【手続補正書】
【提出日】令和2年4月6日(2020.4.6)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
配列番号５５，５５９〜５５，５６４、５５，５６６〜５５，５６９、５５，５７２〜５５，５７５、５５，５７７、５５，５７８、５５，５８０〜５５，５８４、５５，５８６、５５，５８７、５５，５９１、５５，５９５、５５，５９９、５５，６００、５５，６０２、５５，６０５、５５，６０７、５５，６１６、５５，６２０、５５，６２５、５５，６２７、５５，６２８、５５，６３３、５５，６３５、５５，６３９、５５，６４１、５５，６４２、５５，６４５、５５，６４６、５５，６５７、５５，６５８、５５，６６９、５５，６７１〜５５，６７４、５５，６７７、５５，６７８、５５，６８１、５５，６８５〜５５，６９２、５５，６９４〜５５，６９７、５５，７０１、５５，７０４、５５，７０５、５５，７０７〜５５，７０９、５５，７１６、５５，７１８、５５，７２１、５５，７２２、５５，７２４、５５，７２６、５５，７２７、５５，７２８、５５，７３０、５５，７３２〜５５，７３７、５５，７４０、５５，７４３、５５，７４４、５５，７４８、５５，７４９、５５，７５１、５５，７５４、５５，７５６、５５，７６２、５５，７６４、５５，７７１、５５，７７６、５５，７７８、５５，７８１〜５５，７８３、６０，４７６、６０，４７７、６０，４８０〜６０，４８２、６０，４８５、６０，４８７、６０，４９０、６０，４９２、６０，４９４〜６０，４９９、６０，５０４、６０，５０６、６０，５１１、６０，５１５、６０，５１７、６０，５１９、６０，５２２、６０，５２６〜６０，５２９、６０，５３４、６０，５３６、６０，５３９〜６０，５４１、６０，５４７、６０，５４９、６０，５５２、６０，５５４、６０，５５５、６０，５５７、６０，５５８、６０，５６１、６０，５６３、６０，５６４、６０，５６６、６０，５６７、６０，５６９〜６０，５７２、６０，５７５、６０，５７６、６０，５７８、６０，５８１、６０，５８２、６０，５８３、６０，５８８、６０，５９１、６０，５９２、６０，５９４、６０，５９９、６０，６０１、６０，６０４、６０，６０５、６０，６０７、６０，６０８、６０，６１５、６０，６１８〜６０，６２０、６０，６２２、６０，６２８、６０，６３０、６０，６３２、６０，６３３、６０，６３７、６０，６３９、６０，６４０、６０，６４２〜６０，６４５、６０，６４７、６０，６４８、６０，６５０、６０，６５７、６０，６５８、６０，６６０、および６０，６６４の核酸配列からなる群から選択されるスペーサー配列を含むガイドリボ核酸（ｇＲＮＡ）を含む、アルファ１アンチトリプシン欠乏症（ＡＡＴＤ）の患者由来の細胞内のＳＥＲＰＩＮＡ１遺伝子を編集するための組成物。
【請求項２】
ｇＲＮＡが単分子ガイドＲＮＡ（ｓｇＲＮＡ）である、請求項１に記載の組成物。
【請求項３】
ｇＲＮＡが改変型ｇＲＮＡである、請求項１に記載の組成物。
【請求項４】
ｓｇＲＮＡが改変型ｓｇＲＮＡである、請求項２に記載の組成物。
【請求項５】
細胞が肝細胞である、請求項１〜４のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項６】
アルファ１アンチトリプシン欠乏症（ＡＡＴＤ）の患者由来の細胞のＳＥＲＰＩＮＡ１遺伝子を編集する方法であって、化膿性連鎖球菌（Ｓ．ｐｙｏｇｅｎｅｓ）Ｃａｓ９エンドヌクレアーゼ、および、配列番号５５，５５９〜５５，５６４、５５，５６６〜５５，５６９、５５，５７２〜５５，５７５、５５，５７７、５５，５７８、５５，５８０〜５５，５８４、５５，５８６、５５，５８７、５５，５９１、５５，５９５、５５，５９９、５５，６００、５５，６０２、５５，６０５、５５，６０７、５５，６１６、５５，６２０、５５，６２５、５５，６２７、５５，６２８、５５，６３３、５５，６３５、５５，６３９、５５，６４１、５５，６４２、５５，６４５、５５，６４６、５５，６５７、５５，６５８、５５，６６９、５５，６７１〜５５，６７４、５５，６７７、５５，６７８、５５，６８１、５５，６８５〜５５，６９２、５５，６９４〜５５，６９７、５５，７０１、５５，７０４、５５，７０５、５５，７０７〜５５，７０９、５５，７１６、５５，７１８、５５，７２１、５５，７２２、５５，７２４、５５，７２６、５５，７２７、５５，７２８、５５，７３０、５５，７３２〜５５，７３７、５５，７４０、５５，７４３、５５，７４４、５５，７４８、５５，７４９、５５，７５１、５５，７５４、５５，７５６、５５，７６２、５５，７６４、５５，７７１、５５，７７６、５５，７７８、５５，７８１〜５５，７８３、６０，４７６、６０，４７７、６０，４８０〜６０，４８２、６０，４８５、６０，４８７、６０，４９０、６０，４９２、６０，４９４〜６０，４９９、６０，５０４、６０，５０６、６０，５１１、６０，５１５、６０，５１７、６０，５１９、６０，５２２、６０，５２６〜６０，５２９、６０，５３４、６０，５３６、６０，５３９〜６０，５４１、６０，５４７、６０，５４９、６０，５５２、６０，５５４、６０，５５５、６０，５５７、６０，５５８、６０，５６１、６０，５６３、６０，５６４、６０，５６６、６０，５６７、６０，５６９〜６０，５７２、６０，５７５、６０，５７６、６０，５７８、６０，５８１、６０，５８２、６０，５８３、６０，５８８、６０，５９１、６０，５９２、６０，５９４、６０，５９９、６０，６０１、６０，６０４、６０，６０５、６０，６０７、６０，６０８、６０，６１５、６０，６１８〜６０，６２０、６０，６２２、６０，６２８、６０，６３０、６０，６３２、６０，６３３、６０，６３７、６０，６３９、６０，６４０、６０，６４２〜６０，６４５、６０，６４７、６０，６４８、６０，６５０、６０，６５７、６０，６５８、６０，６６０、および６０，６６４の核酸配列からなる群から選択されるスペーサー配列を含むガイドリボ核酸（ｇＲＮＡ）を細胞に導入することを含む方法。
【請求項７】
細胞が肝細胞である、請求項６に記載の方法。
【請求項８】
アルファ１アンチトリプシン（ＡＡＴ）タンパク質活性の回復を、野生型の、または正常なＡＡＴのタンパク質活性と比較することをさらに含む、請求項６または７に記載の方法。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００１２
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００１２】
ゲノム編集によりヒト細胞のＳＥＲＰＩＮＡ１遺伝子を編集する方法が提供され、本方法は、ヒト細胞に１つ以上のデオキシリボ核酸（ＤＮＡ）エンドヌクレアーゼを導入し、ＳＥＲＰＩＮＡ１遺伝子またはＳＥＲＰＩＮＡ１遺伝子の調節エレメントをコードする他のＤＮＡ配列の内部またはその近傍に１つ以上の１本鎖切断（ＳＳＢ）または１つ以上の２本鎖切断（ＤＳＢ）をもたらし、その結果、ＳＥＲＰＩＮＡ１遺伝子の内部またはその近傍での１つ以上の変異またはエクソンの永続的な挿入、欠失、修正、またはその発現もしくは機能の調節の少なくとも１つを生じるか、または、ＳＥＲＰＩＮＡ１遺伝子の発現もしくは機能に影響を与え、あるいは、セーフハーバー座位の内部またはその近傍に１つ以上のＳＳＢまたは１つ以上のＤＳＢをもたらし、その結果、ＳＥＲＰＩＮＡ１遺伝子またはミニ遺伝子の永続的な挿入を生じて、アルファ１アンチトリプシン（ＡＡＴ）タンパク質活性を回復させるステップを含む。
【手続補正３】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００１３
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００１３】
ゲノム編集によりヒト細胞にＳＥＲＰＩＮＡ１遺伝子を挿入する方法もまた提供され、本方法は、ヒト細胞に１つ以上のデオキシリボ核酸（ＤＮＡ）エンドヌクレアーゼを導入し、セーフハーバー座位の内部またはその近傍に１つ以上の１本鎖切断（ＳＳＢ）または２本鎖切断（ＤＳＢ）をもたらし、その結果、ＳＥＲＰＩＮＡ１遺伝子またはミニ遺伝子の永続的な挿入を生じて、アルファ１アンチトリプシン（ＡＡＴ）タンパク質活性を回復させるステップを含む。
【手続補正４】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００１４
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００１４】
１つの局面において、ゲノム編集によりヒト細胞のＳＥＲＰＩＮＡ１遺伝子を編集する方法であって、該細胞に１つ以上のデオキシリボ核酸（ＤＮＡ）エンドヌクレアーゼを導入し、該細胞のＳＥＲＰＩＮＡ１遺伝子またはＳＥＲＰＩＮＡ１遺伝子の調節エレメントをコードする他のＤＮＡ配列の内部またはその近傍に１つ以上の１本鎖切断（ＳＳＢ）または２本鎖切断（ＤＳＢ）をもたらし、その結果、ＳＥＲＰＩＮＡ１遺伝子の内部またはその近傍での１つ以上の変異またはエクソンの永続的な欠失、挿入、または修正を生じて、あるいは、セーフハーバー座位の内部またはその近傍に１つ以上のＳＳＢまたは１つ以上のＤＳＢをもたらし、その結果、ＳＥＲＰＩＮＡ１遺伝子またはミニ遺伝子の永続的な挿入を生じて、アルファ１アンチトリプシン（ＡＡＴ）タンパク質活性を回復させることを含む方法が提供される。
【手続補正５】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００１７
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００１７】
ｉＰＳＣのＳＥＲＰＩＮＡ１遺伝子もしくはＳＥＲＰＩＮＡ１遺伝子の調節エレメントをコードする他のＤＮＡ配列の内部またはその近傍で編集するステップ、または、ｉＰＳＣのＳＥＲＰＩＮＡ１遺伝子のセーフハーバー座位の内部またはその近傍で編集するステップ、または、ｉＰＳＣのＳＥＲＰＩＮＡ１遺伝子の第一エクソンの遺伝子座の内部または近傍で編集するステップは、ｉＰＳＣに１つ以上のデオキシリボ核酸（ＤＮＡ）エンドヌクレアーゼを導入し、ＳＥＲＰＩＮＡ１遺伝子またはＳＥＲＰＩＮＡ１遺伝子の調節エレメントをコードする他のＤＮＡ配列の内部またはその近傍に１つ以上の１本鎖切断（ＳＳＢ）または２本鎖切断（ＤＳＢ）をもたらし、その結果、ＳＥＲＰＩＮＡ１遺伝子の内部またはその近傍での１つ以上の変異またはエクソンの永続的な挿入、修正、欠失、またはその発現もしくは機能の調節を生じるか、または、ＳＥＲＰＩＮＡ１遺伝子の発現もしくは機能に影響を与え、あるいは、セーフハーバー座位の内部またはその近傍に１つ以上のＳＳＢまたは１つ以上のＤＳＢをもたらし、その結果、ＳＥＲＰＩＮＡ１遺伝子の永続的な挿入を生じて、ＡＡＴタンパク質活性を回復させることを含み得る。セーフハーバー座位は、ＡＡＶＳ１（ＰＰＰ１Ｒ１２Ｃ）、ＡＬＢ、Ａｎｇｐｔｌ３、ＡｐｏＣ３、ＡＳＧＲ２、ＣＣＲ５、ＦＩＸ（Ｆ９）、Ｇ６ＰＣ、Ｇｙｓ２、ＨＧＤ、Ｌｐ（ａ）、Ｐｃｓｋ９、Ｓｅｒｐｉｎａ１、ＴＦ、およびＴＴＲからなる群から選択することができる。セーフハーバー座位は、ＡＡＶＳ１のエクソン１−２（ＰＰＰ１Ｒ１２Ｃ）、ＡＬＢのエクソン１−２、Ａｎｇｐｔｌ３のエクソン１−２、ＡｐｏＣ３のエクソン１−２、ＡＳＧＲ２のエクソン１−２、ＣＣＲ５のエクソン１−２、ＦＩＸ（Ｆ９）のエクソン１−２、Ｇ６ＰＣのエクソン１−２、Ｇｙｓ２のエクソン１−２、ＨＧＤのエクソン１−２、Ｌｐ（ａ）のエクソン１−２、Ｐｃｓｋ９のエクソン１−２、Ｓｅｒｐｉｎａ１のエクソン１−２、ＴＦのエクソン１−２、およびＴＴＲのエクソン１−２からなる群から選択することができる。
【手続補正６】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００２３
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００２３】
いくつかの態様において、前駆細胞もしくは初代肝細胞のＳＥＲＰＩＮＡ１遺伝子の、または、前記細胞もしくは初代肝細胞のＳＥＲＰＩＮＡ１遺伝子の調節エレメントをコードする他のＤＮＡ配列の、内部またはその近傍で編集すること、あるいは、前駆細胞または初代肝細胞の白血球のセーフハーバー座位の内部またはその近傍で編集するステップは、前駆細胞または初代肝細胞に１つ以上のデオキシリボ核酸（ＤＮＡ）エンドヌクレアーゼを導入し、ＳＥＲＰＩＮＡ１遺伝子またはＳＥＲＰＩＮＡ１遺伝子の調節エレメントをコードする他のＤＮＡ配列の内部またはその近傍に１つ以上の１本鎖切断（ＳＳＢ）または２本鎖切断（ＤＳＢ）をもたらし、その結果、ＳＥＲＰＩＮＡ１遺伝子の内部またはその近傍での１つ以上の変異またはエクソンの永続的な挿入、修正、欠失、またはその発現もしくは機能の調節を生じるか、または、ＳＥＲＰＩＮＡ１遺伝子の発現もしくは機能に影響を与え、あるいは、セーフハーバー座位の内部またはその近傍で編集し、ＳＥＲＰＩＮＡ１遺伝子の内部またはその近傍での１つ以上の変異の永続的な欠失、挿入、または修正を生じて、アルファ１アンチトリプシン（ＡＡＴ）タンパク質活性を回復させることを含む。セーフハーバー座位は、ＡＡＶＳ１（ＰＰＰ１Ｒ１２Ｃ）、ＡＬＢ、Ａｎｇｐｔｌ３、ＡｐｏＣ３、ＡＳＧＲ２、ＣＣＲ５、ＦＩＸ（Ｆ９）、Ｇ６ＰＣ、Ｇｙｓ２、ＨＧＤ、Ｌｐ（ａ）、Ｐｃｓｋ９、Ｓｅｒｐｉｎａ１、ＴＦ、およびＴＴＲからなる群から選択することができる。セーフハーバー座位は、ＡＡＶＳ１のエクソン１−２（ＰＰＰ１Ｒ１２Ｃ）、ＡＬＢのエクソン１−２、Ａｎｇｐｔｌ３のエクソン１−２、ＡｐｏＣ３のエクソン１−２、ＡＳＧＲ２のエクソン１−２、ＣＣＲ５のエクソン１−２、ＦＩＸ（Ｆ９）のエクソン１−２、Ｇ６ＰＣのエクソン１−２、Ｇｙｓ２のエクソン１−２、ＨＧＤのエクソン１−２、Ｌｐ（ａ）のエクソン１−２、Ｐｃｓｋ９のエクソン１−２、Ｓｅｒｐｉｎａ１のエクソン１−２、ＴＦのエクソン１−２、およびＴＴＲのエクソン１−２からなる群から選択することができる。
【手続補正７】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００２９
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００２９】
いくつかの態様において、幹細胞のＳＥＲＰＩＮＡ１遺伝子または間葉系幹細胞のＳＥＲＰＩＮＡ１遺伝子の調節エレメントをコードする他のＤＮＡ配列の内部またはその近傍を編集するステップは、間葉系幹細胞に１つ以上のデオキシリボ核酸（ＤＮＡ）エンドヌクレアーゼを導入し、ＳＥＲＰＩＮＡ１遺伝子またはＳＥＲＰＩＮＡ１遺伝子の調節エレメントをコードする他のＤＮＡ配列の内部またはその近傍に１つ以上の１本鎖切断（ＳＳＢ）または２本鎖切断（ＤＳＢ）をもたらし、その結果、ＳＥＲＰＩＮＡ１遺伝子の内部またはその近傍での１つ以上の変異またはエクソンの永続的な欠失、挿入、修正、またはその発現もしくは機能の調節を生じるか、または、ＳＥＲＰＩＮＡ１遺伝子の発現もしくは機能に影響を与え、あるいは、セーフハーバー座位の内部またはその近傍に１つ以上のＳＳＢまたは１つ以上のＤＳＢをもたらし、その結果、ＳＥＲＰＩＮＡ１遺伝子の内部または近傍に１つ以上の変異を生じて、ＳＥＲＰＩＮＡ１遺伝子またはミニ遺伝子の永続的な挿入を生じて、アルファ１アンチトリプシン（ＡＡＴ）タンパク質活性を回復させることを含む。セーフハーバー座位は、ＡＡＶＳ１（ＰＰＰ１Ｒ１２Ｃ）、ＡＬＢ、Ａｎｇｐｔｌ３、ＡｐｏＣ３、ＡＳＧＲ２、ＣＣＲ５、ＦＩＸ（Ｆ９）、Ｇ６ＰＣ、Ｇｙｓ２、ＨＧＤ、Ｌｐ（ａ）、Ｐｃｓｋ９、Ｓｅｒｐｉｎａ１、ＴＦ、およびＴＴＲからなる群から選択することができる。セーフハーバー座位は、ＡＡＶＳ１（ＰＰＰ１Ｒ１２Ｃ）のエクソン１−２、ＡＬＢのエクソン１−２、Ａｎｇｐｔｌ３のエクソン１−２、ＡｐｏＣ３のエクソン１−２、ＡＳＧＲ２のエクソン１−２、ＣＣＲ５のエクソン１−２、ＦＩＸ（Ｆ９）のエクソン１−２、Ｇ６ＰＣのエクソン１−２、Ｇｙｓ２のエクソン１−２、ＨＧＤのエクソン１−２、Ｌｐ（ａ）のエクソン１−２、Ｐｃｓｋ９のエクソン１−２、Ｓｅｒｐｉｎａ１のエクソン１−２、ＴＦのエクソン１−２，およびＴＴＲのエクソン１−２からなる群から選択することができる。
【手続補正８】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００３３
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００３３】
いくつかの態様において、患者の細胞内のＳＥＲＰＩＮＡ１遺伝子を編集するステップは、細胞に１つ以上のデオキシリボ核酸（ＤＮＡ）エンドヌクレアーゼを導入し、ＳＥＲＰＩＮＡ１遺伝子またはＳＥＲＰＩＮＡ１遺伝子の調節エレメントをコードする他のＤＮＡ配列の内部またはその近傍に１つ以上の１本鎖切断（ＳＳＢ）または２本鎖切断（ＤＳＢ）をもたらし、その結果、ＳＥＲＰＩＮＡ１遺伝子の内部に１つ以上の変異またはエクソンの永続的な欠失、挿入、または修正、または調節を生じ、ＳＥＲＰＩＮＡ１遺伝子またはミニ遺伝子の永続的な挿入を生じて、ＡＡＴタンパク質活性を回復させることを含む。
【手続補正９】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００３４
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００３４】
いくつかの態様において、患者の細胞内のＳＥＲＰＩＮＡ１遺伝子を編集するステップは、細胞に１つ以上のデオキシリボ核酸（ＤＮＡ）エンドヌクレアーゼを導入し、ＳＥＲＰＩＮＡ１遺伝子またはＳＥＲＰＩＮＡ１遺伝子の調節エレメントをコードするＤＮＡ配列の内部またはその近傍に１つ以上の２本鎖切断（ＤＳＢ）をもたらし、あるいは、ＳＥＲＰＩＮＡ１遺伝子のセーフハーバー座位の内部またはその近傍で編集して、ＳＥＲＰＩＮＡ１遺伝子の内部またはその近傍での１つ以上のエクソンの永続的な欠失、挿入、修正、またはその発現もしくは機能の修正もしくは調節を生じるか、または、ＳＥＲＰＩＮＡ１遺伝子の発現もしくは機能に影響を与え、アルファ１アンチトリプシン（ＡＡＴ）タンパク質活性を回復させることを含む。
【手続補正１０】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０５２４
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０５２４】
従って、本開示は、特に、以下の非限定的な発明に関する：第１の方法、方法１において、本開示は、ゲノム編集によりヒト細胞のＳＥＲＰＩＮＡ１遺伝子を編集する方法であって、ヒト細胞に１つ以上のデオキシリボ核酸（ＤＮＡ）エンドヌクレアーゼを導入し、ＳＥＲＰＩＮＡ１遺伝子またはＳＥＲＰＩＮＡ１遺伝子の調節エレメントをコードする他のＤＮＡ配列の内部またはその近傍に１つ以上の１本鎖切断（ＳＳＢ）または２本鎖切断（ＤＳＢ）をもたらし、その結果、ＳＥＲＰＩＮＡ１遺伝子またはＳＥＲＰＩＮＡ１遺伝子の調節エレメントをコードする他のＤＮＡ配列の内部またはその近傍での１つ以上の変異もしくはエクソンの、永続的な欠失、挿入、または、その発現もしくは機能の修正もしくは調節を生じるか、または、ＳＥＲＰＩＮＡ１遺伝子またはＳＥＲＰＩＮＡ１遺伝子の調節エレメントをコードする他のＤＮＡ配列の発現もしくは機能に影響を与え、アルファ１アンチトリプシン（ＡＡＴ）タンパク質活性を回復させるステップを含む方法を提供する。
【手続補正１１】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０５３０
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０５３０】
別の方法、方法７において、本開示は、編集ステップが、ｉＰＳＣに１つ以上のデオキシリボ核酸（ＤＮＡ）エンドヌクレアーゼを導入し、ＳＥＲＰＩＮＡ１遺伝子またはＳＥＲＰＩＮＡ１遺伝子の調節エレメントをコードする他のＤＮＡ配列の内部またはその近傍に１つ以上の１本鎖切断（ＳＳＢ）または２本鎖切断（ＤＳＢ）をもたらし、その結果、ＳＥＲＰＩＮＡ１遺伝子またはＳＥＲＰＩＮＡ１遺伝子の調節エレメントをコードする他のＤＮＡ配列の内部またはその近傍での１つ以上の変異もしくはエクソンの、永続的な欠失、挿入、または、その発現もしくは機能の修正もしくは調節を生じるか、または、ＳＥＲＰＩＮＡ１遺伝子またはＳＥＲＰＩＮＡ１遺伝子の調節エレメントをコードする他のＤＮＡ配列の発現もしくは機能に影響を与え、あるいは、セーフハーバー座位の内部またはその近傍に１つ以上のＳＳＢまたはＤＳＢをもたらし、その結果、ＳＥＲＰＩＮＡ１遺伝子またはミニ遺伝子の永続的な挿入を生じて、ルファ１アンチトリプシン（ＡＡＴ）タンパク質活性を回復させることを含む方法であって、方法３〜６のいずれかに記載の方法を提供する。
【手続補正１２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０５３６
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０５３６】
別の方法、方法１３において、本開示は、編集ステップが、前駆細胞または初代肝細胞に１つ以上のデオキシリボ核酸（ＤＮＡ）エンドヌクレアーゼを導入し、ＳＥＲＰＩＮＡ１遺伝子またはＳＥＲＰＩＮＡ１遺伝子の調節エレメントをコードする他のＤＮＡ配列の内部またはその近傍に１つ以上の１本鎖切断（ＳＳＢ）または２本鎖切断（ＤＳＢ）をもたらし、その結果、ＳＥＲＰＩＮＡ１遺伝子またはＳＥＲＰＩＮＡ１遺伝子の調節エレメントをコードする他のＤＮＡ配列の内部またはその近傍での１つ以上の変異もしくはエクソンの永続的な欠失、挿入、修正、または、その発現もしくは機能の調節を生じるか、または、ＳＥＲＰＩＮＡ１遺伝子またはＳＥＲＰＩＮＡ１遺伝子の調節エレメントをコードする他のＤＮＡ配列の発現もしくは機能に影響を与え、あるいは、セーフハーバー座位の内部またはその近傍に１つ以上のＳＳＢまたは１つ以上のＤＳＢをもたらし、その結果、ＳＥＲＰＩＮＡ１遺伝子またはミニ遺伝子の永続的な挿入を生じて、アルファ１アンチトリプシン（ＡＡＴ）タンパク質活性を回復させることを含む方法であって、方法１１または１２に記載の方法を提供する。
【手続補正１３】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０５４２
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０５４２】
別の方法、方法１９において、本開示は、編集ステップが、間葉系幹細胞に１つ以上のデオキシリボ核酸（ＤＮＡ）エンドヌクレアーゼを導入し、ＳＥＲＰＩＮＡ１遺伝子またはＳＥＲＰＩＮＡ１遺伝子の調節エレメントをコードする他のＤＮＡ配列の内部またはその近傍に１つ以上の１本鎖切断（ＳＳＢ）または２本鎖切断（ＤＳＢ）をもたらし、その結果、ＳＥＲＰＩＮＡ１遺伝子またはＳＥＲＰＩＮＡ１遺伝子の調節エレメントをコードする他のＤＮＡ配列の内部またはその近傍での１つ以上の変異もしくはエクソンの永続的な欠失、挿入、修正、または、その発現もしくは機能の調節を生じるか、または、ＳＥＲＰＩＮＡ１遺伝子またはＳＥＲＰＩＮＡ１遺伝子の調節エレメントをコードする他のＤＮＡ配列の発現もしくは機能に影響を与え、あるいは、セーフハーバー座位の内部またはその近傍に１つ以上のＳＳＢまたは１つ以上のＤＳＢをもたらし、その結果、ＳＥＲＰＩＮＡ１遺伝子またはミニ遺伝子の永続的な挿入を生じて、アルファ１アンチトリプシン（ＡＡＴ）タンパク質活性を回復させることを含む方法であって、方法１６〜１８のいずれかに記載を提供する。
【手続補正１４】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０５４７
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０５４７】
別の方法、方法２４において、本開示は、編集ステップが、細胞に１つ以上のデオキシリボ核酸（ＤＮＡ）エンドヌクレアーゼを導入し、ＳＥＲＰＩＮＡ１遺伝子またはＳＥＲＰＩＮＡ１遺伝子の調節エレメントをコードする他のＤＮＡ配列の内部またはその近傍に１つ以上の１本鎖切断（ＳＳＢ）または２本鎖切断（ＤＳＢ）をもたらし、その結果、ＳＥＲＰＩＮＡ１遺伝子またはＳＥＲＰＩＮＡ１遺伝子の調節エレメントをコードする他のＤＮＡ配列の内部またはその近傍での１つ以上の変異もしくはエクソンの永続的な欠失、挿入、または、修正もしくは調節を生じて、あるいは、セーフハーバー座位の内部またはその近傍に１つ以上のＳＳＢまたは１つ以上のＤＳＢをもたらし、その結果、ＳＥＲＰＩＮＡ１遺伝子またはミニ遺伝子の永続的な挿入を生じて、アルファ１アンチトリプシン（ＡＡＴ）タンパク質活性を回復させることを含む方法であって、方法２３に記載の方法を提供する。