【手続補正書】
【提出日】平成21年3月30日(2009.3.30)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
個体において肺癌を診断するのを支援するための方法であって、該方法は、
ａ）該個体由来の肺上皮組織を含む生物学的サンプルを、表６からの少なくとも２０種の遺伝子転写物の発現について測定する工程；
ｂ）該少なくとも２０種の遺伝子転写物の該発現を、該遺伝子転写物の癌を有さない個体由来のコントロールサンプルと比較する工程；
を包含し、
表６の最後の列において負のスコアによって示されるような該遺伝子転写物の増加した発現および／または表６の最後の列において正のスコアによって示されるような該遺伝子転写物の減少した発現が、肺癌を有する個体を示す、
方法。
【請求項２】
少なくとも４０種の遺伝子転写物が、測定される、請求項１に記載の方法。
【請求項３】
少なくとも６０種の遺伝子転写物が、測定される、請求項１に記載の方法。
【請求項４】
少なくとも７０種の遺伝子転写物が、測定される、請求項１に記載の方法。
【請求項５】
前記測定される遺伝子転写物は、表５に示される、請求項１に記載の方法。
【請求項６】
前記測定される遺伝子転写物は、表７に示される、請求項１に記載の方法。
【請求項７】
前記測定される遺伝子転写物は、表１に示され、ここで前記コントロールと比較した該遺伝子転写物の測定値は、表１の第３の列を使用して、肺癌における発現の方向を示し、前記個体が肺癌を有するか否かを決定する、請求項１に記載の方法。
【請求項８】
前記測定される転写物は、少なくとも表３の転写物である、請求項７に記載の方法。
【請求項９】
前記使用される転写物は、少なくとも表４に示される転写物である、請求項７に記載の方法。
【請求項１０】
大気汚染物質に曝された個体において肺疾患を診断するのを支援するための方法であって、該方法は、
ａ）試験個体由来のサンプルにおける遺伝子群の発現プロフィールを測定する工程；および
ｂ）該試験個体の発現プロフィールを、同様の大気汚染物質に曝された該肺疾患を有さない第１のコントロール個体の発現プロフィールおよび同様の大気汚染物質に曝された該肺疾患を有する第２のコントロール個体の発現プロフィールに対して比較する工程；
を包含し、
該第２のコントロールの発現プロフィールとよりも該第１のコントロールの発現プロフィールと、該試験個体の発現プロフィールとが類似することは、該試験個体が、該肺疾患に冒されていないことを示し、そして該第１のコントロールの発現プロフィールとよりも該第２のコントロールの発現プロフィールと、該試験個体の発現プロフィールとが類似することは、該試験個体が、該肺疾患に冒されているか、または該肺疾患を発症する高い危険性を有すること示す、
方法。
【請求項１１】
前記遺伝子群は、ＧｅｎＢａｎｋ識別番号ＮＭ＿００３３３５；ＮＭ＿０００９１８；ＮＭ＿００６４３０．１；ＮＭ＿００１４１６．１；ＮＭ＿００４０９０；ＮＭ＿００６４０６．１；ＮＭ＿００３００１．２；ＮＭ＿００１３１９；ＮＭ＿００６５４５．１；ＮＭ＿０２１１４５．１；ＮＭ＿００２４３７．１；ＮＭ＿００６２８６；ＮＭ＿００１００３６９８／／／ＮＭ＿００１００３６９９／／／ＮＭ＿００２９５５；ＮＭ＿００１１２３／／／ＮＭ＿００６７２１；ＮＭ＿０２４８２４；ＮＭ＿００４９３５．１；ＮＭ＿００２８５３．１；ＮＭ＿０１９０６７．１；ＮＭ＿０２４９１７．１；ＮＭ＿０２０９７９．１；ＮＭ＿００５５９７．１；ＮＭ＿００７０３１．１；ＮＭ＿００９５９０．１；ＮＭ＿０２０２１７．１；ＮＭ＿０２５０２６．１；ＮＭ＿０１４７０９．１；ＮＭ＿０１４８９６．１；ＡＦ０１０１４４；ＮＭ＿００５３７４．１；ＮＭ＿００１６９６；ＮＭ＿００５４９４／／／ＮＭ＿０５８２４６；ＮＭ＿００６５３４／／／ＮＭ＿１８１６５９；ＮＭ＿００６３６８；ＮＭ＿００２２６８／／／ＮＭ＿０３２７７１；ＮＭ＿０１４０３３；ＮＭ＿０１６１３８；ＮＭ＿００７０４８／／／ＮＭ＿１９４４４１；ＮＭ＿００６６９４；ＮＭ＿００００５１／／／ＮＭ＿１３８２９２／／／ＮＭ＿１３８２９３；ＮＭ＿０００４１０／／／ＮＭ＿１３９００２／／／ＮＭ＿１３９００３／／／ＮＭ＿１３９００４／／／ＮＭ＿１３９００５／／／ＮＭ＿１３９００６／／／ＮＭ＿１３９００７／／／ＮＭ＿１３９００８／／／ＮＭ＿１３９００９／／／ＮＭ＿１３９０１０／／／ＮＭ＿１３９０１１；ＮＭ＿００４６９１；ＮＭ＿０１２０７０／／／ＮＭ＿１３９３２１／／／ＮＭ＿１３９３２２；ＮＭ＿００６０９５；ＡＩ６３２１８１；ＡＷ０２４４６７；ＮＭ＿０２１８１４；ＮＭ＿００５５４７．１；ＮＭ＿２０３４５８；ＮＭ＿０１５５４７／／／ＮＭ＿１４７１６１；ＡＢ００７９５８．１；ＮＭ＿２０７４８８；ＮＭ＿００５８０９／／／ＮＭ＿１８１７３７／／／ＮＭ＿１８１７３８；ＮＭ＿０１６２４８／／／ＮＭ＿１４４４９０；ＡＫ０２２２１３．１；ＮＭ＿００５７０８；Ｗ２０７１０２；ＡＫ０２３８９５；ＮＭ＿１４４６０６／／／ＮＭ＿１４４９９７；ＮＭ＿０１８５３０；ＡＫ０２１４７４；Ｕ４３６０４．１；ＡＵ１４７０１７；ＡＦ２２２６９１．１；ＮＭ＿０１５１１６；ＮＭ＿００１００５３７５／／／ＮＭ＿００１００５７８５／／／ＮＭ＿００１００５７８６／／／ＮＭ＿００４０８１／／／ＮＭ＿０２０３６３／／／ＮＭ＿０２０３６４／／／ＮＭ＿０２０４２０；ＡＣ００４６９２；ＮＭ＿００１０１４；ＮＭ＿０００５８５／／／ＮＭ＿１７２１７４／／／ＮＭ＿１７２１７５；ＮＭ＿０５４０２０／／／ＮＭ＿１７２０９５／／／ＮＭ＿１７２０９６／／／ＮＭ＿１７２０９７；ＢＥ４６６９２６；ＮＭ＿０１８０１１；ＮＭ＿０２４０７７；ＮＭ＿０１２３９４；ＮＭ＿０１９０１１／／／ＮＭ＿２０７１１１／／／ＮＭ＿２０７１１６；ＮＭ＿０１７６４６；ＮＭ＿０２１８００；ＮＭ＿０１６０４９；ＮＭ＿０１４３９５；ＮＭ＿０１４３３６；ＮＭ＿０１８０９７；ＮＭ＿０１９０１４；ＮＭ＿０２４８０４；ＮＭ＿０１８２６０；ＮＭ＿０１８１１８；ＮＭ＿０１４１２８；ＮＭ＿０２４０８４；ＮＭ＿００５２９４；ＡＦ０７７０５３；ＮＭ＿１３８３８７；ＮＭ＿０２４５３１；ＮＭ＿０００６９３；ＮＭ＿０１８５０９；ＮＭ＿０３３１２８；ＮＭ＿０２０７０６；ＡＩ５２３６１３；およびＮＭ＿０１４８８４と一致する群より選択される遺伝子の少なくとも３０種の配列を含む、請求項７に記載の方法。
【請求項１２】
前記遺伝子群は、ＧｅｎＢａｎｋ識別番号ＮＭ＿００７０６２．１；ＮＭ＿００１２８１．１；ＢＣ０００１２０．１；ＮＭ＿０１４２５５．１；ＢＣ００２６４２．１；ＮＭ＿０００３４６．１；ＮＭ＿００６５４５．１；ＢＧ０３４３２８；ＮＭ＿０２１８２２．１；ＮＭ＿０２１０６９．１；ＮＭ＿０１９０６７．１；ＮＭ＿０１７９２５．１；ＮＭ＿０１７９３２．１；ＮＭ＿０３０７５７．１；ＮＭ＿０３０９７２．１；ＡＦ１２６１８１．１；Ｕ９３２４０．１；Ｕ９０５５２．１；ＡＦ１５１０５６．１；Ｕ８５４３０．１；Ｕ５１００７．１；ＢＣ００５９６９．１；ＮＭ＿００２２７１．１；ＡＬ５６６１７２；ＡＢ０１４５７６．１；ＢＦ２１８８０４；ＡＫ０２２４９４．１；ＡＡ１１４８４３；ＢＥ４６７９４１；ＮＭ＿００３５４１．１；Ｒ８３０００；ＡＬ１６１９５２．１；ＡＫ０２３８４３．１；ＡＫ０２１５７１．１；ＡＫ０２３７８３．１；ＡＵ１４７１８２；ＡＬ０８０１１２．１；ＡＷ９７１９８３；ＡＩ６８３５５２；ＮＭ＿０２４００６．１；ＡＫ０２６５６５．１；ＮＭ＿０１４１８２．１；ＮＭ＿０２１８００．１；ＮＭ＿０１６０４９．１；ＮＭ＿０１９０２３．１；ＮＭ＿０２１９７１．１；ＮＭ＿０１４１２８．１；ＡＫ０２５６５１．１；ＡＡ１３３３４１；およびＡＦ１９８４４４．１の遺伝子からなる群より選択される遺伝子の配列を含む、請求項１に記載の方法。
【請求項１３】
前記遺伝子群は、ＧｅｎＢａｎｋ識別番号ＮＭ＿００７０６２．１；ＮＭ＿００１２８１．１；ＢＣ００２６４２．１；ＮＭ＿０００３４６．１；ＮＭ＿００６５４５．１；ＢＧ０３４３２８；ＮＭ＿０１９０６７．１；ＮＭ＿０１７９２５．１；ＮＭ＿０１７９３２．１；ＮＭ＿０３０７５７．１；ＮＭ＿０３０９７２．１；ＮＭ＿００２２６８／／／ＮＭ＿０３２７７１；ＮＭ＿００７０４８／／／ＮＭ＿１９４４４１；ＮＭ＿００６６９４；Ｕ８５４３０．１；ＮＭ＿００４６９１；ＡＢ０１４５７６．１；ＢＦ２１８８０４；ＢＥ４６７９４１；Ｒ８３０００；ＡＬ１６１９５２．１；ＡＫ０２３８４３．１；ＡＫ０２１５７１．１；ＡＫ０２３７８３．１；ＡＬ０８０１１２．１；ＡＷ９７１９８３；ＡＩ６８３５５２；ＮＭ＿０２４００６．１；ＡＫ０２６５６５．１；ＮＭ＿０１４１８２．１；ＮＭ＿０２１８００．１；ＮＭ＿０１６０４９．１；ＮＭ＿０２１９７１．１；ＮＭ＿０１４１２８．１；ＡＡ１３３３４１；およびＡＦ１９８４４４．１の遺伝子からなる群より選択される遺伝子の配列を含む、請求項１に記載の方法。
【請求項１４】
前記群は、ＧｅｎＢａｎｋ識別番号またはＵｎｉｇｅｎｅ識別番号ＮＭ＿０３０７５７．１；Ｒ８３０００；ＡＫ０２１５７１．１；ＮＭ＿０１４１８２．１；ＮＭ＿１７９３２．１；Ｕ８５４３０．１；ＡＩ６８３５５２；ＢＣ００２６４２．１；ＡＷ０２４４６７；ＮＭ＿０３０９７２．１；ＢＣ０２１１３５．１；ＡＬ１６１９５２．１；ＡＫ０２６５６５．１；ＡＫ０２３７８３．１；ＢＦ２Ｉ８８０４；ＮＭ＿００１２８１．１；ＮＭ＿０２４００６．１；ＡＫ０２３８４３．１；ＢＣ００１６０２．１；ＢＣ０３４７０７．１；ＢＣ０６４６１９．１；ＡＹ２８０５０２．１；ＢＣ０５９３８７．１；ＡＦ１３５４２１．１；ＢＣ０６１５２２．１；Ｌ７６２００．１；Ｕ５０５３２．１；ＢＣ００６５４７．２；ＢＣ００８７９７．２；ＢＣ０００８０７．１；ＡＬ０８０１１２．１；ＢＣ０３３７１８．１／／／ＢＣ０４６１７６．１／／／ＢＣ０３８４４３．１；ＮＭ＿０００３４６．１；ＢＣ００８７１０．１；Ｈｓ．２８８５７５（ＵＮＩＧＥＮＥ  ＩＤ）；ＡＦ０２０５９１．１；ＢＣ０００４２３．２；ＢＣ００２５０３．２；ＢＣ００８７１０．１；ＢＣ００９１８５．２；Ｈｓ．５２８３０４（ＵＮＩＧＥＮＥ  ＩＤ）；Ｕ５０５３２．１；ＢＣ０１３９２３．２；ＢＣ０３１０９１；ＮＭ＿００７０６２；Ｈｓ．２４９５９１（Ｕｎｉｇｅｎｅ  ＩＤ）；ＢＣ０７５８３９．１／／／ＢＣ０７３７６０．１；ＢＣ０７２４３６．１／／／ＢＣ００４５６０．２；ＢＣ００１０１６．２；Ｈｓ．２８６２６１（Ｕｎｉｇｅｎｅ  ＩＤ）；ＡＦ３４８５１４．１；ＢＣ００５０２３．１；ＢＣ０６６３３７．１／／／ＢＣ０５８７３６．１／／／ＢＣ０５０５５５．１；Ｈｓ．２１６６２３（Ｕｎｉｇｅｎｅ  ＩＤ）；ＢＣ０７２４００．１；ＢＣ０４１０７３．１；Ｕ４３９６５．１；ＢＣ０２１２５８．２；ＢＣ０１６０５７．１；ＢＣ０１６７１３．１／／／ＢＣ０１４５３５．１／／／ＡＦ２３７７７１．１；ＢＣ０００３６０．２；ＢＣ００７４５５．２；ＢＣ０００７０１．２；ＢＣ０１００６７．２；ＢＣ０２３５２８．２／／／ＢＣ０４７６８０．１；ＢＣ０６４９５７．１；Ｈｓ．１５６７０１（Ｕｎｉｇｅｎｅ  ＩＤ）；ＢＣ０３０６１９．２；ＢＣ００８７１０．１；Ｕ４３９６５．１；ＢＣ０６６３２９．１；Ｈｓ．４３８８６７（Ｕｎｉｇｅｎｅ  ＩＤ）；ＢＣ０３５０２５．２／／／ＢＣ０５０３３０．１；ＢＣ０２３９７６．２；ＢＣ０７４８５２．２／／／ＢＣ０７４８５１．２；Ｈｓ．４４５８８５（Ｕｎｉｇｅｎｅ  ＩＤ）；ＢＣ００８５９１．２／／／ＢＣ０５０４４０．１／／／；ＢＣ０４８０９６．１；ＡＦ３６５９３１．１；ＡＦ２５７０９９．１；およびＢＣ０２８９１２．１の遺伝子からなる群より選択される遺伝子の配列を含む、請求項１に記載の方法。
【請求項１５】
前記群は、ＧｅｎＢａｎｋ識別番号またはＵｎｉｇｅｎｅ識別番号ＮＭ＿００３３３５；ＮＭ＿００１３１９；ＮＭ＿０２１１４５．１；ＮＭ＿００１００３６９８／／／ＮＭ＿００１００３６９９／／／；ＮＭ＿００２９５５；ＮＭ＿００２８５３．１；ＮＭ＿０１９０６７．１；ＮＭ＿０２４９１７．１；ＮＭ＿０２０９７９．１；ＮＭ＿００５５９７．１；ＮＭ＿００７０３１．１；ＮＭ＿００９５９０．１；ＮＭ＿０２０２１７．１；ＮＭ＿０２５０２６．１；ＮＭ＿０１４７０９．１；ＮＭ＿０１４８９６．１；ＡＦ０１０１４４；ＮＭ＿００５３７４．１；ＮＭ＿００６５３４／／／ＮＭ＿１８１６５９；ＮＭ＿０１４０３３；ＮＭ＿０１６１３８；ＮＭ＿００７０４８／／／ＮＭ＿１９４４４１；ＮＭ＿００００５１／／／ＮＭ＿１３８２９２／／／ＮＭ＿１３８２９３；ＮＭ＿０００４１０／／／ＮＭ＿１３９００２／／／ＮＭ＿１３９００３／／／ＮＭ＿１３９００４／／／ＮＭ＿１３９００５／／／ＮＭ＿１３９００６／／／ＮＭ＿１３９００７／／／ＮＭ＿１３９００８／／／ＮＭ＿１３９００９／／／ＮＭ＿１３９０１０／／／ＮＭ＿１３９０１１；ＮＭ＿０１２０７０／／／ＮＭ＿１３９３２１／／／ＮＭ＿１３９３２２；ＮＭ＿００６０９５；ＡＩ６３２１８１；ＡＷ０２４４６７；ＮＭ＿０２１８１４；ＮＭ＿００５５４７．１；ＮＭ＿２０３４５８；ＮＭ＿０１５５４７／／／ＮＭ＿１４７１６１；ＡＢ００７９５８．１；ＮＭ＿２０７４８８；ＮＭ＿００５８０９／／／ＮＭ＿１８１７３７／／／ＮＭ＿１８１７３８；ＮＭ＿０１６２４８／／／ＮＭ＿１４４４９０；ＡＫ０２２２１３．１；ＮＭ＿００５７０８；ＮＭ＿２０７１０２；ＡＫ０２３８９５；ＮＭ＿１４４６０６／／／ＮＭ＿１４４９９７；ＮＭ＿０１８５３０；ＡＫ０２１４７４；Ｕ４３６０４．１；ＡＵ１４７０１７；ＡＦ２２２６９１．１；ＮＭ＿０１５１１６；ＮＭ＿００１００５３７５／／／ＮＭ＿００１００５７８５／／／ＮＭ＿００１００５７８６／／／ＮＭ＿００４０８１／／／ＮＭ＿０２０３６３／／／ＮＭ＿０２０３６４／／／ＮＭ＿０２０４２０；ＡＣ００４６９２；ＮＭ＿００１０１４；ＮＭ＿０００５８５／／／ＮＭ＿１７２１７４／／／ＮＭ＿１７２１７５；ＮＭ＿０５４０２０／／／ＮＭ＿１７２０９５／／／ＮＭ＿１７２０９６／／／ＮＭ＿１７２０９７；ＢＥ４６６９２６；ＮＭ＿０１８０１１；ＮＭ＿０２４０７７；ＮＭ＿０１９０１１／／／ＮＭ＿２０７１１１／／／ＮＭ＿２０７１１６；ＮＭ＿０１７６４６；ＮＭ＿０１４３９５；ＮＭ＿０１４３３６；ＮＭ＿０１８０９７；ＮＭ＿０１９０１４；ＮＭ＿０２４８０４；ＮＭ＿０１８２６０；ＮＭ＿０１８１１８；ＮＭ＿０１４１２８；ＮＭ＿０２４０８４；ＮＭ＿００５２９４；ＡＦ０７７０５３；ＮＭ＿０００６９３；ＮＭ＿０３３１２８；ＮＭ＿０２０７０６；ＡＩ５２３６１３；およびＮＭ＿０１４８８４の遺伝子からなる群より選択される遺伝子の配列を含み、そしてこれらの遺伝子のうちの少なくとも５種の発現の減少は、前記個体が肺疾患に冒されていることを示す、請求項１に記載の方法。
【請求項１６】
前記群は、ＧｅｎＢａｎｋ識別番号またはＵｎｉｇｅｎｅ識別番号ＮＭ＿０３０７５７．１；Ｒ８３０００；ＡＫ０２１５７１．１；ＮＭ＿１７９３２．１；Ｕ８５４３０．１；ＡＩ６８３５５２；ＢＣ００２６４２．１；ＡＷ０２４４６７；ＮＭ＿０３０９７２．１；ＢＣ０２１１３５．１；ＡＬ１６１９５２．１；ＡＫ０２６５６５．１；ＡＫ０２３７８３．１；ＢＦ２１８８０４；ＡＫ０２３８４３．１；ＢＣ００１６０２．１；ＢＣ０３４７０７．１；ＢＣ０６４６１９．１；ＡＹ２８０５０２．１；ＢＣ０５９３８７．１；ＢＣ０６１５２２．１；Ｕ５０５３２．１；ＢＣ００６５４７，２；ＢＣ００８７９７．２；ＢＣ０００８０７．１；ＡＬ０８０１１２．１；ＢＣ０３３７１８．１／／／  ＢＣ０４６１７６．１／／／；ＢＣ０３８４４３．１；Ｈｓ．２８８５７５（ＵＮＩＧＥＮＥ
ＩＤ）；ＡＦ０２０５９１．１；ＢＣ００２５０３．２；ＢＣ００９１８５．２；Ｈｓ．５２８３０４（ＵＮＩＧＥＮＥ  ＩＤ）；Ｕ５０５３２．１；ＢＣ０１３９２３．２；ＢＣ０３１０９１；Ｈｓ．２４９５９１（Ｕｎｉｇｅｎｅ  ＩＤ）；Ｈｓ．２８６２６１（Ｕｎｉｇｅｎｅ  ＩＤ）；ＡＦ３４８５１４．１；ＢＣ０６６３３７．１／／／ＢＣ０５８７３６．１／／／ＢＣ０５０５５５．１；Ｈｓ．２１６６２３（Ｕｎｉｇｅｎｅ  ＩＤ）；ＢＣ０７２４００．１；ＢＣ０４１０７３．１；Ｕ４３９６５．１；ＢＣ０２１２５８．２；ＢＣ０１６０５７．１；ＢＣ０１６７１３．１／／／ＢＣ０１４５３５．１／／／ＡＦ２３７７７１．１；ＢＣ０００７０１．２；ＢＣ０１００６７．２；Ｈｓ．１５６７０１（Ｕｎｉｇｅｎｅ  ＩＤ）；ＢＣ０３０６１９．２；Ｕ４３９６５．１；Ｈｓ．４３８８６７（Ｕｎｉｇｅｎｅ  ＩＤ）；ＢＣ０３５０２５．２／／／ＢＣ０５０３３０．１；ＢＣ０７４８５２．２／／／ＢＣ０７４８５１．２；Ｈｓ．４４５８８５（Ｕｎｉｇｅｎｅ  ＩＤ）；ＡＦ３６５９３１．１；およびＡＦ２５７０９９．１の遺伝子からなる群より選択される遺伝子の配列を含み、そしてこれらの遺伝子のうちの少なくとも５種の発現の減少は、前記個体が肺疾患に冒されていることを示す、請求項１に記載の方法。
【請求項１７】
前記群は、ＧｅｎＢａｎｋ識別番号またはＵｎｉｇｅｎｅ識別番号ＢＦ２１８８０４；ＡＫ０２２４９４．１；ＡＡ１１４８４３；ＢＥ４６７９４１；ＮＭ＿００３５４１．１；Ｒ８３０００；ＡＬ１６１９５２．１；ＡＫ０２３８４３．１；ＡＫ０２１５７１．１；ＡＫ０２３７８３．１；ＡＵ１４７１８２；ＡＬ０８０１１２．１；ＡＷ９７１９８３；ＡＩ６８３５５２；ＮＭ＿０２４００６．１；ＡＫ０２６５６５．１；ＮＭ＿０１４１８２．１；ＮＭ＿０２１８００１；ＮＭ＿０１６０４９．１；ＮＭ＿０１９０２３．１；ＮＭ＿０２１９７１．１；ＮＭ＿０１４１２８．１；ＡＫ０２５６５１．１；ＡＡ１３３３４１；およびＡＦ１９８４４４．１の遺伝子からなる群より選択される遺伝子の配列を含み、そしてこれらの遺伝子のうちの少なくとも５種の発現の減少は、前記個体が肺疾患に冒されていることを示す、請求項１に記載の方法。
【請求項１８】
前記群は、ＧｅｎＢａｎｋ識別番号またはＵｎｉｇｅｎｅ識別番号ＮＭ＿０００９１８；ＮＭ＿００６４３０．１；ＮＭ＿００１４１６．１；ＮＭ＿００４０９０；ＮＭ＿００６４０６．１；ＮＭ＿００３００１．２；ＮＭ＿００６５４５．１；ＮＭ＿００２４３７．１；ＮＭ＿００６２８６；ＮＭ＿００１１２３／／／ＮＭ００６７２１；ＮＭ＿０２４８２４；ＮＭ＿００４９３５．１；ＮＭ＿００１６９６；ＮＭ＿００５４９４／／／ＮＭ＿０５８２４６；ＮＭ＿００６３６８；ＮＭ＿００２２６８／／／ＮＭ＿０３２７７１；ＮＭ＿００６６９４；ＮＭ＿００４６９１；ＮＭ＿０１２３９４；ＮＭ＿０２１８００；ＮＭ＿０１６０４９；ＮＭ＿１３８３８７；ＮＭ＿０２４５３１；およびＮＭ＿０１８５０９の遺伝子からなる群より選択される遺伝子の配列を含み、そしてこれらの遺伝子のうちの少なくとも５種の発現の増加は、前記個体が肺疾患に冒されていることを示す、請求項１に記載の方法。
【請求項１９】
前記群は、ＧｅｎＢａｎｋ識別番号またはＵｎｉｇｅｎｅ識別番号ＮＭ＿０１４１８２．１；ＮＭ＿００１２８１．１；ＮＭ＿０２４００６．１；ＡＦ１３５４２１．１；Ｌ７６２００．１；ＮＭ＿０００３４６．１；ＢＣ００８７１０．１；ＢＣ０００４２３．２；ＢＣ００８７１０．１；ＮＭ＿００７０６２；ＢＣ０７５８３９．１／／／ＢＣ０７３７６０．１；ＢＣ０７２４３６．１／／／ＢＣ００４５６０．２；ＢＣ００１０１６．２；ＢＣ００５０２３．１；ＢＣ０００３６０．２；ＢＣ００７４５５．２；ＢＣ０２３５２８．２／／／ＢＣ０４７６８０．１；ＢＣ０６４９５７．１；ＢＣ００８７１０．１；ＢＣ０６６３２９．１；ＢＣ０２３９７６．２；ＢＣ００８５９１．２／／／ＢＣ０５０４４０．１／／／ＢＣ０４８０９６．１；およびＢＣ０２８９１２．１の遺伝子からなる群より選択される遺伝子の配列を含み、そしてこれらの遺伝子のうちの少なくとも５種の発現の増加は、前記個体が肺疾患に冒されていることを示す、請求項１に記載の方法。
【請求項２０】
前記群は、ＧｅｎＢａｎｋ識別番号またはＵｎｉｇｅｎｅ識別番号ＮＭ＿００７０６２．１；ＮＭ＿００１２８１．１；ＢＣ０００１２０．１；ＮＭ＿０１４２５５．１；ＢＣ００２６４２．１；ＮＭ＿０００３４６．１；ＮＭ＿００６５４５．１；ＢＧ０３４３２８；ＮＭ＿０２１８２２．１；ＮＭ＿０２１０６９．１；ＮＭ＿０１９０６７．１；ＮＭ＿０１７９２５．１；ＮＭ＿０１７９３２．１；ＮＭ＿０３０７５７．１；ＮＭ＿０３０９７２．１；ＡＦ１２６１８１．１；Ｕ９３２４０．１；Ｕ９０５５２．１；ＡＦ１５１０５６．１；Ｕ８５４３０．１；Ｕ５１００７．１；ＢＣ００５９６９．１；ＮＭ＿００２２７１．１；ＡＬ５６６１７２；およびＡＢ０１４５７６．１の遺伝子からなる群より選択される遺伝子の配列を含み、そしてこれらの遺伝子のうちの少なくとも５種の発現の増加は、前記個体が肺疾患に冒されていることを示す、請求項４〜７に記載の方法。
【請求項２１】
前記群は、群１および群２から選択される遺伝子のうちの５〜９種の配列を含み、群１は、ＧｅｎＢａｎｋ識別番号またはＵｎｉｇｅｎｅ識別番号ＮＭ＿００３３３５；ＮＭ＿００１３１９；ＮＭ＿０２１１４５．１；ＮＭ＿００１００３６９８／／／ＮＭ＿００１００３６９９／／／；ＮＭ＿００２９５５；ＮＭ＿００２８５３．１；ＮＭ＿０１９０６７．１；ＮＭ＿０２４９１７．１；ＮＭ＿０２０９７９．１；ＮＭ＿００５５９７．１；ＮＭ＿００７０３１．１；ＮＭ＿００９５９０．１；ＮＭ＿０２０２１７１；ＮＭ＿０２５０２６．１；ＮＭ＿０１４７０９．１；ＮＭ＿０１４８９６．１；ＡＦ０１０１４４；ＮＭ＿００５３７４．１；ＮＭ＿００６５３４／／／ＮＭ＿１８１６５９；ＮＭ＿０１４０３３；ＮＭ＿０１６１３８；ＮＭ＿００７０４８／／／ＮＭ＿１９４４４１；ＮＭ＿００００５１／／／ＮＭ＿１３８２９２／／／ＮＭ＿１３８２９３；ＮＭ＿０００４１０／／／ＮＭ＿１３９００２／／／ＮＭ＿１３９００３／／／ＮＭ＿１３９００４／／／ＮＭ＿１３９００５／／／ＮＭ＿１３９００６／／／ＮＭ＿１３９００７／／／ＮＭ＿１３９００８／／／ＮＭ＿１３９００９／／／ＮＭ＿１３９０１０／／／ＮＭ＿１３９０１１；ＮＭ＿０１２０７０／／／ＮＭ＿１３９３２１／／／ＮＭ＿１３９３２２；ＮＭ＿００６０９５；ＡＩ６３２１８１；ＡＷ０２４４６７；ＮＭ＿０２１８１４；ＮＭ＿００５５４７．１；ＮＭ＿２０３４５８；ＮＭ＿０１５５４７／／／ＮＭ＿１４７１６１；ＡＢ００７９５８．１；ＮＭ＿２０７４８８；ＮＭ＿００５８０９／／／ＮＭ＿１８１７３７／／／ＮＭ＿１８１７３８；ＮＭ＿０１６２４８／／／ＮＭ＿１４４４９０；ＡＫ０２２２１３．１；ＮＭ＿００５７０８；ＮＭ＿２０７１０２；ＡＫ０２３８９５；ＮＭ＿１４４６０６／／／ＮＭ＿１４４９９７；ＮＭ＿０１８５３０；ＡＫ０２１４７４；Ｕ４３６０４．１；ＡＵ１４７０１７；ＡＦ２２２６９１．１；ＮＭ＿０１５１１６；ＮＭ＿００１００５３７５／／／ＮＭ＿００１００５７８５／／／ＮＭ＿００１００５７８６／／／ＮＭ＿００４０８１／／／ＮＭ＿０２０３６３／／／ＮＭ＿０２０３６４／／／ＮＭ＿０２０４２０；ＡＣ００４６９２；ＮＭ＿００１０１４；ＮＭ＿０００５８５／／／ＮＭ＿１７２１７４／／／ＮＭ＿１７２１７５；ＮＭ＿０５４０２０／／／ＮＭ＿１７２０９５／／／ＮＭ＿１７２０９６／／／ＮＭ＿１７２０９７；ＢＥ４６６９２６；ＮＭ＿０１８０１１；ＮＭ＿０２４０７７；ＮＭ＿０１９０１１／／／ＮＭ＿２０７１１１／／／ＮＭ＿２０７１１６；ＮＭ＿０１７６４６；ＮＭ＿０１４３９５；ＮＭ＿０１４３３６；ＮＭ＿０１８０９７；ＮＭ＿０１９０１４；ＮＭ＿０２４８０４；ＮＭ＿０１８２６０；ＮＭ＿０１８１１８；ＮＭ＿０１４１２８；ＮＭ＿０２４０８４；ＮＭ＿００５２９４；ＡＦ０７７０５３；ＮＭ＿０００６９３；ＮＭ＿０３３１２８；ＮＭ＿０２０７０６；ＡＩ５２３６１３；およびＮＭ＿０１４８８４の遺伝子からなり、そして群２は、ＧｅｎＢａｎｋ識別番号またはＵｎｉｇｅｎｅ識別番号ＮＭ＿０００９１８；ＮＭ＿００６４３０．１；ＮＭ＿００１４１６．１；ＮＭ＿００４０９０；ＮＭ＿００６４０６．１；ＮＭ＿００３００１．２；ＮＭ＿００６５４５．１；ＮＭ＿００２４３７．１；ＮＭ＿００６２８６；ＮＭ＿００１１２３／／／ＮＭ＿００６７２１；ＮＭ＿０２４８２４；ＮＭ＿００４９３５．１；ＮＭ＿００１６９６；ＮＭ＿００５４９４／／／ＮＭ＿０５８２４６；ＮＭ＿００６３６８；ＮＭ＿００２２６８／／／ＮＭ＿０３２７７１；ＮＭ＿００６６９４；ＮＭ＿００４６９１；ＮＭ＿０１２３９４；ＮＭ＿０２１８００；ＮＭ＿０１６０４９；ＮＭ＿１３８３８７；ＮＭ＿０２４５３１；およびＮＭ＿０１８５０９の遺伝子からなり、そして該群は、群３および群４から選択される少なくとも２０種の遺伝子の群を含み、群３は、ＧｅｎＢａｎｋ識別番号またはＵｎｉｇｅｎｅ識別番号ＢＦ２１８８０４；ＡＫ０２２４９４．１；ＡＡ１１４８４３；ＢＥ４６７９４１；ＮＭ＿００３５４１．１；Ｒ８３０００；ＡＬ１６１９５２．１；ＡＫ０２３８４３．１；ＡＫ０２１５７１．１；ＡＫ０２３７８３．１；ＡＵ１４７１８２；ＡＬ０８０１１２．１；ＡＷ９７１９８３；ＡＩ６８３５５２；ＮＭ＿０２４００６．１；ＡＫ０２６５６５．１；ＮＭ＿０１４１８２．１；ＮＭ＿０２１８００．１；ＮＭ＿０１６０４９．１；ＮＭ＿０１９０２３．１；ＮＭ＿０２１９７１．１；ＮＭ＿０１４１２８．１；ＡＫ０２５６５１．１；ＡＡ１３３３４１；およびＡＦ１９８４４４．１の遺伝子からなり、そして群４は、ＧｅｎＢａｎｋ識別番号またはＵｎｉｇｅｎｅ識別番号ＮＭ＿００７０６２．１；ＮＭ＿００１２８１．１；ＢＣ０００１２０．１；ＮＭ＿０１４２５５．１；ＢＣ００２６４２．１；ＮＭ＿０００３４６．１；ＮＭ＿００６５４５．１；ＢＧ０３４３２８；ＮＭ＿０２１８２２．１；ＮＭ＿０２１０６９．１；ＮＭ＿０１９０６７．１；ＮＭ＿０１７９２５．１；ＮＭ＿０１７９３２．１；ＮＭ＿０３０７５７．１；ＮＭ＿０３０９７２．１；ＡＦ１２６１８１．１；Ｕ９３２４０．１；Ｕ９０５５２．１；ＡＦ１５１０５６．１；Ｕ８５４３０．１；Ｕ５１００７．１；ＢＣ００５９６９．１；ＮＭ＿００２２７１．１；ＡＬ５６６１７２；およびＡＢ０１４５７６．１の遺伝子からなる、請求項１に記載の方法。
【請求項２２】
前記群１の遺伝子のいずれか１種の発現の減少および前記群２の遺伝子のいずれか１種の発現の増加、ならびに前記群３の遺伝子の減少および前記群４の遺伝子の増加は、前記個体が肺疾患に冒されていることを示す、請求項２０に記載の方法。
【請求項２３】
前記群は、群５および群６から選択される遺伝子のうちの５〜９種の配列を含み、群５は、ＧｅｎＢａｎｋ識別番号またはＵｎｉｇｅｎｅ識別番号ＮＭ＿０３０７５７．１；Ｒ８３０００；ＡＫ０２１５７１．１；ＮＭ＿１７９３２．１；Ｕ８５４３０．１；ＡＩ６８３５５２；ＢＣ００２６４２．１；ＡＷ０２４４６７；ＮＭ＿０３０９７２．１；ＢＣ０２１１３５．１；ＡＬ１６１９５２．１；ＡＫ０２６５６５．１；ＡＫ０２３７８３．１；ＢＦ２１８８０４；ＡＫ０２３８４３．１；ＢＣ００１６０２．１；ＢＣ０３４７０７．１；ＢＣ０６４６１９．１；ＡＹ２８０５０２．１；ＢＣ０５９３８７．１；ＢＣ０６１５２２．１；Ｕ５０５３２．１；ＢＣ００６５４７．２；ＢＣ００８７９７．２；ＢＣ０００８０７．１；ＡＬ０８０１１２．１；ＢＣ０３３７１８．１／／／ＢＣ０４６１７６．１／／／；ＢＣ０３８４４３．１；Ｈｓ．２８８５７５（ＵＮＩＧＥＮＥ  ＩＤ）；ＡＦ０２０５９１．１；ＢＣ００２５０３．２；ＢＣ００９１８５．２；Ｈｓ．５２８３０４（ＵＮＩＧＥＮＥ  ＩＤ）；Ｕ５０５３２．１；ＢＣ０１３９２３．２；ＢＣ０３１０９１；Ｈｓ．２４９５９１（Ｕｎｉｇｅｎｅ  ＩＤ）；Ｈｓ．２８６２６１（Ｕｎｉｇｅｎｅ  ＩＤ）；ＡＦ３４８５１４．１；ＢＣ０６６３３７．１／／／ＢＣ０５８７３６．１／／／ＢＣ０５０５５５．１；Ｈｓ．２１６６２３（Ｕｎｉｇｅｎｅ  ＩＤ）；ＢＣ０７２４００．１；ＢＣ０４１０７３．１；Ｕ４３９６５．１；ＢＣ０２１２５８．２；ＢＣ０１６０５７．１；ＢＣ０１６７１３．１／／／ＢＣ０１４５３５．１／／／ＡＦ２３７７７１．１；ＢＣ０００７０１．２；ＢＣ０１００６７．２；Ｈｓ．１５６７０１（Ｕｎｉｇｅｎｅ  ＩＤ）；ＢＣ０３０６１９．２；Ｕ４３９６５．１；Ｈｓ．４３８８６７（Ｕｎｉｇｅｎｅ  ＩＤ）；ＢＣ０３５０２５．２／／／ＢＣ０５０３３０．１；ＢＣ０７４８５２．２／／／ＢＣ０７４８５１．２；Ｈｓ．４４５８８５（Ｕｎｉｇｅｎｅ  ＩＤ）；ＡＦ３６５９３１．１；およびＡＦ２５７０９９．１の遺伝子からなり、そして群６は、ＧｅｎＢａｎｋ識別番号またはＵｎｉｇｅｎｅ識別番号ＮＭ＿０１４１８２．１；ＮＭ＿００１２８１．１；ＮＭ＿０２４００６．１；ＡＦ１３５４２１．１；Ｌ７６２００．１；ＮＭ＿０００３４６．１；ＢＣ００８７１０．１；ＢＣ０００４２３．２；ＢＣ００８７１０．１；ＮＭ＿００７０６２；ＢＣ０７５８３９．１／／／ＢＣ０７３７６０．１；ＢＣ０７２４３６．１／／／ＢＣ００４５６０．２；ＢＣ００１０１６．２；ＢＣ００５０２３．１；ＢＣ０００３６０．２；ＢＣ００７４５５．２；ＢＣ０２３５２８．２／／／ＢＣ０４７６８０．１；ＢＣ０６４９５７．１；ＢＣ００８７１０．１；ＢＣ０６６３２９．１；ＢＣ０２３９７６．２；ＢＣ００８５９１．２／／／ＢＣ０５０４４０．１／／／；ＢＣ０４８０９６．１；およびＢＣ０２８９１２．１の遺伝子からなり、そして該群は、群３および群４から選択される少なくとも２０種の遺伝子の群を含み、群３は、ＧｅｎＢａｎｋ識別番号またはＵｎｉｇｅｎｅ識別番号ＢＦ２１８８０４；ＡＫ０２２４９４．１；ＡＡ１１４８４３；ＢＥ４６７９４１；ＮＭ＿００３５４１．１；Ｒ８３０００；ＡＬ��６１９５２．１；ＡＫ０２３８４３．１；ＡＫ０２１５７１．１；ＡＫ０２３７８３．１；ＡＵ１４７１８２；ＡＬ０８０１１２．１；ＡＷ９７１９８３；ＡＩ６８３５５２；ＮＭ＿０２４００６．１；ＡＫ０２６５６５．１；ＮＭ＿０１４１８２．１；ＮＭ＿０２１８００．１；ＮＭ＿０１６０４９．１；ＮＭ＿０１９０２３．１；ＮＭ＿０２１９７１．１；ＮＭ＿０１４１２８．１；ＡＫ０２５６５１．１；ＡＡ１３３３４１；およびＡＦ１９８４４４．１の遺伝子からなり、そして群４は、ＧｅｎＢａｎｋ識別番号またはＵｎｉｇｅｎｅ識別番号ＮＭ＿００７０６２．１；ＮＭ＿００１２８１．１；ＢＣ０００１２０．１；ＮＭ＿０１４２５５．１；ＢＣ００２６４２．１；ＮＭ＿０００３４６．１；ＮＭ＿００６５４５．１；ＢＧ０３４３２８；ＮＭ＿０２１８２２．１；ＮＭ＿０２１０６９．１；ＮＭ＿０１９０６７．１；ＮＭ＿０１７９２５．１；ＮＭ＿０１７９３２．１；ＮＭ＿０３０７５７．１；ＮＭ＿０３０９７２．１；ＡＦ１２６１８１．１；Ｕ９３２４０．１；Ｕ９０５５２．１；ＡＦ１５１０５６．１；Ｕ８５４３０．１；Ｕ５１００７．１；ＢＣ００５９６９．１；ＮＭ＿００２２７１．１；ＡＬ５６６１７２；およびＡＢ０１４５７６．１の遺伝子からなり、該群５の遺伝子の発現の減少および該群６の遺伝子の発現の増加、ならびに該群３の遺伝子の減少および該群４の遺伝子の増加は、前記個体が肺疾患に冒されていることを示す、請求項１に記載の方法。