【手続補正書】
【提出日】平成21年4月7日(2009.4.7)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
親のＡＡＶのパッケージング収量、形質導入効率および／または遺伝子導入効率を上げる方法において、
（ａ）親のＡＡＶキャプシド配列をアライメントにおいて機能的ＡＡＶキャプシド配列のライブラリーと比較する工程；
（ｂ）親のＡＡＶキャプシド中の少なくとも１つのシングルトンを同定する工程であって、かつ、該シングルトンが、並置された機能的ＡＡＶキャプシド配列の対応する位置のアミノ酸が完全に保存されている親のＡＡＶキャプシド中の該位置の可変アミノ酸である工程：
（ｃ）シングルトンを、機能的ＡＡＶキャプシド配列中の対応する該位置に位置するアミノ酸に改変する工程、
を含んで成る上記方法。
【請求項２】
並置された機能的ＡＡＶキャプシド配列が、並置されたｖｐ１配列の完全長にわたり少なくとも８５％同一である少なくとも４つのＡＡＶ配列を含んでなり、そして少なくとも２つの異なるＡＡＶクレードに由来するＡＡＶ配列を含む、請求項１に記載の方法。
【請求項３】
ライブラリーが各クレードに由来する少なくとも２つのＡＡＶ配列を含んでなる請求項１に記載の方法。
【請求項４】
並置されたＡＡＶキャプシド配列のライブラリーが、少なくとも３つの異なるクレードに由来するＡＡＶ配列を含んでなる請求項１に記載の方法。
【請求項５】
並置されたＡＡＶキャプシド配列のライブラリーが、少なくとも３〜１００のＡＡＶ配列を含んでなる請求項１に記載の方法。
【請求項６】
並置されたＡＡＶキャプシド配列のライブラリーが、少なくとも６〜５０のＡＡＶ配列を含んでなる請求項１に記載の方法。
【請求項７】
ライブラリーが少なくとも１２のＡＡＶ配列を含んでなる請求項６に記載の方法。
【請求項８】
親のＡＡＶが複数のシングルトンを含む請求項１に記載の方法。
【請求項９】
親のＡＡＶが２〜４のシングルトンを含む請求項８に記載の方法。
【請求項１０】
工程（ｃ）が異なるシングルトンで繰り返される請求項８に記載の方法。
【請求項１１】
標的ＡＡＶが可変アミノ酸のコドンの部位特異的突然変異誘発法により改変されている、請求項１に記載の方法。
【請求項１２】
部位特異的突然変異誘発法がプラスミド骨格上で運ばれる標的ＡＡＶについて行われる請求項１１に記載方法。
【請求項１３】
改変したＡＡＶをＡＡ粒子にパッケージングする工程をさらに含んでなる請求項１に記載の方法。
【請求項１４】
ＡＡＶ粒子が標的ＡＡＶに比べて上昇したパッケージング効率を有する請求項１３に記載の方法。
【請求項１５】
ＡＡＶ粒子が標的ＡＡＶに比べて上昇した形質導入効率を有する請求項１３に記載の方法。
【請求項１６】
ＡＡＶ粒子が標的ＡＡＶに比べて上昇した遺伝子導入効率を有する請求項１３に記載の方法。
【請求項１７】
請求項１に記載の方法に従い改変されているＡＡＶキャプシドを含んでなるウイルスベクター。
【請求項１８】
天然ではリシンであるアミノ酸残基５３１位にグルタミン酸を有することにより修飾されている配列番号２９のアミノ酸配列を有するＡＡＶ６．１；
天然ではフェニルアラニンであるアミノ酸残基１２９位にロイシンを有することにより修飾されている配列番号２９のアミノ酸配列を有するＡＡＶ６．２；
天然ではフェニルアラニンであるアミノ酸残基１２９位にリシンを、かつ、天然ではロイシンであるアミノ酸残基５３１位にグルタミン酸を有することにより修飾されている配列番号２９のアミノ酸配列を有するＡＡＶ６．１．２；
天然ではアスパラギン酸であるアミノ酸残基５３１位にグルタミン酸を有するように修飾されている配列番号４１のアミノ酸配列を有するｒｈ．８Ｒ；
天然ではリシンであるアミノ酸残基２１７位にグルタミン酸を有するように修飾されている配列番号４４のアミノ酸配列を有するｒｈ．４８．１；
天然ではセリンであるアミノ酸残基３０４位にアスパラギンを有するように修飾されている配列番号４４のアミノ酸配列を有するｒｈ．４８．２；
天然ではリシンであるアミノ酸残基２１７位にグルタミン酸を、かつ、天然ではセリンであるアミノ酸残基３０４位にアスパラギンを有するように修飾されている配列番号４４のアミノ酸配列を有するｒｈ．４８．１．２；
天然ではグルタミン酸であるアミノ酸残基１３７位にリシンを有するように修飾されている配列番号４５のアミノ酸配列を有するｈｕ．４４Ｒ１；
天然ではグルタミン酸であるアミノ酸残基１３７位にリシンを、かつ、天然ではプロリンであるアミノ酸４４６位にロイシンを有するように修飾されている配列番号４５のアミノ酸配列を有するｈｕ．４４Ｒ２；
天然ではグルタミン酸であるアミノ酸残基１３７位にリシンを、かつ、天然ではプロリンであるアミノ酸４４６位にロイシンを、かつ、天然ではグリシンであるアミノ酸６０９位にアスパラギン酸を有するように修飾されている配列番号４５のアミノ酸配列を有するｈｕ．４４Ｒ３；
天然ではグリシンであるアミノ酸３９６位にグルタミン酸を有するように修飾されている配列番号４２のアミノ酸配列を有するｈｕ．２９Ｒ；
天然ではグリシンであるアミノ酸残基２７７位にセリンを含むように修飾された配列番号５０のアミノ酸配列を有するｈｕ．４８Ｒ１；
天然ではグリシンであるアミノ酸残基２７７位にセリンを含み、かつ、天然ではグルタミン酸であるアミノ酸残基３２２位にリシンを含むように修飾された配列番号５０のアミノ酸配列を有するｈｕ．４８Ｒ２；
天然ではグリシンであるアミノ酸残基２７７位にセリンを含み、かつ、天然ではグルタミン酸であるアミノ酸残基３２２位にリシンを含み、かつ、天然ではセリンであるアミノ酸残基５５２位にアスパラギンを含むように修飾された配列番号５０のアミノ酸配列を有するｈｕ．４８Ｒ３；
からなる群から選択される修飾されたアデノ随伴キャプシドを有するウイルスベクター。
【請求項１９】
遺伝子産物を宿主細胞に送達するための薬剤の調製における請求項１７または１８に記載のウイルスベクターの使用。
【請求項２０】
配列番号１のアミノ酸配列を有するｒｈ２０；
配列番号２のアミノ酸配列を有するｒｈ３２／３３；
配列番号３のアミノ酸配列を有するｒｈ３９；
配列番号４のアミノ酸配列を有するｒｈ４６；
配列番号５のアミノ酸配列を有するｒｈ７３；
配列番号６のアミノ酸配列を有するｒｈ７４；
天然ではバリンであるアミノ酸残基４０４位にメチオニンを有することにより修飾された配列番号４９のアミノ酸配列を有するｒｈ５４；
天然ではリシンであるアミノ酸残基５３１位にグルタミン酸を有することにより修飾された配列番号２９のアミノ酸配列を有するＡＡＶ６．１；
天然ではフェニルアラニンであるアミノ酸残基１２９位にロイシンを有することにより修飾された配列番号２９のアミノ酸配列を有するアミノ酸を有するＡＡＶ６．２；
天然ではフェニルアラニンであるアミノ酸残基１２９位にリシンを、かつ、天然ではロイシンであるアミノ酸残基５３１位にグルタミン酸を有することにより修飾された配列番号２９のアミノ酸配列を有するＡＡＶ６．１．２；
天然ではアスパラギン酸であるアミノ酸残基５３１位にグルタミン酸を有するように修飾されている配列番号４１のアミノ酸配列を有するｒｈ．８Ｒ；
天然ではリシンであるアミノ酸残基２１７位にグルタミン酸を有するように修飾されている配列番号４４のアミノ酸配列を有するｒｈ．４８．１；
天然ではセリンであるアミノ酸残基３０４位にアスパラギンを有するように修飾されている配列番号４４のアミノ酸配列を有するｒｈ．４８．２；
天然ではリシンであるアミノ酸残基２１７位にグルタミン酸を、かつ、天然ではセリンであるアミノ酸残基３０４位にアスパラギンを有するように修飾されている配列番号４４のアミノ酸配列を有するｒｈ．４８．１．２；
天然ではグルタミン酸であるアミノ酸残基１３７位にリシンを有するように修飾されている配列番号４５のアミノ酸配列を有するｈｕ．４４Ｒ１；
天然ではグルタミン酸であるアミノ酸残基１３７位にリシンを、かつ、天然ではプロリンであるアミノ酸残基４４６位にロイシンを有するように修飾されている配列番号４５のアミノ酸配列を有するｈｕ．４４Ｒ２；
天然ではグルタミン酸であるアミノ酸残基１３７位にリシンを、かつ、天然ではプロリンであるアミノ酸４４６位にロイシンを、かつ、天然ではグリシンであるアミノ酸６０９位にアスパラギン酸を有するように修飾されている配列番号４５のアミノ酸配列を有するｈｕ．４４Ｒ３；
天然ではグリシンであるアミノ酸３９６位にグルタミン酸を有するように修飾されている配列番号４２のアミノ酸配列を有するｈｕ．２９Ｒ；
天然ではグリシンであるアミノ酸残基２７７位にセリンを含むように修飾された配列番号５０のアミノ酸配列を有するｈｕ．４８Ｒ１；
天然ではグリシンであるアミノ酸残基２７７位にセリンを含み、かつ、天然ではグルタミン酸であるアミノ酸残基３２２位にリシンを含むように修飾された配列番号５０のアミノ酸配列を有するｈｕ．４８Ｒ２；および
天然ではグリシンであるアミノ酸残基２７７位にセリンを含み、かつ、天然ではグルタミン酸であるアミノ酸残基３２２位にリシンを含み、かつ、天然ではセリンであるアミノ酸残基５５２位にアスパラギンを含むように修飾された配列番号５０のアミノ酸配列を有するｈｕ．４８Ｒ３；
からなる群から選択されるＡＡＶ配列をコードする核酸配列を含んでなる核酸分子。