(57)【要約】自動バッチ・データ分析システムを提供する。この自動バッチ・データ分析システムは、例えば、少なくとも１つのシステム・コンポーネントと、データベースとを含む。また、このシステムは、格納されているプログラミング可能な命令を実行する少なくとも１つのコンピューティング・デバイスも含む。命令が実行されると、システム・コンポーネントに関連するデータを取得し、少なくとも部分的にタグに基づいて、受信データからどのデータを抽出のために識別するか決定し、この決定に基づいてタグ付きデータを抽出する。【選択図】図１
2020513818.tif 000002
【特許請求の範囲】
【請求項１】
医薬品製造のための自動バッチ・データ分析システムであって、
少なくとも１つのシステム・コンポーネントと、
データベースと、
格納されたプログラム可能な命令を実行する少なくとも１つのコンピューティング・デバイスと、
を備え、
前記命令が、
前記少なくとも１つのシステム・コンポーネントに関連するデータを取得し、
少なくとも部分的にタグに基づいて、受信したデータから、どのデータを抽出のために識別するか決定し、
前記決定に基づいて、前記タグ付けされたデータを抽出する、システム。
【請求項２】
請求項１記載のシステムにおいて、前記少なくとも１つのコンピューティング・デバイスが、前記少なくとも１つのシステム・コンポーネントを使用して、処方を実行するように構成される、システム。
【請求項３】
請求項１記載のシステムにおいて、前記少なくとも１つのコンピューティング・デバイスが、前記抽出されたデータを、（ｉ）前記データベース、（ｉｉ）前記少なくとも１つのコンピューティング・デバイスのローカル・メモリ、および（ｉｉｉ）メッセージング・キューの内１つ以上に出力するように構成される、システム。
【請求項４】
請求項３記載のシステムにおいて、前記データに対して分析を実行する、システム。
【請求項５】
請求項４記載のシステムにおいて、前記データベースが、前記抽出されたデータを格納するように別個に設計された１つ以上の記憶デバイスを含む、システム。
【請求項６】
請求項１記載のシステムにおいて、前記少なくとも１つのシステム・コンポーネントが、（ｉ）バイオリアクタ、（ｉｉ）発酵機器、（ｉｉｉ）収穫機器、（ｉｖ）精密濾過および精製用機器、（ｖ）培地作成機器、または（ｖｉ）緩衝剤調合機器である、システム。
【請求項７】
請求項１記載のシステムであって、更に、（ｉ）センサ、（ｉｉ）送信機、（ｉｉｉ）スケール、（ｉｖ）スイッチ、（ｖ）ポンプ、（ｖｉ）ポンプ、（ｖｉｉ）制御弁、（ｖｉｉｉ）離散弁、（ｉｘ）固定速度始動器を有するポンプ、（ｘ）可変周波数ドライブを有するポンプ、（ｘｉ）撹拌機、（ｘｉｉ）可変周波数ドライブを有する撹拌機、および（ｘｉｉｉ）リミット・スイッチを有する離散弁の内１つ以上を含む、システム。
【請求項８】
請求項７記載のシステムにおいて、前記データが、（ｉ）前記センサ、（ｉｉ）前記送信機、（ｉｉｉ）前記スケール、（ｉｖ）前記スイッチ、（ｖ）前記ポンプ、（ｖｉ）前記ポンプ、（ｖｉｉ）前記制御弁、（ｖｉｉｉ）前記離散弁、（ｉｘ）前記固定速度始動器を有するポンプ、（ｘ）前記可変周波数ドライブを有するポンプ、（ｘｉ）前記撹拌機、（ｘｉｉ）前記可変周波数ドライブを有する撹拌機、および（ｘｉｉｉ）前記リミット・スイッチを有する離散値の内１つ以上から取得される、システム。
【請求項９】
請求項２記載のシステムにおいて、前記処方が、前記少なくとも１つのシステム・コンポーネントに関連するタスクを実行するための１組の命令である、システム。
【請求項１０】
請求項９記載のシステムにおいて、前記１組の命令が、操作員によって構成される、システム。
【請求項１１】
請求項９記載のシステムにおいて、前記タグが、（ｉ）パラメータ、および（ｉｉ）前記取得されたデータにおける対象メタデータの内１つ以上を、更なる分析のために識別する、システム。
【請求項１２】
請求項１１記載のシステムにおいて、前記対象の１つ以上のパラメータが、それぞれの命令の実行中に識別および抽出されるように、前記タグが前記１組の命令における命令毎に実装可能である、システム。
【請求項１３】
請求項１記載のシステムにおいて、前記取得されたデータがバッチ・データである、システム。
【請求項１４】
請求項１記載のシステムにおいて、前記データが、操作員によって、前記システムに手作業で入力される、システム。
【請求項１５】
請求項１１記載のシステムにおいて、前記パラメータおよび前記メタデータの内前記１つ以上がユーザによって選択可能である、システム。
【請求項１６】
請求項１記載のシステムにおいて、前記データが特定のフォーマットに自動的に要約される、システム。
【請求項１７】
請求項１記載のシステムにおいて、前記少なくとも１つのシステム・コンポーネントが化学反応器である、システム。
【請求項１８】
医薬品製造のための自動バッチ・データ分析方法であって、
少なくとも１つのコンピューティング・デバイスによって、システムのコンポーネントに関連するデータを取得するステップと、
前記少なくとも１つのコンピューティング・デバイスによって、少なくとも部分的にタグに基づいて、前記受信データからどのデータを抽出のために識別するか決定するステップと、
前記少なくとも１つのコンピューティング・デバイスによって、前記決定に基づいて、前記タグ付けされたデータを抽出するステップと、
を含む、方法。
【請求項１９】
プログラミング可能な命令を格納する非一時的コンピュータ読み取り可能媒体であって、前記プログラム可能な命令が、少なくとも１つのコンピューティング・デバイスによって実行されると、前記少なくとも１つのコンピューティング・デバイスに、医薬品製造のための自動バッチ・データ分析方法を実行させ、前記方法が、
システムの少なくとも１つのコンポーネントに関連するデータを取得するステップと、
少なくとも部分的にタグに基づいて、前記受信データからどのデータを抽出のために識別するか決定するステップと、
前記決定に基づいて、前記タグ付けされたデータを抽出するステップと、
を含む、非一時的コンピュータ読み取り可能媒体。
【請求項２０】
医薬品製造のための自動バッチ・データ分析用コンピューティング・デバイスであって、
メモリと、
格納されている命令を実行する少なくとも１つのプロセッサと、
を備え、
前記命令が、
少なくとも１つのシステム・コンポーネントに関連するデータを取得し、
少なくとも部分的にタグに基づいて、前記受信データからどのデータを抽出のために識別するか決定し、
前記決定に基づいて、前記タグ付けされたデータを抽出する、コンピューティング・デバイス。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
関連出願に対する相互引用
[0001]  本願は、２０１７年３月１７日に出願された米国仮特許出願第６２／４７２，９９０号の優先権および権利を主張する。この仮特許出願をここで引用したことにより、その内容全体が本願にも含まれるものとする。
【０００２】
[0002]  ２０１５年１０月２６日に出願された米国仮特許出願第６２／２４６，４７８号、２０１６年２月２５日に出願された米国仮特許出願第６２／２９９，９３０号、および２０１６年１０月２６日に出願されたＰＣＴ国際出願第ＰＣＴ／ＥＰ２０１６／０７５８６９号も、ここで引用したことにより、その内容全体が本願にも含まれるものとする。
【背景技術】
【０００３】
[0003]  本発明は、自動バッチ・データ分析、例えば、自動的に特定の情報を識別し、抽出し、関係付け可能な形態で、抽出情報に対応するコンテキストと共に、分析のために出力するシステムおよび方法に関する。自動バッチ・データ分析は、実例をあげると、薬品の生産と関係付けて実行されてもよい。
【０００４】
[0004]  データ処理は、所与の時間期間にわたって、大量のデータを収集および処理することを伴い、膨大な量のデータ(high volumes of data)を含む。実例をあげると、生命科学産業において、製造実行システム（ＭＥＳ：manufacturing execution systems)を採用して、製造業者がバイオ製品の品質および安全性を確保するのを補助することができる。これは、バッチ記録を使用して、製品が製造されている状態、または製品が製造されていた状態を識別し、および／またはこれらの状態が種々のプロセス要件にしたがうものであることを検証する(verify)ことによって、行うことができる。ＭＥＳを１つ以上のディジタル制御システムと統合して、操作員によって手作業で入力されたデータ、企業の計画システムからのデータ、工場作業所制御システムからキャプチャしたデータ等を収集しつつ、これらのデータが予測範囲内にあることを検証する（そして、異常状況が発生したときはいつでも操作員に警告する）ことができる。次いで、連結データ(consolidated data)を１つ以上のバッチ記録文書に入力し、ＭＥＳデータベースに保存することができる。この構成では、操作員が外部分析システムからキャプチャされた１組のパラメータを検索および分析することを望む場合、パラメータに関する特定の情報を、ＭＥＳデータベースにおける膨大な量の情報から「引き出さなければ」(pulled out)ならない。
【発明の概要】
【発明が解決しようとする課題】
【０００５】
[0005]  前述の「プル」(pull)手順において、欠点の１つは、データまたは関連情報がＭＥＳデータベースにおいて多数の表にまたがって散在する可能性があり、システムの帯域幅制限、リソース集約的な性質がある処理、および情報の全体的な量および混乱というような、種々の制限のために、前述の１組のパラメータのような、特定の種類の情報を、特に処理中に、データから入手することを可能にするのは非常に難しくなるおそれがあるということである。更に、バッチ記録を格納するデータベースは、情報を実行するという意図で構築されるのが通例であり、何らかの関係付け可能な形態または使用可能な形態で、あるいは情報に関連付けられた任意のコンテキストで情報を抽出するようには構築されないのが通例である。
【課題を解決するための手段】
【０００６】
[0006]  本開示の１つ以上の態様によれば、本発明は、自動バッチ・データ分析のためのシステムおよび方法を対象とする。データにおける特定の情報に、対象情報(information of interest)というタグを付けることができる。少なくともこれに関して、タグ付き情報を抽出する、または別のデータベースに、更なる分析のために、「押し出す」ことができる。タグ付け手順は、収集されたデータ、例えば、バイオリアクタ・タンクにおける滴定プロセスのｐＨ値と関連付けて、外部分析システムに関連する特定のタスクを実行するための１組の命令を構築する間に実装することができる。更に、押し出された情報は、この押し出された情報に関する何らかの形態のコンテキストを、ユーザおよび／または操作員に与えることができる、コンテキスト・データまたは情報と共に提供することもできる。
【図面の簡単な説明】
【０００７】
【図１】本発明の１つ以上の態様によるシステム例を示す。
【図２】本発明の１つ以上の態様によるシステム例を示す。
【図３】本発明の１つ以上の態様による他のシステムを示す。
【図４】本発明の１つ以上の態様による処方(recipe)の流れ図例を示す。
【図５】本発明の１つ以上の態様によるデータベース・テーブル例を示す。
【図６】本発明の１つ以上の態様によるフロー・チャート例を示す。
【発明を実施するための形態】
【０００８】
[0012]  本発明は、自動バッチ・データ分析を対象とする。一例では、ＭＥＳのコンピューティング・デバイスが、自動的に、ＭＥＳ処方（例えば、外部分析システムに関連する特定のタスクを実行するための命令の組み合わせ、または１組の命令）に関連する１つ以上のパラメータを識別し、抽出し、例えば、更なる分析のためにデータベース・テーブル、出力ファイル等に出力することができる。ＭＥＳは、一態様では、１つ以上のバイオリアクタ、および／または生物製品を生産するための関連機材(equipment)の実装を含むバッチ・プロセスを実行するために使用することができる。出力される１つ以上のパラメータは、例えば、滴定の前、最中、および後におけるタンク内のバイオリアクタ媒体のｐＨ値のような、後続の分析にとって関心深い、タンク内部のプロセス条件に関するパラメータであってもよい。１つ以上のパラメータに加えて、バイオリアクタ・タンク識別情報、プラント位置情報、ｐＨ測定が行われた正確な時刻等のような、１つ以上のパラメータに関する更に他の情報またはコンテキストも提供することができる。
【０００９】
[0013]  本開示の例によれば、抽出および出力される１つ以上のパラメータは、ＭＥＳ処方を実行する前に、「タグ付け」することができる。以下で更に論ずるが、例えば、バイオリアクタ・タンクにおける前述の滴定プロセスのような、ＭＥＳ処方を実行するためのコンピュータ命令集合を構築するとき、コンピュータ命令集合を構成する命令の各々にとって関心深いあらゆるパラメータがタグ付けされるので、個々の命令が実行されるとき（例えば、滴定）、タグ付けされたパラメータ（例えば、滴定時におけるバイオリアクタ媒体のｐＨ）が識別され、抽出され、別個のデータベースに「押し出す」ことができ、更に処理および分析することができる。
【００１０】
[0014]  したがって、関心深いデータにおける特定の情報には、そのデータにおける情報の収集に先立って、「タグ付け」されるので、「タグ付け」された情報は自動的に識別され、更なる分析のために別個のデータベースに抽出される（例えば、「押し出される」）。少なくともこれに関して、本開示の多数の利点の内の１つは、従来のバッチ・データ処理方法における前述の「プル」手順に伴う遅くリソース集約的な情報処理を回避することである。実例をあげると、ＭＥＳデータベースにおける多数のテーブルに跨がって情報を検索するためにデータベース・コールを実行するのではなく、コンピューティング・デバイスのローカル・メモリに、抽出した情報（タグに基づいて）を格納できることによって、この利点が得られる。本開示の他の利点は、ＭＥＳ処方が実行している間に、タグ付けされたデータおよび／または情報がメッセージング・キューまたは他のデータ・レポジトリに押し出され、したがって、データの抽出が処方プロセスに影響を及ぼさないことである。
【００１１】
[0015]  図１は、本発明の１つ以上の態様によるシステム例１００を示す。システム１００は、１つ以上のコンピューティング・デバイス、例えば、コンピュータ１２０、サーバ・コンピュータ１３０、移動体コンピュータ１４０、スマートフォン・デバイス１５０、タブレット・コンピュータ１６０、および記憶デバイス１７０を含むことができる。これらはネットワーク１９０に接続されている。例えば、コンピュータ１２０は、１人以上のユーザによる使用を意図する、デスクトップ・コンピュータであってもよい。コンピュータ１２０は、１つ以上のプロセッサ１０２、メモリ１０４、例えば、永続的メモリまたはフラッシュ・メモリ（命令１０５およびデータ１０６を含む）、１つ以上のインターフェース１０８、およびディスプレイ１１０のような、デスクトップ・コンピュータに付随する種々のコンポーネントを含む。別の例では、コンピュータ１２０と同様、サーバ・コンピュータ１３０は、少なくとも１つのプロセッサ、同様に命令およびデータを含むメモリ、１つ以上のインターフェース、および／またはディスプレイ（図示せず）を含むことができる。更に、移動体コンピューティング・デバイス１４０は、ラップトップ（あるいは、ウルトラブックのような、携帯用または移動体である任意の種類のコンピュータ）であってもよく、更にコンピュータ１２０および／またはサーバ・コンピュータ１３０と同様のコンポーネントを含むことができる。コンピュータ１２０は、ネットワーク１９０を通じて、サーバ・コンピュータ１３０、移動体コンピュータ１４０、スマートフォン・デバイス１５０、タブレット・コンピュータ１６０、および／または記憶デバイス１７０と通信するように構成することができる。図１に示すように、特定のコンポーネントに関連付けられたカスケード状ブロックは、これらのコンポーネントの内１つよりも多くが存在すればよく、これは一例に過ぎないことを例示するのであり、異なるコンポーネントをカスケード接続することができ、多数の変形があり得ることは理解できよう。
【００１２】
[0016]  コンピュータ１２０は、プロセッサ１０２（例えば、コントローラ、これについては以下で更に論ずる）を含むことができる。プロセッサ１０２は、コンピュータ１２０の種々のコンポーネントに、メモリ１０４に格納されている命令１０５および／またはデータ１０６のような、特定の情報の処理に基づいて、タスクを実行するように命令する。例えば、プロセッサ１０２は、１つ以上の動作、例えば、加算、減算、乗算、比較、１つのプログラムから他のプログラムへのジャンプ、入力および出力の処理等を実行するように構成することができるハードウェアであってもよく、中央処理ユニット（ＣＰＵ）のような任意の標準的なプロセッサ、あるいは特定用途集積回路（ＡＳＩＣ）またはフィールド・プログラマブル・ゲート・ウェイ（ＦＰＧＡ）、もしくは工業用プロセス・コントローラのような専用プロセッサであってもよい。更に、プロセッサ１０２は、情報を処理する、および／またはコンピュータ１２０のコンポーネントに命令する任意の適した構成および／または構成の回路を有してもよい。図１には１つのプロセッサ・ブロックを示すが、コンピュータ１２０は、以上で説明したように、タスクを個々にまたは集合的に実行する複数のプロセッサを含んでもよいことは理解できよう。１つ以上の実施形態では、コンピュータ１２０が工業用コントローラであってもよい。
【００１３】
[0017]  メモリ１０４は、永続的かまたはフラッシュかには関係なく、命令１０５およびデータ１０６のような、プロセッサ１０２によってアクセス可能な情報を格納するように構成された任意の種類のハードウェアであればよい。命令１０５およびデータ１０６は、プロセッサ１０２によって、実行、検索、操作、および／または格納することができる。これは、物理的にコンピュータ１２０に内蔵されても、またはコンピュータ１２０に結合されてもよい。例えば、メモリ１０４は、ＲＯＭ、ＲＡＭ、ＣＤ−ＲＯＭ、ハード・ドライブ、書き込み可能、読み取り専用等でもよい。更に、メモリ１０４に格納される命令１０５は、プロセッサ１０２によって直接または間接的に実行することができる任意の１組の命令を含むことができる。例えば、命令１０５は、プロセッサ１０２によって実行することができるソフトウェアに関連する１つ以上の「ステップ」であってもよい。また、命令１０５は、種々の方法で、例えば、サーバ・コンピュータ１３０および／または記憶デバイス１７０からネットワーク１９０を通じて、メモリ１０４上に転送することもできる。加えて、メモリ１０４に格納されているデータ１０６は、例えば、命令１０５にしたがって、プロセッサ１０２によって検索、格納、または変更することもできる。一態様では、データ１０６はデータの集合体として格納されてもよい。実例をあげると、本発明はいずれの特定のデータ構造にも限定されないが、データ１０６は、レジスタに格納すること、データベースに格納すること、ＸＭＬのような、複数のフィールドおよびレコードを有するテーブルとして、格納することもできる。データ１０６は、ＡＳＣＩＩ、拡張二進コード化十進相互交換コード（ＥＢＣＤＩＣ）、二進、オブジェクティビティ(Objectivity)、ＳＱＬ、または他の適したデータベース・フォーマット等のような、しかしこれらには限定されない、任意のコンピュータ読み取り可能フォーマットに定式化されてもよい(format)。また、データ１０６は、テキスト、コード、ポインタ、データを計算するために１つ以上の関数によって使用される情報等のような、関連データを識別するのに十分であれば、任意の情報でもよい。命令１０５と同様、データ１０６も種々のコンポーネントからネットワーク１９０を通じてメモリ１０４上に転送することができる。
【００１４】
[0018]  インターフェース１０８は、特定のデバイス（現場実装機材、プロセッサ間通信、キーボード、マウス、タッチ感応画面、カメラ、マイクロフォン等）であってもよく、あるいはユーザからの対話処理または種々のコンポーネントからの情報／データのような、情報およびデータのネットワーク１９０を通じた受信をワイヤレスで可能にする接続またはポートであってもよい。実例をあげると、インターフェース１２２は１つ以上の入力／出力ポートを含むことができる。入力／出力ポートは、ディジタル制御バス（Ｆｏｕｎｄａｔｉｏｎ（商標）、ＰｒｏｆｉｔｂｕｓＤＰ（商標）、ＤｅｖｉｃｅＮｅｔ（商標）、Ｍｏｄｂｕｓ  ＩＥＥＥ  ＲＳ−４８５、Ｍｏｄｂｕｓ／ＩＰ、シリアルＩＥＥＥ  ＲＳ−２３２、ユニバーサル・シリアル・バス（ＵＳＢ）ドライブ、ｚｉｐドライブ、カード・リーダ、ＣＤドライブ、ＤＶＤドライブ等）のような、任意の適した型式のデータ・ポートを含むことができる。
【００１５】
[0019]  ディスプレイ１１０は、ユーザにデータを伝達することができる任意の適した型式のデバイスであればよい。例えば、ディスプレイ１１０は、液晶ディスプレイ（ＬＣＤ）画面、発光ダイオード（ＬＥＤ）画面、プラズマ画面等であってもよい。ディスプレイ１１０は、コンピュータ１２０によって実行することができるソフトウェアおよび種々のデータの視覚表現等のような、関連のある、種々の型式の情報をユーザに提供することができる。
【００１６】
[0020]  一態様によれば、ユーザは、インターフェース１０８を使用して、情報および／またはデータを入力することができる。インターフェース１０８は、ディスプレイ１１０上でユーザ／操作員に表示されるグラフィカル・ユーザ・インターフェース（ＧＵＩ）であってもよい。一例として、ＧＵＩは、処理ユニットおよびデータをユーザ／操作員に表示する操作員インターフェース（ＯＩ：operator interface）であってもよい。
【００１７】
[0021]  サーバ・コンピュータ１３０は、ネットワーク機材ラック(network equipment rack)上に実装されるラック、および／またはデータ・センタ内に配置されるラックであってもよい。ある例では、ネットワーク１９０を通じて、サーバ・コンピュータ１３０は、コンピュータ１２０、移動体コンピュータ１４０、スマートフォン・デバイス１５０、タブレット・コンピュータ１６０，および／または記憶デバイス１７０上で実行されるプログラムに関連する種々の要求に応ずる(serve)ことができる。更に他の例では、サーバ・コンピュータ１３０は、バックエンド・システム（ユーザには「見えない」場合もある）をサポートする複数のサーバ・コンピュータの一部となることもできる。
【００１８】
[0022]  移動体コンピュータ１４０、スマートフォン・デバイス１５０、およびタブレット・コンピュータ１６０のような移動体または携帯用コンピューティング・デバイスは、コンピュータ１２０および／またはサーバ・コンピュータ１３０と同様のコンポーネントおよび機能を含むことができ、例えば、１つ以上のプロセッサ、メモリ、入力／出力機能、ディスプレイ等を含むことができ、シン・クライアントおよびリモート・デスクトップ・プロトコル(Thin Client and Remote Desktop protocols)は、共通に(by common)、コンピュータ１２０上にあるディスプレイ１１０およびインターフェース１０８にアクセスする。
【００１９】
[0023]  例えば、移動体コンピュータ１４０は、コンピューティング機能およびネットワーク接続機能(connectivity)を有するのであれば、いずれの型式の移動体または携帯用デバイスでもよい。例えば、移動体コンピュータ１４０は、ラップトップ、ウルトラブック、スマートフォン、ＰＤＡ、タブレット・コンピュータ、ウェアラブル・コンピューティング・デバイス等であってもよい。また、移動体コンピュータ１４０は、１つ以上のプロセッサ、メモリ、ユーザ・インターフェース、有線またはワイヤレス・ネットワーク接続ハードウェア、および移動体コンピューティング・デバイスに付随する他の種類のコンポーネントも有することができる。したがって、移動体コンピュータ１４０は、有線またはワイヤレス接続を介してネットワーク１９０に接続し、サーバ・コンピュータ１３０、記憶デバイス１７０等のような、ネットワーク１９０に接続されている他のコンポーネントと通信することができるのはもっともである。
【００２０】
[0024]  スマートフォン・デバイス１５０は、コンピューティング機能およびネットワーク接続機能を有する移動体セルラ・フォーンであってもよい。例えば、スマートフォン１５０は、１つ以上のプロセッサ、メモリ、ＱＷＥＲＴＹキーパッドのような１つ以上のユーザ・インターフェース、音声認識、カメラ、画像センサ、汎地球測位システム（ＧＰＳ）、加速度計、温度センサ等を含むことができる。コンピュータ１２０およびサーバ・コンピュータ１３０と同様、スマートフォン・デバイス１５０は、コンピュータ命令、アプリケーション、プログラム、ならびに任意の１組の命令およびデータを実行するように構成することができる。更に、タブレット・コンピュータ１６０も、１つ以上のプロセッサ（コンピュータ命令および／またはアプリケーションを実行するように構成される）、メモリ、１つ以上のインターフェース、タッチスクリーン・ディスプレイ、センサ、マイクロフォン、カメラ、スピーカ、ネットワーキング・ハードウェア（有線またはワイヤレス接続を介して、ネットワーク１９０のようなネットワークに接続するように構成される）等を含むことができる。
【００２１】
[0025]  記憶デバイス１７０は、大量のデータを格納するように構成され、更に、ネットワーク１９０の他のコンポーネントによって要求またはアクセスされたときに、そのようなデータを転送するように構成することができる。例えば、記憶デバイス１７０は、ＲＯＭ、ＲＡＭ、ハード・ドライブ、ソリッド・ステート・ドライブ、リムーバブル・ドライブ、ネットワーク・ストレージ、仮想メモリ、多レベル化キャッシュ(multi-leveled cache)、レジスタ、ＣＤ、ＤＶＤ等のような、記憶コンポーネントの集合体であってもよい。加えて、記憶デバイス１７０は、コンピュータ１２０および／またはサーバ・コンピュータ１３０のようなネットワーク１９０の他のコンポーネントが、データにアクセスし、ネットワーク１９０に接続されている他のコンポーネントにデータを提供することができるように、構成することもできる。ある実施形態では、記憶デバイス１７０のようなデバイスは、バッチ・プロセスおよび／またはバッチ製品(batch product)に関するデータの格納のためのＭＥＳデータベースと見なされてもよい。
【００２２】
[0026]  ネットワーク１９０は、ネットワークの１つ以上のコンポーネント間におけるデータ、命令等の送信を容易にするように構成された、有線またはワイヤレスの任意の適した型式のネットワークであればよい。例えば、ネットワーク１９０は、 ローカル・エリア・ネットワーク（ＬＡＮ）（例えば、イーサネット（登録商標）または他のＩＥＥＥ８０２．０３ＬＡＮ技術）、Ｗｉ−Ｆｉ（例えば、ＩＥＥＥ８０２．１１規格）、ワイド・エリア・ネットワーク（ＷＡＮ）、仮想プライベート・ネットワーク（ＶＰＮ）、グローバル・エリア・ネットワーク（ＧＡＮ）、またはこれらの任意の組み合わせであってもよい。これに関して、コンピュータ１２０、サーバ・コンピュータ１３０、移動体コンピュータ１４０、スマートフォン・デバイス１５０、および／またはタブレット・コンピュータ１６０は、ネットワーク１９０を通じて、互いに接続および通信することができる。
【００２３】
[0027]  コンピュータ１２０は、前述の例では、デスクトップ・コンピュータとして差し支えないが、コンピュータ１２０はデスクトップ・コンピュータだけには限定されず、更に、図１に示したコンピュータはいずれも、データおよび／または命令を処理し、データを送信および／または受信することができる任意のデバイスであればよい。更に、これらのコンポーネントは実際には複数のプロセッサ、メモリ、命令、データ、またはディスプレイを含むことができ、これらは同じ物理筐体内に収容しても収容しなくてもよいことは当業者には理解されよう。例えば、命令１０５およびデータ１０６の一部または全部をリムーバブル媒体上に格納してもよく、プロセッサ１０２から物理的に離れているがそれでもなおプロセッサ１０２によってアクセス可能な位置に格納してもよい。更に、図１の種々のコンポーネントはネットワーク１９０に接続されているが、これらのコンポーネントは、任意の適した組み合わせで、互いに接続されてもよいことは理解できよう。
【００２４】
[0028]  図２は、本発明の態様による他のシステム例２００を示す。この例では、システム２００は、製造実行システム（ＭＥＳ）を表し、図１に示した種々のコンポーネントは、 バイオリアクタおよび生物産物の生産のための関連機器の制御を容易にするように構成することができる。関連機器とは、発酵および／または収穫用機器２０２、精密濾過および精製用機器２０４（例えば、クロマトグラフィ・スキッド）、定置洗浄（ＣＩＰ：Clean In Place）システムおよび定置システム（ＳＩＰ： System In Place）システムのような培地作成用機器２０６、緩衝剤調合(buffer preparation)用機器２０８、ならびに種々の現場用デバイス（例えば、送信機を有するセンサ、スケール、スイッチ、ポンプ、制御弁、離散弁(discrete valve)、固定速度始動機または可変周波数ドライブを有するポンプ、可変周波数ドライブを有する攪拌器、リミット・スイッチを有する離散弁）等である。図１のコンピュータ１２０のような１つ以上のコンピュータを、システム２００中に散在させてもよく、各コンピュータを、図示したシステムの特定の制御および／または部分に専用にしてもよい。同様に、図１のサーバ・コンピュータ１３０のようなサーバ・コンピュータも、システム２００中に物理的または仮想的に散在させ、データおよび命令の伝達を容易にするために、システムの特定部分に専用にしてもよい。更に、ＭＥＳによって補助される種々のシステム・コンポーネントは、図１に示したコンポーネントのように、小分子プロセスに使用されるコンポーネントに加えて、および／またはその代わりに、１つ以上の化学プロセスのため（例えば、化学反応器等のようなコンポーネント）にあるのでもよいことは理解できよう。
【００２５】
[0029]  図２は、単体のＭＥＳを示すが、本発明の他の実施形態によれば、ＭＥＳには、１つのシステムとして動作する制御システムが実装されてもよい。一例として、図２のシステム２００は、ＭＥＳシステムであるが、１つのシステムとして動作する、プラント規模の制御システム（ＰＷＣＳ）と組み合わせてもよい。
【００２６】
[0030]  図３は、本発明の１つ以上の態様にしたがって、例えば、図２に示したＭＥＳ（例えば、システム２００）と、ＰＷＣＳとを組み込んだシステム３００を示す。図３に示すように、 プロフェッショナル・プラス・ワークステーション（ＰＲＯ：Professional Plus Workstation）３０２は、システム３００のデータベースとなることができ、バッチ・エクゼキュティブ（ＥＸＥＣ）３０４は、実例をあげると、「処方」情報（以下で更に論ずる）を格納し、バッチ処理を制御することもできる。 バッチ・ヒストリアン（ＢＨＩＳＴ）３０６は、システム３００からのバッチ関連(batch-related data)データを記録および格納することができる。 連続ヒストリアン（ＰＩ−ＰＨＩＳＴ）３０８は、システム３００からの連続プラント・データを記録および格納することができる。端末サーバ（ＴＳ）３１０、３１２、および３１４の各々は、デスクトップ・コンピュータおよびタブレット・コンピュータのような、シン・クライアント端末に対するリモート・アクセス・セッション用のホストになることができ、コントローラ３１６、３１８、および３２０の各々は、 種々の機器および機能を制御するために使用されるアルゴリズム、および／または１組の実行可能命令を実行する(execute and run)ことができるシステム・デバイスである。図３に示すコンポーネントは、そのいずれもが、コンピュータ１２０、サーバ・コンピュータ１３０、移動体コンピュータ１４０、スマートフォン・デバイス１５０、タブレット・コンピュータ１６０、および記憶デバイス１７０の内の１つ以上となること（対応すること）ができる。実施形態では、コントローラ３１６、３１８、および３２０は、ハードウェアであってもよく、１つ以上の制御モジュールを実装する。制御モジュールは、ソフトウェアであってもよく、１つ以上の制御ループを制御し、制御ループは、種々のセンサ、プローブ、アクチュエータ、ポンプ、撹拌機、モニタ等のような、図３に示すシステム３００の種々の現場デバイスを、制御モジュールを通じて制御する。
【００２７】
[0031]  図４は、本発明の１つ以上の態様による滴定処方(titration recipe)およびパラメータ「タグ付け」の流れ図４００を示す。一例として、「処方」(recipe)とは、外部分析システムに関連する特定のタスクを実行するための命令の組み合わせまたは１組の命令としてもよい。そして、命令集合の各命令は、特定のプロセスのステップを実行することができる。実施形態では、処方は、異なる種類のプロセスおよびタスク毎に、ユーザおよび／または操作員によって最初から一意に構築されるものとしてもよい。あるいは、これらは容易に入手可能な処方、または予めプログラミングされている処方にすることもできる。以下で説明するように、処方の命令が実行されるに連れて抽出するために、特定のパラメータにタグ付けすることができる。また、タグ付けプロセスも、ユーザおよび／または操作員によって最初から実装することもできる。図４では、バイオリアクタ・タンクのために滴定を実行する処方を示す。実例をあげると、バイオリアクタ・タンクは、培地作成のためのタンク、または図２に示したＰＷＣＳにおける緩衝剤調合のためのタンクであってもよい。更に、滴定処方は、図３において先に説明したように、バッチ・エクゼキュティブ（ＥＸＥＣ）３０４に格納され、コンピュータ１２０のような、１つ以上の端末によって実行されてもよい。
【００２８】
[0032]  図４に示すように、滴定処方は、１組で少なくとも６つの異なる命令を含むことができる。滴定処方が１つ以上のコンピューティング・デバイスによって実行されると、命令４０２は、タンク内にあるｐＨ計またはセンサをオンに切り替えさせる（ｐＨ計が未だオンになっていない場合）。次いで、命令４０４は、使用される滴定の初期分量(volume)の測定を行わせる。命令４０６において、バイオリアクタ・タンク内の培地に滴定液が添加される前に、１つ以上のｐＨ値を測定することができる。命令４０８において、バイオリアクタ・タンク内の培地に滴定液を添加する。滴定液を添加しながら、命令４１０において、１つ以上のｐＨ値を連続的に測定することができる。例えば、滴定液の全てが添加され終えるまで、培地に添加される滴定液を分量「Ｘ」だけ測定する毎に、ｐＨ値を周期的に(incrementally)測定してもよい。その後、命令４１２は、滴定液の培地への添加後に、１つ以上のｐＨ値の測定を行わせる。先に説明したように、そして当業者には理解されるであろうが、ユーザおよび／または操作員は、以上で説明した処方とは異なる滴定処方を、ユーザおよび／または操作員が望む通りに、例えば、単純にまたは複雑に構築することができる。
【００２９】
[0033]  また、図４は、本発明の態様によるパラメータ「タグ付け」の例も示す。一例として、滴定プロセスの前、最中、および後におけるバイオリアクタ・タンク内にある培地のｐＨ値は、更なる分析にとって興味深いのはもっともである。少なくともこれに関して、滴定処方を構築するユーザおよび／または操作員は、１つ以上の個々の命令に、任意の対象パラメータに対する「タグ」を実装する(implement)こともできる。
【００３０】
[0034]  図４では、実例をあげると、滴定プロセスに関連する種々のパラメータを抽出するために、６つの異なるタグがあるとしてもよい。タグ１は命令４０６に実装され、滴定液が培地に添加される前に、１００回連続して測定されたｐＨ値を抽出するように構成することができる。同様に、タグ２も命令４０６に実装することができるが、タグ１に関連付けられた１００回のｐＨ値測定の各々における滴定液の残り分量の測定値を抽出するように構成することができる。図５に関して以下で説明するように、滴定液の残り分量は、各ｐＨ測定において全て同じになるはずである。何故なら、滴定液は未だ培地に添加されていないからである（例えば、「滴定液追加」命令が未だ実行されていない）。タグ３は、命令４１０に実装され、滴定液の全てが培地に添加され終えるまで、滴定液の「Ｘ」分量増分（例えば、２ｍＬ）毎に測定されるｐＨ値を抽出するように構成することができる。例えば、１００回の増分があるとしてもよく、これは１００回のｐＨ読み取りに相当する(equate to)ことになろう。また、タグ４も命令４１０に実装され、ｐＨ読み取り毎に、滴定液の残り分量測定値を抽出するように構成することができる。例えば、各ｐＨ測定値における残り分量は、滴定液が増々培地に添加されるので、連続的に減少するはずである。タグ５は、タグ１と同様、バイオリアクタ・タンク内にある培地に滴定液の全てが添加された後に、１００回連続的に測定されたｐＨ値を抽出するが、命令４１２に関連付けられる。また、命令４１２に関連付けられるのは、滴定液の残り分量測定値を抽出するように構成されたタグ６であるが、これらの測定値は全てゼロまたはほぼゼロになるはずである。尚、以上で説明したタグ１〜６の全てが必要という訳ではなく、追加の実施形態では、これらの１つ以上が異なる組み合わせで選択されてもよいことは、当業者には理解できよう。
【００３１】
[0035]  図４は、バイオリアクタ・タンクに関連する滴定処方を示すが、パラメータ・タグ付けは、送信機、スケール、スイッチ、ポンプ、制御弁、離散弁、固定速度始動機または可変周波数ドライブを有するポンプ、可変周波数ドライブを有する撹拌機、リミット・スイッチを有する離散弁等によってセンサを制御するための命令のような、システムのあらゆる種類のコンポーネントに関連する異なる種類の処方にも適用することができる。更に、別の例では、パラメータ・タグ付けのために取得されたデータが、先に明記したような、バイオリアクタ・タンク、送信機、スケール、スイッチ等のようなシステム・コンポーネント自体から発信するのではなくてもよく、操作員が手作業の操作(activity)を行い、データをシステムに入力する場合があってもよい。実例をあげると、データおよび／または結果は卓上試験(benchtop test)から得られてもよく、操作員が「合格」または「不合格」のいずれかの結果を選択し、これがタグ付けに該当するとしてもよく、または本発明の態様（１つまたは複数）によるタグ付けのために識別されてもよい。
【００３２】
[0036]  図５は、本発明の１つ以上の態様によるデータベース・テーブル例５００を示す。一例として、データベース・テーブル５００は、抽出されたまたは「押し出された」パラメータの全てを含むことができる。これらのパラメータは、抽出または「押出」のために既にタグ付けされており、図４に示した滴定処方の実行の最中および／または後に、データベース・テーブル５００に出力することができる。実例をあげると、図２および／または図３に示すように、１つ以上のコンピューティング・デバイスのローカル・メモリがデータベース・テーブル５００を格納することができる。尚、実施形態では、データベース・テーブル５００は、更なるデータ検索および分析のために、別個のデータベースに存在してもよいことは理解できよう。更に他の実施形態では、継続処理のために、パラメータをメッセージング・キューに押し出してもよく、次いで収集し特定のフォーマット（例えば、データベース・テーブル５００、ｘｍｌフォーマット等）にパッケージ化してもよい。パラメータ、およびパラメータに関連するメタデータは、任意の様式(fashion)で自動的に定式化することができる。これについては以下で更に論ずる。実例をあげると、図５は表を示すが、抽出された情報は、任意の適したフォーマットで編成および／または要約することができる。パラメータおよび／またはメタデータは、本開示の１つ以上の態様によれば、先に説明したフォーマットで提示したように、選択可能にしてもよい（例えば、処方が未だ実行されているときにリアル・タイムで、またはデータの集計後に）。
【００３３】
[0037]  図５に示すように、データベース・テーブル５００は、３つの行を有するのでもよく、各行は、それぞれの命令（例えば、命令４０６、命令４１０、命令４１２等）に対応するパラメータを収容する。更に、データベース・テーブルは５つの列を含むのでもよい。第１列は、図４に示した滴定処方における特定命令を指定する。第２列は、命令の各々毎に、抽出されたｐＨパラメータを収容する。第３列は、命令の各々について、滴定液の残り分量測定値を示す。第４列は、命令の各々について、測定値が得られた正確な時刻を指定する。第５列は、命令の各々について、バイオリアクタ・タンクに関連する識別情報、タンクが関連付けられたシステムの種類（ＭＥＳ、および／またはＭＥＳとＰＷＣＳとの組み合わせシステム）、タンクが地理的に位置する場所等というような、測定値に関連付けられた任意の関連情報、コンテキスト、メタデータ等を示す。先に説明したが、図２に示したように、コンピューティング・デバイスが、タンクが現在ＭＥＳシステム２００の一部であることを表示することができる、「バイオリアクタ・タンク２０６」という字句のような任意の情報を、ユーザがデータベース・テーブル５００において選択できるとよく、および／または、ユーザは実際のパラメータを選択することができてもよい。したがって、抽出された情報を選択することによって、ユーザには、情報の更なる分析に役立つ、関連付け可能で重要な情報（操作員の意見、注記等）を提示することができる。
【００３４】
[0038]  再度図４を参照すると、命令４１０が実行されて、ｐＨおよび分量測定パラメータがタグ３および４によって抽出されたまたは押し出されたとき、中央の行（命令４１０に対応する）には同じものを入力されればよい。先に説明したように、例えば、使用される滴定液の初期分量には、１００回の分量「Ｘ」の測定値の合計があればよい。言い換えると、一度に分量「Ｘ」ずつ滴定液を培地に添加するとき、滴定液の全てを培地に添加するには、合計で１００回行うことになる。分量「Ｘ」を添加する毎に、ｐＨ計またはセンサを使用してｐＨの読み取りを行う。例えば、図５におけるｐＨ値１０１〜２００はこれらの読み取り値を表す。図５のデータベース・テーブル５００の第３列には、各ｐＨ値に対応する滴定液の残り分量を表す１００の値がある。実例をあげると、最初の分量「Ｘ」を添加した後における滴定液の残り分量は、初期分量から「Ｘ」を差し引いた値となり、これはｐＨ値１０１に対応する。各測定の正確な時刻も記録される。図５において、各測定は１秒毎に行われる。更に、先に説明したような、バイオリアクタ・タンクに関連する識別情報、タンクが関連付けられた制御システムの名称、タンクが地理的に位置する場所（例えば、タンクは「場所Ａ」の設備に位置する）等のような、コンテキスト情報も提供することができる。上記のように、そして図５に示すように、他の種々のパラメータも同様にデータベース・テーブル５００に入力することができる。
【００３５】
[0039]  先に説明したように、データベース・テーブル５００における情報は、他の処方におけるタグ付けによって抽出するまたは押し出すことができる他の多数の型の情報と共に、別個のデータベースに格納することができる。少なくともこれに関して、この情報は、更なる分析のために（例えば、バイオリアクタ・システムにおける他の種類の必須手順に対して、滴定結果を検査および使用する、滴定結果が所定の限度内に入ることを確認する等）、ユーザおよび／または操作員によって容易にアクセス可能であり、システム・データベースにおいて異なる記憶デバイスに跨がって散在しない。更に、パラメータ・タグ付けによって、対象になる全てのパラメータの一意の識別および抽出が、コンテキスト情報（例えば、メタデータ）によって可能になる。これは有用でしかも応用可能であり、本発明でなければ(otherwise)、プル手順では不可能である。
【００３６】
[0040]  図６は、本発明の１つ以上の態様による流れ図６００を示す。流れ図６００は、先に説明したパラメータ・タグ付け手順に基づいて、抽出された情報に対応するコンテキストと共に、関連付け可能な形態で特定の情報（例えば、パラメータ）を識別、抽出、および出力するステップを含む。流れ図６００のステップは、例えば、図１のコンピュータ１２０のような、１つ以上のコンピューティング・デバイス上において実行することができる。
【００３７】
[0041]  ステップ６０２において、コンピューティング・デバイスは、外部分析システムのコンポーネントのための処方を実行することができる。ここで、処方は、前述の滴定処方であってもよく、コンポーネントは前述のバイオリアクタ・タンクであってもよい。処方が実行されると、ステップ６０４において多数の型の情報およびデータを収集することができ、その一部を対象にしてもよい。次に、コンピューティング・デバイスは、ステップ６０６において、収集したデータの内どれを抽出（または押出）のために識別するか（例えば、バッチ・プロセスに関するデータ）決定する。この決定は、少なくとも部分的に、タグ付けプロセスに基づく。タグ付けプロセスは、ユーザおよび／または操作員によって既に処方に組み込まれていてもよい。更に、この決定は、処方の実行の最中、またはその後に行われてもよいことは理解できよう。
【００３８】
[0042]  続いてステップ６０８において、対象情報としてタグ付けられたデータまたはパラメータを抽出する。次いで、ステップ６１０において、抽出されたデータを別個のデータベースに出力する、および／または別個のデータベースおよび／またはミドルウェアへの送信のためにメッセージング・キューに出力する。これに関して、ユーザおよび／または操作員に関心のある全てのパラメータ、情報、および／またはデータは全て、１つのデータベースに存在し、いつの時点でも容易にアクセス可能である。先に説明したように、別個のデータベースは、処方を実行するコンピューティング・デバイスのローカル・メモリ、および／またはシステムの別個のデータベースに格納することができる。ステップ６１２において、任意のユーザおよび／または操作員によって任意の地理的位置から任意の時点において、更なる処理のために、別個のデータベースにおける集計データにアクセスすることができる。例えば、ある地理的位置にいる操作員が、異なる地理的位置にあるバイオリアクタ・タンクにおける培地への滴定の前、最中、および後において、リアル・タイムでｐＨ値に容易にアクセスすることができる。
【００３９】
[0043]  本明細書において説明したシステム、デバイス、設備、および／または方法は、原核および／または真核細胞株を含む任意の所望の細胞株の培養において、もしくは培養と共に使用するのに適している。更に、本明細書において説明したシステム、デバイス、設備、および／または方法によって、真核細胞、原核細胞、および／または真核細胞によって大規模に合成される、例えば、タンパク質、ペプチド、抗生物質、アミノ酸、核酸（ＤＮＡまたはＲＮＡというような）というような真核細胞もしくは原核細胞の産物の産生が可能となる。
【００４０】
[0044]  一実施形態では、真核細胞は哺乳動物細胞である。哺乳動物細胞は、例えば、ヒトまたはげっ歯類またはウシの細胞株または細胞系であってもよい。このような細胞、細胞株、または細胞株の例には、例えば、マウス骨髄腫（ＮＳＯ）細胞株や、チャイニーズハムスター卵巣（ＣＨＯ）細胞株、ＨＴ１０８０、Ｈ９、ＨｅｐＧ２、ＭＣＦ７、ＭＤＢＫ  Ｊｕｒｋａｔ、ＮＩＨ３Ｔ３、ＰＣ１２、ＢＨＫ（ベビー・ハムスター腎細胞）、ＶＥＲＯ、ＳＰ２／０、ＹＢ２／０、Ｙ０、Ｃ１２７、Ｌ細胞、例えば、ＣＯＳ１およびＣＯＳ７というようなＣＯＳ、ＱＣ１−３、ＨＥＫ−２９３、ＶＥＲＯ、ＰＥＲ．Ｃ６、ＨｅＬＡ、ＥＢ１、ＥＢ２、ＥＢ３、腫瘍溶解性またはハイブリドーマの細胞株が含まれる。哺乳動物細胞は、ＣＨＯ細胞株であることが好ましい。一実施形態では、細胞はＣＨＯ細胞である。一実施形態では、細胞は、ＣＨＯ−Ｋ１細胞、ＣＨＯ−Ｋ１  ＳＶ細胞、ＤＧ４４  ＣＨＯ細胞、ＤＵＸＢ１１  ＣＨＯ細胞、ＣＨＯＳ、ＣＨＯ  ＧＳノックアウト細胞、ＣＨＯ  ＦＵＴ８  ＧＳノックアウト細胞、ＣＨＯＺＮ、またはＣＨＯ由来細胞である。ＣＨＯ  ＧＳノックアウト細胞（例えば、ＧＳＫＯ細胞）は、例えば、ＣＨＯ−Ｋ１  ＳＶ  ＧＳノックアウト細胞である。ＣＨＯ  ＦＵＴ８ノックアウト細胞は、例えば、Ｐｏｔｅｌｌｉｇｅｎｔ（登録商標）ＣＨＯＫ１  ＳＶ（ロンザ社（Ｌｏｎｚａ  Ｂｉｏｌｏｇｉｃｓ，  Ｉｎｃ．））である。
【００４１】
[0045]  一実施形態では、真核細胞は幹細胞である。幹細胞は、例えば、胚性幹細胞（ＥＳＣ）、成体幹細胞、人工多能性幹細胞（ｉＰＳＣ）、組織特異的幹細胞（例えば、造血幹細胞）、および間葉系幹細胞（ＭＳＣ）を含む多能性幹細胞とすることができる。
【００４２】
[0046]  一実施形態では、真核細胞は下等真核細胞である。下等真核細胞は、例えば、酵母細胞とすることができる。酵母細胞の例には、例えば、ピキア属（例えば、ピキア・パストリス、ピキア・メタノリカ、ピキア・クルイベリおよびピキア・アングスタ）、コマガタエラ属（例えば、コマガタエラ・パストリス、コマガタエラ・シュードパストリス、またはコマガタエラ・ファフィ）、サッカロミセス属（例えば、サッカロミセス・セレビシエや、セレビシエ、サッカロミセス・クルイベリ、サッカロミセス・ウバルム）、クルイベロミセス属（例えば、クルイベロミセス・ラクチスやクルイベロミセス・マルシアヌス）、カンジダ属（例えば、カンジダ・ユチリス、カンジダ・カカオイ、またはカンジダ・ボイディニー）、ゲオトリクム属（例えば、ゲオトリクム・ファーメンタンス）、ハンゼヌラ・ポリモルファ、ヤロウィア・リポリティカ、またはスキゾサッカロミセス・ポンベが含まれる。好ましいのは、ピキア・パストリス種である。ピキア・パストリス系の例には、Ｘ３３、ＧＳ１１５、ＫＭ７１、ＫＭ７１Ｈ、およびＣＢＳ７４３５がある。
【００４３】
[0047]  一実施形態では、真核細胞は真菌細胞である。真菌細胞は、例えば、 アスペルギルス（Ａ．ニガー、Ａ．フミガタス、Ａ．オリゼー、Ａ．ニデュラ等）、アクレモニウム（Ａ．サーモフィラム等）、ケトミウム（Ｃ．サーモフィラム等）、クリソスポリウム（Ｃ．サーモフィル等）、コルディセプス（Ｃ．ミリタリス等）、コリナスカス、テノミセス、フザリウム（Ｆ．オキシスポラム等）、グロメレラ（Ｇ．グラミニコラ等）、ヒポクレア（Ｈ．ジェコリナ等）、マグナポルテ（Ｍ．オリゼー等）、ミセリオフトラ（Ｍ．サーモフィル等）、ネクトリア（Ｎ，ヘマトコッカ等）、ニューロスポラ（Ｎ．クラッサ等）、ペニシリウム、スポロトリカム（Ｓ．サーモフィル等）、シエラビア（Ｔ．テレストリス、Ｔ．ヘテロタリカ等）、トリコデルマ（Ｔ．リーゼイ等）、またはバーティシリウム（Ｖ．ダーリエ等））である。
【００４４】
[0048]  一実施形態では、真核細胞は、昆虫細胞（例えば、Ｓｆ９、Ｍｉｍｉｃ（商標）  Ｓｆ９、Ｓｆ２１、Ｈｉｇｈ  Ｆｉｖｅ（商標）（ＢＴ１−ＴＮ−５Ｂ１−４）、またはＢＴ１−Ｅａ８８細胞）、藻類細胞（例えば、アンフォラ属、珪藻、デュナリエラ、クロレラ、クラミドモナス、シアノフィタ（シアノバクテリア）、ナンノクロロプシス、スピルリナ、またはオクロモナス）、または植物細胞（例えば、単子葉植物（例えば、トウモロコシ、米、小麦、またはセタリア等）からの細胞、または双子葉植物（例えば、キャッサバ、イモ、大豆、トマト、たばこ、アルファルファ、ヒメツリガネゴケ、またはシロイヌナズナ）からの細胞）である。
【００４５】
[0049]  また、真核細胞は、例えば、ＥＢｘ（登録商標）細胞、ＥＢ１４、ＥＢ２４、ＥＢ２６、ＥＢ６６、またはＥＢｖｌ３というような、鳥の細胞、細胞株、または細胞系統とすることもできる。
【００４６】
[0050]  一実施形態では、原核細胞は、バチルス、ストレプトミセス・ストレプトコッカス、スタフィロコッカス、またはラクトバチルスというようなグラム陽性細胞である。バチルスの例には、Ｂ．サブティリス、Ｂ．アミロリクエファシエンス、Ｂ．リケニフォルミス、Ｂ．ナットー、またはＢ．メガテリウムが含まれる。ある実施形態では、細胞は、 Ｂ． サブティリス３ＮＡ、および Ｂ． サブティリス１６８というような Ｂ． サブティリスである。バチルスは、バチルス遺伝材料センター（ｔｈｅ  Ｂａｃｉｌｌｕｓ  Ｇｅｎｅｔｉｃ  Ｓｔｏｃｋ  Ｃｅｎｔｅｒ），  Ｂｉｏｌｏｇｉｃａｌ  Ｓｃｉｅｎｃｅｓ  ５５６，  ４８４  Ｗｅｓｔ  １２ｔｈ  Ａｖｅｎｕｅ，  Ｃｏｌｕｍｂｕｓ  ＯＨ  ４３２１０−１２１４から市販されている。
【００４７】
[0051]  一実施形態では、原核細胞は、例えば、ＴＧ１、ＴＧ２、Ｗ３１１０、ＤＨ１、ＤＨＢ４、ＤＨ５ａ、ＨＭＳ１７４、ＨＭＳ１７４（ＤＥ３）、ＮＭ５３３、Ｃ６００、ＨＢ１０１、ＪＭ１０９、ＭＣ４１００、ＸＬ１−Ｂｌｕｅ、およびＯｒｉｇａｍｉを含むサルモネラ属菌または大腸菌、更に、ＢＬ−２１またはＢＬ２１（ＤＥ３）等の大腸菌Ｂ系統由来のものというような、グラム陰性細胞であり、これら全てが市販されている。
【００４８】
[0052]  ある実施形態では、細胞は、ヒト肝細胞、動物肝細胞、または非実質細胞というような肝細胞である。例えば、細胞は、接着型の代謝適格ヒト肝細胞や、接着型の誘導試験用ヒト肝細胞、接着型のＱｕａｌｙｓｔ  Ｔｒａｎｓｐｏｒｔｅｒ  Ｃｅｒｔｉｆｉｅｄ（商標）ヒト肝細胞、浮遊型の適格ヒト肝細胞（１０人または２０人のドナーによってプールされた肝細胞を含む）、ヒト肝臓クッパー細胞、ヒト肝星細胞、イヌ肝細胞（単一またはプールされたビーグル肝細胞を含む）、マウス肝細胞（ＣＤ−１およびＣ５７ＢＩ／６肝細胞を含む）、ラット肝細胞（Ｓｐｒａｇｕｅ−Ｄａｗｌｅｙ、Ｗｉｓｔａｒ  ＨａｎおよびＷｉｓｔａｒ肝細胞を含む）、サル肝細胞（カニクイザルまたはアカゲザル肝細胞を含む）、ネコ肝細胞（ドメスティック・ショートヘア肝細胞を含む）、ウサギ肝細胞（ニュージーランドホワイト肝細胞を含む）であってもよい。肝細胞の例は、トライアングル・リサーチ・ラボ有限責任会社（Ｔｒｉａｎｇｌｅ  Ｒｅｓｅａｒｃｈ  Ｌａｂｓ，  ＬＬＣ），  ６  Ｄａｖｉｓ  Ｄｒｉｖｅ  Ｒｅｓｅａｒｃｈ  Ｔｒｉａｎｇｌｅ  Ｐａｒｋ，  Ｎｏｒｔｈ  Ｃａｒｏｌｉｎａ，  ＵＳＡ  ２７７０９から市販されている。
【００４９】
[0053]  ある実施形態では、細胞は、本明細書において記載した細胞の内任意のもののから差別化された形態である。他の実施形態では、細胞は、任意の初代培養細胞由来の細胞である。適した宿主細胞は、例えば、ドイツ微生物／細胞培養保存有限会社（ＤＳＭＺ）、またはアメリカン・タイプ・カルチャー・コレクション（ｔｈｅ  Ａｍｅｒｉｃａｎ  Ｔｙｐｅ  Ｃｕｌｔｕｒｅ  Ｃｏｌｌｅｃｔｉｏｎ）（ＡＴＣＣ）というような培養株保存機関から市販されている。
【００５０】
[0054]  ある実施形態では、本明細書において説明したシステム、デバイス、設備、および/or方法は、懸濁細胞(suspension cells)または足場依存性（接着）細胞(anchorage-dependent (adherent) cell)を培養するのに適している。また、本明細書において説明したシステム、デバイス、設備、および／または方法は、 ポリペプチド産物、核酸産物（例えば、ＤＮＡまたはＲＮＡ）のような製剤および生物製剤製品の生産、あるいは細胞および／またはウィルス療法に使用されるものというような細胞および／またはウィルスの生産のために構成された生産動作に適している。他の実施形態では、本明細書において説明したシステム、デバイス、設備、および／または方法は、バイオシミラーを生産するために使用することができる。
【００５１】
[0055]  特定実施形態では、組み換え治療産物または診断産物というような産物が、培養細胞によって発現または産生される。以下で更に詳しく説明するように、細胞によって産生される産物の例には、抗体分子（例えば、モノクロナール抗体や二重特異性抗体）、抗体類似体（特異的に抗原に結合するが構造的には抗体と無関係である、例えば、ＤＡＲＰｉｎ、アフィボディ、アドネクチンまたはＩｇＮＡＲというようなポリペプチド分子）、融合タンパク質（例えば、Ｆｃ融合タンパク質やキメラサイトカイン）、他の組み換えタンパク質（例えば、糖化タンパク質や、酵素、ホルモン）、ウィルス治療薬（例えば、遺伝子療法およびウィルス性免疫療法用の抗癌腫瘍溶解性ウィルス、ウイルスベクター）、細胞治療薬（例えば、多能性幹細胞、間葉)−幹細胞および成体幹細胞）、ワクチンまたは液体包含粒子（例えば、エクソソームやウイルス状粒子）、ＲＮＡ（例えば、ｓｉＲＮＡのような）もしくはＤＮＡ（例えば、プラスミドＤＮＡのような）、抗生物質、ペプチド、アミノ酸、脂肪酸、あるいは他の有用な生化学的中間体または代謝物があげられるが、これらに限定されるのではない。例えば、ある実施形態では、約４，０００ダルトン〜約１４０，０００ダルトンを超える分子量の分子を産生できる。他の実施形態では、これらの分子はある範囲の複雑性を有することができ、糖鎖形成を含む翻訳後修飾を含むことができる。
【００５２】
[0056]  実施形態では、タンパク質は、例えば、ボトックス（ＢＯＴＯＸ）、マイオブロック（Ｍｙｏｂｌｏｃ）、ニューロブロック（Ｎｅｕｒｏｂｌｏｃ）、ディスポート（Ｄｙｓｐｏｒｔ）（または他のボツリヌス神経毒素の血清型）、アルグルコシダーゼアルファ、ダプトマイシン、ＹＨ−１６、コリオゴナドトロピンアルファ、フィルグラスチム、セトロレリクス、インターロイキン２、アルデスロイキン、テセロイキン、デニロイキン・ディフティトックス、インターフェロン・アルファ−ｎ３（注射用）、インターフェロン・アルファ−ｎ１、ＤＬ−８２３４、インターフェロン、サントリー（Ｓｕｎｔｏｒｙ）（ガンマ１ａ）、インターフェロン・ガンマ、チモシンアルファ１、タソネルミン、デジファブ（ＤｉｇｉＦａｂ）、ビペラタブ（ＶｉｐｅｒａＴＡｂ）、エチタブ（ＥｃｈｉＴＡｂ）、クロファブ（ＣｒｏＦａｂ）、ネシリチド、アバタセプト、アレファセプト、レビフ（Ｒｅｂｉｆ）、エプトテルミンアルファ、テリパラチド（骨粗しょう症）、カルシトニン注射剤（骨疾患）、カルシトニン（経鼻用(nasal)、骨粗しょう症）、エタネルセプト、ヘモグロビングルタマー２５０（ウシ）、ドロトレコギンアルファ、コラゲナーゼ、カルペリチド、組み換えヒト上皮細胞成長因子（局所ゲル、創傷治癒）、ＤＷＰ４０１、ダルベポエチンアルファ、エポエチンオメガ、エポエチンベータ、エポエチンアルファ、デシルジン、レピルジン、ビバリルジン、ノナコグアルファ、モノニン（Ｍｏｎｏｎｉｎｅ）、エプタコグアルファ（活性型）、組み換え第ＶＩＩＩ因子＋ＶＷＦ、リコンビネート（Ｒｅｃｏｍｂｉｎａｔｅ）、組み換え第ＶＩＩＩ因子、第ＶＩＩＩ因子（組み換え型）、アルファンメート（Ａｌｐｈａｎｍａｔｅ）、オクトコグアルファ、第ＶＩＩＩ因子、パリフェルミン、インディキナーゼ（Ｉｎｄｉｋｉｎａｓｅ）、テネクテプラーゼ、アルテプラーゼ、パミテプラーゼ、レテプラーゼ、ナテプラーゼ、モンテプラーゼ、フォリトロピンアルファ、ｒＦＳＨ、ｈｐＦＳＨ、ミカファンギン、ペグフィルグラスチム、レノグラスチム、ナルトグラスチム、セルモレリン、グルカゴン、エキセナチド、プラムリンチド、イミグルセラーゼ、ガルスルファーゼ、ロイコトロピン、モルグラモスチム、酢酸トリプトレリン、ヒストレリン（皮下移植、ヒドロン（Ｈｙｄｒｏｎ））、デスロレリン、ヒストレリン、ナファレリン、ロイプロリド徐放性製剤（アトリゲル（ＡＴＲＩＧＥＬ））、ロイプロリドインプラント（デュロス（ＤＵＲＯＳ））、ゴセレリン、ユートロピン（Ｅｕｔｒｏｐｉｎ）、ＫＰ−１０２プログラム、ソマトロピン、メカセルミン（成長障害）、エンフビルチド、Ｏｒｇ−３３４０８、インスリングラルギン、インスリングルリジン、インスリン（吸入用）、インスリンリスプロ、インスリンデテミル、インスリン（バッカル、ラピッドミスト（ＲａｐｉｄＭｉｓｔ））、メカセルミンリンファバート、アナキンラ、セルモロイキン、９９ｍＴｃアプシチド注射剤、ミエロピド、ベータセロン（Ｂｅｔａｓｅｒｏｎ）、酢酸グラチラマー、ゲポン（Ｇｅｐｏｎ）、サルグラモスチム、オプレルベキン、ヒト白血球由来アルファ・インターフェロン、ビリベ（Ｂｉｌｉｖｅ）、インスリン（組み換え型）、組み換えヒトインスリン、インスリンアスパルト、メカセルミン、ロフェロンＡ（Ｒｏｆｅｒｏｎ−Ａ）、インターフェロン・アルファ２、アルファフェロン（Ａｌｆａｆｅｒｏｎｅ）、インターフェロンアルファコン−１、インターフェロン・アルファ、アボネックス（Ａｖｏｎｅｘ）組み換えヒト黄体形成ホルモン、ドルナーゼアルファ、トラフェルミン、ジコノチド、タルチレリン、ジボテルミンアルファ、アトシバン、ベカプレルミン、エプチフィバチド、ゼマイラ（Ｚｅｍａｉｒａ）、ＣＴＣ−１１１、シャンバック（Ｓｈａｎｖａｃ）−Ｂ、ＨＰＶワクチン（四価）、オクトレオチド、ランレオチド、アンセスチム、アガルシダーゼベータ、アガルシダーゼアルファ、ラロニダーゼ、酢酸プレザチド銅（局所ゲル）、ラスブリカーゼ、ラニビズマブ、アクティミューン（Ａｃｔｉｍｍｕｎｅ）、ペグイントロン（ＰＥＧ−Ｉｎｔｒｏｎ）、トリコミン（Ｔｒｉｃｏｍｉｎ）、組み換えイエダニ(house dust mite)アレルギー減感作注射剤、組み換えヒト副甲状腺ホルモン（ＰＴＨ）１−８４（すなわち骨粗しょう症）、エポエチンデルタ、遺伝子組み換えアンチトロンビンＩＩＩ、グランジトロピン（Ｇｒａｎｄｉｔｒｏｐｉｎ）、ビトラーゼ（Ｖｉｔｒａｓｅ）、組み換えインスリン、インターフェロン・アルファ（経口トローチ）、ＧＥＭ−２１Ｓ、バプレオチド、イデュルスルファーゼ、オマパトリラート、組み換え血清アルブミン、セルトリズマブペゴル、グルカルピダーゼ、ヒト組み換えＣ１エステラーゼインヒビター（血管性浮腫）、ラノテプラーゼ、組み換えヒト成長ホルモン、エンフビルチド（無針注射用、バイオジェクター（Ｂｉｏｊｅｃｔｏｒ）２０００）、ＶＧＶ−１、インターフェロン（アルファ）、ルシナクタント、アビプタジル（吸入用、肺疾患）、イカチバント、エカランチド、オミガナン、オーログラブ（Ａｕｒｏｇｒａｂ）、酢酸ペキシガナン、ＡＤＩ−ＰＥＧ−２０、ＬＤＩ−２００、デガレリクス、シトレデキンベスドトックス、ファブルド（Ｆａｖｌｄ）、ＭＤＸ−１３７９、ＩＳＡｔｘ−２４７、リラグルチド、テリパラチド（骨粗しょう症）、ティファコジン、ＡＡ４５００、Ｔ４Ｎ５リポソームローション、カツマキソマブ、ＤＷＰ４１３、ＡＲＴ−１２３、クリサリン（Ｃｈｒｙｓａｌｉｎ）、デスモテプラーゼ、アメジプラーゼ、コリフォリトロピンアルファ、ＴＨ−９５０７、テズグルチド、ダイアミド（Ｄｉａｍｙｄ）、ＤＷＰ−４１２、成長ホルモン（徐放性注射用）、組み換えＧ−ＣＳＦ、インスリン（吸入用、ＡＩＲ）、インスリン（吸入用、テクノスフィア（Ｔｅｃｈｎｏｓｐｈｅｒｅ））、インスリン（吸入用、ＡＥＲｘ）、ＲＧＮ−３０３、ＤｉａＰｅｐ２７７、インターフェロン・ベータ（Ｃ型肝炎ウィルス感染（ＨＣＶ））、インターフェロン・アルファ−ｎ３（経口用）、ベラタセプト、経皮用インスリンパッチ、ＡＭＧ−５３１、ＭＢＰ−８２９８、キセレセプト（Ｘｅｒｅｃｅｐｔ）、オペバカン、エイズバックス（ＡＩＤＳＶＡＸ）、ＧＶ−１００１、リンフォスキャン（ＬｙｍｐｈｏＳｃａｎ）、ランピルナーゼ、リポキシサン（Ｌｉｐｏｘｙｓａｎ）、ルスプルチド、ＭＰ５２（ベータリン酸３カルシウムキャリア���骨再生）、メラノーマワクチン、シプリューセル−Ｔ、ＣＴＰ−３７、インセジア（Ｉｎｓｅｇｉａ）、ビテスペン、ヒトスロムビン（凍結、手術出血）、スロムビン、トランスミド（ＴｒａｎｓＭＩＤ）、アルフィメプラーゼ、プリカーゼ（Ｐｕｒｉｃａｓｅ）、テルリプレシン（静脈用、肝腎症候群）、ＥＵＲ−１００８Ｍ、組み換えＦＧＦ−Ｉ（注射用、血管疾患）、ＢＤＭ−Ｅ、ロチガプチド、ＥＴＣ−２１６、Ｐ−１１３、ＭＢＩ−５９４ＡＮ、デュラマイシン（吸入用、嚢胞性線維症）、ＳＣＶ−０７、ＯＰＩ−４５、エンドスタチン（Ｅｎｄｏｓｔａｔｉｎ）、アンジオスタチン（Ａｎｇｉｏｓｔａｔｉｎ）、ＡＢＴ−５１０、ボーマン・バークインヒビター濃縮剤、ＸＭＰ−６２９、９９ｍＴｃ−Ｈｙｎｉｃ−アネキシン（Ａｎｎｅｘｉｎ）Ｖ、カハラリドＦ、ＣＴＣＥ−９９０８、テベレリックス（徐放）、オザレリックス、
ロミデプシン、ＢＡＹ−５０４７９８、インターロイキン４、ＰＲＸ−３２１、ペプスカン（Ｐｅｐｓｃａｎ）、イボクタデキン、ｒｈラクトフェリン、ＴＲＵ−０１５、ＩＬ−２１、ＡＴＮ−１６１、シレンギチド、アルブフェロン（Ａｌｂｕｆｅｒｏｎ）、ビファジックス（Ｂｉｐｈａｓｉｘ）、ＩＲＸ−２、オメガインターフェロン、ＰＣＫ−３１４５、ＣＡＰ−２３２、パシレオチド、ｈｕＮ９０１−ＤＭＩ、卵巣癌免疫治療ワクチン、ＳＢ−２４９５５３、オンコバックス（Ｏｎｃｏｖａｘ）−ＣＬ、オンコバックス−Ｐ、ＢＬＰ−２５、ＣｅｒＶａｘ−１６、多エピトープペプチドメラノーマワクチン（ＭＡＲＴ−１、ｇｐ１００、チロシナーゼ）、ネミフィチド、ｒＡＡＴ（吸入用）、ｒＡＡＴ（皮膚科）、ＣＧＲＰ（吸入用、喘息）、ペグスネルセプト、チモシンベータ４、プリチデプシン、ＧＴＰ−２００、ラモプラニン、グラスパ（ＧＲＡＳＰＡ）、ＯＢＩ−１、ＡＣ−１００、サケカルシトニン（経口用、エリゲン）、カルシトニン（経口用、骨粗しょう症）、エキサモレリン、カプロモレリン、カルデバ（Ｃａｒｄｅｖａ）、ベラフェルミン、１３１Ｉ−ＴＭ−６０１、ＫＫ−２２０、Ｔ−１０、ウラリチド、デペレスタット、ヘマチド、クリサリン（局所用）、ｒＮＡＰｃ２、組み換え第ＶＩＩＩ因子（ＰＥＧ化リポソーム）、ｂＦＧＦ、ＰＥＧ化組み換えスタフィロキナーゼ変異体、Ｖ−１０１５３、ソノリシスプロリーゼ（ＳｏｎｏＬｙｓｉｓ  Ｐｒｏｌｙｓｅ）、ニューロバックス（ＮｅｕｒｏＶａｘ）、ＣＺＥＮ−００２、島細胞新生療法、ｒＧＬＰ−１、ＢＩＭ−５１０７７、ＬＹ−５４８８０６、エキセナチド（制御放出、メディソーブ（Ｍｅｄｉｓｏｒｂ））、ＡＶＥ−００１０、ＧＡ−ＧＣＢ、アボレリン、ＡＣＭ−９６０４、酢酸リナクロチド、ＣＥＴｉ−１、ヘモスパン（Ｈｅｍｏｓｐａｎ）、ＶＡＬ（注射用）、即効インスリン（注射用、ビアデル（Ｖｉａｄｅｌ））、経鼻投与用(intranasal)インスリン、インスリン（吸入用）、インスリン（経口用、エリゲン）、組み換えメチオニルヒトレプチン、ピトラキンラ皮下注射、湿疹）、ピトラキンラ（吸入用乾燥粉末、喘息）、ムルチキン（Ｍｕｌｔｉｋｉｎｅ）、ＲＧ−１０６８、ＭＭ−０９３、ＮＢＩ−６０２４、ＡＴ−００１、ＰＩ−０８２４、Ｏｒｇ−３９１４１、Ｃｐｎ１０（自己免疫疾患／炎症）、タラクトフェリン（局所用）、ｒＥＶ−１３１（眼科）、ｒＥＶ−１３１（呼吸器疾患）、経口用組み換えヒトインスリン（糖尿病）、ＲＰＩ−７８Ｍ、オプレルベキン（経口用）、ＣＹＴ−９９００７  ＣＴＬＡ４−Ｉｇ、ＤＴＹ−００１、バラテグラスト、インターフェロン・アルファ−ｎ３（局所用）、ＩＲＸ−３、ＲＤＰ−５８、タウフェロン（Ｔａｕｆｅｒｏｎ）、胆汁酸塩刺激リパーゼ、メリスパーゼ（Ｍｅｒｉｓｐａｓｅ）、アルカリホスファターゼ、ＥＰ−２１０４Ｒ、メラノタン（Ｍｅｌａｎｏｔａｎ）−ＩＩ、ブレメラノチド、ＡＴＬ−１０４、組み換えヒトミクロプラスミン、ＡＸ−２００、セマックス（ＳＥＭＡＸ）、ＡＣＶ−１、Ｘｅｎ−２１７４、ＣＪＣ−１００８、ジノルフィンＡ、ＳＩ−６６０３、ＬＡＢ  ＧＨＲＨ、ＡＥＲ−００２、ＢＧＣ−７２８、マラリアワクチン（ビロソーム、ＰｅｖｉＰＲＯ）、ＡＬＴＵ−１３５、パルボウイルスＢ１９ワクチン、インフルエンザワクチン（組み換えノイラミニダーゼ）、マラリア／ＨＢＶワクチン、炭疽病ワクチン、Ｖａｃｃ−５ｑ、Ｖａｃｃ−４ｘ、ＨＩＶワクチン（経口用）、ＨＰＶワクチン、Ｔａｔトキソイド、ＹＳＰＳＬ、ＣＨＳ−１３３４０、ＰＴＨ（１−３４）リポソームクリーム（ノバソーム（Ｎｏｖａｓｏｍｅ））、オスタボリン（Ｏｓｔａｂｏｌｉｎ）−Ｃ、ＰＴＨ類縁体（局所用、乾癬）、ＭＢＲＩ−９３．０２、ＭＴＢ７２Ｆワクチン（結核）、ＭＶＡ−Ａｇ８５Ａワクチン（結核）、ＦＡＲＡ０４、ＢＡ−２１０、組み換えペストＦＩＶワクチン、ＡＧ−７０２、ＯｘＳＯＤｒｏｌ、ｒＢｅｔＶ１、Ｄｅｒ−ｐ１／Ｄｅｒ−ｐ２／Ｄｅｒ−ｐ７アレルゲン標的化ワクチン（イエダニ(dust mite)アレルギー）、ＰＲ１ペプチド抗原（白血病）、突然変異体ｒａｓワクチン、ＨＰＶ−１６  Ｅ７リポペプチドワクチン、ラビリンシンワクチン（腺癌）、ＣＭＬワクチン、ＷＴ１−ペプチドワクチン（癌）、ＩＤＤ−５、ＣＤＸ−１１０、ペントリス（Ｐｅｎｔｒｙｓ）、ノレリン（Ｎｏｒｅｌｉｎ）、サイトファブ（ＣｙｔｏＦａｂ）、Ｐ−９８０８、
ＶＴ−１１１、イクロカプチド、テルベルミン（皮膚科、糖尿病性脚部潰瘍）、ルピントリビル、レチキュロース、ｒＧＲＦ、ＨＡ、アルファ−ガラクトシダーゼＡ、ＡＣＥ−０１１、ＡＬＴＵ−１４０、ＣＧＸ−１１６０、アンジオテンシン治療用ワクチン、Ｄ−４Ｆ、ＥＴＣ−６４２、ＡＰＰ−０１８、ｒｈＭＢＬ、ＳＣＶ−０７（経口用、結核）、ＤＲＦ−７２９５、ＡＢＴ−８２８、ＥｒｂＢ２特異的イムノトキシン（抗癌）、ＤＴ３ＳＳＩＬ−３、ＴＳＴ−１００８８、ＰＲＯ−１７６２、コムボトックス（Ｃｏｍｂｏｔｏｘ）、コレシストキニン−Ｂ／ガストリン−受容体結合ペプチド、１１１Ｉｎ−ｈＥＧＦ、ＡＥ−３７、トラスツズマブ−ＤＭ１、拮抗剤Ｇ、ＩＬ−１２（組み換え）、ＰＭ−０２７３４、ＩＭＰ−３２１、ｒｈＩＧＦ−ＢＰ３、ＢＬＸ−８８３、ＣＵＶ−１６４７（局所用）、Ｌ−１９系放射線免疫療法剤（癌）、Ｒｅ−１８８−Ｐ−２０４５、ＡＭＧ−３８６、ＤＣ／１５４０／ＫＬＨワクチン（癌）、ＶＸ−００１、ＡＶＥ−９６３３、ＡＣ−９３０１、ＮＹ−ＥＳＯ−１ワクチン（ペプチド）、ＮＡ１７．Ａ２ペプチド、メラノーマワクチン（パルス抗原治療薬）、前立腺癌ワクチン、ＣＢＰ−５０１、組み換えヒトラクトフェリン（ドライアイ）、ＦＸ−０６、ＡＰ−２１４、ＷＡＰ−８２９４Ａ（注射用）、ＡＣＰ−ＨＩＰ、ＳＵＮ−１１０３１、ペプチドＹＹ［３−３６］（肥満、経鼻投与用）、ＦＧＬＬ、アタシセプト、ＢＲ３−Ｆｃ、ＢＮ−００３、ＢＡ−０５８、ヒト副甲状腺ホルモン１−３４（経鼻用、骨粗しょう症）、Ｆ−１８−ＣＣＲ１、ＡＴ−１１００（セリアック病／糖尿病）、ＪＰＤ−００３、ＰＴＨ（７−３４）リポソームクリーム（ノバソーム）、デュラマイシン（眼用、ドライアイ）、ＣＡＢ−２、ＣＴＣＥ−０２１４、グリコＰＥＧ化エリスロポエチン、ＥＰＯ−Ｆｃ、ＣＮＴＯ−５２８、ＡＭＧ−１１４、ＪＲ−０１３、第ＸＩＩＩ因子、アミノカンジン、ＰＮ−９５１、７１６１５５、ＳＵＮ−Ｅ７００１、ＴＨ−０３１８、ＢＡＹ−７３−７９７７、テベレリックス（即時放出）、ＥＰ−５１２１６、ｈＧＨ（制御放出、バイオスフィア（Ｂｉｏｓｐｈｅｒｅ））、ＯＧＰ−Ｉ、シフビルチド、ＴＶ４７１０、ＡＬＧ−８８９、Ｏｒｇ−４１２５９、ｒｈＣＣ１０、Ｆ−９９１、チモペンチン（肺疾患）、ｒ（ｍ）ＣＲＰ、肝選択的インスリン、スバリン、Ｌ１９−ＩＬ−２融合タンパク質、エラフィン、ＮＭＫ−１５０、ＡＬＴＵ−１３９、ＥＮ−１２２００４、ｒｈＴＰＯ、トロンボポエチン受容体アゴニスト（血小板減少症）、ＡＬ−１０８、ＡＬ−２０８、神経成長因子拮抗剤（疼痛）、ＳＬＶ−３１７、ＣＧＸ−１００７、ＩＮＮＯ−１０５、経口用テリパラチド（エリゲン）、ＧＥＭ−ＯＳ１、ＡＣ−１６２３５２、ＰＲＸ−３０２、ＬＦｎ−ｐ２４融合ワクチン（テラポア（Ｔｈｅｒａｐｏｒｅ））、ＥＰ−１０４３、Ｓ小児肺炎ワクチン、マラリアワクチン、髄膜炎細菌グループＢワクチン、新生児グループＢ連鎖球菌ワクチン、炭疽菌ワクチン、ＨＣＶワクチン（ｇｐＥ１＋ｇｐＥ２＋ＭＦ−５９）、中耳炎治療薬、ＨＣＶワクチン（コア抗原＋ＩＳＣＯＭＡＴＲＩＸ）、ｈＰＴＨ（１−３４）（経皮用、ビアダーム（ＶｉａＤｅｒｍ））、７６８９７４、ＳＹＮ−１０１、ＰＧＮ−００５２、アビスクミン、ＢＩＭ−２３１９０、結核ワクチン、多エピトープチロシナーゼペプチド、癌ワクチン、エンカスチム、ＡＰＣ−８０２４、ＧＩ−５００５、ＡＣＣ−００１、ＴＴＳ−ＣＤ３、血管標的化ＴＮＦ（固形腫瘍）、デスモプレシン（バッカル制御放出）、オネルセプト、およびＴＰ−９２０１である。
【００５３】
[0057]  ある実施形態では、ポリペプチドは、アダリムマブ（ヒュミラ（ＨＵＭＩＲＡ）登録商標）、インフリキシマブ（ＲＥＭＩＣＡＤＥ（商標））、リツキシマブ（ＲＩＴＵＸＡＮ（商標）／ＭＡＢ  ＴＨＥＲＡ（商標））エタネルセプト（ＥＮＢＲＥＬ（商標））、ベバシズマブ（ＡＶＡＳＴＩＮ（商標））、トラスツズマブ（ＨＥＲＣＥＰＴＩＮ（商標））、ペグフィルグラスチム（ＮＥＵＬＡＳＴＡ（商標））、またはバイオシミラーおよびバイオベターを含む、任意の他の適したポリペプチドである。
【００５４】
[0058]  使用に適した他のポリペプチドには、以下に列挙されたもの、および米国特許出願公開第２０１６／００９７０７４号の表１に記載されたものがある。
【００５５】
【表１−１】
2020513818.tif 000003
【００５６】
【表１−２】
2020513818.tif 000004
【００５７】
【表１−３】
2020513818.tif 000005
【００５８】
【表１−４】
2020513818.tif 000006
【００５９】
[0059]  他の実施形態では、ポリペプチドは、ホルモン、血液凝固因子、サイトカイン／成長因子、抗体分子、融合タンパク質、タンパク質ワクチン、またはペプチドであり、これらおよびその他の産物例を表２に示す。
【００６０】
【表２−１】
2020513818.tif 000007
【００６１】
【表２−２】
2020513818.tif 000008
【００６２】
【表２−３】
2020513818.tif 000009
【００６３】
[0060]  実施形態では、タンパク質は多特異性のタンパク質であり、例えば、表３に示すような二重特異性抗体である。
【００６４】
【表３−１】
2020513818.tif 000010
【００６５】
【表３−２】
2020513818.tif 000011
【００６６】
【表３−３】
2020513818.tif 000012
【００６７】
【表３−４】
2020513818.tif 000013
【００６８】
【表３−５】
2020513818.tif 000014
【００６９】
【表３−６】
2020513818.tif 000015
【００７０】
[0061]  実施形態では、特に本明細書に記載しない限り、本明細書において説明したシステム、デバイス、設備、および／または方法は、上記のような産物の分離、浄化、および隔離のための操作および／または器具というような任意の適した単位操作および／または器具を、特に記載のない限り、含むこともできる。従来からの現場組立式の設備や、モジュール、移動式設備および仮設設備、または任意の他の適した構造や設備、および／またはレイアウトというような、任意の適した設備および環境を使用することができる。例えば、ある実施形態では、モジュラー・クリーン・ルームを使用することができる。加えて、そして特に本明細書に記載しない限り、本明細書に記載したデバイス、システム、および方法は、１つの場所または設備に収容することおよび／または実行することもでき、あるいは別々または複数の場所および／または設備において収容することおよび／または実行することもできる。
【００７１】
[0062]  更に、そして特に本明細書に記載しない限り、システム、デバイス、設備、および／または方法には、撹拌槽やエアリフト、繊維、マイクロファイバー、中空糸、セラミックマトリックス、流動床、固定床、および／または噴流層式のバイオリアクタを含むが、これらには限定されず、任意の適当な１つまたは複数のリアクタを含むことができる。本明細書において使用する場合、「リアクタ」は、発酵槽または発酵ユニットや他の任意の反応槽を含むことができ、「リアクタ」という用語は「発酵槽」と同じ意味で使用される。例えば、ある態様では、バイオリアクタ・ユニットの一例は、以下の操作の１つ以上または全てを行うことができる。操作には、栄養および／または炭素源の供給、適した気体（例えば、酸素）の注入、発酵培地または細胞培養培地の流入または流出、気相と液相との分離、温度の維持、酸素レベルおよびＣＯ２レベルの維持、ｐＨレベルの維持、かき混ぜ（例えば、撹拌）および／または洗浄／殺菌が含まれる。発酵ユニットというようなリアクタユニットの一例は、そのユニット内に複数のリアクタを含んでもよい。例えば、ユニットは１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、３０個、３５個、４０個、４５個、５０個、６０個、７０個、８０個、９０個または１００個或いはそれ以上のバイオリアクタを各ユニット内に有することができ、および／または設備は、その設備内に単一または複数のリアクタを有する複数のユニットを含んでもよい。様々な実施形態では、バイオリアクタを、バッチ、半供給バッチ、供給バッチ、かん流および／または連続発酵プロセスに適したものにすることができる。リアクタには任意の適当な直径を用いることができる。実施形態では、バイオリアクタは約１００ｍＬ〜約５０，０００Ｌの容積を有することができる。非限定的な例には、１００ｍＬ、２５０ｍＬ、５００ｍＬ、７５０ｍＬ、１リットル、２リットル、３リットル、４リットル、５リットル、６リットル、７リットル、８リットル、９リットル、１０リットル、１５リットル、２０リットル、２５リットル、３０リットル、４０リットル、５０リットル、６０リットル、７０リットル、８０リットル、９０リットル、１００リットル、１５０リットル、２００リットル、２５０リットル、３００リットル、３５０リットル、４００リットル、４５０リットル、５００リットル、５５０リットル、６００リットル、６５０リットル、７００リットル、７５０リットル、８００リットル、８５０リットル、９００リットル、９５０リットル、１０００リットル、１５００リットル、２０００リットル、２５００リットル、３０００リットル、３５００リットル、４０００リットル、４５００リットル、５０００リットル、６０００リットル、７０００リットル、８０００リットル、９０００リットル、１０，０００リットル、１５，０００リットル、２０，０００リットル、および／または５０，０００リットルの容積が含まれる。加えて、適したリアクタは、複数回使用可能、使い捨て(single-use)、消耗品(disposable)、または非消耗品であってもよく、ステンレス鋼（例えば、３１６Ｌまたは他の任意の適したステンレス鋼）やインコネル、プラスチック、および／ま���はガラスというような金属合金を含む、任意の適当な材料から形成することができる。
【００７２】
[0063]  特に本明細書に記載しない限り、本システム、デバイス、設備、および方法は、ベンチ規模、パイロット規模、および完全生産規模の生産能力を含むがこれらに限定されない、所望の生産量または生産能力(production capacity)を有することができる。
【００７３】
[0064]  非限定的な例として、そして限定ではなく、米国特許出願公開第２０１２／００７７４２９号、米国特許出願公開第２０１１／０３１２０８７号、米国特許出願公開第２００９／０３０５６２６号、米国特許第９，３８８，３７３号、米国特許第８，７７１，６３５号、米国特許第８，２９８，０５４号、米国特許第７，６２９，１６７号、米国特許第５，６５６，４９１号は、適していると言って差し支えない設備、機器、および／またはシステムの例について記載しており、これらの特許文献をここで引用したことにより、その内容全体が本願にも含まれるものとする。
【００７４】
[0065]  本開示において説明した実施形態、態様、および／または例は、種々の面で有利である。例えば、特定の処方が構築されるときに対象パラメータの全てにタグ付けすることによって、ユーザおよび／または操作員が、システム・データベースに跨がって散在する種々の記憶デバイスからこれらのパラメータを「プル」する代わりに、タグ付けされたパラメータを、メッセージング・キュー、このようなデータに合わせて設計された１つ以上の別個のデータベース、および／またはミドルウェアに「押し出す」ことが可能になる。少なくともこれに関して、任意の地理的位置から任意の時点において、容易に、便利に、そして素早くリアル・タイムに（そして後の時点ではなく）情報にアクセスすることができる。更に、情報は、種々のコンテキスト・データ、外部分析システムの情報のようなメタデータ、および他の型のコンテキスト・データと共に押し出されるので、この情報を一層関連付けし易い形態にすることができ、更に、ユーザおよび／または操作員が、ユーザに提示されたデータを選択および分析するというように、情報に対して分析を一層正確に実行することが可能になる。加えて、抽出された情報は、処方を実行するコンピューティング・デバイスのローカル・メモリに存在することができ、データベース・コールを実行する必要がなくなる。
【００７５】
[0066]  以上の開示は、本発明を例示するために明示したに過ぎず、限定することを意図するのではない。本発明の主旨おおよび実体を組み込んだ、開示した実施形態の変更は、当業者には想起することができるので、本発明は、添付した請求項およびその均等の範囲内に該当する全てを含むと解釈してしかるべきである。本開示は、素人には馴染みのないかもしれない用語および頭字語を使用するが、当業者には、本明細書において使用した用語および頭字語は馴染みがあるであろう。
【図１】
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【図２】
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【図３】
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【図４】
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【図５】
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【図６】
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【国際調査報告】
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