【手続補正書】
【提出日】平成30年6月7日(2018.6.7)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
ミトコンドリアDNAを備える被験者からのサンプルにおいてD−ループ領域におけるおよび／またはND1遺伝子におけるメチル化パターンを決定することを備える、前記被験者におけるアルツハイマー病およびパーキンソン病から選択された神経変性疾患を発病するリスクを診断または決定するためのインビトロ法であって、前記メチル化パターンは、
（i）表1において示されたD−ループ領域におけるCpGサイト、
（ii）表2において示されたND1遺伝子のCpGサイト、
（iii）表3において示されたD−ループ領域におけるCHGサイト、
（iv）表4において示されたND1遺伝子におけるCHGサイト、および／または
（v）表5において示されたD−ループ領域におけるCHHサイト
からなるグループから選択された少なくとも1つのサイトにおいて決定され、
D−ループ領域における前記CpGサイトの少なくとも1つにおけるハイパーメチル化、D−ループ領域における前記CHGサイトの少なくとも1つにおけるハイパーメチル化、D−ループ領域における前記CHHサイトの少なくとも1つにおけるハイパーメチル化、ND1遺伝子における前記CpGサイトの少なくとも1つにおけるハイポメチル化、および／またはND1遺伝子における前記CHGサイトの少なくとも1つにおけるハイポメチル化は、前記被験者がアルツハイマー病に罹患していること、または前記被験者がアルツハイマー病を発病する高いリスクにあることを示し、または、
D−ループ領域における前記CpGサイトの少なくとも1つにおけるハイポメチル化、D−ループ領域における前記CHGサイトの少なくとも1つにおけるハイポメチル化、および／またはD−ループ領域における前記CHHサイトの少なくとも1つにおけるハイポメチル化は、前記被験者がパーキンソン病に罹患していること、または前記被験者がパーキンソン病を発病する高められたリスクにあることを示す、インビトロ法。
【請求項２】
ステージI〜IIのアルツハイマー病の被験者におけるメチル化パターンに対する、D−ループ領域における少なくとも1つの前記CpGサイトにおけるハイポメチル化、またはD−ループ領域における前記CHGサイトの少なくとも1つにおけるハイポメチル化は、前記被験者がステージIII〜IVのアルツハイマー病に罹患していることを示す、請求項1に記載の方法。
【請求項３】
被験者におけるアルツハイマー病またはパーキンソン病から選択された神経変性疾患の進行を予防するための治療の施行のための被験者を選択するためのインビトロ法であって、
ミトコンドリアDNAを含む前記被験者からのサンプルにおいてD−ループ領域におけるおよび／またはND1遺伝子におけるメチル化パターンを決定することを備え、前記メチル化パターンは、
i．表1において示されたD−ループ領域におけるCpGサイト、
ii．表2において示されたND1遺伝子におけるCpGサイト、
iii．表3において示されたD−ループ領域におけるCHGサイト、
iv．表4において示されたND1遺伝子におけるCHGサイト、および／または
v．表5において示されたD−ループ領域におけるCHHサイト
によって形成されたグループから選択された少なくとも1つのサイトにおいて決定され、
D−ループ領域における前記CpGサイトの少なくとも1つにおけるハイパーメチル化、D−ループ領域における前記CHGサイトの少なくとも1つにおけるハイパーメチル化、D−ループ領域における前記CHHサイトの少なくとも1つにおけるハイパーメチル化、ND1遺伝子における前記CpGサイトの少なくとも1つにおけるハイポメチル化、および／またはND1遺伝子における前記CHGサイトの少なくとも1つにおけるハイポメチル化は、前記被験者がアルツハイマー病を予防することを目的とした治療を受ける候補であることを示し、または、
D−ループ領域における前記CpGサイトの少なくとも1つにおけるハイポメチル化、D−ループ領域における前記CHGサイトの少なくとも1つにおけるハイポメチル化、および／またはD−ループ領域における前記CHHサイトの少なくとも1つにおけるハイポメチル化は、前記被験者がパーキンソン病を予防することを目的とした治療を受ける候補であることを示す、インビトロ法。
【請求項４】
被験者におけるアルツハイマー病またはパーキンソン病から選択された神経変性疾患の進行を監視するための方法であって、
a）ミトコンドリアDNAを備える前記被験者からのサンプルにおいて、D−ループ領域におけるおよび／またはND1遺伝子におけるメチル化パターンを決定するステップであって、前記メチル化パターンは、
（i）表1において示されたD−ループ領域におけるCpGサイト、
（ii）表2において示されたND1遺伝子におけるCpGサイト、
（iii）表3において示されたD−ループ領域におけるCHGサイト、
（vi）表4において示されたND1遺伝子におけるCHGサイト、および／または表5において示されたD−ループ領域におけるCHHサイト
によって形成されたグループからの少なくとも1つのサイトにおいて決定されるステップと、
b）ステップa）において決定された前記メチル化パターンを前記疾患のより早いステージにおいて得られた前記メチル化パターンと比較するステップと
を備え、前記疾患のより早いステージで決定された前記メチル化パターンに対する、D−ループ領域における前記CpGサイトの少なくとも1つにおけるハイポメチル化、D−ループ領域の前記CHGサイトの少なくとも1つにおけるハイポメチル化、D−ループ領域における前記CHHサイトの少なくとも1つにおけるハイポメチル化、ND1遺伝子の前記CpGサイトの少なくとも1つにおけるハイポメチル化、および／またはND1遺伝子における前記CHGサイトの少なくとも1つにおけるハイポメチル化は、アルツハイマー病の進行を示し、および、
疾患のより早いステージにおける前記決定されたメチル化パターンに対する、D−ループ領域における前記CpGサイトの少なくとも1つにおけるハイポメチル化、D−ループ領域における前記CHGサイトの少なくとも1つにおけるハイポメチル化、および／またはD−ループ領域における前記CHHサイトの少なくとも1つにおけるハイポメチル化は、パーキンソン病の進行を示す、方法。
【請求項５】
前記被験者は、ADのステージI〜IIと診断されている、または、前記被験者は、ステージIII〜VのPDと診断されている、請求項4に記載の方法。
【請求項６】
前記メチル化パターンを決定することは、表1において示されたD−ループ領域におけるCpGサイトのメチル化を決定することを備える、請求項1から5に記載の方法。
【請求項７】
前記メチル化パターンを決定することは、表2において示されたND1遺伝子のすべてのCpGサイトにおけるメチル化を決定することを備える、請求項1から6に記載の方法。
【請求項８】
前記メチル化パターンの前記決定は、表3において示されたD−ループ領域におけるすべてのCHGサイトのメチル化を決定することを備える、請求項1から7に記載の方法。
【請求項９】
前記メチル化パターンの前記決定は、表4において示されたND1遺伝子におけるすべてのCHGサイトのメチル化パターンを決定することを備える、請求項1から8のいずれかに記載の方法。
【請求項１０】
前記メチル化パターンを決定することは、表5において示されたD−ループ領域におけるすべてのCHHサイトのメチル化を決定することを備える、請求項1から9に記載の方法。
【請求項１１】
前記メチル化パターンは、メチル化特異的PCR、バイサルファイトシークエンシング、制限消化に基づいた技法、パイロシークエンシング、アッセイChIP-on-chip、メチル化されたサイト（単数または複数）の差別的変換、差別的制限、および差別的重みからなるグループから選択された技法によって決定される、請求項1から10のいずれかに記載の方法。
【請求項１２】
前記メチル化パターンは、パイロシークエンシングによって決定される、請求項11に記載の方法。
【請求項１３】
被験者からのミトコンドリアDNAを含むサンプルにおいて、NCBIデータベースにおいてアクセッション番号NC_012920の下で定義された配列に係る多型位置16519でのヌクレオチドを決定することを備える、前記被験者におけるアルツハイマー病を発病するリスクを診断または決定するためのインビトロ法であって、前記被験者のミトコンドリアDNA分子の少なくとも60%における、前記多型位置におけるヌクレオチドCの検出または前記多型位置でのヌクレオチドCの存在は、前記被験者が前記疾患を有すること、または、前記被験者が前記疾患を発病する高められたリスクにあることを示す、インビトロ法。
【請求項１４】
前記被験者は、アルツハイマー病の早いステージと診断される、請求項13に記載の方法。
【請求項１５】
アルツハイマー病のための予防的治療の施行のための被験者を選択するためのインビトロ法であって、前記被験者からのミトコンドリアDNAサンプルにおいて、NCBIデータベースにおいてアクセッション番号NC_012920の下で定義された配列に係る多型位置16519におけるヌクレオチドを決定することを備え、前記被験者からのミトコンドリアDNA分子の少なくとも60%における、前記多型位置におけるヌクレオチドCの検出または前記多型位置におけるヌクレオチドCの存在は、前記被験者がアルツハイマー病を予防することを目的とした治療を受けるのに適格であることを示す、インビトロ法。
【請求項１６】
NCBIデータベースにおいてアクセッション番号NC_012920を有する配列に係る多型位置16519におけるヌクレオチドの検出は、PCR-RFLPによって行われる、請求項13から15に記載の方法。
【請求項１７】
ミトコンドリアDNAを備える前記サンプルは、生物流体、または固体組織のバイオプシーから選択される、請求項1から16のいずれかに記載の方法。
【請求項１８】
前記生物流体は、末梢血または脳脊髄液から選択される、請求項17に記載の方法。
【請求項１９】
前記固体組織は、脳組織である、請求項18に記載の方法。
【請求項２０】
核酸であって、前記核酸は、
（i）ミトコンドリアDNA領域の少なくとも9つの連続するヌクレオチドを備える核酸であって、前記領域は、
a）表1において示されたD−ループ領域におけるCpGサイト、
b）表2において示されたND1遺伝子におけるCpGサイト、
c）表3において示されたD−ループ領域のCHGサイト、
d）表4において示されたND1遺伝子におけるCHGサイト、および
e）表5において示されたD−ループ領域におけるCHHサイト
からなるグループから選択された少なくとも1つのメチル化サイトを備える、核酸と、
（ii）ミトコンドリアDNAの領域の少なくとも9つの連続するヌクレオチドを備える核酸であって、前記領域は、
a）表1において示されたD−ループ領域におけるCpGサイト、
b）表2において示されたND1遺伝子におけるCpGサイト、
c）表3において示されたD−ループ領域におけるCHGサイト、
d）表4において示されたND1遺伝子におけるCHGサイト、
e）表において示されたD−ループ領域のCHHサイト
からなるグループから選択された少なくとも1つのメチル化サイトを備え、前記CpG、CHG、またはCHHサイトにおけるシトシンに対応する位置は、ウラシルである、核酸と、
（i）または（ii）の核酸と特異的にハイブリダイズするポリヌクレオチドと
からなるグループから選択される、核酸。
【請求項２１】
キットであって、
（i）表1において示されたD−ループ領域におけるCpGサイト、
（ii）表2において示されたND1遺伝子におけるCpGサイト、
（iii）表3において示されたD−ループ領域におけるCHGサイト、
（iv）表4において示されたND1遺伝子におけるCHGサイト、および／または
（v）表5において示されたD−ループ領域におけるCHHサイト
によって形成されたグループから選択されたメチル化サイトを備えるミトコンドリアDNA配列とメチル化に依存した手法で特異的にハイブリダイズすることができる少なくとも1つのオリゴヌクレオチドを備えるキット。
【請求項２２】
キットであって、
（i）表1において示されたD−ループ領域におけるCpGサイト、
（ii）表2において示されたND1遺伝子におけるCpGサイト、
（iii）表3において示されたD−ループ領域におけるCHGサイト、
（iv）表4において示されたND1遺伝子におけるCHGサイト、および／または
（v）表5において示されたD−ループ領域におけるCHHサイト
からなるグループから選択されたミトコンドリアDNAにおけるメチル化サイトに対し、領域の5’または3’の位置と特異的にハイブリダイズすることができる、少なくとも1つのオリゴヌクレオチドを備え、
前記位置におけるメチル化されたシトシンは、ウラシル、または、そのハイブリダイゼーション特性においてシトシンとは区別可能な別の塩基に変換されている、キット。
【請求項２３】
前記少なくとも1つのオリゴヌクレオチドは、SEQ ID NO: 2、SEQ ID NO: 3、SEQ ID NO: 4、および／またはSEQ ID NO: 5から選択された配列を備える、請求項22に記載のキット。
【請求項２４】
アルツハイマー病およびパーキンソン病から選択された被験者における神経変性疾患の診断を決定するためにミトコンドリアDNAのメチル化パターンを決定するための、請求項21から23に記載のキットの使用。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０００６
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０００６】
第1の態様において、発明は、被験者におけるアルツハイマー病およびパーキンソン病から選択された神経変性疾患の発病のリスクを診断または決定するためのインビトロ法に関し、前記被験者は、ミトコンドリアDNAを含む前記被験者からのサンプルにおいて、D−ループ領域におけるおよび／またはND1遺伝子におけるメチル化パターンを含み、前記メチル化パターンは、
i．表1において示されたD−ループ領域におけるCpGサイト、
ii．表2において示されたND1遺伝子におけるCpGサイト、
iii．表3において示されたD−ループ領域におけるCHGサイト、
iv．表4において示されたND1遺伝子におけるCHGサイト、および／または
v．表5において示されたD−ループ領域におけるCHHサイト
によって形成されたグループから選択された少なくとも1つのサイトにおいて決定され、  
D−ループ領域における前記CpGサイトの少なくとも1つにおけるハイパーメチル化、D−ループ領域における前記CHGサイトの少なくとも1つにおけるハイパーメチル化、D−ループ領域における前記CHHサイトの少なくとも1つにおけるハイパーメチル化、ND1遺伝子における前記CpGサイトの少なくとも1つにおけるハイポメチル化、および／またはND1遺伝子における前記CHGサイトの少なくとも1つにおけるハイポメチル化、それは、前記被験者がアルツハイマー病に罹患していること、または前記被験者がアルツハイマー病を発病する高められたリスクを有することを示し、または、  
D−ループ領域における前記CpGサイトの少なくとも1つにおけるハイポメチル化、D−ループ領域における前記CHGサイトの少なくとも1つにおけるハイポメチル化、および／またはD−ループ領域における前記CHHサイトの少なくとも1つにおけるハイポメチル化、それは、前記被験者がパーキンソン病に罹患していること、または前記被験者がパーキンソン病を発病する高められたリスクを有することを示す。
【手続補正３】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０００７
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０００７】
第2の態様において、発明は、被験者におけるアルツハイマー病およびパーキンソン病から選択された神経変性疾患の予防的治療の施行のための被験者を選択するためのインビトロ法に関し、前記被験者は、ミトコンドリアDNAを含む前記被験者からのサンプルにおいて、D−ループ領域におけるおよび／またはND1遺伝子におけるメチル化パターンを含み、前記メチル化パターンは、
i．表1において示されたD−ループ領域におけるCpGサイト、    
ii．表2において示されたND1遺伝子におけるCpGサイト、
iii．表3において示されたD−ループ領域におけるCHGサイト、  
iv．表4において示されたND1遺伝子におけるCHGサイト、および／または  
v．表5において示されたD−ループ領域におけるCHHサイト  
によって形成されたグループから選択された少なくとも1つのサイトにおいて決定され、  
D−ループ領域における前記CpGサイトの少なくとも1つにおけるハイパーメチル化、D−ループ領域における前記CHGサイトの少なくとも1つにおけるハイパーメチル化、D−ループ領域における前記CHHサイトの少なくとも1つにおけるハイパーメチル化、ND1遺伝子における前記CpGサイトの少なくとも1つにおけるハイポメチル化、および／またはND1遺伝子における前記CHGサイトの少なくとも1つにおけるハイポメチル化は、前記被験者がアルツハイマー病を予防することを目的とした治療を受けるのに適格であることを示し、または、  
D−ループ領域における前記CpGサイトの少なくとも1つにおけるハイポメチル化、D−ループ領域の前記CHGサイトの少なくとも1つにおけるハイポメチル化、および／またはD−ループ領域における前記CHHサイトの少なくとも1つにおけるハイポメチル化は、前記被験者がパーキンソン病を予防することを目的とした治療を受けるのに適格であることを示す。
【手続補正４】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０００８
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０００８】
第3の態様において、発明は、被験者におけるアルツハイマー病またはパーキンソン病から選択された神経変性疾患の進行を監視するためのインビトロ法に関し、
a）ミトコンドリアDNAを含む前記被験者からのサンプルにおいて、D−ループ領域におけるおよび／またはND1遺伝子におけるメチル化パターンを決定するステップであって、前記メチル化パターンは、  
i．表1において示されたD−ループ領域におけるCpGサイト、  
ii．表2において示されたND1遺伝子におけるCpGサイト、  
iii．表3において示されたD−ループ領域におけるCHGサイト、  
iv．表4において示されたND1遺伝子におけるCHGサイト、および／または
v．表5において示されたD−ループ領域におけるCHHサイト  
によって形成されたグループから選択された少なくとも1つのサイトにおいて決定されるステップと、  
b）ステップa）において決定されたメチル化パターンを前記疾患のより早いステージにおいて得られた前記メチル化パターンと比較するステップと 
を備え、疾患のより早いステージにおいて決定された前記メチル化パターンに対する、D−ループ領域における前記CpGサイトの少なくとも1つにおけるハイポメチル化、D−ループ領域における前記CHGサイトの少なくとも1つにおけるハイポメチル化、D−ループ領域における前記CHHサイトの少なくとも1つにおけるハイポメチル化、ND1遺伝子における前記CpGサイトの少なくとも1つにおけるハイポメチル化、および／またはND1遺伝子における前記CHGサイトの少なくとも1つにおけるハイポメチル化は、アルツハイマー病の発達を示し、および、  
疾患のより早いステージでの前記決定されたメチル化パターンに対する、D−ループ領域における前記CpGサイトの少なくとも1つにおけるハイポメチル化、D−ループ領域における前記CHGサイトの少なくとも1つにおけるハイポメチル化、および／またはD−ループ領域における前記CHHサイトの少なくとも1つにおけるハイポメチル化は、パーキンソン病の発達を示す。
【手続補正５】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０００９
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０００９】
第4の態様において、発明は、被験者におけるアルツハイマー病の発病のリスクを診断または決定するためのインビトロ法に関し、前記被験者は、前記被験者からのミトコンドリアDNAを備えるサンプルにおいて、NCBIデータベースにおいてアクセッション番号NC_012920の下で定義された配列に係る多型位置16519でヌクレオチドを含み、前記被験者のミトコンドリアDNAの分子の少なくとも60%における、前記多型位置でのヌクレオチドCの検出または前記多型位置でのヌクレオチドCの存在は、前記被験者が前記疾患に罹患していること、または、前記被験者が前記疾患を発病する高められたリスクを有することを示す。
【手続補正６】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００１０
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００１０】
第5の態様において、発明は、アルツハイマー病のための予防的治療を施行される被験者を選択するためのインビトロ法に関し、この方法は、前記被験者からのミトコンドリアDNAを含むサンプルにおいて、NCBIデータベースにおいてアクセッション番号NC_012920の下で定義された配列に係る多型位置16519でのヌクレオチドを決定することを含み、前記被験者からのミトコンドリアDNA分子の少なくとも60%における、前記多型位置でのヌクレオチドCの検出または前記多型位置でのヌクレオチドCの存在は、前記被験者がアルツハイマー病を予防することを目的とした治療を受けるのに適格であることを示す。
【手続補正７】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００１１
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００１１】
第6の態様において、発明は核酸に関し、この核酸は、
（i）ミトコンドリアDNAの領域における少なくとも9つの連続するヌクレオチドを備える核酸であって、前記領域は、  
a）表1において示されたD−ループ領域におけるCpGサイト、  
b）表2において示されたND1遺伝子におけるCpGサイト、  
c）表3において示されたD−ループ領域におけるCHGサイト、  
d）表4において示されたND1遺伝子におけるCHGサイト、および  
e）表5において示されたD−ループ領域におけるCHHサイト  
によって形成されたグループから選択された少なくとも1つのメチル化サイトを備える、核酸と、  
（ii）ミトコンドリアDNA領域の領域における少なくとも9つの連続するヌクレオチドを備える核酸であって、前記領域は、  
a）表1において示されたD−ループ領域におけるCpGサイト、  
b）表2において示されたND1遺伝子におけるCpGサイト、  
c）表3において示されたD−ループ領域におけるCHGサイト、  
d）表4において示されたND1遺伝子におけるCHGサイト、および  
e）表5において示されたD−ループ領域におけるCHHサイト  
によって形成されたグループから選択された少なくとも1つのメチル化サイトを備え、前記CpG、CHG、またはCHHサイトにおけるシトシンに対応する位置は、ウラシルである、核酸と、  
（iii）（i）または（ii）の核酸と特異的にハイブリダイズするポリヌクレオチドと  
によって形成されたグループから選択される。
【手続補正８】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００１２
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００１２】
第7の態様において、発明はキットに関し、このキットは、  
i．表1において示されたD−ループ領域におけるCpGサイト、  
ii．表2において示されたND1遺伝子におけるCpGサイト、  
iii．表3において示されたD−ループ領域におけるCHGサイト、  
iv．表4において示されたND1遺伝子におけるCHGサイト、および／または  
v．表5において示されたD−ループ領域におけるCHHサイト  
によって形成されたグループから選択されたメチル化サイトを備えるミトコンドリアDNA配列とメチル化に依存した手法で特異的にハイブリダイズすることができる少なくとも1つのオリゴヌクレオチドを備える。
【手続補正９】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００１３
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００１３】
第8の態様において、発明はキットに関し、このキットは、  
（i）表1において示されたD−ループ領域におけるCpGサイト、  
（ii）表2において示されたND1遺伝子におけるCpGサイト、  
（iii）表3において示されたD−ループ領域におけるCHGサイト、  
（iv）表4において示されたND1遺伝子におけるCHGサイト、および／または  
（v）表5において示されたD−ループ領域におけるCHHサイト  
によって形成されたグループからの選択されたミトコンドリアDNAにおけるメチル化サイトに対し、位置5’でまたは位置3’で特異的にハイブリダイズすることができる、少なくとも1つのオリゴヌクレオチドを備え、前記位置におけるメチル化されたシトシンは、ウラシル、または、そのハイブリダイゼーション特性においてシトシンとは区別可能な別の塩基に変換されている。
【手続補正１０】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００１４
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００１４】
最後に第9の態様において、発明は、ミトコンドリアDNAのメチル化パターンを決定するための、および、アルツハイマー病およびパーキンソン病から選択された被験者における神経変性疾患の診断を決定するための、第7および第8の発明の態様において定義されたキットの使用に言及する。
【手続補正１１】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００７５
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００７５】
特定の実施形態において、参照パターンに対するメチル化パターンが、アルツハイマー病のステージI〜IIであると診断された被験者からのミトコンドリアDNAを含むサンプルにおいて観察された場合には、表1において示されたD−ループ領域におけるCpGサイトの少なくとも1つにおけるハイポメチル化、または表3において示されたD−ループ領域における前記CHGサイトの1つにおけるハイポメチル化は、被験者がアルツハイマー病のステージIII〜IVに罹患していることを示す。
発明の第2の方法
第2の態様において、発明は、被験者におけるアルツハイマー病およびパーキンソン病から選択された神経変性疾患の予防的治療を施行される被験者を選択するためのインビトロ法（以下、発明の第2の方法）に関し、この方法は、ミトコンドリアDNAを含む前記被験者のサンプルにおいてD−ループ領域におけるおよび／またはND1遺伝子におけるメチル化パターンを決定することを含み、前記メチル化パターンは、  
i．表1において示されたD−ループ領域におけるCpGサイト、  
ii．表2において示されたND1遺伝子におけるCpGサイト、  
iii．表3において示されたD−ループ領域におけるCHGサイト、  
iv．表4において示されたND1遺伝子におけるCHGサイト、および／または  
v．表5において示されたD−ループ領域におけるCHHサイト  
によって形成されたグループから選択された少なくとも1つのサイトにおいて決定され、  
D−ループ領域における前記CpGサイトの少なくとも1つにおけるハイパーメチル化、D−ループ領域における前記CHGサイトの少なくとも1つにおけるハイパーメチル化、D−ループ領域における前記CHHサイトの少なくとも1つにおけるハイパーメチル化、ND1遺伝子における前記CpGサイトの少なくとも1つにおけるハイポメチル化、および／またはND1遺伝子における前記CHGサイトの少なくとも1つにおけるハイポメチル化は、前記被験者がアルツハイマー病を予防することを目的とした治療を受ける候補であることを示し、または、  
D−ループ領域における前記CpGサイトの少なくとも1つにおけるハイポメチル化、D−ループ領域における前記CHGサイトの少なくとも1つにおけるハイポメチル化、および／またはD−ループ領域における前記CHHサイトの少なくとも1つにおけるハイポメチル化、それは、前記被験者がパーキンソン病を予防することを目的とした治療を受ける候補であることを示す。