【手続補正書】
【提出日】平成30年7月11日(2018.7.11)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
治療剤に対する抵抗性の指標としての、ＥＲＣＣ１アイソフォーム３タンパク質の使用。
【請求項２】
治療剤に対する抵抗性の指標としての、ＥＲＣＣ１アイソフォーム３ｍＲＮＡの使用。
【請求項３】
ＥＲＣＣ１アイソフォーム３タンパク質および／またはＥＲＣＣ１アイソフォーム３ｍＲＮＡを、治療剤に対する抵抗性の指標として使用する方法であって、
ａ）液体試料または組織試料に存在するＥＲＣＣ１アイソフォーム３タンパク質の量および／またはＥＲＣＣ１アイソフォーム３ｍＲＮＡの量を測定するステップと、
ｂ）測定された前記量を所定の値と比較するステップであって、前記所定の値を上回る量が、前記治療剤に対する抵抗性を示す、ステップと
を含むかまたはそれからなる、方法。
【請求項４】
治療剤に対する抵抗性のバイオマーカー、好ましくは、がん治療剤に対する抵抗性のバイオマーカー、より好ましくは、白金に基づくがん治療剤、照射に基づくがん治療剤および／またはＤＮＡ破壊的がん治療剤に対する抵抗性のバイオマーカーとしての、ＥＲＣＣ１アイソフォーム３タンパク質および／またはＥＲＣＣ１アイソフォーム３ｍＲＮＡの使用。
【請求項５】
前記抵抗性が、人体由来の液体試料および／または人体由来の組織試料、好ましくは、人体由来の単離された液体試料および／または人体由来の単離された組織試料中のＥＲＣＣ１アイソフォーム３タンパク質および／またはＥＲＣＣ１アイソフォーム３ｍＲＮＡの量によって示されることを特徴とする、請求項１〜４のいずれか一項に記載の方法または使用。
【請求項６】
前記試料が、体液、例えば、末梢血、痰、腹水、リンパ液、尿および／もしくは骨髄、ならびに／または例えば原発性腫瘍由来の生検材料を含むかまたはそれからなることを特徴とする、請求項５に記載の方法または使用。
【請求項７】
前記治療剤が、好ましくは、白金に基づくがん治療剤、照射に基づくがん治療剤およびＤＮＡ破壊的がん治療剤を含むかまたはそれからなる群より選択されるがん治療剤であることを特徴とする、請求項１〜６のいずれか一項に記載の方法または使用。
【請求項８】
前記がんが、固形がん、好ましくは、卵巣がん、乳がん、肺がん、前立腺がん、膵がん、膀胱がん、胃がん、結腸がん、精巣がんおよび頸部がんを含むかまたはそれからなる群より選択されることを特徴とする、請求項７に記載の方法または使用。
【請求項９】
人体由来の液体試料から、好ましくは、多重抗体捕捉方法によって循環腫瘍細胞を単離するステップと、単離された前記循環腫瘍細胞におけるＥＲＣＣ１アイソフォーム３タンパク質および／またはＥＲＣＣ１アイソフォーム３ｍＲＮＡの発現のレベルを決定するステップとを含む、請求項１〜８のいずれか一項に記載の方法または使用。
【請求項１０】
循環腫瘍細胞を単離する前記ステップが、
ａ）前記液体試料を、循環腫瘍細胞に対する結合親和性を有する少なくとも２種の抗体および／または抗体誘導体の所定の組み合わせと混合するステップと、
ｂ）前記試料から、ｉ）前記抗体および／または前記抗体誘導体とｉｉ）前記循環腫瘍細胞との間の複合体を単離するステップと
を含むかまたはそれからなることを特徴とする、請求項９に記載の方法または使用。
【請求項１１】
前記抗体および／または前記抗体誘導体が、
ａ）少なくとも１種の磁性粒子もしくは常磁性粒子にカップリングされ、好ましくは、前記複合体の単離のために磁力が使用される、および／または
ｂ）少なくとも１種の蛍光分子にカップリングされ、好ましくは、前記複合体の単離のために蛍光活性化細胞分取が使用される
ことを特徴とする、請求項１０に記載の方法または使用。
【請求項１２】
２種の前記抗体および／または前記抗体誘導体のうち少なくとも１種が、ＧＰ１．４、ＭＯＣ−３１、Ｂｅｒ−ＥＰ−４、ＨＭＰＶ．２、ＨＭＥＩＶ．２、８Ｂ６、Ｅ２９、１０Ｅ９（抗ＨＥＲ２）、２Ｄ３（抗ＥｐＣＡＭ）、抗ｃＭＥＴ、抗ＥＧＦＲ、抗ｃＫＩＴ、抗ＩＧＦＲおよび１３１−１１７４１を含むかまたはそれからなる群より選択されることを特徴とする、請求項１０または１１のうちの一項に記載の方法または使用。
【請求項１３】
ａ）単離された前記循環腫瘍細胞を溶解するステップと、
ｂ）溶解された単離された前記循環腫瘍細胞に存在するＥＲＣＣ１アイソフォーム３タンパク質および／またはＥＲＣＣ１アイソフォーム３ｍＲＮＡの量を測定するステップと、
ｃ）溶解された単離された前記循環腫瘍細胞に存在し、かつＥＲＣＣ１アイソフォーム３ｍＲＮＡとは異なる少なくとも１種のｍＲＮＡの量を測定するステップであって、前記少なくとも１種のｍＲＮＡが、上皮、間葉系または幹細胞表現型の細胞のマーカーであるｍＲＮＡを含むかまたはそれからなる群より選択される、ステップと
を含み、
ステップｂ）およびステップｃ）について、その順序を変えることができ、
ステップｂ）および／またはステップｃ）における測定が、好ましくは、ＲＴ−ＰＣＲ、ＬＣＲ、ＮＡＳＢＡ、ハイブリダイゼーション方法、ならびに／またはＰＣＲのステップ、制限酵素によるＰＣＲ産物の断片への消化のステップおよび得られた前記断片の解析のステップを含有する方法によって行われる、請求項９〜１２のいずれか一項に記載の方法または使用。
【請求項１４】
ＥＲＣＣ１アイソフォーム３タンパク質および／またはＥＲＣＣ１アイソフォーム３ｍＲＮＡの測定された発現レベルを、第１の所定の値と比較するステップを含み、前記第１の所定の値を上回るＥＲＣＣ１アイソフォーム３タンパク質および／またはＥＲＣＣ１アイソフォーム３ｍＲＮＡの測定された発現レベルが、前記治療剤に対する抵抗性を示す、請求項１〜１３のいずれか一項に記載の方法または使用。
【請求項１５】
ａ）ＥＲＣＣ１アイソフォーム３タンパク質および／またはＥＲＣＣ１アイソフォーム３ｍＲＮＡの測定された発現レベルを、第１の所定の値と比較するステップと、
ｂ）ＥＲＣＣ１アイソフォーム３ｍＲＮＡとは異なる少なくとも１種のｍＲＮＡの測定された発現レベルを、第２の所定の値と比較するステップであって、前記少なくとも１種のｍＲＮＡが、上皮、間葉系または幹細胞表現型の細胞のマーカーであるｍＲＮＡを含むかまたはそれからなる群より選択される、ステップと
を含み、
前記第１の所定の値を上回る前記ＥＲＣＣ１アイソフォーム３タンパク質および／または前記ＥＲＣＣ１アイソフォーム３ｍＲＮＡの測定された発現レベル、ならびに前記第２の所定の値を上回る、ＥＲＣＣ１アイソフォーム３ｍＲＮＡとは異なる前記少なくとも１種のｍＲＮＡの測定された発現レベルが、前記治療剤に対する抵抗性を示すことを特徴とする、請求項１４に記載の方法または使用。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００２９
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００２９】
次の実施例および図面に関連して、本発明に係る主題について、前記主題を本明細書に示す特殊な実施形態に制限することは望まず、より詳細に説明することを目的としている。
例えば、本発明の実施形態において、以下が提供される。
（項目１）
治療剤に対する抵抗性の診断における使用のための、ＥＲＣＣ１アイソフォーム３タンパク質。
（項目２）
治療剤に対する抵抗性の診断における使用のための、ＥＲＣＣ１アイソフォーム３ｍＲＮＡ。
（項目３）
治療剤に対する抵抗性を診断するための方法であって、
ａ）液体試料または組織試料に存在するＥＲＣＣ１アイソフォーム３タンパク質の量および／またはＥＲＣＣ１アイソフォーム３ｍＲＮＡの量を測定するステップと、
ｂ）測定された前記量を所定の値と比較するステップであって、前記所定の値を上回る量が、前記治療剤に対する抵抗性を示す、ステップと
を含むかまたはそれからなる、方法。
（項目４）
治療剤に対する抵抗性のバイオマーカー、好ましくは、がん治療剤に対する抵抗性のバイオマーカー、より好ましくは、白金に基づくがん治療剤、照射に基づくがん治療剤および／またはＤＮＡ破壊的がん治療剤に対する抵抗性のバイオマーカーとしての、ＥＲＣＣ１アイソフォーム３タンパク質および／またはＥＲＣＣ１アイソフォーム３ｍＲＮＡの使用。
（項目５）
前記診断が、人体由来の液体試料および／または人体由来の組織試料、好ましくは、人体由来の単離された液体試料および／または人体由来の単離された組織試料において行われることを特徴とする、先行する項目のうちの一項に記載のＥＲＣＣ１アイソフォーム３タンパク質、ＥＲＣＣ１アイソフォーム３ｍＲＮＡ、方法または使用。
（項目６）
前記試料が、体液、例えば、末梢血、痰、腹水、リンパ液、尿および／もしくは骨髄、ならびに／または例えば原発性腫瘍由来の生検材料を含むかまたはそれからなることを特徴とする、先行する項目に記載のＥＲＣＣ１アイソフォーム３タンパク質、ＥＲＣＣ１アイソフォーム３ｍＲＮＡ、方法または使用。
（項目７）
前記治療剤が、好ましくは、白金に基づくがん治療剤、照射に基づくがん治療剤およびＤＮＡ破壊的がん治療剤を含むかまたはそれからなる群より選択されるがん治療剤であることを特徴とする、先行する項目のうちの一項に記載のＥＲＣＣ１アイソフォーム３タンパク質、ＥＲＣＣ１アイソフォーム３ｍＲＮＡ、方法または使用。
（項目８）
前記がんが、固形がん、好ましくは、卵巣がん、乳がん、肺がん、前立腺がん、膵がん、膀胱がん、胃がん、結腸がん、精巣がんおよび頸部がんを含むかまたはそれからなる群より選択されることを特徴とする、先行する項目に記載のＥＲＣＣ１アイソフォーム３タンパク質、ＥＲＣＣ１アイソフォーム３ｍＲＮＡ、方法または使用。
（項目９）
前記抵抗性の診断が、人体由来の液体試料において、好ましくは、多重抗体捕捉方法によって循環腫瘍細胞を単離するステップと、単離された前記循環腫瘍細胞におけるＥＲＣＣ１アイソフォーム３タンパク質および／またはＥＲＣＣ１アイソフォーム３ｍＲＮＡの発現のレベルを決定するステップとを含むことを特徴とする、先行する項目のうちの一項に記載のＥＲＣＣ１アイソフォーム３タンパク質、ＥＲＣＣ１アイソフォーム３ｍＲＮＡ、方法または使用。
（項目１０）
循環腫瘍細胞を単離する前記ステップが、
ａ）液体試料を、循環腫瘍細胞に対する結合親和性を有する少なくとも２種の抗体および／または抗体誘導体の所定の組み合わせと混合するステップと、
ｂ）前記試料から、ｉ）前記抗体および／または前記抗体誘導体とｉｉ）前記循環腫瘍細胞との間の複合体を単離するステップと
を含むかまたはそれからなることを特徴とする、先行する項目に記載のＥＲＣＣ１アイソフォーム３タンパク質、ＥＲＣＣ１アイソフォーム３ｍＲＮＡ、方法または使用。
（項目１１）
前記抗体および／または前記抗体誘導体が、
ａ）少なくとも１種の磁性粒子もしくは常磁性粒子にカップリングされ、好ましくは、前記複合体の単離のために磁力が使用される、および／または
ｂ）少なくとも１種の蛍光分子にカップリングされ、好ましくは、前記複合体の単離のために蛍光活性化細胞分取が使用される
ことを特徴とする、先行する項目に記載のＥＲＣＣ１アイソフォーム３タンパク質、ＥＲＣＣ１アイソフォーム３ｍＲＮＡ、方法または使用。
（項目１２）
２種の前記抗体および／または前記抗体誘導体のうち少なくとも１種が、ＧＰ１．４、ＭＯＣ−３１、Ｂｅｒ−ＥＰ−４、ＨＭＰＶ．２、ＨＭＥＩＶ．２、８Ｂ６、Ｅ２９、１０Ｅ９（抗ＨＥＲ２）、２Ｄ３（抗ＥｐＣＡＭ）、抗ｃＭＥＴ、抗ＥＧＦＲ、抗ｃＫＩＴ、抗ＩＧＦＲおよび１３１−１１７４１を含むかまたはそれからなる群より選択されることを特徴とする、項目１０および１１のうちの一項に記載のＥＲＣＣ１アイソフォーム３タンパク質、ＥＲＣＣ１アイソフォーム３ｍＲＮＡ、方法または使用。
（項目１３）
前記抵抗性の診断が、
ａ）単離された前記循環腫瘍細胞を溶解するステップと、
ｂ）溶解された単離された前記循環腫瘍細胞に存在するＥＲＣＣ１アイソフォーム３タンパク質および／またはＥＲＣＣ１アイソフォーム３ｍＲＮＡの量を測定するステップと、ｃ）溶解された単離された前記循環腫瘍細胞に存在し、かつＥＲＣＣ１アイソフォーム３ｍＲＮＡとは異なる少なくとも１種のｍＲＮＡの量を測定するステップであって、前記少なくとも１種のｍＲＮＡが、上皮、間葉系または幹細胞表現型の細胞のマーカーであるｍＲＮＡを含むかまたはそれからなる群より選択される、ステップと
を含み、
ステップｂ）およびステップｃ）について、その順序を変えることができ、
ステップｂ）および／またはステップｃ）における測定が、好ましくは、ＲＴ−ＰＣＲ、ＬＣＲ、ＮＡＳＢＡ、ハイブリダイゼーション方法、ならびに／またはＰＣＲのステップ、制限酵素によるＰＣＲ産物の断片への消化のステップおよび得られた前記断片の解析のステップを含有する方法によって行われることを特徴とする、項目９〜１２のうちの一項に記載のＥＲＣＣ１アイソフォーム３タンパク質、ＥＲＣＣ１アイソフォーム３ｍＲＮＡ、方法または使用。
（項目１４）
前記抵抗性の診断が、ＥＲＣＣ１アイソフォーム３タンパク質および／またはＥＲＣＣ１アイソフォーム３ｍＲＮＡの測定された発現レベルを、第１の所定の値と比較するステップを含み、前記第１の所定の値を上回るＥＲＣＣ１アイソフォーム３タンパク質および／またはＥＲＣＣ１アイソフォーム３ｍＲＮＡの測定された発現レベルが、前記治療剤に対する抵抗性を示すことを特徴とする、先行する項目のうちの一項に記載のＥＲＣＣ１アイソフォーム３タンパク質、ＥＲＣＣ１アイソフォーム３ｍＲＮＡ、方法または使用。
（項目１５）
前記抵抗性の診断が、
ａ）ＥＲＣＣ１アイソフォーム３タンパク質および／またはＥＲＣＣ１アイソフォーム３ｍＲＮＡの測定された発現レベルを、第１の所定の値と比較するステップと、
ｂ）ＥＲＣＣ１アイソフォーム３ｍＲＮＡとは異なる少なくとも１種のｍＲＮＡの測定された発現レベルを、第２の所定の値と比較するステップであって、前記少なくとも１種のｍＲＮＡが、上皮、間葉系または幹細胞表現型の細胞のマーカーであるｍＲＮＡを含むかまたはそれからなる群より選択される、ステップと
を含み、
前記第１の所定の値を上回る前記ＥＲＣＣ１アイソフォーム３タンパク質および／または前記ＥＲＣＣ１アイソフォーム３ｍＲＮＡの測定された発現レベル、ならびに前記第２の所定の値を上回る、ＥＲＣＣ１アイソフォーム３ｍＲＮＡとは異なる前記少なくとも１種のｍＲＮＡの測定された発現レベルが、前記治療剤に対する抵抗性を示すことを特徴とする、先行する項目に記載のＥＲＣＣ１アイソフォーム３タンパク質、ＥＲＣＣ１アイソフォーム３ｍＲＮＡ、方法または使用。