(57)【要約】癌に罹っている対象の治療方法であって、ＴＩＭ−３アゴニスト（例えば、抗ＴＩＭ３抗体）を単独で、または別の免疫チェックポイント阻害剤（例えば、ＰＤ−１アンタゴニスト）と組み合わせて前記対象に投与することを特徴とし、前記対象が、末梢血におけるＴＩＭ３陽性細胞（例えば、腫瘍浸潤炎症細胞）または可溶性ＴＩＭ３を高い頻度で有するものとして同定される方法が本明細書で提供される。癌に罹っている対象におけるＴＩＭ−３アンタゴニストを含む治療の有効性を評価するための方法であって、前記対象の一定の細胞集団におけるＴＩＭ３（および必要に応じてＰＤ−１）陽性細胞の頻度および／または末梢血における可溶性ＴＩＭ−３を測定することを特徴とし、ＴＩＭ３（および必要に応じてＰＤ−１）陽性細胞の高い頻度および／または前記対象の可溶性ＴＩＭ３の末梢血の力価が、前記治療への応答の指標である方法もまた提供される。【選択図】なし【特許請求の範囲】
【請求項１】
癌に罹っている対象がＴＩＭ−３アンタゴニストによる治療に応答するか否かを決定するためのインビトロ方法であって、前記対象における可溶性ＴＩＭ−３の血清力価を調べ、次いで（ｉ）前記可溶性ＴＩＭ−３の血清力価が、健常なコントロール対象より高い場合、または（ｉｉ）前記可溶性ＴＩＭ−３の血清力価が、（例えば、実施例に記載の方法で調べると）少なくとも２１００、２２００、２３００、２４００、または２５００ｐｇ／ｍｌである場合、前記対象が、ＴＩＭ−３アンタゴニストによる治療に応答する可能性が高いことを特徴とする、方法。
【請求項２】
癌に罹っている対象がＴＩＭ−３アンタゴニストによる治療に応答するか否かを決定するためのインビトロ方法であって、ＴＩＭ−３陽性であるＣＤ８＋ＴＩＬの割合を調べ、前記割合が、１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、または７０％より高い場合、前記対象が、ＴＩＭ−３アンタゴニストによる治療に応答する可能性が高いことを特徴とする、方法。
【請求項３】
癌に罹っている対象がＴＩＭ−３アンタゴニストによる治療に応答するか否かを決定するためのインビトロ方法であって、ＴＩＭ−３陽性であるナイーブ、セントラルメモリー（ＣＭ）、エフェクターメモリー（ＥＭ）、およびエフェクターＴＩＬの割合を調べ、ＴＩＭ−３陽性であるＥＭ ＴＩＬおよび／またはエフェクターＴＩＬの割合が、ＴＩＭ−３陽性であるナイーブＴＩＬおよび／またはＣＭ ＴＩＬの割合より高い場合、前記対象が、ＴＩＭ−３アンタゴニストによる治療に応答する可能性が高いことを特徴とする、方法。
【請求項４】
癌に罹っている対象がＴＩＭ−３アンタゴニストによる治療に応答するか否かを決定するためのインビトロ方法であって、前記対象のＴＩＬにおけるＴＩＭ−３陽性である樹状細胞、マクロファージ、およびナチュラルキラー（ＮＫ）細胞の割合を調べ、前記割合が、コントロール対象（例えば、ＴＩＭ−３アンタゴニストによる治療に応答しない癌患者に相当）より高い場合、前記対象が、ＴＩＭ−３アンタゴニストによる治療に応答する可能性が高いことを特徴とする、方法。
【請求項５】
癌に罹っている対象がＰＤ−１／ＰＤ−Ｌ１軸アンタゴニストおよびＴＩＭ−３アンタゴニストの組み合わせによる治療に応答するか否かを決定するためのインビトロ方法であって、前記対象におけるＰＤ−１陽性腫瘍浸潤リンパ球（ＴＩＬ）の頻度およびＴＩＭ−３陽性ＴＩＬの頻度を調べることを特徴とし、前記対象のＣＤ８＋ＴＩＬの少なくとも５％が、ＰＤ−１およびＴＩＭ−３の共発現であることにより、前記対象が、ＰＤ−１／ＰＤ−Ｌ１軸アンタゴニストおよびＴＩＭ−３アンタゴニストの組み合わせによる治療に応答する可能性が高いことが示される、方法。
【請求項６】
癌に罹っている対象の治療における使用のためのＴＩＭ−３アンタゴニストであって、前記治療が：
（１）（ａ）前記対象における可溶性ＴＩＭ−３の血清力価を調べ、次いで（ｂ）（ｉ）前記可溶性ＴＩＭ−３の血清力価が健常なコントロール対象より高い場合、または（ｉｉ）前記可溶性ＴＩＭ−３の血清力価が、（例えば、実施例に記載の方法で調べると）少なくとも２１００、２２００、２３００、２４００、または２５００ｐｇ／ｍｌである場合、前記ＴＩＭ−３アンタゴニストを前記対象に投与し；
（２）（ａ）前記対象におけるＴＩＭ−３陽性であるＣＤ８＋ＴＩＬの割合を調べ、次いで（ｂ）前記割合が、１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、または７０％より高い場合、前記ＴＩＭ−３アンタゴニストを前記対象に投与し；
（３）（ａ）ＴＩＭ−３陽性であるナイーブ、セントラルメモリー（ＣＭ）、エフェクターメモリー（ＥＭ）、およびエフェクターＴＩＬの割合を調べ、次いで（ｂ）ＴＩＭ−３陽性であるＥＭ ＴＩＬおよび／またはエフェクターＴＩＬの割合が、ＴＩＭ−３陽性であるナイーブＴＩＬおよび／またはＣＭ ＴＩＬの割合より高い場合、前記ＴＩＭ−３アンタゴニストを前記対象に投与し；または
（４）（ａ）前記対象のＴＩＬにおけるＴＩＭ−３陽性である樹状細胞、マクロファージ、およびナチュラルキラー（ＮＫ）細胞の割合を調べ、次いで（ｂ）前記割合が、コントロール対象（例えば、ＴＩＭ−３アンタゴニストによる治療に応答しない癌患者に相当）より高い場合、前記ＴＩＭ−３アンタゴニストを前記対象に投与すること
を特徴とする、ＴＩＭ−３アンタゴニスト。
【請求項７】
癌に罹っている対象の治療における使用のためのＰＤ−１／ＰＤ−Ｌ１軸アンタゴニストおよびＴＩＭ−３アンタゴニストを含む組み合わせ療法であって、（ｉ）前記対象におけるＰＤ−１陽性腫瘍浸潤リンパ球（ＴＩＬ）の頻度およびＴＩＭ−３陽性ＴＩＬの頻度を調べ、次いで（ｉｉ）ＣＤ８＋ＴＩＬの少なくとも５％がＰＤ−１およびＴＩＭ−３を共発現する場合、前記組み合わせ療法を投与することを特徴とする療法。
【請求項８】
前記ＴＩＭ−３アンタゴニストが、抗ＴＩＭ３抗体である、請求項１〜５のいずれか１項に記載のインビトロ方法、請求項６に記載の使用のためのＴＩＭ−３アンタゴニスト、または請求項７に記載の使用のための組み合わせ療法。
【請求項９】
前記抗ＴＩＭ３抗体が、（ｉ）ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３を含む重鎖可変領域、ならびに（ｉｉ）ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３を含む軽鎖可変領域を含み、
（ａ）前記重鎖ＣＤＲ１が、配列番号：２３−２７からなる群から選択されるアミノ酸配列を含み； 
（ｂ）前記重鎖ＣＤＲ２が、配列番号：２８−３８からなる群から選択されるアミノ酸配列を含み；
（ｃ）前記重鎖ＣＤＲ３が、配列番号：３９−４９からなる群から選択されるアミノ酸配列を含み； 
（ｄ）前記軽鎖ＣＤＲ１が、配列番号：５０および５１からなる群から選択されるアミノ酸配列を含み； 
（ｅ）前記軽鎖ＣＤＲ２が、配列番号：５２および５３からなる群から選択されるアミノ酸配列を含み；ならびに
（ｆ）前記軽鎖ＣＤＲ３が、配列番号：５４−５７からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む、請求項８に記載のインビトロ方法、使用のためのＴＩＭ−３アンタゴニスト、または使用のための組み合わせ療法。
【請求項１０】
前記ＴＩＬが、ＣＤ４＋ＴＩＬである、請求項３に記載のインビトロ方法または請求項６に記載の使用のためのＴＩＭ−３アンタゴニスト
【請求項１１】
前記ＴＩＬが、ＣＤ８＋ＴＩＬである、請求項３に記載のインビトロ方法または請求項６に記載の使用のためのＴＩＭ−３アンタゴニスト。
【請求項１２】
前記ＰＤ−１／ＰＤ−Ｌ１軸アンタゴニストが、抗ＰＤ−１抗体または抗ＰＤ−Ｌ１抗体を含む、請求項５に記載のインビトロ方法または請求項７に記載の使用のための組み合わせ療法。
【請求項１３】
前記抗ＰＤ−１抗体が、ニボルマブ、ペムブロリズマブ、ＭＥＤＩ０６０８、ＡＭＰ−２２４、ＰＤＲ００１、ＢＧＢ−Ａ３１７、またはこれらのいずれかの組み合わせを含む、請求項１２に記載のインビトロ方法または使用のための組み合わせ療法。
【請求項１４】
前記抗ＰＤ−Ｌ１抗体が、ＢＭＳ−９３６５５９、ＭＰＤＬ３２８０Ａ、ＭＥＤＩ４７３６、ＭＳＢ００１０７１８Ｃ、またはこれらのいずれかの組み合わせを含む、請求項１２に記載のインビトロ方法または使用のための組み合わせ療法。
【請求項１５】
前記癌が、結腸、腎臓、または肺の癌を含む、請求項１〜１４のいずれか１項に記載のインビトロ方法、使用のためのＴＩＭ−３アンタゴニスト、または使用のための組み合わせ療法。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
ＥＦＳ−ＷＥＢにより電子的に提出された配列表の参照
本願とともに提出したＡＳＣＩＩテキストファイルにおける電子的に提出された配列表の内容（名称：3338.093PC01_SequenceListing_ST25.txt；サイズ：７１７，８２０バイト；および作成日：２０１８年８月２４日）は、出典明示により本明細書にその全体が取り込まれるものである。
【背景技術】
【０００２】
本開示の背景
Ａ型肝炎ウイルス細胞受容体２（ＨＡＶＣＲ２）としても知られるＴ細胞免疫グロブリンおよびムチンドメイン含有−３（ＴＩＭ３）は、免疫応答の重要な調節因子として機能するＩ型膜貫通タンパク質である。ＴＩＭ３は、活性化ＩＦＮ−γ産生Ｔ細胞（例えば、１型ヘルパーＣＤ４＋Ｔ細胞および細胞傷害性ＣＤ８＋Ｔ細胞）において最初に同定され、そのリガンド（すなわち、フォスファチジルセリン、ガレクチン−９、ＨＭＧＢ１、ＣＥＡＣＡＭ−１、およびＩＬＴ４）の１つへの結合後にＴ細胞の死または枯渇を誘導することが示された。最近の研究により、ＴＩＭ３の発現はまた、多くの自然免疫細胞（例えば、マクロファージ、単球、樹状細胞、マスト細胞、およびナチュラルキラー細胞）の活性化を調節するために重要であることが示されている。Han G et al., Front Immunol. 4: 449 (2013)を参照のこと。
【０００３】
多くの阻害性受容体（例えば、ＰＤ−１およびＣＴＬＡ−４）のように、ＴＩＭ３発現は、癌（例えば、メラノーマ、肺、肝臓、卵巣など）を含む多くのタイプの慢性疾患に関連している。高いＴＩＭ３発現は、腫瘍浸潤リンパ球（ＴＩＬ）、ならびに進行性メラノーマ、非小細胞肺癌、または濾胞性Ｂ細胞非ホジキンリンパ腫に罹っている患者に由来する腫瘍で検出されている。そして、ＴＩＭ３＋Ｔ細胞の存在は、予後不良に伴いより高い発現を示す肺癌進行の有用な指標として報告されている。Anderson AC. Cancer Immunol Res. 2: 393-8 (2014)を参照のこと。ＴＩＭ３と阻害性受容体ＰＤ−１と間の密接な関連が示されている。例えば、多くの腫瘍特異的なＴ細胞は、ＰＤ−１およびＴＩＭ３の両方を発現し、これらのＴ細胞は、ＰＤ−１またはＴＩＭ３のみを発現するＴ細胞と比較してより機能障害性であることが示されている。Fourcade J et al., J Exp Med. 207: 2175-2186 (2010)を参照のこと。
【０００４】
いくつかの免疫チェックポイント経路阻害剤（例えば、ＹＥＲＶＯＹおよびＯＰＤＩＶＯ）の最近の開発により、多くのタイプの疾患（癌を含む）を治療するための新しい免疫療法アプローチが提供され始めている。このような阻害剤は有望な結果を示している一方、大半の患者は、このような治療に応答していない。Sharma P et al., Cell 168: 707-723 (2017)を参照のこと。よって、有効性を高め、副作用を最小にするために、特定の部分集団、最終的には各患者に対する目的に合わせた治療計画の必要性が存在している。
【発明の概要】
【０００５】
本開示の概要
本明細書では、癌に罹っている対象がＴＩＭ−３アンタゴニストによる治療に応答するか否かを決定するためのインビトロ方法であって、前記対象における可溶性ＴＩＭ−３の血清力価を調べ、（ｉ）前記可溶性ＴＩＭ−３の血清力価が、健常なコントロール対象のものより高いか、または（ｉｉ）前記可溶性ＴＩＭ−３の血清力価が、（例えば、実施例に記載の方法で調べると）少なくとも２１００、２２００、２３００、２４００、または２５００ｐｇ／ｍｌである場合、前記対象がＴＩＭ−３アンタゴニストによる治療に応答する可能性が高いことを特徴とする方法が供される。
【０００６】
本明細書では、癌に罹っている対象がＴＩＭ−３アンタゴニストによる治療に応答するか否かを決定するためのインビトロ方法であって、ＴＩＭ−３陽性であるＣＤ８＋ＴＩＬの割合を調べ、前記割合が１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、または７０％より高い場合、前記対象がＴＩＭ−３アンタゴニストによる治療に応答する可能性が高いことを特徴とする方法が供される。
【０００７】
本明細書では、癌に罹っている対象がＴＩＭ−３アンタゴニストによる治療に応答するか否かを決定するためのインビトロ方法であって、ＴＩＭ−３陽性であるナイーブ、セントラルメモリー（ＣＭ）、エフェクターメモリー（ＥＭ）、およびエフェクターＴＩＬの割合を調べ、ＴＩＭ−３陽性であるＥＭ ＴＩＬおよび／またはエフェクターＴＩＬの割合がＴＩＭ−３陽性であるナイーブＴＩＬおよび／またはＣＭ ＴＩＬの割合より高い場合、前記対象がＴＩＭ−３アンタゴニストによる治療に応答する可能性が高いことを特徴とする方法が供される。
【０００８】
本明細書では、癌に罹っている対象がＴＩＭ−３アンタゴニストによる治療に応答するか否かを決定するためのインビトロ方法であって、前記対象のＴＩＬにおけるＴＩＭ−３陽性である樹状細胞、マクロファージ、およびナチュラルキラー（ＮＫ）細胞の割合を調べ、前記割合が、コントロール対象（例えば、ＴＩＭ−３アンタゴニストによる治療に応答しない癌患者に相当）における割合より高い場合、前記対象がＴＩＭ−３アンタゴニストによる治療に応答する可能性が高いことを特徴とする方法が供される。
【０００９】
本明細書では、癌に罹っている対象がＰＤ−１／ＰＤ−Ｌ１軸アンタゴニストおよびＴＩＭ−３アンタゴニストの組み合わせによる治療に応答するか否かを決定するためのインビトロ方法であって、前記対象におけるＰＤ−１陽性腫瘍浸潤リンパ球（ＴＩＬ）の頻度およびＴＩＭ−３陽性ＴＩＬの頻度を調べることを特徴とし、前記対象のＣＤ８＋ＴＩＬの少なくとも５％がＰＤ−１およびＴＩＭ−３の共発現であることにより、前記対象がＰＤ−１／ＰＤ−Ｌ１軸アンタゴニストおよびＴＩＭ−３アンタゴニストの組み合わせによる治療に応答する可能性が高いことが示される方法が供される。
【００１０】
本明細書では、癌に罹っている対象の治療における使用のためのＴＩＭ−３アンタゴニストであって、前記治療が、（１）（ａ）前記対象における可溶性ＴＩＭ−３の血清力価を調べ、次いで（ｂ）（ｉ）前記可溶性ＴＩＭ−３の血清力価が、健常なコントロール対象におけるものより高い場合または（ｉｉ）前記可溶性ＴＩＭ−３の血清力価が、（例えば、実施例に記載の方法で調べると）少なくとも２１００、２２００、２３００、２４００、または２５００ｐｇ／ｍｌである場合、ＴＩＭ−３アンタゴニストを前記対象に投与し；（２）（ａ）前記対象におけるＴＩＭ−３陽性であるＣＤ８＋ＴＩＬの割合を調べ、次いで（ｂ）前記割合が、１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、または７０％より高い場合、前記ＴＩＭ−３アンタゴニストを前記対象に投与し；（３）（ａ）ＴＩＭ−３陽性であるナイーブ、セントラルメモリー（ＣＭ）、エフェクターメモリー（ＥＭ）、およびエフェクターＴＩＬの割合を調べ、次いで（ｂ）ＴＩＭ−３陽性であるＥＭ ＴＩＬおよび／またはエフェクターＴＩＬの割合が、ＴＩＭ−３陽性であるナイーブＴＩＬおよび／またはＣＭ ＴＩＬの割合より高い場合、前記ＴＩＭ−３アンタゴニストを前記対象に投与し；あるいは（４）（ａ）前記対象のＴＩＬにおけるＴＩＭ−３陽性である樹状細胞、マクロファージ、およびナチュラルキラー（ＮＫ）細胞の割合を調べ、次いで（ｂ）前記割合が、コントロール対象（例えば、ＴＩＭ−３アンタゴニストによる治療に応答しない癌患者に相当）における割合より高い場合、前記ＴＩＭ−３アンタゴニストを前記対象に投与することを特徴とする、ＴＩＭ−３アンタゴニストもまた供される。
【００１１】
本開示は、癌に罹っている対象の治療における使用のためのＰＤ−１／ＰＤ−Ｌ１軸アンタゴニストおよびＴＩＭ−３アンタゴニストを含む組み合わせ療法であって、（ｉ）前記対象におけるＰＤ−１陽性腫瘍浸潤リンパ球（ＴＩＬ）の頻度およびＴＩＭ−３陽性ＴＩＬの頻度を調べ、次いで（ｉｉ）ＣＤ８＋ＴＩＬの少なくとも５％が、ＰＤ−１およびＴＩＭ−３を共発現する場合、前記組み合わせ療法を投与することを特徴とする療法をさらに供する。
【００１２】
ある実施態様において、癌に罹っている対象の治療における使用（例えば、単剤療法または組み合わせ療法）のためのＴＩＭ−３アンタゴニストは、抗ＴＩＭ３抗体である。
【００１３】
ある実施態様において、前記抗ＴＩＭ３抗体は、（ｉ）ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３重鎖可変領域、ならびに（ｉｉ）ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３を含む軽鎖可変領域を含み：
（ａ）前記重鎖ＣＤＲ１は、配列番号：２３−２７からなる群から選択されるアミノ酸配列を含み；
（ｂ）前記重鎖ＣＤＲ２は、配列番号：２８−３８からなる群から選択されるアミノ酸配列を含み； 
（ｃ）前記重鎖ＣＤＲ３は、配列番号：３９−４９からなる群から選択されるアミノ酸配列を含み；
（ｄ）前記軽鎖ＣＤＲ１は、配列番号：５０および５１からなる群から選択されるアミノ酸配列を含み；
（ｅ）前記軽鎖ＣＤＲ２は、配列番号：５２および５３からなる群から選択されるアミノ酸配列を含み；ならびに
（ｆ）前記軽鎖ＣＤＲ３は、配列番号：５４−５７からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む。
【００１４】
ある実施態様において、前記ＴＩＬは、ＣＤ４＋ＴＩＬである。
【００１５】
ある実施態様において、前記ＴＩＬは、ＣＤ８＋ＴＩＬである。
【００１６】
ある実施態様において、前記ＰＤ−１／ＰＤ−Ｌ１軸アンタゴニストは、抗ＰＤ−１抗体または抗ＰＤ−Ｌ１抗体を含む。
【００１７】
ある実施態様において、前記抗ＰＤ−１抗体は、ニボルマブ、ペムブロリズマブ、ＭＥＤＩ０６０８、ＡＭＰ−２２４、ＰＤＲ００１、ＢＧＢ−Ａ３１７、またはこれらのいずれかの組み合わせを含む。
【００１８】
ある実施態様において、前記抗ＰＤ−Ｌ１抗体は、ＢＭＳ−９３６５５９、ＭＰＤＬ３２８０Ａ、ＭＥＤＩ４７３６、ＭＳＢ００１０７１８Ｃ、またはこれらのいずれかの組み合わせを含む。
【００１９】
ある実施態様において、前記癌は、結腸、腎臓、または肺癌を含む。
【００２０】
実施態様
実施態様１．癌に罹っている対象がＴＩＭ−３アンタゴニストによる治療に応答するか否かを決定するための方法であって、前記対象における可溶性ＴＩＭ−３の血清力価を調べ、前記可溶性ＴＩＭ−３の血清力価がコントロール対象におけるものより高い場合、前記対象が、ＴＩＭ−３アンタゴニストによる治療に応答する可能性が高いことを特徴とする方法。
【００２１】
実施態様２．前記可溶性ＴＩＭ−３の血清力価が、コントロール対象より前記対象において少なくとも１０％高い場合、前記対象がＴＩＭ−３アンタゴニストによる治療に応答する可能性が高いものである、実施態様１に記載の方法。
【００２２】
実施態様３．前記可溶性ＴＩＭ−３の血清力価が、コントロール対象より前記対象において少なくとも２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、９０％、または１００％（２倍）高い場合、前記対象が、ＴＩＭ−３アンタゴニストによる治療に応答する可能性が高いものである、実施態様１または２に記載の方法。
【００２３】
実施態様４．前記対象が、（例えば、実施例に記載の方法で調べると）少なくとも２１００、２２００、２３００、２４００、または２５００ｐｇ／ｍｌの可溶性ＴＩＭ−３の血清力価を有する場合、前記対象が、ＴＩＭ−３アンタゴニストによる治療に応答する可能性が高いものである、実施態様１−３のいずれか１つに記載の方法。
【００２４】
実施態様５．前記対象が、（例えば、実施例に記載の方法で調べると）少なくとも３０００ｐｇ／ｍｌ可溶性ＴＩＭ−３の血清力価を有する場合、前記対象がＴＩＭ−３アンタゴニストによる治療に応答する可能性が高いものである、実施態様１−４のいずれか１つに記載の方法。
【００２５】
実施態様６．治療上の有効量のＴＩＭ−３アンタゴニストを、コントロール対象より高い可溶性ＴＩＭ−３の血清力価を有する対象に投与することをさらに特徴とする、実施態様１−５のいずれか１つに記載の方法。
【００２６】
実施態様７．癌に罹っている対象の治療方法であって、癌に罹っており、コントロール対象より高い可溶性ＴＩＭ−３の血清力価を有する対象に、治療上の有効量のＴＩＭ−３アンタゴニストを投与することを特徴とする方法。
【００２７】
実施態様８．前記対象が、コントロール対象より前記対象において少なくとも１０％高い可溶性ＴＩＭ−３の血清力価を有する、実施態様７に記載の方法。
【００２８】
実施態様９．前記対象が、コントロール対象より少なくとも２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、９０％、または１００％（２倍）高い可溶性ＴＩＭ−３の血清力価を有する、実施態様７に記載の方法。
【００２９】
実施態様１０．前記対象が、（例えば、実施例に記載の方法で調べると）少なくとも２５００ｐｇ／ｍｌの可溶性ＴＩＭ−３の血清力価を有する、実施態様７−９のいずれか１つに記載の方法。
【００３０】
実施態様１１．前記対象が、（例えば、実施例に記載の方法で調べると）少なくとも３０００ｐｇ／ｍｌの可溶性ＴＩＭ−３の血清力価を有する、実施態様７−１０のいずれか１つに記載の方法。
【００３１】
実施態様１２．投与前に可溶性ＴＩＭ−３の血清力価を測定することをさらに含む、実施態様７−１１のいずれか１つに記載の方法。
【００３２】
実施態様１３．ＴＩＭ−３アンタゴニストによる癌に罹っている対象の治療方法であって、前記対象における可溶性ＴＩＭ−３の血清力価を調べ、前記可溶性ＴＩＭ−３の血清力価がコントロール対象より高い場合、治療上の有効量のＴＩＭ−３アンタゴニストを前記対象に投与することを特徴とする方法。
【００３３】
実施態様１４．前記対象が、コントロール対象より前記対象において少なくとも１０％高い可溶性ＴＩＭ−３の血清力価を有する場合、前記対象に、治療上の有効量のＴＩＭ−３アンタゴニストを投与する、実施態様１３に記載の方法。
【００３４】
実施態様１５．前記対象が、コントロール対象より少なくとも２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、９０％、または１００％（２倍）高い可溶性ＴＩＭ−３の血清力価を有する場合、前記対象に、治療上の有効量のＴＩＭ−３アンタゴニストを投与する、実施態様１３または１４に記載の方法。
【００３５】
実施態様１６．前記対象が、（例えば、実施例に記載の方法で調べると）少なくとも２１００、２２００、２３００、２４００、または２５００ｐｇ／ｍｌの可溶性ＴＩＭ−３の血清力価を有する場合、前記対象に、治療上の有効量のＴＩＭ−３アンタゴニストを投与する、実施態様１３−１５のいずれか１つに記載の方法。
【００３６】
実施態様１７．前記対象が、（例えば、実施例に記載の方法で調べると）少なくとも３０００ｐｇ／ｍｌの可溶性ＴＩＭ−３の血清力価を有する場合、前記対象に、治療上の有効量のＴＩＭ−３アンタゴニストを投与する、実施態様１３−１６のいずれか１つに記載の方法。
【００３７】
実施態様１８．前記可溶性ＴＩＭ−３が、異なるスプライス型可溶性ＴＩＭ−３および／または切断型（shed）ＴＩＭ−３である、実施態様１−１７のいずれか１つに記載の方法。
【００３８】
実施態様１９．前記癌が、固形腫瘍である、実施態様１−１８のいずれか１つに記載の方法。
【００３９】
実施態様２０．前記癌が、結腸、腎臓、または肺の癌である、実施態様１−１９のいずれか１つに記載の方法。
【００４０】
実施態様２１．コントロール対象における可溶性ＴＩＭ−３の血清力価が、少なくとも１０、５０、または１００人の対象における可溶性ＴＩＭ−３の中間もしくは平均力価である、実施態様１−２０のいずれか１つに記載の方法。
【００４１】
実施態様２２．前記ＴＩＭ−３アンタゴニストが、ＴＩＭ−３抗体である、実施態様１−２１のいずれか１つに記載の方法。
【００４２】
実施態様２３．前記ＴＩＭ−３抗体が、ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３を含む重鎖可変領域、ならびにＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３を含む軽鎖可変領域を含み、
（ａ）前記重鎖ＣＤＲ１が、配列番号：２３−２７からなる群から選択されるアミノ酸配列を含み； 
（ｂ）前記重鎖ＣＤＲ２が、配列番号：２８−３８からなる群から選択されるアミノ酸配列を含み； 
（ｃ）前記重鎖ＣＤＲ３が、配列番号：３９−４９からなる群から選択されるアミノ酸配列を含み；
（ｄ）前記軽鎖ＣＤＲ１が、配列番号：５０および５１からなる群から選択されるアミノ酸配列を含み；
（ｅ）前記軽鎖ＣＤＲ２が、配列番号：５２および５３からなる群から選択されるアミノ酸配列を含み；ならびに
（ｆ）前記軽鎖ＣＤＲ３が、配列番号：５４−５７からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む、実施態様２２に記載の方法。
【００４３】
実施態様２４．癌に罹っている対象が、ＰＤ−１／ＰＤ−Ｌ１軸アンタゴニストおよびＴＩＭ−３アンタゴニストの組み合わせによる治療に応答するか否かを決定するための方法であって、前記対象のＰＤ−１陽性腫瘍浸潤リンパ球（ＴＩＬ）の頻度およびＴＩＭ−３陽性ＴＩＬの頻度を調べることを特徴とし、前記対象のＣＤ８＋ＴＩＬの少なくとも５％がＰＤ−１およびＴＩＭ−３の共発現であることにより、前記対象が、ＰＤ−１／ＰＤ−Ｌ１軸アンタゴニストおよびＴＩＭ−３アンタゴニストの組み合わせによる治療に応答する可能性が高いことが示される方法。
【００４４】
実施態様２５．前記対象のＣＤ８＋ＴＩＬの少なくとも１０％、２０％、３０％、または４０％がＰＤ−１およびＴＩＭ−３の共発現であることにより、前記対象が、ＰＤ−１／ＰＤ−Ｌ１軸アンタゴニストおよびＴＩＭ−３アンタゴニストの組み合わせによる治療に応答する可能性が高いことが示されることを含む、実施態様２４に記載の方法。
【００４５】
実施態様２６．前記ＣＤ８＋ＴＩＬの少なくとも５％がＰＤ−１およびＴＩＭ−３を共発現する対象に、ＰＤ−１／ＰＤ−Ｌ１軸アンタゴニストおよびＴＩＭ−３アンタゴニストの組み合わせを投与することをさらに特徴とする、実施態様２４または２５に記載の方法。
【００４６】
実施態様２７．ＰＤ−１／ＰＤ−Ｌ１軸アンタゴニストおよびＴＩＭ−３アンタゴニストの組み合わせによる癌に罹っている対象の治療方法であって、ＣＤ８＋ＴＩＬの少なくとも５％がＰＤ−１およびＴＩＭ−３の共発現を示す対象に、治療上の有効量のＰＤ−１／ＰＤ−Ｌ１軸アンタゴニストおよびＴＩＭ−３アンタゴニストの組み合わせを投与することを特徴とする方法。
【００４７】
実施態様２８．前記対象が、前記ＣＤ８＋ＴＩＬの少なくとも１０％、２０％、３０％、４０％においてＰＤ−１およびＴＩＭ−３の共発現を示す、実施態様２７に記載の方法。
【００４８】
実施態様２９．ＰＤ−１／ＰＤ−Ｌ１軸アンタゴニストおよびＴＩＭ−３アンタゴニストの組み合わせによる癌に罹っている対象の治療方法であって、前記対象のＰＤ−１陽性腫瘍浸潤リンパ球（ＴＩＬ）の頻度およびＴＩＭ−３陽性ＴＩＬの頻度を調べ、ＰＤ−１およびＴＩＭ−３が、前記対象のＣＤ８＋ＴＩＬの少なくとも５％で共発現される場合、ＰＤ−１／ＰＤ−Ｌ１軸アンタゴニストおよびＴＩＭ−３アンタゴニストの組み合わせ前記対象に投与することを特徴とする方法。
【００４９】
実施態様３０．ＰＤ−１およびＴＩＭ−３が、前記ＣＤ８＋ＴＩＬの少なくとも１０％、２０％、３０％、４０％において共発現される場合、前記対象に、ＰＤ−１／ＰＤ−Ｌ１軸アンタゴニストおよびＴＩＭ−３アンタゴニストの組み合わせを投与する、実施態様２９に記載の方法。
【００５０】
実施態様３１．癌に罹っている対象がＴＩＭ−３アンタゴニストによる治療に応答するか否かを決定するための方法であって、ＴＩＭ−３陽性であるＣＤ８＋ＴＩＬの割合を調べ、前記割合が、１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、または７０％より高い場合、前記対象がＴＩＭ−３アンタゴニストによる治療に応答する可能性が高いことを特徴とする方法。
【００５１】
実施態様３２．ＴＩＭ−３アンタゴニストによる癌に罹っている対象の治療方法であって、１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、または７０％より高いＣＤ８＋ＴＩＬの割合を有する対象に、治療上の有効量のＴＩＭ−３アンタゴニストを投与することを特徴とする方法。
【００５２】
実施態様３３．ＴＩＭ−３アンタゴニストによる癌に罹っている対象の治療方法であって、ＴＩＭ−３陽性であるＣＤ８＋ＴＩＬの割合を調べ、前記割合が、１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、または７０％より高い場合、治療上の有効量のＴＩＭ−３アンタゴニストを前記対象に投与することを特徴とする方法。
【００５３】
実施態様３４．癌に罹っている対象がＴＩＭ−３アンタゴニストによる治療に応答するか否かを決定するための方法であって、ＴＩＭ−３陽性であるナイーブ、ＣＭ、ＥＭ、およびＴｅｆｆ ＴＩＬの割合を調べ、ＴＩＭ−３陽性であるＴＩＬエフェクターメモリー（「ＥＭ」）Ｔ細胞および／またはエフェクターＴ（「Ｔｅｆｆ」）細胞の割合が、ＴＩＭ−３陽性であるＴＩＬナイーブＴ細胞および／またはセントラルメモリーＴ細胞（「ＣＭ Ｔ細胞」）の割合より高い場合、前記対象がＴＩＭ−３アンタゴニストによる治療に応答する可能性が高いことを特徴とする方法。
【００５４】
実施態様３５．前記ＴＩＬが、ＣＤ４＋ＴＩＬである、実施態様３４に記載の方法。
【００５５】
実施態様３６．前記ＴＩＬが、ＣＤ８＋ＴＩＬである、実施態様３４に記載の方法。
【００５６】
実施態様３７．前記頻度が、ＣＤ４＋およびＣＤ８Ｔ細胞において測定され、前記高い割合がＣＤ４＋およびＣＤ８＋ＴＩＬ細胞の両方で観察される場合、前記対象が、ＴＩＭ−３アンタゴニストによる治療に応答する可能性が高いものである、実施態様３４に記載の方法。
【００５７】
実施態様３８．ＴＩＭ−３アンタゴニストによる癌に罹っている対象の治療方法であって、ＴＩＭ−３陽性であるＴＩＬナイーブＴ細胞および／またはセントラルメモリーＴ細胞（「ＣＭ Ｔ細胞」）の割合より高いＴＩＭ−３陽性であるＴＩＬエフェクターメモリー（「ＥＭ」）Ｔ細胞および／またはエフェクターＴ（「Ｔｅｆｆ」）細胞の割合を有する対象に、治療上の有効量のＴＩＭ−３アンタゴニストを投与することを特徴とする方法。
【００５８】
実施態様３９．ＴＩＭ−３アンタゴニストによる癌に罹っている対象の治療方法であって、ＴＩＭ−３陽性であるＣＤ４＋ＴＩＬナイーブＴ細胞および／またはＣＤ４＋セントラルメモリーＴ細胞（「ＣＭ Ｔ細胞」）の割合より高いＴＩＭ−３陽性であるＣＤ４＋ＴＩＬエフェクターメモリー（「ＥＭ」）Ｔ細胞および／またはＣＤ４＋エフェクターＴ（「Ｔｅｆｆ」）細胞の割合を有する対象に、治療上の有効量のＴＩＭ−３アンタゴニストを投与することを特徴とする方法。
【００５９】
実施態様４０．ＴＩＭ−３アンタゴニストによる癌に罹っている対象の治療方法であって、ＴＩＭ−３陽性であるＣＤ８＋ＴＩＬナイーブＴ細胞および／またはＣＤ８＋セントラルメモリーＴ細胞（「ＣＭ Ｔ細胞」）の割合より高いＴＩＭ−３陽性であるＣＤ８＋ＴＩＬエフェクターメモリー（「ＥＭ」）Ｔ細胞および／またはＣＤ８＋エフェクターＴ（「Ｔｅｆｆ」）細胞の割合を有する対象に、治療上の有効量のＴＩＭ−３アンタゴニストを投与することを特徴とする方法。
【００６０】
実施態様４１．ＴＩＭ−３アンタゴニストによる癌に罹っている対象の治療方法であって、（ｉ）ＴＩＭ−３陽性であるＣＤ４＋ＴＩＬナイーブＴ細胞および／またはＣＤ４＋セントラルメモリーＴ細胞（「ＣＭ Ｔ細胞」）の割合より高いＴＩＭ−３陽性であるＣＤ４＋ＴＩＬエフェクターメモリー（「ＥＭ」）Ｔ細胞および／またはＣＤ４＋エフェクターＴ（「Ｔｅｆｆ」）細胞の割合；および（ｉｉ）ＴＩＭ−３陽性であるＣＤ８＋ＴＩＬナイーブＴ細胞および／またはＣＤ８＋セントラルメモリーＴ細胞（「ＣＭ Ｔ細胞」）の割合より高いＴＩＭ−３陽性であるＣＤ８＋ＴＩＬエフェクターメモリー（「ＥＭ」）Ｔ細胞および／またはＣＤ８＋エフェクターＴ（「Ｔｅｆｆ」）細胞の割合を有する対象に、治療上の有効量のＴＩＭ−３アンタゴニストを投与することを特徴とする方法。
【００６１】
実施態様４２．ＴＩＭ−３アンタゴニストによる癌に罹っている対象の治療方法であって、ＴＩＭ−３陽性であるナイーブ、ＣＭ、ＥＭ、およびＴｅｆｆ ＴＩＬの割合を調べ、ＴＩＭ−３陽性であるＴＩＬエフェクターメモリー（「ＥＭ」）Ｔ細胞および／またはエフェクターＴ（「Ｔｅｆｆ」）細胞の割合が、ＴＩＭ−３陽性であるＴＩＬナイーブＴ細胞および／またはセントラルメモリーＴ細胞（「ＣＭ Ｔ細胞」）の割合より高い場合、治療上の有効量のＴＩＭ−３アンタゴニストを前記対象に投与することを特徴とする方法。
【００６２】
実施態様４３．前記ＴＩＬが、ＣＤ４＋ＴＩＬである、実施態様４２に記載の方法。
【００６３】
実施態様４４．前記ＴＩＬが、ＣＤ８＋ＴＩＬである、実施態様４２に記載の方法。
【００６４】
実施態様４５．前記頻度が、ＣＤ４＋およびＣＤ８Ｔ細胞において測定され、より高い割合が、ＣＤ４＋およびＣＤ８＋ＴＩＬ細胞の両方で観察される場合、治療上の有効量のＴＩＭ−３アンタゴニストを前記対象に投与することを特徴とする、実施態様４２に記載の方法。
【００６５】
実施態様４６．ＴＩＭ−３陽性細胞のレベルにおける差異が、少なくとも５０％である、実施態様３４−４５のいずれか１つに記載の方法。
【００６６】
実施態様４７．ＴＩＭ−３陽性細胞のレベルにおける差異が、少なくとも１００％である、実施態様３４−４６のいずれか１つに記載の方法。
【００６７】
実施態様４８．ナイーブＴ細胞が、ＣＣＲ７＋ＣＤ４５ＲＯ−であり、Ｔｅｆｆ細胞が、ＣＣＲ７−ＣＤ４５ＲＯ−であり、ＣＭ Ｔ細胞が、ＣＣＲ７＋ＣＤ４５ＲＯ＋であり、ならびにＥＭ Ｔ細胞が、ＣＣＲ７−ＣＤ４５ＲＯ＋である、実施態様３４−４７のいずれか１つに記載の方法。
【００６８】
実施態様４９．癌に罹っている対象がＴＩＭ−３アンタゴニストによる治療に応答するか否かを決定するための方法であって、前記対象のＴＩＬにおけるＴＩＭ−３陽性である樹状細胞、マクロファージ、およびナチュラルキラー（ＮＫ）細胞の割合を調べ、前記割合が、コントロール対象におけるものより高い場合、前記対象が、ＴＩＭ−３アンタゴニストによる治療に応答する可能性が高いことを特徴とする方法。
【００６９】
実施態様５０．ＴＩＭ−３アンタゴニストによる癌に罹っている対象の治療方法であって、前記対象のＴＩＬにおけるＴＩＭ−３陽性である樹状細胞、マクロファージ、およびＮＫ細胞の割合を有する対象に、治療上の有効量のＴＩＭ−３アンタゴニストを投与することを特徴とし、前記割合が、コントロール対象におけるものより高いものである、方法。
【００７０】
実施態様５１．ＴＩＭ−３アンタゴニストによる癌に罹っている対象の治療方法であって、前記対象において、前記対象のＴＩＬにおけるＴＩＭ−３陽性である樹状細胞、マクロファージ、およびＮＫ細胞の割合を調べ、前記割合が、コントロール対象におけるものより高い場合、治療上の有効量のＴＩＭ−３アンタゴニストを前記対象に投与することを特徴とする方法。
【００７１】
実施態様５２．前記ＴＩＭ−３アンタゴニストが、ＴＩＭ−３抗体である、実施態様２４−５１のいずれか１つに記載の方法。
【００７２】
実施態様５３．前記ＴＩＭ−３抗体が、ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３を含む重鎖可変領域、ならびにＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３を含む軽鎖可変領域を含むものであって、
（ａ）前記重鎖ＣＤＲ１が、配列番号：２３−２７からなる群から選択されるアミノ酸配列を含み； 
（ｂ）前記重鎖ＣＤＲ２が、配列番号：２８−３８からなる群から選択されるアミノ酸配列を含み；
（ｃ）前記重鎖ＣＤＲ３が、配列番号：３９−４９からなる群から選択されるアミノ酸配列を含み；
（ｄ）前記軽鎖ＣＤＲ１が、配列番号：５０および５１からなる群から選択されるアミノ酸配列を含み； 
（ｅ）前記軽鎖ＣＤＲ２が、配列番号：５２および５３からなる群から選択されるアミノ酸配列を含み；ならびに
（ｆ）前記軽鎖ＣＤＲ３が、配列番号：５４−５７からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む、実施態様５２に記載の方法。
【００７３】
実施態様５４．前記ＶＨが、配列番号：１−１８からなる群から選択されるアミノ酸配列を含み、前記ＶＬが、配列番号：１９−２２からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む、実施態様５２に記載の方法。
【００７４】
実施態様５５．前記ＰＤ−１／ＰＤ−Ｌ１軸アンタゴニストが、抗ＰＤ−１抗体、抗ＰＤ−Ｌ１抗体、またはこれれらのいずれかの組み合わせである、実施態様２４−３０のいずれか１つに記載の方法。
【００７５】
実施態様５６．前記抗ＰＤ−１抗体が、ニボルマブ、ペムブロリズマブ、ＭＥＤＩ０６０８、ＡＭＰ−２２４、ＰＤＲ００１、ＢＧＢ−Ａ３１７、またはこれらのいずれかの組み合わせを含む、実施態様５５に記載の方法。
【００７６】
実施態様５７．前記抗ＰＤ−Ｌ１抗体が、ＢＭＳ−９３６５５９、ＭＰＤＬ３２８０Ａ、ＭＥＤＩ４７３６、ＭＳＢ００１０７１８Ｃ、またはこれらのいずれかの組み合わせを含む、実施態様５５に記載の方法。
【００７７】
実施態様５８．癌に罹っている対象におけるＴＩＭ−３アンタゴニストを含む治療の有効性を評価するための方法であって、前記治療の前記対象への投与後に前記対象における可溶性ＴＩＭ−３の血清力価を調べ、前記血清力価がコントロール対象と同等である場合、前記治療が、前記対象における有効な治療である可能性が高いことを特徴とする方法。
【００７８】
実施態様５９．前記有効な治療が、前記治療前の腫瘍サイズと比較して少なくとも約１０％、約２０％、約３０％、約４０％、または約５０％まで腫瘍サイズを減少する、実施態様５８に記載の方法。
【００７９】
実施態様６０．前記有効な治療が、前記対象の全生存率を、少なくとも約６ヶ月、少なくとも約７ヶ月、少なくとも約８ヶ月、少なくとも約９ヶ月、少なくとも約１０ヶ月、少なくとも約１１ヶ月、少なくとも約１２ヶ月、少なくとも約１３ヶ月、少なくとも約１４ヶ月少なくとも約１５ヶ月、少なくとも約１６ヶ月、少なくとも約１７ヶ月、少なくとも約１８ヶ月、少なくとも約１９ヶ月、少なくとも約２０ヶ月、少なくとも約２１ヶ月、少なくとも約２２ヶ月、少なくとも約２３ヶ月、少なくとも約２４ヶ月、少なくとも約２５ヶ月、少なくとも約２６ヶ月、少なくとも約２７ヶ月、少なくとも約２８ヶ月、少なくとも約２９ヶ月、少なくとも約３０ヶ月、少なくとも約３年、少なくとも約３．５年、少なくとも約４年、少なくとも約４．５年、少なくとも約５年、または少なくとも約１０年まで有効に増加する、実施態様５８または５９に記載の方法。
【００８０】
実施態様６１．前記有効な治療が、前記対象の無増悪生存期間を、少なくとも約１ヶ月、少なくとも約２ヶ月、少なくとも約３ヶ月、少なくとも約４ヶ月、少なくとも約５ヶ月、少なくとも約６ヶ月、少なくとも約７ヶ月、少なくとも約８ヶ月、少なくとも約９ヶ月、少なくとも約１０ヶ月、少なくとも約１１ヶ月、少なくとも約１年、少なくとも約１５ヶ月、少なくとも約１８ヶ月、少なくとも約２年、少なくとも約３年、少なくとも約４年、または少なくとも約５年まで増加する、実施態様５８−６０のいずれか１つに記載の方法。
【００８１】
実施態様６２．前記ＴＩＭ−３アンタゴニストが、ＴＩＭ−３抗体である、実施態様５８−６１のいずれか１つに記載の方法。
【００８２】
実施態様６３．前記ＴＩＭ−３抗体が、ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３を含む重鎖可変領域、ならびにＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３を含む軽鎖可変領域を含み、
（ａ）前記重鎖ＣＤＲ１が、配列番号：２３−２７からなる群から選択されるアミノ酸配列を含み； 
（ｂ）前記重鎖ＣＤＲ２が、配列番号：２８−３８からなる群から選択されるアミノ酸配列を含み；
（ｃ）前記重鎖ＣＤＲ３が、配列番号：３９−４９からなる群から選択されるアミノ酸配列を含み；
（ｄ）前記軽鎖ＣＤＲ１が、配列番号：５０および５１からなる群から選択されるアミノ酸配列を含み； 
（ｅ）前記軽鎖ＣＤＲ２が、配列番号：５２および５３からなる群から選択されるアミノ酸配列を含み；ならびに
（ｆ）前記軽鎖ＣＤＲ３が、配列番号：５４−５７からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む、実施態様６２に記載の方法。
【００８３】
実施態様６４．
（ａ１）前記重鎖可変領域ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３が、それぞれ、配列番号：２３、２８、３９を含み、前記軽鎖可変領域ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３が、それぞれ、配列番号：５０、５２、５４を含み；
（ａ２）前記重鎖可変領域ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３が、それぞれ、配列番号：２３、３５、３９を含み、前記軽鎖可変領域ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３が、それぞれ、配列番号：５０、５２、５４を含み；
（ａ３）前記重鎖可変領域ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３が、それぞれ、配列番号：２３、３６、３９を含み、前記軽鎖可変領域ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３が、それぞれ、配列番号：５０、５２、５４を含み；
（ａ４）前記重鎖可変領域ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３が、それぞれ、配列番号：２３、３７、３９を含み、前記軽鎖可変領域ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３が、それぞれ、配列番号：５０、５２、５４を含み；
（ａ５）前記重鎖可変領域ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３が、それぞれ、配列番号：２３、２８、４６を含み、前記軽鎖可変領域ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３が、それぞれ、配列番号：５０、５２、５４を含み；
（ａ６）前記重鎖可変領域ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３が、それぞれ、配列番号：２３、２８、４７を含み、前記軽鎖可変領域ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３が、それぞれ、配列番号：５０、５２、５４を含み；
（ａ７）前記重鎖可変領域ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３が、それぞれ、配列番号：２３、２８、４８を含み、前記軽鎖可変領域ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３が、それぞれ、配列番号：５０、５２、５４を含み；
（ａ８）前記重鎖可変領域ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３が、それぞれ、配列番号：２３、２８、４９を含み、前記軽鎖可変領域ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３が、それぞれ、配列番号：５０、５２、５４を含み；
（ａ９）前記重鎖可変領域ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３が、それぞれ、配列番号：２３、３５、４６を含み、前記軽鎖可変領域ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３が、それぞれ、配列番号：５０、５２、５４を含み；
（ａ１０）前記重鎖可変領域ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３が、それぞれ、配列番号：２３、３５、４８を含み、前記軽鎖可変領域ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３が、それぞれ、配列番号：５０、５２、５４を含み；
（ｂ１）前記重鎖可変領域ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３が、それぞれ、配列番号：２４、２９、４０を含み、前記軽鎖可変領域ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３が、それぞれ、配列番号：５０、５２、５５を含み；
（ｂ２）前記重鎖可変領域ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３が、それぞれ、配列番号：２４、３８、４０を含み、前記軽鎖可変領域ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３が、それぞれ、配列番号：５０、５２、５５を含み；
（ｃ）前記重鎖可変領域ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３が、それぞれ、配列番号：２５、３０、４１を含み、前記軽鎖可変領域ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３が、それぞれ、配列番号：５０、５２、５５を含み；
（ｄ）前記重鎖可変領域ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３が、それぞれ、配列番号：２６、３１、４２を含み、前記軽鎖可変領域ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３が、それぞれ、配列番号：５０、５２、５４を含み；
（ｅ）前記重鎖可変領域ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３が、それぞれ、配列番号：２７、３２、４３を含み、前記軽鎖可変領域ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３が、それぞれ、配列番号：５０、５２、５５を含み；
（ｆ）前記重鎖可変領域ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３が、それぞれ、配列番号：２７、３２、４３を含み、前記軽鎖可変領域ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３が、それぞれ、配列番号：５０、５２、５７を含み；
（ｇ１）前記重鎖可変領域ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３が、それぞれ、配列番号：２７、３２、４３を含み、前記軽鎖可変領域ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３が、それぞれ、配列番号：５１、５３、５６を含み；
（ｇ２）前記重鎖可変領域ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３が、それぞれ、配列番号：２７、３２、４３を含み、前記軽鎖可変領域ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３が、それぞれ、配列番号：５０、５２、５７を含み；
（ｇ３）前記重鎖可変領域ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３が、それぞれ、配列番号：２７、３２、４３を含み、前記軽鎖可変領域ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３が、それぞれ、配列番号：５０、５２、５５を含み；
（ｈ）前記重鎖可変領域ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３が、それぞれ、配列番号：２７、３３、４４を含み、前記軽鎖可変領域ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３が、それぞれ、配列番号：５０、５２、５４を含み；または
（ｉ）前記重鎖可変領域ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３が、それぞれ、配列番号：２７、３４、４５を含み、前記軽鎖可変領域ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３が、それぞれ、配列番号：５０、５２、５５を含み；
前記抗体が、ヒトＴＩＭ−３に特異的に結合する、実施態様２３または５３に記載の方法。
【００８４】
実施態様６５．前記ＴＩＭ−３抗体が、重鎖可変領域（ＶＨ）および軽鎖可変領域（ＶＬ）を含むものであって、前記ＶＨおよびＶＬが、
（ａ）配列番号：１および１９をそれぞれ含むＶＨおよびＶＬ；
（ｂ）配列番号：２および２０をそれぞれ含むＶＨおよびＶＬ；
（ｃ）配列番号：３および２０をそれぞれ含むＶＨおよびＶＬ；
（ｄ）配列番号：４および１９をそれぞれ含むＶＨおよびＶＬ；
（ｅ）配列番号：５および２０をそれぞれ含むＶＨおよびＶＬ；
（ｆ）配列番号：５および２１をそれぞれ含むＶＨおよびＶＬ； 
（ｇ）配列番号：５および２２をそれぞれ含むＶＨおよびＶＬ；
（ｈ）配列番号：６および１９をそれぞれ含むＶＨおよびＶＬ； 
（ｉ）配列番号：７および２０をそれぞれ含むＶＨおよびＶＬ；
（ｊ）配列番号：１７および２２をそれぞれ含むＶＨおよびＶＬ；
（ｋ）配列番号：１６および２０をそれぞれ含むＶＨおよびＶＬ； 
（ｌ）配列番号：８および１９をそれぞれ含むＶＨおよびＶＬ； 
（ｍ）配列番号：９および１９をそれぞれ含むＶＨおよびＶＬ；
（ｎ）配列番号：１０および１９をそれぞれ含むＶＨおよびＶＬ；
（ｏ）配列番号：１１および１９をそれぞれ含むＶＨおよびＶＬ； 
（ｐ）配列番号：１２および１９をそれぞれ含むＶＨおよびＶＬ； 
（ｑ）配列番号：１３および１９をそれぞれ含むＶＨおよびＶＬ； 
（ｒ）配列番号：１４および１９をそれぞれ含むＶＨおよびＶＬ； 
（ｓ）配列番号：１５および１９をそれぞれ含むＶＨおよびＶＬ；ならびに
（ｔ）配列番号：１８および１９をそれぞれ含むＶＨおよびＶＬ
からなる群から選択される、実施態様２３または５３に記載の方法。
【００８５】
実施態様６６．前記ＴＩＭ−３抗体が：
（ａ１）配列番号：１３６（または１３７）および１９０をそれぞれ含む重鎖および軽鎖配列；
（ａ２）配列番号：６８（または７５）および１９０をそれぞれ含む重鎖および軽鎖配列；
（ａ３）配列番号：８２（または８９）および１９０をそれぞれ含む重鎖および軽鎖配列；
（ａ４）配列番号：１３８（または１３９）および１９０をそれぞれ含む重鎖および軽鎖配列；
（ａ５）配列番号：９６（または１０６）および１９０をそれぞれ含む重鎖および軽鎖配列；
（ａ６）配列番号：１１６（または１２６）および１９０をそれぞれ含む重鎖および軽鎖配列；
（ａ７）配列番号：１４０（または１４１）および１９０をそれぞれ含む重鎖および軽鎖配列；
（ａ８）配列番号：９７（または１０７）および１９０をそれぞれ含む重鎖および軽鎖配列；
（ａ９）配列番号：１１７（または１２７）および１９０をそれぞれ含む重鎖および軽鎖配列； 
（ａ１０）配列番号：１４２（または１４３）および１９０をそれぞれ含む重鎖および軽鎖配列；
（ａ１１）配列番号：９８（または１０８）および１９０をそれぞれ含む重鎖および軽鎖配列；
（ａ１２）配列番号：１１８（または１２８）および１９０をそれぞれ含む重鎖および軽鎖配列；
（ａ１３）配列番号：１４４（または１４５）および１９０をそれぞれ含む重鎖および軽鎖配列；
（ａ１４）配列番号：９９（または１０９）および１９０をそれぞれ含む重鎖および軽鎖配列；
（ａ１５）配列番号：１１９（または１２９）および１９０をそれぞれ含む重鎖および軽鎖配列；
（ａ１６）配列番号：１４６（または１４７）および１９０をそれぞれ含む重鎖および軽鎖配列；
（ａ１７）配列番号：１００（または１１０）および１９０をそれぞれ含む重鎖および軽鎖配列；
（ａ１８）配列番号：１２０（または１３０）および１９０をそれぞれ含む重鎖および軽鎖配列；
（ａ１９）配列番号：１４８（または１４９）および１９０をそれぞれ含む重鎖および軽鎖配列； 
（ａ２０）配列番号：１０１（または１１１）および１９０をそれぞれ含む重鎖および軽鎖配列；
（ａ２１）配列番号：１２１（または１３１）および１９０をそれぞれ含む重鎖および軽鎖配列；
（ａ２２）配列番号：１５０（または１５１）および１９０をそれぞれ含む重鎖および軽鎖配列；
（ａ２３）配列番号：１０２（または１１２）および１９０をそれぞれ含む重鎖および軽鎖配列；
（ａ２４）配列番号：１２２（または１３２）および１９０をそれぞれ含む重鎖および軽鎖配列；
（ａ２５）配列番号：１５２（または１５３）および１９０をそれぞれ含む重鎖および軽鎖配列；
（ａ２６）配列番号：１０３（または１１３）および１９０をそれぞれ含む重鎖および軽鎖配列；
（ａ２７）配列番号：１２３（または１３３）および１９０をそれぞれ含む重鎖および軽鎖配列；
（ａ２８）配列番号：１５４（または１５５）および１９０をそれぞれ含む重鎖および軽鎖配列；
（ａ２９）配列番号：１８４（または１８５）および１９０をそれぞれ含む重鎖および軽鎖配列；
（ａ３０）配列番号：１８６（または１８７）および１９０をそれぞれ含む重鎖および軽鎖配列；
（ａ３１）配列番号：１８８（または１８９）および１９０をそれぞれ含む重鎖および軽鎖配列；
（ｂ１）配列番号：１５６（または１５７）および１９１をそれぞれ含む重鎖および軽鎖配列；
（ｂ２）配列番号：６９（または７６）および１９１をそれぞれ含む重鎖および軽鎖配列；
（ｂ３）配列番号：８３（または９０）および１９１をそれぞれ含む重鎖および軽鎖配列；
（ｂ４）配列番号：１５８（または１５９）および１９１をそれぞれ含む重鎖および軽鎖配列；
（ｂ５）配列番号：１０４（または１１４）および１９１をそれぞれ含む重鎖および軽鎖配列；
（ｂ６）配列番号：１２４（または１３４）および１９１をそれぞれ含む重鎖および軽鎖配列； 
（ｂ７）配列番号：１６０（または１６１）および１９１をそれぞれ含む重鎖および軽鎖配列； 
（ｃ１）配列番号：１６２（または１６３）および１９１をそれぞれ含む重鎖および軽鎖配列；
（ｃ２）配列番号：７０（または７７）および１９１をそれぞれ含む重鎖および軽鎖配列；
（ｃ３）配列番号：８４（または９１）および１９１をそれぞれ含む重鎖および軽鎖配列；
（ｃ４）配列番号：１６４（または１６５）および１９１をそれぞれ含む重鎖および軽鎖配列；
（ｄ１）配列番号：１６６（または１６７）および１９０をそれぞれ含む重鎖および軽鎖配列；
（ｄ２）配列番号：７１（または７８）および１９０をそれぞれ含む重鎖および軽鎖配列；
（ｄ３）配列番号：８５（または９２）および１９０をそれぞれ含む重鎖および軽鎖配列；
（ｄ４）配列番号：１６８（または１６９）および１９０をそれぞれ含む重鎖および軽鎖配列；
（ｅ１．１）配列番号：１７０（または１７１）および１９２をそれぞれ含む重鎖および軽鎖配列；
（ｅ１．２）配列番号：１７０（または１７１）および１９３をそれぞれ含む重鎖および軽鎖配列；
（ｅ１．３）配列番号：１７０（または１７１）および１９１をそれぞれ含む重鎖および軽鎖配列；
（ｅ２）配列番号：７２（または７９）および１９３をそれぞれ含む重鎖および軽鎖配列；
（ｅ３）配列番号：８６（または９３）および１９３をそれぞれ含む重鎖および軽鎖配列；
（ｅ４）配列番号：１７２（または１７３）および１９３をそれぞれ含む重鎖および軽鎖配列；
（ｅ５）配列番号：１０５（または１１５）および１９３をそれぞれ含む重鎖および軽鎖配列；
（ｅ６）配列番号：１２５（または１３５）および１９３をそれぞれ含む重鎖および軽鎖配列；
（ｅ７）配列番号：１７４（または１７５）および１９３をそれぞれ含む重鎖および軽鎖配列；
（ｆ１）配列番号：１７６（または１７７）および１９０をそれぞれ含む重鎖および軽鎖配列；
（ｆ２）配列番号：７３（または８０）および１９０をそれぞれ含む重鎖および軽鎖配列；
（ｆ３）配列番号：８７（または９４）および１９０をそれぞれ含む重鎖および軽鎖配列；
（ｆ４）配列番号：１７８（または１７９）および１９０をそれぞれ含む重鎖および軽鎖配列；
（ｇ１）配列番号：１８０（または１８１）および１９１をそれぞれ含む重鎖および軽鎖配列；
（ｇ２）配列番号：７４（または８１）および１９１をそれぞれ含む重鎖および軽鎖配列；
（ｇ３）配列番号：８８（または９５）および１９１をそれぞれ含む重鎖および軽鎖配列；または
（ｇ４）配列番号：１８２（または１８３）および１９１をそれぞれ含む重鎖および軽鎖配列を含み、
前記抗体が、ヒトＴＩＭ−３に特異的に結合する、実施態様２３または５３に記載の方法。
【００８６】
実施態様６７．癌に罹っている対象の治療方法であって、癌に罹っており、コントロール対象より高い可溶性ＴＩＭ−３の血清力価を有する対象に、治療上の有効量のＴＩＭ−３アンタゴニストを投与することを特徴とし、前記ＴＩＭ−３アンタゴニストが、重鎖および軽鎖を含む抗体であって、（ｉ）前記重鎖が、配列番号：２３、３５、および４６をそれぞれ含む重鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３を含み、前記軽鎖が、配列番号：５０、５２、および５４をそれぞれ含む軽鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３を含み；（ｉｉ）前記重鎖が、配列番号：１８を含むＶＨを含み、前記軽鎖が、配列番号：１９を含むＶＬを含み；あるいは（ｉｉｉ）前記重鎖が、配列番号：１８６または１８７を含み、前記軽鎖が、配列番号：１９０を含む、方法。
【００８７】
実施態様６８．前記対象が、コントロール対象より前記対象において少なくとも１０％高い可溶性ＴＩＭ−３の血清力価を有する、実施態様６７に記載の方法。
【００８８】
実施態様６９．前記対象が、コントロール対象より少なくとも２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、９０％、または１００％（２倍）高い可溶性ＴＩＭ−３の血清力価を有する、実施態様６７に記載の方法。
【００８９】
実施態様７０．前記対象が、（例えば、実施例に記載の方法で調べると）少なくとも２１００、２２００、２３００、２４００、または２５００ｐｇ／ｍｌの可溶性ＴＩＭ−３の血清力価を有する、実施態様６７−６９のいずれか１つに記載の方法。
【００９０】
実施態様７１．前記対象が、（例えば、実施例に記載の方法で調べると）少なくとも３０００ｐｇ／ｍｌの可溶性ＴＩＭ−３の血清力価を有する、実施態様６７−７０のいずれか１つに記載の方法。
【００９１】
実施態様７２．投与前に可溶性ＴＩＭ−３の血清力価を測定することをさらに特徴とする、実施態様６７−７１のいずれか１つに記載の方法。
【００９２】
実施態様７３．ＴＩＭ−３アンタゴニストによる癌に罹っている対象の治療方法であって、前記対象における可溶性ＴＩＭ−３の血清力価を調べ、前記可溶性ＴＩＭ−３の血清力価が、コントロール対象より高い場合、治療上の有効量のＴＩＭ−３アンタゴニストを前記対象に投与することを特徴とし、前記ＴＩＭ−３アンタゴニストが、重鎖および軽鎖を含む抗体であって、（ｉ）前記重鎖が、配列番号：２３、３５、および４６をそれぞれ含む重鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３を含み、前記軽鎖が、配列番号：５０、５２、および５４をそれぞれ含む軽鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３を含み；（ｉｉ）前記重鎖が、配列番号：１８を含むＶＨを含み、前記軽鎖が、配列番号：１９を含むＶＬを含み；または（ｉｉｉ）前記重鎖が、配列番号：１８６または１８７を含み、前記軽鎖が、配列番号：１９０を含む、方法。
【００９３】
実施態様７４．前記対象が、コントロール対象より前記対象において少なくとも１０％高い可溶性ＴＩＭ−３の血清力価を有する場合、前記対象に、治療上の有効量のＴＩＭ−３アンタゴニストを投与する、実施態様７３に記載の方法。
【００９４】
実施態様７５．前記対象が、コントロール対象より少なくとも２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、９０％、または１００％（２倍）高い可溶性ＴＩＭ−３の血清力価を有する場合、前記対象に、治療上の有効量のＴＩＭ−３アンタゴニストを投与する、実施態様７３または７４に記載の方法。
【００９５】
実施態様７６．前記対象が、（例えば、実施例に記載の方法で調べると）少なくとも２５００ｐｇ／ｍｌの可溶性ＴＩＭ−３の血清力価を有する場合、前記対象に、治療上の有効量のＴＩＭ−３アンタゴニストを投与する、実施態様７３−７５のいずれか１つに記載の方法。
【００９６】
実施態様７７．前記対象が、（例えば、実施例に記載の方法で調べると）少なくとも３０００ｐｇ／ｍｌ可溶性ＴＩＭ−３の血清力価を有する場合、前記対象に、治療上の有効量のＴＩＭ−３アンタゴニストを投与する、実施態様７３−７６のいずれか１つに記載の方法。
【００９７】
実施態様７８．前記可溶性ＴＩＭ−３が、異なるスプライス型可溶性ＴＩＭ−３および／または切断型ＴＩＭ−３である、実施態様６７−７７のいずれか１つに記載の方法。
【００９８】
実施態様７９．前記癌が、固形腫瘍である、実施態様６７−７８のいずれか１つに記載の方法。
【００９９】
実施態様８０．前記癌が、結腸、腎臓または肺癌である、実施態様６７−７９のいずれか１つに記載の方法。
【０１００】
実施態様８１．コントロール対象における可溶性ＴＩＭ−３の血清力価が、少なくとも１０、５０、または１００人の対象における可溶性ＴＩＭ−３の中間もしくは平均力価である、実施態様６７−８０のいずれか１つに記載の方法。
【０１０１】
実施態様８２．前記ＴＩＭ−３アンタゴニストが、ＴＩＭ−３抗体である、実施態様６７−８１のいずれか１つに記載の方法。
【０１０２】
実施態様８３．ＰＤ−１／ＰＤ−Ｌ１軸アンタゴニストおよびＴＩＭ−３アンタゴニストの組み合わせによる癌に罹っている対象の治療方法であって、ＣＤ８＋ＴＩＬの少なくとも５％がＰＤ−１およびＴＩＭ−３の共発現を示す対象に、治療上の有効量のＰＤ−１／ＰＤ−Ｌ１軸アンタゴニストおよびＴＩＭ−３アンタゴニストの組み合わせを投与することを特徴とし、前記ＴＩＭ−３アンタゴニストが、重鎖および軽鎖を含む抗体であって、 （ｉ）前記重鎖が、配列番号：２３、３５、および４６をそれぞれ含む重鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３を含み、前記軽鎖が、配列番号：５０、５２、および５４をそれぞれ含む軽鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３を含み；（ｉｉ）前記重鎖が、配列番号：１８を含むＶＨを含み、前記軽鎖が、配列番号：１９を含むＶＬを含み；または（ｉｉｉ）前記重鎖が、配列番号：１８６または１８７を含み、前記軽鎖が、配列番号：１９０を含むものであって、前記ＰＤ−１アンタゴニストが、ニボルマブである、方法。
【０１０３】
実施態様８４．前記対象が、ＣＤ８＋ＴＩＬの少なくとも１０％、２０％、３０％、４０％においてＰＤ−１およびＴＩＭ−３の共発現を示す、実施態様８３に記載の方法。
【０１０４】
実施態様８５．ＰＤ−１／ＰＤ−Ｌ１軸アンタゴニストおよびＴＩＭ−３アンタゴニストの組み合わせによる癌に罹っている対象の治療方法であって、前記対象のＰＤ−１陽性腫瘍浸潤リンパ球（ＴＩＬ）の頻度およびＴＩＭ−３陽性ＴＩＬの頻度を調べ、ＰＤ−１およびＴＩＭ−３が前記対象のＣＤ８＋ＴＩＬの少なくとも５％において共発現される場合、ＰＤ−１／ＰＤ−Ｌ１軸アンタゴニストおよびＴＩＭ−３アンタゴニストの組み合わせを前記対象に投与することを特徴とし、前記ＴＩＭ−３アンタゴニストが、重鎖および軽鎖を含む抗体であって、（ｉ）前記重鎖が、配列番号：２３、３５、および４６をそれぞれ含む重鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３を含み、前記軽鎖が、配列番号：５０、５２、および５４をそれぞれ含む軽鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３を含み；（ｉｉ）前記重鎖が、配列番号：１８を含むＶＨを含み、前記軽鎖が、配列番号：１９を含むＶＬを含み；あるいは（ｉｉｉ）前記重鎖が、配列番号：１８６または１８７を含み、前記軽鎖が、配列番号：１９０を含むものであり、前記ＰＤ−１アンタゴニストが、ニボルマブである、方法。
【０１０５】
実施態様８６．ＰＤ−１およびＴＩＭ−３が、前記対象のＣＤ８＋ＴＩＬの少なくとも１０％、２０％、３０％、４０％において共発現される場合、前記対象に、ＰＤ−１／ＰＤ−Ｌ１軸アンタゴニストおよびＴＩＭ−３アンタゴニストの組み合わせを投与する、実施態様８５に記載の方法。
【０１０６】
実施態様８７．ＴＩＭ−３アンタゴニストによる癌に罹っている対象の治療方法であって、１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、または７０％より高いＣＤ８＋ＴＩＬの割合を有する対象に、治療上の有効量のＴＩＭ−３アンタゴニストを投与することを特徴とし、前記ＴＩＭ−３アンタゴニストが、重鎖および軽鎖を含む抗体であって、（ｉ）前記重鎖が、配列番号：２３、３５、および４６をそれぞれ含む重鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３を含み、前記軽鎖が、配列番号：５０、５２、および５４をそれぞれ含む軽鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３を含み；（ｉｉ）前記重鎖が、配列番号：１８を含むＶＨを含み、前記軽鎖が、配列番号：１９を含むＶＬを含み；あるいは（ｉｉｉ）前記重鎖が、配列番号：１８６または１８７を含み、前記軽鎖が、配列番号：１９０を含む、方法。
【０１０７】
実施態様８８．ＴＩＭ−３アンタゴニストによる癌に罹っている対象の治療方法であって、ＴＩＭ−３陽性であるＣＤ８＋ＴＩＬの割合を調べ、前記割合が１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、または７０％より高い場合、治療上の有効量のＴＩＭ−３アンタゴニストを前記対象に投与することを特徴とし、前記ＴＩＭ−３アンタゴニストが、重鎖および軽鎖を含む抗体であって、（ｉ）前記重鎖が、配列番号：２３、３５、および４６をそれぞれ含む重鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３を含み、前記軽鎖が、配列番号：５０、５２、および５４をそれぞれ含む軽鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３を含み；（ｉｉ）前記重鎖が、配列番号：１８を含むＶＨを含み、前記軽鎖が、配列番号：１９を含むＶＬを含み；あるいは（ｉｉｉ）前記重鎖が、配列番号：１８６または１８７を含み、前記軽鎖が、配列番号：１９０を含む、方法。
【０１０８】
実施態様８９．ＴＩＭ−３アンタゴニストによる癌に罹っている対象の治療方法であって、前記対象のＴＩＬにおけるＴＩＭ−３陽性である樹状細胞、マクロファージ、およびＮＫ細胞の割合を有する対象に、治療上の有効量のＴＩＭ−３アンタゴニストを投与することを特徴とし、前記割合がコントロール対象より高い場合、前記ＴＩＭ−３アンタゴニストが、重鎖および軽鎖を含む抗体であって、（ｉ）前記重鎖が、配列番号：２３、３５、および４６をそれぞれ含む重鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３を含み、前記軽鎖が、配列番号：５０、５２、および５４をそれぞれ含む軽鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３を含み；（ｉｉ）前記重鎖が、配列番号：１８を含むＶＨを含み、前記軽鎖が、配列番号：１９を含むＶＬを含み；または（ｉｉｉ）前記重鎖が、配列番号：１８６または１８７を含み、前記軽鎖が、配列番号：１９０を含む、方法。
【０１０９】
実施態様９０．ＴＩＭ−３アンタゴニストによる癌に罹っている対象の治療方法であって、前記対象において、前記対象のＴＩＬにおけるＴＩＭ−３陽性である樹状細胞、マクロファージ、およびＮＫ細胞の割合を調べ、前記割合がコントロール対象より高い場合、治療上の有効量のＴＩＭ−３アンタゴニストを前記対象に投与することを特徴とし、前記ＴＩＭ−３アンタゴニストが、重鎖および軽鎖を含む抗体であって、（ｉ）前記重鎖が、配列番号：２３、３５、および４６をそれぞれ含む重鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３を含み、前記軽鎖が、配列番号：５０、５２、および５４をそれぞれ含む軽鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３を含み；（ｉｉ）前記重鎖が、配列番号：１８を含むＶＨを含み、前記軽鎖が、配列番号：１９を含むＶＬを含み；または（ｉｉｉ）前記重鎖が、配列番号：１８６または１８７を含み、前記軽鎖が、配列番号：１９０を含む、方法。
【図面の簡単な説明】
【０１１０】
【図１】図１Ａおよび１Ｂは、健常なヒト対象（「正常」）および癌患者（すなわち、結腸、腎臓、または肺）に由来する末梢血におけるＴＩＭ３＋ＣＤ４＋Ｔ細胞（図１Ａ）およびＴＩＭ３＋ＣＤ８＋Ｔ細胞（図１Ｂ）の頻度を示す。これらの頻度を、合計ＣＤ４＋Ｔ細胞またはＣＤ８＋Ｔ細胞の割合として示す。各円は各患者を表し、グループの各々の平均を横線で示す。
【図２−１】図２Ａ〜２Ｅは、異なる癌患者（すなわち、結腸、腎臓、または肺）から単離された腫瘍浸潤リンパ球（ＴＩＬ）におけるＴＩＭ３および／またはＰＤ−１を発現するＣＤ４＋Ｔ細胞およびＣＤ８＋Ｔ細胞の頻度を示す。ＴＩＭ３＋ＣＤ４＋およびＴＩＭ３＋ＣＤ８＋Ｔ細胞の頻度をそれぞれ図２Ａおよび２Ｂに示す。図２Ａおよび２Ｂにおいて、ＴＩＭ３＋細胞の頻度を、それぞれＴＩＬにおける合計ＣＤ４＋およびＣＤ８＋Ｔ細胞の割合として示す。
【図２−２】ＴＩＬにおいてＰＤ−１も発現するＴＩＭ３＋ＣＤ４＋およびＴＩＭ３＋ＣＤ８＋Ｔ細胞の頻度を、それぞれ図２Ｃおよび２Ｄに示す。図２Ｃおよび２Ｄにおいて、ＰＤ−１＋細胞の頻度を、それぞれＴＩＬにおけるＴＩＭ３＋ＣＤ４＋およびＴＩＭ３＋ＣＤ８＋Ｔ細胞の割合として示す。
【図２−３】図２Ｅは、ＴＩＭ３＋ＣＤ８＋Ｔ細胞の低い頻度（＜８％）（左カラム）およびＴＩＭ３＋ＣＤ８＋Ｔ細胞の高い頻度（右カラム）を示す全ての癌患者に由来するＴＩＬにおけるＣＤ８＋Ｔ細胞上のＰＤ−１発現の比較を示す。ＰＤ−１陽性発現の頻度をＴＩＭ３＋ＣＤ８＋Ｔ細胞の割合として示す。示されるＰ値は、マン・ホイットニーのＵ検定を用いて算出した。
【図３】図３Ａ〜３Ｃは、異なる癌患者（腎臓、肺、結腸、肝臓、卵巣、胃、子宮、または胃腸癌）に由来するＴＩＬにおいてＴＩＭ３を発現する異なるＴ細胞分画の頻度を示す。図３Ａは、異なるＣＤ４＋およびＣＤ８＋Ｔ細胞分画：ナイーブ（ＣＣＲ７＋ＣＤ４５ＲＯ−）、セントラルメモリー（ＣＣＲ７＋ＣＤ４５ＲＯ＋）、エフェクターメモリー（ＣＣＲ７−ＣＤ４５ＲＯ＋）、およびエフェクター（ＣＣＲ７−ＣＤ４５ＲＯ−）を同定するためのゲート法（gating strategy）を供する。図３Ｂは、異なる癌患者に由来するＴＩＬ（ｎ＝２７）においてＴＩＭ３を発現する異なるＣＤ４＋（上部パネル）およびＣＤ８＋（下部パネル）Ｔ細胞分画の頻度を示す。示される頻度は、上記に記載のＣＤ４＋またはＣＤ８＋Ｔ細胞分画内のＴＩＭ−３＋細胞の割合である。図３Ｃは、ＴＩＬと適合する血液との間の異なるＣＤ４＋およびＣＤ８＋Ｔ細胞分画におけるＴＩＭ３＋細胞の頻度の比較を示す。
【図４】図４Ａおよび４Ｂは、異なる癌患者（すなわち、腎臓、結腸、子宮、または肺）に由来するＴＩＬにおいてＴＩＭ３および／またはＰＤ−１を発現するＣＤ８＋Ｔ細胞分画の頻度を示す。図４Ａは、（ｉ）ＰＤ−１のみを発現し（灰色の薄い影）、（ｉｉ）ＴＩＭ３のみを発現し（灰色の暗い影）、および（ｉｉ）ＰＤ−１およびＴＩＭ３の両方を発現する（黒色）ＣＤ８＋Ｔ細胞の頻度を示す。ｘ軸は各癌患者を表す。図４Ｂは、（ｉ）ＰＤ−１のみ（各パネルにおける左上四分円）、（ｉｉ）ＴＩＭ３のみ（各パネルにおける右下四分円）、および（ｉｉ）ＰＤ−１およびＴＩＭ３の両方（各パネルにおける右上四分円）を発現するＣＤ８＋（左パネル）およびＣＤ４＋（右パネル）Ｔ細胞の頻度のフローサイトメトリー分析を示す。
【図５】図５Ａおよび５Ｂは、ＴＩＭ−３を発現する異なる癌患者に由来するＴＩＬにおける異なる骨髄細胞（図５Ａ）およびＮＫ細胞（図５Ｂ）の頻度を示す。図５Ａにおいて、１０人の癌患者に由来するＴＩＬにおける（ｉ）ＴＩＭ−３＋ＣＤ１５＋顆粒球、（ｉｉ）ＴＩＭ３＋形質細胞様樹状細胞（ｐＤＣ）、（ｉｉｉ）ＴＩＭ３＋骨髄性樹状細胞（ｍＤＣ）、および（ｉｖ）ＴＩＭ−３＋単球／マクロファージ（ＣＤ１４＋ＣＤ６４＋）の頻度を示す。図５Ｂにおいて、１０人の癌患者に由来するＴＩＬにおけるＴＩＭ３＋ＣＤ１６−ＣＤ５６＋＋およびＣＤ１６＋ＣＤ５６＋ＣＤ３−ＮＫ細胞の頻度を示す。
【図６】図６Ａおよび６Ｂは、健常なヒト対象（「正常」）および癌患者（結腸、腎臓、および肺）に由来する血清における可溶性ＴＩＭ−３タンパク質のレベルを示す。図６Ａは、ドナー各々のデータを示す。図６Ｂは、ボックスプロットと同一のデータを示す。前記ＴＩＭ−３タンパク質レベルは、異なる患者（ｎ＝２０）に由来する血清を用いてＥＬＩＳＡによって測定した。データポイント上の「****」は、正常および癌患者との統計学的に有意な差異（ｐ＜０．０００１）を示す。データポイント上の「**」は、正常および癌患者との統計学的に有意な差異（ｐ＜０．０１）を示す。前記ｐ値は、マン・ホイットニーのＵ検定を用いて算出した。
【発明を実施するための形態】
【０１１１】
本開示の詳細な説明
定義
本明細書が容易に理解できるようにするために、特定の用語をまず定義した。さらなる定義は、詳細な記載を通して説明する。
【０１１２】
用語「ａ」または「ａｎ」実体は、その実体の１つまたはそれ以上を意味することに留意すべきであり；例えば、「ヌクレオチド配列」は、１つまたはそれ以上のヌクレオチド配列を示すものと理解される。そのようなものとして、用語「ａ」（または「ａｎ」）、「１つまたはそれ以上」、および「少なくとも１つ」は、本明細書で交換可能に用いることができる。
【０１１３】
さらに、本明細書で用いられる「および／または」は、２つの特定された特徴または構成成分の各々の他のものとともにまたは他のものなしの具体的な開示として捉えられるべきである。よって、本明細書で「Ａおよび／またはＢ」などの用語で用いられる用語「および／または」は、「ＡおよびＢ」、「ＡまたはＢ」、「Ａ」（のみ）、および「Ｂ」（のみ）を含むものとされる。同様に、「Ａ、Ｂ、および／またはＣ」などの用語で用いられる用語「および／または」は、下記態様のそれぞれを含むものとされる：Ａ、Ｂ、およびＣ；Ａ、Ｂ、またはＣ；ＡまたはＣ；ＡまたはＢ；ＢまたはＣ；ＡおよびＣ；ＡおよびＢ；ＢおよびＣ；Ａ（のみ）；Ｂ（のみ）；ならびにＣ（のみ）。
【０１１４】
「からなる」および／または「から必須としてなる」に関して記載される類似の態様が提供されていない限り、用語「含む」を用いて本明細書で記載されているものと理解される。
【０１１５】
特に定義されていない限り、本明細書で用いられる技術および科学用語は、本開示が関連する当業者によって一般に理解される意味と同一の意味を有する。例えば、the Concise Dictionary of Biomedicine and Molecular Biology, Juo, Pei-Show, 2nd ed., 2002, CRC Press; The Dictionary of Cell and Molecular Biology, 3rd ed., 1999, Academic Press; and the Oxford Dictionary Of Biochemistry And Molecular Biology, Revised, 2000, Oxford University Pressは、当業者に本開示で用いられる多くの用語の一般的な辞書を提供する。
【０１１６】
単位、識別、および記号は、それらの国際単位系（ＳＩ）で認められる形で示される。数値範囲は、範囲を定義する数値が含まれる。特に断りがなければ、ヌクレオチド配列は、５’から３’方向に左から右に記載される。アミノ酸配列は、アミノからカルボキシ方向に左から右に記載される。本明細書で供される表題は、本開示の様々な態様を限定するものではなく、全体として明細書を参照されうる。よって、直下で定義される用語は、本明細書全体を参照することにより十分に定義されるものである。
【０１１７】
用語「約」は、およそ、大まかに、周辺、または領域を意味するために本明細書で用いられる。用語「約」が数値範囲と合わせて用いられる場合、示される数値以上および以下の境界を広げることによって範囲を修正するものである。一般に、用語「約」は、例えば、１０パーセント上げるか、または下げる（高いか、または低い）変動によって示される値以上および以下の数値を修正しうる。
【０１１８】
本明細書で用いられる用語「Ｔ細胞免疫グロブリンおよびムチンドメイン含有−３」、「ＴＩＭ３」、または「ＴＩＭ−３」は、Ｔ細胞免疫グロブリンおよびムチンドメイン（ＴＩＭ）ファミリーのタンパク質の一員である受容体を意味する。ＴＩＭ−３に対する主なリガンドには、フォスファチジルセリン（ＴＩＭ３−Ｌ）が含まれる。ＴＩＭ３はまた、Ａ型肝炎ウイルス細胞受容体２（ＨＡＶＣＲ２）、Ｔ細胞免疫グロブリンムチン受容体３、ＴＩＭ−３、ＴＩＭＤ３、ＴＩＭＤ−３、腎臓傷害分子−３、ＫＩＭ−３、およびＣＤ３６６とも称される。用語「ＴＩＭ３」には、細胞によって天然に発現されるＴＩＭ３のアイソフォームの変異型のいずれもが含まれる。よって、本明細書に記載の抗体は、ヒト以外の種に由来するＴＩＭ３（例えば、カニクイザルＴＩＭ３）と交差反応することができる。あるいは、前記抗体は、ヒトＴＩＭ−３に特異的であり得、他の種と交差反応を示さない。ＴＩＭ３またはその変異型およびアイソフォームは、それらを天然で発現する細胞または組織から単離されうるか、あるいは当該技術分野で周知の技術および／または本明細書に記載の技術を用いて組み換えで産生されうる。
【０１１９】
ヒトＴＩＭ３の２つのアイソフォームが同定されている。アイソフォーム１（受入番号ＮＰ＿１１６１７１；配列番号：１９４）は、３０１個のアミノ酸からなり、基本的な配列を示す。アイソフォーム２（受入番号ＡＡＨ２０８４３；配列番号：１９５）は、１４２個のアミノ酸からなり、可溶性である。これは、ＴＩＭ３の膜貫通ドメイン、細胞質ドメイン、および細胞外ドメインの一部をコードするアミノ酸残基１４３−３０１を欠失している。アミノ酸残基１３２−１４２はまた、上記に記載の基本的な配列とは異なる。
【０１２０】
下記は、２つの公知のヒトＴＩＭ３アイソフォームアミノ酸配列である。
（ａ）ヒトＴＩＭ３アイソフォーム１（受入番号ＮＭ＿０３２７８２．４を有するヌクレオチド配列；配列番号：１９６によってコードされる受入番号ＮＰ＿１１６１７１；配列番号：１９４）：MFSHLPFDCVLLLLLLLLTRSSEVEYRAEVGQNAYLPCFYTPAAPGNLVPVCWGKGACPVFECGNVVLRTDERDVNYWTSRYWLNGDFRKGDVSLTIENVTLADSGIYCCRIQIPGIMNDEKFNLKLVIKPAKVTPAPTRQRDFTAAFPRMLTTRGHGPAETQTLGSLPDINLTQISTLANELRDSRLANDLRDSGATIRIGIYIGAGICAGLALALIFGALIFKWYSHSKEKIQNLSLISLANLPPSGLANAVAEGIRSEENIYTIEENVYEVEEPNEYYCYVSSRQQPSQPLGCRFAMP
（ｂ）ヒトＴＩＭ３アイソフォーム２（受入番号ＢＣ０２０８４３．１を有するヌクレオチド配列；配列番号：１９７によってコードされる受入番号ＡＡＨ２０８４３；配列番号：１９５）：MFSHLPFDCVLLLLLLLLTRSSEVEYRAEVGQNAYLPCFYTPAAPGNLVPVCWGKGACPVFECGNVVLRTDERDVNYWTSRYWLNGDFRKGDVSLTIENVTLADSGIYCCRIQIPGIMNDEKFNLKLVIKPGEWTFACHLYE
【０１２１】
アイソフォーム１および２のシグナル配列は、アミノ酸１−２１（下線）に相当する。よって、成熟アイソフォーム１および２は、それぞれ、アミノ酸２２〜３０１または１４２からなる。成熟ヒトＴＩＭ３の細胞外ドメインは、配列番号：１９４のアミノ酸２２−２０２からなり、下記アミノ酸配列を有する：SEVEYRAEVGQNAYLPCFYTPAAPGNLVPVCWGKGACPVFECGNVVLRTDERDVNYWTSRYWLNGDFRKGDVSLTIENVTLADSGIYCCRIQIPGIMNDEKFNLKLVIKPAKVTPAPTRQRDFTAAFPRMLTTRGHGPAETQTLGSLPDINLTQISTLANELRDSRLANDLRDSGATIRIG（配列番号：１９８）。
【０１２２】
カニクイザルＴＩＭ３タンパク質は、下記アミノ酸配列（シグナル配列を含む）からなる：MFSHLPFDCVLLLLLLLLTRSSEVEYIAEVGQNAYLPCSYTPAPPGNLVPVCWGKGACPVFDCSNVVLRTENRDVNDRTSGRYWLKGDFHKGDVSLTIENVTLADSGVYCCRIQIPGIMNDEKHNLKLVVIKPAKVTPAPTLQRDLTSAFPRMLTTGEHGPAETQTPGSLPDVNLTQIFTLTNELRDSGATIRTAIYIAAGISAGLALALIFGALIFKWYSHSKEKTQNLSLISLANIPPSGLANAVAEGIRSEENIYTIEEDVYEVEEPNEYYCYVSSGQQPSQPLGCRFAMP（配列番号：１９９）。
【０１２３】
用語「ＴＩＭ−３アンタゴニスト」または「ＴＩＭ３に対するアンタゴニスト」は、ヒトＴＩＭ−３タンパク質またはそのリガンド、あるいはヒトＴＩＭ３またはそのリガンドをコードする核酸にそれぞれ結合し、ヒトＴＩＭ３活性を抑制し、または阻害する全てのアンタゴニストを意味する。このようなアンタゴニストは、ペプチド、核酸、または化合物でありうる。より具体的に、前記アンタゴニストは、アンチセンス−オリゴヌクレオチド、ｓｉＲＮＡ、ｓｈＲＮＡ、ｍｉＲＮＡ、ｄｓＲＮＡ、アプタマー、ＰＮＡ（ペプチド核酸）標的ヒトＴＩＭ３、またはこれらを含むベクターでありうる。ある実施態様において、前記アンタゴニストは、ヒトＴＩＭ３に特異的に結合し、ヒトＴＩＭ３活性を抑制し、または阻害する抗体またはその抗原結合部分でありうる。
【０１２４】
用語「抗体」または「抗体」は、ある実施態様において、ジスルフィド結合により相互接続された少なくとも２つの重（Ｈ）鎖および２つの軽（Ｌ）鎖を含むタンパク質を意味する。各重鎖は、重鎖可変領域（本明細書では、ＶＨと略称される）および重鎖定常領域（本明細書では、ＣＨと略称される）から構成される。ある抗体において、例えば、天然に存在するＩｇＧ抗体であって、前記重鎖定常領域は、ヒンジドメインおよび３つのドメイン（ＣＨ１、ＣＨ２、およびＣＨ３）から構成される。ある抗体において、例えば、天然に存在するＩｇＧ抗体であって、各軽鎖は、軽鎖可変領域（本明細書では、ＶＬと略称される）および軽鎖定常領域から構成される。前記軽鎖定常領域は、１つのドメイン（本明細書では、ＣＬと略称される）から構成される。前記ＶＨおよびＶＬ領域は、フレームワーク領域（ＦＲ）と呼ばれるより保存される領域で散在された相補性決定領域（ＣＤＲ）と呼ばれる超可変領域にさらに細分化することができる。各ＶＨおよびＶＬは、アミノ末端からカルボキシ末端に下記の順番で配列された３つのＣＤＲおよび４つのＦＲ（ＦＲ１、ＣＤＲ１、ＦＲ２、ＣＤＲ２、ＦＲ３、ＣＤＲ３、ＦＲ４）から構成される。重鎖および軽鎖の可変領域は、抗原と相互作用する結合ドメインを含有する。前記抗体の定常領域は、その免疫グロブリンの宿主組織または因子（免疫系の様々な細胞（例えば、エフェクター細胞）および古典的補体系の第１補体（Ｃ１ｑ）を含む）への結合を介在しうる。重鎖は、Ｃ末端リジンを有していてもよく、または有していなくてもよい。特に本明細書で示されていない限り、可変領域におけるアミノ酸は、カバットナンバリングシステムを用いて番号付けされ、定常領域におけるアミノ酸は、ＥＵシステムを用いて番号付けされる。
【０１２５】
本明細書で用いられる「ＩｇＧ抗体」、例えば、ヒトＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３、およびＩｇＧ４抗体は、ある実施態様において、天然に存在するＩｇＧ抗体の構造を有し、すなわち、それは、同一のサブクラスの天然に存在するＩｇＧ抗体と同一数の重鎖および軽鎖ならびにジスルフィド結合を有する。例えば、抗ＴＩＭ３のＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３、またはＩｇＧ４抗体は、２つの重鎖（ＨＣ）および２つの軽鎖（ＬＣ）からなり、前記２つの重鎖および軽鎖は、天然に存在するＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３、およびＩｇＧ４抗体に存在するジスルフィド架橋と同一の数と場所によって結合されている（前記抗体がジスルフィド架橋を改変するように変異が入っていない限り）。
【０１２６】
免疫グロブリンは、ＩｇＡ、分泌ＩｇＡ、ＩｇＧ、およびＩｇＭを含むが、これに限定されない一般に公知のアイソタイプのいずれかに由来しうる。前記ＩｇＧアイソタイプは、ある種におけるサブクラス：ヒトにおけるＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３、およびＩｇＧ４、ならびにマウスにおけるＩｇＧ１、ＩｇＧ２ａ、ＩｇＧ２ｂ、およびＩｇＧ３に分けられる。ある実施態様において、本明細書に記載の抗ＴＩＭ３抗体は、ＩｇＧ１サブタイプのものである。免疫グロブリン、例えば、ＩｇＧ１には、せいぜい数個のアミノ酸において相互に異なる数種類のアロタイプが存在する。「抗体」には、一例として、天然に存在する抗体および天然に存在しない抗体の両方；モノクローナルおよびポリクローナル抗体；キメラおよびヒト化抗体；ヒトおよび非ヒト抗体、ならびに全合成抗体が含まれる。
【０１２７】
抗体の本明細書で用いられる用語「抗原結合部分」（「抗原結合断片」とも呼ばれる）は、抗原に特異的に結合する能力を保持する抗体の１つまたはそれ以上の断片（例えば、ヒトＴＩＭ３）を意味する。抗体の抗原結合機能は、全長抗体の断片によって行われうることが示されている。抗体（例えば、本明細書に記載の抗ＴＩＭ３抗体）の用語「抗原結合部分」に包含される結合断片の例として、（ｉ）ＶＬ、ＶＨ、ＬＣおよびＣＨ１ドメインからなる、Ｆａｂ断片（パパイン切断に由来する断片）または類似する一価断片；（ｉｉ）ヒンジ領域でジスルフィド架橋により結合されている２つのＦａｂ断片を含む、Ｆ（ａｂ’）２断片（ペプシン切断に由来する断片）または類似する二価断片；（ｉｉｉ）ＶＨおよびＣＨ１ドメインからなる、Ｆｄ断片；（ｉｖ）抗体の単一アームのＶＬおよびＶＨドメインからなる、Ｆｖ断片、（ｖ）ＶＨドメインからなる、ｄＡｂ断片（Ward et al., Nature 341:544-546 (1989)）；（ｖｉ）単離された相補性決定領域（ＣＤＲ）、および（ｖｉｉ）合成リンカーによって適宜結合されうる２つまたはそれ以上の単離されたＣＤＲの組み合わせが挙げられる。さらに、Ｆｖ断片、ＶＬ、およびＶＨの２つのドメインは、別々の遺伝子によってコードされているが、それらは、ＶＬおよびＶＨ領域が対になり、一価分子を形成する単一タンパク質鎖として作成することを可能にする合成リンカーによって組み換え法を用いて結合されうる（単鎖Ｆｖ（ｓｃＦｖ）として公知；例えば、Bird et al., Science 242:423-426 (1988)；およびHuston et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 85:5879-5883 (1988)）。このような単一鎖抗体はまた、抗体の用語「抗原結合部分」内に包含されるものとされる。これらの抗体断片は、当業者に公知の従来技術を用いて取得され、前記断片は、インタクトな抗体であるものと同一の手法において有用性についてスクリーニングされる。抗原結合部分は、組換ＤＮＡ技術、あるいはインタクトな免疫グロブリンの酵素または化学的な切断によって作成することができる。
【０１２８】
本明細書で用いられる用語「モノクローナル抗体」は、実質的に均一な抗体の集団に由来する、すなわち、集団に含まれる各抗体は、モノクローナル抗体の産生中に生じうる可能性のある変異型（このような変異型は一般的に少量存在する）を除き、実質的に同一であり、同一エピトープに結合する（例えば、前記抗体は、単一の結合特異性および親和性を示す）抗体を意味する。モディファイヤー「モノクローナル」は、抗体の実質的に均一な集団から取得されるものとして抗体の特徴を示すものであって、いずれか特定の方法による抗体の産生を必要とするものと解釈されるべきではない。用語「ヒトモノクローナル抗体」は、単一の結合特異性を示し、ヒト生殖系列免疫グロブリン配列に由来する可変および任意の定常領域を有する実質的に均一な抗体の集団に由来する抗体を意味する。ある実施態様において、ヒトモノクローナル抗体は、不死化細胞に融合させた、ヒト重鎖導入遺伝子と軽鎖導入遺伝子を含むゲノムを有する遺伝子組み換え非ヒト動物（例えば、遺伝子組み換えマウス）から取得されたＢ細胞を含むハイブリドーマから産生される。
【０１２９】
本明細書で用いられる用語「組み換えヒト抗体」には、組み換え法によって調製され、発現され、作成され、または単離された全ヒト抗体、例えば、（ａ）ヒト免疫グロブリン遺伝子のトランスジェニックまたは染色体導入動物（例えば、マウス）またはこれから調製されたハイブリドーマから単離された抗体、（ｂ）前記抗体を発現するように形質転換された宿主細胞（例えば、トランスフェクトーマ）から単離された抗体、（ｃ）組み換えコンビナトリアルヒト抗体ライブラリーから単離された抗体、および（ｄ）ヒト免疫グロブリン遺伝子配列の他のＤＮＡ配列へのスプライシングに関するいずれか他の方法によって調製され、発現され、作成され、または単離された抗体が含まれる。このような組み換えヒト抗体には、生殖系列遺伝子よってコードされる特定のヒト生殖系列免疫グロブリン配列を利用するが、例えば、抗体成熟中に生じた後の再構成および突然変異を含む可変および定常領域が含まれる。当該技術分野で知られるように（例えば、Lonberg (2005) Nature Biotech. 23(9): 1117-1125を参照のこと）、前記可変領域は、外部抗原に特異的な抗体を形成するめに再構成する様々な遺伝子によってコードされている抗原結合ドメインを含有する。再構成に加え、前記可変領域は、複数の単一アミノ酸変化（体細胞変異または高頻度変異と称される）によってさらに改変されて、抗体のその外部抗原への親和性を高めることができる。前記定常領域は、抗原へのさらなる応答において交代する（すなわち、アイソタイプスイッチ）。それゆえ、抗原に応じて再構成され、体細胞変異の入った軽鎖および重鎖免疫グロブリンポリペプチドをコードする核酸分子は、元の核酸分子と配列同一性を有することはできないが、代わりに実質的に同一または類似である（すなわち、少なくとも８０％の同一性を有する）。
【０１３０】
「ヒト」抗体（ＨｕＭＡｂ）は、フレームワークおよびＣＤＲ領域の両方がヒト生殖系列免疫グロブリン配列に由来する可変領域を有する抗体を意味する。さらに、前記抗体が定常領域を含む場合、前記定常領域はまた、ヒト生殖系列免疫グロブリン配列に由来する。本明細書に記載の抗ＴＩＭ３抗体には、ヒト生殖系列免疫グロブリン配列によってコードされていないアミノ酸残基（例えば、インビトロでランダムもしくは部位特異的変異誘発によって、またはインビボで体細胞変異によって導入された変異）が含まれうる。しかしながら、本明細書で用いられる用語「ヒト抗体」は、別の哺乳類（例えば、マウス）の生殖系列に由来するＣＤＲ配列がヒトフレームワーク配列に移植されている抗体を含むものとされない。用語「ヒト」抗体および「全ヒト」抗体は、同意語として用いられる。
【０１３１】
「ヒト化」抗体は、非ヒト抗体のＣＤＲドメイン以外のアミノ酸のいくつか、ほとんど、または全てが、ヒト免疫グロブリンに由来する対応するアミノ酸に置換されている抗体を意味する。抗体のヒト化型のある実施態様において、ＣＤＲドメイン以外のアミノ酸のいくつか、ほとんど、または全ては、ヒト免疫グロブリンに由来するアミノ酸に置換されている一方で、１つまたはそれ以上のＣＤＲ領域内のいくつか、ほとんど、または全てのアミノ酸は変化していない。アミノ酸の小さな付加、欠失、挿入、置換、または修飾は、特定の抗原に結合する抗体の能力を消失しない限り許容される。「ヒト化」抗体は、元の抗体の抗原特異性と同様の抗原特異性を保持する。
【０１３２】
「キメラ抗体」は、可変領域がある１つの種に由来し、定常領域が別の種に由来する抗体、例えば、可変領域がマウス抗体に由来し、定常領域がヒト抗体に由来する抗体を意味する。
【０１３３】
本明細書で用いられるように、「アイソタイプ」は、重鎖定常領域遺伝子によってコードされる抗体クラス（例えば、ＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３、ＩｇＧ４、ＩｇＭ、ＩｇＡ１、ＩｇＡ２、ＩｇＤ、およびＩｇＥ抗体）を意味する。
【０１３４】
「アロタイプ」は、特定のアイソタイプグループ内の天然に存在する変異型を意味し、当該変異型は、数種類のアミノ酸で異なる（例えば、Jefferis et al. (2009) mAbs 1:1を参照のこと）。本明細書に記載の抗ＴＩＭ３抗体は、いずれのアロタイプであってもよい。本明細書で用いられるように、「ＩｇＧ１ｆ」、「ＩｇＧ１．１ｆ」、または「ＩｇＧ１．３ｆ」アイソタイプと称される抗体は、例えば、配列番号：１２３に示されるように、それぞれ、アロタイプ「ｆ」のＩｇＧ１、エフェクターなしのＩｇＧ１．１、およびエフェクターなしのＩｇＧ１．３抗体、すなわち、カバットのようなＥＵインデックスによる２１４Ｒ、３５６Ｅ、および３５８Ｍを有するものである。
【０１３５】
用語「抗原を認識する抗体」および「抗原特異的な抗体」は、本明細書では、用語「抗原に特異的に結合する抗体」と交換可能に用いられる。
【０１３６】
本明細書で用いられる「単離された抗体」は、他のタンパク質および細胞物質を実質的に含まない抗体を意味するものとされる。
【０１３７】
「Ｆｃ受容体」または「ＦｃＲ」は、免疫グロブリンのＦｃ領域に結合する受容体である。ＩｇＧ抗体に結合するＦｃＲは、ＦｃγＲファミリーの受容体（これらの受容体の対立形質変異型および選択的スプライス型を含む）を含む。前記ＦｃγＲファミリーは、３つの活性化受容体（マウスにおけるＦｃγＲＩ、ＦｃγＲＩＩＩ、およびＦｃγＲＩＶ；ヒトにおけるＦｃγＲＩＡ、ＦｃγＲＩＩＡ、およびＦｃγＲＩＩＩＡ）および１つの阻害性受容体（ＦｃγＲＩＩＢ）からなる。ヒトＦｃγＲの様々な特徴が当該技術分野で知られている。内在性エフェクター細胞タイプの大半は、１つまたはそれ以上の活性化ＦｃγＲおよび阻害性ＦｃγＲＩＩＢを共発現する一方、ナチュラルキラー（ＮＫ）細胞は、１つの活性化Ｆｃ受容体（マウスにおけるＦｃγＲＩＩＩおよびヒトにおけるＦｃγＲＩＩＩＡ）を選択的に発現するが、マウスおよびヒトにおける阻害性ＦｃγＲＩＩＢを発現しない。ヒトＩｇＧ１は、多くのヒトＦｃ受容体に結合し、それが結合する活性化Ｆｃ受容体のタイプについてマウスＩｇＧ２ａと同等であると考えられている。
【０１３８】
「Ｆｃ領域」（断片結晶化可能領域）または「Ｆｃドメイン」もしくは「Ｆｃ」は、その免疫グロブリンの宿主組織または因子への結合（免疫系の様々な細胞（例えば、エフェクター細胞）に局在するＦｃ受容体または古典的補体系の第１補体成分（Ｃ１ｑ）への結合を含む）を介在する抗体の重鎖のＣ末端領域を意味する。よって、Ｆｃ領域は、第１の定常領域免疫グロブリンドメイン（例えば、ＣＨ１またはＣＬ）を除く抗体の定常領域を含む。ＩｇＧ、ＩｇＡ、およびＩｇＤ抗体アイソタイプにおいて、Ｆｃ領域は、抗体の２つの重鎖第２（ＣＨ２）および第３（ＣＨ３）定常領域に由来する２つの同一のタンパク質断片を含み；ＩｇＭおよびＩｇＥ Ｆｃ領域は、各ポリペプチド鎖において３つの重鎖定常領域（ＣＨドメイン２〜４）を含む。ＩｇＧについて、前記Ｆｃ領域は、免疫グロブリンドメインＣＨ２およびＣＨ３、ならびにＣＨ１とＣＨ２ドメインとの間のヒンジを含む。免疫グロブリン重鎖のＦｃ領域の境界の定義は、本明細書で定義されるように変化しうるが、ヒトＩｇＧ重鎖Ｆｃ領域は、ＩｇＧ１についてアミノ酸残基Ｄ２２１、ＩｇＧ２についてＶ２２２、ＩｇＧ３についてＬ２２１、およびＩｇＧ４についてＰ２２４から重鎖のカルボキシ末端までの範囲と定義され、この番号付けは、カバットのようなＥＵインデックスに従ってなされる。ヒトＩｇＧ Ｆｃ領域のＣＨ２ドメインは、アミノ酸２３７からアミノ酸３４０までの範囲であり、ＣＨ３ドメインは、Ｆｃ領域におけるＣＨ２ドメインのＣ末端側に位置し、すなわち、ＩｇＧのアミノ酸３４１からアミノ酸４４７または４４６（Ｃ末端リジン残基が存在しない場合）あるいは４４５（Ｃ末端グリシンおよびリジン残基が存在しない場合）の範囲である。本明細書で用いられるように、前記Ｆｃ領域は、内在性配列Ｆｃ（アロタイプ変異型または変異型Ｆｃ（例えば、天然に存在しないＦｃ）のいずれも含む）であってもよい。Ｆｃはまた、「Ｆｃ融合タンパク質」（例えば、抗体またはイムノアドヘシン）とも称される「Ｆｃ領域を含む結合タンパク質」などのＦｃを含むタンパク質ポリペプチドの単離または文脈におけるこの領域を意味しうる。
【０１３９】
「内在性配列Ｆｃ領域」または「内在性配列Ｆｃ」は、自然界で見出されたＦｃ領域のアミノ酸配列と同一であるアミノ酸配列を含む。内在性配列ヒトＦｃ領域には、内在性配列ヒトＩｇＧ１ Ｆｃ領域；内在性配列ヒトＩｇＧ２ Ｆｃ領域；内在性配列ヒトＩｇＧ３ Ｆｃ領域；および内在性配列ヒトＩｇＧ４ Ｆｃ領域、ならびにこれらの天然に存在する変異型が含まれる。内在性配列Ｆｃには、Ｆｃの様々なアロタイプが含まれる（例えば、Jefferis et al. (2009) mAbs 1:1を参照のこと）。
【０１４０】
本明細書で用いられるように対象物に適用される用語「天然に存在する」は、対象物が自然界で見出すことができることを意味する。例えば、自然界における供給源から単離することができる生物（ウイルスを含む）中に存在し、研究室でヒトによって意図的に改変されていないポリペプチドまたはポリヌクレオチド配列は、天然に存在するものである。
【０１４１】
「ポリペプチド」は、少なくとも２つの連続して結合されたアミノ酸残基を含む鎖（前記鎖の長さに上限なし）を意味する。タンパク質における１つまたはそれ以上のアミノ酸残基は、以下に限定されないが、グリコシル化、リン酸化、またはジスルフィド結合の形成などの修飾を含みうる。「タンパク質」は、１つまたはそれ以上のポリペプチドを含みうる。
【０１４２】
「保存的アミノ酸置換」は、アミノ酸残基の類似する側鎖を有するアミノ酸残基への置換を意味する。類似する側鎖を有するアミノ酸残基のファミリーは、当該技術分野で定義されている。これらのファミリーには、塩基性側鎖（例えば、リジン、アルギニン、ヒスチジン）、酸性側鎖（例えば、アスパラギン酸、グルタミン酸）、無電荷極性側鎖（例えば、グリシン、アスパラギン、グルタミン、セリン、スレオニン、チロシン、システイン、トリプトファン）、非極性側鎖（例えば、アラニン、バリン、ロイシン、イソロイシン、プロリン、フェニルアラニン、メチオニン）、ベータ分岐側鎖（例えば、スレオニン、バリン、イソロイシン）、および芳香族側鎖（例えば、チロシン、フェニルアラニン、トリプトファン、ヒスチジン）を有するアミノ酸が含まれる。ある実施態様において、抗ＴＩＭ３抗体において予測される非必須アミノ酸残基は、同一の側鎖ファミリーから別のアミノ酸残基で置換される。抗原結合を排除せず、ヌクレオチドおよびアミノ酸保存置換を同定する方法は、当該技術分野で周知である（例えば、Brummell et al., Biochem. 32: 1180-1187 (1993)；Kobayashi et al., Protein Eng. 12(10):879-884 (1999)；およびBurks et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 94:412-417 (1997)を参照）。
【０１４３】
ポリペプチドについて、用語「実質的な相同性」は、２つのポリペプチド、またはこれらの指定された配列が、適宜配列され、比較された場合、アミノ酸の少なくとも約８０％、少なくとも約９０％〜９５％、または少なくとも約９８％〜９９．５％において、適当なアミノ酸挿入または欠失で同一となることを示す。
【０１４４】
２つの配列間の同一性パーセントは、２つの配列の最適なアラインメントのために導入することが必要であるギャップ数および各ギャップの長さを考慮して、配列を共有する同一位置の数の関数（すなわち、％相同性＝同一位置の数／位置の総数ｘ１００）である。２つの配列間の配列の比較および同一性パーセントの決定は、下記に非限定的な例として記載されているように、数学的アルゴリズムを用いて行うことができる。
【０１４５】
本明細書で用いられる用語「ベクター」は、それが結合している別の核酸を移送することができる核酸分子を意味するものとされる。ベクターの１つのタイプは、さらなるＤＮＡ断片が連結することができる環状二本鎖ＤＮＡループを意味する「プラスミド」である。ベクターの別のタイプは、さらなるＤＮＡ断片がウイルスゲノムに連結することができるウイルスベクターである。あるベクターは、それらが導入される宿主細胞内で自律的に複製することができる（例えば、細菌の複製開始点を有する細菌ベクターおよびエピソーム哺乳類ベクター）。他のベクター（例えば、非エピソーム哺乳類ベクター）は、宿主細胞への導入により宿主細胞のゲノムに導入され得、それにより宿主ゲノムとともに複製される。さらに、あるベクターは、操作可能に連結されている遺伝子の発現を指揮することができる。このようなベクターは、「組換え発現ベクター」（または単に「発現ベクター」）と本明細書で称される、一般に、組換えＤＮＡ技術において有用な発現ベクターは、プラスミドの形態であることが多い。本明細書において、「プラスミド」および「ベクター」は、プラスミドがベクターの最も一般的に用いられる形態であるため、交換可能に用いることができる。しかしながら、発現ベクターの他の形態、例えば、同等の機能を供するウイルスベクター（例えば、複製欠損レトロウイルス、アデノウイルスおよびアデノ随伴ウイルス）もまた含まれる。
【０１４６】
「免疫応答」は、当該技術分野で理解されるとおりのものであり、一般に、外部物質または異常な物（例えば、癌細胞）に対する脊椎動物内の生物学的反応を意味し、この反応は、当該生物をこれらの物質およびそれらによって引き起こされる疾患から保護する。免疫応答は、免疫系（例えば、Ｔリンパ球、Ｂリンパ球、ナチュラルキラー（ＮＫ）細胞、マクロファージ、好酸球、マスト細胞、樹状細胞、または好中球）の１つまたはそれ以上の細胞およびこれらの細胞または肝臓のいずれかによって産生される可溶性巨大分子（抗体、サイトカイン、および補体を含む）の作用によって介在され、侵入した病原体の脊椎動物の体、病原体に感染した細胞または組織、癌または他の異常な細胞、あるいは、自己免疫または病理学的炎症の場合、正常なヒト細胞もしくは組織への選択的な標的化、結合、傷害、破壊、および／または排除を生じる。免疫反応には、例えば、Ｔ細胞（例えば、エフェクターＴ細胞、Ｔｈ細胞、ＣＤ４＋細胞、ＣＤ８＋Ｔ細胞、またはＴｒｅｇ細胞）の活性化または阻害、あるいは免疫系のいずれか他の細胞（例えば、ＮＫ細胞）の活性化または阻害が含まれる。
【０１４７】
「免疫調節薬」または「免疫調節因子」は、免疫応答を調節し、制御し、または改善することに関連しうる薬剤、例えば、シグナル伝達経路の構成因子を標的とする薬剤を意味する。免疫応答を「調節する」、「制御する」、または「改善する」は、免疫系の細胞またはこのような細胞（例えば、Ｔｈ１細胞などのエフェクターＴ細胞）の活性におけるいずれかの変化を意味する。このような調節には、様々な細胞タイプの数の増加または減少、これらの細胞の活性の上昇または低下、または免疫系内で生じうるいずれか他の変化によって現れうる免疫系の刺激または抑制が含まれる。阻害性および刺激性免疫調節薬の両方が同定されており、これらのうちのあるものは腫瘍微小環境の機能を高めうる。ある実施態様において、前記免疫調節薬は、Ｔ細胞の表面上の分子を標的とする。「免疫調節性標的」または「免疫調節的標的」は、物質、薬剤、部分、化合物、または分子による結合の標的となり、その活性がその結合によって変化される分子（例えば、細胞表面分子）を意味する。免疫調節標的には、例えば、細胞表面上の受容体（「免疫調節性受容体」）および受容体リガンド（「免疫調節性リガンド」）が含まれる。
【０１４８】
「免疫療法」は、免疫系または免疫応答を誘導し、高め、抑制し、または改善することを含む方法により、疾患に罹っているか、または疾患に罹るリスクもしくは再発しやすいリスクを有する対象の治療を意味する。
【０１４９】
「免疫賦活療法」または「免疫賦活治療」は、例えば、癌を治療するために、対象における免疫応答を増加させ（誘導させ、または高める）療法を意味する。
【０１５０】
「Ｔエフェクター」（「Ｔｅｆｆ」）細胞は、細胞溶解活性を有するＴ細胞（例えば、ＣＤ４＋およびＣＤ８＋Ｔ細胞）ならびにＴヘルパー（Ｔｈ）細胞（例えば、Ｔｈ１細胞）を意味するものであって、それらの細胞は、サイトカインを分泌し、他の免疫細胞を活性化し、指揮するが、調節性Ｔ細胞（Ｔｒｅｇ細胞）を含まないものである。本明細書に記載の一定の抗ＴＩＭ３抗体は、Ｔｅｆｆ細胞、例えば、ＣＤ４＋およびＣＤ８＋Ｔｅｆｆ細胞およびＴｈ１細胞を活性化する。
【０１５１】
免疫応答または免疫系を活性化する能力の増加は、Ｔ細胞共刺激受容体のアゴニスト活性の向上および／または阻害性受容体のアンタゴニスト活性の向上から生じうる。免疫応答または免疫系を活性化する能力の増加は、免疫応答を測定するアッセイ、例えば、サイトカインもしくはケモカインの放出、（標的細胞において直接的にまたはＣＤ１０７ａもしくはグランザイムを検出することにより間接的に調べられる）細胞溶解活性、および細胞増殖における変化を測定するアッセイにおけるＥＣ５０の倍増加または活性の最大レベルにより反映されうる。免疫応答または免疫系を活性化する能力の増加は、少なくとも１０％、３０％、５０％、７５％、２倍、３倍、５倍またはそれ以上まで向上しうる。
【０１５２】
本明細書で用いられるように、用語「連結される」は、２つまたはそれ以上の分子の結合を意味する。連結は、共有結合であっても、非共有結合であってもよい。前記連結はまた、遺伝学的であってもよい（すなわち、組換えで融合される）。このような連結は、化学的抱合および組換えタンパク質産生などの広範な様々な技術分野で理解される技術を用いて行うことができる。
【０１５３】
本明細書で用いられるように、「投与する」は、当業者に公知の様々な方法および送達系のいずれかを用いた治療剤を含む組成物の対象への物理的導入を意味する。本明細書に記載の抗ＴＩＭ３抗体のための異なる投与経路としては、例えば、注射または注入による、静脈内、腹腔内、筋肉内、皮下、脊髄、または他の非経口投与経路が挙げられる。本明細書で用いられる用語「非経口投与」は、通常、注射による経腸および局所投与以外の投与様式を意味し、下記に限定されないが、静脈内、腹腔内、筋肉内、動脈内、くも膜下腔内、リンパ内、病巣内、嚢内、眼窩内、心臓内、皮内、気管内、皮下、表皮下、関節内、嚢下、くも膜下、脊髄内、硬膜外、および胸骨内の注射および注入ならびにインビボエレクトロポレーションが挙げられる。あるいは、本明細書に記載の抗体は、非静脈経路、例えば、局所、表皮、または粘膜投与経路により、例えば、鼻腔内、経口、膣、直腸、舌下、または局所に投与することができる。投与はまた、例えば、１回、複数回、および／または１回もしくはそれ以上の長期間にわたり行うことができる。
【０１５４】
本明細書で用いられるように、用語「Ｔ細胞介在応答」は、エフェクターＴ細胞（例えば、ＣＤ８＋細胞）およびヘルパーＴ細胞（例えば、ＣＤ４＋細胞）を含むＴ細胞によって介在される応答を意味する。Ｔ細胞介在応答には、例えば、Ｔ細胞細胞傷害および細胞増殖が含まれる。
【０１５５】
本明細書で用いられるように、用語「細胞傷害性Ｔリンパ球（ＣＴＬ）応答」は、細胞傷害性Ｔ細胞によって誘発される免疫応答を意味する。ＣＴＬ応答は、主にＣＤ８＋Ｔ細胞によって介在される。
【０１５６】
本明細書で用いられるように、用語「阻害する」または「妨害する」（例えば、細胞におけるＴＩＭ３リガンド（「ＴＩＭ３−Ｌ」）のＴＩＭ−３への結合の阻害／妨害と称する）は、交換可能に用いられ、一部のおよび完全な阻害／妨害の両方を含む。ある実施態様において、抗ＴＩＭ３抗体は、ＴＩＭ３−ＬのＴＩＭ３への結合を、（例えば、本明細書でさらに記載されるように調べられるように）少なくとも約５０％、例えば、約６０％、７０％、８０％、９０％、９５％、９９％、または１００％まで阻害する。ある実施態様において、抗ＴＩＭ３抗体は、ＴＩＭ３−ＬのＴＩＭ３への結合を、（例えば、本明細書でさらに記載されるように調べられるように）５０％以下、例えば、約４０％、３０％、２０％、１０％、５％、または１％まで阻害する。
【０１５７】
本明細書で用いられるように、用語「腫瘍の増殖を阻害する」には、腫瘍の増殖における測定可能な減少のいずれか、例えば、少なくとも約１０％、例えば、少なくとも約２０％、少なくとも約３０％、少なくとも約４０％、少なくとも約５０％、少なくとも約６０％、少なくとも約７０％、少なくとも約８０％、少なくとも約９０％、少なくとも 約９９％、または１００％までの腫瘍の増殖の阻害が含まれる。
【０１５８】
本明細書で用いられるように、「癌」は、体内の異常な細胞の制御不能な増殖によって特徴付けられる広い疾患群を意味する。制御不能な細胞分裂は、隣接組織に侵入する悪性腫瘍または細胞の形成を生じ、リンパ系または血流を介して体の遠方部分に転移しうる。「癌」または「癌組織」には、腫瘍が含まれうる。
【０１５９】
本明細書で用いられる用語「腫瘍」は、前がん病変を含む良性（非癌性）または悪性（癌性）のいずれかの過剰な細胞成長もしくは細胞増殖から生じる組織の塊を意味する。
【０１６０】
「腫瘍浸潤炎症細胞」は、典型的に、対象における炎症反応に関与し、腫瘍組織に浸潤する細胞のタイプである。このような細胞には、腫瘍浸潤リンパ球（ＴＩＬ）、マクロファージ、単球、好酸球、組織球、および樹状細胞が含まれる。
【０１６１】
本明細書で用いられる「ＴＩＬ」または「腫瘍浸潤リンパ球」は、腫瘍浸潤リンパ球および他の非リンパ性単核免疫細胞を意味する。
【０１６２】
「ＴＩＭ−３アンタゴニストによる治療に応答する」癌患者は、腫瘍の大きさ（例えば、治療後の腫瘍サイズの減少または腫瘍なし）、腫瘍の成長速度（例えば、治療後の増殖の遅延または停止）、腫瘍細胞の数（例えば、治療後の腫瘍細胞数の減少）、免疫系の活性（例えば、外部抗原に対する活性の亢進および／またはＴ細胞枯渇の減少）、またはこれらのいずれかの組み合わせによって示されるような癌の改善を示す患者を意味する。
【０１６３】
本明細書で用いられる用語「治療する」、「治療している」、および「治療」は、疾患に関連するか、または全生存率を高める症状、合併症、状態または生化学的指標を逆転し、軽減し、寛解し、阻害し、あるいはこれらの進行、発症、重症度または再発を遅延させ、または予防するために、対象に実施され、または活性薬剤を投与するいずれかのタイプの処置または処理を意味する。治療は、疾患に罹っている対象または（例えば、予防のために）疾患に罹っていない対象に行われうる。
【０１６４】
「プログラム死−１（ＰＤ−１）」は、ＣＤ２８ファミリーに属する免疫阻害性受容体を意味する。ＰＤ−１は、インビボで活性化前のＴ細胞で優勢に発現され、２つのリガンド（ＰＤ−Ｌ１およびＰＤ−Ｌ２）に結合する。本明細書で用いられる用語「ＰＤ−１」には、ヒトＰＤ−１（ｈＰＤ−１）、ｈＰＤ−１の変異型、アイソフォーム、および種ホモログ、ならびにｈＰＤ−１と少なくとも１つの共通のエピトープを有する類似体が含まれる。完全なｈＰＤ−１配列は、ＧｅｎＢａｎｋ受入番号Ｕ６４８６３において見出すことができる。
【０１６５】
「プログラム死リガンド−１（ＰＤ−Ｌ１）」は、ＰＤ−１に対する２つの細胞表面糖タンパク質リガンドのうちの１つ（もう１つは、ＰＤ−Ｌ２である）であり、ＰＤ−１への結合によりＴ細胞活性化およびサイトカイン分泌を下流調節する。本明細書で用いられる用語「ＰＤ−Ｌ１」には、ヒトＰＤ−Ｌ１（ｈＰＤ−Ｌ１）、ｈＰＤ−Ｌ１の変異型、アイソフォーム、および種ホモログ、ならびにｈＰＤ−Ｌ１と少なくとも１つの共通のエピトープを有する類似体が含まれる。完全なｈＰＤ−Ｌ１配列は、ＧｅｎＢａｎｋ受入番号Ｑ９ＮＺＱ７において見出すことができる。
【０１６６】
本明細書で用いられる用語「ＰＤ−１／ＰＤ−Ｌ１軸アンタゴニスト」は、ＰＤ−１とＰＤ−Ｌ１との相互作用を阻害する薬剤である。本明細書で用いられるように、ＰＤ−１／ＰＤ−Ｌ１軸結合アンタゴニストには、ＰＤ−１結合アンタゴニストおよびＰＤ−Ｌ１結合アンタゴニストが含まれる。
【０１６７】
用語「エフェクターメモリーＴＩＬ」および「エフェクターメモリーＴ細胞」は、本開示においてＣＣＲ７−ＣＤ４５ＲＯ＋として特徴付けられるＴリンパ球を意味する。
【０１６８】
用語「セントラルメモリーＴＩＬ」および「セントラルメモリーＴ細胞」は、本開示においてＣＣＲ７＋ＣＤ４５ＲＯ＋として特徴付けられるＴリンパ球を意味する。
【０１６９】
用語「ナイーブＴＩＬ」および「ナイーブＴ細胞」は、本開示においてＣＣＲ７＋ＣＤ４５ＲＯ−として特徴付けられるＴリンパ球を意味する。
【０１７０】
用語「エフェクターＴＩＬ」および「エフェクターＴ細胞」は、本開示においてＣＣＲ７−ＣＤ４５ＲＯ−として特徴付けられるＴリンパ球を意味する。
【０１７１】
「血液悪性腫瘍」には、リンパ腫、白血病、骨髄腫、またはリンパ系腫瘍、ならびに脾臓およびリンパ節の癌が含まれる。典型的なリンパ腫には、Ｂ細胞リンパ腫（Ｂ細胞血液癌）およびＴ細胞リンパ腫の両方が含まれる。Ｂ細胞リンパ腫には、ホジキンリンパ腫および多くの非ホジキンリンパ腫の両方が含まれる。Ｂ細胞リンパ腫の非限定的な例として、びまん性大細胞型Ｂ細胞リンパ腫、濾胞性リンパ腫、粘膜関連リンパ組織リンパ腫、小細胞型リンパ球性リンパ腫（慢性リンパ性白血病と重複）、マントル細胞リンパ腫（ＭＣＬ）、バーキットリンパ腫、縦隔大細胞型Ｂ細胞リンパ腫、ワルデンストレーム高ガンマグロブリン血症、結節性辺縁帯Ｂ細胞リンパ腫、脾辺縁帯リンパ腫、血管内大細胞型Ｂ細胞リンパ腫、原発性滲出性リンパ腫、リンパ腫様肉芽腫症が挙げられる。Ｔ細胞リンパ腫の非限定的な例として、節外性Ｔ細胞リンパ腫、皮膚Ｔ細胞リンパ腫、未分化大細胞リンパ腫、および血管免疫芽球性Ｔ細胞リンパ腫が挙げられる。血液悪性腫瘍にはまた、白血病、例えば、以下に限定されないが、二次性白血病、慢性リンパ性白血病、急性骨髄性白血病、慢性骨髄性白血病、および急性リンパ芽球性白血病が挙げられる。さらに、血液悪性腫瘍には、骨髄腫、例えば、以下に限定されないが、多発性骨髄腫およびくすぶり型多発性骨髄腫が挙げられる。他の血液および／またはＢ細胞もしくはＴ細胞に関連する癌も用語「血液悪性腫瘍」に含まれる。
【０１７２】
用語「有効用量」または「有効な用量」は、少なくとも部分的に所望される効果を達成するために十分な量として定義される。薬物または治療剤の「治療上の有効量」または「治療上の有効用量」は、単独で、または別の治療剤と組み合わせて用いられると、疾患症状の重症度の低下、疾患症状のない間の頻度と期間の増加、あるいは疾患の苦痛による機能障害または能力障害の防止によって示される疾患の退縮を促進する薬物の量である。薬物の治療上の有効量もしくは用量には、疾患を発症するか、または疾患を再発するリスクのある対象に単独でまたは別の治療剤と組み合わせて投与されると、その疾患の発症または再発を抑制する薬物の量である「予防上の有効量」または「予防上の有効用量」が含まれる。疾患の退縮を促進し、または疾患の発症または再発を抑制する治療剤の能力は、臨床試験におけるヒト対象、ヒトにおける有効性を予測する動物モデル系、またはインビトロアッセイにおける薬剤の活性の測定などの当業者に公知の様々な方法を用いて評価することができる。
【０１７３】
一例として、抗癌剤は、対象における癌の退縮を促進する薬物である。ある実施態様において、前記薬物の治療上の有効量は、癌を消失するまで癌の退縮を促進する。「癌の退縮を促進する」は、有効な量の薬物を単独で、または抗悪性腫瘍薬と組み合わせて投与すると、患者において、腫瘍成長もしくは大きさの減少、腫瘍の壊死、少なくとも１つの疾患症状の重症度の減少、疾患症状のない間の頻度と期間の増加、疾患の苦痛による機能障害または能力障害の防止、あるいは疾患症状の軽減を生じることを意味する。さらに、治療に関する用語「有効な」および「有効性」には、薬理学的有効性および生理学的安全性の両方が含まれる。薬理学的有効性は、患者において癌の退縮を促進する薬物の能力を意味する。生理学的安全性は、薬物の投与から生じる細胞、器官および／または生物レベルにおける毒性レベルまたは他の有害な生理学的効果（副作用）を意味する。
【０１７４】
腫瘍の治療のための一例として、前記薬物の治療上の有効量もしくは用量は、細胞増殖または腫瘍成長を、治療していない対象と比較して少なくとも約２０％まで、少なくとも約４０％まで、少なくとも約６０％、または少なくとも約８０％まで阻害する。ある実施態様において、前記薬物の治療上の有効量もしくは用量は、細胞増殖または腫瘍成長を完全に阻害する、すなわち、細胞増殖または腫瘍成長を１００％まで阻害する。腫瘍成長を阻害する化合物の能力は、本明細書に記載のアッセイを用いて評価することができる。あるいは、この組成物の特徴は、Ｔ細胞増殖を阻害する化合物の能力を試験することによって評価することができ。このような阻害は、当業者に公知のアッセイによってインビトロで測定することができる。本明細書に記載の他の実施態様において、腫瘍の退縮は、少なくとも約２０日間、少なくとも約４０日間、または少なくとも約６０日間観察し、継続しうる。
【０１７５】
用語「患者」は、ヒト（またはヒト対象）を意味する。
【０１７６】
本明細書で用いられるように、用語「対象」は、ヒト対象を意味する。対象は、癌に罹っている対象でありうる。
【０１７７】
本明細書で記載される用語「重量に基づく」用量または投与量は、患者に投与される用量が、患者の重量に基づいて算出されることを意味する。例えば、６０ｋｇの体重を有する患者が３ｍｇ／ｋｇの抗ＴＩＭ３抗体を必要とする場合、投与するために抗ＴＩＭ３抗体の適当な量（すなわち、１８０ｍｇ）を算出し、使用することができる。
【０１７８】
本開示の方法に関する用語「固定用量」の使用は、単一組成物中の２つまたはそれ以上の異なる抗体（例えば、抗ＴＩＭ３抗体および第２の抗体、例えば、ＰＤ−１またはＰＤ−Ｌ１抗体）が、相互に特定（固定）の比率で組成物中に存在することを意味する。ある実施態様において、前記固定用量は、抗体の重量（例えば、ｍｇ）に基づくものである。ある実施態様において、前記固定用量は、抗体の濃度（例えば、ｍｇ／ｍｌ）に基づくものである。ある実施態様において、２つの抗体（例えば、抗ＴＩＭ３および抗ＰＤ１または抗ＰＤ−Ｌ１）の比率は、少なくとも約１：１、約１：２、約１：３、約１：４、約１：５、約１：６、約１：７、約１：８、約１：９、約１：１０、約１：１５、約１：２０、約１：３０、約１：４０、約１：５０、約１：６０、約１：７０、約１：８０、約１：９０、約１：１００、約１：１２０、約１：１４０、約１：１６０、約１：１８０、約１：２００、約２００：１、約１８０：１、約１６０：１、約１４０：１、約１２０：１、約１００：１、約９０：１、約８０：１、約７０：１、約６０：１、約５０：１、約４０：１、約３０：１、約２０：１、約１５：１、約１０：１、約９：１、約８：１、約７：１、約６：１、約５：１、約４：１、約３：１、または約２：１の第２抗体１ｍｇに対する第１抗体（例えば、抗ＴＩＭ３抗体）のｍｇである。例えば、抗ＴＩＭ３抗体およびＰＤ−１抗体（例えば、ニボルマブ）の２：１の比率は、バイアルまたは注射が、約４８０ｍｇの抗ＴＩＭ３抗体および２４０ｍｇの抗ＰＤ−１抗体、または約２ｍｇ／ｍｌの抗ＴＩＭ３抗体および１ｍｇ／ｍｌの抗ＰＤ−１抗体を含有しうることを意味しうる。
【０１７９】
本明細書に記載の方法および用量に関する用語「フラット用量」の使用は、患者の重量または体表面積（ＢＳＡ）に関わらず、患者に投与される用量を意味する。それゆえ、前記フラット用量は、ｍｇ／ｋｇ用量として提供されるものではなく、むしろ薬剤（例えば、抗ＴＩＭ３抗体）の絶対量として提供される。例えば、６０ｋｇのヒトおよび１００ｋｇのヒトは、同一用量の抗体（例えば、４８０ｍｇの抗ＴＩＭ３抗体）を受容する。
【０１８０】
本明細書で用いられるように、用語「ｕｇ」および「ｕＭ」は、それぞれ、「μｇ」および「μＭ」と交換可能に用いられる。
【０１８１】
本明細書に記載の様々な態様は、下記の項目でさらに詳細に説明されている。
【０１８２】
本開示の方法
本開示は、抗ＴＩＭ−３アンタゴニスト（例えば、抗ＴＩＭ３抗体）単独または別の免疫チェックポイント阻害剤（例えば、抗ＰＤ−１抗体）との組み合わせによる治療に適する対象（例えば、ヒト癌患者）を同定するための方法に関する。
【０１８３】
ある実施態様において、本明細書に記載の方法は、対象の血清における可溶性ＴＩＭ−３の濃度（「血清ＴＩＭ３濃度」）を測定し、または調べ、前記濃度をコントロール対象（例えば、健常な患者）の血清ＴＩＭ３濃度と比較する方法を含む。対象の血清ＴＩＭ３濃度がコントロール対象のものより高い場合、前記対象は、抗ＴＩＭ−３アンタゴニストによる治療に応答する可能性が高い。ある実施態様において、抗ＴＩＭ−３アンタゴニストによる治療に応答する可能性が高い対象は、コントロール対象で観察される濃度より少なくとも１０％高い血清ＴＩＭ３濃度を有する。他の実施態様において、対象の血清ＴＩＭ３濃度は、コントロール対象のものより少なくとも２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、９０％、または１００％（２倍）高い。他の実施態様において、対象の血清ＴＩＭ３濃度は、少なくとも２５００ｐｇ／ｍｌまたは少なくとも３０００ｐｇ／ｍｌである。
【０１８４】
ある実施態様において、本明細書に記載の方法は、ＴＩＭ−３陽性である対象における腫瘍浸潤リンパ球（ＴＩＬ）の割合を測定し、または調べることを含む。他の実施態様において、対象におけるＴＩＬの少なくとも１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、または７０％がＴＩＭ−３陽性である場合、前記対象は、ＴＩＭ−３アンタゴニストによる治療に応答する可能性が高い。ある実施態様において、本明細書に記載の方法は、ＴＩＭ−３陽性である対象におけるＣＤ８＋腫瘍浸潤リンパ球（ＴＩＬ）の割合を測定し、または調べることを含む。ある実施態様において、対象におけるＣＤ８＋ＴＩＬの少なくとも１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、または７０％がＴＩＭ−３陽性である場合、前記対象は、ＴＩＭ−３アンタゴニストによる治療に応答する可能性が高い。ある実施態様において、本明細書に記載の方法は、ＴＩＭ−３陽性である対象におけるＣＤ４＋腫瘍浸潤リンパ球（ＴＩＬ）の割合を測定し、調べることを含む。ある実施態様において、対象におけるＣＤ４＋ＴＩＬの少なくとも１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、または７０％がＴＩＭ−３陽性である場合、前記対象は、ＴＩＭ−３アンタゴニストによる治療に応答する可能性が高い。ある実施態様において、本明細書に記載の方法は、ＴＩＭ−３陽性である対象におけるＣＤ４＋およびＣＤ８＋腫瘍浸潤リンパ球（ＴＩＬ）の割合を測定し、または調べることを含む。他の実施態様において、対象におけるＣＤ４＋および／またはＣＤ８＋ＴＩＬの少なくとも１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、または７０％がＴＩＭ−３陽性である場合、前記対象は、ＴＩＭ−３アンタゴニストによる治療に応答する可能性が高い。
【０１８５】
ある実施態様において、前記方法は、ＴＩＭ−３陽性であるナイーブ（ＣＣＲ７＋ＣＤ４５ＲＯ−）、セントラルメモリー（ＣＭ）（ＣＣＲ７＋ＣＤ４５ＲＯ＋）、エフェクターメモリー（ＥＭ）（ＣＣＲ７−ＣＤＲＯ＋）、およびエフェクター（Ｔｅｆｆ）（ＣＣＲ７−ＣＤ４５ＲＯ−）ＴＩＬの割合を測定し、または調べることを含む。ＴＩＭ−３陽性ＥＭおよび／またはＴｅｆｆ ＴＩＬの割合が、ＴＩＭ−３陽性ナイーブまたはＣＭ ＴＩＬの割合より高い場合、前記対象は、ＴＩＭ−３アンタゴニストによる治療に応答する可能性が高い。ある実施態様において、前記ＴＩＬは、ＣＤ４＋ＴＩＬである。他の実施態様において、前記ＴＩＬは、ＣＤ８＋ＴＩＬである。
【０１８６】
ある実施態様において、本明細書に記載の方法は、ＴＩＭ−３アンタゴニストおよびＰＤ−１アンタゴニストの組み合わせによる治療に適する対象（例えば、ヒト癌患者）を同定することができる。このような対象は、ＰＤ−１陽性およびＴＩＭ−３陽性である対象における腫瘍浸潤リンパ球（ＴＩＬ）の割合を測定し、または調べることによって同定することができ、ＴＩＬの少なくとも５％がＰＤ−１およびＴＩＭ３の両方に陽性である場合、前記対象は、ＴＩＭ−３アンタゴニストおよびＰＤ−１アンタゴニストの両方を含む治療に応答する可能性が高い。ある実施態様において、前記ＴＩＬの少なくとも１０％、２０％、３０％、または４０％がＰＤ−１およびＴＩＭ３の両方を共発現することにより、前記対象が、ＴＩＭ−３アンタゴニストおよびＰＤ−１アンタゴニストの両方を含む治療に応答する可能性が高いことが示される。ある実施態様において、前記ＴＩＬは、ＣＤ４＋ＴＩＬである。他の実施態様において、前記ＴＩＬは、ＣＤ８＋ＴＩＬである。ある実施態様において、ＣＤ４＋およびＣＤ８＋ＴＩＬの少なくとも５％、１０％、２０％、３０％、または４０％がＰＤ−１およびＴＩＭ３の両方に陽性である場合、前記対象は、ＴＩＭ−３アンタゴニストおよびＰＤ−１アンタゴニストの両方を含む治療に応答する可能性が高い。
【０１８７】
本開示はまた、ＴＩＭ−３アンタゴニストによる治療（例えば、抗ＴＩＭ３抗体）に適する対象（例えば、ヒト癌患者）の治療方法であって、治療上の有効量のＴＩＭ−３アンタゴニストを前記対象に投与することを特徴とする方法を提供する。ＴＩＭ−３アンタゴニストによる治療に適する対象は、上記に記載の方法のいずれかによって同定されうる。前記対象は、ＴＩＭ−３アンタゴニスト単独または別の免疫チェックポイント阻害剤（例えば、抗ＰＤ−１抗体）との組み合わせによる治療に適しうる。
【０１８８】
ある実施態様において、ＴＩＭ−３アンタゴニストによる治療に適する対象の血清における可溶性ＴＩＭ３の濃度（「血清ＴＩＭ３濃度」）は、コントロール対象（例えば、健常な患者）の血清で観察される可溶性ＴＩＭ３の濃度より高い。ある実施態様において、前記対象の血清ＴＩＭ３濃度は、コントロール対象で観察されるものより少なくとも１０％高い。他の実施態様において、前記対象の血清ＴＩＭ３濃度は、コントロール対象で観察されるものより少なくとも２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、９０％、または１００％（２倍）高い。ある実施態様において、前記対象の血清ＴＩＭ３濃度は、少なくとも２５００ｐｇ／ｍｌまたは少なくとも３０００ｐｇ／ｍｌである。ある実施態様において、前記対象の血清ＴＩＭ３濃度は、投与前に測定され、または調べられ、対象の血清ＴＩＭ３濃度がコントロール対象のものより高い場合、前記対象は、治療上の有効量のＴＩＭ−３アンタゴニストを投与される。
【０１８９】
ある実施態様において、ＴＩＭ−３アンタゴニストによる治療に適する対象は、少なくとも１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、または７０％のＴＩＭ−３陽性であるＣＤ８＋ＴＩＬを有する。ある実施態様において、ＴＩＭ−３陽性ＣＤ８＋ＴＩＬの割合は、投与前に調べられ、前記割合が合計ＣＤ８＋ＴＩＬの１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、または７０％より高い場合、前記対象は、治療上の有効量のＴＩＭ−３アンタゴニストを投与される。
【０１９０】
ある実施態様において、ＴＩＭ−３アンタゴニストによる治療に適する対象は、ＴＩＭ−３陽性であるナイーブ、セントラルメモリー（ＣＭ）、エフェクターメモリー（ＥＭ）、およびエフェクター（Ｔｅｆｆ）ＴＩＬの割合を測定し、または調べることによって同定することができる。ＴＩＭ−３陽性ＥＭおよび／またはＴｅｆｆ ＴＩＬの割合が、ＴＩＭ−３陽性ナイーブまたはＣＭ ＴＩＬの割合より高い場合、前記対象は、治療上の有効量のＴＩＭ−３アンタゴニストを投与される。ある実施態様において、前記ＴＩＬは、ＣＤ４＋ＴＩＬである。他の実施態様において、前記ＴＩＬは、ＣＤ８＋ＴＩＬである。ある実施態様において、ＴＩＭ−３陽性ナイーブ、ＣＭ、ＥＭ、Ｔｅｆｆ ＴＩＬの割合が投与前に調べられ、ＴＩＭ−３陽性ＥＭおよび／またはＴｅｆｆ ＴＩＬの割合がナイーブおよび／またはＣＭ ＴＩＬの割合より高い場合、前記対象は、治療上の有効量のＴＩＭ−３アンタゴニストを投与される。
【０１９１】
ＴＩＭ−３アンタゴニストおよびＰＤ−１アンタゴニストの組み合わせによる治療に適する対象の治療方法であって、治療上の有効量のＰＤ−１アンタゴニストおよびＴＩＭ−３アンタゴニストの組み合わせを、このような対象に投与することを特徴とする方法もまた、本明細書で提供される。１の実施態様において、ＰＤ１アンタゴニストおよびＴＩＭ−３アンタゴニストの組み合わせは、対象のＣＤ８＋ＴＩＬの少なくとも５％がＰＤ１およびＴＩＭ−３の両方の発現に陽性である場合、前記対象に投与される。ある実施態様において、前記対象におけるＰＤ−１およびＴＩＭ３の両方を発現するＣＤ８＋ＴＩＬの割合は、少なくとも１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、または７０％である。特定の実施態様において、ＰＤ−１およびＴＩＭ３の両方を発現する対象におけるＣＤ８＋ＴＩＬの割合は、ＰＤ−１アンタゴニストおよびＴＩＭ−３アンタゴニストの組み合わせを投与する前に調べられる。
【０１９２】
１の実施態様において、ＴＩＭ−３アンタゴニストおよびＰＤ−１アンタゴニストの組み合わせは、対象のＣＤ４＋ＴＩＬの少なくとも５％が、ＰＤ−１およびＴＩＭ−３の両方の発現に陽性である場合、前記対象に投与される。ある実施態様において、対象におけるＰＤ−１およびＴＩＭ３の両方を発現するＣＤ４＋ＴＩＬの割合は、少なくとも１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、または７０％である。ある実施態様において、ＰＤ−１およびＴＩＭ３の両方を発現する対象におけるＣＤ４＋ＴＩＬの割合は、ＰＤ−１アンタゴニストおよびＴＩＭ−３アンタゴニストの組み合わせを投与する前に調べられる。
【０１９３】
ある実施態様において、ＴＩＭ−３アンタゴニストおよびＰＤ−１アンタゴニストの組み合わせは、対象のＣＤ８＋およびＣＤ４＋ＴＩＬの少なくとも５％がＰＤ−１およびＴＩＭ−３の両方の発現に陽性である場合、前記対象に投与される。ある実施態様において、対象におけるＰＤ−１およびＴＩＭ３の両方を発現するＣＤ８＋およびＣＤ４＋ＴＩＬの割合は、少なくとも１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、または７０％である。ある実施態様において、ＰＤ−１およびＴＩＭ３の両方を発現する対象におけるＣＤ４＋およびＣＤ８＋ＴＩＬの割合は、ＰＤ−１アンタゴニストおよびＴＩＭ−３アンタゴニストの組み合わせを投与する前に調べられる。
【０１９４】
ある実施態様において、ＴＩＭ−３アンタゴニストは、治療上の有効量のＰＤ−１アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ−１抗体または抗ＰＤ−Ｌ１抗体）で投与される。ある実施態様において、ＰＤ−１アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ−１抗体または抗ＰＤ−Ｌ１抗体）は、約８０ｍｇ〜約１２８０ｍｇの範囲であるフラット用量または約１ｍｇ／ｋｇ〜約１２ｍｇ／ｋｇの範囲である重量に基づく用量で投与される。
【０１９５】
ある実施態様において、ＴＩＭ−３アンタゴニストと組み合わせて用いられるＰＤ−１アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ−１抗体または抗ＰＤ−Ｌ１抗体）は、約１００ｍｇ、約２００ｍｇ、約３００ｍｇ、約４００ｍｇ、約５００ｍｇ、約６００ｍｇ、約７００ｍｇ、約８００ｍｇ、約９００ｍｇ、約１０００ｍｇ、約１１００ｍｇ、または約１２００ｍｇのフラット用量で投与される。
【０１９６】
ある実施態様において、ＴＩＭ−３アンタゴニストと組み合わせて用いられるＰＤ−１アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ−１抗体または抗ＰＤ−Ｌ１抗体）は、約１ｍｇ／ｋｇ、約２ｍｇ／ｋｇ、約３ｍｇ／ｋｇ、約４ｍｇ／ｋｇ、約５ｍｇ／ｋｇ、約６ｍｇ／ｋｇ、約７ｍｇ／ｋｇ、約８ｍｇ／ｋｇ、約９ｍｇ／ｋｇ、約１０ｍｇ／ｋｇ、約１１ｍｇ／ｋｇ、または約１２ｍｇ／ｋｇの重量に基づく用量で投与される。
【０１９７】
ある実施態様において、ＴＩＭ−３アンタゴニスト（例えば、抗ＴＩＭ３抗体）との組み合わせによる療法のためのＰＤ−１アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ−１抗体または抗ＰＤ−Ｌ１抗体）は、約１週間、約２週間、約３週間、約４週間、約５週間、または約６週間の投与間隔で投与される。ある実施態様において、ＰＤ−１アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ−１抗体または抗ＰＤ−Ｌ１抗体）のための投与間隔は、約２週間である。ある実施態様において、ＰＤ−１アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ−１抗体または抗ＰＤ−Ｌ１抗体）のための投与間隔は、約３週間である。ある実施態様において、ＰＤ−１アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ−１抗体または抗ＰＤ−Ｌ１抗体）のための投与間隔は、約４週間である。
【０１９８】
ある実施態様において、ＰＤ−１アンタゴニストは、約２週間ごとに約１０ｍｇ／ｋｇの重量に基づく用量で投与される。ある実施態様において、ＰＤ−１アンタゴニストは、約２週間ごとに約２４０ｍｇのフラット用量で投与される。ある実施態様において、ＰＤ−１アンタゴニストは、約４週間ごとに約４８０ｍｇのフラット用量で投与される。ある実施態様において、ＰＤ−１アンタゴニストは、約３週間ごとに約２ｍｇ／ｋｇの重量に基づく用量で投与される。ある実施態様において、ＰＤ−１アンタゴニストは、約３週間ごとに約１２００ｍｇのフラット用量で投与される。ある実施態様において、ＰＤ−１アンタゴニストは、約３週間ごとに約２００ｍｇのフラット用量で投与される。
【０１９９】
本開示は、治療を必要とする対象（例えば、ヒト癌患者）におけるＴＩＭ−３アンタゴニストを含む治療の有効性を評価するための方法であって、前記対象における可溶性ＴＩＭ３の血清力価を調べ、または測定することを含み、前記対象における可溶性ＴＩＭ−３の血清力価が、前記治療に対する対象の応答の指標（例えば、疾患標準化（disease normalization）、例えば、免疫監視の回復）である方法をさらに提供する。１の実施態様において、可溶性ＴＩＭ３の正常な血清力価（例えば、コントロール対象（例えば、健常な患者）で観察されるレベルと同等）は、前記治療が対象において有効であることを示す。ある実施態様において、治療前の対象における可溶性ＴＩＭ３の血清力価と可溶性ＴＩＭ−３の正常な血清力価との間である可溶性ＴＩＭ３の血清力価（例えば、コントロール対象（例えば、健常な患者）で観察されるレベルと同等）は、治療が対象において有効であることを示す。
【０２００】
本開示は、治療を必要とする対象（例えば、ヒト癌患者）におけるＴＩＭ−３アンタゴニストを含む治療の有効性を評価するための方法であって、前記対象における可溶性ＴＩＭ３の血清力価を調べ、または測定することを含むものであって、前記対象における可溶性ＴＩＭ−３の血清力価が、前記対象の前記治療に対する応答の指標である方法を提供する。ある実施態様において、ＴＩＭ−３アンタゴニストの第１の用量が癌に罹っている対象に投与され、前記可溶性ＴＩＭ３のレベルが前記対象の末梢血において測定され、可溶性ＴＩＭ３のレベルの減少は、前記対象がＴＩＭ−３アンタゴニストに応答すること、ならびにさらなる用量が前記対象に投与することができることを示す。ある実施態様において、ＴＩＭ３アンタゴニストの２回またはそれ以上の用量が癌に罹っている対象に投与され、前記可溶性ＴＩＭ３のレベルが前記対象の末梢血において測定され、可溶性ＴＩＭ３のレベルの減少は、前記対象がＴＩＭ−３アンタゴニストに応答すること、ならびにさらなる用量が前記対象に投与することができることを示す。ある実施態様において、ＴＩＭ−３アンタゴニストの１回、２回またはそれ以上の用量が癌に罹っている対象に投与され、前記可溶性ＴＩＭ３のレベルが、異なる時点で前記対象の末梢血において測定され、前記対象に投与されたＴＩＭ３の用量は、前記対象の末梢血における可溶性ＴＩＭ−３の減少レベルに基づいて調整される。例えば、可溶性ＴＩＭ−３のレベルがＴＩＭ−３アンタゴニストの一定用量の投与後にあまり減少しない場合、より高い用量が投与されうる。よって、一般に、可溶性ＴＩＭ−３の血中レベルは、ＴＩＭ−３アンタゴニストで治療されるべき対象の予測または層別化マーカーとして用いることができる。さらなるＴＩＭ−３アンタゴニストによる治療が是認されることを示す可溶性ＴＩＭ−３の減少は、可溶性ＴＩＭ−３少なくとも５％、１０％、２０％、２５％、３０％、５０％、７５％、９０％、または１００％の減少でありうる。ある実施態様において、さらなるＴＩＭ−３アンタゴニストによる治療が是認されることを示す可溶性ＴＩＭ−３の減少は、可溶性ＴＩＭ−３アイソフォームの少なくとも５％、１０％、２０％、２５％、３０％、５０％、７５％、９０％、または１００％の減少である。ある実施態様において、さらなるＴＩＭ−３アンタゴニストによる治療が是認されることを示す可溶性ＴＩＭ−３の減少は、細胞表面から切断されたＴＩＭ３の少なくとも５％、１０％、２０％、２５％、３０％、５０％、７５％、９０％、または１００％の減少である。ある実施態様において、さらなるＴＩＭ−３アンタゴニストによる治療が是認されることを示す可溶性ＴＩＭ−３の減少は、（いずれもの比率における）可溶性ＴＩＭ−３アイソフォームおよび／または細胞表面から切断されたＴＩＭ３の少なくとも５％、１０％、２０％、２５％、３０％、５０％、７５％、９０％、または１００％の減少である。
【０２０１】
ある実施態様において、有効な治療は、癌を治療し（例えば、腫瘍サイズを減少し、または維持し）および／または癌に関連する症状を減少し、もしくは軽減する。ある実施態様において、有効な治療は、腫瘍サイズを、治療前の腫瘍サイズと比較して少なくとも約１０％、約２０％、約３０％、約４０％、または約５０％まで減少する。
【０２０２】
ある実施態様において、有効な治療は、前記対象の生存期間（例えば、前記対象の全生存率）を有効に増加させる。ある実施態様において、有効な治療は、前記対象の全生存率を、少なくとも約６ヶ月、少なくとも約７ヶ月、少なくとも約８ヶ月、少なくとも約９ヶ月、少なくとも約１０ヶ月、少なくとも約１１ヶ月、少なくとも約１２ヶ月、少なくとも約１３ヶ月、少なくとも約１４ヶ月少なくとも約１５ヶ月、少なくとも約１６ヶ月、少なくとも約１７ヶ月、少なくとも約１８ヶ月、少なくとも約１９ヶ月、少なくとも約２０ヶ月、少なくとも約２１ヶ月、少なくとも約２２ヶ月、少なくとも約２３ヶ月、少なくとも約２４ヶ月、少なくとも約２５ヶ月、少なくとも約２６ヶ月、少なくとも約２７ヶ月、少なくとも約２８ヶ月、少なくとも約２９ヶ月、少なくとも約３０ヶ月、少なくとも約３年、少なくとも約３．５年、少なくとも約４年、少なくとも約４．５年、少なくとも約５年、または少なくとも約１０年まで増加させる。
【０２０３】
ある実施態様において、有効な治療は、前記対象の無増悪生存期間を増加させる。ある実施態様において、有効な治療は、前記対象の無増悪生存期間を、少なくとも約１ヶ月、少なくとも約２ヶ月、少なくとも約３ヶ月、少なくとも約４ヶ月、少なくとも約５ヶ月、少なくとも約６ヶ月、少なくとも約７ヶ月、少なくとも約８ヶ月、少なくとも約９ヶ月、少なくとも約１０ヶ月、少なくとも約１１ヶ月、少なくとも約１年、少なくとも約１５ヶ月、少なくとも約１８ヶ月、少なくとも約２年、少なくとも約３年、少なくとも約４年、または少なくとも約５年まで増加させる。
【０２０４】
他の実施態様において、（例えば、ＴＩＬにおける）ＴＩＭ３＋骨髄性またはＴＩＭ３＋ＮＫ細胞分画の頻度が調べられる。例えば、ＴＩＭ３＋細胞の頻度は、癌に罹っている対象におけるｐＤＣ、ｍＤＣ、またはＣＤ１４＋骨髄細胞、あるいはＣＤ１６−ＣＤ５６＋またはＣＤ１６＋ＣＤ５６＋ＮＫ細胞で調べることができ、これらの細胞タイプの１つまたはそれ以上におけるＴＩＭ３＋細胞の頻度は、ＴＩＭ−３アンタゴニストへの応答の予測となる。
【０２０５】
細胞集団間のＴＩＭ−３発現の測定およびＴＩＭ−３陽性細胞の頻度
本開示は、ＴＩＭ−３アンタゴニスト単独または別の免疫チェックポイント阻害剤（例えば、ＰＤ−１アンタゴニスト）との組み合わせによる治療に適する対象（例えば、ヒト癌患者）を同定するための方法であって、前記対象から取得された組織試料におけるＴＩＭ−３発現を測定し、または調べることを含む方法を提供する。ＴＩＭ−３発現を測定するか、または調べるための方法は、本明細書に記載または当該技術分野で公知の方法のいずれかで行うことができる。
【０２０６】
ある実施態様において、対象から取得された組織試料には、下記に限定されないが、臨床的に関連する組織試料、例えば、腫瘍生検、コア生検組織試料、穿刺吸引生検（fine needle aspirate）、あるいは体液（例えば、血液、血漿、血清、リンパ、腹水液、嚢胞液、または尿）の試料が含まれる。ある実施態様において、前記組織試料は、転移したものに由来する。ある実施態様において、組織試料は、複数時点、例えば、治療前、治療中、および／または治療後に対象から取得される。ある実施態様において、組織試料は、対象における異なる場所から取得される（例えば、原発性腫瘍に由来する試料および離れた部位における転移に由来する試料）。
【０２０７】
ある実施態様において、ＴＩＭ−３発現の測定は、前記対象に由来する組織試料を得ることなく行うことができる。ある実施態様において、ＴＩＭ−３アンタゴニストによる治療に適する対象の同定には、（ｉ）適宜、対象から取得された組織試料を提供し（前記組織試料には、腫瘍細胞および／または腫瘍浸潤炎症細胞（例えば、ＴＩＬ）が含まれる）；次いで（ｉｉ）コントロール対象（例えば、健常な患者）で発現されるレベルを考慮して、ＴＩＭ３を発現する組織試料における細胞の割合を測定し、または調べることが含まれる。
【０２０８】
組織試料におけるＴＩＭ−３発現を調べ、または測定することを含む本明細書に記載の方法のいずれかにおいて、前記ステップには、患者に由来する組織試料を得ることを含むことが任意のステップであることが理解されるべきである。すなわち、ある実施態様において、前記方法には、このステップが含まれるが、他の実施態様においては、このステップは含まれない。ある実施態様において、ＴＩＭ−３発現を測定し、または調べるステップは、ＴＩＭ−３発現についてアッセイするための変形（transformative）方法（例えば、フローサイトメトリー）によって行われることも理解されるべきである。他の実施態様において、変形方法に関するものではなく、ＴＩＭ−３発現は、例えば、研究室からの試験結果の報告を再調査することにより調べられる。ある実施態様において、ＴＩＭ−３発現の結果を調べ、または測定することまで、ならびに前記結果を含む方法のステップは、ＴＩＭ−３アンタゴニスト単独または別の免疫チェックポイント阻害剤（例えば、ＴＩＭ−３アンタゴニスト）との組み合わせによる治療の適切な候補を選択する際に用いるための医師または他の医療従事者に提供されうる中間結果を供する。ある実施態様において、前記中間結果を提供するステップは、医療従事者または医療従事者の指示下で行う他の者によって行われる。他の実施態様において、これらのステップは、独立した研究室または研究室の独立した技術者によって行われる。
【０２０９】
ある実施態様において、ＴＩＭ−３を発現する細胞の割合は、ＴＩＭ−３のＲＮＡの存在を検出するためのアッセイを行うことによって評価される。さらなる実施態様において、ＴＩＭ−３のＲＮＡの存在は、ＲＴ−ＰＣＲ、ｉｎ ｓｉｔｕハイブリダイゼーションまたはＲＮアーゼプロテクションによって検出される。ある実施態様において、ＴＩＭ３のＲＮＡの存在は、ＲＴ−ＰＣＲに基づくアッセイによって検出される。他の実施態様において、ＲＴ−ＰＣＲに基づくアッセイをスコア化することは、（例えば、コントロール対象で観察される）所定のレベルと比較して、組織試料におけるＴＩＭ３のＲＮＡ発現のレベルを測定し、または調べることを含む。
【０２１０】
ある実施態様において、ＴＩＭ−３を発現する細胞の割合は、ＴＩＭ−３タンパク質の存在を検出するためのアッセイを行うことにより評価することができる。さらなる実施態様において、ＴＩＭ−３ポリペプチドの存在は、ＩＨＣ（免疫組織化学）、酵素結合免疫吸着測定法（ＥＬＩＳＡ）、インビボイメージング法、またはフローサイトメトリーによって検出される。ある実施態様において、ＴＩＭ−３発現は、ＩＨＣによって測定される。他の実施態様において、ＴＩＭ３の細胞表面発現は、例えば、ＩＨＣまたはインビボイメージング法を用いて測定される。
【０２１１】
ある実施態様において、組織試料におけるＴＩＭ−３を発現する細胞の割合（または頻度）は、フローサイトメトリーによって測定される。ある実施態様において、フローサイトメトリーによって測定される組織試料には、腫瘍浸潤免疫細胞（例えば、ＴＩＬ）が含まれる。ある実施態様において、フローサイトメトリーによって測定される組織試料には、末梢血細胞が含まれる。ある実施態様において、前記フローサイトメトリーは、マルチプレックスアッセイである。ある実施態様において、前記フローサイトメトリーをスコア化することは、ＴＩＭ３、ＣＤ４、ＣＤ８、ＣＣＲ７、ＣＤ４５ＲＯ、およびこれらのいずれかの組み合わせを含むマーカーの発現を検出することを含む。ある実施態様において、前記フローサイトメトリーをスコア化することは、ＴＩＭ３を発現する組織試料におけるＣＤ４＋およびＣＤ８＋Ｔ細胞の特徴を評価することを含む。ある実施態様において、前記フローサイトメトリーをスコア化することは、ＴＩＭ３を発現し、（ｉ）ＣＣＲ７＋ＣＤ４５ＲＯ−（「ナイーブＴ細胞」）、（ｉｉ）ＣＣＲ７−ＣＤ４５ＲＯ−（「Ｔｅｆｆ細胞」）、（ｉｉｉ）ＣＣＲ７＋ＣＤ４５ＲＯ＋（「ＣＭ細胞」）、または（ｉｖ）ＣＣＲ７−ＣＤ４５ＲＯ＋（「ＥＭ細胞」）である組織試料におけるＣＤ８＋およびＣＤ４＋Ｔ細胞の割合を評価することを含む。
【０２１２】
ある実施態様において、可溶性ＴＩＭ３は、対象の末梢血において測定される。可溶性ＴＩＭ−３に結合する薬剤（例えば、実施例にさらに記載されるようなヒトＴＩＭ３の細胞外ドメインに結合する薬剤）は、可溶性ＴＩＭ−３のレベルを調べるために用いることができる。ある実施態様において、可溶性ＴＩＭ３アイソフォームおよびＴＩＭ３陽性細胞から切断されたＴＩＭ３の両方のレベルが測定される。ある実施態様において、これらの可溶性ＴＩＭ−３型のいずれか一方のレベルが測定される。ある実施態様において、これらの可溶性ＴＩＭ−３型の各レベルが別々に測定される。
【０２１３】
細胞集団間のＰＤ−１発現およびＰＤ１陽性細胞の頻度の測定
ある実施態様において、ＴＩＭ−３アンタゴニストおよびＰＤ−１アンタゴニストの両方を含む治療に適する対象（例えば、ヒト癌患者）を同定することは、対象から取得された組織試料におけるＰＤ−１発現を測定し、または調べることを含む。ＰＤ−１発現を測定し、調べるための方法は、本明細書に記載または当該技術分野で公知の方法のいずれかによって行うことができる。
【０２１４】
ある実施態様において、対象から取得された組織試料としては、下記に限定されないが、ＣＤ４＋および／またはＣＤ８＋Ｔ細胞を含む臨床的に関連する組織試料、例えば、腫瘍生検、コア生検組織試料、穿刺吸引生検（fine needle aspirate）、あるいは体液（例えば、血液、血漿、血清、リンパ、腹水液、嚢胞液、または尿）の試料。ある実施態様において、組織試料は、複数時点、例えば、治療前、治療中、および／または治療後に対象から取得される。ある実施態様において、組織試料は、対象における異なる場所から取得される（例えば、原発性腫瘍に由来する試料および離れた部位における転移に由来する試料）。
【０２１５】
ある実施態様において、ＰＤ−１発現の測定は、対象に由来する組織試料を取得することなく行うことができる。ある実施態様において、ＴＩＭ−３アンタゴニストおよびＰＤ−１アンタゴニストの組み合わせによる治療に適する対象を同定することは、（ｉ）適宜、対象から取得された組織試料を供してもよく（前記組織試料には、ＣＤ４＋および／またはＣＤ８＋腫瘍浸潤リンパ球（ＴＩＬ）が含まれる）；次いで（ｉｉ）コントロール対象（例えば、健常なヒト対象）に由来する組織試料で観察される頻度を考慮して、組織試料におけるＰＤ−１＋ＣＤ４＋および／またはＣＤ８＋ＴＩＬの頻度を測定し、または調べることを含む。
【０２１６】
ある実施態様において、対象から取得された組織試料には、下記に限定されないが、臨床的に関連する組織試料、例えば、腫瘍生検、コア生検組織試料、穿刺吸引生検（fine needle aspirate）、あるいは体液（例えば、血液、血漿、血清、リンパ、腹水液、嚢胞液、または尿）の試料が含まれる。ある実施態様において、前記組織試料は、転移したものに由来する。ある実施態様において、組織試料は、複数時点、例えば、治療前、治療中、および／または治療後に対象から取得される。ある実施態様において、組織試料は、対象における異なる場所から取得される（例えば、原発性腫瘍に由来する試料および離れた部位における転移に由来する試料）。
【０２１７】
組織試料におけるＰＤ−１発現を調べ、または測定することを含む本明細書に記載の方法のいずれかにおいて、患者に由来する組織試料を取得することを含むステップは、任意のステップであることが理解されるべきである。すなわち、ある実施態様において、前記方法には、このステップが含まれるが、他の実施態様において、このステップが含まれない。ある実施態様において、ＰＤ−１発現を測定し、または調べるためのステップは、ＰＤ−１発現をアッセイするための変形方法（例えば、フローサイトメトリー）によって行われることも理解されるべきである。他の実施態様において、変形方法に関するものではなく、ＰＤ−１発現は、例えば、研究室からの試験結果の報告を再調査することにより調べられる。ある実施態様において、ＰＤ−１発現の結果を調べ、または測定することまで、ならびに前記結果を含む方法のステップは、ＴＩＭ−３アンタゴニストおよびＰＤ−１アンタゴニストの組み合わせによる治療の適切な候補を選択する際に用いるための医師または他の医療従事者に提供されうる中間結果を供する。ある実施態様において、前記中間結果を提供するステップは、医療従事者または医療従事者の指示下で行う他の者によって行われる。他の実施態様において、これらのステップは、独立した研究室または研究室の独立した技術者によって行われる。
【０２１８】
ある実施態様において、ＰＤ−１＋ＣＤ４＋および／またはＰＤ−１＋ＣＤ８＋ＴＩＬの頻度は、ＰＤ−１ ＲＮＡの存在を検出するためのアッセイを行うことによって評価される。さらなる実施態様において、ＰＤ−１のＲＮＡの存在は、ＲＴ−ＰＣＲ、ｉｎ ｓｉｔｕハイブリダイゼーション、またはＲＮアーゼプロテクションによって検出される。ある実施態様において、ＰＤ−１のＲＮＡの存在は、ＲＴ−ＰＣＴに基づくアッセイによって検出される。他の実施態様において、ＲＴ−ＰＣＲに基づくアッセイをスコア化することは、（例えば、コントロール対象で観察される）所定の頻度と比較して、組織試料におけるＰＤ１＋ＣＤ４＋および／またはＰＤ−１＋ＣＤ８＋ＴＩＬの頻度を測定し、または調べることを含む。
【０２１９】
ある実施態様において、ＰＤ−１＋ＣＤ４＋および／またはＰＤ−１＋ＣＤ８＋ＴＩＬの頻度は、ＰＤ−１タンパク質の存在を検出するためのアッセイを行うことによって評価される。さらなる実施態様において、ＰＤ−１タンパク質の存在は、ＩＨＣ（免疫組織化学）、酵素結合免疫吸着測定法（ＥＬＩＳＡ）、インビボイメージング法、またはフローサイトメトリーによって検出される。ある実施態様において、ＰＤ−１発現は、ＩＨＣによって測定される。他の実施態様において、ＰＤ−１の細胞表面発現は、例えば、ＩＨＣまたはインビボイメージング法を用いて測定される。
【０２２０】
ある実施態様において、組織試料においてＰＤ−１を発現するＣＤ４＋および／またはＣＤ８＋細胞の割合（または頻度）は、フローサイトメトリーによって測定される。ある実施態様において、フローサイトメトリーによって測定される組織試料には、腫瘍浸潤免疫細胞（例えば、ＴＩＬ）が含まれる。ある実施態様において、フローサイトメトリーによって測定される組織試料には、末梢血細胞が含まれる。ある実施態様において、前記フローサイトメトリーは、マルチプレックスアッセイである。ある実施態様において、前記フローサイトメトリーをスコア化することは、ＰＤ−１、ＣＤ４、ＣＤ８、ＣＣＲ７、ＣＤ４５ＲＯ、およびこれらのいずれかの組み合わせを含むマーカーの発現を検出することを含む。ある実施態様において、前記フローサイトメトリーをスコア化することは、ＰＤ−１を発現する組織試料におけるＣＤ４＋およびＣＤ８＋Ｔ細胞の割合を評価することを含む。ある実施態様において、前記フローサイトメトリーをスコア化することは、ＰＤ−１を発現し、（ｉ）ＣＣＲ７＋ＣＤ４５ＲＯ−（「ナイーブＴ細胞」）、（ｉｉ）ＣＣＲ７−ＣＤ４５ＲＯ−（「Ｔｅｆｆ細胞」）、（ｉｉｉ）ＣＣＲ７＋ＣＤ４５ＲＯ＋（「ＣＭ細胞」）、または（ｉｖ）ＣＣＲ７−ＣＤ４５ＲＯ＋（「ＥＭ細胞」）である組織試料におけるＣＤ８＋およびＣＤ４＋Ｔ細胞の割合を評価することを含む。
【０２２１】
（ｉ）癌に罹っている対象が、免疫治療薬（例えば、ＴＩＭ−３アンタゴニスト）による治療に応答する可能性が高いか否か、または（ｉｉ）癌に罹っている対象が、前記対象に投与されている免疫治療薬（例えば、ＴＩＭ−３アンタゴニスト）による治療に応答しているか否かを決定するための方法が本明細書で提供される。前記方法は、一定の細胞集団間のＴＩＭ３陽性細胞の頻度を調べることを含む。ある実施態様において、方法には、癌対象における細胞の所定の集団のＴＩＭ３陽性細胞の頻度を調べ、コントロール対象と比較して癌対象における細胞の所定の集団のＴＩＭ３陽性細胞のより高い頻度により、免疫治療薬（例えば、ＴＩＭ−３アンタゴニスト）による治療に応答する可能性が高いことが示されることが含まれる。ある実施態様において、方法には、免疫治療薬（例えば、ＴＩＭ−３アンタゴニスト）の１回またはそれ以上の投与を受けた癌対象における細胞の所定の集団のＴＩＭ３陽性細胞の頻度を調べ、免疫治療薬の投与前の癌対象より、または免疫治療薬の前回の用量の投与前より免疫治療薬の投与後の癌対象における細胞の所定の集団のＴＩＭ３陽性細胞のより低い頻度により、前記対象が、免疫治療薬（例えば、ＴＩＭ−３アンタゴニスト）による治療に応答する可能性が高いことが示されることが含まれる。上記方法は、下記細胞（腫瘍浸潤細胞、例えば、腫瘍浸潤リンパ球および非リンパ球腫瘍浸潤細胞）の集団におけるＴＩＭ３陽性細胞の頻度を測定すること（例えば、フローサイトメトリーによる）を含みうる。ある実施態様において、前記方法は、ＣＤ８＋ＴＩＬ細胞；ＣＤ４＋エフェクターメモリーＴＩＬ細胞（ＣＤ４＋ＥＭ細胞；ＣＤ４＋ＣＣＲ７−ＣＤ４５ＲＯ＋ＴＩＬ細胞）；ＣＤ８＋エフェクターメモリーＴＩＬ細胞（ＣＤ８＋ＥＭ細胞；ＣＤ８＋ＣＣＲ７−ＣＤ４５ＲＯ＋ＴＩＬ細胞）；ＣＤ４＋エフェクターＴＩＬ細胞（ＣＤ４＋Ｔｅｆｆ細胞；ＣＤ４＋ＣＣＲ７−ＣＤ４５ＲＯ−Ｔ細胞）；ＣＤ８＋エフェクターＴＩＬ細胞（ＣＤ８＋Ｔｅｆｆ細胞；ＣＤ８＋ＣＣＲ７−ＣＤ４５ＲＯ−Ｔ細胞）；腫瘍浸潤骨髄細胞、例えば、ｐＤＣ、ｍＤＣ、およびＣＤ１４＋骨髄細胞；腫瘍浸潤ＮＫ細胞、例えば、ＣＤ１６−ＣＤ５６＋＋ＮＫ細胞、およびＣＤ１６＋ＣＤ５６＋ＮＫ細胞におけるＴＩＭ３陽性細胞の頻度を調べることを含む。ある実施態様は、これらの細胞集団の１つ以上、例えば、これらの細胞集団の２つ、３つ、４つ、５つまたはそれ以上、あるいは全てにおけるＴＩＭ３陽性細胞の頻度を調べ、前記細胞集団の１つまたはそれ以上におけるＴＩＭ−３陽性細胞のより高い頻度により、対象が免疫治療薬（例えば、ＴＩＭ−３アンタゴニスト）による治療に応答する可能性が高いことが示され、あるいは免疫治療薬を受ける前の対象の細胞集団の１つまたはそれ以上におけるＴＩＭ３陽性細胞の頻度と比較して、免疫治療薬（例えば、ＴＩＭ−３アンタゴニスト）の用量を受けた対象の細胞集団の１つまたはそれ以上におけるＴＩＭ３陽性細胞のより低い頻度により、対象が前記免疫治療薬による治療に応答していることが示されることを含む。
【０２２２】
免疫治療薬（例えば、ＴＩＭ−３アンタゴニスト）による対象の治療方法であって、治療上の有効量の前記免疫治療薬（例えば、ＴＩＭ−３アンタゴニスト）を癌に罹っている対象に投与することを特徴とし、前記免疫治療薬を投与する前に、前記対象が、コントロール対象と比較して、１つまたはそれ以上の所定の細胞集団におけるＴＩＭ３陽性細胞のより高い頻度を示し、前記１つまたはそれ以上の所定の細胞集団が、ＣＤ８＋ＴＩＬ細胞；ＣＤ４＋エフェクターメモリーＴＩＬ細胞（ＣＤ４＋ＥＭ細胞；ＣＤ４＋ＣＣＲ７−ＣＤ４５ＲＯ＋ＴＩＬ細胞）；ＣＤ８＋エフェクターメモリーＴＩＬ細胞（ＣＤ８＋ＥＭ細胞；ＣＤ８＋ＣＣＲ７−ＣＤ４５ＲＯ＋ＴＩＬ細胞）；ＣＤ４＋エフェクターＴＩＬ細胞（ＣＤ４＋Ｔｅｆｆ細胞；ＣＤ４＋ＣＣＲ７−ＣＤ４５ＲＯ−Ｔ細胞）；ＣＤ８＋エフェクターＴＩＬ細胞（ＣＤ８＋Ｔｅｆｆ細胞；ＣＤ８＋ＣＣＲ７−ＣＤ４５ＲＯ−Ｔ細胞）；腫瘍浸潤骨髄細胞、例えば、ｐＤＣ、ｍＤＣ、およびＣＤ１４＋骨髄細胞；腫瘍浸潤ＮＫ細胞、例えば、ＣＤ１６−ＣＤ５６＋＋ＮＫ細胞、およびＣＤ１６＋ＣＤ５６＋ＮＫ細胞からなる群から選択されるものである方法もまた本明細書で提供される。
【０２２３】
免疫治療薬（例えば、ＴＩＭ−３アンタゴニスト）による対象の治療方法であって、治療上の有効量の前記免疫治療薬（例えば、ＴＩＭ−３アンタゴニスト）を癌に罹っている対象に投与することを特徴とし、第１（または最初の数回）の用量の免疫治療薬（例えば、ＴＩＭ−３アンタゴニスト）を投与した後に、第１（または最初の数回）の用量の免疫治療薬（例えば、ＴＩＭ−３アンタゴニスト）を投与する前と比較して、１つまたはそれ以上の所定の細胞集団におけるＴＩＭ３陽性細胞のより高い頻度を示し、前記対象が、１つまたはそれ以上の所定の細胞集団におけるＴＩＭ３陽性細胞のより低い頻度を示し、前記１つまたはそれ以上の所定の細胞集団が、ＣＤ８＋ＴＩＬ細胞；ＣＤ４＋エフェクターメモリーＴＩＬ細胞（ＣＤ４＋ＥＭ細胞；ＣＤ４＋ＣＣＲ７−ＣＤ４５ＲＯ＋ＴＩＬ細胞）；ＣＤ８＋エフェクターメモリーＴＩＬ細胞（ＣＤ８＋ＥＭ細胞；ＣＤ８＋ＣＣＲ７−ＣＤ４５ＲＯ＋ＴＩＬ細胞）；ＣＤ４＋エフェクターＴＩＬ細胞（ＣＤ４＋Ｔｅｆｆ細胞；ＣＤ４＋ＣＣＲ７−ＣＤ４５ＲＯ−Ｔ細胞）；ＣＤ８＋エフェクターＴＩＬ細胞（ＣＤ８＋Ｔｅｆｆ細胞；ＣＤ８＋ＣＣＲ７−ＣＤ４５ＲＯ−Ｔ細胞）；腫瘍浸潤骨髄細胞、例えば、ｐＤＣ、ｍＤＣ、およびＣＤ１４＋骨髄細胞；腫瘍浸潤ＮＫ細胞、例えば、ＣＤ１６−ＣＤ５６＋＋ＮＫ細胞、およびＣＤ１６＋ＣＤ５６＋ＮＫ細胞からなる群から選択されるものである方法もまた本明細書で提供される。
【０２２４】
免疫治療薬（例えば、ＴＩＭ−３アンタゴニスト）による対象の治療方法であって、例えば、本明細書に記載される（例えば、前段落における）免疫治療薬（例えば、ＴＩＭ−３アンタゴニスト）による治療に応答する可能性が高いか否かを最初に決定し、可能性が高い場合、治療上の有効量の前記免疫治療薬（例えば、ＴＩＭ−３アンタゴニスト）を投与することを含む方法が本明細書でさらに提供される。
【０２２５】
ＴＩＭ−３アンタゴニスト
ある態様において、本開示は、癌の治療のためにＴＩＭ−３アンタゴニストを使用する方法を特徴とする。本明細書で用いられるように、ＴＩＭ−３アンタゴニストとしては、以下に限定されないが、抗ＴＩＭ３抗体およびその抗原結合部分、ならびに可溶性ＴＩＭ３ポリペプチド（例えば、ＴＩＭ−３リガンドに結合することができるＴＩＭ３−Ｆｃ融合タンパク質）が含まれる。他のＴＩＭ−３アンタゴニストとしては、ＴＩＭ３のリガンドに結合し、それらのＴＩＭ３との相互作用を阻害する薬剤が含まれる。
【０２２６】
抗ＴＩＭ３抗体
本開示のある態様には、治療上の有効量の抗ＴＩＭ３抗体またはその抗原結合部分を、治療を必要とする対象に投与することが含まれる。本開示における使用のために適する抗ＴＩＭ３抗体（またはこれに由来するＶＨ／ＶＬドメイン）は、当該技術分野で周知の方法を用いて作成することができる。あるいは、当該技術分野で知られている抗ＴＩＭ３抗体が用いられうる。
【０２２７】
ある実施態様において、前記抗ＴＩＭ３抗体またはその抗原結合部分は、下記の機能特性のうちの１つまたはそれ以上を示す：
（ａ）可溶性および／または膜結合型ヒトＴＩＭ３に結合する；
（ｂ）可溶性および／または膜結合型カニクイザルＴＩＭ３に結合する；
（ｃ）免疫応答を誘導し、または活性化する；
（ｄ）（例えば、サイトカイン分泌および／または増殖の亢進によって示される）Ｔ細胞活性化、例えば、Ｔｈ１細胞活性を誘導し、または活性化する；
（ｅ）例えば、共培養アッセイにおいて、Ｔ細胞増殖（例えば、ＣＤ４＋、ＣＤ８＋Ｔ細胞、Ｔｈ１細胞、またはＴＩＬ）を誘導し、または活性化する；
（ｆ）Ｔ細胞（例えば、Ｔｈ１細胞または腫瘍浸潤リンパ球（ＴＩＬ）、例えば、ヒト腎臓、肺、膵臓、または乳房癌腫瘍に由来するＴＩＬ）によるＩＦＮ−γ産生を誘導し、または活性化する；
（ｇ）ヒトＴＩＭ３のＰｔｄＳｅｒへの結合を妨害し、または阻害する； 
（ｈ）細胞においてＴＩＭ３に結合すると細胞表面ＴＩＭ３を内在化しないか、または下流調節しない；
（ｉ）ヒトＴＩＭ−３細胞外ドメイン（ｉ）CPVFECG（配列番号：２００）；（ｉｉ）RIQIPGIMND（配列番号：２０２）；（ｉｉｉ）CPVFECGおよびRIQIPGIMND（各配列番号：２００および２０２）；または（ｉｖ）WTSRYWLNGDFR（配列番号：２０１）に結合する；
（ｊ）ヒトＴＩＭ−３の本明細書に記載のＴＩＭ３（例えば、１３Ａ３、３Ｇ４、１７Ｃ３、１７Ｃ８、９Ｆ６、またはＴＩＭ３．２からＴＩＭ３．１８のいずれか）に結合する抗体への結合と競合し、または前記結合を交差妨害する；
（ｋ）ヒトＴＩＭ３に結合するが、下記アミノ酸残基：（配列番号：１９４で番号付けされる）Ｌ４８、Ｃ５８、Ｐ５９、Ｖ６０、Ｆ６１、Ｅ６２、Ｃ６３、Ｇ６４、Ｗ７８、Ｓ８０、Ｒ８１、Ｗ８３、Ｌ８４、Ｇ８６、Ｄ８７、Ｒ８９、Ｄ１０４、Ｒ１１１、Ｑ１１３、Ｇ１１６、Ｍ１１８、およびＤ１２０のうちの１つまたはそれ以上のアミノ酸置換を有するヒトＴＩＭ３に結合しない；ならびに
（ｌ）ＨＤＸ−ＭＳによって調べられるようにヒトＴＩＭ−３領域４９VPVCWGKGACPVFE６２（配列番号：２０４）および１１１RIQIPGIMNDEKFNLKL１２７（配列番号：２０５）に結合する；
（ｍ）Ｘ線結晶構造解析によって調べられるように、ヒトＴＩＭ３の下記アミノ酸：Ｐ５０、Ｖ５１、Ｃ５２、Ｐ５９、Ｖ６０、Ｆ６１、Ｅ６２、Ｃ６３、Ｇ６４、Ｎ６５、Ｖ６６、Ｖ６７、Ｌ６８、Ｒ６９、Ｄ７１、Ｅ７２、Ｄ７４、Ｒ１１１、Ｑ１１３、Ｇ１１６、Ｉ１１７、Ｍ１１８、Ｄ１２０、適宜、Ｔ７０および／またはＩ１１２のうちの少なくとも５個、１０個、１５個、２０個または全てと相互作用する重鎖および／または軽鎖可変領域を有する；ならびに／あるいは
（ｎ）ヒトＴＩＭ３の１３Ａ３またはＴＩＭ３．１８．ＩｇＧ１．３への結合と競合し、または前記結合に交差妨害する。
【０２２８】
ある実施態様において、前記抗ＴＩＭ３抗体は、高い親和性、例えば、１０−７Ｍまたはそれ以下、１０−８Ｍまたはそれ以下、１０−９Ｍまたはそれ以下、１０−１０Ｍまたはそれ以下、１０−１１Ｍまたはそれ以下、１０−１２Ｍまたはそれ以下、１０−１２Ｍ〜１０−７Ｍ、１０−１１Ｍ〜１０−７Ｍ、１０−１０Ｍ〜１０−７Ｍ、あるいは１０−９Ｍ〜１０−７ＭのＫＤでヒトＴＩＭ−３に結合する。ある実施態様において、抗ＴＩＭ３抗体は、例えば、Ｂｉａｃｏｒｅ（登録商標）によって調べられるように、１０−７Ｍまたはそれ以下、１０−８Ｍまたはそれ以下、１０−９Ｍ（１ｎＭ）またはそれ以下、１０−１０Ｍまたはそれ以下、１０−１２Ｍ〜１０−７Ｍ、１０−１１Ｍ〜１０−７Ｍ、１０−１０Ｍ〜１０−７Ｍ、１０−９Ｍ〜１０−７Ｍ、あるいは１０−８Ｍ〜１０−７ＭのＫＤで可溶性ヒトＴＩＭ３に結合する。ある実施態様において、抗ＴＩＭ３抗体は、例えば、フローサイトメトリーおよびスキャッチャードプロットによって調べられるように、活性化されたヒトＣＤ４＋およびＣＤ８＋ＴＩＬなどにおいて、１０−７Ｍまたはそれ以下、１０−８Ｍまたはそれ以下、１０−９Ｍ（１ｎＭ）またはそれ以下、５ｘ１０−１０Ｍまたはそれ以下、１０−１０Ｍまたはそれ以下、１０−１２Ｍ〜１０−７Ｍ、１０−１１Ｍ〜１０−８Ｍ、１０−１０Ｍ〜１０−８Ｍ、１０−９Ｍ〜１０−８Ｍ、１０−１１Ｍ〜１０−９Ｍ、あるいは１０−１０Ｍ〜１０−９ＭのＫＤで結合型（例えば、細胞膜結合型）ヒトＴＩＭ３に結合する。他の実施態様において、抗ＴＩＭ３抗体は、例えば、フローサイトメトリーによって調べられるように、活性化されたヒトＣＤ４＋およびＣＤ８＋ＴＩＬなどにおいて、１０ｕｇ／ｍＬまたはそれ以下、５ｕｇ／ｍＬまたはそれ以下、１ｕｇ／ｍＬまたはそれ以下、０．９ｕｇ／ｍＬまたはそれ以下、０．８ｕｇ／ｍＬまたはそれ以下、０．７ｕｇ／ｍＬまたはそれ以下、０．６ｕｇ／ｍＬまたはそれ以下、０．５ｕｇ／ｍＬまたはそれ以下、０．４ｕｇ／ｍＬまたはそれ以下、０．３ｕｇ／ｍＬまたはそれ以下、０．２ｕｇ／ｍＬまたはそれ以下、０．１ｕｇ／ｍＬまたはそれ以下、０．０５ｕｇ／ｍＬまたはそれ以下、あるいは０．０１ｕｇ／ｍＬまたはそれ以下のＥＣ５０で結合型（例えば、細胞膜結合型）ヒトＴＩＭ３に結合する。
【０２２９】
ある実施態様において、本開示に適する抗ＴＩＭ３抗体は、例えば、１０−７Ｍまたはそれ以下、１０−８Ｍまたはそれ以下、１０−９Ｍまたはそれ以下、１０−１０Ｍまたはそれ以下、１０−１１Ｍまたはそれ以下、１０−１２Ｍまたはそれ以下、１０−１２Ｍ〜１０−７Ｍ、１０−１１Ｍ〜１０−７Ｍ、１０−１０Ｍ〜１０−７Ｍ、あるいは１０−９Ｍ〜１０−７ＭのＫＤでカニクイザルＴＩＭ３に結合する。ある実施態様において、抗ＴＩＭ３抗体は、例えば、Ｂｉａｃｏｒｅ（登録商標）によって調べられるように、１０−７Ｍまたはそれ以下、１０−８Ｍまたはそれ以下、１０−９Ｍ（１ｎＭ）またはそれ以下、１０−１０Ｍまたはそれ以下、１０−１２Ｍ〜１０−７Ｍ、１０−１１Ｍ〜１０−７Ｍ、１０−１０Ｍ〜１０−７Ｍ、１０−９Ｍ〜１０−７Ｍ、あるいは１０−８Ｍ〜１０−７ＭのＫＤで可溶性カニクイザルＴＩＭ３に結合する。他の実施態様において、前記抗ＴＩＭ３抗体は、例えば、フローサイトメトリーによって調べられるように、例えば、１００ｎＭまたはそれ以下、１０ｎＭまたはそれ以下、１００ｎＭ〜０．０１ｎＭ、１００ｎＭ〜０．１ｎＭ、１００ｎＭ〜１ｎＭ、あるいは１０ｎＭ〜１ｎＭのＥＣ５０で膜結合型カニクイザルＴＩＭ３に結合することができる。ある実施態様において、抗ＴＩＭ３抗体は、活性化されたヒトＣＤ４＋およびＣＤ８＋ＴＩＬなどにおいて、例えば、フローサイトメトリーおよびスキャッチャードプロットによって調べられるように、１０−７Ｍまたはそれ以下、１０−８Ｍまたはそれ以下、１０−９Ｍ（１ｎＭ）またはそれ以下、５ｘ１０−１０Ｍまたはそれ以下、１０−１０Ｍまたはそれ以下、１０−１２Ｍ〜１０−７Ｍ、１０−１１Ｍ〜１０−８Ｍ、１０−１０Ｍ〜１０−８Ｍ、１０−９Ｍ〜１０−８Ｍ、１０−１１Ｍ〜１０−９Ｍ、あるいは１０−１０Ｍ〜１０−９ＭのＫＤで結合型（例えば、細胞膜結合型）カニクイザルＴＩＭ３に結合する。
【０２３０】
ある実施態様において、前記抗ＴＩＭ３抗体は、例えば、腫瘍において、例えば、Ｔ細胞を活性化することにより、免疫応答を活性化し、または亢進する。例えば、前記抗ＴＩＭ３抗体は、例えば、ＴＩＭ３介在Ｔ細胞阻害活性の阻害から生じうるサイトカイン（例えば、ＩＦＮ−γ）分泌の増加および／または増殖の上昇によって示されるように、細胞を活性化し、または共刺激することができる。ある実施態様において、ＴＩＭ−３抗体によるＴ細胞の活性化または共刺激は、ＣＤ３刺激の存在を生じる。ある実施態様において、抗ＴＩＭ３抗体は、ＩＦＮ−γ分泌を、例えば、主要なヒトＴ細胞および／またはヒトＴＩＭ３を発現するＴ細胞（例えば、腫瘍浸潤リンパ球（ＴＩＬ））において測定されるように、適宜、１０倍、３０倍、１００倍までの最大値で５０％、１００％（すなわち、２倍）、３倍、４倍、５倍またはそれ以上に増加する。
【０２３１】
ある実施態様において、前記抗ＴＩＭ３抗体は、細胞（例えば、ＣＨＯ細胞またはヒトＴＩＭ３を発現する活性化Ｔ細胞）におけるフォスファチジルセリンのヒトＴＩＭ−３への結合を、例えば、１０μｇ／ｍｌまたはそれ以下、１μｇ／ｍｌまたはそれ以下、０．０１μｇ／ｍｌ〜１０μｇ／ｍｌ、０．１μｇ／ｍｌ〜１０μｇ／ｍｌ、または０．１μｇ／ｍｌ〜１μｇ／ｍｌのＥＣ５０で阻害する。
【０２３２】
ある実施態様において、本開示に適する抗ＴＩＭ３抗体は、ヒトＴＩＭ３の細胞外部分、例えば、細胞外領域のＩｇ様ドメインにおけるエピトープ（例えば、立体構造エピトープ）、すなわち、配列番号：１９４のアミノ酸２２〜２０２に結合する。ある実施態様において、抗ＴＩＭ３抗体は、ヒトＴＩＭ３細胞外ドメインのアミノ酸２２〜１２０（配列番号：１９４）または成熟ヒトＴＩＭ３のアミノ酸１−９９（配列番号：１９８）内に位置するエピトープに結合する。ある実施態様において、抗ＴＩＭ３抗体は、成熟ヒトＴＩＭ３のアミノ酸残基３７−４３（CPVFECG、配列番号：２００）に相当する、配列番号：１９４を有するヒトＴＩＭ３のアミノ酸５８−６４からなる領域または前記領域内のエピトープに結合する。他の実施態様において、抗ＴＩＭ３抗体は、成熟ヒトＴＩＭ３のアミノ酸残基９０−９９（RIQIPGIMND、配列番号：２０２）に相当する、配列番号：１９４を有するヒトＴＩＭ３のアミノ酸１１１−１２０からなる領域または前記領域内のエピトープに結合する。ある実施態様において、抗ＴＩＭ３抗体は、配列番号：１９４を有するヒトＴＩＭ３のアミノ酸５８−６４（CPVFECG、配列番号：２００）からなる領域または前記領域内のエピトープ、あるいは配列番号：１９４を有するヒトＴＩＭ３のアミノ酸１１１−１２０（RIQIPGIMND、配列番号：２０２）からなる領域または前記領域内のエピトープに結合する。ある実施態様において、抗ＴＩＭ３抗体は、成熟ヒトＴＩＭ３のアミノ酸残基５７−８３（WTSRYWLNGDFR、配列番号：２０１）に相当する、配列番号：１９４を有するヒトＴＩＭ３のアミノ酸７８−８９からなる領域または前記領域内のエピトープに結合する。
【０２３３】
ある実施態様において、抗ＴＩＭ３抗体は、１３Ａ３、すなわち、配列番号：１９４のアミノ酸残基Ｃ５８、Ｐ５９、Ｆ６１、Ｅ６２、Ｃ６３、Ｒ１１１、およびＤ１２０のうちの１つまたはそれ以上を含むエピトープ（またはヒトＴＩＭ３領域）と実質的に同一のエピトープに結合する。ある実施態様において、抗ＴＩＭ３抗体は、配列番号：１９４のアミノ酸残基Ｃ５８、Ｐ５９、Ｆ６１、Ｅ６２、Ｃ６３、Ｄ１０４、Ｒ１１１、Ｑ１１３、およびＤ１２０のうちの１つまたはそれ以上を含むエピトープ（またはヒトＴＩＭ３の領域）に結合する。ある実施態様において、抗ＴＩＭ３抗体は、配列番号：１９４のアミノ酸残基Ｃ５８、Ｐ５９、Ｆ６１、Ｅ６２、Ｃ６３、Ｒ１１１、およびＤ１２０のうちの１つまたはそれ以上が、例えば、非保存的アミノ酸置換において、別のアミノ酸に変化しているヒトＴＩＭ３タンパク質に対して、有意に結合しないか、または著しく減少した結合親和性でのみ結合する。他の実施態様において、抗ＴＩＭ３抗体は、配列番号：１９４のアミノ酸残基Ｃ５８、Ｐ５９、Ｆ６１、Ｅ６２、Ｃ６３、Ｄ１０４、Ｒ１１１、Ｑ１１３、およびＤ１２０のうちの１つまたはそれ以上が、例えば、非保存的アミノ酸置換において、別のアミノ酸に変化しているヒトＴＩＭ３タンパク質に対して、有意に結合しないか、または著しく減少した結合親和性でのみ結合する。
【０２３４】
ある実施態様において、抗ＴＩＭ３抗体は、３Ｇ４、すなわち、配列番号：１９４のアミノ酸残基Ｃ５８、Ｐ５９、Ｖ６０、Ｆ６１、Ｅ６２、Ｃ６３、Ｇ１１６、およびＭ１１８のうちの１つまたはそれ以上を含むエピトープ（またはヒトＴＩＭ３の領域）と実質的に同一のエピトープと結合する。ある実施態様において、抗ＴＩＭ３抗体は、配列番号：１９４のアミノ酸残基Ｃ５８、Ｐ５９、Ｖ６０、Ｆ６１、Ｅ６２、Ｃ６３、Ｄ１０４、Ｇ１１６、およびＭ１１８のうちの１つまたはそれ以上を含むエピトープ（またはヒトＴＩＭ３の領域）に結合する。ある実施態様において、抗ＴＩＭ３抗体は、配列番号：１９４のアミノ酸残基Ｃ５８、Ｐ５９、Ｖ６０、Ｆ６１、Ｅ６２、Ｃ６３、Ｇ１１６、およびＭ１１８のうちの１つまたはそれ以上が、例えば、非保存的アミノ酸置換において、別のアミノ酸に変化しているヒトＴＩＭ３タンパク質に対して、有意に結合しないか、または著しく減少した結合親和性でのみ結合する。ある実施態様において、抗ＴＩＭ３抗体は、配列番号：１９４のアミノ酸残基Ｃ５８、Ｐ５９、Ｖ６０、Ｆ６１、Ｅ６２、Ｃ６３、Ｄ１０４、Ｇ１１６、およびＭ１１８のうちの１つまたはそれ以上が、例えば、非保存的アミノ酸置換において、別のアミノ酸に変化しているヒトＴＩＭ３タンパク質に対して、有意に結合しないか、または著しく減少した結合親和性でのみ結合する。
【０２３５】
ある実施態様において、抗ＴＩＭ３抗体は、１７Ｃ３、すなわち、配列番号：１９４のアミノ酸残基Ｃ５８、Ｐ５９、Ｖ６０、Ｆ６１、Ｅ６２、Ｃ６３、Ｇ６４、およびＧ１１６のうちの１つまたはそれ以上を含むエピトープ（またはヒトＴＩＭ３の領域）と実質的に同一のエピトープに結合する。ある実施態様において、抗ＴＩＭ３抗体は、配列番号：１９４のアミノ酸残基Ｃ５８、Ｐ５９、Ｖ６０、Ｆ６１、Ｅ６２、Ｃ６３、Ｇ６４、Ｄ１０４、およびＧ１１６のうちの１つまたはそれ以上を含むエピトープ（またはヒトＴＩＭ３領域）に結合する。ある実施態様において、抗ＴＩＭ３抗体は、配列番号：１９４のアミノ酸残基Ｃ５８、Ｐ５９、Ｖ６０、Ｆ６１、Ｅ６２、Ｃ６３、Ｇ６４、およびＧ１１６のうちの１つまたはそれ以上が、例えば、非保存的アミノ酸置換において、別のアミノ酸に変化しているヒトＴＩＭ３タンパク質に対して、有意に結合しないか、または著しく減少した結合親和性でのみ結合する。ある実施態様において、抗ＴＩＭ３抗体は、配列番号：１９４のアミノ酸残基Ｃ５８、Ｐ５９、Ｖ６０、Ｆ６１、Ｅ６２、Ｃ６３、Ｇ６４、Ｄ１０４、およびＧ１１６のうちの１つまたはそれ以上が、例えば、非保存的アミノ酸置換において、別のアミノ酸に変化しているヒトＴＩＭ３タンパク質に対して、有意に結合しないか、または著しく減少した結合親和性でのみ結合する。
【０２３６】
ある実施態様において、抗ＴＩＭ３抗体は、８Ｂ９、すなわち、配列番号：１９４のアミノ酸残基Ｌ４８、Ｗ７８、Ｓ８０、Ｒ８１、Ｗ８３、Ｇ８６、Ｄ８７、およびＲ８９のうちの１つまたはそれ以上を含むエピトープ（またはヒトＴＩＭ３領域）と実質的に同一のエピトープに結合する。ある実施態様において、抗ＴＩＭ３抗体は、配列番号：１９４のアミノ酸残基Ｌ４８、Ｗ７８、Ｓ８０、Ｒ８１、Ｗ８３、Ｌ８４、Ｇ８６、Ｄ８７、およびＲ８９のうちの１つまたはそれ以上を含むエピトープ（またはヒトＴＩＭ３領域）に結合する。他の実施態様において、抗ＴＩＭ３抗体は、配列番号：１９４のアミノ酸残基Ｌ４８、Ｗ７８、Ｓ８０、Ｒ８１、Ｗ８３、Ｇ８６、Ｄ８７、Ｒ８９、およびＤ１０４のうちの１つまたはそれ以上を含むエピトープ（またはヒトＴＩＭ３領域）に結合する。ある実施態様において、抗ＴＩＭ３抗体は、配列番号：１９４のアミノ酸残基Ｌ４８、Ｗ７８、Ｓ８０、Ｒ８１、Ｗ８３、Ｇ８６、Ｄ８７、およびＲ８９のうちの１つまたはそれ以上が、例えば、非保存的アミノ酸置換において、別のアミノ酸に変化しているヒトＴＩＭ３タンパク質に対して、有意に結合しないか、または著しく減少した結合親和性でのみ結合する。他の実施態様において、抗ＴＩＭ３抗体は、配列番号：１９４のアミノ酸残基Ｌ４８、Ｗ７８、Ｓ８０、Ｒ８１、Ｗ８３、Ｌ８４、Ｇ８６、Ｄ８７、およびＲ８９のうちの１つまたはそれ以上が、例えば、非保存的アミノ酸置換において、別のアミノ酸に変化しているヒトＴＩＭ３タンパク質に対して、有意に結合しないか、または著しく減少した結合親和性でのみ結合する。ある実施態様において、抗ＴＩＭ３抗体は、配列番号：１９４のアミノ酸残基Ｌ４８、Ｗ７８、Ｓ８０、Ｒ８１、Ｗ８３、Ｇ８６、Ｄ８７、Ｒ８９、およびＤ１０４のうちの１つまたはそれ以上が、例えば、非保存的アミノ酸置換において、別のアミノ酸に変化しているヒトＴＩＭ３タンパク質に対して、有意に結合しないか、または著しく減少した結合親和性でのみ結合する。
【０２３７】
他の実施態様において、本開示で用いられるために適する抗ＴＩＭ３抗体は、ヒトＴＩＭ３と、ＣＤＲまたは本明細書に記載の可変領域、例えば、抗体１３Ａ３、３Ｇ４、１７Ｃ３、１７Ｃ８、９Ｆ６、８Ｂ９、８Ｃ４、およびＴＩＭ３．２〜ＴＩＭ３．１８のいずれかの可変領域を含む抗ＴＩＭ３抗体との結合を競合する（または前記抗体の結合を阻害する）。ある実施態様において、抗ＴＩＭ３抗体は、抗体１３Ａ３、３Ｇ４、１７Ｃ３、１７Ｃ８、９Ｆ６、８Ｂ９、８Ｃ４、またはＴＩＭ３．２〜ＴＩＭ３．１８のいずれかのヒトＴＩＭ３への結合を、少なくとも５０％、６０％、７０％、８０％、９０％、または１００％まで阻害する。ある実施態様において、１３Ａ３、３Ｇ４、１７Ｃ３、１７Ｃ８、９Ｆ６、８Ｂ９、８Ｃ４、またはＴＩＭ３．２〜ＴＩＭ３．１８のいずれかは、抗ＴＩＭ３抗体のヒトＴＩＭ−３への結合を、少なくとも５０％、６０％、７０％、８０％、９０％、または１００％まで阻害する。他の実施態様において、抗ＴＩＭ３抗体は、１３Ａ３、３Ｇ４、１７Ｃ３、１７Ｃ８、９Ｆ６、８Ｂ９、８Ｃ４、またはＴＩＭ３．２〜ＴＩＭ３．１８のいずれかのヒトＴＩＭ３への結合を、少なくとも５０％、６０％、７０％、８０％、９０％、または１００％まで阻害し、１３Ａ３、３Ｇ４、１７Ｃ３、１７Ｃ８、９Ｆ６、８Ｂ９、８Ｃ４、またはＴＩＭ３．２〜ＴＩＭ３．１８のいずれかは、抗ＴＩＭ３抗体のヒトＴＩＭ−３への結合を、少なくとも５０％、６０％、７０％、８０％、９０％、または１００％まで阻害する（例えば、両方に対して競合する）。
【０２３８】
ある実施態様において、本明細書に開示の抗ＴＩＭ３抗体は、下記特徴のうちの１個、２個、３個、４個、５個、６個、７個、８個、９個、１０個、１１個、１２個、１３個、１４個、１５個、または全てを有する：
（１）例えば、Ｂｉａｃｏｒｅによって測定されるように、例えば、１０ｎＭまたはそれ以下（例えば、０．０１ｎＭ〜１０ｎＭ）のＫＤで可溶性ヒトＴＩＭ３に結合する；
（２）例えば、Ｂｉａｃｏｒｅによって測定されるように、例えば、１００ｎＭまたはそれ以下（例えば、０．０１ｎＭ〜１００ｎＭ）のＫＤで可溶性カニクイザルＴＩＭ３に結合する；
（３）例えば、フローサイトメトリーによって測定されるように、例えば、１μｇ／ｍＬまたはそれ以下（例えば、０．０１μｇ／ｍＬ〜１μｇ／ｍＬ）のＥＣ５０で膜結合型ヒトＴＩＭ−３に結合する；
（４）例えば、スキャッチャード分析によって測定されるように、例えば、１ｎＭまたはそれ以下（例えば、０．０１ｎＭ〜１０ｎＭ）のＫＤで膜結合型ヒトＴＩＭ３に結合する；
（５）例えば、フローサイトメトリーによって測定されるように、例えば、２０μｇ／ｍＬまたはそれ以下（例えば、０．０１μｇ／ｍＬ〜２０μｇ／ｍＬ）のＥＣ５０で膜結合型カニクイザルＴＩＭ３に結合する；
（６）例えば、スキャッチャード分析によって測定されるように、例えば、１ｎＭまたはそれ以下（例えば、０．０１ｎＭ〜１０ｎＭ）のＫＤで膜結合型カニクイザルＴＩＭ３に結合する；
（７）（ｉ）ＴＩＭ３発現Ｔ細胞（例えば、Ｔｈ１細胞またはＴＩＬ）におけるＩＦＮ−γ産生の増加および／または（ｉｉ）ＴＩＭ−３発現Ｔ細胞（例えば、Ｔｈ１細胞またはＴＩＬ）の細胞増殖の増加によって示されるように、（例えば、ＴＩＭ−３の阻害効果を妨害するか、または減少することによって）Ｔ細胞活性化を誘導し、または亢進する；
（８）混合リンパ球反応（ＭＬＲ）アッセイにおいてＴ細胞増殖を活性化する；
（９）フォスファチジルセリンのＴＩＭ３への結合を阻害する；
（１０）細胞においてＴＩＭ３に結合すると細胞表面ＴＩＭ３を内在化しないか、または下流調節しない；
（１１）ヒトＴＩＭ３細胞外ドメイン（配列番号：１９８）の下記領域のうちの１つに結合する：（ａ）CPVFECG（配列番号：２００）；（ｂ）RIQIPGIMND（配列番号：２０２）；（ｃ）CPVFECGおよびRIQIPGIMND（それぞれ配列番号：２００および２０２）；および（ｄ）WTSRYWLNGDFR（配列番号：２０１）；
（１２）（配列番号：１９４で番号付けされるように）アミノ酸Ｌ４８、Ｃ５８、Ｐ５９、Ｖ６０、Ｆ６１、Ｅ６２、Ｃ６３、Ｇ６４、Ｗ７８、Ｓ８０、Ｒ８１、Ｗ８３、Ｌ８４、Ｇ８６、Ｄ８７、Ｒ８９、Ｄ１０４、Ｒ１１１、Ｑ１１３、Ｇ１１６、Ｍ１１８、およびＤ１２０のうちの１つまたはそれ以上が、野生型ヒトＴＩＭ−３への結合と比較して別のアミノ酸に置換されているヒトＴＩＭ３への結合が減少する； 
（１３）ヒトＴＩＭ３と、１３Ａ３、３Ｇ４、１７Ｃ３、１７Ｃ８、９Ｆ６、８Ｂ９、８Ｃ４、またはＴＩＭ３．７、ＴＩＭ３．８、ＴＩＭ３．１０、ＴＩＭ３．１１、ＴＩＭ３．１２、ＴＩＭ３．１３、ＴＩＭ３．１４、ＴＩＭ３．１５、ＴＩＭ３．１６、ＴＩＭ３．１８のいずれか１つのＶＨおよびＶＬドメインを含む抗体との結合のいずれか、または両方に対して競合する；
（１４）ＨＤＸ−ＭＳによって調べられるように、ヒトＴＩＭ３領域４９VPVCWGKGACPVFE６２（配列番号：２０４）および１１１RIQIPGIMNDEKFNLKL１２７（配列番号：２０５）に結合する；
（１５）Ｘ線結晶構造解析によって調べられるヒトＴＩＭ３の下記アミノ酸（配列番号：１９４に従って番号付けされている）：Ｐ５０、Ｖ５１、Ｃ５２、Ｐ５９、Ｖ６０、Ｆ６１、Ｅ６２、Ｃ６３、Ｇ６４、Ｎ６５、Ｖ６６、Ｖ６７、Ｌ６８、Ｒ６９、Ｄ７１、Ｅ７２、Ｄ７４、Ｒ１１１、Ｑ１１３、Ｇ１１６、Ｉ１１７、Ｍ１１８、Ｄ１２０、ならびに適宜、Ｔ７０および／またはＩ１１２のうちの少なくとも５個、１０個、１５個、２０個、または全てと相互作用する重鎖および／または軽鎖可変領域を有する；および／または
（１６）（ａ）（配列番号：１９４に従って番号付けされている）アミノ酸Ｃ５８、Ｐ５９、Ｆ６１、Ｅ６２、Ｃ６３、Ｒ１１１、Ｄ１２０、ならびに適宜、Ｄ１０４およびＱ１１３のうちの１個、２個、３個、４個、５個、６個、７個、８個、または９個が、野生型ヒトＴＩＭ−３への結合と比較して別のアミノ酸で置換されているヒトＴＩＭ−３への結合が減少し；（ｂ）ＨＤＸ−ＭＳによって調べられるように、４９VPVCWGKGACPVFE６２（配列番号：２０４）、１１１RIQIPGIMNDEKFNLKL１２７（配列番号：２０５）、および１１９NDEKFNLKL１２７（配列番号：２１０）に結合し；および／または（ｃ）ヒトＴＩＭ−３の１３Ａ３またはＴＩＭ３．１８．ＩｇＧ１．３への結合と競合し、または交差妨害する。
【０２３９】
よって、当該技術分野で公知であり、本明細書に記載される方法に従って調べられるように、これらの機能的特徴（例えば、生化学、免疫化学、細胞学、生理学、または他の生物学的活性など）のうちの１つまたはそれ以上を示す抗体は、抗体の非存在下で観察される活性と比較して（例えば、または関連しない特異性のコントロール抗体が存在する場合）特定の活性における統計学的に有意な差異を示すことが理解される。ある実施態様において、所定のアッセイで測定されたパラメータ（例えば、Ｔ細胞増殖、サイトカイン産生）における抗ＴＩＭ３抗体で誘導された増加は、統計学的に有意な増加を、測定されたパラメータの少なくとも１０％まで、例えば、少なくとも２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、９０％、９５％、１００％（すなわち、２倍）、３倍、５倍、または１０倍まで生じ、ある実施態様において、本明細書に記載の抗体は、測定されたパラメータを、抗体の非存在で行われた同一アッセイと比較して、例えば、９２％、９４％、９５％、９７％、９８％、９９％、１００％（すなわち、２倍）、３倍、５倍、または１０倍以上高く増加することができる。逆に、所定のアッセイで測定されたパラメータ（例えば、腫瘍体積、ヒトＴＩＭ−３に結合するＴＩＭ３−Ｌ）における抗ＴＩＭ３抗体で誘導される増加は、統計学的に有意な減少を、測定されたパラメータの少なくとも１０％まで、例えば、少なくとも２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、または９０％まで生じ、ある実施態様において、本明細書に記載の抗体は、測定されたパラメータを、抗体の非存在で行われた同一アッセイと比較して、例えば、９２％、９４％、９５％、９７％、９８％、または９９％まで減少することができる。
【０２４０】
様々な種のＴＩＭ３に対する抗体の結合能を評価するための標準的なアッセイ（例えば、ＥＬＩＳＡ、ウェスタンブロット、およびＲＩＡを含む）が当該技術分野で公知である。抗体の結合反応速度（例えば、結合親和性）はまた、当該技術分野で公知の標準的なアッセイ（例えば、Ｂｉａｃｏｒｅ分析）によって評価することができる。
【０２４１】
ある実施態様において、本開示に適する抗ＴＩＭ３抗体は、内在性抗体ではないか、または天然に存在する抗体ではない。例えば、ある実施態様において、抗ＴＩＭ３抗体は、例えば、より多く、少なく、または異なるタイプの翻訳後修飾を有することによって天然に存在する抗体とは異なる翻訳後修飾を有する。
【０２４２】
ある実施態様において、抗ＴＩＭ３抗体は、例えば、ＣＨＯ−ＯＫＴ３−ＣＤ３２における抗ＴＩＭ３抗体の架橋結合：このような抗体が抗ＴＩＭ３単独を超える活性を亢進しないＴ細胞共培養実験で調べられるようなアゴニスト活性を有しない。ある実施態様において、抗ＴＩＭ３抗体は、ＴＩＭ３とそのリガンドとの相互作用を、アゴニスト活性を促進することなく妨害する。
【０２４３】
ある実施態様において、抗ＴＩＭ３抗体は、ＬＰＳで処理された単球または樹状細胞からのＩＬ−１２産生を亢進する。
【０２４４】
ある実施態様において、抗ＴＩＭ３抗体は、組み合わせ治療によりＣＤ４＋およびＣＤ８＋Ｔ細胞の枯渇を回避することによって、ＰＤ−１およびＴＩＭ３を共発現する腫瘍浸潤ＣＤ４＋およびＣＤ８＋Ｔ細胞を復活させる。
【０２４５】
典型的な抗ＴＩＭ３抗体
本開示に適する特定の抗ＴＩＭ３抗体は、抗体１３Ａ３、３Ｇ４、１７Ｃ３、１７Ｃ８、９Ｆ６、８Ｂ９、８Ｃ４、またはＴＩＭ−３．２〜ＴＩＭ３．１８のいずれか１つのＣＤＲおよび／または可変領域配列を有する抗体（例えば、モノクローナル、組み換え、および／またはヒト抗体）、ならびにそれらの可変領域またはＣＤＲ配列に対して少なくとも８０％同一性（例えば、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、または少なくとも９９％同一性）を有する抗体である。１３Ａ３、８Ｂ９、８Ｃ４、１７Ｃ３、９Ｆ６、３Ｇ４、および１７Ｃ８のＶＨアミノ酸配列は、それぞれ、配列番号：１−７で示される。１３Ａ３、８Ｂ９、および９Ｆ６変異型のＶＨアミノ酸配列は、配列番号：８−１８を示す。１３Ａ３、１７Ｃ３、および３Ｇ４のＶＬアミノ酸配列は、配列番号：１９で示される。８Ｂ９、８Ｃ４、および１７Ｃ８のＶＬアミノ酸配列は、配列番号：２０で示される。９Ｆ６またはその変異型のＶＬアミノ酸配列は、配列番号：２０、２１、または２２で示される。１３Ａおよび８Ｂ９変異型のＶＬアミノ酸配列は、それぞれ、配列番号：１９および配列番号：２０で示される。
【０２４６】
よって、ある実施態様において、抗ＴＩＭ３抗体は、重鎖および軽鎖可変領域を含むものであって、前記重鎖可変領域は、配列番号：１−１８からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む。ある実施態様において、前記軽鎖可変領域は、配列番号：１９−２２からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む。
【０２４７】
ある実施態様において、抗ＴＩＭ３抗体は：
（ａ）配列番号：１および１９をそれぞれ含む、重鎖および軽鎖可変領域配列；
（ｂ）配列番号：２および２０をそれぞれ含む、重鎖および軽鎖可変領域配列；
（ｃ）配列番号：３および２０をそれぞれ含む、重鎖および軽鎖可変領域配列；
（ｄ）配列番号：４および１９をそれぞれ含む、重鎖および軽鎖可変領域配列；
（ｅ）配列番号：５および２０をそれぞれ含む、重鎖および軽鎖可変領域配列；
（ｆ）配列番号：５および２１をそれぞれ含む、重鎖および軽鎖可変領域配列；
（ｇ）配列番号：５および２２をそれぞれ含む、重鎖および軽鎖可変領域配列；
（ｈ）配列番号：６および１９をそれぞれ含む、重鎖および軽鎖可変領域配列；
（ｉ）配列番号：７および２０をそれぞれ含む、重鎖および軽鎖可変領域配列；
（ｊ）配列番号：１７および２２をそれぞれ含む、重鎖および軽鎖可変領域配列；
（ｋ）配列番号：１６および２０をそれぞれ含む、重鎖および軽鎖可変領域配列；
（ｌ）配列番号：８および１９をそれぞれ含む、重鎖および軽鎖可変領域配列；
（ｍ）配列番号：９および１９をそれぞれ含む、重鎖および軽鎖可変領域配列；
（ｎ）配列番号：１０および１９をそれぞれ含む、重鎖および軽鎖可変領域配列；
（ｏ）配列番号：１１および１９をそれぞれ含む、重鎖および軽鎖可変領域配列；
（ｐ）配列番号：１２および１９をそれぞれ含む、重鎖および軽鎖可変領域配列；
（ｑ）配列番号：１３および１９をそれぞれ含む、重鎖および軽鎖可変領域配列；
（ｒ）配列番号：１４および１９をそれぞれ含む、重鎖および軽鎖可変領域配列；
（ｔ）配列番号：１８および１９をそれぞれ含む、重鎖および軽鎖可変領域配列
を含む。
【０２４８】
ある実施態様において、抗ＴＩＭ３抗体は、１３Ａ３、８Ｂ９、８Ｃ４、１７Ｃ３、９Ｆ６、３Ｇ４、および１７Ｃ８、またはＴＩＭ３．２〜ＴＩＭ３．１８のいずれか１つ、あるいはこれらの組み合わせの重鎖および軽鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３を含む。１３Ａ３、８Ｂ９、８Ｃ４、および１７Ｃ３のＶＨ ＣＤＲ１のアミノ酸配列は、それぞれ、配列番号：２３−２６で示される。９Ｆ６、３Ｇ４、および１７Ｃ８のＶＨ ＣＤＲ１のアミノ酸配列は、配列番号：２７で示される。変異型１３Ａ３抗体（すなわち、ＴＩＭ３．１０−ＴＩＭ３．１８）のＶＨ ＣＤＲ１のアミノ酸配列は、変異型ではない１３Ａ３抗体のもの、すなわち、配列番号：２３と同一である。変異型８Ｂ９抗体（すなわち、ＴＩＭ３．８）のＶＨ ＣＤＲ１のアミノ酸配列は、変異型ではない８Ｂ９抗体のもの、すなわち、配列番号：２４と同一である。変異型９Ｆ６抗体（すなわち、ＴＩＭ３．７）のＶＨ ＣＤＲ１のアミノ酸配列は、変異型ではない９Ｆ６抗体のもの、すなわち、配列番号：２７と同一である。１３Ａ３、８Ｂ９、８Ｃ４、１７Ｃ３、９Ｆ６、３Ｇ４、および１７Ｃ８のＶＨ ＣＤＲ２のアミノ酸配列は、それぞれ、配列番号：２８−３４で示される。変異型１３Ａ３抗体ＴＩＭ３．１０、ＴＩＭ３．１７、およびＴＩＭ３．１８のＶＨ ＣＤＲ２のアミノ酸配列は、配列番号：３５で示される。変異型１３Ａ３抗体ＴＩＭ３．１１およびＴＩＭ−３．１２のＶＨ ＣＤＲ２のアミノ酸配列は、それぞれ、配列番号：３６および３７で示される。変異型１３Ａ３抗体ＴＩＭ３．１３およびＴＩＭ−３．１６のＶＨ ＣＤＲ２のアミノ酸配列は、変異型ではない１３Ａ３抗体のもの、すなわち、配列番号：２８である。変異型８Ｂ９抗体（すなわち、ＴＩＭ３．８）のＶＨ ＣＤＲ２のアミノ酸配列は、配列番号：３８で示される。変異型９Ｆ６抗体（すなわち、ＴＩＭ３．７）のＶＨ ＣＤＲ２のアミノ酸配列は、変異型ではない９Ｆ６抗体のもの、すなわち、配列番号：３２と同一である。１３Ａ３、８Ｂ９、８Ｃ４、１７Ｃ３、９Ｆ６、３Ｇ４、および１７Ｃ８のＶＨ ＣＤＲ３のアミノ酸配列は、それぞれ、配列番号：３９−４５で示される。
【０２４９】
変異型１３Ａ３抗体（すなわち、ＴＩＭ３．１０〜ＴＩＭ３．１２のＶＨ ＣＤＲ３のアミノ酸配列は、変異型ではない１３Ａ３抗体のもの、すなわち、配列番号：３９である。変異型１３Ａ３抗体ＴＩＭ３．１３およびＴＩＭ−３．１８のＶＨ ＣＤＲ３のアミノ酸配列は、配列番号：４６で示される。変異型１３Ａ３抗体ＴＩＭ３．１５およびＴＩＭ−３．１７のＶＨ ＣＤＲ３のアミノ酸配列は、配列番号：４８で示される。変異型１３Ａ３抗体ＴＩＭ３．１４およびＴＩＭ−３．１６のＶＨ ＣＤＲ３のアミノ酸配列は、それぞれ、配列番号：４７および４９で示される。変異型８Ｂ９抗体（すなわち、ＴＩＭ３．８）のＶＨ ＣＤＲ３のアミノ酸配列は、変異型ではない８Ｂ９抗体のもの、すなわち、配列番号：４０である。変異型９Ｆ６抗体（すなわち、ＴＩＭ３．７）のＶＨ ＣＤＲ３のアミノ酸配列は、変異型ではない９Ｆ６抗体のもの、すなわち、配列番号：４３と同一である。
【０２５０】
１３Ａ３、８Ｂ９、８Ｃ４、１７Ｃ３、３Ｇ４、および１７Ｃ８のＶＬ ＣＤＲ１のアミノ酸配列は、配列番号：５０で示される。９Ｆ６のＶＬ ＣＤＲ１のアミノ酸配列は、配列番号：５０および５１で示される。１３Ａ３、８Ｂ９、８Ｃ４、１７Ｃ３、３Ｇ４、および１７Ｃ８のＶＬ ＣＤＲ２のアミノ酸配列は、配列番号：５２で示される。９Ｆ６のＶＬ ＣＤＲ２のアミノ酸配列は、配列番号：５２および５３で示される。１３Ａ３、１７Ｃ３、および３Ｇ４のＶＬ ＣＤＲ３のアミノ酸配列は、配列番号：５４で示される。８Ｂ９、８Ｃ４、および１７Ｃ８のＶＬ ＣＤＲ３のアミノ酸配列は、配列番号：５５で示される。９Ｆ６のＶＬ ＣＤＲ３のアミノ酸配列は、配列番号：５５−５７で示される。変異型抗体１３Ａ３、８Ｂ９、および９Ｆ６のＶＬ ＣＤＲのアミノ酸配列は、対応する変異型ではない抗体のものである。
【０２５１】
前記ＣＤＲ領域は、カバットシステム（Kabat, E. A., et al. (1991) Sequences of Proteins of Immunological Interest, Fifth Edition, U.S. Department of Health and Human Services, NIH Publication No. 91-3242）を用いて示される。カバットシステムは、最初に配列されたヒトＩｇＧ１の連続ナンバリングに基づくＥＵインデックスまたはＥＵナンバリングシステムと呼ばれるスキームのための最も一般的なナンバリングシステムである（ＥＵ抗体；Edelman et al. 1969）。本明細書に開示のカバットナンバリングスキームに基づいて、抗体ナンバリングは、他の当該技術分野で公知のシステム、例えば、Ｃｈｏｔｈｉａ、ＩＭＧＴ、Ｍａｒｔｉｎ（Ｃｈｏｔｈｉａの改良型）、またはＡＨｏナンバリングスキームに変更することができる。
【０２５２】
ある実施態様において、前記抗ＴＩＭ３抗体またはその抗原結合部分は：
（ａ）配列番号：２３−２７からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む、重鎖可変領域ＣＤＲ１；
（ｂ）配列番号：２８−３８からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む、重鎖可変領域ＣＤＲ２；
（ｃ）配列番号：３９−４９からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む、重鎖可変領域ＣＤＲ３；
（ｄ）配列番号：５０および５１からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む、軽鎖可変領域ＣＤＲ１；
（ｅ）配列番号：５２および５３からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む、軽鎖可変領域ＣＤＲ２；または
（ｆ）配列番号：５４−５７からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む、軽鎖可変領域ＣＤＲ３
を含み、前記抗体は、ヒトＴＩＭ３に特異的に結合する。
【０２５３】
ある実施態様において、前記抗ＴＩＭ３抗体は、重鎖および軽鎖可変領域を含むものであって、前記重鎖可変領域ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３領域は：
（ａ）配列番号：２３、２８、および３９；
（ｂ）配列番号：２４、２９、および４０；
（ｃ）配列番号：２５、３０、および４１；
（ｄ）配列番号：２６、３１、および４２；
（ｅ）配列番号：２７、３２、および４３；
（ｆ）配列番号：２７、３３、および４４；
（ｇ）配列番号：２７、３４、および４５；
（ｈ）配列番号：２３、３５、および３９；
（ｉ）配列番号：２３、３６、および３９；
（ｊ）配列番号：２３、３７、および３９；
（ｋ）配列番号：２３、２８、および４６；
（ｌ）配列番号：２３、２８、および４７；
（ｍ）配列番号：２３、２８、および４８；
（ｎ）配列番号：２３、２８、および４９；
（ｏ）配列番号：２３、３５、および４６；または
（ｐ）配列番号：２３、３５、および４８
を含み、前記抗体は、ヒトＴＩＭ３に特異的に結合する。
【０２５４】
ある実施態様において、前記抗ヒトＴＩＭ３抗体は、重鎖および軽鎖可変領域を含むものであって、前記軽鎖可変領域ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３領域は：
（ａ）配列番号：５０、５２、および５４；
（ｂ）配列番号：５０、５２、および５５；
（ｃ）配列番号：５１、５３、および５６；または
（ｄ）配列番号：５０、５２、および５７
を含み、前記抗体は、ヒトＴＩＭ３に特異的に結合する。
【０２５５】
ある実施態様において、前記抗ＴＩＭ３抗体は、重鎖および軽鎖可変領域を含むものであって：
（ａ１）前記重鎖可変領域ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３は、それぞれ、配列番号：２３、２８、および３９を含み、前記軽鎖可変領域ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３は、それぞれ、配列番号：５０、５２、および５４を含み；
（ａ２）前記重鎖可変領域ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３は、配列番号：２３、３５、および３９を含み、前記軽鎖可変領域ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３は、それぞれ、配列番号：５０、５２、および５４を含み；
（ａ３）前記重鎖可変領域ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３は、それぞれ、配列番号：２３、３６、および３９を含み、前記軽鎖可変領域ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３は、それぞれ、配列番号：５０、５２、および５４を含み；
（ａ４）前記重鎖可変領域ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３は、それぞれ、配列番号：２３、３７、および３９を含み、前記軽鎖可変領域ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３は、それぞれ、配列番号：５０、５２、および５４を含み；
（ａ５）前記重鎖可変領域ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３は、それぞれ、配列番号：２３、２８、および４６を含み、前記軽鎖可変領域ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３は、それぞれ、配列番号：５０、５２、および５４を含み；
（ａ６）前記重鎖可変領域ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３は、それぞれ、配列番号：２３、２８、および４７を含み、前記軽鎖可変領域ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３は、それぞれ、配列番号：５０、５２、および５４を含み；
（ａ７）前記重鎖可変領域ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３は、それぞれ、配列番号：２３、２８、および４８を含み、前記軽鎖可変領域ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３は、それぞれ、配列番号：５０、５２、および５４を含み；
（ａ８）前記重鎖可変領域ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３は、それぞれ、配列番号：２３、２８、および４９を含み、前記軽鎖可変領域ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３は、それぞれ、配列番号：５０、５２、および５４を含み；
（ａ９）前記重鎖可変領域ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３は、それぞれ、配列番号：２３、３５、および４６を含み、前記軽鎖可変領域ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３は、それぞれ、配列番号：５０、５２、および５４を含み；
（ａ１０）前記重鎖可変領域ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３は、それぞれ、配列番号：２３、３５、および４８を含み、前記軽鎖可変領域ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３は、それぞれ、配列番号：５０、５２、および５４を含み；
（ｂ１）前記重鎖可変領域ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３は、それぞれ、配列番号：２４、２９、および４０を含み、前記軽鎖可変領域ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３は、それぞれ、配列番号：５０、５２、および５５を含み；
（ｂ２）前記重鎖可変領域ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３は、それぞれ、配列番号：２４、３８、および４０を含み、前記軽鎖可変領域ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３は、それぞれ、配列番号：５０、５２、および５５を含み；
（ｃ）前記重鎖可変領域ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３は、それぞれ、配列番号：２５、３０、および４１を含み、前記軽鎖可変領域ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３は、それぞれ、配列番号：５０、５２、および５５を含み；
（ｄ）前記重鎖可変領域ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３は、それぞれ、配列番号：２６、３１、および４２を含み、前記軽鎖可変領域ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３は、それぞれ、配列番号：５０、５２、および５４を含み；
（ｅ）前記重鎖可変領域ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３は、それぞれ、配列番号：２７、３２、および４３を含み、前記軽鎖可変領域ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３は、それぞれ、配列番号：５０、５２、および５５を含み；
（ｆ）前記重鎖可変領域ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３は、それぞれ、配列番号：２７、３２、および４３を含み、前記軽鎖可変領域ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３は、それぞれ、配列番号：５０、５２、および５７を含み；
（ｇ１）前記重鎖可変領域ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３は、それぞれ、配列番号：２７、３２、および４３を含み、前記軽鎖可変領域ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３は、それぞれ、配列番号：５１、５３、および５６を含み；
（ｇ２）前記重鎖可変領域ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３は、それぞれ、配列番号：２７、３２、および４３を含み、前記軽鎖可変領域ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３は、配列番号：５０、５２、および５７を含み；
（ｇ３）前記重鎖可変領域ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３は、それぞれ、配列番号：２７、３２、および４３を含み、前記軽鎖可変領域ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３は、配列番号：５０、５２、および５５を含み；
（ｈ）前記重鎖可変領域ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３は、それぞれ、配列番号：２７、３３、および４４を含み、前記軽鎖可変領域ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３は、それぞれ、配列番号：５０、５２、および５４を含み；または
（ｉ）前記重鎖可変領域ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３は、それぞれ、配列番号：２７、３４、および４５を含み、前記軽鎖可変領域ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３は、それぞれ、配列番号：５０、５２、および５５を含み；
前記抗体は、ヒトＴＩＭ−３に特異的に結合する。
【０２５６】
ある実施態様において、本開示に有用な抗ＴＩＭ３抗体は、１３Ａ３、３Ｇ４、１７Ｃ３、１７Ｃ８、９Ｆ６、８Ｂ９、８Ｃ４、またはＴＩＭ３．２〜ＴＩＭ３．１８のいずれかの対応するするＣＤＲと１個、２個、３個、４個、５個、１〜２個、１〜３個、１〜４個、または１〜５個のアミノ酸変化（すなわち、アミノ酸置換、付加または欠失）において異なるＶＨ ＣＤＲ１、ＶＨ ＣＤＲ２、ＶＨ ＣＤＲ３、ＶＬ ＣＤＲ１、ＶＬ ＣＤＲ２、および／またはＶＬ ＣＤＲ３を含む。ある実施態様において、本開示に有用な抗ＴＩＭ３抗体は、１３Ａ３、３Ｇ４、１７Ｃ３、１７Ｃ８、９Ｆ６、８Ｂ９、８Ｃ４、またはＴＩＭ３．２〜ＴＩＭ３．１８のいずれかにおける対応する配列と比較して、ＣＤＲのそれぞれの１個、２個、３個、４個、５個、または６個において１〜５個のアミノ酸変化を含む。ある実施態様において、抗ＴＩＭ３抗体は、１３Ａ３、３Ｇ４、１７Ｃ３、１７Ｃ８、９Ｆ６、８Ｂ９、８Ｃ４、またはＴＩＭ３．２〜ＴＩＭ３．１８のいずれかにおけるＣＤＲと比較して、全てのＣＤＲにおける１〜５個の合計アミノ酸変化を含む。
【０２５７】
ある実施態様において、抗ＴＩＭ３抗体は、１３Ａ３のＶＨおよびＶＬ ＣＤＲからなるものを含むものであって、１つまたはそれ以上のＣＤＲにおけるアミノ酸のうちの１つまたはそれ以上が、他の本明細書に開示の抗ＴＩＭ３抗体のものである。
【０２５８】
例えば、ある実施態様において、抗ＴＩＭ３抗体は、SRSYYWG（配列番号：２３）と比較して１つまたはそれ以上のアミノ酸修飾を含むＶＨ ＣＤＲ１を含み、例えば、下記の縮重配列：Ｘ１Ｘ２Ｘ３Ｘ４ＹＸ５Ｘ６（配列番号：２１１）（式中、Ｘ１は、アミノ酸のいずれか、例えば、Ｓまたは非存在であり；Ｘ２は、アミノ酸のいずれか、例えば、Ｒまたは非存在であり；Ｘ３は、アミノ酸のいずれか、例えば、Ｓ、Ｒ、またはＤであり；Ｘ４は、アミノ酸のいずれか、例えば、ＹまたはＨであり；Ｘ５は、アミノ酸のいずれか、例えば、ＷまたはＭであり；ならびにＸ６は、アミノ酸のいずれか、例えば、Ｇ、Ｎ、Ｓ、またはＨである）を含みうる。
【０２５９】
ある実施態様において、抗ＴＩＭ３抗体は、SIYYSGFTYYNPSLKS（配列番号：２８）と比較して１つまたはそれ以上のアミノ酸改変を含むＶＨ ＣＤＲ２を含み、例えば、下記の縮重配列：Ｘ１ＩＸ２Ｘ３Ｘ４ＧＸ５Ｘ６Ｘ７Ｘ８ＹＸ９Ｘ１０Ｘ１１Ｘ１２Ｘ１３Ｘ１４（配列番号：２１２）（式中、Ｘ１は、アミノ酸のいずれか、例えば、Ｓ、Ｙ、Ｉ、またはＦであり；Ｘ２は、アミノ酸のいずれか、例えば、Ｙ、Ｈ、Ｎ、またはＳであり；Ｘ３は、アミノ酸のいずれか、例えば、Ｙ、Ｐ、Ｇ、Ｔ、またはＳであり；Ｘ４は、アミノ酸のいずれか、例えば、Ｓ、Ｔ、Ｒ、またはＧであり；Ｘ５は、アミノ酸のいずれか、例えば、Ｆ、Ｓ、またはＤであり；Ｘ６は、アミノ酸のいずれか、例えば、Ｓ、Ｔ、またはＩであり；Ｘ７は、アミノ酸のいずれか、例えば、Ｉまたは非存在であり；Ｘ８は、アミノ酸のいずれか、例えば、Ｙ、Ｎ、またはＩであり；Ｘ９は、アミノ酸のいずれか、例えば、Ｎ、Ｑ、Ｓ、またはＡであり；Ｘ１０は、アミノ酸のいずれか、例えば、Ｐ、Ｓ、Ｑ、またはＤであり；Ｘ１１は、アミノ酸のいずれか、例えば、ＳまたはＫであり；Ｘ１２は、アミノ酸のいずれか、例えば、Ｌ、Ｆ、またはＶであり；Ｘ１３は、アミノ酸のいずれか、例えば、ＫまたはＱであり；ならびにＸ１４は、アミノ酸のいずれか、例えば、ＳまたはＧである）を含みうる。
【０２６０】
ある実施態様において、抗ＴＩＭ３抗体は、GGPYGDYAHWFDP（配列番号：３９）と比較して１つまたはそれ以上のアミノ酸改変を含むＶＨ ＣＤＲ３を含み、例えば、下記の縮重配列：Ｘ１Ｘ２Ｘ３Ｘ４Ｘ５Ｘ６Ｘ７Ｘ８Ｘ９Ｘ１０ＹＧＸ１１Ｘ１２Ｘ１３Ｘ１４Ｘ１５Ｘ１６Ｘ１７Ｘ１８（配列番号：２１３）（式中、Ｘ１は、アミノ酸のいずれか、例えば、Ｄ、Ｅ、または非存在であり；Ｘ２は、アミノ酸のいずれか、例えば、Ｆ、Ｇ、または非存在であり；Ｘ３は、アミノ酸のいずれか、例えば、Ｙまたは非存在であり；Ｘ４は、アミノ酸のいずれか、例えば、Ｇ、Ｓ、または非存在であり；Ｘ５は、アミノ酸のいずれか、例えば、Ｇ、Ｔ、またはＳであり；Ｘ６は、アミノ酸のいずれか、例えば、ＧまたはＳであり；Ｘ７は、アミノ酸のいずれか、例えば、Ｎ、Ｗ、または非存在であり；Ｘ８は、アミノ酸のいずれか、例えば、Ｙ、Ｓ、Ｅ、または非存在であり；Ｘ９は、アミノ酸のいずれか、例えば、Ｙまたは非存在であり；Ｘ１０は、アミノ酸のいずれか、例えば、ＰまたはＹであり；Ｘ１１は、アミノ酸のいずれか、例えば、Ｄまたは非存在であり；Ｘ１２は、アミノ酸のいずれか、例えば、Ｙまたは非存在であり；Ｘ１３は、アミノ酸のいずれか、例えば、Ａまたは非存在であり；Ｘ１４は、アミノ酸のいずれか、例えば、Ｈまたは非存在であり；Ｘ１５は、アミノ酸のいずれか、例えば、Ｗまたは非存在であり；Ｘ１６は、アミノ酸のいずれか、例えば、ＦまたはＭであり；Ｘ１７は、アミノ酸のいずれか、例えば、ＤまたはＥであり；およびＸ１８は、アミノ酸のいずれか、例えば、Ｐ、Ｉ、Ｖ、Ｙ、またはＬである）を含みうる。
【０２６１】
本開示に適する抗ＴＩＭ３抗体のＶＨドメインまたはその１つまたはそれ以上のＣＤＲは、重鎖、例えば、全長重鎖を形成するために定常領域に連結することができる。同様に、本明細書に記載のＶＬドメインまたはその１つまたはそれ以上のＣＤＲは、軽鎖、例えば、全長軽鎖を形成するために定常領域に連結することができる。（適宜、Ｃ末端リジン（Ｋ）残基またはＣ末端グリシンおよびリジン（ＧＫ）残基を欠失していてもよい）全長重鎖および全長軽鎖が組み合わされて、全長抗体を形成する。
【０２６２】
抗ＴＩＭ３抗体のＶＨドメインは、例えば、本明細書でさらに記載されるように、天然に存在するか、改変されているヒトＩｇＧ（例えば、ＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３、またはＩｇＧ４）の定常領域に融合されうる。例えば、ＶＨドメインは、ヒトＩｇＧに融合された本明細書に記載のＶＨドメインのアミノ酸配列、例えば、ＩｇＧ１の定常領域、例えば、下記の野生型ヒトＩｇＧ１定常領域アミノ酸配列：
ASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK（配列番号：５８）
または配列番号：５８のアロタイプ変異型のアミノ酸配列を含み、下記アミノ酸配列：
【化１】
2020531854.tif 000002
を有しうる。
【０２６３】
抗ＴＩＭ３抗体のＶＨドメインは、エフェクターなしの定常領域に融合された本明細書に記載のＶＨドメインのアミノ酸配列、例えば、下記のエフェクターなしのヒトＩｇＧ１定常領域アミノ酸配列：
【化２】
2020531854.tif 000003
を含みうる。
【０２６４】
例えば、ＩｇＧ１のアロタイプ変異型は、配列番号：５９−６１に従って番号付けしているＫ９７Ｒ、Ｄ２３９Ｅ、および／またはＬ２４１Ｍ（上記の下線および太字）を含む。全長重鎖領域、例えば、８Ｃ４（配列番号：７０）内において、ＥＵナンバリングに従って、これらのアミノ酸置換は、Ｋ２１４Ｒ、Ｄ３５６Ｅ、およびＬ３５８Ｍと番号付けされる。ある実施態様において、抗ＴＩＭ３抗体の定常領域は、配列番号：５９−６１で番号付けられるアミノ酸Ｌ１１７、Ａ１１８、Ｇ１２０、Ａ２１３、およびＰ２１４（上記下線）、あるいはＥＵナンバリングに従うＬ２３４、Ａ２３５、Ｇ２３７、Ａ３３０、およびＰ３３１で１つまたはそれ以上の変異または置換を含みうる。さらなる実施態様において、抗ＴＩＭ３抗体の定常領域は、配列番号：５８のアミノ酸Ｌ１１７Ａ、Ａ１１８Ｅ、Ｇ１２０Ａ、Ａ２１３Ｓ、およびＰ２１４Ｓにおける１つまたはそれ以上の変異または置換、あるいはＥＵナンバリングに従うＬ２３４Ａ、Ｌ２３５Ｅ、Ｇ２３７Ａ、Ａ３３０Ｓ、およびＰ３３１Ｓを含む。抗ＴＩＭ３抗体の定常領域はまた、配列番号：５８の１つまたはそれ以上の変異または置換Ｌ１１７Ａ、Ａ１１８Ｅ、およびＧ１２０Ａ、あるいはＥＵナンバリングに従うＬ２３４Ａ、Ｌ２３５Ｅ、およびＧ２３７Ａを含みうる。
【０２６５】
あるいは、抗ＴＩＭ３抗体のＶＨドメインは、ヒトＩｇＧ４定常領域に融合された本明細書に記載のＶＨドメインのアミノ酸配列、例えば、下記のヒトＩｇＧ４アミノ酸配列またはその変異型を含みうる：
ASTKGPSVFPLAPCSRSTSESTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTKTYTCNVDHKPSNTKVDKRVESKYGPPCPSCPAPEFLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSQEDPEVQFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQFNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKGLPSSIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSQEEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSRLTVDKSRWQEGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSLGK（配列番号：６３（Ｓ２２８Ｐを含む））。
【０２６６】
抗ＴＩＭ３抗体のＶＬドメインは、ヒトカッパまたはラムダ軽鎖の定常領域に融合されうる。例えば、抗ＴＩＭ３抗体のＶＬドメインは、下記ヒトＩｇＧ１カッパ軽鎖アミノ酸配列に融合させた本明細書に記載のＶＬドメインのアミノ酸配列を含みうる：
RTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVＤＮＡLQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC（配列番号：６４）。
【０２６７】
ある実施態様において、抗ＴＩＭ３抗体の重鎖定常領域は、Ｃ末端にリジンまたは別のアミノ酸を含み、例えば、重鎖における下記の最後のアミノ酸：LSPGK（配列番号：６５）を含む。ある実施態様において、重鎖定常領域は、Ｃ末端で１つまたはそれ以上のアミノ酸を欠如しており、例えば、Ｃ末端配列LSPG（配列番号：６６）またはLSP（配列番号：６７）を有する。
【０２６８】
典型的な抗ＴＩＭ３抗体の重鎖および軽鎖のアミノ酸配列は、重鎖について配列番号：６８−１８９および軽鎖について配列番号：１９０−１９３を相当する。
【０２６９】
ある実施態様において、本開示に適する抗ＴＩＭ３抗体は：
（ａ１）配列番号：１３６（または１３７）および１９０をそれぞれ含む、重鎖および軽鎖配列；
（ａ２）配列番号：６８（または７５）および１９０をそれぞれ含む、重鎖および軽鎖配列；
（ａ３）配列番号：８２（または８９））および１９０をそれぞれ含む、重鎖および軽鎖配列；
（ａ４）配列番号：１３８（または１３９）および１９０をそれぞれ含む、重鎖および軽鎖配列；
（ａ５）配列番号：９６（または１０６）および１９０をそれぞれ含む、重鎖および軽鎖配列；
（ａ６）配列番号：１１６（または１２６）および１９０をそれぞれ含む、重鎖および軽鎖配列；
（ａ７）配列番号：１４０（または１４１）および１９０をそれぞれ含む、重鎖および軽鎖配列； 
（ａ８）配列番号：９７（または１０７）および１９０をそれぞれ含む、重鎖および軽鎖配列；
（ａ９）配列番号：１１７（または１２７）および１９０をそれぞれ含む、重鎖および軽鎖配列； 
（ａ１０）配列番号：１４２（または１４３）および１９０をそれぞれ含む、重鎖および軽鎖配列；
（ａ１１）配列番号：９８（または１０８）および１９０をそれぞれ含む、重鎖および軽鎖配列；
（ａ１２）配列番号：１１８（または１２８）および１９０をそれぞれ含む、重鎖および軽鎖配列；
（ａ１３）配列番号：１４４（または１４５）および１９０をそれぞれ含む、重鎖および軽鎖配列；
（ａ１４）配列番号：９９（または１０９）および１９０をそれぞれ含む、重鎖および軽鎖配列；
（ａ１５）配列番号：１１９（または１２９）および１９０をそれぞれ含む、重鎖および軽鎖配列；
（ａ１６）配列番号：１４６（または１４７）および１９０をそれぞれ含む、重鎖および軽鎖配列；
（ａ１７）配列番号：１００（または１１０）および１９０をそれぞれ含む、重鎖および軽鎖配列； 
（ａ１８）配列番号：１２０（または１３０）および１９０をそれぞれ含む、重鎖および軽鎖配列；
（ａ１９）配列番号：１４８（または１４９）および１９０をそれぞれ含む、重鎖および軽鎖配列； 
（ａ２０）配列番号：１０１（または１１１）および１９０をそれぞれ含む、重鎖および軽鎖配列；
（ａ２１）配列番号：１２１（または１３１）および１９０をそれぞれ含む、重鎖および軽鎖配列；
（ａ２２）配列番号：１５０（または１５１）および１９０をそれぞれ含む、重鎖および軽鎖配列；
（ａ２３）配列番号：１０２（または１１２）および１９０をそれぞれ含む、重鎖および軽鎖配列；
（ａ２４）配列番号：１２２（または１３２）および１９０をそれぞれ含む、重鎖および軽鎖配列；
（ａ２５）配列番号：１５２（または１５３）および１９０をそれぞれ含む、重鎖および軽鎖配列；
（ａ２６）配列番号：１０３（または１１３）および１９０をそれぞれ含む、重鎖および軽鎖配列；
（ａ２７）配列番号：１２３（または１３３）および１９０をそれぞれ含む、重鎖および軽鎖配列；
（ａ２８）配列番号：１５４（または１５５）および１９０をそれぞれ含む、重鎖および軽鎖配列；
（ａ２９）配列番号：１８４（または１８５）および１９０をそれぞれ含む、重鎖および軽鎖配列；
（ａ３０）配列番号：１８６（または１８７）および１９０をそれぞれ含む、重鎖および軽鎖配列；
（ａ３１）配列番号：１８８（または１８９）および１９０をそれぞれ含む、重鎖および軽鎖配列；
（ｂ１）配列番号：１５６（または１５７）および１９１をそれぞれ含む、重鎖および軽鎖配列；
（ｂ２）配列番号：６９（または７６）および１９１をそれぞれ含む、重鎖および軽鎖配列；
（ｂ３）配列番号：８３（または９０）および１９１をそれぞれ含む、重鎖および軽鎖配列；
（ｂ４）配列番号：１５８（または１５９）および１９１をそれぞれ含む、重鎖および軽鎖配列；
（ｂ５）配列番号：１０４（または１１４）および１９１をそれぞれ含む、重鎖および軽鎖配列；
（ｂ６）配列番号：１２４（または１３４）および１９１をそれぞれ含む、重鎖および軽鎖配列； 
（ｂ７）配列番号：１６０（または１６１）および１９１をそれぞれ含む、重鎖および軽鎖配列； 
（ｃ１）配列番号：１６２（または１６３）および１９１をそれぞれ含む、重鎖および軽鎖配列；
（ｃ２）配列番号：７０（または７７）および１９１をそれぞれ含む、重鎖および軽鎖配列；
（ｃ３）配列番号：８４（または９１）および１９１をそれぞれ含む、重鎖および軽鎖配列；
（ｃ４）配列番号：１６４（または１６５）および１９１をそれぞれ含む、重鎖および軽鎖配列；
（ｄ１）配列番号：１６６（または１６７）および１９０をそれぞれ含む、重鎖および軽鎖配列；
（ｄ２）配列番号：７１（または７８）および１９０をそれぞれ含む、重鎖および軽鎖配列；
（ｄ３）配列番号：８５（または９２）および１９０をそれぞれ含む、重鎖および軽鎖配列；
（ｄ４）配列番号：１６８（または１６９）および１９０をそれぞれ含む、重鎖および軽鎖配列；
（ｅ１．１）配列番号：１７０（または１７１）および1９２をそれぞれ含む、重鎖および軽鎖配列；
（ｅ１．２）配列番号：１７０（または１７１）および１９３をそれぞれ含む、重鎖および軽鎖配列；
（ｅ１．３）配列番号：１７０（または１７１）および１９１をそれぞれ含む、重鎖および軽鎖配列；
（ｅ２）配列番号：７２（または７９）および１９３をそれぞれ含む、重鎖および軽鎖配列；
（ｅ３）配列番号：８６（または９３）および１９３をそれぞれ含む、重鎖および軽鎖配列；
（ｅ４）配列番号：１７２（または１７３）および１９３をそれぞれ含む、重鎖および軽鎖配列；
（ｅ５）配列番号：１０５（または１１５）および１９３をそれぞれ含む、重鎖および軽鎖配列；
（ｅ６）配列番号：１２５（または１３５）および１９３をそれぞれ含む、重鎖および軽鎖配列；
（ｅ７）配列番号：１７４（または１７５）および１９３をそれぞれ含む、重鎖および軽鎖配列；
（ｆ１）配列番号：１７６（または１７７）および１９０をそれぞれ含む、重鎖および軽鎖配列；
（ｆ２）配列番号：７３（または８０）および１９０をそれぞれ含む、重鎖および軽鎖配列；
（ｆ３）配列番号：８７（または９４）および１９０をそれぞれ含む、重鎖および軽鎖配列；
（ｆ４）配列番号：１７８（または１７９）および１９０をそれぞれ含む、重鎖および軽鎖配列；
（ｇ１）配列番号：１８０（または１８１）および１９１をそれぞれ含む、重鎖および軽鎖配列；
（ｇ２）配列番号：７４（または８１）および１９１をそれぞれ含む、重鎖および軽鎖配列；
（ｇ３）配列番号：８８（または９５）および１９１をそれぞれ含む、重鎖および軽鎖配列；または
（ｇ４）配列番号：１８２（または１８３）および１９１をそれぞれ含む、重鎖および軽鎖配列を含むものであって、
前記抗体は、ヒトＴＩＭ−３に特異的に結合する。
【０２７０】
（例えば、前記段落における）本明細書に開示のＴＩＭ−３抗体重鎖配列をコードする核酸配列は、配列番号：２１４−２４１、２４７−２９１、２９４−２９７として供される。（例えば、前記段落における）本明細書に開示のＴＩＭ−３抗体の軽鎖配列をコードする核酸配列は、配列番号：２４２−２４６および２９９として供される。
【０２７１】
ある実施態様において、抗ＴＩＭ３抗体は、例えば、前記段落において本明細書で示される重鎖および軽鎖配列の組み合わせを含むものであって、前記抗体は、２つの重鎖および２つの軽鎖を含み、前記２つの重鎖をともに連結する少なくとも１つのジスルフィド結合をさらに含みうる。抗体はまた、軽鎖のそれぞれを前記重鎖のそれぞれに連結するジスルフィド結合を含みうる。
【０２７２】
他の実施態様において、抗ＴＩＭ３抗体は、ヒト抗体、ヒト化抗体、またはキメラ抗体である。ある実施態様において、抗ＴＩＭ３抗体は、立体構造エピトープに結合する。他の実施態様において、抗ＴＩＭ３抗体は、成熟ヒトＴＩＭ３細胞外ドメインのアミノ酸残基１−９９（配列番号：１９８）または（配列番号：１９４を有する）ヒトＴＩＭ３のアミノ酸２２〜１２０に対応する、成熟ヒトＴＩＭ３細胞外ドメインの下記領域内のアミノ酸残基（配列番号：１９８）：
SEVEYRAEVGQNAYLPCFYTPAAPGNLVPVCWGKGACPVFECGNVVLRTDERDVNYWTSRYWLNGDFRKGDVSLTIENVTLADSGIYCCRIQIPGIMND（配列番号：２０３）
に結合する。
【０２７３】
ある実施態様において、本明細書に記載の抗ＴＩＭ３抗体は、成熟ヒトＴＩＭ３細胞外ドメインのアミノ酸残基３７−４３（配列番号：１９８）に対応する、成熟ヒトＴＩＭ３細胞外ドメイン（配列番号：１９８）の下記領域：CPVFECG（配列番号：２００）内のアミノ酸残基に結合する。
【０２７４】
ある実施態様において、抗ＴＩＭ３抗体は、成熟ヒトＴＩＭ３細胞外ドメインのアミノ酸残基５７−８３（配列番号：１９８）に対応する、成熟ヒトＴＩＭ３細胞外ドメインの下記領域（配列番号：１９８）内のアミノ酸残基：WTSRYWLNGDFR（配列番号：２０１）に結合する。
【０２７５】
ある実施態様において、抗ＴＩＭ３抗体は、成熟ヒトＴＩＭ３細胞外ドメインのアミノ酸残基９０−９９（配列番号：１９８）に対応する、成熟ヒトＴＩＭ３細胞外ドメインの下記領域（配列番号：１９８）内のアミノ酸残基：RIQIPGIMND（配列番号：２０２）に結合する。
【０２７６】
ある実施態様において、抗ＴＩＭ３抗体は、野生型および変異型ヒトＴＩＭ３に対して、抗体１３Ａ３、３Ｇ４、１７Ｃ３、１７Ｃ８、９Ｆ６、８Ｂ９、８Ｃ４、およびＴＩＭ３．２〜ＴＩＭ３．１８のうちの１つまたはそれ以上と同一の結合パターンを有する。ある実施態様において、抗ＴＩＭ３抗体は、成熟ヒトＴＩＭ３細胞外ドメインの下記領域（配列番号：１９８）内のアミノ酸残基：CPVFECG（配列番号：２００）、WTSRYWLNGDFRKGDVSLTIENVTLAD（配列番号：２０１）、および／またはRIQIPGIMND（配列番号：２０２）に結合する。
【０２７７】
ある実施態様において、抗ＴＩＭ３抗体は、ＨＤＸ−ＭＳによって調べられるように、（１）４９VPVCWGKGACPVFE６２（配列番号：２０４）および１１１RIQIPGIMNDEKFNLKL１２７（配列番号：２０５）、あるいは（２）４０YTPAAPGNLVPVCWGKGACPVFE６２（配列番号：２０６）、６６VVLRTDERDVNY７７（配列番号：２０７）、７８WTSRYWLNGDFRKGDVSL９５（配列番号：２０８）、１１０CRIQIPGIMNDEKFNLKL１２７（配列番号：２０９）、および１１９NDEKFNLKL１２７（配列番号：２１０）に結合する。ある実施態様において、抗ＴＩＭ３抗体は、ＨＤＸ−ＭＳによって調べられるように、ｈＴＩＭ３のアミノ酸残基４０−６２および１１１−１２７の領域と相互作用するが、他の領域、例えば、Ｎ末端からアミノ酸残基Ｙ４０の領域、アミノ酸残基Ｅ６２とＲ１１１との間に位置する領域、およびＣ末端からアミノ酸残基Ｌ１２７の領域などとは有意に相互作用しない。
【０２７８】
ある実施態様において、抗ＴＩＭ３抗体は、野生型ヒトＴＩＭ−３への結合と比較して、（配列番号：１９４で番号付けされる）アミノ酸Ｌ４８、Ｃ５８、Ｐ５９、Ｖ６０、Ｆ６１、Ｅ６２、Ｃ６３、Ｇ６４、Ｗ７８、Ｓ８０、Ｒ８１、Ｗ８３、Ｌ８４、Ｇ８６、Ｄ８７、Ｒ８９、Ｄ１０４、Ｒ１１１、Ｑ１１３、Ｇ１１６、Ｍ１１８、およびＤ１２０のうちの１つまたはそれ以上が別のアミノ酸に置換されているヒトＴＩＭ３に対する結合が減少し、前記抗体は、ＨＤＸ−ＭＳによって調べられるように、（１）４９VPVCWGKGACPVFE６２（配列番号：２０４）および１１１RIQIPGIMNDEKFNLKL１２７（配列番号：２０５）、あるいは（２）４０YTPAAPGNLVPVCWGKGACPVFE６２（配列番号：２０６）、６６VVLRTDERDVNY７７（配列番号：２０７）、７８WTSRYWLNGDFRKGDVSL９５（配列番号：２０８）、１１０CRIQIPGIMNDEKFNLKL１２７（配列番号：２０９）、および１１９NDEKFNLKL１２７（配列番号：２１０）に結合する。
【０２７９】
ある実施態様において、抗ＴＩＭ３抗体は、野生型および変異型ヒトＴＩＭ３に対して、ＴＩＭ３．１８．ＩｇＧ１．３または１３Ａ３と同様の結合パターンを有し、すなわち、前記抗体は：
（ｉ）ＨＤＸ−ＭＳによって調べられるように、（１）４９VPVCWGKGACPVFE６２（配列番号：２０４）、１１１RIQIPGIMNDEKFNLKL１２７（配列番号：２０５）、および１１９NDEKFNLKL１２７（配列番号：２１０）に結合するが、例えば、（ａ）アミノ酸残基４９のＮ末端に位置する配列を有するペプチド；（ｂ）アミノ酸残基６２と１１１との間に位置する配列（例えば、７８WTSRYWLNGDFRKGDVSL９５（配列番号：２０８））を有するペプチド；および（ｃ）アミノ酸残基１２７のＣ末端に位置する配列を有するペプチドに有意に結合せず；
（ｉｉ）例えば、酵母表面ディスプレイ法を用いて調べられるように、下記アミノ酸変異：（配列番号：１９４に従って番号付けられる）Ｃ５８、Ｐ５９、Ｆ６１、Ｅ６２、Ｃ６３、Ｒ１１１、Ｄ１２０、適宜、Ｄ１０４およびＱ１１３のうちの１つまたはそれ以上を有するヒトＴＩＭ−３に結合しないか、または前記ヒトＴＩＭ−３への結合が有意に減少し；および／または
（ｉｉｉ）Ｘ線結晶構造解析によって調べられるように、ヒトＴＩＭ３の下記アミノ酸：（配列番号：１９４に従って番号付けられる）Ｐ５０、Ｖ５１、Ｃ５２、Ｐ５９、Ｖ６０、Ｆ６１、Ｅ６２、Ｃ６３、Ｇ６４、Ｎ６５、Ｖ６６、Ｖ６７、Ｌ６８、Ｒ６９、Ｄ７１、Ｅ７２、Ｄ７４、Ｒ１１１、Ｑ１１３、Ｇ１１６、Ｉ１１７、Ｍ１１８、Ｄ１２０、適宜、Ｔ７０および／またはＩ１１２のうちの少なくとも５個、１０個、１５個、２０個、または全てと相互作用する重鎖および／または軽鎖可変領域を有する。
【０２８０】
ある実施態様において、抗ＴＩＭ３抗体は、重鎖および軽鎖を含むものであって、前記重鎖は、配列番号：６８−１８９からなる群から選択され、前記軽鎖は、配列番号：１９０−１９３からなる群から選択される。
【０２８１】
本明細書でさらに記載されるように、本明細書に記載の抗ＴＩＭ３抗体の重鎖定常領域は、アイソタイプのいずれか、例えば、ＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３、およびＩｇＧ４、またはこれらの組み合わせおよび／または改変でありうる。抗ＴＩＭ３抗体は、エフェクター機能を有しうるか、または減少したエフェクター機能が減少しうるか、もしくはエファクター機能を有し得ない。ある実施態様において、抗ＴＩＭ３抗体は、前記抗体に向上した特性を供する改変された重鎖定常領域を含む。
【０２８２】
本明細書に記載の方法で用いることができるさらなるＴＩＭ−３アンタゴニストには、ＭＢＧ−４５３、ＴＳＲ−０２２、ＴＲＬ−６０６１、ＢＧＢＡ４２５、ＬＹ−３３２１３６７、およびいずれか他のＴＩＭ３阻害剤、例えば、抗体、ペプチド、小分子、および二特異性分子、例えば、二特異性抗体（例えば、抗ＴＩＭ３／抗ＰＤ−１二特異性分子）が含まれる。ＴＩＭ−３アンタゴニストは、例えば、ＷＯ２０１１／１５５６０７、ＷＯ２０１１／１５９８７７、ＷＯ２０１３／００６４９０、ＣＮ２０１０／４５９２３８８、ＷＯ２０１５／１０９９３１、ＷＯ２０１５／１１７００２、ＷＯ２０１６／０６８８０３、ＷＯ２０１６／０６８８０２、ＷＯ２０１６／０７１４４８、ＷＯ２０１６／１１１９４７、ＷＯ２０１６／１４４８０３、ＷＯ２０１６／１６１２７０、ＷＯ２０１７／０１９８９７、ＵＳ２０１７／００２９４８５、ＷＯ２０１７／０３１２４２、ＷＯ２０１７／０５５３９９、ＷＯ２０１７／０５５４０４、ＷＯ２０１７／０７９１１２、ＷＯ２０１７／０７９１１５、ＷＯ２０１７／０７９１１６、ＰＣＴ出願番号ＰＣＴ／ＵＳ２０１７／０４１９４６、および／またはＣＮ２０１０／６６３２６７５に記載されている。
【０２８３】
ＰＤ−１アンタゴニスト
１の態様において、本開示は、ＴＩＭ−３アンタゴニストをＰＤ−１アンタゴニストと組み合わせて使用する方法を特徴とする。本明細書で用いられるように、ＰＤ−１アンタゴニストには、以下に限定されないが、ＰＤ−１に結合する薬剤、ＰＤ−Ｌ１に結合する薬剤、およびＰＤ−Ｌ２に結合する薬剤が含まれる。ＰＤ−１に結合する薬剤には、ＰＤ−１に特異的に結合する抗体が含まれる。ＰＤ−Ｌ１およびＰＤ−Ｌ２に結合する薬剤には、ＰＤ−Ｌ１および／またはＰＤ−Ｌ２に特異的に結合する抗体、ならびにＰＤ−Ｌ１および／またはＰＤ−Ｌ２に結合する可溶性ＰＤ−１ポリペプチドが含まれる。
【０２８４】
抗ＰＤ−１抗体
本開示のある態様は、治療上の有効量の抗ＰＤ−１抗体またはその抗原結合部分を、それを必要とする対象に投与することを含む。高い親和性でＰＤ−１に特異的に結合するヒト抗体（ＨｕＭａｂ）は、米国特許第８，００８，４４９号に開示されている。他の抗ＰＤ−１ｍＡｂは、例えば、米国特許第６，８０８，７１０号、第７，４８８，８０２号、第８，１６８，７５７号、および第８，３５４，５０９号、ならびにＰＣＴ公開第ＷＯ ２０１２／１４５４９３号に記載されている。米国特許第８，００８，４４９号に開示の抗ＰＤ−１ ＨｕＭＡｂの各々は、下記特徴のうちの１つまたはそれ以上を有することが示されている：（ａ）Ｂｉａｃｏｒｅバイオセンサーシステムを用いて表面プラズモン共鳴によって示されるように、１ｘ１０−７Ｍまたはそれ以下のＫＤでヒトＰＤ−１に結合し；（ｂ）ヒトＣＤ２８、ＣＴＬＡ−４、またはＩＣＯＳに実質的に結合せず；（ｃ）混合リンパ球反応（ＭＬＲ）アッセイにおいてＴ細胞の増殖を増加し；（ｄ）ＭＬＲアッセイにおいてインターフェロン−γの産生を減少し；（ｅ）ＭＬＲアッセイにおいてＩＬ−２の分泌を増加し；（ｆ）ヒトＰＤ−１およびカニクイザルＰＤ−１に結合し；（ｇ）ＰＤ−Ｌ１および／またはＰＤ−Ｌ２のＰＤ−１に対する結合を阻害し；（ｈ）抗原特異的メモリー反応を活性化し；（ｉ）抗体応答を活性化し；および（ｊ）インビボで腫瘍細胞の増加を阻害する。本発明で用いることができる抗ＰＤ−１ Ａｂには、ヒトＰＤ−１に特異的に結合し、前記特徴の少なくとも１つ、ある実施態様において、少なくとも５つを示すｍＡｂが含まれる。ある実施態様において、前記抗ＰＤ−１抗体は、ニボルマブ（ＯＰＤＩＶＯ（登録商標））である。ある実施態様において、前記抗ＰＤ−１抗体は、ペムブロリズマブ（ＫＥＹＴＲＵＤＡ（登録商標））である。
【０２８５】
ある実施態様において、前記抗ＰＤ−１抗体は、ニボルマブである。ニボルマブ（「ＯＰＤＩＶＯ（登録商標）」としても公知であり；以前に５Ｃ４、ＢＭＳ−９３６５５８、ＭＤＸ−１１０６、またはＯＮＯ−４５３８とも称される）は、ＰＤ−１リガンド（ＰＤ−Ｌ１およびＰＤ−Ｌ２）との相互作用を選択的に阻害し、それにより抗腫瘍Ｔ細胞機能の下流調節を妨害する完全ヒトＩｇＧ４（Ｓ２２８Ｐ）ＰＤ−１免疫チェックポイント阻害抗体である（米国特許第８，００８，４４９号；Wang et al., 2014 Cancer Immunol Res. 2(9):846-56）。
【０２８６】
ある実施態様において、前記抗ＰＤ−１抗体は、ペムブロリズマブである。ペムブロリズマブ（「ＫＥＹＴＲＵＤＡ（登録商標）」、ランブロリズマブ、およびＭＫ−３４７５としても公知）は、ヒト細胞表面受容体ＰＤ−１（プログラム死−１またはプログラム細胞死−１）に対するヒト化モノクローナルＩｇＧ４抗体である。ペムブロリズマブは、例えば、米国特許第８，３５４，５０９号および第８，９００，５８７号に記載される；www.cancer.gov/drugdictionary?cdrid=695789を参照のこと（２０１４年１２月１４日に最終アクセス）。ペムブロリズマブは、再発性または難治性メラノーマの治療のためにＦＤＡによって認可されている。
【０２８７】
他の実施態様において、前記抗ＰＤ−１抗体またはその断片は、ＭＥＤＩ０６０８と交差競合する。さらなる他の実施態様において、前記抗ＰＤ−１抗体またはその断片は、ＭＥＤＩ０６０８と同一エピトープに結合する。ある実施態様において、前記抗ＰＤ−１抗体は、ＭＥＤＩ０６０８と同一ＣＤＲを有する。他の実施態様において、前記抗ＰＤ−１抗体は、モノクローナル抗体であるＭＥＤＩ０６０８（以前、ＡＭＰ−５１４）である。ＭＥＤＩ０６０８は、例えば、米国特許第８，６０９，０８９Ｂ２号に記載されている。
【０２８８】
ある実施態様において、前記ＰＤ−１アンタゴニストは、Ｂ７−ＤＣ Ｆｃ融合タンパク質のＡＭＰ−２２４である。ＡＭＰ−２２４は、米国公開第２０１３／００１７１９９号およびworldwideweb.cancer.gov/publications/dictionaries/cancer-drug?cdrid=700595（２０１５年７月８日に最終アクセス）に記載されている。
【０２８９】
ある実施態様において、前記抗ＰＤ−１抗体は、ヒト化モノクローナル抗体のＢＧＢ−Ａ３１７である。ＢＧＢ−Ａ３１７は、米国公開第２０１５／００７９１０９号に記載される。
【０２９０】
本開示方法で用いることができる抗ＰＤ−１抗体にはまた、ヒトＰＤ−１に特異的に結合し、ヒトＰＤ−１とニボルマブとの結合に交差競合する単離されたＡｂが含まれる（例えば、米国特許第８，００８，４４９号および第８，７７９，１０５号；ＷＯ２０１３／１７３２２３を参照のこと）。抗原への結合を交差競合するＡｂの能力は、これらのＡｂが、その抗原の同一エピトープ領域に結合し、他の交差競合するＡｂの特定のエピトープ領域への結合を立体障害することを示す。これらの交差競合Ａｂは、ＰＤ−１の同一エピトープ領域に対するそれらの結合により、ニボルマブと極めて類似する機能的な特徴を有することが期待される。交差競合するＡｂは、標準的なＰＤ−１結合アッセイ（例えば、Ｂｉａｃｏｒｅ分析、ＥＬＩＳＡアッセイ、またはフローサイトメトリー）においてニボルマブと交差競合するそれらの能力に基づいて容易に同定することができる（例えば、ＷＯ２０１３／１７３２２３を参照）。
【０２９１】
ある実施態様において、ヒトＰＤ−１抗体のニボルマブの同一エピトープ領域とヒトＰＤ−１への結合に交差競合し、または前記エピトープ領域に結合する抗体は、モノクローナル抗体である。ヒト対象への投与のために、これらの交差競合抗体は、キメラ抗体、またはヒト化もしくはヒトＡｂである。このようなキメラ、ヒト化、またはヒトモノクローナル抗体は、当該技術分野で周知の方法によって調製し、単離することができる。
【０２９２】
本開示の発明の方法で用いることができる抗ＰＤ−１抗体にはまた、上記抗体の抗原結合部分が含まれる。抗体の抗原結合機能は、全長抗体の断片によって達成することができることが示されている。抗体の用語「抗原結合部分」内に包含される結合断片の例として、（ｉ）Ｆａｂ断片（ＶＬ、ＶＨ、ＣＬ、およびＣＨ１ドメインからなる一価断片）；（ｉｉ）Ｆ（ａｂ’）２断片（ヒンジ領域でジスルフィド架橋によって連結された２つのＦａｂ断片を含む２価断片）；（ｉｉｉ）ＶＨおよびＣＨ１ドメインからなるＦｄ断片；および（ｉｖ）抗体の単一アームのＶＬおよびＶＨドメインからなるＦｖ断片が挙げられる。
【０２９３】
本開示の方法または組成物における使用に適する抗ＰＤ−１抗体は、高い特異性および親和性でＰＤ−１に結合し、ＰＤ−Ｌ１および／またはＰＤ−Ｌ２の結合を妨害し、ならびにＰＤ−１シグナル伝達経路の免疫抑制効果を阻害する抗体である。本明細書に開示の組成物または方法のいずれかにおいて、抗ＰＤ−１「抗体」には、ＰＤ−１受容体に結合し、リガンド結合を阻害し、免疫系を上流調節する際に全体抗体と同様の機能的な特徴を示す抗原結合部分または断片が含まれる。ある実施態様において、前記抗ＰＤ−１抗体またはその抗原結合部分は、ヒトＰＤ−１への結合についてニボルマブと交差競合する。他の実施態様において、前記抗ＰＤ−１抗体またはその抗原結合部分は、キメラ、ヒト化、またはヒトモノクローナル抗体、あるいはこれらの部分である。ある実施態様において、前記抗体は、ヒト化抗体である。他の実施態様において、前記抗体は、ヒト抗体である。ＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３、またはＩｇＧ４アイソタイプのＡｂが用いられうる。
【０２９４】
ある実施態様において、前記抗ＰＤ−１抗体またはその抗原結合部分は、ヒトＩｇＧ１またはＩｇＧ４アイソタイプの重鎖定常領域を含む。ある他の実施態様において、抗ＰＤ−１抗体またはその抗原結合部分のＩｇＧ４重鎖定常領域の配列は、ヒンジ領域におけるセリン残基を、ＩｇＧ１アイソタイプ抗体において対応する位置で通常見出されるプロリン残基で置換したＳ２２８Ｐ変異を含有する。ニボルマブに存在するこの変異は、野生型ＩｇＧ４抗体と関連するＦｃ受容体を活性化するための低親和性を維持しつつ、内在性ＩｇＧ４抗体によるＦａｂアーム交換を妨げる（Wang et al., 2014 Cancer Immunol Res. 2(9):846-56）。さらなる他の実施態様において、前記抗体は、ヒトカッパまたはラムダ定常領域である軽鎖定常領域を含む。他の実施態様において、前記抗ＰＤ−１抗体またはその抗原結合部分は、ｍＡｂまたはその抗原結合部分である。抗ＰＤ−１抗体の投与を含む本明細書に記載の治療方法のいずれかのある実施態様において、前記抗ＰＤ−１抗体は、ニボルマブである。他の実施態様において、前記抗ＰＤ−１抗体は、ペムブロリズマブである。他の実施態様において、前記抗ＰＤ−１抗体は、米国特許第８，００８，４４９号に記載のヒト抗体１７Ｄ８、２Ｄ３、４Ｈ１、４Ａ１１、７Ｄ３、および５Ｆ４から選択される。さらなる他の実施態様において、前記抗ＰＤ−１抗体は、ＭＥＤＩ０６０８（以前のＡＭＰ−５１４）、ＡＭＰ−２２４、ＰＤＲ００１、またはＢＧＢ−Ａ３１７である。
【０２９５】
抗ＰＤ−Ｌ１抗体
ある実施態様において、本方法で用いられる抗ＰＤ−１抗体は、別のＰＤ−１または抗ＰＤ−Ｌ１アンタゴニストで置き換えることができる。例えば、抗ＰＤ−Ｌ１抗体は、ＰＤ−１とＰＤ−Ｌ１との相互作用を阻害し、それによりＰＤ−１のシグナル伝達経路に対して同様の効果を発揮するため、抗ＰＤ−Ｌ１抗体は、本明細書に開示の方法における抗ＰＤ−１抗体の使用に置き換えることができる。それゆえ、本開示のある態様は、治療上の有効量の抗ＰＤ−Ｌ１抗体またはその抗原結合部分を、それを必要とする対象に投与することを含む。ある実施態様において、前記方法で有用な抗ＰＤ−Ｌ１抗体は、ＢＭＳ−９３６５５９（以前の１２Ａ４またはＭＤＸ−１１０５）である（例えば、米国特許第７，９４３，７４３号；ＷＯ２０１３／１７３２２３を参照のこと）。他の実施態様において、前記抗ＰＤ−Ｌ１抗体は、ＭＰＤＬ３２８０Ａ（ＲＧ７４４６としても公知）（例えば、Herbst et al. (2013) J Clin Oncol 31(suppl):3000. Abstract；米国特許第８，２１７，１４９号）、ＭＥＤＩ４７３６（デュルバルマブ（ＩＭＦＩＮＺＩ（登録商標）とも呼ばれる；Khleif (2013) In: Proceedings from the European Cancer Congress 2013; September 27-October 1, 2013; Amsterdam, The Netherlands）である。ある実施態様において、上記記載のＰＤ−Ｌ１抗体と同一のヒトＰＤ−Ｌ１のエピトープ領域との結合について交差競合し、または前記エピトープ領域に結合する抗体は、ｍＡｂである。ある実施態様において、前記抗ＰＤ−Ｌ１抗体またはその抗原結合部分は、ヒトＰＤ−Ｌ１への結合に対してＢＭＳ−９３６５５９、ＭＰＤＬ３２８０Ａ、ＭＥＤＩ４７３６、またはＭＳＢ００１０７１８Ｃとの結合において競合する。ヒト対象への投与のために、これらの交差競合抗体は、キメラ抗体であってもよく、またはヒト化もしくはヒト抗体であってもよい。このようなキメラ、ヒト化、またはヒトｍＡｂは、当該技術分野で周知の方法によって調製し、単離することができる。２０１４年５月６日出願の米国特許第８，７７９，１０８号または米国第２０１４／０３５６３５３を参照のこと）、またはＭＳＢ００１０７１８Ｃ（アベルマブ（ＢＡＶＥＮＣＩＯ（登録商標））とも呼ばれる）；ＵＳ２０１４／０３４１９１７を参照のこと）。ある実施態様において、前記抗ＰＤ−Ｌ１抗体またはその抗原結合部分は、ヒトＩｇＧ１またはＩｇＧ４アイソタイプの重鎖定常領域を含む。ある実施態様において、前記抗ＰＤ−Ｌ１抗体は、ＢＭＳ−９３６５５９である。ある実施態様において、前記抗ＰＤ−Ｌ１抗体は、ＭＰＤＬ３２８０Ａ（アテゾリズマブ（ＴＥＣＥＮＴＲＩＱ（登録商標）））である。ある実施態様において、前記抗ＰＤ−Ｌ１抗体は、ＭＥＤＩ４７３６（デュルバルマブ（ＩＭＦＩＮＺＩ（登録商標）））である。ある実施態様において、前記抗ＰＤ−Ｌ１抗体は、ＭＳＢ００１０７１８Ｃ（アベルマブ（ＢＡＶＥＮＣＩＯ（登録商標）））である。
【０２９６】
医薬組成物
ヒト患者への投与に適する医薬組成物は、典型的に、非経口投与のために、例えば、液体担体中に、あるいは静脈内投与のために液体溶液または懸濁液への再構成に適するように製剤化される。
【０２９７】
一般に、このような組成物は、典型的に、医薬的に許容される担体を含む。本明細書で用いられるように、用語「医薬的に許容される」は、動物、特にヒトにおける使用について、政府規制当局によって認可されること、または米国薬局方もしくは別の一般に認められる薬局方に記載されることを意味する。用語「担体」は、前記化合物が一緒に投与される希釈剤、補助剤、賦形剤、またはベヒクルを意味する。このような医薬担体は、石油、動物、植物、または合成に由来するもの、例えば、落花生油、大豆油、鉱油、ゴマ油、グリセロールポリエチレングリコールリシノレエートなどを含む、滅菌された液体（例えば、水および油）でありうる。水もしくは生理食塩水溶液およびデキストロース溶液およびグリセロール溶液は、特に、（例えば、ＴＩＭ−３アンタゴニストおよび／またはＰＤ−１アンタゴニストを含む）注射溶液のための担体として用いられうる。非経口投与のための液体組成物は、注射または持続注入による投与のために製剤化することができる。注射または注入による投与経路には、静脈内、腹腔内、筋肉内、くも膜下腔内、および皮下が含まれる。ある実施態様において、（例えば、別々の製剤において、または（同一の製剤または別々の製剤で）一緒に）前記ＴＩＭ−３アンタゴニストおよびＰＤ−１アンタゴニストは、静脈内に投与される。
【０２９８】
患者集団
本明細書に開示の免疫療法、例えば、ＴＩＭ−３アンタゴニスト（例えば、抗ＴＩＭ３抗体）を単独で、または別の免疫チェックポイント阻害剤（例えば、抗ＰＤ−１抗体）と組み合わせて使用するヒト患者における癌を治療するための臨床的な方法が本明細書で提供される。
【０２９９】
本発明の方法を用いて治療されうる癌の例として、肝臓癌、肝細胞癌（ＨＣＣ）、骨癌、膵臓癌、皮膚癌、口腔癌、頭頸部癌、乳癌、肺癌、小細胞肺癌、ＮＳＣＬＣ、皮膚もしくは眼球内悪性メラノーマ、腎臓癌、子宮癌、卵巣癌、結腸直腸癌、大腸癌、直腸癌、肛門部の癌、胃癌、精巣癌、子宮癌、卵管癌、子宮内膜の癌、子宮頚癌、膣癌、外陰癌、頭頚部扁平上皮癌（ＳＣＣＨＮ）、非ホジキンリンパ腫、食道癌、小腸癌、内分泌系の癌、甲状腺癌、副甲状腺癌、副腎の癌、軟部肉腫、尿道癌、陰茎癌、小児期の固形腫瘍、リンパ球性リンパ腫、膀胱癌、腎臓もしくは尿管癌、腎盂腎癌、中枢神経系（ＣＮＳ）の腫瘍、原発性ＣＮＳリンパ腫、腫瘍血管新生、軸椎腫瘍、脳幹神経膠腫、下垂体腺腫、カポジ肉腫、類表皮癌、扁平上皮癌、環境で誘発される癌（アスベストにより誘発される癌を含む）、血液悪性腫瘍（例えば、多発性骨髄腫、Ｂ細胞リンパ腫、ホジキンリンパ腫／縦隔原発Ｂ細胞リンパ腫、非ホジキンリンパ腫、急性骨髄性リンパ腫、慢性骨髄性白血病、慢性リンパ系白血病、濾胞性リンパ腫、びまん性大細胞型Ｂ細胞リンパ腫、バーキットリンパ腫、免疫芽球性大細胞型リンパ腫、前駆Ｂリンパ芽球性リンパ腫、マントル細胞リンパ腫、急性リンパ芽球性白血病、菌状息肉症、未分化大細胞リンパ腫、Ｔ細胞リンパ腫、および前駆Ｔリンパ芽球性リンパ腫を含む）、および前記癌のいずれかの組み合わせが挙げられる。本発明はまた、転移性癌の治療に適用することができる。
【０３００】
ある実施態様において、対象は、免疫チェックポイント阻害剤による治療に難治性である癌に罹っている。ある実施態様において、対象は、ＰＤ−１アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ−１抗体または抗ＰＤ−Ｌ１抗体）による治療に難治性である癌に罹っている。ある実施態様において、前記癌は、固形腫瘍である。他の実施態様において、前記癌は、結腸、腎臓、または肺癌である。
【０３０１】
対象は、治療前、治療中、または治療後に上記に記載の臨床特性のうちの１つまたはそれ以上について試験し、または選択することができる。
【０３０２】
免疫療法
１の態様において、本明細書で供される免疫療法は、癌に罹っている対象を治療するためのＴＩＭ−３アンタゴニスト（例えば、抗ＴＩＭ３抗体）のみの投与、または別の免疫チェックポイント阻害剤（例えば、ＰＤ−１アンタゴニスト、例えば、抗ＰＤ−１抗体）と組み合わせた投与に関する。ある実施態様において、前記ＴＩＭ−３アンタゴニストは、本明細書に記載の抗ＴＩＭ３抗体である。ある実施態様において、前記ＰＤ−１アンタゴニストは、抗ＰＤ−１抗体ニボルマブである。ある実施態様において、投薬計画は、最適な所望される応答（例えば、有効な応答）を供するように調整される。
【０３０３】
本明細書で用いられるように、補助的または組み合わせ投与（共投与）には、同一または異なる製剤における化合物の同時投与、あるいは化合物の別々の投与（例えば、連続投与）が含まれる。よって、例えば、前記ＴＩＭ−３アンタゴニストおよびＰＤ−１アンタゴニストは、単一製剤で同時に投与することができる。あるいは、前記ＴＩＭ−３アンタゴニストおよびＰＤ−１アンタゴニストは、別々の投与のために製剤化することができ、同時にまたは連続して投与される（例えば、ある抗体は、第２の抗体の投与前の約３０分以内に投与される）。
【０３０４】
例えば、前記ＴＩＭ−３アンタゴニストが最初に投与され、次いで（例えば、直後に）ＰＤ−１アンタゴニストを投与することができ、その逆であってもよい。ある実施態様において、前記ＰＤ−１アンタゴニストは、前記ＴＩＭ−３アンタゴニストの投与前に投与される。ある実施態様において、前記ＰＤ−１アンタゴニストは、ＴＩＭ−３アンタゴニストの投与後に投与される。他の実施態様において、前記ＴＩＭ−３アンタゴニストおよびＰＤ−１アンタゴニストは、同時に投与される。このような同時または連続投与により、好ましくは、両方のアンタゴニストが治療される対象に同時に存在することとなる。
【０３０５】
下記の実施例は、例示のために供されるものであって、限定されるものではない。本出願を通して引用される全ての参考文献の内容は、出典明示により本明細書に取り込まれる。
【実施例】
【０３０６】
実施例１：癌患者に由来するＣＤ４およびＣＤ８Ｔリンパ球におけるＴＩＭ−３発現レベルの解析
ＴＩＭ−３発現を用いてＴＩＭ−３アンタゴニストによる治療に適する対象（例えば、ヒト癌患者）を同定するための適合性の評価を開始するために、新鮮な腫瘍組織および適合する末梢血試料を、肺、腎臓、または大腸癌に罹っている患者（Ｃｏｎｖｅｒｓａｎｔ Ｂｉｏ，ＭＴグループ，ベナロヤ）から取得し、解析のために研究室に運んだ。前記腫瘍組織および血液試料は、それぞれ、ＨｙｐｏＴｈｅｒｍｏｓｏｌ ＦＲＳ（ＢｉｏＬｉｆｅ Ｓｏｌｕｔｉｏｎｓ）およびＡＣＤ溶液Ａ（ＢＤ Ｂｉｏｓｃｉｅｎｃｅｓ）中において４℃で終夜運んだ。該試料を回収後２４時間以内に処理し、解析した。
【０３０７】
免疫表現型のための組織処理
腫瘍組織を、重量を測り、Ｍｉｌｔｅｎｙｉ分散キット（Ｍｉｌｔｅｎｙｉ，カタログ番号１３０−０９５−９２９）を用いて分散した。前記末梢血細胞を赤血球（ＲＢＣ）溶解緩衝液（ＢｉｏＬｅｇｅｎｄ，カタログ番号４２０３０１）で処理した。次いで、前記細胞懸濁液（腫瘍組織または末梢血に由来）を、ＨＢＳＳ（Ｃａ、Ｍｇを含まない）で２回洗浄し、ＮＩＲ生存色素（Ｌｉｆｅ ＴｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓによるＭｏｌｅｃｕｌａｒ Ｐｒｏｂｅｓ，カタログ番号Ｌ３４９７６）で染色し、ダルベッコリン酸緩衝生理食塩水（ｄＰＢＳ）中のヒトＡＢ血清でブロックし、次いで暗室中での氷上の４５分間のインキュベーションのために抗体混合物（下記表１を参照）を含有するウェルに加えた。続いて、該細胞をｄＰＢＳ／ＢＳＡ／アジ化Ｎａで２回洗浄し、固定し、次いでＦｏｘＰ３緩衝液キット（ＢｉｏＬｅｇｅｎｄ，カタログ番号４２１４０３）を用いて透過処理した。Ｆｌｕｏｒｅｓｃｅｎｃｅ ｍｉｎｕｓ ｏｎｅ（ＦＭＯ）コントロールを全ての抗体について調製し、陽性細胞集団を調べるために用いた。試料をＦｏｒｔｅｓｓａフローサイトメーター（ＢＤ Ｂｉｏｓｃｉｅｎｃｅｓ）を用いて取得し、データを、ＦｌｏｗＪｏソフトウェア（ＴｒｅｅＳｔａｒ）を用いて解析した。
【０３０８】
フローサイトメトリー分析のための抗体染色
表１（下記）に示されるように、１５カラーパネルを作出し、複数マーカーの発現を試験した（ＣＤ８＋およびＣＤ４＋Ｔ細胞におけるＴＩＭ−３発現に着目した）。
表１：Ｔ細胞分画の免疫蛍光染色に用いられる抗体
【表１】
2020531854.tif 000004
【０３０９】
表２（下記）ならびに図１Ａおよび１Ｂに示されるように、極めて少ないＣＤ４＋およびＣＤ８＋Ｔ細胞が、健常な対象および癌患者の両者の全血においてＴＩＭ３を発現した。ＴＩＭ３＋ＣＤ４＋の頻度は、腫瘍タイプに関して差異があまりなく、全血と比較してＴＩＬでわずかに高かった（図２Ａおよび２Ｂを参照）。ＣＤ４＋Ｔ細胞と比較して、腫瘍タイプにより９．９〜２１％の範囲内の平均頻度において、ＣＤ８＋Ｔ細胞の高い割合がＴＩＭ３＋であった。ＲＣＣおよびより低い程度のＣＲＣは、一般に、肺癌患者より高い頻度のＴＩＭ３＋ＣＤ８Ｔ細胞を示した。表３（下記）および図２Ａおよび２Ｂを参照のこと。
表２：健常なドナーおよび癌に罹っている患者に由来する末梢血試料におけるＴＩＭ３＋ＣＤ４＋およびＴＩＭ３＋ＣＤ８＋Ｔ細胞の平均頻度±ＳＤ
【表２】
2020531854.tif 000005
略語：Ｎ：試料数；ＳＤ：標準偏差；ＲＣＣ：腎細胞癌；ＣＲＣ；結腸直腸癌
【０３１０】
ＴＩＭ３発現に加え、ＰＤ−１発現はまた、上記に記載のＴＩＬにおいて評価した。表３（下記）ならびに図２Ｃおよび２Ｄに示されるように、ＴＩＭ３＋細胞によるＰＤ−１の共発現は、患者により大きく変動し、より高い頻度のＴＩＭ３＋ＣＤ８＋Ｔ細胞（すなわち、少なくとも８％（３つの癌タイプ全てに関するＴＩＭ−３＋ＣＤ８＋Ｔ細胞の中央％を示した））を有する患者は、より低い頻度のＴＩＭ３＋ＣＤ８＋Ｔ細胞を有する患者と比較してＰＤ−１によるより高い共発現を示した（図２Ｅを参照のこと、マン・ホイットニーによるｐ＜０．０００１）。
表３：癌に罹っている患者に由来するＴＩＬにおけるＴＩＭ３＋およびＰＤ−１＋ＴＩＭ３＋ＣＤ４＋およびＣＤ８＋Ｔ細胞の平均頻度±ＳＤ
【表３】
2020531854.tif 000006
略語：ＳＤ：標準偏差；ＴＩＬ：腫瘍浸潤リンパ球；ＲＣＣ：腎細胞癌；ＣＲＣ：結腸直腸癌；Ｎ：試料数
【０３１１】
実施例２：異なるＴ細胞分画におけるＴＩＭ−３発現解析
異なるＴ細胞分画におけるＴＩＭ−３発現を評価するために、新鮮な腫瘍組織および適合する末梢血試料を、様々な癌タイプに罹っている患者（ＭＴグループ ＣＩＮＪ）（腎細胞癌（ｎ＝１６）、結腸直腸（ｎ＝２）、肝臓（ｎ＝２）、子宮（ｎ＝３）、肺（ｎ＝１）、卵巣（ｎ＝１）、胃（ｎ＝１）、および胃腸（ｎ＝１））から取得した。前記腫瘍組織および血液試料は、それぞれ、ＨｙｐｏＴｈｅｒｍｏｓｏｌ ＦＲＳ（ＢｉｏＬｉｆｅ Ｓｏｌｕｔｉｏｎｓ）およびＡＣＤ溶液Ａ（ＢＤ Ｂｉｏｓｃｉｅｎｃｅｓ）中において４℃で終夜運んだ。該試料を回収後２４時間以内に処理し、解析した。
【０３１２】
免疫表現型のための組織処理 
腫瘍組織を、重量を測り、コラゲナーゼＩ、ＩＩ、ＩＶ、およびＤＮＡアーゼＩの弱い混合物を用いて分散し、続いてフィコール分離を行った。末梢白血球を、沈殿緩衝液（Ｍｉｌｔｅｎｙｉ Ｂｉｏｔｅｃｈ）を用いて赤血球から分離した。細胞懸濁液（腫瘍組織または末梢血に由来）をリン酸緩衝生理食塩水（ＰＢＳ）（カルシウムおよびマグネシウムを含まない）で２回洗浄し、近赤外（ＮＩＲ）生存色素（Ｌｉｆｅ ＴｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓによるＭｏｌｅｃｕｌａｒ Ｐｒｏｂｅｓ，カタログ番号Ｌ３４９７６）で染色した。Ｆｃ受容体を、「ＦＡＣＳ緩衝液」（０．５％ ウシ胎児血清および０．１％ アジ化ナトリウムを含有するＰＢＳ）中のヒトガンマグロブリン（Ｊａｃｋｓｏｎ Ｉｍｍｕｎｏｒｅｓｅａｒｃｈ）またはマウスＩｇＧ血清（Ｓｉｇｍａ Ａｌｄｒｉｃｈ）でブロックし、次いで、試料を、４℃で暗室において４５分間で様々な抗体混合物（表１、２、３、４を参照）で染色した。続いて、該細胞をＦＡＣＳ緩衝液で２回洗浄し、次いでＦＡＣＳ溶解溶液（ＢＤ Ｂｉｏｓｃｉｅｎｃｅｓ，カタログ番号３４９２０２）で固定した。Ｆｌｕｏｒｅｓｃｅｎｃｅ ｍｉｎｕｓ ｏｎｅ（ＦＭＯ）コントロールを抗体の一部について調製し、陽性細胞集団を調べるために用いた。試料をＦｏｒｔｅｓｓａフローサイトメーター（ＢＤ Ｂｉｏｓｃｉｅｎｃｅｓ）を用いて取得し、データを、ＦｌｏｗＪｏソフトウェア（ＴｒｅｅＳｔａｒ）を用いて解析した。
【０３１３】
フローサイトメトリー分析のための抗体染色
異なるＴ細胞分画におけるＴＩＭ−３発現を評価するために、上記からの処理した細胞を表４（下記）に記載の抗体混合物で染色した。ゲート法（gating strategy）の代表的な例を図３Ａに示す：ＣＣＲ７＋ＣＤ４５ＲＯ−（「ナイーブ」）、ＣＣＲ７＋ＣＤ４５ＲＯ＋（「セントラルメモリー」）、ＣＣＲ７−ＣＤ４５ＲＯ＋（「エフェクターメモリー」）、およびＣＣＲ７−ＣＤ４５ＲＯ−（「エフェクター」）。ＴＩＬにおけるこれらの分画の平均頻度を表５（下記）に記載する。
表４：Ｔ細胞分画におけるＴＩＭ−３発現解析のための抗体パネル
【表４】
2020531854.tif 000007
【０３１４】
図３Ｂに示されるように、ＴＩＭ３＋細胞の頻度は、Ｔ細胞分画および各患者の両方により変動し、一般的に、ＴＩＭ３を発現するエフェクターメモリーおよびエフェクターＣＤ４＋およびＣＤ８＋Ｔ細胞の割合がより高い傾向がある。ある患者においてＴＩＭ３を発現するエフェクターおよびエフェクターメモリーＴ細胞の割合が高いことは、ＴＩＭ−３阻害に応答したＴ細胞の反応の可能性を示す。さらに、前記データにより、癌に罹っている対象のＴＩＬにおけるＴＩＭ−３＋エフェクターおよび／またはＴＩＭ３＋エフェクターメモリーＴ細胞のより高い頻度は、前記対象がＴＩＭ−３アンタゴニスト（例えば、抗ＴＩＭ３抗体）による癌治療に応答するであろうことを示すことが示唆される。
【０３１５】
全血において、ＴＩＭ−３＋Ｔ細胞の頻度が極めて低いため、ＴＩＬおよび対応する全血の間におけるＴＩＭ３＋Ｔ細胞の頻度に有意な相関関係は存在しなかった（図３Ｃを参照）。
表５：ＣＤ４およびＣＤ８Ｔ細胞分画の平均頻度
【表５】
2020531854.tif 000008
【０３１６】
上記に加え、ＰＤ−１共発現を上記癌患者のＴＩＬにおいて評価した。実施例１で観察されるように、ＴＩＭ３＋ＣＤ８＋ＴＩＬの大半は、解析した試料の大半でＰＤ−１陽性であった（図４Ａおよび４Ｂを参照）。極めて少ないＣＤ８＋ＴＩＬは、ＴＩＭ−３＋ＰＤ−１−であり、前記試料の約半分において、ＰＤ１＋ＣＤ８＋ＴＩＬの大半はまた、ＴＩＭ−３発現陽性であった。この結果は、実施例１から結果と合わせて、例えば、ＴＩＭ−３＋ＰＤ−１＋である対象における癌を治療するためのＰＤ−１アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ−１抗体、例えば、ニボルマブ）とＴＩＭ−３アンタゴニストとの組み合わせの使用を支持するものである。
【０３１７】
実施例３：免疫細胞分画におけるＴＩＭ−３発現の解析
Ｔ細胞は、ＴＩＭ−３を発現する免疫細胞のみではないため、実施例２に記載の試料の一部に由来するＴＩＬから単離した骨髄性およびＮＫ細胞の両方もまた、ＴＩＭ−３発現について評価した。これらの免疫細胞分画を同定するために用いた抗体混合物を表６および７（下記）に記載する。
表６：骨髄細胞分画におけるＴＩＭ−３発現解析のための抗体パネル
【表６】
2020531854.tif 000009
表７：ＮＫ細胞におけるＴＩＭ−３発現解析のための抗体パネル
【表７】
2020531854.tif 000010
【０３１８】
図５Ａに示されるように、極めて少ないＣＤ１５＋顆粒球がＴＩＭ３を発現した。対照的に、ＴＩＭ３を発現する形質細胞様樹状細胞（ｐＤＣ）、骨髄性樹状細胞（ｍＤＣ）、およびＣＤ１４＋ＣＤ６４＋単球／マクロファージの頻度は、前記患者により変動し、その頻度は８０％またはそれ以上高くなった。ＴＩＭ３＋ＣＤ１６−ＣＤ５６＋およびＣＤ１６＋ＣＤ５６＋ＮＫ細胞分画の頻度はまた、患者により変動し、１５％〜９５％の範囲であった（図５Ｂ）。
【０３１９】
実施例４：血清中の可溶性ＴＩＭ−３発現の解析
健常な対象および癌患者の血清における可溶性ＴＩＭ−３発現を比較するために、２０人の正常な健常ボランティア、２０人の結腸、２０人の腎臓および２０人の肺癌患者に由来する凍結した血清試料を氷上で溶かし、商業的に入手可能なＥＬＩＳＡキット（Ｑｕａｎｔｉｋｉｎｅ ＥＬＩＳＡ，カタログ番号ＤＴＩＭ３０，Ｒ＆Ｄ Ｓｙｓｔｅｍｓ）を用いて可溶性ＴＩＭ−３の１：４希釈液で試験した。
【０３２０】
図６Ａおよび６Ｂに示されるように、癌患者における可溶性ＴＩＭ−３発現（ＴＩＭ３の可溶性アイソフォームおよび細胞膜から切断されたＴＩＭ３の両方を含む）は、健常なドナーで観察された発現より有意に高かった（正常に対する結腸および肺，ｐ＜０．０００１；正常に対する腎臓，ｐ＜０．０１、マン・ホイットニーのＵ検定）。このような結果は、可溶性ＴＩＭ−３レベルが、正常なコントロールに比較して癌患者の血清で増加することを示す。よって、可溶性ＴＩＭ−３は、層別化マーカーとして用いることができる。さらなる分析により、対応するＴＩＬ分画における可溶性ＴＩＭ−３発現とＴＩＭ−３発現レベルとの間の相関関係を調べる。
表８．
【表８】
2020531854.tif 000011
2020531854.tif 000012
2020531854.tif 000013
【０３２１】
2020531854.tif 000014
2020531854.tif 000015
2020531854.tif 000016
【０３２２】
2020531854.tif 000017
2020531854.tif 000018
2020531854.tif 000019
【０３２３】
2020531854.tif 000020
2020531854.tif 000021
2020531854.tif 000022
【０３２４】
2020531854.tif 000023
2020531854.tif 000024
2020531854.tif 000025
【０３２５】
2020531854.tif 000026
2020531854.tif 000027
2020531854.tif 000028
【０３２６】
2020531854.tif 000029
2020531854.tif 000030
2020531854.tif 000031
【０３２７】
2020531854.tif 000032
2020531854.tif 000033
2020531854.tif 000034
【０３２８】
2020531854.tif 000035
2020531854.tif 000036
2020531854.tif 000037
【０３２９】
2020531854.tif 000038
2020531854.tif 000039
2020531854.tif 000040
【０３３０】
2020531854.tif 000041
2020531854.tif 000042
2020531854.tif 000043
【０３３１】
2020531854.tif 000044
2020531854.tif 000045
2020531854.tif 000046
【０３３２】
2020531854.tif 000047
2020531854.tif 000048
2020531854.tif 000049
【０３３３】
2020531854.tif 000050
2020531854.tif 000051
2020531854.tif 000052
【０３３４】
2020531854.tif 000053
2020531854.tif 000054
2020531854.tif 000055
【０３３５】
2020531854.tif 000056
2020531854.tif 000057
2020531854.tif 000058
【０３３６】
2020531854.tif 000059
2020531854.tif 000060
2020531854.tif 000061
【０３３７】
2020531854.tif 000062
2020531854.tif 000063
2020531854.tif 000064
2020531854.tif 000065
【０３３８】
このＰＣＴ出願は、出典明示により本明細書に取り込まれる２０１７年８月２８日提出の米国仮出願第６２／５５１，１３７号の利益を請求する。
【図１】
2020531854.tif 000066
【図２−１】
2020531854.tif 000067
【図２−２】
2020531854.tif 000068
【図２−３】
2020531854.tif 000069
【図３】
2020531854.tif 000070
【図４】
2020531854.tif 000071
【図５】
2020531854.tif 000072
【図６】
2020531854.tif 000073
【配列表】
2020531854000001.app
【国際調査報告】
2020531854.tif 000074
2020531854.tif 000075
2020531854.tif 000076
2020531854.tif 000077
2020531854.tif 000078