【誤訳訂正書】
【提出日】令和2年10月13日(2020.10.13)
【誤訳訂正１】
【訂正対象書類名】特許請求の範囲
【訂正対象項目名】全文
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
以下のステップを含む、単一分子を分析するための方法であって：
（ａ）少なくとも１つの個別の試料域をその上に含む担持体を、提供するステップ、ここで、前記試料域が、少なくとも部分的には導電性材料でできている、
（ｂ）前記担持体を、分析対象である少なくとも１つの単一分子を含む液体媒体と接触させるステップ、これによって、前記試料域上の液体媒体の反応空間を形成する、
（ｃ）前記反応空間に電場を直流電圧で印加するステップ、これによって、分析対象である前記少なくとも１つの単一分子の、前記試料域での濃縮を達成する、および
（ｄ）前記少なくとも１つの単一分子を、個別に分析するステップ、
ここで、個別の試料域の前記単一分子は、照射体積要素を提供する光源によって照射され、前記体積要素は全反射によって生成されるエバネセント場であり、前記反応空間は、その上に前記試料域が設けられた前記担持体に形成された単一の反応空間であり、反応が前記単一の反応空間で行われる、
方法。
【請求項２】
以下の工程を含む、複数の単一分子を分析するための方法であって：
（ａ）複数の個別の試料域をその上に含む担持体を、提供するステップ、ここで前記試料域が、少なくとも部分的には導電性材料でできている、
（ｂ）前記担持体を、分析対象である複数の単一分子を含む液体媒体と接触させるステップ、これによって、前記試料域上の少なくとも１つの反応空間を形成する、
（ｃ）前記反応空間に電場を直流電圧で印加するステップ、これによって、分析対象である前記単一分子の、前記試料域での濃縮を達成する、および
（ｄ）前記単一分子を、個別に分析するステップ、
ここで、複数の個別の試料域の前記複数の単一分子は、照射体積要素を提供する光源によって照射され、前記体積要素は全反射によって生成されるエバネセント場であり、前記反応空間は、その上に前記試料域が設けられた前記担持体に形成された単一の反応空間であり、反応が前記単一の反応空間で行われる、
方法。
【請求項３】
単一の核酸分子の配列を決定する、請求項１または２に記載の方法。
【請求項４】
複数の単一の核酸分子の配列を決定する、請求項３に記載の方法。
【請求項５】
試料域が、１〜２０ｎｍの範囲の直径を有し、個別の試料域と試料域との間の距離が、前記試料域の直径の少なくとも２倍である、請求項１〜４のいずれか一項に記載の方法。
【請求項６】
試料域が、１〜２０ｎｍの範囲の直径を有し、個別の試料域と試料域との間の距離が、前記試料域の直径の３〜５００倍である、請求項１〜４のいずれか一項に記載の方法。
【請求項７】
前記担持体は、平坦な表面または構造化された表面を有する、請求項１〜６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項８】
前記担持体は、個別の試料域と試料域と間の領域に導電性の表面を有する、請求項１〜７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項９】
前記試料域の表面は、金属である、請求項１〜８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１０】
前記試料域の表面は、Ａｕ、Ａｇ、Ｃｒ、Ｎｉ、またはＡｌである、請求項１〜８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１１】
前記試料域の表面は、Ａｕである、請求項１〜８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１２】
前記試料域の表面には、核酸合成酵素および／または核酸分解酵素が結合している、請求項１〜１１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１３】
前記電場は、１〜５０００Ｖ／ｃｍの電場強度を有する、請求項１〜１２のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１４】
前記電場は、１０〜２０００Ｖ／ｃｍの電場強度を有する、請求項１〜１２のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１５】
前記電場は、２０〜２００Ｖ／ｃｍの電場強度を有する、請求項１〜１２のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１６】
前記電場は、前記担持体表面とさらなる電極との間に印加され、前記電極は光学測定装置の導電性構造または導電性のマイクロウェル壁であってもよい、請求項１〜１５のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１７】
請求項１〜１６のいずれか一項に記載の方法の、配列集団の部分配列の頻度および／または分布の決定のための使用。
【請求項１８】
前記集団は、少なくとも１０２個の個別の構成要素を含む、請求項１７に記載の使用。
【請求項１９】
前記集団は、少なくとも１０３個の個別の構成要素を含む、請求項１７に記載の使用。
【請求項２０】
前記集団は、少なくとも１０４個の個別の構成要素を含む、請求項１７に記載の使用。
【請求項２１】
（ｉ）少なくとも１つの個別の試料域をその上に含む担持体、ここで、前記試料域が、少なくとも部分的には導電性材料でできている、
（ｉｉ）前記担持体を、分析対象である少なくとも１つの単一分子を含む液体媒体と、接触させるのに適した手段、
（ｉｉｉ）前記担持体を前記液体媒体に接触させる際に形成される反応空間に、電場を直流電圧で印加するのに適した手段、これによって、分析対象である前記少なくとも１つの単一分子の、前記試料域での濃縮を達成する、
（ｉｖ）個別の試料域の単一分子を、個別に照射するための光源であって、少なくとも１つの照射された個別の体積要素を、前記担持体表面の１つの試料域に提供する光源、および
（ｖ）個別の試料域で単一分子から発せられる光を、個別に検出する光検出器
を含む、少なくとも１つの個別の単一分子を分析する装置であって、
ここで、前記少なくとも１つの照射された個別の体積要素は全反射によって生成されるエバネセント場であり、前記接触させるのに適した手段が、その上に前記試料域が設けられた前記担持体に、単一の反応空間を形成するのに適している、
装置。
【請求項２２】
少なくとも１つの単一の核酸分子の配列を決定する、請求項２１に記載の装置。
【請求項２３】
（ｉ）複数の個別の試料域をその上に含む担持体、ここで、前記試料域が少なくとも部分的には導電性材料でできている、
（ｉｉ）前記担持体を、分析対象である複数の単一分子を含む液体媒体と、接触させるのに適した手段、
（ｉｉｉ）前記担持体を前記液体媒体と接触させる際に形成される反応空間に、電場を直流電圧で印加するのに適した手段、これによって、分析対象である前記単一分子の、前記試料域での濃縮を達成する、
（ｉｖ）個別の試料域の単一分子を、個別に照射するための光源であって、少なくとも１つの照射された個別の体積要素を、前記担持体表面の１つの試料域に提供する光源、および
（ｖ）個別の試料域で複数の単一分子から発せられた光を、個別に並行して検出する光検出器
を含む、複数の個別の単一分子を並行分析する装置であって、
ここで、前記少なくとも１つの照射された個別の体積要素は全反射によって生成されるエバネセント場であり、前記接触させるのに適した手段が、その上に前記試料域が設けられた前記担持体に、単一の反応空間を形成するのに適している、
装置。
【請求項２４】
複数の単一の核酸分子の配列を並行して決定する、請求項２３に記載の装置。
【誤訳訂正２】
【訂正対象書類名】明細書
【訂正対象項目名】００１０
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【００１０】
ＤＮＡの配列決定を行うための市販の単一分子ＤＮＡ配列決定技術の手法は、いわゆるコンセンサス決定で、同一ＤＮＡ分子のいくつかのリード（reads）を繰り返し分析することでＤＮＡ配列を決定する。従って、ＤＮＡ断片配列の正確な（好ましくは９９．９％以上の）決定は、いくつかの類似のＤＮＡ断片を分析し、正しいＤＮＡ配列を推定するための複雑な統計アルゴリズムを用いることで達成される。他の単一分子ＤＮＡ配列決定技術で用いられるアルゴリズムは、配列が１つのみ存在すると先験的に仮定する。従って、試料中の他のＤＮＡ分子と比較して配列に違いがあるような少数部分が試料中にある場合、そのような配列の違いは考慮されず、アルゴリズムによって「ノイズ」または「誤り」として処理される。その試料がほぼ同じ濃度のＤＮＡ配列の混合物を含む場合、この分析では「コンセンサス」配列と結論づけることができず、結果は無効になる。この複雑なアルゴリズムの目的は、他の単一分子のＤＮＡ配列を決定する技術の約８５〜９０％という低い一次確度を出来るだけ補うことである。
【誤訳訂正３】
【訂正対象書類名】明細書
【訂正対象項目名】００２２
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【００２２】
本発明の方法は、その上に試料域が設けられた担持体全体またはその一部に形成された、単一の反応空間で行われてもよい。あるいは、前記方法はまた、担持体の複数の個別の反応空間内で行われてもよく、ここで、前記個別の反応空間は、前記方法の少なくともあるステップの間は、互いに連通していない。複数の個別の反応空間は、例えば、担持体上のナノウェルおよび／またはマイクロウェル、および／またはナノスポットまたはマイクロスポットによって形成されてもよい。
【誤訳訂正４】
【訂正対象書類名】明細書
【訂正対象項目名】００６０
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【００６０】
プライマーの配列は、反応条件下で鋳型分子に効率よくアニールするように選択される。例えば、プライマーは、未知の核酸配列に統計的にアニーリングすることができる、普遍的な縮重プライマーであってもよい。他の態様では、プライマーは、核酸鋳型分子の既知の配列部分に、アニーリングすることができるものであってもよい。この態様では、既知のアダプターおよび／または識別子配列を、核酸鋳型分子に組み込んでもよい。プライマーは、標識されていなくてもよく、あるいは蛍光標識基を含んでいてもよい。