【手続補正書】
【提出日】令和2年5月8日(2020.5.8)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
以下の構造（Ｉ）：
【化２３】
2019519490.tif 000001
を有する化合物、またはその立体異性体、塩もしくは互変異性体であって、ここで：
Ｍは、各存在において、独立して、２個またはこれより多くの炭素−炭素二重結合および少なくとも１の共役度を含む部分であり；
Ｌ1は、各存在において、独立して、ｉ）選択肢的なアルキレン、アルケニレン、アルキニレン、ヘテロアルキレン、ヘテロアルケニレンもしくはヘテロアルキニレンリンカー；またはｉｉ）２個の相補的反応性基の反応によって形成できる官能基を含むリンカー、のいずれかであり；
Ｌ2、Ｌ3、Ｌ4およびＬ5は、各存在において、独立して、選択肢的なアルキレン、アルケニレン、アルキニレン、ヘテロアルキレン、ヘテロアルケニレンまたはヘテロアルキニレンリンカーであり；
Ｒ1は、各存在において、独立して、天然または非天然のアミノ酸の側鎖であり；
Ｒ2およびＲ3は、各々独立して、Ｈ、−ＯＨ、−ＳＨ、−ＮＨ2、−ＣＯ2Ｈ、アルキル、アルキルエーテル、アルコキシ、ヘテロアルキル、アルキルアミニル、アルキルカルボニル、アルキルオキシカルボニル、Ｑ、Ｑへの共有結合を含むリンカー、標的化部分への共有結合を含むリンカー、分析物分子への共有結合を含むリンカー、固体支持体への共有結合を含むリンカー、固体支持体残基への共有結合を含むリンカーまたは構造（Ｉ）のさらなる化合物への共有結合を含むリンカーであり、ここで該アルキル、アルキルエーテル、アルキルアミニル、アルキルカルボニルおよびアルキルオキシカルボニルは、ヒドロキシル、アミノ、スルフヒドリル、ホスフェート、チオホスフェート、ホスホアルキル、チオホスホアルキル、ホスホアルキルエーテルもしくはチオホスホアルキルエーテル、またはこれらの組み合わせで必要に応じて置換され；Ｑは、各存在において、独立して、分析物分子、固体支持体または相補的反応性基Ｑ′と共有結合を形成できる反応性基を含む部分であり；
ｍは、各存在において、独立して、０またはこれより大きな整数であり；そして
ｎは、１またはこれより大きな整数である、
化合物、またはその立体異性体、塩もしくは互変異性体。
【請求項２】
Ｒ1は、各存在において、独立して、Ｈ、アルキル、−ＣＨ2ＣＯ2-、−ＣＨ2ＣＨ2ＣＯ2-、−ＣＨ2ＣＨ2ＣＨ2ＣＨ2ＮＨ3+、−ＣＨ2ＣＨ2ＣＨ2ＮＨＣ（＝ＮＨ2+）ＮＨ2またはイミダゾリルである、請求項１に記載の化合物。
【請求項３】
Ｒ1、Ｌ4およびｍは、
【化２４】
2019519490.tif 000002
が（Ｇ）10、（ＧＤＧＤＧＤＧＤＧＤ）または（ＧＫＧＫＧＫＧＫＧＫ）というアミノ酸配列を有するように選択される、請求項１又は２に記載の化合物。
【請求項４】
Ｒ1、Ｌ4およびｍは、
【化２５】
2019519490.tif 000003
がα−ヘリックスまたはβ−シート二次構造を形成できるアミノ酸配列を有するように選択される、請求項１に記載の化合物。
【請求項５】
前記アミノ酸配列は、（ＧＧＥＥＦＭＬＶＹＫＦＡＲＫＨＧＧ）または（ＧＧＭＳＭＶＶＳＧＧ）である、請求項４に記載の化合物。
【請求項６】
Ｌ4およびＬ5は、各存在において非存在である、請求項１〜５のいずれか１項に記載の化合物。
【請求項７】
Ｌ4もしくはＬ5のうちの少なくとも１個の存在、または両方は、以下の構造：
【化２６】
2019519490.tif 000004
を有する、請求項１に記載の化合物。
【請求項８】
Ｌ4もしくはＬ5のうちの少なくとも１個の存在、または両方は、以下の構造：
【化２７】
2019519490.tif 000005
を有する、請求項１に記載の化合物。
【請求項９】
Ｌ1は、各存在において、アルキレンまたはヘテロアルキレンリンカーである、請求項１〜８のいずれか１項に記載の化合物。
【請求項１０】
Ｌ1は、各存在において、２個の相補的反応性基の反応によって形成できる官能基を含むリンカーであり、および、Ｌ1の少なくとも１個の存在に関して、前記官能基は、アルデヒド、オキシム、ヒドラゾン、アルキン、アミン、アジド、アシルアジド、アシルハライド、ニトリル、ニトロン、スルフヒドリル、ジスルフィド、スルホニルハライド、イソチオシアネート、イミドエステル、活性化エステル、ケトン、α，β−不飽和カルボニル、アルケン、マレイミド、α−ハロイミド、エポキシド、アジリジン、テトラジン、テトラゾール、ホスフィン、ビオチンまたはチイラン官能基と、相補的反応性基との反応によって形成できる、請求項１〜８のいずれか１項に記載の化合物。
【請求項１１】
Ｌ1の少なくとも１個の存在に関して、Ｌ1−Ｍは、以下の構造：
【化２８】
2019519490.tif 000006
を有し、ここでＬ1aおよびＬ1bは、各々独立して、選択肢的なリンカーである、請求項１０に記載の化合物。
【請求項１２】
Ｌ1の少なくとも１個の存在に関して、Ｌ1−Ｍは、以下の構造：
【化２９】
2019519490.tif 000007
を有し、ここでＬ1aおよびＬ1bは、各々独立して、選択肢的なリンカーである、請求項１０に記載の化合物。
【請求項１３】
Ｒ2は、−ＮＨ2である、請求項１〜１２のいずれか１項に記載の化合物。
【請求項１４】
Ｑは、以下の構造：
2019519490.tif 000008
のうちの１つを有し、
Ｘは、ハロであり、
ＥＷＧは、電子求引基である、請求項１〜１３のいずれか１項に記載の化合物。
【請求項１５】
Ｒ2またはＲ3のうちの一方は、分析物分子への共有結合を含むリンカーであり、ここで、前記分析物分子は、核酸、核酸ポリマー、アミノ酸、アミノ酸ポリマー、酵素、レセプター、レセプターリガンド、抗体、糖タンパク質、アプタマー、若しくはプリオンであるか、またはポリマービーズ若しくは非ポリマービーズへの共有結合を含むリンカーである、請求項１〜１４のいずれか１項に記載の化合物。
【請求項１６】
Ｍは、各存在において、独立して、ジメチルアミノスチルベン、キナクリドン、フルオロフェニル−ジメチル−ＢＯＤＩＰＹ、ｈｉｓ−フルオロフェニル−ＢＯＤＩＰＹ、アクリジン、テリレン、セキシフェニル、ポルフィリン、ベンゾピレン、（フルオロフェニル−ジメチル−ジフルオロボラ−ジアザ−インダセン）フェニル、（ビス−フルオロフェニル−ジフルオロボラ−ジアザ−インダセン）フェニル、クアテルフェニル、ビ−ベンゾチアゾール、ター−ベンゾチアゾール、ビ−ナフチル、ビ−アントラシル、スクアライン、スクアリリウム、９，１０−エチニルアントラセンまたはター−ナフチル部分である、請求項１〜１５のいずれか１項に記載の化合物。
【請求項１７】
Ｍは、各存在において、独立して、以下の構造：
【化３０】
2019519490.tif 000009
のうちの１つを有する、請求項１〜１５のいずれか１項に記載の化合物。
【請求項１８】
前記化合物は、以下の構造：
2019519490.tif 000010
のうちの１つを有する、請求項１に記載の化合物。
【請求項１９】
サンプルを染色するための方法であって、該方法は、該サンプルに、請求項１〜１８のいずれか１項に記載の化合物を、該サンプルが適切な波長で照射される場合に光学的応答を生じるために十分な量で添加する工程を包含する方法。
【請求項２０】
分析物分子を視覚的に検出するための方法であって、該方法は、
（ａ）Ｒ2またはＲ3は、該分析物分子への共有結合を含むリンカーである請求項１の化合物を提供する工程；および
（ｂ）該化合物をその視覚的特性によって検出する工程、
を包含する方法。
【請求項２１】
分析物分子を視覚的に検出するための方法であって、該方法は、
（ａ）Ｒ2またはＲ3は、ＱまたはＱへの共有結合を含むリンカーである請求項１に記載の化合物と、該分析物分子とを混合する工程；
（ｂ）該化合物と該分析物分子との結合体を形成する工程；ならびに
（ｃ）該結合体をその視覚的特性によって検出する工程、
を包含する方法。
【請求項２２】
請求項１〜１８のいずれか１項に記載の化合物および１もしくはこれより多くの分析物分子を含む、組成物。
【請求項２３】
前記１もしくはこれより多くの分析物分子の検出のための分析方法における請求項２２に記載の組成物の使用。
【請求項２４】
以下の構造（ＩＩ）：
【化３１】
2019519490.tif 000011
を有する化合物、またはその立体異性体、塩もしくは互変異性体であって、ここで：
Ｇは、各存在において、独立して、相補的反応性基と共有結合を形成できる反応性基を含む部分であり；
Ｌ1a、Ｌ2、Ｌ3、Ｌ4およびＬ5は、各存在において、独立して、選択肢的なアルキレン、アルケニレン、アルキニレン、ヘテロアルキレン、ヘテロアルケニレンまたはヘテロアルキニレンリンカーであり；
Ｒ1は、各存在において、独立して、天然または非天然のアミノ酸の側鎖であり；
Ｒ2およびＲ3は、各々独立して、Ｈ、−ＯＨ、−ＳＨ、−ＮＨ2、−ＣＯ2Ｈ、アルキル、アルキルエーテル、アルコキシ、ヘテロアルキル、アルキルアミニル、アルキルカルボニル、アルキルオキシカルボニル、Ｑ、Ｑへの共有結合を含むリンカー、標的化部分への共有結合を含むリンカー、分析物分子への共有結合を含むリンカー、固体支持体への共有結合を含むリンカー、固体支持体残基への共有結合を含むリンカーまたは構造（Ｉ）のさらなる化合物への共有結合を含むリンカーであり、ここで該アルキル、アルキルエーテル、アルキルアミニル、アルキルカルボニルおよびアルキルオキシカルボニルは、ヒドロキシル、アミノ、スルフヒドリル、ホスフェート、チオホスフェート、ホスホアルキル、チオホスホアルキル、ホスホアルキルエーテルもしくはチオホスホアルキルエーテル、またはこれらの組み合わせで必要に応じて置換され；
Ｑは、各存在において、独立して、分析物分子、固体支持体または相補的反応性基Ｑ′と共有結合を形成できる反応性基を含む部分であり；
ｍは、各存在において、独立して、０またはこれより大きな整数であり；そして
ｎは、１またはこれより大きな整数である、
化合物、またはその立体異性体、塩もしくは互変異性体。
【請求項２５】
分析物分子を標識するための方法であって、該方法は、
（ａ）Ｒ2またはＲ3は、ＱまたはＱへの共有結合を含むリンカーである請求項２４に記載の化合物と、該分析物分子とを混合する工程；
（ｂ）該化合物と該分析物分子との結合体を形成する工程；ならびに；
（ｃ）該結合体と式Ｍ−Ｌ1b−Ｇ′の化合物とを反応させて、それによって、少なくとも１個のＧおよび少なくとも１個のＧ′の反応によって少なくとも１個の共有結合を形成する工程、
を包含し、ここで：
Ｍは、２個またはこれより多くの炭素−炭素二重結合および少なくとも１の共役度を含む部分であり；
Ｌ1bは、選択肢的なアルキレン、ヘテロアルキレンまたはヘテロ原子リンカーであり；そして
Ｇ′は、Ｇに対する相補的反応性基である、
方法。
【請求項２６】
分析物分子を標識するための方法であって、該方法は、
（ａ）Ｒ2またはＲ3は、ＱまたはＱへの共有結合を含むリンカーである請求項２４に記載の化合物と、式Ｍ−Ｌ1b−Ｇ′の化合物とを混合し、それによって、ＧおよびＧ′の反応によって少なくとも１個の共有結合を形成する工程；ならびに
（ｂ）工程（Ａ）の生成物と該分析物分子とを反応させ、それによって、工程（Ａ）の生成物と該分析物分子との結合体を形成する工程、
を包含し、ここで：
Ｍは、２個またはこれより多くの炭素−炭素二重結合および少なくとも１の共役度を含む部分であり；
Ｌ1bは、選択肢的なアルキレン、ヘテロアルキレンまたはヘテロ原子リンカーであり；そして
Ｇ′は、Ｇに対する相補的反応性基である、
方法。
【請求項２７】
請求項１に記載の化合物を調製するための方法であって、該方法は、請求項２４に記載の化合物と、式Ｍ−Ｌ1b−Ｇ′の化合物とを混合し、それによって、ＧおよびＧ′の反応によって少なくとも１個の共有結合を形成する工程を包含し、ここで：
Ｍは、２個またはこれより多くの炭素−炭素二重結合および少なくとも１の共役度を含む部分であり；
Ｌ1bは、選択肢的なアルキレン、ヘテロアルキレンまたはヘテロ原子リンカーであり；そして
Ｇ′は、Ｇに対する相補的反応性基である、
方法。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０２３５
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０２３５】
前述から、本発明の具体的実施形態が例証目的のために本明細書で記載されてきたものの、本発明の趣旨および範囲から逸脱することなく、種々の改変がなされ得ることは認識される。よって、本発明は、添付の特許請求の範囲による場合を除いて限定されない。
本発明のまた別の態様は、以下のとおりであってもよい。
〔１〕
以下の構造（Ｉ）：
【化２３】
2019519490.tif 000012
を有する化合物、またはその立体異性体、塩もしくは互変異性体であって、ここで：
Ｍは、各存在において、独立して、２個またはこれより多くの炭素−炭素二重結合および少なくとも１の共役度を含む部分であり；
Ｌ1は、各存在において、独立して、ｉ）選択肢的なアルキレン、アルケニレン、アルキニレン、ヘテロアルキレン、ヘテロアルケニレンもしくはヘテロアルキニレンリンカー；またはｉｉ）２個の相補的反応性基の反応によって形成できる官能基を含むリンカー、のいずれかであり；
Ｌ2、Ｌ3、Ｌ4およびＬ5は、各存在において、独立して、選択肢的なアルキレン、アルケニレン、アルキニレン、ヘテロアルキレン、ヘテロアルケニレンまたはヘテロアルキニレンリンカーであり；
Ｒ1は、各存在において、独立して、天然または非天然のアミノ酸の側鎖であり；
Ｒ2およびＲ3は、各々独立して、Ｈ、−ＯＨ、−ＳＨ、−ＮＨ2、−ＣＯ2Ｈ、アルキル、アルキルエーテル、アルコキシ、ヘテロアルキル、アルキルアミニル、アルキルカルボニル、アルキルオキシカルボニル、Ｑ、Ｑへの共有結合を含むリンカー、標的化部分への共有結合を含むリンカー、分析物分子への共有結合を含むリンカー、固体支持体への共有結合を含むリンカー、固体支持体残基への共有結合を含むリンカーまたは構造（Ｉ）のさらなる化合物への共有結合を含むリンカーであり、ここで該アルキル、アルキルエーテル、アルキルアミニル、アルキルカルボニルおよびアルキルオキシカルボニルは、ヒドロキシル、アミノ、スルフヒドリル、ホスフェート、チオホスフェート、ホスホアルキル、チオホスホアルキル、ホスホアルキルエーテルもしくはチオホスホアルキルエーテル、またはこれらの組み合わせで必要に応じて置換され；Ｑは、各存在において、独立して、分析物分子、固体支持体または相補的反応性基Ｑ′と共有結合を形成できる反応性基を含む部分であり；
ｍは、各存在において、独立して、０またはこれより大きな整数であり；そして
ｎは、１またはこれより大きな整数である、
化合物、またはその立体異性体、塩もしくは互変異性体。
〔２〕
少なくとも１個のＲ1は、中性アミノ酸側鎖である、前記〔１〕に記載の化合物。
〔３〕
少なくとも１個のＲ1は、荷電したアミノ酸側鎖である、前記〔１〕または〔２〕のいずれか１項に記載の化合物。
〔４〕
Ｒ1は、各存在において、独立して、Ｈ、アルキル、−ＣＨ2ＣＯ2-、−ＣＨ2ＣＨ2ＣＯ2-、−ＣＨ2ＣＨ2ＣＨ2ＣＨ2ＮＨ3+、−ＣＨ2ＣＨ2ＣＨ2ＮＨＣ（＝ＮＨ2+）ＮＨ2またはイミダゾリルである、前記〔１〕〜〔３〕のいずれか１項に記載の化合物。
〔５〕
Ｒ1、Ｌ4およびｍは、
【化２４】
2019519490.tif 000013
が（Ｇ）10、（ＧＤＧＤＧＤＧＤＧＤ）または（ＧＫＧＫＧＫＧＫＧＫ）というアミノ酸配列を有するように選択される、前記〔１〕〜〔４〕のいずれか１項に記載の化合物。
〔６〕
Ｒ1、Ｌ4およびｍは、
【化２５】
2019519490.tif 000014
がα−ヘリックスまたはβ−シート二次構造を形成できるアミノ酸配列を有するように選択される、前記〔１〕に記載の化合物。
〔７〕
前記アミノ酸配列は、（ＧＧＥＥＦＭＬＶＹＫＦＡＲＫＨＧＧ）または（ＧＧＭＳＭＶＶＳＧＧ）である、前記〔６〕に記載の化合物。
〔８〕
Ｌ4およびＬ5は、各存在において非存在である、前記〔１〕〜〔７〕のいずれか１項に記載の化合物。
〔９〕
Ｌ4もしくはＬ5、または両方が、少なくとも１個の存在に関して存在する、前記〔１〕〜〔７〕のいずれか１項に記載の化合物。
〔１０〕
存在する場合、Ｌ4もしくはＬ5、または両方が、ヘテロアルキレンリンカーである前記〔９〕に記載の化合物。
〔１１〕
前記ヘテロアルキレンリンカーは、水性溶液中で３〜１１の範囲に及ぶｐＨ値において正電荷または負電荷を維持できる官能基を含む、前記〔１０〕に記載の化合物。
〔１２〕
Ｌ4もしくはＬ5のうちの少なくとも１個の存在、または両方は、以下の構造：
【化２６】
2019519490.tif 000015
を有する、前記〔１１〕に記載の化合物。
〔１３〕
Ｌ4もしくはＬ5のうちの少なくとも１個の存在、または両方は、以下の構造：
【化２７】
2019519490.tif 000016
を有する、前記〔１１〕に記載の化合物。
〔１４〕
Ｌ1は、各存在において、アルキレンまたはヘテロアルキレンリンカーである、前記〔１〕〜〔１３〕のいずれか１項に記載の化合物。
〔１５〕
Ｌ1は、各存在において、２個の相補的反応性基の反応によって形成できる官能基を含むリンカーである、前記〔１〕〜〔１３〕のいずれか１項に記載の化合物。
〔１６〕
Ｌ1の少なくとも１個の存在に関して、前記官能基は、アルデヒド、オキシム、ヒドラゾン、アルキン、アミン、アジド、アシルアジド、アシルハライド、ニトリル、ニトロン、スルフヒドリル、ジスルフィド、スルホニルハライド、イソチオシアネート、イミドエステル、活性化エステル、ケトン、α，β−不飽和カルボニル、アルケン、マレイミド、α−ハロイミド、エポキシド、アジリジン、テトラジン、テトラゾール、ホスフィン、ビオチンまたはチイラン官能基と、相補的反応性基との反応によって形成できる、前記〔１５〕に記載の化合物。
〔１７〕
Ｌ1の少なくとも１個の存在に関して、前記官能基は、アルキンおよびアジドの反応によって形成できる、前記〔１５〕に記載の化合物。
〔１８〕
Ｌ1の少なくとも１個の存在に関して、前記官能基は、アルケン、エステル、アミド、チオエステル、ジスルフィド、炭素環式、複素環式またはヘテロアリール基を含む、前記〔１５〕に記載の化合物。
〔１９〕
Ｌ1の少なくとも１個の存在に関して、Ｌ1は、トリアゾリル官能基を含むリンカーである、前記〔１５〕に記載の化合物。
〔２０〕
Ｌ1の少なくとも１個の存在に関して、Ｌ1−Ｍは、以下の構造：
【化２８】
2019519490.tif 000017
を有し、ここでＬ1aおよびＬ1bは、各々独立して、選択肢的なリンカーである、前記〔１５〕に記載の化合物。
〔２１〕
Ｌ1の少なくとも１個の存在に関して、Ｌ1−Ｍは、以下の構造：
【化２９】
2019519490.tif 000018
を有し、ここでＬ1aおよびＬ1bは、各々独立して、選択肢的なリンカーである、前記〔１５〕に記載の化合物。
〔２２〕
Ｌ1aもしくはＬ1b、または両方が、非存在である、前記〔２０〕または〔２１〕のいずれか１項に記載の化合物。
〔２３〕
Ｌ1aもしくはＬ1b、または両方が、存在する、前記〔２０〕または〔２１〕にいずれか１項に記載の化合物。
〔２４〕
Ｌ1aおよびＬ1bは、存在する場合、各々独立して、アルキレンまたはヘテロアルキレンである、前記〔２３〕に記載の化合物。
〔２５〕
Ｌ2およびＬ3は、独立して、非存在またはヘテロアルキレンリンカーである、前記〔１〕〜〔１７〕のいずれか１項に記載の化合物。
〔２６〕
前記ヘテロアルキレンリンカーは、ペプチジルリンカーである、前記〔２５〕に記載の化合物。
〔２７〕
Ｒ2は、−ＮＨ2である、前記〔１〕〜〔２６〕のいずれか１項に記載の化合物。
〔２８〕
Ｒ3は、Ｑ、Ｑへの共有結合を含むリンカーまたは固体支持体への共有結合を含むリンカーである、前記〔１〕〜〔２７〕のいずれか１項に記載の化合物。
〔２９〕
Ｑは、求核性反応性基、求電子性反応性基または環化付加反応性基を含む、前記〔１〕〜〔２８〕のいずれか１項に記載の化合物。
〔３０〕
Ｑは、スルフヒドリル、ジスルフィド、活性化エステル、イソチオシアネート、アジド、アルキン、アルケン、ジエン、ジエノフィル、酸ハライド、スルホニルハライド、ホスフィン、α−ハロアミド、ビオチン、アミノまたはマレイミド官能基を含む、前記〔２９〕に記載の化合物。
〔３１〕
前記活性化エステルは、Ｎ−スクシンイミドエステル、イミドエステルまたはポリフルオロフェニルエステルである、前記〔３０〕に記載の化合物。
〔３２〕
前記アジドは、アルキルアジドまたはアシルアジドである、前記〔３０〕に記載の化合物。
〔３３〕
Ｑは、表１から選択される部分である、前記〔１〕〜〔２８〕のいずれか１項に記載の化合物。
〔３４〕
Ｒ2またはＲ3のうちの一方は、分析物分子への共有結合を含むリンカーまたは固体支持体への共有結合を含むリンカーである、前記〔１〕〜〔２６〕のいずれか１項に記載の化合物。
〔３５〕
前記分析物分子は、核酸、アミノ酸またはこれらのポリマーである、前記〔３４〕に記載の化合物。
〔３６〕
前記分析物分子は、酵素、レセプター、レセプターリガンド、抗体、糖タンパク質、アプタマーまたはプリオンである、前記〔３４〕に記載の化合物。
〔３７〕
前記固体支持体は、ポリマービーズまたは非ポリマービーズである、前記〔３４〕に記載の化合物。
〔３８〕
ｍは、各存在において、独立して、１〜２０の整数である、前記〔１〕〜〔３７〕のいずれか１項に記載の化合物。
〔３９〕
ｍは、各存在において、独立して、１〜１０の整数である、前記〔１〕〜〔３７〕のいずれか１項に記載の化合物。
〔４０〕
ｎは、１〜１００の整数である、前記〔１〕〜〔３９〕のいずれか１項に記載の化合物。
〔４１〕
ｎは、１〜１０の整数である、前記〔１〕〜〔３９〕のいずれか１項に記載の化合物。
〔４２〕Ｍは、各存在において、独立して、４個もしくはこれより多くのアリールもしくはヘテロアリール環、またはこれらの組み合わせを含む部分である、前記〔１〕〜〔４１〕のいずれか１項に記載の化合物。
〔４３〕
Ｍは、各存在において、独立して、蛍光性または有色である、前記〔１〕〜〔４２〕のいずれか１項に記載の化合物。
〔４４〕
Ｍは、蛍光性である、前記〔４３〕に記載の化合物。
〔４５〕
Ｍは、各存在において、独立して、少なくとも４個の縮合環を含む縮合多環式アリール部分を含む、前記〔１〕〜〔４４〕のいずれか１項に記載の化合物。
〔４６〕
Ｍは、各存在において、独立して、ジメチルアミノスチルベン、キナクリドン、フルオロフェニル−ジメチル−ＢＯＤＩＰＹ、ｈｉｓ−フルオロフェニル−ＢＯＤＩＰＹ、アクリジン、テリレン、セキシフェニル、ポルフィリン、ベンゾピレン、（フルオロフェニル−ジメチル−ジフルオロボラ−ジアザ−インダセン）フェニル、（ビス−フルオロフェニル−ジフルオロボラ−ジアザ−インダセン）フェニル、クアテルフェニル、ビ−ベンゾチアゾール、ター−ベンゾチアゾール、ビ−ナフチル、ビ−アントラシル、スクアライン、スクアリリウム、９，１０−エチニルアントラセンまたはター−ナフチル部分である、前記〔１〕〜〔４５〕のいずれか１項に記載の化合物。
〔４７〕
Ｍは、各存在において、独立して、ｐ−ターフェニル、ペリレン、アゾベンゼン、フェナジン、フェナントロリン、アクリジン、チオキサントレン、クリセン、ルブレン、コロネン、シアニン、ペリレンイミド、もしくはペリレンアミドまたはその誘導体である、前記〔１〕〜〔４５〕のいずれか１項に記載の化合物。
〔４８〕
Ｍは、各存在において、独立して、クマリン染料、レゾルフィン染料、ジピロメテンボロンジフルオリド染料、ルテニウムビピリジル染料、エネルギー移動染料、チアゾールオレンジ染料、ポリメチンまたはＮ−アリール−１，８−ナフタルイミド染料である、前記〔１〕〜〔４５〕のいずれか１項に記載の化合物。
〔４９〕
Ｍは、各存在において、独立して、ピレン、ペリレン、ペリレンモノイミドもしくは６−ＦＡＭまたはその誘導体である、前記〔１〕〜〔４５〕のいずれか１項に記載の化合物。
〔５０〕
Ｍは、各存在において、独立して、以下の構造：
【化３０】
2019519490.tif 000019
のうちの１つを有する、前記〔１〕〜〔４５〕のいずれか１項に記載の化合物。
〔５１〕
表２から選択される化合物。
〔５２〕
サンプルを染色するための方法であって、該方法は、該サンプルに、前記〔１〕〜〔５１〕のいずれか１項に記載の化合物を、該サンプルが適切な波長で照射される場合に光学的応答を生じるために十分な量で添加する工程を包含する方法。
〔５３〕
前記光学的応答は、蛍光応答である、前記〔５２〕に記載の方法。
〔５４〕
前記サンプルは、細胞を含む、前記〔５２〕〜〔５３〕のいずれか１項に記載の方法。
〔５５〕
前記細胞をフローサイトメトリーによって観察する工程をさらに包含する、前記〔５４〕に記載の方法。
〔５６〕
前記蛍光応答を、検出可能に異なる光学的特性を有する第２の発蛍光団の蛍光応答から区別する工程をさらに包含する、前記〔５３〕に記載の方法。
〔５７〕
分析物分子を視覚的に検出するための方法であって、該方法は、
（ａ）Ｒ2またはＲ3は、該分析物分子への共有結合を含むリンカーである前記〔１〕の化合物を提供する工程；および
（ｂ）該化合物をその視覚的特性によって検出する工程、
を包含する方法。
〔５８〕
分析物分子を視覚的に検出するための方法であって、該方法は、
（ａ）Ｒ2またはＲ3は、ＱまたはＱへの共有結合を含むリンカーである前記〔１〕に記載の化合物と、該分析物分子とを混合する工程；
（ｂ）該化合物および該分析物分子の結合体を形成する工程；ならびに
（ｃ）該結合体をその視覚的特性によって検出する工程、
を包含する方法。
〔５９〕
前記〔１〕〜〔５１〕のいずれか１項に記載の化合物および１もしくはこれより多くの分析物分子を含む、組成物。
〔６０〕
前記１もしくはこれより多くの分析物分子の検出のための分析方法における前記〔５９〕に記載の組成物の使用。
〔６１〕
以下の構造（ＩＩ）：
【化３１】
2019519490.tif 000020
を有する化合物、またはその立体異性体、塩もしくは互変異性体であって、ここで：
Ｇは、各存在において、独立して、相補的反応性基と共有結合を形成できる反応性基を含む部分であり；
Ｌ1a、Ｌ2、Ｌ3、Ｌ4およびＬ5は、各存在において、独立して、選択肢的なアルキレン、アルケニレン、アルキニレン、ヘテロアルキレン、ヘテロアルケニレンまたはヘテロアルキニレンリンカーであり；
Ｒ1は、各存在において、独立して、天然または非天然のアミノ酸の側鎖であり；
Ｒ2およびＲ3は、各々独立して、Ｈ、−ＯＨ、−ＳＨ、−ＮＨ2、−ＣＯ2Ｈ、アルキル、アルキルエーテル、アルコキシ、ヘテロアルキル、アルキルアミニル、アルキルカルボニル、アルキルオキシカルボニル、Ｑ、Ｑへの共有結合を含むリンカー、標的化部分への共有結合を含むリンカー、分析物分子への共有結合を含むリンカー、固体支持体への共有結合を含むリンカー、固体支持体残基への共有結合を含むリンカーまたは構造（Ｉ）のさらなる化合物への共有結合を含むリンカーであり、ここで該アルキル、アルキルエーテル、アルキルアミニル、アルキルカルボニルおよびアルキルオキシカルボニルは、ヒドロキシル、アミノ、スルフヒドリル、ホスフェート、チオホスフェート、ホスホアルキル、チオホスホアルキル、ホスホアルキルエーテルもしくはチオホスホアルキルエーテル、またはこれらの組み合わせで必要に応じて置換され；
Ｑは、各存在において、独立して、分析物分子、固体支持体または相補的反応性基Ｑ′と共有結合を形成できる反応性基を含む部分であり；
ｍは、各存在において、独立して、０またはこれより大きな整数であり；そして
ｎは、１またはこれより大きな整数である、
化合物、またはその立体異性体、塩もしくは互変異性体。
〔６２〕
Ｇは、各存在において、独立して、アルデヒド、オキシム、ヒドラゾン、アルキン、アミン、アジド、アシルアジド、アシルハライド、ニトリル、ニトロン、スルフヒドリル、ジスルフィド、スルホニルハライド、イソチオシアネート、イミドエステル、活性化エステル、ケトン、α，β−不飽和カルボニル、アルケン、マレイミド、α−ハロイミド、エポキシド、アジリジン、テトラジン、テトラゾール、ホスフィン、ビオチンまたはチイラン官能基を含む、前記〔６１〕に記載の化合物。
〔６３〕
Ｇは、各存在において、独立して、アルキンまたはアジド基を含む、前記〔６１〕に記載の化合物。
〔６４〕
Ｇは、各存在において、独立して、前記相補的反応性基との反応に際して、アルケン、エステル、アミド、チオエステル、ジスルフィド、炭素環式、複素環式またはヘテロアリール基を含む官能基を形成できる反応性基を含む、前記〔６１〕に記載の化合物。
〔６５〕
前記ヘテロアリールは、トリアゾリルである、前記〔６４〕に記載の化合物。
〔６６〕
各Ｌ1aは、存在しない、前記〔６１〕〜〔６５〕のいずれか１項に記載の化合物。
〔６７〕
各Ｌ1aは、存在する、前記〔６１〕〜〔６５〕のいずれか１項に記載の化合物。
〔６８〕
Ｇは、各存在において、独立して、
【化３２】
2019519490.tif 000021
である、前記〔６１〕〜〔６７〕のいずれか１項に記載の化合物。
〔６９〕
Ｒ1は、前記〔２〕〜〔７〕のいずれか１項に定義されるとおりである、前記〔６１〕〜〔６８〕のいずれか１項に記載の化合物。
〔７０〕
Ｌ4およびＬ5は、各存在において非存在である、前記〔６１〕〜〔６９〕のいずれか１項に記載の化合物。
〔７１〕
Ｌ4もしくはＬ5、または両方は、少なくとも１個の存在に関して存在する、前記〔６１〕〜〔６９〕のいずれか１項に記載の化合物。
〔７２〕
存在する場合、Ｌ4もしくはＬ5、または両方は、前記〔１０〕〜〔１３〕のいずれか１項に定義されるとおりである、前記〔７１〕に記載の化合物。
〔７３〕
Ｌ2およびＬ3は、独立して、非存在またはヘテロアルキレンリンカーである、前記〔６１〕〜〔７２〕のいずれか１項に記載の化合物。
〔７４〕
前記ヘテロアルキレンリンカーは、ペプチジルリンカーである、前記〔７３〕に記載の化合物。
〔７５〕
Ｒ2は、−ＮＨ2である、前記〔６１〕〜〔７４〕のいずれか１項に記載の化合物。
〔７６〕
Ｒ3は、Ｑ、Ｑへの共有結合を含むリンカーまたは固体支持体への共有結合を含むリンカーである、前記〔６１〕〜〔７５〕のいずれか１項に記載の化合物。
〔７７〕
Ｑは、求核性反応性基、求電子性反応性基または環化付加反応性基を含む、前記〔６１〕〜〔７６〕のいずれか１項に記載の化合物。
〔７８〕
Ｑは、スルフヒドリル、ジスルフィド、活性化エステル、イソチオシアネート、アジド、アルキン、アルケン、ジエン、ジエノフィル、酸ハライド、スルホニルハライド、ホスフィン、α−ハロアミド、ビオチン、アミノまたはマレイミド官能基を含む、前記〔７７〕に記載の化合物。
〔７９〕
前記活性化エステルは、Ｎ−スクシンイミドエステル、イミドエステルまたはポリフルオロフェニルエステルである、前記〔７８〕に記載の化合物。
〔８０〕
前記アルキンは、アルキルアジドまたはアシルアジドである、前記〔７８〕に記載の化合物。
〔８１〕
Ｑは、表１から選択される部分である、前記〔６１〕〜〔８０〕のいずれか１項に記載の化合物。
〔８２〕
Ｒ2またはＲ3のうちの一方は、分析物分子への共有結合を含むリンカーまたは固体支持体への共有結合を含むリンカーである、前記〔６１〕〜〔７４〕のいずれか１項に記載の化合物。
〔８３〕
前記分析物分子は、核酸、アミノ酸またはこれらのポリマーである、前記〔８２〕に記載の化合物。
〔８４〕
前記分析物分子は、酵素、レセプター、レセプターリガンド、抗体、糖タンパク質、アプタマーまたはプリオンである、前記〔８２〕に記載の化合物。
〔８５〕
前記固体支持体は、ポリマービーズまたは非ポリマービーズである、前記〔８２〕に記載の化合物。
〔８６〕
ｍは、各存在において、独立して、１〜２０の整数である、前記〔６１〕〜〔８５〕のいずれか１項に記載の化合物。
〔８７〕
ｍは、各存在において、独立して、１〜１０の整数である、前記〔６１〕〜〔８５〕のいずれか１項に記載の化合物。
〔８８〕
ｎは、１〜１００の整数である、前記〔６１〕〜〔８７〕のいずれか１項に記載の化合物。
〔８９〕
ｎは、１〜１０の整数である、前記〔６１〕〜〔８７〕のいずれか１項に記載の化合物。
〔９０〕
表３から選択される化合物。
〔９１〕
分析物分子を標識するための方法であって、該方法は、
（ａ）Ｒ2またはＲ3は、ＱまたはＱへの共有結合を含むリンカーである前記〔６１〕に記載の化合物と、該分析物分子とを混合する工程；
（ｂ）該化合物および該分析物分子の結合体を形成する工程；ならびに；
（ｃ）該結合体と式Ｍ−Ｌ1b−Ｇ′の化合物とを反応させて、それによって、少なくとも１個のＧおよび少なくとも１個のＧ′の反応によって少なくとも１個の共有結合を形成する工程、
を包含し、ここで：
Ｍは、２個またはこれより多くの炭素−炭素二重結合および少なくとも１の共役度を含む部分であり；
Ｌ1bは、選択肢的なアルキレン、ヘテロアルキレンまたはヘテロ原子リンカーであり；そして
Ｇ′は、Ｇに対する相補的反応性基である、
方法。
〔９２〕
分析物分子を標識するための方法であって、該方法は、
（ａ）Ｒ2またはＲ3は、ＱまたはＱへの共有結合を含むリンカーである前記〔６１〕に記載の化合物と、式Ｍ−Ｌ1b−Ｇ′の化合物とを混合し、それによって、ＧおよびＧ′の反応によって少なくとも１個の共有結合を形成する工程；ならびに
（ｂ）工程（Ａ）の生成物と該分析物分子とを反応させ、それによって、工程（Ａ）の生成物および該分析物分子の結合体を形成する工程、
を包含し、ここで：
Ｍは、２個またはこれより多くの炭素−炭素二重結合および少なくとも１の共役度を含む部分であり；
Ｌ1bは、選択肢的なアルキレン、ヘテロアルキレンまたはヘテロ原子リンカーであり；そして
Ｇ′は、Ｇに対する相補的反応性基である、
方法。
〔９３〕
前記〔１〕に記載の化合物を調製するための方法であって、該方法は、前記〔６１〕に記載の化合物と、式Ｍ−Ｌ1b−Ｇ′の化合物とを混合し、それによって、ＧおよびＧ′の反応によって少なくとも１個の共有結合を形成する工程を包含し、ここで：
Ｍは、２個またはこれより多くの炭素−炭素二重結合および少なくとも１の共役度を含む部分であり；
Ｌ1bは、選択肢的なアルキレン、ヘテロアルキレンまたはヘテロ原子リンカーであり；そして
Ｇ′は、Ｇに対する相補的反応性基である、
方法。