【手続補正書】
【提出日】平成21年9月9日(2009.9.9)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
抗体２Ｇ１２によって認識される少なくとも２つのＮ−結合高マンノースオリゴ糖を含む単離されたグリコシル化ポリペプチド、および医薬上許容される賦形剤を含み、ここで、該ポリペプチド上のＮ−結合グリカンの５０％を超えるものは高−マンノースオリゴ糖であり、ここで、該高−マンノースオリゴ糖はＭａｎ９ＧｌｃＮＡｃ２、Ｍａｎ８ＧｌｃＮＡｃ２またはその組合せである、対象において抗体２Ｇ１２によって認識されるエピトープを含む蛋白質に特異的な抗体を誘導するための組成物。
【請求項２】
前記ポリペプチドが少なくとも３つのＮ−結合高−マンノースオリゴ糖を含む請求項１記載の組成物。
【請求項３】
前記ポリペプチドがｇｐ１２０のアミノ酸配列、またはその断片を含む請求項１記載の組成物。
【請求項４】
前記ポリペプチドが真菌糖蛋白質のアミノ酸配列、またはその断片を含む請求項１記載の組成物。
【請求項５】
前記ポリペプチドが、酵母糖蛋白質のアミノ酸配列、またはその断片を含む請求項１記載の組成物。
【請求項６】
前記酵母がＳａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ  ｃｅｒｅｖｉｓｉａｅである請求項５記載の組成物。
【請求項７】
前記酵母糖蛋白質が、ＰＳＴ１、ＥＣＭ３３、Ｇａｓ１、Ｇａｓ５、ＧＰ３８、およびＹＪＬ１７１ｃよりなる群から選択される請求項６記載の組成物。
【請求項８】
前記酵母がＰｉｃｈｉａ  ｐａｓｔｏｒｉｓである請求項５記載の組成物。
【請求項９】
前記酵母がＣａｎｄｉｄａ  ａｌｂｉｃａｎｓである請求項５記載の組成物。
【請求項１０】
前記ポリペプチドが、Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ  ｃｅｒｅｖｉｓｉａｅのＰＳＴ１、ＥＣＭ３３、Ｇａｓ１、Ｇａｓ５、ＧＰ３８、またはＹＪＬ１７１ｃに対するホモログである真菌糖蛋白質のアミノ酸配列を含む請求項４記載の組成物。
【請求項１１】
前記ポリペプチド上のＮ−結合グリカンの少なくとも９０％がＭａｎ９ＧｌｃＮＡｃ２、Ｍａｎ８ＧｌｃＮＡｃ２、またはその組合せである請求項１記載の組成物。
【請求項１２】
前記ポリペプチド上のＮ−結合グリカンの少なくとも９０％がＭａｎ８ＧｌｃＮＡｃ２である請求項１記載の組成物。
【請求項１３】
前記医薬上許容される賦形剤がアジュバントである請求項１記載の組成物。
【請求項１４】
Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ  ｃｅｒｅｖｉｓｉａｅの破壊されたｐｍｒ１遺伝子、またはＳａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ  ｃｅｒｅｖｉｓｉａｅのｐｍｒ１遺伝子の破壊されたホモログ遺伝子を有する突然変異体真菌から単離されたグリコシル化ポリペプチドであって、ここで、該グリコシル化ポリペプチドは抗体２Ｇ１２によって認識されるグリコシル化ポリペプチド、および医薬上許容される賦形剤を含む、対象において抗体２Ｇ１２によって認識されるエピトープを有する蛋白質に特異的な抗体を誘導するための組成物。
【請求項１５】
前記突然変異体真菌が突然変異体酵母である請求項１４記載の組成物。
【請求項１６】
前記突然変異体酵母が破壊されたｐｍｒ１遺伝子を有するＳａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ  ｃｅｒｅｖｉｓｉａｅである請求項１５記載の組成物。
【請求項１７】
前記グリコシル化ポリペプチドがＰＳＴ１のアミノ酸配列、またはその断片を含む請求項１６記載の組成物。
【請求項１８】
Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ  ｃｅｒｅｖｉｓｉａｅの破壊されたｐｍｒ１およびｍｎｎ１遺伝子、またはＳａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ  ｃｅｒｅｖｉｓｉａｅのｐｍｒ１およびｍｎｎ１遺伝子の破壊されたホモログ遺伝子を有する突然変異体真菌から単離されたグリコシル化ポリペプチドであって、ここで、該グリコシル化ポリペプチドは抗体２Ｇ１２によって認識されるグリコシル化ポリペプチド、および医薬上許容される賦形剤を含む、対象において抗体２Ｇ１２によって認識されるエピトープを有する蛋白質に特異的な抗体を誘導するための組成物。
【請求項１９】
前記突然変異体真菌が突然変異体酵母である請求項１８記載の組成物。
【請求項２０】
前記突然変異体酵母が破壊されたｐｍｒ１およびｍｎｎ１遺伝子を有するＳａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ  ｃｅｒｅｖｉｓｉａｅである請求項１９記載の組成物。
【請求項２１】
前記グリコシル化ポリペプチドが、ＰＳＴ１のアミノ酸配列、またはその断片を含む請求項２０記載の組成物。
【請求項２２】
Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ  ｃｅｒｅｖｉｓｉａｅの破壊されたｏｃｈ１およびｍｎｎ１遺伝子、またはｏｃｈ１、ｍｎｎ１、およびｍｎｎ４遺伝子、あるいはＳａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ  ｃｅｒｅｖｉｓｉａｅのｏｃｈ１およびｍｎｎ１、またはｏｃｈ１、ｍｎｎ１、およびｍｎｎ４遺伝子の破壊されたホモログ遺伝子を有する突然変異体真菌から単離されたグリコシル化ポリペプチド、ここで、該グリコシル化ポリペプチドは抗体２Ｇ１２によって認識され、および医薬上許容される賦形剤を含む、対象において抗体２Ｇ１２によって認識されるエピトープを有する蛋白質に特異的な抗体を誘導するための組成物。
【請求項２３】
ａ）突然変異体真菌を発酵させる工程であって、ここで、該突然変異体真菌はグリコシル化ポリペプチドを生産するように突然変異されており、ここで、該グリコシル化ポリペプチドは、抗体２Ｇ１２によって認識される少なくとも２つのＮ−結合高マンノースオリゴ糖を含み、ここで、該グリコシル化ポリペプチド上のＮ−結合グリカンの５０％を超えるものが高−マンノースオリゴ糖である、および該高−マンノースオリゴ糖はＭａｎ９ＧｌｃＮＡｃ２、Ｍａｎ８ＧｌｃＮＡｃ２、またはその組合せである、工程；
ｂ）突然変異体真菌細胞溶解物または上清からグリコシル化ポリペプチドを精製する工程；次いで
ｃ）該グリコシル化ポリペプチドを医薬上許容される賦形剤と共に処方する工程を含む、対象において抗体２Ｇ１２によって認識されるエピトープを含む蛋白質に特異的な抗体を誘導するための組成物を調製する方法。
【請求項２４】
前記突然変異体真菌が突然変異体酵母である請求項２３記載の方法。
【請求項２５】
前記突然変異体酵母が破壊されたｏｃｈ１、ｍｎｎ１、およびｍｎｎ４遺伝子を有するＳａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ  ｃｅｒｅｖｉｓｉａｅである請求項２４記載の方法。
【請求項２６】
前記突然変異体酵母が破壊されたｐｍｒ１およびｍｎｎ１遺伝子を有するＳａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ  ｃｅｒｅｖｉｓｉａｅである請求項２４記載の方法。
【請求項２７】
前記突然変異体酵母が破壊されたｏｃｈ１およびｍｎｎ１遺伝子を有するＳａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ  ｃｅｒｅｖｉｓｉａｅである請求項２４記載の方法。
【請求項２８】
前記突然変異体酵母が破壊されたｏｃｈ１遺伝子を有するＰｉｃｈｉａ  ｐａｓｔｏｒｉｓである請求項２４記載の方法。
【請求項２９】
前記突然変異体酵母が破壊されたｏｃｈ１遺伝子を有するＣａｎｄｉｄａ  ａｌｂｉｃａｎｓである請求項２４記載の方法。
【請求項３０】
前記グリコシル化ポリペプチドが酵母糖蛋白質またはその断片である請求項２３記載の方法。
【請求項３１】
前記酵母糖蛋白質がＳａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ  ｃｅｒｅｖｉｓｉａｅのＰＳＴ１、ＥＣＭ３３、Ｇａｓ１、Ｇａｓ５、ＧＰ３８、およびＹＪＬ１７１ｃよりなる群から選択される請求項３０記載の方法。
【請求項３２】
前記酵母糖蛋白質がＳａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ  ｃｅｒｅｖｉｓｉａｅのＰＳＴ１、ＥＣＭ３３、Ｇａｓ１、Ｇａｓ５、ＧＰ３８、またはＹＪＬ１７１ｃのホモログである請求項３０記載の方法。
【請求項３３】
前記突然変異体真菌が、工程ａ）前に、前記グリコシル化ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含むベクターで形質転換されている請求項２３記載の方法。
【請求項３４】
前記ヌクレオチド配列がｇｐ１２０またはその断片をコードする請求項３３記載の方法。
【請求項３５】
ｇｐ１２０をコードするヌクレオチド配列、または少なくとも２つのＮ−グリコシル化部位を含むその断片を含むポリヌクレオチドを含む突然変異体真菌細胞であって、該突然変異体酵母細胞はｇｐ１２０、または抗体２Ｇ１２によって認識される少なくとも２つのＮ−結合高マンノースオリゴ糖を含む断片を生産することができ、ここで、該高−マンノースオリゴ糖はＭａｎ９ＧｌｃＮＡｃ２、Ｍａｎ８ＧｌｃＮＡｃ２またはその組合せである突然変異体真菌細胞。
【請求項３６】
前記突然変異体真菌が破壊されたｏｃｈ１、ｍｎｎ１、およびｍｎｎ４遺伝子を有するＳａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ  ｃｅｒｅｖｉｓｉａｅである請求項３５記載の突然変異体真菌細胞。
【請求項３７】
前記突然変異体真菌が、破壊されたｐｍｒ１およびｍｎｎ１遺伝子を有するＳａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ  ｃｅｒｅｖｉｓｉａｅである請求項３５記載の突然変異体真菌細胞。
【請求項３８】
前記突然変異体真菌が、破壊されたｏｃｈ１およびｍｎｎ１遺伝子を有するＳａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ  ｃｅｒｅｖｉｓｉａｅである請求項３５記載の突然変異体真菌細胞。
【請求項３９】
前記突然変異体真菌が、破壊されたｏｃｈ１を有するＰｉｃｈｉａ  ｐａｓｔｏｒｉｓである請求項３５記載の突然変異体真菌細胞。
【請求項４０】
有効量の請求項１記載の組成物を含む、対象において、抗体２Ｇ１２によって認識されるエピトープを含む蛋白質に特異的な抗体を創製するための組成物。
【請求項４１】
有効量の請求項１４記載の組成物を含む、対象において、抗体２Ｇ１２によって認識されるエピトープを含む蛋白質に特異的な抗体を創製するための組成物。
【請求項４２】
有効量の請求項１８記載の組成物を含む、対象において、抗体２Ｇ１２によって認識されるエピトープを含む蛋白質に特異的な抗体を創製するための組成物。
【請求項４３】
有効量の請求項２２記載の組成物を含む、対象において、抗体２Ｇ１２によって認識されるエピトープを含む蛋白質に特異的な抗体を創製するための組成物。
【請求項４４】
有効量の請求項１記載の組成物を含む、対象において、病原体に対する中和抗体を誘導するための組成物。
【請求項４５】
前記病原体がＨＩＶである請求項４４記載の組成物。
【請求項４６】
有効量の請求項１４記載の組成物を含む、対象において病原体に対する中和抗体を誘導するための組成物。
【請求項４７】
前記病原体がＨＩＶである請求項４６記載の組成物。
【請求項４８】
有効量の請求項１８記載の組成物を含む、対象において病原体に対する中和抗体を誘導するための組成物。
【請求項４９】
前記病原体がＨＩＶである請求項４８記載の組成物。
【請求項５０】
有効量の請求項２２記載の組成物を含む、対象において病原体に対する中和抗体を誘導するための組成物。
【請求項５１】
前記病原体がＨＩＶである請求項５０記載の組成物。
【請求項５２】
有効量の請求項１記載の組成物を含む、対象において、病原体によって誘導される疾患を予防または治療するための組成物。
【請求項５３】
前記病原体がＨＩＶである請求項５２記載の組成物。
【請求項５４】
有効量の請求項１４記載の組成物を含む、対象において、病原体によって誘導される疾患を予防または治療するための組成物。
【請求項５５】
前記病原体がＨＩＶである請求項５４記載の組成物。
【請求項５６】
有効量の請求項１８記載の組成物を含む、対象において、病原体によって誘導される疾患を予防または治療するための組成物。
【請求項５７】
前記病原体がＨＩＶである請求項５６記載の組成物。
【請求項５８】
有効量の請求項２２記載の組成物を含む、対象において、病原体によって誘導される疾患を予防または治療するための組成物。
【請求項５９】
前記病原体がＨＩＶである請求項５８記載の組成物。
【請求項６０】
抗体２Ｇ１２によって認識される少なくとも２つのＮ−結合高マンノースオリゴ糖を含むグリコシル化ポリペプチドに対する抗体の結合を検出することを含み、ここで、該グリコシル化ポリペプチド上のＮ−結合グリカンの５０％を超えるものは高−マンノースオリゴ糖であり、および、ここで、該高−マンノースオリゴ糖はＭａｎ９ＧｌｃＮＡｃ２、Ｍａｎ８ＧｌｃＮＡｃ２またはその組合せである、Ｎ−結合高マンノースオリゴ糖に特異的に結合する抗体を同定する方法。
【請求項６１】
前記抗体がＨＩＶによって感染される対象の血清中にある請求項６０記載の方法。
【請求項６２】
前記グリコシル化ポリペプチドが突然変異体酵母細胞溶解物である請求項６０記載の方法。
【請求項６３】
Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ  ｃｅｒｅｖｉｓｉａｅの破壊されたｏｃｈ１およびｍｎｎ１、またはｏｃｈ１、ｍｎｎ１およびｍｎｎ４遺伝子、あるいはＳａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ  ｃｅｒｅｖｉｓｉａｅのｏｃｈ１およびｍｎｎ１、またはｏｃｈ１、ｍｎｎ１、およびｍｎｎ４遺伝子の破壊されたホモログ遺伝子を有する突然変異体真菌において生産されたグリコシル化ポリペプチドに対する抗体の結合を検出することを含み、ここで、該グリコシル化ポリペプチドは抗体２Ｇ１２によって認識される、Ｎ−結合高マンノースオリゴ糖に特異的に結合する抗体を同定する方法。
【請求項６４】
前記抗体がＨＩＶによって感染される対象の血清中にある請求項６３記載の方法。
【請求項６５】
突然変異体酵母の全細胞、および医薬上許容される賦形剤を含み、ここで、該突然変異体酵母はＳａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ  ｃｅｒｅｖｉｓｉａｅの破壊されたｐｍｒ１およびｍｎｎ１遺伝子、ｏｃｈ１およびｍｎｎ１遺伝子、またはｏｃｈ１、ｍｎｎ１、およびｍｎｎ４遺伝子、あるいはＳａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ  ｃｅｒｅｖｉｓｉａｅのｐｍｒ１およびｍｎｎ１遺伝子、ｏｃｈ１およびｍｎｎ１遺伝子、またはｏｃｈ１、ｍｎｎ１、およびｍｎｎ４遺伝子の破壊されたホモログ遺伝子を有する、組成物。