【手続補正書】
【提出日】令和2年1月23日(2020.1.23)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
コンピュータにより実装される方法であって、
（ａ）第１の時点において、がんを有する複数の対象に関する情報を取得し、そして前記第１の時点における前記情報に基づいて、第１の状態のセットを生成するために、前記複数の対象のそれぞれの第１の状態を判定するステップであって、前記情報が、前記複数の対象のそれぞれの対象について、少なくとも、無細胞体液からの核酸のジェノタイピングを行うことによって得られた腫瘍の遺伝子プロファイルおよび前記第１の時点の前に前記対象に提供された任意の処置を含む、ステップと、
（ｂ）前記第１の時点よりも後の１つまたは複数の第２の時点において、前記複数の対象に関する前記情報を取得し、そして前記１つまたは複数の第２の時点のうちの所与の一時点における前記情報に基づいて、後続状態のセットを生成するために、前記１つまたは複数の第２の時点のそれぞれにおける前記複数の対象のそれぞれの第２の状態を判定するステップと、
（ｃ）（ａ）からの前記第１の状態のセットおよび（ｂ）からの前記後続状態のセットを使用するステップであって、所与の第１の状態が、前記所与の第１の状態よりも後の後期時点における状態のセットの中で、第２の状態をもたらす確率を判定するように構成される予測アルゴリズムを生成するステップと
を含む、方法。
【請求項２】
（ｄ）より早い時点における状態のセットの中での前記所与の第１の状態に関して、前記所与の第１の状態が、前記後期時点における前記状態のセットの中で、前記第２の状態をもたらす前記確率を判定するステップと、
（ｅ）（ｄ）において判定された前記確率を示す電子出力を生成するステップと
をさらに含む、請求項１に記載の方法。
【請求項３】
コンピュータにより実装される方法であって、
（ａ）第１の時点において、がんを有する複数の対象に関する情報を取得し、そして前記第１の時点における前記情報に基づいて、第１の状態のセットを生成するために、前記複数の対象のそれぞれの第１の状態を判定するステップであって、前記情報が、前記複数の対象のそれぞれの対象について、少なくとも、少なくとも５０個の遺伝子のジェノタイピングを行うことによって得られた腫瘍の遺伝子プロファイルおよび前記第１の時点の前に前記対象に提供された任意の処置を含む、ステップと、
（ｂ）前記第１の時点よりも後の１つまたは複数の第２の時点において、前記複数の対象に関する前記情報を取得し、そして前記１つまたは複数の第２の時点のうちの所与の一時点における前記情報に基づいて、後続状態のセットを生成するために、前記１つまたは複数の第２の時点のそれぞれにおける前記複数の対象のそれぞれの第２の状態を判定するステップと、
（ｃ）（ａ）からの前記第１の状態のセットおよび（ｂ）からの前記後続状態のセットを使用するステップであって、所与の第１の状態が、前記所与の第１の状態よりも後の後期時点における状態のセットの中で、第２の状態をもたらす確率を判定するように構成される予測アルゴリズムを生成するステップと
を含む、方法。
【請求項４】
（ｄ）より早い時点における状態のセットの中での前記所与の第１の状態に関して、前記所与の第１の状態が、前記後期時点における前記状態のセットの中で、前記第２の状態をもたらす前記確率を判定するステップと、
（ｅ）（ｄ）において判定された前記確率を示す電子出力を生成するステップと
をさらに含む、請求項３に記載の方法。
【請求項５】
前記情報が、前記複数の対象由来の無細胞デオキシリボ核酸（ｃｆＤＮＡ）のシーケンシングを行うことと、任意選択で、前記複数の対象のそれぞれの問診を実施することとにより取得された情報を含む、請求項１または３に記載の方法。
【請求項６】
処置が、前記第１の時点の前に前記対象に提供されていた、請求項１または３に記載の方法。
【請求項７】
１つまたは複数の決定ツリーを生成するステップをさらに含み、それぞれの決定ツリーが、ルートノード、１つまたは複数の決定ブランチ、１つまたは複数の決定ノード、および１つまたは複数の終端ノードを含み、前記ルートノードにおける状態が、前記第１の時点を表し、前記１つまたは複数の決定ブランチが、代替えの処置を表し、前記１つまたは複数の決定ノードおよび前記１つまたは複数の終端ノードが、後続状態を表す、請求項１または３に記載の方法。
【請求項８】
前記１つまたは複数の決定ブランチが、複数の決定ブランチを含む、請求項７に記載の方法。
【請求項９】
前記後続状態が、前記対象が生きているかまたは死んでいるかを示す前記対象の生存状態を含む、請求項１または３に記載の方法。
【請求項１０】
前記後続状態が、対象生存率を含む、請求項１または３に記載の方法。
【請求項１１】
前記第１の状態のそれぞれが、１つまたは複数の体細胞変異の共通のセットを含む、請求項１または３に記載の方法。
【請求項１２】
前記情報が、対象のプロファイルをさらに含む、請求項１または３に記載の方法。
【請求項１３】
前記確率が、少なくとも部分的に、複数の処置選択肢の中からの処置選択の関数である、請求項１または３に記載の方法。
【請求項１４】
前記１つまたは複数の第２の時点が、複数の後続時点を含む、請求項１から４のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１５】
複数の後続時点において、前記確率を判定するステップをさらに含む、請求項１４に記載の方法。
【請求項１６】
前記時点が、少なくとも３つの時点または少なくとも４つの時点を含む、請求項１５に記載の方法。
【請求項１７】
前記第１の時点が、前記対象が前記処置を受ける前であり、前記後続時点が、前記対象が前記処置を受けた後である、請求項１に記載の方法。
【請求項１８】
前記後続時点における前記後続状態が、第２の処置が前記後続時点の後に投与されるべきであることの指標である、請求項１３に記載の方法。
【請求項１９】
前記複数の対象に関する前記情報が、前記対象の患者プロファイルからの１つまたは複数の特徴を含み、この特徴が、年齢、性別、ジェンダー、遺伝子プロファイル、酵素レベル、器官機能、生活の質、医療介入の頻度、寛解の状況、および患者の転帰からなる群から選択される、請求項１に記載の方法。
【請求項２０】
前記遺伝子プロファイルが、がんの危険性を増加させるか、薬物動態に影響を及ぼすか、または薬物感受性に影響を及ぼす、１つまたは複数の遺伝子座における対象の遺伝子型を含む、請求項１９に記載の方法。
【請求項２１】
前記複数の対象に関する前記情報が、前記対象の腫瘍プロファイルからの１つまたは複数の特徴を含み、この特徴が、１つまたは複数の遺伝子バリアント、起源組織、腫瘍量、腫瘍の薬物感受性、および腫瘍のステージからなる群から選択される、請求項１に記載の方法。
【請求項２２】
前記１つまたは複数の特徴が、前記対象由来の無細胞核酸分子をアッセイすることによって判定される、請求項２１に記載の方法。
【請求項２３】
前記１つまたは複数の遺伝子バリアントを定量化して、前記１つまたは複数の体細胞変異を含む無細胞核酸分子の比率を判定する、請求項２２に記載の方法。
【請求項２４】
前記１つまたは複数の体細胞変異の前記比率が、前記第１の時点と、前記１つまたは複数の後続時点との間で、増加しているかまたは減少しているかを判定するステップをさらに含む、請求項２３に記載の方法。
【請求項２５】
前記１つまたは複数の体細胞変異の前記比率が、前記１つまたは複数の後続時点のうちの複数の間で、増加しているかまたは減少しているかを判定するステップをさらに含む、請求項２３に記載の方法。
【請求項２６】
前記１つまたは複数の体細胞変異の前記比率が、増加している、請求項２４または２５に記載の方法。
【請求項２７】
前記１つまたは複数の体細胞変異が、増加しており、さらに、前記体細胞変異が、前記処置に対する耐性と関連している、請求項２６に記載の方法。
【請求項２８】
前記アッセイすることが、高スループットシーケンシングを含む、請求項２２に記載の方法。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０１２６
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０１２６】
本発明の好ましい実施形態が本明細書において示され、説明されているが、そのような実施形態が単なる例示として提供されていることは、当業者には明らかである。本発明が本明細書内に提供されている特定の実施例によって制限されることは、意図されない。本発明は、前述の明細書への参照とともに記載されているが、本明細書における実施形態の説明および例証は、制限する意味で解釈されるものではない。当業者であれば、本発明から逸脱することなく、多数の変化形、変更、および置換を想起し得る。さらに、本発明のすべての態様は、本明細書において記載されている特定の表現、構成、または相対的比率に制限されず、それらは、様々な条件および変数に依存することを理解すべきである。本明細書において記載される本発明の実施形態に対する様々な代替形態を、本発明の実践に用いることができることを理解されたい。したがって、本発明は、あらゆるそのような代替形、修正形、変化形、または均等物も網羅すべきであることが企図される。以下の特許請求の範囲が本発明の範囲を定めること、ならびにこれらの特許請求の範囲内の方法と構造、およびそれらの均等物が、それによって網羅されることが意図される。
本発明の実施形態の例として、以下の項目が挙げられる。
（項目１）
コンピュータにより実装される方法であって、
（ａ）第１の時点において、がんを有する複数の対象に関する情報を取得し、そして前記第１の時点における前記情報に基づいて、第１の状態のセットを生成するために、前記複数の対象のそれぞれの第１の状態を判定するステップであって、前記情報が、前記複数の対象のそれぞれの対象について、少なくとも、無細胞体液からの核酸のジェノタイピングを行うことによって得られた腫瘍の遺伝子プロファイルおよび前記第１の時点の前に前記対象に提供された任意の処置を含む、ステップと、
（ｂ）前記第１の時点よりも後の１つまたは複数の第２の時点において、前記複数の対象に関する前記情報を取得し、そして前記１つまたは複数の第２の時点のうちの所与の一時点における前記情報に基づいて、後続状態のセットを生成するために、前記１つまたは複数の第２の時点のそれぞれにおける前記複数の対象のそれぞれの第２の状態を判定するステップと、
（ｃ）（ａ）からの前記第１の状態のセットおよび（ｂ）からの前記後続状態のセットを使用するステップであって、所与の第１の状態が、前記所与の第１の状態よりも後の後期時点における状態のセットの中で、第２の状態をもたらす確率を判定するように構成される予測アルゴリズムを生成するステップと
を含む、方法。
（項目２）
（ｄ）より早い時点における状態のセットの中での前記所与の第１の状態に関して、前記所与の第１の状態が、前記より遅い時点における前記状態のセットの中で、前記第２の状態をもたらす前記確率を判定するステップと、
（ｅ）（ｄ）において判定された前記確率を示す電子出力を生成するステップと
をさらに含む、項目１に記載の方法。
（項目３）
コンピュータにより実装される方法であって、
（ａ）第１の時点において、がんを有する複数の対象に関する情報を取得し、そして前記第１の時点における前記情報に基づいて、第１の状態のセットを生成するために、前記複数の対象のそれぞれの第１の状態を判定するステップであって、前記情報が、前記複数の対象のそれぞれの対象について、少なくとも、少なくとも５０個の遺伝子のジェノタイピングを行うことによって得られた腫瘍の遺伝子プロファイルおよび前記第１の時点の前に前記対象に提供された任意の処置を含む、ステップと、
（ｂ）前記第１の時点よりも後の１つまたは複数の第２の時点において、前記複数の対象に関する前記情報を取得し、そして前記１つまたは複数の第２の時点のうちの所与の一時点における前記情報に基づいて、後続状態のセットを生成するために、前記１つまたは複数の第２の時点のそれぞれにおける前記複数の対象のそれぞれの第２の状態を判定するステップと、
（ｃ）（ａ）からの前記第１の状態のセットおよび（ｂ）からの前記後続状態のセットを使用するステップであって、所与の第１の状態が、前記所与の第１の状態よりも後の後期時点における状態のセットの中で、第２の状態をもたらす確率を判定するように構成される予測アルゴリズムを生成するステップと
を含む、方法。
（項目４）
（ｄ）より早い時点における状態のセットの中での前記所与の第１の状態に関して、前記所与の第１の状態が、前記より遅い時点における前記状態のセットの中で、前記第２の状態をもたらす前記確率を判定するステップと、
（ｅ）（ｄ）において判定された前記確率を示す電子出力を生成するステップと
をさらに含む、項目３に記載の方法。
（項目５）
前記情報を取得するステップが、前記複数の対象由来の無細胞デオキシリボ核酸（ｃｆＤＮＡ）のシーケンシングを行うことと、任意選択で、前記複数の対象のそれぞれの問診を実施することとを含む、項目１または３に記載の方法。
（項目６）
処置が、前記第１の時点の前に前記対象に提供されていた、項目１または３に記載の方法。
（項目７）
１つまたは複数の決定ツリーを生成するステップをさらに含み、それぞれの決定ツリーが、ルートノード、１つまたは複数の決定ブランチ、１つまたは複数の決定ノード、および１つまたは複数の終端ノードを含み、前記ルートノードにおける状態が、前記第１の時点を表し、前記１つまたは複数の決定ブランチが、代替えの処置を表し、前記１つまたは複数の決定ノードおよび前記１つまたは複数の終端ノードが、後続状態を表す、項目１または３に記載の方法。
（項目８）
前記１つまたは複数の決定ブランチが、複数の決定ブランチを含む、項目７に記載の方法。
（項目９）
前記後続状態が、前記対象が生きているかまたは死んでいるかを示す前記対象の生存状態を含む、項目１または３に記載の方法。
（項目１０）
前記後続状態が、対象生存率を含む、項目１または３に記載の方法。
（項目１１）
前記第１の状態のそれぞれが、１つまたは複数の体細胞変異の共通のセットを含む、項目１または３に記載の方法。
（項目１２）
前記情報が、対象のプロファイルをさらに含む、項目１または３に記載の方法。
（項目１３）
前記確率が、少なくとも部分的に、複数の処置選択肢の中からの処置選択の関数である、項目１または３に記載の方法。
（項目１４）
前記１つまたは複数の第２の時点が、複数の後続時点を含む、項目１から４のいずれか一項に記載の方法。
（項目１５）
複数の後続時点において、前記確率を判定するステップをさらに含む、項目１４に記載の方法。
（項目１６）
前記時点が、少なくとも３つの時点または少なくとも４つの時点を含む、項目１５に記載の方法。
（項目１７）
前記第１の時点が、前記対象が前記処置を受ける前であり、前記後続時点が、前記対象が前記処置を受けた後である、項目１に記載の方法。
（項目１８）
第２の処置が、前記後続時点における前記後続状態に基づいて、前記後続時点の後に投与される、項目１３に記載の方法。
（項目１９）
前記複数の対象に関する前記情報が、前記対象の患者プロファイルからの１つまたは複数の特徴を含み、この特徴が、年齢、性別、ジェンダー、遺伝子プロファイル、酵素レベル、器官機能、生活の質、医療介入の頻度、寛解の状況、および患者の転帰からなる群から選択される、項目１に記載の方法。
（項目２０）
前記遺伝子プロファイルが、がんの危険性を増加させるか、薬物動態に影響を及ぼすか、または薬物感受性に影響を及ぼす、１つまたは複数の遺伝子座における対象の遺伝子型を含む、項目１９に記載の方法。
（項目２１）
前記複数の対象に関する前記情報が、前記対象の腫瘍プロファイルからの１つまたは複数の特徴を含み、この特徴が、１つまたは複数の遺伝子バリアント、起源組織、腫瘍量、腫瘍の薬物感受性、および腫瘍のステージからなる群から選択される、項目１に記載の方法。
（項目２２）
前記１つまたは複数の特徴が、前記対象由来の無細胞核酸分子をアッセイすることによって判定される、項目２１に記載の方法。
（項目２３）
前記１つまたは複数の遺伝子バリアントを定量化して、前記１つまたは複数の体細胞変異を含む無細胞核酸分子の比率を判定する、項目２２に記載の方法。
（項目２４）
前記１つまたは複数の体細胞変異の前記比率が、前記第１の時点と、前記１つまたは複数の後続時点との間で、増加しているかまたは減少しているかを判定するステップをさらに含む、項目２３に記載の方法。
（項目２５）
前記１つまたは複数の体細胞変異の前記比率が、前記１つまたは複数の後続時点のうちの複数の間で、増加しているかまたは減少しているかを判定するステップをさらに含む、項目２３に記載の方法。
（項目２６）
前記１つまたは複数の体細胞変異の前記比率が、増加している、項目２４または２５に記載の方法。
（項目２７）
前記１つまたは複数の体細胞変異が、増加しており、さらに、前記体細胞変異が、前記処置に対する耐性と関連している、項目２６に記載の方法。
（項目２８）
前記アッセイすることが、高スループットシーケンシングを含む、項目２２に記載の方法。
（項目２９）
（ａ）第１の時点において、がんを有する対象に関する情報を取得するステップであって、前記情報が、患者プロファイル、腫瘍プロファイル、または処置からの前記対象の少なくとも１つの特徴を含む、ステップと、
（ｂ）前記第１の時点における前記情報に基づいて、前記対象の初期状態を判定するステップと、
（ｃ）前記対象の前記初期状態に基づいて、１つまたは複数の後続時点のそれぞれにおいて、複数の後続状態のそれぞれの確率を判定するステップであって、それによって、状態の転帰に関する確率のセットを提供するステップと、
（ｄ）状態の転帰に関する前記確率のセットに少なくとも部分的に基づいて、前記対象が特定の転帰を得る確率を最適化する、前記がんの処置の推奨を生成するステップと、
（ｅ）（ｄ）において生成された前記推奨を示す電子出力を生成するステップと
を含む、方法。
（項目３０）
前記確率が、少なくとも部分的に、複数の処置選択肢の中からの処置選択の関数である、項目２９に記載の方法。
（項目３１）
前記１つまたは複数の後続時点が、複数の後続時点を含む、項目２９または３０に記載の方法。
（項目３２）
複数の後続時点において、前記確率を判定するステップをさらに含む、項目３１に記載の方法。
（項目３３）
前記時点が、少なくとも３つの時点を含む、項目２９に記載の方法。
（項目３４）
前記時点が、少なくとも４つの時点を含む、項目２９に記載の方法。
（項目３５）
前記第１の時点が、前記対象が前記処置を受ける前であり、前記後続時点が、前記対象が前記処置を受けた後である、項目２９に記載の方法。
（項目３６）
第２の処置が、前記後続時点における前記後続状態に基づいて、前記後続時点の後に投与される、項目３５に記載の方法。
（項目３７）
前記対象の前記少なくとも１つの特徴が、前記患者プロファイルからであり、年齢、ジェンダー、遺伝子プロファイル、酵素レベル、器官機能、生活の質、医療介入の頻度、寛解の状況、および患者の転帰からなる群から選択される、項目２９に記載の方法。
（項目３８）
前記遺伝子プロファイルが、遺伝性がん遺伝子である１つまたは複数の遺伝子座における対象の遺伝子型を含む、項目２９に記載の方法。
（項目３９）
前記遺伝子プロファイルが、薬物動態に影響を及ぼす１つまたは複数の遺伝子座における対象の遺伝子型を含む、項目２９に記載の方法。
（項目４０）
前記遺伝子プロファイルが、薬物感受性に影響を及ぼす１つまたは複数の遺伝子座における対象の遺伝子型を含む、項目２９に記載の方法。
（項目４１）
前記対象の前記少なくとも１つの特徴が、前記腫瘍プロファイルからであり、１つまたは複数の体細胞変異、起源組織、腫瘍量、腫瘍の薬物感受性、および腫瘍のステージからなる群から選択される、項目２９に記載の方法。
（項目４２）
前記少なくとも１つの特徴が、前記対象由来の無細胞核酸分子をアッセイすることによって判定される、項目４０に記載の方法。
（項目４３）
前記体細胞変異を定量化して、前記１つまたは複数の体細胞変異を含む前記腫瘍に由来する無細胞核酸分子の比率を判定する、項目４２に記載の方法。
（項目４４）
前記１つまたは複数の体細胞変異の前記比率が、前記第１の時点と、前記１つまたは複数の後続時点との間で、増加しているかまたは減少しているかを判定するステップをさらに含む、項目４３に記載の方法。
（項目４５）
前記１つまたは複数の体細胞変異の前記比率が、前記１つまたは複数の後続時点のうちの複数の間で、増加しているかまたは減少しているかを判定するステップをさらに含む、項目４３に記載の方法。
（項目４６）
前記アッセイすることが、高スループットシーケンシングを含む、項目４２に記載の方法。
（項目４７）
前記腫瘍プロファイルが、腫瘍組織生検に由来しない、項目２９に記載の方法。
（項目４８）
（ａ）対象に関する、少なくとも、腫瘍の遺伝子プロファイルおよび前記対象に以前提供されていたかまたは現在提供されている処置があればそれを含む、情報を取得し、そして前記情報に基づいて、前記対象の初期状態を判定するステップと、
（ｂ）決定ツリーを提供するステップであって、ルートノードが、初期対象状態を表し、決定ブランチが、前記対象に利用可能な代替えの処置を表し、機会ノードが、不確実性の点を表し、決定ノードまたは終端ノードが、後続状態を表す、ステップと、
（ｃ）前記対象が終端ノードにおいて生存している状態を達成する確率を最大化する、前記対象の処置過程を提供するステップと、
（ｄ）（ｃ）において判定された前記処置過程を示す電子出力を生成するステップと
を含む、方法。
（項目４９）
（ａ）通信ネットワーク上で、１つまたは複数の医療サービス提供者との１つまたは複数の通信リンクを確立するステップと、
（ｂ）前記通信ネットワーク上で、前記１つまたは複数の医療サービス提供者から、１つまたは複数の対象に関する医療情報を受信するステップと、
（ｃ）前記医療サービス提供者から、前記１つまたは複数の対象のそれぞれに由来する無細胞デオキシリボ核酸（ｃｆＤＮＡ）を含む１つまたは複数の試料を受け取るステップと、
（ｄ）前記ｃｆＤＮＡのシーケンシングを行い、そして前記ｃｆＤＮＡに存在する１つまたは複数の遺伝子バリアントを特定するステップと、
（ｅ）前記１つまたは複数の対象のそれぞれについての情報を有するデータベースを作成または補足するステップであって、前記情報が、特定された遺伝子バリアントおよび受信された医療情報の両方を含む、ステップと、
（ｆ）前記データベースおよびコンピュータにより実装されるアルゴリズムを使用するステップであって、対象の初期状態に基づいて、複数の異なる治療介入のそれぞれについて、後続状態の確率を予測する、少なくとも１つの予測モデルを生成するステップと
を含む、方法。
（項目５０）
１つまたは複数のコンピュータプロセッサによって実行すると、
（ａ）第１の時点において、がんを有する複数の対象に関する情報を取得し、そして前記第１の時点における前記情報に基づいて、第１の状態のセットを生成するために、前記複数の対象のそれぞれの第１の状態を判定するステップであって、前記情報が、前記複数の対象のそれぞれの対象について、少なくとも、無細胞体液からの核酸のジェノタイピングを行うことによって得られた腫瘍の遺伝子プロファイルおよび前記第１の時点の前に前記対象に提供された任意の処置を含む、ステップと、
（ｂ）前記第１の時点よりも後の１つまたは複数の第２の時点において、前記複数の対象に関する前記情報を取得し、そして前記１つまたは複数の第２の時点のうちの所与の一時点における前記情報に基づいて、後続状態のセットを生成するために、前記１つまたは複数の第２の時点のそれぞれにおける前記複数の対象のそれぞれの第２の状態を判定するステップと、
（ｃ）（ａ）からの前記第１の状態のセットおよび（ｂ）からの前記後続状態のセットを使用するステップであって、所与の第１の状態が、前記所与の第１の状態よりも後の後期時点における状態のセットの中で、第２の状態をもたらす確率を判定するように構成される予測アルゴリズムを生成するステップと
を含む方法を実装する、機械により実行可能なコードを含む、非一過的コンピュータ可読媒体。
（項目５１）
１つまたは複数のコンピュータプロセッサによって実行すると、
（ａ）第１の時点において、がんを有する複数の対象に関する情報を取得し、そして前記第１の時点における前記情報に基づいて、第１の状態のセットを生成するために、前記複数の対象のそれぞれの第１の状態を判定するステップであって、前記情報が、前記複数の対象のそれぞれの対象について、少なくとも、少なくとも５０個の遺伝子のジェノタイピングを行うことによって得られた腫瘍の遺伝子プロファイルおよび前記第１の時点の前に前記対象に提供された任意の処置を含む、ステップと、
（ｂ）前記第１の時点よりも後の１つまたは複数の第２の時点において、前記複数の対象に関する前記情報を取得し、そして後続状態のセットを生成するために、前記１つまたは複数の第２の時点のうちの所与の一時点における前記情報に基づいて、前記１つまたは複数の第２の時点のそれぞれにおける前記複数の対象のそれぞれの第２の状態を判定するステップと、
（ｃ）（ａ）からの前記第１の状態のセットおよび（ｂ）からの前記後続状態のセットを使用するステップであって、所与の第１の状態が、前記所与の第１の状態よりも後の後期時点における状態のセットの中で、第２の状態をもたらす確率を判定するように構成される予測アルゴリズムを生成するステップと
を含む方法を実装する、機械により実行可能なコードを含む、非一過的コンピュータ可読媒体。
（項目５２）
（ａ）対象に関する、少なくとも、腫瘍の遺伝子プロファイルおよび前記対象に以前提供されていたかまたは現在提供されている処置があればそれを含む、情報を取得し、そして前記情報に基づいて、前記対象の初期状態を判定するステップと、
（ｂ）決定ツリーを提供するステップであって、ルートノードが、初期対象状態を表し、決定ブランチが、前記対象に利用可能な代替えの処置を表し、機会ノードが、不確実性の点を表し、決定ノードまたは終端ノードが、後続状態を表す、ステップと、
（ｃ）前記対象が終端ノードにおいて生存している状態を達成する確率を最大化する、前記対象の処置過程を提供するステップと、
（ｄ）前記処置過程を前記対象に投与するステップと
を含む、方法。
（項目５３）
（ｅ）前記初期状態よりも後の第２の時点において、対象に関する、少なくとも、腫瘍の遺伝子プロファイルおよび前記対象に以前提供されていたかまたは現在提供されている処置があればそれを含む、情報を取得し、そして前記情報に基づいて、複数の後続状態の中から、前記対象の第２の状態を判定するステップと、
（ｆ）前記第２の状態に基づいて、前記対象が終端ノードにおいて生存している状態を達成する確率を最大化する、前記対象の後続の処置過程を提供するステップと、
（ｇ）前記後続の処置過程を前記対象に投与するステップと
をさらに含む、項目５２に記載の方法。
（項目５４）
がんを有する対象のための複数の代替えの処置の中から処置過程を提供するステップを含む方法であって、前記対象が、複数の決定ブランチを含む決定ツリーによって特徴付けられており、それぞれの決定ブランチが、前記複数の代替えの処置の中から１つの代替えの処置を表し、その処置過程が、前記対象が終端ノードにおいて生存している状態を達成する確率を最大化する、方法。