【手続補正書】
【提出日】平成20年11月13日(2008.11.13)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
ヒトにおける加齢黄斑変性症の発生に関連するＣＦＨ遺伝子におけるバリエーションを特異的に検出する核酸分子を含む、個体由来の試料中のバリアントＣＦＨ遺伝子の検出のための単離されたポリヌクレオチド。
【請求項２】
ポリヌクレオチドが、ヒトにおける加齢黄斑変性症の発生に関連するＣＦＨ遺伝子におけるバリエーションにストリンジェントな条件下でハイブリダイズするプローブである、請求項１記載のポリヌクレオチド。
【請求項３】
バリエーションが、ＣＦＨタンパク質の４０２位でヒスチジン以外のアミノ酸をコードする、請求項２記載のポリヌクレオチド。
【請求項４】
バリエーションが、ＣＦＨタンパク質の４０２位でチロシンをコードする、請求項３記載のポリヌクレオチド。
【請求項５】
プローブがＤＮＡプローブである、請求項２記載のポリヌクレオチド。
【請求項６】
プローブが約８ヌクレオチド〜約５００ヌクレオチドである、請求項５記載のポリヌクレオチド。
【請求項７】
プローブが約１０ヌクレオチド〜約２５０ヌクレオチドである、請求項５記載のポリヌクレオチド。
【請求項８】
プローブが１つ以上の非天然または改変ヌクレオチドを含む、請求項５記載のポリヌクレオチド。
【請求項９】
１つ以上の非天然または改変ヌクレオチドが、放射性、蛍光または化学標識されたヌクレオチドである、請求項８記載のポリヌクレオチド。
【請求項１０】
ヒトにおける加齢黄斑変性症の発生に関連するＣＦＨ遺伝子におけるバリエーションの近位にストリンジェントな条件下でハイブリダイズする、ポリヌクレオチドプライマー。
【請求項１１】
ヒトにおける加齢黄斑変性症の発生に関連するＣＦＨ遺伝子におけるバリエーションのすぐ近位にハイブリダイズする、請求項１０記載のポリヌクレオチドプライマー。
【請求項１２】
第１のポリヌクレオチドプライマーがバリエーションの１つの側にハイブリダイズし、第２のポリヌクレオチドプライマーがバリエーションのもう１つの側にハイブリダイズする、ヒトにおける加齢黄斑変性症の発生に関連するＣＦＨ遺伝子におけるバリエーションを特異的に検出する１対のポリヌクレオチドプライマー。
【請求項１３】
ヒトにおける加齢黄斑変性症の発生に関連するＣＦＨ遺伝子におけるバリエーションを含むＤＮＡの領域にハイブリダイズする１対のポリヌクレオチドプライマーであって、ポリヌクレオチドプライマーは、バリエーションの近位のハイブリダイズしたプライマーの末端が約２０〜約１００００ヌクレオチド離れているような様式で該領域にハイブリダイズする、１対のポリヌクレオチドプライマー。
【請求項１４】
バリエーションがＣＦＨタンパク質の４０２位でヒスチジン以外のアミノ酸をコードする、請求項１２記載の１対のポリヌクレオチドプライマー。
【請求項１５】
バリエーションがＣＦＨタンパク質の４０２位でチロシンをコードする、請求項１４記載の１対のポリヌクレオチドプライマー。
【請求項１６】
プライマーがＤＮＡプライマーである、請求項１２記載の１対のポリヌクレオチドプライマー。
【請求項１７】
プライマーが各々約８ヌクレオチド〜約５００ヌクレオチドである、請求項１６記載の１対のポリヌクレオチドプライマー。
【請求項１８】
プライマーが各々約１０ヌクレオチド〜約２５０ヌクレオチドである、請求項１６記載の１対のポリヌクレオチドプライマー。
【請求項１９】
プライマーが１つ以上の非天然または改変ヌクレオチドを含む、請求項１６記載の１対のポリヌクレオチドプライマー。
【請求項２０】
１つ以上の非天然または改変ヌクレオチドが、放射性または蛍光標識されたヌクレオチドである、請求項１９記載の１対のポリヌクレオチドプライマー。
【請求項２１】
（ａ）ヒトにおける加齢黄斑変性症の発生に関連するＣＦＨ遺伝子におけるバリエーションに対してストリンジェントな条件下でハイブリダイズするが、野生型ＣＦＨ遺伝子にはハイブリダイズしないポリヌクレオチドプローブと試料を合わせる工程；および
（ｂ）ハイブリダイゼーションの発生は、加齢黄斑変性症の発生に関連するバリアントＣＦＨ遺伝子が試料中に存在することを示す、ハイブリダイゼーションが発生したかどうかを決定する工程、
を包含する、ヒトにおける加齢黄斑変性症の発生に関連するバリアントＣＦＨ遺伝子を個体から得られた試料において検出する方法。
【請求項２２】
（ａ）ヒトにおける加齢黄斑変性症の発生に関連するＣＦＨ遺伝子におけるバリエーションに対してストリンジェントな条件下でハイブリダイズするポリヌクレオチドプローブと試料を合わせ、それによって組み合わせを生成する工程；
（ｂ）工程（ａ）において生成された組み合わせをストリンジェントなハイブリダイゼーション条件下で維持する工程；および
（ｃ）組み合わせにおいて生じるハイブリダイゼーションをコントロールにおけるハイブリダイゼーションと比較する工程であって、ここでコントロールは、ヒトにおける加齢黄斑変性症の発生に関連するＣＦＨ遺伝子におけるバリエーションに結合しないかまたは、野生型ＣＦＨ遺伝子のみに結合するポリヌクレオチドプローブであり、試料は、（ａ）におけるものと同じ型の試料であり、（ａ）における試料と同様に処理され、組み合わせにおいて発生するがコントロールにおいて発生しないハイブリダイゼーションは、加齢黄斑変性症に関連するバリアントＣＦＨ遺伝子が試料中に存在することを示す、工程、
を包含する、ヒトにおける加齢黄斑変性症の発生に関連するバリアントＣＦＨ遺伝子を個体から得られた試料において検出する方法。
【請求項２３】
ハイブリダイゼーションの程度が工程（ｃ）において決定される、請求項２２記載の方法。
【請求項２４】
（ａ）ヒトにおける加齢黄斑変性症の発生に関連するＣＦＨ遺伝子におけるバリエーションにストリンジェントな条件下でハイブリダイズするポリヌクレオチドプローブと試料の第１の部分を合わせる工程；
（ｂ）野生型ＣＦＨ遺伝子にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするポリヌクレオチドプローブと試料の第２の部分を合わせる工程；および
（ｃ）第１の部分において発生するが第２の部分において発生しないハイブリダイゼーションは、加齢黄斑変性症の発生に関連するバリアントＣＦＨ遺伝子が試料中に存在することを示す、ハイブリダイゼーションが生じたかどうかを決定する工程、
を包含する、ヒトにおける加齢黄斑変性症の発生に関連するバリアントＣＦＨ遺伝子を個体から得られた試料において検出する方法。
【請求項２５】
バリエーションがＣＦＨタンパク質の４０２位でヒスチジン以外のアミノ酸をコードする、請求項２１記載の方法。
【請求項２６】
バリエーションがＣＦＨタンパク質の４０２位でチロシンをコードする、請求項２５記載の方法。
【請求項２７】
試料が、眼、耳、鼻、歯、舌、表皮、上皮、血液、涙、唾液、粘液、尿路、尿、筋肉、軟骨、皮膚、または任意の他の組織もしくは体液から得られた細胞を含む、請求項２１記載の方法。
【請求項２８】
ポリヌクレオチドプローブがＤＮＡプローブである、請求項２１記載の方法。
【請求項２９】
ポリヌクレオチドプローブが約８ヌクレオチド〜約５００ヌクレオチドである、請求項２１記載の方法。
【請求項３０】
（ａ）１対のポリヌクレオチドプライマーと試料を合わせる工程であって、ここで第１のポリヌクレオチドプライマーがＣＦＨタンパク質のアミノ酸４０２をコードするＤＮＡの１つの側にハイブリダイズし、第２のポリヌクレオチドプライマーがＣＦＨタンパク質のアミノ酸４０２をコードするＤＮＡのもう１つの側にハイブリダイズする工程；
（ｂ）試料中のＤＮＡを増幅し、それによって増幅されたＤＮＡを生成する工程；
（ｃ）増幅されたＤＮＡを配列決定する工程；および
（ｄ）バリエーションの存在は、ヒトにおける加齢黄斑変性症の発生に関連するバリアントＣＦＨ遺伝子が試料中で検出されることを示す、ＣＦＨタンパク質の４０２位でヒスチジン以外のアミノ酸をコードするバリエーションの存在をＤＮＡにおいて検出する工程、
を包含する、ヒトにおける加齢黄斑変性症の発生に関連するバリアントＣＦＨ遺伝子を個体から得られた試料において検出する方法。
【請求項３１】
ヒトにおける加齢黄斑変性症の発生に関連するバリアントＣＦＨ遺伝子の存在について個体から得られた試料をアッセイする工程を包含する、加齢黄斑変性症を発現する危険にある個体の同定または同定を補助する方法であって、バリアントＣＦＨ遺伝子の存在は、個体が加齢黄斑変性症を発現する危険にあることを示す、方法。
【請求項３２】
（ａ）ヒトにおける加齢黄斑変性症の発生に関連するＣＦＨ遺伝子におけるバリエーションに対してストリンジェントな条件下でハイブリダイズするが、野生型ＣＦＨ遺伝子にはハイブリダイズしないポリヌクレオチドプローブと個体から得られた試料を合わせる工程；および
（ｂ）ハイブリダイゼーションの発生は、個体が加齢黄斑変性症を発現する危険にあることを示す、ハイブリダイゼーションが発生したかどうかを決定する工程、
を包含する、加齢黄斑変性症を発現する危険にある個体の同定または同定を補助する方法。
【請求項３３】
（ａ）ＣＦＨタンパク質のアミノ酸４０２をコードするヌクレオチドを含む、個体から得られたＤＮＡの領域を配列決定する工程；および
（ｂ）バリエーションの存在は、個体が加齢黄斑変性症を発現する危険にあることを示す、ＣＦＨタンパク質の４０２位でヒスチジン以外のアミノ酸をコードするバリエーションがＤＮＡ中に存在するかどうかを決定する工程、
を包含する、加齢黄斑変性症を発現する危険にある個体の同定または同定を補助する方法。
【請求項３４】
（ａ）ヒトにおける加齢黄斑変性症の発生に関連するＣＦＨ遺伝子におけるバリエーションに対してストリンジェントな条件下でハイブリダイズするポリヌクレオチドプローブを内側に配置する少なくとも１つの容器手段；ならびに
（ｂ）試料中のバリアントＣＦＨ遺伝子の検出における診断キットの使用のための標識および／または指示書、
を含む、個体からの試料中にバリアントＣＦＨ遺伝子を検出するための診断キット。
【請求項３５】
（ａ）ヒトにおける加齢黄斑変性症の発生に関連するＣＦＨ遺伝子におけるバリエーションの１つの側の近位に対してストリンジェントな条件下でハイブリダイズするポリヌクレオチドプライマーを内側に配置する少なくとも１つの容器手段；ならびに
（ｂ）試料中のＣＦＨの検出における診断キットの使用のための標識および／または指示書、
を含む、個体からの試料中にバリアントＣＦＨ遺伝子を検出するための診断キット。
【請求項３６】
ヒトにおける加齢黄斑変性症の発生に関連するＣＦＨ遺伝子におけるバリエーションのもう１つの側に対してストリンジェントな条件下でハイブリダイズする第２のポリヌクレオチドプライマーをさらに含む、請求項３５記載の診断キット。
【請求項３７】
（ａ）有効量の単離もしくは組換え産生された野生型ＣＦＨポリペプチドまたはそのフラグメント；および
（ｂ）薬学的に許容され得る担体、
を含む、加齢黄斑変性症を罹患する被験体を治療するための組成物。
【請求項３８】
ＣＦＨポリペプチドまたはそのフラグメントがＣ３の活性化を阻害する、請求項３７記載の組成物。
【請求項３９】
加齢黄斑変性症を罹患する被験体を治療するための医薬の製造における、請求項３７記載の組成物の使用。
【請求項４０】
（ａ）ＣＦＨポリペプチドをコードする単離もしくは組換え産生された、有効量の核酸分子またはそのフラグメント；および
（ｂ）薬学的に許容され得る担体、
を含む、加齢黄斑変性症を罹患する被験体を治療するための組成物。
【請求項４１】
加齢黄斑変性症を罹患する被験体を治療するための医薬の製造における、請求項４０記載の組成物の使用。
【請求項４２】
（ａ）ヒトにおける加齢黄斑変性症の発生に関連するバリアントＣＦＨポリペプチドに結合する抗体と試料を合わせる工程；および
（ｂ）結合が生じるかどうかを決定する工程、
を包含する、ヒトにおける加齢黄斑変性症の発生に関連するバリアントＣＦＨポリペプチドを個体から得られた試料において検出する方法であって、結合の発生は、加齢黄斑変性症の発生に関連するバリアントＣＦＨポリペプチドが試料中に存在することを示す、方法。
【請求項４３】
（ａ）ヒトにおける加齢黄斑変性症の発生に関連するバリアントＣＦＨ遺伝子またはｍＲＮＡにハイブリダイズするアンチセンス配列を含む核酸分子；および
（ｂ）薬学的に許容され得る担体、
を含む、加齢黄斑変性症を罹患するかまたはその危険にある被験体を治療するための組成物。
【請求項４４】
バリアントＣＦＨ遺伝子に対するアンチセンス配列のハイブリダイゼーションが、バリアントＣＦＨ遺伝子から転写されるＲＮＡの量を減少する、請求項４３記載の組成物。
【請求項４５】
バリアントＣＦＨ  ｍＲＮＡに対するアンチセンス配列のハイブリダイゼーションが、バリアントＣＦＨ  ｍＲＮＡから翻訳されるタンパク質の量を減少し、および／またはバリアントＣＦＨ  ｍＲＮＡのスプライシングを変更する、請求項４３記載の組成物。
【請求項４６】
前記核酸分子が、インビボ安定性、細胞膜を越える輸送またはバリアントＣＦＨ遺伝子もしくはｍＲＮＡに対するハイブリダイゼーションを増大する１つ以上の改変されたヌクレオチドまたはヌクレオシドを含む、請求項４３記載の組成物。
【請求項４７】
加齢黄斑変性症を罹患するかまたはその危険にある被験体を治療するための医薬の製造における、請求項４３記載の組成物の使用。
【請求項４８】
（ａ）ｓｉＲＮＡもしくはｍｉＲＮＡ配列またはその前駆体を含む、ヒトにおける加齢黄斑変性症の発生に関連するバリアントＣＦＨ遺伝子またはｍＲＮＡにハイブリダイズする核酸分子；および
（ｂ）薬学的に許容され得る担体、
を含む、加齢黄斑変性症を罹患するかまたはその危険にある被験体を治療するための組成物。
【請求項４９】
バリアントＣＦＨ遺伝子に対するｓｉＲＮＡまたはｍｉＲＮＡ配列のハイブリダイゼーションが、バリアントＣＦＨ遺伝子から転写されるＲＮＡの量を減少する、請求項４８記載の組成物。
【請求項５０】
バリアントＣＦＨ  ｍＲＮＡに対するｓｉＲＮＡまたはｍｉＲＮＡ配列のハイブリダイゼーションが、バリアントＣＦＨ  ｍＲＮＡから翻訳されたタンパク質の量を減少し、および／またはバリアントＣＦＨ  ｍＲＮＡのスプライシングを変更する、請求項４８記載の組成物。
【請求項５１】
前記核酸分子が、インビボ安定性、細胞膜を越える輸送またはバリアントＣＦＨ遺伝子もしくはｍＲＮＡに対するハイブリダイゼーションを増大する１つ以上の改変されたヌクレオチドまたはヌクレオシドを含む、請求項４８記載の組成物。
【請求項５２】
加齢黄斑変性症を罹患するかまたはその危険にある被験体を治療するための医薬の製造における、請求項４８記載の組成物の使用。
【請求項５３】
（ａ）ヒトにおける加齢黄斑変性症の発生に関連するバリアントＣＦＨポリペプチドに結合するアプタマー；および
（ｂ）薬学的に許容され得る担体、
を含む、加齢黄斑変性症を罹患するかまたはその危険にある被験体を治療するための組成物であって、バリアントＣＦＨポリペプチドに対するアプタマーの結合がバリアントＣＦＨポリペプチドの活性を減少する、組成物。
【請求項５４】
加齢黄斑変性症を罹患するかまたはその危険にある被験体を治療するための医薬の製造における、請求項５３記載の組成物の使用。
【請求項５５】
（ａ）ヒトにおける加齢黄斑変性症の発生に関連するバリアントＣＦＨポリペプチドに結合する小分子；および
（ｂ）薬学的に許容され得る担体、
を含む、加齢黄斑変性症を罹患するかまたはその危険にある被験体を治療するための組成物であって、バリアントＣＦＨポリペプチドに対する小分子の結合がバリアントＣＦＨポリペプチドの活性を減少する、組成物。
【請求項５６】
加齢黄斑変性症を罹患するかまたはその危険にある被験体を治療するための医薬の製造における、請求項５５記載の組成物の使用。
【請求項５７】
（ａ）ヒトにおける加齢黄斑変性症の発生に関連するバリアントＣＦＨポリペプチドに結合する抗体；および
（ｂ）薬学的に許容され得る担体、
を含む、加齢黄斑変性症を罹患するかまたはその危険にある被験体を治療するための組成物であって、バリアントＣＦＨポリペプチドに対する抗体の結合がバリアントＣＦＨポリペプチドの活性を減少する、組成物。
【請求項５８】
加齢黄斑変性症を罹患するかまたはその危険にある被験体を治療するための医薬の製造における、請求項５７記載の組成物の使用。