【手続補正書】
【提出日】平成23年7月1日(2011.7.1)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
以下の構造
【化１８】
2009143946.tif 000001
を有するヌクレオシド化合物であって、ここで、Ｘは、
【化１９】
2009143946.tif 000002
【化２０】
2009143946.tif 000003
【化２１】
2009143946.tif 000004
および
【化２２】
2009143946.tif 000005
からなる群から選択され、ここで、ｎは１〜５の整数である；
Ｒ１およびＲ２は、別個に、Ｈ、低級アルキル、保護基、および色素からなる群から選択される；
Ｒ３は、−Ｈおよび低級アルキルからなる群から選択される；
Ｂは、７−デアザプリン、プリン、またはピリミジンヌクレオシド塩基である；
ここで、Ｂがプリンまたは７−デアザプリンのとき、その糖部分は、該プリンまたはデアザプリンのＮ９位にて結合しており、Ｂがピリミジンのとき、その糖部分は、該ピリミジンのＮ１位にて結合している；そして
ここで、Ｂがプリンのとき、その隣接する三重結合炭素は、該プリンの８位に結合しており、Ｂが７−デアザプリンのとき、その隣接する三重結合炭素は、該７−デアザプリンの７位に結合しており、Ｂがピリミジンのとき、その隣接する三重結合炭素は、該ピリミジンの５位に結合している；
Ｗ１は、−Ｈおよび−ＯＨからなる群から選択される；
Ｗ２は、−ＯＨ、−Ｈ、アミノ、メトキシ、ハロ、またはアジドである；そして
Ｗ３は、−ＰＯ４、−Ｐ２Ｏ７、−Ｐ３Ｏ１０、ホスフェートアナログ、および−ＯＨからなる群から選択される、ヌクレオシド化合物。
【請求項２】
Ｒ１およびＲ２の１個が、色素である、請求項１に記載のヌクレオシド化合物。
【請求項３】
前記色素が、フルオレセイン型色素である、請求項２に記載のヌクレオシド化合物。
【請求項４】
前記色素が、ローダミン型色素およびＦＬＡＮ型色素からなる群から選択される、請求項２に記載のヌクレオシド化合物。
【請求項５】
Ｗ１が、−Ｈである、請求項１に記載のヌクレオシド化合物。
【請求項６】
Ｗ２が、−Ｈまたはフルオロである、請求項１に記載のヌクレオシド化合物。
【請求項７】
Ｂが、ウラシル、シトシン、７−デアザアデニン、および７−デアザグアノシンからなる群から選択される、請求項１に記載のヌクレオシド。
【請求項８】
Ｘが、パラ立体配置を有するアルキルアミノ安息香酸であり、そしてｎ＝１である、請求項１に記載のヌクレオシド化合物。
【請求項９】
ポリヌクレオチドであって、該ポリヌクレオチドの３’末端にて含入させたヌクレオチド化合物を含み、該ヌクレオチドは、以下の構造
【化２８】
2009143946.tif 000006
を有し、ここで、Ｘは、
【化２９】
2009143946.tif 000007
【化３０】
2009143946.tif 000008
【化３１】
2009143946.tif 000009
【化３２】
2009143946.tif 000010
からなる群から選択され、ここで、ｎは、１〜５の整数である；
Ｒ１およびＲ２は、別個に、−Ｈ、低級アルキル、保護基、および色素からなる群から選択される；
Ｒ３は、−Ｈおよび低級アルキルからなる群から選択される；
Ｂは、７−デアザプリン、プリン、またはピリミジンヌクレオシド塩基である；
ここで、Ｂがプリンまたは７−デアザプリンのとき、その糖部分は、該プリンまたはデアザプリンのＮ９位にて結合しており、Ｂがピリミジンのとき、その糖部分は、該ピリミジンのＮ１位にて結合している；そして
ここで、Ｂがプリンのとき、その隣接する三重結合炭素は、該プリンの８位に結合しており、Ｂが７−デアザプリンのとき、その隣接する三重結合炭素は、該７−デアザプリンの７位に結合しており、Ｂがピリミジンのとき、その隣接する三重結合炭素は、該ピリミジンの５位に結合している；
Ｗ１は、−Ｈおよび−ＯＨからなる群から選択される；
Ｗ２は、−Ｈである；そして
Ｗ３は、ホスフェートアナログである、ポリヌクレオチド。
【請求項１０】
Ｒ１およびＲ２の１個が、色素である、請求項９に記載のポリヌクレオチド。
【請求項１１】
前記色素が、フルオレセイン型色素である、請求項１０に記載のポリヌクレオチド。
【請求項１２】
前記色素が、ローダミン型色素およびＦＬＡＮ型色素からなる群から選択される、請求項９に記載のポリヌクレオチド。
【請求項１３】
Ｗ１が、−Ｈである、請求項９に記載のポリヌクレオチド。
【請求項１４】
Ｂが、ウラシル、シトシン、７−デアザアデニン、および７−デアザグアノシンからなる群から選択される、請求項９に記載のポリヌクレオチド。
【請求項１５】
Ｘが、パラ立体配置を有するアルキルアミノ安息香酸であり、そしてｎ＝１である、請求項９に記載のポリヌクレオチド。
【請求項１６】
プライマー伸長反応を行う方法であって、該方法は、以下の工程
テンプレート核酸を提供すること；
該テンプレート核酸の一部にオリゴヌクレオチドプライマーをアニールすること；および
該プライマーを伸長するために、該プライマー−テンプレートハイブリッドに、プライマー伸長試薬を添加すること
を包含し、該プライマー伸長試薬は、以下の構造
【化２３】
2009143946.tif 000011
を有するヌクレオシド化合物を含有し、ここで、Ｘは、
【化２４】
2009143946.tif 000012
【化２５】
2009143946.tif 000013
【化２６】
2009143946.tif 000014
および
【化２７】
2009143946.tif 000015
からなる群から選択され、ここで、ｎは、１〜５の整数であり；
Ｒ１およびＲ２は、別個に、Ｈ、低級アルキル、保護基、および標識からなる群から選択される；
Ｒ３は、−Ｈおよび低級アルキルからなる群から選択される；
Ｂは、７−デアザプリン、プリン、またはピリミジンヌクレオシド塩基である；
ここで、Ｂがプリンまたは７−デアザプリンのとき、その糖部分は、該プリンまたはデアザプリンのＮ９位にて結合しており、Ｂがピリミジンのとき、その糖部分は、該ピリミジンのＮ１位にて結合している；そして
ここで、Ｂがプリンのとき、その隣接する三重結合炭素は、該プリンの８位に結合しており、Ｂが７−デアザプリンのとき、その隣接する三重結合炭素は、該７−デアザプリンの７位に結合しており、Ｂがピリミジンのとき、その隣接する三重結合炭素は、該ピリミジンの５位に結合している；
Ｗ１は、−Ｈおよび−ＯＨからなる群から選択される；
Ｗ２は、−ＯＨ、−Ｈ、アミノ、メトキシ、ハロ、またはアジドであり；そして
Ｗ３は、−ＰＯ４、−Ｐ２Ｏ７、−Ｐ３Ｏ１０、ホスフェートアナログ、および−ＯＨからなる群から選択される、方法。
【請求項１７】
Ｒ１およびＲ２のうちの一方が、色素であり、他方が−Ｈである、請求項１６に記載の方法。
【請求項１８】
前記色素が、フルオレセイン型色素である、請求項１６に記載の方法。
【請求項１９】
前記色素が、ローダミン型色素およびＦＬＡＮ型色素からなる群から選択される、請求項１６に記載の方法。
【請求項２０】
Ｗ１が、−Ｈである、請求項１６に記載の方法。
【請求項２１】
Ｗ２が、−Ｈまたはフルオロである、請求項１６に記載の方法。
【請求項２２】
Ｂが、ウラシル、シトシン、７−デアザアデニン、および７−デアザグアノシンからなる群から選択される、請求項１６に記載の方法。
【請求項２３】
Ｘが、パラ立体配置を有するアルキルアミノ安息香酸であり、そしてｎ＝１である、請求項１６に記載の方法。
【請求項２４】
Ｗ３が、ホスホジエステル結合である、請求項９に記載のポリヌクレオチド。