【手続補正書】
【提出日】平成30年10月23日(2018.10.23)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
群（a）、群（b）、群（c）または群（d）：
（a）KRABドメインまたはそのホモログに機能しうる形で連結されたDNA結合ドメインを含む人工転写リプレッサー（ATR）；
（b）DNMT3A、DNMT3BもしくはDNMT1ドメインまたはそのホモログに機能しうる形で連結されたDNA結合ドメインを含むATR；
（c）DNMT3Lドメインまたはそのホモログに機能しうる形で連結されたDNA結合ドメインを含むATR；および
（d）SETDB1ドメインまたはそのホモログに機能しうる形で連結されたDNA結合ドメインを含むATR
から選択される2以上の人工転写リプレッサー（ATR）あるいはそれらをコードするポリヌクレオチドを含む産物であって、それらのATRの少なくとも2つが、異なる群（a）、群（b）、群（c）または群（d）から選択される、産物、
ここで場合により該産物は組成物またはキットの形態である、該産物。
【請求項２】
(i)KRABドメインまたはそのホモログが、配列番号1〜7のいずれか1つに対して少なくとも60%の同一性を有するアミノ酸配列を含む、
(ii)DNMT3Aドメインまたはそのホモログが、配列番号8に対して少なくとも60%の同一性を有するアミノ酸配列を含む；DNMT3Bドメインまたはそのホモログが、配列番号9または36に対して少なくとも60%の同一性を有するアミノ酸配列を含む；および／またはDNMT1ドメインまたはそのホモログが、配列番号10に対して少なくとも60%の同一性を有するアミノ酸配列を含む、
(iii)DNMT3Lドメインまたはそのホモログが、配列番号11に対して少なくとも60%の同一性を有するアミノ酸配列を含む、
(iv)SETDB1ドメインまたはそのホモログが、配列番号12または13に対して少なくとも60%の同一性を有するアミノ酸配列を含む、ならびに／あるいは、
(v)（a）、（b）、（c）または（d）のDNA結合ドメインが、TALE DNA結合ドメイン、ジンクフィンガードメイン、tetR DNA結合ドメイン、メガヌクレアーゼまたはCRISPR/Cas系から、独立して選択されるドメインを含む、
請求項1に記載の産物。
【請求項３】
2以上のATRをコードするポリヌクレオチドが単一ベクターの形態であり、あるいは別々のベクター内に含まれる、請求項１または２に記載の産物。
【請求項４】
DNA結合ドメインに機能しうる形で連結されていない別のエフェクタータンパク質またはそれをコードするポリヌクレオチドを更に含み、
場合により、該DNA結合ドメインに機能しうる形で連結されていない別のエフェクタータンパク質が、群（a）、群（b）、群（c）または群（d）：
（a）KRABドメインまたはそのホモログ；
（b）DNMT3A、DNMT3BもしくはDNMT1ドメインまたはそのホモログ；
（c）DNMT3Lドメインまたはそのホモログ；および
（d）SETDB1ドメインまたはそのホモログ
から選択されるドメインを含む、請求項１〜３のいずれか1項に記載の産物。
【請求項５】
医薬上許容される担体、希釈剤または賦形剤を更に含む医薬組成物の形態である、請求項１〜４のいずれか1項に記載の産物。
【請求項６】
治療における使用のための、請求項１〜５のいずれか1項に記載の産物であって、好ましくは該2以上のATRまたはそれらをコードするポリヌクレオチドが、同時、連続的または別々に対象に投与するための組合せ製剤であり、
好ましくは
(i) 細胞における該2以上のATRの一過性発現が標的遺伝子をサイレンシングする、
(ii) 細胞への該2以上のATRの送達が標的遺伝子を恒久的にサイレンシングする、
(iii) 細胞への該2以上のATRの送達が該細胞の後代における標的遺伝子を恒久的にサイレンシングする、および／または
(iv)異なるATRのDNA結合ドメインが、0〜30bp離れた結合部位に結合するように選択され、好ましくは該DNA結合ドメインがTALE DNA結合ドメインまたはCRISPR/Cas系である、
前記産物。
【請求項７】
治療における使用のための、KRABドメインまたはそのホモログに機能しうる形で連結されたDNA結合ドメインを含む人工転写リプレッサー（ATR）あるいはそれをコードするポリヌクレオチドであって、該治療において、該ATRが、DNMT3A、DNMT3BもしくはDNMT1ドメインまたはそのホモログに機能しうる形で連結されたDNA結合ドメインを含む第2 ATR、および／またはDNMT3Lドメインまたはそのホモログに機能しうる形で連結されたDNA結合ドメインを含む第3 ATR、および／またはSETDB1ドメインまたはそのホモログに機能しうる形で連結されたDNA結合ドメインを含む第4 ATR、あるいはそれらをコードするポリヌクレオチドと組合せて、同時、連続的または別々に対象に投与される、人工転写リプレッサー（ATR）あるいはそれをコードするポリヌクレオチド。
【請求項８】
治療における使用のための、DNMT3A、DNMT3BもしくはDNMT1ドメインまたはそのホモログに機能しうる形で連結されたDNA結合ドメインを含む人工転写リプレッサー（ATR）あるいはそれをコードするポリヌクレオチドであって、該治療において、該ATRが、KRABドメインまたはそのホモログに機能しうる形で連結されたDNA結合ドメインを含む第2 ATR、および／またはDNMT3Lドメインまたはそのホモログに機能しうる形で連結されたDNA結合ドメインを含む第3 ATR、および／またはSETDB1ドメインまたはそのホモログに機能しうる形で連結されたDNA結合ドメインを含む第4 ATR、あるいはそれらをコードするポリヌクレオチドと組合せて、同時、連続的または別々に対象に投与される、人工転写リプレッサー（ATR）あるいはそれをコードするポリヌクレオチド。
【請求項９】
治療における使用のための、DNMT3Lドメインまたはそのホモログに機能しうる形で連結されたDNA結合ドメインを含む人工転写リプレッサー（ATR）あるいはそれをコードするポリヌクレオチドであって、該治療において、該ATRが、KRABドメインまたはそのホモログに機能しうる形で連結されたDNA結合ドメインを含む第2 ATR、および／またはDNMT3A、DNMT3BもしくはDNMT1ドメインまたはそのホモログに機能しうる形で連結されたDNA結合ドメインを含む第3 ATR、および／またはSETDB1ドメインまたはそのホモログに機能しうる形で連結されたDNA結合ドメインを含む第4 ATR、あるいはそれらをコードするポリヌクレオチドと組合せて、同時、連続的または別々に対象に投与される、人工転写リプレッサー（ATR）あるいはそれをコードするポリヌクレオチド。
【請求項１０】
治療における使用のための、SETDB1ドメインまたはそのホモログに機能しうる形で連結されたDNA結合ドメインを含む人工転写リプレッサー（ATR）あるいはそれをコードするポリヌクレオチドであって、該治療において、該ATRが、DNMT3A、DNMT3BもしくはDNMT1ドメインまたはそのホモログに機能しうる形で連結されたDNA結合ドメインを含む第2 ATR、および／またはDNMT3Lドメインまたはそのホモログに機能しうる形で連結されたDNA結合ドメインを含む第3 ATR、および／またはKRABドメインまたはそのホモログに機能しうる形で連結されたDNA結合ドメインを含む第4 ATR、あるいはそれらをコードするポリヌクレオチドと組合せて、同時、連続的または別々に対象に投与される、人工転写リプレッサー（ATR）あるいはそれをコードするポリヌクレオチド。
【請求項１１】
請求項１または２に記載の該2以上のATRを含む、細胞。
【請求項１２】
請求項１１に記載の細胞の後代である、細胞。
【請求項１３】
治療における使用のための、請求項１１または１２記載の細胞。
【請求項１４】
請求項３に記載の該2以上のATRをコードするポリヌクレオチドで細胞をトランスフェクトすることを含む遺伝子治療の方法、ここで場合により該トランスフェクションをエクスビボで行う、該方法。
【請求項１５】
群（a）、群（b）、群（c）または群（d）：
（a）KRABドメインまたはそのホモログに機能しうる形で連結されたDNA結合ドメインを含む人工転写リプレッサー（ATR）；
（b）DNMT3A、DNMT3BもしくはDNMT1ドメインまたはそのホモログに機能しうる形で連結されたDNA結合ドメインを含むATR；
（c）DNMT3Lドメインまたはそのホモログに機能しうる形で連結されたDNA結合ドメインを含むATR；および
（d）SETDB1ドメインまたはそのホモログに機能しうる形で連結されたDNA結合ドメインを含むATR
から選択される2以上の人工転写リプレッサー（ATR）あるいはそれらをコードするポリヌクレオチドを同時、連続的または別々に対象に投与することを含む遺伝子治療の方法であって、それらのATRの少なくとも2つが、異なる群（a）、群（b）、群（c）または群（d）から選択される、方法。
【請求項１６】
(i) 細胞における該2以上のATRの一過性発現が標的遺伝子をサイレンシングする、
(ii) 細胞への該2以上のATRの送達が標的遺伝子を恒久的にサイレンシングする、
(iii) 細胞への該2以上のATRの送達が該細胞の後代における標的遺伝子を恒久的にサイレンシングする、および／または
(iv)異なるATRのDNA結合ドメインが、0〜30bp離れた結合部位に結合するように選択され、好ましくは該DNA結合ドメインがTALE DNA結合ドメインまたはCRISPR/Cas系である、
請求項１５に記載の方法。
【請求項１７】
群（a）、群（b）、群（c）または群（d）：
（a）KRABドメインまたはそのホモログに機能しうる形で連結されたDNA結合ドメインを含む人工転写リプレッサー（ATR）；
（b）DNMT3A、DNMT3BもしくはDNMT1ドメインまたはそのホモログに機能しうる形で連結されたDNA結合ドメインを含むATR；
（c）DNMT3Lドメインまたはそのホモログに機能しうる形で連結されたDNA結合ドメインを含むATR；および
（d）SETDB1ドメインまたはそのホモログに機能しうる形で連結されたDNA結合ドメインを含むATR
から選択される2以上の人工転写リプレッサー（ATR）あるいはそれらをコードするポリヌクレオチドを含むキットであって、それらのATRの少なくとも2つが、異なる群（a）、群（b）、群（c）または群（d）から選択される、キット。
【請求項１８】
インビトロまたはエクスビボでの使用である、標的遺伝子をサイレンシングするための請求項1〜５のいずれか1項に記載の産物の使用。
【請求項１９】
請求項1〜５のいずれか1項に記載の産物を細胞に投与する工程を含む、標的遺伝子をサイレンシングする方法。
【請求項２０】
DNMT3A、DNMT3BもしくはDNMT1ドメインまたはそのホモログに機能しうる形で連結されたDNA結合ドメインを含む人工転写リプレッサー（ATR）、およびSETDB1ドメインまたはそのホモログに機能しうる形で連結されたDNA結合ドメインを含むATR、あるいはそれらをコードするポリヌクレオチドを含む産物、
ここで場合により該産物はDNMT3LもしくはKRABドメインまたはそのホモログに機能しうる形で連結されたDNA結合ドメインを含むATRあるいはそれをコードするポリヌクレオチドを更に含む、前記産物。
【請求項２１】
群（a）、群（b）、群（c）または群（d）：
（a）KRABドメインまたはそのホモログ；
（b）DNMT3A、DNMT3BもしくはDNMT1ドメインまたはそのホモログ；
（c）DNMT3Lドメインまたはそのホモログ；および
（d）SETDB1ドメインまたはそのホモログ
から選択される2以上のドメインに機能しうる形で連結されたDNA結合ドメインを含む人工転写リプレッサー（ATR）であって、該DNA結合ドメインに機能しうる形で連結されたドメインの少なくとも2つが、異なる群（a）、群（b）、群（c）または群（d）から選択される、人工転写リプレッサー（ATR）、
ここで好ましくは該DNA結合ドメインがTALE DNA結合ドメイン、ジンクフィンガードメイン、tetR DNA結合ドメイン、メガヌクレアーゼまたはCRISPR/Cas系を含むものである、前記人工転写リプレッサー（ATR）。
【請求項２２】
請求項２１に記載のATRをコードするポリヌクレオチド。
【請求項２３】
2以上の異なる人工転写リプレッサー（ATR）またはそれをコードするポリヌクレオチドを含む産物であって、それらの2以上の異なるATRが、群（a）、群（b）、群（c）または群（d）：
（a）KRABドメインまたはそのホモログ；
（b）DNMT3A、DNMT3BもしくはDNMT1ドメインまたはそのホモログ；
（c）DNMT3Lドメインまたはそのホモログ；および
（d）SETDB1ドメインまたはそのホモログ
から選択される2以上のドメインに機能しうる形で連結されたDNA結合ドメインを個々に含み、ここで、それぞれの個々のDNA結合ドメインに機能しうる形で連結されたドメインの少なくとも2つが、異なる群（a）、群（b）、群（c）または群（d）から選択され、
好ましくはここで、該2以上の異なるATRのDNA結合ドメインが、TALE DNA結合ドメイン、ジンクフィンガードメイン、tetR DNA結合ドメイン、メガヌクレアーゼまたはCRISPR/Cas系からなる群から個々に選択される、産物、
ここで場合により該産物は組成物またはキットの形態である、前記産物。
【請求項２４】
群（a）、群（b）、群（c）または群（d）：
（a）KRABドメインまたはそのホモログに機能しうる形で連結されたDNA結合ドメインを含む人工転写リプレッサー（ATR）；
（b）DNMT3A、DNMT3BもしくはDNMT1ドメインまたはそのホモログに機能しうる形で連結されたDNA結合ドメインを含むATR；
（c）DNMT3Lドメインまたはそのホモログに機能しうる形で連結されたDNA結合ドメインを含むATR；および
（d）SETDB1ドメインまたはそのホモログに機能しうる形で連結されたDNA結合ドメインを含むATR
から選択される、ただ1つの人工転写リプレッサー（ATR）、またはそれをコードするポリヌクレオチド、およびDNA結合ドメインに機能しうる形で連結されていない1以上の別のエフェクタータンパク質またはそれらをコードするポリヌクレオチドを含む産物、
好ましくはここで、該DNA結合ドメインに機能しうる形で連結されていない1以上の別のエフェクタータンパク質が、群（a）、群（b）、群（c）または群（d）：
（a）KRABドメインまたはそのホモログ；
（b）DNMT3A、DNMT3BもしくはDNMT1ドメインまたはそのホモログ；
（c）DNMT3Lドメインまたはそのホモログ；および
（d）SETDB1ドメインまたはそのホモログ
から選択されるドメインを含み、ここで、該ドメインが該ATRのエフェクタードメインとは異なる、前記産物、
ここで場合により該産物は組成物またはキットの形態である、前記産物。
【請求項２５】
KRABドメインまたはそのホモログに機能しうる形で連結されたDNA結合ドメインを含む人工転写リプレッサー（ATR）、DNMT3Lドメインまたはそのホモログに機能しうる形で連結されたDNA結合ドメインを含むATR、およびDNMT3Aドメインまたはそのホモログに機能しうる形で連結されたDNA結合ドメインを含むATR、あるいはそれらをコードするポリヌクレオチドを含む、請求項1〜５のいずれか1項に記載の産物。
【請求項２６】
KRABドメインまたはそのホモログに機能しうる形で連結されたDNA結合ドメインを含む人工転写リプレッサー（ATR）、およびDNMT3Lドメインまたはそのホモログに機能しうる形で連結されたDNA結合ドメインを含むATR、あるいはそれらをコードするポリヌクレオチドを含む、請求項1〜５のいずれか1項に記載の産物。
【請求項２７】
DNMT3Lドメインまたはそのホモログに機能しうる形で連結されたDNA結合ドメインを含む人工転写リプレッサー（ATR）、およびDNMT3Aドメインまたはそのホモログに機能しうる形で連結されたDNA結合ドメインを含む人工転写リプレッサー（ATR）、あるいはそれらをコードするポリヌクレオチドを含む、請求項1〜５のいずれか1項に記載の産物。
【請求項２８】
KRABドメインまたはそのホモログに機能しうる形で連結されたDNA結合ドメインを含む人工転写リプレッサー（ATR）、およびDNMT3Aドメインまたはそのホモログに機能しうる形で連結されたDNA結合ドメインを含む人工転写リプレッサー（ATR）、あるいはそれらをコードするポリヌクレオチドを含む、請求項1〜５のいずれか1項に記載の産物。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０２９７
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０２９７】
上記明細書に記載の公表文献はすべて、参考として本明細書に含められる。本発明の範囲および精神から逸脱しない範囲での、記載された本発明の製品、使用、方法およびキットのさまざまな修正および変更は、当業者に明白であろう。本発明は、具体的な好ましい実施形態と関連して説明されたが、当然のことながら、特許請求された本発明は、そうした具体的な実施形態に過度に制限されるべきでない。たしかに、本発明を実施するための記載された方法のさまざまな修正が、生化学およびバイオテクノロジーもしくは関連分野の当業者には明白であり、それは以下の特許請求の範囲に含まれるものとする。
本発明は以下の実施形態を包含する。
[１]  群（a）、（b）、（c）または（d）：
（a）KRABドメインまたはそのホモログに機能しうる形で連結されたDNA結合ドメインを含む人工転写リプレッサー（ATR）；
（b）DNMT3A、DNMT3BもしくはDNMT1ドメインまたはそのホモログに機能しうる形で連結されたDNA結合ドメインを含むATR；
（c）DNMT3Lドメインまたはそのホモログに機能しうる形で連結されたDNA結合ドメインを含むATR；および
（d）SETDB1ドメインまたはそのホモログに機能しうる形で連結されたDNA結合ドメインを含むATR
から選択される2以上の人工転写リプレッサー（ATR）あるいはそれらをコードするポリヌクレオチドを含む産物であって、それらのATRの少なくとも2つが、異なる群（a）、（b）、（c）または（d）から選択される、産物。    
[２]  群（a）、（b）または（c）：
（a）KRABドメインまたはそのホモログに機能しうる形で連結されたDNA結合ドメインを含む人工転写リプレッサー（ATR）；
（b）DNMT3A、DNMT3BもしくはDNMT1ドメインまたはそのホモログに機能しうる形で連結されたDNA結合ドメインを含むATR；および
（c）DNMT3Lドメインまたはそのホモログに機能しうる形で連結されたDNA結合ドメインを含むATR
から選択される2以上の人工転写リプレッサー（ATR）あるいはそれらをコードするポリヌクレオチドを含む産物であって、それらのATRの少なくとも2つが、異なる群（a）、（b）または（c）から選択される、産物。    
[３]  KRABドメインまたはそのホモログが、配列番号1〜7のいずれか1つに対して少なくとも60%の同一性を有するアミノ酸配列を含む、実施形態1または2記載の産物。    
[４]  DNMT3Aドメインまたはそのホモログが、配列番号8に対して少なくとも60%の同一性を有するアミノ酸配列を含む；DNMT3Bドメインまたはそのホモログが、配列番号9または36に対して少なくとも60%の同一性を有するアミノ酸配列を含む；および／またはDNMT1ドメインまたはそのホモログが、配列番号10に対して少なくとも60%の同一性を有するアミノ酸配列を含む、前記実施形態のいずれか記載の産物。    
[５]  DNMT3Lドメインまたはそのホモログが、配列番号11に対して少なくとも60%の同一性を有するアミノ酸配列を含む、前記実施形態のいずれか記載の産物。    
[６]  SETDB1ドメインまたはそのホモログが、配列番号12または13に対して少なくとも60%の同一性を有するアミノ酸配列を含む、前記実施形態のいずれか記載の産物。    
[７]  （a）、（b）、（c）または（d）のDNA結合ドメインが、TALE DNA結合ドメイン、ジンクフィンガードメイン、tetR DNA結合ドメイン、メガヌクレアーゼまたはCRISPR/Cas系から、独立して選択されるドメインを含む、前記実施形態のいずれか記載の産物。    
[８]  2以上のATRをコードするポリヌクレオチドが単一ベクターの形態であり、あるいは別々のベクター内に含まれる、前記実施形態のいずれか記載の産物。    
[９]  DNA結合ドメインに機能しうる形で連結されていない別のエフェクタータンパク質またはそれをコードするポリヌクレオチドを更に含む、前記実施形態のいずれか記載の産物。    
[１０]  DNA結合ドメインに機能しうる形で連結されていない別のエフェクタータンパク質が、群（a）、（b）、（c）または（d）：
（a）KRABドメインまたはそのホモログ；
（b）DNMT3A、DNMT3BもしくはDNMT1ドメインまたはそのホモログ；
（c）DNMT3Lドメインまたはそのホモログ；および
（d）SETDB1ドメインまたはそのホモログ
から選択されるドメインを含む、実施形態9記載の産物。    
[１１]  医薬上許容される担体、希釈剤または賦形剤を更に含む医薬組成物の形態である、前記実施形態のいずれか記載の産物。    
[１２]  治療における使用のための、前記実施形態のいずれか記載の産物。    
[１３]  2以上のATRまたはそれらをコードするポリヌクレオチドが、同時、連続的または別々に対象に投与するための組合せ剤である、治療における使用のための、実施形態1〜8のいずれか記載の産物。    
[１４]  細胞における2以上のATRの一過性発現が標的遺伝子をサイレンシングする、実施形態12または13記載の、治療における使用のための産物。    
[１５]  細胞への2以上のATRの運搬が標的遺伝子を持続的にサイレンシングする、実施形態12〜14のいずれか記載の、治療における使用のための産物。    
[１６]  細胞への2以上のATRの運搬が該細胞の後代における標的遺伝子を持続的にサイレンシングする、実施形態12〜15のいずれか記載の、治療における使用のための産物。    
[１７]  異なるATRのDNA結合ドメインが、0〜30bp離れた結合部位に結合するように選択される、実施形態12〜16のいずれか記載の、治療における使用のための産物。    
[１８]  DNA結合ドメインがTALE DNA結合ドメインまたはCRISPR/Cas系である、実施形態17記載の、治療における使用のための産物。    
[１９]  治療における使用のための、KRABドメインまたはそのホモログに機能しうる形で連結されたDNA結合ドメインを含む人工転写リプレッサー（ATR）あるいはそれをコードするポリヌクレオチドであって、該治療において、該ATRが、DNMT3A、DNMT3BもしくはDNMT1ドメインまたはそのホモログに機能しうる形で連結されたDNA結合ドメインを含む第2 ATR、および／またはDNMT3Lドメインまたはそのホモログに機能しうる形で連結されたDNA結合ドメインを含む第3 ATR、および／またはSETDB1ドメインまたはそのホモログに機能しうる形で連結されたDNA結合ドメインを含む第4 ATR、あるいはそれらをコードするポリヌクレオチドと組合せて、同時、連続的または別々に対象に投与される、人工転写リプレッサー（ATR）あるいはそれをコードするポリヌクレオチド。    
[２０]  治療における使用のための、DNMT3A、DNMT3BもしくはDNMT1ドメインまたはそのホモログに機能しうる形で連結されたDNA結合ドメインを含む人工転写リプレッサー（ATR）あるいはそれをコードするポリヌクレオチドであって、該治療において、該ATRが、KRABドメインまたはそのホモログに機能しうる形で連結されたDNA結合ドメインを含む第2 ATR、および／またはDNMT3Lドメインまたはそのホモログに機能しうる形で連結されたDNA結合ドメインを含む第3 ATR、および／またはSETDB1ドメインまたはそのホモログに機能しうる形で連結されたDNA結合ドメインを含む第4 ATR、あるいはそれらをコードするポリヌクレオチドと組合せて、同時、連続的または別々に対象に投与される、人工転写リプレッサー（ATR）あるいはそれをコードするポリヌクレオチド。    
[２１]  治療における使用のための、DNMT3Lドメインまたはそのホモログに機能しうる形で連結されたDNA結合ドメインを含む人工転写リプレッサー（ATR）あるいはそれをコードするポリヌクレオチドであって、該治療において、該ATRが、KRABドメインまたはそのホモログに機能しうる形で連結されたDNA結合ドメインを含む第2 ATR、および／またはDNMT3A、DNMT3BもしくはDNMT1ドメインまたはそのホモログに機能しうる形で連結されたDNA結合ドメインを含む第3 ATR、および／またはSETDB1ドメインまたはそのホモログに機能しうる形で連結されたDNA結合ドメインを含む第4 ATR、あるいはそれらをコードするポリヌクレオチドと組合せて、同時、連続的または別々に対象に投与される、人工転写リプレッサー（ATR）あるいはそれをコードするポリヌクレオチド。    
[２２]  治療における使用のための、SETDB1ドメインまたはそのホモログに機能しうる形で連結されたDNA結合ドメインを含む人工転写リプレッサー（ATR）あるいはそれをコードするポリヌクレオチドであって、該治療において、該ATRが、DNMT3A、DNMT3BもしくはDNMT1ドメインまたはそのホモログに機能しうる形で連結されたDNA結合ドメインを含む第2 ATR、および／またはDNMT3Lドメインまたはそのホモログに機能しうる形で連結されたDNA結合ドメインを含む第3 ATR、および／またはKRABドメインまたはそのホモログに機能しうる形で連結されたDNA結合ドメインを含む第4 ATR、あるいはそれらをコードするポリヌクレオチドと組合せて、同時、連続的または別々に対象に投与される、人工転写リプレッサー（ATR）あるいはそれをコードするポリヌクレオチド。    
[２３]  実施形態1〜7のいずれか記載の2以上のATRを含む細胞。    
[２４]  実施形態23記載の細胞の後代である細胞。    
[２５]  治療における使用のための、実施形態23または24記載の細胞。    
[２６]  実施形態8記載の2以上のATRをコードするポリヌクレオチドで細胞をトランスフェクトすることを含む遺伝子治療の方法。    
[２７]  トランスフェクションをエクスビボで行う、実施形態26記載の方法。    
[２８]  群（a）、（b）、（c）または（d）：
（a）KRABドメインまたはそのホモログに機能しうる形で連結されたDNA結合ドメインを含む人工転写リプレッサー（ATR）；
（b）DNMT3A、DNMT3BもしくはDNMT1ドメインまたはそのホモログに機能しうる形で連結されたDNA結合ドメインを含むATR；
（c）DNMT3Lドメインまたはそのホモログに機能しうる形で連結されたDNA結合ドメインを含むATR；および
（d）SETDB1ドメインまたはそのホモログに機能しうる形で連結されたDNA結合ドメインを含むATR
から選択される2以上の人工転写リプレッサー（ATR）あるいはそれらをコードするポリヌクレオチドを同時、連続的または別々に対象に投与することを含む遺伝子治療の方法であって、それらのATRの少なくとも2つが、異なる群（a）、（b）、（c）または（d）から選択される、方法。    
[２９]  群（a）、（b）または（c）：
（a）KRABドメインまたはそのホモログに機能しうる形で連結されたDNA結合ドメインを含む人工転写リプレッサー（ATR）；
（b）DNMT3A、DNMT3BもしくはDNMT1ドメインまたはそのホモログに機能しうる形で連結されたDNA結合ドメインを含むATR；および
（c）DNMT3Lドメインまたはそのホモログに機能しうる形で連結されたDNA結合ドメインを含むATR
から選択される2以上の人工転写リプレッサー（ATR）あるいはそれらをコードするポリヌクレオチドを同時、連続的または別々に対象に投与することを含む遺伝子治療の方法であって、それらのATRの少なくとも2つが、異なる群（a）、（b）または（c）から選択される、方法。    
[３０]  群（a）、（b）、（c）または（d）：
（a）KRABドメインまたはそのホモログに機能しうる形で連結されたDNA結合ドメインを含む人工転写リプレッサー（ATR）；
（b）DNMT3A、DNMT3BもしくはDNMT1ドメインまたはそのホモログに機能しうる形で連結されたDNA結合ドメインを含むATR；
（c）DNMT3Lドメインまたはそのホモログに機能しうる形で連結されたDNA結合ドメインを含むATR；および
（d）SETDB1ドメインまたはそのホモログに機能しうる形で連結されたDNA結合ドメインを含むATR
から選択される2以上の人工転写リプレッサー（ATR）あるいはそれらをコードするポリヌクレオチドを含むキットであって、それらのATRの少なくとも2つが、異なる群（a）、（b）、（c）または（d）から選択される、キット。    
[３１]  インビトロまたはエクスビボでの使用である、標的遺伝子をサイレンシングするための実施形態1〜11のいずれか記載の産物の使用。    
[３２]  実施形態1〜11のいずれか記載の産物を細胞に投与する工程を含む、標的遺伝子をサイレンシングする方法。    
[３３]  DNMT3A、DNMT3BもしくはDNMT1ドメインまたはそのホモログに機能しうる形で連結されたDNA結合ドメインを含む人工転写リプレッサー（ATR）、およびSETDB1ドメインまたはそのホモログに機能しうる形で連結されたDNA結合ドメインを含むATR、あるいはそれらをコードするポリヌクレオチドを含む産物。    
[３４]  DNMT3LもしくはKRABドメインまたはそのホモログに機能しうる形で連結されたDNA結合ドメインを含むATRあるいはそれをコードするポリヌクレオチドを更に含む、実施形態33記載の産物。    
[３５]  群（a）、（b）、（c）または（d）：
（a）KRABドメインまたはそのホモログ；
（b）DNMT3A、DNMT3BもしくはDNMT1ドメインまたはそのホモログ；
（c）DNMT3Lドメインまたはそのホモログ；および
（d）SETDB1ドメインまたはそのホモログ
から選択される2以上のドメインに機能しうる形で連結されたDNA結合ドメインを含む人工転写リプレッサー（ATR）であって、該DNA結合ドメインに機能しうる形で連結されたドメインの少なくとも2つが、異なる群（a）、（b）、（c）または（d）から選択される、人工転写リプレッサー（ATR）。    
[３６]  群（a）、（b）または（c）：
（a）KRABドメインまたはそのホモログ；
（b）DNMT3A、DNMT3BもしくはDNMT1ドメインまたはそのホモログ；および
（c）DNMT3Lドメインまたはそのホモログ
から選択される2以上のドメインに機能しうる形で連結されたDNA結合ドメインを含む人工転写リプレッサー（ATR）であって、該DNA結合ドメインに機能しうる形で連結されたドメインの少なくとも2つが、異なる群（a）、（b）または（c）から選択される、人工転写リプレッサー（ATR）。    
[３７]  該DNA結合ドメインがTALE DNA結合ドメイン、ジンクフィンガードメイン、tetR DNA結合ドメイン、メガヌクレアーゼまたはCRISPR/Cas系を含む、実施形態35または36記載のATR。    
[３８]  実施形態35〜37のいずれか記載のATRをコードするポリヌクレオチド。    
[３９]  2以上の異なる人工転写リプレッサー（ATR）またはそれをコードするポリヌクレオチドを含む産物であって、それらの2以上の異なるATRが、群（a）、（b）、（c）または（d）：
（a）KRABドメインまたはそのホモログ；
（b）DNMT3A、DNMT3BもしくはDNMT1ドメインまたはそのホモログ；
（c）DNMT3Lドメインまたはそのホモログ；および
（d）SETDB1ドメインまたはそのホモログ
から選択される2以上のドメインに機能しうる形で連結されたDNA結合ドメインを個々に含み、ここで、それぞれの個々のDNA結合ドメインに機能しうる形で連結されたドメインの少なくとも2つが、異なる群（a）、（b）、（c）または（d）から選択される、産物。    
[４０]  2以上の異なる人工転写リプレッサー（ATR）またはそれをコードするポリヌクレオチドを含む産物であって、それらの2以上の異なるATRが、群（a）、（b）または（c）：
（a）KRABドメインまたはそのホモログ；
（b）DNMT3A、DNMT3BもしくはDNMT1ドメインまたはそのホモログ；および
（c）DNMT3Lドメインまたはそのホモログ
から選択される2以上のドメインに機能しうる形で連結されたDNA結合ドメインを個々に含み、ここで、それぞれの個々のDNA結合ドメインに機能しうる形で連結されたドメインの少なくとも2つが、異なる群（a）、（b）または（c）から選択される、産物。    
[４１]  それらの2以上の異なるATRのDNA結合ドメインが、TALE DNA結合ドメイン、ジンクフィンガードメイン、tetR DNA結合ドメイン、メガヌクレアーゼまたはCRISPR/Cas系からなる群から個々に選択される、実施形態39または40記載の産物。    
[４２]  群（a）、（b）、（c）または（d）：
（a）KRABドメインまたはそのホモログに機能しうる形で連結されたDNA結合ドメインを含む人工転写リプレッサー（ATR）；
（b）DNMT3A、DNMT3BもしくはDNMT1ドメインまたはそのホモログに機能しうる形で連結されたDNA結合ドメインを含むATR；
（c）DNMT3Lドメインまたはそのホモログに機能しうる形で連結されたDNA結合ドメインを含むATR；および
（d）SETDB1ドメインまたはそのホモログに機能しうる形で連結されたDNA結合ドメインを含むATR
から選択される、ただ1つの人工転写リプレッサー（ATR）、またはそれをコードするポリヌクレオチド、およびDNA結合ドメインに機能しうる形で連結されていない1以上の別のエフェクタータンパク質またはそれらをコードするポリヌクレオチドを含む産物。    
[４３]  群（a）、（b）または（c）：
（a）KRABドメインまたはそのホモログに機能しうる形で連結されたDNA結合ドメインを含む人工転写リプレッサー（ATR）；
（b）DNMT3A、DNMT3BもしくはDNMT1ドメインまたはそのホモログに機能しうる形で連結されたDNA結合ドメインを含むATR；および
（c）DNMT3Lドメインまたはそのホモログに機能しうる形で連結されたDNA結合ドメインを含むATR
から選択される、ただ1つの人工転写リプレッサー（ATR）、またはそれをコードするポリヌクレオチド、およびDNA結合ドメインに機能しうる形で連結されていない1以上の別のエフェクタータンパク質またはそれらをコードするポリヌクレオチドを含む産物。    
[４４]  DNA結合ドメインに機能しうる形で連結されていない1以上の別のエフェクタータンパク質が、群（a）、（b）、（c）または（d）：
（a）KRABドメインまたはそのホモログ；
（b）DNMT3A、DNMT3BもしくはDNMT1ドメインまたはそのホモログ；
（c）DNMT3Lドメインまたはそのホモログ；および
（d）SETDB1ドメインまたはそのホモログ
から選択されるドメインを含み、ここで、該ドメインがATRのエフェクタードメインとは異なる、実施形態42または43記載の産物。
【手続補正３】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００４０
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００４０】
ATRをコードするポリヌクレオチドを細胞に運搬（送達）することの代替手段として、本発明のATRをタンパク質トランスダクションにより細胞に運搬（送達）することが可能である。タンパク質トランスダクションは、例えば、ベクター運搬（送達）または直接タンパク質運搬（送達）によるものであることが可能である。
【手続補正４】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００４７
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００４７】
もう1つの態様においては、本発明は、治療における使用のための、本発明の産物を提供し、ここで、2以上の人工転写リプレッサー（ATR）またはそれらをコードするポリヌクレオチドは、同時、連続的または別々に対象に投与するための組合せ剤（組み合わせ製剤）である。
【手続補正５】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００５２
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００５２】
1つの実施形態においては、細胞への本発明の2以上のATRの送達（例えば、該細胞における発現によるもの）は標的遺伝子を持続的に（恒久的に）サイレンシングする。もう1つの実施形態においては、細胞への本発明の2以上のATRの運搬（例えば、該細胞における発現によるもの）は該細胞の後代における標的遺伝子を持続的に（恒久的に）サイレンシングする。例えば、該細胞は幹細胞であることが可能であり、該標的遺伝子は該幹細胞の後代においてサイレンシングされうる（例えば、該標的遺伝子は、該幹細胞の分化から生じた細胞においてサイレンシングされうる）。