【手続補正書】
【提出日】平成29年12月14日(2017.12.14)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
被験者においてｄｅ  ｎｏｖｏ脂質生成を推定するための方法であって、
生物学的サンプル中の３種以上のバイオマーカーのレベルを測定する工程であって、前記バイオマーカーが、被験者から採取されたサンプル中の、ミリスチン酸（１４：０）の全レベル、ミリストレイン酸（１４：１ｎ５）の全レベル、パルミテート（１６：０）の全レベル、パルミトレエート（１６：１ｎ７）の全レベル、サピエン酸（１６：１ｎ１０）の全レベル、スクアレンの全レベル、リノレエート（１８：２ｎ６）の全レベル、アラキドン酸（２０：４ｎ６）の全レベル、ドコサヘキサエン酸（２２：６ｎ３）の全レベル、１つ以上の脂質クラスのミリスチン酸（１４：０）のレベル、１つ以上の脂質クラスのミリストレイン酸（１４：１ｎ５）のレベル、１つ以上の脂質クラスのパルミテート（１６：０）のレベル、１つ以上の脂質クラスのパルミトレエート（１６：１ｎ７）のレベル、１つ以上の脂質クラスのサピエン酸（１６：１ｎ１０）のレベル、１つ以上の脂質クラスのスクアレンのレベル、１つ以上の脂質クラスのリノレエート（１８：２ｎ６）のレベル、１つ以上の脂質クラスのアラキドン酸（２０：４ｎ６）のレベルおよび１つ以上の脂質クラスのドコサヘキサエン酸（２２：６ｎ３）のレベルからなる群から選択される、工程と、
前記被験者において以下のモデル：
（ｉ）ＤＮＬ＝ａ（１６：０）＋ｂ（１６：１ｎ７）−ｃ（１８：２ｎ６）、
（ｉｉ）ＤＮＬ＝（ａ（１６：０）＋ｂ（１６：１ｎ７））／ｃ（１８：２ｎ６）、
（ｉｉｉ）ＤＮＬ＝ａ（１６：０）＋ｂ（１６：１ｎ７）−ｃ（１８：２ｎ６）＋ｄ（１４：０）＋ｅ（１４：１ｎ５）、
（ｉｖ）ＤＮＬ＝ａ（１６：０）＋ｂ（１６：１ｎ７）−ｃ（１８：２ｎ６）＋ｄ（１４：０）＋ｅ（１４：１ｎ５）−ｆ（２０：４ｎ６）−ｇ（２２：６ｎ３）、
（ｖ）ＤＮＬ＝ａ（１６：０）＋ｂ（１６：１ｎ１０）−ｃ（１８：２ｎ６）、または
（ｖｉ）ＤＮＬ＝ａ（１６：０）＋ｂ（１６：１ｎ１０）−ｃ（スクアレン）
の１つを用いてｄｅ  ｎｏｖｏ脂質生成指標スコアを生成して、前記ｄｅ  ｎｏｖｏ脂質生成を推定する工程であって、
式中、ａ、ｂ、ｃ、ｄ、ｅ、ｆ、ｇが定数であり、（１６：０）、（１６：１ｎ７）、１８：２ｎ６）、（１４：０）、（１４：１ｎ５）、（２０：４ｎ６）、（２２：６ｎ３）、（１６：１ｎ１０）およびスクアレンがバイオマーカーアナライトの測定値であり、かつＤＮＬが予測ｄｅ  ｎｏｖｏ脂質生成スコアである、工程と
を含む、方法。
【請求項２】
前記バイオマーカーが、血液中のパルミテート（１６：０）、パルミトレエート（１６：１ｎ７）およびリノレエート（１８：２ｎ６）の全レベルを含む、請求項１に記載の方法。
【請求項３】
前記バイオマーカーが、血液中のミリスチン酸（１４：０）および（１４：１ｎ５）の全レベルをさらに含む、請求項２に記載の方法。
【請求項４】
前記バイオマーカーが、血液中のアラキドン酸（２０：４ｎ６）およびドコサヘキサエン酸（２２：６ｎ３）の全レベルをさらに含む、請求項３に記載の方法。
【請求項５】
前記生物学的サンプルが、皮脂サンプル、皮膚サンプル、表皮サンプルおよび皮膚細胞サンプルからなる群から選択され、前記３種以上のバイオマーカーが、１６：０、１６：１ｎ７、１６：１ｎ１０、１４：０、１４：１ｎ５、１８：２ｎ６、２０：４ｎ６、スクアレンおよび２２：６ｎ３、ならびにそれらの組合せからなる群から選択される、請求項１に記載の方法。
【請求項６】
前記バイオマーカーが、トリアシルグリセリド、ホスファチジルコリンおよびコレステリルエステルからなる群から選択される１つ以上の個別の脂質クラス内で測定される、請求項１に記載の方法。
【請求項７】
前記バイオマーカーが、その骨格から脂肪酸を分離した後に測定される、請求項１に記載の方法。
【請求項８】
前記バイオマーカーが無傷の複合脂質種として測定される、請求項１に記載の方法。
【請求項９】
前記バイオマーカーが全血中脂質で測定される、請求項１に記載の方法。
【請求項１０】
前記ｄｅ  ｎｏｖｏ脂質生成指標スコアを用いて疾患を有する個体の疾患状態を評価する、前記疾患が、糖尿病、または肝臓脂肪症およびインスリン感受性からなる群から選択される糖尿病プロセスである、請求項１に記載の方法。
【請求項１１】
前記ｄｅ  ｎｏｖｏ脂質生成指標スコアを用いて肝臓障害を有する個体の肝臓の健康を評価する、前記肝臓障害が、脂肪症および肝臓インスリン抵抗性からなる群から選択される、請求項１に記載の方法。
【請求項１２】
前記ｄｅ  ｎｏｖｏ脂質生成指標スコアを、肝障害を病期分類するために用いる、前記肝障害が、非アルコール性脂肪性肝炎（ＮＡＳＨ）および非アルコール性脂肪性肝疾患（ＮＡＦＬＤ）からなる群から選択される、請求項１に記載の方法。
【請求項１３】
前記ｄｅ  ｎｏｖｏ脂質生成指標スコアが、ｄｅ  ｎｏｖｏ脂質生成および関連疾患病態に関して治療剤に対する反応をモニターするために用いられる、請求項１に記載の方法。
【請求項１４】
前記治療剤は低分子阻害剤である、請求項１３に記載の方法。
【請求項１５】
前記ｄｅ  ｎｏｖｏ脂質生成指標スコアが、ｄｅ  ｎｏｖｏ脂質生成を阻害する治療剤の有効性を決定するために用いられる、請求項１に記載の方法。
【請求項１６】
前記治療剤が、アセチルＣｏＡカルボキシラーゼ（ＡＣＣ）、脂肪酸シンターゼ（ＦＡＳ）、ステアロイルＣｏＡデサチュラーゼ（ＳＣＤ）、エロンガーゼ（ＥＬＯＶＬ）、およびジアシルグリセロール：ＣｏＡアシルトランスフェラーゼ（ＤＧＡＴ）阻害剤からなる群から選択される、請求項１５に記載の方法。
【請求項１７】
皮脂ｄｅ  ｎｏｖｏ脂質生成指標スコアが、モデル（ｖ）または（ｖｉ）を用いることにより計算される、請求項１に記載の方法。
【請求項１８】
被験者においてｄｅ  ｎｏｖｏ脂質生成を推定するための方法であって、
生物学的サンプル中の１種以上の脂肪酸バイオマーカーのレベルを測定する工程であって、前記１種以上の脂肪酸バイオマーカーが、被験者から採取されたサンプル中の、ミリスチン酸（１４：０）の全レベル、ミリストレイン酸（１４：１ｎ５）の全レベル、パルミテート（１６：０）の全レベル、パルミトレエート（１６：１ｎ７）の全レベル、サピエン酸（１６：１ｎ１０）の全レベル、１８：１ｎ１０の全レベル、スクアレンの全レベル、６−オクタデセン酸（１８：１ｎ１２）の全レベル、リノレエート（１８：２ｎ６）の全レベル、アラキドン酸（２０：４ｎ６）の全レベル、ドコサヘキサエン酸（２２：６ｎ３）の全レベル、１つ以上の脂質クラスのミリスチン酸（１４：０）のレベル、１つ以上の脂質クラスのミリストレイン酸（１４：１ｎ５）のレベル、１つ以上の脂質クラスのパルミテート（１６：０）のレベル、１つ以上の脂質クラスのパルミトレエート（１６：１ｎ７）のレベル、１つ以上の脂質クラスのサピエン酸（１６：１ｎ１０）のレベル、１つ以上の脂質クラスの１８：１ｎ１０のレベル、１つ以上の脂質クラスのスクアレンのレベル、１つ以上の脂質クラスの１８：１ｎ１２のレベル、１つ以上の脂質クラスのリノレエート（１８：２ｎ６）のレベル、１つ以上の脂質クラスのアラキドン酸（２０：４ｎ６）のレベルおよび１つ以上の脂質クラスのドコサヘキサエン酸（２２：６ｎ３）のレベルからなる群から選択される、工程と、
前記被験者において前記１種以上の脂肪酸バイオマーカーの前記測定レベルで構成された統計モデルを用いてｄｅ  ｎｏｖｏ脂質生成指標を生成して、前記ｄｅ  ｎｏｖｏ脂質生成を推定する工程と
を含む、方法。
【請求項１９】
前記脂肪酸バイオマーカーが、血液中のパルミテート（１６：０）、パルミトレエート（１６：１ｎ７）およびリノレエート（１８：２ｎ６）の全レベルを含む、請求項１８に記載の方法。
【請求項２０】
前記脂肪酸バイオマーカーが、血液中のミリスチン酸（１４：０）および（１４：１ｎ５）の全レベルをさらに含む、請求項１９に記載の方法。
【請求項２１】
前記脂肪酸バイオマーカーが、血液中のアラキドン酸（２０：４ｎ６）およびドコサヘキサエン酸（２２：６ｎ３）の全レベルをさらに含む、請求項２０に記載の方法。
【請求項２２】
前記生物学的サンプルが、皮膚サンプル、表皮サンプルおよび皮膚細胞サンプルからなる群から選択され、前記１種以上のバイオマーカーが、１６：０、１６：１ｎ７、１６：１ｎ１０、１８：１ｎ１０、１８：１ｎ１２、１４：０、１４：１ｎ５、１８：２ｎ６、２０：４ｎ６、スクアレンおよび２２：６ｎ３、ならびにそれらの組合せからなる群から選択される、請求項１８に記載の方法。
【請求項２３】
前記脂肪酸バイオマーカーが、トリアシルグリセリド、ホスファチジルコリンおよびコレステリルエステルからなる群から選択される１つ以上の個別の脂質クラス内で測定される、請求項１８に記載の方法。
【請求項２４】
前記脂肪酸バイオマーカーが、その骨格から脂肪酸を分離した後に測定される、請求項２３に記載の方法。
【請求項２５】
前記脂肪酸バイオマーカーが無傷の複合脂質種として測定される、請求項２３に記載の方法。
【請求項２６】
前記脂肪酸バイオマーカーが全血中脂質で測定される、請求項１８に記載の方法。
【請求項２７】
前記脂肪酸バイオマーカーが全脂肪酸に対する割合として表される、請求項１８に記載の方法。
【請求項２８】
前記割合がモル％単位である、請求項２７に記載の方法。
【請求項２９】
前記数学モデルが、前記モデルにおける各バイオマーカーの前記測定レベルの線形結合であり、それにより、陽性マーカーが正の係数を有し、かつ陰性マーカーが負の係数を有する、請求項１８に記載の方法。
【請求項３０】
前記数学モデルが陽性マーカー対陰性マーカーの比を含む、請求項１８に記載の方法。
【請求項３１】
前記比が陽性マーカーの和対陰性マーカーの和からなる、請求項３０に記載の方法。
【請求項３２】
ｄｅ  ｎｏｖｏ脂質生成指標スコアが、以下のモデル：
（ｉ）ＤＮＬ＝ａ（１６：０）＋ｂ（１６：１ｎ７）−ｃ（１８：２ｎ６）、または
（ｉｉ）ＤＮＬ＝（ａ（１６：０）＋ｂ（１６：１ｎ７））／ｃ（１８：２ｎ６）、
（ｉｉｉ）ＤＮＬ＝ａ（１６：０）＋ｂ（１６：１ｎ７）−ｃ（１８：２ｎ６）＋ｄ（１４：０）＋ｅ（１４：１ｎ５）、
（ｉｖ）ＤＮＬ＝ａ（１６：０）＋ｂ（１６：１ｎ７）−ｃ（１８：２ｎ６）＋ｄ（１４：０）＋ｅ（１４：１ｎ５）−ｆ（２０：４ｎ６）−ｇ（２２：６ｎ３）、
（ｖ）ＤＮＬ＝ａ（１６：０）＋ｂ（１６：１ｎ１０）−ｃ（１８：２ｎ６）、または
（ｖｉ）ＤＮＬ＝ａ（１６：０）＋ｂ（１６：１ｎ１０）−ｃ（スクアレン）
の１つを用いて計算され、式中、ａ、ｂ、ｃ、ｄ、ｅ、ｆ、ｇが定数であり、（１６：０）、（１６：１ｎ７）、１８：２ｎ６）、（１４：０）、（１４：１ｎ５）、（２０：４ｎ６）、（２２：６ｎ３）、（１６：１ｎ１０）およびスクアレンがバイオマーカーアナライトの測定値であり、かつＤＮＬが予測ｄｅ  ｎｏｖｏ脂質生成指標スコアである、請求項１８に記載の方法。
【請求項３３】
皮脂ｄｅ  ｎｏｖｏ脂質生成指標スコアが、以下のモデル：
（ｉ）皮脂ＤＮＬ１＝０．０３９８（１６：０）＋０．０４５５（１６：１ｎ１０）−１．３９８（１８：２ｎ６）、または
（ｉｉ）皮脂ＤＮＬ２＝０．０３９８（１６：０）＋０．０４５５（１６：１ｎ１０）−０．０１１３（スクアレン）
の１つを用いることにより計算され、
式中、（１６：０）、（１６：１ｎ１０）、（１８：２ｎ６）およびスクアレンがバイオマーカーアナライトの測定値である、請求項１８に記載の方法。