【手続補正書】
【提出日】平成30年6月14日(2018.6.14)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
ＢＡＰ１バイオマーカーの発現を、ＥＺＨ２阻害剤により、がんにおいて、抗がん効果が生じる可能性があるのかどうかの指標とする方法であって、該方法は、該がんの１または複数の細胞における該ＢＡＰ１バイオマーカーの発現を決定するステップを含み、該ＢＡＰ１バイオマーカーが、該がんにおいて非存在であるか、または基準対照レベルと比較して低レベルで発現する場合、そのことは、抗がん効果を生じさせるための治療有効量のＥＺＨ２阻害剤を投与するべきであることを示す、方法。
【請求項２】
前記がんが、悪性中皮腫、ブドウ膜黒色腫、腎細胞癌、皮膚黒色腫、肺がん、乳がん、卵巣がん、黒色腫でない皮膚がん、髄膜腫、胆管癌、平滑筋肉腫、神経内分泌腫瘍、膵臓がん、傍神経節腫、悪性線維性組織球腫、メラノサイトＢＡＰ１変異非定型皮内腫瘍（ＭＢＡＩＴ）、急性骨髄性白血病、骨髄異形成症候群、および膀胱がんからなる群から選択される、請求項１に記載の方法。
【請求項３】
前記ＢＡＰ１バイオマーカーの発現を、免疫蛍光法により決定する、請求項１に記載の方法。
【請求項４】
前記ＢＡＰ１バイオマーカーの発現を、ウェスタンブロットにより決定する、請求項１に記載の方法。
【請求項５】
前記ＢＡＰ１バイオマーカーの発現を、ｉｎ  ｓｉｔｕハイブリダイゼーションにより決定する、請求項１に記載の方法。
【請求項６】
前記ＢＡＰ１バイオマーカーの発現を、ポリメラーゼ連鎖反応により決定する、請求項１に記載の方法。
【請求項７】
前記ＢＡＰ１バイオマーカーの発現を、該ＢＡＰ１バイオマーカーと特異的に結合する試薬を使用することにより検出する、請求項１に記載の方法。
【請求項８】
前記試薬が、抗体またはその抗原結合性断片である、請求項７に記載の方法。
【請求項９】
前記がんが、悪性中皮腫である、請求項１に記載の方法。
【請求項１０】
前記がんが、ブドウ膜黒色腫である、請求項１に記載の方法。
【請求項１１】
前記がんが、腎細胞癌である、請求項１に記載の方法。
【請求項１２】
前記がんの１または複数の細胞中のＥＺＨ２の発現レベルを決定するステップをさらに含む、請求項１に記載の方法。
【請求項１３】
ＢＡＰ１バイオマーカーの発現レベル、ならびに／またはＥＺＨ２および／もしくはＳＵＺ１２の発現レベルを、がんを有する被験体の処置を開始すべきかどうかについての指標とする方法であって、該方法は、該被験体から得た試料中での該ＢＡＰ１バイオマーカーの発現レベル、ならびに／またはＥＺＨ２および／もしくはＳＵＺ１２の発現レベルを決定するステップを含み、該ＢＡＰ１バイオマーカーが非存在であるか、もしくはＢＡＰ１の基準対照レベルより低レベルで発現し、かつ／またはＥＺＨ２および／もしくはＳＵＺ１２の発現が、ＥＺＨ２の基準対照レベルと比較して増大する場合、そのことは、治療有効量のＥＺＨ２阻害剤による該被験体の処置が開始されるべきであることを示す、方法。
【請求項１４】
前記がんが、悪性中皮腫である、請求項１３に記載の方法。
【請求項１５】
前記がんが、ブドウ膜黒色腫である、請求項１３に記載の方法。
【請求項１６】
前記がんが、腎細胞癌である、請求項１３に記載の方法。
【請求項１７】
前記ＢＡＰ１バイオマーカー、ＳＵＺ１２、およびＥＺＨ２の発現を、免疫蛍光法により決定する、請求項１３に記載の方法。
【請求項１８】
前記ＢＡＰ１バイオマーカー、ＳＵＺ１２、およびＥＺＨ２の発現を、ウェスタンブロットにより決定する、請求項１３に記載の方法。
【請求項１９】
ＢＡＰ１バイオマーカーの発現レベルを、ＥＺＨ２阻害剤により、がんにおいて、抗がん効果が生じる可能性があるのかどうかの指標とする方法であって、該方法は、被験体から得た該がんの試料中での該ＢＡＰ１バイオマーカーの発現レベルを決定するステップを含み、該ＢＡＰ１バイオマーカーが、該がんにおいて非存在であるか、または基準対照レベルと比較して低レベルで発現する場合、そのことは、該ＥＺＨ２阻害剤が、該がんに対して抗がん効果を有する可能性が高いことを示す、方法。
【請求項２０】
前記がんが、悪性中皮腫、ブドウ膜黒色腫、腎細胞癌、皮膚黒色腫、肺がん、乳がん、卵巣がん、黒色腫でない皮膚がん、髄膜腫、胆管癌、平滑筋肉腫、神経内分泌腫瘍、膵臓がん、傍神経節腫、悪性線維性組織球腫、メラノサイトＢＡＰ１変異非定型皮内腫瘍（ＭＢＡＩＴ）、急性骨髄性白血病、骨髄異形成症候群、および膀胱がんからなる群から選択される、請求項１９に記載の方法。
【請求項２１】
前記ＢＡＰ１バイオマーカーが、ＢＡＰ１タンパク質バイオマーカーである、請求項１９に記載の方法。
【請求項２２】
前記ＢＡＰ１バイオマーカーが、ＢＡＰ１核酸バイオマーカーである、請求項１９に記載の方法。
【請求項２３】
前記ＢＡＰ１バイオマーカーの発現を、免疫蛍光法により決定する、請求項１９に記載の方法。
【請求項２４】
前記ＢＡＰ１バイオマーカーの発現を、ウェスタンブロットにより決定する、請求項１９に記載の方法。
【請求項２５】
ＢＡＰ１タンパク質バイオマーカーの発現レベルを、ＥＺＨ２阻害剤に対する、患者におけるがんの感受性の指標とする方法であって、該方法は、該患者から得た該がんの試料を含む細胞における該ＢＡＰ１タンパク質バイオマーカーの発現レベルを決定するステップを含み、該ＢＡＰ１バイオマーカーが非存在であるか、または発現レベルが基準対照レベルと比較して低減されている場合、そのことは、該がんが、ＥＺＨ２阻害剤に対して感受性であることが予測されることを示す、方法。
【請求項２６】
前記がんが、悪性中皮腫、ブドウ膜黒色腫、腎細胞癌、皮膚黒色腫、肺がん、乳がん、卵巣がん、黒色腫でない皮膚がん、髄膜腫、胆管癌、平滑筋肉腫、神経内分泌腫瘍、膵臓がん、傍神経節腫、悪性線維性組織球腫、メラノサイトＢＡＰ１変異非定型皮内腫瘍（ＭＢＡＩＴ）、急性骨髄性白血病、骨髄異形成症候群、および膀胱がんからなる群から選択される、請求項２５に記載の方法。
【請求項２７】
ＥＺＨ２阻害剤により、がんにおいて、抗がん効果が生じる可能性があるのかどうかを決定するためのキットであって、ＢＡＰ１バイオマーカーを検出するための手段を含むキット。
【請求項２８】
ＢＡＰ１バイオマーカーを検出するための前記手段が、１もしくは複数のパッケージングされたプライマー、プローブ、アレイ／マイクロアレイ、バイオマーカー特異的抗体、および／またはビーズを含む、請求項２７に記載のキット。
【請求項２９】
ＢＡＰ１バイオマーカーを検出するための前記手段が、ＢＡＰ１バイオマーカーを検出するための１もしくは複数の抗体、またはその抗原結合性断片を含む、請求項２７に記載のキット。
【請求項３０】
ＥＺＨ２の発現、Ｌ３ＭＢＴＬ２の発現、および／またはＳＵＺ１２の発現を検出するための１もしくは複数のプライマー、プローブ、アレイ／マイクロアレイ、バイオマーカー特異的抗体、および／またはビーズをさらに含む、請求項２７に記載のキット。
【請求項３１】
がんを有する被験体を処置するための組成物であって、該組成物は、ＥＺＨ２阻害剤を含み、該組成物は、該被験体由来の該がんの試料においてＢＡＰ１バイオマーカーが非存在であるか、もしくはＢＡＰ１の基準対照レベルより低レベルで発現し、かつ／または該被験体由来の該がんの試料中のＥＺＨ２および／もしくはＳＵＺ１２の発現が、ＥＺＨ２の基準対照レベルと比較して増大する場合、該被験体に投与されることを特徴とする、組成物。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００１３
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００１３】
本発明は、ＥＺＨ２阻害剤により、がんにおいて、抗がん効果が生じる可能性があるかどうかを決定するためのキットを提供する。ある非限定的な実施形態では、キットは、ＢＡＰ１バイオマーカーを検出するための手段を含む。ある特定の実施形態では、ＢＡＰ１バイオマーカーを検出するための手段は、１もしくは複数のパッケージングされたプライマー、プローブ、アレイ／マイクロアレイ、バイオマーカー特異的抗体、および／またはビーズを含む。ある特定の実施形態では、ＢＡＰ１バイオマーカーを検出するための手段は、ＢＡＰ１バイオマーカーを検出するための１もしくは複数の抗体、またはその抗原結合性断片を含む。ある特定の実施形態では、キットは、ＥＺＨ２および／またはＳＵＺ１２の発現を検出するための１もしくは複数のプライマー、プローブ、アレイ／マイクロアレイ、バイオマーカー特異的抗体、および／またはビーズをさらに含む。
特定の実施形態では、例えば以下が提供される：
（項目１）
ＥＺＨ２阻害剤により、がんにおいて、抗がん効果が生じる可能性があるのかどうかを決定するための方法であって、該がんの１または複数の細胞におけるＢＡＰ１バイオマーカーの発現を決定するステップを含み、該ＢＡＰ１バイオマーカーが、該がんにおいて非存在であるか、または基準対照レベルと比較して低レベルで発現する場合、抗がん効果を生じさせるための治療有効量のＥＺＨ２阻害剤を投与する、方法。
（項目２）
前記がんが、悪性中皮腫、ブドウ膜黒色腫、腎細胞癌、皮膚黒色腫、肺がん、乳がん、卵巣がん、黒色腫でない皮膚がん、髄膜腫、胆管癌、平滑筋肉腫、神経内分泌腫瘍、膵臓がん、傍神経節腫、悪性線維性組織球腫、メラノサイトＢＡＰ１変異非定型皮内腫瘍（ＭＢＡＩＴ）、急性骨髄性白血病、骨髄異形成症候群、および膀胱がんからなる群から選択される、項目１に記載の方法。
（項目３）
前記ＢＡＰ１バイオマーカーの発現を、免疫蛍光法により決定する、項目１に記載の方法。
（項目４）
前記ＢＡＰ１バイオマーカーの発現を、ウェスタンブロットにより決定する、項目１に記載の方法。
（項目５）
前記ＢＡＰ１バイオマーカーの発現を、ｉｎ  ｓｉｔｕハイブリダイゼーションにより決定する、項目１に記載の方法。
（項目６）
前記ＢＡＰ１バイオマーカーの発現を、ポリメラーゼ連鎖反応により決定する、項目１に記載の方法。
（項目７）
前記ＢＡＰ１バイオマーカーの発現を、該ＢＡＰ１バイオマーカーと特異的に結合する試薬を使用することにより検出する、項目１に記載の方法。
（項目８）
前記試薬が、抗体またはその抗原結合性断片である、項目１に記載の方法。
（項目９）
前記がんが、悪性中皮腫である、項目１に記載の方法。
（項目１０）
前記がんが、ブドウ膜黒色腫である、項目１に記載の方法。
（項目１１）
前記がんが、腎細胞癌である、項目１に記載の方法。
（項目１２）
試料中のＥＺＨ２の発現レベルを決定するステップをさらに含む、項目１に記載の方法。
（項目１３）
がんを有する被験体を処置するための方法であって、該被験体から該がんの試料を得るステップと、該試料中において、ＢＡＰ１バイオマーカーの発現レベル、ならびに／またはＥＺＨ２および／もしくはＳＵＺ１２の発現レベルを決定するステップとを含み、該ＢＡＰ１バイオマーカーが非存在であるか、もしくはＢＡＰ１の基準対照レベルより低レベルで発現し、かつ／またはＥＺＨ２および／もしくはＳＵＺ１２の発現が、ＥＺＨ２の基準対照レベルと比較して増大する場合、治療有効量のＥＺＨ２阻害剤による該被験体の処置を開始する、方法。
（項目１４）
前記がんが、悪性中皮腫である、項目１３に記載の方法。
（項目１５）
前記がんが、ブドウ膜黒色腫である、項目１３に記載の方法。
（項目１６）
前記がんが、腎細胞癌である、項目１３に記載の方法。
（項目１７）
前記ＢＡＰ１バイオマーカー、ＳＵＺ１２、およびＥＺＨ２の発現を、免疫蛍光法により決定する、項目１３に記載の方法。
（項目１８）
前記ＢＡＰ１バイオマーカー、ＳＵＺ１２、およびＥＺＨ２の発現を、ウェスタンブロットにより決定する、項目１３に記載の方法。
（項目１９）
ＥＺＨ２阻害剤により、がんにおいて、抗がん効果が生じる可能性があるのかどうかを決定するための方法であって、被験体から該がんの試料を得るステップと、該試料中において、ＢＡＰ１バイオマーカーの発現レベルを決定するステップとを含み、該ＢＡＰ１バイオマーカーが、該がんにおいて非存在であるか、または基準対照レベルと比較して低レベルで発現する場合、該ＥＺＨ２阻害剤は、該がんに対して抗がん効果を有する可能性が高い、方法。
（項目２０）
前記がんが、悪性中皮腫、ブドウ膜黒色腫、腎細胞癌、皮膚黒色腫、肺がん、乳がん、卵巣がん、黒色腫でない皮膚がん、髄膜腫、胆管癌、平滑筋肉腫、神経内分泌腫瘍、膵臓がん、傍神経節腫、悪性線維性組織球腫、メラノサイトＢＡＰ１変異非定型皮内腫瘍（ＭＢＡＩＴ）、急性骨髄性白血病、骨髄異形成症候群、および膀胱がんからなる群から選択される、項目１９に記載の方法。
（項目２１）
前記ＢＡＰ１バイオマーカーが、ＢＡＰ１タンパク質バイオマーカーである、項目１９に記載の方法。
（項目２２）
前記ＢＡＰ１バイオマーカーが、ＢＡＰ１核酸バイオマーカーである、項目１９に記載の方法。
（項目２３）
前記ＢＡＰ１バイオマーカーの発現を、免疫蛍光法により決定する、項目１９に記載の方法。
（項目２４）
前記ＢＡＰ１バイオマーカーの発現を、ウェスタンブロットにより決定する、項目１９に記載の方法。
（項目２５）
ＥＺＨ２阻害剤に対する、患者におけるがんの感受性を予測する方法であって、該患者から該がんの試料を得るステップと、該試料を含む細胞におけるＢＡＰ１タンパク質バイオマーカーの発現レベルを決定するステップとを含み、該ＢＡＰ１バイオマーカーが非存在であるか、または発現レベルが基準対照レベルと比較して低減されている場合、該がんは、ＥＺＨ２阻害剤に対して感受性であることが予測される、方法。
（項目２６）
前記がんが、悪性中皮腫、ブドウ膜黒色腫、腎細胞癌、皮膚黒色腫、肺がん、乳がん、卵巣がん、黒色腫でない皮膚がん、髄膜腫、胆管癌、平滑筋肉腫、神経内分泌腫瘍、膵臓がん、傍神経節腫、悪性線維性組織球腫、メラノサイトＢＡＰ１変異非定型皮内腫瘍（ＭＢＡＩＴ）、急性骨髄性白血病、骨髄異形成症候群、および膀胱がんからなる群から選択される、項目２５に記載の方法。
（項目２７）
ＥＺＨ２阻害剤により、がんにおいて、抗がん効果が生じる可能性があるのかどうかを決定するためのキットであって、ＢＡＰ１バイオマーカーを検出するための手段を含むキット。
（項目２８）
ＢＡＰ１バイオマーカーを検出するための前記手段が、１もしくは複数のパッケージングされたプライマー、プローブ、アレイ／マイクロアレイ、バイオマーカー特異的抗体、および／またはビーズを含む、項目２７に記載のキット。
（項目２９）
ＢＡＰ１バイオマーカーを検出するための前記手段が、ＢＡＰ１バイオマーカーを検出するための１もしくは複数の抗体、またはその抗原結合性断片を含む、項目２７に記載のキット。
（項目３０）
ＥＺＨ２の発現、Ｌ３ＭＢＴＬ２の発現、および／またはＳＵＺ１２の発現を検出するための１もしくは複数のプライマー、プローブ、アレイ／マイクロアレイ、バイオマーカー特異的抗体、および／またはビーズをさらに含む、項目２７に記載のキット。