【手続補正書】
【提出日】令和2年11月2日(2020.11.2)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
対象からの１つ以上の試料を評価する方法であって、
対象からの１つ以上の試料における全無細胞ＤＮＡの量の値を決定すること、および
対象からの１つ以上の試料における特異的な無細胞ＤＮＡの量の値を決定すること
を含む、前記方法。
【請求項２】
（ｉ）対象から１つ以上の試料を得ること；および／または
（ｉｉ）対象からの１つ以上の試料における全無細胞ＤＮＡの量の値、および対象からの１つ以上の試料における特異的な無細胞ＤＮＡの量の値を提供することをさらに含む、請求項１に記載の方法であって、
任意に、全無細胞ＤＮＡの量の値および特異的な無細胞ＤＮＡの量の値が、レポートにおいて提供される、前記方法。
【請求項３】
（ｉ）全無細胞ＤＮＡの量の値および特異的な無細胞ＤＮＡの量の値が、手術の２４時間以内に採られた１つ以上の試料において決定される、任意にここで、手術が移植手術である；および／または
（ｉｉ）全無細胞ＤＮＡの量の値および特異的な無細胞ＤＮＡの量の値が、クロスクランプ除去の２４時間以内に採られた１つ以上の試料において決定される、
請求項１または２に記載の方法。
【請求項４】
対象からの１つ以上の他の試料における全無細胞ＤＮＡの量の値を決定すること、および
対象からの１つ以上の他の試料における特異的な無細胞ＤＮＡの量の値を決定すること
をさらに含む、請求項１〜３のいずれか一項に記載の方法であって、
1つ以上の他の試料が、その次の時点からのものである；
任意に、その次の時点が、少なくとも１週間後、少なくとも２週間後、または１か月後である、前記方法。
【請求項５】
対象からの１つ以上のさらなる試料における全無細胞ＤＮＡの量の値を決定すること、および
対象からの１つ以上のさらなる試料における特異的な無細胞ＤＮＡの量の値を決定すること
をさらに含む、請求項４に記載の方法であって、
１つ以上のさらなる試料が、１つ以上の他のその次の時点からのものである；
任意に、１つ以上の他のその次の時点が、１週間隔、２週間隔、または１か月間隔である、前記方法。
【請求項６】
全無細胞ＤＮＡの量の値および特異的な無細胞ＤＮＡの量の値が、レポートにおいて提供される、請求項４または５に記載の方法であって、
任意に、全無細胞ＤＮＡの量の値および特異的な無細胞ＤＮＡの量の値が、レポートにおいて別々に提供される、任意にここで、全無細胞ＤＮＡの量の値および特異的な無細胞ＤＮＡの量の値が、各々の量の値を経時的に示す別々のグラフにおいて提供される；
任意に、全無細胞ＤＮＡの量の値および特異的な無細胞ＤＮＡの量の値が、レポートにおいて一緒に提供される、任意にここで、全無細胞ＤＮＡの量の値および特異的な無細胞ＤＮＡの量の値が、レポートにおいて、同一のグラフにおいて提供される、任意にここで、グラフが、散布図である；または
任意に、全無細胞ＤＮＡの量の値および特異的な無細胞ＤＮＡの量の値が、レポートにおいて別々におよび一緒に提供される、任意にここで、全無細胞ＤＮＡの量の値および特異的な無細胞ＤＮＡの量の値が、各々の量の値を経時的に示す別々のグラフにおいて提供され、および、全無細胞ＤＮＡの量の値および特異的な無細胞ＤＮＡの量の値が、レポートにおける別のグラフにおいて一緒に提供される、任意にここで、別のグラフが散布図である、前記方法。
【請求項７】
（ｉ）特異的な無細胞ＤＮＡが、ドナー特異的な無細胞ＤＮＡである；
（ｉｉ）全無細胞ＤＮＡが、リアルタイムＰＣＲなどのＰＣＲを使用して測定される；および／または
（ｉｉｉ）特異的な無細胞ＤＮＡが、次世代シークエンシング方法またはミスマッチ増幅方法を使用して測定される、
請求項１〜６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項８】
対象におけるリスクを決定すること、および／または対象におけるリスクのレベルの指摘を提供することをさらに含む、請求項１〜７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項９】
対象におけるリスクを評価する方法であって、
対象からの１つ以上の試料における全無細胞ＤＮＡの量の値を得ること、
対象からの１つ以上の試料における特異的な無細胞ＤＮＡの量の値を得ること、および
対象におけるリスクを評価すること
を含む、前記方法。
【請求項１０】
（ｉ）対象からの１つ以上の試料を得ること；または
（ｉｉ）対象からの１つ以上の試料を提供すること
をさらに含む、請求項９に記載の方法であって、
任意に、１つ以上の試料が、手術の２４時間以内の対象からのものであり、および任意に、手術が、移植手術である、前記方法。
【請求項１１】
１つ以上の試料が、クロスクランプ除去の２４時間以内の対象からのものである；および／または全無細胞ＤＮＡの量の値および特異的な無細胞ＤＮＡの量の値が、レポートから得られる、請求項９または１０に記載の方法。
【請求項１２】
対象からの１つ以上の他の試料における全無細胞ＤＮＡの量の値を得ること、および
対象からの１つ以上の他の試料における特異的な無細胞ＤＮＡの量の値を得ること
をさらに含む、請求項９〜１１のいずれか一項に記載の方法であって、
１つ以上の他の試料が、その次の時点からのものである；
任意に、対象からの１つ以上の他の試料を得ること、および／または提供することをさらに含む；および／または
任意に、その次の時点が、少なくとも１週間後、少なくとも２週間後、または１か月後である、前記方法。
【請求項１３】
対象からの１つ以上のさらなる試料における全無細胞ＤＮＡの量の値を得ること、および
対象からの1つ以上のさらなる試料における特異的な無細胞ＤＮＡの量の値を得ること
をさらに含む、請求項１２に記載の方法であって、
1つ以上のさらなる試料が、1つ以上の他のその次の時点からのものである；
任意に、対象からの1つ以上のさらなる試料を得ること、および／または提供することをさらに含む；および／または
（ｉ）1つ以上の他のその次の時点が、1週間隔である；
（ｉｉ）1つ以上の他のその次の時点が、２週間隔である；または
（ｉｉｉ）1つ以上の他のその次の時点が、1か月間隔である、前記方法。
【請求項１４】
全無細胞ＤＮＡの量の値および特異的な無細胞ＤＮＡの量の値が、レポートから得られる、請求項１２または１３に記載の方法であって、任意に、
（ｉ）全無細胞ＤＮＡの量の値および特異的な無細胞ＤＮＡの量の値が、レポートにおいて別々に提供される；任意にここで、全無細胞ＤＮＡの量の値および特異的な無細胞ＤＮＡの量の値が、各々の量の値を経時的に示す別々のグラフにおいて提供される；
（ｉｉ）全無細胞ＤＮＡの量の値および特異的な無細胞ＤＮＡの量の値が、レポートにおいて一緒に提供される、任意にここで、全無細胞ＤＮＡの量の値および特異的な無細胞ＤＮＡの量の値が、レポートにおける同一のグラフにおいて提供される、および任意にここで、グラフが、散布図である；または
（ｉｉｉ）全無細胞ＤＮＡの量の値および特異的な無細胞ＤＮＡの量の値が、レポートにおいて、別々におよび一緒に提供される、任意にここで、全無細胞ＤＮＡの量の値および特異的な無細胞ＤＮＡの量の値が、各々の量の値を経時的に示す別々のグラフにおいて提供され、および全無細胞ＤＮＡの量の値および特異的な無細胞ＤＮＡの量の値が、レポートにおける別のグラフにおいて一緒に提供される、および任意にここで、別のグラフが、散布図である、前記方法。
【請求項１５】
特異的な無細胞ＤＮＡがドナー特異的な無細胞ＤＮＡである、請求項８〜１３のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１６】
対象が移植レシピエントである、請求項１〜１５のいずれか一項に記載の方法であって、任意に、移植レシピエントが、心臓移植レシピエントである；および任意に、対象が、小児の心臓移植レシピエントである、前記方法。
【請求項１７】
（ｉ）全無細胞ＤＮＡの量の値が、閾値より高く、および特異的な無細胞ＤＮＡの量の値が閾値より高い場合、拒絶反応または有害事象または予後が指摘される；
（ｉｉ）全無細胞ＤＮＡの量の値が、閾値より高く、および特異的な無細胞ＤＮＡの量の値が閾値より高い場合、抗拒絶反応処置が対象に投与されるまたは提案される、またはさらなるモニタリングが実施されるまたは提案される、任意にここで、抗拒絶反応処置が、ステロイドおよび／または病院への入院を含む；
（ｉｉｉ）全無細胞ＤＮＡの量の値が閾値より高く、および特異的な無細胞ＤＮＡの量の値が閾値より低い場合、感染が指摘される；
（ｉｖ）全無細胞ＤＮＡの量の値が閾値より高く、および特異的な無細胞ＤＮＡの量の値が閾値より低い場合、抗感染処置が対象に投与されるまたは提案される、またはさらなるモニタリングが実施されるまたは提案される、任意にここで、抗感染処置が、抗生物質または免疫抑制療法における削減または変化を含む；
（ｖ）全無細胞ＤＮＡの量の値が閾値より低く、および特異的な無細胞ＤＮＡの量の値が閾値より高い場合、初期段階の拒絶反応が指摘される；
（ｖｉ）全無細胞ＤＮＡの量の値が閾値より低く、および特異的な無細胞ＤＮＡの量の値が閾値より高い場合、抗拒絶反応処置が、対象に投与されるまたは提案される、またはさらなるモニタリングが実施されるまたは提案される、任意にここで、抗拒絶反応処置が、ステロイドを含む、および／または任意にここで、抗拒絶反応処置が、病院への入院を含まない；
（ｖｉｉ）全無細胞ＤＮＡの量の値が閾値より低く、および特異的な無細胞ＤＮＡの量の値が閾値より低い場合、臨床状態が全く指摘されない；および／または
（ｖｉｉｉ）全無細胞ＤＮＡの量の値が閾値より低く、および特異的な無細胞ＤＮＡの量の値が閾値より低い場合、対象のさらなるモニタリングが対象に実施されるまたは提案される、任意にここで、対象のモニタリングが、請求項１〜１６のいずれか一項に記載の方法を含む、
請求項１〜１６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１８】
試料が、血液、血漿、または血清を含む、請求項１〜１７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１９】
対象からの１つ以上の試料における全無細胞ＤＮＡの量の値、および対象からの１つ以上の試料における特異的な無細胞ＤＮＡの量の値を含む、レポート。
【請求項２０】
全無細胞ＤＮＡの量の値および特異的な無細胞ＤＮＡの量の値が、手術の２４時間以内に採られた１つ以上の試料からのものである、請求項１９に記載のレポートであって、
任意に、手術が、移植手術である；および／または
全無細胞ＤＮＡの量の値および特異的な無細胞ＤＮＡの量の値が、クロスクランプ除去の２４時間以内に採られた１つ以上の試料からのものである、前記レポート。
【請求項２１】
対象からの１つ以上の他の試料からの全無細胞ＤＮＡの量の値、および対象からの１つ以上の他の試料からの特異的な無細胞ＤＮＡの量の値をさらに含む、請求項１９または２０に記載のレポートであって、
１つ以上の他の試料が、その次の時点からのものである、
任意に、その次の時点が、少なくとも１週間後、少なくとも２週間後、または１か月後である；
任意に、対象からの１つ以上のさらなる試料からの全無細胞ＤＮＡの量の値、および対象からの１つ以上のさらなる試料からの特異的な無細胞ＤＮＡの量の値をさらに含む、
１つ以上のさらなる試料が１つ以上の他のその次の時点からのものである、
任意に、１つ以上の他のその次の時点が、１週間隔、２週間隔、または１か月間隔である、前記レポート。
【請求項２２】
（ｉ）全無細胞ＤＮＡの量の値および特異的な無細胞ＤＮＡの量の値が、レポートにおいて別々に提供される、任意にここで、全無細胞ＤＮＡの量の値および特異的な無細胞ＤＮＡの量の値が、各々の量の値を経時的に示す別々のグラフにおいて提供される、任意にここで、全無細胞ＤＮＡの量の値および特異的な無細胞ＤＮＡの量の値が、レポートにおいて一緒に提供される、任意にここで、全無細胞ＤＮＡの量の値および特異的な無細胞ＤＮＡの量の値が、レポートにおいて同一のグラフにおいて提供される、任意にここで、グラフが散布図である；または
（ｉｉ）全無細胞ＤＮＡの量の値および特異的な無細胞ＤＮＡの量の値が、レポートにおいて、別々におよび一緒に提供される、任意にここで、全無細胞ＤＮＡの量の値および特異的な無細胞ＤＮＡの量の値が、各々の量の値を経時的に示す別々のグラフにおいて提供され、および全無細胞ＤＮＡの量の値および特異的な無細胞ＤＮＡの量の値が、レポートにおける別のグラフにおいて一緒に提供される、任意にここで、別のグラフが散布図である、
請求項１９〜２１のいずれか一項に記載のレポート。
【請求項２３】
対象が移植レシピエントである、請求項１９〜２２のいずれか一項に記載のレポートであって、任意に、移植レシピエントが心臓移植レシピエントである、任意に、対象が、小児の心臓移植レシピエントである、前記レポート。
【請求項２４】
（ｉ）特異的な無細胞ＤＮＡが、ドナー特異的な無細胞ＤＮＡである；
（ｉｉ）全無細胞ＤＮＡが、リアルタイムＰＣＲなどのＰＣＲを使用して測定される；および／または
（ｉｉｉ）特異的な無細胞ＤＮＡが、次世代シークエンシング方法またはミスマッチ増幅方法を使用して測定される、
請求項１９〜２３のいずれか一項に記載のレポート。
【請求項２５】
請求項１〜１８に記載のいずれか１つの方法の値を含むレポートであって、本明細書において提供されるレポートにおける値を提供するやり方のいずれか１つにより、値がレポートにおいて提供される、前記レポート。