【手続補正書】
【提出日】令和2年10月16日(2020.10.16)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
野生型ｐ５３ポリペプチドより、突然変異体ｐ５３ポリペプチドに特異的な抗体を作製するための方法であって、免疫原として、（ｉ）突然変異と、突然変異に直接隣接する少なくとも１つのアミノ酸とを含む、突然変異体ｐ５３ポリペプチドのアミノ酸配列を含む抗原配列、および（ｉｉ）溶媒に接触可能な立体配置にある抗原配列をもたらすための足場配列を含むペプチドまたはポリペプチドを使用するステップを含む方法。
【請求項２】
足場配列が、溶媒に接触可能な配列を含むペプチドまたはポリペプチドに由来し、抗原配列が、ペプチドもしくはポリペプチドの溶媒に接触可能な配列に挿入されるか、またはその全部もしくは一部を置換する、請求項１に記載の方法。
【請求項３】
溶媒に接触可能な配列を含むペプチドまたはポリペプチドが、チオレドキシンであり、溶媒に接触可能な配列が、チオレドキシンの活性部位配列である、請求項２に記載の方法。
【請求項４】
免疫原として使用されるペプチドまたはポリペプチドが、さらに、抗原配列と足場配列との間に、１または複数のリンカー配列を含む、請求項１から３のいずれか一項に記載の方法。
【請求項５】
免疫原として使用されるペプチドまたはポリペプチドが、突然変異体ｐ５３ポリペプチドの少なくとも２つのアミノ酸配列を含む、請求項１から４のいずれか一項に記載の方法。
【請求項６】
免疫原として使用されるペプチドまたはポリペプチドが、さらに、突然変異体ｐ５３ポリペプチドの少なくとも２つのアミノ酸配列の間に、リンカー配列を含む、請求項５に記載の方法。
【請求項７】
突然変異体ｐ５３ポリペプチドの少なくとも２つのアミノ酸配列が、非同一である、請求項５または６に記載の方法。
【請求項８】
突然変異体ｐ５３ポリペプチドのアミノ酸配列が、少なくとも５つのアミノ酸を含む、請求項１から７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項９】
突然変異体ｐ５３ポリペプチドが、ＤＮＡ結合性ドメイン（ＤＢＤ）内に、突然変異を含む、請求項１から８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１０】
突然変異体ｐ５３ポリペプチドが、Ｒ１７５Ｈ、Ｒ２４８Ｑ、Ｒ２７３Ｈ、Ｒ２４８Ｗ、Ｇ２４５Ｓ、Ｒ２７３Ｃ、Ｒ２８２Ｗ、Ｒ２４９Ｓ、Ｇ２４５Ｄ、Ｃ１７６Ｆ、Ｈ１７９Ｙ、Ｈ１７９Ｒ、Ｙ２２０Ｃ、およびＲ３３７Ｈのうちの１つから選択される突然変異を含む、請求項１から８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１１】
突然変異体ｐ５３ポリペプチドが、配列番号３〜１６のうちの１つのアミノ酸配列を含むか、またはこれからなる、請求項１から８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１２】
請求項１から１１のいずれか一項に記載の免疫原を含むがんワクチン。
【請求項１３】
がんに対するワクチン接種の方法における使用のための、請求項１から１１のいずれか一項に記載の免疫原。
【請求項１４】
請求項１から１１のいずれか一項に記載の免疫原の、がんに対するワクチン接種における使用のための医薬の製造における使用。
【請求項１５】
がんが、突然変異体ｐ５３ポリペプチドを発現するか、または突然変異体ｐ５３ポリペプチドをコードする核酸を含む、１または複数の細胞を含むがんである、請求項１２から１４いずれか一項に記載のがんワクチン、免疫原、または使用。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０５４９
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０５４９】
まとめると、ＥＬＩＳＡ、細胞染色、ウェスタンブロット、およびフローサイトメトリーのデータは、ＴｒｘＲ１７５Ｈが、突然変異体Ｒ１７５Ｈ  ｐ５３に対するＴ細胞およびＢ細胞両方の応答を、効果的に誘発しうることを裏付ける。
非限定的に、本発明は以下の態様を含む。
［態様１］
野生型ｐ５３ポリペプチドより、突然変異体ｐ５３ポリペプチドに特異的な抗体を作製するための方法であって、免疫原として、（ｉ）突然変異と、突然変異に直接隣接する少なくとも１つのアミノ酸とを含む、突然変異体ｐ５３ポリペプチドのアミノ酸配列を含む抗原配列、および（ｉｉ）溶媒に接触可能な立体配置にある抗原配列をもたらすための足場配列を含むペプチドまたはポリペプチドを使用するステップを含む方法。
［態様２］
足場配列が、溶媒に接触可能な配列を含むペプチドまたはポリペプチドに由来し、抗原配列が、ペプチドもしくはポリペプチドの溶媒に接触可能な配列に挿入されるか、またはその全部もしくは一部を置換する、態様１に記載の方法。
［態様３］
溶媒に接触可能な配列を含むペプチドまたはポリペプチドが、チオレドキシンであり、溶媒に接触可能な配列が、チオレドキシンの活性部位配列である、態様２に記載の方法。
［態様４］
免疫原として使用されるペプチドまたはポリペプチドが、さらに、抗原配列と足場配列との間に、１または複数のリンカー配列を含む、態様１から３のいずれか一項に記載の方法。
［態様５］
免疫原として使用されるペプチドまたはポリペプチドが、突然変異体ｐ５３ポリペプチドの少なくとも２つのアミノ酸配列を含む、態様１から４のいずれか一項に記載の方法。
［態様６］
免疫原として使用されるペプチドまたはポリペプチドが、さらに、突然変異体ｐ５３ポリペプチドの少なくとも２つのアミノ酸配列の間に、リンカー配列を含む、態様５に記載の方法。
［態様７］
突然変異体ｐ５３ポリペプチドの少なくとも２つのアミノ酸配列が、非同一である、態様５または６に記載の方法。
［態様８］
突然変異体ｐ５３ポリペプチドのアミノ酸配列が、少なくとも５つのアミノ酸を含む、態様１から７のいずれか一項に記載の方法。
［態様９］
突然変異体ｐ５３ポリペプチドが、ＤＮＡ結合性ドメイン（ＤＢＤ）内に、突然変異を含む、態様１から８のいずれか一項に記載の方法。
［態様１０］
突然変異体ｐ５３ポリペプチドが、Ｒ１７５Ｈ、Ｒ２４８Ｑ、Ｒ２７３Ｈ、Ｒ２４８Ｗ、Ｇ２４５Ｓ、Ｒ２７３Ｃ、Ｒ２８２Ｗ、Ｒ２４９Ｓ、Ｇ２４５Ｄ、Ｃ１７６Ｆ、Ｈ１７９Ｙ、Ｈ１７９Ｒ、Ｙ２２０Ｃ、およびＲ３３７Ｈのうちの１つから選択される突然変異を含む、態様１から９のいずれか一項に記載の方法。
［態様１１］
突然変異体ｐ５３ポリペプチドが、配列番号３〜１６のうちの１つのアミノ酸配列を含むか、またはこれからなる、態様１から１０のいずれか一項に記載の方法。
［態様１２］
態様１から１１のいずれか一項に記載の方法により得られるか、または得ることが可能な抗体または抗原結合性断片。
［態様１３］
野生型ｐ５３ポリペプチドより、突然変異体ｐ５３ポリペプチドに特異的である抗体または抗原結合性断片。
［態様１４］
突然変異体ｐ５３ポリペプチドが、ＤＮＡ結合性ドメイン（ＤＢＤ）内に、突然変異を含む、態様１３に記載の抗体または抗原結合性断片。
［態様１５］
突然変異体ｐ５３ポリペプチドが、Ｒ１７５Ｈ、Ｒ２４８Ｑ、Ｒ２７３Ｈ、Ｒ２４８Ｗ、Ｇ２４５Ｓ、Ｒ２７３Ｃ、Ｒ２８２Ｗ、Ｒ２４９Ｓ、Ｇ２４５Ｄ、Ｃ１７６Ｆ、Ｈ１７９Ｙ、Ｈ１７９Ｒ、Ｙ２２０Ｃ、およびＲ３３７Ｈのうちの１つから選択される突然変異を含む、態様１３または１４に記載の抗体または抗原結合性断片。
［態様１６］
突然変異体ｐ５３ポリペプチドが、配列番号３〜１６のうちの１つのアミノ酸配列を含むか、またはこれからなる、態様１３から１５のいずれか一項に記載の抗体または抗原結合性断片。
［態様１７］
Ｒ１７５Ｈ  ｐ５３ポリペプチドに結合することが可能であり、任意に単離されており、アミノ酸配列ｉ）〜ｖｉ）：
ｉ）  ＬＣ−ＣＤＲ１：ＱＳＬＬＮＳＧＮＱＫＳＸ１  （配列番号３１）；
ｉｉ）  ＬＣ−ＣＤＲ２：ＧＡＳ  （配列番号２０）；
ｉｉｉ）  ＬＣ−ＣＤＲ３：ＱＮＤＨＳＹＰＬＴ  （配列番号２１）；
ｉｖ）  ＨＣ−ＣＤＲ１：ＧＸ２ＴＦＴＥＹＴ  （配列番号３２）；
ｖ）  ＨＣ−ＣＤＲ２：ＩＸ３ＰＸ４Ｘ５ＧＸ６Ｔ  （配列番号３３）；
ｖｉ）  ＨＣ−ＣＤＲ３：ＡＲＷＧＧＤＹＶ  （配列番号２７）
を有する抗体もしくは抗原結合性断片、または配列ｉ）〜ｖｉ）のうちの１もしくは複数における、１つもしくは２つもしくは３つのアミノ酸が、別のアミノ酸で置きかえられた、そのバリアント［配列中、Ｘ１＝ＹまたはＮ；Ｘ２＝ＦまたはＹ；Ｘ３＝ＤまたはＮ；Ｘ４＝ＮまたはＹ；Ｘ５＝ＮまたはＳ；およびＸ６＝ＶまたはＧ］。
［態様１８］
ＬＣ−ＣＤＲ１が、ＱＳＬＬＮＳＧＮＱＫＳＹ（配列番号１９）またはＱＳＬＬＮＳＧＮＱＫＳＮ（配列番号２３）のうちの１つである、態様１７に記載の抗体または抗原結合性断片。
［態様１９］
ＨＣ−ＣＤＲ１が、ＧＦＴＦＴＥＹＴ（配列番号２５）またはＧＹＴＦＴＥＹＴ（配列番号２９）のうちの１つである、態様１７または１８に記載の抗体または抗原結合性断片。
［態様２０］
ＨＣ−ＣＤＲ２が、ＩＤＰＮＮＧＶＴ（配列番号２６）またはＩＮＰＹＳＧＧＴ（配列番号３０）のうちの１つである、態様１７から１９のいずれか一項に記載の抗体または抗原結合性断片。
［態様２１］
以下のＣＤＲ：
ＬＣ−ＣＤＲ１：ＱＳＬＬＮＳＧＮＱＫＳＸ１  （配列番号３１）；
ＬＣ−ＣＤＲ２：ＧＡＳ  （配列番号２０）；
ＬＣ−ＣＤＲ３：ＱＮＤＨＳＹＰＬＴ  （配列番号２１）
［配列中、Ｘ１＝ＹまたはＮ］が組み込まれた少なくとも１つの軽鎖可変領域を有する、態様１７から２０のいずれか一項に記載の抗体または抗原結合性断片。
［態様２２］
以下のＣＤＲ：
ＬＣ−ＣＤＲ１：ＱＳＬＬＮＳＧＮＱＫＳＹ  （配列番号１９）；
ＬＣ−ＣＤＲ２：ＧＡＳ  （配列番号２０）；
ＬＣ−ＣＤＲ３：ＱＮＤＨＳＹＰＬＴ  （配列番号２１）
が組み込まれた少なくとも１つの軽鎖可変領域を有する、態様２１に記載の抗体または抗原結合性断片。
［態様２３］
以下のＣＤＲ：
ＬＣ−ＣＤＲ１：ＱＳＬＬＮＳＧＮＱＫＳＮ  （配列番号２３）；
ＬＣ−ＣＤＲ２：ＧＡＳ  （配列番号２０）；
ＬＣ−ＣＤＲ３：ＱＮＤＨＳＹＰＬＴ  （配列番号２１）
が組み込まれた少なくとも１つの軽鎖可変領域を有する、態様２１に記載の抗体または抗原結合性断片。
［態様２４］
以下のＣＤＲ：
ＨＣ−ＣＤＲ１：ＧＸ２ＴＦＴＥＹＴ  （配列番号３２）；
ＨＣ−ＣＤＲ２：ＩＸ３ＰＸ４Ｘ５ＧＸ６Ｔ  （配列番号３３）；
ＨＣ−ＣＤＲ３：ＡＲＷＧＧＤＹＶ  （配列番号２７）
［配列中、Ｘ２＝ＦまたはＹ；Ｘ３＝ＤまたはＮ；Ｘ４＝ＮまたはＹ；Ｘ５＝ＮまたはＳ；およびＸ６＝ＶまたはＧ］が組み込まれた少なくとも１つの重鎖可変領域を有する、態様１７から２３のいずれか一項に記載の抗体または抗原結合性断片。
［態様２５］
以下のＣＤＲ：
ＨＣ−ＣＤＲ１：ＧＦＴＦＴＥＹＴ  （配列番号２５）；
ＨＣ−ＣＤＲ２：ＩＤＰＮＮＧＶＴ  （配列番号２６）；
ＨＣ−ＣＤＲ３：ＡＲＷＧＧＤＹＶ  （配列番号２７）
が組み込まれた少なくとも１つの重鎖可変領域を有する、態様２４に記載の抗体または抗原結合性断片。
［態様２６］
以下のＣＤＲ：
ＨＣ−ＣＤＲ１：ＧＹＴＦＴＥＹＴ  （配列番号２９）；
ＨＣ−ＣＤＲ２：ＩＮＰＹＳＧＧＴ  （配列番号３０）；
ＨＣ−ＣＤＲ３：ＡＲＷＧＧＤＹＶ  （配列番号２７）
が組み込まれた少なくとも１つの重鎖可変領域を有する、態様２４に記載の抗体または抗原結合性断片。
［態様２７］
以下のＣＤＲ：
ＬＣ−ＣＤＲ１：ＱＳＬＬＮＳＧＮＱＫＳＸ１  （配列番号３１）；
ＬＣ−ＣＤＲ２：ＧＡＳ  （配列番号２０）；
ＬＣ−ＣＤＲ３：ＱＮＤＨＳＹＰＬＴ  （配列番号２１）
［配列中、Ｘ１＝ＹまたはＮ］を含む、単離された、軽鎖可変領域のポリペプチド。
［態様２８］
ＬＣ−ＣＤＲ１が、ＱＳＬＬＮＳＧＮＱＫＳＹ（配列番号１９）またはＱＳＬＬＮＳＧＮＱＫＳＮ（配列番号２３）のうちの１つである、態様２７に記載の、単離された、軽鎖可変領域のポリペプチド。
［態様２９］
以下のＣＤＲ：
ＨＣ−ＣＤＲ１：ＧＸ２ＴＦＴＥＹＴ  （配列番号３２）；
ＨＣ−ＣＤＲ２：ＩＸ３ＰＸ４Ｘ５ＧＸ６Ｔ  （配列番号３３）；
ＨＣ−ＣＤＲ３：ＡＲＷＧＧＤＹＶ  （配列番号２７）
［配列中、Ｘ２＝ＦまたはＹ；Ｘ３＝ＤまたはＮ；Ｘ４＝ＮまたはＹ；Ｘ５＝ＮまたはＳ；およびＸ６＝ＶまたはＧ］を含む、単離された、重鎖可変領域のポリペプチド。
［態様３０］
ＨＣ−ＣＤＲ１が、ＧＦＴＦＴＥＹＴ（配列番号２５）またはＧＹＴＦＴＥＹＴ（配列番号２９）のうちの１つである、態様２９に記載の、単離された、重鎖可変領域のポリペプチド。
［態様３１］
ＨＣ−ＣＤＲ２が、ＩＤＰＮＮＧＶＴ（配列番号２６）またはＩＮＰＹＳＧＧＴ（配列番号３０）のうちの１つである、態様２９または３０に記載の、単離された、重鎖可変領域のポリペプチド。
［態様３２］
態様２９から３１のいずれか一項に記載の、重鎖可変領域のポリペプチドと組み合わされた、態様２７または２８に記載の、単離された、軽鎖可変領域のポリペプチド。
［態様３３］
Ｒ１７５Ｈ  ｐ５３ポリペプチドに結合することが可能であり、軽鎖可変領域および重鎖可変領域の配列を含み、
軽鎖が、ＬＣ−ＣＤＲ１：ＱＳＬＬＮＳＧＮＱＫＳＸ１（配列番号３１）、ＱＳＬＬＮＳＧＮＱＫＳＹ（配列番号１９）、またはＱＳＬＬＮＳＧＮＱＫＳＮ（配列番号２３）のうちの１つ；ＬＣ−ＣＤＲ２：ＧＡＳ（配列番号２０）；ＬＣ−ＣＤＲ３：ＱＮＤＨＳＹＰＬＴ（配列番号２１）に対する、少なくとも８５％の、全体的な配列同一性を有するＬＣ−ＣＤＲ１、ＬＣ−ＣＤＲ２、ＬＣ−ＣＤＲ３を含み；そして
重鎖が、ＨＣ−ＣＤＲ１：ＧＸ２ＴＦＴＥＹＴ（配列番号３２）、ＧＦＴＦＴＥＹＴ（配列番号２５）またはＧＹＴＦＴＥＹＴ（配列番号２９）のうちの１つ；ＨＣ−ＣＤＲ２：ＩＸ３ＰＸ４Ｘ５ＧＸ６Ｔ（配列番号３３）、ＩＤＰＮＮＧＶＴ（配列番号２６）、またはＩＮＰＹＳＧＧＴ（配列番号３０）のうちの１つ；ＨＣ−ＣＤＲ３：ＡＲＷＧＧＤＹＶ（配列番号２７）［配列中、Ｘ１＝ＹまたはＮ；Ｘ２＝ＦまたはＹ；Ｘ３＝ＤまたはＮ；Ｘ４＝ＮまたはＹ；Ｘ５＝ＮまたはＳ；およびＸ６＝ＶまたはＧ］に対する、少なくとも８５％の、全体的な配列同一性を有するＨＣ−ＣＤＲ１、ＨＣ−ＣＤＲ２、ＨＣ−ＣＤＲ３を含む、
抗体または抗原結合性断片。
［態様３４］
Ｒ１７５Ｈ  ｐ５３ポリペプチドに結合することが可能であり、軽鎖可変領域および重鎖可変領域の配列を含み、
軽鎖配列が、配列番号１８もしくは２２（図２４）、または配列番号２３７もしくは９４（図４９）の軽鎖配列に対する、少なくとも８５％の配列同一性を有し；そして
重鎖配列が、配列番号２４もしくは２８（図２５）、または配列番号２３９、２４０、もしくは２４１（図５０）の重鎖配列に対する、少なくとも８５％の配列同一性を有する、
抗体または抗原結合性断片。
［態様３５］
Ｒ１７５Ｈ  ｐ５３ポリペプチドに結合することが可能であり、（ｉ）態様１７から３４のいずれか一項に記載の抗原結合性断片またはポリペプチド、および（ｉｉ）Ｒ１７５Ｈ  ｐ５３ポリペプチド以外のポリペプチドに結合することが可能な抗原結合性断片を含む二特異性抗体または二特異性抗原結合性断片である、任意に単離された抗体または抗原結合性断片。
［態様３６］
Ｒ１７５Ｈ  ｐ５３ポリペプチドまたはこの断片に結合した、態様１７から３５のいずれか一項に記載の抗体、抗原結合性断片、またはポリペプチドを含む、任意に単離された、ｉｎ  ｖｉｔｒｏにおける複合体。
［態様３７］
Ｒ２４８Ｑ  ｐ５３ポリペプチドに結合することが可能であり、任意に単離されており、アミノ酸配列ｉ）〜ｖｉ）：
ｉ）  ＬＣ−ＣＤＲ１：ＱＳＬＬＹＳＤＧＫＴＹ  （配列番号４１）；
ｉｉ）  ＬＣ−ＣＤＲ２：ＬＶＳ  （配列番号４２）；
ｉｉｉ）  ＬＣ−ＣＤＲ３：ＷＱＧＴＨＦＰＬＴ  （配列番号４３）；
ｉｖ）  ＨＣ−ＣＤＲ１：ＧＹＴＦＴＤＹＹ  （配列番号４６）；
ｖ）  ＨＣ−ＣＤＲ２：ＩＸ７ＰＫＮＧＧＴ  （配列番号５２）；
ｖｉ）  ＨＣ−ＣＤＲ３：ＡＫＸ８ＧＧＸ９ＤＤＹ  （配列番号５３）
を有する抗体もしくは抗原結合性断片、または配列ｉ）〜ｖｉ）のうちの１もしくは複数における、１つもしくは２つもしくは３つのアミノ酸が、別のアミノ酸で置きかえられた、そのバリアント［配列中、Ｘ７＝ＨまたはＤ；Ｘ８＝ＭまたはＱ；およびＸ９＝ＹまたはＦ］。
［態様３８］
ＨＣ−ＣＤＲ２が、ＩＨＰＫＮＧＧＴ（配列番号４７）またはＩＤＰＫＮＧＧＴ（配列番号５０）のうちの１つである、態様３７に記載の抗体または抗原結合性断片。
［態様３９］
ＨＣ−ＣＤＲ３が、ＡＫＭＧＧＹＤＤＹ（配列番号４８）またはＡＫＱＧＧＦＤＤＹ（配列番号５１）のうちの１つである、態様３７または３８に記載の抗体または抗原結合性断片。
［態様４０］
以下のＣＤＲ：
ＬＣ−ＣＤＲ１：ＱＳＬＬＹＳＤＧＫＴＹ  （配列番号４１）
ＬＣ−ＣＤＲ２：ＬＶＳ  （配列番号４２）
ＬＣ−ＣＤＲ３：ＷＱＧＴＨＦＰＬＴ  （配列番号４３）
が組み込まれた少なくとも１つの軽鎖可変領域を有する、態様３７から３９のいずれか一項に記載の抗体または抗原結合性断片。
［態様４１］
以下のＣＤＲ：
ＨＣ−ＣＤＲ１：ＧＹＴＦＴＤＹＹ  （配列番号４６）；
ＨＣ−ＣＤＲ２：ＩＸ７ＰＫＮＧＧＴ  （配列番号５２）；
ＨＣ−ＣＤＲ３：ＡＫＸ８ＧＧＸ９ＤＤＹ  （配列番号５３）
［配列中、Ｘ７＝ＨまたはＤ；Ｘ８＝ＭまたはＱ；およびＸ９＝ＹまたはＦ］が組み込まれた少なくとも１つの重鎖可変領域を有する、態様３７から４０のいずれか一項に記載の抗体または抗原結合性断片。
［態様４２］
以下のＣＤＲ：
ＨＣ−ＣＤＲ１：ＧＹＴＦＴＤＹＹ  （配列番号４６）；
ＨＣ−ＣＤＲ２：ＩＨＰＫＮＧＧＴ  （配列番号４７）；
ＨＣ−ＣＤＲ３：ＡＫＭＧＧＹＤＤＹ  （配列番号４８）
が組み込まれた少なくとも１つの重鎖可変領域を有する、態様４１に記載の抗体または抗原結合性断片。
［態様４３］
以下のＣＤＲ：
ＨＣ−ＣＤＲ１：ＧＹＴＦＴＤＹＹ  （配列番号４６）；
ＨＣ−ＣＤＲ２：ＩＤＰＫＮＧＧＴ  （配列番号５０）；
ＨＣ−ＣＤＲ３：ＡＫＱＧＧＦＤＤＹ  （配列番号５１）
が組み込まれた少なくとも１つの重鎖可変領域を有する、態様４１に記載の抗体または抗原結合性断片。
［態様４４］
以下のＣＤＲ：
ＬＣ−ＣＤＲ１：ＱＳＬＬＹＳＤＧＫＴＹ  （配列番号４１）
ＬＣ−ＣＤＲ２：ＬＶＳ  （配列番号４２）
ＬＣ−ＣＤＲ３：ＷＱＧＴＨＦＰＬＴ  （配列番号４３）
を含む、単離された、軽鎖可変領域のポリペプチド。
［態様４５］
以下のＣＤＲ：
ＨＣ−ＣＤＲ１：ＧＹＴＦＴＤＹＹ  （配列番号４６）；
ＨＣ−ＣＤＲ２：ＩＸ７ＰＫＮＧＧＴ  （配列番号５２）；
ＨＣ−ＣＤＲ３：ＡＫＸ８ＧＧＸ９ＤＤＹ  （配列番号５３）
［配列中、Ｘ７＝ＨまたはＤ；Ｘ８＝ＭまたはＱ；およびＸ９＝ＹまたはＦ］を含む、単離された、重鎖可変領域のポリペプチド。
［態様４６］
ＨＣ−ＣＤＲ２が、ＩＨＰＫＮＧＧＴ（配列番号４７）またはＩＤＰＫＮＧＧＴ（配列番号５０）のうちの１つである、態様４５に記載の、単離された、重鎖可変領域のポリペプチド。
［態様４７］
ＨＣ−ＣＤＲ３が、ＡＫＭＧＧＹＤＤＹ（配列番号４８）またはＡＫＱＧＧＦＤＤＹ（配列番号５１）のうちの１つである、態様４５または４６に記載の、単離された、重鎖可変領域のポリペプチド。
［態様４８］
態様４５から４７のいずれか一項に記載の、重鎖可変領域のポリペプチドと組み合わされた、態様４４に記載の、単離された、軽鎖可変領域のポリペプチド。
［態様４９］
Ｒ２４８Ｑ  ｐ５３ポリペプチドに結合することが可能であり、軽鎖可変領域および重鎖可変領域の配列を含み、
軽鎖が、ＬＣ−ＣＤＲ１：ＱＳＬＬＹＳＤＧＫＴＹ（配列番号４１）；ＬＣ−ＣＤＲ２：ＬＶＳ（配列番号４２）；ＬＣ−ＣＤＲ３：ＷＱＧＴＨＦＰＬＴ（配列番号４３）に対する、少なくとも８５％の、全体的な配列同一性を有するＬＣ−ＣＤＲ１、ＬＣ−ＣＤＲ２、ＬＣ−ＣＤＲ３を含み；そして
重鎖が、ＨＣ−ＣＤＲ１：ＧＹＴＦＴＤＹＹ（配列番号４６）；ＨＣ−ＣＤＲ２：ＩＸ７ＰＫＮＧＧＴ（配列番号５２）、ＩＨＰＫＮＧＧＴ（配列番号４７）またはＩＤＰＫＮＧＧＴ（配列番号５０）のうちの１つ；ＨＣ−ＣＤＲ３：ＡＫＸ８ＧＧＸ９ＤＤＹ（配列番号５３）、ＡＫＭＧＧＹＤＤＹ（配列番号４８）またはＡＫＱＧＧＦＤＤＹ（配列番号５１）［配列中、Ｘ７＝ＨまたはＤ；Ｘ８＝ＭまたはＱ；およびＸ９＝ＹまたはＦ］のうちの１つに対する、少なくとも８５％の、全体的な配列同一性を有するＨＣ−ＣＤＲ１、ＨＣ−ＣＤＲ２、ＨＣ−ＣＤＲ３を含む、
抗体または抗原結合性断片。
［態様５０］
Ｒ２４８Ｑ  ｐ５３ポリペプチドに結合することが可能であり、軽鎖可変領域および重鎖可変領域の配列を含み、
軽鎖配列が、配列番号４０もしくは４４（図２８）、または配列番号２５１もしくは２５２（図５７）の軽鎖配列に対する、少なくとも８５％の配列同一性を有し；そして
重鎖配列が、配列番号４５もしくは４９（図２９）、または配列番号２５３もしくは２５４（図５８）の重鎖配列に対する、少なくとも８５％の配列同一性を有する、
抗体または抗原結合性断片。
［態様５１］
Ｒ２４８Ｑ  ｐ５３ポリペプチドに結合することが可能であり、（ｉ）態様３７から５０のいずれか一項に記載の抗原結合性断片またはポリペプチド、および（ｉｉ）Ｒ２４８Ｑ  ｐ５３ポリペプチド以外のポリペプチドに結合することが可能な抗原結合性断片を含む二特異性抗体または二特異性抗原結合性断片である、任意に単離された抗体または抗原結合性断片。
［態様５２］
Ｒ２４８Ｑ  ｐ５３ポリペプチドまたはこの断片に結合した、態様３７から５１のいずれか一項に記載の抗体、抗原結合性断片、またはポリペプチドを含む、任意に単離された、ｉｎ  ｖｉｔｒｏにおける複合体。
［態様５３］
Ｒ２７３Ｈ  ｐ５３ポリペプチドに結合することが可能であり、任意に単離されており、アミノ酸配列ｉ）〜ｖｉ）：
ｉ）  ＬＣ−ＣＤＲ１：ＱＳＩＶＨＮＮＧＤＴＹ  （配列番号５９）；
ｉｉ）  ＬＣ−ＣＤＲ２：ＫＶＳ  （配列番号６０）；
ｉｉｉ）  ＬＣ−ＣＤＲ３：ＦＱＧＳＨＬＰＬＴ  （配列番号６１）；
ｉｖ）  ＨＣ−ＣＤＲ１：ＧＦＳＦＳＤＹＹ  （配列番号６３）；
ｖ）  ＨＣ−ＣＤＲ２：ＩＳＶＧＧＴＹＴ  （配列番号６４）；
ｖｉ）  ＨＣ−ＣＤＲ３：ＶＲＤＧＮＤＧＫＦＬＧ  （配列番号６５）
を有する抗体もしくは抗原結合性断片、または配列ｉ）〜ｖｉ）のうちの１もしくは複数における、１つもしくは２つもしくは３つのアミノ酸が、別のアミノ酸で置きかえられた、そのバリアント。
［態様５４］
以下のＣＤＲ：
ＬＣ−ＣＤＲ１：ＱＳＩＶＨＮＮＧＤＴＹ  （配列番号５９）
ＬＣ−ＣＤＲ２：ＫＶＳ  （配列番号６０）
ＬＣ−ＣＤＲ３：ＦＱＧＳＨＬＰＬＴ  （配列番号６１）
が組み込まれた少なくとも１つの軽鎖可変領域を有する、態様５３に記載の抗体または抗原結合性断片。
［態様５５］
以下のＣＤＲ：
ＨＣ−ＣＤＲ１：ＧＦＳＦＳＤＹＹ  （配列番号６３）
ＨＣ−ＣＤＲ２：ＩＳＶＧＧＴＹＴ  （配列番号６４）
ＨＣ−ＣＤＲ３：ＶＲＤＧＮＤＧＫＦＬＧ  （配列番号６５）
が組み込まれた少なくとも１つの重鎖可変領域を有する、態様５３または５４に記載の抗体または抗原結合性断片。
［態様５６］
以下のＣＤＲ：
ＬＣ−ＣＤＲ１：ＱＳＩＶＨＮＮＧＤＴＹ  （配列番号５９）
ＬＣ−ＣＤＲ２：ＫＶＳ  （配列番号６０）
ＬＣ−ＣＤＲ３：ＦＱＧＳＨＬＰＬＴ  （配列番号６１）
を含む、単離された、軽鎖可変領域のポリペプチド。
［態様５７］
以下のＣＤＲ：
ＨＣ−ＣＤＲ１：ＧＦＳＦＳＤＹＹ  （配列番号６３）
ＨＣ−ＣＤＲ２：ＩＳＶＧＧＴＹＴ  （配列番号６４）
ＨＣ−ＣＤＲ３：ＶＲＤＧＮＤＧＫＦＬＧ  （配列番号６５）
を含む、単離された、重鎖可変領域のポリペプチド。
［態様５８］
態様５７に記載の、重鎖可変領域のポリペプチドと組み合わされた、態様５６に記載の、単離された、軽鎖可変領域のポリペプチド。
［態様５９］
Ｒ２７３Ｈ  ｐ５３ポリペプチドに結合することが可能であり、軽鎖可変領域および重鎖可変領域の配列を含み、
軽鎖が、ＬＣ−ＣＤＲ１：ＱＳＩＶＨＮＮＧＤＴＹ（配列番号５９）；ＬＣ−ＣＤＲ２：ＫＶＳ（配列番号６０）；ＬＣ−ＣＤＲ３：ＦＱＧＳＨＬＰＬＴ（配列番号６１）に対する、少なくとも８５％の、全体的な配列同一性を有するＬＣ−ＣＤＲ１、ＬＣ−ＣＤＲ２、ＬＣ−ＣＤＲ３を含み；そして
重鎖が、ＨＣ−ＣＤＲ１：ＧＦＳＦＳＤＹＹ（配列番号６３）；ＨＣ−ＣＤＲ２：ＩＳＶＧＧＴＹＴ（配列番号６４）；ＨＣ−ＣＤＲ３：ＶＲＤＧＮＤＧＫＦＬＧ（配列番号６５）に対する、少なくとも８５％の、全体的な配列同一性を有するＨＣ−ＣＤＲ１、ＨＣ−ＣＤＲ２、ＨＣ−ＣＤＲ３を含む、
抗体または抗原結合性断片。
［態様６０］
Ｒ２７３Ｈ  ｐ５３ポリペプチドに結合することが可能であり、軽鎖可変領域および重鎖可変領域の配列を含み、
軽鎖配列が、配列番号５８（図３２）または配列番号２４７（図５３）の軽鎖配列に対する、少なくとも８５％の配列同一性を有し；そして
重鎖配列が、配列番号６２（図３３）または配列番号２４８（図５４）の重鎖配列に対する、少なくとも８５％の配列同一性を有する、
抗体または抗原結合性断片。
［態様６１］
Ｒ２７３Ｈ  ｐ５３ポリペプチドに結合することが可能であり、（ｉ）態様５３から６０のいずれか一項に記載の抗原結合性断片またはポリペプチド、および（ｉｉ）Ｒ２７３Ｈ  ｐ５３ポリペプチド以外のポリペプチドに結合することが可能な抗原結合性断片を含む二特異性抗体または二特異性抗原結合性断片である、任意に単離された抗体または抗原結合性断片。
［態様６２］
Ｒ２７３Ｈ  ｐ５３ポリペプチドまたはこの断片に結合した、態様５３から６１のいずれか一項に記載の抗体、抗原結合性断片、またはポリペプチドを含む、任意に単離された、ｉｎ  ｖｉｔｒｏにおける複合体。
［態様６３］
薬物部分または検出用部分へとコンジュゲートさせた、態様１７から３５、態様３７から５１、または態様５３から６１のいずれか一項に記載の抗体、抗原結合性断片、またはポリペプチド。
［態様６４］
態様１７から３５、態様３７から５１、または態様５３から６１のいずれか一項に記載の抗原結合性断片またはポリペプチドを含むキメラ抗原受容体（ＣＡＲ）。
［態様６５］
態様６４に記載のキメラ抗原受容体（ＣＡＲ）を含む細胞。
［態様６６］
態様１７から３５、態様３７から５１、態様５３から６１、または態様６３から６５のいずれか一項に記載の抗体、抗原結合性断片、ポリペプチド、コンジュゲート、キメラ抗原受容体（ＣＡＲ）、または細胞と、少なくとも１つの薬学的に許容される担体とを含む組成物。
［態様６７］
態様１７から３５、態様３７から５１、態様５３から６１、態様６３または６4のいずれか一項に記載の抗体、抗原結合性断片、ポリペプチド、コンジュゲート、またはキメラ抗原受容体（ＣＡＲ）をコードする単離核酸。
［態様６８］
態様６７に記載の核酸を含むベクター。
［態様６９］
態様６８に記載のベクターを含む宿主細胞。
［態様７０］
態様１７から３５、態様３７から５１、態様５３から６１、態様６３または６4のいずれか一項に記載の抗体、抗原結合性断片、ポリペプチド、コンジュゲート、またはキメラ抗原受容体（ＣＡＲ）を作製するための方法であって、抗体、抗原結合性断片、ポリペプチド、またはコンジュゲートをコードするベクターの発現に適する条件下で、態様６９に記載の宿主細胞を培養するステップと、抗体、抗原結合性断片、ポリペプチド、またはコンジュゲートを回収するステップとを含む方法。
［態様７１］
治療、または医学的処置の方法における使用のための、態様１７から３５、態様３７から５１、態様５３から６１、または態様６３から６５のいずれか一項に記載の抗体、抗原結合性断片、ポリペプチド、コンジュゲート、キメラ抗原受容体（ＣＡＲ）、または細胞。
［態様７２］
がんの処置における使用のための、態様１７から３５、態様３７から５１、態様５３から６１、または態様６３から６５のいずれか一項に記載の抗体、抗原結合性断片、ポリペプチド、コンジュゲート、キメラ抗原受容体（ＣＡＲ）、または細胞。
［態様７３］
態様１７から３５、態様３７から５１、態様５３から６１、または態様６３から６５のいずれか一項に記載の抗体、抗原結合性断片、ポリペプチド、コンジュゲート、キメラ抗原受容体（ＣＡＲ）、または細胞の、がんの処置における使用のための医薬の製造における使用。
［態様７４］
がんを処置する方法であって、態様１７から３５、態様３７から５１、態様５３から６１、または態様６３から６５のいずれか一項に記載の抗体、抗原結合性断片、ポリペプチド、コンジュゲート、キメラ抗原受容体（ＣＡＲ）、または細胞を、がんを患う患者へと投与するステップを含む方法。
［態様７５］
突然変異体ｐ５３ポリペプチドを含有するか、またはこれを含有することが疑われる試料を、態様１７から３５、態様３７から５１、態様５３から６１、または態様６３から６５のいずれか一項に記載の抗体、抗原結合性断片、ポリペプチド、コンジュゲート、キメラ抗原受容体（ＣＡＲ）、または細胞と接触させるステップと、抗体、抗原結合性断片、ポリペプチド、コンジュゲート、ＣＡＲ、または細胞の、突然変異体ｐ５３ポリペプチドとの複合体の形成を検出するステップとを含む方法。
［態様７６］
対象における疾患または状態を診断する方法であって、ｉｎ  ｖｉｔｒｏにおいて、対象に由来する試料を、態様１７から３５、態様３７から５１、態様５３から６１、または態様６３から６５のいずれか一項に記載の抗体、抗原結合性断片、ポリペプチド、コンジュゲート、キメラ抗原受容体（ＣＡＲ）、または細胞と接触させるステップと、抗体、抗原結合性断片、ポリペプチド、コンジュゲート、ＣＡＲ、または細胞の、突然変異体ｐ５３ポリペプチドとの複合体の形成を検出するステップとを含む方法。
［態様７７］
突然変異体ｐ５３ポリペプチドターゲティング剤による処置のために、対象を選択または層別化する方法であって、ｉｎ  ｖｉｔｒｏにおいて、対象に由来する試料を、態様１７から３５、態様３７から５１、態様５３から６１、または態様６３から６５のいずれか一項に記載の抗体、抗原結合性断片、ポリペプチド、コンジュゲート、キメラ抗原受容体（ＣＡＲ）、または細胞と接触させるステップと、抗体、抗原結合性断片、ポリペプチド、コンジュゲート、ＣＡＲ、または細胞の、突然変異体ｐ５３ポリペプチドとの複合体の形成を検出するステップとを含む方法。
［態様７８］
態様１７から３５、態様３７から５１、態様５３から６１、または態様６３から６５のいずれか一項に記載の抗体、抗原結合性断片、ポリペプチド、コンジュゲート、キメラ抗原受容体（ＣＡＲ）、または細胞の、ｉｎ  ｖｉｔｒｏまたはｉｎ  ｖｉｖｏにおける、突然変異体ｐ５３ポリペプチドの検出のための使用。
［態様７９］
態様１７から３５、態様３７から５１、態様５３から６１、または態様６３から６５のいずれか一項に記載の抗体、抗原結合性断片、ポリペプチド、コンジュゲート、キメラ抗原受容体（ＣＡＲ）、または細胞の、ｉｎ  ｖｉｔｒｏまたはｉｎ  ｖｉｖｏにおける、診断剤または予後診断剤としての使用。
［態様８０］
態様１７から３５、態様３７から５１、態様５３から６１、または態様６３から６５のいずれか一項に記載の抗体、抗原結合性断片、ポリペプチド、コンジュゲート、キメラ抗原受容体（ＣＡＲ）、または細胞の、ｉｎ  ｖｉｖｏにおいて、がんを検出、位置特定、またはイメージングするための方法における使用。
［態様８１］
ｉｎ  ｖｉｖｏにおいて、がんを検出、位置特定、またはイメージングするための方法であって、態様１７から３５、態様３７から５１、態様５３から６１、または態様６３から６５のいずれか一項に記載の抗体、抗原結合性断片、ポリペプチド、コンジュゲート、キメラ抗原受容体（ＣＡＲ）、または細胞を、対象へと投与するステップと、抗体、抗原結合性断片、ポリペプチド、コンジュゲート、キメラ抗原受容体（ＣＡＲ）、または細胞を検出するステップとを含む方法。
［態様８２］
態様１から１１のいずれか一項に記載の免疫原を含むワクチン。
［態様８３］
がんに対するワクチン接種の方法における使用のための、態様１から１１のいずれか一項に記載の免疫原。
［態様８４］
態様１から１１のいずれか一項に記載の免疫原の、がんに対するワクチン接種における使用のための医薬の製造における使用。
［態様８５］
がんに対して、対象にワクチン接種するための方法であって、対象へと、態様１から１１のいずれか一項に記載の免疫原を投与するステップを含み、これにより、対象に、がんに対してワクチン接種する方法。
［態様８６］
がんが、突然変異体ｐ５３ポリペプチドを発現するか、または突然変異体ｐ５３ポリペプチドをコードする核酸を含む、１または複数の細胞を含むがんである、態様８６から８５のいずれか一項に記載のがんワクチン、使用のための免疫原、使用、または方法。
【手続補正３】
【補正対象書類名】図面
【補正対象項目名】図４−２
【補正方法】変更
【補正の内容】
【図４−２】
2019535241.tif 000001