【手続補正書】
【提出日】令和2年7月2日(2020.7.2)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
ＳＴＩＭ００３  ＶＨドメイン(配列番号４０８)と少なくとも９５％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＶＨドメインと、ＳＴＩＭ００３  ＶＬドメイン(配列番号４１５)と少なくとも９５％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＶＬドメインとを含む、ヒト及び/又はマウスＩＣＯＳの細胞外ドメインに結合する単離された抗体。
【請求項２】
前記ＶＨドメインが１セットの重鎖相補性決定領域(ＨＣＤＲ) ＨＣＤＲ１、ＨＣＤＲ２及びＨＣＤＲ３を含み、
ＨＣＤＲ１が配列番号４０５のアミノ酸配列を有するＳＴＩＭ００３  ＨＣＤＲ１であり、
ＨＣＤＲ２が配列番号４０６のアミノ酸配列を有するＳＴＩＭ００３  ＨＣＤＲ２であり、
ＨＣＤＲ３が配列番号４０７のアミノ酸配列を有するＳＴＩＭ００３  ＨＣＤＲ３である、請求項１に記載の抗体。
【請求項３】
前記ＶＬドメインが１セットの軽鎖相補性決定領域(ＬＣＤＲ) ＬＣＤＲ１、ＬＣＤＲ２及びＬＣＤＲ３を含み、
ＬＣＤＲ１が配列番号４１２のアミノ酸配列を有するＳＴＩＭ００３  ＬＣＤＲ１であり、
ＬＣＤＲ２が配列番号４１３のアミノ酸配列を有するＳＴＩＭ００３  ＬＣＤＲ２であり、
ＬＣＤＲ３が配列番号４１４のアミノ酸配列を有するＳＴＩＭ００３  ＬＣＤＲ３である、請求項１又は２に記載の抗体。
【請求項４】
前記ＶＨドメインが１セットの重鎖相補性決定領域(ＨＣＤＲ) ＨＣＤＲ１、ＨＣＤＲ２及びＨＣＤＲ３を含み、
ＨＣＤＲ１が配列番号４０５のアミノ酸配列を有するＳＴＩＭ００３  ＨＣＤＲ１であり、
ＨＣＤＲ２が配列番号４０６のアミノ酸配列を有するＳＴＩＭ００３  ＨＣＤＲ２であり、
ＨＣＤＲ３が配列番号４０７のアミノ酸配列を有するＳＴＩＭ００３  ＨＣＤＲ３であり、前記ＶＬドメインが１セットの軽鎖相補性決定領域(ＬＣＤＲ) ＬＣＤＲ１、ＬＣＤＲ２及びＬＣＤＲ３を含み、
ＬＣＤＲ１が配列番号４１２のアミノ酸配列を有するＳＴＩＭ００３  ＬＣＤＲ１であり、
ＬＣＤＲ２が配列番号４１３のアミノ酸配列を有するＳＴＩＭ００３  ＬＣＤＲ２であり、
ＬＣＤＲ３が配列番号４１４のアミノ酸配列を有するＳＴＩＭ００３  ＬＣＤＲ３である、請求項３に記載の抗体。
【請求項５】
前記ＶＨドメインのアミノ酸配列が配列番号４０８であり、前記ＶＬドメインのアミノ酸配列が配列番号４１５である、請求項１に記載の抗体。
【請求項６】
相補性決定領域(ＣＤＲ) ＨＣＤＲ１、ＨＣＤＲ２及びＨＣＤＲ３を含む抗体ＶＨドメインと、
相補性決定領域 ＬＣＤＲ１、ＬＣＤＲ２及びＬＣＤＲ３を含む抗体ＶＬドメインと
を含み、
前記ＨＣＤＲ１が、ＳＴＩＭ００１のＨＣＤＲ１(配列番号３６３)、ＳＴＩＭ００２のＨＣＤＲ１(配列番号３７７)、ＳＴＩＭ００２−ＢのＨＣＤＲ１(配列番号３９１)、ＳＴＩＭ００３のＨＣＤＲ１(配列番号４０５)、ＳＴＩＭ００４のＨＣＤＲ１(配列番号４１９)、ＳＴＩＭ００５のＨＣＤＲ１(配列番号４３５)、ＳＴＩＭ００６のＨＣＤＲ１(配列番号４４９)、ＳＴＩＭ００７のＨＣＤＲ１(配列番号４６３)、ＳＴＩＭ００８のＨＣＤＲ１(配列番号４７７)若しくはＳＴＩＭ００９のＨＣＤＲ１(配列番号４９１)であるか、又は１、２、３、４若しくは５個のアミノ酸改変を有する該ＨＣＤＲ１の１つを含み、
前記ＨＣＤＲ２が、ＳＴＩＭ００１のＨＣＤＲ２(配列番号３６４)、ＳＴＩＭ００２のＨＣＤＲ２(配列番号３７８)、ＳＴＩＭ００２−ＢのＨＣＤＲ２(配列番号３９２)、ＳＴＩＭ００３のＨＣＤＲ２(配列番号４０６)、ＳＴＩＭ００４のＨＣＤＲ２(配列番号４２０)、ＳＴＩＭ００５のＨＣＤＲ２(配列番号４３６)、ＳＴＩＭ００６のＨＣＤＲ２(配列番号４５０)、ＳＴＩＭ００７のＨＣＤＲ２(配列番号４６４)、ＳＴＩＭ００８のＨＣＤＲ２(配列番号４７８)若しくはＳＴＩＭ００９のＨＣＤＲ２(配列番号４９２)であるか、又は１、２、３、４若しくは５個のアミノ酸改変を有する該ＨＣＤＲ２の１つを含み、
前記ＨＣＤＲ３が、ＳＴＩＭ００１のＨＣＤＲ３(配列番号３６５)、ＳＴＩＭ００２のＨＣＤＲ３(配列番号３７９)、ＳＴＩＭ００２−ＢのＨＣＤＲ３(配列番号３９３)、ＳＴＩＭ００３のＨＣＤＲ３(配列番号４０７)、ＳＴＩＭ００４のＨＣＤＲ３(配列番号４２１)、ＳＴＩＭ００５のＨＣＤＲ３(配列番号４３７)、ＳＴＩＭ００６のＨＣＤＲ３(配列番号４５１)、ＳＴＩＭ００７のＨＣＤＲ３(配列番号４６４)、ＳＴＩＭ００８のＨＣＤＲ３(配列番号４７９)若しくはＳＴＩＭ００９のＨＣＤＲ３(配列番号４９３)であるか、又は１、２、３、４若しくは５個のアミノ酸改変を有する該ＨＣＤＲ３の１つを含み、
前記ＬＣＤＲ１が、ＳＴＩＭ００１のＬＣＤＲ１(配列番号３７０)、ＳＴＩＭ００２のＬＣＤＲ１(配列番号３８４)、ＳＴＩＭ００２−ＢのＬＣＤＲ１(配列番号３９８)、ＳＴＩＭ００３のＬＣＤＲ１(配列番号４１２)、ＳＴＩＭ００４のＬＣＤＲ１(配列番号４２６)、ＳＴＩＭ００５のＬＣＤＲ１(配列番号４４２)、ＳＴＩＭ００６のＬＣＤＲ１(配列番号４５６)、ＳＴＩＭ００７のＬＣＤＲ１(配列番号４７０)、ＳＴＩＭ００８のＬＣＤＲ１(配列番号４８４)若しくはＳＴＩＭ００９のＬＣＤＲ１(配列番号４９８)であるか、又は１、２、３、４若しくは５個のアミノ酸改変を有する該ＬＣＤＲ１の１つを含み、
前記ＬＣＤＲ２が、ＳＴＩＭ００１のＬＣＤＲ２(配列番号３７１)、ＳＴＩＭ００２のＬＣＤＲ２(配列番号３８５)、ＳＴＩＭ００２−ＢのＬＣＤＲ２(配列番号３９９)、ＳＴＩＭ００３のＬＣＤＲ２(配列番号４１３)、ＳＴＩＭ００４のＬＣＤＲ２(配列番号４２７)、ＳＴＩＭ００５のＬＣＤＲ２(配列番号４４３)、ＳＴＩＭ００６のＬＣＤＲ２(配列番号４５７)、ＳＴＩＭ００７のＬＣＤＲ２(配列番号４７１)、ＳＴＩＭ００８のＬＣＤＲ２(配列番号４８５)若しくはＳＴＩＭ００９のＬＣＤＲ２(配列番号４９９)であるか、又は１、２、３、４若しくは５個のアミノ酸改変を有する該ＬＣＤＲ２の１つを含み、
前記ＬＣＤＲ３が、ＳＴＩＭ００１のＬＣＤＲ３(配列番号３７２)、ＳＴＩＭ００２のＬＣＤＲ３(配列番号３８６)、ＳＴＩＭ００２−ＢのＬＣＤＲ３(配列番号４００)、ＳＴＩＭ００３のＬＣＤＲ３(配列番号４１４)、ＳＴＩＭ００４のＬＣＤＲ３(配列番号４２８)、ＳＴＩＭ００５のＬＣＤＲ３(配列番号４４４)、ＳＴＩＭ００６のＬＣＤＲ３(配列番号４５８)、ＳＴＩＭ００７のＬＣＤＲ３(配列番号４７２)、ＳＴＩＭ００８のＬＣＤＲ３(配列番号４８６)若しくはＳＴＩＭ００９のＬＣＤＲ３(配列番号５００)であるか、又は１、２、３、４若しくは５個のアミノ酸改変を有する該ＬＣＤＲ３の１つを含む、
ヒト及び/又はマウスＩＣＯＳの細胞外ドメインに結合する単離された抗体。
【請求項７】
ＳＴＩＭ００１のＶＨドメイン(配列番号３６６)、ＳＴＩＭ００２のＶＨドメイン(配列番号３８０)、ＳＴＩＭ００２−ＢのＶＨドメイン(配列番号３９４)、ＳＴＩＭ００３のＶＨドメイン(配列番号４０８)、ＳＴＩＭ００４のＶＨドメイン(配列番号４２２)、ＳＴＩＭ００５のＶＨドメイン(配列番号４３８)、ＳＴＩＭ００６のＶＨドメイン(配列番号４５２)、ＳＴＩＭ００７のＶＨドメイン(配列番号４６６)、ＳＴＩＭ００８のＶＨドメイン(配列番号４８０)若しくはＳＴＩＭ００９のＶＨドメイン(配列番号４９４)であるか、又は該ＳＴＩＭ００１のＶＨドメイン、該ＳＴＩＭ００２のＶＨドメイン、該ＳＴＩＭ００２−ＢのＶＨドメイン、該ＳＴＩＭ００３のＶＨドメイン、該ＳＴＩＭ００４のＶＨドメイン、該ＳＴＩＭ００５のＶＨドメイン、該ＳＴＩＭ００６のＶＨドメイン、該ＳＴＩＭ００７のＶＨドメイン、該ＳＴＩＭ００８のＶＨドメイン若しくは該ＳＴＩＭ００９のＶＨドメインの配列と少なくとも９０％同一であるアミノ酸配列を有する抗体ＶＨドメインと、
ＳＴＩＭ００１のＶＬドメイン(配列番号３７３)、ＳＴＩＭ００２のＶＬドメイン(配列番号３８７)、ＳＴＩＭ００２−ＢのＶＬドメイン(配列番号４０１)、ＳＴＩＭ００３のＶＬドメイン(配列番号４１５)、ＳＴＩＭ００４のＶＬドメイン(配列番号４２９)、ＳＴＩＭ００５のＶＬドメイン(配列番号４４５)、ＳＴＩＭ００６のＶＬドメイン(配列番号４５９)、ＳＴＩＭ００７のＶＬドメイン(配列番号４７３)、ＳＴＩＭ００８のＶＬドメイン(配列番号４８７)若しくはＳＴＩＭ００９のＶＬドメイン(配列番号５０１)であるか、又は該ＳＴＩＭ００１のＶＬドメイン、該ＳＴＩＭ００２のＶＬドメイン、該ＳＴＩＭ００２−ＢのＶＬドメイン、該ＳＴＩＭ００３のＶＬドメイン、該ＳＴＩＭ００４のＶＬドメイン、該ＳＴＩＭ００５のＶＬドメイン、該ＳＴＩＭ００６のＶＬドメイン、該ＳＴＩＭ００７のＶＬドメイン、該ＳＴＩＭ００８のＶＬドメイン若しくは該ＳＴＩＭ００９のＶＬドメインの配列と少なくとも９０％同一であるアミノ酸配列を有する抗体ＶＬドメインと
を含む請求項６に記載の抗体。
【請求項８】
１セットの重鎖相補性決定領域(ＨＣＤＲ) ＨＣＤＲ１、ＨＣＤＲ２及びＨＣＤＲ３を含むＶＨドメインであって、
ＨＣＤＲ１はＳＴＩＭ００３のＨＣＤＲ１(配列番号４０５)であって、任意に、残基２８に置換を含んでいてもよく、
ＨＣＤＲ２はＳＴＩＭ００３のＨＣＤＲ２(配列番号４０６)であって、任意に、残基５９、残基６３及び/又は残基６４に置換を含んでいてもよく、
ＨＣＤＲ３はＳＴＩＭ００３のＨＣＤＲ３(配列番号４０７)であって、任意に、残基１０８、残基１０９及び/又は残基１１２に置換を含んでいてもよい、
ＶＨドメインと、１セットの軽鎖相補性決定領域(ＬＣＤＲ) ＬＣＤＲ１、ＬＣＤＲ２及びＬＣＤＲ３を含むＶＬドメインであって、
ＬＣＤＲ１はＳＴＩＭ００３のＬＣＤＲ１(配列番号４１２)であって、任意に、残基３６に置換を含んでいてもよく、
ＬＣＤＲ２はＳＴＩＭ００３のＬＣＤＲ２(配列番号４１３)であり、
ＬＣＤＲ３はＳＴＩＭ００３のＬＣＤＲ３(配列番号４１４)であって、任意に、残基１０８又は残基１０９に置換を含んでいてもよい、
ＶＬドメインとを含む抗体。
【請求項９】
前記ＨＣＤＲ１の残基２８の置換が保存的置換、例えばＶ２８Ｆであり、
前記ＨＣＤＲ２の残基５９の置換がＮ５９Ｉであり、
前記ＨＣＤＲ２の残基６３の置換がＧ６３Ｄであり、
前記ＨＣＤＲ２の残基６４の置換がＤ６４Ｎであり、
前記ＨＣＤＲ３の残基１０８の置換がＦ１０８Ｙであり、
前記ＨＣＤＲ３の残基１０９の置換がＹ１０９Ｆであり、及び/又は
前記ＨＣＤＲ３の残基１１２の置換がＨ１１２Ｎである
請求項８に記載の抗体。
【請求項１０】
前記ＬＣＤＲ１の残基３６の置換がＲ３６Ｓであり、
前記ＬＣＤＲ３の残基１０８の置換がＤ１０８Ｇであり、及び/又は
前記ＬＣＤＲ３の残基１０９の置換がＭ１０９Ｎである
請求項８に記載の抗体。
【請求項１１】
前記ＨＣＤＲ１が配列番号５８２であり、
前記ＨＣＤＲ２が配列番号５８７であり、
前記ＨＣＤＲ３が配列番号５８８であり、
前記ＬＣＤＲ１が配列番号４２６であり、
前記ＬＣＤＲ２が配列番号４１３であり、
前記ＬＣＤＲ３が配列番号６０８である、
請求項８に記載の抗体。
【請求項１２】
前記ＶＨドメインのアミノ酸配列が配列番号５８６と少なくとも９５％の配列同一性を有し、前記ＶＬドメインのアミノ酸配列が配列番号６０７と少なくとも９５％の配列同一性を有する、請求項８に記載の抗体。
【請求項１３】
前記ＶＨドメインのアミノ酸配列が配列番号５８６であり、前記ＶＬドメインのアミノ酸配列が配列番号６０７である、請求項１２に記載の抗体。
【請求項１４】
１セットの重鎖相補性決定領域(ＨＣＤＲ) ＨＣＤＲ１、ＨＣＤＲ２及びＨＣＤＲ３を含むＶＨドメインであって、
ＨＣＤＲ１はＳＴＩＭ００１のＨＣＤＲ１(配列番号３６３)であって、任意に、置換Ｓ３５Ｔ及び/又はＦ３７Ｙを含んでいてもよく、
ＨＣＤＲ２はＳＴＩＭ００１のＨＣＤＲ２(配列番号３６４)であって、任意に、置換Ｎ６２Ｓを含んでいてもよく、
ＨＣＤＲ３はＳＴＩＭ００１のＨＣＤＲ３(配列番号３６５)であって、任意に、置換Ｈ１１０Ｗ、Ｙ１１１Ｐ、Ｙ１１２ａＨ及び/又はＹ１１２Ｈを含んでいてもよい、
ＶＨドメインと、１セットの軽鎖相補性決定領域(ＬＣＤＲ) ＬＣＤＲ１、ＬＣＤＲ２及びＬＣＤＲ３を含むＶＬドメインであって、
ＬＣＤＲ１はＳＴＩＭ００１のＬＣＤＲ１(配列番号３７０)であって、任意に、置換Ｅ３５Ｇ及び/又はＹ３６Ｆを含んでいてもよく、
ＬＣＤＲ２はＳＴＩＭ００１のＬＣＤＲ２(配列番号３７１)であって、任意に、置換Ｇ５７Ｖを含んでいてもよく、
ＬＣＤＲ３はＳＴＩＭ００１のＬＣＤＲ３(配列番号３７２)であって、任意に、置換Ｓ１０７Ａを含む
ＶＬドメインとを含む抗体。
【請求項１５】
前記ＨＣＤＲ１が配列番号５６５であり、
前記ＨＣＤＲ２が配列番号５６６であり、
前記ＨＣＤＲ３が配列番号５６７であり、
前記ＬＣＤＲ１が配列番号５９１であり、
前記ＬＣＤＲ２が配列番号５９２であり、
前記ＬＣＤＲ３が配列番号５９３である、
請求項１４に記載の抗体。
【請求項１６】
前記ＶＨドメインのアミノ酸配列が配列番号５６４と少なくとも９５％の配列同一性を有し、前記ＶＬドメインのアミノ酸配列が配列番号５９０と少なくとも９５％の配列同一性を有する、請求項１４に記載の抗体。
【請求項１７】
前記ＶＨドメインのアミノ酸配列が配列番号５６４であり、前記ＶＬドメインのアミノ酸配列が配列番号５９０である、請求項１６に記載の抗体。
【請求項１８】
抗体定常領域を含む請求項１〜１７のいずれか１項に記載の抗体。
【請求項１９】
前記定常領域がヒト重鎖及び/又は軽鎖定常領域を含む、請求項１８に記載の抗体。
【請求項２０】
前記定常領域がＦｃエフェクター陽性である、請求項１８又は１９に記載の抗体。
【請求項２１】
ＩｇＧ１である請求項１９又は２０に記載の抗体。
【請求項２２】
配列番号４１０の重鎖アミノ酸配列及び配列番号４１７の軽鎖酸配列を含む請求項２１に記載の抗体。
【請求項２３】
多重特異性抗体である請求項１〜２２のいずれか１項に記載の抗体。
【請求項２４】
請求項１〜２３のいずれか１項に記載の単離抗体と薬学的に許容される賦形剤とを含む組成物。
【請求項２５】
請求項１〜２３のいずれか１項に記載の抗体をコードする単離核酸と薬学的に許容される賦形剤とを含む組成物。
【請求項２６】
請求項１〜２３のいずれか１項に記載の抗体をコードする核酸を含んでなるインビトロの宿主細胞。
【請求項２７】
ヒト患者の癌を処置する方法に用いるための請求項１〜２３のいずれか１項に記載の抗体又は請求項２４に記載の組成物。
【請求項２８】
前記癌が腎細胞癌、頭頸部癌、黒色腫、非小細胞肺癌、食道癌、子宮頸癌又はびまん性大細胞型Ｂ細胞リンパ腫である、請求項２７に記載抗体又は組成物。
【請求項２９】
前記癌の処置が前記抗体及び抗ＰＤ−Ｌ１抗体を患者に投与することを含む、請求項２７又は２８に記載の抗体又は組成物。
【請求項３０】
抗ＰＤ−Ｌ１抗体がアテゾリズマブである請求項２９に記載の抗体又は組成物。
【請求項３１】
前記抗ＩＣＯＳ抗体及び前記抗ＰＤ−Ｌ１抗体が各々、ＡＤＣＣ、ＡＤＣＰ及び/又はＣＤＣを媒介することができる、請求項２９に記載の抗体又は組成物。
【請求項３２】
前記抗ＩＣＯＳ抗体がヒトＩｇＧ１抗体であり、前記抗ＰＤ−Ｌ１抗体がヒトＩｇＧ１抗体である、請求項２９又は３１に記載抗体又は組成物。
【請求項３３】
患者における癌を処置する方法における使用のための、抗ＩＣＯＳヒトＩｇＧ１抗体及び抗ＰＤＬ１ヒトＩｇＧ１抗体を含むキット。
【請求項３４】
前記抗ＩＣＯＳ抗体及び/又は前記抗ＰＤ−Ｌ１抗体が配列番号３４０のアミノ酸配列を含むヒトＩｇＧ１定常領域を含む、請求項２９又は３１〜３３のいずれか１項に記載抗体、組成物又はキット。
【請求項３５】
(ａ)ヒト可変領域遺伝子セグメントをコードするヒト又はヒト化免疫グロブリン遺伝子座を含むゲノムを有する非ヒト哺乳動物であって、ＩＣＯＳを発現しない哺乳動物を、ヒトＩＣＯＳ抗原で免疫することと、
(ｂ)前記哺乳動物が産生した抗体を単離することと、
(ｃ)ヒトＩＣＯＳ及び非ヒトＩＣＯＳに結合する能力について前記抗体を試験することと、
(ｄ)ヒトＩＣＯＳ及び非ヒトＩＣＯＳの両方に結合する１以上の抗体を選択することと
を含む、ヒト及び非ヒトのＩＣＯＳの細胞外ドメインに結合する抗体を製造する方法。
【請求項３６】
前記哺乳動物がマウス又はラットである、請求項３５に記載の方法。
【請求項３７】
前記非ヒトＩＣＯＳがマウスＩＣＯＳ又はラットＩＣＯＳである、請求項３５又は３６に記載の方法。
【請求項３８】
抗体重鎖可変ドメイン及び/又は抗体軽鎖可変ドメインをコードする核酸を単離すること
を含む請求項３５〜３７のいずれか１項に記載の方法。
【請求項３９】
前記重鎖及び/又は前記軽鎖可変ドメインをコードする核酸をヒト重鎖定常領域及び/又はヒト軽鎖定常領域をコードするヌクレオチド配列とそれぞれ接合することを含む、請求項３８に記載の方法。
【請求項４０】
前記核酸を宿主細胞に導入することを含む、請求項３８又は３９に記載の方法。
【請求項４１】
前記抗体又は前記抗体重鎖及び/若しくは軽鎖可変ドメインの発現のための条件下で前記宿主細胞を培養すること、及び
前記抗体又は前記抗体重鎖及び/若しくは軽鎖可変ドメインを単離し精製すること
を含む、請求項４０に記載の方法。
【請求項４２】
アッセイが、
試験ウェル中の基材に不動化(固定又は付着)された抗体のアレイを提供することと、
前記試験ウェルに、ＩＣＯＳ発現細胞(例えば、活性化初代Ｔ細胞又はＭＪ細胞)を加えることと、
前記細胞の形態を観察することと、
ウェル内の基材に対する、丸形状から平坦形状への細胞の形状変化を検出すること、ここで、前記形状変化は抗体がＩＣＯＳに結合する抗体であることを示し、該抗体はＩＣＯＳアゴニスト抗体であってもよく、
前記試験ウェルから前記抗体を選択することと、
前記選択した抗体のＣＤＲをコードする核酸を発現させることと、
前記抗体を、１又は２以上の追加成分を含む組成物に製剤化することと
を含む、ＩＣＯＳに結合する抗体を選択する方法。