【手続補正書】
【提出日】令和2年11月16日(2020.11.16)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
配列番号８３の配列を含む標的ハイブリダイズ領域を含む、プローブオリゴマー。
【請求項２】
前記プローブオリゴマーが、配列番号８４の配列を含む、請求項１に記載のプローブオリゴマー。
【請求項３】
前記プローブオリゴマーが、配列番号８５の配列を含む、請求項１または２に記載のプローブオリゴマー。
【請求項４】
前記プローブオリゴマーが、配列番号４０の少なくとも１１個の連続したヌクレオチドを含む、請求項１〜３のいずれか１項に記載のプローブオリゴマー。
【請求項５】
前記プローブオリゴマーが、配列番号４０の配列を含む、請求項１〜４のいずれか１項に記載のプローブオリゴマー。
【請求項６】
少なくとも１つのプローブオリゴマーが、非ヌクレオチド検出可能標識を含む、請求項１〜５のいずれか１項に記載のプローブオリゴマー。
【請求項７】
前記非ヌクレオチド検出可能標識が、蛍光標識である、請求項６に記載のプローブオリゴマー。
【請求項８】
前記プローブオリゴマーが消光剤を含む、請求項７に記載のプローブオリゴマー。
【請求項９】
前記非ヌクレオチド検出可能標識が、蛍光標識であり、前記消光剤が、前記プローブが標的核酸にアニーリングされているときよりも、前記プローブが遊離しているときにより大きい程度まで蛍光を吸収する、請求項８に記載のプローブオリゴマー。
【請求項１０】
前記蛍光標識が、ＦＡＭ、ＨＥＸ、またはアクリジンである、請求項７〜９のいずれか１項に記載のプローブオリゴマー。
【請求項１１】
前記消光剤が、ＤＡＢＣＹＬまたはＲＯＸである、請求項８〜１０のいずれか１項に記載のプローブオリゴマー。
【請求項１２】
前記蛍光標識が、前記プローブオリゴマーの５’末端に付着し、前記消光剤が、前記プローブオリゴマーの３’末端に付着するか、または前記蛍光標識が前記プローブオリゴマーの３’末端に付着し、前記消光剤が前記プローブオリゴマーの５’末端に付着する、請求項８〜１１のいずれか１項に記載のプローブオリゴマー。
【請求項１３】
前記プローブオリゴマー中の糖のうちの少なくとも約半分が、２’−Ｏ−メチル−リボースである、請求項１〜１２のいずれか１項に記載のプローブオリゴマー。
【請求項１４】
前記プローブオリゴマーが、その５’末端に第１の自己相補領域およびその３’末端に第２の自己相補領域を含む、請求項１〜１３のいずれか１項に記載のプローブオリゴマー。
【請求項１５】
前記自己相補領域がハイブリダイズして、約４〜７個のワトソン−クリック塩基対またはゆらぎ塩基対を形成することができる、請求項１４に記載のプローブオリゴマー。
【請求項１６】
前記自己相補領域がハイブリダイズして、約５個のワトソン−クリック塩基対またはゆらぎ塩基対を形成することができる、請求項１５に記載のプローブオリゴマー。
【請求項１７】
請求項１〜１６のいずれか１項に記載のプローブオリゴマーを含む、キット。
【請求項１８】
請求項１〜１６のいずれか１項に記載のプローブオリゴマーを含む、組成物。
【請求項１９】
水性、凍結、または凍結乾燥である、請求項１８に記載の組成物。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００４９
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００４９】
節の見出しは、読者の便宜のために提供されており、本開示の範囲を限定するものではない。
特定の実施形態では、例えば、以下が提供される：
（項目１）
少なくとも第１、第２、第３、および第４の増幅オリゴマーを含む組成物またはキットであって、
前記第１の増幅オリゴマーが、配列番号２または３のうちの１つの少なくとも１０個の連続したヌクレオチドを含む標的ハイブリダイズ配列を含み、
前記第２の増幅オリゴマーが、配列番号２０、２１、または２２のうちの１つの少なくとも１０個の連続したヌクレオチドを含む標的ハイブリダイズ配列を含み、
前記第３の増幅オリゴマーが、配列番号４１の少なくとも１０個の連続したヌクレオチドを含む標的ハイブリダイズ配列を含み、
前記第４の増幅オリゴマーが、配列番号３４または３５のうちの１つの少なくとも１０個の連続したヌクレオチドを含む標的ハイブリダイズ配列を含み、
前記第１、第２、第３、および第４の増幅オリゴマーの前記標的ハイブリダイズ配列が各々、Ｂ型肝炎ウイルス配列の少なくとも約１４個の連続したヌクレオチドまたはその相補対を含む、組成物またはキット。
（項目２）
試料中のＢ型肝炎ウイルスを検出する方法であって、
前記試料を少なくとも第１、第２、第３、および第４の増幅オリゴマーと接触させ、それにより組成物を形成することと、
Ｂ型肝炎ウイルス核酸の存在下で少なくとも第１および第２のアンプリコンを産生する核酸増幅反応を前記組成物中で実施することと、前記第１および第２のアンプリコンを定量化することと、を含み、
前記第１のアンプリコンが、前記Ｂ型肝炎ウイルス核酸の存在下での前記第１および第２の増幅オリゴマーの伸長を通して産生され、
前記第２のアンプリコンが、前記Ｂ型肝炎ウイルス核酸の存在下での前記第３および第４の増幅オリゴマーの伸長を通して産生され、
前記第１の増幅オリゴマーが、配列番号２または３のうちの１つの少なくとも１０個の連続したヌクレオチドを含む標的ハイブリダイズ配列を含み、
前記第２の増幅オリゴマーが、配列番号２０、２１、または２２のうちの１つの少なくとも１０個の連続したヌクレオチドを含む標的ハイブリダイズ配列を含み、
前記第３の増幅オリゴマーが、配列番号４１の少なくとも１０個の連続したヌクレオチドを含む標的ハイブリダイズ配列を含み、
前記第４の増幅オリゴマーが、配列番号３４または３５のうちの１つの少なくとも１０個の連続したヌクレオチドを含む標的ハイブリダイズ配列を含み、
前記第１、第２、第３、および第４の増幅オリゴマーの前記標的ハイブリダイズ配列が各々、Ｂ型肝炎ウイルス配列の少なくとも約１４個の連続したヌクレオチドまたはその相補対を含む、方法。
（項目３）
前記第１、第２、第３、および第４の増幅オリゴマーのうちの１つ以上が、プロモーター−プライマーである、項目１に記載の組成物もしくはキットまたは項目２に記載の方法。
（項目４）
前記第２の増幅オリゴマーが、プロモーター−プライマーである、前記項目１〜３のいずれか１項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目５）
前記第４の増幅オリゴマーが、プロモーター−プライマーである、前記項目１〜４のいずれか１項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目６）
前記プロモーター−プライマーのうちの１つ以上が、標的ハイブリダイズ配列の５’位に位置するＴ７プロモーターを含む、項目３〜６のいずれか１項に記載の組成物、キッ
ト、または方法。
（項目７）
１つ以上のプロモーター−プライマーが、配列番号８、９、１０、１１、１２、または１３の配列を含む、項目３〜７のいずれか１項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目８）
前記第１、第２、第３、および第４の増幅オリゴマーのうちの１つ以上が、非ヌクレオチド検出可能標識を含む、前記項目１〜７のいずれか１項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目９）
前記第１の増幅オリゴマーが、配列番号４、５、６、または７のうちの少なくとも１つ、２つ、または３つを含む標的ハイブリダイズ配列を含む、前記項目１〜８のいずれか１項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目１０）
前記第２の増幅オリゴマーが、配列番号２３、２４、２５、２６、２７、および２８のうちの少なくとも１つ、２つ、３つ、４つ、または５つを含む標的ハイブリダイズ配列を含む、前記項目１〜９のいずれか１項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目１１）
前記第３の増幅オリゴマーが、配列番号４２、４３、および４４のうちの少なくとも１つ、２つ、または３つを含む標的ハイブリダイズ配列を含む、前記項目１〜１０のいずれか１項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目１２）
前記第４の増幅オリゴマーが、配列番号３６、３７、３８、または３９のうちの少なくとも１つ、２つ、または３つを含む標的ハイブリダイズ配列を含む、前記項目１〜１１のいずれか１項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目１３）
前記第１の増幅オリゴマーが、配列番号３の少なくとも１１個、１２個、１３個、１４個、１５個、１６個、１７個、１８個、１９個、または２０個の連続したヌクレオチドを含む、前記項目１〜１２のいずれか１項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目１４）
前記第１の増幅オリゴマーが、配列番号３の配列を含む、前記項目１〜１３のいずれか１項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目１５）
前記第１の増幅オリゴマーが、配列番号２の少なくとも１１個、１２個、１３個、１４個、１５個、１６個、１７個、１８個、１９個、２０個、２１個、または２２個の連続したヌクレオチドを含む、前記項目１〜１４のいずれか１項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目１６）
前記第１の増幅オリゴマーが、配列番号２の配列を含む、前記項目１〜１５のいずれか１項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目１７）
前記組成物またはキットが、配列番号３の少なくとも１１個、１２個、１３個、１４個、１５個、１６個、１７個、１８個、１９個、または２０個の連続したヌクレオチドを含む、前記第１の増幅オリゴマーとは異なるさらなる増幅オリゴマーをさらに含む、前記項目１〜１６のいずれか１項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目１８）
前記さらなる増幅オリゴマーが、配列番号３の配列を含む、項目１７に記載の組成物、キット、または方法。
（項目１９）
前記第２の増幅オリゴマーが、配列番号２１の少なくとも１１個、１２個、１３個、１４個、１５個、１６個、１７個、１８個、１９個、２０個、または２１個の連続したヌクレオチドを含む、前記項目１〜１８のいずれか１項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目２０）
前記第２の増幅オリゴマーが、配列番号２１の配列を含む、前記項目１〜１９のいずれか１項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目２１）
前記第２の増幅オリゴマーが、配列番号１４の配列を含む、前記項目１〜２０のいずれか１項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目２２）
前記第２の増幅オリゴマーが、配列番号２２の少なくとも１１個、１２個、１３個、１４個、１５個、１６個、１７個、１８個、１９個、２０個、２１個、２２個、２３個、２４個、２５個、または２６個の連続したヌクレオチドを含む、前記項目１〜２１のいずれか１項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目２３）
前記第２の増幅オリゴマーが、配列番号２２の配列を含む、前記項目１〜２２のいずれか１項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目２４）
前記第２の増幅オリゴマーが、配列番号１５の配列を含む、前記項目１〜２３のいずれか１項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目２５）
前記第２の増幅オリゴマーが、配列番号２０の少なくとも１１個、１２個、１３個、１４個、１５個、１６個、１７個、１８個、１９個、２０個、２１個、２２個、２３個、２４個、２５個、２６個、２７個、または２８個の連続したヌクレオチドを含む、前記項目１〜２４のいずれか１項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目２６）
前記第２の増幅オリゴマーが、配列番号２０の配列を含む、前記項目１〜２５のいずれか１項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目２７）
前記第３の増幅オリゴマーが、配列番号４１の少なくとも１１個、１２個、１３個、１４個、１５個、１６個、１７個、１８個、または１９個の連続したヌクレオチドを含む、前記項目１〜２６のいずれか１項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目２８）
前記第３の増幅オリゴマーが、配列番号４１の配列を含む、前記項目１〜２７のいずれか１項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目２９）
前記第４の増幅オリゴマーが、配列番号３５の位置３０におけるイノシンを含む配列番号３５の少なくとも１０個の連続したヌクレオチドを含む、前記項目１〜２８のいずれか１項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目３０）
前記第４の増幅オリゴマーが、配列番号３４の少なくとも１１個、１２個、１３個、１４個、１５個、１６個、１７個、１８個、１９個、２０個、２１個、２２個、２３個、２４個、２５個、２６個、２７個、または２８個の連続したヌクレオチドを含む、前記項目１〜２９のいずれか１項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目３１）
前記第４の増幅オリゴマーが、配列番号３４の配列を含む、前記項目１〜３０のいずれか１項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目３２）
前記第４の増幅オリゴマーが、配列番号３０の配列を含む、前記項目１〜３１のいずれか１項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目３３）
前記組成物またはキットが、配列番号６９の配列の少なくとも１０個の連続したヌクレオチド、およびＢ型肝炎ウイルス配列の少なくとも約１４個の連続したヌクレオチドまたはその相補体を含む第５の増幅オリゴマーをさらに含む、前記項目１〜３２のいずれか１項に記載のキット、組成物、または方法。
（項目３４）
前記第５の増幅オリゴマーが、配列番号７０、７１、または７２のうちの少なくとも１つまたは２つを含む、項目３３に記載の組成物、キット、または方法。
（項目３５）
前記第５の増幅オリゴマーが、配列番号６９の少なくとも１１個、１２個、１３個、１４個、１５個、１６個、１７個、１８個、１９個、２０個、２１個、２２個、２３個、２４個、２５個、２６個、２７個、２８個、または２９個の連続したヌクレオチドを含む、項目３３または３４に記載の組成物、キット、または方法。
（項目３６）
前記第５の増幅オリゴマーが、配列番号６９の配列を含む、項目３３〜３５のいずれか１項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目３７）
前記第５の増幅オリゴマーが、プロモーター−プライマーである、項目３３〜３６のいずれか１項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目３８）
前記第５の増幅オリゴマーが、配列番号６７の配列を含む、項目３３〜３７のいずれか１項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目３９）
前記組成物またはキットが、配列番号７３の配列の少なくとも１０個の連続したヌクレオチド、およびＢ型肝炎ウイルス配列の少なくとも約１４個の連続したヌクレオチドまたはその相補体を含む第６の増幅オリゴマーをさらに含む、前記項目１〜３８のいずれか１項に記載のキット、組成物、または方法。
（項目４０）
前記第６の増幅オリゴマーが、配列番号７４、７５、または７６のうちの少なくとも１つまたは２つを含む、項目３９に記載の組成物、キット、または方法。
（項目４１）
前記第６の増幅オリゴマーが、配列番号７３の少なくとも１１個、１２個、１３個、１４個、１５個、１６個、１７個、１８個、または１９個の連続したヌクレオチドを含む、前記項目１〜４０のいずれか１項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目４２）
前記第６の増幅オリゴマーが、配列番号７３の配列を含む、前記項目１〜４１のいずれか１項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目４３）
前記組成物が、ＨＢＶ核酸をさらに含む、前記項目１〜４２のいずれか１項に記載の組成物または方法。
（項目４４）
前記組成物またはキットが、少なくとも１つのＤＮＡポリメラーゼをさらに含む、前記項目１〜４３のいずれか１項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目４５）
前記ＤＮＡポリメラーゼが、逆転写酵素である、項目４４に記載の組成物、キット、または方法。
（項目４６）
前記ＤＮＡポリメラーゼが、好熱性である、項目４４または４５に記載の組成物、キット、または方法。
（項目４７）
前記ＤＮＡポリメラーゼが、中温性である、項目４４または４５に記載の組成物、キット、または方法。
（項目４８）
前記組成物またはキットが、ＲＮＡポリメラーゼをさらに含む、前記項目１〜４７のいずれか１項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目４９）
前記ＲＮＡポリメラーゼが、Ｔ７  ＲＮＡポリメラーゼである、項目４８のいずれか１項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目５０）
前記組成物またはキットが、Ｍｇ２＋、緩衝液、およびｄＮＴＰのうちの少なくとも１つ、少なくとも２つ、または各々を含む、前記項目１〜４９のいずれか１項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目５１）
前記組成物またはキットが、ｒＮＴＰをさらに含む、前記項目１〜５０のいずれか１項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目５２）
前記組成物またはキットが、ＨＢＶに特異的にハイブリダイズしない第１の対照増幅オリゴマーおよび第２の対照増幅オリゴマーをさらに含む、前記項目１〜５１のいずれか１項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目５３）
前記第１の対照増幅オリゴマーが、配列番号７７の配列の少なくとも１０個、１１個、１２個、１３個、１４個、１５個、１６個、１７個、１８個、または１９個の連続したヌクレオチドを含む、項目５２に記載の組成物、キット、または方法。
（項目５４）
前記第２の対照増幅オリゴマーが、配列番号８６の配列の少なくとも１０個、１１個、１２個、１３個、１４個、１５個、１６個、１７個、１８個、１９個、２０個、２１個、または２２個の連続したヌクレオチドを含む、項目５２または５３に記載の組成物、キット、または方法。
（項目５５）
前記第１の対照増幅オリゴマーまたは前記第２の対照増幅オリゴマーが、プロモーター−プライマーである、項目５２〜５４のいずれか１項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目５６）
前記組成物またはキットが、前記第１および第２の対照増幅オリゴマーから産生されるアンプリコンに特異的にハイブリダイズするように構成された少なくとも１つの対照プローブオリゴマーをさらに含む、項目５２〜５５のいずれか１項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目５７）
前記対照プローブオリゴマーが、配列番号７９の配列の少なくとも１０個、１１個、１２個、１３個、１４個、１５個、１６個、１７個、１８個、１９個、２０個、２１個、２２個、または２３個の連続したヌクレオチドを含む、項目５６に記載の組成物、キット、または方法。
（項目５８）
前記組成物またはキットが、前記第１および第２の増幅オリゴマーから産生されるアンプリコンに特異的にハイブリダイズするように構成された少なくとも１つのプローブオリゴマーをさらに含む、前記項目１〜５７のいずれか１項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目５９）
前記プローブオリゴマーが、配列番号２９の配列の少なくとも１０個の連続したヌクレオチド、およびＢ型肝炎ウイルス配列の少なくとも約１４個の連続したヌクレオチドまたはその相補体を含む、項目５８に記載の組成物、キット、または方法。
（項目６０）
前記プローブオリゴマーが、配列番号８２の少なくとも１０個、１１個、１２個、１３個、１４個、１５個、１６個、１７個、１８個、１９個、２０個、２１個、２２個、２３個、２４個、２５個、２６個、２７個、または２８個の連続したヌクレオチドを含む、項目５８または５９に記載の組成物、キット、または方法。
（項目６１）
前記プローブオリゴマーが、配列番号８２の配列を含む、項目５８〜６０のいずれか１項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目６２）
前記プローブオリゴマーが、配列番号８２の少なくとも１０個、１１個、１２個、１３個、１４個、１５個、１６個、１７個、１８個、１９個、２０個、２１個、２２個、２３個、２４個、２５個、２６個、２７個、または２８個の連続したヌクレオチドを含む、項目５８〜６１のいずれか１項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目６３）
前記プローブオリゴマーが、配列番号２９の配列を含む、項目５８〜６２のいずれか１項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目６４）
前記組成物またはキットが、前記第３および第４の増幅オリゴマーから産生されるアンプリコンに特異的にハイブリダイズするように構成された少なくとも１つのプローブオリゴマーをさらに含む、項目５８〜６３のいずれか１項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目６５）
前記プローブオリゴマーが、配列番号４０の配列の少なくとも１０個の連続したヌクレオチド、およびＢ型肝炎ウイルス配列の少なくとも約１４個の連続したヌクレオチドまたはその相補体を含む、項目６４に記載の組成物、キット、または方法。
（項目６６）
前記プローブオリゴマーが、配列番号８３の少なくとも１０個、１１個、１２個、１３個、１４個、または１５個の連続したヌクレオチドを含む、項目６４または６５のいずれかに記載の組成物、キット、または方法。
（項目６７）
前記プローブオリゴマーが、配列番号８３の配列を含む、項目６４〜６６のいずれか１項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目６８）
前記プローブオリゴマーが、配列番号４０の少なくとも１１個、１２個、１３個、１４個、１５個、１６個、１７個、１８個、１９個、２０個、２１個、２２個、２３個、２４個、または２５個の連続したヌクレオチドを含む、項目６４〜６７のいずれか１項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目６９）
配列番号８３の配列を含む標的ハイブリダイズ領域を含む、プローブオリゴマー。
（項目７０）
前記プローブオリゴマーが、配列番号８４の配列を含む、項目６４〜６９のいずれか１項に記載の組成物、キット、方法、またはプローブオリゴマー。
（項目７１）
前記プローブオリゴマーが、配列番号８５の配列を含む、項目６４〜７０のいずれか１項に記載の組成物、キット、方法、またはプローブオリゴマー。
（項目７２）
前記プローブオリゴマーが、配列番号４０の少なくとも１１個、１２個、１３個、１４個、１５個、１６個、１７個、１８個、１９個、２０個、２１個、２２個、２３個、２４個、または２５個の連続したヌクレオチドを含む、項目６４〜７１のいずれか１項に記載の組成物、キット、方法、またはプローブオリゴマー。
（項目７３）
前記プローブオリゴマーが、配列番号４０の配列を含む、項目６４〜７２のいずれか１項に記載の組成物、キット、方法、またはプローブオリゴマー。
（項目７４）
配列番号３５の位置３０におけるイノシンを含む、配列番号３５の少なくとも１０個の連続したヌクレオチドと、ＨＢＶ配列の少なくとも１４個の連続したヌクレオチドとを含む、標的ハイブリダイズ領域を含む、増幅オリゴマー。
（項目７５）
配列番号３４または３５の部分配列を含む前記増幅オリゴマーが、配列番号３５の少なくとも１１個、１２個、１３個、１４個、１５個、１６個、１７個、１８個、１９個、２０個、２１個、２２個、２３個、２４個、２５個、２６個、２７個、２８個、２９個、３０個、３１個、３２個、３３個、または３４個の連続したヌクレオチドを含む、項目１〜６８または項目７０〜７４のいずれか１項に記載の組成物、キット、方法、または増幅オリゴマー。
（項目７６）
配列番号３４または３５の部分配列を含む前記増幅オリゴマーが、配列番号３５の配列を含む、項目１〜６８または項目７０〜７４のいずれか１項に記載の組成物、キット、方法、または増幅オリゴマー。
（項目７７）
配列番号３４または３５の部分配列を含む前記増幅オリゴマーが、配列番号３１の配列を含む、項目１〜６８または項目７０〜７４のいずれか１項に記載の組成物、キット、方法、または増幅オリゴマー。
（項目７８）
少なくとも１つのプローブオリゴマーが、非ヌクレオチド検出可能標識を含む、項目５８〜７３または項目７５〜７７のいずれか１項に記載の組成物、キット、方法、またはプローブオリゴマー。
（項目７９）
前記非ヌクレオチド検出可能標識が、蛍光標識である、項目５８〜７３または項目７５〜７８のいずれか１項に記載の組成物、キット、方法、またはプローブオリゴマー。
（項目８０）
前記プローブオリゴマーが消光剤を含む、項目７９に記載の組成物、キット、方法、またはプローブオリゴマー。
（項目８１）
前記非ヌクレオチド検出可能標識が、蛍光標識であり、前記消光剤が、前記プローブが標的核酸にアニーリングされているときよりも、前記プローブが遊離しているときにより大きい程度まで蛍光を吸収する、項目８０に記載の組成物、キット、方法、またはプローブオリゴマー。
（項目８２）
前記蛍光標識が、ＦＡＭ、ＨＥＸ、またはアクリジンである、項目７９〜８１のいずれか１項に記載の組成物、キット、方法、またはプローブオリゴマー。
（項目８３）
前記消光剤が、ＤＡＢＣＹＬまたはＲＯＸである、項目８０〜８２のいずれか１項に記載の組成物、キット、方法、またはプローブオリゴマー。
（項目８４）
前記蛍光標識が、前記プローブオリゴマーの５’末端に付着し、前記消光剤が、前記プローブオリゴマーの３’末端に付着するか、または前記蛍光標識が前記プローブオリゴマーの３’末端に付着し、前記消光剤が前記プローブオリゴマーの５’末端に付着する、項目８０〜８３のいずれか１項に記載の組成物、キット、方法、またはプローブオリゴマー。
（項目８５）
前記プローブオリゴマー中の糖のうちの少なくとも約半分、少なくとも約９０％、または全てが、２’−Ｏ−メチル−リボースである、項目５８〜７３または項目７５〜８４のいずれか１項に記載の組成物、キット、方法、またはプローブオリゴマー。
（項目８６）
前記プローブオリゴマーが、その５’末端に第１の自己相補領域およびその３’末端に第２の自己相補領域を含む、項目５８〜７３または項目７５〜８５のいずれか１項に記載の組成物、キット、方法、またはプローブオリゴマー。
（項目８７）
前記自己相補領域がハイブリダイズして、約４〜７個のワトソン−クリック塩基対またはゆらぎ塩基対を形成することができる、項目８６に記載の組成物、キット、方法、またはプローブオリゴマー。
（項目８８）
前記自己相補領域がハイブリダイズして、約５個のワトソン−クリック塩基対またはゆらぎ塩基対を形成することができる、項目８７に記載の組成物、キット、方法、またはプローブオリゴマー。
（項目８９）
以下の捕捉オリゴマー（ｉ）〜（ｉｖ）：
（ｉ）配列番号４９または９９の少なくとも１０個の連続したヌクレオチドを含む標的ハイブリダイズ配列を含む、第１の捕捉オリゴマー、
（ｉｉ）配列番号５３、１００、１０１、または１０４の少なくとも１０個の連続したヌクレオチドを含む標的ハイブリダイズ配列を含む、第２の捕捉オリゴマー、
（ｉｉｉ）配列番号５７、９６、または１０２の少なくとも１０個の連続したヌクレオチドを含む標的ハイブリダイズ配列を含む、第３の捕捉オリゴマー、
（ｉｖ）配列番号６１、９７、９８、または１０３の少なくとも１０個の連続したヌクレオチドを含む標的ハイブリダイズ配列を含む、第４の捕捉オリゴマー、から選択される２つ以上の異なる捕捉オリゴマーを含む、組成物またはキットであって、
前記２つ以上の異なる捕捉オリゴマーの前記標的ハイブリダイズ配列が各々、Ｂ型肝炎ウイルス配列の少なくとも約１４個の連続したヌクレオチドまたはその相補対を含む、組成物またはキット。
（項目９０）
試料からＨＢＶ核酸を単離する方法であって、
捕捉オリゴマーとＨＢＶ核酸の１つ以上の複合体を形成するための許容条件下で、前記試料を、以下の捕捉オリゴマー（ｉ）〜（ｉｖ）：
（ｉ）配列番号４９または９９の少なくとも１０個の連続したヌクレオチドを含む標的ハイブリダイズ配列を含む、第１の捕捉オリゴマー、
（ｉｉ）配列番号５３、１００、１０１、または１０４の少なくとも１０個の連続したヌクレオチドを含む標的ハイブリダイズ配列を含む、第２の捕捉オリゴマー、
（ｉｉｉ）配列番号５７、９６、または１０２の少なくとも１０個の連続したヌクレオチドを含む標的ハイブリダイズ配列を含む、第３の捕捉オリゴマー、
（ｉｖ）配列番号６１、９７、９８、または１０３の少なくとも１０個の連続したヌクレオチドを含む標的ハイブリダイズ配列を含む、第４の捕捉オリゴマー、から選択される２つ以上の異なる捕捉オリゴマーと接触させ、それにより組成物を形成することであって、前記２つ以上の異なる捕捉オリゴマーの前記標的ハイブリダイズ配列が各々、Ｂ型肝炎ウイルス配列の少なくとも約１４個の連続したヌクレオチドまたはその相補対を含む、形成することと、
前記組成物から前記捕捉オリゴマーを単離することと、を含む、方法。
（項目９１）
前記捕捉オリゴマーを単離することが、前記捕捉オリゴマーを固体支持体と会合させることと、前記固体支持体を洗浄することとを含む、項目９０に記載の方法。
（項目９２）
前記固体支持体が、少なくとも１つまたは少なくとも２つの捕捉オリゴマーの一部分に相補的であるポリ−Ｎ配列を含む、項目９１に記載の方法。
（項目９３）
前記固体支持体が、少なくとも１つまたは少なくとも２つの捕捉オリゴマー中に存在する親和性タグを認識する結合剤を含む、項目９１に記載の方法。
（項目９４）
前記組成物またはキットが、前記捕捉オリゴマー（ｉ）〜（ｉｖ）のうちの少なくとも３つを含む、項目８９に記載の組成物もしくはキットまたは項目９０〜９３のいずれか１項に記載の方法。
（項目９５）
前記組成物またはキットが、捕捉オリゴマー（ｉ）〜（ｉｖ）を含む、項目９４に記載の組成物、キット、または方法。
（項目９６）
前記第１の捕捉オリゴマーが、配列番号５０、５１、および５２のうちの少なくとも１つを含む標的ハイブリダイズ配列を含む、項目８９〜９５のいずれか１項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目９７）
前記第１の捕捉オリゴマーが、配列番号４９の少なくとも１１個、１２個、１３個、１４個、１５個、１６個、１７個、１８個、１９個、２０個、２１個、２２個、２３個、または２４個の連続したヌクレオチドを含む、項目８９〜９６のいずれか１項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目９８）
前記第１の捕捉オリゴマーが、配列番号４９の配列を含む、項目８９〜９７のいずれか１項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目９９）
前記第２の捕捉オリゴマーが、配列番号５４、５５、および５６のうちの少なくとも１つを含む標的ハイブリダイズ配列を含む、項目８９〜９８のいずれか１項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目１００）
前記第２の捕捉オリゴマーが、配列番号５３の少なくとも１１個、１２個、１３個、１４個、１５個、１６個、１７個、１８個、１９個、２０個、２１個、２２個、２３個、または２４個の連続したヌクレオチドの前記配列を含む、項目８９〜９９のいずれか１項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目１０１）
前記第２の捕捉オリゴマーが、配列番号５３を含む、項目８９〜１００のいずれか１項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目１０２）
前記第３の捕捉オリゴマーが、配列番号５８、５９、および６０のうちの少なくとも１つを含む標的ハイブリダイズ配列を含む、項目８９〜１０１のいずれか１項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目１０３）
前記第３の捕捉オリゴマーが、配列番号５７の少なくとも１１個、１２個、１３個、１４個、１５個、１６個、１７個、１８個、１９個、２０個、２１個、２２個、２３個、２４個、または２５個の連続したヌクレオチドを含む、項目８９〜１０２のいずれか１項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目１０４）
前記第３の捕捉オリゴマーが、配列番号５７の配列を含む、項目８９〜１０３のいずれか１項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目１０５）
前記第４の捕捉オリゴマーが、配列番号６２、６３、および６４のうちの少なくとも１つを含む標的ハイブリダイズ配列を含む、項目８９〜１０４のいずれか１項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目１０６）
前記第４の捕捉オリゴマーが、配列番号６１の少なくとも１１個、１２個、１３個、１４個、１５個、１６個、１７個、１８個、１９個、２０個、２１個、２２個、２３個、２４個、２５個、２６個、または２７個の連続したヌクレオチドを含む、項目８９〜１０５のいずれか１項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目１０７）
前記第４の捕捉オリゴマーが、配列番号６１の配列を含む、項目８９〜１０６のいずれか１項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目１０８）
前記捕捉オリゴマーのうちの少なくとも１つが、非ヌクレオチド親和性標識をさらに含む、項目８９〜１０７のいずれか１項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目１０９）
前記捕捉オリゴマーのうちの少なくとも１つが、非ＨＢＶ配列をさらに含む、項目８９〜１０８のいずれか１項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目１１０）
前記２つ、３つ、または４つの捕捉オリゴマーが、非ＨＢＶ配列をさらに含む、項目８９〜１０９のいずれか１項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目１１１）
少なくとも１つ、２つ、３つ、または４つの捕捉オリゴマーが、ポリ−Ｎ配列をさらに含む、項目８９〜１１０のいずれか１項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目１１２）
前記ポリ−Ｎ配列が、ポリ−Ａまたはポリ−Ｔ配列である、項目１１１に記載の組成物、キット、または方法。
（項目１１３）
前記組成物またはキットが、配列番号２または３のうちの１つの少なくとも１０個の連続したヌクレオチドを含む標的ハイブリダイズ配列を含む第１の増幅オリゴマー、
配列番号２０、２１、または２２のうちの１つの少なくとも１０個の連続したヌクレオチドを含む標的ハイブリダイズ配列を含む第２の増幅オリゴマー、
配列番号４１の少なくとも１０個の連続したヌクレオチドを含む標的ハイブリダイズ配列を含む第３の増幅オリゴマー、
配列番号３４または３５のうちの１つの少なくとも１０個の連続したヌクレオチドを含む標的ハイブリダイズ配列を含む第４の増幅オリゴマー、から選択される少なくとも１つの増幅オリゴマーをさらに含み、
前記第１、第２、第３、および第４の増幅オリゴマーの前記標的ハイブリダイズ配列が各々、Ｂ型肝炎ウイルス配列の少なくとも約１４個の連続したヌクレオチドまたはその相補対を含む、項目８９〜１１２のいずれか１項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目１１４）
前記組成物またはキットが、項目８、９、または１３〜１７のいずれか１項に記載の第１の増幅オリゴマーを含む、項目１１３の組成物、キット、または方法。
（項目１１５）
前記組成物またはキットが、項目４、８、１０、または１９〜２６のいずれか１項に記載の第２の増幅オリゴマーを含む、項目１１３または１１４の組成物、キット、または方法。
（項目１１６）
前記第２の増幅オリゴマーが、配列番号２２の少なくとも１１個、１２個、１３個、１４個、１５個、１６個、１７個、１８個、１９個、２０個、２１個、２２個、２３個、２４個、２５個、または２６個の連続したヌクレオチドを含み、前記組成物またはキットが、前記第２の増幅オリゴマーとは異なり、配列番号２０の少なくとも１１個、１２個、１
３個、１４個、１５個、１６個、１７個、１８個、１９個、２０個、２１個、２２個、２３個、２４個、２５個、２６個、２７個、または２８個の連続したヌクレオチドを含む、さらなる増幅オリゴマーをさらに含む、項目１１５に記載の組成物、キット、または方法。
（項目１１７）
前記第２の増幅オリゴマーが、配列番号２２の配列を含む、項目１１６に記載の組成物、キット、または方法。
（項目１１８）
前記さらなる増幅オリゴマーが、配列番号２０の配列を含む、項目１１６または１１７に記載の組成物、キット、または方法。
（項目１１９）
前記組成物またはキットが、項目８、１１、または２７〜２８のいずれか１項に記載の第３の増幅オリゴマーを含む、項目１１３〜１１８のいずれか１項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目１２０）
前記組成物またはキットが、項目５、８、１２、または２９〜３２のいずれか１項に記載の配列番号３４または３５のうちの１つの少なくとも１０個の連続したヌクレオチドを含む標的ハイブリダイズ配列を含む増幅オリゴマーを含む、項目１１３〜１１９のいずれか１項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目１２１）
少なくとも１つの増幅オリゴマーが伸長される線形増幅を実施することをさらに含む、項目１１３〜１２０のいずれか１項に記載の方法。
（項目１２２）
前記線形増幅の前に、前記増幅オリゴマーが、ＨＢＶ核酸と捕捉オリゴマーの複合体と会合し、前記複合体が、固体支持体と会合し、前記方法が、前記固体支持体を洗浄することを含む、項目１２１に記載の方法。
（項目１２３）
前記固体支持体が、マイクロビーズの集団である、項目１２２に記載の方法。
（項目１２４）
前記集団の前記マイクロビーズが、磁性である、項目１２３記載の方法。
（項目１２５）
洗浄ステップに続いて、前記方法が、ＨＢＶ核酸と捕捉オリゴマーの複合体と会合した増幅オリゴマーに対して反対向きの１つ以上のさらなる増幅オリゴマーを付加することを含む、項目１２２〜１２４のいずれか１項に記載の方法。
（項目１２６）
１つ以上の反対向きのさらなる増幅オリゴマーが、プロモーター−プライマーである、項目１２５に記載の方法。
（項目１２７）
１つ以上の反対向きのさらなる増幅オリゴマーが、プロモーター−プライマーではない、項目１２５に記載の方法。
（項目１２８）
前記１つ以上の反対向きのさらなる増幅オリゴマーが、項目８、９、または１３〜１７のいずれか１項に記載の第１の増幅オリゴマーを含む、項目１２５〜１２７のいずれか１項に記載の方法。
（項目１２９）
前記１つ以上の反対向きのさらなる増幅オリゴマーが、項目４、８、１０、または１９〜２６のいずれか１項に記載の第２の増幅オリゴマーを含む、項目１２５〜１２８のいずれか１項に記載の方法。
（項目１３０）
前記１つ以上の反対向きのさらなる増幅オリゴマーが、項目８、１１、または２７〜２８のいずれか１項に記載の第３の増幅オリゴマーを含む、項目１２５〜１２９のいずれか１項に記載の方法。
（項目１３１）
前記１つ以上の反対向きのさらなる増幅オリゴマーが、項目１、５、８、１２、または２９〜３２のいずれか１項に記載の配列番号３４または３５のうちの１つの少なくとも１０個の連続したヌクレオチドを含む標的ハイブリダイズ配列を含む増幅オリゴマーを含む、項目１２５〜１３０のいずれか１項に記載の方法。
（項目１３２）
前記線形増幅に続いて指数関数的増幅を実施することをさらに含む、項目１２１〜１３１のいずれか１項に記載の方法。
（項目１３３）
前記指数関数的増幅が、転写媒介増幅である、項目１３２に記載の方法。
（項目１３４）
１つ、２つ、３つ、４つ、またはそれ以上の標的ハイブリダイズ配列が、Ｂ型肝炎ウイルス配列の少なくとも約１５個、１６個、１７個、１８個、１９個、２０個、２１個、２２個、２３個、２４個、または２５個の連続したヌクレオチドまたはその相補体を含む、前記項目１〜１３３のいずれか１項に記載の方法、組成物、またはオリゴマー。
（項目１３５）
第１および第２の標識のそれぞれと会合した第１および第２の標識のＢ型肝炎アンプリコンを含む
試料中のＢ型肝炎ウイルスのレベルを決定する方法であって、前記方法が、
前記第１の標識から発せられる第１のシグナルを検出することと、
前記第２の標識から発せられる第２のシグナルを検出することと、
前記第１のシグナルまたは前記第２のシグナルが所定の閾値を超えているかを判定することと、
前記試料中のＢ型肝炎のレベルを計算することと、を含み、
前記第１のシグナルまたは前記第２のシグナルが所定の閾値を超えている場合、前記レベルが、前記第１および第２のシグナルのより大きい方から計算され、
前記第１のシグナルおよび前記第２のシグナルが所定の閾値を下回っている場合、前記レベルが、前記第１および第２のシグナルの平均から計算される、方法。
（項目１３６）
前記試料が、インビトロ試料である、項目１３５に記載の方法。
（項目１３７）
前記第１および第２のシグナルに対応する第１および第２のレベルを決定し、前記第１および第２のレベルを算術的に平均化することによって、前記第１および第２のシグナルの平均値を決定することを含む、項目１３５または１３６に記載の方法。
（項目１３８）
Ｂ型肝炎ウイルスの前記レベルが、濃度である、項目１３５〜１３７のいずれか１項に記載の方法。
（項目１３９）
Ｂ型肝炎ウイルスの前記レベルが、量である、項目１３５〜１３７のいずれか１項に記載の方法。
（項目１４０）
前記第１および第２のアンプリコンのうちの一方または両方が、ＨＢＶのＳ  ＯＲＦからの配列を含む、項目１３５〜１３９のいずれか１項に記載の方法。
（項目１４１）
前記第１および第２のアンプリコンのうちの一方または両方が、ＨＢＶのＰ  ＯＲＦからの配列を含む、項目１３５〜１４０のいずれか１項に記載の方法。
（項目１４２）
前記第１および第２のアンプリコンのうちの一方または両方が、ＨＢＶのＳ  ＯＲＦおよびＰ  ＯＲＦの重複からの配列を含む、項目１３５〜１４１のいずれか１項に記載の方法。
（項目１４３）
前記第１のアンプリコンが、配列番号２または３のうちの１つの少なくとも１０個、１１個、１２個、１３個、１４個、１５個、１６個、１７個、１８個、１９個、または２０個の連続したヌクレオチドを含む、項目１３５〜１４２のいずれか１項に記載の方法。
（項目１４４）
前記第１のアンプリコンが、配列番号２０、２１、または２２のうちの１つの少なくとも１０個、１１個、１２個、１３個、１４個、１５個、１６個、１７個、１８個、１９個、または２０個の連続したヌクレオチドを含む、項目１３５〜１４３のいずれか１項に記載の方法。
（項目１４５）
前記第２のアンプリコンが、配列番号４１の少なくとも１０個、１１個、１２個、１３個、１４個、１５個、１６個、１７個、１８個、１９個、または２０個の連続したヌクレオチドを含む、項目１３５〜１４４のいずれか１項に記載の方法。
（項目１４６）
前記第２のアンプリコンが、配列番号３４または３５のうちの１つの少なくとも１０個、１１個、１２個、１３個、１４個、１５個、１６個、１７個、１８個、１９個、または２０個の連続したヌクレオチドを含む、項目１３５〜１４５のいずれか１項に記載の方法。
（項目１４７）
前記所定の閾値が、予測されたランダム誤差が点変異による予測された誤差よりも大きいか、またはそれにほぼ等しい値である、項目１３５〜１４６のいずれか１項に記載の方法。
（項目１４８）
前記所定の閾値が、点変異による予測された誤差が、予測されたランダム誤差よりも大きいか、またはそれにほぼ等しい値である、項目１３５〜１４６のいずれか１項に記載の方法。
（項目１４９）
前記所定の閾値が、約１０ＩＵ／ｍＬ〜約２００ＩＵ／ｍＬの範囲内の濃度に対応する、項目１３５〜１４８のいずれか１項に記載の方法。
（項目１５０）
前記所定の閾値が、約２０ＩＵ／ｍＬ〜約４０ＩＵ／ｍＬ、約４０ＩＵ／ｍＬ〜約６０ＩＵ／ｍＬ、約６０ＩＵ／ｍＬ〜約８０ＩＵ／ｍＬ、または約８０ＩＵ／ｍＬ〜約１００ＩＵ／ｍＬの範囲内である、項目１４９に記載の方法。
（項目１５１）
前記第１の標識、前記第２の標識、または両方が蛍光である、項目１３５〜１５０のいずれか１項に記載の方法。
（項目１５２）
前記第１および第２の標識のうちの少なくとも１つが、プローブに付着している、項目１５１に記載の方法。
（項目１５３）
前記プローブが、消光剤を含む、項目１５２に記載の方法。
（項目１５４）
項目６９〜７３または７８〜８８のいずれか１項に記載のプローブオリゴマーを含む、キットまたは組成物。
（項目１５５）
項目７４〜７７のいずれか１項に記載の増幅オリゴマーを含む、キットまたは組成物。
（項目１５６）
項目６９〜７３または７８〜８８のいずれか１項に記載のプローブオリゴマーをさらに含む、項目１５５に記載のキットまたは組成物。
（項目１５７）
項目１、８、９、もしくは１３〜１７のいずれか１項に記載の第１の増幅オリゴマー、項目１、４、８、１０、もしくは１９〜２６のいずれか１項に記載の第２の増幅オリゴマー、項目１、８、１１、もしくは２７〜２８のいずれか１項に記載の第３の増幅オリゴマー、または項目１、５、８、１２、もしくは２９〜３２のいずれか１項に記載の第４の増幅オリゴマーのうちの少なくとも１つ、２つ、３つ、または４つをさらに含む、項目１５４〜１５６のいずれか１項に記載のキットまたは組成物。
（項目１５８）
項目５８〜６３のいずれか１項に記載のプローブオリゴマーをさらに含む、項目１５４〜１５７のいずれか１項に記載のキットまたは組成物。
（項目１５９）
項目８９もしくは９６〜９８のいずれか１項に記載の第１の捕捉オリゴマー、項目８９もしくは９９〜１０１のいずれか１項に記載の第２の捕捉オリゴマー、項目８９もしくは１０２〜１０４のいずれか１項に記載の第３の捕捉オリゴマー、または項目８９もしくは１０５〜１０７のいずれか１項に記載の第４の捕捉オリゴマーのうちの少なくとも１つ、２つ、３つ、または４つをさらに含む、項目１５４〜１５８のいずれか１項に記載のキットまたは組成物。
（項目１６０）
項目３３〜３８のいずれか１項に記載の第５の増幅オリゴマー、または項目３９〜４２のいずれか１項に記載の第６の増幅オリゴマーのうちの少なくとも１つまたは２つをさらに含む、項目１５４〜１５９のいずれか１項に記載のキットまたは組成物。
（項目１６１）
項目１７、１８、または１１６のいずれか１項に記載のさらなる増幅オリゴマーをさらに含み、前記キットまたは組成物が項目１、４、８、１０、または１９〜２６のいずれか１項に記載の第２の増幅オリゴマーを含む場合、前記さらなる増幅オリゴマーが、前記第２の増幅オリゴマーとは異なる、項目１５４〜１６０のいずれか１項に記載のキットまたは組成物。
（項目１６２）
項目１〜６８、７０〜７３、７５〜８９、９４〜１２０、または１５４〜１６１のいずれか１項に記載のキット。
（項目１６３）
項目１〜６８、７０〜７３、７５〜８９、９４〜１２０、または１５４〜１６１のいずれか１項に記載の組成物。
（項目１６４）
水性、凍結、または凍結乾燥である、項目１６３に記載の組成物。
【手続補正３】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００５０
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００５０】
【図１Ａ】遺伝子型Ａ〜Ｈを代表するＨＢＶクローン配列を有する、例示的な標的捕捉オリゴマー０７０７ｂおよび７３３の整列を示す。
【図１Ｂ】対応する位置における１０個の最も一般的なＨＢＶデータベース配列を有する、例示的な標的捕捉オリゴマー１２９０および１１６８のそれぞれの整列を示す。行は、個々の文字でラベル付けされ（必ずしもＨＢＶ遺伝子型名称に対応していない）、一致する配列の頻度が示される。点は、オリゴマーとの一致を示し、ミスマッチは、文字で示される。図１Ｂの行Ｈおよび図１Ｃの行Ｇの一連のＮは、内部欠失を有するＨＢＶ配列を示す。
【図１Ｃ】同上。
【図１Ｄ−１】ＨＢＶ位置３７６−４７４を包含する領域内の異なるＨＢＶクローンの配列を有する、例示的なオリゴマーの整列を示す。図１Ｄ−２は、図１Ｄ−１の右端からの整列の続きである。
【図１Ｄ−２】同上。
【図２Ａ】異なるＨＢＶクローンの配列を有する、例示的なオリゴマーの整列を示し、３７６−４０２  Ｔ７増幅オリゴマー（配列番号１５）に対する差が示される。
【図２Ｂ−１】例示的なオリゴマー、代表的なＨＢＶ遺伝子型Ａ配列、および１０８ヌクレオチド欠失を含むＧｅｎＢａｎｋ受託番号ＡＢ６７４４３０のＨＢＶ配列の整列を示す。
【図２Ｂ−２】同上。
【図３−１】ＨＢＶ位置６４０−７２０を包含する領域内の異なるＨＢＶクローンの配列を有する、例示的なオリゴマーの整列を示す。
【図３−２】同上。
【図４Ａ】内部増幅オリゴマーＡ３７６およびＡ３５の非存在（Ａ−Ｂ）および存在（Ｃ−Ｄ）下における実験の発生曲線を示す。図４Ａおよび４Ｃは、４０８−４３５プローブオリゴマーによって検出されるアンプリコンの検出を示す。図４Ｂおよび４Ｄは、６６８Ａプローブオリゴマーによって検出されるアンプリコンの検出を示す。矢印は、２，０００ＩＵ／ｍＬの試料のトレースを示し、括弧は、より低濃度の試料のトレースを示す。最低濃度（２ＩＵ／ｍＬ）のトレースは、灰色であり、中間濃度（１０ＩＵ／ｍＬ）のトレースは、黒色である。
【図４Ｂ】同上。
【図４Ｃ】同上。
【図４Ｄ】同上。
【図５】ＰＥＩ遺伝子型パネル上で実施されるアボット（縞模様の棒）およびロシュ（黒色の棒）からの市販のアッセイを比較した、例示的な定量化方法（白色の棒）の予測される定量化に対して観察された対数差分を示す。
【図６Ａ】ＨＢＶ定量化の再現性を実証する散布図を示す。
【図６Ｂ】発生時間をアンプリコン１および２のそれぞれの対数コピー／ｍＬに変換するための較正曲線を示す。
【図６Ｃ】同上。
【手続補正４】
【補正対象書類名】図面
【補正対象項目名】全図
【補正方法】変更
【補正の内容】
【図１Ａ】
2020500513.tif 000001
【図１Ｂ】
2020500513.tif 000002
【図１Ｃ】
2020500513.tif 000003
【図１Ｄ−１】
2020500513.tif 000004
【図１Ｄ−２】
2020500513.tif 000005
【図２Ａ】
2020500513.tif 000006
【図２Ｂ−１】
2020500513.tif 000007
【図２Ｂ−２】
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【図３−１】
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【図３−２】
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【図４Ａ】
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【図４Ｂ】
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【図４Ｃ】
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【図４Ｄ】
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【図５】
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【図６Ａ】
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【図６Ｂ】
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【図６Ｃ】
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