(57)【要約】  本発明は、配列番号１のヌクレオチド配列をアンチセンス鎖に含む、がん処置用ＲＮＡｉ分子、有効量の前記ＲＮＡｉ分子を、それを必要とする対象に投与することを含む、がんを処置する方法に関する。【選択図】なし【特許請求の範囲】
【請求項１】
配列番号１のヌクレオチド配列をアンチセンス鎖に含む、がん処置用ＲＮＡｉ分子。
【請求項２】
配列番号１のヌクレオチド配列をアンチセンス鎖に含むＲＮＡｉ分子を含む、がん処置用組成物。
【請求項３】
配列番号１のヌクレオチド配列が、アンチセンス鎖の５’から２〜８位に配置されている、請求項１に記載のＲＮＡｉ分子又は請求項２に記載の組成物。
【請求項４】
ＢｃＬ２ファミリーのタンパク質発現を抑制する、請求項１又は３に記載のＲＮＡｉ分子又は請求項２若しくは３に記載の組成物。
【請求項５】
ＢｃＬ２ファミリーが、ＢｃＬ−ＸＬである、請求項４に記載のＲＮＡｉ分子又は組成物。
【請求項６】
アンチセンス鎖が、配列番号１４のヌクレオチド配列を含む、請求項１、３〜５のいずれか一項に記載のＲＮＡｉ分子又は請求項２〜５のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項７】
がんがＢｃＬ−ＸＬを発現している、請求項１、３〜６のいずれか一項に記載のＲＮＡｉ分子又は請求項２〜６のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項８】
がんが、脳腫瘍、頭頚部がん、乳がん、肺がん、口腔がん、食道がん、胃がん、十二指腸がん、虫垂がん、大腸がん、直腸がん、肝がん、膵がん、胆嚢がん、胆管がん、肛門がん、腎がん、尿管がん、膀胱がん、前立腺がん、陰茎がん、精巣がん、子宮がん、子宮頸がん、卵巣がん、外陰がん、膣がん、皮膚がん、線維肉腫、悪性線維性組織球腫、脂肪肉腫、横紋筋肉腫、平滑筋肉腫、血管肉腫、カポジ肉腫、リンパ管肉腫、滑膜肉腫、軟骨肉腫、骨肉腫、骨髄腫、リンパ腫、白血病からなる群から選択される、請求項７に記載のＲＮＡｉ分子又は医薬組成物。
【請求項９】
有効量の請求項１、３〜８のいずれか一項に記載のＲＮＡｉ分子、又は、請求項２〜８のいずれか一項に記載の組成物を、それを必要とする対象に投与することを含む、がんの治療方法。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
本開示は、がんの処置に有用なＲＮＡｉ分子、当該ＲＮＡｉ分子を用いたがんの処置方法等に関する。
【背景技術】
【０００２】
がん化学療法は、アルキル化剤など、細胞非特異的に細胞毒性を示す薬剤の使用から始まったが、近年は、がん細胞以外の細胞に対してより影響の少ない、がん特有の分子を標的とした分子標的薬に関心が集まっている。こうした状況の中、ＢｃＬ−ＸＬがいくつかの種類のがんで上方調節されていることが報告されている（非特許文献１）。
【先行技術文献】
【非特許文献】
【０００３】
【非特許文献１】Sarosiek and Leta, FEBS J. 2016;283(19):3523-3533
【発明の概要】
【発明が解決しようとする課題】
【０００４】
がん治療薬の開発は世界中で進められているが、依然として有効性の高いがん治療薬が求められている。
【課題を解決するための手段】
【０００５】
本開示の一部の態様は以下に関する。
［１］  配列番号１のヌクレオチド配列をアンチセンス鎖に含む、がん処置用ＲＮＡｉ分子。
［２］  配列番号１のヌクレオチド配列をアンチセンス鎖に含むＲＮＡｉ分子を含む、がん処置用組成物。
［３］  配列番号１のヌクレオチド配列が、アンチセンス鎖の５’から２〜８位に配置されている、［１］に記載のＲＮＡｉ分子又は［２］に記載の組成物。
［４］  ＢｃＬ２ファミリーのタンパク質発現を抑制する、［１］若しくは［３］に記載のＲＮＡｉ分子又は［２］若しくは［３］に記載の組成物。
［５］  ＢｃＬ２ファミリーが、ＢｃＬ−ＸＬである、［４］に記載のＲＮＡｉ分子又は組成物。
［６］  アンチセンス鎖が、配列番号１４（ACUGACUCCAGCUGUAUCC）のヌクレオチド配列を含む、［１］、［３］〜［５］のいずれか一項に記載のＲＮＡｉ分子又は［２］〜［５］のいずれか一項に記載の組成物。
［７］  がんがＢｃＬ−ＸＬを発現している、［１］、［３］〜［６］のいずれか一項に記載のＲＮＡｉ分子又は［２］〜［６］のいずれか一項に記載の組成物。
［８］  がんが、脳腫瘍、頭頚部がん、乳がん、肺がん、口腔がん、食道がん、胃がん、十二指腸がん、虫垂がん、大腸がん、直腸がん、肝がん、膵がん、胆嚢がん、胆管がん、肛門がん、腎がん、尿管がん、膀胱がん、前立腺がん、陰茎がん、精巣がん、子宮がん、子宮頸がん、卵巣がん、外陰がん、膣がん、皮膚がん、線維肉腫、悪性線維性組織球腫、脂肪肉腫、横紋筋肉腫、平滑筋肉腫、血管肉腫、カポジ肉腫、リンパ管肉腫、滑膜肉腫、軟骨肉腫、骨肉腫、骨髄腫、リンパ腫、白血病からなる群から選択される、［７］に記載のＲＮＡｉ分子又は医薬組成物。
［９］  有効量の［１］、［３］〜［８］のいずれか一項に記載のＲＮＡｉ分子、又は、［２］〜［８］のいずれか一項に記載の組成物を、それを必要とする対象に投与することを含む、がんの治療方法。
［１０］  がんの治療ための医薬の製造における、配列番号１のヌクレオチド配列を含むＲＮＡｉ分子の使用。
【発明の効果】
【０００６】
本開示によるＲＮＡｉ分子及び／又は当該ＲＮＡｉ分子を用いたがんの処置方法は、その態様に応じて以下の１又は２以上の効果を奏し得る。
（１）がん細胞の増殖を抑制することができる。
（２）がん細胞にアポトーシスを誘導することができる。
（３）本来標的とするＢｃＬ−ｘＬ以外に、少なくともＢｃＬ−２、Ｓｍａｄ１、Ｐ２１及びＭＲＳ２から選択される特定の遺伝子の発現を抑制する。
（４）ＢｃＬ−ｘＬを標的とする他のＲＮＡｉ分子に比べ、がん細胞増殖抑制能が高い。
（５）ＢｃＬ−ｘＬを標的とする他のＲＮＡｉ分子に比べ、がん細胞殺傷能が高い。
【図面の簡単な説明】
【０００７】
【図１】図１は、ＢｃＬ−ｘＬを標的とするｓｉＲＮＡのＲＮＡ干渉能を比較した図である。縦軸は、ＢｃＬ−ｘＬの発現量をGAPDHの発現量で正規化し、コントロール（Compound Z）を１とした相対値を示す。
【図２】図２は、ＢｃＬ−ｘＬを標的とするｓｉＲＮＡの癌細胞増殖抑制能を比較した図である。縦軸は、コントロール（Compound Z）を１とした生存率の相対値を示す。
【図３−１】図３−１は、Ａ５４９細胞における、ＢｃＬ−ｘＬを標的とするｓｉＲＮＡの癌細胞増殖抑制能及び癌細胞殺傷能を比較した図である。上段は、コントロール（Compound Z）を１とした生存率の相対値、下段は、死細胞数を生細胞数で除した数値をそれぞれ示す。
【図３−２】図３−２は、ＳＷ１９９０細胞における、ＢｃＬ−ｘＬを標的とするｓｉＲＮＡの癌細胞増殖抑制能及び癌細胞殺傷能を比較した図である。上段は、コントロール（Compound Z）を１とした生存率の相対値、下段は、死細胞数を生細胞数で除した数値をそれぞれ示す。
【図３−３】図３−３は、ＳＵＩＴ−２細胞における、ＢｃＬ−ｘＬを標的とするｓｉＲＮＡの癌細胞増殖抑制能及び癌細胞殺傷能を比較した図である。上段は、コントロール（Compound Z）を１とした生存率の相対値、下段は、死細胞数を生細胞数で除した数値をそれぞれ示す。
【図４】図４は、ＢｃＬ−ｘＬを標的とするｓｉＲＮＡの、他の特定の遺伝子の発現抑制能を比較した図である。縦軸は、各種遺伝子の発現量をGAPDHの発現量で正規化し、コントロール（Compound Z）を１とした相対値を示す。
【図５】図５は、CUGACUC含有ｓｉＲＮＡのアポトーシス誘導活性を示した図である。
【図６】図６は、CUGACUC含有ｓｉＲＮＡの、in vivoでの抗腫瘍効果を示した図である。縦軸は腫瘍サイズ（ｍｍ３）を示す。
【図７】図７は、CUGACUC含有ｓｉＲＮＡの、in vivoでの抗腫瘍効果を示した図である。
【発明を実施するための形態】
【０００８】
本明細書において別様に定義されない限り、本明細書で用いる全ての技術用語及び科学用語は、当業者が通常理解しているものと同じ意味を有する。本明細書中で参照する全ての特許、出願及び他の出版物（オンライン情報を含む）は、その全内容を参照により本明細書に援用する。
また、本明細書は、２０１８年１２月５日に出願された本願優先権主張の基礎となる日本国特許出願（特願２０１８−２２８２８４号）の明細書および図面に記載の内容を包含する。
【０００９】
本開示は、一態様において、配列番号１（CUGACUC）のヌクレオチド配列をアンチセンス鎖（又はアンチセンス領域）に含む、ＲＮＡｉ分子（以下、「本開示のＲＮＡｉ分子」と称することがある）に関する。
ＲＮＡｉ分子は、ＲＮＡ干渉を引き起こすことが可能な任意の分子を指す。ＲＮＡ干渉は、典型的には、二本鎖核酸分子が誘導する、標的ＲＮＡが配列特異的に分解される現象を指す。二本鎖核酸分子は細胞内に入ると、その長さに応じてダイサーにより切断された後、その一方の鎖（アンチセンス鎖又はガイド鎖と称する）がArgonaute（ＡＧＯ）タンパク質を含むＲＮＡ誘導サイレンシング複合体（ＲＩＳＣ）に取り込まれる。ＲＩＳＣは、標的ＲＮＡと相補的な配列を有するアンチセンス鎖（ガイド鎖）をガイド役に標的ＲＮＡを認識し、これを切断する。標的ＲＮＡがｍＲＮＡである場合は、ｍＲＮＡがコードするタンパク質等が発現されなくなる（遺伝子サイレンシング）。
【００１０】
本開示のＲＮＡｉ分子としては、限定されずに、例えば、ｓｉＲＮＡ（低分子干渉ＲＮＡ）などのｓｉＮＡ（低分子干渉核酸）、ｓｈＲＮＡ等が挙げられる。ｓｉＮＡは、典型的には、標的配列に相補性を有するアンチセンス鎖と、アンチセンス鎖に相補性を有するセンス鎖とを有し、両方の鎖が少なくとも部分的に二重鎖を形成している、低分子核酸を指す。
ｓｉＮＡにおけるアンチセンス鎖及びセンス鎖は、それぞれ独立して、長さが１５〜４９ヌクレオチド（例えば長さが１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、２９、３０、３１、３２、３３、３４、３５、３６、３７、３８、３９、４０、４１、４２、４３、４４、４５、４６、４７、４８又は４９ヌクレオチド）、１７〜３５ヌクレオチド、１７〜３０ヌクレオチド、１５〜２５ヌクレオチド、１８〜２５ヌクレオチド、１８〜２３ヌクレオチド、１９〜２１ヌクレオチド、２５〜３０ヌクレオチド、又は２６〜２８ヌクレオチドであってもよい。また、二重鎖領域は、長さが１５〜４９ヌクレオチド（例えば、長さが約１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、２９、３０、３１、３２、３３、３４、３５、３６、３７、３８、３９、４０、４１、４２、４３、４４、４５、４６、４７、４８又は４９ヌクレオチド）、１５〜３５ヌクレオチド、１５〜３０ヌクレオチド、約１５〜２５ヌクレオチド、１７〜２５ヌクレオチド、１７〜２３ヌクレオチド、１７〜２１ヌクレオチド、２５〜３０ヌクレオチド、又は２５〜２８ヌクレオチドであってもよい。
【００１１】
一部の態様において、ｓｉＮＡのセンス鎖及びアンチセンス鎖は、別々のポリヌクレオチド鎖である。かかる態様において、アンチセンス鎖及びセンス鎖は、水素結合、例えばワトソン−クリック型塩基対形成を介して、又は、互いに共有結合的に連結されることにより、二本鎖構造を形成していてもよい。別の態様において、センス鎖及びアンチセンス鎖は、センス領域及びアンチセンス領域を有する単一のポリヌクレオチド鎖の一部であり、かかる態様において、ポリヌクレオチド鎖は、ヘアピン構造を有していてもよい。
【００１２】
ｓｉＮＡは、平滑末端又は突出末端を有していてもよい。突出末端は、１、２、３、４、５、６、７又は８ヌクレオチドのオーバーハングを有していてもよい。オーバーハングは、アンチセンス鎖及び／又はセンス鎖の５’末端又は３’末端のいずれか一方、又は、アンチセンス鎖又はセンス鎖の５’末端及び３’末端の両方に存在してもよい。すなわち、オーバーハングは、アンチセンス鎖の５’末端、アンチセンス鎖の３’末端、アンチセンス鎖の５’末端と３’末端の両方、センス鎖の５’末端、センス鎖の３’末端、センス鎖の５’末端と３’末端の両方、アンチセンス鎖の５’末端とセンス鎖の５’末端の両方、又は、アンチセンス鎖の３’末端とセンス鎖の３’末端の両方に存在してもよい。ｓｉＮＡの末端は、対称であっても、非対称であってもよい。末端が対称なｓｉＮＡ（以下、「対称ｓｉＮＡ」と称することもある）としては、例えば、各末端が平滑末端であるもの、アンチセンス鎖とセンス鎖が同じ側に同じオーバーハングを有しているもの（例えば、アンチセンス鎖の５’末端とセンス鎖の５’末端の両方に同数のヌクレオチドのオーバーハングを有するものや、アンチセンス鎖の３’末端とセンス鎖の３’末端の両方に同数のヌクレオチドのオーバーハングを有するもの）等が挙げられる。末端が非対称なｓｉＮＡ（以下、「非対称ｓｉＮＡ」と称することもある）としては、例えば、一方の末端が平滑末端であり、他方の末端が突出末端であるもの、両末端とも突出末端であるが、オーバーハングの位置、長さ及び／又は種類が異なるもの等が挙げられる。両末端とも突出末端である、末端が非対称なｓｉＮＡとしては、例えば、アンチセンス鎖又はセンス鎖の５’末端及び３’末端の両方にオーバーハングを有するもの、アンチセンス鎖及びセンス鎖とも、同じ側（すなわち、５’末端又は３’末端）にオーバーハングを有するが、その長さ及び／又は種類が異なるもの等が挙げられる。オーバーハングの種類が異なるとは、例えば、オーバーハングを構成するヌクレオチドの種類が異なることを意味する。オーバーハングを構成するヌクレオチドは、ＲＮＡ、ＤＮＡ、及び、後述の種々の修飾を有する核酸を含む。したがって、未修飾ＲＮＡのみで構成されるオーバーハングは、修飾ＲＮＡを含むオーバーハングと種類が異なるし、ある修飾ＲＮＡで構成されるオーバーハングは、別の修飾ＲＮＡで構成されるオーバーハングと種類が異なる。
【００１３】
別の態様において、ｓｉＮＡの末端はループ構造を有していてもよい。例えば、ｓｉＮＡは、一端がループ構造であり、他端が平滑末端であるヘアピン構造（１つのポリヌクレオチドにセンス鎖とアンチセンス鎖を有する）を有しても、一端がループ構造であり、他端が突出末端である（例えば１、２、３、４、５、６、７又は８ヌクレオチドのオーバーハングを有する）ヘアピン構造を有していてもよい。後者の場合、オーバーハングは３’オーバーハング又は５’オーバーハングであってもよく、オーバーハングはセンス鎖又はアンチセンス鎖にあってもよい。
一部の態様において、ｓｉＮＡのセンス鎖は１以上のニックを含んでいてもよい。かかる態様において、センス鎖はニックにより分断されており、アンチセンス鎖がＲＩＳＣに取り込まれると、センス鎖はニックの位置で分断された断片を形成する。
【００１４】
ｓｉＮＡは、非修飾ヌクレオチド及び／又は修飾ヌクレオチドを含んでいてもよい。本明細書において、非修飾ヌクレオチド及び修飾ヌクレオチドを、単に「ヌクレオチド」と総称することがある。非修飾ヌクレオチドは、天然に存在するＤＮＡやＲＮＡを構成するヌクレオチド、すなわち、核酸塩基（アデニン、グアニン、ウラシル、チミン、シトシン）と、糖（リボース、デオキシリボース）と、リン酸基とから構成されるものを指す。非修飾ヌクレオチドで構成される非修飾核酸分子において、隣接する２個の非修飾ヌクレオチド同士は通常ホスホジエステル結合により一方の非修飾ヌクレオチドの３’位と他方の非修飾ヌクレオチドの５’位が連結されている。一態様において、非修飾ヌクレオチドは非修飾リボヌクレオチドであり、非修飾核酸分子は非修飾リボヌクレオチドで構成される。
【００１５】
修飾ヌクレオチドは、非修飾ヌクレオチドに対して化学的修飾を含むヌクレオチドを指す。修飾ヌクレオチドは、人工的に合成したものであっても、天然に存在するものであってもよい。修飾ヌクレオチドは、その核酸塩基、糖、バックボーン（ヌクレオチド間結合）、５’末端及び／又は３’末端が修飾されたものを包含する。修飾ヌクレオチドは、上記部位のいずれか１つが修飾されたもののほか、上記部位の２つ以上が修飾されたものも含む。
【００１６】
核酸塩基に対する修飾としては、限定されずに、例えば、２，４−ジフルオロトルイル、２，６−ジアミノ、５−ブロモ、５−ヨード、２−チオ、ジヒドロ、５−プロピニル、及び、５−メチル修飾、脱塩基などが挙げられる。また、修飾核酸塩基としては、限定されずに、例えば、キサンチン、ヒポキサンチン、イノシン、２−アミノアデニン、アデニン及びグアニンの６−メチル誘導体及び他のアルキル誘導体、ユニバーサル塩基、アデニン及びグアニンの２−プロピル誘導体及び他のアルキル誘導体、５−ハロウラシル及び５−ハロシトシン、５−プロピニルウラシル及び５−プロピニルシトシン、６−アゾウラシル、６−アゾシトシン及び６−アゾチミン、５−ウラシル（シュードウラシル）、４−チオウラシル、８−ハロ、アミノ、チオール、チオアルキル、ヒドロキシル及び他の８−置換アデニン及びグアニン、５−トリフルオロメチル及び他の５−置換ウラシル及び５−置換シトシン、７−メチルグアニン、アシクロヌクレオチド、デアザプリン、プリン及びピリミジンの複素環置換アナログ、例えばアミノエチオキシフェノキサジン、プリン及びピリミジンの誘導体（例えば１−アルキル誘導体、１−アルケニル誘導体、複素芳香環誘導体及び１−アルキニル誘導体）及びその互変異性体、８−オキソ−Ｎ６−メチルアデニン、７−ジアザキサンチン、５−メチルシトシン、５−メチルウラシル、５−（１−プロピニル）ウラシル、５−（１−プロピニル）シトシン、４，４−エタノシトシン、非プリン塩基及び非ピリミジン塩基、例えば２−アミノピリジン及びトリアジン、無塩基ヌクレオチド、デオキシ無塩基ヌクレオチド、逆位無塩基ヌクレオチド、逆位デオキシ無塩基ヌクレオチドなどが挙げられる。
【００１７】
糖に対する修飾としては、限定されずに、２’位の修飾、例えば、２’−Ｏ−アルキル修飾（例えば、２’−Ｏ−メチル修飾、２’−Ｏ−エチル修飾等）、２’−メトキシエトキシ修飾、２’−メトキシエチル修飾、２’−デオキシ修飾、２’−ハロゲン修飾（２’−フルオロ修飾、２’−クロロ修飾、２’−ブロモ修飾等）、２’−Ｏ−アリル修飾、２’−アミノ修飾、２’−Ｓ−アルキル修飾、２’−Ｏ−［２（メチルアミノ）−２−オキソエチル］修飾、２’−アルコキシ修飾、２’−Ｏ−２−メトキシエチル、２’−アリルオキシ（−ＯＣＨ２ＣＨ＝ＣＨ２）、２’−プロパルギル、２’−プロピル、２’−Ｏ−（Ｎ−メチルカルバメート）修飾、２’−Ｏ−（２，４−ジニトロフェニル）修飾、２’−デオキシ−２’−フルオロ−β−Ｄ−アラビノ修飾など、４’位の修飾、例えば、４’チオ修飾、４’-Ｃ-ヒドロキシメチル修飾など、その他、エチニル、エテニル、プロペニル、ＣＦ、シアノ、イミダゾール、カルボキシレート、チオエート、Ｃ１〜Ｃ１０低級アルキル、置換低級アルキル、アルカリル又はアラルキル、ＯＣＦ３、ＯＣＮ、Ｏ−、Ｓ−又はＮ−アルキル、Ｏ−、Ｓ−又はＮ−アルケニル、ＳＯＣＨ３、ＳＯ２ＣＨ３、ＯＮＯ２、ＮＯ２、Ｎ３、ヘテロシクロアルキル、ヘテロシクロアルカリル、アミノアルキルアミノ、ポリアルキルアミノ又は置換シリルなどが挙げられる。上記以外の修飾糖としては、例えば、ロックド核酸（ＬＮＡ）、オキセタン−ＬＮＡ（ＯＸＥ）、アンロックド核酸（ＵＮＡ）、エチレン架橋核酸（ＥＮＡ）、アルトリトール核酸（ＡＮＡ）、ヘキシトール核酸（ＨＮＡ）などが挙げられる。
【００１８】
本開示において、アルキル基は、飽和脂肪族基を含み、これは直鎖アルキル基（例えばメチル、エチル、プロピル、ブチル、ペンチル、ヘキシル、ヘプチル、オクチル、ノニル、デシルなど）、分枝鎖アルキル基（イソプロピル、ｔｅｒｔ−ブチル、イソブチルなど）、シクロアルキル（脂環式）基（シクロプロピル、シクロペンチル、シクロヘキシル、シクロヘプチル、シクロオクチル）、アルキル置換シクロアルキル基を含む。一部の態様において、直鎖又は分枝鎖アルキルはその骨格に６個又はそれ未満の炭素原子を有し（例えば、直鎖についてはＣ１〜Ｃ６、分枝鎖についてはＣ３〜Ｃ６）、より好ましくは４個又はそれ未満の炭素原子を有する。同様に、好ましいシクロアルキルは、その環構造中に３〜８個の炭素原子を有してもよく、より好ましくは５個又は６個の炭素を環構造中に有してもよい。用語Ｃ１〜Ｃ６は、１〜６個の炭素原子を含有するアルキル基を含む。アルキル基は、置換アルキル基、例えば、炭化水素骨格の１個又は２個以上の炭素上で水素に置換する置換基を有するアルキル部分であってもよい。かかる置換基は、例えば、アルケニル、アルキニル、ハロゲン、ヒドロキシル、アルキルカルボニルオキシ、アリールカルボニルオキシ、アルコキシカルボニルオキシ、アリールオキシカルボニルオキシ、カルボキシレート、アルキルカルボニル、アリールカルボニル、アルコキシカルボニル、アミノカルボニル、アルキルアミノカルボニル、ジアルキルアミノカルボニル、アルキルチオカルボニル、アルコキシル、ホスフェート、ホスホナト、ホスフィナト、シアノ、アミノ（アルキルアミノ、ジアルキルアミノ、アリールアミノ、ジアリールアミノ及びアルキルアリールアミノを含む）、アシルアミノ（アルキルカルボニルアミノ、アリールカルボニルアミノ、カルバモイル及びウレイドを含む）、アミジノ、イミノ、スルフヒドリル、アルキルチオ、アリールチオ、チオカルボキシレート、硫酸塩、アルキルスルフィニル、スルホナト、スルファモイル、スルホンアミド、ニトロ、トリフルオロメチル、シアノ、アジド、ヘテロシクリル、アルキルアリール又は、芳香族部分又は複素環式芳香族部分を含んでもよい。
【００１９】
本開示において、アルコキシ基は、酸素原子に共有結合的に連結した、置換及び非置換アルキル、アルケニル及びアルキニル基を含む。アルコキシ基の例は、メトキシ、エトキシ、イソプロピルオキシ、プロポキシ、ブトキシ及びペントキシ基を含む。置換アルコキシ基の例は、ハロゲン化アルコキシ基を含む。アルコキシ基は、例えば、アルケニル、アルキニル、ハロゲン、ヒドロキシル、アルキルカルボニルオキシ、アリールカルボニルオキシ、アルコキシカルボニルオキシ、アリールオキシカルボニルオキシ、カルボキシレート、アルキルカルボニル、アリールカルボニル、アルコキシカルボニル、アミノカルボニル、アルキルアミノカルボニル、ジアルキルアミノカルボニル、アルキルチオカルボニル、アルコキシル、ホスフェート、ホスホナト、ホスフィナト、シアノ、アミノ（アルキルアミノ、ジアルキルアミノ、アリールアミノ、ジアリールアミノ及びアルキルアリールアミノを含む）、アシルアミノ（アルキルカルボニルアミノ、アリールカルボニルアミノ、カルバモイル及びウレイドを含む）、アミジノ、イミノ、スルフヒドリル、アルキルチオ、アリールチオ、チオカルボキシレート、硫酸塩、アルキルスルフィニル、スルホナト、スルファモイル、スルホンアミド、ニトロ、トリフルオロメチル、シアノ、アジド、ヘテロシクリル、アルキルアリール又は芳香族部分又は複素環式芳香族部分で置換されていてもよい。ハロゲン置換アルコキシ基の例は、限定されずに、フルオロメトキシに、ジフルオロメトキシ、トリフルオロメトキシ、クロロメトキシ、ジクロロメトキシ、トリクロロメトキシなどを含む。
本開示において、ハロゲンは、フッ素、臭素、塩素、ヨウ素を含む。
【００２０】
修飾バックボーンとしては、限定されずに、例えば、ホスホロチオエート、チオリン酸−Ｄ−リボース体、トリエステル、チオエート、２’−５’結合（５’−２’又は２’５’ヌクレオチド又は２’５’リボヌクレオチドとも称する）、ＰＡＣＥ、ＰＮＡ、３’−（又は−５’）デオキシ−３’−（又は−５’）チオ−ホスホロチオエート、ホスホロジチオエート、ホスホロセレネート、３’−（又は−５’）デオキシホスフィネート、ボラノホスフェート、３’−（又は−５’）デオキシ−３’−（又は５’−）アミノホスホルアミデート、水素ホスホネート、ホスホネート、ボラノリン酸エステル、ホスホルアミデート、アルキル又はアリールホスホネート及びホスホトリエステル修飾、アルキルホスホトリエステル、ホスホトリエステルリン結合、５’−エトキシホスホジエステル、Ｐ−アルキルオキシホスホトリエステル、メチルホスホネート、モルホリノなど、及び非リン含有結合、例えば、炭酸塩、カルバメート、シリル、硫黄、スルホネート、スルホンアミド、ホルムアセタール、チオホルムアセチル、オキシム、メチレンイミノ、メチレンメチルイミノ、メチレンヒドラゾ、メチレンジメチルヒドラゾ及びメチレンオキシメチルイミノなどが挙げられる。
【００２１】
５’末端及び／又は３’末端修飾としては、例えば、５’末端及び／又は３’末端へのキャッピング部分の付加や、５’末端及び／又は３’末端のリン酸基の修飾、例えば、［３〜３’］−逆位デオキシリボース、デオキシリボヌクレオチド、［５’−３’］−３’−デオキシリボヌクレオチド、［５’−３’］−リボヌクレオチド、［５’−３’］−３’−Ｏ−メチルリボヌクレオチド、３’−グリセリル、［３’−５’］−３’−デオキシリボヌクレオチド、［３’−３’］−デオキシリボヌクレオチド、［５’−２’］−デオキシリボヌクレオチド及び［５−３’］−ジデオキシリボヌクレオチドなどが挙げられる。キャッピング部分の非限定例としては、例えば、無塩基ヌクレオチド、デオキシ無塩基ヌクレオチド、逆位（デオキシ）無塩基ヌクレオチド、炭化水素（アルキル）部分及びその誘導体、ミラーヌクレオチド（Ｌ−ＤＮＡ又はＬ−ＲＮＡ）、ＬＮＡ及びエチレン架橋核酸を含む架橋核酸、結合修飾ヌクレオチド（例えばＰＡＣＥ）及び塩基修飾ヌクレオチド、グリセリル、ジヌクレオチド、非環式ヌクレオチド、アミノ、フルオロ、クロロ、ブロモ、ＣＮ、ＣＦ、メトキシ、イミダゾール、カルボキシレート、チオエート、Ｃ１〜Ｃ１０低級アルキル、置換低級アルキル、アルカリル又はアラルキル、ＯＣＦ３、ＯＣＮ、Ｏ−、Ｓ−又はＮ−アルキル、Ｏ−、Ｓ−又はＮ−アルケニル、ＳＯＣＨ３、ＳＯ２ＣＨ３、ＯＮＯ２、ＮＯ２、Ｎ３、ヘテロシクロアルキル、ヘテロシクロアルカリル、アミノアルキルアミノ、ポリアルキルアミノ又は置換シリルなどが挙げられる。キャッピング部分は、非ヌクレオチド突出として機能することもできる。
【００２２】
本開示における修飾ヌクレオチドには、２’−デオキシリボヌクレオチド、２’−Ｏ−メチルリボヌクレオチド、２’−デオキシ−２’−フルオロリボヌクレオチド、ユニバーサル塩基ヌクレオチド、非環式ヌクレオチド、５−Ｃ−メチルヌクレオチド、ビオチン基、及び末端グリセリル及び/又は逆位デオキシ無塩基残基を含むヌクレオチド、立体障害分子、例えば、蛍光分子などを含むヌクレオチド、３’−デオキシアデノシン（コルジセピン）、３’−アジド−３’−デオキシチミジン（ＡＺＴ）、２’，３’−ジデオキシイノシン（ｄｄＩ）、２’，３’−ジデオキシ−３’−チアシチジン（３ＴＣ）、２’，３’−ジデヒドロ−２’，３’−ジデオキシチミジン（ｄ４Ｔ）、及び３’−アジド−３’−デオキシチミジン（ＡＺＴ）、２’，３’−ジデオキシ−３’−チアシチジン（３ＴＣ）又は２’，３’−ジデヒドロ−２’，３’−ジデオキシチミジン（ｄ４Ｔ）を含むヌクレオチド、ノーザンコンフォメーションを有するヌクレオチド、２’−メチルチオエチル、２’−デオキシ−２’−フルオロヌクレオチド、２’−デオキシ−２’−クロロヌクレオチド、２’−アジドヌクレオチド、及び２’−Ｏ−メチルヌクレオチド、６員環ヌクレオチドアナログ（例えば、WO 2006/047842等に記載のヘキシトール及びアルトリトールヌクレオチドモノマーを含むもの）、ミラーヌクレオチド（例えば、Ｌ−ＤＮＡ（Ｌ−デオキシリボアデノシン−３’−ホスフェート（ミラーｄＡ）、Ｌ−デオキシリボシチジン−３’−ホスフェート（ミラーｄＣ）、Ｌ−デオキシリボグアノシン−３’−ホスフェート（ミラーｄＧ）、Ｌ−デオキシリボチミジン−３’−ホスフェート（鏡像チミジン））及びＬ−ＲＮＡ（Ｌ−リボアデノシン−３’−ホスフェート（ミラーｒＡ）、Ｌ−リボシチジン−３’−ホスフェート（ミラーｒＣ）、Ｌ−リボグアノシン−３’−ホスフェート（ミラーｒＧ）、Ｌ−リボウラシル−３’−ホスフェート（ミラーｄＵ）等）が包含される。
【００２３】
修飾ヌクレオチドの非限定例は、例えば、Gaglione and Messere, Mini Rev Med Chem. 2010;10(7):578-95、Deleavey and Damha, Chem Biol. 2012;19(8):937-54、Bramsen and Kjems, J.Front Genet. 2012;3:154などにも記載されている。
一態様において、アンチセンス鎖に含まれるCUGACUC配列はＲＮＡからなる。特定の態様において、アンチセンス鎖に含まれるCUGACUC配列は非修飾ＲＮＡからなる。
【００２４】
ｓｈＲＮＡは、互いに相補性を有するアンチセンス領域及びセンス領域と、その間に介在するループ領域とを含む１本鎖ＲＮＡ分子であり、アンチセンス領域とセンス領域との対合により二重鎖領域が形成され、ヘアピン状の３次元構造を呈する。ｓｈＲＮＡは細胞内でｄｉｃｅｒにより切断され、二本鎖ｓｉＲＮＡ分子を生成し、これがＲＩＳＣに取り込まれ、ＲＮＡ干渉を引き起こす。ｓｈＲＮＡは典型的には、これをコードする核酸構築物や、これを含むプラスミド等により細胞内で発現され、その作用を発揮するが、ｓｈＲＮＡ分子を直接細胞に送達することも可能である。
【００２５】
本開示のＲＮＡｉ分子がｓｈＲＮＡである場合、ｓｉＮＡにおけるアンチセンス鎖に係る記載はｓｈＲＮＡのアンチセンス領域に適用され、ｓｉＮＡにおけるセンス鎖に係る記載はｓｈＲＮＡのセンス領域に適用される。したがって、本開示のｓｈＲＮＡは、アンチセンス領域にCUGACUC配列を含む。また、本開示のｓｈＲＮＡのアンチセンス領域及びセンス領域は、それぞれ独立して、長さが１５〜４９ヌクレオチド、１７〜３５ヌクレオチド、１７〜３０ヌクレオチド、１５〜２５ヌクレオチド、１８〜２５ヌクレオチド、１８〜２３ヌクレオチド、１９〜２１ヌクレオチド、２５〜３０ヌクレオチド、又は２６〜２８ヌクレオチドであってもよい。また、二重鎖領域は、長さが１５〜４９ヌクレオチド、１５〜３５ヌクレオチド、１５〜３０ヌクレオチド、１５〜２５ヌクレオチド、１７〜２５ヌクレオチド、１７〜２３ヌクレオチド、１７〜２１ヌクレオチド、２５〜３０ヌクレオチド、又は２５〜２８ヌクレオチドであってもよい。また、ループ領域の長さは、ｄｉｃｅｒによる切断が可能であれば特に限定されず、例えば、２〜１００ヌクレオチド、３〜８０ヌクレオチド、４〜７０ヌクレオチド、５〜６０ヌクレオチド、６〜５０ヌクレオチド等であってよい。
【００２６】
一態様において、本開示のＲＮＡｉ分子は、ＢｃＬ２ファミリーのタンパク質発現を抑制する。好ましい態様において、ＢｃＬ２ファミリーはアポトーシス抑制性ＢｃＬ２ファミリーである。アポトーシス抑制性ＢｃＬ２ファミリーには、ＢｃＬ−２、ＢｃＬ−ＸＬ、ＢＦＬ１、ＢｃＬ−Ｗなどが含まれる。特に好ましい態様において、ＢｃＬ２ファミリー分子は、ＢｃＬ−ＸＬである。アポトーシス抑制性ＢｃＬ２ファミリー分子は、アポトーシス促進性ＢｃＬ２ファミリー分子（例えば、ＢＡＸ、ＢＯＫ、ＢＡＫなどのマルチドメインタンパク質、ＢＩＭ、ＢＡＤ、ＢＩＤ、ＮＯＸＡ、ＰＵＭＡ（Ｂｂｃ３）、ＢＭＦ、ＨＲＫ、ＢＩＫなどのＢＨ３のみタンパク質（BH3-only protein））との相互作用を通じて、アポトーシスを抑制すると考えられている。特定の態様において、本開示のＲＮＡｉ分子はＢｃＬ−ＸＬの発現を抑制する。
【００２７】
より好ましい態様において、本開示のＲＮＡｉ分子は、ＢｃＬ−ＸＬのほかに、少なくともＢｃＬ−２、Ｓｍａｄ１、Ｐ２１及び、ＭＲＳ２、ＴＪＰ２、ＳＩＫＥ１、ＧＰＡＮＫ１、ＨＳＰＡ１２Ａ及びＴＹＷ３から選択される１種以上の遺伝子の発現を抑制する。特定の態様において、本開示のＲＮＡｉ分子は、少なくとも以下の遺伝子の組合せを含む遺伝子の発現を抑制する：ＢｃＬ−ＸＬ及びＢｃＬ−２、ＢｃＬ−ＸＬ及びＳｍａｄ１、ＢｃＬ−ＸＬ及びＰ２１、ＢｃＬ−ＸＬ及びＭＲＳ２、ＢｃＬ−ＸＬ及びＴＪＰ２、ＢｃＬ−ＸＬ及びＳＩＫＥ１、ＢｃＬ−ＸＬ及びＧＰＡＮＫ１、ＢｃＬ−ＸＬ及びＨＳＰＡ１２Ａ、ＢｃＬ−ＸＬ及びＴＹＷ３、ＢｃＬ−ＸＬ、ＢｃＬ−２及びＳｍａｄ１、ＢｃＬ−ＸＬ、ＢｃＬ−２及びＰ２１、ＢｃＬ−ＸＬ、ＢｃＬ−２及びＭＲＳ２、ＢｃＬ−ＸＬ、Ｓｍａｄ１及びＰ２１、ＢｃＬ−ＸＬ、Ｓｍａｄ１及びＭＲＳ２、ＢｃＬ−ＸＬ、Ｐ２１及びＭＲＳ２、ＢｃＬ−ＸＬ、Ｓｍａｄ１、Ｐ２１及びＭＲＳ２。
【００２８】
遺伝子発現又はタンパク質発現の抑制は、例えば、本開示のＲＮＡｉ分子を作用させた細胞と作用させていない細胞における遺伝子又はタンパク質の発現量を比較することにより評価することができる。遺伝子の発現量は、既知の任意の手法、例えば、当該遺伝子をコードする核酸分子若しくはそのユニークな断片に特異的にハイブリダイズする核酸を利用した、種々のハイブリダイゼーション法、ノーザンブロット法、サザンブロット法、種々のＰＣＲ法などにより前記核酸分子を検出することにより決定することができる。また、タンパク質の発現量は、既知のタンパク質検出手法、例えば、限定されずに、抗体を利用した免疫沈降法、ＥＩＡ（enzyme immunoassay）（例えば、ＥＬＩＳＡ（emzyme-linked immunosorbent assay）など）、ＲＩＡ（radio immuno assay）（例えば、ＩＲＭＡ（immunoradiometric assay）、ＲＡＳＴ（radioallergosorbent test）、ＲＩＳＴ（radioimmunosorbent test）など）、ウエスタンブロッティング法、免疫組織化学法、免疫細胞化学法、フローサイトメトリー法などにより決定することができる。
【００２９】
一態様において、本開示のＲＮＡｉ分子はＢｃＬ−ＸＬをコードするＢｃＬ２Ｌ１を標的とする。ＢｃＬ２Ｌ１の配列は公知であり、ヒトＢｃＬ２Ｌ１のｍＲＮＡの配列は、例えば、アクセッション番号NM_138578.3（配列番号２）、NM_001317919.1（配列番号３）、NM_001317920.1（配列番号４）、NM_001317921.1（配列番号５）、NM_001322239.1（配列番号６）、NM_001322240.1（配列番号７）、NM_001322242.1（配列番号８）として登録されている。本開示のＲＮＡｉ分子のアンチセンス鎖は配列番号１のヌクレオチド配列を含むため、本開示のＲＮＡｉ分子は、典型的には、ＢｃＬ２Ｌ１における配列番号１と相補性を有する配列（ＧＡＧＴＣＡＧ、配列番号９）を含む領域を標的とする。「相補性を有する」又は「相補的な」は、ある核酸分子が、他の核酸分子と、古典的なワトソン−クリック型か、又は他の非古典的なタイプにより水素結合を形成できることを意味する。「相補性パーセント」は、ある核酸分子と水素結合（例えば、ワトソン−クリック塩基対）を形成することができる他の核酸分子のヌクレオチドのパーセンテージを示す。例えば、第１のオリゴヌクレオチドの合計１０ヌクレオチドのうち５、６、７、８、９又は１０ヌクレオチドが、１０個のヌクレオチドを有する第２のオリゴヌクレオチドと塩基対を形成する場合、相補性パーセントは、それぞれ、５０％、６０％、７０％、８０％、９０％及び１００％となる。「完全に相補的」又は「完全な相補性を有する」は、ある核酸分子の全てのヌクレオチドが、他の核酸分子における同じ数の連続するヌクレオチドと水素結合することを意味する。一態様において、本開示のＲＮＡｉ分子のアンチセンス鎖は、標的核酸分子又はその部分と完全に相補的である。
【００３０】
好ましい態様において、本開示のＲＮＡｉ分子は、アンチセンス鎖（又はアンチセンス領域）の５’末端から２〜８位に配列番号１のヌクレオチド配列を有する。特定の好ましい態様において、本開示のＲＮＡｉ分子は、以下の配列を含むアンチセンス鎖（又はアンチセンス領域）を有する。なお、標的部位はNM_138578.3（配列番号２）における位置を示す。
【表１】
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【００３１】
本開示のＲＮＡｉ分子は作用部位への送達を補助、促進又は容易化する作用を有する既知の任意の送達担体とともに送達又は投与されてもよいし、これらの送達担体なしで直接送達又は投与されてもよい。送達担体としては、ウイルスベクター又は非ウイルスベクターを用いることができる。
【００３２】
ウイルスベクターとしては、限定されずに、アデノウイルス、アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）、レトロウイルス、ワクシニアウイルス、ポックスウイルス、レンチウイルス、ヘルペスウイルスなどをベースとするベクターが挙げられる。ウイルスベクターは、腫瘍溶解性であってもよい。腫瘍溶解性ウイルスベクターはがんの処置に特に有用である。
【００３３】
非ウイルスベクターとしては、限定されずに、例えば、ポリマー粒子、脂質粒子、無機粒子などの粒子状担体、細菌ベクター等が挙げられる。粒子状担体としては、大きさがナノレベルのナノ粒子を用いることができる。ポリマー粒子としては、限定されずに、例えば、カチオン性ポリマー、ポリアミドアミン（ＰＡＭＡＭ）、キトサン、シクロデキストリン、ポリ（乳酸−コ−グリコール酸）（ＰＬＧＡ）、ポリ（乳酸−コ−カプロラクトン酸）（ＰＬＣＡ）、ポリ（βアミノエステル）、アテロコラーゲンなどのポリマーを含むものが挙げられる。脂質粒子にはリポソームや非リポソーム型脂質粒子などが含まれる。リポソームは脂質二重膜で包まれた内腔を有する小胞であり、非リポソーム型脂質粒子は、このような構造を有しない脂質粒子である。無機粒子としては、例えば、金ナノ粒子、量子ドット、シリカナノ粒子、酸化鉄ナノ粒子（例えば、超常磁性酸化鉄ナノ粒子（ＳＰＩＯＮ））、ナノチューブ（例えば、カーボンナノチューブ（ＣＮＴ））、ナノダイヤモンド、フラーレンなどが挙げられる。細菌ベクターとしては、限定されずに、例えば、リステリア菌、ビフィズス菌、サルモネラ菌などをベースにしたものが挙げられる。
【００３４】
本開示のＲＮＡｉ分子は皮膚適用、経皮適用又は注射（静脈注射、皮内注射、皮下注射、筋肉注射、動脈注射、点滴注射等）を介して、全身投与あるいは関係する組織にex vivo又はin vivoで、局所投与することができる。
【００３５】
本開示のＲＮＡｉ分子は、目的に適した送達システムにより送達することができる。送達システムは、例えば、水性及び非水性のゲル、クリーム、複エマルション、マイクロエマルション、リポソーム、軟膏、水性及び非水性の溶液、ローション、エアゾール、炭化水素基剤及びパウダーなどを含んでもよく、賦形剤、例えば可溶化剤、浸透促進剤（例えば脂肪酸、脂肪酸エステル、脂肪族アルコール及びアミノ酸など）及び親水性ポリマー（例えばポリカルボフィル及びポリビニルピロリドンなど）を含むことができる。一態様において、薬学的に許容し得る担体は、リポソーム又は経皮促進剤である。
【００３６】
送達システムは、パッチ、錠剤、坐薬、ペッサリー、ゲル及びクリームを含んでもよく、賦形剤、例えば可溶化剤及び促進剤（例えばプロピレングリコール、胆汁酸塩及びアミノ酸など）、及び他のビヒクル（例えば、ポリエチレングリコール、脂肪酸エステル及び誘導体、及び親水性ポリマー、例えばヒドロキシプロピルメチルセルロース及びヒアルロン酸など）を含むことができる。
本開示のＲＮＡｉ分子の送達に有用な手法やシステムは、例えば、Rettig and Behlke, Mol Ther. 2012;20(3):483-512、Kraft et al., J Pharm Sci. 2014;103(1):29-52、Hong and Nam, Theranostics. 2014;4(12):1211-32、Kaczmarek et al., Genome Med. 2017;9(1):60 などに記載されている。
【００３７】
本開示の一部の態様は、本開示のＲＮＡｉ分子を含む組成物に関する（以下、本開示の組成物と称することがある）。本開示の組成物は、本開示のＲＮＡｉ分子に加え、上述の任意の担体、希釈剤、送達ビヒクル、送達システムなどを含んでもよい。本開示の組成物は、がんなどの疾患の処置に使用できる。したがって、本開示の組成物は、がんなどの疾患の処置のための医薬組成物となり得る（以下、本開示の医薬組成物と称することがある）。本開示の医薬組成物は、１又は２以上の薬学的に許容し得る添加物（例えば、界面活性剤、担体、希釈剤、賦形剤など）を含んでもよい。薬学的に許容し得る添加物は医薬分野でよく知られており、例えば、その全体を本明細書に援用するRemington's Pharmaceutical Sciences, 18th Ed., Mack Publishing Co., Easton, PA (1990)などに記載されている。
【００３８】
一部の態様において、本開示のＲＮＡｉ分子及び医薬組成物は、がんの処置のために使用することができる。がんは、上皮性悪性腫瘍及び非上皮性悪性腫瘍を含む。処置の対象となるがんとしては、限定されずに、例えば、脳腫瘍、頭頚部がん、乳がん、肺がん、口腔がん、食道がん、胃がん、十二指腸がん、虫垂がん、大腸がん、直腸がん、肝がん、膵がん、胆嚢がん、胆管がん、肛門がん、腎がん、尿管がん、膀胱がん、前立腺がん、陰茎がん、精巣がん、子宮がん、子宮頸がん、卵巣がん、外陰がん、膣がん、皮膚がん、線維肉腫、悪性線維性組織球腫、脂肪肉腫、横紋筋肉腫、平滑筋肉腫、血管肉腫、カポジ肉腫、リンパ管肉腫、滑膜肉腫、軟骨肉腫、骨肉腫、骨髄腫、リンパ腫、白血病などが挙げられる。がんは、任意の部位、例えば、脳、頭頚部、胸部、四肢、肺、心臓、胸腺、食道、胃、小腸（十二指腸、空腸、回腸）、大腸（結腸、盲腸、虫垂、直腸）、肝臓、膵臓、胆嚢、肛門、腎、尿管、膀胱、前立腺、陰茎、精巣、子宮、卵巣、外陰、膣、皮膚、横紋筋、平滑筋、滑膜、軟骨、骨、甲状腺、副腎、腹膜、腸間膜、骨髄、血液、血管系、リンパ節等のリンパ系、リンパ液などに存在し得る。
【００３９】
特定の態様において、本開示のＲＮＡｉ分子及び医薬組成物は、ＢｃＬ−ＸＬを発現しているがんの処置のために使用することができる。好ましい態様において、がんにおけるＢｃＬ−ＸＬは過剰発現されている。あるがんがＢｃＬ−ＸＬを発現しているか否か、又は、ＢｃＬ−ＸＬを過剰発現しているか否かは、文献などにより知られているか、そのがんを構成するがん細胞におけるＢｃＬ−ＸＬの発現を検出することなどにより決定することができる。ＢｃＬ−ＸＬの発現は、既知の任意の手法、例えば、ＢｃＬ−ＸＬをコードする核酸分子（Ｂｃｌ２Ｌ１）若しくはそのユニークな断片に特異的にハイブリダイズする核酸を利用した、種々のハイブリダイゼーション法、ノーザンブロット法、サザンブロット法、種々のＰＣＲ法などにより前記核酸分子を検出することや、ＢｃＬ−ＸＬを、既知のタンパク質検出手法、例えば、限定されずに、抗体を利用した免疫沈降法、ＥＩＡ（例えば、ＥＬＩＳＡなど）、ＲＩＡ（例えば、ＩＲＭＡ、ＲＡＳＴ、ＲＩＳＴなど）、ウエスタンブロッティング法、免疫組織化学法、免疫細胞化学法、フローサイトメトリー法などで検出することなどにより決定することができる。がん細胞におけるＢｃＬ−ＸＬの過剰発現は、Ｂｃｌ２Ｌ１遺伝子の増幅による場合があるため、Ｂｃｌ２Ｌ１遺伝子の増幅をＢｃＬ−ＸＬの過剰発現の１つの指標とすることができる。膀胱がん、乳がん、頭頚部がん、肺がん、胃がん、子宮がんなどでＢｃｌ２Ｌ１遺伝子の増幅がみられることが報告されている（Campbell and Tait, Open Biol. 2018;8(5):180002）。
【００４０】
本開示のＲＮＡｉ分子による処置の対象となるがんは、好ましくは、ＢｃＬ−ＸＬのほかに、ＢｃＬ−２、Ｓｍａｄ１、Ｐ２１、ＭＲＳ２、ＴＪＰ２、ＳＩＫＥ１、ＧＰＡＮＫ１、ＨＳＰＡ１２Ａ及びＴＹＷ３から選択される１種以上の遺伝子を発現している。特定の態様において、本開示のＲＮＡｉ分子による処置の対象となるがんは、少なくとも以下の遺伝子の組合せを含む遺伝子を発現している：ＢｃＬ−ＸＬ及びＢｃＬ−２、ＢｃＬ−ＸＬ及びＳｍａｄ１、ＢｃＬ−ＸＬ及びＰ２１、ＢｃＬ−ＸＬ及びＭＲＳ２、ＢｃＬ−ＸＬ、ＢｃＬ−２及びＳｍａｄ１、ＢｃＬ−ＸＬ及びＴＪＰ２、ＢｃＬ−ＸＬ及びＳＩＫＥ１、ＢｃＬ−ＸＬ及びＧＰＡＮＫ１、ＢｃＬ−ＸＬ及びＨＳＰＡ１２Ａ、ＢｃＬ−ＸＬ及びＴＹＷ３、ＢｃＬ−ＸＬ、ＢｃＬ−２及びＰ２１、ＢｃＬ−ＸＬ、ＢｃＬ−２及びＭＲＳ２、ＢｃＬ−ＸＬ、Ｓｍａｄ１及びＰ２１、ＢｃＬ−ＸＬ、Ｓｍａｄ１及びＭＲＳ２、ＢｃＬ−ＸＬ、Ｐ２１及びＭＲＳ２、ＢｃＬ−ＸＬ、Ｓｍａｄ１、Ｐ２１及びＭＲＳ２。
【００４１】
本開示において、「処置」は、疾患の治癒、一時的寛解又は予防などを目的とする医学的に許容される全ての種類の予防的及び／又は治療的介入を包含するものとする。例えば、「処置」は、疾患の進行の遅延又は停止、病変の退縮又は消失、当該疾患発症の予防又は再発の防止などを含む、種々の目的の医学的に許容される介入を包含する。したがって、前記ＲＮＡｉ分子及び医薬組成物は、疾患の治療及び／又は予防に用いることができる。
【００４２】
本開示のＲＮＡｉ分子及び医薬組成物はまた、アポトーシスの異常に起因する疾患、例えば、細胞の異常増殖に起因する疾患などの処置のために使用することができる。細胞の異常増殖に起因する疾患としては、限定されずに、例えば、良性又は悪性腫瘍、過形成症、ケロイド、クッシング症候群、原発性アルドステロン症、紅板症、真性多血症、白板症、過形成瘢痕、扁平苔癬及び黒子症などを含む。
本開示のＲＮＡｉ分子及び医薬組成物はまた、ＢｃＬ−ＸＬの発現に起因する疾患、例えば、ＢｃＬ−ＸＬの発現に伴う細胞の異常増殖に起因する疾患などの処置のために使用することができる。細胞の異常増殖に起因する疾患としては、限定されずに、例えば、良性又は悪性腫瘍、リンパ増殖性疾患などを含む。
【００４３】
本開示のＲＮＡｉ分子又は医薬組成物は、経口及び非経口の両方を包含する種々の経路、例えば、限定することなく、経口、頬側、口腔内、静脈内、筋肉内、皮下、皮内、局所、直腸、動脈内、門脈内、心室内、経粘膜、経皮、鼻腔内、腹腔内、気道内、肺内及び子宮内等の経路で投与してもよく、各投与経路に適した剤形に製剤してもよい。かかる剤形及び製剤方法は任意の公知のものを適宜採用することができる（例えば、Remington's Pharmaceutical Sciences, 18th Ed., Mack Publishing Co., Easton, PA (1990)などを参照）。
【００４４】
例えば、経口投与に適した剤形としては、限定することなく、散剤、顆粒剤、錠剤、カプセル剤、液剤、懸濁剤、乳剤、ゲル剤、シロップ剤などが挙げられ、また非経口投与に適した剤形としては、溶液性注射剤、懸濁性注射剤、乳濁性注射剤、用時調製型注射剤などの注射剤が挙げられる。非経口投与用製剤は、水性又は非水性の等張性無菌溶液又は懸濁液の形態であることができる。
【００４５】
本開示に係る組成物は、いずれの形態で供給されてもよいが、保存安定性の観点から、用時調製可能な形態、例えば、医療の現場あるいはその近傍において、医師及び／又は薬剤師、看護士、若しくはその他のパラメディカルなどによって調製され得る形態で提供されてもよい。この場合、前記組成物は、これらに必須の構成要素の少なくとも１つを含む１個又は２個以上の容器として提供され、使用の前、例えば、２４時間前以内、好ましくは３時間前以内、そしてより好ましくは使用の直前に調製される。調製に際しては、調製する場所において通常入手可能な試薬、溶媒、調剤器具などを適宜使用することができる。
【００４６】
本開示のさらなる態様は、本開示に係るＲＮＡｉ分子若しくは組成物、又はその構成要素を含む、前記ＲＮＡｉ分子若しくは組成物を調製するための、疾患を処置するためのキット又はパック、並びに、そのようなキット又はパックの形で提供される前記ＲＮＡｉ分子若しくは組成物、又はその必要構成要素にも関する。かかるキット又はパックに含まれる、ＲＮＡｉ分子若しくは組成物の各構成要素は、前記ＲＮＡｉ分子若しくは組成物について上記した通りである。本キットは、上記のほか、ＲＮＡｉ分子若しくは組成物の調製方法や使用方法（例えば、投与方法等）などに関する指示、例えば、使用説明書や、使用方法に関する情報を記録した媒体、例えば、フレキシブルディスク、ＣＤ、ＤＶＤ、ブルーレイディスク、メモリーカード、ＵＳＢメモリーなどをさらに含んでいてもよい。また、かかるキット又はパックは、ＲＮＡｉ分子若しくは組成物を完成するための構成要素の全てを含んでいてもよいが、必ずしも全ての構成要素を含んでいなくてもよい。したがって、前記キット又はパックは、医療現場や、実験施設などで通常入手可能な試薬や溶媒、例えば、無菌水や、生理食塩水、ブドウ糖溶液などを含んでいなくてもよい。
【００４７】
本開示の別の態様は、がん、アポトーシスの異常に起因する疾患又はＢｃＬ−ＸＬの発現に起因する疾患を処置する方法であって、該方法が、有効量の本開示に係るＲＮＡｉ分子又は医薬組成物を、それを必要とする対象に投与する工程を含む、前記方法に関する（以下、「本開示の処置方法」と称することがある）。ここで、有効量とは、例えば、当該疾患の発症及び再発を予防し、又は当該疾患を治癒する量である。
【００４８】
前記処置方法において対象に投与するＲＮＡｉ分子又は医薬組成物の具体的な用量は、投与を要する対象に関する種々の条件、例えば、標的の種類、方法の目的、治療内容、疾患の種類、症状の重篤度、対象の一般健康状態、年齢、体重、対象の性別、食事、投与の時期及び頻度、併用している医薬、治療への反応性、及び治療に対するコンプライアンスなどを考慮して決定され得る。前記ＲＮＡｉ分子又は医薬組成物の１日総投与量は、限定されずに、例えば、ＲＮＡｉ分子の量として約１μｇ／ｋｇ〜約１０００ｍｇ／体重ｋｇ、約１０μｇ／ｋｇ〜約１００ｍｇ／体重ｋｇ、約１００μｇ／ｋｇ〜約１０ｍｇ／体重ｋｇであってもよい。あるいは、投与量は患者の表面積に基づいて計算してもよい。
【００４９】
投与経路としては、経口及び非経口の両方を包含する種々の経路、例えば、経口、頬側、口腔内、静脈内、筋肉内、皮下、皮内、局所、直腸、動脈内、門脈内、心室内、経粘膜、経皮、鼻腔内、腹腔内、気道内、肺内及び子宮内等の経路が含まれる。
投与頻度は、用いる製剤又は組成物の性状や、上記のような対象の条件によって異なるが、例えば、１日多数回（すなわち１日２、３、４回又は５回以上）、１日１回、数日毎（すなわち２、３、４、５、６、７日毎など）、１週間に数回（例えば、１週間に２、３、４回など）、１週間毎、数週間毎（すなわち２、３、４週間毎など）であってもよい。
【００５０】
本開示において、用語「対象」は、任意の生物個体、好ましくは動物、さらに好ましくは哺乳動物、さらに好ましくはヒトの個体を意味する。対象は健常（例えば、特定の又は任意の疾患を有しない）であっても、何らかの疾患に罹患していてもよいものとするが、標的核酸分子に関連する疾患の処置等が企図される場合には、典型的には当該疾患に罹患しているか、罹患するリスクを有する対象を意味する。
【００５１】
本開示の別の側面は、がん、アポトーシスの異常に起因する疾患及び／又はＢｃＬ−ＸＬの発現に起因する疾患の処置のための医薬の製造における、本開示のＲＮＡｉ分子の使用（以下、「本開示の使用」と称することがある）に関する。
本開示の使用における「がん」、「アポトーシスの異常に起因する疾患」、「ＢｃＬ−ＸＬの発現に起因する疾患」、「処置」の各用語は、本開示のＲＮＡｉ分子について上記した通りである。
【実施例】
【００５２】
以下の例で本開示の一部の態様をより詳細に説明するが、これらの例は例証を目的とするものであり、前記態様の範囲を制限するものではない。【００５３】
例１  ＢｃＬ−ｘＬを標的とするｓｉＲＮＡのＲＮＡｉ機能評価
ＢｃＬ−ｘＬを標的とするｓｉＲＮＡとして、以下のものを使用して実験を行った。なお、配列中の大文字はＲＮＡ、小文字はＤＮＡを示す。
化合物Ｘ（CUGACUC配列をアンチセンス鎖に含む）
センス鎖：5'-GGAUACAGCUGGAGUCAGUtt-3’（配列番号31）
アンチセンス鎖：5'-ACUGACUCCAGCUGUAUCCtt-3’（配列番号32）
化合物Ｙ（CUGACUC配列をアンチセンス鎖に含まない）
センス鎖：5'-GGUAUUGGUGAGUCGGAUCtt-3’（配列番号33）
アンチセンス鎖：5'-GAUCCGACUCACCAAUACCtt-3’（配列番号34）
化合物Ｚ（コントロール、Allstars negative control siRNA（QIAGEN社））【００５４】
大腸癌細胞株ＨＣＴ１１６を、非働化処理したウシ胎仔血清（ＦＢＳ）を１０％、抗生物質として１００Ｕ／ｍＬのpenicillin、１００μｇ／ｍＬのstreptomycinを含むＤＭＥＭ培地で、３７℃、５％ＣＯ２の条件下で培養を行った。
ｓｉＲＮＡのトランスフェクションは、次の通りに行った。トランスフェクションの前日、ＨＣＴ１１６細胞を０．１×１０５個／ウェルとなるように６ウェル組織培養プラスチックディッシュに播種した。２５０μＬのOpti-MEM I Reduced Serum Medium（Invitrogen）中に各種ｓｉＲＮＡを２５ｐｍｏｌ加え、穏やかに混合した。次に、Lipofectamine RNAiMAX（Invitrogen）を２５０μＬのOpti-MEM I Reduced Serum Medium中に５μＬ希釈し、穏やかに混合した。希釈したｓｉＲＮＡと希釈したLipofectamine RNAiMAXを合わせ、穏やかに混合した後、室温で１５分間インキュベートした。この間、培地を２ｍＬのOpti-MEM I Reduced Serum Mediumに交換した。１５分間のインキュベーション後、ｓｉＲＮＡとLipofectamine RNAiMAXとの複合体を細胞に加え、３７℃、５％ＣＯ２を含む大気下でインキュベートした。５時間のインキュベーション後、３ｍＬの１０％ＦＢＳ入りＤＭＥＭ培地に交換した。トランスフェクション後１日目にＲＮＡを回収し、逆転写してｃＤＮＡにした後、ＢｃＬ−ｘＬのｍＲＮＡ量を7300 Real Time PCR System（Applied BioSystems）を用いて、定量ＰＣＲ法にて定量した。図１の結果が示すように、化合物Ｘと化合物ＹはＢｃＬ−ｘＬに対し同程度の発現抑制効果を示した。【００５５】
例２  ＢｃＬ−ｘＬを標的とするｓｉＲＮＡのがん細胞増殖抑制能の検証
大腸癌細胞株ＨＣＴ１１６、乳癌細胞株ＭＤＡ−ＭＢ−２３１、皮膚癌細胞株Ａ３７５、大腸癌細胞株ＳＷ４８０を、ＨＣＴ１１６はＭｃＣＯＹ’ｓ  ５Ａ培地（Sigma-Aldrich社）、ＭＤＡ−ＭＢ−２３１、Ａ３７５、ＳＷ４８０はＤＭＥＭ培地（Sigma-Aldrich社）（それぞれ、非働化処理したウシ胎仔血清（ＦＢＳ）を１０％、抗生物質として１００Ｕ／ｍＬのpenicillin、１００μｇ／ｍＬのstreptomycinを含む）で、３７℃、５％ＣＯ２の条件下で培養を行った。【００５６】
ｓｉＲＮＡ（化合物Ｘ〜Ｚ）のトランスフェクションは、次の通りに行った。トランスフェクションの前日、ＨＣＴ１１６、Ａ３７５は、０．２５×１０５個／ウェル、ＭＤＡ−ＭＢ−２３１、ＳＷ４８０は、０．５×１０５個／ウェルとなるように６ウェル組織培養プラスチックディッシュに播種した。１２５μＬのOpti-MEM I Reduced Serum Medium（Invitrogen）中にｓｉＲＮＡを２７．５ｐｍｏｌ加え、穏やかに混合した。次に、Lipofectamine RNAiMAX（Invitrogen）を１２５μＬのOpti-MEM I Reduced Serum Medium中に３μＬ希釈し、穏やかに混合した。希釈したｓｉＲＮＡと希釈したLipofectamine RNAiMAXを合わせ、穏やかに混合した後、室温で１５分間インキュベートした。この間、培地を２．５ｍＬのOpti-MEM I Reduced Serum Mediumに交換した。１５分間のインキュベーション後、ｓｉＲＮＡとLipofectamine RNAiMAXとの複合体を細胞に加え、３７℃、５％ＣＯ２を含む大気下でインキュベートした。５時間のインキュベーション後、３ｍＬの１０％ＦＢＳ入り培地に交換した。トランスフェクション後、３日目に細胞数を計測した。図２の結果が示すように、いずれの癌細胞においても、化合物Ｙより化合物Ｘの方が強く増殖を抑制した。【００５７】
例３  ＢｃＬ−ｘＬを標的とするｓｉＲＮＡのがん細胞増殖抑制能及びがん細胞殺傷能の検証
肺癌細胞株Ａ５４９、膵臓癌細胞株ＳＵＩＴ−２、膵臓癌細胞株ＳＷ１９９０を、Ａ５４９はＤＭＥＭ培地（Sigma-Aldrich社）、ＳＵＩＴ−２はＭＥＭ培地（Sigma-Aldrich社）、ＳＷ１９９０はＲＰＭＩ１６４０（Sigma-Aldrich社）（それぞれ、非働化処理したウシ胎仔血清（ＦＢＳ）を１０％、抗生物質として１００Ｕ／ｍＬのpenicillin、１００μｇ／ｍＬのstreptomycinを含む）で、３７℃、５％ＣＯ２の条件下で培養を行った。【００５８】
ｓｉＲＮＡ（化合物Ｘ〜Ｚ）のトランスフェクションは、次の通りに行った。トランスフェクションの前日、それぞれの細胞をＡ５４９、ＳＵＩＴ−２は、０．１５×１０４個／ウェル、ＳＷ１９９０は、０．４５×１０４個／ウェルとなるように９６ウェル組織培養プラスチックディッシュに播種した。５μＬのOpti-MEM I Reduced Serum Medium（Invitrogen）中にｓｉＲＮＡを１．１ｐｍｏｌ加え、穏やかに混合した。次に、Lipofectamine RNAiMAX（Invitrogen）を４．８８μＬのOpti-MEM I Reduced Serum Medium中に０．１２μＬ希釈し、穏やかに混合した。希釈したｓｉＲＮＡと希釈したLipofectamine RNAiMAXを合わせ、穏やかに混合した後、室温で１５分間インキュベートした。この間、培地を１００μＬのOpti-MEM I Reduced Serum Mediumに交換した。１５分間のインキュベーション後、ｓｉＲＮＡとLipofectamine RNAiMAXとの複合体を細胞に加え、３７℃、５％ＣＯ２を含む大気下でインキュベートした。【００５９】
５時間のインキュベーション後、３ｍＬの１０％ＦＢＳ入りのそれぞれの培地に交換した。トランスフェクション後４日目に、Hoechst 33342（Thermo Fisher社、#H3570）とヨウ化プロピジウム（Wako社、#169-26281）をそれぞれ終濃度が、５μｇ／ｍＬ、２μｇ／ｍＬとなるように培地に添加し、Celigo(R) Image Cytometer（Nexcelom Bioscience社、#Celigo-106-0448）にて、Hoechst 33342で染色された細胞を生細胞数と死細胞数の合計として、ヨウ化プロピジウムで染色された細胞を死細胞数として、生細胞数、死細胞数を計測した。図３−１〜３−３の結果が示すように、いずれの癌細胞においても、化合物Ｙより化合物Ｘの方が強く増殖を抑制し、細胞死の割合も化合物Ｙより化合物Ｘの方が多かった。【００６０】
例４  化合物ＸによるＢｃＬ−ｘＬ以外の遺伝子発現への影響
例１と同様にｓｉＲＮＡをＨＣＴ１１６細胞に導入、インキュベートした後、ＲＮＡを回収し、逆転写してｃＤＮＡにした。得られたｃＤＮＡを用い、ＢＣＬ２、ＳＭＡＤ１、Ｐ２１、ＭＲＳ２のｍＲＮＡ量を7300 Real Time PCR System（Applied Bio Systems）により、定量ＰＣＲ法にて定量した。図４の結果が示すように、化合物ＹはＢＣＬ２、ＳＭＡＤ１、Ｐ２１、ＭＲＳ２の発現を抑制しなかったのに対し、化合物Ｘは、これらすべての遺伝子の発現を抑制した。【００６１】
例５  化合物Ｘのアポトーシス誘導活性の検証
細胞の播種密度を０．２×１０５個／ウェルとした以外は例１と同様にして、ｓｉＲＮＡをＨＣＴ１１６細胞に導入、インキュベートした。トランスフェクション後３日目に細胞抽出液を調製し、アポトーシスシグナルである活性化カスパーゼ−３並びに活性化ＰＡＲＰの発現変化をウエスタンブロットにより解析した。
ウエスタンブロットは次のように行った。細胞は氷冷ＰＢＳで洗浄後、TNE lysis buffer（１％ＮＰ−４０、５０ｍＭ  Ｔｒｉｓ−ＨＣｌ、１５０ｍＭ  ＮａＣｌ、１ｍＭ  ＥＤＴＡ、complete Mini EDTA-free（Roche社）、PhosSTOP（Roche社）、ｐＨ７．５）を加え、氷冷で３０分間インキュベートすることで可溶化した。その後、１５０００ｒｐｍ、４℃の条件で１５分間遠心し、上清を細胞抽出液とした。得られた細胞抽出液は、Micro BCA Protein Assay Kit（Thermo Scientific）を用いてタンパク質の定量を行い、１０μｇの細胞抽出液にRed Loading Buffer Pack（New England Biolabs社）を加えて熱処理（１００℃、５分間）することで変性させ、SuperSepTM Ace（Wako社）を用いたＳＤＳ−ＰＡＧＥにより、タンパク質を分離した。分離後、セミドライ式ブロッティング装置（Bio-Rad社）を用いて、PVDF transfer membrane（Immobilon-P：Millipore）に転写した。メンブレンは５％スキムミルク／０．０５％Ｔｗｅｅｎ  ２０添加ＰＢＳ（以下ＰＢＳ−Ｔと略す）で、室温にて１時間でインキュベートしてブロッキングを行った。続いて、ＰＢＳ−Ｔで希釈した各種一次抗体（Bcl-xL (54H6) Rabbit mAb #2764（CST社）、PARP Antibody #9542（CST社）、Cleaved Caspase-3 (Asp175) (5A1E) Rabbit mAb #9664（CST社）、Anti-GAPDH antibody [6C5]（abcam社））で１６時間、４℃でインキュベートした。ＰＢＳ−Ｔで洗浄後、対応するＨＲＰ結合抗マウス若しくはウサギＩｇＧ（CST社）とともに室温で６０分間インキュベートした後、ＰＢＳ−Ｔで洗浄し、SuperSignalTMWest Femto Maximum Sensitivity Substrate（Thermo Scientific）と反応させた後、chemidoc（Bio-Rad社）を用いて化学発光を検出した。各操作間の洗浄には、ＰＢＳ−Ｔによる５分間の振盪を３回行った。図５の結果が示す通り、化合物Ｘにより、アポトーシスシグナルである活性化カスパーゼ−３並びに活性化ＰＡＲＰが観察され、アポトーシスが誘導されたことが示された。一方、化合物Ｙでは活性化カスパーゼ−３は観察されず、活性化ＰＡＲＰもわずかしか観察されなかった。【００６２】
例６  化合物Ｘのin vivoでの抗腫瘍効果の検証
BALB/c nu/nuマウス（６〜８週齢、メス、ｎ＝４、日本クレア社より購入）に、大腸癌細胞系ＨＣＴ１１６細胞１．０×１０５個を皮下接種し、担癌マウスとした。接種後１４日目から、化合物Ｘ又は化合物Ｚをマウスの体重１ｇあたり１ｍｇの用量で週２回腫瘍内投与し、腫瘍の体積をノギスで測定した。なお、各化合物の送達にはLipoTrustTM EX Oligo <in vivo>（北海道システム・サイエンス社）を使用した。また、接種後３５日目にマウスを安楽死させ、腫瘍重量を測定した。腫瘍体積の推移を図６に、腫瘍重量の比較を図７にそれぞれ示す。両図より、化合物Ｘがin vivoでも腫瘍の増殖を顕著に抑制することが分かる。【００６３】
多数の様々な改変が、本発明の精神から逸脱せずになされ得ることを当業者は理解する。したがって、本明細書に記載された本発明の形態は例示にすぎず、本発明の範囲を制限する意図がないことを理解すべきである。
【図１】
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【図２】
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【図３−１】
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【図３−２】
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【図３−３】
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【図４】
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【図５】
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【図６】
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【図７】
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【配列表】
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【国際調査報告】
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