(57)【要約】  本開示は、ヒト第ＸＩ因子および活性型第ＸＩ因子（「第ＸＩａ因子」）に結合するモノクローナル抗体およびその抗原結合性断片、ならびにこれらを含む医薬組成物および処置方法に関する。【特許請求の範囲】
【請求項１】
ＦＸＩおよび／またはＦＸＩａの触媒ドメイン内に結合する単離抗ＦＸＩ抗体またはその抗原結合性断片であって、相補性決定領域ＨＣＤＲ１、ＨＣＤＲ２、およびＨＣＤＲ３を含む重鎖可変領域（ＶＨ）と、相補性決定領域ＬＣＤＲ１、ＬＣＤＲ２、およびＬＣＤＲ３を含む軽鎖可変領域（ＶＬ）とを含み、
前記ＨＣＤＲ１が、配列番号３、６、７、および９からなる群から選択されるアミノ酸配列を含み、
前記ＨＣＤＲ２が、
（ｉ）Ｘ１−Ｉ−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｔ−Ｘ８−ＹＡＤＳＶＫＧ（配列番号５９）［配列中、Ｘ１は、任意のアミノ酸であるか、またはＴもしくはＳであり、Ｘ２は、任意のアミノ酸であるか、またはＤもしくはＥであり、Ｘ３は、任意のアミノ酸であるか、またはＹもしくはＳであり、Ｘ４は、任意のアミノ酸であるか、またはＳ、Ｙ、もしくはＷであり、Ｘ５は、任意のアミノ酸であるか、またはＳ、Ｄ、もしくはＧであり、Ｘ６は、任意のアミノ酸であるか、またはＱ、Ｔ、もしくはＤであり、Ｘ７は、任意のアミノ酸であるか、またはＤもしくはＥであり、Ｘ８は、任意のアミノ酸であるか、またはＹ、Ｈ、もしくはＤであり、ＨＣＤＲ２は、配列番号４ではない］、
（ｉｉ）Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６（配列番号６０）［配列中、Ｘ１は、任意のアミノ酸であるか、またはＥもしくはＤであり、Ｘ２は、任意のアミノ酸であるか、またはＹもしくはＳであり、Ｘ３は、任意のアミノ酸であるか、またはＹ、Ｓ、もしくはＷであり、Ｘ４は、任意のアミノ酸であるか、またはＳ、Ｄ、もしくはＧであり、Ｘ５は、任意のアミノ酸であるか、またはＤ、Ｔ、もしくはＱであり、Ｘ６は、任意のアミノ酸であるか、またはＤもしくはＥであり、ＨＣＤＲ２は、配列番号８ではない］、および
（ｉｉｉ）Ｉ−Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｔ（配列番号６１）［配列中、Ｘ１は、任意のアミノ酸であるか、またはＥもしくはＤであり、Ｘ２は、任意のアミノ酸であるか、またはＹもしくはＳであり、Ｘ３は、任意のアミノ酸であるか、またはＳ、Ｙ、もしくはＷであり、Ｘ４は、任意のアミノ酸であるか、またはＳ、Ｄ、もしくはＧであり、Ｘ５は、任意のアミノ酸であるか、またはＤ、Ｔ、もしくはＱであり、Ｘ６は、任意のアミノ酸であるか、またはＤもしくはＥであり、ＨＣＤＲ２は、配列番号１０ではない］
からなる群から選択されるアミノ酸配列を含み、
前記ＨＣＤＲ３が、配列番号５および１１からなる群から選択されるアミノ酸配列を含み、
前記ＬＣＤＲ１が、配列番号１６、１９、および２２からなる群から選択されるアミノ酸配列を含み、
前記ＬＣＤＲ２が、配列番号１７および２０からなる群から選択されるアミノ酸配列を含み、
前記ＬＣＤＲ３が、配列番号１８および２１からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む、
単離抗ＦＸＩ抗体またはその抗原結合性断片。
【請求項２】
（ｉ）前記ＨＣＤＲ１が、配列番号３のアミノ酸配列を含み、
（ｉｉ）前記ＨＣＤＲ２が、アミノ酸配列Ｘ１−Ｉ−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｔ−Ｘ８−ＹＡＤＳＶＫＧ（配列番号５９）［配列中、Ｘ１は、任意のアミノ酸であるか、またはＴもしくはＳであり、Ｘ２は、任意のアミノ酸であるか、またはＤもしくはＥであり、Ｘ３は、任意のアミノ酸であるか、またはＹもしくはＳであり、Ｘ４は、任意のアミノ酸であるか、またはＳ、Ｙ、もしくはＷであり、Ｘ５は、任意のアミノ酸であるか、またはＳ、Ｄ、もしくはＧであり、Ｘ６は、任意のアミノ酸であるか、またはＱ、Ｔ、もしくはＤであり、Ｘ７は、任意のアミノ酸であるか、またはＤもしくはＥであり、Ｘ８は、任意のアミノ酸であるか、またはＹ、Ｈ、もしくはＤである］を含み、ＨＣＤＲ２が、配列番号４ではなく、
（ｉｉｉ）前記ＨＣＤＲ３が、配列番号５のアミノ酸配列を含み、
（ｉｖ）前記ＬＣＤＲ１が、配列番号１６のアミノ酸配列を含み、
（ｖ）前記ＬＣＤＲ２が、配列番号１７のアミノ酸配列を含み、
（ｖｉ）前記ＬＣＤＲ３が、配列番号１８のアミノ酸配列を含む、
請求項１に記載の抗体または抗原結合性断片。
【請求項３】
（ｉ）前記ＨＣＤＲ１が、配列番号６のアミノ酸配列を含み、
（ｉｉ）前記ＨＣＤＲ２が、アミノ酸配列Ｘ１−Ｉ−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｔ−Ｘ８−ＹＡＤＳＶＫＧ（配列番号５９）［配列中、Ｘ１は、任意のアミノ酸であるか、またはＴもしくはＳであり、Ｘ２は、任意のアミノ酸であるか、またはＤもしくはＥであり、Ｘ３は、任意のアミノ酸であるか、またはＹもしくはＳであり、Ｘ４は、任意のアミノ酸であるか、またはＳ、Ｙ、もしくはＷであり、Ｘ５は、任意のアミノ酸であるか、またはＳ、Ｄ、もしくはＧであり、Ｘ６は、任意のアミノ酸であるか、またはＱ、Ｔ、もしくはＤであり、Ｘ７は、任意のアミノ酸であるか、またはＤもしくはＥであり、Ｘ８は、任意のアミノ酸であるか、またはＹ、Ｈ、もしくはＤである］を含み、ＨＣＤＲ２が、配列番号４ではなく、
（ｉｉｉ）前記ＨＣＤＲ３が、配列番号５のアミノ酸配列を含み、
（ｉｖ）前記ＬＣＤＲ１が、配列番号１６のアミノ酸配列を含み、
（ｖ）前記ＬＣＤＲ２が、配列番号１７のアミノ酸配列を含み、
（ｖｉ）前記ＬＣＤＲ３が、配列番号１８のアミノ酸配列を含む、
請求項１に記載の抗体または抗原結合性断片。
【請求項４】
（ｉ）前記ＨＣＤＲ１が、配列番号７のアミノ酸配列を含み、
（ｉｉ）前記ＨＣＤＲ２が、アミノ酸配列Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６（配列番号６０）［配列中、Ｘ１は、任意のアミノ酸であるか、またはＥもしくはＤであり、Ｘ２は、任意のアミノ酸であるか、またはＹもしくはＳであり、Ｘ３は、任意のアミノ酸であるか、またはＹ、Ｓ、もしくはＷであり、Ｘ４は、任意のアミノ酸であるか、またはＳ、Ｄ、もしくはＧであり、Ｘ５は、任意のアミノ酸であるか、またはＤ、Ｔ、もしくはＱであり、Ｘ６は、任意のアミノ酸であるか、またはＤもしくはＥである］を含み、ＨＣＤＲ２が、配列番号８ではなく、
（ｉｉｉ）前記ＨＣＤＲ３が、配列番号５のアミノ酸配列を含み、
（ｉｖ）前記ＬＣＤＲ１が、配列番号１９のアミノ酸配列を含み、
（ｖ）前記ＬＣＤＲ２が、配列番号２０のアミノ酸配列を含み、
（ｖｉ）前記ＬＣＤＲ３が、配列番号２１のアミノ酸配列を含む、
請求項１に記載の抗体または抗原結合性断片。
【請求項５】
（ｉ）前記ＨＣＤＲ１が、配列番号９のアミノ酸配列を含み、
（ｉｉ）前記ＨＣＤＲ２が、アミノ酸配列Ｉ−Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｔ（配列番号６１）［配列中、Ｘ１は、任意のアミノ酸であるか、またはＥもしくはＤであり、Ｘ２は、任意のアミノ酸であるか、またはＹもしくはＳであり、Ｘ３は、任意のアミノ酸であるか、またはＳ、Ｙ、もしくはＷであり、Ｘ４は、任意のアミノ酸であるか、またはＳ、Ｄ、もしくはＧであり、Ｘ５は、任意のアミノ酸であるか、またはＤ、Ｔ、もしくはＱであり、Ｘ６は、任意のアミノ酸であるか、またはＤもしくはＥである］を含み、ＨＣＤＲ２が、配列番号１０ではなく、
（ｉｉｉ）前記ＨＣＤＲ３が、配列番号１１のアミノ酸配列を含み、
（ｉｖ）前記ＬＣＤＲ１が、配列番号２２のアミノ酸配列を含み、
（ｖ）前記ＬＣＤＲ２が、配列番号２０のアミノ酸配列を含み、
（ｖｉ）前記ＬＣＤＲ３が、配列番号１８のアミノ酸配列を含む、
請求項１に記載の抗体または抗原結合性断片。
【請求項６】
ＦＸＩおよび／またはＦＸＩａの触媒ドメイン内に結合する単離抗ＦＸＩ抗体またはその抗原結合性断片であって、（ｉ）相補性決定領域ＨＣＤＲ１、ＨＣＤＲ２、およびＨＣＤＲ３を含む重鎖可変領域（ＶＨ）と、（ｉｉ）相補性決定領域ＬＣＤＲ１、ＬＣＤＲ２、およびＬＣＤＲ３を含む軽鎖可変領域（ＶＬ）とを含み、
前記ＨＣＤＲ１が、配列番号３、６、７、および９からなる群から選択されるアミノ酸配列を含み、
前記ＨＣＤＲ２が、配列番号２７、２８、２９、３８、３９、４０、４５、４６、および４７からなる群から選択されるアミノ酸配列を含み、
前記ＨＣＤＲ３が、配列番号５および１１からなる群から選択されるアミノ酸配列を含み、
前記ＬＣＤＲ１が、配列番号１６、１９、および２２からなる群から選択されるアミノ酸配列を含み、
前記ＬＣＤＲ２が、配列番号１７および２０からなる群から選択されるアミノ酸配列を含み、
前記ＬＣＤＲ３が、配列番号１８および２１からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む、
単離抗ＦＸＩ抗体またはその抗原結合性断片。
【請求項７】
（ｉ）前記ＨＣＤＲ１が、配列番号３のアミノ酸配列を含み、前記ＨＣＤＲ２が、配列番号４５のアミノ酸配列を含み、前記ＨＣＤＲ３が、配列番号５のアミノ酸配列を含み、前記ＬＣＤＲ１が、配列番号１６のアミノ酸配列を含み、前記ＬＣＤＲ２が、配列番号１７のアミノ酸配列を含み、前記ＬＣＤＲ３が、配列番号１８のアミノ酸配列を含むか、
（ｉｉ）前記ＨＣＤＲ１が、配列番号６のアミノ酸配列を含み、前記ＨＣＤＲ２が、配列番号４５のアミノ酸配列を含み、前記ＨＣＤＲ３が、配列番号５のアミノ酸配列を含み、前記ＬＣＤＲ１が、配列番号１６のアミノ酸配列を含み、前記ＬＣＤＲ２が、配列番号１７のアミノ酸配列を含み、前記ＬＣＤＲ３が、配列番号１８のアミノ酸配列を含むか、
（ｉｉｉ）前記ＨＣＤＲ１が、配列番号７のアミノ酸配列を含み、前記ＨＣＤＲ２が、配列番号４６のアミノ酸配列を含み、前記ＨＣＤＲ３が、配列番号５のアミノ酸配列を含み、前記ＬＣＤＲ１が、配列番号１９のアミノ酸配列を含み、前記ＬＣＤＲ２が、配列番号２０のアミノ酸配列を含み、前記ＬＣＤＲ３が、配列番号２１のアミノ酸配列を含むか、または
（ｉｖ）前記ＨＣＤＲ１が、配列番号９のアミノ酸配列を含み、前記ＨＣＤＲ２が、配列番号４７のアミノ酸配列を含み、前記ＨＣＤＲ３が、配列番号１１のアミノ酸配列を含み、前記ＬＣＤＲ１が、配列番号２２のアミノ酸配列を含み、前記ＬＣＤＲ２が、配列番号２０のアミノ酸配列を含み、前記ＬＣＤＲ３が、配列番号１８のアミノ酸配列を含む、
請求項６に記載の抗体または抗原結合性断片。
【請求項８】
（ｉ）前記ＨＣＤＲ１が、配列番号３のアミノ酸配列を含み、前記ＨＣＤＲ２が、配列番号３８のアミノ酸配列を含み、前記ＨＣＤＲ３が、配列番号５のアミノ酸配列を含み、前記ＬＣＤＲ１が、配列番号１６のアミノ酸配列を含み、前記ＬＣＤＲ２が、配列番号１７のアミノ酸配列を含み、前記ＬＣＤＲ３が、配列番号１８のアミノ酸配列を含むか、
（ｉｉ）前記ＨＣＤＲ１が、配列番号６のアミノ酸配列を含み、前記ＨＣＤＲ２が、配列番号３８のアミノ酸配列を含み、前記ＨＣＤＲ３が、配列番号５のアミノ酸配列を含み、前記ＬＣＤＲ１が、配列番号１６のアミノ酸配列を含み、前記ＬＣＤＲ２が、配列番号１７のアミノ酸配列を含み、前記ＬＣＤＲ３が、配列番号１８のアミノ酸配列を含むか、
（ｉｉｉ）前記ＨＣＤＲ１が、配列番号７のアミノ酸配列を含み、前記ＨＣＤＲ２が、配列番号３９のアミノ酸配列を含み、前記ＨＣＤＲ３が、配列番号５のアミノ酸配列を含み、前記ＬＣＤＲ１が、配列番号１９のアミノ酸配列を含み、前記ＬＣＤＲ２が、配列番号２０のアミノ酸配列を含み、前記ＬＣＤＲ３が、配列番号２１のアミノ酸配列を含むか、または
（ｉｖ）前記ＨＣＤＲ１が、配列番号９のアミノ酸配列を含み、前記ＨＣＤＲ２が、配列番号４０のアミノ酸配列を含み、前記ＨＣＤＲ３が、配列番号１１のアミノ酸配列を含み、前記ＬＣＤＲ１が、配列番号２２のアミノ酸配列を含み、前記ＬＣＤＲ２が、配列番号２０のアミノ酸配列を含み、前記ＬＣＤＲ３が、配列番号１８のアミノ酸配列を含む、
請求項６に記載の抗体または抗原結合性断片。
【請求項９】
（ｉ）前記ＨＣＤＲ１が、配列番号３のアミノ酸配列を含み、前記ＨＣＤＲ２が、配列番号２７のアミノ酸配列を含み、前記ＨＣＤＲ３が、配列番号５のアミノ酸配列を含み、前記ＬＣＤＲ１が、配列番号１６のアミノ酸配列を含み、前記ＬＣＤＲ２が、配列番号１７のアミノ酸配列を含み、前記ＬＣＤＲ３が、配列番号１８のアミノ酸配列を含むか、
（ｉｉ）前記ＨＣＤＲ１が、配列番号６のアミノ酸配列を含み、前記ＨＣＤＲ２が、配列番号２７のアミノ酸配列を含み、前記ＨＣＤＲ３が、配列番号５のアミノ酸配列を含み、前記ＬＣＤＲ１が、配列番号１６のアミノ酸配列を含み、前記ＬＣＤＲ２が、配列番号１７のアミノ酸配列を含み、前記ＬＣＤＲ３が、配列番号１８のアミノ酸配列を含むか、
（ｉｉｉ）前記ＨＣＤＲ１が、配列番号７のアミノ酸配列を含み、前記ＨＣＤＲ２が、配列番号２８のアミノ酸配列を含み、前記ＨＣＤＲ３が、配列番号５のアミノ酸配列を含み、前記ＬＣＤＲ１が、配列番号１９のアミノ酸配列を含み、前記ＬＣＤＲ２が、配列番号２０のアミノ酸配列を含み、前記ＬＣＤＲ３が、配列番号２１のアミノ酸配列を含むか、または
（ｉｖ）前記ＨＣＤＲ１が、配列番号９のアミノ酸配列を含み、前記ＨＣＤＲ２が、配列番号２９のアミノ酸配列を含み、前記ＨＣＤＲ３が、配列番号１１のアミノ酸配列を含み、前記ＬＣＤＲ１が、配列番号２２のアミノ酸配列を含み、前記ＬＣＤＲ２が、配列番号２０のアミノ酸配列を含み、前記ＬＣＤＲ３が、配列番号１８のアミノ酸配列を含む、
請求項６に記載の抗体または抗原結合性断片。
【請求項１０】
前記ＨＣＤＲ１が、配列番号３のアミノ酸配列を含み、前記ＨＣＤＲ２が、配列番号２７、３８、または４５のアミノ酸配列を含み、前記ＨＣＤＲ３が、配列番号５のアミノ酸配列を含み、前記ＬＣＤＲ１が、配列番号１６のアミノ酸配列を含み、前記ＬＣＤＲ２が、配列番号１７のアミノ酸配列を含み、前記ＬＣＤＲ３が、配列番号１８のアミノ酸配列を含む、請求項６に記載の抗体または抗原結合性断片。
【請求項１１】
前記ＨＣＤＲ１が、配列番号６のアミノ酸配列を含み、前記ＨＣＤＲ２が、配列番号２７、３８、または４５のアミノ酸配列を含み、前記ＨＣＤＲ３が、配列番号５のアミノ酸配列を含み、前記ＬＣＤＲ１が、配列番号１６のアミノ酸配列を含み、前記ＬＣＤＲ２が、配列番号１７のアミノ酸配列を含み、前記ＬＣＤＲ３が、配列番号１８のアミノ酸配列を含む、請求項６に記載の抗体または抗原結合性断片。
【請求項１２】
前記ＨＣＤＲ１が、配列番号７のアミノ酸配列を含み、前記ＨＣＤＲ２が、配列番号２８、３９、または４６のアミノ酸配列を含み、前記ＨＣＤＲ３が、配列番号５のアミノ酸配列を含み、前記ＬＣＤＲ１が、配列番号１９のアミノ酸配列を含み、前記ＬＣＤＲ２が、配列番号２０のアミノ酸配列を含み、前記ＬＣＤＲ３が、配列番号２１のアミノ酸配列を含む、請求項６に記載の抗体または抗原結合性断片。
【請求項１３】
前記ＨＣＤＲ１が、配列番号９のアミノ酸配列を含み、前記ＨＣＤＲ２が、配列番号２９、４０、または４７のアミノ酸配列を含み、前記ＨＣＤＲ３が、配列番号１１のアミノ酸配列を含み、前記ＬＣＤＲ１が、配列番号２２のアミノ酸配列を含み、前記ＬＣＤＲ２が、配列番号２０のアミノ酸配列を含み、前記ＬＣＤＲ３が、配列番号１８のアミノ酸配列を含む、請求項６に記載の抗体または抗原結合性断片。
【請求項１４】
ＦＸＩおよび／またはＦＸＩａの触媒ドメイン内に結合する単離抗ＦＸＩ抗体またはその抗原結合性断片であって、重鎖可変領域（ＶＨ）と、軽鎖可変領域（ＶＬ）とを含み、前記ＶＨが、表２から選択される相補性決定領域ＨＣＤＲ１、ＨＣＤＲ２、およびＨＣＤＲ３を含み、前記ＶＬが、表２から選択される相補性決定領域ＬＣＤＲ１、ＬＣＤＲ２、およびＬＣＤＲ３を含む、単離抗ＦＸＩ抗体またはその抗原結合性断片。
【請求項１５】
前記ＶＨが、組み合わされたＨＣＤＲ１、ＨＣＤＲ２、およびＨＣＤＲ３を含み、前記ＶＬが、組み合わされたＬＣＤＲ１、ＬＣＤＲ２、およびＬＣＤＲ３を含む、請求項１４に記載の抗体または抗原結合性断片。
【請求項１６】
前記ＶＨが、ＫａｂａｔによるＨＣＤＲ１、ＨＣＤＲ２、およびＨＣＤＲ３を含み、前記ＶＬが、ＫａｂａｔによるＬＣＤＲ１、ＬＣＤＲ２、およびＬＣＤＲ３を含む、請求項１４に記載の抗体または抗原結合性断片。
【請求項１７】
前記ＶＨが、ＣｈｏｔｈｉａによるＨＣＤＲ１、ＨＣＤＲ２、およびＨＣＤＲ３を含み、前記ＶＬが、ＣｈｏｔｈｉａによるＬＣＤＲ１、ＬＣＤＲ２、およびＬＣＤＲ３を含む、請求項１４に記載の抗体または抗原結合性断片。
【請求項１８】
前記ＶＨが、ＩＭＧＴによるＨＣＤＲ１、ＨＣＤＲ２、およびＨＣＤＲ３を含み、前記ＶＬが、ＩＭＧＴによるＬＣＤＲ１、ＬＣＤＲ２、およびＬＣＤＲ３を含む、請求項１４に記載の抗体または抗原結合性断片。
【請求項１９】
ＦＸＩおよび／またはＦＸＩａの触媒ドメイン内に結合する単離抗ＦＸＩ抗体またはその抗原結合性断片であって、重鎖可変領域（ＶＨ）と、軽鎖可変領域（ＶＬ）とを含み、前記ＶＨが、抗体ＡＭ１の相補性決定領域ＨＣＤＲ１、ＨＣＤＲ２、およびＨＣＤＲ３を含み、前記ＶＬが、抗体ＡＭ１の相補性決定領域ＬＣＤＲ１、ＬＣＤＲ２、およびＬＣＤＲ３を含む、単離抗ＦＸＩ抗体またはその抗原結合性断片。
【請求項２０】
ＦＸＩおよび／またはＦＸＩａの触媒ドメイン内に結合する単離抗ＦＸＩ抗体またはその抗原結合性断片であって、重鎖可変領域（ＶＨ）と、軽鎖可変領域（ＶＬ）とを含み、前記ＶＨが、抗体ＡＭ２の相補性決定領域ＨＣＤＲ１、ＨＣＤＲ２、およびＨＣＤＲ３を含み、前記ＶＬが、抗体ＡＭ２の相補性決定領域ＬＣＤＲ１、ＬＣＤＲ２、およびＬＣＤＲ３を含む、単離抗ＦＸＩ抗体またはその抗原結合性断片。
【請求項２１】
ＦＸＩおよび／またはＦＸＩａの触媒ドメイン内に結合する単離抗ＦＸＩ抗体またはその抗原結合性断片であって、重鎖可変領域（ＶＨ）と、軽鎖可変領域（ＶＬ）とを含み、前記ＶＨが、抗体ＡＭ３またはＡＭ４の相補性決定領域ＨＣＤＲ１、ＨＣＤＲ２、およびＨＣＤＲ３を含み、前記ＶＬが、抗体ＡＭ３またはＡＭ４の相補性決定領域ＬＣＤＲ１、ＬＣＤＲ２、およびＬＣＤＲ３を含む、単離抗ＦＸＩ抗体またはその抗原結合性断片。
【請求項２２】
前記ＶＨが、配列番号３０、４１、および４８のアミノ酸配列を含み、前記ＶＬが、配列番号３４または５５のアミノ酸配列を含む、請求項６に記載の抗体または抗原結合性断片。
【請求項２３】
前記ＶＨが、配列番号４８のアミノ酸配列を含み、前記ＶＬが、配列番号５５のアミノ酸配列を含む、請求項２２に記載の抗体または抗原結合性断片。
【請求項２４】
前記ＶＨが、配列番号４８のアミノ酸配列を含み、前記ＶＬが、配列番号３４のアミノ酸配列を含む、請求項２２に記載の抗体または抗原結合性断片。
【請求項２５】
前記ＶＨが、配列番号４１のアミノ酸配列を含み、前記ＶＬが、配列番号３４のアミノ酸配列を含む、請求項２２に記載の抗体または抗原結合性断片。
【請求項２６】
前記ＶＨが、配列番号３０のアミノ酸配列を含み、前記ＶＬが、配列番号３４のアミノ酸配列を含む、請求項２２に記載の抗体または抗原結合性断片。
【請求項２７】
前記重鎖が、配列番号３２、４３、５０、または５３のアミノ酸配列を含み、前記軽鎖が、配列番号５７または３６のアミノ酸配列を含む、請求項６に記載の抗体または抗原結合性断片。
【請求項２８】
前記重鎖が、配列番号５３のアミノ酸配列を含み、前記軽鎖が、配列番号５７のアミノ酸配列を含む、請求項２２に記載の抗体または抗原結合性断片。
【請求項２９】
前記重鎖が、配列番号５０のアミノ酸配列を含み、前記軽鎖が、配列番号３６のアミノ酸配列を含む、請求項２２に記載の抗体または抗原結合性断片。
【請求項３０】
前記重鎖が、配列番号４３のアミノ酸配列を含み、前記軽鎖が、配列番号３６のアミノ酸配列を含む、請求項２２に記載の抗体または抗原結合性断片。
【請求項３１】
前記重鎖が、配列番号３２のアミノ酸配列を含み、前記軽鎖が、配列番号３６のアミノ酸配列を含む、請求項２２に記載の抗体または抗原結合性断片。
【請求項３２】
前記ＶＨが、配列番号３０、４１、および４８のアミノ酸配列と、少なくとも９０％同一なアミノ酸配列を含み、前記ＶＬが、配列番号３４または５５のアミノ酸配列と、少なくとも９０％同一なアミノ酸配列を含み、かつ、前記ＶＨが、配列番号１２のアミノ酸配列を含まず、前記ＶＬが、配列番号２３のアミノ酸配列を含まない、請求項６に記載の抗体または抗原結合性断片。
【請求項３３】
前記ＶＨが、配列番号３０、４１、および４８のアミノ酸配列と、少なくとも９５％同一なアミノ酸配列を含み、前記ＶＬが、配列番号３４または５５のアミノ酸配列と、少なくとも９５％同一なアミノ酸配列を含み、かつ、前記ＶＨが、配列番号１２のアミノ酸配列を含まず、前記ＶＬが、配列番号２３のアミノ酸配列を含まない、請求項６に記載の抗体または抗原結合性断片。
【請求項３４】
ヒトモノクローナル抗体である、請求項１〜３３のいずれか一項に記載の抗体または抗原結合性断片。
【請求項３５】
ヒト化モノクローナル抗体である、請求項１〜３３のいずれか一項に記載の抗体または抗原結合性断片。
【請求項３６】
ヒトＩｇＧ１アイソタイプ抗体である、請求項１〜３５のいずれか一項に記載の抗体または抗原結合性断片。
【請求項３７】
ヒトＩｇＧ２アイソタイプ抗体またはヒトＩｇＧ４アイソタイプ抗体である、請求項１〜３５のいずれか一項に記載の抗体または抗原結合性断片。
【請求項３８】
単鎖抗体、Ｆａｂ断片、Ｆｖ断片、Ｆ（ａｂ’）２断片、またはｓｃＦｖ断片である、請求項１〜３３のいずれか一項に記載の抗体または抗原結合性断片。
【請求項３９】
請求項１〜３８のいずれか一項に記載の抗体またはその抗原結合性断片と、薬学的に許容される担体とを含む医薬組成物。
【請求項４０】
血栓塞栓性障害を処置する、または血栓塞栓性障害のリスクを管理または低減する方法であって、それを必要とする対象に、請求項１〜３８のいずれか一項に記載の抗体または抗原結合性断片を含む、有効量の医薬組成物を投与することを含む方法。
【請求項４１】
前記対象が、心房細動および深部静脈血栓症と関連する脳卒中の１つまたは複数に罹患しているか、またはこれを発症するリスクを有する、請求項４０に記載の方法。
【請求項４２】
前記対象が、心房細動と関連する脳卒中に罹患しているか、またはこれを発症するリスクを有する、請求項４０に記載の方法。
【請求項４３】
前記対象が、心房細動に罹患している、請求項４０に記載の方法。
【請求項４４】
脳卒中を予防、処置する、または脳卒中のリスクを管理、または低減する方法であって、それを必要とする対象に、請求項１〜３８のいずれか一項に記載の抗体または抗原結合性断片を含む、有効量の医薬組成物を投与することを含む方法。
【請求項４５】
前記対象が、心房細動に罹患している、請求項４４に記載の方法。
【請求項４６】
血栓塞栓性障害を処置する、または血栓塞栓性障害のリスクを管理または低減する方法であって、それを必要とする対象に、１つまたは複数のスタチン療法と組み合わせて、請求項１〜３８のいずれか一項に記載の抗体または断片を含む、有効量の医薬組成物を投与することを含む方法。
【請求項４７】
請求項１〜３８のいずれか一項に記載の抗ＦＸＩ抗体または抗原結合性断片で処置されるか、またはこれを投与された対象における、出血または出血リスクを管理または低減する方法であって、それを必要とする前記対象に、前記抗ＦＸＩ抗体に特異的に結合し、前記抗ＦＸＩ抗体の、ＦＸＩへの結合を遮断する抗イディオタイプ抗体またはその断片を投与するステップを含み、前記抗イディオタイプ抗体またはその断片が、前記抗ＦＸＩ抗体の抗凝固活性を逆転させる、方法。
【請求項４８】
前記抗イディオタイプ抗体またはその断片が、前記抗ＦＸＩ抗体の抗凝固効果を一時的に逆転させるために、前記対象に１回または２回投与される、請求項４７に記載の方法。
【請求項４９】
請求項１〜３８のいずれか一項に記載の抗ＦＸＩ抗体または抗原結合性断片で処置されるか、またはこれを投与された対象における、出血または出血リスクを管理または低減する方法であって、（ｉ）コロイド、クリスタロイド、ヒト血漿、もしくはアルブミンなどの血漿タンパク質を用いた補液、（ｉｉ）濃厚赤血球もしくは全血による輸血、または（ｉｉｉ）新鮮凍結血漿（ＦＦＰ）、プロトロンビン複合体濃縮物（ＰＣＣ）、第ＶＩＩＩ因子インヒビターなどの活性型ＰＣＣ（ＡＰＣＣ）、および／もしくは組換え活性型第ＶＩＩ因子の投与のうちの１つにより、前記出血を管理するのに十分な時間にわたって抗凝固効果を一時的に逆転させることを含む方法。
【請求項５０】
前記対象に、前記抗ＦＸＩ抗体に特異的に結合し、前記抗ＦＸＩ抗体の、ＦＸＩへの結合を遮断する抗イディオタイプ抗体またはその断片の、１回または２回の投与を行うことを含み、前記抗イディオタイプ抗体またはその断片が、前記抗ＦＸＩ抗体の抗凝固活性を逆転させる、請求項４０〜４６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項５１】
以下：（ｉ）コロイド、クリスタロイド、ヒト血漿、もしくはアルブミンなどの血漿タンパク質を用いた補液、（ｉｉ）濃厚赤血球もしくは全血による輸血、または（ｉｉｉ）新鮮凍結血漿（ＦＦＰ）、プロトロンビン複合体濃縮物（ＰＣＣ）、第ＶＩＩＩ因子インヒビターなどの活性型ＰＣＣ（ＡＰＣＣ）、および／もしくは組換え活性型第ＶＩＩ因子の投与のうちの１つにより、出血を管理するのに十分な時間にわたって抗凝固効果を一時的に逆転させることを含む、請求項４０〜４６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項５２】
請求項１〜３８のいずれか一項に記載の抗ＦＸＩ抗体または抗原結合性断片の抗凝固効果を、前記抗ＦＸＩ／ＦＸＩａ抗体またはそれらの抗原結合性断片により処置されている患者において逆転させるための方法であって、有効量の、前記抗ＦＸＩ抗体に特異的に結合する抗イディオタイプ抗体またはその断片を投与することを含む方法。
【請求項５３】
請求項１〜３８のいずれか一項に記載の抗ＦＸＩ抗体に特異的に結合し、前記抗ＦＸＩ抗体の、ＦＸＩへの結合を遮断する抗イディオタイプ抗体またはその断片であって、前記抗ＦＸＩ抗体の抗凝固活性を、少なくとも３０％、または少なくとも４０％逆転させる抗イディオタイプ抗体またはその断片。
【請求項５４】
請求項１〜３８のいずれか一項に記載の抗体またはその抗原結合性断片を含む医薬。
【請求項５５】
請求項１〜３８のいずれか一項に記載の抗体または抗原結合性断片のＶＬ、ＶＨ、またはＶＬおよびＶＨをコードする核酸配列を含むポリヌクレオチド。
【請求項５６】
請求項１〜３８のいずれか一項に記載の抗体または抗原結合性断片の重鎖、軽鎖、または重鎖および軽鎖をコードする、請求項５５に記載のポリヌクレオチド。
【請求項５７】
表２に記載の核酸配列を含む、請求項５５に記載のポリヌクレオチド。
【請求項５８】
請求項５５〜５７のいずれか一項に記載のポリヌクレオチドを含むベクター。
【請求項５９】
請求項５８に記載のベクターを含む宿主細胞。
【請求項６０】
真核細胞である、請求項５９に記載の宿主細胞。
【請求項６１】
哺乳動物細胞である、請求項５９に記載の宿主細胞。
【請求項６２】
抗ＦＸＩ／ＦＸＩａ抗体またはその断片を作製する方法であって、請求項５９〜６１のいずれか一項に記載の宿主細胞を、前記抗ＦＸＩ／ＦＸＩａ抗体またはそれらの断片の発現に適した条件下で培養するステップを含む方法。
【請求項６３】
前記抗ＦＸＩ／ＦＸＩａ抗体またはその断片を精製することをさらに含む、請求項６２に記載の方法。
【請求項６４】
心房細動を伴う患者における、脳卒中および／または全身性塞栓症のリスクを低減する方法であって、前記患者に、治療有効量の、請求項１〜３８のいずれか一項に記載の抗体または抗原結合性断片を投与することを含む方法。
【請求項６５】
前記患者が、非弁膜症性心房細動を有する、請求項６４に記載の方法。
【請求項６６】
前記患者が、証明された、高い出血リスクを有する、請求項６４または６５に記載の方法。
【請求項６７】
慢性腎疾患を伴う患者における、脳卒中および／または全身性塞栓症のリスクを低減する方法であって、前記患者に、治療有効量の、請求項１〜３８のいずれか一項に記載の抗体または抗原結合性断片を投与することを含む方法。
【請求項６８】
前記患者が、末期腎不全（ＥＳＲＤ）を有する、請求項６７に記載の方法。
【請求項６９】
前記患者が、ＥＳＲＤを有し、透析を受けている、請求項６７に記載の方法。
【請求項７０】
前記患者が、非弁膜症性心房細動を有する、請求項６９に記載の方法。
【請求項７１】
前記患者が、証明された、高い出血リスクを有する、請求項７０に記載の方法。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
本出願は、それが参照によりその全体において本明細書に組み込まれる、２０１６年１２月２３日に出願された、米国仮出願第６２／４３８，６４８号明細書の利益を主張する。
【０００２】
配列表
本出願は、ＡＳＣＩＩフォーマットで電子的に提出され、参照によりその全体において本明細書に組み込まれる配列表を含有する。２０１７年１２月１８日に作成された前記ＡＳＣＩＩコピーは、PAT057548-WO-PCT_SL.txtと名付けられ、８２，５０６バイトのサイズである。
【背景技術】
【０００３】
血栓症とは、血栓性素因または凝固亢進状態として公知の遺伝性危険因子と、後天性危険因子との組合せに後続する、血管内部の血栓形成を指す。血管壁の損傷、うっ血、血小板の反応性の増大、および凝血因子の活性化は、血栓症の根源的な特色の一部である。血栓症は、静脈循環および動脈循環のいずれにおいても生じる可能性があり、深部静脈血栓症（ＤＶＴ）、肺塞栓症、および脳卒中の発症を結果としてもたらしうる。動脈系内で血栓が生じると、下流で虚血症が生じることから、急性冠動脈症候群（ＡＣＳ）、虚血性脳卒中、および急性下肢虚血症がもたらされうる。静脈系内の血栓形成は、深部静脈血栓症、肺塞栓症、および慢性血栓塞栓性肺高血圧症をもたらすことが典型的である。凝血はまた、心房細動（ＡＦ）を伴う患者の左心耳内でも形成される可能性があり、脱離した血栓は、重篤となる可能性のある合併症、すなわち、血栓塞栓性脳卒中および全身性塞栓症を結果としてもたらしうる。低分子量ヘパリン（ＬＭＷＨ）、トロンビンインヒビター、および第Ｘａ因子（ＦＸａ）インヒビターを含む、現在利用可能な抗血栓薬は全て、著明な出血リスクと関連する（Weitz J.I. (2010) Thromb. Haemost. 103, 62）。止血に影響を及ぼさず、したがって、出血合併症を結果としてもたらさない抗血栓剤の開発が、強く所望される。
【０００４】
現行の抗凝固剤は、注射されるか、または経口服用される。注射用の抗凝固性ＬＭＷＨは、広く使用されており、かつて適用された未分画ヘパリンを上回る治療プロファイルの改善をもたらしている。過去数十年間にわたり、最も一般に使用された経口抗凝固剤は、ワルファリンであった。ワルファリンは、治療ウィンドウが狭く、このため、凝固状態についての頻繁なモニタリングを要求し、様々な薬物間相互作用を示す。より近年では、経口で利用可能な直接的ＦＸａおよびトロンビンインヒビターが、抗凝固剤市場に参入し、適用を増大させている。
【０００５】
ＬＭＷＨ、ＦＸａインヒビター、およびトロンビンインヒビターは全て、手術後の静脈血栓塞栓性疾患の予防、自発的なＤＶＴおよび肺塞栓症の処置、ならびに心房細動における脳卒中の予防に効果的である。しかし、これらの抗凝固剤はまた、旧来の薬物であるワルファリンおよび未分画ヘパリンについて観察される出血合併症と一般に同等な出血合併症とも関連する。ＡＤＶＡＮＣＥ−２臨床試験では、ＦＸａインヒビターアピキサバン（Ｅｌｉｑｕｉｓ）が、人工膝関節置換術後の患者において、ＬＭＷＨであるエノキサパリンと比較された。急性アピキサバン療法は、静脈血栓塞栓性疾患を予防するのに、エノキサパリンより効果的であったが、いずれの薬剤も、著明な出血リスクと関連した。臨床的に関与性の出血は、アピキサバンを施される患者の４％、およびエノキサパリンで処置された患者の５％において生じた（Lassen, M.R., et al (2009) N. Engl. J. Med. 361, 594）。
【０００６】
ＲＥ−ＬＹ試験では、直接的トロンビンインヒビターであるダビガトラン（Ｐｒａｄａｘａ）が、心房細動および脳卒中のリスクを伴う患者において、ワルファリンと比較された（Connolly, S.J., et al. (2009) N. Engl. J. Med. 361, 1139）。慢性ダビガトラン療法は、脳卒中または全身性塞栓症のリスクの著明な低下と関連した。しかし、大量出血の合併症が、毎日１５０ｍｇのダビガトランを施される患者の３．１％、およびワルファリンを施される患者の３．４％において生じた（ｐ＝０．３１）。
【０００７】
心房細動（ＡＦ）は依然として、臨床実践において、最も一般的な心不整脈であり、心調律異常のための入院の約３分の１を占める。現在、ＡＦは、欧州において、６００万を超える患者に、および米国において、約２３０万に影響を及ぼすと推定されており、老化人口の比率の増大のため、この数は、急速に増大し続けている。６５歳を超える人口の約５％、および８０歳を超える人々の１０％が、ＡＦを発症すると推定されているが、ＡＦの有病数は、年齢だけで説明される有病数を超えて増大しつつある。高血圧症、うっ血性心不全、左室肥大、冠動脈疾患、および糖尿病、ならびに閉塞性睡眠時無呼吸症などのＡＦ危険因子もまた、増加しつつある。ＡＦに罹患する個体の数はそれ自体、欧米人において、今後３０年間で、２〜３倍に増大することが期待される（Kannel and Benjamin (2008) Med Clin North Am. 2008; 92:17-40; Bunch, et al. (2012) J Innovations of Card Rhythm Manag 2012; 3: 855-63）。
【０００８】
ＡＦの主要なリスクは、塞栓性脳卒中の４〜５倍の増大である。ＡＦとの関連に帰着しうる脳卒中のリスクは、年齢と共に急激に増大し、８０〜８９歳では、２３．５％に増大する。ＡＦは、いずれの性別においても、死亡率の倍増と関連する（Kannel and Benjamin 2008）。ＡＦはまた、認知機能の低下および認知症の全ての形態とも非依存的に関連する（Marzona, et al. (2012) CMAJ 2012; 184: 329-36; Geita et al 2013; Bunch et al 2012）。
【０００９】
ＡＦを伴う大半の患者は、心塞栓性脳卒中および全身性塞栓症を予防するのに、生涯にわたる抗凝固療法を要求する。ＣＨＡ２ＤＳ２−ＶＡＳｃリスクスコアは、妥当性が確認され、心房細動患者における血栓塞栓性のリスクを予測し、抗凝固療法から利益を得る患者を同定するのに広く使用されている層別化ツールであり（LIP 2011、Camm, et al. (2012) Eur Heart J 2012; 33: 2719-2747）、証拠の蓄積は、ＣＨＡ２ＤＳ２−ＶＡＳｃが、脳卒中および血栓塞栓症を発症する患者を同定するのに、ＣＨＡＤＳ２などのスコアと少なくとも同程度に正確であるか、または、おそらく、これらより優れており、ＡＦを伴う患者であって、「真にリスクの小さな」患者を同定するのには、決定的に優れていることを示す。ＡＦ患者の８５〜９０％は、抗凝固療法を要求することが推定される。
【００１０】
脳卒中および全身性塞栓症の低減における、ビタミンＫアンタゴニスト（ＶＫＡ）の効果について査定する、６つの試験を含むメタアナリシスでは、脳卒中発症率のリスクの、高度に有意な低減が観察された（脳卒中のリスクの相対的低減は６７％であった）。全死因死亡率は、用量を調整したＶＫＡにより、対照と対比して有意に低減された（２６％）（Hart, Pearce, and Aguilar (2007) Ann Intern Med 2007; 146:857-867）。２〜３の間のＩＮＲ（international normalized ratio）目標値が、最良の利益−危険比と関連し（Hylek et al (2003) N Engl J Med; 349:1019-1026）、国際ガイドラインおよび国内ガイドラインで広く採択されている。
【００１１】
近年では、直接的経口抗凝固剤（ＤＯＡＣ）とも称する、新たな経口抗凝固剤（ＮＯＡＣ）が、承認され、臨床実践に導入されている。これらの薬物は、血栓塞栓性疾患の低減において、ワルファリンと、少なくとも同程度に効果的であるか、またはなお優れている（Connolly, et al. (2009) N Engl J Med; 361:1139-51; Connolly, et al. (2011) N Engl J Med; 364:806-17; Patel, et al. (2011) N Engl J Med 2011; 365:883-91）。ＮＯＡＣはまた、ワルファリンの最も重篤な合併症、すなわち、出血性脳卒中および頭蓋内出血の大幅な低減とも関連した。大量出血事象は、良好に施されたワルファリン療法と同等であるか、またはわずかに少なかった。加えて、ＮＯＡＣは、ワルファリンより小さな薬物間相互作用の可能性と関連し、ルーチンのモニタリングを伴わずに使用することができ、これは、日常的な医療実践におけるそれらの使用を容易とすることが期待される。
【００１２】
近年の改善にもかかわらず、抗凝固剤の使用に伴う出血リスクは、依然として高いままである。例えば、大量出血および臨床的に関与性の非大量出血の年間発症率は、１４．９％であり、ＲＯＣＫＥＴ研究で、リバーロキサバンにより処置された患者における、大量出血事象の年間発症率は、３．６％であった（Patel et al 2011）。出血リスクが高く、ＨＡＳ  Ｂｌｅｄリスクスコアが≧３であると規定された患者における、大量出血の年間発症率は＞５％であった（Gallego, et al. (2012) Carc Arrhythm Electrophysiol.; 5:312-318）。大量出血は、特に関与性の大きな臨床転帰であり、例えば、ＲＯＣＫＥＴ研究では、大量出血が生じた場合、全死因死亡率は、リバーロキサバン群において２０．４％およびワルファリン群において２６．１％であった。大量出血事象が生じた場合、リバーロキサバン群およびワルファリン群、それぞれの患者の４．７％および５．４％で、脳卒中および全身性塞栓症が生じた（Piccini, et al. (2014) Eur Heart J; 35:1873-80）。入院、血液製剤の輸液、および血液供給源の活用もまた、大量出血の発生から重大な影響を受けた。出血リスクはまた、適格性患者において抗凝固剤を施さない、主要な理由でもある。３５カ国の１８２の病院ならびに５３３３人の外来ＡＦ患者および入院ＡＦ患者からのデータを含む、Ｅｕｒｏ  Ｈｅａｒｔ  Ｓｕｒｖｅｙ  ｏｎ  Ａｒｔｉａｌ  Ｆｉｂｒｉｌｌａｔｉｏｎでは、適格性患者の６７％が、退院時に経口抗凝固剤を施されるに過ぎなかった（Nieuwlaat, et al (2005) Eur Heart J;26, 2422-2434）。
【発明の概要】
【発明が解決しようとする課題】
【００１３】
したがって、既存の治療と同等な有効性を伴うが、易出血性を低下させた、脳卒中、全身性塞栓症、認知機能の低下、および死亡率など、ＡＦの血栓塞栓性合併症を低減しうる、より安全な治療に対する満たされていない大きな医療上の必要が存在する。
【課題を解決するための手段】
【００１４】
本開示は、ヒトの第ＸＩ凝固因子およびＸＩａ（活性型第ＸＩ因子）（以下、場合によって、「ＦＸＩ」、「ＦＸＩａ」、および類似の用語で称する）に結合するモノクローナル抗体、およびこれを含む医薬組成物、およびこれを投与するステップを含む処置方法に関する。血栓症または血栓塞栓性疾患／障害（例えば、血栓性脳卒中、心房細動、心房細動における脳卒中の予防（ＳＰＡＦ）、深部静脈血栓症、静脈血栓塞栓症、肺塞栓症、急性冠動脈症候群（ＡＣＳ）、虚血性脳卒中、急性下肢虚血症、慢性血栓塞栓性肺高血圧症、全身性塞栓症）の予防および処置において効果的であるが、出血リスクを保有しないか、または最小限の出血リスクを保有するに過ぎない抗血栓剤を開発すれば、満たされていない大きな医療上の必要が満たされるであろう。本明細書ではまた、本明細書で記載される抗ＦＸＩ抗体で処置されるか、またはこれを投与される患者における、出血または出血リスクを管理する方法も提示される。
【００１５】
具体的な態様では、本明細書で提示される抗体（例えば、ヒトモノクローナル抗体、キメラモノクローナル抗体、ヒト化モノクローナル抗体）は、ヒトのＦＸＩａおよびＦＸＩの触媒ドメイン（ＣＤ）に、同様の高アフィニティーで結合し、ＦＸＩａ内で、不活性のプロテアーゼドメインコンフォメーションを誘導する。
【００１６】
本明細書で記載される、単離抗ＦＸＩ抗体および／または抗ＦＸＩａ抗体、例えば、本明細書で記載される２つの結合性部位を伴う全長ＩｇＧは、ＦＸＩおよび／またはＦＸＩａに、１００ｐＭ以下の平衡解離定数（ＫＤ）で結合する。例えば、本明細書で記載される単離抗体は、ヒトのＦＸＩおよび／またはＦＸＩａに、１００ｐＭ以下、５０ｐＭ以下、４５ｐＭ以下、４０ｐＭ以下、３５ｐＭ以下、２０ｐＭ以下、または１０ｐＭ以下のＫＤで結合しうる。より具体的には、本明細書で記載される単離抗体はまた、ヒトのＦＸＩおよび／またはＦＸＩａに、ＡＭ４について溶液中平衡滴定アッセイ（ＳＥＴ）により測定される０．２ｐＭ以下のＫＤで結合することも可能である。
【００１７】
本明細書で記載される、単離抗ＦＸＩ抗体および／または単離ＦＸＩａ抗体ならびに抗原結合性断片を使用して、第ＩＸ因子（また、ＦＩＸとしても公知である）、第Ｘ因子（ＦＸ）、および／もしくはトロンビンの、直接的もしくは間接的な活性化、ならびに／または血小板受容体への結合を阻害することができ、これにより、内因系凝固経路および／または共通凝固経路の活性化を防止することができる。
【００１８】
本明細書で記載される、単離抗ＦＸＩ抗体および／または単離ＦＸＩａ抗体ならびに抗原結合性断片を使用して、第ＩＸ因子（また、ＦＩＸとしても公知である）、第Ｘ因子（ＦＸ）、および／またはトロンビンの、直接的または間接的な活性化を、１００ｎＭ以下、５０ｎＭ以下、３５ｎＭ以下、２５ｎＭ以下、１０ｎＭ以下、または５．２ｎＭ以下のＩＣ５０で阻害することができる。より具体的には、本明細書で記載される単離抗体またはその抗原結合性断片は、第ＩＸ因子（また、ＦＩＸとしても公知である）、第Ｘ因子（ＦＸ）、および／またはトロンビンの、直接的または間接的な活性化を、１００ｎＭ以下、５０ｎＭ以下、３５ｎＭ以下、２５ｎＭ以下、１０ｎＭ以下、または５．２ｎＭ以下のＩＣ５０で阻害しうる。より具体的には、本明細書で記載される単離抗体またはその抗原結合性断片は、第ＩＸ因子（また、ＦＩＸとしても公知である）、第Ｘ因子（ＦＸ）、および／またはトロンビンの、直接的または間接的な活性化を、１００ｎＭ以下、５０ｎＭ以下、３５ｎＭ以下、２５ｎＭ以下、２０ｎＭ以下、または１８ｎＭ以下のＩＣ５０で阻害しうる。より具体的には、本明細書で記載される単離抗体またはその抗原結合性断片は、第ＩＸ因子（また、ＦＩＸとしても公知である）、第Ｘ因子（ＦＸ）、および／またはトロンビンの、直接的または間接的な活性化を、１００ｎＭ以下、５０ｎＭ以下、３５ｎＭ以下、２５ｎＭ以下、１０ｎＭ以下、または５ｎＭ以下のＩＣ５０で阻害しうる。具体的な実施形態では、本明細書で記載される抗ＦＸＩ抗体またはその抗原結合性断片は、その天然の基質であるＦＩＸの、ＦＸＩａを媒介する活性化を、２ｎＭ以下の、例えば、１．８ｎＭのＩＣ５０で阻害する。
【００１９】
単離抗ＦＸＩ抗体および／もしくは単離抗ＦＸＩａ抗体、またはそれらの抗原結合性断片を使用して、例えば、ＦＸＩおよび／またはＦＸＩａを媒介するＦＩＸの活性化の阻害を介して、内因系凝固経路および／または共通凝固経路を阻害する（例えば、これらの活性化を遮断する）ことができる。したがって、単離抗ＦＸＩａ抗体、またはそれらの抗原結合性断片を使用して、凝血または凝血の拡大を防止することができる。単離抗体またはその抗原結合性断片は、ＦＸＩを媒介するＦＩＸの活性化を阻害することにより、深部静脈血栓症などの凝固障害および脳卒中（例えば、虚血性脳卒中）を予防、処置、または改善するのに使用することができる。
【００２０】
具体的な実施形態では、抗ＦＸＩ抗体および／もしくは抗ＦＸＩａ抗体、またはそれらの抗原結合性断片は、例えば、実施例節で記載されるａＰＴＴアッセイにより決定される通り、濃度依存的に、ヒト血漿の凝血時間（例えば、血餅が形成し始めるまでの時間）を延長することが可能である。具体的な実施形態では、凝血時間（ａＰＴＴ）は、ａＰＴＴアッセイにより決定される通り、全抗ＦＸＩ抗体（例えば、抗体ＡＭ１、ＡＭ２、ＡＭ３、またはＡＭ４）濃度を、１０ｎＭ〜２０ｎＭの範囲、例えば、約１１ｎＭ、１３ｎＭ、または１４ｎＭ（例えば、実施例５において記載される通り）としたとき、ベースラインと比較して倍増した。特定の実施形態では、抗ＦＸＩ抗体および／もしくは抗ＦＸＩａ抗体、またはそれらの抗原結合性断片は、例えば、実施例節で記載されるａＰＴＴアッセイにより決定される通り、５ｎＭ〜２０ｎＭの範囲、例えば、約１３ｎＭのＩＣ５０で、濃度依存的に、ヒト血漿の凝血時間を延長することが可能である。
【００２１】
具体的な態様では、本明細書で記載される抗ＦＸＩ抗体および／もしくは抗ＦＸＩａ抗体、またはそれらの抗原結合性断片は、非常に低濃度の組織因子（ＴＦ）の存在下において、ＦＸＩａ阻害の、トロンビン→ＦＸＩａのフィードフォワードループに対する効果を測定する、ヒト血漿中のトロンビン生成アッセイ（ＴＧＡ）において、トロンビンの量を濃度依存的に低減することが可能である。特定の実施形態では、本明細書で記載される抗ＦＸＩ抗体および／もしくは抗ＦＸＩａ抗体、またはそれらの抗原結合性断片は、例えば、実施例節で記載される通り、ヒト血漿中のトロンビン生成アッセイ（ＴＧＡ）において、トロンビンの量を、５ｎＭ〜１０ｎＭの範囲、例えば、約５ｎＭ、６ｎＭ、または９ｎＭのＩＣ５０値、および約８５ｎＭ〜１８５ｎＭの残留トロンビン濃度で低減することが可能である。
【００２２】
本明細書の具体的な態様では、ヒトＦＸＩおよび／またはＦＸＩａの触媒ドメインに特異的に結合する抗体（例えば、ＡＭ１、ＡＭ２、ＡＭ３、もしくはＡＭ４など、表２における抗体、または抗体ＡＭ１、ＡＭ２、ＡＭ３、またはＡＭ４の、ＨＣＤＲ  １〜３およびＬＣＤＲ  １〜３を含む抗体）またはそれらの抗原結合性断片が提示される。
【００２３】
本明細書で記載される単離抗ＦＸＩ抗体および／もしくは単離ＦＸＩａ抗体、またはその抗原結合性断片は、モノクローナル抗体、ヒトまたはヒト化抗体、キメラ抗体、単鎖抗体、Ｆａｂ断片、Ｆｖ断片、Ｆ（ａｂ’）２断片、またはｓｃＦｖ断片、および／またはＩｇＧのアイソタイプ（例えば、ヒトＩｇＧ１などのＩｇＧ１）でありうる。具体的な実施形態では、本明細書で記載される抗ＦＸＩ抗体および／または抗ＦＸＩａ抗体は、組換えヒト抗体である。具体的な実施形態では、本明細書で記載される抗ＦＸＩ抗体および／または抗ＦＸＩａ抗体は、ヒトＩｇＧ１／ラムダ（λ）抗体である。具体的な実施形態では、本明細書で記載される抗ＦＸＩ抗体および／または抗ＦＸＩａ抗体は、エフェクター機能（例えば、ＡＤＣＣおよび／またはＣＤＣ）の可能性を低減するように操作されたＦｃドメイン、例えば、Ｄ２６５Ａ置換および／またはＰ３２９Ａ置換を含むヒトＦｃドメインを含むヒトＩｇＧ１／ラムダ（λ）抗体である。
【００２４】
本明細書で記載される単離抗ＦＸＩ抗体および／もしくは単離ＦＸＩａ抗体またはそれらの抗原結合性断片はまた、アミノ酸が、ヒトＶＨ生殖細胞系列配列またはヒトＶＬ生殖細胞系列配列のそれぞれに由来する抗体フレームワークに置換されたフレームワークも含みうる。
【００２５】
本開示の別の態様は、表２に記載されているＦａｂの完全重鎖および軽鎖配列を有する単離抗体またはその抗原結合性断片を含む。特定の態様では、表２に記載されている単離抗体またはその抗原結合性断片は、表１に記載されている抗体、例えば、抗体ＮＯＶ１４０１の重鎖配列および軽鎖配列を含まない。より具体的には、単離抗体またはその抗原結合性断片は、抗体ＡＭ１、ＡＭ２、ＡＭ３、またはＡＭ４の重鎖配列および軽鎖配列を含みうる。
【００２６】
本明細書のさらなる態様では、表２に記載されている抗体／Ｆａｂの、重鎖可変ドメイン配列および軽鎖可変ドメイン配列を含む単離抗体またはその抗原結合性断片が提示される。特定の態様では、表２に記載されている単離抗体またはその抗原結合性断片は、表１に記載されている抗体、例えば、抗体ＮＯＶ１４０１の、重鎖可変ドメイン配列および軽鎖可変ドメイン配列を含まない。より具体的には、単離抗体またはその抗原結合性断片は、抗体ＡＭ１、ＡＭ２、ＡＭ３、またはＡＭ４の、重鎖可変ドメイン配列および軽鎖可変ドメイン配列を含みうる。
【００２７】
本明細書のさらなる態様は、Ｋａｂａｔ  ＣＤＲ、ＩＭＧＴ  ＣＤＲ、Ｃｈｏｔｈｉａ  ＣＤＲ、または組合せＣＤＲなど、表２に記載されている抗体の重鎖可変ドメインＣＤＲ（すなわち、ＨＣＤＲ１、ＨＣＤＲ２、およびＨＣＤＲ３）配列と、軽鎖可変ドメインＣＤＲ（すなわち、ＬＣＤＲ１、ＬＣＤＲ２、およびＬＣＤＲ３）配列とを含む単離抗体またはその抗原結合性断片を含む。より具体的には、単離抗体またはその抗原結合性断片は、Ｋａｂａｔ  ＣＤＲ、ＩＭＧＴ  ＣＤＲ、Ｃｈｏｔｈｉａ  ＣＤＲ、または組合せＣＤＲなど、例えば、表２に提示された抗体ＡＭ１、ＡＭ２、ＡＭ３、またはＡＭ４の、ＨＣＤＲ１、ＨＣＤＲ２、ＨＣＤＲ３、ＬＣＤＲ１、ＬＣＤＲ２、およびＬＣＤＲ３の配列を含みうる。
【００２８】
本開示はまた、抗体ＡＭ１、ＡＭ２、ＡＭ３、およびＡＭ４など、本明細書で記載される、例えば、表２に記載されている抗体およびそれらの断片のＶＬポリペプチドおよび／またはＶＨポリペプチドをコードする配列を含む単離核酸にも関する。本開示はまた、抗体ＡＭ１、ＡＭ２、ＡＭ３、およびＡＭ４など、本明細書で記載される、例えば、表２で記載されている抗体およびそれらの断片の軽鎖ポリペプチドおよび／または重鎖ポリペプチドをコードする配列を含む単離核酸にも関する。
【００２９】
本開示は、本明細書で記載される核酸分子の１つまたは複数を含むベクターに関する。本明細書の特定の態様では、抗体ＡＭ１、ＡＭ２、ＡＭ３、およびＡＭ４など、本明細書で記載される、例えば、表２に記載されている抗体およびそれらの断片のＶＬポリペプチドおよびＶＨポリペプチドをコードする核酸配列を含むベクターの集団が提示される。本明細書の特定の態様では、抗体ＡＭ１、ＡＭ２、ＡＭ３、およびＡＭ４など、本明細書で記載される、例えば、表２に記載されている抗体およびそれらの断片の軽鎖ポリペプチドおよび重鎖ポリペプチドをコードする核酸配列を含むベクターの集団が提示される。
【００３０】
本開示はまた、本明細書で記載した抗体の重鎖をコードする組換えＤＮＡ配列と、本明細書で記載した抗体の軽鎖をコードする第２の組換えＤＮＡ配列とを含む単離宿主細胞にも関し、この場合、前記ＤＮＡ配列は、プロモーターに作動可能に連結され、宿主細胞内で発現することが可能である。抗体は、ヒトモノクローナル抗体でありうることが企図される。また、宿主細胞は、非ヒト哺乳動物細胞であることも企図される。
【００３１】
本開示はまた、本明細書で記載される抗体のＶＨをコードする組換えＤＮＡ配列と、本明細書で記載される抗体のＶＬをコードする、第２の組換えＤＮＡ配列とを含む単離宿主細胞であって、前記ＤＮＡ配列を、プロモーターに作動可能に連結し、宿主細胞内で発現させることが可能な単離宿主細胞にも関する。抗体が、ヒトモノクローナル抗体でありうることが想定される。一実施形態ではまた、宿主細胞が、非ヒト哺乳動物細胞であることも想定される。
【００３２】
本開示はまた、ＦＸＩおよび／もしくはＦＸＩａの発現、ならびに／または内因系凝固経路および／もしくは共通凝固経路の活性化を低減する方法であって、細胞を、有効量の、本明細書で記載される単離抗体またはその抗原結合性断片を含む組成物と接触させるステップを含む方法にも関する。
【００３３】
本開示はまた、ＦＸＩおよび／もしくはＦＸＩａの、ＦＩＸへの結合を阻害する方法であって、細胞を、有効量の、本明細書で記載される単離抗体またはその抗原結合性断片を含む組成物と接触させるステップを含む、方法にも関する。
【００３４】
一態様では、細胞は、ヒト細胞であることが企図される。細胞は、対象中にあることがさらに企図される。一実施形態では、細胞は、血小板であることが企図される。特定の実施形態では、対象が、ヒトであることもさらに想定される。
【００３５】
本開示はまた、対象における、血栓塞栓性疾患または血栓塞栓性状態を処置、改善、または予防する方法であって、対象に、有効量の、本明細書で記載される抗体またはそれらの抗原結合性断片（例えば、抗体ＡＭ１、ＡＭ２、ＡＭ３、またはＡＭ４）を含む組成物を投与するステップを含む方法にも関する。一態様では、血栓塞栓性疾患は、血栓性障害（例えば、血栓症、血栓性脳卒中、心房細動、心房細動における脳卒中の予防（ＳＰＡＦ）、深部静脈血栓症、静脈血栓塞栓症、および肺塞栓症）である。具体的な実施形態では、対象が、ヒトであることが想定される。
【００３６】
特定の態様では、前出の単離抗体またはその抗原結合性断片のいずれも、モノクローナル抗体またはその抗原結合性断片でありうる。
【００３７】
本開示の非限定的実施形態は、以下の態様において記載される。
【００３８】
１．ＦＸＩおよび／またはＦＸＩａの触媒ドメイン内に結合する単離抗ＦＸＩ抗体またはその抗原結合性断片であって、相補性決定領域ＨＣＤＲ１、ＨＣＤＲ２、およびＨＣＤＲ３を含む重鎖可変領域（ＶＨ）と、相補性決定領域ＬＣＤＲ１、ＬＣＤＲ２、およびＬＣＤＲ３を含む軽鎖可変領域（ＶＬ）とを含み、
ＨＣＤＲ１が、配列番号３、６、７、および９からなる群から選択されるアミノ酸配列を含み、
ＨＣＤＲ２が、
（ｉ）Ｘ１−Ｉ−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｔ−Ｘ８−ＹＡＤＳＶＫＧ（配列番号５９）［配列中、Ｘ１は、任意のアミノ酸であるか、またはＴもしくはＳであり、Ｘ２は、任意のアミノ酸であるか、またはＤもしくはＥであり、Ｘ３は、任意のアミノ酸であるか、またはＹもしくはＳであり、Ｘ４は、任意のアミノ酸であるか、またはＳ、Ｙ、もしくはＷであり、Ｘ５は、任意のアミノ酸であるか、またはＳ、Ｄ、もしくはＧであり、Ｘ６は、任意のアミノ酸であるか、またはＱ、Ｔ、もしくはＤであり、Ｘ７は、任意のアミノ酸であるか、またはＤもしくはＥであり、Ｘ８は、任意のアミノ酸であるか、またはＹ、Ｈ、もしくはＤであり、ＨＣＤＲ２が、配列番号４ではない］、
（ｉｉ）Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６（配列番号６０）［配列中、Ｘ１は、任意のアミノ酸であるか、またはＥもしくはＤであり、Ｘ２は、任意のアミノ酸であるか、またはＹもしくはＳであり、Ｘ３は、任意のアミノ酸であるか、またはＹ、Ｓ、もしくはＷであり、Ｘ４は、任意のアミノ酸であるか、またはＳ、Ｄ、もしくはＧであり、Ｘ５は、任意のアミノ酸であるか、またはＤ、Ｔ、もしくはＱであり、Ｘ６は、任意のアミノ酸であるか、またはＤもしくはＥであり、ＨＣＤＲ２が、配列番号８ではない］、および
（ｉｉｉ）Ｉ−Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｔ（配列番号６１）［配列中、Ｘ１は、任意のアミノ酸であるか、またはＥもしくはＤであり、Ｘ２は、任意のアミノ酸であるか、またはＹもしくはＳであり、Ｘ３は、任意のアミノ酸であるか、またはＳ、Ｙ、もしくはＷであり、Ｘ４は、任意のアミノ酸であるか、またはＳ、Ｄ、もしくはＧであり、Ｘ５は、任意のアミノ酸であるか、またはＤ、Ｔ、もしくはＱであり、Ｘ６は、任意のアミノ酸であるか、またはＤもしくはＥであり、ＨＣＤＲ２が、配列番号１０ではない］
からなる群から選択されるアミノ酸配列を含み、
ＨＣＤＲ３が、配列番号５および１１からなる群から選択されるアミノ酸配列を含み、
ＬＣＤＲ１が、配列番号１６、１９、および２２からなる群から選択されるアミノ酸配列を含み、
ＬＣＤＲ２が、配列番号１７および２０からなる群から選択されるアミノ酸配列を含み、
ＬＣＤＲ３が、配列番号１８および２１からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む、
単離抗ＦＸＩ抗体またはその抗原結合性断片。
２．（ｉ）ＨＣＤＲ１が、配列番号３のアミノ酸配列を含み、
（ｉｉ）ＨＣＤＲ２が、アミノ酸配列Ｘ１−Ｉ−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｔ−Ｘ８−ＹＡＤＳＶＫＧ（配列番号５９）［配列中、Ｘ１は、任意のアミノ酸であるか、またはＴもしくはＳであり、Ｘ２は、任意のアミノ酸であるか、またはＤもしくはＥであり、Ｘ３は、任意のアミノ酸であるか、またはＹもしくはＳであり、Ｘ４は、任意のアミノ酸であるか、またはＳ、Ｙ、もしくはＷであり、Ｘ５は、任意のアミノ酸であるか、またはＳ、Ｄ、もしくはＧであり、Ｘ６は、任意のアミノ酸であるか、またはＱ、Ｔ、もしくはＤであり、Ｘ７は、任意のアミノ酸であるか、またはＤもしくはＥであり、Ｘ８は、任意のアミノ酸であるか、またはＹ、Ｈ、もしくはＤである］を含み、ＨＣＤＲ２が、配列番号４ではなく、
（ｉｉｉ）ＨＣＤＲ３が、配列番号５のアミノ酸配列を含み、
（ｉｖ）ＬＣＤＲ１が、配列番号１６のアミノ酸配列を含み、
（ｖ）ＬＣＤＲ２が、配列番号１７のアミノ酸配列を含み、
（ｖｉ）ＬＣＤＲ３が、配列番号１８のアミノ酸配列を含む、
態様１の抗体または抗原結合性断片。
３．（ｉ）ＨＣＤＲ１が、配列番号６のアミノ酸配列を含み、
（ｉｉ）ＨＣＤＲ２が、アミノ酸配列Ｘ１−Ｉ−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｔ−Ｘ８−ＹＡＤＳＶＫＧ（配列番号５９）［配列中、Ｘ１は、任意のアミノ酸であるか、またはＴもしくはＳであり、Ｘ２は、任意のアミノ酸であるか、またはＤもしくはＥであり、Ｘ３は、任意のアミノ酸であるか、またはＹもしくはＳであり、Ｘ４は、任意のアミノ酸であるか、またはＳ、Ｙ、もしくはＷであり、Ｘ５は、任意のアミノ酸であるか、またはＳ、Ｄ、もしくはＧであり、Ｘ６は、任意のアミノ酸であるか、またはＱ、Ｔ、もしくはＤであり、Ｘ７は、任意のアミノ酸であるか、またはＤもしくはＥであり、Ｘ８は、任意のアミノ酸であるか、またはＹ、Ｈ、もしくはＤである］を含み、ＨＣＤＲ２が、配列番号４ではなく、
（ｉｉｉ）ＨＣＤＲ３が、配列番号５のアミノ酸配列を含み、
（ｉｖ）ＬＣＤＲ１が、配列番号１６のアミノ酸配列を含み、
（ｖ）ＬＣＤＲ２が、配列番号１７のアミノ酸配列を含み、
（ｖｉ）ＬＣＤＲ３が、配列番号１８のアミノ酸配列を含む、
態様１の抗体または抗原結合性断片。
４．（ｉ）ＨＣＤＲ１が、配列番号７のアミノ酸配列を含み、
（ｉｉ）ＨＣＤＲ２が、アミノ酸配列Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６（配列番号６０）［配列中、Ｘ１は、任意のアミノ酸であるか、またはＥもしくはＤであり、Ｘ２は、任意のアミノ酸であるか、またはＹもしくはＳであり、Ｘ３は、任意のアミノ酸であるか、またはＹ、Ｓ、もしくはＷであり、Ｘ４は、任意のアミノ酸であるか、またはＳ、Ｄ、もしくはＧであり、Ｘ５は、任意のアミノ酸であるか、またはＤ、Ｔ、もしくはＱであり、Ｘ６は、任意のアミノ酸であるか、またはＤもしくはＥである］を含み、ＨＣＤＲ２が、配列番号８ではなく、
（ｉｉｉ）ＨＣＤＲ３が、配列番号５のアミノ酸配列を含み、
（ｉｖ）ＬＣＤＲ１が、配列番号１９のアミノ酸配列を含み、
（ｖ）ＬＣＤＲ２が、配列番号２０のアミノ酸配列を含み、
（ｖｉ）ＬＣＤＲ３が、配列番号２１のアミノ酸配列を含む、
態様１の抗体または抗原結合性断片。
５．（ｉ）ＨＣＤＲ１が、配列番号９のアミノ酸配列を含み、
（ｉｉ）ＨＣＤＲ２が、アミノ酸配列Ｉ−Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｔ（配列番号６１）［配列中、Ｘ１は、任意のアミノ酸であるか、またはＥもしくはＤであり、Ｘ２は、任意のアミノ酸であるか、またはＹもしくはＳであり、Ｘ３は、任意のアミノ酸であるか、またはＳ、Ｙ、もしくはＷであり、Ｘ４は、任意のアミノ酸であるか、またはＳ、Ｄ、もしくはＧであり、Ｘ５は、任意のアミノ酸であるか、またはＤ、Ｔ、もしくはＱであり、Ｘ６は、任意のアミノ酸であるか、またはＤもしくはＥである］を含み、ＨＣＤＲ２が、配列番号１０ではなく、
（ｉｉｉ）ＨＣＤＲ３が、配列番号１１のアミノ酸配列を含み、
（ｉｖ）ＬＣＤＲ１が、配列番号２２のアミノ酸配列を含み、
（ｖ）ＬＣＤＲ２が、配列番号２０のアミノ酸配列を含み、
（ｖｉ）ＬＣＤＲ３が、配列番号１８のアミノ酸配列を含む、
態様１の抗体または抗原結合性断片。
６．ＦＸＩおよび／またはＦＸＩａの触媒ドメイン内に結合する単離抗ＦＸＩ抗体またはその抗原結合性断片であって、（ｉ）相補性決定領域ＨＣＤＲ１、ＨＣＤＲ２、およびＨＣＤＲ３を含む重鎖可変領域（ＶＨ）と、（ｉｉ）相補性決定領域ＬＣＤＲ１、ＬＣＤＲ２、およびＬＣＤＲ３を含む軽鎖可変領域（ＶＬ）とを含み、
ＨＣＤＲ１が、配列番号３、６、７、および９からなる群から選択されるアミノ酸配列を含み、
ＨＣＤＲ２が、配列番号２７、２８、２９、３８、３９、４０、４５、４６、および４７からなる群から選択されるアミノ酸配列を含み、
ＨＣＤＲ３が、配列番号５および１１からなる群から選択されるアミノ酸配列を含み、
ＬＣＤＲ１が、配列番号１６、１９、および２２からなる群から選択されるアミノ酸配列を含み、
ＬＣＤＲ２が、配列番号１７および２０からなる群から選択されるアミノ酸配列を含み、
ＬＣＤＲ３が、配列番号１８および２１からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む、
単離抗ＦＸＩ抗体またはその抗原結合性断片。
７．（ｉ）ＨＣＤＲ１が、配列番号３のアミノ酸配列を含み、ＨＣＤＲ２が、配列番号４５のアミノ酸配列を含み、ＨＣＤＲ３が、配列番号５のアミノ酸配列を含み、ＬＣＤＲ１が、配列番号１６のアミノ酸配列を含み、ＬＣＤＲ２が、配列番号１７のアミノ酸配列を含み、ＬＣＤＲ３が、配列番号１８のアミノ酸配列を含むか、
（ｉｉ）ＨＣＤＲ１が、配列番号６のアミノ酸配列を含み、ＨＣＤＲ２が、配列番号４５のアミノ酸配列を含み、ＨＣＤＲ３が、配列番号５のアミノ酸配列を含み、ＬＣＤＲ１が、配列番号１６のアミノ酸配列を含み、ＬＣＤＲ２が、配列番号１７のアミノ酸配列を含み、ＬＣＤＲ３が、配列番号１８のアミノ酸配列を含むか、
（ｉｉｉ）ＨＣＤＲ１が、配列番号７のアミノ酸配列を含み、ＨＣＤＲ２が、配列番号４６のアミノ酸配列を含み、ＨＣＤＲ３が、配列番号５のアミノ酸配列を含み、ＬＣＤＲ１が、配列番号１９のアミノ酸配列を含み、ＬＣＤＲ２が、配列番号２０のアミノ酸配列を含み、ＬＣＤＲ３が、配列番号２１のアミノ酸配列を含むか、または
（ｉｖ）ＨＣＤＲ１が、配列番号９のアミノ酸配列を含み、ＨＣＤＲ２が、配列番号４７のアミノ酸配列を含み、ＨＣＤＲ３が、配列番号１１のアミノ酸配列を含み、ＬＣＤＲ１が、配列番号２２のアミノ酸配列を含み、ＬＣＤＲ２が、配列番号２０のアミノ酸配列を含み、ＬＣＤＲ３が、配列番号１８のアミノ酸配列を含む、
態様６の抗体または抗原結合性断片。
８．（ｉ）ＨＣＤＲ１が、配列番号３のアミノ酸配列を含み、ＨＣＤＲ２が、配列番号３８のアミノ酸配列を含み、ＨＣＤＲ３が、配列番号５のアミノ酸配列を含み、ＬＣＤＲ１が、配列番号１６のアミノ酸配列を含み、ＬＣＤＲ２が、配列番号１７のアミノ酸配列を含み、ＬＣＤＲ３が、配列番号１８のアミノ酸配列を含むか、
（ｉｉ）ＨＣＤＲ１が、配列番号６のアミノ酸配列を含み、ＨＣＤＲ２が、配列番号３８のアミノ酸配列を含み、ＨＣＤＲ３が、配列番号５のアミノ酸配列を含み、ＬＣＤＲ１が、配列番号１６のアミノ酸配列を含み、ＬＣＤＲ２が、配列番号１７のアミノ酸配列を含み、ＬＣＤＲ３が、配列番号１８のアミノ酸配列を含むか、
（ｉｉｉ）ＨＣＤＲ１が、配列番号７のアミノ酸配列を含み、ＨＣＤＲ２が、配列番号３９のアミノ酸配列を含み、ＨＣＤＲ３が、配列番号５のアミノ酸配列を含み、ＬＣＤＲ１が、配列番号１９のアミノ酸配列を含み、ＬＣＤＲ２が、配列番号２０のアミノ酸配列を含み、ＬＣＤＲ３が、配列番号２１のアミノ酸配列を含むか、または
（ｉｖ）ＨＣＤＲ１が、配列番号９のアミノ酸配列を含み、ＨＣＤＲ２が、配列番号４０のアミノ酸配列を含み、ＨＣＤＲ３が、配列番号１１のアミノ酸配列を含み、ＬＣＤＲ１が、配列番号２２のアミノ酸配列を含み、ＬＣＤＲ２が、配列番号２０のアミノ酸配列を含み、ＬＣＤＲ３が、配列番号１８のアミノ酸配列を含む、
態様６の抗体または抗原結合性断片。
９．（ｉ）ＨＣＤＲ１が、配列番号３のアミノ酸配列を含み、ＨＣＤＲ２が、配列番号２７のアミノ酸配列を含み、ＨＣＤＲ３が、配列番号５のアミノ酸配列を含み、ＬＣＤＲ１が、配列番号１６のアミノ酸配列を含み、ＬＣＤＲ２が、配列番号１７のアミノ酸配列を含み、ＬＣＤＲ３が、配列番号１８のアミノ酸配列を含むか、
（ｉｉ）ＨＣＤＲ１が、配列番号６のアミノ酸配列を含み、ＨＣＤＲ２が、配列番号２７のアミノ酸配列を含み、ＨＣＤＲ３が、配列番号５のアミノ酸配列を含み、ＬＣＤＲ１が、配列番号１６のアミノ酸配列を含み、ＬＣＤＲ２が、配列番号１７のアミノ酸配列を含み、ＬＣＤＲ３が、配列番号１８のアミノ酸配列を含むか、
（ｉｉｉ）ＨＣＤＲ１が、配列番号７のアミノ酸配列を含み、ＨＣＤＲ２が、配列番号２８のアミノ酸配列を含み、ＨＣＤＲ３が、配列番号５のアミノ酸配列を含み、ＬＣＤＲ１が、配列番号１９のアミノ酸配列を含み、ＬＣＤＲ２が、配列番号２０のアミノ酸配列を含み、ＬＣＤＲ３が、配列番号２１のアミノ酸配列を含むか、または
（ｉｖ）ＨＣＤＲ１が、配列番号９のアミノ酸配列を含み、ＨＣＤＲ２が、配列番号２９のアミノ酸配列を含み、ＨＣＤＲ３が、配列番号１１のアミノ酸配列を含み、ＬＣＤＲ１が、配列番号２２のアミノ酸配列を含み、ＬＣＤＲ２が、配列番号２０のアミノ酸配列を含み、ＬＣＤＲ３が、配列番号１８のアミノ酸配列を含む、
態様６の抗体または抗原結合性断片。
１０．ＨＣＤＲ１が、配列番号３のアミノ酸配列を含み、ＨＣＤＲ２が、配列番号２７、３８、または４５のアミノ酸配列を含み、ＨＣＤＲ３が、配列番号５のアミノ酸配列を含み、ＬＣＤＲ１が、配列番号１６のアミノ酸配列を含み、ＬＣＤＲ２が、配列番号１７のアミノ酸配列を含み、ＬＣＤＲ３が、配列番号１８のアミノ酸配列を含む、態様６の抗体または抗原結合性断片。
１１．ＨＣＤＲ１が、配列番号６のアミノ酸配列を含み、ＨＣＤＲ２が、配列番号２７、３８、または４５のアミノ酸配列を含み、ＨＣＤＲ３が、配列番号５のアミノ酸配列を含み、ＬＣＤＲ１が、配列番号１６のアミノ酸配列を含み、ＬＣＤＲ２が、配列番号１７のアミノ酸配列を含み、ＬＣＤＲ３が、配列番号１８のアミノ酸配列を含む、態様６の抗体または抗原結合性断片。
１２．ＨＣＤＲ１が、配列番号７のアミノ酸配列を含み、ＨＣＤＲ２が、配列番号２８、３９、または４６のアミノ酸配列を含み、ＨＣＤＲ３が、配列番号５のアミノ酸配列を含み、ＬＣＤＲ１が、配列番号１９のアミノ酸配列を含み、ＬＣＤＲ２が、配列番号２０のアミノ酸配列を含み、ＬＣＤＲ３が、配列番号２１のアミノ酸配列を含む、態様６の抗体または抗原結合性断片。
１３．ＨＣＤＲ１が、配列番号９のアミノ酸配列を含み、ＨＣＤＲ２が、配列番号２９、４０、または４７のアミノ酸配列を含み、ＨＣＤＲ３が、配列番号１１のアミノ酸配列を含み、ＬＣＤＲ１が、配列番号２２のアミノ酸配列を含み、ＬＣＤＲ２が、配列番号２０のアミノ酸配列を含み、ＬＣＤＲ３が、配列番号１８のアミノ酸配列を含む、態様６の抗体または抗原結合性断片。
１４．ＦＸＩおよび／またはＦＸＩａの触媒ドメイン内に結合する単離抗ＦＸＩ抗体またはその抗原結合性断片であって、重鎖可変領域（ＶＨ）と、軽鎖可変領域（ＶＬ）とを含み、ＶＨが、表２から選択される相補性決定領域ＨＣＤＲ１、ＨＣＤＲ２、およびＨＣＤＲ３を含み、ＶＬが、表２から選択される相補性決定領域ＬＣＤＲ１、ＬＣＤＲ２、およびＬＣＤＲ３を含む、単離抗ＦＸＩ抗体またはその抗原結合性断片。
１５．ＶＨが、組み合わされたＨＣＤＲ１、ＨＣＤＲ２、およびＨＣＤＲ３を含み、ＶＬが、組み合わされたＬＣＤＲ１、ＬＣＤＲ２、およびＬＣＤＲ３を含む、態様１４の抗体または抗原結合性断片。
１６．ＶＨが、ＫａｂａｔによるＨＣＤＲ１、ＨＣＤＲ２、およびＨＣＤＲ３を含み、ＶＬが、ＫａｂａｔによるＬＣＤＲ１、ＬＣＤＲ２、およびＬＣＤＲ３を含む、態様１４の抗体または抗原結合性断片。
１７．ＶＨが、ＣｈｏｔｈｉａによるＨＣＤＲ１、ＨＣＤＲ２、およびＨＣＤＲ３を含み、ＶＬが、ＣｈｏｔｈｉａによるＬＣＤＲ１、ＬＣＤＲ２、およびＬＣＤＲ３を含む、態様１４の抗体または抗原結合性断片。
１８．ＶＨが、ＩＭＧＴによるＨＣＤＲ１、ＨＣＤＲ２、およびＨＣＤＲ３を含み、ＶＬが、ＩＭＧＴによるＬＣＤＲ１、ＬＣＤＲ２、およびＬＣＤＲ３を含む、態様１４の抗体または抗原結合性断片。
１９．ＦＸＩおよび／またはＦＸＩａの触媒ドメイン内に結合する単離抗ＦＸＩ抗体またはその抗原結合性断片であって、重鎖可変領域（ＶＨ）と、軽鎖可変領域（ＶＬ）とを含み、ＶＨが、抗体ＡＭ１の相補性決定領域ＨＣＤＲ１、ＨＣＤＲ２、およびＨＣＤＲ３を含み、ＶＬが、抗体ＡＭ１の相補性決定領域ＬＣＤＲ１、ＬＣＤＲ２、およびＬＣＤＲ３を含む、単離抗ＦＸＩ抗体またはその抗原結合性断片。
２０．ＦＸＩおよび／またはＦＸＩａの触媒ドメイン内に結合する単離抗ＦＸＩ抗体またはその抗原結合性断片であって、重鎖可変領域（ＶＨ）と、軽鎖可変領域（ＶＬ）とを含み、ＶＨが、抗体ＡＭ２の相補性決定領域ＨＣＤＲ１、ＨＣＤＲ２、およびＨＣＤＲ３を含み、ＶＬが、抗体ＡＭ２の相補性決定領域ＬＣＤＲ１、ＬＣＤＲ２、およびＬＣＤＲ３を含む、単離抗ＦＸＩ抗体またはその抗原結合性断片。
２１．ＦＸＩおよび／またはＦＸＩａの触媒ドメイン内に結合する単離抗ＦＸＩ抗体またはその抗原結合性断片であって、重鎖可変領域（ＶＨ）と、軽鎖可変領域（ＶＬ）とを含み、ＶＨが、抗体ＡＭ３またはＡＭ４の相補性決定領域ＨＣＤＲ１、ＨＣＤＲ２、およびＨＣＤＲ３を含み、ＶＬが、抗体ＡＭ３またはＡＭ４の相補性決定領域ＬＣＤＲ１、ＬＣＤＲ２、およびＬＣＤＲ３を含む、単離抗ＦＸＩ抗体またはその抗原結合性断片。
２２．ＶＨが、配列番号３０、４１、および４８のアミノ酸配列を含み、ＶＬが、配列番号３４または５５のアミノ酸配列を含む、態様６の抗体または抗原結合性断片。
２３．ＶＨが、配列番号４８のアミノ酸配列を含み、ＶＬが、配列番号５５のアミノ酸配列を含む、態様２２の抗体または抗原結合性断片。
２４．ＶＨが、配列番号４８のアミノ酸配列を含み、ＶＬが、配列番号３４のアミノ酸配列を含む、態様２２の抗体または抗原結合性断片。
２５．ＶＨが、配列番号４１のアミノ酸配列を含み、ＶＬが、配列番号３４のアミノ酸配列を含む、態様２２の抗体または抗原結合性断片。
２６．ＶＨが、配列番号３０のアミノ酸配列を含み、ＶＬが、配列番号３４のアミノ酸配列を含む、態様２２の抗体または抗原結合性断片。
２７．重鎖が、配列番号３２、４３、５０、または５３のアミノ酸配列を含み、軽鎖が、配列番号５７または３６のアミノ酸配列を含む、態様６の抗体または抗原結合性断片。
２８．重鎖が、配列番号５３のアミノ酸配列を含み、軽鎖が、配列番号５７のアミノ酸配列を含む、態様２２の抗体または抗原結合性断片。
２９．重鎖が、配列番号５０のアミノ酸配列を含み、軽鎖が、配列番号３６のアミノ酸配列を含む、態様２２の抗体または抗原結合性断片。
３０．重鎖が、配列番号４３のアミノ酸配列を含み、軽鎖が、配列番号３６のアミノ酸配列を含む、態様２２の抗体または抗原結合性断片。
３１．重鎖が、配列番号３２のアミノ酸配列を含み、軽鎖が、配列番号３６のアミノ酸配列を含む、態様２２の抗体または抗原結合性断片。
３２．ＶＨが、配列番号３０、４１、および４８のアミノ酸配列と、少なくとも９０％同一なアミノ酸配列を含み、ＶＬが、配列番号３４または５５のアミノ酸配列と、少なくとも９０％同一なアミノ酸配列を含み、かつ、ＶＨが、配列番号１２のアミノ酸配列を含まず、ＶＬが、配列番号２３のアミノ酸配列を含まない、態様６の抗体または抗原結合性断片。
３３．ＶＨが、配列番号３０、４１、および４８のアミノ酸配列と、少なくとも９５％同一なアミノ酸配列を含み、ＶＬが、配列番号３４または５５のアミノ酸配列と、少なくとも９５％同一なアミノ酸配列を含み、かつ、ＶＨが、配列番号１２のアミノ酸配列を含まず、ＶＬが、配列番号２３のアミノ酸配列を含まない、態様６の抗体または抗原結合性断片。
３４．ヒトモノクローナル抗体である、態様１〜３３のいずれか１つの抗体または抗原結合性断片。
３５．ヒト化モノクローナル抗体である、態様１〜３３のいずれか１つの抗体または抗原結合性断片。
３６．ヒトＩｇＧ１アイソタイプ抗体である、態様１〜３５のいずれか１つの抗体または抗原結合性断片。
３７．ヒトＩｇＧ２アイソタイプ抗体またはヒトＩｇＧ４アイソタイプ抗体である、態様１〜３５のいずれか１つの抗体または抗原結合性断片。
３８．単鎖抗体、Ｆａｂ断片、Ｆｖ断片、Ｆ（ａｂ’）２断片、またはｓｃＦｖ断片である、態様１〜３３のいずれか１つの抗体または抗原結合性断片。
３９．態様１〜３８のいずれか１つの抗体またはその抗原結合性断片と、薬学的に許容される担体とを含む医薬組成物。
４０．血栓塞栓性障害を処置する、または血栓塞栓性障害のリスクを管理または低減する方法であって、それを必要とする対象に、態様１〜３８のいずれか１つに記載の抗体または抗原結合性断片を含む、有効量の医薬組成物を投与するステップを含む方法。
４１．対象が、心房細動および深部静脈血栓症と関連する脳卒中の１つまたは複数に罹患しているか、またはこれを発症するリスクを有する、態様４０の方法。
４２．対象が、心房細動と関連する脳卒中に罹患しているか、またはこれを発症するリスクを有する、態様４０の方法。
４３．対象が、心房細動に罹患している、態様４０の方法。
４４．脳卒中を予防、処置する、または脳卒中のリスクを管理、または低減する方法であって、それを必要とする対象に、態様１〜３８のいずれか１つに記載の抗体または抗原結合性断片を含む、有効量の医薬組成物を投与するステップを含む方法。
４５．対象が、心房細動に罹患している、態様４４の方法。
４６．血栓塞栓性障害を処置する、または血栓塞栓性障害のリスクを管理または低減する方法であって、それを必要とする対象に、１つまたは複数のスタチン療法と組み合わせた、態様１〜３８のいずれか１つに記載の抗体または断片を含む、有効量の医薬組成物を投与するステップを含む方法。
４７．態様１〜３８のいずれか１つの抗ＦＸＩ抗体または抗原結合性断片で処置されるか、またはこれを投与された対象における、出血または出血リスクを管理または低減する方法であって、それを必要とする対象に、抗ＦＸＩ抗体に特異的に結合し、抗ＦＸＩ抗体の、ＦＸＩへの結合を遮断する抗イディオタイプ抗体またはその断片を投与するステップを含み、抗イディオタイプ抗体またはその断片が、抗ＦＸＩ抗体の抗凝固活性を逆転（reverse）させる、方法。
４８．抗イディオタイプ抗体またはその断片が、抗ＦＸＩ抗体の抗凝固効果を一時的に逆転させるために、対象に１回または２回投与される、態様４７の方法。
４９．態様１〜３８のいずれか１つの抗ＦＸＩ抗体または抗原結合性断片で処置されるか、またはこれを投与された対象における、出血または出血リスクを管理または低減する方法であって、以下：（ｉ）コロイド、クリスタロイド、ヒト血漿、もしくはアルブミンなどの血漿タンパク質を用いた補液、（ｉｉ）濃厚赤血球もしくは全血による輸血、または（ｉｉｉ）新鮮凍結血漿（ＦＦＰ）、プロトロンビン複合体濃縮物（ＰＣＣ）、第ＶＩＩＩ因子インヒビターなどの活性型ＰＣＣ（ＡＰＣＣ）、および／もしくは組換え活性型第ＶＩＩ因子の投与のうちの１つにより、出血を管理するのに十分な時間にわたって抗凝固効果を一時的に逆転させるステップを含む方法。
５０．対象に、抗ＦＸＩ抗体に特異的に結合し、抗ＦＸＩ抗体の、ＦＸＩへの結合を遮断する抗イディオタイプ抗体またはその断片の、１、２、３、４、または５回の投与を行うステップを含み、抗イディオタイプ抗体またはその断片が、抗ＦＸＩ抗体の抗凝固活性を逆転させる、態様４０〜４６のいずれか１つの方法。
５１．以下：（ｉ）コロイド、クリスタロイド、ヒト血漿、もしくはアルブミンなどの血漿タンパク質を用いた補液、（ｉｉ）濃厚赤血球もしくは全血による輸血、または（ｉｉｉ）新鮮凍結血漿（ＦＦＰ）、プロトロンビン複合体濃縮物（ＰＣＣ）、第ＶＩＩＩ因子インヒビターなどの活性型ＰＣＣ（ＡＰＣＣ）、および／もしくは組換え活性型第ＶＩＩ因子の投与のうちの１つにより、出血を管理するのに十分な時間にわたって抗凝固効果を一時的に逆転させるステップを含む、態様４０〜４６のいずれか１つの方法。
５２．態様１〜３８のいずれか１つの抗ＦＸＩ抗体または抗原結合性断片の、抗ＦＸＩ／ＦＸＩａ抗体またはその抗原結合性断片により処置されている患者における抗凝固効果を逆転させるための方法であって、有効量の、抗ＦＸＩ抗体に特異的に結合する抗イディオタイプ抗体またはその断片を投与するステップを含む方法。
５３．態様１〜３８のいずれか１つの抗ＦＸＩ抗体に特異的に結合し、抗ＦＸＩ抗体の、ＦＸＩへの結合を遮断する抗イディオタイプ抗体またはその断片であって、抗ＦＸＩ抗体の抗凝固活性を、少なくとも３０％、または少なくとも４０％逆転させる抗イディオタイプ抗体またはその断片。
５４．態様１〜３８のいずれか１つに記載の抗体またはその抗原結合性断片を含む医薬。
５５．態様１〜３８のいずれか１つの抗体または抗原結合性断片のＶＬ、ＶＨ、またはＶＬおよびＶＨをコードする核酸配列を含むポリヌクレオチド。
５６．態様１〜３８のいずれか１つの抗体または抗原結合性断片の重鎖、軽鎖、または重鎖および軽鎖をコードする、態様５５のポリヌクレオチド。
５７．表２に記載の核酸配列を含む、態様５５のポリヌクレオチド。
５８．態様５５〜５７のいずれか１つに記載のポリヌクレオチドを含むベクター。
５９．態様５８のベクターを含む宿主細胞。
６０．真核細胞である、態様５９の宿主細胞。
６１．哺乳動物細胞である、態様５９の宿主細胞。
６２．抗ＦＸＩ／ＦＸＩａ抗体またはその断片を作製する方法であって、態様５９〜６１のいずれか１つの宿主細胞を、抗ＦＸＩ／ＦＸＩａ抗体またはその断片の発現に適した条件下で培養するステップを含む方法。
６３．抗ＦＸＩ／ＦＸＩａ抗体またはその断片を精製するステップをさらに含む、態様６２の方法。
６４．心房細動を伴う患者における、脳卒中および／または全身性塞栓症のリスクを低減する方法であって、患者に、治療有効量の、態様１〜３８のいずれか１つに記載の抗体または抗原結合性断片を投与するステップを含む方法。
６５．患者が、非弁膜症性心房細動を有する、態様６４の方法。
６６．患者が、証明された（demonstrated）、高い出血リスクを有する、態様６４または６５の方法。
６７．慢性腎疾患を伴う患者における、脳卒中および／または全身性塞栓症のリスクを低減する方法であって、患者に、治療有効量の、態様１〜３８のいずれか１つに記載の抗体または抗原結合性断片を投与するステップを含む方法。
６８．患者が、末期腎不全（ＥＳＲＤ）を有する、態様６７の方法。
６９．患者が、ＥＳＲＤを有し、透析を受けている、態様６７の方法。
７０．患者が、非弁膜症性心房細動を有する、態様６９の方法。
７１．患者が、証明された、高い出血リスクを有する、態様７０の方法。
７２．対象における、血栓塞栓性障害のリスクを処置または管理または低減する方法における使用のための、態様３９に記載の医薬組成物または態様５４に記載の医薬。
７３．対象が、心房細動および深部静脈血栓症と関連する脳卒中の１つまたは複数に罹患しているか、またはこれを発症するリスクを有する、前出の態様のいずれか１つに記載の医薬組成物または医薬。
７４．対象が、心房細動と関連する脳卒中に罹患しているか、またはこれを発症するリスクを有する、前出の態様のいずれか１つに記載の医薬組成物または医薬。
７５．対象が、心房細動に罹患している、前出の態様のいずれか１つに記載の医薬組成物または医薬。
７６．対象における、脳卒中のリスクを防止、処置、または管理、または低減する方法における使用のための、態様３９に記載の医薬組成物または態様５４に記載の医薬。
７７．対象が、心房細動に罹患している、態様７６に記載の医薬組成物または医薬。
７８．血栓塞栓性障害のリスクを処置または管理または低減する方法であって、医薬組成物または医薬を、それを必要とする対象に、１つまたは複数のスタチン療法と組み合わせて投与するステップを含む方法における使用のための、態様３９に記載の医薬組成物または態様５４に記載の医薬。
７９．血栓塞栓性障害のリスクを処置または管理または低減するための医薬の調製における、態様１〜３８のいずれか１つに記載の抗体または抗原結合性断片の使用。
【００３９】
用語
別段に定義されない限り、本明細書で使用される全ての技術的および科学的用語は、本開示が関する技術分野の当業者により一般的に理解される意味と同じ意味を有する。
【００４０】
「ＦＸＩタンパク質」、「ＦＸＩ抗原」、および「ＦＸＩ」という用語は、互換的に使用され、異なる種における第ＸＩ因子タンパク質を指す。第ＸＩ因子とは、限定的なタンパク質分解により、活性型のセリンプロテアーゼに転換されると、血液凝固の内因系経路に参与するチモーゲンとして、ヒト血漿中に、２５〜３０ｎＭの濃度で存在する糖タンパク質である、哺乳動物の第ＸＩ血漿凝固因子である。
【００４１】
「ＦＸＩａタンパク質」、「ＦＸＩａ抗原」、および「ＦＸＩａ」という用語は、互換的に使用され、異なる種における活性型ＦＸＩタンパク質を指す。チモーゲンである第ＸＩ因子は、血液凝固の接触相を介して、または血小板表面上の、トロンビンを媒介する活性化を介して、その活性形態である第Ｘｌａ凝固因子（ＦＸＩａ）に転換される。第ＸＩ因子のこの活性化時に、内部のペプチド結合は、２つの鎖の各々に切断され、ジスルフィド結合により共に保持された、２つの重鎖および２つの軽鎖から構成されるセリンプロテアーゼである、活性型第Ｘｌａ因子を結果としてもたらす。このセリンプロテアーゼであるＦＸＩａは、第ＩＸ凝固因子を、ＩＸａに転換し、続いて、ＩＸａは、第Ｘ凝固因子を活性化させる（Ｘａ）。次いで、Ｘａは、第ｌｌ凝固因子／トロンビンの活性化を媒介しうる。例えば、ヒトＦＸＩは、表１（配列番号１）に示される配列を有し、先行の報告および文献（Mandle RJ Jr, et al. (1979) Blood;54(4):850、ＮＣＢＩ基準配列：ＡＡＡ５１９８５）において記載されている。
【００４２】
本開示の文脈では、「ＦＸＩ」および「ＦＸＩａ」（など）という用語は、天然のＦＸＩタンパク質およびＦＸＩａタンパク質のそれぞれの突然変異体および変異体であって、上述の報告において記載されている、天然の一次構造（アミノ酸配列）のアミノ酸配列と実質的に同じアミノ酸配列を有する突然変異体および変異体を含む。
【００４３】
「触媒ドメイン」、「セリンプロテアーゼ触媒ドメイン」という用語、および本明細書で使用される同様な用語は、循環中の成熟タンパク質のＮ末端のＧｌｕ１から数えた、アミノ酸Ｉｌｅ３７０〜Ｖａｌ６０７を意味する。これはまた、ＦＸＩのＣ末端における残基３８８〜６２５としても記載することができる。本明細書で使用される「活性部位」という用語は、アミノ酸であるＨｉｓ４１３、Ａｓｐ４６２、およびＳｅ５５７を含む、触媒性三残基を意味する（Bane and Gailani (2014) Drug Disc. 19(9)）。
【００４４】
本明細書で使用される「抗体」という用語は、全抗体および任意の抗原結合性断片（すなわち、「抗原結合性部分」）またはそれらの単鎖体を意味する。全抗体は、ジスルフィド結合により相互接続される少なくとも２つの重（Ｈ）鎖および２つの軽（Ｌ）鎖を含む糖タンパク質である。各重鎖は、重鎖可変領域（本明細書では、ＶＨと略記する）および重鎖定常領域を含む。重鎖定常領域は、３つのドメインであるＣＨ１、ＣＨ２、およびＣＨ３を含む。各軽鎖は、軽鎖可変領域（本明細書では、ＶＬと略記する）および軽鎖定常領域を含む。軽鎖定常領域は、１つのドメインであるＣＬを含む。ＶＨ領域およびＶＬ領域は、フレームワーク領域（ＦＲ）と称するより保存的な領域を散在させた、相補性決定領域（ＣＤＲ）と称する超可変性の領域にさらに細分することができる。各ＶＨおよび各ＶＬは、アミノ末端からカルボキシ末端に、以下の順序で配置される３つのＣＤＲおよび４つのＦＲ：ＦＲ１、ＣＤＲ１、ＦＲ２、ＣＤＲ２、ＦＲ３、ＣＤＲ３、ＦＲ４からなる。重鎖および軽鎖の可変領域は、抗原と相互作用する結合性ドメインを含有する。抗体の定常領域は、免疫グロブリンの、宿主組織または免疫系の多様な細胞（例えば、エフェクター細胞）および古典的補体系の第１の成分（Ｃｌｑ）を含む因子への結合を媒介しうる。
【００４５】
本明細書で使用される、抗体の「抗原結合性部分」または「抗原結合性断片」という用語は、所与の抗原（例えば、ＸＩａ因子（ＦＸＩａ））に特異的に結合する能力を保持する、インタクトな抗体の１つまたは複数の断片を指す。抗体の抗原結合性機能は、インタクトな抗体の断片により果たされうる。抗体の抗原結合性部分または抗原結合性断片という用語内に包含される結合性断片の例は、Ｆａｂ断片、ＶＬドメイン、ＶＨドメイン、ＣＬドメイン、およびＣＨ１ドメインからなる一価断片、ヒンジ領域においてジスルフィド架橋により連結された２つのＦａｂ断片を含む二価断片であるＦ（ａｂ）２断片、ＶＨドメインおよびＣＨ１ドメインからなるＦｄ断片、抗体の単一のアームのＶＬドメインおよびＶＨドメインからなるＦｖ断片、ＶＨドメインまたはＶＬドメインからなる単一ドメイン抗体（ｄＡｂ）断片（Wardら、1989 Nature 341:544〜546）、ならびに単離相補性決定領域（ＣＤＲ）を含む。
【００４６】
さらに、Ｆｖ断片の２つのドメインであるＶＬドメインおよびＶＨドメインは、個別の遺伝子によりコードされるが、組換え法を使用して、それらを単一のタンパク質鎖として作製することを可能とする人工のペプチドリンカーにより付着することができ、この場合、ＶＬ領域およびＶＨ領域は、対合して一価分子（単鎖Ｆｖ（ｓｃＦｖ）として公知であり、例えば、Birdら、1988 Science 242:423〜426、およびHustonら、1988 Proc. Natl. Acad. Sci. 85:5879〜5883を参照されたい）を形成する。このような単鎖抗体は、抗体の１つまたは複数の抗原結合性部分または抗原結合性断片を含む。これらの抗体断片は、当業者に公知の従来の技法を使用して得られ、断片も、インタクトな抗体と同じ形で有用性についてスクリーニングされる。
【００４７】
抗原結合性断片はまた、単一ドメイン抗体、マキシボディ、ミニボディ、イントラボディ、ダイアボディ、トリアボディ、テトラボディ、ｖ−ＮＡＲ、およびｂｉｓ−ｓｃＦｖ（例えば、HollingerおよびHudson、2005、Nature Biotechnology、23、9、1126〜1136を参照されたい）に組み込むこともできる。抗体の抗原結合性部分は、ＩＩＩ型フィブロネクチン（Ｆｎ３）などのポリペプチド（フィブロネクチンポリペプチドモノボディについて記載する米国特許第６，７０３，１９９号明細書を参照されたい）に基づく足場にグラフトすることができる。
【００４８】
抗原結合性断片は、相補的な軽鎖ポリペプチドと併せて抗原結合性領域の対を形成する、タンデムＦｖセグメント（ＶＨ−ＣＨ１−ＶＨ−ＣＨ１）の対を含む単鎖分子に組み込むことができる（Zapataら、1995 Protein Eng. 8（10）:1057〜1062、および米国特許第５，６４１，８７０号明細書）。
【００４９】
本明細書で使用される「アフィニティー」という用語は、単一の抗原性部位における抗体と抗原との間の相互作用の強度を指す。各抗原性部位内では、抗体「アーム」の可変領域は、多数の部位において、弱い非共有結合的力を介して抗原と相互作用し、相互作用が大きいほど、アフィニティーは強くなる。抗体またはその抗原結合性断片（例えば、Ｆａｂ断片）について本明細書で使用される「高アフィニティー」という用語は一般に、１０−９Ｍ以下のＫＤ（例えば、１０−１０Ｍ以下のＫＤ、１０−１１Ｍ以下のＫＤ、１０−１２Ｍ以下のＫＤ、１０−１３Ｍ以下のＫＤ、１０−１４Ｍ以下のＫＤなど）を有する抗体または抗原結合性断片を指す。
【００５０】
「アミノ酸」という用語は、自然発生のアミノ酸および合成アミノ酸のほか、自然発生のアミノ酸と同様の形で機能するアミノ酸類似体およびアミノ酸模倣体も指す。自然発生のアミノ酸とは、遺伝子コードによりコードされるアミノ酸のほか、後で修飾されたアミノ酸、例えば、ヒドロキシプロリン、γ−カルボキシグルタミン酸、およびＯ−ホスホセリンでもある。アミノ酸類似体とは、自然発生のアミノ酸と同じ基本的化学構造、すなわち、水素、カルボキシル基、アミノ基、およびＲ基、例えば、ホモセリン、ノルロイシン、メチオニンスルホキシド、メチオニンメチルスルホニウムに結合したアルファ炭素を有する化合物を指す。このような類似体は、修飾Ｒ基（例えば、ノルロイシン）または修飾ペプチド骨格を有するが、自然発生のアミノ酸と同じ基本的化学構造を保持する。アミノ酸模倣体とは、アミノ酸の一般的な化学構造と異なる構造を有するが、自然発生のアミノ酸と同様の形で機能する化学化合物を指す。
【００５１】
本明細書で使用される「結合特異性」という用語は、１つの抗原決定基だけと反応する個別の抗原結合部位の能力を指す。
【００５２】
抗体（例えば、ＦＸＩ結合性抗体および／またはＦＸＩａ結合性抗体）に「特異的に（または選択的に）結合する」という語句は、タンパク質および他の生体物質の異質な集団内のコグネイト抗原（例えば、ヒトのＦＸＩおよび／もしくはＦＸＩａまたはカニクイザルのＦＸＩおよび／もしくはＦＸＩａ）の存在を決定する結合反応を指す。本明細書では、「抗原を認識する抗体」および「抗原に特異的な抗体」という語句は、「抗原に特異的に結合する抗体」という用語と互換的に使用される。
【００５３】
「ＦＸＩおよび／またはＦＸＩａを媒介する」という用語は、ＦＸＩおよび／またはＦＸＩａが、第ＩＸ因子（また、ＦＩＸとしても公知である）、第Ｘ因子（ＦＸ）、および／もしくはトロンビンを、直接的もしくは間接的に活性化させることにより、かつ／または血小板受容体に結合することにより、内因系凝固経路および／または共通凝固経路を媒介するという事実を指す。
【００５４】
「止血」という用語は、損傷部位における血流を止めるための主要な機構、および創傷治癒時に血管の開存を回復するための主要な機構のそれぞれを表す。正常な止血および病理学的血栓症では、３つの機構：活性化血小板の、血管壁との相互作用を意味する一次止血、フィブリンの形成、および線溶と称する過程が同時に活性化する。
【００５５】
「凝固および凝固カスケード」、「凝固のカスケードモデル」などという用語は、創傷を密封するように形成される凝血を安定化させるのに用いられる、タンパク質ベースの系を指す。凝固経路とは、タンパク質分解性カスケードである。経路の各酵素は、血漿中に、活性化すると、タンパク質分解性切断を受けて、前駆体分子から活性の因子を放出する、チモーゲン（不活性形態にある）として存在する。凝固カスケードは、活性化過程を制御する一連の正および負のフィードバックループとして機能する。経路の最終目標は、次いで、可溶性フィブリノゲンを、凝血を形成するフィブリンに転換しうる、トロンビンを産生することである。
【００５６】
トロンビンの生成過程は、３つの相：内因系経路、および活性の凝血因子：ＦＸａ（活性型第Ｘ因子）を生成させるための代替的な経路である外因系経路、およびトロンビンの形成を結果としてもたらす、最終的な共通経路に分けることができる（Hoffman M.M. and Monroe D.M. (2005) Curr Hematol Rep. 4:391 -396; Johne J, et al. (2006) Biol Chem. 387:173-178）。
【００５７】
「血小板の凝集」とは、血管の破断が生じたら、正常では血流と直接接触しない物質が曝露される過程を指す。これらの物質（主に、コラーゲンおよびフォンヴィレブランド因子）は、血小板が、破断した表面に接着することを可能とする。血小板は、表面に付着すると、さらなる血小板を損傷領域に誘引する化学物質を放出するが、これを血小板の凝集と称する。これらの２つの過程が、出血を止める最初の応答である。
【００５８】
本明細書で使用される「血栓塞栓性障害」という用語または類似の用語は、内因系凝固経路および／または共通凝固経路が、異常に活性化しているか、または自然に不活化しない（例えば、治療手段を伴わずに）、任意の数の状態または疾患を指す。これらの状態は、血栓性脳卒中、心房細動、心房細動における脳卒中の防止（ＳＰＡＦ）、深部静脈血栓症、静脈血栓塞栓症、および肺塞栓症を含むがこれらに限定されない。これらはまた、カテーテルが血栓性となるカテーテル関連状態（例えば、がん患者におけるヒックマンカテーテル）、およびチュービングが凝血を発症させる体外式膜型人工肺（ＥＣＭＯ）も含みうる。
【００５９】
本明細書で使用される「血栓塞栓性」という用語または類似の用語はまた、本開示の抗ＦＸＩ  Ａｂおよび／もしくは抗ＦＸＩａ  Ａｂまたはそれらの抗原結合性断片を使用して防止または処置しうる、任意の数の以下のもの：
・発作性心房細動もしくは発作性心房粗動、遷延性心房細動もしくは遷延性心房粗動、または永続性心房細動もしくは永続性心房粗動などの心不整脈を疑われるか、または確認されている対象における血栓塞栓症、
・心房細動における脳卒中の防止（ＳＰＡＦ）を伴う対象であって、その亜集団が、経皮冠動脈インターベンション（ＰＣＩ）を受けるＡＦ患者である対象、
・出血リスクが大きな患者における、急性静脈血栓塞栓性事象（ＶＴＥ）の処置、および長期的な続発性ＶＴＥの防止、
・一過性虚血性発作（ＴＩＡ）または非機能障害誘発性脳卒中の後の二次防止における大脳および心血管事象、ならびに洞調律を伴う心不全における、血栓塞栓性事象の防止における大脳および心血管事象、
・心不整脈のための心除細動を受ける対象における、左心房内の凝血形成および血栓塞栓症、
・心不整脈のためのアブレーション手順の前、その間、およびその後における血栓症、
・静脈血栓症であり、これは、下肢または上肢における、深部静脈血栓症または表在静脈血栓症、腹部静脈および胸部静脈における血栓症、静脈洞血栓症および頸静脈血栓症の処置および二次防止を含むがこれらに限定されない、
・カテーテルまたはペースメーカーの導線など、静脈内の任意の人工表面上の血栓症、
・静脈血栓症を伴うかまたは伴わない患者における肺塞栓症、
・慢性血栓塞栓性肺高血圧症（ＣＴＥＰＨ）、
・破裂したアテローム性プラーク上の動脈血栓症、動脈内の人工装具上またはカテーテル上の血栓症、および見かけ上正常な動脈内の血栓症であり、これらは、急性冠動脈症候群、ＳＴ上昇型心筋梗塞、非ＳＴ上昇型心筋梗塞、不安定狭心症、ステント血栓症、動脈系内の任意の人工表面の血栓症、および肺高血圧症を伴うかまたは伴わない対象における肺動脈血栓症を含むがこれらに限定されない、
・経皮冠動脈インターベンション（ＰＣＩ）を受ける患者における、血栓症および血栓塞栓症、
・心塞栓性脳卒中および潜因性脳卒中、
・侵襲性および非侵襲性のがん性悪性腫瘍を伴う患者における血栓症、
・留置カテーテルにわたる血栓症、
・重病患者における血栓症および血栓塞栓症、
・心血栓症および血栓塞栓症であり、これらは、心筋梗塞後における心血栓症、心動脈瘤、心筋線維症、心肥大および心機能不全、心筋炎、ならびに心臓内の人工表面などの状態と関連する心血栓症を含むがこれらに限定されない、
・心房細動を伴うかまたは伴わない、心弁性心疾患を伴う患者における血栓塞栓症、
・心弁用の機械的または生物学的人工装具にわたる血栓塞栓症、
・単純型心奇形または複合型心奇形の心臓修復術後において、天然または人工の心パッチ、動脈または静脈の導管を有した患者における血栓塞栓症、
・人工膝関節置換術、人工股関節置換術、および整形外科術、胸部手術または腹部手術の後における、静脈血栓症および血栓塞栓症、
・頭蓋内インターベンションおよび脊髄インターベンションを含む神経外科術の後における、動脈血栓症または静脈血栓症、
・第Ｖ因子  Ｌｅｉｄｅｎ、プロトロンビンの突然変異、抗トロンビンＩＩＩ、プロテインＣ欠損症およびプロテインＳ欠損症、第ＸＩＩＩ因子の突然変異、家族性異常フィブリノゲン血症、先天性プラスミノゲン欠損症、第ＸＩ因子レベルの上昇、鎌状赤血球病、抗リン脂質症候群、自己免疫疾患、慢性腸疾患、ネフローゼ症候群、溶血性尿毒症、骨髄増殖性疾患、播種性血管内凝固、発作性夜間ヘモグロビン尿症、およびヘパリン誘導性血小板減少症を含むがこれらに限定されない、先天性または後天性の血栓性素因、
・慢性腎疾患における血栓症および血栓塞栓症、ならびに
・血液透析を受ける患者、および体外式膜型人工肺を受ける患者における、血栓症および血栓塞栓症
指す場合がある。
【００６０】
「キメラ抗体」という用語は、（ａ）抗原結合性部位（可変領域）を、クラス、エフェクター機能、および／もしくは種が異なるか、またはクラス、エフェクター機能、および／もしくは種を改変された定常領域、あるいはキメラ抗体に新たな特性を付与する全く異なる分子、例えば、酵素、毒素、ホルモン、成長因子、薬物などに連結するように、定常領域またはその一部を、改変するか、置きかえるか、または交換した抗体分子、あるいは（ｂ）可変領域またはその一部を、抗原特異性が異なるか、または抗原特異性を改変された可変領域により改変するか、置きかえるか、またはこれと交換した抗体分子を指す。例えば、マウス抗体は、その定常領域を、ヒト免疫グロブリンに由来する定常領域で置きかえることにより修飾することができる。ヒト定常領域による置きかえに起因して、キメラ抗体は、ヒトにおける抗原性を、元のマウス抗体と比較して低減しながら、抗原の認識におけるその特異性を保持しうる。
【００６１】
「保存的に修飾された変異体」という用語は、アミノ酸配列および核酸配列のいずれにも適用される。特定の核酸配列に関して、保存的に修飾された変異体とは、同一なアミノ酸配列もしくは本質的に同一なアミノ酸配列をコードする核酸、または核酸がアミノ酸配列をコードしない場合は、本質的に同一な配列を指す。遺伝子コードの縮重性のために、多数の機能的に同一な核酸が、所与の任意のタンパク質をコードする。例えば、コドンであるＧＣＡ、ＧＣＣ、ＧＣＧ、およびＧＣＵのいずれも、アミノ酸であるアラニンをコードする。したがって、アラニンがコドンにより指定されるあらゆる位置で、コードされるポリペプチドを改変せずに、コドンを、記載された対応するコドンのいずれかに改変することができる。このような核酸変異は、保存的に修飾された変異の１種である「サイレント変異」である。ポリペプチドをコードする、本明細書のあらゆる核酸配列はまた、核酸のあらゆる可能なサイレント変異についても記載する。当業者は、核酸内の各コドン（通常メチオニンだけのコドンであるＡＵＧ、および通常トリプトファンだけのコドンであるＴＧＧを除く）を修飾して、機能的に同一な分子をもたらしうることを認識するであろう。したがって、記載される各配列内では、ポリペプチドをコードする核酸の各サイレント変異が含意されている。
【００６２】
ポリペプチド配列では、「保存的に修飾された変異体」は、アミノ酸の、化学的に類似するアミノ酸による置換を結果としてもたらす、ポリペプチド配列への個別の置換、欠失、または付加を含む。当技術分野では、機能的に類似するアミノ酸を提示する保存的置換表が周知である。このような保存的に修飾された変異体は、本開示の多型変異体、種間相同体、および対立遺伝子に追加されるものであり、これらを除外するものではない。以下の８つの群：１）アラニン（Ａ）、グリシン（Ｇ）、２）アスパラギン酸（Ｄ）、グルタミン酸（Ｅ）、３）アスパラギン（Ｎ）、グルタミン（Ｑ）、４）アルギニン（Ｒ）、リシン（Ｋ）、５）イソロイシン（Ｉ）、ロイシン（Ｌ）、メチオニン（Ｍ）、バリン（Ｖ）、６）フェニルアラニン（Ｆ）、チロシン（Ｙ）、トリプトファン（Ｗ）、７）セリン（Ｓ）、トレオニン（Ｔ）、および８）システイン（Ｃ）、メチオニン（Ｍ）は、互いに対して保存的置換であるアミノ酸を含有する（例えば、Creighton、Proteins（1984）を参照されたい）。いくつかの実施形態では、「保存的配列修飾」という用語は、アミノ酸配列を含有する抗体の結合特徴にそれほど大きな影響を及ぼしたりこれを改変したりしないアミノ酸修飾を指すのに使用する。
【００６３】
「エピトープ」という用語は、抗体への特異的な結合が可能なタンパク質決定基を意味する。エピトープは通例、アミノ酸または糖側鎖など、化学的に活性な表面分子群からなり、通例、特異的な三次元構造特徴のほか、特異的な電荷特徴も有する。コンフォメーショナルエピトープと非コンフォメーショナルエピトープとは、前者への結合は、変性溶媒の存在下で失われるが、後者への結合は失われないという点で区別される。競合結合アッセイにおいて、当業者に周知の方法のいずれかにより、一方の抗体が、第２の抗体と同じエピトープに結合することが示される場合、２つの抗体は、「競合する」という。
【００６４】
本明細書で使用される「ヒト抗体」という用語は、フレームワーク領域およびＣＤＲ領域のいずれもが、ヒト由来の配列に由来する可変領域を有する抗体を含むことを意図する。さらに、抗体が定常領域を含有する場合、定常領域もまた、このようなヒト配列、例えば、ヒト生殖細胞系列配列またはヒト生殖細胞系列配列の突然変異させたバージョンに由来する。本開示のヒト抗体は、ヒト配列によりコードされないアミノ酸残基（例えば、ｉｎ  ｖｉｔｒｏにおけるランダム突然変異誘発もしくは部位特異的突然変異誘発により導入された突然変異、またはｉｎ  ｖｉｖｏにおける体細胞突然変異により導入された突然変異）を含みうる。
【００６５】
「ヒトモノクローナル抗体」という用語は、単一の結合特異性を提示する抗体であって、フレームワーク領域およびＣＤＲ領域のいずれもが、ヒト配列に由来する可変領域を有する抗体を指す。一実施形態では、ヒトモノクローナル抗体は、ヒト免疫グロブリン遺伝子のライブラリーをスクリーニングするためのファージディスプレイ法を使用して調製する。
【００６６】
「ヒト化」抗体とは、ヒトにおける免疫原性は小さいが、非ヒト抗体の反応性を保持する抗体である。これは、例えば、非ヒトＣＤＲ領域を保持し、抗体の残りの部分を、それらのヒト対応物（すなわち、可変領域の定常領域ならびにフレームワーク部分）で置きかえることにより達成することができる。例えば、Morrisonら、Proc. Natl. Acad. Sci. USA、81:6851〜6855、1984; MorrisonおよびOi、Adv. Immunol.、44:65〜92、1988; Verhoeyenら、Science、239:1534〜1536、1988; Padlan、Molec. Immun.、28:489〜498、1991、およびPadlan、Molec. Immun.、31:169〜217、1994を参照されたい。ヒト操作技術の他の例は、ＵＳ５，７６６，８８６において開示されているＸｏｍａ技術を含むがこれらに限定されない。
【００６７】
２つ以上の核酸配列またはポリペプチド配列の文脈における「同一な」または「同一性」パーセントという用語は、２つ以上の配列または部分配列が同じであることを指す。以下の配列比較アルゴリズムの１つを使用して、または手作業のアライメントおよび目視により測定される比較域または指定領域にわたり、最大の対応性について比較され、配列決定された場合の、２つの配列の、指定された百分率のアミノ酸残基またはヌクレオチドが同じであれば（すなわち、指定される領域にわたる、または、指定されない場合は、配列全体にわたる、６０％の同一性、任意選択で、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、または９９％の同一性を有すれば）、２つの配列は「実質的に同一」である。任意選択で、同一性は、少なくとも約５０ヌクレオチド（または１０アミノ酸）の長さの領域にわたり、またはより好ましくは、１００〜５００、または１０００ヌクレオチド以上（または２０、５０、または２００アミノ酸以上）の長さの領域にわたり存在する。
【００６８】
配列比較では、１つの配列が、それに照らして被験配列を比較する基準配列として働くことが典型的である。配列比較アルゴリズムを使用する場合、被験配列および基準配列をコンピュータに入力し、必要な場合は、部分配列座標を指定し、配列アルゴリズムプログラムパラメータを指定する。デフォルトのプログラムパラメータを使用することもでき、代替的なパラメータを指定することもできる。次いで、配列比較アルゴリズムにより、プログラムパラメータに基づき、被験配列について、基準配列と比べた配列同一性パーセントを計算する。
【００６９】
本明細書で使用される「比較域」は、２つの配列を最適に配列決定した後で、配列を、同じ数の連続的な位置による基準配列と比較しうる、２０〜６００、通例約５０〜約２００、より通例では、約１００〜約１５０からなる群から選択される連続的な位置の数のいずれか１つによるセグメントに対する言及を含む。当技術分野では、比較のための配列アライメント法が周知である。比較のための最適な配列アライメントは、例えば、SmithおよびWaterman （1970） Adv. Appl. Math. 2:482cによる局所相同性アルゴリズムにより行うこともでき、NeedlemanおよびWunsch、J. Mol. Biol. 48:443、1970による相同性アライメントアルゴリズムにより行うこともでき、PearsonおよびLipman、Proc. Nat'l. Acad. Sci. USA 85:2444、1988による類似性検索法により行うこともでき、これらアルゴリズムのコンピュータ化された実装（Ｗｉｓｃｏｎｓｉｎ  Ｇｅｎｅｔｉｃｓ  Ｓｏｆｔｗａｒｅ  Ｐａｃｋａｇｅ、Ｇｅｎｅｔｉｃｓ  Ｃｏｍｐｕｔｅｒ  Ｇｒｏｕｐ、５７５  Ｓｃｉｅｎｃｅ  Ｄｒ．、Ｍａｄｉｓｏｎ、ＷＩにおけるＧＡＰ、ＢＥＳＴＦＩＴ、ＦＡＳＴＡ、およびＴＦＡＳＴＡ）により行うこともでき、手作業のアライメントおよび目視（例えば、Brentら、Current Protocols in Molecular Biology、John Wiley & Sons, Inc.（Ringbou編、2003）を参照されたい）により行うこともできる。
【００７０】
配列同一性パーセントおよび配列類似性パーセントを決定するのに適したアルゴリズムの２つの例は、それぞれ、Altschulら、（1977）Nuc. Acids Res. 25:3389〜3402、およびAltschulら、（1990） J. Mol. Biol. 215:403〜410において記載されている、ＢＬＡＳＴアルゴリズムおよびＢＬＡＳＴ  ２．０アルゴリズムである。ＢＬＡＳＴ解析を実施するためのソフトウェアは、Ｎａｔｉｏｎａｌ  Ｃｅｎｔｅｒ  ｆｏｒ  Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ  Ｉｎｆｏｒｍａｔｉｏｎにより公表されている。このアルゴリズムは、データベース配列内の同じ長さのワードで配列決定したときに、ある正の値の閾値スコアＴにマッチするかまたはこれを満たす、クエリー配列内の短いワード長Ｗを同定することにより、高スコア配列対（ＨＳＰ）をまず同定することを伴う。Ｔを、隣接ワードスコア閾値（Altschulら、前出）と称する。これらの初期の隣接ワードヒットが、これらを含有するより長いＨＳＰを見出す検索を開始するためのシードとして働く。累積アライメントスコアが増大しうる限りにおいて、ワードヒットを、各配列に沿っていずれの方向にも拡張する。累積スコアは、ヌクレオチド配列では、パラメータＭ（マッチする残基の対についてのリウォードスコア、常に＞０）およびＮ（ミスマッチ残基についてのペナルティースコア、常に＜０）を使用して計算する。アミノ酸配列では、スコアリングマトリックスを使用して、累積スコアを計算する。累積アライメントスコアが、達成されたその最大値から量Ｘだけ低下した場合、１つまたは複数の負スコア残基のアライメントの累積のために、累積スコアが、ゼロ以下に低下した場合、または配列のいずれかの末端に達した場合は、各方向へのワードヒットの拡張を停止させる。ＢＬＡＳＴアルゴリズムパラメータであるＷ、Ｔ、およびＸにより、アライメントの感度および速度が決定される。ＢＬＡＳＴＮプログラム（ヌクレオチド配列の場合）では、１１のワード長（Ｗ）、１０の期待値（Ｅ）、Ｍ＝５、Ｎ＝−４をデフォルトとして使用し、両方の鎖の比較を行う。アミノ酸配列のためのＢＬＡＳＴＰプログラムでは、３のワード長、および１０の期待値（Ｅ）、および５０のＢＬＯＳＵＭ６２スコアリングマトリックス（HenikoffおよびHenikoff、Proc. Natl. Acad. Sci. USA 89:10915、1989を参照されたい）アライメント（Ｂ）、１０の期待値（Ｅ）、Ｍ＝５、Ｎ＝−４をデフォルトとして使用し、両方の鎖の比較を行う。
【００７１】
ＢＬＡＳＴアルゴリズムはまた、２つの配列の間の類似性についての統計学的解析（例えば、KarlinおよびAltschul、Proc. Natl. Acad. Sci. USA 90:5873〜5787、1993を参照されたい）も実施する。ＢＬＡＳＴアルゴリズムにより提供される類似性の１つの尺度は、２つのヌクレオチド配列間またはアミノ酸配列間のマッチングが偶然に生じる確率の指標をもたらす最小合計確率（Ｐ（Ｎ））である。例えば、被験核酸を基準核酸に照らして比較したときの最小合計確率が約０．２未満であり、より好ましくは、約０．０１未満であり、最も好ましくは、約０．００１未満であれば、核酸は基準配列と類似すると考えられる。
【００７２】
２つのアミノ酸配列の間の同一性パーセントはまた、ＰＡＭ１２０重み付け残基表、１２のギャップ長ペナルティー、および４のギャップペナルティーを使用するＡＬＩＧＮプログラム（バージョン２．０）に組み込まれた、E. MeyersおよびW. Miller（Comput. Appl. Biosci.、4:11〜17、1988）によるアルゴリズムを使用しても決定することができる。加えて、２つのアミノ酸配列の間の同一性パーセントは、Ｂｌｏｓｓｏｍ  ６２マトリックスまたはＰＡＭ２５０マトリックス、および１６、１４、１２、１０、８、６、または４のギャップ重み付け、および１、２、３、４、５、または６の長さ重み付けを使用する、ＧＣＧソフトウェアパッケージ（インターネット上のgcg.comで入手可能である）内のＧＡＰプログラムに組み込まれた、NeedlemanおよびWunsch（J. Mol, Biol. 48:444〜453、1970）によるアルゴリズムを使用しても決定することができる。
【００７３】
上記で言及した配列同一性百分率以外の、２つの核酸配列またはポリペプチドが実質的に同一であることの別の指標は、下記で記載される通り、第１の核酸によりコードされるポリペプチドが、第２の核酸によりコードされるポリペプチドに対する抗体と免疫学的に交差反応性であることである。したがって、例えば、２つのペプチドが保存的置換だけによって異なる場合、ポリペプチドは、第２のポリペプチドと実質的に同一なことが典型的である。２つの核酸配列が実質的に同一であることの別の指標は、下記で記載される通り、２つの分子またはそれらの相補体が、厳密な条件下で、互いとハイブリダイズすることである。２つの核酸配列が実質的に同一であることのさらに別の指標は、同じプライマーを使用して配列を増幅しうることである。
【００７４】
「単離抗体」という用語は、異なる抗原特異性を有する他の抗体を実質的に含まない抗体を指す（例えば、ＦＸＩおよび／もしくはＦＸＩａに特異的に結合する単離抗体は、ＦＸＩおよび／もしくはＦＸＩａ以外の抗原に特異的に結合する抗体を実質的に含まない）。しかし、ＦＸＩおよび／もしくはＦＸＩａに特異的に結合する単離抗体は、他の抗原に対する交差反応性を有しうる。さらに、単離抗体は、他の細胞内物質および／または化学物質を実質的に含まない場合もある。
【００７５】
「アイソタイプ」という用語は、重鎖定常領域遺伝子によりもたらされる抗体クラス（例えば、ＩｇＭ、ＩｇＥ、ＩｇＧ１またはＩｇＧ４などのＩｇＧ）を指す。アイソタイプはまた、これらのクラスの１つの修飾バージョンも含み、その修飾は、Ｆｃ機能を改変する、例えば、エフェクター機能またはＦｃ受容体への結合を増強または低減するように施されている。
【００７６】
本明細書で使用される「ｋａｓｓｏｃ」または「ｋａ」という用語が、特定の抗体−抗原間相互作用の会合速度を指すことを意図するのに対し、本明細書で使用される「ｋｄｉｓ」または「ｋｄ」という用語は、特定の抗体−抗原間相互作用の解離速度を指すことを意図する。本明細書で使用される「ＫＤ」という用語は、ｋｄのｋａに対する比（すなわち、ｋｄ／ｋａ）から得られる解離定数を指すことを意図し、モル濃度（Ｍ）として表す。抗体のＫＤ値は、当技術分野で十分に確立された方法を使用して決定することができる。抗体のＫＤを決定するための方法は、Ｂｉａｃｏｒｅ（商標）システムなどのバイオセンサーシステムを使用して表面プラズモン共鳴を測定するか、または溶液平衡滴定（ＳＥＴ）により溶液中のアフィニティーを測定するステップを含む。
【００７７】
本明細書で使用される「モノクローナル抗体」または「モノクローナル抗体組成物」という用語は、単一の分子組成による抗体分子の調製物を指す。モノクローナル抗体組成物は、特定のエピトープに対する単一の結合特異性およびアフィニティーを提示する。
【００７８】
本明細書では、「核酸」という用語が、「ポリヌクレオチド」という用語と互換的に使用され、デオキシリボヌクレオチドまたはリボヌクレオチドおよびそれらの一本鎖形態または二本鎖形態におけるポリマーを指す。「核酸」という用語は、公知のヌクレオチド類似体または修飾骨格残基もしくは修飾連結を含有する核酸であって、合成の核酸、自然発生の核酸、および非自然発生の核酸であり、基準核酸と同様の結合特性を有し、基準ヌクレオチドと同様の形で代謝される核酸を包含する。このような類似体の例は、限定なしに述べると、ホスホロチオエート、ホスホルアミデート、メチルホスホネート、キラルメチルホスホネート、２−Ｏ−メチルリボヌクレオチド、ペプチド核酸（ＰＮＡ）を含む。
【００７９】
別段に指し示されない限りにおいて、特定の核酸配列はまた、保存的に修飾されたその変異体（例えば、縮重コドン置換）および相補的配列も暗示的に包含するほか、明示的に指し示される配列も包含する。とりわけ、下記で詳述される通り、縮重コドン置換は、１つまたは複数の選択された（または全ての）コドンの第３の位置が、混合塩基および／またはデオキシイノシン残基で置換された配列を作り出すことにより達成することができる（Batzerら、Nucleic Acid Res. 19:5081、1991; Ohtsukaら、J. Biol. Chem. 260:2605〜2608、1985、およびRossoliniら、Mol. Cell. Probes 8:91〜98、1994）。
【００８０】
「作動可能に連結された」という用語は、２つ以上のポリヌクレオチド（例えば、ＤＮＡ）セグメントの間の機能的関係を指す。「作動可能に連結された」という用語は、転写調節配列の、転写される配列に対する機能的関係を指すことが典型的である。例えば、プロモーター配列またはエンハンサー配列は、それが、適切な宿主細胞内または他の発現系内のコード配列の転写を刺激またはモジュレートするとき、コード配列に作動可能に連結されている。一般に、転写される配列に作動可能に連結されたプロモーター転写調節配列は、転写される配列と物理的に隣接する、すなわち、シス作用型である。しかし、エンハンサーなど、一部の転写調節配列は、その転写をそれらが増強するコード配列に物理的に隣接する必要も、近接して配置される必要もない。
【００８１】
本明細書で使用される「最適化された」という用語は、ヌクレオチド配列を、産生細胞または産生生物、一般に、真核細胞、例えば、ピキア（Pichia）属細胞、チャイニーズハムスター卵巣細胞（ＣＨＯ）、またはヒト細胞において好ましいコドンを使用してアミノ酸配列をコードするように改変していることを意味する。最適化されたヌクレオチド配列は、「親」配列としてもまた公知の出発ヌクレオチド配列により本来コードされるアミノ酸配列を、完全に、または可能な限り多く保持するように操作する。本明細書の最適化された配列は、哺乳動物細胞において好ましいコドンを有するように操作されている。しかし、本明細書ではまた、他の真核細胞または原核細胞におけるこれらの配列の最適化された発現も企図される。最適化されたヌクレオチド配列によりコードされるアミノ酸配列もまた、最適化されていると称する。
【００８２】
本明細書では、「ポリペプチド」および「タンパク質」という用語が、アミノ酸残基のポリマーを指すように互換的に使用される。「ポリペプチド」および「タンパク質」という用語は、１つまたは複数のアミノ酸残基が、対応する自然発生のアミノ酸の人工の化学的模倣体であるアミノ酸ポリマーのほか、自然発生のアミノ酸ポリマーおよび非自然発生のアミノ酸ポリマーにも適用される。別段に指し示されない限りにおいて、特定のポリペプチド配列はまた、保存的に修飾されたその変異体も暗示的に包含する。
【００８３】
本明細書で使用される「組換えヒト抗体」という用語は、ヒト免疫グロブリン遺伝子についてトランスジェニックまたはトランスクロモソーマルである動物（例えば、マウス）またはこれにより調製されるハイブリドーマから単離される抗体、ヒト抗体を発現させるように形質転換された宿主細胞、例えば、トランスフェクトーマから単離される抗体、組換えのコンビナトリアルヒト抗体ライブラリーから単離される抗体、およびヒト免疫グロブリン遺伝子配列の全部または一部の、他のＤＮＡ配列へのスプライシングを伴う、他の任意の手段により調製されるか、発現させるか、創出されるか、または単離される抗体など、組換え手段により調製されるか、発現させるか、創出されるか、または単離される、全てのヒト抗体を含む。このような組換えヒト抗体は、フレームワーク領域およびＣＤＲ領域が、ヒト生殖細胞系列の免疫グロブリン配列に由来する可変領域を有する。しかし、ある種の実施形態では、このような組換えヒト抗体は、ｉｎ  ｖｉｔｒｏの突然変異誘発（または、ヒトＩｇ配列についてトランスジェニックである動物を使用する場合は、ｉｎ  ｖｉｖｏの体細胞突然変異誘発）にかけることができ、したがって、組換え抗体のＶＨ領域およびＶＬ領域のアミノ酸配列は、ヒト生殖細胞系列のＶＨ配列およびＶＬ配列に由来し、これらに関連するが、ｉｎ  ｖｉｖｏのヒト抗体の生殖細胞系列レパートリー内で天然には存在しない可能性がある配列である。
【００８４】
「組換え宿主細胞」（または、簡単に、「宿主細胞」）という用語は、組換え発現ベクターを導入した細胞を指す。このような用語は、特定の対象細胞だけを指すことを意図するものではなく、このような細胞の子孫細胞も指すことを意図するものであることを理解されたい。後続する世代では、突然変異または環境的影響に起因して、ある種の修飾が生じうるため、このような子孫細胞は、実のところ、親細胞と同一ではない可能性もあるが、やはり本明細書で使用される「宿主細胞」という用語の範囲内に含まれる。
【００８５】
「対象」という用語は、ヒトおよび非ヒト動物を含む。非ヒト動物は、非ヒト霊長動物（例えば、カニクイザル）、ヒツジ、ウサギ、イヌ、ウシ、ニワトリ、両生類、および爬虫類など、全ての脊椎動物（例えば、哺乳動物および非哺乳動物）を含む。特記される場合を除き、本明細書では、「患者」または「対象」という用語が互換的に使用される。本明細書で使用される「カニクイザル（cyno）」または「カニクイザル（cynomolgus）」という用語は、カニクイザル（cynomolgus monkey）（カニクイザル（Macaca fascicularis））を指す。
【００８６】
一実施形態では、本明細書で使用される、任意の疾患または障害（例えば、血栓塞栓性障害）「〜を処置すること」またはこれらの「処置」という用語は、疾患または障害を改善すること（すなわち、疾患またはその臨床症状の少なくとも１つの発症を緩徐化するか、停止させるか、または軽減すること）を指す。別の実施形態では、「〜を処置すること」または「処置」とは、患者により識別可能でない可能性があるパラメータを含む少なくとも１つの物理的パラメータを緩和または改善することを指す。さらに別の実施形態では、「〜を処置すること」または「処置」とは、疾患または障害を、物理的にモジュレートする（例えば、識別可能な症状の安定化）か、生理学的にモジュレートする（例えば、物理的パラメータの安定化）か、または物理的かつ生理学的にモジュレートすることを指す。さらに別の実施形態では、「〜を処置すること」または「処置」とは、疾患または障害の発生または発症または進行を防止するかまたは遅延させることを指す。
【００８７】
例えば、血栓塞栓性障害を含む、本明細書で記載される適応に関する場合の「防止」とは、例えば、下記で記載される、血栓塞栓性疾患パラメータの悪化を、血栓塞栓性障害に罹患するリスクを有するか、または前記悪化のリスクを有する患者において、防止または緩徐化する、任意の作用を意味する。
【００８８】
「ベクター」という用語は、それが連結された別のポリヌクレオチドを輸送することが可能なポリヌクレオチド分子を指すことを意図する。ベクターの１つの種類は、さらなるＤＮＡセグメントをライゲーションしうる、環状の二本鎖ＤＮＡループを指す「プラスミド」である。ベクターの別の種類は、さらなるＤＮＡセグメントを、ウイルスゲノムにライゲーションしうる、アデノ随伴ウイルスベクター（ＡＡＶまたはＡＡＶ２）などのウイルスベクターである。ある種のベクター（例えば、細菌の複製起点を有する細菌ベクターおよび哺乳動物のエピソームベクター）は、それらが導入された宿主細胞における自己複製が可能である。他のベクター（例えば、非哺乳動物のエピソームベクター）は、宿主細胞に導入すると、宿主細胞のゲノムに組み込むことができ、これにより、宿主ゲノムと共に複製する。さらに、ある種のベクターは、それらが作動的に連結された遺伝子の発現を方向付けることが可能である。本明細書では、このようなベクターを、「組換え発現ベクター」（または簡単に、「発現ベクター」）と称する。一般に、組換えＤＮＡ法において有用な発現ベクターは、プラスミドの形態にあることが多い。プラスミドはベクターの最も一般的に使用される形態であるので、本明細書では、「プラスミド」と「ベクター」とを互換的に使用することができる。しかし、本開示は、同等な機能をもたらすウイルスベクター（例えば、複製欠損レトロウイルス、アデノウイルス、およびアデノ随伴ウイルス）など、発現ベクターの他の形態も含むことを意図する。
【図面の簡単な説明】
【００８９】
【図１Ａ】ＦＸＩａ抗体ＮＯＶ１０９０、ならびにＮＯＶ１０９０に由来する３つのアフィニティー成熟抗体ＡＭ１、ＡＭ２、およびＡＭ３についてのＥＬＩＳＡ結合曲線を示す図である。図１Ａは、ヒト血漿由来のＦＸＩおよびＦＸＩａに結合する抗体についてのＥＬＩＳＡ曲線を示す。
【図１Ｂ】ＦＸＩａ抗体ＮＯＶ１０９０、ならびにＮＯＶ１０９０に由来する３つのアフィニティー成熟抗体ＡＭ１、ＡＭ２、およびＡＭ３についてのＥＬＩＳＡ結合曲線を示す図である。図１Ｂは、カニクイザルＦＸＩおよびウサギＦＸＩに結合する抗体についてのＥＬＩＳＡ曲線を示す。
【図１Ｃ】ＦＸＩａ抗体ＮＯＶ１０９０、ならびにＮＯＶ１０９０に由来する３つのアフィニティー成熟抗体ＡＭ１、ＡＭ２、およびＡＭ３についてのＥＬＩＳＡ結合曲線を示す図である。図１Ｃは、ヒトプレカリクレインおよびヒトカリクレインに結合する抗体についてのＥＬＩＳＡ曲線を示す。
【図２】ＦＸＩａ抗体についての、ａＰＴＴ化合物による応答曲線を示す図である。プールされたヒト血漿を使用するａＰＴＴアッセイにおいて、凝固時間を延長する、３つのアフィニティー成熟抗体（ＡＭ１、ＡＭ２、ＡＭ３）についての、代表的な応答曲線を示す。アッセイは、実施例５で記載される通り、異なる濃度の抗体の存在下で、内因系凝血カスケードを開始させた後における、凝固時間を測定する。黒線は、ロジスティック非線形当てはめモデルを使用する当てはめ（fit）を表す。点線は、凝血時間が、ベースラインと比較して倍増するとき、すなわち、２×ａＰＴＴ値のときの抗体濃度であって、ＡＭ１、ＡＭ２、およびＡＭ３について、それぞれ、１４ｎＭ、１３ｎＭ、および１１ｎＭである抗体濃度を指し示す。
【図３】ＦＸＩａ抗体についての、ＴＧＡ化合物による応答曲線を示す図である。プールされたヒト血漿を用いるＴＧＡにおいてトロンビン生成を阻害する３つのアフィニティー成熟抗体（ＡＭ１、ＡＭ２、ＡＭ３）についての、代表的な応答曲線を示す。アッセイは、実施例５で記載される通り、異なる濃度のＮＯＶ１４０１の、いわゆるトロンビン→ＦＸＩａフィードフォワードループを介する、非常に低濃度の組織因子（ＴＦ）により誘発されうるトロンビン生成に対する効果を測定する。黒線は、４パラメータ用量応答曲線モデルを使用する当てはめを表す。ＡＭ１、ＡＭ２、およびＡＭ３について、それぞれ、６ｎＭ、７ｎＭ、および９ｎＭのＩＣ５０値を、これらの化合物応答曲線について計算した。
【図４】実施例において記載される、ＮＯＶ１０９０の生殖細胞系列形であるＮＯＶ１４０１、およびＮＯＶ１０９０に由来するアフィニティー成熟抗体ＡＭ４についてのＳＥＴ実験による、代表的な結合曲線を示す図である。ＫＤ値は、実験データを、実施例において記載される、１：１結合モデルに当てはめることから決定した。
【発明を実施するための形態】
【００９０】
本開示は、ＦＸＩおよび／またはＦＸＩａに特異的に結合し、その生物学的活性を阻害する抗体分子の発見に部分的に基づき、特に、チモーゲンであるＦＸＩおよびＦＸＩａに特異的に結合し、その生物学的活性を阻害する抗体分子の発見に部分的に基づく。本開示は、全長ＩｇＧフォーマット抗体、ならびにＦａｂ断片（例えば、抗体ＡＭ１、ＡＭ２、ＡＭ３、およびＡＭ４）など、それらの抗原結合性断片の両方に関する。
【００９１】
したがって、本開示は、ＦＸＩおよび／またはＦＸＩａ（例えば、ヒト、ウサギ、およびカニクイザルのＦＸＩおよび／またはＦＸＩａ）に特異的に結合する抗体、医薬組成物、このような抗体および組成物の作製法および使用法を提供する。
【００９２】
第ＸＩ因子
ＦＸＩは、内因系凝固経路および外因系凝固経路の両方において、ならびに血漿による止血の開始期および増幅期の橋渡しにおいて重要な役割を果たす。第ＸＩＩａ因子およびトロンビンのいずれも、ＦＸＩを活性化させる結果として、持続的なトロンビンの生成および線溶の阻害をもたらしうる。ＦＸＩは、「血管損傷後」に、高組織因子環境下にある、正常な止血で果たす役割は小さいが、血栓症では、鍵となる役割を果たすと考えられる。重度の第ＸＩ因子欠損症は、虚血性脳卒中および静脈の血栓塞栓性事象の発症率の低下と関連する（Salomon et al 2008; Salomon, et al. (2011) Thromb Haemost.; 105:269-73）。重度の第ＸＩ因子欠損症を伴う対象における出血症状は、低頻度であり、軽度で、損傷誘導性であることが多く、口腔粘膜、鼻腔粘膜、および尿路など、線溶活性が増大した組織に影響することが好ましい（Salomon et al 2011）。致命的な臓器における出血は、極めてまれであるか、または認められていない。
【００９３】
血漿凝固とは、血中の凝固因子が相互作用し、活性化する、逐次的な過程であり、最終的には、フィブリンの生成および凝血の形成を結果としてもたらす。凝固の古典的カスケードモデルでは、フィブリン生成の過程は、２つの顕著に異なる経路、すなわち、内因系経路および外因系経路のそれぞれにより開始されうる（Mackman, 2008）。
【００９４】
外因系経路では、血管損傷は、血管外組織因子（ＴＦ）を、第ＶＩＩ因子（ＦＶＩＩ）と相互作用させ、これを活性化させ、これにより、第Ｘ因子およびプロトロンビンの活性化を逐次的にもたらす。活性トロンビンは最終的に、可溶性フィブリノゲンを、フィブリンに転換する。外因系経路は、止血に中心的であり、この経路内の凝固因子に対する干渉は、出血リスクを結果としてもたらす。
【００９５】
内因系経路では、第ＸＩＩ因子は場合によって、接触活性化と称する過程により活性化しうる。活性型第ＸＩＩａ因子の生成は、第ＸＩ因子および第ＩＸ因子の逐次的な活性化をもたらす。第ＩＸａ因子は、第Ｘ因子を活性化させるので、外因系経路と、内因系経路とは、この段階で合流する（共通経路）。トロンビン活性は、トロンビンが、第ＸＩ因子を、第ＸＩＩ因子に依存せずに活性化させる、フィードフォワードループを介して、それ自体の生成を増幅することによりブーストされる。このフィードフォワードループは、持続的な血栓成長には寄与するが、凝血の形成には、血管外組織因子による強力な活性化で十分であるので、止血への関与は、最小限に限られる。したがって、内因系経路は、止血には実質的に関与しない（Gailani and Renne (2007) Arterioscler Thromb Vasc Biol. 2007, 27(12):2507-13, Mueller, Gailiani, and Renne 2011）。
【００９６】
様々な手法を使用して、様々な種にわたるＦＸＩまたはＦＸＩａを阻害する前臨床研究が、この標的の検証に寄与している。ＦＸＩ−／−マウスは、実験による静脈血栓症（Wang, et al. (2006) J Thromb Haemost; 4:1982-8）および動脈血栓症（Wang, et al. (2005) J Thromb Haemost; 3:695-702）に対して抵抗性である。ＦＸＩＩａによるＦＸＩの活性化を遮断する抗体（Ａｂ、１４Ｅ１１）によるマウスの処置は、実験による血栓症の阻害を結果としてもたらし（Cheng, et al. (2010) Blood, 116:3981-9）、虚血性脳卒中のマウスモデルにおける脳梗塞サイズを低減した（Leung, et al. (2012) Transl Stroke Res 2012; 3:381-9）。ＦＸＩａによるＦＩＸの結合および活性化を遮断する抗ＦＸＩ  Ａｂを投与されたヒヒでは、コラーゲンでコーティングされた血管グラフト上において、血小板に富む血栓の増殖の低減が観察され（Tucker, et al. (2009) Blood 2009; 113:936-44）、同様の結果は、このモデルにおいて、１４Ｅ１１によっても見出された（Cheng 2010）。これらの研究のいずれにおいても、過剰な出血は認められなかった。
【００９７】
マウス（Zhang, et al. (2010) Blood 2010; 116:4684-92）、カニクイザル（Younis, et al. (2012) Blood 2012; 119:2401-8）、およびヒヒ（Crosby, et al. (2013) Arterioscler Thromb Vasc Biol 2013; 33:1670-8）において、アンチセンスオリゴヌクレオチドにより、ＦＸＩの合成を遮断することは、過剰な出血を伴わずに、抗血栓効果および抗凝固効果を結果としてもたらした。さらに、ラット（Schumacher, et al. (2007) Eur J Pharmacol 2007; 570:167-74）およびウサギ（Wong, et al. (2011) J Thromb Thrombolysis 2011; 32:129-37）の静脈血栓症モデルおよび動脈血栓症モデルにおいて、低分子量インヒビターでＦＸＩａを遮断することによっても、同様な効果がもたらされている。
【００９８】
重度のＦＸＩ欠損症を伴う患者は、自発的に出血することがまれであり、線溶活性が高度な組織内を除き、軽度の外傷誘導性出血を示すにとどまる。重度のＦＸＩ欠損症の希少性は、これらの患者について、一般集団と比べた血栓プロファイルを明らかにする集団研究の使用を必然化する。とりわけ、このような研究は、これらの患者では、虚血性脳卒中（Salomon 2008）および深部静脈血栓症（ＤＶＴ）（Salomon, et al. (2011) Blood 2008; 111: 4113-17）の発症率が低減されることを報告している。こうして、重度のＦＸＩ欠損症を伴う１１５例の患者において観察される虚血性脳卒中の数（Ｎ＝１）は、イスラエルの一般集団において予測される発症数（Ｎ＝８．６）より少なく（ｐ＜０．００３）、重度のＦＸＩ欠損症を伴う患者におけるＤＶＴの発症数（Ｎ＝０）は、対照集団において予測される発症数（Ｎ＝４．７）より少なかった（ｐ＜０．０１９）。逆に、ＦＸＩレベルが第９０百分位数を上回る個体は、ＤＶＴを発症するリスクが２倍であった（Meijers, et al. (2000) N Engl J Med. 2000; 342:696-701）。
【００９９】
近年、ＤＶＴの素因となる手順である、人工膝関節置換術を受ける患者を、ＦＸＩアンチセンス療法または標準治療（エノキサパリン）で処置した。アンチセンス群（３００ｍｇ）は、標準治療と比較した、静脈血栓症の発症率の７分の１の低下と、出血事象の減少（有意ではない）とを示した（Bueller et al, (2014) N Engl J Med. 372(3):232-40. doi: 10.1056/NEJMoa1405760. Epub 2014 Dec 7）。
【０１００】
ＦＸＩ／ＦＸＩａ抗体および抗原結合性断片
本開示は、ヒトＦＸＩおよび／またはＦＸＩａに特異的に結合する抗体（例えば、ヒトモノクローナル抗体などのモノクローナル抗体）を提示する。一部の実施形態では、本開示は、ヒト、ウサギ、およびカニクイザルのＦＸＩおよび／またはＦＸＩａに特異的に結合する抗体を提示する。本明細書で提示される抗体は、例えば、実施例において記載される通りに単離される、ヒトモノクローナル抗体およびＦａｂを含むがこれらに限定されない。
【０１０１】
一態様では、単離抗体またはそれらの抗原結合性断片は、活性のＦＸＩ（ＦＸＩａ）に結合するが、活性のＦＸＩ（ＦＸＩａ）触媒ドメインに結合すると、ＦＸＩａに、そのコンフォメーションを、不活性コンフォメーションに変化させる。別の態様では、前記単離抗体またはその抗原結合性断片は、前記不活性コンフォメーションのＮ末端の４つの残基、ループ１４５、１８８、および２２０が、活性コンフォメーションと比較して、シフトし、かつ／または不規則的になる変化をさらに誘導する。
【０１０２】
一態様では、単離抗体またはその抗原結合性断片は、ＦＸＩ（例えば、ヒトＦＸＩ）に結合するが、ＦＸＩに結合すると、ＦＸＩ触媒ドメインが、ループ１４５、１８８、および２２０がＦＸＩａ触媒ドメインの構造内と同様に規則的である活性コンフォメーションを取ることを防止する。
【０１０３】
一態様では、単離抗体またはそれらの抗原結合性断片は、ＦＸＩに結合するが、ＦＸＩに結合すると、ＦＸＩ触媒ドメインが、Ｎ末端の４つの残基、ループ１４５、１８８、および２２０がＦＸＩａ触媒ドメインの構造内と同様に規則的である活性コンフォメーションを取ることを防止する。
【０１０４】
一態様では、単離抗体またはそれらの抗原結合性断片は、ＦＸＩに結合するが、ＦＸＩに結合すると、チモーゲン構造内のコンフォメーション変化を誘導し、ＦＸＩａに結合するときに観察される阻害性ＦＸＩコンフォメーションと緊密に関連する阻害性ＦＸＩコンフォメーションをさらにもたらすことにより、ＦＸＩ触媒ドメインが、活性コンフォメーションを取ることを防止する。
【０１０５】
一態様では、単離抗体またはそれらの抗原結合性断片は、ＦＸＩおよび／またはＦＸＩａに結合するが、ＦＸＩおよび／またはＦＸＩａに結合し、ＦＸＩおよび／またはＦＸＩａの触媒ドメインと、抗体：抗原複合体を形成すると、ループ１４５、１８８、および２２０の、活性の第ＸＩ因子（ＦＸＩａ）の触媒ドメインの、複合体化していない構造と比較した場合の、シフトおよび／または配向性の喪失を引き起こす。
【０１０６】
一態様では、単離抗体またはそれらの抗原結合性断片は、ＦＸＩおよび／またはＦＸＩａに結合するが、ＦＸＩおよび／またはＦＸＩａに結合し、ＦＸＩおよび／またはＦＸＩａの触媒ドメインと抗体：抗原複合体を形成すると、Ｎ末端の４つの残基、ループ１４５、１８８、および２２０の、活性の第ＸＩ因子（ＦＸＩａ）の触媒ドメインの、複合体化していない構造と比較した場合の、シフトおよび／または配向性の喪失を引き起こす。
【０１０７】
一態様では、単離抗体またはそれらの抗原結合性断片は、活性のＦＸＩ（ＦＸＩａ）に結合し、ＦＸＩ（ＦＸＩａ）触媒ドメインに、そのコンフォメーションを、ループ１４５、１８８、および２２０が活性コンフォメーションと比較してシフトし、かつ／または配向性が喪失している不活性コンフォメーションに変化させる。
【０１０８】
一態様では、単離抗体またはそれらの抗原結合性断片は、ＦＸＩに結合し、チモーゲン構造内のコンフォメーション変化を誘導し、これにより、ＦＸＩａに結合するときに観察される阻害性ＦＸＩコンフォメーションと緊密に関連する阻害性ＦＸＩコンフォメーションをもたらすことにより、触媒ドメインが、活性コンフォメーションを取ることを防止する。
【０１０９】
具体的な態様では、本開示は、ＦＸＩタンパク質および／またはＦＸＩａタンパク質（例えば、ヒト、ウサギ、およびカニクイザルのＦＸＩおよび／またはＦＸＩａ）に特異的に結合する抗体であって、表２に記載されている配列から選択される配列を含む抗体を提示する。特定の態様では、本明細書で提示される抗体は、表２に記載されている配列から選択される配列を含むが、表１に記載されている配列（例えば、ＣＤＲまたは可変領域配列）を含有しない。
【０１１０】
本明細書の特定の態様では、ＦＸＩおよび／またはＦＸＩａの触媒ドメイン内に結合する単離抗ＦＸＩ抗体またはその抗原結合性断片であって、相補性決定領域ＨＣＤＲ１、ＨＣＤＲ２、およびＨＣＤＲ３を含む重鎖可変領域（ＶＨ）と、相補性決定領域ＬＣＤＲ１、ＬＣＤＲ２、およびＬＣＤＲ３を含む軽鎖可変領域（ＶＬ）とを含み、
ＨＣＤＲ１が、配列番号３、６、７、および９からなる群から選択されるアミノ酸配列を含み、
ＨＣＤＲ２が、
（ｉ）配列番号５９（Ｘ１−Ｉ−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｔ−Ｘ８−ＹＡＤＳＶＫＧ）［配列中、Ｘ１は、任意のアミノ酸であるか、またはＴもしくはＳであり、Ｘ２は、任意のアミノ酸であるか、またはＤもしくはＥであり、Ｘ３は、任意のアミノ酸であるか、またはＹもしくはＳであり、Ｘ４は、任意のアミノ酸であるか、またはＳ、Ｙ、もしくはＷであり、Ｘ５は、任意のアミノ酸であるか、またはＳ、Ｄ、もしくはＧであり、Ｘ６は、任意のアミノ酸であるか、またはＱ、Ｔ、もしくはＤであり、Ｘ７は、任意のアミノ酸であるか、またはＤもしくはＥであり、Ｘ８は、任意のアミノ酸であるか、またはＹ、Ｈ、もしくはＤである］であって、ＨＣＤＲ２が、配列番号４ではない、配列番号５９、
（ｉｉ）配列番号６０（Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６）［配列中、Ｘ１は、任意のアミノ酸であるか、またはＥもしくはＤであり、Ｘ２は、任意のアミノ酸であるか、またはＹもしくはＳであり、Ｘ３は、任意のアミノ酸であるか、またはＹ、Ｓ、もしくはＷであり、Ｘ４は、任意のアミノ酸であるか、またはＳ、Ｄ、もしくはＧであり、Ｘ５は、任意のアミノ酸であるか、またはＤ、Ｔ、もしくはＱであり、Ｘ６は、任意のアミノ酸であるか、またはＤもしくはＥである］であって、ＨＣＤＲ２が、配列番号８ではない、配列番号６０、および
（ｉｉｉ）配列番号６１（Ｉ−Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｔ）［配列中、Ｘ１は、任意のアミノ酸であるか、またはＥもしくはＤであり、Ｘ２は、任意のアミノ酸であるか、またはＹもしくはＳであり、Ｘ３は、任意のアミノ酸であるか、またはＳ、Ｙ、もしくはＷであり、Ｘ４は、任意のアミノ酸であるか、またはＳ、Ｄ、もしくはＧであり、Ｘ５は、任意のアミノ酸であるか、またはＤ、Ｔ、もしくはＱであり、Ｘ６は、任意のアミノ酸であるか、またはＤもしくはＥである］であって、ＨＣＤＲ２が、配列番号１０ではない、配列番号６１
からなる群から選択されるアミノ酸配列を含み、
ＨＣＤＲ３が、配列番号５および１１からなる群から選択されるアミノ酸配列を含み、
ＬＣＤＲ１が、配列番号１６、１９、および２２からなる群から選択されるアミノ酸配列を含み、
ＬＣＤＲ２が、配列番号１７および２０からなる群から選択されるアミノ酸配列を含み、
ＬＣＤＲ３が、配列番号１８および２１からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む、
単離抗ＦＸＩ抗体またはその抗原結合性断片が提示される。
【０１１１】
本明細書の特定の態様では、ＦＸＩおよび／またはＦＸＩａの触媒ドメイン内に結合する単離抗ＦＸＩ抗体またはその抗原結合性断片であって、相補性決定領域ＨＣＤＲ１、ＨＣＤＲ２、およびＨＣＤＲ３を含む重鎖可変領域（ＶＨ）と、相補性決定領域ＬＣＤＲ１、ＬＣＤＲ２、およびＬＣＤＲ３を含む軽鎖可変領域（ＶＬ）とを含み、
（ｉ）ＨＣＤＲ１が、配列番号３のアミノ酸配列を含み、
（ｉｉ）ＨＣＤＲ２が、配列番号５９（Ｘ１−Ｉ−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｔ−Ｘ８−ＹＡＤＳＶＫＧ）［配列中、Ｘ１は、任意のアミノ酸であるか、またはＴもしくはＳであり、Ｘ２は、任意のアミノ酸であるか、またはＤもしくはＥであり、Ｘ３は、任意のアミノ酸であるか、またはＹもしくはＳであり、Ｘ４は、任意のアミノ酸であるか、またはＳ、Ｙ、もしくはＷであり、Ｘ５は、任意のアミノ酸であるか、またはＳ、Ｄ、もしくはＧであり、Ｘ６は、任意のアミノ酸であるか、またはＱ、Ｔ、もしくはＤであり、Ｘ７は、任意のアミノ酸であるか、またはＤもしくはＥであり、Ｘ８は、任意のアミノ酸であるか、またはＹ、Ｈ、もしくはＤである］のアミノ酸配列を含み、ＨＣＤＲ２が、配列番号４ではなく、
（ｉｉｉ）ＨＣＤＲ３が、配列番号５のアミノ酸配列を含み、
（ｉｖ）ＬＣＤＲ１が、配列番号１６のアミノ酸配列を含み、
（ｖ）ＬＣＤＲ２が、配列番号１７のアミノ酸配列を含み、
（ｖｉ）ＬＣＤＲ３が、配列番号１８のアミノ酸配列を含む、
単離抗ＦＸＩ抗体またはその抗原結合性断片が提示される。具体的な実施形態では、ＨＣＤＲ２は、配列番号５９（Ｘ１−Ｉ−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｔ−Ｘ８−ＹＡＤＳＶＫＧ）［配列中、Ｘ１は、ＴまたはＳであり、Ｘ２は、ＤまたはＥであり、Ｘ３は、ＹまたはＳであり、Ｘ４は、Ｓ、Ｙ、またはＷであり、Ｘ５は、Ｓ、Ｄ、またはＧであり、Ｘ６は、Ｑ、Ｔ、またはＤであり、Ｘ７は、ＤまたはＥであり、Ｘ８は、Ｙ、Ｈ、またはＤである］のアミノ酸配列を含み、ＨＣＤＲ２は、配列番号４ではない。
【０１１２】
本明細書の特定の態様では、ＦＸＩおよび／またはＦＸＩａの触媒ドメイン内に結合する単離抗ＦＸＩ抗体またはその抗原結合性断片であって、相補性決定領域ＨＣＤＲ１、ＨＣＤＲ２、およびＨＣＤＲ３を含む重鎖可変領域（ＶＨ）と、相補性決定領域ＬＣＤＲ１、ＬＣＤＲ２、およびＬＣＤＲ３を含む軽鎖可変領域（ＶＬ）とを含み、
（ｉ）ＨＣＤＲ１が、配列番号６のアミノ酸配列を含み、
（ｉｉ）ＨＣＤＲ２が、配列番号５９（Ｘ１−Ｉ−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｔ−Ｘ８−ＹＡＤＳＶＫＧ）［配列中、Ｘ１は、任意のアミノ酸であるか、またはＴもしくはＳであり、Ｘ２は、任意のアミノ酸であるか、またはＤもしくはＥであり、Ｘ３は、任意のアミノ酸であるか、またはＹもしくはＳであり、Ｘ４は、任意のアミノ酸であるか、またはＳ、Ｙ、もしくはＷであり、Ｘ５は、任意のアミノ酸であるか、またはＳ、Ｄ、もしくはＧであり、Ｘ６は、任意のアミノ酸であるか、またはＱ、Ｔ、もしくはＤであり、Ｘ７は、任意のアミノ酸であるか、またはＤもしくはＥであり、Ｘ８は、任意のアミノ酸であるか、またはＹ、Ｈ、もしくはＤである］のアミノ酸配列を含み、ＨＣＤＲ２が、配列番号４ではなく、
（ｉｉｉ）ＨＣＤＲ３が、配列番号５のアミノ酸配列を含み、
（ｉｖ）ＬＣＤＲ１が、配列番号１６のアミノ酸配列を含み、
（ｖ）ＬＣＤＲ２が、配列番号１７のアミノ酸配列を含み、
（ｖｉ）ＬＣＤＲ３が、配列番号１８のアミノ酸配列を含む、
単離抗ＦＸＩ抗体またはその抗原結合性断片が提示される。さらに具体的な態様では、ＨＣＤＲ２は、配列番号５９（Ｘ１−Ｉ−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｔ−Ｘ８−ＹＡＤＳＶＫＧ）［配列中、Ｘ１は、ＴまたはＳであり、Ｘ２は、ＤまたはＥであり、Ｘ３は、ＹまたはＳであり、Ｘ４は、Ｓ、Ｙ、またはＷであり、Ｘ５は、Ｓ、Ｄ、またはＧであり、Ｘ６は、Ｑ、Ｔ、またはＤであり、Ｘ７は、ＤまたはＥであり、Ｘ８は、Ｙ、Ｈ、またはＤである］のアミノ酸配列を含み、ＨＣＤＲ２は、配列番号４ではない。
【０１１３】
本明細書の特定の態様では、ＦＸＩおよび／またはＦＸＩａの触媒ドメイン内に結合する単離抗ＦＸＩ抗体またはその抗原結合性断片であって、相補性決定領域ＨＣＤＲ１、ＨＣＤＲ２、およびＨＣＤＲ３を含む重鎖可変領域（ＶＨ）と、相補性決定領域ＬＣＤＲ１、ＬＣＤＲ２、およびＬＣＤＲ３を含む軽鎖可変領域（ＶＬ）とを含み、
（ｉ）ＨＣＤＲ１が、配列番号７のアミノ酸配列を含み、
（ｉｉ）ＨＣＤＲ２が、配列番号６０（Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６）［配列中、Ｘ１は、任意のアミノ酸であるか、またはＥもしくはＤであり、Ｘ２は、任意のアミノ酸であるか、またはＹもしくはＳであり、Ｘ３は、任意のアミノ酸であるか、またはＹ、Ｓ、もしくはＷであり、Ｘ４は、任意のアミノ酸であるか、またはＳ、Ｄ、もしくはＧであり、Ｘ５は、任意のアミノ酸であるか、またはＤ、Ｔ、もしくはＱであり、Ｘ６は、任意のアミノ酸であるか、またはＤもしくはＥである］のアミノ酸配列を含み、ＨＣＤＲ２が、配列番号８ではなく、
（ｉｉｉ）ＨＣＤＲ３が、配列番号５のアミノ酸配列を含み、
（ｉｖ）ＬＣＤＲ１が、配列番号１９のアミノ酸配列を含み、
（ｖ）ＬＣＤＲ２が、配列番号２０のアミノ酸配列を含み、
（ｖｉ）ＬＣＤＲ３が、配列番号２１のアミノ酸配列を含む、
単離抗ＦＸＩ抗体またはその抗原結合性断片が提示される。さらに具体的な実施形態では、ＨＣＤＲ２は、配列番号６０（Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６）［配列中、Ｘ１は、ＥまたはＤであり、Ｘ２は、ＹまたはＳであり、Ｘ３は、Ｙ、Ｓ、またはＷであり、Ｘ４は、Ｓ、Ｄ、またはＧであり、Ｘ５は、Ｄ、Ｔ、またはＱであり、Ｘ６は、ＤまたはＥである］のアミノ酸配列を含み、ＨＣＤＲ２は、配列番号８ではない。
【０１１４】
本明細書の特定の態様では、ＦＸＩおよび／またはＦＸＩａの触媒ドメイン内に結合する単離抗ＦＸＩ抗体またはその抗原結合性断片であって、相補性決定領域ＨＣＤＲ１、ＨＣＤＲ２、およびＨＣＤＲ３を含む重鎖可変領域（ＶＨ）と、相補性決定領域ＬＣＤＲ１、ＬＣＤＲ２、およびＬＣＤＲ３を含む軽鎖可変領域（ＶＬ）とを含み、
（ｉ）ＨＣＤＲ１が、配列番号９のアミノ酸配列を含み、
（ｉｉ）ＨＣＤＲ２が、配列番号６１（Ｉ−Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｔ）［配列中、Ｘ１は、任意のアミノ酸であるか、またはＥもしくはＤであり、Ｘ２は、任意のアミノ酸であるか、またはＹもしくはＳであり、Ｘ３は、任意のアミノ酸であるか、またはＳ、Ｙ、もしくはＷであり、Ｘ４は、任意のアミノ酸であるか、またはＳ、Ｄ、もしくはＧであり、Ｘ５は、任意のアミノ酸であるか、またはＤ、Ｔ、もしくはＱであり、Ｘ６は、任意のアミノ酸であるか、またはＤもしくはＥである］のアミノ酸配列を含み、ＨＣＤＲ２が、配列番号１０ではなく、
（ｉｉｉ）ＨＣＤＲ３が、配列番号１１のアミノ酸配列を含み、
（ｉｖ）ＬＣＤＲ１が、配列番号２２のアミノ酸配列を含み、
（ｖ）ＬＣＤＲ２が、配列番号２０のアミノ酸配列を含み、
（ｖｉ）ＬＣＤＲ３が、配列番号１８のアミノ酸配列を含む、
単離抗ＦＸＩ抗体またはその抗原結合性断片が提示される。さらに具体的な態様では、ＨＣＤＲ２は、配列番号６１（Ｉ−Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｔ）［配列中、Ｘ１は、ＥまたはＤであり、Ｘ２は、ＹまたはＳであり、Ｘ３は、Ｓ、Ｙ、またはＷであり、Ｘ４は、Ｓ、Ｄ、またはＧであり、Ｘ５は、Ｄ、Ｔ、またはＱであり、Ｘ６は、ＤまたはＥである］のアミノ酸配列を含み、ＨＣＤＲ２は、配列番号１０ではない。
【０１１５】
本明細書の特定の態様では、ＦＸＩおよび／またはＦＸＩａの触媒ドメイン内に結合する単離抗ＦＸＩ抗体またはその抗原結合性断片であって、（ｉ）相補性決定領域ＨＣＤＲ１、ＨＣＤＲ２、およびＨＣＤＲ３を含む重鎖可変領域（ＶＨ）と、（ｉｉ）相補性決定領域ＬＣＤＲ１、ＬＣＤＲ２、およびＬＣＤＲ３を含む軽鎖可変領域（ＶＬ）とを含み、
ＨＣＤＲ１が、配列番号３、６、７、および９からなる群から選択されるアミノ酸配列を含み、
ＨＣＤＲ２が、配列番号２７、２８、２９、３８、３９、４０、４５、４６、および４７からなる群から選択されるアミノ酸配列を含み、
ＨＣＤＲ３が、配列番号５および１１からなる群から選択されるアミノ酸配列を含み、
ＬＣＤＲ１が、配列番号１６、１９、および２２からなる群から選択されるアミノ酸配列を含み、
ＬＣＤＲ２が、配列番号１７および２０からなる群から選択されるアミノ酸配列を含み、
ＬＣＤＲ３が、配列番号１８および２１からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む、
単離抗ＦＸＩ抗体またはその抗原結合性断片が提示される。
【０１１６】
本明細書の具体的な実施形態では、ＦＸＩおよび／またはＦＸＩａの触媒ドメイン内に結合する抗体またはその抗原結合性断片であって、（ａ）相補性決定領域ＨＣＤＲ１、ＨＣＤＲ２、およびＨＣＤＲ３を含む重鎖可変領域（ＶＨ）と、（ｂ）相補性決定領域ＬＣＤＲ１、ＬＣＤＲ２、およびＬＣＤＲ３を含む軽鎖可変領域（ＶＬ）とを含み、
（ｉ）ＨＣＤＲ１が、配列番号３のアミノ酸配列を含み、ＨＣＤＲ２が、配列番号４５のアミノ酸配列を含み、ＨＣＤＲ３が、配列番号５のアミノ酸配列を含み、ＬＣＤＲ１が、配列番号１６のアミノ酸配列を含み、ＬＣＤＲ２が、配列番号１７のアミノ酸配列を含み、ＬＣＤＲ３が、配列番号１８のアミノ酸配列を含むか、
（ｉｉ）ＨＣＤＲ１が、配列番号６のアミノ酸配列を含み、ＨＣＤＲ２が、配列番号４５のアミノ酸配列を含み、ＨＣＤＲ３が、配列番号５のアミノ酸配列を含み、ＬＣＤＲ１が、配列番号１６のアミノ酸配列を含み、ＬＣＤＲ２が、配列番号１７のアミノ酸配列を含み、ＬＣＤＲ３が、配列番号１８のアミノ酸配列を含むか、
（ｉｉｉ）ＨＣＤＲ１が、配列番号７のアミノ酸配列を含み、ＨＣＤＲ２が、配列番号４６のアミノ酸配列を含み、ＨＣＤＲ３が、配列番号５のアミノ酸配列を含み、ＬＣＤＲ１が、配列番号１９のアミノ酸配列を含み、ＬＣＤＲ２が、配列番号２０のアミノ酸配列を含み、ＬＣＤＲ３が、配列番号２１のアミノ酸配列を含むか、または
（ｉｖ）ＨＣＤＲ１が、配列番号９のアミノ酸配列を含み、ＨＣＤＲ２が、配列番号４７のアミノ酸配列を含み、ＨＣＤＲ３が、配列番号１１のアミノ酸配列を含み、ＬＣＤＲ１が、配列番号２２のアミノ酸配列を含み、ＬＣＤＲ２が、配列番号２０のアミノ酸配列を含み、ＬＣＤＲ３が、配列番号１８のアミノ酸配列を含む、抗体またはその抗原結合性断片が提示される。
【０１１７】
本明細書のある種の態様では、ＦＸＩおよび／またはＦＸＩａの触媒ドメイン内に結合する抗体またはその抗原結合性断片であって、（ａ）相補性決定領域ＨＣＤＲ１、ＨＣＤＲ２、およびＨＣＤＲ３を含む重鎖可変領域（ＶＨ）と、（ｂ）相補性決定領域ＬＣＤＲ１、ＬＣＤＲ２、およびＬＣＤＲ３を含む軽鎖可変領域（ＶＬ）とを含み、
（ｉ）ＨＣＤＲ１が、配列番号３のアミノ酸配列を含み、ＨＣＤＲ２が、配列番号３８のアミノ酸配列を含み、ＨＣＤＲ３が、配列番号５のアミノ酸配列を含み、ＬＣＤＲ１が、配列番号１６のアミノ酸配列を含み、ＬＣＤＲ２が、配列番号１７のアミノ酸配列を含み、ＬＣＤＲ３が、配列番号１８のアミノ酸配列を含むか、
（ｉｉ）ＨＣＤＲ１が、配列番号６のアミノ酸配列を含み、ＨＣＤＲ２が、配列番号３８のアミノ酸配列を含み、ＨＣＤＲ３が、配列番号５のアミノ酸配列を含み、ＬＣＤＲ１が、配列番号１６のアミノ酸配列を含み、ＬＣＤＲ２が、配列番号１７のアミノ酸配列を含み、ＬＣＤＲ３が、配列番号１８のアミノ酸配列を含むか、
（ｉｉｉ）ＨＣＤＲ１が、配列番号７のアミノ酸配列を含み、ＨＣＤＲ２が、配列番号３９のアミノ酸配列を含み、ＨＣＤＲ３が、配列番号５のアミノ酸配列を含み、ＬＣＤＲ１が、配列番号１９のアミノ酸配列を含み、ＬＣＤＲ２が、配列番号２０のアミノ酸配列を含み、ＬＣＤＲ３が、配列番号２１のアミノ酸配列を含むか、または
（ｉｖ）ＨＣＤＲ１が、配列番号９のアミノ酸配列を含み、ＨＣＤＲ２が、配列番号４０のアミノ酸配列を含み、ＨＣＤＲ３が、配列番号１１のアミノ酸配列を含み、ＬＣＤＲ１が、配列番号２２のアミノ酸配列を含み、ＬＣＤＲ２が、配列番号２０のアミノ酸配列を含み、ＬＣＤＲ３が、配列番号１８のアミノ酸配列を含む、抗体またはその抗原結合性断片が提示される。
【０１１８】
本明細書の具体的な態様では、ＦＸＩおよび／またはＦＸＩａの触媒ドメイン内に結合する抗体またはその抗原結合性断片であって、（ａ）相補性決定領域ＨＣＤＲ１、ＨＣＤＲ２、およびＨＣＤＲ３を含む重鎖可変領域（ＶＨ）と、（ｂ）相補性決定領域ＬＣＤＲ１、ＬＣＤＲ２、およびＬＣＤＲ３を含む軽鎖可変領域（ＶＬ）とを含み、
（ｉ）ＨＣＤＲ１が、配列番号３のアミノ酸配列を含み、ＨＣＤＲ２が、配列番号２７のアミノ酸配列を含み、ＨＣＤＲ３が、配列番号５のアミノ酸配列を含み、ＬＣＤＲ１が、配列番号１６のアミノ酸配列を含み、ＬＣＤＲ２が、配列番号１７のアミノ酸配列を含み、ＬＣＤＲ３が、配列番号１８のアミノ酸配列を含むか、
（ｉｉ）ＨＣＤＲ１が、配列番号６のアミノ酸配列を含み、ＨＣＤＲ２が、配列番号２７のアミノ酸配列を含み、ＨＣＤＲ３が、配列番号５のアミノ酸配列を含み、ＬＣＤＲ１が、配列番号１６のアミノ酸配列を含み、ＬＣＤＲ２が、配列番号１７のアミノ酸配列を含み、ＬＣＤＲ３が、配列番号１８のアミノ酸配列を含むか、
（ｉｉｉ）ＨＣＤＲ１が、配列番号７のアミノ酸配列を含み、ＨＣＤＲ２が、配列番号２８のアミノ酸配列を含み、ＨＣＤＲ３が、配列番号５のアミノ酸配列を含み、ＬＣＤＲ１が、配列番号１９のアミノ酸配列を含み、ＬＣＤＲ２が、配列番号２０のアミノ酸配列を含み、ＬＣＤＲ３が、配列番号２１のアミノ酸配列を含むか、または
（ｉｖ）ＨＣＤＲ１が、配列番号９のアミノ酸配列を含み、ＨＣＤＲ２が、配列番号２９のアミノ酸配列を含み、ＨＣＤＲ３が、配列番号１１のアミノ酸配列を含み、ＬＣＤＲ１が、配列番号２２のアミノ酸配列を含み、ＬＣＤＲ２が、配列番号２０のアミノ酸配列を含み、ＬＣＤＲ３が、配列番号１８のアミノ酸配列を含む、抗体またはその抗原結合性断片が提示される。
【０１１９】
本明細書の特定の態様では、ＦＸＩおよび／またはＦＸＩａの触媒ドメイン内に結合する抗体またはその抗原結合性断片であって、（ａ）相補性決定領域ＨＣＤＲ１、ＨＣＤＲ２、およびＨＣＤＲ３を含む重鎖可変領域（ＶＨ）と、（ｂ）相補性決定領域ＬＣＤＲ１、ＬＣＤＲ２、およびＬＣＤＲ３を含む軽鎖可変領域（ＶＬ）とを含み、ＨＣＤＲ１が、配列番号３のアミノ酸配列を含み、ＨＣＤＲ２が、配列番号２７、３８、または４５のアミノ酸配列を含み、ＨＣＤＲ３が、配列番号５のアミノ酸配列を含み、ＬＣＤＲ１が、配列番号１６のアミノ酸配列を含み、ＬＣＤＲ２が、配列番号１７のアミノ酸配列を含み、ＬＣＤＲ３が、配列番号１８のアミノ酸配列を含む、抗体またはその抗原結合性断片が提示される。
【０１２０】
本明細書の具体的な態様では、ＦＸＩおよび／またはＦＸＩａの触媒ドメイン内に結合する抗体またはその抗原結合性断片であって、（ａ）相補性決定領域ＨＣＤＲ１、ＨＣＤＲ２、およびＨＣＤＲ３を含む重鎖可変領域（ＶＨ）と、（ｂ）相補性決定領域ＬＣＤＲ１、ＬＣＤＲ２、およびＬＣＤＲ３を含む軽鎖可変領域（ＶＬ）とを含み、ＨＣＤＲ１が、配列番号６のアミノ酸配列を含み、ＨＣＤＲ２が、配列番号２７、３８、または４５のアミノ酸配列を含み、ＨＣＤＲ３が、配列番号５のアミノ酸配列を含み、ＬＣＤＲ１が、配列番号１６のアミノ酸配列を含み、ＬＣＤＲ２が、配列番号１７のアミノ酸配列を含み、ＬＣＤＲ３が、配列番号１８のアミノ酸配列を含む、抗体またはその抗原結合性断片が提示される。
【０１２１】
本明細書の具体的な態様では、ＦＸＩおよび／またはＦＸＩａの触媒ドメイン内に結合する抗体または抗原結合性断片であって、（ａ）相補性決定領域ＨＣＤＲ１、ＨＣＤＲ２、およびＨＣＤＲ３を含む重鎖可変領域（ＶＨ）と、（ｂ）相補性決定領域ＬＣＤＲ１、ＬＣＤＲ２、およびＬＣＤＲ３を含む軽鎖可変領域（ＶＬ）とを含み、ＨＣＤＲ１が、配列番号７のアミノ酸配列を含み、ＨＣＤＲ２が、配列番号２８、３９、または４６のアミノ酸配列を含み、ＨＣＤＲ３が、配列番号５のアミノ酸配列を含み、ＬＣＤＲ１が、配列番号１９のアミノ酸配列を含み、ＬＣＤＲ２が、配列番号２０のアミノ酸配列を含み、ＬＣＤＲ３が、配列番号２１のアミノ酸配列を含む、抗体または抗原結合性断片が提示される。
【０１２２】
本明細書の特定の態様では、ＦＸＩおよび／またはＦＸＩａの触媒ドメイン内に結合する抗体または抗原結合性断片であって、（ａ）相補性決定領域ＨＣＤＲ１、ＨＣＤＲ２、およびＨＣＤＲ３を含む重鎖可変領域（ＶＨ）と、（ｂ）相補性決定領域ＬＣＤＲ１、ＬＣＤＲ２、およびＬＣＤＲ３を含む軽鎖可変領域（ＶＬ）とを含み、ＨＣＤＲ１が、配列番号９のアミノ酸配列を含み、ＨＣＤＲ２が、配列番号２９、４０、または４７のアミノ酸配列を含み、ＨＣＤＲ３が、配列番号１１のアミノ酸配列を含み、ＬＣＤＲ１が、配列番号２２のアミノ酸配列を含み、ＬＣＤＲ２が、配列番号２０のアミノ酸配列を含み、ＬＣＤＲ３が、配列番号１８のアミノ酸配列を含む、抗体または抗原結合性断片が提示される。
【０１２３】
本明細書のある種の態様では、ＦＸＩおよび／またはＦＸＩａの触媒ドメイン内に結合する単離抗ＦＸＩ抗体またはその抗原結合性断片であって、重鎖可変領域（ＶＨ）と、軽鎖可変領域（ＶＬ）とを含み、ＶＨが、表２から選択される相補性決定領域ＨＣＤＲ１、ＨＣＤＲ２、およびＨＣＤＲ３を含み、ＶＬが、表２から選択される相補性決定領域ＬＣＤＲ１、ＬＣＤＲ２、およびＬＣＤＲ３を含む、単離抗ＦＸＩ抗体またはその抗原結合性断片が提示される。
【０１２４】
本明細書の特定の態様では、ＦＸＩおよび／またはＦＸＩａの触媒ドメイン内に結合する抗体または抗原結合性断片であって、（ａ）相補性決定領域ＨＣＤＲ１、ＨＣＤＲ２、およびＨＣＤＲ３を含む重鎖可変領域（ＶＨ）と、（ｂ）相補性決定領域ＬＣＤＲ１、ＬＣＤＲ２、およびＬＣＤＲ３を含む軽鎖可変領域（ＶＬ）とを含み、ＶＨが、抗体ＡＭ１、ＡＭ２、ＡＭ３、またはＡＭ４の、組み合わされたＨＣＤＲ１、ＨＣＤＲ２、およびＨＣＤＲ３を含み、ＶＬが、抗体ＡＭ１、ＡＭ２、ＡＭ３、またはＡＭ４の、組み合わされたＬＣＤＲ１、ＬＣＤＲ２、およびＬＣＤＲ３を含む、抗体または抗原結合性断片が提示される。
【０１２５】
本明細書の特定の態様では、ＦＸＩおよび／またはＦＸＩａの触媒ドメイン内に結合する抗体または抗原結合性断片であって、（ａ）相補性決定領域ＨＣＤＲ１、ＨＣＤＲ２、およびＨＣＤＲ３を含む重鎖可変領域（ＶＨ）と、（ｂ）相補性決定領域ＬＣＤＲ１、ＬＣＤＲ２、およびＬＣＤＲ３を含む軽鎖可変領域（ＶＬ）とを含み、ＶＨが、抗体ＡＭ１、ＡＭ２、ＡＭ３、またはＡＭ４の、ＫａｂａｔによるＨＣＤＲ１、ＨＣＤＲ２、およびＨＣＤＲ３を含み、ＶＬが、ＡＭ１、ＡＭ２、ＡＭ３、またはＡＭ４の、ＫａｂａｔによるＬＣＤＲ１、ＬＣＤＲ２、およびＬＣＤＲ３を含む、抗体または抗原結合性断片が提示される。
【０１２６】
本明細書の特定の態様では、ＦＸＩおよび／またはＦＸＩａの触媒ドメイン内に結合する抗体または抗原結合性断片であって、（ａ）相補性決定領域ＨＣＤＲ１、ＨＣＤＲ２、およびＨＣＤＲ３を含む重鎖可変領域（ＶＨ）と、（ｂ）相補性決定領域ＬＣＤＲ１、ＬＣＤＲ２、およびＬＣＤＲ３を含む軽鎖可変領域（ＶＬ）とを含み、ＶＨが、抗体ＡＭ１、ＡＭ２、ＡＭ３、またはＡＭ４の、ＣｏｔｈｉａによるＨＣＤＲ１、ＨＣＤＲ２、およびＨＣＤＲ３を含み、ＶＬが、抗体ＡＭ１、ＡＭ２、ＡＭ３、またはＡＭ４の、ＣｏｔｈｉａによるＬＣＤＲ１、ＬＣＤＲ２、およびＬＣＤＲ３を含む、抗体または抗原結合性断片が提示される。
【０１２７】
本明細書の特定の態様では、ＦＸＩおよび／またはＦＸＩａの触媒ドメイン内に結合する抗体または抗原結合性断片であって、（ａ）相補性決定領域ＨＣＤＲ１、ＨＣＤＲ２、およびＨＣＤＲ３を含む重鎖可変領域（ＶＨ）と、（ｂ）相補性決定領域ＬＣＤＲ１、ＬＣＤＲ２、およびＬＣＤＲ３を含む軽鎖可変領域（ＶＬ）とを含み、ＶＨが、抗体ＡＭ１、ＡＭ２、ＡＭ３、またはＡＭ４の、ＩＭＧＴによるＨＣＤＲ１、ＨＣＤＲ２、およびＨＣＤＲ３を含み、ＶＬが、抗体ＡＭ１、ＡＭ２、ＡＭ３、またはＡＭ４の、ＩＭＧＴによるＬＣＤＲ１、ＬＣＤＲ２、およびＬＣＤＲ３を含む、抗体または抗原結合性断片が提示される。
【０１２８】
本明細書の具体的な態様では、ＦＸＩおよび／またはＦＸＩａの触媒ドメイン内に結合する単離抗ＦＸＩ抗体またはその抗原結合性断片であって、重鎖可変領域（ＶＨ）と、軽鎖可変領域（ＶＬ）とを含み、ＶＨが、抗体ＡＭ２の相補性決定領域ＨＣＤＲ１、ＨＣＤＲ２、およびＨＣＤＲ３を含み、ＶＬが、抗体ＡＭ２の相補性決定領域ＬＣＤＲ１、ＬＣＤＲ２、およびＬＣＤＲ３を含む、単離抗ＦＸＩ抗体またはその抗原結合性断片が提示される。
【０１２９】
本明細書の具体的な態様では、ＦＸＩおよび／またはＦＸＩａの触媒ドメイン内に結合する単離抗ＦＸＩ抗体またはその抗原結合性断片であって、重鎖可変領域（ＶＨ）と、軽鎖可変領域（ＶＬ）とを含み、ＶＨが、抗体ＡＭ３またはＡＭ４の相補性決定領域ＨＣＤＲ１、ＨＣＤＲ２、およびＨＣＤＲ３を含み、ＶＬが、抗体ＡＭ３またはＡＭ４の相補性決定領域ＬＣＤＲ１、ＬＣＤＲ２、およびＬＣＤＲ３を含む、単離抗ＦＸＩ抗体またはその抗原結合性断片が提示される。
【０１３０】
本明細書の具体的な態様では、ＦＸＩおよび／またはＦＸＩａの触媒ドメイン内に結合する単離抗ＦＸＩ抗体またはその抗原結合性断片であって、重鎖可変領域（ＶＨ）と、軽鎖可変領域（ＶＬ）とを含み、ＶＨが、抗体ＡＭ１の相補性決定領域ＨＣＤＲ１、ＨＣＤＲ２、およびＨＣＤＲ３を含み、ＶＬが、抗体ＡＭ１の相補性決定領域ＬＣＤＲ１、ＬＣＤＲ２、およびＬＣＤＲ３を含む、単離抗ＦＸＩ抗体またはその抗原結合性断片が提示される。
【０１３１】
本明細書の具体的な態様では、ＦＸＩおよび／またはＦＸＩａの触媒ドメイン内に結合する単離抗ＦＸＩ抗体またはその抗原結合性断片であって、重鎖可変領域（ＶＨ）と、軽鎖可変領域（ＶＬ）とを含み、ＶＨが、配列番号３０、４１、および４８のアミノ酸配列を含み、ＶＬが、配列番号３４または５５のアミノ酸配列を含む、単離抗ＦＸＩ抗体またはその抗原結合性断片が提示される。
【０１３２】
本明細書の具体的な態様では、ＦＸＩおよび／またはＦＸＩａの触媒ドメイン内に結合する単離抗ＦＸＩ抗体またはその抗原結合性断片であって、重鎖可変領域（ＶＨ）と、軽鎖可変領域（ＶＬ）とを含み、ＶＨが、配列番号４８のアミノ酸配列を含み、ＶＬが、配列番号５５のアミノ酸配列を含む、単離抗ＦＸＩ抗体またはその抗原結合性断片が提示される。
【０１３３】
本明細書の具体的な態様では、ＦＸＩおよび／またはＦＸＩａの触媒ドメイン内に結合する単離抗ＦＸＩ抗体またはその抗原結合性断片であって、重鎖可変領域（ＶＨ）と、軽鎖可変領域（ＶＬ）とを含み、ＶＨが、配列番号４８のアミノ酸配列を含み、ＶＬが、配列番号３４のアミノ酸配列を含む、単離抗ＦＸＩ抗体またはその抗原結合性断片が提示される。
【０１３４】
本明細書の具体的な態様では、ＦＸＩおよび／またはＦＸＩａの触媒ドメイン内に結合する単離抗ＦＸＩ抗体またはその抗原結合性断片であって、重鎖可変領域（ＶＨ）と、軽鎖可変領域（ＶＬ）とを含み、ＶＨが、配列番号４１のアミノ酸配列を含み、ＶＬが、配列番号３４のアミノ酸配列を含む、単離抗ＦＸＩ抗体またはその抗原結合性断片が提示される。
【０１３５】
本明細書の具体的な態様では、ＦＸＩおよび／またはＦＸＩａの触媒ドメイン内に結合する単離抗ＦＸＩ抗体またはその抗原結合性断片であって、重鎖可変領域（ＶＨ）と、軽鎖可変領域（ＶＬ）とを含み、ＶＨが、配列番号３０のアミノ酸配列を含み、ＶＬが、配列番号３４のアミノ酸配列を含む、単離抗ＦＸＩ抗体またはその抗原結合性断片が提示される。
【０１３６】
本明細書の具体的な態様では、ＦＸＩおよび／またはＦＸＩａの触媒ドメイン内に結合する単離抗ＦＸＩ抗体またはその抗原結合性断片であって、重鎖および軽鎖を含み、重鎖が、配列番号３２、４３、５０、または５３のアミノ酸配列を含み、軽鎖が、配列番号５７または３６のアミノ酸配列を含む、単離抗ＦＸＩ抗体またはその抗原結合性断片が提示される。
【０１３７】
本明細書の具体的な態様では、ＦＸＩおよび／またはＦＸＩａの触媒ドメイン内に結合する単離抗ＦＸＩ抗体またはその抗原結合性断片であって、重鎖および軽鎖を含み、重鎖が、配列番号５３のアミノ酸配列を含み、軽鎖が、配列番号５７のアミノ酸配列を含む、単離抗ＦＸＩ抗体またはその抗原結合性断片が提示される。
【０１３８】
本明細書の具体的な態様では、ＦＸＩおよび／またはＦＸＩａの触媒ドメイン内に結合する単離抗ＦＸＩ抗体またはその抗原結合性断片であって、重鎖および軽鎖を含み、重鎖が、配列番号５０のアミノ酸配列を含み、軽鎖が、配列番号３６のアミノ酸配列を含む、単離抗ＦＸＩ抗体またはその抗原結合性断片が提示される。
【０１３９】
本明細書の具体的な態様では、ＦＸＩおよび／またはＦＸＩａの触媒ドメイン内に結合する単離抗ＦＸＩ抗体またはその抗原結合性断片であって、重鎖および軽鎖を含み、重鎖が、配列番号４３のアミノ酸配列を含み、軽鎖が、配列番号３６のアミノ酸配列を含む、単離抗ＦＸＩ抗体またはその抗原結合性断片が提示される。
【０１４０】
本明細書の具体的な態様では、ＦＸＩおよび／またはＦＸＩａの触媒ドメイン内に結合する単離抗ＦＸＩ抗体またはその抗原結合性断片であって、重鎖および軽鎖を含み、重鎖が、配列番号３２のアミノ酸配列を含み、軽鎖が、配列番号３６のアミノ酸配列を含む、単離抗ＦＸＩ抗体またはその抗原結合性断片が提示される。
【０１４１】
【表１−１】
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【０１４２】
【表１−２】
2020513757.tif 000003
【０１４３】
【表１−３】
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【０１４４】
【表１−４】
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【０１４５】
【表１−５】
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【０１４６】
【表１−６】
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【０１４７】
【表２−１】
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【０１４８】
【表２−２】
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【０１４９】
【表２−３】
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【０１５０】
【表２−４】
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【０１５１】
【表２−５】
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【０１５２】
【表２−６】
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【０１５３】
【表２−７】
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【０１５４】
【表２−８】
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【０１５５】
【表２−９】
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【０１５６】
【表２−１０】
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【０１５７】
具体的な態様では、これらの抗体の各々は、ＦＸＩおよび／もしくはＦＸＩａに結合しうるので、ＶＨ配列、ＶＬ配列、全長軽鎖配列、および全長重鎖配列（アミノ酸配列と、アミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列と）を「混合し、マッチさせて」、他のＦＸＩ結合性抗体および／もしくはＦＸＩａ結合性抗体を創出することができる。このような「混合し、マッチさせた」ＦＸＩ結合性抗体および／もしくはＦＸＩａ結合性抗体は、当技術分野で公知の結合アッセイ（例えば、ＥＬＩＳＡおよび実施例節で記載される他のアッセイ）を使用して調べることができる。これらの鎖を混合し、マッチさせる場合、特定のＶＨ／ＶＬ対合に由来するＶＨ配列を、構造的に類似するＶＨ配列で置きかえるものとする。同様に、特定の全長重鎖／全長軽鎖対合に由来する全長重鎖配列を、構造的に類似する全長重鎖配列で置きかえるものとする。同様に、特定のＶＨ／ＶＬ対合に由来するＶＬ配列を、構造的に類似するＶＬ配列で置きかえるものとする。同様に、特定の全長重鎖／全長軽鎖対合に由来する全長軽鎖配列を、構造的に類似する全長軽鎖配列で置きかえるものとする。
【０１５８】
本明細書で使用される「相補性決定領域」および「ＣＤＲ」という用語は、抗原特異性および抗原結合アフィニティーを付与する、抗体可変領域内のアミノ酸の配列を指す。一般に、各重鎖可変領域（ＨＣＤＲ１、ＨＣＤＲ２、ＨＣＤＲ３）内には、３つのＣＤＲがあり、各軽鎖可変領域（ＬＣＤＲ１、ＬＣＤＲ２、ＬＣＤＲ３）内には、３つのＣＤＲがある。
【０１５９】
所与のＣＤＲの正確なアミノ酸配列の境界は、Kabat et al. (1991), “Sequences of Proteins of Immunological Interest,” 5th Ed. Public Health Service, National Institutes of Health, Bethesda, MD（「Ｋａｂａｔ」番号付けスキーム）、Al-Lazikani et al., (1997) JMB 273, 927-948（「Ｃｈｏｔｈｉａ」番号付けスキーム）、Lefranc et al., (2003) Dev. Comp. Immunol., 27, 55-77（「ＩＭＧＴ」番号付けスキーム）により記載されているスキーム、または「組合せ」システムを含む、周知の多数のスキームのいずれかを使用して、たやすく決定することができる。
【０１６０】
例えば、Ｋａｂａｔによれば、重鎖可変ドメイン（ＶＨ）内の抗体ＮＯＶ１０９０のＣＤＲアミノ酸残基は、３１〜３５（ＨＣＤＲ１）、５０〜６６（ＨＣＤＲ２）、および９９〜１１１（ＨＣＤＲ３）と番号付けされており、軽鎖可変ドメイン（ＶＬ）内のＣＤＲアミノ酸残基は、２２〜３５（ＬＣＤＲ１）、５１〜５７（ＬＣＤＲ２）、および９０〜１００（ＬＣＤＲ３）と番号付けされている。Ｃｈｏｔｈｉａによれば、ＶＨ内のＣＤＲアミノ酸は、２６〜３２（ＨＣＤＲ１）、５２〜５７（ＨＣＤＲ２）、および９９〜１１１（ＨＣＤＲ３）と番号付けされており、ＶＬ内のアミノ酸残基は、２５〜３３（ＬＣＤＲ１）、５１〜５３（ＬＣＤＲ２）、および９２〜９９（ＬＣＤＲ３）と番号付けされている。ＫａｂａｔおよびＣｈｏｔｈｉａの両方のＣＤＲ定義を組み合わせることにより、ＣＤＲは、ヒトＶＨ内のアミノ酸残基２６〜３５（ＨＣＤＲ１）、５０〜６６（ＨＣＤＲ２）、および９９〜１１１（ＨＣＤＲ３）、ならびにヒトＶＬ内のアミノ酸残基２２〜３５（ＬＣＤＲ１）、５１〜５７（ＬＣＤＲ２）、および９０〜１００（ＬＣＤＲ３）からなる。ＫａｂａｔおよびＣｈｏｔｈｉａの両方のＣＤＲ定義を組み合わせることにより、「組合せ」ＣＤＲは、ヒトＶＨ内のアミノ酸残基２６〜３５（ＨＣＤＲ１）、５０〜６６（ＨＣＤＲ２）、および９９〜１０８（ＨＣＤＲ３）、ならびにヒトＶＬ内のアミノ酸残基２４〜３８（ＬＣＤＲ１）、５４〜６０（ＬＣＤＲ２）、および９３〜１０１（ＬＣＤＲ３）からなる。別の例として、ＩＭＧＴによれば、重鎖可変ドメイン（ＶＨ）内のＣＤＲアミノ酸残基は、２６〜３３（ＨＣＤＲ１）、５１〜５８（ＨＣＤＲ２）、および９７〜１０８（ＨＣＤＲ３）と番号付けされており、軽鎖可変ドメイン（ＶＬ）内のＣＤＲアミノ酸残基は、２７〜３６（ＬＣＤＲ１）、５４〜５６（ＬＣＤＲ２）、および９３〜１０１（ＬＣＤＲ３）と番号付けされている。表２は、抗ＦＸＩ抗体、例えば、抗体ＡＭ１、ＡＭ２、ＡＭ３およびＡＭ４について、Ｋａｂａｔ、Ｃｈｏｔｈｉａ、組合せ、およびＩＭＧＴによる、例示的なＨＣＤＲ１、ＨＣＤＲ２、ＨＣＤＲ３、ＬＣＤＲ１、ＬＣＤＲ２、およびＬＣＤＲ３を提示する。別の態様では、本開示は、表２に記載されている、重鎖および軽鎖のＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３、またはそれらの組合せを含むＦＸＩ／ＦＸＩａ結合性抗体を提供する。
【０１６１】
具体的な態様では、これらの抗体の各々は、ＦＸＩおよび／もしくはＦＸＩａに結合することが可能であり、抗原結合特異性は主に、ＣＤＲ１領域、ＣＤＲ２領域、およびＣＤＲ３領域によりもたらされることを踏まえれば、各抗体は、本明細書で提供される他のＦＸＩ結合性分子および／もしくはＦＸＩａ結合性分子を創出するのに、ＶＨ  ＣＤＲ１、ＶＨ  ＣＤＲ２、およびＶＨ  ＣＤＲ３、ならびにＶＬ  ＣＤＲ１、ＶＬ  ＣＤＲ２、およびＶＬ  ＣＤＲ３を含有することが好ましいが、ＶＨ  ＣＤＲ１配列、ＶＨ  ＣＤＲ２配列、およびＶＨ  ＣＤＲ３配列、ならびにＶＬ  ＣＤＲ１配列、ＶＬ  ＣＤＲ２配列、およびＶＬ  ＣＤＲ３配列を、「混合し、マッチさせる」ことができる（すなわち、異なる抗体に由来するＣＤＲを、混合し、マッチさせることができる）。このような「混合し、マッチさせた」ＦＸＩ結合性分子および／もしくはＦＸＩａ結合性抗体は、当技術分野で公知の結合アッセイおよび実施例で記載される結合アッセイ（例えば、ＥＬＩＳＡ、ＳＥＴ、Ｂｉａｃｏｒｅ（商標））を使用して調べることができる。ＶＨ  ＣＤＲ配列を混合し、マッチさせる場合は、特定のＶＨ配列に由来するＣＤＲ１配列、ＣＤＲ２配列、および／またはＣＤＲ３配列を、構造的に類似するＣＤＲ配列で置きかえるものとする。同様に、ＶＬ  ＣＤＲ配列を混合し、マッチさせる場合は、特定のＶＬ配列に由来するＣＤＲ１配列、ＣＤＲ２配列、および／またはＣＤＲ３配列を、構造的に類似するＣＤＲ配列で置きかえるものとする。当業者には、新規のＶＨ配列およびＶＬ配列を、１つまたは複数のＶＨ  ＣＤＲ領域配列および／またはＶＬ  ＣＤＲ領域配列を、本開示のモノクローナル抗体のための、本明細書で示されるＣＤＲ配列に由来する、構造的に類似する配列で置換することにより創出しうることがたやすく明らかであろう。前出に加えて、一実施形態では、本明細書で記載される抗体の抗原結合性断片は、ＶＨ  ＣＤＲ１、ＶＨ  ＣＤＲ２、およびＶＨ  ＣＤＲ３、またはＶＬ  ＣＤＲ１、ＶＬ  ＣＤＲ２、およびＶＬ  ＣＤＲ３を含むことが可能であり、この場合、断片は、ＦＸＩおよび／もしくはＦＸＩａに、単一の可変ドメインとして結合する。
【０１６２】
本開示のある種の態様では、抗ＦＸＩ／ＦＸＩａ抗体またはそれらの抗原結合性断片は、表２に記載されている、Ｆａｂの重鎖配列および軽鎖配列を有しうる。より具体的には、抗ＦＸＩ／ＦＸＩａ抗体またはその抗原結合性断片は、抗体ＡＭ４の重鎖配列および軽鎖配列を有しうる。特定の態様では、抗ＦＸＩ／ＦＸＩａ抗体またはその抗原結合性断片は、抗体ＡＭ３の重鎖配列および軽鎖配列を有しうる。特定の態様では、抗ＦＸＩ／ＦＸＩａ抗体またはその抗原結合性断片は、抗体ＡＭ２の重鎖配列および軽鎖配列を有しうる。特定の態様では、抗ＦＸＩ／ＦＸＩａ抗体またはその抗原結合性断片は、抗体ＡＭ１の重鎖配列および軽鎖配列を有しうる。
【０１６３】
抗体の可変領域または全長鎖が、ヒト生殖細胞系列の免疫グロブリン遺伝子を使用する系から得られる場合、本明細書で使用されるヒト抗体は、特定の生殖細胞系列配列「の産物」であるかまたはこれ「に由来する」、重鎖もしくは軽鎖可変領域または全長重鎖もしくは軽鎖を含む。このような系は、ヒト免疫グロブリン遺伝子を保有するトランスジェニックマウスを、対象の抗原で免疫化するか、または対象の抗原を伴うファージ上で提示されるヒト免疫グロブリン遺伝子ライブラリーをスクリーニングすることを含む。ヒト生殖細胞系列の免疫グロブリン配列「の産物」であるかまたはこれ「に由来する」ヒト抗体は、ヒト抗体のアミノ酸配列を、ヒト生殖細胞系列免疫グロブリンのアミノ酸配列と比較し、配列がヒト抗体の配列と最も近似する（すなわち、同一性％が最大である）ヒト生殖細胞系列の免疫グロブリン配列を選択することにより、それ自体として同定することができる。
【０１６４】
特定のヒト生殖細胞系列の免疫グロブリン配列「の産物」であるかまたはこれ「に由来する」ヒト抗体は、例えば、自然発生の体細胞突然変異または部位特異的突然変異の意図的な導入に起因して、生殖細胞系列配列と比較したアミノ酸の差異を含有しうる。しかし、ＶＨフレームワーク領域またはＶＬフレームワーク領域では、選択されたヒト抗体は、アミノ酸配列が、ヒト生殖細胞系列の免疫グロブリン遺伝子によりコードされるアミノ酸配列と少なくとも９０％の同一であり、ヒト抗体を、他の種の生殖細胞系列免疫グロブリンアミノ酸配列（例えば、マウス生殖細胞系列配列）と比較した場合に、ヒトとして同定するアミノ酸残基を含有することが典型的である。ある種の場合には、ヒト抗体は、アミノ酸配列が、生殖細胞系列の免疫グロブリン遺伝子によりコードされるアミノ酸配列と、少なくとも６０％、７０％、８０％、９０％、または少なくとも９５％、なおまたは、少なくとも９６％、９７％、９８％、または９９％同一でありうる。
【０１６５】
組換えヒト抗体は、ＶＨフレームワーク領域内またはＶＬフレームワーク領域内のヒト生殖細胞系列の免疫グロブリン遺伝子によりコードされるアミノ酸配列との、１０アミノ酸以下の差異を提示することが典型的である。ある種の場合には、ヒト抗体は、生殖細胞系列の免疫グロブリン遺伝子によりコードされるアミノ酸配列との、５アミノ酸以下、なおまたは、４、３、２、または１アミノ酸以下の差異を提示しうる。ヒト生殖細胞系列の免疫グロブリン遺伝子の例は、下記で記載される生殖細胞系列の可変ドメイン断片のほか、ＤＰ４７およびＤＰＫ９も含むがこれらに限定されない。
【０１６６】
相同抗体
さらに別の実施形態では、本開示は、表２に記載されている配列（例えば、配列番号３０、４１、４８、３４、５５、３２、４３、５０、５３、５７、または３６）と相同なアミノ酸配列を含む、抗体またはその抗原結合性断片を提供するが、抗体は、ＦＸＩタンパク質および／またはＦＸＩａタンパク質（例えば、ヒトＦＸＩａ、ウサギＦＸＩａ、およびカニクイザルＦＸＩａ）に結合し、ＡＭ１、ＡＭ２、ＡＭ３、またはＡＭ４など、表２に記載されている抗体の、所望の機能的特性を保持する。具体的な態様では、このような相同抗体は、表２に記載されているＣＤＲアミノ酸配列（例えば、Ｋａｂａｔ  ＣＤＲ、Ｃｈｏｔｈｉａ  ＣＤＲ、ＩＭＧＴ  ＣＤＲ、または組合せＣＤＲ）を保持する。
【０１６７】
他の実施形態では、ＶＨアミノ酸配列および／またはＶＬアミノ酸配列は、表２に示される配列と、５０％、６０％、７０％、８０％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、または９９％同一でありうる。他の実施形態では、ＶＨアミノ酸配列および／またはＶＬアミノ酸配列は、１、２、３、４、または５カ所以下のアミノ酸位置におけるアミノ酸置換を除き同一でありうる。表２に記載されている抗体のＶＨ領域およびＶＬ領域と大きな（すなわち、８０％以上の）同一性を有するＶＨ領域およびＶＬ領域を有する抗体は、表２に記載されている核酸分子の突然変異誘発（例えば、部位特異的突然変異誘発またはＰＣＲ媒介突然変異誘発）の後、本明細書で記載される機能アッセイを使用して、コードされる改変抗体を、機能の保持について調べることにより得ることができる。
【０１６８】
他の実施形態では、全長重鎖アミノ酸配列および／または全長軽鎖アミノ酸配列は、表２に示される配列と、５０％、６０％、７０％、８０％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、または９９％同一でありうる。表２に記載されている全長重鎖と大きな（すなわち、８０％以上の）同一性を有する全長重鎖および全長軽鎖を有する抗体は、このようなポリペプチドをコードする核酸分子の突然変異誘発（例えば、部位特異的突然変異誘発またはＰＣＲ媒介突然変異誘発）の後、本明細書で記載される機能アッセイを使用して、コードされる改変抗体を、機能の保持について調べることにより得ることができる。
【０１６９】
本明細書の具体的な態様では、ＦＸＩおよび／またはＦＸＩａの触媒ドメイン内に結合する単離抗ＦＸＩ抗体またはその抗原結合性断片であって、重鎖可変領域（ＶＨ）と、軽鎖可変領域（ＶＬ）とを含み、ＶＨが、配列番号３０、４１、および４８のアミノ酸配列と、少なくとも９０％同一なアミノ酸配列を含み、ＶＬが、配列番号３４または５５のアミノ酸配列と、少なくとも９０％同一なアミノ酸配列を含み、かつ、ＶＨが、配列番号１２のアミノ酸配列を含まず、ＶＬが、配列番号２３のアミノ酸配列を含まない、単離抗ＦＸＩ抗体またはその抗原結合性断片が提示される。さらに具体的な態様では、単離抗ＦＸＩ抗体またはその抗原結合性断片は、表２に明示された配列から選択される、ＨＣＤＲ１、ＨＣＤＲ２、ＨＣＤＲ３、ＬＣＤＲ１、ＬＣＤＲ２、およびＬＣＤＲ３の配列を含む。
【０１７０】
本明細書の具体的な態様では、ＦＸＩおよび／またはＦＸＩａの触媒ドメイン内に結合する単離抗ＦＸＩ抗体またはその抗原結合性断片であって、重鎖可変領域（ＶＨ）と、軽鎖可変領域（ＶＬ）とを含み、ＶＨが、配列番号３０、４１、および４８のアミノ酸配列と、少なくとも９５％同一なアミノ酸配列を含み、ＶＬが、配列番号３４または５５のアミノ酸配列と、少なくとも９５％同一なアミノ酸配列を含み、かつ、ＶＨが、配列番号１２のアミノ酸配列を含まず、ＶＬが、配列番号２３のアミノ酸配列を含まない、単離抗ＦＸＩ抗体またはその抗原結合性断片が提示される。さらに具体的な態様では、単離抗ＦＸＩ抗体またはその抗原結合性断片は、表２に明示された配列から選択される、ＨＣＤＲ１、ＨＣＤＲ２、ＨＣＤＲ３、ＬＣＤＲ１、ＬＣＤＲ２、およびＬＣＤＲ３の配列を含む。
【０１７１】
本明細書の具体的な態様では、ＦＸＩおよび／またはＦＸＩａの触媒ドメイン内に結合する単離抗ＦＸＩ抗体またはその抗原結合性断片であって、重鎖可変領域（ＶＨ）と、軽鎖可変領域（ＶＬ）とを含み、ＶＨが、配列番号４８のアミノ酸配列と、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、または、少なくとも９９％同一なアミノ酸配列を含み、ＶＬが、配列番号３４のアミノ酸配列と、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、または、少なくとも９９％同一なアミノ酸配列を含み、かつ、ＶＨが、配列番号１２のアミノ酸配列を含まず、ＶＬが、配列番号２３のアミノ酸配列を含まない、単離抗ＦＸＩ抗体またはその抗原結合性断片が提示される。さらに具体的な態様では、単離抗ＦＸＩ抗体またはその抗原結合性断片は、表２に明示された配列から選択される、ＨＣＤＲ１、ＨＣＤＲ２、ＨＣＤＲ３、ＬＣＤＲ１、ＬＣＤＲ２、およびＬＣＤＲ３の配列を含む。
【０１７２】
本明細書の具体的な態様では、ＦＸＩおよび／またはＦＸＩａの触媒ドメイン内に結合する単離抗ＦＸＩ抗体またはその抗原結合性断片であって、重鎖可変領域（ＶＨ）と、軽鎖可変領域（ＶＬ）とを含み、ＶＨが、配列番号４１のアミノ酸配列と、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、または、少なくとも９９％同一なアミノ酸配列を含み、ＶＬが、配列番号３４のアミノ酸配列と、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、または、少なくとも９９％同一なアミノ酸配列を含み、かつ、ＶＨが、配列番号１２のアミノ酸配列を含まず、ＶＬが、配列番号２３のアミノ酸配列を含まない、単離抗ＦＸＩ抗体またはその抗原結合性断片が提示される。さらに具体的な態様では、単離抗ＦＸＩ抗体またはその抗原結合性断片は、表２に明示された配列から選択される、ＨＣＤＲ１、ＨＣＤＲ２、ＨＣＤＲ３、ＬＣＤＲ１、ＬＣＤＲ２、およびＬＣＤＲ３の配列を含む。
【０１７３】
本明細書の具体的な態様では、ＦＸＩおよび／またはＦＸＩａの触媒ドメイン内に結合する単離抗ＦＸＩ抗体またはその抗原結合性断片であって、重鎖可変領域（ＶＨ）と、軽鎖可変領域（ＶＬ）とを含み、ＶＨが、配列番号３０のアミノ酸配列と、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、または、少なくとも９９％同一なアミノ酸配列を含み、ＶＬが、配列番号３４のアミノ酸配列と、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、または、少なくとも９９％同一なアミノ酸配列を含み、かつ、ＶＨが、配列番号１２のアミノ酸配列を含まず、ＶＬが、配列番号２３のアミノ酸配列を含まない、単離抗ＦＸＩ抗体またはその抗原結合性断片が提示される。さらに具体的な態様では、単離抗ＦＸＩ抗体またはその抗原結合性断片は、表２に明示された配列から選択される、ＨＣＤＲ１、ＨＣＤＲ２、ＨＣＤＲ３、ＬＣＤＲ１、ＬＣＤＲ２、およびＬＣＤＲ３の配列を含む。
【０１７４】
本明細書で使用される、２つの配列の間の同一性パーセントとは、２つの配列の最適なアライメントのために導入される必要があるギャップの数および各ギャップの長さを考慮する配列により共有される、同一な位置の数の関数（すなわち、同一性％＝同一な位置の数／位置の総数×１００）である。２つの配列の間の配列の比較および同一性パーセントの決定は、下記の非限定的な例で記載されている、数学的アルゴリズムを使用して達成することができる。
【０１７５】
加えて、または代替的に、本開示のタンパク質配列は、公表されたデータベースに照らして検索を実施する、例えば、関連の配列を同定するための「クエリー配列」としてさらに使用することもできる。例えば、このような検索は、Altschulら、1990 J. Mol. Biol. 215:403〜10によるＢＬＡＳＴプログラム（バージョン２．０）を使用して実施することができる。
【０１７６】
保存的修飾を伴う抗体
ある種の実施形態では、本開示の抗体は、ＣＤＲ１配列、ＣＤＲ２配列、およびＣＤＲ３配列を含む重鎖可変領域、ならびにＣＤＲ１配列、ＣＤＲ２配列、およびＣＤＲ３配列を含む軽鎖可変領域を有し、この場合、これらのＣＤＲ配列の１つまたは複数は、本明細書で記載される抗体またはそれらの保存的修飾に基づき指定されたアミノ酸配列を有し、抗体は、本開示のＦＸＩａ結合性抗体の所望の機能的特性を保持する。
【０１７７】
したがって、本開示は、表２における配列から選択される、ＨＣＤＲ１、ＨＣＤＲ２、およびＨＣＤＲ３の配列を含む重鎖可変領域、およびこれらの保存的修飾と、表２における配列から選択される、ＬＣＤＲ１、ＬＣＤＲ２、およびＬＣＤＲ３の配列を含む軽鎖可変領域、およびこれらの保存的修飾とを含む単離抗体またはその抗原結合性断片を提示し、抗体またはその抗原結合性断片は、ＦＸＩおよび／またはＦＸＩａに特異的に結合するが、この場合、抗体またはその抗原結合性断片は、抗体ＮＯＶ１４０１またはＮＯＶ１０９０ではない。
【０１７８】
具体的な態様では、本開示は、表２に記載されている抗体ＡＭ４の、ＨＣＤＲ１、ＨＣＤＲ２、およびＨＣＤＲ３の配列を含む重鎖可変領域、およびこれらの保存的修飾と、表２に記載されている抗体ＡＭ４の、ＬＣＤＲ１、ＬＣＤＲ２、およびＬＣＤＲ３の配列を含む軽鎖可変領域、およびこれらの保存的修飾とを含む単離抗体またはその抗原結合性断片を提示し、抗体またはその抗原結合性断片は、ＦＸＩおよび／またはＦＸＩａに特異的に結合するが、この場合、抗体またはその抗原結合性断片は、抗体ＮＯＶ１４０１またはＮＯＶ１０９０ではない。
【０１７９】
具体的な態様では、本開示は、表２に記載されている抗体ＡＭ２の、ＨＣＤＲ１、ＨＣＤＲ２、およびＨＣＤＲ３の配列を含む重鎖可変領域、およびこれらの保存的修飾と、表２に記載されている抗体ＡＭ２の、ＬＣＤＲ１、ＬＣＤＲ２、およびＬＣＤＲ３の配列を含む軽鎖可変領域、およびこれらの保存的修飾とを含む単離抗体またはその抗原結合性断片を提示し、抗体またはその抗原結合性断片は、ＦＸＩおよび／またはＦＸＩａに特異的に結合するが、この場合、抗体またはその抗原結合性断片は、抗体ＮＯＶ１４０１またはＮＯＶ１０９０ではない。
【０１８０】
具体的な態様では、本開示は、表２に記載されている抗体ＡＭ１の、ＨＣＤＲ１、ＨＣＤＲ２、およびＨＣＤＲ３の配列を含む重鎖可変領域、およびこれらの保存的修飾と、表２に記載されている抗体ＡＭ１の、ＬＣＤＲ１、ＬＣＤＲ２、およびＬＣＤＲ３の配列を含む軽鎖可変領域、およびこれらの保存的修飾とを含む単離抗体またはその抗原結合性断片を提示し、抗体またはその抗原結合性断片は、ＦＸＩおよび／またはＦＸＩａに特異的に結合するが、この場合、抗体またはその抗原結合性断片は、抗体ＮＯＶ１４０１またはＮＯＶ１０９０ではない。
【０１８１】
他の実施形態では、本開示の抗体は、哺乳動物細胞における発現について最適化されており、全長重鎖配列および全長軽鎖配列を有し、これらの配列の１つまたは複数は、本明細書で記載される抗体またはそれらの保存的修飾に基づき指定されたアミノ酸配列を有し、抗体は、本開示のＦＸＩａ結合性抗体の所望の機能的特性を保持する。したがって、本開示は、哺乳動物細胞における発現のために最適化され、全長重鎖および全長軽鎖からなる単離抗体であって、全長重鎖が、表２に記載されている配列から選択されるアミノ酸配列、およびこれらの保存的修飾を有し、全長軽鎖が、表２に記載されている配列から選択されるアミノ酸配列、およびこれらの保存的修飾を有し、ＦＸＩおよび／またはＦＸＩａ（例えば、ヒト、ウサギ、およびカニクイザルのＦＸＩａ）に特異的に結合する単離抗体を提示する。
【０１８２】
操作抗体および修飾抗体
出発抗体から特性を改変した修飾抗体を操作する出発材料として、本明細書で示されるＶＨ配列および／またはＶＬ配列の１つまたは複数を有する抗体を使用して、本開示の抗体をさらに調製することができる。抗体は、一方または両方の可変領域（すなわち、ＶＨおよび／またはＶＬ）内、例えば、１つもしくは複数のＣＤＲ領域内、および／または１つもしくは複数のフレームワーク領域内の１つまたは複数の残基を修飾することにより操作することができる。加えて、または代替的に、抗体は、定常領域内の残基を修飾して、例えば、抗体のエフェクター機能を改変することによっても操作することができる。
【０１８３】
実施しうる可変領域操作の１つの種類は、ＣＤＲグラフティングである。抗体は、主に６つの重鎖および軽鎖相補性決定領域（ＣＤＲ）内に位置するアミノ酸残基を介して、標的抗原と相互作用する。この理由で、ＣＤＲ内のアミノ酸配列は、個別の抗体の間の多様性が、ＣＤＲの外部の配列より大きい。ＣＤＲ配列は、大半の抗体−抗原間相互作用の一因となるため、異なる特性を伴う異なる抗体に由来するフレームワーク配列にグラフトされた特異的自然発生抗体に由来するＣＤＲ配列を含む発現ベクターを構築することにより、特異的自然発生抗体の特性を模倣する組換え抗体を発現させることが可能である（例えば、Riechmann, L.ら、1998 Nature 332:323〜327; Jones, P.ら、1986 Nature 321:522〜525; Queen, C.ら、1989 Proc. Natl. Acad. U.S.A. 86:10029〜10033、Ｗｉｎｔｅｒによる米国特許第５，２２５，５３９号明細書、ならびにＱｕｅｅｎらによる米国特許第５，５３０，１０１号明細書、同第５，５８５，０８９号明細書、同第５，６９３，７６２号明細書、および同第６，１８０，３７０号明細書を参照されたい）。
【０１８４】
このようなフレームワーク配列は、生殖細胞系列の抗体遺伝子配列を含む公表されたＤＮＡデータベースまたは公表された参考文献から得ることができる。例えば、ヒト重鎖および軽鎖可変領域遺伝子の生殖細胞系列ＤＮＡ配列は、ヒト生殖細胞系列の配列データベースである「ＶＢａｓｅ」（インターネットのmrc-cpe.cam.ac.uk/vbaseで入手可能である）のほか、それらの各々の内容が、参照により本明細書に明示的に組み込まれる、Kabat, E. A.ら、1991 Sequences of Proteins of Immunological Interest、5版、U.S. Department of Health and Human Services、NIH Publication第91-3242号; Tomlinson, I. M.ら、1992 J. Mol. Biol. 227:776〜798、およびCox, J. P. L.ら、1994 Eur. J Immunol. 24:827〜836においても見出すことができる。
【０１８５】
本開示の抗体における使用のためのフレームワーク配列の例は、本開示の、選択された抗体により使用されるフレームワーク配列、例えば、本開示のモノクローナル抗体により使用されるコンセンサス配列および／またはフレームワーク配列と構造的に類似するフレームワーク配列である。ＶＨ  ＣＤＲ１配列、ＶＨ  ＣＤＲ２配列、およびＶＨ  ＣＤＲ３配列、ならびにＶＬ  ＣＤＲ１配列、ＶＬ  ＣＤＲ２配列、およびＶＬ  ＣＤＲ３配列は、フレームワーク配列が由来する生殖細胞系列の免疫グロブリン遺伝子内で見出される配列と同一の配列を有するフレームワーク領域にグラフトすることもでき、ＣＤＲ配列は、生殖細胞系列配列と比較して、１つまたは複数の突然変異を含有するフレームワーク領域にグラフトすることもできる。例えば、ある種の場合には、フレームワーク領域内の残基を突然変異させて、抗体の抗原結合能力を維持または増強することが有益であると見出されている（例えば、Ｑｕｅｅｎらによる米国特許第５，５３０，１０１号明細書、同第５，５８５，０８９号明細書、同第５，６９３，７６２号明細書、および同第６，１８０，３７０号明細書を参照されたい）。本明細書で記載される抗体および抗原結合性断片をその上に構築する足場として用いられうるフレームワークは、ＶＨ１Ａ、ＶＨ１Ｂ、ＶＨ３、Ｖｋ１、Ｖｌ２、およびＶｋ２を含むがこれらに限定されない。当技術分野では、さらなるフレームワークが知られており、例えば、インターネットのvbase.mrc-cpe.cam.ac.uk/index.php?&MMN_position=1:1上のｖＢａｓｅデータベースにおいて見出すことができる。
【０１８６】
したがって、本開示の実施形態は、配列番号３０、４１、および４８からなる群から選択されるアミノ酸配列、またはこのような配列のフレームワーク領域内に１、２、３、４、もしくは５カ所のアミノ酸置換、アミノ酸欠失、もしくはアミノ酸付加を有するアミノ酸配列を含む重鎖可変領域を含み、配列番号３４および５５からなる群から選択されるアミノ酸配列、またはこのような配列のフレームワーク領域内に１、２、３、４、もしくは５カ所のアミノ酸置換、アミノ酸欠失、もしくはアミノ酸付加を有するアミノ酸配列を有する軽鎖可変領域をさらに含み、ＮＯＶ１４０１ではない単離ＦＸＩ／ＦＸＩａ結合性抗体またはそれらの抗原結合性断片に関する。
【０１８７】
可変領域修飾の別の種類は、「アフィニティー成熟」として公知の、ＶＨ  ＣＤＲ１領域内、ＶＨ  ＣＤＲ２領域内、および／もしくはＶＨ  ＣＤＲ３領域内、ならびに／またはＶＬ  ＣＤＲ１領域内、ＶＬ  ＣＤＲ２領域内、および／もしくはＶＬ  ＣＤＲ３領域内のアミノ酸残基を突然変異させて、これにより、対象の抗体の１つまたは複数の結合特性（例えば、アフィニティー）を改善することである。部位特異的突然変異誘発またはＰＣＲ媒介突然変異誘発を実施して、突然変異を導入することができ、本明細書で記載され、実施例でも提示される、ｉｎ  ｖｉｔｒｏアッセイまたはｉｎ  ｖｉｖｏアッセイにおいて、抗体結合性または他の対象の機能的特性に対する効果を査定することができる。保存的修飾（上記で論じた）を導入することができる。突然変異は、アミノ酸の置換の場合もあり、付加の場合もあり、欠失の場合もある。さらに、ＣＤＲ領域内の、典型的には１つ、２つ、３つ、４つ、または５つ以下の残基も改変する。
【０１８８】
抗原結合性ドメインの、代替的なフレームワークまたは足場へのグラフティング
結果として得られるポリペプチドが、ＦＸＩａに特異的に結合する少なくとも１つの結合性領域を含む限りにおいて、多種多様な抗体／免疫グロブリンのフレームワークまたは足場を利用することができる。このようなフレームワークまたは足場は、ヒト免疫グロブリンまたはそれらの断片の５つの主要なイディオタイプを含み、好ましくはヒト化側面を有する他の動物種の免疫グロブリンを含む。この点で、ラクダ科動物において同定される単一重鎖抗体などの単一重鎖抗体は、特に対象である。当業者により、新規のフレームワーク、足場、および断片が、発見および開発され続けている。
【０１８９】
一態様では、本開示は、本開示のＣＤＲをグラフトしうる非免疫グロブリン足場を使用して、非免疫グロブリンベースの抗体を作り出すことに関する。それらが、標的のＦＸＩタンパク質および／またはＦＸＩａタンパク質に特異的な結合性領域を含む限りにおいて、公知または将来の非免疫グロブリンフレームワークおよび非免疫グロブリン足場を利用することができる。公知の非免疫グロブリンフレームワークおよび非免疫グロブリン足場は、フィブロネクチン（Ｃｏｍｐｏｕｎｄ  Ｔｈｅｒａｐｅｕｔｉｃｓ，Ｉｎｃ．、Ｗａｌｔｈａｍ、ＭＡ）、アンキリン（Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｐａｒｔｎｅｒｓ  ＡＧ、Ｚｕｒｉｃｈ、Ｓｗｉｔｚｅｒｌａｎｄ）、ドメイン抗体（Ｄｏｍａｎｔｉｓ，Ｌｔｄ．、Ｃａｍｂｒｉｄｇｅ、ＭＡ、およびＡｂｌｙｎｘ  ｎｖ、Ｚｗｉｊｎａａｒｄｅ、Ｂｅｌｇｉｕｍ）、リポカリン（Ｐｉｅｒｉｓ  Ｐｒｏｔｅｏｌａｂ  ＡＧ、Ｆｒｅｉｓｉｎｇ、Ｇｅｒｍａｎｙ）、低分子モジュラー免疫医薬（Ｔｒｕｂｉｏｎ  Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌｓ  Ｉｎｃ．、Ｓｅａｔｔｌｅ、ＷＡ）、マキシボディ（Ａｖｉｄｉａ，Ｉｎｃ．、Ｍｏｕｎｔａｉｎ  Ｖｉｅｗ、ＣＡ）、プロテインＡ（Ａｆｆｉｂｏｄｙ  ＡＧ、Ｓｗｅｄｅｎ）、およびアフィリン（ガンマ−クリスタリンまたはユビキチン）（Ｓｃｉｌ  Ｐｒｏｔｅｉｎｓ  ＧｍｂＨ、Ｈａｌｌｅ、Ｇｅｒｍａｎｙ）を含むがこれらに限定されない。
【０１９０】
フィブロネクチン足場は、ＩＩＩ型フィブロネクチンドメイン（例えば、ＩＩＩ型フィブロネクチンの第１０モジュール（１０  Ｆｎ３ドメイン））に基づく。ＩＩＩ型フィブロネクチンドメインは、それら自体が互いに対してパックされてタンパク質のコアを形成し、ベータ鎖を互いに接続し、溶媒に露出されるループもさらに含有する（ＣＤＲと類似する）、２つのベータシートの間に分配された、７つまたは８つのベータ鎖を有する。ベータシートサンドイッチの各エッジには、少なくとも３つのこのようなループがあり、エッジは、ベータ鎖の方向に対して垂直なタンパク質の境界である（ＵＳ６，８１８，４１８を参照されたい）。全体的なフォールドは、ラクダおよびラマＩｇＧ内の抗原認識単位全体を含む最小の機能的抗体断片である重鎖可変領域のフォールドと密接に関連するが、これらのフィブロネクチンベースの足場は、免疫グロブリンではない。この構造のために、非免疫グロブリン抗体は、性質およびアフィニティーが抗体の性質およびアフィニティーと類似する抗原結合特性を模倣する。これらの足場は、ｉｎ  ｖｉｖｏにおける抗体のアフィニティー成熟の工程と類似する、ｉｎ  ｖｉｔｒｏにおけるループのランダム化戦略およびシャフリング戦略において使用することができる。これらのフィブロネクチンベースの分子は、標準的なクローニング法を使用して、分子のループ領域を本開示のＣＤＲで置きかえうる、足場として使用することができる。
【０１９１】
アンキリン技術は、アンキリンに由来するリピートモジュールを伴うタンパク質を、異なる標的への結合に使用しうる可変領域を保有する足場として使用することに基づく。アンキリンリピートモジュールとは、２つのアンチパラレルのα−ヘリックスおよびβ−ターンからなる、３３アミノ酸のポリペプチドである。可変領域の結合は、リボソームディスプレイを使用することにより大部分が最適化される。
【０１９２】
アビマーは、ＬＲＰ−１など、天然のＡドメイン含有タンパク質に由来する。これらのドメインは、本来、タンパク質間相互作用に使用され、ヒトでは、２５０を超えるタンパク質が、構造的にＡドメインに基づく。アビマーは、アミノ酸リンカーを介して連結された多数の（２つ〜１０の）異なる「Ａドメイン」単量体からなる。標的抗原に結合しうるアビマーは、例えば、米国特許出願公開第２００４０１７５７５６号明細書、同第２００５００５３９７３号明細書、同第２００５００４８５１２号明細書、および同第２００６０００８８４４号明細書において記載されている方法を使用して創出することができる。
【０１９３】
アフィニティーリガンドであるアフィボディとは、プロテインＡのＩｇＧ結合性ドメインの１つの足場に基づく３ヘリックスバンドルからなる、低分子の単純なタンパク質である。プロテインＡとは、細菌である黄色ブドウ球菌（Staphylococcus aureus）に由来する表面タンパク質である。この足場ドメインは５８アミノ酸からなり、それらのうちの１３がランダム化されており、多数のリガンド変異体を伴うアフィボディライブラリーを作り出す（例えば、ＵＳ５，８３１，０１２を参照されたい）。アフィボディ分子は、抗体を模倣し、１５０ｋＤａである抗体の分子量と比較して、分子量が６ｋＤａである。その小サイズにもかかわらず、アフィボディ分子の結合部位は、抗体の結合部位と同様である。
【０１９４】
アンチカリンとは、Ｐｉｅｒｉｓ  ＰｒｏｔｅｏＬａｂ  ＡＧ社により開発された生成物である。アンチカリンは、通例、化学的に感受性の化合物または不溶性の化合物の生理学的輸送または貯蔵に関与する、広範にわたる低分子の頑健なタンパク質群であるリポカリンに由来する。いくつかの天然リポカリンは、ヒト組織内またはヒト体液中で生じる。タンパク質のアーキテクチャーは、リジッドフレームワークの上部の超可変ループを伴う免疫グロブリンを連想させる。しかし、抗体またはそれらの組換え断片とは対照的に、リポカリンは、単一の免疫グロブリンドメインよりかろうじて大きい、１６０〜１８０アミノ酸残基を伴う単一のポリペプチド鎖からなる。結合性ポケットを構成する４つのループのセットは、顕著な構造可塑性を示し、様々な側鎖を許容する。したがって、異なる形状の規定の標的分子を、高度なアフィニティーおよび特異性で認識するために、結合性部位を独自の工程で再形成することができる。４つのループのセットを突然変異誘発することによりアンチカリンを開発するのには、リポカリンファミリーの１つのタンパク質である、オオモンシロチョウ（Pieris Brassicae）のビリン結合性タンパク質（ＢＢＰ）が使用されている。アンチカリンについて記載する特許出願の１つの例は、ＰＣＴ公開国際公開第１９９９１６８７３号パンフレットにある。
【０１９５】
アフィリン分子とは、タンパク質および低分子に対する特異的なアフィニティーのためにデザインされた低分子非免疫グロブリンタンパク質である。新たなアフィリン分子は、それらの各々が、異なるヒト由来の足場タンパク質に基づく２つのライブラリーから非常に迅速に選択することができる。アフィリン分子は、免疫グロブリンタンパク質に対するいかなる構造相同性も示さない。現在、２つのアフィリン足場が利用されており、それらの一方は、ヒト水晶体の構造タンパク質であるガンマクリスタリンであり、他方は、「ユビキチン」スーパーファミリータンパク質である。いずれのヒト足場も非常に小型で、高度な熱安定性を示し、ｐＨ変化および変性剤に対してほぼ耐性である。この高度な安定性は主に、タンパク質のベータシート構造の展開に起因する。ガンマクリスタリンに由来するタンパク質の例は、ＷＯ２００１０４１４４において記載されており、「ユビキチン様」タンパク質の例は、ＷＯ２００４１０６３６８において記載されている。
【０１９６】
タンパク質エピトープ模倣体（ＰＥＭ）とは、タンパク質間相互作用に関与する主要な二次構造である、タンパク質のベータ−ヘアピン二次構造を模倣する、中程度のサイズの環状ペプチド様分子（分子量：１〜２ｋＤａ）である。
【０１９７】
本開示は、ＦＸＩおよび／またはＦＸＩａタンパク質に特異的に結合する完全ヒト抗体を提供する。キメラ抗体またはヒト化抗体と比較して、本開示のヒトＦＸＩ／ＦＸＩａ結合性抗体は、ヒト対象に投与された場合の抗原性がさらに低減されている。
【０１９８】
ラクダ科動物抗体
ラマ種（アルパカ（Lama paccos）、ラマ（Lama glama）、およびビクーニャ（Lama vicugna））などの新世界メンバーを含む、ラクダおよびヒトコブラクダ（dromedary）（フタコブラクダ（Camelus bactrianus）およびヒトコブラクダ（Calelus dromaderius））ファミリーのメンバーから得られる抗体タンパク質は、サイズ、構造的複雑性、およびヒト対象に対する抗原性に関して特徴付けられている。天然で見出されるこのファミリーの哺乳動物に由来するある種のＩｇＧ抗体は、軽鎖を欠き、したがって、他の動物に由来する抗体の場合の、２つの重鎖および２つの軽鎖を有する、典型的な４つの鎖の四次構造とは構造的に異なっている。ＰＣＴ／ＥＰ９３／０２２１４（１９９４年３月３日に公表された国際公開第９４／０４６７８号パンフレット）を参照されたい。
【０１９９】
ＶＨＨとして同定される小型の単一の可変ドメインである、ラクダ科動物抗体の領域は、標的に対して高いアフィニティーを有する低分子タンパク質をもたらすことから、「ラクダ科動物ナノボディ」として公知の低分子量抗体由来タンパク質を結果としてもたらす遺伝子操作により得ることができる。１９９８年６月２日に取得された米国特許第５，７５９，８０８号を参照されたい。また、Stijlemans, B.ら、2004 J Biol Chem 279:1256〜1261; Dumoulin, M.ら、2003 Nature 424:783〜788; Pleschberger, M.ら、2003 Bioconjugate Chem 14:440〜448; Cortez-Retamozo, V.ら、2002 Int J Cancer 89:456〜62、およびLauwereys, M.ら、1998 EMBO J 17:3512〜3520も参照されたい。ラクダ科動物抗体および抗体断片の操作ライブラリーは、例えば、Ａｂｌｙｎｘ、Ｇｈｅｎｔ、Ｂｅｌｇｉｕｍから市販されている。非ヒト由来の他の抗体と同様に、ラクダ科動物抗体のアミノ酸配列は、ヒト配列により酷似する配列を得るように、組換えにより改変することができる、すなわち、ナノボディは、「ヒト化」することができる。したがって、ヒトに対するラクダ科動物抗体の天然の小さな抗原性を、さらに低減することができる。
【０２００】
ラクダ科動物ナノボディの分子量は、ヒトＩｇＧ分子の分子量の約１０分の１で、タンパク質の物理的直径は、数ナノメートルに過ぎない。サイズが小さいことの１つの帰結は、大型の抗体タンパク質には機能的に不可視である抗原性部位に結合するラクダ科動物ナノボディの能力である、すなわち、ラクダ科動物ナノボディは、古典的な免疫学的技法を使用するこれ以外の形では隠蔽されたままの抗原を検出する試薬として有用であり、可能な治療剤として有用である。したがって、サイズが小さいことのさらに別の帰結は、ラクダ科動物ナノボディが、標的タンパク質のグルーブ内または狭小なクレフト内の特異的部位に結合することの結果として、標的タンパク質を阻害することが可能であり、よって、古典的な抗体の機能よりも、古典的な低分子量の薬物の機能により酷似する能力において用いられうることである。
【０２０１】
低分子量およびコンパクトなサイズはさらに、熱安定性が極めて大きく、極端なｐＨおよびタンパク質分解性消化に対して安定的であり、抗原性が小さいラクダ科動物ナノボディを結果としてもたらす。別の帰結は、ラクダ科動物ナノボディが、循環系から組織にたやすく移動し、血液脳関門もなお越え、神経組織に影響を及ぼす障害も処置しうることである。ナノボディはさらに、血液脳関門を越える薬物輸送も容易としうる。２００４年８月１９日に公表された米国特許出願第２００４０１６１７３８号明細書を参照されたい。これらの特色を、ヒトに対する抗原性が小さいことと組み合わせることにより、大きな治療的可能性が指し示される。さらに、これらの分子は、大腸菌（E. coli）などの原核細胞内で完全に発現させることができ、バクテリオファージとの融合タンパク質として発現させ、機能的である。
【０２０２】
したがって、本開示の特色は、ＦＸＩおよび／またはＦＸＩａに対して高いアフィニティーを有するラクダ科動物抗体またはラクダ科動物ナノボディである。本明細書のある種の実施形態では、ラクダ科動物抗体またはラクダ科動物ナノボディは、天然ではラクダ科動物において産生される、すなわち、他の抗体について本明細書で記載される技法を使用する、ＦＸＩおよび／またはＦＸＩａまたはそのペプチド断片による免疫化の後で、ラクダ科動物により産生される。代替的に、ＦＸＩおよび／またはＦＸＩａ結合性ラクダ科動物ナノボディは、操作されたものである、すなわち、例えば、本明細書の実施例において記載されている、標的としてのＦＸＩおよび／もしくはＦＸＩａ、ならびに／またはそのドメインおよび／もしくはペプチド断片を伴うパニング手順を使用する、適切に突然変異誘発させたラクダ科動物ナノボディタンパク質を提示するファージライブラリーからの選択によって作製される。操作されたナノボディはさらに、遺伝子操作により、レシピエント対象における半減期が、４５分間〜２週間となるようにカスタマイズすることもできる。具体的な実施形態では、ラクダ科動物抗体またはラクダ科動物ナノボディを、例えば、ＰＣＴ／ＥＰ９３／０２２１４において記載されている通り、本開示のヒト抗体の重鎖または軽鎖のＣＤＲ配列を、ナノボディまたは単一ドメイン抗体フレームワーク配列にグラフトすることにより得る。
【０２０３】
二特異性分子および多価抗体
別の態様では、本開示は、本開示のＦＸＩ結合性抗体および／またはＦＸＩａ結合性抗体またはその断片を含む二特異性分子または多特異性分子を特色とする。本開示の抗体またはその抗原結合性領域は、少なくとも２つの異なる結合性部位または標的分子に結合する二特異性分子を作り出すように誘導体化することもでき、別の機能的分子、例えば、別のペプチドまたはタンパク質（例えば、受容体に対する別の抗体またはリガンド）に連結することもできる。本開示の抗体は実際、３つ以上の異なる結合性部位および／または標的分子に結合する多特異性分子を作り出すように誘導体化することもでき、他の２つ以上の機能的分子に連結することもでき、このような多特異性分子はまた、本明細書で使用される「二特異性分子」という用語により包含されることも意図される。本開示の二特異性分子を創出するには、本開示の抗体を、二特異性分子が結果として得られるように、別の抗体、抗体断片、ペプチド、または結合性模倣体など、１つまたは複数の他の結合性分子に機能的に連結する（例えば、化学的カップリング、遺伝子融合、非共有結合的会合により、またはこれら以外の形で）ことができる。
【０２０４】
したがって、本開示は、ＦＸＩおよび／もしくはＦＸＩａに対する少なくとも１つの第１の結合特異性および第２の標的エピトープに対する第２の結合特異性を含む二特異性分子を含む。例えば、第２の標的エピトープは、第１の標的エピトープと異なる、ＦＸＩおよび／もしくはＦＸＩａの別のエピトープである。
【０２０５】
加えて、二特異性分子が多特異性である本開示では、分子は、第１の標的エピトープおよび第２の標的エピトープに加えて、第３の結合特異性もさらに含みうる。
【０２０６】
一実施形態では、本開示の二特異性分子は、結合特異性として、例えば、Ｆａｂ、Ｆａｂ’、Ｆ（ａｂ’）２、Ｆｖ、または単鎖Ｆｖを含む、少なくとも１つの抗体またはその抗体断片を含む。抗体はまた、軽鎖もしくは重鎖の二量体、またはＬａｄｎｅｒら、米国特許第４，９４６，７７８号明細書において記載されている、Ｆｖもしくは単鎖構築物など、その任意の最小断片でありうる。
【０２０７】
ダイアボディとは、同じ鎖上の２つのドメインの間の対合を可能とするには短すぎるリンカーにより接続されたＶＨドメインおよびＶＬドメインを単一のポリペプチド鎖上で発現させた、二価の二特異性分子である。ＶＨドメインおよびＶＬドメインは、別の鎖の相補的なドメインと対合し、これにより、２つの抗原結合性部位を創出する（例えば、Holligerら、1993 Proc. Natl. Acad. Sci. USA 90:6444〜6448; Poljakら、1994 Structure 2:1121〜1123を参照されたい）。ダイアボディは、ＶＨＡ−ＶＬＢおよびＶＨＢ−ＶＬＡ構造（ＶＨ−ＶＬ立体配置）、またはＶＬＡ−ＶＨＢおよびＶＬＢ−ＶＨＡ構造（ＶＬ−ＶＨ立体配置）を伴う２つのポリペプチド鎖を、同じ細胞内で発現させることにより作製することができる。ダイアボディの大半は、細菌内の可溶性形態で発現させることができる。単鎖ダイアボディ（ｓｃＤｂ）は、２つのダイアボディ形成ポリペプチド鎖を、約１５アミノ酸残基のリンカーで接続することにより作製する（HolligerおよびWinter、1997 Cancer Immunol. Immunother.、45（3〜4）:128〜30; Wuら、1996 Immunotechnology、2（1）:21〜36を参照されたい）。ｓｃＤｂは、細菌内の可溶性で活性の単量体形態で発現させることができる（HolligerおよびWinter、1997 Cancer Immunol. Immunother.、45（34）:128〜30; Wuら、1996 Immunotechnology、2（1）:21〜36; PluckthunおよびPack、1997 Immunotechnology、3（2）:83〜105; Ridgwayら、1996 Protein Eng.、9（7）:617〜21を参照されたい）。ダイアボディをＦｃと融合させて、「ジダイアボディ」を作り出すことができる（Luら、2004 J. Biol. Chem.、279（4）:2856〜65を参照されたい）。
【０２０８】
本開示の二特異性分子内で利用しうる他の抗体は、マウスモノクローナル抗体、キメラモノクローナル抗体、およびヒト化モノクローナル抗体である。
【０２０９】
二特異性分子は、当技術分野で公知の方法を使用して、構成要素である結合特異性をコンジュゲートさせることにより調製することができる。例えば、二特異性分子の各結合特異性は、個別に作り出し、次いで、互いとコンジュゲートさせることができる。結合特異性がタンパク質またはペプチドである場合は、様々なカップリング剤または架橋剤を、共有結合的コンジュゲーションに使用することができる。架橋剤の例は、プロテインＡ、カルボジイミド、Ｎ−スクシンイミジル−Ｓ−アセチル−チオアセテート（ＳＡＴＡ）、５，５’−ジチオビス（２−ニトロ安息香酸）（ＤＴＮＢ）、ｏ−フェニレンジマレイミド（ｏＰＤＭ）、Ｎ−スクシンイミジル−３−（２−ピリジルジチオ）プロピオネート（ＳＰＤＰ）、およびスルホスクシンイミジル４−（Ｎ−マレイミドメチル）シクロヘキサン−１−カルボキシレート（スルホ−ＳＭＣＣ）を含む（例えば、Karpovskyら、1984 J. Exp. Med. 160:1686、Liu, MAら、1985 Proc. Natl. Acad. Sci. USA 82:8648を参照されたい）。他の方法は、Paulus、1985 Behring Ins. Mitt. 78号、118〜132; Brennanら、1985 Science 229:81〜83、およびGlennieら、1987 J. Immunol. 139:2367〜2375において記載されている方法を含む。コンジュゲート剤は、ＳＡＴＡおよびスルホ−ＳＭＣＣであり、いずれも、Ｐｉｅｒｃｅ  Ｃｈｅｍｉｃａｌ  Ｃｏ．（Ｒｏｃｋｆｏｒｄ、ＩＬ）から入手可能である。
【０２１０】
結合特異性が、抗体である場合、それらは、２つの重鎖のＣ末端ヒンジ領域をスルフヒドリル結合させることによりコンジュゲートさせることができる。特定の実施形態では、コンジュゲーションの前に、奇数のスルフヒドリル残基、例えば、１つのスルフヒドリル残基を含有するように、ヒンジ領域を修飾する。
【０２１１】
代替的に、いずれの結合特異性も、同じベクター内でコードさせ、同じ宿主細胞内で発現およびアセンブルさせることができる。この方法は、二特異性分子が、ｍＡｂ×ｍＡｂ融合タンパク質、ｍＡｂ×Ｆａｂ融合タンパク質、Ｆａｂ×Ｆ（ａｂ’）２融合タンパク質、またはリガンド×Ｆａｂ融合タンパク質である場合に、特に有用である。本開示の二特異性分子は、１つの単鎖抗体および結合決定基を含む単鎖分子の場合もあり、２つの結合決定基を含む単鎖二特異性分子の場合もある。二特異性分子は、少なくとも２つの単鎖分子を含みうる。二特異性分子を調製する方法については、例えば、米国特許第５，２６０，２０３号明細書、米国特許第５，４５５，０３０号明細書、米国特許第４，８８１，１７５号明細書、米国特許第５，１３２，４０５号明細書、米国特許第５，０９１，５１３号明細書、米国特許第５，４７６，７８６号明細書、米国特許第５，０１３，６５３号明細書、米国特許第５，２５８，４９８号明細書、および米国特許第５，４８２，８５８号明細書において記載されている。
【０２１２】
それらの特異的な標的に対する二特異性分子の結合は、例えば、酵素免疫測定アッセイ（ＥＬＩＳＡ）、ラジオイムノアッセイ（ＲＥＡ）、ＦＡＣＳ解析、バイオアッセイ（例えば、成長阻害アッセイ）、またはウェスタンブロットアッセイにより確認することができる。これらのアッセイの各々では一般に、対象の複合体に特異的な、標識された試薬（例えば、抗体）を利用することにより、特に対象となるタンパク質−抗体間複合体の存在が検出される。
【０２１３】
別の態様では、本開示は、ＦＸＩａに結合する、本開示の抗体の少なくとも２つの同一であるかまたは異なる抗原結合性部分を含む、多価化合物を提供する。抗原結合性部分は、タンパク質の融合または共有結合的連結もしくは非共有結合的連結を介して、併せて連結することができる。代替的に、二特異性分子のための連結法も記載されている。四価化合物は、例えば、本開示の抗体を、本開示の抗体の定常領域に結合する抗体、例えば、Ｆｃ領域またはヒンジ領域と架橋することにより得ることができる。
【０２１４】
三量体化ドメインについては、例えば、Ｂｏｒｅａｎによる特許であるＥＰ１０１２２８０Ｂ１において記載されている。五量体化モジュールについては、例えば、ＰＣＴ／ＥＰ９７／０５８９７において記載されている。
【０２１５】
半減期を延長した抗体
本開示は、ｉｎ  ｖｉｖｏにおける半減期を延長した、ＦＸＩ／ＦＸＩａタンパク質に特異的に結合する抗体を提供する。
【０２１６】
多くの因子が、ｉｎ  ｖｉｖｏにおけるタンパク質の半減期に影響を及ぼしうる。例えば、腎臓における濾過、肝臓における代謝、タンパク質分解性酵素（プロテアーゼ）による分解、および免疫原性応答（例えば、抗体によるタンパク質の中和およびマクロファージおよび樹状細胞による取込み）。様々な戦略を使用して、本開示の抗体の半減期を延長することができる。例えば、ポリエチレングリコール（ＰＥＧ）、ｒｅＣＯＤＥ  ＰＥＧ、抗体足場、ポリシアル酸（ＰＳＡ）、ヒドロキシエチルデンプン（ＨＥＳ）、アルブミン結合性リガンド、および炭水化物シールドとの化学的連結により、アルブミン、ＩｇＧ、ＦｃＲｎ、およびトランスフェリンなどの血清タンパク質に結合するタンパク質との遺伝子融合により、ナノボディ、Ｆａｂ、ＤＡＲＰｉｎ、アビマー、アフィボディ、およびアンチカリンなど、血清タンパク質に結合する他の結合部分とカップリングする（遺伝子的または化学的に）ことにより、ｒＰＥＧ、アルブミン、アルブミンのドメイン、アルブミン結合性タンパク質、およびＦｃとの遺伝子融合により、またはナノ担体、徐放製剤、もしくは医療デバイスへの組込みにより、本発明の抗体の半減期を延長することができる。
【０２１７】
ｉｎ  ｖｉｖｏにおける抗体の血清中循環を延長するため、高分子量のＰＥＧなど、不活性のポリマー分子を、ＰＥＧの、抗体のＮ末端もしくはＣ末端への部位特異的コンジュゲーションを介して、またはリシン残基上に存在するイプシロン−アミノ基を介して、多官能性リンカーを伴うかまたは多官能性リンカーを伴わない、抗体またはそれらの断片に付着することができる。抗体をＰＥＧ化するには、抗体またはその断片を、ポリエチレングリコール（ＰＥＧ）の反応性エステルまたはアルデヒド誘導体などのＰＥＧと、１つまたは複数のＰＥＧ基が抗体または抗体断片に付着する条件下で反応させることが典型的である。ＰＥＧ化は、反応性ＰＥＧ分子（または類似する反応性の水溶性ポリマー）とのアシル化反応またはアルキル化反応により実行することができる。本明細書で使用される「ポリエチレングリコール」という用語は、モノ（Ｃ１〜Ｃ１０）アルコキシ−ポリエチレングリコールもしくはアリールオキシ−ポリエチレングリコールまたはポリエチレングリコール−マレイミドなど、他のタンパク質を誘導体化するのに使用されているＰＥＧの形態のいずれかを包含することを意図するものである。ある種の実施形態では、ＰＥＧ化される抗体は、脱グリコシル化抗体である。直鎖状ポリマーまたは分枝状ポリマーの誘導体化であって、生物学的活性の喪失を結果として最小とする誘導体化が、使用されるであろう。コンジュゲーションの程度を、ＳＤＳ−ＰＡＧＥおよび質量分析により緊密にモニタリングして、ＰＥＧ分子の抗体への適正なコンジュゲーションを確認することができる。反応しなかったＰＥＧは、サイズ除外クロマトグラフィーまたはイオン交換クロマトグラフィーにより、抗体−ＰＥＧコンジュゲートから分離することができる。ＰＥＧ誘導体化抗体は、当業者に周知の方法を使用して、例えば、本明細書で記載されるイムノアッセイにより、結合活性ならびにｉｎ  ｖｉｖｏにおける有効性について調べることができる。当技術分野では、タンパク質をＰＥＧ化する方法が知られており、本開示の抗体に適用することができる。例えば、ＮｉｓｈｉｍｕｒａらによるＥＰ０１５４３１６およびＩｓｈｉｋａｗａらによるＥＰ０４０１３８４を参照されたい。
【０２１８】
他の改変されたＰＥＧ化技術は、ｔＲＮＡシンセターゼおよびｔＲＮＡを含む再構成系を介して、化学的に特定された側鎖を、生合成タンパク質に組み込む、再構成化学的直交性直接操作技術（reconstituting chemically orthogonal directed engineering）（ＲｅＣＯＤＥ  ＰＥＧ）を含む。この技術は、３０を超える新たなアミノ酸の、大腸菌（E. coli）細胞内、酵母細胞内、および哺乳動物細胞内の生合成タンパク質への組込みを可能とする。ｔＲＮＡは、非天然アミノ酸を、アンバーコドンが配置される任意の位置に組み込み、アンバーを終始コドンから、化学的に特定されたアミノ酸の組込みを知らせるコドンに転換する。
【０２１９】
組換えＰＥＧ化技術（ｒＰＥＧ）はまた、血清半減期の延長にも使用することができる。この技術は、３００〜６００アミノ酸の非構造化タンパク質テールを、既存の医薬用タンパク質に遺伝子融合させることを伴う。このような非構造化タンパク質鎖の見かけの分子量は、その実際の分子量の約１５倍であるため、タンパク質の血清半減期は、大きく増大する。化学的コンジュゲーションおよび再精製を要求する従来のＰＥＧ化とは対照的に、製造工程は大きく簡略化され、生成物は、均質である。
【０２２０】
ポリシアリル化は、天然のポリマーであるポリシアル酸（ＰＳＡ）を使用して、活性寿命を延長し、治療用ペプチドおよび治療用タンパク質の安定性を改善する、別の技術である。ＰＳＡとは、シアル酸（糖）のポリマーである。タンパク質および治療用ペプチドの薬物送達に使用される場合、コンジュゲーション時に、ポリシアル酸は、保護的微小環境をもたらす。これは、循環内の治療用タンパク質の活性寿命を延長し、それが免疫系により認識されることを防止する。ＰＳＡポリマーは、天然では、ヒト体内で見出される。ＰＳＡは、数百万年にわたり、それらの壁をＰＳＡでコーティングするように進化したある種の細菌により採用された。次いで、これらの天然でポリシアリル化した細菌は、分子的模倣により、体内の防御系を失効化することが可能となった。自然の究極のステルス技術であるＰＳＡは、このような細菌から、大量に、かつ、所定の物理的特徴を伴って、容易に作製することができる。細菌ＰＳＡは、ヒト体内ではＰＳＡと化学的に同一であるので、タンパク質にカップリングさせた場合でもなお、完全に非免疫原性である。
【０２２１】
別の技術は、抗体に連結されたヒドロキシエチルデンプン（「ＨＥＳ」）誘導体の使用を含む。ＨＥＳとは、蝋状トウモロコシデンプンに由来する、修飾された天然ポリマーであり、体内の酵素により代謝されうる。ＨＥＳ溶液は通例、血液量不足を補い、血液のレオロジー特性を改善するために投与される。抗体のＨＥＳ化は、分子の安定性を増大させることのほか、腎クリアランスを低減することによっても、循環半減期の延長を可能とし、生物学的活性の増大を結果としてもたらす。ＨＥＳの分子量など、異なるパラメータを改変することにより、広範にわたるＨＥＳ抗体コンジュゲートをカスタマイズすることができる。
【０２２２】
ｉｎ  ｖｉｖｏにおける半減期を延長した抗体はまた、１つまたは複数のアミノ酸修飾（すなわち、置換、挿入、または欠失）を、ＩｇＧ定常ドメインまたはそのＦｃＲｎ結合性断片（好ましくはＦｃドメイン断片またはヒンジＦｃドメイン断片）に導入しても作り出すことができる。例えば、国際特許公開第９８／２３２８９号パンフレット、国際特許公開第９７／３４６３１号パンフレット、および米国特許第６，２７７，３７５号明細書を参照されたい。
【０２２３】
さらに、抗体または抗体断片を、ｉｎ  ｖｉｖｏにおいてより安定的とするか、またはｉｎ  ｖｉｖｏにおける半減期を延長するために、抗体を、アルブミン（例えば、ヒト血清アルブミン、ＨＳＡ）にコンジュゲートさせることもできる。当技術分野では、技法が周知であり、例えば、国際特許公開第９３／１５１９９号パンフレット、同第９３／１５２００号パンフレット、および同０１／７７１３７号パンフレット、ならびに欧州特許第４１３，６２２号明細書を参照されたい。加えて、上記で記載した二特異性抗体の文脈では、抗体の特異性は、抗体の１つの結合性ドメインが、ＦＸＩａに結合するのに対し、抗体の第２の結合性ドメインは、血清アルブミン、好ましくは、ＨＳＡに結合するようにデザインすることもできる。
【０２２４】
半減期を延長するための戦略は、ｉｎ  ｖｉｖｏにおける半減期の延長が所望される、ナノボディ、フィブロネクチンベースの結合剤、および他の抗体またはタンパク質においてとりわけ有用である。
【０２２５】
抗体コンジュゲート
本開示は、融合タンパク質を作り出すように、異種タンパク質または異種ポリペプチドに（またはその断片、好ましくは、少なくとも１０、少なくとも２０、少なくとも３０、少なくとも４０、少なくとも５０、少なくとも６０、少なくとも７０、少なくとも８０、少なくとも９０、または少なくとも１００アミノ酸のポリペプチドに）、組換えにより融合させるかまたは化学的にコンジュゲートさせた（共有結合的コンジュゲーションおよび非共有結合的コンジュゲーションの両方を含む）、ＦＸＩ／ＦＸＩａタンパク質に特異的に結合する抗体またはそれらの断片を提供する。特に、本開示は、本明細書で記載される抗体の抗原結合性断片（例えば、Ｆａｂ断片、Ｆｄ断片、Ｆｖ断片、Ｆ（ａｂ）２断片、ＶＨドメイン、ＶＨ  ＣＤＲ、ＶＬドメイン、またはＶＬ  ＣＤＲ）と、異種タンパク質、異種ポリペプチド、または異種ペプチドとを含む融合タンパク質を提供する。当技術分野では、タンパク質、ポリペプチド、またはペプチドを、抗体または抗体断片と融合またはコンジュゲートさせる方法が知られている。例えば、米国特許第５，３３６，６０３号明細書、同第５，６２２，９２９号明細書、同第５，３５９，０４６号明細書、同第５，３４９，０５３号明細書、同第５，４４７，８５１号明細書、および同第５，１１２，９４６号明細書、欧州特許第３０７，４３４号明細書および同第ＥＰ３６７，１６６号明細書、国際特許公開第９６／０４３８８号パンフレットおよび同第９１／０６５７０号パンフレット、Ashkenaziら、1991、Proc. Natl. Acad. Sci. USA 88:10535〜10539; Zhengら、1995、J. Immunol. 154:5590〜5600、およびVilら、1992、Proc. Natl. Acad. Sci. USA 89:11337〜11341を参照されたい。
【０２２６】
さらなる融合タンパク質は、遺伝子シャフリング、モチーフシャフリング、エクソンシャフリング、および／またはコドンシャフリング（まとめて、「ＤＮＡシャフリング」と称する）の技法を介して作り出すことができる。ＤＮＡシャフリングを利用して、本開示の抗体またはそれらの断片の活性を改変する（例えば、アフィニティーが大きく、解離速度が小さい抗体またはそれらの断片）ことができる。一般に、米国特許第５，６０５，７９３号明細書、同第５，８１１，２３８号明細書、同第５，８３０，７２１号明細書、同第５，８３４，２５２号明細書、および同第５，８３７，４５８号明細書、Pattenら、1997、Curr. Opinion Biotechnol. 8:724〜33; Harayama、1998、Trends Biotechnol. 16（2）:76〜82; Hanssonら、1999、J. Mol. Biol. 287:265〜76、ならびにLorenzoおよびBlasco、1998、Biotechniques 24（2）:308〜313（これらの特許および刊行物の各々は、参照によりそれらの全体において本明細書に組み込まれる）を参照されたい。抗体もしくはそれらの断片、またはコードされる抗体もしくはそれらの断片は、組換えの前に、エラープローンＰＣＲによるランダム突然変異誘発、ランダムヌクレオチド挿入、または他の方法にかけることにより改変することができる。ＦＸＩａタンパク質に特異的に結合する抗体またはその断片をコードするポリヌクレオチドは、１つまたは複数の異種分子の１つまたは複数の成分、モチーフ、区間、一部、ドメイン、断片などで組み換えることができる。
【０２２７】
さらに、抗体またはそれらの断片は、精製を容易とするペプチドなどのマーカー配列に融合させることもできる。具体的な実施形態では、マーカーのアミノ酸配列は、それらの多くが市販されている中でとりわけ、ｐＱＥベクター（ＱＩＡＧＥＮ，Ｉｎｃ．、９２５９  Ｅｔｏｎ  Ａｖｅｎｕｅ、Ｃｈａｔｓｗｏｒｔｈ、ＣＡ、９１３１１）において提供されているタグなどのヘキサヒスチジンペプチド（配列番号６８）である。Gentzら、1989、Proc. Natl. Acad. Sci. USA 86:821〜824において記載されている通り、例えば、ヘキサヒスチジン（配列番号６８）は、融合タンパク質の簡便な精製をもたらす。精製に有用な他のペプチドタグは、インフルエンザヘマグルチニンタンパク質に由来するエピトープ（Wilsonら、1984、Cell 37:767）に対応するヘマグルチニン（「ＨＡ」）タグ、および「フラッグ」タグを含むがこれらに限定されない。
【０２２８】
他の実施形態では、本開示の抗体またはそれらの断片を、診断剤または検出可能薬剤とコンジュゲートさせる。このような抗体は、疾患または障害の発生、発症、進行、および／または重症度を、特定の治療の有効性を決定することなど、臨床検査手順の一部としてモニタリングまたは予後診断するのに有用でありうる。このような診断および検出は、抗体を、西洋ワサビペルオキシダーゼ、アルカリホスファターゼ、ベータ−ガラクトシダーゼ、またはアセチルコリンエステラーゼなどであるがこれらに限定されない多様な酵素、ストレプトアビジン／ビオチンおよびアビジン／ビオチンなどであるがこれらに限定されない補欠分子族、ウンベリフェロン、フルオレセイン、イソチオシアン酸フルオレセイン、ローダミン、ジクロロトリアジニルアミンフルオレセイン、ダンシルクロリド、またはフィコエリトリンなどであるがこれらに限定されない蛍光材料、ルミノールなどであるがこれらに限定されない発光材料、ルシフェラーゼ、ルシフェリン、およびエクオリンなどであるがこれらに限定されない生物発光材料、ヨウ素（１３１Ｉ、１２５Ｉ、１２３Ｉ、および１２１Ｉ）、炭素（１４Ｃ）、硫黄（３５Ｓ）、トリチウム（３Ｈ）、インジウム（１１５Ｉｎ、１１３Ｉｎ、１１２Ｉｎ、および１１１Ｉｎ）、テクネシウム（９９Ｔｃ）、タリウム（２０１Ｔｌ）、ガリウム（６８Ｇａ、６７Ｇａ）、パラジウム（１０３Ｐｄ）、モリブデン（９９Ｍｏ）、キセノン（１３３Ｘｅ）、フッ素（１８Ｆ）、１５３Ｓｍ、１７７Ｌｕ、１５９Ｇｄ、１４９Ｐｍ、１４０Ｌａ、１７５Ｙｂ、１６６Ｈｏ、９０Ｙ、４７Ｓｃ、１８６Ｒｅ、１８８Ｒｅ、１４２Ｐｒ、１０５Ｒｈ、９７Ｒｕ、６８Ｇｅ、５７Ｃｏ、６５Ｚｎ、８５Ｓｒ、３２Ｐ、１５３Ｇｄ、１６９Ｙｂ、５１Ｃｒ、５４Ｍｎ、７５Ｓｅ、１１３Ｓｎ、および１１７Ｔｉｎなどであるがこれらに限定されない放射性材料、ならびに多様なポジトロン断層法を使用するポジトロン放出金属および非放射性の常磁性金属イオンを含むがこれらに限定されない検出可能な物質にカップリングすることにより達成することができる。
【０２２９】
本開示は、治療用部分とコンジュゲートさせた抗体またはそれらの断片の使用もさらに包含する。抗体またはその断片は、細胞毒素、例えば、細胞増殖抑制剤または殺細胞剤、治療剤または放射性金属イオン、例えば、アルファ放射体などの治療用部分とコンジュゲートさせることができる。細胞毒素または細胞傷害剤は、細胞に有害な任意の薬剤を含む。
【０２３０】
さらに、抗体またはその断片は、所与の生物学的応答を修飾する治療用部分または薬物部分とコンジュゲートさせることもできる。治療用部分または薬物部分は、古典的化学的治療剤に限定されるとはみなされないものとする。例えば、薬物部分は、所望の生物学的活性を保有するタンパク質、ペプチド、またはポリペプチドでありうる。このようなタンパク質は、例えば、アブリン、リシンＡ、シュードモナス属外毒素、コレラ毒素、またはジフテリア毒素などの毒素、腫瘍壊死因子、α−インターフェロン、β−インターフェロン、神経成長因子、血小板由来成長因子、組織プラスミノゲン活性化因子、アポトーシス剤、抗血管新生剤、または例えば、リンホカインなどの生体応答修飾剤などのタンパク質を含みうる。
【０２３１】
さらに、抗体は、２１３Ｂｉなどのアルファ放射体などの放射性金属イオン、１３１Ｉｎ、１３１ＬＵ、１３１Ｙ、１３１Ｈｏ、１３１Ｓｍを含むがこれらに限定されない放射性金属イオンを、ポリペプチドとコンジュゲートするのに有用な大環状キレート化剤などの治療用部分とコンジュゲートさせることもできる。ある種の実施形態では、大環状キレート化剤は、リンカー分子を介して抗体に付着させうる、１，４，７，１０−テトラアザシクロドデカン−Ｎ，Ｎ’，Ｎ’’，Ｎ’’’−テトラ酢酸（ＤＯＴＡ）である。当技術分野では、このようなリンカー分子が一般に公知であり、各々が参照によりそれらの全体において組み込まれる、Denardoら、1998、Clin Cancer Res. 4（10）:2483〜90; Petersonら、1999、Bioconjug. Chem. 10（4）:553〜7、およびZimmermanら、1999、Nucl. Med. Biol. 26（8）:943〜50において記載されている。
【０２３２】
治療用部分を、抗体にコンジュゲートさせるための技法は周知であり、例えば、Arnonら、「Monoclonal Antibodies For Immunotargeting Of Drugs In Cancer Therapy」、Monoclonal Antibodies And Cancer Therapy、Reisfeldら（編）、243〜56頁（Alan R. Liss, Inc. 1985）; Hellstromら、「Antibodies For Drug Delivery」、Controlled Drug Delivery（2版）、Robinsonら（編）、623〜53頁（Marcel Dekker, Inc. 1987）; Thorpe、「Antibody Carriers Of Cytotoxic Agents In Cancer Therapy: A Review」、Monoclonal Antibodies 84: Biological And Clinical Applications、Pincheraら（編）、475〜506頁（1985）; 「Analysis, Results, And Future Prospective Of The Therapeutic Use Of Radiolabeled Antibody In Cancer Therapy」、Monoclonal Antibodies For Cancer Detection And Therapy、Baldwinら（編）、303〜16頁（Academic Press 1985）、およびThorpeら、1982、Immunol. Rev. 62:119〜58を参照されたい。
【０２３３】
抗体はまた、特に、イムノアッセイまたは標的抗原の精製に有用な固体支持体に付着させることもできる。このような固体支持体は、ガラス、セルロース、ポリアクリルアミド、ナイロン、ポリスチレン、ポリ塩化ビニル、またはポリプロピレンを含むがこれらに限定されない。
【０２３４】
抗体を作製する方法
本開示はまた、ＦＸＩおよび／またはＦＸＩａタンパク質（例えば、ヒト、ウサギ、およびカニクイザルのＦＸＩａ）、例えば、抗体ＡＭ１、ＡＭ２、ＡＭ３、およびＡＭ４に特異的に結合する、本明細書で記載される抗体のＶＨ、ＶＬ、全長重鎖、および／または全長軽鎖をコードする核酸配列を含むポリヌクレオチドも提示する。このような核酸配列は、哺乳動物細胞内の発現について最適化することができる（例えば、表２を参照されたい）。
【０２３５】
本明細書の具体的な態様では、本明細書で記載される、抗ＦＸＩ／ＦＸＩａ抗体または抗原結合性断片、例えば、抗体ＡＭ１、ＡＭ２、ＡＭ３、またはＡＭ４の、ＶＬ、ＶＨ、またはＶＬおよびＶＨをコードするヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチドが提示される。
【０２３６】
本明細書の具体的な態様では、本明細書で記載される抗体または抗原結合性断片、例えば、抗体ＡＭ１、ＡＭ２、ＡＭ３、またはＡＭ４の、重鎖、軽鎖、または重鎖および軽鎖をコードするヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチドが提示される。
【０２３７】
本明細書の特定の態様では、表２に明示されたヌクレオチド配列、例えば、配列番号３１、３３、３５、３７、４２、４４、４９、５１、５２、５４、５６、および５８を含むポリヌクレオチドが提示される。
【０２３８】
本明細書の具体的な態様では、本明細書で記載されるポリヌクレオチド（例えば、表２）を含むベクター（例えば、発現ベクター）が提示される。
【０２３９】
本明細書のある種の態様では、本明細書で記載されるベクター、または本明細書で記載されるポリヌクレオチドを含む宿主細胞が提示される。具体的な態様では、宿主細胞は、真核細胞である。ある種の態様では、宿主細胞は、哺乳動物細胞（例えば、ＣＨＯ細胞などの非ヒト哺乳動物細胞）である種の態様では、宿主細胞は、（ｉ）ＶＨまたは重鎖をコードするヌクレオチド配列を含む、ベクターまたはポリヌクレオチドと、（ｉｉ）ＶＬまたは軽鎖をコードするヌクレオチド配列を含む、ベクターまたはポリヌクレオチドとを含む。具体的な態様では、第１の宿主細胞は、ＶＨまたは重鎖をコードするヌクレオチド配列を含む、ベクターまたはポリヌクレオチドを含み、第２の宿主細胞は、ＶＬまたは軽鎖をコードするヌクレオチド配列を含む、ベクターまたはポリヌクレオチドを含む。
【０２４０】
本明細書の特定の態様では、抗ＦＸＩ／ＦＸＩａ抗体またはその断片を作製する方法であって、本明細書で記載される宿主細胞を、抗ＦＸＩ／ＦＸＩａ抗体またはその断片の発現に適した条件下で培養するステップを含む方法が提示される。
【０２４１】
ある種の態様では、抗ＦＸＩ／ＦＸＩａ抗体またはその断片を作製する方法は、抗ＦＸＩ／ＦＸＩａ抗体またはその断片を精製するステップをさらに含む。
抗体をコードする核酸
本開示は、上記で記載したＦＸＩａ結合性抗体鎖のセグメントまたはドメインを含むポリペプチドをコードする、実質的に精製された核酸分子を提供する。本開示の核酸のいくつかは、配列番号３０、４１、または４８に示される重鎖可変領域をコードするヌクレオチド配列、および／または配列番号３４または５５に示される軽鎖可変領域をコードするヌクレオチド配列を含む。具体的な実施形態では、核酸分子は、表２において同定される核酸分子である。本開示の他のいくつかの核酸分子は、表２において同定される核酸分子のヌクレオチド配列と実質的に（例えば、少なくとも６５、８０％、９５％、または９９％）同一なヌクレオチド配列を含む。適切な発現ベクターから発現させるとき、これらのポリヌクレオチドによりコードされるポリペプチドは、ＦＸＩおよび／もしくはＦＸＩａ抗原結合能を呈することが可能である。
【０２４２】
本開示ではまた、上記で示したＦＸＩａ結合性抗体の重鎖または軽鎖に由来する少なくとも１つのＣＤＲ領域、および、通例３つ全てのＣＤＲ領域をコードするポリヌクレオチドも提供される。他のいくつかのポリヌクレオチドは、上記で示したＦＸＩａ結合性抗体の重鎖および／または軽鎖の可変領域配列の全てまたは実質的に全てをコードする。コードの縮重性のために、様々な核酸配列は、免疫グロブリンアミノ酸配列の各々をコードするであろう。
【０２４３】
本開示の核酸分子は、抗体の可変領域および定常領域の両方をコードしうる。本開示の核酸配列のいくつかは、配列番号３２、４３、５０、または５３に示される重鎖配列と実質的に（例えば、少なくとも８０％、９０％、または９９％）同一な重鎖配列をコードするヌクレオチドを含む。他のいくつかの核酸配列は、配列番号５７または３６に示される軽鎖配列と実質的に（例えば、少なくとも８０％、９０％、または９９％）同一な軽鎖配列をコードするヌクレオチドを含む。
【０２４４】
ポリヌクレオチド配列は、デノボの固相ＤＮＡ合成、またはＦＸＩａ結合性抗体またはその結合性断片をコードする既存の配列（例えば、下記の実施例で記載される配列）に対するＰＣＲによる突然変異誘発により作製することができる。核酸の直接的な化学合成は、Narangら、1979、Meth. Enzymol. 68:90によるホスホトリエステル法、Brownら、Meth. Enzymol. 68:109、1979によるホスホジエステル法、Beaucageら、Tetra. Lett., 22:1859、1981によるジエチルホスホルアミダイト法、および米国特許第４，４５８，０６６号明細書による固体支持体法など、当技術分野で公知の方法により達成することができる。ＰＣＲによる、突然変異の、ポリヌクレオチド配列への導入は、例えば、PCR Technology: Principles and Applications for DNA Amplification、H.A. Erlich（編）、Freeman Press、NY、NY、1992、PCR Protocols: A Guide to Methods and Applications、Innisら（編）、Academic Press、San Diego、CA、1990; Mattilaら、Nucleic Acids Res. 19:967、1991、およびEckertら、PCR Methods and Applications 1:17、1991において記載されている通りに実施することができる。
【０２４５】
本開示ではまた、上記で記載したＦＸＩ結合性抗体および／もしくはＦＸＩａ結合性抗体を作製するための発現ベクターおよび宿主細胞も提供される。多様な発現ベクターを、利用して、ＦＸＩａ結合性抗体鎖または結合性断片をコードするポリヌクレオチドを発現させることができる。ウイルスベースの発現ベクターおよび非ウイルス発現ベクターのいずれを使用しても、哺乳動物宿主細胞内で抗体を作製することができる。非ウイルスベクターおよび非ウイルス系は、プラスミド、典型的に、タンパク質またはＲＮＡを発現させるための発現カセットを伴うエピソームベクター、およびヒト人工染色体を含む（例えば、Harringtonら、Nat Genet 15:345、1997を参照されたい）。例えば、哺乳動物（例えば、ヒト）細胞内のＦＸＩａ結合性ポリヌクレオチドおよびＬＯＸ−１結合性ポリペプチドの発現に有用な非ウイルスベクターは、ｐＴｈｉｏＨｉｓ  Ａ、ｐＴｈｉｏＨｉｓ  Ｂ、およびｐＴｈｉｏＨｉｓ  Ｃ、ｐｃＤＮＡ３．１／Ｈｉｓ、ｐＥＢＶＨｉｓ  Ａ、ｐＥＢＶＨｉｓ  Ｂ、およびｐＥＢＶＨｉｓ  Ｃ（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ、Ｓａｎ  Ｄｉｅｇｏ、ＣＡ）、ＭＰＳＶベクター、ならびに他のタンパク質を発現させるための、当技術分野で公知の他の多数のベクターを含む。有用なウイルスベクターは、レトロウイルス、アデノウイルス、アデノ随伴ウイルス、ヘルペスウイルスに基づくベクター、ＳＶ４０に基づくベクター、パピローマウイルス、ＨＢＰエプスタインバーウイルス、ワクシニアウイルスベクター、およびセムリキ森林熱ウイルス（ＳＦＶ）を含む。Brentら、前出; Smith、Annu. Rev. Microbiol. 49:807、1995、およびRosenfeldら、Cell 68:143、1992を参照されたい。
【０２４６】
発現ベクターの選択は、その中でベクターを発現させる、意図される宿主細胞に依存する。発現ベクターは、ＦＸＩａ結合性抗体鎖または断片をコードするポリヌクレオチドに作動可能に連結されたプロモーターおよび他の調節配列（例えば、エンハンサー）を含有することが典型的である。いくつかの実施形態では、誘導条件下を除き、挿入された配列の発現を防止するのに、誘導的プロモーターを利用する。誘導的プロモーターは、例えば、アラビノース、ｌａｃＺ、メタロチオネインプロモーター、または熱ショックプロモーターを含む。形質転換された生物の培養物は、それらの発現産物が宿主細胞により良好に許容されるコード配列の集団にバイアスをかけずに、非誘導条件下で増殖させることができる。プロモーターに加えて、他の調節的エレメントもまた、ＦＸＩａ結合性抗体鎖または断片の効率的な発現に要求または所望される可能性がある。これらのエレメントは、ＡＴＧ開始コドンおよび隣接のリボソーム結合性部位または他の配列を典型的に含む。加えて、発現の効率は、使用される細胞系に適したエンハンサーを組み入れることにより増強することもできる（例えば、Scharfら、Results Probl. Cell Differ. 20:125、1994、およびBittnerら、Meth. Enzymol., 153:516、1987を参照されたい）。例えば、ＳＶ４０エンハンサーまたはＣＭＶエンハンサーを使用して、哺乳動物宿主細胞内の発現を増大させることができる。
【０２４７】
発現ベクターはまた、挿入されたＦＸＩａ結合性抗体配列によりコードされるポリペプチドとの融合タンパク質を形成するように、分泌シグナル配列の位置ももたらしうる。挿入されたＦＸＩ結合性抗体配列および／もしくはＦＸＩａ結合性抗体配列は、ベクター内に組み入れる前に、シグナル配列に連結することが多い。ＦＸＩ結合性抗体および／もしくはＦＸＩａ結合性抗体の軽鎖可変ドメインおよび重鎖可変ドメインをコードする配列を受容するのに使用されるベクターは、場合によってまた、定常領域またはそれらの一部もコードする。このようなベクターは、定常領域との融合タンパク質としての可変領域の発現を可能とし、これにより、インタクトな抗体またはそれらの断片の作製をもたらす。このような定常領域は、ヒト定常領域であることが典型的である。
【０２４８】
ＦＸＩ結合性抗体鎖および／もしくはＦＸＩａ結合性抗体鎖を保有し、これを発現させるための宿主細胞は、原核細胞の場合もあり、真核細胞の場合もある。大腸菌（E. coli）は、本開示のポリヌクレオチドをクローニングし、発現させるのに有用な１つの原核生物宿主である。使用に適した他の微生物宿主は、枯草菌（Bacillus subtilis）などの桿菌、およびサルモネラ（Salmonella）属種、セラチア（Serratia）属種、および多様なシュードモナス（Pseudomonas）属種など、他の腸内細菌科を含む。これらの原核生物宿主内ではまた、典型的に、宿主細胞と適合性の発現制御配列（例えば、複製起点）を含有する発現ベクターも作製することができる。加えて、ラクトースプロモーター系、トリプトファン（ｔｒｐ）プロモーター系、ベータ−ラクタマーゼプロモーター系、またはファージラムダに由来するプロモーター系など、任意の数の、様々な周知のプロモーターも存在する。プロモーターは、任意選択で、オペレーター配列により発現を制御することが典型的であるが、転写および翻訳を開始して終結させるためのリボソーム結合性部位配列なども有する。本開示のＦＸＩａ結合性ポリペプチドを発現させるのに、酵母など、他の微生物もまた利用することができる。また、バキュロウイルスベクターと組み合わせた昆虫細胞も使用することができる。
【０２４９】
いくつかの具体的な実施形態では、本開示のＦＸＩ結合性ポリペプチドおよび／もしくはＦＸＩａ結合性ポリペプチドを発現させ、作製するのに、哺乳動物宿主細胞を使用する。哺乳動物宿主細胞は、任意の正常非不死化動物細胞または正常不死化動物細胞もしくは非正常不死化動物細胞またはヒト細胞を含む。例えば、ＣＨＯ細胞系、多様なＣｏｓ細胞系、ＨｅＬａ細胞、骨髄腫細胞系、および形質転換Ｂ細胞を含む、インタクトな免疫グロブリンを分泌することが可能な多数の適切な宿主細胞系が開発されている。ポリペプチドを発現させるための、哺乳動物組織細胞培養物の使用については、例えば、Winnacker、FROM GENES TO CLONES、VCH Publishers、N.Y.、N.Y.、1987において一般に論じられている。哺乳動物宿主細胞のための発現ベクターは、複製起点、プロモーター、およびエンハンサーなどの発現制御配列（例えば、Queenら、Immunol. Rev. 89:49〜68、1986を参照されたい）、ならびにリボソーム結合性部位、ＲＮＡスプライス部位、ポリアデニル化部位、および転写ターミネーター配列などの、必要なプロセシング情報部位を含みうる。
【０２５０】
これらの発現ベクターは通例、哺乳動物遺伝子に由来するプロモーターまたは哺乳動物ウイルスに由来するプロモーターを含有する。適切なプロモーターは、構成的プロモーター、細胞型特異的プロモーター、段階特異的プロモーター、および／またはモジュレート可能プロモーターもしくは調節可能プロモーターでありうる。有用なプロモーターは、メタロチオネインプロモーター、構成的アデノウイルス主要後期プロモーター、デキサメタゾン誘導性ＭＭＴＶプロモーター、ＳＶ４０プロモーター、ＭＲＰ  ｐｏｌＩＩＩプロモーター、構成的ＭＰＳＶプロモーター、テトラサイクリン誘導性ＣＭＶプロモーター（ヒト即初期ＣＭＶプロモーターなど）、構成的ＣＭＶプロモーター、および当技術分野で公知のプロモーター−エンハンサーの組合せを含むがこれらに限定されない。
【０２５１】
対象のポリヌクレオチド配列を含有する発現ベクターを導入する方法は、細胞宿主の種類に応じて変化する。例えば、塩化カルシウムトランスフェクションが一般に原核細胞に用いられるのに対し、リン酸カルシウム処理または電気穿孔は、他の細胞宿主に使用することができる（一般に、Sambrookら、前出を参照されたい）。他の方法は、例えば、電気穿孔、リン酸カルシウム処理、リポソーム媒介型形質転換、注射およびマイクロインジェクション、遺伝子銃法、ウィロソーム、イムノリポソーム、ポリカチオン：核酸コンジュゲート、ネイキッドＤＮＡ、人工ビリオン、ヘルペスウイルス構造タンパク質であるＶＰ２２との融合体（ElliotおよびO'Hare、Cell 88:223、1997）、ＤＮＡの薬剤増強型取込み、およびｅｘ  ｖｉｖｏにおける形質導入を含む。組換えタンパク質の長期にわたる高収率作製のためには、安定的発現が所望されることが多い。例えば、ＦＸＩａ結合性抗体鎖または結合性断片を安定的に発現させる細胞系は、ウイルス複製起点または内因性発現エレメント、および選択マーカー遺伝子を含有する、本開示の発現ベクターを使用して調製することができる。ベクターを導入した後、細胞は、強化培地中で１〜２日間にわたり成長させてから、選択培地に切り替えることができる。選択マーカーの目的は、選択に対する耐性を付与し、その存在により細胞の成長を可能とし、これにより、導入された配列を選択培地中で発現させることに成功することである。耐性で安定的にトランスフェクトされた細胞は、細胞型に適した組織培養法を使用して増殖させることができる。
【０２５２】
フレームワークまたはＦｃの操作
本開示の操作抗体は、例えば、抗体の特性を改善するように、ＶＨおよび／またはＶＬ内のフレームワーク残基に修飾を施した操作抗体を含む。このようなフレームワーク修飾は、抗体の免疫原性を低下させるように施すことが典型的である。例えば、１つの手法は、１つまたは複数のフレームワーク残基を、対応する生殖細胞系列配列に「復帰突然変異させる」ことである。より具体的には、体細胞突然変異を経た抗体は、抗体が由来する生殖細胞系列配列と異なるフレームワーク残基を含有しうる。このような残基は、抗体フレームワーク配列を、抗体が由来する生殖細胞系列配列と比較することにより同定することができる。フレームワーク領域配列を、それらの生殖細胞系列の立体配置に戻すには、例えば、部位特異的突然変異誘発により、体細胞突然変異を、生殖細胞系列配列に「復帰突然変異させる」ことができる。このような「復帰突然変異させた」抗体もまた、本開示により包含されることを意図する。
【０２５３】
フレームワーク修飾の別の種類は、１つもしくは複数のフレームワーク領域内の残基、なおまたは、１つもしくは複数のＣＤＲ領域内の残基を突然変異させて、Ｔ細胞エピトープを除去して、これにより、抗体の潜在的な免疫原性を低減することを伴う。この手法はまた、「脱免疫化」とも称し、Ｃａｒｒらによる米国特許公開第２００３０１５３０４３号明細書においてさらに詳細に記載されている。
【０２５４】
フレームワーク内またはＣＤＲ領域内に施された修飾に加えて、またはこれと代替的に、本開示の抗体は、Ｆｃ領域内の修飾を含んで、典型的に、血清半減期、補体の結合、Ｆｃ受容体の結合、および／または抗体依存性細胞性細胞傷害など、抗体の１つまたは複数の機能的特性を改変するように操作することもできる。さらに、本開示の抗体は、化学的に修飾することもでき（例えば、１つまたは複数の化学的部分を抗体に付着することができる）、そのグリコシル化を改変して、ここでもまた、抗体の１つまたは複数の機能的特性を改変するように修飾することもできる。これらの実施形態の各々については、下記でさらに詳細に記載する。Ｆｃ領域内の残基の番号付けは、ＫａｂａｔによるＥＵインデックスである。
【０２５５】
一実施形態では、ヒンジ領域内のシステイン残基の数を改変する、例えば、増大または減少させるように、ＣＨ１のヒンジ領域を修飾する。この手法は、Ｂｏｄｍｅｒらによる米国特許第５，６７７，４２５号明細書においてさらに記載されている。ＣＨ１のヒンジ領域内のシステイン残基の数は、例えば、軽鎖および重鎖のアセンブリーを容易とするか、または抗体の安定性を増大もしくは低下させるように改変する。
【０２５６】
別の実施形態では、抗体のＦｃヒンジ領域を突然変異させて、抗体の生物学的半減期を短縮する。より具体的には、抗体のブドウ球菌属プロテインＡ（ＳｐＡ）への結合が、天然Ｆｃ−ヒンジドメインのＳｐＡへの結合と比べて損なわれるように、１つまたは複数のアミノ酸突然変異を、Ｆｃ−ヒンジ断片のＣＨ２ドメイン−ＣＨ３ドメイン間界面領域に導入する。この手法は、Ｗａｒｄらによる米国特許第６，１６５，７４５号明細書においてさらに詳細に記載されている。
【０２５７】
別の実施形態では、抗体は、その生物学的半減期を延長するように修飾する。多様な手法が可能である。例えば、Ｗａｒｄによる米国特許第６，２７７，３７５号明細書において記載されている突然変異の１つまたは複数を使用することができる。代替的に、生物学的半減期を延長するために、抗体を、Ｐｒｅｓｔａらによる米国特許第５，８６９，０４６号明細書、および同第６，１２１，０２２号明細書において記載されている、ＩｇＧのＦｃ領域のＣＨ２ドメインの２つのループから採取されたサルベージ受容体結合性エピトープを含有するように、ＣＨ１領域内またはＣＬ領域内で改変することもできる。
【０２５８】
さらに他の実施形態では、少なくとも１つのアミノ酸残基を、抗体のエフェクター機能を改変する異なるアミノ酸残基で置きかえることにより、Ｆｃ領域を改変する。例えば、抗体が、エフェクターリガンドに対するアフィニティーを改変しているが、親抗体の抗原結合能は保持するように、１つまたは複数のアミノ酸を、異なるアミノ酸残基で置きかえることができる。それに対するアフィニティーを改変するエフェクターリガンドは、例えば、Ｆｃ受容体または補体のＣ１成分でありうる。この手法は、両方ともＷｉｎｔｅｒらによる米国特許第５，６２４，８２１号明細書、および同第５，６４８，２６０号明細書においてさらに詳細に記載されている。
【０２５９】
別の実施形態では、抗体が、Ｃ１ｑへの結合を改変し、かつ／または補体依存性細胞傷害作用（ＣＤＣ）を低減もしくは消失させるように、アミノ酸残基から選択される１つまたは複数のアミノ酸を、異なるアミノ酸残基で置きかえることができる。この手法は、Ｉｄｕｓｏｇｉｅらによる米国特許第６，１９４，５５１号明細書においてさらに詳細に記載されている。
【０２６０】
別の実施形態では、１つまたは複数のアミノ酸残基を改変して、これにより、補体に結合する抗体の能力を改変する。この手法は、ＢｏｄｍｅｒらによるＰＣＴ公開国際公開第９４／２９３５１号パンフレットにおいてさらに記載されている。
【０２６１】
具体的な実施形態では、本明細書で記載される抗ＦＸＩ／ＦＸＩａ抗体（例えば、抗体ＡＭ１、ＡＭ２、ＡＭ３、またはＡＭ４のＶＬ  ＣＤＲおよびＶＨ  ＣＤＲを含む抗体）は、任意の表面関連ＦＸＩにより引き起こされる、ＡＤＣＣまたはＣＤＣの可能性を低減するように、２つのアミノ酸置換である、Ｄ２６５ＡおよびＰ３２９Ａを含むヒトＩｇＧ（例えば、ＩｇＧ１）Ｆｃ領域を含む。これらのアラニン置換は、ＡＤＣＣおよびＣＤＣを低減することが示されている（例えば、Idosugie et al., J. Immunol. 164:4178-4184, 2000; Shields et al., J. Biol. Chem. 276:6591-6604, 2001を参照されたい）。
【０２６２】
さらに別の実施形態では、１つまたは複数のアミノ酸を修飾することにより、抗体依存性細胞性細胞傷害（ＡＤＣＣ）を媒介する抗体の能力を増大させ、かつ／またはＦｃγ受容体に対する抗体のアフィニティーを増大させるように、Ｆｃ領域を修飾する。この手法は、ＰｒｅｓｔａによるＰＣＴ公開国際公開第００／４２０７２号パンフレットにおいてさらに記載されている。さらに、ヒトＩｇＧ１上の、ＦｃγＲＩ、ＦｃγＲＩＩ、ＦｃγＲＩＩＩ、およびＦｃＲｎに対する結合性部位もマップされており、結合を改善させた変異体も記載されている（Shields, R.L.ら、2001 J. Biol. Chen. 276:6591〜6604を参照されたい）。
【０２６３】
さらに別の実施形態では、抗体のグリコシル化を修飾する。例えば、脱グリコシル化抗体（すなわち、抗体は、グリコシル化を欠く）を作製することができる。グリコシル化は、例えば、「抗原」に対する抗体のアフィニティーを増大させるように改変することができる。このような炭水化物修飾は、例えば、抗体配列内の１つまたは複数のグリコシル化部位を改変することにより達成することができる。例えば、１つまたは複数の可変領域フレームワークグリコシル化部位の消失を結果としてもたらす、１つまたは複数のアミノ酸置換を作製して、これにより、その部位におけるグリコシル化を消失させることができる。このような脱グリコシル化により、抗原に対する抗体のアフィニティーを増大させることができる。このような手法は、Ｃｏらによる米国特許第５，７１４，３５０号明細書、および同第６，３５０，８６１号明細書においてさらに詳細に記載されている。
【０２６４】
加えて、または代替的に、フコシル残基の量を低減した低フコシル化抗体または二分枝型ＧｌｃＮａｃ構造を増大させた抗体など、グリコシル化の種類を改変した抗体を作製することもできる。このようなグリコシル化パターンの改変は、抗体のＡＤＣＣ能を増大させることが証明されている。このような炭水化物修飾は、例えば、グリコシル化機構を改変した宿主細胞内で抗体を発現させることにより達成することができる。当技術分野では、グリコシル化機構を改変した細胞が記載されており、本開示の組換え抗体を発現させ、これにより、グリコシル化を改変した抗体を産生するための宿主細胞として使用することができる。例えば、ＨａｎｇらによるＥＰ１，１７６，１９５は、このような細胞系内で発現させた抗体が、低フコシル化を呈するように、フコシルトランスフェラーゼをコードするＦＵＴ８遺伝子を機能的に破壊した細胞系について記載している。ＰｒｅｓｔａによるＰＣＴ公開国際公開第０３／０３５８３５号パンフレットは、フコースをＡｓｎ（２９７）連結された炭水化物に付着する能力を低減し、また、その宿主細胞内で発現させた抗体の低フコシル化も結果としてもたらす、変異体のＣＨＯ細胞系である、Ｌｅｃｌ３細胞について記載している（また、Shields, R.L.ら、2002 J. Biol. Chem. 277:26733〜26740も参照されたい）。ＵｍａｎａらによるＰＣＴ公開国際公開第９９／５４３４２号パンフレットは、操作細胞系内で発現させた抗体が、抗体のＡＤＣＣ活性の増大を結果としてもたらす二分枝型ＧｌｃＮａｃ構造の増大を呈するように、糖タンパク質を修飾するグリコシルトランスフェラーゼ（例えば、ベータ（１，４）−ＮアセチルグルコサミニルトランスフェラーゼＩＩＩ（ＧｎＴＩＩＩ））を発現させるように操作された細胞系について記載している（また、Umanaら、1999 Nat. Biotech. 17:176〜180も参照されたい）。
【０２６５】
改変抗体を操作する方法
上記で論じた通り、本明細書で示されるＶＨ配列およびＶＬ配列または全長重鎖および全長軽鎖配列を有するＦＸＩａ結合性抗体は、全長重鎖配列および／もしくは全長軽鎖配列、ＶＨ配列および／もしくはＶＬ配列、またはこれらに付着された定常領域を修飾することにより、新たなＦＸＩａ結合性抗体を創出するのに使用することができる。したがって、本開示の別の態様では、本開示のＦＸＩａ結合性抗体の構造特色を使用して、ヒトＦＸＩａに結合し、また、ＦＸＩａの１つまたは複数の機能的特性も阻害すること（例えば、ＦＸＩａとＦＸＩａ受容体の結合を阻害する、ＦＸＩａ依存性の細胞増殖を阻害する）など、本開示の抗体の少なくとも１つの機能的特性を保持する、構造的に関連するＦＸＩａ結合性抗体を創出する。
【０２６６】
例えば、本開示の抗体の１つまたは複数のＣＤＲ領域またはそれらの突然変異は、組換えにより、公知のフレームワーク領域および／または他のＣＤＲと組み合わせて、組換えにより操作された、上記で論じた、本開示の、さらなるＦＸＩａ結合性抗体を創出することができる。他の種類の修飾は、前出の節で記載した修飾を含む。操作法のための出発材料は、本明細書で提示されるＶＨ配列および／もしくはＶＬ配列の１つもしくは複数、またはそれらの１つもしくは複数のＣＤＲ領域である。操作抗体を創出するのに、本明細書で提示されるＶＨ配列および／もしくはＶＬ配列の１つもしくは複数、またはそれらの１つもしくは複数のＣＤＲ領域を有する抗体を実際に調製する（すなわち、タンパク質として発現させる）ことは必要ではない。そうではなくて、配列内に含有される情報を、元の配列に由来する「第２世代の」配列を創出するための出発材料として使用し、次いで、「第２世代の」配列を、タンパク質として調製し、発現させる。
【０２６７】
したがって、別の実施形態では、本開示は、哺乳動物細胞内の発現について最適化されたＦＸＩａ結合性抗体であって、配列番号３２、４３、５０、および５３の群から選択される配列を有する、全長重鎖抗体の配列と、配列番号３６および５７の群から選択される配列を有する、全長軽鎖抗体の配列とからなるＦＸＩａ結合性抗体を調製し、少なくとも１つの変更された抗体配列を創出するように、全長重鎖抗体の配列内および／または全長軽鎖抗体の配列内の、少なくとも１つのアミノ酸残基を変更し、変更された抗体配列を、タンパク質として発現させるための方法を提示する。一実施形態では、重鎖または軽鎖の改変は、重鎖または軽鎖のフレームワーク領域内である。
【０２６８】
改変抗体配列はまた、ＣＤＲ３配列、またはＵＳ２００５／０２５５５５２において記載されている、最小限の不可欠な結合決定基を固定し、ＣＤＲ１配列およびＣＤＲ２配列には多様性を持たせた抗体ライブラリーをスクリーニングすることによっても調製することができる。スクリーニングは、ファージディスプレイ技術など、抗体を、抗体ライブラリーからスクリーニングするのに適切な任意のスクリーニング技術に従い実施することができる。
【０２６９】
標準的な分子生物学の技法を使用して、改変抗体配列を調製し、発現させることができる。改変抗体配列によりコードされる抗体は、ヒト、カニクイザル、ラットおよび／またはマウスＦＸＩａに特異的に結合すること、ならびに抗体が、Ｆ３６Ｅ細胞増殖アッセイおよび／またはＢａ／Ｆ３−ＦＸＩａＲ細胞増殖アッセイにおいて、ＦＸＩａ依存性の細胞増殖を阻害することを含むがこれらに限定されない、本明細書で記載されるＦＸＩａ結合性抗体の機能的特性の１つ、一部、または全部を保持する抗体である。
【０２７０】
本開示の抗体を操作する方法のある種の実施形態では、ＦＸＩａ結合性抗体コード配列の全部または一部に沿って、ランダムに、または選択的に、突然変異を導入することができ、結果として得られる修飾ＦＸＩａ結合性抗体を、本明細書で記載される結合活性および／または他の機能的特性についてスクリーニングすることができる。当技術分野では、突然変異法が記載されている。例えば、ＳｈｏｒｔによるＰＣＴ公開国際公開第０２／０９２７８０号パンフレットは、飽和突然変異誘発、合成ライゲーションアセンブリー、またはこれらの組合せを使用して、抗体の突然変異を創出し、スクリーニングするための方法について記載している。代替的に、ＬａｚａｒらによるＰＣＴ公開国際公開第０３／０７４６７９号パンフレットは、コンピュータによるスクリーニング法を使用して、抗体の生理化学的特性を最適化する方法について記載している。
【０２７１】
本開示のある種の実施形態では、抗体は、脱アミド化部位を除去するように操作されている。脱アミド化は、ペプチド内またはタンパク質内の構造的変化および機能的変化を引き起こすことが公知である。脱アミドは、生物学的活性の低下のほか、タンパク質医薬品の薬物動態および抗原性の改変も結果としてもたらしうる（Anal Chem. 2005年3月1日;77（5）:1432〜9）。
【０２７２】
本開示のある種の実施形態では、抗体は、ｐＩを増大させ、それらの薬物様特性を改善するように操作されている。タンパク質のｐＩは、分子の全体的な生物物理的特性の鍵となる決定因子である。ｐＩが小さな抗体は、可溶性が小さく、安定性が小さく、凝集しやすいことが公知である。さらに、ｐＩが小さな抗体の精製は、とりわけ、臨床における使用のためのスケールアップにおいて、困難であり、問題を生じる可能性がある。本開示の抗ＦＸＩ抗体および／もしくは抗ＦＸＩａ抗体またはＦａｂのｐＩを増大させることにより、それらの可溶性が改善され、抗体を高濃度（＞１００ｍｇ／ｍｌ）で製剤化することが可能となった。抗体を高濃度（例えば、＞１００ｍｇ／ｍｌ）で製剤化することにより、高用量の抗体を投与することが可能であるという利点がもたらされ、これにより、血栓性障害および／または血栓塞栓性障害を含む慢性疾患を処置するための著明な利点である、投与頻度の低減を可能とすることができる。ｐＩの増大はまた、抗体のＩｇＧバージョンのＦｃＲｎを媒介するリサイクリングも増大させ、これにより、薬物が長時間にわたり体内にとどまり、要求される注射の回数を少なくすることも可能としうる。最後に、ｐＩの増大に起因して、抗体の全体的な安定性が著明に改善され、その結果として、保管寿命およびｉｎ  ｖｉｖｏにおける生物学的活性の延長がもたらされる。ｐＩは、８．２以上であることが好ましい。
【０２７３】
改変抗体の機能的特性は、実施例において示されるアッセイ（例えば、ＥＬＩＳＡ、ａＰＴＴアッセイ）など、当技術分野において利用可能であり、かつ／または本明細書で記載される標準的なアッセイを使用して評価することができる。
【０２７４】
予防的使用および治療的使用
本明細書で記載される、ＦＸＩおよび／またはＦＸＩａに結合する抗体（例えば、抗体ＡＭ１、ＡＭ２、ＡＭ３、またはＡＭ４のＶＬ  ＣＤＲおよびＶＨ  ＣＤＲを含む抗ＦＸＩ抗体など、表２に記載されている抗体）は、有効量の、本開示の抗体または抗原結合性断片を、それを必要とする対象に投与することにより、血栓塞栓性疾患または血栓塞栓性障害（例えば、血栓性脳卒中、心房細動、心房細動における脳卒中の防止（ＳＰＡＦ）、深部静脈血栓症、静脈血栓塞栓症、肺塞栓症、急性冠動脈症候群（ＡＣＳ）、虚血性脳卒中、急性下肢虚血症、慢性血栓塞栓性肺高血圧症、または全身性塞栓症）を処置するために、治療的に有用な濃度で使用することができる。本開示は、有効量の、本開示の抗体を、それを必要とする対象に投与することにより、血栓塞栓性障害（例えば、血栓性障害）を処置する方法を提供する。本開示は、有効量の、本開示の抗体（例えば、抗体ＡＭ１、ＡＭ２、ＡＭ３、またはＡＭ４）を、それを必要とする対象に投与することにより、血栓塞栓性障害（例えば、血栓性脳卒中、心房細動、心房細動における脳卒中の防止（ＳＰＡＦ）、深部静脈血栓症、静脈血栓塞栓症、肺塞栓症、急性冠動脈症候群（ＡＣＳ）、虚血性脳卒中、急性下肢虚血症、慢性血栓塞栓性肺高血圧症、または全身性塞栓症）を処置する方法を提供する。
【０２７５】
本明細書で記載される抗体（例えば、抗体、または抗体ＡＭ１、ＡＭ２、ＡＭ３、もしくはＡＭ４のＶＬ  ＣＤＲおよびＶＨ  ＣＤＲを含む抗ＦＸＩ抗体など、表２に記載されている抗体）はとりわけ、本明細書でより詳細に記載される通り、血栓性障害を含むがこれらに限定されない、血栓塞栓性状態または血栓塞栓性障害を処置、防止、および改善するのに使用することができる。
【０２７６】
本明細書で提示される抗体（例えば、抗体ＡＭ１、ＡＭ２、ＡＭ３、またはＡＭ４のＶＬ  ＣＤＲおよびＶＨ  ＣＤＲを含む抗ＦＸＩ抗体など、表２に記載されている抗体）はまた、血栓塞栓性障害を防止、処置、または改善するために、他の薬剤と組み合わせて使用することもできる。例えば、スタチン療法は、血栓性障害および／または血栓塞栓性障害を伴う患者を処置するために、本開示のＦＸＩａ抗体および抗原結合性断片と組み合わせて使用することができる。
【０２７７】
本明細書の具体的な実施形態では、心房細動を伴う患者における脳卒中を処置または防止する方法であって、有効量の、本明細書で記載される抗ＦＸＩ抗体、例えば、抗体ＡＭ１、ＡＭ２、ＡＭ３、もしくはＡＭ４、または抗体ＡＭ１、ＡＭ２、ＡＭ３、もしくはＡＭ４のＶＬ  ＣＤＲおよびＶＨＣＤＲを含む抗ＦＸＩ／ＦＸＩａ抗体など、表２に記載されている抗ＦＸＩ／ＦＸＩａ抗体を、それを必要とする患者に投与するステップを含む方法が提示される。
【０２７８】
本明細書の具体的な実施形態では、心房細動を伴う患者における塞栓性脳卒中および全身性塞栓症など、心房細動（ＡＦ）と関連するリスクまたは状態を管理または防止する方法であって、有効量の、本明細書で記載される抗ＦＸＩ／ＦＸＩａ抗体、例えば、抗体ＡＭ１、ＡＭ２、ＡＭ３、もしくはＡＭ４、または抗体ＡＭ１、ＡＭ２、ＡＭ３、もしくはＡＭ４のＶＬ  ＣＤＲおよびＶＨＣＤＲを含む抗ＦＸＩ／ＦＸＩａ抗体など、表２に記載されている抗ＦＸＩ／ＦＸＩａ抗体を、それを必要とする患者に投与するステップを含む方法が提示される。
【０２７９】
本明細書の具体的な実施形態では、心房細動を伴う患者における塞栓性脳卒中および全身性塞栓症など、心房細動（ＡＦ）と関連する状態を処置、管理、または防止する方法であって、有効量の、本明細書で記載される抗ＦＸＩ抗体、例えば、抗体ＡＭ１、ＡＭ２、ＡＭ３、もしくはＡＭ４、または抗体ＡＭ１、ＡＭ２、ＡＭ３、もしくはＡＭ４のＶＬ  ＣＤＲおよびＶＨＣＤＲを含む抗ＦＸＩ／ＦＸＩａ抗体など、表２に記載されている抗ＦＸＩ／ＦＸＩａ抗体を、それを必要とする患者に投与するステップを含む方法が提示される。特定の実施形態では、ＡＦ患者は、出血リスクが高い。
【０２８０】
本明細書の具体的な実施形態では、対象（例えば、深部静脈血栓症を伴うか、またはこれを発症するリスクを有する対象）における深部静脈血栓症またはこれと関連する状態を処置、管理、または防止する方法であって、有効量の、本明細書で記載される抗ＦＸＩ抗体、例えば、抗体ＡＭ１、ＡＭ２、ＡＭ３、もしくはＡＭ４、または抗体ＡＭ１、ＡＭ２、ＡＭ３、もしくはＡＭ４のＶＬ  ＣＤＲおよびＶＨ  ＣＤＲを含む抗ＦＸＩ／ＦＸＩａ抗体など、表２に記載されている抗ＦＸＩ／ＦＸＩａ抗体を、それを必要とする対象に投与するステップを含む方法が提示される。
【０２８１】
本明細書の具体的な実施形態では、対象（例えば、静脈血栓塞栓症を伴うか、またはこれを発症するリスクを有する対象）における静脈血栓塞栓症（ＶＴＥ）またはこれと関連する状態を処置、管理、または防止する方法であって、有効量の、本明細書で記載される抗ＦＸＩ抗体、例えば、抗体ＡＭ１、ＡＭ２、ＡＭ３、もしくはＡＭ４、または抗体ＡＭ１、ＡＭ２、ＡＭ３、もしくはＡＭ４のＶＬ  ＣＤＲおよびＶＨ  ＣＤＲを含む抗ＦＸＩ／ＦＸＩａ抗体など、表２に記載されている抗ＦＸＩ／ＦＸＩａ抗体を、それを必要とする対象に投与するステップを含む方法が提示される。特定の実施形態では、本明細書で提示される抗ＦＸＩ抗体で処置される対象は、がん患者を含め、１）出血リスクが低い、初回の特発性ＶＴＥ、２）特発性ＶＴＥの再発、または３）血栓性素因と関連するＶＴＥを経ている。
【０２８２】
本明細書の具体的な実施形態では、対象（例えば、肺塞栓症を伴うか、またはこれを発症するリスクを有する対象）における肺塞栓症またはこれと関連する状態を処置、管理、または防止する方法であって、有効量の、本明細書で記載される抗ＦＸＩ抗体、例えば、抗体ＡＭ１、ＡＭ２、ＡＭ３、もしくはＡＭ４、または抗体ＡＭ１、ＡＭ２、ＡＭ３、もしくはＡＭ４のＶＬ  ＣＤＲおよびＶＨ  ＣＤＲを含む抗ＦＸＩ／ＦＸＩａ抗体など、表２に記載されている抗ＦＸＩ／ＦＸＩａ抗体を、それを必要とする対象に投与するステップを含む方法が提示される。
【０２８３】
本明細書の具体的な実施形態では、対象における急性冠動脈症候群（ＡＣＳ）またはこれと関連する状態を処置、管理、または防止する方法であって、有効量の、本明細書で記載される抗ＦＸＩ抗体、例えば、抗体ＡＭ１、ＡＭ２、ＡＭ３、もしくはＡＭ４、または抗体ＡＭ１、ＡＭ２、ＡＭ３、もしくはＡＭ４のＶＬ  ＣＤＲおよびＶＨ  ＣＤＲを含む抗ＦＸＩ／ＦＸＩａ抗体など、表２に記載されている抗ＦＸＩ／ＦＸＩａ抗体を、それを必要とする対象に投与するステップを含む方法が提示される。
【０２８４】
本明細書の具体的な実施形態では、対象（例えば、虚血性脳卒中を伴うか、またはこれを発症するリスクを有する対象）における虚血性脳卒中を処置、管理、または防止する方法であって、有効量の、本明細書で記載される抗ＦＸＩ抗体、例えば、抗体ＡＭ１、ＡＭ２、ＡＭ３、もしくはＡＭ４、または抗体ＡＭ１、ＡＭ２、ＡＭ３、もしくはＡＭ４のＶＬ  ＣＤＲおよびＶＨ  ＣＤＲを含む抗ＦＸＩ／ＦＸＩａ抗体など、表２に記載されている抗ＦＸＩ／ＦＸＩａ抗体を、それを必要とする対象に投与するステップを含む方法が提示される。
【０２８５】
本明細書の具体的な実施形態では、対象における急性下肢虚血症を処置、管理、または防止する方法であって、有効量の、本明細書で記載される抗ＦＸＩ抗体、例えば、抗体ＡＭ１、ＡＭ２、ＡＭ３、もしくはＡＭ４、または抗体ＡＭ１、ＡＭ２、ＡＭ３、もしくはＡＭ４のＶＬ  ＣＤＲおよびＶＨ  ＣＤＲを含む抗ＦＸＩ／ＦＸＩａ抗体など、表２に記載されている抗ＦＸＩ／ＦＸＩａ抗体を、それを必要とする対象に投与するステップを含む方法が提示される。
【０２８６】
本明細書の具体的な実施形態では、対象における慢性血栓塞栓性肺高血圧症を処置、管理、または防止する方法であって、有効量の、本明細書で記載される抗ＦＸＩ抗体、例えば、抗体ＡＭ１、ＡＭ２、ＡＭ３、もしくはＡＭ４、または抗体ＡＭ１、ＡＭ２、ＡＭ３、もしくはＡＭ４のＶＬ  ＣＤＲおよびＶＨ  ＣＤＲを含む抗ＦＸＩ／ＦＸＩａ抗体など、表２に記載されている抗ＦＸＩ／ＦＸＩａ抗体を、それを必要とする対象に投与するステップを含む方法が提示される。
【０２８７】
本明細書の具体的な実施形態では、対象（例えば、全身性塞栓症を伴うか、またはこれを発症するリスクを有する対象）における全身性塞栓症を処置、管理、または防止する方法であって、有効量の、本明細書で記載される抗ＦＸＩ抗体、例えば、抗体ＡＭ１、ＡＭ２、ＡＭ３、もしくはＡＭ４、または抗体ＡＭ１、ＡＭ２、ＡＭ３、もしくはＡＭ４のＶＬ  ＣＤＲおよびＶＨ  ＣＤＲを含む抗ＦＸＩ／ＦＸＩａ抗体など、表２に記載されている抗ＦＸＩ／ＦＸＩａ抗体を、それを必要とする対象に投与するステップを含む方法が提示される。
【０２８８】
本明細書のある種の実施形態では、カテーテルが血栓性となったカテーテル（例えば、がん患者におけるヒックマンカテーテル）関連状態である、またはチュービングが凝血を発症させる体外式膜型人工肺（ＥＣＭＯ）である血栓塞栓性状態を処置、管理、または防止する方法であって、有効量の、本明細書で記載される抗ＦＸＩ抗体、例えば、抗体ＡＭ１、ＡＭ２、ＡＭ３、もしくはＡＭ４、または抗体ＡＭ１、ＡＭ２、ＡＭ３、もしくはＡＭ４のＶＬ  ＣＤＲおよびＶＨ  ＣＤＲを含む抗ＦＸＩ／ＦＸＩａ抗体など、表２に記載されている抗ＦＸＩ／ＦＸＩａ抗体を、それを必要とする対象に投与するステップを含む方法が提示される。
【０２８９】
特定の実施形態では、本明細書で記載される抗ＦＸＩ抗体、例えば、抗体ＡＭ１、ＡＭ２、ＡＭ３、もしくはＡＭ４、または抗体ＡＭ１、ＡＭ２、ＡＭ３、もしくはＡＭ４のＶＬ  ＣＤＲおよびＶＨ  ＣＤＲを含む抗ＦＸＩ／ＦＸＩａ抗体など、表２に記載されている抗ＦＸＩ／ＦＸＩａ抗体による処置を必要とする対象は、
・慢性の抗凝固療法の適応（例えば、ＡＦ、左室性血栓、既往の心塞栓性脳卒中）を伴う対象、
・大量出血のリスクが中等度〜高度である対象、
・ステント血栓症を防止するように、二重の抗血小板療法（アスピリンおよびＰ２Ｙ１２受容体アンタゴニスト）を施すことを要求しうるステント留置を伴う、待機的経皮冠動脈インターベンション（ＰＣＩ）または直接的ＰＣＩを受ける対象
を含みうる。
【０２９０】
特定の実施形態では、以下の状態：
・発作性心房細動もしくは発作性心房粗動、遷延性心房細動もしくは遷延性心房粗動、または永続性心房細動もしくは永続性心房粗動などの心不整脈を疑われるか、または確認されている対象における血栓塞栓症、
・心房細動における脳卒中の防止（ＳＰＡＦ）を伴う対象であって、その亜集団が、経皮冠動脈インターベンション（ＰＣＩ）を受けるＡＦ患者である対象、
・出血リスクが高い患者における、急性静脈血栓塞栓性事象（ＶＴＥ）の処置、および長期的な続発性ＶＴＥの防止、
・一過性虚血性発作（ＴＩＡ）または非機能障害誘発性脳卒中の後の二次防止における大脳および心血管事象、ならびに洞調律を伴う心不全における血栓塞栓性事象の防止における大脳および心血管事象、
・心不整脈のための心除細動を受ける対象における、左心房内の凝血形成および血栓塞栓症、
・心不整脈のためのアブレーション手順の前、その間、およびその後における血栓症、
・静脈血栓症であり、これは、下肢または上肢における、深部静脈血栓症または表在静脈血栓症、腹部静脈および胸部静脈における血栓症、静脈洞血栓症および頸静脈血栓症の処置および二次防止を含むがこれらに限定されない、
・カテーテルまたはペースメーカーの導線など、静脈内の任意の人工表面上の血栓症、
・静脈血栓症を伴うかまたは伴わない患者における肺塞栓症、
・慢性血栓塞栓性肺高血圧症（ＣＴＥＰＨ）、
・破裂したアテローム性プラーク上の動脈血栓症、動脈内の人工装具上またはカテーテル上の血栓症、および見かけ上正常な動脈内の血栓症であり、これらは、急性冠動脈症候群、ＳＴ上昇型心筋梗塞、非ＳＴ上昇型心筋梗塞、不安定狭心症、ステント血栓症、動脈系内の任意の人工表面の血栓症、および肺高血圧症を伴うかまたは伴わない対象における肺動脈血栓症を含むがこれらに限定されない、
・経皮冠動脈インターベンション（ＰＣＩ）を受ける患者における、血栓症および血栓塞栓症、
・心塞栓性脳卒中および潜因性脳卒中、
・侵襲性および非侵襲性のがん性悪性腫瘍を伴う患者における血栓症、
・留置カテーテルにわたる血栓症、
・重病患者における血栓症および血栓塞栓症、
・心血栓症および血栓塞栓症であり、これらは、心筋梗塞後における心血栓症、心動脈瘤、心筋線維症、心肥大および心機能不全、心筋炎、ならびに心臓内の人工表面などの状態と関連する心血栓症を含むがこれらに限定されない、
・心房細動を伴うかまたは伴わない、心弁性心疾患を伴う患者における血栓塞栓症、
・心弁用の機械的または生物学的人工装具にわたる血栓塞栓症、
・単純型心奇形または複合型心奇形の心臓修復術後において、天然または人工の心パッチ、動脈または静脈の導管を有した患者における傷害または外傷、
・人工膝関節置換術、人工股関節置換術、および整形外科術、胸部手術または腹部手術の後における、静脈血栓症および血栓塞栓症、
・頭蓋内インターベンションおよび脊髄インターベンションを含む神経外科術の後における、動脈血栓症または静脈血栓症、
・第Ｖ因子  Ｌｅｉｄｅｎ、プロトロンビンの突然変異、抗トロンビンＩＩＩ、プロテインＣ欠損症およびプロテインＳ欠損症、第ＸＩＩＩ因子の突然変異、家族性異常フィブリノゲン血症、先天性プラスミノゲン欠損症、第ＸＩ因子レベルの上昇、鎌状赤血球病、抗リン脂質症候群、自己免疫疾患、慢性腸疾患、ネフローゼ症候群、溶血性尿毒症、骨髄増殖性疾患、播種性血管内凝固、発作性夜間ヘモグロビン尿症、およびヘパリン誘導性血小板減少症を含むがこれらに限定されない、先天性または後天性の血栓性素因、
・慢性腎疾患における血栓症および血栓塞栓症、
・末期腎不全（ＥＳＲＤ）における血栓症および血栓塞栓症、
・慢性腎疾患またはＥＳＲＤを伴い、血液透析を受ける患者における血栓症および血栓塞栓症、ならびに
・血液透析を受ける患者、および／または体外式膜型人工肺を受ける患者における、血栓症および血栓塞栓症
の１つを、本明細書で記載される抗ＦＸＩ抗体、例えば、抗体ＡＭ１、ＡＭ２、ＡＭ３、もしくはＡＭ４、または抗体ＡＭ１、ＡＭ２、ＡＭ３、もしくはＡＭ４のＶＬ  ＣＤＲおよびＶＨ  ＣＤＲを含む抗ＦＸＩ／ＦＸＩａ抗体など、表２に記載されている抗ＦＸＩ／ＦＸＩａ抗体で処置または管理することができる。
【０２９１】
本明細書の特定の態様では、対象における、脳卒中および／または全身性塞栓症のリスクを処置、管理、防止、または低減する方法であって、それを必要とする対象に、有効量の、本明細書で記載される抗ＦＸＩ／ＦＸＩａ抗体、例えば、抗体ＡＭ１、ＡＭ２、ＡＭ３、もしくはＡＭ４、または抗体ＡＭ１、ＡＭ２、ＡＭ３、もしくはＡＭ４のＶＬ  ＣＤＲおよびＶＨ  ＣＤＲを含む抗ＦＸＩ／ＦＸＩａ抗体など、表２に記載されている抗ＦＸＩ／ＦＸＩａ抗体を投与するステップを含み、対象が、非弁膜症性心房細動などの心房細動を有する、方法が提示される。具体的な態様では、対象は、高い出血リスクが証明された、非弁膜症性心房細動などの心房細動を有する。
【０２９２】
本明細書の特定の態様では、対象における、脳卒中および／または全身性塞栓症のリスクを処置、管理、防止、または低減する方法であって、それを必要とする対象に、有効量の、本明細書で記載される抗ＦＸＩ／ＦＸＩａ抗体、例えば、抗体ＡＭ１、ＡＭ２、ＡＭ３、もしくはＡＭ４、または抗体ＡＭ１、ＡＭ２、ＡＭ３、もしくはＡＭ４のＶＬ  ＣＤＲおよびＶＨ  ＣＤＲを含む抗ＦＸＩ／ＦＸＩａ抗体など、表２に記載されている抗ＦＸＩ／ＦＸＩａ抗体を投与するステップを含み、対象が、ＥＳＲＤを有し、透析を受けている、方法が提示される。具体的な態様では、対象は、非弁膜症性心房細動などの心房細動と、ＥＳＲＤとを有し、透析を受けている。具体的な態様では、対象は、高い出血リスクが証明された、非弁膜症性心房細動などの心房細動と、ＥＳＲＤとを有し、透析を受けている。
【０２９３】
例えば、高い出血リスクが証明された対象は、出血、例えば、手術中の出血もしくは手術後における出血、または抗凝固剤（例えば、ワルファリン）で処置された場合の出血の医学的既往歴により同定することができる。加えて、高い出血リスクが証明された対象は、当技術分野で公知のｉｎ  ｖｉｔｒｏ／ｅｘ  ｖｉｖｏアッセイ、例えば、対象の血漿に関するアッセイであって、ａＰＴＴ、ならびにプロトロンビン時間（ＰＴ）およびトロンビン時間（ＴＴ）など、外因性凝固経路についてのバイオマーカーを測定するアッセイにより同定することができる。
【０２９４】
心房細動患者に特異的な、出血リスクの評価ツール、例えば、ＨＡＳ−ＢＬＥＤ、ＡＴＲＩＡ、ＨＥＭＯＲＲ２ＨＡＧＥＳ、ＯＲＢＩＴ、およびＡＢＣリスクスコアは、心房細動を伴う患者における出血リスクを予測するために開発された。残念ながら、出血リスクは、脳卒中のリスクと緊密に相関するので、ワルファリンまたはＮＯＡＣＳ（新規経口抗凝固剤）などのビタミンＫアンタゴニストを使用するように治療的決定を導く、これらのリスクスコアの価値は、限定されたものであった。しかし、出血リスクスコアは、出血リスクを低減した新たな治療、例えば、抗ＦＸＩ／ＦＸＩａ抗体（例えば、抗体ＡＭ１、ＡＭ２、ＡＭ３、またはＡＭ４）から利益を得る患者を同定するのに、大いに役立ちうる。
【０２９５】
特定の態様では、脳卒中および全身性塞栓症についてのリスクが中等度〜高度である対象は、≧２のＣＨＡ２ＤＳ２ＶＡＳｃリスクスコアを有する。さらなる特定の態様では、ＨＡＳ  ＢＬＥＤリスクスコアが≧３である対象は、高い出血リスクを有するものとして特徴付けられる（Gallego, et al., (2012) Carc Arrhythm Electrophysiol.; 5:312-318, and Friberg et al., (2012) Circulation.; 125:2298-2307を参照されたい）。
【０２９６】
脳卒中、全身性塞栓症、冠動脈血栓症または末梢動脈血栓症、静脈血栓症、および肺塞栓症を含む血栓塞栓性事象のリスクは、血栓形成傾向、血管壁の損傷、およびうっ血など、素因となる因子の存在と共に増大する。医学的既往歴、家族的先行例、および関連する併存疾患についての査定は、患者を、それらの血栓塞栓性のリスクに従い層別化する一助となる。心房細動を伴う患者では、いくつかの評定システム、例えば、ＣＨＡＤＳ２およびＣＨＡ２ＤＳ２−ＶＡＳｃが、脳卒中のリスクを評価するために開発されている。各評定システムは、無作為化試験、ならびに臨床研究および病因論的コホート研究、ならびに簡略化され、使いやすく覚えやすいデバイス、アルゴリズム、計算機、またはオンラインツールに、変換され、重み付けされた、脳卒中のリスク因子についての多変量公式によるデータに基づき開発された。ＣＨＡＤＳ２リスクスコアは、心房細動患者における血栓塞栓性リスクを予測する層別化ツールとして使用された（LIP 2011; Camm et al 2012）が、蓄積された証拠は、ＣＨＡ２ＤＳ２−ＶＡＳｃは、脳卒中および血栓塞栓症を発症する患者の同定において、ＣＨＡＤＳ２などのスコアと、少なくとも同程度に良好であるか、または、おそらく、これより良好であり、「真に低リスクの」、心房細動を伴う患者の同定では、決定的に良好であることを示す。ＣＨＡ２ＤＳ２−ＶＡＳｃスコアは、現在、ガイドラインにより、抗凝固治療から利益を得るはずの患者に関する決定を導き、また、抗凝固治療が正当ではない、低リスクの患者を同定するのにも、推奨されている（Camm et al Eur Heart J (2012) 33, 2719-2747; January et al, AHA/ACC/HRS Atrial Fibrillation Guideline; J Am Coll Cardiol 2014;64:2246-80）。
【０２９７】
具体的な態様では、本明細書で提示される方法により処置されている対象は、少なくとも１８歳である。別の態様では、本明細書で提示される方法により処置されている対象は、少なくとも５０歳である。別の態様では、本明細書で提示される方法により処置されている対象は、少なくとも５５歳である。別の態様では、本明細書で提示される方法により処置されている対象は、少なくとも６０歳である。別の態様では、本明細書で提示される方法により処置されている対象は、少なくとも６５歳である。
【０２９８】
具体的な態様では、本明細書で提示される方法により処置されている対象は、１８ｋｇ／ｍ２以上のボディマス指数（ＢＭＩ）を有する。別の態様では、本明細書で提示される方法により処置されている対象は、３０ｋｇ／ｍ２以上のＢＭＩを有する。別の態様では、本明細書で提示される方法により処置されている対象は、３５ｋｇ／ｍ２以上のＢＭＩを有する。別の態様では、本明細書で提示される方法により処置されている対象は、４０ｋｇ／ｍ２以上のＢＭＩを有する。
【０２９９】
本明細書の具体的な態様では、本明細書で提示される抗ＦＸＩ抗体（例えば、抗体ＡＭ１、ＡＭ２、ＡＭ３、もしくはＡＭ４、または抗体ＡＭ１、ＡＭ２、ＡＭ３、もしくはＡＭ４のＶＬ  ＣＤＲおよびＶＨ  ＣＤＲを含む抗ＦＸＩ／ＦＸＩａ抗体など、表２に記載されている抗ＦＸＩ／ＦＸＩａ抗体）で処置されるかまたはこれを投与される患者における出血、例えば、外傷、手術、月経、または産後と関連する出血を管理する方法であって、抗凝固効果の逆転を含む方法が提示される。ＦＸＩ欠損症は、自発的な出血症状と関連することがまれであり、具体的な態様では、出血は、外傷、手術、月経、または産後と関連することが最も典型的である。出血の遷延は、大きな外傷の後、または口腔粘膜、鼻腔粘膜、生殖器粘膜、または泌尿器粘膜などの高線溶領域を伴う臓器に関与する手術の後で生じうる。抜歯、扁桃摘出術、および子宮または前立腺のアブレーションは、高い出血リスクを伴う手術の例である。また、障害を伴う人々も、鼻血および斑状出血を発症させる傾向が強く、まれだが、尿中または腸内への出血を発症させる場合もある。ＦＸＩ欠損症を伴う患者では、自発的な筋肉または関節の出血および頭蓋内出血の頻度は増大しない。静脈穿刺は通例、出血の長期化と関連しない。ＦＸＩ欠損症と関連する他の遺伝子突然変異は、重度のＦＸＩ欠損症を伴う患者における、異質な予測外の出血傾向に寄与しうる。抗血小板剤、他の抗凝固剤、および線溶薬剤の併用は、出血リスクを増大させうる。
【０３００】
本明細書の特定の実施形態では、本明細書で提示される抗ＦＸＩ抗体（例えば、抗体ＡＭ１、ＡＭ２、ＡＭ３、もしくはＡＭ４、または抗体ＡＭ１、ＡＭ２、ＡＭ３、もしくはＡＭ４のＶＬ  ＣＤＲおよびＶＨ  ＣＤＲを含む抗ＦＸＩ／ＦＸＩａ抗体など、表２に記載されている抗ＦＸＩ／ＦＸＩａ抗体）で処置される患者における出血を管理する方法であって、出血を管理するのに十分な時間にわたる、一次的な抗凝固効果の逆転を含む方法が提示される。具体的な実施形態では、抗凝固効果を逆転するステップは、（ｉ）コロイド、クリスタロイド、ヒト血漿、もしくはアルブミンなどの血漿タンパク質を用いた補液、または（ｉｉ）濃厚赤血球もしくは全血による輸血を含む。特定の実施形態では、例えば、重度の救急症例における、抗凝固剤の効果の逆転のための治療剤は、新鮮凍結血漿（ＦＦＰ）、プロトロンビン複合体濃縮物（ＰＣＣ）、および活性型ＰＣＣ［（ＡＰＣＣ）、例えば、第ＶＩＩＩ因子インヒビターバイパス活性（ＦＥＩＢＡ）］ならびに組換え活性型第ＶＩＩ因子（ｒＦＶＩＩａ）など、止血促進性の血液成分を含むがこれらに限定されない。一実施形態では、例えば、３０μｇ／ｋｇの用量におけるｒＦＶＩＩａの投与に続き、例えば、６時間ごと、５〜７日間にわたる、１ｇのトラネキサム酸に加えて、例えば、２〜４時間ごとに１５〜３０μｇ／ｋｇの用量で、２４〜４８時間にわたるｒＦＶＩＩａの投与を含むレジメンは、本明細書で提示される抗ＦＸＩ抗体（例えば、抗体ＡＭ１、ＡＭ２、ＡＭ３、もしくはＡＭ４、または抗体ＡＭ１、ＡＭ２、ＡＭ３、もしくはＡＭ４のＶＬ  ＣＤＲおよびＶＨ  ＣＤＲを含む抗ＦＸＩ／ＦＸＩａ抗体など、表２に記載されている抗ＦＸＩ／ＦＸＩａ抗体）で処置される対象であって、大手術を受ける対象、および接近不可能な出血部位を伴う患者における止血を回復させ、出血を止める可能性を有しうる。例えば、Ｒｉｄｄｅｌｌｅらは、インヒビターを伴わない重度のＦＸＩ欠損症を伴う、手術を受ける患者４例における経験について報告したが（Riddell et al., 2011, Thromb. Haemost.; 106: 521-527）、患者は、３０μｇ／ｋｇのｒＦＶＩＩａおよび１ｇのトラネキサム酸を、麻酔導入時にｉ．ｖ．投与された。後続の、例えば、１５〜３０μｇ／ｋｇのｒＦＶＩＩａのボーラス投与は、ｒｏｔａｔｉｏｎａｌ  ｔｈｒｏｍｂｏｅｌａｓｔｏｍｅｔｒｙ（ＲＯＴＥＭ）の結果により示される指針の通り、２〜４時間間隔で投与された。患者は、上述の用量のｒＦＶＩＩａで、２４〜４８時間にわたり処置された。６時間ごとに１ｇのトラネキサム酸は、５日間にわたり継続された。この少量シリーズでは、トラネキサム酸と組み合わせた、１５〜３０μｇ／ｋｇという低用量のｒＦＶＩＩａは、この研究の重度のＦＸＩ欠損症における止血異常の矯正において、安全かつ有効であった。インヒビター（通例、重度のＦＸＩ欠損症を伴う患者への輸血または血液製剤の投与の後で獲得される、自家ＦＸＩ中和抗体）を伴う重度のＦＸＩ欠損症を伴う、５件の手術を経た患者４例を含む別の研究では、著者ら（Livnat et al., 2009, Thromb. Haemost.; 102: 487-492）は、以下のプロトコールを適用した：手術の２時間前における、経口トラネキサム酸１ｇ、次いで、インターベンションの直前に、患者に、別のｉ．ｖ．トラネキサム酸１ｇを施した。用量を１５〜３０μｇ／ｋｇの範囲とする組換えＦＶＩＩａを、手術の完了時に注入した。その後、経口トラネキサム酸１ｇを、６時間ごとに、少なくとも７日間にわたり施した。フィブリン接着剤を、患者１例における、摘出された胆嚢床に噴霧した。このプロトコールは、インヒビターを伴う重度のＦＸＩ欠損症を伴う患者における、正常な止血を確保した。
【０３０１】
一態様では、フィブリン接着剤を使用して、ＦＸＩ欠損症を伴う患者における、歯科手術時の局所止血を回復させることができる（Bolton-Maggs (2000) Haemophilia; 6 (S1):100-9）。本明細書で提示される抗ＦＸＩ抗体（例えば、抗体ＡＭ１、ＡＭ２、ＡＭ３、またはＡＭ４）で処置される患者における出血を管理する方法に関する、ある種の実施形態では、フィブリン接着剤の使用と関連する、６時間ごと、５〜７日間にわたるトラネキサム酸１ｇからなるレジメンは、小さな手術を受ける対象、および口腔および鼻腔における出血事象を含む、出血している部位が接近可能な対象において、局所的な止血を確立するのに使用されうる。
【０３０２】
本明細書の特定の態様では、本明細書で記載される抗ＦＸＩ抗体（例えば、抗体ＡＭ１、ＡＭ２、ＡＭ３、もしくはＡＭ４、または抗体ＡＭ１、ＡＭ２、ＡＭ３、もしくはＡＭ４のＶＬ  ＣＤＲおよびＶＨ  ＣＤＲを含む抗ＦＸＩ／ＦＸＩａ抗体など、表２に記載されている抗ＦＸＩ／ＦＸＩａ抗体）で処置されるか、またはこれを投与された患者における、出血または出血リスクを管理する方法であって、それを必要とする患者に、抗ＦＸＩ抗体の抗イディオタイプ抗体またはその抗原結合性断片（例えば、Ｆａｂ）を投与するステップを含み、抗イディオタイプ抗体またはその抗原結合性断片（例えば、Ｆａｂ）が、抗ＦＸＩ抗体に特異的に結合し、抗ＦＸＩ抗体の、ＦＸＩへの結合を遮断する、方法が提示される。具体的な実施形態では、抗イディオタイプ抗体またはその抗原結合性断片（例えば、Ｆａｂ）は、例えば、緊急の大手術時または外傷時において、本明細書で記載される抗ＦＸＩ抗体の効果を逆転させて、出血リスクを緩和する。
【０３０３】
具体的な態様では、抗イディオタイプ抗体またはその抗原結合性断片（例えば、Ｆａｂ）は、抗ＦＸＩ抗体の抗凝固効果を逆転させるか、またはこれを阻害する。特定の態様では、抗イディオタイプ抗体またはその抗原結合性断片（例えば、Ｆａｂ）を、それを必要とする患者に投与して、本明細書で記載される抗ＦＸＩ抗体（例えば、抗体ＡＭ１、ＡＭ２、ＡＭ３、もしくはＡＭ４、または抗体ＡＭ１、ＡＭ２、ＡＭ３、もしくはＡＭ４のＶＬ  ＣＤＲおよびＶＨ  ＣＤＲを含む抗ＦＸＩ／ＦＸＩａ抗体など、表２に記載されている抗ＦＸＩ／ＦＸＩａ抗体）の抗凝固効果を、一時的に逆転させる。
【０３０４】
本明細書の特定の態様では、抗体ＡＭ１、ＡＭ２、ＡＭ３、またはＡＭ４などの抗ＦＸＩ抗体で処置されるか、またはこれを投与された患者における、出血または出血リスクを管理する方法であって、それを必要とする患者に、抗体ＡＭ１、ＡＭ２、ＡＭ３、またはＡＭ４など、抗ＦＸＩ抗体の抗イディオタイプ抗体またはその抗原結合性断片（例えば、Ｆａｂ）を投与するステップを含み、抗イディオタイプ抗体またはその抗原結合性断片（例えば、Ｆａｂ）が、抗ＦＸＩ抗体の抗原結合性領域に特異的に結合し、抗ＦＸＩ抗体の、ＦＸＩおよび／またはＦＸＩａへの結合を遮断する、方法が提示される。具体的な実施形態では、抗体ＡＭ１、ＡＭ２、ＡＭ３、またはＡＭ４など、抗ＦＸＩ抗体の抗イディオタイプ抗体またはその抗原結合性断片（例えば、Ｆａｂ）は、抗ＦＸＩ抗体の抗凝固効果の１つまたは複数を逆転させるか、またはこれを阻害する。ある種の実施形態では、抗ＦＸＩ抗体（例えば、抗体ＡＭ１、ＡＭ２、ＡＭ３、またはＡＭ４）の抗凝固効果の１つまたは複数の、一時的な逆転または阻害を達成する。具体的な実施形態では、抗ＦＸＩ抗体（例えば、抗体ＡＭ１、ＡＭ２、ＡＭ３、またはＡＭ４）の、一時的な逆転または阻害の後、抗ＦＸＩ抗体を、再度、患者に投与する。
【０３０５】
本明細書の特定の態様では、本明細書で記載される抗ＦＸＩ抗体または抗原結合性断片（例えば、抗体ＡＭ１、ＡＭ２、ＡＭ３、またはＡＭ４）で処置されるか、またはこれを投与された対象における、出血または出血リスクを管理または低減する方法であって、それを必要とする対象に、抗ＦＸＩ抗体に特異的に結合し、抗ＦＸＩ抗体の、ＦＸＩへの結合を遮断する抗イディオタイプ抗体またはその断片を投与するステップを含み、抗イディオタイプ抗体またはその断片が、抗ＦＸＩ抗体の抗凝固活性を逆転させる、方法が提示される。具体的な態様では、抗イディオタイプ抗体またはその断片を、対象に、１回または２回にわたり投与して、抗ＦＸＩ抗体の抗凝固効果を一時的に逆転させる。
【０３０６】
本明細書の具体的な態様では、本明細書で記載される抗ＦＸＩ抗体または抗原結合性断片（例えば、抗体ＡＭ１、ＡＭ２、ＡＭ３、またはＡＭ４）で処置されるか、またはこれを投与された対象における、出血または出血リスクを管理または低減する方法であって、以下：（ｉ）コロイド、クリスタロイド、ヒト血漿、もしくはアルブミンなどの血漿タンパク質を用いた補液、（ｉｉ）濃厚赤血球もしくは全血による輸血、または（ｉｉｉ）新鮮凍結血漿（ＦＦＰ）、プロトロンビン複合体濃縮物（ＰＣＣ）、第ＶＩＩＩ因子インヒビターなどの活性型ＰＣＣ（ＡＰＣＣ）、および／もしくは組換え活性型第ＶＩＩ因子の投与のうちの１つにより、出血を管理するのに十分な時間にわたって抗凝固効果を逆転させるステップを含む方法が提示される。具体的な態様では、前記方法は、対象に、本明細書で記載される抗ＦＸＩ／ＦＸＩａ抗体に特異的に結合する抗イディオタイプ抗体またはその断片（例えば、抗体ＡＭ１、ＡＭ２、ＡＭ３、またはＡＭ４）の、１回もしくは２回、またはこれを超える回数の投与を行うステップを含む。具体的な態様では、抗イディオタイプ抗体は、抗ＦＸＩ／ＦＸＩａ抗体の、ＦＸＩ／ＦＸＩａへの結合を遮断し、抗ＦＸＩ抗体の抗凝固活性を逆転させることが可能である。具体的な態様では、前記方法は、以下：（ｉ）コロイド、クリスタロイド、ヒト血漿、もしくはアルブミンなどの血漿タンパク質を用いた補液、（ｉｉ）濃厚赤血球もしくは全血による輸血、または（ｉｉｉ）新鮮凍結血漿（ＦＦＰ）、プロトロンビン複合体濃縮物（ＰＣＣ）、第ＶＩＩＩ因子インヒビターなどの活性型ＰＣＣ（ＡＰＣＣ）、および／もしくは組換え活性型第ＶＩＩ因子（ｒｆＶＩＩａ）の投与のうちの１つにより、出血を管理するのに十分な時間にわたる、抗凝固効果の逆転（例えば、一時的な逆転）を含む。具体的な態様では、このような方法は、任意選択で、トラネキサム酸を投与するステップを含む。
【０３０７】
本明細書の具体的な態様では、本明細書で記載される抗ＦＸＩ抗体または抗原結合性断片（例えば、抗体ＡＭ１、ＡＭ２、ＡＭ３、またはＡＭ４）の、抗ＦＸＩ／ＦＸＩａ抗体またはその抗原結合性断片により処置されている患者における抗凝固効果を逆転させるための方法であって、有効量の、抗ＦＸＩ抗体に特異的に結合する抗イディオタイプ抗体またはその断片を投与するステップと、任意選択で、有効量の新鮮凍結血漿（ＦＦＰ）と、任意選択で、トラネキサム酸とを投与するステップとを含む方法が提示される。
【０３０８】
本明細書の具体的な態様では、抗体ＡＭ４など、本明細書で記載される抗ＦＸＩ抗体または抗原結合性断片の、抗ＦＸＩ／ＦＸＩａ抗体またはその抗原結合性断片により処置されている患者における抗凝固効果を逆転させるための方法であって、有効量の、抗ＦＸＩ抗体に特異的に結合する抗イディオタイプ抗体（例えば、抗ＡＭ４抗体）またはその断片を投与するステップと、任意選択で、有効量の組換え活性型第ＶＩＩ因子（ｒｆＶＩＩａ）と、任意選択で、トラネキサム酸とを投与するステップを含む方法が提示される。
【０３０９】
特定の態様では、抗イディオタイプ抗体は、既に記載されている多様な方法により作製することができる（例えば、Pan et al., 1995, FASEB J. 9:43-49を参照されたい）。抗イディオタイプ抗体は、抗体分子（例えば、抗体ＡＭ１、ＡＭ２、ＡＭ３、またはＡＭ４）により誘発され、抗体の結合性部位内、またはこの近傍の抗原決定基（イディオタイプ）に対して方向付けられる。抗イディオタイプ抗体は、元の抗原と接触する結合性部位の一部と重複し、誘発性抗原を模倣しうる抗原決定基を認識する。
【０３１０】
医薬組成物
本開示は、薬学的に許容される担体と併せて製剤化されたＦＸＩ／ＦＸＩａ結合性抗体（インタクトなまたは結合性断片）を含む医薬組成物を提供する。組成物は加えて、例えば、血栓塞栓性障害（例えば、血栓性障害）の処置または防止に適した１つまたは複数の他の治療剤も含有しうる。薬学的に許容される担体は、組成物を増強するかもしくは安定化させるか、または、組成物の調製を容易とするのに使用することもできる。薬学的に許容される担体は、生理学的に適合性の溶媒、分散媒、コーティング、抗菌剤および抗真菌剤、等張剤および吸収遅延剤などを含む。
【０３１１】
本開示の医薬組成物は、当技術分野で公知の様々な方法により投与することができる。投与経路および／または投与方式は、所望される結果に応じて変化する。投与は、静脈内投与、筋内投与、腹腔内投与、もしくは皮下投与であるか、または標的部位に近接して投与することが好ましい。薬学的に許容される担体は、静脈内投与、筋内投与、皮下投与、非経口投与、脊髄投与、または表皮投与（例えば、注射または注入による）に適したものとする。投与経路に応じて、活性化合物、すなわち、二特異性分子および多特異性分子である抗体は、化合物を、化合物を不活化しうる酸および他の天然の状態の作用から保護する材料でコーティングすることができる。
【０３１２】
特定の態様では、本明細書で記載される抗ＦＸＩ／ＦＸＩａ抗体（例えば、抗体ＡＭ１、ＡＭ２、ＡＭ３、もしくはＡＭ４、または抗体ＡＭ１、ＡＭ２、ＡＭ３、もしくはＡＭ４のＶＬ  ＣＤＲおよびＶＨ  ＣＤＲを含む抗ＦＸＩ／ＦＸＩａ抗体など、表２に記載されている抗ＦＸＩ／ＦＸＩａ抗体）を、皮下注射用の液体バイアル中に、１ｍＬ当たり約７５ｍｇ〜１ｍＬ当たり約２００ｍｇの濃度で製剤化する。特定の実施形態では、医薬組成物は、医薬担体または医薬賦形剤、例えば、スクロースおよびポリソルベート２０を含む。特定の実施形態では、医薬組成物は、Ｌ−ヒスチジンおよび／またはヒスチジンＨＣｌ一水和物を含む。ある種の実施形態では、医薬組成物は、約４〜７または５〜６のｐＨを有する。
【０３１３】
特定の態様では、本明細書で記載される抗ＦＸＩ抗体（例えば、抗体ＡＭ１、ＡＭ２、ＡＭ３、もしくはＡＭ４、または抗体ＡＭ１、ＡＭ２、ＡＭ３、もしくはＡＭ４のＶＬ  ＣＤＲおよびＶＨ  ＣＤＲを含む抗ＦＸＩ／ＦＸＩａ抗体など、表２に記載されている抗ＦＸＩ／ＦＸＩａ抗体）を、皮下注射用の液体バイアル中に、１ｍＬ当たり１５０ｍｇの濃度で製剤化する。一実施形態では、１５０ｍｇ／ｍＬの流体製剤は、ｐＨ＝５．５±０．５として、１５０ｍｇの抗ＦＸＩ抗体、Ｌ−ヒスチジン、ヒスチジンＨＣｌ一水和物、スクロース、およびポリソルベート２０を含有する。組成物は、滅菌であり、かつ、流体であるものとする。適正な流体性は、例えば、レシチンなどのコーティングを使用することにより維持することができ、分散液の場合には、要求される粒子サイズを維持し、界面活性剤を使用することにより維持することができる。多くの場合、組成物中に等張剤、例えば、糖、マンニトールまたはソルビトールなどの多価アルコール、および塩化ナトリウムを含むことが好ましい。注射用組成物の長時間吸収は、組成物中に、吸収を遅延させる薬剤、例えば、モノステアリン酸アルミニウムまたはゼラチンを組み入れることによりもたらすことができる。
【０３１４】
本開示の医薬組成物は、当技術分野において周知であり、日常的に実施されている方法に従い調製することができる。例えば、Remington：The Science and Practice of Pharmacy、Mack Publishing Co.、20版、2000、およびSustained and Controlled Release Drug Delivery Systems、J.R. Robinson編、Marcel Dekker, Inc.、New York、1978を参照されたい。医薬組成物は、ＧＭＰ条件下で製造することが好ましい。本開示の医薬組成物中では、ＦＸＩａ結合性抗体の治療的に有効な用量または治療的に効果的な用量を利用することが典型的である。ＦＸＩａ結合性抗体は、当業者に公知の従来の方法により、薬学的に許容される剤形に製剤化する。投与レジメンは、所望される最適応答（例えば、治療的応答）をもたらすように調整する。例えば、単一のボーラスを投与することもでき、複数に分割された用量をある期間にわたり投与することもでき、治療状況の要件により指し示されるのに応じて、用量を比例的に低減するかまたは増大させることもできる。投与の容易さおよび投与量の均一性のために、非経口組成物を、投与量単位形態で製剤化することがとりわけ有利である。本明細書で使用される投与量単位形態とは、処置される対象のための単位投与量として適した、物理的に個別の単位を指す。各単位は、要求される医薬担体との関連で、所望の治療効果をもたらすように計算された、所定量の活性化合物を含有する。
【０３１５】
本開示の医薬組成物中の有効成分の実際の投与量レベルは、患者に毒性とならずに、特定の患者、組成物、および投与方式に所望される治療的応答を達成するのに有効な量の有効成分を得るように変化させることができる。選択される投与量レベルは、利用される本開示の特定の組成物、それらの活性、投与経路、投与時期、利用される特定の化合物の排出速度、処置の持続期間、利用される特定の組成物と組み合わせて使用される他の薬物、化合物、および／または材料、処置される患者の年齢、性別、体重、状態、全般的健康、および医療既往歴などの因子を含む様々な薬物動態因子に依存する。
【０３１６】
医師は、医薬組成物中で利用される本開示の抗体の投与を、所望の治療効果を達成するのに要求されるレベル未満のレベルで開始し、所望の効果が達成されるまで、投与量を漸増させることができる。一般に、本明細書で記載される血栓性および／または血栓塞栓性障害を処置するのに有効な、本開示の組成物の用量は、投与手段、標的部位、患者の生理学的状態、投与される他の薬物、および処置が予防的であるのか治療的であるのかを含む、多くの異なる因子に応じて変化する。処置投与量は、安全性および有効性を最適化するように滴定することが必要である。抗体の全身投与では、投与量は、宿主の体重１ｋｇ当たり約０．０１〜１５ｍｇの範囲である。抗体の投与では、投与量は、０．１ｍｇ〜５ｍｇの範囲でありうる。例えば、０．１ｍｇ／ｋｇ、０．２ｍｇ／ｋｇ、０．３ｍｇ／ｋｇ、０．４ｍｇ／ｋｇ、０．５ｍｇ／ｋｇ、０．６ｍｇ／ｋｇ、０．７ｍｇ／ｋｇ、０．８ｍｇ／ｋｇ、０．９ｍｇ／ｋｇ、１．０ｍｇ／ｋｇ、１．１ｍｇ／ｋｇ、１．２ｍｇ／ｋｇ、１．３ｍｇ／ｋｇ、１．４ｍｇ／ｋｇ、１．５ｍｇ／ｋｇ、１．６ｍｇ／ｋｇ、１．７ｍｇ／ｋｇ、１．８ｍｇ／ｋｇ、１．９ｍｇ／ｋｇ、２．０ｍｇ／ｋｇ、２．１ｍｇ／ｋｇ、２．２ｍｇ／ｋｇ、２．３ｍｇ／ｋｇ、２．４ｍｇ／ｋｇ、２．５ｍｇ／ｋｇ、２．６ｍｇ／ｋｇ、２．７ｍｇ／ｋｇ、２．８ｍｇ／ｋｇ、２．９ｍｇ／ｋｇ、３．０ｍｇ／ｋｇ、３．１ｍｇ／ｋｇ、３．２ｍｇ／ｋｇ、３．３ｍｇ／ｋｇ、３．４ｍｇ／ｋｇ、３．５ｍｇ／ｋｇ、３．６ｍｇ／ｋｇ、３．７ｍｇ／ｋｇ、３．８ｍｇ／ｋｇ、３．９ｍｇ／ｋｇ、４．０ｍｇ／ｋｇ、４．１ｍｇ／ｋｇ、４．２ｍｇ／ｋｇ、４．３ｍｇ／ｋｇ、４．４ｍｇ／ｋｇ、４．５ｍｇ／ｋｇ、４．６ｍｇ／ｋｇ、４．７ｍｇ／ｋｇ、４．８ｍｇ／ｋｇ、４．９ｍｇ／ｋｇ、または５．０ｍｇ／ｋｇ。例示的な処置レジメは、２週間ごとに１回、または毎月１回、または３〜６カ月ごとに１回の全身投与を伴う。例示的な処置レジメは、毎週１回、２週間ごとに１回、毎月１回、もしくは３〜６カ月ごとに１回、または必要に応じて（ＰＲＮ）の全身投与を伴う。
【０３１７】
ある種の実施形態では、本明細書で記載される抗ＦＸＩ抗体（例えば、抗体ＡＭ１、ＡＭ２、ＡＭ３、もしくはＡＭ４、または抗体ＡＭ１、ＡＭ２、ＡＭ３、もしくはＡＭ４のＶＬ  ＣＤＲおよびＶＨ  ＣＤＲを含む抗ＦＸＩ／ＦＸＩａ抗体など、表２に記載されている抗ＦＸＩ／ＦＸＩａ抗体）を、例えば、ｉ．ｖ．またはｓ．ｃ．により、３ｍｇ／ｋｇの用量で投与する。ある種の実施形態では、本明細書で記載される抗ＦＸＩ抗体（例えば、抗体ＡＭ１、ＡＭ２、ＡＭ３、もしくはＡＭ４、または抗体ＡＭ１、ＡＭ２、ＡＭ３、もしくはＡＭ４のＶＬ  ＣＤＲおよびＶＨ  ＣＤＲを含む抗ＦＸＩ／ＦＸＩａ抗体など、表２に記載されている抗ＦＸＩ／ＦＸＩａ抗体）を、例えば、ｉ．ｖ．またはｓ．ｃ．により、１０ｍｇ／ｋｇの用量で投与する。ある種の実施形態では、本明細書で記載される抗ＦＸＩ抗体（例えば、抗体ＡＭ１、ＡＭ２、ＡＭ３、もしくはＡＭ４、または抗体ＡＭ１、ＡＭ２、ＡＭ３、もしくはＡＭ４のＶＬ  ＣＤＲおよびＶＨ  ＣＤＲを含む抗ＦＸＩ／ＦＸＩａ抗体など、表２に記載されている抗ＦＸＩ／ＦＸＩａ抗体）を、例えば、ｉ．ｖ．またはｓ．ｃ．により、３０ｍｇ／ｋｇの用量で投与する。
【０３１８】
ある種の実施形態では、本明細書で記載される抗ＦＸＩ抗体（例えば、抗体ＡＭ１、ＡＭ２、ＡＭ３、もしくはＡＭ４、または抗体ＡＭ１、ＡＭ２、ＡＭ３、もしくはＡＭ４のＶＬ  ＣＤＲおよびＶＨ  ＣＤＲを含む抗ＦＸＩ／ＦＸＩａ抗体など、表２に記載されている抗ＦＸＩ／ＦＸＩａ抗体）を、例えば、ｉ．ｖ．またはｓ．ｃ．により、５０ｍｇ／ｋｇの用量で投与する。
【０３１９】
ある種の実施形態では、本明細書で記載される抗ＦＸＩ抗体（例えば、抗体ＡＭ１、ＡＭ２、ＡＭ３、もしくはＡＭ４、または抗体ＡＭ１、ＡＭ２、ＡＭ３、もしくはＡＭ４のＶＬ  ＣＤＲおよびＶＨ  ＣＤＲを含む抗ＦＸＩ／ＦＸＩａ抗体など、表２に記載されている抗ＦＸＩ／ＦＸＩａ抗体）を、例えば、ｉ．ｖ．またはｓ．ｃ．により、１００ｍｇ／ｋｇの用量で投与する。
【０３２０】
ある種の実施形態では、本明細書で記載される抗ＦＸＩ抗体（例えば、抗体ＡＭ１、ＡＭ２、ＡＭ３、もしくはＡＭ４、または抗体ＡＭ１、ＡＭ２、ＡＭ３、もしくはＡＭ４のＶＬ  ＣＤＲおよびＶＨ  ＣＤＲを含む抗ＦＸＩ／ＦＸＩａ抗体など、表２に記載されている抗ＦＸＩ／ＦＸＩａ抗体）を、例えば、ｉ．ｖ．経路またはｓ．ｃ．経路により、５ｍｇ〜６００ｍｇの範囲の用量で投与する。
【０３２１】
ある種の実施形態では、本明細書で記載される抗ＦＸＩ抗体（例えば、抗体ＡＭ１、ＡＭ２、ＡＭ３、もしくはＡＭ４、または抗体ＡＭ１、ＡＭ２、ＡＭ３、もしくはＡＭ４のＶＬ  ＣＤＲおよびＶＨ  ＣＤＲを含む抗ＦＸＩ／ＦＸＩａ抗体など、表２に記載されている抗ＦＸＩ／ＦＸＩａ抗体）を、例えば、ｉ．ｖ．経路またはｓ．ｃ．経路により、約５ｍｇ、１０ｍｇ、１５ｍｇ、２０ｍｇ、３０ｍｇ、４０ｍｇ、５０ｍｇ、６０ｍｇ、９０ｍｇ、１００ｍｇ、１２０ｍｇ、１５０ｍｇ、１８０ｍｇ、２００ｍｇ、２１０ｍｇ、２４０ｍｇ、２５０ｍｇ、２７０ｍｇ、３００ｍｇ、３３０ｍｇ、３５０ｍｇ、３６０ｍｇ、３９０ｍｇ、４００ｍｇ、４２０ｍｇ、４５０ｍｇ、４８０ｍｇ、５００ｍｇ、５１０ｍｇ、５４０ｍｇ、５５０ｍｇ、５７０ｍｇ、または６００ｍｇの用量で投与する。
【０３２２】
ある種の実施形態では、本明細書で記載される抗ＦＸＩ抗体（例えば、抗体ＡＭ１、ＡＭ２、ＡＭ３、もしくはＡＭ４、または抗体ＡＭ１、ＡＭ２、ＡＭ３、もしくはＡＭ４のＶＬ  ＣＤＲおよびＶＨ  ＣＤＲを含む抗ＦＸＩ／ＦＸＩａ抗体など、表２に記載されている抗ＦＸＩ／ＦＸＩａ抗体）を、例えば、ｓ．ｃ．経路により、５ｍｇの用量で投与する。
【０３２３】
ある種の実施形態では、本明細書で記載される抗ＦＸＩ抗体（例えば、抗体ＡＭ１、ＡＭ２、ＡＭ３、もしくはＡＭ４、または抗体ＡＭ１、ＡＭ２、ＡＭ３、もしくはＡＭ４のＶＬ  ＣＤＲおよびＶＨ  ＣＤＲを含む抗ＦＸＩ／ＦＸＩａ抗体など、表２に記載されている抗ＦＸＩ／ＦＸＩａ抗体）を、例えば、ｓ．ｃ．経路により、１５ｍｇの用量で投与する。
【０３２４】
ある種の実施形態では、本明細書で記載される抗ＦＸＩ抗体（例えば、抗体ＡＭ１、ＡＭ２、ＡＭ３、もしくはＡＭ４、または抗体ＡＭ１、ＡＭ２、ＡＭ３、もしくはＡＭ４のＶＬ  ＣＤＲおよびＶＨ  ＣＤＲを含む抗ＦＸＩ／ＦＸＩａ抗体など、表２に記載されている抗ＦＸＩ／ＦＸＩａ抗体）を、例えば、ｓ．ｃ．経路により、５０ｍｇの用量で投与する。
【０３２５】
ある種の実施形態では、本明細書で記載される抗ＦＸＩ抗体（例えば、抗体ＡＭ１、ＡＭ２、ＡＭ３、もしくはＡＭ４、または抗体ＡＭ１、ＡＭ２、ＡＭ３、もしくはＡＭ４のＶＬ  ＣＤＲおよびＶＨ  ＣＤＲを含む抗ＦＸＩ／ＦＸＩａ抗体など、表２に記載されている抗ＦＸＩ／ＦＸＩａ抗体）を、例えば、ｓ．ｃ．経路により、１５０ｍｇの用量で投与する。
【０３２６】
ある種の実施形態では、本明細書で記載される抗ＦＸＩ抗体（例えば、抗体ＡＭ１、ＡＭ２、ＡＭ３、もしくはＡＭ４、または抗体ＡＭ１、ＡＭ２、ＡＭ３、もしくはＡＭ４のＶＬ  ＣＤＲおよびＶＨ  ＣＤＲを含む抗ＦＸＩ／ＦＸＩａ抗体など、表２に記載されている抗ＦＸＩ／ＦＸＩａ抗体）を、例えば、ｓ．ｃ．経路により、３００ｍｇの用量で投与する。
【０３２７】
ある種の実施形態では、本明細書で記載される抗ＦＸＩ抗体（例えば、抗体ＡＭ１、ＡＭ２、ＡＭ３、もしくはＡＭ４、または抗体ＡＭ１、ＡＭ２、ＡＭ３、もしくはＡＭ４のＶＬ  ＣＤＲおよびＶＨ  ＣＤＲを含む抗ＦＸＩ／ＦＸＩａ抗体など、表２に記載されている抗ＦＸＩ／ＦＸＩａ抗体）を、例えば、ｓ．ｃ．経路により、６００ｍｇの用量で投与する。
【０３２８】
ある種の実施形態では、本明細書で記載される抗ＦＸＩ抗体（例えば、抗体ＡＭ１、ＡＭ２、ＡＭ３、もしくはＡＭ４、または抗体ＡＭ１、ＡＭ２、ＡＭ３、もしくはＡＭ４のＶＬ  ＣＤＲおよびＶＨ  ＣＤＲを含む抗ＦＸＩ／ＦＸＩａ抗体など、表２に記載されている抗ＦＸＩ／ＦＸＩａ抗体）を、例えば、ｉ．ｖ．経路またはｓ．ｃ．経路により、２倍またはこれを超える、ａＰＴＴ延長の平均持続時間を、３０日間、３５日間、３６日間、３７日間、３８日間、３９日間、４０日間、４１日間、４２日間、４３日間、４４日間、４５日間、または５０日間を超えない期間にわたり達成するのに十分な用量で投与する。
【０３２９】
ある種の実施形態では、本明細書で記載される抗ＦＸＩ抗体（例えば、抗体ＡＭ１、ＡＭ２、ＡＭ３、もしくはＡＭ４、または抗体ＡＭ１、ＡＭ２、ＡＭ３、もしくはＡＭ４のＶＬ  ＣＤＲおよびＶＨ  ＣＤＲを含む抗ＦＸＩ／ＦＸＩａ抗体など、表２に記載されている抗ＦＸＩ／ＦＸＩａ抗体）を、例えば、ｉ．ｖ．経路またはｓ．ｃ．経路により、２倍またはこれを超える、ａＰＴＴ延長の平均持続時間を、４２日間を超えない期間にわたり達成するのに十分な用量で投与する。
【０３３０】
特定の態様では、抗体は通例、複数回投与する。単回の投与の間の間隔は、毎週、毎月、または毎年でありうる。間隔はまた、患者におけるＦＸＩａ結合性抗体の血中レベルを測定することにより指し示される通り、不規則でもありうる。加えて、医師が代替的な投与間隔を決定する場合もあり、毎月または効果的であるのに必要な間隔で投与する。全身投与のいくつかの方法では、投与量は、抗体の血漿中濃度１〜１０００μｇ／ｍＬを達成するように調整し、いくつかの方法では、２５〜５００μｇ／ｍｌを達成するように調整する。代替的に、抗体は、持続放出製剤として投与することもでき、この場合は、低頻度の投与が要求される。投与量および頻度は、患者における抗体の半減期に応じて変化する。一般に、ヒト化抗体は、キメラ抗体および非ヒト抗体の半減期より長い半減期を示す。投与量および投与頻度は、処置が予防的であるのか治療的であるのかに応じて変化しうる。予防的適用では、比較的低投与量を、比較的低頻度の間隔で、長期にわたり投与する。一部の患者には、彼らの余生にわたり処置を施し続ける。治療的適用では場合によって、比較的高投与量が、疾患の進行が軽減されるか終結するまで、比較的短い間隔で要求され、好ましくは、患者が、疾患の症状の部分的または完全な改善を示すまで要求される。その後、患者には、予防的レジメンを投与することができる。
【実施例】
【０３３１】
以下の実施例は、本開示をさらに例示するために提示されるものであり、その範囲を限定するために提示されるものではない。当業者には、本開示の他の変形がたやすく明らかであろうし、添付の特許請求の範囲によっても包含される。
【０３３２】
[実施例１]
アフィニティー成熟抗ＦＸＩ／ＦＸＩａ抗体の作出
成熟パニング
抗ＦＸＩ／ＦＸＩａ抗体ＮＯＶ１０９０（ＮＯＶ１４０１の非生殖細胞系列形であり、ヒトＦｃドメイン内に、Ｄ２６５Ａ置換およびＰ３２９Ａ置換などのＦｃ修飾を含有しない）のアフィニティーおよび生物学的活性を増大させるために、多様化させたカセット／モジュールにより、並列的に、ＣＤＲ−Ｌ３領域と、ＣＤＲ−Ｈ２領域とを交換して（Prassler et al (2009) Immunotherapy; 1(4):571-83）、下記で記載されるＨｕＣＡＬ  ＰＬＡＴＩＮＵＭ（登録商標）Ｍａｔｕｒａｔｉｏｎ  Ｌｉｂｒａｒｉｅｓを作り出した。
【０３３３】
アフィニティーを改善された候補物を選択するために、成熟ライブラリーからの、ファージ由来の候補物を、ヒトＦＸＩの触媒ドメインなど、ヒトＦＸＩによる、２または３ラウンドの成熟パニングにかけた（例えば、参照によりその全体において本明細書に組み込まれる、ＰＣＴ国際公開第２０１６／２０７８５８号パンフレットを参照されたい）。
【０３３４】
各パニングラウンドにおける抗原濃度を低下させることにより、パニングの厳密性を増大させた（Low et al (1996) J Mol Biol; 260(3):359-68）。抗原の低減に加えて、オフ速度選択を実施した（Hawkins et al (1992) J Mol Biol; 226(3):889-96）。これらの戦略を、洗浄ステップの延長と組み合わせた。
【０３３５】
ＨｕＣＡＬ  ＰＬＡＴＩＮＵＭ（登録商標）Ｍａｔｕｒａｔｉｏｎ  Ｌｉｂｒａｒｉｅｓの作出
ＮＯＶ１０９０についての成熟ライブラリーを作り出すために、ＣＤＲ−Ｌ３領域およびＣＤＲ−Ｈ２領域を、フレームワーク領域を一定に保ちながら、トリヌクレオチドにより方向付けられた突然変異誘発を使用するカセット突然変異誘発により最適化した（Virnekaes et al (1994) Nucleic Acids Res; 22(25):5600-7）。
【０３３６】
成熟ライブラリーのクローニングは、親ＮＯＶ１０９０  Ｆａｂ断片をコードする、ＣｙｓＤｉｓｐｌａｙ（商標）ベクター内で実施した。
【０３３７】
ＣＤＲ−Ｌ３を最適化するために、ＣＤＲ−Ｌ３、フレームワーク４のほか、軽鎖の定常領域をコードする約４００ｂｐのＤＮＡ断片を、制限消化により、親抗体の配列から除去し、フレームワーク４および定常ドメインと併せて多様化させたＣＤＲ−Ｌ３領域をコードするＤＮＡ断片のレパートリーで置きかえた。
【０３３８】
第２のライブラリーのために、接続するフレームワーク領域は一定に保ちながら、ＣＤＲ−Ｈ２をコードする配列を多様化させた。親非多様化配列のバックグラウンドを低減するために、親ＣＤＲ−Ｈ２配列およびフレームワーク３配列を含有する約１５０ｂｐのＤＮＡ断片を、制限消化およびライゲーションを介して、約５９０ｂｐの「ダミー」配列で置きかえてから、制限消化およびライゲーションにより、多様化させたＣＤＲ−Ｈ２カセット（フレームワーク３を含む）を挿入した。
【０３３９】
ＭＣ１０６１Ｆ’へのライゲーション混合物の電気穿孔により、全サイズを、それぞれ、７．７×１０８および６．７×１０８とする、ＨＣＤＲ２およびＬＣＤＲ３の多様化のためのライブラリーをもたらした。ライブラリーの増幅は、既に記載されている通りに実施した（Rauchenberger et al (2003) J Biol Chem; 278(40):38194-205）。品質管理のために、ライブラリー１つ当たり、およそ１０〜２０の単一クローンを、ランダムにピックアップし、シーケンシングした。
【０３４０】
抗体ＡＭ１、ＡＭ２、およびＡＭ３を、この工程から同定した。ＡＭ４とは、軽鎖のＮ末端において、２カ所のアミノ酸変化を伴う、ＡＭ３の生殖細胞系列形（表２を参照されたい）である。
【０３４１】
[実施例２]
溶液平衡滴定（ＳＥＴ）による、抗ＦＸＩ／ＦＸＩａ  Ｆａｂ（ＮＯＶ１０９０  Ｆａｂ）についての、ＫＤの決定
方法についての記載
解析的サイズ除外クロマトグラフィー（ＳＥＣ）により解析される通り、少なくとも９０％単量体含量を含有する、ＮＯＶ１０９０  Ｆａｂの純粋な画分を、ＳＥＴによるアフィニティーの決定のために使用した。
【０３４２】
溶液中のＫＤの決定は、記載される通りに実施した（Friguet et al (1985) J Immunol Methods; 77(2):305-19. PubMed PMID: 3981007）。ＳＥＴ法の感度および精度を改善するために、ＳＥＴ法を、古典的ＥＬＩＳＡから、ＥＣＬベースの技術に移した（Haenel et al (2005) Anal Biochem; 339(1):182-4）。
【０３４３】
製造元の指示書に従い、ＭＳＤ  Ｓｕｌｆｏ−ＴＡＧ（商標）ＮＨＳ−Ｅｓｔｅｒ（Ｍｅｓｏ  Ｓｃａｌｅ  Ｄｉｓｃｏｖｅｒｙ、Ｇａｉｔｈｅｒｓｂｕｒｇ、ＭＤ、ＵＳＡ）で標識化された、１ｍｇ／ｍＬのＦｌａｇ  Ｍ２特異的抗体（Ｓｉｇｍａ）を、検出試薬として使用した。
【０３４４】
実験は、ポリプロピレン製のマイクロ滴定プレート内で、０．５％ＢＳＡおよび０．０２％のＴｗｅｅｎ２０を含有する、アッセイ緩衝液としてのＰＢＳ（ＧＩＢＣＯ  １４１９０、ｐＨ  ７．０〜７．２）により実行した。予測されるＫＤの、少なくとも１０倍の濃度で始まる、非標識化ＦＸＩａ抗原の希釈系列を調製した。抗原を伴わないウェルを使用して、Ｂｍａｘ値を決定し、アッセイ緩衝液だけを含有するウェルを使用して、バックグラウンドを決定した。適切な量の結合剤（予測されるＫＤ以下の抗体濃度、６０μＬの最終容量）を添加した後で、混合物を、ＲＴで、一晩にわたりインキュベートした。
【０３４５】
ＭＳＤプレートを、１μｇ／ｍＬのヒト血漿由来ＦＸＩａ（ウェル１つ当たり３０μＬ）でコーティングした。プレートを、０．０５％のＴｗｅｅｎ  ２０を含有するＰＢＳで洗浄した後で、平衡化させた試料を、プレートに移し、２０分間にわたりインキュベートした。インキュベーションの後、ウェル１つ当たり３０μＬのＭＳＤ−Ｓｕｌｆｏタグで標識化された検出抗体（抗Ｆｌａｇ  Ｍ２（Ｓｉｇｍａ）１：２，０００）を、洗浄されたＭＳＤプレートに添加し、Ｅｐｐｅｎｄｏｒｆ製のシェーカー（７００ｒｐｍ）上、ＲＴで３０分間にわたりインキュベートした。
【０３４６】
ＭＳＤプレートを洗浄し、ウェル１つ当たり３０μＬのＭＳＤ  Ｒｅａｄ  Ｂｕｆｆｅｒ  Ｔを、界面活性剤と共に添加した後、Ｓｅｃｔｏｒ  Ｉｍａｇｅｒ  ６０００（Ｍｅｓｏ  Ｓｃａｌｅ  Ｄｉｓｃｏｖｅｒｙ、Ｇａｉｔｈｅｒｓｂｕｒｇ、ＭＤ、ＵＳＡ）を使用して、電気化学発光シグナルを検出した。
【０３４７】
データは、カスタマイズされた当てはめモデルを適用する、ＸＬｆｉｔ（ＩＤＢＳ）ソフトウェアにより査定した。Ｈａｅｎｅｌら（Haenel et al (2005) Anal Biochem; 339(1):182-4）に従う当てはめモデルであって、Ａｂｒａｈａｍら（Abraham et al (1996) J Mol Recognit; 9(5-6):456-61）に従い改変された当てはめモデルを、ＮＯＶ１０９０  ＦａｂのＫＤを決定するために使用した。
【０３４８】
結果
ＮＯＶ１０９０  ＦａｂのＫＤは、ＳＥＴにより、約２１０±１２０ｐＭであると決定された（表３）。この値は、近縁のＮＯＶ１４０１  Ｆａｂについて、同一なＣＤＲにより決定された３０５±８ｐＭのＫＤと符合する（表１を参照されたい）。
【０３４９】
【表３】
2020513757.tif 000018
【０３５０】
[実施例３]
アフィニティー成熟の後における、ＳＥＴスクリーニングによるＫＤの推定
方法についての記載
ＦａｂのＫＤを推定するために細菌溶解物を、ＳＥＴによりスクリーニングした。ＳＥＴスクリーニング法（例えば、Della Ducata et al (2015) J Biomol Screen; 20(10):1256-67を参照されたい）は、一般に、ＳＥＴ決定法について、上記で記載した通りに実施した。Ｈａｅｎｅｌら（Haenel et al (2005) Anal Biochem; 339(1):182-4）により記載された原理に基づき、ＳＥＴにより、成熟結合剤をランク付けするために、一定量の、希釈されたＢＥＬ抽出物（細菌溶解物）を、異なる濃度の抗原と共に、一晩にわたり平衡化させた。
【０３５１】
次いで、混合物を、抗原（ヒト血漿１ｍＬ当たり１μｇのＦＸＩａ）であらかじめコーティングされたＭＳＤプレートに移し、インキュベーションおよび洗浄の後、適切なＭＳＤ−Ｓｕｌｆｏタグで標識化された検出抗体を添加した（抗Ｆｌａｇ  Ｍ２、Ｓｉｇｍａ）。
【０３５２】
その後、抗Ｈｉｓ特異的抗体（Ｊａｃｋｓｏｎ）でコーティングされた、標準的なＭＳＤプレートを使用する、Ｓｅｃｔｏｒ  Ｉｍａｇｅｒ  ６０００（Ｍｅｓｏ  Ｓｃａｌｅ  Ｄｉｓｃｏｖｅｒｙ、Ｇａｉｔｈｅｒｓｂｕｒｇ、ＭＤ、ＵＳＡ）を使用するＥＣＬ検出（ＥＣＬで標識化された抗ヒト（Ｆａｂ）２、Ｄｉａｎｏｖａ）を介して、結合していないＦａｂの濃度を定量化した。
【０３５３】
上記で記載した、対応する当てはめモデルを適用する、ＸＬｆｉｔ（ＩＤＢＳ）ソフトウェアを使用して、アフィニティーを推定し、これにより、成熟により最も改善されたクローンを同定するように、結果を加工した。
【０３５４】
結果
実施例１で記載した、ＮＯＶ１０９０に由来する、３つのアフィニティー成熟ＦＸＩａ抗体ＦａｂについてのＳＥＴスクリーニング結果を、表４にまとめる。３つのＦａｂ全てについて、約７分の１のＫＤ値は、アフィニティー成熟パニングが、高アフィニティー抗体を作り出すことに成功したことを指し示す。
【０３５５】
ＳＥＴスクリーニング結果は、ＳＥＴによる正確なＫＤの決定のための、精製試料による、完全な滴定実験と比較して、非精製Ｆａｂ試料による、わずかに５つのデータ点（１つは定量化、４つは特異的滴定）により生成されているので、正確なＫＤ値ではなく、ＫＤの推定値を表すことに留意されたい。しかし、ＫＤの結果は、一般に、ある妥当な変動内で同等である（Della Ducata et al (2015) J Biomol Screen; 20(10):1256-67を参照されたい）。
【０３５６】
【表４】
2020513757.tif 000019
【０３５７】
[実施例４]
アフィニティー成熟抗ＦＸＩ／ＦＸＩａ  ＩｇＧのＥＬＩＳＡ結合プロファイル
ＥＬＩＳＡ法を使用して、精製されたアフィニティー成熟ＩｇＧを特徴付けた、すなわち、ヒトＦＸＩａ、ヒトＦＸＩ、カニクイザルＦＸＩ、およびウサギＦＸＩのほか、ヒトカリクレインおよびヒトプレカリクレインへの結合について査定した。
【０３５８】
方法についての記載
最適の抗原濃度および抗体濃度のほか、ブロッキング条件について、予備実験で査定し、これに応じて、設定を調整した。
【０３５９】
直接的なコーティングＥＬＩＳＡのために、表５に示される濃度を使用して、抗原を、３８４ウェルＭａｘｉｓｏｒｐ（商標）マイクロ滴定プレート上に、４℃で、一晩にわたり固定化した。ＰＢＳ（ウェル１つ当たり８０μｌ）中に５％の脱脂粉乳によるブロッキングの後、多様な濃度（典型的に、それぞれ、２００ｎＭのＩｇＧまたはＦａｂで始まる、１２点による、１：３の滴定）のＦａｂ含有大腸菌（E. coli）溶解物または精製抗体、ウェル１つ当たり２０μｌを、プレートに添加し、室温で１時間にわたりインキュベートした。結合した抗体は、「ＡｔｔｏＰｈｏｓ」蛍光基質（Ｒｏｃｈｅ、型番１１６８１９８２００１）と組み合わせたそれぞれの、アルカリホスファターゼカップリング二次抗体（アルカリホスファターゼとコンジュゲートさせたＦ（ａｂ）２特異的ヤギ抗ヒトＩｇＧ（Ｊａｃｋｓｏｎ、型番１０９−０５５−０９７、ＰＢＳ＋０．０５％Ｔｗｅｅｎ２０中で、１：５０００に希釈された））を使用して検出した。５３５ｎｍにおける蛍光の発光を、４３０ｎｍにおける励起により記録した。個々のアッセイステップの間に、ＰＢＳ＋０．０５％Ｔｗｅｅｎ２０による、複数の洗浄ステップを実施した。
【０３６０】
【表５】
2020513757.tif 000020
【０３６１】
結果
３つのアフィニティー成熟ＩｇＧ全て、ならびに親ＩｇＧについてのＥＬＩＳＡ結合プロファイルを、図１に示す。全ての抗体（親ＮＯＶ１０９０、ならびにＮＯＶ１０９０の、３つのアフィニティー成熟形（ＡＭ１、ＡＭ２、ＡＭ３））は、ヒトＦＸＩおよびヒトＦＸＩａへの特異的結合（図１Ａ）のほか、カニクイザルＦＸＩおよびウサギＦＸＩへの特異的結合（図１Ｂ）を示す。ヒトプレカリクレインおよびヒトカリクレインに対する結合は、１００ｎＭまで検出されなかった（図１Ｃ）。
【０３６２】
アフィニティー成熟抗体についての、全体的なＥＬＩＳＡ曲線は、ＮＯＶ１０９０と比較して、左にシフトし、ＩＣ５０値は、とりわけ、ヒトＦＸＩａおよびＦＸＩへの結合について低下した。カニクイザルＦＸＩおよびウサギＦＸＩについてのＩＣ５０値は、親変異体と、アフィニティー成熟変異体との間で、いっそう類似している。まとめると、ＥＬＩＳＡデータは、アフィニティー成熟が、ＦＸＩａと最も近縁の酵素であるカリクレインへの非特異的結合を導入せずに、ＦＸＩおよびＦＸＩａ、特に、ヒト酵素への結合を増大させたことを示唆する。
【０３６３】
[実施例５]
アフィニティー成熟させた抗ＦＸＩ／ＦＸＩａ  ＩｇＧの機能的活性
活性化部分トロンボプラスチン時間（ａＰＴＴ）アッセイおよびトロンビン生成アッセイ（ＴＧＡ）を使用することにより、３つのアフィニティー成熟抗体の抗凝固活性について調べた。
【０３６４】
ａＰＴＴアッセイについての記載
凍結乾燥正常ヒト血漿「凝固対照Ｎ」（参照番号：５０２００５０）は、Ｔｅｃｈｎｏｃｌｏｎｅ  ＧｍｂＨ（Ｖｉｅｎｎａ、Ａｕｓｔｒｉａ）から購入した。凝固対照Ｎは、選択された健常ドナーのクエン酸血漿からプールされた。この正常血漿に関して得られる凝血時間は、凝血に関与する凝固因子の正常濃度を反映する。凍結乾燥血漿は、４℃で保管した。その使用前に、バイアルを注意深く回転させ、次いで、室温で１０分間にわたり保つことにより、血漿を、１ｍＬの蒸留水中に再懸濁させた。
【０３６５】
界面活性剤としてのスルファチドおよびシリカを伴う二重活性化ａＰＴＴ試薬である、内因性経路誘発性のＤａｐｔｔｉｎ（登録商標）ＴＣ（型番５０３５０９０）は、高度に精製されたリン脂質の最適混合物と併せて、Ｔｅｃｈｎｏｃｌｏｎｅ  ＧｍｂＨ（Ｖｉｅｎｎａ、Ａｕｓｔｒｉａ）から購入され、リン脂質、スルファチド、およびケイ酸塩を含有した。凍結乾燥された誘発剤は、バイアル上に表示の容量により、蒸留水中で復元した。
【０３６６】
塩化カルシウム（Ｆｌｕｋａ、型番２１１１５）は、蒸留水中に２５ｍＭの原液濃度で調製した。リン酸緩衝生理食塩液（ＰＢＳ、Ｌｉｆｅ  Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ、型番１００１０−０２３）を、抗体の希釈緩衝液として使用した。
【０３６７】
凝血時間の測定は、半自動式の機械的凝血検出システムである、ｂａｌｌ  ｃｏａｇｕｌｏｍｅｔｅｒ  ｍｏｄｅｌ  ＭＣ１０（Ｍｅｒｌｉｎ  ｍｅｄｉｃａｌ、Ｇｅｒｍａｎｙ）により実施した。システムは、ステンレス鋼製のボールを分配した特製のキュベット（Ｍｅｒｌｉｎ  ｍｅｄｉｃａｌ、型番Ｚ０５１００）を用いる。
【０３６８】
キュベットを、ｂａｌｌ  ｃｏａｇｕｌｏｍｅｔｅｒの測定ウェルに入れる。試料、血漿、および誘発剤を、キュベットに添加した後、測定ウェルは、ゆっくりと回転し、キュベットにその長軸の周りを回転させる。キュベットは、やや傾いて置かれるため、重力および慣性力は、ボールを、常にキュベットの最も低い位置に置く。ボール位置の正反対の位置に、磁気センサーがある。適切なインキュベーション時間の後、塩化カルシウム溶液を添加して、タイマーを始動する。凝固が生じると、反応混合物中に、フィブリン鎖が形成される。フィブリン鎖は、ボールを、その慣性位置から引き離し、これにより、磁気センサー内に、インパルスを誘発する。このインパルスは、タイマーを電気的に停止させる。
【０３６９】
ＮＯＶ１０９０およびアフィニティー成熟抗体（例えば、ＡＭ１、ＡＭ２、およびＡＭ３）の希釈系列を、ＰＢＳ中で調製した。復元されたヒト血液血漿、誘発試薬（Ｄａｐｔｔｉｎ）、および塩化カルシウムを、水浴中、３７℃で、１０分間にわたり暖めた。
【０３７０】
アッセイは、もっぱら、ステンレス鋼製のボールを含有する、専用のキュベット内で実施した。ピペッティングスキームを、表６に概括する。
【０３７１】
【表６】
2020513757.tif 000021
【０３７２】
試料は、上記で記載したＭｅｒｌｉｎ  ｂａｌｌ  ｃｏａｇｕｌｏｍｅｔｅｒ内、３７℃の温度、二連で測定した。
【０３７３】
ａＰＴＴアッセイの結果
図２は、親抗体ＮＯＶ１０９０と、３つのアフィニティー成熟抗体（例えば、ＡＭ１、ＡＭ２、およびＡＭ３）とについての、代表的な反応曲線を示す。３つの抗体全ては、ａＰＴＴ凝血時間の、濃度依存的な延長を示した。ａＰＴＴ凝血時間は、抗体濃度を１１〜１４ｎＭとするとき、ベースラインと比較して倍増する。これらの結果は、親であるＮＯＶ１０９０により達成される結果と同等である。
【０３７４】
ＴＧＡについての記載：
ＴＧＡ凍結乾燥正常ヒト血漿（凝固対照Ｎ）は、Ｔｅｃｈｎｏｃｌｏｎｅ  ＧｍｂＨ（Ｃａｔ＃５０２００４０）から購入し、製造元により示唆される容量中の蒸留水中で再構成する。
【０３７５】
Ｔｅｃｈｎｏｃｌｏｎｅ  ＧｍｂＨ（Ｃａｔ＃５００６２３０）製の蛍光性基質であるＺ−Ｇｌｙ−Ｇｌｙ−Ａｒｇ−ＡＭＣを使用して、基質溶液を調製した。凍結乾燥基質のアリコートを、４℃に保った。アッセイにおけるその使用の２０分前に、バイアル上に表示の容量の蒸留水中に新たに基質を溶解させた。再構成された基質溶液は、１ｍＭの濃度の蛍光性ペプチドと、１５ｍＭの濃度のＣａＣｌ２とを含有する。
【０３７６】
誘発試薬である「ＰＰＰ（乏血小板血漿）−Ｒｅａｇｅｎｔ  Ｌｏｗ」は、Ｔｈｒｏｍｂｉｎｏｓｃｏｐｅ（Ｃａｔ＃ＴＳ３１．００）から購入し、バイアル上に表示の蒸留水中で再構成した。「ＰＰＰ−Ｒｅａｇｅｎｔ  Ｌｏｗ」は、リン脂質と組織因子との混合物を、非常に低濃度で含有する。試薬は、使用の直前に、ｐＨ７．４の８０ｍＭトリス／ＨＣｌ、０．０５％（ｗ／ｖ）のＣＨＡＰＳ中で８倍希釈した。
【０３７７】
試料は、Ｃｏｓｔａｒ（製品番号：３６０３）から購入した９６ウェル黒透明底プレートにアリコート分割し、この中で測定した。自動化移入のために、試料を、Ｖ字底９６ウェルプレート（Ｃｏｓｔａｒ、３８９４）に入れ、ＣｙＢｉｏ自動化システム（Ａｎａｌｙｔｉｋ  Ｊｅｎａ  ＵＳ、Ｗｏｂｕｒｎ、ＭＡ、ＵＳＡ）を使用して移した。
【０３７８】
再構成されたヒト血漿、誘発試薬である「ＰＰＰ−Ｒｅａｇｅｎｔ  Ｌｏｗ」、および基質を、水浴中３７℃で１０分間にわたり、あらかじめ加熱した。ＰＢＳ中に１：３の抗体（例えば、ＮＯＶ１４０１、ＡＭ１、ＡＭ２、およびＡＭ３）希釈系列を、９６ウェルプレート内、５μＭ（１μＭの最終最高濃度の５倍の濃度）のＮＯＶ１４０１濃度で始めて、合計８つの希釈率にわたり調製した。２２２μｌの誘発試薬を、１１０８μｌの基質溶液と混合して、１０＋５０誘発試薬基質ミックスを作り出した。自動化システムを使用する後続の移入のために、ウェル１つ当たり８０μｌを、Ｖ字底９６ウェルプレートに添加した。プレートは、３７℃に保った。試薬は、表７に示すスキームに従い添加した。
【０３７９】
【表７】
2020513757.tif 000022
【０３８０】
自動化を使用して、誘発剤／基質混合物を移した。混合物を添加した後で、Ｓｙｎｅｒｇｙ  Ｎｅｏ  ｉｎｓｔｒｕｍｅｎｔ（ＢｉｏＴｅｋ  Ｉｎｓｔｒｕｍｅｎｔ  Ｉｎｃ．、Ｗｉｎｏｏｓｋｉ、ＶＴ、ＵＳＡ）を使用して、それぞれ３６０ｎｍおよび４６０ｎｍの励起および発光を、速やかに記録した。試料は、プレートリーダー内、３７℃の温度で、５５秒間隔の二連で、９０分間にわたり測定した。
【０３８１】
ピークを生成するために、Ｔｅｃｈｎｏｃｌｏｎｅから提供されるＴＧＡ査定ソフトウェアファイルを使用して、トロンビン濃度値データを加工した。ピークについてのプロットを作り出すために、ＧｒａｐｈＰａｄソフトウェアを使用して、トロンビン濃度対抗体濃度のデータを当てはめた。これらのデータを、ＧｒａｐｈＰａｄ  Ｐｒｉｓｍ５ソフトウェア（ＧｒａｐｈＰａｄ  Ｓｏｆｔｗａｒｅ  Ｉｎｃ．、Ｌａ  Ｊｏｌｌａ、ＣＡ、ＵＳＡ）内の非線形回帰モデルに当てはめた。ＩＣ５０値は、ビルトイン型の４パラメータ用量応答曲線式（傾き可変型）：ｙ＝Ｂｏｔｔｏｍ＋（Ｔｏｐ−Ｂｏｔｔｏｍ）／（１＋１０（Ｌｏｇ  ＩＣ５０−ｘ）×Ｈｉｌｌｓｌｏｐｅ）［式中、ｙは、インヒビター濃度をｘとするときに形成される最大トロンビン濃度であり、ＴｏｐおよびＢｏｔｔｏｍは、それぞれ、インヒビターを伴わない場合のトロンビン濃度およびインヒビターの最大濃度におけるトロンビン濃度を表す］を使用して決定した。
【０３８２】
ＴＧＡの結果
図３は、３つのアフィニティー成熟ＦＸＩａ抗体（例えば、ＡＭ１、ＡＭ２、およびＡＭ３）と、比較のために、親抗体ＮＯＶ１０９０の生殖細胞系列形である、ＮＯＶ１４０１とについての、代表的な反応曲線を示す。３つのアフィニティー成熟抗体全ては、ＮＯＶ１４０１と比較して約３〜４分の１のＩＣ５０値で、ＴＧＡにおけるトロンビン生成の、濃度依存的な阻害を示した。ＩＣ５０値および残留トロンビン濃度を、これらの応答曲線から計算し、表８に示す。
【０３８３】
【表８】
2020513757.tif 000023
【０３８４】
ＡＭ３の生殖細胞系列形であるＡＭ４（表１を参照されたい）もまた、ａＰＴＴアッセイおよびＴＧＡにかけたところ、ａＰＴＴ延長およびＴＧＡにおけるＩＣ５０値について、ＡＭ３と比較して、極めて類似する結果がもたらされた。
【０３８５】
[実施例６]
溶液平衡滴定（ＳＥＴ）による、アフィニティー成熟抗ＦＸＩ／ＦＸＩａ  ＩｇＧ（ＡＭ４）についての、ＫＤの決定
実施例２で記載したＳＥＴ法を、使用して、ＡＭ４（ＩｇＧ）について、ＫＤを決定し、その親抗体であるＮＯＶ１０９０の生殖細胞系列形であるＮＯＶ１４０１と比較した。図４は、ＦＸＩａへの結合についての用量反応および当てはめ曲線を、両方の抗体について示し、結果を、表９にまとめる。
【０３８６】
【表９】
2020513757.tif 000024
【０３８７】
近縁の抗体であるＮＯＶ１４０１およびＮＯＶ１０９０の、ＦＸＩａに対するアフィニティーは、同等であるので（データは示さない）、全長ＩｇＧ抗体についての、これらの結合データは、ＡＭ４が、その親抗体であるＮＯＶ１０９０の、約１０倍のアフィニティーを有することを示唆する。およそ１０倍のアフィニティーの増大はまた、ＡＭ１、ＡＭ２、およびＡＭ３についての、ＳＥＴによるＫＤ推定値を、ＮＯＶ１０９０  Ｆａｂについて決定されたＳＥＴによるＫＤ（実施例２および３を参照されたい）と比較しても観察された。
【０３８８】
まとめると、これらのデータは、例えば、ａＰＴＴ延長アッセイと、トロンビン量の低減を示すＴＧＡとにより決定される通り、抗ＦＸＩ／ＦＸＩａ抗体ＡＭ１、ＡＭ２、ＡＭ３、およびＡＭ４が、親ＮＯＶ１０９０と比較した場合、ＦＸＩおよびＦＸＩａに対する結合アフィニティーの増大、ならびに少なくとも同等の抗凝固活性を示すことを示唆する。抗体ＡＭ１、ＡＭ２、ＡＭ３、およびＡＭ４は、ある種のコンセンサスアミノ酸配列、例えば、配列番号５９（組合せＨＣＤＲ２およびＫａｂａｔ  ＨＣＤＲ２）、６０（Ｃｈｏｔｈｉａ  ＨＣＤＲ２）、または６１（ＩＭＧＴ  ＨＣＤＲ２）を共有する場合、ＨＣＤＲ２を除き、同じＣＤＲを共有するので、これらの結果は、同じＨＣＤＲ１、ＨＣＤＲ３、ＬＣＤＲ１、ＬＣＤＲ２、およびＬＣＤＲ３を共有し、ＨＣＤＲ２のコンセンサスアミノ酸配列内に収まる同様の抗ＦＸＩ／ＦＸＩａ抗体であれば、これもまた、有効な結合剤であり、同様の抗凝固活性を呈することを指し示す。
【０３８９】
参照による組込み
特許、特許出願（例えば、特許出願公開）、論文、刊行物、教科書などを含む、本明細書で引用される全ての参考文献、およびこれらにおいて引用された参考文献は、それらがいまだ組み込まれていない範囲まで、参照によりそれらの全体において本明細書に組み込まれる。
【０３９０】
同等物
前出の明細書は、当業者が、本開示を実施することを可能とするのに十分であると考えられる。しかし、前出の記載および実施例が、本文中でいかに詳述されているように見えるとしても、本開示は、多くの様式で実施することができ、本開示は、添付の特許請求の範囲およびそれらの任意の同等物に従うとみなされるべきであることが察知されるであろう。
【図１Ａ】
2020513757.tif 000025
【図１Ｂ】
2020513757.tif 000026
【図１Ｃ】
2020513757.tif 000027
【図２】
2020513757.tif 000028
【図３】
2020513757.tif 000029
【図４】
2020513757.tif 000030
【配列表】
2020513757000001.app
【国際調査報告】
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