(57)【要約】ヒト化Ａｓｇｒ１座位を含む非ヒト動物細胞および非ヒト動物、ならびに当該非ヒト動物細胞および非ヒト動物を使用する方法が提供される。ヒト化Ａｓｇｒ１座位を含む非ヒト動物細胞または非ヒト動物は、ヒトＡＳＧＲ１タンパク質、またはＡｓｇｒ１タンパク質、ヒトＡＳＧＲ１由来の断片を発現する。ヒト化Ａｓｇｒ１座位を含む当該非ヒト動物を使用して、治療用分子または治療用複合体の肝臓へのヒトＡＳＧＲ１介在送達のインビボ有効性を評価する方法、およびヒトＡＳＧＲ１介在性機序を介して作用する治療用分子または治療用複合体の有効性を評価する方法が提供される。【特許請求の範囲】
【請求項１】
改変Ａｓｇｒ１タンパク質をコードする遺伝子改変内因性Ａｓｇｒ１座位を含む非ヒト動物または非ヒト動物ゲノムであって、前記改変Ａｓｇｒ１タンパク質は、細胞質ドメイン、膜貫通ドメインおよび細胞外ドメインを含み、前記細胞外ドメインのすべてまたは一部は、欠失され、オルソロガスなヒトＡＳＧＲ１配列と置き換えられた内因性Ａｓｇｒ１座位のセグメントによりコードされ、および
前記非ヒト動物は、前記改変Ａｓｇｒ１タンパク質を発現する、非ヒト動物または非ヒト動物ゲノム。
【請求項２】
前記細胞外ドメインは、多重コイルドメインとＣ型レクチンドメインを含み、前記Ｃ型レクチンドメインのすべてまたは一部は、欠失され、オルソロガスなヒトＡＳＧＲ１配列と置き換えられた前記内因性Ａｓｇｒ１座位のセグメントによりコードされる、請求項１に記載の非ヒト動物または非ヒト動物ゲノム。
【請求項３】
前記Ｃ型レクチンドメインは、ヒトＡＳＧＲ１のＣ型レクチンドメインである、請求項２に記載の非ヒト動物または非ヒト動物ゲノム。
【請求項４】
前記Ｃ型レクチンドメインは、配列番号２８に記載される配列を含む、請求項２もしくは３に記載の非ヒト動物または非ヒト動物ゲノム。
【請求項５】
前記細胞外ドメインは、多重コイルドメインとＣ型レクチンドメインを含み、前記多重コイルドメインのすべてまたは一部は、欠失され、オルソロガスなヒトＡＳＧＲ１配列と置き換えられた前記内因性Ａｓｇｒ１座位のセグメントによりコードされる、請求項１に記載の非ヒト動物または非ヒト動物ゲノム。
【請求項６】
前記多重コイルドメインは、ヒトＡＳＧＲ１の多重コイルドメインである、請求項５に記載の非ヒト動物または非ヒト動物ゲノム。
【請求項７】
前記多重コイルドメインは、配列番号２７に記載される配列を含む、請求項５もしくは６に記載の非ヒト動物または非ヒト動物ゲノム。
【請求項８】
前記多重コイルドメインと前記Ｃ型レクチンドメインの両方のすべて、または一部は、欠失され、オルソロガスなヒトＡＳＧＲ１配列と置き換えられた前記内因性Ａｓｇｒ１座位のセグメントによりコードされる、請求項２〜７のいずれか１項に記載の非ヒト動物または非ヒト動物ゲノム。
【請求項９】
前記Ｃ型レクチンドメインは、ヒトＡＳＧＲ１のＣ型レクチンドメインであり、前記多重コイルドメインは、ヒトＡＳＧＲ１のＣ型レクチンドメインである、請求項８に記載の非ヒト動物または非ヒト動物ゲノム。
【請求項１０】
前記Ｃ型レクチンドメインは、配列番号２８に記載される配列を含み、前記多重コイルドメインは、配列番号２７に記載される配列を含む、請求項８または９に記載の非ヒト動物または非ヒト動物ゲノム。
【請求項１１】
前記オルソロガスなヒトＡＳＧＲ１配列は、ヒトＡＳＧＲ１遺伝子のエクソン３〜８を含む、請求項１〜１０のいずれか１項に記載の非ヒト動物または非ヒト動物ゲノム。
【請求項１２】
前記オルソロガスなヒトＡＳＧＲ１配列は、配列番号３１に記載される配列を含むＡＳＧＲ１タンパク質セグメントをコードする、請求項１１に記載の非ヒト動物または非ヒト動物ゲノム。
【請求項１３】
前記細胞質ドメインのすべてまたは一部は、内因性非ヒト動物Ａｓｇｒ１配列によりコードされる、請求項１〜１２のいずれか１項に記載の非ヒト動物または非ヒト動物ゲノム。
【請求項１４】
前記膜貫通ドメインのすべてまたは一部は、内因性非ヒト動物Ａｓｇｒ１配列によりコードされる、請求項１〜１３のいずれか１項に記載の非ヒト動物または非ヒト動物ゲノム。
【請求項１５】
前記細胞質ドメインと前記膜貫通ドメインの両方のすべて、または一部は、内因性非ヒト動物Ａｓｇｒ１配列によりコードされる、請求項１３または１４に記載の非ヒト動物または非ヒト動物ゲノム。
【請求項１６】
前記非ヒト動物または非ヒト動物ゲノムが、前記遺伝子改変された内因性Ａｓｇｒ１座位に対してヘテロ接合性である、請求項１〜１５のいずれか１項に記載の非ヒト動物または非ヒト動物ゲノム。
【請求項１７】
前記非ヒト動物または非ヒト動物ゲノムが、前記遺伝子改変された内因性Ａｓｇｒ１座位に対してホモ接合性である、請求項１〜１５のいずれか１項に記載の非ヒト動物または非ヒト動物ゲノム。
【請求項１８】
前記非ヒト動物が哺乳動物であり、または前記非ヒト動物ゲノムが哺乳動物ゲノムである、請求項１〜１７のいずれか１項に記載の非ヒト動物または非ヒト動物ゲノム。
【請求項１９】
前記非ヒト動物が齧歯類であり、または前記非ヒト動物ゲノムが齧歯類ゲノムである、請求項１８に記載の非ヒト動物または非ヒト動物ゲノム。
【請求項２０】
前記非ヒト動物がラットもしくはマウスであり、または前記非ヒト動物ゲノムがラットゲノムもしくはマウスゲノムである、請求項１９に記載の非ヒト動物または非ヒト動物ゲノム。
【請求項２１】
前記非ヒト動物がマウスであり、または前記非ヒト動物ゲノムがマウスゲノムである、請求項２０に記載の非ヒト動物または非ヒト動物ゲノム。
【請求項２２】
前記細胞質ドメインのすべてまたは一部は、内因性マウスＡｓｇｒ１配列によりコードされる、請求項２１に記載の非ヒト動物または非ヒト動物ゲノム。
【請求項２３】
前記細胞質ドメインは、配列番号２９に記載される配列を含む、請求項２２に記載の非ヒト動物または非ヒト動物ゲノム。
【請求項２４】
膜貫通ドメインのすべてまたは一部は、内因性マウスＡｓｇｒ１配列によりコードされる、請求項２１に記載の非ヒト動物または非ヒト動物ゲノム。
【請求項２５】
前記膜貫通ドメインは、配列番号３０に記載される配列を含む、請求項２４に記載の非ヒト動物または非ヒト動物ゲノム。
【請求項２６】
前記細胞質ドメインと前記膜貫通ドメインの両方のすべて、または一部は、内因性マウスＡｓｇｒ１配列によりコードされる、請求項２２〜２５のいずれか１項に記載の非ヒト動物または非ヒト動物ゲノム。
【請求項２７】
前記細胞質ドメインは、配列番号２９に記載される配列を含み、前記膜貫通ドメインは、配列番号３０に記載される配列を含む、請求項２６に記載の非ヒト動物または非ヒト動物ゲノム。
【請求項２８】
前記細胞外ドメインは多重コイルドメインとＣ型レクチンドメインを含み、前記多重コイルドメインと前記Ｃ型レクチンドメインの両方のすべてまたは一部は、欠失され、オルソロガスなヒトＡＳＧＲ１配列と置き換えられた前記内因性Ａｓｇｒ１座位のセグメントによりコードされ、前記細胞質ドメインと前記膜貫通ドメインの両方のすべてまたは一部は、内因性マウスＡｓｇｒ１配列によりコードされる、請求項２１〜２７のいずれか１項に記載の非ヒト動物または非ヒト動物ゲノム。
【請求項２９】
前記Ｃ型レクチンドメインは、ヒトＡＳＧＲ１のＣ型レクチンドメインであり、前記多重コイルドメインは、ヒトＡＳＧＲ１の多重コイルドメインであり、前記細胞質ドメインは、マウスＡｓｇｒ１の細胞質ドメインであり、そして前記膜貫通ドメインは、マウスＡｓｇｒ１の膜貫通ドメインである、請求項２１〜２８のいずれか１項に記載の非ヒト動物または非ヒト動物ゲノム。
【請求項３０】
前記Ｃ型レクチンドメインは、配列番号２８に記載される配列を含み、前記多重コイルドメインは、配列番号２７に記載される配列を含み、前記細胞質ドメインは、配列番号２９に記載される配列を含み、そして前記膜貫通ドメインは、配列番号３０に記載される配列を含む、請求項２８または２９に記載の非ヒト動物または非ヒト動物ゲノム。
【請求項３１】
前記改変Ａｓｇｒ１タンパク質は、配列番号３に記載される配列を含む、請求項３０に記載の非ヒト動物または非ヒト動物ゲノム。
【請求項３２】
ヒト−ＡＳＧＲ１−介在性内部移行を介したインビボでの治療用複合体の肝臓への送達を評価する方法であって、
（ａ）  請求項１〜３１のいずれか１項に記載の非ヒト動物に治療用複合体を投与することであって、前記治療用複合体は、治療用分子と、ヒトＡＳＧＲ１に特異的に結合する抗原結合タンパク質またはリガンドを含む、投与すること、および
（ｂ）  前記非ヒト動物の肝臓への前記治療用分子の送達を評価すること、を含む、方法。
【請求項３３】
前記治療用分子は、リソソーム置換タンパク質または酵素であるか、または前記リソソーム置換タンパク質または酵素をコードする核酸であり、そして工程（ｂ）は、前記非ヒト動物の肝臓中の前記リソソーム置換タンパク質もしくは酵素の存在または活性を評価することを含む、請求項３２に記載の方法。
【請求項３４】
前記治療用分子は、治療用分泌タンパク質をコードする核酸であり、そして工程（ｂ）は、前記非ヒト動物中の前記治療用分泌タンパク質の血清レベルまたは活性を評価することを含む、請求項３２に記載の方法。
【請求項３５】
インビボでのヒトＡＳＧＲ１を介した内部移行に関し、肝臓細胞表面タンパク質または肝臓中の可溶性タンパク質を標的とする治療用分子の有効性を評価する方法であって、
（ａ）  請求項１〜３１のいずれか１項に記載の非ヒト動物に前記治療用分子を投与することであって、前記治療用分子は、前記肝臓細胞表面タンパク質または前記可溶性タンパク質に特異的に結合し、およびヒトＡＳＧＲ１に特異的に結合する二重特異性抗原結合タンパク質を含む、投与すること、および
（ｂ）  前記非ヒト動物の肝臓中の前記肝臓細胞表面タンパク質の細胞表面レベルまたは活性を評価すること、または前記非ヒト動物の肝臓中の前記可溶性タンパク質の発現または活性を評価すること、を含む方法。
【請求項３６】
改変Ａｓｇｒ１タンパク質をコードする遺伝子改変内因性Ａｓｇｒ１座位を含む非ヒト動物細胞であって、前記改変Ａｓｇｒ１タンパク質は、細胞質ドメイン、膜貫通ドメインおよび細胞外ドメインを含み、前記細胞外ドメインのすべてまたは一部は、欠失され、オルソロガスなヒトＡＳＧＲ１配列と置き換えられた内因性Ａｓｇｒ１座位のセグメントによりコードされる、非ヒト動物細胞。
【請求項３７】
前記非ヒト動物細胞が、肝細胞である、請求項３６に記載の非ヒト動物細胞。
【請求項３８】
前記非ヒト動物細胞が、多能性細胞である、請求項３６に記載の非ヒト動物細胞。
【請求項３９】
前記非ヒト動物細胞が、ＥＳ細胞である、請求項３８に記載の非ヒト動物細胞。
【請求項４０】
前記非ヒト動物細胞が、生殖細胞である、請求項３８に記載の非ヒト動物細胞。
【請求項４１】
請求項３６〜４０のいずれか１項に記載の非ヒト動物細胞を含む組成物。
【請求項４２】
配列番号１８、配列番号１９、配列番号２０、配列番号２２、配列番号２３、およびそれらの組み合わせを含む群から選択される配列を含む核酸。
【請求項４３】
配列番号２４として記載される配列を含む、請求項４２に記載の核酸。
【請求項４４】
配列番号３として記載されるアミノ酸配列をコードすることを特徴とする、請求項４２または請求項４３に記載の核酸。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
ＥＦＳウェブ経由でテキストファイルとして提出された配列表への参照
１０３６２ＷＯ０１＿ＳＴ２５．ｔｘｔファイルに記述されている配列表は、５０キロバイトであり、２０１８年６月２６日に作成され、参照により本明細書に組み込まれる。
【背景技術】
【０００２】
多くの疾患が、関連する組織または器官に対する治療用分子の標的化が不十分であるために、適切には治療されていない。対象への生物活性剤の送達は、構成要素が標的の細胞または組織に到達することの困難性により妨げられることが多い。
【０００３】
細胞型特異的な内部移行エフェクター、例えば標的細胞によって間接的または直接的に内部移行されるヒトＡＳＧＲ１のような細胞型特異的な受容体を使用して、インビボにおける特定の標的細胞への治療用分子の送達を促進および強化することができる。同様に、こうした細胞型特異的な内部移行エフェクターは治療目的にふさわしく、インビボで標的の細胞表面受容体または標的の可溶性タンパク質の内部移行を促進することができる。しかしながら、インビボでこうした送達機序および治療機序の有効性を評価するための適切なモデルが未だ不足している。
【発明の概要】
【課題を解決するための手段】
【０００４】
ヒト化Ａｓｇｒ１座位を含み、当該ヒト化Ａｓｇｒ１座位からヒト化またはキメラＡＳＧＲ１タンパク質を発現する非ヒト動物が提供される。ならびに当該非ヒト動物（例えば齧歯類、例えばラットまたはマウス）、当該非ヒト動物から誘導された細胞および組織、ならびに当該動物の作製に有用なヌクレオチド（例えば標的化ベクター、ゲノムなど）の使用方法が提供される。
【０００５】
一つの態様において、改変Ａｓｇｒ１タンパク質をコードする遺伝子改変内因性Ａｓｇｒ１座位を含む非ヒト動物が提供され、この場合において当該改変Ａｓｇｒ１タンパク質は、細胞質ドメイン、膜貫通ドメインおよび細胞外ドメインを含み、当該細胞外ドメインのすべてまたは一部は、欠失され、オルソロガスなヒトＡＳＧＲ１配列と置き換えられた内因性Ａｓｇｒ１座位のセグメントによりコードされている。かかる非ヒト動物の一部において、細胞外ドメインは、多重コイルドメイン（ｃｏｉｌｅｄ−ｃｏｉｌ  ｄｏｍａｉｎ）とＣ型レクチンドメインを含み、当該Ｃ型レクチンドメインのすべてまたは一部は、欠失され、オルソロガスなヒトＡＳＧＲ１配列と置き換えられた内因性Ａｓｇｒ１座位のセグメントによりコードされている。任意で、Ｃ型レクチンドメインは、ヒトＡＳＧＲ１のＣ型レクチンドメインである。任意で、Ｃ型レクチンドメインは、配列番号２８に記載される配列を含む。
【０００６】
かかる動物の一部において、細胞外ドメインは、多重コイルドメインとＣ型レクチンドメインを含み、当該多重コイルドメインのすべてまたは一部は、欠失され、オルソロガスなヒトＡＳＧＲ１配列と置き換えられた内因性Ａｓｇｒ１座位のセグメントによりコードされている。任意で、多重コイルドメインは、ヒトＡＳＧＲ１の多重コイルドメインである。任意で、多重コイルドメインは、配列番号２７に記載される配列を含む。
【０００７】
かかる動物の一部において、多重コイルドメインとＣ型レクチンドメインの両方のすべて、または一部は、欠失され、オルソロガスなヒトＡＳＧＲ１配列と置き換えられた内因性Ａｓｇｒ１座位のセグメントによりコードされている。任意で、Ｃ型レクチンドメインは、ヒトＡＳＧＲ１のＣ型レクチンドメインであり、多重コイルドメインは、ヒトＡＳＧＲ１の多重コイルドメインである。任意で、Ｃ型レクチンドメインは、配列番号２８に記載される配列を含み、多重コイルドメインは、配列番号２７に記載される配列を含む。
【０００８】
かかる動物の一部において、オルソロガスなヒトＡＳＧＲ１配列は、ヒトＡＳＧＲ１遺伝子のエクソン３〜８を含む。任意で、オルソロガスなヒトＡＳＧＲ１配列は、配列番号３１に記載される配列を含むＡＳＧＲ１タンパク質セグメントをコードする。
【０００９】
かかる動物の一部において、細胞質ドメインのすべてまたは一部は、内因性非ヒト動物Ａｓｇｒ１配列によりコードされる。かかる動物の一部において、膜貫通ドメインのすべてまたは一部は、内因性非ヒト動物Ａｓｇｒ１配列によりコードされる。任意で、細胞質ドメインと膜貫通ドメインの両方のすべて、または一部は、内因性非ヒト動物Ａｓｇｒ１配列によりコードされる。
【００１０】
別の態様において、ヒト化Ａｓｇｒ１座位を含む非ヒト動物の細胞または組織（例えば非ヒト肝細胞、非ヒト胚性幹（ＥＳ）細胞、または他の多能性細胞、例えば生殖細胞）、およびそれらを含むインビトロ組成物が提供される。一つの態様において、改変Ａｓｇｒ１タンパク質をコードする遺伝子改変内因性Ａｓｇｒ１座位を含む非ヒト動物細胞が提供され、この場合において当該改変Ａｓｇｒ１タンパク質は、細胞質ドメイン、膜貫通ドメインおよび細胞外ドメインを含み、当該細胞外ドメインのすべてまたは一部は、欠失され、オルソロガスなヒトＡＳＧＲ１配列と置き換えられた内因性Ａｓｇｒ１座位のセグメントによりコードされている。かかる非ヒト動物細胞の一部において、細胞外ドメインは、多重コイルドメインとＣ型レクチンドメインを含み、当該Ｃ型レクチンドメインのすべてまたは一部は、欠失され、オルソロガスなヒトＡＳＧＲ１配列と置き換えられた内因性Ａｓｇｒ１座位のセグメントによりコードされている。任意で、Ｃ型レクチンドメインは、ヒトＡＳＧＲ１のＣ型レクチンドメインである。任意で、Ｃ型レクチンドメインは、配列番号２８に記載される配列を含む。
【００１１】
かかる非ヒト動物細胞の一部において、細胞外ドメインは、多重コイルドメインとＣ型レクチンドメインを含み、当該多重コイルドメインのすべてまたは一部は、欠失され、オルソロガスなヒトＡＳＧＲ１配列と置き換えられた内因性Ａｓｇｒ１座位のセグメントによりコードされている。任意で、多重コイルドメインは、ヒトＡＳＧＲ１の多重コイルドメインである。任意で、多重コイルドメインは、配列番号２７に記載される配列を含む。
【００１２】
かかる非ヒト動物細胞の一部において、多重コイルドメインとＣ型レクチンドメインの両方のすべて、または一部は、欠失され、オルソロガスなヒトＡＳＧＲ１配列と置き換えられた内因性Ａｓｇｒ１座位のセグメントによりコードされている。任意で、Ｃ型レクチンドメインは、ヒトＡＳＧＲ１のＣ型レクチンドメインであり、多重コイルドメインは、ヒトＡＳＧＲ１の多重コイルドメインである。任意で、Ｃ型レクチンドメインは、配列番号２８に記載される配列を含み、多重コイルドメインは、配列番号２７に記載される配列を含む。
【００１３】
かかる非ヒト動物細胞の一部において、オルソロガスなヒトＡＳＧＲ１配列は、ヒトＡＳＧＲ１遺伝子のエクソン３〜８を含む。任意で、オルソロガスなヒトＡＳＧＲ１配列は、配列番号３１に記載される配列を含むＡＳＧＲ１タンパク質セグメントをコードする。
【００１４】
かかる非ヒト動物細胞の一部において、細胞質ドメインのすべてまたは一部は、内因性非ヒト動物Ａｓｇｒ１配列によりコードされる。かかる動物細胞の一部において、膜貫通ドメインのすべてまたは一部は、内因性非ヒト動物Ａｓｇｒ１配列によりコードされる。任意で、細胞質ドメインと膜貫通ドメインの両方のすべて、または一部は、内因性非ヒト動物Ａｓｇｒ１配列によりコードされる。
【００１５】
かかる動物および／または動物細胞の一部は、遺伝子改変された内因性Ａｓｇｒ１座位に関してヘテロ接合性である。かかる動物および／または動物細胞の一部は、遺伝子改変された内因性Ａｓｇｒ１座位に関してホモ接合性である。
【００１６】
かかる非ヒト動物および／または動物細胞の一部は、哺乳動物および／または哺乳動物細胞である。任意で、哺乳動物は齧歯類である。任意で、齧歯類はラットまたはマウスである。任意で、齧歯類はマウスである。任意で、細胞質ドメインのすべてまたは一部は、内因性マウスＡｓｇｒ１配列によりコードされる。任意で、細胞質ドメインは、配列番号２９に記載される配列を含む。任意で、膜貫通ドメインのすべてまたは一部は、内因性マウスＡｓｇｒ１配列によりコードされる。任意で、膜貫通ドメインは、配列番号３０に記載される配列を含む。任意で、細胞質ドメインと膜貫通ドメインの両方のすべて、または一部は、内因性マウスＡｓｇｒ１配列によりコードされる。任意で、細胞質ドメインは、配列番号２９に記載される配列を含み、膜貫通ドメインは、配列番号３０に記載される配列を含む。任意で、細胞外ドメインは多重コイルドメインとＣ型レクチンドメインを含み、この場合において当該多重コイルドメインとＣ型レクチンドメインの両方のすべてまたは一部は、欠失され、オルソロガスなヒトＡＳＧＲ１配列と置き換えられた内因性Ａｓｇｒ１座位のセグメントによりコードされ、細胞質ドメインと膜貫通ドメインの両方のすべてまたは一部は、内因性マウスＡｓｇｒ１配列によりコードされる。任意で、Ｃ型レクチンドメインは、ヒトＡＳＧＲ１のＣ型レクチンドメインであり、多重コイルドメインは、ヒトＡＳＧＲ１の多重コイルドメインであり、細胞質ドメインは、マウスＡｓｇｒ１の細胞質ドメインであり、そして膜貫通ドメインは、マウスＡｓｇｒ１の膜貫通ドメインである。任意で、Ｃ型レクチンドメインは、配列番号２８に記載される配列を含み、多重コイルドメインは、配列番号２７に記載される配列を含み、細胞質ドメインは、配列番号２９に記載される配列を含み、そして膜貫通ドメインは、配列番号３０に記載される配列を含む。任意で、改変Ａｓｇｒ１タンパク質は、配列番号３に記載される配列を含む。
【００１７】
別の態様において、ヒトＡＳＧＲ１介在性内部移行を介したインビボでの治療用複合体の肝臓への送達を評価する方法が提供される。かかる方法の一部は、（ａ）上述の非ヒト動物のいずれかに治療用複合体を投与することであって、当該治療用複合体は、治療用分子と、ヒトＡＳＧＲ１に特異的に結合する抗原結合タンパク質またはリガンドを含む、投与すること、および（ｂ）当該非ヒト動物の肝臓への当該治療用分子の送達を評価すること、を含む。任意で、治療用分子は、リソソーム置換タンパク質または酵素であるか、またはリソソーム置換タンパク質または酵素をコードする核酸であり、そして工程（ｂ）は、非ヒト動物の肝臓中のリソソーム置換タンパク質もしくは酵素の存在または活性を評価することを含む。任意で、治療用分子は、治療用分泌タンパク質をコードする核酸であり、工程（ｂ）は、非ヒト動物中の治療用分泌タンパク質の血清レベルまたは活性を評価することを含む。
【００１８】
別の態様において、ヒトＡＳＧＲ１を介した内部移行に関し、肝臓細胞表面タンパク質または肝臓中の可溶性タンパク質を標的とする治療用分子のインビボでの有効性を評価する方法が提供される。かかる方法の一部は、（ａ）上述の非ヒト動物のいずれかに治療用分子を投与することであって、当該治療用分子は、肝臓細胞の表面タンパク質または可溶性タンパク質に特異的に結合し、そしてヒトＡＳＧＲ１に特異的に結合する二重特異性抗原結合タンパク質を含む、投与すること、および（ｂ）当該非ヒト動物の肝臓中の肝臓細胞表面タンパク質の細胞表面レベルまたは活性を評価すること、または肝臓中の可溶性タンパク質の発現または活性を評価することを含む。
【００１９】
別の態様では、例えば本明細書に記載されるヒト化Ａｓｇｒ１座位、ヒト化ＡＳＧＲ１タンパク質もしくはキメラＡＳＧＲ１タンパク質を発現する内因性非ヒト動物Ａｓｇｒ１座位、および／または本明細書に記載されるヒトＡｓｇｒ１座位を含む非ヒト動物ゲノムを生成するための標的化ベクターなどの核酸が提供される。かかる核酸の一部は、配列番号１８、配列番号１９、配列番号２０、配列番号２２、配列番号２３、およびそれらの組み合わせを含む群から選択される配列を含む。かかる核酸の一部は、配列番号３に記載されるアミノ酸配列をコードする配列を含む。例えば配列番号２４に記載される配列を含む。
【００２０】
特許または出願の書類は、色付きで描かれた少なくとも一つの図面を含有する。色付きの図面を伴う本特許または特許出願公開の写しは、要求により、および必要な料金を支払うことにより、当局に提供されるであろう。
【図面の簡単な説明】
【００２１】
【図１】図１Ａは、ヒトＡＳＧＲ１座位の概略を示す。８個のエクソンが、黒いボックスにより示されており、非翻訳領域（ＵＴＲ）は、白色のボックスにより示されている。膜貫通ドメイン、多重コイルドメイン、およびＣ型レクチンドメインは、図の上部に示されている。アスタリスクは、アレル獲得（ｇａｉｎ−ｏｆ−ａｌｌｅｌｅ）アッセイのための上流プライマー（７３０２ｈＴＵ）および下流プライマー（７３０２ｈＴＤ）の位置を示す。ヒト化のためにマウスＡｓｇｒ１座位内に挿入される断片を下部に示す。
【００２２】
図１Ｂは、マウスＡｓｇｒ１座位の概略を示す。８個のエクソンが、黒いボックスにより示されており、ＵＴＲは、白色のボックスにより示されている。膜貫通ドメイン、多重コイルドメイン、およびＣ型レクチンドメインは、図の上部に示されている。アスタリスクは、アレル消失（ｌｏｓｓ−ｏｆ−ａｌｌｅｌｅ）アッセイのための上流プライマー（７３０２ｍＴＵ）および下流プライマー（７３０２ｍＴＤ）の位置を示す。欠失され、ヒトＡＳＧＲ１座位由来の対応する断片に置き換えられる断片を下部に示す。
【００２３】
【図２】図２Ａは、ハイグロマイシン抵抗性自動削除カセット（ｓｅｌｆ−ｄｅｌｅｔｉｎｇ  ｃａｓｓｅｔｔｅ）を含有するヒト化Ａｓｇｒ１アレル（７３０２アレル）を生成するための大型標的化ベクターの概略を示す。マウスのエクソンは灰色のボックスで示され、ヒトのエクソンは黒色のボックスで示され、そしてＵＴＲは白色のボックスで示されている。異なる領域（マウス／ヒト、ヒト／カセット、およびカセット／マウス）の間の境界は、図の下部で、それぞれＡ、ＢおよびＣと標識された線により示されている。
【００２４】
図２Ｂは、図２Ａのヒト化Ａｓｇｒ１アレルのカセット削除版の概略を示す。マウスのエクソンは灰色のボックスで示され、ヒトのエクソンは黒色のボックスで示され、そしてＵＴＲは白色のボックスで示されている。異なる領域の間の境界（５’のマウス／ヒトの境界、３’のヒト／マウスの境界）は、図の下部で、それぞれＡおよびＤと標識された線により示されている。
【００２５】
【図３】図３は、ヒトＡＳＧＲ１タンパク質（ｈＡＳＧＲ１；配列番号１）、マウスＡｓｇｒ１タンパク質（ｍＡｓｇｒ１；配列番号２）、およびヒト化マウスＡｓｇｒ１タンパク質（７３０２  ｈｕｍＩｎ；配列番号３）のアライメントを示す。下線が引かれた残基は、導入されたヒトエクソンによりコードされる残基である。ボックスの残基は、膜貫通ドメインを構成する。点線は、Ｃ型レクチンドメインを示す。太い実線は、多重コイル領域を示す。
【００２６】
【図４】図４は、ヒト化Ａｓｇｒ１マウス（Ａｓｇｒ１ｈｕ／ｈｕ）は、野生型（Ａｓｇｒ１＋／＋）の同腹仔と類似した血漿脂質プロファイル（総コレステロール、トリグリセリド、ＬＤＬ−ＣおよびＨＤＬ−Ｃを含む）を有することを示す。
【００２７】
【図５】図５は、ヒト化Ａｓｇｒ１マウス（Ａｓｇｒ１ｈｕ／ｈｕ）は、その野生型の同腹仔と類似した体重と血中グルコースを有することを示す。
【００２８】
【図６】図６は、ヒト化Ａｓｇｒ１マウス（Ａｓｇｒ１ｈｕ／ｈｕ）中のヒト化Ａｓｇｒ１タンパク質は、マウスＡｓｇｒ１と類似して、肝膜に共局在することを示す。トランスフェリン受容体（ＴＲＦＲ）およびグリセルアルデヒド−３−リン酸デヒドロゲナーゼ（ＧＡＰＤＨ）はそれぞれ肝臓の膜分画と細胞質分画のローディング対照として使用した。１群当たりＮ＝４が示される。
【００２９】
【図７】図７は、ヒトＡＳＧＲ１タンパク質（配列番号１）、カニクイザル（ｃｙｎｏ）（配列番号３９）、マウスＡｓｇｒ１タンパク質（配列番号２）、およびラットＡｓｇｒ１タンパク質（配列番号４１）のアライメントを示す。下線が引かれた残基は、導入されたヒトエクソンによりコードされる残基である。ヒトとカニクイザルのＡＳＧＲ１タンパク質の間には９７．６％の配列同一性があり（細胞外ドメインでは９８．３％の配列同一性）、ヒトとマウスのＡＳＧＲ１タンパク質の間には７７％の配列同一性があり、そしてヒトとラットのＡＳＧＲ１タンパク質の間には７８．４％の配列同一性がある。
【００３０】
【図８Ａ】図８Ａ〜８Ｃは、１ｘ１０１１の野生型ｓｃＡＡＶ２−ＣＭＶ−ｅＧＦＰ（ｉ、ｖ）、生理食塩水（ｉｉ、ｖｉ）、１ｘ１０１１のｓｃＡＡＶ２−Ｎ５８７ｍｙｃ−ＣＭＶ−ｅＧＦＰウイルスベクター単独（ｉｉｉ、ｖｉｉ）、またはｓｃＡＡＶ２−Ｎ５８７ｍｙｃ−ＣＭＶ−ｅＧＦＰウイルスベクターと二重特異性抗ｍｙｃ−ＡＳＧＲ１抗体（ｉｖ、ｖｉｉｉ）を用いて静脈内注射した１０日後に、ヒトＡＳＧＲ１が肝細胞により発現されるようにトランスジェニック改変されたＣ５７ＢＬ／６マウス（ｉ−ｉｖ）、または野生型Ｃ５７ＢＬ／６マウス（ｖ−ｖｉｉｉ）から採取された肝臓（Ａ）、脾臓（Ｂ）または腎臓（Ｃ）のサンプルの免疫蛍光法の顕微鏡画像を示す。
【図８Ｂ】同上。
【図８Ｃ】同上。
【００３１】
【図９−１】図９Ａ〜９Ｒは、２．１８ｘ１０１１の野生型ｓｓＡＡＶ２−ＣＡＧＧ−ｅＧＦＰ（図９Ｂ、９Ｃ、９Ｅ、９Ｆ）、生理食塩水（図９Ａ、９Ｄ）、２．１８ｘ１０１１のｓｓＡＡＶ２−Ｎ５８７ｍｙｃ−ＣＡＧＧ−ｅＧＦＰウイルスベクター単独（図９Ｇ−９Ｉ、９Ｊ−９Ｌ）またはｓｓＡＡＶ２−Ｎ５８７ｍｙｃ−ＣＡＧＧ−ｅＧＦＰウイルスベクターと二重特異性抗ｍｙｃ−ＡＳＧＲ１抗体（図９Ｍ−９Ｏ、９Ｐ−９Ｒ）を用いて静脈内注射した４週後に、ヒトＡＳＧＲ１が肝細胞により発現されるようにトランスジェニック改変されたＣ５７ＢＬ／６マウス（図９Ｄ−９Ｆ、９Ｊ−９Ｌ、９Ｐ−９Ｒ）、または野生型Ｃ５７ＢＬ／６マウス（図９Ａ−９Ｃ、９Ｇ−９Ｉ、９Ｍ−９Ｏ）から採取された肝臓サンプルの免疫蛍光法の顕微鏡画像を示す。各画像は、１匹のマウスを表している。
【図９−２】同上。
【図９−３】同上。
【発明を実施するための形態】
【００３２】
定義
「タンパク質」、「ポリペプチド」、および「ペプチド」という用語は、本明細書において相互交換可能に使用され、コードアミノ酸および非コードアミノ酸、ならびに化学改変アミノ酸または生化学改変アミノ酸または誘導体化アミノ酸を含むアミノ酸の任意の長さの多量体型を含む。この用語はさらに、例えば修飾されたペプチド主鎖を有するポリペプチドなどの修飾されたポリマーも含む。用語「ドメイン」は、特定の機能または構造を有するタンパク質またはポリペプチドの任意の部分を指す。
【００３３】
タンパク質は、「Ｎ末端」および「Ｃ末端」を有すると言われている。「Ｎ末端」という用語は、タンパク質またはポリペプチドの開始と関連しており、遊離アミン基（−ＮＨ２）を有するアミノ酸により終結する。「Ｃ末端」という用語は、アミノ酸鎖（タンパク質またはポリペプチド）の終わりと関連しており、遊離カルボキシル基（−ＣＯＯＨ）により終結する。
【００３４】
「核酸」および「ポリヌクレオチド」という用語は本明細書において相互交換可能に使用され、リボヌクレオチド、デオキシリボヌクレオチド、またはそのアナログもしくは改変型を含むヌクレオチドの任意の長さの多量体型を含む。この用語には、一本鎖、二本鎖および多重鎖のＤＮＡまたはＲＮＡ、ゲノムＤＮＡ、ｃＤＮＡ、ＤＮＡ−ＲＮＡハイブリッド、ならびにプリン塩基、ピリミジン塩基または他の天然ヌクレオチド塩基、化学改変ヌクレオチド塩基、生化学改変ヌクレオチド塩基、非天然ヌクレオチド塩基もしくは誘導体化ヌクレオチド塩基を含むポリマーが含まれる。
【００３５】
核酸は、「５’末端」と「３’末端」を有すると言われており、一つのモノヌクレオチドのペントース環の５’リン酸がホスホジエステル結合を介して、ある方向で自身に隣接する３’酸素に結合されるようにモノヌクレオチドが反応して、オリゴヌクレオチドが生成される。オリゴヌクレオチドの末端は、その５’リン酸が、モノヌクレオチドのペントース環の３’酸素に連結されていない場合、「５’末端」と呼ばれる。オリゴヌクレオチドの末端は、その３’酸素が、別のモノヌクレオチドのペントース環の５’リン酸に連結されていない場合、「３’末端」と呼ばれる。核酸配列は、より大きなオリゴヌクレオチドの内部分であっても、５’末端と３’末端を有すると言われる場合がある。直線状または環状のＤＮＡ分子のいずれかにおいて、別個のエレメントが、「上流」、または「下流」の５’、または３’エレメントと呼称される。
【００３６】
「ゲノム統合された」という用語は、ヌクレオチド配列が細胞のゲノム内に統合され、その子孫物に受け継がれることができるように細胞内に導入された核酸を指す。任意のプロトコルが、細胞ゲノム内への核酸の安定的組み込みに使用され得る。
【００３７】
「標的化ベクター」という用語は、相同組み換え、非相同末端結合介在ライゲーション（ｎｏｎ−ｈｏｍｏｌｏｇｏｕｓ−ｅｎｄ−ｊｏｉｎｉｎｇ−ｍｅｄｉａｔｅｄ  ｌｉｇａｔｉｏｎ）、または任意の他の細胞ゲノム内の標的位置への組み換え手段により導入されることができる組み換え核酸を指す。
【００３８】
「ウイルスベクター」という用語は、ウイルス起源のエレメントを少なくとも一つ含み、およびウイルスベクター粒子内へのパッキングに充分な、または許容可能なエレメントを含む組み換え核酸を指す。ＤＮＡ、ＲＮＡ、またはその他の核酸を生体外またはインビボのいずれかで移送させる目的に対して、ベクターおよび／または粒子を利用することができる。多くの形態のウイルスベクターが公知である。
【００３９】
「野生型」という用語には、（変異体、疾患性、変更されたなどに対して）「正常」な状態または状況下で存在する構造および／または活性を有する実体を含む。野生型の遺伝子およびポリペプチドはしばしば複数の異なる形態（例えば、アレル）で存在する。
【００４０】
「内因性」という用語は、細胞または非ヒト動物内で自然に存在する核酸配列を指す。たとえば、非ヒト動物の内因性Ａｓｇｒ１配列とは、当該非ヒト動物においてＡｓｇｒ１座位に自然に存在する天然Ａｓｇｒ１配列を指す。
【００４１】
「外因性」の分子または配列は、通常はその形態で細胞に存在しない分子または配列を含む。通常の存在には、細胞の特定の発生段階および環境条件に関する存在が含まれる。外因性の分子または配列は、例えば細胞内の対応する内因性配列の変異型、例えば内因性配列のヒト化型を含むことができ、または細胞内の内因性配列に対応するが、異なる形態である配列（すなわち染色体内ではない）を含むことができる。対照的に、内因性の分子または配列には、特定の環境条件下の特定の発生段階にある特定の細胞中で、通常にその形態で存在する分子または配列が含まれる。
【００４２】
核酸またはタンパク質に関して使用される場合、「異種」という用語は、当該核酸またはタンパク質が、同じ分子内では自然には一緒に存在しない少なくとも二つの部分を含むことを示す。例えば、「異種」という用語は、核酸部分またはタンパク質部分に関して使用される場合、当該核酸またはタンパク質が、自然には相互に同じ関係性で存在しない（例えば一緒に結合しない）二つ以上のサブ配列を含むことを示す。一例として、核酸ベクターの「異種」領域は、自然には他の分子と関連付けられて存在していない別の核酸分子内の核酸のセグメントであるか、または自然には他の分子と関連付けられて存在していない別の核酸分子に結合されている。例えば、核酸ベクターの異種領域は、コード配列を含み得、当該コード配列は、自然には当該コード配列と関連付けられて存在していない配列に隣接されている。同様に、タンパク質の「異種」領域は、自然には他の分子と関連付けられて存在していない別のペプチド分子内のアミノ酸のセグメントであるか、または自然には他の分子と関連付けられて存在していない別のペプチド分子に結合されている（例えば融合タンパク質またはタグ付きタンパク質）。同じように、核酸またはタンパク質は、異種のラベル、または異種の分泌配列もしくは局在配列を含み得る。
【００４３】
「コドン最適化」は、コドン縮重を利用したものであり、アミノ酸を規定する３塩基ペアのコドンの組み合わせの多重性に例示される。一般的に、天然アミノ酸配列を維持しながら、宿主細胞の遺伝子においてより高頻度に、または最も高頻度に使用されるコドンと、天然配列のコドンを少なくとも一つ置換することにより、特定の宿主細胞における発現を強化するための核酸配列の改変プロセスを含む。例えば、Ｃａｓ９タンパク質をコードする核酸を改変して、細菌細胞、酵母細胞、ヒト細胞、非ヒト細胞、哺乳動物細胞、齧歯類細胞、マウス細胞、ラット細胞、ハムスター細胞、もしくはその他の任意の宿主細胞を含む所与の原核細胞または真核細胞において、天然核酸配列と比較して利用頻度の高いコドンへと置換することができる。  コドン利用に関する表は、例えば「Ｃｏｄｏｎ  Ｕｓａｇｅ  Ｄａｔａｂａｓｅ」で容易に入手することができる。これらの表は、多くの方法に適合させることができる。Ｎａｋａｍｕｒａ  ｅｔ  ａｌ．（２０００）Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄｓ  Ｒｅｓｅａｒｃｈ  ２８：２９２を参照のこと。当該文献は全ての目的に対し、その全体で参照により本明細書に組み込まれる。特定宿主における発現のための特定配列のコドン最適化を目的としたコンピュータアルゴリズムも利用可能である（例えば、Ｇｅｎｅ  Ｆｏｒｇｅを参照のこと）。
【００４４】
「座位」という用語は、遺伝子（または重要な配列）、ＤＮＡ配列、ポリペプチドをコードする配列、または生物ゲノムの染色体上の位置の特定の場所を指す。例えば、「Ａｓｇｒ１座位」は、Ａｓｇｒ１遺伝子、Ａｓｇｒ１ＤＮＡ配列、Ａｓｇｒ１をコードする配列、またはかかる配列が存在する位置について特定されている生物体のゲノムの染色体上のＡｓｇｒ１の位置の特定の場所を指す場合がある。「Ａｓｇｒ１座位」は、Ａｓｇｒ１遺伝子の制御エレメントを含む場合があり、例えば、エンハンサー、プロモーター、５’および／または３’非翻訳領域（ＵＴＲ）、またはそれらの組み合わせを含む。
【００４５】
「遺伝子」という用語は、産物（例えば、ＲＮＡ産物および／またはポリペプチド産物）をコードする染色体中のＤＮＡ配列を指し、非コードイントロンにより中断されるコード領域ならびに、５’および３’の両末端でコード領域に隣接する配列を含み、それにより当該遺伝子は、全長ｍＲＮＡ（５’および３’の非翻訳配列を含む）に対応する。「遺伝子」という用語はまた、制御配列（例えばプロモーター、エンハンサーおよび転写因子結合部位）、ポリアデニル化シグナル、内部リボソーム侵入部位、サイレンサー、絶縁配列（ｉｎｓｕｌａｔｉｎｇ  ｓｅｑｕｅｎｃｅ）、およびマトリクス結合領域を含む、他の非コード配列も含む。これらの配列は、遺伝子のコード領域に近くてもよく（例えば１０ｋｂ以内）、または遠くの部位であってもよい。これらは遺伝子の転写および翻訳のレベルまたは速度に影響を与える。
【００４６】
「アレル」という用語は、遺伝子のバリアント形態を指す。一部の遺伝子は様々な形態を有しており、それらは染色体上の同じ位置にあるか、または同じ遺伝子座位にある。二倍体の生物は、各遺伝子座位に二つのアレルを有する。アレルの各ペアは、特定の遺伝子座位の遺伝子型を表す。遺伝子型は、特定の座位に二つの同一アレルがある場合にはホモ接合性、二つのアレルが異なる場合にはヘテロ接合性として記載される。
【００４７】
「プロモーター」はＤＮＡの制御性領域であり、通常、ＴＡＴＡボックスを含み、ＴＡＴＡボックスは、特定のポリヌクレオチド配列に対して適切な転写開始部位でＲＮＡ合成を開始させる指示をＲＮＡポリメラーゼＩＩに出すことができる。プロモーターはさらに、転写開始速度に影響を与える他の領域を含む場合がある。本明細書に開示されるプロモーター配列は、操作可能に連結されたポリヌクレオチドの転写を調節する。プロモーターは、本明細書に開示される細胞型（例えば、真核細胞、非ヒト哺乳動物細胞、ヒト細胞、齧歯類細胞、多能性細胞、一細胞期の胚、分化細胞、またはそれらの組み合わせ）のうちの一つ以上において活性であり得る。プロモーターは、例えば、構造的に活性なプロモーター、条件付きプロモーター、誘導性プロモーター、時間制限プロモーター（例えば、発生的に制御されたプロモーター）、または空間的に制限されたプロモーター（例えば、細胞特異的または組織特異的なプロモーター）であり得る。プロモーターの例は、例えば、国際特許公開ＷＯ２０１３／１７６７７２号に見出すことができ、当該文献は全ての目的に対しその全体で参照により本明細書に組み込まれる。
【００４８】
「操作可能な連結」または「操作可能に連結される」とは、二つ以上の構成要素（例えばプロモーターおよび別の配列エレメント）の並置を含み、この並置により両方の構成要素が正常に機能し、そして当該構成要素の少なくとも一つが機能を介在し、他の構成要素のうち少なくとも一つに影響を及ぼすことが可能となる。例えばプロモーターが一つまたは複数の転写制御因子の存在または非存在に応答してコード配列の転写レベルを制御する場合、プロモーターは、コード配列に操作可能に連結され得る。操作可能な連結は、互いに連続的な配列、またはトランスで作用する配列などを含み得る（例えば制御性配列は、コード配列の転写を制御する距離で作用し得る）。
【００４９】
「バリアント」という用語は、集団において最も多い配列とは（例えば１ヌクレオチド）異なっているヌクレオチド配列、または集団において最も多い配列とは（例えば１アミノ酸）異なっているタンパク質配列を指す。
【００５０】
タンパク質に言及する場合において「断片」という用語は、全長タンパク質よりも短い、またはアミノ酸が少ないタンパク質を意味する。核酸に言及する場合において「断片」という用語は、全長核酸よりも短い、またはヌクレオチドが少ない核酸を意味する。断片は例えばＮ末端断片（すなわちタンパク質のＣ末端部分が除去されている）、Ｃ末端断片（すなわちタンパク質のＮ末端部分が除去されている）または内部断片であってもよい。
【００５１】
二つのポリヌクレオチド配列またはポリペプチド配列の文脈における「配列同一性」または「同一性」は、規定の比較ウィンドウ上で最大対応に整列させたときに同一である、二つの配列中の残基を言及する。タンパク質に関して百分率の配列同一性が使用される場合、同一ではない残基の位置は、保存的アミノ酸置換により異なっている場合が多く、この場合のアミノ酸残基は、類似した化学特性（例えば電荷または疎水性など）を有する他のアミノ酸残基と置換されており、したがって当該分子の機能的特性は変化していない。保存的置換で配列が異なる場合、配列同一性の百分率を上向きに調整し、置換の保存的性質に関して補正してもよい。そのような保存的置換により異なる配列は、「配列類似性」または「類似性」を有すると言われる。この調整を行う手段は公知である。典型的には、当該手段は全長ミスマッチではなく部分的ミスマッチとして保存的置換を格付けし、それによって配列同一性百分率を増加させることを含む。したがって例えば同一アミノ酸がスコア１を与えられる場合、非保存的置換はスコアゼロを与えられ、保存的置換はゼロと１の間のスコアを与えられる。保存的置換の格付けは、例えばＰＣ／ＧＥＮＥプログラム（Ｉｎｔｅｌｌｉｇｅｎｅｔｉｃｓ社、カリフォルニア州マウンテンビュー）に実装されているように算出される。
【００５２】
「配列同一性の百分率」には、最適に整列された（完全合致残基の数が最も多い）二つの配列を比較ウィンドウ上で比較することにより決定された値を含み、この場合において比較ウィンドウ中のポリヌクレオチド配列部分は、２配列の最適整列に関して、参照配列（付加または欠失を含まない）と比較して付加または欠失（すなわちギャップ）を含む場合がある。百分率は、同一の核酸塩基またはアミノ酸残基が両方の配列中に存在する位置の数を決定して、合致位置数を出し、その合致位置数を比較ウィンドウ中の位置の総数で割り、その結果に１００を掛け、配列同一性の百分率を出すことにより算出される。別段の指定（例えば短配列が、連結異種配列を含むなど）が無い限り、比較ウィンドウは、比較される２配列の短い方の全長となる。
【００５３】
別段の記載がない限り、配列同一性／類似性の値には、以下のパラメーターを使用したＧＡＰ  Ｖｅｒｓｉｏｎ１０、またはそれと同等の任意のプログラムを使用して得られた値を含む：ＧＡＰ  Ｗｅｉｇｈｔを５０およびＬｅｎｇｔｈ  Ｗｅｉｇｈｔを３、ならびにｎｗｓｇａｐｄｎａ．ｃｍｐスコアリングマトリクスを使用したヌクレオチド配列に対する同一性％および類似性％；ＧＡＰ  Ｗｅｉｇｈｔを８およびＬｅｎｇｔｈ  Ｗｅｉｇｈｔを２、ならびにＢＬＯＳＵＭ６２スコアリングマトリクスを使用したアミノ酸配列に対する同一性％および類似性％。「同等のプログラム」には、任意の配列比較プログラムが含まれ、それらは対象となる任意の２配列に対し、ＧＡＰ  Ｖｅｒｓｉｏｎ１０により生成された対応アライメントと比較したときに、同一のヌクレオチドまたはアミノ酸残基の合致を有するアライメントと、配列同一性の同一性百分率を生成する。
【００５４】
「保存的アミノ酸置換」という用語は、配列中に通常に存在するアミノ酸と、類似したサイズ、電荷または極性を有する異なるアミノ酸との置換を指す。保存的置換の例としては、非極性（疎水性）残基、例えばイソロイシン、バリンまたはロイシンと、別の非極性残基との置換が挙げられる。同様に保存的置換の例としては、一つの極性（親水性）残基と、別の極性残基の置換が挙げられ、例えばアルギニンとリシン、グルタミンとアスパラギン、またはグリシンとセリンの間の置換が挙げられる。さらには塩基性残基、例えばリシン、アルギニンまたはヒスチジンと別の塩基性残基の置換、または一つの酸性残基、例えばアスパラギン酸またはグルタミン酸と別の酸性残基との置換も、保存的置換のさらなる例である。非保存的置換の例としては、非極性（疎水性）アミノ酸残基、例えばイソロイシン、バリン、ロイシン、アラニンまたはメチオニンと、極性（親水性）残基、例えばシステイン、グルタミン、グルタミン酸またはリシンの置換、または極性残基と非極性残基の置換が挙げられる。一般的なアミノ酸分類を下記に要約する。
【表Ａ】
2020529837.tif 000002
【００５５】
「相同」な配列（例えば核酸配列）は、公知の参照配列と同一、または実質的に相同のいずれかである配列を含み、例えば公知の参照配列に対し、少なくとも５０％、少なくとも５５％、少なくとも６０％、少なくとも６５％、少なくとも７０％、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％同一である配列を含む。相同配列は例えばオルソロガスな配列およびパラロゴスな配列を含み得る。相同遺伝子は、例えば典型的には種形成事象（オルソロガス遺伝子）を介して、または遺伝子複製事象（パラロゴス遺伝子）を介して、共通の祖先ＤＮＡ配列から伝わったものである。「オルソロガス」遺伝子には、種形成により共通の祖先遺伝子から進化した、異なる種の遺伝子が含まれる。オルソログは典型的には進化の過程で同じ機能を保持している。「パラロゴス」遺伝子は、ゲノム内複製により関連付けられた遺伝子を含む。パラログは、進化の過程で新たな機能を発達させ得る。
【００５６】
「インビトロ」という用語には、人工的な環境が含まれ、人工的な環境（たとえば試験管）内で生じたプロセスまたは反応に対するものである。「インビボ」という用語には、自然の環境（例えば細胞または生物体または身体）が含まれ、自然の環境内で生じたプロセスまたは反応に対するものである。「生体外（ｅｘ  ｖｉｖｏ）」という用語には、個々の身体から採取された細胞が含まれ、当該細胞内で生じたプロセスまたは反応に対するものである。
【００５７】
「レポーター遺伝子」という用語は、異種プロモーターおよび／またはエンハンサーエレメントに操作可能に連結されたレポーター遺伝子配列を含む構築体が、当該プロモーターおよび／またはエンハンサーエレメントの活性化に必要な因子を含有する（またはそれらを含有するように作製され得る）細胞内に導入されたときに、容易に、および定量的にアッセイされる遺伝子産物（典型的には酵素）をコードする配列を有する核酸を指す。レポーター遺伝子の例としては、限定されないが、β−ガラクトシダーゼ（ｌａｃＺ）をコードする遺伝子、細菌クロラムフェニコールアセチルトランスフェラーゼ（ｃａｔ）遺伝子、ホタルルシフェラーゼ遺伝子、ベータ−グルクロニダーゼ（ＧＵＳ）をコードする遺伝子、および蛍光タンパク質をコードする遺伝子が挙げられる。「レポータータンパク質」とは、レポーター遺伝子によってコードされるタンパク質を指す。
【００５８】
「蛍光レポータータンパク質」という用語は本明細書で使用される場合、蛍光に基づいて検出可能であるレポータータンパク質を意味し、この場合において蛍光は、レポータータンパク質に直接由来する、蛍光発生基質に対するレポータータンパク質の活性に由来する、または蛍光タグ化化合物への結合アフィニティを有するタンパク質由来のいずれかであってもよい。蛍光タンパク質の蛍光タンパク質としては、緑色蛍光タンパク質（例えば、ＧＦＰ、ＧＦＰ−２、ｔａｇＧＦＰ、ｔｕｒｂｏＧＦＰ、ｅＧＦＰ、Ｅｍｅｒａｌｄ、Ａｚａｍｉ  Ｇｒｅｅｎ、Ｍｏｎｏｍｅｒｉｃ  Ａｚａｍｉ  Ｇｒｅｅｎ、ＣｏｐＧＦＰ、ＡｃｅＧＦＰおよびＺｓＧｒｅｅｎｌ）、黄色蛍光タンパク質（例えば、ＹＦＰ、ｅＹＦＰ、Ｃｉｔｒｉｎｅ、Ｖｅｎｕｓ、ＹＰｅｔ、ＰｈｉＹＦＰおよびＺｓＹｅｌｌｏｗｌ）、青色蛍光タンパク質（例えば、ＢＦＰ、ｅＢＦＰ、ｅＢＦＰ２、Ａｚｕｒｉｔｅ、ｍＫａｌａｍａｌ、ＧＦＰｕｖ、ＳａｐｐｈｉｒｅおよびＴ−ｓａｐｐｈｉｒｅ）、シアン蛍光タンパク質（例えば、ＣＦＰ、ｅＣＦＰ、Ｃｅｒｕｌｅａｎ、ＣｙＰｅｔ、ＡｍＣｙａｎｌおよびＭｉｄｏｒｉｉｓｈｉ−Ｃｙａｎ）、赤色蛍光タンパク質（例えば、ＲＦＰ、ｍＫａｔｅ、ｍＫａｔｅ２、ｍＰｌｕｍ、ＤｓＲｅｄ単量体、ｍＣｈｅｒｒｙ、ｍＲＦＰ１、ＤｓＲｅｄ−Ｅｘｐｒｅｓｓ、ＤｓＲｅｄ２、ＤｓＲｅｄ−単量体、ＨｃＲｅｄ−Ｔａｎｄｅｍ、ＨｃＲｅｄｌ、ＡｓＲｅｄ２、ｅｑＦＰ６１１、ｍＲａｓｐｂｅｒｒｙ、ｍＳｔｒａｗｂｅｒｒｙおよびＪｒｅｄ）、オレンジ蛍光タンパク質（例えば、ｍＯｒａｎｇｅ、ｍＫＯ、Ｋｕｓａｂｉｒａ−Ｏｒａｎｇｅ、Ｍｏｎｏｍｅｒｉｃ  Ｋｕｓａｂｉｒａ−Ｏｒａｎｇｅ、ｍＴａｎｇｅｒｉｎｅおよびｔｄＴｏｍａｔｏ）、およびその細胞中の存在がフローサイトメトリー法により検出可能である任意の他の適切な蛍光タンパク質が挙げられる。
【００５９】
「組み換え」という用語は、二つのポリヌクレオチド間の遺伝情報の交換の任意のプロセスを含み、任意の機序によって発生することができる。二本鎖の破断（ＤＳＢ：ｄｏｕｂｌｅ−ｓｔｒａｎｄ  ｂｒｅａｋｓ）に応答した組み換えは主に二つの保存的ＤＮＡ修復経路：非相同末端結合（ＮＨＥＪ）および相同組換え（ＨＲ）を介して発生する。Ｋａｓｐａｒｅｋ＆Ｈｕｍｐｈｒｅｙ（２０１１）Ｓｅｍｉｎａｒｓ  ｉｎ  Ｃｅｌｌ＆Ｄｅｖ．Ｂｉｏｌ．２２：８８６−８９７を参照のこと。当該文献は全ての目的に対しその全体で参照により本明細書に組み込まれる。同様に、外来性のドナー核酸により介在される標的核酸の修復は、二つのポリヌクレオチド間の遺伝情報の交換の任意のプロセスを含むことができる。
【００６０】
ＮＨＥＪは、相同鋳型を必要としない、破断末端の相互の直接的なライゲーション、または外来性配列との直接的なライゲーションによる、核酸の二本鎖破断の修復を含む。ＮＨＥＪによる非連続配列のライゲーションは多くの場合、二本鎖破断部位近くの欠失、挿入、または転座を生じさせる。例えばＮＨＥＪは、破断末端と外来性ドナー核酸との直接的ライゲーションを介して、外来性のドナー核酸の標的統合を生じさせることもできる（すなわち、ＮＨＥＪを基にした取り込み）。こうしたＮＨＥＪ介在性の標的統合は、相同性誘導型修復（ＨＤＲ：ｈｏｍｏｌｏｇｙ  ｄｉｒｅｃｔｅｄ  ｒｅｐａｉｒ）経路が容易には使用できない場合（例えば非分裂細胞、初代細胞、および相同性を基にしたＤＮＡ修復がほとんど実施されない細胞）の外来性ドナー核酸の挿入に好ましい場合がある。加えて、相同性誘導型修復とは対照的に、開裂部位に隣接する配列同一性の大領域に関する知識が必要ではないため、ゲノム配列に関する知識が限定的なゲノムを有する生物への標的挿入を試みる場合に有益であり得る。統合は外来性ドナー核酸と開裂ゲノム配列の間の平滑末端のライゲーションを介して、または開裂されたゲノム配列においてヌクレアーゼ剤により生成された末端と適合するオーバーハングにより隣接される外来性ドナー核酸を使用した付着末端（すなわち５’または３’のオーバーハングを有する末端）とのライゲーションを介して進行させることができる。例えば、ＵＳ２０１１／０２０７２２、ＷＯ２０１４／０３３６４４、ＷＯ２０１４／０８９２９０およびＭａｒｅｓｃａ  ｅｔ  ａｌ．（２０１３）Ｇｅｎｏｍｅ  Ｒｅｓ．２３（３）：５３９−５４６を参照のこと。それら各々が参照によりその全体ですべての目的に対して本明細書に組み込まれる。平滑末端がライゲーションされている場合、断片結合に必要な微小相同性の生成領域に対して、標的および／またはドナーの切除が必要となる場合があり、これが標的配列において望ましくない変化を生じさせる場合がある。
【００６１】
組み換えも相同性誘導型修復（ＨＤＲ）または相同組換え（ＨＲ）を介して発生させることができる。ＨＤＲまたはＨＲには、ヌクレオチド配列の相同性を必要とし得る核酸修復の形態が含まれ、「標的」分子（すなわち二本鎖破断を経た分子）の修復用の鋳型として「ドナー」分子を使用し、ドナーから標的への遺伝子情報の伝達を誘導する。いかなる特定の学説にも拘束されることは望まないが、こうした伝達には、破断した標的とドナーの間で形成するヘテロ二本鎖ＤＮＡのミスマッチ修復および／もしくは合成依存性の鎖アニーリングならびに／または関連プロセスを含むことができ、鎖アニーリングにおいてドナーは遺伝情報の再合成に使用され、これが標的の一部となる。一部の例では、ドナーポリヌクレオチド、ドナーポリヌクレオチドの一部、ドナーポリヌクレオチドのコピー、またはドナーポリヌクレオチドのコピーの一部が標的ＤＮＡ内に統合される。Ｗａｎｇ  ｅｔ  ａｌ．（２０１３）Ｃｅｌｌ  １５３：９１０−９１８；Ｍａｎｄａｌｏｓ  ｅｔ  ａｌ．（２０１２）ＰＬＯＳ  ＯＮＥ  ７：ｅ４５７６８：１−９；およびＷａｎｇ  ｅｔ  ａｌ．（２０１３）Ｎａｔ  Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．３１：５３０−５３２を参照のこと。それら各々が参照によりその全体ですべての目的に対して本明細書に組み込まれる。
【００６２】
「抗原結合タンパク質」という用語は、抗原に結合するあらゆるタンパク質を含む。抗原結合タンパク質の例としては、抗体、抗体の抗原結合断片、多重特異性抗体（例えば、二重特異性抗体）、ｓｃＦＶ、ｂｉｓ−ｓｃＦＶ、ダイアボディ、トリアボディ、テトラボディ、Ｖ−ＮＡＲ、ＶＨＨ、ＶＬ、Ｆ（ａｂ）、Ｆ（ａｂ）２、ＤＶＤ（二重可変ドメイン抗原結合タンパク質）、ＳＶＤ（単一可変ドメイン抗原結合タンパク質）、二重特異性Ｔ細胞エンゲージャー（ＢｉＴＥ）、またはＤａｖｉｓｂｏｄｙ（本明細書において参照によりその全体が本明細書に組み込まれる米国特許第８，５８６，７１３号）が挙げられる。
【００６３】
抗原結合タンパク質に関連する「多重特異性」または「二重特異性」という用語は、そのタンパク質が同一の抗原上または異なる抗原上のどちらかにおいて異なるエピトープを認識することを意味する。多重特異性抗原結合タンパク質は、単一の多機能性ポリペプチドであり得るか、または相互に共有結合でまたは非共有結合で会合した二つ以上のポリペプチドの多量体複合体であり得る。例えば、抗体またはその断片は、一つまたは複数の他の分子実体、例えばタンパク質またはその断片などに、（例えば、化学的カップリング、遺伝子融合、非共有結合による会合、またはその他により）機能的に連結して、第二の結合特異性を有する二重特異性または多重特異性の抗原結合分子を産生することができる。
【００６４】
「抗原」という用語は、分子全体または分子内のドメインのいずれか物質を指し、当該物質に対する結合特異性を有する抗体の産生を惹起させることができる。抗原という用語は、野生型の宿主生物体においては自己認識を理由として抗体産生を惹起しないが、免疫寛容が破綻する適切な遺伝子操作を伴う宿主動物においてはかかる反応を惹起させることができる物質も含む。
【００６５】
「エピトープ」という用語は、抗原結合タンパク質（例えば、抗体）が結合する抗原上の部位を指す。エピトープは、連続的なアミノ酸から形成されることができ、または一つもしくは複数のタンパク質の三次フォールディングによって並置された非連続的なアミノ酸から形成されることもできる。連続的なアミノ酸から形成されたエピトープ（線状エピトープとしても知られる）は、典型的には、変性溶媒への暴露でも保持されるのに対して、三次フォールディングにより形成されたエピトープ（立体構造エピトープとしても知られる）は、典型的には、変性溶媒を用いた処置で失われる。典型的にはエピトープは、固有の空間構造にある少なくとも３個、より一般的には少なくとも５個、または８〜１０個のアミノ酸を含む。エピトープの空間構造を決定する方法としては例えばＸ線結晶法および２次元核磁気共鳴法が挙げられる。例えば、Ｅｐｉｔｏｐｅ  Ｍａｐｐｉｎｇ  Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ，ｉｎ  Ｍｅｔｈｏｄｓ  ｉｎ  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｂｉｏｌｏｇｙ，Ｖｏｌ．６６，Ｇｌｅｎｎ  Ｅ．Ｍｏｒｒｉｓ，Ｅｄ．（１９９６）を参照のこと。当該文献は参照によりその全体ですべての目的に対して本明細書に組み込まれる。
【００６６】
本明細書に記載の抗体パラトープは、概して、異種エピトープを特異的に認識する相補性決定領域（ＣＤＲ）を最小限で含む（例えば、重鎖および／または軽鎖可変ドメインのＣＤＲ３領域）。
【００６７】
「抗体」という用語には、四つのポリペプチド鎖、すなわちジスルフィド結合によって相互接続された二つの重（Ｈ）鎖と二つの軽（Ｌ）鎖）を含む、免疫グロブリン分子が含まれる。各重鎖は、重鎖可変ドメインおよび重鎖定常領域（ＣＨ）を含む。重鎖定常領域は、ＣＨ１、ＣＨ２、およびＣＨ３の三つのドメインを含む。各軽鎖は、軽鎖可変ドメインおよび軽鎖定常領域（ＣＬ）を含む。重鎖および軽鎖可変ドメインはさらに、フレームワーク領域（ＦＲ）と称されるより保存的な領域に差し込まれている、相補性決定領域（ＣＤＲ）と称される超可変性の領域にさらに細分化することができる。各重鎖および軽鎖可変ドメインは、三つのＣＤＲおよび四つのＦＲを含み、アミノ末端からカルボキシ末端に向かって、以下の順序で配列される。ＦＲ１、ＣＤＲ１、ＦＲ２、ＣＤＲ２、ＦＲ３、ＣＤＲ３、ＦＲ４（重鎖ＣＤＲは、ＨＣＤＲ１、ＨＣＤＲ２、およびＨＣＤＲ３として省略されてもよく、軽鎖ＣＤＲは、ＬＣＤＲ１、ＬＣＤＲ２、およびＬＣＤＲ３として省略されてもよい）。「高アフィニティ」抗体という用語は、その標的エピトープに対して約１０−９Ｍ以下（例えば約１×１０−９Ｍ、１×１０−１０Ｍ、１×１０−１１Ｍ、または約１×１０−１２Ｍ）のＫＤを有する抗体を指す。一実施形態では、ＫＤは、表面プラズモン共鳴、例えば、ＢＩＡＣＯＲＥ（商標）によって測定され、別の実施形態では、ＫＤは、ＥＬＩＳＡによって測定される。
【００６８】
「二重特異性抗体」という用語は、二つ以上のエピトープを選択的に結合することができる抗体を含む。二重特異性抗体は、通例二つの異なる重鎖を含み、各重鎖は、異なるエピトープ、すなわち二つの異なる分子（例えば二つの異なる抗原）上または同一分子（例えば同一抗原）上のいずれかエピトープに特異的に結合する。二重特異性抗体が二つの異なるエピトープ（第一のエピトープおよび第二のエピトープ）を選択的に結合することができる場合、第一のエピトープに対する第一の重鎖の親和性は、一般的に、第二のエピトープに対する第一の重鎖の親和性よりも少なくとも１桁から２桁、または３桁もしくは４桁低く、その逆もまた同様である。二重特異性抗体により認識されるエピトープは、同一の標的の上にも異なる標的の上にも（例えば、同一のタンパク質の上にも異なるタンパク質の上にも）あり得る。二重特異性抗体は、例えば、同一の抗原の異なるエピトープを認識する重鎖を組み合わせることによって作製することができる。例えば、同一の抗原の異なるエピトープを認識する重鎖可変配列をコードする核酸配列は、異なる重鎖定常領域をコードする核酸配列に融合可能であり、こうした配列は、イムノグロブリン軽鎖を発現する細胞内で発現することができる。典型的な二重特異性抗体は、各々が三つの重鎖ＣＤＲとそれに続いて（Ｎ末端からＣ末端へ）ＣＨ１ドメイン、ヒンジ、ＣＨ２ドメイン、およびＣＨ３ドメインを有する二つの重鎖と、抗原結合特異性を付与しないが各重鎖と会合可能であるか、または各重鎖と会合できかつ重鎖抗原結合領域により結合される一つまたは複数のエピトープを結合できるか、または各重鎖と会合できかつ重鎖の一方もしくは両方をエピトープの一方もしくは両方に結合させることができるイムノグロブリン軽鎖とを有する。
【００６９】
「重鎖」または「イムノグロブリン重鎖」という用語には、任意の生物体由来のイムノグロブリン重鎖配列（イムノグロブリン重鎖定常領域配列など）が含まれる。別段の指定のない限り、重鎖可変ドメインは、三つの重鎖ＣＤＲと四つのＦＲ領域とを含む。重鎖の断片としては、ＣＤＲ、ＣＤＲおよびＦＲ、ならびにそれらの組み合わせが挙げられる。典型的な重鎖は、可変ドメインに続いて（Ｎ末端からＣ末端へ）、ＣＨ１ドメイン、ヒンジ、ＣＨ２ドメイン、およびＣＨ３ドメインを有する。重鎖の機能性断片には、エピトープを特異的に認識する（例えば、エピトープをマイクロモル濃度、ナノモル濃度、またはピコモル濃度範囲のＫＤで認識する）ことができ、発現できかつ細胞から分泌可能であり、少なくとも一つのＣＤＲを含む断片が含まれる。重鎖可変ドメインは、可変領域ヌクレオチド配列によってコードされ、概して、生殖系細胞に存在するＶＨ、ＤＨ、およびＪＨセグメントのレパートリー由来の、ＶＨ、ＤＨ、およびＪＨセグメントを含む。様々な生物体のＶ重鎖セグメント、Ｄ重鎖セグメント、およびＪ重鎖セグメントの配列、位置、および命名は、ＩＭＧＴデータベースで見ることができ、これは、インターネットを介してＵＲＬが「ｉｍｇｔ．ｏｒｇ」のＷｏｒｌｄ  Ｗｉｄｅ  Ｗｅｂ（ｗｗｗ）でアクセス可能である。
【００７０】
「軽鎖」という用語は、任意の生物体由来の免疫グロブリン軽鎖配列を含み、別段の規定がない限り、代替軽鎖のみならず、ヒトカッパ（κ）軽鎖およびラムダ（λ）軽鎖、ならびにＶｐｒｅＢを含む。軽鎖可変ドメインは、典型的には、別段の規定がない限り、三つの軽鎖ＣＤＲおよび四つのフレームワーク（ＦＲ）領域を含む。概して、完全長軽鎖は、アミノ末端からカルボキシル末端に向かって、ＦＲ１−ＣＤＲ１−ＦＲ２−ＣＤＲ２−ＦＲ３−ＣＤＲ３−ＦＲ４を含む可変ドメイン、および軽鎖定常領域アミノ酸配列を含む。軽鎖可変ドメインは、軽鎖可変領域ヌクレオチド配列によってコードされ、概して、生殖系細胞に存在する軽鎖ＶおよびＪ遺伝子セグメントのレパートリーに由来する、軽鎖ＶＬおよび軽鎖ＪＬセグメントを含む。様々な生物体の軽鎖Ｖ遺伝子セグメントおよび軽鎖Ｊ遺伝子セグメントの配列、位置、および命名は、ＩＭＧＴデータベースで見ることができ、これは、インターネットを介してＵＲＬが「ｉｍｇｔ．ｏｒｇ」のＷｏｒｌｄ  Ｗｉｄｅ  Ｗｅｂ（ｗｗｗ）でアクセス可能である。軽鎖には、例えば、該軽鎖が含まれるエピトープ結合タンパク質に選択的に結合する第一のエピトープと第二のエピトープのいずれも選択的に結合させることのない軽鎖が含まれる。軽鎖にはまた、該軽鎖が含まれるエピトープ結合タンパク質に選択的に結合する一つ以上のエピトープを結合かつ認識しながら、重鎖を結合かつ認識、または補佐する軽鎖が含まれる。
【００７１】
本明細書において使用される場合、「相補性決定領域」または「ＣＤＲ」という用語には、生物体のイムノグロブリン遺伝子の核酸配列でコードされるアミノ酸配列が含まれ、当該アミノ酸配列は、通常（すなわち、野生型動物では）イムノグロブリン分子（例えば、抗体またはＴ細胞受容体）の軽鎖または重鎖の可変領域における二つのフレームワーク領域の間に存在する。ＣＤＲは、例えば生殖系列配列または再構成された配列によってコードされ、例えば、ナイーヴＢ細胞もしくは成熟Ｂ細胞またはＴ細胞によってコードされ得る。ＣＤＲは、体細胞変異され（例えば動物生殖細胞系でコードされた配列と異なり）、ヒト化され、および／または、アミノ酸置換、付加または欠失で改変され得る。一部の状況（例えばＣＤＲ３について）では、ＣＤＲは、二つ以上の配列（例えば生殖系列配列）によってコードでき、それらの配列は（例えば、再構成されていない核酸配列では）連続していないが、Ｂ細胞の核酸配列では、例えば、配列のスプライシングまたは接続（例えば、重鎖ＣＤＲ３を形成するためのＶ−Ｄ−Ｊ再構成）の結果として、連続している。
【００７２】
標的抗原への抗原結合タンパク質の特異的結合は、少なくとも１０６、１０７、１０８、１０９、または１０１０Ｍ−１のアフィニティを伴う結合を含む。特異的結合は、少なくとも一つの非関連標的に対して発生する非特異的結合から度合がより高く検出可能であり、識別可能である。特異的結合は、特定の官能基または特定の空間適合（例えば錠と鍵のタイプ）の間に結合が形成された結果であり得、一方で非特異的結合は通常、ファンデルワールス力の結果である。しかしながら特異的結合は、抗原結合タンパク質がただ一つの標的に結合することを必ずしも意味するものではない。
【００７３】
一つまたは複数の列挙された要素を「含む」もしくは「含有する」組成物または方法は、具体的に列挙されていない他の要素を含み得る。例えばタンパク質を「含む」または「含有する」組成物は、そのタンパク質を単独で含有してもよく、または他の成分と組み合わせて含有してもよい。「本質的に〜からなる」という移行句は、請求の範囲が、当該請求項に列挙される特定の要素、および請求される発明の基本的および新規な特性に実質的な影響を与えない要素を包含すると解釈されるものであることを意味する。したがって本発明の請求項において使用される場合、「本質的に〜からなる」という用語は、「含む」と均等であると解釈されることは意図されない。
【００７４】
「任意の」または「任意で」は、後述されている事象または状況が起こる場合もあれば起こらない場合もあることを意味すると共に、この記載には、前述の事象または状況が起こる場合の例および起こらない場合の例が包含されることを意味する。
【００７５】
値の範囲指定には、範囲内の全ての整数または範囲を規定する全ての整数、ならびに範囲内の整数により規定されるすべての下部範囲を含む。
【００７６】
文脈から別途明らかでない限り、「約」という用語は、指定された値の測定エラーの標準誤差（例えば、ＳＥＭ）内の値を包含する。
【００７７】
「および／または」という用語は、関連する列記された項目のうちの一つまたは複数の任意の、およびすべての可能性のある組み合わせ、ならびに選択的に解釈される（「または」）場合の組み合わせの欠落を指し、包含する。
【００７８】
「または」という用語は、特定のリストの任意の一つのメンバーを指し、そのリストのメンバーの任意の組み合わせも含む。
【００７９】
項目の単数形の「ａ」、「ａｎ」、および「ｔｈｅ」は、文脈で別途明確に指示されない限り、複数への言及を含む。例えば、「単数のタンパク質」または「少なくとも一つのタンパク質」という用語は、それらの混合物を含む、複数のタンパク質を含み得る。
【００８０】
統計的に有意とは、ｐ≦０．０５を意味する。
【００８１】
Ｉ．概要
本明細書において、ヒト化Ａｓｇｒ１座位を含む非ヒト動物細胞および非ヒト動物、ならびに当該非ヒト動物細胞および非ヒト動物を使用する方法が開示される。ヒト化Ａｓｇｒ１座位を含む非ヒト動物細胞または非ヒト動物は、ヒトＡＳＧＲ１タンパク質の一つまたは複数の断片（例えばヒトＡＳＧＲ１細胞外ドメインのすべてまたは一部）を含むヒトＡＳＧＲ１タンパク質またはキメラＡｓｇｒ１タンパク質を発現する。高効率エンドサイトーシスの肝臓特異的受容体として、ヒトＡＳＧＲ１は、例えば抗体、低分子（抗体−薬剤複合体の一部として）、およびＤＮＡなどの治療剤の肝臓特異的送達に利用することができる。しかしヒトＡＳＧＲ１に特異的に結合する抗原結合タンパク質または二重特異性抗原結合タンパク質は、例えばマウスＡｓｇｒ１などのオルソロガスな非ヒト動物Ａｓｇｒ１タンパク質には結合しないことが多く、その原因は、ヒトＡＳＧＲ１と非ヒト動物Ａｓｇｒ１の間の配列の差異にある。例えばヒトＡＳＧＲ１細胞外ドメインに対して生成された抗体は、マウスＡｓｇｒ１オルソログには結合しない（データは示さず）。これがあるために、ヒトＡＳＧＲ１介在性の送達機序または治療機序のインビボ有効性を、非改変の内因性（すなわち天然型）Ａｓｇｒ１座位を有する野生型非ヒト動物で効率的に評価することができない。ヒト化Ａｓｇｒ１非ヒト動物（例えば、ヒト化Ａｓｇｒ１マウス）は、多くの様々な方法を利用した、ヒトＡＳＧＲ１介在性内部移行を介した様々な治療剤の肝臓特異的送達の検証に使用することができる。例えば、ヒト化Ａｓｇｒ１座位を含む非ヒト動物を使用して、肝臓への治療用分子または治療用複合体のヒトＡＳＧＲ１介在性送達のインビボ有効性を評価することができる。同様に、ヒト化Ａｓｇｒ１座位を含む非ヒト動物を使用して、ヒトＡＳＧＲ１介在性機序を介して作用する治療用分子または治療用複合体の有効性を評価することができる。
【００８２】
ＩＩ．ヒト化Ａｓｇｒ１座位を含む非ヒト動物
本明細書に開示される細胞および非ヒト動物は、ヒト化Ａｓｇｒ１座位を含む。ヒト化Ａｓｇｒ１座位を含む細胞または非ヒト動物は、ヒトＡＳＧＲ１タンパク質を発現するか、または天然型Ａｓｇｒ１タンパク質の一つまたは複数の断片が、ヒトＡＳＧＲ１由来の対応する断片（例えば細胞外ドメインのすべてまたは一部）で置き換えられた、部分的にヒト化されたキメラＡｓｇｒ１タンパク質を発現する。
【００８３】
Ａ．アシアロ糖タンパク質受容体１（ＡＳＧＲ１）
本明細書に記載される細胞および非ヒト動物は、ヒト化Ａｓｇｒ１座位を含む。アシアロ糖タンパク質受容体１（Ｃ−ｔｙｐｅ  ｌｅｃｔｉｎ  ｄｏｍａｉｎ  ｆａｍｉｌｙ  ４  ｍｅｍｂｅｒ  Ｈ１、ｈｅｐａｔｉｃ  ｌｅｃｔｉｎ  Ｈ１、ＨＬ−１、ＡＳＧＰ−Ｒ  １、ＡＳＧＰＲ  １、ＡＳＧＲ１）は、ＡＳＧＲ１（ＣＬＥＣ４Ｈ１）遺伝子にコードされる、アシアロ糖タンパク質受容体（ＡＳＧＰＲまたはＡＳＧＲ）の主要サブユニットである。ＡＳＧＰＲは主に肝細胞の細胞表面上に発現されるヘテロオリゴマータンパク質であり、約１〜５×１０５の結合部位／細胞を有し、脱シアル化された糖たんぱく質を内部移行させ、分解して、循環系からそれらを除去する役割を負う。ＡＳＧＰＲは、良く特徴解析されたＣ型肝臓レクチンであり、肝細胞の類洞表面上に主に発現されている。ＡＳＧＰＲは、肝臓実質細胞による受容体介在エンドサイトーシスを介したガラクトース末端型およびＮ−アセチルガラクトサミン末端型の糖タンパク質の選択的結合と内部移行において役割を担っている。アシアロ糖タンパク質受容体１および２（ＡＳＧＲ１およびＡＳＧＲ２）の２種のタンパク質が含まれ、それらはＡＳＧＲ１遺伝子およびＡＳＧＲ２遺伝子にコードされている。両サブユニットともにＩＩ型の単回通過タンパク質であり、Ｎ末端細胞質ドメイン、単一膜貫通ドメイン、およびＣ末端細胞外糖認識ドメイン（ＣＲＤ）を広く含む。ＡＳＧＲ１は、Ｎ末端細胞質ドメイン（約４０アミノ酸）、単回通過膜貫通ドメイン（約２０アミノ酸）、細胞外多重コイル軸（オリゴマー形成）領域（約８０アミノ酸）、および機能性Ｃ型（カルシウム依存性）糖認識ドメイン（Ｃ型レクチンドメイン）（約１４０アミノ酸）を含有する。ＣＲＤは、末端ガラクトースまたはＮ−アセチルガラクトサミン（ＧａｌＮａｃ）モチーフを有する糖タンパク質に結合する。ＣＲＤは、単量体状態の脱シアル化糖たんぱく質に対し、低いアフィニティを有する。
【００８４】
ＡＳＧＲ１およびＡＳＧＲ２をコードする遺伝子（それぞれＡＳＧＲ１およびＡＳＧＲ２）は、１７番染色体の短アーム上におよそ約５８．６キロ塩基（ｋｂ）離れて位置している。これら遺伝子は進化的に関連しているが、その構造機構は大きく異なっている。ＡＳＧＲ１は８個のエクソンを含み、およそ６ｋｂの長さである。ＡＳＧＲ２は９個のエクソンを含み、およそ１３．５ｋｂの長さである。
【００８５】
ヒトＡＳＧＲ１に対する例示的なコード配列には、ＮＣＢＩのアクセッション番号ＮＭ＿００１６７１（配列番号５）が割り当てられている。マウスＡｓｇｒ１に対する例示的なコード配列には、ＮＣＢＩのアクセッション番号ＮＭ＿００９７１４（配列番号４）が割り当てられている。例示的なヒトＡＳＧＲ１タンパク質は、ＵｎｉＰｒｏｔアクセッション番号Ｐ０７３０６（配列番号１）が割り当てられている。例示的なマウスＡｓｇｒ１タンパク質は、ＵｎｉＰｒｏｔアクセッション番号Ｐ３４９２７（配列番号２）が割り当てられている。ヒト化多重コイルドメインおよびＣ型レクチンドメインを有するマウスＡｓｇｒ１タンパク質は、配列番号３に記載されている。例示的なラットＡｓｇｒ１タンパク質は、ＵｎｉＰｒｏｔアクセッション番号Ｐ０２７０６が割り当てられている。例示的なオランウータンＡｓｇｒ１タンパク質は、ＵｎｉＰｒｏｔアクセッション番号Ｑ５ＲＢＱ８が割り当てられている。
【００８６】
Ｂ．ヒト化Ａｓｇｒ１座位
ヒト化Ａｓｇｒ１座位は、Ａｓｇｒ１遺伝子全体が、対応するオルソロガスなヒトＡＳＧＲ１配列で置き換えられているＡｓｇｒ１座位であってもよく、またはＡｓｇｒ１遺伝子の一部が、対応するオルソロガスなヒトＡＳＧＲ１配列で置き換えられているＡｓｇｒ１座位（すなわちヒト化されている）であってもよい。任意で、対応するオルソロガスなヒトＡＳＧＲ１配列は改変されて、非ヒト動物におけるコドン使用頻度に基づきコドン最適化される。置換された（すなわち、ヒト化された）領域は、例えばエクソン、非コード領域、例えばイントロン、非翻訳領域、もしくは制御性領域（例えば、プロモーター、エンハンサー、または転写リプレッサー結合エレメント）、またはそれらの任意の組み合わせを含むことができる。一つの例として、ヒトＡＳＧＲ１遺伝子の１個、２個、３個、４個、５個、６個、７個、または８個すべてのエクソンに対応するエクソンがヒト化されることができる。例えば、ヒトＡＳＧＲ１遺伝子のエクソン３〜８に対応するエクソンがヒト化されることができる。あるいは抗ヒトＡＳＧＲ１抗原結合タンパク質に認識されるエピトープをコードするＡｓｇｒ１の領域が、ヒト化されることができる。別の例として、Ｎ末端細胞質ドメイン、膜貫通ドメイン、多重コイルドメイン、またはＣ型レクチンドメインのうちの一つまたは複数またはすべてがヒト化されることができる。例えば多重コイルドメインをコードするＡｓｇｒ１座位の領域のすべてまたは一部がヒト化されることができ、Ｃ末端レクチンドメインをコードするＡｓｇｒ１座位の領域のすべてまたは一部がヒト化されることができ、膜貫通ドメインをコードするＡｓｇｒ１座位の領域のすべてまたは一部がヒト化されることができ、および／または細胞質ドメインをコードするＡｓｇｒ１座位の領域のすべてまたは一部がヒト化されることができる。一つの例において、多重コイルドメインをコードするＡｓｇｒ１座位の領域のすべてまたは一部のみがヒト化され、Ｃ型レクチンドメインをコードするＡｓｇｒ１座位の領域のすべてまたは一部のみがヒト化され、または細胞外領域（すなわち多重コイルドメインとＣ型レクチンドメイン）をコードするＡｓｇｒ１座位の領域のすべてまたは一部のみがヒト化される。例えば多重コイルドメインとＣ型レクチンドメインをコードするＡｓｇｒ１座位の領域がヒト化されることができ、それによりキメラＡｓｇｒ１タンパク質は、内因性Ｎ末端細胞質ドメイン、内因性膜貫通ドメイン、ヒト化多重コイルドメインおよびヒト化Ｃ型レクチンドメインを有して産生される。同様にヒトＡＳＧＲ１遺伝子の１、２、３、４、５、６、または７個すべてのイントロンに対応するイントロンがヒト化されることができる。制御性配列を含む隣接非翻訳領域もヒト化されることができる。例えば、５’非翻訳領域（ＵＴＲ）、３’ＵＴＲ、もしくは５’ＵＴＲと３’ＵＴＲの両方がヒト化されることができ、または５’ＵＴＲ、３’ＵＴＲ、もしくは５’ＵＴＲと３’ＵＴＲの両方が内因性を維持することもできる。一つの特定の例では、３’ＵＴＲはヒト化されるが、５’ＵＴＲは内因性を維持する。オルソロガス配列による置換の程度に応じて、例えばプロモーターなどの制御性配列は内因性であってもよく、または置換ヒトオルソロガス配列により供給されてもよい。例えばヒト化Ａｓｇｒ１座位は、内因性の非ヒト動物Ａｓｇｒ１プロモーターを含んでもよい。
【００８７】
ヒト化Ａｓｇｒ１座位によりコードされるＡｓｇｒ１タンパク質は、ヒトＡＳＧＲ１タンパク質由来のドメインを一つまたは複数含んでもよい。例えばＡｓｇｒ１タンパク質は、ヒトＡＳＧＲ１の多重コイルドメイン、ヒトＡＳＧＲ１のＣ型レクチンドメイン、ヒトＡＳＧＲ１の膜貫通ドメイン、およびヒトＡＳＧＲ１の細胞質ドメインのうちの一つまたは複数または全てを含んでもよい。一例として、Ａｓｇｒ１タンパク質は、ヒトＡＳＧＲ１の多重コイルドメインのみ、ヒトＡＳＧＲ１のＣ型レクチンドメインのみ、またはヒトＡＳＧＲ１の細胞外ドメイン（すなわち多重コイルドメインとＣ型レクチンドメイン）のみを含んでもよい。任意でヒト化Ａｓｇｒ１座位によりコードされるＡｓｇｒ１タンパク質はさらに、内因性（すなわち天然型）の非ヒト動物Ａｓｇｒ１タンパク質由来のドメインを一つまたは複数含んでもよい。一例として、ヒト化Ａｓｇｒ１座位によりコードされるＡｓｇｒ１タンパク質は、ヒトＡＳＧＲ１タンパク質由来の多重コイルドメイン、ヒトＡＳＧＲ１タンパク質由来のＣ型レクチンドメイン、内因性（すなわち天然型）非ヒト動物Ａｓｇｒ１タンパク質由来のＮ末端細胞質ドメイン、および内因性（すなわち天然型）非ヒト動物Ａｓｇｒ１タンパク質由来の膜貫通ドメインを含んでもよい。ヒトＡＳＧＲ１タンパク質由来のドメインは、完全ヒト化配列（すなわち当該ドメインをコードする配列全体が、オルソロガスなヒトＡＳＧＲ１配列で置き換えられている）によりコードされてもよく、または部分的にヒト化された配列（すなわち当該ドメインをコードする配列の一部が、オルソロガスなヒトＡＳＧＲ１配列で置き換えられ、当該ドメインをコードする残りの内因性（すなわち天然型）配列は、オルソロガスなヒトＡＳＧＲ１配列と同じアミノ酸をコードし、それにより当該コードされるドメインは、ヒトＡＳＧＲ１タンパク質中の当該ドメインと同一となる）によりコードされてもよい。
【００８８】
一例として、ヒト化Ａｓｇｒ１座位によりコードされるＡｓｇｒ１タンパク質は、ヒトＡＳＧＲ１の多重コイルドメインを含んでもよい。任意で、ヒトＡＳＧＲ１の多重コイルドメインは、配列番号２７に対し、少なくとも８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％または１００％同一である配列を含む、本質的に当該配列からなる、または当該配列からなり、そしてＡｓｇｒ１タンパク質は、天然型Ａｓｇｒ１の活性を維持する（すなわち、受容体介在性エンドサイトーシスを介したガラクトース末端およびＮ−アセチルガラクトサミン末端糖タンパク質に選択的に結合し、内部移行させる能力を維持する）。別の例として、ヒト化Ａｓｇｒ１座位によりコードされるＡｓｇｒ１タンパク質は、ヒトＡＳＧＲ１のＣ型レクチンドメインを含んでもよい。任意で、ヒトＡＳＧＲ１のＣ型レクチンドメインは、配列番号２８に対し、少なくとも８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％または１００％同一である配列を含む、本質的に当該配列からなる、または当該配列からなり、そしてＡｓｇｒ１タンパク質は、天然型Ａｓｇｒ１の活性を維持する。例えば、ヒトＡＳＧＲ１に由来するＡｓｇｒ１タンパク質の領域は、配列番号３１に対し、少なくとも８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％または１００％同一である配列を含んでもよく、本質的に当該配列からなってもよく、または当該配列からなってもよく、そしてＡｓｇｒ１タンパク質は、天然型Ａｓｇｒ１の活性を維持する。別の例として、ヒト化Ａｓｇｒ１座位によりコードされるＡｓｇｒ１タンパク質は、内因性非ヒト動物Ａｓｇｒ１細胞質ドメイン（例えばマウスＡｓｇｒ１細胞質ドメイン）を含んでもよい。任意で、非ヒト動物Ａｓｇｒ１の細胞質ドメインは、配列番号２９に対し、少なくとも８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％または１００％同一である配列を含む、本質的に当該配列からなる、または当該配列からなり、そしてＡｓｇｒ１タンパク質は、天然型Ａｓｇｒ１の活性を維持する。別の例として、ヒト化Ａｓｇｒ１座位によりコードされるＡｓｇｒ１タンパク質は、内因性非ヒト動物Ａｓｇｒ１膜貫通ドメイン（例えばマウスＡｓｇｒ１膜貫通ドメイン）を含んでもよい。任意で、非ヒト動物Ａｓｇｒ１の膜貫通ドメインは、配列番号３０に対し、少なくとも８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％または１００％同一である配列を含む、本質的に当該配列からなる、または当該配列からなり、そしてＡｓｇｒ１タンパク質は、天然型Ａｓｇｒ１の活性を維持する。例えば、ヒト化Ａｓｇｒ１座位によりコードされるＡｓｇｒ１タンパク質は、配列番号３に対し、少なくとも８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％または１００％同一である配列を含んでもよく、本質的に当該配列からなってもよく、または当該配列からなってもよく、そしてＡｓｇｒ１タンパク質は、天然型Ａｓｇｒ１の活性を維持する。
【００８９】
任意で、ヒト化Ａｓｇｒ１座位は、他の要素を含んでもよい。そのような要素の例としては、選択カセット、レポーター遺伝子、リコンビナーゼ認識部位、または他の要素が挙げられる。あるいはヒト化Ａｓｇｒ１座位は、他の要素を欠いてもよい（例えば選択マーカーまたは選択カセットを欠いてもよい）。適切なレポーター遺伝子およびレポータータンパク質の例は、本明細書において別に開示されている。適切な選択マーカーの例としては、ネオマイシンホスホトランスフェラーゼ（ｎｅｏｒ）、ハイグロマイシンＢホスホトランスフェラーゼ（ｈｙｇｒ）、ピューロマイシン−Ｎ−アセチルトランスフェラーゼ（ｐｕｒｏｒ）、ブラストサイジンＳデアミナーゼ（ｂｓｒｒ）、キサンチン／グアニンホスホリボシルトランスフェラーゼ（ｇｐｔ）、または単純ヘルペスウイルスチミジンキナーゼ（ＨＳＶ−ｋ）が挙げられる。リコンビナーゼの例としては、Ｃｒｅ、Ｆｌｐ、およびＤｒｅリコンビナーゼが挙げられる。Ｃｒｅリコンビナーゼ遺伝子の一例は、Ｃｒｅｉであり、当該遺伝子において、Ｃｒｅリコンビナーゼをコードする二つのエクソンはイントロンによって分離され、原核細胞中での発現が妨げられている。そのようなリコンビナーゼは、核への局在化を促進するための核局在化シグナルをさらに含んでもよい（例えばＮＬＳ−Ｃｒｅｉ）。リコンビナーゼ認識部位は、部位特異的リコンビナーゼにより認識されるヌクレオチド配列を含み、組み換え事象の基質として機能することができる。リコンビナーゼ認識部位の例としては、ＦＲＴ、ＦＲＴ１１、ＦＲＴ７１、ａｔｔｐ、ａｔｔ、ｒｏｘ、およびｌｏｘ部位、例えばｌｏＸｐ、ｌｏｘ５１１、ｌｏｘ２２７２、ｌｏｘ６６、ｌｏｘ７１、ｌｏｘＭ２、およびｌｏｘ５１７１が挙げられる。
【００９０】
例えばレポーター遺伝子または選択カセットなどの他の要素は、リコンビナーゼ認識部位に隣接した自動削除カセットであってもよい。例えば、ＵＳ８，６９７，８５１およびＵＳ２０１３／０３１２１２９を参照のこと。それら各々が参照によりその全体ですべての目的に対し本明細書に組み込まれる。一例として、自動削除カセットは、マウスＰｒｍ１プロモーターに操作可能に連結されたＣｒｅｉ遺伝子（Ｃｒｅリコンビナーゼをコードする二つのエクソンを含み、それらはイントロンにより分離されている）およびヒトユビキチンプロモーターに操作可能に連結されたネオマイシン抵抗性遺伝子を含む。Ｐｒｍ１プロモーターを採用することで、自動削除カセットは、Ｆ０動物のオスの生殖細胞において特異的に削除されることができる。選択マーカーをコードするポリヌクレオチドは、標的となる細胞において活性なプロモーターに操作可能に連結されてもよい。プロモーターの例は、本明細書において別に記載されている。別の特定の例として、自動削除選択カセットは、一つまたは複数のプロモーター（例えばヒトユビキチンプロモーターとＥＭ７プロモーターの両方）に操作可能に連結されたハイグロマイシン抵抗遺伝子コード配列、次いでポリアデニル化シグナル、次いで一つまたは複数のプロモーター（例えばｍＰｒｍ１プロモーター）に操作可能に連結されたＣｒｅｉコード配列、次いで別のポリアデニル化シグナルを含有してもよく、この場合においてカセット全体がｌｏｘＰ部位に隣接している。
【００９１】
ヒト化Ａｓｇｒ１座位は、条件付きアレルであってもよい。例えば条件付きアレルは、全ての目的に対しその全体で参照により本明細書に組み込まれるＵＳ２０１１／０１０４７９９に記載されるような多機能アレルであってもよい。例えば条件付きアレルは、（ａ）標的遺伝子の転写に関してセンス方向にある作動配列；（ｂ）センス方向またはアンチセンス方向にある薬剤選択カセット（ＤＳＣ）；（ｃ）アンチセンス方向にある対象のヌクレオチド配列（ＮＳＩ）；および（ｄ）逆方向にある、反転モジュール（ＣＯＩＮ、エクソン分割イントロンおよび可逆性遺伝子トラップ様モジュールを利用する）による条件付け、を含んでもよい。たとえば、ＵＳ２０１１／０１０４７９９を参照のこと。条件付きアレルは、第一のリコンビナーゼに暴露されることで再結合し、（ｉ）作動配列およびＤＳＣを欠き、および（ｉｉ）センス方向にあるＮＳＩとアンチセンス方向にあるＣＯＩＮを含む、条件付きアレルを形成する再結合可能単位をさらに含んでもよい。たとえば、ＵＳ２０１１／０１０４７９９を参照のこと。
【００９２】
一つの例示的なヒト化Ａｓｇｒ１座位（例えば、ヒト化マウスＡｓｇｒ１座位）は、コードエクソン３〜８が、対応するヒト配列で置き換えられている座位である。これらのエクソンは、Ａｓｇｒ１の多重コイルドメインとＣ型レクチンドメインをコードする。任意で、ヒト化配列は、停止コドン〜３’ＵＴＲを過ぎてもよく、および任意で３’ＵＴＲのすぐ下流の配列内までであってもよい。任意でコードエクソン３の上流のイントロン部分もヒト化される。図２Ａおよび２Ｂならびに配列番号２１および２４を参照のこと。
【００９３】
Ｃ．ヒト化Ａｓｇｒ１座位を含む非ヒト細胞および非ヒト動物
本明細書において別に記載されるヒト化Ａｓｇｒ１座位を含む非ヒト動物細胞および非ヒト動物が提供される。当該細胞および非ヒト動物は、ヒト化Ａｓｇｒ１座位に対してヘテロ接合性またはホモ接合性であってもよい。二倍体の生物は、各遺伝子座位に二つのアレルを有する。アレルの各ペアは、特定の遺伝子座位の遺伝子型を表す。遺伝子型は、特定の座位に二つの同一アレルがある場合にはホモ接合性、二つのアレルが異なる場合にはヘテロ接合性として記載される。
【００９４】
本明細書に提供される非ヒト動物細胞は例えば、ヒトＡＳＧＲ１座位に対して相同もしくはオルソロガスなＡｓｇｒ１座位またはゲノム座位を含む任意の非ヒト細胞であってもよい。細胞は、例えば、真菌細胞（例えば酵母）、植物細胞、動物細胞、哺乳動物細胞、非ヒト哺乳動物細胞およびヒト細胞などをはじめとする真核細胞であってもよい。「動物」という用語は、哺乳動物、魚類および鳥類を含む。哺乳動物細胞は例えば、非ヒト哺乳動物細胞、齧歯類細胞、ラット細胞、マウス細胞、またはハムスター細胞であってもよい。他の非ヒト哺乳動物としては例えば、非ヒト霊長類のサル、類人猿、オランウータン、ネコ、イヌ、ウサギ、ウマ、オスウシ、シカ、バイソン、家畜類（例えば、ウシ、去勢オスウシなどのウシ種；例えばヒツジ、ヤギなどのヒツジ種；および例えばブタおよびオスブタなどのブタ種）が挙げられる。鳥類としては例えば、ニワトリ、七面鳥、ダチョウ、ガチョウ、アヒルなどが挙げられる。家畜化動物および農業用動物も含まれる。「非ヒト」という用語は、ヒトを除外する。
【００９５】
細胞はさらに任意の型の未分化状態または分化状態であってもよい。例えば細胞は、分化全能性細胞、多能性細胞（例えば、ヒトの多能性細胞、またはマウス胚性幹（ＥＳ）細胞もしくはラットＥＳ細胞などの非ヒト多能性細胞）、または非多能性細胞であってもよい。分化全能性細胞には、任意の細胞型を生じさせ得る未分化細胞が含まれ、多能性細胞には、複数の分化細胞型へと発展する能力を保有する未分化細胞が含まれる。そのような多能性細胞および／または分化全能性細胞は、例えば、人工多能性幹（ｉＰＳ）細胞などのＥＳ細胞またはＥＳ様細胞であってもよい。ＥＳ細胞には、胚へ導入することで、発生中の胚の任意の組織の一因となることができる、胚誘導性の分化全能性細胞または多能性細胞が含まれる。ＥＳ細胞は、胚盤胞の内側細胞塊から誘導することができ、そして三種の脊椎動物胚葉（内胚葉、外胚葉、および中胚葉）のいずれかの細胞に分化することができる。
【００９６】
本明細書に提供される細胞は、生殖細胞（例えば精子または卵母細胞）であってもよい。細胞は、有糸分裂能力のある細胞または有糸分裂が不活性状態の細胞、減数分裂能力のある細胞または減数分裂が不活性状態の細胞であってもよい。同様に、細胞は、初代体細胞であってもよく、または初代体細胞ではない細胞であってもよい。体細胞には、配偶子、生殖細胞、母細胞、または未分化幹細胞ではない任意の細胞が含まれる。例えば細胞は、肝芽細胞または肝細胞などの肝臓の細胞であってもよい。
【００９７】
本明細書に提供される適切な細胞には、初代細胞も含まれる。初代細胞には、生物体、器官または組織から直接単離された細胞または細胞培養物が含まれる。初代細胞には、形質転換も不死化もされていない細胞が含まれる。初代細胞には、過去に組織培養で継代されなかった、または過去に組織培養で継代されたが組織培養で無制限に継代されることはできない、生物体、器官または組織から取得された任意の細胞が含まれる。そのような細胞は、従来的な技術によって単離され、例えば、肝細胞を含むことができる。
【００９８】
本明細書に提供される他の適切な細胞としては、不死化細胞が挙げられる。不死化細胞には、通常は無制限に増殖しないが、突然変異または変化によって通常の細胞老化を回避し、その代わりに分裂し続けることができる多細胞生物体由来の細胞が含まれる。そのような突然変異または変化は、自然に発生、または意図的に誘導されることができる。不死化細胞株の具体的な例は、ＨｅｐＧ２ヒト肝臓癌細胞株である。様々なタイプの不死化細胞が公知である。不死化細胞または初代細胞には、典型的には細胞培養に使用される細胞、または組み換え遺伝子もしくは組み換えタンパク質の発現に使用される細胞が含まれる。
【００９９】
本明細書に提供される細胞には、一細胞期の胚（すなわち受精卵母細胞または受精卵）も含まれる。そのような一細胞期胚は、任意の遺伝的背景（例えばマウスに関してはＢＡＬＢ／ｃ、Ｃ５７ＢＬ／６、１２９、またはそれらの組み合わせ）由来であってもよく、新鮮または凍結状態であってもよく、そして自然交配またはインビトロ受精から誘導されてもよい。
【０１００】
本明細書に提供される細胞は、正常で健康な細胞であってもよく、または疾患性細胞もしくは突然変異を有する細胞であってもよい。
【０１０１】
本明細書に記載されるヒト化Ａｓｇｒ１座位を含む非ヒト動物は、本明細書において別に記載される方法により作製することができる。「動物」という用語は、哺乳動物、魚類および鳥類を含む。非ヒト哺乳動物としては例えば、非ヒト霊長類のサル、類人猿、オランウータン、ネコ、イヌ、ウマ、オスウシ、シカ、バイソン、ヒツジ、ウサギ、齧歯類（例えばマウス、ラット、ハムスターおよびモルモット）および家畜類（例えば、ウシおよび去勢オスウシなどのウシ種；例えばヒツジおよびヤギなどのヒツジ種；ならびに例えばブタおよびオスブタなどのブタ種）が挙げられる。鳥類としては例えば、ニワトリ、七面鳥、ダチョウ、ガチョウおよびアヒルなどが挙げられる。家畜化動物および農業用動物も含まれる。「非ヒト動物」という用語は、ヒトを除外する。好ましい非ヒト動物としては、例えばマウスおよびラットなどの齧歯類が挙げられる。
【０１０２】
非ヒト動物は、任意の遺伝的背景由来であってもよい。例えば適切なマウスは、１２９系、Ｃ５７ＢＬ／６系、１２９とＣ５７ＢＬ／６の雑種、ＢＡＬＢ／ｃ系統、またはＳｗｉｓｓ  Ｗｅｂｓｔｅｒ系統由来であってもよい。１２９系統の例としては、１２９Ｐ１、１２９Ｐ２、１２９Ｐ３、１２９Ｘ１、１２９Ｓ１（例えば１２９Ｓ１／ＳＶ、１２９Ｓ１／Ｓｖｌｍ）、１２９Ｓ２、１２９Ｓ４、１２９Ｓ５、１２９Ｓ９／ＳｖＥｖＨ、１２９Ｓ６（１２９／ＳｖＥｖＴａｃ）、１２９Ｓ７、１２９Ｓ８、１２９Ｔ１および１２９Ｔ２が挙げられる。例えばＦｅｓｔｉｎｇ  ｅｔ  ａｌ．（１９９９）Ｍａｍｍａｌｉａｎ  Ｇｅｎｏｍｅ  １０：８３６を参照のこと。当該文献は参照によりその全体ですべての目的に対して本明細書に組み込まれる。Ｃ５７ＢＬ系統の例としては、Ｃ５７ＢＬ／Ａ、Ｃ５７ＢＬ／Ａｎ、Ｃ５７ＢＬ／ＧｒＦａ、Ｃ５７ＢＬ／Ｋａｌ＿ｗＮ、Ｃ５７ＢＬ／６、Ｃ５７ＢＬ／６Ｊ、Ｃ５７ＢＬ／６ＢｙＪ、Ｃ５７ＢＬ／６ＮＪ、Ｃ５７ＢＬ／１０、Ｃ５７ＢＬ／１０ＳｃＳｎ、Ｃ５７ＢＬ／１０ＣｒおよびＣ５７ＢＬ／Ｏｌａが挙げられる。適切なマウスは、前述の１２９系統と前述のＣ５７ＢＬ／６系統の雑種由来であってもよい（例えば５０％が１２９で５０％がＣ５７ＢＬ／６）。同様に適切なマウスは、前述の１２９系統と前述のＢＬ／６系統の雑種由来であってもよい（例えば１２９Ｓ６（１２９／ＳｖＥｖＴａｃ）系統）。
【０１０３】
同様に、ラットは、たとえばＡＣＩラット系統、Ｄａｒｋ  Ａｇｏｕｔｉ（ＤＡ）ラット系統、Ｗｉｓｔａｒラット系統、ＬＥＡラット系統、Ｓｐｒａｇｕｅ  Ｄａｗｌｅｙ（ＳＤ）ラット系統、またはたとえばＦｉｓｈｅｒ  Ｆ３４４もしくはＦｉｓｈｅｒ  Ｆ６などのＦｉｓｃｈｅｒラット系統をはじめとする任意のラット系統由来であってもよい。ラットは、上記の２種以上の系統の雑種から誘導された系統から取得されてもよい。例えば適切なラットは、ＤＡ系統またはＡＣＩ系統由来であってもよい。ＡＣＩラット系統は、黒アグーチを有し、腹部と足は白色で、ＲＴ１ａｖ１ハプロタイプであることが特徴である。当該系統は、Ｈａｒｌａｎ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｉｅｓをはじめとする様々な供給源から入手可能である。Ｄａｒｋ  Ａｇｏｕｔｉ（ＤＡ）ラット系統は、アグーチの毛色を有し、ＲＴ１ａｖ１ハプロタイプであることが特徴である。当該ラットは、Ｃｈａｒｌｅｓ  ＲｉｖｅｒおよびＨａｒｌａｎ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｉｅｓをはじめとする様々な供給源から入手可能である。一部の適切なラットは、近交系ラット系統由来であってもよい。例えば、ＵＳ２０１４／０２３５９３３を参照のこと。当該文献は参照によりその全体ですべての目的に対して本明細書に組み込まれる。
【０１０４】
ＩＩＩ．ヒト化Ａｓｇｒ１座位を含む非ヒト動物を、治療用複合体の肝臓へのヒトＡＳＧＲ１介在性送達のインビボ有効性評価に使用する方法、およびヒトＡＳＧＲ１介在性機序を介した治療用分子の作用評価に使用する方法。
本明細書において別に記載されるヒト化Ａｓｇｒ１座位を含む非ヒト動物を、肝臓への治療用分子または治療用分子のヒトＡＳＧＲ１介在性送達のインビボ有効性評価に使用するための様々な方法、およびヒトＡＳＧＲ１介在性機序の評価に使用するための様々な方法が提供される。非ヒト動物がヒト化Ａｓｇｒ１座位を含むことで、当該非ヒト動物は、非ヒト化Ａｓｇｒ１座位を有する非ヒト動物よりも、ヒトＡＳＧＲ１により介在される送達、またはヒトＡＳＧＲ１介在性治療機序をより正確に反映するであろう。一例として、当該方法は、インビボのヒトＡＳＧＲ１介在性内部移行を介した肝臓への治療用複合体の送達を評価することができ、当該方法は、ヒト化Ａｓｇｒ１座位を含む非ヒト動物に治療用複合体を投与することであって、当該治療用複合体は、治療用分子と、ヒトＡＳＧＲ１に特異的に結合する抗原結合タンパク質またはリガンドを含む、投与すること、次いで当該非ヒト動物の肝臓への当該治療用分子の送達を評価することを含む。別の例としては、当該方法は、ヒトＡＳＧＲ１介在性内部移行を介して作用するように設計された治療用分子または治療用複合体、例えばヒトＡＳＧＲ１を介して標的肝臓細胞表面タンパク質を内部移行させるよう設計された治療用複合体のインビボ有効性を評価することができる。
【０１０５】
Ａ．ヒトＡＳＧＲ１介在性内部移行を介した肝臓への治療用分子の送達のインビボ有効性を評価する方法
本明細書において別に記載されるヒト化Ａｓｇｒ１座位を含む非ヒト動物を、ヒトＡＳＧＲ１介在性内部移行を介した治療用分子の肝臓への送達のインビボ有効性評価に使用するための様々な方法が提供される。例えばかかる方法は、（ａ）ヒト化Ａｓｇｒ１座位を含む非ヒト動物に治療用複合体を投与することであって、当該治療用複合体は、治療用分子と、ヒトＡＳＧＲ１に特異的に結合する抗原結合タンパク質またはリガンドを含む、投与すること、および（ｂ）当該非ヒト動物の肝臓への当該治療用分子の送達を評価すること、を含んでもよい。
【０１０６】
治療用分子は、任意の疾患もしくは障害の治療または予防において使用される任意の生物剤または化学剤であってもよい。例えば治療用分子は、治療用核酸（例えば、ＣＲＩＳＰＲ／ＣａｓガイドＲＮＡ、短ヘアピンＲＮＡ（ｓｈＮＡ）、または低分子干渉ＲＮＡ（ｓｉＲＮＡ））または治療用タンパク質（例えばＣａｓ９タンパク質などのＣａｓタンパク質、置換酵素、分泌治療タンパク質など）をコードする核酸であってもよい。あるいは治療用分子は、治療用タンパク質、治療用抗体もしくは治療用抗原結合タンパク質、または任意の他の治療的高分子もしくは低分子であってもよい。
【０１０７】
治療用分子とヒトＡＳＧＲ１抗原結合タンパク質またはリガンドは、任意の手段で一緒に複合体化されてもよい。例えば治療用分子とヒトＡＳＧＲ１抗原結合タンパク質またはリガンドは、直接的な共有結合を介して結合されてもよく、または例えばペプチドリンカーもしくは化学リンカーなどのリンカーを介して結合されてもよい。治療用分子とヒトＡＳＧＲ１抗原結合タンパク質またはリガンドは、特定の官能基または特定の空間適合（例えば錠と鍵のタイプ）の間に結合を形成することで一緒に複合体化されてもよい。具体的な例として、ヒトＡＳＧＲ１抗原結合タンパク質は、治療用分子にも特異的に結合する二重特異性抗原結合タンパク質であってもよい。
【０１０８】
治療用複合体の投与は、本明細書において別に詳細に開示される任意の手段による、および任意の投与経路によるものであってもよい。治療用複合体および治療用分子の送達手段、ならびに投与経路は、本明細書において別に詳細に開示される。
【０１０９】
ヒトＡＳＧＲ１に特異的に結合するヒトＡＳＧＲ１抗原結合タンパク質またはヒトＡＳＧＲ１リガンドを使用してもよい。ヒトＡＳＧＲ１タンパク質は、肝臓において特定の糖タンパク質のエンドサイトーシスを介在する膜貫通型タンパク質であり、そのため、ヒトＡＳＧＲ１と複合体化された分子は、ヒトＡＳＧＲ１とともに内部移行され得る。適切な抗原結合タンパク質の例としては、受容体融合分子、トラップ分子、受容体Ｆｃ融合分子、抗体、Ｆａｂ断片、Ｆ（ａｂ’）２断片、Ｆｄ断片、Ｆｖ断片、一本鎖Ｆｖ（ｓｃＦｖ）分子、ｄＡｂ断片、単離相補性決定領域（ＣＤＲ）、ＣＤＲ３ペプチド、拘束ＦＲ３−ＣＤＲ３−ＦＲ４ペプチド、ドメイン特異的抗体、単一ドメイン抗体、ドメイン欠失抗体、キメラ抗体、ＣＤＲ移植抗体、ダイアボディ、トリアボディ、テトラボディ、ミニボディ、ナノボディ、一価ナノボディ、二価ナノボディ、小モジュラー免疫薬（ＳＭＩＰ：ｓｍａｌｌ  ｍｏｄｕｌａｒ  ｉｍｍｕｎｏｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ）、ラクダ抗体（ＶＨＨ重鎖ホモ二量体抗体）、およびサメ可変ＩｇＮＡＲドメインなどが挙げられる。一つの特定の例では、抗原結合タンパク質は、ヒトＡＳＧＲ１と治療用分子（例えば置換タンパク質または酵素または例えばＡＡＶなどの送達用ビヒクル）に結合する二重特異性抗体である。あるいはヒトＡＳＧＲ１と特異的に相互作用するリガンドまたはリガンド部分（例えばアシアロオロソムコイド（ＡＳＯＲ）またはＢｅｔａ−Ｇａ１ＮａｃまたはそのＡＳＧＲ１に対する受容体結合部分）を使用してもよい。
【０１１０】
非ヒト動物の肝臓への治療用分子の送達は、任意の公知の手段により評価されてもよい。一例として、肝臓内の治療用分子の存在が評価されてもよい。例えば治療用分子が治療用タンパク質である場合、タンパク質検出用の公知のアッセイを使用して非ヒト動物の肝臓における治療用タンパク質の存在が評価されてもよい。同様に、治療用分子が治療用タンパク質をコードする核酸である場合、公知のアッセイを使用して非ヒト動物の肝臓における核酸の発現（例えばｍＲＮＡ発現またはタンパク質発現）が評価されてもよい。コードされた治療用タンパク質が分泌タンパク質である場合、公知のアッセイを使用して、治療用タンパク質の血清レベルが測定されてもよく、またはその意図される標的の細胞型、組織型または器官で分泌された治療用タンパク質の活性が評価されてもよい。非ヒト動物の肝臓における治療用分子の活性は、当該治療用分子の意図される機能に応じて公知のアッセイにより評価されてもよい。例えばＣＲＩＳＰＲ／Ｃａｓなどのゲノム編集剤が導入される場合、公知のアッセイを使用して、特定の標的ゲノム座位でのゲノム編集を評価してもよい。
【０１１１】
特定の例では、治療用複合体はウイルスベクター組成物（例えば、肝臓特異的ウイルスベクター組成物）を含んでもよい。ヒトＡＳＧＲ１を指向するよう設計された、かかるウイルスベクター組成物は、肝臓を標的とするために、本来の指向性を低減または無効化されてもよい。例えばかかる改変ウイルスベクター複合体は、（ｉ）治療用核酸または治療用タンパク質をコードする核酸を含む改変ウイルスベクターであって、当該改変ウイルスベクターは、本来の指向性を無効化または低減されるとともに異種エピトープを含むベクター、ならびに（ｉｉ）（１）当該異種エピトープに特異的に結合する抗原結合タンパク質（例えば抗体）のパラトープ；および（２）ヒトＡＳＧＲ１に特異的に結合する標的化リガンド、を含む再標的化部分を含んでもよい。
【０１１２】
どのようにこれを実現するかの一例において、例えばＳｐｙＣａｔｃｈｅｒ−ＳｐｙＴａｇなどのタンパク質タグ化システムを使用して、抗体とウイルス表面を共有結合させてもよい。あるいは二重特異性抗原結合タンパク質を使用してもよい（例えば、抗体の一つのアームがウイルスに結合し、他方のアームがヒトＡＳＧＲ１への結合を介在する二重特異性抗体など）。特定の例では、再指向化部分は、第一および第二の抗原結合ドメインを含む二特異性抗原結合タンパク質（例えば二重特異性抗体）であり、この場合において当該第一の抗原結合ドメインは、組換えヒトウイルスカプシドタンパク質に挿入された／提示された異種エピトープに特異的に結合するパラトープを含み、当該第二の抗原結合ドメインは、ヒトＡＳＧＲ１に特異的に結合する。
【０１１３】
適切な異種エピトープの例は、Ｍｙｃタグである。例えば、Ｍｙｃタグは、ＡＡＶ２のＮ５８７の後に挿入されてもよい。そのような挿入により、ＡＡＶ２の本来のリガンド結合活性が無効化され、さらに抗Ｍｙｃ抗体により改変ＡＡＶを認識することが可能となる。次いで、ＭｙｃとヒトＡＳＧＲ１の両方に特異的に結合する二重特異性抗体を使用することで、ヒトＡＳＧＲ１（またはヒト化Ａｓｇｒ１）を発現する肝細胞にＡＡＶ（例えば、ＡＡＶ２  Ｎ５８７  Ｍｙｃ）を再標的化させることができる。
【０１１４】
別の例では治療用複合体は、リソソーム置換酵素もしくはタンパク質を含み、またはリソソーム置換酵素もしくはタンパク質をコードする核酸を含む。リソソーム蓄積症は、スフィンゴ脂質、ムコ多糖類、糖タンパク質、グリコーゲンおよびオリゴ糖を含むリソソーム中の様々な基質の分解に影響を及ぼす稀な疾患類であり、これらが病的な細胞中で蓄積されると細胞死が生じ得る。リソソーム蓄積症に影響を受ける器官としては肝臓が挙げられる。これらの疾患の病因は、タンパク質機能の喪失に通常は起因して、不完全な分解産物がリソソーム内に蓄積することにあると考えられている。リソソーム蓄積症は一般的に、正常な機能ではリソソーム含有物を分解するかまたは分解を調整するタンパク質における、機能喪失型または減弱型のバリアントによって引き起こされる。リソソーム蓄積症の例は、ＷＯ２０１７／１００４６７に提供されており、当該文献は全ての目的に対しその全体で参照により本明細書に組み込まれる。例えば最も一般的なリソソーム蓄積症の一つは、ポンペ病（Ｐｏｍｐｅ  ｄｉｓｅａｓｅ）である。ポンペ病は欠損リソソーム酵素アルファ−グルコシダーゼ（ＧＡＡ）によって引き起こされ、その結果、リソソーム内のグリコーゲンのプロセシングが不十分になる。リソソーム内のグリコーゲンの蓄積は、主に骨格組織、心臓組織、および肝組織に生じる。
【０１１５】
リソソーム蓄積症の治療に対する選択肢の一つは、酵素またはタンパク質の置換療法である。置換酵素またはタンパク質は、ヒトＡＳＧＲ１に特異的に結合する抗原結合タンパク質またはリガンドとの治療用複合体に関連付けられることで、特定の標的細胞のリソソームに効率的に送達されることができる。ＷＯ２０１７／１００４６７を参照のこと。当該文献は参照によりその全体ですべての目的に対して本明細書に組み込まれる。そのような治療用複合体を対象に投与してもよく、そして当該治療用複合体は、対象の標的細胞のリソソームに侵入し、酵素活性を提供して、リソソーム蓄積症と関連する酵素活性を置き換えることができる。ヒトＡＳＧＲ１タンパク質は、肝臓において、末端ガラクトースまたはＮ−アセチルガラクトサミン残基が露出した糖タンパク質のエンドサイトーシスとリソソーム分解を介在する膜貫通型タンパク質である。そのため、ヒトＡＳＧＲ１に結合し、一緒に内部移行されるタンパク質が、リソソームの標的となる。したがってヒトＡＳＧＲ１に治療用分子または治療用複合体を指向させる送達方法を使用して、治療剤をリソソーム（例えば肝臓中のリソソーム）の標的とさせることができる。
【０１１６】
ゆえに本明細書に提供される方法の一部は、インビボでのヒトＡＳＧＲ１を介した肝臓へのリソソーム置換タンパク質または酵素を含む治療用複合体の送達を評価する方法である。例えばかかる方法は、（ａ）本明細書において別に記載される非ヒト動物に治療用分子または治療用複合体を投与することであって、当該治療用分子または治療用複合体は、リソソーム置換タンパク質または酵素（またはリソソーム置換タンパク質もしくは酵素をコードする核酸）と、ヒトＡＳＧＲ１に特異的に結合する抗原結合タンパク質を含み、この場合においてＡＳＧＲ１は、細胞結合とリソソーム分画内への取り込みを介在する、投与すること；および（ｂ）当該非ヒト動物の肝臓中のリソソーム置換タンパク質もしくは酵素の存在または活性を評価すること、を含んでもよい。非ヒト動物の肝臓中の置換タンパク質または酵素の活性は、特定の置換タンパク質または酵素に対する公知のアッセイにより評価されてもよく、または公知のアッセイにより、リソソーム中の影響を受ける様々な基質の分解を測定することにより評価されてもよい。
【０１１７】
別の例としては、治療用分子は、治療用分泌タンパク質をコードする核酸であってもよい。肝臓は、主要血漿タンパク質、止血と線溶の因子、キャリアタンパク質、ホルモン類、プロホルモン類およびアポリポタンパク質をはじめとする血液中に分泌されるタンパク質の産生に主要な役割を果たしている。ヒトＡＳＧＲ１タンパク質は、肝臓において特定の糖タンパク質のエンドサイトーシスを介在する膜貫通型タンパク質である。したがって、ヒトＡＳＧＲ１と複合体化された分子は、ヒトＡＳＧＲ１とともに内部移行されることができる。ゆえに、治療用分泌タンパク質をコードする核酸は、ヒトＡＳＧＲ１を標的とする複合体中で当該核酸が送達されることにより肝臓へと標的化されることができる。核酸がＡＳＧＲ１を介して内部移行されてもよく、肝臓が治療用タンパク質を生成および分泌してもよい。
【０１１８】
ゆえに本明細書に提供される方法の一部は、インビボでのヒトＡＳＧＲ１を介した肝臓への治療用分泌タンパク質をコードする核酸の送達を評価する方法である。例えばかかる方法は、（ａ）本明細書に別に記載される非ヒト動物に、治療用分泌タンパク質をコードする核酸（例えばＤＮＡ）を投与する工程であって、当該核酸は、ヒトＡＳＧＲ１に特異的に結合する治療用複合体中で送達され、ＡＳＧＲ１は当該複合体の内部移行を介在する工程；および（ｂ）非ヒト動物において治療用分泌タンパク質の分泌レベル（例えば血清レベル）または活性を評価する工程、を含んでもよい。
【０１１９】
治療用タンパク質の産生および分泌は、任意の公知の手段によって評価されてもよい。例えば導入された核酸の発現は、公知のアッセイを使用して、非ヒト動物の肝臓におけるコードされたｍＲＮＡのレベルを測定することにより評価されてもよく、または非ヒト動物の肝臓におけるコードされた治療用タンパク質のレベルを測定することにより評価されてもよい。治療用タンパク質の分泌は、公知のアッセイを使用して、非ヒト動物におけるコードされた治療用タンパク質の血清レベルを測定することにより評価されてもよい。さらに、分泌された治療用タンパク質が特定の細胞型、組織または器官に対して作用する場合には、分泌された治療用タンパク質の活性は、標的の細胞型、組織または器官において評価されてもよい。
【０１２０】
Ｂ．ヒトＡＳＧＲ１介在性内部移行を介した、標的肝臓細胞表面タンパク質または肝臓中の標的可溶性タンパク質の内部移行に関する治療用複合体のインビボ有効性を評価する方法
ヒトＡＳＧＲ１を介して、標的肝臓細胞表面タンパク質または肝臓中の標的可溶性タンパク質を内部移行するよう設計された治療用複合体のインビボ有効性を評価するための、本明細書において別に記載されるヒト化Ａｓｇｒ１座位を含む非ヒト動物を使用する様々な方法が提供される。治療処理はしばしば、細胞上で、または細胞の近くで作用する一つ以上の標的分子の不活化または遮断を必要とする。例えば、抗体に基づく治療はしばしば、細胞の表面にて発現する特定の抗原、または可溶性リガンドと結合することによって機能し、結果として抗原の通常の生物活性を妨害する。このタイプの治療薬は典型的に、細胞シグナル伝達を減弱または抑制するため、サイトカインとその受容体との間での相互作用を遮断することによって機能する。特定の文脈においては、しかしながら、別の成分とのその物理的相互作用を遮断することを必ずしも伴わない方法で、標的分子の活性を不活化または抑制するために、治療に有益であり得る。標的分子のそのような非遮断減弱が達成され得る一つの方法として、細胞外または細胞表面における標的分子の濃度を減少させることを挙げることができる。例えば、標的分子と、例えばＡＳＧＲ１などの内部移行エフェクタータンパク質の間の物理的結合を促進することで、または実行することで、標的分子は減弱化され、または不活化され得る。これは例えば第一の抗原結合ドメインと第二の抗原結合ドメインを備えた多重特異性（例えば二重特異性）抗原結合分子の使用を介して実現することができる。各抗原結合ドメインは、異なる分子に結合する。第一のドメインは標的分子に特異的に結合し、第二のドメインはＡＳＧＲ１に特異的に結合する。このタイプの物理的分子間結合を通じて、標的分子を、ＡＳＧＲ１と共に細胞へ内部移行させ、細胞内部の分解機構によって処理することができるか、そうでなければ減弱する、隔離する、または不活化することができる。例えば、ＷＯ２０１３／１３８４００およびＵＳ２０１３／０２４３７７５を参照のこと。それら各々が参照によりその全体ですべての目的に対し本明細書に組み込まれる
【０１２１】
ヒトＡＳＧＲ１タンパク質は、肝臓において末端ガラクトースまたはＮ−アセチルガラクトサミン残基が暴露された糖タンパク質のエンドサイトーシスとリソソーム分解を介在する膜貫通型タンパク質であるため、ヒトＡＳＧＲ１と複合体化される細胞表面タンパク質はヒトＡＳＧＲ１とともに内部移行され、標的細胞表面タンパク質または標的可溶性タンパク質は、分解分画に再送付され、または標的細胞表面タンパク質または標的可溶性タンパク質は、内部分画またはエクソソーム中に隔離される。
【０１２２】
したがって本明細書において、ヒトＡＳＧＲ１を介して、標的肝臓細胞表面タンパク質または肝臓中の標的可溶性タンパク質を内部移行するよう設計された治療用複合体のインビボ有効性を評価するための、本明細書において別に記載されるヒト化Ａｓｇｒ１座位を含む非ヒト動物を使用する方法が提供される。例えばかかる方法は、（ａ）本明細書に別に記載される非ヒト動物に治療用複合体を投与することであって、当該治療用複合体は、標的細胞表面タンパク質または標的可溶性タンパク質に特異的に結合し、そしてヒトＡＳＧＲ１に特異的に結合する二重特異性抗原結合タンパク質を含み、この場合においてＡＳＧＲ１は当該標的細胞表面タンパク質または標的可溶性タンパク質の内部移行を介在する、投与すること、および（ｂ）当該非ヒト動物の肝臓中の標的肝臓細胞表面タンパク質の細胞表面レベルまたは活性を評価する工程、または非ヒト動物の肝臓中の標的可溶性タンパク質の発現レベルまたは活性を評価することを含む。治療用複合体の投与は、本明細書に別に記載される任意の適切な手段によるものであってもよい。
【０１２３】
標的細胞表面タンパク質は、肝臓中で発現される任意の細胞表面タンパク質を含んでもよい。標的可溶性タンパク質は、肝臓中で発現される任意の可溶性タンパク質を含んでもよい。非ヒト動物の肝臓中の標的肝臓細胞表面タンパク質の細胞表面レベルまたは活性は、受容体または他のタンパク質の細胞表面レベルを測定するための公知のアッセイにより評価されてもよい。同様に、可溶性タンパク質のレベルは、公知のアッセイにより評価されてもよい。
【０１２４】
Ｃ．非ヒト動物への分子の投与
本明細書に記載される方法は、非ヒト動物に、核酸、タンパク質またはタンパク質複合体を含むある様々な分子（治療用分子または治療用複合体）を導入することを含む。導入は任意の手段により達成することができる。例えば当該分子は、例えばベクター送達、粒子介在送達、エクソソーム介在送達、脂質ナノ粒子介在送達、細胞浸透ペプチド介在送達、または埋め込み型装置介在送達により非ヒト動物内に導入されてもよい。具体的な例としては、分子は、例えばポリ（乳酸）（ＰＬＡ）マイクロスフィア、ポリ（Ｄ，Ｌ−乳酸−コグリコール酸）（ＰＬＧＡ）マイクロスフィア、リポソーム、ミセル、逆ミセル、渦巻き型脂質または脂質微小管などの担体中で、細胞または非ヒト動物内に導入されてもよい。非ヒト動物への送達に関するいくつかの具体的な例としては、水力学的送達、ウイルス介在送達（例えばアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）介在送達）、および脂質ナノ粒子介在送達が挙げられる。
【０１２５】
核酸、タンパク質または他の構成要素の非ヒト動物への導入は、水力学的送達（ＨＤＤ：ｈｙｄｒｏｄｙｎａｍｉｃ  ｄｅｌｉｖｅｒｙ）により実現されてもよい。水力学的送達は、インビボにおける細胞内ＤＮＡ送達に関する完璧な方法として明らかになってきた。実質細胞への遺伝子送達に関しては、必須のＤＮＡ配列のみが選択血管を介して注入される必要があり、それにより現行のウイルスベクターおよび合成ベクターに関連する安全性の懸念が除外される。血流中に注入された場合、ＤＮＡは血液にアクセス可能な様々な組織中の細胞に到達することができる。水力学的送達は、大量の溶液を循環系の非圧縮性血液内に急速注入することで生じる力を用いており、それによって、大型で膜不浸透性の化合物が実質細胞に侵入することを阻んでいる内皮と細胞膜の物理的障壁を克服している。この方法は、ＤＮＡ送達に加えてＲＮＡ、タンパク質、および他の低分子化合物の効率的なインビボでの細胞内送達に有用である。例えば、Ｂｏｎａｍａｓｓａ  ｅｔ  ａｌ．（２０１１）Ｐｈａｒｍ．Ｒｅｓ．２８（４）：６９４−７０１を参照のこと。当該文献は参照によりその全体ですべての目的に対して本明細書に組み込まれる。
【０１２６】
核酸の導入は、例えばＡＡＶ介在送達またはレンチウイルス介在送達などのウイルス介在送達によっても実現することができる。他の例示的なウイルス／ウイルスベクターとしては、レトロウイルス、アデノウイルス、ワクシニアウイルス、ポックスウイルス、および単純ヘルペスウイルスが挙げられる。ウイルスは分裂細胞、非分裂細胞、または分裂細胞と非分裂細胞の両方に感染することができる。ウイルスは宿主ゲノム内に組み込まれることができる。あるいは宿主ゲノム内には組み込まれない。かかるウイルスを操作して、免疫性を減少させてもよい。ウイルスは複製能力があってもよく、または複製能力が欠けていてもよい（例えばビリオン複製および／またはパッケージングの追加的ラウンドに必要な一つまたは複数の遺伝子に欠陥がある）。ウイルスは一過性発現、長期にわたる発現（例えば少なくとも１週、２週、１か月、２か月または３か月）、または永続的な発現（例えばＣａｓ９および／またはｇＲＮＡに関して）を生じさせてもよい。例示的なウイルス力価（例えば、ＡＡＶ力価）としては、１０１２、１０１３、１０１４、１０１５、および１０１６ベクターゲノム／ｍＬが挙げられる。
【０１２７】
ｓｓＤＮＡ  ＡＡＶゲノムは、ＲｅｐとＣａｐの二つのオープンリーディングフレームからなり、これに二つの逆方向末端リピートが隣接することで相補的ＤＮＡ鎖の合成が可能となる。ＡＡＶトランスファープラスミドを構築する場合、導入遺伝子は二つのＩＴＲの間に配置され、ＲｅｐとＣａｐはトランスで供給されてもよい。ＲｅｐとＣａｐに加えて、ＡＡＶはアデノウイルス由来の遺伝子を含有するヘルパープラスミドを必要とし得る。これらの遺伝子（Ｅ４、Ｅ２ａおよびＶＡ）がＡＡＶ複製を介在する。例えばトランスファープラスミド、Ｒｅｐ／Ｃａｐおよびヘルパープラスミドを、アデノウイルス遺伝子のＥ１＋を含有するＨＥＫ２９３にトランスフェクトして、感染性ＡＡＶ粒子を産生させてもよい。あるいはＲｅｐ、Ｃａｐおよびアデノウイルスヘルパー遺伝子を、一つのプラスミド内にまとめる場合もある。類似したパッケージング細胞および方法を、例えばレトロウイルスなどの他のウイルスに使用してもよい。
【０１２８】
複数のＡＡＶ血清型が特定されている。これらの血清型は、感染する細胞型が異なっており（すなわち指向性が異なる）、それにより特定細胞型への優先的形質導入が可能となる。肝臓組織に対する血清型としては、ＡＡＶ７、ＡＡＶ８およびＡＡＶ９が挙げられるが、特にＡＡＶ８が挙げられる。
【０１２９】
指向性は、シュードタイピングを介してさらに改良させてもよい。シュードタイピングは、カプシドと、異なるウイルス血清型由来のゲノムを混合する方法である。シュードタイピングが為されたウイルスを使用することで、形質導入効率を改善し、ならびに指向性を変化させてもよい。異なる血清型から誘導されたハイブリッドカプシドを使用してウイルスの指向性を変化させてもよい。例えばＡＡＶ−ＤＪは、８個の血清型由来のハイブリッドカプシドを含有し、インビボで広範な細胞型に高い感染性を呈する。さらにＡＡＶの血清型を突然変異を通して改変してもよい。他のシュードタイプが為された／改変されたＡＡＶバリアントとしては、ＡＡＶ２／１、ＡＡＶ２／６、ＡＡＶ２／７、ＡＡＶ２／８、ＡＡＶ２／９、ＡＡＶ２．５、ＡＡＶ８．２、およびＡＡＶ／ＳＡＳＴＧが挙げられる。
【０１３０】
導入遺伝子の発現を早めるために、自己相補性ＡＡＶ（ｓｃＡＡＶ）バリアントを使用してもよい。ＡＡＶは細胞のＤＮＡ複製機序に依存してＡＡＶの一本鎖ＤＮＡゲノムの相補鎖を合成するため、導入遺伝子の発現は遅延する場合がある。この遅延に対処するために、感染時に自発的にアニーリングすることができる相補配列を含有するｓｃＡＡＶを使用してもよく、それにより宿主細胞ＤＮＡ合成に対する要求性が排除される。
【０１３１】
パッケージング能力を増強するために、長い導入遺伝子を、二つのＡＡＶトランスファープラスミドの間で分割する場合がある。１番目のプラスミドは３’スプライスドナーを有し、２番目のプラスミドは５’スプライスアクセプターを有する。細胞への共感染時にこれらのウイルスはコンカテマーを形成し、一緒にスプライシングされ、全長導入遺伝子が発現され得る。より長い導入遺伝子の発現が可能となるが、発現の効率は低い。能力を増強させるための類似方法は、相同組換えを利用するものである。例えば導入遺伝子を二つのトランスファープラスミドの間で分割するが、相当な配列が重複していることで共発現が相同組換えと全長導入遺伝子の発現を誘導する。
【０１３２】
核酸とタンパク質の導入は、脂質ナノ粒子（ＬＮＰ）介在送達により実現されてもよい。例えばＬＮＰ介在送達を使用して、ＲＮＡの形態でガイドＲＮＡを送達してもよい。このような方法を介して送達することで、ガイドＲＮＡが一過性に存在することとなり、生分解性脂質のクリアランスが改善され、忍容性が改善され、免疫原性が改善される。脂質製剤は分解から生物分子を防御することができる一方で、細胞取り込みも改善する。脂質ナノ粒子は、分子間力により互いに物理的に関連づけられた複数の脂質分子を含有する粒子である。これら脂質ナノ粒子としては、マイクロスフェア（例えばリポソームなどの単層小胞および多層小胞）、エマルション中の分散相、ミセルまたは懸濁液中の内相が挙げられる。そのような脂質ナノ粒子を使用して、送達用の一つまたは複数の核酸またはタンパク質を封入してもよい。カチオン性脂質を含有する製剤は、例えば核酸などのポリアニオンの送達に有用である。含有され得る他の脂質は、中性脂質（すなわち非電荷または両親媒性の脂質）、アニオン性脂質、トランスフェクションを強化するヘルパー脂質、およびナノ粒子がインビボで存在することができる時間の長さを延長させるためのステルス脂質である。適切なカチオン性脂質、中性脂質、アニオン性脂質、ヘルパー脂質およびステルス脂質の例は、ＷＯ２０１６／０１０８４０Ａ１号に見出すことができる。当該文献は、全ての目的に対しその全体で参照により本明細書に組み込まれる。例示的な脂質ナノ粒子は、カチオン性脂質と、一つまたは複数の他の構成要素を含み得る。一例では、他の構成要素は、例えばコレステロールなどのヘルパー脂質を含み得る。別の例では、他の構成要素は、例えばコレステロールなどのヘルパー脂質と、例えばＤＳＰＣなどの中性脂質を含み得る。別の例では、他の構成要素は、例えばコレステロールなどのヘルパー脂質、例えばＤＳＰＣなどの任意の中性脂質、および例えばＳ０１０、Ｓ０２４、Ｓ０２７、Ｓ０３１またはＳ０３３などのステルス脂質を含み得る。
【０１３３】
免疫原性を減少させる送達様式が選択されてもよい。様式が異なれば、分子が送達される対象に対して与えられる薬力学特性または薬物動態特性も異なり得る。例えば様式が異なれば、組織分布が異なり、半減期が異なり、または時間的分布が異なり得る。送達様式の一部（例えば自律的複製またはゲノム統合により細胞中で存続する核酸ベクターの送達など）は、より持続的な発現と分子の存在をもたらす。一方で他の送達様式は、一過性であり、持続性も低い（例えばＲＮＡまたはタンパク質の送達）。例えばＲＮＡまたはタンパク質としてなど、さらに一過性の様式で構成要素を送達することで、当該構成要素は確実に短期間だけ存在および活性を有することとなり、免疫原性を減少させることができる。
【０１３４】
インビボ投与は、例えば非経口、静脈内、皮下、動脈内または腹腔内などをはじめとする任意の適切な経路によるものであってもよい。全身投与の様式としては例えば静脈内、動脈内、皮下、および腹腔内の経路などの非経口経路が挙げられる。具体的な例は、静脈内点滴である。局所投与の様式を使用してもよい。
【０１３５】
核酸またはタンパク質を含む組成物は、一つまたは複数の生理学的および薬学的に許容可能な担体、希釈剤、賦形剤または補助剤を使用して製剤化されてもよい。製剤化は、選択された投与経路に依存してもよい。「薬学的に許容可能」という用語は、担体、希釈剤、賦形剤または補助剤が、製剤の他の成分との適合性があり、レシピエントに対して実質的に有害ではないことを意味する。
【０１３６】
投与頻度および用量数は特に、導入される構成要素の半減期および投与経路に依存してもよい。非ヒト動物内への核酸またはタンパク質の導入は、１回、またはある期間にわたり複数回実施されてもよい。例えば導入は、ある期間にわたり少なくとも２回、ある期間にわたり少なくとも３回、ある期間にわたり少なくとも４回、ある期間にわたり少なくとも５回、ある期間にわたり少なくとも６回、ある期間にわたり少なくとも７回、ある期間にわたり少なくとも８回、ある期間にわたり少なくとも９回、ある期間にわたり少なくとも１０回、ある期間にわたり少なくとも１１回、ある期間にわたり少なくとも１２回、ある期間にわたり少なくとも１３回、ある期間にわたり少なくとも１４回、ある期間にわたり少なくとも１５回、ある期間にわたり少なくとも１６回、ある期間にわたり少なくとも１７回、ある期間にわたり少なくとも１８回、ある期間にわたり少なくとも１９回、またはある期間にわたり少なくとも２０回実施されてもよい。
【０１３７】
ＩＶ．ヒト化Ａｓｇｒ１座位を含む非ヒト動物の作製方法
本明細書において別に記載されるヒト化Ａｓｇｒ１座位を含む非ヒト動物の作製に関する様々な方法が提供される。遺伝子改変生物を作製するための任意の便利な方法またはプロトコルが、かかる遺伝子改変非ヒト動物の作製に適している。例えば、Ｃｈｏ  ｅｔ  ａｌ．（２００９）Ｃｕｒｒｅｎｔ  Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ  ｉｎ  Ｃｅｌｌ  Ｂｉｏｌｏｇｙ  ４２：１９．１１：１９．１１．１−１９．１１．２２およびＧａｍａ  Ｓｏｓａ  ｅｔ  ａｌ．（２０１０）Ｂｒａｉｎ  Ｓｔｒｕｃｔ．Ｆｕｎｃｔ．２１４（２−３）：９１−１０９を参照のこと。それら各々が参照によりその全体ですべての目的に対して本明細書に組み込まれる。かかる遺伝子改変非ヒト動物は、例えば標的とされるＡｓｇｒ１座位での遺伝子ノックインを介して作製されてもよい。
【０１３８】
例えばヒト化Ａｓｇｒ１座位を含む非ヒト動物の作製方法は、（１）多能性細胞のゲノムを改変し、ヒト化Ａｓｇｒ１座位を含ませること；（２）ヒト化Ａｓｇｒ１座位を含む遺伝子改変多能性細胞を特定または選択すること；（３）遺伝子改変多能性細胞を、非ヒト動物宿主の胚へと導入すること；および（４）宿主胚を代理母に移植および妊娠させること、を含んでもよい。任意で、改変多能性細胞を含む宿主胚（例えば非ヒトＥＳ細胞）を胚盤胞期までインキュベートし、その後に代理母に移植および妊娠させ、Ｆ０の非ヒト動物を産生させてもよい。その後、代理母はヒト化Ａｓｇｒ１座位を含むＦ０世代の非ヒト動物を産生し得る。
【０１３９】
当該方法は、改変標的ゲノム座位を有する細胞または動物を特定することをさらに含んでもよい。様々な方法を使用して、標的の遺伝子改変を有する細胞および動物を特定してもよい。
【０１４０】
スクリーニング工程は例えば、親染色体のアレル改変（ＭＯＡ）を評価するための定量的アッセイを含んでもよい。例えば定量的アッセイは、例えばリアルタイムＰＣＲ（ｑＰＣＲ）などの定量的ＰＣＲを介して実施されてもよい。リアルタイムＰＣＲは標的座位を認識する第一のプライマーセットと、非標的参照座位を認識する第二のプライマーセットを利用してもよい。プライマーセットは、増幅された配列を認識する蛍光プローブを含んでもよい。
【０１４１】
適切な定量的アッセイの他の例としては、蛍光介在ｉｎ  ｓｉｔｕハイブリダイゼーション（ＦＩＳＨ）、比較ゲノムハイブリダイゼーション、定温ＤＮＡ増幅、固定化プローブに対する定量的ハイブリダイゼーション、ＩＮＶＡＤＥＲ（登録商標）プローブ、ＴＡＱＭＡＮ（登録商標）分子ビーコンプローブ、またはＥＣＬＩＰＳＥ（商標）プローブ法（例えば、ＵＳ  ２００５／０１４４６５５を参照のこと。当該文献は参照によりその全体ですべての目的に対して本明細書に組み込まれる）が挙げられる。
【０１４２】
適切な多能性細胞の例は、胚性幹（ＥＳ）細胞である（例えばマウスＥＳ細胞またはラットＥＳ細胞）。改変多能性細胞は例えば、（ａ）５’および３’の標的部位に対応する５’および３’のホモロジーアームに隣接した挿入核酸を含む標的化ベクターを一つまたは複数、細胞内に導入することであって、当該挿入核酸は、ヒト化Ａｓｇｒ１座位を含む、導入すること、および（ｂ）そのゲノム中に標的ゲノム座位で統合された挿入核酸を含む細胞を少なくとも一つ特定すること、による組み換えを介して作製されてもよい。あるいは改変多能性細胞は、（ａ）細胞内に、（ｉ）ヌクレアーゼ剤であって、当該ヌクレアーゼ剤は標的のゲノム座位内の認識部位でニックまたは二本鎖破断を誘導するもの、および（ｉｉ）認識部位に充分に近接して配置された５’および３’の標的部位に対応する５’および３’ホモロジーアームに隣接した挿入核酸を含む一つまたは複数の標的化ベクターであって、当該挿入核酸は、ヒト化Ａｓｇｒ１座位を含むもの、を導入すること、および（ｃ）標的ゲノム座位で改変（例えば挿入核酸の統合）を含む細胞を少なくとも一つ特定すること、により作製されてもよい。所望の認識部位内にニックまたは二本鎖破断を誘導する任意のヌクレアーゼ剤を使用することができる。適切なヌクレアーゼの例としては、Ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｉｏｎ  Ａｃｔｉｖａｔｏｒ−Ｌｉｋｅ  Ｅｆｆｅｃｔｏｒ  Ｎｕｃｌｅａｓｅ（ＴＡＬＥＮ）、ジンクフィンガーヌクレアーゼ（ＺＦＮ）、メガヌクレアーゼ、およびＣｌｕｓｔｅｒｅｄ  Ｒｅｇｕｌａｒｌｙ  Ｉｎｔｅｒｓｐｅｒｓｅｄ  Ｓｈｏｒｔ  Ｐａｌｉｎｄｒｏｍｉｃ  Ｒｅｐｅａｔｓ（ＣＲＩＳＰＲ）／ＣＲＩＳＰＲ−関連（Ｃａｓ）システム、またはかかるシステムの構成要素（例えばＣＲＩＳＰＲ／Ｃａｓ９）が挙げられる。例えば、ＵＳ２０１３／０３０９６７０およびＵＳ２０１５／０１５９１７５を参照のこと。それら各々が参照によりその全体ですべての目的に対し本明細書に組み込まれる。
【０１４３】
ドナー細胞は、任意の段階、例えば胚盤胞期または前−桑実胚期（すなわち４細胞期または８細胞期）などで宿主胚に導入されることができる。生殖細胞系列を介して遺伝子改変を伝達することができる子孫が作製される。例えば、米国特許第７，２９４，７５４号を参照のこと。これは参照によりその全体ですべての目的に対して本明細書に組み込まれる。
【０１４４】
あるいは、本明細書において別に記載される非ヒト動物を作製する方法は、（１）多能性細胞の改変に関する上述の方法を使用して一細胞期胚のゲノムを改変し、ヒト化Ａｓｇｒ１座位を含ませること；（２）遺伝子改変された胚を選択すること；および（３）遺伝子改変された胚を代理母に移植し、妊娠させること、を含んでもよい。生殖細胞系列を介して遺伝子改変を伝達することができる子孫が作製される。
【０１４５】
核移植技術を使用して、非ヒト哺乳類動物を作製することもできる。簡潔に述べると、核移植法は、（１）卵母細胞を除核する工程、または除核された卵母細胞を提供する工程；（２）除核された卵母細胞と組み合わされるドナー細胞またはドナー核を単離または提供する工程；（３）その細胞または核を、除核卵母細胞に注入し、再構成細胞を形成させる工程；（４）再構成細胞を動物の子宮に移植し、胚を形成させる工程；および（５）胚を発生させる工程、を含んでもよい。かかる方法において、卵母細胞は通常、死亡した動物から採取されるが、生きた動物の卵管および／または卵巣のいずれかから単離されてもよい。卵母細胞は、除核の前に、様々な公知の培地中で成熟されてもよい。卵母細胞の除核は、公知の多くの方法において実施することができる。除核卵母細胞にドナー細胞またはドナー核を注入して再構成細胞を形成させることは、融合前の透明帯下にドナー細胞をマイクロインジェクションすることにより行われてもよい。融合は、接触／融合面の全体にわたりＤＣ電気パルスを与えること（エレクトロフュージョン）により、たとえばポリエチレングリコールなどの融合促進化学物質に細胞を暴露することにより、またはたとえばセンダイウイルスなどの不活化ウイルスを用いることにより、誘導されてもよい。再構成細胞は、核ドナーとレシピエント卵母細胞の融合の前、融合の間、および／または融合の後に、電気的および／または非電気的手段により活性化されてもよい。活性化の方法としては、電気パルス、化学誘導ショック、精子の侵入、卵母細胞中の二価カチオン値の上昇、および卵母細胞中の細胞タンパク質のリン酸化の減少（キナーゼ阻害物質によるものとして）が挙げられる。活性化された再構成細胞または胚は、公知の培地中で培養され、その後、動物の子宮に移植されてもよい。例えば、ＵＳ２００８／００９２２４９、ＷＯ１９９９／００５２６６、ＵＳ２００４／０１７７３９０、ＷＯ２００８／０１７２３４、および米国特許第７，６１２，２５０号を参照のこと。それら各々が参照によりその全体ですべての目的に対し本明細書に組み込まれる。
【０１４６】
本明細書に提示される様々な方法により、遺伝子改変された非ヒトＦ０動物の作製が可能となり、この場合において当該遺伝子改変されたＦ０動物の細胞は、ヒト化Ａｓｇｒ１座位を含む。Ｆ０動物を作製するために使用された方法に応じて、ヒト化Ａｓｇｒ１座位を有するＦ０動物内の細胞数は変化するであろうと認識されている。対応する生物（例えば８細胞期のマウス胚）から、例えばＶＥＬＯＣＩＭＯＵＳＥ（登録商標）法を介して前−桑実胚期の胚内にドナーＥＳ細胞を導入することにより、標的の遺伝子改変を含む対象のヌクレオチド配列を有する細胞を含むＦ０動物の細胞群の割合が高くなる。例えば非ヒトＦ０動物の細胞寄与の少なくとも５０％、６０％、６５％、７０％、７５％、８５％、８６％、８７％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％または１００％が、標的の改変を有する細胞群を含んでもよい。
【０１４７】
遺伝子改変されたＦ０動物の細胞は、ヒト化Ａｓｇｒ１座位に対してヘテロ接合性であってもよく、またはヒト化Ａｓｇｒ１座位に対してホモ接合性であってもよい。
【０１４８】
上記および下記に引用されるすべての特許出願、ウェブサイト、他の公表文献、アクセッション番号などは、それぞれの個々の項目が具体的に、および個々に参照により組み込まれると示されるのと同程度にまで、全ての目的に対しその全体で参照により組み込まれる。別バージョンの配列が、別時点のアクセッション番号と関連付けられている場合、本出願の有効な出願日におけるアクセッション番号と関連付けられたバージョンが意図される。有効な出願日は、必要に応じて、実際の出願日、またはアクセッション番号を参照する優先権出願の出願日の早い方が意図される。同様に、別バージョンの公表文献、ウェブサイトなどが別時点で公表された場合、別段の示唆が無い限り、本出願の有効出願日に最も近く公表されたバージョンが意図される。本発明の任意の特性、工程、要素、実施形態または態様が、別段の具体的な示唆が無い限り、任意の他のものと組み合わせて使用され得る。本発明は、明確性および理解を目的として、図および実施例により詳細に記載されているが、特定の変化および改変が、添付の請求の範囲内で実施され得ることが明白であろう。
【０１４９】
配列の簡単な説明
添付の配列表に列挙されるヌクレオチド配列およびアミノ酸配列は、ヌクレオチド塩基に関しては標準的な文字略語を使用して示され、アミノ酸に関しては３文字コードを使用して示されている。ヌクレオチド配列は、配列の５’末端で始まり、３’末端へと進む（すなわち各ラインで左から右へ）標準的な慣例に従っている。各ヌクレオチド配列の一つの鎖のみが示されているが、提示された鎖に対する任意の参照によって相補鎖も含まれると理解される。アミノ酸配列は、配列のアミノ末端で始まり、カルボキシ末端へと進む（すなわち各ラインで左から右へ）標準的な慣例に従っている。
【０１５０】
表１．配列の説明
【表１−１】
2020529837.tif 000003
【表１−２】
2020529837.tif 000004
【実施例】
【０１５１】
実施例１  ヒト化Ａｓｇｒ１座位を含むマウスの作製
アシアロ糖タンパク質受容体（Ａｓｈｗｅｌｌ  Ｒｅｃｅｐｔｏｒ、ＡＳＧＲ）は、レクチン受容体のＣ型クラスに属する、肝臓膜結合優位型糖結合タンパク質受容体（約３３ｋＤａ）である。ＡＳＧＲは、末端ガラクトースまたはＮ−アセチルガラクトサミン（ＧａｌＮａｃ）モチーフを有する糖タンパク質に結合する。受容体介在エンドサイトーシスにより循環系から脱シアル化糖タンパク質を除去することができる。リガンドはリソソーム分解を経る一方で、ＡＳＧＲは細胞表面へとリサイクルで戻される。この受容体はＡＳＧＲ１とＡＳＧＲ２（Ｈ１およびＨ２）の二つのサブユニットのヘテロオリゴマーである。高効率エンドサイトーシスの肝臓特異的受容体として、ＡＳＧＲ１は、例えば抗体、低分子（抗体−薬剤複合体の一部として）、およびＤＮＡなどの治療剤の肝臓特異的送達に利用することができる。しかしながらヒトＡＳＧＲ１細胞外ドメインに対して本発明者らが作製した抗体および二重特異性抗体は、マウスＡｓｇｒ１オルソログには結合しない（Ｂｉａｃｏｒｅデータは示さず）。ゆえに本発明者らは、多くの様々な方法を利用して、様々な治療剤の肝臓特異的送達の検証における使用のためのヒト化Ａｓｇｒ１マウスを作製した。
【０１５２】
ｂＭＱ−６９Ｂ１１由来の２４ｋｂを含む５’ホモロジーアームと、ｂＭＱ−６９Ｂ１１由来の６７ｋｂを含む３’ホモロジーアームを備えた大型標的化ベクターを作製し、マウスＡｓｇｒ１のコードエクソン３〜８（停止コドンおよび３’ＵＴＲを通過し、３’ＵＴＲのちょうど下流の配列まで）と、対応するヒトＡＳＧＲ１の配列とを置き換えた。コードされるＡｓｇｒ１タンパク質は、マウスＡｓｇｒ１膜貫通ドメイン、ならびにヒト多重コイルドメインおよびＣ型レクチンドメインが続いた。図２Ａおよび３を参照のこと。突然変異体アレルを作製するために、Ｆ１Ｈ４マウス胚性幹細胞内に大型標的化ベクターとともにＣＲＩＳＰＲ／Ｃａｓ９の構成要素が導入された。表２に記載されるプライマーとプローブを使用したアレル消失（Ｌｏｓｓ−ｏｆ−ａｌｌｅｌｅ）アッセイを実施し、内因性マウスアレルの消失を検出し、表３に記載されるプライマーとプローブを使用したアレル獲得（ｇａｉｎ−ｏｆ−ａｌｌｅｌｅ）アッセイを実施し、ヒト化アレルの獲得を検出した。アレル消失アッセイとアレル獲得アッセイは例えば、ＵＳ２０１４／０１７８８７９；ＵＳ  ２０１６／０１４５６４６；ＷＯ２０１６／０８１９２３；およびＦｒｅｎｄｅｗｅｙ  ｅｔ  ａｌ．（２０１０）Ｍｅｔｈｏｄｓ  Ｅｎｚｙｍｏｌ．４７６：２９５−３０７を参照のこと。それら各文献は参照によりその全体ですべての目的に対して本明細書に組み込まれる。
【０１５３】
表２．マウスＴＡＱＭＡＮ（登録商標）アレル消失アッセイ
【表２】
2020529837.tif 000005
【０１５４】
表３．ヒトＴＡＱＭＡＮ（登録商標）アレル獲得アッセイ
【表３】
2020529837.tif 000006
【０１５５】
次いでＶＥＬＯＣＩＭＯＵＳＥ（登録商標）法を使用してＦ０マウスを作製した。例えばＵＳ７，５７６，２５９；ＵＳ７，６５９，４４２；ＵＳ７，２９４，７５４；ＵＳ２００８／００７８００；およびＰｏｕｅｙｍｉｒｏｕ  ｅｔ  ａｌ．（２００７）Ｎａｔｕｒｅ  Ｂｉｏｔｅｃｈ．２５（１）：９１−９９。それら各文献は参照によりその全体ですべての目的に対して本明細書に組み込まれる。コードエクソン３の上流のイントロン部分もヒト化された。全部で１８６３ｂｐのマウスＡｓｇｒ１配列が、３９０７ｂｐのヒトＡＳＧＲ１配列により置き換えられた。さらにｌｏｘＰ−ｈＵｂ１−ｅｍ７−ハイグロマイシン耐性遺伝子−ポリアデニル化シグナル−ｍＰｒｍ１−Ｃｒｅｉ−ポリアデニル化シグナル−ｌｏｘＰカセット（５２１８ｂｐ）もヒト３’ＵＴＲの下流に挿入された。当該カセットの直前に、およそ１９０ｂｐの３’ＵＴＲの３’ヒト配列の緩衝が置かれた。得られたハイグロマイシン抵抗性自動削除カセットを含む部分ヒト化マウスＡｓｇｒ１アレルを、配列番号２１（７３０２アレルと呼称される）に記載する。図２Ａにおいて、配列境界領域Ａ、ＢおよびＣを、それぞれ配列番号１８、１９および２０として記載する。ヒトＡＳＧＲ１タンパク質（配列番号１）、マウスＡｓｇｒ１タンパク質（配列番号２）、および部分ヒト化マウスＡｓｇｒ１タンパク質（配列番号３）の比較を図３に示す。
【０１５６】
Ｃｒｅリコンビナーゼを有する自動削除カセットが除去された時点で、ｌｏｘＰおよびクローニング部位（７７ｂｐ）は、残留ｌｏｘＰの直前の３’ＵＴＲ後のおよそ１９０ｂｐの３’ヒト配列とともに、ヒト３’ＵＴＲの下流に残留している。図２Ｂを参照のこと。得られた部分ヒト化マウス、カセット削除Ａｓｇｒ１アレルを、配列番号２４（７３０３アレルと呼称される）に記載する。図２Ｂにおいて、配列境界領域ＡおよびＣを、それぞれ配列番号２２および２３に記載する。
【０１５７】
実施例２  ヒト化Ａｓｇｒ１座位を含むマウスの検証
有効モデルとしてのヒト化Ａｓｇｒ１マウス（Ａｓｇｒ１ｈｕ／ｈｕ）の検証を行うために、Ａｓｇｒ１ｈｕ／ｈｕマウスを表現型解析し、その表現型を野生型同腹仔の表現型と比較した。Ａｓｇｒ１ｈｕ／ｈｕマウスは、野生型同腹仔と比較して血漿脂質レベル（総コレステロール、トリグリセリド、ＨＤＬ−Ｃ、ＬＤＬ−Ｃ）における差異は示さなかった。図４を参照のこと。同様に、Ａｓｇｒ１ｈｕ／ｈｕマウスは、野生型同腹仔と比較して、体重または血中グルコースレベルにおける差異は示さなかった。図５を参照のこと。ヒトＡＳＧＲ１タンパク質は、マウスＡｓｇｒ１と同様に、肝臓膜に共局在していた。図６を参照のこと。結論として、Ａｓｇｒ１ｈｕ／ｈｕマウスは肝臓膜上でヒトＡＳＧＲ１タンパク質を発現するとともに、正常な血漿脂質プロファイルを有している。
【０１５８】
方法
Ａｓｇｒ１ヒト化マウスにおける循環脂質レベルの評価  オスＡｓｇｒ１ヒト化マウス（Ａｓｇｒ１ｈｕｍ／ｈｕｍ）およびそれらの野生型同腹仔（Ａｓｇｒ１＋／＋）の血漿を非絶食状態で採取し、血清化学分析器のＡＤＶＩＡ（登録商標）Ｃｈｅｍｉｓｔｒｙ  ＸＰＴ  Ｓｙｓｔｅｍ（Ｓｉｅｍｅｎｓ社）を使用して血清脂質（トリグリセリド（ＴＧ）、総コレステロール、低密度リポタンパク質コレステロール（ＬＤＬ−Ｃ）、高密度リポタンパク質コレステロール（ＨＤＬ−Ｃ））について分析した。Ｎ＝８匹／群、１１週齢。データはそれぞれに対する平均±ＳＥＭとして表された。
【０１５９】
血中グルコースの評価  血中グルコースは、絶食状態（１６時間）および給餌（非絶食）状態で、Ａｃｃｕ−Ｃｈｅｋグルコメーター（Ｒｏｃｈｅ社）を使用して尾端から測定された。
【０１６０】
Ａｓｇｒ１に関するウェスタンブロット評価。Ａｓｇｒ１ヒト化マウスおよびＷＴマウス（ｎ＝８匹／遺伝子型）から全肝臓を採取し、処理を行うまで−８０℃で凍結保存した。各サンプルについて、約４０ｍｇの凍結肝臓片を全肝臓から切り出し、各片をダウンス型ホモジナイザーに置き、均質な懸濁液が得られるまでホモジナイズした。各肝臓サンプルの細胞質分画および膜分画を、メーカーの「軟組織」プロトコルに従って界面活性剤ベースの市販キット（Ｔｈｅｒｍｏ社カタログ番号８９８４２）を使用して分離した。各サンプルの細胞質分画および膜分画が単離されたら、ＢＣＡタンパク質定量アッセイ（Ｔｈｅｒｍｏ社  カタログ番号２３２２５）をマイクロプレート手順に対するキットのプロトコルに従って各サンプルの２分画に対して実施した。５Ｘの還元性色素を使用して、各サンプルの各細胞質分画と膜分画に対し、ウェスタンブロットサンプルを調製した。すべてのサンプルは、０．８μｇ／μＬで調製された。各サンプルの２０μｇの総タンパク質をウェスタンブロットゲルにロードした。ｈＡＳＧＲ１は、ウサギ抗ｈＡＳＧＲ１ポリクローナル抗体（Ａｂｇｅｎｔ社、カタログ番号ＡＰ１６１３３ａ、２．５％ブロッキングミルクのＴＢＳ−Ｔ溶液中、１：１，０００希釈）を使用して検出した。抗体がマウスタンパク質に対して交差反応を示したため、同腹仔マウスのマウスＡｓｇｒ１が、同抗体を用いて検出された。ｈＡＳＧＲ１検出用の二次抗体は、ロバ抗ウサギＩｇＧ−ＨＲＰ（Ｊａｃｋｓｏｎ社、カタログ番号７１１−０３５−１５２、２．５％ブロッキングミルクのＴＢＳ−Ｔ溶液中、０．１μｇ／ｍＬ）であった。細胞質分画に対するローディング対照として、ウサギ抗ＧＡＰＤＨモノクローナル抗体を使用してすべてのサンプルにおいてＧＡＰＤＨを検出した（Ｃｅｌｌ  Ｓｉｇｎａｌｉｎｇ社  カタログ番号２１１８Ｓ、２．５％ブロッキングミルクのＴＢＳ−Ｔ溶液中、１：１０，０００希釈）。ＧＡＰＤＨ検出用の二次抗体は、ロバ抗ウサギＩｇＧ−ＨＲＰ（Ｊａｃｋｓｏｎ社、カタログ番号７１１−０３５−１５２、２．５％ブロッキングミルクのＴＢＳ−Ｔ溶液中、０．１μｇ／ｍＬ）であった。膜分画のローディング対照として、ウサギ抗トランスフェリン受容体ポリクローナル抗体（Ｒ＆Ｄ社、カタログ番号ＡＦ２４７２、２．５％ブロッキングミルクのＴＢＳ−Ｔ溶液中、０．２５μｇ／ｍＬ）を使用して全てのサンプルにおいてトランスフェリン受容体を検出した。トランスフェリン受容体検出用の二次抗体は、ロバ抗ヤギＩｇＧ−ＨＲＰ（Ｊａｃｋｓｏｎ社、カタログ番号７０５−０３５−１４７、２．５％ブロッキングミルクのＴＢＳ−Ｔ溶液中、０．２μｇ／ｍＬ）であった。
実施例３  異種エピトープを含むアデノ随伴ウイルスベクターの生成
【０１６１】
次いで二重特異性抗ｍｙｃ−ＡＳＧＲ１抗体が、ｓｃＡＡＶ−Ｎ５８７ｍｙｃウイルス粒子を、実施例１で作製されたマウスにおいてインビボでヒト化ＡＳＧＲ１を発現する肝臓細胞に再標的化させ得るかどうかを決定するための実験を行った。これを検証するために、ウイルス粒子を最初に作製した。
【０１６２】
ＡＡＶカプシドタンパク質は、ＰＣＲを使用して、ＦＬＡＧ、ｃ−ｍｙｃ、ヘキサヒスチジンなどのいくつかの異種エピトープのうちの一つを含有するように改変され、組換えカプシドタンパク質をコードするプラスミドを生成する。簡潔に述べると、ＦＬＡＧ、ｃ−ｍｙｃまたはヘキサヒスチジンをコードする配列を、ＡＡＶ２  ＶＰ１カプシドタンパク質のＮ５８７をコードするコドンまたはＡＡＶ６  ＶＰ１カプシドタンパク質のＱ５８５をコードするコドンの後のフレーム中に挿入する。
【０１６３】
アデノ随伴ウイルス生成は、ＨＥＫ２９３細胞を用いたトリプルトランスフェクション方法（例えば、Ｅｒｉｋ  Ａｒｄｅｎ  ａｎｄ  Ｊｏｓｅｐｈ  Ｍ．Ｍｅｔｚｇｅｒ、Ｊ  Ｂｉｏｌ  Ｍｅｔｈｏｄｓ．２０１６；３（２））を参照のこと）を使用して実施する。細胞は、適切なベクター：
−  ヘルパープラスミド、ｐＨｅｌｐｅｒ（Ａｇｉｌｅｎｔ社、Ｃａｔ＃２４００７４）；
−  野生型または改変型のＡＡＶ  ｒｅｐ／ｃａｐ遺伝子をコードするプラスミド（ｐＡＡＶ  ＲＣ２（Ｃｅｌｌ  ｂｉｏｌａｂｓ社、カタログ番号  ＶＰＫ−４２２）、例えば、ｐＡＡＶ  ＲＣ２／６（Ｃｅｌｌ  Ｂｉｏｌａｂｓ社、カタログ番号ＶＰＫ−４２６）、ｐＡＡＶ  ＲＣ２−Ｎ５８７ｍｙｃ、ｐＡＡＶ  ＲＣ２／６−Ｑ５８５ｍｙｃ）；および
−  対象ヌクレオチド配列およびＡＡＶ  ＩＴＲ配列をコードするプラスミド、例えば、ｐｓｃＡＡＶ−ＣＭＶ−ｅＧＦＰ、ｐＡＡＶ−ＣＭＶＧＦＰ  （Ａｇｉｌｅｎｔ社、カタログ番号２４００７４）、ｐＡＡＶ−ＥＦ１ａ−ｅＧＦＰまたはｐＡＡＶ−ＣＡＧＧ−ｅＧＦＰ）などを用いたＰＥＦｐｒｏ（Ｐｏｌｙｐｌｕｓ  ｔｒａｎｓｆｅｃｔｉｏｎ社、ニューヨーク州ニューヨーク）介在トランスフェクションの１日前に播種される。
【０１６４】
トランスフェクションの７２時間後に、培地を収集し、細胞を緩衝液［５０ＭｍのＴｒｉｓ−Ｈｃｌ、１５０ＭｍのＮａＣｌ、および０．５％デオキシコール酸ナトリウム（Ｓｉｇｍａ社、Ｃａｔ＃Ｄ６７５０−１００Ｇ）］中で溶解する。次に、ベンゾナーゼ（Ｓｉｇｍａ社、ミズーリ州セントルイス）を、０．５Ｕ／μＬの最終濃度まで培地と細胞溶解物の両方に加えて、その後に３７℃、６０分のインキュベーションを行う。細胞溶解物を３０分間、４０００ｒｐｍでスピンダウンさせる。細胞溶解物および培地を一緒に混合し、最終濃度８％でＰＥＧ８０００（Ｔｅｋｎｏｖａ社、カタログ番号Ｐ４３４０）を用いて沈殿させる。沈殿物を４００ｎＭ  ＮａＣｌに再懸濁させ、１０分間、１００００ｇで遠心分離する。上清中のウイルスは、１４９，０００ｇで３時間の超遠心分離により沈殿させ、ｑＰＣＲにより力価測定した。
【０１６５】
ＡＡＶゲノムを力価測定するためのｑＰＣＲに関しては、ＡＡＶサンプルを３７℃で１時間、ＤＮａｓｅＩ（Ｔｈｅｒｍｏｆｉｓｈｅｒ  Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ社、カタログ番号ＥＮ０５２５）で処理し、ＤＮＡ  ｅｘｔｒａｃｔ  Ａｌｌ  Ｒｅａｇｅｎｔｓ（Ｔｈｅｒｍｏｆｉｓｈｅｒ  Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ社、カタログ番号４４０３３１９）を使用して溶解する。ＡＡＶ２  ＩＴＲに対するプライマーを使用して、ＱｕａｎｔＳｔｕｄｉｏ  ３  Ｒｅａｌ−Ｔｉｍｅ  ＰＣＲ  Ｓｙｓｔｅｍ（Ｔｈｅｒｍｏｆｉｓｈｅｒ  Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ社）を使用し、カプシド形成ウイルスゲノムを定量化する。ＡＡＶ２  ＩＴＲプライマーの配列は、５’−ＧＧＡＡＣＣＣＣＴＡＧＴＧＡＴＧＧＡＧＴＴ−３’（フォワードＩＴＲ、配列番号３６）および５’−ＣＧＧＣＣＴＣＡＧＴＧＡＧＣＧＡ−３’（リバースＩＴＲ、配列番号３７）（Ａｕｒｎｈａｍｍｅｒ  ｅｔ  ａｌ．，２０１２）であり、それぞれ、ＡＡＶの左側内部逆位反復（ＩＴＲ：ｉｎｔｅｒｎａｌ  ｉｎｖｅｒｔｅｄ  ｒｅｐｅａｔ）配列、およびＡＡＶの右側内部逆位反復（ＩＴＲ）配列に由来する。ＡＡＶ２  ＩＴＲのプローブの配列は、５’−６−ＦＡＭ−ＣＡＣＴＣＣＣＴＣＴＣＴＧＣＧＣＧＣＴＣＧ−ＴＡＭＲＡ−３’（配列番号３８）（Ａｕｒｎｈａｍｍｅｒ  ｅｔ  ａｌ．（２０１２）Ｈｕｍ．  Ｇｅｎｅ  Ｔｈｅｒ．  Ｍｅｔｈｏｄｓ  ２３：１８−２８）である。９５℃で１０分間の活性化工程の後、９５℃で１５秒間および６０℃で３０秒間の２工程のＰＣＲサイクルを４０サイクル実施する。ＴａｑＭａｎ  Ｕｎｉｖｅｒｓａｌ  ＰＣＲ  Ｍａｓｔｅｒ  Ｍｉｘ（Ｔｈｅｒｍｏｆｉｓｈｅｒ  Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ社、カタログ番号４３０４４３７）をｑＰＣＲで使用した。ＤＮＡプラスミド（Ａｇｉｌｅｎｔ社、カタログ番号２４００７４）は、絶対力価を決定するための標準物として使用する。
【０１６６】
ｃ−ｍｙｃエピトープが挿入されたカプシドを含むアデノ随伴ウイルスベクターが作製された。本実施例において、ｃ−ｍｙｃエピトープ（ＥＱＫＬＩＳＥＥＤＬ、配列番号２５）を、ＡＡＶ２  ＶＰ１カプシドタンパク質のアミノ酸Ｎ５８７とＲ５８８の間に挿入した。すなわちｃ−ｍｙｃエピトープをコードするヌクレオチド配列（ＧＡＡ  ＣＡＡ  ＡＡＡ  ＣＴＣ  ＡＴＣ  ＴＣＡ  ＧＡＡ  ＧＡＧ  ＧＡＴ  ＣＴＧ、配列番号２６）を、プラスミドｐＡＡＶ  ＲＣ２（Ｃｅｌｌ  Ｂｉｏｌａｂｓ，Ｉｎｃ．、カルフォルニア州サンディエゴ）内に挿入し、改変されたｐＡＡＶ  ＲＣ２−Ｎ５８７Ｍｙｃプラスミドを使用して、中立状態の指向性を有するＡＡＶウイルスベクター用の改変カプシドタンパク質をコードさせた。
【０１６７】
具体的には、ＢｓｉＷ１制限酵素部位、ｐＡＡＶ  ＲＣ２の３０５０位〜３７７３位の間のヌクレオチド配列、そしてｃ−ｍｙｃエピトープオーバーハングヌクレオチド配列を（５’から３’の方向に）含む第一のポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）産物と、ｃ−ｍｙｃエピトープオーバーハングヌクレオチド配列、ｐＡＡＶ  ＲＣ２の３７７４位〜４３７０位の間のヌクレオチド配列、そしてＰｍｅ１制限酵素部位を（５’から３’の方向に）含む第二のＰＣＲ産物を、表４に記載されるプライマーを使用して作製した。Ｌｉ  ｅｔ  ａｌ．（２０１２）Ｍｅｔｈｏｄｓ  Ｍｏｌ．  Ｂｉｏｌ．８５２：５１−５９に記載されるように、ＢｓｉＷ１（Ｎｅｗ  Ｅｎｇｌａｎｄ  Ｂｉｏｌａｂｓ社、Ｒ０５５３Ｌ）およびＰｍｅ１（Ｎｅｗ  Ｅｎｇｌａｎｄ  Ｂｉｏｌａｂｓ社、Ｒ０５６０Ｌ）を用いてｐＡＡＶ  ＲＣ２を消化し、ライゲーション非依存性クローニングを介して２つのＰＣＲ産物を挿入することによって、ｐＡＡＶ  ＲＣ２−Ｎ５８７Ｍｙｃプラスミド（すなわち、ＶＰ１カプシドタンパク質のアミノ酸Ｎ５８７とＲ５８８の間にｃ−ｍｙｃエピトープをコードするように改変されたｐＡＡＶ  ＲＣ２プラスミド）を作製した。
【０１６８】
表４．
【表４】
2020529837.tif 000007
【０１６９】
具体的には、３７５７〜３７５８位の間に挿入されたｃ−ｍｙｃエピトープ配列を有するｐＡＡＶ  ＲＣ２／６の３７００位および３９４０位を含むｇｂｌｏｃｋ  ＤＮＡ断片を、Ｉｎｔｅｇｒａｔｅｄ  ＤＮＡ  Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ社（アイオワ州コーラルビル）に注文した。Ｌｉ  ｅｔ  ａｌ．（２０１２）Ｍｅｔｈｏｄｓ  Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．８５２：５１−５９に記載されるように、ライゲーション非依存性クローニングを介して、ＭｓｃＩ（Ｎｅｗ  Ｅｎｇｌａｎｄ  Ｂｉｏｌａｂｓ社、カタログ番号Ｒ０５３４Ｌ）およびＡｆｌＩＩ  （Ｎｅｗ  Ｅｎｇｌａｎｄ  Ｂｉｏｌａｂｓ社、カタログ番号Ｒ０５２０Ｌ）を用いて消化されたｐＡＡＶ  ＲＣ２／６内に当該ｇｂｌｏｃｋ断片の挿入を行うことにより、ｐＡＡＶ  ＲＣ２／６−Ｑ５８５Ｍｙｃプラスミドを作製した。
【０１７０】
具体的には、ＢａｍＨＩおよびＮｏｔＩ制限酵素部位を使用して、ＧＦＰ断片をｐｓｃＡＡＶ  ＭＣＳベクター（Ｃｅｌｌ  Ｂｉｏｌａｂｓ社、カタログ番号ＶＰＫ−４３０）に導入することによってｐｓｃＡＡＶ−ＣＭＶ−ｅＧＦＰを作製した。Ｔｈｅｒｍｏｆｉｓｈｅｒ  Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ社（マサチューセッツ州ウォルサム）のデノボ合成によって、ｐＡＡＶ−ＥＦ１ａ−ｅＧＦＰプラスミドおよびｐＡＡＶ−ＣＡＧＧ−ｅＧＦＰを作製した。
【０１７１】
実施例４．ヒト化ＡＳＧＲ１座位を有するマウスにおける、インビボでのｓｃＡＡＶ−Ｎ５８７Ｍｙｃ粒子の二重特異性抗体介在性内部移行
二重特異性抗ｍｙｃ−ＡＳＧＲ１抗体が、ｓｃＡＡＶ２−Ｎ５８７ｍｙｃ−ＣＭＶ−ｅＧＦＰウイルスベクターをインビボでｈＡＳＧＲ１を発現する肝臓細胞に再標的化させることができるかどうかを決定するために、Ｃ５７ＢＬ／６の背景でその肝臓細胞がｈＡＳＧＲ１を発現するように遺伝子改変されたマウス、および対照の野生型Ｃ５７ＢＬ／６マウスに、１ｘ１０１１（ｑＰＣＲによる力価測定）の野生型ｓｃＡＡＶ２−ＣＭＶ−ｅＧＦＰ単独、またはウイルスゲノムと抗体分子の比率が１：８で、二重特異性抗ｍｙｃ−ＡＳＧＲ１抗体と組み合わされたｓｃＡＡＶ２−Ｎ５８７ｍｙｃ−ＣＭＶ−ｅＧＦＰウイルスベクターを  血管内に注射した。対照には、生理食塩水［２５０ｍＭのＮａＣｌ］、またはｓｃＡＡＶ２−Ｎ５８７ｍｙｃ−ＣＭＶ−ｅＧＦＰウイルスベクター単独を注射したマウスが含まれた。注射の１０日後、マウスを屠殺し、４％のＰＦＡで経心腔的灌流を行った。肝臓、腎臓、および心臓の器官を収集し、１５％のスクロース、続いて３０％のスクロース中で脱水した。次いで、器官をスライド上で凍結切片にして、ニワトリ抗ＥＧＦＰ抗体（Ｊａｃｋｓｏｎ  ＩｍｍｕｎｏＲｅｓｅａｒｃｈ  Ｌａｂｓ，Ｉｎｃ．、ペンシルバニア州ウェストグローブ）およびＡｌｅｘａ−４８８結合抗ニワトリ二次抗体（Ｊａｃｋｓｏｎ  ＩｍｍｕｎｏＲｅｓｅａｒｃｈ  Ｌａｂｓ，Ｉｎｃ．、ペンシルバニア州ウェストグローブ）を用いて染色した（図８Ａ〜図８Ｃ）。肝臓中でＡＳＧＲ１を発現するように改変され、野生型ｓｃＡＡＶ２−ＣＭＶ−ｅＧＦＰ、または二重特異性抗ｍｙｃ−ＡＳＧＲ１抗体と組み合わされたｓｃＡＡＶ２−Ｎ５８７ｍｙｃ−ＣＭＶ−ｅＧＦＰを注射されたトランスジェニック動物からの肝臓（図８Ａ（ｉ）および８Ａ（ｉｖ））、ならびに野生型ｓｃＡＡＶ２−ＣＭＶ−ｅＧＦＰを注射された野生型Ｃ５７ＢＬ／６マウスからの肝臓（図８Ａ（ｖ））において、ＧＦＰ陽性細胞を検出した。すべての脾臓または腎臓サンプル（図８Ｂおよび８Ｃ）、さらには生理食塩水またはｓｃＡＡＶ２−Ｎ５８７ｍｙｃ−ＣＭＶ−ｅＧＦＰウイルスベクター単独を注射されたすべての動物からの肝臓、脾臓、もしくは腎臓サンプル（図８Ａ（ｉｉ、ｉｉｉ、ｖｉ、ｖｉｉ））、さらには二重特異性抗ｍｙｃ−ＡＳＧＲ１抗体と組み合わされたｓｃＡＡＶ２−Ｎ５８７ｍｙｃ−ＣＭＶ−ｅＧＦＰを注射された野生型Ｃ５７ＢＬ／６動物から採取された肝臓サンプル（図８Ａ（ｖｉｉｉ））では、ＧＦＰは検出されなかった。要約すると、ｓｃＡＡＶ２−Ｎ５８７ｍｙｃ−ＣＭＶ−ｅＧＦＰウイルスベクターと二重特異性抗ｍｙｃ−ＡＳＧＲ１抗体との組み合わせは、ｈＡＳＧＲ１を発現する（肝）細胞のみに感染した。このことから、ｓｃＡＡＶ２−ＣＭＶ−ｅＧＦＰウイルスベクターが、カプシドタンパク質の改変によって不活性化されたこと、例えばｓｃＡＡＶウイルスベクターの本来の指向性が、例えばｃ−ｍｙｃエピトープによって中立状態となり得たこと、そしてそのようなウイルスベクターは、例えば二重特異性抗ｍｙｃ−ＡＳＧＲ１抗体によって、インビボで肝臓細胞に対して特異的に再標的化されるなど、特異的に再活性化され得たことを強く示唆するものである。
【０１７２】
同様に、二重特異性抗ｍｙｃ−ＡＳＧＲ１抗体が、ｓｓＡＡＶ２−Ｎ５８７ｍｙｃ−ＣＡＧＧ−ｅＧＦＰウイルスベクターをインビボでｈＡＳＧＲ１を発現する肝臓細胞へと再標的化させ得るかどうかを決定するため、Ｃ５７ＢＬ／６バックグラウンドでその肝臓細胞がｈＡＳＧＲ１を発現するよう遺伝子改変されたマウスと、対照の野生型Ｃ５７ＢＬ／６マウスに、２．１８ｘ１０１１（ｑＰＣＲにより力価測定）の野生型ｓｓＡＡＶ２−ＣＡＧＧ−ｅＧＦＰウイルスベクターを単独で、またはウイルスゲノムと抗体分子の比率が１：４のｓｓＡＡＶ２−Ｎ５８７ｍｙｃ−ＣＡＧＧ−ｅＧＦＰウイルスベクターと二重特異性抗ｍｙｃ−ＡＳＧＲ１抗体の組み合わせを用いて、血管内注射した。対照には、ＰＢＳ、またはｓｓＡＡＶ２−Ｎ５８７ｍｙｃ−ＣＡＧＧ−ｅＧＦＰウイルスベクター単独が注射されたマウスが含まれた。注射の４週間後、マウスを屠殺し、４％のＰＦＡで経心腔的灌流を行った。肝臓、腎臓、および心臓の器官を収集し、１５％のスクロース、続いて３０％のスクロース中で脱水した。次いで器官をスライド上で凍結切片にして、ニワトリ抗ＥＧＦＰ抗体（Ｊａｃｋｓｏｎ  ＩｍｍｕｎｏＲｅｓｅａｒｃｈ  Ｌａｂｓ，Ｉｎｃ．、ペンシルバニア州ウェストグローブ）およびＡｌｅｘａ−４８８結合抗ニワトリ二次抗体（Ｊａｃｋｓｏｎ  ＩｍｍｕｎｏＲｅｓｅａｒｃｈ  Ｌａｂｓ，Ｉｎｃ、ペンシルバニア州ウェストグローブ）を用いて染色した（図９Ａ〜９Ｏ）。肝臓中でＡＳＧＲ１を発現するように改変され、野生型ｓｓＡＡＶ２−ＣＡＧＧ−ｅＧＦＰ、または二重特異性抗ｍｙｃ−ＡＳＧＲ１抗体と組み合わされたｓｓＡＡＶ２−Ｎ５８７ｍｙｃ−ＣＡＧＧ−ｅＧＦＰを注射されたトランスジェニック動物からの肝臓（図９Ｅ〜９Ｆ、９Ｐ〜９Ｒ）、および野生型ｓｓＡＡＶ２−ＣＡＧＧ−ｅＧＦＰを注射された野生型Ｃ５７ＢＬ／６マウスからの肝臓（図９Ｂ〜９Ｃ）において、ＧＦＰ陽性細胞を検出した。驚くべきことに、二重特異性抗ｍｙｃ−ＡＳＧＲ１抗体と組み合わせたｓｓＡＡＶ２−Ｎ５８７ｍｙｃ−ＣＡＧＧ−ｅＧＦＰの感染効率は、ＷＴ  ｓｓＡＡＶ２−ＣＡＧＧ−ＧＦＰ（図９Ｅ〜９Ｆ、９Ｐ〜９Ｒ）．よりも非常に高い。生理食塩水、またはｓｓＡＡＶ２−Ｎ５８７ｍｙｃ−ＣＡＧＧ−ｅＧＦＰウイルスベクター単独を注射したすべての動物からの肝臓サンプル（図９Ａ、９Ｄ、９Ｇ〜９Ｌ）、さらには二重特異性抗ｍｙｃ−ＡＳＧＲ１抗体と組み合わされたｓｓＡＡＶ２−Ｎ５８７ｍｙｃ−ＣＡＧＧ−ｅＧＦＰを注射された野生型Ｃ５７ＢＬ／６動物から採取された肝臓サンプル（図９Ｍ〜９Ｏ）において、ＧＦＰは検出されなかったか、またはかろうじて検出された。要約すると、ｓｓＡＡＶ２−Ｎ５８７ｍｙｃ−ＣＡＧＧ−ｅＧＦＰウイルスベクターと二重特異性抗ｍｙｃ−ＡＳＧＲ１抗体との組み合わせは、ｈＡＳＧＲ１を発現する（肝）細胞のみに感染した。このことから、ｓｓＡＡＶ２−Ｎ５８７ｍｙｃ−ＣＡＧＧ−ｅＧＦＰウイルスベクターが、カプシドタンパク質の改変によって不活性化されたこと、例えばｓｃＡＡＶウイルスベクターの本来の指向性が、例えばｃ−ｍｙｃエピトープによって中立状態となり得たこと、そしてそのようなウイルスベクターは、��えば二重特異性抗ｍｙｃ−ＡＳＧＲ１抗体によって、インビボで肝臓細胞に対して特異的に再標的化されるなど、特異的に再活性化され得たことを強く示唆するものである。
【０１７３】
本実施例は、ヒト化ＡＳＧＲ１マウスを使用して、ヒトＡＳＧＲ１に特異的に結合する治療剤候補を、肝臓細胞への標的送達に関して検証し得ることを示すものである。
【図１】
2020529837.tif 000008
【図２】
2020529837.tif 000009
【図３】
2020529837.tif 000010
【図４】
2020529837.tif 000011
【図５】
2020529837.tif 000012
【図６】
2020529837.tif 000013
【図７】
2020529837.tif 000014
【図８Ａ】
2020529837.tif 000015
【図８Ｂ】
2020529837.tif 000016
【図８Ｃ】
2020529837.tif 000017
【図９−１】
2020529837.tif 000018
【図９−２】
2020529837.tif 000019
【図９−３】
2020529837.tif 000020
【配列表】
2020529837000001.app
【国際調査報告】
2020529837.tif 000021
2020529837.tif 000022
2020529837.tif 000023
2020529837.tif 000024
2020529837.tif 000025