【手続補正書】
【提出日】令和2年4月15日(2020.4.15)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
少なくとも1種の分離された細菌及び薬学的に許容される賦形剤を含む治療用組成物であって、前記細菌は、16SリボソームRNA(rRNA)をコードする遺伝子を含み、前記遺伝子は、配列番号1〜51のいずれか1つに示された配列と少なくとも90%の配列同一性を有する配列を含む、治療用組成物。
【請求項２】
16S rRNAをコードする遺伝子が、
配列番号1に示された配列と少なくとも90%の配列同一性を有する配列、
配列番号2に示された配列と少なくとも90%の配列同一性を有する配列、
配列番号3に示された配列と少なくとも90%の配列同一性を有する配列、
配列番号4に示された配列と少なくとも90%の配列同一性を有する配列、
配列番号5に示された配列と少なくとも90%の配列同一性を有する配列、
配列番号6に示された配列と少なくとも90%の配列同一性を有する配列、
配列番号7に示された配列と少なくとも90%の配列同一性を有する配列、
配列番号8に示された配列と少なくとも90%の配列同一性を有する配列、
配列番号9に示された配列と少なくとも90%の配列同一性を有する配列、
配列番号10に示された配列と少なくとも90%の配列同一性を有する配列、
配列番号11に示された配列と少なくとも90%の配列同一性を有する配列、
配列番号12に示された配列と少なくとも90%の配列同一性を有する配列、
配列番号13に示された配列と少なくとも90%の配列同一性を有する配列、
配列番号14に示された配列と少なくとも90%の配列同一性を有する配列、
配列番号15に示された配列と少なくとも90%の配列同一性を有する配列、
配列番号16に示された配列と少なくとも90%の配列同一性を有する配列、
配列番号17に示された配列と少なくとも90%の配列同一性を有する配列、
配列番号18に示された配列と少なくとも90%の配列同一性を有する配列、
配列番号19に示された配列と少なくとも90%の配列同一性を有する配列、
配列番号20に示された配列と少なくとも90%の配列同一性を有する配列、
配列番号21に示された配列と少なくとも90%の配列同一性を有する配列、
配列番号22に示された配列と少なくとも90%の配列同一性を有する配列、
配列番号23に示された配列と少なくとも90%の配列同一性を有する配列、
配列番号24に示された配列と少なくとも90%の配列同一性を有する配列、
配列番号25に示された配列と少なくとも90%の配列同一性を有する配列、
配列番号26に示された配列と少なくとも90%の配列同一性を有する配列、
配列番号27に示された配列と少なくとも90%の配列同一性を有する配列、
配列番号28に示された配列と少なくとも90%の配列同一性を有する配列、
配列番号29に示された配列と少なくとも90%の配列同一性を有する配列、
配列番号30に示された配列と少なくとも90%の配列同一性を有する配列、
配列番号31に示された配列と少なくとも90%の配列同一性を有する配列、
配列番号32に示された配列と少なくとも90%の配列同一性を有する配列、
配列番号33に示された配列と少なくとも90%の配列同一性を有する配列、
配列番号34に示された配列と少なくとも90%の配列同一性を有する配列、
配列番号35に示された配列と少なくとも90%の配列同一性を有する配列、
配列番号36に示された配列と少なくとも90%の配列同一性を有する配列、
配列番号37に示された配列と少なくとも90%の配列同一性を有する配列、
配列番号38に示された配列と少なくとも90%の配列同一性を有する配列、
配列番号39に示された配列と少なくとも90%の配列同一性を有する配列、
配列番号40に示された配列と少なくとも90%の配列同一性を有する配列、
配列番号41に示された配列と少なくとも90%の配列同一性を有する配列、
配列番号42に示された配列と少なくとも90%の配列同一性を有する配列、
配列番号43に示された配列と少なくとも90%の配列同一性を有する配列、
配列番号44に示された配列と少なくとも90%の配列同一性を有する配列、
配列番号45に示された配列と少なくとも90%の配列同一性を有する配列、
配列番号46に示された配列と少なくとも90%の配列同一性を有する配列、
配列番号47に示された配列と少なくとも90%の配列同一性を有する配列、
配列番号48に示された配列と少なくとも90%の配列同一性を有する配列、
配列番号49に示された配列と少なくとも90%の配列同一性を有する配列、
配列番号50に示された配列と少なくとも90%の配列同一性を有する配列、又は
配列番号51に示された配列と少なくとも90%の配列同一性を有する配列を含む、請求項1に記載の治療用組成物。
【請求項３】
配列同一性が少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも98.7%、少なくとも99%、又は100%である、請求項1又は2に記載の治療用組成物。
【請求項４】
16S rRNAをコードする遺伝子が、配列番号1若しくは配列番号21に示された配列と少なくとも90%の配列同一性、配列番号29に示された配列と少なくとも91%の配列同一性、配列番号6、11、19、若しくは24のいずれか1つに示された配列と少なくとも92%の配列同一性、配列番号13、22、26、若しくは35のいずれか1つに示された配列と少なくとも93%の配列同一性、配列番号5、14、15、17、18、23、若しくは50のいずれか1つに示された配列と少なくとも94%の配列同一性、配列番号20、33、41、43、45、46、47、若しくは49のいずれか1つに示された配列と少なくとも95%の配列同一性、配列番号2、7、8、10、12、30、32、39、42、44、若しくは48のいずれか1つに示された配列と少なくとも96%の配列同一性、配列番号3、16、25、31、34、36、37、若しくは40のいずれか1つに示された配列と少なくとも97%の配列同一性、配列番号4若しくは9のいずれか1つに示された配列と少なくとも98%の配列同一性、又は配列番号27、28、38、若しくは51のいずれか1つに示された配列と少なくとも99%の配列同一性を有する配列を含む、請求項1又は2に記載の治療用組成物。
【請求項５】
16S rRNAをコードする遺伝子が、配列番号1若しくは配列番号21に示された配列と少なくとも90%の配列同一性、配列番号6若しくは11に示された配列と少なくとも92%の配列同一性、配列番号35に示された配列と少なくとも93%の配列同一性、配列番号5、19、22、23、若しくは50のいずれか1つに示された配列と少なくとも94%の配列同一性、配列番号13、15、29、33、41、43、45、若しくは46のいずれか1つに示された配列と少なくとも95%の配列同一性、配列番号7、12、32、39、42、若しくは44のいずれか1つに示された配列と少なくとも96%の配列同一性、配列番号3、8、10、16、34、36、37、40、48、若しくは49のいずれか1つに示された配列と少なくとも97%の配列同一性、配列番号4、9、17、若しくは31のいずれか1つに示された配列と少なくとも98%の配列同一性、配列番号2、20、38、若しくは51のいずれか1つに示された配列と少なくとも99%の配列同一性、又は配列番号14、18、24、25、26、27、28、30、若しくは47のいずれか1つに示された配列と100%の配列同一性を有する配列を含む、請求項1又は2に記載の治療用組成物。
【請求項６】
分離された細菌が、Leibniz-Institut DSMZに、アクセッション番号DSM32191、DSM32147、DSM32149、DSM32175、DSM32153、DSM32152、DSM32158、DSM32192、DSM32148、DSM32166、DSM32151、DSM32150、DSM32193、DSM32162、DSM32194、DSM32163、DSM32205、DSM32195、DSM32164、DSM32177、DSM32167、DSM32165、DSM32169、DSM32168、DSM32178、DSM32182、DSM32179、DSM32180、DSM32184、DSM32181、DSM32183、DSM32262、DSM32211、DSM32219、DSM32222、DSM32261、DSM32212、DSM32220、DSM32213、DSM32226、DSM32215、DSM32216、DSM32217、DSM32221、DSM32218、DSM32224、DSM32214、DSM32263、DSM32223、DSM32225、又はDSM32265で寄託された細菌である、請求項1〜5のいずれか一項に記載の治療用組成物。
【請求項７】
組成物が、少なくとも2種の異なる分離された細菌を含み、細菌は、請求項1〜6のいずれか一項で規定されたものである、請求項1〜6のいずれか一項に記載の治療用組成物。
【請求項８】
個体の胃腸管のディスバイオシスを処置する方法における使用のための、請求項1〜7のいずれか一項に記載の治療用組成物。
【請求項９】
ディスバイオシスが、腸内細菌感染に関連するディスバイオシスであり、場任意選択で腸内細菌感染が病原性細菌による感染であり、さらに任意選択で病原性細菌が、1種又は複数の抗生物質を用いる処置に耐性である、請求項8に記載の使用のための治療用組成物。
【請求項１０】
腸内細菌感染が、クロストリジウム属、エシェリキア属、エンテロコッカス属、クレブシエラ属、エンテロバクター属、プロテウス属、サルモネラ属、赤痢菌属、ブドウ球菌属、ビブリオ属、アエロモナス属、カンピロバクター属、バチルス属、ヘリコバクター属、リステリア属、プレシオモナス属、又はエルシニア属の病原性細菌による感染であり、好ましくは病原性細菌が、クロストリジウム・ディフィシル又は大腸菌である、請求項9に記載の使用のための治療用組成物。
【請求項１１】
腸内細菌感染が、反復性又は慢性の感染である、請求項9又は10に記載の使用のための治療用組成物。
【請求項１２】
ディスバイオシスが、炎症性腸疾患(IBD)、回腸嚢炎、過敏性腸症候群(IBS)、代謝性疾患、神経精神病学的障害、自己免疫疾患、アレルギー障害、癌又は肝性脳症に関連するディスバイオシスである、請求項8に記載の使用のための治療用組成物。
【請求項１３】
IBDが、潰瘍性大腸炎(UC)又はクローン病である、又は
代謝性疾患が、メタボリックシンドローム、肥満、2型真性糖尿病、心臓血管疾患、及び非アルコール性脂肪肝からなる群から選択される、又は
神経精神病学的障害が、パーキンソン病、アルツハイマー病、多発性硬化症、ミオクローヌスジストニア、自閉症、及び慢性疲労症候群からなる群から選択される、又は
自己免疫疾患が、突発性血小板減少性紫斑病、関節炎、シェーグレン症候群、全身性エリテマトーデス、及び橋本甲状腺炎からなる群から選択される、又は
アレルギー障害が、アトピー及び喘息からなる群から選択される、又は
癌が、結直腸癌、腸管外腫瘍、乳腺の腫瘍、肝細胞癌腫、リンパ腫、メラノーマ、及び肺癌からなる群から選択される、
請求項12に記載の使用のための治療用組成物。
【請求項１４】
分離された細菌が胞子形成細菌である、請求項1〜13のいずれか一項に記載の治療用組成物又は使用のための治療用組成物。
【請求項１５】
分離された細菌が、1種又は複数の抗生物質を用いる処置に感受性であり、好ましくは抗生物質が、ベータラクタム、フシジン酸、エルファマイシン、アミノグリコシド、ホスホマイシン、及び/又はツニカマイシンである、請求項1〜14のいずれか一項に記載の治療用組成物又は使用のための治療用組成物。
【請求項１６】
組成物中の細菌の少なくとも1種が、病原性腸内細菌に対して拮抗性であるか、病原性腸内細菌の生育を阻害若しくは予防するか、又は腸内細菌により産生される毒素を中和するか若しくはそれに対して防御する、及び/又は
病原性細菌が、クロストリジウム属、エシェリキア属、エンテロコッカス属、クレブシエラ属、エンテロバクター属、プロテウス属、サルモネラ属、赤痢菌属、ブドウ球菌属、ビブリオ属、アエロモナス属、カンピロバクター属、バチルス属、ヘリコバクター属、リステリア属、プレシオモナス属、又はエルシニア属の病原性細菌であり、好ましくは病原性細菌が、クロストリジウム・ディフィシル又は大腸菌である、及び/又は
組成物中の細菌の少なくとも1種が、免疫調節活性を有する、
請求項1〜15のいずれか一項に記載の治療用組成物又は使用のための治療用組成物。
【請求項１７】
組成物が、プレバイオティクス、担体、不溶性繊維、緩衝剤、浸透圧調節剤、消泡剤、及び/又は防腐剤を更に含む、請求項1〜16のいずれか一項に記載の治療用組成物又は使用のための治療用組成物。
【請求項１８】
組成物がケモスタット培地中で提供される、及び/又は
組成物が生理食塩水、任意選択で0.9%生理食塩水中で提供される、及び/又は
組成物が還元性雰囲気下で提供され、好ましくは組成物がN2、CO2、H2、又はそれらの混合物の下にある、
請求項1〜17のいずれか一項に記載の治療用組成物又は使用のための治療用組成物。
【請求項１９】
組成物が経口投与又は直腸投与用である、請求項1〜18のいずれか一項に記載の治療用組成物又は使用のための治療用組成物。
【請求項２０】
組成物が経口投与用であり、凍結乾燥されており、好ましくは安定化剤及び/又は凍結保護剤を更に含む、請求項1〜19のいずれか一項に記載の治療用組成物又は使用のための治療用組成物。
【請求項２１】
組成物がカプセル、錠剤、又は浣腸剤の形態であり、好ましくはカプセル又は錠剤が、腸溶コーティング、pH依存性、徐放性、及び/又は胃耐性である、請求項1〜20のいずれか一項に記載の治療用組成物又は使用のための治療用組成物。
【請求項２２】
(i)請求項1〜7のいずれか一項に規定の分離された細菌を培養する工程;及び
(ii)(i)で得られた細菌を、薬学的に許容される賦形剤と混合する工程
を含む、請求項1〜7のいずれか一項に記載の治療用組成物を調製する方法。
【請求項２３】
(i)請求項1〜7のいずれか一項に規定の第1の分離された細菌を培養する工程;
(ii)請求項1〜7のいずれか一項に規定の第2の分離された細菌を培養する工程;並びに
(iii)(i)及び(ii)で得られた細菌を薬学的に許容される賦形剤と混合する工程、
を含み、工程(i)及び(ii)で培養された細菌は、異なる16S rRNA配列を有し、工程(i)及び(ii)が独立に行われる、
請求項22に記載の方法。
【請求項２４】
請求項22又は23に記載の方法により得ることができる治療用組成物。