【手続補正書】
【提出日】平成21年2月3日(2009.2.3)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
配列番号１、３、７、４５、４７、および５３に挙げるポリヌクレオチド配列以外の、以下からなる群から選択される少なくとも１つの配列ドメインを有するＥＰＳＰＳ酵素をコードする単離されたポリヌクレオチド：
ドメインＩ
【化１】
2008535495.tif 000001
（配列番号１３）（ここで、Ｘ１はリシンまたはトレオニンを表し、Ｘ２はアルギニンを表し、Ｘ３はセリンまたはトレオニンを表す）；
ドメインＩａ
【化２】
2008535495.tif 000002
（配列番号１４）（ここで、Ｘ１はトレオニンを表す）；
ドメインＩｂ
【化３】
2008535495.tif 000003
（配列番号１５）（ここで、Ｘ１はアルギニンを表し、Ｘ２はセリンまたはトレオニンを表す）；
ドメインＩＩ
【化５】
2008535495.tif 000004
（配列番号１７）（ここで、Ｘ１はアスパラギン酸またはアラニンを表し、Ｘ２はセリンまたはトレオニンを表し、Ｘ３はバリンまたはイソロイシンを表し、Ｘ４はトレオニンまたはグルタミン酸、またはリシンを表し、Ｘ５はセリンまたはグリシンを表し、Ｘ６はグルタミンまたはセリンまたはグルタミン酸を表す）；
ドメインＩＩａ
【化６】
2008535495.tif 000005
（配列番号１８）（ここで、Ｘ１はアスパラギン酸を表し、Ｘ２はセリンまたはトレオニンを表し、Ｘ３はバリンまたはイソロイシンを表す）；
ドメインＩＩｂ
【化７】
2008535495.tif 000006
（配列番号１９）（ここで、Ｘ１はトレオニンまたはグルタミン酸またはリシンを表し、Ｘ２はセリンまたはグリシンを表し、Ｘ３はグルタミンまたはセリンまたはグルタミン酸を表す）；
ドメインＩＶ
【化９】
2008535495.tif 000007
（配列番号２１）；
ドメインＶＩ
【化１２】
2008535495.tif 000008
（配列番号２３）（ここで、Ｘ１はアルギニンまたはロイシンを表し、Ｘ２はイソロイシンまたはバリンを表す）；
ドメインＶＩＩ
【化１３】
2008535495.tif 000009
（配列番号２４）（ここで、Ｘ１はアルギニンまたはリシンを表し、Ｘ２はアラニンまたはグルタミン酸またはセリンを表し、Ｘ３はプロリンまたはアラニンを表す）；
ドメインＶＩＩＩ
【化１４】
2008535495.tif 000010
（配列番号２５）（ここで、Ｘ１はアラニンを表し、Ｘ２はグルタミン酸またはグルタミンを表し、Ｘ３はバリンまたはロイシンまたはアラニンを表す）；
ドメインＩＸ
【化１６】
2008535495.tif 000011
（配列番号２７）（ここで、Ｘ１はロイシンを表す）；
ドメインＸＩ
【化１８】
2008535495.tif 000012
（配列番号２９）（ここで、Ｘ１はグルタミンまたはリシンまたはセリンを表し、Ｘ２はアスパラギンまたはヒスチジンを表し、Ｘ３はメチオニンまたはロイシンを表し、Ｘ４はプロリンまたはグルタミンを表し、Ｘ５はトレオニンまたはグルタミン酸またはバリンを表し、Ｘ６はバリンまたはイソロイシンを表し、Ｘ７はアスパラギン酸またはバリンを表し、Ｘ８はロイシンまたはイソロイシンを表し、Ｘ９はロイシンを表す）；
ドメインＸＩａ
【化１９】
2008535495.tif 000013
（配列番号３０）（ここで、Ｘ１はグルタミンまたはリシンまたはセリンを表し、Ｘ２はアスパラギンまたはヒスチジンを表し、Ｘ３はメチオニンを表し、Ｘ４はプロリンまたはグルタミンを表す）；
ドメインＸＩｂ
【化２０】
2008535495.tif 000014
（配列番号３１）（ここで、Ｘ１はトレオニンまたはバリンを表し、Ｘ２はバリンまたはイソロイシンを表し、Ｘ３はアスパラギン酸またはバリンを表し、Ｘ４はロイシンまたはイソロイシンを表し、Ｘ５はロイシンまたはイソロイシンを表す）；
ドメインＸＩＩ
【化２２】
2008535495.tif 000015
（配列番号３３）（ここで、Ｘ１はバリンまたはトレオニンを表し、Ｘ２はグルタミン酸またはグリシンを表し、Ｘ３はロイシンを表し、Ｘ４はアラニンまたはグルタミン酸を表し、Ｘ５はイソロイシンまたはバリンを表す）；
ドメインＸＩＩｂ
【化２４】
2008535495.tif 000016
（配列番号３５）（ここで、Ｘ１はバリンまたはトレオニンを表し、Ｘ２はグルタミン酸またはグリシンを表し、Ｘ３はロイシンを表し、Ｘ４はアラニンまたはグルタミン酸を表し、Ｘ５はイソロイシンまたはバリンを表す）；
ドメインＸＩＩＩ
【化２６】
2008535495.tif 000017
（配列番号３７）（ここで、Ｘ１はロイシンまたはイソロイシンを表し、Ｘ２はイソロイシンを表す）；
ドメインＸＩＶ
【化２７】
2008535495.tif 000018
（配列番号３８）（ここで、Ｘ１はアスパラギン酸またはアスパラギンを表し、Ｘ２はアラニンまたはトレオニンを表す）；
ドメインＸＶ
【化２８】
2008535495.tif 000019
（配列番号３９）（ここで、Ｘ１はロイシンまたはグルタミン酸を表し、Ｘ２はトレオニンまたはセリンを表し、Ｘ３はヒスチジンまたはフェニルアラニンを表し、Ｘ４はアラニンまたはセリンを表す）；
ドメインＸＶＩ
【化２９】
2008535495.tif 000020
（配列番号４０）（ここで、Ｘ１はグリシンを表し、Ｘ２はイソロイシンまたはバリンを表し、Ｘ３はセリンまたはグリシンまたはアラニンまたはリシンを表す）；
ドメインＸＶＩａ
【化３０】
2008535495.tif 000021
（配列番号４１）（ここで、Ｘ１はグリシンを表す）；
ドメインＸＶＩｂ
【化３１】
2008535495.tif 000022
（配列番号４２）（ここで、Ｘ１はイソロイシンまたはバリンを表し、Ｘ２はセリンまたはアラニンまたはリシンを表す）；
ドメインＸＶＩＩ
【化３２】
2008535495.tif 000023
（配列番号４３）（ここで、Ｘ１はアスパラギンまたはアスパラギン酸を表し、Ｘ２はアスパラギン酸を表し、Ｘ３はアラニンまたはグリシンを表す）；
ドメインＸＶＩＩＩ
【化３３】
2008535495.tif 000024
（配列番号４４）（ここで、Ｘ１はセリンまたはプロリンを表す）。
【請求項２】
ａ）配列番号９、１１、５５、５７、５８、もしくは６０のヌクレオチド配列、またはその相補体、
ｂ）配列番号９、１１、５７、５９、もしくは６１のヌクレオチド配列と少なくとも９５％の配列同一性を有するヌクレオチド配列またはその相補体、
ｃ）受託番号Ｂ−３０８３３もしくはＢ−３０８３８として寄託されたプラスミドのＤＮＡ挿入物の除草剤抵抗性ヌクレオチド配列またはその相補体、
ｄ）配列番号１０、１２、５６、または５９のアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードするヌクレオチド配列、および
ｅ）配列番号１０、１２、または５９のアミノ酸配列と少なくとも９５％のアミノ酸配列同一性を有するポリペプチドをコードするヌクレオチド配列
からなる群から選択される、請求項１に記載のポリヌクレオチド。
【請求項３】
植物細胞において機能するプロモーターに連結しており、コードされるＥＰＳＰＳ酵素の十分な発現を可能にするＲＮＡ配列の産生を引き起こし、前記ポリヌクレオチドを用いて形質転換された植物細胞のグリフォセート耐性を高める、請求項１に記載のポリヌクレオチド。
【請求項４】
植物細胞において前記ＲＮＡ配列の３’末端へのひと続きのポリアデニル化ヌクレオチドの付加を引き起こすように機能する３’非翻訳領域をさらに含む、請求項３に記載のポリヌクレオチド。
【請求項５】
前記プロモーターが、前記ポリヌクレオチドに対して異種である、請求項３に記載のポリヌクレオチド。
【請求項６】
アミノ末端クロロプラスト輸送ペプチドおよび前記ＥＰＳＰＳ酵素を含む融合ポリペプチドをコードする、請求項１に記載のポリヌクレオチド。
【請求項７】
ａ）植物細胞のゲノムに、
ｉ）植物細胞においてＲＮＡ配列の産生を引き起こすように機能するプロモーター、
ｉｉ）配列番号７または５３に挙げたポリヌクレオチド配列以外の、以下からなる群から選択される少なくとも１つの配列ドメインを有するＥＰＳＰＳ酵素をコードするＲＮＡ配列の産生を引き起こすポリヌクレオチド、および
ｉｉｉ）植物細胞において前記ＲＮＡ配列の３’末端へのひと続きのポリアデニル化ヌクレオチドの付加を引き起こすように機能する３’非翻訳ポリヌクレオチド
を含むポリヌクレオチドを挿入する工程と、
ｂ）形質転換された植物細胞を得る工程と、
ｃ）前記形質転換された植物細胞から、グリフォセート除草剤に対して増大した耐性を有する遺伝的に形質転換された植物を再生する工程とを含む、グリフォセート除草剤に対して耐性を有する、遺伝的に形質転換された植物を作出する方法：
ドメインＩ
【化３４】
2008535495.tif 000025
（配列番号１３）（ここで、Ｘ１はリシンまたはトレオニンを表し、Ｘ２はアルギニンを表し、Ｘ３はセリンまたはトレオニンを表す）；
ドメインＩａ
【化３５】
2008535495.tif 000026
（配列番号１４）（ここで、Ｘ１はトレオニンを表す）；
ドメインＩｂ
【化３６】
2008535495.tif 000027
（配列番号１５）（ここで、Ｘ１はアルギニンを表し、Ｘ２はセリンまたはトレオニンを表す）；
ドメインＩＩ
【化３８】
2008535495.tif 000028
（配列番号１７）（ここで、Ｘ１はアスパラギン酸またはアラニンを表し、Ｘ２はセリンまたはトレオニンを表し、Ｘ３はバリンまたはイソロイシンを表し、Ｘ４はトレオニンまたはグルタミン酸、またはリシンを表し、Ｘ５はセリンまたはグリシンを表し、Ｘ６はグルタミンまたはセリンまたはグルタミン酸を表す）；
ドメインＩＩａ
【化３９】
2008535495.tif 000029
（配列番号１８）（ここで、Ｘ１はアスパラギン酸を表し、Ｘ２はセリンまたはトレオニンを表し、Ｘ３はバリンまたはイソロイシンを表す）；
ドメインＩＩｂ
【化４０】
2008535495.tif 000030
（配列番号１９）（ここで、Ｘ１はトレオニンまたはグルタミン酸またはリシンを表し、Ｘ２はセリンまたはグリシンを表し、Ｘ３はグルタミンまたはセリンまたはグルタミン酸を表す）；
ドメインＩＶ
【化４２】
2008535495.tif 000031
（配列番号２１）；
ドメインＶＩ
【化４５】
2008535495.tif 000032
（配列番号２３）（ここで、Ｘ１はアルギニンまたはロイシンを表し、Ｘ２はイソロイシンまたはバリンを表す）；
ドメインＶＩＩ
【化４６】
2008535495.tif 000033
（配列番号２４）（ここで、Ｘ１はアルギニンまたはリシンを表し、Ｘ２はアラニンまたはグルタミン酸またはセリンを表し、Ｘ３はプロリンまたはアラニンを表す）；
ドメインＶＩＩＩ
【化４７】
2008535495.tif 000034
（配列番号２５）（ここで、Ｘ１はアラニンを表し、Ｘ２はグルタミン酸またはグルタミンを表し、Ｘ３はバリンまたはロイシンまたはアラニンを表す）；
ドメインＩＸ
【化４９】
2008535495.tif 000035
（配列番号２７）（ここで、Ｘ１はロイシンを表す）；
ドメインＸＩ
【化５１】
2008535495.tif 000036
（配列番号２９）（ここで、Ｘ１はグルタミンまたはリシンまたはセリンを表し、Ｘ２はアスパラギンまたはヒスチジンを表し、Ｘ３はメチオニンまたはロイシンを表し、Ｘ４はプロリンまたはグルタミンを表し、Ｘ５はトレオニンまたはグルタミン酸またはバリンを表し、Ｘ６はバリンまたはイソロイシンを表し、Ｘ７はアスパラギン酸またはバリンを表し、Ｘ８はロイシンまたはイソロイシンを表し、Ｘ９はロイシンを表す）；
ドメインＸＩａ
【化５２】
2008535495.tif 000037
（配列番号３０）（ここで、Ｘ１はグルタミンまたはリシンまたはセリンを表し、Ｘ２はアスパラギンまたはヒスチジンを表し、Ｘ３はメチオニンを表し、Ｘ４はプロリンまたはグルタミンを表す）；
ドメインＸＩｂ
【化５３】
2008535495.tif 000038
（配列番号３１）（ここで、Ｘ１はトレオニンまたはバリンを表し、Ｘ２はバリンまたはイソロイシンを表し、Ｘ３はアスパラギン酸またはバリンを表し、Ｘ４はロイシンまたはイソロイシンを表し、Ｘ５はロイシンまたはイソロイシンを表す）；
ドメインＸＩＩ
【化５５】
2008535495.tif 000039
（配列番号３３）（ここで、Ｘ１はバリンまたはトレオニンを表し、Ｘ２はグルタミン酸またはグリシンを表し、Ｘ３はロイシンを表し、Ｘ４はアラニンまたはグルタミン酸を表し、Ｘ５はイソロイシンまたはバリンを表す）；
ドメインＸＩＩｂ
【化５７】
2008535495.tif 000040
（配列番号３５）（ここで、Ｘ１はバリンまたはトレオニンを表し、Ｘ２はグルタミン酸またはグリシンを表し、Ｘ３はロイシンを表し、Ｘ４はアラニンまたはグルタミン酸を表し、Ｘ５はイソロイシンまたはバリンを表す）；
ドメインＸＩＩＩ
【化５９】
2008535495.tif 000041
（配列番号３７）（ここで、Ｘ１はロイシンまたはイソロイシンを表し、Ｘ２はイソロイシンを表す）；
ドメインＸＩＶ
【化６０】
2008535495.tif 000042
（配列番号３８）（ここで、Ｘ１はアスパラギン酸またはアスパラギンを表し、Ｘ２はアラニンまたはトレオニンを表す）；
ドメインＸＶ
【化６１】
2008535495.tif 000043
（配列番号３９）（ここで、Ｘ１はロイシンまたはグルタミン酸を表し、Ｘ２はトレオニンまたはセリンを表し、Ｘ３はヒスチジンまたはフェニルアラニンを表し、Ｘ４はアラニンまたはセリンを表す）；
ドメインＸＶＩ
【化６２】
2008535495.tif 000044
（配列番号４０）（ここで、Ｘ１はグリシンを表し、Ｘ２はイソロイシンまたはバリンを表し、Ｘ３はセリンまたはグリシンまたはアラニンまたはリシンを表す）；
ドメインＸＶＩａ
【化６３】
2008535495.tif 000045
（配列番号４１）（ここで、Ｘ１はグリシンを表す）；
ドメインＸＶＩｂ
【化６４】
2008535495.tif 000046
（配列番号４２）（ここで、Ｘ１はイソロイシンまたはバリンを表し、Ｘ２はセリンまたはアラニンまたはリシンを表す）；
ドメインＸＶＩＩ
【化６５】
2008535495.tif 000047
（配列番号４３）（ここで、Ｘ１はアスパラギンまたはアスパラギン酸を表し、Ｘ２はアスパラギン酸を表し、Ｘ３はアラニンまたはグリシンを表す）；
ドメインＸＶＩＩＩ
【化６６】
2008535495.tif 000048
（配列番号４４）（ここで、Ｘ１はセリンまたはプロリンを表す）。
【請求項８】
前記形質転換された植物を得る工程が、グリフォセート除草剤に対する耐性の増強についてスクリーニングすることを含む、請求項７に記載の方法。
【請求項９】
前記ポリヌクレオチドが、アミノ末端クロロプラスト輸送ペプチドおよびＥＰＳＰＳ酵素を含む融合ポリペプチドをコードする、請求項７に記載の方法。
【請求項１０】
請求項１に記載の異種ポリヌクレオチドを含む、グリフォセート耐性植物細胞。
【請求項１１】
トウモロコシ、コムギ、イネ、オオムギ、ダイズ、ワタ、サトウダイコン、ナタネ、カノーラ、アマ、ヒマワリ、ジャガイモ、タバコ、トマト、アルファルファ、ポプラ、マツ、ユーカリ、リンゴ、レタス、エンドウ、レンズマメ、ブドウ、およびシバクサからなる群から選択される、請求項１０に記載のグリフォセート耐性植物細胞。
【請求項１２】
請求項１０に記載の植物細胞を有するグリフォセート耐性植物。
【請求項１３】
請求項１２に記載の植物の形質転換された種子。
【請求項１４】
トウモロコシ、コムギ、イネ、オオムギ、ダイズ、ワタ、サトウダイコン、ナタネ、カノーラ、アマ、ヒマワリ、ジャガイモ、タバコ、トマト、アルファルファ、ポプラ、マツ、ユーカリ、リンゴ、レタス、エンドウ、レンズマメ、ブドウ、およびシバクサからなる群から選択される、請求項１２に記載のグリフォセート耐性植物。
【請求項１５】
ａ）配列番号１０、１２、５６、または５９のアミノ酸配列を含むポリペプチド；
ｂ）配列番号９、１１、５５、５７、５８、または６０のヌクレオチド配列によりコードされるポリペプチド；
ｃ）配列番号１０、１２、または５９のアミノ酸配列と少なくとも９５％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むポリペプチドであって、除草剤抵抗活性を有するポリペプチド；
ｄ）配列番号９、１１、５７、５８、または６０のヌクレオチド配列と少なくとも９５％同一のヌクレオチド配列によりコードされるポリペプチドであって、除草剤抵抗活性を有するポリペプチド；および
ｅ）受託番号Ｂ−３０８３３またはＢ−３０８３８として寄託されたプラスミドのＤＮＡ挿入物の除草剤抵抗性ヌクレオチド配列によりコードされるポリペプチド
からなる群から選択される、単離されたポリペプチド。
【請求項１６】
異種アミノ酸配列をさらに含む、請求項１５に記載のポリペプチド。
【請求項１７】
植物種子または植物を有する圃場での雑草を選択的に制御する方法であって、
ａ）ｉ）植物細胞においてＲＮＡ配列の産生を引き起こすように機能するプロモーター、
ｉｉ）配列番号７または５３に挙げるポリヌクレオチド配列以外の、以下からなる群から選択される少なくとも１つの配列ドメインを有するＥＰＳＰＳ酵素をコードするＲＮＡ配列の産生を引き起こすポリヌクレオチド、および
ｉｉｉ）植物細胞において前記ＲＮＡ配列の３’末端にひと続きのポリアデニル化ヌクレオチドの付加を引き起こすように機能する３’非翻訳ポリヌクレオチド
を有する異種ポリヌクレオチドを含むポリヌクレオチドがゲノムに組み込まれている、グリフォセート耐性の前記種子または植物を定植する工程ならびに、
ｂ）前記植物に有意に影響を与えずに、前記雑草を制御するために十分な量のグリフォセート除草剤を、前記圃場の前記植物および前記雑草に適用する工程
を含む方法：
ドメインＩ
【化６７】
2008535495.tif 000049
（配列番号１３）（ここで、Ｘ１はリシンまたはトレオニンを表し、Ｘ２はアルギニンを表し、Ｘ３はセリンまたはトレオニンを表す）；
ドメインＩａ
【化６８】
2008535495.tif 000050
（配列番号１４）（ここで、Ｘ１はトレオニンを表す）；
ドメインＩｂ
【化６９】
2008535495.tif 000051
（配列番号１５）（ここで、Ｘ１はアルギニンを表し、Ｘ２はセリンまたはトレオニンを表す）；
ドメインＩＩ
【化７１】
2008535495.tif 000052
（配列番号１７）（ここで、Ｘ１はアスパラギン酸またはアラニンを表し、Ｘ２はセリンまたはトレオニンを表し、Ｘ３はバリンまたはイソロイシンを表し、Ｘ４はトレオニンまたはグルタミン酸、またはリシンを表し、Ｘ５はセリンまたはグリシンを表し、Ｘ６はグルタミンまたはセリンまたはグルタミン酸を表す）；
ドメインＩＩａ
【化７２】
2008535495.tif 000053
（配列番号１８）（ここで、Ｘ１はアスパラギン酸を表し、Ｘ２はセリンまたはトレオニンを表し、Ｘ３はバリンまたはイソロイシンを表す）；
ドメインＩＩｂ
【化７３】
2008535495.tif 000054
（配列番号１９）（ここで、Ｘ１はトレオニンまたはグルタミン酸またはリシンを表し、Ｘ２はセリンまたはグリシンを表し、Ｘ３はグルタミンまたはセリンまたはグルタミン酸を表す）；
ドメインＩＶ
【化７５】
2008535495.tif 000055
（配列番号２１）；
ドメインＶＩ
【化７８】
2008535495.tif 000056
（配列番号２３）（ここで、Ｘ１はアルギニンまたはロイシンを表し、Ｘ２はイソロイシンまたはバリンを表す）；
ドメインＶＩＩ
【化７９】
2008535495.tif 000057
（配列番号２４）（ここで、Ｘ１はアルギニンまたはリシンを表し、Ｘ２はアラニンまたはグルタミン酸またはセリンを表し、Ｘ３はプロリンまたはアラニンを表す）；
ドメインＶＩＩＩ
【化８０】
2008535495.tif 000058
（配列番号２５）（ここで、Ｘ１はアラニンを表し、Ｘ２はグルタミン酸またはグルタミンを表し、Ｘ３はバリンまたはロイシンまたはアラニンを表す）；
ドメインＩＸ
【化８２】
2008535495.tif 000059
（配列番号２７）（ここで、Ｘ１はロイシンを表す）；
ドメインＸＩ
【化８４】
2008535495.tif 000060
（配列番号２９）（ここで、Ｘ１はグルタミンまたはリシンまたはセリンを表し、Ｘ２はアスパラギンまたはヒスチジンを表し、Ｘ３はメチオニンまたはロイシンを表し、Ｘ４はプロリンまたはグルタミンを表し、Ｘ５はトレオニンまたはグルタミン酸またはバリンを表し、Ｘ６はバリンまたはイソロイシンを表し、Ｘ７はアスパラギン酸またはバリンを表し、Ｘ８はロイシンまたはイソロイシンを表し、Ｘ９はロイシンを表す）；
ドメインＸＩａ
【化８５】
2008535495.tif 000061
（配列番号３０）（ここで、Ｘ１はグルタミンまたはリシンまたはセリンを表し、Ｘ２はアスパラギンまたはヒスチジンを表し、Ｘ３はメチオニンを表し、Ｘ４はプロリンまたはグルタミンを表す）；
ドメインＸＩｂ
【化８６】
2008535495.tif 000062
（配列番号３１）（ここで、Ｘ１はトレオニンまたはバリンを表し、Ｘ２はバリンまたはイソロイシンを表し、Ｘ３はアスパラギン酸またはバリンを表し、Ｘ４はロイシンまたはイソロイシンを表し、Ｘ５はロイシンまたはイソロイシンを表す）；
ドメインＸＩＩ
【化８８】
2008535495.tif 000063
（配列番号３３）（ここで、Ｘ１はバリンまたはトレオニンを表し、Ｘ２はグルタミン酸またはグリシンを表し、Ｘ３はロイシンを表し、Ｘ４はアラニンまたはグルタミン酸を表し、Ｘ５はイソロイシンまたはバリンを表す）；
ドメインＸＩＩｂ
【化９０】
2008535495.tif 000064
（配列番号３５）（ここで、Ｘ１はバリンまたはトレオニンを表し、Ｘ２はグルタミン酸またはグリシンを表し、Ｘ３はロイシンを表し、Ｘ４はアラニンまたはグルタミン酸を表し、Ｘ５はイソロイシンまたはバリンを表す）；
ドメインＸＩＩＩ
【化９２】
2008535495.tif 000065
（配列番号３７）（ここで、Ｘ１はロイシンまたはイソロイシンを表し、Ｘ２はイソロイシンを表す）；
ドメインＸＩＶ
【化９３】
2008535495.tif 000066
（配列番号３８）（ここで、Ｘ１はアスパラギン酸またはアスパラギンを表し、Ｘ２はアラニンまたはトレオニンを表す）；
ドメインＸＶ
【化９４】
2008535495.tif 000067
（配列番号３９）（ここで、Ｘ１はロイシンまたはグルタミン酸を表し、Ｘ２はトレオニンまたはセリンを表し、Ｘ３はヒスチジンまたはフェニルアラニンを表し、Ｘ４はアラニンまたはセリンを表す）；
ドメインＸＶＩ
【化９５】
2008535495.tif 000068
（配列番号４０）（ここで、Ｘ１はグリシンを表し、Ｘ２はイソロイシンまたはバリンを表し、Ｘ３はセリンまたはグリシンまたはアラニンまたはリシンを表す）；
ドメインＸＶＩａ
【化９６】
2008535495.tif 000069
（配列番号４１）（ここで、Ｘ１はグリシンを表す）；
ドメインＸＶＩｂ
【化９７】
2008535495.tif 000070
（配列番号４２）（ここで、Ｘ１はイソロイシンまたはバリンを表し、Ｘ２はセリンまたはアラニンまたはリシンを表す）；
ドメインＸＶＩＩ
【化９８】
2008535495.tif 000071
（配列番号４３）（ここで、Ｘ１はアスパラギンまたはアスパラギン酸を表し、Ｘ２はアスパラギン酸を表し、Ｘ３はアラニンまたはグリシンを表す）；
ドメインＸＶＩＩＩ
【化９９】
2008535495.tif 000072
（配列番号４４）（ここで、Ｘ１はセリンまたはプロリンを表す）。
【請求項１８】
前記植物または植物種子が作物植物を含む、請求項１７に記載の方法。
【請求項１９】
前記プロモーターが、前記ポリヌクレオチドに対して異種であり、前記ポリヌクレオチドを用いて形質転換された植物のグリフォセート耐性を高めるために前記ＥＰＳＰＳ酵素の十分な発現を引き起こすように適合されている、請求項１７に記載の方法。
【請求項２０】
ａ）植物細胞のゲノムに請求項１に記載のポリヌクレオチドを挿入する工程、
ｂ）形質転換された植物細胞を得る工程、および
ｃ）前記形質転換された植物細胞から、グリフォセート除草剤に対して増大した耐性を有する、遺伝的に形質転換された植物を再生する工程
を含む、グリフォセート除草剤に対して耐性を有する、遺伝的に形質転換された植物を作出する方法。
【請求項２１】
配列番号１、３、９、１１、４５、４７、５５、５７、５８、または６０からなる群から選択されるポリヌクレオチドを含むＤＮＡ構築物を用いて植物細胞を形質転換すること、および形質転換された植物を再生することを含む、グリフォセートに耐性の、遺伝的に形質転換された植物を作出する方法。
【請求項２２】
前記ＤＮＡ構築物が、植物細胞において機能するプロモーターをさらに含み、コードされるＥＰＳＰＳ酵素の十分な発現を可能にするＲＮＡ配列の産生を引き起こし、前記ポリヌクレオチドを用いて形質転換された植物細胞のグリフォセート耐性を高める、請求項２１に記載の方法。
【請求項２３】
前記ポリヌクレオチドが、アミノ末端クロロプラスト輸送ペプチドおよびＥＰＳＰＳ酵素を含む融合ポリペプチドをコードする、請求項２１に記載の方法。
【請求項２４】
配列番号１、３、９、１１、４５、４７、５５、５７、５８、および６０からなる群から選択されるポリヌクレオチドを含む、グリフォセート耐性植物細胞。
【請求項２５】
トウモロコシ、コムギ、イネ、オオムギ、ダイズ、ワタ、サトウダイコン、ナタネ、カノーラ、アマ、ヒマワリ、ジャガイモ、タバコ、トマト、アルファルファ、ポプラ、マツ、ユーカリ、リンゴ、レタス、エンドウ、レンズマメ、ブドウ、およびシバクサからなる群から選択される、請求項２４に記載のグリフォセート耐性植物細胞。
【請求項２６】
請求項２４に記載の植物細胞を含むグリフォセート耐性植物。
【請求項２７】
トウモロコシ、コムギ、イネ、オオムギ、ダイズ、ワタ、サトウダイコン、ナタネ、カノーラ、アマ、ヒマワリ、ジャガイモ、タバコ、トマト、アルファルファ、ポプラ、マツ、ユーカリ、リンゴ、レタス、エンドウ、レンズマメ、ブドウ、およびシバクサからなる群から選択される、請求項２６に記載のグリフォセート耐性植物。
【請求項２８】
請求項２６に記載の植物の形質転換された種子。
【請求項２９】
定植された種子または植物を有する圃場における雑草を選択的に制御する方法であって、
ａ）請求項２６に記載の植物、またはそれから得られた形質転換された種子を定植する工程、および
ｂ）前記植物に有意に影響を与えずに、前記雑草を制御するために十分量のグリフォセート除草剤を、前記圃場の前記植物および雑草に適用する工程
を含む方法。
【請求項３０】
前記植物または植物種子が作物植物を含む、請求項２９に記載の方法。
【請求項３１】
前記ポリヌクレオチドが、アミノ末端クロロプラスト輸送ペプチドおよびＥＰＳＰＳ酵素を含む融合ポリペプチドをコードする、請求項２９に記載の方法。