【手続補正書】
【提出日】平成30年11月12日(2018.11.12)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
患者がＩＬ−３３媒介性障害の増加した危険にさらされているかどうかの決定方法であって、ｒｓ４９８８９５６（配列番号１）、ｒｓ１０２０４１３７（配列番号２）、ｒｓ１０１９２０３６（配列番号３）、ｒｓ１０１９２１５７（配列番号４）、ｒｓ１０２０６７５３（配列番号５）、ｒｓ４７４２１６５（配列番号６）からなる群から選択される１つ以上の多型、ならびにｒｓ４９８８９５６（配列番号１）、ｒｓ１０２０４１３７（配列番号２）、ｒｓ１０１９２０３６（配列番号３）、ｒｓ１０１９２１５７（配列番号４）、ｒｓ１０２０６７５３（配列番号５）、及びｒｓ４７４２１６５（配列番号６）からなる群から選択される多型と連鎖不均衡にある多型での遺伝子型を、患者に由来する試料中で決定することを含み、
（ａ）患者の遺伝子型が多型ｒｓ４９８８９５６（配列番号１）でのＧアレルを含む場合、
（ｂ）患者の遺伝子型が多型ｒｓ１０２０４１３７（配列番号２）でのＡアレルを含む場合、
（ｃ）患者の遺伝子型が多型ｒｓ１０１９２０３６（配列番号３）でのＣアレルを含む場合、
（ｄ）患者の遺伝子型が多型ｒｓ１０１９２１５７（配列番号４）でのＣアレルを含む場合、
（ｅ）患者の遺伝子型が多型ｒｓ１０２０６７５３（配列番号５）でのＴアレルを含む場合、
（ｆ）患者の遺伝子型が多型ｒｓ４７４２１６５（配列番号６）でのＴアレルを含む場合、かつ／あるいは
（ｇ）患者の遺伝子型が、ｒｓ４９８８９５６（配列番号１）、ｒｓ１０２０４１３７（配列番号２）、ｒｓ１０１９２０３６（配列番号３）、ｒｓ１０１９２１５７（配列番号４）、ｒｓ１０２０６７５３（配列番号５）、及びｒｓ４７４２１６５（配列番号６）からなる群から選択される多型と連鎖不均衡にある多型での等価アレルを含む場合に、患者がＩＬ−３３媒介性障害の増加した危険にさらされている、方法。
【請求項２】
ＩＬ−３３媒介性障害を患っている患者がＩＬ−３３軸結合アンタゴニストを含む治療に応答する可能性が高いかどうかの決定方法であって、
（ａ）ｒｓ４９８８９５６（配列番号１）、ｒｓ１０２０４１３７（配列番号２）、ｒｓ１０１９２０３６（配列番号３）、ｒｓ１０１９２１５７（配列番号４）、ｒｓ１０２０６７５３（配列番号５）、ｒｓ４７４２１６５（配列番号６）からなる群から選択される１つ以上の多型、ならびにｒｓ４９８８９５６（配列番号１）、ｒｓ１０２０４１３７（配列番号２）、ｒｓ１０１９２０３６（配列番号３）、ｒｓ１０１９２１５７（配列番号４）、ｒｓ１０２０６７５３（配列番号５）、及びｒｓ４７４２１６５（配列番号６）からなる群から選択される多型と連鎖不均衡にある多型での遺伝子型を、ＩＬ−３３媒介性障害を患う患者に由来する試料中で決定することと、
（ｂ）患者を、遺伝子型に基づいて、ＩＬ−３３軸結合アンタゴニストを含む治療に応答性である可能性が高いとして特定することと、を含み、
（ｉ）多型ｒｓ４９８８９５６（配列番号１）での各Ｇアレル、
（ｉｉ）多型ｒｓ１０２０４１３７（配列番号２）での各Ａアレル、
（ｉｉｉ）多型ｒｓ１０１９２０３６（配列番号３）での各Ｃアレル、
（ｉｖ）多型ｒｓ１０１９２１５７（配列番号４）での各Ｃアレル、
（ｖ）多型ｒｓ１０２０６７５３（配列番号５）での各Ｔアレル、
（ｖｉ）多型ｒｓ４７４２１６５（配列番号６）での各Ｔアレル、ならびに／または
（ｖｉｉ）ｒｓ４９８８９５６（配列番号１）、ｒｓ１０２０４１３７（配列番号２）、ｒｓ１０１９２０３６（配列番号３）、ｒｓ１０１９２１５７（配列番号４）、ｒｓ１０２０６７５３（配列番号５）、及びｒｓ４７４２１６５（配列番号６）からなる群から選択される多型と連鎖不均衡にある多型での各等価アレルの存在が、患者がＩＬ−３３軸結合アンタゴニストを含む治療に応答性である可能性の増加を有することを示す、方法。
【請求項３】
患者に由来する試料中のペリオスチンのレベルを決定することを更に含む、請求項１又は２に記載の方法。
【請求項４】
試料中のペリオスチンのレベルが参照ペリオスチンレベル以下である場合に、患者がＩＬ−３３軸結合アンタゴニストによる治療に応答性である可能性の増加を有する、請求項３に記載の方法。
【請求項５】
試料中のペリオスチンのレベルが参照ペリオスチンレベル以上である場合に、患者がＩＬ−３３軸結合アンタゴニストによる治療に応答性である可能性の増加を有する、請求項３に記載の方法。
【請求項６】
ｒｓ４９８８９５６（配列番号１）、ｒｓ１０２０４１３７（配列番号２）、ｒｓ１０１９２０３６（配列番号３）、ｒｓ１０１９２１５７（配列番号４）、ｒｓ１０２０６７５３（配列番号５）、及びｒｓ４７４２１６５（配列番号６）からなる群から選択される多型と連鎖不均衡にある多型が、選択された多型に対する０．６以上のＤ’値を有する、請求項１〜５のいずれか１項に記載の方法。
【請求項７】
Ｄ’値が０．８以上である、請求項６に記載の方法。
【請求項８】
ｒｓ４９８８９５６（配列番号１）、ｒｓ１０２０４１３７（配列番号２）、ｒｓ１０１９２０３６（配列番号３）、ｒｓ１０１９２１５７（配列番号４）、ｒｓ１０２０６７５３（配列番号５）、及びｒｓ４７４２１６５（配列番号６）からなる群から選択される多型と連鎖不均衡にある多型が、表３または表４中の多型である、請求項１〜７のいずれか１項に記載の方法。
【請求項９】
等価アレルが、多型ｒｓ４７４２１６５（配列番号６）と連鎖不均衡にある多型のマイナーアレルである、請求項１〜８のいずれか１項に記載の方法。
【請求項１０】
等価アレルが、多型ｒｓ１０２０６７５３（配列番号５）と連鎖不均衡にある多型のメジャーアレルである、請求項１〜８のいずれか１項に記載の方法。
【請求項１１】
ＩＬ−３３軸結合アンタゴニストが、トリプターゼ−ベータ結合アンタゴニスト、Ｔｈ２細胞上で発現される化学誘引物質受容体相同分子（ＣＲＴＨ２）結合アンタゴニスト、インターロイキン−１３（ＩＬ−１３）結合アンタゴニスト、インターロイキン−１７（ＩＬ−１７）結合アンタゴニスト、ＪＡＫ１アンタゴニスト、及び／またはインターロイキン−５（ＩＬ−５）結合アンタゴニストと組み合わせた投与のために製剤化されている、請求項１〜１０のいずれか１項に記載の方法。
【請求項１２】
ＩＬ−３３軸結合アンタゴニストが、ＩＬ−３３結合アンタゴニスト、ＳＴ２結合アンタゴニスト、またはＩＬ−１ＲＡｃＰ結合アンタゴニストである、請求項１〜１０のいずれか１項に記載の方法。
【請求項１３】
（ａ）ＩＬ−３３結合アンタゴニストが、抗ＩＬ３３抗体またはその抗原結合断片であり、
（ｂ）ＳＴ２結合アンタゴニストが、ＳＴ２−Ｆｃタンパク質、抗ＳＴ２抗体、またはその抗原結合断片であり、あるいは
（ｃ）ＩＬ−１ＲＡｃＰ結合アンタゴニストが、抗ＩＬ−１ＲＡｃＰ抗体である、請求項１２に記載の方法。
【請求項１４】
ＩＬ−３３媒介性障害が、炎症状態、免疫障害、線維障害、好酸球障害、感染症、疼痛、中枢神経系障害、固形腫瘍、及び眼科的障害からなる群から選択される、請求項１〜１３のいずれか１項に記載の方法。
【請求項１５】
炎症状態が、喘息、敗血症、敗血症性ショック、アトピー性皮膚炎、アレルギー性鼻炎、リウマチ性関節炎、及び慢性閉塞性肺疾患（ＣＯＰＤ）からなる群から選択される、請求項１４に記載の方法。
【請求項１６】
免疫障害が、喘息、リウマチ性関節炎、アレルギー、アナフィラキシー、アナフィラキシー性ショック、アレルギー性鼻炎、乾癬、炎症性腸疾患（ＩＢＤ）、クローン病、糖尿病、及び肝臓疾患からなる群から選択される、請求項１４に記載の方法。
【請求項１７】
線維疾患が、特発性肺線維症（ＩＰＦ）である、請求項１４に記載の方法。
【請求項１８】
好酸球障害が、好酸球関連胃腸疾患（ＥＧＩＤ）である、請求項１４に記載の方法。
【請求項１９】
ＥＧＩＤが、好酸球性食道炎である、請求項１８に記載の方法。
【請求項２０】
感染症が、蠕虫感染症、原虫感染症、またはウイルス感染症である、請求項１４に記載の方法。
【請求項２１】
原虫感染症が、森林型熱帯リーシュマニア（Ｌｅｉｓｈｍａｎｉａ  ｍａｊｏｒ）感染症である、請求項２０に記載の方法。
【請求項２２】
ウイルス感染症が、呼吸器合胞体ウイルス（ＲＳＶ）感染症またはインフルエンザ感染症である、請求項２０に記載の方法。
【請求項２３】
疼痛が、炎症性疼痛である、請求項１４に記載の方法。
【請求項２４】
中枢神経系障害が、アルツハイマー病である、請求項１４に記載の方法。
【請求項２５】
固形腫瘍が、乳房腫瘍、結腸腫瘍、前立腺腫瘍、肺腫瘍、腎臓腫瘍、肝臓腫瘍、膵臓腫瘍、胃腫瘍、腸腫瘍、脳腫瘍、骨腫瘍、及び皮膚腫瘍からなる群から選択される、請求項１４に記載の方法。
【請求項２６】
眼科的障害が、眼の加齢性黄斑変性症（ＡＭＤ）、地図状萎縮（ＧＡ）、または網膜症である、請求項１４に記載の方法。
【請求項２７】
参照ペリオスチンレベルが、約２３ｎｇ／ｍｌ〜約５０ｎｇ／ｍｌである、請求項４〜２６のいずれか１項に記載の方法。
【請求項２８】
患者に由来する試料が、全血試料、血清試料、血漿試料、またはこれらの組み合わせである、請求項１〜２７のいずれか１項に記載の方法。
【請求項２９】
ＩＬ−３３媒介性障害を患っている患者を治療するための、有効量のＩＬ−３３軸結合アンタゴニストを含む医薬であって、患者が、多型ｒｓ４９８８９５６（配列番号１）でのＧアレル、多型ｒｓ１０２０４１３７（配列番号２）でのＡアレル、多型ｒｓ１０１９２０３６（配列番号３）でのＣアレル、多型ｒｓ１０１９２１５７（配列番号４）でのＣアレル、多型ｒｓ１０２０６７５３（配列番号５）でのＴアレル、多型ｒｓ４７４２１６５（配列番号６）でのＴアレル、ならびに／またはｒｓ４９８８９５６（配列番号１）、ｒｓ１０２０４１３７（配列番号２）、ｒｓ１０１９２０３６（配列番号３）、ｒｓ１０１９２１５７（配列番号４）、ｒｓ１０２０６７５３（配列番号５）、及びｒｓ４７４２１６５（配列番号６）からなる群から選択される多型と連鎖不均衡にある多型での等価アレル、のうちの１つ以上を含むことが決定されている、医薬。
【請求項３０】
患者に由来する試料中のペリオスチンのレベルが参照ペリオスチンレベル以下である場合に、患者がＩＬ−３３軸結合アンタゴニストによる治療に応答性である可能性の増加を有する、請求項２９に記載の医薬。
【請求項３１】
患者に由来する試料中のペリオスチンのレベルが参照ペリオスチンレベル以上である場合に、患者がＩＬ−３３軸結合アンタゴニストによる治療に応答性である可能性の増加を有する、請求項２９に記載の医薬。
【請求項３２】
ｒｓ４９８８９５６（配列番号１）、ｒｓ１０２０４１３７（配列番号２）、ｒｓ１０１９２０３６（配列番号３）、ｒｓ１０１９２１５７（配列番号４）、ｒｓ１０２０６７５３（配列番号５）、及びｒｓ４７４２１６５（配列番号６）からなる群から選択される多型と連鎖不均衡にある多型が、選択された多型に対する０．６以上のＤ’値を有する、請求項２９〜３１のいずれか１項に記載の医薬。
【請求項３３】
Ｄ’値が０．８以上である、請求項３２に記載の医薬。
【請求項３４】
ｒｓ４９８８９５６（配列番号１）、ｒｓ１０２０４１３７（配列番号２）、ｒｓ１０１９２０３６（配列番号３）、ｒｓ１０１９２１５７（配列番号４）、ｒｓ１０２０６７５３（配列番号５）、及びｒｓ４７４２１６５（配列番号６）からなる群から選択される多型と連鎖不均衡にある多型が、表３または表４中の多型である、請求項２９〜３３のいずれか１項に記載の医薬。
【請求項３５】
等価アレルが、多型ｒｓ４７４２１６５（配列番号６）と連鎖不均衡にある多型のマイナーアレルである、請求項２９〜３４のいずれか１項に記載の医薬。
【請求項３６】
等価アレルが、多型ｒｓ１０２０６７５３（配列番号５）と連鎖不均衡にある多型のメジャーアレルである、請求項２９〜３４のいずれか１項に記載の医薬。
【請求項３７】
ＩＬ−３３軸結合アンタゴニストが、トリプターゼ−ベータ結合アンタゴニスト、Ｔｈ２細胞上で発現される化学誘引物質受容体相同分子（ＣＲＴＨ２）結合アンタゴニスト、インターロイキン−１３（ＩＬ−１３）結合アンタゴニスト、インターロイキン−１７（ＩＬ−１７）結合アンタゴニスト、ＪＡＫ１アンタゴニスト、及び／またはインターロイキン−５（ＩＬ−５）結合アンタゴニストと組み合わせ組み合わせた投与のために製剤化されている、請求項２９〜３６のいずれか１項に記載の医薬。
【請求項３８】
ＩＬ−３３軸結合アンタゴニストが、ＩＬ−３３結合アンタゴニスト、ＳＴ２結合アンタゴニスト、またはＩＬ−１ＲＡｃＰ結合アンタゴニストである、請求項２９〜３７のいずれか１項に記載の医薬。
【請求項３９】
（ａ）ＩＬ−３３結合アンタゴニストが、抗ＩＬ３３抗体またはその抗原結合断片である、
（ｂ）ＳＴ２結合アンタゴニストが、ＳＴ２−Ｆｃタンパク質、抗ＳＴ２抗体、またはその抗原結合断片である、あるいは
（ｃ）ＩＬ−１ＲＡｃＰ結合アンタゴニストが、抗ＩＬ−１ＲＡｃＰ抗体である、請求項３８に記載の医薬。
【請求項４０】
ＩＬ−３３媒介性障害が、炎症状態、免疫障害、線維障害、好酸球障害、感染症、疼痛、中枢神経系障害、固形腫瘍、及び眼科的障害からなる群から選択される、請求項２９〜３９のいずれか１項に記載の医薬。
【請求項４１】
炎症状態が、喘息、敗血症、敗血症性ショック、アトピー性皮膚炎、アレルギー性鼻炎、リウマチ性関節炎、及び慢性閉塞性肺疾患（ＣＯＰＤ）からなる群から選択される、請求項４０に記載の医薬。
【請求項４２】
免疫障害が、喘息、リウマチ性関節炎、アレルギー、アナフィラキシー、アナフィラキシー性ショック、アレルギー性鼻炎、乾癬、炎症性腸疾患（ＩＢＤ）、クローン病、糖尿病、及び肝臓疾患からなる群から選択される、請求項４０に記載の医薬。
【請求項４３】
線維疾患が、特発性肺線維症（ＩＰＦ）である、請求項４０に記載の医薬。
【請求項４４】
好酸球障害が、好酸球関連胃腸疾患（ＥＧＩＤ）である、請求項４０に記載の医薬。
【請求項４５】
ＥＧＩＤが、好酸球性食道炎である、請求項４４に記載の医薬。
【請求項４６】
感染症が、蠕虫感染症、原虫感染症、またはウイルス感染症である、請求項４０に記載の医薬。
【請求項４７】
原虫感染症が、森林型熱帯リーシュマニア（Ｌｅｉｓｈｍａｎｉａ  ｍａｊｏｒ）感染症である、請求項４６に記載の医薬。
【請求項４８】
ウイルス感染症が、呼吸器合胞体ウイルス（ＲＳＶ）感染症またはインフルエンザ感染症である、請求項４６に記載の医薬。
【請求項４９】
疼痛が、炎症性疼痛である、請求項４０に記載の医薬。
【請求項５０】
中枢神経系障害が、アルツハイマー病である、請求項４０に記載の医薬。
【請求項５１】
固形腫瘍が、乳房腫瘍、結腸腫瘍、前立腺腫瘍、肺腫瘍、腎臓腫瘍、肝臓腫瘍、膵臓腫瘍、胃腫瘍、腸腫瘍、脳腫瘍、骨腫瘍、及び皮膚腫瘍からなる群から選択される、請求項４０に記載の医薬。
【請求項５２】
眼科的障害が、眼の加齢性黄斑変性症（ＡＭＤ）、地図状萎縮（ＧＡ）、または網膜症である、請求項４０に記載の医薬。
【請求項５３】
参照ペリオスチンレベルが、約２３ｎｇ／ｍｌ〜約５０ｎｇ／ｍｌである、請求項３０〜５２のいずれか１項に記載の医薬。
【請求項５４】
ｒｓ４９８８９５６（配列番号１）、ｒｓ１０２０４１３７（配列番号２）、ｒｓ１０１９２０３６（配列番号３）、ｒｓ１０１９２１５７（配列番号４）、ｒｓ１０２０６７５３（配列番号５）、及びｒｓ４７４２１６５（配列番号６）からなる群から選択される１つ以上の多型における患者の遺伝子型が、全血試料、血清試料、血漿試料、またはこれらの組み合わせから選択された、患者試料に由来する試料中で決定されている、請求項２９〜５３のいずれか１項に記載の医薬。
【請求項５５】
患者がＩＬ−３３媒介性障害の増加した危険にさらされているかどうか決定するためのキットであって、ｒｓ４９８８９５６（配列番号１）、ｒｓ１０２０４１３７（配列番号２）、ｒｓ１０１９２０３６（配列番号３）、ｒｓ１０１９２１５７（配列番号４）、ｒｓ１０２０６７５３（配列番号５）、及びｒｓ４７４２１６５（配列番号６）からなる群から選択される１つ以上の多型における遺伝子型、ならびにｒｓ４９８８９５６（配列番号１）、ｒｓ１０２０４１３７（配列番号２）、ｒｓ１０１９２０３６（配列番号３）、ｒｓ１０１９２１５７（配列番号４）、ｒｓ１０２０６７５３（配列番号５）、及びｒｓ４７４２１６５（配列番号６）からなる群から選択される多型と連鎖不均衡にある多型での遺伝子型を、患者に由来する試料中で決定するための手段を含み、
（ａ）患者の遺伝子型が多型ｒｓ４９８８９５６（配列番号１）でのＧアレルを含む場合、
（ｂ）患者の遺伝子型が多型ｒｓ１０２０４１３７（配列番号２）でのＡアレルを含む場合、
（ｃ）患者の遺伝子型が多型ｒｓ１０１９２０３６（配列番号３）でのＣアレルを含む場合、
（ｄ）患者の遺伝子型が多型ｒｓ１０１９２１５７（配列番号４）でのＣアレルを含む場合、
（ｅ）患者の遺伝子型が多型ｒｓ１０２０６７５３（配列番号５）でのＴアレルを含む場合、
（ｆ）患者の遺伝子型が多型ｒｓ４７４２１６５（配列番号６）でのＴアレルを含む場合、かつ／あるいは
（ｇ）患者の遺伝子型が、ｒｓ４９８８９５６（配列番号１）、ｒｓ１０２０４１３７（配列番号２）、ｒｓ１０１９２０３６（配列番号３）、ｒｓ１０１９２１５７（配列番号４）、ｒｓ１０２０６７５３（配列番号５）、及びｒｓ４７４２１６５（配列番号６）からなる群から選択される多型と連鎖不均衡にある多型での等価アレルを含む場合に、患者がＩＬ−３３媒介性障害の増加した危険にさらされている、キット。
【請求項５６】
ＩＬ−３３媒介性障害を患っている患者がＩＬ−３３軸結合アンタゴニストを含む治療に応答する可能性が高いかどうか決定するためのキットであって、
（ａ）ｒｓ４９８８９５６（配列番号１）、ｒｓ１０２０４１３７（配列番号２）、ｒｓ１０１９２０３６（配列番号３）、ｒｓ１０１９２１５７（配列番号４）、ｒｓ１０２０６７５３（配列番号５）、及びｒｓ４７４２１６５（配列番号６）からなる群から選択される１つ以上の多型、ならびにｒｓ４９８８９５６（配列番号１）、ｒｓ１０２０４１３７（配列番号２）、ｒｓ１０１９２０３６（配列番号３）、ｒｓ１０１９２１５７（配列番号４）、ｒｓ１０２０６７５３（配列番号５）、及びｒｓ４７４２１６５（配列番号６）からなる群から選択される多型と連鎖不均衡にある多型での遺伝子型を、ＩＬ−３３媒介性障害を患う患者に由来する試料中で決定するための手段と、
（ｂ）患者を、遺伝子型に基づいて、ＩＬ−３３軸結合アンタゴニストを含む治療に応答性である可能性が高いとして特定するための手段と、を含み、
（ｉ）多型ｒｓ４９８８９５６（配列番号１）での各Ｇアレル、
（ｉｉ）多型ｒｓ１０２０４１３７（配列番号２）での各Ａアレル、
（ｉｉｉ）多型ｒｓ１０１９２０３６（配列番号３）での各Ｃアレル、
（ｉｖ）多型ｒｓ１０１９２１５７（配列番号４）での各Ｃアレル、
（ｖ）多型ｒｓ１０２０６７５３（配列番号５）での各Ｔアレル、
（ｖｉ）多型ｒｓ４７４２１６５（配列番号６）での各Ｔアレル、ならびに／または
（ｖｉｉ）ｒｓ４９８８９５６（配列番号１）、ｒｓ１０２０４１３７（配列番号２）、ｒｓ１０１９２０３６（配列番号３）、ｒｓ１０１９２１５７（配列番号４）、ｒｓ１０２０６７５３（配列番号５）、及びｒｓ４７４２１６５（配列番号６）からなる群から選択される多型と連鎖不均衡にある多型での各等価アレルの存在が、患者がＩＬ−３３軸結合アンタゴニストを含む治療に応答性である可能性の増加を有することを示す、キット。