【手続補正書】
【提出日】平成21年9月24日(2009.9.24)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
天然のＩＢＡＢＰ−Ｌポリヌクレオチドと少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９９％又は１００％の核酸配列同一性を有し、天然のＩＢＡＢＰ−Ｌポリヌクレオチドに選択的にハイブリダイズする配列を含み、該配列が少なくとも１００ヌクレオチド長であってもよい、単離されたポリヌクレオチド。
【請求項２】
前記天然のＩＢＡＢＰ−Ｌポリヌクレオチドが、天然のＩＢＡＢＰ−Ｌエクソン１−３ポリヌクレオチドであって、天然のＩＢＡＢＰ−Ｌエクソン１−３ポリヌクレオチドの少なくとも１５個の隣接するヌクレオチドを含んでもよい、請求項１に記載の単離されたポリヌクレオチド。
【請求項３】
（ａ）天然のＩＢＡＢＰ−ＬのＮ末端ポリペプチドの少なくとも４個の隣接するアミノ酸を含む少なくとも１１個のアミノ酸のポリペプチドをコードし、及び（ｂ）哺乳動物に導入すると、天然のＩＢＡＢＰ−Ｌポリペプチドに選択的に結合する抗体を誘発する、請求項１に記載の単離されたポリヌクレオチド。
【請求項４】
天然のＩＢＡＢＰ−Ｌポリヌクレオチドのタンパク質全長のコード配列を含む、請求項１に記載の単離されたポリヌクレオチド。
【請求項５】
請求項１に記載の単離されたポリヌクレオチドを含むプローブ又はプライマー。
【請求項６】
胆汁酸に結合するポリペプチドをコードする請求項１に記載の単離されたポリヌクレオチド。
【請求項７】
請求項１に記載の単離されたポリヌクレオチドを含む細胞。
【請求項８】
請求項１に記載の単離されたポリヌクレオチドを含むベクター。
【請求項９】
（ａ）天然のＩＢＡＢＰ−Ｌポリヌクレオチドに選択的にハイブリダイズする、天然のＩＢＡＢＰ−Ｌエクソン１−３ポリヌクレオチドの少なくとも１５個の隣接しているヌクレオチドを含む第１プライマー；（ｂ）天然のＩＢＡＢＰ−Ｌポリヌクレオチド由来の少なくとも１５個の隣接しているヌクレオチドを含み、該ＩＢＡＢＰ−Ｌエクソン１−３ポリヌクレオチドに選択的にハイブリダイズしてもよい、第２プライマー；及び（ｃ）第１プライマー及び第２プライマーを同封している適切なパッケージを含むキットであって、ここで、第１プライマー、第２プライマー、及びＩＢＡＢＰ−Ｌ ｍＲＮＡを含む試料を用いて行なわれる増幅反応が、試料中のＩＢＡＢＰ−Ｌ ｍＲＮＡの存在を指示する増幅産物を生成する、前記キット。
【請求項１０】
天然のＩＢＡＢＰエクソン４ａポリヌクレオチド由来であってもよい天然のＩＢＡＢＰポリヌクレオチド由来の少なくとも１５個の隣接するヌクレオチドを含む第３プライマーをさらに含む請求項９に記載のキットであって、前記試料がＩＢＡＢＰ ｍＲＮＡをさらに含み、第１プライマー、第２プライマー、第３プライマー、及び試料を用いて行なわれる増幅反応が、試料中のＩＢＡＢＰ−Ｌ ｍＲＮＡの存在を指示する第１増幅産物、及び試料中のＩＢＡＢＰ ｍＲＮＡの存在を指示する第２増幅産物を生成する、前記キット。
【請求項１１】
天然のＩＢＡＢＰ−LのＮ末端ポリペプチドと少なくとも９０％のアミノ酸配列同一性を有する配列を含む単離されたポリペプチドであって、哺乳動物への単離されたポリペプチドの導入が、ＩＢＡＢＰ−Ｌに選択的に結合する抗体の産生を誘発する、前記ポリペプチド。
【請求項１２】
天然のＩＢＡＢＰ−ＬのＮ末端ポリペプチドの少なくとも４個の隣接しているアミノ酸を含む、長さにして少なくとも１１個のアミノ酸である単離されたポリペプチドであって、哺乳動物への単離されたポリペプチドの導入が、天然のＩＢＡＢＰ−Ｌポリペプチドに選択的に結合する抗体の産生を誘発する、前記ポリペプチド。
【請求項１３】
天然のＩＢＡＢＰ−Ｌポリペプチドに選択的に結合する抗体を製造する方法であって、請求項１２に記載の単離されたポリペプチド又はポリペプチドをコードする発現ベクターを哺乳動物に導入することを含み、それによって哺乳動物による抗体の産生を誘発することを含む、前記方法。
【請求項１４】
結腸直腸癌を治療又は予防するのに有効な量のＩＢＡＢＰ−Ｌポリペプチド又は該ポリペプチドをコードする発現ベクター及び医薬として許容される担体を含む医薬組成物。
【請求項１５】
結腸直腸癌を有するか又は結腸直腸癌を発症する危険性のある患者を治療するための薬剤を製造する方法であって、該薬剤を医薬的に有効量のＩＢＡＢＰ−Ｌポリペプチド又は該ポリペプチドをコードする発現ベクターを用いて調合することを含む、前記方法。
【請求項１６】
天然のＩＢＡＢＰ−Ｌポリペプチドに選択的に結合する抗体。
【請求項１７】
ＩＢＡＢＰ−Ｌポリペプチドを含む試料中のＩＢＡＢＰ−Ｌポリペプチドの存在を検出する方法であって、試料に、ＩＢＡＢＰ−Ｌポリペプチドに選択的に結合し、モノクローナル抗体であってもよい抗体を接触させ、ＩＢＡＢＰ−Ｌポリペプチドへの抗体の結合を検出することを含み、前記検出をバイオ−バーコードアッセイ又はＥＬＩＳＡアッセイによって行ってもよい、前記方法。
【請求項１８】
ＩＢＡＢＰ−Ｌポリヌクレオチドを含む試料中のＩＢＡＢＰ−Ｌポリヌクレオチドの存在を検出する方法であって、試料に、ＩＢＡＢＰ−Ｌポリヌクレオチドに選択的に結合するポリヌクレオチド配列を含むプローブ又はプライマーを接触させ、ＩＢＡＢＰ−Ｌ ｍＲＮＡへの該プローブ又はプライマーの結合を検出することを含み、前記検出を増幅反応又はバイオ−バーコードアッセイによって行なってもよい、前記方法。
【請求項１９】
ＩＢＡＢＰ−Ｌポリペプチド及びＩＢＡＢＰポリペプチドを含む試料中のＩＢＡＢＰ−ＬポリペプチドとＩＢＡＢＰポリペプチドとの比を測定することを含む、試料中の発現産物の比を測定する方法であって、該方法が：（ａ）試料とＩＢＡＢＰ−Ｌポリペプチドに選択的に結合する第一抗体とを接触させ、試料中のＩＢＡＢＰ−Ｌポリペプチドへの該第一抗体の結合を測定し；（ｂ）試料とＩＢＡＢＰポリペプチド及びＩＢＡＢＰ−Ｌポリペプチドに選択的に結合する第二抗体とを接触させ、試料中のＩＢＡＢＰポリペプチド及びＩＢＡＢＰ−Ｌポリペプチドへの該第二抗体の結合を測定し；及び（ｃ）試料中のＩＢＡＢＰ−ＬポリペプチドとＩＢＡＢＰポリペプチドとの比を算出することによって行なわれてもよく、ここで該第一抗体及び第二抗体がモノクローナル抗体であってもよく、工程（ａ）及び（ｂ）が単一反応において行なわれてもよく、該方法がＥＬＩＳＡアッセイ又はバイオ−バーコードアッセイを行なうことを含んでもよい、前記方法。
【請求項２０】
ＩＢＡＢＰ−Ｌ ｍＲＮＡ及びＩＢＡＢＰ ｍＲＮＡを含む試料中のＩＢＡＢＰ−Ｌ ｍＲＮＡとＩＢＡＢＰ ｍＲＮＡとの比を測定することを含む、試料中のｍＲＮＡの比を測定する方法であって、（ａ）試料とＩＢＡＢＰ−Ｌ ｍＲＮＡに選択的にハイブリダイズする第１プローブとを接触させ；（ｂ）試料中のＩＢＡＢＰ−Ｌ ｍＲＮＡへの第１プローブのハイブリダイゼーションを測定し；（ｃ）試料とＩＢＡＢＰ ｍＲＮＡ及びＩＢＡＢＰ−Ｌ ｍＲＮＡに選択的にハイブリダイズする第２プローブとを接触させ；（ｄ）試料中のＩＢＡＢＰ及びＩＢＡＢＰ−Ｌ ｍＲＮＡへの第２プローブのハイブリダイゼーションを測定し；及び（ｅ）試料中のＩＢＡＢＰ−Ｌ ｍＲＮＡとＩＢＡＢＰ ｍＲＮＡとの比を算出することを含んでもよい、前記方法。
【請求項２１】
（ａ）試料とＩＢＡＢＰ−Ｌ ｍＲＮＡに選択的にハイブリダイズする少なくとも１つのプライマーとを接触させ、第１増幅反応を行い、試料中のＩＢＡＢＰ−Ｌ ｍＲＮＡの存在を指示する第１増幅産物を生成させ；（ｂ）試料とＩＢＡＢＰ及びＩＢＡＢＰ−Ｌ ｍＲＮＡに選択的にハイブリダイズする少なくとも１つのプライマーとを接触させ、第２増幅反応を行い、試料中のＩＢＡＢＰ及びＩＢＡＢＰ−Ｌ ｍＲＮＡの存在を指示する第２増幅産物を生成させ；（ｃ）第１増幅産物及び第２増幅産物を測定し；（ｄ）試料中のＩＢＡＢＰ−Ｌ ｍＲＮＡとＩＢＡＢＰ ｍＲＮＡとの比を算出することを含む、請求項１９に記載の方法であって、ここで前記接触させる工程及び前記増幅反応を行なう工程を単一反応で行なってもよく、該方法がPCR又はバイオ−バーコードアッセイを行なうことを含んでもよい、前記方法。
【請求項２２】
前記試料が、細胞、組織、糞便試料、血液試料及び胃腸組織試料からなる群より選択される、請求項１７〜２１のいずれか１項に記載の方法。
【請求項２３】
請求項１７〜２２のいずれか１項に記載の自動化方法。