【手続補正書】
【提出日】令和2年5月20日(2020.5.20)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
グラフィカルユーザインターフェース（ＧＵＩ）のための外れ値円形データ視覚化を生成するコンピュータ実装方法であって、
複数の増幅反応から放射データを受信することと、
前記放射データを使用して外れ値円形データ視覚化を生成することであって、前記外れ値円形データ視覚化が複数の線を含み、各線が前記複数の増幅反応のうちの増幅反応からの放射データを表し、各線が長さおよび視覚インジケータを有し、各線の前記長さが前記放射データの蛍光強度の成長を表し、前記視覚インジケータが前記放射データの関連付けられたサイクル数を示し、前記線の各々が共通点から進む複数の放射状の線のうちの１つの放射状の線に沿って配設される、
前記外れ値円形データ視覚化をＧＵＩ上に表示することを含むコンピュータ実装方法。
【請求項２】
蛍光対増幅サイクル数の放射データを使用して増幅曲線プロットを生成することと、
前記ＧＵＩ上の前記外れ値円形データ視覚化に沿って前記増幅曲線プロットを表示することと、をさらに含む、請求項１に記載のコンピュータ実装方法。
【請求項３】
各線と関連付けられた前記角度位置は、プレート内の前記関連付けられた増幅反応の位置に基づく、請求項１に記載のコンピュータ実装方法。
【請求項４】
各線と関連付けられた前記角度位置は、前記線と関連付けられた前記放射データの特徴に基づく、請求項１に記載のコンピュータ実装方法。
【請求項５】
ユーザから前記複数の線の一部分の選択を受信することと、
前記増幅曲線プロットを動的に調節して、前記選択に対応する増幅曲線を表示することと、をさらに含む、請求項２に記載のコンピュータ実装方法。
【請求項６】
前記複数の増幅反応の特徴選択を受信することと、
前記外れ値円形データ視覚化を動的にフィルタリングして、前記特徴選択に合致する前記複数の線を含めることと、をさらに含む、請求項１に記載のコンピュータ実装方法。
【請求項７】
前記特徴選択は、
サブアレイ、サンプル、増幅状態、標的、Ｃｑ、終点Ｒｎ、および増幅スコアからなる群から選択される、請求項６に記載のシステム。
【請求項８】
グラフィカルユーザインターフェース（ＧＵＩ）のための外れ値円形データ視覚化を生成するためのシステムであって、
メモリと、
プロセッサであって、
複数の増幅反応から放射データを受信することと、
複数の線を含む前記放射データを使用して外れ値円形データ視覚化を生成することであって、前記外れ値円形データ視覚化内に含められた各線が前記複数の増幅反応のうちの増幅反応からの放射データを表し、各線が長さおよび視覚インジケータを有し、各線の前記長さが前記放射データの蛍光強度の成長を表し、前記視覚インジケータが前記放射データの関連付けられたサイクル数を示し、前記線の各々が共通点から進む複数の放射状の線のうちの１つの放射状の線に沿って配設される、
前記外れ値円形データ視覚化をＧＵＩ上に表示することを行うように構成されたプロセッサを備えるシステム。
【請求項９】
前記プロセッサは、
蛍光対増幅サイクル数の放射データを使用して増幅曲線プロットを生成することと、
前記ＧＵＩ上の前記外れ値円形データ視覚化に沿って前記増幅曲線プロットを表示することと、を行うようにさらに構成されている、請求項８に記載のシステム。
【請求項１０】
各線と関連付けられた前記角度位置は、プレート内の前記関連付けられた増幅反応の位置に基づく、請求項８に記載のシステム。
【請求項１１】
各線と関連付けられた前記角度位置は、前記線と関連付けられた前記放射データの特徴に基づく、請求項８に記載のシステム。
【請求項１２】
前記プロセッサは、
ユーザから前記複数の線の一部分の選択を受信することと、
前記増幅曲線プロットを動的に調節して、前記選択に対応する増幅曲線を示すことを行うようにさらに構成されている、請求項９に記載のシステム。
【請求項１３】
前記プロセッサは、
前記複数の増幅反応の特徴選択を受信することと、
前記外れ値円形データ視覚化を動的にフィルタリングして、前記特徴選択に合致する前記複数の線を含めることを行うようにさらに構成されている、請求項８に記載のシステム。
【請求項１４】
前記特徴選択は、
サブアレイ、サンプル、増幅状態、標的、Ｃｑ、終点Ｒｎ、および増幅スコアからなる群から選択される、請求項１３に記載のシステム。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００６９
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００６９】
様々な実施形態が、一定の代表的な実施形態、例、および用途に関して説明されてきたが、本教示から逸脱することなく様々な修正および変更が行われてもよいことが当業者には諒解されよう。
なお、好ましい構成態様として、本発明を次のように構成することもできる。
１．  グラフィカルユーザインターフェース（ＧＵＩ）のための外れ値円形データ視覚化を生成するコンピュータ実装方法であって、
複数の増幅反応から放射データを受信することと、
前記放射データを使用して外れ値円形データ視覚化を生成することであって、前記外れ値円形データ視覚化が、複数の線を含み、各線が、前記複数の増幅反応のうちの増幅反応からの放射データを表し、各線が、長さおよび視覚インジケータを有し、各線の前記長さが、前記放射データの蛍光強度の成長を表し、前記視覚インジケータが、前記放射データの関連付けられたサイクル数を示し、各線が、前記複数の線が円形に構成されるように角度位置と関連付けられる、生成することと、
前記外れ値円形データ視覚化をＧＵＩ上に表示することと、を含むコンピュータ実装方法。
２．  蛍光対増幅サイクル数の放射データを使用して増幅曲線プロットを生成することと、
前記ＧＵＩ上の前記外れ値円形データ視覚化に沿って前記増幅曲線プロットを表示することと、をさらに含む、上記１に記載のコンピュータ実装方法。
３．  各線と関連付けられた前記角度位置がプレート内の前記関連付けられた増幅反応の位置に基づく、上記１に記載のコンピュータ実装方法。
４．  各線と関連付けられた前記角度位置が、前記線と関連付けられた前記放射データの特徴に基づく、上記１に記載のコンピュータ実装方法。
５．  ユーザから前記複数の線の一部分の選択を受信することと、
前記増幅曲線プロットを動的に調節して、前記選択に対応する増幅曲線を表示すること、をさらに含む上記２に記載のコンピュータ実装方法。
６．  前記複数の増幅反応の特徴選択を受信することと、
前記外れ値円形データ視覚化を動的にフィルタリングして、前記特徴選択に合致する前記複数の線を含めること、をさらに含む上記１に記載のコンピュータ実装方法。
７．  前記特徴選択は、
サブアレイ、サンプル、増幅状態、標的、Ｃｑ、終点Ｒｎ、および増幅スコアからなる群から選択される、上記６に記載のコンピュータ実装方法。
８．  グラフィカルユーザインターフェース（ＧＵＩ）のための外れ値円形データ視覚化を生成するためのシステムであって、
メモリと、
プロセッサであって、
複数の増幅反応から放射データを受信することと、
複数の線を含む前記放射データを使用して外れ値円形データ視覚化を生成することであって、前記外れ値円形データ視覚化内に含められた各線が、前記複数の増幅反応のうちの増幅反応からの放射データを表し、各線が、長さおよび視覚インジケータを有し、各線の前記長さが、前記放射データの蛍光強度の成長を表し、前記視覚インジケータが、前記放射データの関連付けられたサイクル数を示し、各線が、前記複数の線が円形に構成されるように角度位置と関連付けられる、生成することと、
前記外れ値円形データ視覚化をＧＵＩ上に表示することと、を行うように構成された、プロセッサとを備えるシステム。
９．  前記プロセッサは、
蛍光対増幅サイクル数の放射データを使用して増幅曲線プロットを生成することと、
前記ＧＵＩ上の前記外れ値円形データ視覚化に沿って前記増幅曲線プロットを表示することと、を行うようにさらに構成されている上記８に記載のシステム。
１０．  各線と関連付けられた前記角度位置が、プレート内の前記関連付けられた増幅反応の位置に基づく、 上記８に記載のシステム。
１１．  各線と関連付けられた前記角度位置が、前記線と関連付けられた前記放射データの特徴に基づく、上記８に記載のシステム。
１２．  前記プロセッサは、
ユーザから前記複数の線の一部分の選択を受信することと、
前記増幅曲線プロットを動的に調節して、前記選択に対応する増幅曲線を示すことを行うようにさらに構成されている、上記９に記載のシステム。
１３．  前記プロセッサは、
前記複数の増幅反応の特徴選択を受信することと、
前記外れ値円形データ視覚化を動的にフィルタリングして、前記特徴選択に合致する前記複数の線を含めることを行うようにさらに構成されている、上記８に記載のシステム。
１４．  前記特徴選択は、
サブアレイ、サンプル、増幅状態、標的、Ｃｑ、終点Ｒｎ、および増幅スコアからなる群から選択される、上記１３に記載のシステム。
１５．  遺伝子型決定データを正規化するコンピュータ実装方法であって、
複数の基板からの一組の放射データを受信し、前記放射データが、第１の染色の強度および第２の染色の強度を含み、前記第１の染色が、第１の標的対立遺伝子の存在を示し、前記第２の染色が、第２の標的対立遺伝子の存在を示すことと、
前記第１の染色の前記強度を前記第２の染色の前記強度に対してプロットすることによって前記一組の放射データのプロットを生成することと、
角変換に基づいて前記プロット内の前記放射データを正規化することを含む、コンピュータ実装方法。
１６．  前記放射データの振幅に基づいて前記プロット内の前記放射データを正規化することをさらに含む、上記１５に記載のコンピュータ実装方法。
１７．  前記角変換に基づいて前記プロット内の前記放射データを正規化することに、
高密度の点の前記プロット内の位置を決定することと、
最小標準偏差を有する決定された位置内の一組のデータを基準として決定することと、  前記基準と残りのデータとの間の最小Θ標準偏差を生成する角度を決定して、前記角変換を選択することを含む、上記１５に記載のコンピュータ実装方法。
１８．  前記基準の９５番目のパーセンタイル信号を計算して、振幅倍率を決定することをさらに含む、上記１７に記載のコンピュータ実装方法。
１９．  遺伝子型決定データを正規化するためのシステムであって、
メモリと、
プロセッサであって、
複数の基板からの一組の放射データを受信し、前記放射データが、第１の染色の強度および第２の染色の強度を含み、前記第１の染色が、第１の標的対立遺伝子の存在を示し、前記第２の染色が、第２の標的対立遺伝子の存在を示す、
前記第１の染色の前記強度を前記第２の染色の前記強度に対してプロットすることによって前記一組の放射データのプロットを生成することと、
角スケーリング変換に基づいて前記プロット内の前記放射データを正規化することと、を行うように構成されたプロセッサとを備えるシステム。
２０．  前記プロセッサは、
前記放射データの振幅に基づいて前記プロット内の前記放射データを正規化するようにさらに構成されている、上記１９に記載のシステム。
２１．  前記プロセッサは、前記角変換に基づいて前記プロット内の前記放射データを正規化するように構成されており、これは、
高密度の点の前記プロット内の位置を決定することと、
最小標準偏差を有する決定された位置内の一組のデータを基準として決定することと、  前記基準と残りのデータとの間の最小Θ標準偏差を生成する角度を決定して、前記角変換を選択することと、によってなされる、上記１９に記載のシステム。
２２．  前記プロセッサは、
前記基準の９５番目のパーセンタイル信号を計算して、振幅倍率を決定するようにさらに構成されている、上記２１に記載のシステム。
２３．  グラフィカルユーザインターフェース（ＧＵＩ）のための外れ値円形データ視覚化を生成するコンピュータ実装方法であって、
複数の増幅反応から放射データを受信することと、
前記放射データを使用して外れ値円形データ視覚化を生成することであって、前記外れ値円形データ視覚化が複数の線を含み、各線が前記複数の増幅反応のうちの増幅反応からの放射データを表し、各線が長さおよび視覚インジケータを有し、各線の前記長さが前記放射データの蛍光強度の成長を表し、前記視覚インジケータが前記放射データの関連付けられたサイクル数を示し、前記線の各々が共通点から進む複数の放射状の線のうちの１つの放射状の線に沿って配設される、
前記外れ値円形データ視覚化をＧＵＩ上に表示することを含むコンピュータ実装方法。
２４．  蛍光対増幅サイクル数の放射データを使用して増幅曲線プロットを生成することと、
前記ＧＵＩ上の前記外れ値円形データ視覚化に沿って前記増幅曲線プロットを表示することと、をさらに含む、上記２３に記載のコンピュータ実装方法。
２５．  各線と関連付けられた前記角度位置は、プレート内の前記関連付けられた増幅反応の位置に基づく、上記２３に記載のコンピュータ実装方法。
２６．  各線と関連付けられた前記角度位置は、前記線と関連付けられた前記放射データの特徴に基づく、上記２３に記載のコンピュータ実装方法。
２７．  ユーザから前記複数の線の一部分の選択を受信することと、
前記増幅曲線プロットを動的に調節して、前記選択に対応する増幅曲線を表示することと、をさらに含む、上記２４に記載のコンピュータ実装方法。
２８．  前記複数の増幅反応の特徴選択を受信することと、
前記外れ値円形データ視覚化を動的にフィルタリングして、前記特徴選択に合致する前記複数の線を含めることと、をさらに含む、上記２３に記載のコンピュータ実装方法。
２９．  前記特徴選択は、
サブアレイ、サンプル、増幅状態、標的、Ｃｑ、終点Ｒｎ、および増幅スコアからなる群から選択される、上記２８に記載のシステム。
３０．  グラフィカルユーザインターフェース（ＧＵＩ）のための外れ値円形データ視覚化を生成するためのシステムであって、
メモリと、
プロセッサであって、
複数の増幅反応から放射データを受信することと、
複数の線を含む前記放射データを使用して外れ値円形データ視覚化を生成することであって、前記外れ値円形データ視覚化内に含められた各線が前記複数の増幅反応のうちの増幅反応からの放射データを表し、各線が長さおよび視覚インジケータを有し、各線の前記長さが前記放射データの蛍光強度の成長を表し、前記視覚インジケータが前記放射データの関連付けられたサイクル数を示し、前記線の各々が共通点から進む複数の放射状の線のうちの１つの放射状の線に沿って配設される、
前記外れ値円形データ視覚化をＧＵＩ上に表示することを行うように構成されたプロセッサを備えるシステム。
３１．  前記プロセッサは、
蛍光対増幅サイクル数の放射データを使用して増幅曲線プロットを生成することと、
前記ＧＵＩ上の前記外れ値円形データ視覚化に沿って前記増幅曲線プロットを表示することと、を行うようにさらに構成されている、上記３０に記載のシステム。
３２．  各線と関連付けられた前記角度位置は、プレート内の前記関連付けられた増幅反応の位置に基づく、上記３０に記載のシステム。
３３．  各線と関連付けられた前記角度位置は、前記線と関連付けられた前記放射データの特徴に基づく、上記３０に記載のシステム。
３４．  前記プロセッサは、
ユーザから前記複数の線の一部分の選択を受信することと、
前記増幅曲線プロットを動的に調節して、前記選択に対応する増幅曲線を示すことを行うようにさらに構成されている、上記３１に記載のシステム。
３５．  前記プロセッサは、
前記複数の増幅反応の特徴選択を受信することと、
前記外れ値円形データ視覚化を動的にフィルタリングして、前記特徴選択に合致する前記複数の線を含めることを行うようにさらに構成されている、上記３０に記載のシステム。
３６．  前記特徴選択は、
サブアレイ、サンプル、増幅状態、標的、Ｃｑ、終点Ｒｎ、および増幅スコアからなる群から選択される、上記３５に記載のシステム。