【手続補正書】
【提出日】令和2年6月26日(2020.6.26)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
腸内細菌によって発現されたゼロ、１つまたは複数のアンブラークラスのカルバペネマーゼの存在を判定するための方法であって、
前記腸内細菌を含むサンプルを提供するステップと、
試験サンプル中の前記腸内細菌を、持続期間にわたり、複数の少なくとも４つの試験組成物に適用するステップであって、前記複数の少なくとも４つの試験組成物のそれぞれは、増殖培地および抗生物質を含み、前記少なくとも４つの試験組成物のうち少なくとも１つは、少なくとも１つのカルバペネマーゼ阻害剤をさらに含むステップと、
前記持続期間後における前記複数の少なくとも４つの試験組成物のそれぞれにおける前記腸内細菌の増殖の存在または阻害を検出することによって、前記腸内細菌によって発現されたゼロ、１つまたは複数のアンブラークラスのカルバペネマーゼの存在を判定するステップと、を含む方法。
【請求項２】
以下のことを検出することによって、腸内細菌によって発現された前記１つまたは複数のアンブラークラスのカルバペネマーゼがクラスＡであることを判定するステップを含む請求項１に記載の方法：
第１の試験組成物における増殖の阻害であって、前記抗生物質および阻害剤は、第１の濃度のＴＥＭ、およびアンブラークラスＢのカルバペネマーゼ阻害剤を含む増殖の阻害、
第２の試験組成物における増殖の存在であって、前記抗生物質および阻害剤は、第１の濃度のＤＯＲ、アンブラークラスＣのカルバペネマーゼ阻害剤、およびアンブラークラスＢのカルバペネマーゼ阻害剤を含む増殖の存在、
第３の試験組成物における増殖の阻害であって、前記抗生物質および阻害剤は、第１の濃度のＭＥＭ、アンブラークラスＣのカルバペネマーゼ阻害剤、およびアンブラークラスＡのカルバペネマーゼ阻害剤を含む増殖の阻害。
【請求項３】
以下のことを検出することによって、腸内細菌によって発現された前記１つまたは複数のアンブラークラスのカルバペネマーゼがクラスＢであることを判定するステップを含む請求項１に記載の方法：
第１の試験組成物における増殖の阻害であって、前記抗生物質および阻害剤は、前記抗生物質として第１の濃度のＴＥＭを含み、アンブラークラスＢのカルバペネマーゼ阻害剤をさらに含む増殖の阻害、
第２の試験組成物における増殖の阻害であって、前記抗生物質および阻害剤は、第１の濃度のＤＯＲ、アンブラークラスＣのカルバペネマーゼ阻害剤、およびアンブラークラスＢのカルバペネマーゼ阻害剤を含む増殖の阻害、
第４の試験組成物における増殖の存在であって、前記抗生物質は、第２の濃度のＤＯＲを含む増殖の存在。
【請求項４】
以下のことを検出することによって、腸内細菌によって発現された前記１つまたは複数のアンブラークラスのカルバペネマーゼがクラスＤであることを判定するステップを含む請求項１に記載の方法：
第１の試験組成物における増殖の阻害であって、前記抗生物質および阻害剤は、第１の濃度のＴＥＭ、およびアンブラークラスＢのカルバペネマーゼ阻害剤を含む増殖の阻害、
第２の試験組成物における増殖の阻害であって、前記抗生物質および阻害剤は、第１の濃度のＤＯＲ、アンブラークラスＣのカルバペネマーゼ阻害剤、およびアンブラークラスＢのカルバペネマーゼ阻害剤を含む増殖の阻害、
第４の試験組成物における増殖の阻害であって、前記抗生物質は、第２の濃度のＤＯＲを含む増殖の阻害。
【請求項５】
以下のことを検出することによって、腸内細菌によって発現された１つまたは複数のアンブラークラスのカルバペネマーゼの存在を判定する（ここで、アンブラークラスは同定しない）ステップを含む請求項１に記載の方法：
第１の試験組成物における増殖の阻害であって、前記抗生物質および阻害剤は、第１の濃度のＴＥＭ、およびアンブラークラスＢのカルバペネマーゼ阻害剤を含む増殖の阻害、
第２の試験組成物における増殖の存在であって、前記抗生物質および阻害剤は、第１の濃度のＤＯＲ、アンブラークラスＣのカルバペネマーゼ阻害剤、およびアンブラークラスＢのカルバペネマーゼ阻害剤を含む増殖の存在、
複数の少なくとも４つの試験組成物のうち第３の試験組成物における増殖の存在であって、前記抗生物質および阻害剤は、前記抗生物質として第１の濃度のＭＥＭを含み、さらにアンブラークラスＣのカルバペネマーゼ阻害剤およびアンブラークラスＡのカルバペネマーゼ阻害剤を含む、増殖の存在。
【請求項６】
以下のことを検出することによって、腸内細菌によって発現された１つまたは複数のアンブラークラスＡ、ＢまたはＤのカルバペネマーゼの存在を判定するステップを含む請求項１に記載の方法：
第１の試験組成物における増殖の阻害であって、前記抗生物質および阻害剤は、第１の濃度のＴＥＭ、アンブラークラスＢのカルバペネマーゼ阻害剤を含む増殖の阻害、
第２の試験組成物における増殖の存在であって、前記抗生物質および阻害剤は、第１の濃度のＤＯＲ、アンブラークラスＣのカルバペネマーゼ阻害剤、およびアンブラークラスＢのカルバペネマーゼ阻害剤を含む増殖の存在、
第３の試験組成物における増殖の存在であって、前記抗生物質および阻害剤は、第１の濃度のＭＥＭ、アンブラークラスＣのカルバペネマーゼ阻害剤、およびアンブラークラスＡのカルバペネマーゼ阻害剤を含む増殖の存在。
【請求項７】
以下のことを検出することによって、腸内細菌によって発現された前記１つまたは複数のアンブラークラスのカルバペネマーゼを同定することに関して回答が得られないことを判定するステップを含む請求項１に記載の方法：
第１の試験組成物における増殖の阻害であって、前記抗生物質および阻害剤は、第１の濃度のＴＥＭ、およびアンブラークラスＢのカルバペネマーゼ阻害剤を含む増殖の阻害、
第２の試験組成物における増殖の存在であって、前記抗生物質および阻害剤は、第１の濃度のＤＯＲ、アンブラークラスＣのカルバペネマーゼ阻害剤、およびアンブラークラスＢのカルバペネマーゼ阻害剤を含む増殖の存在、
複数の少なくとも４つの試験組成物のうち第３の試験組成物における増殖の存在であって、前記抗生物質および阻害剤は、第１の濃度のＭＥＭ、アンブラークラスＣのカルバペネマーゼ阻害剤、およびアンブラークラスＡのカルバペネマーゼ阻害剤を含む増殖の存在、
第５の試験組成物における増殖の阻害であって、前記抗生物質および阻害剤は、第３の濃度のＭＥＭ、およびアンブラークラスＣのカルバペネマーゼ阻害剤を含む増殖の阻害。
【請求項８】
以下のことを検出することによって、腸内細菌によって発現された１つまたは複数のアンブラークラスＡ、ＢまたはＤのカルバペネマーゼの存在を判定するステップを含む請求項１に記載の方法：
第１の試験組成物における増殖の阻害であって、前記抗生物質および阻害剤は、第１の濃度のＴＥＭ、およびアンブラークラスＢのカルバペネマーゼ阻害剤を含む増殖の阻害、
第２の試験組成物における増殖の存在であって、前記抗生物質および阻害剤は、第１の濃度のＤＯＲ、アンブラークラスＣのカルバペネマーゼ阻害剤、およびアンブラークラスＢのカルバペネマーゼ阻害剤を含む増殖の存在、
第３の試験組成物における増殖の存在であって、前記抗生物質および阻害剤は、第１の濃度のＭＥＭ、アンブラークラスＣのカルバペネマーゼ阻害剤、およびアンブラークラスＡのカルバペネマーゼ阻害剤を含む増殖の存在、
第５の試験組成物における増殖の存在であって、前記抗生物質および阻害剤は、第３の濃度のＭＥＭ、およびアンブラークラスＣのカルバペネマーゼ阻害剤を含む増殖の存在。
【請求項９】
非発酵性細菌によって発現されたゼロ、１つまたは複数のアンブラークラスのカルバペネマーゼを同定するための方法をさらに含む請求項１に記載の方法であって、
前記方法は、
非発酵性細菌を含むサンプルを提供するステップと、
試験サンプル中の前記非発酵性細菌を、持続期間にわたり、増殖培地および抗生物質およびカルバペネマーゼ阻害剤を含む試験組成物に適用するステップと、
前記持続期間後における前記試験組成物中の前記非発酵性細菌の増殖の存在または阻害を検出することによって、非発酵性細菌によって発現されたゼロ、１つまたは複数のアンブラークラスのカルバペネマーゼの存在を判定するステップと、
を含む方法。
【請求項１０】
非発酵性細菌によって発現されたゼロ、１つまたは複数のアンブラークラスのカルバペネマーゼの存在を判定するための方法をさらに含む請求項１に記載の方法であって、前記本方法は、
非発酵性細菌を含むサンプルを提供するステップと、
試験サンプル中の前記非発酵性細菌を、持続期間にわたり、複数の少なくとも３つの試験組成物に適用するステップであって、前記複数の少なくとも３つの試験組成物のそれぞれは、増殖培地および抗生物質を含み、前記少なくとも３つの試験組成物のうち少なくとも１つは、少なくとも１つのカルバペネマーゼ阻害剤をさらに含むステップと、
前記持続期間後における前記複数の少なくとも３つの試験組成物のそれぞれにおける前記非発酵性細菌の増殖の存在または阻害を検出することによって、前記非発酵性細菌によって発現されたゼロ、１つまたはさらなる１つまたは複数のアンブラークラスのカルバペネマーゼの存在を判定するステップと、
を含む方法。
【請求項１１】
非発酵性細菌によって発現されたゼロ、１つまたは複数のアンブラークラスのカルバペネマーゼの存在を判定するための方法であって、
前記非発酵性細菌を含むサンプルを提供するステップと、
前記試験サンプル中の前記非発酵性細菌を、持続期間にわたり、複数の少なくとも３つの試験組成物に適用するステップであって、前記複数の少なくとも３つの試験組成物のそれぞれは、増殖培地および抗生物質を含み、前記少なくとも３つの試験組成物のうち少なくとも１つは、少なくとも１つのカルバペネマーゼ阻害剤をさらに含むステップと、
前記持続期間後における前記複数の少なくとも３つの試験組成物のそれぞれにおける前記非発酵性細菌の増殖の存在または阻害を検出することによって、前記非発酵性細菌によって発現されたゼロ、１つまたはさらなる１つまたは複数のアンブラークラスのカルバペネマーゼの存在を判定するステップと、
を含む方法。
【請求項１２】
以下のことを検出することによって、非発酵性細菌によって発現された１つまたは複数のアンブラークラスＡ、ＢまたはＤのカルバペネマーゼの存在を判定する請求項１１に記載の方法：
第１の試験組成物における増殖の存在であって、前記抗生物質および阻害剤は、第３の濃度のＤＯＲ、アンブラークラスＣのカルバペネマーゼ阻害剤、およびアンブラークラスＢのカルバペネマーゼ阻害剤を含む増殖の存在、
第２の試験組成物における増殖の存在であって、前記抗生物質および阻害剤は、第４の濃度のＭＥＭ、アンブラークラスＣのカルバペネマーゼ阻害剤、およびアンブラークラスＤのカルバペネマーゼ阻害剤を含む増殖の存在、
第３の試験組成物における増殖の存在であって、前記抗生物質および阻害剤は、第５の濃度のＤＯＲ、アンブラークラスＣのカルバペネマーゼ阻害剤、およびアンブラークラスＤのカルバペネマーゼ阻害剤を含む増殖の存在。
【請求項１３】
前記カルバペネマーゼ阻害剤は、ＡＶＩ、クラブラン酸、ボロン酸、タゾバクタム、スルバクタム、バボルバクタム（ＲＰＸ−７００９）およびＢＬＩ−４８９からなる群から選択されるアンブラークラスＤのカルバペネマーゼ阻害剤である請求項１に記載の方法。
【請求項１４】
前記カルバペネマーゼ阻害剤は、ＥＤＴＡ、ＤＰＡおよびデフェロキサミンからなる群から選択されるアンブラークラスＢのカルバペネマーゼ阻害剤である請求項１に記載の方法。
【請求項１５】
前記カルバペネマーゼ阻害剤は、ＣＬＯＸ、ジクロキサシリンおよびフルクロキサシリンからなる群から選択されるアンブラークラスＣのカルバペネマーゼ阻害剤である  請求項１に記載の方法。
【請求項１６】
前記カルバペネマーゼ阻害剤は、バボルバクタム（ＲＰＸ−７００９）、ＡＶＩ、クラブラン酸、ボロン酸、タゾバクタム、スルバクタム、およびＢＬＩ−４８９からなる群から選択されるアンブラークラスＡのカルバペネマーゼ阻害剤である請求項１に記載の方法。
【請求項１７】
請求項１に記載の方法を実行するための自動システムであって、
複数の区画であって、前記複数の前記区画のそれぞれは、請求項１の方法に記載の少なくとも４個の試験組成物の１個を含む複数の区画と、
前記複数の区画に、腸内細菌、非発酵性細菌、またはその両方を含むサンプルを供給するための手段と、
前記腸内細菌、非発酵性細菌、またはその両方が供給された前記複数の区画から、第１のシグナルを得るための機器と、
前記腸内細菌、非発酵性細菌、またはその両方が供給された前記複数の区画を、持続期間にわたりインキュベートするためのインキュベーターと、
腸内細菌、非発酵性細菌、またはその両方を含む前記複数の区画から、第２のシグナルを得るための機器と、
前記第１のシグナルおよび第２のシグナルを比較することによって、前記腸内細菌、非発酵性細菌、またはその両方が供給された前記複数の区画における増殖の存在または阻害を検出するための検出器と、
前記検出器からの結果のアウトプットを生成するためのコンピューターと、
前記結果のアウトプットを解釈するためのアナライザーと
を備えた自動システム。
【請求項１８】
請求項１１に記載の方法を実行するための自動システムであって、
複数の区画であって、前記複数の前記区画のそれぞれは、請求項１１の方法に記載の少なくとも３個の試験組成物の１個を含む複数の区画と、
前記複数の区画に、腸内細菌、非発酵性細菌、またはその両方を含むサンプルを供給するための手段と、
前記腸内細菌、非発酵性細菌、またはその両方が供給された前記複数の区画から、第１のシグナルを得るための機器と、
前記腸内細菌、非発酵性細菌、またはその両方が供給された前記複数の区画を、持続期間にわたりインキュベートするためのインキュベーターと、
腸内細菌、非発酵性細菌、またはその両方を含む前記複数の区画から、第２のシグナルを得るための機器と、
前記第１のシグナルおよび第２のシグナルを比較することによって、前記腸内細菌、非発酵性細菌、またはその両方が供給された前記複数の区画における増殖の存在または阻害を検出するための検出器と、
前記検出器からの結果のアウトプットを生成するためのコンピューターと、
前記結果のアウトプットを解釈するためのアナライザーと
を備えた自動システム。
【請求項１９】
腸内細菌および／または非発酵性細菌によって発現された１つまたは複数のアンブラークラスのカルバペネマーゼを同定するためのキットであって、複数の区画を有する基板またはパネルを含み、前記複数の区画のそれぞれは、請求項１の方法に記載の少なくとも４個の試験組成物の１個を含むキット。
【請求項２０】
腸内細菌および／または非発酵性細菌によって発現された１つまたは複数のアンブラークラスのカルバペネマーゼを同定するためのキットであって、複数の区画を有する基板またはパネルを含み、前記複数の区画のそれぞれは、請求項１１の方法に記載の少なくとも３個の試験組成物の１個を含むキット。