【手続補正書】
【提出日】令和2年5月21日(2020.5.21)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
トランスジェニック植物であって、少なくとも１つの発現制御配列に作動可能に連結された、
光化学系ＩＩサブユニットＳ（ＰｓｂＳ）、ゼアキサンチンエポキシダーゼ（ＺＥＰ）、およびビオラキサンチンデエポキシダーゼ（ＶＤＥ）；
ＰｓｂＳおよびＺＥＰ；または
ＺＥＰおよびＶＤＥ
をコードする１つまたは複数の異種ヌクレオチド配列を含む、トランスジェニック植物。
【請求項２】
前記１つまたは複数の異種ヌクレオチド配列が双子葉植物に由来する、請求項１に記載のトランスジェニック植物。
【請求項３】
前記１つまたは複数の異種ヌクレオチド配列がＡｒａｂｉｄｏｐｓｉｓ  ｔｈａｌｉａｎａに由来する、請求項１に記載のトランスジェニック植物。
【請求項４】
前記ＶＤＥ、ＰｓｂＳ、またはＺＥＰのうちのいずれかの転写レベルがコントロール植物と比較して増加する、請求項１〜３のいずれか１項に記載のトランスジェニック植物。
【請求項５】
ａ．ＰｓｂＳが、配列番号１のヌクレオチド配列にコードされ、ＺＥＰが、配列番号２のヌクレオチド配列にコードされ、ＶＤＥが、配列番号３のヌクレオチド配列にコードされる、
ｂ．ＰｓｂＳが、配列番号１に対して少なくとも９０％の同一性を有するヌクレオチド配列にコードされ、ＺＥＰが、配列番号２に対して少なくとも９０％の同一性を有するヌクレオチド配列にコードされ、ＶＤＥが、配列番号３に対して少なくとも９０％の同一性を有するヌクレオチド配列にコードされる、
ｃ．ＰｓｂＳが、配列番号１に対して少なくとも７０％の同一性を有するヌクレオチド配列にコードされ、ＺＥＰが、配列番号２に対して少なくとも７０％の同一性を有するヌクレオチド配列にコードされ、ＶＤＥが、配列番号３に対して少なくとも７０％の同一性を有するヌクレオチド配列にコードされる、
ｄ．ＰｓｂＳが、配列番号４のアミノ酸配列を有し、ＺＥＰが、配列番号５のアミノ酸配列を有し、ＶＤＥが、配列番号６のアミノ酸配列を有する、
ｅ．ＰｓｂＳが、配列番号４に少なくとも９０％同一であるアミノ酸配列を有し、ＺＥＰが、配列番号５に少なくとも９０％同一であるアミノ酸配列を有し、ＶＤＥが、配列番号６に少なくとも配列９０％同一であるアミノ酸を有する、
ｆ．ＰｓｂＳが、配列番号４に少なくとも７０％同一であるアミノ酸配列を有し、ＺＥＰが、配列番号５に少なくとも７０％同一であるアミノ酸配列を有し、ＶＤＥが、配列番号６に少なくとも配列７０％同一であるアミノ酸を有する、あるいは
ｇ．ＰｓｂＳが、配列番号７の保存されたドメインを含み、ＺＥＰが、配列番号８の保存されたドメインを含み、ＶＤＥが、配列番号９の保存されたドメインを含む、
請求項１〜３のいずれか１項に記載のトランスジェニック植物。
【請求項６】
前記植物が、作物、モデル植物、単子葉の植物、双子葉の植物、ベンケイソウ型酸代謝（ＣＡＭ）光合成植物、Ｃ３光合成植物、Ｃ４光合成植物、一年生植物、温室植物、園芸種の顕花植物、多年生植物、スイッチグラス植物、メイズ植物、バイオマス植物、またはサトウキビ植物である、請求項１〜３のいずれか１項に記載のトランスジェニック植物。
【請求項７】
前記植物が、スイッチグラス、ススキ、ウマゴヤシ、サトウモロコシ、穀実用モロコシ、サトウキビ（Ｓａｃｃｈａｒｕｍ  ｓｐｐ．）、エネルギー用サトウキビ、エレファントグラス、モロコシ（Ｓｏｒｇｈｕｍ  ｂｉｃｏｌｏｒ）、メイズ（Ｚｅａ  ｍａｙｓ）、キャッサバ（Ｍａｎｉｈｏｔ  ｅｓｃｕｌｅｎｔａ）、ササゲ（Ｖｉｇｎａ  ｕｎｇｕｉｃｕｌａｔａ）、コムギ、オオムギ（Ｈｏｒｄｅｕｍ  ｖｕｌｇａｒｅ）、カラスムギ、イネ（Ｏｒｙｚａ  ｓａｔｉｖａ）、ダイズ（Ｇｌｙｃｉｎｅ  ｍａｘ）、アブラヤシ、ベニバナ、ゴマ、タバコ（Ｎｉｃｏｔｉａｎａ  ｔａｂａｃｕｍ）、アマ、ワタ、ヒマワリ、カメリナ、Ｂｒａｓｓｉｃａ  ｎａｐｕｓ、Ｂｒａｓｓｉｃａ  ｃａｒｉｎａｔａ、Ｂｒａｓｓｉｃａ  ｊｕｎｃｅａ、トウジンビエ、アワ、他の穀物、イネ、脂肪種子、アルファルファ（Ｍｅｄｉｃａｇｏ  ｓａｔｉｖａ）、ジャガイモ（Ｓｏｌａｎｕｍ  ｔｕｂｅｒｏｓｕｍ）、ポプラ（Ｐｏｐｕｌｕｓ  ｓｐｐ．）、ユーカリ（Ｅｕｃａｌｙｐｔｕｓ  ｓｐｐ．）、野菜作物、飼料作物、工芸作物、木質作物、およびバイオマス作物からなる群から選択される、請求項１〜３のいずれか１項に記載のトランスジェニック植物。
【請求項８】
前記植物が、変動光条件下のコントロール植物と比較して、変動光条件下での増大した成長、増大した光合成活動、改善した光防御効率、ならびに改善した量子収量およびＣＯ２固定のうちの１つまたは複数を有する、請求項１〜３のいずれか１項に記載のトランスジェニック植物。
【請求項９】
前記植物が優良系統または優良株である、請求項１〜３のいずれか１項に記載のトランスジェニック植物。
【請求項１０】
前記植物が、除草剤抵抗性、昆虫または有害生物に対する抵抗性、病害抵抗性、改変脂肪酸代謝、および／または改変炭水化物代謝を提供する少なくとも１つのさらなるポリペプチドの発現をさらに含む、請求項１〜３のいずれか１項に記載のトランスジェニック植物。
【請求項１１】
発現ベクターであって、少なくとも１つの発現制御配列に作動可能に連結された、
ＰｓｂＳ、ＺＥＰ、およびＶＤＥ；
ＰｓｂＳおよびＺＥＰ；または
ＺＥＰおよびＶＤＥをコードする１つまたは複数のヌクレオチド配列を含む、発現ベクター。
【請求項１２】
前記少なくとも１つの発現制御配列が、Ｒｂｃｓ１Ａ、ＧＡＰＡ−１、およびＦＢＡ２からなる群から選択されるプロモーターを含む、請求項１１に記載の発現ベクター。
【請求項１３】
Ｒｂｃｓ１ＡプロモーターがＺＥＰの発現を駆動し、ＧＡＰＡ−１プロモーターがＰｓｂＳの発現を駆動し、ＦＢＡ２プロモーターがＶＤＥの発現を駆動する、請求項１１に記載の発現ベクター。
【請求項１４】
前記発現ベクターがＴ−ＤＮＡである、請求項１１〜１３のいずれか１項に記載の発現ベクター。
【請求項１５】
抗生物質抵抗性を提供するポリペプチドをコードするヌクレオチド配列をさらに含む、請求項１１〜１４のいずれか１項に記載の発現ベクター。
【請求項１６】
発現制御配列ならびにＰｓｂＳポリペプチド、ＺＥＰポリペプチド、およびＶＤＥポリペプチドをコードするヌクレオチド配列に隣接する左境界（ＬＢ）ドメインおよび右境界（ＲＢ）ドメインをさらに含む、請求項１１〜１５のいずれか１項に記載の発現ベクター。
【請求項１７】
ａ．ＰｓｂＳが配列番号１のヌクレオチド配列にコードされ、ＺＥＰが配列番号２のヌクレオチド配列にコードされ、ＶＤＥが配列番号３のヌクレオチド配列にコードされる、
ｂ．ＰｓｂＳが、配列番号１に対して少なくとも９０％の同一性を有するヌクレオチド配列にコードされ、ＺＥＰが、配列番号２に対して少なくとも９０％の同一性を有するヌクレオチド配列にコードされ、ＶＤＥが、配列番号３に対して少なくとも９０％の同一性を有するヌクレオチド配列にコードされる、
ｃ．ＰｓｂＳが、配列番号１に対して少なくとも７０％の同一性を有するヌクレオチド配列にコードされ、ＺＥＰが、配列番号２に対して少なくとも７０％の同一性を有するヌクレオチド配列にコードされ、ＶＤＥが、配列番号３に対して少なくとも７０％の同一性を有するヌクレオチド配列にコードされる、
ｄ．ＰｓｂＳが、配列番号４のアミノ酸配列を有し、ＺＥＰが、配列番号５のアミノ酸配列を有し、ＶＤＥが、配列番号６のアミノ酸配列を有する、
ｅ．ＰｓｂＳが、配列番号４に少なくとも９０％同一であるアミノ酸配列を有し、ＺＥＰが、配列番号５に少なくとも９０％同一であるアミノ酸配列を有し、ＶＤＥが、配列番号６に少なくとも配列９０％同一であるアミノ酸を有する、
ｆ．ＰｓｂＳが、配列番号４に少なくとも７０％同一であるアミノ酸配列を有し、ＺＥＰが、配列番号５に少なくとも７０％同一であるアミノ酸配列を有し、ＶＤＥが、配列番号６に少なくとも配列７０％同一であるアミノ酸を有する、あるいは
ｇ．ＰｓｂＳが、配列番号７の保存されたドメインを含み、ＺＥＰが、配列番号８の保存されたドメインを含み、ＶＤＥが、配列番号９の保存されたドメインを含む、
請求項１１〜１６のいずれか１項に記載の発現ベクター。
【請求項１８】
請求項１１〜１７のいずれか１項に記載の発現ベクターを含む細菌細胞。
【請求項１９】
請求項１１〜１７のいずれか１項に記載の発現ベクターを含むアグロバクテリウム細胞。
【請求項２０】
請求項１１〜１７のいずれか１項に記載の発現ベクターを含むトランスジェニック植物。
【請求項２１】
請求項１１〜１７のいずれか１項に記載の発現ベクターを含む種子。
【請求項２２】
請求項２１に記載の種子由来の子孫植物。
【請求項２３】
変動光条件下で植物の成長、光合成効率、光防御効率、ならびに量子収率およびＣＯ２固定のうちの１つまたはそれより多くを増大させる方法であって、前記植物中でのＰｓｂＳ、ＺＥＰ、およびＶＤＥからなる群から選択される２つまたはそれを超えるポリペプチドの発現を増大させる工程であって、それにより、コントロール植物と比較して前記２つまたはそれを超えるポリペプチドの発現が増大した植物が産生される、発現を増大させる工程を含む、方法。
【請求項２４】
植物における非光化学的消光（ＮＰＱ）の緩和速度を増大させる方法であって、植物中での
ＰｓｂＳ、ＺＥＰ、およびＶＤＥ；
ＰｓｂＳおよびＺＥＰ；または
ＺＥＰおよびＶＤＥの発現を増大させる工程であって、それにより、コントロール植物と比較して２つまたはそれを超えるポリペプチドの発現が増大した植物が産生される、発現を増大させる工程を含む、方法。
【請求項２５】
ＰｓｂＳおよびＶＤＥの発現を増大させる工程、
ＰｓｂＳおよびＺＥＰの発現を増大させる工程、
ＺＥＰおよびＶＤＥの発現を増大させる工程、または
ＰｓｂＳ、ＺＥＰ、およびＶＤＥの発現を増大させる工程
を含む、請求項２３または２４に記載の方法。
【請求項２６】
ＰｓｂＳ、ＺＥＰ、および／またはＶＤＥの発現を、ＰｓｂＳ、ＺＥＰ、および／またはＶＤＥをコードする１つまたは複数の異種ヌクレオチド配列の発現によって増大させる、請求項２３〜２５のいずれか１項に記載の方法。
【請求項２７】
ＰｓｂＳ、ＺＥＰ、および／またはＶＤＥの発現を、ＰｓｂＳ、ＺＥＰ、および／またはＶＤＥのプロモーターの改変によって増大させる、請求項２３〜２５のいずれか１項に記載の方法。
【請求項２８】
プロモーターをゲノム編集システムによって改変する、請求項２７に記載の方法。
【請求項２９】
前記ゲノム編集システムがＣＲＩＳＰＲである、請求項２８に記載の方法。
【請求項３０】
変動光条件下での成長特性を改善するための植物を選択する方法であって、
（ａ）植物集団を提供する工程；
（ｂ）ＰｓｂＳ、ＺＥＰ、およびＶＤＥのうちのいずれかの活性を増大させるように前記植物を改変する工程；
（ｂ）前記植物における変動光条件下での非光化学的消光（ＮＰＱ）レベルを検出する工程；
（ｃ）前記植物における変動光条件下でのＮＰＱレベルを、変動光条件下でのＮＰＱのコントロールレベルと比較する工程；および
（ｄ）前記植物を高光強度から低光強度へ移行した場合にＮＰＱ緩和速度が増大した植物を選択する工程であって；それにより、変動光条件下での成長特性が改善された植物が選択される、選択する工程
を含む、方法。
【請求項３１】
前記ＮＰＱのコントロールレベルが、前記集団におけるＮＰＱの最低レベル、前記集団におけるＮＰＱの中程度のレベル、前記集団におけるＮＰＱの平均レベル、およびコントロール植物におけるＮＰＱレベルからなる群から選択される、請求項３０に記載の方法。
【請求項３２】
前記植物を、変異原を用いてＰｓｂＳ、ＺＥＰ、および／またはＶＤＥにおける１つまたは複数の変異を誘導することによって改変する、請求項３０または３１に記載の方法。
【請求項３３】
前記変異原がエタンメチルスルホナート（ＥＭＳ）である、請求項３２に記載の方法。
【請求項３４】
前記植物を、トランスジェニック技術またはゲノム編集システムを使用して異種のＰｓｂＳ、ＺＥＰ、および／またはＶＤＥを導入することによって改変する、請求項３０または３１に記載の方法。
【請求項３５】
前記ゲノム編集システムがＣＲＩＳＰＲである、請求項３４に記載の方法。
【請求項３６】
変動光条件下での成長特性の改善に関連する多型をスクリーニングする方法であって、
（ａ）植物集団を提供する工程；
（ｂ）前記植物においてＰｓｂＳ、ＺＥＰ、およびＶＤＥのうちのいずれかを制御および／またはコードするヌクレオチド配列を得る工程；
（ｃ）前記植物においてＰｓｂＳ、ＺＥＰ、およびＶＤＥのうちのいずれかを制御および／またはコードするヌクレオチド配列内の１つまたは複数の多型を得る工程；
（ｄ）前記植物における高光強度から低光強度への移行の際の非光化学的消光（ＮＰＱ）緩和速度を検出する工程；
（ｅ）前記植物集団における多型のＮＰＱ緩和速度との関連を決定するために統計解析を行う工程；および
（ｆ）前記ＮＰＱ緩和速度と統計的に有意に関連する多型を選択する工程であって；それにより、変動光条件下での成長特性の改善に関連する多型が選択される、選択する工程
を含む、方法。
【請求項３７】
前記多型が一塩基多型（ＳＮＰ）である、請求項３６に記載の方法。
【請求項３８】
前記多型が、ＰｓｂＳ、ＺＥＰ、および／またはＶＤＥのプロモーター内に存在する、請求項３６または３７に記載の方法。
【請求項３９】
前記多型を配列決定またはゲル電気泳動によって検出する、請求項３６〜３８のいずれか１項に記載の方法。
【請求項４０】
前記多型を、変動光条件下での成長特性が改善されている植物を選択するための植物集団のスクリーニングのためにさらに使用する、請求項３６〜３９のいずれか１項に記載の方法。
【請求項４１】
前記多型を、変動光条件下での植物の成長特性を改善するためのＰｓｂＳ、ＺＥＰ、および／またはＶＤＥにおけるゲノム編集のための標的としてさらに使用する、請求項３６〜３９のいずれか１項に記載の方法。
【請求項４２】
前記成長特性の改善が、成長の改善、光合成効率の改善、光防御効率の改善、量子収量の改善、およびＣＯ２固定の改善からなる群から選択される、請求項３０〜４１のいずれか１項に記載の方法。
【請求項４３】
植物におけるＮＰＱを、クロロフィル蛍光の測定によって検出する、請求項３０〜４２のいずれか１項に記載の方法。
【請求項４４】
ＰｓｂＳが、配列番号１のヌクレオチド配列にコードされ、ＺＥＰが、配列番号２のヌクレオチド配列にコードされ、ＶＤＥが、配列番号３のヌクレオチド配列にコードされる、
ＰｓｂＳが、配列番号１に対して少なくとも９０％の同一性を有するヌクレオチド配列にコードされ、ＺＥＰが、配列番号２に対して少なくとも９０％の同一性を有するヌクレオチド配列にコードされ、ＶＤＥが、配列番号３に対して少なくとも９０％の同一性を有するヌクレオチド配列にコードされる、
ＰｓｂＳが、配列番号１に対して少なくとも７０％の同一性を有するヌクレオチド配列にコードされ、ＺＥＰが、配列番号２に対して少なくとも７０％の同一性を有するヌクレオチド配列にコードされ、ＶＤＥが、配列番号３に対して少なくとも７０％の同一性を有するヌクレオチド配列にコードされる、
ＰｓｂＳが、配列番号４のアミノ酸配列を有し、ＺＥＰが、配列番号５のアミノ酸配列を有し、ＶＤＥが、配列番号６のアミノ酸配列を有する、
ＰｓｂＳが、配列番号４に少なくとも９０％同一であるアミノ酸配列を有し、ＺＥＰが、配列番号５に少なくとも９０％同一であるアミノ酸配列を有し、ＶＤＥが、配列番号６に少なくとも９０％同一であるアミノ酸配列を有する、
ＰｓｂＳが、配列番号４に少なくとも７０％同一であるアミノ酸配列を有し、ＺＥＰが、配列番号５に少なくとも７０％同一であるアミノ酸配列を有し、ＶＤＥが、配列番号６に少なくとも７０％同一であるアミノ酸配列を有する、あるいは
ＰｓｂＳが、配列番号７の保存されたドメインを含み、ＺＥＰが、配列番号８の保存されたドメインを含み、ＶＤＥが、配列番号９の保存されたドメインを含む、
請求項２３〜４３のいずれか１項に記載の方法。
【請求項４５】
前記植物が、作物、モデル植物、単子葉の植物、双子葉の植物、ベンケイソウ型酸代謝（ＣＡＭ）光合成植物、Ｃ３光合成植物、Ｃ４光合成植物、一年生植物、温室植物、園芸種の顕花植物、多年生植物、スイッチグラス植物、メイズ植物、バイオマス植物、またはサトウキビ植物である、請求項２３〜４４のいずれか１項に記載の方法。
【請求項４６】
前記植物が、スイッチグラス、ススキ、ウマゴヤシ、サトウモロコシ、穀実用モロコシ、サトウキビ（Ｓａｃｃｈａｒｕｍ  ｓｐｐ．）、エネルギー用サトウキビ、エレファントグラス、モロコシ（Ｓｏｒｇｈｕｍ  ｂｉｃｏｌｏｒ）、メイズ（Ｚｅａ  ｍａｙｓ）、キャッサバ（Ｍａｎｉｈｏｔ  ｅｓｃｕｌｅｎｔａ）、ササゲ（Ｖｉｇｎａ  ｕｎｇｕｉｃｕｌａｔａ）、コムギ、オオムギ（Ｈｏｒｄｅｕｍ  ｖｕｌｇａｒｅ）、カラスムギ、イネ（Ｏｒｙｚａ  ｓａｔｉｖａ）、ダイズ（Ｇｌｙｃｉｎｅ  ｍａｘ）、アブラヤシ、ベニバナ、ゴマ、タバコ（Ｎｉｃｏｔｉａｎａ  ｔａｂａｃｕｍ）、アマ、ワタ、ヒマワリ、カメリナ、Ｂｒａｓｓｉｃａ  ｎａｐｕｓ、Ｂｒａｓｓｉｃａ  ｃａｒｉｎａｔａ、Ｂｒａｓｓｉｃａ  ｊｕｎｃｅａ、ジャガイモ（Ｓｏｌａｎｕｍ  ｔｕｂｅｒｏｓｕｍ）、アルファルファ（Ｍｅｄｉｃａｇｏ  ｓａｔｉｖａ）、トウジンビエ、アワ、他の穀物、イネ、脂肪種子、ポプラ（Ｐｏｐｕｌｕｓ  ｓｐｐ．）、ユーカリ（Ｅｕｃａｌｙｐｔｕｓ  ｓｐｐ．）、野菜作物、飼料作物、工芸作物、木質作物、およびバイオマス作物からなる群から選択される、請求項２３〜４５のいずれか１項に記載の方法。
【請求項４７】
ＶＤＥの転写物レベルがコントロール植物と比較して３倍増大し、ＰｓｂＳの転写物レベルがコントロール植物と比較して３倍増大し、ＺＥＰの転写物レベルがコントロール植物と比較して８倍増大する、
ＶＤＥの転写物レベルがコントロール植物と比較して１０倍増大し、ＰｓｂＳの転写物レベルがコントロール植物と比較して３倍増大し、ＺＥＰの転写物レベルがコントロール植物と比較して６倍増大する、
ＶＤＥの転写物レベルがコントロール植物と比較して４倍増大し、ＰｓｂＳの転写物レベルがコントロール植物と比較して１．２倍増大し、ＺＥＰの転写物レベルがコントロール植物と比較して７倍増大する、
ＶＤＥの転写物レベルがコントロール植物と比較して１６倍増大し、ＰｓｂＳの転写物レベルがコントロール植物と比較して２倍増大し、ＺＥＰの転写物レベルがコントロール植物と比較して８０倍増大する、
ＶＤＥの転写物レベルがコントロール植物と比較して３０倍増大し、ＰｓｂＳの転写物レベルがコントロール植物と比較して４倍増大し、ＺＥＰの転写物レベルがコントロール植物と比較して７４倍増大する、
ＶＤＥのタンパク質レベルがコントロール植物と比較して４７倍増大し、ＰｓｂＳのタンパク質レベルがコントロール植物と比較して３倍増大し、ＺＥＰのタンパク質レベルがコントロール植物と比較して７５倍増大する、
ＶＤＥ、ＰｓｂＳおよびＺＥＰの間のコントロール植物と比較した転写物レベルの増大が、３：３：８、１０：３：６、および４：１．２：７からなる群から選択される比を有する、
ＶＤＥ、ＰｓｂＳおよびＺＥＰの間のコントロール植物と比較したタンパク質レベルの増大が、１６：２：８０、３０：４：７４、４７：３：７５からなる群から選択される比を有する、
コントロール植物と比較したＶＤＥの転写物レベルの増大が約３倍から約１０倍であり、コントロール植物と比較したＰｓｂＳの転写物レベルの増大が約１．２倍から約３倍であり、コントロール植物と比較したＺＥＰの転写物レベルの増大が約６倍から約８倍である、
コントロール植物と比較したＶＤＥのタンパク質レベルの増大が約１６倍から約４７倍であり、コントロール植物と比較したＰｓｂＳのタンパク質レベルの増大が約２倍から約４倍であり、コントロール植物と比較したＺＥＰのタンパク質レベルの増大が約７４倍から約８０倍である、
請求項１〜１０のいずれか１項に記載のトランスジェニック植物。
【請求項４８】
発現を増大させることが、コントロール植物と比較して前記植物におけるＶＤＥの転写物レベルを３倍増大させることを含み、発現を増大させることが、コントロール植物と比較して前記植物におけるＰｓｂＳの転写物レベルを３倍増大させることを含み、発現を増大させることが、コントロール植物と比較して前記植物におけるＺＥＰの転写物レベルを８倍増大させることを含む、
発現を増大させることが、コントロール植物と比較して前記植物におけるＶＤＥの転写物レベルを１０倍増大させることを含み、発現を増大させることが、コントロール植物と比較して前記植物におけるＰｓｂＳの転写物レベルを３倍増大させることを含み、発現を増大させることが、コントロール植物と比較して前記植物におけるＺＥＰの転写物レベルを６倍増大させることを含む、
発現を増大させることが、コントロール植物と比較して前記植物におけるＶＤＥの転写物レベルを４倍増大させることを含み、発現を増大させることが、コントロール植物と比較して前記植物におけるＰｓｂＳの転写物レベルを１．２倍増大させることを含み、発現を増大させることが、コントロール植物と比較して前記植物におけるＺＥＰの転写物レベルを７倍増大させることを含む、
発現を増大させることが、コントロール植物と比較して前記植物におけるＶＤＥのタンパク質レベルを１６倍増大させることを含み、発現を増大させることが、コントロール植物と比較して前記植物におけるＰｓｂＳのタンパク質レベルを２倍増大させることを含み、発現を増大させることが、コントロール植物と比較して前記植物におけるＺＥＰのタンパク質レベルを８０倍増大させることを含む、
発現を増大させることが、コントロール植物と比較して前記植物におけるＶＤＥのタンパク質レベルを３０倍増大させることを含み、発現を増大させることが、コントロール植物と比較して前記植物におけるＰｓｂＳのタンパク質レベルを４倍増大させることを含み、発現を増大させることが、コントロール植物と比較して前記植物におけるＺＥＰのタンパク質レベルを７４倍増大させることを含む、
発現を増大させることが、コントロール植物と比較して前記植物におけるＶＤＥのタンパク質レベルを４７倍増大させることを含み、発現を増大させることが、コントロール植物と比較して前記植物におけるＰｓｂＳのタンパク質レベルを３倍増大させることを含み、発現を増大させることが、コントロール植物と比較して前記植物におけるＺＥＰのタンパク質レベルを７５倍増大させることを含む、
発現を増大させることが、コントロール植物と比較して前記植物におけるＶＤＥ、ＰｓｂＳおよびＺＥＰの転写物レベルを３：３：８、１０：３：６、および４：１．２：７からなる群から選択される比で増大させることを含む、
発現を増大させることが、コントロール植物と比較して前記植物におけるＶＤＥ、ＰｓｂＳおよびＺＥＰのタンパク質レベルを１６：２：８０、３０：４：７４、および４７：３：７５からなる群から選択される比で増大させることを含む、
発現を増大させることが、コントロール植物と比較して前記植物におけるＶＤＥの転写物レベルを約３倍から約１０倍増大させることを含み、発現を増大させることが、コントロール植物と比較して前記植物におけるＰｓｂＳの転写物レベルを約１．２倍から約３倍増大させることを含み、発現を増大させることが、コントロール植物と比較して前記植物におけるＺＥＰの転写物レベルを約６倍から約８倍増大させることを含む、あるいは
発現を増大させることが、コントロール植物と比較して前記植物におけるＶＤＥのタンパク質レベルを約１６倍から約４７倍増大させることを含み、発現を増大させることが、コントロール植物と比較して前記植物におけるＰｓｂＳのタンパク質レベルを約２倍から約４倍増大させることを含み、発現を増大させることが、コントロール植物と比較して前記植物におけるＺＥＰのタンパク質レベルを約７４倍から約８０倍増大させることを含む、
請求項２３〜２９および４４〜４７のいずれか１項に記載の方法。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０３１９
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０３１９】
図２２は、温室での成長実験を示す。結果は、ＺＥＰおよびＶＤＥを過剰発現するＮｉｃｏｔｉａｎａ  ｔａｂａｃｕｍ  ｃｖ．Ｐｅｔｉｔｅ  Ｈａｖａｎａの安定なトランスジェニックＴ１植物（ＺＥＰ−ＶＤＥ）が野生型（Ｎｕｌｌ）と比較して、サイズおよびバイオマスが増加することことを証明した。ＰｓｂＳ（ＰｓｂＳ）またはＺＥＰおよびＰＳＢＳ（ＺＥＰ−ＰｓｂＳ）を過剰発現する系統は、野生型と類似のバイオマスを示した。４組（トランスジェニック系統あたり１組）の植物を図中に示す。各組は３６株の植物を含む。各組についての地上バイオマスを、成長１９日後に３６株の植物の収穫物の総湿重量および総乾燥重量によって決定した。データは、単一の実験の結果を示す。
本発明の実施形態において、例えば以下の項目が提供される。
（項目１）
トランスジェニック植物であって、少なくとも１つの発現制御配列に作動可能に連結された、
光化学系ＩＩサブユニットＳ（ＰｓｂＳ）、ゼアキサンチンエポキシダーゼ（ＺＥＰ）、およびビオラキサンチンデエポキシダーゼ（ＶＤＥ）；
ＰｓｂＳおよびＺＥＰ；または
ＺＥＰおよびＶＤＥ
をコードする１つまたは複数の異種ヌクレオチド配列を含む、トランスジェニック植物。
（項目２）
前記１つまたは複数の異種ヌクレオチド配列が双子葉植物に由来する、項目１に記載のトランスジェニック植物。
（項目３）
前記１つまたは複数の異種ヌクレオチド配列がＡｒａｂｉｄｏｐｓｉｓ  ｔｈａｌｉａｎａに由来する、項目１に記載のトランスジェニック植物。
（項目４）
ＰｓｂＳ、ＺＥＰ、およびＶＤＥをコードする１つまたは複数の異種ヌクレオチド配列を含む、項目１〜３のいずれか１項に記載のトランスジェニック植物。
（項目５）
前記ＶＤＥ、ＰｓｂＳ、またはＺＥＰのうちのいずれかの転写レベルがコントロール植物と比較して増加する、項目１〜４のいずれか１項に記載のトランスジェニック植物。
（項目６）
ＰｓｂＳが、配列番号１のヌクレオチド配列にコードされ、ＺＥＰが、配列番号２のヌクレオチド配列にコードされ、ＶＤＥが、配列番号３のヌクレオチド配列にコードされる、項目１〜５のいずれか１項に記載のトランスジェニック植物。
（項目７）
ＰｓｂＳが、配列番号１に対して少なくとも９０％の同一性を有するヌクレオチド配列にコードされ、ＺＥＰが、配列番号２に対して少なくとも９０％の同一性を有するヌクレオチド配列にコードされ、ＶＤＥが、配列番号３に対して少なくとも９０％の同一性を有するヌクレオチド配列にコードされる、項目１〜５のいずれか１項に記載のトランスジェニック植物。
（項目８）
ＰｓｂＳが、配列番号１に対して少なくとも７０％の同一性を有するヌクレオチド配列にコードされ、ＺＥＰが、配列番号２に対して少なくとも７０％の同一性を有するヌクレオチド配列にコードされ、ＶＤＥが、配列番号３に対して少なくとも７０％の同一性を有するヌクレオチド配列にコードされる、項目１〜５のいずれか１項に記載のトランスジェニック植物。
（項目９）
ＰｓｂＳが、配列番号４のアミノ酸配列を有し、ＺＥＰが、配列番号５のアミノ酸配列を有し、ＶＤＥが、配列番号６のアミノ酸配列を有する、項目１〜５のいずれか１項に記載のトランスジェニック植物。
（項目１０）
ＰｓｂＳが、配列番号４に少なくとも９０％同一であるアミノ酸配列を有し、ＺＥＰが、配列番号５に少なくとも９０％同一であるアミノ酸配列を有し、ＶＤＥが、配列番号６に少なくとも配列９０％同一であるアミノ酸を有する、項目１〜５のいずれか１項に記載のトランスジェニック植物。
（項目１１）
ＰｓｂＳが、配列番号４に少なくとも７０％同一であるアミノ酸配列を有し、ＺＥＰが、配列番号５に少なくとも７０％同一であるアミノ酸配列を有し、ＶＤＥが、配列番号６に少なくとも配列７０％同一であるアミノ酸を有する、項目１〜５のいずれか１項に記載のトランスジェニック植物。
（項目１２）
ＰｓｂＳが、配列番号７の保存されたドメインを含み、ＺＥＰが、配列番号８の保存されたドメインを含み、ＶＤＥが、配列番号９の保存されたドメインを含む、項目１〜５のいずれか１項に記載のトランスジェニック植物。
（項目１３）
前記植物が、作物、モデル植物、単子葉の植物、双子葉の植物、ベンケイソウ型酸代謝（ＣＡＭ）光合成植物、Ｃ３光合成植物、Ｃ４光合成植物、一年生植物、温室植物、園芸種の顕花植物、多年生植物、スイッチグラス植物、メイズ植物、バイオマス植物、またはサトウキビ植物である、項目１〜１２のいずれか１項に記載のトランスジェニック植物。
（項目１４）
前記植物が、スイッチグラス、ススキ、ウマゴヤシ、サトウモロコシ、穀実用モロコシ、サトウキビ、エネルギー用サトウキビ、エレファントグラス、メイズ、キャッサバ、ササゲ、コムギ、オオムギ、カラスムギ、イネ、ダイズ、アブラヤシ、ベニバナ、ゴマ、タバコ、アマ、ワタ、ヒマワリ、カメリナ、Ｂｒａｓｓｉｃａ  ｎａｐｕｓ、Ｂｒａｓｓｉｃａ  ｃａｒｉｎａｔａ、Ｂｒａｓｓｉｃａ  ｊｕｎｃｅａ、トウジンビエ、アワ、他の穀物、イネ、脂肪種子、野菜作物、飼料作物、工芸作物、木質作物、およびバイオマス作物からなる群から選択される、項目１〜１２のいずれか１項に記載のトランスジェニック植物。
（項目１５）
前記植物がタバコ（Ｎｉｃｏｔｉａｎａ  ｔａｂａｃｕｍ）である、項目１〜１２のいずれか１項に記載のトランスジェニック植物。
（項目１６）
前記植物がトウモロコシ（Ｚｅａ  ｍａｙｓ）である、項目１〜１２のいずれか１項に記載のトランスジェニック植物。
（項目１７）
前記植物がイネ（Ｏｒｙｚａ  ｓａｔｉｖａ）である、項目１〜１２のいずれか１項に記載のトランスジェニック植物。
（項目１８）
前記植物がモロコシ（Ｓｏｒｇｈｕｍ  ｂｉｃｏｌｏｒ）である、項目１〜１２のいずれか１項に記載のトランスジェニック植物。
（項目１９）
前記植物がダイズ（Ｇｌｙｃｉｎｅ  ｍａｘ）である、項目１〜１２のいずれか１項に記載のトランスジェニック植物。
（項目２０）
前記植物がササゲ（Ｖｉｇｎａ  ｕｎｇｕｉｃｕｌａｔａ）である、項目１〜１２のいずれか１項に記載のトランスジェニック植物。
（項目２１）
前記植物がポプラ（Ｐｏｐｕｌｕｓ  ｓｐｐ．）である、項目１〜１２のいずれか１項に記載のトランスジェニック植物。
（項目２２）
前記植物がユーカリ（Ｅｕｃａｌｙｐｔｕｓ  ｓｐｐ．）である、項目１〜１２のいずれか１項に記載のトランスジェニック植物。
（項目２３）
前記植物がキャッサバ（Ｍａｎｉｈｏｔ  ｅｓｃｕｌｅｎｔａ）である、項目１〜１２のいずれか１項に記載のトランスジェニック植物。
（項目２４）
前記植物がオオムギ（Ｈｏｒｄｅｕｍ  ｖｕｌｇａｒｅ）である、項目１〜１２のいずれか１項に記載のトランスジェニック植物。
（項目２５）
前記植物がジャガイモ（Ｓｏｌａｎｕｍ  ｔｕｂｅｒｏｓｕｍ）である、項目１〜１２のいずれか１項に記載のトランスジェニック植物。
（項目２６）
前記植物がサトウキビ（Ｓａｃｃｈａｒｕｍ  ｓｐｐ．）である、項目１〜１２のいずれか１項に記載のトランスジェニック植物。
（項目２７）
前記植物がアルファルファ（Ｍｅｄｉｃａｇｏ  ｓａｔｉｖａ）である、項目１〜１２のいずれか１項に記載のトランスジェニック植物。
（項目２８）
前記植物が、変動光条件下のコントロール植物と比較して、変動光条件下での成長が増大する、項目１〜２７のいずれか１項に記載のトランスジェニック植物。
（項目２９）
前記植物が、変動光条件下のコントロール植物と比較して、変動光条件下での光合成効率が増大する、項目１〜２８のいずれか１項に記載のトランスジェニック植物。
（項目３０）
前記植物が、変動光条件下のコントロール植物と比較して、変動光条件下での光防御効率が改善される、項目１〜２９のいずれか１項に記載のトランスジェニック植物。
（項目３１）
前記植物が、変動光条件下のコントロール植物と比較して、変動光条件下での量子収量およびＣＯ２固定が改善される、項目１〜３０のいずれか１項に記載のトランスジェニック植物。
（項目３２）
前記植物が優良系統または優良株である、項目１〜３１のいずれか１項に記載のトランスジェニック植物。
（項目３３）
前記植物が、除草剤抵抗性、昆虫または有害生物に対する抵抗性、病害抵抗性、改変脂肪酸代謝、および／または改変炭水化物代謝を提供する少なくとも１つのさらなるポリペプチドの発現をさらに含む、項目１〜３２のいずれか１項に記載のトランスジェニック植物。
（項目３４）
発現ベクターであって、少なくとも１つの発現制御配列に作動可能に連結された、
ＰｓｂＳ、ＺＥＰ、およびＶＤＥ；
ＰｓｂＳおよびＺＥＰ；または
ＺＥＰおよびＶＤＥをコードする１つまたは複数のヌクレオチド配列を含む、発現ベクター。
（項目３５）
前記少なくとも１つの発現制御配列が、Ｒｂｃｓ１Ａ、ＧＡＰＡ−１、およびＦＢＡ２からなる群から選択されるプロモーターを含む、項目３４に記載の発現ベクター。
（項目３６）
Ｒｂｃｓ１ＡプロモーターがＺＥＰの発現を駆動し、ＧＡＰＡ−１プロモーターがＰｓｂＳの発現を駆動し、ＦＢＡ２プロモーターがＶＤＥの発現を駆動する、項目３４に記載の発現ベクター。
（項目３７）
前記発現ベクターがＴ−ＤＮＡである、項目３４〜３６のいずれか１項に記載の発現ベクター。
（項目３８）
抗生物質抵抗性を提供するポリペプチドをコードするヌクレオチド配列をさらに含む、項目３４〜３７のいずれか１項に記載の発現ベクター。
（項目３９）
発現制御配列ならびにＰｓｂＳポリペプチド、ＺＥＰポリペプチド、およびＶＤＥポリペプチドをコードするヌクレオチド配列に隣接する左境界（ＬＢ）ドメインおよび右境界（ＲＢ）ドメインをさらに含む、項目３４〜３８のいずれか１項に記載の発現ベクター。
（項目４０）
ＰｓｂＳが配列番号１のヌクレオチド配列にコードされ、ＺＥＰが配列番号２のヌクレオチド配列にコードされ、ＶＤＥが配列番号３のヌクレオチド配列にコードされる、項目３４〜３９のいずれか１項に記載の発現ベクター。
（項目４１）
ＰｓｂＳが、配列番号１に対して少なくとも９０％の同一性を有するヌクレオチド配列にコードされ、ＺＥＰが、配列番号２に対して少なくとも９０％の同一性を有するヌクレオチド配列にコードされ、ＶＤＥが、配列番号３に対して少なくとも９０％の同一性を有するヌクレオチド配列にコードされる、項目３４〜３９のいずれか１項に記載の発現ベクター。
（項目４２）
ＰｓｂＳが、配列番号１に対して少なくとも７０％の同一性を有するヌクレオチド配列にコードされ、ＺＥＰが、配列番号２に対して少なくとも７０％の同一性を有するヌクレオチド配列にコードされ、ＶＤＥが、配列番号３に対して少なくとも７０％の同一性を有するヌクレオチド配列にコードされる、項目３４〜３９のいずれか１項に記載の発現ベクター。
（項目４３）
ＰｓｂＳが、配列番号４のアミノ酸配列を有し、ＺＥＰが、配列番号５のアミノ酸配列を有し、ＶＤＥが、配列番号６のアミノ酸配列を有する、項目３４〜３９のいずれか１項に記載の発現ベクター。
（項目４４）
ＰｓｂＳが、配列番号４に少なくとも９０％同一であるアミノ酸配列を有し、ＺＥＰが、配列番号５に少なくとも９０％同一であるアミノ酸配列を有し、ＶＤＥが、配列番号６に少なくとも配列９０％同一であるアミノ酸を有する、項目３４〜３９のいずれか１項に記載の発現ベクター。
（項目４５）
ＰｓｂＳが、配列番号４に少なくとも７０％同一であるアミノ酸配列を有し、ＺＥＰが、配列番号５に少なくとも７０％同一であるアミノ酸配列を有し、ＶＤＥが、配列番号６に少なくとも配列７０％同一であるアミノ酸を有する、項目３４〜３９のいずれか１項に記載の発現ベクター。
（項目４６）
ＰｓｂＳが、配列番号７の保存されたドメインを含み、ＺＥＰが、配列番号８の保存されたドメインを含み、ＶＤＥが、配列番号９の保存されたドメインを含む、項目３４〜３９のいずれか１項に記載の発現ベクター。
（項目４７）
項目３４〜４６のいずれか１項に記載の発現ベクターを含む細菌細胞。
（項目４８）
項目３４〜４６のいずれか１項に記載の発現ベクターを含むアグロバクテリウム細胞。
（項目４９）
項目３４〜４６のいずれか１項に記載の発現ベクターを含むトランスジェニック植物。
（項目５０）
項目３４〜４６のいずれか１項に記載の発現ベクターを含む種子。
（項目５１）
項目５０に記載の種子由来の子孫植物。
（項目５２）
変動光条件下で植物の成長を増大させる方法であって、前記植物中でのＰｓｂＳ、ＺＥＰ、およびＶＤＥからなる群から選択される２つまたはそれを超えるポリペプチドの発現を増大させる工程であって、それにより、コントロール植物と比較して前記２つまたはそれを超えるポリペプチドの発現が増大した植物が産生される、発現を増大させる工程を含む、方法。
（項目５３）
変動光条件下で植物における光合成効率を増大させる方法であって、前記植物中でのＰｓｂＳ、ＺＥＰ、およびＶＤＥからなる群から選択される２つまたはそれを超えるポリペプチドの発現を増大させる工程であって、それにより、コントロール植物と比較して前記２つまたはそれを超えるポリペプチドの発現が増大した植物が産生される、発現を増大させる工程を含む、方法。
（項目５４）
変動光条件下で植物における光防御効率を改善する方法であって、前記植物中でのＰｓｂＳ、ＺＥＰ、およびＶＤＥからなる群から選択される２つまたはそれを超えるポリペプチドの発現を増大させる工程であって、それにより、コントロール植物と比較して前記２つまたはそれを超えるポリペプチドの発現が増大した植物が産生される、発現を増大させる工程を含む、方法。
（項目５５）
変動光条件下で植物における量子収率およびＣＯ２固定を改善する方法であって、前記植物中でのＰｓｂＳ、ＺＥＰ、およびＶＤＥからなる群から選択される２つまたはそれを超えるポリペプチドの発現を増大させる工程であって、それにより、コントロール植物と比較して前記２つまたはそれを超えるポリペプチドの発現が増大した植物が産生される、発現を増大させる工程を含む、方法。
（項目５６）
植物における非光化学的消光（ＮＰＱ）の緩和速度を増大させる方法であって、植物中での
ＰｓｂＳ、ＺＥＰ、およびＶＤＥ；
ＰｓｂＳおよびＺＥＰ；または
ＺＥＰおよびＶＤＥの発現を増大させる工程であって、それにより、コントロール植物と比較して２つまたはそれを超えるポリペプチドの発現が増大した植物が産生される、発現を増大させる工程を含む、方法。
（項目５７）
ＰｓｂＳおよびＶＤＥの発現を増大させる工程を含む、項目５２〜５５のいずれか１項に記載の方法。
（項目５８）
ＰｓｂＳおよびＺＥＰの発現を増大させる工程を含む、項目５２〜５６のいずれか１項に記載の方法。
（項目５９）
ＺＥＰおよびＶＤＥの発現を増大させる工程を含む、項目５２〜５６のいずれか１項に記載の方法。
（項目６０）
ＰｓｂＳ、ＺＥＰ、およびＶＤＥの発現を増大させる工程を含む、項目５２〜５６のいずれか１項に記載の方法。
（項目６１）
ＰｓｂＳ、ＺＥＰ、および／またはＶＤＥの発現を、ＰｓｂＳ、ＺＥＰ、および／またはＶＤＥをコードする１つまたは複数の異種ヌクレオチド配列の発現によって増大させる、項目５２〜６０のいずれか１項に記載の方法。
（項目６２）
ＰｓｂＳ、ＺＥＰ、および／またはＶＤＥの発現を、ＰｓｂＳ、ＺＥＰ、および／またはＶＤＥのプロモーターの改変によって増大させる、項目５２〜６０のいずれか１項に記載の方法。
（項目６３）
プロモーターをゲノム編集システムによって改変する、項目６２に記載の方法。
（項目６４）
前記ゲノム編集システムがＣＲＩＳＰＲである、項目６３に記載の方法。
（項目６５）
変動光条件下での成長特性を改善するための植物を選択する方法であって、
（ａ）植物集団を提供する工程；
（ｂ）ＰｓｂＳ、ＺＥＰ、およびＶＤＥのうちのいずれかの活性を増大させるように前記植物を改変する工程；
（ｂ）前記植物における変動光条件下での非光化学的消光（ＮＰＱ）レベルを検出する工程；
（ｃ）前記植物における変動光条件下でのＮＰＱレベルを、変動光条件下でのＮＰＱのコントロールレベルと比較する工程；および
（ｄ）前記植物を高光強度から低光強度へ移行した場合にＮＰＱ緩和速度が増大した植物を選択する工程であって；それにより、変動光条件下での成長特性が改善された植物が選択される、選択する工程
を含む、方法。
（項目６６）
前記ＮＰＱのコントロールレベルが、前記集団におけるＮＰＱの最低レベル、前記集団におけるＮＰＱの中程度のレベル、前記集団におけるＮＰＱの平均レベル、およびコントロール植物におけるＮＰＱレベルからなる群から選択される、項目６５に記載の方法。
（項目６７）
前記植物を、変異原を用いてＰｓｂＳ、ＺＥＰ、および／またはＶＤＥにおける１つまたは複数の変異を誘導することによって改変する、項目６５〜６６のいずれか１項に記載の方法。
（項目６８）
前記変異原がエタンメチルスルホナート（ＥＭＳ）である、項目６７に記載の方法。
（項目６９）
前記植物を、トランスジェニック技術を使用して異種のＰｓｂＳ、ＺＥＰ、および／またはＶＤＥを導入することによって改変する、項目６５〜６６のいずれか１項に記載の方法。
（項目７０）
前記植物を、ゲノム編集システムを使用してＰｓｂＳ、ＺＥＰ、および／またはＶＤＥのプロモーターを改変することによって改変する、項目６５〜６６のいずれか１項に記載の方法。
（項目７１）
前記ゲノム編集システムがＣＲＩＳＰＲである、項目７０に記載の方法。
（項目７２）
変動光条件下での成長特性の改善に関連する多型をスクリーニングする方法であって、
（ａ）植物集団を提供する工程；
（ｂ）前記植物においてＰｓｂＳ、ＺＥＰ、およびＶＤＥのうちのいずれかを制御および／またはコードするヌクレオチド配列を得る工程；
（ｃ）前記植物においてＰｓｂＳ、ＺＥＰ、およびＶＤＥのうちのいずれかを制御および／またはコードするヌクレオチド配列内の１つまたは複数の多型を得る工程；
（ｄ）前記植物における高光強度から低光強度への移行の際の非光化学的消光（ＮＰＱ）緩和速度を検出する工程；
（ｅ）前記植物集団における多型のＮＰＱ緩和速度との関連を決定するために統計解析を行う工程；および
（ｆ）前記ＮＰＱ緩和速度と統計的に有意に関連する多型を選択する工程であって；それにより、変動光条件下での成長特性の改善に関連する多型が選択される、選択する工程
を含む、方法。
（項目７３）
前記多型が一塩基多型（ＳＮＰ）である、項目７２に記載の方法。
（項目７４）
前記多型が、ＰｓｂＳ、ＺＥＰ、および／またはＶＤＥのプロモーター内に存在する、項目７２〜７３のいずれか１項に記載の方法。
（項目７５）
前記多型を配列決定によって検出する、項目７２〜７４のいずれか１項に記載の方法。
（項目７６）
前記多型をゲル電気泳動によって検出する、項目７２〜７４のいずれか１項に記載の方法。
（項目７７）
前記多型を、変動光条件下での成長特性が改善されている植物を選択するための植物集団のスクリーニングのためにさらに使用する、項目７２〜７６のいずれか１項に記載の方法。
（項目７８）
前記多型を、変動光条件下での植物の成長特性を改善するためのＰｓｂＳ、ＺＥＰ、および／またはＶＤＥにおけるゲノム編集のための標的としてさらに使用する、項目７２〜７６のいずれか１項に記載の方法。
（項目７９）
前記成長特性の改善が、成長の改善、光合成効率の改善、光防御効率の改善、量子収量の改善、およびＣＯ２固定の改善からなる群から選択される、項目６５〜７８のいずれか１項に記載の方法。
（項目８０）
植物におけるＮＰＱを、クロロフィル蛍光の測定によって検出する、項目６５〜７９のいずれか１項に記載の方法。
（項目８１）
ＰｓｂＳが、配列番号１のヌクレオチド配列にコードされ、ＺＥＰが、配列番号２のヌクレオチド配列にコードされ、ＶＤＥが、配列番号３のヌクレオチド配列にコードされる、項目５２〜８０のいずれか１項に記載の方法。
（項目８２）
ＰｓｂＳが、配列番号１に対して少なくとも９０％の同一性を有するヌクレオチド配列にコードされ、ＺＥＰが、配列番号２に対して少なくとも９０％の同一性を有するヌクレオチド配列にコードされ、ＶＤＥが、配列番号３に対して少なくとも９０％の同一性を有するヌクレオチド配列にコードされる、項目５２〜８０のいずれか１項に記載の方法。
（項目８３）
ＰｓｂＳが、配列番号１に対して少なくとも７０％の同一性を有するヌクレオチド配列にコードされ、ＺＥＰが、配列番号２に対して少なくとも７０％の同一性を有するヌクレオチド配列にコードされ、ＶＤＥが、配列番号３に対して少なくとも７０％の同一性を有するヌクレオチド配列にコードされる、項目５２〜８０のいずれか１項に記載の方法。
（項目８４）
ＰｓｂＳが、配列番号４のアミノ酸配列を有し、ＺＥＰが、配列番号５のアミノ酸配列を有し、ＶＤＥが、配列番号６のアミノ酸配列を有する、項目５２〜８０のいずれか１項に記載の方法。
（項目８５）
ＰｓｂＳが、配列番号４に少なくとも９０％同一であるアミノ酸配列を有し、ＺＥＰが、配列番号５に少なくとも９０％同一であるアミノ酸配列を有し、ＶＤＥが、配列番号６に少なくとも９０％同一であるアミノ酸配列を有する、項目５２〜８０のいずれか１項に記載の方法。
（項目８６）
ＰｓｂＳが、配列番号４に少なくとも７０％同一であるアミノ酸配列を有し、ＺＥＰが、配列番号５に少なくとも７０％同一であるアミノ酸配列を有し、ＶＤＥが、配列番号６に少なくとも７０％同一であるアミノ酸配列を有する、項目５２〜８０のいずれか１項に記載の方法。
（項目８７）
ＰｓｂＳが、配列番号７の保存されたドメインを含み、ＺＥＰが、配列番号８の保存されたドメインを含み、ＶＤＥが、配列番号９の保存されたドメインを含む、項目５２〜８０のいずれか１項に記載の方法。
（項目８８）
前記植物が、作物、モデル植物、単子葉の植物、双子葉の植物、ベンケイソウ型酸代謝（ＣＡＭ）光合成植物、Ｃ３光合成植物、Ｃ４光合成植物、一年生植物、温室植物、園芸種の顕花植物、多年生植物、スイッチグラス植物、メイズ植物、バイオマス植物、またはサトウキビ植物である、項目５２〜８７のいずれか１項に記載の方法。
（項目８９）
前記植物が、スイッチグラス、ススキ、ウマゴヤシ、サトウモロコシ、穀実用モロコシ、サトウキビ、エネルギー用サトウキビ、エレファントグラス、メイズ、キャッサバ、ササゲ、コムギ、オオムギ、カラスムギ、イネ、ダイズ、アブラヤシ、ベニバナ、ゴマ、タバコ、アマ、ワタ、ヒマワリ、カメリナ、Ｂｒａｓｓｉｃａ  ｎａｐｕｓ、Ｂｒａｓｓｉｃａ  ｃａｒｉｎａｔａ、Ｂｒａｓｓｉｃａ  ｊｕｎｃｅａ、トウジンビエ、アワ、他の穀物、イネ、脂肪種子、野菜作物、飼料作物、工芸作物、木質作物、およびバイオマス作物からなる群から選択される、項目５２〜８７のいずれか１項に記載の方法。
（項目９０）
前記植物がタバコ（Ｎｉｃｏｔｉａｎａ  ｔａｂａｃｕｍ）である、項目５２〜８７のいずれか１項に記載の方法。
（項目９１）
前記植物がトウモロコシ（Ｚｅａ  ｍａｙｓ）である、項目５２〜８７のいずれか１項に記載の方法。
（項目９２）
前記植物がイネ（Ｏｒｙｚａ  ｓａｔｉｖａ）である、項目５２〜８７のいずれか１項に記載のトランスジェニック植物。
（項目９３）
前記植物がモロコシ（Ｓｏｒｇｈｕｍ  ｂｉｃｏｌｏｒ）である、項目５２〜８７のいずれか１項に記載の方法。
（項目９４）
前記植物がダイズ（Ｇｌｙｃｉｎｅ  ｍａｘ）である、項目５２〜８７のいずれか１項に記載の方法。
（項目９５）
前記植物がササゲ（Ｖｉｇｎａ  ｕｎｇｕｉｃｕｌａｔａ）である、項目５２〜８７のいずれか１項に記載の方法。
（項目９６）
前記植物がポプラ（Ｐｏｐｕｌｕｓ  ｓｐｐ．）である、項目５２〜８７のいずれか１項に記載の方法。
（項目９７）
前記植物がユーカリ（Ｅｕｃａｌｙｐｔｕｓ  ｓｐｐ．）である、項目５２〜８７のいずれか１項に記載の方法。
（項目９８）
前記植物がキャッサバ（Ｍａｎｉｈｏｔ  ｅｓｃｕｌｅｎｔａ）である、項目５２〜８７のいずれか１項に記載の方法。
（項目９９）
前記植物がオオムギ（Ｈｏｒｄｅｕｍ  ｖｕｌｇａｒｅ）である、項目５２〜８７のいずれか１項に記載の方法。
（項目１００）
前記植物がジャガイモ（Ｓｏｌａｎｕｍ  ｔｕｂｅｒｏｓｕｍ）である、項目５２〜８７のいずれか１項に記載の方法。
（項目１０１）
前記植物がサトウキビ（Ｓａｃｃｈａｒｕｍ  ｓｐｐ．）である、項目５２〜８７のいずれか１項に記載の方法。
（項目１０２）
前記植物がアルファルファ（Ｍｅｄｉｃａｇｏ  ｓａｔｉｖａ）である、項目５２〜８７のいずれか１項に記載の方法。
（項目１０３）
ＶＤＥの転写物レベルがコントロール植物と比較して３倍増大し、ＰｓｂＳの転写物レベルがコントロール植物と比較して３倍増大し、ＺＥＰの転写物レベルがコントロール植物と比較して８倍増大する、項目１〜３３のいずれか１項に記載のトランスジェニック植物。
（項目１０４）
ＶＤＥの転写物レベルがコントロール植物と比較して１０倍増大し、ＰｓｂＳの転写物レベルがコントロール植物と比較して３倍増大し、ＺＥＰの転写物レベルがコントロール植物と比較して６倍増大する、項目１〜３３のいずれか１項に記載のトランスジェニック植物。
（項目１０５）
ＶＤＥの転写物レベルがコントロール植物と比較して４倍増大し、ＰｓｂＳの転写物レベルがコントロール植物と比較して１．２倍増大し、ＺＥＰの転写物レベルがコントロール植物と比較して７倍増大する、項目１〜３３のいずれか１項に記載のトランスジェニック植物。
（項目１０６）
ＶＤＥのタンパク質レベルがコントロール植物と比較して１６倍増大し、ＰｓｂＳのタンパク質レベルがコントロール植物と比較して２倍増大し、ＺＥＰのタンパク質レベルがコントロール植物と比較して８０倍増大する、項目１〜３３のいずれか１項に記載のトランスジェニック植物。
（項目１０７）
ＶＤＥのタンパク質レベルがコントロール植物と比較して３０倍増大し、ＰｓｂＳのタンパク質レベルがコントロール植物と比較して４倍増大し、ＺＥＰのタンパク質レベルがコントロール植物と比較して７４倍増大する、項目１〜３３のいずれか１項に記載のトランスジェニック植物。
（項目１０８）
ＶＤＥのタンパク質レベルがコントロール植物と比較して４７倍増大し、ＰｓｂＳのタンパク質レベルがコントロール植物と比較して３倍増大し、ＺＥＰのタンパク質レベルがコントロール植物と比較して７５倍増大する、項目１〜３３のいずれか１項に記載のトランスジェニック植物。
（項目１０９）
ＶＤＥ、ＰｓｂＳおよびＺＥＰの間のコントロール植物と比較した転写物レベルの増大が、３：３：８、１０：３：６、および４：１．２：７からなる群から選択される比を有する、項目１〜３３のいずれか１項に記載のトランスジェニック植物。
（項目１１０）
ＶＤＥ、ＰｓｂＳおよびＺＥＰの間のコントロール植物と比較したタンパク質レベルの増大が、１６：２：８０、３０：４：７４、４７：３：７５からなる群から選択される比を有する、項目１〜３３のいずれか１項に記載のトランスジェニック植物。
（項目１１１）
コントロール植物と比較したＶＤＥの転写物レベルの増大が約３倍から約１０倍であり、コントロール植物と比較したＰｓｂＳの転写物レベルの増大が約１．２倍から約３倍であり、コントロール植物と比較したＺＥＰの転写物レベルの増大が約６倍から約８倍である、項目１〜３３のいずれか１項に記載のトランスジェニック植物。
（項目１１２）
コントロール植物と比較したＶＤＥのタンパク質レベルの増大が約１６倍から約４７倍であり、コントロール植物と比較したＰｓｂＳのタンパク質レベルの増大が約２倍から約４倍であり、コントロール植物と比較したＺＥＰのタンパク質レベルの増大が約７４倍から約８０倍である、項目１〜３３のいずれか１項に記載のトランスジェニック植物。
（項目１１３）
発現を増大させることが、コントロール植物と比較して前記植物におけるＶＤＥの転写物レベルを３倍増大させることを含み、発現を増大させることが、コントロール植物と比較して前記植物におけるＰｓｂＳの転写物レベルを３倍増大させることを含み、発現を増大させることが、コントロール植物と比較して前記植物におけるＺＥＰの転写物レベルを８倍増大させることを含む、項目５２〜６４および８１〜１０２のいずれか１項に記載の方法。
（項目１１４）
発現を増大させることが、コントロール植物と比較して前記植物におけるＶＤＥの転写物レベルを１０倍増大させることを含み、発現を増大させることが、コントロール植物と比較して前記植物におけるＰｓｂＳの転写物レベルを３倍増大させることを含み、発現を増大させることが、コントロール植物と比較して前記植物におけるＺＥＰの転写物レベルを６倍増大させることを含む、項目５２〜６４および８１〜１０２のいずれか１項に記載の方法。
（項目１１５）
発現を増大させることが、コントロール植物と比較して前記植物におけるＶＤＥの転写物レベルを４倍増大させることを含み、発現を増大させることが、コントロール植物と比較して前記植物におけるＰｓｂＳの転写物レベルを１．２倍増大させることを含み、発現を増大させることが、コントロール植物と比較して前記植物におけるＺＥＰの転写物レベルを７倍増大させることを含む、項目５２〜６４および８１〜１０２のいずれか１項に記載の方法。
（項目１１６）
発現を増大させることが、コントロール植物と比較して前記植物におけるＶＤＥのタンパク質レベルを１６倍増大させることを含み、発現を増大させることが、コントロール植物と比較して前記植物におけるＰｓｂＳのタンパク質レベルを２倍増大させることを含み、発現を増大させることが、コントロール植物と比較して前記植物におけるＺＥＰのタンパク質レベルを８０倍増大させることを含む、項目５２〜６４および８１〜１０２のいずれか１項に記載の方法。
（項目１１７）
発現を増大させることが、コントロール植物と比較して前記植物におけるＶＤＥのタンパク質レベルを３０倍増大させることを含み、発現を増大させることが、コントロール植物と比較して前記植物におけるＰｓｂＳのタンパク質レベルを４倍増大させることを含み、発現を増大させることが、コントロール植物と比較して前記植物におけるＺＥＰのタンパク質レベルを７４倍増大させることを含む、項目５２〜６４および８１〜１０２のいずれか１項に記載の方法。
（項目１１８）
発現を増大させることが、コントロール植物と比較して前記植物におけるＶＤＥのタンパク質レベルを４７倍増大させることを含み、発現を増大させることが、コントロール植物と比較して前記植物におけるＰｓｂＳのタンパク質レベルを３倍増大させることを含み、発現を増大させることが、コントロール植物と比較して前記植物におけるＺＥＰのタンパク質レベルを７５倍増大させることを含む、項目５２〜６４および８１〜１０２のいずれか１項に記載の方法。
（項目１１９）
発現を増大させることが、コントロール植物と比較して前記植物におけるＶＤＥ、ＰｓｂＳおよびＺＥＰの転写物レベルを３：３：８、１０：３：６、および４：１．２：７からなる群から選択される比で増大させることを含む、項目５２〜６４および８１〜１０２のいずれか１項に記載の方法。
（項目１２０）
発現を増大させることが、コントロール植物と比較して前記植物におけるＶＤＥ、ＰｓｂＳおよびＺＥＰのタンパク質レベルを１６：２：８０、３０：４：７４、および４７：３：７５からなる群から選択される比で増大させることを含む、項目５２〜６４および８１〜１０２のいずれか１項に記載の方法。
（項目１２１）
発現を増大させることが、コントロール植物と比較して前記植物におけるＶＤＥの転写物レベルを約３倍から約１０倍増大させることを含み、発現を増大させることが、コントロール植物と比較して前記植物におけるＰｓｂＳの転写物レベルを約１．２倍から約３倍増大させることを含み、発現を増大させることが、コントロール植物と比較して前記植物におけるＺＥＰの転写物レベルを約６倍から約８倍増大させることを含む、項目５２〜６４および８１〜１０２のいずれか１項に記載の方法。
（項目１２２）
発現を増大させることが、コントロール植物と比較して前記植物におけるＶＤＥのタンパク質レベルを約１６倍から約４７倍増大させることを含み、発現を増大させることが、コントロール植物と比較して前記植物におけるＰｓｂＳのタンパク質レベルを約２倍から約４倍増大させることを含み、発現を増大させることが、コントロール植物と比較して前記植物におけるＺＥＰのタンパク質レベルを約７４倍から約８０倍増大させることを含む、項目５２〜６４および８１〜１０２のいずれか１項に記載の方法。