【手続補正書】
【提出日】平成30年3月19日(2018.3.19)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
喘息を有する患者を選択的に治療する方法で用いるための、ＩＬ−１３アンタゴニストを含む医薬組成物であって、
前記方法は、
ｉ）ＡＩＲマーカー１、２、３、４、５、６、７、８および９からなる群から選択される少なくとも１つのＡＩＲマーカーを有する患者を同定するステップと、
ｉｉ）その後、治療有効量のＩＬ−１３アンタゴニストを前記患者に投与するステップと
を含む、医薬組成物。
【請求項２】
前記同定するステップが、前記患者からの生物学的試料を前記群から選択される少なくとも１つのＡＩＲマーカーの存在についてアッセイすることを含む、請求項１に記載の医薬組成物。
【請求項３】
喘息を有する患者を選択的に治療する方法で用いるための、ＩＬ−１３アンタゴニストを含む医薬組成物であって、
前記方法は、
ｉ）前記患者からの生物学的試料をＡＩＲマーカー１、２、３、４、５、６、７、８および９からなる前記群から選択される少なくとも１つのＡＩＲマーカーの存在または非存在についてアッセイするステップと、
ｉｉ）前記試料中の前記群から選択される少なくとも１つのＡＩＲマーカーの存在を検出し、それにより、前記患者が前記ＡＩＲマーカーについて陽性であることを判定するステップと、
ｉｉｉ）陽性である前記患者に治療有効量のＩＬ−１３アンタゴニストを選択的に投与するステップと
を含む、医薬組成物。
【請求項４】
前記ＡＩＲマーカーが同型接合または異型接合型で存在するかどうかを判定するステップをさらに含み、同型接合型の前記少なくとも１つのＡＩＲマーカーの存在が、前記患者が前記ＡＩＲマーカーについて陽性であることを決定づける、請求項１から３のいずれか一項に記載の医薬組成物。
【請求項５】
前記ＡＩＲマーカーがＡＩＲマーカー３およびＡＩＲマーカー７からなる群から選択される、請求項１から４のいずれか一項に記載の医薬組成物。
【請求項６】
前記患者が前記ＡＩＲマーカーについて同型接合または異型接合であるかを判定するステップと、治療有効量のＩＬ−１３アンタゴニストを
ＡＩＲマーカー３およびＡＩＲマーカー７の一方について同型接合であり、他方について異型接合であるか、
ＡＩＲマーカー３およびＡＩＲマーカー７の両方について同型接合であるか、または
ＡＩＲマーカー３について同型接合である
前記患者に選択的に投与するステップとを
さらに含む、請求項１、２、３および４のいずれか一項に記載の医薬組成物。
【請求項７】
喘息を有する患者がＩＬ−１３アンタゴニストによる治療に反応する可能性を予測するのを補助する方法であって、前記患者からの生物学的試料をＡＩＲマーカー１、２、３、４、５、６、７、８および９からなる群から選択される少なくとも１つのＡＩＲマーカーの存在または非存在についてアッセイするステップを含み、
ａ）前記少なくとも１つのＡＩＲマーカーの存在が、前記患者が前記ＩＬ−１３アンタゴニストによる治療に反応する可能性の増大を示し、
ｂ）前記少なくとも１つのＡＩＲマーカーの非存在が、前記患者が前記ＩＬ−１３アンタゴニストによる治療に反応する可能性の低減を示す、方法。
【請求項８】
喘息を有する患者がＩＬ−１３アンタゴニストによる治療に反応する可能性を予測するのを補助する方法であって、前記患者からの生物学的試料を同型接合型のＡＩＲマーカー１、２、３、４、５、６、７、８および９からなる群から選択される少なくとも１つのＡＩＲマーカーの存在または非存在についてアッセイするステップを含み、
ａ）同型接合型の前記少なくとも１つのＡＩＲマーカーの存在が、前記患者が前記ＩＬ−１３アンタゴニストによる治療に反応する可能性の増大を示し、
ｂ）同型接合型の前記少なくとも１つのＡＩＲマーカーの非存在が、前記患者が前記ＩＬ−１３アンタゴニストによる治療に反応する可能性の低減を示す、方法。
【請求項９】
喘息を有する患者がＩＬ−１３アンタゴニストによる治療に反応する可能性を予測するのを補助する方法であって、
ａ）前記患者からの生物学的試料を少なくとも１つのＡＩＲマーカーの存在または非存在についてアッセイするステップと、
ｂ）前記ＡＩＲマーカーが同型接合または異型接合型で存在するかを判定するステップと
を含み、
同型接合型の前記少なくとも１つのＡＩＲマーカーの存在が、前記患者が前記ＩＬ−１３アンタゴニストによる治療に反応する可能性の増大を示し、前記少なくとも１つのＡＩＲマーカーが
ｉ）それぞれ同型接合型で存在するＡＩＲマーカー３およびＡＩＲマーカー７、
ｉｉ）同型接合型で存在するＡＩＲマーカー３および異型接合型のＡＩＲマーカー７；
ａ．同型接合型で存在するＡＩＲマーカー７および異型接合型のＡＩＲマーカー３；
ｂ．同型接合型のＡＩＲマーカー３
からなる群から選択される、方法。
【請求項１０】
前記アッセイするステップが、前記生物学的試料を前記少なくとも１つのＡＩＲマーカーの核酸産物、または前記少なくとも１つのＡＩＲマーカーのポリペプチド産物についてアッセイすることを含む、請求項２から９のいずれか一項に記載の医薬組成物または方法。
【請求項１１】
前記アッセイするステップが、前記生物学的試料を前記少なくとも１つのＡＩＲマーカーのゲノム配列についてアッセイすることを含む、請求項２から９のいずれか一項に記載の医薬組成物または方法。
【請求項１２】
前記生物学的試料が、血液、血清、大便、血漿、尿、涙液、唾液および組織試料からなる群から選択される、請求項２から１１のいずれか一項に記載の医薬組成物または方法。
【請求項１３】
アッセイするステップが、ノーザンブロット解析、ポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）、逆転写ポリメラーゼ連鎖反応（ＲＴ−ＰＣＲ）、ＴａｑＭａｎを用いたアッセイ、直接配列決定法、動的対立遺伝子特異的ハイブリダイゼーション、高密度オリゴヌクレオチドＳＮＰアレイ、制限断片長多型（ＲＦＬＰ）アッセイ、プライマー伸長アッセイ、オリゴヌクレオチドリガーゼアッセイ、一本鎖高次構造多型の解析、温度勾配ゲル電気泳動（ＴＧＧＥ）、変性高速液体クロマトグラフィー、高分解能溶融分析、ＤＮＡミスマッチ結合タンパク質アッセイ、ＳＮＰＬｅｘ（登録商標）、キャピラリー電気泳動、サザンブロット、免疫検定、免疫組織化学、ＥＬＩＳＡ、フローサイトメトリ、ウエスタンブロット、ＨＰＬＣおよび質量分析からなる群から選択される技術を含む、請求項２から１２のいずれか一項に記載の医薬組成物または方法。
【請求項１４】
ＩＬ−１３アンタゴニストによる治療に対する喘息を有する患者の反応性を予測するための伝達できる形の情報を作成する方法であって、
請求項７、８または９に記載の方法により得られた結果を、伝達に用いる有形または無形媒体形式に記録するステップ
を含む方法。
【請求項１５】
前記ＩＬ−１３アンタゴニストが、競合を促進する条件下でＩＬ−１３への結合についてＡＮＴＩＢＯＤＹ  ０１９５１／Ｇ１２（配列番号１４および１６）と競合する、請求項１から１４のいずれか一項に記載の医薬組成物または方法。
【請求項１６】
前記ＩＬ−１３アンタゴニストが、ポリペプチドまたはその断片、抗体またはその抗原結合断片、Ｆａｂ、ＳｃＦｖである、請求項１から１５のいずれか一項に記載の医薬組成物または方法。
【請求項１７】
前記ＩＬ−１３アンタゴニストが、配列番号１の残基１０３〜１０７として示されるＦＣＰＨＫＶ（配列番号６７）残基を含むＩＬ−１３のエピトープに結合する抗体またはその断片である、請求項１から１６のいずれか一項に記載の医薬組成物または方法。
【請求項１８】
前記ＩＬ−１３アンタゴニストが、配列番号２０に示す重鎖および配列番号１８に示す軽鎖を含む抗体である、請求項１から１７のいずれか一項に記載の医薬組成物または方法。
【請求項１９】
前記ＩＬ−１３アンタゴニストが、４週ごとに約５０〜１０００ｍｇの用量でｉ．ｖ．投与される抗体である、請求項１から１８のいずれか一項に記載の医薬組成物または方法。
【請求項２０】
前記ＩＬ−１３アンタゴニストが、約１００〜２００ｐＭのＫＤを有する、請求項１から１９のいずれか一項に記載の医薬組成物または方法。
【請求項２１】
前記ＩＬ−１３アンタゴニストが、約２１日のｉｎ  ｖｉｖｏ半減期を有する、請求項１から２０のいずれか一項に記載の医薬組成物または方法。
【請求項２２】
前記ＩＬ−１３アンタゴニストが、
ｉ．（ａ）配列番号２または５に示すＶＨＣＤＲ１ｓ、（ｂ）配列番号３または６に示すＶＨＣＤＲ２ｓ、（ｃ）配列番号４または７に示すＶＨＣＤＲ３ｓ、（ｄ）配列番号８または１１に示すＶＬＣＤＲ１ｓ、（ｅ）配列番号９または１２に示すＶＬＣＤＲ２ｓ、（ｆ）配列番号１０または１３に示すＶＬＣＤＲ３ｓからなるリストから選択される１つまたは複数のＣＤＲを含む抗体、
ｉｉ．配列番号２の重鎖可変領域ＣＤＲ１；配列番号３の重鎖可変領域ＣＤＲ２；配列番号４の重鎖可変領域ＣＤＲ３；配列番号８の軽鎖可変領域ＣＤＲ１；配列番号９の軽鎖可変領域ＣＤＲ２；および配列番号１０の軽鎖可変領域ＣＤＲ３を含む抗体、
ｉｉｉ．配列番号５の重鎖可変領域ＣＤＲ１；配列番号６の重鎖可変領域ＣＤＲ２；配列番号７の重鎖可変領域ＣＤＲ３；配列番号１１の軽鎖可変領域ＣＤＲ１；配列番号１２の軽鎖可変領域ＣＤＲ２；および配列番号１３の軽鎖可変領域ＣＤＲ３を含む抗体、
ｉｖ．配列番号１４に示す重鎖可変領域および配列番号１６に示す軽鎖可変領域を含む抗体、
ｖ．配列番号２０に示す重鎖および配列番号１８に示す軽鎖を含む抗体
からなる群から選択される抗体である、請求項１から２１のいずれか一項に記載の医薬組成物または方法。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０２１２
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０２１２】
【表１５】
2017513937.tif 000001
本発明は以下の態様を包含し得る。
［１］  喘息を有する患者を選択的に治療する方法であって、
ｉ）ＡＩＲマーカー１、２、３、４、５、６、７、８および９からなる群から選択される少なくとも１つのＡＩＲマーカーを有する患者を同定するステップと、
ｉｉ）その後、治療有効量のＩＬ−１３アンタゴニストを前記患者に投与するステップと
を含む方法。
［２］  前記同定するステップが、前記患者からの生物学的試料を前記群から選択される少なくとも１つのＡＩＲマーカーの存在についてアッセイすることを含む、上記［１］に記載の方法。
［３］  喘息を有する患者を選択的に治療する方法であって、
ｉｖ）前記患者からの生物学的試料をＡＩＲマーカー１、２、３、４、５、６、７、８および９からなる前記群から選択される少なくとも１つのＡＩＲマーカーの存在または非存在についてアッセイするステップと、
ｖ）前記試料中の前記群から選択される少なくとも１つのＡＩＲマーカーの存在を検出し、それにより、前記患者が前記ＡＩＲマーカーについて陽性であることを判定するステップと、
ｖｉ）陽性である前記患者に治療有効量のＩＬ−１３アンタゴニストを選択的に投与するステップと
を含む方法。
［４］  前記ＡＩＲマーカーが同型接合または異型接合型で存在するかどうかを判定するステップをさらに含み、同型接合型の前記少なくとも１つのＡＩＲマーカーの存在が、前記患者が前記ＡＩＲマーカーについて陽性であることを決定づける、上記［１］から［３］のいずれか一項に記載の方法。
［５］  前記ＡＩＲマーカーがＡＩＲマーカー３およびＡＩＲマーカー７からなる群から選択される、上記［１］から［４］のいずれか一項に記載の方法。
［６］  前記患者が前記ＡＩＲマーカーについて同型接合または異型接合であるかを判定するステップと、治療有効量のＩＬ−１３アンタゴニストを
ＡＩＲマーカー３およびＡＩＲマーカー７の一方について同型接合であり、他方について異型接合であるか、
ＡＩＲマーカー３およびＡＩＲマーカー７の両方について同型接合であるか、または
ＡＩＲマーカー３について同型接合である
前記患者に選択的に投与するステップとを
さらに含む、上記［１］、［２］、［３］および［４］のいずれか一項に記載の方法。
［７］  喘息を有する患者がＩＬ−１３アンタゴニストによる治療に反応する可能性を予測する方法であって、前記患者からの生物学的試料をＡＩＲマーカー１、２、３、４、５、６、７、８および９からなる群から選択される少なくとも１つのＡＩＲマーカーの存在または非存在についてアッセイするステップを含み、
ａ）前記少なくとも１つのＡＩＲマーカーの存在が、前記患者が前記ＩＬ−１３アンタゴニストによる治療に反応する可能性の増大を示し、
ｂ）前記少なくとも１つのＡＩＲマーカーの非存在が、前記患者が前記ＩＬ−１３アンタゴニストによる治療に反応する可能性の低減を示す、方法。
［８］  喘息を有する患者がＩＬ−１３アンタゴニストによる治療に反応する可能性を予測する方法であって、前記患者からの生物学的試料を同型接合型のＡＩＲマーカー１、２、３、４、５、６、７、８および９からなる群から選択される少なくとも１つのＡＩＲマーカーの存在または非存在についてアッセイするステップを含み、
ａ）同型接合型の前記少なくとも１つのＡＩＲマーカーの存在が、前記患者が前記ＩＬ−１３アンタゴニストによる治療に反応する可能性の増大を示し、
ｂ）同型接合型の前記少なくとも１つのＡＩＲマーカーの非存在が、前記患者が前記ＩＬ−１３アンタゴニストによる治療に反応する可能性の低減を示す、方法。
［９］  喘息を有する患者がＩＬ−１３アンタゴニストによる治療に反応する可能性を予測する方法であって、
ａ）前記患者からの生物学的試料を少なくとも１つのＡＩＲマーカーの存在または非存在についてアッセイするステップと、
ｂ）前記ＡＩＲマーカーが同型接合または異型接合型で存在するかを判定するステップと
を含み、
同型接合型の前記少なくとも１つのＡＩＲマーカーの存在が、前記患者が前記ＩＬ−１３アンタゴニストによる治療に反応する可能性の増大を示し、前記少なくとも１つのＡＩＲマーカーが
ｉ）それぞれ同型接合型で存在するＡＩＲマーカー３およびＡＩＲマーカー７、
ｉｉ）同型接合型で存在するＡＩＲマーカー３および異型接合型のＡＩＲマーカー７；
ａ．同型接合型で存在するＡＩＲマーカー７および異型接合型のＡＩＲマーカー３；
ｂ．同型接合型のＡＩＲマーカー３
からなる群から選択される、方法。
［１０］  前記アッセイするステップが、前記生物学的試料を前記少なくとも１つのＡＩＲマーカーの核酸産物、または前記少なくとも１つのＡＩＲマーカーのポリペプチド産物についてアッセイすることを含む、上記［２］から［９］のいずれか一項に記載の方法。
［１１］  前記アッセイするステップが、前記生物学的試料を前記少なくとも１つのＡＩＲマーカーのゲノム配列についてアッセイすることを含む、上記［２］から［９］のいずれか一項に記載の方法。
［１２］  前記生物学的試料が、血液、血清、大便、血漿、尿、涙液、唾液および組織試料からなる群から選択される、上記［２］から［１１］のいずれか一項に記載の方法。
［１３］  アッセイするステップが、ノーザンブロット解析、ポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）、逆転写ポリメラーゼ連鎖反応（ＲＴ−ＰＣＲ）、ＴａｑＭａｎを用いたアッセイ、直接配列決定法、動的対立遺伝子特異的ハイブリダイゼーション、高密度オリゴヌクレオチドＳＮＰアレイ、制限断片長多型（ＲＦＬＰ）アッセイ、プライマー伸長アッセイ、オリゴヌクレオチドリガーゼアッセイ、一本鎖高次構造多型の解析、温度勾配ゲル電気泳動（ＴＧＧＥ）、変性高速液体クロマトグラフィー、高分解能溶融分析、ＤＮＡミスマッチ結合タンパク質アッセイ、ＳＮＰＬｅｘ（登録商標）、キャピラリー電気泳動、サザンブロット、免疫検定、免疫組織化学、ＥＬＩＳＡ、フローサイトメトリ、ウエスタンブロット、ＨＰＬＣおよび質量分析からなる群から選択される技術を含む、上記［２］から［１２］のいずれか一項に記載の方法。
［１４］  ＩＬ−１３アンタゴニストによる治療に対する喘息を有する患者の反応性を予測するための伝達できる形の情報を作成する方法であって、
（ａ）前記患者が上記［７］、［８］または［９］に記載のＩＬ−１３アンタゴニストによる治療に反応する可能性の増大を判定するステップと、
ｂ）前記判定するステップの結果を、伝達に用いる有形または無形媒体形式に記録するステップと
を含む方法。
［１５］  前記ＩＬ−１３アンタゴニストが、競合を促進する条件下でＩＬ−１３への結合についてＡＮＴＩＢＯＤＹ  ０１９５１／Ｇ１２（配列番号１４および１６）と競合する、上記［１］から［１４］のいずれか一項に記載の方法。
［１６］  前記ＩＬ−１３アンタゴニストが、ポリペプチドまたはその断片、抗体またはその抗原結合断片、Ｆａｂ、ＳｃＦｖである、上記［１］から［１５］のいずれか一項に記載の方法。
［１７］  前記ＩＬ−１３アンタゴニストが、配列番号１の残基１０３〜１０７として示されるＦＣＰＨＫＶ（配列番号６７）残基を含むＩＬ−１３のエピトープに結合する抗体またはその断片である、上記［１］から［１６］のいずれか一項に記載の方法。
［１８］  前記ＩＬ−１３アンタゴニストが、配列番号２０に示す重鎖および配列番号１８に示す軽鎖を含む抗体である、上記［１］から［１７］のいずれか一項に記載の方法。
［１９］  前記ＩＬ−１３アンタゴニストが、４週ごとに約５０〜１０００ｍｇの用量でｉ．ｖ．投与される抗体である、上記［１］から［１８］のいずれか一項に記載の方法。
［２０］  前記ＩＬ−１３アンタゴニストが、約１００〜２００ｐＭのＫＤを有する、上記［１］から［１９］のいずれか一項に記載の方法。
［２１］  前記ＩＬ−１３アンタゴニストが、約２１日のｉｎ  ｖｉｖｏ半減期を有する、上記［１］から［２０］のいずれか一項に記載の方法。
［２２］  前記ＩＬ−１３アンタゴニストが、
ｉ．（ａ）配列番号２または５に示すＶＨＣＤＲ１ｓ、（ｂ）配列番号３または６に示すＶＨＣＤＲ２ｓ、（ｃ）配列番号４または７に示すＶＨＣＤＲ３ｓ、（ｄ）配列番号８または１１に示すＶＬＣＤＲ１ｓ、（ｅ）配列番号９または１２に示すＶＬＣＤＲ２ｓ、（ｆ）配列番号１０または１３に示すＶＬＣＤＲ３ｓからなるリストから選択される１つまたは複数のＣＤＲを含む抗体、
ｉｉ．配列番号２の重鎖可変領域ＣＤＲ１；配列番号３の重鎖可変領域ＣＤＲ２；配列番号４の重鎖可変領域ＣＤＲ３；配列番号８の軽鎖可変領域ＣＤＲ１；配列番号９の軽鎖可変領域ＣＤＲ２；および配列番号１０の軽鎖可変領域ＣＤＲ３を含む抗体、
ｉｉｉ．配列番号５の重鎖可変領域ＣＤＲ１；配列番号６の重鎖可変領域ＣＤＲ２；配列番号７の重鎖可変領域ＣＤＲ３；配列番号１１の軽鎖可変領域ＣＤＲ１；配列番号１２の軽鎖可変領域ＣＤＲ２；および配列番号１３の軽鎖可変領域ＣＤＲ３を含む抗体、
ｉｖ．配列番号１４に示す重鎖可変領域および配列番号１６に示す軽鎖可変領域を含む抗体、
ｖ．配列番号２０に示す重鎖および配列番号１８に示す軽鎖を含む抗体
からなる群から選択される抗体である、上記［１］から［２１］のいずれか一項に記載の方法。