【手続補正書】
【提出日】平成30年4月18日(2018.4.18)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
式ＩまたはＩＩに従った構造を有する化合物であって：
2017524793.tif 000001
Ｒ１ａと、Ｒ１ｂと、Ｒ７ａと、Ｒ７ｂとは、Ｈ、置換または非置換のアルキル、置換または非置換のシクロアルキル、置換または非置換のヘテロアルキル、及び、置換または非置換のヘテロシクロアルキルから、別々に選択され；
Ｒ１ａとＲ１ｂとは、これらに結合される炭素原子と共に、任意に接合され、置換または非置換のＣ３〜Ｃ７シクロアルキルと、置換または非置換の３−〜７−テロシクロアルキルとから選択される部材である環を生成し；
Ｒ７ａとＲ７ｂとは、これらに結合される炭素原子と共に、任意に接合され、置換または非置換のＣ３〜Ｃ７シクロアルキルと、置換または非置換の３−〜７−テロシクロアルキルとから選択される部材である環を生成し；Ｒ１ａ、Ｒ１ｂ、Ｒ７ａ及びＲ７ｂの少なくとも一つは、Ｈではなく、Ｒ８は、Ｈ、
2017524793.tif 000002
及び
2017524793.tif 000003
から選択され、
Ｌｘは、結合、置換または非置換のアルキル、置換または非置換のシクロアルキル、置換または非置換のヘテロアルキル、及び置換または非置換のヘテロシクロアルキルから選択され、
Ｌｘｓは、置換または非置換のアルキル、置換または非置換のシクロアルキル、置換または非置換のヘテロアルキル、及び置換または非置換のヘテロシクロアルキルから選択され、
Ｒｓは、保護または非保護の反応性官能基、結合部位、及び固体担持体から選択され、
Ｒｘは、保護または非保護の反応性官能基、及び結合部位から選択され、それぞれの結合部位は、ヌクレオシド、ヌクレオシドへのリンカー、ヌクレオチド、ヌクレオチドへのリンカー、オリゴヌクレオチド、オリゴヌクレオチドへのリンカー、核酸、核酸へのリンカー、キャリア分子、キャリア分子へのリンカー、固体担持体、及び固体担持体へのリンカーから、独立して選択される部材に共有結合される、前記化合物。
【請求項２】
Ｒ１ａと、Ｒ１ｂと、Ｒ７ａと、Ｒ７ｂとが、独立して、非置換のＣ１、Ｃ２、Ｃ３、Ｃ４、Ｃ５及びＣ６アルキルから選択される、請求項１に記載の化合物。
【請求項３】
Ｒ１ａと、Ｒ１ｂと、Ｒ７ａと、Ｒ７ｂとがそれぞれ、メチルである、請求項２に記載の化合物。
【請求項４】
Ｒ１ａと、Ｒ１ｂと、Ｒ７ａと、Ｒ７ｂとがそれぞれ、Ｈである、請求項３に記載の化合物。
【請求項５】
Ｌｘが、非置換のＣ１、Ｃ２、Ｃ３、Ｃ４、Ｃ５、Ｃ６、Ｃ７、Ｃ８、Ｃ９及びＣ１０アルキルから選択される、請求項１〜４のいずれかに記載の化合物。
【請求項６】
Ｌｘｓが、置換ヘテロアルキルである、請求項１〜４のいずれかに記載の化合物。
【請求項７】
Ｒｘが、ホスホラミダイトと、−ＯＨと、−ＯＤＭＴと、−ＣＯＯＨと、活性エステルと、−ＮＨ２とから選択される、請求項１〜６のいずれかに記載の化合物。
【請求項８】
Ｒｓが、−ＯＨと、−ＯＤＭＴと、固体担持体へのリンカーに共有結合的に結合する結合部位と、から選択される、請求項１〜４及び６のいずれかに記載の化合物。
【請求項９】
Ｒｘが、ホスホラミダイトと、−ＯＨと、−ＯＤＭＴと、−ＣＯＯＨと、活性エステルと、−ＮＨ２とから選択される、請求項８に記載の化合物。
【請求項１０】
Ｒｘが、ヌクレオシドへのリンカーに共有結合される結合部位であり、
前記ヌクレオシドが、以下の構造を有し：
2017524793.tif 000004
環標識Ｂが、核酸塩基であり;
Ｒｎ３が、−ＯＨまたはホスホラミダイトであり;
Ｒｎ５が、−ＯＨまたは−ＯＤＭＴである、請求項１〜５のいずれかに記載の化合物。
【請求項１１】
Ｒ８が、以下：
2017524793.tif 000005
から選択される、請求項１〜４のいずれかに記載の化合物。
【請求項１２】
核酸標的配列を検出する方法であって、前記方法は、以下を備える：
（ａ）前記標的配列を検出部核酸に接触させることであって；
一本鎖ターゲット結合シーケンスを備え、前記検出部核酸は、これにリンクされた；
ｉ）蛍光体；及び
ｉｉ）請求項１〜６のいずれかに従った化合物であって、Ｒ８は、検出部核酸に（直接またはリンカーを通して）共有結合される結合部位を備える、前記化合物、を備え；
前記検出部核酸は、前記蛍光体が励起される際、前記蛍光体と前記化合物との間にドナー・アクセプターエネルギー移動ができるようにする立体構造である、前記標的配列を検出部核酸に接触させること；
（ｂ）前記ターゲット結合シーケンスを前記標的配列にハイブリダイズし、それにより検出部核酸の立体構造を改質し、蛍光パラメータを変化させること；及び、
（ｃ）前記蛍光パラメータの前記変化を検出し、それにより前記核酸標的配列を検出すること、
を備える、前記方法。
【請求項１３】
第１の核酸と第２の核酸とがハイブリダイズするか否かを確認する方法であって、
前記第１の核酸は、請求項１〜６のいずれかに従った化合物を備え、
Ｒ８は、（直接またはリンカーを通して）前記第１の核酸に共有結合される結合部位を備え、前記方法は：
（ａ）前記第１の核酸を前記第２の核酸に接触させること；及び
（ｂ）前記第１の核酸、前記第２の核酸及びその組合せから選択される部材の蛍光特性内で変更を検出し、それにより前記ハイブリダイゼーションが発生するか否かを確認すること、
を備える、前記方法。
【請求項１４】
核酸増幅反応を監視する方法であって、前記方法は：
（ａ）検出部核酸を備える増幅反応混合物を調製することであって、それにリンクされた
ｉ）蛍光体；及び
ｉｉ）請求項１〜６のいずれかに従った化合物であって、Ｒ８は前記検出部核酸に（直接またはリンカーを通して）共有結合で結合される結合部位を備える、前記化合物；
を有する、前記増幅反応混合物を調製すること；
（ｂ）増幅反応混合物を増幅条件に従わせること；
（ｃ）検出部核酸からの蛍光信号のために反応混合物を監視して、アッセイ結果を得ること；及び
（ｄ）核酸増幅反応をモニターするためにアッセイ結果を使用すること、
を備える、前記方法。
【請求項１５】
標的配列の増幅を検出する方法であって、前記方法は：
（ａ）標的配列の側面に位置したＰＣＲプライマーを有する標的配列を備えるサンプル核酸をハイブリダイズすること；
（ｂ）重合酵素でハイブリダイズされたプライマーを拡張してＰＣＲ製品を製作し、ＰＣＲ製品の２鎖を分離して標的配列の知覚及びアンチセンス鎖を利用可能にすること；
（ｃ）検出部核酸を、ＰＣＲ製品内の標的配列の知覚またはアンチセンス鎖にハイブリダイズすること、ここで、検出部核酸は：
ｉ）ＰＣＲ製品内の標的配列の知覚またはアンチセンス鎖の少なくとも一部に相補的であり、かつ、ＰＣＲプライマーの間の領域にハイブリダイズする、一本鎖ターゲット結合シーケンス；
ｉｉ）蛍光体；及び
ｉｉｉ）請求項１〜６のいずれかに従った化合物であって、Ｒ８は、前記検出部核酸に（直接またはリンカーを通して）共有結合で結合される結合部位を備える、前記化合物；
を備え、
ここで、その標的配列へのハイブリダイゼーションの前に、検出部核酸は、蛍光体が励起される際、蛍光体と化合物との間にドナー・アクセプターエネルギー移動ができるようにする立体構造であり；
それにより、検出部核酸の立体構造を改質して、蛍光パラメータを変化させること；及び
（ｄ）蛍光パラメータの変化を測定して、標的配列及びその増幅を検出すること、
を備える、前記方法。