【手続補正書】
【提出日】平成30年1月29日(2018.1.29)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
試料中の血中循環腫瘍細胞（CTC）を検出する方法であって、
試料中のPC-CTCマーカー遺伝子発現産物のレベルを測定する段階；および
該マーカー遺伝子発現産物の検出レベルが参照基準レベルを上回る場合にPC-CTCが存在すると判定する段階
を含む、方法。
【請求項２】
CTCマーカー遺伝子が以下からなる群より選択される、請求項1記載の方法：
IGFBP5；ABI3BP；ADAMTS5；ADAMTSL1；ANG；ARSA；C1RL；C3；C4A；C4B；CCDC80；CD109；CHI3L1；CLEC3B；CMTM3；CMTM7；COL14A1；COL1A2；COL3A1；COL4A6；CSF1；DAG1；DCN；DMKN；FBLN1；FGF1；FMOD；GPC3；GPC4；HMGB1；IFNAR2；IL16；LAMA4；LTBP4；MFAP1A；NID2；OGN；PDAP1；PF4；PLAT；PODN；PRELP；RSPO1；SERPING1；SLURP1；SOD3；SPARC；SPOCK2；SPON2；SULF1；SULF2；TGFB2；TGM2；THBD；THBS1；THSD4；TIMP2；TNXB；TPT1；TWSG1およびWNT4。
【請求項３】
CTCマーカー遺伝子が以下からなる群より選択される、請求項1または2記載の方法：
IGFBP5；ALDH1A1；ALDH1A2；KLF4；DCN；SPARC；WNT；TGFB2；VEGF；COL1A2；COL3A1；およびTIMP2。
【請求項４】
CTCマーカー遺伝子が以下からなる群より選択される、請求項1〜3のいずれか一項記載の方法：
IGFBP5；ALDH1A2；KLF4；DCN；およびSPARC。
【請求項５】
CTCマーカー遺伝子が以下からなる群より選択される、請求項1〜4のいずれか一項記載の方法：
IGFBP5；ALDH1A2；KLF4；およびDCN。
【請求項６】
CTCマーカー遺伝子が以下からなる群より選択される、請求項1〜5のいずれか一項記載の方法：
TPT1；HMGB1；SPON 2；SPARC；およびARSA。
【請求項７】
CTCマーカー遺伝子が以下からなる群より選択される、請求項1〜6のいずれか一項記載の方法：
IL6ST；ARSA；TIMP2；CD55；SULF2；ITGA6；SDC4；CDON；およびSV2A。
【請求項８】
CTCが膵癌CTCである、請求項1〜7のいずれか一項記載の方法。
【請求項９】
試料からCTCを単離する第1の段階をさらに含む、請求項1〜8のいずれか一項記載の方法。
【請求項１０】
発現産物が核酸である、請求項1〜9のいずれか一項記載の方法。
【請求項１１】
発現産物のレベルが、以下からなる群より選択される方法を用いて決定される、請求項10記載の方法：
RT-PCR；定量的RT-PCR；ノーザンブロット法；マイクロアレイに基づく発現分析；次世代シークエンシング；およびRNAインサイチューハイブリダイゼーション。
【請求項１２】
発現産物がポリペプチドである、請求項1〜9のいずれか一項記載の方法。
【請求項１３】
発現産物のレベルが、以下からなる群より選択される方法を用いて決定される、請求項12記載の方法：
ウエスタンブロット法；免疫沈降法；酵素結合免疫吸着アッセイ（ELISA）；放射線免疫アッセイ（RIA）；サンドイッチアッセイ；蛍光インサイチューハイブリダイゼーション（FISH）；免疫組織染色；放射性免疫測定アッセイ；免疫蛍光アッセイ；質量分析法；FACS；および免疫電気泳動アッセイ。
【請求項１４】
CTCマーカー遺伝子標的剤を含む、対象における癌を治療するための薬学的組成物。
【請求項１５】
癌が膵癌である、請求項14記載の薬学的組成物。
【請求項１６】
CTCマーカー遺伝子標的剤がCTCマーカー遺伝子の阻害薬を含む、請求項14〜15のいずれか一項記載の方法。
【請求項１７】
阻害薬が抗体である、請求項16記載の薬学的組成物。
【請求項１８】
阻害薬が阻害性核酸である、請求項16記載の薬学的組成物。
【請求項１９】
CTCマーカー遺伝子標的剤がCTCマーカー遺伝子結合性抗体および化学療法薬を含む、請求項14〜18のいずれか一項記載の薬学的組成物。
【請求項２０】
前記対象が、血液中および／または癌の間質中に存在するCTCのレベルが高い、かつ／またはCTCマーカー遺伝子のレベルが高いと判定された対象である、請求項14〜19のいずれか一項記載の薬学的組成物。
【請求項２１】
CTCマーカー遺伝子標的剤が、以下からなる群より選択されるマーカー遺伝子と結合するCTCマーカー遺伝子結合性抗体を含む、請求項14〜20のいずれか一項記載の薬学的組成物：
IL6ST、SULF2およびSV2A。
【請求項２２】
CTCマーカー遺伝子標的療法による治療に反応する可能性について、対象由来の試料を検査する方法であって、
試料中に存在するCTCマーカー遺伝子発現産物のレベルを測定する段階であって、該試料が血液および／または癌の間質を含む、段階；ならびに
該発現産物のレベルが参照基準レベルに比して高い場合に、対象が治療に反応する可能性が高いと判定する段階
を含む、方法。
【請求項２３】
試料からCTCを単離する第1の段階をさらに含む、請求項22記載の方法。
【請求項２４】
癌が膵癌である、請求項22または23記載の方法。
【請求項２５】
発現産物が核酸である、請求項22〜24のいずれか一項記載の方法。
【請求項２６】
発現産物のレベルが、以下からなる群より選択される方法を用いて決定される、請求項25記載の方法：
RT-PCR；定量的RT-PCR；ノーザンブロット法；マイクロアレイに基づく発現分析；次世代シークエンシング；およびRNAインサイチューハイブリダイゼーション。
【請求項２７】
発現産物がポリペプチドである、請求項22〜24のいずれか一項記載の方法。
【請求項２８】
発現産物のレベルが、以下からなる群より選択される方法を用いて決定される、請求項27記載の方法：
ウエスタンブロット法；免疫沈降法；酵素結合免疫吸着アッセイ（ELISA）；放射線免疫アッセイ（RIA）；サンドイッチアッセイ；蛍光インサイチューハイブリダイゼーション（FISH）；免疫組織染色；放射性免疫測定アッセイ；免疫蛍光アッセイ；質量分析法；FACS；および免疫電気泳動アッセイ。
【請求項２９】
CTCマーカー遺伝子が以下からなる群より選択される、請求項22〜28のいずれか一項記載の方法：
IGFBP5；ABI3BP；ADAMTS5；ADAMTSL1；ANG；ARSA；C1RL；C3；C4A；C4B；CCDC80；CD109；CHI3L1；CLEC3B；CMTM3；CMTM7；COL14A1；COL1A2；COL3A1；COL4A6；CSF1；DAG1；DCN；DMKN；FBLN1；FGF1；FMOD；GPC3；GPC4；HMGB1；IFNAR2；IL16；LAMA4；LTBP4；MFAP1A；NID2；OGN；PDAP1；PF4；PLAT；PODN；PRELP；RSPO1；SERPING1；SLURP1；SOD3；SPARC；SPOCK2；SPON2；SULF1；SULF2；TGFB2；TGM2；THBD；THBS1；THSD4；TIMP2；TNXB；TPT1；TWSG1およびWNT4。
【請求項３０】
CTCマーカー遺伝子が以下からなる群より選択される、請求項22〜29のいずれか一項記載の方法：
IGFBP5；ALDH1A1；ALDH1A2；KLF4；DCN；SPARC；WNT；TGFB2；VEGF；COL1A2；COL3A1；およびTIMP2。
【請求項３１】
CTCマーカー遺伝子が以下からなる群より選択される、請求項22〜29のいずれか一項記載の方法：
IGFBP5；ALDH1A2；KLF4；DCN；およびSPARC。
【請求項３２】
CTCマーカー遺伝子が以下からなる群より選択される、請求項22〜29のいずれか一項記載の方法：
IGFBP5；ALDH1A2；KLF4；およびDCN。
【請求項３３】
CTCマーカー遺伝子が以下からなる群より選択される、請求項22〜29のいずれか一項記載の方法：
TPT1；HMGB1；SPON 2；SPARC；およびARSA。
【請求項３４】
CTCマーカー遺伝子が以下からなる群より選択される、請求項22〜29のいずれか一項記載の方法：
IL6ST；ARSA；TIMP2；CD55；SULF2；ITGA6；SDC4；CDON；およびSV2A。
【請求項３５】
対象の治療の有効性をモニターする方法であって、
癌治療を行った後の対象における血液中および／または癌の間質中に存在するCTCマーカー遺伝子発現産物のレベルを測定する段階；および
CTCマーカー遺伝子発現産物のレベルが参照基準レベルに比して低い場合に対象が治療に反応していると判定し、CTCマーカー遺伝子発現産物が参照基準レベルに比して低くない場合に対象が治療に反応していないと判定する段階
を含む、方法。
【請求項３６】
癌が膵癌である、請求項35記載の方法。
【請求項３７】
参照基準レベルが、癌治療を行う前の患者における遺伝子発現産物のレベルである、請求項35または36記載の方法。
【請求項３８】
試料からCTCを単離する第1の段階をさらに含む、請求項35〜37のいずれか一項記載の方法。
【請求項３９】
発現産物が核酸である、請求項35〜38のいずれか一項記載の方法。
【請求項４０】
発現産物のレベルが、以下からなる群より選択される方法を用いて決定される、請求項39記載の方法：
RT-PCR；定量的RT-PCR；ノーザンブロット法；マイクロアレイに基づく発現分析；次世代シークエンシング；およびRNAインサイチューハイブリダイゼーション。
【請求項４１】
発現産物がポリペプチドである、請求項35〜38のいずれか一項記載の方法。
【請求項４２】
発現産物のレベルが、以下からなる群より選択される方法を用いて決定される、請求項41記載の方法：
ウエスタンブロット法；免疫沈降法；酵素結合免疫吸着アッセイ（ELISA）；放射線免疫アッセイ（RIA）；サンドイッチアッセイ；蛍光インサイチューハイブリダイゼーション（FISH）；免疫組織染色；放射性免疫測定アッセイ；免疫蛍光アッセイ；質量分析法；FACS；および免疫電気泳動アッセイ。
【請求項４３】
CTCマーカー遺伝子が以下からなる群より選択される、請求項35〜42のいずれか一項記載の方法：
IGFBP5；ABI3BP；ADAMTS5；ADAMTSL1；ANG；ARSA；C1RL；C3；C4A；C4B；CCDC80；CD109；CHI3L1；CLEC3B；CMTM3；CMTM7；COL14A1；COL1A2；COL3A1；COL4A6；CSF1；DAG1；DCN；DMKN；FBLN1；FGF1；FMOD；GPC3；GPC4；HMGB1；IFNAR2；IL16；LAMA4；LTBP4；MFAP1A；NID2；OGN；PDAP1；PF4；PLAT；PODN；PRELP；RSPO1；SERPING1；SLURP1；SOD3；SPARC；SPOCK2；SPON2；SULF1；SULF2；TGFB2；TGM2；THBD；THBS1；THSD4；TIMP2；TNXB；TPT1；TWSG1およびWNT4。
【請求項４４】
CTCマーカー遺伝子が以下からなる群より選択される、請求項35〜43のいずれか一項記載の方法：
IGFBP5；ALDH1A1；ALDH1A2；KLF4；DCN；SPARC；WNT；TGFB2；VEGF；COL1A2；COL3A1；およびTIMP2。
【請求項４５】
CTCマーカー遺伝子が以下からなる群より選択される、請求項35〜43のいずれか一項記載の方法：
IGFBP5；ALDH1A2；KLF4；DCN；およびSPARC。
【請求項４６】
CTCマーカー遺伝子が以下からなる群より選択される、請求項35〜43のいずれか一項記載の方法：
IGFBP5；ALDH1A2；KLF4；およびDCN。
【請求項４７】
CTCマーカー遺伝子が以下からなる群より選択される、請求項35〜43のいずれか一項記載の方法：
TPT1；HMGB1；SPON 2；SPARC；およびARSA。
【請求項４８】
CTCマーカー遺伝子が以下からなる群より選択される、請求項35〜43のいずれか一項記載の方法：
IL6ST；ARSA；TIMP2；CD55；SULF2；ITGA6；SDC4；CDON；およびSV2A。