【手続補正書】
【提出日】平成23年1月31日(2011.1.31)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
配列番号１または配列番号６の243乃至645位に記載のアミノ酸配列を含むポリペプチド。
【請求項２】
配列番号１に記載のアミノ酸配列を含む、請求項１に記載のポリペプチド。
【請求項３】
配列番号６の243乃至645位に記載のアミノ酸配列を含む、請求項１に記載のポリペプチド。
【請求項４】
配列番号１に記載のアミノ酸配列を含むポリペプチドに免疫学的に結合する抗体。
【請求項５】
モノクローナル抗体である、請求項４に記載の抗体。
【請求項６】
ポリクローナル抗体である、請求項４に記載の抗体。
【請求項７】
検出可能な標識で標識されている、請求項５に記載のモノクローナル抗体。
【請求項８】
配列番号１に記載のアミノ酸配列を含む組換えポリペプチドに免疫学的に結合する、請求項４に記載の抗体。
【請求項９】
モノクローナル抗体である請求項８に記載の抗体。
【請求項１０】
(a) 免疫原を含む組成物による適切な動物の免疫;
(b) 該動物からのBリンパ球の単離;
(c) 該Bリンパ球を不死化骨髄腫細胞と融合することによるハイブリドーマの取得;及び
(d) 該免疫原に免疫学的に結合する抗体を産生するハイブリドーマ細胞の選択、
を含み、
該免疫原が、配列番号１に記載のアミノ酸配列を含むポリペプチドを含み、
それにより抗体が産生される、抗体を製造する方法。
【請求項１１】
該免疫原が、精製されたポリペプチド、部分的に精製されたポリペプチド、または組み換えポリペプチドからなる群から選択され、該ポリペプチドが配列番号１に記載のアミノ酸配列を含む、請求項１０に記載の方法。
【請求項１２】
該免疫原を含む該組成物が、アジュバントをさらに含む、請求項１０に記載の方法。
【請求項１３】
該免疫原が、配列番号１に記載のアミノ酸配列を含む組換えポリペプチドである、請求項１１に記載の方法。
【請求項１４】
配列番号１に記載のアミノ酸配列を含むポリペプチドに免疫学的に結合する抗体を産生することができるハイブリドーマ。
【請求項１５】
マウスBリンパ球およびマウス不死化骨髄腫細胞の融合により製造される、請求項１４に記載のハイブリドーマ。
【請求項１６】
配列番号１に記載のアミノ酸配列を含むポリペプチドに特異的に免疫反応性である抗体。
【請求項１７】
モノクローナル抗体である、請求項１６に記載の抗体。
【請求項１８】
ポリクローナル抗体である、請求項１６に記載の抗体。
【請求項１９】
検出可能な標識で標識されている、請求項１６に記載のモノクローナル抗体。
【請求項２０】
配列番号１に記載のアミノ酸配列を含む組み換えポリペプチドに免疫学的に結合する、請求項１６に記載の抗体。
【請求項２１】
モノクローナル抗体である、請求項１６に記載の抗体。
【請求項２２】
他のヒトポリペプチドにクロス反応しない、請求項５に記載のモノクローナル抗体。
【請求項２３】
他のヒトポリペプチドにクロス反応しない、請求項１７に記載のモノクローナル抗体。
【請求項２４】
ヒト化抗体である、請求項４に記載の抗体。
【請求項２５】
ヒト化抗体である、請求項１６に記載の抗体。
【請求項２６】
請求項４に記載の抗体を含む医薬組成物。
【請求項２７】
請求項１６に記載の抗体を含む医薬組成物。
【請求項２８】
患者から採取した試料中の癌細胞におけるPTENの有無を決定する方法であって、該試料中の癌細胞における機能的なPTEN遺伝子の発現を決定する段階を含み、該PTEN遺伝子が配列番号１に記載のアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードし、該癌細胞が、肺癌細胞、子宮内膜癌細胞、結腸癌細胞、頭頚癌細胞および乳癌細胞からなる群から選ばれる、方法。
【請求項２９】
該癌が、肺癌である、請求項２８に記載の方法。
【請求項３０】
該癌が、子宮内膜癌である、請求項２８に記載の方法。
【請求項３１】
該癌が、結腸癌である、請求項２８に記載の方法。
【請求項３２】
該癌が、頭頚癌である、請求項２８に記載の方法。
【請求項３３】
該癌が、乳癌である、請求項２８に記載の方法。
【請求項３４】
該試料が、組織試料または液体試料である、請求項２８に記載の方法。
【請求項３５】
該決定が、該試料中のPTEN核酸をアッセイすることを含む、請求項２８に記載の方法。
【請求項３６】
該試料を、該PTEN核酸を増幅するのに適した条件に供することをさらに含む、請求項３５に記載の方法。
【請求項３７】
該決定が、シーケンシング、野生型オリゴヌクレオチドハイブリダイゼーションまたはＲＮアーゼ保護を含む、請求項２８に記載の方法。
【請求項３８】
該野生型オリゴヌクレオチドハイブリダイゼーションが、野生型オリゴヌクレオチドを、アレイ、チップ、またはウエハー中に配置することを含む、請求項３７記載の方法。
【請求項３９】
該決定する段階が、該試料中のPTEN核酸のDNA配列を決定することを含む、請求項２８記載の方法。
【請求項４０】
該決定する段階が、癌試料中のPTENの発現と非癌試料中のPTENの発現とを比較することを含む、請求項２８記載の方法。
【請求項４１】
患者から採取した試料中の癌細胞におけるPTENポリペプチドの有無を決定する方法であって、
(i) 該試料をPTENポリペプチドに免疫学的に結合する抗体と接触させる段階；および
(ii) 該抗体のPTENポリペプチドへの結合を検出する段階
を含み、
該PTENポリペプチドが、配列番号１に記載のアミノ酸配列を含み、
該癌細胞が、肺癌細胞、子宮内膜癌細胞、結腸癌細胞、頭頚癌細胞および乳癌細胞からなる群から選ばれる、方法：
【請求項４２】
該癌が、肺癌である、請求項４１に記載の方法。
【請求項４３】
該癌が、子宮内膜癌である、請求項４１に記載の方法。
【請求項４４】
該癌が、結腸癌である、請求項４１に記載の方法。
【請求項４５】
該癌が、頭頚癌である、請求項４１に記載の方法。
【請求項４６】
該癌が、乳癌である、請求項４１に記載の方法。
【請求項４７】
該試料が、組織試料または液体試料である、請求項４１に記載の方法。
【請求項４８】
該抗体が、モノクローナル抗体である、請求項４１に記載の方法。
【請求項４９】
該モノクローナル抗体が、検出可能な標識で標識されている、請求項４８に記載の方法。
【請求項５０】
該検出可能な標識が、蛍光標識、化学発光標識、放射性標識または酵素標識から選ばれる、請求項４９に記載の方法。
【請求項５１】
患者から採取した試料中のPTEN遺伝子の両方の対立遺伝子が変化しているか否かを決定する方法であって、
(a) 試料がPTEN遺伝子の対立遺伝子の一方を失っているか否かの決定；および
(b) 試料がPTEN遺伝子の他方の対立遺伝子に変化を有しているか否かの決定を含み、
試料が一方の対立遺伝子を失っており、かつ他方の対立遺伝子が変化している場合は、PTEN遺伝子の両方の対立遺伝子が変化しており、
該PTEN遺伝子が、配列番号１に記載のアミノ酸配列を有するタンパク質をコードし、および
該試料が、肺癌試料、子宮内膜癌試料、結腸癌試料、頭頚癌試料および乳癌試料からなる群から選ばれる、方法。
【請求項５２】
該試料が、癌細胞を含む、請求項５１に記載の方法。
【請求項５３】
該試料が、腫瘍標本である、請求項５１に記載の方法。
【請求項５４】
該腫瘍標本が、肺癌腫瘍標本である、請求項５１に記載の方法。
【請求項５５】
該腫瘍標本が、子宮内膜癌腫瘍標本である、請求項５１に記載の方法。
【請求項５６】
該腫瘍標本が、結腸癌腫瘍標本である、請求項５１に記載の方法。
【請求項５７】
該腫瘍標本が、頭頚癌腫瘍標本である、請求項５１に記載の方法。
【請求項５８】
該腫瘍標本が、乳癌腫瘍標本である、請求項５１に記載の方法。
【請求項５９】
PTEN遺伝子の変化を検出する方法であって、患者から採取した試料中においてPTEN遺伝子が変化しているか否かを決定する段階を含み、
該PTEN遺伝子が配列番号１に記載のアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードし、
該試料が、肺癌試料、子宮内膜癌試料、結腸癌試料、頭頚癌試料、乳癌試料からなる群から選ばれ、及び
該PTEN遺伝子の変化が、欠失、挿入、フレームシフトおよび点変異からなる群から選ばれる、方法。
【請求項６０】
該腫瘍試料が、肺癌腫瘍試料である、請求項５９に記載の方法。
【請求項６１】
該腫瘍試料が、子宮内膜癌腫瘍試料である、請求項５９に記載の方法。
【請求項６２】
該腫瘍試料が、結腸癌腫瘍試料である、請求項５９に記載の方法。
【請求項６３】
該腫瘍試料が、頭頚癌腫瘍試料である、請求項５９に記載の方法。
【請求項６４】
該腫瘍試料が、乳癌腫瘍試料である、請求項５９に記載の方法。
【請求項６５】
該決定が、シーケンシング、突然変異オリゴヌクレオチドハイブリダイゼーション、SSCP（商標）またはRNアーゼ保護を含む、請求項５９に記載の方法。
【請求項６６】
該突然変異オリゴヌクレオチドハイブリダイゼーションが、野生型オリゴヌクレオチドを、アレイ、チップ、またはウエハー中に配置することを含む請求項６５に記載の方法。