(57)【要約】本発明は、限定はされないがＰＣＲなどの反応の促進のための、急速かつ試料において使いやすい熱サイクリングまたは温度変化のためのデバイス、システム、および方法を提供する。2020517266.tif 000003
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【特許請求の範囲】
【請求項１】
薄い流体試料層をアッセイするためのデバイスであって、
第１のプレートと、第２のプレートと、スペーサと、クランプとを備え、
ｉ．前記第１のプレートおよび前記第２のプレートが、開放構成および閉鎖構成を含む異なる構成になるように互いに対して移動可能であり、
ｉｉ．前記プレートの各々が、そのそれぞれの表面上に、流体試料と接触するための試料接触領域を備え、
ｉｉｉ．前記プレートのうちの一方または両方が、それぞれのプレートに固定された前記スペーサを備え、
ｉｖ．前記スペーサが、２００ミクロン以下である所定の実質的に均一な高さを有し、前記スペーサのうちの少なくとも１つが、前記試料接触領域内にあり、
ｖ．加熱層が、前記流体試料を加熱するように構成されており、
前記加熱層が、（ａ）前記プレートのうちの一方の上（内表面もしくは外表面の上もしくは近くのいずれか）または前記プレートのうちの一方の内側にあり、かつ（ｂ）加熱源によって加熱することが可能であり、前記加熱源が、光学的に、電気的に、無線周波数（ＲＦ）放射によって、またはそれらの組み合わせによって、前記加熱層に熱エネルギーを送達し、
開放構成では、前記２つのプレートが部分的または完全に分離されており、前記プレート間の間隔は前記スペーサによって調整されず、前記プレートのうちの一方または両方の上に前記試料を付着させ、
前記開放構成で前記試料を付着させた後に構成される閉鎖構成では、前記試料の少なくとも一部が、前記２つのプレートによって圧縮されて実質的に均一な厚さの層になり、かつ前記プレートに対して実質的に停滞し、前記層の前記均一な厚さが、前記２つのプレートの前記試料接触領域によって制限され、かつ前記プレートおよび前記スペーサによって調整され、
前記第１のプレートおよび前記第２のプレートが、前記試料の少なくとも一部を、０．１〜２００μｍの非常に均一な厚さでありかつ前記プレートに対して実質的に停滞した層になるよう制限するように構成されており、
前記第１のプレートが５００μｍ以下の厚さを有し、前記第２のプレートが５ｍｍ以下の厚さを有する、デバイス。
【請求項２】
前記プレートおよび前記試料厚さが、前記試料の温度を１０℃／秒以上の速度で変化させることを可能にするように構成されている、前記請求項のいずれか一項に記載のデバイス。
【請求項３】
前記第１のプレートおよび前記第２のプレートを圧縮して、前記２つのプレートを前記閉鎖構成で一緒に固定するクランプをさらに備え、前記プレート上に挿入された前記クランプの圧力が０．０１ｋｇ／ｃｍ＾２以上である、前記請求項のいずれか一項に記載のデバイス。
【請求項４】
前記加熱層が、前記プレートのうちの一方の上または近くにあり、６０％以上の吸収係数を有し、かつ２ｍｍ未満の厚さを有する、前記請求項のいずれか一項に記載のデバイス。
【請求項５】
均一な厚さの前記試料の前記少なくとも一部の近くに放射線吸収層をさらに備え、前記試料の前記少なくとも一部および前記放射線吸収層の領域が、前記均一な厚さよりも実質的に大きい、前記請求項のいずれか一項に記載のデバイス。
【請求項６】
前記試料の前記少なくとも一部および前記放射線吸収層の前記領域が、前記試料の前記均一な厚さよりも実質的に大きい、前記請求項のいずれか一項に記載のデバイス。
【請求項７】
前記デバイスの前記プレートのうちの一方の厚さが１００μｍ以下である、前記請求項のいずれか一項に記載のデバイス。
【請求項８】
均一な厚さの前記試料の前記少なくとも一部の近くに放射線吸収層をさらに備え、前記デバイスの前記プレートのうちの一方の厚さが１００μｍ以下である、請求項１、２、および４のいずれか一項に記載のデバイス。
【請求項９】
前記第１のプレートおよび前記第２のプレートを前記閉鎖構成において一緒に圧縮するクランプをさらに備え、前記プレート上に挿入された前記クランプの前記圧力が０．０１ｋｇ／ｃｍ＾２以上である、請求項３に記載のデバイス。
【請求項１０】
前記第１のプレートおよび前記第２のプレートを前記閉鎖構成において一緒に圧縮するクランプをさらに備え、かつ均一な厚さの前記試料の前記少なくとも一部の近くに放射線吸収層をさらに備え、前記プレート上に挿入された前記クランプの前記圧力が０．０１ｋｇ／ｃｍ＾２以上である、請求項３に記載のデバイス。
【請求項１１】
薄い流体試料層の温度を急速に変化させるためのシステムであって、
ｉ．前記請求項のいずれか一項に記載のデバイスと、
ｉｉ．前記放射線吸収層が顕著に吸収する電磁波を放射するように構成された、放射線源と
を備え、
ｉｉｉ．コントローラが、前記放射線源を制御し、前記試料の前記温度を変化させるように構成されている、システム。
【請求項１２】
薄い流体試料層の温度を急速に変化させるための方法であって、
ｉ．前記請求項のいずれか一項に記載のデバイスまたはシステムを提供するステップと、
ｉｉ．前記デバイスの前記プレートのうちの一方または両方の上に流体試料を付着させるステップと、
ｉｉｉ．ｉｉの後、前記プレートを閉鎖構成になるように押圧するステップであって、前記プレートが前記試料の少なくとも一部を圧縮して２００μｍ未満の厚さの薄層にする、ステップと、
ｉｖ．前記放射線源からの前記電磁波の存在、強度、波長、周波数、および／または角度を変化させることによって、前記試料層の前記温度を変化させ維持するステップと
を含む、方法。
【請求項１３】
前記クランプが、前記クランプと前記プレートとの間の熱伝導を低減するための断熱層を備えるように構成されており、前記断熱層が、２Ｗ／ｍ−Ｋの熱伝導率の材料を含む、前記請求項のいずれか一項に記載のデバイス、システム、または方法。
【請求項１４】
前記クランプが、前記試料を加熱または冷却する必要がある熱質量を低減するための断熱層を備えるように構成されており、前記断熱層が、２Ｗ／ｍ−Ｋの熱伝導率の材料を含む、前記請求項のいずれか一項に記載のデバイス、システム、または方法。
【請求項１５】
閉鎖構成において、前記クランプが、ＱＭＡＸカード全体を密封するように構成されている、前記請求項のいずれか一項に記載のデバイス、システム、または方法。
【請求項１６】
閉鎖構成において、前記クランプが、前記プレートの表面の一部と熱伝導接触するように構成されている、前記請求項のいずれか一項に記載のデバイス、システム、または方法。
【請求項１７】
閉鎖構成において、前記クランプが、前記プレートの周辺表面領域のみと熱伝導接触する、前記請求項のいずれか一項に記載のデバイス、システム、または方法。
【請求項１８】
閉鎖構成において、前記クランプが、前記プレートの表面領域のみと熱伝導接触し、前記表面領域が、核酸が増幅される前記試料の一部分の外側にある、前記請求項のいずれか一項に記載のデバイス、システム、または方法。
【請求項１９】
前記クランプが、外側の光が前記プレートに入ることまたはプレートの内側の光が外に出ることを可能にする透明な窓を備える、前記請求項のいずれか一項に記載のデバイス、システム、または方法。
【請求項２０】
前記クランプが、外側の光が前記プレートに入ることまたはプレートの内側の光が外に出ることを可能にする透明な窓を備え、透明度が、３０％超、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、９０％、１００％であるか、またはそれらの値のうちのいずれか２つの間の範囲である、前記請求項のいずれか一項に記載のデバイス、システム、または方法。
【請求項２１】
前記クランプが、前記第１のプレートおよび前記第２のプレートを圧縮するための圧力を挿入し、前記圧力が、０．０１ｋｇ／ｃｍ２、０．１ｋｇ／ｃｍ２、０．５ｋｇ／ｃｍ２、１ｋｇ／ｃｍ２、２ｋｇ／ｃｍ２、ｋｇ／ｃｍ２、５ｋｇ／ｃｍ２、１０ｋｇ／ｃｍ２、２０ｋｇ／ｃｍ２、３０ｋｇ／ｃｍ２、４０ｋｇ／ｃｍ２、５０ｋｇ／ｃｍ２、６０ｋｇ／ｃｍ２、１００ｋｇ／ｃｍ２、１５０ｋｇ／ｃｍ２、２００ｋｇ／ｃｍ２、４００ｋｇ／ｃｍ２であるか、またはそれらの値のうちのいずれか２つの間の範囲である、前記請求項のいずれか一項に記載のデバイス、システム、または方法。
【請求項２２】
前記クランプが、前記第１のプレートおよび前記第２のプレートを圧縮するための圧力を挿入し、前記圧力が０．１ｋｇ／ｃｍ２〜２０ｋｇ／ｃｍ２である、前記請求項のいずれか一項に記載のデバイス、システム、または方法。
【請求項２３】
前記クランプが、前記第１のプレートおよび前記第２のプレートを圧縮するための圧力を挿入し、前記圧力が０．１ｋｇ／ｃｍ２〜２０ｋｇ／ｃｍ２である、前記請求項のいずれか一項に記載のデバイス、システム、または方法。
【請求項２４】
前記クランプが、前記第１のプレートおよび前記第２のプレートを圧縮するための圧力を挿入し、前記圧力が０．５ｋｇ／ｃｍ２〜４０ｋｇ／ｃｍ２である、前記請求項のいずれか一項に記載のデバイス、システム、または方法。
【請求項２５】
前記第１のプレートおよび前記第２のプレートを前記閉鎖構成において一緒に圧縮するクランプをさらに備え、かつ前記第１のプレートの少なくとも一部と前記第２のプレートとの間に密封材料をさらに備え、前記プレート上に挿入された前記クランプの圧力が０．０１ｋｇ／ｃｍ＾２以上である、前記請求項のいずれか一項に記載のデバイス、システム、または方法。
【請求項２６】
前記試料の温度を変化させることが、前記温度を周期的に上下に変化させる熱サイクリングである、前記請求項のいずれか一項に記載のデバイス、システム、または方法。
【請求項２７】
前記試料の温度を変化させることが熱サイクリングであり、前記熱サイクリングが、ポリメラーゼ連鎖作用（ＰＣＲ）を使用した核酸の増幅のためである、前記請求項のいずれか一項に記載のデバイス、システム、または方法。
【請求項２８】
前記試料の前記温度の前記変化が、核酸の等温増幅のためである、前記請求項のいずれか一項に記載のデバイス、システム、または方法。
【請求項２９】
前記試料の前記少なくとも一部および前記放射線吸収層の領域が、前記均一な厚さよりも実質的に大きい、前記請求項のいずれか一項に記載のデバイス、システム、または方法。
【請求項３０】
前記放射線吸収層が、ディスク結合ドットオンピラーアンテナ（ｄｉｓｋ−ｃｏｕｐｌｅｄ  ｄｏｔｓ−ｏｎ−ｐｉｌｌａｒ  ａｎｔｅｎｎａ）（Ｄ２ＰＡ）アレイ、シリコンサンドイッチ、グラフェン、超格子、または他のプラズモン材料、その他それらの組み合わせを含む、前記請求項のいずれか一項に記載のデバイス、システム、または方法。
【請求項３１】
前記放射線吸収層が、カーボンもしくはブラックナノ構造またはそれらの組み合わせを含む、前記請求項のいずれか一項に記載のデバイス、システム、または方法。
【請求項３２】
前記放射線吸収層が、放射線エネルギーを吸収するように構成されている、前記請求項のいずれか一項に記載のデバイス、システム、または方法。
【請求項３３】
前記放射線吸収層が、放射線エネルギーを吸収した後、熱の形態でエネルギーを放射するように構成されている、前記請求項のいずれか一項に記載のデバイス、システム、または方法。
【請求項３４】
前記放射線吸収層が、前記試料層の下に、かつ前記試料層と直接接触して位置付けられている、前記請求項のいずれか一項に記載のデバイス、システム、または方法。
【請求項３５】
前記放射線吸収層が、電波、マイクロ波、赤外波、可視光、紫外波、Ｘ線、ガンマ線、および熱放射からなる群から選択される電磁波を吸収するように構成されている、前記請求項のいずれか一項に記載のデバイス、システム、または方法。
【請求項３６】
前記プレートのうちの少なくとも１つが、前記放射線吸収層が吸収する放射線を遮断しない、前記請求項のいずれか一項に記載のデバイス、システム、または方法。
【請求項３７】
前記プレートのうちの一方または両方が、低い熱伝導率を有する、前記請求項のいずれか一項に記載のデバイス、システム、または方法。
【請求項３８】
前記試料層の前記均一な厚さが、前記プレートのうちの一方または両方に固定された１つ以上のスペーサによって調整される、前記請求項のいずれか一項に記載のデバイス、システム、または方法。
【請求項３９】
前記試料が、予混合されたポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）媒体である、前記請求項のいずれか一項に記載のデバイス、システム、または方法。
【請求項４０】
前記デバイスが、所定のプログラムに従って前記試料の温度を変化させるためのＰＣＲアッセイを容易にするように構成されている、前記請求項のいずれか一項に記載のデバイス、システム、または方法。
【請求項４１】
前記デバイスが、診断試験、健康管理、環境試験、および／または法医学的試験を実行するように構成されている、前記請求項のいずれか一項に記載のデバイス、システム、または方法。
【請求項４２】
前記デバイスが、ＤＮＡ増幅、ＤＮＡ定量化、選択的ＤＮＡ単離、遺伝分析、組織適合検査、癌遺伝子同定、感染症試験、遺伝子指紋法、および／または父子鑑定を実行するように構成されている、前記請求項のいずれか一項に記載のデバイス、システム、または方法。
【請求項４３】
前記試料層が、試料蒸発を低減するために横方向に密封されている、前記請求項のいずれか一項に記載のデバイス。
【請求項４４】
前記電磁波の存在、強度、波長、周波数、および／または角度を制御するように構成されたコントローラをさらに備える、前記請求項のいずれか一項に記載のシステム。
【請求項４５】
前記試料接触領域またはその近傍の温度を測定し、前記測定された温度に基づいて前記コントローラに信号を送信するように構成された温度計をさらに備える、前記請求項のいずれか一項に記載のシステム。
【請求項４６】
前記温度計が、光ファイバ温度計、赤外線温度計、液晶温度計、高温計、水晶温度計、シリコンバンドギャップ温度センサ、温度ストリップ、サーミスタ、および熱電対からなる群から選択される、前記請求項のいずれか一項に記載のシステムまたは方法。
【請求項４７】
前記コントローラが、前記放射線源からの前記電磁波の存在、強度、波長、周波数、および／または角度を制御するように構成されている、前記請求項のいずれか一項に記載のシステムまたは方法。
【請求項４８】
前記放射線源および前記放射線吸収層は、前記電磁波が少なくとも１０℃／秒の平均昇温速度傾斜を生じさせ、前記電磁波の除去が少なくとも５℃／秒の平均降温速度傾斜をもたらすように構成されている、前記請求項のいずれか一項に記載のシステムまたは方法。
【請求項４９】
前記放射線源および前記放射線吸収層が、少なくとも１０℃／秒の平均昇温速度傾斜および少なくとも５℃／秒の平均降温速度傾斜を生み出すように構成されている、前記請求項のいずれか一項に記載のデバイス、システム、または方法。
【請求項５０】
前記放射線源および前記放射線吸収層が、ＰＣＲ中に初期化ステップ、変性ステップ、および／または延伸／伸長ステップに到達するために少なくとも１０℃／秒の平均昇温速度傾斜を生み出し、ならびにＰＣＲ中にアニーリングステップおよび／または最終冷却ステップに到達するために少なくとも５℃／秒の平均降温速度傾斜を生み出すように構成されている、前記請求項のいずれか一項に記載のデバイス、システム、または方法。
【請求項５１】
前記ＰＣＲ試料が、鋳型ＤＮＡ、プライマーＤＮＡ、カチオン、ポリメラーゼ、および緩衝剤を含む、前記請求項のいずれか一項に記載のデバイス、システム、または方法。
【請求項５２】
前記プレートを閉鎖形態になるように押圧するステップが、前記プレートを厳密でない押圧力で押圧することを含む、前記請求項のいずれか一項に記載の方法。
【請求項５３】
前記プレートを閉鎖形態になるように押圧するステップが、前記プレートを人間の手で直接押圧することを含む、前記請求項のいずれか一項に記載の方法。
【請求項５４】
非常に均一な厚さの前記層が、１０％未満の厚さの変動を有する、前記請求項のいずれか一項に記載の方法。
【請求項５５】
前記試料の温度を変化させることが熱サイクリングであり、前記熱サイクリングが、ホットスタートＰＣＲ、ネステッドＰＣＲ、タッチダウンＰＣＲ、逆転写ＰＣＲ、ＲＡＣＥ  ＰＣＲ、およびデジタルＰＣＲの群から選択されるポリメラーゼ連鎖作用（ＰＣＲ）を使用した核酸の増幅のためである、前記請求項のいずれか一項に記載のデバイス、システム、または方法。
【請求項５６】
前記試料の前記温度の前記変化が、ループ介在等温増幅、鎖置換増幅、ヘリカーゼ依存性増幅、ニッキング酵素増幅、ローリングサークル増幅、およびリコンビナーゼポリメラーゼ増幅の群から選択される核酸の等温増幅のためである、前記請求項のいずれか一項に記載のデバイス、システム、または方法。
【請求項５７】
ＤＮＡ鋳型、プライマー、ＤＮＡポリメラーゼ、デオキシヌクレオシド三リン酸（ｄＮＴＰ）、二価カチオン（例えば、Ｍｇ２＋）、一価カチオン（例えば、Ｋ＋）、および緩衝液から選択される試薬をさらに含む、前記請求項のいずれか一項に記載のデバイス、システム、または方法。
【請求項５８】
前記スペーサが、実質的に平坦な頂部を有する、前記請求項のいずれか一項に記載のデバイス、システム、または方法。
【請求項５９】
前記プレートのうちの一方が５０μｍ以下である、前記請求項のいずれか一項に記載のデバイス、システム、または方法。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
相互参照
本出願は、２０１７年４月２１日出願の米国仮特許出願（ＵＳＰＰＡ）第６２／４８８，６８４号（代理人整理番号ＥＳＸ−０１４ＰＲＶ３）、２０１８年２月１４日出願のＰＣＴ出願第ＰＣＴ／ＵＳ２０１８／０１８１０８号（代理人整理番号ＥＳＸＰＣＴ１８Ｆ１４）、および２０１８年２月１５日出願のＰＣＴ出願第ＰＣＴ／ＵＳ２０１８／０１８４０５号（代理人整理番号ＥＳＸＰＣＴ１８Ｆ１９）に対する優先権を主張し、これらの各々は、あらゆる目的で参照により全体が本明細書に組み込まれる。
【背景技術】
【０００２】
背景
ある特定の化学的、生物学的、および／または医学的アッセイでは、繰り返される熱サイクル、および／または迅速かつ／もしくは正確な温度制御が実行される必要がある。１つの特定の例は、１つ以上の試料中の所定のヌクレオチド（例えば、ＤＮＡ）を増幅するためのポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）である。ＰＣＲでは、予め設定された熱制御サイクルに従って、試料が特定の温度に繰り返し加熱および冷却される。別の例は、核酸の等温増幅であり、試料は、室温から摂氏６５度まで加熱する必要がある。ある特定のシナリオでは、試料の温度を急速かつ均一に変化させることができることが望ましい。
【発明の概要】
【０００３】
本発明は、急速な熱サイクル変化のためのデバイスおよび方法を提供し、本明細書に開示されるデバイスおよび方法は、限定はされないがＰＣＲなどの反応の促進に適している。
【図面の簡単な説明】
【０００４】
当業者は、以下に記載される図面が単に例示目的のためであることを理解するであろう。図面は、決して本教示の範囲を限定することを意図していない。場合によっては、図面は縮尺どおりではない。実験データ点を提示する図では、データ点をつなぐ線は、単にデータの表示を示すためのものであり、他の意味はない。
【０００５】
【図１】試料の温度を急速に変化させ、試料からの信号を監視するためのシステムのある特定の構成要素の概略図を示す。
【図２】本発明のデバイスの一実施形態の上面図を示し、ＱＭＡＸデバイス（またはＱＭＡＸカード）を示す。
【図３】本発明のデバイスの一実施形態の斜視図および断面図を示す。パネル（Ａ）は、開放構成にあるデバイスの実施形態を示し、パネル（Ｂ）は、試料ホルダーが閉鎖構成にあるときのデバイスの実施形態を示し、２つのプレート間で薄層へと圧縮される試料の温度は、電磁波を試料上へ発射するように位置付けられた加熱源によって急速に変化する。
【図４】本発明のシステムの一実施形態の斜視図および断面図を示す。パネル（Ａ）は、デバイス（システムの試料ホルダー）が開放構成にあるときのシステムの斜視図を示し、パネル（Ｂ）は、試料ホルダーが閉鎖構成にあるときのシステムの断面図を示す。
【図５】本発明のシステムの一実施形態の断面図を示し、システムを示し、温度変化および制御を容易にする追加の要素を示す。
【図６】本発明の別の実施形態の斜視図を示し、プレート上に複数の試料接触領域があり、これは複数の試料の処理および分析を可能にする。
【図７】本発明の例示的な実施形態の断面図を示し、試料がどのように添加および圧縮されるかを示す。
【図８】本発明の例示的な実施形態の断面図を示し、ＰＣＲプロセスを示す。
【図９】本発明の第１のプレートおよび加熱層の例示的な実施形態を示す。パネルＡは、上面図であり、パネルＢは、断面図である。
【図１０】本発明の２つの例示的な実施形態の断面図を示し、第１のプレート、第２のプレート、および加熱層を示す。
【図１１】本発明の例示的な実施形態の断面図を示し、試料の温度を急速に変化させるためのシステムを示す。図１１は、一実施形態による加熱源の詳細な要素を示す。
【図１２】本発明の例示的な実施形態の断面図を示し、試料の温度を急速に変化させるためのシステムを示す。図１２は、一実施形態による加熱源の詳細な要素を示す。
【図１３】本発明の一実施形態を示し、加熱素子は、第１プレートまたは第２プレートのいずれにも接触していない。パネルＡは、上面図を示し、パネルＢは、側面図を示す。
【発明を実施するための形態】
【０００６】
例示的な実施形態の詳細な説明
以下の詳細な説明は、限定ではなく例として本発明のいくつかの実施形態を図示する。存在する場合、本明細書で使用されるセクションの見出しおよび任意のサブタイトルは、単に構成上の目的のためであり、決して、説明される主題を限定するものとして解釈されるべきではない。セクションの見出しおよび／またはサブタイトル下の内容は、セクションの見出しおよび／またはサブタイトルに限定されず、本発明の説明全体に適用される。
【０００７】
いかなる出版物の引用も、出願日前のその開示のためであり、添付の特許請求の範囲が先行発明のためにそのような出版物に先行する権利がないことを認めるものと解釈されるべきではない。さらに、提供される出版日は実際の出版日とは異なる可能性があり、個別に確認する必要がある。
【０００８】
図は厳密な比率で要素を示すことを意図していないことに留意するべきである。明確にするために、図に示される場合にいくつかの構成要素が拡大されている。要素の寸法は、参照により本明細書に提供され組み込まれる説明から詳述されるはずである。
【０００９】
本発明は、ある領域（または関連する領域）にわたって試料を均一な超薄の薄型部分にすること、試料ホルダーの低熱吸収および低熱容量、ならびに領域ヒータ要素によって、試料の温度を急速に変化させるためのデバイスおよび方法を提供する。
【００１０】
いくつかの実施形態では、試料ホルダーは、試料を挟むための２つの薄いプレートを有するＱＭＡＸカードであり、プレートは、典型的には１μｍ〜２ｍｍの厚さを有する。
【００１１】
１．作動原理
本発明の一目的は、試料の温度を急速に上昇および低下させることである。
【００１２】
本発明の別の目的は、数秒で１サイクルの試料温度変化（例えば、９５℃から５５℃）を行うことである。
【００１３】
試料を急速に加熱および冷却するためには、試料の加熱または冷却に必要であるエネルギーを低減する必要がある。１つの材料を加熱および冷却するためのエネルギーは、同じ３つの主要な構成要素を共有する。（ｉ）熱質量（すなわち、材料がエネルギーを吸収および保存する能力。熱質量が大きいほど、加熱に必要なエネルギーは多くなる）、（ｉｉ）放射による熱損失、および（ｉｉｉ）熱伝導／対流による熱損失。急速に加熱するためには、３つのエネルギー構成要素の全てを小さくする必要があるが、急速に冷却するには、第１のエネルギー構成要素を小さくするが、最後の２つのエネルギー構成要素を大きくする必要がある。
【００１４】
理論的および実験的調査を通して、本発明は、急速な加熱および冷却のために３つの構成要素のバランスを取りかつ／または最適化することができる、ある特定の設計に基づいている。
【００１５】
本発明の一実施形態は、図１に示されるように、（ｉ）カード上の試料の急速な加熱および冷却を可能にする、「ＲＨＣ（急速加熱・冷却）カード」または「試料カード」と呼ばれる試料ホルダーと、（ｉｉ）加熱システムと、（ｉｉｉ）冷却システム（任意）と、（ｉｖ）温度制御システムと、（ｖ）信号監視システム（任意）とを備える。本発明のある特定の実施形態が、図１に示されるただ１つの構成要素または数個の構成要素を有することができることに留意されたい。
【００１６】
ＲＨＣカードは、核酸などの分子を増幅するために必要な試料および試薬を保持する。
【００１７】
明らかに、本発明は、異なる試料および異なる用途に使用され得る。
【００１８】
２．急速な加熱および冷却のための試料カード
試料カード（すなわち、ＲＨＣカード）の一実施形態が、図２に示される。ＲＨＣカードは、試料を保持することができ、急速な加熱および冷却を可能にする。
１．図２に示されるように、流体試料の温度を急速に変化させるためのＲＨＣカードの一実施形態であって、
第１のプレート（１０）と、第２のプレート（２０）と、加熱層（１１２）とを備え、
ｉ．プレート（１０、２０）は、異なる構成になるように互いに対して移動可能であり、
ｉｉ．プレートの各々は、そのそれぞれの内表面上に、流体試料と接触するための試料接触領域を有し、
ｉｉｉ．加熱層（１１２）は、流体試料を加熱するように構成されており、
加熱層は、（ａ）プレートのうちの一方の上（内表面もしくは外表面のいずれかの上）またはプレートのうちの一方の内側にあり、（ｂ）加熱源によって加熱することが可能であり、加熱源は、光学的に、電気的に、無線周波数（ＲＦ）放射によって、またはそれらの組み合わせによって、加熱層に熱エネルギーを送達し、
加熱層の加熱領域の少なくとも一部は、試料領域と重なり合い、
構成のうちの１つは、２つのプレートが部分的または完全に分離されており、プレート間の平均間隔が少なくとも３００μｍである、開放構成であり、
構成のうちの別の構成は、開放構成において流体試料を試料接触領域のうちの一方または両方の上に付着させた後に構成される閉鎖構成であり、閉鎖構成では、試料の少なくとも一部は、２つのプレートによって圧縮されて層になり、平均試料厚さは２００μｍ以下である、実施形態。
【００１９】
いくつかの実施形態では、デバイスは、閉鎖構成において試料の少なくとも一部分を調整するスペーサをさらに備え、試料の少なくとも一部分は、２つのプレートによって制限され、２つのプレートの間隔は、スペーサによって調整される（これにより、試料の少なくとも一部分の厚さが調整される）。
【００２０】
試料の厚さ
試料の熱質量を低減し、かつ試料中の熱対流損失を低減するために、いくつかの実施形態では、加熱層によって加熱されている領域における平均試料厚さは、５００μｍ以下、２００μｍ以下、１００μｍ以下、５０μｍ以下、２０μｍ以下、１０μｍ以下、５μｍ以下、２μｍ以下、１μｍ以下、５００ｎｍ以下、３００ｎｍ以下、１００ｎｍ以下、５０ｎｍ以下であるか、またはそれらの値のうちのいずれか２つの間の範囲である。
【００２１】
加熱層によって加熱されている領域における１つの好ましい平均試料厚さは、０．１μｍ〜０．５μｍ、０．５μｍ〜１０μｍ、１０μｍ〜２０μｍ、２０μｍ〜３０μｍ、３０μｍ〜５０μｍ、５０μｍ〜８０μｍ、８０μｍ〜１００μｍ、または１００μｍ〜１５０μｍである。
【００２２】
プレートの厚さ
第１および第２のプレートの熱質量を低減し、かつプレートの熱対流損失を低減するために、第１のプレートまたは第２のプレートは、２ｎｍ以下、１０ｎｍ以下、１００ｎｍ以下、２００ｎｍ以下、５００ｎｍ以下、１０００ｎｍ以下、２μｍ（ミクロン）以下、５μｍ以下、１０μｍ以下、２０μｍ以下、５０μｍ以下、１００μｍ以下、１５０μｍ以下、２００μｍ以下、３００μｍ以下、５００μｍ以下、８００μｍ以下、１ｍｍ（ミリメートル）以下、２ｍｍ以下、３ｍｍ以下、５ｍｍ以下、１０ｍｍ以下、２０ｍｍ以下、またはこれらの値のうちのいずれか２つの間の範囲内の厚さを有する。
【００２３】
第１のプレートまたは第２のプレートの好ましい厚さは、１０ｎｍ以下、１００ｎｍ以下、２００ｎｍ以下、５００ｎｍ以下、１０００ｎｍ以下、２μｍ（ミクロン）以下、５μｍ以下、１０μｍ以下、２０μｍ以下、５０μｍ以下、１００μｍ以下、１５０μｍ以下、２００μｍ以下、３００μｍ以下、５００μｍ以下であるか、またはそれらの値のうちのいずれか２つの間の範囲内である。
【００２４】
いくつかの好ましい実施形態では、加熱層を有するプレートの厚さは、ヒータを有しない他方のプレートよりも薄い。
【００２５】
いくつかの好ましい実施形態では、第１のプレートが１００ｎｍ、２００ｎｍ、５００ｎｍ、１μｍ（ミクロン）、２μｍ、５μｍ、１０μｍ、２５μｍ、５０μｍ、１００μｍ、１２５μｍ、１５０μｍ、１７５μｍ、２００μｍ、２５０μｍ、またはそれらの値のうちのいずれか２つの間の範囲内の厚さを有する一方で、第２のプレートは、２５μｍ、５０μｍ、１００μｍ、１２５μｍ、１５０μｍ、１７５μｍ、２００μｍ、２５０μｍ、５００μｍ、１ｍｍ、１．５ｍｍ、２ｍｍ、またはそれらの値のうちのいずれか２つの間の範囲内の厚さを有する。
【００２６】
いくつかの実施形態では、プレートのうちの少なくとも１つの平均の厚さは、１〜１０００μｍ、１０〜９００μｍ、２０〜８００μｍ、２５〜７００μｍ、２５〜８００μｍ、２５〜６００μｍ、２５〜５００μｍ、２５〜４００μｍ、２５〜３００μｍ、２５〜２００μｍ、３０〜２００μｍ、３５〜２００μｍ、４０〜２００μｍ、４５〜２００μｍ、または５０〜２００μｍの範囲内である。
【００２７】
いくつかの実施形態では、プレートのうちの少なくとも１つの平均の厚さは、５０〜７５μｍ、７５〜１００μｍ、１００〜１２５μｍ、１２５〜１５０μｍ、１５０〜１７５μｍ、または１７５〜２００μｍの範囲内である。
【００２８】
いくつかの実施形態では、プレートのうちの少なくとも１つの平均の厚さは、約５０μｍ、約７５μｍ、約１００μｍ、約１２５μｍ、約１５０μｍ、約１７５μｍ、または約２００μｍである。
【００２９】
プレート面積
いくつかの実施形態では、第１のプレートおよび／または第２のプレートは、１ｍｍ２（平方ミリメートル）以下、１０ｍｍ２以下、２５ｍｍ２以下、５０ｍｍ２以下、７５ｍｍ２以下、１ｃｍ２（平方センチメートル）以下、２ｃｍ２以下、３ｃｍ２以下、４ｃｍ２以下、５ｃｍ２以下、１０ｃｍ２以下、１００ｃｍ２以下、５００ｃｍ２以下、１０００ｃｍ２以下、５０００ｃｍ２以下、１０，０００ｃｍ２以下、１０，０００ｃｍ２以下、またはこれらの値のうちのいずれか２つの間の範囲内の横方向領域を有する。
【００３０】
いくつかの実施形態では、第１のプレートおよび／または第２のプレートは、１０ｍｍ、２０ｍｍ、２５ｍｍ、３０ｍｍ、４０ｍｍ、５０ｍｍ、７５ｍｍ、またはこれらの値のうちのいずれか２つの間の範囲内の幅を有する。
【００３１】
いくつかの実施形態では、プレートの１つの好ましい幅は、２０ｍｍ〜４０ｍｍである。
【００３２】
試料蒸発を低減するための縁部密封
いくつかの実施形態では、プレートが閉鎖構成にあるとき、それは、２つのプレートの縁部を密封する密封材を備え、密封は、温度変化中の試料の蒸発を低減または排除するように構成されている。
【００３３】
密封材は、テープ、プラスチックシール、オイルシール、またはそれらの組み合わせであってもよい。
【００３４】
例（ＲＨＣカード）−１
第１のプレートおよび第２のプレートは、ＰＭＭＡまたはＰＥＴでできている。第１および第２のプレートは、幅１５ｍｍ、長さ２０ｍｍ、および１００μｍ（ミクロン）の同一サイズを有する。高さ３０μｍの周期的スペーサアレイが使用され（最初にプレートのうちの１つに固定される）、閉鎖構成での試料の厚さが３０μｍになる。加熱層は、厚さ４５０ｎｍの金であり、直径６ｍｍであり、プレートのうちの一方の外表面上にある。加熱層を加熱するために４００ｎｍのＬＥＤを使用した。閉鎖構成での試料は、約１２ｍｍの直径の、かつ加熱層にわたった領域を有する。本発明者らは、感温色素を使用して温度を監視した。本発明者らは、３０Ｃから９０Ｃへの温度変化が約２秒で到達され得、約３秒で９０Ｃから３０Ｃに冷却され得ることを見出した。
【００３５】
３．加熱源および温度制御
ＲＨＣカードの加熱層は、加熱源によって加熱されるように構成され、加熱源は、光学的に、電気的に、無線周波数（ＲＦ）放射によって、またはそれらの組み合わせによって、加熱層に熱エネルギーを送達する。
【００３６】
光加熱源
加熱層が加熱源によって光学的に加熱される場合、加熱源は、光源、ＬＥＤ（発光ダイオード）、レーザー、ランプ、またはそれらの組み合わせを含む。一方、加熱層は、光加熱源からの放射エネルギーを顕著に吸収する材料層である。顕著な吸収とは、加熱層が光加熱源からの放射エネルギーを試料およびプレートよりも顕著に吸収することを意味する。
【００３７】
電気加熱源
加熱層が加熱源によって電気的に加熱される場合、電気加熱源は、電気配線を通して加熱層に電力を送る電源を備える。
【００３８】
４．試料信号監視
図１１および１２に示されるように、試料ホルダー内の試料からの信号を検出するために信号センサが使用され得る。
【００３９】
いくつかの実施形態では、信号センサは、流体試料を撮像するように構成された光学センサである。例えば、光学センサは、光検出器、カメラ、または流体試料の画像を取り込むことが可能なデバイスである。いくつかの実施形態では、光学センサは、カメラであってもよい。いくつかの実施形態では、カメラは、モバイルデバイス（例えば、スマートフォンまたはタブレットコンピュータ）に組み込まれたカメラである。いくつかの実施形態では、カメラは、システムの他の部分から分離されている。
【００４０】
いくつかの実施形態では、信号センサは、デバイスからの電気信号を検出するように構成された電気センサである。いくつかの実施形態では、信号センサは、デバイスからの機械信号を検出するように構成された機械センサである。
【００４１】
いくつかの実施形態では、信号センサは、試料中の分析物の量を監視するように構成されている。いくつかの実施形態では、信号センサは、チャンバの外側にあり、チャンバ上の光学開口部を通して試料から光学信号を受信する。
【００４２】
５．試料の種類
本明細書で開示されるデバイス、システム、および方法は、診断試料、臨床試料、環境試料、および食品試料などであるが、これらに限定されない試料に使用され得る。試料の種類としては、それぞれ２０１６年８月１０日および２０１６年９月１４日に出願され、参照によりそれらの全体が本明細書に組み込まれる、ＰＣＴ出願（米国指定）第ＰＣＴ／ＵＳ２０１６／０４５４３７号および第ＰＣＴ／ＵＳ０２１６／０５１７７５号に列挙、記載、および要約された試料が挙げられるが、これらに限定されない。
【００４３】
例えば、いくつかの実施形態では、本明細書で開示されるデバイス、システム、および方法は、細胞、組織、体液、および／またはそれらの混合物を含む試料に使用される。いくつかの実施形態では、試料としては、羊水、房水、硝子体液、血液（例えば、全血、分画血液、血漿、血清など）、母乳、脳脊髄液（ＣＳＦ）、耳垢（ｃｅｒｕｍｅｎ）（耳垢（ｅａｒｗａｘ））、乳糜、糜汁（ｃｈｉｍｅ）、内リンパ液、外リンパ液、糞便、胃酸、胃液、リンパ液、粘液（鼻漏および痰を含む）、心膜液、腹膜液、胸膜液、膿、粘膜の分泌物、唾、皮脂（皮膚の油）、精液、唾液、汗、関節液、涙、嘔吐物、尿、および呼気凝縮液などであるが、これらに限定されない新鮮なまたは処理された体液が挙げられる。いくつかの実施形態では、試料は、ヒト体液を含む。いくつかの実施形態では、試料は、細胞、組織、体液、排泄物、羊水、房水、硝子体液、血液、全血、分画血液、血漿、血清、母乳、脳脊髄液、耳垢、乳糜、糜汁、内リンパ液、外リンパ液、糞便、胃酸、胃液、リンパ液、粘液、鼻漏、痰、心膜液、腹膜液、胸膜液、膿、粘膜の分泌物、唾、皮脂、精液、唾液、汗、関節液、涙、嘔吐物、尿、および呼気凝縮液のうちの少なくとも１つを含む。
【００４４】
いくつかの実施形態では、本明細書で開示されるデバイス、システム、および方法は、川、湖、池、海、氷河、氷山、雨、雪、下水、貯水池、水道水、飲料水などの任意の好適な供給源から得られる環境試料；土壌、堆肥、砂、岩、コンクリート、木材、レンガ、下水などからの固体試料；および空気、水中排熱口、産業排気、車両排気などからの気体試料に使用される。ある特定の実施形態では、環境試料は、供給源からの新鮮なものであり、ある特定の実施形態では、環境試料は処理される。例えば、液体形態ではない試料は、主題のデバイス、システム、および方法が適用される前に液体に変えられる。
【００４５】
いくつかの実施形態では、本明細書で開示されるデバイス、システム、および方法は、動物の消費、例えば、人間の消費に好適であるか、または好適になる可能性を有する食品試料に使用される。いくつかの実施形態では、食品試料は、生の材料、調理済みまたは加工済み食品、植物および動物の食物源、予め加工済みの食品、ならびに部分的または完全に加工済みの食品などを含む。例えば、いくつかの実施形態では、食品試料は、を含む。ある特定の実施形態では、液体形態ではない試料は、主題のデバイス、システム、および方法が適用される前に液体に変えられる。
【００４６】
試料の任意の体積を分析するために主題のデバイス、システム、および方法が使用され得る。体積の例は、これらに限定されないが、約１０ｍＬ以下、５ｍＬ以下、３ｍＬ以下、１マイクロリットル（μＬ、本明細書では「ｕＬ」と同じ）以下、５００μＬ以下、３００μＬ以下、２５０μＬ以下、２００μＬ以下、１７０μＬ以下、１５０μＬ以下、１２５μＬ以下、１００μＬ以下、７５μＬ以下、５０μＬ以下、２５μＬ以下、２０μＬ以下、１５μＬ以下、１０μＬ以下、５μＬ以下、３μＬ以下、１μＬ以下、０．５μＬ以下、０．１μＬ以下、０．０５μＬ以下、０．００１μＬ以下、０．０００５μＬ以下、０．０００１μＬ以下、１０ｐＬ以下、１ｐＬ以下、または任意の２つの値の間の範囲を含む。
【００４７】
いくつかの実施形態では、試料の体積は、これらに限定されないが、約１００μＬ以下、７５μＬ以下、５０μＬ以下、２５μＬ以下、２０μＬ以下、１５μＬ以下、１０μＬ以下、５μＬ以下、３μＬ以下、１μＬ以下、０．５μＬ以下、０．１μＬ以下、０．０５μＬ以下、０．００１μＬ以下、０．０００５μＬ以下、０．０００１μＬ以下、１０ｐＬ以下、１ｐＬ以下、または任意の２つの値の間の範囲を含む。いくつかの実施形態では、試料の体積は、これらに限定されないが、約１０μＬ以下、５μＬ以下、３μＬ以下、１μＬ以下、０．５μＬ以下、０．１μＬ以下、０．０５μＬ以下、０．００１μＬ以下、０．０００５μＬ以下、０．０００１μＬ以下、１０ｐＬ以下、１ｐＬ以下、または任意の２つの値の間の範囲を含む。
【００４８】
いくつかの実施形態において、試料の量は、ほぼ一滴の液体である。ある特定の実施形態では、試料の量は、指または指先を刺すことにより収集された量である。ある特定の実施形態では、試料の量は、マイクロニードル、マイクロピペットまたは静脈吸引から収集された量である。
【００４９】
ある特定の実施形態では、試料ホルダーは、流体試料を保持するように構成されている。ある特定の実施形態では、試料ホルダーは、流体試料の少なくとも一部を圧縮して薄い層にするように構成されている。ある特定の実施形態では、試料ホルダーは、試料を加熱および／または冷却するように構成されている構造を含む。ある特定の実施形態では、加熱源は、試料ホルダー内のある特定の構造によって吸収されて試料の温度を変化させることができる電磁波を提供する。ある特定の実施形態では、信号センサは、試料からの信号を検出および／または測定するように構成されている。ある特定の実施形態では、信号センサは、試料中の分析物を検出および／または測定するように構成されている。ある特定の実施形態では、ヒートシンクは、試料ホルダーおよび／または加熱源から熱を吸収するように構成されている。ある特定の実施形態では、ヒートシンクは、試料ホルダーを少なくとも部分的に囲むチャンバを含む。
【００５０】
６．用途
本明細書で開示されるデバイス、システム、および方法は、２０１６年８月１０日に提出され、参照によりその全体が本明細書に組み込まれるＰＣＴ出願（米国指定）第ＰＣＴ／ＵＳ２０１６／０４５４３７号に列挙、記載、および要約された用途を含む、様々なタイプの生物学的／化学的サンプリング、検知、アッセイ、および用途において使用され得る。
【００５１】
いくつかの実施形態では、本明細書で開示されるデバイス、システム、および方法は、試料中の１つ以上の分析物の有無の決定、定量化、および／または増幅が望まれる様々な分野において、様々な異なる用途に利用される。例えば、ある特定の実施形態では、主題のデバイス、システム、および方法は、タンパク質、ペプチド、核酸、合成化合物、無機化合物、ならびに他の分子、化合物、混合物、および物質の検出に使用される。主題のデバイス、システム、および方法が使用され得る様々な分野としては、人間の疾患および状態の診断、管理、および／または予防、動物の疾患および状態の診断、管理、および／または予防、植物の疾患または状態の診断、管理、および／または予防、農業用途、食品試験、環境試験および汚染除去、薬物試験および予防などが挙げられるが、これらに限定されない。
【００５２】
本発明の用途には、これらに限定されないが、（ａ）例えば、感染症および寄生虫疾患、傷害、心血管疾患、癌、精神障害、神経精神障害、ならびに器質性疾患、例えば、肺疾患、腎疾患などの特定の疾患、またはそれら疾患の特定の病期と相関する化学化合物または生体分子の検出、精製、定量化、および／または増幅、（ｂ）細胞および／または微生物、例えば、環境、例えば、水、土壌、または生体試料、例えば、組織、体液からのウイルス、真菌、および細菌の検出、精製、定量化、および増幅、（ｃ）食品の安全性、人間の健康、または国家安全保障に危険をもたらす化学化合物または生体試料、例えば、有毒廃棄物、炭疽の検出、定量化、（ｄ）医学的または生理学的モニターにおけるバイタルパラメータ、例えば、グルコース、血中酸素レベル、総血球数の検出および定量化、（ｅ）生体試料、例えば、細胞、ウイルス、体液からの特定のＤＮＡまたはＲＮＡの検出および定量化、（ｆ）ゲノム解析のための染色体およびミトコンドリアのＤＮＡの遺伝子配列の配列決定および比較、または（ｇ）例えば、医薬品の合成または精製中の反応生成物の検出および定量化が含まれる。
【００５３】
いくつかの実施形態では、主題のデバイス、システム、および方法は、試料中の核酸、タンパク質、または他の分子もしくは化合物の検出に使用される。ある特定の実施形態では、デバイス、システム、および方法は、例えば、対象における疾患状態の診断、予防、および／または管理に用いられるような、生体試料中の１つ以上、２つ以上、または３つ以上の疾患バイオマーカーの迅速な臨床検出および／または定量化に使用される。ある特定の実施形態では、デバイス、システム、および方法は、環境試料、例えば、川、海、湖、雨、雪、下水、下水処理排水、農業排水、産業排水、水道水、または飲料水中の１つ以上、２つ以上、または３つ以上の環境マーカーの検出および／または定量化に使用される。ある特定の実施形態では、デバイス、システム、および方法は、水道水、飲料水、調理済み食品、加工済み食品、または未加工食品から得られる食品試料からの１つ以上、２つ以上、または３つ以上の食品マークの検出および／または定量化に使用される。
【００５４】
いくつかの実施形態では、主題のデバイスはマイクロ流体デバイスの一部である。いくつかの実施形態では、蛍光信号または発光信号を検出するために主題のデバイス、システム、および方法が使用される。いくつかの実施形態では、主題のデバイス、システム、および方法は、携帯電話、タブレットコンピュータ、およびラップトップコンピュータなどであるが、これらに限定されない通信デバイスを含むか、またはそれと一緒に使用される。いくつかの実施形態では、主題のデバイス、システム、および方法は、光バーコード、無線周波数ＩＤタグ、またはそれらの組み合わせなどであるが、これらに限定されない識別子を含むか、またはそれと一緒に使用される。
【００５５】
いくつかの実施形態では、試料は対象から得られた診断試料であり、分析物はバイオマーカーであり、試料中の分析物の測定量は疾患または状態の診断に役立つ。いくつかの実施形態では、主題のデバイス、システム、および方法は、バイオマーカーの測定量、および疾患もしくは状態を有するリスクがないかもしくはリスクが低い個体におけるバイオマーカーの測定値の範囲を示すレポートを受信するか、またはそれを対象に提供することをさらに含み、測定値の範囲に対するバイオマーカーの測定量は、疾患または状態の診断に役立つ。
【００５６】
いくつかの実施形態では、試料は環境試料であり、分析物は環境マーカーである。いくつかの実施形態では、主題のデバイス、システム、および方法は、試料が得られた環境にさらされる対象の安全性または有害性を示すレポートを受信または提供することを含む。いくつかの実施形態では、主題のデバイス、システム、および方法は、環境マーカーの測定量を含むデータを遠隔地に送信すること、および試料が得られた環境にさらされる対象の安全性または有害性を示すレポートを受信することを含む。
【００５７】
いくつかの実施形態では、試料は食品試料であり、分析物は食品マーカーであり、試料中の食品マーカーの量は、消費する食品の安全性と相関する。いくつかの実施形態では、主題のデバイス、システム、および方法は、試料が得られる食品を消費する対象の安全性または有害性を示すレポートを受信または提供することを含む。いくつかの実施形態では、主題のデバイス、システム、および方法は、食料マーカーの測定量を含むデータを遠隔地に送信すること、および試料が得られる食品を消費する対象の安全性または有害性を示すレポートを受信することを含む。
【００５８】
本明細書に記載のデバイス、装置、およびシステムを用いて実行されるアッセイでは、様々な試料が使用され得る。いくつかの実施形態では、試料は核酸を含む。いくつかの実施形態では、試料はタンパク質を含む。いくつかの実施形態では、試料は炭水化物を含む。試料の温度を急速に変化させ、試料の温度を着実に維持するために、本デバイス、装置、およびシステムが使用され得、これにより、試料を処理するための高速かつ費用対効果の高いアプローチが提供される。加えて、本明細書に記載のデバイス、装置、およびシステムを用いて、様々な用途（例えば、アッセイ）が実行され得る。そのような用途としては、診断試験、健康管理、環境試験、および／または法医学的試験が含まれるが、これらに限定されない。そのような用途としてはまた、様々な生物学的、化学的、および生化学的アッセイ（例えば、ＤＮＡ増幅、ＤＮＡ定量化、選択的ＤＮＡ単離、遺伝分析、組織適合検査、癌遺伝子同定、感染症試験、遺伝子指紋法、および／または父子鑑定）が挙げられるが、これらに限定されない。
【００５９】
いくつかの実施形態では、「試料」は、全血、血漿、血清、尿、唾液、および汗などのヒト体液、ならびに細胞培養物（哺乳類、植物、細菌、真菌）が挙げられるがこれらに限定されない試料を含有するか、または含有しない任意の核酸であってもよい。試料は、新たに取得するか、または任意の所望の方法もしくは便利な方法で、例えば、希釈により、あるいは緩衝液もしくは他の溶液もしくは溶媒を加えることにより、保管もしくは処理され得る。試料には、ヒト細胞、動物細胞、植物細胞、細菌細胞、真菌細胞、およびウイルス粒子などの細胞構造が存在し得る。
【００６０】
本明細書で使用される「核酸」という用語は、任意のＤＮＡもしくはＲＮＡ分子、またはＤＮＡ／ＲＮＡハイブリッド、またはＤＮＡおよび／もしくはＲＮＡの混合物を指す。したがって、「核酸」という用語は、ゲノムまたは染色体ＤＮＡ、プラスミドＤＮＡ、増幅ＤＮＡ、ｃＤＮＡ、全ＲＮＡ、ｍＲＮＡ、および小型ＲＮＡを含むことを意図しているが、これらに限定されない。「核酸」という用語は、天然のＤＮＡおよび／もしくはＲＮＡ分子、または合成ＤＮＡおよび／もしくはＲＮＡ分子を含むことも意図している。いくつかの実施形態では、無細胞核酸が試料中に存在し、本明細書で使用される「無細胞」とは、核酸がいかなる細胞構造にも含まれていないことを示す。いくつかの他の実施形態では、核酸は、ヒト細胞、動物細胞、植物細胞、細菌細胞、真菌細胞、および／またはウイルス粒子を含むがこれらに限定されない細胞構造内に含まれる。無細胞核酸の形態の核酸、または細胞構造内の核酸、またはそれらの組み合わせが、試料中に存在し得る。いくつかのさらなる実施形態では、核酸は、第１のプレートの内表面上に導入される前に精製される。またさらなる実施形態では、核酸は、タンパク質および脂質などの他の分子に関連する複合体内に存在し得る。
【００６１】
本発明の方法は、ある範囲の体積の試料に適している。異なる体積を有する試料を、異なる寸法を有するプレート上に導入することができる。
【００６２】
本明細書で使用される「核酸増幅」には、試料中の標的分子を増幅する（その多数のコピーを生成する）ことによって核酸を検出するために使用される任意の技術が含まれ、本明細書では「標的」とは、目的の核酸の配列または部分配列を指す。好適な核酸増幅技術としては、ホットスタートＰＣＲ、ネステッドＰＣＲ、タッチダウンＰＣＲ、逆転写ＰＣＲ、ＲＡＣＥ  ＰＣＲ、デジタルＰＣＲなどの種々のポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）方法、および、例えばループ介在等温増幅（ＬＡＭＰ）、鎖置換増幅、ヘリカーゼ依存性増幅、ニッキング酵素増幅、ローリングサークル増幅、リコンビナーゼポリメラーゼ増幅などの等温増幅方法が挙げられるが、これらに限定されない。
【００６３】
本明細書で使用される「必要な試薬」には、プライマー、デオキシヌクレオチド（ｄＮＴＰ）、二価カチオン（例えば、Ｍｇ２＋）、一価カチオン（例えば、Ｋ＋）、緩衝液、酵素、およびレポーターが含まれるが、これらに限定されない。核酸増幅に必要な試薬は、第１もしくは第２のプレートまたはその両方の内表面上の乾燥形態、または例えばパラフィンなどの温度が増加すると融解する材料で覆われた、それに埋め込まれた、もしくはそれで包まれた液体形態のいずれかであり得る。
【００６４】
本明細書で使用される「プライマー」とは、いくつかの実施形態では、一対のフォワードおよびリバースプライマーを指し得る。いくつかの実施形態では、プライマーは、複数のプライマーまたはプライマーセットを指し得る。本明細書で使用される、核酸増幅に適した酵素には、ＤＮＡ依存性ポリメラーゼ、またはＲＮＡ依存性ＤＮＡポリメラーゼ、またはＤＮＡ依存性ＲＮＡポリメラーゼが含まれるが、これらに限定されない。
【００６５】
本明細書で使用される「レポーター」という用語は、核酸分子に結合するかもしくは核酸分子内に挿入することができる、または増幅プロセスの副産物によって活性化されて核酸分子もしくは増幅プロセスの可視化を可能にすることができる、任意のタグ、標識、または色素を指す。適切なレポーターには、蛍光標識もしくはタグもしくは色素、挿入剤、分子ビーコン標識、または生物発光分子、またはそれらの組み合わせが含まれるが、これらに限定されない。
【００６６】
いくつかの他の実施形態では、本明細書で使用される「必要な試薬」とは、細胞溶解試薬を含むこともでき、これは細胞構造の破壊を容易にする。細胞溶解試薬には、塩、洗剤、酵素、および他の添加物が含まれるが、これらに限定されない。本明細書において「塩」という用語には、リチウム塩（例えば、塩化リチウム）、ナトリウム塩（例えば、塩化ナトリウム）、カリウム（例えば、塩化カリウム）が含まれるが、これらに限定されない。本明細書において「洗剤」という用語は、アニオン性およびカチオン性を含むイオン性、非イオン性または双性イオン性であり得る。本明細書で使用される「イオン性洗剤」という用語は、水に溶解したときに部分的または全体的にイオン形態である任意の洗剤を含む。適切なアニオン性洗剤には、ドデシル硫酸ナトリウム（ＳＤＳ）または他のアルカリ金属アルキル硫酸塩もしくは同様の洗剤、サルコシル、またはそれらの組み合わせが含まれるが、これらに限定されない。本明細書において「酵素」という用語には、リゾチーム、セルラーゼ、およびプロテイナーゼが含まれるが、これらに限定されない。加えて、ＥＤＴＡ、ＥＧＴＡ、および他のポリアミノカルボン酸を含むがこれらに限定されないキレート剤、ならびにジチオトレイトール（ｄＴＴ）などのいくつかの還元剤も細胞溶解試薬に含まれ得る。本明細書において必要な試薬の組成は、異なる増幅反応の合理的な設計により異なる。
【００６７】
本明細書で使用される「核酸増幅産物」とは、核酸増幅技術によって生成される様々な核酸を指す。本明細書において核酸増幅産物の種類には、一本鎖ＤＮＡ、一本鎖ＲＮＡ、二本鎖ＤＮＡ、線状ＤＮＡ、または環状ＤＮＡなどが含まれるが、これらに限定されない。いくつかの実施形態では、核酸増幅産物は、同じ長さおよび構成を有する同一の核酸であり得る。いくつかの他の実施形態では、核酸増幅産物は、異なる長さおよび構成を有する複数の核酸であり得る。
【００６８】
いくつかの実施形態では、核酸増幅後に蓄積された核酸は、レポーターを使用して定量化される。上記で定義および使用されるように、閉鎖チャンバに蓄積された核酸アンプリコンの有無またはその量と相関する定量化可能な特徴を有するレポーター。
【００６９】
本明細書で使用される「細胞溶解試薬」とは、細胞構造の破壊を容易にする塩、洗剤、酵素、および他の添加剤を含むことを意図しているが、これらに限定されない。本明細書において「塩」という用語には、リチウム塩（例えば、塩化リチウム）、ナトリウム塩（例えば、塩化ナトリウム）、カリウム（例えば、塩化カリウム）が含まれるが、これらに限定されない。本明細書において「洗剤」という用語は、アニオン性およびカチオン性を含むイオン性、非イオン性または双性イオン性であり得る。本明細書で使用される「イオン性洗剤」という用語は、水に溶解したときに部分的または全体的にイオン形態である任意の洗剤を含む。適切なアニオン性洗剤には、ドデシル硫酸ナトリウム（ＳＤＳ）または他のアルカリ金属アルキル硫酸塩もしくは同様の洗剤、サルコシル、またはそれらの組み合わせが含まれるが、これらに限定されない。本明細書において「酵素」という用語には、リゾチーム、セルラーゼ、およびプロテイナーゼが含まれるが、これらに限定されない。加えて、ＥＤＴＡ、ＥＧＴＡ、および他のポリアミノカルボン酸を含むがこれらに限定されないキレート剤、ならびにジチオトレイトール（ｄＴＴ）などのいくつかの還元剤も細胞溶解試薬に含まれ得る。本明細書において必要な試薬の組成は、異なる増幅反応の合理的な設計により異なる。
【００７０】
本明細書で使用される「核酸増幅」には、試料中の標的分子を増幅する（その多数のコピーを生成する）ことによって核酸を検出するために使用される任意の技術が含まれ、本明細書では「標的」とは、目的の核酸の配列または部分配列を指す。適切な核酸増幅技術には、ホットスタートＰＣＲ、ネステッドＰＣＲ、タッチダウンＰＣＲ、逆転写ＰＣＲ、ＲＡＣＥ  ＰＣＲ、デジタルＰＣＲなどの種々のポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）方法、および、例えばループ媒介等温増幅、鎖置換増幅、ヘリカーゼ依存性増幅、ニッキング酵素増幅、ローリングサークル増幅、リコンビナーゼポリメラーゼ増幅などの等温増幅方法が含まれるが、これらに限定されない。
【００７１】
本明細書で使用される「必要な試薬２」には、プライマー、デオキシヌクレオチド（ｄＮＴＰ）、二価カチオン（例えば、Ｍｇ２＋）、一価カチオン（例えば、Ｋ＋）、緩衝液、酵素、およびレポーターが含まれるが、これらに限定されない。核酸増幅に必要な試薬２は、第１もしくは第２のプレートまたはその両方の内表面上の乾燥形態、または例えばパラフィンなどの温度が増加すると融解する材料で覆われた、それに埋め込まれた、もしくはそれで包まれた液体形態のいずれかであり得る。
【００７２】
本明細書で使用される「プライマー」とは、いくつかの実施形態では、一対のフォワードおよびリバースプライマーを指し得る。いくつかの実施形態では、プライマーは、複数のプライマーまたはプライマーセットを指し得る。本明細書で使用される、核酸増幅に適した酵素には、ＤＮＡ依存性ポリメラーゼ、またはＲＮＡ依存性ＤＮＡポリメラーゼ、またはＤＮＡ依存性ＲＮＡポリメラーゼが含まれるが、これらに限定されない。
【００７３】
本明細書で使用される「レポーター」という用語は、核酸分子に結合するかもしくは核酸分子内に挿入することができる、または増幅プロセスの副産物によって活性化されて核酸分子もしくは増幅プロセスの可視化を可能にすることができる、任意のタグ、標識、または色素を指す。適切なレポーターには、蛍光標識もしくはタグもしくは色素、挿入剤、分子ビーコン標識、または生物発光分子、またはそれらの組み合わせが含まれるが、これらに限定されない。
【００７４】
本明細書で使用される「核酸増幅産物」とは、核酸増幅技術によって生成される様々な核酸を指す。本明細書において核酸増幅産物の種類には、一本鎖ＤＮＡ、一本鎖ＲＮＡ、二本鎖ＤＮＡ、線状ＤＮＡ、または環状ＤＮＡなどが含まれるが、これらに限定されない。いくつかの実施形態では、核酸増幅産物は、同じ長さおよび構成を有する同一の核酸であり得る。いくつかの他の実施形態では、核酸増幅産物は、異なる長さおよび構成を有する複数の核酸であり得る。
【００７５】
いくつかの実施形態では、核酸増幅後に蓄積された核酸は、レポーターを使用して定量化される。上記で定義および使用されるように、閉鎖チャンバに蓄積された核酸アンプリコンの有無またはその量と相関する定量化可能な特徴を有するレポーター。
【００７６】
７．ＱＭＡＸカードの外側に別個の加熱素子がある急速加熱・冷却装置
いくつかの実施形態では、装置は、ＲＨＣカードの外側にある別個の加熱素子をさらに備え、ＲＨＣカードの近くにまたはそれと接触して配置されたときにＲＨＣカードを加熱するように構成されている。別個の加熱素子は、ＲＨＣカードを取り付けるまたは取り外すことが可能であり、加熱層と同様の方法で加熱源からエネルギーを得る。別個の加熱素子により、加熱層のないＲＨＣカードが可能になる。例えば、図１３のパネルＡおよびＢに示されるように、加熱素子は、試料カードから分離している。
【００７７】
「ＣＲＯＦカード（またはカード）」、「ＣＯＦカード」、「ＱＭＡＸカード」、「Ｑカード」、「ＣＲＯＦデバイス」、「ＣＯＦデバイス」、「ＱＭＡＸデバイス」、「ＣＲＯＦプレート」、「ＣＯＦプレート」、および「ＱＭＡＸプレート」という用語は、いくつかの実施形態ではＣＯＦカードはスペーサを備えていないことを除いて、互換性があり、これらの用語は、異なる構成（開放構成および閉鎖構成を含む）になるように互いに対して移動可能である第１のプレートおよび第２のプレートを備え、かつプレート間の間隔を調整するスペーサを備える（ＣＯＦのいくつかの実施形態を除く）、デバイスを指す。「Ｘプレート」という用語は、ＣＲＯＦカードの２つのプレートのうちの１つを指し、スペーサはこのプレートに固定されている。ＣＯＦカード、ＣＲＯＦカード、およびＸプレートのさらなる詳細は、２０１７年２月７日に出願された仮特許出願第６２／４５６０６５号に提供され、これはあらゆる目的のためにその全体が本明細書に組み込まれる。
【００７８】
ＲＣＨカードは、プレートのうちの一方の上または内側の加熱層に加え、スペーサを有するかまたは有しない、ＱＭＡＸカードである。
【００７９】
図２は、第１のプレート１０と第２のプレート２０とを備えるＱＭＡＸカード１００を示す。いくつかの実施形態では、第１のプレート１０および第２のプレート２０は、開放構成および閉鎖構成を含む異なる構成になるように互いに対して移動可能である。ある特定の実施形態では、開放構成において、２つのプレートは、部分的または完全に分離されており、プレート間の平均間隔は、少なくとも３００μｍである。ある特定の実施形態では、試料は、プレートの一方または両方の上に付着し得る。ある特定の実施形態では、閉鎖構成において、試料の少なくとも一部は、２つのプレートによって圧縮されて層になり、平均試料厚さは２００μｍ以下である。
【００８０】
いくつかの実施形態では、ＱＭＡＸカード１００は、第１のプレート１０および第２のプレート２０を接続するヒンジ１０３を備え、これにより、２つのプレートは、互いに対して枢動することができる。いくつかの実施形態では、ＱＭＡＸカードは、開放構成と閉鎖構成との間のカードの切り替えを容易にするノッチ１０５を備える。いくつかの実施形態では、プレートの一方または両方は、透明である。いくつかの実施形態では、プレートの一方または両方は、可撓性である。いくつかの実施形態では、ＱＭＡＸカード１００は、加熱層１９０を備える。ある特定の実施形態では、加熱層１９０は、電磁波を吸収し、エネルギーを変換して試料の温度を上昇させるように構成されている。
【００８１】
図３は、本発明のデバイスの一実施形態の斜視図および断面図を示す。パネル（Ａ）は、開放構成にあるデバイス（システムの「試料ホルダー」とも呼ばれる）１００を示す。パネル（Ａ）に示されるように、試料ホルダー１００は、第１のプレート１０と、第２のプレート２０と、間隔機構（図示せず）とを備える。第１のプレート１０および第２のプレート２０はそれぞれ、外表面（それぞれ１１および２１）および内表面（それぞれ１２および２２）を備える。各内表面は、デバイスによって処理および／または分析される流体試料に接触するための試料接触領域（図示せず）を有する。
【００８２】
第１のプレート１０および第２のプレート２０は、異なる構成になるように互いに対して移動可能である。構成のうちの１つは開放構成であり、この構成では、図３のパネル（Ａ）に示されるように、第１のプレート１０および第２のプレート２０が部分的または全体的に分離されており、第１のプレート１０と第２のプレート２０との間の間隔（すなわち、第１のプレートの内表面１１と第２のプレートの内表面２１との間の距離）は、間隔機構によって調整されない。開放構成では、試料を試料接触領域内で第１のプレート、第２のプレート、またはその両方の上に付着させることができる。
【００８３】
図３のパネル（Ａ）に示されるように、第１のプレート１０は、試料接触領域に加熱層１１２をさらに備える。第２のプレート２０が、代替的にまたは追加的に、加熱層１１２を備えることも可能である。いくつかの実施形態では、加熱層１１２は、その上に発せられた放射線（例えば、電磁波）を効率的に吸収するように構成されている。吸収率は、５０％以上、６０％以上、７０％以上、８０％以上、９０％以上、９５％以上、９９％以上、１００％以下、８５％以下、７５％以下、６５％以下、５５％以下、またはこれら２つの値のうちのいずれかの間の範囲内である。加熱層１１２は、吸収された放射線エネルギーの少なくとも実質的な部分を熱（熱エネルギー）に変換するようにさらに構成されている。例えば、加熱層１１２は、電磁波からのエネルギーを吸収した後、熱の形態で放射線を放出するように構成されている。本明細書で使用される「実質的な部分」または「実質的に」という用語は、５０％以上、６０％以上、７０％以上、８０％以上、９０％以上、９５％以上、９９％以上、９９％以上、または９９．９％以上の割合を指す。
【００８４】
加熱層材料
いくつかの実施形態では、加熱層１１２は、金属プラズモン表面、メタマテリアル、ブラックシリコン、グラファイト、カーボンナノチューブ、シリコンサンドイッチ、グラフェン、超格子、プラズモン材料、電磁波を効率的に吸収し、かつ吸収されたエネルギーを熱エネルギーに変換することが可能である任意の材料／構造、およびそれらの任意の組み合わせなどであるがこれらに限定されない材料／構造を含む。ある特定の実施形態では、加熱層１１２は、カーボンナノチューブを含む。
【００８５】
いくつかの実施形態では、加熱層は、２０１０年５月２１日出願の米国仮特許出願第６１／３４７，１７８号、２０１２年４月１０日出願の米国仮特許出願第６１／６２２，２２６号、２０１３年３月１５日出願の米国仮特許出願第６１／８０１，４２４号、２０１３年３月１５日出願の米国仮特許出願第６１／８０１，０９６号、２０１３年３月１５日出願の米国仮特許出願第６１／８０１，９３３号、２０１３年３月１５日出願の米国仮特許出願第６１／７９４，３１７号、２０１４年１２月１０日出願の米国仮特許出願第６２／０９０，２９９号、２０１２年１０月１日出願の米国仮特許出願第６１／７０８，３１４号、２０１１年５月２０日出願のＰＣＴ出願第ＰＣＴ／ＵＳ２０１１／０３７４５５号、２０１３年３月１５日出願のＰＣＴ出願第ＰＣＴ／ＵＳ２０１３／０３２３４７号、２０１４年３月１５日出願のＰＣＴ出願第ＰＣＴ／ＵＳ２０１４／０２９９７９号、２０１４年３月１４日出願のＰＣＴ出願第ＰＣＴ／ＵＳ２０１４／０２８４１７号、２０１４年３月１６日出願のＰＣＴ出願第ＰＣＴ／ＵＳ２０１４／０３０１０８号、２０１３年１０月１日出願のＰＣＴ出願第ＰＣＴ／ＵＳ２０１３／０６２９２３号、２０１３年６月１３日出願の米国特許出願第１３／６９９，２７０号、２０１４年８月１３日出願の米国特許出願第１４／４５９，２３９号、２０１５年９月３０日出願の米国特許出願第１４／８７１，６７８号、２０１３年３月１５日出願の米国特許出願第１３／８３８，６００号、２０１４年８月１３日出願の米国特許出願第１４／４５９，２５１号、２０１５年３月２５日出願の米国特許出願第１４／６６８，７５０号、２０１５年９月１１日出願の米国特許出願第１４／７７５，６３４号、２０１５年９月１１日出願の米国特許出願第１４／７７５，６３８号、２０１４年３月１６日出願の米国特許出願第１４／８５２，４１２号、２０１５年１２月９日出願の米国特許出願第１４／９６４，３９４号、２０１５年１０月５日出願の米国特許出願第１４／４３１，２６６号に記載されるＤ２ＰＡアレイなどであるがこれに限定されない、ドット結合ドットオンピラーアンテナ（ｄｏｔ−ｃｏｕｐｌｅｄ−ｄｏｔｓ−ｏｎ−ｐｉｌｌａｒ  ａｎｔｅｎｎａ）（Ｄ２ＰＡ）アレイを含み、これらの完全な開示は、あらゆる目的で参照により本明細書に組み込まれる。
【００８６】
図３のパネル（Ｂ）は、閉鎖構成にあるときの試料ホルダー１００の斜視図および断面図を示す。断面図は、試料ホルダー１００または間隔機構の全体を示すことなく、デバイスの一部を示す。パネル（Ｂ）に示されるように、試料ホルダー１００は、第１のプレート１０と、第２のプレート２０と、間隔機構（図示せず）とを備える。
【００８７】
図３のパネル（Ｂ）中、第１のプレート１０および第２のプレート２０は、閉鎖構成にある。閉鎖構成では、２つのプレートの内表面１１および２１は互いに向かい合い、２つのプレート間の間隔１０２は間隔機構によって調整される。その結果、図に示すように、２つのプレートは、プレートの一方または両方の上に付着した流体試料９０を圧縮して層にし、層の厚さは間隔機構（図示せず）によって調整される。
【００８８】
いくつかの実施形態では、加熱中に液体の蒸気がカードから漏れ出ることを防止または低減する「蒸発防止リング」が液体領域（例えば、試料領域）の外側にある。
【００８９】
いくつかの実施形態では、加熱中にＱＭＡＸカードをその閉鎖構成に固定するために、ＱＭＡＸカードの外側にクランプがある。
【００９０】
いくつかの実施形態では、２つのプレートは、正確なレベルに設定されず実質的に均一でもない厳密でない押圧力によって圧縮される。ある特定の実施形態では、２つのプレートは人間の手で直接押圧される。
【００９１】
いくつかの実施形態では、プレートとスペーサとを含むＱＭＡＸカードは、カード自体による熱吸収を低減するために、低熱伝導率を有する材料でできている。
【００９２】
いくつかの実施形態では、加熱中にＱＭＡＸカードをその閉鎖構成に固定するために、ＱＭＡＸカードの外側にクランプがある。
【００９３】
いくつかの実施形態では、クランプは、カード自体による熱吸収を低減するために、低熱伝導率を有する材料でできている。いくつかの実施形態では、これらの材料には、ポリマー（例えば、プラスチック）または非晶質有機材料が含まれるが、これらに限定されない。ポリマー材料としては、アクリレートポリマー、ビニルポリマー、オレフィンポリマー、セルロースポリマー、非セルロースポリマー、ポリエステルポリマー、ナイロン、環状オレフィンコポリマー（ＣＯＣ）、ポリ（メチルメタクリレート）（ＰＭＭＡ）、ポリカーボネート（ＰＣ）、環状オレフィンポリマー（ＣＯＰ）、液晶ポリマー（ＬＣＰ）、ポリアミド（ＰＡ）、ポリエチレン（ＰＥ）、ポリイミド（ＰＩ）、ポリプロピレン（ＰＰ）、ポリ（フェニレンエーテル）（ＰＰＥ）、ポリスチレン（ＰＳ）、ポリオキシメチレン（ＰＯＭ）、ポリエーテルエーテルケトン（ＰＥＥＫ）、ポリエーテルスルホン（ＰＥＳ）、ポリ（エチレンフタレート）（ＰＥＴ）、ポリテトラフルオロエチレン（ＰＴＦＥ）、ポリ塩化ビニル（ＰＶＣ）、ポリフッ化ビニリデン（ＰＶＤＦ）、ポリブチレンテレフタレート（ＰＢＴ）、フッ化エチレンプロピレン（ＦＥＰ）、ペルフルオロアルコキシアルカン（ＰＦＡ）、ポリジメチルシロキサン（ＰＤＭＳ）、ゴム、またはそれらの任意の組み合わせが挙げられるが、これらに限定されない。いくつかの実施形態では、これらの材料には、酸化ケイ素、磁器、オルセレン（セラミック）、マイカ、ガラス、様々な金属の酸化物などの誘電材料を含む無機材料が含まれるが、これらに限定されない。いくつかの実施形態では、これらの材料には、酸化アルミニウム、塩化アルミニウム、硫化カドミウム、窒化ガリウム、金塩化物、ヒ化インジウム、水素化ホウ素リチウム、臭化銀、塩化ナトリウムなどの無機化合物が含まれるが、これらに限定されない。いくつかの実施形態では、これらの材料には、水、エタン、メタン、油、ベンゼン、ヘキサン、ヘプタン、シリコーン油、ポリ塩化ビフェニル、液体空気、液体酸素、液体窒素などが挙げられるがこれらに限定されない液体が含まれる。いくつかの実施形態では、これらの材料には、空気、アルゴン、ヘリウム、窒素、酸素、二酸化炭素などが挙げられるがこれらに限定されないガスが含まれる。いくつかの実施形態では、材料は、上記の材料の組み合わせである。
【００９４】
本発明のいくつかの実施形態では、２つのプレート間にスペーサがある。いくつかの実施形態では、スペーサのうちの少なくとも１つは、試料接触領域内にある。いくつかの実施形態では、スペーサは、均一な高さを有する。いくつかの実施形態では、試料の厚さは、スペーサの高さとしての試料である。
【００９５】
スペーサの高さは、プレート間の所望の調整された間隔、ならびに／または調整された最終試料の厚さおよび残留試料の厚さによって選択される。スペーサの高さ（所定のスペーサの高さ）、プレート間の間隔、および／または試料の厚さは、３ｎｍ以下、１０ｎｍ以下、５０ｎｍ以下、１００ｎｍ以下、２００ｎｍ以下、５００ｎｍ以下、８００ｎｍ以下、１０００ｎｍ以下、１μｍ以下、２μｍ以下、３μｍ以下、５μｍ以下、１０μｍ以下、２０μｍ以下、３０μｍ以下、５０μｍ以下、１００μｍ以下、１５０μｍ以下、２００μｍ以下、３００μｍ以下、５００μｍ以下、８００μｍ以下、１ｍｍ以下、２ｍｍ以下、４ｍｍ以下であるか、またはそれらの値のうちのいずれか２つの間の範囲内である。
【００９６】
スペーサの高さ、プレート間の間隔、および／または試料の厚さは、１つの好ましい実施形態では１ｎｍ〜１００ｎｍ、別の好ましい実施形態では１００ｎｍ〜５００ｎｍ、別の好ましい実施形態では５００ｎｍ〜１０００ｎｍ、別の好ましい実施形態では１μｍ（すなわち、１０００ｎｍ）〜２μｍ、別の好ましい実施形態では２μｍ〜３μｍ、別の好ましい実施形態では３μｍ〜５μｍ、別の好ましい実施形態では５μｍ〜１０μｍ、および別の好ましい実施形態では１０μｍ〜５０μｍ、別の好ましい実施形態では５０μｍ〜１００μｍである。
【００９７】
いくつかの実施形態では、ＱＭＡＸデバイスは、カード自体による熱吸収を低減するために完全に透明または部分的に透明である。透明度は、３０％超、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、９０％、１００％であるか、またはそれらの値のうちのいずれか２つの間の範囲である。
【００９８】
いくつかの実施形態では、ＱＭＡＸデバイスは、カード自体による熱吸収を低減するために部分的に反射性である。表面の反射率は、３０％超、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、９０％、１００％であるか、またはそれらの値のうちのいずれか２つの間の範囲である。
【００９９】
いくつかの実施形態では、ＱＭＡＸおよびクランプは、カード自体による熱吸収を低減するためにコーティングされた断熱層である。断熱層は、上記の低熱伝導率材料を含む材料を含む。
【０１００】
いくつかの実施形態では、クランプは、閉鎖構成でＱＭＡＸカード全体を被覆および密封する。
【０１０１】
いくつかの実施形態では、クランプは、閉鎖構成でＱＭＡＸカードの表面の一部を被覆する。
【０１０２】
いくつかの実施形態では、クランプは、光がＱＭＡＸカードの内側に入り、かつＱＭＡＸカードから外に出ることを可能にするための透明な窓を有する。
【０１０３】
いくつかの実施形態では、クランプは、光がＱＭＡＸカードの内側に入り、かつＱＭＡＸカードから外に出ることを可能にするために、完全に透明である。
【０１０４】
クランプの透明度は、３０％超、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、９０％、１００％であるか、またはそれらの値のうちのいずれか２つの間の範囲である。
【０１０５】
いくつかの実施形態では、閉鎖構成においてクランプとＱＭＡＸデバイスとの間に空気または液体が存在する。ある特定の実施形態では、液体としては、水、エタン、メタン、油、ベンゼン、ヘキサン、ヘプタン、シリコーン油、ポリ塩化ビフェニル、液体空気、液体酸素、液体窒素などが挙げられるが、これらに限定されない。ある特定の実施形態では、ガスとしては、空気、アルゴン、ヘリウム、窒素、酸素、二酸化炭素などが挙げられるが、これらに限定されない。
【０１０６】
いくつかの実施形態では、クランプを閉鎖した後、クランプによって加えられたＱＭＡＸカード表面への圧力は、０．０１ｋｇ／ｃｍ２、０．１ｋｇ／ｃｍ２、０．５ｋｇ／ｃｍ２、１ｋｇ／ｃｍ２、２ｋｇ／ｃｍ２、ｋｇ／ｃｍ２、５ｋｇ／ｃｍ２、１０ｋｇ／ｃｍ２、２０ｋｇ／ｃｍ２、３０ｋｇ／ｃｍ２、４０ｋｇ／ｃｍ２、５０ｋｇ／ｃｍ２、６０ｋｇ／ｃｍ２、１００ｋｇ／ｃｍ２、１５０ｋｇ／ｃｍ２、２００ｋｇ／ｃｍ２であるか、またはそれらの値のうちのいずれか２つの間の範囲、および０．１ｋｇ／ｃｍ２〜０．５ｋｇ／ｃｍ２、０．５ｋｇ／ｃｍ２〜１ｋｇ／ｃｍ２、１ｋｇ／ｃｍ２〜５ｋｇ／ｃｍ２、５ｋｇ／ｃｍ２〜１０ｋｇ／ｃｍ２の好ましい範囲（圧力）である。
【０１０７】
図３のデバイスの断面図に示されるように、加熱層１１２は、試料接触領域に広がる。しかしながら、加熱層の横方向領域が、試料接触領域の一部のみを約１％以上、５％以上、１０％以上、２０％以上、５０％以上、８０％以上、９０％以上、９５％以上、９９％以上、８５％以下、７５％以下、５５％以下、４０％以下、２５％以下、８％以下、２．５％以下の割合で占めることが可能であることも留意されるべきである。いくつかの実施形態では、試料の温度変化を容易にするために、いくつかの実施形態では、加熱層の横方向領域は、試料９０が試料接触領域上で試料９０の横寸法にわたって実質的に均一に、加熱層１１２からの熱放射を受容するように構成されている。
【０１０８】
いくつかの実施形態では、放射線吸収領域は、全プレート領域の１０％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、９０％、１００％、またはそれらの値のうちのいずれか２つの間の範囲である。
【０１０９】
いくつかの実施形態では、加熱層１１２は、１０ｎｍ以上、２０ｎｍ以上、５０ｎｍ以上、１００ｎｍ以上、２００ｎｍ以上、５００ｎｍ以上、１μｍ以上、２μｍ以上、５μｍ以上、１０μｍ以上、２０μｍ以上、５０μｍ以上、１００μｍ以上、７５μｍ以下、４０μｍ以下、１５μｍ以下、７．５μｍ以下、４μｍ以下、１．５μｍ以下、７５０ｎｍ以下、４００ｎｍ以下、１５０ｎｍ以下、７５ｎｍ以下、４０ｎｍ以下、１５ｎｍ以下、またはそれらの２つの値のうちのいずれかの間の範囲内の厚さを有する。ある特定の実施形態では、加熱層１１２は、１００ｎｍ以下の厚さを有する。
【０１１０】
いくつかの実施形態では、試料層および加熱層１１２の領域は、均一な厚さよりも実質的に大きい。ここで、「実質的に大きい」という用語は、試料層および／または加熱層の一般的な直径または対角線距離が少なくとも１０倍、１５倍、２０倍、２５倍、３０倍、３５倍、４０倍、４５倍、５０倍、５５倍、６０倍、６５倍、７０倍、７５倍、８０倍、８５倍、９０倍、９５倍、１００倍、１５０倍、２００倍、２５０倍、３００倍、３５０倍、４００倍、４５０倍、５００倍、５５０倍、６００倍、６５０倍、７００倍、７５０倍、８００倍、８５０倍、９００倍、９５０倍、１０００倍、１５００倍、２０００倍、２５００倍、３０００倍、３５００倍、４０００倍、４５００倍、もしくは５０００倍、またはそれらの２つの値のうちのいずれかの間の範囲内であることを意味する。
【０１１１】
図９および１０は、ＱＭＡＸカードの追加の実施形態を示す。図９は、本発明の第１のプレートおよび加熱層の例示的な実施形態を示す。パネルＡは上面図であり、パネルＢは断面図である。図１０は、本発明の２つの例示的な実施形態の断面図を示し、第１のプレート、第２のプレート、および加熱層を示す。全体として、第１のプレートおよび第２のプレート、光学的加熱層は、試料ホルダーと見なされ得、これは、本明細書に示されかつ／または記載される実施形態だけではなく、液体試料の少なくとも一部を圧縮して均一な厚さの層にすることが可能である他の実施形態も指す。
【０１１２】
図９のパネルＡに示されるように、いくつかの実施形態では、加熱層は、第１のプレートと接触している。しかしながら、いくつかの実施形態では、加熱層が第２のプレート２０と接触していてもよいことに留意されたい。加えて、いくつかの実施形態では、加熱層は、プレートのいずれとも接触していない。いくつかの実施形態では、加熱層の別個の構造はなく、第１のプレートおよび／または第２のプレート２０および／または試料自体が、試料の温度を上昇させ得る電磁放射線をある程度吸収することができる。
【０１１３】
いくつかの実施形態では、加熱層は、１０００ｍｍ２未満、９００ｍｍ２、８００ｍｍ２、７００ｍｍ２、６００ｍｍ２、５００ｍｍ２、４００ｍｍ２、３００ｍｍ２、２００ｍｍ２、１００ｍｍ２、９０ｍｍ２、８０ｍｍ２、７５ｍｍ２、７０ｍｍ２、６０ｍｍ２、５０ｍｍ２、４０ｍｍ２、３０ｍｍ２、２５ｍｍ２、２０ｍｍ２、１０ｍｍ２、５ｍｍ２、２ｍｍ２、１ｍｍ２、０．５ｍｍ２、０．２ｍｍ２、０．１ｍｍ２、もしくは０．０１ｍｍ２、またはそれらの２つの値のうちのいずれかの間の範囲内である面積を有する。いくつかの実施形態では、加熱層は、第１のプレート（および／または第２のプレート）の面積よりも実質的に小さい面積を有する。しかしながら、ある特定の実施形態では、加熱層の面積は、第１のプレート（または第２のプレート、または第１のプレートもしくは第２のプレートの試料接触領域）の面積の一部のみを、約１％以上、５％以上、１０％以上、２０％以上、５０％以上、８０％以上、９０％以上、９５％以上、９９％以上、８５％以下、７５％以下、５５％以下、４０％以下、２５％以下、８％以下、２．５％以下の割合で占める。
【０１１４】
いくつかの実施形態では、加熱層は、実質的に均一な厚さを有する。いくつかの実施形態では、加熱層は、１０ｎｍ未満、２０ｎｍ、５０ｎｍ、１００ｎｍ、２００ｎｍ、５００ｎｍ、１μｍ、２μｍ、５μｍ、１０μｍ、２０μｍ、５０μｍ、１００μｍ、２００μｍ、３００μｍ、４００μｍ、５００μｍ、６００μｍ、７００μｍ、８００μｍ、９００μｍ、１ｍｍ、１．５ｍｍ、２ｍｍ、２．５ｍｍ、３ｍｍ、３．５ｍｍ、４ｍｍ、４．５ｍｍ、５ｍｍ、もしくは１０ｍｍ、またはそれらの２つの値のうちのいずれかの間の範囲内の厚さを有する。
【０１１５】
加熱層は、任意の形状をとることができる。例えば、上面図から、加熱層は、正方形、円形、楕円形、三角形、矩形、平行四辺形、台形、五角形、六角形、八角形、多角形、または他の様々な形状であってもよい。
【０１１６】
いくつかの実施形態では、第１のプレートまたは第２のプレートは、２ｎｍ以下、１０ｎｍ以下、１００ｎｍ以下、２００ｎｍ以下、５００ｎｍ以下、１０００ｎｍ以下、２μｍ（ミクロン）以下、５μｍ以下、１０μｍ以下、２０μｍ以下、５０μｍ以下、１００μｍ以下、１５０μｍ以下、２００μｍ以下、３００μｍ以下、５００μｍ以下、８００μｍ以下、１ｍｍ（ミリメートル）以下、２ｍｍ以下、３ｍｍ以下、５ｍｍ以下、１０ｍｍ以下、２０ｍｍ以下、５０ｍｍ以下、１００ｍｍ以下、５００ｍｍ以下、またはこれらの値のうちのいずれか２つの間の範囲内の厚さを有する。
【０１１７】
いくつかの実施形態では、第１のプレートおよび第２のプレートは、１ｍｍ２（平方ミリメートル）以下、１０ｍｍ２以下、２５ｍｍ２以下、５０ｍｍ２以下、７５ｍｍ２以下、１ｃｍ２（平方センチメートル）以下、２ｃｍ２以下、３ｃｍ２以下、４ｃｍ２以下、５ｃｍ２以下、１０ｃｍ２以下、１００ｃｍ２以下、５００ｃｍ２以下、１０００ｃｍ２以下、５０００ｃｍ２以下、１０，０００ｃｍ２以下、１０，０００ｃｍ２以下、またはこれらの値のうちのいずれか２つの間の範囲内の横方向領域を有する。
【０１１８】
いくつかの実施形態では、試料の温度が急速に変化し得るように、加熱層と接触しているプレート（第１プレート、第２プレート、または両方のプレートのいずれか）は薄い。例えば、ある特定の実施形態では、加熱層と接触しているプレートは、５００μｍ以下、２００μｍ、１００μｍ、５０μｍ、２５μｍ、１０μｍ、５μｍ、２．５μｍ、１μｍ、５００ｎｍ、４００ｎｍ、３００ｎｍ、２００ｎｍ、もしくは１００ｎｍ、またはそれらの２つの値のうちのいずれかの間の範囲内の厚さを有する。いくつかの実施形態では、１つのプレートのみが加熱層と接触している場合、加熱層と接触しているプレートは、加熱層と接触していないプレートよりも実質的に薄い。例えば、いくつかの実施形態では、加熱層と接触しているプレートの厚さは、加熱層と接触しているプレートの厚さの１／１，０００，０００未満、１／５００，０００、１／１００，０００、１／５０，０００、１／１０，０００、１／５，０００、１／１，０００、１／５００、１／１００、１／５０、１／１０、１／５、もしくは１／２、またはそれらの２つの値のうちのいずれかの間の範囲内である。
【０１１９】
いくつかの実施形態では、試料層の温度が急速に変化し得るように、試料層は薄い。ある特定の実施形態では、試料層は、１００μｍ以下、５０μｍ、２５μｍ、１０μｍ、５μｍ、２．５μｍ、１μｍ、５００ｎｍ、４００ｎｍ、３００ｎｍ、２００ｎｍ、もしくは１００ｎｍ、またはそれらの２つの値のうちのいずれかの間の範囲内の厚さを有する。
【０１２０】
いくつかの実施形態では、試料ホルダーは、スペーサをさらに備える。ある特定の実施形態では、スペーサは、プレートの一方または両方に固定される。ある特定の実施形態では、スペーサは、試料と混合される。いくつかの実施形態では、スペーサは、均一な高さを有し、スペーサは第２のプレートおよび第２のプレートと一緒に、試料層を調整する。いくつかの実施形態では、試料層の厚さは、スペーサの高さに実質的に等しい。いくつかの実施形態では、プレートは平坦である（例えば、図１０のパネルＡに示されるように）。いくつかの実施形態では、プレートの一方または両方のいずれかが、ウェルを含む（例えば、図１０のパネルＢに示されるように）。例えば、ある特定の実施形態では、ウェルの幅は、５００μｍ未満、２００μｍ、１００μｍ、５０μｍ、２５μｍ、１０μｍ、５μｍ、２．５μｍ、１μｍ、５００ｎｍ、４００ｎｍ、３００ｎｍ、２００ｎｍ、もしくは１００ｎｍ、またはそれらの２つの値のうちのいずれかの間の範囲内であってもよい。ある特定の実施形態では、ウェルの深さは、５００μｍ未満、２００μｍ、１００μｍ、５０μｍ、２５μｍ、１０μｍ、５μｍ、２．５μｍ、１μｍ、５００ｎｍ、４００ｎｍ、３００ｎｍ、２００ｎｍ、１００ｎｍ、５０ｎｍ、２０ｎｍ、１０ｎｍ、５ｎｍ、２ｎｍ、もしくは１ｎｍ、またはそれらの２つの値のうちのいずれかの間の範囲内であってもよい。
【０１２１】
様々な実施形態では、加熱層の位置決めも異なり得る。いくつかの実施形態では、図１０に示されるように、加熱層は、第１のプレートの内表面に位置付けられる。ここで、内表面は、試料と接触している表面として定義され、試料は圧縮されて層になる。もう一方の表面は、外表面である。いくつかの実施形態では、加熱層は、第１のプレートの内表面にある。いくつかの実施形態では、加熱層は、第２のプレートの内表面にある。いくつかの実施形態では、加熱層は、第１のプレートの外表面にある。いくつかの実施形態では、加熱層は、第２のプレートの外表面にある。いくつかの実施形態では、第１のプレートおよび／または第２のプレートの内表面および／または外表面に少なくとも２つの加熱層がある。
【０１２２】
本明細書に示され、かつ記載されるように、いくつかの実施形態では、試料ホルダーは、流体試料を圧縮して薄層にし、したがって試料の熱質量を低減するように構成されている。しかし、熱質量を低減すると、少量のエネルギーが試料の温度を急速に変化させることが可能であり得る。加えて、試料の厚さを制限することによって、熱伝導も制限される。
【０１２３】
いくつかの実施形態では、第１のプレート１０および第２のプレート２０のそれぞれの表面上に試料接触領域がある。試料接触領域は、第１のプレート１０および／または第２のプレート２０の表面の任意の部分であってもよい。いくつかの実施形態では、加熱層は、試料接触領域と少なくとも部分的に重なり合う。重なり合う部分では、近接性および小さい熱質量により、試料は急速に加熱される。
【０１２４】
本発明のいくつかの実施形態によると、急速に加熱および冷却され得る試料カードは、以下の要因および設計の組み合わせおよび／または最適化を使用することによって設計される。
（ｉ）カードならびに試料の熱質量が最小化されて、加熱に必要なエネルギーおよび冷却のために除去されるエネルギーを低減する。
（ｉｉ）カードの異なる位置間および／または試料の異なる位置間の熱伝導が低減されて、異なる位置における異なる温度を可能にする。これを達成する一方法は、カードプレートおよびプレートの厚さを低減することである。
（ｉｉｉ）カードプレートおよび／または試料の表面対体積比が増加し、これにより、所与の体積に対して、小さい厚さを有するが、大きい面積を有する。大きい面積は、急速加熱ならびに急速冷却（放射冷却および／または対流冷却のいずれか）を容易にする。
（ｉｖ）急速に加熱および冷却すること（すなわち、ＲＨＣ）ができるヒータ（例えば、加熱層）が、加熱される試料領域のすぐ隣および近くに配置される。試料領域とヒータの加熱素子との離隔距離は、ヒータ領域の平均直径よりもはるかに小さい（「平均直径」は、その面積の円周を円周率（すなわち、３．１４）で割ったものとして定義される）。ヒータは、組み合わせの光学ヒータもしくは電気ヒータ、または組み合わせであってもよい。光学ヒータの場合、加熱素子は、光源からの光を吸収し、それを熱に変換する。電気加熱の場合、加熱素子は、電流を通過することによって加熱される。
（ｖ）急速冷却のために、放射冷却および対流冷却が調節される。
（ｖｉ）急速冷却のために、放射冷却および／または対流冷却用のヒートシンクが使用される。
【０１２５】
加熱、冷却、および制御
図４は、本発明のシステムの一実施形態の斜視図および断面図を示す。パネル（Ａ）および（Ｂ）に示されるように、いくつかの実施形態では、システムは、試料ホルダー１００と熱制御ユニット２００とを備え、試料ホルダー１００は、第１のプレート１０と、第２のプレート２０と、間隔機構（図示せず）とを備え、熱制御ユニット２００は、加熱源２０２とコントローラ２０４とを備える。図２のパネル（Ａ）および（Ｂ）は、システムの試料ホルダー１００が閉鎖構成にあるときのシステムの斜視図および断面図を示す。
【０１２６】
図３のパネル（Ｂ）に示されるように、熱制御ユニット２００は、加熱源２０２とコントローラ２０４とを備える。いくつかの実施形態では、熱制御ユニット２００は、試料の温度変化のために電磁波の形態でエネルギーを提供する。
【０１２７】
図４のパネル（Ａ）および（Ｂ）の両方を参照すると、加熱源２０２は、電磁波２１０を吸収し、かつ電磁波２１０の実質的な部分を熱に変換するように構成されている試料ホルダー１００の加熱層１１２に、電磁波２１０を発射し、加熱層１１２の近傍にある試料９０の一部分の温度を上昇させる熱放射をもたらすように構成されている。言い換えれば、加熱源２０２および加熱層１１２の結合は、試料９０の温度変化を容易にするために必要とされる熱エネルギーを発生させるように構成されている。
【０１２８】
いくつかの実施形態では、加熱源２０２からの放射線は、電波、マイクロ波、赤外波、可視光、紫外波、Ｘ線、ガンマ線、もしくは熱放射、またはそれらの任意の組み合わせを含む。いくつかの実施形態では、加熱層１１２は、加熱層１１２が最高の吸収効率を有する好ましい光波長範囲を有する。いくつかの実施形態では、加熱源２０２は、加熱層１１２の好ましい波長範囲内の、それと重複する、またはそれを取り囲む波長範囲で電磁波を発射するように構成されている。他の実施形態では、温度変化を容易にするために、波長は、加熱層の好ましい波長から離して合理的に設計される。
【０１２９】
いくつかの実施形態では、加熱源２０２は、狭い波長範囲内のレーザー光を提供するレーザー源を含む。他の実施形態では、加熱源２０２は、その複数のＬＥＤ（発光ダイオード）を含む。
【０１３０】
図４のパネル（Ａ）および（Ｂ）を参照すると、コントローラ２０４は、試料の温度変化のために、加熱源２０２から発射される電磁波２１０を制御するように構成されている。コントローラ２０４が制御する電磁波２１０のパラメータには、存在、強度、波長、入射角、およびそれらの任意の組み合わせが含まれるが、これらに限定されない。いくつかの実施形態では、コントローラは、手動で操作され、例えば、それは、加熱源のオンおよびオフ、したがって加熱源から発射される電磁波の存在を制御する手動スイッチと同じくらい簡単である。他の実施形態では、コントローラは、１つまたは複数の所定のプログラムに従って自動的に電磁波を制御するように構成されるハードウェアおよびソフトウェアを含む。
【０１３１】
いくつかの実施形態では、所定のプログラムは、電磁波２１０のパラメータ（複数可）（例えば、存在、強度、および／または波長）が、それぞれの所定の期間の間所定のレベルに設定されるスケジュールを指す。他の実施形態では、所定のプログラムは、試料９０の温度が、それぞれの所定の期間の間所定のレベルに設定され、１つの所定のレベルから別の所定のレベルへの試料温度の変化の期間もそれぞれ設定されるスケジュールを指す。いくつかの実施形態では、コントローラ２０４はプログラム可能に構成され、これは、コントローラ２０４が、システムのオペレータによって送られるシステムの所定のプログラムを受信および実行するように構成されているハードウェアおよびソフトウェアを含むことを意味する。
【０１３２】
図５は、本発明の一実施形態の断面図を示し、サーマルサイクラーシステムを示し、温度変化および制御を容易にする追加の要素を示す。図５に示されるように、サーマルサイクラーシステムは、試料ホルダー１００と熱制御ユニット２００とを備える。試料ホルダー１００は、第１のプレート１０と、第２のプレート２０と、間隔機構４０と、密封要素３０とを備え、熱制御ユニット２００は、加熱源２０２と、コントローラ２０４と、温度計２０６と、エキスパンダ２０８とを備える。
【０１３３】
図５は、閉鎖構成にある試料ホルダー１００を示し、この構成では、第１および第２のプレート１０および２０の内表面１１および２１は、互いに向かい合い、２つのプレート間の間隔１０２は、間隔機構４０によって調整される。開放構成において試料９０をプレートの一方または両方の上に付着させた場合、閉鎖構成に切り替えると、第１のプレート１０および第２のプレート２０が人間の手または他の機構によって押圧され、試料９０が２つのプレートによって圧縮されて薄い層になる。いくつかの実施形態では、層の厚さは均一であり、２つのプレート間の間隔１０２と同じである。ある特定の実施形態では、間隔１０２（したがって試料層の厚さ）は、間隔機構４０によって調整される。いくつかの実施形態では、間隔機構は、プレートの１つに固定される密閉スペーサを備える。いくつかの実施形態では、間隔機構４０は、プレートの一方または両方に固定される複数の柱状スペーサを備える。ここで、「固定」という用語は、スペーサ（複数可）がプレートに取り付けられ、少なくともプレートの使用中に取り付けが維持されることを意味する。
【０１３４】
いくつかの実施形態では、試料ホルダー１００は、２０１５年８月１０日出願の米国仮特許出願第６２／２０２，９８９号、２０１５年９月１４日出願の米国仮特許出願第６２／２１８，４５５号、２０１６年２月９日出願の米国仮特許出願第６２／２９３，１８８号、２０１６年３月８日出願の米国仮特許出願第６２／３０５，１２３号、２０１６年７月３１日出願の米国仮特許出願第６２／３６９，１８１号、２０１６年９月１５日出願の米国仮特許出願第６２／３９４，７５３号、２０１６年８月１０日出願のＰＣＴ出願（米国指定）第ＰＣＴ／ＵＳ２０１６／０４５４３７号、２０１６年９月１４日出願のＰＣＴ出願（米国指定）第ＰＣＴ／ＵＳ２０１６／０５１７７５号、２０１６年９月１５日出願のＰＣＴ出願（米国指定）第ＰＣＴ／ＵＳ２０１６／０５１７９４号、および２０１６年９月２７日出願のＰＣＴ出願（米国指定）第ＰＣＴ／ＵＳ２０１６／０５４０２５号に記載されたＣＲＯＦデバイスなどであるがこれに限定されない、圧縮調整オープンフロー（ＣＲＯＦ、さらにＱＭＡＸとしても知られる）デバイスであり、これらの完全な開示は、あらゆる目的で参照により本明細書に組み込まれる。
【０１３５】
いくつかの実施形態では、試料ホルダー１００は、閉鎖構成において、媒体接触領域の外側で第１のプレート１０と第２のプレート２０との間の間隔１０２を密封するように構成された密封要素３０を備える。ある特定の実施形態では、密封要素３０は、試料９０の横方向領域全体が十分に画定され測定可能であるように、ある特定の領域（例えば、試料受容領域）内に試料９０を封入する。ある特定の実施形態では、密封要素３０は、試料９０の均一性、特に試料層の厚さの均一性を改善する。
【０１３６】
いくつかの実施形態では、密封要素３０は、閉鎖構成で第１のプレート１０と第２のプレート２０との間に適用される接着剤を含む。接着剤は、デンプン、デキストリン、ゼラチン、アスファルト、瀝青、ポリイソプレン天然ゴム、樹脂、シェラック、セルロースおよびその誘導体、ビニル誘導体、アクリル誘導体、反応性アクリル系基剤、ポリクロロプレン、スチレン−ブタジエン、スチレン−ジエン−スチレン、ポリイソブチレン、アクリロニトリル−ブタジエン、ポリウレタン、ポリスルフィド、シリコーン、アルデヒド縮合樹脂、エポキシ樹脂、アミンベース樹脂、ポリエステル樹脂、ポリオレフィンポリマー、可溶性ケイ酸塩、リン酸セメント、もしくは任意の他の接着剤材料、またはそれらの任意の組み合わせなどの材料から選択されるが、これらに限定されない。いくつかの実施形態では、接着剤は、乾燥接着剤、感圧接着剤、接触接着剤、高温接着剤、または一液型もしくは多液型反応性接着剤、またはそれらの任意の組み合わせである。いくつかの実施形態では、糊は、天然接着剤もしくは合成接着剤、または任意の他の起源からのもの、またはそれらの任意の組み合わせである。いくつかの実施形態では、接着剤は、自然硬化、熱硬化、ＵＶ硬化されるか、または任意の他の処理により、またはそれらの任意の組み合わせにより硬化される。
【０１３７】
いくつかの実施形態では、密封要素３０は、密閉スペーサ（ウェル）を含む。例えば、密閉スペーサは、上面図から円形（または任意の他の密閉された形状）を有し、試料９０を取り囲み、第１のプレート１０および第２のプレート２０と共に試料９０を本質的に制限する。ある特定の実施形態では、密閉スペーサ（ウェル）は、間隔機構４０としても機能する。そのような実施形態では、密閉スペーサは、試料９０の横方向の境界を密封するとともに、試料層の厚さを調整する。
【０１３８】
いくつかの実施形態では、コントローラ２０４は、所定のプログラムに従って、試料９０を伴うアッセイおよび／または反応を容易にするために、試料の温度を調節するように構成されている。いくつかの実施形態では、アッセイおよび／または反応はＰＣＲである。ある特定の実施形態では、コントローラ２０４は、加熱源２０６からの電磁波の存在、強度、および／または周波数を制御するように構成されている。
【０１３９】
図５に示されるように、いくつかの実施形態では、熱制御ユニット２００は、温度計２０６を備える。いくつかの実施形態では、温度計２０６は、試料９０の温度を制御／監視／調節する監視および／またはフィードバック機構を提供する。例えば、いくつかの実施形態では、温度計２０６は、試料接触領域またはその近傍の温度を測定するように構成されている。ある特定の実施形態では、温度計２０６は、試料９０の温度を直接測定するように構成されている。いくつかの実施形態では、温度計２０６は、光ファイバ温度計、赤外線温度計、流体結晶温度計、高温計、水晶温度計、シリコンバンドギャップ温度センサ、温度ストリップ、サーミスタ、および熱電対からなる群から選択される。ある特定の実施形態では、温度計２０６は赤外線温度計である。
【０１４０】
いくつかの実施形態では、温度計２０６は、信号をコントローラ２０４に送信するように構成されている。そのような信号は、コントローラ２０４が対応する変化を行うように、試料９０の温度に関する情報を含む。例えば、ＰＣＲ中、変性ステップに関して、目標温度は９５℃に設定され、測定後、温度計は、試料９０の測定温度が実際には９４．８℃であることを示す信号をコントローラ２０４に送信し、したがって、コントローラ２０４は、電磁波を発射する加熱源２０２の出力を変更するか、または既存の電磁波の特定のパラメータ（例えば、強度もしくは周波数）を調節し、これにより、試料９０の温度は、９５℃に上昇する。このような測定−信号伝達−調節ループは、任意の反応／アッセイにおいて任意のステップに適用される。
【０１４１】
図５に示されるように、熱制御ユニット２００は、加熱源２０２からの電磁波を、より小さい直径からより大きい直径に拡大するように構成されたビームエキスパンダ２０８を備える。いくつかの実施形態では、加熱源２０２から発射される電磁波は、試料接触領域全体を被覆するのに十分である。しかしながら、いくつかの実施形態では、加熱源２０２から発射される電磁波の被覆領域を拡大して、拡大された電磁波２１０をもたらし、試料接触領域（複数可）全体に熱源を提供する必要がある。ビームエキスパンダ２０８は、米国特許第４，５４５，６７７号、同第４，２１４，８１３号、同第４，１２７，８２８号、および同第４，０１６，５０４号、ならびに米国特許公開第２００８／０２９７９１２号および同第２０１０／０２１４６５９号（すべての目的のために、それらの全体が参照により組み込まれる）に記載されるビームエキスパンダを含むがこれらに限定されない任意の既知の技術を用いる。
【０１４２】
図１１および１２は、システムの追加の実施形態を提供する。図１１は、本発明の例示的な実施形態の断面図を示し、試料の温度を急速に変化させるためのシステムを示す。図１１は、一実施形態による加熱源の詳細な要素を示す。
【０１４３】
図１１および図１２に示されるように、いくつかの実施形態では、システムは、試料ホルダーと加熱源とを備える。いくつかの実施形態では、試料ホルダーは、本明細書に記載されるように、第１のプレート、第２のプレート、および／または加熱層を備える。加熱源は、試料に到達し、試料の温度を上昇させる熱に変換され得る電磁波を放出する。いくつかの実施形態では、変換は、加熱層によって実行される。特定の加熱層がない場合、変換は、試料ホルダーの他の部分によって実行される。
【０１４４】
図１１および図１２に示されるように、いくつかの実施形態では、システムは、試料ホルダーを閉じ込めるチャンバを備える。いくつかの実施形態では、チャンバは、図１のヒートシンクの一例である。いくつかの実施形態では、チャンバは、試料の撮像を可能にするように構成された光学開口部を備える。いくつかの実施形態では、チャンバは、加熱源から加熱層への電磁波の通過を可能にするように構成された放射開口部を備える。ある特定の実施形態では、電磁波の通過を可能にするために、窓が放射開口部に位置付けられる。ある特定の実施形態では、フィルタ（例えば、バンドパスフィルタ）が光学開口部に位置付けられて、試料ホルダー内の試料の撮像を可能にする。
【０１４５】
いくつかの実施形態では、チャンバは、試料および／または加熱源から熱を吸収するために使用される。いくつかの実施形態では、チャンバは、金属ケースを備える。いくつかの実施形態では、チャンバは、外層を備える。ある特定の実施形態では、外層は、黒色である。いくつかの実施形態では、外層は、黒色金属から作られる。いくつかの実施形態では、チャンバは、内層を備える。いくつかの実施形態では、内層は、非反射性材料から作られる。ある特定の実施形態では、内層は、黒色である。いくつかの実施形態では、内層は、黒色金属から作られる。
【０１４６】
図１１および図１２に示されるように、いくつかの実施形態では、システムは、試料ホルダー内の流体試料の画像を取り込むように構成された光学センサを備える。いくつかの実施形態では、システムは、光源をさらに備え、これは、場合によっては光学センサと統合され得、場合によっては別々であってもよい。いくつかの実施形態では、光源は、試料に到達することができる励起光を提供するように構成されている。いくつかの実施形態では、試料は、画像が撮影されるように、光学センサによって捕捉され得る信号光を提供することができる。
【０１４７】
図１１に示されるように、いくつかの実施形態では、加熱源は、ＬＥＤまたはレーザーダイオードを備える。ある特定の実施形態では、加熱源は、光をＬＥＤ／レーザーダイオードから試料ホルダーに方向付けるファイバカプラーおよびファイバをさらに備える。
【０１４８】
図１２は、本発明の例示的な実施形態の断面図を示し、試料の温度を急速に変化させるためのシステムを示す。図１２は、一実施形態による加熱源の詳細な要素を示す。図１２に示されるように、いくつかの実施形態では、加熱源は、ＬＥＤまたはレーザーダイオードを備える。ある特定の実施形態では、加熱源は、加熱源から試料ホルダー内の試料に電磁波を集束させる１つ以上の集束レンズをさらに備える。
【０１４９】
いくつかの実施形態では、電磁波の波長は、５０ｎｍ、１００ｎｍ、１５０ｎｍ、２００ｎｍ、２５０ｎｍ、３００ｎｍ、３５０ｎｍ、４００ｎｍ、４５０ｎｍ、５００ｎｍ、５５０ｎｍ、６００ｎｍ、６５０ｎｍ、７００ｎｍ、７５０ｎｍ、８００ｎｍ、８５０ｎｍ、９００ｎｍ、９５０ｎｍ、１μｍ、１０μｍ、２５μｍ、５０μｍ、７５μｍ、もしくは１００μｍ、またはそれらの２つの値のうちのいずれかの間の範囲内である。いくつかの実施形態では、電磁波の波長は、１００ｎｍ〜３００ｎｍ、４００ｎｍ〜７００ｎｍ（可視範囲）、７００ｎｍ〜１０００ｎｍ（ＩＲ範囲）、１μｍ〜１０μｍ、１０μｍ〜１００μｍ、またはそれらの２つの値のうちのいずれかの間の範囲内である。
【０１５０】
生化学およびアッセイ
本発明のサーマルサイクラーシステムおよび関連する方法は、化学的、生物学的、または医学的アッセイまたは反応を容易にするために使用され得る。いくつかの実施形態では、反応は温度変化を必要とする。いくつかの実施形態では、反応は、非特異的反応を回避し、かつ／または待機時間を短縮するために、急速な温度変化を必要とするか、またはそれを好む。ある特定の実施形態では、本発明のシステムおよび方法は、流体試料中のヌクレオチドの増幅のために周期的な温度変化を必要とする反応を容易にするために使用され、そのような反応としては、ポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）が挙げられるが、これに限定されない。以下の説明では、本発明のサーマルサイクラーシステムおよび方法の能力および利用を図示するためにＰＣＲを例として使用する。しかしながら、本明細書で説明するデバイス、システム、および方法のいくつかの実施形態は、温度制御および変化を必要とする他のアッセイおよび／または反応にも適用されることに留意するべきである。
【０１５１】
いくつかの実施形態では、アッセイ（例えば、ＰＣＲ）は、未処理試料を用いて実行され得る。例えば、ＰＣＲ反応の鋳型は、追加の処理を伴わずに、対象から直接得られた試料によって提供され得る。いくつかの実施形態では、試料は、個体からの全血であってもよい。いくつかの実施形態では、そのような「一段階」アプローチにより、本明細書に記載のデバイスのより便利な使用が可能になる。
【０１５２】
いくつかの実施形態では、試料９０は、ポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）用の予混合された反応媒体である。例えば、ある特定の実施形態では、反応媒体は、ＤＮＡ鋳型、２種のプライマー、ＤＮＡポリメラーゼ（例えば、Ｔａｑポリメラーゼ）、デオキシヌクレオシド三リン酸（ｄＮＴＰ）、二価カチオン（例えば、Ｍｇ２＋）、一価カチオン（例えば、Ｋ＋）、および緩衝液などの成分を含むが、これらに限定されない。特定の成分、各成分の濃度、および全体の体積は、反応の合理的な設計によって異なる。
【０１５３】
いくつかの実施形態では、ＰＣＲアッセイは、以下のステップ間で試料温度のいくつかの変化／変更を必要とする：（ｉ）試料を９２〜９８℃に加熱することを必要とする任意選択の初期化ステップ、（２）試料を９２〜９８℃に加熱することを必要とする変性ステップ、（３）試料温度を５０〜６５℃に下げることを必要とするアニーリングステップ、（４）試料を７５〜８０℃に加熱することを必要とする延伸（または伸長）ステップ、（５）ステップ（２）〜（４）を約２０〜４０回繰り返すこと、ならびに（６）アッセイの完了、および試料の温度を周囲温度（例えば、室温）に下げるかまたは約４℃に冷却すること。各ステップの具体的な温度および具体的な期間は様々であり、標的配列の長さ、プライマーの長さ、カチオン濃度、および／またはＧＣの割合を含むがこれらに限定されない、いくつかの要因に依存する。
【０１５４】
本発明のサーマルサイクラーシステムは、ＰＣＲアッセイのための急速な温度変化を提供する。例えば、図３のパネル（Ａ）および（Ｂ）ならびに図４のパネル（Ｂ）を参照すると、いくつかの実施形態では、試料９０（例えば、予混合された反応媒体）は、開放構成におけるプレート１０および２０のうちの一方または両方に添加され、プレートは、閉鎖構成に切り替えられて、試料９０を圧縮して、間隔機構（図示せず）によって調整される厚さ１０２を有する薄層にし、加熱源２０２は、電磁波２１０を第１のプレート１０へ（例えば、具体的には加熱層１１２へ）発射し、加熱層１１２は、電磁波２１０を吸収し、かつ前述の電磁波２１０の少なくとも実質的な部分を熱に変換するように構成されており、これは試料の温度を高め、電磁波２１０の除去は試料９０の温度の低下をもたらす。
【０１５５】
いくつかの実施形態では、電磁波２１０を加熱層１１２へ発射するか、または電磁波の強度を増加させることによって、サーマルサイクラーシステムは、初期化ステップ、変性ステップ、および／または延伸／伸長ステップのうちのいずれかまたは全てに対して急速な加熱を提供し（温度を高め）、いくつかの実施形態では、加熱源２０２から発射される電磁波の除去または電磁波の強度の減少により、アニーリングステップおよび／または最終冷却ステップへの冷却が急速に達成される。いくつかの実施形態では、電磁波２１０または電磁波２１０の強度の増加は、少なくとも５０℃／秒、４５℃／秒、４０℃／秒、３５℃／秒、３０℃／秒、２５℃／秒、２０℃／秒、１８℃／秒、１６℃／秒、１４℃／秒、１２℃／秒、１０℃／秒、９℃／秒、８℃／秒、７℃／秒、６℃／秒、５℃／秒、４℃／秒、３℃／秒、もしくは２℃／秒、またはこれらの２つの値のうちのいずれかの間の範囲内の昇温傾斜速度を生み出す。ある特定の実施形態では、ＰＣＲアッセイにおける平均昇温傾斜速度は、１０℃／秒以上である。いくつかの実施形態では、電磁波２１０の除去または電磁波２１０の強度の低減は、少なくとも５０℃／秒、４５℃／秒、４０℃／秒、３５℃／秒、３０℃／秒、２５℃／秒、２０℃／秒、１８℃／秒、１６℃／秒、１４℃／秒、１２℃／秒、１０℃／秒、９℃／秒、８℃／秒、７℃／秒、６℃／秒、５℃／秒、４℃／秒、３℃／秒、もしくは２℃／秒、またはこれらの２つの値のうちのいずれかの間の範囲内の降温傾斜速度をもたらす。ある特定の実施形態では、ＰＣＲアッセイにおける平均降温傾斜速度は、５℃／秒以上である。本明細書で使用される「傾斜速度」という用語は、２つの予め設定された温度間の温度変化の速度を指す。いくつかの実施形態では、各ステップへの平均昇温または降温は異なる。
【０１５６】
ＰＣＲ中、目標温度に達した後の任意のステップ内で、試料を一定期間の間、目標温度に維持する必要がある。本発明のサーマルサイクラーシステムは、（１）電磁波２１０の強度を調節し、温度が目標まで上昇した場合は下げるか、もしくは温度が目標まで低下した場合は増加させることによって、かつ／または（２）試料に提供される熱と試料から除去される熱とのバランスを取ることによって目標温度を維持することにより、温度維持機能を提供する。
【０１５７】
図７は、ＱＭＡＸカードデバイスを使用した核酸増幅のための例示的な手順の断面図を示す。ステップの例には、（Ａ）核酸を含有する試料を第１のプレート（基板）の内面上に導入すること、（Ｂ）第２のプレート（ＱＭＡＸカード）を第１のプレートの内表面へ押圧して、デバイスの閉鎖構成を形成することであって、ここで核酸増幅に必要な試薬が第２のプレートの内表面上で乾燥している、こと、（ｃ）第１および第２のプレートによって封入されたチャンバ内で核酸増幅産物を蓄積することが含まれる。
【０１５８】
図７は、ＱＭＡＸカードデバイスを使用した核酸増幅のための例示的な手順の断面図を示す。
【０１５９】
試料は、必要に応じて、第１のプレートもしくは第２のプレートのいずれか、またはその両方にも、導入することができる。本明細書の図７は、試料を第１のプレートの内表面上に導入する一例を提供する。
【０１６０】
より詳細には、ステップ（ｂ）において、第２のプレートを、試料と接触している第１のプレートの内表面へ押圧し、デバイスの閉鎖構成を形成する。本明細書で使用される「第２のプレート」とは、試料に接触する内表面上に周期的なスペーサを備えたＱＭＡＸカードを指す。
【０１６１】
より具体的には、ステップ（ｃ）において、デバイスが閉鎖構成にあるとき、加熱源は、第１のプレートもしくは第２のプレートまたは両方の内表面または外表面上の加熱層へ電磁波を発射する。加熱層は、電磁波を吸収し、かつ前述の電磁波からのエネルギーの少なくとも実質的な部分を熱の形態に変換するように構成されており、その熱が閉鎖したチャンバ内の試料に伝達される。いくつかの実施形態では、加熱源は、周囲温度から９８℃までの範囲で前述の試料の温度を調節するようにプログラムされている。いくつかの実施形態では、例えば、従来のＰＣＲの場合、試料は最初に９８℃に加熱され、その後、９４℃、５０〜６５℃、および７２℃の繰り返しサイクルを１５〜４０回受ける。いくつかの実施形態では、例えば、等温増幅の場合、試料の温度は一定の温度に維持される。いくつかの実施形態では、例えば、ＬＡＭＰにより等温増幅を実行する場合、試料は、約１〜７０分間、６０〜６５℃に加熱される。
【０１６２】
図８は、ＱＭＡＸカードデバイスを使用した核酸抽出および増幅を組み合わせた例示的なアッセイ手順の断面図を示す。ステップの例には、（ａ）捕捉プローブを第１のプレート（基板）の内表面上に固定化すること、（ｂ）試料を第１のプレートの内表面上に導入すること、（ｃ）第２のプレート（ＱＭＡＸカード１）を第１のプレートの内表面へ押圧し、デバイスの閉鎖構成を形成することであって、ここで核酸の遊離および捕捉を容易にするために必要な試薬１が第２のプレートの内表面上で乾燥している、こと、（ｄ）第１のプレートの内表面上で上記試料からの核酸を捕捉すること、（ｅ）第２のプレートを取り外し、スポンジを使用して第１のプレートの内表面を洗浄すること、（ｆ）第３のプレート（ＱＭＡＸカード２）を第１のプレートの内表面へ押圧することであって、ここで核酸増幅に必要な試薬２が第３のプレートの内表面上で乾燥している、こと、（ｇ）第１および第３のプレートにより封入されたチャンバ内で核酸増幅産物を蓄積することが含まれる。
【０１６３】
より詳細には、ステップ（ａ）において、捕捉プローブは第１のプレートの内表面上に固定化される。本明細書で使用される「捕捉プローブ」とは、１〜２００ｂｐ、好ましくは５〜５０ｂｐ、より好ましくは１０〜２０ｂｐの長さを有するオリゴヌクレオチドを指す。捕捉プローブは、試料中の目的の核酸配列に相補的な配列を有する。いくつかの実施形態では、同一の捕捉プローブが第１のプレートの表面上に固定化される。いくつかの他の実施形態では、異なる塩基対組成を有する異なる捕捉プローブが、第１のプレートの表面上に固定化される。捕捉プローブは、ＤＮＡ、またはＲＮＡ、またはその両方であり得るが、一本鎖ＤＮＡであることが好ましい。本明細書で使用される「固定化する」とは、プレート表面上に捕捉プローブを固着するプロセスを指す。いくつかの実施形態では、捕捉プローブは共有結合を介して固着され、例えば、プレート表面上のコーティングを容易にするために、捕捉プローブの５’または３’末端のいずれかが修飾される。一般的に使用される３’末端修飾としては、チオール、ジチオール、アミン、ビオチンなどが挙げられるが、これらに限定されない。いくつかの他の実施形態では、捕捉プローブは、基板表面上に受動的に吸収され得る。
【０１６４】
捕捉プローブを用いて固定化した後、プレート表面をブロッカー溶液で遮断する。適切なブロッカーには、６−メルカプトヘキサノール、ウシ血清アルブミンなどが含まれるが、これらに限定されない。
【０１６５】
図８のステップ（ｂ）に示されるように、「試料」は、全血、血漿、血清、尿、唾液、および汗などのヒト体液、ならびに細胞培養物（哺乳類、植物、細菌、真菌）が挙げられるがこれらに限定されない試料を含有するか、または含有しない任意の核酸であってもよい。試料は、新たに取得するか、または任意の所望の方法もしくは便利な方法で、例えば、希釈により、あるいは緩衝液もしくは他の溶液もしくは溶媒を加えることにより、保管もしくは処理され得る。試料には、ヒト細胞、動物細胞、植物細胞、細菌細胞、真菌細胞、およびウイルス粒子などの細胞構造が存在し得る。
【０１６６】
試料は、必要に応じて、第１のプレートもしくは第２のプレートのいずれか、またはその両方にも、導入することができる。本明細書の図８は、試料を第１のプレートの内表面上に導入する一例を提供する。
【０１６７】
より詳細には、ステップ（ｃ）において、第２のプレート（ＱＭＡＸカード１）を、試料と接触している第１のプレート（基板）の内表面へ押圧し、デバイスの閉鎖構成を形成する。核酸増幅に必要な試薬１は、第１もしくは第２のプレートまたはその両方の内表面上の乾燥形態、または例えばパラフィンなどの温度が増加すると融解する材料で覆われた、それに埋め込まれた、もしくはそれで包まれた液体形態のいずれかであり得る。
【０１６８】
より詳細には、ステップ（ｄ）において、上記の試料と接触した後、乾燥させた必要な試薬１が試料に溶解する。破壊された細胞構造から遊離した、または無細胞核酸として存在する、またはそれらの組み合わせのいずれかの目的の核酸は、プレート表面上の相補的な捕捉プローブにハイブリダイズする。ハイブリダイゼーションに使用される時間は、主にＱＭＡＸカード１の内表面上のスペーサの仕様によって異なる。いくつかの実施形態では、例えば、高さが３０μｍのスペーサを有するＱＭＡＸカード１が使用される場合、実験データは、２分後に、目的の核酸と固定化された捕捉プローブとの間のハイブリダイゼーションが平衡に達したことを示した。本明細書の図８（ｄ）で使用される場合、「ハイブリダイズされていない核酸」とは、固定化された捕捉プローブによって捕捉されていない核酸を指す。
【０１６９】
より具体的には、図８のステップ（ｅ）において、第２のプレート（ＱＭＡＸカード１）が第１のプレート（基板）から取り外され、第１のプレート（基板）の表面がスポンジを使用して洗浄される。本明細書で使用される「スポンジ」とは、異なる圧力下で孔径を変化させる柔軟な多孔質材料の種類を指す。洗浄緩衝液を含むスポンジは、汚染物質を除去するために、第１のプレート表面と接触する。いくつかの実施形態では、スポンジは、第１のプレート表面と１回接触する。いくつかの他の実施形態では、スポンジは、第１のプレート表面と２回または３回以上接触する。本明細書で使用される「汚染物質」とは、核酸増幅反応に弊害をもたらす細胞片、タンパク質、非特異的核酸などを含むがこれらに限定されない化合物を指す。
【０１７０】
より具体的には、図８のステップ（ｆ）において、第３のプレート（ＱＭＡＸカード２）は、試料と接触して第１のプレートの内表面へ押圧されて、デバイスの閉鎖構成を形成する。核酸増幅に必要な試薬２は、第１もしくは第３のプレートまたはその両方の内表面上の乾燥形態、または例えばパラフィンなどの温度が増加すると融解する材料で覆われた、それに埋め込まれた、もしくはそれで包まれた液体形態のいずれかであり得る。
【０１７１】
より具体的には、図８のステップ（ｇ）において、デバイスが閉鎖構成にあるとき、加熱源は、第１のプレートもしくは第３のプレートまたは両方の内表面または外表面上の加熱層へ電磁波を発射する。加熱層は、電磁波を吸収し、かつ前述の電磁波からのエネルギーの少なくとも実質的な部分を熱の形態に変換するように構成されており、その熱が閉鎖したチャンバ内の試料に伝達される。いくつかの実施形態では、加熱源は、周囲温度から９８℃までの範囲で前述の試料の温度を調節するようにプログラムされている。いくつかの実施形態では、例えば、従来のＰＣＲの場合、試料は最初に９８℃に加熱され、その後、９４℃、５０〜６５℃、および７２℃の繰り返しサイクルを１５〜４０回受ける。いくつかの実施形態では、例えば、等温増幅の場合、試料の温度は一定の温度に維持される。いくつかの実施形態では、例えば、ＬＡＭＰにより等温増幅を実行する場合、試料は、約１〜７０分間６０〜６５℃に加熱される。
【０１７２】
ＱＭＡＸのいくつかの実施形態では、プレートの一方または両方の試料接触領域は、ＣＯＦ後にどれだけのフローが発生したかをモニタリングするように構成された圧縮オープンフローモニタリング表面構造（ＭＳＳ）を含む。例えば、いくつかの実施形態では、ＭＳＳは、試料中の成分（例えば、血液中の血球）に摩擦を引き起こす浅い正方形のアレイを含む。試料のいくつかの成分の分布を確認することにより、ＣＯＦ下での試料およびその成分のフローに関連する情報を取得することができる。
【０１７３】
ＭＳＳの深さは、スペーサの高さの１／１０００、１／１００、１／１００、１／５、１／２またはいずれかの２つの値の範囲内であり、突起またはウェル形態のいずれかであり得る。
【０１７４】
多重化
図６は、本発明の別の実施形態の斜視図を示し、プレート上に複数の試料接触領域があり、これにより複数の試料の処理および分析が可能になる。図３のパネル（Ａ）および（Ｂ）に示されるように、本発明のサーマルサイクラーシステムは、試料ホルダー１００と熱制御ユニット２００とを備え、試料ホルダー１００は、第１のプレート１０と、複数の第２のプレート２０と、複数の間隔機構（図示せず）とを備え、熱制御ユニット２００は、加熱源２０２とコントローラ２０４とを備える。
【０１７５】
図６のパネル（Ａ）を参照すると、プレートのうちの一方または両方（例えば、第１のプレート１０）は、複数の試料接触領域（印は付けられていない）を備える。いくつかの実施形態では、プレートのうちの一方または両方（例えば、第１のプレート１０）は、複数の加熱層１１２を備える。図４のパネル（Ａ）は、開放構成にある試料ホルダー１００を示し、この構成では、第１のプレート１０および第２のプレート２０は、部分的または全体的に分離されており、プレートのうちの一方または両方の上の１つ以上の試料の付着を可能にする。開放構成では、第１のプレート１０と第２のプレート２０との間の間隔は間隔機構によって調整されない。
【０１７６】
図６のパネル（Ｂ）は、閉鎖構成にある試料ホルダー１００を示し、この構成では、２つのプレートの内表面は、互いに向かい合い、２つのプレート間の間隔１０２は、間隔機構（図示せず）によって調整される。１つ以上の試料をプレート上に付着させた場合、プレートは各試料を圧縮して層にするように構成され、層の厚さは間隔機構によって調整される。
【０１７７】
図６のパネル（Ｂ）に示されるように、複数の第２のプレート２０は、第１のプレート１０の一部を被覆するために使用される。例えば、各第２のプレート２０は、試料が付着した単一の試料接触領域を覆う。各試料接触領域に対して間隔機構が存在し、間隔機構は異なる高さを有し、各試料接触領域および各試料層の異なる厚さに対して異なる間隔１０２をもたらす。例えば、間隔機構は柱状のスペーサである。各試料接触領域は、均一な高さを有するスペーサのセットを有する。異なるスペーサのセットは同じまたは異なる高さを有し、異なる試料に対して同じまたは異なる試料層の厚さをもたらす。
【０１７８】
図６のパネル（Ａ）および（Ｂ）を参照すると、いくつかの実施形態では、コントローラ２０４は、電磁波２１０を第１のプレート１０（したがって加熱層１１２）へ発射するように加熱源２０２を誘導し、電磁波２１０は、加熱層１１２によって吸収され、熱に変換され、試料の温度の変化をもたらす。いくつかの実施形態では、複数の試料接触領域がある場合、複数の試料が処理および分析される。例えば、ある特定の実施形態では、試料の各々は、異なる成分を有する予め混合されたＰＣＲ反応媒体である。同じヌクレオチドを増幅するための、および／または同じもしくは異なる条件で異なるヌクレオチドを増幅するための異なる条件を試験するために、１つの試料ホルダー１００が使用される。
【０１７９】
例示的な実施形態
Ａ１．薄い流体試料層の温度を急速に変化させるためのデバイスであって、
第１のプレートと、第２のプレートと、加熱層とを備え、
ｉ．加熱層が、プレートのうちの一方の上にあり、
ｉｉ．プレートの各々が、そのそれぞれの表面上に、流体試料と接触するための試料接触領域を備え、
ｉｉｉ．プレートが、試料の温度を急速に変化させるための構成を有し、
ａ．試料接触領域が互いに向かい合い、かなり平行であり、
ｂ．接触領域間の平均間隔が２００ミクロン以下であり、
ｃ．２つのプレートが、試料の少なくとも一部を、非常に均一な厚さでかつプレートに対して実質的に停滞した層になるよう調整（または制限）し、
ｄ．加熱層が、均一な厚さの試料の少なくとも一部の近くにあり、
ｅ．試料の少なくとも一部および加熱層の領域が、均一な厚さよりも実質的に大きい、デバイス。
【０１８０】
Ａ２．加熱層が、ディスク結合ドットオンピラーアンテナ（ｄｉｓｋ−ｃｏｕｐｌｅｄ  ｄｏｔｓ−ｏｎ−ｐｉｌｌａｒ  ａｎｔｅｎｎａ）（Ｄ２ＰＡ）アレイ、シリコンサンドイッチ、グラフェン、裏材料、超格子、または他のプラズモン材料、その他それらの組み合わせを含む、実施形態Ａ１に記載のデバイス。
【０１８１】
Ａ３．加熱層が、カーボンもしくはブラックナノ構造またはそれらの組み合わせを含む、実施形態Ａ１に記載のデバイス。
【０１８２】
Ａ４．加熱層が、放射線エネルギーを吸収するように構成されている、実施形態Ａ１〜Ａ３のいずれかに記載のデバイス。
【０１８３】
Ａ５．加熱層が、放射線エネルギーを吸収した後、熱の形態でエネルギーを放射するように構成されている、実施形態Ａ１〜Ａ４のいずれかに記載のデバイス。
【０１８４】
Ａ６．加熱層が、試料層の下に、かつ試料層と直接接触して位置付けられている、実施形態Ａ１〜Ａ５のいずれかに記載のデバイス。
【０１８５】
Ａ７．加熱層が、電波、マイクロ波、赤外波、可視光、紫外波、Ｘ線、ガンマ線、および熱放射からなる群から選択される電磁波を吸収するように構成されている、実施形態Ａ１〜Ａ６のいずれかに記載のデバイス。
【０１８６】
Ａ８．プレートのうちの少なくとも１つが、加熱層が吸収する放射線を遮断しない、実施形態Ａ１〜Ａ７のいずれかに記載のデバイス。
【０１８７】
Ａ９．プレートのうちの一方または両方が、低い熱伝導率を有する、実施形態Ａ１〜Ａ８のいずれかに記載のデバイス。
【０１８８】
Ａ１０．試料層の均一な厚さが、プレートのうちの一方または両方に固定された１つ以上のスペーサによって調整される、実施形態Ａ１〜Ａ９のいずれかに記載のデバイス。
【０１８９】
Ａ１１．試料が、予混合されたポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）媒体である、実施形態Ａ１〜Ａ１０のいずれかに記載のデバイス。
【０１９０】
Ａ１２．デバイスが、所定のプログラムに従って試料の温度を変化させるためのＰＣＲアッセイを容易にするように構成されている、実施形態Ａ１１に記載のデバイス。
【０１９１】
Ａ１３．デバイスが、診断試験、健康管理、環境試験、および／または法医学的試験を実行するように構成されている、実施形態Ａ１〜Ａ１２のいずれかに記載のデバイス。
【０１９２】
Ａ１４．デバイスが、ＤＮＡ増幅、ＤＮＡ定量化、選択的ＤＮＡ単離、遺伝分析、組織適合検査、癌遺伝子同定、感染症試験、遺伝子指紋法、および／または父子鑑定を実行するように構成されている、実施形態Ａ１〜Ａ１３のいずれかに記載のデバイス。
【０１９３】
Ａ１５．試料層が、試料蒸発を低減するために横方向に密封されている、実施形態Ａ１〜Ａ１４のいずれかに記載のデバイス。
【０１９４】
Ｂ１．薄い流体試料層の温度を急速に変化させるためのシステムであって、
第１のプレートと、第２のプレートと、加熱層と、加熱源とを備え、
ｉ．加熱層が、プレートのうちの一方の上にあり、
ｉｉ．加熱源が、加熱層が顕著に吸収する電磁波を放射するように構成されており、
ｉｉｉ．プレートの各々が、そのそれぞれの表面上に、流体試料と接触するための試料接触領域を備え、
ｉｖ．プレートが、試料の温度を急速に変化させるための構成を有し、
ａ．試料接触領域が互いに向かい合い、かなり平行であり、
ｂ．接触領域間の平均間隔が２００μｍ以下であり、
ｃ．２つのプレートが、試料の少なくとも一部を、非常に均一な厚さでありかつプレートに対して実質的に停滞した層になるよう制限し、
ｄ．加熱層が、均一な厚さの試料の少なくとも一部の近くにあり、
ｅ．試料の少なくとも一部および加熱層の領域が、均一な厚さよりも実質的に大きい、システム。
【０１９５】
Ｂ２．加熱層が、ディスク結合ドットオンピラーアンテナ（Ｄ２ＰＡ）アレイ、シリコンサンドイッチ、グラフェン、超格子、または他のプラズモン材料、その他それらの組み合わせを含む、実施形態Ｂ１に記載のシステム。
【０１９６】
Ｂ３．加熱層が、カーボンもしくはブラックナノ構造またはそれらの組み合わせを含む、実施形態Ｂ１に記載のシステム。
【０１９７】
Ｂ４．加熱層が、加熱源からの電磁波の放射エネルギーの少なくとも８０％を吸収するように構成されている、実施形態Ｂ１〜Ｂ３のいずれかに記載のシステム。
【０１９８】
Ｂ５．加熱層が、放射線エネルギーを吸収した後、熱の形態でエネルギーを放射するように構成されている、実施形態Ｂ１〜Ｂ４のいずれかに記載のシステム。
【０１９９】
Ｂ６．加熱層が、試料層の下に、かつ試料層と直接接触して位置付けられている、実施形態Ｂ１〜Ｂ５のいずれかに記載のシステム。
【０２００】
Ｂ７．加熱層が、電波、マイクロ波、赤外波、可視光、紫外波、Ｘ線、ガンマ線、および熱放射からなる群から選択される電磁波を吸収するように構成されている、実施形態Ｂ１〜Ｂ６のいずれかに記載のシステム。
【０２０１】
Ｂ８．プレートのうちの少なくとも１つが、加熱源からの放射線を遮断しない、実施形態Ｂ１〜Ｂ７のいずれかに記載のシステム。
【０２０２】
Ｂ９．プレートのうちの一方または両方が、低い熱伝導率を有する、実施形態Ｂ１〜Ｂ８のいずれかに記載のシステム。
【０２０３】
Ｂ１０．試料層の均一な厚さが、プレートのうちの一方または両方に固定された１つ以上のスペーサによって調整される、実施形態Ｂ１〜Ｂ９のいずれかに記載のシステム。
【０２０４】
Ｂ１１．試料が、予混合されたポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）媒体である、実施形態Ｂ１〜Ｂ１０のいずれかに記載のシステム。
【０２０５】
Ｂ１２．システムが、所定のプログラムに従って試料の温度を変化させるためのＰＣＲアッセイを容易にするように構成されている、実施形態Ｂ１１に記載のシステム。
【０２０６】
Ｂ１３．システムが、診断試験、健康管理、環境試験、および／または法医学的試験を実行するように構成されている、実施形態Ｂ１〜Ｂ１２のいずれかに記載のシステム。
【０２０７】
Ｂ１４．システムが、ＤＮＢ増幅、ＤＮＢ定量化、選択的ＤＮＢ単離、遺伝分析、組織適合検査、癌遺伝子同定、感染症試験、遺伝子指紋法、および／または父子鑑定を実行するように構成されている、実施形態Ｂ１〜Ｂ１５のいずれかに記載のシステム。
【０２０８】
Ｂ１５．試料層が、試料蒸発を低減するために横方向に密封されている、実施形態Ｂ１〜Ｂ１４のいずれかに記載のシステム。
【０２０９】
Ｂ１６．電磁波の存在、強度、波長、周波数、および／または角度を制御するように構成されたコントローラをさらに備える、実施形態Ｂ１〜Ｂ１５のいずれかに記載のシステム。
【０２１０】
Ｂ１７．試料接触領域またはその近傍の温度を測定し、測定された温度に基づいてコントローラに信号を送信するように構成された温度計をさらに備える、実施形態Ｂ１〜Ｂ１６のいずれかに記載のシステム。
【０２１１】
Ｂ１８．温度計が、光ファイバ温度計、赤外線温度計、液晶温度計、高温計、水晶温度計、シリコンバンドギャップ温度センサ、温度ストリップ、サーミスタ、および熱電対からなる群から選択される、実施形態Ｂ１７に記載のシステム。
【０２１２】
Ｃ１．ポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）を、薄い流体ＰＣＲ試料層の温度を急速に変化させることにより容易にするためのシステムであって、
第１のプレートと、第２のプレートと、加熱層と、加熱源と、コントローラとを備え、
ｉ．加熱層が、プレートのうちの一方の上にあり、
ｉｉ．加熱源が、加熱層が顕著に吸収する電磁波を放射するように構成されており、
ｉｉｉ．プレートの各々が、そのそれぞれの表面上に、予め混合されたＰＣＲ媒体である流体ＰＣＲ試料と接触するための試料接触領域を備え、
ｉｖ．コントローラが、加熱源を制御し、所定のプログラムに従って試料の温度を急速に変化させるように構成されており、
ｖ．プレートが、試料の温度を急速に変化させるための構成を有し、
（ａ）試料接触領域が互いに向かい合い、かなり平行であり、
（ｂ）接触領域間の平均間隔が２００μｍ以下であり、
（ｃ）２つのプレートが、試料の少なくとも一部を、非常に均一な厚さでありかつプレートに対して実質的に停滞した層になるよう制限し、
（ｄ）加熱層が、均一な厚さの試料の少なくとも一部の近くにあり、
（ｅ）試料の少なくとも一部および加熱層の領域が、均一な厚さよりも実質的に大きい、システム。
【０２１３】
Ｃ２．コントローラが、加熱源からの電磁波の存在、強度、波長、周波数、および／または角度を制御するように構成されている、実施形態Ｃ１に記載のシステム。
【０２１４】
Ｃ３．加熱源および加熱層が、電磁波が少なくとも１０℃／秒の平均昇温速度傾斜を生じさせ、電磁波の除去が少なくとも５℃／秒の平均降温速度傾斜をもたらすように構成されている、実施形態Ｃ１またはＣ２に記載のシステム。
【０２１５】
Ｃ４．加熱源および加熱層が、少なくとも１０℃／秒の平均昇温速度傾斜および少なくとも５℃／秒の平均降温速度傾斜を生み出すように構成されている、実施形態Ｃ１〜Ｃ２のいずれかに記載のシステム。
【０２１６】
Ｃ５．加熱源および加熱層が、ＰＣＲ中に初期化ステップ、変性ステップ、および／または延伸／伸長ステップに到達するために少なくとも１０℃／秒の平均昇温速度傾斜を生み出し、ならびにＰＣＲ中にアニーリングステップおよび／または最終冷却ステップに到達するために少なくとも５℃／秒の平均降温速度傾斜を生み出すように構成されている、実施形態Ｃ１〜Ｃ２のいずれかに記載のシステム。
【０２１７】
Ｃ６．ＰＣＲ試料が、鋳型ＤＮＡ、プライマーＤＮＡ、カチオン、ポリメラーゼ、および緩衝剤を含む、実施形態Ｃ１〜Ｃ５のいずれかに記載のシステム。
【０２１８】
Ｄ１．薄い流体試料層の温度を急速に変化させるための方法であって、
ｉ．第１のプレートおよび第２のプレートを提供することであって、プレートの各々が、そのそれぞれの内表面上に、試料接触領域を備える、提供することと、
ｉｉ．加熱層および加熱源を提供することであって、加熱層が、プレートのうちの一方の上にあり、加熱源が、加熱層が顕著に吸収する電磁波を放射するように構成されている、提供することと、
ｉｉｉ．プレートの一方または両方の上に流体試料を付着させることと、
ｉｖ．プレートを閉鎖構成になるように押圧することであって、
（ａ）試料接触領域が互いに向かい合い、かなり平行であり、
（ｂ）接触領域間の平均間隔が２００μｍ以下であり、
（ｃ）２つのプレートが、試料の少なくとも一部を、非常に均一な厚さでありかつプレートに対して実質的に停滞した層になるよう制限し、
（ｄ）加熱層が、均一な厚さの試料の少なくとも一部の近くにあり、
（ｅ）試料の少なくとも一部および加熱層の領域が、均一な厚さよりも実質的に大きい、押圧することと、
ｖ．加熱源からの電磁波の存在、強度、波長、周波数、および／または角度を変化させることによって、試料層の温度を変化させ維持することとを含む、方法。
【０２１９】
Ｄ２．プレートを閉鎖形態になるように押圧するステップが、プレートを厳密でない押圧力で押圧することを含む、実施形態Ｄ１に記載の方法。
【０２２０】
Ｄ３．プレートを閉鎖形態になるように押圧するステップが、プレートを人間の手で直接押圧することを含む、実施形態Ｄ１またはＤ２に記載の方法。
【０２２１】
Ｄ４．非常に均一な厚さの層が、１０％未満の厚さの変動を有する、実施形態Ｄ１〜Ｄ３のいずれかに記載の方法。
【０２２２】
Ｄ５．加熱層が、ディスク結合ドットオンピラーアンテナ（Ｄ２ＰＡ）アレイ、シリコンサンドイッチ、グラフェン、超格子、または他のプラズモン材料、その他それらの組み合わせを含む、実施形態Ｄ１〜Ｄ４のいずれかに記載の方法。
【０２２３】
Ｄ６．加熱層が、カーボンもしくはブラックナノ構造またはそれらの組み合わせを含む、実施形態Ｄ１〜Ｄ５のいずれかに記載の方法。
【０２２４】
Ｄ７．加熱層が、加熱源からの電磁波の放射エネルギーの少なくとも８０％を吸収するように構成されている、実施形態Ｄ１〜Ｄ６のいずれかに記載の方法。
【０２２５】
Ｄ８．加熱層が、放射線エネルギーを吸収した後、熱の形態でエネルギーを放射するように構成されている、実施形態Ｄ１〜Ｄ７のいずれかに記載の方法。
【０２２６】
Ｄ９．加熱層が、試料層の下に、かつ試料層と直接接触して位置付けられている、実施形態Ｄ１〜Ｄ８のいずれかに記載の方法。
【０２２７】
Ｄ１０．加熱層が、電波、マイクロ波、赤外波、可視光、紫外波、Ｘ線、ガンマ線、および熱放射からなる群から選択される電磁波を吸収するように構成されている、実施形態Ｄ１〜Ｄ９のいずれかに記載の方法。
【０２２８】
Ｄ１１．プレートのうちの少なくとも１つが、加熱源からの放射線を遮断しない、実施形態Ｄ１〜Ｄ１０のいずれかに記載の方法。
【０２２９】
Ｄ１２．プレートのうちの一方または両方が、低い熱伝導率を有する、実施形態Ｄ１〜Ｄ１１のいずれかに記載の方法。
【０２３０】
Ｄ１３．試料層の均一な厚さが、プレートのうちの一方または両方に固定された１つ以上のスペーサによって調整される、実施形態Ｄ１〜Ｄ１２のいずれかに記載の方法。
【０２３１】
Ｄ１４．試料が、予混合されたポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）媒体である、実施形態Ｄ１〜Ｄ１３のいずれかに記載の方法。
【０２３２】
Ｄ１５．方法が、所定のプログラムに従って試料の温度を変化させるためのＰＣＲアッセイを容易にするために使用される、実施形態Ｄ１４に記載の方法。
【０２３３】
Ｄ１６．方法が、診断試験、健康管理、環境試験、および／または法医学的試験を実行するために使用される、実施形態Ｄ１〜Ｄ１５のいずれかに記載の方法。
【０２３４】
Ｄ１７．方法が、ＤＮＢ増幅、ＤＮＢ定量化、選択的ＤＮＢ単離、遺伝分析、組織適合検査、癌遺伝子同定、感染症試験、遺伝子指紋法、および／または父子鑑定を実行するために使用される、実施形態Ｄ１〜Ｄ１６のいずれかに記載の方法。
【０２３５】
Ｄ１８．試料層が、試料蒸発を低減するために横方向に密封されている、実施形態Ｄ１〜Ｄ１７のいずれかに記載の方法。
【０２３６】
Ｄ１９．加熱源が、電磁波の存在、強度、波長、周波数、および／または角度を制御するように構成されたコントローラによって制御される、実施形態Ｄ１〜Ｄ１８のいずれかに記載の方法。
【０２３７】
Ｄ２０．コントローラが、温度計から信号を受信するように構成されており、温度計が、試料接触領域またはその近傍の温度を測定し、測定された温度に基づいてコントローラに信号を送信するように構成されている、実施形態Ｄ１〜Ｄ１９のいずれかに記載の方法。
【０２３８】
Ｄ２１．温度計が、光ファイバ温度計、赤外線温度計、液晶温度計、高温計、水晶温度計、シリコンバンドギャップ温度センサ、温度ストリップ、サーミスタ、および熱電対からなる群から選択される、実施形態Ｄ２０に記載の方法。
【０２３９】
Ｅ１．ポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）を、流体ＰＣＲ試料の温度を急速に変化させることにより容易にするための方法であって、
ｉ．第１のプレートおよび第２のプレートを提供することであって、プレートの各々が、そのそれぞれの内表面上に、試料接触領域を備える、提供することと、
ｉｉ．加熱層、加熱源、およびコントローラを提供することであって、加熱層が、プレートのうちの一方の上にあり、加熱源が、加熱層が顕著に吸収する電磁波を放射するように構成されている、提供することと、
ｉｉｉ．プレートの一方または両方の上に流体ＰＣＲ試料を付着させることと、
ｉｖ．プレートを閉鎖構成になるように押圧することであって、
（ａ）試料接触領域が互いに向かい合い、かなり平行であり、
（ｂ）接触領域間の平均間隔が２００μｍ以下であり、
（ｃ）２つのプレートが、ＰＣＲ試料の少なくとも一部を、非常に均一な厚さでありかつプレートに対して実質的に停滞した層になるよう制限し、
（ｄ）加熱層が、均一な厚さのＰＣＲ試料の少なくとも一部の近くにあり、
（ｅ）試料の少なくとも一部および加熱層の領域が、均一な厚さよりも実質的に大きい、押圧することと、
ｖ．所定のプログラムに従ってＰＣＲ試料層の温度を変化させ維持することによってＰＣＲを実行するために、コントローラを使用して加熱源を制御することであって、温度を変化させるとき、加熱源が、ＰＣＲ中に少なくとも１０℃／秒の平均昇温速度傾斜および少なくとも５℃／秒の平均降温速度傾斜を生み出す、制御することとを含む、方法。
【０２４０】
Ｅ２．ＰＣＲ試料層の温度を変化させ維持することが、加熱源からの電磁波の強度、波長、周波数、および／または角度を調節することによって達成される、実施形態Ｅ１に記載の方法。
【０２４１】
Ｅ３．加熱源および加熱層が、ＰＣＲ中に初期化ステップ、変性ステップ、および／または延伸／伸長ステップに到達するために少なくとも１０℃／秒の平均昇温速度傾斜を生み出し、ならびにＰＣＲ中にアニーリングステップおよび／または最終冷却ステップに到達するために少なくとも５℃／秒の平均降温速度傾斜を生み出すように構成されている、実施形態Ｅ１〜Ｅ２のいずれかに記載のシステム。
【０２４２】
Ｅ４．ＰＣＲ試料が、鋳型ＤＮＡ、プライマーＤＮＡ、カチオン、ポリメラーゼ、および緩衝剤を含む、実施形態Ｅ１〜Ｅ３のいずれかに記載の方法。
【０２４３】
ＮＮ１  薄い流体試料層の温度を急速に変化させるためのデバイスであって、
第１のプレートと、第２のプレートとを備え、
ｉ．プレートの各々が、そのそれぞれの表面上に、流体試料と接触するための試料接触領域を備え、
ｉｉ．プレートが、試料の温度を急速に変化させるための構成を有し、
ａ．試料接触領域が互いに向かい合い、かなり平行であり、
ｂ．接触領域間の平均間隔が２００ミクロン以下であり、
ｃ．２つのプレートが、試料の少なくとも一部を、非常に均一な厚さでありかつプレートに対して実質的に停滞した層になるよう調整（または制限）し、
ｄ．加熱層が、均一な厚さの試料の少なくとも一部の近くにあり、
ｅ．試料の少なくとも一部および加熱層の領域が、均一な厚さよりも実質的に大きい、デバイス。
【０２４４】
追加の例示的な実施形態
１．試料温度を急速に変化させるためのデバイス
ＡＡ１  流体試料温度を急速に変化させるためのデバイスであって、
第１のプレートと、第２のプレートと、加熱層とを備え、
ｉｖ．プレートが、異なる構成になるように互いに対して移動可能であり、
ｖ．プレートの各々が、そのそれぞれの内表面上に、流体試料と接触するための試料接触領域を有し、
ｖｉ．加熱層が、流体試料を加熱するように構成されており、
加熱層は、（ａ）プレートのうちの一方の上（内表面もしくは外表面のいずれかの上）またはプレートのうちの一方の内側にあり、（ｂ）加熱源によって加熱することが可能であり、加熱源は、光学的に、電気的に、無線周波数（ＲＦ）放射によって、またはそれらの組み合わせによって、加熱層に熱エネルギーを送達し、
加熱層の加熱領域の少なくとも一部が、試料領域と重なり合い、
構成のうちの１つが、２つのプレートが部分的または完全に分離されており、プレート間の平均間隔が少なくとも３００μｍである、開放構成であり、
構成のうちの別の構成が、開放構成において流体試料を試料接触領域のうちの一方または両方の上に付着させた後に構成される閉鎖構成であり、閉鎖構成では、試料の少なくとも一部が、２つのプレートによって圧縮されて層になり、平均試料厚さが２００μｍ以下である、デバイス。
【０２４５】
ＡＡ２．１  流体試料の温度を急速に変化させるためのデバイスであって、
試料ホルダーと、加熱層とを備え、
ｉｖ．試料ホルダーが、第１のプレートと第２のプレートとを備え、プレートの各々が、そのそれぞれの表面上に、流体試料と接触するための試料接触領域を備え、
ｖ．第１のプレートおよび第２のプレートが、流体試料を、０．１〜２００μｍの非常に均一な厚さでありかつプレートに対して実質的に停滞した層になるよう制限するように構成されており、
ｖｉ．加熱層が、（１）１ｍｍ未満の厚さを有し、（２）第１のプレートまたは第２のプレートのいずれかの面積よりも実質的に小さい面積を有し、かつ（３）電磁波からのエネルギーを熱に変換して、均一な厚さの層内の流体試料の少なくとも一部の温度を上昇させるように構成されている、デバイス。
【０２４６】
ＡＡ２．２  流体試料の温度を急速に変化させるためのデバイスであって、
試料ホルダーと、加熱層とを備え、
ｉ．試料ホルダーが、第１のプレートと第２のプレートとを備え、プレートの各々が、そのそれぞれの表面上に、流体試料と接触するための試料接触領域を備え、
ｉｉ．第１のプレートおよび第２のプレートが、試料の少なくとも一部を、０．１〜２００μｍの非常に均一な厚さでありかつプレートに対して実質的に停滞した層になるよう制限するように構成されており、
ｉｉｉ．第１のプレートが、５００μｍ以下の厚さを有し、第２のプレートが、５ｍｍ以下の厚さを有し、
ｉｖ．加熱層が、１ｍｍ未満の厚さおよび１００ｍｍ２未満の面積を有し、電磁波からのエネルギーを熱に変換して、均一な厚さの層内の流体試料の少なくとも一部の温度を上昇させるように構成されている、デバイス。
【０２４７】
ＡＡ２．３  流体試料の温度を急速に変化させるためのデバイスであって、
試料ホルダーと、加熱層とを備え、
ｉ．試料ホルダーが、第１のプレートと第２のプレートとを備え、プレートの各々が、そのそれぞれの表面上に、流体試料と接触するための試料接触領域を備え、
ｉｉ．第１のプレートおよび第２のプレートが、試料の少なくとも一部を、０．１〜２００μｍの非常に均一な厚さでありかつプレートに対して実質的に停滞した層になるよう制限するように構成されており、
ｉｉｉ．第１のプレートが、５００μｍ以下の厚さを有し、第２のプレートが、５ｍｍ以下の厚さを有し、
ｉｖ．加熱層が、（１）１ｍｍ未満の厚さを有し、（２）第１プレートまたは第２プレートのいずれかの面積よりも実質的に小さい１００ｍｍ２未満の面積を有し、かつ（３）電磁波からのエネルギーを熱に変換して、均一な厚さの層内の流体試料の少なくとも一部の温度を上昇させるように構成されている、デバイス。
【０２４８】
ＡＡ３  流体試料の温度を急速に変化させるためのデバイスであって、
試料ホルダーと、加熱層とを備え、
ｉ．試料ホルダーが、第１のプレートと第２のプレートとを備え、プレートの各々が、そのそれぞれの表面上に、流体試料と接触するための試料接触領域を備え、
ｉｉ．第１のプレートおよび第２のプレートが、試料の少なくとも一部を、５００μｍ以下の非常に均一な厚さでありかつプレートに対して実質的に停滞した層になるよう制限するように構成されており、
ｉｉｉ．第１のプレートが、加熱層と接触しており、１μｍ以下の厚さを有し、第２のプレートが、加熱層と接触しておらず、５ｍｍ以下の厚さを有し、
ｉｖ．加熱層が、電磁波からのエネルギーを熱に変換して、均一な厚さの層内の流体試料の少なくとも一部の温度を上昇させるように構成されており、５０％以上の吸収係数を有し、３ｍｍ未満の厚さを有する、デバイス。
【０２４９】
ＡＡ４  流体試料の温度を急速に変化させるためのデバイスであって、
試料ホルダーと、加熱層とを備え、
ｉ．試料ホルダーが、第１のプレートと第２のプレートとを備え、プレートの各々が、そのそれぞれの表面上に、流体試料と接触するための試料接触領域を備え、
ｉｉ．第１のプレートおよび第２のプレートが、試料の少なくとも一部を、５００μｍ以下の非常に均一な厚さでありかつプレートに対して実質的に停滞した層になるよう制限するように構成されており、
ｉｉｉ．第１のプレートが、加熱層と接触しており、１μｍ以下の厚さを有し、第２のプレートが、加熱層と接触しておらず、０．１〜２ｍｍの厚さを有し、
ｉｖ．加熱層が、電磁波からのエネルギーを熱に変換して、均一な厚さの層内の流体試料の少なくとも一部の温度を上昇させるように構成されており、６０％以上の吸収係数を有し、２ｍｍ未満の厚さを有する、デバイス。
【０２５０】
ＡＡ５  流体試料の温度を急速に変化させるためのデバイスであって、
試料ホルダーと、加熱層とを備え、
ｉ．試料ホルダーが、第１のプレートと第２のプレートとを備え、プレートの各々が、そのそれぞれの表面上に、流体試料と接触するための試料接触領域を備え、
ｉｉ．第１のプレートおよび第２のプレートが、試料の少なくとも一部を、５００μｍ以下の非常に均一な厚さでありかつプレートに対して実質的に停滞した層になるよう制限するように構成されており、
ｉｉｉ．第１のプレートが、加熱層と接触しており、１００μｍ以下の厚さを有し、第２のプレートが、加熱層と接触しておらず、０．１〜２ｍｍの厚さを有し、
ｉｖ．加熱層が、電磁波からのエネルギーを熱に変換して、均一な厚さの層内の流体試料の少なくとも一部の温度を上昇させるように構成されており、７０％以上の吸収係数を有し、２ｍｍ未満の厚さを有する、デバイス。
【０２５１】
ＡＡ６．１  加熱層が、プレートのうちの一方の内表面上にある、先行するＡＡ実施形態のいずれかに記載のデバイス。
【０２５２】
ＡＡ６．２  加熱層が、プレートのうちの一方の外表面上にある、先行するＡＡ実施形態のいずれかに記載のデバイス。
【０２５３】
ＡＡ６．３  加熱層が、プレートのうちの一方の内側にある、先行するＡＡ実施形態のいずれかに記載のデバイス。
【０２５４】
ＡＡ６．４  加熱層が、プレートのうちの少なくとも１つと接触している、先行するＡＡ実施形態のいずれかに記載のデバイス。
【０２５５】
ＡＡ６．５  加熱層が、プレートのうちのいずれとも接触していない、先行するＡＡ実施形態のいずれかに記載のデバイス。
【０２５６】
ＡＡ６．６  プレートが閉鎖構成にあるとき、加熱層が試料と接触している、先行するＡＡ実施形態のいずれかに記載のデバイス。
【０２５７】
ＡＡ７．加熱層が、単一の材料または複合材料から作られている、先行するＡＡ実施形態のいずれかに記載のデバイス。
【０２５８】
ＡＡ７．１  加熱層が、高吸収表面を有する半導体または金属材料を含む、先行するＡＡ実施形態のいずれかに記載のデバイス。
【０２５９】
ＡＡ７．２  加熱層が、シリコン、Ｇｅ、ＩｎＰ、ＧａＡｓ、ＣｄＴｅ、ＣｄＳ、ａＳｉ、金属（Ａｕ、Ａｌ、Ａｇ、Ｔｉを含む）、炭素被覆Ａｌ、黒色塗装Ａｌ、炭素（グラフェン、ナノチューブ、ナノワイヤ）、またはそれらの組み合わせを含む、先行するＡＡ実施形態のいずれかに記載のデバイス。
【０２６０】
ＡＡ７．３  高速加熱導電層がシリコン、Ｇｅ、ＩｎＰ、ＧａＡｓ、ＣｄＴｅ、ＣｄＳ、ａＳｉ、金属（Ａｕ、Ａｌ、Ａｇ、Ｔｉを含む）、炭素被覆Ａｌ、黒色塗装Ａｌ、炭素（グラフェン、ナノチューブ、ナノワイヤ）、またはそれらの組み合わせを含む場合に、加熱層が作用している、先行するＡＡ実施形態のいずれかに記載のデバイス。
【０２６１】
ＡＡ８  試料領域と重なる加熱領域の部分が、試料領域の１％未満、５％、１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、９０％、９５％、もしくは９９％、またはそれらの２つの値のうちのいずれかの間の範囲内である、先行するＡＡ実施形態のいずれかに記載のデバイス。
【０２６２】
ＡＡ８．１  試料領域と重なる加熱領域の部分が、０．１ｍｍ２未満、０．５ｍｍ２、１ｍｍ２、５ｍｍ２、１０ｍｍ２、２５ｍｍ２、５０ｍｍ２、７５ｍｍ２、１ｃｍ２（平方センチメートル）、２ｃｍ２、３ｃｍ２、４ｃｍ２、５ｃｍ２、１０ｃｍ２、またはそれらの２つの値のうちのいずれかの間の範囲内である、先行するＡＡ実施形態のいずれかに記載のデバイス。
【０２６３】
ＡＡ９．加熱層の吸収係数が、３０％超、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、９０％、またはそれらの２つの値のうちのいずれかの間の範囲内である、先行するＡＡ実施形態のいずれかに記載のデバイス。
【０２６４】
ＡＡ９．１．加熱層の吸収係数が、６０％超、７０％、８０％、９０％、またはそれらの２つの値のうちのいずれかの間の範囲内である、先行するＡＡ実施形態のいずれかに記載のデバイス。
【０２６５】
ＡＡ９．２．加熱層の吸収係数が、６０％を超える、先行するＡＡ実施形態のいずれかに記載のデバイス。
【０２６６】
ＡＡ１０．加熱層が、１００ｎｍ〜３００ｎｍ、４００ｎｍ〜７００ｎｍ（可視範囲）、７００ｎｍ〜１０００ｎｍ（ＩＲ範囲）、１μｍ〜１０μｍ、１０μｍ〜１００μｍ、またはそれらの２つの値のうちのいずれかの間の範囲内の吸収波長範囲を有する、先行するＡＡ実施形態のいずれかに記載のデバイス。
【０２６７】
ＡＡ１１．加熱層が、３ｍｍ以下、２ｍｍ、１ｍｍ、７５０μｍ、５００μｍ、２５０μｍ、１００μｍ、５０μｍ、２５μｍ、１０μｍ、５００ｎｍ、２００ｎｍ、１００ｎｍ、もしくは５０ｎｍ、またはそれらの２つの値のうちのいずれかの間の範囲内の厚さを有する、先行するＡＡ実施形態のいずれかに記載のデバイス。
【０２６８】
ＡＡ１２．加熱層が、０．１ｍｍ２以下、１ｍｍ２以下、１０ｍｍ２以下、２５ｍｍ２以下、５０ｍｍ２以下、７５ｍｍ２以下、１ｃｍ２（平方センチメートル）以下、２ｃｍ２以下、３ｃｍ２以下、４ｃｍ２以下、５ｃｍ２以下、１０ｃｍ２以下、またはそれらの２つの値のうちのいずれかの間の範囲内の面積を有する、先行するＡＡ実施形態のいずれかに記載のデバイス。
【０２６９】
ＡＡ１３．第１のプレートが、５００μｍ以下、２００μｍ、１００μｍ、５０μｍ、２５μｍ、１０μｍ、５μｍ、２．５μｍ、１μｍ、５００ｎｍ、４００ｎｍ、３００ｎｍ、２００ｎｍ、もしくは１００ｎｍ、またはそれらの２つの値のうちのいずれかの間の範囲内の厚さを有する、先行するＡＡ実施形態のいずれかに記載のデバイス。
【０２７０】
ＡＡ１３．１．第１のプレートが、１０〜２００μｍに等しい厚さを有する、先行するＡＡ実施形態のいずれかに記載のデバイス。
【０２７１】
ＡＡ１４．第２のプレートが、５ｍｍ以下、４ｍｍ、３ｍｍ、２ｍｍ、１ｍｍ、７５０μｍ、５００μｍ、２５０μｍ、１００μｍ、７５μｍ、５０μｍ、もしくは２５μｍ、またはそれらの２つの値のうちのいずれかの間の範囲内の厚さを有する、先行するＡＡ実施形態のいずれかに記載のデバイス。
【０２７２】
ＡＡ１４．１．第２のプレートが、１０〜１０００μｍに等しい厚さを有する、先行するＡＡ実施形態のいずれかに記載のデバイス。
【０２７３】
ＡＡ１５．試料層が、非常に均一な厚さを有する、先行するＡＡ実施形態のいずれかに記載のデバイス。
【０２７４】
ＡＡ１５．１  試料層が、１００μｍ以下、５０μｍ、２０μｍ、１０μｍ、５μｍ、１μｍ、５００ｎｍ、４００ｎｍ、３００ｎｍ、２００ｎｍ、もしくは１００ｎｍ、またはそれらの２つの値のうちのいずれかの間の範囲内の厚さを有する、先行するＡＡ実施形態のいずれかに記載のデバイス。
【０２７５】
ＡＡ１５．２．試料層が、１〜１００μｍの厚さを有する、先行するＡＡ実施形態のいずれかに記載のデバイス。
【０２７６】
ＡＡ１６．プレートのうちの少なくとも１つの面積が、１ｍｍ２以下、１０ｍｍ２以下、２５ｍｍ２以下、５０ｍｍ２以下、７５ｍｍ２以下、１ｃｍ２（平方センチメートル）以下、２ｃｍ２以下、３ｃｍ２以下、４ｃｍ２以下、５ｃｍ２以下、１０ｃｍ２以下、１００ｃｍ２以下、５００ｃｍ２以下、１０００ｃｍ２以下、５０００ｃｍ２以下、１０，０００ｃｍ２以下、１０，０００ｃｍ２以下、またはこれらの値のうちのいずれか２つの間の範囲内である、先行するＡＡ実施形態のいずれかに記載のデバイス。
【０２７７】
ＡＡ１７．１  プレートのうちの少なくとも１つの面積が、５００〜１０００ｍｍ２の範囲内、または約７５０ｍｍ２である、先行するＡＡ実施形態のいずれかに記載のデバイス。
【０２７８】
ＡＡ１８．試料層の厚さを調整するように構成されたスペーサをさらに備える、先行するＡＡ実施形態のいずれかに記載のデバイス。
【０２７９】
ＡＡ１８．１  スペーサが、プレートのうちの一方または両方のいずれかの上に固定されている、先行するＡＡ実施形態のいずれかに記載のデバイス。
【０２８０】
ＡＡ１８．２  スペーサが、プレートのうちの一方または両方のいずれかの内表面上に固定されている、先行するＡＡ実施形態のいずれかに記載のデバイス。
【０２８１】
ＡＡ１８．３  スペーサが、均一な高さを有する、先行するＡＡ実施形態のいずれかに記載のデバイス。
【０２８２】
ＡＡ１８．４  スペーサのうちの少なくとも１つが、試料接触領域内にある、先行するＡＡ実施形態のいずれかに記載のデバイス。
【０２８３】
ＡＡ１８．５  試料層の厚さが、スペーサの高さと同じである、先行するＡＡ実施形態のいずれかに記載のデバイス。
【０２８４】
ＡＡ１９  一方または両方のプレートが可撓性である、先行するＡＡ実施形態のいずれかに記載のデバイス。
【０２８５】
ＡＡ２０．接触プレートおよび第２のプレートのうちの一方または両方のいずれかに取り付けられた密封構造をさらに備え、密封構造が、デバイス内の液体の蒸発を制限するように構成されている、先行するＡＡ実施形態のいずれかに記載のデバイス。
【０２８６】
ＡＡ２１．第１および第２のプレートのうちの一方または両方のいずれかに取り付けられたクランプ構造をさらに備え、クランプ構造が、デバイスの加熱中にデバイスを保持し、試料層の厚さを調整するように構成されている、先行するＡＡ実施形態のいずれかに記載のデバイス。
【０２８７】
ＡＡ２２  第２のプレートが、試料からの電磁波に対して透過性である、先行するＡＡ実施形態のいずれかに記載のデバイス。
【０２８８】
ＡＡ２３．試料ホルダーおよび加熱層が、熱カプラーによって接続されている、先行するＡＡ実施形態のいずれかに記載のデバイス。
【０２８９】
ＡＡ２４．試料の少なくとも一部および加熱層の領域が、均一な厚さよりも実質的に大きい、先行するＡＡ実施形態のいずれかに記載のデバイス。
【０２９０】
ＡＡ２５．加熱層が、電波、マイクロ波、赤外波、可視光、紫外波、Ｘ線、ガンマ線、および熱放射からなる群から選択される電磁波を吸収するように構成されている、先行するＡＡ実施形態のいずれかに記載のデバイス。
【０２９１】
ＡＡ２６．試料が、予混合されたポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）媒体である、先行するＡＡ実施形態のいずれかに記載のデバイス。
【０２９２】
ＡＡ２７．料層が、試料蒸発を低減するために横方向に密封されている、先行するＡＡ実施形態のいずれかに記載のデバイス。
【０２９３】
ＡＡ２８．放射線の面積が、放射線吸収パッドの面積よりも小さく、放射線吸収パッドの面積が、試料液体面積よりも小さく、試料液体の面積が、第１および第２のプレートサイズよりも小さい、先行するＡＡ実施形態のいずれかに記載のデバイス。
【０２９４】
ＡＡ２９．流体試料が、処理済みまたは未処理の体液を含む、先行するＡＡ実施形態のいずれかに記載のデバイス。
【０２９５】
ＡＡ３０．流体試料が、羊水、房水、硝子体液、血液（例えば、全血、分画血液、血漿、血清など）、母乳、脳脊髄液（ＣＳＦ）、耳垢（ｃｅｒｕｍｅｎ）（耳垢（ｅａｒｗａｘ））、乳糜、糜汁、内リンパ液、外リンパ液、糞便、胃酸、胃液、リンパ液、粘液（鼻漏および痰を含む）、心膜液、腹膜液、胸膜液、膿、粘膜の分泌物、唾、皮脂（皮膚の油）、精液、唾液、汗、関節液、涙、嘔吐物、尿、および呼気凝縮液を含む、先行するＡＡ実施形態のいずれかに記載のデバイス。いくつかの実施形態では、試料は、ヒト体液を含む。いくつかの実施形態では、試料は、細胞、組織、体液、排泄物、羊水、房水、硝子体液、血液、全血、分画血液、血漿、血清、母乳、脳脊髄液、耳垢、乳糜、糜汁、内リンパ液、外リンパ液、糞便、胃酸、胃液、リンパ液、粘液、鼻漏、痰、心膜液、腹膜液、胸膜液、膿、粘膜の分泌物、唾、皮脂、精液、唾液、汗、関節液、涙、嘔吐物、尿、もしくは呼気凝縮液、またはそれらの混合物のうちの少なくとも１つを含む。
【０２９６】
ＡＡ３１．流体試料が、核酸もしくはタンパク質、またはそれらの混合物を含む、先行するＡＡ実施形態のいずれかに記載のデバイス。
【０２９７】
ＡＡ３２．流体試料が、ＤＮＡもしくはＲＮＡ、またはそれらの混合物を含む、先行するＡＡ実施形態のいずれかに記載のデバイス。
【０２９８】
２．加熱源を備えた装置
ＢＢ１．流体試料の温度を急速に変化させるための装置であって、
ｉ．ＡＡ実施形態のいずれかに記載のデバイスを保持することができるホルダーと、
ｉｉ．加熱層にエネルギーを供給するように構成された加熱源と、
ｉｉｉ．加熱源を制御するように構成されたコントローラとを備える、装置。
【０２９９】
ＢＢ１．１  加熱源は、加熱層が５０％以上の吸収係数を有する波長範囲の電磁波を放射するように構成されている、先行するＢＢ実施形態のいずれかに記載の装置。
【０３００】
ＢＢ２．加熱源が、発光ダイオード（ＬＥＤ）の１つもしくはアレイ、レーザーの１つもしくはアレイ、ランプの１つもしくはアレイ、またはそれらの組み合わせを含む、先行するＢＢ実施形態のいずれかに記載の装置。
【０３０１】
ＢＢ２．１．加熱源が、ハロゲンランプ、反射体付きハロゲンランプ、集束レンズ付きＬＥＤ、集束レンズ付きレーザー、結合光ファイバ付きハロゲンランプ、結合光ファイバ付きＬＥＤ、結合光ファイバ付きレーザーを含む、先行するＢＢ実施形態のいずれかに記載の装置。
【０３０２】
ＢＢ３．波長が、５０ｎｍ、１００ｎｍ、１５０ｎｍ、２００ｎｍ、２５０ｎｍ、３００ｎｍ、３５０ｎｍ、４００ｎｍ、４５０ｎｍ、５００ｎｍ、５５０ｎｍ、６００ｎｍ、６５０ｎｍ、７００ｎｍ、７５０ｎｍ、８００ｎｍ、８５０ｎｍ、９００ｎｍ、９５０ｎｍ、１μｍ、１０μｍ、２５μｍ、５０μｍ、７５μｍ、もしくは１００μｍ、またはそれらの２つの値のうちのいずれかの間の範囲内である、先行するＢＢ実施形態のいずれかに記載の装置。
【０３０３】
ＢＢ３．１．電磁波の波長が、１００ｎｍ〜３００ｎｍ、４００ｎｍ〜７００ｎｍ（可視範囲）、７００ｎｍ〜１０００ｎｍ（ＩＲ範囲）、１μｍ〜１０μｍ、１０μｍ〜１００μｍ、またはそれらの２つの値のうちのいずれかの間の範囲内である、先行するＢＢ実施形態のいずれかに記載の装置。
【０３０４】
ＢＢ４．試料ホルダーおよび／または加熱源から放射される熱の少なくとも一部を吸収するように構成されたヒートシンクをさらに備える、先行するＢＢ実施形態のいずれかに記載の装置。
【０３０５】
ＢＢ４．１  ヒートシンクが、デバイスを少なくとも部分的に封入するチャンバである、先行するＢＢ実施形態のいずれかに記載の装置。
【０３０６】
ＢＢ４．２．チャンバが、加熱源から加熱層への電磁波の通過を可能にするように構成された下部開口部と、試料の撮像を可能にするように構成された上部開口部とを備える、先行するＢＢ実施形態のいずれかに記載の装置。
【０３０７】
ＢＢ５．試料ホルダーが、光学的に、電気的に、ＲＦによって、またはそれらの組み合わせによって加熱される、先行するＢＢ実施形態のいずれかに記載の装置。
【０３０８】
ＢＢ６．流体試料の温度を急速に変化させるための装置であって、
ｉ．ＡＡ実施形態のいずれかに記載のデバイスと、
ｉｉ．試料ホルダーおよび／または加熱源から放射される熱の少なくとも一部を吸収するように構成されたヒートシンクとを備える、装置。
【０３０９】
ＢＢ７．ヒートシンクが、デバイスを少なくとも部分的に封入するチャンバであり、チャンバが、加熱源から加熱層への電磁波の通過を可能にするように構成された放射開口部と、試料の撮像を可能にするように構成された光学開口部とを備える、先行するＢＢ実施形態のいずれかに記載の装置。
【０３１０】
ＢＢ８．チャンバに取り付けられた冷却部材をさらに備え、冷却部材が、チャンバ内の温度を低下させるように構成されている、先行するＢＢ実施形態のいずれかに記載の装置。
【０３１１】
ＢＢ９．冷却部材がファンである、実施形態ＢＢ７に記載の装置。
【０３１２】
ＢＢ１０．冷却部材がペルチェクーラーである、実施形態ＢＢ７に記載の装置。
【０３１３】
ＢＢ１１．チャンバが、非反射性内面を有する、ＢＢ実施形態のいずれかに記載の装置。
【０３１４】
ＢＢ１１．１  チャンバが、黒色金属でできている内面を有する、ＢＢ実施形態のいずれかに記載の装置。
【０３１５】
ＢＢ１２．装置が、チャンバ壁と、吊り下げ式で熱伝導接触している（すなわち最小の熱伝導接触を有する）、ＢＢ実施形態のいずれかに記載の装置。
【０３１６】
３．試料からの光学信号を観察し、試料温度を急速に変化させるためのシステム
ＣＣ１．流体試料の温度を急速に変化させるためのシステムであって、
ｉ．ＡＡ実施形態のいずれかに記載のデバイスまたはＢＢ実施形態のいずれかに記載の装置と、
ｉｉ．デバイス上の試料からの信号を検知するように構成された信号センサとを備える、システム。
【０３１７】
ＣＣ２．信号センサが、流体試料を撮像するように構成された光学センサである、先行するＣＣ実施形態のいずれかに記載のシステム。
【０３１８】
ＣＣ２．１  光センサが、光検出器、カメラ、または流体試料の画像を取り込むことが可能なデバイスである、先行するＣＣ実施形態のいずれかに記載のシステム。
【０３１９】
ＣＣ３．信号センサが、デバイスからの電気信号を検出するように構成された電気センサである、先行するＣＣ実施形態のいずれかに記載のシステム。
【０３２０】
ＣＣ４  信号センサが、デバイスからの機械信号を検出するように構成された機械センサである、先行するＣＣ実施形態のいずれかに記載のシステム。
【０３２１】
ＣＣ５  信号センサが、試料中の分析物の量を監視するように構成されている、先行するＣＣ実施形態のいずれかに記載のシステム。
【０３２２】
ＣＣ６．信号センサが、チャンバの外側にあり、チャンバ上の光学開口部を通して試料からの光学信号を受信する、先行するＣＣ実施形態のいずれかに記載のシステム。
【０３２３】
ＣＣ７．加熱層に結合された熱カプラーをさらに備える、ＣＣ実施形態のいずれかに記載のシステム。
【０３２４】
ＣＣ８．加熱層の温度を監視するサーモスタットをさらに備える、先行するＣＣ実施形態のいずれかに記載のシステム。
【０３２５】
ＣＣ９．デバイス内の試料の温度の監視を容易にするように構成された温度監視色素をさらに備える、先行するＣＣ実施形態のいずれかに記載のシステム。
【０３２６】
ＣＣ９．１．温度監視色素が液体形態である、先行するＣＣ実施形態のいずれかに記載のシステム。
【０３２７】
ＣＣ９．２  温度監視色素が、ＬＤＳ  ６８８、ＬＤＳ  ６９８、ＬＤＳ  ９５０、ＬＤ  ３９０、ＬＤ  ４２３、ＬＤ  ４２５、もしくはＩＲ  １４４、またはそれらの組み合わせを含む、先行するＣＣ実施形態のいずれかに記載のシステム。
【０３２８】
４．様々な実施形態
ＤＤ１．先行する実施形態のいずれかに記載のデバイス、装置、またはシステムであって、
ｉ．プレートの両方のうちの一方の上に固定されたスペーサがあり、スペーサのうちの少なくとも１つが、試料接触領域内にあり、
ｉｉ．試料層が、０．１〜２００μｍの厚さを有し、
ｉｉｉ．第１のプレートが、加熱層と接触しており、５００μｍ以下の厚さを有し、第２のプレートが、加熱層と接触しておらず、５ｍｍ以下の厚さを有し、
ｉｖ．加熱層が、（１）１ｍｍ未満の厚さを有し、（２）第１プレートまたは第２プレートのいずれかの面積よりも実質的に小さい１００ｍｍ２未満の面積を有し、かつ（３）電磁波からのエネルギーを熱に変換して、均一な厚さの層内の流体試料の少なくとも一部の温度を上昇させるように構成されている、デバイス、装置、またはシステム。
【０３２９】
ＤＤ２．先行する実施形態のいずれかに記載のデバイス、装置、またはシステムであって、
ｉ．加熱層が、第１のプレートの内表面上にあり、プレートが閉鎖構成にあるときに試料と接触しており、
ｉｉ．加熱層がシリコンで作られており、
ｉｉｉ．試料ホルダーを封入するチャンバがあり、チャンバが、非反射性内面を有する、デバイス、装置、またはシステム。
【０３３０】
ＤＤ３．先行する実施形態のいずれかに記載のデバイス、装置、またはシステムであって、
ｉ．加熱層が５０％以上の吸収係数を有する波長範囲の電磁波を放射するように構成された加熱源があり、
ｉｉ．加熱源から加熱層への電磁波の通過を可能にするように構成された下部開口部と、試料の撮像を可能にするように構成された上部開口部とを備える、チャンバがあり、
ｉｉｉ．試料ホルダー内の流体試料の画像を取り込むように構成された光学センサがある、デバイス、装置、またはシステム。
【０３３１】
５．方法
ＥＥ１．流体試料の温度を急速に変化させるための方法であって、
ｉ．ＣＣ実施形態に記載のシステムを得ることと、
ｉｉ．試料ホルダー内に流体試料を付着させることと、
ｉｉｉ．第１のプレートおよび第２のプレートを押圧して、試料の少なくとも一部を圧縮して均一な厚さの層にすることと、
ｉｖ．加熱源からの電磁波の存在、強度、波長、周波数、および／または角度を変化させることによって、試料層の温度を変化させ維持することとを含む、方法。
【０３３２】
ＥＥ２．試料層の温度を変化させることが、温度を上昇させることまたは温度を低下させることを含む、先行するＥＥ実施形態のいずれかに記載の方法。
【０３３３】
ＥＥ３．光学センサを用いて試料層を撮像することをさらに含む、先行するＥＥ実施形態のいずれかに記載の方法。
【０３３４】
ＥＥ４．試料層の温度を監視することと、試料層の温度を変化させ維持するステップを調節することとをさらに含む、先行するＥＥ実施形態のいずれかに記載の方法。
【０３３５】
ＥＥ５．試料層の温度を変化させ維持するステップが、所定のプログラムに従って実行される、先行するＥＥ実施形態のいずれかに記載の方法。
【０３３６】
ＥＥ６．方法が、所定のプログラムに従って試料の温度を変化させるためのポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）アッセイを容易にするようにカスタマイズされる、先行するＥＥ実施形態のいずれかに記載の方法。
【０３３７】
ＥＥ７．試料中の分析物の量をリアルタイムで監視することをさらに含む、先行するＥＥ実施形態のいずれかに記載の方法。
【０３３８】
６．試料
ＦＦ１．試料が核酸を含む、先行する実施形態のいずれかに記載のデバイス、装置、システム、または方法。
【０３３９】
ＦＦ１．１．試料がＤＮＡを含む、先行する実施形態のいずれかに記載のデバイス、装置、システム、または方法。
【０３４０】
ＦＦ１．２  試料がＲＮＡを含む、先行する実施形態のいずれかに記載のデバイス、装置、システム、または方法。
【０３４１】
ＦＦ１．３  試料が、ＤＮＡもしくはＲＮＡ分子、またはＤＮＡ／ＲＮＡハイブリッド、またはＤＮＡおよび／もしくはＲＮＡの混合物を含む、先行する実施形態のいずれかに記載のデバイス、装置、システム、または方法。
【０３４２】
ＦＦ１．４  試料が、ゲノムもしくは染色体ＤＮＡ、プラスミドＤＮＡ、増幅ＤＮＡ、ｃＤＮＡ、全ＲＮＡ、ｍＲＮＡ、および小型ＲＮＡを含む、先行する実施形態のいずれかに記載のデバイス、装置、システム、または方法。
【０３４３】
ＦＦ１．５  試料が、天然ＤＮＡおよび／もしくはＲＮＡ分子、または合成ＤＮＡおよび／もしくはＲＮＡ分子を含む、先行する実施形態のいずれかに記載のデバイス、装置、システム、または方法。
【０３４４】
ＦＦ１．６  試料が無細胞核酸を含み、「無細胞」が、核酸がいかなる細胞構造にも含まれていないことを指す、先行する実施形態のいずれかに記載のデバイス、装置、システム、または方法。
【０３４５】
ＦＦ１．７  試料が、ヒト細胞、動物細胞、植物細胞、細菌細胞、真菌細胞、および／またはウイルス粒子が挙げられるがこれらに限定されない細胞構造内に含まれる核酸を含む、先行する実施形態のいずれかに記載のデバイス、装置、システム、または方法。
【０３４６】
ＦＦ１．８  試料が、精製された核酸を含む、先行する実施形態のいずれかに記載のデバイス、装置、システム、または方法。
【０３４７】
ＦＦ２  試料が、タンパク質および／または脂質を含む、先行する実施形態のいずれかに記載のデバイス、装置、システム、または方法。
【０３４８】
ＦＦ３．試料が、核酸増幅のために構成された試薬を含む、先行する実施形態のいずれかに記載のデバイス、装置、システム、または方法。
【０３４９】
ＦＦ３．１．試料が、予混合されたポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）媒体を含む、先行する実施形態のいずれかに記載のデバイス、装置、システム、または方法。
【０３５０】
ＦＦ３．２．試料が、試料中の標的分子を増幅する（その多数のコピーを生成する）ことによって核酸を検出するように構成された試薬を含み、標的分子が、目的の核酸の配列または部分配列を指す、先行する実施形態のいずれかに記載のデバイス、装置、システム、または方法。
【０３５１】
ＦＦ３．３．核酸増幅が、ホットスタートＰＣＲ、ネステッドＰＣＲ、タッチダウンＰＣＲ、逆転写ＰＣＲ、ＲＡＣＥ  ＰＣＲ、デジタルＰＣＲなどの種々のポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）方法、および例えばループ介在等温増幅（ＬＡＭＰ）、鎖置換増幅、ヘリカーゼ依存性増幅、ニッキング酵素増幅、ローリングサークル増幅、リコンビナーゼポリメラーゼ増幅などの等温増幅方法が挙げられるがこれらに限定されない核酸増幅技術を指す、先行する実施形態のいずれかに記載のデバイス、装置、システム、または方法。
【０３５２】
ＦＦ３．４．試薬が、プライマー、デオキシヌクレオチド（ｄＮＴＰ）、二価カチオン（例えば、Ｍｇ２＋）、一価カチオン（例えば、Ｋ＋）、緩衝液、酵素、もしくはレポーター、またはそれらの任意の組み合わせもしくは混合物を含む、先行する実施形態のいずれかに記載のデバイス、装置、システム、または方法。
【０３５３】
ＦＦ３．５．試薬が、第１もしくは第２のプレートまたはその両方の内表面上の乾燥形態、あるいは例えばパラフィンなどの温度が増加すると融解する材料で覆われた、それに埋め込まれた、またはそれで包まれた液体形態のいずれかである、先行する実施形態のいずれかに記載のデバイス、装置、システム、または方法。
【０３５４】
ＦＦ３．６．プライマーが、フォワードプライマーおよびリバースプライマーの１つ以上の対を含む、先行する実施形態のいずれかに記載のデバイス、装置、システム、または方法。
【０３５５】
ＦＦ３．７．試薬が、ＤＮＡ依存性ポリメラーゼ、またはＲＮＡ依存性ＤＮＡポリメラーゼ、またはＤＮＡ依存性ＲＮＡポリメラーゼを含む、先行する実施形態のいずれかに記載のデバイス、装置、システム、または方法。
【０３５６】
ＦＦ３．８．試薬が、核酸分子に結合するかもしくは核酸分子内に挿入することができる、または増幅プロセスの副産物によって活性化されて核酸分子もしくは増幅プロセスの可視化を可能にすることができる任意のタグ、標識、または色素を指す「レポーター」を含む、先行する実施形態のいずれかに記載のデバイス、装置、システム、または方法。
【０３５７】
ＦＦ３．８．１  レポートとして、蛍光標識もしくはタグもしくは色素、挿入剤、分子ビーコン標識、もしくは生物発光分子、またはそれらの組み合わせが挙げられるが、これらに限定されない、先行する実施形態のいずれかに記載のデバイス、装置、システム、または方法。
【０３５８】
ＦＦ３．９．試薬が、細胞構造の破壊を容易にするように構成された細胞溶解試薬を含む、先行する実施形態のいずれかに記載のデバイス、装置、システム、または方法。
【０３５９】
ＦＦ３．９．１．細胞溶解試薬として、塩、洗剤、酵素、および他の添加剤が挙げられるが、これらに限定されない、先行する実施形態のいずれかに記載のデバイス、装置、システム、または方法。
【０３６０】
ＦＦ３．９．２．塩として、リチウム塩（例えば、塩化リチウム）、ナトリウム塩（例えば、塩化ナトリウム）、カリウム（例えば、塩化カリウム）が挙げられるが、これらに限定されない、先行する実施形態のいずれかに記載のデバイス、装置、システム、または方法。
【０３６１】
ＦＦ３．９．２．洗剤が、アニオン性およびカチオン性を含むイオン性、非イオン性、または双性イオン性である、先行する実施形態のいずれかに記載のデバイス、装置、システム、または方法。
【０３６２】
ＦＦ３．９．３．イオン性洗剤が、水に溶解したときに部分的または全体的にイオン形態である任意の洗剤を含む、先行する実施形態のいずれかに記載のデバイス、装置、システム、または方法。
【０３６３】
ＦＦ３．９．４．アニオン性洗剤として、ドデシル硫酸ナトリウム（ＳＤＳ）もしくは他のアルカリ金属アルキル硫酸塩もしくは同様の洗剤、サルコシル、またはそれらの組み合わせが挙げられるが、これらに限定されない、先行する実施形態のいずれかに記載のデバイス、装置、システム、または方法。
【０３６４】
ＦＦ３．１０．酵素として、リゾチーム、セルロース、およびプロテイナーゼが挙げられるが、これらに限定されない、先行する実施形態のいずれかに記載のデバイス、装置、システム、または方法。
【０３６５】
ＦＦ３．１１．キレート剤として、ＥＤＴＡ、ＥＧＴＡ、および他のポリアミノカルボン酸、ならびにジチオトレイトール（ｄＴＴ）などのいくつかの還元剤が挙げられるが、これらに限定されない、先行する実施形態のいずれかに記載のデバイス、装置、システム、または方法。
【０３６６】
ＦＦ４．試料が、温度変化とともに量が変化する分析物を含む、先行する実施形態のいずれかに記載のデバイス、装置、システム、または方法。
【０３６７】
ＦＦ５．試料が、全血、血漿、血清、尿、唾、および汗などのヒト体液、および細胞培養物（哺乳動物、植物、細菌、真菌）、ならびにそれらの組み合わせまたは混合物を含む、先行する実施形態のいずれかに記載のデバイス、装置、システム、または方法。
【０３６８】
ＦＦ６．試料が、新たに取得されるか、あるいは任意の所望の方法もしくは便利な方法で、例えば、希釈によって、もしくは緩衝液もしくは他の溶液もしくは溶媒を添加することによって、保管もしくは処理される、先行する実施形態のいずれかに記載のデバイス、装置、システム、または方法。
【０３６９】
ＦＦ７．試料が、ヒト細胞、動物細胞、植物細胞、細菌細胞、真菌細胞、およびウイルス粒子、ならびにそれらの組み合わせまたは混合物などの細胞構造を含む、先行する実施形態のいずれかに記載のデバイス、装置、システム、または方法。
【０３７０】
７．測定方法
ＧＧ１．試料中の分析物が染色される、先行する実施形態のいずれかに記載のデバイス、装置、システム、または方法。
【０３７１】
ＧＧ２．分析物の量が、蛍光強度によって測定される、先行するＧＧ実施形態のいずれかに記載のデバイス、装置、システム、または方法。
【０３７２】
ＧＧ３．分析物の量が、比色強度によって測定される、先行するＧＧ実施形態のいずれかに記載のデバイス、装置、システム、または方法。
【０３７３】
ＧＧ４．分析物が、臭化エチジウム（ＥＢ）、メチレンブルー、ＳＹＢＲグリーンＩ、ＳＹＢＲグリーンＩＩ、ピロニンＹ、ＤＡＰＩ、アクリジンオレンジ、もしくはＮａｎｃｙ−５２０、またはそれらの組み合わせで染色された核酸である、先行する実施形態のいずれかに記載のデバイス、装置、システム、または方法。
【０３７４】
ＧＧ５．分析物が、臭化エチジウム（ＥＢ）、メチレンブルー、ピロニンＹ、ＤＡＰＩ、アクリジンオレンジ、もしくはＮａｎｃｙ−５２０、またはそれらの組み合わせで染色されたＤＮＡであり、蛍光強度を用いて測定される、先行する実施形態のいずれかに記載のデバイス、装置、システム、または方法。
【０３７５】
ＧＧ６．分析物が、臭化エチジウム（ＥＢ）、メチレンブルー、ピロニンＹ、ＤＡＰＩ、アクリジンオレンジ、もしくはＮａｎｃｙ−５２０、またはそれらの組み合わせで染色されたＤＮＡであり、比色強度を用いて測定される、先行する実施形態のいずれかに記載のデバイス、装置、システム、または方法。
【０３７６】
ＧＧ７．分析物が、臭化エチジウム（ＥＢ）、メチレンブルー、ＳＹＢＲグリーンＩＩ、ピロニンＹ、もしくはアクリジンオレンジ、またはそれらの組み合わせで染色されたＲＮＡであり、蛍光強度を用いて測定される、先行する実施形態のいずれかに記載のデバイス、装置、システム、または方法。
【０３７７】
ＧＧ８．分析物が、臭化エチジウム（ＥＢ）、メチレンブルー、ＳＹＢＲグリーンＩＩ、ピロニンＹ、もしくはアクリジンオレンジ、またはそれらの組み合わせで染色されたＲＮＡであり、比色強度を用いて測定される、先行する実施形態のいずれかに記載のデバイス、装置、システム、または方法。
【０３７８】
ＧＧ９．分析物が、レポーターによって検出される核酸である、先行する実施形態のいずれかに記載のデバイス、装置、システム、または方法。
【０３７９】
ＧＧ９．１．レポーターとして、核酸分子に結合するかもしくは核酸分子内に挿入することができる、または増幅プロセスの副産物によって活性化されて核酸分子もしくは増幅プロセスの可視化を可能にすることができるタグ、標識、または色素が挙げられるが、これらに限定されない、先行する実施形態のいずれかに記載のデバイス、装置、システム、または方法。
【０３８０】
ＧＧ９．２．レポーターとして、蛍光標識もしくはタグもしくは色素、挿入剤、分子ビーコン標識、もしくは生物発光分子、またはそれらの組み合わせが挙げられるが、これらに限定されない、先行する実施形態のいずれかに記載のデバイス、装置、システム、または方法。
【０３８１】
ＧＧ９．３．レポーターの量が、比色強度によって、かつ／または蛍光強度によって測定される、先行する実施形態のいずれかに記載のデバイス、装置、システム、または方法。
【０３８２】
８．用途
ＨＨ１．デバイス、装置、システム、または方法が、所定のプログラムに従って試料の温度を変化させるためのＰＣＲアッセイを容易にするように構成されている、先行する実施形態のいずれかに記載のデバイス、装置、システム、または方法。
【０３８３】
ＨＨ２．デバイス、装置、システム、または方法が、診断試験、健康管理、環境試験、および／または法医学的試験を実行するように構成されている、先行する実施形態のいずれかに記載のデバイス、装置、システム、または方法。
【０３８４】
ＨＨ３．デバイス、装置、システム、または方法が、ＤＮＡ増幅、ＤＮＡ定量化、選択的ＤＮＡ単離、遺伝分析、組織適合検査、癌遺伝子同定、感染症試験、遺伝子指紋法、および／または父子鑑定を実行するように構成されている、先行する実施形態のいずれかに記載のデバイス、装置、システム、または方法。
【０３８５】
ＨＨ４．デバイス、装置、システム、または方法が、リアルタイムＰＣＲを実行するように構成されている、先行する実施形態のいずれかに記載のデバイス、装置、システム、または方法。
【０３８６】
ＨＨ５．デバイス、装置、システム、または方法が、核酸増幅を実行するように構成されている、先行する実施形態のいずれかに記載のデバイス、装置、システム、または方法。
【０３８７】
ＨＨ５．１  核酸増幅が、試料中の標的分子を増幅する（その多数のコピーを生成する）ことによって核酸を検出するために使用される任意の技術を含み、標的分子が、目的の核酸の配列または部分配列を指す、先行する実施形態のいずれかに記載のデバイス、装置、システム、または方法。
【０３８８】
ＨＨ６  デバイス、装置、システム、または方法が、ホットスタートＰＣＲ、ネステッドＰＣＲ、タッチダウンＰＣＲ、逆転写ＰＣＲ、ＲＡＣＥ  ＰＣＲ、デジタルＰＣＲなどの種々のポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）方法、および例えばループ介在等温増幅（ＬＡＭＰ）、鎖置換増幅、ヘリカーゼ依存性増幅、ニッキング酵素増幅、ローリングサークル増幅、リコンビナーゼポリメラーゼ増幅などの等温増幅方法が挙げられるがこれらに限定されない核酸増幅技術を実行するように構成されている、先行する実施形態のいずれかに記載のデバイス、装置、システム、または方法。
【０３８９】
９．様々な実施形態
ＪＪ１．薄い流体試料層をアッセイするためのデバイスであって、
第１のプレートと、第２のプレートと、スペーサと、クランプとを備え、
ｉ．第１のプレートおよび第２のプレートが、開放構成および閉鎖構成を含む異なる構成になるように互いに対して移動可能であり、
ｉｉ．プレートの各々が、そのそれぞれの表面上に、流体試料と接触するための試料接触領域を備え、
ｉｉｉ．プレートのうちの一方または両方が、それぞれのプレートに固定されたスペーサを備え、
ｉｖ．スペーサが、２００ミクロン以下である所定の実質的に均一な高さを有し、スペーサのうちの少なくとも１つが、試料接触領域内にあり、
ｖ．加熱層が、流体試料を加熱するように構成されており、
加熱層が、（ａ）プレートのうちの一方の上（内表面もしくは外表面の上もしくは近くのいずれか）またはプレートのうちの一方の内側にあり、かつ（ｂ）加熱源によって加熱することが可能であり、加熱源が、光学的に、電気的に、無線周波数（ＲＦ）放射によって、またはそれらの組み合わせによって、加熱層に熱エネルギーを送達し、
開放構成では、２つのプレートが部分的または完全に分離されており、プレート間の間隔はスペーサによって調整されず、プレートのうちの一方または両方の上に試料を付着させ、
開放構成で試料を付着させた後に構成される閉鎖構成では、試料の少なくとも一部が、２つのプレートによって圧縮されて実質的に均一な厚さの層になり、かつプレートに対して実質的に停滞し、層の均一な厚さが、２つのプレートの試料接触領域によって制限され、かつプレートおよびスペーサによって調整され、
第１のプレートおよび第２のプレートが、試料の少なくとも一部を、０．１〜２００μｍの非常に均一な厚さでありかつプレートに対して実質的に停滞した層になるよう制限するように構成されており、
第１のプレートが５００μｍ以下の厚さを有し、第２のプレートが５ｍｍ以下の厚さを有する、デバイス。
【０３９０】
ＪＪ２．プレートおよび試料厚さが、試料の温度を１０℃／秒以上の速度で変化させることを可能にするように構成されている、先行する実施形態のいずれかに記載のデバイス。
【０３９１】
ＪＪ３．第１のプレートおよび第２のプレートを圧縮して、２つのプレートを閉鎖構成で一緒に固定するクランプをさらに備え、プレート上に挿入されたクランプの圧力が０．０１ｋｇ／ｃｍ＾２以上である、先行する実施形態のいずれかに記載のデバイス。
【０３９２】
ＪＪ４．加熱層が、プレートのうちの一方の上または近くにあり、６０％以上の吸収係数を有し、かつ２ｍｍ未満の厚さを有する、先行する実施形態のいずれかに記載のデバイス。
【０３９３】
ＪＪ５．均一な厚さの試料の少なくとも一部の近くに放射線吸収層をさらに備え、試料の少なくとも一部および放射線吸収層の領域が、均一な厚さよりも実質的に大きい、先行する実施形態のいずれかに記載のデバイス。
【０３９４】
ＪＪ６．試料の少なくとも一部および放射線吸収層の領域が、試料の均一な厚さよりも実質的に大きい、先行する実施形態のいずれかに記載のデバイス。
【０３９５】
ＪＪ７．デバイスのプレートのうちの一方の厚さが１００μｍ以下である、先行する実施形態のいずれかに記載のデバイス。
【０３９６】
ＪＪ８．均一な厚さの試料の少なくとも一部の近くに放射線吸収層をさらに備え、デバイスのプレートのうちの一方の厚さが１００μｍ以下である、先行する実施形態のいずれかに記載のデバイス。
【０３９７】
ＪＪ９．第１のプレートおよび第２のプレートを閉鎖構成において一緒に圧縮するクランプをさらに備え、プレート上に挿入されたクランプの圧力が０．０１ｋｇ／ｃｍ＾２以上である、先行する実施形態のいずれかに記載のデバイス。
【０３９８】
ＪＪ１０．第１のプレートおよび第２のプレートを閉鎖構成において一緒に圧縮するクランプをさらに備え、かつ均一な厚さの試料の少なくとも一部の近くに放射線吸収層をさらに備え、プレート上に挿入されたクランプの圧力が０．０１ｋｇ／ｃｍ＾２以上である、先行する実施形態のいずれかに記載のデバイス。
【０３９９】
ＪＪ１１．薄い流体試料層の温度を急速に変化させるためのシステムであって、
ｖ．先行する請求項のいずれかに記載のデバイスと、
ｖｉ．放射線吸収層が顕著に吸収する電磁波を放射するように構成された、放射線源と
を備え、
ｖｉｉ．コントローラが、放射線源を制御し、試料の温度を変化させるように構成されている、システム。
【０４００】
ＪＪ１２．薄い流体試料層の温度を急速に変化させるための方法であって、
ｖｉ．先行する請求項のいずれかに記載のデバイスまたはシステムを提供するステップと、
ｖｉｉ．デバイスのプレートのうちの一方または両方の上に流体試料を付着させるステップと、
ｖｉｉｉ．ｉｉの後、プレートを閉鎖構成になるように押圧するステップであって、プレートが試料の少なくとも一部を圧縮して２００μｍ未満の厚さの薄層にする、ステップと、
ｉｘ．放射線源からの電磁波の存在、強度、波長、周波数、および／または角度を変化させることによって、試料層の温度を変化させ維持するステップと
を含む、方法。
【０４０１】
ＪＪ１３．クランプが、クランプとプレートとの間の熱伝導を低減するための断熱層を備えるように構成されており、断熱層が、２Ｗ／ｍ−Ｋの熱伝導率の材料を含む、先行する実施形態のいずれかに記載のデバイス、システム、または方法。
【０４０２】
ＪＪ１４．クランプが、試料を加熱または冷却する必要がある熱質量を低減するための断熱層を備えるように構成されており、断熱層が、２Ｗ／ｍ−Ｋの熱伝導率の材料を含む、先行する実施形態のいずれかに記載のデバイス、システム、または方法。
【０４０３】
ＪＪ１５．閉鎖構成において、クランプが、ＱＭＡＸカード全体を密封するように構成されている、先行する実施形態のいずれかに記載のデバイス、システム、または方法。
【０４０４】
ＪＪ１６．閉鎖構成において、クランプが、プレートの表面の一部と熱伝導接触するように構成されている、先行する実施形態のいずれかに記載のデバイス、システム、または方法。
【０４０５】
ＪＪ１７．閉鎖構成において、クランプが、プレートの周辺表面領域のみと熱伝導接触する、先行する実施形態のいずれかに記載のデバイス、システム、または方法。
【０４０６】
ＪＪ１８．閉鎖構成において、クランプが、プレートの表面領域のみと熱伝導接触し、表面領域が、核酸が増幅される試料の一部分の外側にある、先行する実施形態のいずれかに記載のデバイス、システム、または方法。
【０４０７】
ＪＪ１９．クランプが、外側の光がプレートに入ることまたはプレートの内側の光が外に出ることを可能にする透明な窓を備える、先行する実施形態のいずれかに記載のデバイス、システム、または方法。
【０４０８】
ＪＪ２０．クランプが、外側の光がプレートに入ることまたはプレートの内側の光が外に出ることを可能にする透明な窓を備え、透明度が、３０％超、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、９０％、１００％であるか、またはそれらの値のうちのいずれか２つの間の範囲である、先行する実施形態のいずれかに記載のデバイス、システム、または方法。
【０４０９】
ＪＪ２１．クランプが、第１のプレートおよび第２のプレートを圧縮するための圧力を挿入し、圧力が、０．０１ｋｇ／ｃｍ２、０．１ｋｇ／ｃｍ２、０．５ｋｇ／ｃｍ２、１ｋｇ／ｃｍ２、２ｋｇ／ｃｍ２、ｋｇ／ｃｍ２、５ｋｇ／ｃｍ２、１０ｋｇ／ｃｍ２、２０ｋｇ／ｃｍ２、３０ｋｇ／ｃｍ２、４０ｋｇ／ｃｍ２、５０ｋｇ／ｃｍ２、６０ｋｇ／ｃｍ２、１００ｋｇ／ｃｍ２、１５０ｋｇ／ｃｍ２、２００ｋｇ／ｃｍ２、４００ｋｇ／ｃｍ２であるか、またはそれらの値のうちのいずれか２つの間の範囲である、先行する実施形態のいずれかに記載のデバイス、システム、または方法。
【０４１０】
ＪＪ２２．クランプが、第１のプレートおよび第２のプレートを圧縮するための圧力を挿入し、圧力が０．１ｋｇ／ｃｍ２〜２０ｋｇ／ｃｍ２である、先行する実施形態のいずれかに記載のデバイス、システム、または方法。
【０４１１】
ＪＪ２３．クランプが、第１のプレートおよび第２のプレートを圧縮するための圧力を挿入し、圧力が０．１ｋｇ／ｃｍ２〜２０ｋｇ／ｃｍ２である、先行する実施形態のいずれかに記載のデバイス、システム、または方法。
【０４１２】
ＪＪ２４．クランプが、第１のプレートおよび第２のプレートを圧縮するための圧力を挿入し、圧力が０．５ｋｇ／ｃｍ２〜４０ｋｇ／ｃｍ２である、先行する実施形態のいずれかに記載のデバイス、システム、または方法。
【０４１３】
ＪＪ２５．第１のプレートおよび第２のプレートを閉鎖構成において一緒に圧縮するクランプをさらに備え、かつ第１のプレートの少なくとも一部と第２のプレートとの間に密封材料をさらに備え、プレート上に挿入されたクランプの圧力が０．０１ｋｇ／ｃｍ＾２以上である、先行する実施形態のいずれかに記載のデバイス、システム、または方法。
【０４１４】
ＪＪ２６．試料の温度を変化させることが、温度を周期的に上下に変化させる熱サイクリングである、先行する実施形態のいずれかに記載のデバイス、システム、または方法。
【０４１５】
ＪＪ２７．試料の温度を変化させることが熱サイクリングであり、熱サイクリングが、ポリメラーゼ連鎖作用（ＰＣＲ）を使用した核酸の増幅のためである、先行する実施形態のいずれかに記載のデバイス、システム、または方法。
【０４１６】
ＪＪ２８．試料の温度の変化が、核酸の等温増幅のためである、先行する実施形態のいずれかに記載のデバイス、システム、または方法。
【０４１７】
ＪＪ２９．試料の少なくとも一部および放射線吸収層の領域が、均一な厚さよりも実質的に大きい、先行する実施形態のいずれかに記載のデバイス、システム、または方法。
【０４１８】
ＪＪ３０．放射線吸収層が、ディスク結合ドットオンピラーアンテナ（Ｄ２ＰＡ）アレイ、シリコンサンドイッチ、グラフェン、超格子、または他のプラズモン材料、その他それらの組み合わせを含む、先行する実施形態のいずれかに記載のデバイス、システム、または方法。
【０４１９】
ＪＪ３１．放射線吸収層が、カーボンもしくはブラックナノ構造またはそれらの組み合わせを含む、先行する実施形態のいずれかに記載のデバイス、システム、または方法。
【０４２０】
ＪＪ３２．放射線吸収層が、放射線エネルギーを吸収するように構成されている、先行する実施形態のいずれかに記載のデバイス、システム、または方法。
【０４２１】
ＪＪ３３．放射線吸収層が、放射線エネルギーを吸収した後、熱の形態でエネルギーを放射するように構成されている、先行する実施形態のいずれかに記載のデバイス、システム、または方法。
【０４２２】
ＪＪ３４．放射線吸収層が、試料層の下に、かつ試料層と直接接触して位置付けられている、先行する実施形態のいずれかに記載のデバイス、システム、または方法。
【０４２３】
ＪＪ３５．放射線吸収層が、電波、マイクロ波、赤外波、可視光、紫外波、Ｘ線、ガンマ線、および熱放射からなる群から選択される電磁波を吸収するように構成されている、先行する実施形態のいずれかに記載のデバイス、システム、または方法。
【０４２４】
ＪＪ３６．プレートのうちの少なくとも１つが、放射線吸収層が吸収する放射線を遮断しない、先行する実施形態のいずれかに記載のデバイス、システム、または方法。
【０４２５】
ＪＪ３７．プレートのうちの一方または両方が、低い熱伝導率を有する、先行する実施形態のいずれかに記載のデバイス、システム、または方法。
【０４２６】
ＪＪ３８．試料層の均一な厚さが、プレートのうちの一方または両方に固定された１つ以上のスペーサによって調整される、先行する実施形態のいずれかに記載のデバイス、システム、または方法。
【０４２７】
ＪＪ３９．試料が、予混合されたポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）媒体である、先行する実施形態のいずれかに記載のデバイス、システム、または方法。
【０４２８】
ＪＪ４０．デバイスが、所定のプログラムに従って試料の温度を変化させるためのＰＣＲアッセイを容易にするように構成されている、先行する実施形態１のいずれかに記載のデバイス、システム、または方法。
【０４２９】
ＪＪ４１．デバイスが、診断試験、健康管理、環境試験、および／または法医学的試験を実行するように構成されている、先行する実施形態のいずれかに記載のデバイス、システム、または方法。
【０４３０】
ＪＪ４２．デバイスが、ＤＮＡ増幅、ＤＮＡ定量化、選択的ＤＮＡ単離、遺伝分析、組織適合検査、癌遺伝子同定、感染症試験、遺伝子指紋法、および／または父子鑑定を実行するように構成されている、先行する実施形態のいずれかに記載のデバイス、システム、または方法。
【０４３１】
ＪＪ４３．試料層が、試料蒸発を低減するために横方向に密封されている、先行する実施形態のいずれかに記載のデバイス。
【０４３２】
ＪＪ４４．電磁波の存在、強度、波長、周波数、および／または角度を制御するように構成されたコントローラをさらに備える、先行する実施形態のいずれかに記載のシステム。
【０４３３】
ＪＪ４５．試料接触領域またはその近傍の温度を測定し、測定された温度に基づいてコントローラに信号を送信するように構成された温度計をさらに備える、先行する実施形態のいずれかに記載のシステム。
【０４３４】
ＪＪ４６．温度計が、光ファイバ温度計、赤外線温度計、液晶温度計、高温計、水晶温度計、シリコンバンドギャップ温度センサ、温度ストリップ、サーミスタ、および熱電対からなる群から選択される、先行する実施形態のいずれかに記載のシステムまたは方法。
【０４３５】
ＪＪ４７．コントローラが、放射線源からの電磁波の存在、強度、波長、周波数、および／または角度を制御するように構成されている、先行する実施形態のいずれかに記載のシステムまたは方法。
【０４３６】
ＪＪ４８．放射線源および放射線吸収層は、電磁波が少なくとも１０℃／秒の平均昇温速度傾斜を生じさせ、電磁波の除去が少なくとも５℃／秒の平均降温速度傾斜をもたらすように構成されている、先行する実施形態のいずれかに記載のシステムまたは方法。
【０４３７】
ＪＪ４９．放射線源および放射線吸収層が、少なくとも１０℃／秒の平均昇温速度傾斜および少なくとも５℃／秒の平均降温速度傾斜を生み出すように構成されている、先行する実施形態のいずれかに記載のデバイス、システム、または方法。
【０４３８】
ＪＪ５０．放射線源および放射線吸収層が、ＰＣＲ中に初期化ステップ、変性ステップ、および／または延伸／伸長ステップに到達するために少なくとも１０℃／秒の平均昇温速度傾斜を生み出し、ならびにＰＣＲ中にアニーリングステップおよび／または最終冷却ステップに到達するために少なくとも５℃／秒の平均降温速度傾斜を生み出すように構成されている、先行する実施形態のいずれかに記載のデバイス、システム、または方法。
【０４３９】
ＪＪ５１．ＰＣＲ試料が、鋳型ＤＮＡ、プライマーＤＮＡ、カチオン、ポリメラーゼ、および緩衝剤を含む、先行する実施形態のいずれかに記載のデバイス、システム、または方法。
【０４４０】
ＪＪ５２．プレートを閉鎖形態になるように押圧するステップが、プレートを厳密でない押圧力で押圧することを含む、先行する実施形態のいずれかに記載の方法。
【０４４１】
ＪＪ５３．プレートを閉鎖形態になるように押圧するステップが、プレートを人間の手で直接押圧することを含む、先行する実施形態のいずれかに記載の方法。
【０４４２】
ＪＪ５４．非常に均一な厚さの層が、１０％未満の厚さの変動を有する、先行する実施形態のいずれかに記載の方法。
【０４４３】
ＪＪ５５．試料の温度を変化させることが熱サイクリングであり、熱サイクリングが、ホットスタートＰＣＲ、ネステッドＰＣＲ、タッチダウンＰＣＲ、逆転写ＰＣＲ、ＲＡＣＥ  ＰＣＲ、およびデジタルＰＣＲの群から選択されるポリメラーゼ連鎖作用（ＰＣＲ）を使用した核酸の増幅のためである、先行する実施形態のいずれかに記載のデバイス、システム、または方法。
【０４４４】
ＪＪ５６．試料の温度の変化が、ループ介在等温増幅、鎖置換増幅、ヘリカーゼ依存性増幅、ニッキング酵素増幅、ローリングサークル増幅、およびリコンビナーゼポリメラーゼ増幅の群から選択される核酸の等温増幅のためである、先行する実施形態のいずれかに記載のデバイス、システム、または方法。
【０４４５】
ＪＪ５７．ＤＮＡ鋳型、プライマー、ＤＮＡポリメラーゼ、デオキシヌクレオシド三リン酸（ｄＮＴＰ）、二価カチオン（例えば、Ｍｇ２＋）、一価カチオン（例えば、Ｋ＋）、および緩衝液から選択される試薬をさらに含む、先行する実施形態のいずれかに記載のデバイス、システム、または方法。
【０４４６】
ＪＪ５８．スペーサが、実質的に平坦な頂部を有する、先行する実施形態のいずれかに記載のデバイス、システム、または方法。
【０４４７】
ＪＪ５９．プレートのうちの一方が５０μｍ以下である、先行する実施形態のいずれかに記載のデバイス、システム、または方法。
【０４４８】
関連文書
本発明は、様々な構成要素が互いに矛盾しない限り、複数の方法で組み合わされ得る、様々な実施形態を含む。実施形態は、単一の発明出願とみなされるべきである。各ファイリングは、個別の独立としてではなく、参照として他の出願を有し、その全体においておよびあらゆる目的のために参照される。これらの実施形態は、本出願の開示だけでなく、本明細書で参照され、組み込まれ、または優先権が主張される文書も含む。
【０４４９】
（１）定義
本明細書に開示されるデバイス、システム、および方法を説明するために使用される用語は、本出願、または２０１６年８月１０日および２０１６年９月１４日にそれぞれ出願されたＰＣＴ出願（米国を指定）第ＰＣＴ／ＵＳ２０１６／０４５４３７号および第ＰＣＴ／ＵＳ０２１６／０５１７７５号、２０１７年２月７日に出願された米国仮出願第６２／４５６０６５号、２０１７年２月８日に出願された米国仮出願第６２／４５６２８７号、２０１７年２月８日に出願された米国仮出願第６２／４５６５０４号に定義されており、それらの全ての出願は、あらゆる目的のためにその全体が本明細書に組み込まれる。
【０４５０】
「ＣＲＯＦカード（またはカード）」、「ＣＯＦカード」、「ＱＭＡＸカード」、「Ｑカード」、「ＣＲＯＦデバイス」、「ＣＯＦデバイス」、「ＱＭＡＸデバイス」、「ＣＲＯＦプレート」、「ＣＯＦプレート」、および「ＱＭＡＸプレート」という用語は、いくつかの実施形態ではＣＯＦカードはスペーサを備えていないことを除いて、互換性があり、これらの用語は、異なる構成（開放構成および閉鎖構成を含む）になるように互いに対して移動可能である第１のプレートおよび第２のプレートを備え、かつプレート間の間隔を調整するスペーサを備える（ＣＯＦカードのいくつかの実施形態を除く）、デバイスを指す。「Ｘプレート」という用語は、ＣＲＯＦカードの２つのプレートのうちの１つを指し、スペーサはこのプレートに固定されている。ＣＯＦカード、ＣＲＯＦカード、およびＸプレートのより詳細は、２０１７年２月７日に出願された仮出願シリアル番号第６２／４５６０６５号に提供され、これはあらゆる目的のためにその全体が本明細書に組み込まれる。
【０４５１】
（２）Ｑカード、スペーサ、および均一な試料厚さ
本明細書に開示されるデバイス、システム、および方法は、試料の検出、分析、および定量化のためにＱカード、スペーサ、および均一な試料厚さの実施形態を含むか、または使用することができる。いくつかの実施形態では、Ｑカードは、試料の少なくとも一部を均一性の高い層にするのに役立つスペーサを備える。スペーサの構造、材料、機能、バリエーション、および寸法、ならびにスペーサおよび試料層の均一性は、本明細書に開示されているか、または２０１６年８月１０日および２０１６年９月１４日にそれぞれ出願されたＰＣＴ出願（米国を指定）第ＰＣＴ／ＵＳ２０１６／０４５４３７号および第ＰＣＴ／ＵＳ０２１６／０５１７７５号、２０１７年２月７日に出願された米国仮出願第６２／４５６０６５号、２０１７年２月８日に出願された米国仮出願第６２／４５６２８７号、２０１７年２月８日に出願された米国仮出願第６２／４５６５０４号に列挙、記載、および要約されており、それらの全ての出願は、あらゆる目的のためにその全体が本明細書に組み込まれる。
【０４５２】
（３）ヒンジ、オープニング用ノッチ、凹型エッジ、およびスライダー
本明細書に開示されるデバイス、システム、および方法は、試料の検出、分析、および定量化のためにＱカードを含むか、または使用することができる。いくつかの実施形態では、Ｑカードは、Ｑカードの操作および試料の測定を容易にするのに役立つヒンジ、ノッチ、凹部、およびスライダーを備える。ヒンジ、ノッチ、凹部、およびスライダーの構造、材料、機能、バリエーション、寸法は、本明細書に開示されているか、または２０１６年８月１０日および２０１６年９月１４日にそれぞれ出願されたＰＣＴ出願（米国を指定）第ＰＣＴ／ＵＳ２０１６／０４５４３７号および第ＰＣＴ／ＵＳ０２１６／０５１７７５号、２０１７年２月７日に出願された米国仮出願第６２／４５６０６５号、２０１７年２月８日に出願された米国仮出願第６２／４５６２８７号、２０１７年２月８日に出願された米国仮出願第６２／４５６５０４号に列挙、記載、および要約されており、それらの全ての出願は、あらゆる目的のためにその全体が本明細書に組み込まれる。
【０４５３】
（４）Ｑカード、スライダー、およびスマートフォン検出システム
本明細書に開示されるデバイス、システム、および方法は、試料の検出、分析、および定量化のためにＱカードを含むか、または使用することができる。いくつかの実施形態では、Ｑカードは、カードがスマートフォン検出システムによって読み取られることを可能にするスライダー（ｓｌｉｄｅｒ）とともに使用される。Ｑカード、スライダー、およびスマートフォン検出システムの構造、材料、機能、バリエーション、寸法、および接続は、本明細書に開示されているか、または２０１６年８月１０日および２０１６年９月１４日にそれぞれ出願されたＰＣＴ出願（米国を指定）第ＰＣＴ／ＵＳ２０１６／０４５４３７号および第ＰＣＴ／ＵＳ０２１６／０５１７７５号、２０１７年２月７日に出願された米国仮出願第６２／４５６０６５号、２０１７年２月８日に出願された米国仮出願第６２／４５６２８７号、２０１７年２月８日に出願された米国仮出願第６２／４５６５０４号に列挙、記載、および要約されており、それらの全ての出願は、あらゆる目的のためにその全体が本明細書に組み込まれる。
【０４５４】
（５）検出方法
本明細書に開示されるデバイス、システム、および方法は、様々なタイプの検出方法を含むか、または使用することができる。検出方法は、本明細書に開示されているか、または２０１６年８月１０日および２０１６年９月１４日にそれぞれ出願されたＰＣＴ出願（米国を指定）第ＰＣＴ／ＵＳ２０１６／０４５４３７号および第ＰＣＴ／ＵＳ０２１６／０５１７７５号、２０１７年２月７日に出願された米国仮出願第６２／４５６０６５号、２０１７年２月８日に出願された米国仮出願第６２／４５６２８７号、２０１７年２月８日に出願された米国仮出願第６２／４５６５０４号に列挙、記載、および要約されており、それらの全ての出願は、あらゆる目的のためにその全体が本明細書に組み込まれる。
【０４５５】
（６）標識
本明細書で開示されるデバイス、システム、および方法は、分析物検出に使用される様々な種類の標識を用いることができる。標識は、本明細書に開示されているか、または２０１６年８月１０日および２０１６年９月１４日にそれぞれ出願されたＰＣＴ出願（米国を指定）第ＰＣＴ／ＵＳ２０１６／０４５４３７号および第ＰＣＴ／ＵＳ０２１６／０５１７７５号、２０１７年２月７日に出願された米国仮出願第６２／４５６０６５号、２０１７年２月８日に出願された米国仮出願第６２／４５６２８７号、２０１７年２月８日に出願された米国仮出願第６２／４５６５０４号に列挙、記載、および要約されており、それらの全ての出願は、あらゆる目的のためにその全体が本明細書に組み込まれる。
【０４５６】
（７）分析物
本明細書に開示されるデバイス、システム、および方法は、様々な種類の分析物（バイオマーカーを含む）の操作および検出に適用することができる。分析物は、本明細書に開示されているか、または２０１６年８月１０日および２０１６年９月１４日にそれぞれ出願されたＰＣＴ出願（米国を指定）第ＰＣＴ／ＵＳ２０１６／０４５４３７号および第ＰＣＴ／ＵＳ０２１６／０５１７７５号、２０１７年２月７日に出願された米国仮出願第６２／４５６０６５号、２０１７年２月８日に出願された米国仮出願第６２／４５６２８７号、２０１７年２月８日に出願された米国仮出願第６２／４５６５０４号に列挙、記載、および要約されており、それらの全ての出願は、あらゆる目的のためにその全体が本明細書に組み込まれる。
【０４５７】
（８）用途（分野および試料）
本明細書に開示されるデバイス、システム、および方法は、様々な用途（分野および試料）に使用することができる。用途は、本明細書に開示されているか、または２０１６年８月１０日および２０１６年９月１４日にそれぞれ出願されたＰＣＴ出願（米国を指定）第ＰＣＴ／ＵＳ２０１６／０４５４３７号および第ＰＣＴ／ＵＳ０２１６／０５１７７５号、２０１７年２月７日に出願された米国仮出願第６２／４５６０６５号、２０１７年２月８日に出願された米国仮出願第６２／４５６２８７号、２０１７年２月８日に出願された米国仮出願第６２／４５６５０４号に列挙、記載、および要約されており、それらの全ての出願は、あらゆる目的のためにその全体が本明細書に組み込まれる。
【０４５８】
（９）クラウド
本明細書に開示されるデバイス、システム、および方法は、データ転送、ストレージ、および／または分析のためにクラウド技術を使用することができる。関連するクラウド技術は、本明細書に開示されているか、または２０１６年８月１０日および２０１６年９月１４日にそれぞれ出願されたＰＣＴ出願（米国を指定）第ＰＣＴ／ＵＳ２０１６／０４５４３７号および第ＰＣＴ／ＵＳ０２１６／０５１７７５号、２０１７年２月７日に出願された米国仮出願第６２／４５６０６５号、２０１７年２月８日に出願された米国仮出願第６２／４５６２８７号、２０１７年２月８日に出願された米国仮出願第６２／４５６５０４号に列挙、記載、および要約されており、それらの全ての出願は、あらゆる目的のためにその全体が本明細書に組み込まれる。
【０４５９】
追加の留意事項
本開示による本発明対象のさらなる例は、以下の列挙された段落に記載されている。
【０４６０】
本明細書および添付の特許請求の範囲で使用される場合、単数形「ａ」、「ａｎ」、および「ｔｈｅ」は、「単一」という語が使用される場合などの文脈がそうではないことを明確に指示しない限り、複数の指示対象を含むことに留意しなければならない。例えば、「分析物」についての言及は、単一の分析物および複数の分析物を含み、「捕捉作用因子」についての言及は、単一の捕捉作用因子および複数の捕捉作用因子を含み、「検出作用因子」についての言及は、単一の検出作用因子および複数の検出作用因子を含み、「剤」についての言及には、単一の剤および複数の剤が含まれる。
【０４６１】
本明細書で使用される場合、「適合させる」および「構成される」という用語は、要素、構成要素、または他の対象物が所与の機能を果たすように設計および／または意図されることを意味する。したがって、「適合される」および「構成される」という用語の使用は、特定の要素、構成要素、または他の対象物が特定の機能を単に果たす「ことができる」ことを意味すると解釈されるべきではない。同様に、特定の機能を果たすように構成されるとして記載されている対象物は、さらにまたはあるいは、その機能を果たすように作動するものとして説明され得る。
【０４６２】
本明細書で使用される場合、「例えば」という句、「例として」という句、および／または「例」もしくは「例示的な」との用語は、本開示による１つ以上の構成要素、特徴、詳細、構造、実施形態、および／または方法に関して使用される場合、記載された構成要素、特徴、詳細、構造、実施形態、および／または方法が、本開示による構成要素、特徴、詳細、構造、実施形態、および／または方法の例示的で非排他的な例であることを伝えることを意図している。したがって、記載される構成要素、特徴、詳細、構造、実施形態、および／または方法は、限定されること、必須とされること、または排他的／網羅的であることを意図してなく、構造的および／もしくは機能的に類似するならびに／または同等である構成要素、特徴、詳細、構造、実施形態、および／または方法を含む他の構成要素、特徴、詳細、構造、実施形態、および／または方法もまた、本開示の範囲内である。
【０４６３】
本明細書で使用される場合、２つ以上の実体（ｅｎｔｉｔｙ）の列挙に関して「のうちの少なくとも１つ」および「１つ以上」という句は、実体の列挙中における実体のうちの任意の１つ以上を意味し、実体の列挙内に具体的に列挙されている各々および全ての実体のうちの少なくとも１つに限定されない。例えば、「ＡおよびＢのうちの少なくとも１つ」（もしくは、同等に「ＡまたはＢのうちの少なくとも１つ」、または同等に「Ａおよび／またはＢのうちの少なくとも１つ」）は、Ａのみ、Ｂのみ、またはＡおよびＢの組み合わせであってもよい。
【０４６４】
本明細書で使用される場合、第１の実体と第２の実体との間に置かれる「および／または」との用語は、（１）第１の実体、（２）第２の実体、および（３）第１の実体および第２の実体のうちの１つを意味する。「および／または」を用いて列挙された複数の実体は、同じ様式で、すなわち、そのように結合された実体のうちの「１つ以上」と解釈すべきである。「および／または」の句によって具体的に特定された実体以外に、具体的に特定されたそれらの実体に関連するかどうかに関わらず、他の実体が任意選択で存在してもよい。
【０４６５】
数値範囲が本明細書で言及される場合、本発明は、端点が含まれる実施形態、両方の端点が除外される実施形態、および一方の端点が含まれ、かつ他方が除外される実施形態を含む。別段の指示がない限り、両方の端点が含まれると見なすべきである。さらに、別段の指示がない限り、または文脈および当業者の理解から明らかでない限り。
【０４６６】
任意の特許、特許出願、または他の参考文献が参照により本明細書に組み込まれ、（１）本開示の組み込まれない部分または他の組み込まれた参考文献のいずれかに矛盾する様式で用語を定義する場合において、および／または（２）その他の点でそれらと矛盾する場合において、本開示の組み込まれていない部分が支配するものとし、その中の用語または組み込まれた開示は、用語が定義されている、および／または組み込まれた開示が元々存在していた参考文献に関してのみ支配するものとする。
【０４６７】
追加の留意事項
本開示による本発明対象のさらなる例は、以下の列挙された段落に記載されている。
【０４６８】
本明細書および添付の特許請求の範囲で使用される場合、単数形「ａ」、「ａｎ」、および「ｔｈｅ」は、「単一」という語が使用される場合などの文脈がそうではないことを明確に指示しない限り、複数の指示対象を含むことに留意しなければならない。例えば、「分析物」についての言及は、単一の分析物および複数の分析物を含み、「捕捉作用因子」についての言及は、単一の捕捉作用因子および複数の捕捉作用因子を含み、「検出作用因子」についての言及は、単一の検出作用因子および複数の検出作用因子を含み、「剤」についての言及には、単一の剤および複数の剤が含まれる。
【０４６９】
本明細書で使用される場合、「適合させる」および「構成される」という用語は、要素、構成要素、または他の対象物が所与の機能を果たすように設計および／または意図されることを意味する。したがって、「適合される」および「構成される」という用語の使用は、特定の要素、構成要素、または他の対象物が特定の機能を単に果たす「ことができる」ことを意味すると解釈されるべきではない。同様に、特定の機能を果たすように構成されるとして記載されている対象物は、さらにまたはあるいは、その機能を果たすように作動するものとして説明され得る。
【０４７０】
本明細書で使用される場合、「例えば」という句、「例として」という句、および／または「例」もしくは「例示的な」との用語は、本開示による１つ以上の構成要素、特徴、詳細、構造、実施形態、および／または方法に関して使用される場合、記載された構成要素、特徴、詳細、構造、実施形態、および／または方法が、本開示による構成要素、特徴、詳細、構造、実施形態、および／または方法の例示的で非排他的な例であることを伝えることを意図している。したがって、記載される構成要素、特徴、詳細、構造、実施形態、および／または方法は、限定されること、必須とされること、または排他的／網羅的であることを意図してなく、構造的および／もしくは機能的に類似するならびに／または同等である構成要素、特徴、詳細、構造、実施形態、および／または方法を含む他の構成要素、特徴、詳細、構造、実施形態、および／または方法もまた、本開示の範囲内である。
【０４７１】
本明細書で使用される場合、２つ以上の実体（ｅｎｔｉｔｙ）の列挙に関して「のうちの少なくとも１つ」および「１つ以上」という句は、実体の列挙中における実体のうちの任意の１つ以上を意味し、実体の列挙内に具体的に列挙されている各々および全ての実体のうちの少なくとも１つに限定されない。例えば、「ＡおよびＢのうちの少なくとも１つ」（もしくは、同等に「ＡまたはＢのうちの少なくとも１つ」、または同等に「Ａおよび／またはＢのうちの少なくとも１つ」）は、Ａのみ、Ｂのみ、またはＡおよびＢの組み合わせであってもよい。
【０４７２】
本明細書で使用される場合、第１の実体と第２の実体との間に置かれる「および／または」との用語は、（１）第１の実体、（２）第２の実体、および（３）第１の実体および第２の実体のうちの１つを意味する。「および／または」を用いて列挙された複数の実体は、同じ様式で、すなわち、そのように結合された実体のうちの「１つ以上」と解釈すべきである。「および／または」の句によって具体的に特定された実体以外に、具体的に特定されたそれらの実体に関連するかどうかに関わらず、他の実体が任意選択で存在してもよい。
【０４７３】
数値範囲が本明細書で言及される場合、本発明は、端点が含まれる実施形態、両方の端点が除外される実施形態、および一方の端点が含まれ、かつ他方が除外される実施形態を含む。別段の指示がない限り、両方の端点が含まれると見なすべきである。さらに、別段の指示がない限り、または文脈および当業者の理解から明らかでない限り。
【０４７４】
任意の特許、特許出願、または他の参考文献が参照により本明細書に組み込まれ、（１）本開示の組み込まれない部分または他の組み込まれた参考文献のいずれかに矛盾する様式で用語を定義する場合において、および／または（２）その他の点でそれらと矛盾する場合において、本開示の組み込まれていない部分が支配するものとし、その中の用語または組み込まれた開示は、用語が定義されている、および／または組み込まれた開示が元々存在していた参考文献に関してのみ支配するものとする。
【図１】
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【図２】
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【図３】
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【図４】
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【図５】
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【図６】
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【図７】
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【図８】
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【図９】
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【図１０】
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【図１１】
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【図１２】
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【図１３】
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【国際調査報告】
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