【手続補正書】
【提出日】平成30年8月13日(2018.8.13)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
対象における癌のステージを判定するためのデータを収集する方法であって、癌を有する対象からの生物学的試料中の循環癌関連マクロファージ様細胞（ＣＡＭＬ）を特徴付けるステップを含み、前記ＣＡＭＬの選択される特性が、前記対象における癌のステージを示す方法。
【請求項２】
前記生物学的試料中の循環腫瘍細胞（ＣＴＣ）を特徴付けるステップをさらに含み、前記ＣＡＭＬ及びＣＴＣの選択される特性が前記対象における癌のステージを示す、請求項１に記載の方法。
【請求項３】
癌治療の効力をモニタリングするためのデータを収集する方法であって、（ａ）癌治療を受けている対象からの生物学的試料中の循環癌関連マクロファージ様細胞（ＣＡＭＬ）の１つ又は複数の選択される特性を検査するステップ、及び（ｂ）治療の前、その間又は完了の後の１つ又は複数の時点で、（ａ）で判定される１つ又は複数の選択される前記特性の検査値を、同じ対象からの類似の生物学的試料で検査される同じ特性の検査値と比較するステップを含み、１つ又は複数の検査値の変化が、前記対象での前記癌治療の効力を示す方法。
【請求項４】
（ａ）前記生物学的試料中の循環腫瘍細胞（ＣＴＣ）の１つ又は複数の選択される特性を検査するステップ、及び（ｂ）治療の前、その間又は完了の後の１つ又は複数の時点で、（ａ）で判定される１つ又は複数の選択される前記特性の検査値を、同じ対象からの類似の生物学的試料で検査される同じ特性の検査値と比較するステップをさらに含む、請求項３に記載の方法。
【請求項５】
前記ＣＡＭＬの選択される特性が、（ｉ）ＣＡＭＬの数；（ｉｉ）ＣＡＭＬの平均サイズ；（ｉｉｉ）個々のＣＡＭＬのサイズ；（ｉｖ）ＣＡＭＬの核の平均サイズ；（ｖ）ＣＡＭＬの形態学的形状；（ｖｉ）ＣＤ１４陽性表現型；（ｖｉｉ）ＣＤ４５発現の程度；（ｖｉｉｉ）ＥｐＣＡＭ発現の程度；（ｉｘ）ビメンチン発現の程度；（ｘ）ＰＤ−Ｌ１発現の程度；（ｘｉ）ＣＤ１１Ｃマーカー発現の程度；（ｘｉｉ）ＣＤ１４６マーカー発現の程度；（ｘｉｉｉ）ＣＤ２０２ｂマーカー発現の程度；（ｘｉｖ）ＣＤ３１マーカー発現の程度；（ｘｖ）ＲＡＤ５０マーカー発現の程度；（ｘｖｉ）ＰＤ−１マーカー発現の程度；（ｘｖｉｉ）ＣＣＲマーカー発現の程度；（ｘｖｉｉｉ）ＰＤＸ−１マーカー発現の程度；（ｘｉｘ）ＣＤ１０マーカー発現の程度；（ｘｘ）ＡＲマーカー発現の程度；（ｘｘｉ）ＥＲマーカー発現の程度；（ｘｘｉｉ）ＣＡＭＬ中の白血球の存在；（ｘｘｉｉｉ）マーカーの位置；（ｘｘｉｖ）前記ＣＡＭＬでの、拡散しているか又は空胞及び／若しくは摂取物と会合している、前記癌と関連した１つ又は複数のマーカーの存在；並びに（ｘｘｖ）マーカー染色の強度からなる群から選択される１つ又は複数の特性である、請求項１〜４のいずれか一項に記載の方法。
【請求項６】
前記ＣＡＭＬの選択される特性が、（ｉ）ＣＡＭＬの数；（ｉｉ）ＣＡＭＬの平均サイズ；（ｉｉｉ）マーカー染色の強度；（ｉｖ）マーカーの位置；（ｖ）個々のＣＡＭＬのサイズ；（ｖｉ）ＰＤ−Ｌ１マーカー発現の程度；（ｖｉｉ）ＣＤ３１マーカー発現の程度のうちの１つ又は複数である、請求項１〜４のいずれか一項に記載の方法。
【請求項７】
前記ＣＡＭＬの選択される特性が、（ｉ）直径約１４μｍ〜約６４μｍのサイズを有する、複数の個々の核及び／又は拡大した融合核小体；（ｉｉ）約２０ミクロン〜約３００ミクロンの範囲の細胞のサイズ；（ｉｉｉ）紡錘形、オタマジャクシ形、円形、長方形、及び無定形からなる群から選択される形態学的形状；（ｉｖ）以下のマーカー：ＣＫ８、１８及び１９、ビメンチン、ＣＤ４５、ＣＤ１１ｃ、ＣＤ１４、ＣＤ１４６、ＣＤ２０２ｂ、ＣＤ３１のうちの１つ又は複数の発現、のうちの１つ又は複数である、請求項１〜４のいずれか一項に記載の方法。
【請求項８】
前記ＣＴＣの選択される特性が、（ｉ）ＣＴＣの数；（ｉｉ）ＣＴＣに結合した白血球（ＷＢＣ）の数；（ｉｉｉ）核の状態；（ｉｖ）サイトケラチン８発現の程度；（ｖ）サイトケラチン１８発現の程度；（ｖｉ）サイトケラチン１９発現の程度；（ｖｉｉ）ＥｐＣＡＭ発現の程度；（ｖｉｉｉ）ビメンチン発現の程度；（ｉｘ）ＰＤ−Ｌ１発現の程度；（ｘ）ウロプラキン発現の程度；（ｘｉ）サイトケラチン形態；（ｘｉｉ）マーカーの位置；及び（ｘｉｉｉ）マーカー染色の強度からなる群から選択される１つ又は複数の特性である、請求項２又は４に記載の方法。
【請求項９】
前記ＣＴＣの選択される特性が、（ｉ）ＣＴＣの数；（ｉｉ）マーカー染色の強度；（ｉｉｉ）マーカーの位置；（ｉｖ）ＣＴＣに結合した白血球（ＷＢＣ）の数、のうちの１つ又は複数である、請求項２又は４に記載の方法。
【請求項１０】
前記ＣＡＭＬが、サイズ排除方法、赤血球溶解、ＦＩＣＯＬＬ、マイクロ流体チップ及びフローサイトメトリー又はこれらの組合せからなる群から選択される１つ又は複数の手段を使用して前記生物学的試料から収集される、請求項１又は３に記載の方法。
【請求項１１】
前記サイズ排除方法が、マイクロフィルターの使用を含み、前記マイクロフィルターが精密孔配置及び均一な孔分布を有する、請求項１０に記載の方法。
【請求項１２】
前記ＣＡＭＬ及びＣＴＣが、サイズ排除方法、赤血球溶解、ＦＩＣＯＬＬ、マイクロ流体チップ及びフローサイトメトリー又はこれらの組合せからなる群から選択される１つ又は複数の手段を使用して前記生物学的試料から収集される、請求項２又は４に記載の方法。
【請求項１３】
前記サイズ排除方法が、約５〜１０ミクロンの孔径を有するマイクロフィルターの使用を含む、請求項１２に記載の方法。
【請求項１４】
前記サイズ排除方法が、マイクロフィルターの使用を含み、前記マイクロフィルターが精密孔配置及び均一な孔分布を有する、請求項１２に記載の方法。
【請求項１５】
前記マイクロフィルターが、約７〜８ミクロンの孔径を有する請求項１３又は１４に記載の方法。
【請求項１６】
ＣＡＭＬ及びＣＴＣの数が、物理的サイズに基づく選別、流体力学的サイズに基づく選別、グループ分け、トラッピング、免疫捕捉、大細胞の濃縮、又はサイズに基づく小細胞の排除、に基づいてマイクロ流体チップを使用して判定される、請求項５又は８に記載の方法。
【請求項１７】
ＣＡＭＬ及びＣＴＣの数が、低圧精密濾過アッセイを使用して判定される、請求項５又は８に記載の方法。
【請求項１８】
前記生物学的試料が、末梢血、血液、リンパ節、骨髄、脳脊髄液、組織及び尿からなる群から選択される１つ又は複数である、請求項１〜１７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１９】
前記癌が固形腫瘍である、又は前記癌が上皮細胞癌、癌腫、肉腫、神経芽細胞腫又は黒色腫である、又は前記癌が乳癌、前立腺癌、肺癌、膵臓癌又は結腸直腸癌である、請求項１〜１８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２０】
対象におけるウイルス感染を診断するためのデータを収集する方法であって、対象から得た生物学的試料から循環癌関連マクロファージ様細胞（ＣＡＭＬ）を収集するステップ、及び収集した前記ＣＡＭＬをウイルスについてスクリーニングするステップを含み、
前記スクリーニングが、ウイルスマーカーについてＣＡＭＬを染色することによるものであるか又は前記ＣＡＭＬからのＤＮＡ又はＲＮＡの分子分析によるものであり、或いは、前記ウイルス感染が、ヒト免疫不全ウイルス（ＨＩＶ）、Ｂ型肝炎ウイルス（ＨＢＶ）又はエプスタイン・バーウイルス（ＥＢＶ）感染である、方法。
【請求項２１】
選択される薬物標的マーカーを循環癌関連マクロファージ様細胞（ＣＡＭＬ）及び／又は循環腫瘍細胞（ＣＴＣ）においてスクリーニングするためのコンパニオン診断方法のためのデータを収集する方法であって、前記ＣＡＭＬ及び／又はＣＴＣが選択される薬物標的マーカーを発現又は保有するかどうか判定するために、対象からの生物学的試料からＣＡＭＬ及び／又はＣＴＣを収集するステップを含み、
選択される前記薬物標的マーカーが細胞表面マーカー、ポリヌクレオチド又は遺伝子の突然変異、増幅又は転座である、方法。
【請求項２２】
前記細胞表面マーカーがＰＤ−Ｌ１である、請求項２１に記載の方法。
【請求項２３】
循環癌関連マクロファージ様細胞（ＣＡＭＬ）を得るステップ、及び前記細胞で分子分析を実行するステップを含む、ＣＡＭＬの分子分析の方法であって、
前記分子分析が、核酸配列決定、ノーザンブロット分析及びサザンブロット分析のうちの１つ又は複数である、方法。
【請求項２４】
ＣＡＭＬを蛍光免疫染色又は比色染色によって視覚化するステップをさらに含む、請求項１記載の方法。
【請求項２５】
ＣＡＭＬの分子分析が癌の診断後に実行される、請求項２３記載の方法。
【請求項２６】
ＣＡＭＬのサイズ及び数が癌のステージを支持する、請求項１記載の方法。