【手続補正書】
【提出日】令和1年12月13日(2019.12.13)
【手続補正１】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００１６
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００１６】
＜参照による組み込み＞
本明細書で言及されるすべての出版物、特許、および特許出願は、あたかも個々の出版物、特許、または特許出願が参照により組み込まれるように具体的かつ個々に指示される程度に、参照により本明細書に組み込まれる。
本願は以下の発明を包含する。
［項目１］  被験体の細胞により標的タンパク質又は機能ＲＮＡの発現を増加させることによって必要としている被験体のアラジール症候群を処置する方法であって、該細胞は、保持されたイントロン含有ｍＲＮＡ前駆体（ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体）を有し、該ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体は、保持されたイントロン、５’スプライス部位に隣接しているエクソン、及び３’スプライス部位に隣接しているエクソンを含み、ここでＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体は、標的タンパク質又は機能ＲＮＡをコードし、該方法は、被験体の細胞を、標的タンパク質又は機能ＲＮＡをコードするＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分に相補的なアンチセンスオリゴマー（ＡＳＯ）と接触させる工程を含み、それによって、保持されたイントロンは、標的タンパク質又は機能ＲＮＡをコードするＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体から構成的にスプライシングされ、それにより、被験体の細胞内で、標的タンパク質又は機能ＲＮＡをコードするｍＲＮＡのレベルを増加させ、標的タンパク質又は機能ＲＮＡの発現を増加させる、方法。
［項目２］  保持されたイントロン含有ｍＲＮＡ前駆体（ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体）を有している細胞によってＪＡＧ１である標的タンパク質の発現を増加させる方法であって、該ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体は、保持されたイントロン、保持されたイントロンの５’スプライス部位に隣接しているエクソン、及び保持されたイントロンの３’スプライス部位に隣接しているエクソンを含み、ここでＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体はＪＡＧ１タンパク質をコードし、該方法は、細胞を、ＪＡＧ１タンパク質をコードするＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分に相補的なアンチセンスオリゴマー（ＡＳＯ）と接触させる工程を含み、それによって、保持されたイントロンは、ＪＡＧ１タンパク質をコードするＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体から構成的にスプライシングされ、それにより、細胞内で、ＪＡＧ１タンパク質をコードするｍＲＮＡのレベルを増加させ、ＪＡＧ１タンパク質の発現を増加させる、方法。
［項目３］  標的タンパク質がＪＡＧ１である、項目１に記載の方法。
［項目４］  標的タンパク質又は機能ＲＮＡが、被験体において量又は活性が不足している標的タンパク質又は機能ＲＮＡを機能的に増強又は交換する、補償するタンパク質又は補償する機能ＲＮＡである、項目１に記載の方法。
［項目５］  細胞が、ＪＡＧ１タンパク質の量又は活性の不足によって引き起こされた疾病を有する被験体内にあるか又は被験体に由来する、項目２に記載の方法。
［項目６］  標的タンパク質の量の不足が、標的タンパク質のハプロ不全によって引き起こされ、ここで被験体は、機能的な標的タンパク質をコードする第１の対立遺伝子、及び標的タンパク質が産生されない第２の対立遺伝子、又は非機能性の標的タンパク質をコードする第２の対立遺伝子を有し、アンチセンスオリゴマーは、第１の対立遺伝子から転写されたＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分に結合する、項目１〜５のいずれか１項に記載の方法。
［項目７］  被験体が、標的タンパク質の量又は機能の不足から結果として生じる障害によって引き起こされた疾病を有し、ここで被験体が、
ａ．第１の変異対立遺伝子であって、
ｉ．標的タンパク質が、野生型対立遺伝子からの産生と比較して、低下したレベルで産生される、
ｉｉ．標的タンパク質が、同等の野生型タンパク質と比較して、機能が低下した形態で産生される、又は
ｉｉｉ．標的タンパク質が産生されない、第１の変異対立遺伝子、及び
ｂ．第２の変異対立遺伝子であって、
ｉ．標的タンパク質が、野生型対立遺伝子からの産生と比較して、低下したレベルで産生される、
ｉｉ．標的タンパク質が、同等の野生型タンパク質と比較して、機能が低下した形態で産生される、又は
ｉｉｉ．標的タンパク質が産生されない、第２の変異対立遺伝子を有し、及び
ここで被験体が、ａ．ｉｉｉ．の第１の変異対立遺伝子を有するときに、第２の変異対立遺伝子は、ｂ．ｉ．又はｂ．ｉｉ．の変異対立遺伝子であり、被験体が、ｂ．ｉｉｉ．の第２の変異対立遺伝子を有するときに、第１の変異対立遺伝子は、ａ．ｉ．又はａ．ｉｉ．の変異対立遺伝子であり、及びＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体は、ａ．ｉ．又はａ．ｉｉ．である第１の変異対立遺伝子及び／又はｂ．ｉ．又はｂ．ｉｉ．である第２の変異対立遺伝子のいずれかから転写される、項目１〜５のいずれか１項に記載の方法。
［項目８］  標的タンパク質が、同等の野生型タンパク質と比較して機能が低下した形態で産生される、項目７に記載の方法。
［項目９］  標的タンパク質が、同等の野生型タンパク質と比較して完全に機能的である形態で産生される、項目７に記載の方法。
［項目１０］  ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分が、保持されたイントロンにおいて、保持されたイントロンの５’スプライス部位に対する＋６の領域から、保持されたイントロンの３’スプライス部位に対する−１６の領域内にある、項目１〜９のいずれか１項に記載の方法。
［項目１１］  ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分が、保持されたイントロンにおいて、
（ａ）保持されたイントロンの５’スプライス部位に対する、＋６から＋５００、＋６から＋４００、＋６から３００、＋６から２００、又は＋６から＋１００の領域内；又は
（ｂ）保持されたイントロンの３’スプライス部位に対する、−１６から−５００、−１６から−４００、−１６から−３００、−１６から−２００、又は−１６から−１００の領域内にある、項目１〜９のいずれか１項に記載の方法。
［項目１２］  ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分が、
（ａ）保持されたイントロンの５’スプライス部位に隣接しているエクソンにおける＋２ｅから−４ｅの領域内；又は
（ｂ）保持されたイントロンの３’スプライス部位に隣接しているエクソンにおける＋２ｅから−４ｅの領域内にある、項目１〜９のいずれか１項に記載の方法。
［項目１３］  ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体が、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１に対して、少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％又は１００％の配列同一性を有する遺伝子配列によってコードされる、項目１〜１２のいずれか１項に記載の方法。
［項目１４］  ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体が、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２に対して少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％又は１００％の配列同一性を有する配列を含む、項目１〜１３のいずれか１項に記載の方法。
［項目１５］  アンチセンスオリゴマーが、機能ＲＮＡ又は標的タンパク質をコードする遺伝子から転写されたｍＲＮＡ前駆体の選択的スプライシングを調節することにより標的タンパク質又は機能ＲＮＡの量を増加させない、項目１〜１４のいずれか１項に記載の方法。
［項目１６］  アンチセンスオリゴマーが、標的タンパク質又は機能ＲＮＡをコードする遺伝子の突然変異から結果として生じる異常スプライシングを調節することにより標的タンパク質または機能ＲＮＡの量を増加させない、項目１〜１５のいずれか１項に記載の方法。
［項目１７］  ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体が、全長ｍＲＮＡ前駆体の部分的スプライシング又は野生型ｍＲＮＡ前駆体の部分的スプライシングによって産生された、項目１〜１６のいずれか１項に記載の方法。
［項目１８］  標的タンパク質又は機能ＲＮＡをコードするｍＲＮＡが、全長成熟ｍＲＮＡ又は野生型成熟ｍＲＮＡである、項目１〜１７のいずれか１項に記載の方法。
［項目１９］  産生される標的タンパク質が、全長タンパク質又は野生型タンパク質である、項目１〜１８のいずれか１項に記載の方法。
［項目２０］  アンチセンスオリゴマーと接触させられた細胞内で産生された標的タンパク質又は機能ＲＮＡをコードするｍＲＮＡの総量は、対照細胞において産生された標的タンパク質又は機能ＲＮＡをコードするｍＲＮＡの総量と比較して、約１．１倍から約１０倍、約１．５倍から約１０倍、約２倍から約１０倍、約３倍から約１０倍、約４倍から約１０倍、約１．１倍から約５倍、約１．１倍から約６倍、約１．１倍から約７倍、約１．１倍から約８倍、約１．１倍から約９倍、約２倍から約５倍、約２倍から約６倍、約２倍から約７倍、約２倍から約８倍、約２倍から約９倍、約３倍から約６倍、約３倍から約７倍、約３倍から約８倍、約３倍から約９倍、約４倍から約７倍、約４倍から約８倍、約４倍から約９倍、少なくとも約１．１倍、少なくとも約１．５倍、少なくとも約２倍、少なくとも約２．５倍、少なくとも約３倍、少なくとも約３．５倍、少なくとも約４倍、少なくとも約５倍、又は少なくとも約１０倍増加される、項目１〜１９のいずれか１項に記載の方法。
［項目２１］  アンチセンスオリゴマーと接触させられた細胞によって産生された標的タンパク質の総量は、対照細胞によって産生された標的タンパク質の総量と比較して、約１．１倍から約１０倍、約１．５倍から約１０倍、約２倍から約１０倍、約３倍から約１０倍、約４倍から約１０倍、約１．１倍から約５倍、約１．１倍から約６ 倍、約１．１倍から約７倍、約１．１倍から約８倍、約１．１倍から約９倍、約２倍から約５倍、約２倍から約６倍、約２倍から約７倍、約２倍から約８倍、約２倍から約９倍、約３倍から約６倍、約３ 倍から約７倍、約３倍から約８倍、約３倍から約９倍、約４倍から約７倍、約４倍から約８倍、約４倍から約９倍、少なくとも約１．１倍、少なくとも約１．５倍、少なくとも約２倍、少なくとも約２．５倍、少なくとも約３倍、少なくとも約３．５倍、少なくとも約４倍、少なくとも約５倍、又は少なくとも約１０倍増加される、項目１〜２０のいずれか１項に記載の方法。
［項目２２］  アンチセンスオリゴマーが、ホスホロチオエート結合又はホスホロジアミデート結合を含む骨格修飾を含む、項目１〜２１のいずれか１項に記載の方法。
［項目２３］  アンチセンスオリゴマーが、ホスホロジアミデートモルホリノ、ロックド核酸、ペプチド核酸、２’−Ｏ−メチル、２’−フルオロ、又は２’−Ｏ−メトキシエチル部分を含む、項目１〜２２のいずれか１項に記載の方法。
［項目２４］  アンチセンスオリゴマーが、少なくとも１つの修飾された糖部を含む、項目１〜２３のいずれか１項に記載の方法。
［項目２５］  各糖部が、修飾された糖部である、項目２４に記載の方法。
［項目２６］  アンチセンスオリゴマーが、８〜５０の核酸塩基、８〜４０の核酸塩基、８〜３５の核酸塩基、８〜３０の核酸塩基、８〜２５の核酸塩基、８〜２０の核酸塩基、８〜１５の核酸塩基、９〜５０の核酸塩基、９〜４０の核酸塩基、９〜３５の核酸塩基、９〜３０の核酸塩基、９〜２５の核酸塩基、９〜２０の核酸塩基、９〜１５の核酸塩基、１０〜５０の核酸塩基、１０〜４０の核酸塩基、１０〜３５の核酸塩基、１０〜３０の核酸塩基、１０〜２５の核酸塩基、１０〜２０の核酸塩基、１０〜１５の核酸塩基、１１〜５０の核酸塩基、１１〜４０の核酸塩基、１１〜３５の核酸塩基、１１〜３０の核酸塩基、１１〜２５の核酸塩基、１１〜２０の核酸塩基、１１〜１５の核酸塩基、１２〜５０の核酸塩基、１２〜４０の核酸塩基、１２〜３５の核酸塩基、１２〜３０の核酸塩基、１２〜２５の核酸塩基、１２〜２０の核酸塩基、又は１２〜１５の核酸塩基から成る、項目１〜２５のいずれか１項に記載の方法。
［項目２７］  アンチセンスオリゴマーが、タンパク質をコードするＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分に、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、又は１００％相補的である、項目１〜２６のいずれか１項に記載の方法。
［項目２８］  ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分が、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：４３７〜４３９から選択される配列内にある、項目１〜２７のいずれか１項に記載の方法。
［項目２９］  アンチセンスオリゴマーが、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３〜４３６のいずれか１つに対して、少なくとも約８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、又は９９％配列同一性であるヌクレオチド配列を含む、項目１〜２８のいずれか１項に記載の方法。
［項目３０］  アンチセンスオリゴマーが、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３〜４３６から選択されるヌクレオチド配列を含む、項目１〜２８のいずれか１項に記載の方法。
［項目３１］  細胞が、標的タンパク質又は機能ＲＮＡをコードする遺伝子から転写されたＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の集団を含み、ここでＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の集団は、２つ以上の保持されたイントロンを含み、アンチセンスオリゴマーは、ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の集団において最も豊富な保持されたイントロンに結合する、項目１〜３０のいずれか１項に記載の方法。
［項目３２］  最も豊富な保持されたイントロンへのアンチセンスオリゴマーの結合が、標的タンパク質又は機能ＲＮＡをコードするｍＲＮＡを産生するために、ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の集団からの２つ以上の保持されたイントロンのスプライシングアウトを誘発する、項目３１に記載の方法。
［項目３３］  細胞が、標的タンパク質又は機能ＲＮＡをコードする遺伝子から転写されたＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の集団を含み、ここでＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の集団は、２つ以上の保持されたイントロンを含み、アンチセンスオリゴマーは、ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の集団において２番目に豊富な保持されたイントロンに結合する、項目１〜３０のいずれか１項に記載の方法。
［項目３４］  ２番目に豊富な保持されたイントロンへのアンチセンスオリゴマーの結合が、標的タンパク質又は機能ＲＮＡをコードするｍＲＮＡを産生するために、ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の集団からの２つ以上の保持されたイントロンのスプライシングアウトを誘発する、項目３３に記載の方法。
［項目３５］  疾病が、疾患また障害である、項目５〜３４のいずれか１項に記載の方法。
［項目３６］  疾患又は障害が、アラジール症候群又は筋ジストロフィーである、項目３５に記載の方法。
［項目３７］  標的タンパク質及びＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体が、ＪＡＧ１遺伝子によってコードされる、項目３６に記載の方法。
［項目３８］  ＪＡＧ１タンパク質発現を評価する工程をさらに含む、項目１〜３７のいずれか１項に記載の方法。
［項目３９］  アンチセンスオリゴマーが、ＪＡＧ１ ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分に結合し、ここで標的部分は、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：４９、５０、５１、５２、５３、５４、５５、５６、及び５７から選択される配列内にある、項目１〜３８のいずれか１項に記載の方法。
［項目４０］  被験体がヒトである、項目１〜３９のいずれか１項に記載の方法。
［項目４１］  被験体がヒト以外の動物である、項目１〜３９のいずれか１項に記載の方法。
［項目４２］  被験体が、胎児、胚、又は小児である、項目１〜４０のいずれか１項に記載の方法。
［項目４３］  細胞がエクスビボにある、項目１〜４１のいずれか１項に記載の方法。
［項目４４］  アンチセンスオリゴマーが、被験体の腹腔内注射、筋肉内注射、皮下注射、又は静脈内注射によって投与される、項目１〜４１のいずれか１項に記載の方法。
［項目４５］  ５’スプライス部位に隣接しているエクソンの−３ｅから−１ｅ及び保持されたイントロンの＋１から＋６での９つのヌクレオチドが、対応する野生型配列と同一である、項目１〜４４のいずれか１項に記載の方法。
［項目４６］  保持されたイントロンの−１５から−１及び３’スプライス部位に隣接しているエクソンの＋１ｅでの１６のヌクレオチドは、対応する野生型配列と同一である、項目１〜４５のいずれか１項に記載の方法。
［項目４７］  項目１〜３９のいずれか１項の方法で使用される、アンチセンスオリゴマー。
［項目４８］  ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３〜４３６のいずれか１つに対して、少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、又は１００％の配列同一性を有する配列を含む、アンチセンスオリゴマー。
［項目４９］  項目４７又は４８のアンチセンスオリゴマー及び賦形剤を含む、医薬組成物。
［項目５０］  腹腔内注射、筋肉内注射、皮下注射、又は静脈内注射により医薬組成物を投与することによって必要としている被験体を処置する方法。
［項目５１］  タンパク質不足又は機能ＲＮＡ不足に関係する必要としている被験体のアラジール症候群を処置するために細胞によって標的タンパク質又は機能ＲＮＡの発現を増加させる方法に使用するためのアンチセンスオリゴマーを含む組成物であって、ここでタンパク質不足又は機能ＲＮＡ不足は、被験体における量又は活性の不足であり、アンチセンスオリゴマーは、標的タンパク質又は機能ＲＮＡをコードする保持されたイントロン含有ｍＲＮＡ前駆体（ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体）の構成的スプライシングを増強し、ここで標的タンパク質は、
（ａ）不足したタンパク質；又は
（ｂ）被験体において不足したタンパク質を機能的に増強又は交換する、補償するタンパク質であり、
及び機能ＲＮＡは、
（ａ）不足したＲＮＡ；又は
（ｂ）被験体において不足した機能ＲＮＡを機能的に増強又は交換する、補償する機能ＲＮＡであり、
ここでＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体は、保持されたイントロン、５’スプライス部位に隣接しているエクソン、及び３’スプライス部位に隣接しているエクソンを含み、保持されたイントロンは、標的タンパク質又は機能ＲＮＡをコードするＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体からスプライシングされ、それによって、被験体において標的タンパク質又は機能ＲＮＡの産生又は活性を増加させる、組成物。
［項目５２］  必要としている被験体においてＪＡＧ１タンパク質に関係する疾病を処置する方法に使用するためのアンチセンスオリゴマーを含む組成物であって、該方法は、被験体の細胞によってＪＡＧ１タンパク質の発現を増加させる工程を含み、ここで細胞は、保持されたイントロン、保持されたイントロンの５’スプライス部位に隣接しているエクソン、及び保持されたイントロンの３’スプライス部位に隣接しているエクソンを含む、保持されたイントロン含有ｍＲＮＡ前駆体（ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体） を有し、ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体は、ＪＡＧ１タンパク質をコードし、該方法はまた、細胞をアンチセンスオリゴマーと接触させる工程を含み、それによって、保持されたイントロンは、ＪＡＧ１タンパク質をコードするＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の転写産物から構成的にスプライシングされ、それにより、被験体の細胞内で、ＪＡＧ１タンパク質をコードするｍＲＮＡのレベルを増加させ、標的タンパク質又は機能ＲＮＡの発現を増加させる、組成物。
［項目５３］  疾病が、疾患また障害である、項目５２に記載の組成物。
［項目５４］  疾患又は障害が、アラジール症候群又は筋ジストロフィーである、項目５３に記載の組成物。
［項目５５］  標的タンパク質及びＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体が、ＪＡＧ１遺伝子によってコードされる、項目５４に記載の組成物。
［項目５６］  アンチセンスオリゴマーが、保持されたイントロンにおいて、保持されたイントロンの５’スプライス部位に対する＋６の領域から、保持されたイントロンの３’スプライス部位に対する−１６の領域内にある、ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の一部を標的とする、項目５１〜５５のいずれか１項に記載の組成物。
［項目５７］  アンチセンスオリゴマーが、保持されたイントロンにおいて、
（ａ）保持されたイントロンの５’スプライス部位に対する＋６から＋１００の領域内；又は
（ｂ）保持されたイントロンの３’スプライス部位に対する−１６から−１００の領域内にある、ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の一部を標的とする、項目５１〜５６のいずれか１項に記載の組成物。
［項目５８］  アンチセンスオリゴマーが、少なくとも１つの保持されたイントロンの５’スプライス部位の約１００のヌクレオチド下流から、少なくとも１つの保持されたイントロンの３’スプライス部位の約１００のヌクレオチド上流までの領域内にある、ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の一部を標的とする、項目５１〜５７のいずれか１項に記載の組成物。
［項目５９］  ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分が、
（ａ）保持されたイントロンの５’スプライス部位に隣接しているエクソンにおける＋２ｅから−４ｅの領域内；又は
（ｂ）保持されたイントロンの３’スプライス部位に隣接しているエクソンにおける＋２ｅから−４ｅの領域内にある、項目５１〜５７のいずれか１項に記載の組成物。
［項目６０］  ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体が、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１に対して、少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％又は１００％の配列同一性を有する遺伝子配列によってコードされる、項目５１〜５９のいずれか１項に記載の組成物。
［項目６１］  ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体が、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２に対して、少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％又は１００％の配列同一性を有する配列を含む、項目５１〜６０のいずれか１項に記載の組成物。
［項目６２］  アンチセンスオリゴマーが、標的タンパク質又は機能ＲＮＡをコードする遺伝子から転写されたｍＲＮＡ前駆体の選択的スプライシングを調節することにより標的タンパク質又は機能ＲＮＡの量を増加させない、項目５１〜６１のいずれか１項に記載の組成物。
［項目６３］  アンチセンスオリゴマーが、標的タンパク質又は機能ＲＮＡをコードする遺伝子の突然変異から結果として生じる異常スプライシングを調節することにより機能ＲＮＡ又は機能タンパク質の量を増加させない、項目５１〜６２のいずれか１項に記載の組成物。
［項目６４］  ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体が、全長ｍＲＮＡ前駆体又は野生型ｍＲＮＡ前駆体から部分的スプライシングによって産生される、項目５１〜６３のいずれか１項に記載の組成物。
［項目６５］  標的タンパク質又は機能ＲＮＡをコードするｍＲＮＡが、全長成熟ｍＲＮＡ又は野生型成熟ｍＲＮＡである、項目５１〜６４のいずれか１項に記載の組成物。
［項目６６］  産生される標的タンパク質が、全長タンパク質又は野生型タンパク質である、項目５１〜６５のいずれか１項に記載の組成物。
［項目６７］  保持されたイントロンが、律速のイントロンである、項目５１〜６６のいずれか１項に記載の組成物。
［項目６８］  保持されたイントロンが、ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体において最も豊富な保持されたイントロンである、項目５１〜６７のいずれか１項に記載の組成物。
［項目６９］  保持されたイントロンが、ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体において２番目に豊富な保持されたイントロンである、項目５１〜６７のいずれか１項に記載の組成物。
［項目７０］  アンチセンスオリゴマーが、ホスホロチオエート結合又はホスホロジアミデート結合を含む骨格修飾を含む、項目５１〜６９のいずれか１項に記載の組成物。
［項目７１］  アンチセンスオリゴマーが、アンチセンスオリゴヌクレオチドである、項目５１〜７０のいずれか１項に記載の組成物。
［項目７２］  アンチセンスオリゴマーが、ホスホロジアミデートモルホリノ、ロックド核酸、ペプチド核酸、２’−Ｏ−メチル、２’−フルオロ、又は２’−Ｏ−メトキシエチル部分を含む、項目５１〜７１のいずれか１項に記載の組成物。
［項目７３］  アンチセンスオリゴマーが、少なくとも１つの修飾された糖部を含む、項目５１〜７２のいずれか１項に記載の組成物。
［項目７４］  各糖部が、修飾された糖部である、項目７３に記載の組成物。
［項目７５］  アンチセンスオリゴマーが、８〜５０の核酸塩基、８〜４０の核酸塩基、８〜３５の核酸塩基、８〜３０の核酸塩基、８〜２５の核酸塩基、８〜２０の核酸塩基、８〜１５の核酸塩基、９〜５０の核酸塩基、９〜４０の核酸塩基、９〜３５の核酸塩基、９〜３０の核酸塩基、９〜２５の核酸塩基、９〜２０の核酸塩基、９〜１５の核酸塩基、１０〜５０の核酸塩基、１０〜４０の核酸塩基、１０〜３５の核酸塩基、１０〜３０の核酸塩基、１０〜２５の核酸塩基、１０〜２０の核酸塩基、１０〜１５の核酸塩基、１１〜５０の核酸塩基、１１〜４０の核酸塩基、１１〜３５の核酸塩基、１１〜３０の核酸塩基、１１〜２５の核酸塩基、１１〜２０の核酸塩基、１１〜１５の核酸塩基、１２〜５０の核酸塩基、１２〜４０の核酸塩基、１２〜３５の核酸塩基、１２〜３０の核酸塩基、１２〜２５の核酸塩基、１２〜２０の核酸塩基、又は１２〜１５の核酸塩基から成る、項目５１〜７４のいずれか１項に記載の組成物。
［項目７６］  アンチセンスオリゴマーが、タンパク質をコードするＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分に、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、又は１００％相補的である、項目５１〜７５のいずれか１項に記載の組成物。
［項目７７］  アンチセンスオリゴマーが、ＪＡＧ１ ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の標的部分に結合し、ここで標的部分は、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：４３７〜４３９から選択される配列内にある、請求項５１〜７６のいずれか１項に記載の組成物。
［項目７８］  アンチセンスオリゴマーが、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３〜４３６のいずれか１つに対して、少なくとも約８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、又は９９％配列同一性であるヌクレオチド配列を含む、項目５１〜７７のいずれか１項に記載の組成物。
［項目７９］  アンチセンスオリゴマーが、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３〜４３６から選択されるヌクレオチド配列を含む、項目５１〜７７のいずれか１項に記載の組成物。
［項目８０］  項目５１〜７９の組成物のいずれかのアンチセンスオリゴマー、及び賦形剤を含む、医薬組成物。
［項目８１］  腹腔内注射、筋肉内注射、皮下注射、又は静脈内注射により項目８０の医薬組成物を投与することによって必要としている被験体を処置する方法。
［項目８２］  不足したＪＡＧ１ ｍＲＮＡの転写産物の標的配列にハイブリダイズするアンチセンスオリゴマー、及び薬学的に許容可能な賦形剤を含む、医薬組成物であって、ここで不足したＪＡＧ１ ｍＲＮＡの転写産物は保持されたイントロンを含み、アンチセンスオリゴマーは、不足したＪＡＧ１ ｍＲＮＡの転写産物からの保持されたイントロンのスプライシングアウトを誘発する、医薬組成物。
［項目８３］  不足したＪＡＧ１ ｍＲＮＡの転写産物が、ＪＡＧ１ ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の転写産物である、項目８２に記載の医薬組成物。
［項目８４］  ＪＡＧ１ ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の転写産物の標的部分は、保持されたイントロンにおいて、保持されたイントロンの５’スプライス部位に対する＋６の領域から、保持されたイントロンの３’スプライス部位に対する−１６の領域内にある、項目８２又は８３に記載の医薬組成物。
［項目８５］  ＪＡＧ１ ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の転写産物が、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１に対して、少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％又は１００％の配列同一性を有する遺伝子配列によってコードされる、項目８２〜８４のいずれか１項に記載の医薬組成物。
［項目８６］  ＪＡＧ１ ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の転写産物が、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２に対して、少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％又は１００％の配列同一性を有する配列を含む、項目８２〜８５のいずれか１項に記載の医薬組成物。
［項目８７］  アンチセンスオリゴマーが、ホスホロチオエート結合又はホスホロジアミデート結合を含む骨格修飾を含む、項目８２〜８６のいずれか１項に記載の医薬組成物。
［項目８８］  アンチセンスオリゴマーが、アンチセンスオリゴヌクレオチドである、項目８２〜８７のいずれか１項に記載の医薬化合物。
［項目８９］  アンチセンスオリゴマーが、ホスホロジアミデートモルホリノ、ロックド核酸、ペプチド核酸、２’−Ｏ−メチル、２’−フルオロ、又は２’−Ｏ−メトキシエチル部分を含む、項目８２〜８８のいずれか１項に記載の医薬組成物。
［項目９０］  アンチセンスオリゴマーが、少なくとも１つの修飾された糖部を含む、項目８２〜８９のいずれか１項に記載の医薬組成物。
［項目９１］  アンチセンスオリゴマーが、８〜５０の核酸塩基、８〜４０の核酸塩基、８〜３５の核酸塩基、８〜３０の核酸塩基、８〜２５の核酸塩基、８〜２０の核酸塩基、８〜１５の核酸塩基、９〜５０の核酸塩基、９〜４０の核酸塩基、９〜３５の核酸塩基、９〜３０の核酸塩基、９〜２５の核酸塩基、９〜２０の核酸塩基、９〜１５の核酸塩基、１０〜５０の核酸塩基、１０〜４０の核酸塩基、１０〜３５の核酸塩基、１０〜３０の核酸塩基、１０〜２５の核酸塩基、１０〜２０の核酸塩基、１０〜１５の核酸塩基、１１〜５０の核酸塩基、１１〜４０の核酸塩基、１１〜３５の核酸塩基、１１〜３０の核酸塩基、１１〜２５の核酸塩基、１１〜２０の核酸塩基、１１〜１５の核酸塩基、１２〜５０の核酸塩基、１２〜４０の核酸塩基、１２〜３５の核酸塩基、１２〜３０の核酸塩基、１２〜２５の核酸塩基、１２〜２０の核酸塩基、又は１２〜１５の核酸塩基を含む、項目８２〜９０のいずれか１項に記載の医薬組成物。
［項目９２］  アンチセンスオリゴマーが、ＪＡＧ１ ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の転写産物の標的部分に、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、又は１００％相補的である、項目８２〜９１のいずれか１項に記載の医薬組成物。
［項目９３］  ＪＡＧ１ ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の転写産物の標的部分は、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：４３７〜４３９から選択される配列内にある、項目８２〜９２のいずれか１項に記載の医薬組成物。
［項目９４］  アンチセンスオリゴマーが、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３〜４３６のいずれか１つに対して、少なくとも約８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、又は９９％配列同一性であるヌクレオチド配列を含む、項目８２〜９３のいずれか１項に記載の医薬組成物。
［項目９５］  アンチセンスオリゴマーが、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３〜４３６から選択されるヌクレオチド配列を含む、項目８２〜９３のいずれか１項に記載の医薬組成物。
［項目９６］  医薬組成物が、髄腔内注射、脳室内注射、腹腔内注射、筋肉内注射、皮下注射、又は静脈内注射のために製剤される、項目８２〜９５のいずれか１項に記載の医薬組成物。
［項目９７］  ツベリンタンパク質の機能形態をコードする十分に処理されたＪＡＧ１ ｍＲＮＡの転写産物を産生するために、保持されたイントロンの除去を促進するように不足したＪＡＧ１ ｍＲＮＡの転写産物の処理を誘発する方法であって、該方法は、
（ａ）アンチセンスオリゴマーを被験体の標的細胞と接触させる工程；
（ｂ）アンチセンスオリゴマーを不足したＪＡＧ１ ｍＲＮＡの転写産物にハイブリダイズする工程であって、不足したＪＡＧ１ ｍＲＮＡの転写産物が、ツベリンタンパク質の機能形態をコードすることができ、少なくとも１つの保持されたイントロンを含む、工程；
（ｃ）ツベリンタンパク質の機能形態をコードする十分に処理されたＪＡＧ１ ｍＲＮＡの転写産物を産生するために、不足したＪＡＧ１ ｍＲＮＡの転写産物から少なくとも１つの保持されたイントロンを除去する工程；及び
（ｄ）十分に処理されたＪＡＧ１ ｍＲＮＡの転写産物からツベリンタンパク質の機能形態を翻訳する工程を含む、方法。
［項目９８］  保持されたイントロンが、保持されたイントロン全体である、項目９７に記載の方法。
［項目９９］  不足したＪＡＧ１ ｍＲＮＡの転写産物が、ＪＡＧ１ ＲＩＣ ｍＲＮＡ前駆体の転写産物である、項目９７又は９８に記載の方法。
［項目１００］  ＪＡＧ１タンパク質の量又は活性の不足によって引き起こされた疾病を有する被験体を処置する方法であって、該方法は、
ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３〜４３６のいずれか１つに対して、少なくとも約８０％、８５％、９０％、９１％、９２％ 、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、又は９９％の配列同一性を有するヌクレオチド配列を含むアンチセンスオリゴマーを被験体に投与する工程を含む、方法。
【手続補正２】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
ＪＡＧ１タンパク質をコードする保持されたイントロン含有ｍＲＮＡ前駆体（ＲＩＣ  ｍＲＮＡ前駆体）の標的部分に相補的なアンチセンスオリゴマー（ＡＳＯ）を含む医薬組成物であって、該ＲＩＣ  ｍＲＮＡ前駆体は、保持されたイントロン、保持されたイントロンの５’スプライス部位に隣接しているエクソン、及び保持されたイントロンの３’スプライス部位に隣接しているエクソンを含み、ＲＩＣ  ｍＲＮＡ前駆体を発現する細胞においてＡＳＯがＲＩＣ  ｍＲＮＡ前駆体に結合することにより、保持されたイントロンはＲＩＣ  ｍＲＮＡ前駆体から構成的にスプライシングされ、それにより、細胞内で、ＪＡＧ１タンパク質をコードするｍＲＮＡのレベルを増加させる、前記医薬組成物。
【請求項２】
医薬として使用するための、請求項１に記載の医薬組成物。
【請求項３】
被検体においてアラジール症候群の処置に使用するための、請求項１又は２に記載の医薬組成物。
【請求項４】
ＲＩＣ  ｍＲＮＡ前駆体の標的部分が、保持されたイントロンの５’スプライス部位に対する＋６の領域から、保持されたイントロンの３’スプライス部位に対する−１６の領域内にある、請求項１〜３のいずれか１項に記載の医薬組成物。
【請求項５】
ＲＩＣ  ｍＲＮＡ前駆体が、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２に対して少なくとも８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、又は１００％の配列同一性を有する配列を含む、請求項１〜４のいずれか１項に記載の医薬組成物。
【請求項６】
ＲＩＣ  ｍＲＮＡ前駆体の標的部分が、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：４３７〜４３９から選択される配列内にある、請求項１〜５のいずれか１項に記載の医薬組成物。
【請求項７】
ＡＳＯが、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：３〜４３６から選択される配列に対して、少なくとも８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、又は１００％の配列同一性を有する配列を含む、請求項１〜６のいずれか１項に記載の医薬組成物。
【請求項８】
ＪＡＧ１タンパク質が、同等の野生型タンパク質と比較して：
ｉ）  機能が低下した形態；又は
ｉｉ）  完全に機能的である形態、
で産生される、請求項１〜７のいずれか１項に記載の医薬組成物。
【請求項９】
ＡＳＯが、ホスホロチオエート結合若しくはホスホロジアミデート結合を含む骨格修飾、又は修飾された糖部若しくは糖アナログを含み、ホスホロジアミデートモルホリノ、ロックド核酸、ペプチド核酸、２’−Ｏ−メチル部分、２’−フルオロ部分、又は２’−Ｏ−メトキシエチル部分を含んでいてもよい、請求項１〜８のいずれか１項に記載の医薬組成物。
【請求項１０】
ＡＳＯが、８〜５０の核酸塩基から成る、請求項１〜９のいずれか１項に記載の医薬組成物。
【請求項１１】
ＪＡＧ１タンパク質が、処置すべき被検体において量又は活性が不足している、請求項１〜１０のいずれか１項に記載の医薬組成物。
【請求項１２】
ＪＡＧ１タンパク質が、処置すべき被検体において量又は活性が不足しており、ＪＡＧ１タンパク質の量の不足が、ＪＡＧ１タンパク質のハプロ不全によって引き起こされ、ここで、被検体は、機能的なＪＡＧ１タンパク質をコードする第１の対立遺伝子、及びＪＡＧ１タンパク質が産生されない第２の対立遺伝子又は非機能性のＪＡＧ１タンパク質をコードする第２の対立遺伝子を有し、ＡＳＯは、第１の対立遺伝子から転写されたＲＩＣ  ｍＲＮＡ前駆体の標的部分に結合する、請求項１〜１１のいずれか１項に記載の医薬組成物。
【請求項１３】
ＪＡＧ１タンパク質が、処置すべき被検体において量又は活性が不足しており、被検体は、第１の変異対立遺伝子及び第２の変異対立遺伝子を有し、ＪＡＧ１タンパク質は、
ａ．  第１の変異対立遺伝子から：
ｉ．  野生型対立遺伝子からの産生と比較して低下したレベルで産生される；
ｉｉ．  同等の野生型ＪＡＧ１タンパク質と比較して機能が低下した形態で産生される；又は
ｉｉｉ．  産生されない、及び
ｂ．  第２の変異対立遺伝子から：
ｉ．  野生型対立遺伝子からの産生と比較して低下したレベルで産生される；
ｉｉ．  同等の野生型ＪＡＧ１タンパク質と比較して機能が低下した形態で産生される；又は
ｉｉｉ．  産生されない、
ここで、被検体が第１の変異対立遺伝子ａ．ｉｉｉ．を有する場合、第２の変異対立遺伝子はｂ．ｉ．又はｂ．ｉｉ．であり、被検体が第２の変異対立遺伝子ｂ．ｉｉｉ．を有する場合、第１の変異対立遺伝子はａ．ｉ．又はａ．ｉｉ．であり、ＲＩＣ  ｍＲＮＡ前駆体は、ａ．ｉ．若しくはａ．ｉｉ．である第１の変異対立遺伝子又はｂ．ｉ．若しくはｂ．ｉｉである第２の変異対立遺伝子から転写される、請求項１〜１１のいずれか１項に記載の医薬組成物。
【請求項１４】
ＡＳＯが、髄空内注射、脳室内注射、腹腔内注射、筋肉内注射、皮下注射、又は静脈内注射によって投与される、請求項１〜１３のいずれか１項に記載の医薬組成物。
【請求項１５】
ＡＳＯが、ＪＡＧ１タンパク質をコードする遺伝子から転写されたｍＲＮＡ前駆体の選択的スプライシングを調節することによって細胞内のＪＡＧ１タンパク質又はＪＡＧ１タンパク質をコードするｍＲＮＡの量を増加させない、請求項１〜１４のいずれか１項に記載の医薬組成物。