【手続補正書】
【提出日】令和2年5月15日(2020.5.15)
【手続補正１】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０３３８
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０３３８】
様々な刊行物、特許及び特許出願が本明細書に引用されており、これらの開示は、その全体が引用により組み込まれる。
本件出願は、以下の態様の発明を提供する。
（態様１）
ピチンデウイルスゲノムセグメントであって、該ゲノムセグメントは、ウイルスオープンリーディングフレーム（「ORF」）を該ORFの野生型位置以外の位置に担持するように操作されており、該ピチンデウイルスゲノムセグメントは、以下のもの：
（i）  核タンパク質(「NP」)をコードするORFが、ピチンデウイルスの5’非翻訳領域(「UTR」)の制御下にあるSセグメント；
（ii）  マトリックスタンパク質Z(「Zタンパク質」)をコードするOFRが、ピチンデウイルスの5'UTRの制御下にあるSセグメント；
（iii）  RNA依存性RNAポリメラーゼL(「Lタンパク質」)をコードするORFが、ピチンデウイルスの5'UTRの制御下にあるSセグメント；
（iv）  ウイルス糖タンパク質(「GP」)をコードするORFが、ピチンデウイルスの3'UTRの制御下にあるSセグメント；
（v）  Lタンパク質をコードするORFが、ピチンデウイルスの3'UTRの制御下にあるSセグメント；
（vi）  Zタンパク質をコードするORFが、ピチンデウイルスの3'UTRの制御下にあるSセグメント；
（vii）  GPをコードするORFが、ピチンデウイルスの5'UTRの制御下にあるLセグメント；
（viii）  NPをコードするORFが、ピチンデウイルスの5'UTRの制御下にあるLセグメント；
（ix）  Lタンパク質をコードするORFが、ピチンデウイルスの5'UTRの制御下にあるLセグメント；
（x）  GPをコードするORFが、ピチンデウイルスの3'UTRの制御下にあるLセグメント；
（xi）  NPをコードするORFが、ピチンデウイルスの3'UTRの制御下にあるLセグメント；及び
（xii）  Zタンパク質をコードするORFが、ピチンデウイルスの3'UTRの制御下にあるLセグメント
からなる群から選択される、ピチンデウイルスゲノムセグメント。
（態様２）
前記ピチンデウイルスの3'UTRが、前記ピチンデウイルスSセグメント又は前記ピチンデウイルスLセグメントの3'UTRであり、かつ前記ピチンデウイルスの5'UTRが、前記ピチンデウイルスSセグメント又は前記ピチンデウイルスLセグメントの5'UTRである、態様1記載のピチンデウイルスゲノムセグメント。
（態様３）
態様1記載のピチンデウイルスゲノムセグメントのcDNA。
（態様４）
態様3記載のcDNAを含むDNA発現ベクター。
（態様５）
態様1記載のピチンデウイルスゲノムセグメント、態様3記載のcDNA、又は態様4記載のベクターを含む宿主細胞。
（態様６）
ピチンデウイルス粒子がSセグメント及びLセグメントを含むように、態様1記載のピチンデウイルスゲノムセグメント及び第2のピチンデウイルスゲノムセグメントを含むピチンデウイルス粒子。
（態様７）
前記ピチンデウイルス粒子が、感染性及び複製可能である、態様6記載のピチンデウイルス粒子。
（態様８）
前記ピチンデウイルス粒子が、弱毒化されている、態様6記載のピチンデウイルス粒子。
（態様９）
前記ピチンデウイルス粒子が、感染性であるが、非相補細胞においてさらなる感染性子孫を生成できない、態様6記載のピチンデウイルス粒子。
（態様１０）
GP、NP、Zタンパク質、及びLタンパク質をコードする4つのORFの少なくとも1つが、除去されているか、又は機能的に不活化されている、態様9記載のピチンデウイルス粒子。
（態様１１）
GP、NP、Zタンパク質、及びLタンパク質をコードする4つのORFの少なくとも1つが、除去されており、ピチンデウイルス以外の生物からの異種ORFで置き換えられている、態様9記載のピチンデウイルス粒子。
（態様１２）
GP、NP、Zタンパク質、及びLタンパク質をコードする4つのOFRのうち1つのみが、除去されており、ピチンデウイルス以外の生物からの異種ORFで置き換えられている、態様9記載のピチンデウイルス粒子。
（態様１３）
前記GPをコードするORFが、除去されており、ピチンデウイルス以外の生物からの異種ORFで置き換えられている、態様9記載のピチンデウイルス粒子。
（態様１４）
前記NPをコードするORFが、除去されており、ピチンデウイルス以外の生物からの異種ORFで置き換えられている、態様9記載のピチンデウイルス粒子。
（態様１５）
前記Zタンパク質をコードするORFが、除去されており、ピチンデウイルス以外の生物からの異種ORFで置き換えられている、態様9記載のピチンデウイルス粒子。
（態様１６）
前記Lタンパク質をコードするORFが、除去されており、ピチンデウイルス以外の生物からの異種ORFで置き換えられている、態様9記載のピチンデウイルス粒子。
（態様１７）
前記異種ORFが、レポータータンパク質をコードする、態様11〜16のいずれか1項記載のピチンデウイルス粒子。
（態様１８）
前記異種ORFが、感染性生物、腫瘍、又はアレルゲンに由来する抗原をコードする、態様11〜16のいずれか1項記載のピチンデウイルス粒子。
（態様１９）
抗原をコードする前記異種ORFが、ヒト免疫不全ウイルス抗原、C型肝炎ウイルス抗原、水痘帯状疱疹（varizella zoster）ウイルス抗原、サイトメガロウイルス抗原、結核菌抗原、腫瘍関連抗原、及び腫瘍特異的抗原(腫瘍ネオ抗原及び腫瘍ネオエピトープなど)から選択される、態様18記載のピチンデウイルス粒子。
（態様２０）
前記ピチンデウイルス粒子の増殖又は感染力が、ピチンデウイルス以外の生物からの前記異種ORFによって影響されない、態様11〜18のいずれか1項記載のピチンデウイルス粒子。
（態様２１）
態様1記載のピチンデウイルスゲノムセグメントを生成する方法であって、前記方法が、態様3記載のcDNAを転写することを含む方法。
（態様２２）
態様6記載のピチンデウイルス粒子を作製する方法であって、前記方法が：
（i）宿主細胞に態様3記載のcDNAをトランスフェクトすること；
（ii）該宿主細胞に、第2のピチンデウイルスゲノムセグメントのcDNAを含むプラスミドをトランスフェクトすること；
（iii）該宿主細胞を、ウイルス形成に好適な条件下に維持すること；及び
（iv）該ピチンデウイルス粒子を収集すること
を含む方法。
（態様２３）
前記Lセグメント及び前記Sセグメントの転写が、二方向性プロモーターを使用して行われる、態様22記載の方法。
（態様２４）
前記方法が、宿主細胞にピチンデウイルスポリメラーゼをコードする1以上の核酸をトランスフェクトすることをさらに含む、態様22記載の方法。
（態様２５）
前記ピチンデウイルスポリメラーゼが前記Lタンパク質である、態様24記載の方法。
（態様２６）
前記方法が、前記宿主細胞に前記NPタンパク質をコードする1以上の核酸をトランスフェクトすることをさらに含む、態様22又は24記載の方法。
（態様２７）
前記Lセグメント及び前記Sセグメントの転写が、それぞれ：
（i）RNAポリメラーゼIプロモーター；
（ii）RNAポリメラーゼIIプロモーター；及び
（iii）T7プロモーター
からなる群から選択されるプロモーターの制御下にある、態様22記載の方法。
（態様２８）
態様6〜19のいずれか1項記載のピチンデウイルス粒子及び医薬として許容し得る担体を含むワクチン。
（態様２９）
態様6〜19のいずれか1項記載のピチンデウイルス粒子及び医薬として許容し得る担体を含む医薬組成物。
（態様３０）
前記ピチンデウイルスゲノムセグメント又はピチンデウイルス粒子が、株Munchique CoAn4763単離株P18、又はP2株に由来する、態様1記載のピチンデウイルスゲノムセグメント又は態様6記載のピチンデウイルス粒子。
（態様３１）
1つのLセグメント及び2つのSセグメントを含む三セグメントピチンデウイルス粒子であって、前記三セグメントピチンデウイルス粒子の増殖が、I型インターフェロン受容体、II型インターフェロン受容体及び組換え活性化遺伝子1(RAG1)を欠き、かつ104 PFU の前記三セグメントピチンデウイルス粒子に感染しているマウスにおける70日の持続感染後に、複製可能二セグメントウイルス粒子をもたらさない、三セグメントピチンデウイルス粒子。
（態様３２）
2つの別々のセグメントの代わりに、一方のみに2つのピチンデウイルスのORFを結合している前記2つのSセグメントのセグメント間の組換えが、ウイルスプロモーター活性を抑制する、態様31記載の三セグメントピチンデウイルス粒子。
（態様３３）
2つのLセグメント及び1つのSセグメントを含む三セグメントピチンデウイルス粒子であって、前記三セグメントピチンデウイルス粒子の増殖が、I型インターフェロン受容体、II型インターフェロン受容体及び組換え活性化遺伝子1(RAG1)を欠き、かつ104 PFUの前記三セグメントピチンデウイルス粒子に感染しているマウスにおける70日の持続感染後に、複製可能二セグメントウイルス粒子をもたらさない、三セグメントピチンデウイルス粒子。
（態様３４）
2つの別々のセグメントの代わりに、一方のみに2つのピチンデウイルスORFを結合している前記2つのLセグメントのセグメント間の組換えが、ウイルスプロモーター活性を抑制する、態様33記載の三セグメントピチンデウイルス粒子。
（態様３５）
前記2つのSセグメントの1つが：
(i)NPをコードするORFが、ピチンデウイルスの5'UTRの制御下にあるSセグメント；
(ii)Zタンパク質をコードするORFが、ピチンデウイルスの5'UTRの制御下にあるSセグメント；
(iii)Lタンパク質をコードするORFが、ピチンデウイルスの5'UTRの制御下にあるSセグメント；
(iv)GPをコードするORFが、ピチンデウイルスの3’UTRの制御下にあるSセグメント；
(v)LをコードするORFが、ピチンデウイルスの3’UTRの制御下にあるSセグメント；及び
(vi)Zタンパク質をコードするORFが、ピチンデウイルスの3’UTRの制御下にあるSセグメント；
からなる群から選択される、態様31記載の三セグメントピチンデウイルス粒子。
（態様３６）
前記2つのLセグメントが：
(i)GPをコードするORFが、ピチンデウイルスの5'UTRの制御下にあるLセグメント；
(ii)NPをコードするORFが、ピチンデウイルスの5'UTRの制御下にあるLセグメント；
(iii)Lタンパク質をコードするORFが、ピチンデウイルスの5'UTRの制御下にあるLセグメント；
(iv)GPをコードするORFが、ピチンデウイルスの3'UTRの制御下にあるLセグメント；
(v)NPをコードするORFが、ピチンデウイルスの3'UTRの制御下にあるLセグメント；及び
(vi)Zタンパク質をコードするORFが、ピチンデウイルスの3'UTRの制御下にあるLセグメント
からなる群から選択される、態様33記載の三セグメントピチンデウイルス粒子。
（態様３７）
前記ピチンデウイルスの3'UTRが、前記ピチンデウイルスSセグメント又は前記ピチンデウイルスLセグメントの3'UTRであり、かつ前記ピチンデウイルスの5'UTRが、前記ピチンデウイルスSセグメント又は前記ピチンデウイルスLセグメントの5'UTRである、態様35又は36記載の三セグメントピチンデウイルス粒子。
（態様３８）
前記2つのSセグメントが、(i)ピチンデウイルス以外の生物からの1つ又は2つの異種ORF；又は(ii)1つ又は2つの重複ピチンデウイルスORF；又は(iii)1つのピチンデウイルス以外の生物からの異種ORF及び１つの重複ピチンデウイルスORFを含む、態様31記載の三セグメントピチンデウイルス粒子。
（態様３９）
前記2つのLセグメントが、(i)ピチンデウイルス以外の生物からの1つ又は2つの異種ORF；又は(ii)2つの重複ピチンデウイルスORF；又は(iii)1つのピチンデウイルス以外の生物からの異種ORF及び1つの重複ピチンデウイルスORFを含む、態様33記載の三セグメントピチンデウイルス粒子。
（態様４０）
前記異種ORFが、感染性生物、腫瘍、又はアレルゲンに由来する抗原をコードする、態様38又は39記載の三セグメントピチンデウイルス粒子。
（態様４１）
前記抗原をコードする異種ORFが、ヒト免疫不全ウイルス抗原、C型肝炎ウイルス抗原、水痘帯状疱疹（varizella zoster）ウイルス抗原、サイトメガロウイルス抗原、結核菌抗原、腫瘍関連抗原、及び腫瘍特異的抗原(腫瘍ネオ抗原及び腫瘍ネオエピトープなど)から選択される、態様40記載の三セグメントピチンデウイルス粒子。
（態様４２）
少なくとも1つの異種ORFが蛍光タンパク質をコードする、態様38又は39記載の三セグメントピチンデウイルス粒子。
（態様４３）
前記蛍光タンパク質が緑色蛍光タンパク質又は赤色蛍光タンパク質である、態様42記載の三セグメントピチンデウイルス粒子。
（態様４４）
前記三セグメントピチンデウイルス粒子が、4つ全てのピチンデウイルスORFを含み、該三セグメントピチンデウイルス粒子が、感染性及び複製可能である、態様31〜41のいずれか1項記載の三セグメントピチンデウイルス粒子。
（態様４５）
前記三セグメントピチンデウイルス粒子が、前記4つのピチンデウイルスORFの1以上を欠き、該三セグメントピチンデウイルス粒子が、感染性であるが、非相補細胞においてさらなる感染性子孫を生成できない、態様31〜43のいずれか1項記載の三セグメントピチンデウイルス粒子。
（態様４６）
前記三セグメントピチンデウイルス粒子が、前記4つのピチンデウイルスORFsの1つを欠き、該三セグメントピチンデウイルス粒子が、感染性であるが、非相補細胞においてさらなる感染性子孫を生成できない、態様31〜43のいずれか1項記載の三セグメントピチンデウイルス粒子。
（態様４７）
前記ピチンデウイルスがGP ORFを欠く、態様44又は45記載の三セグメントピチンデウイルス粒子。
（態様４８）
1つのLセグメント及び2つのSセグメントを含む三セグメントピチンデウイルス粒子であって、第1のSセグメントが、GPをコードするORFをピチンデウイルスの3'UTRの制御下の位置に及び第1の対象の遺伝子をコードするORFをピチンデウイルス5'UTRの制御下の位置に担持するように操作されており、かつ第2のSセグメントが、NPをコードするORFをピチンデウイルスの3'UTRの制御下の位置に及び第2の対象の遺伝子をコードするORFをピチンデウイルス5'UTRの制御下の位置に担持するように操作されている、三セグメントピチンデウイルス粒子。
（態様４９）
1つのLセグメント及び2つのSセグメントを含む三セグメントピチンデウイルス粒子であって、第1のSセグメントが、GPをコードするORFをピチンデウイルスの5'UTRの制御下の位置に及び第１の対象の遺伝子をコードするORFをピチンデウイルスの3'UTRの制御下の位置に担持するように操作されており、かつ第2のSセグメントが、NPをコードするORFをピチンデウイルスの5'UTRの制御下の位置に及び第2の対象の遺伝子をコードするORFをピチンデウイルスの3'UTRの制御下の位置に担持するように操作されている、三セグメントピチンデウイルス粒子。
（態様５０）
前記対象の遺伝子が、感染性生物、腫瘍、又はアレルゲンに由来する抗原をコードする、態様48又は49記載の三セグメントピチンデウイルス粒子。
（態様５１）
前記対象の遺伝子が、ヒト免疫不全ウイルス抗原、C型肝炎ウイルス抗原、水痘帯状疱疹（varizella zoster）ウイルス抗原、サイトメガロウイルス抗原、結核菌抗原、腫瘍関連抗原、及び腫瘍特異的抗原(腫瘍ネオ抗原及び腫瘍ネオエピトープなど)から選択される抗原をコードする、態様50記載の三セグメントピチンデウイルス粒子。
（態様５２）
少なくとも1つの対象の遺伝子が蛍光タンパク質をコードする、態様48又は49記載の三セグメントピチンデウイルス粒子。
（態様５３）
前記蛍光タンパク質が緑色蛍光タンパク質又は赤色蛍光タンパク質である、態様52記載の三セグメントピチンデウイルス粒子。
（態様５４）
態様31、33、35、36、48又は49のいずれか1項記載の三セグメントピチンデウイルス粒子ゲノムのcDNA。
（態様５５）
態様54記載のcDNAを含むDNA発現ベクター。
（態様５６）
態様31又は33記載の三セグメントピチンデウイルス粒子、態様54記載のcDNA、又は態様55記載のベクターを含む宿主細胞。
（態様５７）
前記三セグメントピチンデウイルス粒子が弱毒化されている、態様31〜49のいずれか1項記載の三セグメントピチンデウイルス粒子。
（態様５８）
態様31記載の三セグメントピチンデウイルス粒子を作製する方法であって、前記方法が：
(i)前記Lセグメント及び2つのSセグメントの1以上のcDNAを宿主細胞にトランスフェクトすること；
(ii)ウイルス形成に好適な条件下で該宿主細胞を維持すること；及び
(iii)ピチンデウイルス粒子を収集すること
を含む方法。
（態様５９）
態様33記載の三セグメントピチンデウイルス粒子を作製する方法であって、前記方法が：
(i)2つのLセグメント及び1つのSセグメントの1以上のcDNAを宿主細胞にトランスフェクトすること；
(ii)ウイルス形成に好適な条件下で該宿主細胞を維持すること；及び
(iii)ピチンデウイルス粒子を収集すること
を含む方法。
（態様６０）
1つのLセグメント及び2つのSセグメントの転写が、二方向性プロモーターを使用して行われる、態様58記載の方法。
（態様６１）
2つのLセグメント及び1つのSセグメントの転写が、二方向性プロモーターを使用して行われる、態様59記載の方法。
（態様６２）
前記方法が、ピチンデウイルスポリメラーゼをコードする1以上の核酸を前記宿主細胞にトランスフェクトすることをさらに含む、態様58又は59記載の方法。
（態様６３）
前記ピチンデウイルスポリメラーゼが前記Lタンパク質である、態様62記載の方法。
（態様６４）
前記方法が、前記NPタンパク質をコードする1以上の核酸を前記宿主細胞にトランスフェクトすることをさらに含む、態様58、59、60又は61記載の方法。
（態様６５）
前記Lセグメント及び前記2つのSセグメントの転写が、それぞれ：
（i）RNAポリメラーゼIプロモーター；
（ii）RNAポリメラーゼIIプロモーター；及び
（iii）T7プロモーター
からなる群から選択されるプロモーターの制御下にある、態様58記載の方法。
（態様６６）
2つのLセグメント及び前記Sセグメントの転写が、それぞれ：
（i）RNAポリメラーゼIプロモーター；
（ii）RNAポリメラーゼIIプロモーター；及び
（iii）T7プロモーター
からなる群から選択されるプロモーターの制御下にある、態様59記載の方法。
（態様６７）
前記三セグメントピチンデウイルス粒子が、前記二セグメントピチンデウイルス粒子と同じトロピズムを有する、態様31〜49のいずれか1項記載の三セグメントピチンデウイルス粒子。
（態様６８）
前記三セグメントピチンデウイルス粒子が複製欠損である、態様31〜49のいずれか1項記載の三セグメントピチンデウイルス粒子。
（態様６９）
態様31〜49、67又は68のいずれか1項記載の三セグメントピチンデウイルス粒子及び医薬として許容し得る担体を含むワクチン。
（態様７０）
態様31〜49、67又は68のいずれか1項記載の三セグメントピチンデウイルス粒子及び医薬として許容し得る担体を含む医薬組成物。
（態様７１）
前記ピチンデウイルスが、株Munchique CoAn4763単離株P18、又はP2株である、態様31〜49、67又は68のいずれか1項記載の三セグメントピチンデウイルス粒子。