【手続補正書】
【提出日】平成21年9月10日(2009.9.10)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
α−２−マクログロブリン／低密度リポタンパク質受容体関連タンパク質結合タンパク質１（ＲＡＰ）のアミノ酸配列変異体を含むポリペプチドであって、前記ＲＡＰ変異体が、タンパク質内部の相補的な形式の繰り返しの対に対し、同様な相補的な形式の繰り返しの対に対する野生型ＲＡＰの親和性よりも少なくとも３倍高い親和性で、選択的に結合する、ポリペプチド。
【請求項２】
前記ＣＲ含有タンパク質が、ＬＤＬＲ（Ｐ０１１３０）、ＬＲＰ１（Ｐ９８１５７）、ＬＲＰ１Ｂ（Ｑ９ＮＺＲ２）、ＬＲＰ２（Ｐ９８１６４）、ＬＲＰ３（Ｏ７５０７４）、ＬＲＰ４（Ｏ７５０９６）、ＬＲＰ５（Ｏ７５１９７）、ＬＲＰ６（Ｏ７５５８１）、ＬＲＰ８（Ｑ１４１１４）、ソルチリン（Ｑ９２６７３）、ＬＲＰｌＯ（Ｑ７Ｚ４Ｆ１）、ＬＲＰＩｌ（Ｑ８６ＶＺ４）、ＬＲＰ１２（Ｑ９Ｙ５６１）、ＦＤＣ−Ｄ８６（ＣＤ３２０）、ＶＬＤＬＲ（Ｐ９８１５５）、ＴＡＤＧ−１５（ＳＴ１４、Ｑ８ＷＶＣ１）、ＴＭＰＳ３（Ｐ５７７２７）、ＴＭＰＳ４（Ｑ９ＮＲＳ４）、ＴＭＰＳ６（Ｑ８ＩＵ８０）、Ｑ６ＩＣＣ２、Ｑ６ＰＪ７２、Ｑ７６Ｂ６１、Ｑ７ＲＴＹ８、Ｑ７Ｚ７Ｋ９、Ｑ８６ＹＤ５、Ｑ８ＮＡＮ７、Ｑ８ＮＢＪ０、Ｑ８ＷＷ８８、Ｑ９６ＮＴ６、Ｑ９ＢＹＥ１、Ｑ９ＢＹＥ２、Ｑ９ＮＰＦ０及びコリン（ｃｏｒｉｎ）（Ｑ８ＩＺＲ７）からなる群より選択される、請求項１に記載のポリペプチド。
【請求項３】
前記ＲＡＰ変異体が、成熟ＲＡＰのアミノ酸１〜１４３及び３２０〜３２３を欠失している、請求項１に記載のポリペプチド。
【請求項４】
Ｎ末端から少なくとも２００個及び最大２４３個のアミノ酸を欠失している、請求項１に記載のＲＡＰ変異体。
【請求項５】
Ｃ末端から最大１１個のアミノ酸を欠失している、請求項４に記載のＲＡＰ変異体。
【請求項６】
Ｃ末端から少なくとも４アミノ酸を欠失している、請求項５に記載のＲＡＰ変異体。
【請求項７】
（ａ）少なくとも７１個のアミノ酸長であり、かつ、（ｂ）アミノ酸２５６〜２７０を含む、成熟ＲＡＰの連続部分を含むＲＡＰ変異体。
【請求項８】
（ａ）少なくとも７１個のアミノ酸長であり、かつ、（ｂ）アミノ酸２５６〜２７０を含む、ＲＡＰ  ｄ３の連続部分を含むＲＡＰ変異体。
【請求項９】
前記変異体が、ＲＡＰの２５１位、２５６位、２５７位、２６６位、２７０位、２７９位、２８０位、２９６位又は３０５位のいずれか１ヶ所に変異を含む、請求項８に記載のポリペプチド。
【請求項１０】
前記変異体が、マトリプターゼタンパク質と選択的に結合する、請求項１〜９のいずれか１項に記載のポリペプチド。
【請求項１１】
前記変異体が、ＲＡＰの２５１位、２５６位、２５７位、２６６位、２７０位、又は２８０位のいずれか１ヶ所に変異を含む、請求項１０に記載のポリペプチド。
【請求項１２】
前記変異体が、ＲＡＰの２５１位に変異を含む、請求項１０〜１１のいずれか１項に記載のポリペプチド。
【請求項１３】
前記変異体が、ＲＡＰの２５６位に変異を含む、請求項１０〜１２のいずれか１項に記載のポリペプチド。
【請求項１４】
前記変異体が、ＲＡＰの２５７位に変異を含む、請求項１０〜１３のいずれか１項に記載のポリペプチド。
【請求項１５】
前記変異体が、ＲＡＰの２６６位に変異を含む、請求項１０〜１４のいずれか１項に記載のポリペプチド。
【請求項１６】
前記変異体が、ＲＡＰの２７０位に変異を含む、請求項１０〜１５のいずれか１項に記載のポリペプチド。
【請求項１７】
前記変異体が、ＲＡＰの２８０位に変異を含む、請求項１０〜１６のいずれか１項に記載のポリペプチド。
【請求項１８】
前記変異体が、ＶＬＤＬＲタンパク質と選択的に結合する、請求項１〜９のいずれか１項に記載のポリペプチド。
【請求項１９】
前記変異体が、ＲＡＰの２５１位、２５６位、２７０位又は２７９位のいずれか１ヶ所に変異を含む、請求項１８に記載のポリペプチド。
【請求項２０】
前記変異体が、ＲＡＰの２５１位に変異を含む、請求項１８〜１９のいずれか１項に記載のポリペプチド。
【請求項２１】
前記変異体が、ＲＡＰの２５６位に変異を含む、請求項１８〜２０のいずれか１項に記載のポリペプチド。
【請求項２２】
前記変異体が、ＲＡＰの２７０位に変異を含む、請求項１８〜２１のいずれか１項に記載のポリペプチド。
【請求項２３】
前記変異体が、ＲＡＰの２９６位に変異を含む、請求項１８〜２２のいずれか１項に記載のポリペプチド。
【請求項２４】
前記変異体が、ＦＤＣ−８Ｄ６（ＣＤ３２０）タンパク質と選択的に結合する、請求項１〜９のいずれか１項に記載のポリペプチド。
【請求項２５】
前記変異体が、ＲＡＰの２５１位、２５６位、２７０位、２７９位又は３０５位のいずれか１ヶ所に変異を含む、請求項２４に記載のポリペプチド。
【請求項２６】
前記変異体が、ＲＡＰの２５１位に変異を含む、請求項２４〜２５のいずれか１項に記載のポリペプチド。
【請求項２７】
前記変異体が、ＲＡＰの２５６位に変異を含む、請求項２４〜２６のいずれか１項に記載のポリペプチド。
【請求項２８】
前記変異体が、ＲＡＰの２７０位に変異を含む、請求項２４〜２７のいずれか１項に記載のポリペプチド。
【請求項２９】
前記変異体が、ＲＡＰの２７９位に変異を含む、請求項２４〜２８のいずれか１項に記載のポリペプチド。
【請求項３０】
前記変異体が、ＲＡＰの３０５位に変異を含む、請求項２４〜２９のいずれか１項に記載のポリペプチド。
【請求項３１】
前記変異体が、ＲＡＰの２７１〜３１９位に少なくとも１つのさらなる変異を含む、請求項１〜３０に記載のポリペプチド。
【請求項３２】
前記変異体が、ＲＡＰの２０５〜２５０位に少なくとも１つの変異を含む、請求項１〜３０に記載のポリペプチド。
【請求項３３】
前記変異が、酸性アミノ酸の塩基性アミノ酸との置換である、請求項９〜３２のいずれか１項に記載のポリペプチド。
【請求項３４】
前記酸性アミノ酸が、Ｄ及びＥからなる群より選択される、請求項３３に記載のポリペプチド。
【請求項３５】
前記塩基性アミノ酸が、Ｋ及びＲからなる群より選択される、請求項３３に記載のポリペプチド。
【請求項３６】
前記変異が、塩基性アミノ酸の酸性アミノ酸との置換である、請求項９〜３２のいずれか１項に記載のポリペプチド。
【請求項３７】
前記塩基性アミノ酸が、Ｋ及びＲからなる群より選択される、請求項３６に記載のポリペプチド。
【請求項３８】
前記酸性アミノ酸が、Ｄ及びＥからなる群より選択される、請求項３６に記載のポリペプチド。
【請求項３９】
前記変異が、Ａ、Ｃ、Ｄ、Ｅ、Ｇ、Ｉ、Ｋ、Ｌ、Ｍ、Ｎ、Ｐ、Ｑ、Ｒ、Ｓ、Ｔ及びＶからなる群から選択されるアミノ酸の、Ｆ、Ｙ、Ｗ及びＨからなる群から選択されるアミノ酸への置換である、請求項４−９−３２のいずれか１項に記載のポリペプチドポリペプチド。
【請求項４０】
以下の位置：１７５、２０５、２１３、２１７、２２６、２３０、２３２、２３９、２４６、２４９、２５１、２５６、２５７、２６１、２６６、２６７、２６８、２７０、２７３、２８７、２９０、２９４、２９６、２９７、２９８、３０５、３１２、３１３のうちの３つ又はそれ以上の位置に変異を含む、請求項１〜３２のいずれか１項に記載のポリペプチド。
【請求項４１】
以下の位置：２０５、２１７、２４９、２５１、２５６、２５７、２６６、２７０、２９４、２９６、２９７、３０５のうちの３つ又はそれ以上の位置に変異を含む、請求項１〜３２のいずれか１項に記載のポリペプチド。
【請求項４２】
Ｒ２０５Ｓ、Ｓ２１３Ｔ、Ｅ２１７Ｋ、Ｌ２２６Ｍ、Ｈ２４９Ｙ、Ｅ２３０Ｖ、Ｓ２３２Ｐ、Ｅ２３９Ｇ、Ｅ２４６Ｇ、Ｅ２５１Ｌ、Ｅ２５１Ｋ、Ｅ２５１Ｔ、Ｅ２５１Ｇ、Ｅ２５１Ｐ、Ｅ２５１Ｎ、Ｅ２５１Ｒ、Ｋ２５６Ｒ、Ｋ２５６Ｖ、Ｋ２５６Ａ、Ｋ２５６Ｉ、Ｋ２５６Ｐ、Ｋ２５６Ｌ、Ｉ２６６Ｆ、Ｉ２６６Ｔ、Ｋ２５７Ｙ、Ｑ２６１Ｒ、Ａ２６７Ｖ、Ｈ２６８Ｒ、Ｋ２７０Ｐ、Ｋ２７０Ｄ、Ｋ２７０Ｎ、Ｋ２７０Ｇ、Ｋ２７０Ｅ、Ｋ２７０Ｗ、Ｌ２７１Ｍ、Ｈ２７３Ｙ、Ｄ２７９Ｙ、Ｖ２８３Ｍ、Ｒ２８７Ｈ、Ｈ２９０Ｙ、Ｈ２９０Ｌ、Ｅ２９４Ｖ、Ｒ２９６Ｌ、Ｔ２９７Ｉ、Ｋ２９８Ｒ、Ｋ３０５Ｔ、Ｋ３０６Ｍ、Ｓ３１２Ｆ、Ｇ３１３Ｄの変異のうちの３つ又はそれ以上を含む、請求項１〜３２のいずれか１項に記載のポリペプチド。
【請求項４３】
請求項１−４２に記載のポリペプチドのオリゴマー的な組み合わせからなり、前記組み合わせにおける各ポリペプチドによって規定される多価結合特性を伴う、ポリペプチド。
【請求項４４】
請求項１−４３に記載のポリペプチドを含む、疾患の処置のための組成物であって、前記ポリペプチドが、前記疾患の病態生理学に関与するタンパク質と選択的に結合する、組成物。
【請求項４５】
診断薬又は治療薬と結合している請求項１〜４４のいずれか１項に記載のポリペプチドを含む化合物。
【請求項４６】
前記ポリペプチドと診断薬又は治療薬とがリンカーを通じて結合している、請求項４５に記載の化合物。
【請求項４７】
前記リンカーがペプチドリンカーである、請求項４６に記載の化合物。
【請求項４８】
前記治療薬が、膠細胞由来神経成長因子（ＧＤＮＦ）、脳由来神経成長因子（ＢＤＮＦ）、神経成長因子（ＮＧＦ）、ディスインテグリン及びメタロプロテアーゼドメイン１０（ＡＤＡＭ１０）、ＬＲＰ５／６に対するシャペロンタンパク質（ＭＥＳＤ）、癌化学治療薬、プロテアーゼ阻害剤、プロアポトーシス分子、自己免疫抗原、リソソーム酵素、ナノ粒子、複合糖質及び核酸からなる群より選択される、請求項４５に記載の化合物。
【請求項４９】
薬学的に許容可能な担体、希釈剤又は賦形剤中に請求項１〜３９又は４５に記載の化合物を含む、医薬組成物。
【請求項５０】
請求項１〜４３又は４５に記載の医薬組成物を含む、対象の中枢神経系に診断薬又は治療薬を送達するための組成物。
【請求項５１】
前記対象が神経系疾患を罹患するヒト対象である、請求項５０に記載の組成物。
【請求項５２】
前記神経系疾患が、アルツハイマー病、パーキンソン病、多発性硬化症、筋萎縮性側索硬化症、及び中枢神経系の癌からなる群より選択される、請求項５１に記載の組成物。
【請求項５３】
請求項４５に記載の医薬組成物を含む、対象の特異的組織又は組織群に、診断薬又は治療薬を送達するための組成物。
【請求項５４】
前記診断薬又は治療薬が血液脳関門を通過して送達される、請求項５３に記載の組成物。
【請求項５５】
請求項１〜４３又は４４のいずれか一項に記載のポリペプチドをコードする核酸。
【請求項５６】
（ａ）  候補となるＲＡＰ変異体を作製する工程と、
（ｂ）  ＣＲ含有タンパク質由来の少なくとも２つのＣＲ対に対する、前記候補となるＲＡＰ変異体の結合を測定する工程であって、前記ＣＲ対が、全てのＣＲ含有タンパク質のうち任意のその他のＣＲ対の内部には存在しないカルシウム結合ループ内のアミノ酸の組み合わせによって特定される、測定する工程と、
を含む、請求項１に記載のＲＡＰ変異体をスクリーニングする、方法。
【請求項５７】
（ａ）  候補となるＲＡＰ変異体を作製する工程と、
（ｂ）  ＣＲ含有タンパク質由来の少なくとも２つのＣＲ対に対する、前記候補となるＲＡＰ変異体の結合を測定する工程であって、前記ＣＲ対が、全てのＣＲ含有タンパク質のうち１０％未満のＣＲ対の内部に存在する、カルシウム結合ループ内のアミノ酸の組み合わせによって特定される、測定する工程と、
を含む、請求項１に記載のＲＡＰ変異体をスクリーニングする、方法。