【手続補正書】
【提出日】令和2年7月13日(2020.7.13)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
ＭＵ１１４０のアミノ酸配列（配列番号１１５６）を含み、
ａ．  １位のフェニルアラニンのアラニンへの変更と１３位のアルギニンの：
ｉ．  アラニン（Ｆ１Ａ  Ｒ１３Ａ）、
ｉｉ．  バリン（Ｆ１Ａ  Ｒ１３Ｖ）、
ｉｉｉ．  アスパラギン（Ｆ１Ａ  Ｒ１３Ｎ）、もしくは
ｉｖ．  セリン（Ｆ１Ａ  Ｒ１３Ｓ）への変更との組合せ；
ｂ．  １位のフェニルアラニンのグリシンへの変更と１３位のアルギニンの：
ｉ．  グリシン（Ｆ１Ｇ  Ｒ１３Ｇ）への変更との組合せ；
ｃ．  １位のフェニルアラニンのヒスチジンへの変更と１３位のアルギニンの：
ｉ．  アスパラギン（Ｆ１Ｈ  Ｒ１３Ｎ）への変更との組合せ；
ｄ．  １位のフェニルアラニンのイソロイシンへの変更と１３位のアルギニンの：
ｉ．  アラニン（Ｆ１Ｉ  Ｒ１３Ａ）、
ｉｉ．  グリシン（Ｆ１Ｉ  Ｒ１３Ｇ）、
ｉｉｉ．  イソロイシン（Ｆ１Ｉ  Ｒ１３Ｉ）、
ｉｖ．  アスパラギン（Ｆ１Ｉ  Ｒ１３Ｎ）、
ｖ．  プロリン（Ｆ１Ｉ  Ｒ１３Ｐ）、
ｖｉ．  グルタミン（Ｆ１Ｉ  Ｒ１３Ｑ）、
ｖｉｉ．  グルタミン酸（Ｆ１Ｉ  Ｒ１３Ｓ）、
ｖｉｉｉ．  セリン（Ｆ１Ｉ  Ｒ１３Ｖ）、もしくは
ｉｘ．  バリン（Ｆ１Ｉ  Ｒ１３Ｅ）への変更との組合せ；
ｅ．  １位のフェニルアラニンのロイシンへの変更と１３位のアルギニンの：
ｉ．  アラニン（Ｆ１Ｌ  Ｒ１３Ａ）、
ｉｉ．  アスパラギン酸（Ｆ１Ｌ  Ｒ１３Ｄ）、
ｉｉｉ．  グリシン（Ｆ１Ｌ  Ｒ１３Ｇ）、
ｉｖ．  アスパラギン（Ｆ１Ｌ  Ｒ１３Ｎ）、
ｖ．  プロリン（Ｆ１Ｌ  Ｒ１３Ｐ）、もしくは
ｖｉ．  グルタミン（Ｆ１Ｌ  Ｒ１３Ｑ）への変更との組合せ；
ｆ．  １位のフェニルアラニンのスレオニンへの変更と１３位のアルギニンの：
ｉ．  アラニン（Ｆ１Ｔ  Ｒ１３Ａ）、
ｉｉ．  アスパラギン（Ｆ１Ｔ  Ｒ１３Ｎ）、もしくは
ｉｉｉ．  バリン（Ｆ１Ｔ  Ｒ１３Ｖ）への変更との組合せ；
ｇ．  １位のフェニルアラニンのバリンへの変更と１３位のアルギニンの：
ｉ．  アラニン（Ｆ１Ｖ  Ｒ１３Ａ）、
ｉｉ．  アスパラギン（Ｆ１Ｖ  Ｒ１３Ｎ）、
ｉｉｉ．  グルタミン（Ｆ１Ｖ  Ｒ１３Ｑ）、
ｉｖ．  アスパラギン酸（Ｆ１Ｖ  Ｒ１３Ｄ）、
ｖ．  バリン（Ｆ１Ｖ  Ｒ１３Ｖ）、もしくは
ｖｉ．  プロリン（Ｆ１Ｖ  Ｒ１３Ｐ）への変更との組合せ；または
ｈ．  １位フェニルアラニンのチロシンへの変更と１３位のアルギニンの：
ｉ．  アスパラギン酸（Ｆ１Ｙ  Ｒ１３Ｄ）、もしくは
ｉｉ．  グリシン（Ｆ１Ｙ  Ｒ１３Ｇ）への変更との組合せ、を含む二つの変異をさらに含む、非天然由来の翻訳後修飾されたランチビオティック。
【請求項２】
１位のフェニルアラニンのバリンへの変更と１３位のアルギニンの：
ｉ．  アラニン（Ｆ１Ｖ  Ｒ１３Ａ）、
ｉｉ．  アスパラギン（Ｆ１Ｖ  Ｒ１３Ｎ）、
ｉｉｉ．  グルタミン（Ｆ１Ｖ  Ｒ１３Ｑ）、
ｉｖ．  アスパラギン酸（Ｆ１Ｖ  Ｒ１３Ｄ）、
ｖ．  バリン（Ｆ１Ｖ  Ｒ１３Ｖ）、または
ｖｉ．  プロリン（Ｆ１Ｖ  Ｒ１３Ｐ）、への変更との組合せを含む二つの変異を含む、請求項１に記載の非天然由来の翻訳後修飾されたランチビオティック。
【請求項３】
前記二つの変異が、１位のフェニルアラニンのバリンへの変更と１３位のアルギニンのアスパラギンへの変更（ＦＩＶ  Ｒ１３Ｎ）（配列番号５５０）とからなる、請求項２に記載の非天然由来の翻訳後修飾されたランチビオティック。
【請求項４】
配列番号５５０または配列番号１１６１のアミノ酸配列を含む、非天然由来のランチビオティック。
【請求項５】
配列番号５５０のアミノ酸配列を含み、翻訳後修飾される、請求項４に記載の非天然由来のランチビオティック。
【請求項６】
前記翻訳後修飾が、５位にＤｈａを、８位にＡｂｕを、１４位にＤｈｂを含む、請求項５に記載の非天然由来のランチビオティック。
【請求項７】
前記翻訳後修飾が、図１に記載されるように（Ａｌａ３−Ｓ−Ａｌａ７）間のランチオニン（Ａｌａ−Ｓ−Ａｌａ）残基によって形成される環（環Ａ）、メチル−ランチオニン残基（Ａｂｕ−Ｓ−Ａｌａ）によって形成される環（環Ｂ）、図１に記載されるように（Ａｌａ１６−Ｓ−Ａｌａ２１）間のランチオニン（Ａｌａ−Ｓ−Ａｌａ）残基によって形成される環（環Ｃ）、およびチオエーテル連結によってアミノビニル基に連結された１９位のＡｌａ（Ａｌａ１９−Ｓ−ＣＨ＝ＣＨ−ＮＨ−）（環Ｄ）を含む、請求項５に記載の非天然由来のランチビオティック。
【請求項８】
前記翻訳後修飾されたＭＵ１１４０バリアントが、環Ａ、環Ｂ、環Ｃ、および環Ｄを含み、
ａ．  これらの環のうち二つが、環Ａ中の一つ（Ａｌａ３−Ｓ−Ａｌａ７）と環Ｃ中の一つ（Ａｌａ１６−Ｓ−Ａｌａ２１）とを含むランチオニン（Ａｌａ−Ｓ−Ａｌａ）残基によって形成され；
ｂ．  メチル−ランチオニン残基（Ａｂｕ−Ｓ−Ａｌａ）が、８位のアルファ−アミノ酪酸残基と１１位のＡｌａとを含む環Ｂ（Ａｂｕ８−Ｓ−Ａｌａ１１）を形成し；
ｃ．  第４の環であるＤが、チオエーテル連結によってアミノビニル基に連結された１９位のＡｌａ（Ａｌａ１９−Ｓ−ＣＨ＝ＣＨ−ＮＨ−）から構成され、
ならびに、５位のアミノ酸が、Ｄｈａに修飾され、８位のアミノ酸が、Ａｂｕに修飾され、１４位のアミノ酸が、Ｄｈｂに修飾されている、請求項５から７のいずれか１項に記載の非天然由来のランチビオティック。
【請求項９】
配列番号１１５７のアミノ酸配列を含む、翻訳後修飾された非天然由来のランチビオティック。
【請求項１０】
請求項１から３および５から８のいずれか１項に記載の非天然由来のランチビオティックと、医薬的に許容可能な担体、医薬的に許容可能な希釈剤、他の希釈剤または賦形剤とを含む、抗微生物組成物。
【請求項１１】
抗真菌剤、追加の抗微生物剤、膜破壊剤、またはそれらの組合せをさらに含む、請求項１０に記載の抗微生物組成物。
【請求項１２】
前記追加の抗微生物剤が、グラム陰性の静菌または殺細菌の活性を有し、前記膜破壊剤が、グラム陰性細菌を前記バリアントランチビオティックに対し感受性にする、請求項１１に記載の抗微生物組成物。
【請求項１３】
非天然由来のランチビオティックが、組成物中に約０．００１、０．０１、０．１、１、５、１０、２０、３０、４０、５０、７５、１００、１５０、２００、３００、４００、５００、６００、７００、８００、９００、または１，０００ｍｇ／ｋｇまたはｍｇ／Ｌで存在する、請求項１０から１２のいずれか１項に記載の抗微生物組成物。
【請求項１４】
対象の中または上に存在する、細菌の繁殖を低減するかまたは細菌数を低減するのに用いられる請求項１０から１３のいずれか１項に記載の抗微生物組成物。
【請求項１５】
組成物もしくは無生物の物体の中もしくは上の細菌の繁殖を低減するかまたは細菌数を低減するのに有効な期間、請求項１から３および５から８のいずれか１項に記載の抗微生物組成物を、前記組成物または物体に接触させることを含む、組成物もしくは無生物の物体の中もしくは上に存在する細菌の繁殖を低減するかまたは細菌数を低減する方法。
【請求項１６】
配列番号７５８または配列番号１１６３のポリヌクレオチドを含む、単離された組換えストレプトコッカス・ミュータンス株。
【請求項１７】
（ａ）乳酸の発現が野生型Ｓ．ミュータンス株に比べて約８０％以上減るような、乳酸合成に関与するポリヌクレオチド中の変異；（ｂ）組換えアルコールデヒドロゲナーゼのポリヌクレオチド；および（ｃ）請求項１から３および５から８のいずれか１項に記載の非天然由来のランチビオティックをコードする組換えポリヌクレオチド、を含む、単離された組換えストレプトコッカス・ミュータンス株。
【請求項１８】
請求項１から４および９のいずれか１項に記載のランチビオティックをコードする、ポリヌクレオチド。
【請求項１９】
請求項１８に記載のポリヌクレオチドを含む、宿主細胞。
【請求項２０】
前記細菌が、グラム陽性細菌である、請求項１４または１５に記載の方法。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０１９９
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０１９９】
アミノ酸置換の概要は、図８に見られ、６つの異なる群に分けられる。
第１群：活性＞ＳＭ２５３対照株（透明域＞０．３１９ｃｍ２）
第２群：２回の反復実験で活性＞ＳＭ２５３（１回の反復実験
第３群：１回の反復で活性＞ＳＭ２５３であり、１回の反復実験で活性≦ＳＭ２５３
第４群：活性＞ＳＭ２５３対照株（透明域＞０．１６７ｃｍ２であるが透明域＜０．３１９ｃｍ２）
第５群：活性≦ＳＭ２５３対照（透明域≦０．１６７ｃｍ２）
第６群：決定せず
本発明は以下の態様を含みうる。
［１］ＭＵ１１４０のアミノ酸配列を含み、
ａ．  １３位のアルギニンのアスパラギンへの変更（Ｒ１３Ｎ）；
ｂ．  １７位のフェニルアラニンのロイシン（Ｆ１７Ｌ）またはチロシン（Ｆ１７Ｙ）への変更；
ｃ．  １８位のアスパラギンのアラニンへの変更（Ｎ１８Ａ）；
ｄ．  ２０位のチロシンのフェニルアラニンへの変更（Ｙ２０Ｆ）；または
ｅ．  それらの組合せ、を含む変異をさらに含む、非天然由来のランチビオティック。
［２］ＭＵ１１４０のアミノ酸配列を含み、二つの変異をさらに含み、一つの変異が：
ａ．  １３位のアルギニンのアスパラギンへの変更（Ｒ１３Ｎ）；
ｂ．  １７位のフェニルアラニンのロイシン（Ｆ１７Ｌ）またはチロシン（Ｆ１７Ｙ）への変更；
ｃ．  １８位のアスパラギンのアラニンへの変更（Ｎ１８Ａ）；
ｄ．  ２０位のチロシンのフェニルアラニンへの変更（Ｙ２０Ｆ）；または
ｅ．  それらの組合せ、を含む、非天然由来のランチビオティック。
［３］一つの変異が、１３位のアルギニンのアスパラギンへの変更（Ｒ１３Ｎ）である、上記［２］に記載の非天然由来のランチビオティック。
［４］一つの変異が、１位のフェニルアラニンのバリンへの変更（ＦＩＶ）である、上記［２］または［３］に記載の非天然由来のランチビオティック。
［５］ＭＵ１１４０のアミノ酸配列を含み、二つの変異をさらに含み、一つの変異が、
ａ．１位のフェニルアラニンのバリンへの変更（Ｆ１Ｖ）；
ｂ．１位のフェニルアラニンのアラニンへの変更（Ｆ１Ａ）；
ｃ．１位のフェニルアラニンのイソロイシンへの変更（Ｆ１Ｉ）；
ｄ．１位のフェニルアラニンのロイシンへの変更（Ｆ１Ｌ）；
ｅ．１位のフェニルアラニンのスレオニンへの変更（Ｆ１Ｔ）；または
ｆ．１位のフェニルアラニンのチロシンへの変更（Ｆ１Ｙ）、を含む、非天然由来のランチビオティック。
［６］一つの変異が、１位のフェニルアラニンのバリンへの変更（ＦＩＶ）である、上記［５］に記載の非天然由来のランチビオティック。
［７］一つの変異が、１３位のアルギニンのアスパラギンへの変更（Ｒ１３Ｎ）である、上記［５］または［６］に記載の非天然由来のランチビオティック。
［８］ＭＵ１１４０のアミノ酸配列を含み、
ａ．  １位のフェニルアラニンのアラニンへの変更と、１３位のアルギニンの：
ｉ．  アラニン（Ｆ１Ａ  Ｒ１３Ａ）、
ｉｉ．  バリン（Ｆ１Ａ  Ｒ１３Ｖ）、
ｉｉｉ．  アスパラギン（Ｆ１Ａ  Ｒ１３Ｎ）、もしくは
ｉｖ．  セリン（Ｆ１Ａ  Ｒ１３Ｓ）への変更との組合せ；
ｂ．  １位のフェニルアラニンのグリシンへの変更と、１３位のアルギニンの：
ｉ．  グリシン（Ｆ１Ｇ  Ｒ１３Ｇ）への変更との組合せ；
ｃ．  １位のフェニルアラニンのヒスチジンへの変更と、１３位のアルギニンの：
ｉ．  アスパラギン（Ｆ１Ｈ  Ｒ１３Ｎ）への変更との組合せ；
ｄ．  １位のフェニルアラニンのイソロイシンへの変更と、１３位のアルギニンの：
ｉ．  アラニン（Ｆ１Ｉ  Ｒ１３Ａ）、
ｉｉ．  グリシン（Ｆ１Ｉ  Ｒ１３Ｇ）、
ｉｉｉ．  イソロイシン（Ｆ１Ｉ  Ｒ１３Ｉ）、
ｉｖ．  アスパラギン（Ｆ１Ｉ  Ｒ１３Ｎ）、
ｖ．  プロリン（Ｆ１Ｉ  Ｒ１３Ｐ）、
ｖｉ．  グルタミン（Ｆ１Ｉ  Ｒ１３Ｑ）、
ｖｉｉ．  グルタミン酸（Ｆ１Ｉ  Ｒ１３Ｓ）、
ｖｉｉｉ．  セリン（Ｆ１Ｉ  Ｒ１３Ｖ）、もしくは
ｉｘ．  バリン（Ｆ１Ｉ  Ｒ１３Ｅ）への変更との組合せ；
ｅ．  １位のフェニルアラニンのロイシンへの変更と、１３位のアルギニンの：
ｉ．  アラニン（Ｆ１Ｌ  Ｒ１３Ａ）、
ｉｉ．  アスパラギン酸（Ｆ１Ｌ  Ｒ１３Ｄ）、
ｉｉｉ．  グリシン（Ｆ１Ｌ  Ｒ１３Ｇ）、
ｉｖ．  アスパラギン（Ｆ１Ｌ  Ｒ１３Ｎ）、
ｖ．  プロリン（Ｆ１Ｌ  Ｒ１３Ｐ）、もしくは
ｖｉ．  グルタミン（Ｆ１Ｌ  Ｒ１３Ｑ）への変更との組合せ；
ｆ．  １位のフェニルアラニンのスレオニンへの変更と、１３位のアルギニンの：
ｉ．  アラニン（Ｆ１Ｔ  Ｒ１３Ａ）、
ｉｉ．  アスパラギン（Ｆ１Ｔ  Ｒ１３Ｎ）、もしくは
ｉｉｉ．  バリン（Ｆ１Ｔ  Ｒ１３Ｖ）への変更との組合せ；
ｇ．  １位のフェニルアラニンのバリンへの変更と、１３位のアルギニンの：
ｉ．  アラニン（Ｆ１Ｖ  Ｒ１３Ａ）、
ｉｉ．  アスパラギン（Ｆ１Ｖ  Ｒ１３Ｎ）、
ｉｉｉ．  グルタミン（Ｆ１Ｖ  Ｒ１３Ｑ）、
ｉｖ．  アスパラギン酸（Ｆ１Ｖ  Ｒ１３Ｄ）、
ｖ．  バリン（Ｆ１Ｖ  Ｒ１３Ｖ）、もしくは
ｖｉ．  プロリン（Ｆ１Ｖ  Ｒ１３Ｐ）への変更との組合せ；または
ｈ．  １位のフェニルアラニンのチロシンへの変更と、１３位のアルギニンの：
ｉ．  アスパラギン酸（Ｆ１Ｙ  Ｒ１３Ｄ）、もしくは
ｉｉ．  グリシン（Ｆ１Ｙ  Ｒ１３Ｇ）、への変更との組合せ、を含む二つの変異をさらに含む、非天然由来のランチビオティック。
［９］１位のフェニルアラニンのバリンへの変更と、１３位のアルギニンの：
ｉ．  アラニン（Ｆ１Ｖ  Ｒ１３Ａ）、
ｉｉ．  アスパラギン（Ｆ１Ｖ  Ｒ１３Ｎ）、
ｉｉｉ．  グルタミン（Ｆ１Ｖ  Ｒ１３Ｑ）、
ｉｖ．  アスパラギン酸（Ｆ１Ｖ  Ｒ１３Ｄ）、
ｖ．  バリン（Ｆ１Ｖ  Ｒ１３Ｖ）、または
ｖｉ．  プロリン（Ｆ１Ｖ  Ｒ１３Ｐ）、への変更との組合せを含む二つの変異を含む、上記［８］に記載の非天然由来のランチビオティック。
［１０］前記二つの変異が、１位のフェニルアラニンのバリンへの変更と、１３位のアルギニンのアスパラギンへの変更との組合せ（ＦＩＶ  Ｒ１３Ｎ）とからなる、上記［９］に記載の非天然由来のランチビオティック。
［１１］ＭＵ１１４０のアミノ酸配列を含み、
ａ．  １位のフェニルアラニンのイソロイシンへの変更と、１３位のアルギニンのアラニンへの変更との組合せ、１５位のグリシンのアラニンへの変更との組合せ（Ｆ１Ｉ  Ｒ１３Ａ  Ｇ１５Ａ）；
ｂ．  １位のフェニルアラニンのイソロイシンへの変更と、１３位のアルギニンのアスパラギン酸への変更との組合せ、１５位のグリシンのアラニンへの変更との組合せ（Ｆ１Ｉ  Ｒ１３Ｄ  Ｇ１５Ａ）；
ｃ．  １位のフェニルアラニンのイソロイシンへの変更と、４位のトリプトファンのイソロイシンへの変更との組合せ、１３位のアルギニンのアラニンへの変更との組合せ（Ｆ１Ｉ  Ｗ４Ｉ  Ｒ１３Ａ）；
ｄ．  １位のフェニルアラニンのイソロイシンへの変更と、４位のトリプトファンのメチオニンへの変更との組合せ、１３位のアルギニンのアスパラギン酸への変更との組合せ（Ｆ１Ｉ  Ｗ４Ｍ  Ｒ１３Ｄ）；
ｅ．  １位のフェニルアラニンのイソロイシンへの変更と、４位のトリプトファンのメチオニンへの変更との組合せ、１３位のアルギニンのアスパラギンへの変更との組合せ（Ｆ１Ｉ  Ｗ４Ｍ  Ｒ１３Ｎ）；
ｆ．  １位のフェニルアラニンのイソロイシンへの変更と、２位のリジンのアラニンへの変更との組合せ、１３位のアルギニンのアラニンへの変更との組合せ（Ｆ１Ｉ  Ｋ２Ａ  Ｒ１３Ａ）；
ｇ．  １位のフェニルアラニンのイソロイシンへの変更と、６位のロイシンのバリンへの変更との組合せ、１３位のアルギニンのアラニンへの変更との組合せ（Ｆ１Ｉ  Ｌ６Ｖ  Ｒ１３Ａ）；
ｈ．  １位のフェニルアラニンのイソロイシンへの変更と、１３位のアルギニンのアラニンへの変更との組合せ、２０位のチロシンのフェニルアラニンへの変更との組合せ（Ｆ１Ｉ  Ｒ１３Ａ  Ｙ２０Ｆ）；
ｉ．  １位のフェニルアラニンのイソロイシンへの変更と、１３位のアルギニンのアスパラギン酸への変更との組合せ、２０位のチロシンのフェニルアラニンへの変更との組合せ（Ｆ１Ｉ  Ｒ１３Ｄ  Ｙ２０Ｆ）；
ｊ．  １位のフェニルアラニンのイソロイシンへの変更と、１３位のアルギニンのアスパラギンへの変更との組合せ、２０位のチロシンのフェニルアラニンへの変更との組合せ（Ｆ１Ｉ  Ｒ１３Ｎ  Ｙ２０Ｆ）；
ｋ．  １位のフェニルアラニンのロイシンへの変更と、１３位のアルギニンのアスパラギンへの変更との組合せ、２０位のチロシンのフェニルアラニンへの変更との組合せ（Ｆ１Ｌ  Ｒ１３Ｎ  Ｙ２０Ｆ）；
ｌ．  １位のフェニルアラニンのロイシンへの変更と、１３位のアルギニンのアラニンへの変更との組合せ、２０位のチロシンのフェニルアラニンへの変更との組合せ（Ｆ１Ｌ  Ｒ１３Ａ  Ｙ２０Ｆ）；または
ｍ．  １位のフェニルアラニンのロイシンへの変更と、１３位のアルギニンのアスパラギン酸への変更との組合せ、２０位のチロシンのフェニルアラニンへの変更との組合せ（Ｆ１Ｌ  Ｒ１３Ｄ  Ｙ２０Ｆ）を含む三つの変異をさらに含む、非天然由来のランチビオティック。
［１２］ＭＵ１１４０のアミノ酸配列を含み、
ａ．  １位のフェニルアラニンのイソロイシンへの変更と、２位のリジンのアラニンへの変更との組合せ、４位のトリプトファンのリジンへの変更との組合せ、１３位のアルギニンのアラニンへの変更との組合せ（Ｆ１Ｉ  Ｋ２Ａ  Ｗ４Ｋ  Ｒ１３Ａ）；または
ｂ．  １位のフェニルアラニンのイソロイシンへの変更と、２位のリジンのアラニンへの変更との組合せ、４位のトリプトファンのリジンへの変更との組合せ、１３位のアルギニンのアスパラギン酸への変更との組合せ（Ｆ１Ｉ  Ｋ２Ａ  Ｗ４Ｋ  Ｒ１３Ｄ）の変異をさらに含む、非天然由来のランチビオティック。
［１３］ＭＵ１１４０のアミノ酸配列を含み、１位のフェニルアラニンのイソロイシンへの変更と、２位のリジンのアラニンへの変更との組合せ、４位のトリプトファンのメチオニンへの変更との組合せ、１３位のアルギニンのアラニンへの変更との組合せ、２０位のチロシンのフェニルアラニンへの変更との組合せ（Ｆ１Ｉ  Ｋ２Ａ  Ｗ４Ｋ  Ｒ１３Ａ  Ｙ２０Ｆ）の変異をさらに含む、非天然由来のランチビオティック。
［１４］ＭＵ１１４０のアミノ酸配列（配列番号１１５６）を含み、
ａ．  １３位のアルギニンのアスパラギンへの変更（Ｒ１３Ｎ）；
ｂ．  １７位のフェニルアラニンのロイシン（Ｆ１７Ｌ）またはチロシン（Ｆ１７Ｙ）への変更；
ｃ．  １８位のアスパラギンのアラニンへの変更（Ｎ１８Ａ）；
ｄ．  ２０位のチロシンのフェニルアラニンへの変更（Ｙ２０Ｆ）；または
ｅ．  それらの組合せ  を含む変異をさらに含む、非天然由来の翻訳後修飾されたランチビオティック。
［１５］ＭＵ１１４０のアミノ酸配列（配列番号１１５６）を含み、二つの変異をさらに含み、一つの変異は：
ａ．  １３位のアルギニンのアスパラギンへの変更（Ｒ１３Ｎ）；
ｂ．  １７位のフェニルアラニンのロイシン（Ｆ１７Ｌ）またはチロシン（Ｆ１７Ｙ）への変更；
ｃ．  １８位のアスパラギンのアラニンへの変更（Ｎ１８Ａ）；
ｄ．  ２０位のチロシンのフェニルアラニンへの変更（Ｙ２０Ｆ）；または
ｅ．  それらの組合せ  を含む、非天然由来の翻訳後修飾されたランチビオティック。
［１６］一つの変異が、１３位のアルギニンのアスパラギンへの変更（Ｒ１３Ｎ）である、上記［１５］に記載の非天然由来の翻訳後修飾されたランチビオティック。
［１７］一つの変異が、１位のフェニルアラニンのバリンへの変更（ＦＩＶ）である、上記［１５］または［１６］に記載の非天然由来の翻訳後修飾されたランチビオティック。
［１８］ＭＵ１１４０のアミノ酸配列（配列番号１１５６）を含み、二つの変異をさらに含み、一つの変異は：
ａ．  １位のフェニルアラニンのバリンへの変更（Ｆ１Ｖ）；
ｂ．  １位のフェニルアラニンのアラニンへの変更（Ｆ１Ａ）；
ｃ．  １位のフェニルアラニンのイソロイシンへの変更（Ｆ１Ｉ）；
ｄ．  １位のフェニルアラニンのロイシンへの変更（Ｆ１Ｌ）；
ｅ．  １位のフェニルアラニンのスレオニンへの変更（Ｆ１Ｔ）；または
ｆ．  １位フェニルアラニンのチロシンへの変更（Ｆ１Ｙ）を含む、非天然由来の翻訳後修飾されたランチビオティック。
［１９］一つの変異が、１位のフェニルアラニンのバリンへの変更（ＦＩＶ）である、上記［１８］に記載の非天然由来の翻訳後修飾されたランチビオティック。
［２０］一つの変異が、１３位のアルギニンのアスパラギンへの変更（Ｒ１３Ｎ）である、上記［１８］または［１９］に記載の非天然由来の翻訳後修飾されたランチビオティック。
［２１］ＭＵ１１４０のアミノ酸配列（配列番号１１５６）を含み、
ａ．  １位のフェニルアラニンのアラニンへの変更と１３位のアルギニンの：
ｉ．  アラニン（Ｆ１Ａ  Ｒ１３Ａ）、
ｉｉ．  バリン（Ｆ１Ａ  Ｒ１３Ｖ）、
ｉｉｉ．  アスパラギン（Ｆ１Ａ  Ｒ１３Ｎ）、もしくは
ｉｖ．  セリン（Ｆ１Ａ  Ｒ１３Ｓ）への変更との組合せ；
ｂ．  １位のフェニルアラニンのグリシンへの変更と１３位のアルギニンの：
ｉ．  グリシン（Ｆ１Ｇ  Ｒ１３Ｇ）への変更との組合せ；
ｃ．  １位のフェニルアラニンのヒスチジンへの変更と１３位のアルギニンの：
ｉ．  アスパラギン（Ｆ１Ｈ  Ｒ１３Ｎ）への変更との組合せ；
ｄ．  １位のフェニルアラニンのイソロイシンへの変更と１３位のアルギニンの：
ｉ．  アラニン（Ｆ１Ｉ  Ｒ１３Ａ）、
ｉｉ．  グリシン（Ｆ１Ｉ  Ｒ１３Ｇ）、
ｉｉｉ．  イソロイシン（Ｆ１Ｉ  Ｒ１３Ｉ）、
ｉｖ．  アスパラギン（Ｆ１Ｉ  Ｒ１３Ｎ）、
ｖ．  プロリン（Ｆ１Ｉ  Ｒ１３Ｐ）、
ｖｉ．  グルタミン（Ｆ１Ｉ  Ｒ１３Ｑ）、
ｖｉｉ．  グルタミン酸（Ｆ１Ｉ  Ｒ１３Ｓ）、
ｖｉｉｉ．  セリン（Ｆ１Ｉ  Ｒ１３Ｖ）、もしくは
ｉｘ．  バリン（Ｆ１Ｉ  Ｒ１３Ｅ）への変更との組合せ；
ｅ．  １位のフェニルアラニンのロイシンへの変更と１３位のアルギニンの：
ｉ．  アラニン（Ｆ１Ｌ  Ｒ１３Ａ）、
ｉｉ．  アスパラギン酸（Ｆ１Ｌ  Ｒ１３Ｄ）、
ｉｉｉ．  グリシン（Ｆ１Ｌ  Ｒ１３Ｇ）、
ｉｖ．  アスパラギン（Ｆ１Ｌ  Ｒ１３Ｎ）、
ｖ．  プロリン（Ｆ１Ｌ  Ｒ１３Ｐ）、もしくは
ｖｉ．  グルタミン（Ｆ１Ｌ  Ｒ１３Ｑ）への変更との組合せ；
ｆ．  １位のフェニルアラニンのスレオニンへの変更と１３位のアルギニンの：
ｉ．  アラニン（Ｆ１Ｔ  Ｒ１３Ａ）、
ｉｉ．  アスパラギン（Ｆ１Ｔ  Ｒ１３Ｎ）、もしくは
ｉｉｉ．  バリン（Ｆ１Ｔ  Ｒ１３Ｖ）への変更との組合せ；
ｇ．  １位のフェニルアラニンのバリンへの変更と１３位のアルギニンの：
ｉ．  アラニン（Ｆ１Ｖ  Ｒ１３Ａ）、
ｉｉ．  アスパラギン（Ｆ１Ｖ  Ｒ１３Ｎ）、
ｉｉｉ．  グルタミン（Ｆ１Ｖ  Ｒ１３Ｑ）、
ｉｖ．  アスパラギン酸（Ｆ１Ｖ  Ｒ１３Ｄ）、
ｖ．  バリン（Ｆ１Ｖ  Ｒ１３Ｖ）、もしくは
ｖｉ．  プロリン（Ｆ１Ｖ  Ｒ１３Ｐ）への変更との組合せ；または
ｈ．  １位フェニルアラニンのチロシンへの変更と１３位のアルギニンの：
ｉ．  アスパラギン酸（Ｆ１Ｙ  Ｒ１３Ｄ）、もしくは
ｉｉ．  グリシン（Ｆ１Ｙ  Ｒ１３Ｇ）への変更との組合せ、を含む二つの変異をさらに含む、非天然由来の翻訳後修飾されたランチビオティック。
［２２］１位のフェニルアラニンのバリンへの変更と１３位のアルギニンの：
ｉ．  アラニン（Ｆ１Ｖ  Ｒ１３Ａ）、
ｉｉ．  アスパラギン（Ｆ１Ｖ  Ｒ１３Ｎ）、
ｉｉｉ．  グルタミン（Ｆ１Ｖ  Ｒ１３Ｑ）、
ｉｖ．  アスパラギン酸（Ｆ１Ｖ  Ｒ１３Ｄ）、
ｖ．  バリン（Ｆ１Ｖ  Ｒ１３Ｖ）、または
ｖｉ．  プロリン（Ｆ１Ｖ  Ｒ１３Ｐ）、への変更との組合せを含む二つの変異を含む、上記［２１］に記載の非天然由来の翻訳後修飾されたランチビオティック。
［２３］前記二つの変異が、１位のフェニルアラニンのバリンへの変更と１３位のアルギニンのアスパラギンへの変更（ＦＩＶ  Ｒ１３Ｎ）（配列番号５５０）とからなる、上記［２２］に記載の非天然由来の翻訳後修飾されたランチビオティック。
［２４］ＭＵ１１４０のアミノ酸配列（配列番号１１５６）を含み、
ａ．  １位のフェニルアラニンのイソロイシンへの変更と、１３位のアルギニンのアラニンへの変更との組合せ、１５位のグリシンのアラニンへの変更との組合せ（Ｆ１Ｉ  Ｒ１３Ａ  Ｇ１５Ａ）；
ｂ．  １位のフェニルアラニンのイソロイシンへの変更と、１３位のアルギニンのアスパラギン酸への変更との組合せ、１５位のグリシンのアラニンへの変更との組合せ（Ｆ１Ｉ  Ｒ１３Ｄ  Ｇ１５Ａ）；
ｃ．  １位のフェニルアラニンのイソロイシンへの変更と、４位のトリプトファンのイソロイシンへの変更との組合せ、１３位のアルギニンのアラニンへの変更との組合せ（Ｆ１Ｉ  Ｗ４Ｉ  Ｒ１３Ａ）；
ｄ．  １位のフェニルアラニンのイソロイシンへの変更と、４位のトリプトファンのメチオニンへの変更との組合せ、１３位のアルギニンのアスパラギン酸への変更との組合せ（Ｆ１Ｉ  Ｗ４Ｍ  Ｒ１３Ｄ）；
ｅ．  １位のフェニルアラニンのイソロイシンへの変更と、４位のトリプトファンのメチオニンへの変更との組合せ、１３位のアルギニンのアスパラギンへの変更との組合せ（Ｆ１Ｉ  Ｗ４Ｍ  Ｒ１３Ｎ）；
ｆ．  １位のフェニルアラニンのイソロイシンへの変更と、２位のリジンのアラニンへの変更との組合せ、１３位のアルギニンのアラニンへの変更との組合せ（Ｆ１Ｉ  Ｋ２Ａ  Ｒ１３Ａ）；
ｇ．  １位のフェニルアラニンのイソロイシンへの変更と、６位のロイシンのバリンへの変更との組合せ、１３位のアルギニンのアラニンへの変更との組合せ（Ｆ１Ｉ  Ｌ６Ｖ  Ｒ１３Ａ）；
ｈ．  １位のフェニルアラニンのイソロイシンへの変更と、１３位のアルギニンのアラニンへの変更との組合せ、２０位のチロシンのフェニルアラニンへの変更との組合せ（Ｆ１Ｉ  Ｒ１３Ａ  Ｙ２０Ｆ）；
ｉ．  １位のフェニルアラニンのイソロイシンへの変更と、１３位のアルギニンのアスパラギン酸への変更との組合せ、２０位のチロシンのフェニルアラニンへの変更との組合せ（Ｆ１Ｉ  Ｒ１３Ｄ  Ｙ２０Ｆ）；
ｊ．  １位のフェニルアラニンのイソロイシンへの変更と、１３位のアルギニンのアスパラギンへの変更との組合せ、２０位のチロシンのフェニルアラニンへの変更との組合せ（Ｆ１Ｉ  Ｒ１３Ｎ  Ｙ２０Ｆ）；
ｋ．  １位のフェニルアラニンのロイシンへの変更と、１３位のアルギニンのアスパラギンへの変更との組合せ、２０位のチロシンのフェニルアラニンへの変更との組合せ（Ｆ１Ｌ  Ｒ１３Ｎ  Ｙ２０Ｆ）；
ｌ．  １位のフェニルアラニンのロイシンへの変更と、１３位のアルギニンのアラニンへの変更との組合せ、２０位のチロシンのフェニルアラニンへの変更との組合せ（Ｆ１Ｌ  Ｒ１３Ａ  Ｙ２０Ｆ）；または
ｍ．  １位のフェニルアラニンのロイシンへの変更と、１３位のアルギニンのアスパラギン酸への変更との組合せ、２０位のチロシンのフェニルアラニンへの変更との組合せ（Ｆ１Ｌ  Ｒ１３Ｄ  Ｙ２０Ｆ）を含む三つの変異をさらに含む、非天然由来の翻訳後修飾されたランチビオティック。
［２５］ＭＵ１１４０のアミノ酸配列（配列番号１１５６）を含み、
ａ．  １位のフェニルアラニンのイソロイシンへの変更と、２位のリジンのアラニンへの変更との組合せ、４位のトリプトファンのリジンへの変更との組合せ、１３位のアルギニンのアラニンへの変更との組合せ（Ｆ１Ｉ  Ｋ２Ａ  Ｗ４Ｋ  Ｒ１３Ａ）；または
ｂ．  １位のフェニルアラニンのイソロイシンへの変更と、２位のリジンのアラニンへの変更との組合せ、４位のトリプトファンのリジンへの変更との組合せ、１３位のアルギニンのアスパラギン酸への変更との組合せ（Ｆ１Ｉ  Ｋ２Ａ  Ｗ４Ｋ  Ｒ１３Ｄ）の変異をさらに含む、非天然由来の翻訳後修飾されたランチビオティック。
［２６］ＭＵ１１４０のアミノ酸配列（配列番号１１５６）を含み、１位のフェニルアラニンのイソロイシンへの変更と、２位のリジンのアラニンへの変更との組合せ、４位のトリプトファンのメチオニンへの変更との組合せ、１３位のアルギニンのアラニンへの変更との組合せ、２０位のチロシンのフェニルアラニンへの変更との組合せ（Ｆ１Ｉ  Ｋ２Ａ  Ｗ４Ｋ  Ｒ１３Ａ  Ｙ２０Ｆ）の変異をさらに含む、非天然由来の翻訳後修飾されたランチビオティック。
［２７］ＭＵ１１４０の単アミノ酸変異を含み、配列番号２から４３１のいずれか一つによってコードされるアミノ酸配列を有する、非天然由来のランチビオティック。
［２８］ＭＵ１１４０の複数箇所のアミノ酸変異を含み、図７に記載されるようなバリアントである、非天然由来のランチビオティック。
［２９］図８：第１群、第２群、または第３群に記載されるようないずれかのバリアントを含む、非天然由来のランチビオティック。
［３０］図８：第１群に記載されるようないずれかのバリアントを含む、非天然由来のランチビオティック。
［３１］図６に記載されるようなＭＵ１１４０の単アミノ酸変異を含む、非天然由来のランチビオティック。
［３２］配列番号５５０のアミノ酸配列を含む、非天然由来のランチビオティック。
［３３］翻訳後修飾される、上記［２７］から［３２］のいずれか１項に記載の非天然由来のランチビオティック。
［３４］前記翻訳後修飾が、５位にＤｈａを含む、上記［３３］に記載の非天然由来のランチビオティック。
［３５］前記翻訳後修飾が、８位にＡｂｕを含む、上記［３３］または上記［３４］に記載の非天然由来のランチビオティック。
［３６］前記翻訳後修飾が、１４位にＤｈｂを含む、上記［３３］から上記［３５］のいずれか１項に記載の非天然由来のランチビオティック。
［３７］前記翻訳後修飾が、５位にＤｈａを、８位にＡｂｕを、１４位にＤｈｂを含む、上記［３３］から上記［３６］のいずれか１項に記載の非天然由来のランチビオティック。
［３８］前記翻訳後修飾が、図１に記載されるように（Ａｌａ３−Ｓ−Ａｌａ７）間のランチオニン（Ａｌａ−Ｓ−Ａｌａ）残基によって形成される環（環Ａ）を含む、上記［３３］から上記［３７］のいずれか１項に記載の非天然由来のランチビオティック。
［３９］前記翻訳後修飾が、図１に記載されるように、８位のアルファ−アミノ酪酸残基と１１位のＡｌａとを含む環である環Ｂ（Ａｂｕ８−Ｓ−Ａｌａ１１）を形成するメチル−ランチオニン残基（Ａｂｕ−Ｓ−Ａｌａ）を含む、上記［３３］から上記［３８］のいずれか１項に記載の非天然由来のランチビオティック。
［４０］前記翻訳後修飾が、図１に記載されるように（Ａｌａ１６−Ｓ−Ａｌａ２１）間のランチオニン（Ａｌａ−Ｓ−Ａｌａ）残基によって形成される環（環Ｃ）を含む、上記［３３］から上記［３９］のいずれか１項に記載の非天然由来のランチビオティック。
［４１］前記翻訳後修飾が、図１に記載されるようにチオエーテル連結によってアミノビニル基に連結された１９位のＡｌａ（Ａｌａ１９−Ｓ−ＣＨ＝ＣＨ−ＮＨ−）である環Ｄを含む、上記［３３］から上記［４０］のいずれか１項に記載の非天然由来のランチビオティック。
［４２］前記翻訳後修飾が、環Ａ、Ｂ、Ｃ、およびＤを含む、上記［３３］から上記［４１］のいずれか１項に記載の非天然由来のランチビオティック。
［４３］前記翻訳後修飾されたＭＵ１１４０バリアントが、環Ａ、環Ｂ、環Ｃ、および環Ｄを含み、
ａ．  これらの環のうち二つが、環Ａ中の一つ（Ａｌａ３−Ｓ−Ａｌａ７）と環Ｃ中の一つ（Ａｌａ１６−Ｓ−Ａｌａ２１）とを含むランチオニン（Ａｌａ−Ｓ−Ａｌａ）残基によって形成され；
ｂ．  メチル−ランチオニン残基（Ａｂｕ−Ｓ−Ａｌａ）が、８位のアルファ−アミノ酪酸残基と１１位のＡｌａとを含む環Ｂ（Ａｂｕ８−Ｓ−Ａｌａ１１）を形成し；
ｃ．  第４の環であるＤが、チオエーテル連結によってアミノビニル基に連結された１９位のＡｌａ（Ａｌａ１９−Ｓ−ＣＨ＝ＣＨ−ＮＨ−）から構成され、
ならびに、５位のアミノ酸が、Ｄｈａに修飾され、８位のアミノ酸が、Ａｂｕに修飾され、１４位のアミノ酸が、Ｄｈｂに修飾されている、上記［３３］から［４２］のいずれか１項に記載の非天然由来のランチオビオティック。
［４４］図５または図７のランチビオティックバリアントをコードするポリヌクレオチドからポリペプチドを発現することによって宿主細胞中に生産され、前記発現されたポリペプチドは、前記宿主細胞中で翻訳後修飾される、単離されたランチビオティックバリアント。
［４５］前記宿主細胞が、Ｓ．ミュータンスである、上記［４４］に記載の単離されたランチビオティックバリアント。
［４６］配列番号１１５７のアミノ酸配列を含む、翻訳後修飾された非天然由来のランチビオティック。
［４７］上記［１］から［２６］または［３３］から［４６］のいずれか１項に記載の非天然由来のランチビオティックと、医薬的に許容可能な担体、医薬的に許容可能な希釈剤、他の希釈剤または賦形剤とを含む、抗微生物組成物。
［４８］抗真菌剤、追加の抗微生物剤、膜破壊剤、またはそれらの組合せをさらに含む、上記［４７］に記載の抗微生物組成物。
［４９］前記追加の抗微生物剤が、グラム陰性の静菌または殺細菌の活性を有し、前記膜破壊剤が、グラム陰性細菌を前記バリアントランチビオティックに対し感受性にする、上記［４８］に記載の抗微生物組成物。
［５０］非天然由来のランチビオティックが、組成物中に約０．００１、０．０１、０．１、１、５、１０、２０、３０、４０、５０、７５、１００、１５０、２００、３００、４００、５００、６００、７００、８００、９００、または１，０００ｍｇ／ｋｇまたはｍｇ／Ｌで存在する、上記［４７］から［４９］のいずれか１項に記載の抗微生物組成物。
［５１］治療有効量の上記［４７］から［５０］のいずれか１項に記載の抗微生物組成物を対象に投与することを含む、対象の中または上に存在する、細菌の繁殖を低減するかまたは細菌数を低減する方法。
［５２］前記対象がヒトである、上記［５１］に記載の方法。
［５３］前記組成物が、経口的に、局所的に、経鼻的に、バッカルで、舌下に、経粘膜的に、直腸性に、経皮的に、吸入によって、注射によって、または髄腔内に投与される、上記［４７］または［５２］に記載の方法。
［５４］前記注射が、筋肉内、静脈内、肺内、筋肉内、皮内、腹腔内、くも膜下腔内、または皮下の注射である、上記［５３］に記載の方法。
［５５］３と８の間のｐＨの生理的溶液中に上記［１］から［２６］または［３３］から［４６］のいずれか１項に記載の有効量の非天然由来のランチビオティックを含む保存剤。
［５６］組成物中の細菌の繁殖または細菌数を低減するのに充分な、ある量の上記［１］から［２６］または［３３］から［４６］のいずれか１項に記載の非天然由来のランチビオティックを含む、食品、飲料、ガム、または歯磨き剤の組成物。
［５７］組成物もしくは物体の中もしくは上の細菌の繁殖を低減するかまたは細菌数を低減するのに有効な期間、上記［１］から［２６］または［３３］から［４６］のいずれか１項に記載の抗微生物組成物を、前記組成物または物体に接触させることを含む、組成物もしくは物体の中もしくは上に存在する細菌の繁殖を低減するかまたは細菌数を低減する方法。
［５８］前記組成物が、食品、飲料、ガム、または歯磨き剤である、上記［５７］に記載の方法。
［５９］固体表面または布地を、上記［１］から［２６］または［３３］から［４６］に記載のランチビオティック組成物、または前記固体表面もしくは布地に被覆、固相化、連結、もしくは結合されている前記組成物とともに含む、組成物。
［６０］バイオフィルムもしくは生物付着の状態の中もしくは上で細菌の繁殖を低減するかまたは細菌数を低減するのに有効な期間、上記［４７］から［５０］のいずれか１項に記載の抗微生物組成物を、前記バイオフィルムまたは生物付着の状態に接触させることを含む、バイオフィルムまたは生物付着の状態を低減する方法。
［６１］上記［１］から［２６］または［３３］から［４６］のいずれか１項に記載のランチビオティックと、一つまたは複数のアプリケーターとを含むキット。
［６２］上記［１］から［２６］または［３３］から［４６］のいずれか１項に記載の非天然由来のランチビオティックを投与することを含む、細菌感染と診断された対象を予防または治療する方法。
［６３］前記対象がヒトである、上記［６２］に記載の方法。
［６４］前記対象が、グラム陽性細菌に感染している、上記［６２］または［６３］に記載の方法。
［６５］前記グラム陽性細菌が、スタフィロコッカス・エピデルミディス（Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ  ｅｐｉｄｅｒｍｉｄｉｓ）、バンコマイシン耐性のエンテロコッカス（Ｅｎｔｅｒｏｃｏｃｃｉ）、バンコマイシン耐性のエンテロコッカス・フェカリス（Ｅｎｔｅｒｏｃｏｃｃｕｓ  ｆａｅｃａｌｉｓ）、エンテロコッカス・フェカリス（Ｅｎｔｅｒｏｃｏｃｃｕｓ  ｆａｅｃａｌｉｓ）、エンテロコッカス・フェシウム（Ｅｎｔｅｒｏｃｏｃｃｕｓ  ｆａｅｃｉｕｍ）、プロピオニバクテリウム・アクネス（Ｐｒｏｐｉｏｎｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ａｃｎｅｓ）、ストレプトコッカス・サリバリウス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ  ｓａｌｉｖａｒｉｕｓ）、ストレプトコッカス・サンギス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ  ｓａｎｇｕｉｓ）、ストレプトコッカス・ミティス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ  ｍｉｔｉｓ）、ストレプトコッカス・ピオゲネス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ  ｐｙｏｇｅｎｅｓ）、ラクトバチルス・サリバリウス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓａｌｉｖａｒｉｕｓ）、リステリア・モノサイトゲネス（Ｌｉｓｔｅｒｉａ  ｍｏｎｏｃｙｔｏｇｅｎｅｓ）、アクチノマイセス・イスラエリー（Ａｃｔｉｎｏｍｙｃｅｓ  ｉｓｒａｅｌｉｉ）、アクチノマイセス・ネスランディ（Ａｃｔｉｎｏｍｙｃｅｓ  ｎａｅｓｌｕｎｄｉｉ）、アクチノマイセス・ビスコーサス（Ａｃｔｉｎｏｍｙｃｅｓ  ｖｉｓｃｏｓｕｓ）、バチルス・アンシラシス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ａｎｔｈｒａｃｉｓ）、ストレプトコッカス・アガラクティエ（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ  ａｇａｌａｃｔｉａｅ）、ストレプトコッカス・インターメディウス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ  ｉｎｔｅｒｍｅｄｉｕｓ）、ストレプトコッカス・ニューモニエ（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ  ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ）、コリネバクテリウム・ジフテリア（Ｃｏｒｙｎｅｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｄｉｐｈｔｈｅｒｉａ）、クロストリジウム・スポロゲネス（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｓｐｏｒｏｇｅｎｅｓ）、クロストリジウム・ボツリナム（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｏｔｕｌｉｎｕｍ）、クロストリジウム・パーフリンゲンス（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｐｅｒｆｒｉｎｇｅｎｓ）、クロストリジウム・テタニ（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｔｅｔａｎｉ）、またはクロストリジウム・ディフィシル（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｄｉｆｆｉｃｉｌｅ）のうち一つまたは複数である、上記［６４］に記載の方法。
［６６］前記グラム陽性細菌が、クロストリジウム・ディフィシルである、上記［６５］に記載の方法。
［６７］前記対象が、グラム陰性細菌に感染している、上記［６２］または［６３］に記載の方法。
［６８］前記グラム陰性細菌が、アシネトバクター・バウマニ、ボルデテラ・パーツシス、ボレリア・ブルグドルフェリ、ブルセラ・アボルタス、ブルセラ・カニス、ブルセラ・メリテンシス、ブルセラ・スイス（Ｂｒｕｃｅｌｌａ  ｓｕｉｓ）、カンピロバクター・ジェジュニ（Ｃａｍｐｙｌｏｂａｃｔｅｒ  ｊｅｊｕｎｉ）、コクシエラ・バーネッティ（Ｃｏｘｉｅｌｌａ  ｂｕｒｎｅｔｉｉ）、大腸菌（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉ）、フランシセラ・ツラレンシス（Ｆｒａｎｃｉｓｅｌｌａ  ｔｕｌａｒｅｎｓｉｓ）、ヘモフィルス・インフルエンザ（Ｈａｅｍｏｐｈｉｌｕｓ  インフルエンザ）、ヘリコバクター・ピロリ（Ｈｅｌｉｃｏｂａｃｔｅｒ  ｐｙｌｏｒｉ）、クレブシエラ・ニューモニエ（Ｋｌｅｂｓｉｅｌｌａ  ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ）、レジオネラ・ニューモフィラ（Ｌｅｇｉｏｎｅｌｌａ  ｐｎｅｕｍｏｐｈｉｌａ）、レプトスピラ・インターロガンス（Ｌｅｐｔｏｓｐｉｒａ  ｉｎｔｅｒｒｏｇａｎｓ）、ナイセリア・ゴノレア（Ｎｅｉｓｓｅｒｉａ  ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ）、ナイセリア・メニンギティディス（Ｎｅｉｓｓｅｒｉａ  ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｅｓ）、シュードモナス・エルギノーザ（Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ  ａｅｒｕｇｉｎｏｓａ）、リケッチア・リケッチイ（Ｒｉｃｋｅｔｔｓｉａ  ｒｉｃｋｅｔｔｓｉｉ）、サルモネラ・エンテリティディス（Ｓａｌｍｏｎｅｌｌａ  ｅｎｔｅｒｉｔｉｄｉｓ）、サルモネラ・ティフィ（Ｓａｌｍｏｎｅｌｌａ  ｔｙｐｈｉ）、サルモネラ・ティフィムリウム（Ｓａｌｍｏｎｅｌｌａ  ｔｙｐｈｉｍｕｒｉｕｍ）、セラチア・マルセッセンス（Ｓｅｒｒａｔｉａ  ｍａｒｃｅｓｃｅｎｓ），シゲラ・ソンネ（Ｓｈｉｇｅｌｌａ  ｓｏｎｎｅｉ），トレポネーマ・パリズム（Ｔｒｅｐｏｎｅｍａ  ｐａｌｌｉｄｕｍ）、ビブリオ・コレラ（Ｖｉｂｒｉｏ  ｃｈｏｌｅｒａ）、エルシニア・エンテロコリチカ（Ｙｅｒｓｉｎｉａ  ｅｎｔｅｒｏｃｏｌｉｔｉｃａ）、またはエルシニア・ペスティス（Ｙｅｒｓｉｎｉａ  ｐｅｓｔｉｓ）のうち一つまたは複数である、上記［６７］に記載の方法。
［６９］前記非天然由来のランチビオティックが、一つまたは複数の追加の抗微生物剤、膜破壊剤、またはそれらの組合せをさらに含む、上記［６２］から［６８］のいずれか１項に記載の方法。
［７０］上記［４６］に記載の非天然由来のランチビオティックと、医薬的に許容可能な担体、医薬的に許容可能な希釈剤、他の希釈剤、賦形剤、またはそれらの組合せとを含む、抗微生物組成物。
［７１］抗真菌剤、追加の抗微生物剤、膜破壊剤またはそれらの組合せをさらに含む、上記［４７］に記載の抗微生物組成物。
［７２］前記追加の抗微生物剤が、グラム陰性の静菌または殺細菌の活性を有し、前記膜破壊剤が、グラム陰性細菌を前記バリアントランチビオティックに対し感受性にする、上記［４８］に記載の抗微生物組成物。
［７３］前記非天然由来のランチビオティックが、約０．００１、０．０１、０．１、１、５、１０、２０、３０、４０、５０、７５、１００、１５０、２００、３００、４００、５００、６００、７００、８００、９００、または１，０００ｍｇ／ｋｇまたはｍｇ／Ｌで前記組成物中に存在する、上記［７０］から［７２］のいずれか１項に記載の抗微生物組成物。
［７４］上記［７０］から［７３］のいずれか１項に記載の治療有効量の抗微生物組成物を対象に投与することを含む、対象の中または上に存在する細菌の繁殖を低減するかまたは細菌数を低減する方法。
［７５］前記対象がヒトである、上記［７４］に記載の方法。
［７６］前記組成物が、経口的に、局所的に、経鼻的に、バッカルで、舌下に、経粘膜的に、直腸性に、経皮的に、吸入によって、注射によって、または髄腔内に投与される、上記［７３］または［７４］に記載の方法。
［７７］前記注射が、筋肉内、静脈内、肺内、筋肉内、皮内、腹腔内、くも膜下腔内、または皮下の注射である、上記［７５］の方法。
［７８］３と８の間のｐＨの生理的溶液中に、有効量の上記［４６］に記載の非天然由来のランチビオティックを含む保存剤。
［７９］組成物中の細菌の繁殖または細菌数を低減するのに充分なある量の上記［４６］に記載の非天然由来のランチビオティックを含む、食品、飲料、ガム、または歯磨き剤の組成物。
［８０］組成物もしくは物体の中もしくは上の細菌の繁殖を低減するかまたは細菌数を低減するのに有効な期間、上記［４６］に記載の非天然由来のランチビオティックを、前記組成物または物体に接触させることを含む、組成物もしくは物体の中もしくは上に存在する細菌の繁殖を低減するかまたは細菌数を低減する方法。
［８１］前記組成物が、食品、飲料、ガム、または歯磨き剤である、上記［８０］に記載の方法。
［８２］固体表面または布地を、上記［４６］に記載の非天然由来のランチビオティック、または前記固体表面もしくは布地に被覆、固相化、連結、もしくは結合されている前記ランチビオティックとともに含む、組成物。
［８３］バイオフィルムもしくは生物付着の状態の中もしくは上で細菌の繁殖を低減するかまたは細菌数を低減するのに有効な期間、上記［４６］に記載の非天然由来のランチビオティックを、前記バイオフィルムまたは生物付着の状態に接触させることを含む、バイオフィルムまたは生物付着の状態を低減する方法。
［８４］上記［４６］に記載のランチビオティックおよび一つまたは複数のアプリケーターを含むキット。
［８５］上記［４６］に記載の非天然由来のランチビオティックを投与することを含む、細菌感染と診断された対象を予防または治療する方法。
［８６］前記対象がヒトである、上記［８５］に記載の方法。
［８７］前記対象が、グラム陽性細菌に感染している、上記［８５］または［８６］に記載の方法。
［８８］前記グラム陽性細菌が、スタフィロコッカス・エピデルミディス、バンコマイシン耐性のエンテロコッカス、バンコマイシン耐性のエンテロコッカス・フェカリス、エンテロコッカス・フェカリス、エンテロコッカス・フェシウム、プロピオニバクテリウム・アクネス、ストレプトコッカス・サリバリウス、ストレプトコッカス・サンギス、ストレプトコッカス・ミティス、ストレプトコッカス・ピオゲネス、ラクトバチルス・サリバリウス、リステリア・モノサイトゲネス、アクチノマイセス・イスラエリー、アクチノマイセス・ネスランディ、アクチノマイセス・ビスコーサス、バチルス・アンシラシス、ストレプトコッカス・アガラクティエ、ストレプトコッカス・インターメディウス、ストレプトコッカス・ニューモニエ、コリネバクテリウム・ジフテリア、クロストリジウム・スポロゲネス、クロストリジウム・ボツリナム、クロストリジウム・パーフリンゲンス、クロストリジウム・テタニ、クロストリジウム・ディフィシルのうち一つまたは複数である、上記［８７］に記載の方法。
［８９］前記グラム陽性細菌が、クロストリジウム・ディフィシルである、上記［８８］に記載の方法。
［９０］前記対象が、グラム陰性細菌に感染している、上記［８５］または［８６］に記載の方法。
［９１］前記グラム陰性細菌が、アシネトバクター・バウマニ、ボルデテラ・パーツシス、ボレリア・ブルグドルフェリ、ブルセラ・アボルタス、ブルセラ・カニス、ブルセラ・メリテンシス、ブルセラ・スイス、カンピロバクター・ジェジュニ、コクシエラ・バーネッティ、エシェリキア・コリ、フランシセラ・ツラレンシス、ヘモフィルス・インフルエンザ、ヘリコバクター・ピロリ、クレブシエラ・ニューモニエ、レジオネラ・ニューモフィラ、レプトスピラ・インターロガンス、ナイセリア・ゴノレア、ナイセリア・メニンギティディス、シュードモナス・エルギノーザ、リケッチア・リケッチイ、サルモネラ・エンテリティディス、サルモネラ・ティフィ、サルモネラ・ティフィムリウム、セラチア・マルセッセンス、シゲラ・ソンネ、トレポネーマ・パリズム、ビブリオ・コレラ、エルシニア・エンテロコリチカ、またはエルシニア・ペスティスのうち一つまたは複数である、上記［９０］に記載の方法。
［９２］前記非天然由来のランチビオティックが、一つまたは複数の追加の抗微生物剤、膜破壊剤、またはそれらの組合せをさらに含む、上記［８５］から［９１］のいずれか１項に記載の方法。
［９３］配列番号２〜４３１のいずれか一つを含むか、または図７に記載されるようなバリアントをコードする、精製ポリヌクレオチドまたはそれらの組合せ。
［９４］配列番号７５６、７５７、７５８、７５９、または７６０のいずれか一つを含む、精製ポリヌクレオチド。
［９５］配列番号７０９、７１４、７１６、７３５、７４７、７５１、７５４、または７５８のいずれか一つを含む、精製ポリヌクレオチド。
［９６］配列番号７５８を含む、精製ポリヌクレオチド。
［９７］配列番号１１６３を含む、精製ポリヌクレオチド。
［９８］配列番号７５８のポリヌクレオチドを含む宿主細胞。
［９９］配列番号１１６３のポリヌクレオチドを含む宿主細胞。
［１００］配列番号７５８のポリヌクレオチドを含む、単離された組換えストレプトコッカス・ミュータンス株。
［１０１］配列番号１１６３のポリヌクレオチドを含む、単離された組換えストレプトコッカス・ミュータンス株。
［１０２］配列番号１１６１のアミノ酸配列を含む非天然由来のポリペプチド。
［１０３］（ａ）乳酸の発現が野生型Ｓ．ミュータンス株に比べて約８０％以上減るような、乳酸合成に関与するポリヌクレオチド中の変異；（ｂ）組換えアルコールデヒドロゲナーゼのポリヌクレオチド；および（ｃ）上記［１］から［２６］または［３３］から［４６］のいずれか１項に記載の非天然由来のランチビオティックをコードする組換えポリヌクレオチド、を含む、単離された組換えストレプトコッカス・ミュータンス株。