【手続補正書】
【提出日】平成30年10月23日(2018.10.23)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
患者のサンプル中の病原体を検出する方法であって、
それぞれ波数および吸光度値を有する１つ以上のスペクトル成分を有する、患者のサンプルを代表するサンプル赤外線スペクトルを前記サンプルの乾燥なしで生成するステップと、
それぞれ波数および吸光度値の１つ以上のデータベーススペクトル成分を有するスペクトルモデルの参照データベースを提供するステップであって、前記データベーススペクトル成分は病原体を同定するステップと、
前記参照データベースが、１つ以上のサンプルスペクトル成分に対応する１つ以上のデータベーススペクトル成分を有するかどうか決定するステップと、
同定した対応するデータベース成分のリストを作成するステップと、
を含むことを特徴とする血液サンプル中の病原体を検出する方法。
【請求項２】
前記スペクトルモデルの参照データベースを提供するステップが、１つ以上スペクトルの窓を選択するステップをさらに含み、前記参照データベースが１つ以上のデータベーススペクトル成分を有するかどうか決定するステップが、選択された１つ以上のスペクトルの窓と前記参照データベースとを比較するステップを含むことを特徴とする請求項１に記載の方法。
【請求項３】
各成分の波数について吸光度値から対応する水のブランク強度値を引くステップをさらに含むことを特徴とする請求項１に記載の方法。
【請求項４】
まとめられた個別のスペクトルモデルのそれぞれにおいてサンプル成分の数を決定し、所定の分類基準に基づいて前記まとめられたスペクトルモデルを分類するステップをさらに含むことを特徴とする請求項１に記載の方法。
【請求項５】
前記病原体が血液媒介ウイルス性疾病を含む群から選択されることを特徴とする請求項１に記載の方法。
【請求項６】
前記病原体が、ヒト免疫不全ウイルス（ＨＩＶ）、Ｂ型肝炎ウイルス（ＨＢＶ）、Ｃ型肝炎ウイルス（ＨＣＶ）、アレナウイルス科のウイルス（ラッサ熱、フニンおよびマチュポを含む）、ブニヤウイルス科のウイルス（クリミア・コンゴ出血熱、リフトバレー熱、ハンタン出血熱を含む）、フィロウイルス科のウイルス（エボラおよびマールブルグ）、フラビウイルス科のウイルス（黄熱、デング、オムスク出血熱、キャサヌール森林病、ウエストナイルウイルス）、アルファウイルス科（Ａｌｐｈａｖｉｒｉｄａｅ）のウイルスまたはベクター、バベシア・ディバージェンス（Ｂａｂｅｓｉａ  Ｂ．ｄｉｖｅｒｇｅｎｓ）、バベシア・ビゲミナ（Ｂ．ｂｉｇｅｍｉｎａ）、バベシア・エクイ（Ｂ．ｅｑｕｉ）、バベシア・ミクロフティ（Ｂ．ｍｉｃｒｏｆｔｉ）、バベシア・ダンカニ（Ｂ．ｄｕｎｃａｎｉ）、リーシュマニア  トキソプラズマ原虫（Ｌｅｉｓｈｍａｎｉａ  Ｔｏｘｏｐｌａｓｍａ  ｇｏｎｄｉｉ）、熱帯熱マラリア原虫（Ｐｌａｓｍｏｄｉｕｍ  ｆａｌｃｉｐａｒｕｍ）、三日熱マラリア原虫（Ｐｌａｓｍｏｄｉｕｍ  ｖｉｖａｘ）、プラスモディウム・オバール・クルチシ（Ｐｌａｓｍｏｄｉｕｍ  ｏｖａｌｅ  ｃｕｒｔｉｓｉ）、プラスモディウム・オバール・ワリケリ（Ｐｌａｓｍｏｄｉｕｍ  ｏｖａｌｅ  ｗａｌｌｉｋｅｒｉ）、四日熱マラリア原虫（Ｐｌａｓｍｏｄｉｕｍ  ｍａｌａｒｉａｅ）、二日熱マラリア原虫（Ｐｌａｓｍｏｄｉｕｍ  ｋｎｏｗｌｅｓｉ）、ブルセイトリパノソーマ（Ｔｒｙｐａｎｏｓｏｍａ  ｂｒｕｃｅｉ）およびクルーズトリパノソーマ（Ｔｒｙｐａｎｏｓｏｍａ  ｃｒｕｚｉ）を含む群から選択されることを特徴とする請求項１に記載の方法。
【請求項７】
前記データベーススペクトル成分が、肝炎Ａ、肝炎Ｂ、肝炎Ｃ、肝炎Ｄ、肝炎Ｅ、肝炎Ｇまたはこれらの組み合わせから選択される特定の肝炎ウイルスを同定することを特徴とする請求項１に記載の方法。
【請求項８】
前記患者のサンプルを代表する前記赤外線スペクトルが血液サンプルの厚層から生成されることを特徴とする請求項１に記載の方法。
【請求項９】
前記患者のサンプルを代表する前記赤外線スペクトルが血液の単一液滴から生成されることを特徴とする請求項１に記載の方法。
【請求項１０】
前記患者のサンプルを代表する前記赤外線スペクトルが、容量５〜５０μｌ、または５〜２５μｌの血液の単一液滴から作成されることを特徴とする請求項９に記載の方法。
【請求項１１】
前記データベーススペクトル成分がマラリアを同定する請求項１に記載の方法。
【請求項１２】
前記患者のサンプルを代表する前記赤外線スペクトルが血液サンプルの厚層から生成されることを特徴とする請求項１１に記載の方法。
【請求項１３】
前記患者のサンプルを代表する前記赤外線スペクトルが血液の単一液滴から生成されることを特徴とする請求項１１に記載の方法。
【請求項１４】
前記患者のサンプルを代表する前記赤外線スペクトルが容量５〜５０μｌの血液の単一液滴から作成されることを特徴とする請求項１３に記載の方法。
【請求項１５】
前記データベーススペクトル成分が、マラリアの特定の段階を同定することを特徴とする請求項１１に記載の方法。
【請求項１６】
前記データベーススペクトル成分が１つ以上のプラスモディウム種を同定することを特徴とする請求項１１に記載の方法。
【請求項１７】
前記データベーススペクトル成分が、熱帯熱マラリア原虫、三日熱マラリア原虫、プラスモディウム・オバール・クルチシ（Ｐｌａｓｍｏｄｉｕｍ  ｏｖａｌｅ  ｃｕｒｔｉｓｉ）、プラスモディウム・オバール・ワリケリ（Ｐｌａｓｍｏｄｉｕｍ  ｏｖａｌｅ  ｗａｌｌｉｋｅｒｉ）、四日熱マラリア原虫、二日熱マラリア原虫またはこれらの組み合わせを含む群から選択される１つ以上のプラスモディウム種を同定する請求項１６に記載の方法。
【請求項１８】
患者のサンプル中の病原体を検出する方法を実行するアプリケーションを一過性でない形態で保存するためのコンピュータが読み込み可能な記憶媒体であって、前記患者のサンプル中の病原体を検出する方法は、
（ｉ）患者のサンプルを代表するＩＲスペクトルを記録するステップと、
（ｉｉ）前記スペクトルをスペクトルモデルの参照データベースと比較して、患者のサンプルの波数および吸光度の１つ以上のスペクトル成分を同定するステップであって、前記スペクトル成分は病原体を同定するステップと、
（ｉｉｉ）データベースの個別のスペクトルモデルに対応する同定されたサンプル成分のリストを作成するステップと、を含み、
ステップ（ｉ）〜（ｉｉｉ）が自動化されており、さらに、記録されたＩＲスペクトルから水のブランクの強度値を引くことを特徴とするコンピュータが読み込み可能な記憶媒体。
【請求項１９】
ＩＲスペクトルの捕捉のための分光計とコンピュータとを含む、患者のサンプル中の病原体を検出するシステムであって、
前記分光計は前記患者のサンプルを代表するＩＲスペクトルを生成するように構成されており、
前記コンピュータは、前記スペクトルをスペクトルモデルの参照データベースに適用して、前記患者のサンプルの波数および吸光度の１つ以上のスペクトル成分を同定するように構成されており、前記スペクトル成分は病原体を同定し、
前記コンピュータは、前記参照データベースの個別のスペクトルモデルに対応する同定された１つ以上のサンプル成分のリストを作成するようにさらに構成されており、前記コンピュータは前記スペクトルから水のブランクの強度値を引くようにさらに構成されていることを特徴とする患者のサンプル中の病原体を検出するシステム。
【請求項２０】
前記患者のサンプルのサンプル容量と等しい水のサンプル容量で水のブランクを測定して、各成分の波数について吸光度値から対応する水のブランク強度値を生成するステップをさらに含むことを特徴とする請求項１に記載の方法。
【請求項２１】
前記患者のサンプルが全血サンプルであり、前記全血サンプル中の赤血球を溶解するステップをさらに含むことを特徴とする請求項１に記載の方法。