【手続補正書】
【提出日】令和2年9月17日(2020.9.17)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
配列番号１のアミノ酸配列に含まれるエピトープに結合する抗体またはその抗原結合断片であって、前記抗体の軽鎖またはその抗原結合断片は、配列番号３、配列番号４、配列番号５、配列番号６、配列番号７、配列番号８の少なくとも３つのアミノ酸配列を含み、前記抗体の重鎖またはその抗原結合断片は、配列番号９、配列番号１０、配列番号１１、配列番号１２、配列番号１３、配列番号１４の少なくとも３つのアミノ酸配列を含む抗体またはその抗原結合断片。
【請求項２】
前記抗原結合断片がＦａｂ、Ｆ（ａｂ’）２、Ｆａｂ’、ｓｃＦｖまたはジｓｃＦｖである、請求項１に記載の抗原結合断片。
【請求項３】
前記抗体が、モノクローナル抗体、好ましくはＩｇＧ型モノクローナル抗体である、請求項１に記載の抗体。
【請求項４】
前記抗体の軽鎖またはその抗原結合断片が、配列番号３、配列番号４、配列番号５、配列番号６、配列番号７、配列番号８のすべてを含む、および／または、
前記抗体の重鎖またはその抗原結合断片が、配列番号９、配列番号１０、配列番号１１、配列番号１２、配列番号１３、配列番号１４のすべてを含む、請求項１〜３のいずれか一項に記載の抗体またはその抗原結合断片。
【請求項５】
前記抗体の重鎖またはその抗原結合断片が、配列番号１１０のアミノ酸配列を含み、前記抗体の軽鎖またはその抗原結合断片が、配列番号１１１のアミノ酸配列を含み、
好ましくは、前記抗体の軽鎖が、配列番号１５のアミノ酸配列を含み、前記抗体の重鎖が、配列番号１６のアミノ酸配列を含み、
好ましくは、前記抗体が、ウサギ抗体またはウサギ由来の抗体である、請求項１〜３のいずれか一項に記載の抗体。
【請求項６】
前記抗体またはその抗原結合断片が、検出可能な標識にさらに結合されており、好ましくは、前記検出可能な標識が、酵素、フルオロフォアまたは放射性同位体である、請求項１〜５のいずれか一項に記載の抗体またはその抗原結合断片。
【請求項７】
試料中の配列番号１に含まれるエピトープの存在または発現の検出に使用するための、請求項１〜６のいずれか一項に記載の抗体またはその抗原結合断片。
【請求項８】
試料中のヒトＰＤ−Ｌ１または配列番号１のアミノ酸配列を含むその任意の断片の存在または発現を検出する方法であって、前記試料を請求項１〜６のいずれか一項に記載の抗体またはその抗原結合断片と接触させるステップ、および結合した抗体またはその抗原結合断片の存在を検出するステップを含む方法。
【請求項９】
前記試料が、がんを有するまたはがんのリスクがある対象、Ｔ細胞機能不全を有する対象、急性または慢性感染症を有する対象、または、腫瘍免疫のリスクがあるかまたはそれを示す対象に由来する、請求項８に記載の方法。
【請求項１０】
請求項８または９に記載の方法における請求項１〜６のいずれか一項に記載の抗体またはその抗原結合断片の使用。
【請求項１１】
請求項１〜５のいずれか一項に記載の抗体またはその抗原結合断片をコードする単離されたポリヌクレオチド。
【請求項１２】
請求項１１に記載のポリヌクレオチドを含む発現ベクター。
【請求項１３】
請求項５に記載の抗体の製造における請求項１２に記載の発現ベクターの使用であって、前記抗体が、配列番号１５および配列番号１６のアミノ酸配列を含む、発現ベクターの使用。
【請求項１４】
請求項１２に記載の少なくとも１つの発現ベクターを含む宿主細胞。
【請求項１５】
請求項１〜３のいずれか一項に記載の抗体の製造における請求項１４に記載の宿主細胞の使用であって、前記抗体の重鎖またはその抗原結合断片が、配列番号１１０のアミノ酸配列を含み、前記抗体の軽鎖またはその抗原結合断片が、配列番号１１１のアミノ酸配列を含み、
好ましくは、前記抗体の軽鎖が、配列番号１５のアミノ酸配列を含み、前記抗体の重鎖が、配列番号１６のアミノ酸配列を含む、使用。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０１３８
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０１３８】
さらに、図５に示されるように、本発明の抗体を用いて得られた染色結果の実験間変動は、ｒ＝０．９９の相関効率によって示されるように驚くほど低く、そのため、ＩＨＣ染色、および本明細書に開示されるＦＦＰＥ腫瘍組織におけるＰＤ−Ｌ１発現の得られたスコアリングは、異なる染色実験間で同等である。したがって、本発明の抗体は、一般的に使用される２つのＩＨＣプラットフォーム（例えば、Ｄｉｓｃｏｖｅｒｙ  ＸＴ（登録商標）Ｓｙｓｔｅｍ、ＶｅｎｔａｎａおよびＡｕｔｏｓｔａｉｎｅｒＬｉｎｋ、Ｄａｋｏ）上で、病理学において日常的に使用されるＦＦＰＥ腫瘍組織試料（例えば、生検由来）におけるＰＤ−Ｌ１発現を確実に検出することができる抗ＰＤ−Ｌ１抗体の満たされていない必要性を満たす。
また、本発明は以下を提供する。
［１］
配列番号１のアミノ酸配列に含まれるエピトープに結合する抗体またはその抗原結合断片であって、前記抗体の軽鎖またはその抗原結合断片は、配列番号３、配列番号４、配列番号５、配列番号６、配列番号７、配列番号８の少なくとも３つのアミノ酸配列を含み、前記抗体の重鎖またはその抗原結合断片は、配列番号９、配列番号１０、配列番号１１、配列番号１２、配列番号１３、配列番号１４の少なくとも３つのアミノ酸配列を含む抗体またはその抗原結合断片。
［２］
前記抗原結合断片がＦａｂである、［１］に記載の抗原結合断片。
［３］
前記抗原結合断片が、Ｆ（ａｂ’）２である、［１］に記載の抗原結合断片。
［４］
前記抗原結合断片が、Ｆａｂ’である、［１］に記載の抗原結合断片。
［５］
前記抗原結合断片が、ｓｃＦｖである、［１］に記載の抗原結合断片。
［６］
前記抗原結合断片が、ジｓｃＦｖである、［１］に記載の抗原結合断片。
［７］
前記抗体が、モノクローナル抗体である、［１］に記載の抗体。
［８］
前記モノクローナル抗体が、ＩｇＧ型モノクローナル抗体である、［７］に記載の抗体。
［９］
前記抗体の軽鎖またはその抗原結合断片が、配列番号３、配列番号４、配列番号５、配列番号６、配列番号７、配列番号８のすべてを含む、［２］〜［８］のいずれか一項に記載の抗体またはその抗原結合断片。
［１０］
前記抗体の重鎖またはその抗原結合断片が、配列番号９、配列番号１０、配列番号１１、配列番号１２、配列番号１３、配列番号１４のすべてを含む、［２］〜［９］のいずれか一項に記載の抗体またはその抗原結合断片。
［１１］
前記抗体の重鎖またはその抗原結合断片が、配列番号１１０のアミノ酸配列を含み、前記抗体の軽鎖またはその抗原結合断片が、配列番号１１１のアミノ酸配列を含む、［１］〜［８］のいずれか一項に記載の抗体またはその抗原結合断片。
［１２］
前記抗体の軽鎖が、配列番号１５のアミノ酸配列を含み、前記抗体の重鎖が、配列番号１６のアミノ酸配列を含む、［１１］に記載の抗体。
［１３］
前記抗体の軽鎖が、配列番号１１４のアミノ酸配列を含み、前記抗体の重鎖が、配列番号１１５のアミノ酸配列を含む、［１１］に記載の抗体。
［１４］
前記抗体が、ウサギ抗体である、［１３］に記載の抗体。
［１５］
前記抗体が、ウサギ由来の抗体である、［１３］に記載の抗体。
［１６］
前記抗体またはその抗原結合断片が、検出可能な標識にさらに結合されている、［１］〜［１５］のいずれか一項に記載の抗体またはその抗原結合断片。
［１７］
前記検出可能な標識が、酵素である、［１６］に記載の抗体またはその抗原結合断片。
［１８］
前記検出可能な標識が、フルオロフォアである、［１６］に記載の抗体またはその抗原結合断片。
［１９］
前記検出可能な標識が、放射性同位体である、［１６］に記載の抗体またはその抗原結合断片。
［２０］
試料中の配列番号１に含まれるエピトープの存在または発現の検出に使用するための、［１］〜［１９］のいずれか一項に記載の抗体またはその抗原結合断片。
［２１］
前記試料が、生物学的試料である、［２０］に記載の使用のための抗体またはその抗原結合断片。
［２２］
前記生物学的試料が、組織試料である、［２１］に記載の使用のための抗体またはその抗原結合断片。
［２３］
前記試料が、固定された組織試料である、［２１］に記載の使用のための抗体またはその抗原結合断片。
［２４］
前記試料が、ホルムアルデヒド固定されたパラフィン包埋（ＦＦＰＥ）組織である、［２１］に記載の使用のための抗体またはその抗原結合断片。
［２５］
前記組織試料が、腫瘍組織に由来する、［２０］〜［２４］のいずれか一項に記載の使用のための抗体またはその抗原結合断片。
［２６］
前記検出が、フローサイトメトリーによって行われる、［２０］〜［２５］のいずれか一項に記載の使用のための抗体またはその抗原結合断片。
［２７］
前記検出が、ＥＬＩＳＡによって行われる、［２０］〜［２５］のいずれか一項に記載の使用のための抗体またはその抗原結合断片。
［２８］
前記検出が、ウェスタンブロッティングによって行われる、［２０］〜［２５］のいずれか一項に記載の使用のための抗体またはその抗原結合断片。
［２９］
前記検出が、免疫組織化学（ＩＨＣ）によって行われる、［２０］〜［２５］のいずれか一項に記載の使用のための抗体またはその抗原結合断片。
［３０］
試料中のヒトＰＤ−Ｌ１または配列番号１のアミノ酸配列を含むその任意の断片の存在または発現を検出する方法であって、前記試料を［１］〜［１９］のいずれか一項に記載の抗体またはその抗原結合断片と接触させるステップ、および結合した抗体またはその抗原結合断片の存在を検出するステップを含む方法。
［３１］
前記試料が、生物学的試料である、［３０］に記載の方法。
［３２］
前記生物学的試料が、組織試料である、［３１］に記載の方法。
［３３］
前記生物学的試料が、固定された組織試料である、［３１］に記載の方法。
［３４］
前記固定された組織試料が、ホルムアルデヒド固定されたパラフィン包埋（ＦＦＰＥ）組織試料である、［３３］に記載の方法。
［３５］
前記固定された組織試料が、ホルムアルデヒド固定されたパラフィン包埋（ＦＦＰＥ）腫瘍組織試料である、［３３］に記載の方法。
［３６］
前記試料が、がんを有するまたはがんのリスクがある対象に由来する、［３０］〜［３５］のいずれか一項に記載の方法。
［３７］
前記試料が、Ｔ細胞機能不全を有する対象に由来する、［３０］〜［３５］のいずれか一項に記載の方法。
［３８］
前記試料が、急性または慢性感染症を有する対象に由来する、［３０］〜［３５］のいずれか一項に記載の方法。
［３９］
前記試料が、腫瘍免疫のリスクがあるかまたはそれを示す対象に由来する、［３０］〜［３５］のいずれか一項に記載の方法。
［４０］
［３０］〜［３５］のいずれか一項に記載の方法における［１］〜［１８］のいずれか一項に記載の抗体またはその抗原結合断片の使用。
［４１］
［１］〜［１５］のいずれか一項に記載の抗体またはその抗原結合断片をコードする単離されたポリヌクレオチド。
［４２］
［４１］に記載のポリヌクレオチドを含む発現ベクター。
［４３］
［１１］〜［１５］のいずれか一項に記載の抗体の製造における［４２］に記載の発現ベクターの使用であって、前記抗体が、配列番号１５および配列番号１６のアミノ酸配列を含む、発現ベクターの使用。
［４４］
［４１］に記載の少なくとも１つの発現ベクターを含む宿主細胞。
［４５］
［１２］に記載の抗体の製造における［４３］に記載の宿主細胞の使用。
［４６］
患者におけるがんを治療する方法であって、
（ｉ）試料中の［３０］〜［３５］のいずれか一項に記載のヒトＰＤ−Ｌ１の存在または発現を検出するステップ、および
（ｉｉ）（ｉ）からの前記ＰＤ−Ｌ１発現の結果を参照試料と比較するステップ、および
（ｉｉｉ）ステップ（ｉ）で検出された試料中の前記ＰＤ−Ｌ１発現が前記参照試料と比較して増加している場合、免疫チェックポイント阻害剤を前記患者に投与するステップ
を含む方法。
［４７］
前記参照試料が、がんに罹患していない健康な対象に由来するまたはそれから得られる、［４６］に記載の方法。
［４８］
前記患者に投与される工程（ｉｉｉ）の前記免疫チェックポイント阻害剤が、抗ＰＤ−Ｌ１抗体、または抗ＰＤ−１抗体である、［４６］または［４７］に記載の方法。
［４９］
前記免疫チェックポイント阻害剤が、約５ｍｇ／ｋｇ体重から約３０ｍｇ／ｋｇ体重の用量で投与される、［４６］〜［４８］のいずれか一項に記載の方法。
［５０］
前記免疫チェックポイント阻害剤が、毎週５００〜８００ｍｇ、または２週間毎に９００〜１６００ｍｇ、または３週間毎に１２５０〜２４００ｍｇの固定投薬レジメンで投与される、［４５］〜［４７］のいずれか一項に記載の方法。