【手続補正書】
【提出日】令和2年2月17日(2020.2.17)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
試料中の標的を同定する方法であって、
ａ．試料由来の核酸を複数のガイド核酸（ｇＮＡ）−核酸ガイド化ヌクレアーゼ系タンパク質複合体と接触させるステップであって、前記複合体は、少なくとも１つの標的へと標的化されており、かつ前記核酸、前記ｇＮＡ−核酸ガイド化ヌクレアーゼ系タンパク質複合体、または前記核酸および前記ｇＮＡ−核酸ガイド化ヌクレアーゼ系タンパク質複合体の両方は標識を含む、ステップと、
ｂ．前記標識由来の特定のシグナルを検出することによって達成される、前記試料中の前記標的を同定するステップであって、特定のシグナルの存在は、前記核酸への前記ｇＮＡ−核酸ガイド化ヌクレアーゼ系タンパク質複合体の結合を示す、ステップと
を含む方法。
【請求項２】
前記核酸が、標識を含み、前記標識が、インターカレーター型の標識である、請求項１に記載の方法。
【請求項３】
前記核酸が、前記接触ステップの前にまたは前記接触ステップの後に標識される、請求項２に記載の方法。
【請求項４】
前記核酸ガイド化ヌクレアーゼ系タンパク質が、ＣＲＩＳＰＲ／Ｃａｓ系タンパク質である、請求項１に記載の方法。
【請求項５】
前記方法が、小滴を生成するステップをさらに含み、前記小滴のサブセットが、ｇＮＡ−核酸ガイド化ヌクレアーゼ系タンパク質複合体を含むか、または前記小滴のサブセットが、前記核酸に結合したｇＮＡ−核酸ガイド化ヌクレアーゼ系タンパク質複合体を含む、請求項１から４のいずれかに記載の方法。
【請求項６】
複数の前記ｇＮＡ−核酸ガイド化ヌクレアーゼ系タンパク質複合体が、標識を含む、請求項１に記載の方法。
【請求項７】
複数の前記ｇＮＡ−核酸ガイド化ヌクレアーゼ系タンパク質複合体が、前記接触ステップの前に標識される、請求項６に記載の方法。
【請求項８】
前記核酸が、標識を含み、かつ前記核酸および前記複数の前記ｇＮＡ−核酸ガイド化ヌクレアーゼ系タンパク質複合体の両方が、前記接触ステップの前に標識されるか；または
前記核酸が、接触の後に標識され、かつ前記複数の前記ｇＮＡ−核酸ガイド化ヌクレアーゼ系タンパク質複合体が、前記接触ステップの前に標識される、請求項７に記載の方法。
【請求項９】
前記核酸が、第１の標識を含み、かつ前記ｇＮＡ−核酸ガイド化ヌクレアーゼ系タンパク質複合体が、第２の標識を含み、前記第１の標識および前記第２の標識が、蛍光共鳴エネルギー移動用のドナー／アクセプターペアを含む、請求項１に記載の方法。
【請求項１０】
前記同定するステップが、単一のシグナルまたは複数のシグナルを検出することを含む、請求項１から９のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１１】
前記ＣＲＩＳＰＲ／Ｃａｓ系タンパク質が、Ｃａｓ９、ＣａｓＸ、ＣａｓＹ、Ｃｐｆ１、Ｃａｓ３、Ｃａｓ８ａ−ｃ、Ｃａｓ１０、Ｃｓｅ１、Ｃｓｙ１、Ｃｓｎ２、Ｃａｓ４、Ｃｓｍ２およびＣｍ５からなる群から選択される、請求項５から１０のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１２】
前記核酸ガイド化ヌクレアーゼ系タンパク質が、活性がない核酸ガイド化ヌクレアーゼ系タンパク質または核酸ガイド化ヌクレアーゼ系ニッカーゼタンパク質である、請求項１１に記載の方法。
【請求項１３】
前記活性がない核酸ガイド化ヌクレアーゼ系タンパク質が、ｄＣａｓ９である、請求項１２に記載の方法。
【請求項１４】
前記標識が、酵素、酵素基質、抗体、抗原結合性断片、ペプチド、発色団、発光団、フルオロフォア、色原体、ハプテン、抗原、放射性同位元素、磁性粒子、金属ナノ粒子、酸化還元活性マーカー基、アプタマー、結合ペアの一方のメンバーおよびこれらの組合せからなる群から選択される、請求項１から１３のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１５】
前記試料が、ヒト試料臨床試料、法医学的試料、環境試料、メタゲノム試料および食品試料からなる群から選択される、請求項１から１４のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１６】
前記核酸、前記ｇＮＡ−核酸ガイド化ヌクレアーゼ系タンパク質複合体、または前記核酸および前記ｇＮＡ−核酸ガイド化ヌクレアーゼ系タンパク質複合体の両方が、複数の標識を含む、請求項１から１５のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１７】
前記複合体が、複数の標的へと標的化されている、請求項１から１６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１８】
前記標的が、個体または病原体である、請求項１から１７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１９】
異なる標的へと標的化された前記複合体が、異なる標識または同じ標識を含む、請求項１７に記載の方法。
【請求項２０】
前記ｇＮＡ−核酸ガイド化ヌクレアーゼ系タンパク質複合体が、基材に付着されているかまたは溶液中に存在する、請求項１から１９のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２１】
前記基材が、シリカ、プラスチック、ガラスまたは金属である、請求項２０に記載の方法。
【請求項２２】
前記基材が、二次元の基材または三次元の基材である、請求項２１に記載の方法。
【請求項２３】
前記基材が、チャンバーを含むかまたは円筒状アレイである、請求項２１に記載の方法。
【請求項２４】
前記ｇＮＡ−核酸ガイド化ヌクレアーゼ系タンパク質複合体が、既知の順序で基材に付着されている、請求項２０に記載の方法。
【請求項２５】
前記基材が、再使用可能である、請求項２０から２４のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２６】
前記核酸が、基材に付着されている、請求項１から１９のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２７】
前記核酸が、シークエンシングによってさらに分析される、請求項１から２６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２８】
前記核酸が、せん断される、請求項１から２７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２９】
前記核酸が、増幅されるか、または伸長できないヌクレオチドを用いて１または複数の末端において遮断される、請求項１から２８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３０】
複数の標的が、同時に同定される、請求項１から２９のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３１】
２４時間未満で実行される、請求項１から３０のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３２】
前記試料が、複数の検出ステップに供される、請求項１から３１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３３】
前記核酸が、ＤＮＡを含む、請求項１から３２のいずれかに記載の方法。
【請求項３４】
ガイド核酸（ｇＮＡ）−核酸ガイド化ヌクレアーゼ系タンパク質複合体の収集物であって、前記ｇＮＡが、少なくとも１つの標的へと標的化されており、かつ複数の前記複合体が、標識を含む、収集物。
【請求項３５】
前記核酸ガイド化ヌクレアーゼ系タンパク質が、ＣＲＩＳＰＲ／Ｃａｓ系タンパク質である、請求項３４に記載の収集物。
【請求項３６】
複数の前記ｇＮＡが標識を含むか、複数の核酸ガイド化ヌクレアーゼ系タンパク質が標識を含むか、または複数のｇＮＡおよび複数の核酸ガイド化ヌクレアーゼ系タンパク質の両方が標識を含む、請求項３４に記載の収集物。
【請求項３７】
前記ｇＮＡが、２つ以上の標識を含む、請求項３４から３６のいずれか一項に記載の収集物。
【請求項３８】
前記ｇＮＡが、複数の標的へと標的化されている、請求項３４から３７のいずれか一項に記載の収集物。
【請求項３９】
前記標的が、個体または病原体である、請求項３４から３８のいずれか一項に記載の収集物。
【請求項４０】
異なる標的へと標的化されている前記ｇＮＡが、異なる標識を含むか、または同じ標識を含む、請求項３４から３９のいずれか一項に記載の収集物。
【請求項４１】
前記核酸ガイド化ヌクレアーゼ系タンパク質が、異なる標識を含むかまたは同じ標識を含む、請求項３４から３９のいずれか一項に記載の収集物。
【請求項４２】
前記標識が、酵素、酵素基質、抗体、抗原結合性断片、ペプチド、発色団、発光団、フルオロフォア、色原体、ハプテン、抗原、放射性同位元素、磁性粒子、金属ナノ粒子、酸化還元活性マーカー基、アプタマー、結合ペアの一方のメンバーおよびこれらの組合せからなる群から選択される、請求項３４から４１のいずれか一項に記載の収集物。
【請求項４３】
前記複合体が、２つ以上の標識を含む、請求項３４から４２のいずれか一項に記載の収集物。
【請求項４４】
前記複合体が、基材に付着されているか、前記ｇＮＡが、前記基材に付着されているか、または前記核酸ガイド化ヌクレアーゼ系タンパク質が、前記基材に付着されているか、または前記複合体が、溶液中に存在する、請求項３４から４３のいずれか一項に記載の収集物。
【請求項４５】
前記基材が、シリカ、プラスチック、ガラスまたは金属である、請求項４４に記載の収集物。
【請求項４６】
前記基材が、二次元の基材または三次元の基材である、請求項４５に記載の収集物。
【請求項４７】
前記基材が、チャンバーを含むかまたは円筒状アレイである、請求項４５に記載の収集物。
【請求項４８】
前記複合体が、既知の順序で基材に付着されているか、または前記ｇＮＡが、既知の順序で基材に付着されている、請求項３４から４４のいずれか一項に記載の収集物。
【請求項４９】
前記核酸ガイド化ヌクレアーゼ系タンパク質が、Ｃａｓ９、ＣａｓＸ、ＣａｓＹ、Ｃｐｆ１、Ｃａｓ３、Ｃａｓ８ａ−ｃ、Ｃａｓ１０、Ｃｓｅ１、Ｃｓｙ１、Ｃｓｎ２、Ｃａｓ４、Ｃｓｍ２およびＣｍ５からなる群から選択されるＣＲＩＳＰＲ／Ｃａｓ系タンパク質である、請求項３４から４８のいずれか一項に記載の収集物。
【請求項５０】
前記核酸ガイド化ヌクレアーゼ系タンパク質が、活性がない核酸ガイド化ヌクレアーゼ系タンパク質または核酸ガイド化ヌクレアーゼ系ニッカーゼタンパク質である、請求項４９に記載の収集物。
【請求項５１】
請求項３４から５０に記載の収集物のいずれか一つを含むキット。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００１０
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００１０】
別の態様では、本明細書に記載されている収集物（ｃｏｌｌｅｃｔｉｏｎ）および組成物のいずれか一つを含むキットが、本明細書に提供される。
特定の実施形態では、例えば、以下が提供される：
（項目１）
試料中の標的を同定する方法であって、
ａ．試料由来の核酸を複数のガイド核酸（ｇＮＡ）−核酸ガイド化ヌクレアーゼ系タンパク質複合体と接触させるステップであって、前記複合体は、少なくとも１つの標的へと標的化されており、かつ前記核酸、前記ｇＮＡ−核酸ガイド化ヌクレアーゼ系タンパク質複合体、または前記核酸および前記ｇＮＡ−核酸ガイド化ヌクレアーゼ系タンパク質複合体の両方は標識を含む、ステップと、
ｂ．前記標識由来の特定のシグナルを検出することによって達成される、前記試料中の前記標的を同定するステップであって、特定のシグナルの存在は、前記核酸への前記ｇＮＡ−核酸ガイド化ヌクレアーゼ系タンパク質複合体の結合を示す、ステップと
を含む方法。
（項目２）
前記核酸が、標識を含む、項目１に記載の方法。
（項目３）
前記標識が、インターカレーター型の標識である、項目２に記載の方法。
（項目４）
前記核酸が、前記接触ステップの前に標識される、項目２に記載の方法。
（項目５）
前記核酸が、前記接触ステップの後に標識される、項目２に記載の方法。
（項目６）
前記核酸ガイド化ヌクレアーゼ系タンパク質が、ＣＲＩＳＰＲ／Ｃａｓ系タンパク質である、項目２に記載の方法。
（項目７）
小滴を生成するステップをさらに含み、前記小滴のサブセットが、ｇＮＡ−核酸ガイド化ヌクレアーゼ系タンパク質複合体を含む、項目１から６のいずれかに記載の方法。
（項目８）
前記小滴のサブセットが、前記核酸に結合したｇＮＡ−核酸ガイド化ヌクレアーゼ系タンパク質複合体を含む、項目７に記載の方法。
（項目９）
複数の前記ｇＮＡ−核酸ガイド化ヌクレアーゼ系タンパク質複合体が、標識を含む、項目１に記載の方法。
（項目１０）
複数の前記ｇＮＡ−核酸ガイド化ヌクレアーゼ系タンパク質複合体が、前記接触ステップの前に標識される、項目９に記載の方法。
（項目１１）
複数の前記ｇＮＡ−核酸ガイド化ヌクレアーゼ系タンパク質複合体が、前記接触ステップの後に標識される、項目９に記載の方法。
（項目１２）
前記核酸が、標識を含む、項目９に記載の方法。
（項目１３）
前記核酸および前記複数の前記ｇＮＡ−核酸ガイド化ヌクレアーゼ系タンパク質複合体の両方が、前記接触ステップの前に標識される、項目１２に記載の方法。
（項目１４）
前記核酸および前記複数の前記ｇＮＡ−核酸ガイド化ヌクレアーゼ系タンパク質複合体の両方が、前記接触ステップの後に標識される、項目１２に記載の方法。
（項目１５）
前記核酸が、接触の前に標識され、かつ前記複数の前記ｇＮＡ−核酸ガイド化ヌクレアーゼ系タンパク質複合体が、前記接触ステップの後に標識される、項目１２に記載の方法。
（項目１６）
前記核酸が、接触の後に標識され、かつ前記複数の前記ｇＮＡ−核酸ガイド化ヌクレアーゼ系タンパク質複合体が、前記接触ステップの前に標識される、項目１２に記載の方法。
（項目１７）
前記核酸が、第１の標識を含み、かつ前記ｇＮＡ−核酸ガイド化ヌクレアーゼ系タンパク質複合体が、第２の標識を含み、前記第１の標識および前記第２の標識が、蛍光共鳴エネルギー移動用のドナー／アクセプターペアを含む、項目１２に記載の方法。
（項目１８）
前記接触させるステップが、室温で実行される、項目１から１７のいずれか一項に記載の方法。
（項目１９）
前記同定するステップが、単一のシグナルを検出することを含む、項目１から１８のいずれか一項に記載の方法。
（項目２０）
前記同定するステップが、複数のシグナルを検出することを含む、項目１から１８のいずれか一項に記載の方法。
（項目２１）
前記核酸ガイド化ヌクレアーゼ系タンパク質が、Ｃａｓ９、ＣａｓＸ、ＣａｓＹ、Ｃｐｆ１、Ｃａｓ３、Ｃａｓ８ａ−ｃ、Ｃａｓ１０、Ｃｓｅ１、Ｃｓｙ１、Ｃｓｎ２、Ｃａｓ４、Ｃｓｍ２およびＣｍ５からなる群から選択されるＣＲＩＳＰＲ／Ｃａｓ系タンパク質である、項目１から２０のいずれか一項に記載の方法。
（項目２２）
前記核酸ガイド化ヌクレアーゼ系タンパク質が、活性がない核酸ガイド化ヌクレアーゼ系タンパク質である、項目２１に記載の方法。
（項目２３）
前記核酸ガイド化ヌクレアーゼ系タンパク質が、ｄＣａｓ９である、項目２２に記載の方法。
（項目２４）
前記核酸ガイド化ヌクレアーゼ系タンパク質が、核酸ガイド化ヌクレアーゼ系ニッカーゼタンパク質である、項目２１に記載の方法。
（項目２５）
前記核酸ガイド化ヌクレアーゼ系タンパク質が、オフターゲット結合の低下を呈する、項目２１に記載の方法。
（項目２６）
前記標識が、酵素、酵素基質、抗体、抗原結合性断片、ペプチド、発色団、発光団、フルオロフォア、色原体、ハプテン、抗原、放射性同位元素、磁性粒子、金属ナノ粒子、酸化還元活性マーカー基、アプタマー、結合ペアの一方のメンバーおよびこれらの組合せからなる群から選択される、項目１から２５のいずれか一項に記載の方法。
（項目２７）
前記標識が、検出可能な標識である、項目１から２５のいずれか一項に記載の方法。
（項目２８）
前記試料が、臨床試料、法医学的試料、環境試料、メタゲノム試料および食品試料からなる群から選択される、項目１から２７のいずれか一項に記載の方法。
（項目２９）
前記試料が、ヒトに由来する、項目１から２８のいずれか一項に記載の方法。
（項目３０）
前記試料が、前記接触前に処理されない、項目１から２９のいずれか一項に記載の方法。
（項目３１）
前記核酸、前記ｇＮＡ−核酸ガイド化ヌクレアーゼ系タンパク質複合体、または前記核酸および前記ｇＮＡ−核酸ガイド化ヌクレアーゼ系タンパク質複合体の両方が、複数の標識を含む、項目１から３０のいずれか一項に記載の方法。
（項目３２）
前記複合体が、複数の標的へと標的化されている、項目１から３１のいずれか一項に記載の方法。
（項目３３）
前記標的が、個体である、項目１から３２のいずれか一項に記載の方法。
（項目３４）
前記標的が、病原体である、項目１から３２のいずれか一項に記載の方法。
（項目３５）
前記病原体が、表１に記載の病原体から選択される、項目３３に記載の方法。
（項目３６）
異なる標的へと標的化された前記複合体が、異なる標識を含む、項目３２に記載の方法。
（項目３７）
異なる標的へと標的化された前記複合体が、同じ標識を含む、項目３２に記載の方法。
（項目３８）
前記ｇＮＡ−核酸ガイド化ヌクレアーゼ系タンパク質複合体が、基材に付着されている、項目１から３７のいずれか一項に記載の方法。
（項目３９）
前記基材が、シリカ、プラスチック、ガラスまたは金属である、項目３８に記載の方法。
（項目４０）
前記基材が、二次元の基材である、項目３９に記載の方法。
（項目４１）
前記基材が、三次元の基材を含む、項目３９に記載の方法。
（項目４２）
前記基材が、チャンバーを含むかまたは円筒状アレイである、項目３９に記載の方法。
（項目４３）
前記ｇＮＡ−核酸ガイド化ヌクレアーゼ系タンパク質複合体が、既知の順序で基材に付着されている、項目３８に記載の方法。
（項目４４）
前記基材が、再使用可能である、項目３８から４３のいずれか一項に記載の方法。
（項目４５）
前記ｇＮＡ−核酸ガイド化ヌクレアーゼ系タンパク質複合体が、溶液中に存在する、項目１から３７のいずれか一項に記載の方法。
（項目４６）
前記ｇＮＡ−核酸ガイド化ヌクレアーゼ系タンパク質複合体が、少なくとも１つの特異なｇＮＡを含む、項目１から４５のいずれか一項に記載の方法。
（項目４７）
前記接触が、溶液中で行われる、項目１から３７のいずれか一項に記載の方法。
（項目４８）
前記核酸が、基材に付着されている、項目１から３７のいずれか一項に記載の方法。
（項目４９）
前記基材が、シリカ、プラスチック、ガラスまたは金属である、項目４８に記載の方法。
（項目５０）
前記核酸が、シークエンシングによってさらに分析される、項目１から４９のいずれか一項に記載の方法。
（項目５１）
前記核酸が、せん断される、項目１から５０のいずれか一項に記載の方法。
（項目５２）
前記核酸が、増幅される、項目１から５１のいずれか一項に記載の方法。
（項目５３）
前記核酸が、伸長できないヌクレオチドを用いて１または複数の末端において遮断される、項目１から５２のいずれか一項に記載の方法。
（項目５４）
複数の標的が、同時に同定される、項目１から５３のいずれか一項に記載の方法。
（項目５５）
２４時間未満で実行される、項目１から５４のいずれか一項に記載の方法。
（項目５６）
前記試料が、事前のスクリーニングステップに供される、項目１から５５のいずれか一項に記載の方法。
（項目５７）
前記試料が、複数の検出ステップに供される、項目１から５５のいずれか一項に記載の方法。
（項目５８）
前記核酸へのｇＮＡ−核酸ガイド化ヌクレアーゼ系タンパク質複合体の結合が、標的の存在を示す、項目１から５７のいずれかに記載の方法。
（項目５９）
核酸へのｇＮＡ−核酸ガイド化ヌクレアーゼ系タンパク質複合体の結合の欠如が、標的が存在しないことを示す、項目１から５７のいずれかに記載の方法。
（項目６０）
前記核酸が、ＤＮＡを含む、項目１から５９のいずれかに記載の方法。
（項目６１）
前記核酸が、ＤＮＡである、項目１から５９のいずれかに記載の方法。
（項目６２）
少なくとも１つの標的へと標的化されたガイド核酸（ｇＮＡ）の収集物であって、複数の前記ｇＮＡが標識を含む、収集物。
（項目６３）
複数の標的へと標的化されている、項目６２に記載の収集物。
（項目６４）
前記標的が、個体である、項目６２から６３のいずれか一項に記載の収集物。
（項目６５）
前記標的が、病原体である、項目６２から６３のいずれか一項に記載の収集物。
（項目６６）
前記病原体が、表１に記載の病原体から選択される、項目６５に記載の収集物。
（項目６７）
異なる標的へと標的化されている前記ｇＮＡが、異なる標識を含む、項目６３から６６のいずれか一項に記載の収集物。
（項目６８）
異なる標的へと標的化されている前記ｇＮＡが、同じ標識を含む、項目６３から６６のいずれか一項に記載の収集物。
（項目６９）
前記標識が、検出可能な標識である、項目６２から６８のいずれか一項に記載の収集物。
（項目７０）
前記標識が、酵素、酵素基質、抗体、抗原結合性断片、ペプチド、発色団、発光団、フルオロフォア、色原体、ハプテン、抗原、放射性同位元素、磁性粒子、金属ナノ粒子、酸化還元活性マーカー基、アプタマー、結合ペアの一方のメンバーおよびこれらの組合せからなる群から選択される、項目６２から６９のいずれか一項に記載の収集物。
（項目７１）
前記ｇＮＡが、２つ以上の標識を含む、項目６２から７０のいずれか一項に記載の収集物。
（項目７２）
前記ｇＮＡが、基材に付着されている、項目６２から７１のいずれか一項に記載の収集物。
（項目７３）
前記基材が、シリカ、プラスチック、ガラスまたは金属である、項目７２に記載の収集物。
（項目７４）
前記基材が、二次元の基材である、項目７３に記載の収集物。
（項目７５）
前記基材が、三次元の基材を含む、項目７３に記載の収集物。
（項目７６）
前記基材が、チャンバーを含むかまたは円筒状アレイである、項目７３に記載の収集物。
（項目７７）
前記ｇＮＡが、既知の順序で基材に付着されている、項目６２から７６のいずれか一項に記載の収集物。
（項目７８）
前記基材が、再使用可能である、項目７２から７７のいずれか一項に記載の収集物。
（項目７９）
前記ｇＮＡが、溶液中に存在する、項目６２から７１のいずれか一項に記載の収集物。
（項目８０）
少なくとも１つの特異なｇＮＡを含む、項目６２から７９のいずれか一項に記載の収集物。
（項目８１）
前記ｇＮＡが、核酸ガイド化ヌクレアーゼ系タンパク質と複合体化している、項目６２から８０のいずれか一項に記載の収集物。
（項目８２）
前記核酸ガイド化ヌクレアーゼ系タンパク質が、ＣＲＩＳＰＲ／Ｃａｓ系タンパク質である、項目８１に記載の収集物。
（項目８３）
前記ＣＲＩＳＰＲ／Ｃａｓ系タンパク質が、Ｃａｓ９、ＣａｓＸ、ＣａｓＹ、Ｃｐｆ１、Ｃａｓ３、Ｃａｓ８ａ−ｃ、Ｃａｓ１０、Ｃｓｅ１、Ｃｓｙ１、Ｃｓｎ２、Ｃａｓ４、Ｃｓｍ２およびＣｍ５からなる群から選択される、項目８２に記載の収集物。
（項目８４）
前記核酸ガイド化ヌクレアーゼ系タンパク質が、活性がない核酸ガイド化ヌクレアーゼ系タンパク質である、項目８１に記載の収集物。
（項目８５）
前記核酸ガイド化ヌクレアーゼ系タンパク質が、ｄＣａｓ９である、項目８４に記載の収集物。
（項目８６）
前記核酸ガイド化ヌクレアーゼ系タンパク質が、核酸ガイド化ヌクレアーゼ系ニッカーゼタンパク質である、項目８１に記載の収集物。
（項目８７）
前記核酸ガイド化ヌクレアーゼ系タンパク質が、オフターゲット結合の低下を呈する、項目８１に記載の収集物。
（項目８８）
前記核酸ガイド化ヌクレアーゼ系タンパク質が、標識をさらに含む、項目６２から８７のいずれか一項に記載の収集物。
（項目８９）
ガイド核酸（ｇＮＡ）−核酸ガイド化ヌクレアーゼ系タンパク質複合体の収集物であって、前記ｇＮＡが、少なくとも１つの標的へと標的化されており、かつ複数の前記複合体が、標識を含む、収集物。
（項目９０）
前記核酸ガイド化ヌクレアーゼ系タンパク質が、ＣＲＩＳＰＲ／Ｃａｓ系タンパク質である、項目８９に記載の収集物。
（項目９１）
複数の前記ｇＮＡが標識を含む、項目８９に記載の収集物。
（項目９２）
複数の核酸ガイド化ヌクレアーゼ系タンパク質が、標識を含む、項目８９に記載の収集物。
（項目９３）
複数のｇＮＡおよび複数の核酸ガイド化ヌクレアーゼ系タンパク質の両方が、標識を含む、項目８９に記載の収集物。
（項目９４）
前記ｇＮＡが、複数の標的へと標的化されている、項目８９から９３のいずれか一項に記載の収集物。
（項目９５）
前記標的が、個体である、項目８９から９４のいずれか一項に記載の収集物。
（項目９６）
前記標的が、病原体である、項目８９から９４のいずれか一項に記載の収集物。
（項目９７）
前記病原体が、表１に記載の病原体から選択される、項目９６に記載の収集物。
（項目９８）
異なる標的へと標的化されている前記ｇＮＡが、異なる標識を含む、項目８９から９７のいずれか一項に記載の収集物。
（項目９９）
異なる標的へと標的化されている前記ｇＮＡが、同じ標識を含む、項目８９から９７のいずれか一項に記載の収集物。
（項目１００）
前記核酸ガイド化ヌクレアーゼ系タンパク質が、異なる標識を含む、項目８９から９７のいずれか一項に記載の収集物。
（項目１０１）
前記核酸ガイド化ヌクレアーゼ系タンパク質が、同じ標識を含む、項目８９から９７のいずれか一項に記載の収集物。
（項目１０２）
前記標識が、検出可能な標識である、項目８９から１０１のいずれか一項に記載の収集物。
（項目１０３）
前記標識が、酵素、酵素基質、抗体、抗原結合性断片、ペプチド、発色団、発光団、フルオロフォア、色原体、ハプテン、抗原、放射性同位元素、磁性粒子、金属ナノ粒子、酸化還元活性マーカー基、アプタマー、結合ペアの一方のメンバーおよびこれらの組合せからなる群から選択される、項目８９から１０１のいずれか一項に記載の収集物。
（項目１０４）
前記複合体が、２つ以上の標識を含む、項目８９から１０３のいずれか一項に記載の収集物。
（項目１０５）
前記複合体が、基材に付着されている、項目８９から１０４のいずれか一項に記載の収集物。
（項目１０６）
前記ｇＮＡが、前記基材に付着されている、項目１０５に記載の収集物。
（項目１０７）
前記核酸ガイド化ヌクレアーゼ系タンパク質が、前記基材に付着されている、項目１０５に記載の収集物。
（項目１０８）
前記基材が、シリカ、プラスチック、ガラスまたは金属である、項目１０５に記載の収集物。
（項目１０９）
前記基材が、二次元の基材である、項目１０８に記載の収集物。
（項目１１０）
前記基材が、三次元の基材である、項目１０８に記載の収集物。
（項目１１１）
前記基材が、チャンバーを含むかまたは円筒状アレイである、項目１０８に記載の収集物。
（項目１１２）
前記複合体が、既知の順序で基材に付着されている、項目８９から１０５のいずれか一項に記載の収集物。
（項目１１３）
前記基材が、再使用可能である、項目８９から１１２のいずれか一項に記載の収集物。
（項目１１４）
前記複合体が、溶液中に存在する、項目８９から１０４のいずれか一項に記載の収集物。
（項目１１５）
少なくとも１つの特異なｇＮＡを含む、項目８９から１１４のいずれか一項に記載の収集物。
（項目１１６）
前記核酸ガイド化ヌクレアーゼ系タンパク質が、Ｃａｓ９、ＣａｓＸ、ＣａｓＹ、Ｃｐｆ１、Ｃａｓ３、Ｃａｓ８ａ−ｃ、Ｃａｓ１０、Ｃｓｅ１、Ｃｓｙ１、Ｃｓｎ２、Ｃａｓ４、Ｃｓｍ２およびＣｍ５からなる群から選択されるＣＲＩＳＰＲ／Ｃａｓ系タンパク質である、項目８９から１１５のいずれか一項に記載の収集物。
（項目１１７）
前記核酸ガイド化ヌクレアーゼ系タンパク質が、活性がない核酸ガイド化ヌクレアーゼ系タンパク質である、項目１１６に記載の収集物。
（項目１１８）
前記核酸ガイド化ヌクレアーゼ系タンパク質が、ｄＣａｓ９である、項目１１７に記載の収集物。
（項目１１９）
前記核酸ガイド化ヌクレアーゼ系タンパク質が、核酸ガイド化ヌクレアーゼ系ニッカーゼタンパク質である、項目１１６に記載の収集物。
（項目１２０）
前記核酸ガイド化ヌクレアーゼ系タンパク質が、オフターゲット結合の低下を呈する、項目１１６に記載の収集物。
（項目１２１）
項目６２から１２０に記載の収集物のいずれか一つを含むキット。