【手続補正書】
【提出日】令和2年3月27日(2020.3.27)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
以下の構造（Ｉ）：
2019516812.tif 000001
を有する化合物、またはその立体異性体、塩もしくは互変異性体であって、ここで：
Ａは、各存在において、独立して、１個またはこれより多くの、縮合された炭素環式環系または複素環式環系を含む部分であり；
Ｍは、各存在において、独立して、２個またはこれより多くの炭素−炭素二重結合および少なくとも１の共役度を含む部分であり；
Ｌ1は、各存在において、独立して、ｉ）選択肢的なアルキレン、アルケニレン、アルキニレン、ヘテロアルキレン、ヘテロアルケニレン、ヘテロアルキニレンもしくはヘテロ原子リンカー；またはｉｉ）２個の相補的反応性基の反応によって形成できる官能基を含むリンカー、のいずれかであり；
Ｌ2、Ｌ3、Ｌ4およびＬ5は、各存在において、独立して、選択肢的なアルキレン、アルケニレン、アルキニレン、ヘテロアルキレン、ヘテロアルケニレン、ヘテロアルキニレンまたはヘテロ原子リンカーであり；
Ｒ1は、各存在において、独立して、Ｈ、アルキルまたはアルコキシであり；
Ｒ2およびＲ3は、各々独立して、Ｈ、ＯＨ、ＳＨ、アルキル、アルコキシ、アルキルエーテル、−ＯＰ（＝Ｒa）（Ｒb）Ｒc、Ｑ、Ｑへの共有結合を含むリンカー、分析物分子への共有結合を含むリンカー、固体支持体への共有結合を含むリンカーまたは構造（Ｉ）のさらなる化合物への共有結合を含むリンカーであり、ここで：Ｒaは、ＯまたはＳであり；Ｒbは、ＯＨ、ＳＨ、Ｏ-、Ｓ-、ＯＲdまたはＳＲdであり；Ｒcは、ＯＨ、ＳＨ、Ｏ-、Ｓ-、ＯＲd、ＳＲd、アルキル、アルコキシ、アルキルエーテル、アルコキシアルキルエーテル、ホスフェート、チオホスフェート、ホスホアルキル、チオホスホアルキル、ホスホアルキルエーテルまたはチオホスホアルキルエーテルであり；そしてＲdは、対イオンであり；
Ｒ4は、各存在において、独立して、ＯＨ、ＳＨ、Ｏ-、Ｓ-、ＯＲdまたはＳＲdであり；
Ｒ5は、各存在において、独立して、オキソ、チオキソまたは非存在であり；
Ｑは、各存在において、独立して、分析物分子、固体支持体または相補的反応性基Ｑ′と共有結合を形成できる反応性基を含む部分であり；
ｍは、各存在において、独立して、０またはこれより大きな整数であるが、ただしｍの少なくとも１個の存在は、１またはこれより大きな整数であり；そして
ｎは、１またはこれより大きな整数である、
化合物、またはその立体異性体、塩もしくは互変異性体。
【請求項２】
Ａは、各存在において、独立して、以下の構造：
2019516812.tif 000002
のうちの１つを有する、請求項１に記載の化合物。
【請求項３】
Ｌ1の少なくとも１個の存在に関して、Ｌ1−Ｍは、以下の構造：
2019516812.tif 000003
を有し、ここでＬ1aおよびＬ1bは、各々独立して、選択肢的なリンカーである、請求項１に記載の化合物。
【請求項４】
Ｌ1の少なくとも１個の存在に関して、Ｌ1−Ｍは、以下の構造：
2019516812.tif 000004
を有し、ここでＬ1aおよびＬ1bは、各々独立して、選択肢的なリンカーである、請求項１に記載の化合物。
【請求項５】
Ｌ1は、各存在において、独立して、選択肢的なアルキレンまたはヘテロアルキレンリンカーである、請求項１〜２のいずれか１項に記載の化合物。
【請求項６】
前記化合物は、以下の構造（ＩＡ）：
2019516812.tif 000005
を有し、ここで：
ｘ1、ｘ2、ｘ3、ｘ4、ｘ5およびｘ6は、各存在において、独立して、０〜６の整数である、
請求項１〜５のいずれか１項に記載の化合物。
【請求項７】
Ｒ4は、各存在において、独立して、ＯＨ、Ｏ-またはＯＲdである、請求項１〜６のいずれか１項に記載の化合物。
【請求項８】
Ｒ5は、各存在において、オキソである、請求項１〜７のいずれか１項に記載の化合物。
【請求項９】
Ｒ1は、Ｈである、請求項１〜８のいずれか１項に記載の化合物。
【請求項１０】
Ｒ2およびＲ3は、各々独立して、ＯＨまたは−ＯＰ（＝Ｒa）（Ｒb）Ｒcである、請求項１〜９のいずれか１項に記載の化合物。
【請求項１１】
Ｒ2またはＲ3のうちの一方は、ＯＨまたは−ＯＰ（＝Ｒa）（Ｒb）Ｒcであり、Ｒ2またはＲ3のうちの他方は、ＱまたはＱへの共有結合を含むリンカーである、請求項１〜９のいずれか１項に記載の化合物。
【請求項１２】
Ｑは、表１から選択される部分である、請求項１〜９または１１のいずれか１項に記載の化合物。
【請求項１３】
Ｒ2またはＲ3のうちの一方は、ＯＨまたは−ＯＰ（＝Ｒa）（Ｒb）Ｒcであり、Ｒ2またはＲ3のうちの他方は、分析物分子への共有結合を含むリンカーまたは固体支持体への共有結合を含むリンカーであり、前記分析物分子は、核酸もしくはそのポリマー、アミノ酸もしくはそのポリマー、酵素、レセプター、レセプターリガンド、抗体、糖タンパク質、アプタマーまたはプリオンであり、前記固体支持体は、ポリマービーズまたは非ポリマービーズである、請求項１〜９のいずれか１項に記載の化合物。
【請求項１４】
Ｍは、各存在において、独立して、ジメチルアミノスチルベン、キナクリドン、フルオロフェニル−ジメチル−ＢＯＤＩＰＹ、ｈｉｓ−フルオロフェニル−ＢＯＤＩＰＹ、アクリジン、テリレン、セキシフェニル、ポルフィリン、ベンゾピレン、（フルオロフェニル−ジメチル−ジフルオロボラ−ジアザ−インダセン）フェニル、（ビス−フルオロフェニル−ジフルオロボラ−ジアザ−インダセン）フェニル、クアテルフェニル、ビ−ベンゾチアゾール、ター−ベンゾチアゾール、ビ−ナフチル、ビ−アントラシル、スクアライン、スクアリリウム、９，１０−エチニルアントラセンまたはター−ナフチル部分である、請求項１〜１３のいずれか１項に記載の化合物。
【請求項１５】
Ｍは、各存在において、独立して、ｐ−ターフェニル、ペリレン、アゾベンゼン、フェナジン、フェナントロリン、アクリジン、チオキサントレン、クリセン、ルブレン、コロネン、シアニン、ペリレンイミド、もしくはペリレンアミドまたはその誘導体である、請求項１〜１３のいずれか１項に記載の化合物。
【請求項１６】
Ｍは、各存在において、独立して、クマリン染料、レゾルフィン染料、ジピロメテンボロンジフルオリド染料、ルテニウムビピリジル染料、エネルギー移動染料、チアゾールオレンジ染料、ポリメチンまたはＮ−アリール−１，８−ナフタルイミド染料である、請求項１〜１３のいずれか１項に記載の化合物。
【請求項１７】
Ｍは、各存在において、独立して、ピレン、ペリレン、ペリレンモノイミドもしくは６−ＦＡＭまたはその誘導体である、請求項１〜１３のいずれか１項に記載の化合物。
【請求項１８】
Ｍは、各存在において、独立して、以下の構造：
2019516812.tif 000006
のうちの１つを有する、請求項１〜１３のいずれか１項に記載の化合物。
【請求項１９】
表２から選択される化合物。
【請求項２０】
分析物分子を視覚的に検出するための方法であって、該方法は、
（ａ）Ｒ2またはＲ3は、ＱまたはＱへの共有結合を含むリンカーである請求項１に記載の化合物と、該分析物分子とを混合する工程；
（ｂ）該化合物および該分析物分子の結合体を形成する工程；ならびに
（ｃ）該結合体をその視覚的特性によって検出する工程、
を包含する方法。
【請求項２１】
以下の構造（ＩＩ）：
2019516812.tif 000007
を有する化合物、またはその立体異性体、塩もしくは互変異性体であって、ここで：
Ａは、各存在において、独立して、１個またはこれより多くの、縮合された炭素環式環系または複素環式環系を含む部分であり；
Ｇは、各存在において、独立して、相補的反応性基と共有結合を形成できる反応性基を含む部分であり；
Ｌ1a、Ｌ2、Ｌ3、Ｌ4およびＬ5は、各存在において、独立して、選択肢的なアルキレン、アルケニレン、アルキニレン、ヘテロアルキレン、ヘテロアルケニレン、ヘテロアルキニレンまたはヘテロ原子リンカーであり；
Ｒ1は、各存在において、独立して、Ｈ、アルキルまたはアルコキシであり；
Ｒ2およびＲ3は、各々独立して、Ｈ、ＯＨ、ＳＨ、アルキル、アルコキシ、アルキルエーテル、−ＯＰ（＝Ｒa）（Ｒb）Ｒc、Ｑ、Ｑへの共有結合を含むリンカー、分析物分子への共有結合を含むリンカー、固体支持体への共有結合を含むリンカーまたは構造（ＩＩ）のさらなる化合物への共有結合を含むリンカーであり、ここで：Ｒaは、ＯまたはＳであり；Ｒbは、ＯＨ、ＳＨ、Ｏ-、Ｓ-、ＯＲdまたはＳＲdであり；Ｒcは、ＯＨ、ＳＨ、Ｏ-、Ｓ-、ＯＲd、ＳＲd、アルキル、アルコキシ、アルキルエーテル、アルコキシアルキルエーテル、ホスフェート、チオホスフェート、ホスホアルキル、チオホスホアルキル、ホスホアルキルエーテルまたはチオホスホアルキルエーテルであり；そしてＲdは、対イオンであり；
Ｒ4は、各存在において、独立して、ＯＨ、ＳＨ、Ｏ-、Ｓ-、ＯＲdまたはＳＲdであり；
Ｒ5は、各存在において、独立して、オキソ、チオキソまたは非存在であり；
Ｑは、各存在において、独立して、分析物分子、固体支持体または相補的反応性基Ｑ′との共有結合を形成できる反応性基を含む部分であり；
ｍは、各存在において、独立して、０またはこれより大きな整数であるが、ただしｍの少なくとも１個の存在は、１またはこれより大きな整数であり；そして
ｎは、１またはこれより大きな整数である、
化合物、またはその立体異性体、塩もしくは互変異性体。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０２１９
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０２１９】
前述から、本発明の具体的実施形態が例証目的のために本明細書で記載されてきたものの、本発明の趣旨および範囲から逸脱することなく、種々の改変がなされ得ることは認識される。よって、本発明は、添付の特許請求の範囲による場合を除いて限定されない。
本発明の好ましい態様は、下記の通りである。
本発明のまた別の態様は、以下のとおりであってもよい。
〔１〕以下の構造（Ｉ）：
2019516812.tif 000008
を有する化合物、またはその立体異性体、塩もしくは互変異性体であって、ここで：
Ａは、各存在において、独立して、１個またはこれより多くの、縮合された炭素環式環系または複素環式環系を含む部分であり；
Ｍは、各存在において、独立して、２個またはこれより多くの炭素−炭素二重結合および少なくとも１の共役度を含む部分であり；
Ｌ1は、各存在において、独立して、ｉ）選択肢的なアルキレン、アルケニレン、アルキニレン、ヘテロアルキレン、ヘテロアルケニレン、ヘテロアルキニレンもしくはヘテロ原子リンカー；またはｉｉ）２個の相補的反応性基の反応によって形成できる官能基を含むリンカー、のいずれかであり；
Ｌ2、Ｌ3、Ｌ4およびＬ5は、各存在において、独立して、選択肢的なアルキレン、アルケニレン、アルキニレン、ヘテロアルキレン、ヘテロアルケニレン、ヘテロアルキニレンまたはヘテロ原子リンカーであり；
Ｒ1は、各存在において、独立して、Ｈ、アルキルまたはアルコキシであり；
Ｒ2およびＲ3は、各々独立して、Ｈ、ＯＨ、ＳＨ、アルキル、アルコキシ、アルキルエーテル、−ＯＰ（＝Ｒa）（Ｒb）Ｒc、Ｑ、Ｑへの共有結合を含むリンカー、分析物分子への共有結合を含むリンカー、固体支持体への共有結合を含むリンカーまたは構造（Ｉ）のさらなる化合物への共有結合を含むリンカーであり、ここで：Ｒaは、ＯまたはＳであり；Ｒbは、ＯＨ、ＳＨ、Ｏ-、Ｓ-、ＯＲdまたはＳＲdであり；Ｒcは、ＯＨ、ＳＨ、Ｏ-、Ｓ-、ＯＲd、ＳＲd、アルキル、アルコキシ、アルキルエーテル、アルコキシアルキルエーテル、ホスフェート、チオホスフェート、ホスホアルキル、チオホスホアルキル、ホスホアルキルエーテルまたはチオホスホアルキルエーテルであり；そしてＲdは、対イオンであり；
Ｒ4は、各存在において、独立して、ＯＨ、ＳＨ、Ｏ-、Ｓ-、ＯＲdまたはＳＲdであり；
Ｒ5は、各存在において、独立して、オキソ、チオキソまたは非存在であり；
Ｑは、各存在において、独立して、分析物分子、固体支持体または相補的反応性基Ｑ′と共有結合を形成できる反応性基を含む部分であり；
ｍは、各存在において、独立して、０またはこれより大きな整数であるが、ただしｍの少なくとも１個の存在は、１またはこれより大きな整数であり；そして
ｎは、１またはこれより大きな整数である、
化合物、またはその立体異性体、塩もしくは互変異性体。
〔２〕Ａは、各存在において、独立して、１個またはこれより多くの、縮合されたアリール環系またはヘテロアリール環系を含む部分である、前記〔１〕に記載の化合物。
〔３〕Ａは、各存在において、独立して、１個またはこれより多くの、縮合された二環式または三環式の、アリール環系またはヘテロアリール環系を含む部分である、前記〔１〕に記載の化合物。
〔４〕Ａは、各存在において、独立して、１個またはこれより多くの、以下の構造のうちの１つを有する縮合された炭素環式環系または複素環式環系を含み：
2019516812.tif 000009
ここで：
ａ1、ａ2およびａ3は、各存在において、独立して、５員、６員または７員の炭素環式環または複素環式環であり；そして
Ｌ6は、直接結合またはリンカーである、
前記〔１〕に記載の化合物。
〔５〕Ａは、各存在において、独立して、以下の構造：
2019516812.tif 000010
のうちの１つを有する、前記〔１〕に記載の化合物。
〔６〕Ｌ1は、各存在において、２個の相補的反応性基の反応によって形成できる官能基を含むリンカーである、前記〔１〕〜〔５〕のいずれか１項に記載の化合物。
〔７〕Ｌ1の少なくとも１個の存在に関して、前記官能基は、アルデヒド、オキシム、ヒドラゾン、アルキン、アミン、アジド、アシルアジド、アシルハライド、ニトリル、ニトロン、スルフヒドリル、ジスルフィド、スルホニルハライド、イソチオシアネート、イミドエステル、活性化エステル、ケトン、α，β−不飽和カルボニル、アルケン、マレイミド、α−ハロイミド、エポキシド、アジリジン、テトラジン、テトラゾール、ホスフィン、ビオチンまたはチイラン官能基と、相補的反応性基との反応によって形成できる、前記〔６〕に記載の化合物。
〔８〕Ｌ1の少なくとも１個の存在に関して、前記官能基は、アルキンおよびアジドの反応によって形成できる、前記〔６〕に記載の化合物。
〔９〕Ｌ1の少なくとも１個の存在に関して、前記官能基は、アルケン、エステル、アミド、チオエステル、ジスルフィド、カルボン酸、複素環式またはヘテロアリール基を含む、前記〔６〕に記載の化合物。
〔１０〕Ｌ1の少なくとも１個の存在に関して、Ｌ1は、トリアゾリル官能基を含むリンカーである、前記〔６〕に記載の化合物。
〔１１〕Ｌ1の少なくとも１個の存在に関して、Ｌ1−Ｍは、以下の構造：
2019516812.tif 000011
を有し、ここでＬ1aおよびＬ1bは、各々独立して、選択肢的なリンカーである、前記〔６〕に記載の化合物。
〔１２〕Ｌ1の少なくとも１個の存在に関して、Ｌ1−Ｍは、以下の構造：
2019516812.tif 000012
を有し、ここでＬ1aおよびＬ1bは、各々独立して、選択肢的なリンカーである、前記〔６〕に記載の化合物。
〔１３〕Ｌ1aもしくはＬ1b、または両方は、非存在である、前記〔１１〕〜〔１２〕のいずれか１項に記載の化合物。
〔１４〕Ｌ1aもしくはＬ1b、または両方は、存在する、前記〔１１〕〜〔１２〕のいずれか１項に記載の化合物。
〔１５〕Ｌ1aおよびＬ1bは、存在する場合、各々独立して、アルキレンまたはヘテロアルキレンである、前記〔１４〕に記載の化合物。
〔１６〕Ｌ1aおよびＬ1bは、存在する場合、独立して、以下の構造：
2019516812.tif 000013
のうちの１つを有する、前記〔１４〕に記載の化合物。
〔１７〕Ｌ1は、各存在において、独立して、選択肢的なアルキレンまたはヘテロアルキレンリンカーである、前記〔１〕〜〔５〕のいずれか１項に記載の化合物。
〔１８〕Ｌ2、Ｌ3、Ｌ4およびＬ5は、各存在において、独立して、Ｃ1−Ｃ6アルキレン、Ｃ2−Ｃ6アルケニレンまたはＣ2−Ｃ6アルキニレンである、前記〔１〕〜〔１７〕のいずれか１項に記載の化合物。
〔１９〕前記化合物は、以下の構造（ＩＡ）：
2019516812.tif 000014
を有し、ここで：
ｘ1、ｘ2、ｘ3、ｘ4、ｘ5およびｘ6は、各存在において、独立して、０〜６の整数である、
前記〔１〕〜〔１８〕のいずれか１項に記載の化合物。
〔２０〕ｘ3およびｘ4は、各存在において、ともに２である、前記〔１９〕に記載の化合物。
〔２１〕ｘ1、ｘ2、ｘ5およびｘ6は、各存在において、各々１である、前記〔１９〕または〔２０〕に記載の化合物。
〔２２〕Ｌ1は、各存在において、独立して、トリアゾリル官能基を含む、前記〔１９〕〜〔２１〕のいずれか１項に記載の化合物。
〔２３〕Ｌ1は、各存在において、独立して、選択肢的なアルキレンまたはヘテロアルキレンリンカーである、前記〔１９〕〜〔２１〕のいずれか１項に記載の化合物。
〔２４〕Ｒ4は、各存在において、独立して、ＯＨ、Ｏ-またはＯＲdである、前記〔１〕〜〔２３〕のいずれか１項に記載の化合物。
〔２５〕Ｒ5は、各存在において、オキソである、前記〔１〕〜〔２４〕のいずれか１項に記載の化合物。
〔２６〕Ｒ1は、Ｈである、前記〔１〕〜〔２５〕のいずれか１項に記載の化合物。
〔２７〕Ｒ2およびＲ3は、各々独立して、ＯＨまたは−ＯＰ（＝Ｒa）（Ｒb）Ｒcである、前記〔１〕〜〔２６〕のいずれか１項に記載の化合物。
〔２８〕Ｒ2またはＲ3のうちの一方は、ＯＨまたは−ＯＰ（＝Ｒa）（Ｒb）Ｒcであり、Ｒ2またはＲ3のうちの他方は、ＱまたはＱへの共有結合を含むリンカーである、前記〔１〕〜〔２６〕のいずれか１項に記載の化合物。
〔２９〕Ｑは、求核性反応性基、求電子性反応性基または環化付加反応性基を含む、前記〔１〕〜〔２６〕または〔２８〕のいずれか１項に記載の化合物。
〔３０〕Ｑは、スルフヒドリル、ジスルフィド、活性化エステル、イソチオシアネート、アジド、アルキン、アルケン、ジエン、ジエノフィル、酸ハライド、スルホニルハライド、ホスフィン、α−ハロアミド、ビオチン、アミノまたはマレイミド官能基を含む、前記〔２９〕に記載の化合物。
〔３１〕前記活性化エステルは、Ｎ−スクシンイミドエステル、イミドエステルまたはポリフルオロフェニルエステルである、前記〔３０〕に記載の化合物。
〔３２〕前記アルキンは、アルキルアジドまたはアシルアジドである、前記〔３０〕に記載の化合物。
〔３３〕Ｑは、表１から選択される部分を含む、前記〔１〕〜〔２６〕または〔２８〕のいずれか１項に記載の化合物。
〔３４〕Ｒ2またはＲ3のうちの一方は、ＯＨまたは−ＯＰ（＝Ｒa）（Ｒb）Ｒcであり、Ｒ2またはＲ3のうちの他方は、分析物分子への共有結合を含むリンカーまたは固体支持体への共有結合を含むリンカーである、前記〔１〕〜〔２６〕のいずれか１項に記載の化合物。
〔３５〕前記分析物分子は、核酸、アミノ酸またはこれらのポリマーである、前記〔３４〕に記載の化合物。
〔３６〕前記分析物分子は、酵素、レセプター、レセプターリガンド、抗体、糖タンパク質、アプタマーまたはプリオンである、前記〔３４〕に記載の化合物。
〔３７〕前記固体支持体は、ポリマービーズまたは非ポリマービーズである、前記〔３４〕に記載の化合物。
〔３８〕ｍは、各存在において、独立して、１〜１０の整数である、前記〔１〕〜〔３７〕のいずれか１項に記載の化合物。
〔３９〕ｍは、各存在において、独立して、１〜５の整数である、前記〔１〕〜〔３７〕のいずれか１項に記載の化合物。
〔４０〕ｎは、１〜１００の整数である、前記〔１〕〜〔３９〕のいずれか１項に記載の化合物。
〔４１〕ｎは、１〜１０の整数である、前記〔１〕〜〔３９〕のいずれか１項に記載の化合物。
〔４２〕Ｍは、各存在において、独立して、４個もしくはこれより多くのアリールもしくはヘテロアリール環、またはこれらの組み合わせを含む部分である、前記〔１〕〜〔４１〕のいずれか１項に記載の化合物。
〔４３〕Ｍは、各存在において、独立して、蛍光性または有色である、前記〔１〕〜〔４２〕のいずれか１項に記載の化合物。
〔４４〕Ｍは、蛍光性である、前記〔４３〕に記載の化合物。
〔４５〕Ｍは、各存在において、独立して、少なくとも４個の縮合環を含む縮合多環式アリール部分を含む、前記〔１〕〜〔４４〕のいずれか１項に記載の化合物。
〔４６〕Ｍは、各存在において、独立して、ジメチルアミノスチルベン、キナクリドン、フルオロフェニル−ジメチル−ＢＯＤＩＰＹ、ｈｉｓ−フルオロフェニル−ＢＯＤＩＰＹ、アクリジン、テリレン、セキシフェニル、ポルフィリン、ベンゾピレン、（フルオロフェニル−ジメチル−ジフルオロボラ−ジアザ−インダセン）フェニル、（ビス−フルオロフェニル−ジフルオロボラ−ジアザ−インダセン）フェニル、クアテルフェニル、ビ−ベンゾチアゾール、ター−ベンゾチアゾール、ビ−ナフチル、ビ−アントラシル、スクアライン、スクアリリウム、９，１０−エチニルアントラセンまたはター−ナフチル部分である、前記〔１〕〜〔４５〕のいずれか１項に記載の化合物。
〔４７〕Ｍは、各存在において、独立して、ｐ−ターフェニル、ペリレン、アゾベンゼン、フェナジン、フェナントロリン、アクリジン、チオキサントレン、クリセン、ルブレン、コロネン、シアニン、ペリレンイミド、もしくはペリレンアミドまたはその誘導体である、前記〔１〕〜〔４５〕のいずれか１項に記載の化合物。
〔４８〕Ｍは、各存在において、独立して、クマリン染料、レゾルフィン染料、ジピロメテンボロンジフルオリド染料、ルテニウムビピリジル染料、エネルギー移動染料、チアゾールオレンジ染料、ポリメチンまたはＮ−アリール−１，８−ナフタルイミド染料である、前記〔１〕〜〔４５〕のいずれか１項に記載の化合物。
〔４９〕Ｍは、各存在において、独立して、ピレン、ペリレン、ペリレンモノイミドもしくは６−ＦＡＭまたはその誘導体である、前記〔１〕〜〔４５〕のいずれか１項に記載の化合物。
〔５０〕Ｍは、各存在において、独立して、以下の構造：
2019516812.tif 000015
のうちの１つを有する、前記〔１〕〜〔４５〕のいずれか１項に記載の化合物。
〔５１〕表２から選択される化合物。
〔５２〕サンプルを染色するための方法であって、該方法は、該サンプルに、前記〔１〕〜〔５１〕のいずれか１項に記載の化合物を、該サンプルが適切な波長で照射される場合に光学的応答を生じるために十分な量で添加する工程を包含する方法。
〔５３〕前記光学的応答は、蛍光応答である、前記〔５２〕に記載の方法。
〔５４〕前記サンプルは、細胞を含む、前記〔５２〕〜〔５３〕のいずれか１項に記載の方法。
〔５５〕前記細胞をフローサイトメトリーによって観察する工程をさらに包含する、前記〔５４〕に記載の方法。
〔５６〕前記蛍光応答を、検出可能に異なる光学的特性を有する第２の発蛍光団の蛍光応答から区別する工程をさらに包含する、前記〔５３〕に記載の方法。
〔５７〕分析物分子を視覚的に検出するための方法であって、該方法は、
（ａ）Ｒ2またはＲ3は、該分析物分子への共有結合を含むリンカーである前記〔１〕の化合物を提供する工程；および
（ｂ）該化合物をその視覚的特性によって検出する工程、
を包含する方法。
〔５８〕分析物分子を視覚的に検出するための方法であって、該方法は、
（ａ）Ｒ2またはＲ3は、ＱまたはＱへの共有結合を含むリンカーである前記〔１〕に記載の化合物と、該分析物分子とを混合する工程；
（ｂ）該化合物および該分析物分子の結合体を形成する工程；ならびに
（ｃ）該結合体をその視覚的特性によって検出する工程、
を包含する方法。
〔５９〕前記〔１〕〜〔５１〕のいずれか１項に記載の化合物および１もしくはこれより多くの分析物分子を含む、組成物。
〔６０〕前記１もしくはこれより多くの分析物分子の検出のための分析方法における前記〔５９〕に記載の組成物の使用。
〔６１〕以下の構造（ＩＩ）：
2019516812.tif 000016
を有する化合物、またはその立体異性体、塩もしくは互変異性体であって、ここで：
Ａは、各存在において、独立して、１個またはこれより多くの、縮合された炭素環式環系または複素環式環系を含む部分であり；
Ｇは、各存在において、独立して、相補的反応性基と共有結合を形成できる反応性基を含む部分であり；
Ｌ1a、Ｌ2、Ｌ3、Ｌ4およびＬ5は、各存在において、独立して、選択肢的なアルキレン、アルケニレン、アルキニレン、ヘテロアルキレン、ヘテロアルケニレン、ヘテロアルキニレンまたはヘテロ原子リンカーであり；
Ｒ1は、各存在において、独立して、Ｈ、アルキルまたはアルコキシであり；
Ｒ2およびＲ3は、各々独立して、Ｈ、ＯＨ、ＳＨ、アルキル、アルコキシ、アルキルエーテル、−ＯＰ（＝Ｒa）（Ｒb）Ｒc、Ｑ、Ｑへの共有結合を含むリンカー、分析物分子への共有結合を含むリンカー、固体支持体への共有結合を含むリンカーまたは構造（ＩＩ）のさらなる化合物への共有結合を含むリンカーであり、ここで：Ｒaは、ＯまたはＳであり；Ｒbは、ＯＨ、ＳＨ、Ｏ-、Ｓ-、ＯＲdまたはＳＲdであり；Ｒcは、ＯＨ、ＳＨ、Ｏ-、Ｓ-、ＯＲd、ＳＲd、アルキル、アルコキシ、アルキルエーテル、アルコキシアルキルエーテル、ホスフェート、チオホスフェート、ホスホアルキル、チオホスホアルキル、ホスホアルキルエーテルまたはチオホスホアルキルエーテルであり；そしてＲdは、対イオンであり；
Ｒ4は、各存在において、独立して、ＯＨ、ＳＨ、Ｏ-、Ｓ-、ＯＲdまたはＳＲdであり；
Ｒ5は、各存在において、独立して、オキソ、チオキソまたは非存在であり；
Ｑは、各存在において、独立して、分析物分子、固体支持体または相補的反応性基Ｑ′との共有結合を形成できる反応性基を含む部分であり；
ｍは、各存在において、独立して、０またはこれより大きな整数であるが、ただしｍの少なくとも１個の存在は、１またはこれより大きな整数であり；そして
ｎは、１またはこれより大きな整数である、
化合物、またはその立体異性体、塩もしくは互変異性体。
〔６２〕Ｇは、各存在において、独立して、アルデヒド、オキシム、ヒドラゾン、アルキン、アミン、アジド、アシルアジド、アシルハライド、ニトリル、ニトロン、スルフヒドリル、ジスルフィド、スルホニルハライド、イソチオシアネート、イミドエステル、活性化エステル、ケトン、α，β−不飽和カルボニル、アルケン、マレイミド、α−ハロイミド、エポキシド、アジリジン、テトラジン、テトラゾール、ホスフィン、ビオチンまたはチイラン官能基を含む、前記〔６１〕に記載の化合物。
〔６３〕Ｇは、各存在において、独立して、アルキンまたはアジド基を含む、前記〔６１〕に記載の化合物。
〔６４〕Ｇは、各存在において、独立して、前記相補的反応性基との反応に際して、アルケン、エステル、アミド、チオエステル、ジスルフィド、カルボン酸基、複素環式またはヘテロアリール基を含む官能基を形成できる反応性基を含む、前記〔６１〕に記載の化合物。
〔６５〕前記ヘテロアリールは、トリアゾリルである、前記〔６４〕に記載の化合物。
〔６６〕Ｌ2、Ｌ3、Ｌ4およびＬ5は、各存在において、独立して、Ｃ1−Ｃ6アルキレン、Ｃ2−Ｃ6アルケニレンまたはＣ2−Ｃ6アルキニレンである、前記〔６１〕〜〔６５〕のいずれか１項に記載の化合物。
〔６７〕前記化合物は、以下の構造（ＩＩＡ）：
2019516812.tif 000017
を有し、ここで：
ｘ1、ｘ2、ｘ3、ｘ4、ｘ5およびｘ6は、各存在において、独立して、０〜６の整数である、
前記〔６１〕に記載の化合物。
〔６８〕各Ｌ1aは、非存在である、前記〔６１〕〜〔６７〕のいずれか１項に記載の化合物。
〔６９〕各Ｌ1aは、存在する、前記〔６１〕〜〔６７〕のいずれか１項に記載の化合物。
〔７０〕Ｌ1aは、各存在において、独立して、ヘテロアルキレンである、前記〔６９〕に記載の化合物。
〔７１〕Ｌ1aは、以下の構造：
2019516812.tif 000018
を有する、前記〔７０〕に記載の化合物。
〔７２〕Ｇは、各存在において、独立して、
2019516812.tif 000019
である、前記〔７１〕に記載の化合物。
〔７３〕ｘ3およびｘ4は、各存在において、ともに２である、前記〔６７〕〜〔７２〕のいずれか１項に記載の化合物。
〔７４〕ｘ1、ｘ2、ｘ5およびｘ6は、各存在において、各々１である、前記〔６７〕〜〔７３〕のいずれか１項に記載の化合物。
〔７５〕Ａは、前記〔２〕〜〔５〕のいずれか１項に定義されるとおりである、前記〔６１〕〜〔７４〕のいずれか１項に記載の化合物。
〔７６〕Ｒ4は、各存在において、独立して、ＯＨ、Ｏ-またはＯＲdである、前記〔６１〕〜〔７５〕のいずれか１項に化合物。
〔７７〕Ｒ5は、各存在において、オキソである、前記〔６１〕〜〔７６〕のいずれか１項に化合物。
〔７８〕Ｒ1は、Ｈである、前記〔６１〕〜〔７７〕のいずれか１項に記載の化合物。
〔７９〕Ｒ2およびＲ3は、各々独立して、ＯＨまたは−ＯＰ（＝Ｒa）（Ｒb）Ｒcである、前記〔６１〕〜〔７８〕のいずれか１項に記載の化合物。
〔８０〕Ｒ2またはＲ3のうちの一方は、ＯＨまたは−ＯＰ（＝Ｒa）（Ｒb）Ｒcであり、Ｒ2またはＲ3のうちの他方は、ＱまたはＱへの共有結合を含むリンカーである、前記〔６１〕〜〔７８〕のいずれか１項に記載の化合物。
〔８１〕Ｑは、求核性反応性基、求電子性反応性基または環化付加反応性基を含む、前記〔６１〕〜〔７８〕または〔８０〕のいずれか１項に記載の化合物。
〔８２〕Ｑは、スルフヒドリル、ジスルフィド、活性化エステル、イソチオシアネート、アジド、アルキン、アルケン、ジエン、ジエノフィル、酸ハライド、スルホニルハライド、ホスフィン、α−ハロアミド、ビオチン、アミノまたはマレイミド官能基を含む、前記〔８３〕に記載の化合物。
〔８３〕前記活性化エステルは、Ｎ−スクシンイミドエステル、イミドエステルまたはポリフルオロフェニルエステルである、前記〔８２〕に記載の化合物。
〔８４〕前記アルキンは、アルキルアジドまたはアシルアジドである、前記〔８２〕に記載の化合物。
〔８５〕Ｑは、表１から選択される部分である、前記〔６１〕〜〔７８〕または〔８０〕のいずれか１項に記載の化合物。
〔８６〕Ｒ2またはＲ3のうちの一方は、ＯＨまたは−ＯＰ（＝Ｒa）（Ｒb）Ｒcであり、Ｒ2またはＲ3のうちの他方は、分析物分子への共有結合を含むリンカーまたは固体支持体への共有結合を含むリンカーである、前記〔６０〕〜〔７８〕のいずれか１項に記載の化合物。
〔８７〕前記分析物分子は、核酸、アミノ酸またはこれらのポリマーである、前記〔８６〕に記載の化合物。
〔８８〕前記分析物分子は、酵素、レセプター、レセプターリガンド、抗体、糖タンパク質、アプタマーまたはプリオンである、前記〔８６〕に記載の化合物。
〔８９〕前記固体支持体は、ポリマービーズまたは非ポリマービーズである、前記〔８６〕に記載の化合物。
〔９０〕ｍは、各存在において、独立して、１〜１０の整数である、前記〔６１〕〜〔８９〕のいずれか１項に記載の化合物。
〔９１〕ｍは、各存在において、独立して、１〜５の整数である、前記〔６１〕〜〔８９〕のいずれか１項に記載の化合物。
〔９２〕ｎは、１〜１００の整数である、前記〔６１〕〜〔９１〕のいずれか１項に記載の化合物。
〔９３〕ｎは、１〜１０の整数である、前記〔６１〕〜〔９１〕のいずれか１項に記載の化合物。
〔９４〕表３から選択される化合物。
〔９５〕分析物分子を標識するための方法であって、該方法は、
（ａ）Ｒ2またはＲ3は、ＱまたはＱへの共有結合を含むリンカーである前記〔６１〕に記載の化合物と、該分析物分子とを混合する工程；
（ｂ）該化合物および該分析物分子の結合体を形成する工程；ならびに；
（ｃ）該結合体と式Ｍ−Ｌ1b−Ｇ′の化合物とを反応させて、それによって、少なくとも１個のＧおよび少なくとも１個のＧ′の反応によって少なくとも１個の共有結合を形成する工程、
を包含し、ここで：
Ｍは、２個またはこれより多くの炭素−炭素二重結合および少なくとも１の共役度を含む部分であり；
Ｌ1bは、選択肢的なアルキレン、ヘテロアルキレンまたはヘテロ原子リンカーであり；そして
Ｇ′は、Ｇに対する相補的反応性基である、
方法。
〔９６〕分析物分子を標識するための方法であって、該方法は、
（ａ）Ｒ2またはＲ3は、ＱまたはＱへの共有結合を含むリンカーである前記〔６１〕に記載の化合物と、式Ｍ−Ｌ1b−Ｇ′の化合物とを混合し、それによって、ＧおよびＧ′の反応によって少なくとも１個の共有結合を形成する工程；ならびに
（ｂ）工程（Ａ）の生成物と該分析物分子とを反応させ、それによって、工程（Ａ）の生成物および該分析物分子の結合体を形成する工程、
を包含し、ここで：
Ｍは、２個またはこれより多くの炭素−炭素二重結合および少なくとも１の共役度を含む部分であり；
Ｌ1bは、選択肢的なアルキレン、ヘテロアルキレンまたはヘテロ原子リンカーであり；そして
Ｇ′は、Ｇに対する相補的反応性基である、
方法。
〔９７〕前記〔１〕に記載の化合物を調製するための方法であって、該方法は、前記〔６１〕に記載の化合物と、式Ｍ−Ｌ1b−Ｇ′の化合物とを混合し、それによって、ＧおよびＧ′の反応によって少なくとも１個の共有結合を形成する工程を包含し、ここで：
Ｍは、２個またはこれより多くの炭素−炭素二重結合および少なくとも１の共役度を含む部分であり；
Ｌ1bは、選択肢的なアルキレン、ヘテロアルキレンまたはヘテロ原子リンカーであり；そして
Ｇ′は、Ｇに対する相補的反応性基である、
方法。