(57)【要約】【解決手段】システムは、対象分析物を支持するフローセルと、フローセルに結合されて、複数流路から、フローセルを通る流路を選択するセレクタバルブと、フローセルに結合されて、分析作業の間、選択される流路を通じて流体を変位させるポンプと、セレクタバルブに結合されて、セレクタバルブに流路を選択するよう命令する制御回路と、を備えることができる。【選択図】図４
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【特許請求の範囲】
【請求項１】
フローセルがシステムに装着されているときに、前記フローセルに流体的に接続して対象分析物を支持する複数流路と、
前記複数流路に結合されるとともに前記複数流路間で選択する流路セレクタバルブと、
前記フローセルが前記システムに装着されているときに、前記フローセルに流体的に接続するとともに、分析作業の間、前記流路セレクタバルブが選択する前記複数流路の１つを通じて流体を変位させるポンプと、
前記流路セレクタバルブに動作可能に結合されるとともに、１つ以上のプロセッサ及びコンピュータ実行可能命令を記憶するメモリを有する制御回路と、
を備えるシステムであり、
前記コンピュータ実行可能命令は、前記１つ以上のプロセッサによって実行されるときに、前記１つ以上のプロセッサを制御して、前記流路セレクタバルブに流路を選択するよう命令する、システム。
【請求項２】
前記複数流路が、前記フローセルの第１チャネルを通じて流体を流す第１流路と、前記フローセルの第２チャネルを通じて流体を流す第２流路とを含み、前記第２流路は前記第１流路とは異なる、請求項１に記載のシステム。
【請求項３】
前記複数流路は、前記第１流路及び前記第２流路の両方を包含する第３流路を含む、請求項２に記載のシステム。
【請求項４】
前記流路セレクタバルブは、前記フローセルが前記システムに装着されているときに前記フローセルをバイパスするバイパスラインに更に流体的に結合され、
また前記流路セレクタバルブは、前記流路ではなく前記バイパスラインを制御可能に選択する、請求項１に記載のシステム。
【請求項５】
前記分析作業の間、前記制御回路は、前記流路セレクタバルブに、選択される前記流路を分析プロトコルに基づいて選択するように自動的に命令する、請求項１に記載のシステム。
【請求項６】
前記流路セレクタバルブの流体的上流に位置付けられ、複数の試薬から試薬を選択し、選択される前記試薬を前記流路セレクタバルブの入口に導く試薬セレクタバルブを更に備える、請求項１に記載のシステム。
【請求項７】
前記フローセルが前記システムに装着されているときに、前記フローセルを前記流路セレクタバルブと流体的に接続する１つ以上のマニホールドを備え、
前記フローセルが前記システムに装着されているときに、前記１つ以上のマニホールドは、前記流路セレクタバルブと前記フローセルとの間に流体的に挿入される、請求項１に記載のシステム。
【請求項８】
前記ポンプは、前記フローセルの流体的下流に配置されるシリンジポンプを備える、請求項１に記載のシステム。
【請求項９】
複数の試薬から分析プロトコルに従って試薬を選択する試薬セレクタバルブと、
分析対象物を支持するフローセルと、
前記試薬セレクタバルブと前記フローセルとの間に流体的に挿入され、前記フローセルを通る複数流路から前記フローセルを通る流路を選択し、前記分析プロトコルに従って、選択される前記試薬を、選択される前記流路を通じて導く流路セレクタバルブと、
前記フローセルに流体的に接続され、前記分析プロトコルに従って、選択される前記試薬を、選択される前記流路を通じて変位させるポンプと、
前記流路セレクタバルブに動作可能に結合され、１つ以上のプロセッサ及びコンピュータ実行可能命令を記憶するメモリを有する制御回路と、
を備えるシステムであり、
前記コンピュータ実行可能命令は、前記１つ以上のプロセッサによって実行されるときに、前記１つ以上のプロセッサを制御して、前記流路セレクタバルブに流路を選択させる、システム。
【請求項１０】
前記複数流路は、前記フローセルのあるチャネルを通る第１流路と、前記フローセルの第２チャネルを通る第２流路とを含み、前記第２流路は前記第１流路とは異なる、請求項９に記載のシステム。
【請求項１１】
前記複数流路は、前記第１流路及び前記第２流路の両方を包含する第３流路を含む、請求項１０に記載のシステム。
【請求項１２】
前記流路セレクタバルブは、前記フローセルをバイパスするバイパスラインに更に流体的に接続され、
前記流路セレクタバルブは、前記フローセルを通る流路ではなく前記バイパスラインを選択するよう更に制御可能である、請求項９に記載のシステム。
【請求項１３】
前記フローセルがシーケンシングシステムに装着されているときに、前記セレクタバルブと前記フローセルとの間で流体的に結合されて、前記フローセルをセレクタバルブと係合する１つ以上のマニホールドを備える、請求項９に記載のシステム。
【請求項１４】
フローセルの流体的上流の流路セレクタバルブを制御して、前記フローセルを通る複数流路から前記フローセルを通る流路を選択するステップと、
分析プロトコルに従って、選択される前記流路を通じて試薬を変位させるステップと、
を含む方法であり、
前記複数流路は、前記フローセルのあるチャネルを通る第１流路と、前記フローセルの第２チャネルを通る第２流路と、前記第１流路及び前記第２流路の両方を包含する第３流路とを含み、前記第２流路は前記第１流路とは異なる、方法。
【請求項１５】
前記流路セレクタバルブと流体的に接続される試薬セレクタバルブを制御するステップを更に含み、
前記試薬セレクタバルブは、前記分析プロトコルに従って前記流路セレクタバルブ及び前記フローセルを通じて変位させるために、複数の試薬から異なる試薬を選択し、
前記流路セレクタバルブは前記試薬セレクタバルブと前記フローセルとの間に流体的に挿入される、請求項１４に記載の方法。
【請求項１６】
前記分析プロトコルの連続的サイクルの間、前記流路セレクタバルブ、前記試薬セレクタバルブ、又は前記流路セレクタバルブ及び前記試薬セレクタバルブの位置を変えることを命令するステップを更に含む、請求項１５に記載の方法。
【請求項１７】
前記流路セレクタバルブに、前記フローセルを通る流路ではなく、前記フローセルをバイパスするバイパスラインを選択するよう命令するステップを更に含む、請求項１４に記載の方法。
【請求項１８】
前記フローセルをシーケンシングシステムに装着して、前記フローセルを、前記流路セレクタバルブと前記フローセルとの間に流体的に挿入される複数のマニホールドと流体的に接続して、前記フローセルを前記流路セレクタバルブと流体的に接続するステップを更に含み、
前記フローセルの装着を、前記試薬を変位させる前に実施する、請求項１４に記載の方法。
【請求項１９】
前記フローセルの下流に位置付けられるポンプによって、選択される前記流路を通じて前記試薬を変位させる、請求項１４に記載の方法。
【請求項２０】
前記ポンプはシリンジポンプを備える、請求項１９に記載の方法。
【発明の詳細な説明】
【関連出願の相互参照】
【０００１】
この出願は、2017年1月5日に出願した米国特許出願第62/442,677号の優先権の利益を主張する2017年12月13日に出願した米国特許出願第15/841,095号の優先権の利益と、米国特許出願第62/442,677号の優先権の利益を同様に主張する2017年3月24日に出願した英国（ＧＢ）特許出願第1704761.4号の利益とを主張し、これら全出願の全内容を参照により本明細書に援用するものとする。
【背景技術】
【０００２】
対象分子、特にデオキシリボ核酸、リボ核酸及び他の生体試料をシーケンシングする器械が開発され進化し続けている。シーケンシング作業に先立って、試薬と混合され最終的にはフローセルに導入される、ライブラリを形成するために対象分子の試料を調製する。フローセルでは個々の分子が部位に付着し検出性を高めるために増幅されるであろう。シーケンシング作業はその後、部位で分子を結合するステップと、結合した成分をタグ付けするステップと、部位で成分を撮像するステップと、結果として生じる画像データを処理するステップと、から成るサイクルを繰り返すことを含む。
【０００３】
このようなシーケンシングシステムでは、流体システム（又はサブシステム）は、プログラムされたコンピュータ及び適切なインタフェース等の制御システムの制御下で物質（例えば試薬）の流れを生み出す。
【発明の概要】
【課題を解決するための手段】
【０００４】
本明細書で説明する主題の１つ以上の実施形態の詳細を、添付図面及び以下の説明で述べる。この説明、図面及び特許請求の範囲から、他の構成、態様及び利点が明らかになるであろう。
【０００５】
ある実施形態では、フローセルがシステムに装着されているときに、フローセルに流体的に接続して対象分析物を支持する複数流路と、流路に結合されるとともに複数流路間で選択する流路セレクタバルブと、フローセルがシステムに装着されているときに、フローセルに流体的に接続するとともに、分析作業の間、流路セレクタバルブが選択する複数流路の１つを通じて流体を変位させるポンプと、流路セレクタバルブに動作可能に結合されるとともに、１つ以上のプロセッサ及びコンピュータ実行可能命令を記憶する又は記憶しているメモリを有する制御回路と、を備えるシステムであり、コンピュータ実行可能命令は、１つ以上のプロセッサによって実行されるときに、１つ以上のプロセッサを制御して、流路セレクタバルブに流路を選択するよう命令する、システムを提供できる。
【０００６】
システムのある実施形態では、複数流路が、フローセルの第１チャネルを通じて流体を流す第１流路と、フローセルの第２チャネルを通じて流体を流す第２流路とを含むことができ、第２流路は第１流路とは異なる。
【０００７】
システムのある実施形態では、複数流路は、第１流路及び第２流路の両方を包含する第３流路を含むことができる。
【０００８】
システムのある実施形態では、流路セレクタバルブを、フローセルがシステムに装着されているときにフローセルをバイパスするバイパスラインに更に流体的に結合することができ、また流路セレクタバルブを、流路ではなくバイパスラインを選択するように制御できる。
【０００９】
システムのある実施形態では、制御回路は、流路セレクタバルブに、分析作業の間、選択される流路を分析プロトコルに基づいて選択するように自動的に命令することができる。
【００１０】
システムのある実施形態では、システムは、流路セレクタバルブの流体的上流に位置付けられ、複数の試薬から試薬を選択し、選択される試薬を流路セレクタバルブの入口に導く試薬セレクタバルブを更に備えることができる。
【００１１】
システムのある実施形態では、システムは、フローセルがシステムに装着されているときに、フローセルを流路セレクタバルブと流体的に接続する１つ以上のマニホールドを備えることができ、フローセルがシステムに装着されているときに、１つ以上のマニホールドを、流路セレクタバルブとフローセルとの間に流体的に挿入することができる。
【００１２】
システムのある実施形態では、ポンプは、フローセルの流体的下流に配置されるシリンジポンプを備えることができる。
【００１３】
ある実施形態では、複数の試薬から分析プロトコルに従って試薬を選択する試薬セレクタバルブと、分析対象物を支持するフローセルと、試薬セレクタバルブとフローセルとの間に流体的に挿入され、フローセルを通る複数流路からフローセルを通る流路を選択し、分析プロトコルに従って、選択される試薬を、選択される流路を通じて導く流路セレクタバルブと、フローセルに流体的に接続され、分析プロトコルに従って、選択される試薬を、選択される流路を通じて変位させるポンプと、流路セレクタバルブに動作可能に結合され、１つ以上のプロセッサ及びコンピュータ実行可能命令を記憶する又は記憶しているメモリを有する制御回路と、を備えるシステムであり、コンピュータ実行可能命令は、１つ以上のプロセッサによって実行されるときに、１つ以上のプロセッサを制御して、流路セレクタバルブに流路を選択させる、システムを提供することができる。
【００１４】
システムのある実施形態では、複数流路は、フローセルのあるチャネルを通る第１流路と、フローセルの第２チャネルを通る第２流路とを含むことができ、第２流路は第１流路とは異なる。
【００１５】
システムのある実施形態では、複数流路は、第１流路及び第２流路の両方を包含する第３流路を含むことができる。
【００１６】
システムのある実施形態では、流路セレクタバルブを、フローセルをバイパスするバイパスラインに更に流体的に接続させることができ、流路セレクタバルブを、フローセルを通る流路ではなくバイパスラインを選択するよう更に制御可能とし得る。
【００１７】
システムのある実施形態では、システムは、フローセルがシーケンシングシステムに装着されているときに、セレクタバルブとフローセルとの間で流体的に結合されて、フローセルをセレクタバルブと係合する１つ以上のマニホールドを備えることができる。
【００１８】
ある実施形態では、フローセルの流体的上流の流路セレクタバルブを制御して、フローセルを通る複数流路からフローセルを通る流路を選択するステップと、分析プロトコルに従って、選択される流路を通じて試薬を変位させるステップと、を含む方法であり、複数流路は、フローセルのあるチャネルを通る第１流路と、フローセルの第２チャネルを通る第２流路と、第１流路及び第２流路の両方を包含する第３流路とを含み、第２流路は第１流路とは異なる、方法を提供できる。
【００１９】
方法のある実施形態では、方法は、流路セレクタバルブと流体的に接続される試薬セレクタバルブを制御するステップを更に含むことができ、試薬セレクタバルブは、分析プロトコルに従って流路セレクタバルブ及びフローセルを通じて変位させるために、複数の試薬から異なる試薬を選択し、流路セレクタバルブを試薬セレクタバルブとフローセルとの間に流体的に挿入することができる。
【００２０】
方法のある実施形態では、方法は、分析プロトコルの連続的サイクルの間、流路セレクタバルブ、試薬セレクタバルブ、又は流路セレクタバルブ及び試薬セレクタバルブの位置を変えることを命令するステップを更に含むことができる。
【００２１】
方法のある実施形態では、方法は、流路セレクタバルブに、フローセルを通る流路ではなく、フローセルをバイパスするバイパスラインを選択するよう命令するステップを更に含むことができる。
【００２２】
方法のある実施形態では、方法は、フローセルをシーケンシングシステムに装着して、フローセルを、流路セレクタバルブとフローセルとの間に流体的に挿入される複数のマニホールドと流体的に接続して、フローセルを流路セレクタバルブと流体的に接続するステップを更に含むことができ、フローセルの装着を、試薬を変位させる前に実施する。
【００２３】
方法のある実施形態では、フローセルの下流に位置付けられるポンプによって、選択される流路を通じて試薬を変位させることができる。
【００２４】
方法のかかる実施形態では、ポンプはシリンジポンプを備えることができ、又はポンプをシリンジポンプとすることができる。
【００２５】
本明細書で説明する主題の１つ以上の実施形態の詳細を、添付図面及び以下の説明で述べる。本明細書、図面及び特許請求の範囲から、他の構成、態様及び利点が明らかになるであろう。なお、以下の図面の相対寸法は縮尺に合っていないことがある。
【００２６】
同様の特性が図面にわたって同様の部分を現す添付図面を参照して以下の詳細な説明を読解するときに、本開示のこれらの構成、他の構成、態様及び利点をより良く理解することができる。
【図面の簡単な説明】
【００２７】
【図１】開示される技術を用いることができるシーケンシングシステムの実施例の概略図である。
【図２】図１の例示的シーケンシングシステムの流体システムの一実施形態の概略図である。
【図３】図１の例示的シーケンシングシステムの処理及び制御システムの実施例の概略図である。
【図４】図１の例示的シーケンシングシステム用流体システムの一部の他の実施形態の概略図である。
【図５】図１のシーケンシングシステムで使用される共通ラインセレクタバルブの実施形態の模式分解立体図である。
【図６】図１のシーケンシングシステムの共通ラインセレクタバルブが可能にする例示的ポート結合を示す模式図である。
【図７Ａ】図１のシーケンシングシステムの共通ラインセレクタバルブの実施形態の異なる構成の立面断面図であり、流体がバルブを通って流れ得る様子の例を描写する図である。
【図７Ｂ】図１のシーケンシングシステムの共通ラインセレクタバルブの実施形態の異なる構成の立面断面図であり、流体がバルブを通って流れ得る様子の例を描写する図である。
【図８】図８Ａ〜Ｆは、図１のシーケンシングシステムの共通ラインセレクタバルブの実施形態の異なる構成の平断面図であり、様々な構成によってバルブの異なるポート結合を説明する図である。
【図９Ａ】図１のシーケンシングシステムのフローセルを通り、共通ラインセレクタバルブが選択するいくつかの流路の概略図である。
【図９Ｂ】図１のシーケンシングシステムのフローセルを通り、共通ラインセレクタバルブが選択するいくつかの流路の概略図である。
【図９Ｃ】図１のシーケンシングシステムのフローセルを通り、共通ラインセレクタバルブが選択するいくつかの流路の概略図である。
【図９Ｄ】図１のシーケンシングシステムのフローセルを通り、共通ラインセレクタバルブが選択するいくつかの流路の概略図である。
【図１０】流体を図１のシーケンシングシステムのフローセルに吸引することなく流体システムをプライミングする例示的方法を示す図である。
【図１１】試薬セレクタバルブ、共通ラインセレクタバルブ、ノズル及びいくつかの流体チャネルを有し、図１のシーケンシングシステムとインタフェースをとるマニホールド組立体の実施形態の斜視図である。
【図１２】図１のシーケンシングシステムを作動させる方法の実施形態の流れ図である。
【図１３】いくつかの試薬間で選択し当該試薬を結合するための付加的な共通ラインセレクタバルブを有する、図１のシーケンシングシステム用の流体システムの他の実施形態の概略図である。
【発明を実施するための形態】
【００２８】
図１は、シーケンシングしてその成分、成分の順序及び試料の一般的構造を決定することができる分子試料を処理するように構成されるシーケンシングシステム１０の実施形態を示す。システムは、生体試料を受け取って処理する器械１２を含む。試料源１４は、多くの場合組織試料を含み得る試料１６を供給する。試料源は、その配列が決定される、例えば人間、動物、微生物、植物若しくは他のドナー（環境試料を含む）等の個人若しくは被検体、又は対象の有機分子を含む他の任意の対象を含み得る。当然ながら、有機体から採取する試料以外の合成分子を含む試料とともに、システムを用いることができる。多くの場合に、分子は、最終的対象の特定機能を有するその遺伝子及び変異体を決定できる配列のデオキシリボ核酸、リボ核酸又は塩基対を有する他の分子を含み得る。
【００２９】
試料１６を試料／ライブラリ調製システム１８に導入する。このシステムは、分析用試料を分離でき、切断でき又は調製できる。結果として生じるライブラリは、シーケンシング作業を促進する長さの対象分子を含み得る。結果として生じるライブラリはその後器械１２に供給され、器械１２においてシーケンシング作業が行われる。実際問題として、テンプレートと呼ぶこともできるライブラリを、自動的プロセス又は半自動的プロセスで試薬と結合し、その後、シーケンシング前にフローセルに導入する。
【００３０】
図１に示す実施形態では、器械は、試料ライブラリを受けるフローセル又はアレイ２０を含む。フローセルは、ライブラリの分子の付着とシーケンシング作業中に検出できる位置又は部位での増幅とを含む、発生ケミストリーをシーケンシングできる１つ以上の流体チャネルを含む。例えば、フローセル／アレイ２０は、位置又は部位の１つ以上の表面に固定されるシーケンシングテンプレートを含み得る。「フローセル」は、パターン化されたアレイ、例えばマイクロアレイ及びナノアレイ等を含み得る。実際問題として、当該位置又は部位を、支持部の１つ以上の表面上に、規則的な繰り返しパターン、複雑な非繰り返しパターン又はランダム配置で配置できる。発生ケミストリーをシーケンシングできるように、フローセルはまた、物質を導入でき、例えば、反応及びフラッシング等に用いる、様々な試薬、バッファ及び他の反応媒体を包含できる。物質は、フローセルを通って流れ、個々の部位で対象分子と接触できる。
【００３１】
器械において、フローセル２０を、この実施形態では符号２４で示す１つ以上の方向で移動できる、可動ステージ２２上に装着する。フローセル２０を例えば、試薬及び他の流体をフローセル２０から又はフローセル２０へ搬送できるために、可動ステージ２２上のポート又はシステムの他の要素とのインタフェースとできる、取外し可能かつ交換可能なカートリッジの形態で設けることができる。ステージを、シーケンシング中に放射又は光２８をフローセルに向けることができる光学検出システム２６と関連付ける。光学検出システムは、フローセルの部位に配置される分析物を検出するために蛍光顕微鏡法等の様々な方法を使用できる。非限定的な例として、光学検出システム２６は、共焦点線走査を使用して、プログレッシブピクセル化画像データを生み出すことができる。プログレッシブピクセル化画像を分析して、フローセルに個々の部位を配置して、各部位に直近に付着又は結合したヌクレオチドの種類を決定することができる。試料に沿って１つ以上の放射地点を走査する技術又は「ステップアンドシュート」撮像アプローチを使用する技術等の他の撮像技術も適切に使用できる。光学検出システム２６及びステージ２２は、領域の画像を取得する間又は説明するようにフローセルを任意の適切なモード（例えば点走査、線走査、「ステップアンドシュート」走査）で走査できつつ、フローセル及び検出システムの静的関係を維持するように協働することができる。
【００３２】
撮像するため、より一般的には部位で分子を検出するために多数の技術を使用できる一方、現在考えられる実施形態は、蛍光タグを励起させる波長での共焦点光学撮像を使用できる。自らの吸収スペクトルによって励起されるタグは、自らの発光スペクトルによって蛍光シグナルを戻す。光学検出システム２６は、このようなシグナルを捕捉して、信号発生部位を分析できる解像度でピクセル化画像データを処理し、結果として生じる画像データ（すなわちピクセル化画像データから得られるデータ）を処理及び保存するように構成される。
【００３３】
シークエンシング作業において、例えば単一のヌクレオチド又はオリゴヌクレオチドに関する反応を促進する、周期的かつ自動的な又は半自動的な作業又は処理が実装される。当該反応に続いて、その後のサイクルに備えるフラッシング、撮像及びデブロッキングが行われる。シーケンシングしフローセル上に固定するために調製される試料ライブラリは、あらゆる有用な情報をライブラリから引き出す前に、多数のこのようなサイクルを経ることができる。光学検出システムは、電子検出回路（例えばカメラ又は撮像電子回路又はチップ）を使用することで、シーケンシング作業の各サイクル中に、フローセル（及びその部位）の走査から画像データを生成できる。その後、結果として生じる画像データを分析して、撮像データで個々の部位を配置し、部位に存在する分子を、部位の画像データにおけるピクセルの群又はクラスタが示す、特定の位置で検出された具体的な色又は光の波長（特定の蛍光タグの特徴的な発光スペクトル）等に関して分析及び特徴付けできる。デオキシリボ核酸又はリボ核酸のシーケンシングを適用する際に、例えば、４つの共通ヌクレオチドを、識別可能な蛍光発光スペクトル（光の波長又は波長範囲）によって表すことができる。それぞれの発光スペクトルをその後、当該ヌクレオチドに対応する値に割り当てることができる。この分析及び周期的に決定される各部位に対する値の追跡に基づいて、各部位に対して個々のヌクレオチド及びヌクレオチドの順序を決定することができる。その後これらの配列を更に処理して、遺伝子及び染色体等を含むより長いセグメントをアセンブルすることができる。本明細書で使用される用語「自動的」及び「半自動的」は、作業を開始した後又は作業を含むプロセスを開始した後、人間による干渉がほとんど無い状態又は全く無い状態で、システムのプログラミング又は設定によって作業を行うことを意味する。
【００３４】
図示した実施形態では、バルブ３２を通じて試薬３０をフローセルに引き込み又は吸引する。バルブは、受容体又は導管から、例えばピペッター又はシッパー（図１には示されていない）によって、受容体又は容器が保管する試薬にアクセスすることができる。バルブ３２は実施される作業の規定のシーケンスに基づいて試薬を選択できる。バルブは、流路３４を通じて試薬をフローセル内に向けるコマンドを更に受け取ることができる。出口又は排出流路３６は、フローセルから使用された試薬を導く。図示した実施形態では、ポンプ３８はシステムによって試薬を移動させて供給する。ポンプは他の有益な機能を、例えばシステムを通る試薬又は他の流体の測定、及び空気又は他の流体の吸引等を提供することもできる。ポンプ３８の下流の追加的なバルブ４０は、使用された試薬を廃棄容器又は受容体４２に適切に導くことができる。
【００３５】
器械は、様々なシステム構成要素を作動させ、センサからのフィードバックによって当該システム構成要素の動作を監視し、画像データを収集し及び画像データを少なくとも部分的に処理する命令に役立つ、ある範囲の回路を更に含む。図１に示す実施形態では、制御／管理システム４４は、制御システム４６とデータ取得及び分析システム４８とを含む。両システムは、１つ以上のプロセッサ（例えばマイクロプロセッサ、マルチコアプロセッサ、フィールドプログラマブルゲートアレイ等のデジタル処理回路又は他の任意の適切な処理回路）と、関連するメモリ回路５０（例えばソリッドステートメモリ装置、ダイナミックメモリ装置並びにオンボード及び／又はオフボードのメモリ装置等）とを含み得る。メモリ回路５０は、機械が実行可能な、例えば１つ以上のコンピュータ、プロセッサ又は他の類似する論理装置を制御してある機能を提供するための命令を記憶できる。特定用途向け又は汎用コンピュータは、少なくとも部分的に制御システム並びにデータ取得及び分析システムを構成することができる。制御システムは、例えば流体制御、光学制御、ステージ制御及び器械の他の任意の有益な機能のためのコマンドを処理するように構成される（例えばプログラムされる）回路を含み得る。データ取得及び分析システム４８は、光学検出システムとインタフェースを取って、光学検出システム若しくはステージ又はこれら両方の移動、周期的検出のための発光、並びに戻った信号の受け取り及び処理等を命じる。器械は、符号５２として示す、器械の制御及び監視、試料の移送、自動化又は半自動化されたシーケンシング作業の起動及びレポートの生成等を可能にするオペレータインタフェース等の様々なインタフェースを含むこともできる。最終的に、図１の実施形態では、外部ネットワーク又はシステム５４を、例えば分析、制御、監視、サービス及び他の作業のために、器械と接続し、器械と協働することができる。
【００３６】
なお、図１では単一のフローセル及び流体通路並びに単一の光学検出システム２６を図示している一方、ある器械には複数のフローセル及び流体通路を収容できる。例えば、現在考えられる実施形態では、このような２つの構造体を設けて、シーケンシング及びスループットを向上させる。実際問題として、任意の数のフローセル及び通路を設けることができる。これらは、同じ又は異なる試薬容器、廃棄容器、制御システム及び画像分析システム等を利用できる。複数の流体システムを設ける場合に、これらを別個に制御することができ、又は調和させて制御することができる。  
【００３７】
図２は、図１のシーケンシングシステムの流体システムの実施例を示す。図示した実施形態では、フローセル２０は、分析（例えばシーケンシングを含む）作業の間、流動物質（例えば試薬、バッファ、反応媒体）を受け取るために、組として集められ得る一連の経路又はレーン５６Ａ及び５６Ｂを含む。レーン５６Ａは共通レーン５８（第１共通レーン）に接続される一方、レーン５６Ｂは第２共通レーン６０に接続される。流体をフローセルに入らずに迂回させ得るバイパスライン６２も設ける。上述したように、一連の容器又は受容体６４は、分析作業の間に利用することができる試薬及び他の流体を保管できる。試薬セレクタバルブ（ＲＳＶ）６６は、モータ又はアクチュエータ（図示せず）に接続されて、フローセルに導入される１つ以上の試薬を選択できる。その後選択される試薬を、同様にモータ（図示せず）を含む共通ラインセレクタバルブ（ＣＬＳＶ）６８に進める。共通ラインセレクタバルブに、共通ライン５８及び６０の１つ以上又は両共通ラインを選択して、試薬６４をレーン５６Ａ及び／若しくは５６Ｂに制御して流すよう、又はバイパスライン６２にバイパスラインを通じて試薬の１つ以上を流すよう命令できる。
【００３８】
使用済み試薬は、フローセルを出て、フローセルとポンプ３８との間に接続されるラインを通る。図示した実施形態では、ポンプは、一対のシリンジ７０を有するシリンジポンプを含む。アクチュエータ７２は、試験、検査及び分析（例えばシーケンシング）サイクルの様々な作業中に、一対のシリンジ７０を制御し移動させて試薬及び他の流体を吸引し、試薬及び流体を排出する。ポンプ組立体は、バルブ、器械及びアクチュエータ等（図示せず）を含む他の様々な部品及び構成要素を含み得る。図示した実施形態において、圧力センサ７４Ａ及び７４Ｂはポンプの入口ラインにかかる圧力を感知する一方、圧力センサ７４Ｃを設けてシリンジポンプが出力する圧力を感知する。
【００３９】
システムが使用する流体は、ポンプから使用済み試薬セレクタバルブ７６に入る。バルブは、使用済み試薬及び他の流体に対する複数流路の１つを選択できる。図示した実施形態において、第１流路は第１使用済み試薬容器７８につながる一方、第２流路は流量計８０を通って第２使用済み試薬容器８２につながる。使用される試薬によっては、試薬を収集すること、又は特定の試薬を廃棄用の別個の容器に置くことが有利となり得て、使用済み試薬セレクタバルブ７６はこのような制御ができる。
【００４０】
なお、ポンプアセンブリ内のバルブは、ポンプに、試薬、溶剤、クリーナ及び空気等を含む様々な流体を吸引させることができ、共通ライン、バイパスライン及びフローセルの１つ以上を通って注入又は循環させることができる。さらに、上述したように、現在考えられる実施形態では、図２に表す流体システムの２つの並列な実装を共通の制御下で設ける。流体システムのそれぞれは、単一の分析器械の一部となり得て、異なるフローセル及び試料ライブラリに対するシーケンシング作業を含む機能を並列に実行できる。
【００４１】
流体システムは、試験、検証及び分析（例えばシーケンシングを含む）等の規定のプロトコルを実装する制御システム４６のコマンドの下で動作する。規定のプロトコルを予め制定でき、規定のプロトコルは、試薬の吸引、空気の吸引、他の流体の吸引、並びにこのような試薬、空気及び流体等の排出等の動作に対する一連のイベント及び作業を含む。プロトコルは、フローセルで起こる反応並びにフローセル及びその部位の撮像等の、器械の他の作業に関するこのような流体作業を調和させることができる。図示した実施形態において、制御システム４６は、バルブに対するコマンド信号を提供するように構成される１つ以上のバルブインタフェース８４と、ポンプアクチュエータの作業を命令するように構成されるポンプインタフェース８６とを使用する。圧力センサ７４Ａ−Ｃ及び流量計８０等からのフィードバックを受け取って当該フィードバックを処理する、様々な入力／出力回路８８も設けられる。
【００４２】
図３は、制御／管理システム４４の特定の機能的要素を示す。図示するように、メモリ回路５０は、試験中、試運転中、トラブルシューティング中、サービス中及び分析作業中に実行される規定の手順を記憶する。このような多数のプロトコル及び手順をメモリ回路に実装でき記憶でき、これらを時々更新又は変更することができる。図３に示すように、これらは、様々なバルブ、ポンプ及び他の任意の流体アクチュエータを制御するとともに、バルブ等の流体センサ並びに流れ及び圧力センサからのフィードバックを受け取り処理する流体制御プロトコル９０を含み得る。ステージ制御プロトコル９２は、例えば撮像中に、フローセルの所望の移動を可能とする。光学制御プロトコル９４は、撮像要素にフローセルの一部を照射する命令を発行できるとともに、処理を行うため戻った信号を受け取る命令を発行できる。画像取得及び処理プロトコル９６は、分析に関して有益なデータを抽出するために、画像データを少なくとも部分的に処理できる。他のプロトコル及び手順を、同一のメモリ回路又は符号９８で示す異なるメモリ回路で提供することができる。実際問題として、メモリ回路を、揮発性メモリ及び不揮発性メモリの両者等の１つ以上のメモリ装置として設けることができる。このメモリを、器械内に存在させることができ、オフボードとすることができる。
【００４３】
１つ以上のプロセッサ１００は、記憶されたプロトコルにアクセスし、器械上で当該プロトコルを実行する。上述したように、処理回路を、特定用途向けコンピュータ、汎用コンピュータ又は任意の適切なハードウェア、ファームウェア及びソフトウェアプラットフォームの一部とすることができる。人間のオペレータが、オペレータインタフェース１０１を経て、プロセッサ及び器械の作業に命令することができる。オペレータインタフェースによって、試験、試運転、トラブルシューティング及びサービスを行うことができ、またオペレータインタフェースは器械で発生し得る任意の問題を報告することができる。またオペレータは、分析作業を起動でき監視できる。
【００４４】
図４は、器械１２の実施形態に関する流体システム１２０の一部を示す。矢印は、物質（例えば試薬、バッファ及び分析物）を試料分析中に図示される様々な流路を通じて流す能力を示す。図４に示す実施形態に関して、フローセル２０は、レーングループＡ及びレーングループＢとして表示される、２つのレーングループを含む。フローセル２０の他の実施形態は、異なる数のレーングループ、例えば３つ以上のレーングループを含み得る。更に他の実施形態では、フローセル２０は、１つのみのレーングループを含むことができる。フローセル２０を、分析システムにおける取外可能な及び／又は交換可能な品目とすることができる。
【００４５】
図示した２つのレーングループＡ及びＢはそれぞれ、２つの流体チャネル又はレーンを含み、図４において当該流体チャネル又はレーンをレーンＬ１、Ｌ２、Ｌ３及びＬ４として示す。この点について、レーングループＡ及びＢがそれぞれ２つのレーンを含むため、レーングループＡ及びＢを「レーンペア」と呼ぶことができる。図示した実施形態に関して、フローセル２０は、分析プロトコルの間、レーングループＡ及びＢを通じて、物質（例えば流体）を矢印が示す方向に動かすように設計される。試験等のための他のプロトコルは、ある物質を異なる方向に流すことができる。
【００４６】
さらに、図４に示す流体システムのポンプ３８は、多数のシリンジポンプ１２４（例えばシリンジポンプ１２４Ａ及び１２４Ｂ）を含む。図示したように、シリンジポンプ１２４はそれぞれ、アクチュエータ１２８（例えばアクチュエータ１２８Ａ及び１２８Ｂ）が作動させる、１つ以上のシリンジ１２６（例えばレーングループＡに対応するシリンジ１２６Ａ及びレーングループＢに対応するシリンジ１２６Ｂ）を含む。図示したシリンジポンプ１２４はバルブ１３０（例えばバルブ１３０Ａ及び１３０Ｂ）も含み、シリンジポンプはバルブ１３０によって、流体を、ポンプ１２４の様々なオリフィス又はポートに押込み又は引出し得る。
【００４７】
シリンジポンプ１２４、試薬セレクタバルブ６６及び共通ラインセレクタバルブ６８の制御によって、フローセル２０を通じて流体を進める方法を、完全に又は部分的に調整する。図２に関して上述したように、試薬セレクタバルブ６６を、様々な試薬の試薬源に流体結合させ、試薬源と共通ラインセレクタバルブ６８との間で選択的に流体結合させ得る。例として、試薬セレクタバルブから共通ラインセレクタバルブへの共通ライン１４０は、試薬セレクタバルブ６６の試薬出口ポートを、共通ラインセレクタバルブ６８の共通ライン入口ポートと流体的に結合できる。そして試薬セレクタバルブから共通ラインセレクタバルブへの共通ライン１４０は、様々な流体（例えば試薬）を試薬セレクタバルブ６６と共通ラインセレクタバルブ６８との間で流すように設計される。
【００４８】
本明細書で更に詳細に議論するように、共通ラインセレクタバルブ６８は、（例えば選択される試薬ポートを経て）試薬セレクタバルブ６６で選択される試薬と、フローセル２０内の様々な流路との間を選択的に流体結合できる。このようにして、共通ラインセレクタバルブ６８をフローセル２０に結合して、流体に関してフローセル２０を通る流路を、複数の流路から選択する。当該複数の流路は、フローセルのあるチャネルを通る第１流路と、フローセルの第２チャネルを通り第１流路とは異なる第２流路と、を含む。ある実施形態では、複数の流路は、第１流路及び第２流路の両方を含む第３流路を含む。図示される実施形態において、当該構成は、共通ラインセレクタバルブ６８がとりわけ、試薬セレクタバルブ６６と、レーングループＡ及びＢ（それぞれ第１レーングループ及び第２レーングループ）の一方又は両方との間を選択的に流体結合できるように構成されることを意味する。そしてある実施形態では、共通ラインセレクタバルブ６８がとりわけ、試薬セレクタバルブ６６と、他の流路との間を選択的に流体結合できるように構成されることを意味する。このようにして、共通ラインセレクタバルブ６８は、フローセル２０の各レーングループ又はレーンペアを個々にアドレス指定できる。また共通ラインセレクタバルブ６８は、試薬セレクタバルブ６６と、バイパスライン１４２との間を選択的に流体結合できる。この構成は、フローセル２０を通じて流体を吸引すること無しに試薬を使用する準備をする（prime）のに有益となることができ、特定の試験プロトコル及び他のプロトコルに対して有益となることができる。本明細書で使用する用語「流体的に結合する」は、流路間に流体を流すことができる、流路間の結合を示すことを意図する。したがって、選択される又は選択的な流体結合は、選択的に流路を結合して流体を当該流路間に流せる能力を示し、当該流路は他の状態（流体的に結合されていないとき）では互いに流体的に分離される（流体は当該流路間を流れることができない）。分析作業の間、制御回路は自動的に、共通ラインセレクタバルブ６８に（例えばモータによって）分析プロトコルに基づいて流路を選択するよう命令する。例えば、フローセルをシーケンシングシステムに装着でき、フローセル２０が適切に装着されているときに、１つ以上のマニホールド（例えば複数のマニホールド）はフローセル２０を共通ラインセレクタバルブ６８と係合できる。制御回路は、ある診断を実施して適切な流体接続が確立されていることを保証でき、流体システム１２０の試薬プライミングを含む特定の予分析作業（例えば予シーケンシング作業）を実施でき、その後様々な分析（例えばシーケンシングを含む）プロトコルを開始することができる。
【００４９】
上述したように、共通ラインセレクタバルブ６８を用いる選択的流体結合を、バルブ６８のある物理構成を使用して達成できる。バルブ６８の実施形態を図５に模式的に示す。図示するように、共通ラインセレクタバルブ６８は、互いに分離して表される静止部１５０と可動部１５２とを含む。組立時に、静止部１５０及び可動部１５２は、これらそれぞれの流体要素（例えば流体ポート、流体チャネル）間での流体漏れを妨げるように、互いに直接当接するように位置付けられる。可動部１５２は、静止部１５０に対して矢印１５４で表すように移動（例えば平行移動、回転）して、これらそれぞれの流体要素間で様々な流体接続を形成するように構成される。可動部１５２が平行移動し、回転し又はこれら両方を行うかどうかは、共通ラインセレクタバルブ６８の特定幾何学的形態（例えば長尺、環状、多角形状）とともに、バルブ６８の様々な機械結合１５６及び流体結合１５８の性質によることができる。共通ラインセレクタバルブ６８の機械結合１５６は、バルブ６８とシーケンシングシステム１０の他の構成要素（例えばバルブ６６，６８を含むマニホールド組立体のハウジング及び本明細書で説明する様々な流路）との間でファスナによって行う結合を含むことができる。機械結合１５６は、可動部１５２とモータ等のアクチュエータとの間の結合、及び可動部１５２と静止部１５０との間の結合も含み得る。
【００５０】
流体結合１５８を動的として、調整、閉鎖、開放、形成及び閉塞等することができる。流体結合１５８は、図４の共通ライン５８及び６０並びに試薬セレクタバルブから共通ラインセレクタバルブへの共通ライン１４０等の様々なライン（例えば図２の流路３４）への結合を含み得る。ある実施形態では、流体結合は、例えばフローセル２０がシーケンシングシステムに装着されているときに、作動して共通ラインセレクタバルブ６８をフローセル２０に流体的に結合する、１つ以上のマニホールドを含み得る。
【００５１】
本実施形態によれば、可動部１５２の静止部１５０に対する動き１５４は、個々のチャネル１６０と個々のポート１６２との間の重なりを調整して、流体的に結合されるポートの様々な組み合わせを生み出す。流体的に結合されるポートの様々な組み合わせを用いて、フローセル２０を通る流体の流路を定める。
【００５２】
図示される実施形態では、個々のチャネル１６０は可動部１５２の一部であり（例えば可動部１５２に形成される）、個々のポート１６２は静止部１５０の一部である（例えば静止部１５０に形成される）。しかしながら、共通ラインセレクタバルブ６８の他の実施形態は、個々のポート１６２の一部又は全部を可動部１５２に有することができ、個々のチャネル１６０の一部又は全部を静止部１５０に有することができる。個々のチャネル１６０及び個々のポート１６２の各部分の構成を、例えばサブトラクティブ製造（例えばエッチング、機械加工及びリソグラフィ）又は付加製造によって達成できる。共通ラインセレクタバルブ６８の１つ以上の材料を、システム１０（図１）分析及びの試験プロトコル中に、通常使用される流体に耐えるように選択又は設計でき、例えば１つ以上の材料が試薬から離し、ひび割れ又は他の化学的に誘起される劣化を妨げることができる。さらに、共通ラインセレクタバルブ６８の１つ以上の材料を、可動部１５０と静止部１５２との間で、ある摩擦係数を有し、アクチュエータ又はユーザが加える一定の大きさの力の下で可動部１５２が依然として自由に移動できつつ、可動部１５２の偶発的変動に十分抵抗するように選択することができる。
【００５３】
図示するように、可動部１５２及び静止部１５０は、軸線方向１６４で重なる環状の幾何学的形状を含む。図示する実施形態では、可動部１５２の中心点１６６と静止部１５０の中心点１６８とが軸線方向１６４に沿って実質的に位置合わせされるように重なる。バルブ６８の他の実施形態は、例えばバルブ６８を含むカートリッジ内の空間的制約及び特定の設計留意点等のために、中心点１６６，１６８が互いにオフセットされる配置を有することができる。実際に、可動部１５２及び静止部１５０の寸法は同じでなくても良く、例えば同じ周長、長さ又は深さを有するとともに相違する幾何学的形状（相違する形状）を有することができる。例えば、図５の概略図において、可動部１５２が静止部１５０に対して積層される関係が表されている一方、共通ラインセレクタバルブ６８のある実施形態は、静止部１５２内に入れ子式にされる（が同様に積層される関係である）可動部１５２を有することができる。
【００５４】
共通ラインセレクタバルブ６８を用いて流体結合を生成するために、静止部１５０の厚さ１７０にわたって（例えば平行な平面１７２，１７４の間を）延びる特定の個々のポート１６２は、特定の内部チャネル１６０と軸線方向１６６で位置合わせされる。個々のポート１６２は、表面１７２から静止部１５０を通って表面１７４に延びる。表面１７２は、可動部１５２から離れる方向を向く静止部１５０の第１側面である。表面１７４は、可動部１５２を向くとともに可動部１５２に直接当接する静止部１５０の第２側面である。静止部１５０において、個々のポート１６２は互いに分離し異なるものである。個々のポート１６２を用いて、流体結合１５８の配置によって、流体を送達し又は受け取ることができる。
【００５５】
本実施形態によれば、個々のチャネル１６０は、互いに結合される個々のポート１６２の異なる組み合わせが可能な幾何学的形状を有する。この構成は、共通ラインセレクタバルブ６８のポートの様々な例示的組み合わせを含む、図６に模式的に表される。図示されるように、共通ラインセレクタバルブ６８の実施形態は、５つの異なるポートを含むが、他の実施形態では他の数のポートを含むことができる。
【００５６】
例示的バルブ構成６８Ａによって表現されるように、バルブ６８の第１流体チャネル１６０Ａは、ポート１，２及び３を流体的に結合する。一例として、ポート２を入口とするとともにポート１及び３をレーングループの出口（レーングループにつながる）とすることができる。このような構成を、高スループット構成と呼ぶことができ、当該構成では、例えば並列レーングループＡ及びＢにおいて、並行する作業（例えばシーケンシング作業）を実施する。ある試験プロトコル、例えば圧力試験プロトコルにおいて、ある流体を異なる流れ方向に進めることが、すなわちレーングループＡ及びＢから進めてバルブ６８及び共通ライン１４０を通じて戻すことができる。
【００５７】
また、例示的バルブ構成６８Ｂでは、バルブ６８の第２流体チャネル１６０Ｂは、ポート２及び３のみを流体的に結合する。したがって、２が流体入口であるとともに、３が流体出口である実施形態では、共通ラインセレクタバルブ６８はフローセル２０を通る単一のレーングループの流れを選択する。バルブ構成６８Ｃでは、第３流体チャネル１６０Ｃは、ポート２及びポート５を流体的に結合する。このような構成において、共通ラインセレクタバルブ６８は、これらのポートの間のみに流体を流し、ポート５が流体的にレーングループ以外のライン（例えばバイパスライン）に流体的に接続されているときには、流体をフローセル２０のレーングループに流さず、その代わりにレーングループをバイパスする。共通ラインセレクタバルブ６８の様々なポートの流体結合は、図６に表す組み合わせ以外の組み合わせをもたらすことができ、実際に、共通ラインセレクタバルブ６８の実施形態を用いてポートのいずれか１つ又は組み合わせを選択することができる。
【００５８】
流体的に結合されるポートの様々な組み合わせを、共通ラインセレクタバルブ６８の可動部１５２を静止部１５０に対して移動させて、可動部１５２の様々な個々のチャネル１６０を、静止部１５０の個々のポート１６２の幾つかの組み合わせと位置合わせすることで構成する。共通ラインセレクタバルブ６８の実施形態の立面断面図である図７Ａ及び７Ｂを参照して、チャネル１６０を使用してポート１６２を流体的に結合できる方法が、更に理解される。図７Ａ及び７Ｂに示す実施形態では、図を明瞭にするために、ポート１６２のあるポート（例えばバイパスライン及び空気入口ポート）は図示されていない。しかしながら、バルブ６８の様々な領域にこのようなポートが存在できることを理解するはずである。
【００５９】
図７Ａ及び７Ｂでは、可動部１５２を静止部１５０の容器領域１８０内で入れ子にし、可動部１５２は静止部１５０に対して回転可能である。描写される実施形態において、第１チャネル１６０Ａは第１ポート（レーングループＡのポート１６２Ａ）、第２ポート（レーングループＢのポート１６２Ｂ）及び第３ポート（試薬セレクタバルブのポート１６２Ｃ）と軸線方向で重なり、これらポートを互いに流体的に結合する。本実施形態によれば、図示するように、チャネル１６０は可動部１５２の厚さ１８２（平行な表面１８４，１８６間の距離によって定められる）の一部のみにわたって延びる。表面１８４は静止部１５０の表面１７４に当接し、表面１８６は静止部１５０から離れる方向を向く。
【００６０】
可動部１５２は静止部１５０に対して密封されるため、流体はポート１６２Ａ，１６２Ｂ及び１６２Ｃの間のみを通過する。例えばシーケンシングプロトコルの一部の間に、物質がフローセル２０（図４）内に進むときに、流体は、第１チャネル１６０Ａの形状によって定まる、ポート１６２Ｃからポート１６２Ａ及び１６２Ｂに延びる矢印が描写するようにのみ流れることができる。さらに、共通ラインセレクタバルブ６８が可動部１５２を図７Ａに対して回転させることによって生み出される方向を向く、図７Ｂに表されるように、可動部１５２（可動部１５２の本体）はレーングループＡのポート１６２Ａに対して堅く密封されて、流体はポート１６２Ａから出ない。図７Ａの第１チャネル１６０Ａがポートと位置合わせされる代わりに、図７Ｂでは、第２チャネル１６０Ａがポート１６２Ｂ及び１６２Ｃと位置合わせされ、これにより２つのポート１６２Ｂ及び１６２Ｃを流体的に接続して、共通ラインセレクタバルブ６８から各ポートを通じて流体を流す。例えばシーケンシングプロトコル中、流体がフローセル２０内に進むときに、流体は、矢印が表すように、試薬セレクタバルブ６６から、試薬セレクタバルブのポート１６２Ｃを通じ、第２チャネル１６２Ｂを通じ、レーングループＢのポート１６２Ｂから（例えば図２及び４のライン６０を経て）レーングループＢに流れることができる。
【００６１】
可動部１５２の静止部１５０に対する位置を調整するとともにポンプ３８を用いて適切に吸引することで、他の多数の流体結合及び流れ方向を実現することができる。それから、可動部１５２及び静止部１５０の両方が環状である実施形態では、可動部１５２の回転によって、円弧状チャネル１６０の特定のチャネルを、可動部１５０の様々な周方向位置に位置付けられるポート１６２の１つ以上と位置合わせするように機能する。チャネル１６０は様々な幾何学的形状を有することができ、一般に様々な形状を示すが、ある共有パラメータ（例えば、可動部１５２の厚さ１８２に沿う、チャネル１６０の寸法によって定められるチャネル深さ、可動部の半径方向における、チャネル１６０の寸法によって定められるチャネル幅）を有する。様々な幾何学的形状によって、様々な流体接続を構成することができる。
【００６２】
試薬セレクタバルブ６６、レーングループＡ及びＢ、バイパスライン１４２、並びに空気に対するポートを有する共通ラインセレクタバルブ６８の一実施形態を、図８Ａから８Ｆに表す。図８Ａから８Ｆは、様々な位置及び方向における共通ラインセレクタバルブ６８の平面図である。様々なシェーディング又はハッシングを用いて、共通ラインセレクタバルブ６８の複数ポート１６２の間を区別する。シーケンシングシステムの制御回路は、図８Ａから８Ｆに示す共通ラインセレクタバルブ６８の一連の位置を指示して、例えば、ある試験作業、予シーケンシング作業又はシーケンシング作業に対応付けることができることが理解されるはずである。
【００６３】
図８Ａ−８Ｆに示す共通ラインセレクタバルブ６８は、軸線方向１６４の周りを回転するとともに様々な内部チャネル１６０を含む、可動部１５２を有する。また、可動部１５２はポート１６２に対して堅く密封され、チャネル１６０が適切に位置合わせされて他のポート１６２に流れることができない限り、流体はポート１６２から出ない。例えば、図８Ａに示す共通ラインセレクタバルブ６８の方向によって、試薬セレクタバルブのポート１６２Ｃを、レーングループＡのポート１６２Ａ及びレーングループＢのポート１６２Ｂの両方に、第１チャネル１６２Ａの実施形態を用いて流体的に結合する。以下、図８Ａに示す共通ラインセレクタバルブ６８の方向を、「試薬セレクタバルブからレーングループＡ及びＢまで」の位置と呼ぶ。第１チャネル１６０Ａは、軸線方向でポート１６２Ａ，１６２Ｂ及び１６２Ｃと重なり、ポート１６２Ａ，１６２Ｂ及び１６２Ｃを一緒に流体的に接続するように、幾何学的に設計される。なお、図８Ａに表す位置において、共通ラインセレクタバルブ６８の残りのチャネル１６０は、共通ラインセレクタバルブ６８の他のポート１６２と一緒に結合しないように位置付けられ幾何学的に設計される。
【００６４】
静止部１５０に対して可動部１５２を軸線方向１６４周りに、時計回りに回転することで、共通ラインセレクタバルブ６８を図８Ｂに表す位置に移す。これにより、レーングループＡのポート１６２Ａを試薬セレクタバルブのポート１６２Ｃに、第２チャネル１６２Ｂの実施形態を用いて流体結合する。以下、当該位置を、「試薬セレクタバルブからレーングループＡまで」の位置と呼ぶ。第２チャネル１６０Ｂは、軸線方向でポート１６２Ａ及び１６２Ｃと重なり、ポート１６２Ａ及び１６２Ｃを一緒に流体的に接続するように、幾何学的に設計される。図示するように、図８Ｂに表す位置において、共通ラインセレクタバルブ６８の残りのチャネル１６０は、共通ラインセレクタバルブ６８の他のポート１６２と一緒に結合しないように位置付けられ幾何学的に設計される。したがって、第１チャネル１６０Ａは、レーングループＢのポート１６２Ｂに流体的に結合するが、複数チャネル１６０は互いに流体的に分離されているため、レーングループＢのポート１６２Ｂは、他のポートから流体的に分離されたままである。
【００６５】
時計回りの回転を進めて、共通ラインセレクタバルブ６８は、図８Ｃに表す構成に移る。当該位置では、試薬セレクタバルブのポート１６２ＣをレーングループＢのポート１６２Ｂに第２チャネル１６０Ｂを用いて流体的に結合する。以下、当該位置を、「試薬セレクタバルブからレーングループＢまで」の位置と呼ぶ。第２チャネル１６０Ｂを適切な寸法にして、隣接する２つのポート１６２のみを結合するため、第２チャネル１６０Ｂをいくつかの異なる位置で隣接するポートを結合するために利用できる。したがって、本実施形態によれば、チャネル１６０の１つを用いて、複数ポート１６２間の流体結合の複数の組み合わせを生み出すことができる。ここで、残りのポート１６２は、ポート１６２のそれぞれの位置との組み合わせで、チャネル１６０の位置決め及び幾何学的設計のために他のポート１６２からもう一度分離される。
【００６６】
図８Ａ−８Ｃに示す方向は、図４に示す流体システム１２０の実施形態が、上述したように、試薬セレクタバルブ６６から受ける流体を単一レーングループ（例えばレーングループＡ又はＢ）を通じて導き又は両レーングループＡ及びＢを通じて同時に導くように動作できるようにする。さらに、時計回りの回転の文脈で説明される一方、共通ラインセレクタバルブ６８を、これとともに又はこれに加えて、チャネル１６０の現在位置及び所望のポートの組み合わせによって、逆時計回りに回転できる。例えば、図８Ａに表す方向から始まり、可動部１５２を逆時計回りに回転させて、図８Ｄに表す方向を作り出すことができる。
【００６７】
図８Ｄに示す方向は、流体システム１２０の実施形態が、流体を試薬セレクタバルブ６６とバイパスライン１４２との間で流すことができるようにする。以下、当該方向を、「試薬セレクタバルブからバイパスまで」の位置と呼ぶ。この位置では、第３チャネル１６０Ｃの実施形態は、試薬セレクタバルブポート１６２Ｃをバイパスポート１６２Ｄに流体的に結合する。図示する位置では、第３チャネル１６０Ｃは、試薬セレクタバルブポート１６２Ｃ及びバイパスポート１６２Ｄのみを流体的に結合しながら、残りのポート１６２の流体分離を維持するように、幾何学的に設計され位置付けられる。
【００６８】
上述したように、共通ラインセレクタバルブ６８は、空気入口ポート１６２Ｅも含む。空気入口ポート１６２Ｅは、空気を流体システム１２０内に吸引でき、診断又は他の目的に有益でとなり得る。例えば、図８Ｅに示す方向（例えば可動部１５２を図８Ｄから逆時計回りに回転することによって作り出される）は、空気入口ポート１６２Ｅを、レーングループＡのポート１６２Ａ及びレーングループＢのポート１６２Ｂの両方に、第４チャネル１６０Ｄを用いて流体的に結合する。以下、当該方向を、「空気からレーングループＡ及びＢまで」の位置と呼ぶ。図示する方向は、圧力試験又は他のプロトコルの前に、レーングループＡ及びＢを乾燥させるのに有益となり得る。
【００６９】
可動部１５２を更に回転することによって、図８Ｆに示す方向を作り出すことができる。以下、当該方向を、「空気からバイパスまで」の位置と呼ぶ。この構成では、第１チャネル１６０Ａは、空気入口ポート１６２Ｅをバイパスポート１６２Ｄに流体的に結合し、このことは、ある圧力テストの間に空気を流体システム１２０内に導入し得るのに有益である。なお、第２チャネル１６０Ｂも、この流体結合を作り出すことができる。
【００７０】
図８Ａ−８Ｆに示す共通ラインセレクタバルブ６８の方向及び他の潜在的な位置も、プロセッサ１００が流体システムの様々な流路を分離、調製及び試験できる診断目的に有益となり得る。上述した共通ラインセレクタバルブ６８（具体的には試薬セレクタバルブ６６を伴う共通ラインセレクタバルブ６８）のある位置に起因する、流体システム１２０を通る流体の例示的流路を、図９Ａ−９Ｄに描写する。
【００７１】
図９Ａに描写する実施形態では、共通ラインセレクタバルブ６８の位置は、図８Ａに関して説明される「試薬セレクタバルブからレーングループＡ及びＢまで」の位置である。したがって作業中、試薬セレクタバルブ６６は、試薬セレクタバルブから共通ラインセレクタバルブへの共通ライン１４０を通って共通ラインセレクタバルブ６８に進む、試薬６４を選択する。試薬セレクタバルブポート１６２Ｃは、共通ラインセレクタバルブ６８を経て、レーングループＡのポート１６２Ａ及びレーングループＢのポート１６２Ｂにそれぞれ流体的に結合されているため、試薬は、共通ラインセレクタバルブ６８を通って、共通ライン５８及び６０を経てレーングループＡ及びＢに流れる。図９Ａの実施形態において、このことは陰を付けたレーングループＡ及びＢの両方と、フローセル２０を通るシリンジポンプ１２４までの流れの進行を示すボールド体の矢印とに表される。この構成は、フローセル２０に関するシーケンシングスループットの最高水準を表すと考えられる。
【００７２】
図９Ｂに描写する実施形態では、共通ラインセレクタバルブ６８の位置は、図８Ｂに関して説明される「試薬セレクタバルブからレーングループＡまで」の位置である。したがって作業中、試薬セレクタバルブ６６は、共通ライン１４０を通って共通ラインセレクタバルブ６８に進む、試薬６４を選択する。試薬セレクタバルブポート１６２Ｃは、共通ラインセレクタバルブ６８を経て、レーングループＡのポート１６２Ａのみに流体的に結合されているため、試薬は、共通ラインセレクタバルブ６８を通って、共通ライン５８を経てレーングループＡ（レーン１Ｌ１及び２Ｌ２）に流れる。図９Ｂの実施形態において、このことはレーングループＡのみに陰を付けたことと、フローセル２０を通る対応シリンジポンプ１２４Ａまでの流れの進行を示すライン５８のボールド体の矢印とに表される。この構成により、レーングループＢで実行されるシーケンシング作業から分離され当該作業とは異なる、レーングループＡでのシーケンシング作業が可能になり、レーングループＡとレーングループＢとの間でシーケンシング作業のパラメータを独立に制御することができる。
【００７３】
図９Ｃに描写する実施形態では、共通ラインセレクタバルブ６８の位置は、図８Ｃに関して説明される「試薬セレクタバルブからレーングループＢまで」の位置である。したがって作業中及び制御回路の命令時に、試薬セレクタバルブ６６は、共通ライン１４０を通って共通ラインセレクタバルブ６８に進む、試薬６４を選択する。試薬セレクタバルブポート１６２Ｃは、共通ラインセレクタバルブ６８を経て、レーングループＢのポート１６２Ｂのみに流体的に結合されているため、試薬は、共通ラインセレクタバルブ６８を通って、共通ライン５８を経てレーングループＢ（レーン３Ｌ３及び４Ｌ４）に流れる。図９Ｂの実施形態において、このことはレーングループＢのみに陰を付けていることと、フローセル２０を通る対応シリンジポンプ１２４Ｂまでの流れの進行を示すライン５８のボールド体の矢印とに表される。
【００７４】
上述したように、ある実施形態では、レーングループを、共通ラインセレクタバルブ６８の出力から分離し、また試薬を共通ラインセレクタバルブ６８を通じて流し、例えばシーケンシング中に新たな試薬を導入するために流体システム１２０をプライミングすることが好ましいことがある。例えば、あるプロトコルの間、試薬セレクタバルブ６６から共通ラインセレクタバルブ６８を通って延びる流体素子に、使用される試薬を満たすことが好ましいことがある。このような実施形態では、共通ラインセレクタバルブ６８を、図８Ｄに関して説明される「試薬セレクタバルブからバイパスまで」の位置に位置付けることができる。図示される実施形態では、共通ラインセレクタバルブ６８を、試薬セレクタバルブポート１６２Ｃがバイパスポート１６２Ｄのみに流体的に結合され、それにより流体が、バイパスライン１４２と共通ラインセレクタバルブ６８との間で流れるが、共通ラインセレクタバルブ６８とレーングループＡ及び／又はＢとの間では流れないように位置付ける。この構成は、共通ラインセレクタバルブ６８からバイパスライン１４２を通りシリンジポンプに１２４Ａに達するボールド体の矢印として示される。なお、シリンジポンプ１２４Ａ及びシリンジポンプ１２４Ｂの一方又は両方をバイパスライン１４２と組み合わせて使用できるが、ある特定の実施形態では、バイパスライン１４２をシリンジポンプ１２４Ａのみと合わせて使用する。
【００７５】
バイパスポート１６２Ｄを用いる動作の例示的シーケンスを図１０に描写する。図１０は、流体をフローセル２０を通じて吸引することなく、流体システム１２０の特定部分をプライミングする方法２００を示す。なお、このようなプライミングは、マイクロリットルのオーダーの量の流体を利用するシーケンシング作業において、多くの場合重要となる。したがって、流体ライン内に依然として存在する任意の材料は、測定の不正確さ、及び試薬の相対量の変動等をもたらすおそれがある。
【００７６】
プライミングシーケンスを始めるため、２０２で最初に表すように、共通ラインセレクタバルブ６８は第１位置に存在し、この例では共通ラインセレクタバルブ６８は、「試薬セレクタバルブからレーングループＡ及びＢまで」の位置として上述した「高出力」位置に存在する。この位置では、流体システム１２０は、試薬６４の１つ以上を導入するフローセル２０を調製するプロトコルを完了している。
【００７７】
新たな試薬を受け取り使用するように流体システム１２０を準備するため、共通ラインセレクタバルブ６８を、２０４で「試薬セレクタバルブからバイパスまで」の位置として表されるとともに図９Ｄに関して議論される第２位置に（例えばモータ及び関連するコントローラによって）移動することができる。また、この位置では、バイパスポート１６２Ｄ及び試薬セレクタバルブポート１６２Ｃが流体的に接続される。２０２から２０４への移行で表すように、可動部１５２を静止部１５０に対して反時計回りに移動することで、共通ラインセレクタバルブ６８を、第１位置から第２位置へ変位させることができる。これにより、第３チャネル１６０Ｃを、試薬セレクタバルブポート１６２Ｃ及びバイパスポート１６２Ｄを流体的に結合する位置に移動させる。
【００７８】
試薬セレクタバルブ６６も（例えばモータ及び関連コントローラによって）制御可能に位置付けられて、２０６において表すように、所望の試薬を選択する。試薬セレクタバルブ６６は、様々な利用可能試薬に対応する多数の異なる位置を有することができ、試薬を、適切に選択しているときに、続いて試薬を試薬セレクタバルブ６６を通じて共通ライン１４０に共通ラインセレクタバルブ６８へ向かって吸引し得る。２０８で表すようなかかる吸引を、シリンジポンプ１２４の１つ以上を用いて達成できる。図示される実施形態では、シリンジポンプ１２４はバイパスライン１４２に流体的に結合され、次にバイパスライン１４２はバイパスループ２１０に流体的に結合される。バイパスループ２１０は、流体システム１２０をプライミング及び／又はフラッシングするために使用される物質に関するキャッシュとして役立つことができる。バイパスループ２１０は、例えば適切な量のバッファ及び試薬等をキャッシングできるように、共通ライン５８，６０の直径又は幅よりも大きな直径又は幅を有することができる。図示される実施形態によれば、選択される試薬６４を、バイパスライン１４２に入れることなく、バイパスループ２１０内に吸引する。
【００７９】
試薬がバイパスループ２１０内に適切に吸引されると、試薬を試薬セレクタバルブ６６の補助廃棄物ポートに又はシリンジポンプ廃物物に直接分注することができる。例えば、２１２で表すように、このことを、試薬セレクタバルブ６６をその廃棄物ポートに移すとともにシリンジポンプ１２４にバイパスライン１４２及びバイパスループ２１０を加圧させて、試薬を２０８で実施される吸引と比較して逆方向に流すことによって実施できる。２１４で表すように、プライミングを望む各試薬に対して、前述したプロセスを実施でき、続いて共通ラインセレクタバルブ６８を適切なシーケンシング位置（例えば試薬セレクタバルブからレーングループＡ及びＢまでの位置）に移行して戻すことができる。
【００８０】
図１１を参照して、本明細書で説明する様々な構成の様々な接続及び流体ライン等の性質を更に理解することができる。図１１は、試薬セレクタバルブ６６、共通ラインセレクタバルブ６８、バイパスループ２１０及び様々な流体接続を有するマニホールド組立体２２０の斜視図である。ある実施形態において、マニホールド組立体２２０を、様々な試薬コンテナとのインタフェースとなって、試薬セレクタバルブ６６が、このような試薬を、フローセル２０に最終的に送達するために試薬源から選択できるように構成されるシッパーマニホールド組立体であると考えることができる。
【００８１】
マニホールド組立体２２０は、試薬及び他の流体に関する流路を定めるために形成されるチャネルを含む。図１１に見られるように、モータ２２２及び２２４はバルブ６６及び６８を駆動し制御する。１つ以上のモータインタフェース又は接続部２２６は動力を供給し、必要に応じて、モータへ信号を供給するとともにモータから信号を受け取る。上述したように、制御回路は、試験中、試運転中及びサービス中並びに複数シーケンシング作業中、モータを制御する（とともにモータを用いてバルブを制御する）。
【００８２】
マニホールド組立体２２０内の試薬及び流体経路は、作業中それぞれの容器（図示せず）から試薬及び他の流体を引き出すシッパー２２８に結合する。図１１で一般に符号２３０で示す、試薬及び流体に対する流路を、成型、エッチング又は他の適切なプロセスによってマニホールド組立体２２０の本体２３２（例えばモノリシック構造）に形成して、上述したポンプが試薬及び流体を吸引するよう命令されるときに、試薬及び流体をシッパーからバルブへ移動させることができる。シッパーの少なくとも１つを、（例えば反応及び撮像前の）シーケンシング作業中に試薬を混合する際に支援するノズルシッパー２３４として構成する。また図１１には、試薬及び流体を混合し（例えばこれにより混合容積として役立つ）、必要に応じて流体システム１２０をプライミングするために、引き出し移動させ得るバイパスループ２１０を示す。バイパスループ又はバイパスラインが混合容積として役立つ実施形態では、混合容積をバイパスライン６２又はバイパスループ２１０の一部又は全部とすることができる。例えば、試薬を所望の配列でバイパスループ又はライン内に吸引できるが、試薬がバイパスループ又はラインの全長は通過しない（これにより、試薬を廃棄するルートで送り得る）。バイパスライン（またはバイパスラインにおいて混合容積として役立つ部分）に試薬の所望の配列をロードすると、例えば行先容器につながる流路と流体的に接続して、その後バイパスライン内にロードされた試薬のセット全体をバイパスラインから行先容器に戻し排出できるように、バルブを用いて、試薬が導入されるバイパスラインの端部を切り替えることができる。行先容器を例えば、コンテナ、チューブ又は試薬を包含するように設計される他の容器とすることができる。行先容器を例えば、一時的作業容積として使用できる。試薬及び／又は他の材料を、例えば混合によってフローセルへの搬送用に調製するために、当該一時的作業容積に送達できる。このように、試薬及び他の流体を、行先容器で調製した後、行先容器からフローセルに送達することができる。
【００８３】
本明細書では、表現「流体的に接続される」等を用いて、互いに流体的に連通するように配置する２つ以上の構成要素間の接続を説明でき、同様に、表現「電気的に接続される」を用いて、２つ以上の構成要素間の電気接続を説明できることが理解される。表現「流体的に挿入される」を用いて、例えば構成要素の特定の順序を説明できる。例えば、構成要素Ｂが構成要素Ａと構成要素Ｃとの間に流体的に挿入される場合、構成要素Ａから構成要素Ｃまで流れる流体は、構成要素Ｃに到達する前に構成要素Ｂを通って流れることができる。
【００８４】
本明細書で説明する実施形態に従って、シーケンシングシステムを動作させる様々な方法を実施することができる。一例として、図１２は、共通ラインセレクタバルブ６８を有するシーケンシングシステムを動作させて、例えばフローセル２０のレーングループを個々にアドレス指定する、方法２４０の実施形態を描写する。例えばシーケンシングプロトコル又は試験プロトコル等の間、制御回路が実行する命令に基づいて、方法２４０の全部又は一部を実施できる。なお、さらに、本明細書で説明する特定のふるまいを、示される順序とは異なる順序で実施でき又は完全に除外でき、必要に応じて他の作業を方法２４０に含むことができる。
【００８５】
上述したように、シーケンシングシステムの特定の構成要素を着脱可能、交換可能又は使い捨てとできる。例えばある実施形態において、フローセル２０を、シーケンシングシステムの様々なコネクタとインタフェースをとるように構成される特徴を有する使い捨てカートリッジ又は類似する構造の一部とすることができる。したがって、方法２４０は、例えば制御回路がフローセル２０がシーケンシングシステムに装着されたと判定するときに、フローセル２０を、共通ラインセレクタバルブ６８とフローセル２０との間の１つ以上の（例えば複数の）マニホールドと流体的に係合するステップ（ブロック２４２）を含む。当該流体係合によって、試薬セレクタバルブ６６及び共通ラインセレクタバルブ６８から試薬を移す前に、フローセル２０が共通ラインセレクタバルブ６８と係合する。
【００８６】
方法２４０は、共通ラインセレクタバルブ６８を（例えば共通ラインセレクタバルブ６８の位置を）制御して、フローセル２０を通る流路を、フローセルを通る複数の流路から選択するステップ（ブロック２４４）も含む。例えば、フローセル２０を通る流路を選択するステップは、どのレーンを通って流体がフローセル２０内を流れるかを選択することを含み得る。例えば図９Ａから９Ｃを参照して、制御回路は、（例えば図９Ｂに表すように）レーングループＡのみを通って流れる第１流路、（例えば図９Ｃに表すように）レーングループＢのみを通って流れる第２流路、又は（例えば図９Ａに表すように）第１流路及び第２流路の両方を含む第３流路の間で選択できる。
【００８７】
フローセル２０に関する適切な試薬の選択に関して、試薬に関する適切な流路を選択できる。したがって、方法２４０は、（ブロック２４６において）シーケンシングプロトコルに従って、試薬セレクタバルブ６６を制御して、複数の試薬から、共通ラインセレクタバルブ６８及びフローセル２０を通じて変位させる様々な試薬を選択するステップを含むことができる。試薬セレクタバルブ６６は、流体的に共通ラインセレクタバルブ６８の上流である。
【００８８】
方法２４０は、その後（ブロック２４８において）シーケンシングプロトコルに従って選択される流路を通じて試薬を変位させるステップを含む。例えば、制御回路は、ポンプ３８に、選択される試薬を、試薬セレクタバルブ６６を通じ、試薬セレクタバルブから共通ラインセレクタバルブへの共通ライン１４０を通じ、共通ラインセレクタバルブ６６を通じ、フローセル２０を通る選択流路を通じて引き出すことができる。
【００８９】
いくつかのシーケンシング作業中、いくつかの試薬を利用でき、このことは、共通ラインセレクタバルブ６８及び／又は試薬セレクタバルブ６６のいくつかの位置を選択して、複数試薬間で適切に移行できることを意味する。したがって、方法２４０は、（ブロック２５０において）シーケンシングプロトコルの連続的なサイクルの間、共通ラインセレクタバルブ６８及び／又は試薬セレクタバルブ６６の位置の変化を命令するステップを含む。当該連続的なサイクルを、試薬をフローセル２０内に導入するサイクル若しくはシーケンシング反応シーケンスの全サイクル、又はこれらの両方とすることができる。例えば、図１０を参照して説明するように、試薬セレクタバルブ６６及び共通ラインセレクタバルブ６８の位置を変化させて、複数試薬間で移行できる。実際には、このような移行は、共通ラインセレクタバルブ６８に、フローセル２０を通る流路ではなくてバイパスラインを選択して、例えばマニホールド組立体２２０のある流体構造体の試薬プライミングを実行するよう命令することを伴うことができる。
【００９０】
これとともに又はこれに代えて、本明細書で説明する共通ラインセレクタバルブ６８を使って、様々な共通ライン間で選択し及び／又は様々な共通ラインを組み合わせ得ることが理解されるはずである。例えば一実施形態では、図１３に模式的に表すように、付加的な共通ラインセレクタバルブ２６０を、試薬セレクタバルブ６６とフローセル２０との間に位置付けられる、共通ラインセレクタバルブ６８の上流に位置付けることができる。例えば、付加的な共通ラインセレクタバルブ２６０を利用して、いくつかの試薬につながる複数ポート間で選択して、試薬を付加的な共通ラインセレクタバルブ２６０及び後のいくつかの組み合わせの流体素子に引き込むことができる。一例として、制御回路は、付加的な共通ラインセレクタバルブ２６０に、第１試薬源２６２及び第２試薬源２６４につながるポートを流体的に結合する位置へ移行するよう命令できる。このように複数ポートを一緒に流体的に結合することで、付加的な共通ラインセレクタバルブ２６０は、例えばポンプ３８の働きによって、第１試薬及び第２試薬を同時に流体システム１２０内に吸引できる。付加的な共通ラインセレクタバルブ２６０からの組み合わせに対応する試薬セレクタバルブ６６のポートを選択して、流体を共通ラインセレクタバルブ６８に結合し、その後フローセルに結合することができる。
【００９１】
一例として、このような構成は、局所的に供給され得る液体によって希釈されることがある物質を大量にパッケージ化し輸送することを防止するのに特に有益となり得る。バッファの環境において、例えば、第１試薬源２６２を濃縮バッファ溶液とすることができ、第２試薬源２６４を水等の希釈剤とすることができる。ある状況において、図示するように第１試薬源２６２及び第２試薬源２６４を流体的に結合して、濃縮バッファ溶液を適切な程度希釈することが有益となり得る。付加的なバルブを使用することが、（例えば相対流量を制御するために）様々な試薬の相対混合量を更に制御するのに適切となり得ると現在考えられる。
【００９２】
本開示又は特許請求の範囲内に、例えば(a), (b)又は(c)等の順序を示すインジケータが存在する場合には、このような順序又はシーケンスを明確に示さない限り、任意の特定の順序又はシーケンスを伝えることがないことを理解できる。例えば、(i), (ii)及び(iii)とラベル付けされた３つのステップが存在する場合、別段の定めが無い限り、これらのステップを任意の順序で（又は禁止されていない場合には同時にも）実施することができると理解される。例えば、ステップ(ii)がステップ(i)で生み出される要素を扱うことを伴う場合、ステップ(ii)は、ステップ(i)よりも後のある時点で起こると予測できる。同様に、ステップ(i)がステップ(ii)で生み出される要素を扱うことを伴う場合、逆のことが起こると予測できることが理解される。
【００９３】
「するような(to)」という表現、例えば「２つの流路の間で切り替えるようなバルブ」という表現を、「するように構成される」、例えば「２つの流路の間で切り替えるように構成されるバルブ」等の表現に置き換えることができることも理解できる。
【００９４】
「約」、「ほぼ」、「実質的に」又は「通常の」等の用語を、量又は同様の定量化できる属性に言及して使用するときに、別段の定めが無い限り、当該用語は、特定された値の±１０％以内の値を含むと理解される。
【００９５】
本開示で列挙する特許請求の範囲に加えて、以下の付加的な実施形態が本開示の範囲内に含まれることが理解される。
【００９６】
実施形態１：
対象分析物を支持するフローセルと、前記フローセルに結合されて、複数流路から、前記フローセルを通る流路を選択するセレクタバルブと、前記フローセルに結合されて、分析作業の間、選択される前記流路を通じて流体を変位させるポンプと、前記セレクタバルブに結合されて、前記セレクタバルブに流路を選択するよう命令する制御回路と、を備えるシステム。
【００９７】
実施形態２：
前記複数流路が、前記フローセルのあるチャネルを通る第１流路と、前記フローセルの第２チャネルを通る第２流路とを含み、前記第２流路は前記第１流路とは異なる、実施形態１のシステム。
【００９８】
実施形態３：
前記複数流路は、前記第１流路及び前記第２流路の両方を包含する第３流路を含む、実施形態２のシステム。
【００９９】
実施形態４：
前記セレクタバルブは、前記フローセルをバイパスするバイパスラインに結合され、また前記セレクタバルブは、前記フローセルを通る流路ではなく前記バイパスラインを選択するように制御可能である、実施形態１のシステム。
【０１００】
実施形態５：
前記分析作業の間、前記制御回路は、前記セレクタバルブに、選択される前記流路を分析プロトコルに基づいて選択するように自動的に命令する、実施形態１のシステム。
【０１０１】
実施形態６：
複数の試薬から試薬を選択し、選択される前記試薬を前記セレクタバルブの入口に導くように、前記セレクタバルブの流体的上流に存在する試薬セレクタバルブを備える、実施形態１のシステム。
【０１０２】
実施形態７：
前記フローセルがシーケンシングシステムに装着されているときに、前記セレクタバルブと前記フローセルとの間で流体的に結合されて、前記フローセルを前記セレクタバルブと係合する複数のマニホールドを備える、実施形態１のシステム。
【０１０３】
実施形態８：
前記ポンプは、前記フローセルの流体的下流に存在するシリンジポンプを備える、実施形態１のシステム。
【０１０４】
実施形態９：
複数の試薬から分析プロトコルに従って試薬を選択する試薬セレクタバルブと、分析対象物を支持するフローセルと、前記試薬セレクタバルブと前記フローセルとの間で結合され、複数流路から前記フローセルを通る流路を選択し、前記分析プロトコルに従って、選択される前記試薬を、選択される前記流路を通じて導くセレクタバルブと、前記フローセルに結合され、前記分析プロトコルに従って、選択される前記試薬を、選択される前記流路を通じて変位させるポンプと、前記セレクタバルブに結合され、前記セレクタバルブに流路を選択するよう命令する制御回路と、を備えるシステム。
【０１０５】
実施形態１０：
前記複数流路は、前記フローセルのあるチャネルを通る第１流路と、前記フローセルの第２チャネルを通る第２流路とを含み、前記第２流路は前記第１流路とは異なる、実施形態９のシステム。
【０１０６】
実施形態１１：
前記複数流路は、前記第１流路及び前記第２流路の両方を包含する第３流路を含む、実施形態１０のシステム。
【０１０７】
実施形態１２：
前記セレクタバルブは、前記フローセルをバイパスするバイパスラインに結合され、また前記セレクタバルブは、前記フローセルを通る流路ではなく前記バイパスラインを選択するよう制御可能である、実施形態９のシステム。
【０１０８】
実施形態１３：
前記フローセルがシーケンシングシステムに装着されているときに、前記セレクタバルブと前記フローセルとの間で流体的に結合されて、前記フローセルをセレクタバルブと係合する複数のマニホールドを備える、実施形態９のシステム。
【０１０９】
実施形態１４：
フローセルの流体的上流のセレクタバルブを制御して、前記フローセルを通る複数流路から前記フローセルを通る流路を選択するステップと、分析プロトコルに従って、選択される前記流路を通じて試薬を変位させるステップと、を含む方法であり、前記複数流路は、前記フローセルのあるチャネルを通る第１流路と、前記フローセルの第２チャネルを通る第２流路と、前記第１流路及び前記第２流路の両方を包含する第３流路とを含み、前記第２流路は前記第１流路とは異なる、方法。
【０１１０】
実施形態１５：
前記セレクタバルブの流体的上流に存在する試薬セレクタバルブを制御して、前記分析プロトコルに従って前記セレクタバルブ及び前記フローセルを通じて変位させるために、複数の試薬から異なる試薬を選択するステップを含む、実施形態１４の方法。
【０１１１】
実施形態１６：
前記分析プロトコルの連続的サイクルの間、前記セレクタバルブ及び／又は試薬セレクタバルブの位置を変えることを命令するステップを含む、実施形態１５の方法。
【０１１２】
実施形態１７：
前記セレクタバルブに、前記フローセルを通る流路ではなく、バイパスラインを選択するよう命令するステップを含む、実施形態１４の方法。
【０１１３】
実施形態１８：
前記フローセルを、前記セレクタバルブと前記フローセルとの間に存在する複数のマニホールドと流体的に係合して、前記フローセルがシーケンシングシステムに装着されているときかつ前記試薬を変位させる前に、前記フローセルを前記セレクタバルブと係合するステップを含む、実施形態１４の方法。
【０１１４】
実施形態１９：
前記フローセルの流体的下流に存在するポンプによって、選択される前記流路を通じて前記試薬を変位させる、実施形態１４の方法。
【０１１５】
実施形態２０：
前記ポンプはシリンジポンプを備える、実施形態１９の方法。
【０１１６】
（このような概念が互いに矛盾しない条件下で）前述の概念のあらゆる組み合わせが本明細書で開示される本発明の主題の一部であると考えられることが理解されるはずである。本開示の最後に現れる特許請求の範囲に記載される主題のあらゆる組み合わせは、本明細書で開示される本発明の主題の一部であると考えられる。また本明細書で明白に使用され、参照として援用される任意の開示に現れ得る用語には、本明細書で開示される特定の概念と最も調和する意味が与えられるべきであることを理解されるはずである。
【図１】
2020510187.tif 000003
【図２】
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【図３】
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【図４】
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【図５】
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【図６】
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【図７Ａ】
2020510187.tif 000009
【図７Ｂ】
2020510187.tif 000010
【図８−１】
2020510187.tif 000011
【図８−２】
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【図９Ａ】
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【図９Ｂ】
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【図９Ｃ】
2020510187.tif 000015
【図９Ｄ】
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【図１０】
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【図１１】
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【図１２】
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【図１３】
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【国際調査報告】
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2020510187.tif 000022
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