【手続補正書】
【提出日】令和2年9月8日(2020.9.8)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
インビトロで養子免疫療法のためにBKウイルス特異的Tリンパ球を増殖させる方法であって、
(i)対象から単離された1つ以上の細胞を表1〜3に列挙されたエピトープのうちの1個以上を含むタンパク質と接触させること、及び
(ii)BKウイルス特異的Tリンパ球が前記1つ以上の細胞から増殖するような条件下で1つ以上の細胞を培養すること
を含む方法。
【請求項２】
インビトロで養子免疫療法のためにJCウイルス特異的Tリンパ球を増殖させる方法であって、
(i)対象から単離された1つ以上の細胞を表1〜3に列挙されたエピトープのうちの1個以上を含むタンパク質と接触させること、及び
(ii)JCウイルス特異的Tリンパ球が前記1つ以上の細胞から増殖するような条件下で1つ以上の細胞を培養すること
を含む方法。
【請求項３】
1個以上のエピトープが、表1に列挙されたBKウイルス(BKV)エピトープ、表2に列挙されたJCウイルス(JCV)エピトープ、又は表3によるハイブリッドエピトープを含む、請求項1又は2に記載の方法。
【請求項４】
請求項1〜3のいずれか一項に記載の方法により製造された増殖させたTリンパ球を含む、対象においてポリオーマウイルス感染症又はがんの処置又は予防に使用するための組成物。
【請求項５】
ポリオーマウイルス感染症がBKV感染症、JCV感染症又はMCV感染症である、請求項4に記載の組成物。
【請求項６】
請求項1〜3のいずれか一項に記載の方法により製造された増殖させたBKウイルス特異的Tリンパ球を含む、対象においてポリオーマウイルス関連がんの処置又は予防に使用するための組成物。
【請求項７】
ポリオーマウイルス関連がんがBKV関連がん、JCV関連がん又はMCV関連がんである、請求項6に記載の組成物。
【請求項８】
表1〜3に列挙されたエピトープのうちの1個以上を含む単離されたタンパク質。
【請求項９】
1個以上のエピトープが、表1に列挙されたBKウイルス(BKV)エピトープ、表2に列挙されたJCウイルス(JCV)エピトープ又は表3によるハイブリッドエピトープを含む、請求項8に記載の単離されたタンパク質。
【請求項１０】
ペプチドが表1〜3に列挙された複数のエピトープを含む、請求項8又は9に記載の単離されたタンパク質。
【請求項１１】
複数のエピトープのうちの少なくとも2個の間に介在アミノ酸配列をさらに含む、請求項10に記載の単離されたタンパク質。
【請求項１２】
タンパク質が、対象への投与時に免疫反応を誘発することができる、請求項8〜11のいずれか一項に記載の単離されたタンパク質。
【請求項１３】
エピトープが、HLA-A1、-A2、-A3、-A11、-A23、-A24、-A26、-A29、-A30、-B7、-B8、-B27、-B35、-B38、-B40、-B41、-B44、-B51、-B56、-B57又は-B58に対するHLAクラスI拘束性を有する、請求項8〜12のいずれか一項に記載の単離されたタンパク質。
【請求項１４】
エピトープが、HLA-DP、-DM、-DOA、-DOB、-DQ、又は-DRに対するHLAクラスII拘束性を有する、請求項8〜12のいずれか一項に記載の単離されたタンパク質。
【請求項１５】
単離されたタンパク質が、配列番号5、6、36、41及び42に記載されるエピトープアミノ酸配列を含む、請求項8〜14のいずれか一項に記載の単離されたタンパク質。
【請求項１６】
単離されたタンパク質が、メルケル細胞ウイルス(MCV)由来の1個以上のエピトープをさらに含む、請求項8〜15のいずれか一項に記載の単離されたタンパク質。
【請求項１７】
非ポリオーマウイルス由来の1個以上のエピトープをさらに含む、請求項8〜16のいずれか一項に記載の単離されたタンパク質。
【請求項１８】
非ポリオーマウイルス由来の1個以上のエピトープが、アデノウイルス(ADV)、エプスタインバーウイルス(EBV)又はサイトメガロウイルス(CMV)由来の1個以上のエピトープを含む、請求項17に記載の単離されたタンパク質。
【請求項１９】
請求項8〜18のいずれか一項に記載の単離されたタンパク質をコードする単離された核酸。
【請求項２０】
請求項19に記載の単離された核酸を含む発現構築物。
【請求項２１】
請求項20に記載の発現構築物を含む宿主細胞。
【請求項２２】
請求項8〜18のいずれか一項に記載の単離されたタンパク質、及び薬学的に許容される担体を含むワクチン組成物。
【請求項２３】
アジュバントをさらに含む、請求項22に記載のワクチン組成物。
【請求項２４】
対象においてポリオーマウイルス感染症の処置又は予防に使用するための、請求項22又は23に記載のワクチン組成物。
【請求項２５】
ポリオーマウイルス感染症がBKウイルス(BKV)感染症、JCウイルス(JCV)感染症又はメルケル細胞ウイルス(MCV)感染症である、請求項24に記載のワクチン組成物。
【請求項２６】
対象においてポリオーマウイルス関連がんの処置又は予防に使用するための、請求項22又は23に記載のワクチン組成物。
【請求項２７】
ポリオーマウイルス関連がんがBKV関連がん、JCV関連がん又は又はMCV関連がんである、請求項26に記載のワクチン組成物。
【請求項２８】
対象においてTリンパ球免疫反応の誘導に使用するための、請求項22〜27のいずれか一項に記載のワクチン組成物。
【請求項２９】
対象から単離されたTリンパ球を請求項8〜18のいずれか一項に記載の単離されたタンパク質と接触させることによって、BKV特異的Tリンパ球の存在を検出することを含む、対象においてBKウイルス感染を検出する方法。
【請求項３０】
対象が免疫不全である、請求項1、2、3又は29に記載の方法。
【請求項３１】
表1〜3に列挙された1個以上のエピトープを認識するT細胞受容体(TCR)を含む細胞傷害性T細胞(CTL)を含む、対象においてポリオーマウイルス感染症又はポリオーマウイルス関連がんの処置又は予防に使用するための医薬組成物。
【請求項３２】
対象においてポリオーマウイルス感染症又はポリオーマウイルス関連がんを処置又は予防するための医薬の製造における、請求項1〜3のいずれか一項に記載の方法により製造された増殖させたTリンパ球の使用。
【請求項３３】
対象においてポリオーマウイルス関連がんを処置又は予防するための医薬の製造における、請求項1〜3のいずれか一項に記載の方法により製造された増殖させたBKウイルス特異的Tリンパ球の使用。
【請求項３４】
対象においてポリオーマウイルス感染症又はポリオーマウイルス関連がんを処置又は予防するための医薬の製造における、表1〜3に列挙された1個以上のエピトープを認識するT細胞受容体(TCR)を含む細胞傷害性T細胞(CTL)を含む医薬組成物の使用。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００７９
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００７９】
一部の実施形態において、方法は、対象のHLA型を決定することを含む。一部の実施形態において、対象は、対象が本明細書に提供されるエピトープに拘束されたHLAを発現する場合に、本明細書で提供される方法による処置に適していると同定される。いくつかの実施形態において、本明細書で提供される方法はさらに、本明細書で提供される治療方法を使用して上記同定された対象を処置すること（例えば、本明細書に提供される医薬組成物を対象に投与することによる）を含む。一部の実施形態において、対象には、本明細書に記載のCTLを含む組成物が投与され、該CTLは、対象により発現されるHLAに拘束されたHLAである本明細書に提供されるエピトープを認識するTCRを含む。一部の実施形態において、対象には、対象により発現されるHLAに拘束されたHLAである本明細書において提供されるエピトープを含むポリペプチドを含む組成物が投与される。一部の実施形態において、対象には、対象により発現されるHLAに拘束されたHLAである本明細書において提供されるエピトープを含むポリペプチドを提示するAPCを含む組成物が投与される。一部の実施形態において、対象には、対象により発現されるHLAに拘束されたHLAである本明細書において提供されるエピトープを含むポリペプチドをコードする核酸を含む組成物が投与される。
本発明は、例えば以下の実施形態を包含する：
［実施形態１］表1〜3に列挙されたエピトープのうちの1個以上を含む単離されたタンパク質。
［実施形態２］1個以上のエピトープが、表1に列挙されたBKウイルス(BKV)エピトープを含む、実施形態1に記載の単離されたタンパク質。
［実施形態３］1個以上のエピトープが、表2に列挙されたJCウイルス(JCV)エピトープを含む、実施形態1に記載の単離されたタンパク質。
［実施形態４］1個以上のエピトープが、表3によるハイブリッドエピトープを含む、実施形態1に記載の単離されたタンパク質。
［実施形態５］ペプチドが表1〜3に列挙された複数のエピトープを含む、実施形態1〜4のいずれかに記載の単離されたタンパク質。
［実施形態６］複数のエピトープが、表1に列挙された複数のBKVエピトープを含む、実施形態5に記載の単離されたタンパク質。
［実施形態７］複数のエピトープが、表2に列挙された複数のJCVエピトープを含む、実施形態5に記載の単離されたタンパク質。
［実施形態８］複数のエピトープが、表1に列挙されたBKVエピトープ及び表2に列挙されたJCVエピトープを含む、実施形態5に記載の単離されたタンパク質。
［実施形態９］複数のエピトープのうちの少なくとも2個の間に介在アミノ酸配列をさらに含む、実施形態5〜9のいずれかに記載の単離されたタンパク質。
［実施形態１０］タンパク質が、対象への投与時に免疫反応を誘発することができる、実施形態1〜9のいずれかに記載の単離されたタンパク質。
［実施形態１１］エピトープが、広範囲のヒト集団を提供するように選択される、実施形態1〜10のいずれかに記載の単離されたタンパク質。
［実施形態１２］エピトープが、HLA-A1、-A2、-A3、-A11、-A23、-A24、-A26、-A29、-A30、-B7、-B8、-B27、-B35、-B38、-B40、-B41、-B44、-B51、-B56、-B57又は-B58に対するHLAクラスI拘束性を有する、実施形態11に記載の単離されたタンパク質。
［実施形態１３］エピトープが、HLA-DP、-DM、-DOA、-DOB、-DQ、又は-DRに対するHLAクラスII拘束性を有する、実施形態11に記載の単離されたタンパク質。
［実施形態１４］エピトープが、HLA-DRB又は-DQBに対するHLAクラスII拘束性を有する、実施形態13に記載の単離されたタンパク質。
［実施形態１５］単離されたタンパク質が、配列番号5、6、36、41及び42に記載されるエピトープアミノ酸配列を含む、実施形態1〜14のいずれかに記載の単離されたタンパク質。
［実施形態１６］単離されたタンパク質が、配列番号5、6、36、41及び42に記載されるエピトープアミノ酸配列から本質的になる、実施形態1〜8のいずれかに記載の単離されたタンパク質。
［実施形態１７］単離されたタンパク質が、配列番号5、6、36、41及び42に記載されるエピトープアミノ酸配列からなる、実施形態1〜8のいずれかに記載の単離されたタンパク質。
［実施形態１８］単離されたタンパク質が、メルケル細胞ウイルス(MCV)由来の1個以上のエピトープをさらに含む、実施形態1〜17のいずれかに記載の単離されたタンパク質。
［実施形態１９］非ポリオーマウイルス由来の1個以上のエピトープをさらに含む、実施形態1〜18のいずれかに記載の単離されたタンパク質。
［実施形態２０］非ポリオーマウイルス由来の1個以上のエピトープが、アデノウイルス(ADV)、エプスタインバーウイルス(EBV)又はサイトメガロウイルス(CMV)由来の1個以上のエピトープを含む、実施形態19に記載の単離されたタンパク質。
［実施形態２１］実施形態1〜20のいずれかに記載の単離されたタンパク質をコードする単離された核酸。
［実施形態２２］実施形態21に記載の単離された核酸を含む発現構築物。
［実施形態２３］実施形態22に記載の発現構築物を含む宿主細胞。
［実施形態２４］実施形態23に記載の宿主細胞中で単離されたタンパク質を発現させること、及び単離されたタンパク質を少なくとも部分的に精製することを含む、単離されたタンパク質を製造する方法。
［実施形態２５］実施形態1〜20のいずれかに記載の単離されたタンパク質、及び薬学的に許容される担体を含む医薬組成物。
［実施形態２６］実施形態21に記載の単離された核酸を含む医薬組成物。
［実施形態２７］実施形態1〜20のいずれかに記載の単離されたタンパク質、及び薬学的に許容される担体を含むワクチン組成物。
［実施形態２８］アジュバントをさらに含む、実施形態27に記載のワクチン組成物。
［実施形態２９］実施形態25若しくは実施形態26に記載の医薬組成物、又は実施形態27若しくは実施形態28に記載のワクチン組成物を対象に投与することを含む、対象においてポリオーマウイルス感染症を処置又は予防する方法。
［実施形態３０］ポリオーマウイルス感染症がBKウイルス(BKV)感染症である、実施形態29に記載の方法。
［実施形態３１］ポリオーマウイルス感染症がJCウイルス(JCV)感染症である、実施形態29に記載の方法。
［実施形態３２］ポリオーマウイルス感染症がメルケル細胞ウイルス(MCV)感染症である、実施形態29に記載の方法。
［実施形態３３］実施形態25若しくは実施形態26に記載の医薬組成物、又は実施形態27若しくは実施形態28に記載のワクチン組成物を対象に投与することを含む、対象においてポリオーマウイルス関連がんを処置又は予防する方法。
［実施形態３４］ポリオーマウイルス関連がんがBKV関連がんである、実施形態33に記載の方法。
［実施形態３５］ポリオーマウイルス関連がんがJCV関連がんである、実施形態33に記載の方法。
［実施形態３６］ポリオーマウイルス関連がんがMCV関連がんである、実施形態33に記載の方法。
［実施形態３７］実施形態25若しくは実施形態26に記載の医薬組成物、又は実施形態27若しくは実施形態28に記載のワクチン組成物を対象に投与することを含む、対象においてTリンパ球免疫反応を誘導する方法。
［実施形態３８］養子免疫療法のためにBKウイルス特異的Tリンパ球を増殖させる方法であって、
(i)対象から単離された1つ以上の細胞を実施形態1〜20のいずれかに記載の単離されたタンパク質と接触させること、及び
(ii)BKウイルス特異的Tリンパ球が前記1つ以上の細胞から増殖するような条件下で1つ以上の細胞を培養すること
を含む方法。
［実施形態３９］養子免疫療法のためにJCウイルス特異的Tリンパ球を増殖させる方法であって、
(i)対象から単離された1つ以上の細胞を実施形態1〜20のいずれかに記載の単離されたタンパク質と接触させること、及び
(ii)JCウイルス特異的Tリンパ球が前記1つ以上の細胞から増殖するような条件下で1つ以上の細胞を培養すること
を含む方法。
［実施形態４０］実施形態38又は実施形態39に記載の増殖させたTリンパ球を対象に投与することを含む、対象においてポリオーマウイルス感染症又はがんを処置又は予防する方法。
［実施形態４１］ポリオーマウイルス感染症がBKV感染症である、実施形態40に記載の方法。
［実施形態４２］ポリオーマウイルス感染症がJCV感染症である、実施形態40に記載の方法。
［実施形態４３］ポリオーマウイルス感染症がMCV感染症である、実施形態40に記載の方法。
［実施形態４４］実施形態38又は実施形態39に記載の増殖させたBKウイルス特異的Tリンパ球を対象に投与することを含む、対象においてポリオーマウイルス関連がんを処置又は予防する方法。
［実施形態４５］ポリオーマウイルス関連がんがBKV関連がんである、実施形態44に記載の方法。
［実施形態４６］ポリオーマウイルス関連がんがJCV関連がんである、実施形態44に記載の方法。
［実施形態４７］ポリオーマウイルス関連がんがMCV関連がんである、実施形態44に記載の方法。
［実施形態４８］対象から単離されたTリンパ球を実施形態1〜20のいずれかに記載の単離されたタンパク質と接触させることによって、BKV特異的Tリンパ球の存在を検出することを含む、対象においてBKウイルス感染を検出する方法。
［実施形態４９］実施形態29又は47に記載の方法に従って、対象においてBKウイルス感染症を処置することをさらに含む、実施形態48に記載の方法。
［実施形態５０］対象が哺乳動物である、実施形態29〜49のいずれかに記載の方法。
［実施形態５１］対象がヒトである、実施形態50に記載の方法。
［実施形態５２］対象が免疫不全である、実施形態29〜51のいずれかに記載の方法。
［実施形態５３］表1〜3に列挙された1個以上のエピトープを認識するT細胞受容体(TCR)を含む細胞傷害性T細胞(CTL)を含む医薬組成物を対象に投与することを含む、対象においてがんを処置又は予防する方法。
［実施形態５４］1個以上のエピトープが、表1に列挙されたBKウイルス(BKV)エピトープを含む、実施形態53に記載の方法。
［実施形態５５］1個以上のエピトープが、表2に列挙されたJCウイルス(JCV)エピトープを含む、実施形態53又は実施形態54に記載の方法。
［実施形態５６］1個以上のエピトープが、表3によるハイブリッドエピトープを含む、実施形態53〜55のいずれかに記載の方法。
［実施形態５７］がんがポリオーマウイルス関連がんである、実施形態53〜56のいずれかに記載の方法。
［実施形態５８］ポリオーマウイルスがBKウイルス(BKV)である、実施形態57に記載の方法。
［実施形態５９］ポリオーマウイルスがJCウイルス(JCV)である、実施形態57に記載の方法。
［実施形態６０］ポリオーマウイルスがメルケル細胞ウイルス(MCV)である、実施形態57に記載の方法。
［実施形態６１］表1〜3に列挙された1個以上のエピトープを認識するT細胞受容体(TCR)を含む細胞傷害性T細胞(CTL)を含む医薬組成物を対象に投与することを含む、対象においてポリオーマウイルス感染症を処置又は予防する方法。
［実施形態６２］1個以上のエピトープが、表1に列挙されたBKウイルス(BKV)エピトープを含む、実施形態61に記載の方法。
［実施形態６３］1個以上のエピトープが、表2に列挙されたJCウイルス(JCV)エピトープを含む、実施形態61又は実施形態62に記載の方法。
［実施形態６４］1個以上のエピトープが、表3によるハイブリッドエピトープを含む、実施形態61〜63のいずれかに記載の方法。
［実施形態６５］ポリオーマウイルスがBKウイルス(BKV)である、実施形態61〜64のいずれかに記載の方法。
［実施形態６６］ポリオーマウイルスがJCウイルス(JCV)である、実施形態61〜64のいずれかに記載の方法。
［実施形態６７］ポリオーマウイルスがメルケル細胞ウイルス(MCV)である、実施形態61〜64のいずれかに記載の方法。
［実施形態６８］TCRが、2つ以上のポリオーマウイルスによって共有されるエピトープを認識する、実施形態53〜67のいずれかに記載の方法。
［実施形態６９］共有されるエピトープが、少なくとも2つのポリオーマウイルス間の配列相同性の領域を含み、配列相同性の領域がエピトープ配列の全長にわたって少なくとも3つのアミノ酸である、実施形態68に記載の方法。
［実施形態７０］2つのポリオーマウイルスがBKV及びJCVである、実施形態68又は69に記載の方法。
［実施形態７１］TCRの少なくとも1つがBKV又はJCV由来のVP1エピトープを認識する、実施形態53〜70のいずれかに記載の方法。
［実施形態７２］TCRの少なくとも1つがBKV又はJCV由来のLTAエピトープを認識する、実施形態53〜71のいずれかに記載の方法。
［実施形態７３］TCRの少なくとも1つがBKV又はJCV由来のSTAエピトープを認識する、実施形態53〜72のいずれかに記載の方法。
［実施形態７４］CTLが、表1〜3に列挙されたエピトープのうちの少なくとも2個を認識するTCRを集合的に含む、実施形態53〜73のいずれかに記載の方法。
［実施形態７５］CTLが、表1〜3に列挙されたエピトープのうちの少なくとも5個を認識するTCRを集合的に含む、実施形態74に記載の方法。
［実施形態７６］CTLが、表1〜3に列挙されたエピトープのうちの少なくとも10個を認識するTCRを集合的に含む、実施形態75に記載の方法。
［実施形態７７］CTLが、表1〜3又は2に列挙されたエピトープのうちの少なくとも15個を認識するTCRを集合的に含む、実施形態76に記載の方法。
［実施形態７８］CTLが、表1〜3に列挙されたエピトープのうちの少なくとも20個を認識するTCRを集合的に含む、実施形態77に記載の方法。
［実施形態７９］CTLが、表1〜3に列挙されたエピトープのうちの少なくとも25個を認識するTCRを集合的に含む、実施形態78に記載の方法。
［実施形態８０］CTLが、表1〜3に列挙されたエピトープのうちの少なくとも30個を認識するTCRを集合的に含む、実施形態79に記載の方法。
［実施形態８１］CTLが、MCVエピトープを認識するTCRを集合的に含む、実施形態53〜80のいずれかに記載の方法。
［実施形態８２］TCRが、少なくとも2つの異なるウイルス由来のエピトープを集合的に認識する、実施形態53〜81のいずれかに記載の方法。
［実施形態８３］TCRが、少なくとも3つの異なるウイルス由来のエピトープを集合的に認識する、実施形態82に記載の方法。
［実施形態８４］TCRが、少なくとも4つの異なるウイルス由来のエピトープを集合的に認識する、実施形態83に記載の方法。
［実施形態８５］TCRが、少なくとも5つの異なるウイルス由来のエピトープを集合的に認識する、実施形態84に記載の方法。
［実施形態８６］TCRが、非ポリオーマウイルス由来の1個以上のエピトープを集合的に認識する、実施形態53〜85のいずれかに記載の方法。
［実施形態８７］非ポリオーマウイルス由来の1個以上のエピトープが、アデノウイルス(ADV)、エプスタインバーウイルス(EBV)又はサイトメガロウイルス(CMV)由来の1個以上のエピトープを含む、実施形態86に記載の方法。
［実施形態８８］対象が、1個以上のエピトープが拘束されているヒト白血球抗原(HLA)を発現する、実施形態53〜87のいずれかに記載の方法。
［実施形態８９］CTLが対象に対して自家である、実施形態53〜88のいずれかに記載の方法。
［実施形態９０］CTLが対象に対して自家でない、実施形態53〜88のいずれかに記載の方法。
［実施形態９１］CTLがCTLライブラリー又はバンクから得られる、実施形態90に記載の方法。
［実施形態９２］対象が免疫不全である、実施形態53〜96のいずれかに記載の方法。
［実施形態９３］表1〜3に列挙された1個以上のエピトープを含むポリオーマウイルスペプチドを提示する抗原提示細胞(APC)とCTLを接触させることを含む、ポリオーマウイルス特異的細胞傷害性T細胞(CTL)の増殖を誘導する方法。
［実施形態９４］1個以上のエピトープが、表1に列挙されたBKウイルス(BKV)エピトープを含む、実施形態93に記載の方法。
［実施形態９５］1個以上のエピトープが、表2に列挙されたJCウイルス(JCV)エピトープを含む、実施形態93又は実施形態94記載の方法。
［実施形態９６］1個以上のエピトープが、表3によるハイブリッドエピトープを含む、実施形態93〜95のいずれかに記載の方法。
［実施形態９７］CTLがインビトロでAPCと接触される、実施形態93〜96のいずれかに記載の方法。
［実施形態９８］ポリオーマウイルス特異的CTLが2つ以上のポリオーマウイルスに特異的である、実施形態93〜97のいずれかに記載の方法。
［実施形態９９］2つ以上のポリオーマウイルスが、2つ以上のBKV、JCV及びMKVを含む、実施形態98に記載の方法。
［実施形態１００］1個以上のエピトープが、非ポリオーマウイルス由来の1個以上のエピトープを含む、実施形態93〜99のいずれかに記載の方法。
［実施形態１０１］非ポリオーマウイルス由来の1個以上のエピトープが、アデノウイルス(ADV)、エプスタインバーウイルス(EBV)又はサイトメガロウイルス(CMV)由来の1個以上のエピトープを含む、実施形態100に記載の方法。
［実施形態１０２］CTLが、1つ以上のサイトカインの存在下でAPCに接触される、実施形態93〜101のいずれかに記載の方法。
［実施形態１０３］APCがB細胞を含む、実施形態93〜102のいずれかに記載の方法。
［実施形態１０４］APCが抗原提示T細胞を含む、実施形態93〜103のいずれかに記載の方法。
［実施形態１０５］APCが樹状細胞を含む、実施形態93〜104のいずれかに記載の方法。
［実施形態１０６］APCがaK562細胞を含む、実施形態93〜105のいずれかに記載の方法。
［実施形態１０７］CTLが、末梢血単核球(PBMC)の試料由来である、実施形態93〜106のいずれかに記載の方法。
［実施形態１０８］表1〜3に列挙された1個以上のエピトープを含むワクチン組成物を対象に投与することを含む、対象においてがんを処置又は予防する方法。
［実施形態１０９］1個以上のエピトープが、表1に列挙されたBKウイルス(BKV)エピトープを含む、実施形態108に記載の方法。
［実施形態１１０］1個以上のエピトープが、表2に列挙されたJCウイルス(JCV)エピトープを含む、実施形態108又は実施形態109に記載の方法。
［実施形態１１１］1個以上のエピトープが、表3によるハイブリッドエピトープを含む、実施形態108〜110のいずれかに記載の方法。
［実施形態１１２］がんがポリオーマウイルス関連がんである、実施形態108〜111のいずれかに記載の方法。
［実施形態１１３］ポリオーマウイルスがBKウイルス(BKV)である、実施形態112に記載の方法。
［実施形態１１４］ポリオーマウイルスがJCウイルス(JCV)である、実施形態112に記載の方法。
［実施形態１１５］ポリオーマウイルスがメルケル細胞ウイルス(MCV)である、実施形態112に記載の方法。
［実施形態１１６］表1〜3に列挙された1個以上のエピトープを含むワクチン組成物を対象に投与することを含む、対象においてポリオーマウイルス感染症を処置又は予防する方法。
［実施形態１１７］1個以上のエピトープが、表1に列挙されたBKウイルス(BKV)エピトープを含む、実施形態116に記載の方法。
［実施形態１１８］1個以上のエピトープが、表2に列挙されたJCウイルス(JCV)エピトープを含む、実施形態116又は実施形態117に記載の方法。
［実施形態１１９］1個以上のエピトープが、表3によるハイブリッドエピトープを含む、実施形態116〜118のいずれかに記載の方法。
［実施形態１２０］ポリオーマウイルスがBKウイルス(BKV)である、実施形態116〜119のいずれかに記載の方法。
［実施形態１２１］ポリオーマウイルスがJCウイルス(JCV)である、実施形態116〜119のいずれかに記載の方法。
［実施形態１２２］ポリオーマウイルスがメルケル細胞ウイルス(MCV)である、実施形態116〜119のいずれかに記載の方法。
［実施形態１２３］1個以上のエピトープが、2つ以上のポリオーマウイルスによって共有されるエピトープを含む、実施形態108〜122のいずれかに記載の方法。
［実施形態１２４］共有されるエピトープが、少なくとも2つのポリオーマウイルス間の配列相同性の領域を含み、配列相同性の領域がエピトープ配列の全長にわたって少なくとも3つのアミノ酸である、実施形態123に記載の方法。
［実施形態１２５］2つのポリオーマウイルスがBKV及びJCVである、実施形態123又は124に記載の方法。
［実施形態１２６］ワクチン組成物が、非ポリオーマウイルス由来の1個以上のエピトープをさらに含む、実施形態108〜125のいずれかに記載の方法。
［実施形態１２７］非ポリオーマウイルス由来の1個以上のエピトープが、アデノウイルス(ADV)、エプスタインバーウイルス(EBV)又はサイトメガロウイルス(CMV)由来の1個以上のエピトープを含む、実施形態126に記載の方法。
［実施形態１２８］1個以上のエピトープが、表1〜3に列挙されたエピトープのうちの少なくとも2個を含む、実施形態108〜127のいずれかに記載の方法。
［実施形態１２９］1個以上のエピトープが、表1〜3に列挙されたエピトープのうちの少なくとも5個を含む、実施形態128に記載の方法。
［実施形態１３０］1個以上のエピトープが、表1〜3に列挙されたエピトープのうちの少なくとも10個を含む、実施形態129に記載の方法。
［実施形態１３１］1個以上のエピトープが、表1〜3に列挙されたエピトープのうちの少なくとも15個を含む、実施形態130に記載の方法。
［実施形態１３２］1個以上のエピトープが、表1〜3に列挙されたエピトープのうちの少なくとも20個を含む、実施形態131に記載の方法。
［実施形態１３３］1個以上のエピトープが、表1〜3に列挙されたエピトープのうちの少なくとも25個を含む、実施形態132に記載の方法。
［実施形態１３４］対象が、1個以上のエピトープが拘束されているヒト白血球抗原(HLA)を発現する、実施形態108〜133のいずれかに記載の方法。
［実施形態１３５］ワクチン組成物がアジュバントをさらに含む、実施形態108〜134のいずれかに記載の方法。
［実施形態１３６］対象が免疫不全である、実施形態108〜135のいずれかに記載の方法。
［実施形態１３７］対象がヒトである、実施形態53〜136のいずれかに記載の方法。
［実施形態１３８］細胞がIL-21の存在下で培養される、実施形態38又は39に記載の方法。
［実施形態１３９］IL-21が約30ng/mlの濃度で存在する、実施形態138に記載の方法。
［実施形態１４０］IL-21の存在下でCTLを培養することをさらに含む、実施形態93〜107のいずれかに記載の方法。
［実施形態１４１］IL-21が約30ng/mlの濃度で存在する、実施形態140に記載の方法。