【手続補正書】
【提出日】令和2年10月12日(2020.10.12)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
肺炎桿菌（Ｋｌｅｂｓｉｅｌｌａ  ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ）Ｏ１抗原に特異的に結合する単離抗原結合タンパク質であって、前記抗原結合タンパク質は、ａ）クレブシエラのオプソニン作用による死滅（ＯＰＫ）を誘導する、ｂ）血清殺菌活性測定法によって測定されるように補体依存性の死滅を介してクレブシエラを死滅させる、またはｃ）クレブシエラのＯＰＫを誘導し、血清殺菌活性測定法によって測定されるように補体依存性の死滅を介してクレブシエラを死滅させる、単離抗原結合タンパク質。
【請求項２】
前記抗原結合タンパク質は、リポ多糖（ＬＰＳ）を中和しない、請求項１に記載の抗原結合タンパク質。
【請求項３】
前記抗原結合タンパク質は、ＬＰＳを中和する、請求項１に記載の抗原結合タンパク質。
【請求項４】
（ｉ）クレブシエラのＯＰＫを誘導し、血清殺菌活性測定法によって測定されるように補体依存性の死滅を介してクレブシエラを死滅させ、かつリポ多糖（ＬＰＳ）を中和するまたは（ｉｉ）クレブシエラのＯＰＫを誘導し、血清殺菌活性測定法によって測定されるように補体依存性の死滅を介してクレブシエラを死滅させるが、ＬＰＳを中和しない、請求項１に記載の抗原結合タンパク質。
【請求項５】
前記抗原結合タンパク質は、致命的なクレブシエラによる攻撃に暴露されたマウスにおいて治療的に有効である、請求項１〜４のいずれか一項に記載の抗原結合タンパク質。
【請求項６】
前記クレブシエラは、肺炎桿菌（Ｋ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ）、Ｋ．オキシトカ（Ｋ．ｏｘｙｔｏｃａ）、Ｋ．グラニュロマティス（Ｋ．ｇｒａｎｕｌｏｍａｔｉｓ）、臭鼻菌（Ｋ．ｏｚａｅｎａｅ）、鼻硬腫菌（Ｋ．ｒｈｉｎｏｓｃｌｅｒｍｏａｔｉｓ）、またはＫ．プランチコラ（Ｋ．ｐｌａｎｔｉｃｏｌａ）である、請求項１〜５のいずれか一項に記載の抗原結合タンパク質。
【請求項７】
前記クレブシエラは、肺炎桿菌（Ｋ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ）である、請求項６に記載の抗原結合タンパク質。
【請求項８】
前記クレブシエラは、多薬剤抵抗性である、請求項１〜７のいずれか一項に記載の抗原結合タンパク質。
【請求項９】
前記肺炎桿菌（Ｋ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ）は、株Ｋｐ１１３１１５またはＫｐ８５６１である、請求項８に記載の抗原結合タンパク質。
【請求項１０】
前記肺炎桿菌（Ｋ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ）は、表８の列１〜１３４の１つに列挙される株である、請求項８に記載の抗原結合タンパク質。
【請求項１１】
前記抗原結合タンパク質は、多薬剤抵抗性の肺炎桿菌（Ｋ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ）株を、少なくとも１つの抗生物質に対して感受性にする、請求項８〜１０のいずれか一項に記載の抗原結合タンパク質。
【請求項１２】
前記クレブシエラは、抗生物質に対して感受性である、請求項１〜７のいずれか一項に記載の抗原結合タンパク質。
【請求項１３】
前記肺炎桿菌（Ｋ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ）は、表８の列１３５〜１８４の１つに列挙される株である、請求項１２に記載の抗原結合タンパク質。
【請求項１４】
前記抗原結合タンパク質は、肺炎桿菌（Ｋ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ）Ｏ１抗原のＤ−ガラクタンＩＩドメインに結合する、請求項１〜１３のいずれか一項に記載の抗原結合タンパク質。
【請求項１５】
相補性決定領域（ＣＤＲ）：ＨＣＤＲ１、ＨＣＤＲ２、ＨＣＤＲ３、ＬＣＤＲ１、ＬＣＤＲ２、およびＬＣＤＲ３のセットを含む、肺炎桿菌（Ｋｌｅｂｓｉｅｌｌａ  ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ）Ｏ１抗原に特異的に結合する単離抗原結合タンパク質であって、ＨＣＤＲ１、ＨＣＤＲ２、ＨＣＤＲ３、ＬＣＤＲ１、ＬＣＤＲ２、およびＬＣＤＲ３が、以下のアミノ酸配列：
（ａ）配列番号１、２、３、４、５、および７；
（ｂ）配列番号１、２、３、４、６、および７；
（ｃ）配列番号１、２、３、４、５、および１１；
（ｄ）配列番号１、２、３、４、１０、および１１；
（ｅ）配列番号１、５９、６０、４、５、および１１；または
（ｆ）配列番号１、５９、６０、４、１０、および１１
を含む、単離抗原結合タンパク質。
【請求項１６】
肺炎桿菌（Ｋｌｅｂｓｉｅｌｌａ  ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ）Ｏ１抗原に特異的に結合する単離抗原結合タンパク質であって、前記抗原結合タンパク質は、配列番号８、１２、６１、もしくは６２と少なくとも９５％、９６％、９７％、９８％、もしくは９９％同一な重鎖可変領域（ＶＨ）および／または配列番号９、１３もしくは６３と少なくとも９５％、９６％、９７％、９８％、もしくは９９％同一な軽鎖可変領域（ＶＬ）を含む、単離抗原結合タンパク質。
【請求項１７】
その前記抗原結合タンパク質は、配列番号８、１２、６１、または６２を含むＶＨおよび配列番号９、１３または６３を含むＶＬを含む、請求項１６に記載の抗原結合タンパク質。
【請求項１８】
配列番号８を含むＶＨを含む、肺炎桿菌（Ｋｌｅｂｓｉｅｌｌａ  ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ）Ｏ１抗原に特異的に結合する単離抗原結合タンパク質。
【請求項１９】
配列番号９を含むＶＬを含む、肺炎桿菌（Ｋｌｅｂｓｉｅｌｌａ  ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ）Ｏ１抗原に特異的に結合する単離抗原結合タンパク質。
【請求項２０】
配列番号１２を含むＶＨを含む、肺炎桿菌（Ｋｌｅｂｓｉｅｌｌａ  ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ）Ｏ１抗原に特異的に結合する単離抗原結合タンパク質。
【請求項２１】
配列番号１３を含むＶＬを含む、肺炎桿菌（Ｋｌｅｂｓｉｅｌｌａ  ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ）Ｏ１抗原に特異的に結合する単離抗原結合タンパク質。
【請求項２２】
配列番号８、１２、６１、または６２を含むＶＨおよび配列番号９、１３または６３を含むＶＬを含む抗体と、肺炎桿菌（Ｋｌｅｂｓｉｅｌｌａ  ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ）Ｏ１抗原中の同じエピトープに特異的に結合する単離抗原結合タンパク質。
【請求項２３】
配列番号８、１２、６１、または６２を含むＶＨおよび配列番号９、１３または６３を含むＶＬを含む抗体の肺炎桿菌（Ｋｌｅｂｓｉｅｌｌａ  ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ）Ｏ１抗原への結合を競合的に阻害する単離抗原結合タンパク質。
【請求項２４】
相補性決定領域（ＣＤＲ）：ＨＣＤＲ１、ＨＣＤＲ２、ＨＣＤＲ３、ＬＣＤＲ１、ＬＣＤＲ２、およびＬＣＤＲ３のセットを含む、肺炎桿菌（Ｋｌｅｂｓｉｅｌｌａ  ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ）Ｏ１抗原に特異的に結合する単離抗原結合タンパク質であって、前記ＨＣＤＲ１、ＨＣＤＲ２、ＨＣＤＲ３、ＬＣＤＲ１、ＬＣＤＲ２、およびＬＣＤＲ３は、
それぞれ配列番号４１、４２、４３、４４、４５、および４６、
それぞれ配列番号３２、３３、３４、３５、３６、および３８、
それぞれ配列番号３２、３３、３４、３５、３７、および３８、
それぞれ配列番号１４、１５、１６、１７、１８、および２０、
それぞれ配列番号１４、１５、１６、１７、１９、および２０、
それぞれ配列番号２３、２４、２５、２６、２７、および２９、または
それぞれ配列番号２３、２４、２５、２６、２８、および２９
のアミノ酸配列を含む、単離抗原結合タンパク質。
【請求項２５】
肺炎桿菌（Ｋｌｅｂｓｉｅｌｌａ  ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ）Ｏ１抗原に特異的に結合する単離抗原結合タンパク質であって、前記抗原結合タンパク質は、
それぞれ配列番号４７および配列番号４８、
それぞれ配列番号３９および配列番号４０、
それぞれ配列番号２１および配列番号２２、または
それぞれ配列番号３０および配列番号３１
と少なくとも９５％、９６％、９７％、９８％、または９９％同一なＶＨおよびＶＬを含む、単離抗原結合タンパク質。
【請求項２６】
前記抗原結合タンパク質は、
それぞれ配列番号４７および配列番号４８、
それぞれ配列番号３９および配列番号４０、
それぞれ配列番号２１および配列番号２２、または
それぞれ配列番号３０および配列番号３１
を含むＶＨおよびＶＬを含む、請求項２５に記載の抗原結合タンパク質。
【請求項２７】
配列番号４７、配列番号３９、配列番号２１、または配列番号３０を含むＶＨを含む、肺炎桿菌（Ｋｌｅｂｓｉｅｌｌａ  ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ）Ｏ１抗原に特異的に結合する単離抗原結合タンパク質。
【請求項２８】
配列番号４８、配列番号４０、配列番号２２、または配列番号３１を含むＶＬを含む、肺炎桿菌（Ｋｌｅｂｓｉｅｌｌａ  ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ）Ｏ１抗原に特異的に結合する単離抗原結合タンパク質。
【請求項２９】
それぞれ配列番号４７および配列番号４８、
それぞれ配列番号３９および配列番号４０、
それぞれ配列番号２１および配列番号２２、または
それぞれ配列番号３０および配列番号３１
を含むＶＨおよびＶＬを含む抗体として、肺炎桿菌（Ｋｌｅｂｓｉｅｌｌａ  ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ）Ｏ１抗原中の同じエピトープに特異的に結合する単離抗原結合タンパク質。
【請求項３０】
それぞれ配列番号４７および配列番号４８、
それぞれ配列番号３９および配列番号４０、
それぞれ配列番号２１および配列番号２２、または
それぞれ配列番号３０および配列番号３１
を含むＶＨおよびＶＬを含む抗体の肺炎桿菌（Ｋｌｅｂｓｉｅｌｌａ  ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ）Ｏ１抗原への結合を競合的に阻害する単離抗原結合タンパク質。
【請求項３１】
前記抗原結合タンパク質は、マウス、非ヒト、ヒト化、キメラ、リサーフェシング、またはヒトである、請求項１〜３０のいずれか一項に記載の抗原結合タンパク質。
【請求項３２】
前記抗原結合タンパク質は、ヒト化、キメラ、リサーフェシング、またはヒトである、請求項１〜３０のいずれか一項に記載の抗原結合タンパク質。
【請求項３３】
前記抗原結合タンパク質は、抗体である、請求項１〜３２のいずれか一項に記載の抗原結合タンパク質。
【請求項３４】
前記抗原結合タンパク質は、抗体の抗原結合断片である、請求項１〜３３のいずれか一項に記載の抗原結合タンパク質。
【請求項３５】
モノクローナル抗体、組換え抗体、ヒト抗体、ヒト化抗体、キメラ抗体、二重特異性抗体、多重特異性抗体、またはその抗原結合断片である、請求項１〜３４のいずれか一項に記載の抗原結合タンパク質。
【請求項３６】
前記抗原結合タンパク質は、Ｆａｂ、Ｆａｂ’、Ｆ（ａｂ’）２、Ｆｄ、単鎖ＦｖもしくはｓｃＦｖ、ジスルフィド連結Ｆｖ、Ｖ−ＮＡＲドメイン、ＩｇＮａｒ、イントラボディ、ＩｇＧΔＣＨ２、ミニボディ、Ｆ（ａｂ’）３、テトラボディ、トリアボディ、ダイアボディ、シングルドメイン抗体、ＤＶＤ−Ｉｇ、Ｆｃａｂ、ｍＡｂ２、（ｓｃＦｖ）２、またはｓｃＦｖ−Ｆｃを含む、請求項１〜３２、３４、または３５のいずれか一項に記載の抗原結合タンパク質。
【請求項３７】
約４．０Ｅ−０９〜６．０Ｅ−０９ｎＭの範囲のＫｄでクレブシエラＯ１抗原に結合する、請求項１〜３６のいずれか一項に記載の抗原結合タンパク質。
【請求項３８】
結合親和性は、フローサイトメトリー、Ｂｉａｃｏｒｅ、ＫｉｎＥｘａ、またはラジオイムノアッセイによって測定される、請求項３７に記載の抗原結合タンパク質。
【請求項３９】
前記抗原結合タンパク質は、ａ）肺炎桿菌（Ｋｌｅｂｓｉｅｌｌａ  ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ）（肺炎桿菌（Ｋ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ））のオプソニン作用による死滅（ＯＰＫ）を誘導する、ｂ）血清殺菌活性測定法によって測定されるように補体依存性の死滅を介して肺炎桿菌（Ｋ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ）を死滅させる、および／またはｃ）リポ多糖（ＬＰＳ）を中和する、請求項１５〜３８のいずれか一項に記載の抗原結合タンパク質。
【請求項４０】
前記抗原結合タンパク質は、（ｉ）肺炎桿菌（Ｋ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ）のＯＰＫを誘導し、血清殺菌活性測定法によって測定されるように補体依存性の死滅を介して肺炎桿菌（Ｋ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ）を死滅させ、ＬＰＳを中和するまたは（ｉｉ）肺炎桿菌（Ｋ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ）のＯＰＫを誘導し、血清殺菌活性測定法によって測定されるように補体依存性の死滅を介して肺炎桿菌（Ｋ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ）を死滅させるが、ＬＰＳを中和しない、請求項３９に記載の抗原結合タンパク質。
【請求項４１】
前記肺炎桿菌（Ｋ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ）は、多薬剤抵抗性である、請求項３９または４０に記載の抗原結合タンパク質。
【請求項４２】
前記肺炎桿菌（Ｋ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ）は、株Ｋｐ１１３１１５またはＫｐ８５６１である、請求項４１に記載の抗原結合タンパク質。
【請求項４３】
前記肺炎桿菌（Ｋ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ）は、表８の列１〜１３４の１つに列挙される株である、請求項４１に記載の抗原結合タンパク質。
【請求項４４】
前記抗原結合タンパク質は、多薬剤抵抗性の肺炎桿菌（Ｋ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ）株を抗生物質に対して感受性にする、請求項４１〜４３のいずれか一項に記載の抗原結合タンパク質。
【請求項４５】
前記クレブシエラは、抗生物質に対して感受性である、請求項３９または４０に記載の抗原結合タンパク質。
【請求項４６】
前記肺炎桿菌（Ｋ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ）は、表８の列１３５〜１８４の１つに列挙される株である、請求項４５に記載の抗原結合タンパク質。
【請求項４７】
前記抗原結合タンパク質は、リポ多糖（ＬＰＳ）を中和しない、請求項１５〜４６のいずれか一項に記載の抗原結合タンパク質。
【請求項４８】
前記抗原結合タンパク質は、ＬＰＳを中和する、請求項１５〜４６のいずれか一項に記載の抗原結合タンパク質。
【請求項４９】
前記抗原結合タンパク質は、致命的なクレブシエラによる攻撃に暴露されたマウスにおいて治療的に有効である、請求項１５〜４８のいずれか一項に記載の抗原結合タンパク質。
【請求項５０】
前記抗原結合タンパク質は、
（ａ）ＩｇＡ定常ドメイン、
（ｂ）ＩｇＤ定常ドメイン、
（ｃ）ＩｇＥ定常ドメイン、
（ｄ）ＩｇＧ１定常ドメイン、
（ｅ）ＩｇＧ２定常ドメイン、
（ｆ）ＩｇＧ３定常ドメイン、
（ｇ）ＩｇＧ４定常ドメイン、および
（ｈ）ＩｇＭ定常ドメイン
からなる群から選択される重鎖免疫グロブリン定常ドメインを含む、請求項１〜４９のいずれか一項に記載の抗原結合タンパク質。
【請求項５１】
前記抗原結合タンパク質は、ＩｇＧ１定常ドメインを含む、請求項５０に記載の抗原結合タンパク質。
【請求項５２】
前記抗原結合タンパク質は、
（ａ）Ｉｇカッパ定常ドメイン、および
（ｂ）Ｉｇラムダ定常ドメイン
からなる群から選択される軽鎖免疫グロブリン定常ドメインを含む、請求項１〜５１のいずれか一項に記載の抗原結合タンパク質。
【請求項５３】
前記抗原結合タンパク質は、ヒトＩｇＧ１定常ドメインおよびヒトラムダ定常ドメインを含む、請求項１〜４９に記載のいずれか一項に記載の抗原結合タンパク質。
【請求項５４】
請求項１〜５３のいずれか一項に記載のその抗原結合タンパク質をコードする単離核酸分子。
【請求項５５】
前記核酸分子が、制御配列に作動可能に連結される、請求項５４に記載の核酸分子。
【請求項５６】
請求項５４または５５に記載の核酸分子を含むベクター。
【請求項５７】
請求項５４もしくは５５に記載の核酸分子または請求項５６に記載のベクターにより形質転換された宿主細胞。
【請求項５８】
前記宿主細胞が、哺乳類宿主細胞である、請求項５７に記載の宿主細胞。
【請求項５９】
前記宿主細胞は、ＨＥＫ２９３細胞、ＮＳ０マウス骨髄腫細胞、ＰＥＲ．Ｃ６（登録商標）ヒト細胞、またはチャイニーズハムスター卵巣（ＣＨＯ）細胞である、請求項５８に記載の哺乳類宿主細胞。
【請求項６０】
請求項１〜５３のいずれか一項に記載の抗原結合タンパク質を産生するハイブリドーマ。
【請求項６１】
請求項１〜５３のいずれか一項に記載の抗原結合タンパク質を産生する単離宿主細胞。
【請求項６２】
請求項１〜５３のいずれか一項に記載の抗原結合タンパク質を作製するための方法であって、（ａ）前記抗原結合タンパク質を発現する宿主細胞を培養するステップまたは請求項５７〜５９もしくは６１のいずれか一項に記載の宿主細胞または請求項６０に記載のハイブリドーマを培養するステップおよび（ｂ）その前記抗原結合タンパク質を前記培養宿主細胞から単離するステップを含む方法。
【請求項６３】
請求項６２に記載の方法を使用して産生される抗原結合タンパク質。
【請求項６４】
請求項１〜５３または６３のいずれか一項に記載の抗原結合タンパク質および薬学的に許容可能な賦形剤を含む医薬組成物。
【請求項６５】
前記薬学的に許容可能な賦形剤は、保存剤、安定剤、または酸化防止剤である、請求項６４に記載の医薬組成物。
【請求項６６】
医薬として使用される請求項６４または６５に記載の医薬組成物。
【請求項６７】
標識基またはエフェクター基をさらに含む、請求項１〜５３もしくは６３のいずれか一項に記載の抗原結合タンパク質または請求項６４〜６６のいずれか一項に記載の医薬組成物。
【請求項６８】
前記標識基が、同位体標識、磁気標識、レドックス活性成分、光学色素、ビオチン化基、ビオチンシグナル伝達ペプチド、緑色蛍光タンパク質（ＧＦＰ）、青色蛍光タンパク質（ＢＦＰ）、シアン蛍光タンパク質（ＣＦＰ）、黄色蛍光タンパク質（ＹＦＰ）などの蛍光成分、ヒスチジンペプチド（ｈｉｓ）、ヘマグルチニン（ＨＡ）、金結合ペプチド、およびＦｌａｇなどの二次レポーターによって認識されるポリペプチドエピトープからなる群から選択される、請求項６７に記載の抗原結合タンパク質または医薬組成物。
【請求項６９】
前記エフェクター基が、放射性同位体、放射性核種、毒素、治療薬、および化学療法剤からなる群から選択される、請求項６７に記載の抗原結合タンパク質または医薬組成物。
【請求項７０】
クレブシエラ感染症に関連する状態を治療するための、請求項１〜５３または６３〜６９のいずれか一項に記載の抗原結合タンパク質または医薬組成物の使用。
【請求項７１】
クレブシエラ感染症に関連する状態の治療、予防、または回復を、それを必要としている対象において行うための方法であって、有効量の請求項１〜５３または６３〜６９のいずれか一項に記載の抗原結合タンパク質または医薬組成物を前記対象に投与するステップを含む方法。
【請求項７２】
クレブシエラに感染した対象においてクレブシエラの増殖を阻害するまたはクレブシエラの数を低下させるための方法であって、請求項１〜５３または６３〜６９のいずれか一項に記載の抗原結合タンパク質または医薬組成物をそれを必要としている対象に投与するステップを含む方法。
【請求項７３】
クレブシエラ感染症に関連する状態の治療をそれを必要としている対象において行うための方法であって、肺炎桿菌（Ｋｌｅｂｓｉｅｌｌａ  ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ）Ｏ１抗原に特異的に結合する抗原結合タンパク質の有効量を前記対象に投与するステップを含む方法。
【請求項７４】
肺炎桿菌（Ｋｌｅｂｓｉｅｌｌａ  ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ）および黄色ブドウ球菌（Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ  ａｕｒｅｕｓ）の同時感染に関連する状態の治療、予防、または回復をそれを必要としている対象において行うための方法であって、肺炎桿菌（Ｋｌｅｂｓｉｅｌｌａ  ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ）Ｏ１抗原に特異的に結合する抗原結合タンパク質の有効量を前記対象に投与するステップを含む方法。
【請求項７５】
肺炎桿菌（Ｋｌｅｂｓｉｅｌｌａ  ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ）および黄色ブドウ球菌（Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ  ａｕｒｅｕｓ）に同時感染した対象において、肺炎桿菌（Ｋｌｅｂｓｉｅｌｌａ  ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ）の毒性を阻害する、低下させる、またはなくすための方法であって、肺炎桿菌（Ｋｌｅｂｓｉｅｌｌａ  ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ）Ｏ１抗原に特異的に結合する抗原結合タンパク質の有効量を前記対象に投与するステップを含む方法。
【請求項７６】
肺炎桿菌（Ｋｌｅｂｓｉｅｌｌａ  ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ）および黄色ブドウ球菌（Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ  ａｕｒｅｕｓ）の両方に感染した対象の生存を増加させるための方法であって、肺炎桿菌（Ｋｌｅｂｓｉｅｌｌａ  ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ）Ｏ１抗原に特異的に結合する抗原結合タンパク質の有効量を前記対象に投与するステップを含む方法。
【請求項７７】
前記クレブシエラは、抗生物質抵抗性である、請求項７１〜７６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項７８】
前記クレブシエラは、セファロスポリン、キノロン、カルバペネム、メロペネム、フルオロキノロン、テトラサイクリン、クロラムフェニコール、トリメトプリム、スルホンアミド、および／またはコリスチンに対して抵抗性である、請求項７７に記載の方法。
【請求項７９】
前記クレブシエラは、抗生物質に対して感受性である、請求項７１〜７６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項８０】
抗生物質に対して抗生物質抵抗性のクレブシエラ株を感作するための方法であって、肺炎桿菌（Ｋｌｅｂｓｉｅｌｌａ  ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ）Ｏ１抗原に特異的に結合する抗原結合タンパク質と前記抗体抵抗性のクレブシエラ株を接触させるステップを含む方法。
【請求項８１】
抗生物質を投与するステップをさらに含む、請求項７１〜７８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項８２】
前記抗原結合タンパク質および前記抗生物質は、相乗的な治療効果をもたらす、請求項８１に記載の方法。
【請求項８３】
抗生物質抵抗性のクレブシエラ株に感染した対象においてクレブシエラ感染症を予防するまたは治療するための方法であって、抗生物質および肺炎桿菌（Ｋｌｅｂｓｉｅｌｌａ  ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ）Ｏ１抗原に特異的に結合する抗原結合タンパク質を対象に同時投与するステップを含み、前記同時投与は、等モル量の前記抗原結合タンパク質または前記抗生物質の投与の個々の効果の合計よりも大きな治療効果をもたらす方法。
【請求項８４】
前記治療効果は、前記抗原結合タンパク質または前記抗生物質の１つのみを投与した対象の相加的な生存パーセントよりも大きな生存パーセントをもたらす、請求項８３に記載の方法。
【請求項８５】
前記抗生物質は、メロペネムである、請求項８１〜８４に記載のいずれか一項に記載の方法。
【請求項８６】
肺炎桿菌（Ｋｌｅｂｓｉｅｌｌａ  ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ）Ｏ１抗原に特異的に結合する前記抗原結合タンパク質は、抗体またはその抗原結合断片である、請求項７３〜８５のいずれか一項に記載の方法。
【請求項８７】
肺炎桿菌（Ｋｌｅｂｓｉｅｌｌａ  ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ）Ｏ１抗原に特異的に結合する前記抗原結合タンパク質は、請求項１〜５３または６３〜６９のいずれか一項に記載の前記抗原結合タンパク質または前記医薬組成物である、請求項７３〜８５のいずれか一項に記載の方法。
【請求項８８】
クレブシエラは、肺炎桿菌（Ｋ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ）、Ｋ．オキシトカ（Ｋ．ｏｘｙｔｏｃａ）、Ｋ．プランチコラ（Ｋ．ｐｌａｎｔｉｃｏｌａ）、臭鼻菌（Ｋ．ｏｚａｅｎａｅ）、鼻硬腫菌（Ｋ．ｒｈｉｎｏｓｃｌｅｒｍｏａｔｉｓ）、および／またはＫ．グラニュロマティス（Ｋ．ｇｒａｎｕｌｏｍａｔｉｓ）である、請求項７１〜７３または７７〜８７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項８９】
前記状態は、肺炎、尿路感染症、敗血症／セプシス、新生児敗血症／セプシス、下痢、軟部組織感染症、臓器移植後の感染症、外科手術による感染症、創傷感染症、肺感染症、化膿性肝膿瘍（ＰＬＡ）、眼内炎、髄膜炎、壊死性髄膜炎、強直性脊椎炎、および脊椎関節症からなる群から選択される、請求項７０、７１、７３、７４、７７〜７９、８２、または８５〜８８のいずれか一項に記載の使用または方法。
【請求項９０】
前記状態は、院内感染症である、請求項７０、７１、７３、７４、７７〜７９、８２、または８５〜８８のいずれか一項に記載の使用または方法。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０２８４
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０２８４】
具体的な実施形態の前出の説明は、本開示の一般的性質を十分に完全に明らかにするものであり、したがって第三者が、当技術分野の範囲内の知識を適用することにより、本開示の一般的概念から逸脱することなく、過度の実験を行うことなしにかかる具体的な実施形態を容易に改良しおよび／またはそれを様々な適用に適合させることができる。したがって、かかる適合形態および改良形態は、本明細書に提供される教示および指針に基づけば、開示される実施形態の均等物の意味および範囲内にあることが意図される。本明細書における用語法または表現法は、限定ではなく、説明を目的とするものであり、したがって本明細書の用語法または表現法は当業者によって教示および指針を踏まえて解釈されるべきであることが理解されなければならない。
本発明は、例えば以下の実施形態を包含する：
［実施形態１］肺炎桿菌（Ｋｌｅｂｓｉｅｌｌａ  ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ）Ｏ１抗原に特異的に結合する単離抗原結合タンパク質であって、前記抗原結合タンパク質は、ａ）クレブシエラのオプソニン作用による死滅（ＯＰＫ）を誘導する、ｂ）血清殺菌活性測定法によって測定されるように補体依存性の死滅を介してクレブシエラを死滅させる、またはｃ）クレブシエラのＯＰＫを誘導し、血清殺菌活性測定法によって測定されるように補体依存性の死滅を介してクレブシエラを死滅させる、単離抗原結合タンパク質。
［実施形態２］前記抗原結合タンパク質は、リポ多糖（ＬＰＳ）を中和しない、実施形態１に記載の抗原結合タンパク質。
［実施形態３］前記抗原結合タンパク質は、ＬＰＳを中和する、実施形態１に記載の抗原結合タンパク質。
［実施形態４］（ｉ）クレブシエラのＯＰＫを誘導し、血清殺菌活性測定法によって測定されるように補体依存性の死滅を介してクレブシエラを死滅させ、かつリポ多糖（ＬＰＳ）を中和するまたは（ｉｉ）クレブシエラのＯＰＫを誘導し、血清殺菌活性測定法によって測定されるように補体依存性の死滅を介してクレブシエラを死滅させるが、ＬＰＳを中和しない、実施形態１に記載の抗原結合タンパク質。
［実施形態５］前記抗原結合タンパク質は、致命的なクレブシエラによる攻撃に暴露されたマウスにおいて治療的に有効である、実施形態１〜４のいずれかに記載の抗原結合タンパク質。
［実施形態６］前記クレブシエラは、肺炎桿菌（Ｋ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ）、Ｋ．オキシトカ（Ｋ．ｏｘｙｔｏｃａ）、Ｋ．グラニュロマティス（Ｋ．ｇｒａｎｕｌｏｍａｔｉｓ）、臭鼻菌（Ｋ．ｏｚａｅｎａｅ）、鼻硬腫菌（Ｋ．ｒｈｉｎｏｓｃｌｅｒｍｏａｔｉｓ）、またはＫ．プランチコラ（Ｋ．ｐｌａｎｔｉｃｏｌａ）である、実施形態５のいずれかに記載の抗原結合タンパク質。
［実施形態７］前記クレブシエラは、肺炎桿菌（Ｋ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ）である、実施形態６に記載の抗原結合タンパク質。
［実施形態８］前記クレブシエラは、多薬剤抵抗性である、実施形態１〜７のいずれかに記載の抗原結合タンパク質。
［実施形態９］前記肺炎桿菌（Ｋ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ）は、株Ｋｐ１１３１１５またはＫｐ８５６１である、実施形態８に記載の抗原結合タンパク質。
［実施形態１０］前記肺炎桿菌（Ｋ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ）は、表８の列１〜１３４の１つに列挙される株である、実施形態８に記載の抗原結合タンパク質。
［実施形態１１］前記抗原結合タンパク質は、多薬剤抵抗性の肺炎桿菌（Ｋ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ）株を、少なくとも１つの抗生物質に対して感受性にする、実施形態８〜１０のいずれかに記載の抗原結合タンパク質。
［実施形態１２］前記クレブシエラは、抗生物質に対して感受性である、実施形態１〜７のいずれかに記載の抗原結合タンパク質。
［実施形態１３］前記肺炎桿菌（Ｋ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ）は、表８の列１３５〜１８４の１つに列挙される株である、実施形態１２に記載の抗原結合タンパク質。
［実施形態１４］前記抗原結合タンパク質は、肺炎桿菌（Ｋ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ）Ｏ１抗原のＤ−ガラクタンＩＩドメインに結合する、実施形態１〜１３のいずれかに記載の抗原結合タンパク質。
［実施形態１５］相補性決定領域（ＣＤＲ）：ＨＣＤＲ１、ＨＣＤＲ２、ＨＣＤＲ３、ＬＣＤＲ１、ＬＣＤＲ２、およびＬＣＤＲ３のセットを含む、肺炎桿菌（Ｋｌｅｂｓｉｅｌｌａ  ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ）Ｏ１抗原に特異的に結合する単離抗原結合タンパク質であって、
ＨＣＤＲ１は、配列番号１のアミノ酸配列を有し、
ＨＣＤＲ２は、配列番号２または５９のアミノ酸配列を有し、
ＨＣＤＲ３は、配列番号３または６０のアミノ酸配列を有し、
ＬＣＤＲ１は、配列番号４のアミノ酸配列を有し、
ＬＣＤＲ２は、配列番号５または１０のアミノ酸配列を有し、
ＬＣＤＲ３は、配列番号１１のアミノ酸配列を有する、単離抗原結合タンパク質。
［実施形態１６］肺炎桿菌（Ｋｌｅｂｓｉｅｌｌａ  ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ）Ｏ１抗原に特異的に結合する単離抗原結合タンパク質であって、前記抗原結合タンパク質は、配列番号１２、６１、もしくは６２と少なくとも９５％、９６％、９７％、９８％、もしくは９９％同一な重鎖可変領域（ＶＨ）および／または配列番号１３もしくは６３と少なくとも９５％、９６％、９７％、９８％、もしくは９９％同一な軽鎖可変領域（ＶＬ）を含む、単離抗原結合タンパク質。
［実施形態１７］その前記抗原結合タンパク質は、配列番号１２、６１、または６２を含むＶＨおよび配列番号１３または６３を含むＶＬを含む、実施形態１６に記載の抗原結合タンパク質。
［実施形態１８］配列番号１２を含むＶＨを含む、肺炎桿菌（Ｋｌｅｂｓｉｅｌｌａ  ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ）Ｏ１抗原に特異的に結合する単離抗原結合タンパク質。
［実施形態１９］配列番号１３を含むＶＬを含む、肺炎桿菌（Ｋｌｅｂｓｉｅｌｌａ  ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ）Ｏ１抗原に特異的に結合する単離抗原結合タンパク質。
［実施形態２０］配列番号１２、６１、または６２を含むＶＨおよび配列番号１３または６３を含むＶＬを含む抗体と、肺炎桿菌（Ｋｌｅｂｓｉｅｌｌａ  ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ）Ｏ１抗原中の同じエピトープに特異的に結合する単離抗原結合タンパク質。
［実施形態２１］配列番号１２、６１、または６２を含むＶＨおよび配列番号１３または６３を含むＶＬを含む抗体の肺炎桿菌（Ｋｌｅｂｓｉｅｌｌａ  ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ）Ｏ１抗原への結合を競合的に阻害する単離抗原結合タンパク質。
［実施形態２２］相補性決定領域（ＣＤＲ）：ＨＣＤＲ１、ＨＣＤＲ２、ＨＣＤＲ３、ＬＣＤＲ１、ＬＣＤＲ２、およびＬＣＤＲ３のセットを含む、肺炎桿菌（Ｋｌｅｂｓｉｅｌｌａ  ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ）Ｏ１抗原に特異的に結合する単離抗原結合タンパク質であって、前記ＨＣＤＲ１、ＨＣＤＲ２、ＨＣＤＲ３、ＬＣＤＲ１、ＬＣＤＲ２、およびＬＣＤＲ３は、
それぞれ配列番号４１、４２、４３、４４、４５、および４６、
それぞれ配列番号３２、３３、３４、３５、３６、および３８、
それぞれ配列番号３２、３３、３４、３５、３７、および３８、
それぞれ配列番号１、２、３、４、５、および７、
それぞれ配列番号１、２、３、４、６、および７、
それぞれ配列番号１４、１５、１６、１７、１８、および２０、
それぞれ配列番号１４、１５、１６、１７、１９、および２０、
それぞれ配列番号２３、２４、２５、２６、２７、および２９、または
それぞれ配列番号２３、２４、２５、２６、２８、および２９
のアミノ酸配列を含む、単離抗原結合タンパク質。
［実施形態２３］肺炎桿菌（Ｋｌｅｂｓｉｅｌｌａ  ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ）Ｏ１抗原に特異的に結合する単離抗原結合タンパク質であって、前記抗原結合タンパク質は、
それぞれ配列番号４７および配列番号４８、
それぞれ配列番号３９および配列番号４０、
それぞれ配列番号８および配列番号９、
それぞれ配列番号２１および配列番号２２、または
それぞれ配列番号３０および配列番号３１
と少なくとも９５％、９６％、９７％、９８％、または９９％同一なＶＨおよびＶＬを含む、単離抗原結合タンパク質。
［実施形態２４］前記抗原結合タンパク質は、
それぞれ配列番号４７および配列番号４８、
それぞれ配列番号３９および配列番号４０、
それぞれ配列番号８および配列番号９、
それぞれ配列番号２１および配列番号２２、または
それぞれ配列番号３０および配列番号３１
を含むＶＨおよびＶＬを含む、実施形態２３に記載の抗原結合タンパク質。
［実施形態２５］配列番号４７、配列番号３９、配列番号８、配列番号２１、または配列番号３０を含むＶＨを含む、肺炎桿菌（Ｋｌｅｂｓｉｅｌｌａ  ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ）Ｏ１抗原に特異的に結合する単離抗原結合タンパク質。
［実施形態２６］配列番号４８、配列番号４０、配列番号９、配列番号２２、または配列番号３１を含むＶＬを含む、肺炎桿菌（Ｋｌｅｂｓｉｅｌｌａ  ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ）Ｏ１抗原に特異的に結合する単離抗原結合タンパク質。
［実施形態２７］それぞれ配列番号４７および配列番号４８、
それぞれ配列番号３９および配列番号４０、
それぞれ配列番号８および配列番号９、
それぞれ配列番号２１および配列番号２２、または
それぞれ配列番号３０および配列番号３１
を含むＶＨおよびＶＬを含む抗体として、肺炎桿菌（Ｋｌｅｂｓｉｅｌｌａ  ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ）Ｏ１抗原中の同じエピトープに特異的に結合する単離抗原結合タンパク質。
［実施形態２８］それぞれ配列番号４７および配列番号４８、
それぞれ配列番号３９および配列番号４０、
それぞれ配列番号８および配列番号９、
それぞれ配列番号２１および配列番号２２、または
それぞれ配列番号３０および配列番号３１
を含むＶＨおよびＶＬを含む抗体の肺炎桿菌（Ｋｌｅｂｓｉｅｌｌａ  ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ）Ｏ１抗原への結合を競合的に阻害する単離抗原結合タンパク質。
［実施形態２９］前記抗原結合タンパク質は、マウス、非ヒト、ヒト化、キメラ、リサーフェシング、またはヒトである、実施形態１〜２８のいずれかに記載の抗原結合タンパク質。
［実施形態３０］前記抗原結合タンパク質は、ヒト化、キメラ、リサーフェシング、またはヒトである、実施形態１〜２８のいずれかに記載の抗原結合タンパク質。
［実施形態３１］前記抗原結合タンパク質は、抗体である、実施形態１〜３０のいずれかに記載の抗原結合タンパク質。
［実施形態３２］前記抗原結合タンパク質は、抗体の抗原結合断片である、実施形態１〜３１のいずれかに記載の抗原結合タンパク質。
［実施形態３３］モノクローナル抗体、組換え抗体、ヒト抗体、ヒト化抗体、キメラ抗体、二重特異性抗体、多重特異性抗体、またはその抗原結合断片である、実施形態１〜３２のいずれかに記載の抗原結合タンパク質。
［実施形態３４］前記抗原結合タンパク質は、Ｆａｂ、Ｆａｂ’、Ｆ（ａｂ’）２、Ｆｄ、単鎖ＦｖもしくはｓｃＦｖ、ジスルフィド連結Ｆｖ、Ｖ−ＮＡＲドメイン、ＩｇＮａｒ、イントラボディ、ＩｇＧΔＣＨ２、ミニボディ、Ｆ（ａｂ’）３、テトラボディ、トリアボディ、ダイアボディ、シングルドメイン抗体、ＤＶＤ−Ｉｇ、Ｆｃａｂ、ｍＡｂ２、（ｓｃＦｖ）２、またはｓｃＦｖ−Ｆｃを含む、実施形態１〜３０、３２、または３３のいずれかに記載の抗原結合タンパク質。
［実施形態３５］約４．０Ｅ−０９〜６．０Ｅ−０９ｎＭの範囲のＫｄでクレブシエラＯ１抗原に結合する、実施形態１〜３４のいずれかに記載の抗原結合タンパク質。
［実施形態３６］結合親和性は、フローサイトメトリー、Ｂｉａｃｏｒｅ、ＫｉｎＥｘａ、またはラジオイムノアッセイによって測定される、実施形態３５に記載の抗原結合タンパク質。
［実施形態３７］前記抗原結合タンパク質は、ａ）肺炎桿菌（Ｋｌｅｂｓｉｅｌｌａ  ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ）（肺炎桿菌（Ｋ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ））のオプソニン作用による死滅（ＯＰＫ）を誘導する、ｂ）血清殺菌活性測定法によって測定されるように補体依存性の死滅を介して肺炎桿菌（Ｋ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ）を死滅させる、および／またはｃ）リポ多糖（ＬＰＳ）を中和する、実施形態１５〜３６のいずれかに記載の抗原結合タンパク質。
［実施形態３８］前記抗原結合タンパク質は、（ｉ）肺炎桿菌（Ｋ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ）のＯＰＫを誘導し、血清殺菌活性測定法によって測定されるように補体依存性の死滅を介して肺炎桿菌（Ｋ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ）を死滅させ、ＬＰＳを中和するまたは（ｉｉ）肺炎桿菌（Ｋ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ）のＯＰＫを誘導し、血清殺菌活性測定法によって測定されるように補体依存性の死滅を介して肺炎桿菌（Ｋ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ）を死滅させるが、ＬＰＳを中和しない、実施形態３７に記載の抗原結合タンパク質。
［実施形態３９］前記肺炎桿菌（Ｋ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ）は、多薬剤抵抗性である、実施形態３７または３８に記載の抗原結合タンパク質。
［実施形態４０］前記肺炎桿菌（Ｋ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ）は、株Ｋｐ１１３１１５またはＫｐ８５６１である、実施形態３９に記載の抗原結合タンパク質。
［実施形態４１］前記肺炎桿菌（Ｋ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ）は、表８の列１〜１３４の１つに列挙される株である、実施形態３９に記載の抗原結合タンパク質。
［実施形態４２］前記抗原結合タンパク質は、多薬剤抵抗性の肺炎桿菌（Ｋ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ）株を抗生物質に対して感受性にする、実施形態３９〜４１のいずれかに記載の抗原結合タンパク質。
［実施形態４３］前記クレブシエラは、抗生物質に対して感受性である、実施形態３７または３８に記載の抗原結合タンパク質。
［実施形態４４］前記肺炎桿菌（Ｋ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ）は、表８の列１３５〜１８４の１つに列挙される株である、実施形態４３に記載の抗原結合タンパク質。
［実施形態４５］前記抗原結合タンパク質は、リポ多糖（ＬＰＳ）を中和しない、実施形態１５〜４４のいずれかに記載の抗原結合タンパク質。
［実施形態４６］前記抗原結合タンパク質は、ＬＰＳを中和する、実施形態１５〜４４のいずれかに記載の抗原結合タンパク質。
［実施形態４７］前記抗原結合タンパク質は、致命的なクレブシエラによる攻撃に暴露されたマウスにおいて治療的に有効である、実施形態１５〜４６のいずれかに記載の抗原結合タンパク質。
［実施形態４８］前記抗原結合タンパク質は、
（ａ）ＩｇＡ定常ドメイン、
（ｂ）ＩｇＤ定常ドメイン、
（ｃ）ＩｇＥ定常ドメイン、
（ｄ）ＩｇＧ１定常ドメイン、
（ｅ）ＩｇＧ２定常ドメイン、
（ｆ）ＩｇＧ３定常ドメイン、
（ｇ）ＩｇＧ４定常ドメイン、および
（ｈ）ＩｇＭ定常ドメイン
からなる群から選択される重鎖免疫グロブリン定常ドメインを含む、実施形態１〜４７のいずれかに記載の抗原結合タンパク質。
［実施形態４９］前記抗原結合タンパク質は、ＩｇＧ１定常ドメインを含む、実施形態４８に記載の抗原結合タンパク質。
［実施形態５０］前記抗原結合タンパク質は、
（ａ）Ｉｇカッパ定常ドメイン、および
（ｂ）Ｉｇラムダ定常ドメイン
からなる群から選択される軽鎖免疫グロブリン定常ドメインを含む、実施形態１〜４９のいずれかに記載の抗原結合タンパク質。
［実施形態５１］前記抗原結合タンパク質は、ヒトＩｇＧ１定常ドメインおよびヒトラムダ定常ドメインを含む、実施形態１〜４７に記載のいずれかに記載の抗原結合タンパク質。
［実施形態５２］実施形態１〜５１のいずれかに記載のその抗原結合タンパク質をコードする単離核酸分子。
［実施形態５３］前記核酸分子が、制御配列に作動可能に連結される、実施形態５２に記載の核酸分子。
［実施形態５４］実施形態５２または５３に記載の核酸分子を含むベクター。
［実施形態５５］実施形態５２もしくは５３に記載の核酸分子または実施形態５４に記載のベクターにより形質転換された宿主細胞。
［実施形態５６］前記宿主細胞が、哺乳類宿主細胞である、実施形態５５に記載の宿主細胞。
［実施形態５７］前記宿主細胞は、ＨＥＫ２９３細胞、ＮＳ０マウス骨髄腫細胞、ＰＥＲ．Ｃ６（登録商標）ヒト細胞、またはチャイニーズハムスター卵巣（ＣＨＯ）細胞である、実施形態５６に記載の哺乳類宿主細胞。
［実施形態５８］実施形態１〜５１のいずれかに記載の抗原結合タンパク質を産生するハイブリドーマ。
［実施形態５９］実施形態１〜５１のいずれかに記載の抗原結合タンパク質を産生する単離宿主細胞。
［実施形態６０］実施形態１〜５１のいずれかに記載の抗原結合タンパク質を作製するための方法であって、（ａ）前記抗原結合タンパク質を発現する宿主細胞を培養するステップまたは実施形態５５〜５７もしくは５９のいずれかに記載の宿主細胞または実施形態５８に記載のハイブリドーマを培養するステップおよび（ｂ）その前記抗原結合タンパク質を前記培養宿主細胞から単離するステップを含む方法。
［実施形態６１］実施形態６０に記載の方法を使用して産生される抗原結合タンパク質。
［実施形態６２］実施形態１〜５１または６１のいずれかに記載の抗原結合タンパク質および薬学的に許容可能な賦形剤を含む医薬組成物。
［実施形態６３］前記薬学的に許容可能な賦形剤は、保存剤、安定剤、または酸化防止剤である、実施形態６２に記載の医薬組成物。
［実施形態６４］医薬として使用される実施形態６２または６３に記載の医薬組成物。
［実施形態６５］標識基またはエフェクター基をさらに含む、実施形態１〜５１もしくは６１のいずれかに記載の抗原結合タンパク質または実施形態６２〜６４のいずれかに記載の医薬組成物。
［実施形態６６］前記標識基が、同位体標識、磁気標識、レドックス活性成分、光学色素、ビオチン化基、ビオチンシグナル伝達ペプチド、緑色蛍光タンパク質（ＧＦＰ）、青色蛍光タンパク質（ＢＦＰ）、シアン蛍光タンパク質（ＣＦＰ）、黄色蛍光タンパク質（ＹＦＰ）などの蛍光成分、ヒスチジンペプチド（ｈｉｓ）、ヘマグルチニン（ＨＡ）、金結合ペプチド、およびＦｌａｇなどの二次レポーターによって認識されるポリペプチドエピトープからなる群から選択される、実施形態６５に記載の抗原結合タンパク質または医薬組成物。
［実施形態６７］前記エフェクター基が、放射性同位体、放射性核種、毒素、治療薬、および化学療法剤からなる群から選択される、実施形態６５に記載の抗原結合タンパク質または医薬組成物。
［実施形態６８］クレブシエラ感染症に関連する状態を治療するための、実施形態１〜５１または６１〜６７のいずれかに記載の抗原結合タンパク質または医薬組成物の使用。
［実施形態６９］クレブシエラ感染症に関連する状態の治療、予防、または回復を、それを必要としている対象において行うための方法であって、有効量の実施形態１〜５１または６１〜６７のいずれかに記載の抗原結合タンパク質または医薬組成物を前記対象に投与するステップを含む方法。
［実施形態７０］クレブシエラに感染した対象においてクレブシエラの増殖を阻害するまたはクレブシエラの数を低下させるための方法であって、実施形態１〜５１または６１〜６７のいずれかに記載の抗原結合タンパク質または医薬組成物をそれを必要としている対象に投与するステップを含む方法。
［実施形態７１］クレブシエラ感染症に関連する状態の治療をそれを必要としている対象において行うための方法であって、肺炎桿菌（Ｋｌｅｂｓｉｅｌｌａ  ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ）Ｏ１抗原に特異的に結合する抗原結合タンパク質の有効量を前記対象に投与するステップを含む方法。
［実施形態７２］肺炎桿菌（Ｋｌｅｂｓｉｅｌｌａ  ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ）および黄色ブドウ球菌（Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ  ａｕｒｅｕｓ）の同時感染に関連する状態の治療、予防、または回復をそれを必要としている対象において行うための方法であって、肺炎桿菌（Ｋｌｅｂｓｉｅｌｌａ  ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ）Ｏ１抗原に特異的に結合する抗原結合タンパク質の有効量を前記対象に投与するステップを含む方法。
［実施形態７３］肺炎桿菌（Ｋｌｅｂｓｉｅｌｌａ  ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ）および黄色ブドウ球菌（Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ  ａｕｒｅｕｓ）に同時感染した対象において、肺炎桿菌（Ｋｌｅｂｓｉｅｌｌａ  ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ）の毒性を阻害する、低下させる、またはなくすための方法であって、肺炎桿菌（Ｋｌｅｂｓｉｅｌｌａ  ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ）Ｏ１抗原に特異的に結合する抗原結合タンパク質の有効量を前記対象に投与するステップを含む方法。
［実施形態７４］肺炎桿菌（Ｋｌｅｂｓｉｅｌｌａ  ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ）および黄色ブドウ球菌（Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ  ａｕｒｅｕｓ）の両方に感染した対象の生存を増加させるための方法であって、肺炎桿菌（Ｋｌｅｂｓｉｅｌｌａ  ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ）Ｏ１抗原に特異的に結合する抗原結合タンパク質の有効量を前記対象に投与するステップを含む方法。
［実施形態７５］前記クレブシエラは、抗生物質抵抗性である、実施形態６９〜７４のいずれかに記載の方法。
［実施形態７６］前記クレブシエラは、セファロスポリン、キノロン、カルバペネム、メロペネム、フルオロキノロン、テトラサイクリン、クロラムフェニコール、トリメトプリム、スルホンアミド、および／またはコリスチンに対して抵抗性である、実施形態７５に記載の方法。
［実施形態７７］前記クレブシエラは、抗生物質に対して感受性である、実施形態６９〜７４のいずれかに記載の方法。
［実施形態７８］抗生物質に対して抗生物質抵抗性のクレブシエラ株を感作するための方法であって、肺炎桿菌（Ｋｌｅｂｓｉｅｌｌａ  ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ）Ｏ１抗原に特異的に結合する抗原結合タンパク質と前記抗体抵抗性のクレブシエラ株を接触させるステップを含む方法。
［実施形態７９］抗生物質を投与するステップをさらに含む、実施形態６９〜７８のいずれかに記載の方法。
［実施形態８０］前記抗原結合タンパク質および前記抗生物質は、相乗的な治療効果をもたらす、実施形態７９に記載の方法。
［実施形態８１］抗生物質抵抗性のクレブシエラ株に感染した対象においてクレブシエラ感染症を予防するまたは治療するための方法であって、抗生物質および肺炎桿菌（Ｋｌｅｂｓｉｅｌｌａ  ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ）Ｏ１抗原に特異的に結合する抗原結合タンパク質を対象に同時投与するステップを含み、前記同時投与は、等モル量の前記抗原結合タンパク質または前記抗生物質の投与の個々の効果の合計よりも大きな治療効果をもたらす方法。
［実施形態８２］前記治療効果は、前記抗原結合タンパク質または前記抗生物質の１つのみを投与した対象の相加的な生存パーセントよりも大きな生存パーセントをもたらす、実施形態８１に記載の方法。
［実施形態８３］前記抗生物質は、メロペネムである、実施形態７９〜８２に記載のいずれかに記載の方法。
［実施形態８４］肺炎桿菌（Ｋｌｅｂｓｉｅｌｌａ  ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ）Ｏ１抗原に特異的に結合する前記抗原結合タンパク質は、抗体またはその抗原結合断片である、実施形態７１〜８３のいずれかに記載の方法。
［実施形態８５］肺炎桿菌（Ｋｌｅｂｓｉｅｌｌａ  ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ）Ｏ１抗原に特異的に結合する前記抗原結合タンパク質は、実施形態１〜５１または６１〜６７のいずれかに記載の前記抗原結合タンパク質または前記医薬組成物である、実施形態７１〜８３のいずれかに記載の方法。
［実施形態８６］クレブシエラは、肺炎桿菌（Ｋ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ）、Ｋ．オキシトカ（Ｋ．ｏｘｙｔｏｃａ）、Ｋ．プランチコラ（Ｋ．ｐｌａｎｔｉｃｏｌａ）、臭鼻菌（Ｋ．ｏｚａｅｎａｅ）、鼻硬腫菌（Ｋ．ｒｈｉｎｏｓｃｌｅｒｍｏａｔｉｓ）、および／またはＫ．グラニュロマティス（Ｋ．ｇｒａｎｕｌｏｍａｔｉｓ）である、実施形態６９〜７１または７５〜８５のいずれかに記載の方法。
［実施形態８７］前記状態は、肺炎、尿路感染症、敗血症／セプシス、新生児敗血症／セプシス、下痢、軟部組織感染症、臓器移植後の感染症、外科手術による感染症、創傷感染症、肺感染症、化膿性肝膿瘍（ＰＬＡ）、眼内炎、髄膜炎、壊死性髄膜炎、強直性脊椎炎、および脊椎関節症からなる群から選択される、実施形態６８、６９、７１、７２、７５〜７７、７９、８０、または８３〜８６のいずれかに記載の使用または方法。
［実施形態８８］前記状態は、院内感染症である、実施形態６８、６９、７１、７２、７５〜７７、７９、８０、または８３〜８６のいずれかに記載の使用または方法。