【手続補正書】
【提出日】平成30年3月1日(2018.3.1)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】請求項１１
【補正方法】変更
【補正の内容】
【請求項１１】
以下のポリヌクレオチド（Ｆ１）及び（Ｆ２）を含む請求項１０に記載のプライマーセット。
（Ｆ１）配列番号１８の塩基配列のうち塩基番号１から２７２５の塩基配列との同一性が９０％以上である塩基配列の少なくとも一部と特異的にハイブリダイズするポリヌクレオチド
（Ｆ２）配列番号１８の塩基配列のうち塩基番号６３４１から９５２９の塩基配列との同一性が９０％以上である塩基配列の少なくとも一部と特異的にハイブリダイズするポリヌクレオチド
【手続補正２】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】請求項１２
【補正方法】変更
【補正の内容】
【請求項１２】
配列番号８５に記載の塩基配列を含むポリヌクレオチド、配列番号８６に記載の塩基配列を含むポリヌクレオチド、配列番号５３に記載のポリヌクレオチドを含むポリヌクレオチド、配列番号５４に記載の塩基配列を含むポリヌクレオチド、配列番号８３に記載の塩基配列を含むポリヌクレオチド、配列番号８４に記載の塩基配列を含むポリヌクレオチド、配列番号８１に記載のポリヌクレオチドを含むポリヌクレオチド、配列番号８２に記載の塩基配列を含むポリヌクレオチド、配列番号１１に記載の塩基配列を含むポリヌクレオチド、配列番号１２に記載の塩基配列を含むポリヌクレオチド、配列番号９１に記載の塩基配列を含むポリヌクレオチド及び配列番号９２に記載の塩基配列を含むポリヌクレオチドからなる群より選ばれる２以上のポリヌクレオチドを含む請求項１０に記載のプライマーセット。
【手続補正３】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】請求項１７
【補正方法】変更
【補正の内容】
【請求項１７】
変異の有無の検出を請求項１０〜１２のいずれか一項に記載のプライマーセット、もしくは請求項１３に記載のキットを用いて行う、請求項１４〜１６のいずれか一項に記載の方法。
【手続補正４】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０００７
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０００７】
本発明は、以下の各発明を提供する：
〔１〕下記（ａ）または（ｂ）に示すタンパク質をコードするポリヌクレオチド。
（ａ）配列番号６から８のいずれかのアミノ酸配列を含むタンパク質
（ｂ）配列番号６から８のいずれかのアミノ酸配列と９０％以上の同一性を有し、かつ植物にポティウイルス抵抗性を付与できるタンパク質
〔２〕下記（ｃ）から（ｅ）のいずれかである請求項１に記載のポリヌクレオチド。
（ｃ）配列番号１から３のいずれかの塩基配列を含むＤＮＡ
（ｄ）配列番号１から３のいずれかの塩基配列と相補的な塩基配列からなるＤＮＡとストリンジェントな条件下でハイブリダイズし、かつ植物にポティウイルス抵抗性を付与できるタンパク質をコードするＤＮＡ
（ｅ）配列番号１から３のいずれかの塩基配列と９０％以上の同一性を有し、かつ植物にポティウイルス抵抗性を付与できるタンパク質をコードするＤＮＡ
〔３〕下記（ａ）または（ｂ）に示すタンパク質。
（ａ）配列番号６から８のいずれかのアミノ酸配列を含むタンパク質
（ｂ）配列番号６から８のいずれかのアミノ酸配列と９０％以上の同一性を有し、かつ植物にポティウイルス抵抗性を付与できるタンパク質
〔４〕〔１〕または〔２〕に記載のポリヌクレオチドを有するベクター。
〔５〕〔１〕または〔２〕に記載のポリヌクレオチドが導入されている形質転換体。
〔６〕植物である〔５〕に記載の形質転換体。
〔７〕植物が、双子葉植物である〔５〕に記載の形質転換体。
〔８〕〔１〕または〔２〕に記載のポリヌクレオチド、もしくは〔４〕に記載のベクターを植物細胞内に導入することを含む、ポティウイルス抵抗性が付与された形質転換植物の作製方法。
〔９〕下記（Ａ）〜（Ｆ）からなる群より選ばれる少なくとも１つであるポティウイルス抵抗性マーカー。
（Ａ）配列番号１８の塩基配列の塩基番号７８２の塩基のＳＮＰマーカー
（Ｂ）配列番号１８の塩基配列の塩基番号９７７の塩基のＳＮＰマーカー
（Ｃ）配列番号１８の塩基配列の塩基番号１３９１から１７３０の塩基配列のＳＳＲマーカー
（Ｄ）配列番号１８の塩基配列の塩基番号６５９４のＳＮＰマーカー
（Ｅ）配列番号１８の塩基配列の塩基番号７２７０のＳＮＰマーカー
（Ｆ）配列番号１８の塩基配列の塩基番号２００１から７５２９の塩基配列のＳＴＳマーカー
〔１０〕下記（Ａ）〜（Ｆ）からなる群より選ばれる少なくとも１つのＲｓｖ４遺伝子マーカーを検出し得る２以上のポリヌクレオチドから構成されるポティウイルス抵抗性検出用プライマーセット。
（Ａ）配列番号１８の塩基配列の塩基番号７８２の塩基のＳＮＰ
（Ｂ）配列番号１８の塩基配列の塩基番号９７７の塩基のＳＮＰ
（Ｃ）配列番号１８の塩基配列の塩基番号１３９１から１７３０の塩基配列のＳＳＲ
（Ｄ）配列番号１８の塩基配列の塩基番号６５９４のＳＮＰ
（Ｅ）配列番号１８の塩基配列の塩基番号７２７０のＳＮＰ
（Ｆ）配列番号１８の塩基配列の塩基番号２００１から７５２９の塩基配列のＳＴＳ
〔１１〕以下のポリヌクレオチド（Ｆ１）及び（Ｆ２）を含む〔１０〕に記載のプライマーセット。
（Ｆ１）配列番号１８の塩基配列のうち塩基番号１から２７２５の塩基配列との同一性が９０％以上である塩基配列の少なくとも一部と特異的にハイブリダイズするポリヌクレオチド
（Ｆ２）配列番号１８の塩基配列のうち塩基番号６３４１から９５２９の塩基配列との同一性が９０％以上である塩基配列の少なくとも一部と特異的にハイブリダイズするポリヌクレオチド
〔１２〕配列番号８５に記載の塩基配列を含むポリヌクレオチド、配列番号８６に記載の塩基配列を含むポリヌクレオチド、配列番号５３に記載のポリヌクレオチドを含むポリヌクレオチド、配列番号５４に記載の塩基配列を含むポリヌクレオチド、配列番号８３に記載の塩基配列を含むポリヌクレオチド、配列番号８４に記載の塩基配列を含むポリヌクレオチド、配列番号８１に記載のポリヌクレオチドを含むポリヌクレオチド、配列番号８２に記載の塩基配列を含むポリヌクレオチド、配列番号１１に記載の塩基配列を含むポリヌクレオチド、配列番号１２に記載の塩基配列を含むポリヌクレオチド、配列番号９１に記載の塩基配列を含むポリヌクレオチド及び配列番号９２に記載の塩基配列を含むポリヌクレオチドからなる群より選ばれる２以上のポリヌクレオチドを含む〔１０〕に記載のプライマーセット。
〔１３〕〔１０〕〜〔１２〕のいずれか一項に記載のプライマーセットを含むポティウイルス抵抗性検出用キット。
〔１４〕ダイズの核酸試料中の配列番号１３の塩基配列またはこれと９０％以上の同一性を有する塩基配列の挿入の有無を検出し、挿入がなければポティウイルスへの抵抗性ありと判断し、挿入があればポティウイルスへの抵抗性なしと判断する、ダイズのポティウイルス抵抗性の判定方法。
〔１５〕挿入位置が、配列番号４または５の塩基配列またはこれと９０％以上の同一性を有する塩基配列中１６９番目のアデニン及び１７０番目のグアニンの間である、〔１４〕に記載の方法。
〔１６〕ダイズの核酸試料中の配列番号１３の塩基配列またはこれと９０％以上の同一性を有する塩基配列の挿入の有無の検出は、〔９〕記載のマーカーのタイピングにより行う〔１４〕または〔１５〕に記載の方法。
〔１７〕変異の有無の検出を〔１０〕〜〔１２〕のいずれか一項に記載のプライマーセット、もしくは〔１３〕に記載のキットを用いて行う、〔１４〕〜〔１６〕のいずれか一項に記載の方法。
【手続補正５】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００２０
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００２０】
配列番号６のアミノ酸配列は、ダイズ品種Ｐｅｋｉｎｇから得たＲｓｖ４タンパク質のアミノ酸配列である。配列番号７のアミノ酸配列は、ダイズ品種ＢｙｏuｔｏｕＳｈｕｓｈｉｔｏｕ１から得たＲｓｖ４タンパク質のアミノ酸配列である。配列番号８のアミノ酸配列は、ダイズ品種Ｆｕｋｕｓｅｎｎａｒｉから得たＲｓｖ４タンパク質のアミノ酸配列である。よって、（ｂ）は（ａ）の変異体、誘導体、バリアントまたはホモログを意味している。