【手続補正書】
【提出日】令和2年4月9日(2020.4.9)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
IgVドメインもしくはその特異的結合断片、IgCドメインもしくはその特異的結合断片、または両方を含む、バリアントCD80ポリペプチドであって、SEQ ID NO:28のナンバリングを基準にした位置68、18、4、9、10、11、12、13、14、15、16、17、20、21、22、24、25、27、28、29、30、31、33、36、37、38、40、41、42、43、44、47、48、50、52、53、54、59、60、61、62、63、64、65、66、67、69、70、72、74、76、77、80、81、83、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、99、102、103、104、107、108、109、110、114、115、116、117、118、120、121、122、126、127、128、129、130、133、137、140、142、143、144、148、149、152、154、160、162、164、168、169、174、175、177、183、178、185、188、190、192、193、または199から選択される位置に対応する、未改変CD80またはその特異的結合断片における1つまたは複数の位置に1つまたは複数のアミノ酸改変を含む、バリアントCD80ポリペプチド。
【請求項２】
前記未改変CD80が、
（i）SEQ ID NO:28に示されるアミノ酸配列、（ii）SEQ ID NO:28に対して少なくとも95％の配列同一性を有するアミノ酸配列；あるいは（iii）（i）または（ii）の配列の一部分であって、IgVドメインもしくはIgCドメインまたはそれらの特異的結合断片を含む、部分
を含む、請求項1記載のバリアントCD80ポリペプチド。
【請求項３】
最大1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、もしくは20個のアミノ酸改変、任意でアミノ酸置換を含むか、または
SEQ ID NO:28またはその特異的結合断片に対して少なくとも85％、86％、87％、88％、89％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、もしくは99％の配列同一性を示すアミノ酸配列を含む、
請求項1または2記載のバリアントCD80ポリペプチド。
【請求項４】
前記1つまたは複数のアミノ酸改変が
V68M, H18Y, V4M, K9E, E10R, V11S, A12G, A12T, A12V, T13N, L14A, S15V, S15F, C16S, C16G, C16L, G17W, H18L, H18R, V20L, S21P, V22A, E24G, L25P, Q27R, T28A, T28S, R29C, R29D, R29H, R29V, I30V, Y31F, Y31H, Y31L, Q33H, K36E, K36G, K37E, K37Q, M38I, M38L, M38T, M38V, L40M, T41A, T41G, T41D, T41I, M42T, M43I, M43Q, M43R, M43V, S44P, M47T, N48I, N48D, W50G, E52G, Y53C, K54M, F59L, F59S, D60V, I61N, T62S, N63S, N64S, L65H, S66H, I67F, I67T, V68A, I69T, L70Q, L70P, L70R, L72P, P74L, D76G, E77G, E77K, Y80N, E81A, E81R, E81V, V83A, V83I, L85I, L85R, K86E, Y87N, E88D, E88G, K89E, K89N, K89R, D90K, D90L, D90N, A91E, A91G, A91S, A91T, F92L, F92N, F92P, F92Y, K93I, K93E, K93Q, K93R, K93V, R94G, R94L, R94F, E95K, H96R, L97R, E99D, E99G, L102S, S103L, S103P, V104A, V104L, D107N, F108L, P109S, P109H, T110A, D115G, S114T, F116S, F116L, E117V, E117G, I118V, I118A, I118T, T120S, S121P, N122S, I126L, I126V, I127T, C128Y, C128R, S129L, S129P, T130A, G133D, P137L, S140T, L142S, E143G, N144D, N144S, L148S, N149D, N149S, N152T, T154I, T154A, E160G, E162G, Y164H, S168G, K169E, K169I, K169S, M174T, M174V, T175A, N177S, H178R, L183H, K185E, H188D, H188Q, R190S, N192D, Q193L, T199S
またはその保存的アミノ酸置換から選択される、請求項1〜3のいずれか一項記載のバリアントCD80ポリペプチド。
【請求項５】
前記1つまたは複数のアミノ酸改変が、
2019521643.tif 000001
2019521643.tif 000002
2019521643.tif 000003
2019521643.tif 000004
2019521643.tif 000005
2019521643.tif 000006
2019521643.tif 000007
2019521643.tif 000008
から選択される、請求項1〜4のいずれか一項記載のバリアントCD80ポリペプチド。
【請求項６】
前記IgVドメインもしくはその特異的結合断片および前記IgCドメインもしくはその特異的結合断片を含むか、または
前記IgVドメインもしくはその特異的結合断片を含む、
請求項1〜5のいずれか一項記載のバリアントCD80ポリペプチド。
【請求項７】
SEQ ID NO:55〜108、280〜346、414〜475のうちのいずれかもしくはその特異的結合断片に示されるアミノ酸配列、またはSEQ ID NO:55〜108、280〜346、414〜475のうちのいずれかもしくはその特異的結合断片に対して少なくとも95％の配列同一性を示しかつ前記1つまたは複数のアミノ酸改変を含有するアミノ酸配列を含むか、あるいは
SEQ ID NO:153〜195、347、373〜386、476〜477のいずれかもしくはその特異的結合断片に示されるアミノ酸配列、またはSEQ ID NO:153〜195、347、373〜386、476〜477のいずれかもしくはその特異的結合断片に対して少なくとも95％の配列同一性を示しかつ前記1つまたは複数のアミノ酸改変を含有するアミノ酸配列を含む、
請求項1〜6のいずれか一項記載のバリアントCD80ポリペプチド。
【請求項８】
ヒトCD28、ヒトPD-L1、またはヒトCTLA-4のエクトドメインのそれぞれに対する前記未改変CD80ポリペプチドの結合と比較して向上した親和性で、ヒトCD28、ヒトPD-L1、またはヒトCTLA-4のエクトドメインに特異的に結合する、請求項1〜7のいずれか一項記載のバリアントCD80ポリペプチド。
【請求項９】
前記エクトドメインに対する向上した親和性が、前記エクトドメインに対する前記未改変CD80の結合親和性と比較して、1.2倍、1.5倍、2倍、3倍、4倍、5倍、6倍、7倍、8倍、9倍、10倍、20倍、30倍、40倍、50倍、または60倍より大きく向上している、請求項8記載のバリアントCD80ポリペプチド。
【請求項１０】
可溶性タンパク質である、請求項1〜9のいずれか一項記載のバリアントCD80ポリペプチド。
【請求項１１】
多量体化ドメインに連結されている、請求項1〜10のいずれか一項記載のバリアントCD80ポリペプチド。
【請求項１２】
前記多量体化ドメインが、エフェクター機能が低下しているFcドメインまたはそのバリアントである、請求項11記載のバリアントCD80ポリペプチド。
【請求項１３】
前記Fcドメインまたはそのバリアントが、SEQ ID NO:226もしくはSEQ ID NO:227に示されるアミノ酸配列、またはSEQ ID NO:226もしくはSEQ ID NO:227に対して少なくとも85％の配列同一性を示すアミノ酸配列を含む、請求項12記載のバリアントCD80ポリペプチド。
【請求項１４】
前記バリアントCD80ポリペプチドの細胞外ドメイン（ECD）またはその特異的結合断片に連結された膜貫通ドメインをさらに含む膜貫通型免疫調節タンパク質である、請求項1〜13のいずれか一項記載のバリアントCD80ポリペプチド。
【請求項１５】
前記膜貫通ドメインが、SEQ ID NO:1の243〜263番目の残基として示されるアミノ酸配列、またはSEQ ID NO:1の243〜263番目の残基に対して少なくとも85％の配列同一性を示すその機能的バリアントを含む、請求項14記載のバリアントCD80ポリペプチド。
【請求項１６】
前記膜貫通ドメインに連結された細胞質ドメインをさらに含む、請求項14または請求項15記載のバリアントCD80ポリペプチド。
【請求項１７】
前記細胞質ドメインが、SEQ ID NO:1の264〜288番目の残基として示されるアミノ酸配列、または、SEQ ID NO:1の264〜288番目の残基に対して少なくとも85％の配列同一性を示すその機能的バリアントを含む、請求項16記載のバリアントCD80ポリペプチド。
【請求項１８】
免疫グロブリンスーパーファミリー（IgSF）ドメインを含む第二のポリペプチドに連結された請求項1〜17のいずれか一項記載のバリアントCD80を含む、免疫調節ポリペプチド。
【請求項１９】
前記IgSFドメインが、未改変または野生型IgSFドメインと比較して、親和性が改変されており、かつその同族結合パートナーのうちの1つまたは複数に対する変化した結合性を示す、請求項18記載の免疫調節ポリペプチド。
【請求項２０】
細胞の表面上の分子に特異的に結合する標的化部分に連結された、請求項1〜17のいずれか一項記載のバリアントCD80または請求項18もしくは19記載の免疫調節ポリペプチドを含む、コンジュゲート。
【請求項２１】
前記標的化部分が、免疫細胞または腫瘍細胞の表面上の分子に特異的に結合する、請求項20記載のコンジュゲート。
【請求項２２】
前記部分が、抗体または抗原結合断片である、請求項20または21記載のコンジュゲート。
【請求項２３】
融合タンパク質である、請求項20〜22のいずれか一項記載のコンジュゲート。
【請求項２４】
請求項1〜17のいずれか一項記載のバリアントCD80ポリペプチドまたは請求項18もしくは19記載の免疫調節ポリペプチドをコードする、核酸分子。
【請求項２５】
請求項24記載の核酸分子を含む、ベクター。
【請求項２６】
請求項24記載の核酸分子または請求項25記載のベクターを含む、細胞。
【請求項２７】
バリアントCD80ポリペプチドまたは免疫調節タンパク質を生産する方法であって、請求項24記載の核酸分子または請求項25記載のベクターを、宿主細胞において該タンパク質が発現する条件下で宿主細胞に導入する工程を含む、方法。
【請求項２８】
前記バリアントCD80ポリペプチドまたは前記免疫調節タンパク質を前記細胞から単離または精製する工程をさらに含む、請求項27記載の方法。
【請求項２９】
バリアントCD80ポリペプチドを発現する細胞を改変する方法であって、請求項1〜17のいずれか一項記載のバリアントCD80ポリペプチドをコードする核酸分子を、宿主細胞において該ポリペプチドが発現する条件下で宿主細胞に導入する工程を含む、方法。
【請求項３０】
請求項1〜17のいずれか一項記載のバリアントCD80ポリペプチド、請求項18もしくは19記載の免疫調節タンパク質、請求項24記載の核酸分子、または請求項25記載のベクターを発現する、改変細胞。
【請求項３１】
前記バリアントCD80ポリペプチドもしくは免疫調節ポリペプチドが、膜貫通ドメインを含まず、かつ/もしくは、前記細胞の表面上には発現しない;および/または
前記バリアントCD80ポリペプチドもしくは免疫調節ポリペプチドが、前記改変細胞から分泌される、
請求項30記載の改変細胞。
【請求項３２】
膜貫通ドメインを含みかつ/もしくは請求項14〜17のいずれか一項記載の膜貫通型免疫調節タンパク質である、バリアントCD80ポリペプチド
を含む、および/または
前記細胞の表面上に発現するバリアントCD80ポリペプチドを含む
請求項30記載の改変細胞。
【請求項３３】
免疫細胞である、請求項30〜32のいずれか一項記載の改変細胞。
【請求項３４】
キメラ抗原受容体（CAR）または改変されたT細胞受容体をさらに含む、請求項30〜33のいずれか一項記載の改変細胞。
【請求項３５】
請求項1〜17のいずれか一項記載のバリアントCD80ポリペプチドまたは請求項18もしくは19記載の免疫調節ポリペプチドをコードする核酸分子を含む、感染性物質。
【請求項３６】
細菌またはウイルスである、請求項35記載の感染性物質。
【請求項３７】
請求項1〜17のいずれか一項記載のバリアントCD80ポリペプチド、請求項18もしくは19記載の免疫調節タンパク質、請求項20〜23のいずれか一項記載のコンジュゲート、請求項30〜34のいずれか一項記載の改変細胞、または請求項35もしくは36記載の感染性物質と、薬学的に許容し得る賦形剤とを含む、薬学的組成物。
【請求項３８】
請求項37記載の薬学的組成物を含む、製造品またはキット。
【請求項３９】
対象における免疫応答を調節するための医薬の製造における、請求項37記載の薬学的組成物の使用。
【請求項４０】
対象における免疫応答の調節に使用するための、請求項37記載の薬学的組成物。
【請求項４１】
前記免疫応答の調節が、前記対象における疾患または病態を治療する、請求項39記載の使用または請求項40記載の薬学的組成物。