【誤訳訂正書】
【提出日】令和1年12月18日(2019.12.18)
【誤訳訂正１】
【訂正対象書類名】特許請求の範囲
【訂正対象項目名】全文
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
試料中の標的物の試料濃度を決定する方法であって、
標的物の局所的な濃度を示す個別の局所的な測定値のデータ点を含むアッセイデータを、アッセイアセンブリの複数のアッセイ領域のそれぞれにて得るステップであって、前記アッセイ領域は、前記アッセイアセンブリを流れる試料が順番に各アッセイ領域を流れるように直列に連結され、各アッセイ領域は、その表面に固定化されている複数のプローブ物を含み、前記試料が前記アッセイ領域の１つから次のものまで流れる際に前記標的物の濃度が減少するように、前記プローブ物は前記試料中の前記標的物に結合するように配置されているステップと；
前記アッセイデータをパラメータ化された関数でモデル化するステップと；
１つ以上のパラメータの少なくとも１つに基づいて試料濃度を示す値を決定するステップと、を含み、
前記パラメータ化された関数がロジスティック関数であり、前記パラメータ化された関数が下記数式に比例することを特徴とする方法。
【数１】
2017534885.tif 000001
（式中、ＤＰｍａｘおよびＳｈａｐｅは前記アッセイアセンブリに特有の固定パラメータであり、ＤＰｍａｘはアッセイ領域から検出できる局所的な測定値の最大振幅を示し、Ｓｈａｐｅは１つのアッセイ領域から次のものまで試料が流れる際に標的物の濃度が減少した量または割合を示し、Ｏｆｆｓｅｔは試料標的濃度に依存するパラメータであり、ＤＺｉは、順番における個別のアッセイ領域ｉの位置を示す。）
【請求項２】
前記パラメータ化された関数が試料濃度の範囲について得られたアッセイデータセットから得られることを特徴とする請求項１に記載の方法。
【請求項３】
較正関数を用いて、１つ以上のパラメータの少なくとも１つに基づいて値を決定するステップを含み、前記較正関数が、所与の値を超える標的物の試料濃度での使用のための第１の関数と、所与の値未満の標的物の試料濃度での使用のための第２の関数と、を含むことを特徴とする請求項１乃至２のいずれか１項に記載の方法。
【請求項４】
各局所的な測定値が、個別のアッセイ領域の表面での屈折率の変動を示す請求項１乃至３のいずれか１項に記載の方法。
【請求項５】
前記個別のアッセイ領域の表面での前記屈折率の変動が、前記個別のアッセイ領域を流れる増幅器溶液によって増幅され、結合した標的物と増幅器が相互作用した際に前記個別のアッセイ領域での前記屈折率の変動が増幅するように、前記アッセイ領域の表面に結合した標的物と相互作用するように前記増幅器溶液が配置されていることを特徴とする請求項４に記載の方法。
【請求項６】
各局所的な測定値が、増幅前シグナルと増幅後シグナルとの差を含み、前記試料と前記個別のアッセイ領域との相互作用後に、かつ前記増幅器溶液と個別のアッセイ領域に結合した標的物との相互作用前に、増幅前シグナルが検出され、前記個別のアッセイ領域に結合した標的物と前記増幅器溶液との相互作用後に、増幅後シグナルが検出されることを特徴とする請求項５に記載の方法。
【請求項７】
前記アッセイデータをモデル化するステップが、調整項を用いて前記試料のバルク屈折率を算定するステップを含むことを特徴とする請求項６に記載の方法。
【請求項８】
前記調整項は、前記試料と前記アッセイ領域との相互作用の前に検出されたベースラインシグナルと、前記増幅前シグナルとの差に基づいて決定されることを特徴とする請求項７に記載の方法。
【請求項９】
各局所的な測定値が、前記増幅器溶液が前記個別のアッセイ領域と相互作用する比率を示すことを特徴とする請求項５に記載の方法。
【請求項１０】
前記順番におけるアッセイ領域の位置を示す量が、前記アッセイ領域の位置の上流のプローブ物の量を示す請求項１乃至９のいずれか１項に記載の方法。
【請求項１１】
試料中の標的物の試料濃度を決定するためのシステムであって、
アッセイアセンブリの複数のアッセイ領域のそれぞれでの標的物の局所的な濃度を示す個別の局所的な測定値のデータ点を含むアッセイデータを得、
前記アッセイデータをパラメータ化された関数でモデル化し、
１つ以上のパラメータの少なくとも１つに基づいて試料濃度を示す値を決定するように配置された処理装置を含み、
ここで、前記アッセイ領域は、前記アッセイアセンブリを流れる試料が各アッセイ領域を順番に流れるように直列に連結されており、
各アッセイ領域はその表面に固定化されている複数のプローブ物を含み、前記プローブ物は、前記試料が前記アッセイ領域の１つから次のものまで流れる際に前記標的物の濃度が減少するように、前記標的物に結合するように配置されており、
前記パラメータ化された関数がロジスティック関数であり、前記パラメータ化された関数が下記数式に比例することを特徴とするシステム。
【数２】
2017534885.tif 000002
（式中、ＤＰｍａｘおよびＳｈａｐｅは前記アッセイアセンブリに特有の固定パラメータであり、Ｏｆｆｓｅｔは試料標的濃度に依存するパラメータであり、ＤＺｉは、順番における個別のアッセイ領域ｉの位置を示す。）
【請求項１２】
前記システムは、アッセイアセンブリを流れる試料が各アッセイ領域を順番に流れるように直列に連結された複数のアッセイ領域を含み、各アッセイ領域はその表面に固定化されている複数のプローブ物を含み、前記プローブ物は、前記試料が前記アッセイ領域の１つから次のものまで流れる際に標的物の濃度が減少するように標的物に結合するように配置されているアッセイアセンブリと；
各アッセイ領域で局所的な測定を実施して、前記複数のアッセイ領域のそれぞれでの前記標的物の局所的な濃度を示す個別の局所的な測定値のデータ点を含むアッセイデータを得るように配置された少なくとも１つの検出器と、をさらに含み；
前記処理装置が、前記少なくとも１つの検出器からアッセイデータを得るように配置されている請求項１１に記載のシステム。
【誤訳訂正２】
【訂正対象書類名】明細書
【訂正対象項目名】００３２
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【００３２】
一部の実施形態では、各局所的な測定値は、増幅前シグナルと増幅後シグナルとの差を含む。試料と個別のアッセイ領域との相互作用後に、増幅器溶液と個別のアッセイ領域に結合した標的物との相互作用前に増幅前シグナルが検出される。増幅器溶液と個別のアッセイ領域に結合した標的物との相互作用後に、増幅後シグナルが検出される。増幅前シグナルは試料のバルク試料屈折率からの寄与を含み得る。増幅器の適用に続く洗浄ステップで、非結合増幅器および試料を緩衝液で実質的に洗い流した後に、増幅後シグナルを得てもよい。そのような実施形態では、局所的な測定値のパラメータ化された関数は、増幅前シグナルに影響を与えるが増幅後シグナルに影響を与えない試料のバルク試料屈折率を算定するための調整項を含み得る。調整項は、１つ以上の変数パラメータの一部としてデータ点に合わせてもよく、例えば一部の実施形態ではＯｆｆｓｅｔと共に同時に合わせてもよい。他の実施形態では、試料のアッセイ領域との相互作用前に検出されたベースラインシグナルと、増幅前シグナルとの差に基づいて調整項を決定し得る。そのような実施形態では、この項を合わせる必要はないが、調整項は、局所的な測定値（増幅前と増幅後のシグナルの差）から単に引くことができる。
【誤訳訂正３】
【訂正対象書類名】明細書
【訂正対象項目名】００３５
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【００３５】
一部の実施形態では、増幅器溶液の濃度は、アッセイアセンブリを増幅器で飽和させない程度のものである。そのような実施形態では、局所的な測定値は、標的試料中の濃度並びに増幅器溶液の濃度に依存する。それ故に、試料濃度と増幅器自体の両方からの減少効果が合わせられる。これらの２つの異なる減少プロセスは、パラメータ化された関数で特徴づけられてもよく、例えば、パラメータ化された関数は、増幅器または追加の項の減少を明らかにするための追加のパラメータを含有する。代替として、または追加して、「Ｓｈａｐｅ」パラメータは、試料濃度および増幅器濃度の両方を変動させるベクトルであり得る。一部の実施形態では、Ｓｈａｐｅは、増幅器の変動濃度を捕捉するための位置／上流の結合容量を示す量の関数であり得る。一部の実施形態では、増幅器の濃度の効果は、アッセイアセンブリ中に存在するプローブ物の密度の効果と同種であると考えることができる。したがって、例えば、ＤＺｉの値は、後に詳細に説明するように、アッセイアセンブリの相対結合容量を考慮するようにＤＺｉをどのように調整するかと同様に、増幅器濃度を明らかにするように調整し得る。
【誤訳訂正４】
【訂正対象書類名】明細書
【訂正対象項目名】００４８
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【００４８】
さらなる態様では、試料中の標的物の試料濃度を決定する方法が提供される。該方法は、アッセイアセンブリのアッセイ領域に固定化されている標的物の局所的な濃度を示す局所的な測定値を含むアッセイデータを、アッセイアセンブリを用いるアッセイから得るステップを備え、ここで、アッセイ領域はアッセイ領域の表面に固定化されている複数のプローブ物を含み、プローブ物は標的物に結合するように配置されている。増幅器溶液とアッセイ領域の表面に結合した標的物との相互作用の後に増幅した変動のような、アッセイ領域の表面での屈折率の変動を示すシグナルに局所的な測定値は基づいている。局所的な測定値は、増幅前シグナルと増幅後シグナルとの差を含み、ここで、増幅前シグナルは、試料とアッセイ領域との相互作用の後に、かつ増幅器溶液とアッセイ領域に結合した標的物との相互作用の前に検出され、増幅後シグナルは、増幅器溶液とアッセイ領域に結合した標的物との相互作用の後に、かつアッセイ領域を緩衝液で洗浄した後に検出される。該方法は、試料のバルク試料屈折率を考慮するように、調整項を用いて局所的な測定値を調整するステップと、調整した局所的な測定値を用いて試料濃度を示す値を決定するステップとをさらに含む。
【誤訳訂正５】
【訂正対象書類名】明細書
【訂正対象項目名】００４９
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【００４９】
一部の実施形態では、調整項は、試料とアッセイ領域との相互作用の前に検出されたベースラインシグナルと、増幅前シグナルとの差に基づいて決定される。ここで、上記の試料のバルクのバルク試料屈折率の寄与に対する補償に関する特徴が同等に適用可能である。