【手続補正書】
【提出日】令和2年10月23日(2020.10.23)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
ｍＲＮＡ癌ワクチンであって、
次のうちの１つまたは複数：
（ａ）個別化癌抗原である１〜５００のペプチドエピトープをコードする１つもしくは複数のオープンリーディングフレームをそれぞれ有する１つもしくは複数のｍＲＮＡ、
（ｂ）癌抗原ペプチドエピトープをコードするオープンリーディングフレームをそれぞれ有する１つもしくは複数のｍＲＮＡであって、前記ｍＲＮＡワクチンは、５〜１００のペプチドエピトープをコードし、前記ペプチドエピトープのうちの少なくとも２つは、個別化癌抗原である、前記ｍＲＮＡ、及び／または
（ｄ）癌抗原ペプチドエピトープをコードするオープンリーディングフレームをそれぞれ有する１つもしくは複数のｍＲＮＡであって、前記ｍＲＮＡワクチンは、５〜１００のペプチドエピトープをコードし、前記ペプチドエピトープのうちの少なくとも３つは、複合バリアントであり、前記ペプチドエピトープのうちの少なくとも２つは、点変異である、前記ｍＲＮＡ
を含む、脂質ナノ粒子を含む、前記ｍＲＮＡ癌ワクチン。
【請求項２】
ｍＲＮＡ癌ワクチンであって、
（ｉ）個別化癌抗原である１〜５００ペプチドエピトープをコードする１つまたは複数のオープンリーディングフレームをそれぞれ有する１つまたは複数のｍＲＮＡと、
（ｉｉ）前記個別化癌抗原に対する免疫応答を高めるポリペプチドをコードするオープンリーディングフレームを有するｍＲＮＡと、
を含む、脂質ナノ粒子を含み、
任意選択で、（ｉ）及び（ｉｉ）は、およそ５：１の質量比で存在し、任意選択で、前記ペプチドエピトープのうちの少なくとも１つは、活性化癌遺伝子変異ペプチドまたは従来型癌抗原であり、任意選択で、前記ペプチドエピトープのうちの少なくとも３つは、複合バリアントであり、前記ペプチドエピトープのうちの少なくとも２つは、点変異である、前記ｍＲＮＡ癌ワクチン。
【請求項３】
（ａ）前記１つまたは複数のｍＲＮＡがそれぞれ、配列番号１７６に示すヌクレオチド配列を含む５’ＵＴＲを含む、
（ｂ）前記１つまたは複数のｍＲＮＡがそれぞれ、ポリＡテールを含み、任意選択で、前記ポリＡテールが、約１００ヌクレオチドを含む、
（ｃ）前記１つまたは複数のｍＲＮＡがそれぞれ、５’キャップ１構造を含む、及び／または
（ｄ）前記１つまたは複数のｍＲＮＡが、少なくとも１つの化学修飾を含み、任意選択で、前記化学修飾が、シュードウリジン、Ｎ１−メチルシュードウリジン、２−チオウリジン、４’−チオウリジン、５−メチルシトシン、２−チオ−１−メチル−１−デアザ−シュードウリジン、２−チオ−１−メチル−シュードウリジン、２−チオ−５−アザ−ウリジン、２−チオ−ジヒドロシュードウリジン、２−チオ−ジヒドロウリジン、２−チオ−シュードウリジン、４−メトキシ−２−チオ−シュードウリジン、４−メトキシ−シュードウリジン、４−チオ−１−メチル−シュードウリジン、４−チオ−シュードウリジン、５−アザ−ウリジン、ジヒドロシュードウリジン、５−メチルウリジン、５−メチルウリジン、５−メトキシウリジン、及び２’−Ｏ−メチルウリジンからなる群から選択され、さらに任意選択で、前記１つまたは複数のｍＲＮＡが、Ｎ１−メチルシュードウリジンで完全に修飾されている、
請求項１または２に記載のｍＲＮＡ癌ワクチン。
【請求項４】
（ａ）前記１つまたは複数のｍＲＮＡが、４５〜５５の個別化癌抗原をコードする、
（ｂ）前記１つまたは複数のｍＲＮＡが、５２の個別化癌抗原をコードする、
（ｃ）前記個別化癌抗原のそれぞれが、別個のオープンリーディングフレームによってコードされる、または
（ｄ）前記ペプチドエピトープが、２〜１００のペプチドエピトープから構成されるコンカテマー癌抗原の形態であり、任意選択で、前記コンカテマー癌抗原は、５〜１００のペプチドエピトープから構成され、
任意選択で、
（ｉ）前記コンカテマー癌抗原が、切断感受性部位が間に入ることによって散在している、前記２〜１００のペプチドエピトープ、もしくは任意選択で、５〜１００のペプチドエピトープの１つ以上を含む、
（ｉｉ）前記コンカテマー癌抗原が、リンカーなしで互いに直接連結されているそれぞれのペプチドエピトープをコードする前記ｍＲＮＡの１つ以上を含む、
（ｉｉｉ）前記コンカテマー癌抗原が、単一のヌクレオチドリンカーで互いに連結されているそれぞれのペプチドエピトープをコードする前記ｍＲＮＡの１つ以上を含む、
（ｉｖ）前記コンカテマー癌抗原が、２５〜３５アミノ酸を含み、かつ中央に位置するＳＮＰ変異を含む、それぞれのペプチドエピトープの１つ以上を含む、
（ｖ）前記コンカテマー癌抗原が、４５〜５５のペプチドエピトープをコードする前記ｍＲＮＡの１つ以上を含む、
（ｖｉ）前記コンカテマー癌抗原が、５２のペプチドエピトープをコードする前記ｍＲＮＡの１つ以上を含む、
（ｖｉｉ）前記コンカテマー癌抗原が、前記ペプチドエピトープの順序が偽エピトープを最小化する順序になるように配置される、前記ペプチドエピトープをコードする前記ｍＲＮＡの１つ以上を含む、及び／または
（ｖｉｉｉ）それぞれのペプチドエピトープが、中央に位置するＳＮＰ変異を含み、前記ＳＮＰ変異の両側には７〜１５の隣接アミノ酸が存在する、
請求項１〜３のいずれか１項に記載のｍＲＮＡ癌ワクチン。
【請求項５】
（ａ）前記免疫応答が、
（ｉ）Ｉ型インターフェロン経路のシグナル伝達を刺激すること、
（ｉｉ）ＮＦｋＢ経路のシグナル伝達を刺激すること、
（ｉｉｉ）炎症反応を刺激すること、
（ｉｖ）サイトカイン産生を刺激すること、または
（ｖ）樹状細胞の発生、活性もしくは動員を刺激すること、及び
（ｖｉ）（ｉ）〜（ｖｉ）のいずれかの組み合わせを特徴とする細胞性または体液性免疫応答を含む、あるいは
（ｂ）前記ｍＲＮＡワクチンが、前記ペプチドエピトープと、前記個別化癌抗原に対する免疫応答を高める前記ポリペプチドとの両方をコードする単一のｍＲＮＡ構築物を含む、
請求項２に記載のｍＲＮＡ癌ワクチン。
【請求項６】
それぞれのｍＲＮＡが、同じまたは異なる脂質ナノ粒子に製剤化され、任意選択で、
（ｉ）癌個別化癌抗原をコードするそれぞれのｍＲＮＡが、同じまたは異なる脂質ナノ粒子に製剤化され、さらに任意選択で、前記個別化癌抗原に対する免疫応答を高めるポリペプチドをコードするそれぞれのｍＲＮＡが、同じまたは異なる脂質ナノ粒子に製剤化される、
（ｉｉ）個別化癌抗原をコードするそれぞれのｍＲＮＡが、同じ脂質ナノ粒子に製剤化され、前記個別化癌抗原に対する免疫応答を高めるポリペプチドをコードするそれぞれのｍＲＮＡが、異なる脂質ナノ粒子に製剤化される、
（ｉｉｉ）個別化癌抗原をコードするそれぞれのｍＲＮＡが、同じ脂質ナノ粒子に製剤化され、前記個別化癌抗原に対する免疫応答を高めるポリペプチドをコードするそれぞれのｍＲＮＡが、個別化癌抗原をコードするそれぞれのｍＲＮＡと同じ脂質ナノ粒子に製剤化される、あるいは
（ｉｖ）個別化癌抗原をコードするそれぞれのｍＲＮＡが、異なる脂質ナノ粒子に製剤化され、前記個別化癌抗原に対する免疫応答を高めるポリペプチドをコードするそれぞれのｍＲＮＡが、それぞれの個別化癌抗原をコードするそれぞれのｍＲＮＡと同じ脂質ナノ粒子に製剤化される、
請求項１〜５のいずれか１項に記載のｍＲＮＡ癌ワクチン。
【請求項７】
（ａ）前記ペプチドエピトープが、Ｔ細胞エピトープ及び／またはＢ細胞エピトープである、
（ｂ）前記ペプチドエピトープが、Ｔ細胞エピトープとＢ細胞エピトープの組み合わせを含む、
（ｃ）前記ペプチドエピトープのうちの少なくとも１つが、Ｔ細胞エピトープである、
（ｄ）前記ペプチドエピトープのうちの少なくとも１つが、Ｂ細胞エピトープである、
（ｅ）前記ペプチドエピトープが、前記対象のＭＨＣに対する結合強度について最適化されている、あるいは
（ｆ）前記ｍＲＮＡワクチンがさらに、１つまたは複数の従来型癌抗原をコードするオープンリーディングフレームを有するｍＲＮＡを含む、
請求項１〜６のいずれか１項に記載のｍＲＮＡ癌ワクチン。
【請求項８】
次の条件のうちの１つまたは複数：
（ｉ）前記ペプチドエピトープのうちの少なくとも１つは、従来型癌抗原であること、
（ｉｉ）前記ペプチドエピトープのうちの少なくとも１つは、反復多型であること、
（ｉｉｉ）前記反復多型は、ｐ５３における反復体細胞癌変異を含むこと、
及び／または
（ｉｖ）前記ｍＲＮＡ癌ワクチンが、安定剤を含まないこと
を満たす、請求項１〜７のいずれか１項に記載のｍＲＮＡ癌ワクチン。
【請求項９】
（ａ）前記脂質ナノ粒子が、約２０〜６０％のイオン化可能なアミノ脂質：５〜２５％の中性脂質：２５〜５５％のステロール；０．５〜１５％のＰＥＧ修飾脂質のモル比を含み、任意選択で、前記イオン化可能なアミノ脂質は、カチオン性脂質であり、任意選択で、
（ｉ）前記脂質ナノ粒子が、約５０％の化合物２５：約１０％のＤＳＰＣ：約３８．５％のコレステロール；約１．５％のＰＥＧ−ＤＭＧのモル比を含む、または
（ｉｉ）前記イオン化可能なアミノ脂質が、例えば、２，２−ジリノレイル−４−ジメチルアミノエチル−［１，３］−ジオキソラン（ＤＬｉｎ−ＫＣ２−ＤＭＡ）、ジリノレイル−メチル−４−ジメチルアミノブチレート（ＤＬｉｎ−ＭＣ３−ＤＭＡ）、及びジ（（Ｚ）−ノナ−２−エン−１−イル）９−（（４−（ジメチルアミノ）ブタノイル）オキシ）ヘプタデカンジオエート（Ｌ３１９）からなる群から選択される、
（ｂ）前記脂質ナノ粒子が、式（Ｉ）の化合物を含み、任意選択で、式（Ｉ）の化合物が、化合物２５である、
（ｃ）前記脂質ナノ粒子が、０．４未満の多分散値を有する、あるいは
（ｄ）前記脂質ナノ粒子が、中性のｐＨ値で正味の中性電荷を有する、
請求項１〜８のいずれか１項に記載のｍＲＮＡ癌ワクチン。
【請求項１０】
（ａ）前記ｍＲＮＡが、免疫チェックポイント調節因子をコードするオープンリーディングフレームをさらに含み、任意選択で、前記免疫チェックポイント調節因子が、阻害性チェックポイントポリペプチドであり、好ましくは、前記阻害性チェックポイントポリペプチドが、ＰＤ１、ＰＤ−Ｌ１、ＣＴＬＡ４、ＴＩＭ−３、ＶＩＳＴＡ、Ａ２ＡＲ、Ｂ７−Ｈ３、Ｂ７−Ｈ４、ＢＴＬＡ、ＩＤＯ、ＫＩＲ、ＬＡＧ３、またはそれらの組み合わせを阻害する、あるいは
（ｂ）前記ｍＲＮＡが、追加の癌治療剤をさらに含み、任意選択で、前記追加の癌治療剤は、免疫チェックポイント調節因子であり、さらに任意選択で、前記免疫チェックポイント調節因子が、阻害性チェックポイントポリペプチドであり、好ましくは、前記阻害性チェックポイントポリペプチドが、ＰＤ１、ＰＤ−Ｌ１、ＣＴＬＡ４、ＴＩＭ−３、ＶＩＳＴＡ、Ａ２ＡＲ、Ｂ７−Ｈ３、Ｂ７−Ｈ４、ＢＴＬＡ、ＩＤＯ、ＫＩＲ、ＬＡＧ３、またはそれらの組み合わせを阻害する、
請求項１〜９のいずれか１項に記載のｍＲＮＡ癌ワクチン。
【請求項１１】
前記チェックポイント阻害剤ポリペプチドが、抗体であり、任意選択で、前記阻害性チェックポイントポリペプチドが、ＣＴＬＡ４に特異的に結合する抗ＣＴＬＡ４抗体またはその抗原結合断片、ＰＤ１に特異的に結合する抗ＰＤ１抗体またはその抗原結合断片、ＰＤ−Ｌ１に特異的に結合する抗ＰＤ−Ｌ１抗体またはその抗原結合断片、及びそれらの組み合わせから選択される抗体であり、さらに任意選択で、
（ｉ）前記チェックポイント阻害剤ポリペプチドが、アテゾリズマブ、アベルマブ、またはデュルバルマブから選択される抗ＰＤ−Ｌ１抗体である、
（ｉｉ）前記チェックポイント阻害剤ポリペプチドが、トレメリムマブまたはイピリムマブから選択される抗ＣＴＬＡ−４抗体である、あるいは
（ｉｉｉ）前記チェックポイント阻害剤ポリペプチドが、ニボルマブまたはペンブロリズマブから選択される抗ＰＤ１抗体である、
請求項１０に記載のｍＲＮＡ癌ワクチン。
【請求項１２】
癌を有する対象に、請求項１〜１１のいずれか１項に記載のｍＲＮＡ癌ワクチンを投与することを含む、対象のワクチン接種方法であって、任意選択で、前記ｍＲＮＡワクチンが、１０μｇ〜４００μｇの前記ｍＲＮＡワクチンを送達するために十分な用量レベルで前記対象に投与され、さらに任意選択で、前記ｍＲＮＡワクチンが、０．０３３ｍｇ、０．１ｍｇ、０．２ｍｇ、または０．４ｍｇを送達するために十分な用量レベルで前記対象に投与され、及び／または前記ｍＲＮＡワクチンが、２回、３回、４回またはそれより多い回数で前記対象に投与され、好ましくは、前記ｍＲＮＡワクチンが、３週間ごとに１日１回投与される、ワクチン接種方法。
【請求項１３】
（ａ）前記ｍＲＮＡワクチンが、皮内、筋肉内、及び／または皮下投与によって投与され、任意選択で、前記ｍＲＮＡワクチンが、筋肉内投与によって投与される、
（ｂ）追加の癌治療剤を投与することをさらに含み、任意選択で、前記追加の癌治療剤は、前記対象に対する免疫チェックポイント調節因子である、及び／または
（ｃ）前記癌が、
（ｉ）非小細胞肺癌（ＮＳＣＬＣ）、小細胞肺癌、メラノーマ、膀胱尿路上皮癌、ＨＰＶ陰性頭頸部扁平上皮癌（ＨＮＳＣＣ）、及び高頻度マイクロサテライト（ＭＳＩ  Ｈ）／ミスマッチ修復（ＭＭＲ）欠損である固形悪性腫瘍からなる群であって、任意選択で、前記ＮＳＣＬＣが、ＥＧＦＲ感受性変異及び／またはＡＬＫ転座がない、及び／または高頻度マイクロサテライト（ＭＳＩ  Ｈ）／ミスマッチ修復（ＭＭＲ）欠損である前記固形悪性腫瘍が、結腸直腸癌、胃腺癌、食道腺癌、及び子宮内膜癌からなる群から選択される群；及び／または
（ｉｉ）膵臓、腹膜、大腸、小腸、胆道、肺、子宮内膜、卵巣、生殖管、胃腸管、子宮頸部、胃、尿路、結腸、直腸、ならびに造血系及びリンパ系組織の癌
から選択される、
請求項１２に記載の方法。
【請求項１４】
（ｂ）が選択される請求項１３に記載の方法であって、
（ｉ）前記免疫チェックポイント調節因子が、阻害性チェックポイントポリペプチドであり、任意選択で、
（Ａ）前記阻害性チェックポイントポリペプチドが、ＰＤ１、ＰＤ−Ｌ１、ＣＴＬＡ４、ＴＩＭ−３、ＶＩＳＴＡ、Ａ２ＡＲ、Ｂ７−Ｈ３、Ｂ７−Ｈ４、ＢＴＬＡ、ＩＤＯ、ＫＩＲ、ＬＡＧ３、またはそれらの組み合わせを阻害する、あるいは
（Ｂ）前記チェックポイント阻害剤ポリペプチドが、抗体であり、さらに任意選択で、前記阻害性チェックポイントポリペプチドが、ＣＴＬＡ４に特異的に結合する抗ＣＴＬＡ４抗体またはその抗原結合断片、ＰＤ１に特異的に結合する抗ＰＤ１抗体またはその抗原結合断片、ＰＤ−Ｌ１に特異的に結合する抗ＰＤ−Ｌ１抗体またはその抗原結合断片、及びそれらの組み合わせから選択される抗体であり、好ましくは、
前記チェックポイント阻害剤ポリペプチドが、アテゾリズマブ、アベルマブ、またはデュルバルマブから選択される抗ＰＤ−Ｌ１抗体である、
前記チェックポイント阻害剤ポリペプチドが、トレメリムマブまたはイピリムマブから選択される抗ＣＴＬＡ−４抗体である、あるいは
前記チェックポイント阻害剤ポリペプチドが、ニボルマブまたはペンブロリズマブから選択される抗ＰＤ１抗体である、
（ｉｉ）前記免疫チェックポイント調節因子が、１００〜３００ｍｇを送達するために十分な用量レベルで前記対象に投与され、さらに任意選択で、前記免疫チェックポイント調節因子が、２００ｍｇを送達するために十分な用量レベルで前記対象に投与される、
（ｉｉｉ）前記免疫チェックポイント調節因子が、静脈内注入によって投与される、
（ｉｖ）前記免疫チェックポイント調節因子が、２回、３回、４回またはそれより多い回数で前記対象に投与される、及び／または
（ｖ）前記免疫チェックポイント調節因子が、前記ｍＲＮＡワクチン投与と同じ日に前記対象に投与される、方法。
【請求項１５】
１０００〜３０００ヌクレオチドを含むコンカテマー癌抗原をコードするｍＲＮＡの生成方法であって、
（ａ）請求項１〜１１のいずれか１項に記載の癌抗原をコードするオープンリーディングフレームを含む第１のポリヌクレオチド及び５’−ＵＴＲを含む第２のポリヌクレオチドの、固形担体に複合化したポリヌクレオチドへの結合と、
（ｂ）前記第２のポリヌクレオチドの３’末端の、前記第１のポリヌクレオチドの５’末端への適切な条件下でのライゲーションであって、前記適切な条件がＤＮＡリガーゼを含み、それによって、第１のライゲーション産物が生成する前記ライゲーションと、
（ｃ）３’−ＵＴＲを含む第３のポリヌクレオチドの５’末端の、前記第１のライゲーション産物の３’末端への、適切な条件下でのライゲーションであって、前記適切な条件がＲＮＡリガーゼを含み、それによって、第２のライゲーション産物が生成する前記ライゲーションと、
（ｄ）前記固形担体からの前記第２のライゲーション産物の遊離と、
を含み、それによって、前記１０００〜３０００ヌクレオチドを含むコンカテマー癌抗原をコードするｍＲＮＡが生成する、前記方法。