【手続補正書】
【提出日】平成30年5月21日(2018.5.21)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
Ｘ１ＰＸ３Ｘ４ＰＸ６Ｘ７ＰＧＸ１０Ｘ１１ＡＸ１３Ｘ１４Ｘ１５ＤＬＸ１８Ｘ１９ＹＸ２１Ｘ２２ＲＬＸ２５Ｘ２６ＹＬＸ２９Ｘ３０ＶＡ（配列番号１）の配列を含むペプチドであって、式中、
Ｘ１は、Ｇｌｙ、Ａｒｇ、または前記ペプチドを別のペプチドと架橋させることができるアミノ酸であり、
Ｘ３、Ｘ４、およびＸ６は各々、独立して、荷電アミノ酸であり、
Ｘ１０は荷電アミノ酸であり、
Ｘ７は、Ｔｙｒ、または前記ペプチドを別のペプチドと架橋させることができるアミノ酸であり、
Ｘ１１は、荷電アミノ酸、または前記ペプチドを別のペプチドと架橋させることができるアミノ酸であり、
Ｘ１３は、Ｓｅｒ、または前記ペプチドを別のペプチドと架橋させることができるアミノ酸であり、
Ｘ１４は、ＩｌｅまたはＧｌｕであり、
Ｘ１５は、Ｇｌｕ、Ａｓｐ、Ｇｌｎ、またはＧｌｙであり、
Ｘ１８は、芳香族アミノ酸または疎水性アミノ酸であり、
Ｘ１９は、Ｇｌｕ、Ａｓｐ、Ｇｌｎ、Ａｌａ、またはＴｒｐであり、
Ｘ２１、Ｘ２５、Ｘ２９は各々、独立して、Ｔｙｒ、Ｐｈｅ、Ｔｒｐ、Ｈｉｓ、またはシクロヘキシル側鎖を有するアミノ酸であり、Ｔｙｒ、Ｐｈｅ、Ｔｒｐ、シクロヘキシル側鎖は、１つ以上のフッ素で置換されていてもよく、
Ｘ２２は、Ａｌａ、Ｇｌｙ、Ｓｅｒ、またはＶａｌであり、
Ｘ２６は、Ａｓｎ、Ｌｅｕ、Ｉｌｅ、またはＨｉｓであり、
Ｘ３０は、ＡｌａまたはＡｒｇであり、
前記ペプチドは、前記ペプチドを別のペプチドと架橋させることができる１〜２個のアミノ酸を含む、ペプチド、または、
Ｘ１ＰＸ３Ｘ４ＰＸ６Ｘ７ＰＧＸ１０ＡＡＸ１３Ｘ１４ＡＡＬＨＡＹＸ２１ＡＸ２３ＬＸ２５ＮＹＬＸ２９Ｘ３０ＶＸ３２（配列番号４８）の配列を含むペプチドであって、式中、
Ｘ１は任意選択により存在し、存在するとき、Ｘ１はＧｌｙ、Ａｒｇ、または前記ペプチドを別のペプチドと架橋させることができるアミノ酸であり、
Ｘ３、Ｘ４、およびＸ６は各々、独立して、中性アミノ酸または正荷電アミノ酸であり、
Ｘ７は、Ｔｙｒ、または前記ペプチドを別のペプチドと架橋させることができるアミノ酸であり、
Ｘ１０は、Ａｓｐまたは中性アミノ酸であり、
Ｘ１３は、Ｓｅｒ、Ｔｈｒ、または前記ペプチドを別のペプチドと架橋させることができるアミノ酸であり、
Ｘ１４は、ＩｌｅまたはＬｅｕであり、
Ｘ２１、Ｘ２５、Ｘ２９は各々、独立して、Ｔｙｒ、Ｐｈｅ、Ｔｒｐ、Ｈｉｓ、またはシクロヘキシル側鎖を有するアミノ酸であり、Ｔｙｒ、Ｐｈｅ、Ｔｒｐ、シクロヘキシル側鎖は、１つ以上のフッ素で置換されていてもよく、
Ｘ２３は、Ａｒｇ、Ｌｅｕ、またはＡｌａであり、
Ｘ３０は、ＡｌａまたはＡｒｇであり、
Ｘ３２は、Ａｌａ、Ｓｅｒ、またはＡｒｇであり、
前記ペプチドは、前記ペプチドを別のペプチドと架橋させることができる１〜２個のアミノ酸を含む、ペプチド。
【請求項２】
Ｘ−６Ｘ−５Ｘ−４Ｘ−３Ｘ−２Ｘ−１Ｘ１ＰＸ３Ｘ４ＰＸ６Ｘ７ＰＧＸ１０Ｘ１１ＡＸ１３Ｘ１４Ｘ１５Ｘ１６ＬＸ１８Ｘ１９Ｘ２０Ｘ２１Ｘ２２Ｘ２３ＬＸ２５Ｘ２６ＹＬＸ２９Ｘ３０Ｘ３１Ｘ３２（配列番号１３）の配列を含むペプチドであって、式中、
Ｘ３およびＸ４は各々、独立して、中性アミノ酸または荷電アミノ酸であり、
Ｘ６は、荷電アミノ酸、または前記ペプチドを別のペプチドと架橋させることができるアミノ酸であり、
Ｘ７は、Ｔｙｒ、Ｈｉｓ、または前記ペプチドを別のペプチドと架橋させることができるアミノ酸であり、
Ｘ１０は、Ｐｒｏ、荷電アミノ酸、または前記ペプチドを別のペプチドと架橋させることができるアミノ酸であり、
Ｘ１１は、Ａｌａ、Ｓｅｒ、中性アミノ酸もしくは荷電アミノ酸、または前記ペプチドを別のペプチドと架橋させることができるアミノ酸であり、
Ｘ１３は、Ｓｅｒ、Ｐｒｏ、Ｔｈｒ、または前記ペプチドを別のペプチドと架橋させることができるアミノ酸であり、
Ｘ１４は、Ｉｌｅ、Ｇｌｕ、Ｖａｌ、Ｌｅｕ、または前記ペプチドを別のペプチドと架橋させることができるアミノ酸であり、
Ｘ１５は、Ｇｌｕ、Ｌｙｓ、Ａｒｇ、Ａｌａ、Ｓｅｒ、Ａｓｐ、Ｇｌｎ、またはＧｌｙであり、
Ｘ１６は、Ａｓｐ、Ｇｌｕ、Ｇｌｎ、Ａｌａ、またはＳｅｒであり、
Ｘ１８は、芳香族アミノ酸または疎水性アミノ酸であり、
Ｘ１９は、Ｇｌｕ、Ｌｙｓ、Ｌｅｕ、Ｍｅｔ、Ｈｉｓ、Ａｓｐ、Ｇｌｎ、Ａｌａ、Ｓｅｒ、Ｔｒｐ、またはＡｒｇであり、
Ｘ２０は、ＴｙｒまたはＰｈｅであり、
Ｘ２１は、Ｇｌｎ、Ｔｙｒ、Ｐｈｅ、Ｔｒｐ、Ｈｉｓ、またはシクロヘキシル側鎖を有するアミノ酸であり、Ｔｙｒ、Ｐｈｅ、Ｔｒｐ、シクロヘキシル側鎖は、１つ以上のフッ素で置換されていてもよく、
Ｘ２２は、Ａｌａ、Ｇｌｎ、Ｔｒｐ、Ｌｅｕ、Ｔｙｒ、Ｇｌｙ、Ｓｅｒ、Ｖａｌ、またはＡｓｎであり、
Ｘ２３は、Ａｒｇ、Ａｓｐ、Ｌｅｕ、またはＡｌａであり、
Ｘ２５は、Ｇｌｎ、Ｔｙｒ、Ｐｈｅ、Ｔｒｐ、Ｈｉｓ、Ａｓｐ、またはシクロヘキシル側鎖を有するアミノ酸であり、Ｔｙｒ、Ｐｈｅ、Ｔｒｐ、シクロヘキシル側鎖は、１つ以上のフッ素で置換されていてもよく、
Ｘ２６は、Ａｓｎ、Ａｌａ、Ｌｅｕ、Ａｒｇ、Ｐｈｅ、Ｉｌｅ、Ｈｉｓ、またはＧｌｎであり、
Ｘ２９は、Ａｌａ、Ｌｅｕ、Ｇｌｕ、Ａｓｎ、Ｇｌｎ、Ｔｙｒ、Ｐｈｅ、Ｔｒｐ、Ｈｉｓ、またはシクロヘキシル側鎖を有するアミノ酸であり、Ｔｙｒ、Ｐｈｅ、Ｔｒｐ、シクロヘキシル側鎖は、１つ以上のフッ素で置換されていてもよく、
Ｘ３０は、Ａｌａ、Ａｒｇ、またはＶａｌであり、
Ｘ３１は、Ｖ、または前記ペプチドを別のペプチドと架橋させることができるアミノ酸であり、
Ｘ３２は、Ｖ、Ａｌａ、Ａｒｇ、Ｓｅｒ、または前記ペプチドを別のペプチドと架橋させることができるアミノ酸であり、
Ｘ−６、Ｘ−５、Ｘ−４、Ｘ−３、Ｘ−２、Ｘ−１、およびＸ１は任意選択であり、
前記ペプチドは、前記ペプチドを別のペプチドと架橋させることができる１〜２個のアミノ酸を含む、ペプチド。
【請求項３】
Ｘ−６が存在する場合、Ｘ−６はＧｌｙであり、Ｘ−５〜Ｘ１は存在し、
Ｘ−５が存在する場合、Ｘ−５はＣｙｓまたはＳｅｃであり、Ｘ−４〜Ｘ１は存在し、
Ｘ−４が存在する場合、Ｘ−４はＧｌｙであり、Ｘ−３〜Ｘ１は存在し、
Ｘ−３が存在する場合、Ｘ−３はＧｌｙであり、Ｘ−２〜Ｘ１は存在し、
Ｘ−２が存在する場合、Ｘ−２はＰｒｏ、Ｃｙｓ、Ｓｅｃ、またはＧｌｙであり、Ｘ−１およびＸ１は存在し、
Ｘ−１が存在する場合、Ｘ−１はＡｒｇまたはＧｌｙであり、Ｘ１は存在し、
Ｘ１が存在する場合、Ｘ１はＧｌｙ、Ａｒｇ、または前記ペプチドを別のペプチドと架橋させることができるアミノ酸である、請求項２に記載のペプチド。
【請求項４】
Ｘ−６〜Ｘ１は存在せず、Ｘ１１、Ｘ１５、Ｘ１６、Ｘ１９は各々、ＡｌａまたはＳｅｒであり、Ｘ１８はＨｉｓであり、Ｘ２０はＴｙｒであり、Ｘ２６はＡｓｎである、請求項２に記載のペプチド。
【請求項５】
第２のペプチドと会合した第１のペプチドを含むペプチド二量体であって、前記第１および第２のペプチドは各々、独立して、
Ｘ１ＰＸ３Ｘ４ＰＸ６Ｘ７ＰＧＤＸ１１ＡＸ１３Ｘ１４Ｘ１５ＤＬＸ１８Ｘ１９ＹＸ２１Ｘ２２ＲＬＸ２５Ｘ２６ＹＬＸ２９Ｘ３０ＶＡ（配列番号１）
のペプチド配列を含み、式中、
Ｘ１は、Ｇｌｙ、Ａｒｇ、または前記ペプチドを別のペプチドと架橋させることができるアミノ酸であり、
Ｘ３、Ｘ４、およびＸ６は各々、独立して、荷電アミノ酸であり、
Ｘ１０は荷電アミノ酸であり、
Ｘ７は、Ｔｙｒ、または前記ペプチドを別のペプチドと架橋させることができるアミノ酸であり、
Ｘ１１は、荷電アミノ酸、または前記ペプチドを別のペプチドと架橋させることができるアミノ酸であり、
Ｘ１３は、Ｓｅｒ、または前記ペプチドを別のペプチドと架橋させることができるアミノ酸であり、
Ｘ１４は、ＩｌｅまたはＧｌｕであり、
Ｘ１５は、Ｇｌｕ、Ａｓｐ、Ｇｌｎ、またはＧｌｙであり、
Ｘ１８は、芳香族アミノ酸または疎水性アミノ酸であり、
Ｘ１９は、Ｇｌｕ、Ａｓｐ、Ｇｌｎ、Ａｌａ、またはＴｒｐであり、
Ｘ２１、Ｘ２５、Ｘ２９は各々、独立して、Ｔｙｒ、Ｐｈｅ、Ｔｒｐ、Ｈｉｓ、またはシクロヘキシル側鎖を有するアミノ酸であり、Ｔｙｒ、Ｐｈｅ、Ｔｒｐ、シクロヘキシル側鎖は、１つ以上のフッ素で置換されていてもよく、
Ｘ２２は、Ａｌａ、Ｇｌｙ、Ｓｅｒ、またはＶａｌであり、
Ｘ２６は、Ａｓｎ、Ｌｅｕ、Ｉｌｅ、またはＨｉｓであり、
Ｘ３０は、ＡｌａまたはＡｒｇであり、
前記第１および第２のペプチドは各々、前記第１のペプチドを前記第２のペプチドと架橋させる１〜２個のアミノ酸を含む、ペプチド二量体、または、
第２のペプチドと会合した第１のペプチドを含むペプチド二量体であって、
前記第１および第２のペプチドは各々、独立して、配列番号１３のペプチド配列を含む、
前記第１および第２のペプチドは各々、独立して、配列番号４８のペプチド配列を含む、または
前記第１および第２のペプチドは各々、独立して、配列番号１、１３および４８からなる群から選択されるペプチド配列を含む、ペプチド二量体。
【請求項６】
二量体はホモ二量体である、請求項５に記載のペプチド二量体。
【請求項７】
二量体はヘテロ二量体である、請求項５に記載のペプチド二量体。
【請求項８】
ペプチドは、第２のペプチドと会合して、標的タンパク質に結合するペプチド二量体を形成する第１のペプチドであり、標的タンパク質は、Ｒａｓ、Ｒａｓ変異体、Ｍｙｃ／Ｍａｘ、ＲａｌＡ、βカテニン、ＹＡＰ／ＴＥＡＤ、およびＮＥＭＯ／ＩκＢキナーゼである、請求項１〜７のいずれか一項に記載のペプチド。
【請求項９】
ＰＸａＸｂＰＸｃＸｄＰ（配列番号２）の配列を含むオリゴマー化ドメインを含むペプチドであって、式中、Ｘａ、Ｘｂ、Ｘｃは、任意の非プロリンアミノ酸であり、Ｘｄは、前記ペプチドを第２のペプチドと架橋させることができるアミノ酸である、または、式中、Ｘａ、Ｘｂは、任意の非プロリンアミノ酸であり、ＸｃおよびＸｄは、前記ペプチドを第２のペプチドと架橋させることができるアミノ酸である、ペプチド。
【請求項１０】
第２のペプチドは、
ＰＸａＸｂＰＸｃＸｄＰ（配列番号２）の配列を含む、請求項９に記載のペプチド。
【請求項１１】
Ｘ１３Ｘ１４Ｘ１５ＤＬＸ１８Ｘ１９ＹＸ２１Ｘ２２ＲＬＸ２５Ｘ２６ＹＬＸ２９Ｘ３０ＶＡ（配列番号３）の配列を含むαヘリックスドメインをさらに含み、式中、Ｘ１３、Ｘ１４、Ｘ１５、Ｘ１８、Ｘ１９、Ｘ２１、Ｘ２２、Ｘ２５、Ｘ２６、Ｘ２９、およびＸ３０は、請求項１〜１０のいずれか一項に定義された通りである、請求項９に記載のペプチド。
【請求項１２】
Ｒａｓに関連した疾患または状態の処置を必要とする対象において当該処置における使用のための、請求項１〜１１のいずれか一項に記載のペプチド。
【請求項１３】
Ｒａｓに関連した疾患は、増殖性疾患である、請求項１２に記載の使用のためのペプチド。
【請求項１４】
増殖性疾患は癌である、請求項１２に記載の使用のためのペプチド。
【請求項１５】
Ｒａｓに関連した疾患は、ＣＦＣ症候群、毛細血管奇形−動静脈奇形症候群、Ｃｏｓｔｅｌｌｏ症候群、Ｌｅｇｉｕｓ症候群、神経線維腫症１型、Ｎｏｏｎａｎ症候群、または多発性黒子を伴うＮｏｏｎａｎ症候群（以前はＬＥＯＰＡＲＤ症候群）である、請求項１２に記載の使用のためのペプチド。
【請求項１６】
ペプチド二量体のライブラリをスクリーニングする方法であって、
第１のペプチドおよび第２のペプチドをコードするベクターでディスプレイ細胞を形質転換させるステップであって、前記第１および第２のペプチドが会合して、細胞壁タンパク質に融合したペプチド二量体を形成する、形質転換させるステップと、
前記ディスプレイ細胞を第１の標識と接触させるステップであって、前記第１の標識は、標的タンパク質を含み、前記標的に対する向上した結合性を有する前記ペプチド二量体を発現する細胞と会合し、前記標的に対する向上した結合性を有する前記ペプチド二量体を発現しない細胞とは会合しない、接触させるステップと、
前記第１の標識が会合している前記ディスプレイ細胞を単離させるステップと、
前記標的に対して向上した結合性を示す前記第１および第２のペプチドを同定するステップと、を含む、方法。
【請求項１７】
ペプチド二量体は、αヘリックス構造を各々が備える２つのペプチドのペプチドホモ二量体またはペプチドヘテロ二量体である、請求項１６に記載の方法。
【請求項１８】
請求項１〜１１のいずれか一項に記載のペプチドをコードする核酸。
【請求項１９】
請求項１８に記載の核酸を含む宿主細胞。
【請求項２０】
請求項１〜１１のいずれか一項に記載のペプチドを含む宿主細胞。