【手続補正書】
【提出日】令和2年2月17日(2020.2.17)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
―  デジタル画像（106.1〜106-4;106.5〜106.7）の1つまたは複数のセット（112;113）の各々について、空間DBMS（316）の空間データベース（318）にセットIDを格納する工程（702）であって、各デジタル画像セットの前記デジタル画像が、IHC組織サンプル（100）の同じ層（102）または隣接する層（102;110;108）を示す、工程（702）と、
―  前記デジタル画像の各々について、複数の空間データオブジェクトを前記空間データベースに前記セットIDと関連付けて格納する工程（704）であって、各空間データオブジェクトが点、線、多角形、またはそれらの組み合わせであり、かつ前記組織サンプルの生物医学的特徴を表し、前記データオブジェクトによって表される前記組織サンプルの前記生物医学的特徴が生物医学的特徴の少なくとも2つの異なるタイプに属する、工程（704）と、
―  前記空間DBMSによって、前記1つまたは複数のセットに含まれる前記デジタル画像の前記空間データオブジェクトをカバーする少なくとも1つの空間インデックスを作成する工程（706）であって、前記デジタル画像の1つまたは複数のセットの各々の前記少なくとも2つの異なる生物医学的特徴のタイプの各々について、それぞれの空間インデックスまたは少なくとも1つの空間インデックスのパーティションを作成する、工程（706）と、
―  前記1つまたは複数のデジタル画像セットのうちの1つを選択する工程（708）と、
―  前記空間DBMSによって、前記選択されたデジタル画像セットの2つ以上のデジタル画像の空間データオブジェクトの相対位置を決定するために前記少なくとも1つの空間インデックスに対して空間データベース操作を適用する工程（710）と、
―  前記相対位置を、前記2つ以上のデジタル画像の前記空間データオブジェクトによって表される前記組織サンプルの生物医学的特徴の距離および/または相対位置を決定するための入力として提供する工程（712）と
を含む、IHC組織サンプル（100）を解析するための画像解析方法。
【請求項２】
前記空間データオブジェクトの各々が、前記空間データベースの表のそれぞれの行にデータレコードとして格納される、請求項1記載の画像解析方法。
【請求項３】
前記空間インデックスが、
―  R木インデックス、
―  R+木インデックス、
―  R*木インデックス、
―  ヒルベルトR木インデックス、
―  四分木インデックス、
―  グリッド空間インデックス、
―  Zオーダインデックス、
―  UB木インデックス、
―  X木インデックス、
―  Kd木インデックス、
―  m木インデックス、
―  バイナリ空間分割（BSP木）インデックス
を含む群より選択される、請求項1または2記載の画像解析方法。
【請求項４】
前記少なくとも2つのタイプが、特定の細胞型、特定の細胞小器官型、特定のクラスター型の細胞クラスター、複数の細胞にまたがる特定の解剖学的構造物、特定の組織型、腫瘍組織を含む群より選択される、請求項1〜3のいずれか一項記載の画像解析方法。
【請求項５】
―  前記1つもしくは複数のセットの前記デジタル画像の一部もしくは全部における生物学的特徴のうちの1つもしくは複数を自動的に同定する工程であって、前記同定が、特定のタイプの生物学的特徴を表す前記デジタル画像の画素領域を自動的に分類するためのブロブ抽出およびブロブ分類操作を自動的に行うことを含む、工程、ならびに/または
―  前記空間DBMS（316）によって、前記1つもしくは複数のセットの前記デジタル画像の一部もしくは全部における前記生物学的特徴のうちの1つもしくは複数のさらなる生物学的特徴を受け取る工程であって、前記受け取られるさらなる生物学的特徴が、特定のタイプの生物学的特徴を表しているとして手動で分類された前記デジタル画像の画素領域である、工程、
―  前記自動的に同定されたおよび/もしくは手動で分類された生物医学的特徴から空間データオブジェクトを自動的に抽出し、前記抽出された空間データオブジェクトについて空間データオブジェクトを格納する前記工程を行う工程
をさらに含む、請求項1〜4のいずれか一項記載の画像解析方法。
【請求項６】
―  前記1つまたは複数のデジタル画像セットの各々の前記デジタル画像の各々について、それぞれの空間インデックスを作成するかまたは前記少なくとも1つの空間インデックスのパーティションを作成する工程
をさらに含む、請求項1〜5のいずれか一項記載の画像解析方法。
【請求項７】
前記空間データオブジェクトの相対位置の前記解析を行う前に前処理操作を行う工程をさらに含み、前記前処理が、
―  前記空間DBMSによって、前記デジタル画像の前記空間データオブジェクトのエリアサイズ、幾何中心および/または最小外接矩形（minimum bounding rectangle）を自動的に事前計算すること、ならびに
―  前記事前計算されたエリアサイズ、幾何中心および/または最小外接矩形を、前記生物医学的特徴の距離および/または相対位置を決定するために使用すること
を含む、請求項1〜6のいずれか一項記載の画像解析方法。
【請求項８】
―  画像解析アプリケーションプログラムによって、前記デジタル画像セットの各々を生成する工程であって、IHC組織サンプルの同じ層または隣接する層を示す複数のデジタル画像を共通の座標系内に位置合わせするための画像位置合わせ操作を行うことを含む、工程
をさらに含む、請求項1〜7のいずれか一項記載の画像解析方法。
【請求項９】
前記デジタル画像セットのうちの少なくとも1つの前記生成が、
―  IHC組織サンプルの同じ層を示す複数のデジタル画像を生成するためのスペクトルアンミキシング操作を行うことであって、前記少なくとも1つのセットの前記デジタル画像の各々が異なる色に対応する、こと
を含む、請求項8記載の画像解析方法。
【請求項１０】
複数のデジタル画像セットのセットIDおよび前記複数のデジタル画像セットから導出された空間データオブジェクトが前記空間データベースに格納され、
―  前記デジタル画像セットのうちの1つもしくは複数の第1のデジタル画像セットが、治療前の腫瘍生検サンプルのデジタル画像をそれぞれ含み、かつ
―  前記デジタル画像セットのうちの1つもしくは複数の第2のデジタル画像セットが、治療中の腫瘍生検サンプルのデジタル画像をそれぞれ含み、かつ/または
―  前記デジタル画像セットのうちの1つもしくは複数の第3のデジタル画像セットが、治療後の腫瘍生検サンプルのデジタル画像をそれぞれ含む、
請求項1〜9のいずれか一項記載の画像解析方法。
【請求項１１】
複数のデジタル画像セットのセットIDおよび前記複数のデジタル画像セットから導出された空間データオブジェクトが前記空間データベースに格納され、
前記デジタル画像セットのうちの第4のデジタル画像セットが、特定の状態を有する人の第1のコホートの組織サンプルのデジタル画像を含み、前記デジタル画像セットのうちの第5のデジタル画像セットが、特定の状態を有さない人の第2のコホートの組織サンプルのデジタル画像を含み、
前記方法が、
―  前記第4のデジタル画像セットおよび前記第5のデジタル画像セットを選択し、前記空間DBMSによって、前記第4のデジタル画像セットおよび第5のデジタル画像セットの各々に対して前記解析を行う工程、
―  前記第4のデジタル画像セット内の前記デジタル画像の2つ以上の異なる生物学的特徴を表す空間データオブジェクトの相対位置の第1の統計的平均値を計算する工程、
―  前記第5のデジタル画像セット内の前記デジタル画像の前記2つ以上の異なる生物学的特徴を表す空間データオブジェクトの相対位置の第2の統計的平均値を計算する工程、ならびに
―  前記第1の人コホートと前記第2の人コホートとの間の統計的有意差を同定するために前記第1の統計的平均値と前記第2の統計的平均値を自動的に比較する工程
を含む、請求項1〜10のいずれか一項記載の画像解析方法。
【請求項１２】
前記空間データオブジェクトの相対位置を解析するための前記空間データベース操作が、
―  前記選択されたセット内の前記デジタル画像のうちの1つのデジタル画像の第1の領域が同じセットの別のデジタル画像の第2の領域に完全に含まれているかどうか判定すること、
―  前記選択されたセット内の前記デジタル画像のうちの1つのデジタル画像の第1の領域が同じセットの別のデジタル画像の第2の領域とオーバーラップしているかどうか判定すること、
―  前記選択されたセット内の前記デジタル画像のうちの1つのデジタル画像における第1のタイプの生物学的特徴を表す空間データオブジェクトの、同じセットの前記デジタル画像のうちの別のデジタル画像における別のタイプの生物学的特徴を表す空間データオブジェクトに対する空間距離を決定すること、
―  前記選択されたセット内の前記デジタル画像のうちの1つのデジタル画像における第1のタイプの生物学的特徴を表す空間データオブジェクトの、同じセットの前記デジタル画像のうちの別のデジタル画像における別のタイプの生物学的特徴を表す空間データオブジェクトの位置に対する相対位置のパターンを決定すること
を含む群より選択される、請求項1〜11のいずれか一項記載の画像解析方法。
【請求項１３】
―  前記空間DBMSによって、前記デジタル画像セットのうちの1つまたは複数の前記デジタル画像のうちの1つまたは複数の空間データオブジェクトの密度を計算する工程、および
―  前記空間DBMSによってまたは画像解析アプリケーションプログラムによって前記空間データオブジェクトを複数の既定の生物医学的特徴クラスのうちの1つに自動的に分類するために前記計算された密度を解析する工程
をさらに含む、請求項1〜12のいずれか一項記載の画像解析方法。
【請求項１４】
空間データベース（318）を備えた空間DBMS（316）を含み、かつプロセッサ（328）を含む画像解析システムであって、前記プロセッサが、
―  デジタル画像（106.1〜106-4;106.5〜106.7）の1つまたは複数のセット（112;113）の各々について、空間DBMS（316）の空間データベース（318）にセットIDを格納すること（702）であって、各デジタル画像セットの前記デジタル画像が、IHC組織サンプルの同じ層（102）または隣接する層（102;110;108）を示す、こと、
―  前記デジタル画像の各々について、複数の空間データオブジェクトを前記空間データベースに前記セットIDと関連付けて格納すること（704）であって、各空間データオブジェクトが点、線、多角形、またはそれらの組み合わせであり、かつ前記組織サンプルの生物医学的特徴を表し、前記データオブジェクトによって表される前記組織サンプルの前記生物医学的特徴が生物医学的特徴の少なくとも2つの異なるタイプに属する、こと、
―  前記1つまたは複数のセットに含まれる前記デジタル画像の前記空間データオブジェクトをカバーする少なくとも1つの空間インデックスを作成するための前記空間DBMSの第1のプログラムルーチンを実行すること（706）であって、前記デジタル画像の1つまたは複数のセットの各々の前記少なくとも2つの異なる生物医学的特徴のタイプの各々について、それぞれの空間インデックスまたは少なくとも1つの空間インデックスのパーティションを作成する、こと、
―  前記1つまたは複数のデジタル画像セットのうちの1つの選択を受け取ること（708）、
―  前記選択されたデジタル画像セットの2つ以上のデジタル画像の空間データオブジェクトの相対位置を決定するために前記少なくとも1つの空間インデックスに対して空間データベース操作を適用するため、ならびに前記相対位置を、前記2つ以上のデジタル画像の前記空間データオブジェクトによって表される前記組織サンプルの生物医学的特徴の距離および/または相対位置を決定するための入力として提供する（712）ための、前記空間DBMSの第2のプログラムルーチンを実行すること（710）
のために構成されている、画像解析システム。
【請求項１５】
―  空間データベースであって、
○  各デジタル画像セットのデジタル画像がIHC組織サンプルの同じ層（102）または隣接する層（102;110;108）を示す、デジタル画像（106.1〜106-4;106.5〜106.7）の1つまたは複数のセット（112;113）の少なくともセットIDと、
○  各空間データオブジェクトが点、線、多角形、またはそれらの組み合わせでありかつ前記組織サンプルの生物医学的特徴を表す、前記デジタル画像の各々についての複数の空間データオブジェクトであって、前記データオブジェクトによって表される前記組織サンプルの前記生物医学的特徴が生物医学的特徴の少なくとも2つの異なるタイプに属する、複数の空間データオブジェクトと
を含む空間データベースと、
―  前記1つまたは複数のセットに含まれる前記デジタル画像の前記空間データオブジェクトをカバーする少なくとも1つの空間インデックスを作成するための第1のプログラムルーチンであって、前記デジタル画像の1つまたは複数のセットの各々の前記少なくとも2つの異なる生物医学的特徴のタイプの各々について、それぞれの空間インデックスまたは少なくとも1つの空間インデックスのパーティションを作成する、第1のプログラムルーチンと、
―  前記1つまたは複数のデジタル画像セットのうちの選択されたデジタル画像セットの2つ以上のデジタル画像の空間データオブジェクトの相対位置を決定するために前記少なくとも1つの空間インデックスに対して空間データベース操作を適用するため、ならびに前記相対位置を、前記2つ以上のデジタル画像の前記空間データオブジェクトによって表される前記組織サンプルの生物医学的特徴の距離および/または相対位置を決定するための入力として提供するための、第2のプログラムルーチンと
を含む、空間データベース管理システム。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００５６
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００５６】
本明細書で使用される「セットID」とは、データベース内のデジタル画像セットを一意に識別する識別子である。
[本発明1001]
―  デジタル画像（106.1〜106-4;106.5〜106.7）の1つまたは複数のセット（112;113）の各々について、空間DBMS（316）の空間データベース（318）にセットIDを格納する工程（702）であって、各デジタル画像セットの前記デジタル画像が、IHC組織サンプル（100）の同じ層（102）または隣接する層（102;110;108）を示す、工程（702）と、
―  前記デジタル画像の各々について、複数の空間データオブジェクトを前記空間データベースに前記セットIDと関連付けて格納する工程（704）であって、各空間データオブジェクトが点、線、多角形、またはそれらの組み合わせであり、かつ前記組織サンプルの生物医学的特徴を表す、工程（704）と、
―  前記空間DBMSによって、前記1つまたは複数のセットに含まれる前記デジタル画像の前記空間データオブジェクトをカバーする少なくとも1つの空間インデックスを作成する工程（706）と、
―  前記1つまたは複数のデジタル画像セットのうちの1つを選択する工程（708）と、
―  前記空間DBMSによって、前記選択されたデジタル画像セットの2つ以上のデジタル画像の空間データオブジェクトの相対位置を決定するために前記少なくとも1つの空間インデックスに対して空間データベース操作を適用する工程（710）と、
―  前記相対位置を、前記2つ以上のデジタル画像の前記空間データオブジェクトによって表される前記組織サンプルの生物医学的特徴の距離および/または相対位置を決定するための入力として提供する工程（712）と
を含む、IHC組織サンプル（100）を解析するための画像解析方法。
[本発明1002]
前記空間データオブジェクトの各々が、前記空間データベースの表のそれぞれの行にデータレコードとして格納される、本発明1001の画像解析方法。
[本発明1003]
前記空間インデックスが、
―  R木インデックス、
―  R+木インデックス、
―  R*木インデックス、
―  ヒルベルトR木インデックス、
―  四分木インデックス、
―  グリッド空間インデックス、
―  Zオーダインデックス、
―  UB木インデックス、
―  X木インデックス、
―  Kd木インデックス、
―  m木インデックス、
―  バイナリ空間分割（BSP木）インデックス
を含む群より選択される、前記本発明のいずれかの画像解析方法。
[本発明1004]
前記解析された2つ以上のデータオブジェクトによって表される前記組織サンプルの前記生物医学的特徴が、生物医学的特徴の少なくとも2つの異なるタイプに属する、前記本発明のいずれかの画像解析方法。
[本発明1005]
前記少なくとも2つのタイプが、特定の細胞型、特定の細胞小器官型、特定のクラスター型の細胞クラスター、複数の細胞にまたがる特定の解剖学的構造物、特定の組織型、腫瘍組織を含む群より選択される、本発明1004の画像解析方法。
[本発明1006]
―  前記1つもしくは複数のセットの前記デジタル画像の一部もしくは全部における生物学的特徴のうちの1つもしくは複数を自動的に同定する工程であって、前記同定が、特定のタイプの生物学的特徴を表す前記デジタル画像の画素領域を自動的に分類するためのブロブ抽出およびブロブ分類操作を自動的に行うことを含む、工程、ならびに/または
―  前記空間DBMS（316）によって、前記1つもしくは複数のセットの前記デジタル画像の一部もしくは全部における前記生物学的特徴のうちの1つもしくは複数のさらなる生物学的特徴を受け取る工程であって、前記受け取られるさらなる生物学的特徴が、特定のタイプの生物学的特徴を表しているとして手動で分類された前記デジタル画像の画素領域である、工程、
―  前記自動的に同定されたおよび/もしくは手動で分類された生物医学的特徴から空間データオブジェクトを自動的に抽出し、前記抽出された空間データオブジェクトについて空間データオブジェクトを格納する前記工程を行う工程
をさらに含む、前記本発明のいずれかの画像解析方法。
[本発明1007]
―  前記1つまたは複数のデジタル画像セットの各々の前記デジタル画像の各々について、それぞれの空間インデックスを作成するかまたは前記少なくとも1つの空間インデックスのパーティションを作成する工程
をさらに含む、前記本発明のいずれかの画像解析方法。
[本発明1008]
―  前記1つまたは複数のデジタル画像セットの各々の前記少なくとも2つの異なる生物医学的特徴のタイプの各々について、それぞれの空間インデックスまたは前記少なくとも1つの空間インデックスのパーティションを作成する工程
をさらに含む、本発明1004〜1007のいずれかの画像解析方法。
[本発明1009]
前記空間データオブジェクトの相対位置の前記解析を行う前に前処理操作を行う工程をさらに含み、前記前処理が、
―  前記空間DBMSによって、前記デジタル画像の前記空間データオブジェクトのエリアサイズ、幾何中心および/または最小外接矩形（minimum bounding rectangle）を自動的に事前計算すること、ならびに
―  前記事前計算されたエリアサイズ、幾何中心および/または最小外接矩形を、前記生物医学的特徴の距離および/または相対位置を決定するために使用すること
を含む、前記本発明のいずれかの画像解析方法。
[本発明1010]
―  画像解析アプリケーションプログラムによって、前記デジタル画像セットの各々を生成する工程であって、IHC組織サンプルの同じ層または隣接する層を示す複数のデジタル画像を共通の座標系内に位置合わせするための画像位置合わせ操作を行うことを含む、工程
をさらに含む、前記本発明のいずれかの画像解析方法。
[本発明1011]
前記デジタル画像セットのうちの少なくとも1つの前記生成が、
―  IHC組織サンプルの同じ層を示す複数のデジタル画像を生成するためのスペクトルアンミキシング操作を行うことであって、前記少なくとも1つのセットの前記デジタル画像の各々が異なる色に対応する、こと
を含む、本発明1010の画像解析方法。
[本発明1012]
複数のデジタル画像セットのセットIDおよび前記複数のデジタル画像セットから導出された空間データオブジェクトが前記空間データベースに格納され、
―  前記デジタル画像セットのうちの1つもしくは複数の第1のデジタル画像セットが、治療前の腫瘍生検サンプルのデジタル画像をそれぞれ含み、かつ
―  前記デジタル画像セットのうちの1つもしくは複数の第2のデジタル画像セットが、治療中の腫瘍生検サンプルのデジタル画像をそれぞれ含み、かつ/または
―  前記デジタル画像セットのうちの1つもしくは複数の第3のデジタル画像セットが、治療後の腫瘍生検サンプルのデジタル画像をそれぞれ含む、
前記本発明のいずれかの画像解析方法。
[本発明1013]
複数のデジタル画像セットのセットIDおよび前記複数のデジタル画像セットから導出された空間データオブジェクトが前記空間データベースに格納され、
前記デジタル画像セットのうちの第4のデジタル画像セットが、特定の状態を有する人の第1のコホートの組織サンプルのデジタル画像を含み、前記デジタル画像セットのうちの第5のデジタル画像セットが、特定の状態を有さない人の第2のコホートの組織サンプルのデジタル画像を含み、
前記方法が、
―  前記第4のデジタル画像セットおよび前記第5のデジタル画像セットを選択し、前記空間DBMSによって、前記第4のデジタル画像セットおよび第5のデジタル画像セットの各々に対して前記解析を行う工程、
―  前記第4のデジタル画像セット内の前記デジタル画像の2つ以上の異なる生物学的特徴を表す空間データオブジェクトの相対位置の第1の統計的平均値を計算する工程、
―  前記第5のデジタル画像セット内の前記デジタル画像の前記2つ以上の異なる生物学的特徴を表す空間データオブジェクトの相対位置の第2の統計的平均値を計算する工程、ならびに
―  前記第1の人コホートと前記第2の人コホートとの間の統計的有意差を同定するために前記第1の統計的平均値と前記第2の統計的平均値を自動的に比較する工程
を含む、前記本発明のいずれかの画像解析方法。
[本発明1014]
前記空間データオブジェクトの相対位置を解析するための前記空間データベース操作が、
―  前記選択されたセット内の前記デジタル画像のうちの1つのデジタル画像の第1の領域が同じセットの別のデジタル画像の第2の領域に完全に含まれているかどうか判定すること、
―  前記選択されたセット内の前記デジタル画像のうちの1つのデジタル画像の第1の領域が同じセットの別のデジタル画像の第2の領域とオーバーラップしているかどうか判定すること、
―  前記選択されたセット内の前記デジタル画像のうちの1つのデジタル画像における第1のタイプの生物学的特徴を表す空間データオブジェクトの、同じセットの前記デジタル画像のうちの別のデジタル画像における別のタイプの生物学的特徴を表す空間データオブジェクトに対する空間距離を決定すること、
―  前記選択されたセット内の前記デジタル画像のうちの1つのデジタル画像における第1のタイプの生物学的特徴を表す空間データオブジェクトの、同じセットの前記デジタル画像のうちの別のデジタル画像における別のタイプの生物学的特徴を表す空間データオブジェクトの位置に対する相対位置のパターンを決定すること
を含む群より選択される、前記本発明のいずれかの画像解析方法。
[本発明1015]
―  前記空間DBMSによって、前記デジタル画像セットのうちの1つまたは複数の前記デジタル画像のうちの1つまたは複数の空間データオブジェクトの密度を計算する工程、および
―  前記空間DBMSによってまたは画像解析アプリケーションプログラムによって前記空間データオブジェクトを複数の既定の生物医学的特徴クラスのうちの1つに自動的に分類するために前記計算された密度を解析する工程
をさらに含む、前記本発明のいずれかの画像解析方法。
[本発明1016]
空間データベース（318）を備えた空間DBMS（316）を含み、かつプロセッサ（328）を含む画像解析システムであって、前記プロセッサが、
―  デジタル画像（106.1〜106-4;106.5〜106.7）の1つまたは複数のセット（112;113）の各々について、空間DBMS（316）の空間データベース（318）にセットIDを格納すること（702）であって、各デジタル画像セットの前記デジタル画像が、IHC組織サンプルの同じ層（102）または隣接する層（102;110;108）を示す、こと、
―  前記デジタル画像の各々について、複数の空間データオブジェクトを前記空間データベースに前記セットIDと関連付けて格納すること（704）であって、各空間データオブジェクトが点、線、多角形、またはそれらの組み合わせであり、かつ前記組織サンプルの生物医学的特徴を表す、こと、
―  前記1つまたは複数のセットに含まれる前記デジタル画像の前記空間データオブジェクトをカバーする少なくとも1つの空間インデックスを作成するための前記空間DBMSの第1のプログラムルーチンを実行すること（706）、
―  前記1つまたは複数のデジタル画像セットのうちの1つの選択を受け取ること（708）、
―  前記選択されたデジタル画像セットの2つ以上のデジタル画像の空間データオブジェクトの相対位置を決定するために前記少なくとも1つの空間インデックスに対して空間データベース操作を適用するため、ならびに前記相対位置を、前記2つ以上のデジタル画像の前記空間データオブジェクトによって表される前記組織サンプルの生物医学的特徴の距離および/または相対位置を決定するための入力として提供する（712）ための、前記空間DBMSの第2のプログラムルーチンを実行すること（710）
のために構成されている、画像解析システム。
[本発明1017]
―  空間データベースであって、
○  各デジタル画像セットのデジタル画像がIHC組織サンプルの同じ層（102）または隣接する層（102;110;108）を示す、デジタル画像（106.1〜106-4;106.5〜106.7）の1つまたは複数のセット（112;113）の少なくともセットIDと、
○  各空間データオブジェクトが点、線、多角形、またはそれらの組み合わせでありかつ前記組織サンプルの生物医学的特徴を表す、前記デジタル画像の各々についての複数の空間データオブジェクトと
を含む空間データベースと、
―  前記1つまたは複数のセットに含まれる前記デジタル画像の前記空間データオブジェクトをカバーする少なくとも1つの空間インデックスを作成するための第1のプログラムルーチンと、
―  前記1つまたは複数のデジタル画像セットのうちの選択されたデジタル画像セットの2つ以上のデジタル画像の空間データオブジェクトの相対位置を決定するために前記少なくとも1つの空間インデックスに対して空間データベース操作を適用するため、ならびに前記相対位置を、前記2つ以上のデジタル画像の前記空間データオブジェクトによって表される前記組織サンプルの生物医学的特徴の距離および/または相対位置を決定するための入力として提供するための、第2のプログラムルーチンと
を含む、空間データベース管理システム。