【手続補正書】
【提出日】令和2年6月8日(2020.6.8)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
１つ以上のフラビウイルスに対して、個体にワクチン接種する際に使用するためのフラビウイルスエンベロープ二量体エピトープ（ＥＤＥ）であって、
前記ＥＤＥが、安定化組換えフラビウイルスであり、
前記二量体が、
ａ）前記２つのｓＥ単量体間で少なくとも１つのジスルフィド鎖間結合で共有結合的に安定化される、ならびに／または
ｂ）各単量体の二量体界面またはドメインＩ（ＤＩ）／ドメインＩＩＩ（ＤＩＩＩ）リンカーにおいて、少なくとも１つのｓＥ単量体のアミノ酸配列中の少なくとも１つのアミノ酸残基を、少なくとも１つのかさ高い側鎖アミノ酸で置換することによって非共有結合的に安定化される、ならびに／または
ｃ）前記２つのｓＥ単量体間で少なくとも１つのスルフヒドリル反応性架橋剤で共有結合的に安定化される、ならびに／または、
ｄ）改変糖類を介して前記２つのｓＥ単量体を連結することによって共有結合的に安定化される、ならびに／または、
ｅ）ＤＥＮＶ−１、ＤＥＮＶ−２、ＤＥＮＶ−３、ＤＥＮＶ−４、ジカ、もしくは他のフラビウイルスのうちのいずれか１つもしくは２つからの天然および／もしくは変異エンベロープポリペプチドのホモ二量体もしくはヘテロ二量体であり、
前記１つ以上のフラビウイルスが、ジカウイルス、ジカウイルスおよびデングウイルス、ジカウイルスおよび他のフラビウイルス、デング以外のフラビウイルスから選択される、ＥＤＥ。
【請求項２】
前記組換えｓＥ単量体が、
ジカウイルス（ＺＩＫＶ、ＫＪ７７６７９１、Ｈ−ＰＦ−２０１３＿Ｆｒｅｎｃｈ＿Ｐｏｌｙｎｅｓｉａ株）配列番号１；
デングウイルス血清型１（ＤＥＮＶ−１、ＮＣ＿００１４７７）配列番号２；
デングウイルス血清型２（ＤＥＮＶ−２、ＮＣ＿００１４７４）配列番号３；
デングウイルス血清型３（ＤＥＮＶ−３、ＮＣ＿００１４７５）配列番号４；
デングウイルス血清型４（ＤＥＮＶ−４、ＮＣ＿００２６４０）配列番号５；
他のフラビウイルス：
セントルイス脳炎ウイルス（ＳＬＥＶ、ＮＣ＿００７５８０）配列番号６；
日本脳炎ウイルス（ＪＥＶ、ＮＣ＿００１４３７）配列番号７；
マリーバレー脳炎ウイルス（ＭＶＥＶ、ＮＣ＿０００９４３）配列番号８；
ウエストナイルウイルス（ＷＮＶ、ＮＣ＿００１５６３）配列番号９；
ＷＯ２０１６／０１２８００の配列番号１３２、配列番号１３３、配列番号１３４、配列番号１３５；
下記表に記載される変異＃１〜＃１３の中から選択される少なくとも１つの変異を有する変異体ｓＥ；ならびに、
下記表に記載される変異＃１４〜＃１８の中から選択される少なくとも１つの変異、
からなる群から選択される、請求項１に記載の使用のためのＥＤＥ。
【表１】
2019523647.tif 000001
【請求項３】
前記二量体が、前記２つのｓＥ単量体間で少なくとも１つ、２つ、または３つのジスルフィド鎖間結合で共有結合的に安定化されている、請求項１または２に記載の使用のためのＥＤＥ。
【請求項４】
前記二量体が、前記ｓＥ単量体間で少なくとも１つ、２つ、または３つのスルフヒドリル反応性架橋剤で共有結合的に安定化されている、請求項１〜３のいずれか一項に記載の使用のためのＥＤＥ。
【請求項５】
前記組換えｓＥのうちの１つまたは前記２つの組換えｓＥが、ＤＥＮＶ−２のＨ２７Ｆ、Ｈ２７Ｗ、Ｈ２４４Ｆ、Ｈ２４４Ｗ、Ｌ２７８Ｆ、Ｌ２９２ＦおよびＬ２９４Ｎに対応する変異からなる群より選択される少なくとも１つの変異を有する、請求項１〜４のいずれか一項に記載の使用のためのＥＤＥ。
【請求項６】
前記二量体が、変異体ｓＥのホモ二量体またはヘテロ二量体であり、
一方のｓＥ単量体が、グリコシル化部位を導入する少なくとも１つの変異を有し、前記変異したアミノ酸残基が、Ｘ官能基を担持する改変糖でグリコシル化され、
−他方のｓＥ単量体が、グリコシル化部位を導入する少なくとも１つの変異を有し、前記変異したアミノ酸残基が、Ｙ官能基を担持する改変糖でグリコシル化され、
両方の変異した残基が、具体的にはクリック化学によって、第１のｓＥ単量体の糖のＸ官能基を他方のｓＥ単量体の糖のＹ官能基と反応させることによって、前記改変糖類を介して一緒に結合している、
請求項１〜５のいずれか一項に記載の使用のためのＥＤＥ。
【請求項７】
前記ＥＤＥが、前記ＤＥＮＶ−１もしくはＤＥＮＶ−２ポリペプチド配列の、Ｅ４９、Ｋ６４、Ｑ７７、Ｗ１０１、Ｖ１２２（ＤＥＮＶ−１；Ｋ１２２  ＤＥＮＶ−２）、Ｎ１３４、Ｎ１５３、Ｔ１５５、Ｉ１６１、Ａ１６２（ＤＥＮＶ−１；Ｉ１６２  ＤＥＮＶ−２）、Ｐ１６９（ＤＥＮＶ−１；Ｓ１６９  ＤＥＮＶ−２）、Ｔ２００（ＤＥＮＶ−１；Ｑ２００  ＤＥＮＶ−２）、Ｋ２０２（ＤＥＮＶ−１；Ｅ２０２  ＤＥＮＶ−２）、Ｅ２０３、Ｌ３０８（ＤＥＮＶ−１；Ｖ３０８もしくはＩ３０８  ＤＥＮＶ−２＿、Ｋ３１０、Ｑ３２３（ＤＥＮＶ−１；Ｒ３２３  ＤＥＮＶ−２）、Ｗ３９１、Ｆ３９２；ジカＰＦ１３のＴ４９、Ｓ６４、Ｑ７７、Ｗ１０１、Ｓ１２２、Ｎ１３４、Ｎ１５４、Ｔ１５６、Ｋ１６６  Ｔ２０５、Ｎ２０７、Ｎ２０８、Ｆ３１４、Ｋ３１６、Ｅ３１９、Ｗ４００、Ｈ４０１に対応する位置のうちの１つ以上；またはフラビウイルスの等価残基；
ならびに／あるいは
ジカＰＦ１３のＲ２、Ｍ６８、Ａ６９、Ｓ７０、Ｄ７１、Ｓ７２、Ｒ７３、Ｃ７４、Ｑ７７、Ｄ８３、Ｖ９７、Ｄ９８、Ｒ９９、Ｗ１０１、Ｇ１０２、Ｎ１０３、Ｇ１０４、Ｃ１０５、Ｇ１０６、Ｌ１１３、Ｋ２５１、Ｒ２５２、Ｑ２５３、Ｔ３１５、Ｋ３１６、Ｑ３３１、Ｋ３７３に対応する位置のうちの１つ以上、例えばジカＰＦ１３のＴ３１５、Ｋ３７３、Ｓ７０、Ｓ７２、Ｑ７７、Ｒ９９、Ｇ１０４、Ｍ６８、Ｒ２５２、Ｄ８３、Ｑ２５３に対応する位置のうちの１つ以上、ならびに／あるいは、
前記ＤＥＮＶ−２もしくはＤＥＮＶ−４ポリペプチド配列の、Ａ７１、Ｃ１０５、Ｃ７４、Ｄ１５４、Ｄ２４９、Ｄ２７１、Ｄ３０９、Ｄ３６２、Ｄ９８、Ｅ１４８、Ｅ３１１、Ｅ４４、Ｅ７１、Ｅ８４、Ｇ１０２、Ｇ１０４、Ｇ１０６、Ｇ１５２、Ｇ１５６、Ｇ２８、Ｇ２９、Ｇ３７４、Ｈ１５８、Ｈ２７、Ｉ１１３、Ｉ３０８、Ｉ４６、Ｋ２４６、Ｋ２４７、Ｋ３１０、Ｋ３２３、Ｋ３２５、Ｋ４７、Ｌ１１３、Ｌ４５、Ｌ８２、Ｍ２７８、Ｎ１０３、Ｎ１５３、Ｎ３６２、Ｎ６７、Ｎ８３、Ｑ２４８、Ｑ２７１、Ｑ３２５、Ｑ７７、Ｒ２、Ｒ２４７、Ｒ３２３、Ｒ７３、Ｒ９９、Ｓ７２、Ｓ８１、Ｔ１１５、Ｔ１５５、Ｔ３６１、Ｔ４６、Ｔ６８、Ｔ６９、Ｔ７０、Ｔ７２、Ｖ１１３、Ｖ１１４、Ｖ２５０、Ｖ３０９、Ｖ３２４、Ｖ９７、Ｗ１０１、に対応する位置のうちの１つ以上、またはフラビウイルスの等価残基、を含む、請求項１〜６のいずれかに記載の使用のためのＥＤＥ。
【請求項８】
１つ以上のフラビウイルスに対して、個体にワクチン接種する際に使用するための、または１つ以上のフラビウイルスによる感染の予防および／または治療のための方法における使用のための、請求項１〜７のいずれか一項に記載のＥＤＥをコードする核酸であって、前記１つ以上のフラビウイルスが、ジカウイルス、ジカウイルスおよびデングウイルス、ジカウイルスおよび他のフラビウイルス、デング以外のフラビウイルスから選択される、核酸。
【請求項９】
１つ以上のフラビウイルスに対して、個体にワクチン接種する際に使用するための、または１つ以上のフラビウイルスによる感染の予防および／または治療のための方法における使用のための組成物であって、
ａ）請求項１〜７のいずれか一項に記載のＥＤＥ、
ｂ）請求項８に記載の核酸、
ｃ）請求項８に記載の核酸を含むベクター、
ｄ）請求項８に記載の核酸、または請求項８に記載の核酸を含むベクターを含む、宿主細胞、
のうちのいずれか１つ以上を含み、
前記１つ以上のフラビウイルスが、ジカウイルス、ジカウイルスおよびデングウイルス、ジカウイルスおよび他のフラビウイルス、デング以外のフラビウイルスから選択される、組成物。
【請求項１０】
請求項１〜７のいずれか一項に記載のＥＤＥに対する単離された中和抗体またはその抗原結合断片であって、
１つ以上のフラビウイルスによる感染の予防および／または治療のための方法における使用のためのものであり、
前記１つ以上のフラビウイルスは、ジカウイルス、ジカウイルスおよびデングウイルス、ジカウイルスおよび他のフラビウイルス、デング以外のフラビウイルスから選択される、
単離された中和抗体またはその抗原結合断片。
【請求項１１】
前記抗体または断片が、
配列番号１５〜２６および前記配列番号１５〜２６のいずれか１つから３０、２０、１５、または１０％以下の改変を有する配列からなる群から選択されるアミノ酸配列を有する、ＣＤＲ領域を含む、
改変が３０、２０、１５、または１０％以下である、配列番号１５、１６および１７のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域ならびに／または配列番号２１、２２および２３のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域を含む、または
改変が３０、２０、１５、または１０％以下である、配列番号１８、１９および２０のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域ならびに／または配列番号２４、２５および２６のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域を含む、
請求項１０に記載の使用のための抗体またはその断片。
【請求項１２】
ａ）配列番号１を含む重鎖ならびに／または配列番号３７を含む軽鎖、
ｂ）配列番号２を含む重鎖ならびに／または配列番号３８を含む軽鎖、
ｃ）配列番号４２を含む重鎖ならびに／または配列番号８８を含む軽鎖、
ｄ）配列番号５６を含む重鎖ならびに／または配列番号１０２を含む軽鎖、
ｅ）配列番号５７を含む重鎖ならびに／または配列番号１０３を含む軽鎖、
ｆ）配列番号５８を含む重鎖ならびに／または配列番号１０４を含む軽鎖、
ｇ）配列番号６１を含む重鎖ならびに／または配列番号１０７を含む軽鎖、
ｈ）配列番号６４を含む重鎖ならびに／または配列番号１１０を含む軽鎖、
ｉ）配列番号６５を含む重鎖ならびに／または配列番号１１１を含む軽鎖、
ｊ）配列番号７０を含む重鎖ならびに／または配列番号１１６を含む軽鎖、または
上記配列のいずれかに対して少なくとも９０％の相同性を有する配列、
を含む、請求項１０または１１に記載の使用のための抗体またはその断片。
【請求項１３】
前記抗体またはその断片が、１種以上の血清型のデングウイルスおよび／またはジカウイルスを中和する、請求項１０〜１２のいずれか一項に記載の使用のための抗体またはその断片。
【請求項１４】
前記抗体またはその断片が、
ａ）１種以上の血清型のデングウイルスおよび／またはジカウイルスを８０％、９０％、９８％または１００％中和し、
ｂ）すべての血清型のデングウイルスおよびジカウイルスを中和し、
ｃ）すべての血清型のデングウイルスおよびジカウイルスを８０％または９０％または９８％または１００％中和し、
ｄ）すべての血清型のデングウイルスおよびジカウイルスを１００％中和し、
ｅ）すべての血清型のデングウイルスを同じ濃度の抗体または断片で１００％中和し、
ｆ）１種以上の血清型のデングウイルスおよび／またはジカウイルスを０．５〜０．０１μｇ／ｍｌの濃度で８０、９０、９８または１００％中和し、
ｇ）すべての血清型のデングウイルスおよびジカウイルスを０．５〜０．０１μｇ／ｍｌの濃度で８０、９０、９８または１００％中和する、
請求項１０〜１３のいずれか一項に記載の使用のための抗体またはその断片。
【請求項１５】
１つ以上のフラビウイルスによる感染の予防および／または治療のための方法における使用のための、請求項１０〜１４のいずれかに記載の抗体またはその断片をコードする核酸であって、前記１つ以上のフラビウイルスが、ジカウイルス、ジカウイルスおよびデングウイルス、ジカウイルスおよび他のフラビウイルス、デング以外のフラビウイルスから選択される、核酸。