【手続補正書】
【提出日】平成21年2月16日(2009.2.16)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
クラミジアタンパク質Ct-858及びCt-875若しくはその免疫原性フラグメント又はそれらをコードする１若しくは複数のポリヌクレオチドの組み合わせを含む組成物。
【請求項２】
クラミジアCt-089タンパク質若しくはその免疫原性フラグメント又はそれらをコードするポリヌクレオチドを含む、請求項１に記載の組成物。
【請求項３】
2、3、4、5又は6個のクラミジアタンパク質又は免疫原性フラグメント又はそれらをコードするポリヌクレオチドを含む、請求項１又は２に記載の組成物。
【請求項４】
クラミジアPmpDpdタンパク質若しくはその免疫原性フラグメント又はそれらをコードするポリヌクレオチドをさらに含む、請求項２又は３に記載の組成物。
【請求項５】
クラミジアSwibタンパク質若しくはその免疫原性フラグメント又はそれらをコードするポリヌクレオチドをさらに含む、請求項４に記載の組成物。
【請求項６】
クラミジアMompタンパク質若しくはその免疫原性フラグメント又はそれらをコードするポリヌクレオチドをさらに含む、請求項４又は５に記載の組成物。
【請求項７】
クラミジアCt-622タンパク質若しくはその免疫原性フラグメント又はそれらをコードするポリヌクレオチドをさらに含む、請求項６に記載の組成物。
【請求項８】
クラミジアPmpGpdタンパク質若しくはその免疫原性フラグメント又はそれらをコードするポリヌクレオチドをさらに含む、請求項６又は７に記載の組成物。
【請求項９】
製薬上許容される担体をさらに含む、請求項１〜８のいずれか１項に記載の組成物。
【請求項１０】
アジュバントをさらに含む、請求項１〜９のいずれか１項に記載の組成物。
【請求項１１】
アジュバントがTh1応答の優先的刺激因子である、請求項１０に記載の組成物。
【請求項１２】
アジュバントが3D-MPL、QS21又は3D-MPLとQS21の組み合わせを含む、請求項１１に記載の組成物。
【請求項１３】
アジュバントが水中油型エマルジョンをさらに含む、請求項１２に記載の組成物。
【請求項１４】
アジュバントがリポソームをさらに含む、請求項１２に記載の組成物。
【請求項１５】
２以上のタンパク質若しくは免疫原性フラグメントが融合タンパク質を形成するように連結されているか、又は該タンパク質若しくは免疫原性フラグメントをコードする１若しくは複数のポリヌクレオチドが、２以上の該タンパク質若しくは免疫原性フラグメントの融合体をコードする、請求項１〜１４のいずれか１項に記載の組成物。
【請求項１６】
クラミジアポリペプチド若しくはその免疫原性フラグメント又はそれらをコードするポリヌクレオチドの以下の組み合わせのうち１つを含む組成物であって：
1b.  Momp、PmpDpd、Ct-858、Ct-875、Swib、Ct-089
1b'. PmpDpd、Ct-858、Ct-875、Swib、Ct-089
2b.  Momp、PmpDpd、Ct-858、Ct-622、Ct-875、Swib、Ct-089
3b.  Momp、PmpDpd、Ct-858、PmpGpd、Ct-622、Ct-875、Ct-089
4b.  Ct-858、Ct-875
5b.  Momp、Ct-858、Ct-875、Ct-089
5b'. Momp、Ct-858、Ct-875
6b.  Momp、PmpD、Ct-858、PmpGpd、Ct-875、Ct-089
1c.  Swib、Momp、PmpDpd、Ct-858、PmpGpd及びCt-875のうち５個
1c'. PmpDpd、Ct-858、Ct-0875、Swibのうち３個
2c.  Momp、PmpDpd、Ct-858、Ct-622、Ct-875及びSwibのうち５個
3c.  Momp、PmpDpd、Ct-858、PmpGpd、Ct-622及びCt-875のうち５個
4c.  Ct-858、Ct-875、Ct-622及びCt-089のうち３個
5c'. PmpDpd、Ct-858、Ct-875、Ct-089のうち３個
6c.  Momp、PmpD、Ct-858、PmpGpd及びCt-875のうち４個
組成物1b〜6cのすべての中に、Ct-875及びCt-858タンパク質又は免疫原性誘導体又はこれらをコードするポリヌクレオチドが存在するように提供される、前記組成物。
【請求項１７】
Swib、Momp、Ct-858、Ct-875、Ct-622、Ct-089、PmpGのパッセンジャードメイン（PmpGpd）及びPmpDのパッセンジャードメイン(PmpDpd)、若しくはその免疫原性フラグメント、又はポリヌクレオチドが、組成物中に存在する場合に、
i）Ct-089−配列番号16のポリペプチド(E血清型由来のCt-089)と少なくとも95％の相同性を有するポリペプチド若しくはその免疫原性フラグメント、又はこれらをコードするポリヌクレオチド；
ii）Ct-858−配列番号6のポリペプチド(E血清型由来のCt-858)と少なくとも95％の相同性を有するポリペプチド若しくはその免疫原性フラグメント、又はこれらをコードするポリヌクレオチド；
iii）Ct-875−配列番号8のポリペプチド(E血清型由来のCt-875)と少なくとも95％の相同性を有するポリペプチド若しくはその免疫原性フラグメント、又はこれらをコードするポリヌクレオチド；
iv）PmpDパッセンジャードメイン−配列番号14のポリペプチド(LII血清型由来のPmpD)と少なくとも95％の相同性を有するポリペプチド若しくはその免疫原性フラグメント、又はこれらをコードするポリヌクレオチド；
v）Swib−配列番号2のポリペプチド(LII血清型由来のSwib)と少なくとも95％の相同性を有するポリペプチド若しくはその免疫原性フラグメント、又はこれらをコードするポリヌクレオチド；
vi）Momp−配列番号4のポリペプチド(F血清型由来のMomp)と少なくとも95％の相同性を有するポリペプチド若しくはその免疫原性フラグメント、又はこれらをコードするポリヌクレオチド；
vii）Ct-622−配列番号10のポリペプチド(E血清型由来のCt-622)と少なくとも95％の相同性を有するポリペプチド若しくはその免疫原性フラグメント、又はこれらをコードするポリヌクレオチド；
viii）PmpGパッセンジャードメイン−配列番号12のポリペプチド(LII血清型由来のPmpG)と少なくとも95％の相同性を有するポリペプチド若しくはその免疫原性フラグメント、又はこれらをコードするポリヌクレオチド；
である、請求項１〜１６のいずれか１項に記載の組成物。
【請求項１８】
組成物中の全てのクラミジアタンパク質若しくはその免疫原性フラグメント又はそれらをコードする１若しくは複数のポリヌクレオチドが、クラミジア・トラコマチス（Chlamydia trachomatis）由来である、請求項１〜１７のいずれか１項に記載の組成物。
【請求項１９】
PmpDpd又はPmpGpdが、完全長のPmpD又はPmpG又はそれらのフラグメントの一部分として存在する、請求項１〜１８のいずれか１項に記載の組成物。
【請求項２０】
請求項１〜１９のいずれか１項に記載の組成物の医薬としての使用。
【請求項２１】
クラミジア感染の治療又は予防のための医薬の製造における、請求項１〜１９のいずれか１項に記載の組成物の使用。
【請求項２２】
クラミジア感染がクラミジア・トラコマチス感染である、請求項２１に記載の使用。
【請求項２３】
第１のクラミジア・トラコマチス血清型に由来するクラミジアタンパク質Ct-858及びCt-875、その免疫原性フラグメント又はそれらをコードするポリヌクレオチドの、第２のクラミジア・トラコマチス血清型によるクラミジア感染の治療又は予防のためのワクチンの製造における使用。
【請求項２４】
ワクチンがCt-089、Ct-858及びCt-875、その免疫原性フラグメント又はそれらをコードするポリヌクレオチドを含む、請求項２３に記載の使用。
【請求項２５】
第１のクラミジア・トラコマチス血清型が、クラミジア・トラコマチス血清型A、B、Ba、C、D、Da、E、F、G、H、I、Ia、J、Ja、K、L1、L2及びL3からなるリストから選択される、請求項２３又は２４に記載の使用。
【請求項２６】
クラミジア・トラコマチス血清型が、クラミジア・トラコマチスの眼血清型から選択される、請求項２３〜２５のいずれか１項に記載の使用。
【請求項２７】
第１のクラミジア・トラコマチス血清型が、クラミジア・トラコマチスの眼血清型A、B、Ba及びCから選択される、請求項２６に記載の使用。
【請求項２８】
第１のクラミジア・トラコマチス血清型が、クラミジア・トラコマチスの眼生殖器血清型から選択される、請求項２３〜２５のいずれか１項に記載の使用。
【請求項２９】
第１のクラミジア・トラコマチス血清型が、クラミジア・トラコマチスの眼生殖器血清型D、Da、E、F、G、H、I、Ia、J、Ja及びKから選択される、請求項２８に記載の使用。
【請求項３０】
第１のクラミジア・トラコマチス血清型が、クラミジア・トラコマチスLGV血清型から選択される、請求項２３〜２５のいずれか１項に記載の使用。
【請求項３１】
第１のクラミジア・トラコマチス血清型が、クラミジア・トラコマチスLGV血清型L1、L2及びL3から選択される、請求項３０に記載の使用。
【請求項３２】
第１のクラミジア・トラコマチス血清型が、他のクラミジア・トラコマチス血清型の大部分と高いレベルの配列同一性を有するクラミジア・トラコマチス血清型であるように選択される、請求項２３〜３１のいずれか１項に記載の使用。
【請求項３３】
クラミジア・トラコマチス血清型が、一般的なクラミジア・トラコマチス血清型の大部分と高いレベルの配列同一性を有するクラミジア・トラコマチス血清型であるように選択される、請求項２３〜３１のいずれか１項に記載の使用。
【請求項３４】
第１及び第２のクラミジア・トラコマチス血清型が、同一の疾患状態と関連するクラミジア・トラコマチス血清型である、請求項２３〜３３のいずれか１項に記載の使用。
【請求項３５】
第１及び第２のクラミジア・トラコマチス血清型が、異なる疾患状態と関連するクラミジア・トラコマチス血清型である、請求項２３〜３１のいずれか１項に記載の使用。
【請求項３６】
ワクチンが１以上の追加の抗原を含む、請求項２３〜３５のいずれか１項に記載の使用。
【請求項３７】
１以上の追加の抗原がクラミジア・トラコマチス抗原である、請求項３６に記載の使用。
【請求項３８】
１以上の追加の抗原が、Momp、Ct-622、PmpGpd及びPmpDpdからなるリストから選択される、請求項３６又は３７に記載の使用。
【請求項３９】
ワクチンがアジュバントをさらに含む、請求項２３〜３８のいずれか１項に記載の使用。
【請求項４０】
アジュバントがTh1応答の優先的刺激因子である、請求項３９に記載の使用。
【請求項４１】
アジュバントが3D-MPL、QS21、又は3D-MPLとQS21の組み合わせを含む、請求項４０に記載の使用。
【請求項４２】
アジュバントが水中油型エマルジョンをさらに含む、請求項４１に記載の使用。
【請求項４３】
アジュバントがリポソームをさらに含む、請求項４１に記載の使用。
【請求項４４】
個体における先のクラミジア感染を測定する方法であって、以下：
(i)個体に由来するサンプルを、クラミジアタンパク質Ct-858及びCt-875若しくはその免疫原性フラグメント又はそれらをコードする１若しくは複数のポリヌクレオチドの組み合わせと接触させること；
(ii)該サンプルの応答を定量すること；
を含む、前記方法。
【請求項４５】
クラミジアタンパク質若しくはその免疫原性フラグメント又はそれらをコードする１若しくは複数のポリヌクレオチドの組み合わせがCt-089をさらに含む、請求項４４に記載の方法。
【請求項４６】
サンプルが全血である、請求項４４又は４５に記載の方法。
【請求項４７】
サンプルが精製した細胞である、請求項４４又は４５に記載の方法。
【請求項４８】
応答がリンパ球増殖をモニターすることによって定量される、請求項４４〜４７のいずれか１項に記載の方法。
【請求項４９】
応答がサイトカインの産生をモニターすることによって定量される、請求項４４〜４７のいずれか１項に記載の方法。
【請求項５０】
応答が特異抗体の産生をモニターすることによって定量される、請求項４４〜４７のいずれか１項に記載の方法。
【請求項５１】
個体が血清陰性である、請求項４４〜５０のいずれか１項に記載の方法。
【請求項５２】
個体が血清陽性である、請求項４４〜５０のいずれか１項に記載の方法。