製物組成物の効果を評価するために、糞便試料を採取することができる。ＳＣＦＡレベル、特に、アセテート、プロピオネート、およびブチレートが定量化され得る。ＳＣＦＡ、クレアチン、およびヒドロキシ−ＳＣＦＡは、糞便試料をアルカリ化し、例えば、１Ｄ  １Ｈ  ＮＭＲ分光計を用いて試料の代謝組成物のフィンガープリントを得、教師つき多変量統計法により分析することによって定量化され得る。イヌリンは、陽性対照としての役割を果たし得る。
【０４３０】
いくつかの実施形態では、患者の試料または対象試料からの微生物培養の微生物代謝産物プロファイルは、胃腸感染症、および／または炎症性疾患、障害、もしくは状態を発症する危険因子を同定するために使用される。診断、予後危険評価の目的、または処置評価の目的のための例示的な代謝産物には、表５に列挙されたものを含む。いくつかの実施形態では、微生物代謝産物プロファイルは、回復または再発事象を含む対象の疾患状態をより評価するために、対象の疾患および処置時に異なる時点で得られる。このようなモニタリングはまた、新たな胃腸疾患、障害、または状態を発症する対象のリスクを低下させるために重要である。いくつかの実施形態では、代謝産物プロファイルは、その後の処置の情報を提供する。
【０４３１】
さらに、処置する医師または他の医療従事者によって有用であることを決定される場合、本明細書に記載のグリカンポリマー調製物組成物は、様々な他の標準治療と併用して投与され得る。いくつかの実施形態では、グリカンポリマー調製物および標準治療剤の投与の組み合わせは、相加的または相乗的処置効果を有する。グリカンポリマー調製物は、標準治療による処置前、それと同時に、またはその後に投与され得る。場合によっては、治療法は、胃腸管の正常な微生物叢の組成および健康（例えば、抗菌、抗ウイルス性、または抗真菌剤の使用）を乱し、有害な細菌または病原体の望ましくない増殖をもたらし得、本明細書に記載の症状のうちの１つ以上を生じ得る。いくつかの実施形態では、本明細書に記載のグリカンポリマー調製物の投与は、それらの症状を緩和し、胃腸微生物群の組成を改善するのに有用である。
【０４３２】
組み合わせ
さらなる物質をグリカンポリマー調製物と共に投与することができる。いくつかの実施形態では、グリカンポリマー調製物はまた、他の薬剤（例えば、治療剤、微量栄養素、プレバイオティクス、プロバイオティクス、またはシンバイオティクス）と組み合わされ得る。
【０４３３】
これらの物質は、例えば、疾患、障害（例えば、本明細書に記載のもの）の症状を緩和する細菌（例えば、腸管内）の増殖を促し、生態学的地位または腸内のプロバイオティクスまたは有益な共生細菌の付着を増大させることによって、グリカンポリマーの用量の作用を増強し得る。これらの物質は、グリカンポリマー調製物による処置前、グリカンポリマー調製物による処置中、グリカンポリマー調製物による処置後、またはこれらの任意の組み合わせで投与することができる。グリカンポリマー調製物での処置中に投与される場合、これらの物質は、与えられたグリカンポリマー調製物の投与と共に、またはグリカンポリマー調製物の投与の前もしくはその後、またはこれらの任意の組み合わせで投与され得る。一実施形態では、グリカンポリマー調製物と併せて用いられる物質には、プロバイオティクス微生物、プレバイオティクス、治療剤、または緩衝液／担体／賦形剤が含まれる。これらの物質のうちの１つ以上は、処置前、処置中、処置後、またはこれらのいくつかの組み合わせの任意の適当な時に、グリカンポリマー調製物と併用して使用することができる。
【０４３４】
いくつかの実施形態では、さらなる薬剤は、治療剤、例えば、ディスバイオシスを引き起こす薬物、例えば、正常な胃腸の微生物叢の増殖を中断する薬物、例えば、化学療法薬、抗糖尿病薬、免疫抑制薬、抗菌薬、抗精神病薬、プロトンポンプ阻害薬、または非ステロイド性抗炎症薬（ＮＳＡＩＤ）と組み合わせられ得る。グリカンポリマー調製物は、いくつかの実施形態では、ヒト対象における薬物または処置誘発性の症状を軽減する。症状には、例えば、体重増加、便秘、胸やけ、胃のむかつき、ガス、膨満感、鼓腸、下痢、腹痛、筋けいれん、吐き気、および嘔吐などの、消化異常が含まれる。
【０４３５】
いくつかの実施形態では、さらなる薬剤は、微量栄養素である。いくつかの実施形態では、微量栄養素は、微量元素、コリン、ビタミン、およびポリフェノールからなる群から選択される。いくつかの実施形態では、微量栄養素は、微量金属である。微量栄養素として適当な微量元素としては、ホウ素、コバルト、クロム、カルシウム、銅、フッ化物、ヨウ素、鉄、マグネシウム、マンガン、モリブデン、セレン、および亜鉛が挙げられるが、これらに限定されない。いくつかの実施形態では、微量栄養素は、ビタミンである。微量栄養素として適当なビタミンとしては、ビタミンＢ複合体、ビタミンＢ１（チアミン）、ビタミンＢ２（リボフラビン）、ビタミンＢ３（ナイアシン）、ビタミンＢ５（パントテン酸）、ビタミンＢ６群（ピリドキシン、ピリドキサール、ピリドキサミン）、ビタミンＢ７（ビオチン）、ビタミンＢ８（エルガデニル酸）、ビタミンＢ９（葉酸）、ビタミンＢ１２（シアノコバラミン）、コリン、ビタミンＡ（ｒｅｔｉｎｏｌ）、ビタミンＣ（アスコルビン酸）、ビタミンＤ、ビタミンＥ（トコフェロール）、ビタミンＫ、カロテノイド（アルファカロチン、ベータカロチン、クリプトキサンチン、ルテイン、リコピン）、およびゼアキサンチンが挙げられるが、これらに限定されない。
【０４３６】
いくつかの実施形態では、微量栄養素は、ポリフェノールである。ポリフェノールは、１つ以上のヒドロキシル基を有する少なくとも１つの芳香環を有することを特徴とする化学化合物または分子である。いくつかの実施形態では、ポリフェノールは、合成ポリフェノールまたは天然に存在するポリフェノールである。いくつかの実施形態では、ポリフェノールは、天然に存在するポリフェノールであり、かつ、植物源材料に由来する。いくつかの実施形態では、ポリフェノールは、フラボノイドまたはカテキンである。いくつかの実施形態では、フラボノイドまたはカテキンは、アントシアニン、カルコン、ジヒドロカルコン、ジヒドロフラボノール、フラバノール、フラバノン、フラボン、フラボノール、およびイソフラボノイドから選択される。いくつかの実施形態では、ポリフェノールは、リグナンである。いくつかの実施形態では、ポリフェノールは、アルキルメトキシフェノール、アルキルフェノール、クルクミノイド、フラノクマリン、ヒドロキシベンズアルデヒド、ヒドロキシベンゾケトン、ヒドロキシ桂皮アルデヒド、ヒドロキシクマリン、ヒドロキシフェニルプロペン、メトキシフェノール、ナフトキノン、フェノールテルペン、およびチロソールから選択される。いくつかの実施形態では、ポリフェノールは、タンニンまたはタンニン酸である。いくつかの実施形態では、ポリフェノールは、ヒドロキシ安息香酸、ヒドロキシ桂皮酸、ヒドロキシフェニル酢酸、ヒドロキシフェニルプロパン酸、およびヒドロキシフェニルペンタン酸から選択される。いくつかの実施形態では、ポリフェノールは、スチルベンである。
【０４３７】
いくつかの実施形態では、本明細書に記載のグリカンポリマー調製物を含む、医薬組成物、医療用食品、および栄養補助食品は、プレバイオティクス物質またはその調製物をさらに含む。
【０４３８】
いくつかの実施形態では、プレバイオティクスは、本明細書に記載のグリカンポリマー調製物を含む、医薬組成物、医療用食品、または栄養補助食品を受けている対象に投与され得る。プレバイオティクスは、摂取されると、腸内の限られた数の常在細菌の好ましい増殖または活性を選択的に刺激することによって、宿主に有益な生理学的効果をもたらし得る、消化されない物質である（Ｇｉｂｓｏｎ  Ｇ  Ｒ，Ｒｏｂｅｒｆｒｏｉｄ  Ｍ  Ｂ．Ｊ  Ｎｕｔｒ．１９９５  Ｊｕｎｅ；１２５（６）：１４０１−１２．）。食物繊維またはプレバイオティクスオリゴ糖（例えば、結晶性セルロース、コムギふすま、オートムギふすま、トウモロコシ繊維、ダイズ繊維、ビート繊維など）などのプレバイオティクスは、さらに、発酵可能な量の炭水化物を細菌に供給し、それらの微生物集団（例えば、乳酸菌とビフィズス菌）の消化管内のレベルを増加させることによって、腸内でのプロバイオティクス細菌および／または共生細菌の増殖を促進し得る。
【０４３９】
プレバイオティクスとしては、様々なガラクタンおよび炭水化物系ガム、例えば、オオバコ、グアー、カラギーン、ジェラン、ラクツロース、およびコンニャク等が挙げられるが、これらに限定されない。いくつかの実施形態では、プレバイオティクスは、ガラクトオリゴ糖（ＧＯＳ）、ラクツロース、ラフィノース、スタキオース、ラクトスクロース、フルクト−オリゴ糖（ＦＯＳ、例えば、オリゴフルクトースまたはオリゴフルクタン）、イヌリン、イソマルト−オリゴ糖、キシロ−オリゴ糖（ＸＯＳ）、パラチノースオリゴ糖、イソマルトースオリゴ糖（ＩＭＯＳ）、トランスガラクトシル化オリゴ糖（例えば、トランスガラクト−オリゴ糖）、トランスガラクトシル化二糖類、大豆オリゴ糖（例えば、大豆オリゴ糖）、キトサンオリゴ糖（チオセス）、ゲンチオオリゴ糖、大豆およびペクチン性オリゴ糖、グルコオリゴ糖、ペクチンオリゴ糖、パラチノース重縮合物、ジフルクトース無水物ＩＩＩ、ソルビトール、マルチトール、ラクチトール、ポリオール、ポリデキストロース、直鎖および分岐鎖デキストラン、プララン（ｐｕｌｌａｌａｎ）、ヘミセルロース、還元パラチノース、セルロース、ベータ−グルコース、ベータ−ガラクトース、ベータ−フルクトース、ベルバスコース、ガラクチノール、キシラン、イヌリン、キトサン、ベータ−グルカン、グアーガム、アラビアゴム、ペクチン、高アルギン酸ナトリウム、およびラムダカラゲナン、またはこれらの混合物のうちの１つ以上を含む。
【０４４０】
プレバイオティクスは、特定の食品、例えば、チコリー根、キクイモ、タンポポの若葉、ニンニク、リーク、タマネギ、アスパラガス、コムギふすま、小麦粉、バナナ、ミルク、ヨーグルト、モロコシ、ゴボウ、ブロッコリー、芽キャベツ、キャベツ、カリフラワー、カラードグリーン、ケール、ラディシュ、およびルタバガ、およびミソに見出すことができる。いくつかの実施形態では、本明細書に記載のグリカンポリマーは、プレバイオティクスに富む食品を含む食事と共に対象に投与される。可溶性および不溶性繊維の適当な供給源は、商業的に入手可能である。
【０４４１】
いくつかの実施形態では、グリカンポリマー調製物を含む、医薬組成物、医療用食品、および栄養補助食品は、例えば、一般的に安全と認められる物質（ＧＲＡＳ）である細菌培養物または公知の共生性もしくはプロバイオティクス微生物に由来する、プロバイオティクス細菌またはその調製物をさらに含む。いくつかの実施形態では、内因性共生微生物または体外から投与されたプロバイオティクス微生物の有益な効果を最大限にするために、グリカンポリマー調製物を含む医薬組成物、医療用食品、および栄養補助食品は、胃腸管内の有利な細菌の増殖および／または活性を刺激するために投与される。
【０４４２】
適当なプロバイオティクスの例としては、バクテロイデス（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ）、ブラウティア（Ｂｌａｕｔｉａ）、クロストリジウム（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ）、フソバクテリウム（Ｆｕｓｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）、ユウバクテリウム（Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ）、ルミノコッカス（Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ）、ペプトコッカス（Ｐｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ）、ペプトストレプトコッカス（Ｐｅｐｔｏｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ）、アッカーマンシア（Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ）、フィーカリバクテリウム（Ｆａｅｃａｌｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ）、ロゼブリア（Ｒｏｓｅｂｕｒｉａ）、プレボテーラ（Ｐｒｅｖｏｔｅｌｌａ）、ビフィドバクテリウム（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）、ラクトバチルス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ）、バチルス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ）、エンテロコッカス（Ｅｎｔｅｒｏｃｏｃｃｕｓ）、エシェリキア（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ）、ストレプトコッカス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ）、サッカロミセス（Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ）、ストレプトマイセス（Ｓｔｒｅｐｔｏｍｙｃｅｓ）の属、およびクリステンセネラ（Ｃｈｒｉｓｔｅｎｓｅｎｅｌｌａｃｅａｅ）ファミリーとして分類される生物が挙げられるが、これらに限定されない。本明細書に記載の方法および組成物に使用され得るプロバイオティクス細菌の非排他的な例には、Ｌ．アシドフィルス（Ｌ．ａｃｉｄｏｐｈｉｌｕｓ）、Ｌ．クリスパータス（Ｌ．Ｃｒｉｓｐａｔｕｓ）、Ｌ．カゼイ（Ｌ．ｃａｓｅｉ）、Ｌ．ラムノーサス（Ｌ．ｒｈａｍｎｏｓｕｓ）、Ｌ．ロイテリー（Ｌ．ｒｅｕｔｅｒｉ）、Ｌ．ファーメンタム（Ｌ．ｆｅｒｍｅｎｔｕｍ）、Ｌ．プランタルム（Ｌ．ｐｌａｎｔａｒｕｍ）、Ｌ．スポロゲネス（Ｌ．ｓｐｏｒｏｇｅｎｅｓ）、およびＬ．ブルガリカス（Ｌ．ｂｕｌｇａｒｉｃｕｓ）などのラクトバチルス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ）種、ならびにＢ．ラクティス（Ｂ．ｌａｃｔｉｓ）、Ｂ．アニマ―リス（Ｂ．ａｎｉｍａｌｉｓ）、Ｂ．ビフィダム（Ｂ．ｂｉｆｉｄｕｍ）、Ｂ．ロンガム（Ｂ．ｌｏｎｇｕｍ）、Ｂ．アドレスセンティス（Ｂ．ａｄｏｌｅｓｃｅｎｔｉｓ）、およびＢ．インファンティス（Ｂ．ｉｎｆａｎｔｉｓ）などのビフィドバクテリウム（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｕｍ）種が含まれる。サッカロミセス・ブラウディ（Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ  ｂｏｕｌａｒｄｉｉ）等の酵母もまた、例えば、経口剤形または食品を介した、消化管への投与のためのプロバイオティクスとして適当である。例えば、ヨーグルトは、ラクトバチルス・ブルガリカス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｂｕｌｇａｒｉｃｕｓ）およびストレプトコッカス・サーモフィルス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ  ｔｈｅｒｍｏｐｈｉｌｕｓ）等の細菌種をすでに含んでいる製品である。
【０４４３】
胃腸の微生物叢の調節に有益な細菌は、例えば、過酸化水素（Ｈ２Ｏ２）およびバクテリオシン等の、有機酸（乳酸および酢酸）を産生するまたは細胞毒性もしくは細胞増殖抑制剤を産生する（病原体の増殖を阻害するために）細菌を含み得る。バクテリオシンは、密接に関連した細菌を死滅させることができるか、またはより広域の活性を呈することができる（例えば、ナイシン）、低分子の抗菌ペプチドである。
【０４４４】
有益な細菌は、アッカーマンシア属（Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ）、アナエロフィルム属（Ａｎａｅｒｏｆｉｌｕｍ）、バクテロイデス属（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ）、ブラウティア属（Ｂｌａｕｔｉａ）、ビフィドバクテリウム属（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）、ブチリビブリオ属（Ｂｕｔｙｒｉｖｉｂｒｉｏ）、クロストリジウム属（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ）、コプロコッカス属（Ｃｏｐｒｏｃｏｃｃｕｓ）、ディアリスター属（Ｄｉａｌｉｓｔｅｒ）、ドレア属（Ｄｏｒｅａ）、フソバクテリウム属（Ｆｕｓｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）、ユウバクテリウム属（Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ）、フィーカリバクテリウム属（Ｆａｅｃａｌｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ）、ラクノスピラ属（Ｌａｃｈｎｏｓｐｉｒａ）、ラクトバチルス属（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ）、ファスコラークトバクテリウム属（Ｐｈａｓｃｏｌａｒｃｔｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）、ペプトコッカス属（Ｐｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ）、ペプトストレプトコッカス属（Ｐｅｐｔｏｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ）、プレボテーラ属（Ｐｒｅｖｏｔｅｌｌａ）、ロゼブリア属（Ｒｏｓｅｂｕｒｉａ）、ルミノコッカス属（Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ）およびストレプトコッカス属（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ）の１種以上、ならびに／またはアッカーマンシア・ムニシフィラ（Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｎｉｃｉｐｈｉｌｉａ）種、ミヌタ（ｍｉｎｕｔａ）種、クロストリジウム・コッコイデス（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｃｏｃｃｏｉｄｅｓ）種、クロストリジウム・レプツム（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｌｅｐｔｕｍ）種、クロストリジウム・シンデンス（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｓｃｉｎｄｅｎｓ）種、ディアリスター・インビサス（Ｄｉａｌｉｓｔｅｒ  ｉｎｖｉｓｕｓ）種、ユウバクテリウム・レクタル（Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｒｅｃｔａｌ）種、ユウバクテリウム・エリゲンス（Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｅｌｉｇｅｎｓ）種、フィーカリバクテリウム・プラウスニッツィイ（Ｆａｅｃａｌｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｐｒａｕｓｎｉｔｚｉｉ）種、ストレプトコッカス・サリバリウス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ  ｓａｌｉｖａｒｉｕｓ）種およびストレプトコッカス・サーモフィラス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ  ｔｈｅｒｍｏｐｈｉｌｕｓ）種の１種以上を含み得る。
【０４４５】
いくつかの実施形態では、表１９、２０または２１の列１から選択される細菌分類群と本明細書に記載のグリカン調製物とを含む組み合わせが提供される。いくつかの実施形態では、組み合わせ調製物は、表１９、２０または２１の列１から選択される微生物の微生物調製物、および列３〜１０（表１９）または列２〜９（表２０および２１）から選択されるグリカン調製物を含む。いくつかの実施形態では、それを必要とするヒト対象への投与（例えば、経口または経直腸投与）に適したシンバイオティクスの組み合わせが提供される。いくつかの実施形態では、組み合わせのために選択される細菌分類群は、胞子形成細菌分類群である。いくつかの実施形態では、組み合わせのために選択されるグリカン調製物は、胞子形成細菌分類群の（発酵性）基質（例えば、グリコシダーゼ酵素のための）である。
【０４４６】
さらに、必要に応じて、グリカンポリマー調製物を含む医薬組成物、医療用食品、および栄養補助食品は、治療効果のある薬剤、プレバイオティクス物質、および／またはプロバイオティクス細菌を含んでもよい。あるいはまたはさらに、治療効果のある薬剤、プレバイオティクス物質、および／またはプロバイオティクス細菌は、別々に（例えば、グリカンポリマーの投与の前、それと同時に、またはその後）、グリカンポリマーの医薬組成物、医療用食品、または栄養補助食品の一部として（例えば、共製剤として）ではなく、投与されてもよい。いくつかの実施形態では、グリカンポリマーの調製物を含む医薬組成物または医療用食品または栄養補助食品は、医師または他の医療従事者によって決定され得るような、推奨された、または規定の食事、例えば、プロバイオティクスおよび／またはプレバイオティクス含有食品に富む食事と組み合わせて投与される。治療効果のある薬剤、プレバイオティクス物質、および／またはプロバイオティクス細菌は、対象の腸内のマイクロバイオームを調節するために投与されてもよい。いくつかの実施形態では、複合効果（例えば、微生物、ゲノム、または機能的変化の数または強度における）は、相加的である。他の実施形態では、複合効果（例えば、微生物、ゲノム、または機能的変化の数または強度における）は、相乗的である。
【０４４７】
グリカンポリマー調製物の投与
本明細書に記載の方法（例えば、表５に列挙された疾患、障害または状態の処置の方法）において使用される任意のグリカンポリマー調製物組成物について、治療有効量は、当業者に公知の実験動物モデルから初めに推定され得る。このような情報は、ヒトにおける有用な用量をより正確に決定するために使用され得る。初期投与量はまた、インビトロまたはインビボのデータからも推定することができる。初期投与量はまた、モデルアッセイにおける本明細書に記載の方法で用いられる化合物の有効性を公知の化合物の有効性と比較することによって製剤化され得る。例えば、初期投与量は、モデルアッセイにおけるグリカンポリマー調製物調製物の有効性を、本発明の状態を処置する際に有効性を示したその他の化合物の有効性と比較することによって製剤化され得る。この方法において、初期投与量は、本明細書に記載の方法において使用されるグリカンポリマー調製物調製物のためのモデルアッセイで得られた有効な濃度の有効な投与量の対照化合物に対する比率を乗算することによって得ることができる。例えば、本方法において有用な調製物が、モデルアッセイにおいて公知の化合物の２倍有効である（例えば、グリカンポリマー調製物調製物の有効濃度（ＥＣ５０）が同じアッセイにおいて公知の化合物のＥＣ５０の半分に相当する）場合、グリカンポリマー調製物調製物の初期有効投与量は、公知の化合物に対して公知の投与量の半分となろう。これらの初期ガイドラインを用いて、ヒトなどの対象における有効投与量は、当業者によって決定され得る。投与量および間隔は、治療効果を維持するのに十分であるグリカンポリマー調製物調製物のレベルを提供するために個々に調節され得る。当業者であれば、過度な実験を行わずに治療的に有効な局所投与量を最適化することができよう。
【０４４８】
処置される障害および対象ならびに投与経路に応じて、本組成物は、様々な用量で投与され得る。一実施形態では、最小有効量または用量のグリカンポリマー調製物が使用される。いくつかの実施形態では、グリカンポリマー調製物は、約０．０１ｍｇ／ｋｇ〜約１０，０００ｍｇ／ｋｇ、約０．１ｍｇ／ｋｇ〜約１，０００ｍｇ／ｋｇ、約１ｍｇ／ｋｇ〜約１００ｍｇ／ｋｇ、０．０５ｍｇ／ｋｇ〜約５，０００ｍｇ／ｋｇ、約０．５ｍｇ／ｋｇ〜約５，０００ｍｇ／ｋｇ、約５ｍｇ／ｋｇ〜約５００ｍｇ／ｋｇの用量で投与される。この用量は、ｍｇ／ｋｇ／日として投与され得、初期用量として投与され得るか、または最終用量に達するように、時間（例えば、日または週間）とともに増加もしくは減少され得る。
【０４４９】
いくつかの実施形態では、グリカンポリマー調製物は、１対象当たりの１日総用量、約１ｍｇ／日〜約１００グラム／日、約１０ｍｇ／日〜約１０グラム／日、約１００ｍｇ／日〜約１０グラム／日、約１グラム／日〜約１０グラム／日、約２グラム／日〜約２０グラム／日、約５グラム／日〜約５０グラム／日、約１０グラム／日〜約１００グラム／日、約１０グラム／日〜約５０グラム／日、約１０グラム／日〜約７５グラム／日、約２０グラム／日〜約１００グラム／日、約２０グラム／日〜約５０グラム／日、約２０グラム／日〜約７５グラム／日、約２０グラム／日〜約１００グラム／日、約５０グラム／日〜約１５０グラム／日、または約５０グラム／日〜約２００グラム／日で投与される。
【０４５０】
いくつかの実施形態では、症状を示す対象における胃腸疾患、障害、または状態の症状は、対象に、ある期間（例えば、処置期間）中、増加する、減少する、または一定の量（または用量）のグリカンポリマー調製物組成物を投与することによって軽減または解消される。
【０４５１】
一実施形態では、本組成物は、１×１０７〜１×１０１３ＣＦＵ／用量および細菌株、または１×１０９〜１×１０１１ＣＦＵ／用量および細菌株からなる量で、有益な、共生的な、および／またはプロバイオティクス細菌である菌株を含有する。
【０４５２】
いくつかの実施形態では、医薬組成物は、１日１回、２回、または３回投与される。いくつかの実施形態では、医薬組成物は、１日２回投与される。いくつかの実施形態では、医薬組成物は、所定の日数（処置期間）にわたって毎日投与される。いくつかの実施形態では、処置期間は、１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、２１、２８、３５、４２、４９、５６、６３、７０、１００、２００、３００、または３６５日間である。いくつかの実施形態では、処置期間は、１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、または１２ヶ月間である。いくつかの実施形態では、処置期間は、１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２年間、または一生である。
【０４５３】
一実施形態では、胃腸疾患、障害、または状態における処置期間の全期間は、約１日〜１０年間、１日〜１年間、１日〜６ヶ月間、１日〜３ヶ月間、１日〜１ヶ月間、１日〜１週間、１日〜５日間、１日〜１０日間、１週間〜約１２週間、または約４週間〜約１０週間、または約４週間〜約８週間、または約６週間であり得る。対象は、適当な処置期間、例えば、１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、または１０超の処置期間を受けてもよい。処置期間中、対象は、任意選択により、プレバイオティクスおよび／またはプロバイオティクスを含有する食品の摂取と共に、本明細書に記載のグリカンポリマー調製物組成物を摂取する。一実施形態では、グリカンポリマー調製物組成物はまた、本明細書に記載の、別の物質（例えば、プロバイオティクスもしくは共生的に有益な細菌、プレバイオティクス物質、または治療剤）との併用で投与され得る。
【０４５４】
いくつかの実施形態では、グリカンポリマー調製物組成物はまた、正常な胃腸微生物叢の増殖を妨げる抗生物質と組み合わせられ得る。典型的には、抗生物質処置の期間は、１〜１４日間、または２〜１０日間、または５〜７日間である。いくつかの実施形態では、グリカンポリマー調製物は、１つ以上の抗生物質処置が終了した直後（例えば、抗生物質処置が終了してから１時間、６時間、１２時間、２４時間、３６時間、４８時間、３日間、４日間、５日間、６日間、７日間、２週間、３週間、または４週間後）に、それを必要とする対象に投与される。一連の抗生物質処置中、グリカンポリマー調製物組成物は、抗生物質処置の開始時に、抗生物質処置直後、例えば、処置から１、２、３、４、５、６、７日、もしくはそれ以上の後に提供され得るか、または望ましくない病原体の胃増殖の診断の際に投与され得る。
【０４５５】
いくつかの実施形態では、グリカンポリマー調製物組成物はまた、ディスバイオシスを引き起こす薬物、例えば、正常な胃腸の微生物叢の増殖を中断する薬物、例えば、化学療法薬、抗糖尿病薬、免疫抑制薬、抗菌薬、抗精神病薬、プロトンポンプ阻害薬、または非ステロイド性抗炎症薬（ＮＳＡＩＤ）と組み合わせられ得る。グリカンポリマー調製物組成物は、いくつかの実施形態では、ヒト対象における薬物または処置誘発性の症状を軽減する。症状には、例えば、体重増加、便秘、胸やけ、胃のむかつき、ガス、膨満感、鼓腸、下痢、腹痛、筋けいれん、吐き気、および嘔吐などの、消化異常が含まれる。いくつかの実施形態では、グリカンポリマー調製物は、１つ以上の薬物処置が終了した直後（例えば、薬物処置が終了してから１時間、６時間、１２時間、２４時間、３６時間、４８時間、３日間、４日間、５日間、６日間、７日間、２週間、３週間、または４週間後）に、それを必要とする対象に投与される。一連の薬物処置中、グリカンポリマー調製物組成物は、薬物処置の開始前（例えば、１、２、３、４、５、６、７日前）、薬物処置の開始日に、または抗生物質処置直後、例えば、処置から１、２、３、４、５、６、７日、もしくはそれ以上後に提供されてもよく、また任意選択により、薬物処置の持続期間の初めにのみ（例えば、短期間の間）、またはそれを通して提供されてもよく、さらに、薬物処置期間の終了後に所望の期間中（例えば、その後、１〜７日間、１〜１４日間、または１〜２１日間）継続されてもよい。いくつかの実施形態では、グリカンポリマー調製物組成物の投与は、薬物処置と併せて１つ以上の副作用が生じる、および／または診断される（例えば、消化異常または病原体の増殖）ときに、開始または継続される。いくつかの実施形態では、ディスバイオシスを引き起こす処置剤は、薬物ではなく、放射線処置または外科手術であり、グリカンポリマー調製物組成物はまた、本明細書に記載のように投与され得る。
【０４５６】
いくつかの実施形態では、処置期間の総数および期間は、処置に対する対象の応答に基づく。例えば、個体は、グリカンポリマー調製物組成物による処置から１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、または１４日後に症状の軽減を経験し得る。別の例では、個体は、グリカンポリマー調製物組成物による処置から１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２ヶ月後に症状の軽減を経験し得る。従って、処置期間は、グリカンポリマー調製物組成物に対する個々の対象の応答および１つ以上の症状の緩和の開始によって決定される。従って、対象は、所与の用量のグリカンポリマー調製物組成物で症状を経験する可能性があり、症状が消失するまで、対象はその用量またはより低用量にとどまることが必要である可能性がある。従って、一実施形態では、処置の期間は、開始時に決定されないが、最大用量のグリカンポリマー調製物組成物が１日毎に達成される、または症状の所望のレベルの軽減が達成されるまで継続する。一実施形態では、処置は連続的である。
【０４５７】
一実施形態では、対象は、処置レジメン中第１の処置期間中のある用量および第２の処置期間中第２の用量を与えられ得る。例えば、対象は、グリカンポリマー調製物組成物の１用量を１週間にわたり、および第２の用量をその後の１週間にわたり投与され得る。
【０４５８】
対象は、グリカンポリマー調製物組成物を自己投与し得、グリカンポリマー調製物組成物は、医療従事者、例えば、医師またはその他の資格のある医療従事者によって供給または推奨され（または処方され）、任意選択により、試験結果（例えば、対象から採取された試料からのバイオマーカーに対して得られた）ならびに／または健康の変化および処置エンドポイントは、医療従事者によってモニタリングされる。いくつかの実施形態では、グリカンポリマー調製物組成物は医療専門家によって投与される。
【０４５９】
一実施形態では、それを必要とする対象は、グリカンポリマー調製物組成物を用いた処置の反復過程を経ることができる。処置過程は、症状が再発するか、または望ましくないレベルまで増加した場合、反復することができる。あるいは、処置過程は、一定または所定の間隔で反復することができる。従って、処置は、約１ヶ月後、２ヶ月後、３ヶ月後、４ヶ月後、６ヶ月後、８ヶ月後、１０ヶ月後、１年後、１８ヶ月後、２年後、３年後、４年後、５年後、または５年超後、またはこれらの任意の組み合わせで反復され得る（例えば、処置は、１年後、次いで、その後２〜５年毎に反復され得る）。処置は、最初の処置において使用されるものと同じ形態（例えば、期間、投与量、投与のタイミング、追加の物質等）で反復することができ、または修正することができる。例えば、処置期間は、短縮または延長することができ、投与量は、増加または減少することができる。任意選択により、グリカンポリマー調製物による処置は、例えば、グリカンポリマー調製物に加えて、多少の他の物質、または多少の物質（例えば、プレバイオティクス物質、プロバイオティクス細菌、または治療剤）を含有する、異なる数の薬剤または薬剤の組成と組み合わせて生じ得る。
【０４６０】
さらなる物質をグリカンポリマー調製物組成物と共に投与することができる。これらの物質は、例えば、胃腸疾患、障害、または状態の症状を緩和する胃腸管内の細菌の増殖を促し、生態学的地位または腸内のプロバイオティクスまたは有益な共生細菌の付着を増大させることによって、グリカンポリマー調製物の用量の作用を増強し得る。これらの物質は、グリカンポリマー調製物による処置前、グリカンポリマー調製物による処置中、グリカンポリマー調製物による処置後、またはこれらの任意の組み合わせで投与することができる。グリカンポリマー調製物での処置中に投与される場合、これらの物質は、与えられたグリカンポリマー調製物の投与と共に、またはグリカンポリマー調製物の投与の前もしくはその後、またはこれらの任意の組み合わせで投与され得る。一実施形態では、グリカンポリマー調製物組成物と併せて用いられる物質には、プロバイオティクス微生物、プレバイオティクス、治療剤、または緩衝液／担体／賦形剤が含まれる。これらの物質のうちの１つ以上は、処置前、処置中、処置後、またはこれらのいくつかの組み合わせの任意の適当な時に、グリカンポリマー調製物組成物と併用して使用することができる。
【０４６１】
【表１】
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【０４６２】
【表２】
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【０４６３】
【表３】
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【０４６４】
【表４】
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【０４６５】
【表５】
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【０４６６】
【表６】
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【０４６７】
【表７】
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【０４６８】
【表８】
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【０４６９】
【表９】
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【０４７０】
【表１０】
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【０４７１】
【表１１】
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【０４７２】
【表１２】
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【０４７３】
【表１３】
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【０４７４】
【表１４】
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【０４７５】
【表１５】
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【０４７６】
【表１６】
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【０４７７】
【表１７】
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【０４７８】
【表１８】
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【０４７９】
【表１９】
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【０４８０】
【表２０】
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【０４８１】
【表２１】
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【０４８２】
【表２２】
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【０４８３】
【表２３】
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【０４８４】
【表２４】
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【０４８５】
【表２５】
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【０４８６】
【表２６】
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【０４８７】
【表２７】
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【０４８８】
【表２８】
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【０４８９】
【表２９】
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【０４９０】
【表３０】
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【０４９１】
【表３１】
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【０４９２】
【表３２】
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【０４９３】
【表３３】
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【０４９４】
【表３４】
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【０４９５】
【表３５】
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【０４９６】
【表３６】
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【０４９７】
【表３７】
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【０４９８】
【表３８】
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【０４９９】
【表３９】
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【０５００】
【表４０】
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【０５０１】
【表４１】
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【０５０２】
【表４２】
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【０５０３】
【表４３】
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【０５０４】
【表４４】
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【０５０５】
【表４５】
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【０５０６】
【表４６】
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【０５０７】
【表４７】
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【０５０８】
【表４８】
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【０５０９】
【表４９】
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【０５１０】
【表５０】
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【０５１１】
【表５１】
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【０５１２】
【表５２】
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【０５１３】
【表５３】
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【０５１４】
【表５４】
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【０５１５】
【表５５】
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【０５１６】
【表５６】
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【０５１７】
【表５７】
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【０５１８】
【表５８】
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【０５１９】
【表５９】
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【０５２０】
【表６０】
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【０５２１】
【表６１】
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【０５２２】
【表６２】
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【０５２３】
【表６３】
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【０５２４】
【表６４】
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【０５２５】
【表６５】
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【０５２６】
【表６６】
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【０５２７】
【表６７】
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【０５２８】
【表６８】
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【０５２９】
【表６９】
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【０５３０】
【表７０】
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【０５３１】
【表７１】
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【０５３２】
【表７２】
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【０５３３】
【表７３】
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【０５３４】
【表７４】
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【０５３５】
【表７５】
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【０５３６】
【表７６】
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【０５３７】
【表７７】
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【０５３８】
【表７８】
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【０５３９】
【表７９】
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【０５４０】
【表８０】
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【０５４１】
【表８１】
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【０５４２】
【表８２】
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【０５４３】
【表８３】
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【０５４４】
【表８４】
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【０５４５】
【表８５】
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【０５４６】
【表８６】
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【０５４７】
【表８７】
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【０５４８】
【表８８】
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【０５４９】
番号付き実施形態
１．望ましくないレベルの代謝産物（例えば、短鎖脂肪酸（ＳＣＦＡ）（例えば、プロピオネートまたはブチレート）、アンモニア、トリメチルアミン（ＴＭＡ）、トリメチルアミンＮ−オキシド（ＴＭＡＯ）、尿毒症性溶質（例えば、ｐ−クレゾールまたはインドール）、リポ多糖類（ＬＰＳ）、または胆汁酸（例えば、二次胆汁酸））に関連する疾患または障害を有する対象を処置する方法であって、
任意選択により、グリカンポリマー調製物を、それが代謝産物の産生またはレベルを調節することに基づいて、選択する工程、および
代謝産物のレベルの調節をもたらすのに有効な量のグリカンポリマー調製物を投与し、それによって疾患または障害を処置する工程
を含む方法。
【０５５０】
２．望ましくないレベルの代謝産物（例えば、短鎖脂肪酸（ＳＣＦＡ）（例えば、プロピオネートまたはブチレート）、アンモニア、トリメチルアミン（ＴＭＡ）、トリメチルアミンＮ−オキシド（ＴＭＡＯ）、尿毒症性溶質（例えば、ｐ−クレゾールまたはインドール）、リポ多糖類（ＬＰＳ）、または胆汁酸（例えば、二次胆汁酸））に関連する疾患または障害を有する対象を処置する方法であって、
任意選択により、グリカンポリマー調製物が代謝産物の産生またはレベルを調節するという知見を取得する工程、および
代謝産物のレベルの調節をもたらすのに有効な量のグリカンポリマー調製物を投与し、それによって疾患または障害を処置する工程
を含む方法。
【０５５１】
３．グリカンポリマー調製物が代謝産物の産生またはレベルを調節するという根拠または知見に応じて、グリカンポリマー調製物を投与する、項１または２のいずれかに記載の方法。
【０５５２】
３．グリカンポリマー調製物のグリカンポリマー、または少なくとも２０、３０、４０、５０、６０、７０、８０、９０、９５、もしくは９９％（重量または数による）のグリカンポリマーが、表１に列挙された特性の１つ以上（例えば、２、３、４、５、または６つ）有し、任意選択により、
ａ．グルコース、マンノースもしくはガラクトースサブユニット、またはそれらの組み合わせ、および少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含むグリカンポリマー、
ｂ．グルコース、マンノースもしくはガラクトースサブユニット、またはそれらの組み合わせ、および少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含むグリカンポリマー、
ｃ．キシロース、アラビノース、フコースもしくはラムノースサブユニット、またはそれらの組み合わせ、および少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含むグリカンポリマー、
ｄ．キシロース、アラビノース、フコースもしくはラムノースサブユニット、またはそれらの組み合わせ、および少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含むグリカンポリマー、
ｅ．グルコースもしくはガラクトースサブユニット、またはそれらの組み合わせ、および少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含むグリカンポリマー、または
ｆ．グルコースもしくはガラクトースサブユニット、またはそれらの組み合わせ、および少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含むグリカンポリマー
から選択される、項１〜３のいずれかに記載の方法。
【０５５３】
４．グリカンポリマーおよび／またはグリカンポリマー調製物が、以下の特徴：
ｉ．グリカンポリマーが、グルコースおよび少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含み、任意選択により、アルファ−グリコシド結合がアルファ−１，３グリコシド結合、アルファ−１，４グリコシド結合、またはそれらの組み合わせであり、さらに任意選択により、調製物の平均重合度（ＤＰ）がＤＰ２〜４、ＤＰ２〜６、ＤＰ３〜１０、またはＤＰ３〜１５である；
ｉｉ．グリカンポリマー調製物が、少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含み、任意選択により、ベータ−グリコシド結合が、ベータ−１，３グリコシド結合、ベータ−１，４グリコシド結合、またはそれらの組み合わせである；
ｉｉｉ．グリカンポリマー調製物が、ガラクトースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇｌｕ−ｇａｌ調製物）；
ｉｖ．グリカンポリマー調製物が、マンノースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇｌｕ−ｍａｎ調製物）；および
ｖ．グリカンポリマー調製物が、ガラクトースおよびマンノースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇｌｕ−ｇａｌ−ｍａｎ調製物）
のうちの１つ、２つ、３つ、またはそれを超える、例えば全てを含む、項１〜３のいずれかに記載の方法。
【０５５４】
５．グリカンポリマーおよび／またはグリカンポリマー調製物が、以下の特徴：
ｉ．グリカンポリマーが、グルコースおよび少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含み、任意選択により、ベータ−グリコシド結合がベータ−１，３グリコシド結合、ベータ−１，４グリコシド結合、またはそれらの組み合わせであり、さらに任意選択により、調製物の平均重合度（ＤＰ）がＤＰ２〜４、ＤＰ２〜６、ＤＰ３〜１０、またはＤＰ３〜１５である；
ｉｉ．グリカンポリマー調製物が、少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含み、任意選択により、アルファ−グリコシド結合が、アルファ−１，３グリコシド結合、アルファ−１，４グリコシド結合またはそれらの組み合わせである；
ｉｉｉ．グリカンポリマー調製物が、ガラクトースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇｌｕ−ｇａｌ調製物）；
ｉｖ．グリカンポリマー調製物が、マンノースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇｌｕ−ｍａｎ調製物）；および
ｖ．グリカンポリマー調製物が、ガラクトースおよびマンノースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇｌｕ−ｇａｌ−ｍａｎ調製物）
のうちの１つ、２つ、３つ、またはそれを超える、例えば全てを含む、項１〜３のいずれかに記載の方法。
【０５５５】
６．グリカンポリマーおよび／またはグリカンポリマー調製物が、以下の特徴：
ｉ．グリカンポリマーが、ガラクトースおよび少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含み、任意選択により、アルファ−グリコシド結合がアルファ−１，３グリコシド結合、アルファ−１，４グリコシド結合、またはそれらの組み合わせであり、さらに任意選択により、調製物の平均重合度（ＤＰ）がＤＰ２〜４、ＤＰ２〜６、ＤＰ３〜１０、またはＤＰ３〜１５である；
ｉｉ．グリカンポリマー調製物が、少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含み、任意選択により、ベータ−グリコシド結合が、ベータ−１，３グリコシド結合、ベータ−１，４グリコシド結合、またはそれらの組み合わせである；
ｉｉｉ．グリカンポリマー調製物が、グルコースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇａｌ−ｇｌｕ調製物）；
ｉｖ．グリカンポリマー調製物が、マンノースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇａｌ−ｍａｎ調製物）；および
ｖ．グリカンポリマー調製物が、グルコースおよびマンノースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇａｌ−ｍａｎ−ｇｌｕ調製物）
のうちの１つ、２つ、３つ、またはそれを超える、例えば全てを含む、項１〜３のいずれかに記載の方法。
【０５５６】
７．グリカンポリマーおよび／またはグリカンポリマー調製物が、以下の特徴：
ｉ．グリカンポリマーが、ガラクトースおよび少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含み、任意選択により、ベータ−グリコシド結合がベータ−１，３グリコシド結合、ベータ−１，４グリコシド結合、またはそれらの組み合わせであり、さらに任意選択により、調製物の平均重合度（ＤＰ）がＤＰ２〜４、ＤＰ２〜６、ＤＰ３〜１０、またはＤＰ３〜１５である；
ｉｉ．グリカンポリマー調製物が、少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含み、任意選択により、アルファ−グリコシド結合が、アルファ−１，３グリコシド結合、アルファ−１，４グリコシド結合またはそれらの組み合わせである；
ｉｉｉ．グリカンポリマー調製物が、グルコースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇａｌ−ｇｌｕ調製物）；
ｉｖ．グリカンポリマー調製物が、マンノースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇａｌ−ｍａｎ調製物）；および
ｖ．グリカンポリマー調製物が、グルコースおよびマンノースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇａｌ−ｇｌｕ−ｍａｎ調製物）
のうちの１つ、２つ、３つ、またはそれを超える、例えば全てを含む、項１〜３のいずれかに記載の方法。
【０５５７】
８．グリカンポリマーおよび／またはグリカンポリマー調製物が、以下の特徴：
ｉ．グリカンポリマーが、マンノースおよび少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含み、任意選択により、アルファ−グリコシド結合がアルファ−１，３グリコシド結合、アルファ−１，４グリコシド結合、またはそれらの組み合わせであり、さらに任意選択により、調製物の平均重合度（ＤＰ）がＤＰ２〜４、ＤＰ２〜６、ＤＰ３〜１０、またはＤＰ３〜１５である；
ｉｉ．グリカンポリマー調製物が、少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含み、任意選択により、ベータ−グリコシド結合が、ベータ−１，３グリコシド結合、ベータ−１，４グリコシド結合、またはそれらの組み合わせである；
ｉｉｉ．グリカンポリマー調製物が、ガラクトースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｍａｎ−ｇａｌ調製物）；
ｉｖ．グリカンポリマー調製物が、グルコースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｍａｎ−ｇｌｕ調製物）；および
ｖ．グリカンポリマー調製物が、ガラクトースおよびグルコースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｍａｎ−ｇａｌ−ｇｌｕ調製物）
のうちの１つ、２つ、３つ、またはそれを超える、例えば全てを含む、項１〜３のいずれかに記載の方法。
【０５５８】
９．グリカンポリマーおよび／またはグリカンポリマー調製物が、以下の特徴：
ｉ．グリカンポリマーが、マンノースおよび少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含み、任意選択により、ベータ−グリコシド結合がベータ−１，３グリコシド結合、ベータ−１，４グリコシド結合、またはそれらの組み合わせであり、さらに任意選択により、調製物の平均重合度（ＤＰ）がＤＰ２〜４、ＤＰ２〜６、ＤＰ３〜１０、またはＤＰ３〜１５である；
ｉｉ．グリカンポリマー調製物が、少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含み、任意選択により、アルファ−グリコシド結合が、アルファ−１，３グリコシド結合、アルファ−１，４グリコシド結合またはそれらの組み合わせである；
ｉｉｉ．グリカンポリマー調製物が、ガラクトースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｍａｎ−ｇａｌ調製物）；
ｉｖ．グリカンポリマー調製物が、グルコースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｍａｎ−ｇｌｕ調製物）；および
ｖ．グリカンポリマー調製物が、ガラクトースおよびグルコースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｍａｎ−ｇａｌ−ｇｌｕ調製物）
のうちの１つ、２つ、３つ、またはそれを超える、例えば全てを含む、項１〜３のいずれかに記載の方法。
【０５５９】
１０．グリカンポリマーおよび／またはグリカンポリマー調製物が、以下の特徴：
ｉ．グリカンポリマーが、ガラクトースおよび少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含み、任意選択により、アルファ−グリコシド結合がアルファ−１，３グリコシド結合、アルファ−１，４グリコシド結合、またはそれらの組み合わせであり、さらに任意選択により、調製物の平均重合度（ＤＰ）がＤＰ２〜４、ＤＰ２〜６、ＤＰ３〜１０、またはＤＰ３〜１５である；
ｉｉ．グリカンポリマー調製物が、アルファ−１，２グリコシド結合、アルファ−１，６グリコシド結合、またはそれらの組み合わせを含むグリカンポリマーをさらに含む；
ｉｉｉ．グリカンポリマー調製物が、少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含み、任意選択により、ベータ−グリコシド結合が、ベータ−１，３グリコシド結合、ベータ−１，４グリコシド結合、ベータ−１，６グリコシド結合、またはそれらの組み合わせである；
ｉｖ．グリカンポリマー調製物が、フコースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇａｌ−ｆｕｃ調製物）；
ｖ．グリカンポリマー調製物が、マンノースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇａｌ−ｍａｎ調製物）；および
ｖｉ．グリカンポリマー調製物が、フコースおよびマンノースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇａｌ−ｆｕｃ−ｍａｎ調製物）
のうちの１つ、２つ、３つ、またはそれを超える、例えば全てを含む、項１〜３のいずれかに記載の方法。
【０５６０】
１１．グリカンポリマーおよび／またはグリカンポリマー調製物が、以下の特徴：
ｉ．グリカンポリマーが、ガラクトースおよび少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含み、任意選択により、ベータ−グリコシド結合がベータ−１，３グリコシド結合、ベータ−１，４グリコシド結合、またはそれらの組み合わせであり、さらに任意選択により、調製物の平均重合度（ＤＰ）がＤＰ２〜４、ＤＰ２〜６、ＤＰ３〜１０、またはＤＰ３〜１５である；
ｉｉ．グリカンポリマー調製物が、ベータ−１，６グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含む；
ｉｉｉ．グリカンポリマー調製物が、少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含み、任意選択により、アルファ−グリコシド結合が、アルファ−１，２グリコシド結合、アルファ−１，３グリコシド結合、アルファ−１，４グリコシド結合、アルファ−１，６−グリコシド結合またはそれらの組み合わせである；
ｉｖ．グリカンポリマー調製物が、フコースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇａｌ−ｆｕｃ調製物）；
ｖ．グリカンポリマー調製物が、マンノースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇａｌ−ｍａｎ調製物）；および
ｖｉ．グリカンポリマー調製物が、フコースおよびマンノースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇａｌ−ｆｕｃ−ｍａｎ調製物）
のうちの１つ、２つ、３つ、またはそれを超える、例えば全てを含む、項１〜３のいずれかに記載の方法。
【０５６１】
１２．グリカンポリマーおよび／またはグリカンポリマー調製物が、以下の特徴：
ｉ．グリカンポリマーが、フコースおよび少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含み、任意選択により、アルファ−グリコシド結合がアルファ−１，３グリコシド結合、アルファ−１，４グリコシド結合、またはそれらの組み合わせであり、さらに任意選択により、調製物の平均重合度（ＤＰ）がＤＰ２〜４、ＤＰ２〜６、ＤＰ３〜１０、またはＤＰ３〜１５である；
ｉｉ．グリカンポリマー調製物が、アルファ−１，２グリコシド結合、アルファ−１，６グリコシド結合、またはそれらの組み合わせを含むグリカンポリマーをさらに含む；
ｉｉｉ．グリカンポリマー調製物が、少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含み、任意選択により、ベータ−グリコシド結合が、ベータ−１，３グリコシド結合、ベータ−１，４グリコシド結合、ベータ−１，６グリコシド結合、またはそれらの組み合わせである；
ｉｖ．グリカンポリマー調製物が、ガラクトースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｆｕｃ−ｇａｌ調製物）；
ｖ．グリカンポリマー調製物が、マンノースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｆｕｃ−ｍａｎ調製物）；および
ｖｉ．グリカンポリマー調製物が、ガラクトースおよびマンノースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｆｕｃ−ｇａｌ−ｍａｎ調製物）
のうちの１つ、２つ、３つ、またはそれを超える、例えば全てを含む、項１〜３のいずれかに記載の方法。
【０５６２】
１３．グリカンポリマーおよび／またはグリカンポリマー調製物が、以下の特徴：
ｉ．グリカンポリマーが、フコースおよび少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含み、任意選択により、ベータ−グリコシド結合がベータ−１，３グリコシド結合、ベータ−１，４グリコシド結合、またはそれらの組み合わせであり、さらに任意選択により、調製物の平均重合度（ＤＰ）がＤＰ２〜４、ＤＰ２〜６、ＤＰ３〜１０、またはＤＰ３〜１である；
ｉｉ．グリカンポリマー調製物が、ベータ−１，６グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含む；
ｉｉｉ．グリカンポリマー調製物が、少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含み、任意選択により、アルファ−グリコシド結合が、アルファ−１，２グリコシド結合、アルファ−１，３グリコシド結合、アルファ−１，４グリコシド結合、アルファ−１，６−グリコシド結合またはそれらの組み合わせである；
ｉｖ．グリカンポリマー調製物が、ガラクトースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｆｕｃ−ｇａｌ調製物）；
ｖ．グリカンポリマー調製物が、マンノースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｆｕｃ−ｍａｎ調製物）；および
ｖｉ．グリカンポリマー調製物が、ガラクトースおよびマンノースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｆｕｃ−ｇａｌ−ｍａｎ調製物）
のうちの１つ、２つ、３つ、またはそれを超える、例えば全てを含む、項１〜３のいずれかに記載の方法。
【０５６３】
１４．グリカンポリマーおよび／またはグリカンポリマー調製物が、以下の特徴：
ｉ．グリカンポリマーが、マンノースおよび少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含み、任意選択により、アルファ−グリコシド結合がアルファ−１，３グリコシド結合、アルファ−１，４グリコシド結合、またはそれらの組み合わせであり、さらに任意選択により、調製物の平均重合度（ＤＰ）がＤＰ２〜４、ＤＰ２〜６、ＤＰ３〜１０、またはＤＰ３〜１５である；
ｉｉ．グリカンポリマー調製物が、アルファ−１，２グリコシド結合、アルファ−１，６グリコシド結合、またはそれらの組み合わせを含むグリカンポリマーをさらに含む；
ｉｉｉ．グリカンポリマー調製物が、少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含み、任意選択により、ベータ−グリコシド結合が、ベータ−１，３グリコシド結合、ベータ−１，４グリコシド結合、ベータ−１，６グリコシド結合、またはそれらの組み合わせである；
ｉｖ．グリカンポリマー調製物が、フコースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｍａｎ−ｆｕｃ調製物）；
ｖ．グリカンポリマー調製物が、ガラクトースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｍａｎ−ｇａｌ調製物）；および
ｖｉ．グリカンポリマー調製物が、ガラクトースおよびフコースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｍａｎ−ｇａｌ−ｆｕｃ調製物）
のうちの１つ、２つ、３つ、またはそれを超える、例えば全てを含む、項１〜３のいずれかに記載の方法。
【０５６４】
１５．グリカンポリマーおよび／またはグリカンポリマー調製物が、以下の特徴：
ｉ．グリカンポリマーが、マンノースおよび少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含み、任意選択により、ベータ−グリコシド結合がベータ−１，３グリコシド結合、ベータ−１，４グリコシド結合、またはそれらの組み合わせであり、さらに任意選択により、調製物の平均重合度（ＤＰ）がＤＰ２〜４、ＤＰ２〜６、ＤＰ３〜１０、またはＤＰ３〜１５である；
ｉｉ．グリカンポリマー調製物が、ベータ−１，６グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含む；
ｉｉｉ．グリカンポリマー調製物が、少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含み、任意選択により、アルファ−グリコシド結合が、アルファ−１，２グリコシド結合、アルファ−１，３グリコシド結合、アルファ−１，４グリコシド結合、アルファ−１，６−グリコシド結合またはそれらの組み合わせである；
ｉｖ．グリカンポリマー調製物が、フコースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｍａｎ−ｆｕｃ調製物）；
ｖ．グリカンポリマー調製物が、ガラクトースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｍａｎ−ｇａｌ調製物）；および
ｖｉ．グリカンポリマー調製物が、ガラクトースおよびフコースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｍａｎ−ｇａｌ−ｆｕｃ調製物）
のうちの１つ、２つ、３つ、またはそれを超える、例えば全てを含む、項１〜３のいずれかに記載の方法。
【０５６５】
１６．グリカンポリマーおよび／またはグリカンポリマー調製物が、以下の特徴：
ｉ．グリカンポリマーが、グルコース、キシロースおよびアラビノースのうちの１つ、２つ、または３つ、ならびに少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含み、任意選択により、アルファ−グリコシド結合がアルファ−１，３グリコシド結合、アルファ−１，４グリコシド結合、またはそれらの組み合わせであり、さらに任意選択により、調製物の平均重合度（ＤＰ）がＤＰ２〜４、ＤＰ２〜６、ＤＰ３〜１０、またはＤＰ３〜１５である；
ｉｉ．グリカンポリマー調製物が、アルファ−１，２グリコシド結合、アルファ−１，６グリコシド結合、またはそれらの組み合わせを含むグリカンポリマーをさらに含む；
ｉｉｉ．グリカンポリマー調製物が、少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含み、任意選択により、ベータ−グリコシド結合が、ベータ−１，３グリコシド結合、ベータ−１，４グリコシド結合、ベータ−１，６グリコシド結合、またはそれらの組み合わせである；
ｉｖ．グリカンポリマー調製物が、グルコースを含むグリカンポリマーを含む；
ｖ．グリカンポリマー調製物が、キシロースを含むグリカンポリマーを含む、および
ｖｉ．グリカンポリマー調製物が、アラビノースを含むグリカンポリマーを含む
のうちの１つ、２つ、３つ、またはそれを超える、例えば全てを含む、項１〜３のいずれかに記載の方法。
【０５６６】
１７．グリカンポリマーおよび／またはグリカンポリマー調製物が、以下の特徴：
ｉ．グリカンポリマーが、グルコース、キシロースおよびアラビノースのうちの１つ、２つ、または３つ、ならびに少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含み、任意選択により、ベータ−グリコシド結合がベータ−１，３グリコシド結合、ベータ−１，４グリコシド結合、またはそれらの組み合わせであり、さらに任意選択により、調製物の平均重合度（ＤＰ）がＤＰ２〜４、ＤＰ２〜６、ＤＰ３〜１０、またはＤＰ３〜１５である；
ｉｉ．グリカンポリマー調製物が、ベータ−１，６グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含む；
ｉｉｉ．グリカンポリマー調製物が、少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含み、任意選択により、アルファ−グリコシド結合が、アルファ−１，２グリコシド結合、アルファ−１，３グリコシド結合、アルファ−１，４グリコシド結合、アルファ−１，６−グリコシド結合またはそれらの組み合わせである；
ｉｖ．グリカンポリマー調製物が、グルコースを含むグリカンポリマーを含む；
ｖ．グリカンポリマー調製物が、キシロースを含むグリカンポリマーを含む、および
ｖｉ．グリカンポリマー調製物が、アラビノースを含むグリカンポリマーを含む
のうちの１つ、２つ、３つ、またはそれを超える、例えば全てを含む、項１〜３のいずれかに記載の方法。
【０５６７】
１８．グリカンポリマーおよび／またはグリカンポリマー調製物が、以下の特徴：
ｉ．グリカンポリマーが、グルコースおよび少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含み、任意選択により、アルファ−グリコシド結合がアルファ−１，３グリコシド結合であり、さらに任意選択により、調製物の平均重合度（ＤＰ）がＤＰ２〜４、ＤＰ２〜６、ＤＰ３〜１０、またはＤＰ３〜１５である；
ｉｉ．グリカンポリマー調製物が、アルファ−１，２グリコシド結合、アルファ−１，４グリコシド結合、アルファ−１，６グリコシド結合、またはそれらの組み合わせを含むグリカンポリマーをさらに含む；
ｉｉｉ．グリカンポリマー調製物が、少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含む；
ｉｖ．グリカンポリマー調製物が、ガラクトースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇｌｕ−ｇａｌ調製物）；
ｖ．グリカンポリマー調製物が、アラビノースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇｌｕ−ａｒａ調製物）；
ｖｉ．グリカンポリマー調製物が、キシロースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇｌｕ−ｘｙｌ調製物）；および
ｖｉｉ．グリカンポリマー調製物が、ガラクトース、アラビノース、またはキシロースのうちの２つまたは３つを含むグリカンポリマーをさらに含む
のうちの１つ、２つ、３つ、またはそれを超える、例えば全てを含む、項１〜３のいずれかに記載の方法。
【０５６８】
１９．グリカンポリマーおよび／またはグリカンポリマー調製物が、以下の特徴：
ｉ．グリカンポリマーが、ガラクトースおよび少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含み、任意選択により、アルファ−グリコシド結合がアルファ−１，３グリコシド結合であり、さらに任意選択により、調製物の平均重合度（ＤＰ）がＤＰ２〜４、ＤＰ２〜６、ＤＰ３〜１０、またはＤＰ３〜１５である；
ｉｉ．グリカンポリマー調製物が、アルファ−１，２グリコシド結合、アルファ−１，４グリコシド結合、アルファ−１，６グリコシド結合、またはそれらの組み合わせを含むグリカンポリマーをさらに含む；
ｉｉｉ．グリカンポリマー調製物が、少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含む；
ｉｖ．グリカンポリマー調製物が、グルコースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇａｌ−ｇｌｕ調製物）；
ｖ．グリカンポリマー調製物が、アラビノースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇａｌ−ａｒａ調製物）；
ｖｉ．グリカンポリマー調製物が、キシロースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇａｌ−ｘｙｌ調製物）；および
ｖｉｉ．グリカンポリマー調製物が、グルコース、アラビノース、またはキシロースのうちの２つまたは３つを含むグリカンポリマーをさらに含む
のうちの１つ、２つ、３つ、またはそれを超える、例えば全てを含む、項１〜３のいずれかに記載の方法。
【０５６９】
２０．グリカンポリマーおよび／またはグリカンポリマー調製物が、以下の特徴：
ｉ．グリカンポリマーが、キシロースおよびアラビノースのうちの１つまたは２つ、ならびに少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含み、任意選択により、アルファ−グリコシド結合がアルファ−１，３グリコシド結合であり、さらに任意選択により、調製物の平均重合度（ＤＰ）がＤＰ２〜４、ＤＰ２〜６、ＤＰ３〜１０、またはＤＰ３〜１５である；
ｉｉ．グリカンポリマー調製物が、アルファ−１，２グリコシド結合、アルファ−１，４グリコシド結合、アルファ−１，６グリコシド結合、またはそれらの組み合わせを含むグリカンポリマーをさらに含む；
ｉｉｉ．グリカンポリマー調製物が、少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含む；
ｉｖ．グリカンポリマー調製物が、キシロースを含むグリカンポリマーを含む、および
ｖ．グリカンポリマー調製物が、アラビノースを含むグリカンポリマーを含む
のうちの１つ、２つ、３つ、またはそれを超える、例えば全てを含む、項１〜３のいずれかに記載の方法。
【０５７０】
２１．グリカンポリマーおよび／またはグリカンポリマー調製物が、以下の特徴：
ｉ．グリカンポリマーが、アラビノースおよび少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含み、任意選択により、アルファ−グリコシド結合がアルファ−１，３グリコシド結合であり、さらに任意選択により、調製物の平均重合度（ＤＰ）がＤＰ２〜４、ＤＰ２〜６、ＤＰ３〜１０、またはＤＰ３〜１５である；
ｉｉ．グリカンポリマー調製物が、少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含む；
ｉｉｉ．グリカンポリマー調製物が、ガラクトースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ａｒａ−ｇａｌ調製物）；
ｉｖ．グリカンポリマー調製物が、キシロースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ａｒａ−ｘｙｌ調製物）；および
ｖ．グリカンポリマー調製物が、ガラクトースおよびキシロースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ａｒａ−ｇａｌ−ｘｙｌ調製物）
のうちの１つ、２つ、３つ、またはそれを超える、例えば全てを含む、項１〜３のいずれかに記載の方法。
【０５７１】
２２．グリカンポリマーおよび／またはグリカンポリマー調製物が、以下の特徴：
ｉ．グリカンポリマーが、ガラクトースおよび少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含み、任意選択により、アルファ−グリコシド結合がアルファ−１，３グリコシド結合であり、さらに任意選択により、調製物の平均重合度（ＤＰ）がＤＰ２〜４、ＤＰ２〜６、ＤＰ３〜１０、またはＤＰ３〜１５である；
ｉｉ．グリカンポリマー調製物が、少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含む；
ｉｉｉ．グリカンポリマー調製物が、アラビノースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇａｌ−ａｒａ調製物）；
ｉｖ．グリカンポリマー調製物が、キシロースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇａｌ−ｘｙｌ調製物）；および
ｖ．グリカンポリマー調製物が、アラビノースおよびキシロースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇａｌ−ａｒａ−ｘｙｌ調製物）
のうちの１つ、２つ、３つ、またはそれを超える、例えば全てを含む、項１〜３のいずれかに記載の方法。
【０５７２】
２３．グリカンポリマーおよび／またはグリカンポリマー調製物が、以下の特徴：
ｉ．グリカンポリマーが、キシロースおよび少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含み、任意選択により、アルファ−グリコシド結合がアルファ−１，３グリコシド結合であり、さらに任意選択により、調製物の平均重合度（ＤＰ）がＤＰ２〜４、ＤＰ２〜６、ＤＰ３〜１０、またはＤＰ３〜１５である；
ｉｉ．グリカンポリマー調製物が、少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含む；
ｉｉｉ．グリカンポリマー調製物が、ガラクトースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｘｙｌ−ｇａｌ調製物）；
ｉｖ．グリカンポリマー調製物が、アラビノースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｘｙｌ−ａｒａ調製物）；および
ｖ．グリカンポリマー調製物が、ガラクトースおよびアラビノースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｘｙｌ−ａｒａ−ｇａｌ調製物）
のうちの１つ、２つ、３つ、またはそれを超える、例えば全てを含む、項１〜３のいずれかに記載の方法。
【０５７３】
２４．グリカンポリマーおよび／またはグリカンポリマー調製物が、以下の特徴：
ｉ．グリカンポリマーが、グルコースおよび少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含み、任意選択により、アルファ−グリコシド結合がアルファ−１，３グリコシド結合であり、さらに任意選択により、調製物の平均重合度（ＤＰ）がＤＰ２〜４、ＤＰ２〜６、ＤＰ３〜１０、またはＤＰ３〜１５である；
ｉｉ．グリカンポリマー調製物が、少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含む；および
ｉｉｉ．グリカンポリマー調製物が、アラビノース、ガラクトースまたはキシロースのうちの１つ、２つ、または３つを含むグリカンポリマーをさらに含む
のうちの１つ、２つ、またはそれを超える、例えば全てを含む、項１〜３のいずれかに記載の方法。
【０５７４】
２５．グリカンポリマーおよび／またはグリカンポリマー調製物が、以下の特徴：
ｉ．グリカンポリマーが、グルコースおよび少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含み、任意選択により、調製物の平均重合度（ＤＰ）がＤＰ２〜４、ＤＰ２〜６、ＤＰ３〜１０、またはＤＰ３〜１５である；
ｉｉ．グリカンポリマー調製物が、アルファ−１，２グリコシド結合、アルファ−１，３グリコシド結合、アルファ−１，４グリコシド結合、アルファ−１，６グリコシド結合、またはそれらの組み合わせを含むグリカンポリマーをさらに含む；
ｉｉｉ．グリカンポリマー調製物が、少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含む；および
ｉｖ．グリカンポリマー調製物が、ガラクトース、マンノース、アラビノース、またはシアル酸のうちの１つ、２つ、３つ、または４つを含むグリカンポリマーをさらに含む
のうちの１つ、２つ、３つ、またはそれを超える、例えば全てを含む、項１〜３のいずれかに記載の方法。
【０５７５】
２６．グリカンポリマーおよび／またはグリカンポリマー調製物が、以下の特徴：
ｉ．グリカンポリマーが、グルコースおよび少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含み、任意選択により、アルファ−グリコシド結合がアルファ−１，３グリコシド結合であり、さらに任意選択により、調製物の平均重合度（ＤＰ）がＤＰ２〜４、ＤＰ２〜６、ＤＰ３〜１０、またはＤＰ３〜１５である；
ｉｉ．グリカンポリマー調製物が、少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含む；
ｉｉｉ．グリカンポリマー調製物が、キシロースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇｌｕ−ｘｙｌ調製物）；および
ｉｖ．グリカンポリマー調製物が、マンノース、アラビノース、またはガラクトースのうちの１つ、２つ、または３つを含むグリカンポリマーをさらに含む
のうちの１つ、２つ、３つ、またはそれを超える、例えば全てを含む、項１〜３のいずれかに記載の方法。
【０５７６】
２７．グリカンポリマーおよび／またはグリカンポリマー調製物が、以下の特徴：
ｉ．グリカンポリマーが、グルコースおよび少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含み、任意選択により、調製物の平均重合度（ＤＰ）がＤＰ２〜４、ＤＰ２〜６、ＤＰ３〜１０、またはＤＰ３〜１５である；
ｉｉ．グリカンポリマー調製物が、少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含み、任意選択により、アルファ−グリコシド結合が、アルファ−１，３グリコシド結合である；
ｉｉｉ．グリカンポリマー調製物が、少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含む；
ｉｖ．グリカンポリマー調製物が、キシロースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇｌｕ−ｘｙｌ調製物）；および
ｖ．グリカンポリマー調製物が、マンノース、アラビノース、またはガラクトースのうちの１つ、２つ、または３つを含むグリカンポリマーをさらに含む
のうちの１つ、２つ、３つ、またはそれを超える、例えば全てを含む、項１〜３のいずれかに記載の方法。
【０５７７】
２８．グリカンポリマーおよび／またはグリカンポリマー調製物が、以下の特徴：
ｉ．グリカンポリマーが、キシロースおよび少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含み、任意選択により、アルファ−グリコシド結合がアルファ−１，３グリコシド結合であり、さらに任意選択により、調製物の平均重合度（ＤＰ）がＤＰ２〜４、ＤＰ２〜６、ＤＰ３〜１０、またはＤＰ３〜１５である；
ｉｉ．グリカンポリマー調製物が、少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含む；
ｉｉｉ．グリカンポリマー調製物が、グルコースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｘｙｌ−ｇｌｕ調製物）；および
ｉｖ．グリカンポリマー調製物が、マンノース、アラビノース、またはガラクトースのうちの１つ、２つ、または３つを含むグリカンポリマーをさらに含む
のうちの１つ、２つ、３つ、またはそれを超える、例えば全てを含む、項１〜３のいずれかに記載の方法。
【０５７８】
２９．グリカンポリマーおよび／またはグリカンポリマー調製物が、以下の特徴：
ｉ．グリカンポリマーが、キシロースおよび少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含み、さらに任意選択により、調製物の平均重合度（ＤＰ）がＤＰ２〜４、ＤＰ２〜６、ＤＰ３〜１０、またはＤＰ３〜１５である；
ｉｉ．グリカンポリマー調製物が、少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含み、任意選択により、アルファ−グリコシド結合が、アルファ−１，３グリコシド結合である；
ｉｉｉ．グリカンポリマー調製物が、少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含む；
ｉｖ．グリカンポリマー調製物が、グルコースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｘｙｌ−ｇｌｕ調製物）；および
ｖ．グリカンポリマー調製物が、マンノース、アラビノース、またはガラクトースのうちの１つ、２つ、または３つを含むグリカンポリマーをさらに含む
のうちの１つ、２つ、３つ、またはそれを超える、例えば全てを含む、項１〜３のいずれかに記載の方法。
【０５７９】
３０．グリカンポリマーおよび／またはグリカンポリマー調製物が、以下の特徴：
ｉ．グリカンポリマーが、グルコースおよび少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含み、任意選択により、アルファ−グリコシド結合がアルファ−１，３グリコシド結合であり、さらに任意選択により、調製物の平均重合度（ＤＰ）がＤＰ２〜４、ＤＰ２〜６、ＤＰ３〜１０、またはＤＰ３〜１５である；
ｉｉ．グリカンポリマー調製物が、アルファ−１，２グリコシド結合、アルファ−１，４グリコシド結合、アルファ−１，６グリコシド結合、またはそれらの組み合わせを含むグリカンポリマーをさらに含む；
ｉｉｉ．グリカンポリマー調製物が、少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含む；
ｉｖ．グリカンポリマー調製物が、キシロースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇｌｕ−ｘｙｌ調製物）；
ｖ．グリカンポリマー調製物が、アラビノースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇｌｕ−ａｒａ調製物）；
ｖｉ．グリカンポリマー調製物が、ガラクトースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇｌｕ−ｇａｌ調製物）；および
ｖｉｉ．グリカンポリマー調製物が、キシロース、アラビノース、またはガラクトースのうちの１つ、２つ、または３つを含むグリカンポリマーをさらに含む
のうちの１つ、２つ、３つ、またはそれを超える、例えば全てを含む、項１〜３のいずれかに記載の方法。
【０５８０】
３１．グリカンポリマーおよび／またはグリカンポリマー調製物が、以下の特徴：
ｉ．グリカンポリマーが、キシロースおよび少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含み、任意選択により、アルファ−グリコシド結合がアルファ−１，３グリコシド結合であり、さらに任意選択により、調製物の平均重合度（ＤＰ）がＤＰ２〜４、ＤＰ２〜６、ＤＰ３〜１０、またはＤＰ３〜１５である；
ｉｉ．グリカンポリマー調製物が、アルファ−１，２グリコシド結合、アルファ−１，４グリコシド結合、アルファ−１，６グリコシド結合、またはそれらの組み合わせを含むグリカンポリマーをさらに含む；
ｉｉｉ．グリカンポリマー調製物が、少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含む；
ｉｖ．グリカンポリマー調製物が、グルコースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｘｙｌ−ｇｌｕ調製物）；
ｖ．グリカンポリマー調製物が、アラビノースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｘｙｌ−ａｒａ調製物）；
ｖｉ．グリカンポリマー調製物が、ガラクトースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｘｙｌ−ｇａｌ調製物）；および
ｖｉｉ．グリカンポリマー調製物が、グルコース、アラビノース、またはガラクトースのうちの１つ、２つ、または３つを含むグリカンポリマーをさらに含む
のうちの１つ、２つ、３つ、またはそれを超える、例えば全てを含む、項１〜３のいずれかに記載の方法。
【０５８１】
３２．グリカンポリマーおよび／またはグリカンポリマー調製物が、以下の特徴：
ｉ．グリカンポリマーが、アラビノースおよび少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含み、任意選択により、アルファ−グリコシド結合がアルファ−１，３グリコシド結合であり、さらに任意選択により、調製物の平均重合度（ＤＰ）がＤＰ２〜４、ＤＰ２〜６、ＤＰ３〜１０、またはＤＰ３〜１５である；
ｉｉ．グリカンポリマー調製物が、アルファ−１，２グリコシド結合、アルファ−１，４グリコシド結合、アルファ−１，６グリコシド結合、またはそれらの組み合わせを含むグリカンポリマーをさらに含む；
ｉｉｉ．グリカンポリマー調製物が、少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含む；
ｉｖ．グリカンポリマー調製物が、キシロースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ａｒａ−ｘｙｌ調製物）；
ｖ．グリカンポリマー調製物が、グルコースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ａｒａ−ｇｌｕ調製物）；
ｖｉ．グリカンポリマー調製物が、ガラクトースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ａｒａ−ｇａｌ調製物）；および
ｖｉｉ．グリカンポリマー調製物が、キシロース、グルコース、またはガラクトースのうちの１つ、２つ、または３つを含むグリカンポリマーをさらに含む
のうちの１つ、２つ、３つ、またはそれを超える、例えば全てを含む、項１〜３のいずれかに記載の方法。
【０５８２】
３３．グリカンポリマーおよび／またはグリカンポリマー調製物が、以下の特徴：
ｉ．グリカンポリマーが、ガラクトースおよび少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含み、任意選択により、アルファ−グリコシド結合がアルファ−１，３グリコシド結合であり、さらに任意選択により、調製物の平均重合度（ＤＰ）がＤＰ２〜４、ＤＰ２〜６、ＤＰ３〜１０、またはＤＰ３〜１５である；
ｉｉ．グリカンポリマー調製物が、アルファ−１，２グリコシド結合、アルファ−１，４グリコシド結合、アルファ−１，６グリコシド結合、またはそれらの組み合わせを含むグリカンポリマーをさらに含む；
ｉｉｉ．グリカンポリマー調製物が、少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含む；
ｉｖ．グリカンポリマー調製物が、キシロースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇａｌ−ｘｙｌ調製物）；
ｖ．グリカンポリマー調製物が、アラビノースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇａｌ−ａｒａ調製物）；
ｖｉ．グリカンポリマー調製物が、グルコースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇａｌ−ｇｌｕ調製物）；および
ｖｉｉ．グリカンポリマー調製物が、キシロース、アラビノース、またはグルコースのうちの１つ、２つ、または３つを含むグリカンポリマーをさらに含む
のうちの１つ、２つ、３つ、またはそれを超える、例えば全てを含む、項１〜３のいずれかに記載の方法。
【０５８３】
３４．グリカンポリマー調製物のグリカンポリマーの、グリカンポリマー、または少なくとも２０、３０、４０、５０、６０、７０、８０、９０、９５、もしくは９９％（重量または数による）のグリカンポリマーが、グリコシダーゼ酵素の基質である、項１〜３３のいずれかに記載の方法。
【０５８４】
３５．グリコシダーゼ酵素がヒト腸内微生物中に存在する、項３４に記載の方法。
【０５８５】
３６．ヒト腸内微生物が、グリコ分類群クラス１、ｂｕｔおよび／またはｂｕｋ遺伝子含有細菌分類群のメンバーである、項３５に記載の方法。
【０５８６】
３７．ヒト腸内微生物が、グリコ分類群クラス２、ｃｕｔＣ遺伝子陰性細菌分類群のメンバーである、項３５に記載の方法。
【０５８７】
３８．ヒト腸内微生物が、グリコ分類群クラス３、ウレアーゼ遺伝子陰性細菌分類群のメンバーである、項３５に記載の方法。
【０５８８】
３９．ヒト腸内微生物が、グリコ分類群クラス４、プロピオン酸キナーゼ、プロピオン酸ＣｏＡトランスフェラーゼ、プロピオン酸ＣｏＡリガーゼ、プロピオニルＣｏＡカルボキシラーゼ、メチルマロニル−ＣｏＡカルボキシトランスフェラーゼ、（Ｓ）−メチルマロニル−ＣｏＡデカルボキシラーゼ、メチルマロン酸セミアルデヒドデヒドロゲナーゼ、およびプロパナールデヒドロゲナーゼから選択される（例えば、酵素委員会（ＥＣ）番号６．４．１．３、２．１．３．１、４．１．１．４１、１．２．１．２７、２．３．３．５、１．２．１．８７、１．３．１．９５、１．３．８．７、２．３．１．５４、２．３．１．１６８、２．３．１．８、および２．３．１．２２２に対応する酵素から選択される））、１つ以上（例えば、１、２、３、４つ、またはそれを超える数（例えば、全て）を含まない）のプロピオン酸産生関連酵素を含まない、細菌分類群のメンバーである、項３５に記載の方法。
【０５８９】
４０．ヒト腸内微生物が、グリコ分類群クラス５、７アルファ−ヒドロキシステロイドデヒドロゲナーゼ、１２アルファ−ヒドロキシステロイドデヒドロゲナーゼ、７ベータ−ヒドロキシステロイドデヒドロゲナーゼ（ＮＡＤＰ＋）、２ベータ−ヒドロキシステロイドデヒドロゲナーゼ、３ベータ−ヒドロキシコラン酸３−デヒドロゲナーゼ（ＮＡＤ＋）、３アルファ−ヒドロキシコラン酸デヒドロゲナーゼ（ＮＡＤＰ＋）、３ベータ−ヒドロキシコラン酸３−デヒドロゲナーゼ（ＮＡＤＰ＋）、３アルファ−ヒドロキシ胆汁酸−ＣｏＡ−エステル３−デヒドロゲナーゼ、３アルファ−ヒドロキシコラン酸デヒドロゲナーゼ（ＮＡＤ＋）、胆汁酸ＣｏＡ−トランスフェラーゼ、胆汁酸７アルファ−デヒドラターゼ、および胆汁酸ＣｏＡリガーゼから選択される（例えば、酵素委員会（ＥＣ）番号１．１．１．１５９、１．１．１．１７６、１．１．１．２０１、１．１．２３８、１．１．１．３９１、１．１．３９２、１．１．３９３、１．１．３９５、１．１．１．５２、２．８．３．２５、４．２．１．１０６、および６．２．１．７に対応する酵素から選択される）、１つ以上（例えば、１、２、３、４つ、またはそれを超える数（例えば、全て）を含む）の胆汁酸産生（例えば、二次胆汁酸産生）関連酵素を含む細菌分類群のメンバーである、項３５に記載の方法。
【０５９０】
４１．ヒト腸内微生物が、グリコ分類群クラス６、トリプトファナーゼ（例えば、酵素委員会（ＥＣ）番号４．１．９９．１に対応する酵素）から選択される、１つ以上（例えば、１、２、３、４つ、またはそれを超える数（例えば、全て）を含まない）のインドール産生関連酵素を含まない細菌分類群のメンバーである、項３５に記載の方法。
【０５９１】
４２．ヒト腸内微生物が、グリコ分類群クラス７、４−ヒドロキシフェニルアセテートデカルボキシラーゼおよびアルデヒドフェレドキシンオキシドレダクターゼから選択される（例えば、酵素委員会（ＥＣ）番号４．１．１．８３、２．６．１．−、４．１．１．−、および１．２．７．５に対応する酵素から選択される）、１つ以上（例えば、１つまたは両方を含まない）のｐ−クレゾール産生関連酵素を含まない細菌分類群のメンバーである、項３５に記載の方法。
【０５９２】
４３．グリカンポリマーが、ＧＴ５、ＧＨ９４、ＧＨ１３サブファミリー９、ＧＨ１３サブファミリー３９、ＧＨ１３サブファミリー３６、ＧＨ１１３またはＧＨ１１２  ＣＡＺｙファミリーの１つ以上、例えば、２つ、３つ、４つ、またはそれを超える、から選択されるグリコシダーゼ酵素の基質である、項３４、３５、または３６に記載の方法。
【０５９３】
４４．グリカンポリマーが、ＧＴ２、ＧＴ４、ＧＴ５、ＧＴ３５、ＧＴ５１、ＧＨ１、ＧＨ２、ＧＨ３、ＧＨ４、ＧＨ１３、ＧＨ１３サブファミリー９、ＧＨ１３サブファミリー３１、ＧＨ１８、ＧＨ２３、ＧＨ２５、ＧＨ２８、ＧＨ３１、ＧＨ３２、ＧＨ３６、ＧＨ５１、ＧＨ７３、ＧＨ７７またはＧＨ９４  ＣＡＺｙファミリーの１つ以上、例えば、２つ、３つ、４つ、またはそれを超える、から選択されるグリコシダーゼ酵素の基質である、項３４、３５、または３６に記載の方法。
【０５９４】
４５．グリカンポリマーが、ＧＴ１１、ＧＴ１０、ＧＨ９２、ＧＨ５１、ＧＨ３５、ＧＨ２９、ＧＨ２８、ＧＨ２０、ＧＨ１３０、ＧＨ１３サブファミリー８、またはＧＨ１３サブファミリー１４  ＣＡＺｙファミリーの１つ以上、例えば、２つ、３つ、４つ、またはそれを超える、から選択されるグリコシダーゼ酵素の基質である、項３４、３５、または３７に記載の方法。
【０５９５】
４６．グリカンポリマーが、ＧＴ２、ＧＴ４、ＧＨ２、ＧＨ２３、ＧＨ３、ＧＴ８、ＧＴ５１、ＧＴ９、ＧＨ１、ＧＨ９２、ＧＨ７３、ＧＨ３１、ＧＨ２０、ＧＨ２８、ＧＴ２５、ＧＴ２８、ＧＴ３５、ＧＨ１８、ＧＴ０、ＧＨ１３、ＧＨ３６、ＧＨ９７、ＧＨ１０５、ＧＨ２５、ＧＨ４、ＧＨ３２、ＧＨ７８、ＧＨ２９、ＧＨ０、ＧＨ５１、ＧＴ１０、またはＧＨ７７  ＣＡＺｙファミリーの１つ以上、例えば、２つ、３つ、４つ、またはそれを超える、から選択されるグリコシダーゼ酵素の基質である、項３４、３５、または３７に記載の方法。
【０５９６】
４７．グリカンポリマーが、ＧＴ３、ＧＨ９７、ＧＨ４３サブファミリー２４、ＧＨ２７、ＧＨ１３３、ＧＨ１３サブファミリー８、またはＧＨ１３  ＣＡＺｙファミリーの１つ以上、例えば、２つ、３つ、４つ、またはそれを超える、から選択されるグリコシダーゼ酵素の基質である、項３４、３５、または３８に記載の方法。
【０５９７】
４８．グリカンポリマーが、ＧＴ２、ＧＴ４、ＧＨ２、ＧＨ２３、ＧＨ３、ＧＴ５１、ＧＨ１、ＧＴ８、ＧＨ９２、ＧＴ９、ＧＨ７３、ＧＨ３１、ＧＨ２０、ＧＨ２８、ＧＴ３５、ＧＴ２８、ＧＨ１８、ＧＨ１３、ＧＨ９７、ＧＨ２５、ＧＨ３６、ＧＨ４、ＧＨ１０５、ＧＨ３２、ＧＨ７８、ＧＨ２９、ＧＨ０、ＧＴ２５、ＧＨ５１、ＧＨ７７、ＧＨ８８、またはＧＨ２４  ＣＡＺｙファミリーの１つ以上、例えば、２つ、３つ、４つ、またはそれを超える、から選択されるグリコシダーゼ酵素の基質である、項３４、３５、または３８に記載の方法。
【０５９８】
４９．グリカンポリマーが、ＧＨ１３サブファミリー３、ＧＨ１３サブファミリー３０、ＧＨ３０サブファミリー２、ＧＨ３０サブファミリー５、ＧＨ４３サブファミリー２２、ＧＨ４３サブファミリー８、またはＧＨ８４  ＣＡＺｙファミリーの１つ以上、例えば、２つ、３つ、４つ、またはそれを超える、から選択されるグリコシダーゼ酵素の基質である、項３４、３５、または３９に記載の方法。
【０５９９】
５０．グリカンポリマーが、ＧＨ３、ＧＨ１０６、ＧＨ１０５、ＧＨ２、ＧＨ２０、ＧＨ２８、ＧＨ７６、ＧＨ９７、またはＧＨ９２  ＣＡＺｙファミリーの１つ以上、例えば、２つ、３つ、４つ、またはそれを超える、から選択されるグリコシダーゼ酵素の基質である、項３４、３５、または３９に記載の方法。
【０６００】
５１．グリカンポリマーが、ＧＨ１３サブファミリー１９、ＧＨ１３サブファミリー２１、ＧＨ２３、ＧＨ３３、ＧＨ３７またはＧＨ１０４  ＣＡＺｙファミリーの１つ以上、例えば、２つ、３つ、４つ、またはそれを超える、から選択されるグリコシダーゼ酵素の基質である、項３４、３５、または４０に記載の方法。
【０６０１】
５２．グリカンポリマーが、ＧＨ２３、ＧＨ２４、またはＧＨ３３  ＣＡＺｙファミリーの１つ以上、例えば、２つ、３つ、４つ、またはそれを超える、から選択されるグリコシダーゼ酵素の基質である、項３４、３５、または４０に記載の方法。
【０６０２】
５３．グリカンポリマーが、ＧＨ１３サブファミリー２０、ＧＨ１３サブファミリー３１、ＧＨ１３サブファミリー３９、ＧＨ３９、ＧＨ４３サブファミリー１１、ＧＨ５サブファミリー４４、またはＧＨ９４  ＣＡＺｙファミリーの１つ以上、例えば、２つ、３つ、４つ、またはそれを超える、から選択されるグリコシダーゼ酵素の基質である、項３４、３５、または４１に記載の方法。
【０６０３】
５４．グリカンポリマーが、ＧＨ２、ＧＨ３１、ＧＨ２３、ＧＨ１３、またはＧＨ２４  ＣＡＺｙファミリーの１つ以上、例えば、２つ、３つ、４つ、またはそれを超える、から選択されるグリコシダーゼ酵素の基質である、項３４、３５、または４１に記載の方法。
【０６０４】
５５．グリカンポリマーが、ＧＨ１３サブファミリー３、ＧＨ１３サブファミリー３０、ＧＨ１２１、ＧＨ１５、ＧＨ４３サブファミリー２７、ＧＨ４３サブファミリー３４、またはＧＨ４３サブファミリー８  ＣＡＺｙファミリーの１つ以上、例えば、２つ、３つ、４つ、またはそれを超える、から選択されるグリコシダーゼ酵素の基質である、項３４、３５、または４２に記載の方法。
【０６０５】
５６．グリカンポリマーが、ＧＨ９２、ＧＨ９７、ＧＨ７６、ＧＨ２８、ＧＨ２０、ＧＨ１０５、ＧＨ２、ＧＨ５０、ＧＨ３、またはＧＨ１０６  ＣＡＺｙファミリーの１つ以上、例えば、２つ、３つ、４つ、またはそれを超える、から選択されるグリコシダーゼ酵素の基質である、項３４、３５、または４２に記載の方法。
【０６０６】
５７．グリカンポリマーを選択する工程が、それが項４３、４４、４５、４６、４７、４８、４９、５０、５１、５２、５３、５４、５５、または５６のいずれか一項の基質特異性を有することに基づいて選択する工程を含む、項１に記載の方法。
【０６０７】
５８．代謝産物が、短鎖脂肪酸（ＳＣＦＡ）（例えば、ブチレートおよび／またはプロピオネート）、アンモニア、トリメチルアミン（ＴＭＡ）、トリメチルアミンＮ−オキシド（ＴＭＡＯ）、尿毒症性溶質（例、ｐ−クレゾールまたはインドール）、または胆汁酸（例えば、二次胆汁酸）のうちの１つである、項１〜５７のいずれか一項に記載の方法。
【０６０８】
５９．代謝産物が短鎖脂肪酸（ＳＣＦＡ）である、項５８に記載の方法。
【０６０９】
６０．ＳＣＦＡがアセテート、ブチレート、および／またはプロピオネートである、項５９に記載の方法。
【０６１０】
６１．代謝産物が、ＴＭＡおよび／またはＴＭＡＯである、項５８に記載の方法。
【０６１１】
６２．代謝産物が、アンモニアである、項５８に記載の方法。
【０６１２】
６３．代謝産物が、胆汁酸である、項５８に記載の方法。
【０６１３】
６４．代謝産物が、尿毒症性溶質、例えば、ｐ−クレゾールである、項５８に記載の方法。
【０６１４】
６５．代謝産物が、尿毒症性溶質、例えば、インドールである、項５８に記載の方法。
【０６１５】
６６．疾患または障害が、下痢（例えば、薬物毒性誘発性下痢、例えば、チロシンキナーゼ阻害剤または化学療法剤（例えば、ＦＯＬＦＩＲＩレジメン）の投与を含む処置レジメンにより誘発されるもの；または放射線誘発性下痢および放射線誘発性急性腸管症状）であり、任意選択により、ＳＣＦＡがブチレートであり、さらに任意選択により、ブチレートのレベルが増加する（例えば、同じ処置を受けているがグリカンポリマー調製物を投与されていない対象に対して、またはグリカンポリマー調製物の投与前の対象におけるレベルに対して）、項５９または６０のいずれかに記載の方法。
【０６１６】
６７．疾患または障害が、クローン病、炎症性腸疾患、過敏性腸疾患、過敏性腸疾患−便秘（ＩＢＳ−Ｃ）、または潰瘍性大腸炎から選択され、任意選択により、ＳＣＦＡがブチレートである、項５９または６０のいずれかに記載の方法。
【０６１７】
６８．疾患または障害が、非アルコール性脂肪性肝疾患（ＮＡＦＬＤ）または非アルコール性脂肪性肝炎（ＮＡＳＨ）から選択され、任意選択により、ＳＣＦＡがブチレートである、項５９または６０のいずれかに記載の方法。
【０６１８】
６９．疾患または障害が肝性脳症であり、任意選択により、ＳＣＦＡがブチレートである、項５９または６０のいずれかに記載の方法。
【０６１９】
７０．疾患または障害がトリメチルアミン尿症（ｔｉｍｅｔｈｙｌａｍｉｎｕｒｉａ）（例えば、続発性トリメチルアミン尿症）である、項６１に記載の方法。
【０６２０】
７１．疾患または障害が慢性疾患（例えば、慢性腎臓病または末期腎臓病）である、項６１に記載の方法。
【０６２１】
７２．疾患または障害が慢性疾患（例えば、慢性心疾患、慢性心不全、慢性血管疾患）である、項６１に記載の方法。
【０６２２】
７３．疾患または障害が、非アルコール性脂肪性肝疾患（ＮＡＦＬＤ）または非アルコール性脂肪性肝炎（ＮＡＳＨ）のうちの１つである、項６１に記載の方法。
【０６２３】
７４．疾患または障害が慢性腎臓病である、項６２に記載の方法。
【０６２４】
７５．疾患または障害が肝硬変であり、任意選択により、最小限の肝性脳症（ＭＨＥ）を伴うものである、項６２に記載の方法。
【０６２５】
７６．疾患または障害が肝性脳症である、項６２に記載の方法。
【０６２６】
７７．疾患または障害が尿素サイクル異常症である、項６２に記載の方法。
【０６２７】
７８．疾患または障害がプロピオン酸血症である、項５９または６０のいずれかに記載の方法。
【０６２８】
７９．疾患または障害が肝硬変、アルコール性肝硬変、原発性胆汁性肝硬変、または腸不全関連肝疾患から選択される、項６３に記載の方法。
【０６２９】
８０．疾患または障害が疾患または障害が、クローン病、炎症性腸疾患、過敏性腸疾患、過敏性腸疾患−便秘（ＩＢＳ−Ｃ）、または潰瘍性大腸炎から選択される、項６３に記載の方法。
【０６３０】
８１．疾患または障害が、非アルコール性脂肪性肝疾患（ＮＡＦＬＤ）または非アルコール性脂肪性肝炎（ＮＡＳＨ）から選択される、項６３に記載の方法。
【０６３１】
８２．疾患または障害が慢性腎臓病である、項６５に記載の方法。
【０６３２】
８３．疾患または障害が肝性脳症である、項６５に記載の方法。
【０６３３】
８４．疾患または障害が肝性フェニルケトン尿症である、項６５に記載の方法。
【０６３４】
８５．疾患または障害が慢性腎臓病である、項６４に記載の方法。
【０６３５】
８６．疾患または障害が肝性脳症である、項６４に記載の方法。
【０６３６】
８７．代謝産物レベルが、対象において、または疾患もしくは障害を有する対象からの適当な試料において増加する、例えば、基準、例えば、所定の基準値、処置前の対象におけるレベル、または健康な対照と比較して増加する、項６６〜８６のいずれか一項に記載の方法。
【０６３７】
８８．代謝産物レベルが、対象、または疾患もしくは障害を有する対象からの適当な試料において減少する、例えば、基準、例えば、所定の基準値、処置前の対象におけるレベル、または健康な対照と比較して減少する、項６６〜８６のいずれか一項に記載の方法。
【０６３８】
８９．代謝産物のレベル、または望ましくない代謝産物のレベルの症状を、例えば代謝産物のレベルを取得することによって、任意選択により、対象を処置する前（例えば、ベースラインとして）、処置中（例えば、処置成功をモニターするため）、および／または処置後（例えば、疾患または障害の再発を評価するため）に評価する工程をさらに含む、項１〜８８のいずれか一項に記載の方法。
【０６３９】
９０．ブチレートのレベル（例えば、全身レベル、例えば、血液または糞便レベル）が、例えばグリカンポリマー調製物で処置していない対象と比較して、増加する（例えば、ブチレート産生（例えば、胃腸微生物による）の産生率またはレベルが増加する）、項４〜９、３６、４３、４４、５９、６０、６６〜６９、または８７のいずれかに記載の方法。
【０６４０】
９１．ＴＭＡのレベル（例えば、全身レベル、例えば、血液または糞便レベル）が、例えばグリカンポリマー調製物で処置していない対象と比較して、減少する（例えば、コリンからＴＭＡへの変換（例えば、胃腸微生物による）の変換率またはレベルが減少する）、項１０〜１７、３６、４３、４４、５９、６０、７０、または８８のいずれかに記載の方法。
【０６４１】
９２．アンモニアのレベル（例えば、全身レベル、例えば、血液または糞便レベル）が、例えばグリカンポリマー調製物で処置していない対象と比較して、減少する（例えば、尿素からアンモニアへの変換（例えば、胃腸微生物による）の変換率またはレベルが減少する）、項１８〜２０、３７、４５、４６、６１、７０〜７３、または８８のいずれかに記載の方法。
【０６４２】
９３．プロピオン酸のレベル（例えば、全身レベル、例えば、血液または糞便レベル）が、例えばグリカンポリマー調製物で処置していない対象と比較して、減少する（例えば、プロピオン酸産生（例えば、胃腸微生物による）の産生率またはレベルが減少する）、項２１〜２４、３９、４９、５０、５９、６０、７８、または８８のいずれかに記載の方法。
【０６４３】
９４．二次胆汁酸のレベル（例えば、全身レベル、例えば、腸または糞便レベル）が、例えばグリカンポリマー調製物で処置していない対象と比較して、増加する（例えば、胆汁酸から二次胆汁酸への変換（例えば、胃腸微生物による）の変換率またはレベルが増加する）、項２５、４０、５１、５２、６３、７９〜８１、または８７のいずれかに記載の方法。
【０６４４】
９５．インドールのレベル（例えば、全身レベル、例えば、糞便レベル）が、例えばグリカンポリマー調製物で処置していない対象と比較して、減少する（例えば、インドール産生（例えば、胃腸微生物による）の産生率またはレベルが減少する）、項２６〜２９、４１、５３、５４、６５、８２〜８４、または８８のいずれかに記載の方法。
【０６４５】
９６．ｐ−クレゾールのレベル（例えば、全身レベル）が、例えばグリカンポリマー調製物で処置していない対象と比較して、減少する（例えば、ｐ−クレゾールへのチロシン変換（例えば、胃腸微生物による）の変換率またはレベルが減少する）、項３０〜３３、４２、５５、５６、６４、８５、８６、または８８のいずれかに記載の方法。
【０６４６】
９７．項１〜９６のいずれか一項に記載の方法であって、
ａ）対象が望ましくないレベルの代謝産物（例えば、項５８〜６５のいずれかに記載の望ましくないレベルの代謝産物）を有すること、
ｂ）対象が疾患または障害（例えば、項６６〜８６のいずれか１つに記載の疾患または障害）を有すること、
ｃ）対象が腸内微生物叢のディスバイオシス（例えば、（例えば、項３６〜４２のいずれかに記載のクラス１、クラス２、クラス３、クラス４、クラス５、クラス６、またはクラス７細菌分類群の）誤較正レベル／相対存在度）を有すること、
ｄ）対象がグリカンポリマー（例えば、項３〜３３のいずれかに記載のグリカンポリマー）による先の処置に応答したこと、
ｅ）対象がディスバイオシスをもたらす処置または他の環境、例えば、抗生物質処置、または処置前の胃の手術を経験したこと、
のうちの１つ以上の知見の取得に基づいて、またはそれに応答して、処置のために対象を選択する工程をさらに含み、
任意選択により、選択基準を決定するための適当な値を取得する工程を含む、方法。
【０６４７】
９８．対象が、（ａ）〜（ｅ）のうちの任意の２つ以上の知見の取得に基づいて、またはそれに応答して、処置のために選択される、項９７に記載の方法。
【０６４８】
９９．対象が、（ａ）〜（ｅ）のうちの任意の３つ以上の知見の取得に基づいて、またはそれに応答して、処置のために選択される、項９７に記載の方法。
【０６４９】
１００．対象が、（ａ）〜（ｅ）のうちの任意の４つ以上の知見の取得に基づいて、またはそれに応答して、処置のために選択される、項９７に記載の方法。
【０６５０】
１０１．対象が、（ａ）〜（ｅ）のうちの全ての知見の取得に基づいて、またはそれに応答して、処置のために選択される、項９７に記載の方法。
【０６５１】
１０２．適当な値が、対象からの適当な生物学的試料を分析することによって取得され得る、項９７〜１０１のいずれかに記載の方法。
【０６５２】
１０３．試料が血液、糞便、尿、唾液、または臓器組織試料である、項１０２に記載の方法。
【０６５３】
１０４．代謝産物の望ましくないレベルが調節される、例えば、処置期間後、３％、５％、１０％、１５％、２０％、２５％、３０％、３５％、４０％、または５０％（例えば、基準、例えば、所定の基準値、処置前の対象におけるレベル、または健康な対照と比較した場合）減少する（例えば、対象において、または処置された対象から採取された適当なサンプルにおいて）、項１〜１０３のいずれか一項に記載の方法。
【０６５４】
１０５．代謝産物の望ましくないレベルが、処置期間後、３％、５％、１０％、１５％、２０％、２５％、３０％、３５％、４０％、または５０％（例えば、基準、例えば、所定の基準値、処置前の対象におけるレベル、または健康な対照と比較した場合）増加する（例えば、処置された対象から採取された適当なサンプルにおいて）、項１〜１０４のいずれか一項に記載の方法。
【０６５５】
１０６．処置する工程が、第２の治療剤（例えば、疾患または障害を処置するための、および／または代謝産物のレベルを調節するための、グリカンポリマー以外の治療剤）を投与する工程をさらに含む、項１〜１０５のいずれか一項に記載の方法。
【０６５６】
１０７．処置する工程が、腸内微生物（例えば、ヒト腸内微生物）の調製物を投与する工程をさらに含む、項１〜１０６のいずれか一項に記載の方法。
【０６５７】
１０８．腸内微生物（例えば、ヒト腸内微生物）が、
ｉ．クラス１（例えば、ｂｕｔおよび／またはｂｕｋ遺伝子含有細菌分類群）、
ｉｉ．クラス２（例えば、ｃｕｔＣ遺伝子陰性細菌分類群）、
ｉｉｉ．クラス３（例えば、ウレアーゼ遺伝子陰性細菌分類群）、
ｉｖ．クラス４（例えば、プロピオン酸キナーゼ、プロピオン酸ＣｏＡトランスフェラーゼ、プロピオン酸ＣｏＡリガーゼ、プロピオニルＣｏＡカルボキシラーゼ、メチルマロニル−ＣｏＡカルボキシトランスフェラーゼ、（Ｓ）−メチルマロニル−ＣｏＡデカルボキシラーゼ、メチルマロン酸セミアルデヒドデヒドロゲナーゼ、およびプロパナールデヒドロゲナーゼから選択される（例えば、酵素委員会（ＥＣ）番号６．４．１．３、２．１．３．１、４．１．１．４１、１．２．１．２７、２．３．３．５、１．２．１．８７、１．３．１．９５、１．３．８．７、２．３．１．５４、２．３．１．１６８、２．３．１．８、および２．３．１．２２２に対応する酵素から選択される）、１つ以上のプロピオン酸産生関連酵素を欠く、細菌分類群）、
ｖ．クラス５（例えば、７アルファ−ヒドロキシステロイドデヒドロゲナーゼ、１２アルファ−ヒドロキシステロイドデヒドロゲナーゼ、７ベータ−ヒドロキシステロイドデヒドロゲナーゼ（ＮＡＤＰ＋）、２ベータ−ヒドロキシステロイドデヒドロゲナーゼ、３ベータ−ヒドロキシコラン酸３−デヒドロゲナーゼ（ＮＡＤ＋）、３アルファ−ヒドロキシコラン酸デヒドロゲナーゼ（ＮＡＤＰ＋）、３ベータ−ヒドロキシコラン酸３−デヒドロゲナーゼ（ＮＡＤＰ＋）、３アルファ−ヒドロキシ胆汁酸−ＣｏＡ−エステル３−デヒドロゲナーゼ、３アルファ−ヒドロキシコラン酸デヒドロゲナーゼ（ＮＡＤ＋）、胆汁酸ＣｏＡ−トランスフェラーゼ、胆汁酸７アルファ−デヒドラターゼ、および胆汁酸ＣｏＡリガーゼから選択される（例えば、酵素委員会（ＥＣ）番号１．１．１．１５９、１．１．１．１７６、１．１．１．２０１、１．１．２３８、１．１．１．３９１、１．１．３９２、１．１．３９３、１．１．３９５、１．１．１．５２、２．８．３．２５、４．２．１．１０６、および６．２．１．７に対応する酵素から選択される）、１つ以上の胆汁酸産生関連酵素を含む、細菌分類群）、
ｖｉ．クラス６（例えば、トリプトファナーゼ（例えば、酵素委員会（ＥＣ）番号４．１．９９．１に対応する酵素）から選択される、１つ以上のインドール産生関連酵素を欠く、細菌分類群）、または
ｖｉｉ．クラス７（例えば、４−ヒドロキシフェニルアセテートデカルボキシラーゼおよびアルデヒドフェレドキシンオキシドレダクターゼから選択される（例えば、酵素委員会（ＥＣ）番号４．１．１．８３、２．６．１．−、４．１．１．−、および１．２．７．５に対応する酵素から選択される）、１つ以上のｐ−クレゾール産生関連酵素を欠く、細菌分類群）
細菌分類群
である、項１０７に記載の方法。
【０６５８】
１０９．腸内微生物が、その代謝産物との関係に基づいて（例えば、代謝産物との、その正の相関、負の相関、または相関の欠如に基づいて）選択される、項１０８に記載の方法。
【０６５９】
１１０．腸内微生物の選択が、腸内微生物の代謝産物との関係に基づいて（例えば、代謝産物との、その正の相関、負の相関、または相関の欠如に基づいて）、表３から腸内微生物を選択する工程を含む、項１０９に記載の方法。
【０６６０】
１１１．グリカンポリマーが、腸内微生物（例えば、ヒト腸内微生物）の基質である、項１０７〜１１０のいずれかに記載の方法。
【０６６１】
１１２．グリカンポリマーが、腸内微生物グリコシダーゼ酵素の基質であり、腸内微生物の増殖を促進する、項１〜１１１のいずれか一項に記載の方法。
【０６６２】
１１３．グリカン調製物が毎日投与される、項１〜１１２のいずれか一項に記載の方法。
【０６６３】
１１４．グリカン調製物が単一の処置期間にわたって投与される、項１〜１１３のいずれか一項に記載の方法。
【０６６４】
１１５．グリカン調製物が複数の処置期間にわたって投与され、例えば、間の処置期間が隣接する処置期間の一方または両方よりも長い、または間の処置期間が隣接する処置期間の一方または両方よりも短い、項１〜１１３のいずれかに記載の方法。
【０６６５】
１１６．グリカンポリマーが結腸または腸の微生物成分の基質である、項１〜１１５のいずれかに記載の方法。
【０６６６】
１１７．グリカンポリマー調製物が経口的または経直腸的に投与される、項１〜１１６のいずれかに記載の方法。
【０６６７】
１１８．対象の体内（例えば、腸（ｇｕｔ）（結腸、腸（ｉｎｔｅｓｔｉｎｅ））、血液、尿、臓器（例えば、肝臓、腎臓）、脳）における産物（例えば、短鎖脂肪酸（ＳＣＦＡ）、アンモニア、トリメチルアミン（ＴＭＡ）、トリメチルアミンＮ−オキシド（ＴＭＡＯ）、尿毒症性溶質、または胆汁酸）の産生またはレベルを調節する方法であって、産物の産生またはレベルを調節するのに十分な有効量のグリカンポリマー調製物を対象に投与する（例えば、経口または経直腸）工程を含み、任意選択により、グリカンポリマーが結腸または腸の微生物成分の基質である、方法。
【０６６８】
１１９．微生物成分が、
ａ）産物を産生し、例えば、それにより、産物のレベルまたは産生を増加させる、
ｂ）産生者分類群によって産物に変換される前駆産物または代替産物を産生し、例えば、それにより、産物のレベルまたは産生を増加させる、
ｃ）産物を産生しないが、産物の産生者分類群と競合または拮抗し（例えば、空間および／または栄養素につき競合する、または産生分類群に対し毒性の抗菌物質を産生する）、例えば、それにより、産生者分類群の相対存在度が減少し、産物のレベルまたは産生が減少する、
、項１１８に記載の方法。
【０６６９】
１２０．微生物成分が表２の成分から選択される、項１１９に記載の方法。
【０６７０】
１２１．微生物成分が表３の菌株から選択される、項１１９に記載の方法。
【０６７１】
１２２．微生物成分が、表４のグリコシダーゼファミリーからのグリコシダーゼ酵素を含む成分から選択される、項１１９に記載の方法。
【０６７２】
１２３．微生物成分が、項４３〜５５のいずれか一項に記載のグリコシダーゼファミリーからのグリコシダーゼ酵素を含む成分から選択される、項１１９に記載の方法。
【０６７３】
１２４．産物が表３の代謝産物から選択される、項１１９または１２１のいずれかに記載の方法。
【０６７４】
１２５．産物がＳＣＦＡであり、対象が表５のＳＣＦＡの行から選択される状態を有する、項１１９に記載の方法。
【０６７５】
１２６．産物がアンモニアであり、対象が表５のアンモニアの行から選択される状態を有する、項１１９に記載の方法。
【０６７６】
１２７．産物がＴＭＡであり、対象が表５のＴＭＡの行から選択される状態を有する、項１１９に記載の方法。
【０６７７】
１２８．産物が胆汁酸であり、対象が表５の胆汁酸の行から選択される状態を有する、項１１９に記載の方法。
【０６７８】
１２９．産物が尿毒症性溶質（例えば、ｐ−クレゾールまたはインドール）であり、対象が表５のｐ−クレゾールまたはインドールの行から選択される状態を有する、項１１９に記載の方法。
【０６７９】
１３０．産物を調節する、例えば産生する、微生物（例えば、細菌分類群）の識別情報を取得する工程をさらに含む、項１１８または１１９に記載の方法。
【０６８０】
１３１．微生物成分を調節するその能力に基づいてグリカン調製物を選択する工程をさらに含む、項１１８〜１３０のいずれか一項に記載の方法。
【０６８１】
１３２．グリカン調製物が微生物成分のグリコシダーゼ酵素の基質であり、例えば、微生物成分および産物が表３の同じ列からのものである、項１１８〜１３０のいずれか一項に記載の方法。
【０６８２】
１３３．前記対象が、ヒト、例えば、ヒト患者である、項１〜１３２のいずれかに記載の方法。
【０６８３】
１３４．項１〜１３３のいずれかに記載の方法における使用のための、例えば本明細書に記載の、グリカンポリマー調製物。
【０６８４】
１３５．予め選択されたヒト腸内微生物（例えば、そのグリコシダーゼプロファイルのために選択された）のグリコシダーゼ酵素（例えば、ＣＡＺｙファミリー）の基質としての使用のためのグリカンポリマー調製物を選択する方法であって、
ａ）微生物のグリコシダーゼ（例えばＣＡＺｙファミリー）プロファイルの値を取得する工程、
ｂ）グリコシダーゼ（例えば、ＣＡＺｙファミリー）プロファイルに基づいて、微生物の基質となり得るグリカンポリマーを同定、設計、または選択する工程、
ｃ）任意選択により、
ｉ．ヒト腸内微生物（例えば、単一株、設計された株の群、または目的の微生物を含むエクスビボの群（例えば、糞便試料由来））のパネルを組み立てる工程
ｉｉ．微生物のパネルを試験グリカン調製物と接触させる工程、
ｉｉｉ．（目的の）ヒト腸内微生物の増殖を評価する工程、
ｄ）グリカンポリマー調製物を選択する工程
を含む方法。
【０６８５】
１３６．（ａ）が、表４のグリコシダーゼ（例えば、ＣＡＺｙファミリー）プロファイルの値を見出す工程を含む、項１３５に記載の方法。
【０６８６】
１３７．（ｂ）が、表４に見出されるグリカンポリマーを同定、設計、または選択する工程を含む、項１３５に記載の方法。
【０６８７】
１３８．（ａ）が、表４のグリコシダーゼ（例えば、ＣＡＺｙファミリー）プロファイルの値を見出すことを含み、（ｂ）が、表４に見出される、同じ列にある、例えば、（ａ）のグリコシダーゼプロファイルのグリコシダーゼ（例えば、ＣＡＺｙファミリー）の基質である、グリカンポリマーを同定、設計、または選択する工程を含む、項１３５に記載の方法。
【０６８８】
１３９．項１３５〜１３８のいずれかの方法によって作製または選択されたグリカン調製物。
【０６８９】
１４０．グリカンポリマーを含むグリカンポリマー調製物であって、例えば、調製物が少なくとも０．５、１、２、５、１０、５０、または１００ｋｇを含み、例えば、少なくとも純度２０、３０、４０、５０、６０、７０、８０、９０、９５または９９％であり、
ｉ）グルコース、マンノースもしくはガラクトースサブユニット、またはそれらの組み合わせ、および少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合、または
ｉｉ）グルコース、マンノースもしくはガラクトースサブユニット、またはそれらの組み合わせ、および少なくとも１つのベータ−グリコシド結合
を含み、
ｉ）ＧＴ５、ＧＨ９４、ＧＨ１３サブファミリー９、ＧＨ１３サブファミリー３９、ＧＨ１３サブファミリー３６、ＧＨ１１３またはＧＨ１１２  ＣＡＺｙファミリー、
ｉｉ）ＧＴ２、ＧＴ４、ＧＴ５、ＧＴ３５、ＧＴ５１、ＧＨ１、ＧＨ２、ＧＨ３、ＧＨ４、ＧＨ１３、ＧＨ１３サブファミリー９、ＧＨ１３サブファミリー３１、ＧＨ１８、ＧＨ２３、ＧＨ２５、ＧＨ２８、ＧＨ３１、ＧＨ３２、ＧＨ３６、ＧＨ５１、ＧＨ７３、ＧＨ７７またはＧＨ９４  ＣＡＺｙファミリー、
ｉｉｉ）ＧＴ１１、ＧＴ１０、ＧＨ９２、ＧＨ５１、ＧＨ３５、ＧＨ２９、ＧＨ２８、ＧＨ２０、ＧＨ１３０、ＧＨ１３サブファミリー８、またはＧＨ１３サブファミリー１４  ＣＡＺｙファミリー、または
ｉｖ）ＧＴ２、ＧＴ４、ＧＨ２、ＧＨ２３、ＧＨ３、ＧＴ８、ＧＴ５１、ＧＴ９、ＧＨ１、ＧＨ９２、ＧＨ７３、ＧＨ３１、ＧＨ２０、ＧＨ２８、ＧＴ２５、ＧＴ２８、ＧＴ３５、ＧＨ１８、ＧＴ０、ＧＨ１３、ＧＨ３６、ＧＨ９７、ＧＨ１０５、ＧＨ２５、ＧＨ４、ＧＨ３２、ＧＨ７８、ＧＨ２９、ＧＨ０、ＧＨ５１、ＧＴ１０、またはＧＨ７７  ＣＡＺｙファミリー
から選択される１つ以上、例えば２つ、３つ、４つ、またはそれを超える、ヒト腸内微生物グリコシダーゼ酵素の基質である、グリカンポリマー調製物。
【０６９０】
１４１．グリカンポリマー調製物であって、例えば、調製物が少なくとも約０．５、１、２、５、１０、５０、または１００ｋｇを含み、例えば、少なくとも純度２０、３０、４０、５０、６０、７０、８０、９０、９５または９９％であり、
ｉ）キシロース、アラビノース、フコースもしくはラムノースサブユニット、またはそれらの組み合わせ、および少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合、または
ｉｉ）キシロース、アラビノース、フコースもしくはラムノースサブユニット、またはそれらの組み合わせ、および少なくとも１つのベータ−グリコシド結合
を含むグリカンポリマーを含み、
ｉ）ＧＴ１１、ＧＴ１０、ＧＨ９２、ＧＨ５１、ＧＨ３５、ＧＨ２９、ＧＨ２８、ＧＨ２０、ＧＨ１３０、ＧＨ１３サブファミリー８、またはＧＨ１３サブファミリー１４  ＣＡＺｙファミリー、または
ｉｉ）ＧＴ２、ＧＴ４、ＧＨ２、ＧＨ２３、ＧＨ３、ＧＴ８、ＧＴ５１、ＧＴ９、ＧＨ１、ＧＨ９２、ＧＨ７３、ＧＨ３１、ＧＨ２０、ＧＨ２８、ＧＴ２５、ＧＴ２８、ＧＴ３５、ＧＨ１８、ＧＴ０、ＧＨ１３、ＧＨ３６、ＧＨ９７、ＧＨ１０５、ＧＨ２５、ＧＨ４、ＧＨ３２、ＧＨ７８、ＧＨ２９、ＧＨ０、ＧＨ５１、ＧＴ１０、またはＧＨ７７  ＣＡＺｙファミリー
から選択される１つ以上、例えば２つ、３つ、４つ、またはそれを超える、ヒト腸内微生物グリコシダーゼ酵素の基質である、グリカンポリマー調製物。
【０６９１】
１４２．グリカンポリマー調製物であって、例えば、調製物が少なくとも０．５、１、２、５、１０、５０、または１００ｋｇを含み、例えば、少なくとも純度２０、３０、４０、５０、６０、７０、８０、９０、９５または９９％であり、
ｉ）グルコースもしくはガラクトースサブユニット、またはそれらの組み合わせ、および少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合、または
ｉｉ）グルコースもしくはガラクトースサブユニット、またはそれらの組み合わせ、および少なくとも１つのベータ−グリコシド結合
を含むグリカンポリマーを含み、
ｉ）ＧＴ３、ＧＨ９７、ＧＨ４３サブファミリー２４、ＧＨ２７、ＧＨ１３３、ＧＨ１３サブファミリー８、ＧＨ１３  ＣＡＺｙファミリー、または
ｉｉ）ＧＴ２、ＧＴ４、ＧＨ２、ＧＨ２３、ＧＨ３、ＧＴ８、ＧＴ５１、ＧＴ９、ＧＨ１、ＧＨ９２、ＧＨ７３、ＧＨ３１、ＧＨ２０、ＧＨ２８、ＧＴ２５、ＧＴ２８、ＧＴ３５、ＧＨ１８、ＧＴ０、ＧＨ１３、ＧＨ３６、ＧＨ９７、ＧＨ１０５、ＧＨ２５、ＧＨ４、ＧＨ３２、ＧＨ７８、ＧＨ２９、ＧＨ０、ＧＨ５１、ＧＴ１０、ＧＨ７７、ＧＴ２、ＧＴ４、ＧＨ２、ＧＨ２３、ＧＨ３、ＧＴ５１、ＧＨ１、ＧＴ８、ＧＨ９２、ＧＴ９、ＧＨ７３、ＧＨ３１、ＧＨ２０、Ｇｈ２８、ＧＴ３５、ＧＴ２８、ＧＨ１８、ＧＨ１３、ＧＨ９７、ＧＨ２５、ＧＨ３６、ＧＨ４、ＧＨ１０５、ＧＨ３２、ＧＨ７８、ＧＨ２９、ＧＨ０、ＧＴ２５、ＧＨ５１、ＧＨ７７、ＧＨ８８、ＧＨ２４  ＣＡＺｙファミリー
から選択される１つ以上、例えば２つ、３つ、４つ、またはそれを超える、ヒト腸内微生物グリコシダーゼ酵素の基質である、グリカンポリマー調製物。
【０６９２】
１４３．グリカンポリマー調製物であって、例えば、調製物が少なくとも０．５、１、２、５、１０、５０、または１００ｋｇを含み、例えば、少なくとも純度２０、３０、４０、５０、６０、７０、８０、９０、９５または９９％であり、
アラビノース、ガラクトース、キシロース、もしくはグルコースサブユニット、またはそれらの組み合わせ、および少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合、
を含むグリカンポリマーを含み、
ｉ）ＧＨ１３サブファミリー３、ＧＨ１３サブファミリー３０、ＧＨ３０サブファミリー２、ＧＨ３０サブファミリー５、ＧＨ４３サブファミリー２２、ＧＨ４３サブファミリー８、もしくはＧＨ８４  ＣＡＺｙファミリー、または
ｉｉ）ＧＨ３、ＧＨ１０６、ＧＨ１０５、ＧＨ２、ＧＨ２０、ＧＨ２８、ＧＨ７６、ＧＨ９７、またはＧＨ９２  ＣＡＺｙファミリー
から選択される１つ以上、例えば２つ、３つ、４つ、またはそれを超える、ヒト腸内微生物グリコシダーゼ酵素の基質である、グリカンポリマー調製物。
【０６９３】
１４４．グリカンポリマー調製物であって、例えば、調製物が少なくとも０．５、１、２、５、１０、５０、または１００ｋｇを含み、例えば、少なくとも純度２０、３０、４０、５０、６０、７０、８０、９０、９５または９９％であり、
グルコースおよび少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合、
を含むグリカンポリマーを含み、
ｉ）ＧＨ１３サブファミリー１９、ＧＨ１３サブファミリー２１、ＧＨ２３、ＧＨ３３、ＧＨ３７もしくはＧＨ１０４  ＣＡＺｙファミリー、または
ｉｉ）ＧＨ２３、ＧＨ２４、またはＧＨ３３  ＣＡＺｙファミリー
から選択される１つ以上、例えば２つ、３つ、４つ、またはそれを超える、ヒト腸内微生物グリコシダーゼ酵素の基質である、グリカンポリマー調製物。
【０６９４】
１４５．グリカンポリマー調製物であって、例えば、調製物が少なくとも０．５、１、２、５、１０、５０、または１００ｋｇを含み、例えば、少なくとも純度２０、３０、４０、５０、６０、７０、８０、９０、９５または９９％であり、
ｉ）グルコースもしくはキシロースサブユニット、またはそれらの組み合わせ、および少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合、または
ｉｉ）グルコースもしくはキシロースサブユニット、またはそれらの組み合わせ、および少なくとも１つのベータ−グリコシド結合、
を含むグリカンポリマーを含み、
ｉ）ＧＨ１３サブファミリー２０、ＧＨ１３サブファミリー３１、ＧＨ１３サブファミリー３９、ＧＨ３９、ＧＨ４３サブファミリー１１、ＧＨ５サブファミリー４４、もしくはＧＨ９４  ＣＡＺｙファミリー、または
ｉｉ）ＧＨ２、ＧＨ３１、ＧＨ２３、ＧＨ１３、またはＧＨ２４  ＣＡＺｙファミリー
から選択される１つ以上、例えば２つ、３つ、４つ、またはそれを超える、ヒト腸内微生物グリコシダーゼ酵素の基質である、グリカンポリマー調製物。
【０６９５】
１４６．グリカンポリマー調製物であって、例えば、調製物が少なくとも０．５、１、２、５、１０、５０、または１００ｋｇを含み、例えば、少なくとも純度２０、３０、４０、５０、６０、７０、８０、９０、９５または９９％であり、
グルコース、キシロース、アラビノース、もしくはガラクトースサブユニット、またはそれらの組み合わせおよび少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合、
を含むグリカンポリマーを含み、
ｉ）ＧＨ１３サブファミリー３、ＧＨ１３サブファミリー３０、ＧＨ１２１、ＧＨ１５、ＧＨ４３サブファミリー２７、ＧＨ４３サブファミリー３４、もしくはＧＨ４３サブファミリー８  ＣＡＺｙファミリー、または
ｉｉ）ＧＨ９２、ＧＨ９７、ＧＨ７６、ＧＨ２８、ＧＨ２０、ＧＨ１０５、ＧＨ２、ＧＨ５０、ＧＨ３、またはＧＨ１０６  ＣＡＺｙファミリー
から選択される１つ以上、例えば２つ、３つ、４つ、またはそれを超える、ヒト腸内微生物グリコシダーゼ酵素の基質である、グリカンポリマー調製物。
【０６９６】
１４７．医薬組成物、医療用食品、栄養補助食品、食品成分、または治療用栄養製品として製剤化され、例えば、製剤化する工程が、調製物を複数の剤形または部分に分割することを含む、項１４０〜１４６のいずれか一項に記載のグリカン調製物。
【０６９７】
１４８．液体として経口投与のために製剤化された、項１４０〜１４７のいずれか一項に記載のグリカン調製物。
【０６９８】
１４９．液体が、飲料、シロップ、水溶液または水性懸濁液である、項１４８に記載のグリカン調製物。
【０６９９】
１５０．固体として経口投与のために製剤化された、項１４０〜１４７のいずれか一項に記載のグリカン調製物。
【０７００】
１５１．固体が、錠剤、丸剤、カプセル、ロゼンジ、キャンディ、または粉末である、項１５０に記載のグリカン調製物。
【０７０１】
１５２．固体が、固形食品である、項１５０に記載のグリカン調製物。
【０７０２】
１５３．粉末が、経口投与前に水溶液中での再構成のために製剤化された、項１５１に記載のグリカン調製物。
【０７０３】
１５４．固体または液体として経直腸投与のために製剤化された、項１４０〜１４７のいずれか一項に記載のグリカン調製物。
【０７０４】
１５５．浣腸剤または坐剤として製剤化された、項１５４に記載のグリカン調製物。
【０７０５】
１５６．遅延放出または時間制御システムとして製剤化された、項１４０〜１５５のいずれか一項に記載のグリカン調製物。
【０７０６】
１５７．薬学的に許容される担体または賦形剤をさらに含む、項１４０〜１５６のいずれか一項に記載のグリカン調製物。
【０７０７】
１５８．食品的に許容される担体または賦形剤をさらに含む、項１４０〜１５６のいずれか一項に記載のグリカン調製物。
【０７０８】
１５９．第２の治療剤をさらに含む、項１４０〜１５８のいずれか一項に記載のグリカン調製物。
【０７０９】
１６０．腸内微生物（例えば、ヒト腸内微生物）の調製物をさらに含む、項１４０〜１５９のいずれか一項に記載のグリカン調製物。
【０７１０】
１６１．グリカンポリマーが、腸内微生物の基質である、項１６０に記載のグリカン調製物。
【０７１１】
１６２．グリカンポリマーが、腸内微生物グリコシダーゼ酵素の基質であり、腸内微生物の増殖を促進する、項１６１に記載のグリカン調製物。
【０７１２】
１６３．項１４０〜１６２のいずれか一項に記載のグリカン調製物を含む、単位剤形。
【０７１３】
１６４．経腸投与、経鼻、経口、または経直腸投与、または経管栄養のために製剤化された、項１６３に記載の単位剤形。
【０７１４】
１６５．単位剤形、例えば、グリカンポリマー調製物成分の単位剤形が、約０．０１ｋｃａｌ〜約１ｋｃａｌ、０．１ｋｃａｌ〜５ｋｃａｌ、０．０１ｋｃａｌ〜１０ｋｃａｌ、または０．１ｋｃａｌ〜１０ｋｃａｌのカロリー値を有する、項１６３または１６４に記載の単位剤形。
【０７１５】
１６６．結腸または大腸における時限放出および／または標的放出のために製剤化された、項１６３〜１６５のいずれか一項に記載の単位剤形。
【０７１６】
１６７．項１４０〜１６２のいずれか一項に記載のグリカン調製物を含む、医薬組成物。
【０７１７】
１６８．項１４０〜１６２のいずれか一項に記載のグリカンポリマー調製物またはその一部をそれぞれ含む、医薬組成物のセットであって、集合的に、セットが少なくとも０．１、０．５、１、２、５、１０、または１００キログラムの調製物を含む、セット。
【０７１８】
１６９．項１４０〜１６２のいずれか一項に記載のグリカン調製物を含む、医療用食品。
【０７１９】
１７０．項１４０〜１６２のいずれか一項に記載のグリカンポリマー調製物またはその一部をそれぞれ含む、医療用食品の一部のセットであって、集合的に、セットが少なくとも０．１、０．５、１、２、５、１０、または１００キログラムの調製物を含む、セット。
【０７２０】
１７１．項１４０〜１６２のいずれか一項に記載のグリカン調製物を含む、栄養補助食品。
【０７２１】
１７２．項１４０〜１６２のいずれか一項に記載のグリカンポリマー調製物またはその一部をそれぞれ含む、栄養補助食品の一部のセットであって、集合的に、セットが少なくとも０．１、０．５、１、２、５、１０、または１００キログラムの調製物を含む、セット。
【０７２２】
１７３．項１４０〜１６２のいずれか一項に記載のグリカン調製物を含む、食品成分。
【０７２３】
１７４．項１４０〜１６２のいずれか一項に記載のグリカンポリマー調製物またはその一部をそれぞれ含む、食品成分の一部のセットであって、集合的に、セットが少なくとも０．１、０．５、１、２、５、１０、または１００キログラムの調製物を含む、セット。
【０７２４】
１７５．ヒト腸内微生物の調製物を提供する工程、
グリカンポリマーがヒト腸内微生物の基質である、項１４０〜１６２のいずれか一項に記載のグリカンポリマー調製物を提供する工程、
ヒト腸内微生物をグリカンポリマーと組み合わせる工程
を含む、共調製物の作製方法。
【０７２５】
１７６．ヒト腸内微生物が、表２に列挙された微生物から選択される、項１７５に記載の方法。
【０７２６】
１７７．ヒト腸内微生物が、表３に列挙された微生物から選択される、項１７５に記載の方法。
【０７２７】
１７８．ヒト腸内微生物のＣＡＺｙファミリープロファイルを同定する工程、および同定されたヒト腸内微生物のＣＡＺｙファミリープロファイルに基づいて、基質であるグリカンポリマー調製物を選択する工程をさらに含む、項１７５〜１７７のいずれか一項に記載の方法。
【０７２８】
１７９．経口、経鼻または経直腸送達または経管栄養のための共調製物を製剤化する工程をさらに含む、項１７５〜１７８のいずれか一項に記載の方法。
【０７２９】
１８０．時限放出製剤として共調製物を製剤化する工程をさらに含む、項１７５〜１７９のいずれか一項に記載の方法。
【０７３０】
１８１．調製物の放出が結腸または大腸で起こる、項１８０に記載の方法。
【０７３１】
１８２．約５０％、６０％、７０％、８０％、９０％、９５％または９８％を超える調製物の微生物が、胃の通過後（例えば結腸または大腸に到達するとき）に生存可能である、項１７５〜１８１のいずれか一項に記載の方法。
【０７３２】
１８３．結腸または大腸内で放出された後に、約１％、５％、１０％、１５％、２０％、２５％、３０％、４０％、５０％、６０％または７５％を超える調製物の微生物が移植する、項１７５〜１８２のいずれか一項に記載の方法。
【０７３３】
１８４．グリカンポリマー調製物が、グリカンポリマーの合成のために同定されたＣＡＺｙファミリープロファイルから１つ以上のグリコシダーゼを選択する、グリコシダーゼ指向合成によって作製される、項１７５〜１８３のいずれか一項に記載の方法。
【０７３４】
１８５．グリカンポリマー調製物が、同定されたＣＡＺｙファミリープロファイルに基づいて、非酵素ポリマー触媒を用いて合成および設計される、項１７５〜１８３のいずれか一項に記載の方法。
【０７３５】
１８６．共調製物を医薬組成物に製剤化する工程をさらに含む、項１７５〜１８５のいずれか一項に記載の方法。
【０７３６】
１８７．ヒト腸内微生物の調製物および項１４０〜１６２のいずれか一項に記載のグリカンポリマーの調製物を含む、シンバイオティクス共調製物。
【０７３７】
１８８．薬学的に許容される賦形剤または担体をさらに含む、項１８７に記載のシンバイオティクス共調製物。
【０７３８】
１８９．経鼻、経口、経胃または経直腸送達のための単位剤形として製剤化された、項１８７または１８８に記載のシンバイオティクス共調製物。
【０７３９】
１９０．胃酸による不活化から調製物のヒト腸内微生物を保護するように製剤化された、項１８７〜１８９のいずれか一項に記載のシンバイオティクス共調製物。
【０７４０】
１９１．項１８７〜１９０のいずれか一項に記載のシンバイオティクス共調製物を、ヒト腸内微生物を移植するのに有効な量および時間で対象に投与する工程を含む、それを必要とするヒト対象の結腸または大腸にヒト腸内微生物を移植する方法。
【０７４１】
１９２．ヒト対象が、腸の微生物叢のディスバイオシスを有し、例えば、そのようなディスバイオシスを引き起こす処置または曝露を受けており、例えば、ヒト対象が、処置または曝露を受けたと同定された、項１９１に記載の方法。
【０７４２】
１９３．対象が抗生物質処置を受けている、項１９１または１９２に記載の方法。
【０７４３】
１９４．対象が抗生物質処置を受けていない、項１９１または１９２に記載の方法。
【０７４４】
１９５．腸（例えば、結腸または大腸）の微生物叢が安定である（例えば、分類群の相対存在度において有意な変化がない）、項１９１〜１９４のいずれか一項に記載の方法。
【０７４５】
１９６．腸（例えば、結腸または大腸）の微生物叢が不安定である（例えば、分類群の相対存在度において有意な変化がある）、項１９１〜１９４のいずれか一項に記載の方法。
【０７４６】
１９７．移植の程度が、シンバイオティクス共調製物の投与前または投与後に、例えば、１６Ｓ、定量培養、またはｑＰＣＲによる、分析によって決定される、項１９１〜１９６のいずれか一項に記載の方法。
【０７４７】
１９８．移植の程度が、シンバイオティクス共調製物中で対象に投与された生物の数と、対象の腸から回収可能な生物の数との比較を通して、例えば定量培養またはｑＰＣＲを通して、決定される、項１９１〜１９７のいずれか一項に記載の方法。
【０７４８】
１９９．ヒト対象が表５に列挙された疾患または障害、例えば、急性嚢炎、アレルギー性疾患、ＡＩＤＳ、アテローム性動脈硬化症、喘息、アトピー性皮膚炎、自閉症スペクトラム障害、慢性機能性便秘、セリアック病、慢性萎縮性胃炎、慢性嚢炎、クロストリジウム・ディフィシル（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｄｉｆｆｉｃｉｌｅ）関連疾患（ＣＤＡＤ）、セリアック病、結腸直腸腺腫、結腸直腸癌、クローン病、嚢胞性線維症、うつ病、糖尿病（Ｉ型）、糖尿病（ＩＩ型）、下痢、湿疹、腸瘻造設、家族性地中海熱、食物過敏症、移植片対宿主病（ＧｖＨＤ）、肝性脳症、高血圧、炎症性腸疾患、過敏性腸疾患、過敏性腸疾患−便秘（ＩＢＳ−Ｃ）、肺癌、顕微鏡的大腸炎、多発性硬化症、非アルコール性脂肪肝疾患（ＮＡＦＬＤ）、非アルコール性脂肪性肝炎（ＮＡＳＨ）、肥満関連喘息、パーキンソン病（ＰＤ）、放射線誘発性急性腸管症状、赤痢、短腸症候群、脊髄損傷関連腸機能障害、全身性炎症反応症候群、全身性エリテマトーデス、または潰瘍性大腸炎を有する、項１９１〜１９８のいずれか一項に記載の方法。
【０７４９】
２００．ヒト対象が、表５に列挙された疾患または障害、例えば、アテローム性動脈硬化症、心血管疾患、ＨＩＶにおける心血管リスク、頸動脈アテローム性動脈硬化症、慢性心疾患、慢性心不全、慢性腎臓病、慢性血管疾患、結腸直腸癌、冠状動脈性心臓病、冠状動脈疾患（ＣＡＤ）、糖尿病（ＩＩ型）、末期腎臓病、ＨＩＶ、炎症性腸疾患、虚血性発作、メタボリックシンドローム、非アルコール性脂肪性肝疾患（ＮＡＦＬＤ）、肥満、放射線誘発急性腸管症状（ＲＩＡＩＳ）、または脳卒中を有する、項１９１〜１９８のいずれか一項に記載の方法。
【０７５０】
２０１．ヒト対象が、表５に列挙された疾患または障害、例えば、慢性腎臓病、ヘリコバクター・ピロリ感染症、肝性脳症、または最小限の肝性脳症（ＭＨＥ）を伴う肝硬変を有する、項１９１〜１９８のいずれか一項に記載の方法。
【０７５１】
２０２．本明細書に記載のグリカンポリマー調製物および微生物の調製物を含む組成物を、ディスバイオシスの処置に有効な量で投与する工程
を含む、ディスバイオシスを有する対象を処置する方法。
【０７５２】
２０３．微生物が胞子形成微生物である、項２０２に記載の方法。
【０７５３】
２０４．グリカンポリマー調製物が、キシロース、アラビノース、グルコース、ガラクトースまたはそれらの組み合わせを含む、項２０２または２０３に記載の方法。
【０７５４】
２０５．グリカンポリマー調製物のグリカンポリマー、または少なくとも２０、３０、４０、５０、６０、７０、８０、９０、９５、もしくは９９％（重量または数による）のグリカンポリマーが、表１に列挙された特性の１つ以上（例えば、２、３、４、５、または６つ）有し、任意選択により、
ａ．キシロースもしくはアラビノースサブユニット、またはそれらの組み合わせ、および少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含むグリカンポリマー、
ｂ．キシロースもしくはアラビノースサブユニット、またはそれらの組み合わせ、および少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含むグリカンポリマー、
ｃ．ガラクトース、キシロース、もしくはアラビノースサブユニット、またはそれらの組み合わせ、および少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含むグリカンポリマー、
ｄ．ガラクトース、キシロース、もしくはアラビノースサブユニット、またはそれらの組み合わせ、および少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含むグリカンポリマー、
ｅ．グルコース、キシロース、もしくはアラビノースサブユニット、またはそれらの組み合わせ、および少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含むグリカンポリマー、
ｆ．グルコース、キシロース、もしくはアラビノースサブユニット、またはそれらの組み合わせ、および少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含むグリカンポリマー、
ｇ．キシロース、アラビノース、グルコースもしくはガラクトースサブユニット、またはそれらの組み合わせ、および少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含むグリカンポリマー、
ｈ．キシロース、アラビノース、グルコース、もしくはガラクトースサブユニット、またはそれらの組み合わせおよび少なくとも１つのベータ−グリコシド結合、またはそれらの組み合わせおよび少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含むグリカンポリマー
から選択される、項２０２〜２０４のいずれか一項に記載の方法。
【０７５５】
２０６．グリカンポリマー調製物のグリカンポリマーの、グリカンポリマー、または少なくとも２０、３０、４０、５０、６０、７０、８０、９０、９５、もしくは９９％（重量または数による）のグリカンポリマーが、グリコシダーゼ酵素の基質である、項２０２〜２０５のいずれか一項に記載の方法。
【０７５６】
２０７．グリコシダーゼ酵素が胞子形成ヒト腸内微生物中に存在する、項２０２〜２０６のいずれか一項に記載の方法。
【０７５７】
２０８．グリカンポリマーが、ＧＴ５、ＧＴ３５、ＧＴ３、ＧＨ９７、ＧＨ９５、ＧＨ９２、ＧＨ８９、ＧＨ８８、ＧＨ７８、ＧＨ７７、ＧＨ５７、ＧＨ５１、ＧＨ４３サブファミリー３４、ＧＨ４３サブファミリー２４、ＧＨ４３サブファミリー１０、ＧＨ４２、ＧＨ３６、ＧＨ３５、ＧＨ３３、ＧＨ３２、ＧＨ３１、ＧＨ３、ＧＨ２９、ＧＨ２８、ＧＨ２７、ＧＨ２４、ＧＨ２０、ＧＨ２、ＧＨ１６、ＧＨ１３３、ＧＨ１３０、ＧＨ１３サブファミリー８、ＧＨ１３サブファミリー３８、ＧＨ１３サブファミリー１４、ＧＨ１３、ＧＨ１２３、ＧＨ１１５、ＧＨ１０９、またはＧＨ１０５  ＣＡＺｙファミリーのうちの１つのグリコシダーゼ酵素の基質である、項２０２〜２０７のいずれか一項に記載の方法。
【０７５８】
２０９．微生物が、表１９、列１の微生物のいずれか１つである、項２０２〜２０８のいずれか一項に記載の方法。
【０７５９】
２１０．微生物が、表２０、列１の微生物のいずれか１つである、項２０２〜２０８のいずれか一項に記載の方法。
【０７６０】
２１１．微生物が、表２１、列１の微生物のいずれか１つである、項２０２〜２０８のいずれか一項に記載の方法。
【０７６１】
２１２．微生物が、表１９、列１の微生物のいずれか１つであり、グリカン調製物が、表１９、列３、表１９、列４、表１９、列５、表１９、列６、表１９、列７、表１９、列８、表１９、列９、または表１９、列１０のいずれか１つである、項２０２〜２０８のいずれか一項に記載の方法。
【０７６２】
２１３．微生物が、表２０、列１の微生物のいずれか１つであり、グリカン調製物が、表２０、列２、表２０、列３、表２０、列４、表２０、列５、表２０、列６、表２０、列７、表２０、列８、または表２０、列９のいずれか１つである、項２０２〜２０８のいずれか一項に記載の方法。
【０７６３】
２１４．微生物が、表２１、列１の微生物のいずれか１つであり、グリカン調製物が、表２１、列２、表２１、列３、表２１、列４、表２１、列５、表２１、列６、表２１、列７、表２１、列８、または表２１、列９のいずれか１つである、項２０２〜２０８のいずれか一項に記載の方法。
【０７６４】
２１５．胞子形成微生物（例えば、胞子形成細菌分類群）のヒト腸内微生物グリコシダーゼ酵素の基質であるグリカンポリマーを含む、本明細書に記載のグリカンポリマー調製物。
【０７６５】
２１６．グリカンポリマー調製物であって、任意選択により、例えば、調製物が少なくとも約０．５、１、２、５、１０、５０、または１００ｋｇを含み、および／または、さらに任意選択により、例えば、少なくとも純度２０、３０、４０、５０、６０、７０、８０、９０、９５または９９％であり、
ａ．キシロースもしくはアラビノースサブユニット、またはそれらの組み合わせ、および少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合、
ｂ．キシロースもしくはアラビノースサブユニット、またはそれらの組み合わせ、および少なくとも１つのベータ−グリコシド結合、
ｃ．ガラクトース、キシロースもしくはアラビノースサブユニット、またはそれらの組み合わせ、および少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合、
ｄ．ガラクトース、キシロースもしくはアラビノースサブユニット、またはそれらの組み合わせ、および少なくとも１つのベータ−グリコシド結合、
ｅ．グルコース、キシロースもしくはアラビノースサブユニット、またはそれらの組み合わせ、および少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合、
ｆ．グルコース、キシロースもしくはアラビノースサブユニット、またはそれらの組み合わせ、および少なくとも１つのベータ−グリコシド結合、
ｇ．キシロース、アラビノース、グルコース、もしくはガラクトースサブユニット、またはそれらの組み合わせおよび少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合、
ｈ．キシロース、アラビノース、グルコース、もしくはガラクトースサブユニット、またはそれらの組み合わせおよび少なくとも１つのベータ−グリコシド結合、またはそれらの組み合わせおよび少なくとも１つのベータ−グリコシド結合、
を含むグリカンポリマーを含み、
ＧＴ５、ＧＴ３５、ＧＴ３、ＧＨ９７、ＧＨ９５、ＧＨ９２、ＧＨ８９、ＧＨ８８、ＧＨ７８、ＧＨ７７、ＧＨ５７、ＧＨ５１、ＧＨ４３サブファミリー３４、ＧＨ４３サブファミリー２４、ＧＨ４３サブファミリー１０、ＧＨ４２、ＧＨ３６、ＧＨ３５、ＧＨ３３、ＧＨ３２、ＧＨ３１、ＧＨ３、ＧＨ２９、ＧＨ２８、ＧＨ２７、ＧＨ２４、ＧＨ２０、ＧＨ２、ＧＨ１６、ＧＨ１３３、ＧＨ１３０、ＧＨ１３サブファミリー８、ＧＨ１３サブファミリー３８、ＧＨ１３サブファミリー１４、ＧＨ１３、ＧＨ１２３、ＧＨ１１５、ＧＨ１０９、またはＧＨ１０５  ＣＡＺｙファミリーのうちの１つのヒト腸内微生物グリコシダーゼ酵素の基質である、グリカンポリマー調製物。
【０７６６】
２１７．微生物が、表１９、列１の微生物のいずれか１つである、項２１５または２１６に記載のグリカンポリマー調製物。
【０７６７】
２１８．微生物が、表２０、列１の微生物のいずれか１つである、項２１５または２１６に記載のグリカンポリマー調製物。
【０７６８】
２１９．微生物が、表２１、列１の微生物のいずれか１つである、項２１５または２１６に記載のグリカンポリマー調製物。
【０７６９】
２２０．微生物が、表１９、列１の微生物のいずれか１つであり、グリカン調製物が、表１９、列３、表１９、列４、表１９、列５、表１９、列６、表１９、列７、表１９、列８、表１９、列９、表１９、列１０のいずれか１つである、項２１５〜２１９のいずれか一項に記載のグリカンポリマー調製物。
【０７７０】
２２１．微生物が、表２０、列１の微生物のいずれか１つであり、グリカン調製物が、表２０、列２、表２０、列３、表２０、列４、表２０、列５、表２０、列６、表２０、列７、表２０、列８、または表２０、列９のいずれか１つである、項２１５〜２１９のいずれか一項に記載のグリカンポリマー調製物。
【０７７１】
２２２．微生物が、表２１、列１の微生物のいずれか１つであり、グリカン調製物が、表２１、列２、表２１、列３、表２１、列４、表２１、列５、表２１、列６、表２１、列７、表２１、列８、または表２１、列９のいずれか１つである、項２１５〜２１９のいずれか一項に記載のグリカンポリマー調製物。
【０７７２】
２２３．
胞子形成微生物（例えば、胞子形成ヒト腸内微生物）の調製物を提供する工程、
グリカンポリマーが胞子形成微生物の基質である、グリカンポリマー調製物（本明細書に記載）を提供する工程、
胞子形成微生物の調製物をグリカンポリマー調製物と組み合わせる工程、
を含む、共調製物の作製方法。
【０７７３】
２２４．グリカンポリマーが、
ａ．キシロースもしくはアラビノースサブユニット、またはそれらの組み合わせ、および少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合、
ｂ．キシロースもしくはアラビノースサブユニット、またはそれらの組み合わせ、および少なくとも１つのベータ−グリコシド結合、
ｃ．ガラクトース、キシロースもしくはアラビノースサブユニット、またはそれらの組み合わせ、および少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合、
ｄ．ガラクトース、キシロースもしくはアラビノースサブユニット、またはそれらの組み合わせ、および少なくとも１つのベータ−グリコシド結合、
ｅ．グルコース、キシロースもしくはアラビノースサブユニット、またはそれらの組み合わせ、および少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合、
ｆ．グルコース、キシロースもしくはアラビノースサブユニット、またはそれらの組み合わせ、および少なくとも１つのベータ−グリコシド結合、
ｇ．キシロース、アラビノース、グルコース、もしくはガラクトースサブユニット、またはそれらの組み合わせおよび少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合、または
ｈ．キシロース、アラビノース、グルコース、もしくはガラクトースサブユニット、またはそれらの組み合わせおよび少なくとも１つのベータ−グリコシド結合、またはそれらの組み合わせおよび少なくとも１つのベータ−グリコシド結合
のうちの１つを含む、項２２３に記載の方法。
【０７７４】
２２５．グリカンポリマーが、ＧＴ５、ＧＴ３５、ＧＴ３、ＧＨ９７、ＧＨ９５、ＧＨ９２、ＧＨ８９、ＧＨ８８、ＧＨ７８、ＧＨ７７、ＧＨ５７、ＧＨ５１、ＧＨ４３サブファミリー３４、ＧＨ４３サブファミリー２４、ＧＨ４３サブファミリー１０、ＧＨ４２、ＧＨ３６、ＧＨ３５、ＧＨ３３、ＧＨ３２、ＧＨ３１、ＧＨ３、ＧＨ２９、ＧＨ２８、ＧＨ２７、ＧＨ２４、ＧＨ２０、ＧＨ２、ＧＨ１６、ＧＨ１３３、ＧＨ１３０、ＧＨ１３サブファミリー８、ＧＨ１３サブファミリー３８、ＧＨ１３サブファミリー１４、ＧＨ１３、ＧＨ１２３、ＧＨ１１５、ＧＨ１０９、またはＧＨ１０５  ＣＡＺｙファミリーのうちの１つのグリコシダーゼ酵素の基質である、項２２３または２２４に記載の方法。
【０７７５】
２２６．微生物が、表１９、列１の微生物のいずれか１つである、項２２３〜２２５のいずれか一項に記載の方法。
【０７７６】
２２７．微生物が、表２０、列１の微生物のいずれか１つである、項２２３〜２２５のいずれか一項に記載の方法。
【０７７７】
２２８．微生物が、表２１、列１の微生物のいずれか１つである、項２２３〜２２５のいずれか一項に記載の方法。
【０７７８】
２２９．微生物が、表１９、列１の微生物のいずれか１つであり、グリカン調製物が、表１９、列３、表１９、列４、表１９、列５、表１９、列６、表１９、列７、表１９、列８、表１９、列９、または表１９、列１０のいずれか１つである、項２２３〜２２８のいずれか一項に記載の方法。
【０７７９】
２３０．微生物が、表２０、列１の微生物のいずれか１つであり、グリカン調製物が、表２０、列２、表２０、列３、表２０、列４、表２０、列５、表２０、列６、表２０、列７、表２０、列８、または表２０、列９のいずれか１つである、項２２３〜２２８のいずれか一項に記載の方法。
【０７８０】
２３１．微生物が、表２１、列１の微生物のいずれか１つであり、グリカン調製物が、表２１、列２、表２１、列３、表２１、列４、表２１、列５、表２１、列６、表２１、列７、表２１、列８、または表２１、列９のいずれか１つである、項２２３〜２２８のいずれか一項に記載の方法。
【０７８１】
２３２．経口、経鼻または経直腸送達または経管栄養のための共調製物を製剤化する工程をさらに含む、項２２３〜２３１のいずれか一項に記載の方法。
【０７８２】
２３３．時限放出製剤として共調製物を製剤化する工程をさらに含む、項２２３〜２３２のいずれか一項に記載の方法。
【０７８３】
２３４．調製物の放出が結腸または大腸で起こる、項２３３に記載の方法。
【０７８４】
２３５．約５０％、６０％、７０％、８０％、９０％、９５％または９８％を超える調製物の微生物が、胃の通過後（例えば結腸または大腸に到達するとき）に生存可能である、項２２３〜２３４のいずれか一項に記載の方法。
【０７８５】
２３６．結腸または大腸内で放出された後に、約１％、５％、１０％、１５％、２０％、２５％、３０％、４０％、５０％、６０％または７５％を超える調製物の微生物が移植する、項２２３〜２３５のいずれか一項に記載の方法。
【０７８６】
２３７．グリカンポリマー調製物が、グリカンポリマーの合成のために同定されたＣＡＺｙファミリープロファイルから１つ以上のグリコシダーゼを選択する、グリコシダーゼ指向合成によって作製される、項２２３〜２３６のいずれか一項に記載の方法。
【０７８７】
２３８．グリカンポリマー調製物が、同定されたＣＡＺｙファミリープロファイルに基づいて、非酵素ポリマー触媒を用いて合成および設計される、項２２３〜２３７のいずれか一項に記載の方法。
【０７８８】
２３９．共調製物を医薬組成物に製剤化する工程をさらに含む、項２２３〜２３８のいずれか一項に記載の方法。
【０７８９】
２４０．ヒト腸内微生物の調製物および項２２３〜２３９のいずれか一項に記載のグリカンポリマーの調製物を含む、シンバイオティクス共調製物。
【０７９０】
２４１．薬学的に許容される賦形剤または担体をさらに含む、項２４０に記載のシンバイオティクス共調製物。
【０７９１】
２４２．経鼻、経口、経胃または経直腸送達のための単位剤形として製剤化された、項２４０または２４１に記載のシンバイオティクス共調製物。
【０７９２】
２４３．胃酸による不活化から調製物のヒト腸内微生物を保護するように製剤化された、項２４０〜２４２のいずれか一項に記載のシンバイオティクス共調製物。
【０７９３】
２４４．項２４０〜２４３のいずれか一項に記載のシンバイオティクス共調製物を、ヒト腸内微生物を移植するのに有効な量および時間で対象に投与する工程を含む、それを必要とするヒト対象の結腸または大腸にヒト腸内微生物を移植する方法。
【０７９４】
２４５．ヒト対象が、腸の微生物叢のディスバイオシスを有し、例えば、そのようなディスバイオシスを引き起こす処置（例えば、抗菌処置、癌処置など）または曝露（例えば、細菌性病原体（例えば、Ｃ．ｄｉｆｆ．）などの病原体への曝露）を受けており、任意選択により、例えば、ヒト対象が、処置または曝露を受けたと同定された、項２４４に記載の方法。
【０７９５】
２４６．ヒト対象が抗生物質処置を受けている、項２４４または２４５に記載の方法。
【０７９６】
２４７．ヒト対象が抗生物質処置を受けていない、項２４４または２４５に記載の方法。
【０７９７】
２４８．腸（例えば、結腸または大腸）の微生物叢が安定である（例えば、分類群の相対存在度において有意な変化がない）、項２４４〜２４７のいずれか一項に記載の方法。
【０７９８】
２４９．腸（例えば、結腸または大腸）の微生物叢が不安定である（例えば、分類群の相対存在度において有意な変化がある）、項２４４〜２４７のいずれか一項に記載の方法。
【０７９９】
２５０．移植の程度が、シンバイオティクス共調製物の投与前または投与後に、例えば、１６Ｓ、定量培養、またはｑＰＣＲによる、分析によって決定される、項２４４〜２４９のいずれか一項に記載の方法。
【０８００】
２５１．移植の程度が、シンバイオティクス共調製物中で対象に投与された生物の数と、対象の腸から回収可能な生物の数との比較を通して、例えば定量培養またはｑＰＣＲを通して、決定される、項２４４〜２５０のいずれか一項に記載の方法。
【０８０１】
２５２．本明細書に記載の任意の実施形態の方法。
【０８０２】
２５３．本明細書に記載の任意の実施形態の組成物。
【０８０３】
２５４．グリカンポリマー、例えば、ヒト腸内微生物中に存在するグリコシダーゼ酵素の基質であるグリカンポリマー、の調製物を作製する方法であって、
グリカンポリマーの製造に適した複数のグリカンサブユニット、例えば糖モノマーまたは糖ダイマーを提供する工程；および
複数のグリカンサブユニットを、グリコシダーゼ酵素分子、例えば、ヒト腸内微生物に由来するものと、グリカンサブユニットのグリカンポリマーへの組み込みを（例えば、縮合反応により）生じる条件下で、接触させる工程、
それにより、ヒト腸内微生物の基質であるグリカンポリマー調製物を作製する工程、
を含む方法であって、任意選択により、
ｉ）グリカンポリマー調製物が、少なくとも約０．２５、０．５、１、５、１０、２０、５０、１００、２００、３００、４００または５００キログラムのグリカンポリマーを含む、および／または
ｉｉ）グリカンポリマー調製物が、少なくとも約１５％、３０％、４５％、６０％、または約７５％の収率（投入グリカンサブユニットのパーセンテージとしての重量／重量基準で決定される）で産生される
、方法。
【０８０４】
２５５．グリコシダーゼ酵素分子が由来するヒト腸内微生物が、グリカンポリマーが基質である、ヒト腸内微生物と同じ分類群、例えば、門、目、ファミリー、属または種のものである、項２５４に記載の方法。
【０８０５】
２５６．グリコシダーゼ酵素分子が由来するヒト腸内微生物が、第１の分類群、例えば、門、目、ファミリー、属または種のものであり、グリカンポリマーが基質であるヒト腸内微生物が、第２の分類群、例えば、門、目、ファミリー、属または種のものである、項２５４に記載の方法。
【０８０６】
２５７．グリカンポリマー調製物を、医薬組成物、医療用食品、栄養補助食品、食品成分、または治療用栄養製品に製剤化する工程をさらに含む、項２５４〜２５６のいずれかに記載の方法。
【０８０７】
２５８．調製物を、例えば、経口または経直腸などの経腸投与のために、または経鼻、経口または胃管栄養などの経管栄養のために、複数の部分、例えば、単位用量または製剤に分割する工程、例えば、調製物を少なくとも１０、１００、または１，０００の部分に分割する工程をさらに含む、項２５４〜２５７のいずれかに記載の方法。
【０８０８】
２５９．複数の部分が、その部分に存在するグリカンポリマーの量に関して、重量で０．５％、１％、２％、５％、１０％、または２０％以下異なる、項２５８に記載の方法。
【０８０９】
２６０．調製物を賦形剤または担体と組み合わせる工程を含む、項２５４〜２５９のいずれか一項に記載の方法。
【０８１０】
２６１．賦形剤または担体が薬学的に許容される賦形剤または担体である、項２６０に記載の方法。
【０８１１】
２６２．賦形剤または担体が食品である、項２６０に記載の方法。
【０８１２】
２６３．グリコシダーゼ酵素およびグリコシダーゼ酵素分子が、表４（列２）、２３（列Ａ）、２４（列Ａ）、または２２（列１）から独立して選択される、項２５４〜２６２のいずれか一項に記載の方法。
【０８１３】
２６４．グリコシダーゼ酵素をコードするアミノ酸配列が、配列番号１〜１２４のいずれか１つによってコードされるアミノ酸と少なくとも９５％、９７％、または９９％の配列同一性を共有する、項２５４〜２６３のいずれか一項に記載の方法。
【０８１４】
２６５．グリコシダーゼ酵素をコードするアミノ酸配列が、表２３または２４の配列番号１２、１８、３１、３８、３９、４８、５６、５７、６４、６８、７２、８３、８４、９２、９３、９９、１０４、１１０、および１１７のいずれか１つによってコードされるアミノ酸と少なくとも９５％、９７％、または９９％の配列同一性を共有する、項２５４〜２６４のいずれか一項に記載の方法。
【０８１５】
２６６．グリコシダーゼ酵素分子をコードするアミノ酸配列が、配列番号１〜１２４のいずれか１つによってコードされるアミノ酸と少なくとも９５％、９７％、または９９％の配列同一性を共有する、項２５４〜２６５のいずれか一項に記載の方法。
【０８１６】
２６７．グリコシダーゼ酵素分子をコードするアミノ酸配列が、表２３または２４の配列番号１２、１８、３１、３８、３９、４８、５６、５７、６４、６８、７２、８３、８４、９２、９３、９９、１０４、１１０、および１１７のいずれか１つによってコードされるアミノ酸と少なくとも９５％、９７％、または９９％の配列同一性を共有する、項２５４〜２６６のいずれか一項に記載の方法。
【０８１７】
２６８．グリコシダーゼ酵素および／またはグリコシダーゼ酵素分子がビフィドバクテリウム（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）からのもの以外である、項２６２〜２６７のいずれか一項に記載の方法。
【０８１８】
２６９．グリコシダーゼ酵素および／またはグリコシダーゼ酵素分子がラクトバチルス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ）からのもの以外である、項２６２〜２６７のいずれか一項に記載の方法。
【０８１９】
２７０．グリコシダーゼ酵素およびグリコシダーゼ酵素分子が、同一のヒト腸内微生物起源のものである、項２５４〜２６９のいずれか一項に記載の方法。
【０８２０】
２７１．グリコシダーゼ酵素およびグリコシダーゼ酵素分子が、表４（列２）、２３（列Ａ）、２４（列Ａ）、または２２（列１）から選択される、項２７０に記載の方法。
【０８２１】
２７２．グリコシダーゼ酵素およびグリコシダーゼ酵素分子のアミノ酸配列が、少なくとも９５％、９７％、または９９％の配列同一性を共有する、項２５４〜２７１のいずれか一項に記載の方法。
【０８２２】
２７３．アミノ酸配列をコードする核酸配列が、配列番号１〜１２４の１つである、項２７２に記載の方法。
【０８２３】
２７４．アミノ酸配列をコードする核酸配列が、表２３または２４の配列番号１２、１８、３１、３８、３９、４８、５６、５７、６４、６８、７２、８３、８４、９２、９３、９９、１０４、１１０、および１１７の１つである、項２７２に記載の方法。
【０８２４】
２７５．グリコシダーゼ酵素およびグリコシダーゼ酵素分子が、表４（列２）、２３（列Ａ）、２４（列Ａ）、または２２（列１）から選択される、項２７２に記載の方法。
【０８２５】
２７６．グリコシダーゼ酵素および／またはグリコシダーゼ酵素分子がビフィドバクテリウム（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）からのもの以外である、項２７２〜２７５のいずれか一項に記載の方法。
【０８２６】
２７７．グリコシダーゼ酵素および／またはグリコシダーゼ酵素分子がラクトバチルス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ）からのもの以外である、項２７２〜２７５のいずれか一項に記載の方法。
【０８２７】
２７８．グリコシダーゼ酵素およびグリコシダーゼ酵素分子の両方が、同一のＣＡＺｙファミリー（例えば、同一のＧＨファミリー（例えば、ＧＨ１〜ＧＨ１３５の１つ以上）および／またはＧＴファミリー（例えば、ＧＴ１〜ＧＴ１０１の１つ以上）、例えば、表４（列１）、２３（列Ｃ）、２４（列Ｃ）、または２２（列１）に列挙されたもの、である、項２５４〜２７７のいずれか一項に記載の方法。
【０８２８】
２７９．ヒト腸内微生物の識別情報（例えば、分類学的、１６ｓ）、および任意選択により、そのグリコシダーゼプロファイル（例えば、ＣＡＺｙファミリープロファイル）を取得する工程を含む、項２５４〜２７８のいずれか一項に記載の方法。
【０８２９】
２８０．ヒト腸内微生物が、表２に列挙された門（列１）、綱（列２）または属（列３）の微生物分類群から選択される、項２５４〜２７９のいずれか一項に記載の方法。
【０８３０】
２８１．ヒト腸内微生物が、表３に列挙された株（列１）または門（列２）の微生物分類群から選択される、項２５４〜２７９のいずれか一項に記載の方法。
【０８３１】
２８２．ヒト腸内微生物が、表４、列３に列挙された属の微生物分類群から選択される、項２５４〜２７９のいずれか一項に記載の方法。
【０８３２】
２８３．ヒト腸内微生物が、表２２、列１に列挙された微生物から選択される、項２５４〜２７９のいずれか一項に記載の方法。
【０８３３】
２８４．ヒト腸内微生物が、表１９、列１および２に列挙された微生物分類群（胞子菌）から選択される、項２５４〜２７９のいずれか一項に記載の方法。
【０８３４】
２８５．ヒト腸内微生物が、表２０、列１に列挙された微生物分類群（胞子菌）から選択される、項２５４〜２７９のいずれか一項に記載の方法。
【０８３５】
２８６．ヒト腸内微生物が、表２１、列１に列挙された微生物（胞子菌）から選択される、項２５４〜２７９のいずれか一項に記載の方法。
【０８３６】
２８７．ヒト腸内微生物が、ビフィドバクテリウム（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）以外のものである、項２５４〜２８６のいずれか一項に記載の方法。
【０８３７】
２８８．ヒト腸内微生物が、ラクトバチルス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ）以外のものである、項２５４〜２８７のいずれか一項に記載の方法。
【０８３８】
２８９．ヒト腸内微生物の識別情報、および／またはそのグリコシダーゼ遺伝子プロファイルに応答して、グリコシダーゼ酵素分子およびグリカンサブユニットのいずれかまたは両方を選択する工程を含む、項２７９に記載の方法。
【０８３９】
２９０．グリコシダーゼ酵素分子（例えば、単離されたグリコシダーゼ酵素分子またはグリコシダーゼ酵素分子を含む細胞抽出物）が結合基質（例えば、固体粒子の表面などの固体表面、または高ＭＷ炭素含有分子、例えば、アガロース、セルロース、などのマトリックス材料）上に配置されている、例えば、共有結合的にまたは非共有結合的に結合している、項２５４〜２８９のいずれか一項に記載の方法。
【０８４０】
２９１．結合基質が細菌細胞以外のものである、項２９０に記載の方法。
【０８４１】
２９２．接触させる工程が、無細胞プロセスを含む、項２５４〜２９１のいずれか一項に記載の方法。
【０８４２】
２９３．ヒト腸内微生物が細菌である、項２５４〜２９２のいずれか一項に記載の方法。
【０８４３】
２９４．調製物に関するパラメータ、例えば、物理的パラメータ、例えば、分子量、例えば、平均分子量もしくは分子量分布、グリカンサブユニット組成または純度、または生物学的特性に関するパラメータ、例えば、ヒト腸内微生物の増殖を調節する能力、微生物によって産生される微生物代謝産物を、例えばエクスビボアッセイにおいて、調節する能力、またはバイオマーカー、例えば、炎症もしくは免疫バイオマーカー、毒性もしくは廃棄化合物、細菌化合物）を例えば、ヒト対象において、調節する能力、の値を取得する工程をさらに含む、項２５４〜２９３のいずれか一項に記載の方法。
【０８４４】
２９５．値を取得するためのアッセイを実行する工程を含む、項２９４に記載の方法。
【０８４５】
２９６．他者から値を取得する工程を含む、項２９４に記載の方法。
【０８４６】
２９７．値を基準値と比較して、例えば、使用、例えば治療的使用、への適合性について、グリカン調製物を評価する、項２９４〜２９６のいずれかに記載の方法。
【０８４７】
２９８．グリコシダーゼ酵素が、配列番号１〜１２４の１つ以上から選択される核酸配列によりコードされる、項２５４〜２９７のいずれか一項に記載の方法。
【０８４８】
２９９．グリコシダーゼ酵素が、配列番号１２、１８、３１、３８、３９、４８、５６、５７、６４、６８、７２、８３、８４、９２、９３、９９、１０４、１１０、および１１７の１つ以上から選択される核酸配列によりコードされる、項２５４〜２９８のいずれか一項に記載の方法。
【０８４９】
３００．グリコシダーゼ酵素分子が、配列番号１〜１２４の１つ以上から選択される核酸配列と少なくとも８０、８５、９０、９１、９２、９３、９４、９５、９６、９７、９８、９９、または１００％同一である核酸配列によってコードされる、項２５４〜２９９のいずれか一項に記載の方法。
【０８５０】
３０１．グリコシダーゼ酵素分子が、配列番号１２、１８、３１、３８、３９、４８、５６、５７、６４、６８、７２、８３、８４、９２、９３、９９、１０４、１１０、および１１７の１つ以上から選択される核酸配列と少なくとも８０、８５、９０、９１、９２、９３、９４、９５、９６、９７、９８、９９、または１００％同一である核酸配列によってコードされる、項２５４〜３００のいずれか一項に記載の方法。
【０８５１】
３０２．グリコシダーゼ酵素および／またはグリコシダーゼ酵素分子がビフィドバクテリウム（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）以外のヒト腸内細菌由来である、項２５４〜３０１のいずれか一項に記載の方法。
【０８５２】
３０３．グリコシダーゼ酵素および／またはグリコシダーゼ酵素分子がラクトバチルス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ）以外のヒト腸内細菌由来である、項２５４〜３０２のいずれか一項に記載の方法。
【０８５３】
３０４．グリコシダーゼ酵素および／またはグリコシダーゼ酵素分子がアルファ−ガラクトシダーゼ以外である、項２５４〜３０３のいずれか一項に記載の方法。
【０８５４】
３０５．グリコシダーゼ酵素および／またはグリコシダーゼ酵素分子がベータ−ガラクトシダーゼ以外である、項２５４〜３０４のいずれか一項に記載の方法。
【０８５５】
３０６．グリコシダーゼ酵素および／またはグリコシダーゼ酵素分子がｉ）アルファ−ガラクトシダーゼ；ｉｉ）ベータ−ガラクトシダーゼ、ｉｉｉ）アルファ−グルコシダーゼ  ｉｖ）ベータ−グルコシダーゼ、ｖ）アルファ−キシロシダーゼ、ｖｉ）ベータ−キシロシダーゼ、ｖｉｉ）アルファ−マンノシダーゼ、ｖｉｉｉ）ベータ−マンノシダーゼ、ｉｘ）アルファ−フルクトフラノシダーゼ、および／またはｘ）ベータ−フルクトフラノシダーゼ以外、またはｉ）、ｉｉ）、ｉｉｉ）、ｉｖ）、ｖ）、ｖｉ）、ｖｉｉ）、ｖｉｉｉ）、ｉｘ）、およびｘ）の任意の組み合わせ（例えば、任意の２つ、３つ、４つ、５つ、６つ、７つ、または８つ）以外である、項２５４〜３０５のいずれか一項に記載の方法。
【０８５６】
３０７．グリカンサブユニットが、グルコース、ガラクトース、マンノース、フルクトース、フコース、ラムノース、キシロース、およびアラビノースから選択される糖モノマーである、項２５４〜３０６のいずれか一項に記載の方法。
【０８５７】
３０８．グリカン単位が、スクロース、マルトース、ゲンチビオース、ラクツロース、ラクトース、ラフィノース、メリビオース、キシロビオース、アラビノビオース、フルクトビオース、ツラノース、セロビオース、マンノビオース、ガラクトビオース、ソホロース、ラミナリビオース、およびキトビオースから選択される糖ダイマーである、項２５４〜３０７のいずれか一項に記載の方法。
【０８５８】
３０９．グリカン単位が、スクロース、イソマルトース、マルトース、メレジトース、ゲンチビオース、セロビオース、メリビオース、ラフィノース、ラクトース、ラクツロース、およびパラチノースから選択される糖ダイマー（例えば、表２３、列Ｅおよび２４、列Ｅに列挙されたもの）である、項２５４〜３０８のいずれか一項に記載の方法。
【０８５９】
３１０．グリカン単位がラクトース以外の糖ダイマーである、項２５４〜３０９のいずれか一項に記載の方法。
【０８６０】
３１１．グリカン単位がラクツロース以外の糖ダイマーである、項２５４〜３１０のいずれか一項に記載の方法。
【０８６１】
３１２．グリカンサブユニットのグリカンポリマーへの組み込みを生じる条件が、モノマーをグリカンポリマーに組み込むための縮合反応に適したものである、項２５４〜３１１のいずれか一項に記載の方法。
【０８６２】
３１３．グリカンサブユニットのグリカンポリマーへの組み込みを生じる条件が、ダイマー出発物質からのグリカンポリマーへのモノマーの組み込みを伴う、トランスグリコシル化反応（例えば、トランスガラクトシル化、トランスグルコシル化、トランスフルクトシル化）に適したものである、項２５４〜３１２のいずれか一項に記載の方法。
【０８６３】
３１４．グリカンサブユニットのグリカンポリマーへの組み込みを生じる条件が、加水分解反応に適したものである、項２５４〜３１３のいずれか一項に記載の方法。
【０８６４】
３１５．グリカン調製物の平均重合度（ＤＰ）が、少なくとも約ＤＰ２、少なくとも約ＤＰ３、少なくとも約ＤＰ４、または少なくともＤＰ５である、項２５４〜３１４のいずれか一項に記載の方法。
【０８６５】
３１６．グリカン調製物の平均重合度（ＤＰ）が、約ＤＰ２〜ＤＰ４、ＤＰ２〜ＤＰ５、ＤＰ２と〜ＤＰ６、ＤＰ３〜ＤＰ５、またはＤＰ３〜ＤＰ６である、項２５４〜３１５のいずれか一項に記載の方法。
【０８６６】
３１７．グリカン調製物の平均重合度（ＤＰ）が、約ＤＰ２〜ＤＰ８、約ＤＰ２〜ＤＰ１０、約ＤＰ３〜ＤＰ８、または約ＤＰ３〜ＤＰ１０である、項２５４〜３１６のいずれか一項に記載の方法。
【０８６７】
３１８．調製物の少なくとも５０％、６０％、７０％、８０％、９０％、９５％、または少なくとも９９％のグリカンポリマーが、２以上のＤＰを有する、項２５４〜３１７のいずれか一項に記載の方法。
【０８６８】
３１９．調製物の少なくとも５０％、６０％、７０％、８０％、９０％または少なくとも９５％のグリカンポリマーが、３以上のＤＰを有する、項２５４〜３１８のいずれか一項に記載の方法。
【０８６９】
３２０．調製物の少なくとも５０％、６０％、７０％、８０％、９０％または少なくとも９５％のグリカンポリマーが、約ＤＰ２〜４、ＤＰ２〜５、ＤＰ２〜６、ＤＰ２〜８、ＤＰ２〜１０、ＤＰ３〜５、ＤＰ３〜６、ＤＰ３〜８、または約ＤＰ３〜１０のＤＰを有する、項２５４〜３１９のいずれか一項に記載の方法。
【０８７０】
３２１．調製物のグリカンポリマーが０の分岐度（ＤＢ）を有する、項２５４〜３２０のいずれか一項に記載の方法。
【０８７１】
３２２．調製物の少なくとも５０％、６０％、７０％、８０％、９０％または少なくとも９５％のグリカンポリマーが分岐している、項２５４〜３２１のいずれか一項に記載の方法。
【０８７２】
３２３．調製物の１％、５％、１０％、２０％、３０％、４０％以下または５０％以下のグリカンポリマーが分岐している、項２５４〜３２２のいずれか一項に記載の方法。
【０８７３】
３２４．調製物の分岐グリカンポリマーが、１つ以上（例えば、１つ、２つ、３つ、４つ、または５つ）の分岐点を含む、項３２２または３２３に記載の方法。
【０８７４】
３２５．調製物のグリカンポリマーが、アルファ−グリコシド結合、例えば、調製物のグリカンポリマーのグリコシド結合の少なくとも約９０％、９５％、９８％、９９％、または１００％がアルファ−グリコシド結合である、項２５４〜３２４のいずれか一項に記載の方法。
【０８７５】
３２６．調製物のグリカンポリマーが、ベータ−グリコシド結合、例えば、調製物のグリカンポリマーのグリコシド結合の少なくとも約９０％、９５％、９８％、９９％、または１００％がベータ−グリコシド結合である、項２５４〜３２５のいずれか一項に記載の方法。
【０８７６】
３２７．調製物のグリカンポリマーが、アルファ−およびベータ−グリコシド結合を含む、項２５４〜３２６のいずれか一項に記載の方法。
【０８７７】
３２８．アルファ−対ベータ−グリコシド結合比が、１：１、１：２、１：３、１：４または１：５である、項３２７に記載の方法。
【０８７８】
３２９．ベータ−対アルファ−グリコシド結合比が、１：１、１：２、１：３、１：４または１：５である、項３２７に記載の方法。
【０８７９】
３３０．ベータ−対アルファ−グリコシド結合比が、１：４である、項３２７に記載の方法。
【０８８０】
３３１．調製物のグリカンポリマーのアルファ−対ベータ−グリコシド結合比が、０または約０．１：１〜１：５、１：１〜１：５または１：１〜１：４である、項２５４〜３３０のいずれか一項に記載の方法。
【０８８１】
３３２．調製物のグリカンポリマーのベータ−対アルファ−グリコシド結合比が、０または約０．１：１〜１：５、１：１〜１：５または１：１〜１：４である、項２５４〜３３１のいずれか一項に記載の方法。
【０８８２】
３３３．グリカンポリマーが、グルコース、ガラクトース、マンノース、フルクトース、フコース、ラムノース、キシロース、および／またはアラビノースのうちの１つ以上のグリカン単位を含む、項２５４〜３３２のいずれか一項に記載の方法。
【０８８３】
３３４．グリカンポリマーが、１，２グリコシド結合、１，３グリコシド結合、１，４グリコシド結合、１，５グリコシド結合、または１，６グリコシド結合から選択される１つ以上のグリコシド結合を含む、項２５４〜３３３のいずれか一項に記載の方法。
【０８８４】
３３５．グリカンポリマー調製物が、少なくとも２０％、３０％、４０％、５０％または少なくとも６０％（モル％）の１，４グリコシド結合を含む、項３３４に記載の方法。
【０８８５】
３３６．グリカンポリマー調製物が、少なくとも８０％、９０％、少なくとも９５％、または１００％（モル％）の１，４グリコシド結合を含む、項３３４に記載の方法。
【０８８６】
３３７．グリカンポリマー調製物が、少なくとも２０％、３０％、４０％、５０％または少なくとも６０％（モル％）の１，６グリコシド結合を含む、項３３４に記載の方法。
【０８８７】
３３８．グリカンポリマー調製物が、少なくとも８０％、９０％、少なくとも９５％、または１００％（モル％）の１，６グリコシド結合を含む、項３３４に記載の方法。
【０８８８】
３３９．グリカンポリマー調製物が、１０％以下、５％、１％以下または０％の１，２グリコシド結合を含む、項３３４に記載の方法。
【０８８９】
３４０．グリカンポリマー調製物が、１０％以下、５％、１％以下または０％の１，３グリコシド結合を含む、項３３４に記載の方法。
【０８９０】
３４１．グリカンポリマー調製物が、１０％以下、５％、１％以下または０％の１，４グリコシド結合を含む、項３３４に記載の方法。
【０８９１】
３４２．グリカンポリマー調製物が、１０％以下、５％、１％以下または０％の１，６グリコシド結合を含む、項３３４に記載の方法。
【０８９２】
３４３．グリカンポリマーがガラクトオリゴ糖（ＧＯＳ）以外である、項２５４〜３４２のいずれか一項に記載の方法。
【０８９３】
３４４．グリカンポリマーがガラクトースホモポリマー以外である、項３３３に記載の方法。
【０８９４】
３４５．グリカンポリマー調製物が、９９％、９５％、９０％、８０％、７０％、６０％、５０％未満のガラクトースホモポリマーである、項３３３に記載の方法。
【０８９５】
３４６．調製物中の第１および第２の最も存在度の高いグリカンポリマーが、ｉ）ガラクトースホモポリマーおよび／またはｉｉ）末端グルコースを有するガラクトースポリマー以外である、項３３３に記載の方法。
【０８９６】
３４７．グリカンポリマーが、ｉ）フルクトオリゴ糖（ＦＯＳ）、ｉｉ）ガラクトオリゴ糖（ＧＯＳ）、ｉｉｉ）キシロオリゴ糖（ＸＯＳ）、ｉｖ）イソマルトオリゴ糖（ＩＭＯＳ）、およびｖ）グルコオリゴ糖（ＧＬＯＳ）、またはｉ）、ｉｉ）、ｉｉｉ）、ｉｖ）およびｖ）の任意の組み合わせ（１つ、２つ、３つ、４つ、または全て）である、項２５４〜３４６のいずれか一項に記載の方法。
【０８９７】
３４８．グリカンポリマーが、ｉ）ラクトスクロース、ｉｉ）ラクツロスクロース、ｉｉｉ）２−アルファ−グルコシルラクトース、ｉｖ）ゲンチオオリゴ糖、ｖ）ペクチンオリゴ糖、およびｖｉ）マルトシルフルクトシド、またはｉ）、ｉｉ）、ｉｉｉ）、ｉｖ）、ｖ）およびｖｉ）の任意の組み合わせ（１つ、２つ、３つ、４つ、５つ、または全て）である、項２５４〜３４７のいずれか一項に記載の方法。
【０８９８】
３４９．複数のグリカンサブユニットが、第１および第２のグリカンサブユニットを含み、第１および第２のグリカンサブユニットが異なる構造を有する、項２５４〜３４８のいずれか一項に記載の方法。
【０８９９】
３５０．複数のグリカンサブユニットが、第１および第２のグリカンサブユニットを含み、第１および第２のグリカンサブユニットが同一の構造を有する、項２５４〜３４９のいずれか一項に記載の方法。
【０９００】
３５１．グリカンポリマーが、グルコース、マンノースもしくはガラクトースサブユニット、またはそれらの組み合わせ、および少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含む、項２５４〜３５０のいずれか一項に記載の方法。
【０９０１】
３５２．グリカンポリマーが、グルコース、マンノースもしくはガラクトースサブユニット、またはそれらの組み合わせ、および少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含む、項２５４〜３５１のいずれか一項に記載の方法。
【０９０２】
３５３．グリカンポリマーが、キシロース、アラビノース、フコースもしくはラムノースサブユニット、またはそれらの組み合わせ、および少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含む、項２５４〜３５２のいずれか一項に記載の方法。
【０９０３】
３５４．グリカンポリマーが、キシロース、アラビノース、フコースもしくはラムノースサブユニット、またはそれらの組み合わせ、および少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含む、項２５４〜３５３のいずれか一項に記載の方法。
【０９０４】
３５５．グリカンポリマーが、グルコースもしくはガラクトースサブユニット、またはそれらの組み合わせ、および少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含む、項２５４〜３５４のいずれか一項に記載の方法。
【０９０５】
３５６．グリカンポリマーが、グルコースもしくはガラクトースサブユニット、またはそれらの組み合わせ、および少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含む、項２５４〜３５５のいずれか一項に記載の方法。
【０９０６】
３５７．グリカンポリマーおよび／またはグリカンポリマー調製物が、以下の特徴：
ｉ．グリカンポリマーが、グルコースおよび少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含み、任意選択により、アルファ−グリコシド結合がアルファ−１，３グリコシド結合、アルファ−１，４グリコシド結合、またはそれらの組み合わせであり、さらに任意選択により、調製物の平均重合度（ＤＰ）がＤＰ２〜４、ＤＰ２〜６、ＤＰ３〜１０、またはＤＰ３〜１５である；
ｉｉ．グリカンポリマー調製物が、少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含み、任意選択により、ベータ−グリコシド結合が、ベータ−１，３グリコシド結合、ベータ−１，４グリコシド結合、またはそれらの組み合わせである；
ｉｉｉ．グリカンポリマー調製物が、ガラクトースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇｌｕ−ｇａｌ調製物）；
ｉｖ．グリカンポリマー調製物が、マンノースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇｌｕ−ｍａｎ調製物）；および
ｖ．グリカンポリマー調製物が、ガラクトースおよびマンノースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇｌｕ−ｇａｌ−ｍａｎ調製物）
のうちの１つ、２つ、３つ、またはそれを超える、例えば全てを含む、項２５４〜３０６のいずれかに記載の方法。
【０９０７】
３５８．グリカンポリマーおよび／またはグリカンポリマー調製物が、以下の特徴：
ｉ．グリカンポリマーが、グルコースおよび少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含み、任意選択により、ベータ−グリコシド結合がベータ−１，３グリコシド結合、ベータ−１，４グリコシド結合、またはそれらの組み合わせであり、さらに任意選択により、調製物の平均重合度（ＤＰ）がＤＰ２〜４、ＤＰ２〜６、ＤＰ３〜１０、またはＤＰ３〜１５である；
ｉｉ．グリカンポリマー調製物が、少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含み、任意選択により、アルファ−グリコシド結合が、アルファ−１，３グリコシド結合、アルファ−１，４グリコシド結合またはそれらの組み合わせである；
ｉｉｉ．グリカンポリマー調製物が、ガラクトースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇｌｕ−ｇａｌ調製物）；
ｉｖ．グリカンポリマー調製物が、マンノースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇｌｕ−ｍａｎ調製物）；および
ｖ．グリカンポリマー調製物が、ガラクトースおよびマンノースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇｌｕ−ｇａｌ−ｍａｎ調製物）
のうちの１つ、２つ、３つ、またはそれを超える、例えば全てを含む、項２５４〜３０６のいずれかに記載の方法。
【０９０８】
３５９．グリカンポリマーおよび／またはグリカンポリマー調製物が、以下の特徴：
ｉ．グリカンポリマーが、ガラクトースおよび少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含み、任意選択により、アルファ−グリコシド結合がアルファ−１，３グリコシド結合、アルファ−１，４グリコシド結合、またはそれらの組み合わせであり、さらに任意選択により、調製物の平均重合度（ＤＰ）がＤＰ２〜４、ＤＰ２〜６、ＤＰ３〜１０、またはＤＰ３〜１５である；
ｉｉ．グリカンポリマー調製物が、少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含み、任意選択により、ベータ−グリコシド結合が、ベータ−１，３グリコシド結合、ベータ−１，４グリコシド結合、またはそれらの組み合わせである；
ｉｉｉ．グリカンポリマー調製物が、グルコースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇａｌ−ｇｌｕ調製物）；
ｉｖ．グリカンポリマー調製物が、マンノースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇａｌ−ｍａｎ調製物）；および
ｖ．グリカンポリマー調製物が、グルコースおよびマンノースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇａｌ−ｍａｎ−ｇｌｕ調製物）
のうちの１つ、２つ、３つ、またはそれを超える、例えば全てを含む、項２５４〜３０６のいずれかに記載の方法。
【０９０９】
３６０．グリカンポリマーおよび／またはグリカンポリマー調製物が、以下の特徴：
ｉ．グリカンポリマーが、ガラクトースおよび少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含み、任意選択により、ベータ−グリコシド結合がベータ−１，３グリコシド結合、ベータ−１，４グリコシド結合、またはそれらの組み合わせであり、さらに任意選択により、調製物の平均重合度（ＤＰ）がＤＰ２〜４、ＤＰ２〜６、ＤＰ３〜１０、またはＤＰ３〜１５である；
ｉｉ．グリカンポリマー調製物が、少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含み、任意選択により、アルファ−グリコシド結合が、アルファ−１，３グリコシド結合、アルファ−１，４グリコシド結合またはそれらの組み合わせである；
ｉｉｉ．グリカンポリマー調製物が、グルコースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇａｌ−ｇｌｕ調製物）；
ｉｖ．グリカンポリマー調製物が、マンノースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇａｌ−ｍａｎ調製物）；および
ｖ．グリカンポリマー調製物が、グルコースおよびマンノースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇａｌ−ｇｌｕ−ｍａｎ調製物）
のうちの１つ、２つ、３つ、またはそれを超える、例えば全てを含む、項２５４〜３０６のいずれかに記載の方法。
【０９１０】
３６１．グリカンポリマーおよび／またはグリカンポリマー調製物が、以下の特徴：
ｉ．グリカンポリマーが、マンノースおよび少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含み、任意選択により、アルファ−グリコシド結合がアルファ−１，３グリコシド結合、アルファ−１，４グリコシド結合、またはそれらの組み合わせであり、さらに任意選択により、調製物の平均重合度（ＤＰ）がＤＰ２〜４、ＤＰ２〜６、ＤＰ３〜１０、またはＤＰ３〜１５である；
ｉｉ．グリカンポリマー調製物が、少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含み、任意選択により、ベータ−グリコシド結合が、ベータ−１，３グリコシド結合、ベータ−１，４グリコシド結合、またはそれらの組み合わせである；
ｉｉｉ．グリカンポリマー調製物が、ガラクトースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｍａｎ−ｇａｌ調製物）；
ｉｖ．グリカンポリマー調製物が、グルコースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｍａｎ−ｇｌｕ調製物）；および
ｖ．グリカンポリマー調製物が、ガラクトースおよびグルコースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｍａｎ−ｇａｌ−ｇｌｕ調製物）
のうちの１つ、２つ、３つ、またはそれを超える、例えば全てを含む、項２５４〜３０６のいずれかに記載の方法。
【０９１１】
３６２．グリカンポリマーおよび／またはグリカンポリマー調製物が、以下の特徴：
ｉ．グリカンポリマーが、マンノースおよび少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含み、任意選択により、ベータ−グリコシド結合がベータ−１，３グリコシド結合、ベータ−１，４グリコシド結合、またはそれらの組み合わせであり、さらに任意選択により、調製物の平均重合度（ＤＰ）がＤＰ２〜４、ＤＰ２〜６、ＤＰ３〜１０、またはＤＰ３〜１５である；
ｉｉ．グリカンポリマー調製物が、少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含み、任意選択により、アルファ−グリコシド結合が、アルファ−１，３グリコシド結合、アルファ−１，４グリコシド結合またはそれらの組み合わせである；
ｉｉｉ．グリカンポリマー調製物が、ガラクトースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｍａｎ−ｇａｌ調製物）；
ｉｖ．グリカンポリマー調製物が、グルコースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｍａｎ−ｇｌｕ調製物）；および
ｖ．グリカンポリマー調製物が、ガラクトースおよびグルコースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｍａｎ−ｇａｌ−ｇｌｕ調製物）
のうちの１つ、２つ、３つ、またはそれを超える、例えば全てを含む、項２５４〜３０６のいずれかに記載の方法。
【０９１２】
３６３．グリカンポリマーおよび／またはグリカンポリマー調製物が、以下の特徴：
ｉ．グリカンポリマーが、ガラクトースおよび少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含み、任意選択により、アルファ−グリコシド結合がアルファ−１，３グリコシド結合、アルファ−１，４グリコシド結合、またはそれらの組み合わせであり、さらに任意選択により、調製物の平均重合度（ＤＰ）がＤＰ２〜４、ＤＰ２〜６、ＤＰ３〜１０、またはＤＰ３〜１５である；
ｉｉ．グリカンポリマー調製物が、アルファ−１，２グリコシド結合、アルファ−１，６グリコシド結合、またはそれらの組み合わせを含むグリカンポリマーをさらに含む；
ｉｉｉ．グリカンポリマー調製物が、少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含み、任意選択により、ベータ−グリコシド結合が、ベータ−１，３グリコシド結合、ベータ−１，４グリコシド結合、ベータ−１，６グリコシド結合、またはそれらの組み合わせである；
ｉｖ．グリカンポリマー調製物が、フコースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇａｌ−ｆｕｃ調製物）；
ｖ．グリカンポリマー調製物が、マンノースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇａｌ−ｍａｎ調製物）；および
ｖｉ．グリカンポリマー調製物が、フコースおよびマンノースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇａｌ−ｆｕｃ−ｍａｎ調製物）
のうちの１つ、２つ、３つ、またはそれを超える、例えば全てを含む、項２５４〜３０６のいずれかに記載の方法。
【０９１３】
３６４．グリカンポリマーおよび／またはグリカンポリマー調製物が、以下の特徴：
ｉ．グリカンポリマーが、ガラクトースおよび少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含み、任意選択により、ベータ−グリコシド結合がベータ−１，３グリコシド結合、ベータ−１，４グリコシド結合、またはそれらの組み合わせであり、さらに任意選択により、調製物の平均重合度（ＤＰ）がＤＰ２〜４、ＤＰ２〜６、ＤＰ３〜１０、またはＤＰ３〜１５である；
ｉｉ．グリカンポリマー調製物が、ベータ−１，６グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含む；
ｉｉｉ．グリカンポリマー調製物が、少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含み、任意選択により、アルファ−グリコシド結合が、アルファ−１，２グリコシド結合、アルファ−１，３グリコシド結合、アルファ−１，４グリコシド結合、アルファ−１，６−グリコシド結合またはそれらの組み合わせである；
ｉｖ．グリカンポリマー調製物が、フコースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇａｌ−ｆｕｃ調製物）；
ｖ．グリカンポリマー調製物が、マンノースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇａｌ−ｍａｎ調製物）；および
ｖｉ．グリカンポリマー調製物が、フコースおよびマンノースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇａｌ−ｆｕｃ−ｍａｎ調製物）
のうちの１つ、２つ、３つ、またはそれを超える、例えば全てを含む、項２５４〜３０６のいずれかに記載の方法。
【０９１４】
３６５．グリカンポリマーおよび／またはグリカンポリマー調製物が、以下の特徴：
ｉ．グリカンポリマーが、フコースおよび少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含み、任意選択により、アルファ−グリコシド結合がアルファ−１，３グリコシド結合、アルファ−１，４グリコシド結合、またはそれらの組み合わせであり、さらに任意選択により、調製物の平均重合度（ＤＰ）がＤＰ２〜４、ＤＰ２〜６、ＤＰ３〜１０、またはＤＰ３〜１５である；
ｉｉ．グリカンポリマー調製物が、アルファ−１，２グリコシド結合、アルファ−１，６グリコシド結合、またはそれらの組み合わせを含むグリカンポリマーをさらに含む；
ｉｉｉ．グリカンポリマー調製物が、少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含み、任意選択により、ベータ−グリコシド結合が、ベータ−１，３グリコシド結合、ベータ−１，４グリコシド結合、ベータ−１，６グリコシド結合、またはそれらの組み合わせである；
ｉｖ．グリカンポリマー調製物が、ガラクトースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｆｕｃ−ｇａｌ調製物）；
ｖ．グリカンポリマー調製物が、マンノースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｆｕｃ−ｍａｎ調製物）；および
ｖｉ．グリカンポリマー調製物が、ガラクトースおよびマンノースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｆｕｃ−ｇａｌ−ｍａｎ調製物）
のうちの１つ、２つ、３つ、またはそれを超える、例えば全てを含む、項２５４〜３０６のいずれかに記載の方法。
【０９１５】
３６６．グリカンポリマーおよび／またはグリカンポリマー調製物が、以下の特徴：
ｉ．グリカンポリマーが、フコースおよび少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含み、任意選択により、ベータ−グリコシド結合がベータ−１，３グリコシド結合、ベータ−１，４グリコシド結合、またはそれらの組み合わせであり、さらに任意選択により、調製物の平均重合度（ＤＰ）がＤＰ２〜４、ＤＰ２〜６、ＤＰ３〜１０、またはＤＰ３〜１である；
ｉｉ．グリカンポリマー調製物が、ベータ−１，６グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含む；
ｉｉｉ．グリカンポリマー調製物が、少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含み、任意選択により、アルファ−グリコシド結合が、アルファ−１，２グリコシド結合、アルファ−１，３グリコシド結合、アルファ−１，４グリコシド結合、アルファ−１，６−グリコシド結合またはそれらの組み合わせである；
ｉｖ．グリカンポリマー調製物が、ガラクトースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｆｕｃ−ｇａｌ調製物）；
ｖ．グリカンポリマー調製物が、マンノースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｆｕｃ−ｍａｎ調製物）；および
ｖｉ．グリカンポリマー調製物が、ガラクトースおよびマンノースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｆｕｃ−ｇａｌ−ｍａｎ調製物）
のうちの１つ、２つ、３つ、またはそれを超える、例えば全てを含む、項２５４〜３０６のいずれかに記載の方法。
【０９１６】
３６７．グリカンポリマーおよび／またはグリカンポリマー調製物が、以下の特徴：
ｉ．グリカンポリマーが、マンノースおよび少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含み、任意選択により、アルファ−グリコシド結合がアルファ−１，３グリコシド結合、アルファ−１，４グリコシド結合、またはそれらの組み合わせであり、さらに任意選択により、調製物の平均重合度（ＤＰ）がＤＰ２〜４、ＤＰ２〜６、ＤＰ３〜１０、またはＤＰ３〜１５である；
ｉｉ．グリカンポリマー調製物が、アルファ−１，２グリコシド結合、アルファ−１，６グリコシド結合、またはそれらの組み合わせを含むグリカンポリマーをさらに含む；
ｉｉｉ．グリカンポリマー調製物が、少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含み、任意選択により、ベータ−グリコシド結合が、ベータ−１，３グリコシド結合、ベータ−１，４グリコシド結合、ベータ−１，６グリコシド結合、またはそれらの組み合わせである；
ｉｖ．グリカンポリマー調製物が、フコースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｍａｎ−ｆｕｃ調製物）；
ｖ．グリカンポリマー調製物が、ガラクトースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｍａｎ−ｇａｌ調製物）；および
ｖｉ．グリカンポリマー調製物が、ガラクトースおよびフコースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｍａｎ−ｇａｌ−ｆｕｃ調製物）
のうちの１つ、２つ、３つ、またはそれを超える、例えば全てを含む、項２５４〜３０６のいずれかに記載の方法。
【０９１７】
３６８．グリカンポリマーおよび／またはグリカンポリマー調製物が、以下の特徴：
ｉ．グリカンポリマーが、マンノースおよび少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含み、任意選択により、ベータ−グリコシド結合がベータ−１，３グリコシド結合、ベータ−１，４グリコシド結合、またはそれらの組み合わせであり、さらに任意選択により、調製物の平均重合度（ＤＰ）がＤＰ２〜４、ＤＰ２〜６、ＤＰ３〜１０、またはＤＰ３〜１５である；
ｉｉ．グリカンポリマー調製物が、ベータ−１，６グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含む；
ｉｉｉ．グリカンポリマー調製物が、少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含み、任意選択により、アルファ−グリコシド結合が、アルファ−１，２グリコシド結合、アルファ−１，３グリコシド結合、アルファ−１，４グリコシド結合、アルファ−１，６−グリコシド結合またはそれらの組み合わせである；
ｉｖ．グリカンポリマー調製物が、フコースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｍａｎ−ｆｕｃ調製物）；
ｖ．グリカンポリマー調製物が、ガラクトースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｍａｎ−ｇａｌ調製物）；および
ｖｉ．グリカンポリマー調製物が、ガラクトースおよびフコースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｍａｎ−ｇａｌ−ｆｕｃ調製物）
のうちの１つ、２つ、３つ、またはそれを超える、例えば全てを含む、項２５４〜３０６のいずれかに記載の方法。
【０９１８】
３６９．グリカンポリマーおよび／またはグリカンポリマー調製物が、以下の特徴：
ｉ．グリカンポリマーが、グルコース、キシロースおよびアラビノースのうちの１つ、２つ、または３つ、ならびに少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含み、任意選択により、アルファ−グリコシド結合がアルファ−１，３グリコシド結合、アルファ−１，４グリコシド結合、またはそれらの組み合わせであり、さらに任意選択により、調製物の平均重合度（ＤＰ）がＤＰ２〜４、ＤＰ２〜６、ＤＰ３〜１０、またはＤＰ３〜１５である；
ｉｉ．グリカンポリマー調製物が、アルファ−１，２グリコシド結合、アルファ−１，６グリコシド結合、またはそれらの組み合わせを含むグリカンポリマーをさらに含む；
ｉｉｉ．グリカンポリマー調製物が、少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含み、任意選択により、ベータ−グリコシド結合が、ベータ−１，３グリコシド結合、ベータ−１，４グリコシド結合、ベータ−１，６グリコシド結合、またはそれらの組み合わせである；
ｉｖ．グリカンポリマー調製物が、グルコースを含むグリカンポリマーを含む；
ｖ．グリカンポリマー調製物が、キシロースを含むグリカンポリマーを含む、および
ｖｉ．グリカンポリマー調製物が、アラビノースを含むグリカンポリマーを含む
のうちの１つ、２つ、３つ、またはそれを超える、例えば全てを含む、項２５４〜３０６のいずれかに記載の方法。
【０９１９】
３７０．グリカンポリマーおよび／またはグリカンポリマー調製物が、以下の特徴：
ｉ．グリカンポリマーが、グルコース、キシロースおよびアラビノースのうちの１つ、２つ、または３つ、ならびに少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含み、任意選択により、ベータ−グリコシド結合がベータ−１，３グリコシド結合、ベータ−１，４グリコシド結合、またはそれらの組み合わせであり、さらに任意選択により、調製物の平均重合度（ＤＰ）がＤＰ２〜４、ＤＰ２〜６、ＤＰ３〜１０、またはＤＰ３〜１５である；
ｉｉ．グリカンポリマー調製物が、ベータ−１，６グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含む；
ｉｉｉ．グリカンポリマー調製物が、少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含み、任意選択により、アルファ−グリコシド結合が、アルファ−１，２グリコシド結合、アルファ−１，３グリコシド結合、アルファ−１，４グリコシド結合、アルファ−１，６−グリコシド結合またはそれらの組み合わせである；
ｉｖ．グリカンポリマー調製物が、グルコースを含むグリカンポリマーを含む；
ｖ．グリカンポリマー調製物が、キシロースを含むグリカンポリマーを含む、および
ｖｉ．グリカンポリマー調製物が、アラビノースを含むグリカンポリマーを含む
のうちの１つ、２つ、３つ、またはそれを超える、例えば全てを含む、項２５４〜３０６のいずれかに記載の方法。
【０９２０】
３７１．グリカンポリマーおよび／またはグリカンポリマー調製物が、以下の特徴：
ｉ．グリカンポリマーが、グルコースおよび少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含み、任意選択により、アルファ−グリコシド結合がアルファ−１，３グリコシド結合であり、さらに任意選択により、調製物の平均重合度（ＤＰ）がＤＰ２〜４、ＤＰ２〜６、ＤＰ３〜１０、またはＤＰ３〜１５である；
ｉｉ．グリカンポリマー調製物が、アルファ−１，２グリコシド結合、アルファ−１，４グリコシド結合、アルファ−１，６グリコシド結合、またはそれらの組み合わせを含むグリカンポリマーをさらに含む；
ｉｉｉ．グリカンポリマー調製物が、少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含む；
ｉｖ．グリカンポリマー調製物が、ガラクトースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇｌｕ−ｇａｌ調製物）；
ｖ．グリカンポリマー調製物が、アラビノースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇｌｕ−ａｒａ調製物）；
ｖｉ．グリカンポリマー調製物が、キシロースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇｌｕ−ｘｙｌ調製物）；および
ｖｉｉ．グリカンポリマー調製物が、ガラクトース、アラビノース、またはキシロースのうちの２つまたは３つを含むグリカンポリマーをさらに含む
のうちの１つ、２つ、３つ、またはそれを超える、例えば全てを含む、項２５４〜３０６のいずれかに記載の方法。
【０９２１】
３７２．グリカンポリマーおよび／またはグリカンポリマー調製物が、以下の特徴：
ｉ．グリカンポリマーが、ガラクトースおよび少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含み、任意選択により、アルファ−グリコシド結合がアルファ−１，３グリコシド結合であり、さらに任意選択により、調製物の平均重合度（ＤＰ）がＤＰ２〜４、ＤＰ２〜６、ＤＰ３〜１０、またはＤＰ３〜１５である；
ｉｉ．グリカンポリマー調製物が、アルファ−１，２グリコシド結合、アルファ−１，４グリコシド結合、アルファ−１，６グリコシド結合、またはそれらの組み合わせを含むグリカンポリマーをさらに含む；
ｉｉｉ．グリカンポリマー調製物が、少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含む；
ｉｖ．グリカンポリマー調製物が、グルコースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇａｌ−ｇｌｕ調製物）；
ｖ．グリカンポリマー調製物が、アラビノースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇａｌ−ａｒａ調製物）；
ｖｉ．グリカンポリマー調製物が、キシロースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇａｌ−ｘｙｌ調製物）；および
ｖｉｉ．グリカンポリマー調製物が、グルコース、アラビノース、またはキシロースのうちの２つまたは３つを含むグリカンポリマーをさらに含む
のうちの１つ、２つ、３つ、またはそれを超える、例えば全てを含む、項２５４〜３０６のいずれかに記載の方法。
【０９２２】
３７３．グリカンポリマーおよび／またはグリカンポリマー調製物が、以下の特徴：
ｉ．グリカンポリマーが、キシロースおよびアラビノースのうちの１つまたは２つ、ならびに少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含み、任意選択により、アルファ−グリコシド結合がアルファ−１，３グリコシド結合であり、さらに任意選択により、調製物の平均重合度（ＤＰ）がＤＰ２〜４、ＤＰ２〜６、ＤＰ３〜１０、またはＤＰ３〜１５である；
ｉｉ．グリカンポリマー調製物が、アルファ−１，２グリコシド結合、アルファ−１，４グリコシド結合、アルファ−１，６グリコシド結合、またはそれらの組み合わせを含むグリカンポリマーをさらに含む；
ｉｉｉ．グリカンポリマー調製物が、少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含む；
ｉｖ．グリカンポリマー調製物が、キシロースを含むグリカンポリマーを含む；および
ｖ．グリカンポリマー調製物が、アラビノースを含むグリカンポリマーを含む
のうちの１つ、２つ、３つ、またはそれを超える、例えば全てを含む、項２５４〜３０６のいずれかに記載の方法。
【０９２３】
３７４．グリカンポリマーおよび／またはグリカンポリマー調製物が、以下の特徴：
ｉ．グリカンポリマーが、アラビノースおよび少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含み、任意選択により、アルファ−グリコシド結合がアルファ−１，３グリコシド結合であり、さらに任意選択により、調製物の平均重合度（ＤＰ）がＤＰ２〜４、ＤＰ２〜６、ＤＰ３〜１０、またはＤＰ３〜１５である；
ｉｉ．グリカンポリマー調製物が、少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含む；
ｉｉｉ．グリカンポリマー調製物が、ガラクトースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ａｒａ−ｇａｌ調製物）；
ｉｖ．グリカンポリマー調製物が、キシロースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ａｒａ−ｘｙｌ調製物）；および
ｖ．グリカンポリマー調製物が、ガラクトースおよびキシロースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ａｒａ−ｇａｌ−ｘｙｌ調製物）
のうちの１つ、２つ、３つ、またはそれを超える、例えば全てを含む、項２５４〜３０６のいずれかに記載の方法。
【０９２４】
３７５．グリカンポリマーおよび／またはグリカンポリマー調製物が、以下の特徴：
ｉ．グリカンポリマーが、ガラクトースおよび少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含み、任意選択により、アルファ−グリコシド結合がアルファ−１，３グリコシド結合であり、さらに任意選択により、調製物の平均重合度（ＤＰ）がＤＰ２〜４、ＤＰ２〜６、ＤＰ３〜１０、またはＤＰ３〜１５である；
ｉｉ．グリカンポリマー調製物が、少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含む；
ｉｉｉ．グリカンポリマー調製物が、アラビノースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇａｌ−ａｒａ調製物）；
ｉｖ．グリカンポリマー調製物が、キシロースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇａｌ−ｘｙｌ調製物）；および
ｖ．グリカンポリマー調製物が、アラビノースおよびキシロースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇａｌ−ａｒａ−ｘｙｌ調製物）
のうちの１つ、２つ、３つ、またはそれを超える、例えば全てを含む、項２５４〜３０６のいずれかに記載の方法。
【０９２５】
３７６．グリカンポリマーおよび／またはグリカンポリマー調製物が、以下の特徴：
ｉ．グリカンポリマーが、キシロースおよび少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含み、任意選択により、アルファ−グリコシド結合がアルファ−１，３グリコシド結合であり、さらに任意選択により、調製物の平均重合度（ＤＰ）がＤＰ２〜４、ＤＰ２〜６、ＤＰ３〜１０、またはＤＰ３〜１５である；
ｉｉ．グリカンポリマー調製物が、少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含む；
ｉｉｉ．グリカンポリマー調製物が、ガラクトースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｘｙｌ−ｇａｌ調製物）；
ｉｖ．グリカンポリマー調製物が、アラビノースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｘｙｌ−ａｒａ調製物）；および
ｖ．グリカンポリマー調製物が、ガラクトースおよびアラビノースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｘｙｌ−ａｒａ−ｇａｌ調製物）
のうちの１つ、２つ、３つ、またはそれを超える、例えば全てを含む、項２５４〜３０６のいずれかに記載の方法。
【０９２６】
３７７．グリカンポリマーおよび／またはグリカンポリマー調製物が、以下の特徴：
ｉ．グリカンポリマーが、グルコースおよび少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含み、任意選択により、アルファ−グリコシド結合がアルファ−１，３グリコシド結合であり、さらに任意選択により、調製物の平均重合度（ＤＰ）がＤＰ２〜４、ＤＰ２〜６、ＤＰ３〜１０、またはＤＰ３〜１５である；
ｉｉ．グリカンポリマー調製物が、少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含む；および
ｉｉｉ．グリカンポリマー調製物が、アラビノース、ガラクトースまたはキシロースのうちの１つ、２つ、または３つを含むグリカンポリマーをさらに含む
のうちの１つ、２つ、またはそれを超える、例えば全てを含む、項２５４〜３０６のいずれかに記載の方法。
【０９２７】
３７８．グリカンポリマーおよび／またはグリカンポリマー調製物が、以下の特徴：
ｉ．グリカンポリマーが、グルコースおよび少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含み、任意選択により、調製物の平均重合度（ＤＰ）がＤＰ２〜４、ＤＰ２〜６、ＤＰ３〜１０、またはＤＰ３〜１５である；
ｉｉ．グリカンポリマー調製物が、アルファ−１，２グリコシド結合、アルファ−１，３グリコシド結合、アルファ−１，４グリコシド結合、アルファ−１，６グリコシド結合、またはそれらの組み合わせを含むグリカンポリマーをさらに含む；
ｉｉｉ．グリカンポリマー調製物が、少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含む；および
ｉｖ．グリカンポリマー調製物が、ガラクトース、マンノース、アラビノース、またはシアル酸のうちの１つ、２つ、３つ、または４つを含むグリカンポリマーをさらに含む
のうちの１つ、２つ、３つ、またはそれを超える、例えば全てを含む、項２５４〜３０６のいずれかに記載の方法。
【０９２８】
３７９．グリカンポリマーおよび／またはグリカンポリマー調製物が、以下の特徴：
ｉ．グリカンポリマーが、グルコースおよび少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含み、任意選択により、アルファ−グリコシド結合がアルファ−１，３グリコシド結合であり、さらに任意選択により、調製物の平均重合度（ＤＰ）がＤＰ２〜４、ＤＰ２〜６、ＤＰ３〜１０、またはＤＰ３〜１５である；
ｉｉ．グリカンポリマー調製物が、少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含む；
ｉｉｉ．グリカンポリマー調製物が、キシロースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇｌｕ−ｘｙｌ調製物）；および
ｉｖ．グリカンポリマー調製物が、マンノース、アラビノース、またはガラクトースのうちの１つ、２つ、または３つを含むグリカンポリマーをさらに含む
のうちの１つ、２つ、３つ、またはそれを超える、例えば全てを含む、項２５４〜３０６のいずれかに記載の方法。
【０９２９】
３８０．グリカンポリマーおよび／またはグリカンポリマー調製物が、以下の特徴：
ｉ．グリカンポリマーが、グルコースおよび少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含み、任意選択により、調製物の平均重合度（ＤＰ）がＤＰ２〜４、ＤＰ２〜６、ＤＰ３〜１０、またはＤＰ３〜１５である；
ｉｉ．グリカンポリマー調製物が、少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含み、任意選択により、アルファ−グリコシド結合が、アルファ−１，３グリコシド結合である；
ｉｉｉ．グリカンポリマー調製物が、少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含む；
ｉｖ．グリカンポリマー調製物が、キシロースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇｌｕ−ｘｙｌ調製物）；および
ｖ．グリカンポリマー調製物が、マンノース、アラビノース、またはガラクトースのうちの１つ、２つ、または３つを含むグリカンポリマーをさらに含む
のうちの１つ、２つ、３つ、またはそれを超える、例えば全てを含む、項２５４〜３０６のいずれかに記載の方法。
【０９３０】
３８１．グリカンポリマーおよび／またはグリカンポリマー調製物が、以下の特徴：
ｉ．グリカンポリマーが、キシロースおよび少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含み、任意選択により、アルファ−グリコシド結合がアルファ−１，３グリコシド結合であり、さらに任意選択により、調製物の平均重合度（ＤＰ）がＤＰ２〜４、ＤＰ２〜６、ＤＰ３〜１０、またはＤＰ３〜１５である；
ｉｉ．グリカンポリマー調製物が、少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含む；
ｉｉｉ．グリカンポリマー調製物が、グルコースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｘｙｌ−ｇｌｕ調製物）；および
ｉｖ．グリカンポリマー調製物が、マンノース、アラビノース、またはガラクトースのうちの１つ、２つ、または３つを含むグリカンポリマーをさらに含む
のうちの１つ、２つ、３つ、またはそれを超える、例えば全てを含む、項２５４〜３０６のいずれかに記載の方法。
【０９３１】
３８２．グリカンポリマーおよび／またはグリカンポリマー調製物が、以下の特徴：
ｉ．グリカンポリマーが、キシロースおよび少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含み、さらに任意選択により、調製物の平均重合度（ＤＰ）がＤＰ２〜４、ＤＰ２〜６、ＤＰ３〜１０、またはＤＰ３〜１５である；
ｉｉ．グリカンポリマー調製物が、少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含み、任意選択により、アルファ−グリコシド結合が、アルファ−１，３グリコシド結合である；
ｉｉｉ．グリカンポリマー調製物が、少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含む；
ｉｖ．グリカンポリマー調製物が、グルコースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｘｙｌ−ｇｌｕ調製物）；および
ｖ．グリカンポリマー調製物が、マンノース、アラビノース、またはガラクトースのうちの１つ、２つ、または３つを含むグリカンポリマーをさらに含む
のうちの１つ、２つ、３つ、またはそれを超える、例えば全てを含む、項２５４〜３０６のいずれかに記載の方法。
【０９３２】
３８３．グリカンポリマーおよび／またはグリカンポリマー調製物が、以下の特徴：
ｉ．グリカンポリマーが、グルコースおよび少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含み、任意選択により、アルファ−グリコシド結合がアルファ−１，３グリコシド結合であり、さらに任意選択により、調製物の平均重合度（ＤＰ）がＤＰ２〜４、ＤＰ２〜６、ＤＰ３〜１０、またはＤＰ３〜１５である；
ｉｉ．グリカンポリマー調製物が、アルファ−１，２グリコシド結合、アルファ−１，４グリコシド結合、アルファ−１，６グリコシド結合、またはそれらの組み合わせを含むグリカンポリマーをさらに含む；
ｉｉｉ．グリカンポリマー調製物が、少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含む；
ｉｖ．グリカンポリマー調製物が、キシロースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇｌｕ−ｘｙｌ調製物）；
ｖ．グリカンポリマー調製物が、アラビノースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇｌｕ−ａｒａ調製物）；
ｖｉ．グリカンポリマー調製物が、ガラクトースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇｌｕ−ｇａｌ調製物）；および
ｖｉｉ．グリカンポリマー調製物が、キシロース、アラビノース、またはガラクトースのうちの１つ、２つ、または３つを含むグリカンポリマーをさらに含む
のうちの１つ、２つ、３つ、またはそれを超える、例えば全てを含む、項２５４〜３０６のいずれかに記載の方法。
【０９３３】
３８４．グリカンポリマーおよび／またはグリカンポリマー調製物が、以下の特徴：
ｉ．グリカンポリマーが、キシロースおよび少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含み、任意選択により、アルファ−グリコシド結合がアルファ−１，３グリコシド結合であり、さらに任意選択により、調製物の平均重合度（ＤＰ）がＤＰ２〜４、ＤＰ２〜６、ＤＰ３〜１０、またはＤＰ３〜１５である；
ｉｉ．グリカンポリマー調製物が、アルファ−１，２グリコシド結合、アルファ−１，４グリコシド結合、アルファ−１，６グリコシド結合、またはそれらの組み合わせを含むグリカンポリマーをさらに含む；
ｉｉｉ．グリカンポリマー調製物が、少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含む；
ｉｖ．グリカンポリマー調製物が、グルコースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｘｙｌ−ｇｌｕ調製物）；
ｖ．グリカンポリマー調製物が、アラビノースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｘｙｌ−ａｒａ調製物）；
ｖｉ．グリカンポリマー調製物が、ガラクトースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｘｙｌ−ｇａｌ調製物）；および
ｖｉｉ．グリカンポリマー調製物が、グルコース、アラビノース、またはガラクトースのうちの１つ、２つ、または３つを含むグリカンポリマーをさらに含む
のうちの１つ、２つ、３つ、またはそれを超える、例えば全てを含む、項２５４〜３０６のいずれかに記載の方法。
【０９３４】
３８５．グリカンポリマーおよび／またはグリカンポリマー調製物が、以下の特徴：
ｉ．グリカンポリマーが、アラビノースおよび少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含み、任意選択により、アルファ−グリコシド結合がアルファ−１，３グリコシド結合であり、さらに任意選択により、調製物の平均重合度（ＤＰ）がＤＰ２〜４、ＤＰ２〜６、ＤＰ３〜１０、またはＤＰ３〜１５である；
ｉｉ．グリカンポリマー調製物が、アルファ−１，２グリコシド結合、アルファ−１，４グリコシド結合、アルファ−１，６グリコシド結合、またはそれらの組み合わせを含むグリカンポリマーをさらに含む；
ｉｉｉ．グリカンポリマー調製物が、少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含む；
ｉｖ．グリカンポリマー調製物が、キシロースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ａｒａ−ｘｙｌ調製物）；
ｖ．グリカンポリマー調製物が、グルコースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ａｒａ−ｇｌｕ調製物）；
ｖｉ．グリカンポリマー調製物が、ガラクトースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ａｒａ−ｇａｌ調製物）；および
ｖｉｉ．グリカンポリマー調製物が、キシロース、グルコース、またはガラクトースのうちの１つ、２つ、または３つを含むグリカンポリマーをさらに含む
のうちの１つ、２つ、３つ、またはそれを超える、例えば全てを含む、項２５４〜３０６のいずれかに記載の方法。
【０９３５】
３８６．グリカンポリマーおよび／またはグリカンポリマー調製物が、以下の特徴：
ｉ．グリカンポリマーが、ガラクトースおよび少なくとも１つのアルファ−グリコシド結合を含み、任意選択により、アルファ−グリコシド結合がアルファ−１，３グリコシド結合であり、さらに任意選択により、調製物の平均重合度（ＤＰ）がＤＰ２〜４、ＤＰ２〜６、ＤＰ３〜１０、またはＤＰ３〜１５である；
ｉｉ．グリカンポリマー調製物が、アルファ−１，２グリコシド結合、アルファ−１，４グリコシド結合、アルファ−１，６グリコシド結合、またはそれらの組み合わせを含むグリカンポリマーをさらに含む；
ｉｉｉ．グリカンポリマー調製物が、少なくとも１つのベータ−グリコシド結合を含むグリカンポリマーをさらに含む；
ｉｖ．グリカンポリマー調製物が、キシロースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇａｌ−ｘｙｌ調製物）；
ｖ．グリカンポリマー調製物が、アラビノースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇａｌ−ａｒａ調製物）；
ｖｉ．グリカンポリマー調製物が、グルコースを含むグリカンポリマーをさらに含む（例えば、ｇａｌ−ｇｌｕ調製物）；および
ｖｉｉ．グリカンポリマー調製物が、キシロース、アラビノース、またはグルコースのうちの１つ、２つ、または３つを含むグリカンポリマーをさらに含む
のうちの１つ、２つ、３つ、またはそれを超える、例えば全てを含む、項２５４〜３０６のいずれかに記載の方法。
【０９３６】
３８７．グリカンポリマーが、ＧＴ５、ＧＨ９４、ＧＨ１３サブファミリー９、ＧＨ１３サブファミリー３９、ＧＨ１３サブファミリー３６、ＧＨ１１３またはＧＨ１１２  ＣＡＺｙファミリーの１つ以上、例えば、２つ、３つ、４つ、またはそれを超える、から選択されるヒト腸内微生物グリコシダーゼ酵素の基質である、項３５１、３５２、または３５７〜３６２のいずれかに記載の方法。
【０９３７】
３８８．グリカンポリマーが、ＧＴ２、ＧＴ４、ＧＴ５、ＧＴ３５、ＧＴ５１、ＧＨ１、ＧＨ２、ＧＨ３、ＧＨ４、ＧＨ１３、ＧＨ１３サブファミリー９、ＧＨ１３サブファミリー３１、ＧＨ１８、ＧＨ２３、ＧＨ２５、ＧＨ２８、ＧＨ３１、ＧＨ３２、ＧＨ３６、ＧＨ５１、ＧＨ７３、ＧＨ７７またはＧＨ９４  ＣＡＺｙファミリーの１つ以上、例えば、２つ、３つ、４つ、またはそれを超える、から選択されるヒト腸内微生物グリコシダーゼ酵素の基質である、項３５１、３５２、または３５７〜３６２のいずれかに記載の方法。
【０９３８】
３８９．グリカンポリマーが、ＧＴ１１、ＧＴ１０、ＧＨ９２、ＧＨ５１、ＧＨ３５、ＧＨ２９、ＧＨ２８、ＧＨ２０、ＧＨ１３０、ＧＨ１３サブファミリー８、またはＧＨ１３サブファミリー１４  ＣＡＺｙファミリーの１つ以上、例えば、２つ、３つ、４つ、またはそれを超える、から選択されるヒト腸内微生物グリコシダーゼ酵素の基質である、項３５３、３５４、または３６３〜３７０のいずれか一項に記載の方法。
【０９３９】
３９０．グリカンポリマーが、ＧＴ２、ＧＴ４、ＧＨ２、ＧＨ２３、ＧＨ３、ＧＴ８、ＧＴ５１、ＧＴ９、ＧＨ１、ＧＨ９２、ＧＨ７３、ＧＨ３１、ＧＨ２０、ＧＨ２８、ＧＴ２５、ＧＴ２８、ＧＴ３５、ＧＨ１８、ＧＴ０、ＧＨ１３、ＧＨ３６、ＧＨ９７、ＧＨ１０５、ＧＨ２５、ＧＨ４、ＧＨ３２、ＧＨ７８、ＧＨ２９、ＧＨ０、ＧＨ５１、ＧＴ１０、またはＧＨ７７  ＣＡＺｙファミリーの１つ以上、例えば、２つ、３つ、４つ、またはそれを超える、から選択されるヒト腸内微生物グリコシダーゼ酵素の基質である、項３５３、３５４、または３６３〜３７０のいずれか一項に記載の方法。
【０９４０】
３９１．グリカンポリマーが、ＧＴ３、ＧＨ９７、ＧＨ４３サブファミリー２４、ＧＨ２７、ＧＨ１３３、ＧＨ１３サブファミリー８、またはＧＨ１３  ＣＡＺｙファミリーの１つ以上、例えば、２つ、３つ、４つ、またはそれを超える、から選択されるヒト腸内微生物グリコシダーゼ酵素の基質である、項３５５、３５６、または３７１〜３７３のいずれかに記載の方法。
【０９４１】
３９２．グリカンポリマーが、ＧＴ２、ＧＴ４、ＧＨ２、ＧＨ２３、ＧＨ３、ＧＴ８、ＧＴ５１、ＧＴ９、ＧＨ１、ＧＨ９２、ＧＨ７３、ＧＨ３１、ＧＨ２０、ＧＨ２８、ＧＴ２５、ＧＴ２８、ＧＴ３５、ＧＨ１８、ＧＴ０、ＧＨ１３、ＧＨ３６、ＧＨ９７、ＧＨ１０５、ＧＨ２５、ＧＨ４、ＧＨ３２、ＧＨ７８、ＧＨ２９、ＧＨ０、ＧＨ５１、ＧＴ１０、ＧＨ７７、ＧＴ２、ＧＴ４、ＧＨ２、ＧＨ２３、ＧＨ３、ＧＴ５１、ＧＨ１、ＧＴ８、ＧＨ９２、ＧＴ９、ＧＨ７３、ＧＨ３１、ＧＨ２０、Ｇｈ２８、ＧＴ３５、ＧＴ２８、ＧＨ１８、ＧＨ１３、ＧＨ９７、ＧＨ２５、ＧＨ３６、ＧＨ４、ＧＨ１０５、ＧＨ３２、ＧＨ７８、ＧＨ２９、ＧＨ０、ＧＴ２５、ＧＨ５１、ＧＨ７７、ＧＨ８８、またはＧＨ２４  ＣＡＺｙファミリーの１つ以上、例えば、２つ、３つ、４つ、またはそれを超える、から選択されるヒト腸内微生物グリコシダーゼ酵素の基質である、項３５５、３５６、または３７１〜３７３のいずれかに記載の方法。
【０９４２】
３９３．グリカンポリマーが、ＧＨ１３サブファミリー３、ＧＨ１３サブファミリー３０、ＧＨ３０サブファミリー２、ＧＨ３０サブファミリー５、ＧＨ４３サブファミリー２２、ＧＨ４３サブファミリー８、またはＧＨ８４  ＣＡＺｙファミリーの１つ以上、例えば、２つ、３つ、４つ、またはそれを超える、から選択されるヒト腸内微生物グリコシダーゼ酵素の基質である、項３４９、３５０、または３７４〜３７７のいずれかに記載の方法。
【０９４３】
３９４．グリカンポリマーが、ＧＨ３、ＧＨ１０６、ＧＨ１０５、ＧＨ２、ＧＨ２０、ＧＨ２８、ＧＨ７６、ＧＨ９７、またはＧＨ９２  ＣＡＺｙファミリーの１つ以上、例えば、２つ、３つ、４つ、またはそれを超える、から選択されるグリコシダーゼ酵素の基質である、項３４９、３５０、または３７４〜３７７のいずれかに記載の方法。
【０９４４】
３９５．グリカンポリマーが、ＧＨ１３サブファミリー１９、ＧＨ１３サブファミリー２１、ＧＨ２３、ＧＨ３３、ＧＨ３７またはＧＨ１０４  ＣＡＺｙファミリーの１つ以上、例えば、２つ、３つ、４つ、またはそれを超える、から選択されるヒト腸内微生物グリコシダーゼ酵素の基質である、項３４９、３５０、または３７８のいずれかに記載の方法。
【０９４５】
３９６．グリカンポリマーが、ＧＨ２３、ＧＨ２４、またはＧＨ３３  ＣＡＺｙファミリーの１つ以上、例えば、２つ、３つ、４つ、またはそれを超える、から選択されるヒト腸内微生物グリコシダーゼ酵素の基質である、項３４９、３５０、または３７８のいずれかに記載の方法。
【０９４６】
３９７．グリカンポリマーが、ＧＨ１３サブファミリー２０、ＧＨ１３サブファミリー３１、ＧＨ１３サブファミリー３９、ＧＨ３９、ＧＨ４３サブファミリー１１、ＧＨ５サブファミリー４４、またはＧＨ９４  ＣＡＺｙファミリーの１つ以上、例えば、２つ、３つ、４つ、またはそれを超える、から選択されるヒト腸内微生物グリコシダーゼ酵素の基質である、項３４９、３５０、または３７９〜３８２のいずれかに記載の方法。
【０９４７】
３９８．グリカンポリマーが、ＧＨ２、ＧＨ３１、ＧＨ２３、ＧＨ１３、またはＧＨ２４  ＣＡＺｙファミリーの１つ以上、例えば、２つ、３つ、４つ、またはそれを超える、から選択されるヒト腸内微生物グリコシダーゼ酵素の基質である、項３４９、３５０、または３７９〜３８２のいずれかに記載の方法。
【０９４８】
３９９．グリカンポリマーが、ＧＨ１３サブファミリー３、ＧＨ１３サブファミリー３０、ＧＨ１２１、ＧＨ１５、ＧＨ４３サブファミリー２７、ＧＨ４３サブファミリー３４、またはＧＨ４３サブファミリー８  ＣＡＺｙファミリーの１つ以上、例えば、２つ、３つ、４つ、またはそれを超える、から選択されるヒト腸内微生物グリコシダーゼ酵素の基質である、項３４９、３５０、または３８３〜３８６のいずれかに記載の方法。
【０９４９】
４００．グリカンポリマーが、ＧＨ９２、ＧＨ９７、ＧＨ７６、ＧＨ２８、ＧＨ２０、ＧＨ１０５、ＧＨ２、ＧＨ５０、ＧＨ３、またはＧＨ１０６  ＣＡＺｙファミリーの１つ以上、例えば、２つ、３つ、４つ、またはそれを超える、から選択されるヒト腸内微生物グリコシダーゼ酵素の基質である、項３４９、３５０、または３８３〜３８６に記載の方法。
【０９５０】
４０１．調製物のグリカンポリマーが、ＧＴ５、ＧＨ９４、ＧＨ１３サブファミリー９、ＧＨ１３サブファミリー３９、ＧＨ１３サブファミリー３６、ＧＨ１１３またはＧＨ１１２  ＣＡＺｙファミリーのグリコシダーゼ酵素を含むヒト腸内微生物の基質である、グリカンポリマー調製物を作製する結果となる条件下で、
複数のグルコース、マンノース、および／またはガラクトースを含有するグリカンサブユニット（例えば、モノマーまたはダイマー）を提供する工程；
複数のグリカンサブユニットを、ＧＴ５、ＧＨ９４、ＧＨ１３サブファミリー９、ＧＨ１３サブファミリー３９、ＧＨ１３サブファミリー３６、ＧＨ１１３またはＧＨ１１２  ＣＡＺｙファミリーのうちの１つから選択されるグリコシダーゼ酵素と接触させる工程；
を含む、グリカンポリマー調製物の作製方法。
【０９５１】
４０２．調製物のグリカンポリマーが、ＧＴ２、ＧＴ４、ＧＴ５、ＧＴ３５、ＧＴ５１、ＧＨ１、ＧＨ２、ＧＨ３、ＧＨ４、ＧＨ１３．０、ＧＨ１３．９、ＧＨ１３．３１、ＧＨ１８、ＧＨ２３、ＧＨ２５、ＧＨ２８、ＧＨ３１、ＧＨ３２、ＧＨ３６、ＧＨ５１、ＧＨ７３、ＧＨ７７、ＧＨ９４  ＣＡＺｙファミリーのグリコシダーゼ酵素を含むヒト腸内微生物の基質である、グリカンポリマー調製物を作製する結果となる条件下で、
複数のグルコース、マンノース、および／またはガラクトースを含有するグリカンサブユニット（例えば、モノマーまたはダイマー）を提供する工程；
複数のグリカンサブユニットを、ＧＴ２、ＧＴ４、ＧＴ５、ＧＴ３５、ＧＴ５１、ＧＨ１、ＧＨ２、ＧＨ３、ＧＨ４、ＧＨ１３．０、ＧＨ１３．９、ＧＨ１３．３１、ＧＨ１８、ＧＨ２３、ＧＨ２５、ＧＨ２８、ＧＨ３１、ＧＨ３２、ＧＨ３６、ＧＨ５１、ＧＨ７３、ＧＨ７７またはＧＨ９４  ＣＡＺｙファミリーのうちの１つから選択されるグリコシダーゼ酵素と接触させる工程；
を含む、グリカンポリマー調製物の作製方法。
【０９５２】
４０３．調製物のグリカンポリマーが、ＧＨ１３サブファミリー３、ＧＨ１３サブファミリー３０、ＧＨ３０サブファミリー２、ＧＨ３０サブファミリー５、ＧＨ４３サブファミリー２２、ＧＨ４３サブファミリー８、またはＧＨ８４  ＣＡＺｙファミリーのグリコシダーゼ酵素を含むヒト腸内微生物の基質である、グリカンポリマー調製物を作製する結果となる条件下で、
複数のキシロース、アラビノース、ガラクトースおよび／またはグルコースを含有するグリカンサブユニット（例えば、モノマーまたはダイマー）を提供する工程；
複数のグリカンサブユニットを、ＧＨ１３サブファミリー３、ＧＨ１３サブファミリー３０、ＧＨ３０サブファミリー２、ＧＨ３０サブファミリー５、ＧＨ４３サブファミリー２２、ＧＨ４３サブファミリー８、またはＧＨ８４  ＣＡＺｙファミリーのうちの１つから選択されるグリコシダーゼ酵素と接触させる工程、
を含む、グリカンポリマー調製物の作製方法。
【０９５３】
４０４．調製物のグリカンポリマーが、ＧＨ３、ＧＨ１０６、ＧＨ１０５、ＧＨ２、ＧＨ２０、ＧＨ２８、ＧＨ７６、ＧＨ９７、またはＧＨ９２  ＣＡＺｙファミリーのグリコシダーゼ酵素を含むヒト腸内微生物の基質である、グリカンポリマー調製物を作製する結果となる条件下で、
複数のキシロース、アラビノース、ガラクトースおよび／またはグルコースを含有するグリカンサブユニット（例えば、モノマーまたはダイマー）を提供する工程；
複数のグリカンサブユニットを、ＧＨ３、ＧＨ１０６、ＧＨ１０５、ＧＨ２、ＧＨ２０、ＧＨ２８、ＧＨ７６、ＧＨ９７、またはＧＨ９２  ＣＡＺｙファミリーのうちの１つから選択されるグリコシダーゼ酵素と接触させる工程；
を含む、グリカンポリマー調製物の作製方法。
【０９５４】
４０５．調製物のグリカンポリマーが、ＧＨ１３サブファミリー１９、ＧＨ１３サブファミリー２１、ＧＨ２３、ＧＨ３３、ＧＨ３７もしくはＧＨ１０４  ＣＡＺｙファミリーのグリコシダーゼ酵素を含むヒト腸内微生物の基質である、グリカンポリマー調製物を作製する結果となる条件下で、
複数のグルコースおよび／またはシアル酸を含有するグリカンサブユニット（例えば、モノマーまたはダイマー）を提供する工程；
複数のグリカンサブユニットを、ＧＨ１３サブファミリー１９、ＧＨ１３サブファミリー２１、ＧＨ２３、ＧＨ３３、ＧＨ３７またはＧＨ１０４  ＣＡＺｙファミリーのうちの１つから選択されるグリコシダーゼ酵素と接触させる工程、
を含む、グリカンポリマー調製物の作製方法。
【０９５５】
４０６．調製物のグリカンポリマーが、ＧＨ２３、ＧＨ２４、またはＧＨ３３  ＣＡＺｙファミリーのグリコシダーゼ酵素を含むヒト腸内微生物の基質である、グリカンポリマー調製物を作製する結果となる条件下で、
複数のグルコースおよび／またはシアル酸を含有するグリカンサブユニット（例えば、モノマーまたはダイマー）を提供する工程；
複数のグリカンサブユニットを、ＧＨ２３、ＧＨ２４、またはＧＨ３３  ＣＡＺｙファミリーのうちの１つから選択されるグリコシダーゼ酵素と接触させる工程；
を含む、グリカンポリマー調製物の作製方法。
【０９５６】
４０７．調製物のグリカンポリマーが、ＧＨ１３サブファミリー２０、ＧＨ１３サブファミリー３１、ＧＨ１３サブファミリー３９、ＧＨ３９、ＧＨ４３サブファミリー１１、ＧＨ５サブファミリー４４、またはＧＨ９４  ＣＡＺｙファミリーのグリコシダーゼ酵素を含むヒト腸内微生物の基質である、グリカンポリマー調製物を作製する結果となる条件下で、
複数のグルコース、キシロース、マンノース、アラビノース、および／またはガラクトースを含有するグリカンサブユニット（例えば、モノマーまたはダイマー）を提供する工程；
複数のグリカンサブユニットを、ＧＨ１３サブファミリー２０、ＧＨ１３サブファミリー３１、ＧＨ１３サブファミリー３９、ＧＨ３９、ＧＨ４３サブファミリー１１、ＧＨ５サブファミリー４４、またはＧＨ９４  ＣＡＺｙファミリーのうちの１つから選択されるグリコシダーゼ酵素と接触させる工程；
を含む、グリカンポリマー調製物の作製方法。
【０９５７】
４０８．調製物のグリカンポリマーが、ＧＨ２、ＧＨ３１、ＧＨ２３、ＧＨ１３、またはＧＨ２４  ＣＡＺｙファミリーのグリコシダーゼ酵素を含むヒト腸内微生物の基質である、グリカンポリマー調製物を作製する結果となる条件下で、
複数のグルコース、キシロース、マンノース、アラビノース、および／またはガラクトースを含有するグリカンサブユニット（例えば、モノマーまたはダイマー）を提供する工程；
複数のグリカンサブユニットを、ＧＨ２、ＧＨ３１、ＧＨ２３、ＧＨ１３、またはＧＨ２４  ＣＡＺｙファミリーのうちの１つから選択されるグリコシダーゼ酵素と接触させる工程、
を含む、グリカンポリマー調製物の作製方法。
【０９５８】
４０９．調製物のグリカンポリマーが、ＧＨ１３サブファミリー３、ＧＨ１３サブファミリー３０、ＧＨ１２１、ＧＨ１５、ＧＨ４３サブファミリー２７、ＧＨ４３サブファミリー３４、またはＧＨ４３サブファミリー８  ＣＡＺｙファミリーのグリコシダーゼ酵素を含むヒト腸内微生物の基質である、グリカンポリマー調製物を作製する結果となる条件下で、
複数のグルコース、キシロース、アラビノース、および／またはガラクトースを含有するグリカンサブユニット（例えば、モノマーまたはダイマー）を提供する工程；
複数のグリカンサブユニットを、ＧＨ１３サブファミリー３、ＧＨ１３サブファミリー３０、ＧＨ１２１、ＧＨ１５、ＧＨ４３サブファミリー２７、ＧＨ４３サブファミリー３４、またはＧＨ４３サブファミリー８  ＣＡＺｙファミリーのうちの１つから選択されるグリコシダーゼ酵素と接触させる工程、
を含む、グリカンポリマー調製物の作製方法。
【０９５９】
４１０．調製物のグリカンポリマーが、ＧＨ９２、ＧＨ９７、ＧＨ７６、ＧＨ２８、ＧＨ２０、ＧＨ１０５、ＧＨ２、ＧＨ５０、ＧＨ３、またはＧＨ１０６  ＣＡＺｙファミリーのグリコシダーゼ酵素を含むヒト腸内微生物の基質である、グリカンポリマー調製物を作製する結果となる条件下で、
複数のグルコース、キシロース、アラビノース、および／またはガラクトースを含有するグリカンサブユニット（例えば、モノマーまたはダイマー）を提供する工程；
複数のグリカンサブユニットを、ＧＨ９２、ＧＨ９７、ＧＨ７６、ＧＨ２８、ＧＨ２０、ＧＨ１０５、ＧＨ２、ＧＨ５０、ＧＨ３、またはＧＨ１０６  ＣＡＺｙファミリーのうちの１つから選択されるグリコシダーゼ酵素と接触させる工程；
を含む、グリカンポリマー調製物の作製方法。
【０９６０】
４１１．調製物のグリカンポリマーが、ＧＴ１１、ＧＴ１０、ＧＨ９２、ＧＨ５１、ＧＨ３５、ＧＨ２９、ＧＨ２８、ＧＨ２０、ＧＨ１３０、ＧＨ１３サブファミリー８、ＧＨ１３サブファミリー１４  ＣＡＺｙファミリーのグリコシダーゼ酵素を含むヒト腸内微生物の基質である、グリカンポリマー調製物を作製する結果となる条件下で、
複数のグルコース、マンノース、および／またはガラクトースを含有するグリカンサブユニット（例えば、モノマーまたはダイマー）を提供する工程；
複数のグリカンサブユニットを、ＧＴ１１、ＧＴ１０、ＧＨ９２、ＧＨ５１、ＧＨ３５、ＧＨ２９、ＧＨ２８、ＧＨ２０、ＧＨ１３０、ＧＨ１３サブファミリー８、ＧＨ１３サブファミリー１４  ＣＡＺｙファミリーのうちの１つから選択されるグリコシダーゼ酵素と接触させる工程；
を含む、グリカンポリマー調製物の作製方法。
【０９６１】
４１２．調製物のグリカンポリマーが、ＧＴ２、ＧＴ４、ＧＨ２、ＧＨ２３、ＧＨ３、ＧＴ８、ＧＴ５１、ＧＴ９、ＧＨ１、ＧＨ９２、ＧＨ７３、ＧＨ３１、ＧＨ２０、ＧＨ２８、ＧＴ２５、ＧＴ２８、ＧＴ３５、ＧＨ１８、ＧＴ０、ＧＨ１３、ＧＨ３６、ＧＨ９７、ＧＨ１０５、ＧＨ２５、ＧＨ４、ＧＨ３２、ＧＨ７８、ＧＨ２９、ＧＨ０、ＧＨ５１、ＧＴ１０、ＧＨ７７  ＣＡＺｙファミリーのグリコシダーゼ酵素を含むヒト腸内微生物の基質である、グリカンポリマー調製物を作製する結果となる条件下で、
複数のグルコース、マンノース、および／またはガラクトースを含有するグリカンサブユニット（例えば、モノマーまたはダイマー）を提供する工程；
複数のグリカンサブユニットを、ＧＴ２、ＧＴ４、ＧＨ２、ＧＨ２３、ＧＨ３、ＧＴ８、ＧＴ５１、ＧＴ９、ＧＨ１、ＧＨ９２、ＧＨ７３、ＧＨ３１、ＧＨ２０、ＧＨ２８、ＧＴ２５、ＧＴ２８、ＧＴ３５、ＧＨ１８、ＧＴ０、ＧＨ１３、ＧＨ３６、ＧＨ９７、ＧＨ１０５、ＧＨ２５、ＧＨ４、ＧＨ３２、ＧＨ７８、ＧＨ２９、ＧＨ０、ＧＨ５１、ＧＴ１０、ＧＨ７７  ＣＡＺｙファミリーのうちの１つから選択されるグリコシダーゼ酵素と接触させる工程、
を含む、グリカンポリマー調製物の作製方法。
【０９６２】
４１３．調製物のグリカンポリマーが、ＧＴ１１、ＧＴ１０、ＧＨ９２、ＧＨ５１、ＧＨ３５、ＧＨ２９、ＧＨ２８、ＧＨ２０、ＧＨ１３０、ＧＨ１３サブファミリー８、ＧＨ１３サブファミリー１４  ＣＡＺｙファミリーのグリコシダーゼ酵素を含むヒト腸内微生物の基質である、グリカンポリマー調製物を作製する結果となる条件下で、
複数のキシロース、アラビノース、フコースおよび／またはラムノースを含有するグリカンサブユニット（例えば、モノマーまたはダイマー）を提供する工程；
複数のグリカンサブユニットを、ＧＴ１１、ＧＴ１０、ＧＨ９２、ＧＨ５１、ＧＨ３５、ＧＨ２９、ＧＨ２８、ＧＨ２０、ＧＨ１３０、ＧＨ１３サブファミリー８、ＧＨ１３サブファミリー１４  ＣＡＺｙファミリーのうちの１つから選択されるグリコシダーゼ酵素と接触させる工程；
を含む、グリカンポリマー調製物の作製方法。
【０９６３】
４１４．グリカンポリマー調製物を作製する結果となる条件下、例えば、基質およびグリコシダーゼ酵素と同じ行の列Ｆ、Ｇ、Ｈ、Ｉ、Ｊ、Ｋ、および／またはＬの条件下で、
表２３の列Ｅの基質の複数のグリカンサブユニット、例えば、モノマーまたはダイマーを提供する工程；
基質の複数のグリカンサブユニットを、基質と同じ行の列Ａのグリコシダーゼ酵素と接触させる工程；
を含む、グリカンポリマー調製物の作製方法。
【０９６４】
４１５．グリカンポリマー調製物が、約２〜４または約２〜５の平均ＤＰを有する、項４１４に記載の方法。
【０９６５】
４１６．グリカンポリマー調製物が、少なくとも２０％、３０％、４０％、５０％または少なくとも６０％（モル％）の１，４グリコシド結合を含む、項４１４または４１５のいずれかに記載の方法。
【０９６６】
４１７．グリカンポリマー調製物が、少なくとも８０％、９０％、少なくとも９５％、または１００％（モル％）の１，４グリコシド結合を含む、項４１４または４１５のいずれかに記載の方法。
【０９６７】
４１８．グリカンポリマー調製物が、少なくとも２０％、３０％、４０％、５０％または少なくとも６０％（モル％）の１，６グリコシド結合を含む、項４１４または４１５のいずれかに記載の方法。
【０９６８】
４１９．グリカンポリマー調製物が、少なくとも８０％、９０％、少なくとも９５％、または１００％（モル％）の１，６グリコシド結合を含む、項４１４または４１５のいずれかに記載の方法。
【０９６９】
４２０．グリカンポリマー調製物が、１０％以下、５％、１％以下または０％の１，２グリコシド結合を含む、項４１４または４１５のいずれかに記載の方法。
【０９７０】
４２１．グリカンポリマー調製物が、１０％以下、５％、１％以下または０％の１，３グリコシド結合を含む、項４１４または４１５のいずれかに記載の方法。
【０９７１】
４２２．グリカンポリマー調製物が、１０％以下、５％、１％以下または０％の１，４グリコシド結合を含む、項４１４または４１５のいずれかに記載の方法。
【０９７２】
４２３．グリカンポリマー調製物が、１０％以下、５％、１％以下または０％の１，６グリコシド結合を含む、項４１４または４１５のいずれかに記載の方法。
【０９７３】
４２４．グリコシド結合分布（ｍｏｌ％）が、
ａ）アルファ−１，２が１０％未満、アルファ１，３が１０％未満、アルファ１，４が少なくとも３０％、アルファ１，６が少なくとも３０％、ベータ１，２が５％未満、ベータ１，３が５％未満、ベータ１，４／１，６が５％未満、
ｂ）アルファ−１，２が５％未満、アルファ１，３が５％未満、アルファ１，４が少なくとも５％、アルファ１，６が５％未満、ベータ１，２が少なくとも１％、ベータ１，３が少なくとも１％、ベータ１，４／１，６が少なくとも８５％、
ｃ）アルファ−１，２が５％未満、アルファ１，３が５％未満、アルファ１，４が５％未満、アルファ１，６が少なくとも８５％、ベータ１，２が５％未満、ベータ１，３が５％未満、ベータ１，４／１，６が５％未満、
ｄ）アルファ−１，２が１０％未満、アルファ１，３が５％未満、アルファ１，４が少なくとも１５％、アルファ１，６が少なくとも５０％、ベータ１，２が５％未満、ベータ１，３が５％未満、ベータ１，４／１，６が５％未満、
ｅ）アルファ−１，２が５％未満、アルファ１，３が５％未満、アルファ１，４が１５％未満、アルファ１，６が少なくとも８５％、ベータ１，２が５％未満、ベータ１，３が５％未満、ベータ１，４／１，６が５％未満、
ｆ）アルファ−１，２が５％未満、アルファ１，３が５％未満、アルファ１，４が５％未満、アルファ１，６が５％未満、ベータ１，２が５％未満、ベータ１，３が５％未満、ベータ１，４／１，６が少なくとも８５％、
ｇ）アルファ−１，２が５％未満、アルファ１，３が５％未満、アルファ１，４が少なくとも５０％、アルファ１，６が少なくとも５％、ベータ１，２が１０％未満、ベータ１，３が５％未満、ベータ１，４／１，６が少なくとも１０％、
のうちの１つである、項４１４または４１５のいずれかに記載の方法。
【０９７４】
４２５．調製物のグリカンポリマーが、ＧＴ２、ＧＴ４、ＧＨ２、ＧＨ２３、ＧＨ３、ＧＴ８、ＧＴ５１、ＧＴ９、ＧＨ１、ＧＨ９２、ＧＨ７３、ＧＨ３１、ＧＨ２０、ＧＨ２８、ＧＴ２５、ＧＴ２８、ＧＴ３５、ＧＨ１８、ＧＴ０、ＧＨ１３、ＧＨ３６、ＧＨ９７、ＧＨ１０５、ＧＨ２５、ＧＨ４、ＧＨ３２、ＧＨ７８、ＧＨ２９、ＧＨ０、ＧＨ５１、ＧＴ１０、ＧＨ７７  ＣＡＺｙファミリーのグリコシダーゼ酵素を含むヒト腸内微生物の基質である、グリカンポリマー調製物を作製する結果となる条件下で、
複数のキシロース、アラビノース、フコースおよび／またはラムノースを含有するグリカンサブユニット（例えば、モノマーまたはダイマー）を提供する工程；
複数のグリカンサブユニットを、ＧＴ２、ＧＴ４、ＧＨ２、ＧＨ２３、ＧＨ３、ＧＴ８、ＧＴ５１、ＧＴ９、ＧＨ１、ＧＨ９２、ＧＨ７３、ＧＨ３１、ＧＨ２０、ＧＨ２８、ＧＴ２５、ＧＴ２８、ＧＴ３５、ＧＨ１８、ＧＴ０、ＧＨ１３、ＧＨ３６、ＧＨ９７、ＧＨ１０５、ＧＨ２５、ＧＨ４、ＧＨ３２、ＧＨ７８、ＧＨ２９、ＧＨ０、ＧＨ５１、ＧＴ１０、ＧＨ７７  ＣＡＺｙファミリーのうちの１つから選択されるグリコシダーゼ酵素と接触させる工程、
を含む、グリカンポリマー調製物の作製方法。
【０９７５】
４２６．調製物のグリカンポリマーが、ＧＴ３、ＧＨ９７、ＧＨ４３サブファミリー２４、ＧＨ２７、ＧＨ１３３、ＧＨ１３サブファミリー８、ＧＨ１３  ＣＡＺｙファミリーのグリコシダーゼ酵素を含むヒト腸内微生物の基質である、グリカンポリマー調製物を作製する結果となる条件下で、
複数のグルコースおよび／またはガラクトースを含有するグリカンサブユニット（例えば、モノマーまたはダイマー）を提供する工程；
複数のグリカンサブユニットを、ＧＴ３、ＧＨ９７、ＧＨ４３サブファミリー２４、ＧＨ２７、ＧＨ１３３、ＧＨ１３サブファミリー８、ＧＨ１３  ＣＡＺｙファミリーのうちの１つから選択されるグリコシダーゼ酵素と接触させる工程、
を含む、グリカンポリマー調製物の作製方法。
【０９７６】
４２７．調製物のグリカンポリマーが、ＧＴ２、ＧＴ４、ＧＨ２、ＧＨ２３、ＧＨ３、ＧＴ８、ＧＴ５１、ＧＴ９、ＧＨ１、ＧＨ９２、ＧＨ７３、ＧＨ３１、ＧＨ２０、ＧＨ２８、ＧＴ２５、ＧＴ２８、ＧＴ３５、ＧＨ１８、ＧＴ０、ＧＨ１３、ＧＨ３６、ＧＨ９７、ＧＨ１０５、ＧＨ２５、ＧＨ４、ＧＨ３２、ＧＨ７８、ＧＨ２９、ＧＨ０、ＧＨ５１、ＧＴ１０、ＧＨ７７、ＧＴ２、ＧＴ４、ＧＨ２、ＧＨ２３、ＧＨ３、ＧＴ５１、ＧＨ１、ＧＴ８、ＧＨ９２、ＧＴ９、ＧＨ７３、ＧＨ３１、ＧＨ２０、Ｇｈ２８、ＧＴ３５、ＧＴ２８、ＧＨ１８、ＧＨ１３、ＧＨ９７、ＧＨ２５、ＧＨ３６、ＧＨ４、ＧＨ１０５、ＧＨ３２、ＧＨ７８、ＧＨ２９、ＧＨ０、ＧＴ２５、ＧＨ５１、ＧＨ７７、ＧＨ８８、ＧＨ２４  ＣＡＺｙファミリーのグリコシダーゼ酵素を含むヒト腸内微生物の基質である、グリカンポリマー調製物を作製する結果となる条件下で、
複数のグルコースおよび／またはガラクトースを含有するグリカンサブユニット（例えば、モノマーまたはダイマー）を提供する工程；
複数のグリカンサブユニットを、ＧＴ２、ＧＴ４、ＧＨ２、ＧＨ２３、ＧＨ３、ＧＴ８、ＧＴ５１、ＧＴ９、ＧＨ１、ＧＨ９２、ＧＨ７３、ＧＨ３１、ＧＨ２０、ＧＨ２８、ＧＴ２５、ＧＴ２８、ＧＴ３５、ＧＨ１８、ＧＴ０、ＧＨ１３、ＧＨ３６、ＧＨ９７、ＧＨ１０５、ＧＨ２５、ＧＨ４、ＧＨ３２、ＧＨ７８、ＧＨ２９、ＧＨ０、ＧＨ５１、ＧＴ１０、ＧＨ７７、ＧＴ２、ＧＴ４、ＧＨ２、ＧＨ２３、ＧＨ３、ＧＴ５１、ＧＨ１、ＧＴ８、ＧＨ９２、ＧＴ９、ＧＨ７３、ＧＨ３１、ＧＨ２０、Ｇｈ２８、ＧＴ３５、ＧＴ２８、ＧＨ１８、ＧＨ１３、ＧＨ９７、ＧＨ２５、ＧＨ３６、ＧＨ４、ＧＨ１０５、ＧＨ３２、ＧＨ７８、ＧＨ２９、ＧＨ０、ＧＴ２５、ＧＨ５１、ＧＨ７７、ＧＨ８８、ＧＨ２４  ＣＡＺｙファミリーのうちの１つから選択されるグリコシダーゼ酵素と接触させる工程、
を含む、グリカンポリマー調製物の作製方法。
【０９７７】
４２８．グリコシダーゼ酵素またはグリコシダーゼ酵素分子が、ＧＨ１、ＧＨ２、ＧＨ３、ＧＨ３５、ＧＨ４２、およびＧＨ５０のうちの１つ以上のもの以外である、項４０１〜４１３または４２５〜４２７のいずれか一項に記載の方法。
【０９７８】
４２９．グリコシダーゼ酵素またはグリコシダーゼ酵素分子が、ＧＨ３２、ＧＨ６８、ＧＨ１００のうちの１つ以上のもの以外である、項４０１〜４１３または４２５〜４２７のいずれか一項に記載の方法。
【０９７９】
４３０．グリコシダーゼ酵素またはグリコシダーゼ酵素分子が、ＧＨ１、ＧＨ２、ＧＨ３、ＧＨ４、ＧＨ５、ＧＨ８、ＧＨ９、ＧＨ１０、ＧＨ１１、ＧＨ１２、ＧＨ１３、ＧＨ１４、ＧＨ１６、ＧＨ２６、ＧＨ２８、ＧＨ３０、ＧＨ３１、ＧＨ３２、ＧＨ３５、ＧＨ４２、ＧＨ４３、ＧＨ４４、ＧＨ５０、ＧＨ５１、ＧＨ５７、ＧＨ６２、ＧＨ６３、ＧＨ６８、ＧＨ７０、ＧＨ９７、ＧＨ１００、ＧＨ１１６、ＧＨ１１９、ＧＨ１２２のうちの１つ以上のもの以外である、項４０１〜４１３または４２５〜４２７のいずれか一項に記載の方法。
【０９８０】
４３１．本明細書に開示される方法によって、例えば、項２５４〜４３０のいずれかに記載の方法によって、作製される、産生可能な、または作製可能な、グリカンポリマー調製物。
【０９８１】
４３２．本明細書に開示される方法によって、例えば、項２５４〜４３０のいずれかに記載の方法によって、選択される、または選択可能な、グリカンポリマー調製物。
【０９８２】
４３３．医薬組成物、医療用食品、栄養補助食品、食品成分、または治療用栄養製品として製剤化された、項４３１に記載のグリカンポリマー調製物。
【０９８３】
４３４．賦形剤または担体をさらに含む、項４３１のグリカンポリマー調製物。
【０９８４】
４３５．項４３１〜４３４のいずれか一項に記載のグリカン調製物を含む、単位剤形。
【０９８５】
４３６．経腸投与、経口、経口または経直腸投与、または経管栄養のために製剤化された、項４３５に記載の単位剤形。
【０９８６】
４３７．粉末またはシロップとして製剤化された、項４３５または項４３６のいずれかに記載の単位剤形。
【０９８７】
４３８．結腸または大腸における時限放出および／または標的放出のために製剤化された、項４３５〜４３７のいずれか一項に記載の単位剤形。
【０９８８】
４３９．項４３１〜４３４のいずれか一項に記載のグリカンポリマー調製物を含む、医薬組成物。
【０９８９】
４４０．項４３１〜４３４のいずれか一項に記載のグリカンポリマー調製物を含む、医療用食品。
【０９９０】
４４１．項４３１〜４３４のいずれか一項に記載のグリカンポリマー調製物を含む、栄養補助食品。
【０９９１】
４４２．項４３１〜４３４のいずれか一項に記載のグリカンポリマー調製物を含む、食品成分。
【０９９２】
４４３．項４３１〜４３４のいずれか一項に記載のグリカンポリマー調製物を含む、治療用栄養製品。
【０９９３】
４４４．本明細書に記載の、例えば、項２５４〜４３０のいずれか一項に記載の方法によって生成される、反応混合物であって、
少なくとも０．２５、０．５、１、５、１０、２０、５０、１００、２００、３００、４００または５００キログラムのグリカンポリマーを含むグリカンポリマー調製物を産生するのに適した量で、および／または少なくとも約１５％、３０％、４５％、６０％、または約７５％（投入グリカンサブユニットの％として重量／重量基準で決定される場合）の収率を得るのに適当な条件下で、
グリカンポリマーの製造に適した複数のグリカンサブユニット、例えば糖モノマーまたは糖ダイマー；および
グリコシダーゼ酵素分子（例えば、表４（列２）、表２３（列Ａ）、表２４（列Ａ）、または表２２（列１）；またはグリコ分類群クラス１、クラス２、クラス３、クラス４、クラス５、クラス６、もしくはクラス７に関連する１つ以上のグリコシダーゼ酵素）、
を含む反応混合物。
【０９９４】
４４５．本明細書に記載の方法、例えば、項２５４〜４３０のいずれかの方法、の実施に適した、項４４４に記載の反応混合物。
【０９９５】
４４６．項４３１に記載の調製物を、医薬組成物、医療用食品、栄養補助食品、食品成分、または治療用栄養製品に製剤化することを含む、医薬組成物、医療用食品、栄養補助食品、食品成分、または治療用栄養製品を作製する方法。
【０９９６】
４４７．調製物を、複数の部分、例えば、単位用量または製剤、例えば、少なくとも１０、１００、または少なくとも１，０００の部分、に分割する工程を含む、項４４６に記載の方法。
【０９９７】
４４８．調製物を賦形剤と組み合わせる工程を含む、項４４６に記載の方法。
【０９９８】
４４９．項４３１に記載のグリカンポリマー調製物、またはその一部。
【０９９９】
４５０．項４３１に記載のグリカンポリマー調製物の画分、例えば、分子量画分。
【１０００】
４５１．画分が、グリカン調製物のものとは異なる平均ＤＰ、例えば、約３、４、または５の平均ＤＰを含む、項４５０に記載の分子量画分。
【１００１】
４５２．項２５４〜４３０のいずれかに記載の方法によって作製される、または作製可能なグリカンポリマーの調製物を作製、評価、選択、分類、または提供する方法であって、
候補調製物を取得する工程；
調製物に関するパラメータ、例えば、物理的パラメータ、例えば、分子量、例えば、平均分子量もしくは分子量分布、グリカンサブユニット組成または純度、または生物学的特性に関するパラメータ、例えば、ヒト腸内微生物の増殖を調節する能力、微生物によって産生される微生物代謝産物を、例えばエクスビボアッセイにおいて、調節する能力、またはバイオマーカー、例えば、炎症もしくは免疫バイオマーカー、毒性もしくは廃棄化合物、細菌化合物）を例えば、ヒト対象において、調節する能力、の値を、例えばアッセイを実施することによって、取得する工程；および
値を基準値と比較する工程、
それにより、グリカンポリマーの調製物を作製、評価、選択、分類、または提供する工程
を含む方法。
【１００２】
４５３．値を取得するためのアッセイを実行する工程を含む、項４５２に記載の方法。
【１００３】
４５４．他者から値を取得する工程を含む、項４５２に記載の方法。
【１００４】
４５５．値を参照値と比較して、例えば、使用への、例えばグリカンポリマーの調製物としての、適合性について、または、産物もしくは剤形、例えば本明細書に記載の産物または剤形への製剤化について、候補を評価する、項４５２〜４５４のいずれかに記載の方法。
【１００５】
４５６．標的ヒト腸内微生物を調節する医薬組成物を作製する方法であって、
複数のグリカンサブユニットを提供する工程；
複数のグリカンサブユニットを、標的腸内微生物中に存在するグリコシダーゼ活性を有するグリコシダーゼ酵素組成物と、グリカンサブユニットのグリカンポリマーへの組み込みを生じる条件下で、接触させる工程、
任意選択により、グリカンポリマーを精製する工程、および
腸への投与および腸内微生物の調節のための医薬組成物としてグリカンポリマーを製剤化し、それにより、標的ヒト腸内微生物を調節する医薬組成物を作製する工程
を含む方法。
【１００６】
４５７．配列番号１〜１２４の１つ以上から選択される核酸配列と少なくとも８０、８５、９０、９１、９２、９３、９４、９５、９６、９７、９８、９９、または１００％同一である、核酸配列によってコードされるグリコシダーゼ酵素を含むグリコシダーゼ酵素分子の精製調製物であって、グリコシダーゼ酵素がヒト腸内微生物中に存在する、精製調製物。
【１００７】
４５８．配列番号１〜１２４の１つ以上から選択される核酸配列と少なくとも８０、８５、９０、９１、９２、９３、９４、９５、９６、９７、９８、９９、または１００％同一である、核酸配列を含むベクターであって、核酸がヒト腸内微生物中に存在するグリコシダーゼ酵素をコードし、ベクターはグリコシダーゼ酵素を発現するために使用することができる、ベクター。
【１００８】
４５９．配列番号１〜１２４の１つ以上から選択される核酸配列によりコードされるグリコシダーゼ酵素、およびグリコシダーゼ酵素の基質、例えば、グリカンサブユニット、例えば、モノマーまたはダイマー
を含み、基質が、例えば、縮合によって、グリカンポリマーを形成するのに十分な量で存在する、反応混合物。
【実施例】
【１００９】
本発明は、以下の実施例によってさらに例示される。実施例は、例示の目的のみで提供され、決して本発明の範囲または内容を限定すると考えられるべきではない。本発明の実践は、別記されない限り、当技術分野の技術内の、タンパク質化学、生物化学、組換えＤＮＡ技術、および薬理学の従来の方法が用いられるであろう。かかる技術は、文献内に十分に説明される。例えば、Ｔ．Ｅ．Ｃｒｅｉｇｈｔｏｎ，Ｐｒｏｔｅｉｎｓ：Ｓｔｒｕｃｔｕｒｅｓ  ａｎｄ  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｐｒｏｐｅｒｔｉｅｓ（Ｗ．Ｈ．Ｆｒｅｅｍａｎ  ａｎｄ  Ｃｏｍｐａｎｙ，１９９３）、Ｇｒｅｅｎ＆Ｓａｍｂｒｏｏｋ  ｅｔ  ａｌ．，Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｃｌｏｎｉｎｇ：Ａ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｍａｎｕａｌ，４ｔｈ  Ｅｄｉｔｉｏｎ（Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｏｒ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｐｒｅｓｓ，２０１２）、Ｃｏｌｏｗｉｃｋ＆Ｋａｐｌａｎ，Ｍｅｔｈｏｄｓ  Ｉｎ  Ｅｎｚｙｍｏｌｏｇｙ（Ａｃａｄｅｍｉｃ  Ｐｒｅｓｓ）、Ｒｅｍｉｎｇｔｏｎ：Ｔｈｅ  Ｓｃｉｅｎｃｅ  ａｎｄ  Ｐｒａｃｔｉｃｅ  ｏｆ  Ｐｈａｒｍａｃｙ，２２ｎｄ  Ｅｄｉｔｉｏｎ（Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ  Ｐｒｅｓｓ，２０１２）、Ｓｕｎｄｂｅｒｇ＆Ｃａｒｅｙ，Ａｄｖａｎｃｅｄ  Ｏｒｇａｎｉｃ  Ｃｈｅｍｉｓｔｒｙ：Ｐａｒｔｓ  Ａ  ａｎｄ  Ｂ，５ｔｈ  Ｅｄｉｔｉｏｎ（Ｓｐｒｉｎｇｅｒ，２００７）を参照のこと。
【１０１０】
実施例１．精製グリコシダーゼ酵素を用いたグリカンポリマーの産生方法
グリカンは、本明細書、例えば表４、２２、２３および２４に記載され、例えば配列番号１〜１２４によってコードされる、１つ以上の部分的または完全に精製されたヒドロラーゼまたはトランスフェラーゼ酵素によって触媒されるグリコシド結合の逆加水分解によって生成され得る。選択される酵素は、グリコシルヒドロラーゼ、グリコシルトランスフェラーゼ、ならびに糖ヌクレオチドおよびホスホリル糖を含むがこれらに限定されない未活性化糖ドナーまたは活性化糖ドナーを用いるものを含む多糖リアーゼを含む、グリコシド結合を加水分解することが知られている任意の酵素であり得る。理想的には、選択された酵素は、宿主マイクロバイオームの構造または健康に対して好ましい効果（例えば、代謝産物、例えば、ＳＣＦＡ（例えば、ブチレート、プロピオネート）、ＴＭＡ／ＴＭＡＯ、アンモニア、尿毒症性溶質（例えば、インドール、ｐ−クレゾール）、ＬＰＳ、または胆汁酸（例えば、二次胆汁酸）の調節）を有する、グリコ分類群（例えば、クラス１、クラス２、クラス３、クラス４、クラス５、クラス６、またはクラス７）からのグリコシルヒドロラーゼから単離されるかまたはそれに関連する。
【１０１１】
グリコシル供与体は、未活性化モノマーグリコシド（例えば、グルコース、ガラクトース、グルクロン酸など）、活性化モノマーグリコシド（例えば、ホスホグルコース、ラクトース、マルトビオース、ＵＤＰ−グルコース、１−フルオログルコース、トリクロロアセトイミド化グルコース、パラ−ニトロフェニルグルコース、ヘキセヌロン酸）、またはオリゴマーまたはポリマーグリコシド（例えば、マルトース、ガラクトオリゴ糖）からなってもよい。
【１０１２】
グリコシルアクセプターは、モノマー糖（例えば、グルコース、ガラクトース、グルクロン酸）、オリゴマー（例えば、ラクトース、マルトビオース、ガラクトオリゴ糖）、または他のグリコシドと相溶性があると報告されている非糖基質（例えば、ソルビトール、グリセロール）を含む、グリコシルヒドロラーゼまたはトランスフェラーゼと適合性のある任意の基質からなり得る。いくつかの実施形態では、グリコシル受容体およびグリコシル供与体は同じ材料であり得、例えば、マルトビオースは供与体でも受容体でもあり得る。
【１０１３】
目的の酵素は、水；水と、アセトン、エタノール、イソプロパノール、ポリエチレングリコール、ｔ−ブタノールまたは他の報告されている溶媒などの混和性溶媒との混合物；または純有機溶媒を含む生体適合性溶媒中に１〜５０Ｕ／ｍＬの濃度まで溶解または懸濁され得る。グリコシル供与体および受容体は、５〜５０重量％の濃度で培地に添加される。培地のｐＨは、生体適合性緩衝液、例えば、酢酸ナトリウム緩衝液、クエン酸／リン酸水素二ナトリウム緩衝液、リン酸緩衝液などを用いて、２．５〜８．０の範囲に調整される。次いで、反応物を、選択されたグリコシダーゼ酵素分子と適合する温度、典型的には３５℃〜９０℃で、２〜４８時間穏やかに撹拌させる。
【１０１４】
その宿主から最小の構造変化で単離されるかまたは組換え系から発現されるグリコシダーゼ酵素分子を用いる合成の条件は、天然の生理学、すなわち５〜７．５のｐＨおよび３５〜６０℃の温度をより厳密に反映し得る。
【１０１５】
理想的には、その安定性を改善するために修飾されたグリコシダーゼ酵素分子を使用する合成のための条件は、生理学的条件、例えば、３．５〜８のｐＨおよび３５〜７０℃の温度からさらに逸脱し得る。タンパク質安定性の変化は、合成収率、変換率、リサイクル性、またはタンパク質産生収率を含む、望ましい特性を高めるために使用され得る。
【１０１６】
理想的には、極端な温度またはｐＨの条件に耐えるように進化した極限性細菌から高度に修飾または単離されたグリコシダーゼ酵素分子を用いた合成条件は、生理学的条件、例えば、２．０〜８のｐＨおよび９０℃までの温度から大きく逸脱し得る。
【１０１７】
一実施形態では、選択された基質（表２３、列Ｅ）を２０ｍｌのシンチレーションバイアルに入れた。特定のｐＨのＭｃＩｌｖａｉｎｅ緩衝液（表２３、列Ｊ）をバイアルに添加し、粉末をヒートガンで短時間加熱することによって溶解した。緩衝化基質溶液を室温に冷却した後、選択された酵素を添加し（表２３、列Ｈ）、溶液を穏やかに回転させて混合し、蓋をしたバイアルを特定の温度の水浴に撹拌せずに入れた（表２３、列Ｋ）。特定の時間が経過すると（表２３、列Ｌ）、バイアルを沸騰水浴中で２０分間加熱して酵素を失活させた。次いで、試料を５０ｍｌコニカル遠心チューブに移し、約２００ｍｇ／ｍｌまで希釈した。次いで、希釈生成物を実施例１８に記載の方法により精製した。単離された物質を実施例１１〜１５に記載のように特徴付けし、データを表２３（ＳＥＣ）および表２４（ＨＳＱＣ−ＮＭＲ）に示す。
【１０１８】
【表８９】
2020513410.tif 000091
【１０１９】
【表９０】
2020513410.tif 000092
【１０２０】
【表９１】
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【１０２１】
【表９２】
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【１０２２】
【表９３】
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【１０２３】
【表９４】
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【１０２４】
【表９５】
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【１０２５】
【表９６】
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【１０２６】
【表９７】
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【１０２７】
【表９８】
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【１０２８】
実施例２．ベータ−ガラクトシダーゼおよびラクトースを介したベータ−ガラクトオリゴ糖の生成
６０℃の０．０５Ｍ、ｐＨ５酢酸ナトリウム緩衝液に、ラクトースを４００ｍｇ／ｍＬの濃度まで添加した。基質が溶解するまで、反応物を穏やかに撹拌した。次いで、ベータ−ガラクトシダーゼのストック溶液（Ｍｅｇａｚｙｍｅ、カタログ番号Ｅ−ＢＧＬＡＮ）を、１０Ｕ／ｍｌの最終濃度まで反応物に添加した。覆いのある水浴中で、反応を６０℃で２６時間維持した。反応が完了したと見なされたら、酵素を失活させるために１０分間１００℃に加熱し、次いで水で２％総炭水化物濃度に希釈した（表２３、３１行目）。次いで、産物を実施例１１〜１８に記載のように特徴付け、単離および精製し、図５に示した。単離されたオリゴ糖は、ＤＰ≧３が２０％超の分子量、ベータ−グリコシドが５０％超のグリコシド立体化学、１，４−グリコシド結合が１０％超の位置化学、およびＤ−ガラクトースが５０％超の構成要素を有する。
【１０２９】
実施例３．アルファ−ガラクトシダーゼおよびメリビオースを介したアルファ−ガラクトオリゴ糖の生成
６０℃の０．０５Ｍ、ｐＨ５酢酸ナトリウム緩衝液に、メリビオースを１０００ｍｇ／ｍＬの濃度まで添加した。基質が溶解するまで、反応物を穏やかに撹拌した。次いで、アルファ−ガラクトシダーゼのストック溶液（Ｍｅｇａｚｙｍｅ、カタログ番号Ｅ−ＡＧＬＡＮ）を、１０Ｕ／ｍＬの最終濃度まで反応物に添加した。覆いのある水浴中で、反応を６０℃で２２時間維持した。反応が完了したと見なされたら、酵素を失活させるために１０分間１００℃に加熱し、次いで水で２％総炭水化物濃度に希釈した（表２３、２９行目）。次いで、産物を実施例１１〜１８に記載のように特徴付け、単離および精製した（図８）。単離されたオリゴ糖は、ＤＰ≧３が２０％超の分子量、アルファ−グリコシドが５０％超のグリコシド立体化学、１，４−グリコシド結合が１０％超の位置化学、およびＤ−ガラクトースが５０％超の構成要素を有する。
【１０３０】
実施例４．ベータ−グルコシダーゼおよびセロビオースを介したベータ−グルコオリゴ糖の生成
６０℃の０．０５Ｍ、ｐＨ５酢酸ナトリウム緩衝液に、セロビオースを２００ｍｇ／ｍＬの濃度まで添加した。基質が溶解するまで、反応物を穏やかに撹拌した。次いで、ベータ−グルコシダーゼのストック溶液（Ｍｅｇａｚｙｍｅ、カタログ番号Ｅ−ＢＧＯＳＰＣ）を、１０Ｕ／ｍＬの最終濃度まで反応物に添加した。覆いのある水浴中で、反応を６０℃で２６時間維持した。反応が完了したと見なされたら、酵素を失活させるために１０分間１００℃に加熱し、次いで水で２％総炭水化物濃度に希釈した（表２３、１０行目）。次いで、産物を実施例１１〜１８に記載のように特徴付け、単離および精製した（図６）。単離されたオリゴ糖は、ＤＰ≧３が１０％超の分子量、ベータ−グリコシドが５０％超のグリコシド立体化学、１，４−グリコシド結合が１０％超の位置化学、およびＤ−グルコースが９０％超の構成要素を有する（表２４、１０行目）。
【１０３１】
実施例５．アルファ−グルコシダーゼおよびマルトースを介したアルファ−グルコオリゴ糖の生成
５５℃の０．０５Ｍ、ｐＨ６．５マレイン酸ナトリウム緩衝液に、マルトースを１０００ｍｇ／ｍＬの濃度まで添加した。基質が溶解するまで、反応物を穏やかに撹拌した。次いで、アルファ−グルコシダーゼのストック溶液（Ｍｅｇａｚｙｍｅ、カタログ番号Ｅ−ＴＳＡＧＬ）を、１０Ｕ／ｍＬの最終濃度まで反応物に添加した。覆いのある水浴中で、反応を５５℃で２４時間維持した。反応が完了したと見なされたら、酵素を失活させるために１０分間１００℃に加熱し、次いで水で２％総炭水化物濃度に希釈した（表２３、２７行目）。次いで、産物を実施例１１〜１８に記載のように特徴付け、単離および精製した（図７Ａ、Ｂ）。単離されたオリゴ糖は、ＤＰ≧３が１５％超の分子量、アルファ−グリコシドが５０％超のグリコシド立体化学、１，４−グリコシド結合が１０％超の位置化学、およびＤ−グルコースが９０％超の構成要素を有する（表２４、１１行目）。
【１０３２】
実施例６．選択的グリコシダーゼを用いた基質混合物の処置によるオリゴ糖の選択的生成
混合組成（立体化学、位置化学、およびモノマー組成物の混合物を含む）を有するオリゴ糖は、実施例１に記載の条件下で、基質の混合物を、１つ以上の基質に対して選択的なグリコシダーゼで処理することによって生成される。この例では、グリコシダーゼに感受性である基質はグリコシド結合供与体として作用し、グリコシダーゼに感受性でない基質はグリコシド結合受容体としてのみ作用する。基質の異なる組み合わせを、異なって選択的なグリコシダーゼと混合することによって、オリゴ糖の別個の組み合わせを生成し得る（図１２）。
【１０３３】
一実施形態では、６０℃の０．０５Ｍ、ｐＨ５酢酸ナトリウム緩衝液に、セロビオースとラクトースの１：２ｗ／ｗ混合物を最終濃度６００ｍｇ／ｍＬまで添加した。基質が溶解するまで、反応物を穏やかに撹拌した。次いで、ベータ−グルコシダーゼのストック溶液（Ｍｅｇａｚｙｍｅ、カタログ番号Ｅ−ＢＧＯＳＰＣ）を、１０Ｕ／ｍＬの最終濃度まで反応物に添加した。覆いのある水浴中で、反応を６０℃で２６時間維持した。反応が完了したと見なされたら、酵素を失活させるために１０分間１００℃に加熱し、次いで水で２％総炭水化物濃度に希釈した。次いで、産物を実施例１１〜１８に記載のように特徴付け、単離および精製した（図１４）。単離されたオリゴ糖は、ＤＰ≧３が１０％超の分子量、ベータ−グリコシドが５０％超のグリコシド立体化学、１，４−グリコシド結合が１０％超の位置化学、およびＤ−グルコースが５０％超、およびＤ−ガラクトースが５０％未満の構成要素を有する。
【１０３４】
第２の実施形態では、６０℃の０．０５Ｍ、ｐＨ５酢酸ナトリウム緩衝液に、セロビオースとラクトースの１：２ｗ／ｗ混合物を最終濃度６００ｍｇ／ｍＬまで添加した。基質が溶解するまで、反応物を穏やかに撹拌した。次いで、ベータ−ガラクトシダーゼのストック溶液（Ｍｅｇａｚｙｍｅ、カタログ番号Ｅ−ＢＧＬＡＮ）を、１０Ｕ／ｍｌの最終濃度まで反応物に添加した。覆いのある水浴中で、反応を６０℃で２６時間維持した。反応が完了したと見なされたら、酵素を失活させるために１０分間１００℃に加熱し、次いで水で２％総炭水化物濃度に希釈した。次いで、産物を実施例１１〜１８に記載のように特徴付け、単離および精製した（図１３）。単離されたオリゴ糖は、ＤＰ≧３が２０％超の分子量、ベータ−グリコシドが５０％超のグリコシド立体化学、１，４−グリコシド結合が１０％超の位置化学、およびＤ−グルコースが５０％未満、およびＤ−ガラクトースが５０％超の構成要素を有する。
【１０３５】
他の実施形態では、選択された基質混合物は、構成モノマーによって（例えば、マルトースおよびメリビオース、またはＬ−アラビノビオースおよびＤ−アラビノビオース）、グリコシド立体化学によって（例えばマルトースおよびセロビオース）、位置化学によって（例えばラクトースおよびアロラクトース）、活性化戦略によって（例えば、１−（パラ−ニトロフェニル）−Ｄ−グルコースおよびラクトース）、またはグリコシド酵素の基質を区別するこれらまたは他の因子の任意の組み合わせによって、異なり得る。選択されたグリコシダーゼは、基質に対する選択性（例えば、グルコシダーゼ対ガラクトシダーゼ）、グリコシド立体化学（例えば、アルファ−グルコシダーゼ対ベータ−グルコシダーゼ）、位置化学（例えば、１，６−グルコシダーゼ対１，３−グルコシダーゼ）、鎖位置（例えば、エンドグリコシダーゼ対エキソグリコシダーゼ；還元末端選択的対非還元末端選択的）、またはグリコシド酵素を区別するこれらまたは他の因子の任意の組み合わせによって異なり得る。
【１０３６】
実施例７．有機／水性混合溶媒系を用いた単糖からのオリゴ糖の生成
実施例１に記載のグリカンは、熱力学的逆加水分解事象を介して単糖から生成し得る。糖加水分解酵素は、単糖がより高次のオリゴ糖と絶えず交換され、反応の支配的方向が環境の水分活性によって決定される、熱力学的平衡を確立する。生理学的条件下で見出される基質に対する高濃度の水は、これらの酵素が主として加水分解的に作用する原因となる。特定の実験室条件下では、反応の支配的方向をグリコシド結合の形成に有利に働くように変更することができ、これは、モノマー成分からのオリゴ糖の形成を可能にする。
【１０３７】
グルコースを０．１Ｍ、ｐＨ５．２の酢酸ナトリウム緩衝液に１０％（ｗ／ｗ）の濃度で溶解した。基質を溶解した後、水性部分に、ｔｅｒｔ−ブタノール、ジエチレングリコールジメチルエーテル（ＤＥＧＤ）、テトラエチレングリコールジメチルエーテル（ＴＥＧＤ）、またはトリメチルホスフェート（ＴＭＰ）のうちの１つの有機溶媒を４容量添加した。ベータ−グルコシダーゼストック溶液を反応物に１０Ｕ／ｍｌの濃度まで添加した。覆いのある水浴中で反応物を５０℃に加熱し、１０日間にわたってモニターした。反応が完了したと見なされた後、反応物を１００℃で１０分間加熱して、酵素を失活させた。次いで、反応物をベンチトップ遠心分離で遠心分離して沈殿したグリカンを回収し、上清をデカントすることによって除去した。次いで、産物を実施例１１〜１８に記載のように特徴付けおよび精製した。ＤＰ＞１グリカンの存在を実証する蛍光標識糖鎖電気泳動実験を図９に示す。
【１０３８】
実施例８．反応改質剤の添加による産物分布のシフト
反応率、総物質収率、変換効率、または得られるグリカンの構造分布を制御するために、他の改質剤を反応物に加えてもよい。一実施形態では、実施例１２に記載の反応物にモノマーＤ−ガラクトースを添加した。２４時間にわたる産物プロファイルの比較は、ガラクトースがオリゴ糖形成速度を遅くするとともに、産物分布をより高い割合のオリゴ糖へシフトさせることを示した（図１０）。
【１０３９】
６０℃の０．０５Ｍ、ｐＨ５酢酸ナトリウム緩衝液に、ラクトースを４００ｍｇ／ｍＬの濃度まで添加した。ラクトースを溶解するまで穏やかに撹拌した。次いで、Ｄ−ガラクトースを１１５ｍｇ／ｍＬの最終濃度まで反応物に添加し、溶解するまで穏やかに撹拌した。次いで、ベータ−ガラクトシダーゼのストック溶液（Ｍｅｇａｚｙｍｅ、カタログ番号Ｅ−ＢＧＬＡＮ）を、１０Ｕ／ｍｌの最終濃度まで反応物に添加した。覆いのある水浴中で、反応を６０℃で２４時間維持した。反応が完了したと見なされたら、酵素を失活させるために１０分間１００℃に加熱し、次いで水で２％総炭水化物濃度に希釈した。次いで、産物を実施例６〜８に記載のように特徴付け、単離および精製した。
【１０４０】
実施例９．細菌培養分離株による逆加水分解を介したグリカンの産生方法
記載の（例えば実施例１に）グリカンは、生存全細胞、非生存全細胞、部分細胞または細胞成分、細胞培養物上清、またはグリコシドヒドロラーゼを含む細菌培地の他の部分のカテゴリーからの１つ以上を含む、単離された細菌調製物によって触媒されるグリコシド結合の逆加水分解によって生成され得る。この実験では、細菌株、株の組み合わせ、または全細菌群が適当な条件下、適当な培地中で最初に増殖される。次いで、培養物を標準的な技術を用いて回収し、次いで単離した培養物を実施例１に記載の逆加水分解条件に供して、その株、組合せまたは群に合わせたグリカンを生成する。
【１０４１】
株、組み合わせ、または株の群は、例えば、Ｍａｒｔｅｎｓ，Ｅ．Ｃ．；ｅｔ  ａｌ．Ｃｅｌｌ  Ｈｏｓｔ＆Ｍｉｃｒｏｂｅ，２００８，４，４４７．；Ｒｏｍａｎｏ，Ｋ．Ａ．；ｅｔ  ａｌ．ｍＢｉｏ，２０１５，６，ｅ０２４８１−１４．；Ａｔｌａｓ，Ｒ．Ｍ．，Ｈａｎｄｂｏｏｋ  ｏｆ  Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌｏｇｉｃａｌ  Ｍｅｄｉａ，４ｔｈ  Ｅｄ．，２０１０．；または目的の株または複数の株につき最適化された培養条件を選択する他の公表された文献に記載されている任意の周知の手段を用いて培養することができる。培養物が適当な密度に達したら、濾過、遠心分離、または凍結乾燥を含む任意の適当な方法によって培養物を培地から採取する。
【１０４２】
必要に応じて、単離した細胞を、収集後に、ビーズビート、凍結乾燥、または他の技術によって溶解して、天然に発現されている細胞内または膜結合グリコシルヒドロラーゼを含む生存不能な細胞物質の混合物を得る。
【１０４３】
必要に応じて、培養上清を細胞物質から独立して単離し、凍結乾燥して、天然に発現された細胞外グリコシルヒドロラーゼの混合物を得る。
【１０４４】
必要に応じて、組み合わせた細胞および培養上清を一緒に溶解および凍結乾燥して、全て発現されたグリコシルヒドロラーゼの混合物を得る。
【１０４５】
記載のように単離されたグリコシルヒドロラーゼは、次いで、例えば、精製酵素の代わりに単離されたグリコシルヒドロラーゼを用いて実施例１に記載のように、グリカンを生成するために使用される。実施例１に記載の条件は、発現された酵素の接近可能性を増大させるために、ＤＭＳＯまたはトルエンを含む細胞透過剤の添加によってさらに改変され得る。単離された固体の活性は、任意の適当な技術、例えば、Ｇｏｕｌａｓ、ｅｔ  ａｌ．Ｉｎｔｅｒｎａｔｉｏｎａｌ  Ｄａｉｒｙ  Ｊｏｕｒｎａｌ  １７（２００７）６４８−６５６に記載のものを用いて測定され得る。この方法を使用して生成されたグリカンに適用する場合、実施例１６〜１８に記載の精製は、遠心分離、滅菌濾過、およびゲル濾過クロマトグラフィーを含む任意の周知の方法によって残留細胞物質を除去するために変更され得る。次いで、グリカンを使用して、例えばヒト対象への有効量の投与時に、例えば腸内で、特定の株、組み合わせ、または株の群の増殖を増加させ得る。
【１０４６】
さらなる実施形態では、唯一の炭水化物源としてグルコースを含有する培地中で増殖させた約４００ｍｇのビフィドバクテリウム・ロンガム（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｌｏｎｇｕｍ）（ＢＬＯ．１６）を含有するバイオマスペレットを、１ｍｌの０．０１×ＰＢＳで６回洗浄して、あらゆる残留培地を除去した。各洗浄について、ペレットをボルテックスにより再懸濁し、次いで１０，０００ｇで３分間の遠心分離により収集した。洗浄が完了した後、バイオマスを約１００ｍｇ／ｍｌで水に再懸濁し、室温で１時間、１６ｍｌの０．０１×ＰＢＳおよび４０μｌのトルエンで希釈して、細胞膜透過性を高めた。細胞ペレットを１０分間にわたる１０，０００ｇの遠心分離により回収し、上清を廃棄した。次いで、ペレットを同様の方法で２０ｍｌの０．０１×ＰＢＳで４回洗浄した。その後、バイオマスを４ｍｌの水に再懸濁し、酵素合成の目的で凍結乾燥した。
【１０４７】
バイオマスの調製後、２５０ｍｇのマルトースを１．５ｍｌのマイクロ遠心チューブに量り取り、４０℃の水浴中で短時間加熱しながら、２５０μｌの０．０５Ｍ、ｐＨ５酢酸緩衝液に溶解した。凍結乾燥バイオマスをマルトース溶液に添加した。反応物を３日間４０℃に保ち、オリゴマー産生をモニターした。各時間間隔で、試料の２０μｌ部分を沸騰水浴中で１０分間加熱して酵素を失活させた。次いで、この部分を水で約２０ｍｇ／ｍｌに希釈し、０．２μｍで濾過して反応の進行をＳＥＣまたはＴＬＣで確認した。
【１０４８】
実施例１０．定義されたグリカンを用いた細菌培養物の前処理によってヒドロラーゼ発現を誘導するための方法
実施例３に記載の単離された細菌調製物によるグリカンの産生方法は、酵素発現レベルをシフトさせるために、培養増殖工程において特定のグリコシルヒドロラーゼの発現を誘導することによってさらに改変され得る。この実施例において、実施例８に記載の細胞培養条件は、基質としてそのグリカン、グリコシド、オリゴ糖、または繊維の代謝に特異的なグリコシルヒドロラーゼを発現するように培養物を誘導するために、グリカン（例えば、先の合成からのもの）、グリコシド（例えば、アルファ−１，６−マンノビオース）、オリゴ糖（例えば、ラクトース、ＧＯＳ）、または繊維（例えば、セルロース、イヌリン、ペクチン）を、他の炭素源の代わりに添加することによってさらに改変され得る。このようにして、単離された細菌調製物の酵素活性は、所望のグリカンの産生を改善するために調整および増強され得る。例えば、アルファ−１，６−グルコース結合の産生に有利に働く細胞単離物は、イソマルトースなどのアルファ−１，６−グルコース結合を支配的に含有するオリゴ糖上で所望の株を培養することによって産生される。菌株が、イソマルトースを消化することができる酵素の上方制御を示唆する増殖速度を達成するまで、培養はイソマルトースを唯一の炭素源として確立される。この培養物からの単離物は、アルファ−１，６−グルコース加水分解に選択的なグリコシダーゼに富んでいる。この濃縮された単離物は、次いで、逆加水分解によりグリカンを産生するために使用される。グリカンは、アルファ−１，６−グルコシダーゼに富む細菌分類群の増殖を選択的に促進するために、対象、例えば腸に投与することができる。
【１０４９】
第２の実施形態では、グルコースの代わりに唯一の炭水化物源としてメリビオース（ガラクトース−アルファ−１，６−グルコース）を含む培地中で実施例９に記載のバイオマスを増殖させ、下方制御されたグルコシルヒドロラーゼおよび上方制御されたガラクトシルヒドロラーゼを有するバイオマスを得た。次いで、実施例９に記載の手順を、ｐＨ５．５、２５０μｌのクエン酸／リン酸緩衝液に溶解した１００ｍｇのメリビオースでマルトースを置換することにより改変した。次いで、実施例９に記載のように、手順に同様に従って、アルファ−グルコースの代わりにアルファ−ガラクトースのオリゴマーを作製した。
【１０５０】
実施例１１．グリカン調製物
オーバーヘッド撹拌器およびジャケット短経路凝縮器を備えた丸底フラスコに、１つ以上の単糖類または二糖類を、乾燥重量で３〜２０％の１つ以上の触媒、例えば、酸、イオン、イオン／酸含有触媒、例えば、米国特許第９，０７９，１７１号明細書および国際公開第２０１６／００７７７８号パンフレット（これらは参照によりその全体が本明細書に組み込まれる）に記載のものなど、と共に添加した。水または別の相溶性溶媒（０〜１０当量）は、乾燥混合物に添加し、スラリーは、選択された丸底フラスコの輪郭にできるだけ精確に合う大きさのパドルを用いて、約１００ｒｐｍで混合した。次いで、この混合物を８０〜１８５℃に加熱した。一旦固体が融解状態に達したら、容器を１０〜１０００ｍｂａｒの真空圧下に設置した。反応物を３０分間〜８時間撹拌し、絶えず反応物から水を除去した。反応進行は、ＨＰＬＣによってモニタリングした。十分なオリゴマー形成が生じたとき、撹拌器を止め、反応物を室温まで冷却し、大気圧まで放出し、生成物（固体またはシロップのいずれか）は、約５０Ｂｒｉｘ（１００ｇの溶液当たりの糖のグラム量）の溶液を作製するのに十分な水の体積中に溶解した。一旦溶解が完了すると、固体触媒を、濾過によって除去し、オリゴマー溶液を、例えば、回転蒸発によって、約５０〜７５Ｂｒｉｘまで濃縮した。有機溶媒が使用された場合には、水非混和性溶媒が、二相性抽出によって除去され得、水混和性溶媒は、濃縮工程と同時に回転蒸発によって除去され得る。
【１０５１】
とりわけ、以下のグリカンを複数のバッチで作製し、本明細書に記載の様々なアッセイで試験した：
単一グリカン単位（ホモグリカン）：ａｒａ１００、ｆｒｕ１００、ｇａｌ１００、ｇａｌＡ１００、ｇｌｃＮａｃ１００、ｇｌｕ１００、ｇｌｕＡ１００、Ｌｇｌｕ１００、ｍａｎ１００、ｒｈａ１００、ｘｙｌ１００。
【１０５２】
２グリカン単位（ヘテログリカン）：Ａｒａ６０Ｘｙｌ４０、Ａｒａ８０Ｘｙｌ２０、Ｇａｌ２０Ａｒａ８０、Ｇａｌ２０Ｘｙｌ８０、Ｇａｌ４０Ａｒａ６０、Ｇａｌ４０Ｍａｎ６０、Ｇａｌ４０Ｘｙｌ６０、Ｇａｌ５７Ｇｌｕ４３、Ｇａｌ６０Ａｒａ４０、Ｇａｌ６０Ｍａｎ４０、Ｇａｌ６０Ｘｙｌ４０、Ｇａｌ８０Ａｒａ２０、Ｇａｌ８０Ｍａｎ２０、Ｇａｌ８０Ｘｙｌ２０、Ｇｌｕ２０Ａｒａ８０、Ｇｌｕ２０Ｘｙｌ８０、Ｇｌｕ４０Ａｒａ６０、Ｇｌｕ４０Ｇａｌ６０、Ｇｌｕ４０Ｘｙｌ６０、Ｇｌｕ５０Ｇａｌ５０、Ｇｌｕ５０Ｌｇｌｕ５０、Ｇｌｕ６０Ａｒａ４０、Ｇｌｕ６０Ｇａｌ２０Ｍａｎ２０、Ｇｌｕ６０Ｇａｌ４０、Ｇｌｕ６０Ｍａｎ４０、Ｇｌｕ６０Ｘｙｌ４０、Ｇｌｕ６６Ｆｒｕ３３、Ｇｌｕ７５Ｇａｌａ２５、Ｇｌｕ７５ＧｌｕＡ２５、Ｇｌｕ７５ＧｌｕＮ２５、Ｇｌｕ８０Ａｒａ２０、Ｇｌｕ８０Ｇａｌ２０、Ｇｌｕ８０Ｌｇｌｕ２０、Ｇｌｕ８０Ｍａｎ２０、Ｇｌｕ８０Ｘｙｌ２０、Ｇｌｕ９０ＬＧｌｕ１０、Ｍａｎ２０Ａｒａ８０、Ｍａｎ２０Ｘｙｌ８０、Ｍａｎ４０Ａｒａ６０、Ｍａｎ４０Ｘｙｌ６０、Ｍａｎ６０Ａｒａ４０、Ｍａｎ６０Ｇｌｕ４０、Ｍａｎ６０Ｘｙｌ４０、Ｍａｎ７５Ｇａｌ２５、Ｍａｎ８０Ａｒａ２０、Ｍａｎ８０Ｇａｌ２０、Ｍａｎ８０Ｇｌｕ２１、Ｍａｎ８０Ｘｙｌ２０、Ｘｙｌ６０Ａｒａ４０、Ｘｙｌ７５Ａｒａ２５、Ｘｙｌ８０Ａｒａ２０、ならびにハイブリッドグリカンｇｌｕ９０ｓｏｒ１０およびｇｌｕ９０ｇｌｙ１０。
【１０５３】
３グリカン単位（ヘテログリカン）：Ｇａｌ５Ｘｙｌ５Ａｒａ９０、Ｇａｌ５Ｘｙｌ９０Ａｒａ５、Ｇａｌ１０Ｘｙｌ１０Ａｒａ８０、Ｇａｌ１０Ｘｙｌ４５Ａｒａ４５、Ｇａｌ１０Ｘｙｌ８０Ａｒａ１０、Ｇａｌ２０Ｘｙｌ２０Ａｒａ６０、Ｇａｌ２０Ｘｙｌ４０Ａｒａ４０、Ｇａｌ２０Ｘｙｌ６０Ａｒａ２０、Ｇａｌ３０Ｘｙｌ３０Ａｒａ４０、Ｇａｌ３０Ｘｙｌ４０Ａｒａ３０、Ｇａｌ３３Ｍａｎ３３Ａｒａ３３、Ｇａｌ３３Ｍａｎ３３Ｘｙｌ３３、Ｇａｌ３３Ｘｙｌ３３Ａｒａ３３、Ｇａｌ４５Ｘｙｌ１０Ａｒａ４５、Ｇａｌ４５Ｘｙｌ４５Ａｒａ１０、Ｇａｌ５０Ｇｌｕ２５Ｆｒｕ２５、Ｇａｌ４０Ｘｙｌ２０Ａｒａ４０、Ｇａｌ４０Ｘｙｌ３０Ａｒａ３０、Ｇａｌ４０Ｘｙｌ４０Ａｒａ２０、Ｇａｌ６０Ｘｙｌ２０Ａｒａ２０、Ｇａｌ８０Ｘｙｌ１０Ａｒａ１０、Ｇａｌ９０Ｘｙｌ５Ａｒａ５、Ｇｌｕ５Ｇａｌ５Ｍａｎ９０、Ｇｌｕ５Ｇａｌ９０Ｍａｎ５、Ｇｌｕ５Ｘｙｌ５Ａｒａ９０、Ｇｌｕ５Ｘｙｌ９０Ａｒａ５、Ｇｌｕ１０Ｇａｌ１０Ｍａｎ８０、Ｇｌｕ１０Ｇａｌ４５Ｍａｎ４５、Ｇｌｕ１０Ｇａｌ８０Ｍａｎ１０、Ｇｌｕ１０Ｘｙｌ１０Ａｒａ８０、Ｇｌｕ１０Ｘｙｌ４５Ａｒａ４５、Ｇｌｕ１０Ｘｙｌ８０Ａｒａ１０、Ｇｌｕ２０Ｇａｌ２０Ｍａｎ６０、Ｇｌｕ２０Ｇａｌ４０Ｍａｎ４０、Ｇｌｕ２０Ｇａｌ６０Ｍａｎ２０、Ｇｌｕ２０Ｇａｌ８０、Ｇｌｕ２０Ｘｙｌ２０Ａｒａ６０、Ｇｌｕ２０Ｘｙｌ４０Ａｒａ４０、Ｇｌｕ２０Ｘｙｌ６０Ａｒａ２０、Ｇｌｕ３０Ｇａｌ３０Ｍａｎ４０、Ｇｌｕ３０Ｇａｌ４０Ｍａｎ３０、Ｇｌｕ３０Ｘｙｌ３０Ａｒａ４０、Ｇｌｕ３０Ｘｙｌ４０Ａｒａ３０、Ｇｌｕ３３Ｇａｌ３３Ａｒａ３３、Ｇｌｕ３３Ｇａｌ３３Ｆｕｃ３３、Ｇｌｕ３３Ｇａｌ３３Ｍａｎ３３、Ｇｌｕ３３Ｇａｌ３３Ｘｙｌ３３、Ｇｌｕ３３Ｍａｎ３３Ａｒａ３３、Ｇｌｕ３３Ｍａｎ３３Ｘｙｌ３３、Ｇｌｕ３３Ｘｙｌ３３Ａｒａ３３、Ｇｌｕ４０Ｇａｌ２０Ｍａｎ４０、Ｇｌｕ４０Ｇａｌ３０Ｍａｎ３０、Ｇｌｕ４０Ｇａｌ４０Ｍａｎ２０、Ｇｌｕ４０Ｘｙｌ２０Ａｒａ４０、Ｇｌｕ４０Ｘｙｌ３０Ａｒａ３０、Ｇｌｕ４０Ｘｙｌ４０Ａｒａ２０、Ｇｌｕ４５Ｇａｌ１０Ｍａｎ４５、Ｇｌｕ４５Ｇａｌ４５Ｍａｎ１０、Ｇｌｕ４５Ｘｙｌ１０Ａｒａ４５、Ｇｌｕ４５Ｘｙｌ４５Ａｒａ１０、Ｇｌｕ６０Ｘｙｌ２０Ａｒａ２０、Ｇｌｕ７５ＧｌｕＮＡｃ２５、Ｇｌｕ８０Ｇａｌ１０Ｍａｎ１０、Ｇｌｕ８０Ｘｙｌ１０Ａｒａ１０、Ｇｌｕ９０Ｇａｌ５Ｍａｎ５、Ｇｌｕ９０Ｘｙｌ５Ａｒａ５、Ｍａｎ３３Ｘｙｌ３３Ａｒａ３３、Ｍａｎ５２Ｇｌｕ２９Ｇａｌ１９。
【１０５４】
４グリカン単位（ヘテログリカン）：Ｇａｌ２５Ｍａｎ２５Ｘｙｌ２５Ａｒａ２５、Ｇｌｕ２５Ｇａｌ２５Ｍａｎ２５Ａｒａ２５、Ｇｌｕ２５Ｇａｌ２５Ｍａｎ２５Ｘｙｌ２５、Ｇｌｕ２５Ｇａｌ２５Ｘｙｌ２５Ａｒａ２５、Ｇｌｕ２５Ｍａｎ２５Ｘｙｌ２５Ａｒａ２５。
【１０５５】
５グリカン単位（ヘテログリカン）：Ｇｌｕ２０Ｇａｌ２０Ｍａｎ２０Ｘｙｌ２０Ａｒａ２０。
【１０５６】
グリカンは、モノマーが構成する物質の割合を反映する１００の中からの数に従って、モノマーの糖成分を表す３〜６文字コードによって記載されている。したがって、「ｇｌｕ１００」は、１００％のＤ−グルコース（グリカン単位）のインプットから生成されるグリカンに属し、「ｇｌｕ５０ｇａｌ５０」は、５０％のＤ−グルコースおよび５０％のＤ−ガラクトース（グリカン単位）のインプットから、またはあるいは、ラクトースダイマー（グリカン単位）のインプットから生成されるグリカンに属するものと見なす。本明細書において使用される場合、ｘｙｌ＝Ｄ−キシロース；ａｒａ＝Ｌ−アラビノース；ｇａｌ＝Ｄ−ガラクトース；ｇｌｕ＝Ｄ−グルコース；ｒｈａ＝Ｌ−ラムノース；ｆｕｃ＝Ｌ−フコース；ｍａｎ＝Ｄ−マンノース；ｓｏｒ＝Ｄ−ソルビトール；ｇｌｙ＝Ｄ−グリセロール；ｎｅｕ＝ＮＡｃ−ノイラミン酸；Ｌｇｌｕ＝Ｌ−グルコース；ｇｌｕＡ＝Ｄ−グルクロン酸；ｇｌｕＮ＝Ｄ−グルコサミン；ｇｌｕＮＡｃ＝Ｎ−アセチル−Ｄ−グルコサミン；ｇａｌＡ＝Ｄ−ガラクツロン酸。３−Ｂｎ＝ベンジル；３−Ｏｂｎ＝３−ベンジルオキシ；６−ＴＢＤＰＳ＝６−ｔｅｒｔ−ブチルジフェニルシリル；ｇａｌｎａｃ＝Ｎ−アセチルガラクトサミン；ｒｉｂ＝Ｄ−リボース；Ｓｏｒ＝ソルビトール。
【１０５７】
実施例１２．精製
オリゴ糖および多糖を２５〜５０Ｂｒｉｘの最終濃度まで脱イオン水中に溶解した。次いで、材料を、少なくとも２質量当量のＤｏｗｅｘ  Ｍｏｎｏｓｐｈｅｒｅ  ８８イオン交換樹脂に曝露した。曝露は、滞留時間が、溶液が３〜５の最終ｐＨを達成するのに十分である限り、フラスコ中で、１２０〜１７０ｒｐｍで旋回させることによってまたは湿ったスラリー充填カラムを通して濾過することによって生じ得る。オリゴマー溶液は、濾過（旋回反応の場合のように）または溶出（カラム濾過の場合のように）によって単離され、プロセスは、溶液のｐＨが５．５超まで類似の様式でＤｏｗｅｘ  Ｍｏｎｏｓｐｈｅｒｅ  ７７イオン交換樹脂を用いて繰り返された。最後に、溶液が十分に清澄化されるまで溶液をＤｏｗｅｘ  Ｏｐｔｉｐｏｒｅ  ＳＤ−２吸着脱色用樹脂にさらし、０．２ミクロンフィルターを通して濾過して残留樹脂および樹脂微粉を除去した。次いで、最終溶液を、回転蒸発によって５０〜８５Ｂｒｉｘに濃縮するか、または凍結乾燥によって固体になるまで濃縮した。
【１０５８】
実施例１３．小規模でのハイスループット調製
オリゴマーおよびポリマーを、２４−、４８−、または９６−ウェルプレート中またはアルミニウム加熱ブロック内に収容されたサイズが均一なアレイの１ドラムのバイアル中、並列様式で合成した。この実施例では、全ての液体輸送は、プログラム可能なロボットによって、または目盛付きピペットを用いて手動で処理された。各バイアルまたはウェルに、乾燥重量で２０〜１００％の１つ以上の触媒、例えば、酸、イオン、イオン／酸含有触媒、例えば、米国特許第９，０７９，１７１号明細書および国際公開第２０１６／００７７７８号パンフレットに記載のものなどを添加した。プレートまたは加熱ブロックを、１０〜８００ｍｂａｒの真空下で５０〜１５０℃に加熱した真空オーブン中に覆わないまま設置した。オーブン真空ポンプを、再循環冷却トラップ、続いて、ドライアイス／アセトントラップからなる二段階の冷却器によって保護した。プレートまたはブロックを、撹拌せずに、高温かつ減圧下で、３０分間〜６時間加熱した。予め設定された期間の後、オーブンを大気圧まで放出し、プレートまたはブロックを室温まで冷却し、各ウェルまたはバイアルを、脱イオン水を用いて約５０Ｂｒｉｘまで希釈した。実施例１２に記載される固相抽出工程は、各カラムからの溶離液が蠕動ポンプまたはその他の好適な小型ポンプにより２〜６床体積／時の速度で次のカラムの上部に直ちに流れる、連続湿式充填カラムを通して溶離することによって行った。次いで、カラムスタックを脱イオン水ですすぎ、合わせた流出物を、凍結乾燥によって濃縮して、１〜１０質量％の残留水分含量を有する固体粉末を単離した。
【１０５９】
実施例１４．低分子量種の除去
低分子量種を除去するために、オリゴマーまたはポリマーを修飾した。
【１０６０】
一実施形態では、分離は、浸透分離によって達成された。Ｓｐｅｃｔｒｕｍ  Ｌａｂｓからの約４５ｃｍの１．０ｋＤ  ＭＷＣＯ  Ｂｉｏｔｅｃｈ  ＣＥ透析チューブ（折径３１ｍｍ）を、脱イオン水に入れ、１０分間浸し、次いで、一方の末端を透析チューブクリップで密封した。２５Ｂｒｉｘ溶液の８グラムの乾燥オリゴ糖を滅菌濾過し、数ｍＬの空気と共に第２のクリップでチューブを密封し、チューブを浮かせた。次いで、充填したチューブを、３ガロンのタンクの脱イオン水中に入れて、密封したチューブの緩やかな旋回を誘発するのに十分な力で撹拌した。８時間後、タンク内の水を交換し、チューブをさらに１６時間撹拌させた。一旦透析が完了し、物質が９５％超のＤＰ２＋収率および９０％超のＤＰ３＋収率を有すると、希釈溶液を滅菌濾過し、約６５Ｂｒｉｘの最終濃度まで真空下で濃縮するか、または１〜１０％の残留水分を有する固体になるまで凍結乾燥した。
【１０６１】
第２の実施形態では、分離は、接線流濾過（ＴＦＦ）によって達成された。この場合、脱イオン水中に溶解し、滅菌濾過した１００ｍＬの２５Ｂｒｉｘグリカン試料を、製造業者の推奨に従って調製されたＳｐｅｃｔｒｕｍ  Ｌａｂｓ  ＫｒｏｓＦｌｏ  Ｒｅｓｅａｒｃｈ  ＩＩｉ  ＴＦＦシステムの供給ボトルに入れた。次いで、試料を、２５ｐｓｉｇの膜貫通圧で１ｋＤ  ｍＰＥＳ  ＭｉｄｉＫｒｏｓ中空フィルターを通して透析濾過した。０．５透析体積毎に採取された供給ストックのＨＰＬＣ試料を使用して、物質がいつ９５％超のＤＰ２＋収率および９０％超のＤＰ３＋収率を有するかを決定し、この時点で、溶液を滅菌濾過し、６５Ｂｒｉｘのシロップになるまで真空下で濃縮するか、または１〜１０質量％の残留水分含量を有する固体になるまで凍結乾燥した。
【１０６２】
第３の実施形態では、分離はエタノール沈殿によって達成された。この場合、１００ｍＬの２５Ｂｒｉｘグリカン試料を、９００ｍＬの純粋なＵＳＰグレードのエタノールが入った激しく撹拌されているビーカーに、１０ｍＬ／分以下の速度で注いだ。一旦添加が完了すると、沈殿した固体を室温またはそれよりわずかに低い温度でさらに１５分間撹拌した。水和およびガミングを防止するために、窒素雰囲気下で微細フリット焼結ガラス漏斗を通して濾過することにより、沈殿した固体を単離した。固形物をエタノールで１回すすぎ、次いで、２５Ｂｒｉｘの最終濃度まで水中に溶解し、６５Ｂｒｉｘ超に再濃縮した。次いで、このシロップを２５Ｂｒｉｘに希釈し、もう一度濃縮して、残留エタノールを確実に除去した。
【１０６３】
実施例１５．調製物の分析方法
液体屈折分析による濃度測定
この実験は、任意の所与の水溶液中のグリカンの量を定量化するように設計された。Ｍｅｔｔｌｅｒ−Ｔｏｌｅｄｏ  Ｒｅｆｒａｃｔｏ  ３０ＧＳ携帯型糖用屈折計を、高純度の逆浸透脱イオン水を用いて較正した。数滴のグリカン溶液を、屈折計のレンズの上に０．２ミクロンのシリンジフィルターを通して直接濾過した。測定を室温で行い、Ｂｒｉｘとして報告した。グリカンを、２３℃で明らかな固化または結晶化を行わずに、５０、６０、７０または７５Ｂｒｉｘになるまで通常の方法で濃縮した。次いで、Ｂｒｉｘは、水の比重が１．０ｇ／ｍＬに等しいと仮定して、溶解度に変換され得る。従って、７５Ｂｒｉｘ（７５グラムのグリカンおよび２５グラムの水からなる１００グラムの溶液）は、３．０ｇ／ｍＬの水溶解度と等しい。比較として、Ｄ−グルコースの水溶解度は、２５℃で０．９０９ｇ／ｍＬ（４８Ｂｒｉｘ）であることがＳｉｇｍａ−Ａｌｄｒｉｃｈにより報告されている。
【１０６４】
加水分解およびＧＣ−ＭＳによるモノマー組成
この実験は、所与のオリゴ糖内のモノマー含有量の比率を定量化するように設計された。グリコシル組成分析を、Ｓａｎｔａｎｄｅｒ  ｅｔ  ａｌ．（２０１３）Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌｏｇｙ  １５９：１４７１によってこれまでに説明されている、試料から酸性メタノリシスによって産生された単糖類メチルグリコシドのペル−Ｏ−トリメチルシリル（ＴＭＳ）誘導体のガスクロマトグラフィー／質量分析法（ＧＣ／ＭＳ）の組み合わせによって実施した。１００〜２００μｇの試料を、適当な試験管中に凍結乾燥させた。イノシトール（２０μｇ）を、内部標準物として試料に添加し、次いで、この試料を、１Ｍ  ＨＣｌ／メタノール中で、８０℃で１８時間加熱した。次いで、得られた単糖類を、ＭｅＯＨ中のピリジンおよび無水酢酸を用いて再度アセチル化し、Ｔｒｉ−Ｓｉｌ（Ｐｉｅｒｃｅ）により８０℃で３０分間ペル−Ｏ−トリメチルシリル化した。ＴＭＳメチルグリコシドのＧＣ／ＭＳ分析を、インターフェースで５９７５Ｃ  ＭＳＤに接続されたＡｇｉｌｅｎｔ  ７８９０Ａ  ＧＣにより、シリカキャピラリーカラム（３０ｍ×０．２５ｍｍ内径）に結合されたＳｕｐｅｌｃｏ  Ｅｑｕｉｔｙ−１を用いて行った。各ピークは、公知の基準および例示されたグリカン内のモノマーの相対的割合のそれぞれのピークに許容される公平な計算の積分との比較に基づいて構成成分の糖に割り当てられた。列挙された全てのグリカンにおいて、所与のオリゴ糖のモノマー組成が実験誤差内でインプット比に一致し、出力組成が測定の精度内でインプット組成に一致した、という条件を通常の方法で識別することができる。
【１０６５】
サイズ排除クロマトグラフィー（ＳＥＣ）による分子量分布
この実験は、所与のオリゴ糖内での分子量の分布を定量化するように設計された。この測定は、Ｍｏｎｏｇｒａｐｈ  ｏｆ  Ｕｎｉｔｅｄ  Ｓｔａｔｅｓ  Ｐｈａｒｍａｃｏｐｅｉａ，３８（６）Ｉｎ−Ｐｒｏｃｅｓｓ  Ｒｅｖｉｓｉｏｎ：Ｈｅｐａｒｉｎ  Ｓｏｄｉｕｍ（ＵＳＰ３７−ＮＦ３２）に記載される方法を用いて、ＨＰＬＣによって行われた。分離は、１．０ｍＬ／分の流量で溶離液として５０ｍＭの酢酸アンモニウムおよびＥＬＳＤ検出器を用いて、ＧＥ  ｓｕｐｅｒｐｏｓｅ１２カラムを介したＡｇｉｌｅｎｔ  １２００  ＨＰＬＣシステムにおいて達成された。カラム温度を３０℃に設定し、デキストラン（１ｋＤ、５ｋＤ、１０ｋＤ重量）を使用して、標準曲線を描いた。２ｍｇ／ｍｌ溶液の試料を調製し、０．４５μｍのスピンフィルターを通過させ、続いて、ＨＰＬＣに４０μｌ注入した。３次の多項式曲線は、対数分子量および列挙された基準の溶出体積に基づいて構築された。試料についての重量平均分子量（Ｍｗ）、数平均分子量（Ｍｎ）、および多分散性指数（ＰＤＩ）は、標準曲線との比較によって計算された。図１は、平均分子量が１２１２ｇ／ｍｏｌまたは約ＤＰ７であると決定された、ｇｌｕ１００の試料のＳＥＣ評価の際に生成された曲線を示す。曲線を誘導する１０％の最大吸収での曲線の点によって定義される、物質の分子量の上部末端は、４５５９ｇ／ｍｏｌまたは約ＤＰ２８であることが決定された。曲線を追跡する１０％の最大吸収での曲線の点によって定義される、物質の分子量の下部末端は、２００ｇ／ｍｏｌまたは約ＤＰ１であることが決定された。ｇｌｕ５０ｇａｌ５０試料の同様の分析は、それぞれ、１１９５ｇ／ｍｏｌ（約ＤＰ７）、４３３１ｇ／ｍｏｌ（約ＤＰ２７）、および２２１ｇ／ｍｏｌ（約ＤＰ１）のＭＷ、高質量、および低質量を示した。
【１０６６】
イオン親和性クロマトグラフィー（ＩＡＣ）による分子量分布
２（ＤＰ２＋）および３（ＤＰ３＋）以上のＤＰを有するグリカンの割合は、イオン親和性クロマトグラフィーによって測定され得る。グリカンの試料を、５０〜１００ｍｇ／ｍＬになるまで希釈し、この溶液１０μＬを、７．８×３００ｍｍ  ＢｉｏＲａｄ  Ａｍｉｎｅｘ  ＨＰＸ−４２ＡカラムおよびＲＩ検出器を装備するＡｇｉｌｅｎｔ  １２６０  ＢｉｏＰｕｒｅ  ＨＰＬＣに注入した。溶離液として純粋なＨＰＬＣグレードの水を用いて、試料を８０℃のカラムを通して０．６ｍＬ／分で溶出し、ＲＩ検出器を５０℃で維持した。ＤＰ１〜６を示すピークは、参照基準と比較し、Ａｇｉｌｅｎｔ  ＣｈｅｍＳｔａｔｉｏｎソフトウェアを用いて積分することによって割り当てられる。ピークは、典型的には、ＤＰ１、ＤＰ２、ＤＰ３、ＤＰ４〜７、およびＤＰ８＋として積分される。実施例１１に記載の反応によって達成可能なＤＰは、モノマーごとに異なるが、手順に従えばバッチ間で一貫している。例えば、ｇｌｕ１００の１７のバッチにわたって、ＤＰ２＋値は、７７〜９３％の範囲におよび、ＤＰ３＋値は、８０〜９０％の範囲に及んだ。逆に、６バッチのａｒａ１００にわたって、ＤＰ２＋値は、６３〜７８％の範囲におよび、ＤＰ３＋値は、４８〜７１％の範囲に及んだ。モノマーの混合物は、個々の成分の平均として挙動した。
【１０６７】
２Ｄ  ＮＭＲによるアルファ／ベータ分布
この実験は、二次元ＮＭＲによって所与の試料内のアルファ−グリコシド結合とベータ−グリコシド結合との比率を定量化するように設計された。約１５０ｍｇの６５Ｂｒｉｘオリゴ糖溶液を、４００ｍｂａｒの圧力下、真空オーブン中で、４５〜９５℃で安定した質量になるまで乾燥させた。試料は、Ｄ２Ｏ中の２サイクルの溶解に供され、乾燥させて、残りのＨ２Ｏを除去した。乾燥後、試料を、０．１％アセトンを含む７５０μＬのＤ２Ｏ中で溶解し、３ｍｍ  ＮＭＲチューブに入れ、２１．１℃で作動するＢｒｕｋｅｒ  ＢＢＦＯプローブを装備する、５００．１３ＭＨｚ  １Ｈ（１２５．７７ＭＨｚ  １３Ｃ）で作動するＢｒｕｋｅｒ  Ａｖａｎｃｅ−ＩＩＩ中で分析した。試料は、標準的なＢｒｕｋｅｒパルス配列を用いて、ヘテロ原子の単一の量子コヒーレンスパルス配列（ＨＳＱＣ）を用いて分析した。４〜６ｐｐｍ（１Ｈ）と８０〜１２０ｐｐｍ（１３Ｃ）との間のアノマープロトンは、Ｒｏｓｌｕｎｄ  ｅｔ  ａｌ．（２００８）Ｃａｒｂｏｈｙｄｒａｔｅ  Ｒｅｓ．３４３：１０１−１１２において報告された、グルコースとの類似性によって割り当てられた。スペクトルは、内部アセトンシグナル：１Ｈ−２．２２ｐｐｍ；１３Ｃ−３０．８ｐｐｍを基準にした。異性体は、Ｍｅｓｔｒｅｌａｂ  ＲｅｓｅａｒｃｈからのＭＮｏｖａソフトウェアパッケージ（Ｓａｎｔｉａｇｏ  ｄｅ  Ｃｏｍｐｏｓｔｅｌａ，Ｓｐａｉｎ）を用いてそれらのそれぞれのピークの積分によって定量化された。図２は、代表的なスペクトルのアノマー領域を示す。この方法で３００を超える試料がアッセイされ、表２９は、ｒｈａ１００の場合に４：１と高く、ｇｌｕ５０ｇａｌ５０の場合に１：１と低いアルファ／ベータ比を示す、組み合わせの試料にわたる分布を列挙する。
【１０６８】
【表９９】
2020513410.tif 000101
【１０６９】
ＮＭＲによる組成物の同定
この実験は、構成モノマーの２Ｄ−ＮＭＲの同定によってグリカンの組成を同定するように設計された。約１５０ｍｇの６５Ｂｒｉｘオリゴ糖溶液を、４００ｍｂａｒの圧力下、真空オーブン中で、４５〜９５℃で安定した質量になるまで乾燥させた。試料は、Ｄ２Ｏ中の２サイクルの溶解に供され、乾燥させて、残りのＨ２Ｏを除去した。乾燥後、試料を、０．１％アセトンを含む７５０μＬのＤ２Ｏ中で溶解し、３ｍｍ  ＮＭＲチューブに入れ、７０℃で作動するＢｒｕｋｅｒ  ＢＢＦＯプローブを装備する、５００．１３ＭＨｚ  １Ｈ（１２５．７７ＭＨｚ  １３Ｃ）で作動するＢｒｕｋｅｒ  Ａｖａｎｃｅ−ＩＩＩ中で分析した。試料は、標準的なＢｒｕｋｅｒパルス配列を用いて、ヘテロ原子の単一の量子コヒーレンスパルス配列（ＨＳＱＣ）を用いて分析した。次いで、単一糖モノマーから生じる各グリカンスペクトルのアノマー領域を、そのモノマーへの特定のグリコシド結合の特徴を示すピークについて試験した。任意の所与のグリカンについては、ＨＳＱＣスペクトルは、特定の位置化学および立体化学の結合配置に固有であるピークの同定を可能にする。例えば、図５は、これらのピークがどのように特定のグリコシドの位置化学および立体化学を同定するために使用され得るかを示す、ｇｌｕ１００調製物のスペクトルの部分割り当てを示す。多糖内の単一炭水化物環のスピン単離の性質により、１超のモノマーによるグリカンのＨＳＱＣスペクトルは、その構成糖のそれぞれのＨＳＱＣピークの合計によって表されると予測される。したがって、各構成モノマーは、他の構成モノマーにかかわらず、そのモノマーを含む任意のグリカンに見られるであろう固有のＨＳＱＣピークを有し、さらに、グリカンを合成するために使用されるモノマーは、各構成モノマーに特有のフィンガープリントピークを同定することによって決定され得る。例えば、図３Ｂは、ｇｌｕ５０ｇａｌ５０のＨＳＱＣスペクトルがｇｌｕ１００（図３Ａ）およびｇａｌ１００（図３Ｃ）のハイブリッドであることを示す。表３０は、選択されたグリカン単位におけるフィンガープリントピークを列挙する。
【１０７０】
【表１００】
2020513410.tif 000102
【１０７１】
３個以下の異なるグリカン単位を含むグリカンの合成の際に出発物質として使用される各グリカン単位について、少なくとも５つのピークが出現した。４個以上の異なるグリカン単位を含むグリカンのＨＳＱＣスペクトルは、各構成グリカン単位において少なくとも４つのピークを有する。
【１０７２】
図６Ａおよび６Ｂは、それぞれ、ｍａｎ１００およびｘｙｌ１００のＨＳＱＣスペクトルを示す。
【１０７３】
グリコシド結合分析
この実験は、所与のオリゴ糖内でグリコシド位置異性体（分岐）の分布を定量化するように設計された。グリコシル結合分析のために、試料をパーメチル化し、脱重合化し、還元し、アセチル化し、得られた部分的にメチル化したアルジトールアセテート（ＰＭＡＡ）を、Ｈｅｉｓｓ  ｅｔ  ａｌ（２００９）Ｃａｒｂｏｈｙｄｒ．Ｒｅｓ．３４４：９１５によって記載されるように、ガスクロマトグラフィー−質量分析法（ＧＣ−ＭＳ）によって分析された。試料を、２００μｌのジメチルスルホキシド中で懸濁し、１日間撹拌した。パーメチル化は、水酸化ナトリウム（１５分）およびヨウ化メチル（４５分）による２ラウンドの処置によって達成された。水溶液は、２Ｍトリフルオロ酢酸を添加し、１２１℃で２時間加熱することによって加水分解された。固体を真空下で単離し、酢酸／トリフルオロ酢酸中でアセチル化した。得られたＰＭＡＡを、インターフェースで５９７５Ｃ  ＭＳＤ（質量選択検出器、電子衝撃イオン化モード）に接続されたＡｇｉｌｅｎｔ  ７８９０Ａ  ＧＣにより分析し、分離は、シリカキャピラリーカラムに結合された３０ｍ  Ｓｕｐｅｌｃｏ  ＳＰ−２３３１結合相において行われた。図４は、この分析からの３つの代表的なＧＣスペクトルを示す。これらの分析は、グリカンが、少なくとも０．１％、０．２％、０．５％、１％、２％、５％、１０％またはそれを超える１，２−グリコシド結合型、例えば、ａｒａ１００＝３．８％、ｇａｌ１００＝７．２％；少なくとも０．１％、０．２％、０．５％、１％、２％、５％、１０％またはそれを超える１，３−グリコシド結合型、例えば、３−ｂｎ−ｇｌｕ１００＝１．７％、ｇｌｕ５０ｇａｌ５０＝１０．４％；少なくとも０．１％、０．２％、０．５％、１％、２％、５％、１０％またはそれを超える１，４−グリコシド結合型、例えば、ｇｌｕ５０ｇａｌ５０＝５．９％、ｇａｌ３３ｍａｎ３３ａｒａ３３＝１０．１％；および少なくとも０．１％、０．２％、０．５％、１％、２％、５％、１０％、１５％、２０％、２５％またはそれを超える１，６−グリコシド結合型、例えば、ｇａｌ３３ｍａｎ３３ａｒａ３３＝１３．４％、ｇｌｕ１００＝２５．４％を有することを示す。物質はまた、少なくとも０．０５の分岐度（ＤＢ）である、少なくとも５％、１０％、１５％、２０％、２５％、３０％、４０％、５０％の、またはそれを超える分岐結合タイプ（１，３，６−、１，４，６−、または１，２，４−グリコシドが挙げられるが、これらに限定されない、例えば表３１）を含有していた。分岐度は、モノマー単位の総数に対する分岐モノマーの平均数として定義される。例えば、２０％のグルコースモノマー単位が３つ以上の他のグルコースモノマーへのグリコシド結合を含むｇｌｕ１００グリカンポリマーは、０．２０のＤＢを有するであろう。グリカンはまた、フラノース形態で約３〜１２％のモノマー単位を有する。単一モノマーに由来するグリカンは、少なくとも１２個の異なる非末端置換パターンからなっていた。２つのモノマーに由来するグリカンは、少なくとも１８個の異なる非末端置換パターン、例えば、ｇｌｕ−１，２−ｇｌｕ；ｇｌｕ−１，２−ｇａｌ；ｇａｌ−１，２−ｇｌｕ；ｇａｌ−１，２−ｇａｌ��ｇｌｕ−１，２（ｇｌｕ）、６−ｇｌｕ；ｇｌｕ−１，３−ｇｌｕ；ｇｌｕ−１，３−ｇａｌ；などからなっていた。３つ以上のモノマーに由来するグリカンは、少なくとも２４個の異なる非末端置換パターンからなった。
【１０７４】
【表１０１】
2020513410.tif 000103
【１０７５】
【表１０２】
2020513410.tif 000104
【１０７６】
【表１０３】
2020513410.tif 000105
【１０７７】
【表１０４】
2020513410.tif 000106
【１０７８】
蛍光標識糖鎖電気泳動（ＦＡＣＥ）
この実験は、バックグラウンドシグナル（例えば、細菌培養物からの物質、残留酵素、緩衝液など）が伝統的なＳＥＣ技術に干渉する場合に、所与のオリゴ糖内のグリカンの分子量を定量するように設計された。選択されたグリカンを、８−アミノピレン−１，３，６−トリスルホン酸（ＡＰＴＳ）または８−アミノナフタレン−１，３，６−トリスルホン酸（ＡＮＴＳ）などのポリアニオン染料で標識し、ゲル電気泳動によって分離した。選択されたグリカンを水中で１００ｍｇ／ｍＬに希釈し、この溶液５μＬを１．００ｍＬに希釈して最終溶液濃度０．５μｇ／μＬを得た。３時間真空乾燥した１０ｎｍｏｌのグリカンに、２μｌの０．１Ｍ  ＡＰＴＳまたはＡＮＴＳ、２μＬのＴＨＦ中１Ｍ  ＮａＣＮＢＨ３、および２μＬの１．７Ｍクエン酸を加え、混合物を７０℃に２時間保った。標識溶液を９４μｌの水で希釈し、その後、４μＬのこの標識グリカン溶液を１μｌの水中４０％グリセロールと混合し、２０％ポリアクリルアミドプレキャストゲル（Ｌｉｆｅ−Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ）上に充填した。電気泳動を４℃で、１００Ｖで５分間、次いで４００Ｖで４０分間行った。マルトデキストリンおよびプルラン１２，０００を同じ様式で処理し、各ゲルの標準として使用した。Ｂｉｏ−Ｒａｄ  Ｉｍａｇｅ  Ｌａｂ  ３．０ソフトウェアパッケージを使用して、Ｂｉｏ−Ｒａｄ  Ｇｅｌ  Ｄｏｃ  ＥＺ  Ｉｍａｇｅｒでゲルを可視化した。Ｂｉｏ−Ｒａｄソフトウェアで撮影した画像は、ＧＥ  ＩｍａｇｅＱｕａｎｔ  ＴＬ  ８．１ソフトウェアを使用して処理した。
【１０７９】
投与（例えば、対象の腸に）したときの代謝産物の産生またはレベルを調節するのに有効な、グリコシド酵素（例えば、ヒト腸内微生物中に存在するグリコシダーゼ酵素）の基質である、グリカン調製物を生成するために、本明細書に記載のように反応条件を調節して、所望の平均重合度、分岐度、およびグリコシド結合の分布を達成し得、また、必要に応じて、ヒト腸内微生物は、本明細書に記載のように、クラス１、クラス２、クラス３、クラス４、クラス５、クラス６、またはクラス７から選択されるグリコ分類群のうちの１つである。
【１０８０】
実施例１６．イオン交換クロマトグラフィーによるグリカンポリマー調製物の精製
必要に応じて、本明細書中に記載のように生成された任意のグリカンは、イオン交換クロマトグラフィーによって精製される。オリゴ糖および多糖を合成し、２５〜５０Ｂｒｉｘの最終濃度まで脱イオン水中に溶解した。次いで、材料を、少なくとも２質量当量のＤｏｗｅｘ  Ｍｏｎｏｓｐｈｅｒｅ  ８８イオン交換樹脂に曝露した。曝露は、溶液が３〜５の最終ｐＨを達成するのに十分な滞留時間で、フラスコ内で、１２０〜１７０ｒｐｍで旋回させることによって、または湿ったスラリー充填カラムを通して濾過することによって生じ得る。オリゴマー溶液は、濾過（旋回反応の場合のように）または溶出（カラム濾過の場合のように）によって単離され、プロセスは、溶液のｐＨが５．５超まで類似の様式でＤｏｗｅｘ  Ｍｏｎｏｓｐｈｅｒｅ  ７７イオン交換樹脂を用いて繰り返された。最後に、溶液が十分に清澄化されるまで溶液をＤｏｗｅｘ  Ｏｐｔｉｐｏｒｅ  ＳＤ−２吸着脱色用樹脂にさらし、滅菌０．２ミクロンフィルターを通して濾過して残留固形物および潜在的な微生物汚染物質を除去した。細胞物質反応物から単離されたグリカンは、遠心分離、ゲルクロマトグラフィー、限外濾過または透析、沈殿、または残留細胞物質を除去するための他の周知の方法によって、さらに精製され得る。
【１０８１】
実施例１７．活性炭クロマトグラフィーによるグリカンポリマー調製物の分画
必要に応じて、本明細書に記載のように生成した任意のグリカンは、活性炭クロマトグラフィーによって分画される。オリゴ糖および多糖を合成し、活性炭上のクロマトグラフィーによって異なる分子量のプールに分画した。５００ｍｇの４０〜６０Ｂｒｉｘグリカン水溶液および６ｇの活性炭（グリカン：炭＝１：１２、ｗ／ｗ）を１００ｍＬの１％ｖ／ｖエタノール／水溶液中で撹拌した。混合物を２５０ｍＬビーカー中、室温で３時間、３００ｒｐｍで撹拌し、６ｇのセライト５４５（Ａｃｒｏｓ  Ｏｒｇａｎｉｃｓ）を予め充填した粗ガラスフリットを通して真空濾過した。木炭およびセライトをよく混合し、空の２０ｍＬ  Ｂｉｏｔａｇｅ  Ｓａｍｐｌｅｔカートリッジに充填した。カートリッジの出口を、８ｇの木炭／セライト混合物（１：１、ｗ／ｗ）で予め充填した第２の２０ｍＬ  Ｂｉｏｔａｇｅ  Ｓａｍｐｌｅｔカートリッジの入口に接続した。次に、１００ｍＬのエタノール／水溶出液（０％、１％、３％、５％、７％、１０％、１５％、２０％、２５％、３０％、３５％、４０％、４５％、５０％、ｖ／ｖ）を３．７ｍＬ／分の流速でカートリッジカラムに通して、Ｍａｓｔｅｒｆｌｅｘ蠕動ポンプを用いてグリカン画分を脱着させた。各画分について１００ｍＬの溶出液を回収し、真空乾燥した。
【１０８２】
一実施形態では、このプロセスは、グリカンからモノマー糖のみを除去するために使用された。この実施形態では、モノマーがもはやカラムから溶出しなくなるまで、木炭を１％水性エタノールで洗浄した。次いで、木炭を５０％エタノール水溶液で洗浄して、図１１に示されるように、全ての残留グリカンを除去した。
【１０８３】
第２の実施形態では、この方法を用いてグリカンを平均分子量が増大する複数のプールに分割した。この実施形態では、木炭は、エタノール比率が増加する（例えば、１％、２％、５％、１０％、２０％、５０％）溶出液で順次洗浄された。溶出液中のエタノールの画分が増加するにつれて、分子量が増加する画分を回収した。
【１０８４】
実施例１８．酵母発酵によるモノマーおよびダイマー材料の除去
必要に応じて、本明細書中に記載のように生成される任意のグリカンは、酵母発酵によってそのモノマーおよびダイマー材料が除去される。オリゴ糖および多糖は、酵母培養物を用いた発酵によってモノマー種およびいくつかのダイマー種から合成および精製した。この手順は主に、細菌の発酵に排他的に利用可能であるグリカンの存在度を富化するために、宿主代謝によって消化可能であり得る物質を除去することを意図している。パン酵母（２ｇ、Ｆｌｅｉｓｃｈｍａｎｎ’ｓ  Ｙｅａｓｔ、Ｆｅｎｔｏｎ、ＭＯ）を脱イオン水１０ｍｌ中で１〜１６時間、４℃で膨潤させた。アルギン酸ナトリウム（２．５ｇ）を、約８０℃に維持された熱撹拌プレート上で約３００ｒｐｍで１時間撹拌することによって、１００ｍｌの熱脱イオン水に溶解した。アルギン酸ナトリウム溶液の最終容量を脱イオン水で１００ｍｌに調整した。アルギン酸塩溶液の温度を約３０℃に冷却した後、酵母懸濁液をアルギン酸塩溶液と約１００ｒｐｍで１０分間混合した。混合物を、２１ゲージ針を備えた１５ｍｌシリンジに移し、２００ｍｌ  Ｅｒｌｅｎｍｅｙｅｒフラスコ中の攪拌していない４％塩化カルシウム（Ｓｉｇｍａ）溶液にゆっくりと滴下して酵母固定化アルギン酸ビーズを形成した。次いで、ビーズを１時間４℃に保って固化し、水で少なくとも５回洗浄して塩化カルシウムを除去した。この酵母ビーズストックを、長くとも１週間、水中で４℃に保った。酵母ビーズを、３７℃で２４時間、２０Ｂｒｉｘのグリカン溶液に、２５ｍｌグリカン溶液あたり約６ｍｌのビーズの比率で添加した。使用済みビーズを新しいビーズと交換し、さらに３９時間インキュベートした。単糖類除去の進行をＳＥＣ−ＨＰＬＣによってモニターした。さらなる単糖除去を必要とする試料には、第２のビーズ補充を適用した。酵母処置後、グリカン溶液を０．２μｍの滅菌フィルターを通して濾過し、実施例１６に記載のようにイオン交換カラムに通した。濾液を回収し、真空中で濃縮した。この方法を用いて、全てのモノマーガラクトースおよびグルコースをグリカンから除去した。いくつかのダイマー（例えば、メリビオース、アロラクトース）は発酵に耐性があったが、いくつかのダイマー材料（例えば、マルトース、ラクトース）は、この方法を用いて除去することができた。図７Ａ〜７Ｂは、酵母発酵前後のマルトース由来グリカンを示す。
【１０８５】
マルトース、スクロース、パラチノース、セロビオース、メレジトース、およびメリビオースから作製されたグリカンを精製するために、パン酵母（Ｆｌｅｉｓｃｈｍａｎｎ’ｓ  Ｙｅａｓｔ、Ｆｅｎｔｏｎ、ＭＯ）が選択された。ラフィノース、ゲンチオビオース、ラクトース、およびラクツロースから作製されたグリカンを精製するために、クルイベロミセス・マルシアヌス（Ｋｌｕｙｖｅｒｏｍｙｃｅｓ  ｍａｒｘｉａｎｕｓ）（ＡＴＣＣ  ４６５３７）が選択された。クルイベロミセス・マルシアヌス（Ｋｌｕｙｖｅｒｏｍｙｃｅｓ  ｍａｒｘｉａｎｕｓ）ビーズは、酵母懸濁液が１０ｇの新たに培養された酵母を２．５ｍｌの水と混合することによって作られたことを除いて、類似の方法で作製された。
【１０８６】
実施例１９．低ＤＰグリカンの効果を評価するための単一株増殖アッセイ
インビトロアッセイは、胃腸管の共生生物および病原体を含む様々な細菌株の能力を評価するため、増殖基質として酵素的に合成されたグリカン（即ち、グリカンポリマー）およびそれらが由来する糖を利用するために行われた。アッセイは、酵素的に合成されたグリカンが、それらが由来する糖と、それらがヒトマイクロバイオームの潜在的に有益または有害な細菌メンバーの増殖をどの程度よく支持するかにおいて、異なるかどうかを決定するように設計された。細菌株を、パラジウム触媒を特徴とする嫌気性チャンバ（ＡＳ−５８０、Ａｎａｅｒｏｂｅ  Ｓｙｓｔｅｍｓ）中、全ての工程で取り扱った。チャンバは最初に、水素５％、二酸化炭素５％および窒素９０％からなる嫌気性ガス混合物でパージすることによって嫌気性にし、その後、この同じ嫌気性ガス混合物を使用して嫌気性状態に維持した。酸素の存在下で色が変化するＯｘｏｉｄ嫌気性インジケーターストリップを用いてチャンバの嫌気性を毎日確認した。全ての培養培地、アッセイプレート、他の試薬およびプラスチック消耗品を、細菌と接触する前に少なくとも２４〜４８時間、嫌気性チャンバ内で予め還元した。酵素的に合成されたグリカン、ラクト−オリゴ、メリブ−オリゴ、マルト−オリゴ、スクロ−オリゴ、ラフィノ−オリゴおよびラクツロ−オリゴ、およびそれらが由来する糖、ラクトース、メリビオース、マルトース、スクロース、ラフィノースおよびラクツロースをフィルター滅菌し、滅菌水中５％ｗ／ｖで調製し、アッセイ中０．５％ｗ／ｖの最終濃度でＣｏｓｔａｒ  ３３７０アッセイプレートに添加し、各グリカンは３つの隣接していないウェル内でアッセイし、デキストロースおよび水を陽性および陰性対照として供給した。
【１０８７】
細菌分離株は、Ａｍｅｒｉｃａｎ  Ｔｙｐｅ  Ｃｕｌｔｕｒｅ  Ｃｏｌｌｅｃｔｉｏｎ（ＡＴＣＣ）およびＬｅｉｂｎｉｚ  Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅ  ＤＳＭＺ−Ｇｅｒｍａｎ  Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅ  ｏｆ  Ｍｉｃｒｏｏｒｇａｎｉｓｍｓ  ａｎｄ  Ｃｅｌｌ  Ｃｕｌｔｕｒｅｓ（ＤＳＭＺ）から得た。バクテロイデス門（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｔｅｓ）バクテロイデス・シータイオタオミクロン（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ  ｔｈｅｔａｉｏｔａｏｍｉｃｒｏｎ）ＡＴＣＣ  ２９７４１「ＢＴＨ．８」およびパラバクテロイデス・ディスタソニス（Ｐａｒａｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ  ｄｉｓｔａｓｏｎｉｓ）ＡＴＣＣ  ８５０３「ＰＤＩ．６」、クロストリジウム目（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉａｌｅｓ）クロストリジウム・シンデンス（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｓｃｉｎｄｅｎｓ）ＡＴＣＣ  ３５７０４「ＣＳＣ．３２」、ドレア・フォルミシゲネランス（Ｄｏｒｅａ  ｆｏｒｍｉｃｉｇｅｎｅｒａｎｓ）ＡＴＣＣ  ２７７５５「ＤＦＯ．３６」、ドレア・ロンギカテナ（Ｄｏｒｅａ  ｌｏｎｇｉｃａｔｅｎａ）ＤＳＭ  １３８１４「ＤＬＯ．７６」およびブラウティア・ハンセニイ（Ｂｌａｕｔｉａ  ｈａｎｓｅｎｉｉ）ＡＴＣＣ  ２７７５２「ＢＨＡ．２０」の培養物を、牛赤身挽肉、カゼインの酵素消化物、酵母エキス、リン酸カリウム、デキストロース、システイン、ヘミンおよびビタミンＫ１を含む予め還元された濃縮培地、Ｃｈｏｐｐｅｄ  Ｍｅａｔ  Ｇｌｕｃｏｓｅブロス（ＣＭＧ、Ａｎａｅｒｏｂｅ  Ｓｙｓｔｅｍｓ）中、３７℃で１８〜４８時間、嫌気的に増殖させた。製造業者のプロトコルに従ってＧｅｎ５  ２．０  Ａｌｌ−Ｉｎ−Ｏｎｅ  Ｍｉｃｒｏｐｌａｔｅ  Ｒｅａｄｅｒ  Ｓｏｆｔｗａｒｅを備えたＢｉｏｔｅｋ  Ｓｙｎｅｒｇｙ  ２プレートリーダーを使用して、Ｃｏｓｔａｒ  ３３７０ポリスチレン９６ウェル平底アッセイプレートにおいて６００ｎＭ（ＯＤ６００）での各培養物の光学密度を測定し、糖を含まずに調製した規定培地および半規定培地において最終的にＯＤ６００  ０．０１まで細胞を希釈することによって、接種物を調製した。Ｄ．フォルミシゲネランス（Ｄ．Ｆｏｒｍｉｃｉｇｅｎｅｒａｎｓ）、Ｐ．ディスタソニス（Ｐ．Ｄｉｓｔａｓｏｎｉｓ）、Ｂ．ハンセニイ（Ｂ．Ｈａｎｓｅｎｉｉ）およびＤ．ロンギカテナ（Ｄ．Ｌｏｎｇｉｃａｔｅｎａ）分離株を、０〜５％（ｖ／ｖ）ＣＭＧを添加した、９００ｍｇ／Ｌ塩化ナトリウム、２６ｍｇ／Ｌ塩化カルシウム二水和物、２０ｍｇ／Ｌ塩化マグネシウム六水和物、１０ｍｇ／Ｌ塩化マンガン四水和物、４０ｍｇ／Ｌ硫酸アンモニウム、４ｍｇ／Ｌ硫酸鉄七水和物、１ｍｇ／Ｌ塩化コバルト六水和物、３００ｍｇ／Ｌ第二リン酸カリウム、１．５ｇ／Ｌ第二リン酸ナトリウム、５ｇ／Ｌ炭酸水素ナトリウム、０．１２５ｍｇ／Ｌビオチン、１ｍｇ／Ｌピリドキシン、１ｍ／Ｌパントテン酸塩、７５ｍｇ／Ｌヒスチジン、７５ｍｇ／Ｌグリシン、７５ｍｇ／Ｌトリプトファン、１５０ｍｇ／Ｌアルギニン、１５０ｍｇ／Ｌメチオニン、１５０ｍｇ／Ｌトレオニン、２２５ｍｇ／Ｌバリン、２２５ｍｇ／Ｌイソロイシン、３００ｍｇ／Ｌロイシン、４００ｍｇ／Ｌシステイン、および４５０ｍｇ／Ｌプロリン（Ｔｈｅｒｉｏｔ  ＣＭ  ｅｔ  ａｌ．Ｎａｔ  Ｃｏｍｍｕｎ．２０１４；５：３１１４）中で試験した。Ｂ．シータイオタオミクロン（Ｂ．ｔｈｅｔａｉｏｔａｏｍｉｃｒｏｎ）を、１００ｍＭリン酸カリウム緩衝液（ｐＨ７．２）、１５ｍＭ塩化ナトリウム、８．５ｍＭ硫酸アンモニウム、４ｍＭ  Ｌ−システイン、１．９μＭヘマチン、２００μＭ  Ｌ−ヒスチジン、１００μＭ塩化マグネシウム、１．４μＭ硫酸鉄七水和物、５０μＭ塩化カルシウム、１μｇ／ｍＬビタミンＫ３および５ｎｇ／ｍＬビタミンＢ１２（Ｍａｒｔｅｎｓ  ＥＣ  ｅｔ  ａｌ．Ｃｅｌｌ  Ｈｏｓｔ  ＆  Ｍｉｃｒｏｂｅ  ２００８；４，４４７−４５７）中で試験した。Ｃ．シンデンス（Ｃ．ｓｃｉｎｄｅｎｓ）を、０〜１０％ＣＭＧを添加した、１０ｇ／Ｌトリプトンペプトン、５ｇ／Ｌ酵母エキス、０．５ｇ／Ｌ  Ｌ−システイン塩酸塩、０．１Ｍリン酸カリウム緩衝液ｐＨ７．２、１μｇ／ｍＬビタミンＫ３、０．０８％ｗ／ｖ塩化カルシウム、０．４μｇ／ｍＬ硫酸鉄七水和物、１μｇ／ｍＬレサズリン、１．２μｇ／ｍＬヘマチン、０．２ｍＭヒスチジン、０．０５％Ｔｗｅｅｎ  ８０、０．５％肉エキス（Ｓｉｇｍａ）、１％微量ミネラル補給剤（ＡＴＣＣ）、１％ビタミン補給剤（ＡＴＣＣ）、０．０１７％ｖ／ｖ酢酸、０．００１％ｖ／ｖイソ吉草酸、０．２％ｖ／ｖプロピオン酸および０．２％ｖ／ｖ  Ｎ−酪酸（Ｒｏｍａｎｏ  ＫＡ  ｅｔ  ａｌ．ｍＢｉｏ  ２０１５；６（２）：ｅ０２４８１−１４）中で試験した。細菌を、９６ウェルマイクロプレート中、最終濃度０．５％ｗ／ｖ、１ウェル当たり２００μＬの最終容量で、酵素的に合成されたグリカン、ラクト−オリゴ、メリブ−オリゴ、マルト−オリゴ、スクロ−オリゴ、ラフィノ−オリゴおよびラクツロ−オリゴ、および糖、ラクトース、メリビオース、マルトース、スクロース、ラフィノース、ラクツロースおよびデキストロースに、３７℃で１８〜４８時間、嫌気的に曝露した。インキュベーション時間の終わりに、各分離株についてのＯＤ６００測定値を、製造業者の仕様書に従って、Ｇｅｎ５  ２．０ソフトウェア付きのＢｉｏｔｅｋ  Ｓｙｎｅｒｇｙ２リーダーを用いて得た。グリカンまたは糖が存在しない場合の株の平均ＯＤ６００値を差し引くことによって、各株の測定値をブランクにした。表８および次の３段落は、得られた結果を要約する。
【１０８８】
【表１０５】
2020513410.tif 000107
【１０８９】
いくつかの酵素的に合成されたグリカンは、アッセイにおいて、それらが由来する糖とは異なるレベルの腸内共生細菌の増殖を支持する。表８に見られるように、ラフィノ−オリゴは、アッセイにおいて、ファーミキューテス門（Ｆｉｒｍｉｃｕｔｅｓ）Ｄ．フォルミシゲネランス（Ｄ．ｆｏｒｍｉｃｉｇｅｎｅｒａｎｓ）、Ｃ．シンデンス（Ｃ．ｓｃｉｎｄｅｎｓ）、Ｄ．ロンギカテナ（Ｄ．ｌｏｎｇｉｃａｔｅｎａ）およびＢ．ハンセニイ（Ｂ．ｈａｎｓｅｎｉｉ）ならびにバクテロイデス門（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｔｅ）Ｂ．シータイオタオミクロン（Ｂ．ｔｈｅｔａｉｏｔａｏｍｉｃｒｏｎ）につきラフィノースよりも高い増殖を支持した。ラクツロ−オリゴは、アッセイにおいて、Ｄ．フォルミシゲネランス（Ｄ．ｆｏｒｍｉｃｉｇｅｎｅｒａｎｓ）、Ｃ．シンデンス（Ｃ．ｓｃｉｎｄｅｎｓ）、Ｐ．ディスタソニス（Ｐ．ｄｉｓｔａｓｏｎｉｓ）、Ｂ．シータイオタオミクロン（Ｂ．ｔｈｅｔａｉｏｔａｏｍｉｃｒｏｎ）およびＤ．ロンギカテナ（Ｄ．ｌｏｎｇｉｃａｔｅｎａ）につきラクツロースよりも高い増殖を支持したが、Ｂ．ハンセニイ（Ｂ．ｈａｎｓｅｎｉｉ）は、アッセイにおいてラクツロースよりもラクツロ−オリゴにおいて、より増殖しなかった。アッセイにおいて、スクロ−オリゴは、Ｄ．フォルミシゲネランス（Ｄ．ｆｏｒｍｉｃｉｇｅｎｅｒａｎｓ）、Ｐ．ディスタソニス（Ｐ．ｄｉｓｔａｓｏｎｉｓ）およびＢ．ハンセニイ（Ｂ．ｈａｎｓｅｎｉｉ）につきスクロースより高い増殖、ならびにＢ．シータイオタオミクロン（Ｂ．ｔｈｅｔａｉｏｔａｏｍｉｃｒｏｎ）およびＤ．ロンギカテナ（Ｄ．ｌｏｎｇｉｃａｔｅｎａ）につきスクロースより低い増殖を支持した。酵素的に合成されたグリカンはまた、アッセイにおいて細菌株を超えてそれらがどれだけの増殖を支持するかにおいても異なる。アッセイにおいて、ラフィノ−オリゴは０．７より大きいＯＤ６００値を有する、Ｐ．ディスタソニス（Ｐ．ｄｉｓｔａｓｏｎｉｓ）、Ｂ．シータイオタオミクロン（Ｂ．ｔｈｅｔａｉｏｔａｏｍｉｃｒｏｎ）、およびＢ．ハンセニイ（Ｂ．ｈａｎｓｅｎｉｉ）の高レベルの増殖、０．３〜０．７のＯＤ６００値を有する、Ｄ．フォルミシゲネランス（Ｄ．ｆｏｒｍｉｃｉｇｅｎｅｒａｎｓ）の中レベルの増殖、および０．１〜０．３のＯＤ６００値を有する、Ｃ．シンデンス（Ｃ．ｓｃｉｎｄｅｎｓ）およびＤ．ロンギカテナ（Ｄ．ｌｏｎｇｉｃａｔｅｎａ）のより低レベルの増殖を支持した。
【１０９０】
アッセイにおいて、いくつかの酵素的に合成されたグリカンはまた、それらが由来する糖とは異なるレベルの腸内病原体の増殖を支持する。アッセイにおいて、スクロ−オリゴはスクロースよりもＳ．エンテリカ（Ｓ．ｅｎｔｅｒｉｃａ）、Ｅ．フェシウム（Ｅ．ｆａｅｃｉｕｍ）およびＣ．ディフィシル（Ｃ．ｄｉｆｆｉｃｉｌｅ）につき半分未満の増殖を支持したが、ラフィノ−オリゴはラフィノースよりもこれらの病原体のより多くの増殖を支持した。ラクツロ−オリゴおよびラクツロースは、アッセイにおいてこれらの病原体の同様の増殖レベルを支持した。
【１０９１】
いくつかの酵素的に合成されたグリカンは、それらが由来する糖と同様のアッセイにおける細菌増殖のレベルを支持する。アッセイにおいて、細菌共生物Ｄ．フォルミシゲネランス（Ｄ．ｆｏｒｍｉｃｉｇｅｎｅｒａｎｓ）、Ｄ．ロンギカテナ（Ｄ．ｌｏｎｇｉｃａｔｅｎａ）、Ｂ．ハンセニイ（Ｂ．ｈａｎｓｅｎｉｉ）、Ｃ．シンデンス（Ｃ．ｓｃｉｎｄｅｎｓ）、Ｐ．ディスタソニス（Ｐ．ｄｉｓｔａｓｏｎｉｓ）およびＢ．シータイオタオミクロン（Ｂ．ｔｈｅｔａｉｏｔａｏｍｉｃｒｏｎ）は同様のレベルまで増殖し、光学濃度は、ラクト−オリゴおよびラクトース、メリブ−オリゴおよびメリビオース、ならびにマルト−オリゴおよびマルトースにおいて、２０％以下異なっていた。腸内病原体Ｓ．エンテリカ（Ｓ．ｅｎｔｅｒｉｃａ）、Ｅ．フェシウム（Ｅ．ｆａｅｃｉｕｍ）、およびＣ．ディフィシル（Ｃ．ｄｉｆｆｉｃｉｌｅ）も、増殖において３０％の差があったラクト−オリゴおよびラクトースにおけるＣ．ディフィシル（Ｃ．ｄｉｆｆｉｃｉｌｅ）を除いて、メリブ−オリゴおよびメリビオース、マルト−オリゴおよびマルトース、ならびにラクト−オリゴおよびラクトースにおけるアッセイでほぼ同様のレベルまで増殖した。
【１０９２】
酵素的に合成されたグリカンおよびそれらが支持する細菌株に関するアッセイにおいてそれらが由来する糖の活性と、様々な細菌株につきそれらが支持する増殖のレベルとの間で観察された違いは、酵素的に合成されたグリカンが、治療上の利益のためにインビボで１つ以上の有益な微生物を差次的に支持するために、投与され得ることを示唆する。例えば、Ｃ．シンデンス（Ｃ．ｓｃｉｎｄｅｎｓ）は、Ｃ．ディフィシル（Ｃ．ｄｉｆｆｉｃｉｌｅ）関連下痢に対する防御と関連づけられている（Ｂｕｆｆｉｅ  ｅｔ  ａｌ，Ｎａｔｕｒｅ  ２０１５）。Ｃ．シンデンス（Ｃ．ｓｃｉｎｄｅｎｓ）の増殖を選択的に促進する酵素的に合成されたグリカンの投与は、インビボでのＣ．シンデンス（Ｃ．ｓｃｉｎｄｅｎｓ）の増殖を促進し得、それにより、Ｃ．ディフィシル（Ｃ．ｄｉｆｆｉｃｉｌｅ）関連下痢の予防または処置において有益であり得る。
【１０９３】
実施例２０．選択された代謝産物産生者のグリコシダーゼプロファイルおよび糖利用
腸内細菌によってコードされる代謝機能を炭水化物利用遺伝子と関連付けることは、特定の代謝産物関連ヒト疾患についてグリカンポリマー調製物のインシリコスクリーニングの可能性を有する。しかしながら、多くの代謝機能が多系統性であることが証明されており、したがって、１６Ｓ  ｒＲＮＡ遺伝子配列決定は適当な分析方法ではない（Ｖｉｔａｌ  ｅｔ  ａｌ．，２０１４，Ｍａｒｔｉｎｅｚ  ｄｅｌ  Ｃａｍｐｏ  ｅｔ  ａｌ．，２０１５）。この課題を克服するために、ゲノムおよびメタゲノム解析を利用して、代謝産物合成に関与する遺伝子を直接アッセイし、これらの遺伝子を配列決定されたゲノムを介して炭水化物利用に結び付けることができる。
【１０９４】
炭水化物活性酵素データベース（Ｃａｒｂｏｈｙｄｒａｔｅ−Ａｃｔｉｖｅ  ｅｎＺＹｍｅｓ  Ｄａｔａｂａｓｅ）（ＣＡＺｙ；ｈｔｔｐ：／／ｗｗｗ．ｃａｚｙ．ｏｒｇ／）は、グリコシド結合を分解、修飾、または生成する酵素のための触媒または炭水化物結合モジュールと共に、酵素のファミリーを記載する。グリコシドヒドロラーゼ（ＧＨ）およびグリコシルトランスフェラーゼ（ＧＴ）は、腸のマイクロバイオームにおける炭水化物の利用にとって重要である酵素である。ＣＡＺｙファミリーは系統発生的に広く分布している（Ｋａｏｕｔａｒｉ  ｅｔ  ａｌ．，２０１３）。
【１０９５】
Ｈｕｍａｎ  Ｍｉｃｒｏｂｉｏｍｅ  Ｐｒｏｊｅｃｔの一部として胃腸管から単離された合計４３９の配列決定されたゲノムをこの分析に利用した（ｈｔｔｐ：／／ｈｍｐｄａｃｃ．ｏｒｇ／ｒｅｆｅｒｅｎｃｅ＿ｇｅｎｏｍｅｓ／ｒｅｆｅｒｅｎｃｅ＿ｇｅｎｏｍｅｓ．ｐｈｐ）。標的タンパク質に対して９０％の全域的同一性を要する、ＵＳＥＡＲＣＨ  ｖ８および−ｕｓｅａｒｃｈ＿ｇｌｏｂａｌオプションを使用した炭水化物活性酵素データベース（Ｃａｒｂｏｈｙｄｒａｔｅ  Ａｃｔｉｖｅ  Ｅｎｚｙｍｅ  Ｄａｔａｂａｓｅ）（ＣＡＺｙ；ｈｔｔｐ：／／ｗｗｗ．ｃａｚｙ．ｏｒｇ／）を使用して、全てのゲノムに注釈を付した。さらに、全てのゲノムは、１）ブチレート産生、２）ＴＭＡ−リアーゼによるコリンのＴＭＡへの変換、および３）尿素のアンモニアへのウレアーゼ変換、におけるそれらの予測される関与について、注釈が付けられた。ブチレート産生のために、注釈は腸マイクロバイオームにおいてコードされている最も存在度の高い経路であるアセチル−ＣｏＡ経路に焦点が当てられた（Ｖｉｔａｌ  ｅｔ  ａｌ．，２０１４）。ブチレート産生を予測するために、経路の末端遺伝子（ｂｕｔおよびｂｕｋ）を使用し、Ｖｉｔａｌ  ｅｔ  ａｌ．のゲノム分析で同定された標的タンパク質に対して９０％の大域的同一性を必要とした。ＴＭＡリアーゼの可能性を予測するために、Ｍａｒｔｉｎｅｚ  ｄｅｌ  Ｃａｍｐｏ  ｅｔ  ａｌ．に記載のｃｕｔＣ遺伝子に対するＢＬＡＳＴＰでは、標的タンパク質およびクエリータンパク質の両方の４０％超について、６０％を超える同一性が必要である。代謝産物産生およびＣＡＺｙ含量の両方の注釈に従い、代謝産物産生者（ブチレート）または非代謝産物産生者（ＴＭＡ）における炭水化物利用遺伝子の富化を、ＦＤＲ補正を伴うＷｉｌｃｏｘ検定を用いて実施した。ウレアーゼ、インドール、ｐ−クレゾール、プロピオン酸、および二次胆汁酸変換については、全てのＨＭＰゲノムに、−ｕｓｅａｒｃｈ＿ｇｌｏｂａｌオプションを使用して７０％を超える全域的同一性を有するＫＥＧＧデータベースを使用して、注釈を付した。ウレアーゼ産生のために、ＥＣ番号３．５．１．５を、ウレアーゼ陽性ゲノムを同定するためのウレアーゼ酵素に対するマーカーとして使用した。インドール産生のために、ＥＣ番号４．１．９９．１を、インドール陽性ゲノムを同定するためのトリプトファナーゼ酵素に対するマーカーとして使用した。ｐ−クレゾール産生については、ＥＣ番号４．１．１．８３、２．６．１．−、４．１．１．−、１．２．７．５を使用して、４−フェニルヒドロキシアセテートを介したチロシンからｐ−クレゾールへの経路を同定した。プロピオン酸については、ＥＣ番号６．４．１．３、２．１．３．１、４．１．１．４１、１．２．１．２７、２．３．３．５、１．２．１．８７、１．３．１．９５、１．３．８．７、２．３．１．５４、２．３．１．１６８、２．３．１．８、２．３．１．２２２は、プロピオン酸産生のための全ての経路を同定するために使用された。二次胆汁酸変換については、以下のＥＣ番号を用いて胆汁酸変換剤を同定した：１．１．１．１５９、１．１．１．１７６、１．１．１．２０１、．１．１．２３８、��．１．１．３９１、１．１．３９２、１．１．３９３、１．１．３９５、１．１．１．５２、２．８．３．２５、４．２．１．１０６、６．２．１．７。
【１０９６】
健康なヒト腸マイクロバイオームから、ヒトマイクロバイオームプロジェクト（Ｈｕｍａｎ  Ｍｉｃｒｏｂｉｏｍｅ  Ｐｒｏｊｅｃｔ）の一部として単離された共生細菌種の配列にわたる合計４３９個の配列決定されたゲノムは、ブチレートを産生する、尿素を、ウレアーゼを通してアンモニアに変換する、およびコリンをＴＭＡに変換する、その能力につき予測された（図１５）。これら３つの重要な細菌機能はそれぞれ、系統を超えて広く、しかし不連続的に分布しており、これは、マイクロバイオームの代謝能力を特徴付けるための機能的アプローチの重要性を実証している。例えば、ブチレートの産生は、ファイカリバクテリウム（Ｆａｅｃａｌｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ）およびロゼブリア（Ｒｏｓｅｂｕｒｉａ）種において普遍的であると予測されるが、ユーバクテリウム（Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ）およびラクノスピラ（Ｌａｃｎｏｓｐｉｒａｃｅａｅ）種は、そのブチレート産生能力においてより可変性であるようである。さらに、これら３つの代謝機能の産生は、種の間で全体的に重複せず、毒性代謝産物の有益かつ同時の抑制の選択的産生の可能性を提示しているようである。
【１０９７】
合計７つのＣＡＺｙファミリーおよびサブファミリーが、予測されるブチレート産生者および非ブチレート産生者との間で差次的な存在度を有すると同定された（図１６Ａ〜１６Ｂ；Ｐ＜０．００１、ＦＤＲ補正を伴うＷｉｌｃｏｘ順位和）。これらのファミリーのうち、２つは、グルコースおよびマンノースを含有するグリカンをそれぞれ標的とすることが知られている、非ブチレート産生者（ＧＨ１３．３６およびＧＨ１１３）において、ほぼ完全に不在である（図１６Ａ〜１６Ｂ；下記の表９）。全体として、ブチレート産生者に富む酵素は、グルコース、マンノース、およびガラクトースを構成するグリカンを標的とし、グルコースが最も一般的な標的組成物である（表９）。この所見は、様々なグリカン組成物中で増殖し、ＳＣＦＡ産生についてアッセイした、エクスビボ糞便群および定義されたインビトロ群の両方を用いて実験的に支持されている。ブチレートを含むＳＣＦＡ産生の増加に最も寄与するモノマー組成および相互作用を同定するために、インプットとしてのモノマー組成のパーセンテージが全ての２次相互作用項を許容する、ＬＡＳＳＯ線形回帰モデルを使用した（定義された群の交差検定からの最小ラムダとエクスビボでの最小ラムダの１標準誤差以内の最大ラムダとを有するＲにおけるｇｌｍｎｅｔ）。全ての正のモデル係数が図２２Ａ〜２２Ｂに示されている。ここでは、グルコースは、定義された群につき、ブチレートを含む全てのＳＣＦＡ産生の重要な予測因子であり（図２２Ｂ）、グルコース、ガラクトース、およびマンノースの組み合わせは、エクスビボの糞便群においてブチレート産生を増加させる一方、グルコース単独ではアセテート産生を増加させると予測される（図２２Ａ）。単一細菌株の増殖を予測するためのインプットとしてのパーセントモノマー組成を有するＬＡＳＳＯ線形回帰モデルを使用して、代謝能力の予測としてのモノマー標的組成の使用をさらに支持することで、本発明者らは、モノマー組成が細菌の増殖を非常に予測しやすいことを示す。これらの知見は、ブチレート産生者と非ブチレート産生者との間で最も差次的なグリカン標的遺伝子を支持するが、これらはブチレート産生者においてコードされる最も存在度の高いグリコシルヒドロラーゼを網羅していない（図１７）。
【１０９８】
【表１０６】
2020513410.tif 000108
【１０９９】
この方法は、ＴＭＡおよびアンモニアを含む、有害でありかつ減少させることが望ましい代謝産物について、グリカンを標的化するためにさらに適用することができる。例えば、１１のＣＡＺｙファミリーおよびサブファミリーが、ｃｕｔＣ遺伝子をコードしない分類群において排他的かつ過剰表現されていることが同定され（図１８Ａ〜１８Ｂ；Ｐ＜０．０５、Ｗｉｌｃｏｘ順位和、ＦＤＲ補正）、これは、腸内でのコリンのＴＭＡへの変換の原因であることが示されている（Ｍａｒｔｉｎｅｚ  ｄｅｌ  Ｃａｍｐｏ，ｅｔ  ａｌ）。さらに、これらのファミリーの少なくとも１つは、ｃｕｔＣ遺伝子もコードしていないほぼ５０％の細菌種にコードされている。これらのファミリーは、より広範なグリカン組成物を標的とするが（図１８Ａ〜１８Ｂ、表１０）、ガラクトースおよびグルコースは最も存在度の高い標的モノマー組成物である。これらのＣＡＺｙファミリーおよびサブファミリーは、ｃｕｔＣ陽性ゲノムと陰性ゲノムとの間で最も差次的に存在度が高いが、別の遺伝子セットがｃｕｔＣ陰性ゲノムにおいて最も存在度が高いことが見出され得、これもまたＴＭＡ減少の望ましい標的である（図１９）。
【１１００】
【表１０７】
2020513410.tif 000109
【１１０１】
この用途をウレアーゼ酵素による尿素のアンモニア切断の産生に拡張して、ウレアーゼ陽性ゲノムと陰性ゲノムとの間で差次的にコードされた７つのＣＡＺｙファミリーおよびサブファミリーを同定した（図２０Ａ〜２０Ｂ、Ｐ＜０．０５、Ｗｉｌｃｏｘ順位和、ＦＤＲ補正）。さらに、これらの酵素は、ウレアーゼ陰性ゲノムに排他的であり、グルコースおよびガラクトース含有グリカンの排他的標的である（図２０Ａ〜２０Ｂ、表１１）。これらのＣＡＺｙファミリーおよびサブファミリーは、ウレアーゼ陽性ゲノムと陰性ゲノムとの間で最も差次的に存在度が高いが、別の遺伝子セットがウレアーゼ陰性ゲノムにおいて最も存在度が高いことが見出され得、したがって、これもまたアンモニア減少の望ましい標的である（図２１）。
【１１０２】
【表１０８】
2020513410.tif 000110
【１１０３】
この用途をプロピオネート産生に拡張して、プロピオネート産生者と非プロピオネート産生者との間で差次的にコードされた７つのＣＡＺｙファミリーおよびサブファミリーを同定した（図３０Ｇ、Ｐ＜０．０１、Ｗｉｌｃｏｘ順位和、ＦＤＲ補正）。これらの酵素は、非プロピオン酸産生者に富んでおり、Ｎ−アセチルグルコサミン、キシロース、アラビノース、グルコース、ガラクトース、およびフコースの標的である（図３０Ｇ、表２５）。これらのＣＡＺｙファミリーおよびサブファミリーは、非プロピオネート産生者およびプロピオネート産生者の間で最も差次的に存在度が高いが、別の遺伝子セットが非プロピオネート産生者において最も存在度が高いことが見出され得、したがって、これもまたプロピオネート減少の望ましい標的である（図３０Ｈ）。
【１１０４】
【表１０９】
2020513410.tif 000111
【１１０５】
この用途を胆汁酸変換に拡張して、二次胆汁酸変換者と非二次胆汁酸変換者との間で差次的にコードされた６つのＣＡＺｙファミリーおよびサブファミリーを同定した（図３０Ａ、Ｐ＜０．０５、Ｗｉｌｃｏｘ順位和、ＦＤＲ補正）。これらの酵素は二次胆汁酸変換剤に富んでおり、排他的にトレハロース、シアル酸、およびグルコースの標的である（図３０Ａ、表２６）。これらのＣＡＺｙファミリーおよびサブファミリーは、二次胆汁酸変換者および非二次胆汁酸変換者の間で最も差次的に存在度が高いが、別の遺伝子セットが非プロピオネート産生者において最も存在度が高いことが見出され得、したがって、これもまた二次胆汁酸変換の望ましい標的である（図３０Ｂ）。
【１１０６】
【表１１０】
2020513410.tif 000112
【１１０７】
この適用をインドール産生に拡大して、非インドール産生細菌において排他的にコードされる７つのＣＡＺｙファミリーおよびサブファミリーが同定された（図３０Ｃ）。これらの酵素は、非インドール産生細菌に排他的にコードされており、グルコース、キシロース、アラビノース、およびマンノースの標的について富化されている（図３０Ｃ、表２７）。これらのＣＡＺｙファミリーおよびサブファミリーは、非インドール産生細菌において排他的にコードされているが、別の遺伝子セットが非インドール産生細菌において最も存在度が高いことが見出され得、したがって、これもまたインドール減少の望ましい標的である（図３０Ｄ）。
【１１０８】
【表１１１】
2020513410.tif 000113
【１１０９】
この用途をｐ−クレゾール産生に拡張して、ｐ−クレゾール産生者と非ｐ−クレゾール産生者との間で差次的にコードされた７つのＣＡＺｙファミリーおよびサブファミリーを同定した（図３０Ｅ、Ｐ＜０．０１、Ｗｉｌｃｏｘ順位和、ＦＤＲ補正）。これらの酵素は、非ｐ−クレゾール産生細菌に豊んでおり、キシロース、アラビノース、ガラクトース、およびグルコースの標的について豊化されている（図３０Ｅ、表２８）。これらのＣＡＺｙファミリーおよびサブファミリーは、非インドール産生細菌において排他的にコードされているが、別の遺伝子セットが非ｐ−クレゾール産生細菌において最も存在度が高いことが見出され得、したがって、これもまたｐ−クレゾール減少の望ましい標的である（図３０Ｆ）。
【１１１０】
【表１１２】
2020513410.tif 000114
【１１１１】
合成グリカン上で良好に増殖する全ての株について、表１２に記載のように、モノマー組成は特定のグリカン上での菌株増殖を強く予測する。
【１１１２】
【表１１３】
2020513410.tif 000115
【１１１３】
実施例２１．例示的なグリカンポリマー調製物を用いた微生物の標的富化
目的の微生物種が微生物群に存在する場合、微生物群を特定のグリカンポリマー調製物と接触させると、その種の表現の増加が観察され得る。例えば、バクテロイデス（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ）属の種は、最大数の炭水化物活性酵素（ＣＡＺｙｍｅ）を有することが知られている。これらの種の中で、バクテロイデス・セルロリティカス（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ  ｃｅｌｌｕｌｏｌｙｔｉｃｕｓ）のゲノム配列は、その属における全ての既知の配列決定されたゲノムの炭水化物分解に貢献する酵素をコードする遺伝子の最大数を含む：３７３のＧＨ、２８の炭水化物エステラーゼおよび８４のグリコシルトランスフェラーゼを含む５０３の全ＣＡＺｙｍｅ（ＭｃＮｕｌｔｙ  ｅｔ  ａｌ，ＰＬＯＳ  Ｂｉｏｌｏｇｙ，ｄｏｉ：１０．１３７１／ｊｏｕｒｎａｌ．ｐｂｉｏ．１００１６３７）例示的なグリカンポリマー調製物の投与に応答して、バクテロイデス・セルロリティカス（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ  ｃｅｌｌｕｌｏｌｙｔｉｃｕｓ）がその表現において選択的に増加され得ることを示すために、１５の細菌株を含む複合細菌群を組み立てて試験した。
【１１１４】
この定義された群の組成は以下の通りである：１）アクチノバクテリア（Ａｃｔｉｎｏｂａｃｔｅｒｉａ）門：２株のビフィドバクテリウム・ロンガム（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｌｏｎｇｕｍ）；２）ファーミキューテス（Ｆｉｒｍｉｃｕｔｅｓ）門：ブラウティア・ハンセニイ（Ｂｌａｕｔｉａ  ｈａｎｓｅｎｉｉ）、クロストリジウム・ネキシレ（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｎｅｘｉｌｅ）、クロストリジウム・シンデンス（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｓｃｉｎｄｅｎｓ）、ドレア・フォルミシゲネランス（Ｄｏｒｅａ  ｆｏｒｍｉｃｉｇｅｎｅｒａｎｓ）、ドレア・ロンギカテナ（Ｄｏｒｅａ  ｌｏｎｇｉｃａｔｅｎａ）、ルミノコッカス・オベウム（Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ  ｏｂｅｕｍ）；３）バクテロイデス（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｔｅｓ）門：バクテロイデス・カカエ（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ  ｃａｃｃａｅ）、バクテロイデス・セルロリティカス（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ  ｃｅｌｌｕｌｏｌｙｔｉｃｕｓ）、バクテロイデス・シータイオタオミクロン（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ  ｔｈｅｔａｉｏｔａｏｍｉｃｒｏｎ）、バクテロイデス・ブルガタス（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ  ｖｕｌｇａｔｕｓ）、プレボテラ・コプリ（Ｐｒｅｖｏｔｅｌｌａ  ｃｏｐｒｉ）、パラバクテロイデス・ディスタソニス（Ｐａｒａｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ  ｄｉｓｔａｓｏｎｉｓ）；４）ベルコミクロビウム（Ｖｅｒｒｕｃｏｍｉｃｒｏｂｉａ）門：アッカーマンシア・ムシニフィラ（Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａ）。
【１１１５】
各株は、標準的な挽肉グルコース培地中で１８時間、別々に増殖させた。各培養物を０．０１の最終光学濃度（ＯＤ６００）に希釈し、最終混合群に組み合わせた。この群は、唯一の炭素源として以下の炭水化物：グルコース、ＦＯＳ、Ｇｌｕ１００（「Ｇｌｕ」とも称される）、Ｇｌｕ５０Ｇａｌ５０（「ＧｌｕＧａｌ」とも称される）、Ｇａｌ１００（「Ｇａｌ」とも称される）、およびＭａｎ５２Ｇｌｕ２９Ｇａｌ１９（「ＭａｎＧｌｕＧａｌ」とも称される）、を供給した培地上で４８時間増殖した。対照として、炭素源を添加せずに水を培地に添加した。
【１１１６】
得られた群は、個々の株と同様に、グリカンを含まないか、または上記の各グリカンを含む、増殖培地を含有する９６ウェルプレート（平底Ｃｏｓｔａｒ、３００μＬ）に添加された。アッセイにおける各グリカンの最終濃度は５％であった。各グリカンは各増殖プレート内で３回再供給され、これは細菌の唯一の炭素源であった。プレートを嫌気性チャンバＡＳ−５８０中で、３７℃で合計４８時間インキュベートした。
【１１１７】
１８時間および４８時間で、グリカンと共にインキュベートした各群について光学密度を決定し、１５０μＬの培養物をとり、１６Ｓ  ｒＲＮＡ遺伝子の配列決定のために−８０℃で直ちに凍結して群組成における変化を時間およびグリカンの関数として決定した。
【１１１８】
この定義された群における各株の表現を決定するために、各群からゲノムＤＮＡを抽出し、１６Ｓ  ｒＲＮＡ遺伝子を増幅し、配列決定した。図２３Ａ〜２３Ｂに示すように、１５株から構成される定義された群をＧｌｕ１００グリカン上で増殖させた場合、バクテロイデス・セルロリティカス（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ  ｃｅｌｌｕｌｏｌｙｔｉｃｕｓ）の相対存在度は平均４％から３０％に増加したが、他の炭素源では増加しなかった。
【１１１９】
さらに、図２３Ａに示されるように、群がＧｌｕ１００以外の炭素源の存在下で増殖し、次いでＧｌｕ１００が、確立された群に追加されたとき、図２３Ｂに示されるように、バクテロイデス・セルロリティカス（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ  ｃｅｌｌｕｌｏｌｙｔｉｃｕｓ）の相対存在度は平均４％から１４％に増加した（Ｇａｌ１００、Ｇｌｕ５０Ｇａｌ５０、Ｍａｎ５２Ｇｌｕ２９Ｇａｌ１９）。重要なことに、Ｂ．セルロリティカス（Ｂ．ｃｅｌｌｕｌｏｌｙｔｉｃｕｓ）が、グルコースまたはＦＯＳの存在下で生育した群などの定常期間の群に添加された場合、Ｂ．セルロリティカス（Ｂ．ｃｅｌｌｕｌｏｌｙｔｉｃｕｓ）において変化は観察されず、これは、窒素またはリン源などの他の成長制限栄養素が消費されている可能性が高いことを意味している（図２３Ａ〜２３Ｂ）。データは、本明細書に記載のグリカンポリマーを用いた細菌群における特定の分類群の標的濃縮の実現可能性を示唆している。
【１１２０】
実施例２２．確立されたインビトロ定義群へのシンバイオティクス投与の実証
特定の病状では、天然の微生物叢は、抗生物質、または微生物叢に損傷を与える他の薬剤の摂取によって混乱する可能性がある。プロバイオティクス種の投与は、天然の微生物叢を修復するための一般的な試みである。しかし、ＦＤＡが承認したプロバイオティクスの大部分は、成人の腸内微生物叢に非常に少ない存在度で存在する乳酸菌である。さらに、これらの種の投与は、バクテロイデス（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ）属のメンバーなどの共生微生物叢の回復を生じない。さらに、確立された複合群へのプロバイオティクス種の移植は多くの場合困難である。したがって、そのプロバイオティクス種によって選択的に消費される炭素源と共にプロバイオティクスを同時投与することは、この種の常在群への移植の成功を保証するために必要とされ得る。ここで、確立された群へのバクテロイデス・セルロリティカス（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ  ｃｅｌｌｕｌｏｌｙｔｉｃｕｓ）の移植の成功が実証され、ここで、群は、例示的なグリカンポリマー調製物（Ｇｌｕ１００グリカン）の同時投与により有意に改善された。
【１１２１】
１４株（バクテロイデス・セルロリティカス（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ  ｃｅｌｌｕｌｏｌｙｔｉｃｕｓ）を除く実施例２１に記載の１５株全て）から構成される定義群を、唯一の炭素源として６グリカンまたは水の存在下で１８時間増殖させた。１８時間目に、ＯＤ＝０．１のバクテロイデス・セルロリティカス（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ  ｃｅｌｌｕｌｏｌｙｔｉｃｕｓ）の培養物を各群に添加した。表１３に示すように、バクテロイデス・セルロリティカス（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ  ｃｅｌｌｕｌｏｌｙｔｉｃｕｓ）の移植がその好ましい炭素源（Ｇｌｕ１００）に依存するかどうかを試験するために、２０μＬの５％Ｇｌｕ１００、またはバクテロイデス・セルロリティカス（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ  ｃｅｌｌｕｌｏｌｙｔｉｃｕｓ）および２０μＬの５％Ｇｌｕ１００をそれぞれの確立された群に添加した。
【１１２２】
【表１１４】
2020513410.tif 000116
【１１２３】
４８時間で、各群について光学密度を決定し、１５０μＬの培養物をとり、１６Ｓ  ｒＲＮＡ遺伝子の配列決定のために−８０℃で直ちに凍結して群組成における変化を時間およびグリカンの関数として決定した。
【１１２４】
この定義された群における各株の表現を決定するために、ＭｏＢｉｏ  Ｍｉｃｒｏｂｉｏｍｅ  ＤＮＡ／ＲＮＡ抽出キット（カタログ番号２７５００−４−ＥＰ）を用いて１５０μＬの培養物からゲノムＤＮＡを抽出した。１６Ｓ  ｒＲＮＡ遺伝子のＶ４領域は、Ｃａｐｏｒａｓｏ  ＪＧ  ｅｔ  ａｌ，ＩＳＭＥ  Ｊに記載の５１５フォワードおよび８０６リバースプライマーを用いて増幅した。単位複製配列は対末端ケミストリーを用い、２５０ｂｐ長のリードでＩｌｌｕｍｉｎａ  ＭｉＳｅｑの装置を用いて配列決定した。操作的分類単位（ＯＴＵ）は、９７％の配列同一性を用いて選択された。１６株に一致する１５のＯＴＵが得られた。ビフィドバクテリウム・ロンガム（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｌｏｎｇｕｍ）の２株は、１６Ｓ  ｒＲＮＡ遺伝子によって分解することができず、したがって、１のＯＴＵは両方の株を表していた。
【１１２５】
図２４Ａに示すように、バクテロイデス・セルロリティカス（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ  ｃｅｌｌｕｌｏｌｙｔｉｃｕｓ）の相対存在度は、Ｇｌｕ１００または水上で増殖した群において８％であり、他のグリカン上で増殖した群については２％にすぎなかった。
【１１２６】
しかしながら、Ｇｌｕ１００をバクテロイデス・セルロリティカス（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ  ｃｅｌｌｕｌｏｌｙｔｉｃｕｓ）と同時に投与したとき、この菌株の相対存在度は、グリカンポリマー調製物の存在下で群が増殖していた場合は平均で２％から１０％に、またはグリカンポリマー調製物の非存在下で群が増殖していた場合は２５％に増加した（図２４Ｂ）。重要なことに、Ｂ．セルロリティカス（Ｂ．ｃｅｌｌｕｌｏｌｙｔｉｃｕｓ）が、グルコースまたはＦＯＳの存在下で生育した群などの定常期間の群に添加された場合、Ｂ．セルロリティカス（Ｂ．ｃｅｌｌｕｌｏｌｙｔｉｃｕｓ）において変化は観察されず、これは、窒素またはリン源などの他の成長制限栄養素が消費されている可能性が高いことを意味している（図２４Ａ〜２４Ｂ）。
【１１２７】
実施例２３．グリカンポリマー調製物の細菌増殖および代謝産物産生を調節する能力を評価するためのエクスビボアッセイ
エクスビボアッセイを実施して、インビトロの設定において、異なるグリカンを利用するためのヒト糞便群の能力を評価した。エクスビボアッセイは、グリカンが、保護効果に関連するものを含む複合細菌群および短鎖脂肪酸を差次的に調節するために使用され得るかどうかを決定するために設計された。糞便試料およびスラリーを、パラジウム触媒を特徴とする嫌気性チャンバ（ＡＳ−５８０、Ａｎａｅｒｏｂｅ  Ｓｙｓｔｅｍｓ）中で取り扱った。グリカンｇｌｕ３３ｇａｌ３３ｍａｎ３３、ｇａｌ３３ｍａｎ３３ａｒａ３３、ｇｌｕ５０ｇａｌ５０、ｇｌｕ３３ｇａｌ３３ａｒａ３３、ｇａｌ１００、ｇｌｕ４０ｍａｎ６０、ｇａｌ３３ｍａｎ３３ｘｙｌ３３、ｇｌｕ４０ｇａｌ６０、ｇｌｕ２０ｇａｌ８０、ｇｌｕ６０ｇａｌ４０、ｇｌｕ８０ａｒａ２０、ｇａｌ４０ｍａｎ６０、ｍａｎ８０ｘｙｌ２０、ｇａｌ６０ａｒａ４０、ｇｌｕ１００、ｇａｌ８０ｍａｎ２０、ｇａｌ４０ａｒａ６０、ｇａｌ８０ａｒａ２０、ｇａｌ６０ｍａｎ４０、ｇｌｕ８０ｇａｌ２０、ｘｙｌ６０ａｒａ４０、ｇｌｕ８０ｘｙｌ２０、ｇｌｕ６０ｍａｎ４０、ｇｌｕ２０ｘｙｌ８０、ｇｌｕ２０ｍａｎ８０、ｍａｎ６０ａｒａ４０、ｇｌｕ８０ｍａｎ２０、ｇｌｕ６０ｘｙｌ４０、ｇａｌ２０ｍａｎ８０、ｇａｌ６０ｘｙｌ４０、ｇａｌ８０ｘｙｌ２０、ｇｌｕ４０ａｒａ６０、ｇｌｕ６０ａｒａ４０、ｘｙｌ２０ａｒａ８０、ｍａｎ５２ｇｌｕ２９ｇａｌ１９、ｇａｌ４０ｘｙｌ６０、ｇｌｕ４０ｘｙｌ６０、ｍａｎ６０ｘｙｌ４０、ｘｙｌ１００、ｇｌｕ２０ａｒａ８０、ｇａｌ２０ａｒａ８０、ｇａｌ２０ｘｙｌ８０、ｍａｎ２０ａｒａ８０、ｍａｎ１００、ｘｙｌ４０ａｒａ６０、ａｒａ１００、ｘｙｌ８０ａｒａ２０および市販の対照、ＦＯＳ（Ｎｕｔｒａｆｌｏｒａ  ＦＯＳ；ＮＯＷ  Ｆｏｏｄｓ、Ｂｌｏｏｍｉｎｇｄａｌｅ  ＩＬ）を水中５％ｗ／ｖで調製し、濾過滅菌し、アッセイ中０．５％ｗ／ｖの最終濃度で９６ウェル・ディープウェルマイクロプレートアッセイプレートに添加し、水を陽性対照および陰性対照として供給した。
【１１２８】
寄付されたヒト糞便試料を−８０℃で保存した。作業ストックを調製するために、糞便試料を嫌気性チャンバに移し、解凍した。糞便試料を、リン酸緩衝生理食塩水（ＰＢＳ）ｐＨ７．４（Ｐ０２６１、Ｔｅｋｎｏｖａ  Ｉｎｃ．、Ｈｏｌｌｉｓｔｅｒ、ＣＡ）中、２０％ｗ／ｖに調製し、１５％グリセロール、−８０℃で保存した。２０％ｗ／ｖ糞便スラリー＋１５％グリセロールを２，０００×ｇで遠心分離し、上清を除去し、ペレットを、９００ｍｇ／Ｌ塩化ナトリウム、２６ｍｇ／Ｌ塩化カルシウム二水和物、２０ｍｇ／Ｌ塩化マグネシウム六水和物、１０ｍｇ／Ｌ塩化マンガン四水和物、４０ｍｇ／Ｌ硫酸アンモニウム、４ｍｇ／Ｌ硫酸鉄七水和物、１ｍｇ／Ｌ塩化コバルト六水和物、３００ｍｇ／Ｌリン酸カリウム二塩基、１．５ｇ／Ｌリン酸ナトリウム二塩基、５ｇ／Ｌ炭酸水素ナトリウム、０．１２５ｍｇ／Ｌビオチン、１ｍｇ／Ｌピリドキシン、１ｍ／Ｌパントテン酸塩、７５ｍｇ／Ｌヒスチジン、７５ｍｇ／Ｌグリシン、７５ｍｇ／Ｌトリプトファン、１５０ｍｇ／Ｌアルギニン、１５０ｍｇ／Ｌメチオニン、１５０ｍｇ／Ｌトレオニン、２２５ｍｇ／Ｌバリン、２２５ｍｇ／Ｌイソロイシン、３００ｍｇ／Ｌロイシン、４００ｍｇ／Ｌシステイン、および４５０ｍｇ／Ｌプロリン（Ｔｈｅｒｉｏｔ  ＣＭ  ｅｔ  ａｌ．Ｎａｔ  Ｃｏｍｍｕｎ．２０１４；５：３１１４）中に懸濁し、１％ｗ／ｖ糞便スラリーとした。調製した１％ｗ／ｖ糞便スラリーを、９６ウェルディープウェルマイクロプレート中、最終濃度０．５％ｗ／ｖ、１ウェル当たり５００μＬの最終容量のグリカンｇｌｕ３３ｇａｌ３３ｍａｎ３３、ｇａｌ３３ｍａｎ３３ａｒａ３３、ｇｌｕ５０ｇａｌ５０、ｇｌｕ３３ｇａｌ３３ａｒａ３３、ｇａｌ１００、ｇｌｕ４０ｍａｎ６０、ｇａｌ３３ｍａｎ３３ｘｙｌ３３、ｇｌｕ４０ｇａｌ６０、ｇｌｕ２０ｇａｌ８０、ｇｌｕ６０ｇａｌ４０、ｇｌｕ８０ａｒａ２０、ｇａｌ４０ｍａｎ６０、ｍａｎ８０ｘｙｌ２０、ｇａｌ６０ａｒａ４０、ｇｌｕ１００、ｇａｌ８０ｍａｎ２０、ｇａｌ４０ａｒａ６０、ｇａｌ８０ａｒａ２０、ｇａｌ６０ｍａｎ４０、ｇｌｕ８０ｇａｌ２０、ｘｙｌ６０ａｒａ４０、ｇｌｕ８０ｘｙｌ２０、ｇｌｕ６０ｍａｎ４０、ｇｌｕ２０ｘｙｌ８０、ｇｌｕ２０ｍａｎ８０、ｍａｎ６０ａｒａ４０、ｇｌｕ８０ｍａｎ２０、ｇｌｕ６０ｘｙｌ４０、ｇａｌ２０ｍａｎ８０、ｇａｌ６０ｘｙｌ４０、ｇａｌ８０ｘｙｌ２０、ｇｌｕ４０ａｒａ６０、ｇｌｕ６０ａｒａ４０、ｘｙｌ２０ａｒａ８０、ｍａｎ５２ｇｌｕ２９ｇａｌ１９、ｇａｌ４０ｘｙｌ６０、ｇｌｕ４０ｘｙｌ６０、ｍａｎ６０ｘｙｌ４０、ｘｙｌ１００、ｇｌｕ２０ａｒａ８０、ｇａｌ２０ａｒａ８０、ｇａｌ２０ｘｙｌ８０、ｍａｎ２０ａｒａ８０、ｍａｎ１００、ｘｙｌ４０ａｒａ６０、ａｒａ１００、ｘｙｌ８０ａｒａ２０および市販のＦＯＳに、３７℃で４５時間、嫌気的に曝露した。インキュベーション後、アッセイ試料を分割し、その一部をＤＮＡ抽出および配列決定に使用し、他の部分を短鎖脂肪酸分析に使用した。
【１１２９】
ゲノムＤＮＡをグリカンおよび対照で処理した糞便スラリーから抽出し、１６Ｓ  ｒＲＮＡ遺伝子の可変領域４を増幅して配列を決定した（Ｅａｒｔｈ  Ｍｉｃｒｏｂｉｏｍｅ  Ｐｒｏｊｅｃｔ  ｐｒｏｔｏｃｏｌ  ｗｗｗ．ｅａｒｔｈｍｉｃｒｏｂｉｏｍｅ．ｏｒｇ／ｅｍｐ−ｓｔａｎｄａｒｄ−ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ／１６ｓ／およびＣａｐｏｒａｓｏ  ＪＧ  ｅｔ  ａｌ．２０１２．Ｕｌｔｒａ−ｈｉｇｈ−ｔｈｒｏｕｇｈｐｕｔ  ｍｉｃｒｏｂｉａｌ  ｃｏｍｍｕｎｉｔｙ  ａｎａｌｙｓｉｓ  ｏｎ  ｔｈｅ  Ｉｌｌｕｍｉｎａ  ＨｉＳｅｑ  ａｎｄ  ＭｉＳｅｑ  ｐｌａｔｆｏｒｍｓ．ＩＳＭＥ  Ｊ．）。操作的分類単位（ＯＴＵ）を、１６Ｓ  ｒＲＮＡ配列を９７％の同一性で整列させることによって形成した。
【１１３０】
グリカンおよび対照で処置した糞便スラリーを４℃で１０分間４０００×ｇで遠心分離し、上清を新しいチューブに移した。分析まで試料を−８０℃で凍結保存した。試料を冷凍庫から取り出して解凍した。１ｍＬの培養上清をガラスバイアルに移した。懸濁液のｐＨを、１００μＬの５０％硫酸を添加することにより、２〜３に調整した。酸性化した試料を室温に保ち、１０分間ボルテックスした。揮発性抽出のために、５０μＬの内部標準（１％の２−メチルペンタン酸溶液）および１０００μＬの無水エチルエーテルを添加した。チューブを１０分間反転揺動混合し、次いで、２０００ｇで２分間遠心分離した。分析のために１μＬの上部エーテル層をクロマトグラムに注入した。
【１１３１】
ＳＣＦＡ濃度のクロマトグラフィー分析は、フレームイオン化検出器（ＦＩＤ）を備えたＡｇｉｌｅｎｔ  ７８９０Ｂシステム（Ａｇｉｌｅｎｔ  Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ、Ｓａｎｔａ  Ｃｌａｒａ、ＣＡ）を使用して実施した。０．２５μｍの膜厚でコーティングされた３０ｍ×０．２５ｍｍの高分解能ガスクロマトグラフィーキャピラリーカラムを揮発性酸（Ａｇｉｌｅｎｔ  Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ）に使用した（ＤＢ−ＦＦＡＰ）。キャリアガスとして窒素を用いた。オーブン温度は１４５℃であり、ＦＩＤおよび注入口は２２５℃に設定された。注入された試料容量は１μＬであり、各分析の実行時間は１２分であった。クロマトグラムおよびデータ統合は、ＯｐｅｎＬａｂ  ＣｈｅｍＳｔａｔｉｏｎソフトウェア（Ａｇｉｌｅｎｔ  Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ）を使用して実施した。結果を表１４および１５に概括する。
【１１３２】
グリカンで処置した糞便スラリー試料のＯＴＵの相対存在度を、種レベルでのマイクロバイオーム組成の差について、ノンパラメトリックＷｉｌｃｏｘｏｎ順位和検定を用いて無添加グリカン群と比較した。異なるグリカンにわたる、種組成と、ブチレート、アセテートおよびプロピオネートレベルとの間の関連を調べるために、本発明者らは、まずグリカン処置群に存在する種の割合を無添加炭素（対照）群から得られたものに対して正規化した。このようにして各グリカン処置について得られた倍率変化値を、次いで、Ｓｐｅａｒｍａｎの順位相関法を用いてグリカンから得られたブチレートレベルと相関させた［Ｍｙｌｅｓ  Ｈｏｌｌａｎｄｅｒ＆Ｄｏｕｇｌａｓ  Ａ．Ｗｏｌｆｅ（１９７３），Ｎｏｎｐａｒａｍｅｔｒｉｃ  Ｓｔａｔｉｓｔｉｃａｌ  Ｍｅｔｈｏｄｓ．Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ：Ｊｏｈｎ  Ｗｉｌｅｙ＆Ｓｏｎｓ．１８５−１９４（Ｋｅｎｄａｌｌ  ａｎｄ  Ｓｐｅａｒｍａｎ  ｔｅｓｔｓ）］。統計的有意性（ベンジャミニホフバーグ補正ｐ値＜０．０５）［Ｂｅｎｊａｍｉｎｉ，Ｙ．，ａｎｄ  Ｈｏｃｈｂｅｒｇ，Ｙ．（１９９５）Ｊｏｕｒｎａｌ  ｏｆ  ｔｈｅ  Ｒｏｙａｌ  Ｓｔａｔｉｓｔｉｃａｌ  Ｓｏｃｉｅｔｙ  Ｓｅｒｉｅｓ  Ｂ５７，２８９−３００．］で見出された、種とブチレートレベルとの関連性が同定され、最も強い関連を表すプロットを図２５Ａ〜２５Ｄ、２６Ａ〜２６Ｆ、および２７Ａ〜２７Ｄに示す。
【１１３３】
【表１１５】
2020513410.tif 000117
【１１３４】
表１４に示すように、４８個の合成グリカンは、アッセイにおける平均無添加グリカン対照と比較して、非分岐短鎖脂肪酸ブチレート、アセテートおよびプロピオネートの産生を差次的に調節する。アッセイでは、最大増加倍率がブチレートおよびプロピオネートで観察され、１グリカンがブチレートを少なくとも１０倍増加させ、４グリカンがプロピオネートを少なくとも１０倍増加させ、どのグリカンもアセテートを少なくとも１０倍増加させなかった。アッセイでは、グリカンなしの対照と比較して３〜１０倍のシフトが、３８グリカンを有するブチレート、２８グリカンを有するアセテート、および２７グリカンを有するプロピオネートにおいて観察された。アッセイでは、グリカンなしの対照と比較して３倍未満のシフトが、９グリカンを有するブチレート、２０グリカンを有するアセテート、および１７グリカンを有するプロピオネートにおいて観察された。
【１１３５】
アッセイにおいて、ブチレートは、グリカン組成に応じて様々な程度に調節された。ブチレートは、３つのインプットが各３分の１のマンノース、ガラクトースおよびグルコースであるトリマーを用いて、平均無添加グリカン対照と比較して、アッセイにおいて少なくとも１０倍増加した。グルコースがインプットモノマーの８０％未満を構成するグルコースおよびガラクトースを含有するグリカン、ならびにインプットの２つが少なくとも各３分の１のマンノースおよびガラクトースである３つのモノマーから構成されるグリカンを用いたアッセイにおいて、ブチレートは少なくとも５倍増加した。アッセイにおいて、ブチレートは、アラビノースおよびキシロースからなる４つのグリカンのうちの２つ、およびインプットが少なくとも８０％アラビノースである５つのグリカンのうちの４つでは、５倍未満増加した。
【１１３６】
アッセイにおいて、アセテートは、グリカン組成に応じて様々な程度に調節された。ＦＯＳを除いて、アッセイにおいてアセテートを少なくとも５倍増加させたグリカンは、インプットモノマーとしてグルコースを含んでいた。ｍａｎ１００およびｇａｌ１００を除いて、アッセイにおいてアセテートを３倍未満増加させたグリカンは、インプットモノマーとしてアラビノースおよび／またはキシロースを含んでいた。したがって、アッセイにおいて、モノマー組成はアセテート産生に影響を与えるようであり、グルコースのインプットはアセテート産生に有利に働き、アラビノースおよびキシロースのインプットは比較的低アセテートに向かう傾向がある。
【１１３７】
アッセイにおいて、プロピオネートは、グリカン組成に応じて様々な程度に調節された。アッセイにおいて、プロピオネートを少なくとも１０倍増加させた４個のグリカンのうち３個は、インプットとしてガラクトースおよびマンノースの両方を含み、４個のうち２個はインプットとしてキシロースおよびマンノースの両方を含んでいた。プロピオネートは、インプットモノマーとしてマンノースを含む１６個のグリカンのうち１４個でアッセイにおいて少なくとも５倍増加した。アッセイにおいて、プロピオネートが３倍未満シフトした１８個のグリカンのうち１６個は、インプットモノマーとしてキシロースおよび／またはアラビノースを含んでいた。したがって、アッセイにおいて、モノマー組成はプロピオネート産生に影響を与えるようであり、マンノースのインプットはプロピオネート産生に有利に働き、アラビノースおよびキシロースのインプットは比較的低プロピオネートに向かう傾向がある。
【１１３８】
【表１１６】
2020513410.tif 000118
【１１３９】
表１５に観察されるように、グリカンは、平均無添加グリカン対照と比較して、アッセイにおいて、分岐短鎖脂肪酸イソバレレート、イソブチレートおよびイソカプロエートを差次的に調節する。アッセイでは、５グリカンを有するイソブチレート、１グリカンを有するイソバレエート、および３グリカンを有するイソカプロエートにおいて、少なくとも２倍の増加が観察された。アッセイでは、３６グリカンを有するイソブチレート、３８グリカンを有するイソバレエート、および２５グリカンを有するイソカプロエートにおいて、２倍未満のシフトが観察された。アッセイでは、６グリカンを有するイソブチレート、９グリカンを有するイソバレエート、および４グリカンを有するイソカプロエートにおいて、少なくとも２倍の減少が観察された。検出限界を下回るレベルと一致して、イソブチレートは２グリカンでのアッセイでは検出されず、イソバレレートは１グリカンでは検出されず、イソカプロエートは１６グリカンでは検出されなかった。
【１１４０】
アッセイにおいて、分岐短鎖脂肪酸の調節はグリカン組成に依存するようである。アッセイにおいてイソブチレートが少なくとも２倍増加した５つのグリカンのうち４つは、グルコースおよび／またはガラクトースと組み合わせたマンノースを含んでいた。アッセイにおいてイソブチレートが少なくとも２倍減少した６つのグリカン全てがガラクトースを含んでいた。グリカンが分岐短鎖脂肪酸を選択的に増加または減少させる能力は、それらが治療的利益のためにインビボで短鎖脂肪酸を選択的に調節するために投与され得ることを示唆する。
【１１４１】
アッセイにおける短鎖脂肪酸のグリカン調節は、多数の分類群におけるシフトと関連している。図２５Ａ〜２５Ｄに示されるように、１６Ｓ  ｒＲＮＡ配列決定分析は、クロストリジウム（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉａｃｅａｅ）、ツリシバクター（Ｔｕｒｉｃｉｂａｃｔｅｒ）、ロゼブリア（Ｒｏｓｅｂｕｒｉａ）およびバクテロイデス・フラジリス（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ  ｆｒａｇｉｌｉｓ）として同定された細菌がアッセイにおいてブチレートと正の相関関係を有していたことを示す。分類群クロストリジウム科（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉａｃｅａｅ）およびロゼブリア（Ｒｏｓｅｂｕｒｉａ）の多くのメンバーは、報告されたゲノム分析に基づいてブチレート産生者として同定されており、それらの相対存在度の増加はアッセイにおけるブチレートの増加と直接関連し得る。ツリシバクター（Ｔｕｒｉｃｉｂａｃｔｅｒ）およびＢ．フラジリス（Ｂ．ｆｒａｇｉｌｉｓ）とブチレート生産との相関関係は、間接的効果と関連し得る。ツリシバクター（Ｔｕｒｉｃｉｂａｃｔｅｒ）はラクテートを産生すると報告されており（Ｂｏｓｓｈａｒｄ  ＰＰ  ｅｔ  ａｌ，ＩＪＳＥＭ  ２００２）、ラクテートはブチレート合成の前駆体である（Ｂｏｕｒｒｉａｕｄ  Ｃ  ｅｔ  ａｌ，ＪＡＭ  ２００５；Ｂｅｌｅｎｇｕｅｒ  Ａ  ｅｔ  ａｌ，ＡＥＭ  ２００７）。Ｂ．フラジリス（Ｂ．ｆｒａｇｉｌｉｓ）はアセテートを産生し（Ｍａｃｆａｒｌａｎｅ  Ｓ  ｅｔ  ａｌ，ＰＮＳ  ２００３）、これはロゼブリア（Ｒｏｓｅｂｕｒｉａ）を含む細菌によるブチレート産生に利用されることが示されている（Ｄｕｎｃａｎ  ＳＨ  ｅｔ  ａｌ，ＢＪＮ  ２００４）。ツリシバクター（Ｔｕｒｉｃｉｂａｃｔｅｒ）およびＢ，フラジリス（Ｂ．ｆｒａｇｉｌｉｓ）は、クロストリジウム科（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉａｃｅａｅ）およびロゼブリア（Ｒｏｓｅｂｕｒｉａ）などの細菌によってブチレートに変換される前駆体を提供することによって、ブチレート産生の増加に間接的に貢献し得る。
【１１４２】
アッセイにおけるアセテートのグリカン調節は、いくつかの細菌分類群と負の相関関係があり、他の細菌分類群と正の相関関係があった。図２６Ａ〜２６Ｆに示されるように、ルミノコッカス科（Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃａｃｅａｅ）、リケネラ科（Ｒｉｃｋｅｎｅｌｌａｃｅａｅ）およびオシロスピラ（Ｏｓｃｉｌｌｏｓｐｉｒａ）を含む分類群は、アッセイにおけるアセテート産生と強い負の相関関係を有していた。アッセイにおいてアセテートと正の相関関係を有した分類群には、バクテロイデス・ユニフォルミス（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ  ｕｎｉｆｏｒｍｉｓ）、クロストリジウム科（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉａｃｅａｅ）およびバクテロイデス・オバツス（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ  ｏｖａｔｕｓ）が含まれていた。図２７Ａ〜２７Ｄに示されるように、アッセイでは、Ｂ．オバツス（Ｂ．ｏｖａｔｕｓ）およびＢ．ユニフォルミス（Ｂ．ｕｎｉｆｏｒｍｉｓ）もプロピオネートと正の相関関係を有していた一方、プロピオネートと最も強い負の相関関係を有していた分類群は、アセテートと最も強い相関関係を有していた分類群とは異なっており、ビフィドバクテリウム（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）、ルミノコッカス・ブロミイ（Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ  ｂｒｏｍｉｉ）、およびロゼブリア・ファエシス（Ｒｏｓｅｂｕｒｉａ  ｆａｅｃｉｓ）を含んでいた。したがって、アッセイにおけるグリカンによる細菌分類群の相対存在度の差次的調節は、短鎖脂肪酸の差次的調節と関連するようである。
【１１４３】
実施例２４．グリカンポリマー調製物の胞子形成細菌分類群の細菌増殖を調節する能力
胃腸管の種々の細菌胞子形成共生株の、増殖基質として異なるグリカンを利用する能力を評価するインビトロのアッセイを実施した。このアッセイは、選択されたグリカンの、健康に良い効果に関連している胞子形成腸内共生体の増殖を促進する能力を評価するように設計された。細菌株を、パラジウム触媒を特徴とする嫌気性チャンバ（ＡＳ−５８０、Ａｎａｅｒｏｂｅ  Ｓｙｓｔｅｍｓ）中、すべての工程で取り扱った。チャンバは最初に、水素５％、二酸化炭素５％および窒素９０％からなる嫌気性ガス混合物でパージすることによって嫌気性にし、その後、この同じ嫌気性ガス混合物を使用して嫌気性状態に維持した。酸素の存在下で色が変化するＯｘｏｉｄ嫌気性インジケーターストリップを用いてチャンバの嫌気性を毎日確認した。すべての培養培地、アッセイプレート、他の試薬およびプラスチック消耗品を、細菌と接触する前に２４〜４８時間、嫌気性チャンバ内で予め還元した。グリカンｇａｌ１００、ｇｌｕ２０ｇａｌ８０、ｇｌｕ４０ｇａｌ６０、ｇｌｕ５０ｇａｌ５０、ｇｌｕ６０ｇａｌ４０、ｇｌｕ８０ｇａｌ２０、ｇｌｕ１００、ｇｌｕ８０ｍａｎ２０、ｇｌｕ６０ｍａｎ４０、ｇｌｕ４０ｍａｎ６０、ｇｌｕ２０ｍａｎ８０、ｍａｎ１００、ｘｙｌ１００、ｘｙｌ８０ａｒａ２０、ｘｙｌ６０ａｒａ４０、ｘｙｌ４０ａｒａ６０、ｘｙｌ２０ａｒａ８０、ａｒａ１００、ｇｌｕ８０ａｒａ２０、ｇｌｕ６０ａｒａ４０、ｇｌｕ４０ａｒａ６０、ｇｌｕ２０ａｒａ８０、ｇｌｕ８０ｘｙｌ２０、ｇｌｕ６０ｘｙｌ４０、ｇｌｕ４０ｘｙｌ６０、ｇｌｕ２０ｘｙｌ８０、ｇａｌ８０ｍａｎ２０、ｇａｌ６０ｍａｎ４０、ｇａｌ４０ｍａｎ６０、ｇａｌ２０ｍａｎ８０、ｇａｌ８０ｘｙｌ２０、ｇａｌ６０ｘｙｌ４０、ｇａｌ４０ｘｙｌ６０、ｇａｌ２０ｘｙｌ８０、ｇａｌ８０ａｒａ２０、ｇａｌ６０ａｒａ４０、ｇａｌ４０ａｒａ６０、ｇａｌ２０ａｒａ８０、ｍａｎ８０ｘｙｌ２０、ｍａｎ６０ｘｙｌ４０、ｍａｎ４０ｘｙｌ６０、ｍａｎ２０ｘｙｌ８０、ｍａｎ８０ａｒａ２０、ｍａｎ６０ａｒａ４０、ｍａｎ４０ａｒａ６０、ｍａｎ２０ａｒａ８０、ｇｌｕ３３ｇａｌ３３ａｒａ３３、ｍａｎ５２ｇｌｕ２９ｇａｌ１９、ｇｌｕ３３ｇａｌ３３ｍａｎ３３、ｇｌｕ３３ｇａｌ３３ｘｙｌ３３、ｇａｌ３３ｍａｎ３３ｘｙｌ３３、ｇａｌ３３ｍａｎ３３ａｒａ３３、および市販の対照、ＦＯＳ（Ｎｕｔｒａｆｌｏｒａ  ＦＯＳ；ＮＯＷ  Ｆｏｏｄｓ、Ｂｌｏｏｍｉｎｇｄａｌｅ  ＩＬ）を、水中５％ｗ／ｖに調製し、濾過滅菌し、Ｃｏｓｔａｒ  ３３７０アッセイプレートに添加し、アッセイにおいて最終濃度０．５％ｗ／ｖとし、各グリカンは２つの隣接しないウェルでアッセイし、デキストロースと水を陽性対照および陰性対照として供給した。
【１１４４】
細菌分離株は、Ａｍｅｒｉｃａｎ  Ｔｙｐｅ  Ｃｕｌｔｕｒｅ  Ｃｏｌｌｅｃｔｉｏｎ（ＡＴＣＣ）およびＬｅｉｂｎｉｚ  Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅ  ＤＳＭＺ−Ｇｅｒｍａｎ  Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅ  ｏｆ  Ｍｉｃｒｏｏｒｇａｎｉｓｍｓ  ａｎｄ  Ｃｅｌｌ  Ｃｕｌｔｕｒｅｓ（ＤＳＭＺ）から得た。クロストリジウム・シンデンス（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｓｃｉｎｄｅｎｓ）ＡＴＣＣ  ３５７０４「ＣＳＣ．３２」、クロストリジウム・ネキシレ（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｎｅｘｉｌｅ）ＡＴＣＣ  ２７７５７「ＣＮＥ．３１」、ブラウティア・プロダクタ（Ｂｌａｕｔｉａ  ｐｒｏｄｕｃｔａ）ＡＴＣＣ  ２７３４０「ＢＰＲ．２２」、ドレア・ロンギカテナ（Ｄｏｒｅａ  ｌｏｎｇｉｃａｔｅｎａ）ＤＳＭ  １３８１４「ＤＬＯ．７６」、ルミノコッカス・オベウム（Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ  ｏｂｅｕｍ）ＡＴＣＣ  ２９７１４「ＲＯＢ．７４」およびブラウティア・ハンセニイ（Ｂｌａｕｔｉａ  ｈａｎｓｅｎｉｉ）ＡＴＣＣ  ２７７５２「ＢＨＡ．２０」の培養物を、牛赤身挽肉、カゼインの酵素消化物、酵母エキス、リン酸カリウム、デキストロース、システイン、ヘミンおよびビタミンＫ１を含む予め還元された濃縮培地、Ｃｈｏｐｐｅｄ  Ｍｅｅｔ  Ｇｌｕｃｏｓｅブロス（ＣＭＧ、Ａｎａｅｒｏｂｅ  Ｓｙｓｔｅｍｓ）中、３７℃で１８〜４８時間、嫌気的に増殖させた。製造業者のプロトコルに従ってＧｅｎ５  ２．０  Ａｌｌ−Ｉｎ−Ｏｎｅ  Ｍｉｃｒｏｐｌａｔｅ  Ｒｅａｄｅｒ  Ｓｏｆｔｗａｒｅを備えたＢｉｏｔｅｋ  Ｓｙｎｅｒｇｙ  ２プレートリーダーを使用して、Ｃｏｓｔａｒ  ３３７０ポリスチレン９６ウェル平底アッセイプレートにおいて６００ｎＭ（ＯＤ６００）での各培養物の光学密度を測定し、糖を含まずに調製した規定培地および半規定培地において最終的にＯＤ６００  ０．０１まで細胞を希釈することによって、接種物を調製した。Ｂ．ハンセニイ（Ｂ．ｈａｎｓｅｎｉｉ）、Ｂ．プロドゥクタ（Ｂ．Ｐｒｏｄｕｃｔａ）、およびＤ．ロンギカテナ（Ｄ．ｌｏｎｇｉｃａｔｅｎａ）分離株を、０〜１０％（ｖ／ｖ）ＣＭＧを添加した、９００ｍｇ／Ｌ塩化ナトリウム、２６ｍｇ／Ｌ塩化カルシウム二水和物、２０ｍｇ／Ｌ塩化マグネシウム六水和物、１０ｍｇ／Ｌ塩化マンガン四水和物、４０ｍｇ／Ｌ硫酸アンモニウム、４ｍｇ／Ｌ硫酸鉄七水和物、１ｍｇ／Ｌ塩化コバルト六水和物、３００ｍｇ／Ｌリン酸カリウム二塩基、１．５ｇ／Ｌリン酸ナトリウム二塩基、５ｇ／Ｌ炭酸水素ナトリウム、０．１２５ｍｇ／Ｌビオチン、１ｍｇ／Ｌピリドキシン、１ｍ／Ｌパントテン酸塩、７５ｍｇ／Ｌヒスチジン、７５ｍｇ／Ｌグリシン、７５ｍｇ／Ｌトリプトファン、１５０ｍｇ／Ｌアルギニン、１５０ｍｇ／Ｌメチオニン、１５０ｍｇ／Ｌトレオニン、２２５ｍｇ／Ｌバリン、２２５ｍｇ／Ｌイソロイシン、３００ｍｇ／Ｌロイシン、４００ｍｇ／Ｌシステイン、および４５０ｍｇ／Ｌプロリン（Ｔｈｅｒｉｏｔ  ＣＭ  ｅｔ  ａｌ．Ｎａｔ  Ｃｏｍｍｕｎ．２０１４；５：３１１４）中で試験した。Ｃ．シンデンス（Ｃ．ｓｃｉｎｄｅｎｓ）、Ｃ．ネキシレ（Ｃ．ｎｅｘｉｌｅ）およびＲ．オベウム（Ｒ．ｏｂｅｕｍ）を、１０ｇ／Ｌトリプトンペプトン、５ｇ／Ｌ酵母エキス、０．５ｇ／Ｌ  Ｌ−���ステイン塩酸塩、０．１Ｍリン酸カリウム緩衝液ｐＨ７．２、１μｇ／ｍＬビタミンＫ３、０．０８％ｗ／ｖ塩化カルシウム、０．４μｇ／ｍＬ硫酸鉄七水和物、１μｇ／ｍＬレサズリン、１．２μｇ／ｍＬヘマチン、０．２ｍＭヒスチジン、０．０５％Ｔｗｅｅｎ  ８０、０．５％肉エキス（Ｓｉｇｍａ）、１％微量ミネラル補給剤（ＡＴＣＣ）、１％ビタミン補給剤（ＡＴＣＣ）、０．０１７％ｖ／ｖ酢酸、０．００１％ｖ／ｖイソ吉草酸、０．２％ｖ／ｖプロピオン酸および０．２％ｖ／ｖ  Ｎ−酪酸（Ｒｏｍａｎｏ  ＫＡ  ｅｔ  ａｌ．ｍＢｉｏ  ２０１５；６（２）：ｅ０２４８１−１４）中で試験した。細菌を、９６ウェルマイクロプレート中、最終濃度０．５％ｗ／ｖ、１ウェル当たり２００μＬの最終容量の、グリカンｇａｌ１００、ｇｌｕ２０ｇａｌ８０、ｇｌｕ４０ｇａｌ６０、ｇｌｕ５０ｇａｌ５０、ｇｌｕ６０ｇａｌ４０、ｇｌｕ８０ｇａｌ２０、ｇｌｕ１００、ｇｌｕ８０ｍａｎ２０、ｇｌｕ６０ｍａｎ４０、ｇｌｕ４０ｍａｎ６０、ｇｌｕ２０ｍａｎ８０、ｍａｎ１００、ｘｙｌ１００、ｘｙｌ８０ａｒａ２０、ｘｙｌ６０ａｒａ４０、ｘｙｌ４０ａｒａ６０、ｘｙｌ２０ａｒａ８０、ａｒａ１００、ｇｌｕ８０ａｒａ２０、ｇｌｕ６０ａｒａ４０、ｇｌｕ４０ａｒａ６０、ｇｌｕ２０ａｒａ８０、ｇｌｕ８０ｘｙｌ２０、ｇｌｕ６０ｘｙｌ４０、ｇｌｕ４０ｘｙｌ６０、ｇｌｕ２０ｘｙｌ８０、ｇａｌ８０ｍａｎ２０、ｇａｌ６０ｍａｎ４０、ｇａｌ４０ｍａｎ６０、ｇａｌ２０ｍａｎ８０、ｇａｌ８０ｘｙｌ２０、ｇａｌ６０ｘｙｌ４０、ｇａｌ４０ｘｙｌ６０、ｇａｌ２０ｘｙｌ８０、ｇａｌ８０ａｒａ２０、ｇａｌ６０ａｒａ４０、ｇａｌ４０ａｒａ６０、ｇａｌ２０ａｒａ８０、ｍａｎ８０ｘｙｌ２０、ｍａｎ６０ｘｙｌ４０、ｍａｎ４０ｘｙｌ６０、ｍａｎ２０ｘｙｌ８０、ｍａｎ８０ａｒａ２０、ｍａｎ６０ａｒａ４０、ｍａｎ４０ａｒａ６０、ｍａｎ２０ａｒａ８０、ｇｌｕ３３ｇａｌ３３ａｒａ３３、ｍａｎ５２ｇｌｕ２９ｇａｌ１９、ｇｌｕ３３ｇａｌ３３ｍａｎ３３、ｇｌｕ３３ｇａｌ３３ｘｙｌ３３、ｇａｌ３３ｍａｎ３３ｘｙｌ３３、ｇａｌ３３ｍａｎ３３ａｒａ３３、市販のＦＯＳおよびデキストロースに、３７℃で、１８〜４８時間、嫌気的に曝露した。インキュベーション時間の終わりに、各分離株についてのＯＤ６００測定値を、製造業者の仕様書に従って、Ｇｅｎ５  ２．０ソフトウェア付きのＢｉｏｔｅｋ  Ｓｙｎｅｒｇｙ２リーダーを用いて得た。
【１１４５】
【表１１７】
2020513410.tif 000119
【１１４６】
表１６に見られるように、グリカンは、アッセイにおける６つの胞子形成腸内共生体の増殖を様々な程度で支持する。このアッセイでは、ｇａｌ１００、ｇｌｕ２０ｇａｌ８０、ｘｙｌ８０ａｒａ２０、ｘｙｌ６０ａｒａ４０、ｇｌｕ２０ｘｙｌ８０は６株全ての増殖を支持し、ｇｌｕ４０ｇａｌ６０、ｇｌｕ５０ｇａｌ５０、ｇｌｕ６０ｇａｌ４０、ｘｙｌ４０ａｒａ６０、ｘｙｌ２０ａｒａ８０、ｇｌｕ４０ｘｙｌ６０およびｇｌｕ３３ｇａｌ３３ａｒａ３３は５株の増殖を支持し、ｘｙｌ１００、ｇａｌ６０ａｒａ４０、ｍａｎ５２ｇｌｕ２９ｇａｌ１９、およびｇｌｕ３３ｇａｌ３３ｍａｎ３３は４株の増殖を支持し、ｇｌｕ２０ａｒａ８０、ｇａｌ２０ａｒａ８０、ｍａｎ４０ｘｙｌ６０、ｍａｎ２０ｘｙｌ８０、ｇｌｕ３３ｇａｌ３３ｘｙｌ３３およびｇａｌ３３ｍａｎ３３ａｒａ３３は３株の増殖を支持する。
【１１４７】
アッセイにおける胞子形成共生物の増殖の調節は、グリカンの組成によって変化する。グルコースおよびガラクトースのインプットを有するオリゴマーは、アッセイにおいて６つの株の少なくとも半分を支持し、アッセイにおいて増殖が支持される株の割合は、一般的に、ガラクトースの割合が増加するにつれて増加する。このアッセイでは、ｇｌｕ８０ｇａｌ２０およびｇｌｕ１００は３株を支持し、ｇｌｕ５０ｇａｌ５０は５株を支持し、ｇａｌ１００およびｇｌｕ２０ｇａｌ８０は６株の増殖を支持する。インプットとしてｇｌｕ、ｇａｌおよび他の１つのモノマーを含む４つのオリゴマーのうち、３つのオリゴマー（ｇｌｕ３３ｇａｌ３３ａｒａ３３、ｍａｎ５２ｇｌｕ２９ｇａｌ１９およびｇｌｕ３３ｇａｌ３３ｍａｎ３３）はアッセイにおいて４株の増殖を支持し、１つのオリゴマー（ｇｌｕ３３ｇａｌ３３ｘｙｌ３３）はアッセイにおいて３株の増殖を支持する。アッセイにおいて、キシロースおよびアラビノースのインプットを有するオリゴマーならびにグルコースおよびキシロースのインプットを有するオリゴマーにより支持される菌株の数は、キシロースのインプットの割合が増加するにつれて増加する。このアッセイでは、ｇｌｕ８０ｘｙｌ２０は２株を支持し、ｇｌｕ６０ｘｙｌ４０は３株を支持し、ｇｌｕ４０ｘｙｌ６０は５株を支持し、ｇｌｕ２０ｘｙｌ８０は６株を支持する。このアッセイでは、キシロースおよびアラビノースの両方のインプットを含有するオリゴマーは５または６株の増殖を支持し、ｘｙｌ１００は４株の増殖を支持し、ａｒａ１００は２株を支持する。
【１１４８】
健康なヒトの胃腸管は、何百もの異なる細菌種を含み得る多様な微生物群を含有する。米国特許出願公開第２０１６／０１５８２９４号明細書に記載のように、腸内微生物叢は、ヒトの健康において重要な役割を果たし、病原体に対するコロニー形成耐性、宿主免疫応答の調節、必須栄養素の産生および栄養素吸収、ならびに腸上皮完全性の維持を含む利点を有する。ディスバイオシス条件下では、腸のマイクロバイオーム集団が変化し、宿主に対する負の影響は、免疫応答の変化、炎症の増加、代謝応答の変化、および病原体に対する感受性の増加を含み得る。プロバイオティクスは、正常な健康ヒト微生物叢に存在する何百という細菌種のうちのほんの数種にすぎない。胞子形成共生細菌は、正常で健康なヒトマイクロバイオーム中に豊富に存在し、腸上皮バリア完全性と代謝および免疫応答の調節、ならびにＣ．シンデンス（Ｃ．ｓｃｉｎｄｅｎｓ）によるクロストリジウム・ディフィシル（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｄｉｆｆｉｃｉｌｅ）感染に対する防御と関連するブチレート産生を含む、様々な有益な効果に関連する種を含む。胞子形成共生細菌の増殖を促進するためにグリカンを投与して、一連の健康効果を提供し、微生物のディスバイオシスに関連する疾患を予防および処置し得る。
【１１４９】
実施例２５．胞子形成細菌分類群のグリコシダーゼプロファイルおよび糖利用
胞子形成細菌分類群が豊富であるグリコシドヒドロラーゼ（ＧＨ）およびグリコシルトランスフェラーゼ（ＧＴ）は、本質的に実施例２０に記載のように同定された。
【１１５０】
非胞子形成細菌と比較した場合、胞子形成細菌からのゲノムが富化された４０のグリコシドヒドロラーゼおよびトランスフェラーゼ（ＣＡＺｙ）ファミリーおよびサブファミリーの遺伝子が同定された（図２８、Ｐ＜０．０５、Ｗｉｌｃｏｘ順位和、ＦＤＲ補正）。胞子菌は表１７に概括される。
【１１５１】
【表１１８】
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【１１５２】
例えば、ＧＨ４３、ＧＨ１３、およびＧＨ２８は、胞子形成細菌からのゲノムにおいて、はるかに高度に表現されていた（図２８）。過剰濃縮はまた、一般的に、胞子形成細菌からの全てのゲノムにわたり検出される、より高い出現率に対応していた（図２９Ａ）。全体として、胞子形成細菌が豊富であると同定されたＣＡＺｙｍｅファミリーは、胞子形成細菌ではない細菌と比較した場合、胞子形成細菌ゲノムの大部分に存在していた（図２９Ｂ）。これらの結果は、特定の炭水化物活性酵素が胞子形成細菌に富んでいることを示す。表１８は、これらの酵素ファミリーによって標的とされる可能性が高いグリカンモノマーを示す。
【１１５３】
【表１１９】
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【１１５４】
多くがグルコース、キシロース、ガラクトース、およびアラビノース含有基質を標的としており、これは、これらの成分を有するグリカンが胞子形成細菌の増殖を促進するために使用され得ることを示唆している。グルコース、キシロース、ガラクトース、および／またはアラビノースを含むグリカンは、単一株増殖アッセイにおいて胞子形成細菌の増殖を促進した（実施例２４、表１６参照）。
【１１５５】
実施例２７．標的グリコシダーゼを用いて合成したオリゴ糖の存在下でのヒトからの糞便スラリー中のグリコシダーゼをコードする特定の分類群の濃縮
グリカン調製物を、インビトロで健康なヒト対象からの糞便スラリー中の特定のグリコシダーゼをコードする標的細菌種のレベルを調節するそれらの能力について試験した（エキソビボアッセイとも称される）。糞便試料およびスラリーを、パラジウム触媒を特徴とする嫌気性チャンバ（ＡＳ−５８０、Ａｎａｅｒｏｂｅ  Ｓｙｓｔｅｍｓ）中で取り扱った。グリカンを水中５％ｗ／ｖで調製し、濾過滅菌し、アッセイ中０．５％ｗ／ｖの最終濃度で９６ウェル・ディープウェルマイクロプレートアッセイプレートに添加し、水を陽性対照および陰性対照として供給した。
【１１５６】
寄付されたヒト糞便試料を−８０℃で保存した。作業ストックを調製するために、糞便試料を嫌気性チャンバに移し、解凍した。糞便サンプルを、リン酸緩衝生理食塩水（ＰＢＳ）ｐＨ７．４（Ｐ０２６１、Ｔｅｋｎｏｖａ  Ｉｎｃ．、Ｈｏｌｌｉｓｔｅｒ、ＣＡ））中、２０％ｗ／ｖに調製し、１５％グリセロール、−８０℃で保存した。２０％ｗ／ｖ糞便スラリー＋１５％グリセロールを２，０００×ｇで遠心分離し、上清を除去し、ペレットを、７５０μＭの尿素および０．１％のペプトンを添加した９００ｍｇ／Ｌ塩化ナトリウム、２６ｍｇ／Ｌ塩化カルシウム二水和物、２０ｍｇ／Ｌ塩化マグネシウム六水和物、１０ｍｇ／Ｌ塩化マンガン四水和物、４０ｍｇ／Ｌ硫酸アンモニウム、４ｍｇ／Ｌ硫酸鉄七水和物、１ｍｇ／Ｌ塩化コバルト六水和物、３００ｍｇ／Ｌリン酸カリウム二塩基、１．５ｇ／Ｌリン酸ナトリウム二塩基、５ｇ／Ｌ炭酸水素ナトリウム、０．１２５ｍｇ／Ｌビオチン、１ｍｇ／Ｌピリドキシン、１ｍ／Ｌパントテン酸塩、７５ｍｇ／Ｌヒスチジン、７５ｍｇ／Ｌグリシン、７５ｍｇ／Ｌトリプトファン、１５０ｍｇ／Ｌアルギニン、１５０ｍｇ／Ｌメチオニン、１５０ｍｇ／Ｌトレオニン、２２５ｍｇ／Ｌバリン、２２５ｍｇ／Ｌイソロイシン、３００ｍｇ／Ｌロイシン、４００ｍｇ／Ｌシステイン、および４５０ｍｇ／Ｌプロリン（Ｔｈｅｒｉｏｔ  ＣＭ  ｅｔ  ａｌ．Ｎａｔ  Ｃｏｍｍｕｎ．２０１４；５：３１１４）中に懸濁し、１％ｗ／ｖ糞便スラリーとした。
【１１５７】
調製した１％ｗ／ｖ糞便スラリーを、９６ウェルディープウェルマイクロプレート中、最終濃度０．５％ｗ／ｖ、１ウェル当たり５００μＬの最終容量のメリビオース−１、メリビオース−ｅｎｚ１９−１、メリビオース−ｅｎｚ２０−１、メリビオース−ｅｎｚ１６−１、メリビオース−ｅｎｚ１７−１、ラフィノース−１、ラフィノース−ｅｎｚ１９−１、ラフィノース−ｅｎｚ１６−１に、３７℃で１４時間、嫌気的に曝露した。メリビオースおよびラフィノースは、特定の酵素（ｅｎｚ１９、ｅｎｚ２０など）を有するオリゴ糖を生成するために使用される基質を示し、ダッシュの後の数字は、別のグリカン調製物（例えば、−３）とは異なる特性を有するグリカン調製物（例えば、−１）を示し、これは、本明細書に記載のグリカン調製物の範囲内で互いに異なる。
【１１５８】
インキュベーション後、ゲノムＤＮＡをグリカンおよび対照で処理した糞便スラリーから抽出し、１６Ｓ  ｒＲＮＡ遺伝子の可変領域４を増幅して配列を決定した（Ｅａｒｔｈ  Ｍｉｃｒｏｂｉｏｍｅ  Ｐｒｏｊｅｃｔ  ｐｒｏｔｏｃｏｌ  ｗｗｗ．ｅａｒｔｈｍｉｃｒｏｂｉｏｍｅ．ｏｒｇ／ｅｍｐ−ｓｔａｎｄａｒｄ−ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ／１６ｓ／およびＣａｐｏｒａｓｏ  ＪＧ  ｅｔ  ａｌ．２０１２．Ｕｌｔｒａ−ｈｉｇｈ−ｔｈｒｏｕｇｈｐｕｔ  ｍｉｃｒｏｂｉａｌ  ｃｏｍｍｕｎｉｔｙ  ａｎａｌｙｓｉｓ  ｏｎ  ｔｈｅ  Ｉｌｌｕｍｉｎａ  ＨｉＳｅｑ  ａｎｄ  ＭｉＳｅｑ  ｐｌａｔｆｏｒｍｓ．ＩＳＭＥ  Ｊ．）。生配列を逆多重化し、各試料をＵＮＯＩＳＥ２（Ｅｄｇａｒ  ２０１６）で別々に処理した。簡潔には、対になった末端の読取り値を統合し、品質フィルターにかけた。次いで、固有読取り値をノイズ除去し、そしてフィルタリングされていない統合された配列をノイズ除去された配列にマッピングした。分類法は、ＲＤＰ分類器（ＲＤＰ  ｃｌａｓｓｉｆｉｅｒ）を用いてノイズ除去された配列に割り当てられた（Ｗａｎｇ  ２００７）。
【１１５９】
本明細書に示されるように、酵素を合成するために使用されるグリコシダーゼが腸内微生物種によってコードされている場合、得られるオリゴ糖はそれらの特定の種を富化する。例えば、ラクノスピラ科（Ｌａｃｈｎｏｓｐｉｒａｃｅａｅ）によってコードされるグリコシダーゼを用いてオリゴ糖を生成する場合、得られるオリゴ糖は、元の親基質、または異なる種によってコードされる酵素を介して生成されるオリゴ糖のいずれかよりもラクノスピラ科（Ｌａｃｈｎｏｓｐｉｒａｃｅａｅ）を富化する（図３１Ａ〜３１Ｂ）。これは、オリゴ糖を生成するために使用される基質とは無関係に該当する（図３１Ａ〜３１Ｂ）。これは、オリゴ糖を腸のマイクロバイオーム中のグリコシダーゼに標的化して、分類群および目的の機能を特異的に濃縮するためのメカニズムを実証する。
【１１６０】
関連のない分類群は、共有グリコシルヒドロラーゼを同定することによって、さらに標的とされ得る。本明細書に示されるように、３つの固有の属、ビフィドバクテリウム（Ｂｉｆｉｄｏａｂａｃｔｅｒｉａ）、バクテロイデス（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ）、およびロゼブリア（Ｒｏｓｅｂｕｒｉａ）に豊富に存在するグリコシルヒドロラーゼを使用すると、３つの分類群全てがエクスビボ群において同時に富化される（図３２Ａ〜３２Ｄ）。これは、門をまたいだ種を標的とし、さらに機能またはグリコ分類群を標的とする能力を実証する。
【１１６１】
同等物および範囲
本願は、様々な交付済み特許、公開された特許出願、学術論文、および他の刊行物を指し、これらは全て参照により本明細書に組み込まれる。組み込まれた参照文献のうちの何らかと本出願との間で矛盾がある場合、本出願が制御するものとする。さらに、先行技術に含まれる本発明の任意の特定の実施形態は特許請求の範囲のうちのいずれか１つ以上から明確に排除され得る。かかる実施形態は、当業者には公知であると見なされるため、排除が本明細書に明確に記述されない場合であっても除外され得る。本発明の任意の特定の実施形態は、先行技術の存在に関連しているかどうかであっても、何らかの理由で、いかなる特許請求の範囲からも除外され得る。
【１１６２】
当業者は、単なる通常の実験を用いて、本明細書に記載される特定の実施形態の多くの同等物を認識し、または解明することができるであろう。本明細書に記載される本発明の実施形態の範囲は、添付の特許請求の範囲に記述されるが、上の発明の詳細な説明、図面、または実施例に限定されることは意図されない。当業者は、この説明への様々な変更および修正が、以下の特許請求の範囲に定義されるように、本発明の精神または範囲から逸脱することなくなされ得ることが理解されよう。
【図１】
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【図２】
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【図３Ａ】
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【図３Ｂ】
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【図３Ｃ】
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【図４】
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【図５】
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【図６】
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【図７】
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【図８】
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【図９】
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【図１０】
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【図１１】
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【図１２】
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【図１３】
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【図１４】
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【図１５】
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【図１６】
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【図１７】
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【図１８】
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【図１９】
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【図２０】
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【図２１】
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【図２２】
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【図２３】
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【図２４】
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【図２５】
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【図２６−１】
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【図２６−２】
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【図２７】
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【図２８】
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【図２９】
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【図３０−１】
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【図３０−２】
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【図３０−３】
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【図３０−４】
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【図３１】
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【図３２】
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【配列表】
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【国際調査報告】
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