【手続補正書】
【提出日】平成21年2月9日(2009.2.9)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
ウイルス又は生物体中のレプリキン骨格を同定する方法であって、
（１）末端リジン及び該末端リジンに直接隣接するリジン；
（２）末端ヒスチジン及び該末端ヒスチジンに直接隣接するヒスチジン、
（３）ほかのリジンから約６〜約１０個のアミノ酸残基におけるリジン；及び
（４）少なくとも６％のリジン、
を含む約１６〜約３０個のアミノ酸から成る、一連のレプリキン骨格ペプチドを同定する工程を含む、方法。
【請求項２】
前記一連のレプリキン骨格ペプチドの個々のメンバー又は複数のメンバーを同定する工程を更に含んで成る、請求項１に記載の方法。
【請求項３】
更に、エクソスケルトン骨格（Exoskeleton Scaffold)を同定することを含んで成り、ここで前記一連のレプリキン骨格ペプチドが第一系列のウイルス、ウイルス株又は生物体中で同定され、そして該第一系列のウイルス、ウイルス株又は生物体との比較として、前記エクソスケルトン骨格が後発ウイルス、ウイルス株又は生物体中で同定され、ここで該エクソスケルトン骨格が、該レプリキン骨格と約同数のアミノ酸から成るアミノ酸配列から成り、そして更に（１）末端リジン及び該末端リジンに直接隣接するリジン、（２）末端ヒスチジン及び該末端ヒスチジンに直接隣接するヒスチジンを含んで成り、そして（３）ほかのリジンから約６〜約１０個のアミノ酸残基中にリジンを含まない、請求項１に記載の方法。
【請求項４】
更に、請求項１に記載の第一及び第二レプリキン骨格ペプチドを同定する工程、第一レプリキン骨格ペプチドと第二レプリキン骨格ペプチドを比較する工程、及び該第二レプリキン骨格ペプチドが該第一レプリキン骨格ペプチドから変化しない場合、ワクチンとして第一又は第二レプリキン骨格ペプチドのいずれかを選択する工程を含んで成る、請求項１に記載のレプリキン骨格ペプチドを同定する方法。
【請求項５】
７〜約５０個のアミノ酸から成る単離又は合成されたインフルエンザウイルスペプチドであって、（１）第二リジン残基から６〜１０個の残基に位置する少なくとも１つのリジン残基、ここで該ペプチドは末端リジン残基である少なくとも１つのリジン残基、及び他方の末端残基である少なくとも１つのリジン残基又は少なくとも１つのヒスチン残基を含んで成る；（２）少なくとも１つのヒスチジン残基；及び（３）該単離又は合成されたインフルエンザウイルスペプチドがインフルエンザウイルスのＨ５Ｎ１株中に存在する少なくとも６％のリジン残基、を含んで成るインフルエンザウイルスペプチド。
【請求項６】
前記単離又は合成されたインフルエンザウイルスペプチドがインフルエンザウイルスの新興株中に存在する、請求項５に記載の単離又は合成されたインフルエンザウイルスペプチド。
【請求項７】
配列番号１６のアミノ酸配列を含んで成る、請求項５に記載の単離又は合成されたインフルエンザウイルスペプチド。
【請求項８】
アミノ酸配列、ＫＫＮＳＴＹＰＴＩＫＲＳＹＮＮＴＮＱＥＤＬＬＶＬＷＧＩＨＨ（配列番号１５）を含んで成る、請求項５に記載の単離又は合成されたインフルエンザウイルスペプチド。
【請求項９】
約１６〜約３０個のアミノ酸から成り、そして
（１）末端リジン及び該末端リジンに直接隣接するリジン；
（２）末端ヒスチジン及び該末端ヒスチジンに直接隣接するヒスチジン、
（３）ほかのリジンから約６〜約１０個のアミノ酸残基におけるリジン；及び
（４）少なくとも６％のリジン、
を含んで成る、単離又は合成されたインフルエンザウイルスペプチドであって、ここで該ペプチドの相同体が、複数のウイルスの異種検体、ウイルス株又は生物体に存在し、ここで該相同体が約１６〜約３０個のアミノ酸から成り、そして
（１）末端リジン及び該末端リジンに直接隣接するリジン；
（２）末端ヒスチジン及び該末端ヒスチジンに直接隣接するヒスチジン、
（３）ほかのリジンから約６〜約１０個のアミノ酸残基におけるリジン；及び
（４）少なくとも６％のリジン、
を含んで成る、インフルエンザウイルスペプチド。
【請求項１０】
（１）第二リジン残基から約６〜約１０個の残基に位置する少なくとも１つのリジン残基；（２）少なくとも１つのヒスチジン残基；（３）少なくとも６％のリジン残基を含んで成る、７〜約５０個のアミノ酸から成るインフルエンザウイルスの少なくとも１つの単離又は合成されたペプチドを含んで成る予防的又は治療的ウイルスワクチン。
【請求項１１】
前記単離又は合成されたペプチドが、インフルエンザウイルスの新興株中に存在する、請求項１０に記載の予防的又は治療的ウイルスワクチン。
【請求項１２】
前記単離又は合成されたペプチドが、インフルエンザウイルスのＨ５Ｎ１株中に存在する、請求項１０に記載の予防的又は治療的ウイルスワクチン。
【請求項１３】
ＫＫＮＳＴＹＰＴＩＫＲＳＹＮＮＴＮＱＥＤＬＬＶＬＷＧＩＨＨ（配列番号１５）を含んで成るアミノ酸配列を含むペプチドを含んで成る、請求項１０に記載の予防的又は治療的ウイルスワクチン。
【請求項１４】
配列番号４５９、配列番号４６０、配列番号４６１、配列番号４６２、配列番号４６３、配列番号４６４、配列番号４６５、配列番号４６６、配列番号４６７、配列番号４６８、配列番号４６９のいずれかを更に含んで成る、請求項１０に記載の予防的又は治療的ウイルスワクチン。
【請求項１５】
更に、配列番号４５９を含んで成る、請求項１３に記載の予防的又は治療的ウイルスワクチン。
【請求項１６】
更に、医薬的に許容される担体及び／又はアジュバントを含んで成る、請求項１０に記載の予防的又は治療的ウイルスワクチン。
【請求項１７】
更に、ワクチンＶ１２０３０４Ｕ２を含んで成る、請求項１３に記載の予防的又は治療的ウイルスワクチン。
【請求項１８】
少なくとも１つの単離又は合成したインフルエンザウイルスレプリキンペプチドの有効量を投与する工程を含んで成るインフルエンザウイルスに対する抗体を産生するために対象の免疫系を刺激する方法であって、該インフルエンザウイルスレプリキンペプチドが、（１）第二リジン残基から６〜１０個の残基中に位置する少なくとも１つのリジン残基、ここで該ペプチドは末端リジン残基である少なくとも１つのリジン残基、及び他方の末端残基である少なくとも１つのリジン残基又は少なくとも１つのヒスチジン残基を含んで成る；（２）少なくとも１つのヒスチジン残基、及び（３）少なくとも６％のリジン残基を含んで成る７〜約５０個のアミノ酸から成る、方法。
【請求項１９】
更に、医薬的に許容される担体及び／又はアジュバントを含んで成り、そして更にインフルエンザ感染を予防又は治療する工程を含んで成る、請求項１８に記載の方法。
【請求項２０】
前記単離又は合成されたインフルエンザウイルスペプチドが新興ウイルス中に存在する、請求項１８に記載の方法。
【請求項２１】
前記単離又は合成されたインフルエンザウイルスペプチドがインフルエンザウイルスのＨ５Ｎ１株中に存在する、請求項１８に記載の方法。
【請求項２２】
前記単離又は合成されたインフルエンザウイルスペプチドが、ＫＫＮＳＴＹＰＴＩＫＲＳＹＮＮＴＮＱＥＤＬＬＶＬＷＧＩＨＨ（配列番号１５）を含むアミノ酸配列を含んで成る、請求項１８に記載の方法。
【請求項２３】
予防的又は治療的ウイルスワクチンを製造する方法であって、約１６〜約３０個のアミノ酸から成る複数のレプリキン骨格ペプチドを含んで成るレプリキン骨格を同定する工程、及び予防又は治療的ウイルスワクチンとして少なくとも１つの該レプリキン骨格ペプチドを単離又は合成する工程を含んで成り、ここで該レプリキン骨格ペプチドが：
（１）末端リジン及び該末端リジンに直接隣接するリジン；
（２）末端ヒスチジン及び該末端ヒスチジンに直接隣接するヒスチジン、
（３）ほかのリジンから約６〜約１０個のアミノ酸残基におけるリジン；及び
（４）少なくとも６％のリジン、
を含んで成る、方法。
【請求項２４】
前記レプリキン骨格ペプチドがインフルエンザウイルス中に存在する、請求項２３
に記載の方法。
【請求項２５】
複数の基準をタンパク質配列を表すデータに対して適用する工程；
該基準に基づき、該タンパク質配列中の任意のサブシーケンスを同定する工程；及び
該同定したサブシーケンスをデータファイルに出力する工程を含んで成る方法であって、
該基準が：
該サブシーケンス中に含まれるアミノ酸のセット｛ａ｝；
該サブシーケンスから除外されるアミノ酸のセット｛ｂ｝；及び
セット｛ａ｝及び｛ｂ｝のメンバー間の最小及び最大許容ギャップ、
を含んで成る、方法。
【請求項２６】
前記タンパク質配列がネットワークを介して得られる、請求項２５に記載の方法。
【請求項２７】
請求項２５に記載の方法を実行するための、コンピュータ実行可能命令を記憶する機械可読媒体。
【請求項２８】
複数の基準をタンパク質配列を表すデータに対して適用する工程；
該基準に基づき、該タンパク質配列中のサブシーケンスを同定する工程、ここで該同定されたサブシーケンスは、そのリジンアミノ酸間の距離の所定の許容範囲、及びそのヒスチジンアミノ酸と最も遠いリジンアミノ酸の間の距離の所定の許容範囲を有し；そして
該同定したサブシーケンスをデータファイルに出力する工程、
を含んで成る方法。
【請求項２９】
前記タンパク質配列がネットワークを介して得られる、請求項２８に記載の方法。
【請求項３０】
請求項２８に記載の方法を実行するための、コンピュータ実行可能命令を記憶する機械可読媒体。