【事件の表示】
　特願２０１２−５０５０１７「ＰＣＲ反応をリアルタイムで監視するための光検出システム」拒絶査定不服審判事件〔平成２２年１０月２１日国際公開、ＷＯ２０１０／１１８５４１、平成２４年１０月１１日国内公表、特表２０１２−５２４２４２〕について、次のとおり審決する。
【結　論】
　本件審判の請求は、成り立たない。
【理　由】
　
第１　手続の経緯
　本願は、平成２２年４月９日（パリ条約による優先権主張外国庁受理：平成２１年４月１５日　（ＥＰ）欧州特許庁）を国際出願日として特許出願されたものであって、平成２６年２月４日付けで拒絶理由が通知され、この通知に対して同年５月９日に意見書及び手続補正書が提出されたが、同月２８日付けで拒絶査定がなされ、同拒絶査定の謄本は同年６月２日に請求人に送達された。 
　これに対し、同年１０月２日に拒絶査定不服審判が請求されるとともに、それと同時に手続補正がなされたものである。
第２　平成２６年１０月２日にされた手続補正についての補正の却下の決定
［補正の却下の決定の結論］  
　平成２６年１０月２日にされた手続補正（以下、「本件補正」という。）を却下する。 
［補正の却下の決定の理由］  
１　本件補正の内容について  
　本件補正は、平成２６年５月９日に提出された手続補正書に記載された特許請求の範囲の請求項１の記載（下記（１）参照。）を、同年１０月２日に提出された手続補正書に記載された特許請求の範囲の請求項１に記載（下記（２）参照。）されたとおりに補正することをその一部に含むものである。  
（１）本件補正前の特許請求の範囲の請求項１の記載  
　平成２６年５月９日に提出された手続補正書に記載された特許請求の範囲の請求項１の記載は、次のとおりのものである。  
　「【請求項１】
　少なくとも２つの異なる試料チャンバ（１０１−１０４）中の複数の試料成分を検出する光多重システム（１００）であって、
　該光多重システムは第１の光学ユニット（１０６）と第２の光学ユニット（１０７）とを有しており、前記第１の光学ユニットおよび前記第２の光学ユニットは空間的に相互に離隔されており、前記第１の光学ユニットは第１の光源（１０８）および第１の検出器（１０９）を含み、前記第２の光学ユニットは第２の光源（１１０）および第２の検出器（１１１）を含み、
　前記光多重システムは、
　前記第１の光源および前記第２の光源によってそれぞれ少なくとも１つの試料チャンバを照明し、かつ、前記第１の検出器および前記第２の検出器によってそれぞれ少なくとも１つの試料チャンバからの光を受信するように、少なくとも２つの試料チャンバを各光学ユニットに対応する位置で受け取り、
　前記第１の光学ユニットおよび前記第２の光学ユニットを前記少なくとも２つの試料チャンバに対して相対運動させる（１１３）ことにより、前記第１の光学ユニットが第２の試料チャンバに位置合わせされ、かつ、前記第２の光学ユニットが第１の試料チャンバに位置合わせされることを可能にする
ように構成されており、
　前記相対運動が生じるたびに、各光学ユニットと各試料チャンバとの間の位置合わせによって、各光学ユニットから放出される光子の伝搬経路が各試料チャンバへの光学的なアクセスにマッチングされている、
ことを特徴とする光多重システム。」
（２）本件補正後の特許請求の範囲の請求項１の記載  
　平成２６年１０月２日に提出された手続補正書に記載された特許請求の範囲の請求項１の記載は、次のとおりのものである。  
　「【請求項１】
　少なくとも２つの異なる試料チャンバ（１０１−１０４）中の複数の試料成分を検出する光多重システム（１００）であって、
　該光多重システムは
、
　
第１のポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）の生成物の検出を行うための
　
第２のポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）の生成物の検出を行うための
、
　
前記少なくとも２つの異なる試料チャンバの第１の試料チャンバと関連する第１のヒータであって、前記第１のヒータは、前記第１の試料チャンバにおいて第１の温度経過を形成する、第１のヒータと、
　前記少なくとも２つの異なる試料チャンバの第２の試料チャンバと関連する第２のヒータであって、前記第２のヒータは、前記第２の試料チャンバにおいて第２の温度経過を形成する、第２のヒータと、
　ＰＣＲプロトコルを受け取る制御ユニットと
　を有しており、前記第１の光学ユニットおよび前記第２の光学ユニットは空間的に相互に離隔されており、前記第１の光学ユニットは第１の光源（１０８）および第１の検出器（１０９）を含み、前記第２の光学ユニットは第２の光源（１１０）および第２の検出器（１１１）を含み、
　前記光多重システムは、
　
（ａ）
、
、前記
２つ
同時に
（ｂ）
前記
前記
を、前記第１の光学ユニットおよび前記第２の
ここで、前記第１の光学ユニットおよび前記第２の光学ユニットは、空間的に相互に離隔された前記第１の光学ユニットおよび前記第２の光学ユニットのそれぞれの試料チャンバにおいて、２つの異なる光波長を用いて、第１の光学測定および第２の光学測定を同時に行い、
　前記第１の光学ユニットおよび前記第２の光学ユニットを前記少なくとも２つの試料チャンバに対して相対運動させる（１１３）ことにより、前記第１の光学ユニットが第２の試料チャンバに位置合わせされ、かつ、前記第２の光学ユニットが第１の試料チャンバに位置合わせされることを可能にする
ように構成されて
おり、
　前記相対運動が生じるたびに、各光学ユニットと各試料チャンバとの間の位置合わせによって、各光学ユニットから放出される光子の伝搬経路が各試料チャンバへの光学的なアクセスにマッチングされており、
　
前記制御ユニットは、前記ＰＣＲプロトコルにしたがって、前記第１の試料チャンバおよび前記第２の試料チャンバにおいてリアルタイムＰＣＲ反応を生じさせるように、前記第１のヒータおよび前記第２のヒータを制御し、前記制御ユニットは、前記少なくとも２つの試料チャンバに対して、前記第１の光学ユニットおよび前記第２の光学ユニットを相対運動させることにより増幅された目標ＤＮＡ分子を同時に定量化する、
ことを特徴とする光多重システム。」
　（当審注：下線部は補正箇所に対応している。）  
２　本件補正の適否について
（１）本件補正の目的について
　本件補正は、特許請求の範囲の請求項１において、「ＰＣＲプロトコルを受け取る制御ユニット」であって、「前記ＰＣＲプロトコルにしたがって、前記第１の試料チャンバおよび前記第２の試料チャンバにおいてリアルタイムＰＣＲ反応を生じさせるように、前記第１のヒータおよび前記第２のヒータを制御し、前記制御ユニットは、前記少なくとも２つの試料チャンバに対して、前記第１の光学ユニットおよび前記第２の光学ユニットを相対運動させることにより増幅された目標ＤＮＡ分子を同時に定量化する、」「制御器ユニット」を付加することを含むものである。
　しかしながら、上記補正事項は、「光多重システム」の構成要素として新たに「制御器ユニット」を付加するものであるから、構成の外的付加に該当し、本件補正前の請求項１の構成の一部を限定的に減縮しているものということはできない。
　したがって、本件補正は、特許法第１７条の２第５項第２号の特許請求の範囲の減縮を目的とするものに該当しない。
　また、本件補正は、特許法第１７条の２第５項第１号の請求項の削除、第３号の誤記の訂正、第４号の明りょうでない記載の釈明のいずれにも該当しない。
　したがって、本件補正後の特許請求の範囲の請求項１についての本件補正は、特許法第１７条の２第５項各号のいずれにも該当しないものである。
（２）独立特許要件の検討
　上記「（１）補正の目的について」において判断したように、上記補正はいわゆる目的外の補正を含むものであり、特許法の規定に違反するものであるが、仮に上記補正が、請求人が審判請求書において主張するように、特許法第１７条の２第５項第２号の特許請求の範囲の減縮を目的とするものとして、本件補正後の特許請求の範囲の請求項１に係る発明（以下、「本願補正発明」という。） が、特許出願の際独立して特許を受けられるものかどうか（特許法第１７条の２第６項において準用する同法第１２６条第７項の規定に適合するか）を検討する。
ア　引用文献について
（ア）引用文献に記載された事項　 
　本願の優先日前に頒布され、原査定の拒絶の理由において引用された刊行物である特表２００８−５３７５９４号公報（以下、「引用文献」という。）には、以下の事項が図面と共に記載されている。 
　（下線は当審により引用発明の認定に直接用いた記載に付加した。） 
（引−１）「【０００７】
　広くは、
本発明は、リアルタイムＰＣＲ（ポリメラーゼ連鎖反応）、本明細書において多重ＰＣＲと呼ぶ、における複数目標化学種を検出するための技術に関する。
（引−２）「【００１１】
　その他の実施形態において、個々の異なる波長で蛍光灯（当審注：「蛍光」の誤記であると思われる。）を発する複数の化学種を含む複数の処理チャンバを有するディスクを回転させ、複数の発光蛍光灯光線（当審注：「発光蛍光光線」の誤記であると思われる。）を生成するために、複数の光線を有するディスクを励起し、及び複数の異なる光学モジュールにより蛍光灯光線（当審注：「蛍光光線」の誤記であると思われる。）を捕獲する方法であって、モジュールは、異なる波長のために光学的に構成され、複数の異なるモジュールをハウジング内に収容する。」
（引−３）「【００１３】
　
装置は、リアルタイムＰＣＲを行い、同時に、発生する限りは全ての種類の生物学的反応を分析できる。装置は、各反応の温度を独立して又は選択されたグループとして調節でき、
（引−４）「【００１６】
　図１は、
多重蛍光検出装置１０
装置１０は、４つの光学モジュール１６を有し、４つの異なる染料の光学検出のため４つの「チャネル」を有する。特に、装置１０は、４つの光学モジュール１６を有し、任意の所定時間に回転ディスク１３の異なる領域を励起し、染料と異なる波長で発せられた蛍光灯エネルギー（当審注：「蛍光エネルギー」の誤記であると思われる。）を収集する。その結果、モジュール１６は、試料２２内部で発生する複数、並列反応を調べるため使用されてよい。
（引−５）「【００１８】
　単一試料２２を説明したが、
ディスク１３は、試料を保持した複数のチャンバを包含してよい。光学モジュール１６は、異なる波長で一部又は全ての異なるチャンバを問審できる。
（引−６）「【００２０】
　図１に示したように、個々の光学モジュール１６は、光ファイババンドル１４の一つの脚部に連結されてよい。光ファイババンドル１４は、光学モジュール１６から感度を失うことなく蛍光信号を収集するための可撓性機構を含む。一般に、光ファイババンドルは、並んで横たえられ、末端部で一緒に固着され、可撓性の保護ジャケットに入れられた複数の光ファイバーを含む。或いは、光ファイババンドル１４は、共通の末端部を有するガラス又はプラスチックの少数の別個の大直径多モードファイバーを備えてよい。例えば、４光学モジュール装置の場合、光ファイババンドル１４は、個々の１ｍｍのコア直径を有する４つの別個の多モードファイバーを含む。束の共通末端部は、一緒に束縛された４つのファイバーを収容する。この実施例において、検出器１８の開口は、８ｍｍであってよく、そしてそれは、４つのファイバーに連結するのに十二分である。
【００２１】
　この実施例では、
光ファイババンドル１４は、光学モジュール１６を単一検出器１８に連結する。
検出器は、単一検出器内に各光ファイバー毎に一つの多重光電子倍増要素
を含んでよい。
（引−７）「【００２６】
　図１の実施例において、試料２２は、ディスク１３のチャンバ内に収容され、制御部２３の制御の状態にあって回転プラットフォームに取付けられる。
スロットセンサトリガ２７は、ディスク回転時データ取得をチャンバ位置と同期させるため、制御部２３及びデータ取得装置２１により利用される出力信号を出力する。
チャンバをディスクに位置決めする。
スロットセンサトリガ２７は、任意の物理的構造体又はメカニズムを使用してよく、それが回転するときディスク１３の放射状位置を位置決めする。光学モジュール１６は、物理的に回転プラットフォーム２５上に実装されてよい。その結果、光学モジュール１６は、同時に異なるチャンバと重なり合わされる。
（引−８）「【００２７】
　又、
検出装置１０は、ディスク１３上の試料２２の温度を調節するための加熱素子（不図示）を含む。
【００２８】
　一部の実施形態において、加熱素子は、空気を加熱し、熱空気を一以上の試料の上に押しあてて、温度を調節する。更に、試料は、直接ディスクにより加熱されてよい。この場合、加熱素子は、プラットフォーム２５内に位置決めされ、熱的にディスク１３に連結されてよい。
加熱素子内部の電気抵抗は、制御部２３により制御してディスクの選択された領域を加熱してよい。
（引−９）「【００３２】
　
データ取得装置２１は、順を追って又は併行して各染料毎に装置１０からデータを収集してよい。
（引−１０）「【００３４】
　リアルタイムのＰＣＲの場合、蛍光を使用し、３つの一般的な技術の一つで増幅の量を測定する。第１の技術は、二本鎖ＤＮＡに結合すると同時にその蛍光が増加する、シブルグリーン（Sybr Green）（オレゴン州、ユーゲン（Eugene）にあるモレキュラープローブス（Molecular Probes））等の染料を使用する。第２の技術は、増幅目標配列に結合されるとその蛍光が変化する蛍光標識プローブを使用する（ハイブリダイゼーションプローブ、ヘアピンプローブ等）。この技術は、二本鎖ＤＮＡ結合染料の使用と類似しているが、より具体的である、というのはプローブが、目標配列の特定の部分のみに結合することになるからである。第３の技術は、ポリメラーゼ酵素のエキソヌクレアーゼ活性が、ＰＣＲの伸長相時プローブからクエンチャー分子を開裂し、蛍光活性にする、加水分解プローブ（（カリフォルニア州、フォスター市（Foster City）にあるアプライドバイオシステムズ（Applied BioSystems）のタクマン（Taqman）（商標））の使用である。」
（引−１１）「【００９１】
　図８は、多重蛍光検出装置１０の機能ブロック図である。特に、図８は、装置構成要素と構成要素を通過する光の一般的な経路間の電気的接続を示す。図８の実施例において、
装置１０は、少なくとも一つのプロセッサ１２２又はその他の制御ロジック、メモリ１２４、ディスクモータ１２６、光源３０、励起フィルター３４、レンズ３８、検出フィルター４０、捕集レンズ４２、検出器１８、スロットセンサトリガ２７、通信インターフェース１３０、加熱素子１３４、レーザ１３６、及び電源１３２を含む。
更に、光源３０、フィルター３４及び４０、レンズ３８並びに捕集レンズ４２は、一つの光学モジュール１６を表す。
【００９２】
　光は、図８の幾つかの構成要素を通過する特定の経路に追従する。ひとたび光が光源３０から発せられると、光は、励起フィルター３４に入り、別の波長の光として出ていく。次に、光は、レンズ３８を通過し、そこで検出装置１０を出て処理チャンバ（不図示）内の試料２２を励起する。試料２２は、異なる波長で蛍光を発することにより応答する、このとき、この蛍光灯（当審注：「蛍光」の誤記であると思われる。）がレンズ３８に入り、検出フィルター４０によってフィルターをかけられる。フィルター４０は、試料２２から所望の蛍光以外の波長のバックグラウンド光を取り除く。残りの光は、捕集レンズ４２を通って伝送され、検出器１８で検出される前に光ファイババンドル１４の脚部に入る。検出器１８は、続いて受容した光信号を増幅する。
【００９３】
　プロセッサ１２２、メモリ１２４、及び通信インターフェース１３０は、制御部２３の一部であってよい。プロセッサ１２２は、ディスクモータ１２６を制御し、必要に応じてディスク１３を回転又はスピンし、蛍光情報を収集又は流体をディスク１３を通って移動する。
プロセッサ１２２は、スロットセンサトリガ２７から受容したディスク場所情報を使用し、回転時ディスク１３
上のチャンバの場所を識別し、ディスクから受容した蛍光データの取得を同期する。
【００９４】
　又、プロセッサ１２２は、光学モジュール１６内の光源３０をオン及びオフする時期を制御してよい。実施形態によっては、プロセッサ１２２は、励起フィルター３４及び検出フィルター４０を制御する。照光されている試料にもよるが、プロセッサ１２２は、フィルターを変更し、励起光の異なる波長が試料に到達し、又は蛍光の異なる波長が捕集レンズ４２に到達するのを可能にする。実施形態によっては、一方又は両方のフィルターが、特定の光学モジュール１６の光源３０に対して最適化されてよいが、プロセッサ１２２によって変更できない。
【００９５】
　捕集レンズ４２は、捕集レンズから検出器１８までの光の光学経路を提供する光ファイババンドル１４の一つの脚部に連結されてよい。プロセッサ１２２は、検出器１８の操作を制御してよい。検出器１８は、絶え間なく全ての光を検出しているが、実施形態によっては他の取得モードを利用してよい。プロセッサ１２２は、検出器１８がデータ収集する時期を決定でき、検出器１８の他の構成パラメーターをプログラムに基づいて設定してよい。一つの実施形態において、検出器１８は、捕集レンズ４２により提供された光から蛍光情報を捕獲する光電子倍増管である。応答して、検出器１８は、受容光を表す出力信号１２８（例えば、アナログ出力信号）を生成する。
図８には示していないが、検出器１８は、装置１０の他の光学モジュール１６から同時に光を受容してよい。その場合、出力信号１２８は、種々の光学モジュール１６から検出器１８によって受容された光学入力の組合せを電気的に表わす。
【００９６】
　又、プロセッサ１２２は、装置１０からのデータの流れを制御してよい。検出器１８から採取された蛍光、加熱素子１３４及び関連センサーからの試料の温度、並びにディスク
回転情報等のデータは、分析のためメモリー１２４に格納されてよい。プロセッサ１２２は、マイクロプロセッサ、デジタル信号プロセッサ（ＤＳＰ）、特定用途向け集積回路（ＡＳＩＣ）、書替え可能ゲートアレイ（ＦＰＧＡ）、又はその他のデジタルロジック回路のいずれか一つ又はそれより多くを備えてよい。更に、プロセッサ１２２は、メモリ１２４等のコンピュータ読み取り可能な媒体に格納されるファームウェア、ソフトウェア又はその組合せのために操作環境を含む。
【００９７】
　メモリ１２４は、種々の情報を格納するための一以上のメモリを含んでよい。例えば、一つのメモリが、特定の構成パラメーター、実行可能な命令を包含し、一つのメモリが、収集されたデータを包含してよい。従って、プロセッサ１２２は、装置の操作及び較正を制御するためメモリ１２４内に保存されたデータを使用してよい。メモリ１２４としては、読み書き可能メモリ（ＲＡＭ）、読み取り専用メモリ（ＲＯＭ）、電気的に消去およびプログラム可能ＲＯＭ（ＥＥＰＲＯＭ）、フラシュメモリ等が挙げられてよい。
【００９８】
　
プロセッサ１２２は、更に加熱素子１３４を制御してよい。メモリ１２４に包含された命令に基づき、加熱素子１３４を選択的に駆動し、所望の加熱プロファイルにより一以上のチャンバの温度を制御してよい。
（引−１２）「【０１０１】
　又、検出装置１０との通信は、高周波（ＲＦ）通信又はローカルエリア・ネットワーク（ＬＡＮ）接続により達成されてよい。更に、結合性は、直接接続、又はハブ若しくはルータ等のネットワークアクセスポイントによって達成されてよい、そしてそれは有線又は無線通信を支援してよい。例えば、検出装置１０は、目的データ取得装置２１による受信のため特定ＲＦ高周波のデータを送信してよい。データ取得装置２１は、汎用のコンピュータ、ノートブック・コンピュータ、手持ち式の演算装置、又は特定用途向け装置であってよい。更に、
複数データ取得装置は、データを同時に受容してよい。
（引−１３）「【図１】
」
（引−１４）「【図２】
」
（引−１５）「【図８】
」
（イ）引用文献に記載された発明について
ａ　上記摘記事項（引−１３）を参酌すると、複数の「光学モジュール（１６）」は空間的に相互に隔離されているものと認められる。
ｂ　上記摘記事項（引−１）ないし（引−１５）及び上記ａに照らすと、引用文献には、
　「リアルタイムＰＣＲ（ポリメラーゼ連鎖反応）における複数目標化学種を検出するための多重蛍光検出装置（１０）であって、
　少なくとも一つのプロセッサ（１２２）又はその他の制御ロジック、メモリ（１２４）、回転ディスク（１３）、光源（３０）、励起フィルター（３４）、レンズ（３８）、検出フィルター（４０）、捕集レンズ（４２）、検出器（１８）、スロットセンサトリガ（２７）、及び加熱素子（１３４）を含み、光源（３０）、フィルター（３４）及び（４０）、レンズ（３８）並びに捕集レンズ（４２）は、一つの光学モジュール（１６）を表し、
　回転ディスク（１３）は、個々の異なる波長で蛍光を発する複数の化学種を含む試料を保持した複数のチャンバを包含し、
　空間的に相互に隔離された４つの異なる染料の光学検出のための４つの光学モジュール（１６）を有し、個々の光学モジュール（１６）は、異なる波長で異なるチャンバを問審でき、任意の所定時間に回転ディスク（１３）の異なる領域を励起し、染料と異なる波長で発せられた蛍光エネルギーを収集し、光ファイババンドル（１４）の一つの脚部に連結し、
　光ファイババンドル（１４）の光ファイバーは、光学モジュール（１６）により収集された蛍光を搬送し、捕獲した光を有効に検出器（１８）に伝送し、
　検出器（１８）は、各光ファイバー毎に一つの多重光電子増倍要素を含んであり、
　スロットセンサトリガ（２７）は、ディスク回転時、データ取得をチャンバ位置と同期させ、データ取得装置（２１）により利用される出力信号を出力し、制御部（２３）が回転ディスク（１３）の放射状位置を位置決めし、その結果、物理的に回転プラットフォーム上に実装された光学モジュール（１６）が、同時に異なるチャンバと重なり合わされ、
　加熱素子（１３４）は、ディスク（１３）上の試料（２２）の温度を調整するためのものであり、回転ディスク（１３）の選択された領域を加熱し、
　プロセッサ（１２２）は、
　　スロットセンサトリガ（２７）から受容したディスク場所情報を使用し、回転ディスク（１３）上のチャンバの場所を識別し、ディスクから受容した蛍光データの取得を同期させ、
　　メモリ（１２４）に包含された命令に基づき、加熱素子（１３４）を選択的に駆動して、所望の加熱プロファイルにより一以上のチャンバの温度を制御し、
　試料（２２）の並行問審を行うため、光学モジュール（１６）が同時に起動され、
　検出器（１８）が、装置（１０）の他の光学モジュール（１６）から同時に光を受容し、
　データ取得装置（２１）が、併行して各染料毎に装置（１０）からデータを収集し、
　各反応の温度を独立して又は選択されたグループとして調整できる、
多重蛍光検出装置。」
の発明（以下、「引用発明」という。）が記載されているものと認められる。  
イ　対比・判断  
（ア）本願補正発明と引用発明との対比  
　以下、本願補正発明と引用発明とを対比する。  
ａ　引用発明の「多重蛍光検出装置（１０）」は、「個々の異なる波長で蛍光を発する複数の化学種を含む試料を保持した複数のチャンバを包含」した「回転ディスク（１３）の異なる領域を励起し、染料と異なる波長で発せられた蛍光エネルギーを収集し、」「検出器（１８）」で検出する装置である。
　すると、引用発明の「多重蛍光検出装置（１０）」は、本願補正発明の「少なくとも２つの異なる試料チャンバ（１０１−１０４）中の複数の試料成分を検出する光多重システム（１００）」に相当する。
ｂ　引用発明は、「リアルタイムＰＣＲ（ポリメラーゼ連鎖反応）における複数目標化学種を検出するための多重蛍光検出装置（１０）」である。
　さらに、引用発明の「光学モジュール（１６）」は、「回転ディスク（１３）の異なる領域を励起し、染料と異なる波長で発せられた蛍光エネルギーを収集し」、「光ファイババンドル（１４）の一つの脚部に連結」され、この「光ファイババンドル（１４）の光ファイバーは、光学モジュール（１６）により収集された蛍光を搬送し、捕獲した光を有効に検出器（１８）に伝送」しており、「各光ファイバー毎に一つ」設けられる「多重光電子増倍要素」は、試料を励起して発した蛍光を検出している。
　すると、引用発明の「光学モジュール（１６）」、「光ファイババンドル（１４）の光ファイバー」及び「各光ファイバー毎に一つ」設けられる「多重光電子増倍要素」と、本願補正発明の「第１のポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）の生成物の検出を行うための第１の光学ユニット（１０６）」及び「第２のポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）の生成物の検出を行うための第２の光学ユニット（１０７）」とは、「ポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）の生成物の検出を行うための光学検出手段」という点で共通する。
ｃ　上記ｂに照らして、引用発明の「光学モジュール（１６）」を構成する「光源（３０）」と、本願補正発明の「第１光学ユニット」が含む「第１の光源（１０８）」及び「第２光学ユニット」が含む「第２の光源（１１０）」とは、「ポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）の生成物の検出を行うための光学検出手段が含む光源」という点で共通する。
　同様に、引用発明の「各光ファイバー毎に一つ」設けられる「多重光電子増倍要素」と、本願補正発明の「第１光学ユニット」が含む「第１の検出器（１０９）」及び「第２光学ユニット」が含む「第２の検出器（１１１）」とは、「ポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）の生成物の検出を行うための光学検出手段が含む検出器」という点で共通する。
ｄ　上記ｂに照らして、引用発明が「４つの異なる染料の光学検出のための４つの光学モジュール（１６）」を有し、各「光学モジュール（１６）」に連結される光ファイバー毎に「多重光電子増倍要素」を一つ設けることと、本願補正発明が「第１のポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）の生成物の検出を行うための第１の光学ユニット（１０６）」及び「第２のポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）の生成物の検出を行うための第２の光学ユニット（１０７）」を有することとは、「異なるポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）の生成物の検出を行うために複数の光学検出手段を有する」という点で共通する。
ｅ　引用発明の「所望の加熱プロファイルにより一以上のチャンバの温度を制御」する「加熱素子（１３４）」と、本願補正発明の「少なくとも２つの異なる試料チャンバの第１の試料チャンバと関連する第１のヒータであって」、「前記第１の試料チャンバにおいて第１の温度経過を形成する、第１のヒータ」及び「少なくとも２つの異なる試料チャンバの第２の試料チャンバと関連する第２のヒータであって」、「前記第２の試料チャンバにおいて第２の温度経過を形成する、第２のヒータ」とは、「試料チャンバと関連するヒータであって、試料チャンバにおいて所定の温度経過を形成する、ヒータ」という点で共通する。
ｆ　引用発明の「多重蛍光検出装置」は、「回転ディスク（１３）」が「個々の異なる波長で蛍光を発する複数の化学種を含む試料を保持した複数のチャンバを包含」しており、「４つの異なる染料の光学検出のための４つの光学モジュール（１６）を有し、個々の光学モジュール（１６）は、異なる波長で異なるチャンバを問審でき」るものであるから、「回転ディスク（１３）」の「複数のチャンバ」では、異なるポリメラーゼ連鎖反応が起こっているといえる。
　さらに、引用発明は、「加熱素子（１３４）を選択的に駆動して所望の加熱プロファイルにより」「チャンバの温度を制御」し、「各反応の温度を独立して調整できる」のであるから、異なるポリメラーゼ連鎖反応が生じる複数のチャンバに対して、それぞれ「加熱素子（１３４）」を設け、各ポリメラーゼ連鎖反応に対応した温度プロファイルで「チャンバ」の温度を制御していることは明らかである。
　すると、上記ｅに照らし、引用発明が、異なるポリメラーゼ連鎖反応が生じる複数の「チャンバ」に対応するように複数の「加熱素子（１３４）」を有することと、本願補正発明が、「前記少なくとも２つの異なる試料チャンバの第１の試料チャンバと関連する第１のヒータであって、前記第１のヒータは、前記第１の試料チャンバにおいて第１の温度経過を形成する、第１のヒータと、前記少なくとも２つの異なる試料チャンバの第２の試料チャンバと関連する第２のヒータであって、前記第２のヒータは、前記第２の試料チャンバにおいて第２の温度経過を形成する、第２のヒータ」を有することとは、「少なくとも２つの異なる試料チャンバそれぞれに設けられるヒータであって、各ヒータは、対応する試料チャンバにおいて所定の温度経過を形成する複数のヒータ」という点で共通する。
ｇ　引用発明の「メモリ（１２４）に包含された命令に基づき、加熱素子（１３４）を選択的に駆動して、所望の加熱プロファイルにより一以上のチャンバの温度を制御」する「プロセッサ（１２２）」は、本願補正発明の「ＰＣＲプロトコルを受け取る制御ユニット」に相当する。
ｈ　引用発明が、「試料（２２）の並行問審を行うため、光学モジュール（１６）が同時に起動され、検出器（１８）が、装置（１０）の他の光学モジュール（１６）から同時に光を受容」することと、本願補正発明が「（ａ）前記第１の光源および前記第２の光源によって、それぞれ、前記少なくとも２つの試料チャンバを同時に照明し、かつ、（ｂ）前記第１の検出器および前記第２の検出器によってそれぞれ前記少なくとも２つの試料チャンバからの光を同時に受信する」こととは、「（ａ）複数の光学検出手段の光源によって、それぞれ、複数の試料チャンバを同時に照明し、かつ、（ｂ）複数の光学検出手段の検出器によってそれぞれ前記複数の試料チャンバからの光を同時に受信する」という点で共通する。
ｉ　引用発明の「４つの光学モジュール（１６）」が空間的に相互に隔離されていることと、本願補正発明の「前記第１の光学ユニットおよび前記第２の光学ユニット」が「空間的に相互に離隔されて」いることは、「複数の光学検出手段が空間的に相互に隔離されている」という点で共通する。
ｊ　上記ｉに照らして、引用発明が、「空間的に相互に隔離され」、「異なる波長で異なるチャンバを問審する」「４つの光学モジュール（１６）」を有し、「制御部（２３）が回転ディスク（１３）の放射状位置を位置決めし、その結果、光学モジュール（１６）が、同時に異なるチャンバと重なり合わされ」、「試料（２２）の並行問審を行うため」、「光学モジュール（１６）が同時に起動され」、「検出器（１８）が、装置（１０）の他の光学モジュール（１６）から同時に光を受容し」、「データ取得装置（２１）が、併行して各染料毎に装置（１０）からデータを収集」することと、本願補正発明の「前記少なくとも２つの試料チャンバを、前記第１の光学ユニットおよび前記第２の光学ユニットに対応する位置で受け取り、ここで、前記第１の光学ユニットおよび前記第２の光学ユニットは、空間的に相互に離隔された前記第１の光学ユニットおよび前記第２の光学ユニットのそれぞれの試料チャンバにおいて、２つの異なる光波長を用いて、第１の光学測定および第２の光学測定を同時に行」うこととは、「少なくとも２つの試料チャンバを、各光学検出手段に対応する位置で受け取り、ここで、各光学検出手段は、空間的に相互に離隔された各光学検出手段のそれぞれの試料チャンバにおいて、異なる光波長を用いて、複数の光学測定を同時に行う」点で共通する。
ｋ　引用発明が「制御部（２３）が回転ディスク（１３）の放射状位置を位置決めし、その結果、物理的に回転プラットフォーム上に実装された光学モジュール（１６）が、同時に異なるチャンバと重なり合わされ」、「試料（２２）の並行問審を行うため、光学モジュール（１６）が同時に起動され」、「検出器（１８）が、装置（１０）の他の光学モジュール（１６）から同時に光を受容」することと、本願補正発明が「前記第１の光学ユニットおよび前記第２の光学ユニットを前記少なくとも２つの試料チャンバに対して相対運動させる（１１３）ことにより、前記第１の光学ユニットが第２の試料チャンバに位置合わせされ、かつ、前記第２の光学ユニットが第１の試料チャンバに位置合わせされることを可能にするように構成されており、前記相対運動が生じるたびに、各光学ユニットと各試料チャンバとの間の位置合わせによって、各光学ユニットから放出される光子の伝搬経路が各試料チャンバへの光学的なアクセスにマッチングされて」いることとは、「複数の光学検出手段を少なくとも２つの試料チャンバに対して相対運動させることにより、各光学検出手段が、それぞれ対応する試料チャンバに位置合わせされることを可能にするように構成されており、前記相対運動が生じるたびに、各光学検出手段と各試料チャンバとの間の位置合わせによって、各光学検出手段から放出される光子の伝搬経路が各試料チャンバへの光学的なアクセスにマッチングされて」いるという点で共通する。
ｌ　引用発明は、「リアルタイムＰＣＲ（ポリメラーゼ連鎖反応）における複数目標化学種を検出するための多重蛍光検出装置（１０）」であるから、「蛍光データの取得」とは、「増幅された目標ＤＮＡ分子のデータの取得」を意味していることは明らかである。そうすると、上記ｆに照らして、引用発明の「プロセッサ（１２２）」が「メモリ（１２４）に包含された命令に基づき、加熱素子（１３４）を選択的に駆動して、所望の加熱プロファイルにより一以上のチャンバの温度を制御し」、「回転ディスク（１３）上のチャンバの場所を識別し」、「同時に異なるチャンバと重なり合わされ」た「光学モジュール（１６）」による「蛍光データの取得を同期させ」ることと、本願補正発明の「前記制御ユニットは、前記ＰＣＲプロトコルにしたがって、前記第１の試料チャンバおよび前記第２の試料チャンバにおいてリアルタイムＰＣＲ反応を生じさせるように、前記第１のヒータおよび前記第２のヒータを制御し、前記制御ユニットは、前記少なくとも２つの試料チャンバに対して、前記第１の光学ユニットおよび前記第２の光学ユニットを相対運動させることにより増幅された目標ＤＮＡ分子を同時に定量化する」こととは、「制御ユニットは、ＰＣＲプロトコルにしたがって、複数の試料チャンバにおいてリアルタイムＰＣＲ反応を生じさせるように、複数のヒータを制御し、前記制御ユニットは、少なくとも２つの試料チャンバに対して、複数の光学検出手段を相対運動させることにより増幅された目標ＤＮＡ分子のデータを同時に取得する」という点で共通する。
ｍ　してみると、本願補正発明と引用発明とは、次の一致点で一致し、次の各相違点で相違している。 
《一致点》
　「少なくとも２つの異なる試料チャンバ中の複数の試料成分を検出する光多重システムであって、
　該光多重システムは、
　異なるポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）の生成物の検出を行うための複数の光学検出手段と、
　少なくとも２つの異なる試料チャンバそれぞれに設けられるヒータであって、各ヒータは、対応する試料チャンバにおいて所定の温度経過を形成する複数のヒータと、
　ＰＣＲプロトコルを受け取る制御ユニットと
　を有しており、複数の光学検出手段は空間的に相互に隔離されており、前記複数の光学検出手段はそれぞれ光源および検出器を含み、
　前記光多重システムは、
  （ａ）複数の光学検出手段の光源によって、それぞれ、複数の試料チャンバを同時に照明し、かつ、（ｂ）複数の光学検出手段の検出器によってそれぞれ前記複数の試料チャンバからの光を同時に受信するように、少なくとも２つの試料チャンバを、各光学検出手段に対応する位置で受け取り、ここで、各光学検出手段は、空間的に相互に離隔された各光学検出手段のそれぞれの試料チャンバにおいて、異なる光波長を用いて、複数の光学測定を同時に行い、
　複数の光学検出手段を少なくとも２つの試料チャンバに対して相対運動させることにより、各光学検出手段が、それぞれ対応する試料チャンバに位置合わせされることを可能にするように構成されており、
　前記相対運動が生じるたびに、各光学検出手段と各試料チャンバとの間の位置合わせによって、各光学検出手段から放出される光子の伝搬経路が各試料チャンバへの光学的なアクセスにマッチングされており、
　前記制御ユニットは、ＰＣＲプロトコルにしたがって、複数の試料チャンバにおいてリアルタイムＰＣＲ反応を生じさせるように、複数のヒータを制御し、前記制御ユニットは、少なくとも２つの試料チャンバに対して、複数の光学検出手段を相対運動させることにより増幅された目標ＤＮＡ分子のデータを同時に取得する、
　光多重システム。」
である点。
《相違点１》
　異なるポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）の生成物の検出を行うための光学検出手段として、本願補正発明が「光学ユニット」を２つ備えているのに対して、「光学モジュール（１６）」及び光学モジュール毎に設けられる「多重光電子増倍要素」を４組備える点。
《相違点２》
　本願補正発明が、「第１の光学ユニット（１０６）」に「第１の検出器（１０９）」、「第２の光学ユニット（１０７）」に「第２の検出器（１１１）」を含むのに対して、引用発明の「光学モジュール（１６）」は検出器を含んでおらず、光ファイバーで「検出器（１８）」の「多重光電子増倍要素」と連結されている点。
《相違点３》
　本願補正発明が、「増幅された目標ＤＮＡ分子を定量化」しているのに対して、引用発明は、増幅された目標ＤＮＡ分子の定量化を行っているか不明である点。
（イ）当審の判断
ａ　相違点についての検討
（ａ）相違点１について
　「光多重システム」を構成するにあたり、光学検出手段を幾つ設けるかは、検出を行うポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）の数によって決定される事項である。
　したがって、引用発明において、ポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）の生成物の検出手段の数を２つとすることは、装置設計上の要請に基づき、当業者が適宜なし得ることであるといえる。
（ｂ）相違点２について
　「蛍光分析装置」の技術分野において、１つの光学モジュール内に、励起用光源と蛍光検出器を設けることは、例えば、本願の優先日前に頒布され、原査定の拒絶の理由において周知例として引用された刊行物である特表２００７−５０４４７７号公報（以下、「周知例１」という。）や本願の優先日前に頒布された刊行物である特表２００８−５４４２５４号公報（以下、「周知例２」という。）にそれぞれ開示されているように周知の装置構成技術である。
　したがって、引用発明において、「光ファイバー」と「多重光電子増倍要素」を連結する複雑な構造に代えて、励起用光源と蛍光検出器を１つの光学モジュールに設けて一体化する上記周知技術を採用し、「多重光電子増倍要素」を「光学モジュール（１６）」に含ませることは、設計的事項であるというべきである。
（ｃ）相違点３について
　上記摘記事項（引−１０）には、リアルタイムＰＣＲ測定において、目標ＤＮＡ分子の増幅の量を測定することが記載されている。そして、「リアルタイムＰＣＲ測定装置」の技術分野において、異なる波長を用いて複数のＤＮＡ分子を同時に定量化することは、例えば、本願の優先日前に頒布された刊行物である特表２００７−２２２１６０号公報（以下、「周知例３」という。特に、公報【００１２】段参照。）及び本願の優先日前に頒布された刊行物である特表２００４−５０４０３６号公報（以下、「周知例４」という。特に、公報【００９４】段参照。）にそれぞれ開示されているとおり周知技術である。
　すると、引用文献の記載事項及び上記周知技術に基づき、異なる波長で同時に問審可能なリアルタイムＰＣＲ測定手段である引用発明を、複数のＤＮＡ分子を同時に定量化するために使用することは、当業者によって容易に想起されることである。
ｂ　本願補正発明の奏する作用・効果についての検討 
　本願補正発明によってもたらされる作用・効果は、引用文献の記載事項並びに上記周知技術から当業者が予測し得る程度のものであって、格別なものではない。 
ウ　小括
　以上のとおりであるから、本願補正発明は、引用発明及び上記周知技術に基づき、当業者が容易に発明をすることができたものであるから、特許法第２９条第２項の規定により特許出願の際独立して特許を受けることができないものである。 
３　補正却下の決定のまとめ 
　以上のとおり、上記２（１）に説示したように、本件補正は、特許法第１７条の２第５項各号に掲げるいずれの事項を目的とするものでもない。
　また、仮に本件補正が、特許請求の範囲の減縮を目的とするものであるとしても、上記２（２）で検討したように、本願補正発明は、同法第２９条第２項に規定する要件を満たしておらず、特許出願の際に独立して特許を受けることができるものであるということはできないから、本件補正は、同法第１７条の２第６項において準用する同法第１２６条第７項の規定に違反するものである。
　したがって、本件補正は、同法１５９条第１項の規定において読み替えて準用する同法第５３条第１項の規定により却下すべきものである。
　よって、補正の却下の決定の結論のとおり決定する。  
第３　本願発明について 
１　本願発明 
　平成２６年１０月２日付けの手続補正は上記のとおり却下されたので、本願の請求項１ないし１３に係る発明は、平成２６年５月９日付け手続補正書により補正された特許請求の範囲の請求項１ないし１３に記載された事項により特定されるものであって、そのうち、請求項１に係る発明は以下のとおりのものである（以下、同請求項１に係る発明を「本願発明」という。）。 
　「【請求項１】
　少なくとも２つの異なる試料チャンバ（１０１−１０４）中の複数の試料成分を検出する光多重システム（１００）であって、
　該光多重システムは第１の光学ユニット（１０６）と第２の光学ユニット（１０７）とを有しており、前記第１の光学ユニットおよび前記第２の光学ユニットは空間的に相互に離隔されており、前記第１の光学ユニットは第１の光源（１０８）および第１の検出器（１０９）を含み、前記第２の光学ユニットは第２の光源（１１０）および第２の検出器（１１１）を含み、
　前記光多重システムは、
　前記第１の光源および前記第２の光源によってそれぞれ少なくとも１つの試料チャンバを照明し、かつ、前記第１の検出器および前記第２の検出器によってそれぞれ少なくとも１つの試料チャンバからの光を受信するように、少なくとも２つの試料チャンバを各光学ユニットに対応する位置で受け取り、
　前記第１の光学ユニットおよび前記第２の光学ユニットを前記少なくとも２つの試料チャンバに対して相対運動させる（１１３）ことにより、前記第１の光学ユニットが第２の試料チャンバに位置合わせされ、かつ、前記第２の光学ユニットが第１の試料チャンバに位置合わせされることを可能にする
ように構成されており、
　前記相対運動が生じるたびに、各光学ユニットと各試料チャンバとの間の位置合わせによって、各光学ユニットから放出される光子の伝搬経路が各試料チャンバへの光学的なアクセスにマッチングされている、
ことを特徴とする光多重システム。」
２　引用文献の記載事項 
　原査定の拒絶の理由に引用された引用文献の記載事項、周知例１及び周知例２に開示された周知技術に関しては、上記第２の２（２）ア及び上記第２の２（２）イ（イ）ａ（ｂ）においてそれぞれ示したとおりである。
３　本願発明と引用発明との対比 
　本願発明は、上記第２の２（２）で検討した本願補正発明において、「第１の光学ユニット（１０６）」について「第１のポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）の生成物の検出を行うため」という発明特定事項、「第２の光学ユニット（１０７）」について「第２のポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）の生成物の検出を行うため」という発明特定事項、「光多重システム」が「少なくとも２つの異なる試料チャンバの第１の試料チャンバと関連する第１のヒータであって、前記第１のヒータは、前記第１の試料チャンバにおいて第１の温度経過を形成する、第１のヒータ」と、「少なくとも２つの異なる試料チャンバの第２の試料チャンバと関連する第２のヒータであって、前記第２のヒータは、前記第２の試料チャンバにおいて第２の温度経過を形成する、第２のヒータ」と、「ＰＣＲプロトコルを受け取る制御ユニット」を有するという発明特定事項、第１の光源および第２の光源による試料チャンバの照明について、「少なくとも２つの試料チャンバを同時に照明」するという発明特定事項、第１の検出器および第２の検出器による試料チャンバからの光の受信について、「少なくとも２つの試料チャンバからの光を同時に受信する」という発明特定事項、少なくとも２つの試料チャンバの受け取りを、「前記第１の光学ユニットおよび前記第２の光学ユニットに対応する位置」で行うという発明特定事項、光多重システムが「前記第１の光学ユニットおよび前記第２の光学ユニットは、空間的に相互に離隔された前記第１の光学ユニットおよび前記第２の光学ユニットのそれぞれの試料チャンバにおいて、２つの異なる光波長を用いて、第１の光学測定および第２の光学測定を同時に行」うという発明特定事項、及び、「制御ユニット」が「前記ＰＣＲプロトコルにしたがって、前記第１の試料チャンバおよび前記第２の試料チャンバにおいてリアルタイムＰＣＲ反応を生じさせるように、前記第１のヒータおよび前記第２のヒータを制御し、前記制御ユニットは、前記少なくとも２つの試料チャンバに対して、前記第１の光学ユニットおよび前記第２の光学ユニットを相対運動させることにより増幅された目標ＤＮＡ分子を同時に定量化する」という発明特定事項が無いものである。
　したがって、本願発明と引用発明とは、次の一致点で一致し、次の各相違点で相違している。 
《一致点》 
　「少なくとも２つの異なる試料チャンバ中の複数の試料成分を検出する光多重システムであって、
　該光多重システムは、
　複数の光学検出手段を有しており、複数の光学検出手段は空間的に相互に隔離されており、前記複数の光学検出手段はそれぞれ光源および検出器を含み、
　前記光多重システムは、
  複数の光学検出手段の光源によって、それぞれ少なくとも１つの試料チャンバを照明し、かつ、複数の光学検出手段の検出器によってそれぞれ少なくとも１つの試料チャンバからの光を受信するように、少なくとも２つの試料チャンバを、各光学検出手段に対応する位置で受け取り、
　複数の光学検出手段を少なくとも２つの試料チャンバに対して相対運動させることにより、各光学検出手段が、それぞれ対応する試料チャンバに位置合わせされることを可能にするように構成されており、
　前記相対運動が生じるたびに、各光学検出手段と各試料チャンバとの間の位置合わせによって、各光学検出手段から放出される光子の伝搬経路が各試料チャンバへの光学的なアクセスにマッチングされている、
　光多重システム。」
である点。
《相違点１》
　光学検出手段として、本願補正発明が「光学ユニット」を２つ備えているのに対して、「光学モジュール（１６）」及び光学モジュール毎に設けられる「多重光電子増倍要素」を４組備える点。
《相違点２》
  本願補正発明が、「第１の光学ユニット（１０６）」に「第１の検出器（１０９）」、「第２の光学ユニット（１０７）」に「第２の検出器（１１１）」を含むのに対して、引用発明の「光学モジュール（１６）」は検出器を含んでおらず、光ファイバーで「検出器（１８）」の「多重光電子増倍要素」と連結されている点。
４　当審の判断
（１）相違点についての検討
ア　相違点１について 
　上記第２の２（２）イ（イ）ａ（ａ）において説示したように、引用発明において、光学検出手段の数を２つとすることは、装置の具体化に伴う設計的事項にすぎない。 
イ　相違点２について 
　上記第２の２（２）イ（イ）ａ（ｂ）において説示したように、「蛍光分析装置」の技術分野において、１つの光学モジュール内に、励起用光源と蛍光検出器を設けることは、周知例１や周知例２にそれぞれ開示されているように周知なのであるから、引用発明において、「光ファイバー」と「多重光電子増倍要素」を連結する複雑な構造に代えて、上記周知技術を採用し、「多重光電子増倍要素」を「光学モジュール（１６）」に含む構成とすることは、設計変更の域を出ない。
（２）本願発明の奏する作用・効果についての検討 
　本願発明によってもたらされる作用・効果は、引用文献の記載事項並びに上記周知技術から当業者が予測し得る程度のものであって、格別なものではない。 
５　むすび 
　以上のとおり、本願発明は、本願出願前に頒布された上記引用文献に記載された発明及び周知技術に基づいて当業者が容易に発明をすることができたものであるから、特許法第２９条第２項の規定により特許を受けることができない。  
　したがって、本願発明が特許を受けることができないものである以上、本願の請求項２ないし２２に係る発明について検討するまでもなく、本願は拒絶すべきものである。  
　よって、結論のとおり審決する。