【手続補正書】
【提出日】令和2年6月23日(2020.6.23)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
配列番号２の核酸配列に対して少なくとも９０％の配列同一性を含むＴ細胞受容体α鎖をコードする核酸分子、配列番号３の核酸配列に対して少なくとも９０％の配列同一性を含むＴ細胞受容体β鎖をコードする核酸分子、または両方を含む、ベクター。
【請求項２】
前記Ｔ細胞受容体α鎖をコードする前記核酸分子が配列番号２の核酸配列を含み、前記Ｔ細胞受容体β鎖をコードする前記核酸分子が配列番号３の核酸配列を含み、または両方である、請求項１に記載のベクター。
【請求項３】
配列番号２の核酸配列および配列番号３の核酸配列を含む、請求項２に記載のベクター。
【請求項４】
前記Ｔ細胞受容体α鎖をコードする前記核酸、前記Ｔ細胞受容体β鎖をコードする前記核酸、または両方が、プロモーターに作動可能に連結されている、請求項１〜３のいずれか一項に記載のベクター。
【請求項５】
細胞内ドメインを欠く末端切断型ＣＤ３４タンパク質をコードする核酸分子をさらに含む、請求項１〜４のいずれか一項に記載のベクター。
【請求項６】
レトロウイルスベクターである、請求項１〜５のいずれか一項に記載のベクター。
【請求項７】
ＳＡＭＥＮレトロウイルスベクターである、請求項６に記載のベクター。
【請求項８】
配列番号６の核酸配列を含む、請求項７に記載のベクター。
【請求項９】
請求項１〜８のいずれか一項に記載のベクターを含む、単離された宿主細胞。
【請求項１０】
ウイルスのｇａｇタンパク質、ウイルスのｐｏｌタンパク質、ウイルスのｅｎｖタンパク質、またはこれらの２つまたはそれより多くの組合せをコードする核酸をさらに含む、請求項９に記載の宿主細胞。
【請求項１１】
ＰＧ１３細胞である、請求項１０に記載の宿主細胞。
【請求項１２】
リンパ球である、請求項９に記載の宿主細胞。
【請求項１３】
前記リンパ球がＴ細胞である、請求項１２に記載の宿主細胞。
【請求項１４】
配列番号４のアミノ酸配列に対して少なくとも９５％の配列同一性を含むＴ細胞受容体α鎖をコードする異種核酸および配列番号５のアミノ酸配列に対して少なくとも９５％の配列同一性を含むＴ細胞受容体β鎖をコードする異種核酸分子を含む、改変されたＴ細胞。
【請求項１５】
前記Ｔ細胞受容体α鎖をコードする前記異種核酸が、配列番号４のアミノ酸配列を含むまたはそれからなるタンパク質をコードし、前記Ｔ細胞受容体β鎖をコードする前記異種核酸が、配列番号５のアミノ酸配列を含むまたはそれからなるタンパク質をコードする、請求項１４に記載の改変されたＴ細胞。
【請求項１６】
前記Ｔ細胞受容体α鎖をコードする前記異種核酸が、配列番号２の核酸配列を含むまたはそれからなり、前記Ｔ細胞受容体β鎖をコードする前記異種核酸が、配列番号３の核酸配列を含むまたはそれからなる、請求項１４または請求項１５に記載の改変されたＴ細胞。
【請求項１７】
細胞内ドメインを欠く末端切断型ＣＤ３４タンパク質をコードする異種核酸をさらに含む、請求項１４〜１６のいずれか一項に記載の改変されたＴ細胞。
【請求項１８】
請求項１〜８のいずれか一項に記載のベクターで形質導入された改変されたＴ細胞。
【請求項１９】
腎細胞癌を有する被験体に対して自己であるゲノムを含む、請求項１４〜１８のいずれか一項に記載の改変されたＴ細胞。
【請求項２０】
請求項１４〜１９のいずれか一項に記載の改変されたＴ細胞および薬学的に許容される担体を含む、医薬組成物。
【請求項２１】
請求項１４に記載の改変されたＴ細胞を含む、腎細胞癌（ＲＣＣ）を処置または阻害するための組成物。
【請求項２２】
前記改変されたＴ細胞の集団を、前記被験体に投与する前に増殖させる、請求項２１に記載の組成物。
【請求項２３】
前記ＲＣＣが明細胞ＲＣＣである、請求項２１または２２に記載の組成物。
【請求項２４】
前記ＲＣＣが、配列番号１のアミノ酸配列を含むヒト内在性レトロウイルス−Ｅ（ＨＥＲＶ−Ｅ）タンパク質を発現する、請求項２１〜２３のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項２５】
腎細胞癌抗原特異的Ｔ細胞受容体を発現する改変されたＴ細胞を作製する方法であって、
被験体から得られたリンパ球の集団を抗ＣＤ３抗体およびインターロイキン−２と接触させて、活性化Ｔ細胞の集団を産生すること、
該活性化Ｔ細胞の集団を請求項１〜８のいずれか一項に記載のベクターで形質導入して、形質導入されたＴ細胞の集団を産生すること、ならびに
該形質導入されたＴ細胞の集団を増殖させることによって、該改変されたＴ細胞を産生すること
を含む、方法。
【請求項２６】
前記形質導入されたＴ細胞の集団を増殖させることが、前記形質導入されたＴ細胞を抗ＣＤ３、抗ＣＤ２８、ＩＬ−２、およびＩＬ−１５と接触させることを含む、請求項２５に記載の方法。
【請求項２７】
前記形質導入されたＴ細胞を抗ＣＤ３、抗ＣＤ２８、ＩＬ−２、およびＩＬ−１５と接触させることが、該細胞を抗ＣＤ３、抗ＣＤ２８、ＩＬ−２、およびＩＬ−１５と９〜１１日間接触させることを含む、請求項２６に記載の方法。
【請求項２８】
前記形質導入されたＴ細胞を抗ＣＤ３４抗体と接触させることによって、前記形質導入されたＴ細胞の集団を富化することをさらに含む、請求項２５〜２７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２９】
前記リンパ球の集団が、腎細胞癌（ＲＣＣ）を有する被験体から得られる、請求項２５〜２８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３０】
前記リンパ球の集団が、配列番号１を含むタンパク質を発現する腎細胞癌を有する被験体から得られ、該被験体がＨＬＡ−Ａ１１陽性である、請求項２５〜２９のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３１】
配列番号２の核酸配列に対して少なくとも９０％の配列同一性を含むＴ細胞受容体α鎖をコードする単離された核酸。
【請求項３２】
配列番号２の核酸配列を含むまたはそれからなる、請求項３１に記載の核酸。
【請求項３３】
配列番号４のアミノ酸配列を含むまたはそれからなるタンパク質をコードする、請求項３１または請求項３２に記載の核酸。
【請求項３４】
配列番号３の核酸配列に対して少なくとも９０％の配列同一性を含むＴ細胞受容体β鎖をコードする単離された核酸。
【請求項３５】
配列番号３の核酸配列を含むまたはそれからなる、請求項３４に記載の核酸。
【請求項３６】
配列番号５のアミノ酸配列を含むまたはそれからなるタンパク質をコードする、請求項３４または請求項３５に記載の核酸。
【請求項３７】
配列番号４のアミノ酸配列に対して少なくとも９５％の配列同一性を含む、単離されたＴ細胞受容体α鎖ポリペプチド。
【請求項３８】
配列番号４のアミノ酸配列を含むまたはそれからなる、請求項３７に記載のポリペプチド。
【請求項３９】
配列番号５のアミノ酸配列に対して少なくとも９５％の配列同一性を含む、単離されたＴ細胞受容体β鎖ポリペプチド。
【請求項４０】
配列番号５のアミノ酸配列を含むまたはそれからなる、請求項３９に記載のポリペプチド。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０００８
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０００８】
一部の実施形態では、方法は、被験体またはドナーからＴ細胞の集団を得ること、ＴＣＲα鎖（配列番号２など）およびＴＣＲβ鎖（配列番号３など）をコードする核酸を含むベクターをＴ細胞の集団に形質導入すること、改変されたＴ細胞の集団を生成すること、ならびに改変されたＴ細胞を含む組成物を被験体に投与することによって、ＲＣＣ（例えば、ｃｃＲＣＣまたは転移性ｃｃＲＣＣ）を有する被験体を処置することを含む。一部の例では、Ｔ細胞の集団は、核酸分子を形質導入する前にｉｎ  ｖｉｔｒｏで活性化される。他の例では、改変されたＴ細胞の集団は、被験体に投与する前に増殖および／または富化される。
本発明は、例えば、以下の項目を提供する。
（項目１）
配列番号２の核酸配列に対して少なくとも９０％の配列同一性を含むＴ細胞受容体α鎖をコードする核酸分子、配列番号３の核酸配列に対して少なくとも９０％の配列同一性を含むＴ細胞受容体β鎖をコードする核酸分子、または両方を含む、ベクター。
（項目２）
前記Ｔ細胞受容体α鎖をコードする前記核酸分子が配列番号２の核酸配列を含み、前記Ｔ細胞受容体β鎖をコードする前記核酸分子が配列番号３の核酸配列を含み、または両方である、項目１に記載のベクター。
（項目３）
配列番号２の核酸配列および配列番号３の核酸配列を含む、項目２に記載のベクター。
（項目４）
前記Ｔ細胞受容体α鎖をコードする前記核酸、前記Ｔ細胞受容体β鎖をコードする前記核酸、または両方が、プロモーターに作動可能に連結されている、項目１〜３のいずれか一項に記載のベクター。
（項目５）
細胞内ドメインを欠く末端切断型ＣＤ３４タンパク質をコードする核酸分子をさらに含む、項目１〜４のいずれか一項に記載のベクター。
（項目６）
レトロウイルスベクターである、項目１〜５のいずれか一項に記載のベクター。
（項目７）
ＳＡＭＥＮレトロウイルスベクターである、項目６に記載のベクター。
（項目８）
配列番号６の核酸配列を含む、項目７に記載のベクター。
（項目９）
項目１〜８のいずれか一項に記載のベクターを含む、単離された宿主細胞。
（項目１０）
ウイルスのｇａｇタンパク質、ウイルスのｐｏｌタンパク質、ウイルスのｅｎｖタンパク質、またはこれらの２つまたはそれより多くの組合せをコードする核酸をさらに含む、項目９に記載の宿主細胞。
（項目１１）
ＰＧ１３細胞である、項目１０に記載の宿主細胞。
（項目１２）
リンパ球である、項目９に記載の宿主細胞。
（項目１３）
前記リンパ球がＴ細胞である、項目１２に記載の宿主細胞。
（項目１４）
配列番号４のアミノ酸配列に対して少なくとも９５％の配列同一性を含むＴ細胞受容体α鎖をコードする異種核酸および配列番号５のアミノ酸配列に対して少なくとも９５％の配列同一性を含むＴ細胞受容体β鎖をコードする異種核酸分子を含む、改変されたＴ細胞。
（項目１５）
前記Ｔ細胞受容体α鎖をコードする前記異種核酸が、配列番号４のアミノ酸配列を含むまたはそれからなるタンパク質をコードし、前記Ｔ細胞受容体β鎖をコードする前記異種核酸が、配列番号５のアミノ酸配列を含むまたはそれからなるタンパク質をコードする、項目１４に記載の改変されたＴ細胞。
（項目１６）
前記Ｔ細胞受容体α鎖をコードする前記異種核酸が、配列番号２の核酸配列を含むまたはそれからなり、前記Ｔ細胞受容体β鎖をコードする前記異種核酸が、配列番号３の核酸配列を含むまたはそれからなる、項目１４または項目１５に記載の改変されたＴ細胞。
（項目１７）
細胞内ドメインを欠く末端切断型ＣＤ３４タンパク質をコードする異種核酸をさらに含む、項目１４〜１６のいずれか一項に記載の改変されたＴ細胞。
（項目１８）
項目１〜８のいずれか一項に記載のベクターで形質導入された改変されたＴ細胞。
（項目１９）
腎細胞癌を有する被験体に対して自己であるゲノムを含む、項目１４〜１８のいずれか一項に記載の改変されたＴ細胞。
（項目２０）
項目１４〜１９のいずれか一項に記載の改変されたＴ細胞および薬学的に許容される担体を含む、医薬組成物。
（項目２１）
腎細胞癌（ＲＣＣ）を処置または阻害する方法であって、
ＲＣＣを有する被験体からＴ細胞の集団を得ること、
配列番号２に対して少なくとも９０％の配列同一性を有する核酸を含むＴ細胞受容体α鎖をコードする核酸および配列番号３に対して少なくとも９０％の配列同一性を有する核酸を含むＴ細胞受容体β鎖をコードする核酸を含むベクターで該Ｔ細胞の集団を形質導入することによって、改変されたＴ細胞の集団を産生すること、ならびに
該改変されたＴ細胞を含む組成物を該被験体に投与することによって、該ＲＣＣを処置または阻害すること
を含む、方法。
（項目２２）
前記Ｔ細胞受容体α鎖をコードする前記核酸が、配列番号２の核酸配列を含むまたはそれからなり、前記Ｔ細胞受容体β鎖をコードする前記核酸が、配列番号３の核酸配列を含むまたはそれからなる、項目２１に記載の方法。
（項目２３）
前記Ｔ細胞受容体α鎖をコードする前記核酸が、配列番号４のアミノ酸配列を含むまたはそれからなるタンパク質をコードし、前記Ｔ細胞受容体β鎖をコードする前記核酸が、配列番号５のアミノ酸配列を含むまたはそれからなるタンパク質をコードする、項目２１または項目２２に記載の方法。
（項目２４）
前記ベクターが、細胞内ドメインを欠く末端切断型ＣＤ３４タンパク質をコードする核酸をさらに含む、項目２１〜２３のいずれか一項に記載の方法。
（項目２５）
前記ベクターがレトロウイルスベクターである、項目２１〜２４のいずれか一項に記載の方法。
（項目２６）
前記改変されたＴ細胞の集団が、前記被験体に投与する前に、抗ＣＤ３４抗体を用いる選択によって富化される、項目２５に記載の方法。
（項目２７）
前記Ｔ細胞の集団が、形質導入の前に活性化される、項目２１〜２６のいずれか一項に記載の方法。
（項目２８）
形質導入の前に、ＣＤ４を発現するＴ細胞を前記Ｔ細胞の集団から枯渇させる、項目２１〜２７のいずれか一項に記載の方法。
（項目２９）
前記改変されたＴ細胞の集団を、前記被験体に投与する前に増殖させる、項目２１〜２８のいずれか一項に記載の方法。
（項目３０）
前記改変されたＴ細胞の集団を前記被験体に投与する前に、該被験体に免疫抑制療法が施される、項目２１〜２９のいずれか一項に記載の方法。
（項目３１）
前記ＲＣＣが明細胞ＲＣＣである、項目２１〜３０のいずれか一項に記載の方法。
（項目３２）
前記ＲＣＣが、配列番号１のアミノ酸配列を含むヒト内在性レトロウイルス−Ｅ（ＨＥＲＶ−Ｅ）タンパク質を発現する、項目２１〜３１のいずれか一項に記載の方法。
（項目３３）
前記被験体が、ヒト白血球抗原（ＨＬＡ）血清型ＨＬＡ−Ａ１１について陽性である、項目２１〜３２のいずれか一項に記載の方法。
（項目３４）
ＲＣＣを有する被験体を選択することをさらに含み、該ＲＣＣが、配列番号１を含むＨＥＲＶ−Ｅタンパク質を発現し、該被験体がＨＬＡ−Ａ１１について陽性である、項目２１〜３３のいずれか一項に記載の方法。
（項目３５）
腎細胞癌抗原特異的Ｔ細胞受容体を発現する改変されたＴ細胞を作製する方法であって、
被験体からリンパ球の集団を得ること、
該リンパ球の集団を抗ＣＤ３抗体およびインターロイキン−２と接触させて、活性化Ｔ細胞の集団を産生すること、
該活性化Ｔ細胞の集団を項目１〜８のいずれか一項に記載のベクターで形質導入して、形質導入されたＴ細胞の集団を産生すること、ならびに
該形質導入されたＴ細胞の集団を増殖させることによって、該改変されたＴ細胞を産生すること
を含む、方法。
（項目３６）
前記形質導入されたＴ細胞の集団を増殖させることが、前記形質導入されたＴ細胞を抗ＣＤ３、抗ＣＤ２８、ＩＬ−２、およびＩＬ−１５と接触させることを含む、項目３５に記載の方法。
（項目３７）
前記形質導入されたＴ細胞を抗ＣＤ３、抗ＣＤ２８、ＩＬ−２、およびＩＬ−１５と接触させることが、該細胞を抗ＣＤ３、抗ＣＤ２８、ＩＬ−２、およびＩＬ−１５と９〜１１日間接触させることを含む、項目３６に記載の方法。
（項目３８）
前記形質導入されたＴ細胞を抗ＣＤ３４抗体と接触させることによって、前記形質導入されたＴ細胞の集団を富化することをさらに含む、項目３５〜３７のいずれか一項に記載の方法。
（項目３９）
前記リンパ球の集団が、腎細胞癌（ＲＣＣ）を有する被験体から得られる、項目３５〜３８のいずれか一項に記載の方法。
（項目４０）
前記リンパ球の集団が、配列番号１を含むタンパク質を発現する腎細胞癌を有する被験体から得られ、該被験体がＨＬＡ−Ａ１１陽性である、項目３５〜３９のいずれか一項に記載の方法。
（項目４１）
配列番号２の核酸配列に対して少なくとも９０％の配列同一性を含むＴ細胞受容体α鎖をコードする単離された核酸。
（項目４２）
配列番号２の核酸配列を含むまたはそれからなる、項目４１に記載の核酸。
（項目４３）
配列番号４のアミノ酸配列を含むまたはそれからなるタンパク質をコードする、項目４１または項目４２に記載の核酸。
（項目４４）
配列番号３の核酸配列に対して少なくとも９０％の配列同一性を含むＴ細胞受容体β鎖をコードする単離された核酸。
（項目４５）
配列番号３の核酸配列を含むまたはそれからなる、項目４４に記載の核酸。
（項目４６）
配列番号５のアミノ酸配列を含むまたはそれからなるタンパク質をコードする、項目４４または項目４５に記載の核酸。
（項目４７）
配列番号４のアミノ酸配列に対して少なくとも９５％の配列同一性を含む、単離されたＴ細胞受容体α鎖ポリペプチド。
（項目４８）
配列番号４のアミノ酸配列を含むまたはそれからなる、項目４７に記載のポリペプチド。
（項目４９）
配列番号５のアミノ酸配列に対して少なくとも９５％の配列同一性を含む、単離されたＴ細胞受容体β鎖ポリペプチド。
（項目５０）
配列番号５のアミノ酸配列を含むまたはそれからなる、項目４９に記載のポリペプチド。