(57)【要約】  本開示は、哺乳動物における疾患の治療に好適な医薬組成物の分野に該当する。本開示は、パーキンソン病および関連する疾患を治療するための非病原性糞便微生物または滅菌糞便ろ液を含む新規組成物を提供する。本開示はまた、本明細書に開示される組成物で対象を治療するための方法も提供する。【特許請求の範囲】
【請求項１】
それを必要とするヒト対象においてパーキンソン病（ＰＤ）を治療するための方法であって、前記方法が、生きた非病原性糞便細菌または非細胞性糞便ろ液を含む薬学的に活性な用量の治療用組成物を、前記ヒト対象に経口投与することを含む、方法。
【請求項２】
前記対象が、Ｉ〜Ｖ期からなる群から選択される臨床病期のＰＤを有する、請求項１に記載の方法。
【請求項３】
前記治療用組成物が、非選択的な糞便微生物叢を含む、請求項１に記載の方法。
【請求項４】
前記糞便微生物叢が、ドナーの糞便微生物叢全体を含む、請求項２に記載の方法。
【請求項５】
前記糞便微生物叢が、合成糞便材料に由来する、請求項２に記載の方法。
【請求項６】
前記方法が、前記対象におけるＰＤの進行速度を減少させる、請求項１に記載の方法。
【請求項７】
前記用量が、少なくとも２週間にわたって１日に少なくとも１回投与される、請求項１に記載の方法。
【請求項８】
前記用量が、少なくとも２週間にわたって１週間に少なくとも２回投与される、請求項１に記載の方法。
【請求項９】
前記用量が、少なくとも４週間にわたって１週間に少なくとも２回投与される、請求項７に記載の方法。
【請求項１０】
前記用量が、少なくとも８週間にわたって１週間に少なくとも２回投与される、請求項７に記載の方法。
【請求項１１】
前記用量が、少なくとも４週間にわたって１週間に少なくとも３回投与される、請求項１に記載の方法。
【請求項１２】
前記治療用組成物が、生きた非病原性糞便細菌および非細胞性糞便ろ液の両方を含む、請求項１に記載の方法。
【請求項１３】
前記方法が、第１の投与スケジュールと、その後の第２の投与スケジュールとを含み、前記第２の投与スケジュールが、前記第１の投与スケジュールの用量以下の維持用量を含む、請求項１に記載の方法。
【請求項１４】
前記治療用組成物が、遅延放出剤形または徐放性腸溶放出剤形として製剤化される、請求項１に記載の方法。
【請求項１５】
前記治療用組成物が、腸溶性コーティングカプセルまたは耐酸性カプセルとして製剤化される、請求項１に記載の方法。
【請求項１６】
前記薬学的に活性な用量が、１０８〜１０１４ｃｆｕまたは総細胞数である、請求項１に記載の方法。
【請求項１７】
前記治療用組成物が、液体、凍結、凍結乾燥、噴霧乾燥、泡沫乾燥、または粉末形態である、請求項１に記載の方法。
【請求項１８】
前記治療用組成物が、ポリエチレングリコール、スキムミルク、エリトリトール、アラビトール、ソルビトール、グルコース、フルクトース、アラニン、グリシン、プロリン、スクロース、ラクトース、リボース、トレハロース、ジメチルスルホキシド（ＤＭＳＯ）、グリセロール、およびこれらの組み合わせからなる群から選択される抗凍結剤を含む、請求項１に記載の方法。
【請求項１９】
前記対象が、前記組成物の投与前に抗生物質で前治療される、請求項１に記載の方法。
【請求項２０】
前記方法が、振戦、動作の緩慢化（動作緩慢）、筋肉の硬直、姿勢およびバランスの障害、自動動作の喪失、発話の変化、ならびに筆跡の変化からなる群から選択される１つ以上のＰＤ症状を除去または減少させる、請求項１に記載の方法。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
関連出願の相互参照
本出願は、２０１７年４月５日に出願された、米国仮特許出願第６２／４８２，１６２号、および２０１７年５月２６日に出願された、米国仮特許出願第６２／５１１，７４０号に対する優先権を主張する。これらの米国仮特許出願の各々は、それらの全体が参照により本明細書に組み込まれる。
【０００２】
本開示は、パーキンソン病（ＰＤ）および関連する障害を治療するのに好適な医薬組成物および方法に関する。
【背景技術】
【０００３】
哺乳動物は、多様な微生物種を哺乳動物の消化管（ＧＩ）内に宿している。これらの微生物間および微生物と宿主、例えば宿主免疫系との間の相互作用により、微生物叢(microbiota)が形成される。健康な微生物叢は、広範囲の病原体に対するコロニー形成抵抗性、必須栄養素の生合成および吸収、ならびに健康な腸上皮および適切に制御された全身性免疫を維持する免疫刺激を含む、複数の利点を宿主に提供する。不均衡な微生物叢（「腸内毒素症」または「混乱した共生」とも呼ばれる）は、微生物叢の機能を失い、病原体に対する感受性の増加、代謝プロファイルの変化、あるいは局所もしくは全身の炎症または自己免疫につながる可能性がある炎症性シグナルの誘導をもたらす場合がある。加えて、そのような混乱した微生物叢は、入ってくる病原体（複数可）によって感染される可能性があり、これが、他の症状の中でも特に、痛み、下痢、おなら、便秘を引き起こす可能性がある。したがって、腸内微生物叢は、腸の病原性感染症のような多くの障害の発症機序において重要な役割を果たしている。
【０００４】
病気の患者の腸内へのヒト結腸微生物叢の移植または投与は、糞便微生物叢移植（ＦＭＴ）と呼ばれ、糞便細菌療法としても広く知られている。ＦＭＴは、主要な病原体の増殖および生存に反する生態環境を作り出すことにより、それらを制御する多様な微生物群を腸に再増殖させると考えられる。ＦＭＴは、正常な組成的および機能的腸内微生物群集の迅速な再構成を可能にする治療プロトコルを提示する。
【０００５】
ＦＭＴは、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｄｉｆｆｉｃｉｌｅ感染症（ＣＤＩ）の治療のために使用されてきた。ＦＭＴはまた、Ｅ．ｃｏｌｉおよびバンコマイシン耐性Ｅｎｔｅｒｏｃｏｃｃｉ（ＶＲＥ）のような他の腸感染因子の治療にも提案されている。ＦＭＴは、均質化された便、もしくはクロストリジウム綱などの培養便成分のいずれかの形態で、結腸鏡、浣腸を通して、または経鼻空腸チューブを介して、ヒト微生物叢を注入することを必然的に伴い、結腸内に移植し、それによって病原性細菌、例えばＣ．ｄｉｆｆｉｃｉｌｅを置換または根絶する。
【０００６】
パーキンソン病（ＰＤ）は、動作に影響を与える神経系の慢性進行性障害である。ＰＤは、脳の黒質領域内の神経細胞が失われたときに発症し、神経伝達物質ドーパミンの有効性を減少させる。ドーパミンレベルは、腸内でも減少し得る。米国ではおよそ１００万人がＰＤを抱えて生きている。ＰＤは、通常、６０歳ぐらいで発症し、加齢に伴ってそのリスクが増加する。男性は、女性よりもＰＤを発症する可能性が高い。ＰＤの家族歴ならびに除草剤および殺虫剤への継続的な曝露により、人へのリスクが高まる場合がある。
【０００７】
ＰＤは、硬直または動作緩慢を引き起こす。ＰＤは、緩やかに発症し、手の微動または口蓋化したもしくは不明瞭な発話の発症によって症状が始まることが多い。患者は、姿勢動揺も患う。消化管症状には、嘔吐または腫脹の感覚、排泄困難、および便秘が含まれる。
【０００８】
ＰＤの重症度は、軽度、中程度、または進行として分類することができる。ＰＤの軽度期では、患者は、振戦、顔表情の変化、および微動症状の可能性を示す。中程度期では、患者は、動作の緩慢化、平衡感覚の異常、および足が地面に「くっつく」ような感覚を有する事例を含む動作の症状を体の両側で示す場合がある。ＰＤの進行期では、歩行が困難になり、幻覚および妄想が顕著になる。
【０００９】
現在のところ、ＰＤに対する治療法は存在しないが、症状を管理するための治療選択肢はある。ＰＤを治療するために使用されるいくつかの医薬品は、人の脳内のドーパミンを増加または置換する。外科手術を使用して、脳の領域を調整し、症状を改善することができる。現在の治療は、ＰＤの症状のうちのいくつかを軽減することはできるが、様々な効果を有し、かつ望ましくない副作用を伴う。加えて、これらの治療に対する患者の応答は、多くの場合経時的に減少する。したがって、投与がより容易なＰＤおよび関連する障害に対するより効果的な治療のためのさらなる薬物または治療に対する医療的必要性は満たされていない。
【発明の概要】
【００１０】
本開示は、ＰＤを治療または予防するための組成物、方法、および投与計画を提供する。
【００１１】
一態様では、本開示は、ＰＤの治療を、それを必要とする対象において行うための方法であって、生きた非病原性糞便細菌または滅菌糞便ろ液を含むか、またはそれに由来する薬学的に活性な用量の治療用組成物を対象に投与することを含む、方法を提供する。一態様では、滅菌糞便ろ液は、ドナーの便に由来する。別の態様では、滅菌糞便ろ液は、培養された微生物に由来する。
【００１２】
別の態様では、本開示は、ＰＤを治療するための医薬品の製造における、生きた非病原性糞便細菌を含む組成物の使用を提供する。
【００１３】
一態様では、本開示は、ＰＤの治療を、それを必要とする対象において行うための方法であって、非病原性の生きた合成細菌混合物、または非病原性の生きた精製もしくは抽出糞便微生物叢を含む薬学的に活性な用量の治療用組成物を対象に経口投与することを含み、用量が、少なくとも３、８、１０、または２０週間連続して、１日に少なくとも１回もしくは２回または１週間に少なくとも１回もしくは２回の投与スケジュールで投与される、方法を提供する。
【００１４】
一態様では、本開示は、ＰＤの治療を、それを必要とする対象において行うための方法であって、液体、凍結、凍結乾燥、またはカプセル封入滅菌糞便ろ液を含む薬学的に活性な用量の治療用組成物を対象に経口投与することを含み、用量が、少なくとも３、８、１０、または２０週間連続して、１日に少なくとも１回もしくは２回または１週間に少なくとも１回もしくは２回の投与スケジュールで投与される、方法を提供する。
【００１５】
一態様では、ある方法は、少なくとも約８０％のＰＤの寛解率、治癒率、奏効率、または解消率を達成する。一態様では、本開示は、振戦、動作の緩慢化（動作緩慢）、筋肉の硬直、姿勢およびバランスの障害、自動動作の喪失、発話の変化、ならびに筆跡の変化からなる群から選択される１つ以上のＰＤ症状を除去または減少させる方法を提供する。
【００１６】
ある態様では、治療用組成物中の糞便微生物叢は、ドナーの実質的にすべての非選択的な糞便微生物叢、再構成糞便材料、または合成糞便材料を含む。
【発明を実施するための形態】
【００１７】
本明細書において別途定義されていない限り、用語は、関連技術分野の当業者による従来の用法に従って理解されるものとする。
【００１８】
本明細書で使用される場合、「治療する」という用語は、（ｉ）疾患、障害、もしくは症状を完全にもしくは部分的に阻害すること、例えばその発症を阻止すること、（ｉｉ）疾患、障害、もしくは症状を完全にもしくは部分的に軽減すること、例えば疾患、障害、および／もしくは症状の後退を引き起こすこと、または（ｉｉｉ）疾患、障害、および／もしくは症状にかかりやすい場合があるが、まだそれに罹っていると診断されていない患者に疾患、障害、もしくは症状が発症するのを完全にもしくは部分的に予防することを指す。同様に、「治療」とは、治療療法および予防対策または予防的対策の両方を指す。
【００１９】
本明細書で使用される場合、「治療有効量」または「薬学的に活性な用量」とは、指定された疾患、障害、または症状を治療するのに有効である組成物の量を指す。
【００２０】
本明細書で使用される場合、「微生物叢」および「細菌叢」とは、真核生物、アーキア、細菌、およびウイルス（細菌ウイルス（すなわち、ファージ）を含む）を持続的および一時的の両方で対象の体内に、または体表に住んでいる微生物の群集を指す。非選択的な糞便微生物叢とは、選択なしのドナーの糞便試料に由来する糞便微生物の群集または混合物を指し、このような糞便試料中に見られる微生物成分および微生物群集構造に実質的に類似している。
【００２１】
本明細書で使用される場合、「滅菌糞便ろ液」または「非細胞性糞便ろ液」とは、糞便材料の液体成分を指し、液体成分は、細胞に基づく生きた微生物（例えば、細菌、真菌、またはそれらの胞子）を含まないか、または実質的に含まないが、バクテリオファージおよび非細胞性生物学的物質を保持している。好ましくは、非細胞性または滅菌糞便ろ液は、真核生物宿主細胞に対するウイルスも含まない。
【００２２】
本明細書で使用される場合、「寛解率、治癒率、または解消率」とは、所与の治療に応じて、治癒しているか、または症状の寛解もしくは完全な解消が得られる患者の割合を指す。ＰＤの寛解、治癒、または解消とは、本明細書に記載される治療を受ける前の患者に現れた１つ以上の症状の完全な停止を指す。このような症状には、振戦、動作の緩慢化（動作緩慢）、筋肉の硬直、姿勢およびバランスの障害、自動動作の喪失、発話の変化、ならびに筆跡の変化が含まれる可能性があるが、これらに限定されない。前述の症状の各々を以下にさらに説明する。
●振戦。振戦、または揺れは、通常、手足、多くは患者の手または指で始まる。患者は、丸薬丸め振戦として知られる、自身の親指および人差し指を前後にこすることを経験し得る。パーキンソン病の１つの特性は、リラックスしたとき（休息時）の患者の手の振戦である。
●動作の緩慢化（動作緩慢）。経時的に、パーキンソン病は、患者の動作能力を減少させ、患者の動作を緩慢にし、単純な作業を困難で時間のかかるものにする場合がある。歩行時の患者の歩幅が短くなる場合があるか、または椅子から立ち上がるのが困難に感じる場合がある。また、患者は、歩行しようとすると自身の脚を引きずり、移動が困難になる場合がある。
●筋肉の硬直。筋硬直は、患者の体のあらゆる部分に生じ得る。筋硬直は、患者の動作範囲を制限し、痛みをもたらす可能性がある。
●姿勢およびバランスの障害。パーキンソン病の結果として、患者の姿勢が前かがみになる場合があり、または患者はバランスの問題を有する場合がある。
●自動動作の喪失。パーキンソン病では、患者は、まばたき、微笑、歩行時の自身の腕の振りを含む、無意識の動作を行う能力の減少を有する場合がある。
●発話の変化。パーキンソン病の結果として、患者は発話の問題を有し得る。患者は、口蓋化して発音するか、早口で話すか、不明瞭に発音するか、または発話前に躊躇する場合がある。患者の発話は、通常の抑揚を有するものではなく単調であり得る。
●筆跡の変化。書くことが困難になる可能性があり、患者の筆跡が小さくなる場合がある。
【００２３】
本明細書で使用される場合、「奏効率(response rate)」とは、所与の治療で肯定的な応答（例えば、１つ以上の症状の重症度または頻度の減少）を示す患者の割合を指す。
【００２４】
本明細書で使用される場合、ＰＤ患者の病期分類は、表１に要約されたＨｏｅｈｎ＆Ｙａｈｒの病期分類に従っている（Ｈｏｅｈｎ  ＭＭ，Ｙａｈｒ  ＭＤ，Ｐａｒｋｉｎｓｏｎｉｓｍ：ｏｎｓｅｔ，ｐｒｏｇｒｅｓｓｉｏｎ  ａｎｄ  ｍｏｒｔａｌｉｔｙ．Ｎｅｕｒｏｌｏｇｙ  １９６７，１７：４２７−４２）も参照されたい）。
【表１】
2020513018.tif 000002
【００２５】
本明細書で使用される場合、「統一パーキンソン病評価スケール」または「ＵＰＤＲＳ」とは、ＰＤの経時的経過をたどる評価ツールを指し、ＰＤ症状のレベルまたは重症度を表す（表２）。ＵＰＤＲＳは、３つの部分を有する試験からなる。これは、１）精神機能、行動、および気分の節、２）日常生活活動（ＡＤＬ）の節、ならびに３）運動の節から構成される。Ｉ部、ＩＩ部、およびＩＩＩ部の試験には、合計３１個の項目が含まれる。各項目は、０〜４の範囲のスコアを受け、０は障害の不存在を表し、４は最高度の障害を表す。各研究訪問でのＩ部、ＩＩ部、およびＩＩＩ部の合計は、ＵＰＤＲＳの総スコアを提供する。合計１９９点の得点が可能である。１９９は最悪（合計）の身体障害を表し、０は身体障害がない。ＵＰＤＲＳは、本明細書に記載される治療中の有効性変数の基線からの変化を測定するために使用される。
【表２−１】
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【表２−２】
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【表２−３】
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【表２−４】
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【表２−５】
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【表２−６】
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【表２−７】
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【００２６】
本明細書で使用される場合、「症候的抗パーキンソン病療法」とは、非糞便微生物叢に基づく治療を指す。このような治療の例としては、ブロモクリプチン、ベンズトロピン、レボドパ、ロピニロール、プラミペキソール、ロチゴチン、カベルゴリン、エンタカポン、トルカポン、アマンタジン(amantidine)、およびセレギリンのうちのいずれかが挙げられる。
【００２７】
本明細書で使用される場合、「ＰＤの進行速度を減少させる」とは、本明細書に提供される治療を経時的に受けていないＰＤ患者が経験する悪化と比較して、例えば、ＵＰＤＲＳスコアによって数量化されるような、ＰＤ患者が経験する悪化を減少させることを意味する。
【００２８】
本明細書で使用される場合、「症候的抗パーキンソン病療法についての必要性を遅らせる」とは、糞便微生物叢に基づく治療を受けていない患者と比較して、糞便微生物叢に基づく治療を受けているＰＤ患者に対する症候的抗パーキンソン病療法についての必要性を遅らせることを意味する。
【００２９】
本明細書で使用される場合、「ＰＤの初期の兆候」とは、以下のうちの１つ以上を指す。
ａ）休息時の片手の４〜８Ｈｚのピル・ローリング振戦、
ｂ）休息時に最大であり、動作中には減少し、睡眠中は存在しない振戦、
ｃ）硬直および動作の緩慢化（動作緩慢）、動作の減少（運動機能低下）、ならびに動作の開始の困難（無動）、
ｄ）顔が仮面のようになり、口が開き、まばたきが減少し、憂うつと混同される可能性がある、
ｅ）姿勢が前かがみになる、
ｆ）歩行の開始の困難、歩幅が短く、脚を引きずるような歩行になる、大股とともに腕を振らずに腰に対して腕を曲げて保持する、
ｇ）歩行が時折思わず早くなる、患者が時折倒れないように駆け出す（加速歩行）、
ｈ）姿勢反射の喪失から生じる、重心が移動したときに前方（推進力）または後方（逆行推進力）に倒れる傾向、
ｉ）発話不全になる、特徴的な単調さ、口ごもる構音障害、
ｊ）運動機能低下および遠位筋の制御障害により、小字症および日常生活活動の困難の増加がもたらされる、
ｋ）低頻度のまばたきおよび顔表情の喪失、
ｌ）動作の減少、
ｍ）姿勢反射の障害、および／または
ｎ）特徴的な歩行異常。
【００３０】
本明細書で使用される場合、「早期のＰＤ患者」とは、Ｈｏｅｈｎ＆Ｙａｈｒによって定義される、症候的抗パーキンソン病療法を必要としない、パーキンソン病のＩ期またはＩＩ期のＰＤ患者である。好ましくは、そのようなＰＤ患者は、少なくともその後の９か月間、症候的抗パーキンソン病療法を必要としない。早期のＰＤ患者は、関連する試験を行うことなどによって特定される場合がある。
【００３１】
本明細書で使用される場合、「真核生物」とは、核および膜結合細胞小器官を含む細胞に属することを指す。
【００３２】
本明細書で使用される場合、「細菌（ｂａｃｔｅｒｉａ）」、「細菌（ｂａｃｔｅｒｉｕｍ）」、および「アーキア」とは、膜結合核を欠き、細胞小器官を欠く単細胞原核生物を指す。
【００３３】
本明細書で使用される場合、「コロニー形成単位」（ｃｆｕ）とは、所与の試料中の生存能力のある微生物細胞の数の推定値を指す。
【００３４】
本明細書で使用される場合、「生存能力のある」とは、増殖する能力を保有していることを意味する。
【００３５】
本明細書で使用される場合、「糞便細菌」とは、糞便物質中に存在し得る細菌を指す。
【００３６】
本明細書で使用される場合、「単離される」または「精製される」とは、（１）最初に生成されたときに付随した（自然界において、または実験現場においてに関係なく）成分のうちの少なくともいくつかの成分から分離され、かつ／または（２）人の手で生成、調製、精製、および／もしくは製造された細菌または他の実体もしくは物質を指す。単離または精製された細菌は、細菌に最初に付随した他の成分の少なくとも約１０％、約２０％、約３０％、約４０％、約５０％、約６０％、約７０％、約８０％、約９０％、またはそれ以上から分離することができる。
【００３７】
本明細書で使用される場合、「細菌毒性」活性または細菌には、病原性細菌細胞などの細菌細胞を殺滅する能力が含まれる。「細菌毒性」活性または細菌には、病原性細菌細胞などの細菌細胞の成長、代謝、および／または増殖を部分的または完全に阻害する能力が含まれる。
【００３８】
本明細書で使用される場合、細菌または任意の他の微生物もしくは実体を指す「病原体」および「病原性」という用語には、当該微生物または実体を含む宿主微生物の疾患、障害、もしくは症状を引き起こし得る、または疾患、障害、もしくは症状に影響を及ぼし得る任意のこのような微生物または実体が含まれる。
【００３９】
本明細書で使用される場合、「胞子」または「胞子」の群集には、一般的に生存能力があり、同じ細菌の栄養型よりも熱および殺菌剤のような環境影響に対してより耐性があり、典型的に、発芽および成長が可能な細菌（または他の単細胞微生物）が含まれる。「胞子形成体」または「胞子を形成することができる」細菌とは、好適な環境条件下で胞子を生成する遺伝子および他の必要な能力を含む細菌である。
【００４０】
本明細書で使用される場合、２種類以上の細菌の「組み合わせ」には、同じ材料中、もしくは生成物中のいずれか、または物理的に結合した生成物中の２種類の細菌の物理的共存、ならびに２種類の細菌の一時的な同時投与または同時局在化が含まれる。
【００４１】
本明細書で使用される場合、「対象」とは、ヒト、実験室動物（例えば、霊長類、ラット、マウス）、家畜（例えば、ウシ、ヒツジ、ヤギ、ブタ、シチメンチョウ、ニワトリ）、および家庭用ペット（例えば、イヌ、ネコ、げっ歯類など）を含む任意の動物対象を指す。対象または患者は、健康であり得るか、または消化管病原体による感染症に罹患している可能性があるか、または消化管病原体による感染症を発症するリスクがあるか、もしくは他人に伝染するリスクがある可能性がある。
【００４２】
本明細書で使用される場合、「シャノン多様性指数」とは、以下の数式を使用して、所与の群集に存在する種の存在量および均一性を説明する多様性指数を指しており、
【数１】
2020513018.tif 000010
式中、Ｈは、シャノン多様性指数であり、Ｒは、群集中の種の総数であり、ｐｉは、ｉ番目の種から構成されるＲの割合である。値がより大きくなることは、多様で均等に分布している群集であることを示しており、値が０であることは、１つの種のみが所与の群集中に存在していることを示している。詳細については、Ｓｈａｎｎｏｎ  ａｎｄ  Ｗｅａｖｅｒ，（１９４９）Ｔｈｅ  ｍａｔｈｅｍａｔｉｃａｌ  ｔｈｅｏｒｙ  ｏｆ  ｃｏｍｍｕｎｉｃａｔｉｏｎ．Ｔｈｅ  Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ  ｏｆ  Ｉｌｌｉｎｏｉｓ  Ｐｒｅｓｓ，Ｕｒｂａｎａ．１１７ｐｐ．を参照されたい。
【００４３】
本明細書で使用される場合、「抗生物質」とは、細菌を殺滅することにより、細菌の成長を阻害することにより、または細菌の生存能力を減少させることにより、細菌感染を治療および／または予防するために使用される物質を指す。
【００４４】
本明細書で使用される場合、「間欠的な投与スケジュール」とは、治療用組成物が、所定の期間（治療期間）にわたって投与されることを意味しており、この所定の期間の後に、所定の期間が続き、この所定の期間では、このような治療用組成物による治療が差し控えられる（休息期間）ことを意味する。間欠的投与計画は、数日間または数週間の治療期間／数日間または数週間の休息期間として表すことができる。例えば、４／１間欠的な投与スケジュールとは、治療期間が４週間／４日間で休息期間が１週間／１日間である間欠的な投与スケジュールを指す。
【００４５】
本明細書で使用される場合、「連続的な投与スケジュール」とは、治療用組成物が休息期間なしで治療期間中に投与される投与スケジュールを指す。連続的な投与スケジュールの治療期間全体を通じて、治療用組成物は、例えば、毎週、毎日、または１日おきに、または３日おきに投与することができる。治療用組成物が投与される日には、治療用組成物は当日全体を通じて、単回投与または複数回投与で投与することができる。
【００４６】
本明細書で使用される場合、「投与頻度」とは、投与量の治療用組成物を所与の時間内に投与する頻度を指す。投与頻度は、所定時間当たりの投与回数、例えば１日１回、１週間に１回、または２週間に１回として表すことができる。
【００４７】
本明細書で使用される場合、「投与間隔」とは、対象に投与される複数回の投与間に経過する時間の長さを指す。
【００４８】
ＰＤは、中枢神経系の退化性障害である。ＰＤは、突発性パーキンソニズムまたは突発性パーキンソン病としても知られている。疾患の原因はいまだ分かっていないが、脳の黒質内の神経細胞の障害として現れ、神経伝達物質であるドーパミンの生成の不足をもたらす。ドーパミンレベルの減少により、脳内の不規則な神経発火を介して動作障害が引き起こされる可能性がある。ＰＤに付随する主な運動障害には、振戦、硬直、動作緩慢、および姿勢動揺が含まれる。
【００４９】
パーキンソン病に対する現在の薬品治療は、ドーパミンを模倣するか、または体内のドーパミンレベルを増加させるかのいずれかである、ドーパミン作用薬に焦点を当てている。最も一般的な治療は、レボドパであり、これはドーパミンの代謝前駆物質である。しかしながら、長期のレボドパ治療は、突然の不随意動作である運動障害を伴うことが多い。加えて、長期のレボドパ治療により「オン−オフ」効果を発症し、患者は「オン」時間中、正常な動作を経験し、「オフ」時間中、ＰＤ関連の運動障害に戻る。レボドパ治療が進むにつれて、これらの副作用が増加し、「オフ」時間がより長く続く。他のドーパミン作用薬、抗コリン作用薬、および／またはアマンタジンも、単独で、またはレボドパ治療と組み合わせてのいずれかで使用される。
【００５０】
脳深部刺激などの外科手技も、パーキンソン病の症状を軽減するために用いられてきた。最近の研究では、脳の特定の領域がＰＤにおいて活動過多であり、ＰＤ振戦の原因となっている可能性があり、マウスモデルおよびヒトにおけるＰＤの症状を改善するために、皮質刺激が提案されている。
【００５１】
ＧＩ消化管の多くの慢性疾患および障害が、それらの基礎的な病的状態（例えば、ＰＤ）として慢性感染症／蔓延を有する。一態様では、本開示は、ＧＩ消化管における「異常な」細菌叢の存在に関連する様々な疾患状態（例えば、ＰＤ）の治療および／または予防のための、糞便微生物叢、それに由来する１つ以上の微生物種、それに由来する活性断片または成分の使用を含み、これに関する。細菌の活性断片は、細菌の活性断片および細菌から分泌されたタンパク質を調製／同定するための任意の既知の方法によって、そのような細菌から単離された任意の活性分子とすることができる。そのような方法としては、超音波処理、浸透圧衝撃、洗浄剤の溶解、高圧、以前に記載されているように、次に飼料添加物として使用される細菌、植物、または動物などの他の微生物への適切なＤＮＡの移植が挙げられるが、これらに限定されない。一態様では、細菌の活性断片もしくは成分は、ミコレートもしくはそれらの派生物、多糖類、リポグリカン、低分子ペプチド、チオペプチド、タンパク質、核酸分子、代謝物、細胞壁成分、またはこれらの任意の組み合わせからなる群から選択される。一態様では、活性断片は、タンパク質または分泌物である。別の態様では、活性断片は、分泌されたタンパク質である。
【００５２】
一態様では、本開示は、それを必要とする対象においてＰＤを治療するための方法であって、生きた非病原性糞便細菌および／または滅菌糞便ろ液を含む薬学的に活性な用量の治療用組成物を対象に経口投与することを含む、方法を提供する。別の態様では、本開示は、ＰＤを治療するための医薬品の製造における、生きた非病原性糞便細菌および／または滅菌糞便ろ液を含む組成物の使用を提供する。
【００５３】
一態様では、治療用組成物は、単離または精製された生きた非病原性糞便細菌の群集を含む。一態様では、治療用組成物は、非選択的な糞便微生物叢を含む。別の態様では、治療用組成物は、非選択的で実質的に完全な糞便微生物叢を含む。別の態様では、治療用組成物は、全範囲の糞便微生物叢を含む。一態様では、糞便微生物叢に基づく治療に加えて、ある方法は、症候的抗パーキンソン病療法を、同時に、または順次に、患者に投与することをさらに含む。別の態様では、糞便微生物叢に基づく治療に加えて、ある方法は、ブロモクリプチン、ベンズトロピン、レボドパ、ロピニロール、プラミペキソール、ロチゴチン、カベルゴリン、エンタカポン、トルカポン、アマンタジン、セレギリン、またはこれらの組み合わせを、同時に、または順次に、患者に投与することをさらに含む。
【００５４】
一態様では、本明細書に記載される糞便微生物叢に基づくＰＤ療法は、レボドパ（カルビドパを含むか、または含まない）、ドーパミンアゴニスト（ＤＡ）、ドーパミンを不活性化する酵素の阻害剤（ＭＡＯ  Ｂ阻害剤およびＣＯＭＴ阻害剤）、抗コリン作用薬、アマンタジン、およびエストロゲンからなる群から選択される別の治療と組み合わされて、連続的に、同時に、または順次に、使用される。さらなる態様では、本明細書に記載される糞便微生物叢に基づく治療は、レボドパ、モノアミンオキシダーゼＢ（ＭＡＯ  Ｂ）阻害剤（例えば、セレギリンおよびラサギリン）、ドーパミンアゴニスト（例えば、注射によって与えられるブロモクリプチン、プラミペキソール、ロピニロール、経皮性ロチゴチン、およびアポモルヒネ）、カテコール−Ｏ−メチルトランスフェラーゼ（ＣＯＭＴ）阻害剤（例えば、トルカポンおよびエンタカポン）、抗コリン性医薬品（例えば、トリヘキシフェニジル、ベンズトロピン、オルフェナドリン、プロシクリジン、およびビペリデン）、アマンタジンからなる群から選択される１つ以上の薬物と組み合わされて使用される。
【００５５】
一態様では、本開示は、振戦、動作の緩慢化（動作緩慢）、筋肉の硬直、姿勢およびバランスの障害、自動動作の喪失、発話の変化、ならびに筆跡の変化からなる群から選択される１つ以上のＰＤ症状を除去または減少させる方法を提供する。別の態様では、本開示は、１つ以上の初期のＰＤ症状を除去、改善、軽減、または減少させる方法を提供する。別の態様では、本明細書に提供される治療方法は、１つ以上の非運動ＰＤ症状、例えば、憂うつ、睡眠障害、認知症、精神病、および幻覚を減少、軽減、または制御することができる。
【００５６】
さらなる態様では、本明細書に提供される治療方法は、振戦、動作緩慢、硬直、および姿勢動揺からなる群から選択される１つ以上のＰＤの一時的な運動症状を減少、軽減、または制御することができる。別の態様では、本明細書に提供される治療方法は、すくみ足歩行、小字症（手書きの縮み）、仮面様表情（人の顔が通常より表情が少ないように見える場合がある）、不要な加速、前かがみの姿勢（前方に傾く傾向）、筋緊張症、細かい運動の機敏性および運動協調性の障害、粗大運動協調性の障害、動作の不足（腕の振りの減少）、静止不能、発話の問題（筋肉制御の喪失によって引き起こされる声の口蓋化または不明瞭な発話など）、嚥下困難、性機能障害、けいれん、ならびに嚥下動作の減少から生じるよだれおよび過度の唾液からなる群から選択される１つ以上のＰＤの二次的な運動症状を減少、軽減、または制御することができる。別の態様では、本明細書に提供される治療方法は、ＰＤ患者における以下のものからなる群から選択される１つ以上の症状を減少、軽減、または制御することができる。
●嗅覚の喪失、便秘
●ＲＥＭ行動障害（睡眠障害）
●気分障害
●起立性低血圧（起立時の低血圧）
●睡眠障害
●便秘
●膀胱の問題
●性的問題
●過度の唾液
●体重減少または増加
●視覚および歯科の問題
●疲労および活力の喪失
●憂うつ
●心配および不安
●皮膚の問題
●記憶の困難、思考の緩慢化、混乱、および場合によっては、痴呆などの認知の問題、ならびに
●衝動的行動などの医薬品の副作用
【００５７】
一態様では、本明細書に記載されるＰＤ療法は、吐き気、眠気、めまい、頭痛、嘔吐、口の乾燥、眼のかすみ、便秘、膀胱を空にすることの困難、発汗の障害、および頻脈、起立後の低血圧、混乱、幻覚、妄想、動揺、下腿および足の腫れ、足首の腫れ、運動障害、尿の褐変、ならびに精神病からなる群から選択される１つ以上の副作用を含まないか、またはこれらを実質的に含まない。
【００５８】
一態様では、本明細書で治療される患者は、７〜１０日の広範囲の経口抗菌療法で前治療される。一態様では、単剤抗生物質計画を使用する。別の態様では、多剤抗生物質計画を使用する。例示的な抗生物質計画としては、（ａ）シプロフロキサシンおよびメトロニダゾール、（ｂ）トリメトプリム・スルファメトキサゾール合剤およびメトロニダゾール、（ｃ）モキシフロキサシン、（ｄ）アモキシシリン／クラブラン酸が挙げられる。さらなる例示的な構成物質としては、ピペラシリン／タゾバクタム、アンピシリン／スルバクタム、チカルシリン／クラブラン酸、イミペネム、メロペネム、チゲサイクリン（重度のペニシリンアレルギーが懸念される場合）が挙げられる。別の態様では、多剤計画は、メトロニダゾール、ならびにセフトリアキソン、セフォタキシム、シプロフロキサシン、およびレボフロキサシンなどの第３世代のセファロスポリンまたはフルオロキノロンからなり得る。
【００５９】
一態様では、本開示は、、それを必要とする対象においてＰＤを治療するための方法であって、生きた非病原性糞便細菌を含む薬学的に活性な用量の治療用組成物を対象に投与することを含む、方法を提供する。一態様では、本開示は、それを必要とする対象においてＰＤを治療するための方法であって、生きた非病原性糞便細菌を含む薬学的に活性な用量の治療用組成物を、毎日または毎週、対象に投与することを含む、方法を提供する。一態様では、治療用組成物を、それを必要とするＰＤ患者に、少なくとも２日間または２週間連続して、１日に少なくとも１回または１週間に少なくとも１回投与する。一態様では、治療用組成物を、少なくとも３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、もしくは１５日間または３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、もしくは１５週間連続して、１日に少なくとも１回または１週間に少なくとも１回投与する。別の態様では、治療用組成物を、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、または１２週間連続して、１日に少なくとも１回または１週間に少なくとも１回投与する。一態様では、治療用組成物を、最大で４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、もしくは２０日間または４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、もしくは２０週間連続して、１日に少なくとも１回または１週間に少なくとも１回投与する。別の態様では、治療用組成物を、最大で１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、もしくは１２週間または１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、もしくは１２か月間連続して、１日に少なくとも１回または１週間に少なくとも１回投与する。さらなる態様では、治療用組成物を、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、もしくは１２か月間または１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、もしくは１２年間連続して、少なくとも１回、対象の全寿命にわたって慢性的に投与するか、または無期限に投与する。
【００６０】
一態様では、治療用組成物を、それを必要とするＰＤ患者に、少なくとも２日間または２週間連続して、１日に少なくとも２回または１週間に少なくとも２回投与する。一態様では、治療用組成物を、少なくとも３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、もしくは１５日間または３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、もしくは１５週間連続して、１日に少なくとも２回または１週間に少なくとも２回投与する。別の態様では、治療用組成物を、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、または１２週間連続して、１日に少なくとも２回または１週間に少なくとも２回投与する。一態様では、治療用組成物を、最大で４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、もしくは２０日間または４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、もしくは２０週間連続して、１日に少なくとも２回または１週間に少なくとも２回投与する。別の態様では、治療用組成物を、最大で１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、もしくは１２週間または１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、もしくは１２か月間連続して、１日に少なくとも２回または１週間に少なくとも２回投与する。さらなる態様では、治療用組成物を、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、もしくは１２か月間または１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、もしくは１２年間連続して、少なくとも２回、対象の全寿命にわたって慢性的に投与するか、または無期限に投与する。
【００６１】
一態様では、治療用組成物を、それを必要とするＰＤ患者に、少なくとも２日間または２週間連続して、１日に少なくとも３回または１週間に少なくとも３回投与する。一態様では、治療用組成物を、少なくとも３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、もしくは１５日間または３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、もしくは１５週間連続して、１日に少なくとも３回または１週間に少なくとも３回投与する。別の態様では、治療用組成物を、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、または１２週間連続して、１日に少なくとも３回または１週間に少なくとも３回投与する。一態様では、治療用組成物を、最大で４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、もしくは２０日間または、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、もしくは２０週間連続して、１日に少なくとも３回または１週間に少なくとも３回投与する。別の態様では、治療用組成物を、最大で１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、もしくは１２週間または１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、もしくは１２か月間連続して、１日に少なくとも３回または１週間に少なくとも３回投与する。さらなる態様では、治療用組成物を、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、もしくは１２か月間または１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、もしくは１２年間連続して、少なくとも３回、対象の全寿命にわたって慢性的に投与するか、または無期限に投与する。
【００６２】
一態様では、本開示は、それを必要とする対象においてＰＤを治療するための方法であって、非病原性の生きた合成細菌混合物、または非病原性の生きた精製もしくは抽出糞便微生物叢を含む薬学的に活性な用量の治療用組成物を対象に経口投与することを含み、用量が、少なくとも３日間もしくは３週間連続して、１日に少なくとも１回もしくは２回または１週間に少なくとも１回もしくは２回の投与スケジュールで投与される、方法を提供する。別の態様では、ある用量は、１〜１２週間、２〜１２週間、３〜１２週間、４〜１２週間、５〜１２週間、６〜１２週間、７〜１２週間、８〜１２週間、９〜１２週間、１０〜１２週間、１〜２週間、２〜３週間、３〜４週間、４〜５週間、５〜６週間、６〜７週間、７〜８週間、８〜９週間、９〜１０週間、または１０〜１１週間の期間にわたって、１日に少なくとも１回、２回、もしくは３回または１日に少なくとも１回、２回、もしくは３回投与される。
【００６３】
一態様では、本開示は、それを必要とする対象においてＰＤを治療するための方法であって、第１の投与スケジュールと、その後の第２の投与スケジュールと、を含む、方法を提供する。一態様では、第１の投与スケジュールは、治療用量または導入用量を含む。一態様では、第１の投与スケジュールは、連続的な投与スケジュールを含む。別の態様では、第２の投与スケジュールは、第１の投与スケジュールの薬学的に活性な用量以下の維持用量を含む。別の態様では、第２の投与スケジュールは、少なくとも約２、４、６、８、１０、１２、１８、２４、３６、４８、７２、または９６か月間続く。一態様では、第２の投与スケジュールは、治療される対象の全寿命にわたって、または無期限に永久に続く。一態様では、第２の投与スケジュールは、連続的な投与スケジュールである。別の態様では、第２の投与スケジュールは、間欠的な投与スケジュールである。さらなる態様では、第２の投与スケジュールは間欠的な投与スケジュールであり、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、または１４日間の治療期間を含み、その後に、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、または１４日間の休息期間が続く。別の態様では、第２の投与スケジュールは、１日おきに、２日おきに、または３、４、５、６、７、８日おきに、第２の用量（例えば、維持投与量）を投与することを含む。別の態様では、維持用量は、滴定を伴って、または伴わないで（または別様に、投与量もしくは投与スケジュールを変更しながら）長期間にわたって投与される。一態様では、第１の投与スケジュールと第２の投与スケジュールとの間の間隔は、少なくとも約１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、または１２週間である。別の態様では、第２の投与スケジュール（例えば、維持用量）は、第１の投与スケジュール（例えば、当初治療用量）で使用される投与量よりも、約２、５、１０、５０、１００、２００、４００、８００、１０００、５０００倍以上低い投与量を含む。別の態様では、第２の投与スケジュール（例えば、維持投与スケジュール）は、第１の投与スケジュール（例えば、当初治療投与スケジュール）以下の投与頻度を有する。別の態様では、第２の投与スケジュール（例えば、維持投与スケジュール）は、第１の投与スケジュール（例えば、当初治療投与スケジュール）よりも長い投与間隔を有する。
【００６４】
一態様では、ある方法において使用される第１の投与スケジュールまたは第２の投与スケジュールは、週に１回、週に２回、または週に３回とすることができる。「週に１回」という用語は、用量が１週間に１回、好ましくは各週の同じ曜日に投与されることを意味する。「週に２回」とは、用量が１週間に２回、好ましくは各週間の２つの同じ曜日に投与されることを意味する。「週に３回」とは、用量が１週間に３回、好ましくは各週間の３つの同じ曜日に投与されることを意味する。
【００６５】
一態様では、治療される対象は、既にＰＤを患っている対象である。遺伝的にＰＤにかかりやすいか、または罹患しやすい臨床的に無症候性のヒト対象への開示された治療用組成物の投与は、ＰＤの臨床的症状の発症を予防するためにも有用である。遺伝的にＰＤにかかりやすいか、または罹患しやすいヒト対象は、ＰＤを示すか、または罹患している身近な家族、または親類を有するヒト対象とすることができる。別の態様では、治療される対象は、ＰＤを予防するべき対象である。別の態様では、治療される対象は、ＰＤにかかりやすいか、またはＰＤに対する感受性が強い。別の態様では、治療される対象は、ＰＤを有すると診断された対象である。一態様では、治療される対象は、ＰＤ療法を必要とする患者である。別の態様では、治療される患者は、免疫無防備状態である。別の態様では、治療される患者は、ＰＤおよび消化管障害（例えば、慢性便秘、ＩＢＤ、ＩＢＳ、またはＣ．ｄｉｆｆ感染症）の両方を有する。
【００６６】
一態様では、治療される対象は、Ｉ期、ＩＩ期、ＩＩＩ期、ＩＶ期、またはＶ期のＰＤを有する。一態様では、本明細書に記載される方法は、ＰＤ患者の症状を改善して、患者のＰＤ病期分類を少なくとも１つまたは２つの病期だけ再分類される（例えば、ＩＩＩ期からＩＩ期へ、またはＩＩＩ期からＩ期へ）ようにすることができる。別の態様では、本明細書に記載される方法は、ＰＤ患者の症状の悪化を防止し、患者のＰＤ病期分類が同じままであるか、または悪化をより緩やかにすることができる。別の態様では、本明細書に記載される方法は、対象におけるＰＤの進行速度を減少させることができる。さらなる態様では、本明細書に記載される方法は、対象における症候的抗パーキンソン病療法の必要性を遅らせることができる。一態様では、患者は、パーキンソン病の１つ以上の早期の兆候と診断された後に、本明細書に記載される治療に供される。
【００６７】
一態様では、治療される対象はヒト患者である。一態様では、患者は男性患者である。一態様では、患者は女性患者である。一態様では、患者は早産(premuature)新生児である。一態様では、患者は正期産児である。一態様では、患者は新生児である。一態様では、患者は乳児である。一態様では、患者は幼児である。一態様では、患者は低年齢小児である。一態様では、患者は小児である。一態様では、患者は青年期の人である。一態様では、患者は小児科患者である。一態様では、患者は老年患者である。一態様では、ヒト患者は、約１８、１５、１２、１０、８、６、４、３、２、または１歳以下の未成年患者である。別の態様では、ヒト患者は成人患者である。別の態様では、ヒト患者は高齢患者である。さらなる態様では、ヒト患者は、約３０、３５、４０、４５、５０、５５、６０、６５、７０、７５、８０、８５、９０、または９５歳を超える患者である。別の態様では、患者は、約１〜５歳、２〜１０歳、３〜１８歳、２１〜５０歳、２１〜４０歳、２１〜３０歳、５０〜９０歳、６０〜９０歳、７０〜９０歳、６０〜８０歳、または６５〜７５歳である。一態様では、患者は、若い高齢患者（６５〜７４歳）である。一態様では、患者は、中程度の高齢患者（７５〜８４歳）である。一態様では、患者は、高齢の患者（８５歳を超える）である。
【００６８】
一態様では、ある方法は、治療用組成物を経口投与するか、浣腸剤で投与するか、または直腸坐剤を利用して投与することを含む。一態様では、本明細書において投与される治療用組成物は、腸溶性コーティング（および／または耐酸性）カプセルもしくはマイクロカプセルとして製剤化されるか、または食品、食品添加物、乳製品ベースの製品、大豆ベースの製品、もしくはこれらの派生物、ゼリー、風味のある液体、氷塊、アイスクリーム、もしくはヨーグルトの一部として製剤化されるか、またはこれらと一緒に投与される。別の態様では、本明細書において投与される治療用組成物は、耐酸腸溶性コーティングカプセルとして製剤化される。治療用組成物は、食品または飲料と組み合わせて、販売用の粉末として提供することができる。食品または飲料は、乳製品ベースの製品または大豆ベースの製品とすることができる。別の態様では、食品または栄養補助食品は、治療用組成物を含有する腸溶性コーティングおよび／または耐酸性マイクロカプセルを含む。
【００６９】
ある態様では、治療用組成物は液体培養物を含む。別の態様では、治療用組成物は凍結乾燥され、粉砕され、粉末化される。次に、治療用組成物を注入してもよく、例えば食塩水中に浣腸剤として溶解させてもよい。あるいは、粉末は、経口投与用の腸溶性コーティングおよび／または耐酸性カプセルとしてカプセル封入してもよい。これらのカプセルは、腸溶性コーティングおよび／または耐酸性マイクロカプセルの形態をとってもよい。粉末は、好ましくは、飲用するために再構成するための、または食品添加物として再構成するための口当たりの良い形態で提供することができる。さらなる態様では、食品はヨーグルトである。一態様では、粉末を再構成して、経鼻十二指腸注入を介して注入してもよい。
【００７０】
別の態様では、本明細書において投与される治療用組成物は、液体、凍結、凍結乾燥（ｆｒｅｅｚｅ−ｄｒｉｅｄ）状、噴霧乾燥、凍結乾燥（ｌｙｏｐｈｉｌｉｚｅｄ）状、または粉末形態である。さらなる態様では、本明細書において投与される治療用組成物は、遅延放出剤形または徐放性腸溶放出剤形として製剤化される。別の態様では、本明細書において投与される治療用組成物は、賦形剤、食塩水、緩衝剤、緩衝化剤、または流体−グルコース−セロビオース寒天（ＲＧＣＡ）培地を含む。別の態様では、本明細書において投与される治療用組成物は抗凍結剤を含む。一態様では、抗凍結剤は、ポリエチレングリコール、スキムミルク、エリトリトール、アラビトール、ソルビトール、グルコース、フルクトース、アラニン、グリシン、プロリン、スクロース、ラクトース、リボース、トレハロース、ジメチルスルホキシド（ＤＭＳＯ）、グリセロール、またはこれらの組み合わせを含む。
【００７１】
一態様では、本明細書において投与される治療用組成物は、酸抑制剤、制酸剤、Ｈ２拮抗薬、プロトンポンプ阻害剤、またはこれらの組み合わせをさらに含む。一態様では、本明細書において投与される治療用組成物は、非生体物質を実質的に含まない。別の態様では、本明細書において投与される治療用組成物は、残留繊維、ＤＮＡ、ウイルス外被材料、および生存不可能な材料からなる群から選択される無細胞物質を実質的に含まない。
【００７２】
一態様では、治療用組成物はまた、ポリオール、フルクトオリゴ糖（ＦＯＳ）、オリゴフルクトース、イヌリン、ガラクトオリゴ糖（ＧＯＳ）、キシロオリゴ糖（ＸＯＳ）、ポリデキストロース、単糖、タガトース、および／またはマンノオリゴ糖からなる群から選択されるプレバイオティクス栄養素も含むか、またはプレバイオティクス栄養素を用いて補充される。
【００７３】
一態様では、ある方法は、治療用細菌または微生物叢組成物を投与する前に、対象を抗生物質組成物で前治療することをさらに含む。一態様では、本明細書において投与される抗生物質組成物は、リファブチン、クラリスロマイシン、クロファジミン、バンコマイシン、リファンピシン、ニトロイミダゾール、クロラムフェニコール、およびこれらの組み合わせからなる群から選択される抗生物質を含む。別の態様では、本明細書において投与される抗生物質組成物は、リファキシミン、リファマイシン誘導体、リファンピシン、リファブチン、リファペンチン、リファラジル、ビコザマイシン、アミノグリコシド、ゲンタマイシン、ネオマイシン、ストレプトマイシン、パロモマイシン、ベルダマイシン、ムタマイシン、シソマイシン、ネチルマイシン、レチマイシン、カナマイシン、アズトレオナム、アズトレオナムマクロライド、クラリスロマイシン、ジリスロマイシン、ロキシトロマイシン、テリスロマイシン、アジスロマイシン、次サリチル酸ビスマス、バンコマイシン、ストレプトマイシン、フィダキソマイシン、アミカシン、アルベカシン、ネオマイシン、ネチルマイシン、パロモマイシン、ロドストレプトマイシン、トブラマイシン、アプラマイシン、およびこれらの組み合わせからなる群から選択される抗生物質を含む。さらなる態様では、ある方法は、治療用細菌または微生物叢組成物の投与前に、対象を抗炎症薬で前治療することをさらに含む。
【００７４】
一態様では、ある方法は、少なくとも約１０％、１５％、２０％、２５％、３０％、３５％、４０％、４５％、５０％、５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、または９９％のＰＤの寛解率、治癒率、奏効率、または解消率を達成する。一態様では、治療方法は、４、８、または１２週間の治療後に、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、または１１を超えるＵＰＤＲＳスコアの減少を達成する。別の態様では、治療方法は、治療の４、８、または１２週間後に、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、または１１を超えるＵＰＤＲＳスコアの減少を、患者集団の少なくとも１０％、２０％、３０％、５０％、６０％、７０％、８０％、または９０％の患者において達成する。一態様では、治療方法は、ベースライン（例えば、治療直前）と比較して、治療の４、８、または１２週間後にＵＰＤＲＳスコアの少なくとも１０％、２０％、３０％、５０％、６０％、７０％、８０％、または９０％の減少を達成する。一態様では、治療方法は、ベースライン（例えば、治療直前）と比較して、治療の４、８、または１２週間後にＵＰＤＲＳスコアの少なくとも１０％、２０％、３０％、５０％、６０％、７０％、８０％、または９０％の減少を、少なくとも１０％、２０％、３０％、５０％、６０％、７０％、８０％、または９０％の患者において達成する。ＵＰＤＲＳは、ＰＤの重症度を特徴付け、かつ数量化するための例として使用されているが、同様のまたは比較可能なシステム（例えば、ＭＤＳ−ＵＰＤＲＳ）も同様に使用することができる。ＵＰＤＲＳが言及されている本願のそれぞれの事例において、ＵＰＤＲＳの代わりに、別の同様の基準またはシステムを使用することができる。このような代わりとなるシステムには、例えば、ＵＰＤＲＳ身体障害スコア（ＵＤＳ）が含まれる（Ｍａｒｔｉｎｅｚ−Ｍａｒｔｉｎ  ｅｔ  ａｌ．，Ｎｅｕｒｏｌｏｇｉａ．２０００  Ｎｏｖ；１５（９）：３８２−７）。別の態様では、本明細書で言及されているＵＰＤＲＳスコアの減少は、ＵＰＤＲＳの総スコアの減少である。別の態様では、本明細書で言及されているＵＰＤＲＳスコアの減少は、１）精神状態、行動、および気分、２）日用生活活動（ＡＤＬ）、ならびに３）運動の節についてのサブスコアのうちのいずれか１つまたは２つの減少を指す。
【００７５】
一態様では、本明細書に記載される治療方法は、ＰＤ症状の改善の急激な発生を達成することができる。別の態様では、患者のＰＤ症状は、結腸鏡下送達または浣腸を利用した、５回以下の糞便微生物叢の注入の１週間後に改善する。別の態様では、ＰＤ患者は、本明細書に記載される１回の治療過程の後に、１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、または１５週間、治療の着手を行わなくとも、症状の改善を経験する。
【００７６】
別の態様では、ＰＤ患者は、糞便微生物叢の集中的な投与の誘導期と、その後のより集中的でない投与の維持期と、を含む、糞便微生物叢に基づく治療に供される。一態様では、誘導期は、結腸鏡下送達または浣腸を利用した、新鮮な糞便微生物叢の注入を含む。一態様では、誘導期は、結腸鏡下送達または浣腸を利用した、１〜２週間にわたる、５〜１０回の新鮮な糞便微生物叢の注入を含む。別の段階では、誘導期は、凍結乾燥されたドナー由来の非選択的な糞便微生物叢を含有する耐酸性／遅延放出カプセルを摂取することを含む。一態様では、維持期は、凍結乾燥されたドナー由来の非選択的な糞便微生物を含有するカプセルを摂取することを含む。さらなる態様では、維持期は、１日６回以上、４回以上、または２回以上のカプセルの摂取を含み、各カプセルは、約１０１０〜１０１３細胞総数を含む。さらなる態様では、維持期は、１日おきに６回以上、４回以上、または２回以上のカプセルの摂取を含み、各カプセルは、約１０１０〜１０１３細胞総数を含む。
【００７７】
一態様では、それぞれ約２００ｍｇの医薬組成物が、薬理学的に活性な用量を含む。一態様では、それぞれ約７５、１００、１２５、１５０、１７５、２００、２５０、３００、３５０、４００、４５０、５００、７５０、１０００、１５００、または２０００ｍｇの医薬組成物が、薬理学的に活性な用量を含む。
【００７８】
一態様では、薬学的に活性な用量または治療有効用量は、少なくとも約１０５、１０６、１０７、１０８、１０９、１０１０、１０１１、１０１２、１０１３、１０１４、または１０１５ｃｆｕを含む。別の態様では、薬学的に活性な治療有効用量は、最大で約１０５、１０６、１０７、１０８、１０９、１０１０、１０１１、１０１２、１０１３、１０１４、または１０１５ｃｆｕを含む。さらなる態様では、薬理学的に活性な治療有効用量は、１０８ｃｆｕ〜１０１４ｃｆｕ、１０９ｃｆｕ〜１０１３ｃｆｕ、１０１０ｃｆｕ〜１０１２ｃｆｕ、１０９ｃｆｕ〜１０１４ｃｆｕ、１０９ｃｆｕ〜１０１２ｃｆｕ、１０９ｃｆｕ〜１０１１ｃｆｕ、１０９ｃｆｕ〜１０１０ｃｆｕ、１０１０ｃｆｕ〜１０１４ｃｆｕ、１０１０ｃｆｕ〜１０１３ｃｆｕ、１０１１ｃｆｕ〜１０１４ｃｆｕ、１０１１ｃｆｕ〜１０１３ｃｆｕ、１０１２ｃｆｕ〜１０１４ｃｆｕ、および１０１３ｃｆｕ〜１０１４ｃｆｕからなる群から選択される。一態様では、医薬組成物は、前述の薬学的に活性な用量または治療有効用量を、約０．２、０．４、０．６、０．８、または１．０グラムの単位重量で、または０．２、０．４、０．６、０．８、または１．０ミリリットルの単位容積で含む。
【００７９】
一態様では、薬学的に活性な用量または治療有効用量は、少なくとも約１０５、１０６、１０７、１０８、１０９、１０１０、１０１１、１０１２、１０１３、１０１４、または１０１５個の細胞または胞子を含む。別の態様では、薬学的に活性な用量または治療有効用量は、最大で約１０５、１０６、１０７、１０８、１０９、１０１０、１０１１、１０１２、１０１３、１０１４、または１０１５個の総細胞または胞子を含む。さらなる態様では、薬理学的に活性な用量または治療有効用量は、１０８〜１０１４、１０９〜１０１３、１０１０〜１０１２、１０９〜１０１４、１０９〜１０１２、１０９〜１０１１、１０９〜１０１０、１０１０〜１０１４、１０１０〜１０１３、１０１１〜１０１４、１０１１〜１０１３、１０１２〜１０１４、および１０１３〜１０１４個の細胞または胞子からなる群から選択される。ある態様では、薬学的に活性な用量の細胞数または治療有効用量の細胞数は、生細胞に関するものである。一態様では、医薬組成物は、前述の薬学的に活性な用量または治療有効用量を、約０．２、０．４、０．６、０．８、または１．０グラムの単位重量で、または０．２、０．４、０．６、０．８、または１．０ミリリットルの単位容積で含む。ある態様では、薬学的に活性な用量または治療有効用量は、１０１０〜１０１２個の細胞を含む。別の態様では、薬学的に活性な用量または治療有効用量は、カプセル当たり１０１０〜１０１２個の細胞を含む。
【００８０】
一態様では、本明細書において投与される治療用組成物は糞便細菌を含む。一態様では、本明細書において投与される治療用組成物は、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ、Ｂａｃｉｌｌｕｓ、Ｃｏｌｌｉｎｓｅｌｌａ、Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ、Ｆｕｓｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ、Ｐｒｏｐｉｏｎｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ、Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ、Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉ、Ｇｅｍｍｉｇｅｒ、Ｄｅｓｕｌｆｏｍｏｎａｓ、Ｐｅｐｔｏｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ、Ｃｏｐｒｏｃｏｃｃｕｓ、Ｄｏｒｅａ、およびＭｏｎｉｌｉａからなる群から選択される１種類以上、２種類以上、３種類以上、４種類以上、または５種類以上の単離微生物、精製微生物、または培養微生物を含む。
【００８１】
一態様では、本明細書において投与される治療用組成物は、Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ  ｆｒａｇｉｌｉｓ  ｓｓｐ．ｖｕｌｇａｔｕｓ、Ｃｏｌｌｉｎｓｅｌｌａ  ａｅｒｏｆａｃｉｅｎｓ、Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ  ｆｒａｇｉｌｉｓ  ｓｓｐ．ｔｈｅｔａｉｏｔａｏｍｉｃｒｏｎ、Ｐｅｐｔｏｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ  ｐｒｏｄｕｃｔｕｓ  ＩＩ、Ｐａｒａｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ  ｄｉｓｔａｓｏｎｉｓ、Ｆｕｓｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｐｒａｕｓｎｉｔｚｉｉ、Ｃｏｐｒｏｃｏｃｃｕｓ  ｅｕｔａｃｔｕｓ、Ｃｏｌｌｉｎｓｅｌｌａ  ａｅｒｏｆａｃｉｅｎｓ  ＩＩＩ、Ｐｅｐｔｏｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ  ｐｒｏｄｕｃｔｕｓ  Ｉ、Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ  ｂｒｏｍｉｉ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ａｄｏｌｅｓｃｅｎｔｉｓ、Ｇｅｍｍｉｇｅｒ  ｆｏｒｍｉｃｉｌｉｓ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｌｏｎｇｕｍ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｓｉｒａｅｕｍ、Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ  ｔｏｒｑｕｅｓ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｒｅｃｔａｌｅ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｅｌｉｇｅｎｓ、Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ  ｅｇｇｅｒｔｈｉｉ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｌｅｐｔｕｍ、Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ  ｆｒａｇｉｌｉｓ  ｓｓｐ．Ａ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｂｉｆｏｒｍｅ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｒｅｃｔａｌｅ  ＩＩＩ−Ｆ、Ｃｏｐｒｏｃｏｃｃｕｓ  ｃｏｍｅｓ、Ｐｓｅｕｄｏｆｌａｖｏｎｉｆｒａｃｔｏｒ  ｃａｐｉｌｌｏｓｕｓ、Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ  ａｌｂｕｓ、Ｄｏｒｅａ  ｆｏｒｍｉｃｉｇｅｎｅｒａｎｓ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｖｅｎｔｒｉｏｓｕｍ  Ｉ、Ｆｕｓｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｒｕｓｓｉ、Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ  ｏｂｅｕｍ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｒｅｃｔａｌｅ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｒａｍｏｓｕｍ、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｌｅｉｃｈｍａｎｎｉｉ、Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ  ｃａｌｌｉｄｕｓ、Ｂｕｔｙｒｉｖｉｂｒｉｏ  ｃｒｏｓｓｏｔｕｓ、Ａｃｉｄａｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ  ｆｅｒｍｅｎｔａｎｓ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｖｅｎｔｒｉｏｓｕｍ、Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ  ｆｒａｇｉｌｉｓ  ｓｓｐ．ｆｒａｇｉｌｉｓ、Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ  ＡＲ、Ｃｏｐｒｏｃｏｃｃｕｓ  ｃａｔｕｓ、Ａｅｒｏｓｔｉｐｅｓ  ｈａｄｒｕｓ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｃｙｌｉｎｄｒｏｉｄｅｓ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｒｕｍｉｎａｎｔｉｕｍ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ＣＨ−１、Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ  ｅｐｉｄｅｒｍｉｄｉｓ、Ｐｅｐｔｏｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ  ＢＬ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｌｉｍｏｓｕｍ、Ｔｉｓｓｉｒｅｌｌａ  ｐｒａｅａｃｕｔａ、Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ  Ｌ、Ｆｕｓｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｍｏｒｔｉｆｅｒｕｍ  Ｉ、Ｆｕｓｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｎａｖｉｆｏｒｍｅ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｉｎｎｏｃｕｕｍ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｒａｍｏｓｕｍ、Ｐｒｏｐｉｏｎｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ａｃｎｅｓ、Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ  ｆｌａｖｅｆａｃｉｅｎｓ、Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ  ＡＴ、Ｐｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ  ＡＵ−１、Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ  ｆｒａｇｉｌｉｓ  ｓｓｐ．ｏｖａｔｕｓ、−ｓｓｐ．ｄ、−ｓｓｐ．ｆ；Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ  Ｌ−１、Ｌ−５；Ｆｕｓｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｎｕｃｌｅａｔｕｍ、Ｆｕｓｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｍｏｒｔｉｆｅｒｕｍ、Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉ、Ｇｅｍｅｌｌａ  ｍｏｒｂｉｌｌｏｒｕｍ、Ｆｉｎｅｇｏｌｄｉａ  ｍａｇｎｕｓ、Ｐｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ  Ｇ、−ＡＵ−２；Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ  ｉｎｔｅｒｍｅｄｉｕｓ、Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ  ｌａｃｔａｒｉｓ、Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ  ＣＯ  Ｇｅｍｍｉｇｅｒ  Ｘ、Ｃｏｐｒｏｃｏｃｃｕｓ  ＢＨ、−ＣＣ；Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｔｅｎｕｅ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｒａｍｕｌｕｓ、Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ  ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｉｆｏｒｍｉｓ  ｓｓｐ．ｃｌｏｓｔｒｉｄｌｉｆｏｒｍｉｓ、Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ  ｃｏａｇｕｌａｎｓ、Ｐｒｅｖｏｔｅｌｌａ  ｏｒａｌｉｓ、Ｐｒｅｖｏｔｅｌｌａ  ｒｕｍｉｎｉｃｏｌａ、Ｏｄｏｒｉｂａｃｔｅｒ  ｓｐｌａｎｃｈｎｉｃｕｓ、Ｄｅｓｕｉｆｏｍｏｎａｓ  ｐｉｇｒａ、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  Ｇ、Ｓｕｃｃｉｎｉｖｉｂｒｉｏ  Ａ、およびこれらの組み合わせからなる群から選択される少なくとも１種類、少なくとも２種類、少なくとも３種類、少なくとも４種類、少なくとも５種類、少なくとも６種類、または少なくとも７種類の糞便微生物を含む。
【００８２】
一態様では、本明細書において投与される治療用組成物は、生存能力のあるＢａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ、Ｆｕｓｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ、Ｐｒｏｐｉｏｎｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ、Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ、Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉ、Ｇｅｍｍｉｇｅｒ、Ｄｅｓｕｌｆｏｍｏｎａｓ、Ｐｅｐｔｏｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ、Ｍｏｎｉｌｉａ、または任意のこれらの組み合わせを含まない。別の態様では、本明細書において投与される治療用組成物は、生存能力のあるＢａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ  ｆｒａｇｉｌｉｓ  ｓｓｐ．ｖｕｌｇａｔｕｓ、Ｃｏｌｌｉｎｓｅｌｌａ  ａｅｒｏｆａｃｉｅｎｓ、Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ  ｆｒａｇｉｌｉｓ  ｓｓｐ．ｔｈｅｔａｉｏｔａｏｍｉｃｒｏｎ、Ｐｅｐｔｏｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ  ｐｒｏｄｕｃｔｕｓ  ＩＩ、Ｐａｒａｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ  ｄｉｓｔａｓｏｎｉｓ、Ｆｕｓｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｐｒａｕｓｎｉｔｚｉｉ、Ｃｏｐｒｏｃｏｃｃｕｓ  ｅｕｔａｃｔｕｓ、Ｃｏｌｌｉｎｓｅｌｌａ  ａｅｒｏｆａｃｉｅｎｓ  ＩＩＩ、Ｐｅｐｔｏｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ  ｐｒｏｄｕｃｔｕｓ  Ｉ、Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ  ｂｒｏｍｉｉ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ａｄｏｌｅｓｃｅｎｔｉｓ、Ｇｅｍｍｉｇｅｒ  ｆｏｒｍｉｃｉｌｉｓ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｌｏｎｇｕｍ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｓｉｒａｅｕｍ、Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ  ｔｏｒｑｕｅｓ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｒｅｃｔａｌｅ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｅｌｉｇｅｎｓ、Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ  ｅｇｇｅｒｔｈｉｉ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｌｅｐｔｕｍ、Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ  ｆｒａｇｉｌｉｓ  ｓｓｐ．Ａ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｂｉｆｏｒｍｅ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｒｅｃｔａｌｅ  ＩＩＩ−Ｆ、Ｃｏｐｒｏｃｏｃｃｕｓ  ｃｏｍｅｓ、Ｐｓｅｕｄｏｆｌａｖｏｎｉｆｒａｃｔｏｒ  ｃａｐｉｌｌｏｓｕｓ、Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ  ａｌｂｕｓ、Ｄｏｒｅａ  ｆｏｒｍｉｃｉｇｅｎｅｒａｎｓ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｖｅｎｔｒｉｏｓｕｍ  Ｉ、Ｆｕｓｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｒｕｓｓｉ、Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ  ｏｂｅｕｍ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｒｅｃｔａｌｅ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｒａｍｏｓｕｍ、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｌｅｉｃｈｍａｎｎｉｉ、Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ  ｃａｌｌｉｄｕｓ、Ｂｕｔｙｒｉｖｉｂｒｉｏ  ｃｒｏｓｓｏｔｕｓ、Ａｃｉｄａｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ  ｆｅｒｍｅｎｔａｎｓ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｖｅｎｔｒｉｏｓｕｍ、Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ  ｆｒａｇｉｌｉｓ  ｓｓｐ．ｆｒａｇｉｌｉｓ、Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ  ＡＲ、Ｃｏｐｒｏｃｏｃｃｕｓ  ｃａｔｕｓ、Ａｅｒｏｓｔｉｐｅｓ  ｈａｄｒｕｓ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｃｙｌｉｎｄｒｏｉｄｅｓ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｒｕｍｉｎａｎｔｉｕｍ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ＣＨ−１、Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ  ｅｐｉｄｅｒｍｉｄｉｓ、Ｐｅｐｔｏｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ  ＢＬ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｌｉｍｏｓｕｍ、Ｔｉｓｓｉｒｅｌｌ���  ｐｒａｅａｃｕｔａ、Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ  Ｌ、Ｆｕｓｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｍｏｒｔｉｆｅｒｕｍ  Ｉ、Ｆｕｓｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｎａｖｉｆｏｒｍｅ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｉｎｎｏｃｕｕｍ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｒａｍｏｓｕｍ、Ｐｒｏｐｉｏｎｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ａｃｎｅｓ、Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ  ｆｌａｖｅｆａｃｉｅｎｓ、Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ  ＡＴ、Ｐｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ  ＡＵ−１、Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ  ｆｒａｇｉｌｉｓ  ｓｓｐ．ｏｖａｔｕｓ、−ｓｓｐ．ｄ、−ｓｓｐ．ｆ；Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ  Ｌ−１、Ｌ−５；Ｆｕｓｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｎｕｃｌｅａｔｕｍ、Ｆｕｓｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｍｏｒｔｉｆｅｒｕｍ、Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉ、Ｇｅｍｅｌｌａ  ｍｏｒｂｉｌｌｏｒｕｍ、Ｆｉｎｅｇｏｌｄｉａ  ｍａｇｎｕｓ、Ｐｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ  Ｇ、−ＡＵ−２；Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ  ｉｎｔｅｒｍｅｄｉｕｓ、Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ  ｌａｃｔａｒｉｓ、Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ  ＣＯ  Ｇｅｍｍｉｇｅｒ  Ｘ、Ｃｏｐｒｏｃｏｃｃｕｓ  ＢＨ、−ＣＣ；Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｔｅｎｕｅ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｒａｍｕｌｕｓ、Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ  ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｉｆｏｒｍｉｓ  ｓｓｐ．ｃｌｏｓｔｒｉｄｌｉｆｏｒｍｉｓ、Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ  ｃｏａｇｕｌａｎｓ、Ｐｒｅｖｏｔｅｌｌａ  ｏｒａｌｉｓ、Ｐｒｅｖｏｔｅｌｌａ  ｒｕｍｉｎｉｃｏｌａ、Ｏｄｏｒｉｂａｃｔｅｒ  ｓｐｌａｎｃｈｎｉｃｕｓ、Ｄｅｓｕｉｆｏｍｏｎａｓ  ｐｉｇｒａ、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  Ｇ、Ｓｕｃｃｉｎｉｖｉｂｒｉｏ  Ａ、またはこれらの組み合わせを含まない。
【００８３】
一態様では、本明細書において投与される治療用組成物は糞便微生物叢を含む。別の態様では、本明細書において使用される糞便微生物叢の調製は、エタノール処理、洗浄剤処理、熱処理、照射、および超音波処理からなる群から選択される処理を含む。別の態様では、本明細書において使用される糞便微生物叢の調製は、エタノール処理、洗浄剤処理、熱処理、照射、および超音波処理からなる群から選択される処理を含まない。一態様では、本明細書において使用される糞便微生物叢の調製は、密度勾配、ろ過（例えば、ふるい、ナイロンメッシュ）、およびクロマトグラフィーからなる群から選択される分離工程を含む。別の態様では、本明細書において使用される糞便微生物叢の調製は、密度勾配法、ろ過処理（例えば、ふるい、ナイロンメッシュ）、およびクロマトグラフィーからなる群から選択される分離工程を含まない。別の態様では、本明細書において使用される糞便微生物叢は、ドナーの糞便微生物叢全体を含む。別の態様では、本明細書において投与される治療用組成物は、糞便微生物叢のドナーに由来する真核細胞を実質的に含まない糞便微生物叢を含む。
【００８４】
別の態様では、本明細書において投与される治療用組成物は、糞便微生物を用いてさらに補充、植種、または増強された糞便微生物叢を含む。一態様では、糞便微生物叢は、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ、Ｃｏｌｌｉｎｓｅｌｌａ、Ｄｏｒｅａ、Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ、Ｃｏｐｒｏｃｏｃｃｕｓ、Ｐｒｅｖｏｔｅｌｌａ、Ｖｅｉｌｌｏｎｅｌｌａ、Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ、Ｂａｃｃｉｌｌｕｓ、またはこれらの組み合わせの非病原性（または、弱毒化病原性）細菌を用いて補充される。別の態様では、本明細書において投与される治療用組成物は、Ｖｅｉｌｌｏｎｅｌｌａｃｅａｅ、Ｆｉｒｍｉｃｕｔｅｓ、Ｇａｍｍａｐｒｏｔｅｏｂａｃｔｅｒｉａ、Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｔｅｓ、またはこれらの組み合わせの種を用いてさらに補充されるか、植種される、または補強された糞便微生物叢を含む。別の態様では、本明細書において投与される治療用組成物は、糞便細菌胞子を用いてさらに補充された糞便微生物叢を含む。一態様では、糞便細菌胞子は、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ胞子、Ｂａｃｉｌｌｕｓ胞子、またそれらの両方である。
【００８５】
ある態様では、治療用組成物は、ヒト、ウシ、乳用子牛、反すう動物、ヒツジ、ヤギ、またはシカからなる群から選択される対象に由来する糞便微生物叢を含む。別の態様では、治療用組成物は、ヒト、ウシ、乳用子牛、反すう動物、ヒツジ、ヤギ、またはシカからなる群から選択される対象に投与することができる。ある態様では、治療用組成物は実質的に無臭であるか、またはほとんど無臭である。
【００８６】
ある態様では、本明細書において提供または投与される治療用組成物は、０．３以上、０．４以上、０．５以上、０．６以上、０．７以上、０．８以上、０．９以上、１．０以上、１．１以上、１．２以上、１．３以上、１．４以上、１．５以上、１．６以上、１．７以上、１．８以上、１．９以上、２．０以上、２．１以上、２．２以上、２．３以上、２．４以上、２．５以上、３．０以上、３．１以上、３．２以上、３．３以上、３．４以上、３．５以上、３．６以上、３．７以上、３．８以上、３．９以上、４．０以上、４．１以上、４．２以上、４．３以上、４．４以上、４．５以上、または５．０以上のシャノン多様性指数を有する糞便微生物叢を含む。別の態様では、治療用組成物は、０．１〜３．０、０．１〜２．５、０．１〜２．４、０．１〜２．３、０．１〜２．２、０．１〜２．１、０．１〜２．０、０．４〜２．５、０．４〜３．０、０．５〜５．０、０．７〜５．０、０．９〜５．０、１．１〜５．０、１．３〜５．０、１．５〜５．０、１．７〜５．０、１．９〜５．０、２．１〜５．０、２．３〜５．０、２．５〜５．０、２．７〜５．０、２．９〜５．０、３．１〜５．０、３．３〜５．０、３．５〜５．０、３．７〜５．０、３１．９〜５．０、または４．１〜５．０のシャノン多様性指数を有する糞便微生物叢を含む。一態様では、シャノン多様性指数は、門レベルで計算される。別の態様では、シャノン多様性指数は、科レベルで計算される。一態様では、シャノン多様性指数は、属レベルで計算される。別の態様では、シャノン多様性指数は、種レベルで計算される。さらなる態様では、治療用組成物は、正常な健康なヒト糞便細菌叢に似た割合の含有量の細菌叢の調製物を含む。
【００８７】
さらなる態様では、治療用組成物は、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、または１０種類の異なる科に由来する糞便細菌を含む。ある態様では、本明細書において提供または投与される治療用組成物は、重量割合で０．０５％、０．１％、０．２％、０．３％、０．４％、０．５％、０．６％、０．７％、０．８％、０．９％、１％、２％、３％、４％、５％、６％、７％、８％、９％、または１０％以下の非生体物質／生物学的物質を含む糞便微生物叢を含む。別の態様では、本明細書において提供または投与される治療用組成物は、重量割合で２０％、２５％、３０％、３５％、４０％、４５％、５０％、５５％、６０％、６５％、７０％、７５％，８０％，８５％，９０％，または９５％以下の非生体物質／生物学的物質を含む糞便微生物叢を含む。別の態様では、本明細書において提供または投与される治療用組成物は、２．０ｍｍ、１．０ｍｍ、０．３３ｍｍ、０．５ｍｍ、０．２５ｍｍ、０．２１２ｍｍ、０．１８０ｍｍ、０．１５０ｍｍ、０．１２５ｍｍ、０．１０６ｍｍ、０．０９０ｍｍ、０．０７５ｍｍ、０．０６３ｍｍ、０．０５３ｍｍ、０．０４５ｍｍ、０．０３８ｍｍ、０．０３２ｍｍ、０．０２５ｍｍ、０．０２０ｍｍ、０．０１ｍｍ、０．００２ｍｍ、０．１ｍｍ、または０．２ｍｍのふるいサイズ、除外サイズ、または粒子ろ過サイズを有するふるい、カラム、または同様のろ過装置を通過する糞便試料の非生体物質の粒子および／または生物学的物質の粒子を含むか、粒子からなるか、または粒子から本質的になる。「非生体物質」は、賦形剤、例えば、処理対象の糞便材料に添加される抗凍結剤のような薬学的に不活性な物質を含まない。「生物学的物質」とは、糞便材料中の生きた物質を指しており、細菌およびアーキアのような原核細胞（例えば、胞子を形成して生きた原核細胞になることができる生きた原核細胞および胞子）、原虫および真菌、ならびにウイルスのような真核細胞を含む微生物を含む。一態様では、「生物学的物質」とは、正常な健康なヒトの結腸に存在する生体物質、例えば、微生物、真核細胞、およびウイルスを指す。ある態様では、本明細書において提供または投与される治療用組成物は、ヒト糞便の抽出物を含み、この組成物は実質的に無臭である。ある態様では、本明細書において提供または投与される治療用組成物は、凍結乾燥製剤、粗製剤、半精製製剤、または精製製剤中の糞便材料または糞便細菌叢調製物を含む。
【００８８】
ある態様では、治療用組成物中の糞便微生物叢は、高度に微調整または精製された糞便細菌叢、例えば、糞便細菌叢材料以外の材料を実質的に含まない糞便細菌叢を含む。ある態様では、糞便微生物叢をさらに処理して、例えば、篩分けの前に、後に、または前後に精密ろ過することができる。別の態様では、高度に精製された糞便微生物叢の生成物を限外ろ過して大きな分子を除去するが、治療用細菌叢、例えば細菌を保持する。
【００８９】
別の態様では、本明細書において使用される治療用組成物中の糞便微生物叢は、実質的に単離もしくは精製された糞便細菌叢または全（もしくは実質的にすべての）微生物叢を含むか、または本質的にこれらからなり、全微生物叢は、糞便細菌叢の単離物であり（または、単離物を含み）、単離物は、糞便細菌叢材料以外の材料を少なくとも約９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％、９９．６％、９９．７％、９９．８％、または９９．９％単離されたか、もしくは純粋であり、または約０．１％、０．２％、０．３％、０．４％、０．５％、０．６％、０．７％、０．８％、０．９％、または１．０％以下の糞便細菌叢材料以外の材料を有するか、それよりも多くの糞便細菌叢材料以外の材料を有するか、またはＳａｄｏｗｓｋｙらによるＷＯ２０１２／１２２４７８Ａ１、もしくはＢｏｒｏｄｙらによる国際特許公開公報第２０１２／０１６２８７Ａ２号に記載されているように、実質的に単離、精製された細菌叢であるか、または実質的にすべての細菌叢である。
【００９０】
ある態様では、治療用組成物中の糞便微生物叢は、ドナーの実質的にすべての、もしくは非選択的な糞便微生物叢、再構成糞便材料、または合成糞便材料を含む。別の態様では、治療用組成物中の糞便微生物叢は抗生物質耐性群集を含まない。別の態様では、治療用組成物は糞便微生物叢を含み、異物（例えば、残留繊維、ＤＮＡ、ＲＮＡ、ウイルス外被材料、生存不可能な材料のような無細胞物質を含む非生体物質、および糞便物質のドナーに由来する真核細胞のような生体物質）をほとんど含まない。
【００９１】
ある態様では、本明細書において使用される治療用組成物中の糞便微生物叢は、疾患スクリーニングされた新鮮な同種糞便または同等に凍結乾燥され、かつ再構成された糞便に由来する。ある態様では、新鮮な同種糞便は抗生物質耐性群集を含まない。別の態様では、治療用組成物中の糞便微生物叢は合成糞便組成物に由来する。ある態様では、合成糞便組成物は、好ましくは比例含有量で、抗生物質耐性群集を含まない正常な健康なヒト糞便細菌叢に類似する生存能力のある細菌叢の調製物を含む。好適な微生物は、以下：Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ、Ｆｕｓｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ、Ｐｒｏｐｉｏｎｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ、Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ、Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉ、Ｇｅｍｍｉｇｅｒ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ、Ｄｅｓｕｌｆｏｍｏｎａｓ、Ｐｅｐｔｏｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ、Ｃｏｌｌｉｎｓｅｌｌａ、Ｃｏｐｒｏｃｏｃｃｕｓ、Ｄｏｒｅａ、およびＲｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓから選択することができる。
【００９２】
ある態様では、本明細書に開示される治療において使用される治療用組成物は、滅菌糞便ろ液または非細胞性糞便ろ液を含む。一態様では、滅菌糞便ろ液はドナーの便に由来する。別の態様では、滅菌糞便ろ液は、培養された微生物に由来する。別の態様では、滅菌糞便ろ液は、非細胞性非微粒子糞便成分を含む。一態様では、滅菌糞便ろ液は、２０１４年５月３０日に公開された、国際特許公開公報第２０１４／０７８９１１号に記載されているように作製される。別の態様では、滅菌糞便ろ液は、Ｏｔｔ  ｅｔ  ａｌ．，Ｇａｓｔｒｏｅｎｔｅｒｏｌｏｇｙ  １５２：７９９−９１１（２０１７）に記載されているように作製される。
【００９３】
一態様では、糞便ろ液は、分泌されたもの、排泄されたもの、または別様に液体の成分もしくは微生物叢、例えば、抗生物質もしくは抗炎症性である可能性がある生物学的に活性な分子（ＢＡＭ）を含み、この糞便ろ液は細菌叢抽出物中に保存、保持、または再構成される。
【００９４】
一態様では、例示的な治療用組成物は、定義されたドナープールからのドナーに由来する開始材料を含み、このドナーは、遠心分離され、次に、例えば、金属製のふるいもしくはミリポアフィルターのいずれか、または同等物を使用して、非常に高レベルのろ過によりろ過された便を提供し、最終的には、細菌起源の細胞（例えば、多くの場合約５マイクロメートル未満の直径）のみを維持することを可能にする。最初の遠心分離の後、固形材料は液体から分離され、次に、例えば、ミリポアろ過を使用して、および任意選択的にナノ膜の使用も含めて、フィルターおよび接線フィルターのサイズを漸進的に減少させて、固体をろ過する。ろ過はまた、国際特許公開公報第２０１２／１２２４７８号に記載されているようなふるいによって、しかし．０１２０ｍｍ未満のふるいを使用するのとは対照的に、約．０１１０ｍｍまで減少させて行うこともでき、最終的に、細菌細胞のみ存在させる。
【００９５】
ここで、遠心分離中に分離された上清を取り出し、ろ過、例えば、ミリポアろ過または同等のシステムで漸進的にろ過して、約０．２２マイクロメートルのフィルターを通して精密ろ過された液体を生じる。これにより、細菌およびウイルスを含む、すべての生体物質を含むすべての粒子状物質を除去する。次に、生成物を滅菌するが、この目的は、細菌の分泌物、特に抗菌性バクテリオシン、細菌由来のサイトカイン様生成物であって、いずれもツリシン（ドナーの便中の病原菌によって分泌された）、バクテリオシン（コリシン、トロウズリキシン（ｔｒｏｕｄｕｌｉｘｉｎｅ）もしくはプタインジシン（ｐｕｔａｉｎｄｉｃｉｎｅ）、またはミクロシンもしくはサブチロシンＡを含む）、ランバイオティクス（ｌａｎｂｉｏｔｉｃｓ）（ナイシン、サブチリン、エピデルミン、ミュータシン、メルサシジン、アクタガルジン、シンナマイシン）、ラクチシン、および他の抗菌性または抗炎症性化合物を含む、生物学的に活性な分子（ＢＡＭ）を伴う、細菌の分泌物を維持しながら細菌を除去することである。
【００９６】
一態様では、本明細書において使用される治療用組成物は、本質的に精製糞便微生物叢と非細胞性糞便ろ液との組み合わせからなる再構成された糞便細菌叢を含む。別の態様では、本明細書において使用される治療用組成物は、１つ以上の非細胞性非微粒子糞便成分を用いて補充された精製糞便微生物叢を含む。一態様では、本明細書において使用される治療用組成物は、１つ以上の非細胞性非微粒子糞便成分を含む。一態様では、１つ以上の非細胞性非微粒子糞便成分は、合成分子、糞便微生物によって精製された生物学的に活性な分子、または両方を含む。別の態様では、１つ以上の非細胞性非微粒子糞便成分は、生物学的に活性なタンパク質もしくはペプチド、微量栄養素、脂肪、砂糖、小さい炭水化物、微量元素、無機塩、灰、粘液、アミノ酸、栄養素、ビタミン、ミネラル、または任意のこれらの組み合わせを含む。一態様では、１つ以上の非細胞性非微粒子糞便成分は、バクテリオシン、ランバイオティクス（ｌａｎｂｉｏｔｉｃ）、およびラクチシンからなる群から選択される１つ以上の生物学的に活性な分子を含む。別の態様では、１つ以上の非細胞性非微粒子糞便成分は、コリシン、トロウズリキシン、プタインジシン、ミクロシン、およびサブチロシンＡからなる群から選択される１つ以上のバクテリオシンを含む。一態様では、１つ以上の非細胞性非微粒子糞便成分は、ツリシン、ナイシン、スブチリン、エピデルミン、ミュータシン、メルサシジン、アクタガルジン、およびシンナマイシンからなる群から選択される１つ以上のランバイオティクス（ｌａｎｂｉｏｔｉｃｓ）を含む。別の態様では、１つ以上の非細胞性非微粒子糞便成分は、抗胞子化合物、抗菌性化合物、抗炎症性化合物、または任意のこれらの組み合わせを含む。さらなる態様では、１つ以上の非細胞性非微粒子糞便成分は、インターロイキン、サイトカイン、ロイコトリエン、エイコサノイド、または任意のこれらの組み合わせを含む。
【００９７】
別の態様では、本明細書において提供される治療方法は、糞便細菌細胞、例えば、ヒトＧＩ微生物叢の部分的もしくは完全な表示物と、細菌叢（微生物叢）の単離された、処理された、ろ過された、濃縮された、再構成された、かつ／または人工の液体成分（例えば、糞便ろ液）との両方の使用を含み、この細菌叢（微生物叢）は、他の成分の中でも特に、例えば、バクテリオシン（コリシン、トロウズリキシンもしくはプタインジシン、またはミクロシンもしくはサブチロシンＡを含む、細菌によって生成されるタンパク性毒素）、ランバイオティクス（ｌａｎｂｉｏｔｉｃｓ）（特徴的な多環式チオエーテルアミノ酸ランチオニンまたはメチルランチオニン、ならびにツリシン（ドナーの便中の病原菌によって分泌された）、ナイシン、スブチリン、エピデルミン、ミュータシン、メルサシジン、アクタガルジン、シンナマイシンを含む、不飽和アミノ酸デヒドロアラニおよび２−アミノイソ酪酸を含有するペプチド抗生物質のクラス）、ラクチシン（孔形成ペプチド性毒素の科）、ならびに細菌もしくは微生物叢の他の微生物によって生成され、かつ／または微生物叢の「液体成分」中に見られる、他の抗菌性もしくは抗炎症性化合物および／もしくはさらなる生物学的に活性な分子（ＢＡＭ）などの細菌分泌生成物を含む。
【００９８】
一態様では、糞便細菌に基づく治療用組成物は、糞便非細胞性ろ液に基づく治療用組成物と同時に使用される。別の態様では、患者は、第２の糞便細菌に基づく治療用組成物を与えられる前に、第１の糞便非細胞性ろ液に基づく治療用組成物で治療されるか、またはその逆である。さらなる態様では、治療方法は、第１の工程、感染性病原体（複数可）を非選択的に除去するための抗生物質による前治療、第２の工程、選択された感染性病原体（複数可）をさらに抑制するための糞便非細胞性ろ液に基づく治療工程、および第３の工程、機能的腸内微生物叢を再構築するための糞便細菌に基づく治療用組成物を患者に与えるという３つの工程を含む。
【００９９】
ある態様では、治療用組成物を制酸剤のような他のアジュバントと組み合わせて、胃内の細菌不活性化を抑制する（例えば、Ｍｙｌａｎｔａ、Ｍｕｃａｉｎｅ、Ｇａｓｔｒｏｇｅｌ）。別の態様では、胃内の酸分泌は、Ｈ２−拮抗薬またはプロトンポンプ阻害剤を使用して薬学的に抑制することもできる。Ｈ２−拮抗薬の例は、ラニチジンである。プロトンポンプ阻害剤の例は、オメプラゾールである。一態様では、酸抑制剤は、治療用組成物を投与する前に、または治療用組成物の投与と同時投与される。
【０１００】
ある態様では、治療用組成物は、以下の形態：適切な希釈剤で再構成することができる浣腸組成物；腸溶性コーティングカプセル；腸溶性コーティングマイクロカプセル；耐酸性錠剤；耐酸性カプセル；耐酸性マイクロカプセル；鼻腔内注入もしくは結腸鏡下注入に適する希釈剤で再構成される粉末；経口摂取に適する希釈剤、香味剤、および胃酸抑制剤で再構成される粉末；食品もしくは飲料で再構成される粉末；または組成物、粉末、ゼリー、もしくは液体の腸溶性コーティングマイクロカプセルおよび／もしくは耐酸性マイクロカプセルを含む食品もしくは栄養補助食品である。
【０１０１】
ある態様では、治療方法は、ＰＤの治癒、症状の減少、または症状の割合の減少をもたらす。別の態様では、治療方法は、細菌叢の変化ももたらす。細菌叢の変化は、可能な限り「ほぼ完全」であることが好ましく、細菌叢は、任意の残りの元の細菌叢が密集することになる生存能力のある微生物によって置き換えられる。典型的に、腸内細菌叢中の変化は、胃腸系への一連の所定の細菌叢の導入を含み、したがって好ましい形態では、治療方法は、このような治療を必要とする患者の病原性腸内細菌叢を、実質的にまたは完全に置き換えることを含む。
【０１０２】
別の態様では、治療用組成物を薬学的に許容される担体と一緒に投与することができる。本明細書で使用される場合、「薬学的に許容される担体」とは、医薬組成物、例えば患者に投与することができる投与剤形の形成を可能にするために、生きた細菌と混合される無毒性の溶媒、分散剤、賦形剤、アジュバント、または他の材料を指す。薬学的に許容される担体は、液体（例えば、生理食塩水）、ゲルもしくは固体形態の希釈剤、アジュバント、賦形剤、または耐酸性のカプセル封入成分とすることができる。好適な希釈剤および賦形剤としては、薬学的グレードの生理食塩水、デキストロース、グリセロール、マンニトール、ラクトース、デンプン、ステアリン酸マグネシウム、サッカリンナトリウム、セルロース、炭酸マグネシウムなど、およびこれらの組み合わせが挙げられる。別の態様では、治療用組成物は、湿潤剤もしくは乳化剤のような補助物質、安定化剤、またはｐＨ緩衝剤を含有し得る。ある態様では、治療用組成物は、約１％〜５％、５％〜１０％、１０％〜１５％、１５〜２０％、２０％〜２５％、２５〜３０％、３０〜３５％、４０〜４５％、５０％〜５５％、１％〜９５％、２％〜９５％、５％〜９５％、１０％〜９５％、１５％〜９５％、２０％〜９５％、２５％〜９５％、３０％〜９５％、３５％〜９５％、４０％〜９５％、４５％〜９５％、５０％〜９５％、５５％〜９５％、６０％〜９５％、６５％〜９５％、７０％〜９５％、４５％〜９５％、８０％〜９５％、または８５％〜９５％の活性成分を含有する。ある態様では、治療用組成物は、約２％〜７０％、５％〜６０％、１０％〜５０％、１５％〜４０％、２０％〜３０％、２５％〜６０％、３０％〜６０％、または３５％〜６０％の活性成分を含有する。
【０１０３】
ある態様では、治療用組成物を、錠剤、飲薬、ボーラス、カプセル、またはプレミックスの中へと組み込むことができる。このような投与剤形へのこれらの活性成分の製剤化は、薬学的製剤分野で周知の方法によって達成することができる。例えば、米国特許第４，３９４，３７７号を参照されたい。ゼラチンカプセルに任意の所望の剤形の活性成分を充填すると、カプセルを容易に生成することができる。必要に応じて、これらの材料は、砂糖、デンプン、粉ミルク、精製結晶セルロースなどのような不活性粉末希釈剤で希釈して、カプセルに充填するのに便利なように容積を増やすことができる。
【０１０４】
ある態様では、従来の製剤プロセスを使用して、治療用組成物を含有する錠剤を調製することができる。活性成分に加えて、錠剤は、基剤、崩壊剤、吸収剤、結合剤、および滑沢剤を含有してもよい。典型的な基剤としては、ラクトース、砂糖、塩化ナトリウム、デンプン、およびマンニトールが挙げられる。デンプンもアルギン酸と同様に優れた崩壊剤である。ラウリル硫酸ナトリウムおよびジオクチルスルホコハク酸ナトリウムのような界面活性剤もまた、時として使用される。広く使用される吸収剤は、デンプンおよびラクトースを含む。炭酸マグネシウムは、油性物質にも有用である。結合剤としては、例えば、ゼラチン、ガム、デンプン、デキストリン、ポリビニルピロリドン、および様々なセルロース誘導体を使用することができる。広く使用される滑沢剤の中でも特に、ステアリン酸マグネシウム、タルク、パラフィンワックス、様々な金属石鹸、およびポリエチレングリコールがある。
【０１０５】
ある態様では、錠剤のような固形組成物を調製するためには、活性成分を薬学的担体、例えば、コーンスターチ、ラクトース、スクロース、ソルビトール、タルク、ステアリン酸、ステアリン酸マグネシウム、リン酸二カルシウム、もしくはガムのような従来の錠剤化成分と混合するか、または他の薬学的希釈剤、例えば水と混合して、本発明の組成物の均質な混合物を含有する固形予備製剤組成物を形成する。これらの予備処方組成物を均質であると記載する場合、活性成分が組成物全体に均一に分散されていて、組成物を等しく有効な単位投与剤形（錠剤、丸薬、およびカプセルなど）に容易に細分割しうることを意味している。次に、この固形予備処方組成物を、所望量（例えば、少なくとも約１０５、１０６、１０７、１０８、１０９、１０１０、１０１１、１０１２、または１０１３ｃｆｕまたは総細胞数）の活性成分を含有する上記に記載されるタイプの単位投与剤形に細分割する。本明細書において使用される治療用組成物には、風味を付けることができる。
【０１０６】
ある態様では、治療用組成物は錠剤または丸薬とすることができる。一態様では、錠剤または丸薬にコーティングを施すか、または別様に、錠剤もしくは丸薬を配合して、長期作用の利点をもたらす投与剤形を形成することができる。例えば、錠剤または丸薬は、内部投与成分および外部投与成分を含むことができ、外部投与成分が内部投与成分の外側を包み込む剤形である。２つの成分は、腸溶層で分離することができ、腸溶層は、胃内の崩壊に耐えて、内部成分が無傷で通過して十二指腸に達することができるか、または内部成分の放出を遅らせることができるように作用する。多種多様な材料をこのような腸溶層またはコーティングに使用することができ、このような材料には、いくつかのポリマー酸、およびポリマー酸と、シェラック、セチルアルコール、および酢酸セルロースのような材料とのいくつかの混合物が含まれる。
【０１０７】
ある態様では、治療用組成物は飲薬とすることができる。一態様では、飲薬は、生理食塩水の懸濁液の形態の治療用組成物を選択することによって調製される。水溶性の形態の一方の成分は、一方の成分の水溶液の他方の成分との懸濁液を調製することによって、水不溶性の形態の他方の成分と合わせて使用することができる。水不溶性の形態のいずれの活性成分も、懸濁液として調製されてもよく、またはポリエチレングリコールのようないくつかの生理学的に許容される溶媒中で調製されてもよい。水不溶性の形態のいずれの活性成分の懸濁液も、ピーナッツ油、コーン油、ゴマ油などのような油の中で調製することができるか、プロピレングリコールもしくはポリエチレングリコールのようなグリコールの中で調製することができるか、または特定の活性成分の溶解度に応じて、水の中で調製することができる。活性成分を懸濁状態に保つためには、好適な生理学的に許容されるアジュバントが必要となる場合がある。アジュバントは、カルボキシメチルセルロース、ポリビニルピロリドン、ゼラチン、およびアルギン酸塩のような増粘剤を含むことができ、これらの増粘剤の中から選択することができる。界面活性剤は、一般に、活性成分、特に脂溶性プロピオン酸塩増強化合物を懸濁するように作用する。液体非溶媒中で懸濁液を作製するために最も有用なものが、アルキルフェノールポリエチレンオキシド付加物、ナフタレンスルホネート、アルキルベンゼンスルホネート、およびポリオキシエチレンソルビタンエステルである。加えて、液体の親水性、密度、および表面張力に影響を与える多くの物質が、懸濁液を個々の場合において作製を支援することができる。例えば、シリコーン消泡剤、グリコール、ソルビトール、および砂糖は、有用な懸濁剤とすることができる。
【０１０８】
ある態様では、治療用組成物は、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ａｂｓｏｎｕｍ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ａｒｇｅｎｔｉｎｅｎｓｅ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂａｒａｔｉｉ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｏｔｕｌｉｎｕｍ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｃａｄａｖｅｒｉｓ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｃａｒｎｉｓ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｃｅｌａｔｕｍ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｃｈａｕｖｏｅｉ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｏｆｏｒｍｅ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｃｏｃｈｌｅａｒｉｕｍ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｆａｌｌａｘ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｆｅｌｓｉｎｅｕｍ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｇｈｏｎｉｉ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｇｌｙｃｏｌｉｃｕｍ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｈａｅｍｏｌｙｔｉｃｕｍ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｈａｓｔｉｆｏｒｍｅ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｈｉｓｔｏｌｙｔｉｃｕｍ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｉｎｄｏｌｉｓ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｉｒｒｅｇｕｌａｒｅ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｌｉｍｏｓｕｍ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｍａｌｅｎｏｍｉｎａｔｕｍ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｎｏｖｙｉ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｏｒｏｔｉｃｕｍ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｐａｒａｐｕｔｒｉｆｉｃｕｍ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｐｅｒｆｒｉｎｇｅｎｓ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｐｉｌｉｆｏｒｍｅ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｐｕｔｒｅｆａｃｉｅｎｓ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｐｕｔｒｉｆｉｃｕｍ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｓａｒｄｉｎｉｅｎｓｅ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｓａｒｔａｇｏｆｏｒｍｅ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｓｃｉｎｄｅｎｓ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｓｅｐｔｉｃｕｍ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｓｏｒｄｅｌｌｉｉ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｓｐｈｅｎｏｉｄｅｓ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｓｐｉｒｏｆｏｒｍｅ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｓｐｏｒｏｇｅｎｅｓ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｓｕｂｔｅｒｍｉｎａｌｅ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｓｙｍｂｉｏｓｕｍ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｔｅｒｔｉｕｍ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｔｅｔａｎｉ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｗｅｌｃｈｉｉ、ａｎｄ  Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｖｉｌｌｏｓｕｍからなる群から選択される１つ以上、２つ以上、３つ以上、または４つ以上のＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ種の非病原性胞子を含む。
【０１０９】
ある態様では、治療用組成物は、精製、単離、または培養された生存能力のある非病原性Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍと、Ｃｏｌｌｉｎｓｅｌｌａ、Ｃｏｐｒｏｃｏｃｃｕｓ、Ｄｏｒｅａ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ、およびＲｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓからなる群から選択される１つ以上の属に由来する複数の精製、単離、または培養された生存能力のある非病原性微生物と、を含む。別の態様では、治療用組成物は、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ、Ｃｏｌｌｉｎｓｅｌｌａ、Ｃｏｐｒｏｃｏｃｃｕｓ、Ｄｏｒｅａ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ、およびＲｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓからなる群から選択される１つ以上の属に由来する複数の精製、単離、または培養された生存能力のある非病原性微生物を含む。
【０１１０】
ある態様では、治療用組成物は、Ｃｏｌｌｉｎｓｅｌｌａ、Ｃｏｐｒｏｃｏｃｃｕｓ、Ｄｏｒｅａ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ、およびＲｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓからなる群から選択される２つ以上の属を含む。別の態様では、治療用組成物は、Ｃｏｐｒｏｃｏｃｃｕｓ、Ｄｏｒｅａ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ、およびＲｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓからなる群から選択される２つ以上の属を含む。さらなる態様では、治療用組成物は、Ｃｏｐｒｏｃｏｃｃｕｓ  ｃａｔｕｓ、Ｃｏｐｒｏｃｏｃｃｕｓ  ｃｏｍｅｓ、Ｄｏｒｅａ  ｌｏｎｇｉｃａｔｅｎａ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｅｌｉｇｅｎｓ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｄｒｕｍ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｒｅｃｔａｌｅ、およびＲｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ  ｔｏｒｑｕｅｓからなる群から選択される１つ以上、２つ以上、３つ以上、４つ以上、または５つ以上の種を含む。
【０１１１】
一態様では、治療用組成物は、少なくとも約１０５、１０６、１０７、１０８、１０９、１０１０、１０１１、１０１２、または１０１３ｃｆｕまたは総細胞数を含む。別の態様では、治療用組成物は、最大で約１０５、１０６、１０７、１０８、１０９、１０１０、１０１１、１０１２、１０１３、または１０１４ｃｆｕまたは総細胞数を含む。
【０１１２】
別の態様では、治療用組成物は、少なくとも約１０５、１０６、１０７、１０８、１０９、１０１０、１０１１、１０１２、または１０１３個の細胞または総細胞数を含む。別の態様では、治療用組成物は、最大で約１０５、１０６、１０７、１０８、１０９、１０１０、１０１１、１０１２、１０１３、または１０１４個の細胞または総細胞数を含む。
【０１１３】
一態様では、治療用組成物は、経口カプセル、マイクロカプセル、錠剤、または丸薬として製剤化される。別の態様では、カプセル、マイクロカプセル、錠剤、または丸薬は、腸内送達のために適合される。さらなる態様では、カプセル、マイクロカプセル、錠剤、または丸薬は、腸溶性カプセル、マイクロカプセル、錠剤、または丸薬である。別の態様では、カプセル、マイクロカプセル、錠剤、または丸薬は、腸溶性コーティングを含むか、耐酸性であるか、または両方である。
【０１１４】
一態様では、本願は、以下の実施形態を提供する。
【０１１５】
実施形態１．それを必要とするヒト対象においてパーキンソン病（ＰＤ）を治療するための方法であって、生きた非病原性糞便細菌または非細胞性糞便ろ液を含む薬学的に活性な用量の治療用組成物を当該対象に投与することを含む、方法。
【０１１６】
実施形態２．当該対象が消化管障害をさらに含む、実施形態１の方法。
【０１１７】
実施形態３．当該対象が、慢性便秘をさらに含む、実施形態１の方法。
【０１１８】
実施形態４．当該対象が、Ｉ〜Ｖ期からなる群から選択される臨床病期(clinical stage)のＰＤを有する、実施形態１の方法。
【０１１９】
実施形態５．当該対象が、早期ＰＤ患者である、実施形態１の方法。
【０１２０】
実施形態６．当該対象が、パーキンソン病の１つ以上の早期兆候を示す、実施形態１の方法。
【０１２１】
実施形態７．前記方法が、当該対象におけるＰＤの進行速度を減少させる、実施形態１の方法。
【０１２２】
実施形態８．当該方法が、当該対象における症候的抗パーキンソン病療法の必要性を遅らせる、実施形態１の方法。
【０１２３】
実施形態９．当該組成物が、単離または精製された生きた当該非病原性糞便細菌の群集を含む、実施形態１の方法。
【０１２４】
実施形態１０．当該組成物が、非選択的な糞便微生物叢を含む、実施形態１の方法。
【０１２５】
実施形態１１．当該投与が、毎日行われる、実施形態１の方法。
【０１２６】
実施形態１２．当該投与が、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、または１０週間続く、実施形態１の方法。
【０１２７】
実施形態１３．当該用量が、少なくとも２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、もしくは１５日間または２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、もしくは１５週間連続して、１日に少なくとも１回または１週間に少なくとも１回投与される、実施形態１の方法。
【０１２８】
実施形態１４．当該用量が、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、または１２週間連続して、１日に少なくとも１回または１週間に少なくとも１回投与される、実施形態１の方法。
【０１２９】
実施形態１５．当該用量が、最大で３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、もしくは２０日間または３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、もしくは２０週間連続して、１日に少なくとも１回または１週間に少なくとも１回投与される、実施形態１の方法。
【０１３０】
実施形態１６．当該用量が、最大で１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、または１２週間連続して、１日に少なくとも１回または１週間に少なくとも１回投与される、実施形態１の方法。
【０１３１】
実施形態１７．当該用量が、少なくとも２日間または２週間にわたって、１日に少なくとも２回または１週間に少なくとも２回投与される、実施形態１の方法。
【０１３２】
実施形態１８．当該用量が、少なくとも３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、もしくは１５日間または３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、もしくは１５週間連続して、１日に少なくとも２回または１週間に少なくとも２回投与される、実施形態１７の方法。
【０１３３】
実施形態１９．当該用量が、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、または１２週間連続して、１日に少なくとも２回または１週間に少なくとも２回投与される、実施形態１７の方法。
【０１３４】
実施形態２０．当該用量が、最大で３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、もしくは２０日間または３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、もしくは２０週間連続して、１日に少なくとも２回または１週間に少なくとも２回投与される、実施形態１７の方法。
【０１３５】
実施形態２１．当該用量が、最大で１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、または１２週間連続して、１日に少なくとも２回または１週間に少なくとも２回投与される、実施形態１７の方法。
【０１３６】
実施形態２２．当該用量が、少なくとも１日または１週間にわたって、１日に少なくとも３回または１週間に少なくとも３回投与される、実施形態１の方法。
【０１３７】
実施形態２３．当該用量が、少なくとも２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、もしくは１５日間または２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、もしくは１５週間連続して、１日に少なくとも３回または１週間に少なくとも３回投与される、実施形態２２の方法。
【０１３８】
実施形態２４．当該用量が、最大で２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、もしくは１５日間または２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、もしくは１５週間連続して、１日に少なくとも３回または１週間に少なくとも３回投与される、実施形態２２の方法。
【０１３９】
実施形態２５．治療用組成物が、生きた非病原性糞便細菌および非細胞性糞便ろ液の両方を含む、実施形態１の方法。
【０１４０】
実施形態２６．治療用組成物が、非細胞性糞便ろ液を用いて補充された、生きた非病原性糞便細菌を含む、実施形態１の方法。
【０１４１】
実施形態２７．当該非細胞性糞便ろ液が、生物学的に活性なタンパク質もしくはペプチド、微量栄養素、脂肪、砂糖、小さい炭水化物、微量元素、無機塩、灰、粘液、アミノ酸、栄養素、ビタミン、ミネラル、または任意のこれらの組み合わせを含む、実施形態１、２５、または２６の方法。
【０１４２】
実施形態２８．当該非細胞性糞便ろ液が、バクテリオシン、ランバイオティクス（ｌａｎｂｉｏｔｉｃ）、およびラクチシンからなる群から選択される１つ以上の生物学的に活性な分子を含む、実施形態１、２５、または２６の方法。
【０１４３】
実施形態２９．当該非細胞性糞便ろ液が、コリシン、トロウズリキシン、プタインジシン、ミクロシン、およびサブチロシンＡからなる群から選択される１つ以上のバクテリオシンを含む、実施形態１、２５、または２６の方法。
【０１４４】
実施形態３０．当該非細胞性糞便ろ液が、ツリシン、ナイシン、スブチリン、エピデルミン、ミュータシン、メルサシジン、アクタガルジン、およびシンナマイシンからなる群から選択される１つ以上のランバイオティクス（ｌａｎｂｉｏｔｉｃｓ）を含む、実施形態１、２５、または２６の方法。
【０１４５】
実施形態３１．当該非細胞性糞便ろ液が、抗胞子化合物、抗菌性化合物、抗炎症性化合物、または任意のこれらの組み合わせを含む、実施形態１、２５、または２６の方法。
【０１４６】
実施形態３２．当該非細胞性糞便ろ液が、インターロイキン、サイトカイン、ロイコトリエン、エイコサノイド、または任意のこれらの組み合わせを含む、実施形態１、２５、または２６の方法。
【０１４７】
実施形態３３．当該方法が、第１の投与スケジュールと、その後の第２の投与スケジュールと、を含む、先行する請求項のいずれか一項に記載の方法。
【０１４８】
実施形態３４．当該第２の投与スケジュールが、当該第１の投与スケジュールの用量以下の維持用量を含む、実施形態３３の方法。
【０１４９】
実施形態３５．当該第２の投与スケジュールが、少なくとも約２、４、６、８、１０、１２、１８、２４、３６、４８、７２、または９６か月間続く、実施形態３４の方法。
【０１５０】
実施形態３６．当該第２の投与スケジュールが、永久に続く、実施形態３４の方法。
【０１５１】
実施形態３７．当該第１の投与スケジュールと当該第２の投与スケジュールとの間の間隔が、少なくとも約１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、または１２週間である、実施形態３３の方法。
【０１５２】
実施形態３８．当該第２の投与スケジュールが、連続的な投与スケジュールである、実施形態３３の方法。
【０１５３】
実施形態３９．当該第２の投与スケジュールが、間欠的な投与スケジュールである、実施形態３３の方法。
【０１５４】
実施形態４０．当該間欠的な投与スケジュールが、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、または１４日間の治療期間を含み、この治療期間の後に、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、または１４日間の休息期間が続く、実施形態３９の方法。
【０１５５】
実施形態４１．当該組成物が、遅延放出剤形または徐放性腸溶放出剤形として製剤化される、先行する請求項のいずれか一項に記載の方法。
【０１５６】
実施形態４２．当該投与が、経口的に、浣腸によって、または直腸坐剤を介して、投与することを含み、先行する請求項のいずれか一項に記載の方法。
【０１５７】
実施形態４３．当該組成物が、腸溶性コーティングカプセル、耐酸性、腸溶性コーティングカプセル、腸陽性コーティングマイクロカプセルとして製剤化されるか、または食品、食品添加物、乳製品ベースの製品、大豆ベースの製品、もしくはこれらの派生物、ゼリー、またはヨーグルトの一部として製剤化される、先行する請求項のいずれか一項に記載の方法。
【０１５８】
実施形態４４．当該方法が、胃腸内毒素症を除去または減少させる、先行する請求項のいずれか一項に記載の方法。
【０１５９】
実施形態４５．当該方法が、当該対象の消化管における細菌多様性を増加させる、先行する請求項のいずれか一項に記載の方法。
【０１６０】
実施形態４６．当該薬学的に活性な用量が、少なくとも約１０５、１０６、１０７、１０８、１０９、１０１０、１０１１、１０１２、または１０１３ｃｆｕまたは総細胞数を含む、先行する請求項のいずれか一項に記載の方法。
【０１６１】
実施形態４７．当該薬学的に活性な用量が、最大で約１０５、１０６、１０７、１０８、１０９、１０１０、１０１１、１０１２、または１０１３ｃｆｕまたは総細胞数を含む、実施形態１の方法。
【０１６２】
実施形態４８．当該薬学的に活性な用量が、１０５〜１０１４、１０６〜１０１４、１０７〜１０１４、１０８〜１０１４、１０９〜１０１３、１０１０〜１０１２、１０９〜１０１４、１０９〜１０１２、１０９〜１０１１、１０９〜１０１０、１０１０〜１０１４、１０１０〜１０１３、１０１１〜１０１４、１０１１〜１０１３、１０１２〜１０１４、および１０１３〜１０１４ｃｆｕまたは総細胞数からなる群から選択される、実施形態１の方法。
【０１６３】
実施形態４９．当該組成物が、糞便微生物を用いてさらに補充された糞便微生物叢を含む、実施形態１の方法。
【０１６４】
実施形態５０．当該糞便微生物が、Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ  ｆｒａｇｉｌｉｓ  ｓｓｐ．ｖｕｌｇａｔｕｓ、Ｃｏｌｌｉｎｓｅｌｌａ  ａｅｒｏｆａｃｉｅｎｓ、Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ  ｆｒａｇｉｌｉｓ  ｓｓｐ．ｔｈｅｔａｉｏｔａｏｍｉｃｒｏｎ、Ｐｅｐｔｏｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ  ｐｒｏｄｕｃｔｕｓ  ＩＩ、Ｐａｒａｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ  ｄｉｓｔａｓｏｎｉｓ、Ｆｕｓｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｐｒａｕｓｎｉｔｚｉｉ、Ｃｏｐｒｏｃｏｃｃｕｓ  ｅｕｔａｃｔｕｓ、Ｃｏｌｌｉｎｓｅｌｌａ  ａｅｒｏｆａｃｉｅｎｓ  ＩＩＩ、Ｐｅｐｔｏｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ  ｐｒｏｄｕｃｔｕｓ  Ｉ、Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ  ｂｒｏｍｉｉ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ａｄｏｌｅｓｃｅｎｔｉｓ、Ｇｅｍｍｉｇｅｒ  ｆｏｒｍｉｃｉｌｉｓ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｌｏｎｇｕｍ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｓｉｒａｅｕｍ、Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ  ｔｏｒｑｕｅｓ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｒｅｃｔａｌｅ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｅｌｉｇｅｎｓ、Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ  ｅｇｇｅｒｔｈｉｉ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｌｅｐｔｕｍ、Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ  ｆｒａｇｉｌｉｓ  ｓｓｐ．Ａ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｂｉｆｏｒｍｅ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｒｅｃｔａｌｅ  ＩＩＩ−Ｆ、Ｃｏｐｒｏｃｏｃｃｕｓ  ｃｏｍｅｓ、Ｐｓｅｕｄｏｆｌａｖｏｎｉｆｒａｃｔｏｒ  ｃａｐｉｌｌｏｓｕｓ、Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ  ａｌｂｕｓ、Ｄｏｒｅａ  ｆｏｒｍｉｃｉｇｅｎｅｒａｎｓ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｖｅｎｔｒｉｏｓｕｍ  Ｉ、Ｆｕｓｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｒｕｓｓｉ、Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ  ｏｂｅｕｍ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｒｅｃｔａｌｅ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｒａｍｏｓｕｍ、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｌｅｉｃｈｍａｎｎｉｉ、Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ  ｃａｌｌｉｄｕｓ、Ｂｕｔｙｒｉｖｉｂｒｉｏ  ｃｒｏｓｓｏｔｕｓ、Ａｃｉｄａｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ  ｆｅｒｍｅｎｔａｎｓ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｖｅｎｔｒｉｏｓｕｍ、Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ  ｆｒａｇｉｌｉｓ  ｓｓｐ．ｆｒａｇｉｌｉｓ、Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ  ＡＲ、Ｃｏｐｒｏｃｏｃｃｕｓ  ｃａｔｕｓ、Ａｅｒｏｓｔｉｐｅｓ  ｈａｄｒｕｓ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｃｙｌｉｎｄｒｏｉｄｅｓ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｒｕｍｉｎａｎｔｉｕｍ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ＣＨ−１、Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ  ｅｐｉｄｅｒｍｉｄｉｓ、Ｐｅｐｔｏｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ  ＢＬ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｌｉｍｏｓｕｍ、Ｔｉｓｓｉｒｅｌｌａ  ｐｒａｅａｃｕｔａ、Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ  Ｌ、Ｆｕｓｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｍｏｒｔｉｆｅｒｕｍ  Ｉ、Ｆｕｓｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｎａｖｉｆｏｒｍｅ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｉｎｎｏｃｕｕｍ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｒａｍｏｓｕｍ、Ｐｒｏｐｉｏｎｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ａｃｎｅｓ、Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ  ｆｌａｖｅｆａｃｉｅｎｓ、Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ  ＡＴ、Ｐｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ  ＡＵ−１、Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ  ｆｒａｇｉｌｉｓ  ｓｓｐ．ｏｖａｔｕ���、−ｓｓｐ．ｄ、−ｓｓｐ．ｆ；Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ  Ｌ−１、Ｌ−５；Ｆｕｓｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｎｕｃｌｅａｔｕｍ、Ｆｕｓｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｍｏｒｔｉｆｅｒｕｍ、Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉ、Ｇｅｍｅｌｌａ  ｍｏｒｂｉｌｌｏｒｕｍ、Ｆｉｎｅｇｏｌｄｉａ  ｍａｇｎｕｓ、Ｐｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ  Ｇ、−ＡＵ−２；Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ  ｉｎｔｅｒｍｅｄｉｕｓ、Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ  ｌａｃｔａｒｉｓ、Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ  ＣＯ  Ｇｅｍｍｉｇｅｒ  Ｘ、Ｃｏｐｒｏｃｏｃｃｕｓ  ＢＨ、−ＣＣ；Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｔｅｎｕｅ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｒａｍｕｌｕｓ、Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ  ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｉｆｏｒｍｉｓ  ｓｓｐ．ｃｌｏｓｔｒｉｄｌｉｆｏｒｍｉｓ、Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ  ｃｏａｇｕｌａｎｓ、Ｐｒｅｖｏｔｅｌｌａ  ｏｒａｌｉｓ、Ｐｒｅｖｏｔｅｌｌａ  ｒｕｍｉｎｉｃｏｌａ、Ｏｄｏｒｉｂａｃｔｅｒ  ｓｐｌａｎｃｈｎｉｃｕｓ、Ｄｅｓｕｉｆｏｍｏｎａｓ  ｐｉｇｒａ、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  Ｇ、Ｓｕｃｃｉｎｉｖｉｂｒｉｏ  Ａ、およびこれらの組み合わせからなる群から選択される、実施形態４９の方法。
【０１６５】
実施形態５１．当該糞便微生物叢が、最近胞子を用いてさらに補充される、実施形態１０の方法。
【０１６６】
実施形態５２．当該細菌胞子が、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ胞子またはＢａｃｉｌｌｕｓ胞子である、実施形態５１の方法。
【０１６７】
実施形態５３．当該糞便微生物叢の調製が、エタノール処理、洗浄剤処理、熱処理、照射、および超音波処理からなる群から選択される処理を含む、実施形態１０の方法。
【０１６８】
実施形態５４．当該糞便微生物叢の調製が、エタノール処理、洗浄剤処理、熱処理、照射、および超音波処理からなる群から選択される処理を含まない、実施形態１０の方法。
【０１６９】
実施形態５５．当該糞便微生物叢の調製が、密度勾配、ろ過、およびクロマトグラフィーからなる群から選択される分離工程を含む、実施形態１０の方法。
【０１７０】
実施形態５６．当該糞便微生物叢の調製が、密度勾配、ろ過、およびクロマトグラフィーからなる群から選択される分離工程を含まない、実施形態１０の方法。
【０１７１】
実施形態５７．前記糞便微生物叢が、ドナーの糞便微生物叢全体を含む、実施形態１０の方法。
【０１７２】
実施形態５８．当該組成物が、当該糞便微生物叢のドナー由来の真核細胞を実質的に含まない、実施形態１０の方法。
【０１７３】
実施形態５９．当該糞便微生物叢が、再構成糞便材料に由来する、実施形態１０の方法。
【０１７４】
実施形態６０．当該糞便微生物叢が、合成糞便材料に由来する、実施形態１０の方法。
【０１７５】
実施形態６１．当該糞便微生物叢が、抗生物質耐性群集を含まない、実施形態１０の方法。
【０１７６】
実施形態６２．当該糞便微生物叢が、正常で健康なヒト糞便細菌叢に似た割合の含有量の生存能力のある細菌叢の調製物を含む、実施形態１０の方法。
【０１７７】
実施形態６３．当該糞便微生物叢が、少なくとも７つの異なる科由来の細菌を含む、実施形態１０の方法。
【０１７８】
実施形態６４．当該糞便微生物叢が、０．４〜５．０のシャノン多様性指数を有する、実施形態１０の方法。
【０１７９】
実施形態６５．当該糞便微生物叢が、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ、Ｂａｃｉｌｌｕｓ、Ｃｏｌｌｉｎｓｅｌｌａ、Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ、Ｆｕｓｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ、Ｐｒｏｐｉｏｎｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ、Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ、Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉ、Ｇｅｍｍｉｇｅｒ、Ｄｅｓｕｌｆｏｍｏｎａｓ、Ｐｅｐｔｏｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ、およびＭｏｎｉｌｉａからなる群から選択される１つ以上の微生物を含む、実施形態１０の方法。
【０１８０】
実施形態６６．当該糞便微生物叢が、生存能力のあるＢａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ、Ｆｕｓｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ、Ｐｒｏｐｉｏｎｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ、Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ、Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉ、Ｇｅｍｍｉｇｅｒ、Ｄｅｓｕｌｆｏｍｏｎａｓ、Ｐｅｐｔｏｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ、Ｍｏｎｉｌｉａ、または任意のこれらの組み合わせを含まない、実施形態１０の方法。
【０１８１】
実施形態６７．当該糞便微生物が、Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ  ｆｒａｇｉｌｉｓ  ｓｓｐ．ｖｕｌｇａｔｕｓ、Ｃｏｌｌｉｎｓｅｌｌａ  ａｅｒｏｆａｃｉｅｎｓ、Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ  ｆｒａｇｉｌｉｓ  ｓｓｐ．ｔｈｅｔａｉｏｔａｏｍｉｃｒｏｎ、Ｐｅｐｔｏｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ  ｐｒｏｄｕｃｔｕｓ  ＩＩ、Ｐａｒａｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ  ｄｉｓｔａｓｏｎｉｓ、Ｆｕｓｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｐｒａｕｓｎｉｔｚｉｉ、Ｃｏｐｒｏｃｏｃｃｕｓ  ｅｕｔａｃｔｕｓ、Ｃｏｌｌｉｎｓｅｌｌａ  ａｅｒｏｆａｃｉｅｎｓ  ＩＩＩ、Ｐｅｐｔｏｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ  ｐｒｏｄｕｃｔｕｓ  Ｉ、Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ  ｂｒｏｍｉｉ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ａｄｏｌｅｓｃｅｎｔｉｓ、Ｇｅｍｍｉｇｅｒ  ｆｏｒｍｉｃｉｌｉｓ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｌｏｎｇｕｍ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｓｉｒａｅｕｍ、Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ  ｔｏｒｑｕｅｓ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｒｅｃｔａｌｅ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｅｌｉｇｅｎｓ、Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ  ｅｇｇｅｒｔｈｉｉ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｌｅｐｔｕｍ、Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ  ｆｒａｇｉｌｉｓ  ｓｓｐ．Ａ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｂｉｆｏｒｍｅ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｒｅｃｔａｌｅ  ＩＩＩ−Ｆ、Ｃｏｐｒｏｃｏｃｃｕｓ  ｃｏｍｅｓ、Ｐｓｅｕｄｏｆｌａｖｏｎｉｆｒａｃｔｏｒ  ｃａｐｉｌｌｏｓｕｓ、Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ  ａｌｂｕｓ、Ｄｏｒｅａ  ｆｏｒｍｉｃｉｇｅｎｅｒａｎｓ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｖｅｎｔｒｉｏｓｕｍ  Ｉ、Ｆｕｓｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｒｕｓｓｉ、Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ  ｏｂｅｕｍ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｒｅｃｔａｌｅ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｒａｍｏｓｕｍ、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｌｅｉｃｈｍａｎｎｉｉ、Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ  ｃａｌｌｉｄｕｓ、Ｂｕｔｙｒｉｖｉｂｒｉｏ  ｃｒｏｓｓｏｔｕｓ、Ａｃｉｄａｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ  ｆｅｒｍｅｎｔａｎｓ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｖｅｎｔｒｉｏｓｕｍ、Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ  ｆｒａｇｉｌｉｓ  ｓｓｐ．ｆｒａｇｉｌｉｓ、Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ  ＡＲ、Ｃｏｐｒｏｃｏｃｃｕｓ  ｃａｔｕｓ、Ａｅｒｏｓｔｉｐｅｓ  ｈａｄｒｕｓ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｃｙｌｉｎｄｒｏｉｄｅｓ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｒｕｍｉｎａｎｔｉｕｍ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ＣＨ−１、Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ  ｅｐｉｄｅｒｍｉｄｉｓ、Ｐｅｐｔｏｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ  ＢＬ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｌｉｍｏｓｕｍ、Ｔｉｓｓｉｒｅｌｌａ  ｐｒａｅａｃｕｔａ、Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ  Ｌ、Ｆｕｓｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｍｏｒｔｉｆｅｒｕｍ  Ｉ、Ｆｕｓｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｎａｖｉｆｏｒｍｅ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｉｎｎｏｃｕｕｍ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｒａｍｏｓｕｍ、Ｐｒｏｐｉｏｎｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ａｃｎｅｓ、Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ  ｆｌａｖｅｆａｃｉｅｎｓ、Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ  ＡＴ、Ｐｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ  ＡＵ−１、Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ  ｆｒａｇｉｌｉｓ  ｓｓｐ．ｏｖａｔｕ���、−ｓｓｐ．ｄ、−ｓｓｐ．ｆ；Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ  Ｌ−１、Ｌ−５；Ｆｕｓｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｎｕｃｌｅａｔｕｍ、Ｆｕｓｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｍｏｒｔｉｆｅｒｕｍ、Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉ、Ｇｅｍｅｌｌａ  ｍｏｒｂｉｌｌｏｒｕｍ、Ｆｉｎｅｇｏｌｄｉａ  ｍａｇｎｕｓ、Ｐｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ  Ｇ、−ＡＵ−２；Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ  ｉｎｔｅｒｍｅｄｉｕｓ、Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ  ｌａｃｔａｒｉｓ、Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ  ＣＯ  Ｇｅｍｍｉｇｅｒ  Ｘ、Ｃｏｐｒｏｃｏｃｃｕｓ  ＢＨ、−ＣＣ；Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｔｅｎｕｅ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｒａｍｕｌｕｓ、Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ  ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｉｆｏｒｍｉｓ  ｓｓｐ．ｃｌｏｓｔｒｉｄｌｉｆｏｒｍｉｓ、Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ  ｃｏａｇｕｌａｎｓ、Ｐｒｅｖｏｔｅｌｌａ  ｏｒａｌｉｓ、Ｐｒｅｖｏｔｅｌｌａ  ｒｕｍｉｎｉｃｏｌａ、Ｏｄｏｒｉｂａｃｔｅｒ  ｓｐｌａｎｃｈｎｉｃｕｓ、Ｄｅｓｕｉｆｏｍｏｎａｓ  ｐｉｇｒａ、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  Ｇ、Ｓｕｃｃｉｎｉｖｉｂｒｉｏ  Ａ、およびこれらの組み合わせからなる群から選択される１つ以上の微生物を含む、実施形態１０の方法。
【０１８２】
実施形態６８．当該組成物が、細菌胞子を少なくとも約２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、８５％、９０％、９５％、９９％、または９９．５％含む、実施形態１の方法。
【０１８３】
実施形態６９．当該組成物が、液体、凍結、凍結乾燥（ｆｒｅｅｚｅ−ｄｒｉｅｄ）、噴霧乾燥、泡沫乾燥、凍結乾燥（ｌｙｏｐｈｉｌｉｚｅｄ）、または粉末形態である、実施形態１の方法。
【０１８４】
実施形態７０．当該組成物が、賦形剤、食塩水、緩衝剤、緩衝化剤、または流体−グルコース−セロビオース寒天（ＲＧＣＡ）培地を含む、実施形態１の方法。
【０１８５】
実施形態７１．当該組成物が抗凍結剤を含む、実施形態１の方法。
【０１８６】
実施形態７２．当該抗凍結剤が、ポリエチレングリコール、スキムミルク、エリトリトール、アラビトール、ソルビトール、グルコース、フルクトース、アラニン、グリシン、プロリン、スクロース、ラクトース、リボース、トレハロース、ジメチルスルホキシド（ＤＭＳＯ）、グリセロール、またはこれら組み合わせを含む、実施形態７１の方法。
【０１８７】
実施形態７３．当該組成物が、酸抑制剤、制酸剤、Ｈ２拮抗薬、プロトンポンプ阻害剤、またはこれらの組み合わせをさらに含む、実施形態１の方法。
【０１８８】
実施形態７４．当該組成物が非生体物質を実質的に含まない、実施形態１の方法。
【０１８９】
実施形態７５．当該組成物が、残留繊維、ＤＮＡ、ウイルス外被材料、および生存不可能な材料からなる群から選択される無細胞物質を実質的に含まない、実施形態１の方法。
【０１９０】
実施形態７６．前記組成物が、腸溶性コーティングカプセルもしくはマイクロカプセル、耐酸性カプセルもしくはマイクロカプセル、再構成に好適な粉末、経鼻十二指腸注入として製剤化されるか、または浣腸もしくは結腸鏡下注入の形態で送達するためのものである、実施形態１の方法。
【０１９１】
実施形態７７．当該組成物が、食品、液体飲料、食品添加物、乳製品ベースの製品、大豆ベースの製品、またはこれらの派生物、ゼリー、もしくはヨーグルトと一緒に投与される、実施形態１の方法。
【０１９２】
実施形態７８．当該対象が、当該組成物の投与前に抗生物質で前治療される、実施形態１の方法。
【０１９３】
実施形態７９．当該抗生物質が、リファブチン、クラリスロマイシン、クロファジミン、バンコマイシン、リファンピシン、ニトロイミダゾール、クロラムフェニコール、およびこれらの組み合わせからなる群から選択される、実施形態７８の方法。
【０１９４】
実施形態８０．当該抗生物質が、リファキシミン、リファマイシン誘導体、リファンピシン、リファブチン、リファペンチン、リファラジル、ビコザマイシン、アミノグリコシド、ゲンタマイシン、ネオマイシン、ストレプトマイシン、パロモマイシン、ベルダマイシン、ムタマイシン、シソマイシン、ネチルマイシン、レチマイシン、カナマイシン、アズトレオナム、アズトレオナムマクロライド、クラリスロマイシン、ジリスロマイシン、ロキシトロマイシン、テリスロマイシン、アジスロマイシン、次サリチル酸ビスマス、バンコマイシン、ストレプトマイシン、フィダキソマイシン、アミカシン、アルベカシン、ネオマイシン、ネチルマイシン、パロモマイシン、ロドストレプトマイシン、トブラマイシン、アプラマイシン、およびこれらの組み合わせからなる群から選択される、実施形態７８の方法。
【０１９５】
実施形態８１．当該対象が、当該組成物の投与前に抗炎症薬で前治療される、先行する請求項のいずれか一項に記載の方法。
【０１９６】
実施形態８２．当該組成物が、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ａｂｓｏｎｕｍ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ａｒｇｅｎｔｉｎｅｎｓｅ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂａｒａｔｉｉ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｏｔｕｌｉｎｕｍ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｃａｄａｖｅｒｉｓ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｃａｒｎｉｓ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｃｅｌａｔｕｍ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｃｈａｕｖｏｅｉ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｏｆｏｒｍｅ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｃｏｃｈｌｅａｒｉｕｍ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｆａｌｌａｘ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｆｅｌｓｉｎｅｕｍ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｇｈｏｎｉｉ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｇｌｙｃｏｌｉｃｕｍ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｈａｅｍｏｌｙｔｉｃｕｍ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｈａｓｔｉｆｏｒｍｅ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｈｉｓｔｏｌｙｔｉｃｕｍ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｉｎｄｏｌｉｓ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｉｒｒｅｇｕｌａｒｅ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｌｉｍｏｓｕｍ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｍａｌｅｎｏｍｉｎａｔｕｍ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｎｏｖｙｉ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｏｒｏｔｉｃｕｍ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｐａｒａｐｕｔｒｉｆｉｃｕｍ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｐｅｒｆｒｉｎｇｅｎｓ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｐｉｌｉｆｏｒｍｅ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｐｕｔｒｅｆａｃｉｅｎｓ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｐｕｔｒｉｆｉｃｕｍ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｓａｒｄｉｎｉｅｎｓｅ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｓａｒｔａｇｏｆｏｒｍｅ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｓｃｉｎｄｅｎｓ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｓｅｐｔｉｃｕｍ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｓｏｒｄｅｌｌｉｉ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｓｐｈｅｎｏｉｄｅｓ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｓｐｉｒｏｆｏｒｍｅ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｓｐｏｒｏｇｅｎｅｓ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｓｕｂｔｅｒｍｉｎａｌｅ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｓｙｍｂｉｏｓｕｍ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｔｅｒｔｉｕｍ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｔｅｔａｎｉ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｗｅｌｃｈｉｉ、およびＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｖｉｌｌｏｓｕｍからなる群から選択される１つ以上、２つ以上、３つ以上、または４つ以上のＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ種の非病原性胞子を含む、先行する請求項のいずれか一項に記載の方法。
【０１９７】
実施形態８３．当該組成物が、精製、単離、または培養された生存能力のある非病原性Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍと、Ｃｏｌｌｉｎｓｅｌｌａ、Ｃｏｐｒｏｃｏｃｃｕｓ、Ｄｏｒｅａ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ、およびＲｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓからなる群から選択される１つ以上の属に由来する複数の精製、単離、または培養された生存能力のある非病原性微生物と、を含む、実施形態１の方法。
【０１９８】
実施形態８４．当該組成物が、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ、Ｃｏｌｌｉｎｓｅｌｌａ、Ｃｏｐｒｏｃｏｃｃｕｓ、Ｄｏｒｅａ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ、およびＲｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓからなる群から選択される１つ以上の属に由来する複数の精製、単離、または培養された生存能力のある非病原性微生物を含む、実施形態１の方法。
【０１９９】
実施形態８５．当該組成物が、Ｃｏｌｌｉｎｓｅｌｌａ、Ｃｏｐｒｏｃｏｃｃｕｓ、Ｄｏｒｅａ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ、およびＲｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓからなる群から選択される２つ以上の属を含む、実施形態８３の方法。
【０２００】
実施形態８６．当該組成物が、Ｃｏｐｒｏｃｏｃｃｕｓ、Ｄｏｒｅａ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ、およびＲｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓからなる群から選択される２つ以上の属を含む、実施形態８３の方法。
【０２０１】
実施形態８７．当該複数の生存能力のある非病原性微生物が、Ｃｏｐｒｏｃｏｃｃｕｓ  ｃａｔｕｓ、Ｃｏｐｒｏｃｏｃｃｕｓ  ｃｏｍｅｓ、Ｄｏｒｅａ  ｌｏｎｇｉｃａｔｅｎａ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｅｌｉｇｅｎｓ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｄｒｕｍ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｒｅｃｔａｌｅ、およびＲｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ  ｔｏｒｑｕｅｓからなる群から選択される１つ以上、２つ以上、３つ以上、４つ以上、または５つ以上の種を含む、実施形態８３または８４の方法。
【０２０２】
実施形態８８．当該方法が、振戦、動作の緩慢化（動作緩慢）、筋肉の硬直、姿勢およびバランスの障害、自動動作の喪失、発話の変化、ならびに筆跡の変化からなる群から選択される１つ以上のＰＤ症状を除去または減少させる、先行する請求項のいずれか一項に記載の方法。
【０２０３】
実施形態８９．当該方法が、症候的抗パーキンソン病療法に当該対象が供されることをさらに含む、先行する請求項のいずれか一項に記載の方法。
【０２０４】
実施形態９０．当該方法が、ブロモクリプチン、ベンズトロピン、レボドパ、ロピニロール、プラミペキソール、ロチゴチン、カベルゴリン、エンタカポン、トルカポン、アマンタジン、セレギリン、またはこれらの組み合わせを投与することをさらに含む、先行する請求項のいずれか一項に記載の方法。
【０２０５】
実質的に本明細書に記載および例示され、添付の図を参照して記載される、実施形態１の方法。
【０２０６】
本開示は、本開示の例示として提供される、以下の非制限的な実施例を参照することによってより良好に理解され得る。以下の実施例は、本開示の好ましい態様をより完全に例示するために提示されているが、いかなる方法でも、広範囲の本開示を限定するものと解釈されるべきではない。したがって、添付の特許請求の範囲は、本明細書に含まれる態様の記載に限定されるべきではない。
【実施例】
【０２０７】
実施例１：糞便微生物叢の調製
米国特許公開第２０１４／０１４７４１７号または国際特許公開公報第２０１４／１５２４８４号に公開されたプロトコルに本質的に従って、糞便微生物叢を調製する。例示的なプロトコルを以下に要約する。
【０２０８】
好適でないドナーを除外するために使用される基準のリストに従って、潜在的な糞便微生物叢ドナーをスクリーニングする。潜在的な糞便微生物叢ドナーは、過去３か月の間に抗生物質、下剤、ダイエット丸薬、免疫調節剤、または化学療法を受けた場合には除外される。潜在的な糞便微生物叢ドナーは、あらゆる既知の感染性疾患、病的肥満、糖尿病、過敏性腸症候群、炎症性腸疾患、慢性下痢、便秘、大腸ポリープもしくは癌、免疫不全、メタボリック症候群、慢性疲労症候群、大きなＧＩ手術、または糞便微生物叢の特定の変化に潜在的に付随する他の疾患もしくは症状の病歴がある場合には除外される。潜在的な糞便微生物叢ドナーは、Ｃ反応性タンパク質、赤血球沈降速度、Ａ型肝炎、Ｂ型肝炎、Ｃ型肝炎、ヒト免疫不全ウイルス、ヒトＴリンパ球向性ウイルス、または梅毒に対する陽性実験室試験を示す場合には除外される。潜在的な糞便微生物叢ドナーは、便卵、寄生虫、またはウイルスに対する陽性試験を示す場合には除外される。潜在的な糞便微生物叢ドナーは、過去３か月内に伝染病が存在していた領域で、ハイリスク性行動をとっているか、収監されていたか、または任意の入れ墨もしくはボディピアッシングを受けていた場合には除外される。
【０２０９】
ドナーの糞便材料（新鮮な糞便）を滅菌された容器に回収し、次に、それを混合器に移す。およそ５００〜１０００ｍＬの０．９％の生理食塩水を混合器に加え、糞便試料と十分に混合する。得られた懸濁液を、最終的な懸濁液を回収する前に、こし器を通して少なくとも４回ろ過する。最終的な懸濁液を、５０ｍＬのチューブ中で１２００×ｇで３分間遠心分離する。上清を捨て、ペレットを、およそ５０ｍＬの滅菌された０．９％の生理食塩水中に緩やかに再懸濁する。遠心分離および再懸濁工程を、さらに２〜４回繰り返す。最後の遠心分離の際に、上清を捨てる。糞便微生物叢を直ちに使用する場合、得られたペレットを、緩やかに混合することによって、１．５容積の０．９％の生理食塩水中に再懸濁する。糞便微生物叢を保存する場合、得られたペレットを、１０％の滅菌されたグリセロール中に再懸濁し、摂氏−８０度で保存する。糞便微生物叢を凍結させる場合、患者への投与前に室温まで温める。糞便微生物叢を凍結乾燥する場合、乾燥保護製剤および凍結乾燥手順は、本質的に、２０１６年１１月１７日に公開された、米国特許公開第２０１６／０３３１７９１号に記載されているものに従う。
【０２１０】
実施例２：腸管機能不全を有するＰＤ患者のための経口カプセル治療プロトコル（短い計画）。
患者を４つのグループに分ける（グループ１〜４）。グループ１の患者に、患者が便通の改善の兆候を示すまで、前治療の抗生物質（例えば、バンコマイシン、メトロニダゾール、およびコルヒチン）を投与する。グループ２は抗生物質を受けない。グループ１および２の両方が、結腸内視鏡検査前の腸管前処置と、その後のカプセル糞便微生物叢療法と、を受ける。グループ３および４は、腸管前処置を受けず、グループ３は抗生物質の前治療を受け、グループ４は抗生物質の前治療を受けない。以下のように、２週間にわたってカプセルを投与する：４日間にわたって２つのカプセル（各々が１０９〜１０１１個の細菌微生物を含有する）を１日２回与え、１０日間にわたって１日おきに２つのカプセルを１日２回与える。最初の４日間にわたる負荷用量（治療用量とも呼ばれる）では高用量カプセル（約１０１２の細胞総数）を使用する。その後の１０日間にわたる維持用量では低用量カプセル（約１０９の細胞総数）を使用する。抗生物質の前治療を受けた患者において、抗生物質を終えた後にカプセルを１日投与する。経口カプセル治療の前、治療中、および治療後に、患者の症状を観察し、臨床検査を行う。治療前、治療中、および治療後のＤＮＡのメタゲノム解析（２〜４日間、１週間、６週間、１２週間）も実施する。
【０２１１】
実施例３：腸管機能不全を有するＰＤ患者のための経口カプセル治療プロトコル（中程度の計画）。
患者を４つのグループに分ける（グループ１〜４）。グループ１の患者に、患者が便通の改善の兆候を示すまで、前治療の抗生物質（例えば、便秘が問題である場合、バンコマイシン、メトロニダゾール、およびコルヒチン）を投与する。グループ２は抗生物質を受けない。グループ１および２の両方が、結腸内視鏡検査前の腸管前処置と、その後のカプセル糞便微生物叢療法と、を受ける。グループ３および４は、腸管前処置を受けず、グループ３は抗生物質の前治療を受け、グループ４は抗生物質の前治療を受けない。以下のように、１８週間以上にわたってカプセルを投与する：１４日間にわたって２つのカプセルを１日２回、１４日間にわたって２つのカプセルを１日おきに１日２回、１４日間にわたって４つのカプセルを１週間に２回、および１２週間にわたって４つのカプセルを１週間に１回（例えば、毎週月曜日）。最初の４週間にわたる負荷用量（治療用量とも呼ばれる）では高用量カプセル（約１０１２の細胞総数）を使用する。その後の１４週間にわたる維持用量では低用量カプセル（約１０９の細胞総数）を使用する。抗生物質の前治療を受けた患者において、抗生物質を終えた後にカプセルを１日投与する。経口カプセル治療の前、治療中、および治療後に、患者の症状を観察し、臨床検査を行う。治療前、治療中、および治療後のＤＮＡのメタゲノム解析（２〜４日間、１週間、６週間、１２週間）も実施する。
【０２１２】
実施例４：ＰＤ患者の治療。
５９歳のＰＤ患者を、凍結乾燥されたドナー由来の非選択的な糞便微生物叢を含有する耐酸性／遅延放出二重カプセル封入経口カプセルに基づいて、糞便微生物叢に基づく治療により治療する。患者の症状としては、重度の腫脹、重度の切迫、左腕の硬直、不安定性の問題、歩行中に首を回すことができないこと、および焦点を合わせることができないことが含まれる。患者は、１日当たり１回の排便を経験している。患者は、２週間の誘導期中の１０回の糞便微生物叢療法の液体直腸浣腸注入と、その後の６週間の維持治療期間中の１日当たり４つのカプセル（各カプセルの細胞総数：約１０９〜１０１２）と、を含む、８週間の治療スケジュールに供される。初期治療後の第３週に、患者は、処方されたＰＤ医薬品を使用しないで、もはや腫脹を経験せず、活力が増し、左腕がわずかに動き、ベッドから起き上がることができる。患者は、引き続き胸焼けを感じる。患者は、１日当たり２回の排便を経験する。初期治療後の第４週に、患者は、数秒の切迫を経験し、処方されたＰＤ医薬品がなければベッドから起き上がることができず、ＰＤ症状、手のひら上の白変模様、および重度の頭痛を経験する。患者は、１日当たり２〜３回の排便を経験する。初期治療後の第５週に、患者は、軽度の切迫、空嘔吐、手振りの使用と、鼓腸と、げっぷとの増加、ならびに動作の全体的な改善（右腕がわずかに改善し、左腕の硬直はまだ存在する）を経験する。患者の全体的な生命観が改善した。患者は、１日当たり１回の排便を経験する。患者の症状は、第７週には、第５週と同様の範囲の改善を維持する。患者は、８週目に甲状腺摘除のために治療を中止する。
【０２１３】
実施例５：ＰＤ患者の治療。
５５歳のＰＤ患者を、凍結乾燥されたドナー由来の非選択的な糞便微生物叢を含有する耐酸性／遅延放出二重カプセル封入経口カプセルに基づいて、糞便微生物叢に基づく治療により治療する。患者の症状としては、軽度の腫脹、軽度の切迫、軽度の腹部不快感、感覚喪失、喉の締め付け感が含まれる。患者は、感覚喪失、のどの締め付け感、左手の薬指の振戦、左肩の凍結、長引く咳、左腕の硬直、重度の便秘、排便前の痛み、および左脚の振戦などの以前の症状を経験した。患者は、患者は、１日当たり２回の排便を経験する。患者は、１週間の誘導期中の５回の糞便微生物叢の結腸鏡下(colonscopic)注入と、維持期間中の６週間にわたる１日当たり４つのカプセルと、を含む、７週間の治療計画を開始する。初期糞便微生物叢療法後の第５週に、患者は、腫脹、腹部不快感、または切迫がないことを経験する。さらなるいくつかのＰＤ症状の改善も観察される。例えば、左脚および腕の振戦が減少する。しかしながら、バランスの減少も観察される。第６週には、ＰＤ症状の主な改善は観察されない。
【０２１４】
実施例６：ＰＤ患者の治療。
６０歳のＰＤ患者を、糞便微生物叢に基づく治療で治療する。患者の症状としては、発話、手の振戦、歩行困難、および小字症が含まれる。患者は、２週間の誘導期中の１０回の新鮮な糞便微生物叢の注入と、維持期間中の６週間にわたる１日当たり４つのカプセルと、を含む、８週間の治療計画を処方される。
【０２１５】
様々な修正を、本開示の範囲から逸脱しない範囲で、本明細書において説明され、例示される構造および方法に加えることができることから、これまでの説明に含まれるすべての内容は、限定ではなく、例示として解釈されるべきことが意図される。本開示の広さ、および範囲は、上記の例示的な実施形態のうちのいずれによっても限定されるべきではなく、以下の本明細書に添付の特許請求の範囲およびそれらの同等物に従ってのみ定義されるべきである。本明細書において引用されるすべての特許文献および非特許文献は、その全体が参照により本明細書に組み込まれる。
【国際調査報告】
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