(57)【特許請求の範囲】
【請求項１】
１又はそれ以上の異種タンパク質をコードするＤＮＡ塩基配列に対して作動可能に連結されたｈｔｒＡプロモータ塩基配列を含んでなるＤＮＡ構造を有する弱毒化細菌、及び薬学的に許容し得る担体を含有することを特徴とするワクチン組成物。
【請求項２】
前記細菌がグラム陰性細菌であることを特徴とする請求項１に記載のワクチン組成物。
【請求項３】
前記細菌が、サルモネラ、ボルデテラ、ビブリオ、ヘモフィルス、ナイセリア及びエルジニアの各属から選ばれることを特徴とする請求項２に記載のワクチン組成物。
【請求項４】
前記細菌が、エンテロトキシン原性大腸菌、チフス菌、ネズミチフス菌、腸炎菌、豚コレラ菌、百日咳菌、インフルエンザ菌、淋菌及びエルジニアの各属から選ばれることを特徴とする請求項２に記載のワクチン組成物。
【請求項５】
ｈｔｒＡプロモータ塩基配列が、２以上のタンパク質からなる融合タンパクをコードするＤＮＡ塩基配列に対して作動可能に連結されていることを特徴とする請求項１から４の何れか１つに記載のワクチン組成物。
【請求項６】
融合しあっているタンパク質が可撓性のヒンジ領域によって連結されていることを特徴とする請求項５に記載のワクチン組成物。
【請求項７】
ヒンジ領域が、４個以上のアミノ酸からなり、次の配列で規定されるアミノ酸鎖であることを特徴とする請求項６に記載のワクチン組成物
−［Ｘ］ｐ−Ｐｒｏ−［Ｙ］ｑ−Ｐｒｏ−［Ｚ］ｒ−
ここで、Ｐｒｏはプロリン、ＸとＹはおのおの独立してグリシン又はかさばらない側鎖を有するアミノ酸、Ｚは何らかのアミノ酸、ｐは正の整数、ｑは１から１０までの正の整数、そしてｒは０又は０より大きな正の整数である。
【請求項８】
ｈｔｒＡプロモータが、第１及び第２の異種タンパク質をコードするＤＮＡ塩基配列に対して作動可能に連結されており、第１の異種タンパク質は、破傷風毒素フラグメントＣ又は１つ或いはそれ以上のそのエピトープを含む抗原性配列であることを特徴とするクレーム５、６又は７のいずれか１つに記載のワクチン組成物。
【請求項９】
経口投与用、又は経鼻腔内投与用に適合されたものであることを特徴とする請求項１から８の何れか１つに記載のワクチン組成物。
【請求項１０】
弱毒化細菌が、細菌の芳香族アミノ酸生合成経路に関する遺伝子中に非復帰突然変異を有することによって弱毒化されていることを特徴とする請求項１から９の何れか１つに記載のワクチン組成物。
【請求項１１】
弱毒化細菌が、ｈｔｒＡ遺伝子中に非復帰突然変異を付加的に有していることを特徴とする請求項１０に記載のワクチン組成物。
【請求項１２】
弱毒化細菌が、芳香族アミノ酸生合成経路に関する２つの異なった遺伝子のそれぞれに非復帰突然変異を内包していることを特徴とする請求項１０又は１１に記載のワクチン組成物。
【請求項１３】
前記芳香族アミノ酸生合成経路における前記遺伝子が、ａｒｏ−Ａ、ａｒｏ−Ｃ、ａｒｏ−Ｄ、及び、ａｒｏ−Ｅから選択されることを特徴とする請求項１０から１２の何れか１つに記載のワクチン組成物。
【請求項１４】
前記２つの異なった遺伝子は、ａｒｏ−Ａ及びａｒｏ−Ｄであることを特徴とする請求項１２に記載のワクチン組成物。
【発明の詳細な説明】
ＨＴＲＡ−プロモータを用いた弱毒化細菌における異種タンパク質の発現
本発明は、ＤＮＡ構造、そのＤＮＡ構造を含んでいる複製可能な発現ベクター、そのＤＮＡ構造を含んでいる弱毒化細菌、及びかかる弱毒化細菌を含んでいるワクチンに関する。
近年、細菌の芳香環生合成経路に関する遺伝子に非復帰突然変異を導入することによって弱毒化したサルモネラ菌株を基にした、新しい世代のサルモネラ経口生ワクチンが出現した。そのような菌株は、例えばＥＰ−Ａ−０３２２２３７に開示されている。上記サルモネラ経口生ワクチンは、ヒト及び動物のサルモネラ症用ワクチンとして有望であることを示しているが、それはまた、免疫系へ異種抗原を供給するためのキャリアとして効果的に使用することもできる。混合サルモネラワクチンは、ウィルス、細菌、及び寄生生物由来の抗原を供給するのに使用されて、遺伝子組み替え抗原に対する分泌性、体液性、及び細胞媒介性免疫応答を引き出した。混合サルモネラワクチンは、一回経口投与による多種ワクチン供給システムとしての大きな可能性を示す［C. Hormaeche et al, FEMS Symposium No. 63, Plenum, New York; pp 71-83, 1992］。
混合サルモネラワクチンを開発するに当たって克服すべき問題がある。主に考慮すべき点は、免疫応答を充分に誘発させ得るように、サルモネラワクチン中の遺伝子組み替え抗原について高レベルの形質発現を得ることである。しかしながら、高水準の異種抗原の発現が未調整のままだと、毒性を有し、また、細胞の生存能力に影響を及ぼす可能性があり［I. Charles and G. Dougan, TIBTECH 8, pp 117-21, 1990］、ワクチンを無効にし、又は組み替えＤＮＡを無駄にしてしまう。この問題に対して、いくつかの解決案、例えば、エッセンシャル遺伝子である”オン−オフ”プロモータを担持しているプラスミドからの形質発現、又はサルモネラ染色体への異種遺伝子の組み込み等が述べられている。
上記問題を克服するための別の取り組み方としては、イン  ビボで誘導することができるプロモータの使用があるだろう。そのようなプロモータの一つに、嫌気性条件下で誘導される大腸菌亜硝酸塩還元酵素のプロモータｎｉｒＢがある。我々が先に行った国際特許出願ＰＣＴ／ＧＢ９３／０１６１７には、ｎｉｒＢプロモータを含む構造を用いて形質転換した細菌を含有するワクチン組成物が記載されている。
本発明は、誘導可能な異種プロモータ、詳しくは、ストレス誘導タンパク質をコードするｈｔｒＡ遺伝子のためのプロモータを含んでいるＤＮＡ構造の調製に関する。
ｈｔｒＡ遺伝子は、K. Johnson et al, Mol. Microbios 1991; 5:401-7、及びそこで引用された文献に記載されており、４２℃を超える温度に反応して生産される熱ショックタンパク質をコードしている遺伝子の一例である。
従って、本発明の最初の局面は、１又はそれ以上の異種タンパクをコードするＤＮＡ塩基配列に対して作動可能に連結されたｈｔｒＡプロモータ塩基配列を含んでいるＤＮＡ構造を提供する。
その一態様として、本発明は、上記定義にかかるＤＮＡ構造であって、２以上の異種タンパクからなる融合タンパクをコードするＤＮＡ塩基配列に対して作動可能に連結されたｈｔｒＡプロモータ塩基配列を含んでいるものを提供する。
融合タンパクを構成しているタンパク質同士は、可撓性のヒンジ領域によって連結していてもよい。
本発明の他の局面は、第１及び第２の異種タンパクをコードするＤＮＡ塩基配列に対して作動可能に連結されたｈｔｒＡプロモータ塩基配列を含むＤＮＡ構造であって、その第１の異種タンパクが、破傷風毒素（テタヌストキシン）のフラグメントＣ或いは１又はそれ以上のそのエピトープを含む抗原性配列であるものを提供する。
本発明のさらに他の局面は、上記定義にかかるＤＮＡ構造を含んでいる複製可能な形質発現因子であって、細菌への利用に適したものを提供する。
本発明のさらに他の局面は、上記定義にかかる構造によって形質発現されており、好適には実質的に純粋な状態の融合タンパクを提供する。
本発明のさらに他の局面は、上記定義にかかるＤＮＡ構造を用いて弱毒化細菌を形質転換することを特徴とする弱毒化細菌の調製方法を提供する。
本発明のさらにまた別の局面は、上記定義にかかるＤＮＡ構造を含んでいる宿主細胞、例えば、そのような細菌細胞を提供する。そのＤＮＡ構造は、染色体の外にある状態、例えばプラスミドの中に存在していてもよく、あるいはそれ自体知られている方法により宿主（例えば細菌）の染色体中に組み込まれていてもよい。
さらに本発明は、上記定義にかかる弱毒化ワクチン又はそこから形質発現させた融合タンパクと、薬学的に許容し得る担体とを含有することを特徴とするワクチン組成物も提供する。
第１及び第２のタンパク質は、異種タンパク質であることが好ましく、ポリペプチド免疫原であることが特に好ましい。例えば、それらは、ウィルス、細菌、菌類、酵母、又は寄生生物に由来する抗原性配列であってもよい。特に、第１のタンパク質は、破傷風毒素のフラグメントＣ又はそのエピトープを含んでいる抗原性配列であることが好ましい。
第２のタンパク質は、病原性有機体の抗原決定群であることが好ましい。例えば、その抗原決定群は、ウィルス、細菌、菌類、酵母、又は寄生生物に由来する抗原性配列であってもよい。
第１及び／又は第２の異種タンパク質として用いられるウィルスの抗原性配列としては、例えば、ＨＩＶ−１やＨＩＶ−２のようなヒト免疫不全ウィルス（ＨＩＶ）のタイプ、ＨＩＶ−１やＨＩＶ−２のようなＨＩＶ由来のＣＤ４受容体結合部位、Ａ型、Ｂ型、又はＣ型肝炎ウィルス、タイプ２やタイプ１４のようなヒトのライノウィルス、単純ヘルペスウィルス、タイプ２やタイプ３のポリオウィルス、口蹄疫病ウィルス（ＦＭＤＶ）、狂犬病ウィルス、ロタウィルス、インフルエンザウィルス、コクサッキーウィルス、例えばタイプ１６パピローマウィルスのようなヒトのパピローマウィルス（ＨＰＶ）、それらのＥ７タンパク質、Ｅ７タンパク質又はそのエピトープを含んでいるフラグメント、そして、サル免疫不全ウィルス（ＳＩＶ）等に由来する配列がある。
細菌に由来する抗原の例としては、百日咳菌［Bordetella pertussis］（例えば、Ｐ６９タンパク質及び糸状赤血球凝集素（ＦＨＡ）抗原［filamentous haemagglutinin antigens］）、コレラ菌［Vibrio cholerae］、炭そ菌［Bacillus anthracis］、そして、大腸菌非耐熱性毒素Ｂサブユニット（ＬＴ−Ｂ）［E. coli heat Labile toxin B subunit］、大腸菌Ｋ８８抗原、エンテロトキシン原性大腸菌抗原［enterotoxigenic E. coli antigens］等の大腸菌抗原に由来するものがある。他の抗原の例としては、細胞表面抗原ＣＤ４、マンソン住血吸虫Ｐ２８グルタチオン  Ｓ−トランスフェラーゼ抗原（Ｐ２８抗原）［Schistoma mansoni P28 glutathione S-transferase antigens］、そして吸虫類、マイコプラスマ属、回虫類、条虫類、トラコーマクラミジア、マラリア寄生虫（例えば、熱帯熱マラリア原虫［Plasmodium falciparum］等のプラスモディウム属やバベシア属に属する寄生虫）の抗原があり、また、上記各抗原由来の免疫原エピトープをコードするペプチドなどがある。
好ましい抗原には、完全な長さのマンソン住血吸虫Ｐ２８、免疫原性Ｐ２８  ａａ  １１５−１３１ペプチド（これはＢ細胞及びＴ細胞エピトープを含む）のオリゴマー（例えば２分子、４分子、８分子からなるオリゴマー）、ヒトパピローマウィルスＥ７タンパク、単純ヘルペス抗原、口蹄疫病ウィルス抗原、サル免疫不全ウィルス抗原、例えばジフテリア毒素のガングリオシド結合領域のようなジフテリア毒素抗原が含まれる。
本願で用いられる際、ｈｔｒＡプロモータとは、かかるプロモータ自体、又は、その一部や誘導体であって、ある形質をコードしている塩基配列の発現をプロモートする能力を備えたものを意味する。好ましい塩基配列は、
0003731004.tif 000002
であり、これはｈｔｒＡプロモータを含んでいる。
本発明の構造においてＤＮＡ塩基配列は、２以上のタンパクからなり、隣接し合うそのタンパク同士がヒンジ領域によって区別される融合タンパク質をコードしていてもよい。ヒンジ領域とは、ドメイン間に空間的及び一時的な分離を生じさせることによって、第１及び第２の両タンパクとは関係の無い折り畳みが生じるように設計された領域である。
ヒンジ領域は、典型的には、アミノ酸のプロリン及び／又はグリシンを高い割合でコードしている配列である。ヒンジ領域は、アミノ酸のプロリン及び／又はグリシンで全てが構成されていてもよい。
ヒンジ領域は、グリシン−プロリンのジペプチド単位を１又はそれ以上含んでいてもよい。
このヒンジ領域は、例えば、アミノ酸を約１５個まで含んでいてもよく、例えば、少なくとも４個、好ましくは６〜１４個であって、第１及び第２のタンパク間に可撓性を与えるような数のアミノ酸を含ませることができる。
その一態様として、ヒンジ領域は、抗体イムノグロブリンのヒンジドメインと実質的に対応したものとすることができる。ＩｇＧ抗体のヒンジ領域は特にプロリンが豊富であり［T.E. Michaelson et al. J. Biol. Chem. 252, 883-9 1977］、抗原結合性ドメインと末端ドメインの間に柔軟な連結を生じさせると考えられている。
如何なる理論にも拘束される意図はないが、プロリンは、このアミノ酸の特徴である環状構造が、プロリン残基と隣接アミノ酸とを連結するペプチド結合のまわりでの回転を阻止することにより、ヒンジの剛直部分を形成すると考えられている。この性質は、プロリン残基とこれに隣接する残基が、整然としたアルファヘリックス構造やベータストランド構造になることを阻止すると考えられている。柔軟性は、非常に限られた立体化学的要求しか持っていない最も単純なアミノ酸であるグリシンにより与えられると考えられている。グリシンは、ヒンジ中の柔軟な関節として機能すると考えられている。他のアミノ酸、特にかさばる側鎖を有しないもの、例えばアラニン、セリン、アスパラギン、スレオニン等がグリシンと取って代わってもよい。
好ましい一態様において、ヒンジ領域は、４個以上のアミノ酸からなり、
−［Ｘ］ｐ−Ｐｒｏ−［Ｙ］ｑ−Ｐｒｏ−［Ｚ］ｒ−
の配列で定義されるアミノ酸鎖である。
ここで、Ｐｒｏはプロリン、ＸとＹはおのおの独立してグリシン又はかさばらない側鎖を有するアミノ酸、Ｚは何らかのアミノ酸、ｐは正の整数、ｑは１から１０までの正の整数、そしてｒは０又は０より大きな正の整数である。
ヒンジ領域は、第１及び第２の両タンパクとは異種の、はっきり区別できる領域とすることができる。また、ヒンジ領域は、第１タンパクのカルボキシ末端部又は第２タンパクのアミノ末端部によって規定することができる。
本発明は、最も好ましい局面において、ヒンジ領域によって連結された第１及び第２ポリペプチド免疫原をコードするＤＮＡ塩基配列に対して作動可能に連結されたｈｔｒＡプロモータを含んでいるＤＮＡ分子であって、第１ポリペプチド免疫原が破傷風毒素のフラグメントＣ又はそのエピトープを含むものを提供する。
本発明の別の好ましい局面においては、ヒンジ領域によって連結された第１及び第２ポリペプチド免疫原をコードするＤＮＡ塩基配列に対して作動可能に連結されたｈｔｒＡプロモータを含んでおり、細菌に利用するのに適しており、複製可能な形質発現ベクターであって、第１ポリペプチド免疫原が破傷風毒素のフラグメントＣ又はそのエピトープを含むものが提供される。
また別の局面において、本発明は、第１のタンパクをコードするＤＮＡに対して作動可能に連結されたｈｔｒＡプロモータを含んでおり、その３’末端からヒンジ領域をコードするＤＮＡ塩基配列が延在し、その下流に１又はそれ以上のエンドヌクレアーゼ制限部位があるＤＮＡ構造を提供する。
かかるタンパク質は、上記定義にかかる抗原性タンパクであることが好ましく、ＴｅｔＣフラグメント又はそのエピトープであるのが特に好ましい。
ヒンジ領域によって連結された第１及び第２の異種タンパクについての安定した形質発現は、イン  ビボにおいて得ることができる。異種タンパクは、弱毒化細菌内で形質発現させることができ、その弱毒化細菌はワクチンとして使用できる。
弱毒化細菌は、サルモネラ、ボルデテラ、ビブリオ、ヘモフィルス、ナイセリア、そしてエルジニアの各属から選んでよい。もしくは、弱毒化細菌は、エンテロトキシン原性大腸菌の弱毒化株であってもよい。好ましくは、次の各種を挙げることができる。：チフス菌［S. typhi］−ヒトチフスの原因；ネズミチフス菌［S. typhimurium］−いくつかの動物種でのサルモネラ症の原因；腸炎菌［S. enteritidis］−ヒト食中毒の原因；豚コレラ菌［S. choleraesuis］−豚のサルモネラ症の原因；百日咳菌［Bordetella pertussis］−百日咳菌の原因；インフルエンザ菌［Haemophilus influenzae］−髄膜炎の原因；淋菌［Neisseria gonorrhoeae］−淋病の原因；エルジニア［Yersinia］−食中毒の原因。
細菌の弱毒化は、細菌の芳香族アミノ酸生合成経路に関する遺伝子の非復帰突然変異に起因するものであってもよい。芳香族アミノ酸生合成経路の分岐点に位置する化合物であるコリスミ酸の合成にかかわる遺伝子は少なくとも１０個ある。これらのうちの幾つかは、細菌ゲノム上の広範に異なる位置に配列している。例えば、ａｒｏ−Ａ（５−エノールピルビルシキメート−３−フォスフェート  シンターゼ；５−enolpyruvylshikimate-3-phosphate synthase）、ａｒｏ−Ｃ（コリスメート  シンターゼ；chorismate synthase）、ａｒｏ−Ｄ（３−ジヒドロキネート  デヒドラターゼ；3-dihydroquinate dehydratase）、及び、ａｒｏ−Ｅ（シキメート  デヒドロゲナーゼ；shikimate dehydrogenase）等がそれである。従って、突然変異はａｒｏ−Ａ、ａｒｏ−Ｃ、ａｒｏ−Ｄ又はａｒｏ−Ｅ遺伝子に起こってもよい。
しかしながら、弱毒化細菌は、その芳香族アミノ酸生合成経路に関する２個の異なる遺伝子のそれぞれに非復帰突然変異を内包していることが好ましい。あるいは弱毒化細菌は、その芳香族アミノ酸生合成経路中の非復帰突然変異と、ｈｔｒＡ、ＯｍｐＲ又はＯｓｍＣのような調節遺伝子中の非復帰突然変異とを内包していることが好ましい。好適な弱毒化細菌の例は、例えば、ＥＰ−Ａ−０３２２２３７やＥＰ−Ａ−０４００９５８等に開示されている。
本発明にかかるＤＮＡ構造を含んでいる弱毒化細菌は、ワクチンとして使用することができる。また、細菌によって発現させた融合タンパク（好ましくは実質的に純粋な状態である）も、ワクチンの調製に使用することができる。例えば、精製されたＴｅｔＣ−Ｐ２８融合タンパクは、それ自体が免疫原性を有することが見出された。従って、本発明はさらなる局面において、薬学的に許容し得る担体又は希釈剤、及び活性成分として上記定義にかかる弱毒化細菌又は融合タンパクを含有することを特徴とするワクチン組成物を提供する。
ワクチンは１又はそれ以上の適当なアジュバントを含有していてもよい。
ワクチンは、患者に経口投与できるように凍結乾燥した状態、例えばカプセルに入った状態で提供すると有益である。そのようなカプセルは、腸溶性コーティング、例えばユードラジット”Ｓ”［Eudragit "S"］、ユードラジット”Ｌ”［Edragit "L"］、酢酸セルロース、酢酸フタル酸セルロース、又はヒドロキシプロピルメチルセルロース等を含有する腸溶性コーティングを備えていてもよい。これらのカプセル剤は、そのまま用いてもよいし、あるいは凍結乾燥材料を投与前に元に戻して、例えば懸濁剤として用いてもよい。有機体の生存率を確保するためには、適切なｐＨの緩衝液で戻すのが有利である。弱毒化細菌及びワクチンを過度の胃酸から保護するためには、各回のワクチン投与前に重炭酸ナトリウム剤を投与するのが有利である。あるいは、ワクチンは、注射投与用、鼻腔内投与用、又は哺乳動物投与用［intramammary administration］投与用に調製してもよい。
ワクチン組成物は、粘膜への供給用、例えば、経口投与、経鼻腔内投与、経気管支内投与等に適合させるのが好ましい。
本発明のＤＮＡ構造を含んでいる弱毒化細菌は予防又は宿主の治療に用いてもよい。宿主は、主にヒト宿主であるが、動物宿主であってもよい。従って、微生物とりわけ病原体に起因する感染症は、本発明による弱毒化細菌の有効量を投与することによって阻止される。そして、細菌は、異種タンパク又は微生物に対する抗体を上昇させ得るタンパクを発現する。適用量は、宿主の身長と体重、処方されたワクチンのタイプ、異種タンパクの性質等の様々な因子に依存するであろう。
本発明の弱毒化細菌は、弱毒化細菌を上記定義にかかるＤＮＡ構造を用いて形質転換することによって調製してもよい。あらゆる適切な形質転換手法を利用して差し支えなく、例えば、エレクトロポレーション［electroporation］を利用できる。このようにして、タンパクを発現し得る弱毒化細菌又はその細菌にとっては異種のタンパクが得られる。弱毒化細菌の培養菌は、好気性条件の下で生育させてもよい。すると、異種タンパクの発現をごく僅かに押さえたままで、ワクチンを処方するのに充分な量の細菌を調製することができる。
発現ベクターは、ｈｔｒＡプロモータ、転写終結部位、翻訳開始及び終止コドンを含む適切な転写及び翻訳調節要素を備えており、また、適切なリボソーム結合部位を備えている。ベクターは、典型的には複製起点を含んでおり、所望により抗生物質抵抗性遺伝子のような選択マーカー遺伝子を含む。ベクターは、例えばプラスミドであっても差し支えない。
本発明を以下の実験例と添付の図面を参照しつつ説明するが、本発明はこれらに限定されるわけではない。
ここで図１は、ｈｔｒＡプロモータを含んでいる、本発明の一局面にかかるプラスミドｐＨＴＲＡ１の構成を模式的に示す図である。
図２は、ｈｔｒＡプロモータ及びヒンジ領域に連結される破傷風毒素Ｃ−フラグメントをコードするＤＮＡを含んでいるプラスミドｐＨＴＲＡ２の構成を模式的に示す図である。
図３は、プラスミドｐＴＥＣＨ２の構造を説明したものである。
図４は、中間体プラスミドｐＢＤ９０７の構造を説明したものである。
図５は、図１に示された手順に従って調製されたプラスミドｐＨＴＲＡ１の構造を示したものである。
図６は、図２に示された手順に従って調製された生産物であるプラスミドｐＨＴＲＡ２の構造を示したものである。
図７Ａ乃至７Ｂは、プロモータｎｉｒＢ、ｇｒｏＥ及びｈｒｔＡに対する温度変化の影響を説明したものである。
図８は、マクロファージ内におけるｈｔｒＡ、ｎｉｒＢ及びｇｒｏＥからのｌａｃＺの発現を示したものである。
実験例  １
ｈｔｒＡ−ＴｅｔＣ−ヒンジ構造の調製
図１からわかるように、ｈｔｒＡプロモータと破傷風毒素Ｃフラグメントをコードする遺伝子とを含んでいるベクターを調製するための出発材料は、プラスミドｐＴＥＴｎｉｒ１５であった。その構造と調製方法は、我々の先の国際出願ＰＣＴ／ＧＢ９３／０１６１７（公開番号ＷＯ９４／０３６１５）及びそこでの引用文献、例えばＷＯ−Ａ−９２１５９６８９に開示されている。
プラスミドｐＴＥＴｎｉｒ１５は、破傷風毒素のＣ−フラグメント（ＴｅｔＣ）をコードする遺伝子に連結したｎｉｒＢプロモータを含んでいる。図１に示すように、ｐＴＥＴｎｉｒ１５をＳａｃＩＩ及びＢａｍＨＩで消化し、生じた２．９ｋｂ及び８１３ｂｐのフラグメントをゲル精製した。２．９ｋｂのフラグメントは、百日咳菌の糸状赤血球凝集素（ＦＨＡ）遺伝子に由来する１．７４ｋｂフラグメントにつながれた。この１．７４ｋｂフラグメントは、ＳＥＱ．ＩＤ．ＮＯ．７に示された塩基配列を有する。生じたプラスミドをｐＢＤ９０７と称した。図５に、このプラスミドの制限地図を示す。中間体プラスミドｐＢＤ９０７を調製する目的は、ｎｉｒＢプロモータ塩基配列をｈｔｒＡプロモータ塩基配列に置き換えることができるように、ＴｅｔＣフラグメント中に存在するＥｃｏＲＩ部位を除去することにあった。これは、プラスミドｐＢＤ９０７をＥｃｏＲＩとＢｇｌＩＩで消化することによって成し遂げられた。生じた４５３５ｂｐフラグメントをゲル精製し、ｈｔｒＡプロモータを含んでいる次の５５ｂｐオリゴヌクレオチドにつないだ。
Ｏｌｉｇｏ−１
0003731004.tif 000003
Ｏｌｉｇｏ−２
0003731004.tif 000004
生じた中間体プラスミドｐＩＮＴ中のプロモータの存在は、ＤＮＡ塩基配列決定によって確認した。それから、プラスミドｐＩＮＴをＳａｃＩＩ及びＢａｍＨＩＩで消化し、ｐＴＥＴｎｉｒ１５由来の８１３ｂｐにつないで、プラスミドｐＨＴＲＡ１を形成した。ｐＨＴＲＡ１のＤＮＡ塩基配列をＳＥＱ．ＩＤ．ＮＯ．４に示す。そのｈｔｒＡ領域は、最初の５５塩基対により定義され、塩基配列
0003731004.tif 000005
を有する。
ＳＥＱ．ＩＤ．ＮＯ．４に関し、GAACTTが−３５ボックスであり、TCTGAが−１０ボックスである。５１３塩基対及び２２３５塩基対に、それぞれＳａｃＩＩ及びＡｌｗＮ  １制限部位がある。
プラスミドｐＨＴＲＡ１は、ネズミチフス菌株ＢＲＤ５０９（１９９２年１０月１２日付をもって承認番号NCTC12716の下に寄託）を形質転換するのに使用され、生じたＢＲＤ９３５と称する株について、標準法によりＴｅｔＣフラグメントの形質発現を検査した。ＢＲＤ９３５株は、ナショナル コレクション オブ タイプ カルチャー、コリンデール、ユナイテッド キングダム［National Collection of Type Cultures, Colindale, United Kingdom］に１９９５年１月２７日付をもって承認番号NCTC12883の下に寄託された。
図２に示すように、プラスミドｐＨＴＲＡ１は、ＴｅｔＣフラグメントのＣ−末端に”ヒンジ”領域が存在する部分的変更が加えられた構成を調製するのに使用された。”ヒンジ”領域を表現するヌクレオチド塩基配列は、プラスミドｐＴＥＣＨ２から得た。このｐＴＥＣＨ２は、ＳＥＱ．ＩＤ．ＮＯ．５に述べられたＤＮＡ塩基配列を有し、５３３位及び２３０４位にそれぞれＳａｃＩＩ及びＡｌｗＮＩ制限部位を備えている。このプラスミドの調製方法は、我々の先の国際出願ＰＣＴ／ＧＢ９３／０１６１７（公開番号WO94/03615）に開示されている。
プラスミドｐＴＥＣＨ２は、破傷風毒素Ｃフラグメントが連結したｎｉｒＢプロモータ領域を含んでおり、そのＣフラグメントの３’末端には、他のポリペプチドをコードする遺伝子の挿入が可能ないくつかの制限部位に伴って、Gly-Pro-Gly-Proを繰り返す特徴をコードするヒンジ領域が、ＢａｍＨＩ制限部位を介して連結している。ヒンジ領域と破傷風毒素Ｃフラグメント領域の一部とをコードしている１．７ｋｂフラグメントは、ＳａｃＩＩ及びＡｌｗＮＩを用いて消化してｐＴＥＣＨ２から取り出したあと、精製した。生じたフラグメントのＤＮＡ塩基配列をＳＥＱ．ＩＤ．ＮＯ．６に示す。
ｈｔｒＡプロモータ及び破傷風毒素ＣフラグメントをコードしているがヒンジはコードしていないプラスミドｐＨＴＲＡ１を、ＳａｃＩＩ及びＡｌｗＮＩを用いて消化し、生じた２ｋｂフラグメントをゲル精製した。
ｐＴＥＣＨ２由来の１．７ｋｂフラグメント（ＳＥＱ．ＩＤ．ＮＯ．６）と、ｐＨＴＲＡ１由来の２ｋｂフラグメントとをつないで、３’末端にヒンジ領域を有する破傷風毒素Ｃフラグメントの遺伝子と、これに対して作動可能に連結されたｈｔｒＡプロモータとを一体的に内包するｐＨＴＲＡ２を形成した。
弱毒化ネズミチフス菌株をベクターｐＨＴＲＡ２を用いて形質転換し、そして標準的手法により選択したあと、プラスミドｐＨＴＲＡ２を内包しているサルモネラ株ＢＲＤ１０６２を分離した。
プラスミドｐＨＴＲＡ２は、ヒンジ領域によって連結された融合タンパクをコードする構造を調製するための中間体として利用できる。そして、我々の先の国際出願ＰＣＴ／ＧＢ９３／０１６１７に記載された手法に従えば、さらに別のタンパクをヒンジ領域上の制限エンドヌクレアーゼ部位内にクローニングすることができる。
材料及び方法
細菌株
大腸菌ＨＢ１０１及びＢＲＤ５０９（弱毒化ネズミチフス菌ａｒｏＡ、ａｒｏＤ株。認証番号NCTC12716で寄託）を使用して実験を行った。細菌はルリアブロス（ＬＢ）［Luria broth］培地、又は適切な抗生物質を補充し、１．６ｗ／ｖ％寒天で固化したＬＢ培地中で生育させた。
ＤＮＡの操作
プラスミドＤＮＡはアルカリ溶菌法により精製した［R. Maniatis, et al., 1982, Molecular Cloning - A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory, New York］。制限されたＤＮＡフラグメントは、タウツ及びレンツ（Tautz and Rentz）の方法により寒天ゲルから精製した［1983, "An optimised freeze-squeeze method for the recovery of DNA Fragments from agarose gels". Analytical Biochem., 132, 14-19］。制限酵素は、ドイツのベーリンガー  マンハイム［Boehringer Mannheim］と米国のニュー  イングランド  バイオラブス［New England Biolabs］により提供されたものであり、製造者の指示に従って使用した。
ＤＮＡ塩基配列決定
二重鎖塩基配列を決定するためのＤＮＡを、ステファンら［Stephen et al.］の方法により分離した［1990, A Rapid Method for Isolating High Quality Plasmid DNA Suitable for DNA Sequencing, Nucleic Acid Research, 18, No. 24, p 7463］。配列決定は、シークエンス  バージョン  ２  キット（ＵＳＢ）［Sequense Version 2 kit］を用いて実行した。このキットは、製造者の指示に従って使用した。
オリゴヌクレオチド
ＳＡＭ  １  オリゴヌクレオチド  シンセサイザー（Biolabs社、イギリス）を用いて合成した。
実験例  ２
ｈｔｒＡ−ｌａｃＺ構造の調製
ｈｔｒＡプロモータの諸特性を、別の２つの誘導可能なプロモータ、すなわちｎｉｒＢ及びｇｒｏＥと比較した。
ｎｉｒＢ、ｈｔｒＡ及びｇｒｏＥプロモータの下流へのｌａｃＺの補助的クローニング
プラスミドｐＭＡＣ１８７８（ファーマシア［Pharmacia］）を制限酵素ＳａｌＩ及びＢａｍＨＩ［１４］で開裂した後、そのプラスミドから、プロモータの無いｌａｃＺ遺伝子をコードするＤＮＡフラグメントを低融点アガロース法により精製した。プラスミドｐＴＥＴｎｉｒ−１５［S.N. Chatfield et al, Bio/Technology 10, 888-892］及びｐＴＥＴｈｔｒＡ−１は、それぞれｎｉｒＢプロモータ、ｈｔｒＡプロモータを内包する。これらのプラスミドをＳａｌＩ及びＢａｍＨＩエンドヌクレアーゼを用いて消化し、ｌａｃＺをコードする精製済みフラグメントをプロモータの下流にはめ込んでクローニングした。プラスミドｐＲＺ−ＰＥＳは、ｇｒｏＥプロモータ由来のβ−ガラクトシダーゼ（β−ｇａｌ）の形質発現を測定するために使用された。ｐＲＺ−ＰＥＳは、ｇｒｏＥＳ及びｌａｃＺ遺伝子の上流に大腸菌ｇｒｏＥ−オペロンのプロモータを含んでいる。それは、プラスミドｐＯＦ３９［O. Fayet et al., J. Bacteriol. 171, 1379-1385(1989)］由来のオペロンを担持している２．１ｋｂのＥｃｏＲＩ−ＨｉｎｄＩＩＩフラグメントを、ｐＵＣ１９に補助的クローニングすることによって構成された。それから、新規のＢａｌＩＩ部位を、突然変位誘発を起こす部位を利用して、ｇｒｏＥＳ遺伝子とｇｒｏＥＬ遺伝子の間に導入した。ｇｒｏＥプロモータとｇｒｏＥＳ遺伝子とを担持しているそのＥｃｏＲＩ−ＢｇｌＩＩフラグメントを、ＥｃｏＲＩ−ＢａｍＨＩ切除プロモータ−プローブ  プラスミドｐＲＦ５２５５［P.F. Lambert et al., J. Bacteriol. 162, 441-444(1985)］の中にクローニングし、プラスミドｐＲＺ−ＰＥＳを得た。そのプラスミドを、ネズミチフス菌ＬＢ５０１０（ｒ-ｍ+）［L.R. Bullas et al., J. Bacteriol. 256, 471-474(1983)］の中で調製し、エレクトロポレーションを利用してネズミチフス菌株ＢＲＤ９１５（ネズミチフス菌ＳＬ１３４４  ｈｔｒＡ）［S.N. Chatfield et al, Microbial Pathog. 12, 145-151(1992)］の中に導入した。正のｌａｃ活性を有する組み替え体は、アンピシリンとＸ−ｇａｌを含有するＬ寒天平板培地上でスクリーニングした。
ｌａｃＺ形質発現に対する環境条件変化の影響
組み替えプラスミドを内包する細菌株を、Ｌ−ブロス培地中で３０℃に保持［skaing］して一晩中生育させた。培地は１：５０に希釈され、生育は、ＯＤ600が２．８〜３．４に到達するまで、さらに３０℃で３時間続けられた。各培地０．２ｍｌずつを４℃に保管し、β−ガラクトシダーゼ活性のベースラインを測定するために使用した。そして各培地の残部を、後述するような異なる生育条件に移し、特別のことがない限り、０、２、４、６、及び２４時間目にサンプルを採取した。各時点でＯＤ600を測定し、細菌はβ−ガラクトシダーゼ分析を行うのに先立ち４℃で保管した。
感染したＨＥｐ−２、Ｃａｃｏ−２及びＴＨＰ  １−マクロファージ細胞系における形質発現の測定
細胞は、２４穴プレートに１穴当たり約１０5個を撒き、ドルベッコ［Dolbecco］の修正イーグル培地、これにはフェノールフタレインが含有されておらず（ＩＣＮフロー）、１０％（容量／容量）ウシ胎児血清と２ｍＭグルタミンが補充されている、中で３７℃、５％ＣＯ2雰囲気下、一晩中生育した。一晩中培養して希釈された培地の細菌１０8のＣＦＵを組織培養細胞に添加し、３０℃でインキュベートした。いろいろな時点で組織培養の培地を採取し、細胞外細菌についてβ−ガラクトシダーゼ活性を測定した。各サンプル中の細菌数は生存数を数えることにより測定し、対応するＯＤ600は標準曲線を用いて測定した。感染した細胞は、燐酸緩衝生理食塩液（ＰＢＳ）で洗浄し、２００ｍｇ／ｍｌゲンタマイシンの存在下でさらに一時間インキュベートし、細胞外細菌を死滅させた。その後、細胞を、無菌蒸留水とピペットによる強い撹拌で溶菌した。おのおのの溶菌物について、β−ガラクトシダーゼ活性を測定した。各溶菌物中の細菌数は、生存数を数えることにより測定し、対応するＯＤ600の値は標準曲線を用いて測定した。
結  果
本研究のために選ばれた各プロモータからの形質発現は、環境条件の変化に対して感受性を有している。ｎｉｒＢが嫌気的条件の変化に反応することは、すでに知られていた。最初の実験は、同様の多数複製プラスミド（multicopy plasmid）上に存在しサルモネラワクチン株ＢＲＤ９１５に内包される各プロモータに由来する、ｌａｃＺの形質発現レベルを評価するために行われた。異なるプロモータに対する温度変化の影響を、図７に示す。温度を３０℃から３７℃に変化させると（図７Ａ）、ｌａｃＺをｎｉｒＢ及びｈｔｒＡプロモータから形質発現させた場合には、β−ガラクトシダーゼ酵素単位が増加した。ｇｒｏＥプロモータからは、β−ガラクトシダーゼ単位の顕著な増加は認められなかった。温度を３０℃から４２℃に変化させると、３つ全てのプロモータからβ−ガラクトシダーゼ単位数が増加した。β−ガラクトシダーゼレベルの増加速度は、ｇｒｏＥからの場合と比べて、ｈｔｒＡ及びｎｉｒＢからの場合のほうが速かった（図７Ｂ）。温度を３７℃から４２℃に変化させることによって、ｎｉｒＢ及びｈｔｒＡプロモータの誘導と、それよりも緩和ではあるがｇｒｏＥプロモータからのβ−ガラクトシダーゼ単位の増加が起きた（図７Ｃ）。
またさらに、異なるプロモータからのβ−ガラクトシダーゼ形質発現は、真核生物細胞に入れた細菌のための選択を通じて試験されもした。ＨＥｐ−２、Ｃａｃｏ−２及びＴＨＰ−１マクロファージ細胞系を、１０8個の細菌に感染させ、３０℃でインキュベートした。β−ガラクトシダーゼ単位数をＨＥｐ−２の感染後３時間測定したところ、ｈｔｒＡ及びｎｉｒＢプロモータからのｌａｃＺの形質発現が著しく向上することがわかった（図２）。しかしながら、ｇｒｏＥプロモータからのｌａｃＺ形質発現の増加は検出されなかった。同様の結果が、Ｃａｃｏ−２細胞の感染において得られた（図示せず）。これに対して、マクロファージの細胞内環境においては、３つ全てのプロモータが誘導された（図８）。ｎｉｒＢプロモータが最も大きく影響を受け、ｇｒｏＥの受けた影響が最も少なかった（図８）。各細胞系の細胞外培地中のβ−ガラクトシダーゼ単位数を測定したが、酵素活性の増加は見られなかった（図示せず）。
マクロファージ内での生育が、３つ全てのプロモータからの形質発現に影響を与えることがわかったので、マクロファージのファゴソーム内で普通に見られる過酸化水素に対する、それらの感受性を監視した。細菌を１００μＭの過酸化水素中に３０℃でインキュベートしたが、ｇｒｏＥ及びｎｉｒＢプロモータへの顕著な作用は起こらなかった。これに対して、ｈｔｒＡプロモータからは、β−ガラクトシダーゼのレベルが増加し、４時間経過までにベースラインのレベルから１０Ｕまで達した。その後、６時間経過までにベースラインのレベルまで急激に減少した（図示せず）。プラスミドｐＬＫ［M. Szabo et al, J. Bacteriol. 174, 7245-7252］からのｌａｃＺの構造発現に対しては、いかなる環境条件も顕著な影響を及ぼさなかった（図示せず）。
本研究においては、異なる生育条件下でｌａｃＺ遺伝子を形質発現させるために、３つの環境調節性プロモータを使用した。プロモータは、３種類の誘導可能な細菌プロモータを代表しており、すなわち、嫌気的誘導性の大腸菌ｎｉｒＢ、σE依存性ｈｔｒＡ、及びσ32依存性ｇｒｏＥである。ｎｉｒＢプロモータからの形質発現は、転写開始点の上流にある−５２位と−３０位の間に結合する転写因子ＦＮＲに依存する。ＦＮＲ依存性転写は、第２転写因子ＮａｒＬと一緒になって調節を受ける場合がある。しかしながら、ここで使用されたプラスミドｐＴＥＴｎｉｒ−１５は、ＦＮＲ依存性結合部位だけしか含んでいない。
細菌は、環境的ストレスが加えられた条件に対して、多種のタンパク質の合成速度を迅速に変化させて対応する。多くの場合、トランジット  インダクション（transit induction）は、タンパク質レベルを迅速に調節して、新しい安定状態に適合させる。我々は、本研究において、β−ガラクトシダーゼのレベルに対する環境条件の影響を試験した。我々は、温度変化による作用が、ｇｒｏＥに対する場合と比べて、ｈｔｒＡプロモータに対する場合のほうが強いことを発見した。この結果は、ｈｔｒＡプロモータがインビボ試験において、ＲＮＡポリメラーゼ［１１，１２］を含有するσEによって、ｇｒｏＥ（σ32依存性である）よりも先に誘導され、また、σ32と一緒になって誘導される事実と整合する。意外にも、ｎｉｒＢも同様に、温度の上昇によって高められた。高温時に生育培地中の酸素濃度が低い可能性もあるが、温度を３０℃から３７℃に変化させると、ｎｉｒＢプロモータから形質発現させたβ−ガラクトシダーゼ単位の急速な増加をもたらすと言う事実は、ＦＮＲが、他のストレスタンパク調節因子のように、数々の環境刺激に反応するであろうことを示唆している。同様に、ｈｔｒＡも嫌気的生育条件の下で誘導されたことから、このプロモータがσE以外の因子により調節されているか、または低い酸素分圧の下でもσEが活性化されていると考えられる。
ネズミチフス菌が発病力を保持するためには、その菌がマクロファージ内で生き延びることが可能でなければならない。この生き残りは、過酸化水素の生産を包含する毒性の殺菌メカニズムが及ぶ範囲に耐える細菌の耐久力に依存する。大腸菌ｈｔｒＡ突然変異体とは異なり、ネズミチフス菌ｈｔｒＡ突然変異体は温度上昇によっては死滅しないが、顕著なレベルの過酸化水素から生き延びる能力がどちらかと言うと損なわれていることが、すでに知られている。興味深いことに、試験したプロモータのうち過酸化水素の存在下で形質発現したものは、ｈｔｒａＡプロモータただ一つだけであった。
細胞内環境の影響を測定するために、試験に供したプラスミドを内包するサルモネラ菌をいくつかの異なる培養真核生物細胞系に入れた後で、３つの異なるプロモータからの形質発現のレベルを監視した。細菌をインビトロで生育させ、３０℃で真核生物細胞を感染させるのに使用した。というのは、温度が３０℃から３７℃に変化すると、ｈｔｒＡ及びｎｉｒＢプロモータが、双方とも劇的に誘導されるからである。我々は、ｎｉｒＢ及びｈｔｒＡプロモータ双方からのβ−ガラクトシダーゼ形質発現のレベルが、試験に供した全ての細胞系で増加したのに対して、ｇｒｏＥプロモータは、感染させたマクロファージ内でのみ誘導されたことを発見した。
配  列  表
（１）概括的情報
(i)出願人
(A)名称：メデヴァ  ホールディングス  ビーヴィ
(B)ストリート：チャーチル−ラーン  ２２３
(C)都市名：アムステルダム
(E)国名：オランダ国
(F)郵便番号：１０７８ＥＤ
(ii)発明の名称：ワクチン
(iii)配列の数：７
(iv)コンピュータ読取フォーム
(A)記録媒体のタイプ：フロッピーディスク
(B)コンピュータ：IBM PC compatible
(C)オペレーティングシステム：PC-DOS/MS-DOS
(D)ソフトウエアー：PatentIn Release #1.0, Version #1.25（EPO）
(vi)優先権出願データ
(A)出願番号：GB 9401795.1
(B)提出日：１９９４年１月３１日
（２）SEQ ID NO:1についての情報：
(i)配列の特性
(A)長さ：５５塩基対
(B)型：核酸
(C)鎖の数：１本鎖
(D)トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：DNA（genomic）
(iii)ハイポセティカル配列：NO
(iii)アンチセンス：NO
(vi)起源：
(A)生物名：Salmonella typhimurium
(ix)配列の特徴
(A)ネーム／キー：promoter
(B)存在位置：1..55
(xi)配列：SEQ ID NO:1:
0003731004.tif 000006
（２）SEQ ID NO:2についての情報：
(i)配列の特性
(A)長さ：５５塩基対
(B)型：核酸
(C)鎖の数：１本鎖
(D)トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：DNA（genomic）
(iii)ハイポセティカル配列：NO
(iii)アンチセンス：NO
(xi)配列：SEQ ID NO:2:
0003731004.tif 000007
（２）SEQ ID NO:3についての情報：
(i)配列の特性
(A)長さ：５５塩基対
(B)型：核酸
(C)鎖の数：１本鎖
(D)トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：DNA（genomic）
(iii)ハイポセティカル配列：NO
(iii)アンチセンス：YES
(xi)配列：SEQ ID NO:3:
0003731004.tif 000008
（２）SEQ ID NO:4についての情報：
(i)配列の特性
(A)長さ：３７１２塩基対
(B)型：核酸
(C)鎖の数：２本鎖
(D)トポロジー：環状
(ii)配列の種類：DNA（genomic）
(iii)ハイポセティカル配列：NO
(iii)アンチセンス：NO
(ix)配列の特徴
(A)ネーム／キー：htrA promoter
(B)存在位置：1..55
(ix)配列の特徴
(A)ネーム／キー：SacII restriction site
(B)存在位置：513
(ix)配列の特徴
(A)ネーム／キー：AlwN 1 restriction site
(B)存在位置：2235
(xi)配列：SEQ ID NO:4:
0003731004.tif 000009
0003731004.tif 000010
0003731004.tif 000011
0003731004.tif 000012
（２）SEQ ID NO:5についての情報：
(i)配列の特性
(A)長さ：３７６９塩基対
(B)型：核酸
(C)鎖の数：２本鎖
(D)トポロジー：環状
(ii)配列の種類：DNA（genomic）
(iii)ハイポセティカル配列：NO
(iii)アンチセンス：NO
(xi)配列：SEQ ID NO:5:
0003731004.tif 000013
0003731004.tif 000014
0003731004.tif 000015
0003731004.tif 000016
（２）SEQ ID NO:6についての情報：
(i)配列の特性
(A)長さ：１７６６塩基対
(B)型：核酸
(C)鎖の数：２本鎖
(D)トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：DNA（genomic）
(iii)ハイポセティカル配列：NO
(iii)アンチセンス：NO
(v)フラグメント型：中間部（internal）
(ix)配列の特徴
(A)ネーム／キー：hinge region
(B)存在位置：923..934
(xi)配列：SEQ ID NO:6:
0003731004.tif 000017
0003731004.tif 000018
（２）SEQ ID NO:7についての情報：
(i)配列の特性
(A)長さ：１７３６塩基対
(B)型：核酸
(D)トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：DNA（genomic）
(v)フラグメント型：中間部（internal）
(xi)配列：SEQ ID NO:7:
0003731004.tif 000019
0003731004.tif 000020
【図１ａ】
0003731004.tif 000021
【図１ｂ】
0003731004.tif 000022
【図２】
0003731004.tif 000023
【図３】
0003731004.tif 000024
【図４】
0003731004.tif 000025
【図５】
0003731004.tif 000026
【図６】
0003731004.tif 000027
【図７Ａ】
0003731004.tif 000028
【図７Ｂ】
0003731004.tif 000029
【図７Ｃ】
0003731004.tif 000030
【図８】
0003731004.tif 000031