【手続補正書】
【提出日】平成29年12月25日(2017.12.25)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
ＭＤＭ２ｉ治療に対する対象のがんまたは腫瘍の感受性を予測する方法であって、対象から得られたがんまたは腫瘍試料中の図１Ａ〜１Ｅに列挙された遺伝子から選択される少なくとも３つの遺伝子の発現のレベルを測定することを含む方法。
【請求項２】
ＭＤＭ２ｉ治療に対する対象のがんまたは腫瘍の感受性を予測する方法であって、
ａ）対象から得られたがんまたは腫瘍試料中の図１Ａ〜１Ｅに列挙された遺伝子から選択される少なくとも３つの遺伝子の発現のレベルを測定すること；および
ｂ）がんまたは腫瘍試料が野生型ＴＰ５３遺伝子を有するかどうかを決定すること
を含む方法。
【請求項３】
図１Ａ〜１Ｅに列挙された遺伝子から選択される遺伝子が、図１Ａ〜１Ｅに列挙された遺伝子の全てである、請求項１または２に記載の方法。
【請求項４】
図１Ａ〜１Ｅに列挙された遺伝子から選択される遺伝子が、ＢＡＸ、Ｃ１ＱＢＰ、ＦＤＸＲ、ＧＡＭＴ、ＲＰＳ２７Ｌ、ＳＬＣ２５Ａ１１、ＴＰ５３、ＴＲＩＡＰ１、ＺＭＡＴ３、ＡＥＮ、Ｃ１２ｏｒｆ５、ＧＲＳＦ１、ＥＩＦ２Ｄ、ＭＰＤＵ１、ＳＴＸ８、ＴＳＦＭ、ＤＩＳＣ１、ＳＰＣＳ１、ＰＲＰＦ８、ＲＣＢＴＢ１、ＳＰＡＧ７、ＴＩＭＭ２２、ＴＮＦＲＳＦ１０Ｂ、ＡＣＡＤＳＢ、ＤＤＢ２、ＦＡＳ、ＧＤＦ１５、ＧＲＥＢ１、ＰＤＥ１２、ＰＯＬＨ、Ｃ１９ｏｒｆ６０、ＨＨＡＴ、ＩＳＣＵ、ＭＤＭ２、ＭＥＤ３１、ＭＥＴＲＮ、ＰＨＬＤＡ３、ＣＤＫＮ１Ａ、ＳＥＳＮ１およびＸＰＣである、請求項１または２に記載の方法。
【請求項５】
図１Ａ〜１Ｅに列挙された遺伝子から選択される遺伝子が、ＲＰＳ２７Ｌ、ＦＤＸＲ、ＣＤＫＮ１ＡおよびＡＥＮである、請求項１または２に記載の方法。
【請求項６】
遺伝子の発現のレベルを測定することがｍＲＮＡの発現のレベルを測定することを含む、請求項１〜４のいずれか一項に記載の方法。
【請求項７】
遺伝子の発現のレベルを測定することが遺伝子によってコードされるタンパク質の発現のレベルを測定することを含む、請求項１〜４のいずれか一項に記載の方法。
【請求項８】
ＭＤＭ２ｉが、スピロオキシインドール誘導体、インドール誘導体、ピロリジン−２−カルボキサミド誘導体、ピロリジノン誘導体、イソインドリノン誘導体、またはイミダゾチアゾール誘導体である、請求項１〜７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項９】
ＭＤＭ２ｉが、化合物Ａもしくはその塩、化合物Ｂもしくはその塩、ＣＧＭ０９７、ＲＧ７３８８、ＭＫ−８２４２（ＳＣＨ９００２４２）、ＭＩ−２１９、ＭＩ−３１９、ＭＩ−７７３、ＭＩ−８８８、Ｎｕｔｌｉｎ−３ａ、ＲＧ７１１２（ＲＯ５０４５３３７）、ＴＤＰ５２１２５２、ＴＤＰ６６５７５９、ＰＸＮ７２７、またはＰＸＮ８２２である、請求項１〜７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１０】
ＭＤＭ２ｉが、化合物Ａもしくはその塩、または化合物Ｂもしくはその塩である、請求項１〜７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１１】
図１Ａ〜１Ｅに列挙された遺伝子から選択される少なくとも３つの遺伝子からなる、ＭＤＭ２ｉ治療に対する対象のがんまたは腫瘍の感受性を予測するための遺伝子シグネチャー。
【請求項１２】
図１Ａ〜１Ｅに列挙された遺伝子から選択される遺伝子が、ＢＡＸ、Ｃ１ＱＢＰ、ＦＤＸＲ、ＧＡＭＴ、ＲＰＳ２７Ｌ、ＳＬＣ２５Ａ１１、ＴＰ５３、ＴＲＩＡＰ１、ＺＭＡＴ３、ＡＥＮ、Ｃ１２ｏｒｆ５、ＧＲＳＦ１、ＥＩＦ２Ｄ、ＭＰＤＵ１、ＳＴＸ８、ＴＳＦＭ、ＤＩＳＣ１、ＳＰＣＳ１、ＰＲＰＦ８、ＲＣＢＴＢ１、ＳＰＡＧ７、ＴＩＭＭ２２、ＴＮＦＲＳＦ１０Ｂ、ＡＣＡＤＳＢ、ＤＤＢ２、ＦＡＳ、ＧＤＦ１５、ＧＲＥＢ１、ＰＤＥ１２、ＰＯＬＨ、Ｃ１９ｏｒｆ６０、ＨＨＡＴ、ＩＳＣＵ、ＭＤＭ２、ＭＥＤ３１、ＭＥＴＲＮ、ＰＨＬＤＡ３、ＣＤＫＮ１Ａ、ＳＥＳＮ１およびＸＰＣである、請求項１１に記載の遺伝子シグネチャー。
【請求項１３】
図１Ａ〜１Ｅに列挙された遺伝子から選択される遺伝子が、ＲＰＳ２７Ｌ、ＦＤＸＲ、ＣＤＫＮ１ＡおよびＡＥＮである、請求項１１に記載の遺伝子シグネチャー。
【請求項１４】
ＭＤＭ２ｉが、スピロオキシインドール誘導体、インドール誘導体、ピロリジン−２−カルボキサミド誘導体、ピロリジノン誘導体、イソインドリノン誘導体、またはイミダゾチアゾール誘導体である、請求項１１〜１３のいずれか一項に記載の遺伝子シグネチャー。
【請求項１５】
ＭＤＭ２ｉが、化合物Ａもしくはその塩、化合物Ｂもしくはその塩、ＣＧＭ０９７、ＲＧ７３８８、ＭＫ−８２４２（ＳＣＨ９００２４２）、ＭＩ−２１９、ＭＩ−３１９、ＭＩ−７７３、ＭＩ−８８８、Ｎｕｔｌｉｎ−３ａ、ＲＧ７１１２（ＲＯ５０４５３３７）、ＴＤＰ５２１２５２、ＴＤＰ６６５７５９、ＰＸＮ７２７、またはＰＸＮ８２２である、請求項１１〜１３のいずれか一項に記載の遺伝子シグネチャー。
【請求項１６】
図１Ａ〜１Ｅに列挙された少なくとも３つの遺伝子を検出するための複数の核酸プローブを含む組成物。
【請求項１７】
図１Ａ〜１Ｅに列挙された少なくとも３つの遺伝子が、図１Ａ〜１Ｅに列挙された遺伝子の全てである、請求項１６に記載の組成物。
【請求項１８】
図１Ａ〜１Ｅに列挙された少なくとも３つの遺伝子が、ＢＡＸ、Ｃ１ＱＢＰ、ＦＤＸＲ、ＧＡＭＴ、ＲＰＳ２７Ｌ、ＳＬＣ２５Ａ１１、ＴＰ５３、ＴＲＩＡＰ１、ＺＭＡＴ３、ＡＥＮ、Ｃ１２ｏｒｆ５、ＧＲＳＦ１、ＥＩＦ２Ｄ、ＭＰＤＵ１、ＳＴＸ８、ＴＳＦＭ、ＤＩＳＣ１、ＳＰＣＳ１、ＰＲＰＦ８、ＲＣＢＴＢ１、ＳＰＡＧ７、ＴＩＭＭ２２、ＴＮＦＲＳＦ１０Ｂ、ＡＣＡＤＳＢ、ＤＤＢ２、ＦＡＳ、ＧＤＦ１５、ＧＲＥＢ１、ＰＤＥ１２、ＰＯＬＨ、Ｃ１９ｏｒｆ６０、ＨＨＡＴ、ＩＳＣＵ、ＭＤＭ２、ＭＥＤ３１、ＭＥＴＲＮ、ＰＨＬＤＡ３、ＣＤＫＮ１Ａ、ＳＥＳＮ１およびＸＰＣである、請求項１６に記載の組成物。
【請求項１９】
図１Ａ〜１Ｅに列挙された少なくとも３つの遺伝子が、ＲＰＳ２７Ｌ、ＦＤＸＲ、ＣＤＫＮ１ＡおよびＡＥＮである、請求項１６に記載の組成物。
【請求項２０】
複数の核酸プローブがアレイまたはマイクロアレイを含む、請求項１６〜１８のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項２１】
ＭＤＭ２ｉに対する感受性を示す図１Ａ〜１Ｅに列挙された少なくとも３つの遺伝子の検出のための試薬および使用説明書を含むキット。
【請求項２２】
ＭＤＭ２ｉに対するがんまたは腫瘍試料の感受性を予測するためのキットであって、図１Ａ〜１Ｅに列挙された少なくとも３つの遺伝子に対応するヌクレオチド配列に特異的に結合する核酸プローブ、および核酸を標識する手段を含むキット。
【請求項２３】
ＭＤＭ２ｉに対するがんまたは腫瘍試料の感受性を予測するためのキットであって、図１Ａ〜１Ｅに列挙された少なくとも３つの遺伝子によってコードされるポリペプチドに特異的に結合する抗体またはリガンド、および遺伝子によってコードされるポリペプチドまたはペプチドに特異的に結合する抗体またはリガンドを標識する手段を含むキット。
【請求項２４】
図１Ａ〜１Ｅに列挙された少なくとも３つの遺伝子が、図１Ａ〜１Ｅに列挙された遺伝子の全てである、請求項２１〜２３のいずれか一項に記載のキット。
【請求項２５】
図１Ａ〜１Ｅに列挙された少なくとも３つの遺伝子が、ＢＡＸ、Ｃ１ＱＢＰ、ＦＤＸＲ、ＧＡＭＴ、ＲＰＳ２７Ｌ、ＳＬＣ２５Ａ１１、ＴＰ５３、ＴＲＩＡＰ１、ＺＭＡＴ３、ＡＥＮ、Ｃ１２ｏｒｆ５、ＧＲＳＦ１、ＥＩＦ２Ｄ、ＭＰＤＵ１、ＳＴＸ８、ＴＳＦＭ、ＤＩＳＣ１、ＳＰＣＳ１、ＰＲＰＦ８、ＲＣＢＴＢ１、ＳＰＡＧ７、ＴＩＭＭ２２、ＴＮＦＲＳＦ１０Ｂ、ＡＣＡＤＳＢ、ＤＤＢ２、ＦＡＳ、ＧＤＦ１５、ＧＲＥＢ１、ＰＤＥ１２、ＰＯＬＨ、Ｃ１９ｏｒｆ６０、ＨＨＡＴ、ＩＳＣＵ、ＭＤＭ２、ＭＥＤ３１、ＭＥＴＲＮ、ＰＨＬＤＡ３、ＣＤＫＮ１Ａ、ＳＥＳＮ１およびＸＰＣである、請求項２１〜２３のいずれか一項に記載のキット。
【請求項２６】
図１Ａ〜１Ｅに列挙された少なくとも３つの遺伝子が、ＲＰＳ２７Ｌ、ＦＤＸＲ、ＣＤＫＮ１ＡおよびＡＥＮである、請求項２１〜２３のいずれか一項に記載のキット。
【請求項２７】
ＭＤＭ２ｉが、スピロオキシインドール誘導体、インドール誘導体、ピロリジン−２−カルボキサミド誘導体、ピロリジノン誘導体、イソインドリノン誘導体、またはイミダゾチアゾール誘導体である、請求項２１〜２６のいずれか一項に記載のキット。
【請求項２８】
ＭＤＭ２ｉが、化合物Ａもしくはその塩、化合物Ｂもしくはその塩、ＣＧＭ０９７、ＲＧ７３８８、ＭＫ−８２４２（ＳＣＨ９００２４２）、ＭＩ−２１９、ＭＩ−３１９、ＭＩ−７７３、ＭＩ−８８８、Ｎｕｔｌｉｎ−３ａ、ＲＧ７１１２（ＲＯ５０４５３３７）、ＴＤＰ５２１２５２、ＴＤＰ６６５７５９、ＰＸＮ７２７、またはＰＸＮ８２２である、請求項２１〜２６のいずれか一項に記載のキット。
【請求項２９】
ＭＤＭ２ｉが、化合物Ａもしくはその塩または化合物Ｂもしくはその塩である、請求項２１〜２６のいずれか一項に記載のキット。