【手続補正書】
【提出日】平成20年12月15日(2008.12.15)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
１以上の異種タンパク質化合物を表面ディスプレイする生物学的媒介物を含有してなる、薬剤として使用するための医薬組成物であって：
ａ）１以上の非病原性バクテリア株の細胞と、
ｂ）二官能性架橋剤によって、前記細胞の表面上のアクセス可能な化学的物質に結合された１以上のタンパク質化合物と
を含んでなり、
前記細胞は、前記１以上のタンパク質化合物をコードするトランスジェニック核酸分子を含まず、また前記二官能性架橋剤はシッフ塩基を介して前記細胞のアミノ基に共有結合され、また前記タンパク質化合物および前記架橋剤は前記細胞に対して起源において異種である医薬組成物。
【請求項２】
請求項１に記載の組成物であって、前記二官能性架橋剤は、グルタルアルデヒド、ポリアゼチジンおよびパラホルムアルデヒドからなる群から選択される組成物。
【請求項３】
請求項１または２に記載の組成物であって、前記生物学的媒介物は、遺伝子的に修飾されていないバクテリア株もしくは遺伝子的に修飾されたバクテリア株、またはそれらの組み合せの細胞を含んでなる組成物。
【請求項４】
請求項１〜３の何れか１項に記載の組成物であって、前記バクテリア株は、ラクトコッカス、ラクトバチルス、ロイコノストック、Ｎ族ストレプトコッカス、エンテロコッカス、ビフィドバクテリウム、非病原性のスタフィロコッカス、および非病原性のバチルスからなる群から選択されるバクテリア属のメンバーである組成物。
【請求項５】
請求項１〜４の何れか１項に記載の組成物であって、前記株は、ラクトバチルスおよびビフィドバクテリウムからなる群から選択されるバクテリア属のメンバーである組成物。
【請求項６】
請求項１〜５の何れか１項に記載の組成物であって、前記株は、ラクトバチルス・アセトトレランス、ラクトバチルス・アシジピシチス、ラクトバチルス・アシドフィルス、ラクトバチルス・アギリス、ラクトバチルス・アルギドゥス、ラクトバチルス・アリメタリウス、ラクトバチルス・アミロリティクス、ラクトバチルス・アミロフィルス、ラクトバチルス・アミロボルス、ラクトバチルス・アニマリス、ラクトバチルス・アリゾネンシス、ラクトバチルス・アビアリウス、ラクトバチルス・ビフェルメンタンス、ラクトバチルス・ブレビス、ラクトバチルス・ブフネリ、ラクトバチルス・カゼイ、ラクトバチルス・コエロホミニス、ラクトバチルス・コリノイデス、ラクトバチルス・コリニホルミス・亜種コリニホルミス、ラクトバチルス・コリニホルミス亜種トルケンス、ラクトバチルス・クリスパツス、ラクトバチルス・クルバツス、ラクトバチルス・サイプリカセイ、ラクトバチルス・デルブルエッキイ亜種ブルガリクス、ラクトバチルス・デルブルエッキイ亜種デルブルエッキイ、ラクトバチルス・デルブルエッキイ亜種ラクチス、ラクトバチルス・ドゥリアヌス、ラクトバチルス・エクイ、ラクトバチルス・ファルチミニス、ラクトバチルス・フェリントシェンシス、ラクトバチルス・フェルメントゥム、ラクトバチルス・フォルニカリリス、ラクトバチルス・フルクチボランス、ラクトバチルス・フルメンティ、ラクトバチルス・フクエンシス、ラクトバチルス・ガリナルム、ラクトバチルス・ガッセリ、ラクトバチルス・グラミニス、ラクトバチルス・ハムステリ、ラクトバチルス・ヘルベチクス、ラクトバチルス・ヘルベチクス亜種ジュグルチ、ラクトバチルス・ヘテロヒオッキイ、ラクトバチルス・ヒルガルディイ、ラクトバチルス・ホモヒオッキイ、ラクトバチルス・インテスチナリス、ラクトバチルス・ジャポニクス、ラクトバチルス・ジェンセニイ、ラクトバチルス・ジョンソニイ、ラクトバチルス・ケフィリ、ラクトバチルス・キムチイ、ラクトバチルス・クンケエイ、ラクトバチルス・レイヒマンニイ、ラクトバチルス・レティバジ、ラクトバチルス・リンドネリ、ラクトバチルス・マレフェルメンタンス、ラクトバチルス・マリ、ラクトバチルス・マルタロミクス、ラクトバチルス・マニホチボランス、ラクトバチルス・ミンデンシス、ラクトバチルス・ムコサエ、ラクトバチルス・ムリヌス、ラクトバチルス・ナゲリイ、ラクトバチルス・オリス、ラクトバチルス・パニス、ラクトバチルス・パンテリ、ラクトバチルス・パラブフネリ、ラクトバチルス・パラカセイ亜種パラカセイ、ラクトバチルス・パラカセイ亜種シュードプランタルム、ラクトバチルス・パラカセイ亜種トレランス、ラクトバチルス・パラケフィリ、ラクトバチルス・パラリメンタリウス、ラクトバチルス・パラプランタルム、ラクトバチルス・ペントスス、ラクトバチルス・ペロレンス、ラクトバチルス・プランタルム、ラクトバチルス・ポンチス、ラクトバチルス・プシタチ、ラクトバチルス・リューテリ、ラクトバチルス・ラムノスス、ラクトバチルス・ルミニス、ラクトバチルス・サケイ、ラクトバチルス・サリバリウス、ラクトバチルス・サリバリウス亜種サリチニウス、ラクトバチルス・サリバリウス亜種サリバリウス、ラクトバチルス・サンフランシセンシス、ラクトバチルス・シャルペアエ、ラクトバチルス・スエビクス、ラクトバチルス・テルモフィルス、ラクトバチルス・テルモトレランス、ラクトバチルス・ワクチノステルクス、ラクトバチルス・バギナリス、ラクトバチルス・ベルスモルデンシス、ラクトバチルス・ビツリヌス、ラクトバチルス・ベルミホルメ、ラクトバチルス・ゼアエ、ビフィドバクテリウム・アドレッセンチス、 ビフィドバクテリウム・アエロフィルム、ビフィドバクテリウム・アンギュラツム、ビフィドバクテリウム・アニマリス、ビフィドバクテリウム・アステロイデス、ビフィドバクテリウム・ビフィドゥム、ビフィドバクテリウム・ボウム、ビフィドバクテリウム・ブレベ、 ビフィドバクテリウム・カテヌラツム、ビフィドバクテリウム・コエリヌム、ビフィドバクテリウム・コリネフォルメ、ビフィドバクテリウム・クニクリ、ビフィドバクテリウム・デンティウム、ビフィドバクテリウム・ガリクム、ビフィドバクテリウム・ガリナルム、ビフィドバクテリウム・インディクム、ビフィドバクテリウム・ロングム、ビフィドバクテリウム・ロングム ｂｖ ロングム、ビフィドバクテリウム・ロングム ｂｖ インファンティス、ビフィドバクテリウム・ロングム ｂｖ スイス、ビフィドバクテリウム・マグヌム、ビフィドバクテリウム・メリチクム、ビフィドバクテリウム・ミニマム、ビフィドバクテリウム・シュードカテヌラツム、ビフィドバクテリウム・シュードロングム、ビフィドバクテリウム・シュードロングム亜種グロボスム、ビフィドバクテリウム・シュードロングム亜種シュードロングム、ビフィドバクテリウム・プシクロアエロフィルム、ビフィドバクテリウム・プロルム、ビフィドバクテリウム・ルミナンティウム、ビフィドバクテリウム・サエキュラレ、ビフィドバクテリウム・スカルドビイ、ビフィドバクテリウム・スブティレ、ビフィドバクテリウム・テルモアシドフィルム、ビフィドバクテリウム・テルモアシドフィルム亜種スイス、ビフィドバクテリウム・テルモフィルム、ビフィドバクテリウム・ウリナリスから選択されるバクテリア属のメンバーである組成物。
【請求項７】
請求項１〜６の何れか１項に記載の組成物であって、前記１以上のタンパク質化合物は、動物もしくはヒトの病原体に由来する抗原、またはその変異体である組成物。
【請求項８】
請求項７に記載の組成物であって、前記動物もしくはヒトの病原体が、ポックスウイルス科、ヘルペスウイルス科、アデノウイルス科、パルボウイルス科、パポバウイルス科、ヘパドナウイルス科、ピコルナウイルス科、カルシウイルス科、レオウイルス科、トガウイルス科、フラビウイルス科、アレナウイルス科、レトロウイルス科、ブンヤウイルス科、オルトミクソウイルス科、パラミクソウイルス科、ラブドウイルス科、アルボウイルス、オンコウイルス、未分類ウイルス（肝炎ウイルス、アストロウイルス、およびトロウイルスから選択される）、バチルス、マイコバクテリウム、プラスモジウム、プリオン、コレラ、シゲラ、大腸菌、サルモネラ、コリネバクテリウム、ボレリア、ヘモフィルス、オンコセルカ、ボルデテラ、ニューモコッカス、住血吸虫、クロストリジウム、クラミジア、ストレプトコッカス、スタフィロコッカス、カンピロバクター、レジオネラ、トキソプラスモス、リステリア、ビブリオ、ノカルジア、クロストリジウム、ナイセリア、カンジダ、トリコモナス、ガルドネレラ、トレポネマ、ヘモフィルス、クレブシエラ、エンテロバクター、プロテウス、シュードモナス、セラチア、レプトスピラ、表皮糸状菌属、小胞子菌属、白癬菌属、アクレモニウム、アスペルギルス、カンジダ、 フサリウム、スコプラリオプシス属、オニココラ、シタリジウム、ヒストプラズマ、クリプトコッカス、ブラストマイセス、コクシジオイデス、パラコクシジオイデス、接合菌、スポロトリクス、ボルデテラ、ブルセラ、パスツレラ、リケッチア、バルトネラ、エルジニア、ジアルジア、ロドコッカス、エルジニア、およびトキソプラズマからなる群から選択される組成物。
【請求項９】
請求項１〜６の何れか１項に記載の組成物であって、前記１以上のタンパク質化合物は、抽出物、精製物、組換え体、突然変異体もしくはペプチド供給源、またはそれらの変種のアレルゲンを含んでなる組成物。
【請求項１０】
請求項９に記載の組成物であって、前記アレルゲンの供給源は、カバノキ、ネコ、杉樹、オリーブ樹、ブタクサ、他の雑草、刺す昆虫、蚊／蚋、ゴキブリ、ウシ、イヌ、塵ダニ、草、屋外カビ、屋内カビ、齧歯類、ウマ、ナッツ、ミルク、大豆、小麦、卵、甲殻類および魚からなる群から選択される組成物。
【請求項１１】
請求項９に記載の組成物であって、前記アレルゲンの供給源が、カバノキ花粉（Bet v）、草花粉（Phl p、Lol p、Cyn d またはSor h）、ハウスダストダニ（Der pまたはDer f）、ダニ（Eur m 、Blo t 、Gly m、Lep d）、ブタクサ花粉（Amb a）、杉樹花粉（Cry j）、ネコ（Fel d）、スズメバチ（Ves vまたはDol m）、ミツバチ（Api m）およびゴキブリ（Bla gおよびPer a）からなる群から選択される組成物。
【請求項１２】
請求項９に記載の組成物であって、前記アレルゲンが、Ｂｅｔｖ１、Ｂｅｔｖ２、Ｐｈｌ  ｐ１もしくはＰｈｌ  ５、Ｌｏｌ  ｐ１、Ｌｏｌ  ｐ５、Ｃｙｎ  ｄ１、Ｓｏｒ  ｈ１、Ｄｅｒ  ｐ１、Ｄｅｒ  ｐ２、Ｄｅｒ  ｆ１、Ｄｅｒ  ｆ２、Ｅｕｒ  ｍ１、Ｂｌｏ  ｔ１、Ｇｌｙ  ｍ１、Ｌｅｐ  ｄ１、Ａｍｂ  ａ１、Ｃｒｙ  ｊ１、Ｆｅｌ  ｄ１、Ｖｅｓ  ｖ１、２または５、Ｄｏｌ  ｍ１、Ｄｏｌ  ｍ２、Ｄｏｌ  ｍ５、Ａｐｉ  ｍ１、Ｂｌａ  ｇ１、およびＰｅｒ  ａ１からなる群から選択されるタンパク質またはペプチドである組成物。
【請求項１３】
請求項１〜６の何れか１項に記載の組成物であって、前記１以上のタンパク質化合物は、動物またはヒトの癌抗原またはその変異体である組成物。
【請求項１４】
請求項１〜６の何れか１項に記載の組成物であって、前記１以上のタンパク質化合物は、動物またはヒトを起源とする自己抗原またはその変異体である組成物。
【請求項１５】
請求項１〜１４の何れか１項に記載の組成物であって、更に、スペーサー化合物を含有する組成物。
【請求項１６】
請求項１５に記載の組成物であって、前記スペーサーがキトサンである組成物。
【請求項１７】
請求項１〜１６の何れか１項に記載の組成物であって、細胞当りの前記結合されたタンパク質化合物の分子数が１〜約１００，０００の範囲である組成物
【請求項１８】
請求項１〜１６の何れか１項に記載の組成物であって、細胞当りの前記結合されたタンパク質化合物の分子数が１〜約１０，０００の範囲である組成物。
【請求項１９】
請求項１〜１８の何れか１項に記載の組成物を含有してなる封入された製剤。
【請求項２０】
請求項１〜１９の何れか１項に記載の組成物の使用であって、動物またはヒト患者における感染性疾患、癌、アレルギー、および自己免疫疾患からなる群から選択される疾患を予防および／または治療するための薬剤を製造するための使用。
【請求項２１】
請求項９〜１１の何れか１項に記載の組成物の使用であって、動物またはヒト患者におけるアレルギーを予防および／または治療するための薬剤を製造するための使用。
【請求項２２】
請求項２０に記載の組成物の使用であって、前記感染性疾患は、ポックスウイルス科、ヘルペスウイルス科、アデノウイルス科、パルボウイルス科、パポバウイルス科、ヘパドナウイルス科、ピコルナウイルス科、カルシウイルス科、レオウイルス科、トガウイルス科、フラビウイルス科、アレナウイルス科、レトロウイルス科、ブンヤウイルス科、オルトミクソウイルス科、パラミクソウイルス科、ラブドウイルス科、アルボウイルス、オンコウイルス、未分類ウイルス（肝炎ウイルス、アストロウイルス、およびトロウイルスから選択される）、バチルス、マイコバクテリウム、プラスモジウム、プリオン、コレラ、シゲラ、大腸菌、サルモネラ、コリネバクテリウム、ボレリア、ヘモフィルス、オンコセルカ、ボルデテラ、ニューモコッカス、住血吸虫、クロストリジウム、クラミジア、ストレプトコッカス、スタフィロコッカス、カンピロバクター、レジオネラ、トキソプラスモス、リステリア、ビブリオ、ノカルジア、クロストリジウム、ナイセリア、カンジダ、トリコモナス、ガルドネレラ、トレポネマ、ヘモフィルス、クレブシエラ、エンテロバクター、プロテウス、シュードモナス、セラチア、レプトスピラ、表皮糸状菌属、小胞子菌属、白癬菌属、アクレモニウム、アスペルギルス、カンジダ、 フサリウム、スコプラリオプシス属、オニココラ、シタリジウム、ヒストプラズマ、クリプトコッカス、ブラストマイセス、コクシジオイデス、パラコクシジオイデス、接合菌、スポロトリクス、ボルデテラ、ブルセラ、パスツレラ、リケッチア、バルトネラ、エルジニア、ジアルジア、ロドコッカス、エルジニア、およびトキソプラズマからなる群から選択される動物またはヒトの病原体によって生じる使用。
【請求項２３】
動物またはヒト患者の疾患またはアレルギーを予防および／または治療するための、請求項１〜２２の何れか１項に記載の医薬組成物。
【請求項２４】
請求項２３に記載の医薬組成物であって、前記疾患は、感染性疾患、癌、アレルギーおよび自己免疫疾患からなる群から選択される医薬組成物。
【請求項２５】
１以上の異種タンパク質化合物を表面ディスプレイする生物学的媒介物を含有してなる請求項１の医薬組成物を製造する方法であって：
ａ．下記を含有する混合物を調製することと；
ｉ）１以上のバクテリア株の細胞、
ｉｉ）１以上の異種タンパク質化合物、および
ｉｉｉ）異種二官能性架橋剤
ｂ．該混合物をインキュベートして、前記二官能性架橋剤がシッフ塩基を介して前記細胞のアミノ基に共有結合された前記生物学的媒介物を形成する工程と；
ｃ．該生物学的媒介物を前記混合物から分離する工程と
を含んでなり、
前記細胞は、前記１以上のタンパク質化合物をコードするトランスジェニック核酸分子を含まない方法。
【請求項２６】
請求項２５に記載の方法であって、前記二官能性架橋剤が、グルタルアルデヒド、ポリアゼチジンおよびパラホルムアルデヒドからならる群から選択される方法。
【請求項２７】
請求項２５または２６に記載の方法であって、前記工程（ｂ）における混合物が０℃以下の温度でインキュベートされる方法。
【請求項２８】
請求項２５または２６に記載の方法であって、前記温度が、−１℃〜−３０℃である方法。
【請求項２９】
請求項２５〜２８の何れか１項に記載の方法であって、前記生物学的媒介物が、遺伝子修飾されていないバクテリア株または遺伝子修飾されたバクテリア株を含んでなる方法。
【請求項３０】
請求項２５〜２９の何れか１項に記載の方法であって、前記バクテリア株は、ラクトコッカス、ラクトバチルス、ロイコノストック、Ｎ族ストレプトコッカス、エンテロコッカス、ビフィドバクテリウム、非病原性のスタフィロコッカス、および非病原性のバチルスからなる群から選択されるバクテリア属のメンバーである方法。
【請求項３１】
請求項３０に記載の方法であって、前記バクテリア株は、ラクトバチルスおよびビフィドバクテリウムからなる群から選択されるバクテリア属のメンバーである方法。
【請求項３２】
請求項３１に記載の方法であって、前記バクテリア株は、ラクトバチルス・アセトトレランス、ラクトバチルス・アシジピシチス、ラクトバチルス・アシドフィルス、ラクトバチルス・アギリス、ラクトバチルス・アルギドゥス、ラクトバチルス・アリメタリウス、ラクトバチルス・アミロリティクス、ラクトバチルス・アミロフィルス、ラクトバチルス・アミロボルス、ラクトバチルス・アニマリス、ラクトバチルス・アリゾネンシス、ラクトバチルス・アビアリウス、ラクトバチルス・ビフェルメンタンス、ラクトバチルス・ブレビス、ラクトバチルス・ブフネリ、ラクトバチルス・カゼイ、ラクトバチルス・コエロホミニス、ラクトバチルス・コリノイデス、ラクトバチルス・コリニホルミス・亜種コリニホルミス、ラクトバチルス・コリニホルミス亜種トルケンス、ラクトバチルス・クリスパツス、ラクトバチルス・クルバツス、ラクトバチルス・サイプリカセイ、ラクトバチルス・デルブルエッキイ亜種ブルガリクス、ラクトバチルス・デルブルエッキイ亜種デルブルエッキイ、ラクトバチルス・デルブルエッキイ亜種ラクチス、ラクトバチルス・ドゥリアヌス、ラクトバチルス・エクイ、ラクトバチルス・ファルチミニス、ラクトバチルス・フェリントシェンシス、ラクトバチルス・フェルメントゥム、ラクトバチルス・フォルニカリリス、ラクトバチルス・フルクチボランス、ラクトバチルス・フルメンティ、ラクトバチルス・フクエンシス、ラクトバチルス・ガリナルム、ラクトバチルス・ガッセリ、ラクトバチルス・グラミニス、ラクトバチルス・ハムステリ、ラクトバチルス・ヘルベチクス、ラクトバチルス・ヘルベチクス亜種ジュグルチ、ラクトバチルス・ヘテロヒオッキイ、ラクトバチルス・ヒルガルディイ、ラクトバチルス・ホモヒオッキイ、ラクトバチルス・インテスチナリス、ラクトバチルス・ジャポニクス、ラクトバチルス・ジェンセニイ、ラクトバチルス・ジョンソニイ、ラクトバチルス・ケフィリ、ラクトバチルス・キムチイ、ラクトバチルス・クンケエイ、ラクトバチルス・レイヒマンニイ、ラクトバチルス・レティバジ、ラクトバチルス・リンドネリ、ラクトバチルス・マレフェルメンタンス、ラクトバチルス・マリ、ラクトバチルス・マルタロミクス、ラクトバチルス・マニホチボランス、ラクトバチルス・ミンデンシス、ラクトバチルス・ムコサエ、ラクトバチルス・ムリヌス、ラクトバチルス・ナゲリイ、ラクトバチルス・オリス、ラクトバチルス・パニス、ラクトバチルス・パンテリ、ラクトバチルス・パラブフネリ、ラクトバチルス・パラカセイ亜種パラカセイ、ラクトバチルス・パラカセイ亜種シュードプランタルム、ラクトバチルス・パラカセイ亜種トレランス、ラクトバチルス・パラケフィリ、ラクトバチルス・パラリメンタリウス、ラクトバチルス・パラプランタルム、ラクトバチルス・ペントスス、ラクトバチルス・ペロレンス、ラクトバチルス・プランタルム、ラクトバチルス・ポンチス、ラクトバチルス・プシタチ、ラクトバチルス・リューテリ、ラクトバチルス・ラムノスス、ラクトバチルス・ルミニス、ラクトバチルス・サケイ、ラクトバチルス・サリバリウス、ラクトバチルス・サリバリウス亜種サリチニウス、ラクトバチルス・サリバリウス亜種サリバリウス、ラクトバチルス・サンフランシセンシス、ラクトバチルス・シャルペアエ、ラクトバチルス・スエビクス、ラクトバチルス・テルモフィルス、ラクトバチルス・テルモトレランス、ラクトバチルス・ワクチノステルクス、ラクトバチルス・バギナリス、ラクトバチルス・ベルスモルデンシス、ラクトバチルス・ビツリヌス、ラクトバチルス・ベルミホルメ、ラクトバチルス・ゼアエ、ビフィドバクテリウム・アドレッセンチス、 ビフィドバクテリウム・アエロフィルム、ビフィドバクテリウム・アンギュラツム、ビフィドバクテリウム・アニマリス、ビフィドバクテリウム・アステロイデス、ビフィドバクテリウム・ビフィドゥム、ビフィドバクテリウム・ボウム、ビフィドバクテリウム・ブレベ、 ビフィドバクテリウム・カテヌラツム、ビフィドバクテリウム・コエリヌム、ビフィドバクテリウム・コリネフォルメ、ビフィドバクテリウム・クニクリ、ビフィドバクテリウム・デンティウム、ビフィドバクテリウム・ガリクム、ビフィドバクテリウム・ガリナルム、ビフィドバクテリウム・インディクム、ビフィドバクテリウム・ロングム、ビフィドバクテリウム・ロングム bv ロングム、ビフィドバクテリウム・ロングム bv インファンティス、ビフィドバクテリウム・ロングム bv スイス、ビフィドバクテリウム・マグヌム、ビフィドバクテリウム・メリチクム、ビフィドバクテリウム・ミニマム、ビフィドバクテリウム・シュードカテヌラツム、ビフィドバクテリウム・シュードロングム、ビフィドバクテリウム・シュードロングム亜種グロボスム、ビフィドバクテリウム・シュードロングム亜種シュードロングム、ビフィドバクテリウム・プシクロアエロフィルム、ビフィドバクテリウム・プロルム、ビフィドバクテリウム・ルミナンティウム、ビフィドバクテリウム・サエキュラレ、ビフィドバクテリウム・スカルドビイ、ビフィドバクテリウム・スブティレ、ビフィドバクテリウム・テルモアシドフィルム、ビフィドバクテリウム・テルモアシドフィルム亜種スイス、ビフィドバクテリウム・テルモフィルム、ビフィドバクテリウム・ウリナリスから選択されるバクテリア種のメンバーである方法。
【請求項３３】
請求項２５〜３２の何れか１項に記載の方法であって、前記１以上のタンパク質化合物は、動物もしくはヒトの病原体に由来する抗原、またはその変異体である方法。
【請求項３４】
請求項３３に記載の方法であって、前記動物もしくはヒトの病原体が、ポックスウイルス科、ヘルペスウイルス科、アデノウイルス科、パルボウイルス科、パポバウイルス科、ヘパドナウイルス科、ピコルナウイルス科、カルシウイルス科、レオウイルス科、トガウイルス科、フラビウイルス科、アレナウイルス科、レトロウイルス科、ブンヤウイルス科、オルトミクソウイルス科、パラミクソウイルス科、ラブドウイルス科、アルボウイルス、オンコウイルス、未分類ウイルス（肝炎ウイルス、アストロウイルス、およびトロウイルスから選択される）、バチルス、マイコバクテリウム、プラスモジウム、プリオン、コレラ、シゲラ、大腸菌、サルモネラ、コリネバクテリウム、ボレリア、ヘモフィルス、オンコセルカ、ボルデテラ、ニューモコッカス、住血吸虫、クロストリジウム、クラミジア、ストレプトコッカス、スタフィロコッカス、カンピロバクター、レジオネラ、トキソプラスモス、リステリア、ビブリオ、ノカルジア、クロストリジウム、ナイセリア、カンジダ、トリコモナス、ガルドネレラ、トレポネマ、ヘモフィルス、クレブシエラ、エンテロバクター、プロテウス、シュードモナス、セラチア、レプトスピラ、表皮糸状菌属、小胞子菌属、白癬菌属、アクレモニウム、アスペルギルス、カンジダ、 フサリウム、スコプラリオプシス属、オニココラ、シタリジウム、ヒストプラズマ、クリプトコッカス、ブラストマイセス、コクシジオイデス、パラコクシジオイデス、接合菌、スポロトリクス、ボルデテラ、ブルセラ、パスツレラ、リケッチア、バルトネラ、エルジニア、ジアルジア、ロドコッカス、エルジニア、およびトキソプラズマからなる群から選択される方法。
【請求項３５】
請求項２５〜３４の何れか１項に記載の方法であって、前記１以上のタンパク質化合物が、抽出物、精製物、組換え体、突然変異体もしくはペプチド供給源、またはそれらの変種のアレルゲンである方法。
【請求項３６】
請求項３３に記載の方法であって、前記アレルゲンの供給源が、カバノキ、ネコ、杉樹、オリーブ樹、ブタクサ、他の雑草、刺す昆虫、蚊／蚋、ゴキブリ、ウシ、イヌ、塵ダニ、草、屋外カビ、屋内カビ、齧歯類、ウマ、ナッツ、ミルク、大豆、小麦、卵、甲殻類および魚からなる群から選択される方法。
【請求項３７】
請求項３５に記載の方法であって、前記アレルゲンの供給源が、カバノキ花粉（Bet v）、草花粉（Phl p、Lol p、Cyn d  またはSor h）、ハウスダストダニ（Der pまたはDer f）、ダニ（Eur m 、Blo t 、Gly m、Lep d）、ブタクサ花粉（Amb a）、杉樹花粉（Cry j）、ネコ（Fel d）、スズメバチ（Ves vまたはDol m）、ミツバチ（Api m）およびゴキブリ（Bla gおよびPer a）からなる群から選択される法。
【請求項３８】
請求項３５に記載の方法であって、前記アレルゲンが、Ｂｅｔｖ１、Ｂｅｔｖ２、Ｐｈｌ  ｐ１もしくはＰｈｌ  ５、Ｌｏｌ  ｐ１、Ｌｏｌ  ｐ５、Ｃｙｎ  ｄ１、Ｓｏｒ  ｈ１、Ｄｅｒ  ｐ１、Ｄｅｒ  ｐ２、Ｄｅｒ  ｆ１、Ｄｅｒ  ｆ２、Ｅｕｒ  ｍ１、Ｂｌｏ  ｔ１、Ｇｌｙ  ｍ１、Ｌｅｐ  ｄ１、Ａｍｂ  ａ１、Ｃｒｙ  ｊ１、Ｆｅｌ  ｄ１、Ｖｅｓ  ｖ１、２または５、Ｄｏｌ  ｍ１、Ｄｏｌ  ｍ２、Ｄｏｌ  ｍ５、Ａｐｉ  ｍ１、Ｂｌａ  ｇ１、およびＰｅｒ  ａ１からなる群から選択されるタンパク質またはペプチドである方法。
【請求項３９】
請求項２５〜３２の何れか１項に記載の方法であって、前記１以上のタンパク質化合物が、動物またはヒトの癌抗原またはその変種である方法。
【請求項４０】
請求項２５〜３４の何れか１項に記載の方法であって、前記１以上のタンパク質化合物が、動物またはヒトを起源とする自己抗原またはその変異体である方法。
【請求項４１】
請求項２５〜４０の何れか１項に記載の方法であって、前記混合物が、更にスペーサー化合物を含有する方法。
【請求項４２】
請求項３７に記載の方法であって、前記スペーサーがキトサンである方法。
【請求項４３】
請求項２３〜３８の何れか１項に記載の方法であって、前記結合されたタンパク質化合物の細胞当りの分子数が１〜約１００，０００の範囲である方法。
【請求項４４】
請求項２３〜３８の何れか１項に記載の方法であって、前記結合されたタンパク質化合物の細胞当りの分子数が１〜約１０，０００の範囲である方法
【請求項４５】
請求項２３〜４０の何れか１項に記載の方法であって、更に、前記生物学的媒介物を封入する工程を含んでなる方法。