【手続補正書】
【提出日】平成21年8月10日(2009.8.10)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
次のものから選択されるアミノ酸配列を含む又はから成るペプチド
x-I-x-x-x-x-x-x-x-x-Y-x-x-x-F-K-x (配列番号：163)
x-I-x-x-x-x-x-x-x-x-Y-x-x-x-F-K-x (配列番号：169)
x-I-x-P-x-x-x-x-T-x-Y-x-x-K-F-x-G (配列番号：170)
G-Y-x-F-T-x-x-x-x-x-W (配列番号：162)
x-A-S-x-x-x-x-x-x-x-x (配列番号：164)
x-x-S-x-x-x-S (配列番号：165)
Q-Q-x-x-x-x-P-x-x (配列番号：166)
G-Y-T-F-T-x-x-x-x-x-W (配列番号：167)
G-Y-x-F-x-x-Y-x-M-x-W (配列番号：168)
x-A-S-x-x-x-x-x-x-x-x (配列番号：171)
x-A-S-x-x-x-x-x-x-L-x (配列番号：172)
x-x-S-x-x-x-S (配列番号：173)
x-T-S-x-L-x-x (配列番号：174)
Q-Q-x-x-S-x-P-x-T (配列番号：175) 及び
Q-Q-x-N-x-x-P-x-x (配列番号：176)
（ただし、「ｘ」は任意のアミノ酸残基を示し、「−」はペプチド結合を示し、ペプチドは、Ｎ末端からＣ末端の向きで示される）。
【請求項２】
次のものから選択されるアミノ酸配列を含む又はから成るペプチド
G-Y-[TA]-F-T-[RNS]-[YN]-[WGN]-[IM]-[NF]-W
[NWY]-I-[YND]-[PT]-[SY]-[DNT]-[SG]-[YDE]-[TP]-[NRT]-Y-[NSA]-[QD]-[KD]-F-K-[DG]
[LKE]-[RG]-[GML]-[LTY]-[LTG]-[PGN]-[DY]-[YAF]
[KR]-A-S-[QS]-[NDS]-[VI]-[DSG]-[TNS]-[NY]-[VLY]-[ANL]
[SYR]-[AT]-S-[YRI]-[RL]-[YHA]-S
Q-Q-[YG]-[NS]-[TS]-[YFS]-P-[LTP]-[TF]
G-Y-T-F-T-[RNYSTDEG]-[NYF]-[WGAY]-[IMV]-[NGQH]-W
G-Y-[ATS]-F-[T/S]-[SDG]-Y-[NWV]-M-[FQHN]-W
[NWEAY]-I-[YND]-[PT]-[SYG]-[DTGY]-[SGD]-[YEGS]-[TP]-[NTYGS]-Y-[NAI]-[QDE]-[KD]-F-K-[DGN]
[YWKNLR]-I-[DN]-P-[YAEFS]-[NYS]-[GD]-[DSG]-T-[RESKN]-Y-[SAN]-[QSEP]-K-F-[KQT]-G
[KR]-A-S-[QS]-[NSDT]-[VI]-[DGSR]-[TSYNK]-[NADY]-[VYGL]-[ALD]
[RK]-A-S-[QR]-[DSG]-[IV]-[SN]-[NSG]-[YW]-L-[NHA]
[SRW]-[AT]-S-[YIT]-[RL]-[YAE]-S
[YLDTK]-T-S-[RNKV]-L-[HAG]-[SP]
Q-Q-[YGWR]-[NSAG]-S-[YSDW]-P-[LPYI]-T 及び
Q-Q-[GNSTY]-N-[TES]-[FDWY]-P-[TYRF]-[FT]
（ただし、括弧中に示されるアミノ酸のうちの１つは各位置で関連する場合に選択され、ペプチドは、Ｎ末端からＣ末端の向きで示される）。
【請求項３】
次のものから選択されるアミノ酸配列を含む又はから成るペプチド
G-Y-T-F-T-R-[YN]-W-[IM]-N-W
N-I-Y-P-[SY]-D-[SG]-Y-T-N-Y-N-Q-K-F-K-[DG]
L-[RG]-G-L-L-P-[DY]-Y
K-A-S-Q-N-V-[DSG]-T-N-V-A
S-A-S-Y-R-Y-S
Q-Q-Y-N-S-Y-P-L-T
G-Y-T-F-T-[RNS]-Y-W-[IM]-N-W
G-Y-T-F-T-S-Y-W-M-H-W
N-I-Y-P-S-D-S-Y-T-N-Y-N-Q-K-F-K-G
[YW]-I-N-P-Y-N-G-D-T-[ES]-Y-N-Q-K-F-K-G
K-A-S-Q-N-V-S-T-N-V-A
R-A-S-Q-S-I-S-N-Y-L-[NA]
S-A-S-Y-R-Y-S
Y-T-S-N-L-A-S
Q-Q-Y-N-S-Y-P-L-T 及び
Q-Q-N-N-E-D-P-[YR]-T
（ただし、括弧中に示されるアミノ酸のうちの１つは各位置で関連する場合に選択され、ペプチドは、Ｎ末端からＣ末端の向きで示される）。
【請求項４】
配列番号８、６、１０、１２、１４、１６、２２、２４、２６、２８、３０、３２、３８、４０、４２、４４、４６、４８、５４、５６、５８、６０、６２、６４、７０、７２、７４、７６、７８、８０、８６、８８、９０、９２、９４、又は９６の任意の１つに記載されるアミノ酸配列を含み、好ましくは配列番号８、１０、又は１６の任意の１つに記載されるアミノ酸配列を含むペプチド。
【請求項５】
配列番号８、２、４、６、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２２、２４、２６、２８、３０、３２、３４、３６、３８、４０、４２、４４、４６、４８、５０、５２、５４、５６、５８、６０、６２、６４、６６、６８、７０、７２、７４、７６、７８、８０、８２、８４、８６、８８、９０、９２、９４、若しくは９６の任意の１つに記載されるアミノ酸配列又はその機能的等価物若しくは断片を含む又はから成る請求項４に記載のペプチド。
【請求項６】
ＧＰＩ連結エピトープに対する反応性を有する抗体に由来するペプチド又は機能的に等価なリガンド。
【請求項７】
前記抗体は、抗ＴＣＲ  Ｖβ抗体、ホスファチジルイノシトール、ホスファチジルセリン、又はカルジオリピン（ジアシルグリセロール）等のリン脂質、リン脂質グリカン、一本鎖ＤＮＡ、及び二本鎖ＤＮＡから成る群から選択されるエピトープに対する反応性をさらに有する、請求項６に記載のペプチド又は機能的に等価なリガンド。
【請求項８】
前記抗体は、ヒト膵臓α細胞、甲状腺の瀘胞細胞、副腎髄質、胃及び腸管、唾液腺、卵巣、横紋筋、結合組織の細胞に対する反応性をさらに有する、請求項７に記載のペプチド又は機能的に等価なリガンド。
【請求項９】
Ｆａｂ、Ｆ（ａｂ’）２、Ｆｖ、又はｓｃＦｖの断片である、請求項６〜８のいずれか一項に記載のペプチド又は機能的に等価なリガンド。
【請求項１０】
前記抗体の超可変領域に由来する、請求項６〜９のいずれか一項に記載のペプチド又は機能的に等価なリガンド。
【請求項１１】
連結された、請求項１〜１０のいずれか一項に記載の２つ以上のペプチドを含むペプチド。
【請求項１２】
連結された、配列番号８、配列番号１０、又は配列番号１６に記載されるアミノ酸配列を含む２つ以上のペプチドを含む、請求項１１に記載のペプチド。
【請求項１３】
単量体ペプチドのホモ二量体であり、単量体ペプチドは、配列番号１５９、配列番号１６０、又は配列番号１６１に記載されるアミノ酸配列から成る、請求項１２に記載のペプチド。
【請求項１４】
化学的に修飾された、生物学的物質若しくは合成物質に結合した、又は酵素、指標化合物、薬物、毒素、若しくは放射性標識に抱合された、請求項１〜１３のいずれか一項に記載のペプチド又は機能的に等価なリガンド。
【請求項１５】
請求項１〜１４のいずれか一項に記載のペプチド又は機能的に等価なリガンドを含む抗体又は抗体断片。
【請求項１６】
配列番号６、８、１０、１２、１４、１６、２２、２４、２６、２８、３０、３２、３８、４０、４２、４４、４６、４８、５４、５６、５８、６０、６２、６４、７０、７２、７４、７６、７８、８０、８６、８８、９０、９２、９４、及び９６に記載される１、２、３、４、５、又は６つの配列を含む、請求項１５に記載の抗体又は抗体断片。
【請求項１７】
請求項１〜１４のいずれか一項に記載のペプチドに対する反応性を示す抗体又は機能的に等価なリガンド。
【請求項１８】
請求項１〜１４のいずれか一項に記載のペプチド、請求項１５若しくは１６に記載の抗体若しくは抗体断片、又は請求項１７に記載の抗体若しくは機能的に等価なリガンド、をコードする核酸分子。
【請求項１９】
請求項１７に記載の核酸分子を取り込んだベクター。
【請求項２０】
請求項１７に記載の核酸分子又は請求項１９に記載のベクターを取り込んだ宿主細胞。
【請求項２１】
請求項１〜１４のいずれか一項に記載のペプチド、請求項１５又は１６に記載の抗体又は抗体断片、請求項１７に記載の抗体又は等価なリガンドを発現させる方法であって、請求項１８に記載の核酸分子又は宿主細胞における請求項１９に記載のベクターを発現させることを含む方法。
【請求項２２】
患者における疾患を治療する方法であって、請求項１〜１４のいずれか一項に記載のペプチド、請求項１５若しくは１６に記載の抗体若しくは抗体断片、又は請求項１７に記載の抗体若しくは等価なリガンド、請求項１８に記載の核酸分子、請求項１９に記載のベクター、或いは請求項２０に記載の宿主細胞を患者に投与することを含む方法。
【請求項２３】
疾患の療法又は診断における使用のための、請求項１〜１４のいずれか一項に記載のペプチド、請求項１５若しくは１６に記載の抗体若しくは抗体断片、請求項１７に記載の抗体若しくは等価なリガンド、請求項１８に記載の核酸分子、請求項１９に記載のベクター、又は請求項２０に記載の宿主細胞。
【請求項２４】
前記疾患は、ＧＰＩ連結エピトープに対する反応性を有する自己抗体の存在により特徴づけられ、抗ＴＣＲ  Ｖβ抗体、シグナリング能力を有する分子、ホスファチジルイノシトール、ホスファチジルセリン、及びカルジオリピン（ジアシルグリセロール）を含むリン脂質、リン脂質グリカン、インスリン作用のセカンドメッセンジャー、一本鎖ＤＮＡ及び二本鎖ＤＮＡ、並びにＧＰＩ連結の要素、におけるエピトープに対して反応性でもある、請求項２２又は２３に記載の方法又は使用。
【請求項２５】
前記疾患は、ＩＤＤＭ、ＮＩＤＤＭ、器官特異的若しくは非器官特異的自己免疫疾患、心血管疾患、癌性悪液質及び癌、又は抗リン脂質抗体及び／若しくは高インスリン血症及び／若しくは高グルカゴン血症及び／若しくはインスリン抵抗性及び／若しくはグルコース不耐性が存在する他の疾患から成る群から選択される、請求項２２又は２３に記載の方法又は使用。
【請求項２６】
抗リン脂質抗体及び／又は高インスリン血症、インスリン抵抗性、並びにグルコース不耐性が存在する前記他の疾患は、乾癬、湿疹、白斑、黒色表皮腫、皮膚老化、円形脱毛症、アルツハイマー病、統合失調症、うつ病、パーキンソン病、片頭痛、多発性硬化症、重症筋無力症、筋萎縮性側索硬化症及び関連疾患、運動性ニューロン及び関連疾患、甲状腺疾患、クッシング症候群及びアジソン病、多嚢胞性卵巣症候群、性腺機能低下症及び男性における早発性禿頭症、肥満、Ｘ症候群、抗リン脂質抗体及びループス抗凝固因子抗体に関連する疾患、セリアック病、胃炎、炎症性腸疾患、関節炎及び関連疾患、喘息、嚢胞性線維症、骨粗鬆症及び骨減少症、扁平苔癬及び白板症、貧血、発作性夜間血色素尿症、睡眠時無呼吸、不眠、癌、ＨＩＶ、感染、並びに免疫調節における機能不全から成る群から選択される、請求項２５に記載の方法。
【請求項２７】
前記疾患は、グルコース不耐性に関連する疾患又は自己血糖調節の低下若しくは悪化に関連する疾患である、請求項２２又は２３に記載の方法又は使用。
【請求項２８】
薬学的に許容し得る担体と共に、請求項１〜１４のいずれか一項に記載のペプチド、請求項１５若しくは１６に記載の抗体若しくは抗体断片、請求項１７に記載の抗体若しくは等価なリガンド、請求項１８に記載の核酸分子、請求項１９に記載のベクター、又は請求項２０に記載の宿主細胞を含む医薬組成物。
【請求項２９】
請求項１〜１４のいずれか一項に記載のペプチドを含むワクチン組成物。
【請求項３０】
アジュバントを含む請求項２９に記載のワクチン組成物。
【請求項３１】
疾患又は障害に対して個体にワクチン接種する方法であって、個体に請求項１〜１４のいずれか一項に記載のペプチド又は請求項２９若しくは３０のいずれか一項に記載のワクチン組成物を個体に投与することを含む方法。
【請求項３２】
ペプチドに対する抗体は個体中で形成される、請求項３１に記載の方法。
【請求項３３】
自己免疫抗体の存在又はレベルについて個体を診断する方法であって、血液試料、血漿試料、若しくは血清試料、又は他の体液を、請求項１〜１４のいずれか一項に記載のペプチドと、前記自己免疫抗体に対する標的の存在下で接触させること、及び特異的に標的に結合する前記自然発生の自己抗体の量を評価することを含む方法。
【請求項３４】
前記標的は、Ｔ細胞受容体Ｖβ鎖上の少なくとも１つのエピトープを同定する抗ＴＣＲ  Ｖβポリクローナル免疫グロブリン分子若しくは抗ＴＣＲ  Ｖβモノクローナル免疫グロブリン分子又はその任意の一部である、請求項３３に記載の方法。
【請求項３５】
前記ペプチド、抗体、及び／又は標的は標識される、請求項３３又は３４に記載の方法。
【請求項３６】
少なくとも１つは請求項１〜１４のいずれか一項に記載のペプチドであるペプチドのアレイ。