【手続補正書】
【提出日】平成30年3月23日(2018.3.23)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
標的の増幅および検出を集積したマイクロ流体装置であって、
マイクロチップを備え、
前記マイクロチップは、
少なくとも１つの試料リザーバと、
前記マイクロチップを少なくとも１つの増幅チャンバに接続するように構成された少なくとも１つの接続構造と、
少なくとも１つの試薬リザーバと、
少なくとも１つの混合リザーバと、
前記マイクロチップから取り外し可能である少なくとも１つの増幅チャンバと、
少なくとも１つの検出チャンバとを含み、
前記少なくとも１つの試薬リザーバは、前記少なくとも１つの混合リザーバに接続され、
前記少なくとも１つの混合リザーバは、前記少なくとも１つの検出チャンバに接続される、マイクロ流体装置。
【請求項２】
前記少なくとも１つの試料リザーバは、前記少なくとも１つの増幅チャンバに接続され、
前記少なくとも１つの増幅チャンバは、前記少なくとも１つの混合リザーバに接続される、請求項１に記載のマイクロ流体装置。
【請求項３】
前記少なくとも１つの増幅チャンバは、前記少なくとも１つの接続構造を介して、前記マイクロチップ上に組み立てられ、
前記少なくとも１つの接続構造は、１つ以上の接続部を含む、請求項１または２に記載のマイクロ流体装置。
【請求項４】
前記少なくとも１つの検出チャンバは、前記マイクロチップから取り外し可能である、請求項１〜３のいずれか１項に記載のマイクロ流体装置。
【請求項５】
前記少なくとも１つの試料リザーバは、前記マイクロチップ上に設けられ、試料を収容するためのリザーバと、前記試料リザーバ上に設けられた取り外し可能な蓋とを含む、請求項１〜４のいずれか１項に記載のマイクロ流体装置。
【請求項６】
前記取り外し可能な蓋は、空気入口と、前記蓋の内側に取り付けられ、内側から前記空気入口を覆うための疎水性通気膜とを含む、請求項５に記載のマイクロ流体装置。
【請求項７】
前記少なくとも１つの試料リザーバは、前記マイクロチップに設けられた第１流路、第１接続部、第１弾性チューブ、またはそれらの組み合わせを介して、前記少なくとも１つの増幅チャンバに接続され、
前記第１流路は、必要に応じて、前記流路の開閉を制御するバルブを含み、
前記第１接続部は、必要に応じて、ネジ付き接管、スリーブ接続部または鋳造接続部であり、
前記第１弾性チューブは、必要に応じて、シリコーン、プラスチックまたはゴムを含み、
前記バルブは、必要に応じて、弾性バルブ、相変化バルブまたはトルクバルブである、請求項１〜６のいずれか１項に記載のマイクロ流体装置。
【請求項８】
前記少なくとも１つの増幅チャンバは、前記マイクロチップに設けられた第２流路、第２接続部、第２弾性チューブ、またはそれらの組み合わせを介して、前記少なくとも１つの混合リザーバに接続され、
前記第２流路は、必要に応じて、前記流路の開閉を制御するバルブを含み、
前記第２接続部は、必要に応じて、ネジ付き接管、スリーブ接続部または鋳造接続部であり、
前記第２弾性チューブは、必要に応じて、シリコーン、プラスチックまたはゴムを含み、
前記バルブは、必要に応じて、弾性バルブ、相変化バルブまたはトルクバルブである、請求項７に記載のマイクロ流体装置。
【請求項９】
前記少なくとも１つの試料リザーバは、前記マイクロチップに設けられた前記第１流路に接続され、
前記第１流路は、前記第１接続部に接続され、
前記第１接続部は、前記第１弾性チューブに接続され、
前記第１弾性チューブは、前記少なくとも１つの増幅チャンバに接続され、
前記少なくとも１つの増幅チャンバは、前記第２弾性チューブに接続され、
前記第２弾性チューブは、前記第２接続部に接続され、
前記第２接続部は、前記マイクロチップに設けられた前記第２流路に接続され、
前記第２流路は、前記少なくとも１つの混合リザーバに接続される、請求項８に記載のマイクロ流体装置。
【請求項１０】
前記少なくとも１つの検出チャンバは、前記マイクロチップに設けられた第１導入流路を介して、導入流路開口に接続され、
前記少なくとも１つの検出チャンバは、前記マイクロチップに設けられた第２導入流路に接続され、
前記マイクロチップに設けられた前記第２導入流路は、前記マイクロチップに設けられた第３流路を介して、前記少なくとも１つの混合リザーバに接続され、
前記第３流路は、必要に応じて、前記流路の開閉を制御するバルブを含み、
前記バルブは、必要に応じて、弾性バルブ、相変化バルブまたはトルクバルブである、請求項１〜９のいずれか１項に記載のマイクロ流体装置。
【請求項１１】
前記少なくとも１つの試薬リザーバは、前記マイクロチップに設けられた第４流路を介して、前記少なくとも１つの混合リザーバに接続され、
前記第４流路は、必要に応じて、前記流路の開閉を制御するバルブを含み、
前記バルブは、必要に応じて、弾性バルブ、相変化バルブまたはトルクバルブである、請求項１〜１０のいずれか１項に記載のマイクロ流体装置。
【請求項１２】
前記少なくとも１つの試薬リザーバは、前記マイクロチップ上に設けられ、少なくとも１つの試薬を収容するためのリザーバと、前記試薬リザーバ上に設けられた取り外し可能な蓋とを含み、
前記取り外し可能な蓋は、空気入口と、前記蓋の内側に取り付けられ、内側から前記空気入口を覆う疎水性通気膜とを含み、
前記少なくとも１つの試薬は、核酸ハイブリッドを形成するための試薬である、請求項１〜１１のいずれか１項に記載のマイクロ流体装置。
【請求項１３】
前記少なくとも１つの検出チャンバは、試料から少なくとも１つの標的分子を検出するためのアレイを含み、
前記アレイは、核酸マイクロアレイ、タンパク質マイクロアレイ、組織マイクロアレイ、抗体マイクロアレイ、またはそれらの組み合わせである、請求項１〜１２のいずれか１項に記載のマイクロ流体装置。
【請求項１４】
前記マイクロ流体装置は、支持プラットフォームをさらに含む、請求項１〜１３のいずれか１項に記載のマイクロ流体装置。
【請求項１５】
前記支持プラットフォームは、金属のような熱伝導性材料を含み、
前記支持プラットフォームは、前記少なくとも１つの増幅チャンバを封入するまたは埋入するための少なくとも１つの溝を備えた板を含む、請求項１４に記載のマイクロ流体装置。
【請求項１６】
前記支持プラットフォームは、前記マイクロチップに集積された一部であるまたは前記マイクロチップから取り外し可能である、請求項１４または１５に記載のマイクロ流体装置。
【請求項１７】
制御サブシステムをさらに含み、
必要に応じて、前記制御サブシステムは、流体制御サブシステム、光学サブシステムおよび／または熱制御サブシステムを含み、
必要に応じて、前記流体制御サブシステムは、前記導入流路開口、前記排出流路開口、および／または前記混合リザーバ開口に直接接続され、
必要に応じて、前記流体制御サブシステムは、少なくとも１つの流体容器、少なくとも１つのポンプ、および／または少なくとも１つのバルブ、および前記少なくとも１つの流体容器、前記少なくとも１つのポンプおよび／または前記少なくとも１つのバルブを接続する流路を含み、前記バルブは、必要に応じて、弾性バルブ、相変化バルブまたはトルクバルブであり、
必要に応じて、前記少なくとも１つの流体容器は、溶液容器、気体容器および／または廃棄物容器を含み、
必要に応じて、前記溶液容器は、例えば、前記検出チャンバ内に配置されたマイクロアレイから未結合の分子を洗い流すための溶液などの洗浄溶液を含み、前記溶液容器は、必要に応じて、前記導入流路開口に接続され、
必要に応じて、前記気体容器は、乾燥空気を含み、前記気体容器は、必要に応じて、前記導入流路開口に接続され、
必要に応じて、前記廃棄物容器は、廃棄物を収集するために使用され、前記廃棄物容器は、必要に応じて、前記排出流路開口に接続される、請求項１〜１６のいずれか１項に記載のマイクロ流体装置。
【請求項１８】
前記流体制御システムは、必要に応じて双方向バルブを介して、前記排出流路開口および前記混合リザーバ開口の両方に接続されたポンプを含み、
必要に応じて、前記熱制御サブシステムは、前記少なくとも１つの増幅チャンバ用の加熱および／または冷却素子を含み、
必要に応じて、前記熱制御サブシステムは、前記少なくとも１つの検出チャンバ用の加熱および／または冷却素子をさらに含み、
必要に応じて、前記光学サブシステムは、前記検出チャンバ内の反応、例えば前記検出チャンバ内に配置されたアレイ上のハイブリダイゼーション反応を示す画像を撮影するためのカメラを含む、請求項１７に記載のマイクロ流体装置。
【請求項１９】
前記少なくとも１つの混合リザーバの容積は、前記少なくとも１つの試料リザーバおよび前記少なくとも１つの試薬リザーバの合計容積よりも大きい、請求項１〜１８のいずれか１項に記載のマイクロ流体装置。
【請求項２０】
標的の増幅および検出を集積した方法であって、
（１）標的を含有するまたは標的を含有する疑いのある試料を請求項１〜１９のいずれか１項に記載の前記マイクロ流体装置の少なくとも１つの試料リザーバに添加し、前記少なくとも１つの試料リザーバを封止することと、
（２）少なくとも１つの試薬を少なくとも１つの試薬リザーバに添加し、前記少なくとも１つの試薬リザーバを封止することと、
（３）前記マイクロ流体装置を動作させ、前記試料を少なくとも１つの増幅チャンバに移送し、前記標的が前記試料中に存在する場合、前記標的の増幅反応を行うことと、
（４）前記マイクロ流体装置を動作させ、前記増幅反応の産物を前記少なくとも１つの混合リザーバに移送することと、
（５）前記マイクロ流体装置を動作させ、前記少なくとも１つの試薬を前記少なくとも１つの混合リザーバに移送し、前記増幅反応の前記産物と混合することによって、混合物を形成することと、
（６）前記マイクロ流体装置を動作させ、前記混合物を前記少なくとも１つの検出チャンバに移動することによって、ハイブリダイゼーション反応を行うことと、
（７）前記ハイブリダイゼーション反応の産物を検出することとを含み、前記ハイブリダイゼーション反応の産物の存在、不存在または量は、前記試料中に前記標的の存在、不存在または量を表し、
必要に応じて、前記方法は、洗浄溶液を用いて、前記少なくとも１つの検出チャンバを洗浄することをさらに含み、
必要に応じて、前記試料は、生体試料であり、
必要に応じて、前記試料は、組織または体液から取得され、例えば結合組織、上皮組織、筋肉組織または神経組織、脳、肺、肝臓、脾臓、骨髄、胸腺、心臓、リンパ、血液、骨、軟骨、膵臓、腎臓、胆嚢、胃、腸、精巣、卵巣、子宮、直腸、神経系、腺体および内部血管からなる群から選択される組織、または血液、尿、唾液、骨髄、精子、腹水、およびそれらの亜分画物、例えば血清または血漿からなる群から選択される体液から取得され、
必要に応じて、前記方法は、前記試料中の１つまたは複数の標的の存在、不存在、量および／または性質を解析し、
必要に応じて、前記標的は、ポリヌクレオチド、ポリペプチド（例えば、抗体）または小分子である、方法。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００３９
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００３９】
特に明記しない限り、記載された実施形態の実施は、当業者の実施技能の範囲内にある、有機化学技術、高分子技術、（組換え技術を含む）分子生物学技術、細胞生物学技術、生化学技術および配列決定技術の従来技術およびその説明を採用する。そのような従来技術は、ポリペプチドおよびタンパク質の合成および修飾、ポリヌクレオチドの合成および修飾、ポリマ配列の合成、ポリヌクレオチドのハイブリダイゼーションおよび連結、並びに標識を用いてハイブリダイゼーションの検出を含む。本明細書中の例を参照することによって、好適な技術の具体的な実例を提供することができる。しかしながら、他の同等する従来手順も、当然使用可能である。そのような従来技術および説明は、Green, et al.,Eds., Genome Analysis: A Laboratory Manual Series (Vols. I-IV) (1999)；Weiner, Gabriel, Stephens, Eds., Genetic Variation: A Laboratory Manual (2007)；Dieffenbach, Dveksler, Eds., PCR Primer: A Laboratory Manual (2003)；Bowtell and Sambrook, DNA Microarrays: A Molecular Cloning Manual (2003)；Mount, Bioinformatics: Sequence and Genome Analysis (2004)；Sambrook and Russell, Condensed Protocols from Molecular Cloning: A Laboratory Manual (2006)；およびSambrook and Russell, Molecular Cloning: A Laboratory Manual (2002)（すべてCold Spring Harbor Laboratory Pressより）；Ausubel et al. eds., Current Protocols in Molecular Biology (1987)；T. Brown ed., Essential Molecular Biology (1991), IRL Press；Goeddel ed., Gene Expression Technology (1991), Academic Press；A. Bothwell et al.eds., Methods for Cloning and Analysis of Eukaryotic Genes (1990), Bartlett Publ.；M. Kriegler, Gene Transfer and Expression (1990), Stockton Press；R. Wu et al. eds., Recombinant DNA Methodology (1989), Academic Press；M. McPherson et al., PCR: A Practical Approach (1991), IRL Press at Oxford University Press；Stryer, Biochemistry (4th Ed.) (1995), W. H. Freeman, New York N.Y.；Gait, Oligonucleotide Synthesis: A Practical Approach (2002), IRL Press, London；Nelson and Cox, Lehninger, Principles of Biochemistry (2000) 3rd Ed., W. H. Freeman Pub., New York, N.Y.；Berg, et al., Biochemistry (2002) 5th Ed., W. H. Freeman Pub., New York, N.Y.；D. Weir& C. Blackwell, eds., Handbook of Experimental Immunology (1996), Wiley-Blackwellなどの標準的な実験室マニュアルに見つけることができ、上記マニュアルのすべては、その全内容があらゆる目的のために参照により本明細書に援用される。
【手続補正３】
【補正対象書類名】図面
【補正対象項目名】図３（ａ）
【補正方法】変更
【補正の内容】
【図３（ａ）】
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