【手続補正書】
【提出日】平成30年1月16日(2018.1.16)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
アミノ酸配列ＫＶＮＰＱＧＰＧＰＥＥＫ（配列番号１）によって定められるＧＰＣ−１可動性ループの一部分の中に位置する、抗グリピカン１（ＧＰＣ−１）抗体の単離されたエピトープであって、
（ｉ）ＫＶＮＰＱＧＰＧＰＥＥＫ（配列番号１）；
（ｉｉ）ＶＮＰＱＧＰＧＰＥＥＫ（配列番号２）、ＶＮＰＱＧＰＧＰＥＥ（配列番号３）、ＮＰＱＧＰＧＰＥＥ（配列番号４）、ＫＶＮＰＱＧＰＧＰＥ（配列番号５）またはＫＶＮＰＱＧＰＧＰ（配列番号６）からなる、ＫＶＮＰＱＧＰＧＰＥＥＫ（配列番号１）のフラグメント；
（ｉｉｉ）ＶＮＰＱＧＰＧＰＥＥ（配列番号３）の変異体であって、
Ｖ（ｖａｌ）が他の任意のアミノ酸で置換されている１位；
Ｎ（ａｓｎ）が他の任意のアミノ酸で置換されている２位；
Ｐ（ｐｒｏ）が他の任意のアミノ酸で置換されている３位；
Ｑ（ｇｌｎ）がＹ（ｔｙｒ）、Ａ（ａｌａ）、Ｅ（ｇｌｕ）、Ｖ（ｖａｌ）、Ｍ（ｍｅｔ）、Ｆ（ｐｈｅ）、Ｌ（ｌｅｕ）、Ｉ（ｉｌｅ）、Ｔ（ｔｈｒ）またはＲ（ａｒｇ）のいずれか１つで置換されている４位；
Ｇ（ｇｌｙ）がＡ（ａｌａ）、Ｓ（ｓｅｒ）、Ｔ（ｔｈｒ）、Ｈ（ｈｉｓ）、Ｗ（ｔｒｐ）、Ｙ（ｔｙｒ）、Ｆ（ｐｈｅ）またはＭ（ｍｅｔ）のいずれか１つで置換されている５位；
Ｐ（ｐｒｏ）が他の任意のアミノ酸で置換されている８位；
Ｅ（ｇｌｕ）がＱ（ｇｌｎ）、Ｄ（ａｓｐ）、Ｆ（ｐｈｅ）、Ｈ（ｈｉｓ）またはＭ（ｍｅｔ）で置換されている１０位
のうちのいずれか１つまたは複数の位置に置換を含む、前記ＶＮＰＱＧＰＧＰＥＥ（配列番号３）の変異体；
（ｉｖ）ＮＰＱＧＰＧＰＥＥ（配列番号４）の変異体であって、
Ｎ（ａｓｎ）がＨ（ｈｉｓ）で置換されている１位；
Ｐ（ｐｒｏ）が他の任意のアミノ酸で置換されている２位；
Ｑ（ｇｌｎ）がＮ（ａｓｎ）、Ｍ（ｍｅｔ）、Ｔ（ｔｈｒ）、Ｓ（ｓｅｒ）またはＲ（ａｒｇ）のいずれか１つで置換されている３位；
Ｐ（ｐｒｏ）がＡ（ａｌａ）で置換されている５位；
Ｐ（ｐｒｏ）がＡ（ａｌａ）、Ｄ（ａｓｐ）、Ｃ（ｃｙｓ）、Ｅ（ｇｌｕ）、Ｚ（ｇｌｘ）、Ｇ（ｇｌｙ）、Ｈ（ｈｉｓ）、Ｋ（ｌｙｓ）、Ｍ（ｍｅｔ）、Ｆ（ｐｈｅ）、Ｐ
（ｐｒｏ）、Ｓ（ｓｅｒ）、Ｔ（ｔｈｒ）、Ｗ（ｔｒｐ）またはＹ（ｔｙｒ）のいずれか１つで置換されている７位；
Ｅ（ｇｌｕ）が他の任意のアミノ酸で置換されている９位
のうちのいずれか１つまたは複数の位置に置換を含む、前記ＮＰＱＧＰＧＰＥＥ（配列番号４）の変異体；または
（ｖ）ＫＶＮＰＱＧＰＧＰＥ（配列番号５）またはＫＶＮＰＱＧＰＧＰ（配列番号６）の変異体であって、
Ｋ（ｌｙｓ）がＷ（ｔｒｐ）、Ｒ（ａｒｇ）、Ｌ（ｌｙｓ）、Ｙ（ｔｙｒ）またはＦ（ｐｈｅ）のいずれか１つで置換されている１位；
Ｎ（ａｓｎ）がＨ（ｈｉｓ）、Ｐ（ｐｒｏ）またはＤ（ａｓｐ）のいずれか１つで置換されている３位；
Ｐ（ｐｒｏ）がＲ（ａｒｇ）、Ｋ（ｌｙｓ）、Ｗ（ｔｒｐ）、Ｓ（ｓｅｒ）、Ｈ（ｈｉｓ）またはＮ（ａｓｎ）のいずれか１つで置換されている４位；
Ｇ（ｇｌｙ）がＤ（ａｓｐ）、Ｅ（ｇｌｕ）、Ｎ（ａｓｎ）、Ｑ（ｇｌｎ）、Ｋ（ｌｙｓ）、Ｒ（ａｒｇ）またはＡ（ａｌａ）のいずれか１つで置換されている８位；
Ｐ（ｐｒｏ）がＭ（ｍｅｔ）、Ａ（ａｌａ）、Ｉ（ｉｌｅ）、Ｋ（ｌｙｓ）、Ｒ（ａｒｇ）、Ｑ（ｇｌｎ）、Ｓ（ｓｅｒ）、Ｔ（ｔｈｒ）またはＹ（ｔｙｒ）のいずれか１つで置換されている９位
のうちのいずれか１つまたは複数の位置にのみ置換を含む、前記ＫＶＮＰＱＧＰＧＰＥ（配列番号５）またはＫＶＮＰＱＧＰＧＰ（配列番号６）の変異体
からなる前記エピトープ。
【請求項２】
第一のセグメントおよび第二のセグメントを含み、
（ｉ）第１のセグメントが、ＶＮＰＱＧＰＧＰＥＥＫ（配列番号２）、ＫＶＮＰＱＧＰＧＰＥ（配列番号５）もしくはＫＶＮＰＱＧＰＧＰ（配列番号６）からなる、ＫＶＮＰＱＧＰＧＰＥＥＫ（配列番号１）のフラグメント、前記ＶＮＰＱＧＰＧＰＥＥＫ（配列番号２）の変異体、前記ＫＶＮＰＱＧＰＧＰＥ（配列番号５）またはＫＶＮＰＱＧＰＧＰ（配列番号６）の変異体であり、
（ｉｉ）第二のセグメントがアミノ酸配列ＴＱＮＡＲＡ（配列番号８）を含む、
請求項１に記載のエピトープ。
【請求項３】
第二のセグメントがアミノ酸配列ＴＱＮＡＲＡＦＲＤ（配列番号７）を含む、請求項２に記載のエピトープ。
【請求項４】
第一のセグメントおよび第二のセグメントを含み、
（ｉ）第１のセグメントが、ＮＰＱＧＰＧＰＥＥ（配列番号４）からなる、ＫＶＮＰＱＧＰＧＰＥＥＫ（配列番号１）のフラグメントまたは前記ＮＰＱＧＰＧＰＥＥ（配列番号４）の変異体であり、
（ｉｉ）第二のセグメントがアミノ酸配列ＡＬＳＴＡＳＤＤＲ（配列番号９）を含む、請求項１に記載のエピトープ。
【請求項５】
第一のセグメントおよび第二のセグメントを含み、
（ｉ）第１のセグメントが、ＶＮＰＱＧＰＧＰＥＥ（配列番号３）からなる、ＫＶＮＰＱＧＰＧＰＥＥＫ（配列番号１）のフラグメントであり、
（ｉｉ）第二のセグメントが、アミノ酸配列ＰＲＥＲＰＰ（配列番号１０）または
アミノ酸配列ＱＤＡＳＤＤＧＳＧＳ（配列番号１１）
を含む、請求項１に記載のエピトープ。
【請求項６】
第一のセグメント、第二のセグメントおよび第三のセグメントを含み、
（ｉ）第１のセグメントが、ＶＮＰＱＧＰＧＰＥＥ（配列番号３）からなる、ＫＶＮＰ
ＱＧＰＧＰＥＥＫ（配列番号１）のフラグメントであり、
（ｉｉ）第二のセグメントが、アミノ酸配列ＰＲＥＲＰＰ（配列番号１０）を含み、第三のセグメントが、アミノ酸配列ＱＤＡＳＤＤＧＳＧＳ（配列番号１１）を含む、請求項１に記載のエピトープ。
【請求項７】
アミノ酸配列ＣＧＥＬＹＴＱＮＡＲＡＦＲＤＬＣＧＮＰＫＶＮＰＱＧＰＧＰＥＥＫＲＲＲＧＣ（配列番号１２）を含む、請求項１〜３のいずれか１項に記載のエピトープ。
【請求項８】
２つ以上の異なるエピトープの組合せを含むエピトープの取合せであって、
（ａ）前記異なるエピトープがそれぞれ、請求項１〜７のいずれか１項に記載のエピトープであるか、または、
（ｂ）前記取合せは、請求項２に記載のエピトープである第一のエピトープと、請求項３に記載のエピトープである第二のエピトープとを含むか、または、
（ｃ）前記取合せは、請求項２に記載のエピトープである第一のエピトープと、請求項４または５に記載のエピトープである第二のエピトープとを含む、
エピトープの取合せ。
【請求項９】
請求項１〜７のいずれか１項に記載のエピトープをコードする、核酸。
【請求項１０】
対象の前立腺癌を検出する方法であって、前記対象から採取された生体試料中に請求項１〜７のいずれか１項に記載のエピトープの存在を検出することと、前記試料中に検出された前記エピトープの量に基づいて、前記対象に前立腺癌があるか、前立腺癌が発症する可能性が高いことを判定することとを含む、方法。
【請求項１１】
前記試料中にエピトープの存在を検出することが、前記試料と、請求項１〜７のいずれか１項に記載のエピトープと特異的に結合することが可能な結合実体とを接触させることを含む、請求項１０に記載の方法。
【請求項１２】
前記結合実体が抗体の集団である、請求項１１に記載の方法。
【請求項１３】
前記抗体の集団が、ＭＩＬ３８抗体（ＣＢＡ２０１４００２６）、ウサギ抗ＧＰＣ−１ポリクローナル抗体（ａｂ１３７６０４、ａｂｃａｍ社）、マウス抗グリピカンモノクローナル抗体２６００クローン４Ｄ１（Ｍｉｌｌｉｐｏｒｅ社）またはヤギ抗グリピカン１抗体（ＡＡ２４−５３０）のいずれか１つまたは複数のものを含む、請求項１２に記載の方法。
【請求項１４】
請求項１〜７のいずれか１項に記載のエピトープを含む、融合タンパク質。
【請求項１５】
ＧＰＣ−１の検出方法の陽性対照要素としての請求項１〜７のいずれか１項に記載のエピトープ、請求項８に記載のエピトープの取合せまたは請求項１４に記載の融合タンパク質の使用。