【手続補正書】
【提出日】平成30年11月6日(2018.11.6)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
広汎性発達障害の調節因子を同定するための方法であって、
（１）前記広汎性発達障害に関連する細胞における複数の遺伝子の発現レベルを表す第１のデータセットを得ること；
（２）前記広汎性発達障害に関連する前記細胞の機能活性または細胞応答を表す第２のデータセットを得ること；
（３）プログラムされた計算システムを使用して、前記第１のデータセットおよび前記第２のデータセットに基づく、前記複数の遺伝子の前記発現レベルと前記機能活性または細胞応答とを関連付ける第１の因果関係ネットワークを生成すること；
（４）前記第１の因果関係ネットワークと対照細胞データに基づく第２の因果関係ネットワークからディファレンシャル因果関係ネットワークを生成すること；および
（５）前記生成ディファレンシャル因果関係ネットワークから前記広汎性発達障害にユニークな因果関係を同定し、ここで前記ユニークな因果関係に関連する遺伝子が前記広汎性発達障害の調節因子として同定されること
を含む、方法。
【請求項２】
前記第１の因果関係ネットワークは前記第１のデータセットおよび前記第２のデータセットにのみ基づいており、前記第１の因果関係ネットワークの生成は前記第１のデータセットおよび前記第２のデータセット以外のいかなる既知の生物学的関係にも基づかない、請求項１に記載の方法。
【請求項３】
前記広汎性発達障害が自閉症スペクトラム障害、レット症候群または小児期崩壊性障害である、請求項１に記載の方法。
【請求項４】
前記自閉症スペクトラム障害が自閉症、アスペルガー症候群または特定不能広汎性発達障害（ＰＤＤ−ＮＯＳ）である、請求項３に記載の方法。
【請求項５】
前記広汎性発達障害がアルツハイマー病である、請求項１に記載の方法。
【請求項６】
前記調節因子が前記広汎性発達障害を刺激または促進する、請求項１に記載の方法。
【請求項７】
前記調節因子が前記広汎性発達障害を阻害する、請求項１に記載の方法。
【請求項８】
前記対照細胞データが対照細胞における複数の遺伝子の発現レベルを表す第１の対照データセットおよび前記対照細胞の機能活性または細胞応答を表す第２の対照データセットを含み、かつ
前記方法が、工程（５）の前に、プログラムされた計算システムを使用して、前記第１の対照データセットおよび前記第２の対照データセットのみに基づく、前記複数の遺伝子の前記発現レベルと前記対照細胞の前記機能活性または細胞応答とを関連付ける前記第２の因果関係ネットワークを生成することをさらに含み、ここで前記第２の因果関係ネットワークの前記生成は前記第１の対照データセットおよび前記第２の対照データセット以外のいかなる既知の生物学的関係にも基づかない、請求項１に記載の方法。
【請求項９】
前記広汎性発達障害に関連する前記細胞が環境摂動に曝され、前記対照細胞データが得られる由来である対照細胞が前記環境摂動に曝されていない同一の細胞である、請求項１に記載の方法。
【請求項１０】
前記環境摂動が、薬剤との接触、培養条件の変更、遺伝子改変／突然変異の導入、および遺伝子改変／突然変異を引き起こす伝達体のうち１以上を含む、請求項９に記載の方法。
【請求項１１】
前記広汎性発達障害に関連する前記細胞が、前記広汎性発達障害に罹患している第１の被験体から得られる細胞であり、前記対照細胞データが得られる由来である対照細胞が、前記第１の被験体に遺伝的に関連していて前記広汎性発達障害に罹患していない第２の被験体に由来する細胞である、請求項１に記載の方法。
【請求項１２】
前記第１のディファレンシャル因果関係ネットワークと、前記広汎性発達障害に関連する細胞から得られるデータのみに基づいて生成される第２のディファレンシャル因果関係ネットワークとに基づくデルタ−デルタ因果関係ネットワークを生成することをさらに含む、請求項１１に記載の方法。
【請求項１３】
前記第２のディファレンシャル因果関係ネットワークが、前記第１の因果関係ネットワークと、環境摂動に曝される前記広汎性発達障害に関連する細胞に由来するデータに基づく第１の比較関係ネットワークとに基づく、請求項１２に記載の方法。
【請求項１４】
前記環境摂動が、薬剤との接触、培養条件の変更、遺伝子改変／突然変異の導入、および遺伝子改変／突然変異を引き起こす伝達体のうち１以上を含む、請求項１３に記載の方法。
【請求項１５】
前記第１のデータセットが前記複数の遺伝子のタンパク質および／またはｍＲＮＡ発現レベルを含む、請求項１に記載の方法。
【請求項１６】
前記第１のデータセットがリピドミクスデータ、メタボロミクスデータ、トランスクリプトミクスデータおよび一塩基多型（ＳＮＰ）データのうち１以上をさらに含む、請求項１に記載の方法。
【請求項１７】
前記第２のデータセットが生体エネルギー論的プロファイリング、細胞増殖、アポトーシス、オルガネラ機能、アデノシン三リン酸（ＡＴＰ）のレベル、反応性酸素種（ＲＯＳ）のレベル、酸化的リン酸化（ＯＸＰＨＯＳ）のレベル、酸素消費速度（ＯＣＲ）のレベルおよび細胞外酸性化速度（ＥＣＡＲ）のうち１以上の指標となるデータを含む、請求項１に記載の方法。
【請求項１８】
工程（４）が人工知能（ＡＩ）ベースのインフォマティクスプラットフォームにより行われる、請求項１に記載の方法。
【請求項１９】
前記ＡＩベースのインフォマティクスプラットフォームが、統計的カットオフ点を設けずに、第１のデータセットおよび第２のデータセットからの全データ入力を受け取る、請求項１８に記載の方法。
【請求項２０】
工程（４）が、
（ａ）前記第１のデータセットおよび前記第２のデータセットに基づくネットワークフラグメントのリストを生成すること（各ネットワークフラグメントは１以上の関係によってつながっている複数の変数を含む）；
（ｂ）トライアルネットワークのアンサンブルを生成すること（各トライアルネットワークはネットワークフラグメントのリストの異なるサブセットから構築される）；および
（ｃ）コンセンサス関係ネットワークである進化したトライアルネットワークのアンサンブルを生成するために、ローカル変換によって各トライアルネットワークを並行して進化させること
を含む、請求項１に記載の方法。
【請求項２１】
前記第１の因果関係ネットワーク内の１以上の因果関係に関する予測の信頼水準を得るために、前記第１の因果関係ネットワークが入力データに基づくｉｎ  ｓｉｌｉｃｏシミュレーションによって精密化され、ここで前記入力データは前記第１のデータセットおよび前記第２のデータセットにおける前記データの一部またはすべてを含む、請求項２０に記載の方法。
【請求項２２】
生物学的システムにおける前記同定されたユニークな因果関係をバリデートすることをさらに含む、請求項２０に記載の方法。
【請求項２３】
前記第１の因果関係ネットワークが前記第１のデータセットおよび前記第２のデータセットにのみ基づき、前記第１の因果関係ネットワークの生成は前記第１のデータセットおよび前記第２のデータセット以外のいかなる既知の生物学的関係にも基づかない、請求項２０に記載の方法。
【請求項２４】
前記第１のディファレンシャル因果関係ネットワークと、比較細胞から得られるデータに基づいて生成される第２のディファレンシャル因果関係ネットワークとに基づくデルタ−デルタ因果関係ネットワークを生成することをさらに含む、請求項１に記載の方法。
【請求項２５】
前記比較細胞が正常細胞である、請求項２４に記載の方法。
【請求項２６】
自閉症スペクトラム障害、アルツハイマー病、自閉症、アスペルガー症候群、レット症候群、小児期崩壊性障害、または特定不能広汎性発達障害（ＰＤＤ−ＮＯＳ）を含む広汎性発達障害の調節因子を同定するための方法であって、
（１）プログラムされた計算システムを使用して、広汎性発達障害に関連する細胞における複数の遺伝子の発現レベルを表す第１のデータセットと、前記広汎性発達障害に関連する前記細胞の機能活性または細胞応答を表す第２のデータセットとから第１の因果関係ネットワークを生成すること、
（２）前記第１の因果関係ネットワークと、対照細胞データに基づく第２の因果関係ネットワークとからディファレンシャル因果関係ネットワークを生成すること；および
（３）前記生成ディファレンシャル因果関係ネットワークから前記広汎性発達障害にユニークな因果関係を同定し、ここで前記ユニークな因果関係に関連する遺伝子が広汎性発達障害の調節因子として同定されること；
を含み、それによって前記広汎性発達障害の調節因子を同定する、方法。
【請求項２７】
前記第１の因果関係ネットワーク内の１以上の因果関係に関する予測の信頼水準を得るために、前記生成された第１の因果関係ネットワークが入力データに基づくｉｎ  ｓｉｌｉｃｏシミュレーションによって精密化される、請求項２６に記載の方法。
【請求項２８】
前記第１のディファレンシャル因果関係ネットワークと、比較細胞から得られるデータにのみ基づいて生成される第２のディファレンシャル因果関係ネットワークとに基づくデルタ−デルタ因果関係ネットワークを生成することをさらに含む、請求項２６に記載の方法。
【請求項２９】
前記第１の因果関係ネットワークを生成することが、
前記第１のデータセットおよび前記第２のデータセットに基づく１セットのネットワークフラグメントにおける各ネットワークフラグメントのベイジアン確率スコアを決定すること；
トライアルネットワークのアンサンブルを生成すること（各トライアルネットワークは前記セットのネットワークフラグメントの異なるサブセットから構築される）；ならびに
ローカル変換により各トライアルネットワークを進化させ、その結果としてコンセンサス関係ネットワークを形成する、進化したトライアルネットワークのアンサンブルを得ること
を含む、請求項１または請求項２６に記載の方法。
【請求項３０】
前記第１の因果関係ネットワークを生成することが、
他のノードへの影響を観察して前記コンセンサス関係ネットワークにおける各関係の方向性に関する情報を得ながら、前記コンセンサス関係ネットワークにおける各ノードにシミュレーションされた変動をかけること；および
前記コンセンサス関係ネットワークに、各関係の方向性に関する前記得られた情報を適用して前記第１の因果関係ネットワークを得ること
をさらに含む、請求項２９に記載の方法。
【請求項３１】
自閉症スペクトラム障害、アルツハイマー病、自閉症、アスペルガー症候群、レット症候群、小児期崩壊性障害、または特定不能広汎性発達障害（ＰＤＤ−ＮＯＳ）を含む広汎性発達障害の調節因子を同定するための方法であって、
（１）前記広汎性発達障害に関連する細胞を含む前記広汎性発達障害のモデルから生成された第１の因果関係ネットワークを提供すること、
（２）プログラムされた計算システムを使用して、前記第１の因果関係ネットワークと、対照細胞データに基づく第２の因果関係ネットワークとから第１のディファレンシャル因果関係ネットワークを生成すること；および
（３）前記第１のディファレンシャル因果関係ネットワークから前記広汎性発達障害にユニークな因果関係を同定し、ここで前記ユニークな因果関係に関連する遺伝子が前記広汎性発達障害の調節因子として同定されること
を含み、それによって前記広汎性発達障害の調節因子を同定する、方法。
【請求項３２】
前記第１の因果関係ネットワークが、前記広汎性発達障害の前記モデルから得られる第１のデータセットおよび第２のデータセットから生成され、ここで前記第１のデータセットは前記広汎性発達障害に関連する前記細胞における複数の遺伝子の発現レベルを表し、前記第２のデータセットは前記広汎性発達障害に関連する前記細胞の機能活性または細胞応答を表し、ここで前記第１の因果関係ネットワークの前記生成は前記第１のデータセットおよび前記第２のデータセット以外のいかなる既知の生物学的関係にも基づかない、
請求項３１に記載の方法。
【請求項３３】
前記第１の因果関係ネットワークが、ｉｎ  ｓｉｌｉｃｏシミュレーションによって得られる前記第１の因果関係ネットワーク内の１以上の因果関係に関する予測の信頼水準に関する情報を含む、請求項３１に記載の方法。
【請求項３４】
前記第１のディファレンシャル因果関係ネットワークと、比較細胞から得られるデータにのみ基づいて生成される第２のディファレンシャル因果関係ネットワークとに基づくデルタ−デルタ因果関係ネットワークを生成することをさらに含む、請求項３１に記載の方法。
【請求項３５】
前記第１の因果関係ネットワークおよび前記第２の因果関係ネットワークが両方ともベイジアンネットワークである、請求項１、２６および３１のいずれか一項に記載の方法。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０５５４
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０５５４】
均等論：
当業者ならば、慣例の実験だけを用いて、本明細書に記載の特定の実施形態および方法に対する多くの均等物を認識または確認することができるであろう。このような均等物は以下の特許請求の範囲に包含されるものとする。
本発明の実施形態として、例えば以下を挙げることができる。
[1]  被験体が広汎性発達障害に罹患しているかどうかを評価する方法であって、
（１）前記被験体から得られた生体サンプルにおいて、表２〜６に挙げられたマーカーのうち１以上の発現レベルを、前記マーカーを前記マーカーが検出できるように変換する試薬を用いて決定すること；
（２）前記被験体から得られた生体サンプルにおける１以上のマーカーの発現レベルを、対照サンプルにおける１以上のマーカーの発現レベルと比較すること；および
（３）前記被験体が広汎性発達障害に罹患しているかどうかを評価し、前記対照サンプルにおける１以上のマーカーの発現レベルに比べての、前記被験体から得られた生体サンプルにおける１以上のマーカーの発現レベルの変調が、前記被験体が広汎性発達障害に罹患しているという指標となること、
を含む、方法。
[2]  被験体が広汎性発達障害を発症する素因を持つかどうかを予測する方法であって、  （１）前記被験体から得られた生体サンプル中に存在する、表２〜６に挙げられたマーカーのうち１以上の発現レベルを、前記マーカーを前記マーカーが検出できるように変換する試薬を用いて決定すること；
（２）前記被験体から得られた生体サンプル中に存在する１以上のマーカーの発現レベルを、対照サンプル中に存在する１以上のマーカーの発現レベルと比較すること；および  （３）前記被験体が広汎性発達障害を発症する素因を持つかどうか予測し、前記対照サンプルにおける１以上のタンパク質の発現レベルに比べての、前記被験体から得られた生体サンプルにおける１以上のタンパク質の発現レベルの変調が、前記被験体が広汎性発達障害を発症する素因を持つという指標となること、
を含む、方法。
[3]  被験体において広汎性発達障害の重症度を予測する方法であって、
（１）前記被験体から得られた生体サンプルにおいて、表２〜６に挙げられたマーカーのうち１以上の発現レベルを、前記マーカーを前記マーカーが検出できるように変換する試薬を用いて決定すること；
（２）前記被験体から得られた生体サンプルにおける１以上のマーカーの発現レベルを、対照サンプルにおける１以上のマーカーの発現レベルと比較すること；および
（３）前記広汎性発達障害の重症度を評価し、前記対照サンプルにおける１以上のマーカーの発現レベルに比べての、前記被験体から得られた生体サンプルにおける１以上のマーカーの発現レベルの変調が、前記被験体における広汎性発達障害の重症度の指標となること
を含む、方法。
[4]  被験体において広汎性発達障害または広汎性発達障害の症状の進行をモニタリングするための方法であって、
（１）第１の時点で前記被験体から得られた第１の生体サンプル中に存在する、表２〜６に挙げられたマーカーのうち１以上の発現レベルを、前記マーカーを前記マーカーが検出できるように変換する試薬を用いて決定すること；
（２）その後の第２の時点で前記被験体から得られた第２の生体サンプル中に存在する、表２〜６に挙げられたマーカーのうち１以上の発現レベルを、前記マーカーを前記マーカーが検出できるように変換する試薬を用いて決定すること；および
（３）第１の時点で前記被験体から得られた第１のサンプル中に存在する、表２〜６に挙げられた１以上のマーカーの発現レベルを、その後の第２の時点で前記被験体から得られた第２のサンプル中に存在する１以上のマーカーの発現レベルと比較すること；および  （４）広汎性発達障害の進行をモニタリングし、第１のサンプルに比べて第２のサンプルにおける１以上のマーカーの発現レベルの変調が、前記被験体における広汎性発達障害または広汎性発達障害の症状の進行の指標となること
を含む、方法。
[5]  広汎性発達障害に罹患しているまたは広汎性発達障害を発症する素因を持つと同定された被験体のために治療計画を選択することをさらに含む、[1]〜[4]のいずれかに記載の方法。
[6]  広汎性発達障害に罹患しているまたは広汎性発達障害を発症する素因を持つと同定された被験体に治療計画を投与することをさらに含む、[1]〜[5]のいずれかに記載の方法。
[7]  広汎性発達障害の進行が軽減、遅延または緩和されると判定された被験体に対して実施中の治療計画の投与を継続することをさらに含む、[4]に記載の方法。
[8]  被験体において広汎性発達障害または広汎性発達障害の症状を治療するための治療計画の有効性を評価するための方法であって、
（１）前記被験体に治療計画の少なくとも一部を投与する前に被験体から得られた第１の生体サンプル中に存在する、表２〜６に挙げられたマーカーのうち１以上の発現レベルを、前記マーカーを前記マーカーが検出できるように変換する試薬を用いて決定すること；
（２）前記被験体に治療計画の少なくとも一部を投与した後に被験体から得られた第２の生体サンプル中に存在する、表２〜６に挙げられたマーカーのうち１以上の発現レベルを、前記マーカーを前記マーカーが検出できるように変換する試薬を用いて決定すること；
（３）前記被験体に治療計画の少なくとも一部を投与する前に被験体から得られた第１のサンプル中に存在する、表２〜６に挙げられた１以上のマーカーの発現レベルを、治療計画の少なくとも一部を投与した後に被験体から得られた第２のサンプル中に存在する前記１以上のマーカーの発現レベルと比較すること；および
（４）前記治療計画が広汎性発達障害または広汎性発達障害の症状を治療するために有効であるかどうかを評価し、第１のサンプルに比べての第２のサンプルにおける前記１以上のマーカーの発現レベルの変調が、前記治療計画が前記被験体における広汎性発達障害または広汎性発達障害の症状を治療するために有効であるという指標となること、
を含む、方法。
[9]  前記治療計画が広汎性発達障害または広汎性発達障害の症状を治療するために有効であると判定された被験体に対して治療計画の投与を継続すること、または前記治療計画が広汎性発達障害または広汎性発達障害の症状を治療するために有効でないと判定された被験体に対して治療計画の投与を中止することをさらに含む、[8]に記載の方法。
[10]  被験体において広汎性発達障害または広汎性発達障害の症状を治療するための化合物を同定する方法であって、
（１）生体サンプルと試験化合物を接触させること；
（２）前記生体サンプル中に存在する、表２〜６に挙げられた１以上のマーカーの発現レベルを決定すること；
（３）前記生体サンプルにおける１以上のマーカーの発現レベルを試験化合物に接触させていない対照サンプルのレベルと比較すること；および
（４）前記生体サンプルにおける１以上のマーカーの発現レベルを変調する試験化合物を選択し、
それにより、被験体において広汎性発達障害または広汎性発達障害の症状を治療するための化合物を同定すること
を含む、方法。
[11]  前記広汎性発達障害が自閉症スペクトラム障害である、[1]〜[10]のいずれかに記載の方法。
[12]  前記広汎性発達障害が自閉症障害である、[1]〜[10]のいずれかに記載の方法。
[13]  前記広汎性発達障害がアルツハイマー病である、[1]〜[10]のいずれかに記載の方法。
[14]  前記広汎性発達障害が自閉症およびアルツハイマー病である、[1]〜[10]のいずれかに記載の方法。
[15]  前記広汎性発達障害がアスペルガー症候群である、[1]〜[10]のいずれかに記載の方法。
[16]  前記広汎性発達障害が特定不能広汎性発達障害である、[1]〜[10]のいずれかに記載の方法。
[17]  前記被験体が広汎性発達障害に罹患している、[1]〜[10]のいずれかに記載の方法。
[18]  前記被験体が広汎性発達障害の亜症候群性発現を示す、[1]〜[10]のいずれかに記載の方法。
[19]  前記被験体が広汎性発達障害に罹患している疑いがある、または広汎性発達障害を発症する素因を持つ疑いがある、[1]〜[10]のいずれかに記載の方法。
[20]  前記１以上のマーカーの発現レベルが核酸レベルで決定される、[1]〜[19]のいずれかに記載の方法。
[21]  前記１以上のマーカーの発現レベルがＲＮＡを検出することにより決定される、[20]に記載の方法。
[22]  前記１以上のマーカーの発現レベルがｍＲＮＡ、ｍｉＲＮＡ、またはｈｎＲＮＡを検出することにより決定される、[20]に記載の方法。
[23]  前記１以上のマーカーの発現レベルがＤＮＡを検出することにより決定される、[20]に記載の方法。
[24]  前記１以上のマーカーの発現レベルがｃＤＮＡを検出することにより決定される、[20]に記載の方法。
[25]  前記１以上のマーカーの発現レベルが、ポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）増幅反応、逆転写酵素ＰＣＲ解析、定量的逆転写酵素ＰＣＲ解析、ノーザンブロット解析、ＲＮアーゼ保護アッセイ、デジタルＲＮＡ検出／定量、およびそれらの組合せまたは部分的組合せからなる群から選択される技術を使用することにより決定される、[20]に記載の方法。[26]  １以上のマーカーの発現レベルの決定が、抗体を用いてイムノアッセイを行うことを含む、[20]に記載の方法。
[27]  前記１以上のマーカーがタンパク質を含む、[1]〜[19]のいずれかに記載の方法。[28]  前記タンパク質が前記１以上のマーカーのうち少なくとも１つと結合する結合タンパク質を用いて検出される、[27]に記載の方法。
[29]  前記結合タンパク質が、前記タンパク質と特異的に結合する抗体またはその抗原結合フラグメントを含む、[27]に記載の方法。
[30]  前記抗体またはその抗原結合フラグメントが、マウス抗体、ヒト抗体、ヒト化抗体、二重特異性抗体、キメラ抗体、Ｆａｂ、Ｆａｂ'、Ｆ（ａｂ'）2、ｓｃＦｖ、ＳＭＩＰ、アフィボディ、アビマー、バーサボディ、ナノボディ、ドメイン抗体、および上記のいずれかの抗原結合フラグメントからなる群から選択される、[29]に記載の方法。
[31]  前記抗体またはその抗原結合フラグメントが標識を含む、[29]に記載の方法。
[32]  前記標識が放射性標識、ビオチン標識、発色団、蛍光団、および酵素からなる群から選択される、[31]に記載の方法。
[33]  前記１以上のマーカーのうち少なくとも１つの発現レベルが、イムノアッセイ、ウエスタンブロット解析、ラジオイムノアッセイ、免疫蛍光測定、免疫沈降、平衡透析、免疫拡散、電気化学発光イムノアッセイ（ＥＣＬＩＡ）、ＥＬＩＳＡアッセイ、ポリメラーゼ連鎖反応、免疫ポリメラーゼ連鎖反応、およびそれらの任意の組合せまたは部分的組合せからなる群から選択される技術を使用することにより決定される、[1]〜[32]のいずれかに記載の方法。
[34]  前記イムノアッセイが、電気化学発光、化学発光、蛍光化学発光、蛍光偏光、および時間分解蛍光からなる群から選択される溶液に基づくイムノアッセイを含む、[33]に記載の方法。
[35]  前記イムノアッセイが、電気化学発光、化学発光、および蛍光化学発光からなる群から選択されるサンドイッチイムノアッセイを含む、[33]に記載の方法。
[36]  前記サンプルが前記被験体から得られた流体またはその成分を含む、[1]〜[35]のいずれかに記載の方法。
[37]  前記流体が、血液、血清、滑液、リンパ液、血漿、尿、羊水、眼房水、硝子体液、胆汁、母乳、脳脊髄液、耳垢、乳び、嚢胞液、内リンパ液、糞便、胃酸、胃液、粘液、乳頭穿刺液、心膜液、外リンパ液、腹腔液、胸膜液、膿、唾液、皮脂、精液、汗、血清、痰、涙、膣分泌物、および生検から回収された流体からなる群から選択される、[36]に記載の方法。
[38]  前記サンプルが前記被験体から得られた組織もしくは細胞、またはそれらの成分を含む、[1]〜[37]のいずれかに記載の方法。
[39]  被験体において広汎性発達障害を治療する、その症状を緩和する、その進行を阻害する、または予防するための方法であって、それを必要とする被験体に、表２〜６に挙げられたマーカーのうち１以上を含む医薬組成物の治療上有効な量を投与することを含む、方法。
[40]  被験体において広汎性発達障害を治療する、その症状を緩和する、その進行を阻害する、または予防するための方法であって、それを必要とする被験体に、表２〜６に挙げられたマーカーのうち１以上の発現または活性を変調する薬剤を含む医薬組成物の治療上有効な量を投与することを含む、方法。
[41]  前記薬剤が表２〜６に挙げられたマーカーのうち１以上の発現または活性を阻害する、[40]に記載の方法。
[42]  前記薬剤が表２〜６に挙げられたマーカーのうち１以上の発現または活性を増強する、[40]に記載の方法。
[43]  表２〜６に挙げられたマーカーのうち１以上の発現または活性を変調する薬剤を同定する方法であって、
（１）前記１以上のマーカーと試験薬剤を接触させること、
（２）前記試験薬剤と接触させた１以上のマーカーの発現または活性を検出すること、  （３）前記試験薬剤と接触させた１以上のマーカーの発現または活性を、前記試験薬剤と接触させていない１以上のマーカーの発現または活性と比較すること、および
（４）前記１以上のマーカーの発現または活性を変調する薬剤を同定すること
を含む、方法。
[44]  前記薬剤が、表２〜６に挙げられた１以上のマーカーのうち少なくとも１つを下方調節する、[43]に記載の方法。
[45]  前記薬剤が、表２〜６に挙げられた１以上のマーカーのうち少なくとも１つを上方調節する、[44]に記載の方法。
[46]  被験体において広汎性発達障害を治療する、その症状を緩和する、その進行を阻害する、または予防するための方法であって、それを必要とする被験体に、[43]に記載の方法に従って同定された薬剤を含む医薬組成物の治療上有効な量を投与することを含む、方法。
[47]  前記被験体がヒト被験体である、[1]〜[46]のいずれかに記載の方法。