【手続補正書】
【提出日】平成21年9月25日(2009.9.25)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
被験体において肝細胞癌（ＨＣＣ）を診断するための、またはＨＣＣを発現する被験体の素因を評価するための、または被験体において該病状の進行を評価するための、または被験体において該疾患の段階もしくは重篤度を決定するためのin vitro方法であって、
ａ）該被験体由来の肝組織サンプルにおいて、アルコールデヒドロゲナーゼ（ＡＤＨ）をコードする遺伝子［ＡＤＨ遺伝子］、抗酸化タンパク質２（ＡＯＰ２）をコードする遺伝子［遺伝子ＡＯＰ２］、レギュカルチン（ＳＭＰ３０）をコードする遺伝子［ＳＭＰ３０遺伝子］、ステロール運搬タンパク質２（ＮＳＬＴ）をコードする遺伝子［ＮＳＬＴ遺伝子］、ソルビトールデヒドロゲナーゼ（ＳＤＨ）をコードする遺伝子［ＳＤＨ遺伝子］、アルブミン（ＳＡＰ）をコードする遺伝子［ＳＡＰ遺伝子］、ホスホグルコムターゼ（ＰＧＭ）をコードする遺伝子［ＰＧＭ遺伝子］、フェニルアラニン  ４−ヒドロキシラーゼ（Ｐ４Ｈ）をコードする遺伝子［Ｐ４Ｈ遺伝子］、アポリポタンパク質Ａ１（ＡＰＯＡ１）をコードする遺伝子［ＡＰＯＡ１遺伝子］、カルボニックアンヒドラーゼＩＩＩ（ＣＡＩＩＩ）をコードする遺伝子［ＣＡＩＩＩ遺伝子］、２型アルデヒドデヒドロゲナーゼ（ＡｄＤＨｍ）をコードする遺伝子［３０ＡｄＤＨｍ遺伝子］、オルニチンアミノトランスフェラーゼ（ＯＡＴ）をコードする遺伝子［ＯＡＴ遺伝子］、オルニチンカルバモイルトランスフェラーゼ（ＯＣＴ）をコードする遺伝子［ＯＣＴ遺伝子］およびそれらの組合せから選択される遺伝子の発現レベルを定量することと、
ｂ）該レベルを対照サンプルのものと比較することと、
を含み、
該レベルの、対照サンプルの発現レベルに対する低下がＨＣＣを示し、あるいは、
ａ）該被験体由来の肝組織サンプルにおいて、アルコールデヒドロゲナーゼ（ＡＤＨ）、抗酸化タンパク質２（ＡＯＰ２）、レギュカルチン（ＳＭＰ３０）、ステロール運搬タンパク質２（ＮＳＬＴ）、ソルビトールデヒドロゲナーゼ（ＳＤＨ）、アルブミン（ＳＡＰ）、ホスホグルコムターゼ（ＰＧＭ）、フェニルアラニン  ４−ヒドロキシラーゼ（Ｐ４Ｈ）、アポリポタンパク質Ａ１（ＡＰＯＡ１）、カルボニックアンヒドラーゼＩＩＩ（ＣＡＩＩＩ）、２型アルデヒドデヒドロゲナーゼ（ＡｄＤＨｍ）、オルニチンアミノトランスフェラーゼ（ＯＡＴ）、オルニチンカルバモイルトランスフェラーゼ（ＯＣＴ）およびそれらの組合せから選択されるタンパク質のレベルを定量することと、
ｂ）該レベルを対照サンプルのものと比較することと、
を含み、
該レベルの、対照サンプルのレベルに対する低下がＨＣＣを示すことを特徴とする、方法。
【請求項２】
前記遺伝子  ＡＤＨ、ＡＯＰ２、ＳＭＰ３０、ＮＳＬＴ、ＳＤＨ、ＳＡＰ、ＰＧＭ、Ｐ４Ｈ、ＡＰＯＡ１、ＣＡＩＩＩ、ＡｄＤＨｍ、ＯＡＴおよびＯＣＴの任意の１つ、２つ、３つ、４つ、５つ、６つ、７つ、８つ、９つ、１０、１１、１２または１３の遺伝子の発現レベルを定量することを含み、または
前記タンパク質  ＡＤＨ、ＡＯＰ２、ＳＭＰ３０、ＮＳＬＴ、ＳＤＨ、ＳＡＰ、ＰＧＭ、Ｐ４Ｈ、ＡＰＯＡ１、ＣＡＩＩＩ、ＡｄＤＨｍ、ＯＡＴおよびＯＣＴの任意の１つ、２つ、３つ、４つ、５つ、６つ、７つ、８つ、９つ、１０、１１、１２または１３のタンパク質のレベルを定量することを含む、
請求項１に記載の方法。
【請求項３】
ＨＣＣ治療の有効性の検証および評価のためのin vitro方法であって、該疾患の異なる時期もしくは段階に、または治療もしくはそれを行わない期間中に、同じ被験体において、タンパク質  ＡＤＨ、ＡＯＰ２、ＳＭＰ３０、ＮＳＬＴ、ＳＤＨ、ＳＡＰ、ＰＧＭ、Ｐ４Ｈ、ＡＰＯＡ１、ＣＡＩＩＩ、ＡｄＤＨｍ、ＯＡＴおよび／またはＯＣＴのレベル、および／または遺伝子  ＡＤＨ、ＡＯＰ２、ＳＭＰ３０、ＮＳＬＴ、ＳＤＨ、ＳＡＰ、ＰＧＭ、Ｐ４Ｈ、ＡＰＯＡ１、ＣＡＩＩＩ、ＡｄＤＨｍ、ＯＡＴおよび／またはＯＣＴの発現レベルを定量することと、それらを、正常であると考えられる対照値または同じ被験体の前値と比較することとを含み、ある治療薬が遺伝子  ＡＤＨ、ＡＯＰ２、ＳＭＰ３０、ＮＳＬＴ、ＳＤＨ、ＳＡＰ、ＰＧＭ、Ｐ４Ｈ、ＡＰＯＡ１、ＣＡＩＩＩ、ＡｄＤＨｍ、ＯＡＴおよび／またはＯＣＴの発現レベル、またはタンパク質  ＡＤＨ、ＡＯＰ２、ＳＭＰ３０、ＮＳＬＴ、ＳＤＨ、ＳＡＰ、ＰＧＭ、Ｐ４Ｈ、ＡＰＯＡ１、ＣＡＩＩＩ、ＡｄＤＨｍ、ＯＡＴおよび／またはＯＣＴのレベルを高める場合に、該治療薬がＨＣＣ治療の候補になる、方法。
【請求項４】
被験体においてＨＣＣをin vitroで診断するための、またはＨＣＣを発現する被験体の素因を評価するための、または被験体において該疾患の進行を評価するための、または被験体において該疾患の段階もしくは重篤度を決定するための、またはＨＣＣ治療の有効性を検証し、評価するための、
（i）遺伝子  ＡＤＨ、ＡＯＰ２、ＳＭＰ３０、ＮＳＬＴ、ＳＤＨ、ＳＡＰ、ＰＧＭ、Ｐ４Ｈ、ＡＰＯＡ１、ＣＡＩＩＩ、ＡｄＤＨｍ、ＯＡＴ、および／またはＯＣＴから選択される遺伝子のヌクレオチド配列、または該遺伝子の１つの特異的断片を増幅するためのプライマーオリゴヌクレオチド対、または該遺伝子の１つを同定するためのプローブ、
（ii）ＡＤＨ、ＡＯＰ２、ＳＭＰ３０、ＮＳＬＴ、ＳＤＨ、ＳＡＰ、ＰＧＭ、Ｐ４Ｈ、ＡＰＯＡ１、ＣＡＩＩＩ、ＡｄＤＨｍ、ＯＡＴおよび／またはＯＣＴから選択されるタンパク質、または
（iii）ＡＤＨ、ＡＯＰ２、ＳＭＰ３０、ＮＳＬＴ、ＳＤＨ、ＳＡＰ、ＰＧＭ、Ｐ４Ｈ、ＡＰＯＡ１、ＣＡＩＩＩ、ＡｄＤＨｍ、ＯＡＴおよびＯＣＴから選択されるタンパク質と結合する能力を有する抗体
の使用。
【請求項５】
ＨＣＣ治療における化合物のスクリーニング、調査、同定、開発および有効性評価における、遺伝子  ＡＤＨ、ＡＯＰ２、ＳＭＰ３０、ＮＳＬＴ、ＳＤＨ、ＳＡＰ、ＰＧＭ、Ｐ４Ｈ、ＡＰＯＡ１、ＣＡＩＩＩ、ＡｄＤＨｍ、ＯＡＴ、ＯＣＴおよびそれらの組合せから選択される遺伝子の、および／またはタンパク質  ＡＤＨ、ＡＯＰ２、ＳＭＰ３０、ＮＳＬＴ、ＳＤＨ、ＳＡＰ、ＰＧＭ、Ｐ４Ｈ、ＡＰＯＡ１、ＣＡＩＩＩ、ＡｄＤＨｍ、ＯＡＴ、ＯＣＴおよびそれらの組合せから選択されるタンパク質の使用。
【請求項６】
ＨＣＣ治療における化合物のスクリーニング、調査、同定、開発および有効性評価のための方法であって、（ｉ）低下したレベルの遺伝子を発現する細胞系を候補化合物と接触させることと、（ｉｉ）該遺伝子の発現を評価し、該遺伝子の発現が高まる場合に、該候補化合物が、ＨＣＣ治療において潜在的に有用な化合物であるとすることとを含み、該遺伝子が遺伝子  ＡＤＨ、ＡＯＰ２、ＳＭＰ３０、ＮＳＬＴ、ＳＤＨ、ＳＡＰ、ＰＧＭ、Ｐ４Ｈ、ＡＰＯＡ１、ＣＡＩＩＩ、ＡｄＤＨｍ、ＯＡＴ、ＯＣＴおよびそれらの組合せから選択される、方法
【請求項７】
被験体において肝細胞癌（ＨＣＣ）の発現前段階を確認するためのin vitro方法であって、
ａ）該被験体由来の肝組織サンプルにおいて、遺伝子  ＡＤＨ、ＡＯＰ２、ＳＭＰ３０、ＮＳＬＴ、ＳＤＨ、ＳＡＰ、ＰＧＭ、およびそれらの組合せから選択される遺伝子の発現レベルを定量することと、
ｂ）該レベルを対照サンプルのものと比較することと、
を含み、
該レベルの、対照サンプルの発現レベルに対する低下がＨＣＣの発現前段階を示す、あるいは、
ａ）該被験体由来の肝組織サンプルにおいて、ＡＤＨ、ＡＯＰ２、ＳＭＰ３０、ＮＳＬＴ、ＳＤＨ、ＳＡＰ、ＰＧＭ、およびそれらの組合せから選択されるタンパク質のレベルを定量することと、
ｂ）該レベルを対照サンプルのものと比較することと、
を含み、
該レベルの、対照サンプルのレベルに対する低下がＨＣＣの発現前段階を示すことを特徴とする、方法。
【請求項８】
前記遺伝子  ＡＤＨ、ＡＯＰ２、ＳＭＰ３０、ＮＳＬＴ、ＳＤＨ、ＳＡＰおよびＰＧＭの任意の１つ、２つ、３つ、４つ、５つ、６つまたは７つの遺伝子のレベルを定量することを含み、または
前記タンパク質  ＡＤＨ、ＡＯＰ２、ＳＭＰ３０、ＮＳＬＴ、ＳＤＨ、ＳＡＰおよびＰＧＭの任意の１つ、２つ、３つ、４つ、５つ、６つまたは７つのタンパク質のレベルを定量することを含む、
請求項７に記載の方法。
【請求項９】
in vitroでＨＣＣの発現前段階を確認するための、
(i)遺伝子  ＡＤＨ、ＡＯＰ２、ＳＭＰ３０、ＮＳＬＴ、ＳＤＨ、ＳＡＰおよびＰＧＭから選択される遺伝子のヌクレオチド配列、または該遺伝子の１つの特異的断片を増幅するためのプライマーオリゴヌクレオチド対、または該遺伝子の１つを同定するためのプローブ、
(ii) ＡＤＨ、ＡＯＰ２、ＳＭＰ３０、ＮＳＬＴ、ＳＤＨ、ＳＡＰおよび／またはＰＧＭから選択されるタンパク質、または
(iii) ＡＤＨ、ＡＯＰ２、ＳＭＰ３０、ＮＳＬＴ、ＳＤＨ、ＳＡＰおよびＰＧＭから選択されるタンパク質と結合する能力を有する抗体
の使用。
【請求項１０】
ＨＣＣの発現前段階の治療における化合物のスクリーニング、調査、同定、開発および有効性評価における、遺伝子  ＡＤＨ、ＡＯＰ２、ＳＭＰ３０、ＮＳＬＴ、ＳＤＨ、ＳＡＰ、ＰＧＭおよびそれらの組合せから選択される遺伝子の、および／またはタンパク質  ＡＤＨ、ＡＯＰ２、ＳＭＰ３０、ＮＳＬＴ、ＳＤＨ、ＳＡＰ、ＰＧＭおよびそれらの組合せから選択されるタンパク質の使用。
【請求項１１】
ＨＣＣの発現前段階の治療における化合物のスクリーニング、調査、同定、開発および有効性評価のための方法であって、（ｉ）低下したレベルの遺伝子を発現する細胞系を候補化合物と接触させることと、（ｉｉ）該遺伝子の発現を評価し、該遺伝子の発現が高まる場合に、該候補化合物が、ＨＣＣの発現前段階の治療において潜在的に有用な化合物であるとすることとを含み、該遺伝子が遺伝子  ＡＤＨ、ＡＯＰ２、ＳＭＰ３０、ＮＳＬＴ、ＳＤＨ、ＳＡＰ、ＰＧＭおよびそれらの組合せから選択される、方法。
【請求項１２】
遺伝子  ＡＤＨ、ＡＯＰ２、ＳＭＰ３０、ＮＳＬＴ、ＳＤＨ、ＳＡＰ、ＰＧＭ、Ｐ４Ｈ、ＡＰＯＡ１、ＣＡＩＩＩ、ＡｄＤＨｍ、ＯＡＴおよび／またはＯＣＴの発現、またはタンパク質  ＡＤＨ、ＡＯＰ２、ＳＭＰ３０、ＮＳＬＴ、ＳＤＨ、ＳＡＰ、ＰＧＭ、Ｐ４Ｈ、ＡＰＯＡ１、ＣＡＩＩＩ、ＡｄＤＨｍ、ＯＡＴおよび／またはＯＣＴの活性を増強する化合物の治療上有効な量を、１種以上の薬学上許容される賦形剤および／または担体とともに含む医薬組成物、ならびに遺伝子  ＡＤＨ、ＡＯＰ２、ＳＭＰ３０、ＮＳＬＴ、ＳＤＨ、ＳＡＰおよび／またはＰＧＭの発現、またはタンパク質  ＡＤＨ、ＡＯＰ２、ＳＭＰ３０、ＮＳＬＴ、ＳＤＨ、ＳＡＰおよび／またはＰＧＭの活性を増強する化合物の治療上有効な量を、１種以上の薬学上許容される賦形剤および／または担体とともに含む医薬組成物から選択される医薬組成物。
【請求項１３】
ＨＣＣ治療または予防のための、遺伝子  ＡＤＨ、ＡＯＰ２、ＳＭＰ３０、ＮＳＬＴ、ＳＤＨ、ＳＡＰ、ＰＧＭ、Ｐ４Ｈ、ＡＰＯＡ１、ＣＡＩＩＩ、ＡｄＤＨｍ、ＯＡＴおよび／またはＯＣＴの発現、またはタンパク質  ＡＤＨ、ＡＯＰ２、ＳＭＰ３０、ＮＳＬＴ、ＳＤＨ、ＳＡＰ、ＰＧＭ、Ｐ４Ｈ、ＡＰＯＡ１、ＣＡＩＩＩ、ＡｄＤＨｍ、ＯＡＴおよび／またはＯＣＴの活性を増強する化合物を含む、医薬組成物。
【請求項１４】
ＨＣＣの発現前段階の治療または予防のための、遺伝子  ＡＤＨ、ＡＯＰ２、ＳＭＰ３０、ＮＳＬＴ、ＳＤＨ、ＳＡＰおよび／またはＰＧＭの発現、またはタンパク質  ＡＤＨ、ＡＯＰ２、ＳＭＰ３０、ＮＳＬＴ、ＳＤＨ、ＳＡＰおよび／またはＰＧＭの活性を増強する化合物を含む、医薬組成物。
【請求項１５】
遺伝子  ＡＤＨ、ＡＯＰ２、ＳＭＰ３０、ＮＳＬＴ、ＳＤＨ、ＳＡＰ、ＰＧＭ、Ｐ４Ｈ、ＡＰＯＡ１、ＣＡＩＩＩ、ＡｄＤＨｍ、ＯＡＴおよびＯＣＴから選択される遺伝子のｍＲＮＡまたはｃＤＮＡの断片を特異的に増幅するためのプライマーオリゴヌクレオチド対、または１つ以上の前記遺伝子を同定するためのプローブ。
【請求項１６】
ＡＤＨ、ＡＯＰ２、ＳＭＰ３０、ＮＳＬＴ、ＳＤＨ、ＳＡＰ、ＰＧＭ、Ｐ４Ｈ、ＡＰＯＡ１、ＣＡＩＩＩ、ＡｄＤＨｍ、ＯＡＴおよびＯＣＴから選択されるタンパク質と結合する能力を有する抗体。
【請求項１７】
（ｉ）遺伝子  ＡＤＨ、ＡＯＰ２、ＳＭＰ３０、ＮＳＬＴ、ＳＤＨ、ＳＡＰ、ＰＧＭ、Ｐ４Ｈ、ＡＰＯＡ１、ＣＡＩＩＩ、ＡｄＤＨｍ、ＯＡＴおよびＯＣＴから選択される１つ以上の遺伝子を同定するための１つ以上のプローブを含む固相支持体、ならびに（ｉｉ）ＡＤＨ、ＡＯＰ２、ＳＭＰ３０、ＮＳＬＴ、ＳＤＨ、ＳＡＰ、ＰＧＭ、Ｐ４Ｈ、ＡＰＯＡ１、ＣＡＩＩＩ、ＡｄＤＨｍ、ＯＡＴおよびＯＣＴから選択されるタンパク質と結合する能力を有する１つ以上の抗体を含む固相支持体から選択される固相支持体。
【請求項１８】
遺伝子  ＡＤＨ、ＡＯＰ２、ＳＭＰ３０、ＮＳＬＴ、ＳＤＨ、ＳＡＰ、ＰＧＭ、Ｐ４Ｈ、ＡＰＯＡ１、ＣＡＩＩＩ、ＡｄＤＨｍ、ＯＡＴおよび／またはＯＣＴ、またはタンパク質  ＡＤＨ、ＡＯＰ２、ＳＭＰ３０、ＮＳＬＴ、ＳＤＨ、ＳＡＰ、ＰＧＭ、Ｐ４Ｈ、ＡＰＯＡ１、ＣＡＩＩＩ、ＡｄＤＨｍ、ＯＡＴおよび／またはＯＣＴの発現レベルの検出のための試薬を含むキット。
【請求項１９】
−遺伝子  ＡＤＨ、ＡＯＰ２、ＳＭＰ３０、ＮＳＬＴ、ＳＤＨ、ＳＡＰ、ＰＧＭ、Ｐ４Ｈ、ＡＰＯＡ１、ＣＡＩＩＩ、ＡｄＤＨｍ、ＯＡＴおよびＯＣＴのｍＲＮＡもしくはそれらの対応するｃＤＮＡの断片の特異的増幅のための１以上のプライマーオリゴヌクレオチド対、および／または
−遺伝子  ＡＤＨ、ＡＯＰ２、ＳＭＰ３０、ＮＳＬＴ、ＳＤＨ、ＳＡＰ、ＰＧＭ、Ｐ４Ｈ、ＡＰＯＡ１、ＣＡＩＩＩ、ＡｄＤＨｍ、ＯＡＴおよびＯＣＴから選択される１つ以上の遺伝子の同定のための１つ以上のプローブ、および／または
−ＡＤＨ、ＡＯＰ２、ＳＭＰ３０、ＮＳＬＴ、ＳＤＨ、ＳＡＰ、ＰＧＭ、Ｐ４Ｈ、ＡＰＯＡ１、ＣＡＩＩＩ、ＡｄＤＨｍ、ＯＡＴおよびＯＣＴから選択されるタンパク質と、もしくは抗原決定基を含むそれらの断片と結合する能力を有する１つ以上の抗体
を含む、請求項１８に記載のキット。
【請求項２０】
被験体においてＨＣＣをin vitroで診断するための、またはＨＣＣを発現する被験体の素因を評価するための、または被験体において該疾患の進行を評価するための、または被験体において該疾患の段階もしくは重篤度を決定するための、またはＨＣＣ治療の有効性を検証し、評価するための、請求項１８または１９に記載のキットの使用。
【請求項２１】
ＨＣＣの発現前段階を確認するためのin vitro方法の実施のためのキットであって、遺伝子  ＡＤＨ、ＡＯＰ２、ＳＭＰ３０、ＮＳＬＴ、ＳＤＨ、ＳＡＰおよび／またはＰＧＭ、またはタンパク質  ＡＤＨ、ＡＯＰ２、ＳＭＰ３０、ＮＳＬＴ、ＳＤＨ、ＳＡＰおよび／またはＰＧＭの発現レベルの検出のための試薬を含む、キット。
【請求項２２】
−遺伝子  ＡＤＨ、ＡＯＰ２、ＳＭＰ３０、ＮＳＬＴ、ＳＤＨ、ＳＡＰおよびＰＧＭのｍＲＮＡもしくはそれらの対応するｃＤＮＡの断片の特異的増幅のための１以上のプライマーオリゴヌクレオチド対、および／または
−遺伝子  ＡＤＨ、ＡＯＰ２、ＳＭＰ３０、ＮＳＬＴ、ＳＤＨ、ＳＡＰおよびＰＧＭから選択される１つ以上の遺伝子の同定のための１つ以上のプローブ、および／または
−ＡＤＨ、ＡＯＰ２、ＳＭＰ３０、ＮＳＬＴ、ＳＤＨ、ＳＡＰおよびＰＧＭから選択されるタンパク質と、もしくは抗原決定基を含むそれらの断片と結合する能力を有する１つ以上の抗体
を含む、請求項２１に記載のキット。
【請求項２３】
前記プローブおよび前記抗体が固相支持体上に固定されている、請求項１８、１９、２１、または２２のいずれか一項に記載のキット。