【手続補正書】
【提出日】令和2年5月1日(2020.5.1)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
配列番号９のアミノ酸配列を含む第１の重鎖、配列番号７のアミノ酸配列を含む第１の軽鎖、配列番号１２のアミノ酸配列を含む第２の重鎖、及び配列番号４のアミノ酸配列を含む第２の軽鎖を含む、PD-1及びCTLA-4に結合する二重特異性結合タンパク質。
【請求項２】
IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgA、IgM、IgE及びIgD由来のFc領域から成る群より選択されるドメインを含むFc領域を含む、請求項１記載の二重特異性結合タンパク質。
【請求項３】
前記Fc領域が変異型Fc領域を含む、請求項２記載の二重特異性結合タンパク質。
【請求項４】
前記Fc領域が非グリコシル化されている、請求項２記載の二重特異性結合タンパク質。
【請求項５】
前記Fc領域が脱グリコシル化されている、請求項２記載の二重特異性結合タンパク質。
【請求項６】
前記Fc領域が、低フコシル化を有するか、又は非フコシル化されている、請求項２記載の二重特異性結合タンパク質。
【請求項７】
請求項１記載の二重特異性結合タンパク質と薬学的に許容されるキャリアとを含む組成物。
【請求項８】
請求項１記載のタンパク質又は抗体をコードするヌクレオチド配列を含む核酸分子。
【請求項９】
請求項８記載の核酸分子を含むベクター。
【請求項１０】
請求項９記載のベクターを含む宿主細胞。
【請求項１１】
請求項１記載の二重特異性結合タンパク質を含む、対象において癌を治療又は予防するための医薬組成物。
【請求項１２】
前記癌が、卵巣癌、乳癌、大腸癌、前立腺癌、子宮頸癌、子宮癌、精巣癌、膀胱癌、頭部及び頚部癌、黒色腫、膵臓癌、腎細胞癌並びに肺癌のうちの1つ又は複数である、請求項１１記載の医薬組成物。
【請求項１３】
請求項１記載の二重特異性結合タンパク質を含む、対象において免疫応答を増強するための医薬組成物。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０３１５
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０３１５】
本開示の具体的な態様について考察してきたが、上記の記載は例示であり、限定するものではない。本明細書および下記の特許請求の範囲を検討すれば、本開示の多くの変更形態が当業者に明らかになるであろう。本開示の全範囲は、特許請求の範囲をその均等物の全範囲と共に、および本明細書をその変更形態と共に参照して決定されるべきである。
以下、本発明の実施形態を示す。
（１）第１のエピトープに結合する第１の結合ドメイン（ＢＤ１）と、
第２のエピトープに結合する第２の結合ドメイン（ＢＤ２）と、
ＣH２およびＣH３ドメインを含むＦｃ領域と
を含むタンパク質であって、
前記Ｆｃ領域は、前記ＣH２ドメイン、前記ＣH３ドメイン、または前記ＣH２およびＣH３ドメインの境界面における溶媒曝露ループにＢＤ２を含み、
前記タンパク質は、前記第１および第２のエピトープの各々に結合するために二価である、タンパク質。
（２）前記Ｆｃ領域は、前記ＣH２ドメイン、前記ＣH３ドメイン、または前記ＣH２およびＣH３ドメインの前記境界面においてアミノ酸配列における溶媒曝露ループにＢＤ２を含む、（１）に記載のタンパク質。
（３）前記溶媒曝露ループは、前記ＣH２ドメイン由来のアミノ酸配列を含む、（２）に記載のタンパク質。
（４）前記溶媒曝露ループは、アミノ酸配列ＩＳＲＴＰ（配列番号３９）を含む、（３）に記載のタンパク質。
（５）前記溶媒曝露ループは、前記ＣH３ドメイン由来のアミノ酸配列を含む、（２）に記載のタンパク質。
（６）前記溶媒曝露ループは、アミノ酸配列ＳＮＧを含む、（５）に記載のタンパク質。
（７）前記溶媒曝露ループは、前記ＣH２ドメインおよび前記ＣH３ドメインの前記境界面由来のアミノ酸配列を含む、（２）に記載のタンパク質。
（８）前記溶媒曝露ループは、アミノ酸配列ＡＫＧＱＰ（配列番号４０）を含む、（７）に記載のタンパク質。
（９）ＢＤ２は、一本鎖可変フラグメント（ｓｃＦｖ）を含む、（１）〜（８）のいずれか一に記載のタンパク質。
（１０）ＢＤ１は、Ｆａｂドメイン、ｓｃＦｖ、単一ドメイン抗体、および抗体可変ドメインからなる群から選択される結合ドメインを含む、（１）〜（８）のいずれか一に記載のタンパク質。
（１１）ＢＤ１は、Ｆａｂドメインを含む、（１）〜（８）のいずれか一に記載のタンパク質。
（１２）前記Ｆａｂドメインは、抗体ヒンジ領域を介して前記Ｆｃ領域に連結されている、（１１）に記載のタンパク質。
（１３）前記Ｆｃ領域は、ＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３、ＩｇＧ４、ＩｇＡ、ＩｇＭ、ＩｇＥ、およびＩｇＤ由来のＦｃ領域からなる群から選択されるドメインを含む、（１）〜（８）のいずれか一に記載のタンパク質。
（１４）前記Ｆｃ領域は、変異型Ｆｃ領域を含む、（１３）に記載のタンパク質。
（１５）前記Ｆｃ領域は、非グリコシル化されている、（１３）に記載のタンパク質。
（１６）前記Ｆｃ領域は、脱グリコシル化されている、（１３）に記載のタンパク質。
（１７）前記Ｆｃ領域は、低フコシル化を有するか、または非フコシル化されている、（１３）に記載のタンパク質。
（１８）ＢＤ２と前記Ｆｃ領域との間にタンパク質リンカーＬ１をさらに含む、（１）〜（８）のいずれか一に記載のタンパク質。
（１９）ＢＤ２と前記Ｆｃ領域との間に第１のタンパク質リンカーＬ１および第２のタンパク質リンカーＬ２をさらに含む、（１）〜（８）のいずれか一に記載のタンパク質。
（２０）ＢＤ２は、タンパク質リンカーＬ１を介して前記Ｆｃ領域と結合される、（１）〜（８）のいずれか一に記載のタンパク質。
（２１）ＢＤ２は、２つのタンパク質リンカーＬ１およびＬ２を介して前記Ｆｃ領域と結合される、（１）〜（８）のいずれか一に記載のタンパク質。
（２２）Ｌ１およびＬ２は、（Ｇ4Ｓ）2（配列番号４１）、（Ｇ4Ｓ）3（配列番号４２）、および（Ｇ4Ｓ）4（配列番号４３）から独立に選択される、（１８）〜（２１）のいずれか一に記載のタンパク質。
（２３）Ｎ末端からＣ末端に以下のポリペプチドドメイン：
ＶH１−ＣH１−ＣH２（Ｎ末端）−ＢＤ２−ＣH２（Ｃ末端）−ＣH３
を含むキメラ重鎖を含み、および
ＢＤ１は、Ｆａｂドメインを含み、
ＶH１は、前記Ｆａｂドメインの重鎖可変ドメインを含み、およびＣH１は、前記Ｆａｂの重鎖定常ドメイン１を含む、（１）に記載のタンパク質。
（２４）Ｎ末端からＣ末端に以下のポリペプチドドメイン：
ＶH１−ＣH１−ＣH２−ＢＤ２−ＣH３
を含むキメラ重鎖を含み、および
ＢＤ１は、Ｆａｂドメインを含み、
ＶH１は、前記Ｆａｂドメインの重鎖可変ドメインを含み、およびＣH１は、前記Ｆａｂの重鎖定常ドメイン１を含む、（１）に記載のタンパク質。
（２５）Ｎ末端からＣ末端に以下のポリペプチドドメイン：
ＶH１−ＣH１−ＣH２−ＣH３（Ｎ末端）−ＢＤ２−ＣH３（Ｃ末端）
を含むキメラ重鎖を含み、および
ＢＤ１は、Ｆａｂドメインを含み、
ＶH１は、前記Ｆａｂドメインの重鎖可変ドメインを含み、ＣH１は、前記Ｆａｂの重鎖定常ドメイン１を含む、（１）に記載のタンパク質。
（２６）ＢＤ２は、ｓｃＦｖを含む、（２３）〜（２５）のいずれか一に記載のタンパク質。
（２７）前記ｓｃＦｖは、Ｎ末端からＣ末端に、
ＶH２−ポリペプチドリンカー−ＶL２またはＶL２−ポリペプチドリンカー−ＶH２を含み、
ＶH２は、前記ｓｃＦｖの重鎖可変ドメインを含み、およびＶL２は、前記ｓｃＦｖの軽鎖可変ドメインを含む、（２６）に記載のタンパク質。
（２８）ＢＤ２と前記Ｆｃ領域との間にタンパク質リンカーＬ１をさらに含む、（２３）〜（２７）のいずれか一に記載のタンパク質。
（２９）ＢＤ２と前記Ｆｃ領域との間に第１のタンパク質リンカーＬ１および第２のタンパク質リンカーＬ２をさらに含む、（２３）〜（２７）のいずれか一に記載のタンパク質。
（３０）ＢＤ２は、リンカー（Ｌ１）を介して前記Ｆｃ領域の前記ＣH２ドメイン、前記ＣH２ドメイン、または前記ＣH２およびＣH３ドメインの前記境界面に結合される、（２３）〜（２５）のいずれか一に記載のタンパク質。
（３１）ＢＤ２は、２つのタンパク質リンカーＬ１およびＬ２を介して前記Ｆｃ領域の前記ＣH２ドメイン、前記ＣH２ドメイン、または前記ＣH２およびＣH３ドメインの前記境界面に結合される、（２３）〜（２５）のいずれか一に記載のタンパク質。
（３２）Ｌ１およびＬ２は、１〜２５アミノ酸長を有するタンパク質リンカーから独立に選択される、（２８）〜（３１）のいずれか一に記載のタンパク質。
（３３）Ｌ１およびＬ２は、（Ｇ4Ｓ）2（配列番号４１）、（Ｇ4Ｓ）3（配列番号４２）、および（Ｇ4Ｓ）4（配列番号４３）から独立に選択される、（２８）〜（３１）のいずれか一に記載のタンパク質。
（３４）前記第１および第２のエピトープは異なる、（１）〜（３３）のいずれか一に記載のタンパク質。
（３５）前記第１および第２のエピトープは同じである、（１）〜（３４）のいずれか一に記載のタンパク質。
（３６）配列番号１のアミノ酸配列を含む第１のペプチドおよび配列番号２のアミノ酸配列を含む第２のペプチドを含むＰＤ−１およびＣＴＬＡ−４に結合する二重特異性結合タンパク質。
（３７）配列番号３のアミノ酸配列を含む第１のペプチドおよび配列番号４のアミノ酸配列を含む第２のペプチドを含むＰＤ−１およびＣＴＬＡ−４に結合する二重特異性結合タンパク質。
（３８）配列番号５のアミノ酸配列を含む第１のペプチドおよび配列番号６のアミノ酸配列を含む第２のペプチドを含むＰＤ−１およびＣＴＬＡ−４に結合する二重特異性結合タンパク質。
（３９）配列番号９のアミノ酸配列を含む第１の重鎖、配列番号７のアミノ酸配列を含む第１の軽鎖、配列番号１２のアミノ酸配列を含む第２の重鎖、および配列番号４のアミノ酸配列を含む第２の軽鎖を含むＰＤ−１およびＣＴＬＡ−４に結合する二重特異性結合タンパク質。
（４０）配列番号１４のアミノ酸配列を含む第１のペプチドおよび配列番号１５のアミノ酸配列を含む第２のペプチドを含むＰＤ−Ｌ１およびＣＴＬＡ−４に結合する二重特異性結合タンパク質。
（４１）配列番号１６のアミノ酸配列を含む第１のペプチドおよび配列番号１７のアミノ酸配列を含む第２のペプチドを含むＰＤ−Ｌ１およびＣＴＬＡ−４に結合する二重特異性結合タンパク質。
（４２）配列番号１８のアミノ酸配列を含む第１のペプチドおよび配列番号１９のアミノ酸配列を含む第２のペプチドを含むＰＤ−Ｌ１およびＣＴＬＡ−４に結合する二重特異性結合タンパク質。
（４３）配列番号２２または配列番号８９のアミノ酸配列を含む第１のペプチドおよび配列番号２３または配列番号９０のアミノ酸配列を含む第２のペプチドを含むＰＤ−１およびＴＩＭ３に結合する二重特異性結合タンパク質。
（４４）配列番号２４または配列番号９１のアミノ酸配列を含む第１のペプチドおよび配列番号２３または配列番号９２のアミノ酸配列を含む第２のペプチドを含むＰＤ−１およびＴＩＭ３に結合する二重特異性結合タンパク質。
（４５）配列番号９のアミノ酸配列を含む第１の重鎖、配列番号７のアミノ酸配列を含む第１の軽鎖、配列番号２７または配列番号３０のアミノ酸配列を含む第２の重鎖、および配列番号２６または配列番号２８のアミノ酸配列を含む第２の軽鎖を含むＰＤ−１およびＴＩＭ３に結合する二重特異性結合タンパク質。
（４６）配列番号３４のアミノ酸配列を含む第１のペプチドおよび配列番号３２のアミノ酸配列を含む第２のペプチドを含むＯＸ４０およびＰＤ−Ｌ１に結合する二重特異性結合タンパク質。
（４７）配列番号３５のアミノ酸配列を含む第１のペプチドおよび配列番号３２のアミノ酸配列を含む第２のペプチドを含むＯＸ４０およびＰＤ−Ｌ１に結合する二重特異性結合タンパク質。
（４８）配列番号３６または配列番号９４のアミノ酸配列を含む第１のペプチドおよび配列番号３２または配列番号９３のアミノ酸配列を含む第２のペプチドを含むＯＸ４０およびＰＤ−Ｌ１に結合する二重特異性結合タンパク質。
（４９）ＣＤＲ１、ＣＤＲ２およびＣＤＲ３を含む重鎖ならびにＣＤＲ１、ＣＤＲ２およびＣＤＲ３を含む軽鎖を含むＴＩＭ３に結合する抗体またはその抗原結合フラグメントであって、前記重鎖ＣＤＲ１は、配列番号７９を含み、前記重鎖ＣＤＲ２は、配列番号８０を含み、前記重鎖ＣＤＲ３は、配列番号８１を含み、および前記軽鎖ＣＤＲ１は、配列番号８２を含み、前記軽鎖ＣＤＲ２は、配列番号８３を含み、前記軽鎖ＣＤＲ３は、配列番号８４を含む、抗体またはその抗原結合フラグメント。
（５０）重鎖可変領域および軽鎖可変領域を含み、前記重鎖可変領域は、配列番号８５を含み、および前記軽鎖可変領域は、配列番号８６を含む、（４９）に記載の抗体またはその抗原結合フラグメント。
（５１）前記重鎖は、配列番号８７を含み、および前記軽鎖は、配列番号８８を含む、（４９）に記載の抗体またはその抗原結合フラグメント。
（５２）（１）〜（５１）のいずれか一に記載のタンパク質または抗体と、薬学的に許容されるキャリアとを含む組成物。
（５３）（１）〜（５１）のいずれか一に記載のタンパク質または抗体をコードするヌクレオチド配列を含む核酸分子。
（５４）（５３）に記載の核酸分子を含むベクター。
（５５）（５４）に記載のベクターを含む宿主細胞。
（５６）対象において癌を治療または予防する方法であって、（１）〜（５１）のいずれか一に記載のタンパク質または抗体を前記対象に投与するステップを含む方法。
（５７）前記癌は、卵巣癌、乳癌、大腸癌、前立腺癌、子宮頸癌、子宮癌、精巣癌、膀胱癌、頭部および頚部癌、黒色腫、膵臓癌、腎細胞癌、ならびに肺癌の１つまたは複数である、（５６）に記載の方法。
（５８）対象において免疫応答を増強する方法であって、（１）〜（５１）のいずれか一に記載のタンパク質または抗体を前記対象に投与するステップを含む方法。