【手続補正書】
【提出日】令和2年5月22日(2020.5.22)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
8〜42アミノ酸残基長の免疫原として活性のポリペプチド、又は該ポリペプチドをコードする核酸であって、該ポリペプチドが、配列番号1、配列番号2、配列番号3、配列番号15、配列番号16、若しくは配列番号17のいずれかのアミノ酸の連続配列からなるか、又は配列番号1、配列番号2、配列番号3、配列番号15、配列番号16、若しくは配列番号17のいずれかに対して少なくとも90％の配列同一性を有するその機能的相同体からなる、上記ポリペプチド又は核酸。
【請求項２】
(a)1種以上の請求項1記載の免疫原として活性のポリペプチド、又は該1種以上の免疫原として活性なポリペプチドをコードする核酸、及び
(b)アジュバント、薬学的に許容される賦形剤、及び保存剤の1種以上
を含む組成物。
【請求項３】
エクソン9変異体CALRを特異的に認識する細胞、インターロイキン、IFN-γ、抗生物質、及び抗がん剤、の1種以上をさらに含む、請求項2記載の組成物であって、
場合によって、
(a)抗がん剤が、アクチミド、アザシチジン、アザチオプリン、ブレオマイシン、カルボプラチン、カペシタビン、シスプラチン、クロラムブシル、シクロホスファミド、シタラビン、ダウノルビシン、ドセタキセル、ドキシフルリジン、ドキソルビシン、エピルビシン、エトポシド、フルダラビン、フルオロウラシル、ゲムシタビン、ヒドロキシウレア、イダルビシン、イリノテカン、レナリドミド、ロイコボリン、メクロレタミン、メルファラン、メルカプトプリン、メトトレキサート、ミトキサントロン、オキサリプラチン、パクリタキセル、ペメトレキセド、レブリミド、テモゾロミド、テニポシド、チオグアニン、バルルビシン、ビンブラスチン、ビンクリスチン、ビンデシン、及びビノレルビンから選択される化学療法剤であり、そして／又は
(b)抗生物質が、アモキシリン、ペニシリン、アシクロビル、及びビダラビンから選択され、そして／又は
(c)インターロイキンがIL-2及び／又はIL-21である、
上記組成物。
【請求項４】
CALR若しくはエクソン9変異体CALR又はこれらの免疫原として活性の断片ではない免疫原として活性のタンパク質又はペプチド断片をさらに含む、請求項2又は3に記載の組成物。
【請求項５】
アジュバントが、細菌DNAベースのアジュバント、油／界面活性剤ベースのアジュバント、ウイルスdsRNAベースのアジュバント、モンタニドISAアジュバント、GM-CSF及びイミダゾキノリンからなる群より選択される1種以上であり、場合によってモンタニドISAアジュバントがモンタニドISA-51又はモンタニドISA-720である、請求項2〜4のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項６】
免疫原として活性のポリペプチド、又は該免疫原として活性のポリペプチドをコードする核酸を含む抗原提示細胞を含み、場合によって該抗原提示細胞が樹状細胞である、請求項2〜5のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項７】
上記免疫原として活性のポリペプチドをコードする核酸がベクター内に含まれており、場合によって該ベクターがT細胞刺激性ポリペプチドをコードする核酸をさらに含む、請求項2〜6のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項８】
請求項1に記載のポリペプチド若しくは核酸、又は請求項2〜7のいずれか一項に記載の組成物を活性成分として含む、エクソン9変異体CALRの発現によって特徴付けられる臨床状態を治療又は予防するための薬剤。
【請求項９】
上記ポリペプチドが、配列番号1若しくは配列番号16のアミノ酸の連続配列、又は配列番号1若しくは配列番号16に対して少なくとも90％の配列同一性を有するその機能的相同体からなる、請求項8に記載の薬剤。
【請求項１０】
上記ポリペプチドが、配列番号2、配列番号3、又は配列番号15のアミノ酸配列からなる、請求項8に記載の薬剤。
【請求項１１】
上記状態ががんである、請求項8〜10のいずれか一項に記載の薬剤。
【請求項１２】
上記状態が骨髄増殖性障害であり、場合によって該骨髄増殖性障害が本態性血小板血症、原発性骨髄線維症、真性赤血球増加症、急性骨髄性白血病又は慢性骨髄性白血病である、請求項8〜10のいずれか一項に記載の薬剤。
【請求項１３】
化学療法、放射線治療、免疫刺激物質による治療、遺伝子治療、抗体による治療、及び樹状細胞を使用する治療から選択される治療と組み合わせて使用するための、請求項8〜12のいずれか一項に記載の薬剤。
【請求項１４】
上記免疫原として活性のポリペプチドが、50μg〜500μg、場合によって80μg〜300μg、場合によって100μg〜250μgの用量で投与される、請求項8〜13のいずれか一項に記載の薬剤。
【請求項１５】
上記組成物が個体における臨床障害のリスクを軽減するために投与される、請求項8〜14のいずれか一項に記載の薬剤。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００１５
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００１５】
本発明は、以下を提供する。
１．  骨髄増殖性障害を治療又は予防する方法において使用するためのワクチン組成物であって、
a)
(i)配列番号1又は配列番号16を含む、CALRのエクソン9変異体、例えば、配列番号10に示される、CALRのエクソン9変異体、
(ii)配列番号10に示されるエクソン9変異体CALRの、免疫原として活性のペプチド断片であって、配列番号10のアミノ酸361〜411のうちの少なくとも一部を含む断片、
(iii)配列番号16若しくは配列番号1、又はその断片からなる、免疫原として活性のペプチド、
(iv)(i)、(ii)、又は(iii)のポリペプチドの機能的相同体であって、配列番号10と少なくとも70%の配列同一性を共有し、且つ/又は最大で3個のアミノ酸、例えば、最大で2個のアミノ酸、例えば、最大で1個のアミノ酸が置換されていることを除き、配列番号16、配列番号1、若しくは配列番号10のアミノ酸の連続配列と同一な配列からなる、免疫原として活性のポリペプチドである機能的相同体、
(v)(i)、(ii)、(iii)、又は(iv)のポリペプチドのうちのいずれかを含むポリペプチド、
(vi)(i)、(ii)、(iii)、(iv)、又は(v)のポリペプチドのうちのいずれかをコードする核酸
のうちの1つ以上、
又は
b)
(vii)配列番号6に示されるJAK2V617F変異体、
(viii)配列番号6に示されるJAK2V617F変異体の、免疫原として活性のペプチド断片であって、アミノ酸617を少なくとも含む断片、
(ix)(vii)及び(viii)のポリペプチドの機能的相同体であって、配列番号6と少なくとも70%の配列同一性を共有し、且つ/又は最大で3個のアミノ酸、例えば、最大で2個のアミノ酸、例えば、最大で1個のアミノ酸が置換されていることを除き、配列番号6のアミノ酸の連続配列と同一な配列からなる、免疫原として活性のポリペプチドであり、配列番号6のアミノ酸617を少なくとも含む機能的相同体、
(x)(vii)、(viii)、又は(ix)のポリペプチドのうちのいずれかを含むポリペプチド、
(xi)(vii)、(viii)、(ix)、又は(x)のポリペプチドのうちのいずれかをコードする核酸
のうちの1つ以上
を含み、
アジュバントをさらに含む
組成物。
２．  任意選択で、アジュバントをさらに含む、医薬として使用するための上記1に記載のワクチン組成物。
３．  前記免疫原として活性のペプチド断片が、配列番号10の8〜50個のアミノ酸の範囲、例えば、8〜40個のアミノ酸の範囲、例えば、8〜29個のアミノ酸の範囲の連続配列、又は最大で3個のアミノ酸が置換されているその機能的相同体を含むか、又はそれからなる、上記1又は2に記載のワクチン組成物。
４．  前記免疫原として活性のペプチド断片が、配列番号16若しくは配列番号1の8〜50個のアミノ酸の範囲、例えば、8〜40個のアミノ酸の範囲、例えば、8〜29個のアミノ酸の範囲の連続配列、又は最大で3個のアミノ酸が置換されているその機能的相同体を含むか、又はそれからなる、上記1〜3のいずれかに記載のワクチン組成物。
５．  前記免疫原として活性のペプチド断片が、
a)配列番号2若しくは配列番号3の8〜29個のアミノ酸の範囲の連続配列、又は
b)配列番号15の15〜20個のアミノ酸の範囲の連続配列、又は
c)配列番号1の25〜36個のアミノ酸の範囲の連続配列、又は
d)配列番号17の39〜44個のアミノ酸の範囲の連続配列、又は
e)最大で2個のアミノ酸が置換されているその機能的相同体
を含むか又はそれからなる、上記1〜4のいずれかに記載のワクチン組成物。
６．  前記免疫原として活性のペプチド断片が、
a)配列番号2若しくは配列番号3若しくは配列番号15の8〜11個のアミノ酸の範囲の連続配列、例えば、配列番号2若しくは配列番号3若しくは配列番号15の9〜10個のアミノ酸の連続配列、又は
b)配列番号2若しくは配列番号3若しくは配列番号1若しくは配列番号17の11〜29個のアミノ酸の範囲、例えば、15〜29個のアミノ酸の範囲、例えば、20〜29個のアミノ酸の範囲の連続配列、例えば、配列番号2若しくは配列番号3の25〜29個のアミノ酸の連続配列、又は
c)配列番号17の29〜44個のアミノ酸の範囲、例えば、36〜44個のアミノ酸の範囲、例えば、29〜36個のアミノ酸の範囲の連続配列、例えば、配列番号17の40〜44個のアミノ酸の連続配列、又は
d)a)、b)、又はc)の機能的相同体であって、最大で2個のアミノ酸が置換されている機能的相同体
を含むか又はそれからなる、上記1〜5のいずれかに記載のワクチン組成物。
７．  配列番号16又は配列番号1を含むエクソン9変異体CALRの発現によって特徴付けられる臨床状態にある個体に投与されると、配列番号16若しくは配列番号1を含むエクソン9変異体CALRを発現するがん細胞、及び/又は配列番号16若しくは配列番号1を含むエクソン9変異体CALRを発現する抗原提示細胞に対する免疫応答を誘発することが可能である、上記1〜6のいずれかに記載のワクチン組成物。
８．  個体における細胞性免疫応答を誘発することが可能である、上記1〜7のいずれかに記載のワクチン組成物。
９．  前記細胞性免疫応答が、エクソン9変異体CALRに対して特異的である、上記8に記載のワクチン組成物。
１０．  エクソン9変異体CALRを特異的に認識する細胞傷害性T細胞の形成を誘発することが可能である、上記1〜9のいずれかに記載のワクチン組成物。
１１．  エクソン9変異体CALRを特異的に認識する細胞を含む、上記1〜10のいずれかに記載のワクチン組成物。
１２．  前記免疫原として活性のペプチド断片が、配列番号6の8〜50個のアミノ酸の範囲、例えば、8〜40個のアミノ酸の範囲、例えば、8〜29個のアミノ酸の範囲の連続配列、又は最大で3個のアミノ酸が置換されているその機能的相同体からなる、上記1〜11のいずれかに記載のワクチン組成物。
１３．  前記免疫原として活性のペプチド断片が、配列番号7の8〜9個のアミノ酸の範囲の連続配列、又は最大で2個のアミノ酸が置換されているその機能的相同体からなる、上記1〜12のいずれかに記載のワクチン組成物。
１４．  前記免疫原として活性のペプチド断片が、
a)配列番号7の8〜9個のアミノ酸の範囲の連続配列、
b)最大で2個のアミノ酸が置換されているa)の機能的相同体
を含むか又はそれからなる、上記1〜13のいずれかに記載のワクチン組成物。
１５．  配列番号6のJAK2V617Fの発現によって特徴付けられる臨床状態にある個体に投与されると、細胞、例えば、配列番号6のJAK2V617F、又はこれと少なくとも70%の配列同一性を共有する機能的相同体を発現する、がん細胞及び/又は抗原提示細胞に対する免疫応答を誘発することが可能である、上記1〜14のいずれかに記載のワクチン組成物。
１６．  個体における細胞性免疫応答を誘発することが可能である、上記1〜15のいずれかに記載のワクチン組成物。
１７．  前記細胞性免疫応答が、JAK2V617Fに対して特異的である、上記16に記載のワクチン組成物。
１８．  JAK2V617Fを特異的に認識する細胞傷害性T細胞の形成を誘発することが可能である、上記1〜17のいずれかに記載のワクチン組成物。
１９．  JAK2V617Fを特異的に認識する細胞を含む、上記1〜18のいずれかに記載のワクチン組成物。
２０．  前記医薬が、骨髄増殖性障害を治療又は予防するためのものである、上記1〜19のいずれかに記載のワクチン組成物。
２１．  骨髄増殖性障害が、本態性血小板血症、原発性骨髄線維症、真性赤血球増加症、又は急性骨髄性白血病若しくは慢性骨髄性白血病である、上記1〜20のいずれかに記載のワクチン組成物。
２２．  以下の特徴:
a)ELISPOTアッセイにより決定して、ある臨床状態にある個体の、PBL集団内のINF-γ産生細胞を、PBL 104個当たり少なくとも1個の頻度で誘発することが可能であること、及び/又は
b)腫瘍組織試料中の、エピトープペプチドと反応性であるCTL(細胞傷害性T細胞)の、in situにおける検出が可能であること、又は
c)エクソン9変異体CALR又はJAK2V617Fを特異的に認識することが可能であるT細胞の増殖を、in vitroにおいて誘導することが可能であること
のうちの少なくとも1つを有し、MHCクラスI拘束性ペプチドを含む、上記1〜21のいずれかに記載のワクチン組成物。
２３．  MHCクラスI分子によって拘束されるペプチド断片を含む、上記1〜22のいずれかに記載のワクチン組成物。
２４．  MHCクラスII分子によって拘束されるペプチド断片を含む、上記1〜23のいずれかに記載のワクチン組成物。
２５．  臨床状態にある個体のPBL集団内のINF-γ産生細胞を、PBL 104個当たり少なくとも5個の頻度で誘発することが可能であるペプチド断片を含む、上記1〜24のいずれかに記載のワクチン組成物。
２６．  配列番号16又は配列番号1を含むエクソン9変異体CALRが発現される臨床状態にある個体のPBL集団内のINF-γ産生細胞を誘発することが可能であるペプチド断片を含む、上記1〜25のいずれかに記載のワクチン組成物。
２７．  配列番号6のJAK2V617F、又は配列番号6に対して少なくとも70%の同一性を有するその機能的相同体が発現される臨床状態にある個体の、PBL集団内のINF-γ産生細胞を誘発することが可能であるペプチド断片を含む、上記1〜26のいずれかに記載のワクチン組成物。
２８．  骨髄増殖性障害ががんである、上記1〜27のいずれかに記載のワクチン組成物。
２９．  ペプチド断片が、最大で50個のアミノ酸残基、好ましくは、最大で30個のアミノ酸残基、より好ましくは、最大で20個のアミノ酸残基、例えば、最大で9個のアミノ酸残基からなる、上記1〜28のいずれかに記載のワクチン組成物。
３０．  ペプチド断片が、配列番号2、配列番号3、配列番号15、配列番号1、配列番号17、及び前述のうちのいずれかの機能的相同体であって、最大で3個のアミノ酸が置換されている、同一な配列のポリペプチドである機能的相同体からなる群から選択される、上記1〜29のいずれかに記載のワクチン組成物。
３１．  ペプチド断片が、配列番号7及びその機能的相同体であって、最大で3個のアミノ酸、例えば、最大で2個のアミノ酸、例えば、最大で1個のアミノ酸が置換されている、同一な配列のポリペプチドである機能的相同体からなる群から選択される、上記1〜30のいずれかに記載のワクチン組成物。
３２．  ペプチド断片が配列番号7である、上記1〜31のいずれかに記載のワクチン組成物。
３３．  前記ポリペプチドが、配列番号7のアミノ酸の連続配列、好ましくは、配列番号7を含む、最大で100個のアミノ酸、好ましくは、最大で60個のアミノ酸、より好ましくは、最大で20個のアミノ酸、例えば、最大で9個のアミノ酸のポリペプチドである、上記1〜32のいずれかに記載のワクチン組成物。
３４．  前記ポリペプチドが、配列番号2、配列番号3、配列番号15、配列番号1、又は配列番号17のアミノ酸のうちの少なくとも8アミノ酸の連続配列を含む、最大で100個のアミノ酸、好ましくは、最大で60個のアミノ酸、より好ましくは、最大で20個のアミノ酸、例えば、最大で9個のアミノ酸のポリペプチドである、上記1〜33のいずれかに記載のワクチン組成物。
３５．  前記ポリペプチドが、配列番号2、配列番号3、配列番号15、配列番号1、又は配列番号17を含む、最大で100個のアミノ酸、例えば、最大で90個のアミノ酸、例えば、最大で80個のアミノ酸、例えば、最大で60個のアミノ酸、例えば、最大で40個のアミノ酸、例えば、最大で30個のアミノ酸、例えば、最大で29個のアミノ酸のポリペプチドである、上記1〜34のいずれかに記載のワクチン組成物。
３６．  ワクチンが、ワクチン接種された個体における、細胞、例えば、配列番号16若しくは配列番号1を含むエクソン9変異体CALRを発現するがん細胞、及び/又は配列番号16若しくは配列番号1を含むエクソン9変異体CALRの抗原を提示する抗原提示細胞に対する細胞傷害効果を有するT細胞の産生を誘発する、上記1〜35のいずれかに記載のワクチン組成物。
３７．  ワクチンが、ワクチン接種された個体における、配列番号7を含む変異体JAK2を発現するがん細胞、及び/又は配列番号6の変異体JAK2の抗原を提示する抗原提示細胞に対する細胞傷害効果を有するT細胞の産生を誘発する、上記1〜36のいずれかに記載のワクチン組成物。
３８．  対象における臨床応答を誘発することが可能であり、臨床応答が、安定、部分奏効、又は完全寛解により特徴付けられる、上記1〜37のいずれかに記載のワクチン組成物。
３９．  CALRでもエクソン9変異体CALRでもないタンパク質又はペプチド断片から選択される免疫原として活性のタンパク質又はペプチド断片をさらに含む、上記1〜38のいずれかに記載のワクチン組成物。
４０．  JAK2でもJAK2V617Fでもないタンパク質又はペプチド断片から選択される免疫原として活性のタンパク質又はペプチド断片をさらに含む、上記1〜39のいずれかに記載のワクチン組成物。
４１．  アジュバントが、細菌DNAベースのアジュバント、油/界面活性剤ベースのアジュバント、ウイルスdsRNAベースのアジュバント、及びイミダゾキニリンからなる群から選択される、上記1〜40のいずれかに記載のワクチン組成物。
４２．  アジュバントがMontanide ISAアジュバントである、上記1〜41のいずれかに記載のワクチン組成物。
４３．  アジュバントがMontanide ISA 51又はMontanide ISA 720である、上記42に記載のワクチン組成物。
４４．  アジュバントがMontanide ISA 51である、上記43に記載のワクチン組成物。
４５．  アジュバントがGM-CSFである、上記1〜41のいずれかに記載のワクチン組成物。
４６．  免疫原として活性のペプチド断片、又は前記免疫原として活性のペプチド断片をコードする核酸を含む抗原提示細胞を含む、上記1〜45のいずれかに記載のワクチン組成物。
４７．  抗原提示細胞が樹状細胞である、上記45に記載のワクチン組成物。
４８．  核酸が、上記1〜47のいずれかに記載のペプチドをコードする、上記2又は上記3に記載のワクチン組成物。
４９．  核酸がベクター内に含まれる、上記1〜48のいずれかに記載のワクチン組成物。
５０．  ベクターが、ウイルスベクター及び細菌ベクターからなる群から選択される、上記48に記載のワクチン組成物。
５１．  ベクターが、T細胞刺激性ポリペプチドをコードする核酸をさらに含む、上記48又は49に記載のワクチン組成物。
５２．  配列番号16若しくは配列番号1を含むエクソン9変異体CALR及び/又は配列番号6の変異体JAK2V617Fが発現される骨髄増殖性障害を治療するためのものである、上記1〜51のいずれかに記載のワクチン組成物。
５３．  上記1〜51のいずれかに記載のワクチン組成物、及び第2の有効成分を含むキット。
５４．  第2の有効成分が免疫刺激組成物である、上記53に記載のキット。
５５．  免疫刺激組成物がIFN-γを含む、上記54に記載のキット。
５６．  さらなる免疫刺激組成物が、1種以上のインターロイキンを含む、上記54又は55に記載のキット。
５７．  インターロイキンが、IL-2及び/又はIL-21から選択される、上記53〜56のいずれかに記載のキット。
５８．  第2の有効成分が抗がん剤である、上記53〜56のいずれかに記載のキット。
５９．  抗がん剤が化学療法剤である、上記58に記載のキット。
６０．  化学療法剤が、アクチミド、アザシチジン、アザチオプリン、ブレオマイシン、カルボプラチン、カペシタビン、シスプラチン、クロラムブシル、シクロホスファミド、シタラビン、ダウノルビシン、ドセタキセル、ドキシフルリジン、ドキソルビシン、エピルビシン、エトポシド、フルダラビン、フルオロウラシル、ゲムシタビン、ヒドロキシウレア、イダルビシン、イリノテカン、レナリドミド、ロイコボリン、メクロレタミン、メルファラン、メルカプトプリン、メトトレキサート、ミトキサントロン、オキサリプラチン、パクリタキセル、ペメトレキセド、レブリミド、テモゾロミド、テニポシド、チオグアニン、バルルビシン、ビンブラスチン、ビンクリスチン、ビンデシン、及びビノレルビンから選択される、上記59に記載のキット。
６１．  第2の有効成分が抗生物質である、上記53〜60のいずれかに記載のキット。
６２．  抗生物質が、アモキシリン、ペニシリン、アシクロビル、及び/又はビダラビンから選択される、上記61に記載のワクチン組成物を含むキット。
６３．  提供される組成物が、同時に、又は逐次的に投与される、上記53〜62のいずれかに記載のキット。
６４．  上記1〜52のいずれかに記載のペプチド断片、及びクラスIのHLA分子若しくはクラスIIのHLA分子、又はこのような分子の断片の複合体。
６５．  単量体である、上記64に記載の複合体。
６６．  多量体である、上記64に記載の複合体。
６７．  ある臨床状態にある個体において、エクソン9変異体CALRに対して反応性のT細胞、又はJAK2V617Fに対して反応性のT細胞の存在を検出する方法であって、腫瘍組織又は血液試料を、上記64から66のいずれかに記載の複合体と接触させるステップ、及び複合体の、組織又は血液細胞との結合を検出するステップ、を含む方法。
６８．  上記1〜52、103〜104、又は107〜108のいずれかに記載のペプチド断片に特異的に結合することが可能である分子。
６９．  抗体又はその断片である、上記68に記載の分子。
７０．  T細胞受容体である、上記68又は69に記載の分子。
７１．  上記68〜70のいずれかに記載の分子の結合を遮断することが可能である分子。
７２．  エクソン9変異体CALRの発現及び/又はJAK2V617Fの発現によって特徴付けられる臨床状態を治療又は予防する方法であって、前記臨床状態にある個体に、有効量の、上記1〜52のいずれかに記載のワクチン組成物、上記68〜71のいずれかに記載の分子、上記97〜102のいずれかに記載の組成物、又は上記103〜104若しくは107〜108のいずれかに記載のペプチドを投与するステップを含む方法。
７３．  治療又は予防される臨床状態が、エクソン9変異体CALR及び/又はJAK2V617Fが発現されるがん疾患である、上記72に記載の方法。
７４．  さらなるがん治療と組み合わされる、上記72又は73に記載の方法。
７５．  さらなる治療が、化学療法、放射線治療、免疫刺激物質による治療、遺伝子治療、抗体による治療、及び樹状細胞を使用する治療からなる群から選択される、上記74に記載の方法。
７６．  治療又は予防される臨床状態が、抗原提示細胞内のエクソン9変異体CALRの発現及び/又はJAK2V617Fの発現を引き起こす障害である、上記72〜75のいずれかに記載の方法。
７７．  前記障害に対するさらなる治療と組み合わされる、上記76に記載の方法。
７８．  さらなる治療が、化学療法、免疫刺激物質による治療、遺伝子治療、抗体による治療、及び樹状細胞を使用する治療からなる群から選択される、上記77に記載の方法。
７９．  エクソン9変異体CALR又はJAK2V617Fの免疫原として活性のペプチド断片を、個体当たり50μg〜500μgの範囲、例えば、80μg〜300μgの範囲、例えば、100μg〜250μgの範囲の用量で投与され、個体が、好ましくはヒトである、上記72〜78のいずれかに記載の方法。
８０．  臨床状態を治療又は予防するための医薬の製造における、上記1〜72のいずれかに記載のワクチン組成物、上記74〜63のいずれかに記載のキット、上記68〜70のいずれかに記載の分子、又は上記89〜96のいずれかに記載のペプチド断片の使用。
８１．  治療又は予防される疾患が、エクソン9変異体CALR及び/又はJAK2V617Fが発現されるがん疾患である、上記80に記載の使用。
８２．  さらなるがん治療と組み合わされる、上記80又は81に記載の使用。
８３．  さらなる治療が、化学療法、放射線治療、免疫刺激物質による治療、遺伝子治療、抗体による治療、及び樹状細胞を使用する治療からなる群から選択される、上記82に記載の使用。
８４．  治療又は予防される臨床状態が、抗原提示細胞内のエクソン9変異体CALRの発現及び/又はJAK2V617Fの発現を引き起こす障害である、上記83に記載の使用。
８５．  前記感染に対するさらなる治療と組み合わされる、上記84に記載の使用。
８６．  さらなる治療が、化学療法、免疫刺激物質による治療、遺伝子治療、抗体による治療、及び樹状細胞を使用する治療からなる群から選択される、上記85に記載の使用。
８７．  免疫化をモニタリングする方法であって、
a)個体に由来する血液試料を用意するステップ、
b)(i)配列番号16又は配列番号1を含むCALRのエクソン9変異体、例えば、配列番号10に示される、CALRのエクソン9変異体、又は
(ii)配列番号10に示されるエクソン9変異体CALRの、免疫原として活性のペプチド断片であって、配列番号10のアミノ酸361〜411のうちの少なくとも一部を含む断片、又は
(iii)配列番号1、配列番号2、配列番号3、配列番号15、若しくは配列番号17、又はその断片からなる、免疫原として活性のペプチド、又は
(iv)配列番号6に示されるJAK2V617F変異体、又は
(v)配列番号6に示されるJAK2V617F変異体の、免疫原として活性のペプチド断片であって、配列番号6のアミノ酸617を少なくとも含む断片、又は
(vi)前述のうちのいずれかの機能的相同体
を用意するステップ、
c)前記血液試料が、タンパク質又はペプチドに特異的に結合する、抗体、又はT細胞受容体を含むT細胞を含むかどうかを決定するステップ
を含み、
これにより、前記タンパク質又はペプチドに対する免疫応答が、前記個体において惹起されたかどうかを決定する
方法。
８８．  ペプチド断片が、上記1〜52のいずれかに記載のペプチド断片である、上記87に記載の方法。
８９．  変異体CALRの発現と関連する臨床状態、例えば、骨髄増殖性障害の治療又は予防において使用するための、配列番号16若しくは配列番号1の連続配列のうちの少なくとも一部を含む、免疫原として活性のエクソン9変異体CALRのペプチド断片、又はその機能的相同体であって、最大で3個のアミノ酸が置換されていることを除き、同一な配列のポリペプチドである機能的相同体、又は前記ペプチド断片をコードする核酸。
９０．  上記1〜52のいずれかに記載のペプチド断片である、上記89に記載のペプチド断片。
９１．  がんの治療又は予防において使用するための、上記89又は90に記載のペプチド断片。
９２．  エクソン9変異体CALRの発現と関連する臨床状態、例えば、骨髄増殖性障害の治療又は予防において使用するための、配列番号2、配列番号3、配列番号15、配列番号1、若しくは配列番号17を含むか又はそれからなる、上記89〜91のいずれかに記載のペプチド断片、又はその機能的相同体であって、最大で3個のアミノ酸が置換されていることを除き、同一な配列のポリペプチドである機能的相同体、又は前記CALRのペプチド断片をコードする核酸。
９３．  変異体JAK2V617Fの発現と関連する臨床状態、例えば、骨髄増殖性障害の治療又は予防において使用するための、配列番号7の連続配列のうちの少なくとも一部を含む、免疫原として活性のJAK2V617Fのペプチド断片、又はその機能的相同体であって、最大で3個のアミノ酸が置換されていることを除き、同一な配列のポリペプチドである機能的相同体、又は前記JAK2V617Fのペプチド断片をコードする核酸。
９４．  上記1〜52のいずれかに記載のペプチド断片である、上記93に記載のペプチド断片。
９５．  がんの治療又は予防において使用するための、上記93又は94に記載のペプチド断片。
９６．  JAK2V617Fの発現と関連する臨床状態、例えば、骨髄増殖性障害の治療又は予防において使用するための、配列番号7を含むか若しくはそれからなる、上記93〜95のいずれかに記載のペプチド断片、又はその機能的相同体であって、最大で3個のアミノ酸が置換されていることを除き、同一な配列のポリペプチドである機能的相同体、又は前記JAK2のペプチド断片をコードする核酸。
９７．  エクソン9変異体CALRを特異的に認識する細胞を含む組成物であって、好ましくは、エクソン9変異体CALRが、最大で3個のアミノ酸が置換された配列番号16の連続配列を含む、組成物。
９８．  細胞が、細胞傷害性T細胞である、上記97に記載の組成物。
９９．  細胞が、上記のいずれかに記載のペプチド若しくはペプチド断片、又は上記103〜104に記載のペプチド若しくはペプチド断片を、T細胞を含む細胞集団と接触させることにより得られる、上記97又は98に記載の組成物。
１００．  JAK2V617Fを特異的に認識する細胞を含む組成物であって、好ましくは、JAK2V617Fが、最大で3個のアミノ酸が置換された配列番号6の連続配列を含む、組成物。
１０１．  細胞が、細胞傷害性T細胞である、上記100に記載の組成物。
１０２．  細胞が、上記107又は108に記載のペプチド又はペプチド断片を、T細胞を含む細胞集団と接触させることにより得られる、上記100又は101に記載の組成物。
１０３．  CALRの配列(配列番号9)、又は配列番号1の配列を含むCALRのエクソン9変異体の配列のうちの50までの連続アミノ酸を含むか、又はそれからなるペプチドであって、前記変異体が、任意選択で、配列番号10の配列を有し、前記連続アミノ酸が、配列番号1、2、3、15、16、又は17のうちのいずれか1つの配列を含み、より好ましくは、前記連続アミノ酸が、配列番号1、配列番号2、配列番号3、又は配列番号17を含み、任意選択で、最大で1〜10個の間の連続アミノ酸が、置換、例えば、保存的置換により置き換えられている、ペプチド。
１０４．  免疫原として活性である、上記103に記載のペプチド。
１０５．  上記103又は104に記載のペプチド、並びに任意選択で保存剤及び/又はアジュバントを含む医薬組成物。
１０６．  それを必要とする個体を治療する方法であって、上記103又は104に記載のペプチドを前記個体に投与するステップを含む方法。
１０７．  JAK2の配列(配列番号5)、又は配列番号6の配列を含むJAK2V617Fの配列のうちの50個までの連続アミノ酸を含むか、又はそれからなるペプチドであって、前記連続アミノ酸が、配列番号7の配列を含み、任意選択で、最大で1〜10個の間の連続アミノ酸が、置換、例えば、保存的置換により置き換えられている、ペプチド。
１０８．  免疫原として活性である、上記107に記載のペプチド。
１０９．  上記107又は108に記載のペプチド、並びに任意選択で保存剤及び/又はアジュバントを含む医薬組成物。
１１０．  それを必要とする個体を治療する方法であって、上記107又は108に記載のペプチドを前記個体に投与するステップを含む方法。
［定義］
アジュバント:投与された免疫原として活性のペプチド/抗原/核酸構築物との混合剤が、前記ペプチド/抗原に対する免疫応答を増加させるか又はそうでない場合は改変する任意の物質。