【手続補正書】
【提出日】平成21年3月6日(2009.3.6)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
細菌サンプルを受け入れる捕集媒体；及び
前記捕集媒体上又はその中に位置する複数のバクテリオファージを含み、各バクテリオファージは、１つの出力波長で光を発することができる蛋白質をコードする核酸を含み、前記捕集媒体は、固体基質である細菌の検出捕集装置。
【請求項２】
前記核酸は、蛍光を発する蛋白質をコードし、前記蛍光を発する蛋白質は、前記出力波長の光を発することによって１つの入力波長の光に応答する請求項１の細菌の検出捕集装置。
【請求項３】
前記蛍光を発する蛋白質は、緑色蛍光蛋白質（ＧＦＰ）を含み；前記入力波長は３９５ｎｍであり、前記出力波長は５１０ｎｍであることを特徴とする請求項２の細菌の検出捕集装置。
【請求項４】
前記核酸は、発光基質の存在下において前記出力波長で光を発することができる化学発光する蛋白質をコードする請求項１の細菌の検出捕集装置。
【請求項５】
前記化学発光する蛋白質は、ルシフェラーゼであり、前記発光基質は、ルシフェリンである請求項４の細菌の検出捕集装置。
【請求項６】
前記バクテリオファージは、細菌の１つの菌株に感染すること及び／又はこれを溶解することに特異的である請求項１〜５の何れかの細菌の検出捕集装置。
【請求項７】
前記細菌の菌株は、メチシリン耐性黄色ブドウ球菌（ＭＲＳＡ）の菌株である請求項６の細菌の検出捕集装置。
【請求項８】
前記菌株は、ＭＲＳＡ株３、１５又は１６である請求項７の細菌の検出捕集装置。
【請求項９】
前記バクテリオファージは、ＮＣＩＭＢ９５６３として寄託された株であり、更に光を発することができる蛋白質をコードする核酸を含む請求項１〜８の何れかの細菌の検出捕集装置。
【請求項１０】
前記細菌の菌株は、炭疽菌株である請求項１〜６の何れかの細菌の検出捕集装置。
【請求項１１】
前記バクテリオファージは、炭疽菌ファージガンマであり、更に光を発することができる蛋白質をコードする核酸を含む請求項１０の細菌の検出捕集装置。
【請求項１２】
前記バクテリオファージは、前記基質に固定されている請求項１〜１１の何れかの細菌の検出捕集装置。
【請求項１３】
前記バクテリオファージは、前記基質に共有結合により固定されている請求項１２の細菌の検出捕集装置。
【請求項１４】
前記バクテリオファージと前記基質との間の共有結合は、カップリング剤により補われている請求項１３の細菌の検出捕集装置。
【請求項１５】
前記基質は、ナイロン又はアミノ若しくはカルボキシ表面基を有するその他のポリマーを含み、かつ前記カップリング剤は、カルボジイミド又はグルタルアルデヒドであり；前記基質は、セルロース又はその他の水酸基含有ポリマーを含み、かつ前記カップリング剤は、ビニルスルホニルエチレンエーテル又はトリアジンを含み；或いは前記基質は、ポリエチレン又は同類のポリマーを含み、かつ前記カップリング剤は、コロナ放電又は過マンガン酸酸化を含む請求項１４の細菌の検出捕集装置。
【請求項１６】
前記バクテリオファージは、その尾部をつながずに、その頭部を介して固定されている請求項１２〜１５の何れかの細菌の検出捕集装置。
【請求項１７】
前記基質は、プラスチック材料を含む請求項１〜１６の何れかの細菌の検出捕集装置。
【請求項１８】
更に、水性栄養培地、好ましくはグルコースを含む水性栄養培地を含む請求項１〜１７の何れかの細菌の検出捕集装置。
【請求項１９】
更に、前記捕集培地を入れるための容器を含む請求項１〜１８の何れかの細菌の検出捕集装置。
【請求項２０】
複数のバクテリオファージ株を含み、各株は異なる細菌の菌株に感染すること及び／又はこれを溶解することに特異的であり、各株のバクテリオファージは、異なる出力波長で光を発することができる蛋白質をコードする核酸を含む請求項１〜５の何れかの細菌の検出捕集装置。
【請求項２１】
請求項１〜２０の何れかの細菌の検出捕集装置；前記細菌の検出捕集装置を収容するソケット；及び前記ソケットの位置から前記出力波長の光を検出することができる光検出器を含む細菌の検出装置。
【請求項２２】
更に、前記ソケットの位置に前記入力波長の光を放出することができる光源を含む請求項２又は３に従属するような請求項２１の細菌の検出装置。
【請求項２３】
更に、前記出力波長での光の検出を表示するため前記光検出器と連絡したユーザーインターフェースを含む請求項２１又は２２の細菌の検出装置。
【請求項２４】
更に、前記光検出器と前記ユーザーインターフェースとの間に介在したプロセッサを含み、前記プロセッサは、経時で検出した出力波長での光の強度の変化を計算し、前記ユーザーインターフェースを介して強度の変化を表示するためのものである請求項２３の細菌の検出装置。
【請求項２５】
前記光検出器は、複数の異なる出力波長での光を検出することができる請求項２１〜２４の何れかの細菌の検出装置。
【請求項２６】
サンプル中の細菌を検出するための請求項１〜２０の何れかの細菌の検出捕集装置又は請求項２１〜２５の何れかの細菌の検出装置の使用。
【請求項２７】
下記工程を含むサンプル中の細菌を検出する方法：
ａ）前記サンプルを、請求項１〜２０の何れかの細菌の検出捕集装置中のバクテリオファージに露出し、その結果、前記サンプル中の細菌が前記バクテリオファージに感染し、かつ前記細菌において前記核酸が発現する工程；及び
ｂ）前記サンプルから前記出力波長で発せられた光を検出し、前記光の検出が細菌の存在を示す工程。
【請求項２８】
前記細菌の検出捕集装置は、請求項２の細菌の検出捕集装置であり、前記方法は、更に、前記サンプルに前記入力波長の光を当てる工程を含む請求項２７の方法。
【請求項２９】
前記核酸は、化学発光する蛋白質をコードし、前記方法は、更に、前記サンプルに化学発光基質を与える工程を含む請求項２７の方法。
【請求項３０】
前記バクテリオファージは、細菌の１つの菌株に特異的であり、前記出力波長での光の検出は、前記菌株の存在を示す請求項２７〜２９の何れかの方法。
【請求項３１】
前記菌株は、ＭＲＳＡ株、好ましくはＭＲＳＡ株３、１５又は１６である請求項３０の方法。
【請求項３２】
前記菌株は、炭疽菌である請求項３０の方法。
【請求項３３】
工程ａ）は、前記サンプルに関し前記基質をこすりつける工程を含む請求項１〜１７の何れかに従属するような請求項２７の方法。
【請求項３４】
工程ａ）は、好ましくはグルコースを含む水性栄養培地中で、前記バクテリオファージに感染させた後、前記細菌を増殖させる工程をさらに含む請求項２７〜３３の何れかの方法。
【請求項３５】
工程ｂ）は、前記バクテリオファージが前記細菌に感染するときに、前記出力波長の光を検出することを含み、前記出力波長の光の強度が増大していることの検出が細菌の存在を示す請求項２７〜３４の何れかの方法。
【請求項３６】
前記サンプルは、複数のバクテリオファージの株に接触され、各株は異なる細菌の菌株に特異的であり、各株のバクテリオファージは、異なる出力波長で光を発することができる蛋白質をコードし、前記方法は、更に各出力波長で前記サンプルから発せられた光を検出する工程を含み、ある波長での光の検出が細菌の対応する菌株の存在を示す請求項２７〜３５の何れかの方法。
【請求項３７】
更に、前記バクテリオファージで前記サンプル中の細菌を死滅させる工程を含む請求項２７〜３６の何れかの方法。