【手続補正書】
【提出日】令和2年6月29日(2020.6.29)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
（ｉ）配列番号１０、４０、５０、６０、７０、８０、１００、１２０、１３０、１４０、１５０、および１７０から選択されるＨ−ＣＤＲ１、または（ｉ）の８０％またはそれより高く保存された配列相同体、
（ｉｉ）配列番号１１、４１、５１、６１、７１、８１、１０１、１２１、１３１、１４１、１５１、および１７１から選択されるＨ−ＣＤＲ２、または（ｉｉ）の８０％またはそれより高く保存された配列相同体、
（ｉｉｉ）配列番号１２、４２、５２、６２、７２、８２、１０２、１２２、１３２、１４２、１５２、および１７２から選択されるＨ−ＣＤＲ３、または（ｉｉｉ）の８０％またはそれより高く保存された配列相同体、
（ｉｖ）配列番号１５、４５、５５、６５、７５、８５、１０５、１２５、１３５、１４５、１５５、および１７５から選択されるＬ−ＣＤＲ１、または（ｉｖ）の８０％またはそれより高く保存された配列相同体、
（ｖ）配列番号１６、４６、５６、６６、７６、８６、１０６、１２６、１３６、１４６、１５６、および１７６から選択されるＬ−ＣＤＲ２、または（ｖ）の８０％またはそれより高く保存された配列相同体、ならびに
（ｖｉ）配列番号１７、４７、５７、６７、７７、８７、１０７、１２７、１３７、１４７、１５７、および１７７から選択されるＬ−ＣＤＲ３、または（ｖｉ）の８０％またはそれより高く保存された配列相同体
をそれぞれ含む、単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合性断片。
【請求項２】
（ｉ）配列番号１０、４０、５０、６０、７０、８０、１００、１２０、１３０、１４０、１５０、および１７０から選択されるＨ−ＣＤＲ１、または（ｉ）の５個未満のアミノ酸置換を含む保存された配列相同体、
（ｉｉ）配列番号１１、４１、５１、６１、７１、８１、１０１、１２１、１３１、１４１、１５１、および１７１から選択されるＨ−ＣＤＲ２、または（ｉｉ）の５個未満のアミノ酸置換を含む保存された配列相同体、
（ｉｉｉ）配列番号１２、４２、５２、６２、７２、８２、１０２、１２２、１３２、１４２、１５２、および１７２から選択されるＨ−ＣＤＲ３、または（ｉｉｉ）の５個未満のアミノ酸置換を含む保存された配列相同体、
（ｉｖ）配列番号１５、４５、５５、６５、７５、８５、１０５、１２５、１３５、１４５、１５５、および１７５から選択されるＬ−ＣＤＲ１、または（ｉｖ）の５個未満のアミノ酸置換を含む保存された配列相同体、
（ｖ）配列番号１６、４６、５６、６６、７６、８６、１０６、１２６、１３６、１４６、１５６、および１７６から選択されるＬ−ＣＤＲ２、または（ｖ）の５個未満のアミノ酸置換を含む保存された配列相同体、ならびに
（ｖｉ）配列番号１７、４７、５７、６７、７７、８７、１０７、１２７、１３７、１４７、１５７、および１７７から選択されるＬ−ＣＤＲ３、または（ｖｉ）の５個未満のアミノ酸置換を含む保存された配列相同体
をそれぞれ含む、単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合性断片。
【請求項３】
重鎖におけるＡ１００Ｒ、Ｎ３１Ｓ、Ｔ６２Ａのうちの１つもしくは複数、および／または軽鎖におけるＳ５２Ｙから選択される、ＣＤＲにおけるアミノ酸置換をさらに含む、請求項１または２に記載の単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合性断片。
【請求項４】
重鎖におけるＶ５０Ａ、Ｇ５３Ａ、Ｓ３５Ｔのうちの１つもしくは複数、および／または軽鎖におけるＶ３０Ｉ／Ａ、Ｇ９１Ａ、Ｙ９４Ｆのうちの１つもしくは複数から選択される、ＣＤＲにおけるアミノ酸置換をさらに含む、請求項１または２に記載の単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合性断片。
【請求項５】
（ｉ）配列番号１３、２３、３３、４３、５３、６３、７３、８３、１０３、１２３、１３３、１４３、１５３、および１７３から選択される重鎖可変ドメイン、またはその８０％またはそれより高く保存された配列相同体、ならびに
（ｉｉ）配列番号１８、２８、３８、４８、５８、６８、７８、８８、１０８、１２８、１３８、１４８、１５８、および１７８から選択される軽鎖可変ドメイン、またはその８０％またはそれより高く保存された配列相同体
を含む、単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合性断片。
【請求項６】
（ｉ）配列番号１３、２３、３３、４３、５３、６３、７３、８３、１０３、１２３、１３３、１４３、１５３、および１７３から選択される重鎖可変ドメイン、またはその１０個未満のアミノ酸置換を含む保存された配列相同体、ならびに
（ｉｉ）配列番号１８、２８、３８、４８、５８、６８、７８、８８、１０８、１２８、１３８、１４８、１５８、および１７８から選択される軽鎖可変ドメイン、またはその１０個未満のアミノ酸置換を含む保存された配列相同体
を含む、単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合性断片。
【請求項７】
（ｉ）配列番号１３、２３、３３、４３、５３、６３、７３、８３、１０３、１２３、１３３、１４３、１５３、および１７３から選択される重鎖可変ドメイン、またはその８０％またはそれより高く保存された配列相同体であって、さらに、それぞれ、配列番号１０、４０、５０、６０、７０、８０、１００、１２０、１３０、１４０、１５０、および１７０から選択されるＨ−ＣＤＲ１、配列番号１１、４１、５１、６１、７１、８１、１０１、１２１、１３１、１４１、１５１、および１７１から選択されるＨ−ＣＤＲ２、配列番号１２、４２、５２、６２、７２、８２、１０２、１２２、１３２、１４２、１５２、および１７２から選択されるＨ−ＣＤＲ３を含む、重鎖可変ドメイン、ならびに
（ｉｉ）配列番号１８、２８、３８、４８、５８、６８、７８、８８、１０８、１２８、１３８、１４８、１５８、および１７８から選択される軽鎖可変ドメイン、またはその８０％またはそれより高く保存された配列相同体であって、さらに、それぞれ、配列番号１５、４５、５５、６５、７５、８５、１０５、１２５、１３５、１４５、１５５、および１７５から選択されるＬ−ＣＤＲ１、配列番号１６、４６、５６、６６、７６、８６、１０６、１２６、１３６、１４６、１５６、および１７６から選択されるＬ−ＣＤＲ２、ならびに配列番号１７、４７、５７、６７、７７、８７、１０７、１２７、１３７、１４７、１５７、および１７７から選択されるＬ−ＣＤＲ３を含む、軽鎖可変ドメイン
を含む、単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合性断片。
【請求項８】
（ｉ）配列番号１３、２３、３３、４３、５３、６３、７３、８３、１０３、１２３、１３３、１４３、１５３、および１７３から選択される重鎖可変ドメイン、またはその１０個未満のアミノ酸置換を含む保存された配列相同体であって、さらに、それぞれ、配列番号１０、４０、５０、６０、７０、８０、１００、１２０、１３０、１４０、１５０、および１７０から選択されるＨ−ＣＤＲ１、配列番号１１、４１、５１、６１、７１、８１、１０１、１２１、１３１、１４１、１５１、および１７１から選択されるＨ−ＣＤＲ２、配列番号１２、４２、５２、６２、７２、８２、１０２、１２２、１３２、１４２、１５２、および１７２から選択されるＨ−ＣＤＲ３を含む、重鎖可変ドメイン、ならびに
（ｉｉ）配列番号１８、２８、３８、４８、５８、６８、７８、８８、１０８、１２８、１３８、１４８、１５８、および１７８から選択される軽鎖可変ドメイン、またはその１０個未満のアミノ酸置換を含む保存された配列相同体であって、さらに、それぞれ、配列番号１５、４５、５５、６５、７５、８５、１０５、１２５、１３５、１４５、１５５、および１７５から選択されるＬ−ＣＤＲ１、配列番号１６、４６、５６、６６、７６、８６、１０６、１２６、１３６、１４６、１５６、および１７６から選択されるＬ−ＣＤＲ２、ならびに配列番号１７、４７、５７、６７、７７、８７、１０７、１２７、１３７、１４７、１５７、および１７７から選択されるＬ−ＣＤＲ３を含む、軽鎖可変ドメインを含む、単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合性断片。
【請求項９】
（ｉ）配列番号１３、２３、３３、４３、５３、６３、７３、８３、１０３、１２３、１３３、１４３、１５３、および１７３から選択される重鎖可変ドメイン、ならびに
（ｉｉ）配列番号１８、２８、３８、４８、５８、６８、７８、８８、１０８、１２８、１３８、１４８、１５８、および１７８から選択される軽鎖可変ドメイン、またはその１０個未満のアミノ酸置換を含む保存された配列相同体であって、さらに、それぞれ、配列番号１５、４５、５５、６５、７５、８５、１０５、１２５、１３５、１４５、１５５、および１７５から選択されるＬ−ＣＤＲ１、配列番号１６、４６、５６、６６、７６、８６、１０６、１２６、１３６、１４６、１５６、および１７６から選択されるＬ−ＣＤＲ２、ならびに配列番号１７、４７、５７、６７、７７、８７、１０７、１２７、１３７、１４７、１５７、および１７７から選択されるＬ−ＣＤＲ３を含む、軽鎖可変ドメイン
を含む、単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合性断片。
【請求項１０】
（ｉ）配列番号１３、２３、３３、４３、５３、６３、７３、８３、１０３、１２３、１３３、１４３、１５３、および１７３から選択される重鎖可変ドメイン、またはその１０個未満のアミノ酸置換を含む保存された配列相同体であって、さらに、それぞれ、配列番号１０、４０、５０、６０、７０、８０、１００、１２０、１３０、１４０、１５０、および１７０から選択されるＨ−ＣＤＲ１、配列番号１１、４１、５１、６１、７１、８１、１０１、１２１、１３１、１４１、１５１、および１７１から選択されるＨ−ＣＤＲ２、配列番号１２、４２、５２、６２、７２、８２、１０２、１２２、１３２、１４２、１５２、および１７２から選択されるＨ−ＣＤＲ３を含む、重鎖可変ドメイン、ならびに
（ｉｉ）配列番号１８、２８、３８、４８、５８、６８、７８、８８、１０８、１２８、１３８、１４８、１５８、および１７８から選択される軽鎖可変ドメイン
を含む、単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合性断片。
【請求項１１】
表２Ａ〜２Ｄにおいてそれぞれのバリアントで記載された、それぞれの対応するＶＨ、ＶＬ、ならびにそれぞれのＨ−ＣＤＲおよびＬ−ＣＤＲを含む、単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合性断片。
【請求項１２】
前記抗体または抗原結合性断片が、
ａ）キメラ抗体もしくはその断片であるか、または
ｂ）ヒト化抗体もしくはその断片であるか、または
ｃ）ヒト抗体もしくはその断片であるか、または
ｄ）Ｆａｂ、Ｆａｂ’、Ｆｖ、ｓｃＦｖ、ｄｓＦｖ、Ｆ（ａｂ）２、Ｆｄ、およびダイアボディからなる群から選択される抗原結合性断片である、請求項１から１１のいずれか一項に記載の単離された抗体または抗原結合性断片。
【請求項１３】
前記抗体が、ＩｇＧである、請求項１から１２のいずれか一項に記載の単離された抗体または抗原結合性断片。
【請求項１４】
前記抗体が結合する標的または前記結合性断片の標的が、構造Ｎｅｕ５Ａｃα２→３Ｇａｌβ１→３ＧａｌＮＡｃβ１→３Ｇａｌα１→４Ｇａｌβ１→４Ｇｌｃβ１を有する炭水化物抗原ＳＳＥＡ４である、請求項１から１３のいずれか一項に記載の単離された抗体またはその抗原結合性断片。
【請求項１５】
前記抗体が、標的細胞に結合すると、ＣＤＣおよび／またはＡＤＣＣ誘導活性を有する、請求項１から１４のいずれか一項に記載の単離された抗体または抗原結合性断片。
【請求項１６】
請求項１から１４のいずれか一項に記載の単離された抗体またはその抗原結合性断片と、薬学的に許容される担体とを含む、医薬組成物。
【請求項１７】
１つまたは複数の治療剤をさらに含む、請求項１６に記載の医薬組成物。
【請求項１８】
前記治療剤が、治療用抗体、化学療法剤、またはサイトカインから選択される、請求項１７に記載の医薬組成物。
【請求項１９】
請求項１から１４のいずれか一項に記載の抗体と、細胞毒性剤とを含む、イムノコンジュゲート。
【請求項２０】
式ＡＢ−（Ｌ−Ｄ）ｐを有し、式中、
（ａ）ＡＢが、請求項１から１４のいずれか一項に記載の抗体であり、
（ｂ）Ｌが、リンカーであり、
（ｃ）Ｄが、好適な細胞毒性薬物であり、
（ｄ）ｐが、１から８の範囲である、請求項１９に記載のイムノコンジュゲート。
【請求項２１】
前記薬物が、ＭＭＡＥまたはＭＭＡＦである、請求項２０に記載のイムノコンジュゲート（ＡＤＣ）。
【請求項２２】
前記リンカーが、切断可能なリンカーである、請求項２０に記載のイムノコンジュゲート。
【請求項２３】
前記切断可能なリンカーが、アルコキシアミン切断性リンカーである、請求項２２に記載のＡＤＣ。
【請求項２４】
請求項１９〜２３のいずれか一項に記載のイムノコンジュゲートと、薬学的に許容される担体とを含む、医薬製剤。
【請求項２５】
追加の治療剤をさらに含む、請求項２４に記載の医薬製剤。
【請求項２６】
請求項１から１４のいずれか一項に記載の抗体をコードする、単離された核酸（ｃＤＮＡ）。
【請求項２７】
請求項２６に記載の核酸を含む、宿主細胞。
【請求項２８】
抗体を産生する方法であって、前記抗体が産生されるように、請求項２７に記載の宿主細胞を培養することを含む、方法。
【請求項２９】
（ａ）配列番号１５、４５、５５、６５、７５、８５、１０５、１２５、１３５、１４５、１５５、および１７５から選択されるＬ−ＣＤＲ１、ならびに配列番号１６、４６、５６、６６、７６、８６、１０６、１２６、１３６、１４６、１５６、および１７６から選択されるＬ−ＣＤＲ２、ならびに配列番号１７、４７、５７、６７、７７、８７、１０７、１２７、１３７、１４７、１５７、および１７７から選択されるＬ−ＣＤＲ３、またはそれぞれのＬ−ＣＤＲの５個またはそれより少ない保存されたアミノ酸置換を有する保存された配列相同体の配列を有する、３つのＶＬドメインＣＤＲをコードする、核酸を提供するステップと、
（ｂ）配列番号１０、４０、５０、６０、７０、８０、１００、１２０、１３０、１４０、１５０、および１７０から選択されるＨ−ＣＤＲ１、配列番号１１、４１、５１、６１、７１、８１、１０１、１２１、１３１、１４１、１５１、および１７１から選択されるＨ−ＣＤＲ２、配列番号１２、４２、５２、６２、７２、８２、１０２、１２２、１３２、１４２、１５２、および１７２から選択されるＨ−ＣＤＲ３、またはそれぞれのＨ−ＣＤＲの５個またはそれより少ない保存されたアミノ酸置換を有する保存された配列相同体の配列を有する、３つのＶＨドメインＣＤＲをコードする核酸のレパートリーを、
前記３つのＶＬドメインＣＤＲをコードする前記核酸と組み合わせて、前記３つのＶＬドメインＣＤＲをコードする核酸および前記３つのＶＨドメインＣＤＲのレパートリーの産生物レパートリーを提供するステップと、
（ｃ）前記産生物レパートリーの核酸を発現させるステップと、
（ｄ）ＳＳＥＡ４に特異的に結合し、前記産生物レパートリーの前記核酸から発現される、可変ドメインを含む、抗原結合性断片を選択するステップと、
（ｅ）前記抗原結合性断片を含む抗体を産生するステップと
によって産生される、抗体。
【請求項３０】
ＳＳＥＡ４陽性がんを有する対象を処置するための、請求項１６〜１８のいずれか一項に記載の医薬組成物または請求項２４もしくは２５に記載の医薬製剤。
【請求項３１】
前記ＳＳＥＡ４陽性がんが、脳、肺、乳房、口腔、食道、胃、肝臓、胆管、膵臓、結腸、腎臓、子宮頸、卵巣、および／または前立腺のがんである、請求項３０に記載の医薬組成物または医薬製剤。
【請求項３２】
前記処置が１つまたは複数の追加の治療モダリティまたは薬剤を組み合わせて、個体に投与することをさらに含む、請求項３０に記載の医薬組成物または医薬製剤。
【請求項３３】
組み合わされた処置モダリティが、治療用抗体、細胞療法、放射線、サイトカイン、および／または化学療法剤である、請求項３２に記載の医薬組成物または医薬製剤。
【請求項３４】
ＳＳＥＡ４陽性細胞の増殖を阻害するための請求項１６〜１８のいずれか一項に記載の医薬組成物または請求項２４もしくは２５に記載の医薬製剤であって、前記医薬組成物または医薬製剤は、前記細胞に、前記抗体／断片／ＡＤＣが、炭水化物抗原を発現する前記細胞の表面上のＳＳＥＡ４に結合するのを許容する条件下において曝露され、それによって前記細胞の増殖を阻害する、医薬組成物または医薬製剤。
【請求項３５】
ＳＳＥＡ４陽性がんを有する対象を処置するための請求項１６〜１８のいずれか一項に記載の医薬組成物または請求項２４もしくは２５に記載の医薬製剤であって、前記ＳＳＥＡ４陽性がんが、第１の治療剤に対して耐性である、医薬組成物または医薬製剤。
【請求項３６】
前記ＳＳＥＡ４陽性がんが、脳、肺、乳房、口腔、食道、胃、肝臓、胆管、膵臓、結腸、腎臓、子宮頸、卵巣、および／または前立腺のがんである、請求項３５に記載の医薬組成物または医薬製剤。
【請求項３７】
前記第１の治療剤が、ＳＳＥＡ４以外の抗原に結合する第１の抗体／結合性断片／ＡＤＣ、および／または放射線、および／または化学療法剤を含む、請求項３５に記載の医薬組成物または医薬製剤。
【請求項３８】
生物学的試料においてＳＳＥＡ４を検出する方法であって、前記生物学的試料を、請求項１から１４のいずれか一項に記載の抗ＳＳＥＡ４抗体と、前記抗ＳＳＥＡ４抗体が、天然に存在するＳＳＥＡ４に結合するのを許容する条件下において接触させることと、前記生物学的試料において、前記抗ＳＳＥＡ４抗体と天然に存在するＳＳＥＡ４との間で複合体が形成されるかどうかを検出することとを含む、方法。
【請求項３９】
前記生物学的試料が、がん試料である、請求項３８に記載の方法。
【請求項４０】
ＳＳＥＡ４陽性がんを検出するための、請求項１から１４のいずれか一項に記載の抗ＳＳＥＡ４抗体を含む医薬組成物であって、前記検出は（ｉ）標識した抗ＳＳＥＡ４抗体を、炭水化物抗原を発現する腫瘍を有するかまたはそれを有する疑いのある対象に投与するステップと、（ｉｉ）前記対象において、前記標識した抗ＳＳＥＡ４抗体を検出するステップであって、前記標識した抗ＳＳＥＡ４抗体の検出が、前記対象におけるＳＳＥＡ４陽性がんを示す、ステップとを含む、医薬組成物。
【請求項４１】
ＳＳＥＡ４陽性がんを検出するための方法であって、（ｉ）標識した抗ＳＳＥＡ４抗体を、炭水化物抗原を発現する腫瘍を有するかまたはそれを有する疑いのある対象に由来する試料と接触させるステップであって、前記標識した抗ＳＳＥＡ４抗体が、請求項１から１４のいずれか一項に記載の抗ＳＳＥＡ４抗体を含む、ステップと、（ｉｉ）前記試料において、前記標識した抗ＳＳＥＡ４抗体を検出するステップであって、前記標識した抗ＳＳＥＡ４抗体の検出が、前記試料におけるＳＳＥＡ４陽性がんを示す、ステップとを含む、方法。
【請求項４２】
１０−７Ｍより低い親和性定数で、ＳＳＥＡ４に特異的に結合する、請求項１から１４のいずれか一項に記載の単離された抗体。
【請求項４３】
ＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３、またはＩｇＧ４である、請求項１から１４のいずれか一項に記載の単離された抗体。
【請求項４４】
ＩｇＧ１λまたはＩｇＧ１κである、請求項１から１４のいずれか一項に記載の単離された抗体。
【請求項４５】
前記モノクローナル抗体またはその抗原結合性部分が、１×１０−７Ｍまたはそれより低いＫＤで、ＳＳＥＡ４に結合し、前記ＫＤが、表面プラズモン共鳴（Ｂｉａｃｏｒｅ）分析によって測定される、請求項１から１４のいずれか一項に記載のモノクローナル抗体またはその抗原結合性部分。
【請求項４６】
結合親和性が、５０ｎＭより低い、請求項４５に記載の単離された抗ＳＳＥＡ４抗体またはその結合性断片。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０３３４
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０３３４】
別途定義されない限り、本明細書に使用されるすべての技術用語および科学用語は、本発明が属する技術分野の当業者によって広く理解されているものと同じ意味を有する。いずれの公知の方法、デバイス、および材料も、本発明の実施または試験において使用することができるが、これに関する方法、デバイス、および材料が、本明細書において記載されている。
本発明は、例えば、以下の項目を提供する。
(項目１)
（ｉ）配列番号１０、４０、５０、６０、７０、８０、１００、１２０、１３０、１４０、１５０、および１７０から選択されるＨ−ＣＤＲ１、または（ｉ）の８０％またはそれより高く保存された配列相同体、
（ｉｉ）配列番号１１、４１、５１、６１、７１、８１、１０１、１２１、１３１、１４１、１５１、および１７１から選択されるＨ−ＣＤＲ２、または（ｉｉ）の８０％またはそれより高く保存された配列相同体、
（ｉｉｉ）配列番号１２、４２、５２、６２、７２、８２、１０２、１２２、１３２、１４２、１５２、および１７２から選択されるＨ−ＣＤＲ３、または（ｉｉｉ）の８０％またはそれより高く保存された配列相同体、
（ｉｖ）配列番号１５、４５、５５、６５、７５、８５、１０５、１２５、１３５、１４５、１５５、および１７５から選択されるＬ−ＣＤＲ１、または（ｉｖ）の８０％またはそれより高く保存された配列相同体、
（ｖ）配列番号１６、４６、５６、６６、７６、８６、１０６、１２６、１３６、１４６、１５６、および１７６から選択されるＬ−ＣＤＲ２、または（ｖ）の８０％またはそれより高く保存された配列相同体、ならびに
（ｖｉ）配列番号１７、４７、５７、６７、７７、８７、１０７、１２７、１３７、１４７、１５７、および１７７から選択されるＬ−ＣＤＲ３、または（ｖｉ）の８０％またはそれより高く保存された配列相同体
をそれぞれ含む、単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合性断片。
(項目２)
（ｉ）配列番号１０、４０、５０、６０、７０、８０、１００、１２０、１３０、１４０、１５０、および１７０から選択されるＨ−ＣＤＲ１、または（ｉ）の５個未満のアミノ酸置換を含む保存された配列相同体、
（ｉｉ）配列番号１１、４１、５１、６１、７１、８１、１０１、１２１、１３１、１４１、１５１、および１７１から選択されるＨ−ＣＤＲ２、または（ｉｉ）の５個未満のアミノ酸置換を含む保存された配列相同体、
（ｉｉｉ）配列番号１２、４２、５２、６２、７２、８２、１０２、１２２、１３２、１４２、１５２、および１７２から選択されるＨ−ＣＤＲ３、または（ｉｉｉ）の５個未満のアミノ酸置換を含む保存された配列相同体、
（ｉｖ）配列番号１５、４５、５５、６５、７５、８５、１０５、１２５、１３５、１４５、１５５、および１７５から選択されるＬ−ＣＤＲ１、または（ｉｖ）の５個未満のアミノ酸置換を含む保存された配列相同体、
（ｖ）配列番号１６、４６、５６、６６、７６、８６、１０６、１２６、１３６、１４６、１５６、および１７６から選択されるＬ−ＣＤＲ２、または（ｖ）の５個未満のアミノ酸置換を含む保存された配列相同体、ならびに
（ｖｉ）配列番号１７、４７、５７、６７、７７、８７、１０７、１２７、１３７、１４７、１５７、および１７７から選択されるＬ−ＣＤＲ３、または（ｖｉ）の５個未満のアミノ酸置換を含む保存された配列相同体
をそれぞれ含む、単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合性断片。
(項目３)
重鎖におけるＡ１００Ｒ、Ｎ３１Ｓ、Ｔ６２Ａのうちの１つもしくは複数、および／または軽鎖におけるＳ５２Ｙから選択される、ＣＤＲにおけるアミノ酸置換をさらに含む、項目１または２に記載の単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合性断片。
(項目４)
重鎖におけるＶ５０Ａ、Ｇ５３Ａ、Ｓ３５Ｔのうちの１つもしくは複数、および／または軽鎖におけるＶ３０Ｉ／Ａ、Ｇ９１Ａ、Ｙ９４Ｆのうちの１つもしくは複数から選択される、ＣＤＲにおけるアミノ酸置換をさらに含む、項目１または２に記載の単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合性断片。
(項目５)
（ｉ）配列番号１３、２３、３３、４３、５３、６３、７３、８３、１０３、１２３、１３３、１４３、１５３、および１７３から選択される重鎖可変ドメイン、またはその８０％またはそれより高く保存された配列相同体、ならびに
（ｉｉ）配列番号１８、２８、３８、４８、５８、６８、７８、８８、１０８、１２８、１３８、１４８、１５８、および１７８から選択される軽鎖可変ドメイン、またはその８０％またはそれより高く保存された配列相同体
を含む、単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合性断片。
(項目６)
（ｉ）配列番号１３、２３、３３、４３、５３、６３、７３、８３、１０３、１２３、１３３、１４３、１５３、および１７３から選択される重鎖可変ドメイン、またはその１０個未満のアミノ酸置換を含む保存された配列相同体、ならびに
（ｉｉ）配列番号１８、２８、３８、４８、５８、６８、７８、８８、１０８、１２８、１３８、１４８、１５８、および１７８から選択される軽鎖可変ドメイン、またはその１０個未満のアミノ酸置換を含む保存された配列相同体
を含む、単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合性断片。
(項目７)
（ｉ）配列番号１３、２３、３３、４３、５３、６３、７３、８３、１０３、１２３、１３３、１４３、１５３、および１７３から選択される重鎖可変ドメイン、またはその８０％またはそれより高く保存された配列相同体であって、さらに、それぞれ、配列番号１０、４０、５０、６０、７０、８０、１００、１２０、１３０、１４０、１５０、および１７０から選択されるＨ−ＣＤＲ１、配列番号１１、４１、５１、６１、７１、８１、１０１、１２１、１３１、１４１、１５１、および１７１から選択されるＨ−ＣＤＲ２、配列番号１２、４２、５２、６２、７２、８２、１０２、１２２、１３２、１４２、１５２、および１７２から選択されるＨ−ＣＤＲ３を含む、重鎖可変ドメイン、ならびに
（ｉｉ）配列番号１８、２８、３８、４８、５８、６８、７８、８８、１０８、１２８、１３８、１４８、１５８、および１７８から選択される軽鎖可変ドメイン、またはその８０％またはそれより高く保存された配列相同体であって、さらに、それぞれ、配列番号１５、４５、５５、６５、７５、８５、１０５、１２５、１３５、１４５、１５５、および１７５から選択されるＬ−ＣＤＲ１、配列番号１６、４６、５６、６６、７６、８６、１０６、１２６、１３６、１４６、１５６、および１７６から選択されるＬ−ＣＤＲ２、ならびに配列番号１７、４７、５７、６７、７７、８７、１０７、１２７、１３７、１４７、１５７、および１７７から選択されるＬ−ＣＤＲ３を含む、軽鎖可変ドメイン
を含む、単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合性断片。
(項目８)
（ｉ）配列番号１３、２３、３３、４３、５３、６３、７３、８３、１０３、１２３、１３３、１４３、１５３、および１７３から選択される重鎖可変ドメイン、またはその１０個未満のアミノ酸置換を含む保存された配列相同体であって、さらに、それぞれ、配列番号１０、４０、５０、６０、７０、８０、１００、１２０、１３０、１４０、１５０、および１７０から選択されるＨ−ＣＤＲ１、配列番号１１、４１、５１、６１、７１、８１、１０１、１２１、１３１、１４１、１５１、および１７１から選択されるＨ−ＣＤＲ２、配列番号１２、４２、５２、６２、７２、８２、１０２、１２２、１３２、１４２、１５２、および１７２から選択されるＨ−ＣＤＲ３を含む、重鎖可変ドメイン、ならびに
（ｉｉ）配列番号１８、２８、３８、４８、５８、６８、７８、８８、１０８、１２８、１３８、１４８、１５８、および１７８から選択される軽鎖可変ドメイン、またはその１０個未満のアミノ酸置換を含む保存された配列相同体であって、さらに、それぞれ、配列番号１５、４５、５５、６５、７５、８５、１０５、１２５、１３５、１４５、１５５、および１７５から選択されるＬ−ＣＤＲ１、配列番号１６、４６、５６、６６、７６、８６、１０６、１２６、１３６、１４６、１５６、および１７６から選択されるＬ−ＣＤＲ２、ならびに配列番号１７、４７、５７、６７、７７、８７、１０７、１２７、１３７、１４７、１５７、および１７７から選択されるＬ−ＣＤＲ３を含む、軽鎖可変ドメインを含む、単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合性断片。
(項目９)
（ｉ）配列番号１３、２３、３３、４３、５３、６３、７３、８３、１０３、１２３、１３３、１４３、１５３、および１７３から選択される重鎖可変ドメイン、ならびに
（ｉｉ）配列番号１８、２８、３８、４８、５８、６８、７８、８８、１０８、１２８、１３８、１４８、１５８、および１７８から選択される軽鎖可変ドメイン、またはその１０個未満のアミノ酸置換を含む保存された配列相同体であって、さらに、それぞれ、配列番号１５、４５、５５、６５、７５、８５、１０５、１２５、１３５、１４５、１５５、および１７５から選択されるＬ−ＣＤＲ１、配列番号１６、４６、５６、６６、７６、８６、１０６、１２６、１３６、１４６、１５６、および１７６から選択されるＬ−ＣＤＲ２、ならびに配列番号１７、４７、５７、６７、７７、８７、１０７、１２７、１３７、１４７、１５７、および１７７から選択されるＬ−ＣＤＲ３を含む、軽鎖可変ドメインをさらに含む、単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合性断片。
(項目１０)
（ｉ）配列番号１３、２３、３３、４３、５３、６３、７３、８３、１０３、１２３、１３３、１４３、１５３、および１７３から選択される重鎖可変ドメイン、またはその１０個未満のアミノ酸置換を含む保存された配列相同体であって、さらに、それぞれ、配列番号１０、４０、５０、６０、７０、８０、１００、１２０、１３０、１４０、１５０、および１７０から選択されるＨ−ＣＤＲ１、配列番号１１、４１、５１、６１、７１、８１、１０１、１２１、１３１、１４１、１５１、および１７１から選択されるＨ−ＣＤＲ２、配列番号１２、４２、５２、６２、７２、８２、１０２、１２２、１３２、１４２、１５２、および１７２から選択されるＨ−ＣＤＲ３を含む、重鎖可変ドメイン、ならびに
（ｉｉ）配列番号１８、２８、３８、４８、５８、６８、７８、８８、１０８、１２８、１３８、１４８、１５８、および１７８から選択される軽鎖可変ドメイン
をさらに含む、単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合性断片。
(項目１１)
表２Ａ〜２Ｄにおいてそれぞれのバリアントで記載された、それぞれの対応するＶＨ、ＶＬ、ならびにそれぞれのＨ−ＣＤＲおよびＬ−ＣＤＲを含む、単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合性断片。
(項目１２)
前記抗体または抗原結合性断片が、
ａ）キメラ抗体もしくはその断片であるか、または
ｂ）ヒト化抗体もしくはその断片であるか、または
ｃ）ヒト抗体もしくはその断片であるか、または
ｄ）Ｆａｂ、Ｆａｂ’、Ｆｖ、ｓｃＦｖ、ｄｓＦｖ、Ｆ（ａｂ）２、Ｆｄ、およびダイアボディからなる群から選択される抗原結合性断片である、項目１から１１のいずれか一項に記載の単離された抗体または抗原結合性断片。
(項目１３)
前記抗体が、ＩｇＧである、項目１から１２のいずれか一項に記載の単離された抗体または抗原結合性断片。
(項目１４)
前記抗体が結合する標的または前記結合性断片の標的が、構造Ｎｅｕ５Ａｃα２→３Ｇａｌβ１→３ＧａｌＮＡｃβ１→３Ｇａｌα１→４Ｇａｌβ１→４Ｇｌｃβ１を有する炭水化物抗原ＳＳＥＡ４である、項目１から１３のいずれか一項に記載の単離された抗体またはその抗原結合性断片。
(項目１５)
前記抗体が、標的細胞に結合すると、ＣＤＣおよび／またはＡＤＣＣ誘導活性を有する、項目１から１４のいずれか一項に記載の単離された抗体または抗原結合性断片。
(項目１６)
項目１から１４のいずれか一項に記載の単離された抗体またはその抗原結合性断片と、薬学的に許容される担体とを含む、医薬組成物。
(項目１７)
１つまたは複数の治療剤をさらに含む、項目１６に記載の医薬組成物。
(項目１８)
前記治療剤が、治療用抗体、化学療法剤、またはサイトカインから選択される、項目１７に記載の医薬組成物。
(項目１９)
項目１から１４のいずれか一項に記載の抗体と、細胞毒性剤とを含む、イムノコンジュゲート。
(項目２０)
式ＡＢ−（Ｌ−Ｄ）ｐを有し、式中、
（ａ）ＡＢが、項目１から１４のいずれか一項に記載の抗体であり、
（ｂ）Ｌが、リンカーであり、
（ｃ）Ｄが、好適な細胞毒性薬物であり、
（ｄ）ｐが、１から８の範囲である、項目１９に記載のイムノコンジュゲート。
(項目２１)
前記薬物が、ＭＭＡＥまたはＭＭＡＦである、項目２０に記載のイムノコンジュゲート（ＡＤＣ）。
(項目２２)
前記リンカーが、切断可能なリンカーである、項目２０に記載のイムノコンジュゲート。
(項目２３)
前記切断可能なリンカーが、アルコキシアミン切断性リンカーである、項目２２に記載のＡＤＣ。
(項目２４)
項目に記載のイムノコンジュゲートと、薬学的に許容される担体とを含む、医薬製剤。
(項目２５)
追加の治療剤をさらに含む、項目２４に記載の医薬製剤。
(項目２６)
項目１から１４のいずれか一項に記載の抗体をコードする、単離された核酸（ｃＤＮＡ）。
(項目２７)
項目２６に記載の核酸を含む、宿主細胞。
(項目２８)
抗体を産生する方法であって、前記抗体が産生されるように、項目２７に記載の宿主細胞を培養することを含む、方法。
(項目２９)
（ａ）配列番号１５、４５、５５、６５、７５、８５、１０５、１２５、１３５、１４５、１５５、および１７５から選択されるＬ−ＣＤＲ１、ならびに配列番号１６、４６、５６、６６、７６、８６、１０６、１２６、１３６、１４６、１５６、および１７６から選択されるＬ−ＣＤＲ２、ならびに配列番号１７、４７、５７、６７、７７、８７、１０７、１２７、１３７、１４７、１５７、および１７７から選択されるＬ−ＣＤＲ３、またはそれぞれのＬ−ＣＤＲの５個またはそれより少ない保存されたアミノ酸置換を有する保存された配列相同体の配列を有する、３つのＶＬドメインＣＤＲをコードする、核酸を提供するステップと、
（ｂ）配列番号１０、４０、５０、６０、７０、８０、１００、１２０、１３０、１４０、１５０、および１７０から選択されるＨ−ＣＤＲ１、配列番号１１、４１、５１、６１、７１、８１、１０１、１２１、１３１、１４１、１５１、および１７１から選択されるＨ−ＣＤＲ２、配列番号１２、４２、５２、６２、７２、８２、１０２、１２２、１３２、１４２、１５２、および１７２から選択されるＨ−ＣＤＲ３、またはそれぞれのＨ−ＣＤＲの５個またはそれより少ない保存されたアミノ酸置換を有する保存された配列相同体の配列を有する、３つのＶＨドメインＣＤＲをコードする核酸のレパートリーを、
前記３つのＶＬドメインＣＤＲをコードする前記核酸と組み合わせて、前記３つのＶＬドメインＣＤＲをコードする核酸および前記３つのＶＨドメインＣＤＲのレパートリーの産生物レパートリーを提供するステップと、
（ｃ）前記産生物レパートリーの核酸を発現させるステップと、
（ｄ）ＳＳＥＡ４に特異的に結合し、前記産生物レパートリーの前記核酸から発現される、可変ドメインを含む、抗原結合性断片を選択するステップと、
（ｅ）前記抗原結合性断片を含む抗体を産生するステップと
によって産生される、抗体。
(項目３０)
ＳＳＥＡ４陽性がんを有する対象を処置する方法であって、それを必要とする前記対象に、有効量の、項目１６、１７、１８、２４、および２５のいずれか一項に記載の医薬組成物を投与することを含む、方法。
(項目３１)
前記ＳＳＥＡ４陽性がんが、脳、肺、乳房、口腔、食道、胃、肝臓、胆管、膵臓、結腸、腎臓、子宮頸、卵巣、および前立腺のがんから選択される、項目３０に記載の方法。
(項目３２)
１つまたは複数の追加の治療モダリティまたは薬剤を組み合わせて、個体に投与することをさらに含む、項目３０に記載の方法。
(項目３３)
組み合わされた処置モダリティが、治療用抗体、細胞療法、放射線、サイトカイン、または化学療法剤から選択される、項目３２に記載の方法。
(項目３４)
ＳＳＥＡ４陽性細胞の増殖を阻害する方法であって、前記細胞を、項目１６、１７、１８、２４、および２５のいずれか一項に記載の医薬製剤に、前記抗体／断片／ＡＤＣが、炭水化物抗原を発現する前記細胞の表面上のＳＳＥＡ４に結合するのを許容する条件下において曝露し、それによって前記細胞の増殖を阻害することを含む、方法。
(項目３５)
ＳＳＥＡ４陽性がんを有する対象を処置する方法であって、前記ＳＳＥＡ４陽性がんが、第１の治療剤に対して耐性であり、前記方法が、個体に、有効量の、項目１６、１７、１８、２４、および２５のいずれか一項に記載の医薬製剤を投与することを含む、方法。
(項目３６)
前記ＳＳＥＡ４陽性がんが、脳、肺、乳房、口腔、食道、胃、肝臓、胆管、膵臓、結腸、腎臓、子宮頸、卵巣、および／または前立腺のがんである、項目３５に記載の方法。
(項目３７)
前記第１の治療剤が、ＳＳＥＡ４以外の抗原に結合する第１の抗体／結合性断片／ＡＤＣ、および／または放射線、および／または化学療法剤を含む、項目３５に記載の方法。
(項目３８)
生物学的試料においてＳＳＥＡ４を検出する方法であって、前記生物学的試料を、項目１から１４のいずれか一項に記載の抗ＳＳＥＡ４抗体と、前記抗ＳＳＥＡ４抗体が、天然に存在するＳＳＥＡ４に結合するのを許容する条件下において接触させることと、前記生物学的試料において、前記抗ＳＳＥＡ４抗体と天然に存在するＳＳＥＡ４との間で複合体が形成されるかどうかを検出することとを含む、方法。
(項目３９)
前記生物学的試料が、がん試料である、項目３８に記載の方法。
(項目４０)
ＳＳＥＡ４陽性がんを検出するための方法であって、（ｉ）標識した抗ＳＳＥＡ４抗体を、炭水化物抗原を発現する腫瘍を有するかまたはそれを有する疑いのある対象に投与するステップであって、前記標識した抗ＳＳＥＡ４抗体が、項目１から１４のいずれか一項に記載の抗ＳＳＥＡ４抗体を含む、ステップと、（ｉｉ）前記対象において、前記標識した抗ＳＳＥＡ４抗体を検出するステップであって、前記標識した抗ＳＳＥＡ４抗体の検出が、前記対象におけるＳＳＥＡ４陽性がんを示す、ステップとを含む、方法。
(項目４１)
ＳＳＥＡ４陽性がんを検出するための方法であって、（ｉ）標識した抗ＳＳＥＡ４抗体を、炭水化物抗原を発現する腫瘍を有するかまたはそれを有する疑いのある対象に由来する試料と接触させるステップであって、前記標識した抗ＳＳＥＡ４抗体が、項目１から１４のいずれか一項に記載の抗ＳＳＥＡ４抗体を含む、ステップと、（ｉｉ）前記試料において、前記標識した抗ＳＳＥＡ４抗体を検出するステップであって、前記標識した抗ＳＳＥＡ４抗体の検出が、前記試料におけるＳＳＥＡ４陽性がんを示す、ステップとを含む、方法。
(項目４２)
１０−７Ｍより低い親和性定数で、ＳＳＥＡ４に特異的に結合する、項目１から１４のいずれか一項に記載の単離された抗体。
(項目４３)
ＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３、またはＩｇＧ４である、項目１から１４のいずれか一項に記載の単離された抗体。
(項目４４)
ＩｇＧ１λまたはＩｇＧ１κである、項目１から１４のいずれか一項に記載の単離された抗体。
(項目４５)
前記モノクローナル抗体またはその抗原結合性部分が、１×１０−７Ｍまたはそれより低いＫＤで、ＳＳＥＡ４に結合し、前記ＫＤが、表面プラズモン共鳴（Ｂｉａｃｏｒｅ）分析によって測定される、項目１から１４のいずれか一項に記載のモノクローナル抗体またはその抗原結合性部分。
(項目４６)
結合親和性が、５０ｎＭより低い、項目４５に記載の単離された抗ＳＳＥＡ４抗体またはその結合性断片。