【手続補正書】
【提出日】平成20年12月4日(2008.12.4)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
化合物による処置のために癌を有する患者を同定する方法であって、該方法は、
（ａ）患者の該癌から得られたサンプルを、α−チューブリンのアイソタイプ、β−チューブリンのアイソタイプ、カタストロフ促進タンパク質および微小管結合タンパク質からなる群より選択される少なくとも１つのマーカーの発現レベルまたはタンパク質レベルについて分析する工程であって、相関が、化合物に対する感受性と、該マーカーの発現レベルまたはタンパク質レベルとの間に存在し、そして、
該化合物が、式（Ｖ）：
【化１】
2008522624.tif 000001
の化合物またはその薬学的に受容可能な塩、Ｃ１〜Ｃ８アルキルエステルまたはＣ１〜Ｃ８アルキルアミドである、工程；ならびに
（ｂ）該患者を、該少なくとも１つのマーカーの発現レベルまたはタンパク質レベルに基づいて処置のために同定する工程；
を包含する、方法。
【請求項２】
前記化合物は、式（Ｖ）：
【化２】
2008522624.tif 000002
の化合物またはその薬学的に受容可能な塩である、請求項１に記載の方法。
【請求項３】
少なくとも１つのα−チューブリンのアイソタイプの発現レベルまたはタンパク質レベルが分析される、請求項１に記載の方法。
【請求項４】
少なくとも１つのβ−チューブリンのアイソタイプの発現レベルまたはタンパク質レベルが分析される、請求項１に記載の方法。
【請求項５】
前記マーカーのうちの少なくとも１つは、クラスＩ  β−チューブリンのアイソタイプ（ＨＭ４０／ＴＵＢＢ）、クラスＩＩＩ  β−チューブリンのアイソタイプ（Ｈβ４／ＴＵＢＢ４）、クラスＩＶａ  β−チューブリンのアイソタイプ（Ｈβ５／ＴＵＢＢ５）、およびクラスＩＶｂ  β−チューブリンのアイソタイプ（Ｈβ２）からなる群より選択される、請求項１に記載の方法。
【請求項６】
前記マーカーのうちの少なくとも１つは、クラスＩ  α−チューブリンのアイソタイプ（ＴＵＢＡ３／ｂ−α１）、クラスＩＩＩ  β−チューブリンのアイソタイプ（Ｈβ４／ＴＵＢＢ４）、およびクラスＩＶｂ  β−チューブリンのアイソタイプ（Ｈβ２）からなる群より選択される、請求項１に記載の方法。
【請求項７】
前記マーカーのうちの少なくとも１つは、クラスＩ  α−チューブリンのアイソタイプ（ＴＵＢＡ３／ｂ−α１）である、請求項１に記載の方法。
【請求項８】
前記マーカーのうちの少なくとも１つは、クラスＩＩＩ  β−チューブリンのアイソタイプ（Ｈｂ４／ＴＵＢＢ４）である、請求項１に記載の方法。
【請求項９】
前記マーカーのうちの少なくとも１つは、クラスＩＶｂ  β−チューブリンのアイソタイプ（Ｈβ２）である、請求項１に記載の方法。
【請求項１０】
前記マーカーのうちの少なくとも１つは、スタスミンである、請求項１に記載の方法。
【請求項１１】
前記マーカーのうちの少なくとも１つは、ＭＡＰ４である、請求項１に記載の方法。
【請求項１２】
前記マーカーのうちの少なくとも１つは、ＴＡＵである、請求項１に記載の方法。
【請求項１３】
少なくとも２つの前記マーカーの発現レベルまたはタンパク質レベルが、分析される、請求項１に記載の方法。
【請求項１４】
少なくとも２つの前記マーカーの発現レベルまたはタンパク質レベルが、分析され、該少なくとも２つマーカーは、クラスＩ  α−チューブリンのアイソタイプ（ＴＵＢＡ３／ｂ−α１）、クラスＩＩＩ  β−チューブリンのアイソタイプ（Ｈβ４／ＴＵＢＢ４）、クラスＩＶｂ  β−チューブリンのアイソタイプ（Ｈβ２）、スタスミン、ＴＡＵ、およびＭＡＰ４からなる群より選択される、請求項１に記載の方法。
【請求項１５】
少なくとも３つの前記マーカーの発現レベルまたはタンパク質レベルが、分析される、請求項１に記載の方法。
【請求項１６】
少なくとも３つの前記マーカーの発現レベルまたはタンパク質レベルが、分析され、該少なくとも３つのマーカーは、クラスＩ  α−チューブリンのアイソタイプ（ＴＵＢＡ３／ｂ−α１）、クラスＩＩＩ  β−チューブリンのアイソタイプ（Ｈβ４／ＴＵＢＢ４）、クラスＩＶｂ  β−チューブリンのアイソタイプ（Ｈβ２）、スタスミン、ＴＡＵ、およびＭＡＰ４からなる群より選択される、請求項１に記載の方法。
【請求項１７】
前記癌は、乳癌、卵巣癌、および肺癌からなる群より選択される、請求項１に記載の方法。
【請求項１８】
前記癌は、乳癌である、請求項１に記載の方法。
【請求項１９】
前記癌は、多剤耐性の癌である、請求項１に記載の方法。
【請求項２０】
前記癌の細胞は、Ｐ−糖タンパク質（Ｐｇｐ）を発現する、請求項１に記載の方法。
【請求項２１】
前記癌は、パクリタキセル耐性の癌である、請求項１に記載の方法。
【請求項２２】
前記癌からサンプルを得る工程は、該癌の生検サンプルを得る工程を包含する、請求項１に記載の方法。
【請求項２３】
前記癌からサンプルを得る工程は、該癌からＲＮＡのサンプルを得る工程を包含する、請求項１に記載の方法。
【請求項２４】
前記ＲＮＡのサンプルを得る工程の後に該ＲＮＡをｃＤＮＡに逆転写する工程をさらに包含する、請求項２３に記載の方法。
【請求項２５】
前記マーカーに特異的なプライマーを使用して前記ｃＤＮＡに対してＰＣＲを行なう工程；および
該マーカーの発現を決定する工程；
をさらに包含する、請求項２４に記載の方法。
【請求項２６】
前記ｃＤＮＡと、α−チューブリンのアイソタイプ、β−チューブリンのアイソタイプ、および微小管結合タンパク質からなる群より選択される前記マーカーに特異的なプローブのアレイとを接触させる工程；および
該マーカーの発現レベルを定量化する工程；
をさらに包含する、請求項２３に記載の方法。
【請求項２７】
前記癌からサンプルを得る工程は、該癌からタンパク質のサンプルを得る工程を包含する、請求項１に記載の方法。
【請求項２８】
前記サンプルと、前記マーカーに特異的な抗体とを接触させる工程；
をさらに包含する、請求項２７に記載の方法。
【請求項２９】
前記サンプルを前記マーカーについて質量分析を使用して分析する工程；
をさらに包含する、請求項２７に記載の方法。
【請求項３０】
前記癌からサンプルを得る工程は、該癌から細胞のサンプルを得る工程を包含する、請求項１に記載の方法。
【請求項３１】
前記患者を前記少なくとも１つのマーカーの発現レベルまたはタンパク質レベルに基づいて同定する工程は、該少なくとも１つのマーカーの増加したレベルに基づいて該患者を同定する工程を包含する、請求項１に記載の方法。
【請求項３２】
前記少なくとも１つのマーカーの増加したレベルは、コントロール細胞におけるレベルの少なくとも２倍である、請求項３１に記載の方法。
【請求項３３】
前記少なくとも１つのマーカーの増加したレベルは、コントロール細胞におけるレベルの少なくとも３倍である、請求項３１に記載の方法。
【請求項３４】
前記少なくとも１つのマーカーの増加したレベルは、コントロール細胞におけるレベルの少なくとも５倍である、請求項３１に記載の方法。
【請求項３５】
癌を有する患者を処置するための組成物であって、該組成物は、式（Ｖ）：
【化３】
2008522624.tif 000003
の化合物またはその薬学的に受容可能な塩、Ｃ１〜Ｃ８アルキルエステル、またはＣ１〜Ｃ８アルキルアミドを含み、該組成物は、α−チューブリンのアイソタイプ、β−チューブリンのアイソタイプ、カタストロフ促進タンパク質および微小管結合タンパク質からなる群より選択される少なくとも１つのマーカーの発現レベルまたはタンパク質レベルに基づいて、該患者に投与するために適切である、組成物。
【請求項３６】
前記化合物は、式（Ｖ）：
【化４】
2008522624.tif 000004
の化合物またはその薬学的に受容可能な塩である、請求項３５に記載の組成物。
【請求項３７】
前記マーカーは、α−チューブリンのアイソタイプからなる群より選択される、請求項３５に記載の組成物。
【請求項３８】
前記マーカーは、β−チューブリンのアイソタイプからなる群より選択される、請求項３５に記載の組成物。
【請求項３９】
前記マーカーは、クラスＩ  β−チューブリンのアイソタイプ（ＨＭ４０／ＴＵＢＢ）、クラスＩＩＩ  β−チューブリンのアイソタイプ（Ｈβ４／ＴＵＢＢ４）、クラスＩＶａ  β−チューブリンのアイソタイプ（Ｈβ５／ＴＵＢＢ５）、およびクラスＩＶｂ  β−チューブリンのアイソタイプ（Ｈβ２）からなる群より選択される、請求項３５に記載の組成物。
【請求項４０】
前記マーカーは、クラスＩ  α−チューブリンのアイソタイプ（ＴＵＢＡ３／ｂ−α１）、クラスＩＩＩ  β−チューブリンのアイソタイプ（Ｈβ４／ＴＵＢＢ４）、およびクラスＩＶｂ  β−チューブリンのアイソタイプ（Ｈβ２）からなる群より選択される、請求項３５に記載の組成物。
【請求項４１】
前記マーカーは、クラスＩＩＩ  β−チューブリンのアイソタイプ（Ｈβ４／ＴＵＢＢ４）およびクラスＩＶｂ  β−チューブリンのアイソタイプ（Ｈβ２）からなる群より選択される、請求項３５に記載の組成物。
【請求項４２】
前記マーカーは、クラスＩ  α−チューブリンのアイソタイプ（ＴＵＢＡ３／ｂ−α１）である、請求項３５に記載の組成物。
【請求項４３】
前記マーカーは、クラスＩＩＩ  β−チューブリンのアイソタイプ（Ｈｂ４／ＴＵＢＢ４）である、請求項３５に記載の組成物。
【請求項４４】
前記マーカーは、クラスＩＶｂ  β−チューブリンのアイソタイプ（Ｈβ２）である、請求項３５に記載の組成物。
【請求項４５】
前記マーカーは、スタスミンである、請求項３５に記載の組成物。
【請求項４６】
前記マーカーは、ＭＡＰ４である、請求項３５に記載の組成物。
【請求項４７】
前記マーカーは、ＴＡＵである、請求項３５に記載の組成物。
【請求項４８】
癌の処置のための医薬の製造であって、患者の該癌が、α−チューブリンのアイソタイプ、β−チューブリンのアイソタイプ、カタストロフ促進タンパク質および微小管結合タンパク質からなる群より選択される少なくとも１つのマーカーの発現レベルまたはタンパク質レベルを有するとして同定され、ここで相関が、化合物に対する感受性と、該マーカーの発現レベルまたはタンパク質レベルとの間に存在する、製造における、式（Ｖ）：
【化５】
2008522624.tif 000005
の化合物またはその薬学的に受容可能な塩、Ｃ１〜Ｃ８アルキルエステルまたはＣ１〜Ｃ８アルキルアミドの使用。
【請求項４９】
前記化合物は、式（Ｖ）：
【化６】
2008522624.tif 000006
の化合物またはその薬学的に受容可能な塩である、請求項４８に記載の使用。
【請求項５０】
前記マーカーは、クラスＩ  α−チューブリンのアイソタイプ（ＴＵＢＡ３／ｂ−α１）である、請求項４８または請求項４９に記載の使用。
【請求項５１】
前記マーカーは、クラスＩＩＩ  β−チューブリンのアイソタイプ（Ｈｂ４／ＴＵＢＢ４）である、請求項４８または請求項４９に記載の使用。
【請求項５２】
前記マーカーは、クラスＩＶｂ  β−チューブリンのアイソタイプ（Ｈβ２）である、請求項４８または請求項４９に記載の使用。
【請求項５３】
前記マーカーは、スタスミンである、請求項４８または請求項４９に記載の使用。
【請求項５４】
前記マーカーは、ＭＡＰ４である、請求項４８または請求項４９に記載の使用。
【請求項５５】
前記マーカーは、ＴＡＵである、請求項４８または請求項４９に記載の使用。