【誤訳訂正書】
【提出日】平成30年11月6日(2018.11.6)
【誤訳訂正１】
【訂正対象書類名】特許請求の範囲
【訂正対象項目名】全文
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
バイオポリマーの配列を決定するためのデバイスであって、
少なくとも１つの流体ナノチャネルを備える基板と、
前記基板に隣接して配置され、それぞれが少なくとも１つのナノ電極対を備える複数の電極構造であり、各ナノ電極対が、前記少なくとも１つのナノ電極対のナノ電極間のギャップを画定する領域を含み、前記少なくとも１つのナノ電極対が、前記少なくとも１つの流体ナノチャネルと交差する、複数の電極構造と、
前記少なくとも１つのナノ電極対と一体化され、前記少なくとも１つのナノ電極対の前記ナノ電極間の前記ギャップの間隔を調節するアクチュエータと、
を備えるデバイス。
【請求項２】
前記基板がシリコンである、請求項１に記載のデバイス。
【請求項３】
前記アクチュエータが、前記基板に組み込まれた圧電素子である、請求項１に記載のデバイス。
【請求項４】
前記アクチュエータが、前記基板の外にある圧電素子である、請求項１に記載のデバイス。
【請求項５】
前記ギャップが、前記基板の平面に実質的に直交しない角度に向いている、請求項１に記載のデバイス。
【請求項６】
前記アクチュエータが、カンチレバー構造を備える、請求項１に記載のデバイス。
【請求項７】
前記アクチュエータが、複数の固定点を持つブリッジ構造を備える、請求項１に記載のデバイス。
【請求項８】
前記アクチュエータが、前記基板の平面に実質的に平行に移動可能である、請求項１に記載のデバイス。
【請求項９】
前記少なくとも１つのナノ電極対が複数のナノ電極対を含み、前記複数のナノ電極対のナノ電極間のギャップが同じアクチュエータによって調節可能である、請求項１に記載のデバイス。
【請求項１０】
前記アクチュエータが、熱膨張によって駆動される、請求項１に記載のデバイス。
【請求項１１】
前記アクチュエータが、バイメタル撓み素子を備える、請求項１０に記載のデバイス。
【請求項１２】
前記熱膨張が、前記基板に一体化された加熱素子によって推進される、請求項１０に記載のデバイス。
【請求項１３】
前記熱膨張が、前記基板の外にある加熱素子によって推進される、請求項１０に記載のデバイス。
【請求項１４】
バイオポリマー配列決定のためのデバイスであって、
少なくとも１つの流体ナノチャネルを備える基板と、
前記基板上に配置され、それぞれが少なくとも１つのナノ電極対を備える複数の電極構造であり、各ナノ電極対が、前記少なくとも１つのナノ電極対のナノ電極間のギャップを画定する領域を有する、複数の電極構造と、
前記少なくとも１つのナノ電極対と一体化され、前記少なくとも１つのナノ電極対の前記ナノ電極間の前記ギャップの間隔を調節するアクチュエータと、
前記少なくとも１つのナノ電極対の前記ナノ電極と電気通信し、前記ギャップを横断する電流を使用してバイオポリマーの配列を特定するデータ処理装置と、
を備えるデバイス。
【請求項１５】
前記基板がシリコンである、請求項１４に記載のデバイス。
【請求項１６】
前記アクチュエータが、前記基板に組み込まれた圧電素子である、請求項１４に記載のデバイス。
【請求項１７】
前記アクチュエータが、前記基板の外にある圧電素子である、請求項１４に記載のデバイス。
【請求項１８】
前記ギャップが、前記基板の平面に実質的に直交しない角度に向いている、請求項１４に記載のデバイス。
【請求項１９】
前記アクチュエータが、カンチレバー構造を備える、請求項１４に記載のデバイス。
【請求項２０】
前記アクチュエータが、複数の固定点を持つブリッジ構造を備える、請求項１４に記載のデバイス。
【請求項２１】
前記アクチュエータが、前記基板の平面に実質的に平行に移動可能である、請求項１４に記載のデバイス。
【請求項２２】
前記少なくとも１つのナノ電極対が複数のナノ電極対を含み、前記複数のナノ電極対のナノ電極間のギャップが同じアクチュエータによって調節可能である、請求項１４に記載のデバイス。
【請求項２３】
前記アクチュエータが、熱膨張によって駆動される、請求項１４に記載のデバイス。
【請求項２４】
前記アクチュエータが、バイメタル撓み素子を備える、請求項２３に記載のデバイス。
【請求項２５】
前記熱膨張が、前記基板に一体化された加熱素子によって推進される、請求項２３に記載のデバイス。
【請求項２６】
前記熱膨張が、前記基板の外にある加熱器によって推進される、請求項２３に記載のデバイス。
【請求項２７】
前記データ処理装置が、外部コンピューター装置に含まれる、請求項１４に記載のデバイス。
【請求項２８】
前記外部コンピューター装置がクラウドコンピューティングデバイスである、請求項２７に記載のデバイス。
【請求項２９】
前記電流がトンネル電流である、請求項１４に記載のデバイス。
【請求項３０】
バイオポリマーの配列を決定するためのシステムであって、
少なくとも１つの流体チャネルを備える基板と、
前記基板上に又は前記基板に隣接して配置された複数の電極構造であり、当該複数の電極構造のそれぞれが、ギャップによって離間された少なくとも１つの電極対を含み、前記少なくとも１つの電極対が、前記少なくとも１つの流体チャネルと交差する、複数の電極構造と、
前記少なくとも１つの電極対と一体化され、前記ギャップの間隔を制御可能に調節するアクチュエータと、
を備えるシステム。
【請求項３１】
前記バイオポリマーが、前記ギャップの少なくとも一部を通り抜ける核酸分子である、請求項３０に記載のシステム。
【請求項３２】
前記少なくとも１つの電極対と電気通信する制御システムであって、前記ギャップ内を核酸分子が流れたときに前記少なくとも１つの電極対の間の電流を測定する制御システムをさらに備える、請求項３１に記載のシステム。
【請求項３３】
前記電流がトンネル電流である、請求項３２に記載のシステム。
【請求項３４】
前記複数の電極構造の少なくとも部分集合が、複数の電極対を備える、請求項３０に記載のシステム。
【請求項３５】
前記複数の電極対が独立してアドレス指定可能である、請求項３４に記載のシステム。
【請求項３６】
前記電極対の少なくとも１つが独立してアドレス指定可能である、請求項３０に記載のシステム。
【請求項３７】
核酸分子の配列決定方法であって、
基板にナノチャネルを設ける工程であって、前記ナノチャネルが、ギャップによって離間された１対のナノ電極を含む工程と、
前記ナノチャネルに複数の生体分子を流す工程であって、前記生体分子が、核酸分子のモノマーの少なくとも一部に対応するモノマーを備え、前記生体分子が、既知の配列を含むバイオポリマーを備える工程と、
前記ナノ電極を使用して、前記複数の生体分子の少なくとも部分集合を通る電流を測定する工程と、
前記電流の測定値に基づき、前記核酸分子の配列を決定する工程と、
を含む方法。
【請求項３８】
前記ナノチャネルが、ギャップを有するナノ電極の複数の対を備える、請求項３７に記載の方法。
【請求項３９】
所望でないデータを生成するナノ電極の対にフラッグを立てる工程と、
前記フラッグを立てられたナノ電極の対からのデータ収集を停止する工程と、
をさらに含む、請求項３８に記載の方法。
【請求項４０】
前記ナノ電極の複数の対のいくつかの部分集合が、異なる金属、コーティング、又はそれに結合されている部分で形成されている、請求項３８又は３９に記載の方法。
【請求項４１】
前記複数の生体分子が、既知の配列を含む複数の合成又は天然バイオポリマーを備える、請求項３７から４０のいずれか１項に記載の方法。
【請求項４２】
前記複数のバイオポリマーが対称配列を有する、請求項４１に記載の方法。
【請求項４３】
前記測定された電流に基づき較正設定を提供することと、
前記較正設定を不揮発性メモリーに記憶させることと、
をさらに含む、請求項３７から４２のいずれか１項に記載の方法。
【請求項４４】
前記不揮発性メモリーが、（ｉ）前記ナノチャネルを含む機器上、又は前記ナノチャネルに近接する機器上にある、又は（ｉｉ）前記ナノチャネルに対して遠隔に配置されている機器上にある、請求項４３に記載の方法。
【請求項４５】
前記不揮発性メモリーがバッテリーバックアップされている、請求項４３又は４４に記載の方法。
【請求項４６】
前記較正設定が、個々の電極対用に保持された１つ又は複数の較正値を含む、請求項４３から４５のいずれか１項に記載の方法。
【請求項４７】
前記生体分子がキットの一部として供給される、請求項３７から４６のいずれか１項に記載の方法。
【請求項４８】
前記生体分子のバイオポリマーが、ホモポリマー配列を備える、請求項３７から４７のいずれか１項に記載の方法。
【請求項４９】
前記生体分子のバイオポリマーがポリＧの領域を備える、請求項４８に記載の方法。
【請求項５０】
前記生体分子のバイオポリマーが反復配列を備える、請求項３７から４７のいずれか１項に記載の方法。
【請求項５１】
前記生体分子のバイオポリマーが標識を備える、請求項３７から５０のいずれか１項に記載の方法。
【請求項５２】
前記生体分子のバイオポリマーが、天然又は合成塩基を備える、請求項３７から５１のいずれか１項に記載の方法。
【請求項５３】
前記天然又は合成塩基が修飾されている、請求項５２に記載の方法。
【請求項５４】
前記電極がそこに結合している相互作用分子を有する、請求項３７から５３のいずれか１項に記載の方法。
【請求項５５】
前記相互作用分子が、異なる塩基に対して異なる相互作用するよう、構成又は適合されている、請求項５４に記載の方法。
【請求項５６】
前記生体分子が、前記核酸分子の異なるモノマーに対応する異なるモノマーを備える、請求項３７から５５のいずれか１項に記載の方法。
【請求項５７】
前記電流がトンネル電流を備える、請求項３７から５６のいずれか１項に記載の方法。
【請求項５８】
前記トンネル電流が前記生体分子を通る、請求項５７に記載の方法。
【請求項５９】
前記生体分子が成長する核酸鎖に組み込まれることができる、請求項３７から５８のいずれか１項に記載の方法。
【請求項６０】
前記生体分子が、個々のヌクレオチド及び異なるサブユニットを備える、請求項３７から５９のいずれか１項に記載の方法。
【誤訳訂正２】
【訂正対象書類名】明細書
【訂正対象項目名】００１２
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【００１２】
[0012]  本明細書で提供される態様のいくつかの実施形態では、間隔は、ナノ電極で測定された電流が所定の電流プロファイルに対応するように調節可能である。本明細書で提供される態様のいくつかの実施形態では、ナノチャネルが、ギャップを有するナノ電極の複数の対を備える。本明細書で提供される態様のいくつかの実施形態では、方法はさらに、ナノ電極の対を選択する工程であって、そのそれぞれが、ナノ電極の対による複数の参照較正部分に関する電流の測定によって決定されるように、所望のギャップの間隔に設定される工程を備える。本明細書で提供される態様のいくつかの実施形態では、ナノチャネル内を複数の参照較正部分が流れるときに、所望のナノ電極対のギャップの間隔を持たないギャップが調節され、かつ電流が測定される。本明細書で提供される態様のいくつかの実施形態では、所望のナノ電極対のギャップの間隔を持たないナノ電極の対にフラッグが立てられ、ナノ電極の対からのデータ収集が停止される。本明細書で提供される態様のいくつかの実施形態では、方法はさらに、ナノチャネル内を参照較正部分が流れたときのナノ電極の対のそれぞれによる電流の測定値に基づき、ギャップのそれぞれに関して間隔を調節する工程を備える。本明細書で提供される態様のいくつかの実施形態では、ナノ電極の複数の対のいくつかの部分集合が、異なる金属、コーティング、又はそれに結合されている部分で形成され、電流の測定値（１つ又は複数）が、ナノ電極の複数の対の部分集合のそれぞれに関連した異なる較正値による較正設定（１つ又は複数）をもたらす。本明細書で提供される態様のいくつかの実施形態では、複数の参照較正部分が、既知の配列を含有する合成又は天然バイオポリマーである。本明細書で提供される態様のいくつかの実施形態では、複数の参照較正部分が、対称配列を有する。本明細書で提供される態様のいくつかの実施形態では、電流の測定値（１つ又は複数）が、不揮発性メモリーに記憶される較正設定を提供する。本明細書で提供される態様のいくつかの実施形態では、不揮発性メモリーが、（ｉ）ナノチャネルを含み若しくはナノチャネルに近接しているか、又は（ｉｉ）ナノチャネルに対して遠隔に配置されている、機器上にある。本明細書で提供される態様のいくつかの実施形態では、不揮発性メモリーが、バッテリーバックアップされている。本明細書で提供される態様のいくつかの実施形態では、較正設定が、個々の電極対に関して保持される１つ又は複数の較正値を備える。本明細書で提供される態様のいくつかの実施形態では、参照較正部分が、キットの一部として供給される。本明細書で提供される態様のいくつかの実施形態では、参照較正部分が、ホモポリマー配列に対応する。
【誤訳訂正３】
【訂正対象書類名】明細書
【訂正対象項目名】００５９
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【００５９】
[0077]  いくつかの実施形態では、ＲＮＡ分子の最大及び最小のシグナルを提供し得る、様々な種類のホモポリマーの連続（即ち、塩基の配列）、例えばポリＧ及びポリＵ  ＲＮＡの領域を含み得る、既知の配列を備える合成オリゴを利用してもよい。ホモポリマー核酸の連続のその他の組合せを利用してもよい。
【誤訳訂正４】
【訂正対象書類名】明細書
【訂正対象項目名】００６０
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【００６０】
[0078]  いくつかの実施形態では、合成又は天然オリゴは、ホモポリマーの連続とホモポリマーの連続を含まない配列との組合せを含んでいてもよい、既知の配列を備える。いくつかの実施形態では、未知の配列を備える合成又は天然オリゴを利用してもよく、その場合、ナノ電極対ギャップ間隔は、未知の配列データ測定の測定値を利用して設定することができる。いくつかの実施形態では、信号が向きに依存しないように、対称的な配列を備える合成又は天然オリゴを利用してもよい。
【誤訳訂正５】
【訂正対象書類名】明細書
【訂正対象項目名】００６６
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【００６６】
[0084]  ナノ電極対ギャップ間隔を、その他の部分の測定値又はナノ電極対の間の直接的な測定値を使用して設定し得る、いくつかの実施形態では、制御パラメーターに設定する際の変化は、既知の実際のギャップ間隔から又は例えば表から得られる既知の相対的な制御パラメーターの変化から、直接線形補間によって決定されてもよい。その他の方法、例えば、制御パラメーターの変化の関数として、ナノ電極対ギャップ間隔の動きに関する多項式、対数、指数方程式、これらの組合せ、又は任意のその他の適切な数学的表現を使用した、所望の変化の計算が利用されてもよく、上記の制御パラメーターは、パルス幅変調である出力、デジタル−アナログ変換器、電気的に調節可能な電位差計の設定、制御回路のメモリーの設定、又はナノ電極対ギャップ間隔を制御するための任意のその他の適切な方法とすることができる。