(57)【要約】本発明は、ＨＬＡ抗原に結合し、かつ細胞傷害性Ｔリンパ球（ＣＴＬ）を誘導する、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：３５に由来する単離されたペプチドまたは断片を提供する。これらのペプチドには、１個、２個または数個のアミノ酸の置換、欠失または付加を有する、上述したアミノ酸配列の１つが含まれうる。本発明はまた、これらのペプチドを含む薬学的組成物も提供する。本発明のペプチドは、がんを治療するために用いることができる。【特許請求の範囲】
【請求項１】
ＨＬＡ抗原と結合し、かつ細胞傷害性Ｔリンパ球（ＣＴＬ）誘導能を有する単離されたペプチドであって、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：３５のアミノ酸配列またはその免疫学的活性断片からなる、単離されたペプチド。
【請求項２】
ＨＬＡ抗原がＨＬＡ−Ａ２４である、請求項１記載の単離されたペプチド。
【請求項３】
ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１、８、９、１１、１２、１８、２２、２４、２５、２６および３２からなる群より選択されるアミノ酸配列を含む、請求項１または２記載の単離されたペプチド。
【請求項４】
ノナペプチドまたはデカペプチドである、請求項１〜３のいずれか一項記載の単離されたペプチド。
【請求項５】
１個、２個または数個のアミノ酸が置換、欠失、または付加されている、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１、８、９、１１、１２、１８、２２、２４、２５、２６および３２からなる群より選択されるアミノ酸配列からなる、請求項４記載の単離されたペプチド。
【請求項６】
以下からなる群より選択される少なくとも１つの置換を有する、請求項５記載のペプチド：
（ａ）Ｎ末端から２番目のアミノ酸が、フェニルアラニン、チロシン、メチオニンおよびトリプトファンからなる群より選択される；ならびに
（ｂ）Ｃ末端アミノ酸が、フェニルアラニン、ロイシン、イソロイシン、トリプトファンおよびメチオニンからなる群より選択される。
【請求項７】
請求項１〜６のいずれか一項記載のペプチドをコードする、単離されたポリヌクレオチド。
【請求項８】
ＣＴＬを誘導するための組成物であって、請求項１〜６のいずれか一項記載の１種もしくは複数種のペプチド、または請求項７記載の１種もしくは複数種のポリヌクレオチドを含む、組成物。
【請求項９】
がんの治療および／もしくは予防のための、ならびに／またはその術後再発の予防のための薬学的組成物であって、請求項１〜６のいずれか一項記載の１種もしくは複数種のペプチド、または請求項７記載の１種もしくは複数種のポリヌクレオチドを含む、薬学的組成物。
【請求項１０】
ＨＬＡ抗原がＨＬＡ−Ａ２４である対象に対する投与を目的とする、請求項９記載の薬学的組成物。
【請求項１１】
がんの治療を目的とする、請求項９または１０記載の薬学的組成物。
【請求項１２】
ＣＴＬ誘導能を有する抗原提示細胞（ＡＰＣ）を誘導するための方法であって、以下からなる群より選択される段階を含む方法：
（ａ）ＡＰＣを、請求項１〜６のいずれか一項記載のペプチドと、インビトロ、エクスビボまたはインビボで接触させる段階；および
（ｂ）請求項１〜６のいずれか一項記載のペプチドをコードするポリヌクレオチドを、ＡＰＣに導入する段階。
【請求項１３】
以下からなる群より選択される段階を含む方法のいずれかによって、ＣＴＬを誘導するための方法：
（ａ）ＣＤ８陽性Ｔ細胞を、ＨＬＡ抗原と請求項１〜６のいずれか一項記載のペプチドとの複合体をその表面に提示するＡＰＣと共培養する段階、
（ｂ）ＣＤ８陽性Ｔ細胞を、ＨＬＡ抗原と請求項１〜６のいずれか一項記載のペプチドとの複合体をその表面に提示するエキソソームと共培養する段階、および
（ｃ）請求項１〜６のいずれか一項記載のペプチドに結合するＴ細胞受容体（ＴＣＲ）サブユニットポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む遺伝子を、Ｔ細胞に導入する段階。
【請求項１４】
ＨＬＡ抗原と請求項１〜６のいずれか一項記載のペプチドとの複合体をその表面に提示する、単離されたＡＰＣ。
【請求項１５】
請求項１２記載の方法によって誘導される、請求項１４記載のＡＰＣ。
【請求項１６】
請求項１〜６記載のペプチドのいずれかを標的とする、単離されたＣＴＬ。
【請求項１７】
請求項１３記載の方法によって誘導される、請求項１６記載のＣＴＬ。
【請求項１８】
対象におけるがんに対する免疫応答を誘導する方法であって、請求項１〜６のいずれか一項記載のペプチド、その免疫学的活性断片、または該ペプチドもしくは該断片をコードするポリヌクレオチドを含む組成物を対象に投与する段階を含む方法。
【請求項１９】
請求項１〜６のペプチドのいずれかとＨＬＡ抗原とを含む複合体を提示するエキソソーム。
【請求項２０】
請求項１〜６のペプチドのいずれかに対する、抗体またはその断片。
【請求項２１】
請求項１〜６のペプチドのいずれかをコードするヌクレオチド配列を含むベクター。
【請求項２２】
請求項２１記載の発現ベクターによって形質転換された、または該ベクターをトランスフェクションした宿主細胞。
【請求項２３】
請求項１〜６のペプチドのいずれか、請求項７記載のヌクレオチド、または請求項２０記載の抗体を含む、診断キット。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
本出願は、２００９年３月４日に出願した米国仮特許出願第６１／２０９，２４２号の恩典を主張し、それらの全内容は参照により本明細書に組み入れられる。
【０００２】
本発明は、生物科学の分野、より具体的にはがん治療の分野に関連する。特に本発明は、がんワクチンとして極めて有効な新規ペプチド、ならびに腫瘍を治療および予防するための薬物に関連する。
【背景技術】
【０００３】
ＣＤ８陽性ＣＴＬは、主要組織適合遺伝子複合体（ＭＨＣ）クラスＩ分子上の腫瘍関連抗原（ＴＡＡ）由来のエピトープペプチドを認識し、その後、腫瘍細胞を殺傷することが実証されている。ＴＡＡの最初の例としてメラノーマ抗原（ＭＡＧＥ）ファミリーが発見されて以来、他の多くのＴＡＡが、免疫学的アプローチによって発見されており（Boon T, Int J Cancer 1993 May 8, 54(2): 177-80（非特許文献１）;Boon T & van der Bruggen P, J Exp Med 1996 Mar 1, 183(3): 725-9（非特許文献２））、このＴＡＡのいくつかは、免疫療法の標的として臨床開発の過程にある。
【０００４】
強力かつ特異的な抗腫瘍免疫応答を誘導する新規ＴＡＡの同定により、さまざまな種類のがんに対するペプチドワクチン接種戦略の臨床的適用のさらなる発展が保証される（Harris CC, J Natl Cancer Inst 1996 Oct 16, 88(20): 1442-55（非特許文献３）;Butterfield LH et al., Cancer Res 1999 Jul 1, 59(13): 3134-42（非特許文献４）;Vissers JL et al., Cancer Res 1999 Nov 1, 59(21): 5554-9（非特許文献５）;van der Burg SH et al., J Immunol 1996 May 1, 156(9): 3308-14（非特許文献６）;Tanaka F et al., Cancer Res 1997 Oct 15, 57(20): 4465-8（非特許文献７）;Fujie T et al., Int J Cancer 1999 Jan 18, 80(2): 169-72（非特許文献８）;Kikuchi M et al., Int J Cancer 1999 May 5, 81(3): 459-66（非特許文献９）;Oiso M et al., Int J Cancer 1999 May 5, 81(3): 387-94（非特許文献１０））。これまでに、これらの腫瘍関連抗原由来ペプチドを用いた試験がいくつか臨床で報告されている。残念ながら、がんワクチンの臨床試験においては今まで、低い奏功率しか報告されていない（Belli F et al., J Clin Oncol 2002 Oct 15, 20(20): 4169-80（非特許文献１１）;Coulie PG et al., Immunol Rev 2002 Oct, 188: 33-42（非特許文献１２）;Rosenberg SA et al., Nat Med 2004 Sep, 10(9): 909-15（非特許文献１３））。
【０００５】
好都合なＴＡＡが、がん細胞の増殖および生存のため、免疫療法の標的として、不可欠であるが、これはそのようなＴＡＡの使用が、治療的に推進された免疫選択の結果としてのＴＡＡの欠失、突然変異または下方制御に起因するがん細胞の免疫回避という、詳細に記述されているリスクを最小限に抑える可能性があるためである。
【０００６】
Ｖａｎ  Ｇｏｇｈ（Ｖａｎｇ）と呼ばれるショウジョウバエ（Ｄｒｏｓｏｐｈｉｌａ）遺伝子は、異常な単眼、肢および剛毛を有するショウジョウバエの出現の原因となる突然変異の原因として初めて同定された（Taylor et al., Genetics. 1998 Sep;150(1):199-210（非特許文献１４））。ショウジョウバエＶａｎｇ遺伝子と相同性があるＶａｎｇ−ｌｉｋｅ  １（ＶＡＮＧＬ１）は、２３，０４０種の遺伝子を含むゲノムワイドｃＤＮＡマイクロアレイによる遺伝子発現プロファイルを用いて、いくつかのがん細胞、例えば肝細胞癌、膵がんおよび膀胱がんにおいて上方制御されている新規分子として同定された（Okabe et al., Cancer Res. 2001 Mar 1;61(5):2129-37（非特許文献１５））。ヒト正常組織における発現解析では、ＶＡＮＧＬ１転写物は１６種の成人正常組織のうち精巣および卵巣で特異的に検出された。さらに、ｓｉＲＮＡまたはアンチセンスによるＶＡＮＧＬ１発現の下方制御は、ＶＡＮＧＬ１を発現する肝癌細胞における細胞増殖抑制を引き起こした（Yagyu et al., Int J Oncol. 2002 Jun;20(6):1173-8（非特許文献１６）、WO 03／027322号（特許文献１））。
【先行技術文献】
【特許文献】
【０００７】
【特許文献１】ＷＯ  ０３／０２７３２２号
【非特許文献】
【０００８】
【非特許文献１】Boon T, Int J Cancer 1993 May 8, 54(2): 177-80
【非特許文献２】Boon T & van der Bruggen P, J Exp Med 1996 Mar 1, 183(3): 725-9
【非特許文献３】Harris CC, J Natl Cancer Inst 1996 Oct 16, 88(20): 1442-55
【非特許文献４】Butterfield LH et al., Cancer Res 1999 Jul 1, 59(13): 3134-42
【非特許文献５】Vissers JL et al., Cancer Res 1999 Nov 1, 59(21): 5554-9
【非特許文献６】van der Burg SH et al., J Immunol 1996 May 1, 156(9): 3308-14
【非特許文献７】Tanaka F et al., Cancer Res 1997 Oct 15, 57(20): 4465-8
【非特許文献８】Fujie T et al., Int J Cancer 1999 Jan 18, 80(2): 169-72
【非特許文献９】Kikuchi M et al., Int J Cancer 1999 May 5, 81(3): 459-66
【非特許文献１０】Oiso M et al., Int J Cancer 1999 May 5, 81(3): 387-94
【非特許文献１１】Belli F et al., J Clin Oncol 2002 Oct 15, 20(20): 4169-80
【非特許文献１２】Coulie PG et al., Immunol Rev 2002 Oct, 188: 33-42
【非特許文献１３】Rosenberg SA et al., Nat Med 2004 Sep, 10(9): 909-15
【非特許文献１４】Taylor et al., Genetics. 1998 Sep;150(1):199-210
【非特許文献１５】Okabe et al., Cancer Res. 2001 Mar 1;61(5):2129-37
【非特許文献１６】Yagyu et al., Int J Oncol. 2002 Jun;20(6):1173-8
【発明の概要】
【０００９】
本発明は、免疫療法に適用し得る標的の発見に少なくとも一部基づく。ＴＡＡは一般に免疫系によって「自己」として認知され、このため多くの場合は免疫原性を有しないため、適切な標的の発見は極めて重要である。上述したように、ＶＡＮＧＬ１（ＧｅｎＢａｎｋアクセッション番号ＡＢ０５７５９６の遺伝子（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：３４）によってコードされるＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：３５）は、膀胱がん、乳がん、子宮頸がん、胆管細胞癌、子宮内膜症、肝臓がん、ＮＳＣＬＣ（非小細胞肺がん）、骨肉腫、膵がん、ＳＣＬＣ（小細胞肺がん）およびＡＭＬ、膀胱がん、乳がん、子宮頸がん、胆管細胞癌、子宮内膜症、肝臓がん、ＮＳＣＬＣ、骨肉腫、膵がん、ＳＣＬＣおよびＡＭＬなどのがんにおいて上方制御されていると同定されている。このため、ＶＡＮＧＬ１は、免疫療法の標的の候補である。本発明は、ＶＡＮＧＬ１に対して特異的なＣＴＬを誘導する能力を有する、ＶＡＮＧＬ１の遺伝子産物の特定のエピトープペプチドの同定に少なくとも一部基づく。以下に詳細に考察するように、健常ドナーから入手した末梢血単核細胞（ＰＢＭＣ）を、ＶＡＮＧＬ１に由来するＨＬＡ−Ａ＊２４０２結合候補ペプチドを用いて刺激した。続いて、候補ペプチドのそれぞれによってパルス刺激したＨＬＡ−Ａ２４陽性標的細胞に対する特異的な細胞傷害性を有するＣＴＬ株を樹立した。これらの結果は、これらのペプチドが、ＶＡＮＧＬ１を発現する細胞に対して強力かつ特異的な免疫応答を誘導し得るＨＬＡ−Ａ２４拘束性エピトープペプチドであることを実証している。さらに、ＶＡＮＧＬ１に強い免疫原性があり、そのエピトープが腫瘍免疫療法のための有効な標的であることも示している。したがって、本発明は、ＶＡＮＧＬ１（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：３５）またはその免疫学的活性断片からなる、ＨＬＡ抗原と結合する単離されたペプチドを提供する。これらのペプチドはＣＴＬ誘導能を有すると予想され、ＣＴＬをエクスビボで誘導するために用いることが可能であり、あるいは膀胱がん、乳がん、子宮頸がん、胆管細胞癌、子宮内膜症、肝臓がん、ＮＳＣＬＣ、骨肉腫、膵がん、ＳＣＬＣおよびＡＭＬといったがんに対する免疫応答を誘導するために対象に投与するために用いることが可能である。好ましくは、そのようなペプチドはノナペプチドまたはデカペプチドであり、より好ましくは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１〜３３の群から選択されるアミノ酸配列からなる。特に、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１、８、９、１１、１２、１８、２２、２４、２５、２６および３２の群から選択されるアミノ配列からなるペプチドは、強いＣＴＬ誘導能を示す。
【００１０】
本発明のペプチドは、改変されたペプチドが元のＣＴＬ誘導能を保っている限り、１個、２個またはそれ以上のアミノ酸が置換または付加されたものを、包含する。
【００１１】
さらに、本発明は、本発明のいずれかのペプチドをコードする、単離されたポリヌクレオチドを提供する。これらのポリヌクレオチドは本発明のペプチドと同様に、ＣＴＬ誘導能を有するＡＰＣを誘導または調製するために用いることが可能であり、あるいはがんに対する免疫応答を誘導するために対象に投与するために用いることが可能である。
【００１２】
対象に投与されると、本発明のペプチドはＡＰＣの表面に提示され、続いて各ペプチドを標的とするＣＴＬを誘導する。このため、本発明の１つの局面によれば、ＣＴＬを誘導するための本発明のいずれかのペプチドまたはポリヌクレオチドを含む組成物または物質も提供される。さらに、いずれかのペプチドまたはポリヌクレオチドを含む組成物または物質を、膀胱がん、乳がん、子宮頸がん、胆管細胞癌、子宮内膜症、肝臓がん、ＮＳＣＬＣ、骨肉腫、膵がん、ＳＣＬＣおよびＡＭＬといったがんの治療および／もしくは予防、ならびに／またはその術後再発を予防するために用いることもできる。したがって、本発明はまた、本発明のいずれかのペプチドまたはポリヌクレオチドを含む、がんの治療および／もしくは予防、ならびに／またはその術後再発を予防するための薬学的組成物または物質も提供する。本発明の薬学的組成物または物質は、本発明のペプチドまたはポリヌクレオチドの代わりに／それらに加えて本発明のペプチドのいずれかを提示するＡＰＣまたはエキソソームを、有効成分として含み得る。
【００１３】
本発明のペプチドまたはポリヌクレオチドは、例えば、対象に由来するＡＰＣをペプチドと接触させること、または本発明のペプチドをコードするポリヌクレオチドをＡＰＣに導入することにより、その表面にＨＬＡ抗原と本発明のペプチドとの複合体を提示するＡＰＣを誘導することができる。そのようなＡＰＣは標的ペプチドに対する高いＣＴＬ誘導能を有し、がん免疫療法のために有用である。したがって、本発明は、ＣＴＬ誘導能を有するＡＰＣを誘導するための方法、およびそれらの方法によって得られるＡＰＣを包含する。
【００１４】
本発明はまた、ＣＴＬを誘導するための方法であって、ＣＤ８陽性細胞を、本発明のペプチドをその表面に提示するＡＰＣもしくはエキソソームと共培養する段階、または本発明のペプチドと結合するＴ細胞受容体（ＴＣＲ）サブユニットポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む遺伝子を導入する段階を含む方法も提供する。それらの方法によって得られるＣＴＬは、膀胱がん、乳がん、子宮頸がん、胆管細胞癌、子宮内膜症、肝臓がん、ＮＳＣＬＣ、骨肉腫、膵がん、ＳＣＬＣおよびＡＭＬといったがんを治療および／または予防するために有用である。したがって、本発明は、本方法によって得られるＣＴＬを包含する。
【００１５】
さらに、本発明は、がんに対する免疫応答を誘導するための方法であって、ＶＡＮＧＬ１ポリペプチド、ＶＡＮＧＬ１ポリペプチドをコードするポリヌクレオチド、ＶＡＮＧＬ１ポリペプチドを提示するエキソソームまたはＡＰＣを含む組成物または物質を投与する段階を含む方法を提供する。
【００１６】
本発明は、がんなどの、ＶＡＮＧＬ１過剰発現と関係のある任意のさまざまな疾患に適用することができ、例示的ながんには膀胱がん、乳がん、子宮頸がん、胆管細胞癌、子宮内膜症、肝臓がん、ＮＳＣＬＣ、骨肉腫、膵がん、ＳＣＬＣおよびＡＭＬが含まれる。
【００１７】
本発明の前記の概要および以下の詳細な説明はいずれも例示的な態様のものであって、本発明または本発明の他の代替的な態様を限定するものではないことが理解されるべきである。
【図面の簡単な説明】
【００１８】
【図１】ＶＡＮＧＬ１に由来するペプチドにより誘導されたＣＴＬに対するＩＦＮ−γ  ＥＬＩＳＰＯＴアッセイの結果を示す写真を示す。ＶＡＮＧＬ１−Ａ２４−９−４４３（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１）により刺激されたウェル番号＃５中のＣＴＬ（ａ）、ＶＡＮＧＬ１−Ａ２４−９−１８２（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：８）による＃１（ｂ）、ＶＡＮＧＬ１−Ａ２４−９−１８４（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：９）による＃５（ｃ）、ＶＡＮＧＬ１−Ａ２４−９−１０９（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１１）による＃２、＃３、＃５、＃６、＃７および＃８（ｄ）、ＶＡＮＧＬ１−Ａ２４−９−１９５（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１２）による＃２および＃４（ｅ）、ＶＡＮＧＬ１−Ａ２４−１０−２３４（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１８）（ｆ）による＃２、ＶＡＮＧＬ１−Ａ２４−１０−１２３（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２２）による＃１、＃３、＃６および＃８（ｇ）、ＶＡＮＧＬ１−Ａ２４−１０−２３１（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２４）による＃５および＃６（ｈ）、ＶＡＮＧＬ１−Ａ２４−１０−１５２（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２５）による＃３（ｉ）、ＶＡＮＧＬ１−Ａ２４−１０−２８６（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２６）による＃１および＃８（ｊ）、ならびにＶＡＮＧＬ１−Ａ２４−１０−２１５（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：３２）による＃２（ｋ）はそれぞれ、対照と比較して強力なＩＦＮ−γ産生を示した。これらの画像のウェル上の四角は、対応するウェルからの細胞を増殖させてＣＴＬ株を樹立したことを示している。図中の「＋」は、適切なペプチドをパルスした標的細胞に対するＩＦＮ−γ産生を示しており、「−」は、いずれのペプチドもパルスもしなかった標的細胞に対するＩＦＮ−γ産生を示している。
【図２−１】ＩＦＮ−γ  ＥＬＩＳＡアッセイによって検出した、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１（ａ）、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：８（ｂ）、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：９（ｃ）、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１１（ｄ）、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１２（ｅ）およびＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１８（ｆ）により刺激されたＣＴＬ株のＩＦＮ−γ産生を示す線グラフを示す。これにより、各ペプチドによる刺激によって樹立されたＣＴＬ株が、対照と比較して強力なＩＦＮ−γ産生を示したことが実証された。図中の「＋」は、適切なペプチドをパルスした標的細胞に対するＩＦＮ−γ産生を示しており、「−」は、いずれのペプチドもパルスしなかった標的細胞に対するＩＦＮ−γ産生を示している。
【図２−２】ＩＦＮ−γ  ＥＬＩＳＡアッセイによって検出した、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２２（ｇ）、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２４（ｈ）、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２５（ｉ）およびＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：３２（ｊ）により刺激されたＣＴＬ株のＩＦＮ−γ産生を示す線グラフを示す。これにより、各ペプチドによる刺激によって樹立されたＣＴＬ株が、対照と比較して強力なＩＦＮ−γ産生を示したことが実証された。図中の「＋」は、適切なペプチドをパルスした標的細胞に対するＩＦＮ−γ産生を示しており、「−」は、いずれのペプチドもパルスしなかった標的細胞に対するＩＦＮ−γ産生を示している。
【図３】ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：８（ａ）、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１８（ｂ）、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２２（ｃ）およびＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２４（ｄ）により刺激されたＣＴＬ株からの限界希釈によって樹立されたＣＴＬクローンのＩＦＮ−γ産生を示している。これにより、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：８（ａ）、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１８（ｂ）、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２２（ｃ）およびＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２４（ｄ）による刺激によって樹立されたＣＴＬクローンが、対照と比較して強力なＩＦＮ−γ産生を示したことが実証された。図中の「＋」は、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：８（ａ）、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１８（ｂ）、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２２（ｃ）およびＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２４（ｄ）をパルスした標的細胞に対するＩＦＮ−γ産生を示しており、「−」は、いずれのペプチドもパルスしなかった標的細胞に対するＩＦＮ−γ産生を示している。
【図４】ＶＡＮＧＬ１およびＨＬＡ−Ａ＊２４０２を発現する標的細胞に対する特異的ＣＴＬ活性を示す線グラフを示す。ＨＬＡ−Ａ＊２４０２のみを、または完全長ＶＡＮＧＬ１遺伝子のみをトランスフェクトしたＣＯＳ７細胞を、対照として調製した。ＶＡＮＧＬ１−Ａ２４−９−４４３（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１）により樹立されたＣＴＬクローンは、ＶＡＮＧＬ１およびＨＬＡ−Ａ＊２４０２の両方をトランスフェクトしたＣＯＳ７細胞に対して特異的ＣＴＬ活性を示した（黒菱形）。一方、ＨＬＡ−Ａ＊２４０２（白三角）またはＶＡＮＧＬ１（白丸）のいずれかを発現する標的細胞に対する有意な特異的ＣＴＬ活性は検出されなかった。ＶＡＮＧＬ１遺伝子、例えば膀胱がん、乳がん、子宮頸がん、胆管細胞癌、子宮内膜症、肝臓がん、ＮＳＣＬＣ、骨肉腫、膵がん、ＳＣＬＣおよびＡＭＬなど。
【発明を実施するための形態】
【００１９】
態様の説明
本発明の態様を実施または試験するにあたって、本明細書に記載の方法および材料と類似のまたは同等な任意の方法および材料を用いることができるが、好ましい方法、装置、および材料をここに記載する。しかしながら、本材料および方法について記載する前に、本明細書に記載の特定の大きさ、形状、寸法、材料、方法論、プロトコール等は慣行的な実験法および最適化に従って変更可能であるため、本発明がこれらに限定されないことが理解されるべきである。本記載に使用する専門用語は特定の型または態様のみを説明する目的のためのものであり、添付の特許請求の範囲によってのみ限定される本発明の範囲を限定することは意図されないことも、同様に理解されるべきである。
【００２０】
Ｉ．定義
本明細書で用いる「１つの（ａ）」、「１つの（ａｎ）」、および「その（ｔｈｅ）」という単語は、特に他に具体的に指示がない限り「少なくとも１つ」を意味する。
【００２１】
「ポリペプチド」、「ペプチド」、および「タンパク質」という用語は、本明細書で互換的に用いられ、アミノ酸残基のポリマーを指す。本用語は、１個または複数個のアミノ酸残基が修飾された残基であるか、または対応する天然アミノ酸の人工的な化学的模倣体などの非天然残基であるアミノ酸ポリマーと、天然アミノ酸ポリマーとに適用される。
【００２２】
本明細書で用いる「アミノ酸」という用語は、天然アミノ酸および合成アミノ酸、ならびに天然アミノ酸と同様に機能するアミノ酸類似体およびアミノ酸模倣体を指す。アミノ酸は、Ｌ−アミノ酸またはＤ−アミノ酸のいずれかであり得る。天然アミノ酸とは、遺伝暗号によってコードされるアミノ酸、および細胞内で翻訳後に修飾されたアミノ酸（例えば、ヒドロキシプロリン、γ−カルボキシグルタミン酸、およびＯ−ホスホセリン）である。「アミノ酸類似体」という語句は、天然アミノ酸と同じ基本化学構造（水素、カルボキシ基、アミノ基、およびＲ基に結合したα炭素）を有するが、修飾されたＲ基または修飾された骨格を有する化合物（例えば、ホモセリン、ノルロイシン、メチオニン、スルホキシド、メチオニンメチルスルホニウム）を指す。「アミノ酸模倣体」という語句は、一般的なアミノ酸とは異なる構造を有するが、同様の機能を有する化合物を指す。
【００２３】
アミノ酸は、本明細書において、ＩＵＰＡＣ−ＩＵＢ生化学命名法委員会（Ｂｉｏｃｈｅｍｉｃａｌ  Ｎｏｍｅｎｃｌａｔｕｒｅ  Ｃｏｍｍｉｓｓｉｏｎ）の推奨する、一般に公知の３文字表記または１文字表記により参照されてもよい。
【００２４】
「遺伝子」、「ポリヌクレオチド」、「ヌクレオチド」、および「核酸」という用語は、本明細書において互換的に用いられ、かつ、他に特記しない限り、これらは、一般に受け入れられている１文字コードにより参照されるアミノ酸と同様である。
【００２５】
特記しない限り、「がん」という用語はＶＡＮＧＬ１遺伝子を過剰発現するがんを指し、例としては膀胱がん、乳がん、子宮頸がん、胆管細胞癌、子宮内膜症、肝がん、ＮＳＣＬＣ、骨肉腫、膵がん、ＳＣＬＣ、およびＡＭＬを含むが、それらに限定されない。
【００２６】
特記しない限り、「細胞傷害性Ｔリンパ球」、「細胞傷害性Ｔ細胞」、および「ＣＴＬ」という用語は本明細書において互換的に用いられ、特に別段の定めのない限り、非自己細胞（例えば、腫瘍細胞、ウイルス感染細胞）を認識し、そのような細胞の死滅を誘導することができるＴリンパ球の亜群を指す。
【００２７】
特記しない限り、「ＨＬＡ−Ａ２４」という用語は、ＨＬＡ−Ａ２４０２などのサブタイプを含むＨＬＡ−Ａ２４型を指す。
【００２８】
特記しない限り、本明細書で使用する「キット」という用語は、試薬および他の材料の組み合わせに関して用いられる。本明細書では、キットは、マイクロアレイ、チップ、マーカー、などを含むことを企図する。「キット」という用語は、試薬および／または材料の、特定の組み合わせ限定することを意図しない。
【００２９】
特記しない限り、本明細書で使用する技術用語および科学用語はすべて、本発明が属する技術分野の当業者が通常理解している意味と同じ意味を有する。
【００３０】
ＩＩ．ペプチド
ＶＡＮＧＬ１由来のペプチドが、ＣＴＬによって認識される抗原として機能することを実証するために、ＶＡＮＧＬ１（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：３５）由来のペプチドを解析して、それらが、一般的に見られるＨＬＡアリルであるＨＬＡ−Ａ２４によって拘束される抗原エピトープであるかどうかを判定した（Date Y et al., Tissue Antigens 47: 93-101, 1996;Kondo A et al., J Immunol 155: 4307-12, 1995;Kubo RT et al., J Immunol 152: 3913-24, 1994）。ＶＡＮＧＬ１由来のＨＬＡ−Ａ２４結合ペプチドの候補を、ＨＬＡ−Ａ２４に対するそれらの結合親和性の情報を用いて同定した。候補ペプチドは以下のペプチドである：
ＶＡＮＧＬ１−Ａ２４−９−４４３  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：  １）、
ＶＡＮＧＬ１−Ａ２４−９−４１６  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：  ２）、
ＶＡＮＧＬ１−Ａ２４−９−２６４  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：  ３）、
ＶＡＮＧＬ１−Ａ２４−９−１１７  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：  ４）、
ＶＡＮＧＬ１−Ａ２４−９−１２９  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：  ５）、
ＶＡＮＧＬ１−Ａ２４−９−１５２  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：  ６）、
ＶＡＮＧＬ１−Ａ２４−９−３９７  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：  ７）、
ＶＡＮＧＬ１−Ａ２４−９−１８２  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：  ８）、
ＶＡＮＧＬ１−Ａ２４−９−１８４  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：  ９）、
ＶＡＮＧＬ１−Ａ２４−９−２８６  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：  １０）、
ＶＡＮＧＬ１−Ａ２４−９−１０９  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：  １１）、
ＶＡＮＧＬ１−Ａ２４−９−１９５  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：  １２）、
ＶＡＮＧＬ１−Ａ２４−９−４８０  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：  １３）、
ＶＡＮＧＬ１−Ａ２４−９−２１５  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：  １４）、
ＶＡＮＧＬ１−Ａ２４−９−４５７  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：  １５）、
ＶＡＮＧＬ１−Ａ２４−９−２４４  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：  １６）、
ＶＡＮＧＬ１−Ａ２４−９−４１９  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：  １７）、
ＶＡＮＧＬ１−Ａ２４−１０−２３４  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：  １８）、
ＶＡＮＧＬ１−Ａ２４−１０−１０９  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：  １９）、
ＶＡＮＧＬ１−Ａ２４−１０−２２１  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：  ２０）、
ＶＡＮＧＬ１−Ａ２４−１０−１９９  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：  ２１）、
ＶＡＮＧＬ１−Ａ２４−１０−１２３  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：  ２２）、
ＶＡＮＧＬ１−Ａ２４−１０−１９３  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：  ２３）、
ＶＡＮＧＬ１−Ａ２４−１０−２３１  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：  ２４）、
ＶＡＮＧＬ１−Ａ２４−１０−１５２  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：  ２５）、
ＶＡＮＧＬ１−Ａ２４−１０−２８６  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：  ２６）、
ＶＡＮＧＬ１−Ａ２４−１０−５０５  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：  ２７）、
ＶＡＮＧＬ１−Ａ２４−１０−４０７  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：  ２８）、
ＶＡＮＧＬ１−Ａ２４−１０−１８６  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：  ２９）、
ＶＡＮＧＬ１−Ａ２４−１０−４１８  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：  ３０）、
ＶＡＮＧＬ１−Ａ２４−１０−２８９  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：  ３１）、
ＶＡＮＧＬ１−Ａ２４−１０−２１５  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：  ３２）、および
ＶＡＮＧＬ１−Ａ２４−１０−２６３  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：  ３３）。
【００３１】
さらに、これらのペプチドを負荷した樹状細胞（ＤＣ）によってＴ細胞をインビトロで刺激した後、以下のペプチドのそれぞれを用いてＣＴＬの樹立に成功した:
ＶＡＮＧＬ１−Ａ２４−９−４４３  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：  １）、
ＶＡＮＧＬ１−Ａ２４−９−１８２  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：  ８）、
ＶＡＮＧＬ１−Ａ２４−９−１８４  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：  ９）、
ＶＡＮＧＬ１−Ａ２４−９−１０９  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：  １１）、
ＶＡＮＧＬ１−Ａ２４−９−１９５  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：  １２）、
ＶＡＮＧＬ１−Ａ２４−１０−２３４  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：  １８）、
ＶＡＮＧＬ１−Ａ２４−１０−１２３  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：  ２２）、
ＶＡＮＧＬ１−Ａ２４−１０−２３１  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：  ２４）、
ＶＡＮＧＬ１−Ａ２４−１０−１５２  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：  ２５）、
ＶＡＮＧＬ１−Ａ２４−１０−２８６  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：  ２６）、および
ＶＡＮＧＬ１−Ａ２４−１０−２１５  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：  ３２）。
【００３２】
これらの樹立されたＣＴＬは、それぞれのペプチドをパルス刺激した標的細胞に対して強力な特異的ＣＴＬ活性を示した。これらの結果は、ＶＡＮＧＬ１がＣＴＬによって認識される抗原であること、および試験された該ペプチドがＨＬＡ−Ａ２４によって拘束されるＶＡＮＧＬ１のエピトープペプチドであることを実証している。
【００３３】
ＶＡＮＧＬ１遺伝子は、膀胱がん、乳がん、子宮頸がん、胆管細胞癌、子宮内膜症、肝臓がん、ＮＳＣＬＣ、骨肉腫、膵がん、ＳＣＬＣおよびＡＭＬなどのがん細胞で過剰発現され、ほとんどの正常臓器では発現されないため、免疫療法の優れた標的となる。したがって、本発明は、ＣＴＬにより認識されるＶＡＮＧＬ１由来のエピトープのノナペプチド（９個のアミノ酸残基からなるペプチド）およびデカペプチド（１０個のアミノ酸残基からなるペプチド）を提供する。または、本発明は、ＨＬＡ抗原と結合して細胞傷害性Ｔリンパ球（ＣＴＬ）を誘導する単離されたペプチドであって、該ペプチドがＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：３５のアミノ酸配列またはその免疫学的に活性な断片からなるペプチドを提供する。より具体的には、いくつかの態様において、本発明は、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１、８、９、１１、１２、１８、２２、２４、２５、２６および３２からなる群より選択されるアミノ酸配列からなるペプチドを提供する。
【００３４】
一般に、例えばインターネット上などで現在入手可能なソフトウエアプログラム、例えば、Parker KC et al., J Immunol 1994 Jan 1, 152(1): 163-75に記載されたものなどを利用して、さまざまなペプチドとＨＬＡ抗原との間の結合親和性をインシリコで計算することができる。ＨＬＡ抗原との結合親和性は、例えば、Parker KC et al., J Immunol 1994 Jan 1, 152(1): 163-75;およびKuzushima K et al., Blood 2001, 98(6): 1872-81、Larsen MV et al. BMC Bioinformatics. 2007 Oct 31; 8: 424、および Buus S et al. Tissue Antigens., 62:378-84, 2003、に記載された通りに測定することができる。結合親和性を決定するための方法は、例えば、Journal of Immunological Methods, 1995, 185: 181-190； Protein Science, 2000, 9: 1838-1846に記載されている。したがって、このようなソフトウエアプログラムを用いて、ＨＬＡ抗原との高い結合親和性を有する、ＶＡＮＧＬ１に由来する断片を選択することができる。したがって、本発明は、そのような公知のプログラムを用いてＨＬＡ抗原と結合することが明らかにされた、ＶＡＮＧＬ１に由来する任意の断片からなるペプチドを包含する。さらに、そのようなペプチドには、完全長ＶＡＮＧＬ１からなるペプチドも含まれうる。
【００３５】
本発明のペプチドには、ペプチドがそのＣＴＬ誘導能を保っている限り、付加的なアミノ酸残基が隣接していてもよい。付加的なアミノ酸残基は、それらが元のペプチドのＣＴＬ誘導能を損なわない限り、任意の種類のアミノ酸から構成され得る。したがって、本発明は、ＶＡＮＧＬ１に由来するペプチドを含む、ＨＬＡ抗原に対する結合親和性を有するペプチドを包含する。そのようなペプチドは、例えば約４０アミノ酸未満であり、約２０アミノ酸未満であることが多く、通常は約１５アミノ酸未満である。
【００３６】
一般に、ペプチド中の１個または複数のアミノ酸の改変はそのペプチドの機能に影響せず、または場合によっては元のタンパク質の所望の機能を強化することさえあることが知られている。実際に、改変されたペプチド（すなわち、元の参照配列に対して１個、２個または数個のアミノ酸残基を置換または付加することによって改変されたアミノ酸配列で構成されるペプチド）は、元のペプチドの生物活性を保持することが知られている（Mark et al., Proc Natl Acad Sci USA 1984, 81: 5662-6;Zoller and Smith, Nucleic Acids Res 1982, 10: 6487-500; Dalbadie-McFarland et al., Proc Natl Acad Sci USA 1982, 79: 6409-13）。したがって、本発明の１つの態様によれば、本発明のＣＴＬ誘導能を有するペプチドは、１個、２個またはさらにそれ以上のアミノ酸が付加された、および／または置換された、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１、８、９、１１、１２、１８、２２、２４、２５、２６および３２からなる群より選択されるアミノ酸配列からなるペプチドで構成されうる。
【００３７】
当業者は、単一のアミノ酸もしくはわずかな割合のアミノ酸を変更するアミノ酸配列に対する個々の付加または置換が、元のアミノ酸側鎖の特性の保存をもたらすことを認識しているであろう；したがって、それらは「保存的置換」または「保存的改変」と称され、この場合、タンパク質の変化は類似の機能を有するタンパク質をもたらす。機能的に類似したアミノ酸を提示する保存的置換の表は、当技術分野において周知である。アミノ酸側鎖の特性の例には、疎水性アミノ酸（Ａ、Ｉ、Ｌ、Ｍ、Ｆ、Ｐ、Ｗ、Ｙ、Ｖ）、親水性アミノ酸（Ｒ、Ｄ、Ｎ、Ｃ、Ｅ、Ｑ、Ｇ、Ｈ、Ｋ、Ｓ、Ｔ）、ならびに以下の官能基または特徴を共通して有する側鎖がある：脂肪族側鎖（Ｇ、Ａ、Ｖ、Ｌ、Ｉ、Ｐ）；ヒドロキシル基を含む側鎖（Ｓ、Ｔ、Ｙ）；イオウ原子含有側鎖（Ｃ、Ｍ）；カルボン酸およびアミド含有側鎖（Ｄ、Ｎ、Ｅ、Ｑ）；塩基含有側鎖（Ｒ、Ｋ、Ｈ）；ならびに芳香族含有側鎖（Ｈ、Ｆ、Ｙ、Ｗ）。加えて、以下の８つの群はそれぞれ、相互に保存的置換であるアミノ酸を含む：
１）アラニン（Ａ）、グリシン（Ｇ）；
２）アスパラギン酸（Ｄ）、グルタミン酸（Ｅ）；
３）アスパラギン（Ｎ）、グルタミン（Ｑ）；
４）アルギニン（Ｒ）、リジン（Ｋ）；
５）イソロイシン（Ｉ）、ロイシン（Ｌ）、メチオニン（Ｍ）、バリン（Ｖ）；
６）フェニルアラニン（Ｆ）、チロシン（Ｙ）、トリプトファン（Ｗ）；
７）セリン（Ｓ）、トレオニン（Ｔ）；および
８）システイン（Ｃ）、メチオニン（Ｍ）（例えば、Creighton, Proteins (1984)を参照）。
【００３８】
このような保存的改変ペプチドも、本発明のペプチドであるとみなされる。しかし、本発明のペプチドはこれらに限定されず、そのペプチドがＣＴＬ誘導能を保持する限り、非保存的改変を含み得る。さらに、改変ペプチドは、ＶＡＮＧＬ１の多型バリアント、種間相同体、および対立遺伝子のＣＴＬ誘導性ペプチドを、除外しない。必要なＣＴＬ誘導能を保持するためには、少数（例えば、１個、２個もしくは数個）のアミノ酸、またはわずかな割合のアミノ酸を改変することができる。本明細書において、「数個」という用語は、５個またはそれ未満のアミノ酸、例えば、３個またはそれ未満のアミノ酸を意味する。改変させるアミノ酸の割合は、２０％もしくはそれ未満、例えば１５％またはそれ未満、例えば１０％または１〜５％であってよい。
【００３９】
さらに、より高い結合親和性が達成されるように、ペプチドにそのようなアミノ酸残基による置換または付加を行ってもよい。免疫療法に用いられる場合、本発明のペプチドは、ＨＬＡ抗原との複合体として細胞またはエキソソームの表面に提示される。天然に提示されるペプチドの他に、ＨＬＡ抗原への結合によって提示されるペプチドの配列の規則性は既知であることから（J Immunol 1994, 152: 3913;Immunogenetics 1995, 41: 178;J Immunol 1994, 155: 4307）、そのような規則性に基づいた改変を本発明の免疫原性ペプチドに導入してもよい。例えば、高いＨＬＡ−Ａ２４結合親和性を示すペプチドは、Ｎ末端から２番目のアミノ酸がフェニルアラニン、チロシン、メチオニンまたはトリプトファンによって置換されており、かつそのＣ末端のアミノ酸がフェニルアラニン、ロイシン、イソロイシン、トリプトファンまたはメチオニンによって置換されているペプチドも好都合に用いることができる。ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１、８、９、１１、１２、１８、２２、２４、２５、２６および３２からなる群より選択されるアミノ酸配列を有するペプチドであって、前記ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯのアミノ酸配列のＮ末端から２番目のアミノ酸がフェニルアラニン、チロシン、メチオニンもしくはトリプトファンによって置換されている、およびペプチド、および／または前記ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯのアミノ酸配列のＣ末端がフェニルアラニン、ロイシン、イソロイシン、トリプトファンもしくはメチオニンによって置換されているアミノ酸配列を有するペプチドは、本発明に包含される。置換を、末端アミノ酸の箇所だけでなく、ペプチドのＴ細胞受容体（ＴＣＲ）認識にかかわる可能性のある位置に導入することもできる。いくつかの研究により、アミノ酸置換を有するペプチドは元のものと同等であるか、またはそれよりも優れることが実証されており、これには例えばＣＡＰ１、ｐ５３（２６４−２７２）、Ｈｅｒ−２／ｎｅｕ（３６９−３７７）またはｇｐ１００（２０９−２１７）がある（Zaremba et al. Cancer Res. 57, 4570-4577, 1997, T. K. Hoffmann et al. J Immunol. (2002) Feb 1;168(3):1338-47., S. O. Dionne et al. Cancer Immunol immunother. (2003) 52: 199-206およびS. O. Dionne et al. Cancer Immunology, Immunotherapy (2004) 53, 307-314）。
【００４０】
さらに、１個、２個または数個のアミノ酸を本発明のペプチドのＮ末端および／またはＣ末端に付加することもできる。高いＨＬＡ抗原結合親和性を有し、ＣＴＬ誘導能を保持している、そのような改変ペプチドもまた、本発明に含まれる。
【００４１】
しかしながら、ペプチド配列が、異なる機能を有する内因性または外因性のタンパク質のアミノ酸配列の一部と同一である場合、自己免疫障害または特定の物質に対するアレルギー症状などの副作用が誘発される可能性がある。したがって、ペプチドの配列が別のタンパク質のアミノ酸配列と一致する状況を回避するために、利用可能なデータベースを用いて相同性検索を行うことができる。相同性検索から、対象ペプチドと、１つまたは２つのアミノ酸の違いを有するペプチドさえも存在しないことが明らかになった場合には、そのような副作用のいかなる危険も伴わずに、ＨＬＡ抗原とのその結合親和性を増大させるため、および／またはそのＣＴＬ誘導能を増大させるために、対象ペプチドを改変し得る。
【００４２】
上記のようにＨＬＡ抗原に対する高い結合親和性を有するペプチドは、非常に効果的であると予測されるが、指標としての高い結合親和性の存在に従って選択された候補ペプチドを、ＣＴＬ誘導能の存在についてさらに調べる。本明細書において「ＣＴＬ誘導能」という語句は、抗原提示細胞（ＡＰＣ）上に提示された場合に、ＣＴＬを誘導するペプチドの能力を示す。さらに、「ＣＴＬ誘導能」は、ＣＴＬ活性化を誘導する、ＣＴＬ増殖を誘導する、ＣＴＬによる標的細胞の溶解を促進する、およびＣＴＬのＩＦＮ−γ産生を増加させるペプチドの能力を含む。
【００４３】
ＣＴＬ誘導能の確認は、ヒトＭＨＣ抗原を保有するＡＰＣ（例えば、Ｂリンパ球、マクロファージ、および樹状細胞（ＤＣ））、またはより具体的にはヒト末梢血単核白血球由来のＤＣを誘導し、ペプチドによる刺激後にＣＤ８陽性細胞と混合し、その後、標的細胞に対してＣＴＬによって産生および放出されたＩＦＮ−γを測定することにより達成される。反応系として、ヒトＨＬＡ抗原を発現するように作製されたトランスジェニック動物（例えば、BenMohamed L, Krishnan R, Longmate J, Auge C, Low L, Primus J, Diamond DJ, Hum Immunol 2000 Aug, 61(8): 764-79, Related Articles, Books, Linkout Induction of CTL response by a minimal epitope vaccine in HLA A*0201/DR1 transgenic mice: dependence on HLA class II restricted T(H) responseに記載されているもの）を用いることができる。例えば、標的細胞を５１Ｃｒ等で放射標識してもよく、標的細胞から放出された放射能から細胞傷害活性を算出してもよい。あるいは、固定化したペプチドを保有するＡＰＣの存在下で、ＣＴＬによって産生および放出されたＩＦＮ−γを測定し、抗ＩＦＮ−γモノクローナル抗体を用いて培地上の阻止帯を可視化することによって、試験し得る。
【００４４】
上記のようにペプチドのＣＴＬ誘導能を試験した結果、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１、８、９、１１、１２、１８、２２、２４、２５、２６、および３２によって示されるアミノ酸配列からなるペプチドより選択されるノナペプチドまたはデカペプチドが、ＨＬＡ抗原に対する高い結合親和性に加えて、特に高いＣＴＬ誘導能を示すことが判明した。したがって、これらのペプチドは本発明の態様として例示される。
【００４５】
さらに、相同性解析の結果から、これらのペプチドが任意の他の公知のヒト遺伝子産物に由来するペプチドと有意な相同性を有していないことが示された。そのため、免疫療法に用いた場合の未知または望ましくない免疫応答の可能性が低くなる。したがって、この局面からもまた、これらのペプチドはがん患者においてＶＡＮＧＬ１に対する免疫を誘発するのに使用される。よって、本発明のペプチド、好ましくはＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１、８、９、１１、１２、１８、２２、２４、２５、２６、および３２からなる群より選択されるアミノ酸配列からなるペプチド。
【００４６】
上記の本発明のペプチドの改変に加えて、本発明のペプチドを、それらがＣＴＬ誘導能を保持する限り、他のペプチドと連結させることができる。例示的な他のペプチドには、以下のものが含まれる：本発明のペプチド、または他のＴＡＡに由来するＣＴＬ誘導性ペプチド。ペプチド間のリンカーは当技術分野において周知であり、例えば、ＡＡＹ（P. M. Daftarian et al., J Trans Med 2007, 5:26）、ＡＡＡ、ＮＫＲＫ（R. P. M. Sutmuller et al., J Immunol. 2000, 165: 7308-7315）またはK (S. Ota et al., Can Res. 62, 1471-1476, K. S. Kawamura et al., J Immunol. 2002, 168: 5709-5715）がある。
【００４７】
例えば、ＨＬＡクラスＩおよび／またはクラスＩＩを介して免疫応答を増大させるために、ＶＡＮＧＬ１腫瘍関連抗原ペプチド以外のペプチドを実質的に同時に用いることもできる。がん細胞が複数の腫瘍関連遺伝子を発現し得ることは十分に証明されている。当業者が、特定の対象が付加的な腫瘍関連遺伝子を発現するか否かを判定し、続いて、そのような遺伝子の発現産物に由来するＨＬＡクラスＩおよび／またはＨＬＡクラスＩＩ結合ペプチドをＶＡＮＧＬ１組成物またはワクチンの中に含めることは、定型的な実験の範囲にとどまる。
【００４８】
ＨＬＡクラスＩおよびＨＬＡクラスＩＩ結合ペプチドの例は当業者には公知であると考えられ（例えば、Coulie, Stem Cells 13:393-403, 1995を参照）、本明細書中に開示されたものと同様の様式で本発明に用いることができる。当業者は、１つもしくは複数のＶＡＮＧＬ１ペプチド、および非ＶＡＮＧＬ１ペプチドの１つもしくは複数を含むポリペプチド、あるいはそのようなポリペプチドをコードする核酸を、分子生物学の標準的な手順に従って調製することができる。
【００４９】
すなわち、そのような「ポリトープ（ｐｏｌｙｔｏｐｅ）」は、さまざまな配置（例えば、連鎖する、一部重なる）で連結できる、免疫原性または免疫応答刺激性の可能性を有する２つまたはそれ以上のペプチドの群のことである。ポリトープ（またはポリトープをコードする核酸）は、免疫応答を刺激、強化および／または誘発する上でのポリトープの有効性を試験するために、例えば動物に対して、標準的な免疫化プロトコールに従って投与することができる。
【００５０】
ポリトープを形成するために、これらのペプチドを直接、または隣接する配列の使用を介して連結でき、ポリトープのワクチンとしての使用は当技術分野において周知である（例えば、Thomson et al., Proc. Natl. Acad. Sci USA 92(13):5845-5849, 1995；Gilbert et al., Nature Biotechnol. 15(12):1280-1284, 1997；Thomson et al., J Immunol. 157(2):822-826, 1996；Tarn et al., J Exp. Med. 171(l):299-306, 1990を参照）。エピトープのさまざまな数および組み合わせを含むポリトープを調製し、ＣＴＬによる認識、および免疫応答を増大させる上での有効性に関して試験することができる。
【００５１】
さらに、本発明のペプチドを、それらがＣＴＬ誘導性を保持する限り、他の物質とさらに連結させることもできる。そのような物質は、以下を含み得る：ペプチド、脂質、糖および糖鎖、アセチル基、天然および合成ポリマーなど。ペプチドは、修飾が本明細書に記載されたペプチドの生物活性を損なわない限り、グリコシル化、側鎖酸化またはリン酸化などの改変を含んでもよい。これらの種類の修飾は、付加的な機能（例えば、標的化機能および送達機能）を付与するため、またはポリペプチドを安定化するために行い得る。
【００５２】
例えば、ポリペプチドのインビボ安定性を高めるために、Ｄ−アミノ酸、アミノ酸模倣体または非天然アミノ酸を導入することが当技術分野では公知である；この概念を本ポリペプチドに適合させることもできる。ポリペプチドの安定性は多くの方法でアッセイすることができる。例えば、ペプチダーゼ、ならびにヒト血漿および血清などのさまざまな生体媒質を用いて、安定性を試験することができる（例えば、Verhoef et al., Eur J Drug Metab Pharmacokin 1986, 11: 291-302を参照）。
【００５３】
その上、上述したように、１個、２個または数個のアミノ酸残基が、置換されている、欠失している、または付加されている、改変されたペプチドの中から、元のペプチドと比較して同じまたはより高い活性を有するものをスクリーニングまたは選択することができる。本発明はしたがって、元と比較して同じまたはより高い活性を有する改変されたペプチドをスクリーニングまたは選択する方法も提供する。例えば、本方法は以下の段階を含み得る：
ａ：本発明のペプチドの少なくとも１つのアミノ酸残基の置換、欠失または付加を行う段階；
ｂ：前記ペプチドの活性を決定する段階；および
ｃ：元と比較して同じまたはより高い活性を有するペプチドを選択する段階。
【００５４】
本明細書において、前記活性には、ＭＨＣ結合活性、ＡＰＣまたはＣＴＬ誘導能、および細胞傷害活性が含まれうる。
【００５５】
本明細書において、本発明のペプチドは「ＶＡＮＧＬ１ペプチド」または「ＶＡＮＧＬ１ポリペプチド」と記述されることもある。
【００５６】
ＩＩＩ．ＶＡＮＧＬ１ペプチドの調製
本発明のペプチドは、周知の手法を用いて調製することができる。例えば、組換えＤＮＡ技術または化学合成によって、ペプチドを合成的に調製してもよい。本発明のペプチドは、個々に、または２つもしくはそれ以上のペプチドを含む、より長いペプチドとして合成することができる。ペプチドを単離してもよく、すなわち、他の天然の宿主細胞タンパク質およびそれらの断片、あるいは任意の他の化学物質を実質的に含まないように精製または単離することができる。
【００５７】
本発明のペプチドは、修飾が本明細書に記載されたペプチドの生物活性を損なわない限り、グリコシル化、側鎖酸化またはリン酸化などの修飾を含んでもよい。他の修飾には、例えば、ペプチドの血清中半減期を延長させるために用いることのできる、Ｄ−アミノ酸または他のアミノ酸模倣体の組み込みが含まれる。
【００５８】
選択されたアミノ酸配列に基づいた化学合成によって、本発明のペプチドを得てもよい。例えば、この合成に採用し得る従来のペプチド合成法には、以下のものが含まれる：
(i)Peptide Synthesis, Interscience, New York, 1966;
(ii)The Proteins, Vol. 2, Academic Press, New York, 1976;
(iii)Peptide Synthesis（日本語）， Maruzen Co., 1975;
(iv)Basics and Experiment of Peptide Synthesis（日本語）, Maruzen Co., 1985;
(v)Development of Pharmaceuticals (second volume)（日本語）, Vol. 14 (peptide synthesis), Hirokawa, 1991;
(vi)ＷＯ９９／６７２８８;および
(vii)Barany G. & Merrifield R.B., Peptides Vol. 2, 「Solid Phase Peptide Synthesis」, Academic Press, New York, 1980, 100-118。
【００５９】
あるいは、ペプチドを作製するための任意の公知の遺伝子工学的方法（例えば、Morrison J, J Bacteriology 1977, 132: 349-51;Clark-Curtiss & Curtiss, Methods in Enzymology (eds. Wu et al.) 1983, 101: 347-62）を採用して、本発明のペプチドを得てもよい。例えば、最初に、発現可能な形態で（例えば、プロモーター配列に相当する調節配列の下流に）目的のペプチドをコードするポリヌクレオチドを有する適切なベクターを調製し、適切な宿主細胞に入れて形質転換する。このようなベクターおよび宿主細胞もまた、本発明によって提供される。次いで、該宿主細胞を培養して、関心対象のペプチドを産生させる。インビトロ翻訳系を採用して、ペプチドをインビトロで作製してもよい。
【００６０】
ＩＶ．ポリヌクレオチド
本発明は、前述の本発明のペプチドをコードする任意のポリヌクレオチドを提供する。これらは、天然のＶＡＮＧＬ１遺伝子（ＧｅｎＢａｎｋアクセッション番号ＡＢ０５７５９６、（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：３４））由来のポリヌクレオチド、およびその保存的に改変されたヌクレオチド配列を有するポリヌクレオチドを含む。本明細書において「保存的に改変されたヌクレオチド配列」という語句は、同一のまたは本質的に同一のアミノ酸配列をコードする配列を指す。遺伝暗号の縮重のため、数多くの機能的に同一な核酸が任意の特定のタンパク質をコードする。例えば、コドンＧＣＡ、ＧＣＣ、ＧＣＧ、およびＧＣＵはすべて、アミノ酸のアラニンをコードする。したがって、あるコドンによってアラニンが指定されるあらゆる位置において、コードされるポリペプチドを変化させることなく、該コドンを記載された対応するコドンのいずれかに変更し得る。このような核酸の変異は「サイレント変異」であり、保存的に改変された変異の一種である。ペプチドをコードする本明細書中のあらゆる核酸配列は、該核酸の可能性のあるあらゆるサイレント変異をも表す。核酸中の各コドン（通常メチオニンに対する唯一のコドンであるＡＵＧ、および通常トリプトファンに対する唯一のコドンであるＴＧＧを除く）を改変して、機能的に同一な分子を得ることができることを、当業者は認識するであろう。したがって、ペプチドをコードする核酸の各サイレント変異は、公開した各配列において非明示的に記載されている。
【００６１】
本発明のポリヌクレオチドは、ＤＮＡ、ＲＮＡ、およびそれらの誘導体から構成されてもよい。当業者には周知の通り、ＤＮＡ分子は、天然の塩基Ａ、Ｔ、Ｃ、およびＧなどの塩基から構成され、ＲＮＡではＴはＵに置き換えられる。当業者は、非天然の塩基もまたポリヌクレオチドに含まれることを認識するであろう。
【００６２】
本発明のポリヌクレオチドは、介在するアミノ酸配列を伴って、または伴わずに、本発明の複数のペプチドをコードし得る。例えば、介在するアミノ酸配列は、ポリヌクレオチドまたは翻訳されたペプチドの切断部位（例えば、酵素認識配列）を提供し得る。さらに、ポリヌクレオチドは、本発明のペプチドをコードするコード配列に対する任意の付加的配列を含み得る。例えば、ポリヌクレオチドは、ペプチドの発現に必要な調節配列を含む組換えポリヌクレオチドであってよく、またはマーカー遺伝子等を有する発現ベクター（プラスミド）であってもよい。一般に、例えばポリメラーゼおよびエンドヌクレアーゼを用いる従来の組換え技術によりポリヌクレオチドを操作することによって、そのような組換えポリヌクレオチドを調製してもよい。
【００６３】
組換え技術および化学合成技術の両方を用いて、本発明のポリヌクレオチドを作製してもよい。例えば、適切なベクター内に挿入することによってポリヌクレオチドを作製してもよく、これはコンピテント細胞にトランスフェクトした場合に発現され得る。あるいは、ＰＣＲ技術または適切な宿主内での発現を用いて、ポリヌクレオチドを増幅してもよい（例えば、Sambrook et al., Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory, New York, 1989を参照されたい）。あるいは、Beaucage SL & Iyer RP, Tetrahedron 1992, 48: 2223-311;Matthes et al., EMBO J 1984, 3: 801-5に記載されているような固相技術を用いて、ポリヌクレオチドを合成し得る。
【００６４】
Ｖ．エキソソーム
本発明は、本発明のペプチドとＨＬＡ抗原との間で形成された複合体を自身の表面上に提示する、エキソソームと称される細胞内小胞をさらに提供する。エキソソームは、例えば公表特許公報  特表平１１−５１０５０７号およびＷＯ９９／０３４９９に詳述されている方法を用いることによって調製してもよく、治療および／または予防の対象となる患者から得られたＡＰＣを用いて調製してもよい。本発明のエキソソームは、本発明のペプチドと同様に、ワクチンとして接種してもよい。
【００６５】
前記複合体中に含まれるＨＬＡ抗原の型は、治療および／または予防を必要とする対象のものと一致しなければならない。例えば日本人では、ＨＬＡ−Ａ２４、特にＨＬＡ−Ａ２４０２がよく見られる。日本人および白人の間で高発現するＡ２４型の使用は、有効な結果を得るのに好ましく、かつＡ２４０２などの亜型も使用される。典型的には、臨床では、治療を必要とする患者のＨＬＡ抗原の型が予め調べられ、これにより、この抗原に対して高レベルの結合親和性を有する、または抗原提示によるＣＴＬ誘導能を有するペプチドの適切な選択が可能となる。さらに、高い結合親和性およびＣＴＬ誘導能を示すペプチドを取得するために、天然のＶＡＮＧＬ１の部分ペプチドのアミノ酸配列に基づいて、１個、２個、または数個のアミノ酸の置換、欠失または付加を行ってもよい。
【００６６】
本発明のエキソソームに対してＡ２４型ＨＬＡ抗原を用いる場合には、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１、８、９、１１、１２、１８、２２、２４、２５、２６、および３２の配列を含むペプチドが使用される。
【００６７】
ＶＩ．抗原提示細胞（ＡＰＣ）
本発明はまた、ＨＬＡ抗原と本発明のペプチドとの間に形成された複合体をその表面上に提示する単離されたＡＰＣを提供する。ＡＰＣは、治療および／または予防の対象となる患者に由来してもよく、単独で、または本発明のペプチド、エキソソーム、もしくはＣＴＬを含む他の薬物と併用して、ワクチンとして投与してもよい。
【００６８】
前記ＡＰＣは特定の種類の細胞に限定されず、これには、リンパ球によって認識されるように自身の細胞表面上にタンパク質性抗原を提示することが知られているＤＣ、ランゲルハンス細胞、マクロファージ、Ｂ細胞、および活性化Ｔ細胞が含まれる。ＤＣは、ＡＰＣの中で最も強力なＣＴＬ誘導作用を有する代表的なＡＰＣであるため、ＤＣは本発明のＡＰＣとして使用される。
【００６９】
例えば、本発明のＡＰＣは、末梢血単球からＤＣを誘導し、次にそれらをインビトロ、エクスビボ、またはインビボで本発明のペプチドと接触させる（で刺激する）ことによって得てもよい。本発明のペプチドを対象に投与した場合、本発明のペプチドを提示するＡＰＣが対象の体内で誘導される。したがって、本発明のＡＰＣは、本発明のペプチドを対象に投与した後、該対象からＡＰＣを回収することによって得てもよい。あるいは、本発明のＡＰＣは、対象から回収されたＡＰＣを本発明のペプチドと接触させることによって得てもよい。
【００７０】
対象においてがんに対する免疫応答を誘導するために、本発明のＡＰＣ自体、または本発明のペプチド、エキソソーム、もしくはＣＴＬを含む他の薬物と併用して対象に投与してもよい。例えば、エクスビボ投与は以下の段階を含み得る：
ａ：第１の対象からＡＰＣを回収する段階、
ｂ：段階ａのＡＰＣをペプチドと接触させる段階、および
ｃ：段階ｂのＡＰＣを第２の対象に投与する段階。
【００７１】
第１の対象と第２の対象は同一の個体であってもよく、または異なる個体であってもよい。段階ｂによって得られたＡＰＣは、膀胱がん、乳がん、子宮頸がん、胆管細胞癌、子宮内膜症、肝がん、ＮＳＣＬＣ、骨肉腫、膵がん、ＳＣＬＣ、およびＡＭＬなどのがんを治療および／または予防するためのワクチンでありうる。
【００７２】
本発明の１つの局面によると、ＡＰＣは高レベルのＣＴＬ誘導能を有する。「高レベルのＣＴＬ誘導能」という用語における高レベルとは、ペプチドと接触させていないＡＰＣ、またはＣＴＬを誘導し得ないペプチドと接触させたＡＰＣによるＣＴＬ誘導能のレベルと比較したものである。高レベルのＣＴＬ誘導能を有するそのようなＡＰＣは、上記の方法に加え、本発明のペプチドをコードするポリヌクレオチドをインビトロでＡＰＣに導入する段階を含む方法によって調製することができる。導入する遺伝子は、ＤＮＡまたはＲＮＡの形態であってよい。導入の方法の例には、特に制限なく、リポフェクション、エレクトロポレーション、およびリン酸カルシウム法などの、当分野において従来より行われる種々の方法を使用し得る。より具体的には、Cancer Res 1996, 56: 5672-7;J Immunol 1998, 161: 5607-13;J Exp Med 1996, 184: 465-72；公表特許公報特表２０００−５０９２８１号に記載されているように、それを実行し得る。遺伝子をＡＰＣに導入することによって、該遺伝子は細胞内で転写、翻訳等を受け、次いで、得られたタンパク質はＭＨＣクラスＩまたはクラスＩＩによってプロセシングされ、提示経路を経て本発明の部分ペプチドが提示される。
【００７３】
ＶＩＩ．細胞傷害性Ｔリンパ球（ＣＴＬ）
本発明のペプチドのいずれかに対して誘導されたＣＴＬは、インビボでがん細胞を標的とする免疫応答を強化させるため、ペプチド自体と同様にワクチンとして用いてもよい。したがって本発明は、本発明のペプチドのいずれかによって特異的に誘導または活性化された、単離されたＣＴＬを提供する。
【００７４】
そのようなＣＴＬは、（１）本発明のペプチドを対象に投与すること、または（２）対象由来のＡＰＣおよびＣＤ８陽性細胞もしくは末梢血単核白血球をインビトロで本発明のペプチドと接触させる（で刺激する）こと、または（３）ＣＤ８陽性細胞もしくは末梢血単核白血球を、ＨＬＡ抗原とペプチドとの複合体をその表面上に提示するＡＰＣもしくはエキソソームとインビトロで接触させること、または（４）本発明のペプチドに結合するＴ細胞受容体（ＴＣＲ）サブユニットをコードするポリヌクレオチドを含む遺伝子を導入することによって得てもよい。このようなＡＰＣまたはエキソソームは上記の方法によって調製してもよく、（４）の詳細な方法は以下の「ＶＩＩＩ．Ｔ細胞受容体（ＴＣＲ）」の章において記載する。
【００７５】
本発明のＣＴＬは、治療および／または予防の対象となる患者に由来してもよく、単独で、または効果を調節する目的で本発明のペプチドもしくはエキソソームを含む他の薬物と併用して投与してもよい。得られたＣＴＬは、本発明のペプチド、例えば誘導に用いた同一のペプチドを提示する標的細胞に対して特異的に作用する。標的細胞は、がん細胞のようにＶＡＮＧＬ１を内因的に発現する細胞、またはＶＡＮＧＬ１遺伝子をトランスフェクトした細胞であってよく、本発明のペプチドによる刺激によって該ペプチドを細胞表面上に提示する細胞もまた、活性化されたＣＴＬの攻撃の標的となり得る。
【００７６】
ＶＩＩＩ．Ｔ細胞受容体（ＴＣＲ）
本発明はまた、Ｔ細胞受容体（ＴＣＲ）のサブユニットを形成し得るポリペプチドをコードする核酸を含む組成物、およびそれを使用する方法を提供する。ＴＣＲサブユニットは、ＶＡＮＧＬ１を提示する腫瘍細胞に対する特異性をＴ細胞に付与するＴＣＲを形成する能力を有する。当該技術分野における公知の方法を用いることにより、本発明の１種または複数種のペプチドで誘導されたＣＴＬのＴＣＲサブユニットとしての、α鎖およびβ鎖の核酸を同定し得る（ＷＯ２００７／０３２２５５、およびMorgan et al., J Immunol, 171, 3288 (2003)）。例えば、ＴＣＲを解析するためには、ＰＣＲ法が好ましい。解析のためのＰＣＲプライマーは、例えば、５'側プライマーとしての５'−Ｒプライマー（５'−ｇｔｃｔａｃｃａｇｇｃａｔｔｃｇｃｔｔｃａｔ−３'）（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：３６）、および３'側プライマーとしての、ＴＣＲα鎖Ｃ領域に特異的な３−ＴＲａ−Ｃプライマー（５'−ｔｃａｇｃｔｇｇａｃｃａｃａｇｃｃｇｃａｇｃｇｔ−３'）（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：３７）、ＴＣＲβ鎖Ｃ１領域に特異的な３−ＴＲｂ−Ｃ１プライマー（５'−ｔｃａｇａａａｔｃｃｔｔｔｃｔｃｔｔｇａｃ−３'）（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：３８）、またはＴＣＲβ鎖Ｃ２領域に特異的な３−ＴＲβ−Ｃ２プライマー（５'−ｃｔａｇｃｃｔｃｔｇｇａａｔｃｃｔｔｔｃｔｃｔｔ−３'）（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：３９）でありうるが、これらに限定されない。ＴＣＲ誘導体は、ＶＡＮＧＬ１ペプチドを提示する標的細胞と高い結合力で結合することができ、かつ任意で、ＶＡＮＧＬ１ペプチドを提示する標的細胞の効率的な殺傷をインビボおよびインビトロで媒介し得る。
【００７７】
ＴＣＲサブユニットをコードする核酸を、適切なベクター、例えばレトロウイルスベクターに組み込んでもよい。これらのベクターは、当該技術分野において周知である。該核酸またはそれらを有用に含むベクターを、Ｔ細胞、例えば患者由来のＴ細胞に導入し得る。有利には、本発明は、患者自身のＴ細胞（または別の哺乳動物のＴ細胞）の迅速な改変を可能にして、優れたがん細胞殺傷特性を有する改変Ｔ細胞を迅速かつ容易に作製する、容易に入手可能な組成物を提供する。
【００７８】
特異的ＴＣＲは、本発明のペプチドとＨＬＡ分子との複合体を特異的に認識し、そのＴＣＲがＴ細胞の表面にある場合に標的細胞に対するＴ細胞特異的活性をもたらすことのできる受容体である。上記の複合体の特異的認識は任意の公知の方法によって確認することができ、好ましい方法には、例えば、ＨＬＡ分子および本発明のペプチドを用いる四量体分析、ならびにＥＬＩＳＰＯＴアッセイが含まれる。ＥＬＩＳＰＯＴアッセイを行うことにより、ＴＣＲを細胞表面に発現しているＴ細胞がＴＣＲによって細胞を認識すること、およびシグナルが細胞内に伝達されることを確認することができる。該複合体がＴ細胞表面に存在する場合に上述した複合体がＴ細胞性細胞傷害活性をもたらすことの確認を、公知の方法によって行うこともできる。好ましい方法には、例えば、クロム放出アッセイのような、ＨＬＡ陽性標的細胞に対する細胞傷害活性の決定が含まれる。
【００７９】
また、本発明は、ＨＬＡ−Ａ２４との関連で、ＶＡＮＧＬ１ペプチド、例えばＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１、８、９、１１、１２、１８、２２、２４、２５、２６および３２などと結合するＴＣＲサブユニットポリペプチドをコードする核酸による形質導入によって調製されるＣＴＬも提供する。形質導入されたＣＴＬはインビボでがん細胞にホーミングすることができ、これは周知のインビトロ培養方法によって増殖させることができる（例えば、Kawakami et al., J Immunol., 142, 3452-3461 (1989)を参照）。本発明のＣＴＬは、治療または防御を必要とする患者におけるがんの治療または予防において有用な免疫原性組成物を形成するために用いることができる（WO2006／031221号）。
【００８０】
予防（ｐｒｅｖｅｎｔｉｏｎおよびｐｒｏｐｈｙｌａｘｉｓ）は、疾患による死亡率または罹患率の負荷を軽減する任意の行為を含む。予防（ｐｒｅｖｅｎｔｉｏｎおよびｐｒｏｐｈｙｌａｘｉｓ）は、「第一次、第二次、および第三次の予防レベルで」行われ得る。第一次の予防（ｐｒｅｖｅｎｔｉｏｎおよびｐｒｏｐｈｙｌａｘｉｓ）が疾患の発生を回避するのに対し、第二次および第三次レベルの予防（ｐｒｅｖｅｎｔｉｏｎおよびｐｒｏｐｈｙｌａｘｉｓ）は、疾患の進行および症状の出現を予防（ｐｒｅｖｅｎｔｉｏｎおよびｐｒｏｐｈｙｌａｘｉｓ）することに加え、機能を回復させ、かつ疾患関連の合併症を軽減することによって、既存の疾患の悪影響を軽減することを目的とした行為を包含する。あるいは、予防（ｐｒｅｖｅｎｔｉｏｎおよびｐｒｏｐｈｙｌａｘｉｓ）は、特定の障害の重症度を軽減すること、例えば腫瘍の増殖および転移を減少させること、血管新生を軽減することを目的とした広範囲の予防的治療を含む。
【００８１】
がんの治療および／もしくは予防、ならびに／またはその術後再発の予防は、以下の、がん細胞の外科的切除、がん性細胞の増殖の阻害、腫瘍の退行または退縮、寛解誘導およびがんの発生の抑制、腫瘍退縮、ならびに転移の低減または阻害などの段階のいずれかを含む。がんの効果的な治療および／または予防は、死亡率を減少させ、がんを有する個体の予後を改善し、血中の腫瘍マーカーのレベルを低下させ、かつがんに伴う検出可能な症状を緩和する。例えば、症状の軽減または改善は効果的な治療を構成し、および／または予防は１０％、２０％、３０％、もしくはそれ以上の、軽減もしくは安定した疾患を含む。
【００８２】
ＩＸ．薬学的な物質または組成物
予防（ｐｒｅｖｅｎｔｉｏｎおよびｐｒｏｐｈｙｌａｘｉｓ）は、疾患による死亡率または罹患率の負荷を軽減する任意の行為を含む。予防（ｐｒｅｖｅｎｔｉｏｎおよびｐｒｏｐｈｙｌａｘｉｓ）は、「第一次、第二次、および第三次の予防レベルで」行われ得る。第一次の予防（ｐｒｅｖｅｎｔｉｏｎおよびｐｒｏｐｈｙｌａｘｉｓ）が疾患の発生を回避するのに対し、第二次および第三次レベルの予防（ｐｒｅｖｅｎｔｉｏｎおよびｐｒｏｐｈｙｌａｘｉｓ）は、疾患の進行および症状の出現を予防（ｐｒｅｖｅｎｔｉｏｎおよびｐｒｏｐｈｙｌａｘｉｓ）することに加え、機能を回復させ、かつ疾患関連の合併症を軽減することによって、既存の疾患の悪影響を軽減することを目的とした行為を包含する。あるいは、予防（ｐｒｅｖｅｎｔｉｏｎおよびｐｒｏｐｈｙｌａｘｉｓ）は、特定の障害の重症度を軽減すること、例えば腫瘍の増殖および転移を減少させること、血管新生を軽減することを目的とした広範囲の予防的治療を含む。
【００８３】
がんの治療および／もしくは予防、ならびに／またはその術後再発の予防は、以下の、がん細胞の外科的切除、がん性細胞の増殖の阻害、腫瘍の退行または退縮、寛解誘導およびがんの発生の抑制、腫瘍退縮、ならびに転移の低減または阻害などの段階のいずれかを含む。がんの効果的な治療および／または予防は、死亡率を減少させ、がんを有する個体の予後を改善し、血中の腫瘍マーカーのレベルを低下させ、かつがんに伴う検出可能な症状を緩和する。例えば、症状の軽減または改善は効果的な治療を構成し、および／または予防は１０％、２０％、３０％、もしくはそれ以上の、軽減もしくは安定した疾患を含む。
【００８４】
ＶＡＮＧＬ１の発現は、正常組織と比較して、膀胱がん、乳がん、子宮頸がん、胆管細胞癌、子宮内膜症、肝がん、ＮＳＣＬＣ、骨肉腫、膵がん、ＳＣＬＣ、およびＡＭＬなどのがんにおいて特異的に上昇するため、本発明のペプチドまたはポリヌクレオチドを、がんの治療および／もしくは予防、ならびに／またはその術後再発の予防に用いてもよい。したがって本発明は、がんの治療および／もしくは予防、ならびに／またはその術後再発の予防のための、本発明のペプチドまたはポリヌクレオチドの１種または複数種を有効成分として含む薬学的な物質または組成物を提供する。あるいは、薬学的な物質または組成物として用いるために、本発明のペプチドを、前述のエキソソームまたはＡＰＣなどの細胞のいずれかの表面上に発現させてもよい。加えて、本発明のペプチドのいずれかを標的とする前述のＣＴＬもまた、本発明の薬学的な物質または組成物の有効成分として用いてもよい。
【００８５】
別の態様において、本発明はまた、がんまたは腫瘍を治療または予防するための薬学的な組成物または物質の製造における、以下の中より選択される有効成分の使用を提供する：
（ａ）本発明のペプチド；
（ｂ）本明細書に開示するようなペプチドを発現可能な形態でコードする核酸；
（ｃ）本発明のペプチドをその表面上に提示するＡＰＣまたはエキソソーム；および
（ｄ）本発明の細胞傷害性Ｔ細胞。
【００８６】
あるいは、本発明はさらに、がんまたは腫瘍の治療または予防において用いるための、以下の中より選択される有効成分を提供する：
（ａ）本発明のペプチド；
（ｂ）本明細書に開示するようなペプチドを発現可能な形態でコードする核酸；
（ｃ）本発明のペプチドをその表面上に提示するＡＰＣまたはエキソソーム；および
（ｄ）本発明の細胞傷害性Ｔ細胞。
【００８７】
あるいは、本発明はさらに、がんまたは腫瘍を治療または予防するための薬学的な組成物または物質を製造するための方法またはプロセスであって、有効成分としての、以下の中より選択される有効成分と共に薬学的にまたは生理学的に許容される担体を製剤化する段階を含む方法またはプロセスを提供する：
（ａ）本発明のペプチド；
（ｂ）本明細書に開示するようなペプチドを発現可能な形態でコードする核酸；
（ｃ）本発明のペプチドをその表面上に提示するＡＰＣまたはエキソソーム；および
（ｄ）本発明の細胞傷害性Ｔ細胞。
【００８８】
別の態様において、本発明はまた、有効成分を薬学的にまたは生理学的に許容される担体と混合する段階を含む、がんまたは腫瘍を治療または予防するための薬学的な組成物または物質を製造するための方法またはプロセスであって、この有効成分が以下の中より選択される方法またはプロセスを提供する：
（ａ）本発明のペプチド；
（ｂ）本明細書に開示するようなペプチドを発現可能な形態でコードする核酸；
（ｃ）本発明のペプチドをその表面上に提示するＡＰＣまたはエキソソーム；および
（ｄ）本発明の細胞傷害性Ｔ細胞。
【００８９】
本発明の薬学的な物質または組成物は、ワクチンとして使用される。本発明において、「ワクチン」（免疫原性組成物とも称される）という語句は、動物に接種した際に、抗腫瘍免疫を誘導する機能を有する物質を指す。
【００９０】
本発明の薬学的な物質または組成物は、ヒト、ならびに非限定的にマウス、ラット、モルモット、ウサギ、ネコ、イヌ、ヒツジ、ヤギ、ブタ、ウシ、ウマ、サル、ヒヒ、およびチンパンジー、特に商業的に重要な動物または家畜を含む任意の他の哺乳動物を含む対象または患者において、がんを治療および／もしくは予防する、ならびに／またはその術後再発を予防するために用いてもよい。
【００９１】
本発明により、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１、８、９、１１、１２、１８、２２、２４、２５、２６および３２のアミノ酸配列を含むペプチドは、強力かつ特異的な免疫応答を誘導し得るＨＬＡ−Ａ２４拘束性エピトープペプチドまたはその候補であることが判明した。したがって、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１、８、９、１１、１２、１８、２２、２４、２５、２６および３２のアミノ酸配列を有するこれらのペプチドのいずれかを含む本発明の薬学的な物質または組成物は、ＨＬＡ抗原がＨＬＡ−Ａ２４である対象に投与するのに特に適している。同じことが、これらのペプチドのいずれかをコードするポリヌクレオチド（すなわち、本発明のポリヌクレオチド）を含む薬学的な物質または組成物にも当てはまる。
【００９２】
本発明の薬学的な物質または組成物によって治療すべきがんは限定されず、これには、例えば膀胱がん、乳がん、子宮頸がん、胆管細胞癌、子宮内膜症、肝がん、ＮＳＣＬＣ、骨肉腫、膵がん、ＳＣＬＣおよびＡＭＬを含む、ＶＡＮＧＬ１が関与する（例えば、過剰発現している）任意のがんが含まれる。
【００９３】
本薬学的な物質または組成物は、前述の有効成分に加えて、がん性細胞に対するＣＴＬを誘導する能力を有するその他のペプチド、該その他のペプチドをコードするその他のポリヌクレオチド、該その他のペプチドを提示するその他の細胞等を含み得る。本明細書において、がん性細胞に対するＣＴＬを誘導する能力を有するその他のペプチドは、がん特異的抗原（例えば、同定されたＴＡＡ）によって例示されるが、これに限定されない。
【００９４】
必要に応じて、本発明の薬学的な物質または組成物は、例えば本発明のペプチドのいずれかといった有効成分の抗腫瘍効果をその他の治療物質が阻害しない限り、有効成分として該治療物質を任意に含み得る。例えば、製剤は、抗炎症物質または組成物、鎮痛剤、化学療法剤等を含み得る。医薬自体に他の治療物質を含めることに加えて、本発明の医薬を、１つまたは複数の他の薬理学的な物質または組成物と連続してまたは同時に投与してもよい。医薬および薬理学的な物質または組成物の量は、例えば、使用される薬理学的な物質または組成物の種類、治療する疾患、ならびに投与のスケジュールおよび投与経路に依存する。
【００９５】
本明細書において特に言及される成分に加えて、本発明の薬学的な物質または組成物は、当該製剤の種類を考慮して、当技術分野において慣例的な他の物質または組成物も含み得ることが理解されるべきである。
【００９６】
本発明の１つの態様において、本薬学的な物質または組成物を、例えばがんのような治療されるべき疾患の病態を治療するのに有用な材料を含む製品およびキットに含めてもよい。該製品は、ラベルを有する本薬学的な物質または組成物のいずれかの容器を含み得る。適切な容器には、ボトル、バイアル、および試験管が含まれる。該容器は、ガラスまたはプラスチックなどのさまざまな材料から形成され得る。容器上のラベルには、物質または組成物が、疾患の１つまたは複数の状態の治療または予防のために用いられることが示されるべきである。ラベルはまた、投与等に関する指示も示し得る。
【００９７】
上記の容器に加えて、本発明の薬学的な物質または組成物を含むキットは、任意で、薬学的に許容される希釈剤を収容した第２の容器をさらに含み得る。それは、使用のための指示書と共に、他の緩衝液、希釈剤、フィルター、注射針、シリンジ、および添付文書を含む、商業上および使用者の立場から見て望ましい他の材料をさらに含み得る。
【００９８】
必要に応じて、有効成分を含む１つまたは複数の単位剤形を含み得るパックまたはディスペンサー装置にて、薬学的な組成物を提供することができる。該パックは、例えば、ブリスターパックのように金属またはプラスチックホイルを含み得る。パックまたはディスペンサー装置には、投与に関する指示書が添付され得る。
【００９９】
（１）有効成分としてペプチドを含む薬学的な物質または組成物
本発明のペプチドは、薬学的な物質もしくは組成物として直接投与することができ、または必要であれば、従来の製剤方法によって製剤化される。後者の場合、本発明のペプチドに加えて、薬物に通常用いられる担体、賦形剤等が特に制限なく適宜含まれ得る。そのような担体の例は、滅菌水、生理食塩水、リン酸緩衝液、培養液等である。さらに、薬学的な物質または組成物は、必要に応じて、安定剤、懸濁液、保存剤、界面活性剤等を含み得る。本発明の薬学的な物質または組成物は、抗がん目的に用いることができる。
【０１００】
インビボでＣＴＬを誘導するために、本発明のペプチドを、本発明のペプチドの２種以上を含む組み合わせとして調製することができる。ペプチドはカクテルであってよく、または標準的な技術を用いて互いにコンジュゲートしてもよい。例えば、該ペプチドを化学的に結合させても、または1個もしくは数個のアミノ酸をリンカーとして有し得る、単一の融合ポリペプチド配列として発現させてもよい（例えば、リジンリンカー：K. S. Kawamura et al. J. Immunol. 2002, 168: 5709-5715）。組み合わせにおけるペプチドは、同一であっても異なっていてもよい。本発明のペプチドを投与することによって、該ペプチドはＨＬＡ抗原によってＡＰＣ上に高密度で提示され、次いで、提示されたペプチドと該ＨＬＡ抗原との間に形成された複合体に対して特異的に反応するＣＴＬが誘導される。あるいは、ＡＰＣ（例えば、ＤＣ）を対象から取り出し、続いて本発明のペプチドによって刺激して、本発明のペプチドのいずれかをそれらの細胞表面に提示するＡＰＣを得る。これらのＡＰＣを対象に再び投与し、対象においてＣＴＬを誘導させ、その結果として、腫瘍関連内皮に対する攻撃性を高めることもできる。
【０１０１】
有効成分として本発明のペプチドを含む、がんの治療および／または予防のための薬学的な物質または組成物は、細胞性免疫が効率よく確立されるようにアジュバントを含むことができ、または他の有効成分と共に投与することができ、かつ顆粒内への製剤化によって投与されうる。アジュバントとは、免疫学的活性を有するタンパク質と共に（または連続して）投与した場合に、該タンパク質に対する免疫応答を増強させる化合物を指す。適用し得るアジュバントには、文献（Clin Microbiol Rev 1994, 7: 277-89）に記載されているものが含まれる。アジュバントの例には、リン酸アルミニウム、水酸化アルミニウム、ミョウバン、コレラ毒素、サルモネラ毒素、不完全フロイントアジュバント（ＩＦＡ）、完全フロイントアジュバント（ＣＦＡ）、ＩＳＣＯＭａｔｒｉｘ、ＧＭ−ＣＳＦ、ＣｐＧ、水中油型エマルション等が含まれるが、これらに限定されない。
【０１０２】
さらに、リポソーム製剤、直径数マイクロメートルのビーズにペプチドが結合している顆粒製剤、およびペプチドに脂質が結合している製剤が好都合に用いられ得る。
【０１０３】
本発明の別の態様において、本発明のペプチドは、薬学的に許容される塩の形態で投与してもよい。塩の好ましい例には、アルカリ金属との塩、金属との塩、有機塩基との塩、有機酸との塩、および無機酸との塩が含まれる。
【０１０４】
いくつかの態様において、本発明の薬学的な物質または組成物は、ＣＴＬを刺激する（ｐｒｉｍｅ）成分を含む。脂質は、ウイルス抗原に対してインビボでＣＴＬを刺激し得る物質または組成物として同定された。例えば、パルミチン酸残基をリジン残基のεアミノ基およびαアミノ基に付着させ、次に本発明のペプチドに連結させることができる。次いで、脂質付加したペプチドを、ミセルもしくは粒子の状態で直接投与すること、リポソーム中に取り込ませること、またはアジュバント中に乳化させることができる。ＣＴＬ応答の脂質による刺激の別の例として、トリパルミトイル−Ｓ−グリセリルシステイニル−セリル−セリン（Ｐ３ＣＳＳ）などの大腸菌（Ｅ．ｃｏｌｉ）リポタンパク質を、適切なペプチドに共有結合させて、ＣＴＬを刺激するために用いることができる（例えば、Deres et al., Nature 1989, 342: 561-4を参照されたい）。
【０１０５】
投与方法は、経口、皮内、皮下、静脈内注射等、および全身投与または標的部位の近傍への局所投与であってよい。投与は、単回投与によって行うこともできるし、または複数回投与によって強化することもできる。本発明のペプチドの用量を、治療する疾患、患者の年齢、体重、投与方法等に従って適切に調節することができ、これは通常０．００１  ｍｇ〜１０００  ｍｇ、例えば０．００１  ｍｇ〜１０００  ｍｇ、例えば０．１  ｍｇ〜１０  ｍｇであり、数日から数ヶ月に１度投与することができる。当業者は、適切な用量を適切に選択することができる。
【０１０６】
（２）有効成分としてポリヌクレオチドを含む薬学的な物質または組成物
本発明の薬学的な物質または組成物はまた、本明細書に開示するペプチドをコードする核酸を発現可能な形態で含み得る。本明細書において、「発現可能な形態で」という語句は、ポリヌクレオチドが、細胞内に導入された場合に、抗腫瘍免疫を誘導するポリペプチドとしてインビボで発現され得ることを意味する。例示的な態様において、関心対象のポリヌクレオチドの核酸配列は、該ポリヌクレオチドの発現に必要な調節エレメントを含む。ポリヌクレオチドには、標的細胞のゲノム中への安定的な組み込みが達成されるように、必要なものを備えさせることができる（相同組換えカセットベクターの説明に関しては、例えばThomas KR & Capecchi MR, Cell 1987, 51: 503-12を参照されたい）。例えば、Wolff et al., Science 1990, 247: 1465-8;米国特許第５，５８０，８５９号；第５，５８９，４６６号；第５，８０４，５６６号；第５，７３９，１１８号；第５，７３６，５２４号；第５，６７９，６４７号；およびＷＯ  ９８／０４７２０を参照されたい。ＤＮＡに基づく送達技術の例には、「裸のＤＮＡ」、促進された（ブピバカイン、ポリマー、ペプチド媒介性）送達、カチオン性脂質複合体、および粒子媒介性（「遺伝子銃」）または圧力媒介性の送達が含まれる（例えば、米国特許第５，９２２，６８７号を参照されたい）。
【０１０７】
ウイルスベクターまたは細菌ベクターによって、本発明のペプチドを発現させることもできる。発現ベクターの例には、ワクシニアウイルスまたは鶏痘ウイルスなどの弱毒化ウイルス宿主が含まれる。このアプローチは、例えば、ペプチドをコードするヌクレオチド配列を発現させるためのベクターとして、ワクシニアウイルスの使用を伴う。宿主内に導入すると、組換えワクシニアウイルスは免疫原性ペプチドを発現し、それによって免疫応答を誘発する。免疫化プロトコールに有用なワクシニアベクターおよび方法は、例えば米国特許第４，７２２，８４８号に記載されている。別のベクターはＢＣＧ（カルメット・ゲラン桿菌）である。ＢＣＧベクターは、Stover et al., Nature 1991, 351: 456-60に記載されている。治療的投与または免疫化に有用である多種多様な他のベクター、例えばアデノウイルスベクターおよびアデノ随伴ウイルスベクター、レトロウイルスベクター、チフス菌（Ｓａｌｍｏｎｅｌｌａ  ｔｙｐｈｉ）ベクター、無毒化炭疽毒素ベクター等が明らかであろう。例えば、Shata et al., Mol Med Today 2000, 6: 66-71;Shedlock et al., J Leukoc Biol 2000, 68: 793-806;Hipp et al., In Vivo 2000, 14: 571-85を参照されたい。
【０１０８】
ポリヌクレオチドの患者内への送達は、直接的であってもよく、この場合、ポリヌクレオチドを保有するベクターに患者を直接曝露し、または間接的であってもよく、この場合、まずインビトロで細胞を関心対象のポリヌクレオチドで形質転換し、次いで該細胞を患者内に移植する。これら２つのアプローチはそれぞれ、インビボおよびエクスビボの遺伝子治療として公知である。
【０１０９】
遺伝子治療の方法の一般的な総説に関しては、Goldspiel et al., Clinical Pharmacy 1993, 12: 488-505;Wu and Wu, Biotherapy 1991, 3: 87-95;Tolstoshev, Ann Rev Pharmacol Toxicol 1993, 33: 573-96;Mulligan, Science 1993, 260: 926-32;Morgan & Anderson, Ann Rev Biochem 1993, 62: 191-217;Trends in Biotechnology 1993, 11(5): 155-215を参照されたい。本発明にも用いることのできる、組換えＤＮＡ技術の分野において一般に公知の方法は、eds. Ausubel et al., Current Protocols in Molecular Biology, John Wiley & Sons, NY, 1993;およびKrieger, Gene Transfer and Expression, A Laboratory Manual, Stockton Press, NY, 1990に記載されている。
【０１１０】
投与方法は、経口、皮内、皮下、静脈内注射等であってよく、全身投与または標的部位の近傍への局所投与が用いられる。投与は、単回投与によって行うこともできるし、または複数回投与によって強化することもできる。適切な担体中のポリヌクレオチドの用量、または本発明のペプチドをコードするポリヌクレオチドで形質転換した細胞の用量を、治療する疾患、患者の年齢、体重、投与方法等に従って適切に調節することができ、これは通常０．００１  ｍｇ〜１０００  ｍｇ、例えば０．００１  ｍｇ〜１０００  ｍｇ、例えば０．１  ｍｇ〜１０  ｍｇであり、数日に１度〜数ヶ月に１度投与することができる。当業者は、適切な用量を適切に選択することができる。
【０１１１】
Ｘ．ペプチド、エキソソーム、ＡＰＣ、およびＣＴＬを用いる方法
ＡＰＣおよびＣＴＬを調製するため、または誘導するために、本発明のペプチドおよびポリヌクレオチドを用いることができる。ＣＴＬを誘導するために、本発明のエキソソームおよびＡＰＣを用いることもできる。ペプチド、ポリヌクレオチド、エキソソーム、およびＡＰＣは、任意の他の化合物がそれらのＣＴＬ誘導能を阻害しない限り、該化合物と組み合わせて用いることができる。したがって、前述の本発明の薬学的な物質または組成物のいずれかをＣＴＬを誘導するために用いることができ、それに加えて、前記ペプチドおよびポリヌクレオチドを含むものを、以下に説明されるように、ＡＰＣを誘導するために用いることもできる。
【０１１２】
（１）抗原提示細胞（ＡＰＣ）を誘導する方法
本発明は、本発明のペプチドまたはポリヌクレオチドを用いて、高いＣＴＬ誘導能を有するＡＰＣを誘導する方法を提供する。
【０１１３】
本発明の方法は、ＡＰＣを本発明のペプチドとインビトロ、エクスビボ、またはインビボで接触させる段階を含む。例えば、ＡＰＣを該ペプチドとエクスビボで接触させる方法は、以下の段階を含み得る：
ａ：対象からＡＰＣを回収する段階；および
ｂ：段階ａのＡＰＣを該ペプチドと接触させる段階。
【０１１４】
前記ＡＰＣは特定の種類の細胞に限定されず、これには、リンパ球によって認識されるようにその細胞表面上にタンパク質性抗原を提示することが知られているＤＣ、ランゲルハンス細胞、マクロファージ、Ｂ細胞、および活性化Ｔ細胞が含まれる。DCは、ＡＰＣの中では最も強力なＣＴＬ誘導能を有するため、好ましく用いられ得る。本発明の任意のペプチドを、単独で、または本発明の他のペプチドと共に用いることができる。
【０１１５】
一方、本発明のペプチドを対象に投与する場合には、ＡＰＣはインビボでペプチドと接触し、その結果、高いCTL誘導能を有するＡＰＣが対象の体内で誘導される。したがって、本発明は、本発明のペプチドを対象に投与することを含む。同様に、本発明のポリヌクレオチドを発現可能な形態で対象に投与する場合には、本発明のペプチドがインビボで発現されてＡＰＣと接触し、その結果、高いCTL誘導能を有するＡＰＣが対象の体内で誘導される。したがって、本発明はまた、本発明のポリヌクレオチドを対象に投与することも含む。「発現可能な形態」は、「IX．薬学的物質または組成物、（2）ポリヌクレオチドを有効成分として含む薬学的物質または組成物」の章に上述されている。
【０１１６】
さらに本発明は、ＣＴＬ誘導能を有するＡＰＣを誘導するために、本発明のポリヌクレオチドをＡＰＣに導入することを含む。例えば、本方法は以下の段階を含み得る：
ａ：対象からＡＰＣを回収する段階；および
ｂ：本発明のペプチドをコードするポリヌクレオチドを導入する段階。
【０１１７】
段階ｂは、「ＶＩ．抗原提示細胞」の章に上記した通りに行うことができる。
【０１１８】
または、本発明は、ＶＡＮＧＬ１に対するＣＴＬ活性を特異的に誘導する抗原提示細胞（ＡＰＣ）を調製するための方法であって、以下の段階の１つを含む方法を提供する：
（ａ）ＡＰＣを、本発明のペプチドと、インビトロ、エクスビボまたはインビボで接触させる段階；および
（ｂ）本発明のペプチドをコードするポリヌクレオチドをＡＰＣに導入する段階。
【０１１９】
（２）ＣＴＬを誘導する方法
さらに本発明は、本発明のペプチド、ポリヌクレオチド、またはエキソソームもしくはＡＰＣを用いてＣＴＬを誘導する方法を提供する。
【０１２０】
本発明はまた、本発明のペプチドとＨＬＡ抗原との複合体を認識するＴ細胞受容体（ＴＣＲ）サブユニットを形成し得るポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを用いて、ＣＴＬを誘導する方法を提供する。好ましくは、ＣＴＬを誘導する方法は、以下からなる群より選択される少なくとも１つの段階を含む：
ａ）ＣＤ８陽性Ｔ細胞を、ＨＬＡ抗原と本発明のペプチドとの複合体をその表面上に提示する抗原提示細胞および／またはエキソソームと接触させる段階；ならびに
ｂ）本発明のペプチドとＨＬＡ抗原との複合体を認識するＴＣＲサブユニットを形成し得るポリペプチドをコードするポリヌクレオチドをＣＤ８陽性細胞に導入する段階。
【０１２１】
本発明のペプチド、ポリヌクレオチド、ＡＰＣ、またはエキソソームを対象に投与すると、該対象の体内でＣＴＬが誘導されて、がん細胞を標的とする免疫応答の強さが強化される。したがって、本発明の方法は、本発明のペプチド、ポリヌクレオチド、ＡＰＣ、またはエキソソームを対象に投与する段階を含む。
【０１２２】
あるいは、エクスビボで使用することによってＣＴＬを誘導することもでき、ＣＴＬの誘導後に活性化したＣＴＬを対象に戻す。例えば、この方法は以下の段階を含み得る：
ａ：対象からＡＰＣを回収する段階；
ｂ：段階ａのＡＰＣをペプチドと接触させる段階；および
ｃ：段階ｂのＡＰＣをＣＤ８陽性細胞と共培養する段階。
【０１２３】
上記の段階ｃにおいてＣＤ８陽性細胞と共培養すべきＡＰＣは、「ＶＩ．抗原提示細胞」の章で上記したように、本発明のポリヌクレオチドを含む遺伝子をＡＰＣに導入することによって調製することもできるが、これに限定されず、ＨＬＡ抗原と本発明のペプチドとの複合体をその表面上に効率的に提示する任意のＡＰＣを本方法に用いることができる。
【０１２４】
そのようなＡＰＣの代わりに、ＨＬＡ抗原と本発明のペプチドとの複合体をその表面上に提示するエキソソームを用いることもできる。すなわち、本発明はまた、ＨＬＡ抗原と本発明のペプチドとの複合体をその表面上に提示するエキソソームを共培養する工程を含み得る。そのようなエキソソームは、「Ｖ．エキソソーム」の章で上記した方法によって調製し得る。
【０１２５】
さらに、本発明のペプチドに結合するＴＣＲサブユニットをコードするポリヌクレオチドを含む遺伝子をＣＤ８陽性細胞に導入することによって、ＣＴＬを誘導することもできる。そのような形質導入は、「ＶＩＩＩ．Ｔ細胞受容体（ＴＣＲ）」の章で上記した通りに行うことができる。
【０１２６】
本明細書に記載されたものと類似のまたは等価な、方法および材料を本発明の実施または試験に用いることができるが、ここでは適切な方法および材料について説明する。本明細書で言及される刊行物、特許出願、特許および他の参考文献はすべて、それらの全体が参照により本明細書に組み入れられる。矛盾のある場合は、定義を含めて、本明細書が優先される。加えて、材料、方法および例は、単に例示であり、限定することを意図したものではない。
【０１２７】
（３）免疫応答を誘導する方法
さらに本発明は、ＶＡＮＧＬ１に関連する疾患に対する免疫応答を誘導する方法を提供する。適切な疾患にはがんが含まれ、その例には、膀胱がん、乳がん、子宮頸がん、胆管細胞癌、子宮内膜症、肝がん、ＮＳＣＬＣ、骨肉腫、膵がん、ＳＣＬＣ、およびＡＭＬが含まれるが、これに限定されない。
【０１２８】
本方法は、本発明のペプチドまたはそれらをコードするポリヌクレオチドのいずれかを含む物質または組成物を投与する段階を含む。本発明の方法はまた、本発明のペプチドのいずれかを提示するエキソソームまたはＡＰＣの投与を意図する。詳細については、「ＩＸ．薬学的な物質または組成物」の項目、特に本発明の薬学的な物質または組成物のワクチンとしての使用について記載している部分を参照されたい。加えて、免疫応答を誘導するために本発明の方法に使用できるエキソソームおよびＡＰＣは、上記の「Ｖ．エキソソーム」、「ＶＩ．抗原提示細胞（ＡＰＣ）」、ならびに「Ｘ．ペプチド、エキソソーム、ＡＰＣ、およびＣＴＬを用いる方法」の（１）および（２）の項目において詳述されている。
【０１２９】
本発明はまた、免疫応答を誘導する薬学的な物質または組成物を製造するための方法またはプロセスであって、本発明のペプチドを薬学的に許容される担体と共に混合するまたは製剤化する段階を含む方法を提供する。
【０１３０】
あるいは、本発明の方法は、以下を含むワクチンまたは薬学的組成物を投与する段階を含み得る：
（ａ）本発明のペプチド；
（ｂ）本明細書に開示するようなペプチドを発現可能な形態でコードする核酸；
（ｃ）本発明のペプチドをその表面上に提示するＡＰＣまたはエキソソーム；または
（ｄ）本発明の細胞傷害性Ｔ細胞。
【０１３１】
本発明において、ＶＡＮＧＬ１を過剰発現するがんをこれらの有効成分で治療することができる。がんには、膀胱がん、乳がん、子宮頸がん、胆管細胞癌、子宮内膜症、肝がん、ＮＳＣＬＣ、骨肉腫、膵がん、ＳＣＬＣ、およびＡＭＬが含まれるが、これらに限定されない。したがって、有効成分を含むワクチンまたは薬学的組成物を投与する前に、治療すべき細胞または組織におけるＶＡＮＧＬ１の発現レベルが同じ器官の正常細胞と比較して増強されているかどうかを確認することが好ましい。したがって１つの態様において、本発明は、以下の段階を含み得る、ＶＡＮＧＬ１を（過剰）発現するがんを治療する方法を提供する：
ｉ）治療すべきがんを有する対象から得られた細胞または組織において、ＶＡＮＧＬ１の発現レベルを決定する段階；
ｉｉ）ＶＡＮＧＬ１の発現レベルを正常対照と比較する段階；および
ｉｉｉ）上記の（ａ）〜（ｄ）からなる群より選択される少なくとも１つの成分を、正常対照と比較してＶＡＮＧＬ１を過剰発現するがんを有する対象に投与する段階。
【０１３２】
あるいは、本発明はまた、ＶＡＮＧＬ１を過剰発現するがんを有する対象への投与において用いるための、上記の（ａ）〜（ｄ）からなる群より選択される少なくとも１つの成分を含むワクチンまたは薬学的組成物を提供する。換言すれば、本発明はさらに、本発明のＶＡＮＧＬ１ポリペプチドで治療すべき対象を同定する方法であって、対象由来の細胞または組織におけるＶＡＮＧＬ１の発現レベルを測定する段階を含んでよく、該遺伝子の正常対照レベルと比較して該レベルが上昇していることにより、対象が本発明のＶＡＮＧＬ１ポリペプチドで治療され得るがんを有することが示される方法を提供する。本発明の、がんを治療するための方法を以下でより詳細に記載する。
【０１３３】
本発明の方法で治療されるべき対象は、好ましくはほ乳類である。例示的なほ乳類としては、例えばヒト、非ヒト霊長類、マウス、ラット、イヌ、ネコ、ウマ、およびウシが挙げられるが、これらに限定されない。
【０１３４】
本発明に従って、対象から得られた細胞または組織におけるＶＡＮＧＬ１の発現レベルを測定する。発現レベルは、当技術分野で公知の方法を用いて、転写（核酸）産物レベルで測定することができる。例えば、ＶＡＮＧＬ１のｍＲＮＡを、ハイブリダイゼーション法（例えば、ノーザンハイブリダイゼーション）によってプローブを用いて定量することができる。検出は、チップまたはアレイ上で行ってもよい。アレイの使用は、ＶＡＮＧＬ１の発現レベルを検出するのに好ましい。当業者は、ＶＡＮＧＬ１の配列情報を使用して、そのようなプローブを調製することができる。例えば、ＶＡＮＧＬ１のｃＤＮＡをプローブとして用いてもよい。必要に応じて、プローブを、色素、蛍光物質、および同位体などの適切な標識で標識してもよく、該遺伝子の発現レベルをハイブリダイズした標識の強度として検出してもよい。
【０１３５】
さらに、増幅に基づく検出法（例えば、ＲＴ−ＰＣＲ）によりプライマーを用いて、ＶＡＮＧＬ１（例えば、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：３４）の転写産物を定量してもよい。そのようなプライマーは、該遺伝子の入手可能な配列情報に基づいて調製し得る。
【０１３６】
具体的には、本発明の方法に用いられるプローブまたはプライマーは、ストリンジェントな条件下、中程度にストリンジェントな条件下、または低ストリンジェントな条件下で、ＶＡＮＧＬ１のｍＲＮＡとハイブリダイズする。本明細書で使用する「ストリンジェントな（ハイブリダイゼーション）条件」という語句は、プローブまたはプライマーがその標的配列とはハイブリダイズするが、その他の配列とはハイブリダイズしない条件を指す。ストリンジェントな条件は配列に依存し、異なる状況下では異なる。より長い配列の特異的ハイブリダイゼーションは、短い配列よりも高い温度で観察される。一般に、ストリンジェントな条件の温度は、所定のイオン強度およびｐＨにおける特定の配列の融解温度（Ｔｍ）よりも約５℃低くなるように選択される。Ｔｍとは、平衡状態で、標的配列に相補的なプローブの５０％が標的配列とハイブリダイズする（所定のイオン強度、ｐＨ、および核酸濃度における）温度である。標的配列は一般に過剰に存在するため、Ｔｍでは、平衡状態でプローブの５０％が占有される。典型的には、ストリンジェントな条件とは、ｐＨ７．０〜８．３において塩濃度がナトリウムイオン約１．０  Ｍ未満、典型的にはナトリウムイオン（または他の塩）約０．０１〜１．０  Ｍであり、かつ温度が、短いプローブまたはプライマー（例えば、１０〜５０ヌクレオチド）に関しては少なくとも約３０℃、およびより長いプローブまたはプライマーに関しては少なくとも約６０℃である条件である。ストリンジェントな条件はまた、ホルムアミドなどの不安定化物質の添加によって達成してもよい。
【０１３７】
あるいは、本発明の診断のために、翻訳産物を検出してもよい。例えば、ＶＡＮＧＬ１タンパク質（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：３５）またはその免疫学的断片の量を測定し得る。翻訳産物としてタンパク質の量を測定する方法には、タンパク質を特異的に認識する抗体を用いる免疫測定法が含まれる。抗体は、モノクローナルまたはポリクローナルであってよい。さらに、断片または改変抗体がＶＡＮＧＬ１タンパク質への結合能を保持する限り、抗体の任意の断片または改変物（例えば、キメラ抗体、ｓｃＦｖ、Ｆａｂ、Ｆ（ａｂ'）２、Ｆｖ等）で検出してもよい。本発明のペプチドに対するこのような抗体およびその断片もまた、本発明によって提供される。タンパク質を検出するためのこのような種類の抗体を調製する方法は、当技術分野において周知であり、本発明において任意の方法を使用して、そのような抗体およびその等価物を調製してもよい。
【０１３８】
ＶＡＮＧＬ１遺伝子の発現レベルをその翻訳産物に基づいて検出する別の方法として、ＶＡＮＧＬ１タンパク質に対する抗体を用いた免疫組織化学的解析により、染色強度を測定してもよい。すなわち、この測定では、強力な染色により、該タンパク質の存在／レベルの増加が示され、それと同時にＶＡＮＧＬ１遺伝子の高発現レベルが示される。
【０１３９】
がん細胞における標的遺伝子、例えばＶＡＮＧＬ１遺伝子の発現レベルは、そのレベルが、標的遺伝子の対照レベル（例えば、正常細胞におけるレベル）から例えば１０％、２５％、もしくは５０％上昇しているか、または１．１倍超、１．５倍超、２．０倍超、５．０倍超、１０．０倍超、もしくはそれ以上まで上昇している場合に、上昇しているとみなすことができる。
【０１４０】
対照レベルは、疾患状態（がん性または非がん性）がわかっている対象から予め回収し保存しておいた試料を用いることにより、がん細胞と同時に測定することができる。加えて、治療すべきがんを有する器官の非がん性領域から得られた正常細胞を、正常対照として用いてもよい。あるいは、対照レベルは、疾患状態がわかっている対象由来の試料中のＶＡＮＧＬ１遺伝子の予め測定された発現レベルを解析することによって得られた結果に基づいて、統計的方法により決定してもよい。さらに、対照レベルは、以前に試験された細胞に由来する発現パターンのデータベースに由来し得る。
【０１４１】
さらに、本発明の１つの局面に従って、生体試料中のＶＡＮＧＬ１遺伝子の発現レベルを、複数の参照試料から測定される複数の対照レベルと比較してもよい。対象由来の生体試料の組織型と類似の組織型に由来する参照試料から測定された対照レベルを用いることが好ましい。さらに、疾患状態が判明している集団におけるＶＡＮＧＬ１遺伝子の発現レベルの基準値を用いることが好ましい。基準値は、当技術分野において公知の任意の方法によって得ることができる。例えば、平均値  ＋／−  ２  Ｓ．Ｄ．または平均値  ＋／−  ３  Ｓ．Ｄ．の範囲を、基準値として用いることができる。
【０１４２】
本発明との関連において、非がん性であるとわかっている生体試料から測定された対照レベルは「正常対照レベル」と称される。一方、対照レベルががん性の生体試料から測定される場合、これは「がん性対照レベル」と称される。
【０１４３】
ＶＡＮＧＬ１遺伝子の発現レベルが正常対照レベルと比較して上昇しているか、またはがん性対照レベルと類似している／同等である場合、対象は治療をうけるべきがんを有する、と診断されうる。
【０１４４】
より具体的には、本発明は、（ｉ）対象が治療すべきがんを有するかどうかを診断する方法、および／または（ｉｉ）がん治療のための対象を選択する方法であって、以下の段階を含む方法を提供する：
ａ）治療すべきがんを有する疑いのある対象から得られた細胞または組織におけるＶＡＮＧＬ１の発現レベルを決定する段階；
ｂ）ＶＡＮＧＬ１の発現レベルを正常対照レベルと比較する段階；
ｃ）ＶＡＮＧＬ１の発現レベルが正常対照レベルと比較して上昇している場合に、該対象が治療すべきがんを有すると診断する段階；および
ｄ）段階ｃ）において対象が治療すべきがんを有すると診断される場合に、がん治療のために該対象を選択する段階。
【０１４５】
あるいは、そのような方法は以下の段階を含む：
ａ）治療すべきがんを有する疑いのある対象から得られた細胞または組織におけるＶＡＮＧＬ１の発現レベルを決定する段階；
ｂ）ＶＡＮＧＬ１の発現レベルをがん性対照レベルと比較する段階；
ｃ）ＶＡＮＧＬ１の発現レベルががん性対照レベルと比較して類似しているか、または同等である場合に、該対象が治療すべきがんを有すると診断する段階；および
ｄ）段階ｃ）において対象が治療すべきがんを有すると診断される場合に、がん治療のために該対象を選択する段階。
【０１４６】
本発明はまた、本発明のＶＡＮＧＬ１ポリペプチドで治療され得るがんに罹患しているかまたはその疑いがある対象を診断または判定するための診断キットを提供し、このキットはまた、がん免疫療法の有効性または適用性を評価および／またはモニターするのにも有用であり得る。好ましくは、がんには、膀胱がん、乳がん、子宮頸がん、胆管細胞癌、子宮内膜症、肝がん、ＮＳＣＬＣ、骨肉腫、膵がん、ＳＣＬＣ、およびＡＭＬが含まれるが、これらに限定されない。より詳細には、キットは、対象由来の細胞におけるＶＡＮＧＬ１遺伝子の発現を検出するための少なくとも１つの試薬を含むことが好ましく、試薬は以下の群より選択され得る：
（ａ）ＶＡＮＧＬ１遺伝子のｍＲＮＡを検出するための試薬；
（ｂ）ＶＡＮＧＬ１タンパク質またはその免疫学的断片を検出するための試薬；および
（ｃ）ＶＡＮＧＬ１タンパク質の生物活性を検出するための試薬。
【０１４７】
ＶＡＮＧＬ１遺伝子のｍＲＮＡを検出するのに適した試薬には、ＶＡＮＧＬ１  ｍＲＮＡの一部に対する相補的配列を有するオリゴヌクレオチドなどの、ＶＡＮＧＬ１  ｍＲＮＡに特異的に結合するか、またはＶＡＮＧＬ１  ｍＲＮＡを特異的に同定する核酸が含まれる。このような種類のオリゴヌクレオチドは、ＶＡＮＧＬ１  ｍＲＮＡに特異的なプライマーおよびプローブによって例示される。このような種類のオリゴヌクレオチドは、当技術分野において周知の方法に基づいて調製し得る。必要に応じて、ＶＡＮＧＬ１  ｍＲＮＡを検出するための試薬を固体マトリックス上に固定化し得る。さらに、ＶＡＮＧＬ１  ｍＲＮＡを検出するための２つ以上の試薬をキットに含めてもよい。
【０１４８】
一方、ＶＡＮＧＬ１タンパク質またはその免疫学的断片を検出するのに適した試薬には、ＶＡＮＧＬ１タンパク質またはその免疫学的断片に対する抗体が含まれる。抗体は、モノクローナルまたはポリクローナルであってよい。さらに、抗体の任意の断片または改変体（例えば、キメラ抗体、ｓｃＦｖ、Ｆａｂ、Ｆ（ａｂ'）２、Ｆｖ等）も、その断片または改変抗体がＶＡＮＧＬ１タンパク質またはその免疫学的断片への結合能を保持する限り、試薬として用いてもよい。タンパク質を検出するためのこのような種類の抗体を調製する方法は、当技術分野において周知であり、本発明において任意の方法を使用して、そのような抗体およびその等価物を調製してもよい。さらに、直接連結または間接標識技術により、抗体をシグナル発生分子で標識してもよい。標識、および抗体を標識し、その標的に対する抗体の結合を検出する方法は当技術分野において周知であり、任意の標識および方法を本発明のために使用してもよい。さらに、ＶＡＮＧＬ１タンパク質を検出するための２つ以上の試薬をキットに含めてもよい。
【０１４９】
キットは、前述の試薬のうちの２つ以上を含み得る。例えば、がんに罹患していないまたはがんに罹患している対象から得られた組織試料は、有用な対照試薬として役立ち得る。本発明のキットは、緩衝液、希釈液、フィルター、針、シリンジ、および使用説明書を備えた包装封入物（例えば、文書、テープ、ＣＤ−ＲＯＭ等）を含む、商業上の観点および使用者の観点から望ましいその他の材料をさらに含んでもよい。これらの試薬等は、ラベルを貼った容器中に保持されてもよい。適切な容器には、瓶、バイアル、および試験管が含まれる。容器は、ガラスまたはプラスチックなどの種々の材料から形成され得る。
【０１５０】
本発明の１つの態様において、試薬がＶＡＮＧＬ１  ｍＲＮＡに対するプローブである場合には、該試薬を多孔性ストリップなどの固体マトリックス上に固定化して、少なくとも１つの検出部位を形成してもよい。多孔性ストリップの測定または検出領域は、それぞれが核酸（プローブ）を含む複数の部位を含み得る。検査ストリップはまた、陰性および／または陽性対照用の部位を含み得る。あるいは、対照部位は、検査ストリップとは別のストリップ上に位置してもよい。任意で、異なる検出部位は異なる量の固定化核酸を含んでいてもよく、すなわち、第１検出部位ではより大量の固定化核酸を、および以降の部位ではより少量の固定化核酸を含んでよい。試験試料を添加すると、検出可能なシグナルを呈する部位の数により、試料中に存在するＶＡＮＧＬ１  ｍＲＮＡの量の定量的指標が提供される。検出部位は、適切に検出可能な任意の形状で構成することができ、典型的には、検査ストリップの幅全体にわたってバーまたはドットの形状である。
【０１５１】
本発明のキットは、陽性対照試料またはＶＡＮＧＬ１標準試料をさらに含み得る。本発明の陽性対照試料は、ＶＡＮＧＬ１陽性試料を回収し、次にそれらのＶＡＮＧＬ１レベルをアッセイすることによって調製することができる。あるいは、精製ＶＡＮＧＬ１タンパク質またはポリヌクレオチドを、ＶＡＮＧＬ１を発現しない細胞に添加して、陽性試料またはＶＡＮＧＬ１標準試料を形成してもよい。本発明において、精製ＶＡＮＧＬ１は組換えタンパク質であってよい。陽性対照試料のＶＡＮＧＬ１レベルは、例えばカットオフ値よりも高い。
【０１５２】
１つの態様において、本発明はさらに、本発明の抗体またはその断片を特異的に認識することのできるタンパク質またはその部分的タンパク質を含む、診断キットを提供する。
【０１５３】
本発明のタンパク質の部分的ペプチドの例には、本発明のタンパク質のアミノ酸配列中の少なくとも８個、好ましくは１５個、より好ましくは２０個の連続したアミノ酸からなるポリペプチドが含まれる。本発明のタンパク質またはペプチド（ポリペプチド）を用いて、試料（例えば、血液、組織）中の抗体を検出することによって、がんを診断することができる。本発明のタンパク質およびペプチドを調製するための方法は上記の通りである。
【０１５４】
がんに対する診断方法は、抗ＶＡＮＧＬ１抗体の量と、上記のような対応する対照試料中のそれとの違いを判定することによって行われる。対象の細胞または組織が遺伝子の発現産物（ＶＡＮＧＬ１）に対する抗体を含み、かつ抗ＶＡＮＧＬ１抗体の量が正常対照における量と比較したレベルに関してカットオフ値を上回ると判定されたならば、その対象はがんに罹患していると疑われる。
【０１５５】
別の態様において、本発明の診断キットは、本発明のペプチドおよびそれと結合するＨＬＡ分子を含む。抗原ペプチドおよびＨＬＡ分子を用いて抗原特異的ＣＴＬを検出するための方法は既に確立している（例えば、Altman JD et al., Science. 1996, 274(5284): 94-6）。このため、本発明のペプチドとＨＬＡ分子との複合体を、腫瘍抗原特異的ＣＴＬを検出するための検出方法に適用し、それによって、がんのより早期の発見、再発および／または転移を可能にすることができる。さらに、本発明のペプチドを有効成分として含む医薬を適用し得る対象の選択のため、またはその医薬の治療効果の評価のために用いることもできる。
【０１５６】
特に、公知の方法に従って（例えば、Altman JD et al., Science. 1996, 274(5284): 94-6）、放射性標識したＨＬＡ分子および本発明のペプチドのオリゴマー複合体、例えば四量体などを調製することができる。その複合体を用いることで、例えば、がんに罹患していると疑われる対象に由来する末梢血リンパ球中の抗原ペプチド特異的ＣＴＬを定量することにより、診断を下すことができる。
【０１５７】
本発明はさらに、本明細書に記載されたペプチドエピトープを用いることによって、対象の免疫学的応答を評価するための方法または診断用薬剤を提供する。本発明の１つの態様においては、本明細書に記載されたＨＬＡ  Ａ−２４拘束性ペプチドを、対象の免疫応答を評価または予測するための試薬として用いる。評価しようとする免疫応答は、インビトロまたはインビボで免疫原を免疫担当細胞と接触させることによって誘導する。いくつかの態様においては、ペプチドエピトープを認識してそれと結合する抗原特異的ＣＴＬの生成をもたらし得る任意の薬剤を、試薬として用いてもよい。ペプチド試薬を必ずしも免疫原として用いる必要はない。そのような分析のために用いられるアッセイ系には、四量体、細胞内リンホカインに関する染色およびインターフェロン放出アッセイ、またはＥＬＩＳＰＯＴアッセイといった比較的最近開発された技術が含まれる。好ましい態様において、ペプチド試薬と接触させる免疫担当細胞は、樹状細胞を含む抗原提示細胞であってよい。
【０１５８】
例えば、本発明のペプチドを、腫瘍細胞抗原または免疫原に対する曝露後の抗原特異的ＣＴＬの存在に関して末梢血単核細胞を評価するための四量体染色アッセイに用いてもよい。ＨＬＡ四量体複合体を用いると、抗原特異的ＣＴＬを直接可視化し（例えば、Ogg et al., Science 279: 2103-2106, 1998；およびAltman et al, Science 174: 94-96, 1996を参照）、末梢血単核細胞の試料中の抗原特異的ＣＴＬ集団の頻度を決定し得る。本発明のペプチドを用いる四量体試薬を以下のように作製し得る：
ＨＬＡ分子と結合するペプチドを、対応するＨＬＡ重鎖およびβ２−ミクログロブリンの存在下で再フォールディングさせて、３分子複合体を生成する。この複合体において、重鎖のカルボキシル末端の、タンパク質中に事前に作製した部位でビオチン化する。続いて、ストレプトアビジンをこの複合体に添加して、３分子複合体およびストレプトアビジンからなる四量体を形成する。蛍光標識したストレプトアビジンを利用することで、四量体を用いて抗原特異的細胞を染色することができる。続いて細胞を、例えば、フローサイトメトリーによって同定することができる。そのような分析は、診断または予後判定の目的に用い得る。この手順によって同定された細胞を治療の目的に用いることもできる。
【０１５９】
本発明はまた、本発明のペプチドを含む、免疫リコール応答(例えば、Bertoni et aL, J. Clin. Invest. 100: 503-513, 1997およびPenna et aL, J Exp. Med. 174: 1565-1570, 1991を参照）を評価するための試薬も提供する。例えば、治療すべきがんを有する個体からの患者ＰＢＭＣ試料を、特異的ペプチドを用いて抗原特異的ＣＴＬの存在に関して分析する。ＰＢＭＣを培養し、その細胞を本発明のペプチドで刺激することによって、単核細胞を含む血液試料を評価することができる。適切な培養期間後、増殖した細胞集団を、例えばＣＴＬ活性について分析することができる。
【０１６０】
本ペプチドを、ワクチンの有効性を評価するための試薬として用いることもできる。免疫原をワクチン接種した患者から採取されたＰＢＭＣを、例えば、上記方法のいずれかを用いて分析することができる。患者のＨＬＡ型を判定し、その患者に存在する対立遺伝子特異的分子を認識するペプチドエピトープ試薬を分析のために選択する。ワクチンの免疫原性は、ＰＢＭＣ試料中のエピトープ特異的ＣＴＬの存在によって示され得る。
【０１６１】
本発明のペプチドを、当技術分野において周知の手法（例えば、CURRENT PROTOCOLS IN IMMUNOLOGY, Wiley/Greene, NY；およびAntibodies A Laboratory Manual, Harlow and Lane, Cold Spring Harbor Laboratory Press, 1989を参照）を用いて抗体を作製するために用いることもでき、この抗体は、がんを診断またはモニターするための試薬として有用であり得る。そのような抗体は、ＨＬＡ分子との関連でペプチドを認識する抗体、すなわち、ペプチド−ＭＨＣ複合体と結合する抗体を含み得る。
【０１６２】
または、本発明は数多くの用途も提供し、そのいくつかを本明細書において説明する。例えば、本発明は、ＶＡＮＧＬ１免疫原性ポリペプチドの発現を特徴とする疾患を診断または検出する方法を提供する。これらの方法は、生体試料におけるＶＡＮＧＬ１  ＨＬＡ結合ペプチド、またはＶＡＮＧＬ１  ＨＬＡ結合ペプチドとＨＬＡクラスＩ分子との複合体の発現を決定する段階を含む。ペプチドまたはペプチドとＨＬＡクラスＩ分子との複合体の発現は、ペプチドまたは複合体に対する結合パートナーを用いるアッセイによって決定または検出することができる。好ましい態様において、ペプチドまたは複合体に対する結合パートナーは、このペプチドを認識して特異的に結合する抗体である。腫瘍生検標本などの生体試料におけるＶＡＮＧＬ１の発現を、ＶＡＮＧＬ１プライマーを用いる標準的なＰＣＲ増幅プロトコールによって検査することもできる。腫瘍発現の一例は本明細書に提示されており、ＶＡＮＧＬ１増幅のための例示的な条件およびプライマーのさらなる開示は、ＷＯ２００３／２７３２２号に見いだすことができる。
【０１６３】
好ましくは、本診断方法は、生体試料中のＶＡＮＧＬ１  ＨＬＡ結合ペプチドの存在を検出するために、対象から単離された生体試料を、ＶＡＮＧＬ１  ＨＬＡ結合ペプチドに対して特異的な薬剤と接触させる段階を含む。本明細書で使用する「接触させる」とは、生体試料を薬剤に十分に近接させて、かつ、その薬剤と生体試料中に存在するＶＡＮＧＬ１  ＨＬＡ結合ペプチドとの間の特異的相互作用が可能となるように、例えば濃度、温度、時間、イオン強度などの適切な条件下に置くことを意味する。一般に、薬剤を生体試料と接触させるための条件は、生体試料中での分子とその同族物（cognate）（例えば、タンパク質とその受容体同族物（cognate）、抗体とそのタンパク質抗原同族物（cognate）、核酸とその相補的配列同族物（cognate））との間の特異的相互作用を促進することが当業者に公知である条件である。分子とその同族物（cognate）との間の特異的相互作用を促進するための例示的な条件は、Ｌｏｗらに対して発行された米国特許第５，１０８，９２１に記載されている。
【０１６４】
本発明の診断方法は、インビボおよびインビトロのいずれかまたは両方で行うことができる。したがって、生体試料は、本発明においてインビボまたはインビトロに位置することができる。例えば、生体試料がインビボの組織であって、ＶＡＮＧＬ１免疫原性ポリペプチドに対して特異的な薬剤を用いて、組織中のそのような分子の存在を検出することができる。または、生体試料を、インビトロで採取または単離することもできる（例えば、血液試料、腫瘍生検標本、組織抽出物）。特に好ましい態様において、生体試料は細胞を含む試料、より好ましくは、診断または治療を行おうとする対象から採取した腫瘍細胞を含む試料でありうる。
【０１６５】
または、診断を、フルオレセインで標識したＨＬＡ多量体複合体で染色して、抗原特異的Ｔ細胞の直接的な定量を可能にする方法によって行うこともできる（例えば、Altman, J. D. et al., 1996, Science 274: 94；Altman, J. D. et al., 1993, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 90: 10330;）。細胞内リンホカインの染色、およびインターフェロン−γ放出アッセイまたはＥＬＩＳＰＯＴアッセイも提供されている。四量体染色、細胞内リンホカイン染色、およびＥＬＩＳＰＯＴアッセイはいずれも、より習慣的なアッセイよりも感度が少なくとも１０倍高いようである（Murali-Krishna, K. et al., 1998, Immunity 8: 177；Lalvani, A. et al., 1997, J. Exp. Med. 186: 859；Dunbar, P. R. et al., 1998, Curr. Biol. 8: 413;）。五量体（例えば、US 2004-209295A号）、デキストラマー（dextramer）（例えば、WO 02／072631号）、およびストレプタマー（streptamer）（例えば、Nature medicine 6. 631-637 (2002)を用いることもできる。
【０１６６】
ＸＩ．抗体
本発明は、本発明のペプチドに結合する抗体を提供する。好ましい抗体は、本発明のペプチドに特異的に結合し、本発明のペプチドではないものとは結合しない（または弱く結合する）と考えられる。または、抗体は本発明のペプチドならびにその相同体に結合する。
【０１６７】
本発明のペプチドに対する抗体は、がん診断用および予後判定用アッセイ、ならびに画像方法論において使用し得る。同様に、そのような抗体は、ＶＡＮＧＬ１ががん患者において同じく発現または過剰発現される範囲において、他のがんの治療、診断および／または予後判定における用途も有し得る。さらに、細胞内で発現される抗体（例えば、単鎖抗体）は、ＶＡＮＧＬ１の発現が関与しているがん、例えば膀胱がん、乳がん、子宮頸がん、胆管細胞癌、子宮内膜症、肝臓がん、ＮＳＣＬＣ、骨肉腫、膵がん、ＳＣＬＣおよびＡＭＬなどの治療において治療的に有用である。
【０１６８】
本発明はまた、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１〜３３からなる群より選択されるアミノ酸配列からなるポリペプチドを含む、ＶＡＮＧＬ１タンパク質（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：３５）またはその断片の検出および／または定量のためのさまざまな免疫学的アッセイも提供する。そのようなアッセイは、ＶＡＮＧＬ１タンパク質またはその断片を適宜認識してそれと結合することのできる１種または複数種の抗ＶＡＮＧＬ１抗体を含み得る。本発明において、ＶＡＮＧＬ−１ポリペプチドに結合する抗ＶＡＮＧＬ１抗体は、好ましくは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１〜３３からなる群より選択されるアミノ酸配列からなるポリペプチドを認識する。抗体の結合特異性は、阻害試験で確認することができる。すなわち、分析しようとする抗体と完全長ＶＡＮＧＬ１ポリペプチドとの間の結合が、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１〜３３のアミノ酸配列からなるいずれかの断片ポリペプチドの存在下で阻害されたならば、この抗体がその断片と特異的に結合することが示される。本発明において、そのような免疫学的アッセイは、さまざまな種類のラジオイムノアッセイ、イムノクロマトグラフ法、酵素結合免疫吸着アッセイ（ＥＬＩＳＡ）、酵素結合免疫蛍光アッセイ（ＥＬＩＦＡ）などを非限定的に含む、当技術分野において周知のさまざまな免疫学的アッセイ形式の範囲内で行われる。
【０１６９】
本発明の免疫学的であるが抗体を用いない関連アッセイには、Ｔ細胞免疫原性アッセイ（阻害性または刺激性）、ならびに主要組織適合性遺伝子複合体（ＭＨＣ）結合アッセイも含まれる。加えて、本発明の標識抗体を用いる放射線シンチグラフィー画像法を非限定的に含む、ＶＡＮＧＬ１を発現するがんを検出することのできる免疫学的な画像法も、本発明によって提供される。そのようなアッセイは、膀胱がん、乳がん、子宮頸がん、胆管細胞癌、子宮内膜症、肝臓がん、ＮＳＣＬＣ、骨肉腫、膵がん、ＳＣＬＣおよびＡＭＬといった、ＶＡＮＧＬ１を発現するがんの検出、モニタリングおよび予後判定において臨床的に有用である。
【０１７０】
本発明は、本発明のペプチドに結合する抗体を提供する。本発明の抗体は、モノクローナルまたはポリクローナル抗体などの任意の形態で用いることができ、これには、ウサギなどの動物に本発明のペプチドで免疫することによって得られる抗血清、あらゆるクラスのポリクローナルおよびモノクローナル抗体、ヒト抗体、ならびに遺伝子組換えによって作製されるヒト化抗体が含まれる。
【０１７１】
抗体を得るための抗原として用いられる本発明のペプチドは、任意の動物種に由来し得るが、好ましくはヒト、マウスまたはラットなどの哺乳動物、より好ましくはヒトに由来する。ヒト由来のペプチドは、本明細書に開示されたヌクレオチド配列またはアミノ酸配列から得てもよい。
【０１７２】
本発明によれば、免疫抗原として用いるペプチドは、完全なタンパク質またはこのタンパク質の部分ペプチドであってよい。部分ペプチドは、例えば、本発明のペプチドのアミノ（Ｎ）末端断片またはカルボキシ（Ｃ）末端断片であってよい。
【０１７３】
本明細書では、抗体を、ＶＡＮＧＬ１ペプチドの全長またはその断片のいずれかと反応するタンパク質と定義する。好ましい態様において、本発明の抗体は、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１〜３３からなる群より選択されるアミノ酸配列からなるＶＡＮＧＬ１の断片ペプチドを認識する。オリゴペプチドを合成する方法は当技術分野において周知である。合成後任意で、ペプチドを免疫原として用いる前に精製してもよい。本発明において、免疫原性を強化するために、オリゴペプチド（例えば、９ｍｅｒまたは１０ｍｅｒ）を、担体と結合または連結させてもよい。担体として、キーホールリンペットヘモシアニン（ＫＬＨ）が周知である。ＫＬＨとペプチドを結合する方法もまた、当技術分野において周知である。
【０１７４】
あるいは、本発明のペプチドまたはその断片をコードする遺伝子を公知の発現ベクターに挿入してもよく、続いて、本明細書に記載された宿主細胞を形質転換する。所望のペプチドまたはその断片を、任意の標準的な方法によって宿主細胞の外側または内側から回収し、その後に抗原として用いてもよい。あるいは、ペプチドを発現する細胞全体もしくはそれらの溶解物、または化学合成したペプチドを抗原として用いてもよい。
【０１７５】
任意の哺乳動物を抗原で免疫し得るが、細胞融合のために用いる親細胞との適合性を考慮することが好ましい。一般に、齧歯目（Ｒｏｄｅｎｔｉａ）、ウサギ目（Ｌａｇｏｍｏｒｐｈａ）または霊長目（Ｐｒｉｍａｔｅｓ）の動物が用いられる。齧歯目の動物には、例えば、マウス、ラットおよびハムスターが含まれる。ウサギ目の動物には、例えば、ウサギが含まれる。霊長目の動物には、例えば、狭鼻下目（Ｃａｔａｒｒｈｉｎｉ）のサル（旧世界ザル）、例えばカニクイザル（Ｍａｃａｃａ  ｆａｓｃｉｃｕｌａｒｉｓ）、アカゲザル、マントヒヒおよびチンパンジーなどが含まれる。
【０１７６】
動物を抗原で免疫する方法は、当技術分野で公知である。抗原の腹腔内注射または皮下注射が、哺乳動物を免疫するための標準的な方法である。より具体的には、抗原を、適量のリン酸緩衝食塩水（ＰＢＳ）、生理的食塩水などに希釈し、懸濁させてもよい。必要に応じて、抗原懸濁液を、適量の標準的なアジュバント、例えばフロイント完全アジュバントなどと混合してエマルションとし、続いて哺乳動物に投与してもよい。好ましくは、その後、適量のフロイント不完全アジュバントと混合した抗原を、４〜２１日毎に数回投与する。適切な担体を免疫に用いてもよい。上記のように免疫した後、血清を、所望の抗体の量の増加に関して、標準的な方法によって検査する。
【０１７７】
本発明のペプチドに対するポリクローナル抗体は、血清中の所望の抗体の増加に関して調べた免疫後の哺乳動物から血液を回収し、任意の従来法により、血液から血清を分離することによって調製してもよい。ポリクローナル抗体にはポリクローナル抗体を含む血清が含まれ、さらに、ポリクローナル抗体を含む画分を血清から単離してもよい。免疫グロブリンＧまたはＭは、本発明のペプチドのみを認識する画分から、例えば本発明のペプチドを結合したアフィニティーカラムを用いて、さらにこの画分をプロテインＡまたはプロテインＧカラムを用いて精製し、調製することができる。
【０１７８】
モノクローナル抗体を調製するには、抗原で免疫した哺乳動物から免疫細胞を回収し、上記の通りに血清中の所望の抗体のレベル上昇について確かめた上で、細胞融合に供する。細胞融合に用いる免疫細胞は、脾臓から採取することが好ましい。上記の免疫細胞と融合させる、他の好ましい親細胞には、例えば、哺乳動物の骨髄腫細胞、より好ましくは、薬物による融合細胞の選択のための特性を獲得した骨髄腫細胞が含まれる。
【０１７９】
上記の免疫細胞および骨髄腫細胞を、公知の方法、例えば、Milstein et al.（Galfre and Milstein, Methods Enzymol 73: 3-46 (1981)）の方法に従って、融合させることができる。
【０１８０】
細胞融合によって結果として得られたハイブリドーマは、それらをＨＡＴ培地（ヒポキサンチン、アミノプテリンおよびチミジンを含む培地）などの標準的な選択培地中で培養することによって選択し得る。ＨＡＴ培地中で、典型的には、所望のハイブリドーマを除く他の細胞（非融合細胞）のすべてが死滅するのに十分な期間である数日間から数週間にわたって細胞培養を継続する。続いて、所望の抗体を産生するハイブリドーマ細胞のスクリーニングおよびクローニングを行うために、標準的な限界希釈を行う。
【０１８１】
ハイブリドーマを調製するために非ヒト動物を抗原で免疫する上記の方法に加えて、ＥＢウイルスに感染したヒトリンパ球などのリンパ球を、ペプチド、ペプチド発現細胞またはそれらの溶解物でインビトロで免疫してもよい。続いて、免疫後のリンパ球を、Ｕ２６６などの、無限に分裂することのできるヒト由来の骨髄腫細胞と融合させて、ペプチドに結合可能な所望のヒト抗体を産生するハイブリドーマを得ることができる（未審査公開日本特許出願第(JP-A)Sho 63-17688号）。
【０１８２】
続いて、得られたハイブリドーマをマウスの腹腔内に移植し、腹水を抽出する。得られたモノクローナル抗体は、例えば、硫酸アンモニウム沈殿、プロテインＡまたはプロテインＧカラム、ＤＥＡＥイオン交換クロマトグラフィー、または本発明のペプチドを結合させたアフィニティーカラムによって精製することができる。本発明の抗体は、本発明のペプチドの精製および検出のためだけでなく、本発明のペプチドのアゴニストおよびアンタゴニストの候補として使用することもできる。
【０１８３】
あるいは、免疫化リンパ球などの抗体を産生する免疫細胞をがん遺伝子によって不死化し、モノクローナル抗体の調製に用いることもできる。
【０１８４】
このようにして得られるモノクローナル抗体は、遺伝子工学手法を用いて、組換えによって調製することもできる（例えば、Borrebaeck and Larrick, Therapeutic Monoclonal Antibodies, published in the United Kingdom by MacMillan Publishers LTD (1990)を参照）。例えば、抗体をコードするＤＮＡを、抗体を産生するハイブリドーマまたは免疫化リンパ球などの免疫細胞からクローニングし、適切なベクターに挿入して、宿主細胞に導入することで、組換え抗体を調製することができる。本発明はまた、上記の通りに調製された組換え抗体も提供する。
【０１８５】
さらに、本発明の抗体は、それが本発明のペプチドの１種または複数種と結合する限り、抗体断片または改変抗体であってもよい。例えば、抗体断片は、Ｆａｂ、Ｆ（ａｂ'）２、Ｆｖ、または、Ｈ鎖およびＬ鎖由来のＦｖ断片が適切なリンカーによって連結されている一本鎖Ｆｖ（ｓｃＦｖ）であってよい（Huston et al., Proc Natl Acad Sci USA 85: 5879-83 (1988)）。より具体的には、パパインまたはペプシンなどの酵素で抗体を処理することによって、抗体断片を作製してもよい。あるいは、抗体断片をコードする遺伝子を構築し、発現ベクター中に挿入して、適切な宿主細胞内で発現させてもよい（例えば、Co et al., J Immunol 152: 2968-76 (1994)；Better and Horwitz, Methods Enzymol 178: 476-96 (1989)；Pluckthun and Skerra, Methods Enzymol 178: 497-515 (1989)；Lamoyi, Methods Enzymol 121: 652-63 (1986)；Rousseaux et al., Methods Enzymol 121: 663-9 (1986)；Bird and Walker, Trends Biotechnol 9: 132-7 (1991)を参照）。
【０１８６】
ポリエチレングリコール（ＰＥＧ）のような種々の分子との結合によって、抗体を改変してもよい。本発明はそのような改変抗体を提供する。改変抗体は、抗体を化学的に改変することによって得ることができる。これらの改変方法は当技術分野において慣例的である。
【０１８７】
あるいは、本発明の抗体を、非ヒト抗体由来の可変領域とヒト抗体由来の定常領域とのキメラ抗体として、または、非ヒト抗体由来の相補性決定領域（ＣＤＲ）、ヒト抗体由来のフレームワーク領域（ＦＲ）および定常領域を含むヒト化抗体として得てもよい。そのような抗体は、公知の技術に従って調製することができる。ヒト化は、齧歯類のＣＤＲまたはＣＤＲ配列で、ヒト抗体の対応する配列を置換することによって行うことができる（例えば、Verhoeyen et al., Science 239:1534-1536 (1988)を参照）。したがって、そのようなヒト化抗体は、実質的に完全ではないヒト可変ドメインが、非ヒト種由来の対応する配列によって置換されたキメラ抗体である。
【０１８８】
ヒトのフレームワーク領域および定常領域に加えて、ヒト可変領域をも含む完全ヒト抗体を用いることもできる。そのような抗体は、当技術分野において公知のさまざまな手法を用いて作製することができる。例えば、インビトロの方法は、バクテリオファージ上に提示されたヒト抗体断片の組換えライブラリーの使用を含む（例えば、Hoogenboom & Winter, J. Mol. Biol. 227:381 (1991)を参照）。同様に、ヒト免疫グロブリン遺伝子座を、トランスジェニック動物、例えば内因性の免疫グロブリン遺伝子が部分的または完全に不活性化されたマウスに導入することによって、ヒト抗体を作製することもできる。このアプローチは、例えば米国特許第6,150,584号、第5,545,807号、第5,545,806号、第5,569,825号、第5,625,126号、第5,633,425号、および第5,661,016号に記載されている。
【０１８９】
上記のようにして得られた抗体を、均質になるまで精製してもよい。例えば、一般のタンパク質に対して使用される分離および精製方法に従って、抗体の分離および精製を行うことができる。例えば、これらに限定されないが、アフィニティークロマトグラフィーなどのカラムクロマトグラフィー、濾過、限外濾過、塩析、透析、ＳＤＳポリアクリルアミドゲル電気泳動、および等電点電気泳動などを適切に選択して組み合わせて使用することによって、抗体を分離および単離することができる（Antibodies: A Laboratory Manual. Ed Harlow and David Lane, Cold Spring Harbor Laboratory (1988)）。プロテインＡカラムおよびプロテインＧカラムをアフィニティーカラムとして用いることができる。用いられる例示的なプロテインＡカラムには、例えばＨｙｐｅｒ  Ｄ、ＰＯＲＯＳ、およびＳｅｐhａｒｏｓｅ  Ｆ．Ｆ（Ｐｈａｒｍａｃｉａ）が含まれる。
【０１９０】
例示的なクロマトグラフィーには、アフィニティークロマトグラフィー以外に、例えばイオン交換クロマトグラフィー、疎水性クロマトグラフィー、ゲル濾過、逆相クロマトグラフィー、吸着クロマトグラフィーなどが含まれる（Strategies for Protein Purification and Characterization: A Laboratory Course Manual. Ed Daniel R. Marshak et al., Cold Spring Harbor Laboratory Press (1996)）。クロマトグラフィー手順は、ＨＰＬＣおよびＦＰＬＣなどの液相クロマトグラフィーによって実施することができる。
【０１９１】
例えば、吸光度の測定、酵素結合免疫吸着アッセイ（ＥＬＩＳＡ）、酵素イムノアッセイ（ＥＩＡ）、ラジオイムノアッセイ（ＲＩＡ）および／または免疫蛍光法を、本発明の抗体の抗原結合活性を測定するために用いてもよい。ＥＬＩＳＡの場合、本発明の抗体をプレート上に固定化し、本発明のペプチドをプレートに添加し、続いて、所望の抗体を含む試料、例えば抗体産生細胞の培養上清または精製抗体を添加する。次いで、一次抗体を認識し、アルカリホスファターゼなどの酵素で標識された二次抗体を添加し、プレートをインキュベートする。続いて洗浄後に、ｐ−ニトロフェニルリン酸などの酵素基質をプレートに添加し、吸光度を測定して、試料の抗原結合活性を評価する。ペプチドの断片、例えばＣ末端断片またはＮ末端断片などを、抗体の結合活性を評価するための抗原として用いてもよい。本発明による抗体の活性を評価するために、ＢＩＡｃｏｒｅ（Ｐｈａｒｍａｃｉａ）を用いてもよい。
【０１９２】
上記の方法は、本発明の抗体を本発明のペプチドを含むと推定される試料に曝露させて、抗体とペプチドによって形成された免疫複合体を検出または測定することによって、本発明のペプチドの検出または測定を可能にする。
【０１９３】
本発明によるペプチドの検出または測定の方法は、ペプチドを特異的に検出または測定することができるため、本方法は、ペプチドを用いる種々の実験において有用であり得る。
【０１９４】
ＸＩＩ．ベクターおよび宿主細胞
本発明はまた、本発明のペプチドをコードするヌクレオチドが導入されたベクターおよび宿主細胞も提供する。本発明のベクターは、本発明のヌクレオチド、特にＤＮＡを宿主細胞内に保持させるため、本発明のペプチドを発現させるため、または本発明のヌクレオチドを遺伝子治療のために投与するために有用である。
【０１９５】
大腸菌（Ｅ．  ｃｏｌｉ）が宿主細胞であり、ベクターを大腸菌（例えば、ＪＭ１０９、ＤＨ５α、ＨＢ１０１またはＸＬ１Ｂｌｕｅ）内で増幅して大量に産生させる場合には、ベクターは、大腸菌において増幅するための「複製起点」、および、形質転換された大腸菌を選択するためのマーカー遺伝子（例えば、アンピシリン、テトラサイクリン、カナマイシン、クロラムフェニコールなどの薬物によって選択される薬物耐性遺伝子）を有する必要がある。例えば、Ｍ１３系ベクター、ｐＵＣ系ベクター、ｐＢＲ３２２、ｐＢｌｕｅｓｃｒｉｐｔ、ｐＣＲ−Ｓｃｒｉｐｔなどを用いることができる。加えて、上記のベクターと同様に、ｐＧＥＭ−Ｔ、ｐＤＩＲＥＣＴおよびｐＴ７も、ｃＤＮＡのサブクローニングおよび抽出に用いることができる。本発明のタンパク質を産生させるためにベクターを用いる場合には、発現ベクターが特に有用である。例えば、大腸菌において発現させる発現ベクターは、大腸菌内で増幅するために上記の特性を有する必要がある。ＪＭ１０９、ＤＨ５α、ＨＢ１０１またはＸＬ１Ｂｌｕｅなどの大腸菌を宿主細胞として用いる場合、ベクターは、大腸菌内で所望の遺伝子を効率的に発現し得るプロモーター、例えば、ｌａｃＺプロモーター（Ward et al., Nature 341: 544-6 (1989)；FASEB J 6: 2422-7 (1992)）、ａｒａＢプロモーター（Better et al., Science 240: 1041-3 (1988)）、Ｔ７プロモーターなどを有する必要がある。この点に関して、例えば、ｐＧＥＸ−５Ｘ−１（Ｐｈａｒｍａｃｉａ）、「ＱＩＡｅｘｐｒｅｓｓ  ｓｙｓｔｅｍ」（Ｑｉａｇｅｎ）、ｐＥＧＦＰおよびｐＥＴ（この場合、宿主はＴ７  ＲＮＡポリメラーゼを発現するＢＬ２１であることが好ましい）を上記のベクターの代わりに用いることもできる。さらに、ベクターが、ペプチド分泌のためのシグナル配列をも含んでもよい。大腸菌のペリプラズムへのペプチドの分泌を導く例示的なシグナル配列は、ｐｅｌＢシグナル配列（Lei et al., J Bacteriol 169: 4379 (1987)）である。ベクターを標的宿主細胞に導入するための手段には、例えば、塩化カルシウム法およびエレクトロポレーション法が含まれる。
【０１９６】
大腸菌の他に、例えば、哺乳動物由来の発現ベクター（例えば、ｐｃＤＮＡ３（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ）およびｐＥＧＦ−ＢＯＳ（Nucleic Acids Res 18(17): 5322 (1990))、ｐＥＦ、ｐＣＤＭ８）、昆虫細胞由来の発現ベクター（例えば，「Ｂａｃ−ｔｏ−ＢＡＣバキュロウイルス発現系」（ＧＩＢＣＯ  ＢＲＬ）、ｐＢａｃＰＡＫ８）、植物由来の発現ベクター（例えば、ｐＭＨ１、ｐＭＨ２）、動物ウイルス由来の発現ベクター（例えば、ｐＨＳＶ、ｐＭＶ、ｐＡｄｅｘＬｃｗ）、レトロウイルス由来の発現ベクター（例えば、ｐＺＩｐｎｅｏ）、酵母由来の発現ベクター（例えば、「ピキア（Ｐｉｃｈｉａ）発現キット」（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ）、ｐＮＶ１１、ＳＰ−Ｑ０１）および枯草菌（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｕｂｔｉｌｉｓ）由来の発現ベクター（例えば、ｐＰＬ６０８、ｐＫＴＨ５０）を、本発明のポリペプチドの産生に使用することができる。
【０１９７】
ベクターを、ＣＨＯ細胞、ＣＯＳ細胞またはＮＩＨ３Ｔ３細胞などの動物細胞内で発現させるためには、ベクターは、この種の細胞における発現に必要なプロモーター、例えば、ＳＶ４０プロモーター（Mulligan et al., Nature 277: 108 (1979)）、ＭＭＬＶ−ＬＴＲプロモーター、ＥＦ１αプロモーター（Mizushima et al., Nucleic Acids Res 18: 5322 (1990)）、ＣＭＶプロモーターなどを有する必要があるほか、形質転換体を選択するためのマーカー遺伝子（例えば、薬物（例えば、ネオマイシン、Ｇ４１８）によって選択される薬物耐性遺伝子）を有することが好ましい。これらの特徴を備える公知のベクターの例には、例えば、ｐＭＡＭ、ｐＤＲ２、ｐＢＫ−ＲＳＶ、ｐＢＫ−ＣＭＶ、ｐＯＰＲＳＶおよびｐＯＰ１３が含まれる。
【０１９８】
以下の実施例は、本発明を説明するため、ならびに当業者が同じものを作製および使用するのを支援するために提供される。実施例は、本発明の範囲をいかなる形であれ他の方法で限定することを意図するものではない。
【実施例】
【０１９９】
材料および方法
細胞株
ＨＬＡ−Ａ２４陽性ヒトＢリンパ球をエプスタイン・バーウイルスで形質転換して、Ａ２４リンパ芽球様細胞株（Ａ２４ＬＣＬ）を樹立した。アフリカミドリザル腎細胞株であるＣＯＳ７は、ＡＴＣＣから購入した。
【０２００】
ＶＡＮＧＬ１由来のペプチドの候補選択
ＨＬＡ−Ａ＊２４０２分子に結合するＶＡＮＧＬ１由来の９ｍｅｒおよび１０ｍｅｒペプチドを、結合予測ソフトウエア「ＢＩＭＡＳ」（www-bimas.cit.nih.gov/molbio/hla_bind)(Parker  et al. （J Immunol 1994, 152(1): 163-75)、 Kuzushima  et al.（ Blood 2001, 98(6): 1872-81)）を用いて予測した。これらのペプチドは、標準的な固相合成法に従ってＳＩＧＭＡ（札幌、日本）によって合成され、逆相高速液体クロマトグラフィー（ＨＰＬＣ）によって精製した。ペプチドの純度（＞９０％）および同一性を、それぞれ分析用ＨＰＬＣおよび質量分析によって測定した。ペプチドをジメチルスルホキシド（ＤＭＳＯ）に２０  ｍｇ／ｍｌで溶解し、−８０℃で保存した。
【０２０１】
インビトロでのＣＴＬ誘導
単球由来の樹状細胞（ＤＣ）を抗原提示細胞（ＡＰＣ）として用いて、ヒト白血球抗原（ＨＬＡ）上に提示されたペプチドに対する細胞傷害性Ｔリンパ球（ＣＴＬ）応答を誘導した。他所に記載されているように、ＤＣをインビトロで作製した（Nakahara S et al., Cancer Res 2003 Jul 15, 63(14): 4112-8）。具体的には、Ｆｉｃｏｌｌ−Ｐｌａｑｕｅ（Ｐｈａｒｍａｃｉａ）溶液によって健常なボランティア（ＨＬＡ−Ａ＊２４０２陽性）から単離した末梢血単核細胞（ＰＢＭＣ）を、プラスチック製の組織培養皿（Ｂｅｃｔｏｎ  Ｄｉｃｋｉｎｓｏｎ）への付着によって分離し、それらを単球画分として濃縮した。２％加熱非働化自己血清（ＡＳ）を含むＡＩＭ−Ｖ培地（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ）中で、１，０００  Ｕ／ｍｌの顆粒球マクロファージコロニー刺激因子（ＧＭ−ＣＳＦ）（Ｒ＆Ｄ  Ｓｙｓｔｅｍ）および１，０００  Ｕ／ｍｌのインターロイキン（ＩＬ）−４（Ｒ＆Ｄ  Ｓｙｓｔｅｍ）の存在下で、単球が濃縮した集団を培養した。培養の７日後、サイトカインで誘導したＤＣに、ＡＩＭ−Ｖ培地中で３時間、３７℃にて、３μｇ／ｍｌのβ２−ミクログロブリンの存在下で２０μｇ／ｍｌの各合成ペプチドをパルスした。作製した細胞は、その細胞表面上に、ＣＤ８０、ＣＤ８３、ＣＤ８６、およびＨＬＡクラスＩＩなどのＤＣ関連分子を発現しているようであった（データは示さず）。次いで、ペプチドパルスしたこれらのＤＣをＸ線照射（２０  Ｇｙ）により不活化し、ＣＤ８  Ｐｏｓｉｔｉｖｅ  Ｉｓｏｌａｔｉｏｎ  Ｋｉｔ（Ｄｙｎａｌ）を用いた陽性選択によって得られた自己ＣＤ８＋  Ｔ細胞と１：２０の比率で混合した。これらの培養物を４８ウェルプレート（Ｃｏｒｎｉｎｇ）中に準備し、各ウェルは、０．５  ｍｌのＡＩＭ−Ｖ／２％  ＡＳ培地中に、１．５×１０４個のペプチドパルスしたＤＣ、３×１０５個のＣＤ８＋  Ｔ細胞、および１０  ｎｇ／ｍｌのＩＬ−７（Ｒ＆Ｄ  Ｓｙｓｔｅｍ）を含んだ。３日後、これらの培養物に、ＩＬ−２（ＣＨＩＲＯＮ）を最終濃度２０  ＩＵ／ｍｌになるように補充した。７日目および１４日目に、ペプチドパルスした自己ＤＣでＴ細胞をさらに刺激した。ＤＣは上記と同じ方法によって毎回調製した。２１日目の３回目のペプチド刺激後、ペプチドパルスしたＡ２４ＬＣＬ細胞に対してＣＴＬを試験した（Tanaka H et al., Br J Cancer 2001 Jan 5, 84(1): 94-9;Umano Y et al., Br J Cancer 2001 Apr 20, 84(8): 1052-7;Uchida N et al., Clin Cancer Res 2004 Dec 15, 10(24): 8577-86;Suda T et al., Cancer Sci 2006 May, 97(5): 411-9;Watanabe T et al., Cancer Sci 2005 Aug, 96(8): 498-506）。
【０２０２】
ＣＴＬ増殖手順
Ｒｉｄｄｅｌｌ  ｅｔ  ａｌ．（Walter EA et al., N Engl J Med 1995 Oct 19, 333(16): 1038-44;Riddell SR et al., Nat Med 1996 Feb, 2(2): 216-23）によって記載されている方法と類似の方法を用いて、ＣＴＬを培養液中で増殖させた。合計５×１０４個のＣＴＬを、４０  ｎｇ／ｍｌの抗ＣＤ３モノクローナル抗体（Ｐｈａｒｍｉｎｇｅｎ）の存在下で、マイトマイシンＣによって不活化した２種類のヒトＢリンパ芽球様細胞株と共に、２５  ｍｌのＡＩＭ−Ｖ／５％  ＡＳ培地中に懸濁した。培養開始１日後に、１２０  ＩＵ／ｍｌのＩＬ−２を該培養物に添加した。５、８、および１１日目に、３０  ＩＵ／ｍｌのＩＬ−２を含む新たなＡＩＭ−Ｖ／５％  ＡＳ培地を、培養物に供給した（Tanaka H et al., Br J Cancer 2001 Jan 5, 84(1): 94-9;Umano Y et al., Br J Cancer 2001 Apr 20, 84(8): 1052-7;Uchida N et al., Clin Cancer Res 2004 Dec 15, 10(24): 8577-86;Suda T et al., Cancer Sci 2006 May, 97(5): 411-9;Watanabe T et al., Cancer Sci 2005 Aug, 96(8): 498-506）。
【０２０３】
ＣＴＬクローンの樹立
９６丸底マイクロタイタープレート（Ｎａｌｇｅ  Ｎｕｎｃ  Ｉｎｔｅｒｎａｔｉｏｎａｌ）において０．３個、１個、および３個のＣＴＬ／ウェルとなるように、希釈を行った。ＣＴＬを、１×１０４細胞／ウェルの２種類のヒトＢリンパ芽球様細胞株、３０  ｎｇ／ｍｌの抗ＣＤ３抗体、および１２５  Ｕ／ｍｌのＩＬ−２と共に、全部で１５０μｌ／ウェルの５％ＡＳ含有ＡＩＭ−Ｖ培地中で培養した。１０日後、５０μｌ／ウェルのＩＬ−２を、１２５  Ｕ／ｍｌ  ＩＬ−２の最終濃度に到達するように培地に添加した。１４日目にＣＴＬ活性を試験し、上記と同じ方法を用いてＣＴＬクローンを増殖させた（Uchida N et al., Clin Cancer Res 2004 Dec 15, 10(24): 8577-86;Suda T et al., Cancer Sci 2006 May, 97(5): 411-9;Watanabe T et al., Cancer Sci 2005 Aug, 96(8): 498-506）。
【０２０４】
特異的ＣＴＬ活性
特異的ＣＴＬ活性を調べるために、インターフェロン（ＩＦＮ）−γ酵素結合免疫スポット（ＥＬＩＳＰＯＴ）アッセイおよびＩＦＮ−γ酵素結合免疫吸着アッセイ（ＥＬＩＳＡ）を行った。具体的には、ペプチドパルスしたＡ２４ＣＬ（１×１０４個／ウェル）を刺激細胞として調製した。４８ウェル中の培養細胞を応答細胞として用いた。ＩＦＮ−γ  ＥＬＩＳＰＯＴアッセイおよびＩＦＮ−γ  ＥＬＩＳＡアッセイは、製造手順の下で行った。
【０２０５】
プラスミドトランスフェクション
標的遺伝子またはＨＬＡ−Ａ＊２４０２のオープンリーディングフレームをコードするｃＤＮＡをＰＣＲによって増幅した。ＰＣＲ増幅産物をｐＣＡＧＧＳベクターにクローニングした。製造業者の推奨する手順に従ってリポフェクタミン２０００（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ）を用いて、標的遺伝子およびＨＬＡ−Ａ２４の陰性細胞株であるＣＯＳ７にプラスミドをトランスフェクトした。トランスフェクションから２日後、トランスフェクトした細胞をベルセン（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ）で回収し、ＣＴＬ活性アッセイのための標的細胞（５×１０４細胞／ウェル）として使用した。
【０２０６】
結果
がんにおけるＶＡＮＧＬ１発現の増大
ｃＤＮＡ−マイクロアレイを用いてさまざまながんから得られた包括的遺伝子発現プロファイルデータから、ＶＡＮＧＬ１（ＧｅｎＢａｎｋアクセッション番号第ＡＢ０５７５９６（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：３４））の発現が上昇していることが明らかになった。ＶＡＮＧＬ１の発現は、対応する正常組織と比較して、膀胱がん２７例中２３例、乳がん４７例中３０例、子宮頸がん１７例中１４例、胆管細胞癌１２例中９例、子宮内膜症１２例中５例、肝臓がん１３例中１１例、ＮＳＣＬＣ  ３５例中２９例、骨肉腫２３例中８例、膵がん８例中８例、ＳＣＬＣ  １５例中１２例、およびＡＭＬ  ３５例中１４例において確かに上昇していた（表１）。
【０２０７】
（表１）対応する正常組織と比較してがん性組織においてＶＡＮＧＬ１の上方制御が認められた症例の比率
2012519470.tif 000002
【０２０８】
ＶＡＮＧＬ１由来のＨＬＡ−Ａ２４結合ペプチドの予測
表２ａおよび２ｂは、ＶＡＮＧＬ１のＨＬＡ−Ａ２４結合９ｍｅｒおよび１０ｍｅｒペプチドを、結合親和性の高い順に示す。潜在的なＨＬＡ−Ａ２４結合能を有する合計３３種のペプチドを選択し、エピトープペプチドを決定するために調べた。
【０２０９】
（表２ａ）ＶＡＮＧＬ１に由来するＨＬＡ−Ａ２４結合９ｍｅｒペプチド
2012519470.tif 000003
開始位置はＶＡＮＧＬ１のＮ末端からのアミノ酸残基の数を示す。
結合スコアは「ＢＩＭＡＳ」から導き出している。
【０２１０】
（表２ｂ）ＶＡＮＧＬ１に由来するＨＬＡ−Ａ２４結合１０ｍｅｒペプチド
2012519470.tif 000004
開始位置はＶＡＮＧＬ１のＮ末端からのアミノ酸残基の数を示す。
結合スコアは「ＢＩＭＡＳ」から導き出している。
【０２１１】
ＨＬＡ−Ａ＊２４０２拘束性のＶＡＮＧＬ１由来の予測ペプチドによるＣＴＬの誘導、およびＶＡＮＧＬ１由来ペプチドで刺激したＣＴＬ株の樹立
ＶＡＮＧＬ１由来のペプチドに対するＣＴＬを、「材料および方法」に記載したプロトコールに従って作製した。ペプチド特異的なＣＴＬ活性は、ＩＦＮ−γ  ＥＬＩＳＰＯＴアッセイによって決定した（図１ａ〜ｋ）。ＶＡＮＧＬ１−Ａ２４−９−４４３（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１）で刺激したウェル番号＃５（ａ）、ＶＡＮＧＬ１−Ａ２４−９−１８２（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：８）による＃１（ｂ）、ＶＡＮＧＬ１−Ａ２４−９−１８４（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：９）による＃５（ｃ）、ＶＡＮＧＬ１−Ａ２４−９−１０９（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１１）による＃２、＃３、＃５、＃６、＃７および＃８（ｄ）、ＶＡＮＧＬ１−Ａ２４−９−１９５（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１２）による＃２および＃４（ｅ）、ＶＡＮＧＬ１−Ａ２４−１０−２３４（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１８）による＃２（ｆ）、ＶＡＮＧＬ１−Ａ２４−１０−１２３（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２２）による＃１、＃３、＃６および＃８（ｇ）、ＶＡＮＧＬ１−Ａ２４−１０−２３１（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２４）による＃５および＃６（ｈ）、ＶＡＮＧＬ１−Ａ２４−１０−１５２（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２５）による＃３（ｉ）、ＶＡＮＧＬ１−Ａ２４−１０−２８６（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２６）による＃１および＃８（ｊ）、ならびにＶＡＮＧＬ１−Ａ２４−１０−２１５（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：３２）による＃２（ｋ）は、対照ウェルと比較して強力なＩＦＮ−γ産生を示した。さらに、ＶＡＮＧＬ１−Ａ２４−９−４４３（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１）で刺激した陽性ウェル番号＃５（ａ）、ＶＡＮＧＬ１−Ａ２４−９−１８２（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：８）による＃１（ｂ）、ＶＡＮＧＬ１−Ａ２４−９−１８４（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：９）による＃５（ｃ）、ＶＡＮＧＬ１−Ａ２４−９−１０９（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１１）による＃２（ｄ）、ＶＡＮＧＬ１−Ａ２４−９−１９５（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１２）による＃４（ｅ）、ＶＡＮＧＬ１−Ａ２４−１０−２３４（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１８）による＃２（ｆ）、ＶＡＮＧＬ１−Ａ２４−１０−１２３（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２２）による＃３（ｇ）、ＶＡＮＧＬ１−Ａ２４−１０−２３１（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２４）による＃５（ｈ）、ＶＡＮＧＬ１−Ａ２４−１０−１５２（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２５）による＃３（ｉ）、およびＶＡＮＧＬ１−Ａ２４−１０−２１５（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：３２）による＃２（ｊ）、における細胞を増殖させて、ＣＴＬ株を樹立した。これらのＣＴＬ株のＣＴＬ活性を、ＩＦＮ−γ  ＥＬＩＳＡアッセイによって測定した（図２ａ〜ｊ）。すべてのＣＴＬ株が、ペプチドをパルスしなかった標的細胞と比較して、対応するペプチドをパルスした標的細胞に対して強力なＩＦＮ−γ産生を示した。一方、表１に示した他のペプチドによる刺激によっては、それらのペプチドがＨＬＡ−Ａ＊２４０２との結合活性を有する可能性があるにもかかわらず、強力なＩＦＮ−γ産生は検出されなかった（データは示さず）。結果として、ＶＡＮＧＬ１由来の１１種のペプチドが、強力なＣＴＬを誘導し得るペプチドとしてスクリーニングされたことが示された。
【０２１２】
ＶＡＮＧＬ１特異的ペプチドに対するＣＴＬクローンの樹立
「材料および方法」に記載した通りに、ＣＴＬ株からの限界希釈によってＣＴＬクローンを樹立し、ペプチドをパルスした標的細胞に対するＣＴＬクローンからのＩＦＮ−γ産生を、ＩＦＮ−γ  ＥＬＩＳＡアッセイによって測定した。図３において、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：８（ａ）、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１８（ｂ）、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２２（ｃ）およびＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２４（ｄ）で刺激したＣＴＬクローンから、強力なＩＦＮ−γ産生が測定された。
【０２１３】
ＶＡＮＧＬ１およびＨＬＡ−Ａ＊２４０２を外因的に発現する標的細胞に対する特異的ＣＴＬ活性
これらのペプチドに対して産生された樹立ＣＴＬ株を、ＶＡＮＧＬ１およびＨＬＡ−Ａ＊２４０２分子を外因的に発現する標的細胞を認識する能力について調べた。ＶＡＮＧＬ１の全長およびＨＬＡ−Ａ＊２４０２分子遺伝子の両方をトランスフェクトしたＣＯＳ７細胞（ＶＡＮＧＬ１およびＨＬＡ−Ａ＊２４０２遺伝子を外因的に発現する標的細胞の具体的なモデル）に対する特異的ＣＴＬ活性を、対応するペプチドによって産生されたＣＴＬ株をエフェクター細胞として用いて試験した。ＶＡＮＧＬ１遺伝子の全長またはＨＬＡ−Ａ＊２４０２のいずれかをトランスフェクトしたＣＯＳ７細胞を、対照として調製した。図４において、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１で刺激したＣＴＬは、ＶＡＮＧＬ１およびＨＬＡ−Ａ＊２４０２の両方を発現するＣＯＳ７細胞に対して強力なＣＴＬ活性を示した。一方、対照に対して有意な特異的ＣＴＬ活性は検出されなかった。したがってこれらのデータにより、ＶＡＮＧＬ１−Ａ２４−９−４４３（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１）のペプチドが内因的にプロセシングされて、ＨＬＡ−Ａ＊２４０２分子と共に標的細胞上に発現され、ＣＴＬによって認識されることが明らかに実証された。これらの結果から、ＶＡＮＧＬ１に由来するこのペプチドが、ＶＡＮＧＬ１を発現する腫瘍を有する患者に対してがんワクチンを適用するために利用できる可能性があることが示された。
【０２１４】
抗原ペプチドの相同性解析
ＶＡＮＧＬ１−Ａ２４−９−４４３（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１）、ＶＡＮＧＬ１−Ａ２４−９−１８２（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：８）、ＶＡＮＧＬ１−Ａ２４−９−１８４（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：９）、ＶＡＮＧＬ１−Ａ２４−９−１０９（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１１）、ＶＡＮＧＬ１−Ａ２４−９−１９５（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１２）、ＶＡＮＧＬ１−Ａ２４−１０−２３４（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１８）、ＶＡＮＧＬ１−Ａ２４−１０−１２３（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２２）、ＶＡＮＧＬ１−Ａ２４−１０−２３１（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２４）、ＶＡＮＧＬ１−Ａ２４−１０−１５２（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２５）、ＶＡＮＧＬ１−Ａ２４−１０−２８６（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２６）およびＶＡＮＧＬ１−Ａ２４−１０−２１５（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：３２）で刺激したＣＴＬは、有意かつ特異的なＣＴＬ活性を示した。この結果は、ＶＡＮＧＬ１−Ａ２４−９−４４３（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１）、ＶＡＮＧＬ１−Ａ２４−９−１８２（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：８）、ＶＡＮＧＬ１−Ａ２４−９−１８４（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：９）、ＶＡＮＧＬ１−Ａ２４−９−１０９（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１１）、ＶＡＮＧＬ１−Ａ２４−９−１９５（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１２）、ＶＡＮＧＬ１−Ａ２４−１０−２３４（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１８）、ＶＡＮＧＬ１−Ａ２４−１０−１２３（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２２）、ＶＡＮＧＬ１−Ａ２４−１０−２３１（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２４）、ＶＡＮＧＬ１−Ａ２４−１０−１５２（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２５）、ＶＡＮＧＬ１−Ａ２４−１０−２８６（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２６）およびＶＡＮＧＬ１−Ａ２４−１０−２１５（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：３２）の配列が、ヒト免疫系を感作させることが知られている他の分子に由来するペプチドと相同的であるという事実に起因する可能性がある。この可能性を否定するために、ＢＬＡＳＴアルゴリズム(www.ncbi.nlm.nih.gov/blast/blast.cgi)を用いて、クエリーとしてのこれらのペプチド配列に対して相同性解析を行ったところ、有意な相同性を有する配列はないことが判明した。相同性解析のこれらの結果は、ＶＡＮＧＬ１−Ａ２４−９−４４３（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１）、ＶＡＮＧＬ１−Ａ２４−９−１８２（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：８）、ＶＡＮＧＬ１−Ａ２４−９−１８４（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：９）、ＶＡＮＧＬ１−Ａ２４−９−１０９（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１１）、ＶＡＮＧＬ１−Ａ２４−９−１９５（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１２）、ＶＡＮＧＬ１−Ａ２４−１０−２３４（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１８）、ＶＡＮＧＬ１−Ａ２４−１０−１２３（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２２）、ＶＡＮＧＬ１−Ａ２４−１０−２３１（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２４）、ＶＡＮＧＬ１−Ａ２４−１０−１５２（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２５）、ＶＡＮＧＬ１−Ａ２４−１０−２８６（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２６）およびＶＡＮＧＬ１−Ａ２４−１０−２１５（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：３２）の配列が固有のものであり、したがって、これらの分子がある非関連分子に対して予期しない免疫応答を引き起こす可能性はほとんどないことを示している。
【０２１５】
結論として、ＶＡＮＧＬ１由来の新規なＨＬＡ−Ａ２４エピトープペプチドが同定された。さらに、ＶＡＮＧＬ１のエピトープペプチドが、がん免疫療法のために有用であることが実証された。
【０２１６】
産業上の利用可能性
本発明は、強力かつ特異的な抗腫瘍免疫応答を誘導し、かつ幅広いがんの種類に対する適用性を有する新規ＴＡＡ、詳細にはＶＡＮＧＬ１由来の新規ＴＡＡを提供する。このようなＴＡＡは、ＶＡＮＧＬ１と関連のある疾患、例えば、がん、より詳細には膀胱がん、乳がん、子宮頸がん、胆管細胞癌、子宮内膜症、肝臓がん、ＮＳＣＬＣ、骨肉腫、膵がん、ＳＣＬＣおよびＡＭＬなどに対するペプチドワクチンとして有用である。
【０２１７】
本発明はその特定の態様に関して本明細書において詳細に記載されるが、前述の説明は本質的に例示的かつ説明的なものであって、本発明およびその好ましい態様を説明することを意図していることが理解されるべきである。ルーチンな実験を通して、当業者は、その境域および境界が添付の特許請求の範囲によって規定される本発明の精神および範囲から逸脱することなく、さまざまな変更および修正がなされ得ることを容易に認識するであろう。
【図１】
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【図２−１】
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【図２−２】
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【図３】
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【国際調査報告】
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