【手続補正書】
【提出日】令和2年10月29日(2020.10.29)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
ヒトIgGのFc領域と抗原結合領域とを含むポリペプチドであって、
該Fc領域が、CH2およびCH3ドメインを含み、
該Fc領域が、EUナンバリングに従うヒトIgG1内の以下のアミノ酸位置に対応する（i）第1の変異および（ii）第2の変異:
i.  E430、E345、またはS440に第1の変異、ただし、S440における変異はS440YまたはS440Wであるものとする;および
ii.  K322またはP329に第2の変異
を含む、
該ポリペプチド。
【請求項２】
第1の変異が、E430G、E345K、E430S、E430F、E430T、E345Q、E345R、E345Y、S440W、およびS440Yからなる群より選択される、請求項1に記載のポリペプチド。
【請求項３】
第1の変異がE430GまたはE345Kから選択される、請求項1に記載のポリペプチド。
【請求項４】
第2の変異が、K322E、K322D、K322N、P329H、P329K、P329R、P329D、P329E、P329F、P329G、P329I、P329L、P329M、P329N、P329Q、P329S、P329T、P329V、P329W、P329A、およびP329Yからなる群より選択される、請求項1〜3のいずれか一項に記載のポリペプチド。
【請求項５】
第2の変異がK322Eである、請求項1〜4のいずれか一項に記載のポリペプチド。
【請求項６】
第2の変異が、P329R、P329K、およびP329Dの群から選択される、請求項1〜4のいずれか一項に記載のポリペプチド。
【請求項７】
Fc領域が、CH3ドメイン内の位置K439に対応するさらなる変異を含むか、あるいは、該さらなる変異は、第1の変異が位置S440に存在しない場合にはS440位に存在し得る、請求項7または8に記載のポリペプチド。
【請求項８】
前記さらなる変異がS440KまたはK439Eから選択される、請求項9に記載のポリペプチド。
【請求項９】
同じ第1の変異を有するが第2の変異は有しない前記ポリペプチドと同一である親ポリペプチドと比べて少なくとも20%、例えば少なくとも30%もしくは少なくとも40%、または少なくとも50%もしくは少なくとも60%もしくは少なくとも70%、または少なくとも80%もしくは少なくとも90%低減したFcエフェクター機能を有する、請求項1〜8のいずれか一項に記載のポリペプチド。
【請求項１０】
Fcエフェクター機能を誘導しない、請求項1〜9のいずれか一項に記載のポリペプチド。
【請求項１１】
Fcエフェクター機能が、補体依存性細胞傷害（CDC）、補体依存性細胞介在性細胞傷害（CDCC）、補体活性化、抗体依存性細胞介在性細胞傷害（ADCC）、抗体依存性細胞介在性貪食（ADCP）、C1q結合、およびFcγR結合の群から選択される、請求項12または13に記載のポリペプチド。
【請求項１２】
抗体、単一特異性抗体、二重特異性抗体、または多重特異性抗体である、請求項1〜11のいずれか一項に記載のポリペプチド。
【請求項１３】
Fc領域がヒトIgG1アイソタイプである、請求項1〜12のいずれか一項に記載のポリペプチド。
【請求項１４】
ヒト抗体、ヒト化抗体、またはキメラ抗体である、請求項1〜13のいずれか一項に記載のポリペプチド。
【請求項１５】
抗原結合領域がTNFR-SFのメンバーに結合する、請求項1〜14のいずれか一項に記載のポリペプチド。
【請求項１６】
TNFR-SFが細胞内デスドメインを含まないものである、請求項15に記載のポリペプチド。
【請求項１７】
TNFR-SFのメンバーが、FAS、DR4、DR5、TNFR1、DR6、DR3、EDAR、およびNGFRの群より選択される、請求項15に記載のポリペプチド。
【請求項１８】
TNFR-SFが、OX40、CD40、CD30、CD27、4-1BB、RANK、TACI、BLySR、BCMA、RELT、およびGITRの群より選択される、請求項16に記載のポリペプチド。
【請求項１９】
ヒト免疫グロブリンのFc領域と抗原結合領域とを含むポリペプチドのFcエフェクター機能を低減させる方法であって、
該Fc領域が、CH2およびCH3ドメインを含み、
該Fc領域が、EUナンバリングに従うヒトIgG1内の（i）位置E430、E345、またはS440に対応する第1の変異を含み、
該方法が、EUナンバリングに従うヒトIgG1内の（ii）位置K322またはP329に対応する第2の変異を導入する工程を含む、
該方法。
【請求項２０】
第1の変異が、E430G、E345K、E430S、E430F、E430T、E345Q、E345R、E345Y、S440W、およびS440Yからなる群より選択される、請求項19に記載の方法。
【請求項２１】
第1の変異がE430GまたはE345Kから選択される、請求項19または20に記載の方法。
【請求項２２】
第2の変異が、K322E、K322D、K322N、P329H、P329K、P329R、P329D、P329E、P329F、P329G、P329I、P329L、P329M、P329N、P329Q、P329S、P329T、P329V、P329W、P329A、およびP329Yからなる群より選択される、請求項19〜21のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２３】
第2の変異が、K322E、P329R、P329K、およびP329Dの群から選択される、請求項19〜22のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２４】
Fc領域が1つまたは複数のさらなる変異をCH3ドメイン内に含む、請求項19〜23のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２５】
Fc領域が、EUナンバリングに従うヒトIgG1内の位置S440またはK439のうちの1つに対応するCH3ドメイン内にさらなる変異を含む、請求項24に記載の方法。
【請求項２６】
前記さらなる変異がS440KまたはK439Eから選択される、請求項25に記載の方法。
【請求項２７】
Fcエフェクター機能が、同じ第1の変異を有するが第2の変異は有しないポリペプチドと同一である親ポリペプチドと比べて少なくとも20%、例えば少なくとも30%もしくは少なくとも40%、または少なくとも50%もしくは少なくとも60%もしくは少なくとも70%、または少なくとも80%もしくは少なくとも90%低減される、請求項19〜26のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２８】
Fcエフェクター機能が、補体依存性細胞傷害（CDC）、補体依存性細胞介在性細胞傷害（CDCC）、抗体依存性細胞介在性細胞傷害（ADCC）、抗体依存性細胞介在性貪食（ADCP）、C1q結合、およびFcγR結合の群から選択される、請求項19〜27のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２９】
ADCCが、第2の変異を含んでいないこと以外は前記抗体と同一である比較抗体と比べて少なくとも20%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも90%、少なくとも100%低減される、請求項28に記載の方法。
【請求項３０】
請求項1〜18のいずれか一項に記載の少なくとも1種類のポリペプチドを含む、組成物。
【請求項３１】
請求項1〜18のいずれか一項に記載の1種または複数種のポリペプチドを含む、請求項30に記載の組成物。
【請求項３２】
請求項1〜18のいずれか一項で規定したとおりの第1のポリペプチドと第2のポリペプチドとを含む、請求項30〜31のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項３３】
第1の抗原結合領域と第1のFc領域とを含む第1のポリペプチド、第2の抗原結合領域と第2のFc領域とを含む第2のポリペプチドまたは抗体を含み、第1および第2のFc領域が、（i）第1の変異、（ii）第2の変異、（iii）さらなる変異を含み、これら変異が、EUナンバリングに従うヒトIgG1内の以下のアミノ酸位置に対応する:
（i）第1の変異E430、E345、またはS440、ただし、S440における変異はS440YまたはS440Wであるものとする;
（ii）E322またはP329における第2の変異;
（iii）K439またはS440におけるさらなる変異、ただし、該さらなる変異がS440に存在するならば、第1の変異はS440に存在しないものとし、第1および第2のFc領域は、さらなる変異を同じアミノ酸位置に含まないものとする、
請求項32に記載の組成物。
【請求項３４】
第1のポリペプチドおよび第2のポリペプチドが、TNFR1、FAS、DR3、DR4、DR5、DR6、NGFR、およびEDARからなる群より選択される細胞内デスドメインを有する1つまたは複数のTNFR-SFのメンバー上の異なるエピトープに結合する、請求項32〜33のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項３５】
第1のポリペプチドおよび第2のポリペプチドが、細胞内デスドメインを有しない1つまたは複数のTNFR-SFのメンバー、例えばOX40、CD40、CD30、CD27、4-1BB、RANK、TACI、BLySR、BCMA、RELT、およびGITR上の異なるエピトープに結合する、請求項32〜33のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項３６】
細胞内デスドメインを有しないTNFR-SFの1つのメンバー、例えばOX40、CD40、CD30、CD27、4-1BB、RANK、TACI、BLySR、BCMA、RELT、およびGITRに結合する第1のポリペプチドが、細胞内デスドメインを有しないTNFR-SFの1つのメンバー、例えばOX40、CD40、CD30、CD27、4-1BB、RANK、TACI、BLySR、BCMA、RELT、およびGITRに結合する第2の抗体の結合をブロックしないものである、請求項32〜33のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項３７】
第1のポリペプチドおよび第2のポリペプチドならびに/または任意のさらなるポリペプチドが、組成物中で等モル比で存在している、請求項30〜36のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項３８】
薬学的組成物である、請求項30〜37のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項３９】
医薬としての使用のための、請求項1〜18のいずれか一項に記載のポリペプチドまたは請求項30〜38のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項４０】
がん、自己免疫疾患、炎症性疾患、または感染性疾患の処置における使用のための、請求項1〜18のいずれか一項に記載のポリペプチドまたは請求項30〜39のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項４１】
請求項1〜18のいずれか一項に記載のポリペプチドまたは請求項30〜40のいずれか一項に記載の組成物を含むパーツキット（kit of parts）であって、該ポリペプチドまたは組成物が、1つまたは複数の容器内、例えばバイアル内に存在している、該パーツキット。
【請求項４２】
請求項1〜18のいずれか一項に記載のポリペプチドまたは請求項30〜40のいずれか一項に記載の組成物が、治療において同時、別々、または逐次の使用のためのものである、請求項41に記載のパーツキット。
【請求項４３】
疾患の処置のための医薬の製造のための、請求項1〜18のいずれか一項に記載のポリペプチドまたは請求項30〜38のいずれか一項に記載の組成物の使用。
【請求項４４】
疾患が、がん、自己免疫疾患、炎症性疾患、または感染性疾患である、請求項43に記載の使用。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００２８
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００２８】
[本発明1001]
ヒトIgGのFc領域と抗原結合領域とを含むポリペプチドであって、
該Fc領域が、CH2およびCH3ドメインを含み、
該Fc領域が、EUナンバリングに従うヒトIgG1内の以下のアミノ酸位置に対応する（i）第1の変異および（ii）第2の変異:
i.  E430、E345、またはS440に第1の変異、ただし、S440における変異はS440YまたはS440Wであるものとする;および
ii.  K322またはP329に第2の変異
を含む、
該ポリペプチド。
[本発明1002]
第1の変異が、E430G、E345K、E430S、E430F、E430T、E345Q、E345R、E345Y、S440W、およびS440Yからなる群より選択される、本発明1001のポリペプチド。
[本発明1003]
第1の変異がE430GまたはE345Kから選択される、本発明1001のポリペプチド。
[本発明1004]
第2の変異が、K322E、K322D、K322N、P329H、P329K、P329R、P329D、P329E、P329F、P329G、P329I、P329L、P329M、P329N、P329Q、P329S、P329T、P329V、P329W、P329A、およびP329Yからなる群より選択される、前記本発明のいずれかのポリペプチド。
[本発明1005]
第2の変異がK322Eである、前記本発明のいずれかのポリペプチド。
[本発明1006]
第2の変異が、P329R、P329K、およびP329Dの群から選択される、本発明1001〜1004のいずれかのポリペプチド。
[本発明1007]
Fc領域が1つまたは複数のさらなる変異を含む、前記本発明のいずれかのポリペプチド。
[本発明1008]
Fc領域が1つまたは複数のさらなる変異をCH2またはCH3ドメイン内に含む、前記本発明のいずれかのポリペプチド。
[本発明1009]
Fc領域が、CH3ドメイン内の位置K439に対応するさらなる変異を含むか、あるいは、該さらなる変異は、第1の変異が位置S440に存在しない場合にはS440位に存在し得る、本発明1007または1008のポリペプチド。
[本発明1010]
前記さらなる変異がS440KまたはK439Eから選択される、本発明1009のポリペプチド。
[本発明1011]
Fc領域が、最大で10個の変異、例えば9個の変異、例えば8個の変異、例えば7個の変異、例えば6個の変異、例えば5個の変異、例えば4個の変異、例えば3個の変異、または例えば2個の変異を含む、前記本発明のいずれかのポリペプチド。
[本発明1012]
同じ第1の変異を有するが第2の変異は有しない前記ポリペプチドと同一である親ポリペプチドと比べて少なくとも20%、例えば少なくとも30%もしくは少なくとも40%、または少なくとも50%もしくは少なくとも60%もしくは少なくとも70%、または少なくとも80%もしくは少なくとも90%低減したFcエフェクター機能を有する、前記本発明のいずれかのポリペプチド。
[本発明1013]
Fcエフェクター機能を誘導しない、前記本発明のいずれかのポリペプチド。
[本発明1014]
Fcエフェクター機能が、補体依存性細胞傷害（CDC）、補体依存性細胞介在性細胞傷害（CDCC）、補体活性化、抗体依存性細胞介在性細胞傷害（ADCC）、抗体依存性細胞介在性貪食（ADCP）、C1q結合、およびFcγR結合の群から選択される、本発明1012〜1013のポリペプチド。
[本発明1015]
抗体、単一特異性抗体、二重特異性抗体、または多重特異性抗体である、前記本発明のいずれかのポリペプチド。
[本発明1016]
Fc領域が、ヒトIgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgE、IgD、IgM、IgAアイソタイプ、または混合アイソタイプである、前記本発明のいずれかのポリペプチド。
[本発明1017]
Fc領域がヒトIgG1アイソタイプである、前記本発明のいずれかのポリペプチド。
[本発明1018]
ヒト抗体、ヒト化抗体、またはキメラ抗体である、前記本発明のいずれかのポリペプチド。
[本発明1019]
抗原結合領域がTNFR-SFのメンバーに結合する、前記本発明のいずれかのポリペプチド。
[本発明1020]
TNFR-SFが細胞内デスドメインを含まないものである、本発明1019のポリペプチド。
[本発明1021]
TNFR-SFのメンバーが、FAS、DR4、DR5、TNFR1、DR6、DR3、EDAR、およびNGFRの群より選択される、本発明1019のポリペプチド。
[本発明1022]
TNFR-SFが、OX40、CD40、CD30、CD27、4-1BB、RANK、TACI、BLySR、BCMA、RELT、およびGITRの群より選択される、本発明1020のポリペプチド。
[本発明1023]
ヒト免疫グロブリンのFc領域と抗原結合領域とを含むポリペプチドのFcエフェクター機能を低減させる方法であって、
該Fc領域が、CH2およびCH3ドメインを含み、
該Fc領域が、EUナンバリングに従うヒトIgG1内の（i）位置E430、E345、またはS440に対応する第1の変異を含み、
該方法が、EUナンバリングに従うヒトIgG1内の（ii）位置K322またはP329に対応する第2の変異を導入する工程を含む、
該方法。
[本発明1024]
第1の変異が、E430G、E345K、E430S、E430F、E430T、E345Q、E345R、E345Y、S440W、およびS440Yからなる群より選択される、本発明1023の方法。
[本発明1025]
第1の変異がE430GまたはE345Kから選択される、本発明1023または1024の方法。
[本発明1026]
第2の変異が、K322E、K322D、K322N、P329H、P329K、P329R、P329D、P329E、P329F、P329G、P329I、P329L、P329M、P329N、P329Q、P329S、P329T、P329V、P329W、P329A、およびP329Yからなる群より選択される、本発明1023〜1025のいずれかの方法。
[本発明1027]
第2の変異が、K322E、P329R、P329K、およびP329Dの群から選択される、本発明1023〜1026のいずれかの方法。
[本発明1028]
Fc領域が1つまたは複数のさらなる変異をCH3ドメイン内に含む、本発明1023〜1027のいずれかの方法。
[本発明1029]
Fc領域が、EUナンバリングに従うヒトIgG1内の位置S440またはK439のうちの1つに対応するCH3ドメイン内にさらなる変異を含む、本発明1028の方法。
[本発明1030]
前記さらなる変異がS440KまたはK439Eから選択される、本発明1029の方法。
[本発明1031]
Fcエフェクター機能が、同じ第1の変異を有するが第2の変異は有しないポリペプチドと同一である親ポリペプチドと比べて少なくとも20%、例えば少なくとも30%もしくは少なくとも40%、または少なくとも50%もしくは少なくとも60%もしくは少なくとも70%、または少なくとも80%もしくは少なくとも90%低減される、本発明1023〜1030のいずれかの方法。
[本発明1032]
Fcエフェクター機能が、補体依存性細胞傷害（CDC）、補体依存性細胞介在性細胞傷害（CDCC）、抗体依存性細胞介在性細胞傷害（ADCC）、抗体依存性細胞介在性貪食（ADCP）、C1q結合、およびFcγR結合の群から選択される、本発明1023または1031のいずれかの方法。
[本発明1033]
ADCCが、第2の変異を含んでいないこと以外は前記抗体と同一である比較抗体と比べて少なくとも20%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも90%、少なくとも100%低減される、本発明1032の方法。
[本発明1034]
本発明1001〜1022のいずれかの少なくとも1種類のポリペプチドを含む、組成物。
[本発明1035]
前記本発明のいずれかの1種または複数種のポリペプチドを含む、本発明1034の組成物。
[本発明1036]
本発明1001〜1022のいずれかで規定したとおりの第1のポリペプチドと第2のポリペプチドとを含む、本発明1034〜1035のいずれかの組成物。
[本発明1037]
第1の抗原結合領域と第1のFc領域とを含む第1のポリペプチド、第2の抗原結合領域と第2のFc領域とを含む第2のポリペプチドまたは抗体を含み、第1および第2のFc領域が、（i）第1の変異、（ii）第2の変異、（iii）さらなる変異を含み、これら変異が、EUナンバリングに従うヒトIgG1内の以下のアミノ酸位置に対応する:
（i）第1の変異E430、E345、またはS440、ただし、S440における変異はS440YまたはS440Wであるものとする;
（ii）E322またはP329における第2の変異;
（iii）K439またはS440におけるさらなる変異、ただし、該さらなる変異がS440に存在するならば、第1の変異はS440に存在しないものとし、第1および第2のFc領域は、さらなる変異を同じアミノ酸位置に含まないものとする、
本発明1036の組成物。
[本発明1038]
第1のポリペプチドおよび第2のポリペプチドが、TNFR1、FAS、DR3、DR4、DR5、DR6、NGFR、およびEDARからなる群より選択される細胞内デスドメインを有する1つまたは複数のTNFR-SFのメンバー上の異なるエピトープに結合する、本発明1036〜1037のいずれかの組成物。
[本発明1039]
第1のポリペプチドおよび第2のポリペプチドが、細胞内デスドメインを有しない1つまたは複数のTNFR-SFのメンバー、例えばOX40、CD40、CD30、CD27、4-1BB、RANK、TACI、BLySR、BCMA、RELT、およびGITR上の異なるエピトープに結合する、本発明1036〜1037のいずれかの組成物。
[本発明1040]
細胞内デスドメインを有しないTNFR-SFの1つのメンバー、例えばOX40、CD40、CD30、CD27、4-1BB、RANK、TACI、BLySR、BCMA、RELT、およびGITRに結合する第1のポリペプチドが、細胞内デスドメインを有しないTNFR-SFの1つのメンバー、例えばOX40、CD40、CD30、CD27、4-1BB、RANK、TACI、BLySR、BCMA、RELT、およびGITRに結合する第2の抗体の結合をブロックしないものである、本発明1036〜1037のいずれかの組成物。
[本発明1041]
第1のポリペプチドと第2のポリペプチドが、組成物中で1:49〜49:1のモル比、例えば1:1のモル比、1:2のモル比、1:3のモル比、1:4のモル比、1:5のモル比、1:6のモル比、1:7のモル比、1:8のモル比、1:9のモル比、1:10のモル比、1:15のモル比、1:20のモル比、1:25のモル比、1:30のモル比、1:35のモル比、1:40のモル比、1:45のモル比、1:50のモル比、50:1のモル比、45:1のモル比、40:1のモル比、35:1のモル比、30:1のモル比 a 25:1のモル比、20:1のモル比、15:1のモル比、10:1のモル比、9:1のモル比、8:1のモル比、7:1のモル比、6:1のモル比、5:1のモル比、4:1のモル比、3:1のモル比、2:1のモル比で存在している、本発明1034〜1040のいずれかの組成物。
[本発明1042]
第1のポリペプチドおよび第2のポリペプチドならびに/または任意のさらなるポリペプチドが、組成物中で等モル比で存在している、本発明1034〜1040のいずれかの組成物。
[本発明1043]
薬学的組成物である、本発明1034〜1042のいずれかの組成物。
[本発明1044]
医薬としての使用のための、本発明1001〜1022のいずれかのポリペプチドまたは本発明1034〜1043のいずれかの組成物。
[本発明1045]
がん、自己免疫疾患、炎症性疾患、または感染性疾患の処置における使用のための、本発明1001〜1022のいずれかのポリペプチドまたは本発明1034〜1044のいずれかの組成物。
[本発明1046]
有効量の前記本発明のいずれかの抗体または組成物を個体に投与する工程を含む、疾患を有する個体を処置する方法。
[本発明1047]
疾患が、がん、自己免疫疾患、炎症性疾患、および感染性疾患の群から選択される、本発明1046の方法。
[本発明1048]
さらなる治療剤をさらに投与する工程を含む、本発明1046〜1047のいずれかの方法。
[本発明1049]
さらなる治療剤が、化学療法薬（非限定的にパクリタキセル、テモゾロミド、シスプラチン、カルボプラチン、オキサリプラチン、イリノテカン、ドキソルビシン、ゲムシタビン、5-フルオロウラシル、ペメトレキセドを含む）、キナーゼ阻害薬（非限定的にソラフェニブ、スニチニブ、もしくはエベロリムスを含む）、アポトーシス調節剤（非限定的に組換えヒトTRAILもしくはビリナパントを含む）、RAS阻害薬、プロテアソーム阻害薬（非限定的にボルテゾミブを含む）、ヒストンデアセチラーゼ阻害薬（非限定的にボリノスタットを含む）、栄養補助食品、サイトカイン（非限定的にIFN-γを含む）、抗体または抗体模倣物（非限定的に抗EGFR、抗IGF-1R、抗VEGF、抗CD20、抗CD38、抗HER2、抗PD-1、抗PD-L1、抗CTLA4、抗CD40、抗CD137、抗GITR抗体および抗体模倣物を含む）、抗体-薬物コンジュゲートからなる群より選択される1種または複数種の抗がん剤である、本発明1048の方法。
[本発明1050]
前記本発明のいずれかのポリペプチドまたは組成物を含むパーツキット（kit of parts）であって、該ポリペプチドまたは組成物が、1つまたは複数の容器内、例えばバイアル内に存在している、該パーツキット。
[本発明1051]
前記本発明のいずれかのポリペプチドまたは組成物が、治療において同時、別々、または逐次の使用のためのものである、本発明1050のパーツキット。
[本発明1052]
疾患の処置のための医薬の製造のための、本発明1001〜1043のいずれかのポリペプチドまたは組成物の使用。
[本発明1053]
疾患が、がん、自己免疫疾患、炎症性疾患、または感染性疾患である、本発明1052の使用。
本発明のこれらおよび他の局面、特に、上記ポリペプチドまたは抗体の種々の使用および治療用途を以下にさらに詳細に説明する。