【手続補正書】
【提出日】令和2年2月28日(2020.2.28)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
ヌクレオチドプロモーター配列及び活性化可能なプロモーターの１以上の構成要素に結合した１以上の転写阻害成分を含む、活性化可能なプロモーターであって、１以上の転写阻害成分が、活性化可能なプロモーターから引き離されている場合に、該ヌクレオチドプロモーター配列が活性化するように構成されている、プロモーター。
【請求項２】
（Ｉ）前記活性化可能なプロモーターの１以上の構成要素がヌクレオチドの構成要素である；
（ＩＩ）前記活性化可能なプロモーターの１以上の構成要素がヌクレオチドの構成要素であり、且つ前記活性化可能なプロモーターの１以上の構成要素が：
（ａ）１以上のヌクレオチド塩基又はヌクレオチド塩基類似体である、
（ｂ）１以上のヌクレオチド糖基である、若しくは
（ｃ）１以上のヌクレオチドリン酸基である；
（ＩＩＩ）前記１以上の転写阻害成分が、１以上の分解性成分を介して、活性化可能なプロモーターの１以上の構成要素に結合している；及び／又は
（ＩＶ）前記１以上の転写阻害成分が、１以上の分解性成分を介して、活性化可能なプロモーターの１以上の構成要素に結合しており、且つ：
（ａ）前記１以上の分解性成分が光分解性成分である；
（ｂ）前記１以上の分解性成分が、２−ニトロベンジルを含む光分解性成分である；
（ｃ）前記１以上の分解性成分がリンカーを更に含み、前記１以上の転写阻害成分及び前記１以上の分解性成分がリンカーを介して活性化可能なプロモーターの１以上の構成要素に結合している；
（ｄ）前記１以上の分解性成分がリンカーを更に含み、前記１以上の転写阻害成分及び前記１以上の分解性成分がリンカーを介して活性化可能なプロモーターの１以上の構成要素に結合しており、前記リンカーがジアミンリンカーである；
（ｅ）前記１以上の分解性成分がリンカーを更に含み、前記１以上の転写阻害成分及び前記１以上の分解性成分がリンカーを介して活性化可能なプロモーターの１以上の構成要素に結合しており、前記リンカーがジアミンリンカーであり、前記ジアミンリンカーが、式─Ｎ（Ｈ）（ＣＨ２）ｎＮ（Ｈ）─（前記式中、ｎが１〜２０、任意選択で、１〜１２である）のリンカーから選択される、アルキルジアミンリンカーである；
（ｆ）前記１以上の分解性成分がリンカーを更に含み、前記１以上の転写阻害成分及び前記１以上の分解性成分がリンカーを介して活性化可能なプロモーターの１以上の構成要素に結合しており、前記リンカーがジアミンリンカーであり、前記ジアミンリンカーが、式─Ｎ（Ｈ）（ＣＨ２）ｎＮ（Ｈ）─（前記式中、ｎが１〜８である）のリンカーから選択される、アルキルジアミンリンカーである；及び／又は
（ｇ）前記１以上の分解性成分がリンカーを更に含み、前記１以上の転写阻害成分及び前記１以上の分解性成分がリンカーを介して活性化可能なプロモーターの１以上の構成要素に結合しており、前記リンカーがジアミンリンカーであり、前記ジアミンリンカーが、１，６−ジアミノヘキサンである、
請求項１に記載の活性化可能なプロモーター。
【請求項３】
（Ｉ）前記活性化可能なプロモーターの１以上の構成要素が、１以上のヌクレオチド塩基又はヌクレオチド塩基類似体である；
（ＩＩ）前記活性化可能なプロモーターの１以上の構成要素が、１以上のヌクレオチド塩基又はヌクレオチド塩基類似体であり、前記１以上のヌクレオチド塩基がプリン塩基であり、リンカーがプリン環に結合している；
（ＩＩＩ）前記活性化可能なプロモーターの１以上の構成要素が、１以上のヌクレオチド塩基又はヌクレオチド塩基類似体であり、前記１以上のヌクレオチド塩基がプリン塩基であり、リンカーがプリン環に結合しており：
（ａ）前記1以上のヌクレオチド塩基がアデニン及び／若しくはグアニンである；並びに／又は
（ｂ）前記リンカーがプリン環に、好ましくは、８位で結合している；
（ＩＶ）前記活性化可能なプロモーターの１以上の構成要素が、１以上のヌクレオチド塩基又はヌクレオチド塩基類似体であり、前記１以上のヌクレオチド塩基がピリミジン塩基であり、リンカーがピリミジン環に結合している；或いは
（Ｖ）前記活性化可能なプロモーターの１以上の構成要素が、１以上のヌクレオチド塩基又はヌクレオチド塩基類似体であり、前記１以上のヌクレオチド塩基がピリミジン塩基であり、リンカーがピリミジン環に結合しており：
（ａ）前記１以上のヌクレオチド塩基がチミン及び／若しくはシトシン及び／若しくはウラシルである；並びに／又は
（ｂ）前記リンカーがピリミジン環に、好ましくは、５位で結合している、
請求項２（ＩＶ）（ｃ）、２（ＩＶ）（ｄ）、２（ＩＶ）（ｅ）、２（ＩＶ）（ｆ）又は２（ＩＶ）（ｇ）のいずれか１つに記載の活性化可能なプロモーター。
【請求項４】
前記１以上の転写阻害成分がビオチン：ストレプトアビジン複合体を含み、該複合体のビオチン成分が1以上の分解性成分に結合している、請求項２又は３に記載の活性化可能なプロモーター。
【請求項５】
前記１以上の転写阻害成分が、ヌクレオチドプロモーター配列の１以上の構成要素に結合している、上記請求項のいずれか１項に記載の活性化可能なプロモーター。
【請求項６】
（Ｉ）オープンリーディングフレーム若しくは遺伝子に作動可能に連結された；或いは
（ＩＩ）オープンリーディングフレーム若しくは遺伝子に作動可能に連結され、前記オープンリーディングフレーム又は遺伝子が、膜タンパク質をコードし；任意選択で、該膜タンパク質が：
（ｉ）ポンプ、チャネル、孔、受容体タンパク質、トランスポータータンパク質、又は細胞認識若しくは細胞間相互作用に影響するタンパク質を含む；及び／或いは
（ｉｉ）α−ヘモリシン（αＨＬ）孔タンパク質である、
上記請求項のいずれか１項に記載の活性化可能なプロモーターを含む、発現システム。
【請求項７】
（Ｉ）前記システムが、バクテリオファージ転写構成要素と共に使用するために、作動可能に構成されている；及び／若しくは前記ヌクレオチドプロモーター配列がＴ７プロモーターを含む；
（ＩＩ）前記システムが、原核転写構成要素、任意選択で、細菌の転写構成要素と共に使用するために、作動可能に構成されている；又は
（ＩＩＩ）前記システムが、真核転写構成要素、任意選択で、昆虫又は哺乳動物の転写構成要素と共に使用するために、作動可能に構成されている、
請求項６に記載の発現システム。
【請求項８】
１以上の更なる転写要素を更に含み、任意選択で、該転写要素がエンハンサーである、請求項６又は７に記載の発現システム。
【請求項９】
請求項６〜８のいずれか１項に記載の発現システムを含み、任意選択で：
（ｉ）前記ベクターが直鎖状の二本鎖ＤＮＡ分子若しくは繋がった二本鎖ＤＮＡ分子である；及び／又は
（ｉｉ）前記ベクターがウイルスベクター、任意選択で、レトロウイルス、レンチウイルス、アデノウイルス、アデノ随伴ウイルス又は単純ヘルペスウイルスベクターである、ベクター。
【請求項１０】
請求項９に記載のベクターを含む送達システムであって、前記送達システムが、酵母システム、リポフェクションシステム、マイクロインジェクションシステム、バイオリスティックシステム、ヴィロソーム、リポソーム、イムノリポソーム、ポリカチオン、脂質：核酸複合体又は人工ウイルス粒子を含み；任意選択で、前記送達システムがウイルス送達システムを含む、送達システム。
【請求項１１】
水性媒体、及び請求項６〜８のいずれか１項に記載の発現システム、又は請求項９に記載のベクターを含む反応容器であって；該水性媒体が転写試薬を含み；該反応容器が脱結合剤を受容するように構成され、該剤が発現システム又はベクターの活性化可能なプロモーターの１以上の構成要素から、１以上の転写阻害成分を引き離すことができ、転写産物が引き離し後に発現され得る、反応容器。
【請求項１２】
前記容器が：
（ａ）試験管；
（ｂ）マイクロタイタープレートのウェル；
（ｃ）基板の領域、任意選択で、該領域がアレイを含む基板の複数の領域の一つである、領域；
（ｄ）マイクロ流体構造のセル；
（ｅ）生物学的な細胞；
（ｆ）合成細胞；
（ｇ）水性液滴若しくはヒドロゲル物体を含む水性物体；又は
（ｈ）水性液滴若しくはヒドロゲル物体を含む水性物体であって、反応容器が：
（Ｉ）水性液滴又はヒドロゲル物体の表面の少なくとも一部において、両親媒性分子の外層を含む；
（ＩＩ）水性液滴又はヒドロゲル物体の表面の少なくとも一部において、両親媒性分子の外層を含み、前記両親媒性分子の外層が水性液滴又はヒドロゲル物体を封入している；
（ＩＩＩ）水性液滴又はヒドロゲル物体の表面の少なくとも一部において、両親媒性分子の外層を含み、前記両親媒性分子の外層が水性液滴又はヒドロゲル物体を封入しており、前記両親媒性分子が脂質分子を含む；
（ＩＶ）水性液滴又はヒドロゲル物体の表面の少なくとも一部において、両親媒性分子の外層を含み、前記両親媒性分子の外層が水性液滴又はヒドロゲル物体を封入しており、前記両親媒性分子が脂質分子を含み、前記両親媒性分子がリン脂質分子を含む；及び／又は
（Ｖ）水性液滴又はヒドロゲル物体の表面の少なくとも一部において、両親媒性分子の外層を含み、前記両親媒性分子の外層が水性液滴又はヒドロゲル物体を封入しており、前記両親媒性分子が脂質分子を含み、前記両親媒性分子がリン脂質分子を含み、前記リン脂質が非ＰＥＧ化リン脂質及びＰＥＧ化リン脂質を含み；
（ｉ）２．５〜１５モル％のリン脂質がＰＥＧ化リン脂質である；
（ｉｉ）５〜１５モル％のリン脂質がＰＥＧ化リン脂質である；
（ｉｉｉ）７．５〜１５モル％のリン脂質がＰＥＧ化リン脂質である；若しくは
（ｉｖ）１０〜１５モル％のリン脂質がＰＥＧ化リン脂質である、
請求項１１に記載の反応容器。
【請求項１３】
請求項１２（ｈ）に記載の１以上の反応容器、及び疎水性媒体を含む組成物であって：
（Ａ）該1以上の反応容器が疎水性媒体中に配置されている；又は
（Ｂ）該1以上の反応容器が疎水性媒体中に配置されており：
（Ｉ）前記疎水性媒体がオイルを含む；
（ＩＩ）前記疎水性媒体がオイルを含み、前記オイルがシリコーン油、炭化水素若しくはフルオロカーボン、又はそれらの２つ以上の混合物を含む；
（ＩＩＩ）前記疎水性媒体がオイルを含み、前記オイルがシリコーン油、炭化水素若しくはフルオロカーボン、又はそれらの２つ以上の混合物を含み、前記疎水性媒体が炭化水素及びシリコーン油の混合物を含む；
（ＩＶ）前記疎水性媒体がオイルを含み、前記オイルがシリコーン油、炭化水素若しくはフルオロカーボン、又はそれらの２つ以上の混合物を含み、前記疎水性媒体が炭化水素及びシリコーン油の混合物を含み、前記疎水性媒体が５０：５０〜２０：８０の体積比又は５０：５０〜８０：２０の体積比、好ましくは、５０：５０〜４０：６０の体積比の炭化水素：シリコーン油を含む；
（Ｖ）前記疎水性媒体がオイルを含み、前記オイルがシリコーン油、炭化水素若しくはフルオロカーボン、又はそれらの２つ以上の混合物を含み、前記炭化水素がＣ１０−Ｃ２０アルカンであり、好ましくは、前記炭化水素がヘキサデカンである；
（ＶＩ）前記１以上の反応容器が、集合体を形成する複数の反応容器を含む；
（ＶＩＩ）前記１以上の反応容器が、集合体を形成する複数の反応容器を含み、集合体中の１以上の反応容器が、集合体中の少なくとも1つの他の反応容器と接触している；
（ＶＩＩＩ）前記１以上の反応容器が、集合体を形成する複数の反応容器を含み、集合体中の１以上の反応容器が、集合体中の少なくとも1つの他の反応容器と接触しており、接触している反応容器の間に接触面が形成される；
（ＩＸ）前記１以上の反応容器が、集合体を形成する複数の反応容器を含み、集合体中の１以上の反応容器が、集合体中の少なくとも1つの他の反応容器と接触しており、接触している反応容器の間に接触面が形成され、前記接触面が両親媒性分子の層、好ましくは、両親媒性分子の二重層を含むか、若しくは前記接触面が両親媒性分子の層を含まない；
（Ｘ）前記１以上の反応容器が、集合体を形成する複数の反応容器を含み、集合体中の１以上の反応容器が、集合体中の少なくとも1つの他の反応容器と接触しており、接触している反応容器の間に接触面が形成され、反応容器のネットワークを形成するために、複数の反応容器が接続されている；
（ＸＩ）前記１以上の反応容器が、集合体を形成する複数の反応容器を含み、集合体中の１以上の反応容器が、集合体中の少なくとも1つの他の反応容器と接触しており、接触している反応容器の間に接触面が形成され、
前記接触面が両親媒性分子の層、好ましくは、両親媒性分子の二重層を含むか、若しくは前記接触面が両親媒性分子の層を含まず、
反応容器のネットワークを形成するために、複数の反応容器が接続されている；
（ＸＩＩ）前記１以上の反応容器が、集合体を形成する複数の反応容器を含み、集合体中の１以上の反応容器が、集合体中の少なくとも1つの他の反応容器と接触しており、接触している反応容器の間に接触面が形成され、反応容器のネットワークを形成するために、複数の反応容器が接続されており、両親媒性分子の二重層を含む接触面を介して、少なくとも２つの反応容器が接続され、前記の少なくとも２つの反応容器の水性媒体が二重層内の孔を介して、流体をやりとりする、任意選択で前記孔がα−ヘモリシン（αＨＬ）で構成される；及び／又は
（ＸＩＩＩ）前記１以上の反応容器が、集合体を形成する複数の反応容器を含み、集合体中の１以上の反応容器が、集合体中の少なくとも1つの他の反応容器と接触しており、接触している反応容器の間に接触面が形成され、
前記接触面が両親媒性分子の層、好ましくは、両親媒性分子の二重層を含むか、若しくは前記接触面が両親媒性分子の層を含まず、
反応容器のネットワークを形成するために、複数の反応容器が接続されており、両親媒性分子の二重層を含む接触面を介して、少なくとも２つの反応容器が接続され、前記の少なくとも２つの反応容器の水性媒体が二重層内の孔を介して、流体をやりとりする、任意選択で前記孔がα−ヘモリシン（αＨＬ）で構成される、
組成物。
【請求項１４】
請求項１３（Ｘ）、１３（ＸＩ）、１３（ＸＩＩ）又は１３（ＸＩＩＩ）のいずれか１つに記載の組成物を含む、電気化学回路。
【請求項１５】
転写産物の発現方法であって、該方法が以下：
（ａ）請求項１１〜１３のいずれか１項に記載の反応容器又は組成物を提供すること、及び該容器に脱結合剤を提供すること（該剤は、活性化可能なプロモーターの１以上の構成要素から１以上の転写阻害成分を引き離すことができる）ことを含み；該転写産物が引き離し後に発現する；又は
（ｂ）請求項１〜５のいずれか１項に記載の活性化可能なプロモーターを脱結合剤と接触させること（該剤は、活性化可能なプロモーターの１以上の構成要素から１以上の転写阻害成分を引き離すことができる）ことを含み；該転写産物が引き離し後に発現し、任意選択で、前記活性化可能なプロモーターが請求項６〜８のいずれか１項に記載の発現システム中に含まれるか、又は前記活性化可能なプロモーターが請求項９に記載のベクター中に含まれる；
任意選択で、前記活性化可能なプロモーターの分解性成分が光分解性成分であり、任意選択で前記光分解性成分が２−ニトロベンジルを含み、前記脱結合剤が電磁放射線であり、任意選択で、該電磁放射線が赤外線（ＩＲ）であり、好ましくは、該電磁放射線が紫外線（ＵＶ）である、
方法。
【請求項１６】
ペプチド、オリゴペプチド、ポリペプチド又はタンパク質の製造方法であって、該方法が請求項１５に記載の方法によって転写産物を発現させること、及び該転写産物をペプチド、オリゴペプチド、ポリペプチド又はタンパク質に翻訳することを含み、任意選択で、前記反応容器が、請求項１１並びに請求項１２（ａ）、１２（ｂ）、１２（ｃ）、１２（ｄ）、１２（ｆ）、１２（ｇ）及び１２（ｈ）のいずれか１つに記載の容器であるか、又は請求項１３に記載の組成物であり、前記水性媒体がｉｎ  ｖｉｔｒｏ転写及び翻訳システムを含む、方法。