【手続補正書】
【提出日】平成21年10月23日(2009.10.23)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
高血圧を有していない個人における脳卒中の素因を予測する方法であって、
前記個人由来のサンプル中においてＰＤＥ４Ｄ遺伝子座内の多型の対立遺伝子の存在もしくは不在を検出する工程であって、前記対立遺伝子の存在が高血圧を有していない個人における脳卒中の素因と関連している工程と、および
前記ヒトにおける脳卒中の素因の存在もしくは不在を前記サンプル中の前記対立遺伝子の存在もしくは不在に基づいて予測する工程であって、前記対立遺伝子の存在が高血圧を有していない個人においては脳卒中の素因と関連しているが、高血圧を有している個人においては脳卒中を予測しない工程と、を含み、
前記多型は、
ＳＮＰ９  Ａ／Ｇ（Ａの存在は脳卒中の素因と関連している）と、
ＳＮＰ２１９  Ｃ／Ｔ（Ｔの存在は脳卒中の素因と関連している）と、
ＳＮＰ４２  Ａ／Ｇ（Ｇの存在は脳卒中の素因と関連している）と、
ＳＮＰ２２０  Ｃ／Ａ（Ａの存在は脳卒中の素因と関連している）と、および
ＡＣ００８８１８−１内のマイクロサテライトリピート（ＴＣＡＴ）（９個のマイクロサテライトリピート（ＴＣＡＴ）の存在は脳卒中の素因と関連している）と、からなる群から選択される、方法。
【請求項２】
前記検出する工程は、ＳＮＰ９  Ａ／Ｇの１つの対立遺伝子を検出する工程を含み、そして前記予測する工程は、ＳＮＰ９  Ａ／ＧのＡ対立遺伝子が存在する場合に脳卒中の素因を予測する工程を含む、請求項１に記載の方法。
【請求項３】
前記検出する工程は、ＳＮＰ２１９  Ｃ／Ｔの１つの対立遺伝子を検出する工程を含み、そして前記予測する工程は、ＳＮＰ２１９  Ｃ／ＴのＴ対立遺伝子が存在する場合に脳卒中の素因を予測する工程を含む、請求項１に記載の方法。
【請求項４】
前記検出する工程は、ＳＮＰ４２  Ａ／Ｇの１つの対立遺伝子を検出する工程を含み、そして前記予測する工程は、ＳＮＰ４２  Ａ／ＧのＧ対立遺伝子が存在する場合に脳卒中の素因を予測する工程を含む、請求項１に記載の方法。
【請求項５】
前記検出する工程は、ＳＮＰ２２０  Ｃ／Ａの１つの対立遺伝子を検出する工程を含み、そして前記予測する工程は、ＳＮＰ２２０  Ｃ／ＡのＡ対立遺伝子が存在する場合に脳卒中の素因を予測する工程を含む、請求項１に記載の方法。
【請求項６】
前記検出する工程は、ＡＣ００８８１８−１のマイクロサテライト対立遺伝子を検出する工程を含み、そして前記予測する工程は、ＡＣ００８８１８−１内の９個のマイクロサテライトリピート（ＴＣＡＴ）が存在する場合に脳卒中の素因を予測する工程を含む、請求項１に記載の方法。
【請求項７】
前記予測する工程は、個人の脳卒中の素因の存在もしくは不在を記録する工程を含む、請求項１に記載の方法。
【請求項８】
前記多型は、前記多型の少なくとも２つの代替対立遺伝子間を識別する１つのオリゴヌクレオチドを用いて検出される、請求項１に記載の方法。
【請求項９】
高血圧を有していないヒトにおける脳卒中の素因を予測するためのキットであって、
蛍光色素で検出可能に標識された少なくとも１つの対立遺伝子特異的プローブ及び／又は少なくとも１つの対立遺伝子特異的プライマーであって：
−ＳＮＰ９  Ａ／ＧのＡ対立遺伝子とＧ対立遺伝子とを識別するプローブもしくはプライマー；又は
−ＳＮＰ２１９  Ｃ／ＴのＣ対立遺伝子とＴ対立遺伝子とを識別するプローブもしくはプライマー；又は
−ＳＮＰ４２  Ａ／ＧのＡ対立遺伝子とＧ対立遺伝子とを識別するプローブもしくはプライマー；又は
−ＳＮＰ２２０  Ｃ／ＡのＣ対立遺伝子とＡ対立遺伝子とを識別するプローブもしくはプライマー；又は
−ＡＣ００８８１８−１中のマイクロサテライト反復（ＴＣＡＴ）を識別するプローブもしくはプライマー；
から選択されるプローブもしくはプライマー、及び
請求項１〜８及び１４のいずれか１項に記載の方法を行うための説明書、
を含んで成るキット。
【請求項１０】
個人における脳卒中の素因を予測するために使用するためのコンピュータプログラム製品であって、前記コンピュータプログラム製品は、
プログラムコードでコード化されたコンピュータ可読媒体を含み、前記プログラムコードは、
ホストコンピュータで、個人における脳卒中の素因と関連するＰＤＥ４Ｄ遺伝子座の多型の１つの対立遺伝子の存在を指示する情報を受信するためのコンピュータコードであって、前記多型はＳＮＰ９  Ａ／Ｇ、ＳＮＰ２１９  Ｃ／Ｔ、ＳＮＰ４２  Ａ／Ｇ、ＳＮＰ２２０  Ｃ／Ａ、およびＡＣ００８８１８−１内のマイクロサテライトリピート（ＴＣＡＴ9）からなる群から選択されるコンピュータコードと、および
前記個人における脳卒中の素因を決定するためのコンピュータコードであって、前記個人が：
ＳＮＰ９  Ａ／Ｇ内のＡ；
ＳＮＰ２１９  Ｃ／Ｔ内のＴ；
ＳＮＰ４２  Ａ／Ｇ内のＧ；
ＳＮＰ２２０  Ｃ／Ａ内のＡ；
ＡＣ００８８１８−１内の９個のマイクロサテライトリピート（ＴＣＡＴ）；を有する場合に脳卒中の素因が予測されるコンピュータコード、を含むコンピュータプログラム製品。
【請求項１１】
個人における脳卒中の素因を決定するためのコンピュータ実施方法であって、
ホストコンピュータで、個人における脳卒中の素因と関連するＰＤＥ４Ｄ遺伝子座の多型の１つの対立遺伝子の存在を指示する情報を受信する工程であって、前記多型はＳＮＰ９  Ａ／Ｇ、ＳＮＰ２１９  Ｃ／Ｔ、ＳＮＰ４２  Ａ／Ｇ、ＳＮＰ２２０  Ｃ／Ａ、およびＡＣ００８８１８−１内のマイクロサテライトリピート（ＴＣＡＴ9）からなる群から選択される工程と、および
前記個人における脳卒中の素因を決定する工程であって、前記個人が：
ＳＮＰ９  Ａ／Ｇ内のＡ；
ＳＮＰ２１９  Ｃ／Ｔ内のＴ；
ＳＮＰ４２  Ａ／Ｇ内のＧ；
ＳＮＰ２２０  Ｃ／Ａ内のＡ；
ＡＣ００８８１８−１内の９個のマイクロサテライトリピート（ＴＣＡＴ）；を有する場合に脳卒中の素因が予測される工程と、を含む方法。
【請求項１２】
ヒトにおける脳卒中の素因を予測する方法であって、
前記ヒト由来のサンプル中でＰＤＥ４Ｄ遺伝子座のＳＮＰ１７５  Ｔ／Ｃを検出する工程と、および
前記ヒトにおける脳卒中の素因の存在もしくは不在を前記サンプル中の前記多型の１つの対立遺伝子の存在もしくは不在に基づいて予測する工程であって、Ｔの存在が高血圧を有している個人における脳卒中の素因と関連している工程と、を含む方法。
【請求項１３】
高血圧を有しているヒトにおける脳卒中の素因を予測するためのキットであって、ＳＮＰ１７５  Ｔ／ＣのＴ対立遺伝子とＣ対立遺伝子とを識別するプローブもしくはプライマー及び請求項１２に記載の方法を行うための説明書を含み、前記プローブは蛍光色素で検出可能に標識されている、キット。
【請求項１４】
ヒトにおける脳卒中のリスク減少を予測する方法であって、
前記ヒト由来のサンプル中でＰＤＥ４ＤのＡＣ００８８１８−１内のマイクロサテライト対立遺伝子を検出する工程と、および
前記ヒトにおける脳卒中のリスク減少の存在もしくは不在を前記サンプル中の前記多型の１つの対立遺伝子の存在もしくは不在に基づいて予測する工程であって、１０個のマイクロサテライトリピート（ＴＣＡＴ）の存在が高血圧を有していない個人における脳卒中のリスク減少と関連している工程と、を含む方法。
【請求項１５】
高血圧を有している個人における脳卒中の素因を予測するために使用するためのコンピュータプログラム製品であって、
プログラムコードでコード化されたコンピュータ可読媒体を含み、前記プログラムコードは、
ホストコンピュータで、高血圧を有している個人における脳卒中の素因と関連しているＰＤＥ４Ｄ遺伝子座の多型の対立遺伝子の存在を指示する情報を受信するためのコンピュータコードであって、前記多型はＳＮＰ１７５  Ｔ／Ｃであるコンピュータコードと、および
前記個人における脳卒中の素因を決定するためのコンピュータコードであって、前記個人がＳＮＰ１７５  Ｔ／Ｃ内のＴを有する場合に脳卒中の素因が予測されるコンピュータコード、を含むコンピュータプログラム製品。
【請求項１６】
高血圧を有している個人における脳卒中の素因を決定するためのコンピュータ実施方法であって、
ホストコンピュータで、高血圧を有している個人における脳卒中の素因と関連しているＰＤＥ４Ｄ遺伝子座の多型の対立遺伝子の存在を指示する情報を受信する工程であって、このとき前記多型はＳＮＰ１７５  Ｔ／Ｃである工程と、および
前記個人における脳卒中の素因を決定する工程であって、前記個人がＳＮＰ１７５  Ｔ／Ｃ内のＴを有する場合に脳卒中の素因が予測される工程と、を含む方法。