(57)【要約】  培養容器内に存在している特定の細胞を効率的に抽出することを目的として、培養中の細胞を撮影することにより、細胞表面の勾配に応じて陰影が変化する画像を取得する画像取得部（１００）と、画像取得部（１００）によって取得された画像を処理して、画像の陰影から細胞表面の各位置における高さ寸法を算出する細胞高算出部（１２０）と、細胞高算出部（１２０）によって算出された細胞表面の高さ寸法と位置情報とを対応づけて記憶する記憶部（１３０）とを備える観察装置（１００）である。
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【特許請求の範囲】
【請求項１】
培養中の細胞を撮影することにより、細胞表面の勾配に応じて陰影が変化する画像を取得する画像取得部と、
該画像取得部により取得された画像を処理して、画像の陰影から前記細胞表面の各位置における高さ寸法を算出する細胞高算出部と、
該細胞高算出部により算出された前記細胞表面の高さ寸法と位置情報とを対応づけて記憶する記憶部とを備える観察装置。
【請求項２】
前記画像取得部により取得された画像を処理して前記細胞の存在する細胞領域を抽出する細胞領域抽出部を備え、
前記細胞高算出部が、前記細胞領域抽出部により抽出された前記細胞領域の各位置における前記細胞表面の高さ寸法を算出する請求項１に記載の観察装置。
【請求項３】
前記記憶部に対応づけて記憶されている前記高さ寸法と前記位置情報とを対応づけて表示する表示部を備える請求項２に記載の観察装置。
【請求項４】
前記表示部が、前記細胞領域抽出部により抽出された前記細胞領域を前記高さ寸法に応じて色分けして表示する請求項３に記載の観察装置。
【請求項５】
前記細胞高算出部が算出した前記高さ寸法に基づいて前記細胞をクラス分類する分類部を備え、
前記表示部が、前記分類部によりクラス分類された分類と前記記憶部に記憶されている前記位置情報とを対応づけて表示する請求項３に記載の観察装置。
【請求項６】
前記細胞高算出部が、前記細胞に対して照明される照明の方向および平行な陰影の変化から前記細胞表面の高さ寸法を算出する請求項１に記載の観察装置。
【請求項７】
前記細胞高算出部が、前記画像取得部により取得された画像を処理して、該画像の陰影から前記細胞表面の連続する前記高さ寸法を算出する請求項６に記載の観察装置。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
本発明は、観察装置に関するものである。
【背景技術】
【０００２】
ＥＳ細胞およびｉＰＳ細胞などの万能細胞の制作過程では、遺伝子の導入や発現に失敗して、万能細胞の特性を持たない細胞が多数発生する。再生医療等に応用するには、万能細胞の特性を持たない細胞を取り除き、万能細胞のみを抽出する必要がある。
例えば、ｉＰＳ細胞になっているか否かを見極めるには、多能性を持つ細胞が発現しているＯｃｔ３／４、Ｎａｎｏｇ、ＴＲＡ−１−６０、ＴＲＡ−１−８１等の未分化マーカと呼ばれるタンパク質を、ｑＰＣＲ法あるいは免疫染色法により検査する方法が知られている（例えば、特許文献１参照。）。
【先行技術文献】
【特許文献】
【０００３】
【特許文献１】特開２０１４−１００１４１号公報
【発明の概要】
【発明が解決しようとする課題】
【０００４】
しかしながら、これらの方法はコストおよび時間がかかるため、細胞の選別は、培養作業者が、位相差顕微鏡下において、複数回分裂した細胞の集まりであるコロニーの形状を観察し、作業者の経験、培養条件およびコロニー同士を比較するなどして、ｉＰＳ細胞になっていそうなコロニーを選別することを感覚的に行っており手間がかかっていた。
特に、コロニーが小さい場合には形状の差異も小さく、ｉＰＳ細胞であるか否かの見極めが困難であった。【０００５】
本発明は、培養容器内に存在している特定の細胞を効率的に抽出することができる観察装置を提供することを目的としている。
【課題を解決するための手段】
【０００６】
本発明の一態様は、培養中の細胞を撮影することにより、細胞表面の勾配に応じて陰影が変化する画像を取得する画像取得部と、該画像取得部により取得された画像を処理して、画像の陰影から前記細胞表面の各位置における高さ寸法を算出する細胞高算出部と、該細胞高算出部により算出された前記細胞表面の高さ寸法と位置情報とを対応づけて記憶する記憶部とを備える観察装置である。【０００７】
本態様によれば、画像取得部により画像が取得されると、取得された画像が細胞高算出部により処理されて細胞表面の各位置における高さ寸法が算出される。そして、算出された細胞表面の高さ寸法は位置情報と対応づけて記憶部に記憶される。【０００８】
細胞はその培養過程における分裂等により数が変化して細胞の集合体であるコロニーの面積が変化するとともに、高さ寸法も変化し、同種の細胞は同等の高さ寸法を有することになる。本態様によれば、高さ寸法と位置情報とを対応づけて記憶することにより、観察者がいずれかの位置の細胞が観察したい細胞であることを特定できれば、記憶されている同等の高さ寸法の位置に存在する細胞を選択することにより、観察したい細胞のみを効率的に観察することができる。【０００９】
上記態様においては、前記画像取得部により取得された画像を処理して前記細胞の存在する細胞領域を抽出する細胞領域抽出部を備え、前記細胞高算出部が、前記細胞領域抽出部により抽出された前記細胞領域の各位置における前記細胞表面の高さ寸法を算出してもよい。
この構成により、細胞領域抽出部により抽出された細胞領域の各位置について細胞表面の高さ寸法が算出され、細胞の存在しない領域についての高さ寸法の算出を省略することができる。これにより、培養容器内に存在している特定の細胞をさらに効率的に観察することができる。【００１０】
また、上記態様においては、前記記憶部に対応づけて記憶されている前記高さ寸法と前記位置情報とを対応づけて表示する表示部を備えていてもよい。
この構成により、表示部に表示された高さ寸法によって観察したい細胞を簡易に選択して観察することができる。【００１１】
また、上記態様においては、前記表示部が、前記細胞領域抽出部により抽出された前記細胞領域を前記高さ寸法に応じて色分けして表示してもよい。
この構成により、同程度の高さ寸法を有する細胞領域を色により簡易に特定することができ、同程度の高さ寸法を有する細胞を簡易に選択して効率的に観察することができる。【００１２】
また、上記態様においては、前記細胞高算出部が算出した前記高さ寸法に基づいて前記細胞をクラス分類する分類部を備え、前記表示部が、前記分類部によりクラス分類された分類と前記記憶部に記憶されている前記位置情報とを対応づけて表示してもよい。
上記態様においては、前記細胞高算出部が、前記細胞に対して照明される照明の方向および平行な陰影の変化から前記細胞表面の高さ寸法を算出してもよい。
また、上記態様においては、前記細胞高算出部が、前記画像取得部により取得された画像を処理して、該画像の陰影から前記細胞表面の連続する前記高さ寸法を算出してもよい。
【発明の効果】
【００１３】
本発明によれば、培養容器内に存在している特定の細胞を効率的に抽出することができるという効果を奏する。
【図面の簡単な説明】
【００１４】
【図１】本発明の一実施形態に係る観察装置を示すブロック図である。
【図２】図１の観察装置により取得された画像の一例を示す図である。
【図３】図２の画像から抽出された細胞領域を示す図である。
【図４】図２の画像から抽出された一の細胞領域の画像上に輝度の変化を検出する直線を表示した図である。
【図５】図４の直線に沿う図４の画像の輝度の変化を示す図である。
【図６】図５の輝度の変化から算出された図４の直線に沿う細胞表面の高さ寸法の変化を示す図である。
【図７】画像を取得する画像取得部を示す全体構成図である。
【図８】図７の画像取得部における照明光学系の一部を示す斜視図である。
【図９Ａ】図８の照明光学系におけるライン光源の一例を示す側面図である。
【図９Ｂ】図９Ａのライン光源を光軸方向に見た正面図である。
【図１０】図８の照明光学系におけるライン光源の他の例を示す図である。
【図１１】図７の画像取得部の対物光学系群を示す図である。
【図１２】図１１の対物光学系群における対物光学系の配列を示す図である。
【図１３】図１１の対物光学系群における開口絞りの配列を示す図である。
【図１４】図１１の対物光学系群の像面におけるラインセンサの配置を示す図である。
【図１５】図８の照明光学系におけるライン光源、シリンドリカルレンズおよびプリズムの配置を示す図である。
【図１６】偏斜照明の作用を説明する図である。
【図１７】図１６の偏斜照明によって照明された試料の画像の一例を示す図である。
【図１８Ａ】試料の一例を示す図である。
【図１８Ｂ】図７の画像取得部によって取得された図１８Ａの試料の２次元画像を示す図である。
【図１８Ｃ】図１８Ｂの画像を反転処理およびつなぎ合わせ処理することにより得られた画像を示す図である。
【図１９】図７の画像取得部の他の態様におけるライン光源の配置を示す図である。
【図２０】図１の観察装置により細胞表面の高さ寸法と位置情報とを対応づけて表示する表示例を示す図である。
【発明を実施するための形態】
【００１５】
本発明の一実施形態に係る観察装置２００について図面を参照して以下に説明する。
本実施形態に係る観察装置２００は、図１に示されるように、細胞の画像を取得する画像取得部１００と、取得された画像を処理することにより細胞領域を抽出する細胞領域抽出部１１０と、抽出された各細胞領域における細胞表面の各位置の高さ寸法を算出する細胞高算出部１２０と、算出された高さ寸法と位置情報とを対応づけて記憶する情報記憶部（記憶部）１３０とを備えている。細胞領域抽出部１１０および細胞高算出部１２０はプロセッサにより構成され、情報記憶部１３０はメモリあるいは記憶媒体等により構成されている。
【００１６】
画像取得部１００は、培養中の細胞を撮影することにより、細胞表面の勾配に応じて陰影が変化する画像を取得するものであり、詳細については後述する。
細胞領域抽出部１１０は、画像取得部１００により取得された図２に示されるような画像Ｇ内におけるエッジ検出や輪郭追跡により、図３に示されるように、細胞Ｘと細胞以外との境界を抽出し、その境界が閉じているものを細胞ＸあるいはコロニーＹとして認識し、その大きさから細胞ＸとコロニーＹとを区別する。
【００１７】
細胞高算出部１２０は、画像取得部１００により取得された画像を処理して、画像の陰影から細胞表面の各位置における高さ寸法を算出する。
画像取得部１００により取得された画像は、細胞表面の勾配に応じて陰影が変化するので、勾配が大きければ輝度の変化量も大きくなり、同じ勾配が連続すれば一定の輝度が連続する。
【００１８】
例えば、図４に示される画像Ｈにおいて、照明方向と平行な所定の直線に沿う輝度の変化を図５に示す。そして、この輝度の変化を用いて得られる勾配を積分することにより、図６に示されるように、上記直線に沿う細胞表面の形状を算出することができる。コロニーＹのない領域の輝度を基準として、勾配の大きさと向きを推定することにより、上記直線に沿う細胞表面の各位置の相対的な高さ寸法を算出することができる。
【００１９】
細胞高算出部１２０により算出された、細胞ＸあるいはコロニーＹの各位置における高さ寸法は、位置情報と対応付けて情報記憶部１３０に記憶される。
さらに、コロニーＹの１つの直線上における高さ寸法のみならず、コロニーＹの複数位置における直線上の高さ寸法を算出し情報記憶部１３０に記憶させてもよく、コロニーＹの立体的な情報として情報記憶部１３０に記憶させてもよい。
【００２０】
ここで、画像取得部１００について説明する。
画像取得部１００は、図７に示されるように、試料（細胞）Ａを収容した容器（培養容器）１を支持するステージ２と、該ステージ２に支持された試料Ａに照明光を照射する照明部３と、試料Ａを透過した照明光をラインセンサ１３によって検出して試料Ａの画像Ｇを取得する撮像部４と、試料Ａに対する撮像部４の焦点の位置を調整するフォーカス調整機構５と、撮像部４をラインセンサ１３の長手方向に直交する走査方向に移動させる走査機構６とを備えている。照明部３、撮像部４、フォーカス調整機構５、走査機構６およびラインセンサ１３はステージ２によって上面を閉塞された筐体１０１内に密封状態に収容されている。
【００２１】
以下の説明において、撮像部４の光軸（対物光学系１１の光軸）に沿う方向をＺ方向、走査機構６による撮像部４の走査方向をＸ方向、ラインセンサ１３の長手方向をＹ方向とするＸＹＺ直交座標系を用いる。画像取得部１００は、図７に示されるように、Ｚ方向が鉛直方向となり、Ｘ方向およびＹ方向が水平方向となる姿勢に配置される。
【００２２】
容器１は、細胞培養用のフラスコまたはディッシュのような、全体的に光学的に透明な樹脂から形成された容器であり、互いに対向する上板１ａおよび底板１ｂを有している。試料Ａは、例えば、培地Ｂ中で培養される細胞である。上板１ａの内側の面は、照明光をフレネル反射する反射面となっている。
ステージ２は、水平に配置された平板状の載置台２ａを備え、載置台２ａ上に容器１が載置される。載置台２ａは、照明光を透過させるように光学的に透明な材質、例えばガラスからなる。
【００２３】
照明部３は、ステージ２の下方に配置され斜め上方に向けてライン状の照明光を射出する照明光学系７を備え、上板（反射部材）１ａおいて照明光が斜め下方に反射されることにより、斜め上方から照明光を試料Ａに照射する。
【００２４】
具体的には、照明光学系７は、図８に示されるように、撮像部４の側方に配置され照明光を撮像部４に向かってＸ方向に発するライン光源８と、該ライン光源８から発せられた照明光を平行光束に変換するシリンドリカルレンズ（レンズ）９と、シリンドリカルレンズ９から射出された照明光を上方へ偏向するプリズム（偏向素子）１０とを備えている。
【００２５】
ライン光源８は、光を射出する射出面を有する光源本体８１と、該光源本体８１の射出面上に設けられた照明マスク８２とを備えている。照明マスク８２は、Ｚ方向に延びる短辺と、Ｙ方向に延び短辺よりも長い長辺とを有する長方形の開口部８２ａを有する。射出面から発せられた光が開口部８２ａのみを透過することによって、Ｙ方向に長手方向を有するライン状の横断面（照明光の光軸に交差する断面）を有する照明光が生成される。
【００２６】
図９Ａ、図９Ｂおよび図１０は、ライン光源８の具体的な構成の一例を示している。
図９Ａおよび図９Ｂのライン光源８において、光源本体８１は、Ｙ方向に一列に配列したＬＥＤからなるＬＥＤ列８１ａと、ＬＥＤ列８１ａから発せられた光を拡散する拡散板８１ｂとを備えている。照明マスク８２は、拡散板８１ｂの射出側の面上に設けられている。
【００２７】
図１０のライン光源８において、光源本体８１は、光拡散性光ファイバ８１ｃと、該光ファイバ８１ｃに光を供給する、ＬＥＤまたはＬＳＤ（Ｓｕｐｅｒｌｕｍｉｎｅｓｃｅｎｔ  ｄｉｏｄｅ）のような光源８１ｄとを備えている。光拡散性光ファイバ８１ｃを用いることにより、ＬＥＤ列８１ａを用いた場合に比べて、照明光の光強度の均質性を高めることができる。
【００２８】
シリンドリカルレンズ９は、Ｙ方向に延びＺ方向のみに湾曲する曲面をライン光源８とは反対側に有する。したがって、シリンドリカルレンズ９は、Ｚ方向に屈折力を有し、Ｙ方向に屈折力を有しない。また、照明マスク８２は、シリンドリカルレンズ９の焦点面または該焦点面の近傍に位置している。これにより、照明マスク８２の開口部８２ａから射出された発散光束の照明光は、シリンドリカルレンズ９によってＺ方向のみ曲げられて、Ｚ方向に一定の寸法を有する光束（ＸＺ平面において平行光束）に変換される。
【００２９】
プリズム１０は、シリンドリカルレンズ９の光軸に対して４５°の角度をなして傾斜し、シリンドリカルレンズ９を透過した照明光を上方へ偏向する偏向面１０ａを有する。偏向面１０ａにおいて偏向された照明光は、載置台２ａおよび容器１の底板１ｂを透過し、上板１ａにおいて反射されて試料Ａを上方から照明し、試料Ａおよび底板１ｂを透過した照明光が撮像部４に入射する。
【００３０】
撮像部４は、一列に配列された複数の対物光学系１１を有する対物光学系群１２と、該対物光学系群１２によって結ばれた試料Ａの光学像を撮影するラインセンサ１３とを備えている。
各対物光学系１１は、図１１に示されるように、物体側（試料Ａ側）から順に、第１レンズ群Ｇ１、開口絞りＡＳ、および第２レンズ群Ｇ２を備えている。複数の対物光学系１１は、図１２に示されるように、光軸をＺ方向に平行に延ばしてＹ方向に配列され、同一面上に光学像を結ぶ。したがって、像面には、Ｙ方向に一列に並ぶ複数の光学像Ｉが形成される（図１４参照。）。開口絞りＡＳも、図１３に示されるように、Ｙ方向に一列に配列する。
【００３１】
ラインセンサ１３は、長手方向に配列された複数の受光素子を有し、ライン状の１次元画像を取得する。ラインセンサ１３は、図１４に示されるように、複数の対物光学系１１の像面上にＹ方向に配置されている。ラインセンサ１３は、像面に光学像Ｉを結んだ照明光を検出することによって、試料Ａのライン状の１次元画像を取得する。
【００３２】
隣接する対物光学系１１の間には隙間ｄが生じる。Ｙ方向において試料Ａの像に切れ目が無い画像を得るために、対物光学系群１２は以下の２つの条件を満たす。
第１の条件は、各対物光学系１１において、図１１に示されるように、入射瞳位置が最も試料Ａ側に位置する第１レンズ群Ｇ１よりも像側に位置することである。これは、開口絞りＡＳを第１レンズ群Ｇ１の像側焦点よりも物体側に配置することによって実現している。第１の条件を満たすことにより、焦点面から第１レンズ群Ｇ１に近付くにつれて軸外主光線が対物光学系１１の光軸に近付くので、走査方向に垂直な方向（Ｙ方向）の実視野Ｆが第１レンズ群Ｇ１の直径φよりも大きくなる。したがって、隣接する２つの対物光学系１１の視野がＹ方向に互いに重なり合い、視野の欠けがない試料Ａの光学像が像面に形成される。
【００３３】
第２の条件は、図１１に示されるように、各対物光学系１１の物体面から像面への投影横倍率の絶対値が１倍以下であることである。第２の条件を満たすことにより、像面には、複数の対物光学系１１によって結ばれた複数の光学像ＩがＹ方向に互いに重なり合うことなく配列する。したがって、ラインセンサ１３は、複数の対物光学系１１による複数の光学像Ｉを互いに空間的に分離して、撮像することができる。投影横倍率が１倍よりも大きい場合、Ｙ方向に隣接する２つの光学像Ｉが像面において互いに重なり合ってしまう。
【００３４】
第２の条件を満たす場合であっても、実視野Ｆよりも外側を通る光が隣接する光学像に重なることを確実に防止するために、像面の近傍に照明光の透過範囲を規制する視野絞りＦＳを設けることが好ましい。
【００３５】
対物光学系群１２の一例を以下に示す。
入射瞳の位置（第１レンズ群Ｇ１の最も物体側の面から入射瞳までの距離）２０．１ｍｍ
投影横倍率  −０．７５６倍
実視野Ｆ  ２．６６ｍｍ
第１レンズ群Ｇ１のレンズ直径φ  ２．１ｍｍ
第１レンズ群Ｇ１のＹ方向のレンズ間隔ｄ  ２．３ｍｍ
視野の重なり幅Ｄ  ０．３６ｍｍ（＝２．６６／２−（２．３−２．６６／２））
【００３６】
ここで、照明部３は、撮像部４の光軸に対して斜め方向から試料Ａに照明光を照射する偏斜照明を行うように構成されている。具体的には、図１５に示されるように、照明マスク８２は、上述したようにシリンドリカルレンズ９の焦点面またはその近傍に位置し、かつ、照明マスク８２の短辺の中心はシリンドリカルレンズ９の光軸に対して距離Δだけ下側に偏心している。これにより、プリズム１０からは、ＸＺ平面内においてＺ方向に対して傾斜する方向に照明光が射出される。そして、略水平な上板１ａにおいて反射された照明光は、ＸＺ平面内においてＺ方向に対して斜めに試料面（対物光学系１１の焦点面）に入射し、試料Ａを透過した照明光は斜めに対物光学系１１に入射する。
【００３７】
シリンドリカルレンズ９によって平行光束に変換された照明光は、照明マスク８２が短辺方向に幅を有しているので、角度分布を有する。このような照明光が対物光学系１１に斜めに入射すると、図１３において二点鎖線で示されるように、光軸側に位置する一部のみが開口絞りＡＳを通過して像面に到達し、光軸に対して外側に位置する他の部分は開口絞りＡＳの外縁によって遮られる。
【００３８】
図１６は、試料Ａとして高い屈折率を有する細胞を観察する際の偏斜照明の作用を説明する図である。図１６において対物光学系１１を左から右へ移動させるものとする。照明光の入射角度が対物光学系１１の取り込み角と同等である場合、試料Ａが存在しない領域を透過した光線ａ，ｅおよび試料Ａの表面に略垂直に入射した光線ｃは、ほとんど屈折されることなく、入射瞳の辺縁の近傍を通過し、像面に到達する。このような光線ａ，ｃ，ｅは、像面において中くらいの明るさの光学像を結ぶ。
【００３９】
図１６において試料Ａの左端を透過した光線ｂは、外側に屈折され、入射瞳の外側に達し、開口絞りＡＳによってケラレる。このような光線ｃは、像面において暗い光学像を結ぶ。図１６において試料Ａの右端を透過した光線ｄは、内側に屈折され、入射瞳の辺縁よりも内側を通過する。このような光線ｄは、像面においてより明るい光学像を結ぶ。上記の結果、図１７に示されるように、一方の側が明るく、他方の側に影が付き立体的に見える高コントラストの試料Ａの画像が取得される。
【００４０】
対物光学系１１に斜めに入射した照明光のうち、一部が開口絞りＡＳを通過し、他の部分が開口絞りＡＳにおいて遮られるような角度分布の照明光を有するために、対物光学系１１に入射する際の照明光の光軸に対する入射角度は、下記の条件式（１）および（２）を満たすことが好ましい。
θｍｉｎ  ＞  ０．５ＮＡ      （１）
θｍａｘ  ＜  １．５ＮＡ      （２）
θｍｉｎは、対物光学系１１の光軸に対する照明光の入射角度の最小値（最も光軸側に位置する光線の入射角度）、θｍａｘは、対物光学系１１の光軸に対する照明光の入射角度の最大値（光軸に対して最も径方向外側に位置する光線の入射角度）、ＮＡは対物光学系１１の開口数である。
【００４１】
上記画像取得部１００による観察において条件式（１）および（２）を満たすときにコントラストの高い試料Ａの画像が取得されることが実験的に確認されている。条件式（１）および（２）を満たすためには、シリンドリカルレンズ９の焦点距離Ｆｌと照明マスク８２の開口部８２ａの短辺の長さＬが、下記の条件式（３）を満たすことが好ましい。
Ｌ  ＞  （θｍａｘ−θｍｉｎ）Ｆｌ      （３）
【００４２】
さらに、プリズム１０の偏向角（対物光学系１１の光軸に対する偏向面１０ａの傾斜角度）が４５°である場合、シリンドリカルレンズ９の光軸に対する照明マスク８２の短辺の中心位置のシフト量（偏心距離）Δは、下記の条件式（４）を満たすことが好ましい。
Δ＝ＮＡ／Ｆｌ      （４）
プリズムの偏向角が４５°でない場合には、偏向角の４５°からのずれ量に応じてΔが補正される。具体的には、偏向角が４５°よりも大きい場合には、Δをより大きくし、偏向角が４５°よりも小さい場合には、Δをより小さくする。
【００４３】
条件式（１）〜（４）を満たすことによって、試料Ａが細胞のような位相物体であっても高いコントラストの付いた画像Ｇを取得することができる。条件式（１）〜（４）を満たさない場合には、試料Ａのコントラストが低下する。
【００４４】
フォーカス調整機構５は、例えば図示しない直動アクチュエータによって、照明光学系７および撮像部４を一体的にＺ方向に移動させる。これにより、静止したステージ２に対する照明光学系７および撮像部４のＺ方向の位置を変更し、試料Ａに対する対物光学系群１２の焦点合わせを行うことができる。
【００４５】
走査機構６は、例えばフォーカス調整機構５を支持する直動アクチュエータによって、フォーカス調整機構５と一体的に撮像部４および照明光学系７をＸ方向に移動させる。
なお、走査機構６は、撮像部４および照明光学系７ではなく、ステージ２をＸ方向に移動させる方式で構成されていてもよく、撮像部４および照明光学系７と、ステージ２との両方をＸ方向に移動可能に構成されていてもよい。
【００４６】
次に、画像取得部１００の作用について、容器１内で培養中の細胞である試料Ａを観察する場合を例に挙げて説明する。
ライン光源８からＸ方向に発せられたライン状の照明光は、シリンドリカルレンズ９によって平行光束に変換され、プリズム１０によって上方に偏向され、光軸に対して斜め上方に射出される。照明光は、載置台２ａおよび容器１の底板１ｂを透過し、上板１ａにおいて斜め下方に向けて反射され、試料Ａ、底板１ｂおよび載置台２ａを透過し、複数の対物光学系１１によって集光される。各対物光学系１１の内部を斜めに進む照明光は、開口絞りＡＳにおいて部分的にケラレ、一部のみが開口絞りＡＳを通過することにより、陰影の付いた試料Ａの光学像を像面に結ぶ。
【００４７】
像面に形成された試料Ａの光学像は、像面に配置されたラインセンサ１３によって撮像されて試料Ａの一次元画像が取得される。撮像部４は、走査機構６の作動によってＸ方向に移動しながら、ラインセンサ１３による１次元画像の取得を繰り返す。これにより、底板１ｂ上に分布する試料Ａの２次元画像が取得される。
【００４８】
ここで、各対物光学系１１によって像面に結ばれる像は倒立像になる。したがって、例えば、図１８Ａに示される試料Ａの２次元画像を取得した場合、図１８Ｂに示されるように、各対物光学系１１に対応する部分画像Ｐにおいて像が倒立する。この像の倒立を補正するために、図１８Ｃに示されるように、各部分画像Ｐを走査方向に垂直な方向に反転する処理が行われる。
【００４９】
対物光学系１１の投影横倍率の絶対値が１よりも大きい場合、各部分画像Ｐの縁部の視野は、隣接する部分画像Ｐの縁部の視野と重複する。この場合には、図１８Ｃに示されるように、縁部を互いに重なり合わせて部分画像Ｐをつなぎ合わせる処理が行われる。各対物光学系１１の投影横倍率が１倍である場合、このようなつなぎ合わせ処理は不要となる。
【００５０】
このように、ラインセンサ１３を試料Ａに対して走査して試料Ａの２次元画像を取得するライン走査型の画像取得部１００において、偏斜照明を用いることによって、細胞のような無色透明の位相物体であっても高いコントラストの付いた画像Ｇを取得することができるという利点がある。また、容器１の上板１ａを反射部材として利用し、照明部３、撮像部４、フォーカス調整機構５および走査機構６の全てをステージ２の下方に集約することによって、コンパクトな装置を実現することができるという利点がある。
【００５１】
さらに、照明部３、撮像部４、フォーカス調整機構５および走査機構６の全てをステージ２の下方の筐体内に密封状態に収容しているので、高温多湿のインキュベータ内に収容することができ、インキュベータ内で試料Ａの培養を行いながら、経時的に画像Ｇを取得することができる。
【００５２】
また、対物光学系群１２の近傍に配置されたプリズム１０によって、上板１ａの低い容器１にも対応することができる。
すなわち、上板１ａの位置が低い容器１を使用する場合、上述した条件式（１）〜（４）を満たすためには、照明部３からの照明光の射出位置を、対物光学系群１２の光軸に近付ける必要がある。しかし、対物光学系群１２のレンズや枠等が邪魔となり、対物光学系群１２の近傍にライン光源８を配置することは難しい。
【００５３】
そこで、図１５に示されるように、プリズム１０を、載置台２ａと対物光学系群１２との間に挿入して、対物光学系群１２の上部、かつ、光軸からわずかに径方向にずれた位置に配置し、ライン光源８を対物光学系群１２から水平方向に離れた位置に配置する。これにより、対物光学系群１２の光軸の近傍から斜め上方に向けて照明光を射出することができる。
【００５４】
上板１ａの位置が高い容器１を使用する場合、偏斜照明によってコントラストの付いた試料Ａの光学像を得るためには、対物光学系群１２の光軸から離れた位置から照明光が斜め上方に射出される。したがって、図１９に示されるように、プリズム１０を省略して、ライン光源８から斜め上方に向けて照明光が射出される位置に、ライン光源８を配置してもよい。
【００５５】
さらに、上板１ａの高さが同一である容器１しか使用しない場合には、試料面、反射部材の反射面（上板１ａ）および照明光学系７の相対位置関係が変化しないので、試料Ａへの照明光の照射角度は一定となる。したがって、この場合には、図１９に示されるように、プリズム１０とシリンドリカルレンズ９を省略してもよい。
【００５６】
照明光を反射するための反射部材として容器１の上板１ａを利用することとしたが、これに代えて、容器１の上方に設けた反射部材によって照明光を反射する方式で構成してもよい。
【００５７】
このように構成された本実施形態に係る観察装置２００の作用について以下に説明する。
画像取得部１００により、容器１における培養面の画像Ｇが取得されると、取得された画像Ｇが細胞領域抽出部１１０に送られる。
【００５８】
細胞領域抽出部１１０は、送られて来た画像Ｇにおいてエッジ検出等により複数の細胞領域を抽出する。
そして、抽出された各細胞領域について、細胞高算出部１２０により細胞表面の高さ寸法が算出され、算出された高さ寸法と当該高さ寸法を有する細胞表面の位置情報とが対応づけられて情報記憶部１３０に記憶される。
【００５９】
したがって、観察者が、画像Ｇを観察して、画像Ｇ内の一の細胞領域において特定の細胞Ｘの存在を確認した場合には、当該細胞Ｘにおける高さ寸法と同等の高さ寸法が対応づけられている位置の細胞Ｘを観察することにより、確認された特定の細胞Ｘと同等の性質を有する細胞Ｘについて選択的に観察することができる。
【００６０】
すなわち、画像Ｇ内の全ての箇所を逐次観察する場合と比較して、観察したい特定の細胞Ｘと同等の性質を有する細胞Ｘを選んで観察することができ、時間と手間をかけずに、特定の細胞Ｘを選別することができる。また、細胞高さによって特定の細胞Ｘを選別するので、コロニーＹの大きさが小さい場合であっても、細胞Ｘを精度よく選別することができるという利点がある。
【００６１】
なお、本実施形態においては、細胞高さと位置情報とを対応づけて情報記憶部１３０に記憶することに止めているが、本実施形態においては、情報記憶部１３０に記憶された細胞高さと位置情報とを対応づけて表示する表示部を備えていてもよい。
例えば、図２０に示されるように、表示部が、画像取得部１００から送られて来た画像Ｇを表示するとともに、画像Ｇに重畳して、抽出された細胞領域を最大の高さ寸法に応じて色分けして表示することにしてもよい。
【００６２】
また、コロニーＹか否かを識別する場合に、コロニーＹの面積、形状、テクスチャなどから複数のパラメータによって識別することが好ましい。これにより、目的に即したコロニーＹのみを観察対象とすることができる。
【００６３】
また、細胞Ｘの種類あるいは培養の目的に応じて選択基準を変えてもよい。これにより、目的に即したコロニーＹを選択することができる。この場合には、選択基準のテーブルを備えていれば、選択基準の切替を容易に行うことができる。また、選択基準は観察者が適宜設定できることにしてもよい。
【００６４】
さらに、観察者がいずれかの画像（全体画像）Ｇにおいて、いずれかのコロニーＹを指定したときに、指定されたコロニーＹの時間変化を示す動画を表示することにしてもよい。すなわち、画像取得部１００によって、時間間隔をあけて複数枚の全体画像Ｇを取得しておき、いずれかの全体画像ＧにおいてコロニーＹが指定された場合に、コロニーＹが指定された全体画像Ｇを基準として過去および未来の複数の全体画像Ｇにおける対応するコロニーＹを抽出し、古い画像Ｇから順に所定時間間隔で切り替えて表示すればよい。
【００６５】
指定したコロニーＹを動画表示する場合に、コロニーＹの中心位置を算出し、各画像Ｇにおいて抽出されたコロニーＹの中心位置を動画の中心する範囲で全体画像Ｇから部分画像Ｈを切り出すことにしてもよい。動画再生中にコロニーＹの移動によるブレが少なくなり、コロニーＹの時間変化を視認しやすくすることができる。
【００６６】
また、コロニーＹの動画表示を行う場合には、図７に示されるように、指定されたコロニーＹを含む部分画像Ｈを表示した全体画像Ｇと動画とを同時に表示することが好ましい。
また、画像取得の時間間隔は任意に変更できることにしてもよい。培養初期や大きく動き回る細胞Ｘの撮影時等の形態変化の大きい場合には、時間間隔を小さくすることにより、誤差を減らすことができる。
【００６７】
また、細胞Ｘの高さ寸法と位置情報とを対応づけて情報記憶部１３０に記憶する際に、高さ寸法の近似する細胞領域をグルーピングして記憶することにしてもよい。この場合に、統計手法の１つであるクラスター分析あるいは予め定められた境界値に基づいて、増殖速度の近似する測定領域をグルーピングしてもよい。
【００６８】
また、照明部３は複数の照明を備え、任意に切り替えられることにしてもよい。容器１の壁で照明がケラレる場合に照明を切り替えて画像取得範囲を広げることができる。また、複数方向からの情報を合わせることにより、精度の高い測定が可能となる。
また、ラインセンサ１３の幅は容器１の短辺以上であることが好ましい。これにより１回の操作によって培養面全面の画像Ｇを取得することができる。
【００６９】
また、本実施形態においては、表示部が、画像Ｇに重畳した色分けによって位置情報に対応づけて高さ寸法を表示することとしたが、これに代えて、位置情報と高さ寸法とを数値によって対応づけて表示することにしてもよい。さらに表示部は、図６のような推定断面を合わせて表示してもよい。
本実施形態においては、観察装置２００として、ライン状に撮影することによって細胞表面の勾配に応じて陰影が変化する画像Ｇを取得するものを例示したが、細胞表面の勾配に応じて陰影が変化する画像Ｇが取得可能であればよく、スクエア状に撮影するものを採用してもよい。
【００７０】
以上のような構成により、焦点位置を変更した複数枚の画像Ｇを取得し解析することによって細胞Ｘの高さ寸法を算出する手間が無く、所望の焦点位置の１枚の画像Ｇに基づいて細胞Ｘの高さを算出することが可能である。これにより、容器１内に存在しているｉＰＳ細胞のような特定の細胞を効率的に抽出することができる。
【００７１】
また、本実施形態においては、細胞高算出部１２０によって算出された高さ寸法に基づいて細胞Ｘをクラス分類する分類部を備えていてもよい。これにより、表示部において、分類部によりクラス分類された分類と情報記憶部１３０に記憶されている位置情報とが対応づけて表示されるようになっている。
【００７２】
また、細胞高算出部１２０は、細胞Ｘに対して照明される照明の方向および平行な陰影の変化から細胞表面の高さ寸法を算出してもよい。また、画像取得部１００により取得された画像Ｇを処理して、画像Ｇの陰影から細胞表面の連続する高さ寸法を算出してもよい。
【符号の説明】
【００７３】
１００  画像取得部
１１０  細胞領域抽出部
１２０  細胞高算出部
１３０  情報記憶部（記憶部）
２００  観察装置
Ａ  試料（細胞）
Ｇ，Ｈ  画像
Ｘ  細胞
【図１】
2019176044.tif 000003
【図２】
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【図３】
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【図４】
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【図５】
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【図６】
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【図７】
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【図８】
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【図９Ａ】
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【図９Ｂ】
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【図１０】
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【図１１】
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【図１２】
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【図１３】
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【図１４】
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【図１５】
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【図１６】
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【図１７】
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【図１８Ａ】
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【図１８Ｂ】
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【図１８Ｃ】
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【図１９】
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【図２０】
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【手続補正書】
【提出日】令和2年9月11日(2020.9.11)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
培養中の細胞を撮影することにより、細胞表面の勾配に応じて陰影が変化する画像を取得する画像取得部と、
該画像取得部により取得された画像を処理して、画像の陰影から前記細胞表面の各位置における高さ寸法を算出する細胞高算出部と、
該細胞高算出部により算出された前記細胞表面の高さ寸法と位置情報とを対応づけて記憶する記憶部とを備える観察装置。
【請求項２】
前記画像取得部により取得された画像を処理して前記細胞の存在する細胞領域を抽出する細胞領域抽出部を備え、
前記細胞高算出部が、前記細胞領域抽出部により抽出された前記細胞領域の各位置における前記細胞表面の高さ寸法を算出する請求項１に記載の観察装置。
【請求項３】
前記記憶部に対応づけて記憶されている前記高さ寸法と前記位置情報とを対応づけて表示する表示部を備える請求項２に記載の観察装置。
【請求項４】
前記表示部が、任意に設定された選択基準に基づいて選択された前記細胞領域を表示する請求項３に記載の観察装置。
【請求項５】
前記表示部が、前記細胞領域抽出部により抽出された前記細胞領域を前記高さ寸法に応じて色分けして表示する請求項３に記載の観察装置。
【請求項６】
前記細胞高算出部が算出した前記高さ寸法に基づいて前記細胞をクラス分類する分類部を備え、
前記表示部が、前記分類部によりクラス分類された分類と前記記憶部に記憶されている前記位置情報とを対応づけて表示する請求項３に記載の観察装置。
【請求項７】
前記細胞高算出部が、前記細胞に対して照明される照明の方向に平行な陰影の変化から前記細胞表面の高さ寸法を算出する請求項１に記載の観察装置。
【請求項８】
前記細胞高算出部が、前記画像取得部により取得された画像を処理して、該画像の陰影から前記細胞表面の連続する前記高さ寸法を算出する請求項７に記載の観察装置。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００１２
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００１２】
また、上記態様においては、前記細胞高算出部が算出した前記高さ寸法に基づいて前記細胞をクラス分類する分類部を備え、前記表示部が、前記分類部によりクラス分類された分類と前記記憶部に記憶されている前記位置情報とを対応づけて表示してもよい。
上記態様においては、前記細胞高算出部が、前記細胞に対して照明される照明の方向に平行な陰影の変化から前記細胞表面の高さ寸法を算出してもよい。
また、上記態様においては、前記細胞高算出部が、前記画像取得部により取得された画像を処理して、該画像の陰影から前記細胞表面の連続する前記高さ寸法を算出してもよい。
【手続補正３】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００７２
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００７２】
また、細胞高算出部１２０は、細胞Ｘに対して照明される照明の方向に平行な陰影の変化から細胞表面の高さ寸法を算出してもよい。また、画像取得部１００により取得された画像Ｇを処理して、画像Ｇの陰影から細胞表面の連続する高さ寸法を算出してもよい。
【国際調査報告】
2019176044.tif 000026
2019176044.tif 000027
2019176044.tif 000028
2019176044.tif 000029