【手続補正書】
【提出日】令和2年10月21日(2020.10.21)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
表面タンパク質の第１アイソフォームを発現しているヒト細胞を含んでいる薬学的組成物であって、
上記表面タンパク質の上記第１アイソフォームは、当該表面タンパク質の第２アイソフォームと機能的に区別できないが、免疫学的には区別でき、
上記表面タンパク質の上記第２アイソフォームを発現している細胞を有する患者の治療に使用するための、薬学的組成物。
【請求項２】
上記表面タンパク質は、細胞外ポリペプチド配列を有しており、
上記第１アイソフォームは、上記第２アイソフォームと比較すると、１個、２個、３個、４個または５個のアミノ酸の挿入、欠失および／または置換を有している、請求項１に記載の薬学的組成物。
【請求項３】
上記第１アイソフォームと上記第２アイソフォームとは、（i）抗体様分子結合、（ii）抗体結合、または（iii）抗体もしくは抗体様分子を有している免疫エフェクター細胞の反応、または（iv）キメラ抗原受容体（ＣＡＲ）を有している免疫エフェクター細胞の反応、によって区別できる、請求項１または２に記載の薬学的組成物。
【請求項４】
上記表面タンパク質は、以下から選択される、請求項１〜３のいずれか１項に記載の薬学的組成物：
ＣＤ１ａ、ＣＤ１ｂ、ＣＤ１ｃ、ＣＤ１ｄ、ＣＤ１ｅ、ＣＤ２、ＣＤ３、ＣＤ３ｄ、ＣＤ３ｅ、ＣＤ３ｇ、ＣＤ４、ＣＤ５、ＣＤ６、ＣＤ７、ＣＤ８ａ、ＣＤ８ｂ、ＣＤ９、ＣＤ１０、ＣＤ１１ａ、ＣＤ１１ｂ、ＣＤ１１ｃ、ＣＤ１１ｄ、ＣＤｗｌ２、ＣＤ１３、ＣＤ１４、ＣＤ１５、ＣＤ１５ｕ、ＣＤ１５ｓ、ＣＤ１５ｓｕ、ＣＤ１６、ＣＤ１６ｂ、ＣＤ１７、ＣＤ１８、ＣＤ１９、ＣＤ２０、ＣＤ２１、ＣＤ２２、ＣＤ２３、ＣＤ２４、ＣＤ２５、ＣＤ２６、ＣＤ２７、ＣＤ２８、ＣＤ２９、ＣＤ３０、ＣＤ３１、ＣＤ３２、ＣＤ３３、ＣＤ３４、ＣＤ３５、ＣＤ３６、ＣＤ３７、ＣＤ３８、ＣＤ３９、ＣＤ４０、ＣＤ４１、ＣＤ４２ａ、ＣＤ４２ｂ、ＣＤ４２ｃ、ＣＤ４２ｄ、ＣＤ４３、ＣＤ４４、ＣＤ４５、ＣＤ４５ＲＡ、ＣＤ４５ＲＢ、ＣＤ４５ＲＣ、ＣＤ４５ＲＯ、ＣＤ４６、ＣＤ４７、ＣＤ４８、ＣＤ４９ａ、ＣＤ４９ｂ、ＣＤ４９ｃ、ＣＤ４９ｄ、ＣＤ４９ｅ、ＣＤ４９ｆ、ＣＤ５０、ＣＤ５１、ＣＤ５２、ＣＤ５３、ＣＤ５４、ＣＤ５５、ＣＤ５６、ＣＤ５７、ＣＤ５８、ＣＤ５９、ＣＤ６０ａ、ＣＤ６０ｂ、ＣＤ６０ｃ、ＣＤ６１、ＣＤ６２Ｅ、ＣＤ６２Ｌ、ＣＤ６２Ｐ、ＣＤ６３、ＣＤ６４、ＣＤ６５、ＣＤ６５ｓ、ＣＤ６６ａ、ＣＤ６６ｂ、ＣＤ６６ｃ、ＣＤ６６ｄ、ＣＤ６６ｅ、ＣＤ６６ｆ、ＣＤ６８、ＣＤ６９、ＣＤ７０、ＣＤ７１、ＣＤ７２、ＣＤ７３、ＣＤ７４、ＣＤ７５、ＣＤ７５ｓ、ＣＤ７７、ＣＤ７９ａ、ＣＤ７９ｂ、ＣＤ８０、ＣＤ８１、ＣＤ８２、ＣＤ８３、ＣＤ８４、ＣＤ８５ａ、ＣＤ８５ｄ、ＣＤ８５ｊ、ＣＤ８５ｋ、ＣＤ８６、ＣＤ８７、ＣＤ８８、ＣＤ８９、ＣＤ９０、ＣＤ９１、ＣＤ９２、ＣＤ９３、ＣＤ９４、ＣＤ９５、ＣＤ９６、ＣＤ９７、ＣＤ９８、ＣＤ９９、ＣＤ９９Ｒ、ＣＤ１００、ＣＤ１０１、ＣＤ１０２、ＣＤ１０３、ＣＤ１０４、ＣＤ１０５、ＣＤ１０６、ＣＤ１０７ａ、ＣＤ１０７ｂ、ＣＤ１０８、ＣＤ１０９、ＣＤ１１０、ＣＤ１１１、ＣＤ１１２、ＣＤ１１３、ＣＤ１１４、ＣＤ１１５、ＣＤ１１６、ＣＤ１１７、ＣＤ１１８、ＣＤ１１９、ＣＤ１２０ａ、ＣＤ１２０ｂ、ＣＤ１２１ａ、ＣＤ１２１ｂ、ＣＤ１２２、ＣＤ１２３、ＣＤ１２４、ＣＤ１２５、ＣＤ１２６、ＣＤ１２７、ＣＤ１２９、ＣＤ１３０、ＣＤ１３１、ＣＤ１３２、ＣＤ１３３、ＣＤ１３４、ＣＤ１３５、ＣＤ１３６、ＣＤ１３７、ＣＤ１３８、ＣＤ１３９、ＣＤ１４０ａ、ＣＤ１４０ｂ、ＣＤ１４１、ＣＤ１４２、ＣＤ１４３、ＣＤ１４４、ＣＤｗ１４５、ＣＤ１４６、ＣＤ１４７、ＣＤ１４８、ＣＤｗ１４９、ＣＤ１５０、ＣＤ１５１、ＣＤ１５２、ＣＤ１５３、ＣＤ１５４、ＣＤ１５５、ＣＤ１５６ａ、ＣＤ１５６ｂ、ＣＤ１５６ｃ、ＣＤ１５７、ＣＤ１５８ｅ、ＣＤ１５８ｉ、ＣＤ１５８ｋ、ＣＤ１５９ａ、ＣＤ１５９ｃ、ＣＤ１６０、ＣＤ１６１、ＣＤ１６２、ＣＤ１６３、ＣＤ１６４、ＣＤ１６５、ＣＤ１６６、ＣＤ１６７ａ、ＣＤ１６７ｂ、ＣＤ１６８、ＣＤ１６９、ＣＤ１７０、ＣＤ１７１、ＣＤ１７２ａ、ＣＤ１７２ｂ、ＣＤ１７２ｇ、ＣＤ１７３、ＣＤ１７４、ＣＤ１７５、ＣＤ１７５ｓ、ＣＤ１７６、ＣＤ１７７、ＣＤ１７８、ＣＤ１７９ａ、ＣＤ１７９ｂ、ＣＤ１８０、ＣＤ１８１、ＣＤ１８２、ＣＤ１８３、ＣＤ１８４、ＣＤ１８５、ＣＤ１８６、ＣＤ１９１、ＣＤ１９２、ＣＤ１９３、ＣＤ１９４、ＣＤ１９５、ＣＤ１９６、ＣＤ１９７、ＣＤｗ１９８、ＣＤ１９９、ＣＤ２００、ＣＤ２０１、ＣＤ２０２ｂ、ＣＤ２０３ｃ、ＣＤ２０４、ＣＤ２０５、ＣＤ２０６、ＣＤ２０７、ＣＤ２０８、ＣＤ２０９、ＣＤ２１０、ＣＤｗ２１０ｂ、ＣＤ２１２、ＣＤ２１３ａ１、ＣＤ２１３ａ２、ＣＤ２１５、ＣＤ２１７ａ、ＣＤ２１８ａ、ＣＤ２１８ｂ、ＣＤ２２０、ＣＤ２２１、ＣＤ２２２、ＣＤ２２３、ＣＤ２２４、ＣＤ２２５、ＣＤ２２６、ＣＤ２２７、ＣＤ２２８、ＣＤ２２９、ＣＤ２３０、ＣＤ２３１、ＣＤ２３２、ＣＤ２３３、ＣＤ２３４、ＣＤ２３５ａ、ＣＤ２３５ｂ、ＣＤ２３６、ＣＤ２３６Ｒ、ＣＤ２３８、ＣＤ２３９、ＣＤ２４０ＣＥ、ＣＤ２４０ＤＣＥ、ＣＤ２４０Ｄ、ＣＤ２４１、ＣＤ２４２、ＣＤ２４３、ＣＤ２４４、ＣＤ２４５、ＣＤ２４６、ＣＤ２４７、ＣＤ２４８、ＣＤ２４９、ＣＤ２５２、ＣＤ２５３、ＣＤ２５４、ＣＤ２５６、ＣＤ２６６、ＣＤ２６７、ＣＤ２６８、ＣＤ２６９、ＣＤ２７０、ＣＤ２７１、ＣＤ２７２、ＣＤ２７３、ＣＤ２７４、ＣＤ２７５、ＣＤ２７６、ＣＤ２７７、ＣＤ２７８、ＣＤ２７９、ＣＤ２８０、ＣＤ２８１、ＣＤ２８２、ＣＤ２８３、ＣＤ２８４、ＣＤ２８６、ＣＤ２８９、ＣＤ２９０、ＣＤ２９２、ＣＤｗ２９３、ＣＤ２９４、ＣＤ２９５、ＣＤ２９６、ＣＤ２９７、ＣＤ２９８、ＣＤ２９９、ＣＤ３００ａ、ＣＤ３００ｃ、ＣＤ３００ｅ、ＣＤ３０１、ＣＤ３０２、ＣＤ３０３、ＣＤ３０４、ＣＤ３０５、ＣＤ３０６、ＣＤ３０７ａ、ＣＤ３０７ｂ、ＣＤ３０７ｃ、ＣＤ３０７ｄ、ＣＤ３０７ｅ、ＣＤ３０８、ＣＤ３０９、ＣＤ３１２、ＣＤ３１４、ＣＤ３１５、ＣＤ３１６、ＣＤ３１７、ＣＤ３１８、ＣＤ３１９、ＣＤ３２０、ＣＤ３２１、ＣＤ３２２、ＣＤ３２４、ＣＤ３２５、ＣＤ３２６、ＣＤ３２７、ＣＤ３２８、ＣＤ３２９、ＣＤ３３１、ＣＤ３３２、ＣＤ３３３、ＣＤ３３４、ＣＤ３３５、ＣＤ３３６、ＣＤ３３７、ＣＤ３３８、ＣＤ３３９、ＣＤ３４０、ＣＤ３４４、ＣＤ３４９、ＣＤ３５０、ＣＤ３５１、ＣＤ３５２、ＣＤ３５３、ＣＤ３５４、ＣＤ３５５、ＣＤ３５７、ＣＤ３５８、ＣＤ３６０、ＣＤ３６１、ＣＤ３６２、ＣＤ３６３、ＣＤ３６４、ＣＤ３６５、ＣＤ３６６、ＣＤ３６７、ＣＤ３６８、ＣＤ３６９、ＣＤ３７０、ＣＤ３７１、ＢＣＭＡ、免疫グロブリン軽鎖（λまたはκ）、ＨＬＡタンパク質、およびβ２−ミクログロブリン。
【請求項５】
上記第１アイソフォームは、上記患者の元来のゲノムＤＮＡにはコードされていない、請求項１〜４のいずれか１項に記載の薬学的組成物。
【請求項６】
上記第１アイソフォームは、
上記患者の元来のゲノムＤＮＡ中にある上記表面タンパク質の遺伝子をコードしている配列を遺伝子編集により変化させることによって得られる、または、
上記表面タンパク質をコードしているｍＲＮＡをＲＮＡ編集により変化させることによって得られる、
請求項１〜５のいずれか１項に記載の薬学的組成物。
【請求項７】
上記配列の変化は、塩基エディタによって行われる、請求項６に記載の薬学的組成物。
【請求項８】
上記塩基エディタは、ＤＮＡ結合モジュールと融合したデアミナーゼである、請求項７に記載の薬学的組成物。
【請求項９】
上記塩基エディタは、シチジンデアミナーゼまたはアデニンデアミナーゼである、請求項８に記載の薬学的組成物。
【請求項１０】
上記デアミナーゼは、ニッカーゼＣａｓ９と融合している、請求項８に記載の薬学的組成物。
【請求項１１】
上記第１アイソフォームは、上記表面タンパク質の上記第２アイソフォームのアミノ酸配列において、１個、２個、３個、４個もしくは５個のアミノ酸（または、６個、７個、８個、９個、１０個、１１個、１２個、１５個もしくは２０個のアミノ酸）を、挿入、欠失および／または置換させることによって得られる、請求項１〜１０のいずれか１項に記載の薬学的組成物。
【請求項１２】
上記挿入、欠失および／または置換は、上記表面タンパク質の細胞外の部位に位置している、請求項１１に記載の薬学的組成物。
【請求項１３】
上記細胞は、上記表面タンパク質の上記第２アイソフォームを発現している細胞の特異的除去の前、同時または後に投与される、
請求項１〜１２のいずれか１項に記載の薬学的組成物。
【請求項１４】
上記細胞は、上記表面タンパク質の上記第２アイソフォームに対して反応する抗体または抗体様分子を発現している、請求項１〜１３のいずれか１項に記載の薬学的組成物。
【請求項１５】
上記表面タンパク質は、ＣＤ３３、ＣＤ３４、ＣＤ４５、ＣＤ１２３、ＣＤ１９、ＣＤ８およびＣＤ４から選択される、
請求項１４に記載の薬学的組成物。
【請求項１６】
上記表面タンパク質は、ＣＤ４５である、請求項１５に記載の薬学的組成物。
【請求項１７】
上記塩基エディタは、Ｃａｓ９  ＳａＫＫＨ−ＢＥ３、Ｃａｓ９  ＳａＫＫＨ、または、Ｃａｓ９  ＶＱＲである、請求項７に記載の薬学的組成物。
【請求項１８】
上記ヒト細胞は、造血細胞、ＣＤ４＋Ｔ細胞、ＣＤ８＋Ｔ細胞、記憶Ｔ細胞、制御性Ｔ細胞（Ｔ  ｒｅｇ）、ナチュラルキラー細胞（ＮＫ）、自然リンパ球（ＩＬＣ）、樹状細胞（ＤＣ）、Ｂリンパ球、粘膜関連インバリアントＴ細胞（ＭＡＩＴ）、およびガンマデルタＴ細胞（γδＴ）からなる群から選択される、請求項１〜１７のいずれか１項に記載の薬学的組成物。
【請求項１９】
上記治療は、造血幹細胞移植を含む、請求項１〜１８のいずれか１項に記載の薬学的組成物。
【請求項２０】
上記ヒト細胞は、キメラ抗原受容体を有している免疫エフェクター細胞であり、
上記免疫エフェクター細胞は、表面タンパク質の第１アイソフォームまたは第２アイソフォームのいずれかに対して特異的に反応し、
医学的状態を治療するために使用される、
請求項１に記載の薬学的組成物。
【請求項２１】
上記医学的状態は、（ｉ）造血性疾患、（ｉｉ）悪性造血性疾患、（ｉｉｉ）非悪性造血性疾患、（ｉｖ）移植片対宿主病、からなる群より選択される、請求項２０に記載の薬学的組成物。
【請求項２２】
下記の構成要素を備えている、キット：
（ａ）細胞表面タンパク質をコードしている遺伝子のゲノム位置を標的とする、塩基エディタガイドＲＮＡであって、
（i）上記遺伝子には、核酸のマーカー配列に関して異なる２種類のアイソフォームが存在しており、アイソフォーム１は第１マーカー配列を有しており、アイソフォーム２は第２マーカー配列を有しており、
（ii）上記ゲノム位置は、塩基エディタＰＡＭ配列と、上記第１マーカー配列または上記第２マーカー配列と、を有している、塩基エディタガイドＲＮＡ；ならびに、
（ｂ）任意構成で、アイソフォーム１およびアイソフォーム２の遺伝子産物にそれぞれ特異的に結合する、第１抗体および第２抗体。
【請求項２３】
上記細胞表面タンパク質は、マウスＴｈｙ１またはマウスＣＤ４５である、請求項２２に記載のキット。
【請求項２４】
上記細胞表面タンパク質は、マウスＣＤ４５であり、
上記塩基エディタガイドＲＮＡは、配列番号００４、配列番号００５、および配列番号００６から選択される核酸配列を有している、
請求項２３に記載のキット。