【手続補正書】
【提出日】令和2年2月3日(2020.2.3)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
（ｉ）配列番号３を含むペプチド、および／または（ｉｉ）ＲＯＲ１タンパク質のエピトープに特異的に結合する、結合タンパク質であって、前記エピトープが、配列番号３に記載のアミノ酸配列内にあり、前記結合タンパク質がモノクローナル抗体またはその抗原結合断片である、結合タンパク質。
【請求項２】
配列番号１５または１６に記載のアミノ酸配列と少なくとも９０％同一である軽鎖可変ドメイン（ＶＬ）と、配列番号１２、１３または１４に記載のアミノ酸配列と少なくとも９０％同一である重鎖可変ドメイン（ＶＨ）とを含む抗体またはその抗原結合断片を含む結合タンパク質であって、前記抗体が、（ｉ）配列番号３を含むペプチド、および／または（ｉｉ）ＲＯＲ１タンパク質のエピトープに特異的に結合し、前記エピトープが、配列番号３に記載のアミノ酸配列内にある、結合タンパク質。
【請求項３】
前記ＲＯＲ１タンパク質が、ヒトＲＯＲ１である、請求項１または２に記載の結合タンパク質。
【請求項４】
（１）（ａ）配列番号６または１つもしくは２つのアミノ酸置換を有する配列番号６のバリアントに記載の重鎖ＣＤＲ１アミノ酸配列；（ｂ）配列番号７または１つもしくは２つのアミノ酸置換を有する配列番号７のバリアントで示される重鎖ＣＤＲ２アミノ酸配列；および（ｃ）配列番号８または１つもしくは２つのアミノ酸置換を有する配列番号８のバリアントで示される重鎖ＣＤＲ３アミノ酸配列を含み、ならびに
（２）（ａ）配列番号９または１つもしくは２つのアミノ酸置換を有する配列番号９のバリアントで示される軽鎖ＣＤＲ１アミノ酸配列；（ｂ）配列番号１０または１つもしくは２つのアミノ酸置換を有する配列番号１０のバリアントで示される軽鎖ＣＤＲ２アミノ酸配列；および（ｃ）配列番号１１または１つもしくは２つのアミノ酸置換を有する配列番号１１のバリアントで示される軽鎖ＣＤＲ３アミノ酸配列を含む、
請求項１から３のいずれか一項に記載の結合タンパク質。
【請求項５】
（ｉ）それぞれ、配列番号１２、１３もしくは１４に記載の重鎖可変ドメイン（ＶＨ）配列内のＣＤＲ１、ＣＤＲ２およびＣＤＲ３のアミノ酸配列を有する重鎖ＣＤＲ１、重鎖ＣＤＲ２および重鎖ＣＤＲ３；および／または（ｉｉ）それぞれ、配列番号１５もしくは１６に記載の軽鎖可変ドメイン（ＶＬ）配列内のＣＤＲ１、ＣＤＲ２およびＣＤＲ３のアミノ酸配列を有する軽鎖ＣＤＲ１、軽鎖ＣＤＲ２および軽鎖ＣＤＲ３を含む、請求項１から４のいずれか一項に記載の結合タンパク質。
【請求項６】
前記重鎖ＣＤＲ１が、配列番号２１、２２、２３または２４に記載の配列を含み、前記重鎖ＣＤＲ２が、配列番号２５、２６、２７または２８に記載の配列を含み、前記重鎖ＣＤＲ３が配列番号２９または３０に記載の配列を含み；かつ前記軽鎖ＣＤＲ１が、配列番号３１または３２に記載の配列を含み、前記軽鎖ＣＤＲ２が、配列番号３３または３４に記載の配列を含み、前記軽鎖ＣＤＲ３が配列番号３５または３６に記載の配列を含む、請求項４または５に記載の結合タンパク質。
【請求項７】
前記結合タンパク質が配列番号３７を含むＶＨおよび配列番号３８を含むＶＬを含む、請求項１から６のいずれか一項に記載の結合タンパク質。
【請求項８】
配列番号１５または１６に記載の軽鎖可変ドメイン（ＶＬ）配列、および配列番号１２、１３または１４に記載の重鎖可変ドメイン（ＶＨ）配列を含む、請求項１から７のいずれか一項に記載の結合タンパク質。
【請求項９】
前記結合タンパク質が、モノクローナル抗体またはその抗原結合断片である、請求項２から８のいずれか一項に記載の結合タンパク質。
【請求項１０】
前記抗体またはその抗原結合断片が、モノクローナル抗体６Ｄ４のＶＬおよびＶＨを含む、請求項１から９のいずれか一項に記載の結合タンパク質。
【請求項１１】
ＲＯＲ２に結合しない、請求項１から１０のいずれか一項に記載の結合タンパク質。
【請求項１２】
マーカーをさらに含む、請求項１から１１のいずれか一項に記載の結合タンパク質。
【請求項１３】
前記マーカーが、酵素、色素、蛍光標識、ペプチドタグ、またはタンパク質タグである、請求項１２に記載の結合タンパク質。
【請求項１４】
前記結合タンパク質が、被験体からの生物学的試料の細胞中に内因的に存在する前記ＲＯＲ１タンパク質と特異的に結合することができる、請求項１から１３のいずれか一項に記載の結合タンパク質。
【請求項１５】
前記試料が、血液悪性疾患および固形腫瘍からなる群より選択される腫瘍組織に由来する、請求項１４に記載の結合タンパク質。
【請求項１６】
前記試料が、慢性リンパ性白血病（ＣＬＬ）、マントル細胞リンパ腫（ＭＣＬ）、卵巣がん、肺がん、膵がんまたは乳がんに由来する、請求項１４または１５に記載の結合タンパク質。
【請求項１７】
請求項１から１６のいずれか一項に記載の結合タンパク質と担体または賦形剤とを含む組成物。
【請求項１８】
請求項１から１６のいずれか一項に記載の結合タンパク質をコードする、ポリヌクレオチド。
【請求項１９】
発現制御配列に作動可能に連結されている請求項１８に記載のポリヌクレオチドを含む、発現構築物。
【請求項２０】
請求項１８に記載のポリヌクレオチドまたは請求項１９に記載の発現構築物を含む、宿主細胞。
【請求項２１】
請求項１から１６のいずれか一項に記載の結合タンパク質を作製するための方法であって、請求項１８に記載のポリヌクレオチドまたは請求項１９に記載の発現構築物を含む宿主細胞を、前記結合タンパク質を発現させるのに好適な条件下で培養するステップを含む、方法。
【請求項２２】
完全長ＲＯＲ１を発現する細胞を同定するための方法であって、細胞を請求項１から１６のいずれか一項に記載の結合タンパク質または請求項１７に記載の組成物と接触させるステップ、および前記細胞への前記結合タンパク質の特異的結合を検出することによって、完全長ＲＯＲ１を発現する細胞を同定するステップを含む、方法。
【請求項２３】
（ａ）生物学的試料を請求項１から１６のいずれか一項に記載の結合タンパク質または請求項１７に記載の組成物と接触させるステップ、および（ｂ）前記結合タンパク質と前記試料中のタンパク質もしくはエピトープとの特異的結合またはその欠如を検出するステップを含み、それによって、前記試料中のＲＯＲ１タンパク質またはＲＯＲ１エピトープの存在または非存在を検出する、検出方法。
【請求項２４】
組織試料中のＲＯＲ１の存在を同定するための方法であって、組織試料を請求項１から１６のいずれか一項に記載の結合タンパク質または請求項１７に記載の組成物と接触させるステップ、および前記組織への前記結合タンパク質の特異的結合を検出することによって、ＲＯＲ１を発現する組織を同定するステップを含む、方法。
【請求項２５】
請求項１から１６のいずれか一項に記載の結合タンパク質または請求項１７に記載の組成物の、被験体からの組織試料への特異的結合を、被験体が完全長ＲＯＲ１を発現する細胞に関連する疾患を有する、または有するリスクがあるかどうかの指標とする方法であって、前記被験体からの前記組織試料を請求項１から１６のいずれか一項に記載の結合タンパク質または請求項１７に記載の組成物と接触させるステップ、および前記組織への前記結合タンパク質の前記特異的結合を検出するステップを含み、前記特異的結合は、前記被験体が完全長ＲＯＲ１を発現する細胞に関連する前記疾患を有する、または有するリスクがあることを示す、方法。
【請求項２６】
請求項１から１６のいずれか一項に記載の結合タンパク質または請求項１７に記載の組成物の、被験体からの組織試料への特異的結合を、疾患または状態を有する被験体が、ＲＯＲ１特異的処置から恩恵を受けることになるかどうかの指標とする方法であって、前記被験体からの前記組織試料を請求項１から１６のいずれか一項に記載の結合タンパク質または請求項１７に記載の組成物と接触させるステップ、および前記組織への前記結合タンパク質の前記特異的結合を検出するステップを含み、前記特異的結合は前記被験体がＲＯＲ１特異的処置から恩恵を受けることになるか否かを示す、方法。
【請求項２７】
請求項１から１６のいずれか一項に記載の結合タンパク質または請求項１７に記載の組成物の、被験体からの組織試料への特異的結合を、完全長ＲＯＲ１を発現する細胞に関連する疾患または状態を有する被験体の予後の指標とする方法であって、前記被験体からの前記組織試料を請求項１から１６のいずれか一項に記載の結合タンパク質または請求項１７に記載の組成物と接触させるステップ、および前記組織への前記結合タンパク質の前記特異的結合を検出するステップを含み、前記特異的結合は、前記被験体がＲＯＲ１特異的処置の非存在下で予後不良であると示す、方法。
【請求項２８】
前記結合タンパク質の前記結合は、免疫組織化学または免疫ブロットにより検出される、請求項２２から２７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２９】
前記試料が被験体から得られる、請求項２３から２８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３０】
前記試料が、ホルマリン固定もしくは凍結された組織切片および／または透過処理された細胞を含むか、ならびに／あるいは前記試料が、血液悪性疾患および固形腫瘍からなる群より選択される腫瘍に由来し、および／または正常組織に由来する、請求項２３から２９のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３１】
前記試料が、ＣＬＬ、ＭＣＬ、卵巣がん、肺がん、膵がんまたは乳がんに由来する、請求項３０に記載の方法。
【請求項３２】
前記試料が由来する前記組織中の前記ＲＯＲ１またはエピトープの均一または均質な発現は、前記被験体または試料が抗ＲＯＲ１療法での処置の候補であることを示す、請求項２３から３１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３３】
抗ＲＯＲ１療法での処置の候補と示された前記被験体または試料は、前記抗ＲＯＲ１療法の投与の候補である、請求項３２に記載の方法。
【請求項３４】
前記抗ＲＯＲ１療法は養子細胞療法である、請求項３２または３３に記載の方法。
【請求項３５】
疾患または状態の処置のための医薬組成物であって、抗ＲＯＲ１治療剤を含み、請求項１から１６のいずれか一項に記載の結合タンパク質または請求項１７に記載の組成物の、前記疾患または状態を有する被験体からの組織または試料への結合の検出により決定されるとき、前記組織または試料が、表面で発現されるＲＯＲ１の均一または均質な発現を有すると同定されている、方法。
【請求項３６】
疾患または状態の処置のための医薬の製造における、抗ＲＯＲ１治療剤を含む医薬組成物の使用であって、請求項１から１６のいずれか一項に記載の結合タンパク質または請求項１７に記載の組成物の、前記疾患または状態を有する被験体からの組織または試料への結合の検出により決定されるとき、前記組織または試料が、表面で発現されるＲＯＲ１の均一または均質な発現を有すると同定されている、使用。
【請求項３７】
前記疾患または状態が、ＣＬＬ、ＭＣＬ、乳がん、肺がん、卵巣がん、および膵がんからなる群より選択される腫瘍である、請求項３５に記載の医薬組成物または請求項３６に記載の使用。
【請求項３８】
表面で発現されるＲＯＲ１の前記発現が、請求項２２から３３のいずれか一項に記載の方法によって決定される、請求項３５から３７のいずれか一項に記載の医薬組成物または使用。
【請求項３９】
前記ＲＯＲ１治療剤が、養子細胞療法を含む、請求項３５から３８のいずれか一項に記載の医薬組成物または使用。
【請求項４０】
請求項１から１６のいずれか一項に記載の結合タンパク質または請求項１７に記載の組成物を含む、キット。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０１９０
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０１９０】
一般に、下記の特許請求の範囲において使用する用語は、本明細書および本特許請求の範囲において開示する特定の実施形態に本特許請求の範囲を限定すると解釈すべきでなく、そのような特許請求の範囲を伴う均等物の全範囲とともにすべての可能な実施形態を含むと解釈すべきである。したがって、本特許請求の範囲は、本開示によって限定されない。
本発明は、例えば、以下の項目を提供する。
(項目１)
ＲＯＲ１の細胞内プロテインキナーゼのＣ末端側にある前記ＲＯＲ１の部分と特異的に結合する結合タンパク質であって、任意選択で、免疫グロブリン様結合タンパク質である、および／あるいは抗体もしくはその抗原結合断片であるか、または抗体もしくはその抗原結合断片を含む、結合タンパク質。
(項目２)
（ｉ）配列番号３を含むペプチドであって、前記ペプチドが、任意選択で配列番号３からなる、ペプチド、および／または（ｉｉ）ＲＯＲ１タンパク質のエピトープに特異的に結合する、結合タンパク質であって、前記エピトープが、（ａ）配列番号３に記載のアミノ酸配列内にあるか、および／または（ｂ）配列番号３に記載のアミノ酸配列内の１つもしくは複数のアミノ酸を含む、結合タンパク質。
(項目３)
配列番号１５または１６に記載のアミノ酸配列と少なくとも９０％同一である軽鎖可変ドメイン（ＶＬ）と、配列番号１２、１３または１４に記載のアミノ酸配列と少なくとも９０％同一である重鎖可変ドメイン（ＶＨ）とを含む抗体またはその断片を含む結合タンパク質であって、前記抗体が、任意選択で、（ｉ）配列番号３を含むペプチドであって、前記ペプチドが、任意選択で配列番号３からなる、ペプチド、および／または（ｉｉ）ＲＯＲ１タンパク質のエピトープに特異的に結合し、前記エピトープが、（ａ）配列番号３に記載のアミノ酸配列内にあるか、および／または（ｂ）配列番号３に記載のアミノ酸配列内の１つもしくは複数のアミノ酸を含む、結合タンパク質。
(項目４)
配列番号３に記載のアミノ酸配列と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列内に位置するエピトープに結合する、項目１から３のいずれか一項に記載の結合タンパク質。
(項目５)
前記ＲＯＲ１またはＲＯＲ１タンパク質が、ヒトＲＯＲ１である、項目１から４のいずれか一項に記載の結合タンパク質。
(項目６)
前記ＲＯＲ１および／または前記ペプチドおよび／または前記エピトープと１×１０−７Ｍまたはそれ未満のＫｄで結合する、項目１から５のいずれか一項に記載の結合タンパク質。
(項目７)
（ａ）配列番号６または１つもしくは２つのアミノ酸置換を有する配列番号６のバリアントに記載の重鎖ＣＤＲ１アミノ酸配列；（ｂ）配列番号７または１つもしくは２つのアミノ酸置換を有する配列番号７のバリアントで示される重鎖ＣＤＲ２アミノ酸配列；および（ｃ）配列番号８または１つもしくは２つのアミノ酸置換を有する配列番号８のバリアントで示される重鎖ＣＤＲ３アミノ酸配列を含む、項目１から６のいずれか一項に記載の結合タンパク質。
(項目８)
（ａ）配列番号９または１つもしくは２つのアミノ酸置換を有する配列番号９のバリアントで示される軽鎖ＣＤＲ１アミノ酸配列；（ｂ）配列番号１０または１つもしくは２つのアミノ酸置換を有する配列番号１０のバリアントで示される軽鎖ＣＤＲ２アミノ酸配列；および（ｃ）配列番号１１または１つもしくは２つのアミノ酸置換を有する配列番号１１のバリアントで示される軽鎖ＣＤＲ３アミノ酸配列を含む、項目１から７のいずれか一項に記載の結合タンパク質。
(項目９)
（ｉ）配列番号１２、１３もしくは１４に記載の重鎖可変ドメイン（ＶＨ）配列内のＣＤＲ３のアミノ酸配列を有する重鎖ＣＤＲ３；および／または（ｉｉ）配列番号１５もしくは１６に記載の軽鎖可変ドメイン（ＶＬ）配列内のＣＤＲ３のアミノ酸配列を有する軽鎖ＣＤＲ３を含む、項目１から８のいずれか一項に記載の結合タンパク質。
(項目１０)
前記重鎖ＣＤＲ３が、配列番号２９または配列番号３０に記載の配列を含み、および／または前記軽鎖ＣＤＲ３が、配列番号３５または配列番号３６に記載の配列を含む、項目９に記載の結合タンパク質。
(項目１１)
配列番号１２、１３もしくは１４に記載の重鎖可変ドメイン（ＶＨ）配列内の、ＣＤＲ１および／もしくはＣＤＲ２のアミノ酸配列をそれぞれ有する、重鎖ＣＤＲ１および／もしくは重鎖ＣＤＲ２；ならびに／または（ｉｉ）配列番号１５もしくは１６に記載の軽鎖可変ドメイン（ＶＬ）配列内のＣＤＲ３のアミノ酸配列をそれぞれ有する、軽鎖ＣＤＲ１および／もしくは軽鎖ＣＤＲ２をさらに含む、項目９または１０に記載の結合タンパク質。
(項目１２)
前記重鎖ＣＤＲ１が、配列番号２１、２２、２３または２４に記載の配列を含み、および／または前記重鎖ＣＤＲ２が、配列番号２５、２６、２７または２８に記載の配列を含むか；および／または前記軽鎖ＣＤＲ１が、配列番号３１または３２に記載の配列を含み、前記軽鎖ＣＤＲ２が、配列番号３３または３４に記載の配列を含む、項目１１に記載の結合タンパク質。
(項目１３)
配列番号１５または１６に記載のアミノ酸配列と少なくとも９０％同一である軽鎖可変ドメイン（ＶＬ）、および配列番号１２、１３または１４に記載のアミノ酸配列と少なくとも９０％同一である重鎖可変ドメイン（ＶＨ）を含むか；ならびに／あるいは配列番号３７を含むＶＨ、および／または配列番号３８を含むＶＬを含む、項目１から１２のいずれか一項に記載の結合タンパク質。
(項目１４)
抗体またはその抗原結合断片である、項目１から１３のいずれか一項に記載の結合タンパク質。
(項目１５)
抗体を含み、前記抗体が、モノクローナル抗体またはその抗原結合断片である、項目１４に記載の結合タンパク質。
(項目１６)
前記モノクローナル抗体が、６Ｄ４と称する抗体の抗原結合部分である、および／または６Ｄ４と称する抗体の抗原結合部分を含む、項目１５に記載の結合タンパク質。
(項目１７)
抗体の抗原結合断片を含み、前記抗原結合断片がｓｃＦｖである、項目１６に記載の結合タンパク質。
(項目１８)
前記ｓｃＦｖが、モノクローナル抗体６Ｄ４のＶＬおよびＶＨを含む、項目１７に記載の結合タンパク質。
(項目１９)
ＲＯＲ２に結合しない、項目１から１８のいずれか一項に記載の結合タンパク質。
(項目２０)
ＲＯＲ１の細胞内プロテインキナーゼドメインのＣ末端側に位置するＲＯＲ１エピトープとの特異的結合について基準結合タンパク質または免疫グロブリン様結合タンパク質と競合する、結合タンパク質。
(項目２１)
ＲＯＲ１との結合および／または配列番号３のペプチドとの結合について項目１から１９のいずれか一項に記載の結合タンパク質と競合する、ならびに／あるいは項目１から１９のいずれか一項に記載の結合タンパク質と同じまたは重複するＲＯＲ１のエピトープと結合する、結合タンパク質。
(項目２２)
前記基準結合タンパク質が、配列番号６に記載の重鎖ＣＤＲ１アミノ酸配列、配列番号７に記載の重鎖ＣＤＲ２アミノ酸配列、配列番号８に記載の重鎖ＣＤＲ３アミノ酸配列、配列番号９に記載の軽鎖ＣＤＲ１アミノ酸配列、配列番号１０に記載の軽鎖ＣＤＲ２アミノ酸配列、および配列番号１１に記載の軽鎖ＣＤＲ３アミノ酸配列を含む、項目２０に記載の結合タンパク質。
(項目２３)
前記基準結合タンパク質が、配列番号１５または１６に記載のアミノ酸配列と少なくとも９０％同一である軽鎖可変ドメイン（ＶＬ）、および配列番号１２、１３または１４に記載のアミノ酸配列と少なくとも９０％同一である重鎖可変ドメイン（ＶＨ）を含む、項目２０または２２に記載の結合タンパク質。
(項目２４)
前記結合タンパク質、前記基準結合タンパク質、または両方が、抗体またはその抗原結合断片である、項目２０から２３のいずれか一項に記載の結合タンパク質。
(項目２５)
前記結合タンパク質、前記基準結合タンパク質、または両方が抗体を含み、前記抗体が、モノクローナル抗体である、項目２４に記載の結合タンパク質。
(項目２６)
前記結合タンパク質、前記基準結合タンパク質、または両方が、キメラまたはヒト化抗体である、項目２４または２５に記載の結合タンパク質。
(項目２７)
前記結合タンパク質、前記基準結合タンパク質、または両方が、抗体の抗原結合断片を含み、前記抗原結合断片が、ｓｃＦｖである、項目２４に記載の結合タンパク質。
(項目２８)
前記結合タンパク質、前記基準結合タンパク質、または両方が、抗原結合ドメインを含む融合タンパク質である、項目２０から２７のいずれか一項に記載の結合タンパク質。
(項目２９)
前記融合タンパク質の抗原結合ドメインが、抗体の抗原結合断片である、項目２８に記載の結合タンパク質。
(項目３０)
抗体の前記抗原結合断片が、ｓｃＦｖである、項目２９に記載の結合タンパク質。
(項目３１)
基準抗体が、モノクローナル抗体６Ｄ４である、項目２０から３０のいずれか一項に記載の結合タンパク質。
(項目３２)
マーカーをさらに含む、項目１から３１のいずれか一項に記載の結合タンパク質。
(項目３３)
前記マーカーが、酵素、色素、蛍光標識、ペプチドタグ、またはタンパク質タグである、項目３２に記載の結合タンパク質。
(項目３４)
（ａ）前記結合タンパク質が、生物学的試料の細胞中に内因的に存在する前記タンパク質、前記ＲＯＲ１および／またはエピトープと特異的に結合することができ、前記試料が、ホルマリン固定もしくは凍結された組織切片および／または透過処理された細胞を任意選択で含むか、および／または任意選択で被験体の腫瘍に由来するものであり、ならびに／あるいは（ｂ）前記結合タンパク質が、ＲＯＲ１の内因性発現を、基準抗体が前記内因性発現を検出しない条件下で検出することができ、前記基準抗体が、任意選択で、ポリクローナルＲＯＲ１抗体、ＲＯＲ１のＮ末端部分を認識するＲＯＲ１抗体、ａｂ１３５６６９、抗ヒトＲＯＲ１ヤギポリクローナル抗体、抗ヒトＲＯＲ１ウサギポリクローナル抗体、抗ＲＯＲ１  ４Ａ５、および抗ヒトＲＯＲ１  ２Ａ２からなる群より選択される、項目１から３３のいずれか一項に記載の結合タンパク質。
(項目３５)
前記試料が、血液悪性疾患および固形腫瘍からなる群より選択される腫瘍組織に由来する、項目３４に記載の結合タンパク質。
(項目３６)
前記試料が、（ａ）ＣＬＬまたはＭＣＬに由来するか、あるいは（ｂ）卵巣がん、任意選択で肺腺癌、腺癌、扁平上皮癌、小細胞癌および非定型カルチノイドの中から選択される肺がん、または任意選択でトリプルネガティブ乳がんである乳がんに由来する、項目３５に記載の結合タンパク質。
(項目３７)
前記試料が、骨髄、脂肪組織、副甲状腺、食道および膵臓からなる群より選択される正常組織に由来する、項目３５に記載の結合タンパク質。
(項目３８)
完全長ＲＯＲ１と特異的に結合する、項目１から３７のいずれか一項に記載の結合タンパク質。
(項目３９)
項目１から３８のいずれか一項に記載の結合タンパク質と担体または賦形剤とを含む組成物。
(項目４０)
項目１から３８のいずれか一項に記載の結合タンパク質をコードする、単離されたポリヌクレオチド。
(項目４１)
前記ポリヌクレオチドを含有する宿主細胞用にコドン最適化される、項目４０に記載のポリヌクレオチド。
(項目４２)
発現制御配列に作動可能に連結されている項目４０または４１に記載のポリヌクレオチドを含む、発現構築物。
(項目４３)
プラスミドまたはウイルスベクター内に存在する、項目４２に記載の発現構築物。
(項目４４)
レンチウイルスベクターまたはγ−レトロウイルスベクターから選択されるウイルスベクター内に存在する、項目４２または４３に記載の発現構築物。
(項目４５)
項目４２から４４のいずれか一項に記載の発現構築物を含むか、または発現構築物により提供されるポリヌクレオチドを含む宿主細胞。
(項目４６)
項目１から３８のいずれか一項に記載の結合タンパク質を作製するための方法であって、項目４２から４５のいずれか一項に記載の発現構築物を含むか、または発現構築物により提供されるポリヌクレオチドを含む宿主細胞を、前記結合タンパク質を発現させるのに好適な条件下で培養するステップ、および任意選択で、前記結合タンパク質を培養物から単離するステップを含む、方法。
(項目４７)
完全長ＲＯＲ１を発現する細胞を同定するための方法であって、細胞を項目１から３８のいずれか一項に記載の結合タンパク質と接触させるステップ、および前記細胞への前記結合タンパク質の特異的結合を検出することによって、完全長ＲＯＲ１を発現する細胞を同定するステップを含む、方法。
(項目４８)
（ａ）生物学的試料を項目１から３８のいずれか一項に記載の結合タンパク質または項目３８に記載の組成物と接触させるステップ、および（ｂ）前記結合タンパク質と前記試料中のペプチドもしくはエピトープとの特異的結合またはその欠如を検出するステップを含み、それによって、前記試料中のＲＯＲ１またはＲＯＲ１エピトープの存在または非存在を検出する、検出方法。
(項目４９)
（ｂ）で検出された前記特異的結合のレベルを基準レベルと比較するステップをさらに含み、前記基準レベルと比較した結合レベルの増加が、前記試料中のＲＯＲ１またはＲＯＲ１エピトープの存在を示す、項目４８に記載の検出方法。
(項目５０)
前記試料が、被験体から得られる、項目４８または４９に記載の検出方法。
(項目５１)
前記試料が、組織切片および／または細胞を含む、項目４８から５０のいずれかに記載の検出方法。
(項目５２)
前記試料が、ホルマリン固定もしくは凍結された組織切片および／または透過処理された細胞を含むか、ならびに／あるいは前記試料が、血液悪性疾患および固形腫瘍からなる群より選択される腫瘍に由来し、および／または正常組織に由来する、項目５０または５１に記載の検出方法。
(項目５３)
前記試料が、（ａ）ＣＬＬまたはＭＣＬに由来するか、あるいは（ｂ）卵巣がん、任意選択で肺腺癌、腺癌、扁平上皮癌、小細胞癌および非定型カルチノイドの中から選択される肺がん、または任意選択でトリプルネガティブ乳がんである乳がんに由来するか、あるいは（ｃ）骨髄、脂肪組織、副甲状腺、食道および膵臓からなる群より選択される正常組織に由来する、項目５２に記載の方法。
(項目５４)
前記細胞が、ホルマリン固定され、パラフィンに包埋されているか、または前記細胞が、凍結され、最適切断温度化合物に包埋されている、項目４７から５３のいずれか一項に記載の方法。
(項目５５)
前記細胞中の完全長ＲＯＲ１の存在が、免疫組織化学または免疫ブロッティングによって検出される、項目４７から５４のいずれか一項に記載の方法。
(項目５６)
組織試料中のＲＯＲ１の存在を同定するための方法であって、組織試料を項目１から３８のいずれか一項に記載の結合タンパク質と接触させるステップ、および前記組織への前記結合タンパク質の特異的結合を検出することによって、前記ＲＯＲ１を発現する組織を同定するステップを含み、前記ＲＯＲ１は、任意選択で完全長および／または細胞表面ＲＯＲ１である、方法。
(項目５７)
完全長ＲＯＲ１を発現する細胞に関連する疾患を有する、または有するリスクがある被験体を同定するための方法であって、前記被験体からの組織試料を項目１から３８のいずれか一項に記載の結合タンパク質と接触させるステップ、および前記組織への前記結合タンパク質の特異的結合を検出することによって、完全長ＲＯＲ１を発現する細胞に関連する疾患を有する、または有するリスクがある被験体を同定するステップを含む、方法。
(項目５８)
完全長ＲＯＲ１を発現する細胞に関連する前記疾患が、過剰増殖性疾患または状態である、項目５７に記載の方法。
(項目５９)
前記過剰増殖性疾患または状態が、腫瘍である、項目５８に記載の方法。
(項目６０)
前記腫瘍が、任意選択でＣＬＬまたはＭＣＬである血液腫瘍であり、および／または任意選択で肺腺癌、腺癌、扁平上皮癌、小細胞癌、非定型カルチノイドもしくはトリプルネガティブ乳がんである、任意選択で乳がん、肺がん、卵巣がんもしくは膵がん腫瘍である、固形腫瘍である、項目５９に記載の方法。
(項目６１)
前記腫瘍が、原発性腫瘍、転移性腫瘍、または両方を含む、項目５９または６０に記載の方法。
(項目６２)
前記結合タンパク質を接触させる前記試料またはその一部分の中の細胞の少なくとも５０％、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、または少なくとも９０％が、前記方法により前記ＲＯＲ１またはエピトープを発現すると決定された場合、前記被験体または試料が、抗ＲＯＲ１療法での処置の候補として同定され、前記抗ＲＯＲ１療法が、任意選択で養子細胞療法である任意選択で免疫療法である、項目４７から６１のいずれかに記載の方法。
(項目６３)
前記試料が由来する前記組織が、前記方法により、前記ＲＯＲ１またはエピトープを均一にまたは均質に発現すると決定された場合、前記被験体または試料が、抗ＲＯＲ１療法での処置の候補として同定され、前記抗ＲＯＲ１療法が、任意選択で養子細胞療法である任意選択で免疫療法である、項目４７から６１のいずれかに記載の方法。
(項目６４)
前記試料を得た前記被験体に、ＲＯＲ１標的化療法を投与するステップをさらに含み、前記ＲＯＲ１標的化療法が、任意選択で養子細胞療法である任意選択で免疫療法である、項目４７から６３のいずれかに記載の方法。
(項目６５)
過剰増殖性疾患または状態を有する被験体が、ＲＯＲ１特異的処置から恩恵を受けることになるかどうかを同定するための方法であって、前記被験体からの組織試料を項目１から３８のいずれか一項に記載の結合タンパク質と接触させるステップ、および前記組織への前記結合タンパク質の特異的結合を検出することによって、前記被験体がＲＯＲ１特異的処置から恩恵を受けることになるか否かを同定するステップを含む、方法。
(項目６６)
前記特異的結合が、前記結合タンパク質を接触させた前記組織もしくはその一部分の表面積の、または前記組織もしくはその一部分の中の細胞の、少なくとも５０％、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、または少なくとも９０％において検出された、および／あるいは前記組織において均一にまたは均質に観察された場合には、前記被験体が、前記ＲＯＲ１特異的処置から恩恵を受けることになる被験体として同定される、項目６５に記載の方法。
(項目６７)
前記処置が、免疫療法であり、前記免疫療法が、任意選択で養子細胞療法であり、任意選択で抗ＲＯＲ１抗体を含むキメラ抗原受容体を含み、前記抗ＲＯＲ１抗体が、任意選択で、Ｒ１２と称する抗体であるか、またはＲ１２と称する抗体と結合について競合する、項目６５または６６に記載の方法。
(項目６８)
完全長ＲＯＲ１を発現する細胞に関連する過剰増殖性疾患または状態を有する被験体の予後を決定するための方法であって、前記被験体からの組織試料を項目１から３８のいずれか一項に記載の結合タンパク質と接触させるステップ、および前記組織への前記結合タンパク質の特異的結合を検出するステップを含み、特異的結合を検出するステップによって前記被験体がＲＯＲ１特異的処置の非存在下で予後不良であると同定される、方法。
(項目６９)
特異的結合を検出するステップによって前記被験体が腫瘍転移を有すると同定され、および／または前記組織試料が、ホルマリン固定され、パラフィンに包埋されているか、もしくは前記細胞が、凍結され、最適切断温度化合物に包埋されている、項目６８に記載の方法。
(項目７０)
前記被験体を前記抗ＲＯＲ１療法で処置するステップをさらに含む、項目４７から６９のいずれかに記載の方法。
(項目７１)
疾患または状態を有する被験体に抗ＲＯＲ１療法を投与するステップを含む処置の方法であって、被験体における前記疾患または状態の組織または試料が、表面で発現されるＲＯＲ１の均一または均質な発現を有すると同定されている、方法。
(項目７２)
前記疾患または状態が、腫瘍であり、任意選択で固形腫瘍または血液腫瘍である、項目７１に記載の方法。
(項目７３)
前記腫瘍が、ＣＬＬ、ＭＣＬ、乳がん、肺がん、卵巣がん、および膵がんからなる群より選択される、項目７２に記載の方法。
(項目７４)
前記腫瘍が、肺腺癌、腺癌、扁平上皮癌、小細胞癌、非定型カルチノイド、またはトリプルネガティブ乳がんである、項目７３に記載の方法。
(項目７５)
決定が、項目４７から７０のいずれか一項に記載の方法によって行われる、項目７１から７４のいずれかに記載の方法。
(項目７６)
前記疾患または状態が、肺腺癌、腺癌、扁平上皮癌、小細胞癌、非定型カルチノイド、またはトリプルネガティブ乳がんである、項目１から７５のいずれかに記載の方法。
(項目７７)
前記抗ＲＯＲ１療法が、免疫療法を含む、項目７０から７６のいずれかに記載の方法。
(項目７８)
前記免疫療法が、養子細胞療法を含む、項目７７に記載の方法。
(項目７９)
前記免疫療法が、抗ＲＯＲ１抗体断片を含むキメラ抗原受容体を発現する細胞を含む、項目７８に記載の方法。
(項目８０)
前記抗体断片が、Ｒ１２と称する抗体、その抗原結合領域を含有する抗体に由来するか、またはＲ１２と称する抗体と結合について競合する、項目７９に記載の方法。
(項目８１)
前記細胞が、Ｔ細胞またはＮＫ細胞を含む、項目７９または８０に記載の方法。
(項目８２)
前記組織への前記結合タンパク質の特異的結合が、免疫組織化学または免疫ブロッティングによって検出される、項目４７から７０のいずれか一項に記載の方法。
(項目８３)
項目１から３８のいずれか一項に記載の結合タンパク質または免疫グロブリン様結合タンパク質を含む、キット。
(項目８４)
項目３９に記載の組成物を含む、キット。
(項目８５)
組織試料中の完全長ＲＯＲ１の存在を検出するために使用される、項目８３または８４に記載のキット。
(項目８６)
組織試料が、ホルマリン固定され、パラフィンに包埋されているか、または前記組織試料が、凍結され、最適切断温度化合物に包埋されている、項目８３または８４に記載のキット。
(項目８７)
組織試料中の完全長ＲＯＲ１の存在が、免疫組織化学または免疫ブロッティングによって検出される、項目８３から８６のいずれか一項に記載のキット。