【手続補正書】
【提出日】令和1年12月16日(2019.12.16)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
生物活性を有する精製された熱安定性ポリペプチドと、
許容温度での機能的コンフォメーションにおいて光を吸収し、かつ／又は蛍光を示す精製された熱に不安定な水溶性物質と
を含む水系組成物であって、
前記ポリペプチドの最高許容温度は、前記水溶性物質の最高許容温度より高く、ここで生物活性を有する前記ポリペプチドが酵素であり、そして、
前記水溶性物質が、ハロバクテリウム・サリナルム（Halobacterium salinarum）由来のバクテリオロドプシン、又はその機能的誘導体を含む、前記水系組成物。
【請求項２】
前記ポリペプチドの許容温度で、前記ポリペプチドは生物活性を有するか、又は前記ポリペプチドの生物活性は可逆的にブロックされている、請求項１に記載の水系組成物。
【請求項３】
前記ポリペプチド及び前記水溶性物質の両方に許容される第１の温度と比較して、第１の温度より高くかつ前記水溶性物質の最高許容温度より高い第２の温度で、
（ａ）前記ポリペプチドの生物活性の５０％以上があるか、又は可逆的にブロックされており、かつ
（ｂ）前記水溶性物質の７５％以上が機能を喪失したコンフォメーションを有する、
請求項１又は２に記載の水系組成物。
【請求項４】
第２の温度で、前記組成物中において、光を吸収し、かつ／又は蛍光を示す前記水溶性物質の能力の７５％以上が不可逆的にブロックされている、請求項３に記載の水系組成物。
【請求項５】
生物活性を有する前記ポリペプチドが好熱性生体由来である、請求項１から４のいずれか１項に記載の水系組成物。
【請求項６】
前記酵素が鋳型ＲＮＡ又はＤＮＡポリメラーゼである、請求項１〜５のいずれか一項に記載の水系組成物。
【請求項７】
前記水溶性物質が、機能的コンフォメーションにおいて、可視光を吸収し、具体的には５００ｎｍから６５０ｎｍの波長範囲の可視光を吸収する、請求項１から６のいずれか１項に記載の水系組成物。
【請求項８】
前記水系組成物が1つ以上の反応槽に格納されており、具体的にはマイクロウェルプレートの形態である複数の反応槽に格納されている、請求項１から７のいずれか１項に記載の水系組成物。
【請求項９】
前記組成物がリアルタイムＰＣＲ装置に収納されている、請求項６から８のいずれか１項に記載の水系組成物。
【請求項１０】
前記組成物中に含まれる熱安定性ポリペプチドの存在を示すための、請求項１から９のいずれか１項に記載の水系組成物の使用。
【請求項１１】
前記組成物が熱に不安定な水溶性物質の最高許容温度より高い温度にさらされていないことをさらに示すための、請求項１０に記載の水系組成物の使用であって、
前記水溶性物質は前記組成物に含まれ、
許容温度での機能的コンフォメーションにおいて、前記水溶性物質は光を吸収し、かつ／又は蛍光を示し、そして
前記ポリペプチドの最高許容温度は、前記水溶性物質の最高許容温度より高い、
前記使用。
【請求項１２】
組成物の処理状況を確認する方法であって、前記組成物の処理は温度変更の適用を含み、
ａ．生物活性を有する精製された熱安定性ポリペプチドと、許容温度での機能的コンフォメーションにおいて光を吸収し、かつ／又は蛍光を示す精製された熱に不安定な水溶性物質とを含む水系組成物を用意する工程であって、ここで前記ポリペプチドの最高許容温度は前記水溶性物質の最高許容温度より高い、工程；
生物活性を有する前記ポリペプチドが酵素であり、そして
前記水溶性物質が、ハロバクテリウム・サリナルム（Halobacterium salinarum）由来のバクテリオロドプシン、又はその機能的誘導体を含み、
ｂ．前記水溶性物質の最高許容温度より高い温度への変更を適用することによって工程（ａ）の組成物を処理する工程であって、ここで前記水溶性物質のコンフォメーションが不可逆的に変化し、それにより機能を失う、工程；および
ｃ．前記水溶性物質の機能的コンフォメーションを光学的手段によって評価する工程；
を含み、これらの工程によって前記組成物の処理状況を確認する、
方法。
【請求項１３】
組成物の第１の未処理状況及び第２の処理状況を確認する方法であって、前記組成物の処理は温度変更の適用を含み、
ａ．生物活性を有する精製された熱安定性ポリペプチドと、許容温度での機能的コンフォメーションにおいて光を吸収し、かつ／又は蛍光を示す精製された熱に不安定な水溶性物質とを含む水系組成物を用意する工程であって、ここで前記ポリペプチドの最高許容温度は前記水溶性物質の最高許容温度より高い、工程；
ｂ．前記水溶性物質の最高許容温度より低い温度で、温度変更することなく工程（ａ）の組成物を保持し、それにより前記水溶性物質のコンフォメーションは機能を維持する、工程；
ｃ．前記水溶性物質の機能的コンフォメーションを光学的手段により評価する工程；
ｄ．前記水溶性物質の最高許容温度より高い温度への変更を適用することによって工程（ａ）の組成物を処理する工程であって、ここで前記水溶性物質のコンフォメーションは不可逆的に変化し、それにより機能を失う、工程；および
ｅ．工程（ｃ）を繰り返す工程；
を含み、これらの工程によって第１の未処理状況及び第２の処理状況を確認する、
方法。
【請求項１４】
生物活性を有する精製された熱安定性ポリペプチドと、許容温度での機能的コンフォメーションにおいて光を吸収し、かつ／又は蛍光を示す精製された熱に不安定な水溶性物質とを含む水系組成物を含む部材のキットであって、
ここで、前記ポリペプチドの最高許容温度は前記水溶性物質の最高許容温度より高く、
生物活性を有する前記ポリペプチドが酵素であり、そして
前記水溶性物質が、ハロバクテリウム・サリナルム（Halobacterium salinarum）由来のバクテリオロドプシン、又はその機能的誘導体を含む、キット。
【請求項１５】
前記ポリペプチド及び前記水溶性物質が１つの容器に混合物として存在する、請求項１４に記載のキット。
【請求項１６】
複数の成分を混合して混合物を調製する過程で、第１の成分の存在、及び任意に更なる成分の存在を確認する方法であって；
ａ．反応混合物の２つ以上の成分を別々の水溶液として用意する工程であって、ここで前記成分のうちの１つは生物活性を有する精製された熱安定性ポリペプチドを含み、そしてここで、生物活性を有する前記ポリペプチドが酵素である、工程；
ｂ．第１の成分を選択し、そして許容温度での機能的コンフォメーションにおいて光を吸収し、かつ／又は蛍光を示す第１の精製された熱に不安定な水溶性物質を用いて前記第１の成分を染色する工程であって、ここで工程（ａ）のポリペプチドの最高許容温度は第１の水溶性物質の最高許容温度より高く、ここで、前記水溶性物質が、ハロバクテリウム・サリナルム（Halobacterium salinarum）由来のバクテリオロドプシン、又はその機能的誘導体を含む、工程；
ｃ．任意に、更なる成分を選択し、そして許容温度での機能的コンフォメーションにおいて光を吸収し、かつ／又は蛍光を示す更なる精製された熱に不安定な水溶性物質を用いて前記更なる成分を染色する工程であって、ここで工程（ａ）のポリペプチドの最高許容温度は、前記更なる水溶性物質の最高許容温度より高い、工程；
ｄ．前記２つ以上の成分を混合する工程；
ｅ．工程（ｄ）で得られた混合物中の第１の精製された熱に不安定な水溶性物質の機能的コンフォメーションを評価し、それにより混合物中の第１の成分の存在を確認する工程；および
ｆ．任意に、工程（ｄ）で得られた混合物中の更なる精製された熱に不安定な水溶性物質の機能的コンフォメーションを評価し、それにより混合物中のそれぞれの更なる成分の存在を確認する工程；
を含み、これらの工程によって異なる成分を混合して混合物を調製する過程で、第１の成分の存在、及び任意に更なる成分の存在を確認する、
方法。
【請求項１７】
工程（ａ）から（ｆ）が、前記水溶性物質の最高許容温度より低い温度で、温度変更することなく実施され、これにより、前記第１の水溶性物質及び任意に前記更なる水溶性物質のコンフォメーションは機能を維持する、請求項１６に記載の方法。
【請求項１８】
前記水溶性物質の最高許容温度より高い温度を適用することによって工程（ｄ）の前記組成物を処理する追加の工程（ｇ）を含み、
ここで、第１の水溶性物質及び任意の更なる水溶性物質のコンフォメーションが不可逆的に変化し、それにより機能を失う、請求項１６又は１７に記載の方法。
【請求項１９】
光学的評価、具体的には目視評価、比色測定、及び蛍光測定のいずれか１つによる評価の追加を行う追加の工程（ｈ）を更に含む、請求項１８に記載の方法。