【手続補正書】
【提出日】平成30年11月9日(2018.11.9)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
（ａ）配列番号１６１、配列番号１００〜１１４、及び配列番号１５９〜１６０，１６２〜１６７からなる群から選ばれたアミノ酸配列に６０％〜９５％の配列同一性を含むＣＤＲ‐Ｌ１と、
（ｂ）配列番号１２３、配列番号１１５〜１２２，１２４〜１２６、及び配列番号１６８〜１７０からなる群から選ばれたアミノ酸配列に６０％〜９５％の配列同一性を含むＣＤＲ‐Ｌ２と、
（ｃ）配列番号１３５、配列番号１２７〜１３４，１３６〜１４２、及び配列番号１７１〜１７３からなる群から選ばれたアミノ酸配列に６０％〜９５％の配列同一性を含むＣＤＲ‐Ｌ３と、
（ｄ）配列番号１４３、配列番号８１〜８３、及び配列番号１４４からなる群から選ばれたアミノ酸配列に６０％〜９５％の配列同一性を含むＣＤＲ‐Ｈ１と、
（ｅ）配列番号１４６、配列番号８４〜８９、及び配列番号１４５，１４７〜１５１からなる群から選ばれたアミノ酸配列に６０％〜９５％の配列同一性を含むＣＤＲ‐Ｈ２と、
（ｆ）配列番号１５３、配列番号９０〜９９、及び配列番号１５２，１５４〜１５８からなる群から選ばれたアミノ酸配列に６０％〜９５％の配列同一性を含むＣＤＲ‐Ｈ３と、を含む抗体。
【請求項２】
配列番号３７，３８、配列番号１５〜３６、及び配列番号３９〜５２、またはこれらの断片からなる群から選ばれたアミノ酸配列と９５％以上のアミノ酸配列の同一性を含む可変ドメインを含む、請求項１に記載の抗体。
【請求項３】
次からなる群：
配列番号３７及び配列番号３８；
配列番号２９及び配列番号３０；
配列番号１５及び配列番号１６；
配列番号１７及び配列番号１８；
配列番号１９及び配列番号２０；
配列番号２１及び配列番号２２；
配列番号２３及び配列番号２４；
配列番号２５及び配列番号２６；
配列番号２７及び配列番号２８；
配列番号３１及び配列番号３２；
配列番号３５及び配列番号３６；
配列番号３９及び配列番号４０；
配列番号４２及び配列番号３２；
配列番号４４及び配列番号４５；
配列番号４６及び配列番号３２；
配列番号４７及び配列番号３２；
配列番号４８及び配列番号５０；
配列番号４８及び配列番号４９；及び
配列番号５１及び配列番号５２、
から選ばれた可変ドメイン対を含む、請求項１に記載の抗体。
【請求項４】
モノクローナル抗体を含む、請求項１〜請求項３のうちいずれか１項に記載の抗体。
【請求項５】
ＩｇＧ１アイソタイプまたはＩｇＧ２アイソタイプを含む、請求項１〜請求項４のうちいずれか１項に記載の抗体。
【請求項６】
前記抗体は第１群抗体、第２群抗体、第３群抗体及び第４群抗体からなる群から選ばれた抗体群を含む、請求項１〜請求項５のうちいずれか１項に記載の抗体。
【請求項７】
前記抗体はＮ‐アセチルノイラミンシアリルＴｎ抗原（ＡｃＳＴｎ）及びＮ‐グリコリルノイラミンシアリルＴｎ抗原（ＧｃＳＴｎ）からなる群から選ばれた抗原を特異的に標的化する、請求項６に記載の抗体。
【請求項８】
前記抗原は９‐Ｏ‐アセチル基を含む、請求項７に記載の抗体。
【請求項９】
前記抗体は２つ以上のグリカンクラスターに結合する、請求項１〜請求項８のうちいずれか１項に記載の抗体。
【請求項１０】
前記抗体は二重特異的抗体を含む、請求項１〜請求項９のうちいずれか１項に記載の抗体。
【請求項１１】
前記抗体は抗体薬物接合体を含む、請求項１〜請求項１０のうちいずれか１項に記載の抗体。
【請求項１２】
前記抗体薬物接合体は治療剤または細胞傷害剤を含む、請求項１１に記載の抗体。
【請求項１３】
前記細胞傷害剤は前記抗体に直接接合されている、請求項１２に記載の抗体。
【請求項１４】
前記細胞傷害剤はリンカーを介して前記抗体に接合されている、請求項１２に記載の抗体。
【請求項１５】
前記リンカーは切断可能なリンカー及び切断不可能なリンカーからなる群から選ばれる、請求項１４に記載の抗体。
【請求項１６】
前記抗体薬物接合体は細胞傷害剤を含んでおり、前記細胞傷害剤はＤＮＡ損傷剤または細胞骨格の抑制剤である、請求項１２〜請求項１５のうちいずれか１項に記載の抗体。
【請求項１７】
前記抗体は腫瘍関連炭水化物抗原（ＴＡＣＡ）に結合する、請求項１〜請求項１６のうちいずれか１項に記載の抗体。
【請求項１８】
前記ＴＡＣＡはＴｎ抗原、シアリル化されたＴｎ抗原（ＳＴｎ）、トムセン−フリーデンライヒ抗原、ルイスＹ（ＬｅＹ）抗原、ルイスＸ（ＬｅＸ）抗原、シアリルルイスＸ（ＳＬｅＸ）抗原、シアリルルイスＡ（ＳＬｅＡ）抗原、グローボＨ、段階特異性胚抗原‐３（ＳＳＥＡ‐３）、シアル酸を含むグリコスフィンゴリピド、ガングリオシドＧＤ２、ガングリオシドＧＤ３、ガングリオシドＧＭ２、フコシルＧＭ１、ガングリオシドＮｅｕ５ＧｃＧＭ３、及びポリシアル酸関連抗原からなる群から選ばれる、請求項１７に記載の抗体。
【請求項１９】
請求項１〜請求項１８のいずれか１項に記載の抗体の少なくとも１つを含む薬学組成物。
【請求項２０】
請求項１〜請求項１８のいずれか１項に記載の抗体の少なくとも１つ及びこれの使用指針を含むキット。
【請求項２１】
腫瘍細胞を死滅させるための薬学組成物であって、
前記組成物の前記抗体が前記腫瘍細胞に接触させられる、請求項１９に記載の薬学組成物。
【請求項２２】
治療が必要な対象において癌を治療するための薬学組成物であって、
前記組成物が前記対象に投与される、請求項１９に記載の薬学組成物。
【請求項２３】
前記癌は上皮癌を含む、請求項２２に記載の薬学組成物。
【請求項２４】
前記上皮癌は乳癌、大腸癌、肺癌、膀胱癌、子宮頸癌、卵巣癌、胃癌、前立腺癌及び肝癌の少なくとも１つを含む、請求項２３に記載の薬学組成物。
【請求項２５】
対象で腫瘍容積を減少させるための薬学組成物であって、
前記組成物が前記対象に投与される、請求項１９に記載の薬学組成物。
【請求項２６】
抗腫瘍細胞免疫活性を増加させるための薬学組成物であって、
前記組成物の前記抗体が１つ以上の免疫耐性腫瘍細胞に接触させられる、請求項１９に記載の薬学組成物。
【請求項２７】
前記抗腫瘍細胞免疫活性は先天的免疫活性を含む、請求項２６に記載の薬学組成物。
【請求項２８】
前記先天的免疫活性はナチュラルキラー（ＮＫ）細胞の抗腫瘍細胞活性を含む、請求項２７に記載の薬学組成物。
【請求項２９】
前記抗腫瘍細胞免疫活性は後天的免疫活性を含む、請求項２６に記載の薬学組成物。
【請求項３０】
前記後天的免疫活性はＢ細胞の抗腫瘍細胞活性を含む、請求項２９に記載の薬学組成物。
【請求項３１】
前記後天的免疫活性は樹状細胞（ＤＣ）の抗腫瘍細胞活性を含む、請求項２９に記載の薬学組成物。
【請求項３２】
前記組成物はＣＤ８０、ＣＤ８６、ＩＬ‐１２、及びＴＮＦ‐αからなる群から選ばれた１つ以上の因子のＤＣ発現を増加させる、請求項３１に記載の薬学組成物。
【請求項３３】
治療が必要な対象で免疫耐性腫瘍を治療するための薬学組成物であって、
前記組成物が前記対象に投与される、請求項１９に記載の薬学組成物。
【請求項３４】
対象から癌幹細胞（ＣＳＣ）を減少または取り除くための薬学組成物であって、前記組成物が前記対象に投与される、請求項１９に記載の薬学組成物。
【請求項３５】
前記ＣＳＣは乳房組織、卵巣組織、膵臓組織、膀胱組織、子宮頸組織、大腸組織、及び肺組織の少なくとも１つに存在する、請求項３４に記載の薬学組成物。
【請求項３６】
前記ＣＳＣはＣＤ１３３及びＣＤ４４バイオマーカーの少なくとも一方を含む、請求項３４または請求項３５に記載の薬学組成物。
【請求項３７】
前記対象に１つ以上の化学療法剤がさらに投与される、請求項３４〜請求項３６のうちいずれか１項に記載の薬学組成物。
【請求項３８】
前記１つ以上の化学療法剤はパクリタキセル及びカルボプラチンからなる群から選ばれる、請求項３７に記載の薬学組成物。
【請求項３９】
（ａ）配列番号１６１、配列番号１００〜１１４、及び配列番号１５９〜１６０，１６２〜１６７からなる群から選ばれたアミノ酸配列に６０％〜９５％の配列同一性を含むＣＤＲ‐Ｌ１と、
（ｂ）配列番号１２３、配列番号１１５〜１２２，１２４〜１２６、及び配列番号１６８〜１７０からなる群から選ばれたアミノ酸配列に６０％〜９５％の配列同一性を含むＣＤＲ‐Ｌ２と、
（ｃ）配列番号１３５、配列番号１２７〜１３４，１３６〜１４２、及び配列番号１７１〜１７３からなる群から選ばれたアミノ酸配列に６０％〜９５％の配列同一性を含むＣＤＲ‐Ｌ３と、
（ｄ）配列番号１４３、配列番号８１〜８３、及び配列番号１４４からなる群から選ばれたアミノ酸配列に６０％〜９５％の配列同一性を含むＣＤＲ‐Ｈ１と、
（ｅ）配列番号１４６、配列番号８４〜８９、及び配列番号１４５，１４７〜１５１からなる群から選ばれたアミノ酸配列に６０％〜９５％の配列同一性を含むＣＤＲ‐Ｈ２と、
（ｆ）配列番号１５３、配列番号９０〜９９、及び配列番号１５２，１５４〜１５８からなる群から選ばれたアミノ酸配列に６０％〜９５％の配列同一性を含むＣＤＲ‐Ｈ３と、を含む、イントラボディ。
【請求項４０】
次からなる群：
配列番号３７及び配列番号３８；
配列番号２９及び配列番号３０；
配列番号１５及び配列番号１６；
配列番号１７及び配列番号１８；
配列番号１９及び配列番号２０；
配列番号２１及び配列番号２２；
配列番号２３及び配列番号２４；
配列番号２５及び配列番号２６；
配列番号２７及び配列番号２８；
配列番号３１及び配列番号３２；
配列番号３５及び配列番号３６；
配列番号３９及び配列番号４０；
配列番号４２及び配列番号３２；
配列番号４４及び配列番号４５；
配列番号４６及び配列番号３２；
配列番号４７及び配列番号３２；
配列番号４８及び配列番号５０；
配列番号４８及び配列番号４９；及び
配列番号５１及び配列番号５２、
から選ばれた可変ドメイン対を含む、請求項３９に記載のイントラボディ。
【請求項４１】
（ａ）配列番号１６１、配列番号１００〜１１４、及び配列番号１５９〜１６０，１６２〜１６７からなる群から選ばれたアミノ酸配列に６０％〜９５％の配列同一性を含むＣＤＲ‐Ｌ１と、
（ｂ）配列番号１２３、配列番号１１５〜１２２，１２４〜１２６、及び配列番号１６８〜１７０からなる群から選ばれたアミノ酸配列に６０％〜９５％の配列同一性を含むＣＤＲ‐Ｌ２と、
（ｃ）配列番号１３５、配列番号１２７〜１３４，１３６〜１４２、及び配列番号１７１〜１７３からなる群から選ばれたアミノ酸配列に６０％〜９５％の配列同一性を含むＣＤＲ‐Ｌ３と、
（ｄ）配列番号１４３、配列番号８１〜８３、及び配列番号１４４からなる群から選ばれたアミノ酸配列に６０％〜９５％の配列同一性を含むＣＤＲ‐Ｈ１と、
（ｅ）配列番号１４６、配列番号８４〜８９、及び配列番号１４５，１４７〜１５１からなる群から選ばれたアミノ酸配列に６０％〜９５％の配列同一性を含むＣＤＲ‐Ｈ２と、
（ｆ）配列番号１５３、配列番号９０〜９９、及び配列番号１５２，１５４〜１５８からなる群から選ばれたアミノ酸配列に６０％〜９５％の配列同一性を含むＣＤＲ‐Ｈ３と、を含む、キメラ抗原受容体（ＣＡＲ）。
【請求項４２】
次からなる群：
配列番号３７及び配列番号３８；
配列番号２９及び配列番号３０；
配列番号１５及び配列番号１６；
配列番号１７及び配列番号１８；
配列番号１９及び配列番号２０；
配列番号２１及び配列番号２２；
配列番号２３及び配列番号２４；
配列番号２５及び配列番号２６；
配列番号２７及び配列番号２８；
配列番号３１及び配列番号３２；
配列番号３５及び配列番号３６；
配列番号３９及び配列番号４０；
配列番号４２及び配列番号３２；
配列番号４４及び配列番号４５；
配列番号４６及び配列番号３２；
配列番号４７及び配列番号３２；
配列番号４８及び配列番号５０；
配列番号４８及び配列番号４９；及び
配列番号５１及び配列番号５２、
から選ばれた可変ドメイン対を含む、請求項４１に記載のＣＡＲ。
【請求項４３】
請求項１〜請求項５のうちいずれか１項に記載の抗体をコードする構造体。
【請求項４４】
配列番号１９２〜２３３及びこれらの断片からなる群から選ばれたヌクレオチド配列と９５％以上の配列同一性を有する１つ以上のヌクレオチド配列を含む、請求項４３に記載の構造体。
【請求項４５】
請求項３９または請求項４０に記載のイントラボディをコードする構造体。
【請求項４６】
請求項４１または請求項４２に記載のＣＡＲをコードする構造体。
【請求項４７】
請求項４３〜請求項４６のうちいずれか１項に記載の１つ以上の構造体を含む細胞。
【請求項４８】
請求項４３〜請求項４６のうちいずれか１項に記載の１つ以上の構造体を含むウィルス。
【請求項４９】
請求項１〜請求項１２、請求項１７、及び請求項１８のうちいずれか１項に記載の抗体を用いることを含む、ＳＴｎを発現する細胞及び組織の少なくとも一方を同定する方法。
【請求項５０】
請求項１〜請求項１２、請求項１７、及び請求項１８のうちいずれか１項に記載の抗体を用いることを含む、組織または器官で癌性細胞を同定する方法。
【請求項５１】
前記組織または器官は乳房、卵巣及び膵臓からなる群から選ばれる、請求項５０に記載の方法。
【請求項５２】
請求項１〜請求項３のうちいずれか１項に記載の抗体の配列分析／情報化された変異体を含む、抗体変異体。
【請求項５３】
前記抗体変異体は向上されたエピトープ特異性及び／または親和性を含む、請求項５２に記載の抗体変異体。
【請求項５４】
前記抗体変異体はＣＤＲ長さの改変を含む、請求項５２または請求項５３に記載の抗体変異体。
【請求項５５】
前記ＣＤＲ長さの改変はＣＤＲ‐Ｈ３長さの改変を含む、請求項５４に記載の抗体変異体。
【請求項５６】
前記抗体変異体は１つ以上のＣＤＲに１つ以上のアミノ酸の置換を含む、請求項５２または請求項５３に記載の抗体変異体。
【請求項５７】
前記抗体変異体は１つ以上の生殖細胞遺伝子の改変を含む、請求項５２または請求項５３に記載の抗体変異体。
【請求項５８】
前記抗体変異体はｓｃＦｖ、モノボディ、ディアボディ、イントラボディ、ＣＡＲ、または抗体模倣体を含む、請求項５２〜請求項５７のうちいずれか１項に記載の抗体変異体。
【請求項５９】
抗体断片ディスプレイライブラリーを開発する方法であって、
（ａ）請求項１〜請求項３のいずれか１項に記載の２つ以上の抗体の間で可変ドメインアミノ酸の配列を整列するステップと、
（ｂ）前記整列された抗体の間で定常及び可変アミノ酸を同定するステップと、
（ｃ）抗体断片ディスプレイライブラリーを構築するステップと、を含み、ライブラリー構成要素の間の可変性が前記ステップ（ｂ）で同定された可変アミノ酸のアミノ酸の変動に制限される、方法。
【請求項６０】
請求項５９に記載の方法によって生産された抗体断片ディスプレイライブラリー。
【請求項６１】
請求項６０に記載の抗体断片ディスプレイライブラリーから単離された１つ以上の可変ドメインを含む抗体。
【請求項６２】
前記抗体はｓｃＦｖ、モノボディ、ディアボディ、イントラボディ、ＣＡＲ、または抗体模倣体を含む、請求項６１に記載の抗体。