【手続補正書】
【提出日】平成30年4月4日(2018.4.4)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
個々の対象における疾患または障害の診断を容易にするための方法であって、以下の工程：
複数の低分子のそれぞれのレベルの標準範囲を含む参照低分子プロファイルを作成する工程であって、該参照低分子プロファイルは複数の参照試料の分析に基づき、それぞれの参照試料は複数の参照対象中の対象から入手される工程、ここで該参照低分子プロファイルを作成する工程は、
それぞれの参照試料について、参照試料の低分子プロファイルを作成する工程であって、該参照試料の低分子プロファイルが、該参照試料中の複数種の低分子のそれぞれの存在または非存在およびレベルに関する情報を含む工程；および
複数の参照対象について低分子プロファイルを統計解析して、複数種の低分子のそれぞれのレベルの標準範囲を決定し、それによって、参照低分子プロファイルを作成する工程
を含む；
個々の対象から入手した試料の低分子プロファイルを作成する工程であって、個々の対象から入手した試料の低分子プロファイルが、個々の対象から入手した試料中の複数種の低分子のそれぞれの存在または非存在およびレベルに関する情報を含む工程、ここで個々の対象から入手した試料の低分子プロファイルを作成する工程は、実験操作中に、個々の対象から入手した試料から実験データを作成する工程を含む；
実験操作中に、少なくとも１つのアンカー試料（anchor sample）から実験データを作成する工程であって、該少なくとも１つのアンカー試料が、複数の参照対象に由来する参照試料のプールされたアリコートから作り出され、それによって、操作間のばらつきの補正を可能にする工程；
操作間のばらつきの補正後に、個々の対象から入手した該試料の低分子プロファイルと、該参照低分子プロファイルとを比較して、それぞれが異常なレベルを有する、個々の対象から入手した試料中の低分子のサブセットを特定する工程であって、個々の対象から入手した該試料中の低分子の異常なレベルが、該低分子の標準範囲外のレベルであり、該比較および特定が、計算装置のプロセッサ上で動作する分析機能を用いて行われる、工程；
該低分子の特定されたサブセットの異常なレベルに基づいてデータベースから診断情報を得る工程であって、データベースが、複数の疾患および障害それぞれについて、複数種の低分子のうちの１種類または複数種の低分子の異常なレベルを、疾患または障害に関する情報と関連付ける情報を含む、工程；ならびに
得られた診断情報を記憶する工程であって、記憶された診断情報が、以下：異常なレベルを有する低分子の特定されたサブセットと関連付けられた少なくとも１つの生化学経路の特定、異常なレベルを有する低分子の特定されたサブセットと関連付けられた少なくとも１つの疾患または障害の特定、および異常なレベルを有する低分子の特定されたサブセットと関連付けられた少なくとも１つの推奨されるフォローアップ検査の特定、の１つまたは複数を含む、工程
を含み、
それによって、個々の対象における疾患または障害の診断を容易にする、方法。
【請求項２】
複数の疾患または障害について個々の対象をスクリーニングする方法であって、以下の工程：
複数の低分子のそれぞれのレベルの標準範囲を含む参照低分子プロファイルを作成する工程であって、該参照低分子プロファイルは複数の参照試料の分析に基づき、それぞれの参照試料は複数の参照対象中の対象から入手される工程、ここで該参照低分子プロファイルを作成する工程は、
それぞれの参照試料について、参照試料の低分子プロファイルを作成する工程であって、該参照試料の低分子プロファイルが、該参照試料中の複数種の低分子のそれぞれの存在または非存在およびレベルに関する情報を含む工程；および
複数の参照対象について低分子プロファイルを統計解析して、複数種の低分子のそれぞれのレベルの標準範囲を決定し、それによって、参照低分子プロファイルを作成する工程
を含む；
個々の対象から入手した試料の低分子プロファイルを作成する工程であって、個々の対象から入手した試料の低分子プロファイルが、個々の対象から入手した試料中の複数種の低分子のそれぞれの存在または非存在およびレベルに関する情報を含む工程、ここで個々の対象から入手した試料の低分子プロファイルを作成する工程は、実験操作中に、個々の対象から入手した試料から実験データを作成する工程を含む；
実験操作中に、少なくとも１つのアンカー試料から実験データを作成する工程であって、該少なくとも１つのアンカー試料が、複数の参照対象に由来する参照試料のプールされたアリコートから作り出され、それによって、操作間のばらつきの補正を可能にする工程；
複数種の低分子のいずれかが個々の対象から入手した試料中で異常なレベルを有するかどうか確かめるために、操作間のばらつきの補正後に、個々の対象から入手した該試料の低分子プロファイルと、該参照低分子プロファイルとを比較する工程であって、個々の対象から入手した該試料中の低分子の異常なレベルが、該低分子の標準範囲外にあるレベルである、工程；
試料中の複数種の低分子のいずれかの異常なレベルを有する低分子プロファイルについて、それぞれが個々の対象から入手した試料中で異常なレベルを有する、低分子のサブセットを特定する工程であって、該比較および特定は、計算装置のプロセッサ上で動作する分析機能を用いて行われる工程；
試料中の複数種の低分子のいずれかの異常なレベルを有する低分子プロファイルについて、低分子の特定されたサブセットの異常なレベルに基づいてデータベースから診断情報を得る工程であって、データベースが、複数の疾患および障害それぞれについて、複数種の低分子のうちの１種類または複数種の低分子の異常なレベルを、疾患または障害に関する情報と関連付ける情報を含む、工程；
試料中の複数種の低分子のいずれかの異常なレベルを有する低分子プロファイルについて、得られた診断情報を記憶する工程であって、記憶された診断情報が、以下：異常なレベルを有する低分子の特定されたサブセットと関連付けられた少なくとも１つの生化学経路の特定、異常なレベルを有する低分子の特定されたサブセットと関連付けられた少なくとも１つの疾患または障害の特定、および異常なレベルを有する低分子の特定されたサブセットと関連付けられた少なくとも１つの推奨されるフォローアップ検査の特定、の１つまたは複数を含む、工程；ならびに
試料中の複数種の低分子のいずれの異常なレベルも有さない低分子プロファイルについて、異常なレベルが検出されなかったことを示す情報を記憶する工程
を含み、
それによって、複数の疾患および障害について個々の対象をスクリーニングする、方法。
【請求項３】
複数の疾患または障害について疾患または障害を発症するリスク増加について個々の対象をスクリーニングするための方法であって、以下の工程：
複数の低分子のそれぞれのレベルの標準範囲を含む参照低分子プロファイルを作成する工程であって、該参照低分子プロファイルは複数の参照試料の分析に基づき、それぞれの参照試料は複数の参照対象中の対象から入手される工程、ここで該参照低分子プロファイルを作成する工程は、
それぞれの参照試料について、参照試料の低分子プロファイルを作成する工程であって、該参照試料の低分子プロファイルが、該参照試料中の複数種の低分子のそれぞれの存在または非存在およびレベルに関する情報を含む工程；および
複数の参照対象について低分子プロファイルを統計解析して、複数種の低分子のそれぞれのレベルの標準範囲を決定し、それによって、参照低分子プロファイルを作成する工程
を含む；
個々の対象から入手した試料の低分子プロファイルを作成する工程であって、個々の対象から入手した試料の低分子プロファイルが、個々の対象から入手した試料中の複数種の低分子のそれぞれの存在または非存在およびレベルに関する情報を含む工程、ここで個々の対象から入手した試料の低分子プロファイルを作成する工程は、実験操作中に、個々の対象から入手した試料から実験データを作成する工程を含む；
実験操作中に、少なくとも１つのアンカー試料から実験データを作成する工程であって、該少なくとも１つのアンカー試料が、複数の参照対象に由来する参照試料のプールされたアリコートから作り出され、それによって、操作間のばらつきの補正を可能にする工程；
複数種の低分子のいずれかが個々の対象から入手した試料中で異常なレベルを有するかどうか確かめるために、操作間のばらつきの補正後に、個々の対象から入手した該試料の低分子プロファイルと、該参照低分子プロファイルとを比較する工程であって、個々の対象から入手した該試料中の低分子の異常なレベルが、該低分子の標準範囲外にあるレベルである、工程；
個々の対象から入手した試料中の複数種の低分子のいずれかの異常なレベルを有する低分子プロファイルについて、以下を含む工程を実施する工程：
それぞれの低分子が試料中で異常なレベルを有する、低分子のサブセットを特定する工程；
該低分子の特定されたサブセットの異常なレベルに基づいてデータベースから診断情報を得る工程であって、データベースが、複数の疾患および障害それぞれについて、複数種の低分子のうちの１種類または複数種の低分子の異常なレベルを、疾患または障害に関する情報と関連付ける情報を含む、工程；および
得られた診断情報を記憶する工程であって、記憶された診断情報が、異常なレベルを有する低分子の特定されたサブセットと関連付けられた疾患または障害を発症するリスク増加の特定を含む、工程；ならびに
個々の対象から入手した試料中の複数種の低分子のいずれの異常なレベルも有さない低分子プロファイルについて、異常なレベルが検出されなかったことを示す情報を記憶する工程
を含み、
それによって、複数の疾患および障害について疾患または障害を発症するリスク増加について個々の対象をスクリーニングする、方法。
【請求項４】
異常なレベルを有すると特定された低分子のサブセットの１つまたは複数からのデータの重みつき組み合わせに基づいて疾患特異的または障害特異的な複合スコアを作成する工程をさらに含み、前記低分子の特定されたサブセットの異常なレベルに基づいてデータベースから診断情報を得る工程が、作成された疾患特異的または障害特異的な複合スコアに基づいてデータベースから診断情報を得る工程を含む、請求項１、２、および３のいずれか一項記載の方法。
【請求項５】
個々の対象から入手した試料の低分子プロファイルが、試料に存在する内因性低分子および微生物性低分子に関する情報を含む、請求項１、２、および３のいずれか一項記載の方法。
【請求項６】
個々の対象から入手した試料の低分子プロファイルが、試料に存在する生体異物性低分子または食事性低分子に関する情報をさらに含む、請求項５記載の方法。
【請求項７】
異常なレベルを有する低分子の特定されたサブセットと関連付けられた１つまたは複数の生化学経路を表す情報を表示する工程をさらに含む、請求項１、２、および３のいずれか一項記載の方法。
【請求項８】
低分子の特定されたサブセットの異常なレベルに基づいてデータベースから診断情報を得る工程が、
個々の対象から入手した試料の低分子プロファイルと参照低分子プロファイルとの比較に基づいて１つまたは複数の異常生化学経路を特定する工程であって、記憶された診断情報が１つまたは複数の異常生化学経路の特定を含む、工程
を含む、請求項１、２、および３のいずれか一項記載の方法。
【請求項９】
試料の低分子プロファイルと参照低分子プロファイルとの比較に基づいて１つまたは複数の異常生化学経路を特定する工程が、
複数の生化学経路を特定する工程であって、それぞれの生化学経路が、試料の作成された低分子プロファイルの中の低分子の１つまたは複数と関連付けられる、工程；および
複数の生化学経路それぞれについて、経路の生化学距離（biochemical distance）を計算し、該計算された生化学距離と、該経路の生化学距離の標準範囲とを比較し、計算された生化学距離が標準範囲外にあれば、生化学経路を異常であると特定する工程
を含む、請求項８記載の方法。
【請求項１０】
異常であると特定された低分子のいずれかと生化学経路が関連付けられれば、該生化学経路は異常であると特定される、請求項８記載の方法。
【請求項１１】
低分子プロファイルを作成するために分析される、個々の対象から入手した試料の量が、１００μＬ（０．１００ｍＬ）未満の体積を有する、請求項１、２、および３のいずれか一項記載の方法。
【請求項１２】
異常なレベルを有する低分子の特定されたサブセットの図による表示を含むデータを記憶する工程をさらに含む、請求項１、２、および３のいずれか一項記載の方法。
【請求項１３】
個々の対象から入手した試料中の異常なレベルの低分子が、参照低分子プロファイルに存在しかつ個々の対象から入手した試料の低分子プロファイルに存在しない低分子を含むか、または
個々の対象から入手した試料中の異常なレベルの低分子が、個々の対象に由来する試料の低分子プロファイルに存在しかつ参照低分子プロファイルでは希少な低分子を含む、請求項１、２、および３のいずれか一項記載の方法。
【請求項１４】
それぞれの低分子について、該低分子の参照レベルの標準範囲が、複数の参照対象に由来する参照試料から作成された低分子プロファイルの統計解析における四分位範囲に基づいている、請求項１、２、および３のいずれか一項記載の方法。
【請求項１５】
複数種の低分子中のそれぞれの低分子について、該低分子の参照レベルの標準範囲が、複数の参照対象に由来する参照試料から作成された低分子プロファイルの統計解析における標準スコア（Ｚ−スコア）の範囲に基づいている、請求項１、２、および３のいずれか一項記載の方法。
【請求項１６】
個々の対象に由来する試料が血液、血漿、血清、皮膚、表皮組織、脂肪組織、大動脈組織、肝臓組織、尿、脳脊髄液、歯肉滲出液、または細胞試料を含む、請求項１、２、および３のいずれか一項記載の方法。
【請求項１７】
参照低分子プロファイル中の複数種の低分子が２００〜２５，０００種類の低分子を含む、請求項１、２、および３のいずれか一項記載の方法。
【請求項１８】
複数の疾患および障害が、３−メチルクロトニルＣｏＡカルボキシラーゼ欠損症、アルギニノコハク酸リアーゼ欠損症、アデノシンデアミナーゼ欠損症、アルギニン血症、ビオチニダーゼ欠損症、コバラミン欠損症（Ｃｂｌ）、Ｃｂｌ Ａ、Ｃｂｌ Ｃ、シトルリン血症、カルニチンパルミトイルトランスフェラーゼ２欠損症（ＣＰＴＩＩ）、シスチン症、ジヒドロピリミジンデヒドロゲナーゼ欠損症、グルタル酸尿症、３−ヒドロキシ−３−メチルグルタル酸尿症（ＨＭＧ ＣｏＡリアーゼ欠損症）、ホロカルボキシラーゼ、ホモシスチン尿症、イソ吉草酸血症、リジン尿性タンパク質不耐症、中鎖アシルＣｏＡデヒドロゲナーゼ欠損症、メチルマロン酸血症、モリブデン補因子欠損症または亜硫酸酸化酵素欠損症、メープルシロップ尿症、オルニチントランスカルバミラーゼ欠損症、プロピオン酸血症、フェニルケトン尿症（ＰＫＵ）、コハク酸セミアルデヒドデヒドロゲナーゼ欠損症、スクシニルリアーゼ欠損症、チミジンホスホリラーゼ欠損症、トリメチルリジンヒドロキシラーゼε欠損症、チロシン血症、超長鎖アシルＣｏＡデヒドロゲナーゼ欠損症、キサンチン尿症、Ｘ連鎖性クレアチン輸送体、サルコシン血症、クエン酸輸送体欠損症、ピルビン酸デヒドロゲナーゼ欠損症、高オルニチン・ホモシトルリン・高アンモニア血症、芳香族アミノ酸デカルボキシラーゼ欠損症、スミス・レムリ・オピッツ症候群、原発性カルニチン欠損症、シトリン欠損症、ＡＢＡＴ欠損症、ＧＬＵＴ１欠損症、ＭＧＡ、ＳＣＡＤ欠損症、ウロカナーゼ欠損症、３−ヒドロキシイソブチリル−ＣｏＡ加水分解酵素欠損症、高シュウ酸尿症、ＢＢＯＸ欠損症、アセトアミノフェン誘導毒性、糖尿病、肝機能不全、代謝疾患、心血管機能不全、腎機能不全、肺機能不全、炎症、ホルモンアンバランス、酸化ストレス、ミトコンドリア機能不全、ストレス増加、代謝老化、マイクロバイオームアンバランス、多量栄養素アンバランス、および大気汚染曝露のうちの１０以上を含む、請求項１、２、および３のいずれか一項記載の方法。
【請求項１９】
記憶された診断情報が、異常なレベルを有する低分子の特定されたサブセットと関連付けられた障害の特定を含む、請求項１、２、および３のいずれか一項記載の方法。
【請求項２０】
それぞれの参照試料について参照試料の低分子プロファイルを作成する工程が、個々の対象から入手した試料から実験データが作成される実験操作中とは別個の実験操作中に複数の参照試料に由来する実験データを作成する工程を含む、請求項１、２、および３のいずれか一項記載の方法。
【請求項２１】
実験操作中に個々の対象から得られた実験データが、液体クロマトグラフィー/質量分析法を用いて得られる、請求項１、２、および３のいずれか一項記載の方法。
【請求項２２】
実験操作中に個々の対象から得られた実験データが、液体クロマトグラフィー/タンデム質量分析法または超高速液体クロマトグラフィー/タンデム質量分析法を用いて得られる、請求項１、２、および３のいずれか一項記載の方法。
【請求項２３】
個々の対象から入手した試料の低分子プロファイルが、レベルを測定した試料中のそれぞれの低分子の特定を含む、請求項１、２、および３のいずれか一項記載の方法。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００１５
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００１５】
態様は、複数の疾患または障害について疾患または障害を発症するリスクが高いかどうか個々の対象をスクリーニングするための方法を含む。前記方法は、個々の対象から試料を入手する工程、ならびに試料中にある複数種の低分子それぞれの存在または非存在およびレベルに関する情報を含む試料の低分子プロファイルを作成する工程を含む。前記方法はまた、複数種の低分子のいずれかが試料中で異常なレベルを有するかどうか確かめるために、試料の低分子プロファイルと、複数種の低分子それぞれのレベルの標準範囲を含む参照低分子プロファイルとを比較する工程も含む。試料中にある低分子の異常なレベルは、低分子の標準範囲外にあるレベルである。試料中にある複数種の低分子のいずれかの異常なレベルを有する低分子プロファイルについて、それぞれの低分子が試料中で異常なレベルを有する、低分子のサブセットが特定され、ここで、比較および特定は、計算装置のプロセッサ上で動作する分析機能を用いて行われる。試料中にある複数種の低分子のいずれかの異常なレベルを有する低分子プロファイルについて、低分子の特定されたサブセットの異常なレベルに基づいてデータベースから診断情報が得られる。データベースは、複数の疾患および障害それぞれについて、複数種の低分子のうちの1種類または複数種の低分子の異常なレベルを、疾患または障害に関する情報と関連付ける情報を含む。試料中にある複数種の低分子のいずれかの異常なレベルを有する低分子プロファイルについて、得られた診断情報は記憶される。記憶された診断情報は、異常なレベルを有する低分子の特定されたサブセットと関連付けられた疾患または障害を発症するリスクが高いことの特定を含む。試料中にある複数種の低分子のいずれの異常なレベルも有さない低分子プロファイルについて、異常なレベルが検出されなかったことを示す情報が記憶される。
[本発明1001]
個々の対象における疾患または障害の診断を容易にするための方法であって、以下の工程:
個々の対象から試料を入手する工程;
試料中にある複数種の低分子それぞれの存在または非存在およびレベルに関する情報を含む試料の低分子プロファイルを作成する工程;
該試料の低分子プロファイルと、複数種の低分子それぞれのレベルの標準範囲を含む参照低分子プロファイルとを比較して、それぞれの低分子が異常なレベルを有する、試料中にある低分子のサブセットを特定する工程であって、該試料中にある低分子の異常なレベルが、該低分子の標準範囲外のレベルであり、該比較および特定が、計算装置のプロセッサ上で動作する分析機能を用いて行われる、工程;
該低分子の特定されたサブセットの異常なレベルに基づいてデータベースから診断情報を得る工程であって、データベースが、複数の疾患および障害それぞれについて、複数種の低分子のうちの1種類または複数種の低分子の異常なレベルを、疾患または障害に関する情報と関連付ける情報を含む、工程;ならびに
得られた診断情報を記憶する工程であって、記憶された診断情報が、以下:異常なレベルを有する低分子の特定されたサブセットと関連付けられた少なくとも1つの生化学経路の特定、異常なレベルを有する低分子の特定されたサブセットと関連付けられた少なくとも1つの疾患または障害の特定、および異常なレベルを有する低分子の特定されたサブセットと関連付けられた少なくとも1つの推奨されるフォローアップ検査の特定、の1つまたは複数を含む、工程
を含み、
それによって、個々の対象における疾患または障害の診断を容易にする、方法。
[本発明1002]
複数の疾患または障害について個々の対象をスクリーニングする方法であって、以下の工程:
個々の対象から試料を入手する工程;
試料中にある複数種の低分子それぞれの存在または非存在およびレベルに関する情報を含む試料の低分子プロファイルを作成する工程;
複数種の低分子のいずれかが試料中で異常なレベルを有するかどうか確かめるために、該試料の低分子プロファイルと、複数種の低分子それぞれのレベルの標準範囲を含む参照低分子プロファイルとを比較する工程であって、該試料中にある低分子の異常なレベルが、該低分子の標準範囲外にあるレベルである、工程;
試料中にある複数種の低分子のいずれかの異常なレベルを有する低分子プロファイルについて、それぞれの低分子が試料中で異常なレベルを有する、低分子のサブセットを特定する工程；
ここで、該比較および特定は、計算装置のプロセッサ上で動作する分析機能を用いて行われ；
試料中にある複数種の低分子のいずれかの異常なレベルを有する低分子プロファイルについて、低分子の特定されたサブセットの異常なレベルに基づいてデータベースから診断情報を得る工程であって、データベースが、複数の疾患および障害それぞれについて、複数種の低分子のうちの1種類または複数種の低分子の異常なレベルを、疾患または障害に関する情報と関連付ける情報を含む、工程;
試料中にある複数種の低分子のいずれかの異常なレベルを有する低分子プロファイルについて、得られた診断情報を記憶する工程であって、記憶された診断情報が、以下:異常なレベルを有する低分子の特定されたサブセットと関連付けられた少なくとも1つの生化学経路の特定、異常なレベルを有する低分子の特定されたサブセットと関連付けられた少なくとも1つの疾患または障害の特定、および異常なレベルを有する低分子の特定されたサブセットと関連付けられた少なくとも1つの推奨されるフォローアップ検査の特定、の1つまたは複数を含む、工程;ならびに
試料中にある複数種の低分子のいずれの異常なレベルも有さない低分子プロファイルについて、異常なレベルが検出されなかったことを示す情報を記憶する工程
を含み、
それによって、複数の疾患および障害について個々の対象をスクリーニングする、方法。
[本発明1003]
異常なレベルを有すると特定された低分子のサブセットの1つまたは複数からのデータの重みつき組み合わせに基づいて疾患特異的または障害特異的な複合スコアを作成する工程をさらに含み、前記低分子の特定されたサブセットの異常なレベルに基づいてデータベースから診断情報を得る工程が、作成された疾患特異的または障害特異的な複合スコアに基づいてデータベースから診断情報を得る工程を含む、本発明1001または本発明1002の方法。
[本発明1004]
3-メチルクロトニルグリシン、β-ヒドロキシイソバレラート、β-ヒドロキシイソバレロイルカルニチン、グルタリルカルニチン(C5)、3-メチルクロトニルグリシン、アジパート、グルタラート(ペンタンジオアート)、オクタデカンジオアート(C18)、ヘキサデカンジオアート(C16)、テトラデカンジオアート(C14)、ドデカンジオアート(C12)、イソバレラート、ロイシン、イソバレリルグリシン、α-ヒドロキシイソバレラート、スクシニルカルニチン、3-メチルグルタリルカルニチン、イソバレリルカルニチン、アラニルアラニン、ピログルタミルバリン、X-12007、X-12814、エチルマロナート、N-アセチルロイシン、およびその組み合わせからなる群より選択される1種類または複数種の低分子の異常なレベルが、3-メチルクロトニルCoAカルボキシラーゼ欠損症を示し;
2'-デオキシアデノシン、2'-デオキシイノシン、アデニン、N2-メチルグアノシン、2'-デオキシグアノシン、ウラート、N1-メチルアデノシン、アデノシン、アラントイン、キサンチン、グアノシン、ヒポキサンチン、N2,N2-ジメチルグアノシン、7-メチルグアノシン、およびその組み合わせからなる群より選択される1種類または複数種の低分子の異常なレベルが、アデノシンデアミナーゼ欠損症を示し;
アルギニノスクシナート、N-δ-アセチルオルニチン、ソルボース、フルクトース、シトルリン、メチル-4-ヒドロキシベンゾアート、ウラシル、アルギニン、アスパルタート、イソロイシルアスパルタート、オルニチン、ウリジン、ホモシトルリン、オロタート、ホモアルギニン、O-スルホ-L-チロシン、パルミトイルスフィンゴミエリン、X-13507、X-15245、X-15664、X-15454、およびその組み合わせからなる群より選択される1種類または複数種の低分子の異常なレベルが、アルギニノコハク酸リアーゼ欠損症を示し;
アルギニン、4-グアニジノブタノアート、ホモアルギニン、N-アセチルアルギニン、オルニチン、尿素、ホモシトルリン、ウラシル、アスパルタート、アルギニノスクシナート、プロリン、オロタート、クレアチニン、ウリジン、3-ウレイドプロピオナート、クレアチン、ベタイン、ロイシン、イソロイシン、γ-グルタミルロイシン、X-12339、X-12681、およびその組み合わせからなる群より選択される1種類または複数種の低分子の異常なレベルが、アルギニン血症を示し;
キシリトール、ビオチン、3-メチルクロトニルグリシン、プロピオニルカルニチン(C3)、およびその組み合わせからなる群より選択される1種類または複数種の低分子の異常なレベルが、ビオチニダーゼ欠損症を示し;
メチルマロン酸、ホモシステイン、2-メチルシトラート、シスタチオニン、2-メチルマロニルカルニチン、プロピオニルカルニチン、X-12749、およびその組み合わせからなる群より選択される1種類または複数種の低分子の異常なレベルが、Cbl(コバラミン欠損症)を示し;
メチルマロン酸、ホモシステイン、2-メチルシトラート、シスタチオニン、2-メチルマロニルカルニチン、チグリルカルニチン、2-メチルブチリルカルニチン、プロピオニルカルニチン、X-12749、およびその組み合わせからなる群より選択される1種類または複数種の低分子の異常なレベルが、Cbl Aを示し;
メチルマロン酸、ホモシステイン、2-メチルシトラート、シスタチオニン、2-メチルマロニルカルニチン、プロピオニルカルニチン、X-12749、X-17677、およびその組み合わせからなる群より選択される1種類または複数種の低分子の異常なレベルが、Cbl Cを示し;
シトルリン、アルギニノコハク酸、ホモシトルリン、3-ウレイドプロピオナート、N-アセチルアラニン、フェニルアセタート、フェニルアセチルグルタミン、4-ウレイドブチラート、N-カルバモイルアスパルタート、グアニジノアセタート、尿素、4-グアニジノブタノアート、N-アセチルアルギニン、ヒプラート、オルニチン、2-メチルヒプラート、フェニルアセチルグリシン、4-フェニルブチラート、クレアチニン、オロタート、3,4-ジヒドロキシフェニルアセタート、ホモアルギニン、グアニジノスクシナート、γ-グルタミルフェニルアラニン、γ-グルタミルイソロイシン、トリプトファン、1,5-アンヒドログルシトール(1,5-AG)、N-アセチル-シトルリン、X-19684、X-12681、X-20598、X-18446、X-20588、およびその組み合わせからなる群より選択される1種類または複数種の低分子の異常なレベルが、シトルリン血症を示し;
カルニチン、アシルカルニチン、N-オクタノイルグリシン(C8エステル)、セバカート(C8)、カプラート(C10)、カプリラート(C8)、オクタノイルカルニチン、ヘキサノイルカルニチン、およびその組み合わせからなる群より選択される1種類または複数種の低分子の異常なレベルが、カルニチンパルミトイルトランスフェラーゼ2欠損症(CPTII)を示し;
システイン、cys-gly(酸化型)、X-12846、X-12303、X-19145、1,5-アンヒドログルシトール(1,5-AG)、グリココレナートスルファート、4-アセチルフェノールスルファート、クレゾールグルクロニド、エリスリトール、バニリルマンデラート、N2,N2-ジメチル-グアノシン、フェニルアセチルグルタミン、X-12216、X-17717、X-15667、X-12119、X-11315、X-12731、X-12705、X-17685、X-18371、およびその組み合わせからなる群より選択される1種類または複数種の低分子の異常なレベルが、シスチン症を示し;
シチジン、5,6-ジヒドロウラシル、4-ウレイドブチラート、3-ウレイドプロピオナート、ウリジン、オロタート、N-カルバモイルアスパルタート、ウラシル、チミン、およびその組み合わせからなる群より選択される1種類または複数種の低分子の異常なレベルが、ジヒドロピリミジンデヒドロゲナーゼ欠損症を示し;
グルタラート(ペンタンジオアート)、グルタリルカルニチン(C5)、3-ヒドロキシグルタラート、グルタコナート、3-メチルグルタリルカルニチン、2-アミノアジパート、X-12364、X-15674、およびその組み合わせからなる群より選択される1種類または複数種の低分子の異常なレベルが、グルタル酸尿症1型を示し;
クレアチン、3-(4-ヒドロキシフェニル)ラクタート、1,3-ジパルミトイルグリセロール、グアニジノアセタート、クレアチニン、システインs-スルファート、X-19602、X-12906、X-13007、X-10458、およびその組み合わせからなる群より選択される1種類または複数種の低分子の異常なレベルが、グアニジノ酢酸メチルトランスフェラーゼ(GAMT)欠損症を示し;
3-メチルグルタリルカルニチン(C6)、β-ヒドロキシイソバレラート、β-ヒドロキシイソバレロイルカルニチン、グルタリルカルニチン(C5)、アルギニルプロリン、1-ステアロイルグリセロホスホエタノールアミン、o-クレゾールスルファート、3-メチルクロトニルグリシン、アジパート、グルタラート(ペンタンジオアート)、オクタデカンジオアート(C18)、ヘキサデカンジオアート(C16)、テトラデカンジオアート(C14)、ドデカンジオアート(C12)、イソバレラート、アセチルカルニチン、パルミトイルカルニチン、ヘキサノイルカルニチン、ミリストイルカルニチン、ヘキセンジオイルカルニチン、X-17715、X-12741、X-16134、X-10593、X-12688、およびその組み合わせからなる群より選択される1種類または複数種の低分子の異常なレベルが、3-ヒドロキシ-3-メチルグルタル酸尿症(HMG CoAリアーゼ欠損症)を示し;
β-ヒドロキシイソバレラート、3-メチルクロトニルグリシン、β-ヒドロキシイソバレロイルカルニチン(C5)、プロピオニルグリシン(C3)、3-ヒドロキシプロパノアート、チグロイルグリシン、スクシニルカルニチン、2-メチルシトラート、3-ヒドロキシイソブチラート、ラクタート、3-ヒドロキシ-2-エチルプロピオナート、イソブチリルグリシン、α-ヒドロキシイソバレロイルカルニチン、3-メチル-2-オキソブチラート、3-メチル-2-オキソバレラート、3-ヒドロキシ-2-メチルブチラート、4-メチル-2-オキソペンタノアート、マロニルカルニチン、α-ヒドロキシイソバレラート、2-ヒドロキシ-3-メチルバレラート、プロピオニルカルニチン、チグリルカルニチン、イソバレリルカルニチン、ヒドロキシブチリルカルニチン、スクシナート、2-メチルマロニルカルニチン、α-ヒドロキシイソカプロアート、ビオチン、およびその組み合わせからなる群より選択される1種類または複数種の低分子の異常なレベルが、ホロカルボキシラーゼ合成酵素欠損症を示し;
ホモシステイン、システイン、メチオニン、他のアミノ酸、γ-グルタミルメチオニン、5-メチルチオアデノシン(MTA)、S-アデノシルホモシステイン(SAH)、N1-メチルアデノシン、グリシルプロリン、1-エイコセノイルグリセロホスホエタノールアミン(20:1n9)、1-メチルニコチンアミド、N-アセチル-アスパルチル-グルタマート(NAAG)、ピリドキサール、2-ヒドロキシイソブチラート、アシソガ、カルノシン、3-メトキシチロシン、2-ヒドロキシデカノアート、δ-トコフェロール、α-CEHC(2,5,7,8-テトラメチル-2-(2'-カルボキシエチル)-6-ヒドロキシクロマン)スルファート)、N-アセチルトリプトファン、アデニン、コルチゾール、X-18965、X-15649、X-17303、X-18897、X-11564、X-18891、X-12748、X-18918、X-18905、X-18606、X-16574、X-18895、X-18907、X-19455、X-18909、X-19574、X-12110、X-20676、X-11360、X-18920、およびその組み合わせからなる群より選択される1種類または複数種の低分子の異常なレベルが、ホモシスチン尿症を示し;
イソバレラート(C5)、イソバレリルグリシン、イソバレリルカルニチン(C5)、バレラート;バレリルカルニチン、β-ヒドロキシイソバレラート、フェニルカルニチン、β-ヒドロキシブチラート、3-メチルクロトニルグリシン、α-ヒドロキシブチラート、X-16577、X-14331、およびその組み合わせからなる群より選択される1種類または複数種の低分子の異常なレベルが、イソ吉草酸血症を示し;
オルニチン、アルギニン、リジン、アスパラギン、N6-アセチルリジン、グルタミン、N2-アセチルリジン、N-アセチルアルギニン、γ-グルタミルグルタミン、プロリン、S-メチルシステイン、2-ヒドロキシデカノアート、1-メチルイミダゾールアセタート、2-アミノヘプタノアート、3-メチルグルタリルカルニチン、グルタリルカルニチン、N6-トリメチルリジン、5-(ガラクトシルヒドロキシ)-L-リジン、X-15636、17654、X-12193、X-12425、およびその組み合わせからなる群より選択される1種類または複数種の低分子の異常なレベルが、リジン尿性タンパク質不耐症を示し;
アシルカルニチン、カルニチン、有機酸、N-オクタノイルグリシン、カプロアート(6:0)、カプリラート(8:0)、ヘプタノアート(7:0)、ドデカンジオアート、デカノイルカルニチン、N-パルミトイルタウリン、ペラルゴナート(9:0)、デオキシカルニチン、O-メチルカテコールスルファート、1-ステアロイルグリセロホスホコリン(18:0)、1-マルガロイルグリセロホスホコリン(17:0)、1-ドコサペンタエノイルグリセロホスホコリン(22:5n3)、4-オクテンジオアート、アジパート、ヘプタノイルグリシン、3-メチルアジパート、2-ヒドロキシグルタラート、α-CEHC(2,5,7,8-テトラメチル-2-(2'-カルボキシエチル)-6-ヒドロキシクロマン)スルファート、X-11521(考えられる実験式:C15H27NO4および構造:2-オクテノイルカルニチン)、X-15646、X-12802、X-11478、X-11440(考えられる二硫酸ヒドロキシプレグネン-ジオールまたは二硫酸プレグナノロン-ジオール)、X-15486、X-18913、メチルヘキサノイルグルタミン、X-13837、X-18946、X-11861、X-18888、X-18922、X-17438、X-18916、X-16674、X-12824からなる群より選択される1種類または複数種の低分子の異常なレベルが、中鎖アシルCoAデヒドロゲナーゼ欠損症を示し;
メチルマロナート、メチルマロニルCoA、2-メチルマロニルカルニチン、プロピオニルカルニチン(C3)、チグリルカルニチン、2-メチルブチリルカルニチン(C5)、2-メチルシトラート、スクシニルカルニチン、プロピオニルグリシン、3-ヒドロキシプロパノアート、バレリルカルニチン、イソバレリルカルニチン、スクシナート、チグロイルグリシン、β-ヒドロキシイソバレロイルカルニチン、β-ヒドロキシイソバレラート、イソブチリルカルニチン、3-ヒドロキシ-2-エチルプロピオナート、ブチリルカルニチン、3-メチルグルタリルカルニチン、メチルスクシナート、3-メチル-2-オキソバレラート、3-メチル-2-オキソブチラート、X-12749、X-17564、X-12114、およびその組み合わせからなる群より選択される1種類または複数種の低分子の異常なレベルが、メチルマロン酸血症を示し;
キサンチン、S-スルホシステイン、チオスルファート、5-HETE、ロイコトリエンB4、13-HODE+9-HODE、12-HETE、ウラート、およびその組み合わせからなる群より選択される1種類または複数種の低分子の異常なレベルが、モリブデン補因子欠損症または亜硫酸酸化酵素欠損症を示し;
ロイシン、イソロイシン、バリン、2-ヒドロキシ-3-メチルバレラート、α-ヒドロキシイソバレラート、イソバレリルカルニチン、2-アミノヘプタノアート、4-メチル-2-オキソペンタノアート、1-リノレノイルグリセロホスホコリン(18:3n3)、2-リノレノイルグリセロホスホコリン(18:3n3)、1-ミリストイルグリセロホスホコリン(14:0)、2-ミリストイルグリセロホスホコリン、二硫酸5α-アンドロスタン-3α,17β-ジオール、バリン、3-メチル-2-オキソブチラート、イソバレラート、イソブチリルカルニチン、3-ヒドロキシイソブチラート、2-メチルブチリルカルニチン、β-ヒドロキシイソバレロイルカルニチン、アロ-イソロイシン、3-メチル-2-オキソバレラート、β-ヒドロキシイソバレラート、スクシナート、アセチルカルニチン、2-メチルシトラート、チグロイルグリシン、チグリルカルニチン、ヒドロキシブチリルカルニチン、α-ヒドロキシイソカプロアート、X-13581、X-17690、X-13689(グルクロニドコンジュゲート)、およびその組み合わせからなる群より選択される1種類または複数種の低分子の異常なレベルが、メープルシロップ尿症を示し;
オロタート、シトルリン、アルギニン、フェニルアセチルグルタミン、ステアリドナート(18:4n3)、3-ウレイドプロピオナート、2-メチルヒプラート、2-ヒドロキシフェニルアセタート、フェニルカルニチン、ヒプラート、フェニルプロピオニルグリシン、ベンゾアート、メチル-4-ヒドロキシベンゾアート、4-フェニルブチラート、2-ペンタンアミド-3-フェニルプロパン酸、フェニルアセタート、フェニルアセチルグリシン、trans-4-ヒドロキシプロリン、pro-ヒドロキシ-pro、尿素、フェニルラクタート(PLA)、グアニジノスクシナート、オルニチン、X-20598、X-20588、およびその組み合わせからなる群より選択される1種類または複数種の低分子の異常なレベルが、オルニチントランスカルバミラーゼ欠損症を示し;
プロピオナート、プロピオニルグリシン(C3)、2-メチルシトラート、3-ヒドロキシプロパノアート、プロピオニルカルニチン(C3)、1-ペンタデカノイルグリセロホスホコリン(15:0)、チグロイルグリシン、スクシニルカルニチン、グルタリルカルニチン(C5)、3-メチルグルタリルカルニチン(C6)、チグリルカルニチン、ブチリルカルニチン、2-メチルマロニルカルニチン、β-ヒドロキシイソバレラート、X-12819、およびその組み合わせからなる群より選択される1種類または複数種の低分子の異常なレベルが、プロピオン酸血症を示し;
フェニルアラニン、γ-グルタミルフェニルアラニン、フェニルラクタート、N-アセチルフェニルアラニン、フェニルピルバート、γ-グルタミルチロシン、3-メトキシチロシン、4-ヒドロキシフェニルピルバート、p-クレゾールスルファート、カテコールスルファート、フェニルアセチルグルタミン、フェニルアラニルアルギニン、バリルフェニルアラニン、ヒスチジルフェニルアラニン、フェニルアラニルセリン、ロイシルフェニルアラニン、スレオニルフェニルアラニン、フェニルアラニルアラニン、フェニルアラニルグリシン、フェニルアラニルグルタマート、フェニルアラニルフェニルアラニン、アスパルチルフェニルアラニン、トリプトフィルフェニルアラニン、フェニルアラニルイソロイシン、グリシルフェニルアラニン、フェニルアラニルロイシン、フェニルアラニルアスパルタート、o-クレゾールスルファート、フェニルアセチルグリシン、X-16283、X-15497、およびその組み合わせからなる群より選択される1種類または複数種の低分子の異常なレベルが、フェニルケトン尿症(PKU)を示し;
γ-アミノブチラート(GABA)、スクシンイミド、およびその組み合わせからなる群より選択される1種類または複数種の低分子の異常なレベルが、コハク酸セミアルデヒドデヒドロゲナーゼ欠損症を示し;
N6-スクシニルアデノシン、キサントシン、2'-デオキシグアノシン、2'-デオキシイノシン、アデニン、およびその組み合わせからなる群より選択される1種類または複数種の低分子の異常なレベルが、スクシニルアデノシンリアーゼ欠損症を示し;
チミジン、2'-デオキシウリジン、5,6-ジヒドロチミン、5-メチルウリジン(リボチミジン);ヒプラート、2-リノレオイルグリセロホスホコリン、4-メチルカテコールスルファート、1-アラキドイルグリセロホスホコリン(20:0)、タウロリトコラート3-スルファート、グリコリトコラートスルファート、イミダゾールプロピオナート、X-13862、X-19330、X-20620、X-12170、およびその組み合わせからなる群より選択される1種類または複数種の低分子の異常なレベルが、チミジンホスホリラーゼ欠損症を示し;
N-6-トリメチルリジン、1-アラキドノイルグリエルコホスファート、X-16574、X-12822、X-15136、およびその組み合わせからなる群より選択される1種類または複数種の低分子の異常なレベルが、トリメチルリジンヒドロキシラーゼを示し;
チロシン、3-(4-ヒドロキシフェニル)ラクタート、4-ヒドロキシフェニルピルバート、3-(3-ヒドロキシフェニル)プロピオナート、4-ヒドロキシフェニルアセタート、フェニルラクタート(PLA)、X-13581、およびその組み合わせからなる群より選択される1種類または複数種の低分子の異常なレベルが、チロシン血症を示し;
ミリストイルカルニチン、ステアロイルカルニチン(C18)、パルミトイルカルニチン(C16)、オレオイルカルニチン(C18)、ミリストレアート(14:1n5)、リノレオイルカルニチン、9-メチル尿酸、キシルロース、アラキドナート(20:4n6)、ドコサヘキサエノアート(DHA;22:6n3)、エイコサペンタン酸(EPA)、5,8-テトラデカジエン酸、1-ドコサヘキサエノイル-GPC(22:6;DHA-GPC)、X-18739(2-テトラデセノイルカルニチンの考えられる異性体)、およびその組み合わせからなる群より選択される1種類または複数種の低分子の異常なレベルが、超長鎖アシルCoAデヒドロゲナーゼ欠損症を示し;
ウラート、クレアチン、ヒポキサンチン、キサントシン、2'-デオキシイノシン、イノシン、N2-メチルグアノシン、クレアチニン、およびその組み合わせからなる群より選択される1種類または複数種の低分子の異常なレベルが、キサンチン尿症を示し;
クレアチン、グリシルロイシン、2-ヒドロキシオクタノアート、X-11483、X-18943、X-17422、X-17761、X-17335、1,6-アンヒドログルコース、およびその組み合わせからなる群より選択される1種類または複数種の低分子の異常なレベルが、X連鎖性クレアチン輸送体を示し;
2-ヒドロキシアセトアミノフェンスルファート、2-メトキシアセトアミノフェンスルファート、3-(システイン-S-イル)アセトアミノフェン、4-アセトアミノフェンスルファート、4-アセトアミドフェノール、p-アセトアミドフェニルグルクロニス、グリコヒオコラート、クリコケノデオキシコラート、タウロコラート、タウロケノデオキシコラート、グルタチオン、およびその組み合わせからなる群より選択される1種類または複数種の低分子の異常なレベルが、アセトアミノフェン誘導毒性を示し;
キシルロース、カプロアート(6:0)、ヘプタノアート(7:0)、カプリラート(C8)、ペラルゴナート(9:0)、カプラート(C10)、ミリストレアート(14:1n5)、エイコサペンタン酸(EPA)、ドコサヘキサエノアート(DHA;22:6n3)、アラキドナート(20:4n6)、スベラート(オクタンジオアート)、セバカート(C8)、ドデカンジオアート(C12)、ヘキサノイルグリシン(C6)、N-オクタノイルグリシン、ヘキサノイルカルニチン、オクタノイルカルニチン、デカノイルカルニチン、cis-4-デセノイルカルニチン、ミリストイルカルニチン、パルミトイルカルニチン(C16)、ステアロイルカルニチン(C18)、オレオイルカルニチン(C18)、デオキシカルニチン、カルニチン、3-ヒドロキシデカノアート、5-ヒドロキシヘキサノアート、N-パルミトイルタウリン、1-マルガロイルグリセロホスホコリン(17:0)、1-ステアロイルグリセロホスホコリン(18:0)、1-ドコサペンタエノイルグリセロホスホコリン(22:5n3)、9-メチル尿酸、α-CEHC(2,5,7,8-テトラメチル-2-(2'-カルボキシエチル)-6-ヒドロキシクロマン)スルファート、O-メチルカテコールスルファート、5,8-テトラデカジエン酸、メチルヘキサノイルグルタミン、2-ヒドロキシグルタラート、3-メチルアジパート、4-オクテンジオアート、ヘプタノイルグリシン、およびその組み合わせからなる群より選択される1種類または複数種の低分子の異常なレベルが、脂肪酸酸化障害を示し;
1,5-アンヒドログルシトール(1,5-AG)、2-ヒドロキシブチラート(AHB)、3-ヒドロキシブチラート、グルコース、グリシン、イソロイシン、ロイシン、バリン、およびその組み合わせからなる群より選択される1種類または複数種の低分子の異常なレベルが、糖尿病を示し;ならびに
グリココラート、グリコケノデオキシコラート、タウロコラート、タウロケノデオキシコラート、およびその組み合わせからなる群より選択される1種類または複数種の低分子の異常なレベルが、肝機能不全を示し;
ジメチルグリシン、ベタイン、コリン、グリシン、サルコシン、およびその組み合わせからなる群より選択される1種類または複数種の低分子の異常なレベルが、サルコシン血症を示し;
α-ケトグルタラート、スクシナート、フマラート、マラート、グルタマート、シトラート、およびその組み合わせからなる群より選択される1種類または複数種の低分子の異常なレベルが、クエン酸輸送体欠損症を示し;
ピルバートおよびラクタートからなる群より選択される1種類または複数種の低分子の異常なレベルが、ピルビン酸デヒドロゲナーゼ欠損症を示し;
ウラシル、3-ウレイドプロピオナート、オロタート、グルタミン、N-アセチル-β-アラニン、ウリジン、N-アセチルアスパルタート(NAA)、ジメチルアルギニン(SDMA+ADMA)、5-メチルチオアデノシン(MTA)、β-アラニン、4-ウレイドブチラート、ホモシトルリン、オルニチン、およびその組み合わせからなる群より選択される1種類または複数種の低分子の異常なレベルが、高オルニチン・ホモシトルリン・高アンモニア血症を示し;
チロシン、フェニルアラニン、トリプトファン、3-メトキシチロシン、5-ヒドロキシトリプトファン、L-ドーパ、ホモバニラート、5-ヒドロキシインドールアセタート、バニル乳酸、およびその組み合わせからなる群より選択される1種類または複数種の低分子の異常なレベルが、芳香族アミノ酸デカルボキシラーゼ欠損症を示し;
コレスタノール、7-デヒドロコレステロール、およびその組み合わせからなる群より選択される1種類または複数種の低分子の異常なレベルが、スミス・レムリ・オピッツ症候群を示し;
N6-トリメチルリジン、カルニチン、およびその組み合わせからなる群より選択される1種類または複数種の低分子の異常なレベルが、原発性カルニチン欠損症を示し;ならびに
オロタート、シトルリン、およびその組み合わせからなる群より選択される1種類または複数種の低分子の異常なレベルが、シトリン欠損症を示し;ならびに
2-ピロリドン、GABA、およびその組み合わせからなる群より選択される1種類または複数種の低分子の異常なレベルが、ABAT欠損症を示し;ならびに
フルクトース、マンノース、プロリルヒドロキシプロリン、ヒドロキシプロリン、グリシルプロリン、N-アセチルノイラミナート、ジメチルアルギニン(ADMA+SDMA)、グルタミン、γ-グルタミルグルタミン、N-アセチル-アスパルチル-グルタマート(NAAG)、N-アセチルグルタミン、エチルマロナート、クレアチン、グルコース、およびその組み合わせからなる群より選択される1種類または複数種の低分子の異常なレベルが、GLUT1欠損症を示し;ならびに
3-メチルグルタリルカルニチン、3-メチルグルタコン酸、3-メチルグルタル酸、およびその組み合わせからなる群より選択される1種類または複数種の低分子の異常なレベルが、MGAを示し;ならびに
ブチリルグリシン、エチルマロナート、ブチリルカルニチン、メチルスクシナート、およびその組み合わせからなる群より選択される1種類または複数種の低分子の異常なレベルが、SCAD欠損症を示し;ならびに
cis-ウロカナート、trans-ウロカナート、イミダゾールプロピオナート、およびその組み合わせからなる群より選択される1種類または複数種の低分子の異常なレベルが、ウロカナーゼ欠損症を示し;ならびに
3-ヒドロキシイソブチラート、イソブチリルグリシン、およびその組み合わせからなる群より選択される1種類または複数種の低分子の異常なレベルが、3-ヒドロキシイソブチリル-CoA加水分解酵素欠損症を示し;ならびに
オキサラート、グリコラート、およびその組み合わせからなる群より選択される1種類または複数種の低分子の異常なレベルが、高シュウ酸尿症を示し;ならびに
ヘキサデカンジオアート(C16)、ドコサジオアート、エイコサノジオアート、オクタデカンジオアート(C18)、ドデカンジオアート(C12)、2-アミノオクタノアート、2-アミノヘプタノアート、α-ヒドロキシイソカプロアート、イソバレラート(C5)、デカノイルカルニチン(C10)、cis-4-デセノイルカルニチン、パルミトイルカルニチン(C16)、オレオイルカルニチン(C18)、ラウリルカルニチン(C12)、ミリストレオイルカルニチン、ミリストイルカルニチン、グリセロール、3-ヒドロキシミリスタート、2-ヒドロキシデカノアート、3-ヒドロキシラウラート、3-ヒドロキシセバカート、3-ヒドロキシオクタノアート、3-ヒドロキシデカノアート、ペラルゴナート(9:0)、カプロアート(6:0)、およびその組み合わせからなる群より選択される1種類または複数種の低分子の異常なレベルが、BBOX欠損症を示す、本発明1001または本発明1002の方法。
[本発明1005]
試料中にある複数種の低分子それぞれの存在または非存在およびレベルに関する情報を含む試料の低分子プロファイルを作成する工程が、該試料から該複数種の低分子の少なくとも一部を抽出する工程を含む、本発明1001または本発明1002の方法。
[本発明1006]
低分子の特定されたサブセットの異常なレベルに基づいてデータベースから診断情報を得る工程であって、データベースが、複数の疾患および障害それぞれについて、複数種の低分子のうちの1種類または複数種の低分子の異常なレベルを、疾患または障害に関する情報と関連付ける情報を含む、工程が、
試料の低分子プロファイルと参照低分子プロファイルとの比較に基づいて1つまたは複数の異常生化学経路を特定する工程であって、記憶された診断情報が1つまたは複数の異常生化学経路の特定を含む、工程
を含む、本発明1001または本発明1002の方法。
[本発明1007]
試料の低分子プロファイルと参照低分子プロファイルとの比較に基づいて1つまたは複数の異常生化学経路を特定する工程が、
複数の生化学経路を特定する工程であって、それぞれの生化学経路が、作成された試料の低分子プロファイルの中にある低分子の1つまたは複数と関連付けられる、工程;
複数の生化学経路それぞれについて、経路の生化学距離(biochemical distance)を計算し、該計算された生化学距離と、該経路の生化学距離の標準範囲とを比較し、計算された生化学距離が標準範囲外にあれば、生化学経路を異常だと特定する工程
を含む、本発明1006の方法。
[本発明1008]
生化学経路が、異常だと特定された低分子のいずれかと関連付けられれば、該生化学経路は異常だと特定される、本発明1007の方法。
[本発明1009]
異常だと特定された経路に関する情報を表示する工程をさらに含む、本発明1007の方法。
[本発明1010]
個々の対象が複数の疾患および障害のうちの1つまたは複数の症候を示す、本発明1001または本発明1002の方法。
[本発明1011]
個々の対象が複数の疾患および障害の症候を示さない、本発明1001または本発明1002の方法。
[本発明1012]
個々の対象がヒト新生児またはヒト乳児である、本発明1001または本発明1002の方法。
[本発明1013]
異常なレベルを有する低分子の特定されたサブセットと関連付けられた、記憶された診断情報が、少なくとも1つの疾患または障害の提案される診断を含む、本発明1001または本発明1002の方法。
[本発明1014]
異常なレベルを有する低分子の特定されたサブセットと関連付けられた、記憶された診断情報が、疾患または障害の診断を裏付けるための少なくとも1つの推奨される診断検査または診断法の特定を含む、本発明1001または本発明1002の方法。
[本発明1015]
複数の疾患および障害が希少疾患または希少障害を含む、本発明1001または本発明1002の方法。
[本発明1016]
個々の対象から得られた試料の体積が100μL(0.100mL)未満である、本発明1001または本発明1002の方法。
[本発明1017]
個々の対象から得られた試料の体積が25μL〜100μL(0.025mL〜0.100mL)である、本発明1001または本発明1002の方法。
[本発明1018]
試料の低分子プロファイルが、試料に存在する内因性低分子および微生物性低分子に関する情報を含む、本発明1001または本発明1002の方法。
[本発明1019]
試料の低分子プロファイルが、試料に存在する生体異物性低分子に関する情報をさらに含む、本発明1018の方法。
[本発明1020]
試料の低分子プロファイルが、試料に存在する食事性低分子に関する情報をさらに含む、本発明1018の方法。
[本発明1021]
試料の低分子プロファイルが、試料に存在する生体異物性低分子に関する情報をさらに含む、本発明1020の方法。
[本発明1022]
異常なレベルを有する低分子の特定されたサブセットと関連付けられた1つまたは複数の生化学経路を表す情報を表示する工程をさらに含む、本発明1001または本発明1002のいずれかの方法。
[本発明1023]
異常なレベルを有する低分子の特定されたサブセットと関連付けられた1つまたは複数の生化学経路を表す情報を表示する工程が、
異常なレベルを有する低分子の特定されたサブセットと関連付けられたスーパー経路(superpathway)を表す情報を表示する工程;および
異常なレベルを有する低分子の特定されたサブセットと関連付けられたサブ経路(subpathway)を表す情報を表示する工程
を含む、本発明1022の方法。
[本発明1024]
複数種の低分子と関連付けられた複数の経路の図による表示、および複数の経路の中のどの経路が、異常なレベルを有する低分子の特定されたサブセットと関連付けられたかを図で示したものを表示する工程をさらに含む、本発明1001または本発明1002の方法。
[本発明1025]
異常なレベルを有する低分子の特定されたサブセットが指定済生化学物質を含む、本発明1001または本発明1002の方法。
[本発明1026]
異常なレベルを有する低分子の特定されたサブセットの中にある、それぞれの指定済生化学物質について、該指定済生化学物質と関連付けられた生化学経路を表す情報を表示する工程をさらに含む、本発明1025の方法。
[本発明1027]
複数種の低分子と関連付けられた複数の経路の図による表示、および複数の経路の中のどの経路が、異常なレベルを有する低分子の特定されたサブセットと関連付けられたかを図で示したものを含むデータを記憶する工程をさらに含む、本発明1001または本発明1002の方法。
[本発明1028]
異常なレベルを有する低分子の特定されたサブセットの図による表示を表示する工程をさらに含む、本発明1001または本発明1002の方法。
[本発明1029]
異常なレベルを有する低分子の特定されたサブセットの図による表示を含むデータを記憶する工程をさらに含む、本発明1001または本発明1002の方法。
[本発明1030]
試料中にある異常なレベルの低分子が、参照低分子プロファイルに存在しかつ個々の対象に由来する試料の低分子プロファイルに存在しない低分子を含む、本発明1001または本発明1002の方法。
[本発明1031]
試料中にある異常なレベルの低分子が、個々の対象に由来する試料の低分子プロファイルに存在しかつ参照低分子プロファイルでは希少な低分子を含む、本発明1001または本発明1002の方法。
[本発明1032]
個々の対象から試料の低分子プロファイルを作成する工程が、
実験操作中に、個々の対象に由来する試料から実験データを作成する工程;および
実験操作中に、少なくとも1つのアンカー試料(anchor sample)から実験データを作成する工程
を含む、本発明1001または本発明1002の方法。
[本発明1033]
少なくとも1つのアンカー試料が、複数の対象に由来する試料のプールされたアリコートを含む、本発明1032の方法。
[本発明1034]
それぞれの低分子の参照レベルの標準範囲が、複数の対象に由来する試料から作成された低分子プロファイルの統計解析に基づいている、本発明1033の方法。
[本発明1035]
それぞれの低分子の参照レベルの標準範囲が、複数の参照対象に由来する試料から作成された低分子プロファイルの統計解析に基づいている、本発明1001または本発明1002の方法。
[本発明1036]
それぞれの低分子の参照レベルの標準範囲が、複数の参照対象に由来する試料から作成された低分子プロファイルの統計解析における四分位範囲に基づいている、本発明1035の方法。
[本発明1037]
それぞれの低分子の参照レベルの標準範囲が、複数の参照対象に由来する試料から作成された低分子プロファイルの統計解析における標準スコア(Z-スコア)の範囲に基づいている、本発明1036の方法。
[本発明1038]
複数の参照対象の中にあるそれぞれの参照対象から参照試料を得る工程;
それぞれの参照対象について参照試料の低分子プロファイルを作成する工程であって、該低分子プロファイルが、それぞれの参照試料について、該参照試料中にある複数種の低分子それぞれの存在または非存在およびレベルに関する情報を含む、工程;ならびに
複数の参照対象について低分子プロファイルを統計解析して、複数種の低分子それぞれのレベルの標準範囲を決定し、それによって、参照低分子プロファイルを作成する工程
をさらに含む、本発明1001または本発明1002の方法。
[本発明1039]
個々の対象に由来する試料が血液、血漿、または血清を含む、本発明1001または本発明1002の方法。
[本発明1040]
個々の対象に由来する試料が尿を含む、本発明1001または本発明1002の方法。
[本発明1041]
個々の対象に由来する試料が血液、血漿、血清、皮膚、表皮組織、脂肪組織、大動脈組織、肝臓組織、尿、脳脊髄液、歯肉滲出液、または細胞試料を含む、本発明1001または本発明1002の方法。
[本発明1042]
複数種の低分子が少なくとも200種類の低分子を含む、本発明1001または本発明1002の方法。
[本発明1043]
複数種の低分子が少なくとも500種類の低分子を含む、本発明1001または本発明1002の方法。
[本発明1044]
複数種の低分子が500〜1300種類の低分子を含む、本発明1001または本発明1002の方法。
[本発明1045]
複数種の低分子が500〜25,000種類の低分子を含む、本発明1001または本発明1002の方法。
[本発明1046]
複数の疾患および障害が、3-メチルクロトニルCoAカルボキシラーゼ欠損症、アルギニノコハク酸リアーゼ欠損症、アデノシンデアミナーゼ欠損症、アルギニン血症、ビオチニダーゼ欠損症、コバラミン欠損症(Cbl)、Cbl A、Cbl C、シトルリン血症、カルニチンパルミトイルトランスフェラーゼ2欠損症(CPTII)、シスチン症、ジヒドロピリミジンデヒドロゲナーゼ欠損症、グルタル酸尿症、3-ヒドロキシ-3-メチルグルタル酸尿症(HMG CoAリアーゼ欠損症)、ホロカルボキシラーゼ、ホモシスチン尿症、リジン尿性タンパク質不耐症、イソ吉草酸血症、中鎖アシルCoAデヒドロゲナーゼ欠損症、メチルマロン酸血症、モリブデン補因子欠損症または亜硫酸酸化酵素欠損症、メープルシロップ尿症、オルニチントランスカルバミラーゼ欠損症、プロピオン酸血症、フェニルケトン尿症(PKU)、コハク酸セミアルデヒドデヒドロゲナーゼ欠損症、スクシニルリアーゼ欠損症、チミジンホスホリラーゼ欠損症、トリメチルリジンヒドロキシラーゼε欠損症、チロシン血症、超長鎖アシルCoAデヒドロゲナーゼ欠損症、キサンチン尿症、X連鎖性クレアチン輸送体、サルコシン血症、クエン酸輸送体欠損症、ピルビン酸デヒドロゲナーゼ欠損症、高オルニチン・ホモシトルリン・高アンモニア血症、芳香族アミノ酸デカルボキシラーゼ欠損症、スミス・レムリ・オピッツ症候群、原発性カルニチン欠損症、シトリン欠損症、ABAT欠損症、GLUT1欠損症、MGA、SCAD欠損症、ウロカナーゼ欠損症、3-ヒドロキシイソブチリル-CoA加水分解酵素欠損症、高シュウ酸尿症、BBOX欠損症、アセトアミノフェン誘導毒性、糖尿病、および肝機能不全のうちの2以上を含む、本発明1001または本発明1002の方法。
[本発明1047]
複数の疾患および障害が、3-メチルクロトニルCoAカルボキシラーゼ欠損症、アルギニノコハク酸リアーゼ欠損症、アデノシンデアミナーゼ欠損症、アルギニン血症、ビオチニダーゼ欠損症、コバラミン欠損症(Cbl)、Cbl A、Cbl C、シトルリン血症、カルニチンパルミトイルトランスフェラーゼ2欠損症(CPTII)、シスチン症、ジヒドロピリミジンデヒドロゲナーゼ欠損症、グルタル酸尿症、3-ヒドロキシ-3-メチルグルタル酸尿症(HMG CoAリアーゼ欠損症)、ホロカルボキシラーゼ、ホモシスチン尿症、イソ吉草酸血症、リジン尿性タンパク質不耐症、中鎖アシルCoAデヒドロゲナーゼ欠損症、メチルマロン酸血症、モリブデン補因子欠損症または亜硫酸酸化酵素欠損症、メープルシロップ尿症、オルニチントランスカルバミラーゼ欠損症、プロピオン酸血症、フェニルケトン尿症(PKU)、コハク酸セミアルデヒドデヒドロゲナーゼ欠損症、スクシニルリアーゼ欠損症、チミジンホスホリラーゼ欠損症、トリメチルリジンヒドロキシラーゼε欠損症、チロシン血症、超長鎖アシルCoAデヒドロゲナーゼ欠損症、キサンチン尿症、X連鎖性クレアチン輸送体、サルコシン血症、クエン酸輸送体欠損症、ピルビン酸デヒドロゲナーゼ欠損症、高オルニチン・ホモシトルリン・高アンモニア血症、芳香族アミノ酸デカルボキシラーゼ欠損症、スミス・レムリ・オピッツ症候群、原発性カルニチン欠損症、シトリン欠損症、ABAT欠損症、GLUT1欠損症、MGA、SCAD欠損症、ウロカナーゼ欠損症、3-ヒドロキシイソブチリル-CoA加水分解酵素欠損症、高シュウ酸尿症、BBOX欠損症、アセトアミノフェン誘導毒性、糖尿病、および肝機能不全のうちの5以上を含む、本発明1001または本発明1002の方法。
[本発明1048]
複数の疾患および障害が、3-メチルクロトニルCoAカルボキシラーゼ欠損症、アルギニノコハク酸リアーゼ欠損症、アデノシンデアミナーゼ欠損症、アルギニン血症、ビオチニダーゼ欠損症、コバラミン欠損症(Cbl)、Cbl A、Cbl C、シトルリン血症、カルニチンパルミトイルトランスフェラーゼ2欠損症(CPTII)、シスチン症、ジヒドロピリミジンデヒドロゲナーゼ欠損症、グルタル酸尿症、3-ヒドロキシ-3-メチルグルタル酸尿症(HMG CoAリアーゼ欠損症)、ホロカルボキシラーゼ、ホモシスチン尿症、イソ吉草酸血症、リジン尿性タンパク質不耐症、中鎖アシルCoAデヒドロゲナーゼ欠損症、メチルマロン酸血症、モリブデン補因子欠損症または亜硫酸酸化酵素欠損症、メープルシロップ尿症、オルニチントランスカルバミラーゼ欠損症、プロピオン酸血症、フェニルケトン尿症(PKU)、コハク酸セミアルデヒドデヒドロゲナーゼ欠損症、スクシニルリアーゼ欠損症、チミジンホスホリラーゼ欠損症、トリメチルリジンヒドロキシラーゼε欠損症、チロシン血症、超長鎖アシルCoAデヒドロゲナーゼ欠損症、キサンチン尿症、X連鎖性クレアチン輸送体、サルコシン血症、クエン酸輸送体欠損症、ピルビン酸デヒドロゲナーゼ欠損症、高オルニチン・ホモシトルリン・高アンモニア血症、芳香族アミノ酸デカルボキシラーゼ欠損症、スミス・レムリ・オピッツ症候群、原発性カルニチン欠損症、シトリン欠損症、ABAT欠損症、GLUT1欠損症、MGA、SCAD欠損症、ウロカナーゼ欠損症、3-ヒドロキシイソブチリル-CoA加水分解酵素欠損症、高シュウ酸尿症、BBOX欠損症、アセトアミノフェン誘導毒性、糖尿病、および肝機能不全のうちの10以上を含む、本発明1001または本発明1002の方法。
[本発明1049]
記憶された診断情報が、異常なレベルを有する低分子の特定されたサブセットと関連付けられた障害の特定を含む、本発明1001または本発明1002の方法。
[本発明1050]
特定された障害が3-メチルクロトニルCoAカルボキシラーゼ欠損症であり、異常なレベルを有する低分子の特定されたサブセットが、3-メチルクロトニルグリシン、β-ヒドロキシイソバレラート、β-ヒドロキシイソバレロイルカルニチン、グルタリルカルニチン(C5)、3-メチルクロトニルグリシン、アジパート、グルタラート(ペンタンジオアート)、オクタデカンジオアート(C18)、ヘキサデカンジオアート(C16)、テトラデカンジオアート(C14)、ドデカンジオアート(C12)、イソバレラート、ロイシン、イソバレリルグリシン、α-ヒドロキシイソバレラート、スクシニルカルニチン、3-メチルグルタリルカルニチン、イソバレリルカルニチン、アラニルアラニン、ピログルタミルバリン、X-12007、X-12814、エチルマロナート、N-アセチルロイシン、およびその組み合わせからなる群より選択される1種類または複数種の代謝産物を含む、本発明1049の方法。
[本発明1051]
特定された障害がアデノシンデアミナーゼ欠損症であり、異常なレベルを有する低分子の特定されたサブセットが、デオキシアデノシン、S-アデノシルホモシステイン、2'-デオキシイノシン、アデニン、N2-メチルグアノシン、2'-デオキシグアノシン、ウラート、N1-メチルアデノシン、アデノシン、アラントイン、キサンチン、グアノシン、ヒポキサンチン、N2,N2-ジメチルグアノシン、7-メチルグアノシン、およびその組み合わせからなる群より選択される1種類または複数種の代謝産物を含む、本発明1049の方法。
[本発明1052]
特定された障害がアルギニノコハク酸リアーゼ欠損症であり、異常なレベルを有する低分子の特定されたサブセットが、アルギニノスクシナート、N-δ-アセチルオルニチン、ソルボース、フルクトース、シトルリン、メチル-4-ヒドロキシベンゾアート、ウラシル、アルギニン、アスパルタート、イソロイシルアスパルタート、オルニチン、ウリジン、ホモシトルリン、オロタート、ホモアルギニン、O-スルホ-L-チロシン、パルミトイルスフィンゴミエリン、X-13507、X-15245、X-15664、X-15454、およびその組み合わせからなる群より選択される1種類または複数種の代謝産物を含む、本発明1049の方法。
[本発明1053]
特定された障害がアルギニン血症であり、異常なレベルを有する低分子の特定されたサブセットが、アルギニン、4-グアニジノブタノアート、ホモアルギニン、N-アセチルアルギニン、オルニチン、尿素、ホモシトルリン、ウラシル、アスパルタート、アルギニノスクシナート、プロリン、オロタート、クレアチニン、ウリジン、3-ウレイドプロピオナート、クレアチン、ベタイン、ロイシン、イソロイシン、γ-グルタミルロイシン、X-12339、X-12681、およびその組み合わせからなる群より選択される1種類または複数種の代謝産物を含む、本発明1049の方法。
[本発明1054]
特定された障害がビオチニダーゼ欠損症であり、異常なレベルを有する低分子の特定されたサブセットが、キシリトール、ビオチン、3-メチルクロトニルグリシン、プロピオニルカルニチン(C3)、およびその組み合わせからなる群より選択される1種類または複数種の代謝産物を含む、本発明1049の方法。
[本発明1055]
特定された障害がCbl(コバラミン欠損症)であり、異常なレベルを有する低分子の特定されたサブセットが、メチルマロン酸、ホモシステイン、2-メチルシトラート、シスタチオニン、2-メチルマロニルカルニチン、プロピオニルカルニチン、X-12749、およびその組み合わせからなる群より選択される1種類または複数種の代謝産物を含む、本発明1049の方法。
[本発明1056]
特定された障害がCbl Aであり、異常なレベルを有する低分子の特定されたサブセットが、メチルマロン酸、ホモシステイン、2-メチルシトラート、シスタチオニン、2-メチルマロニルカルニチン、チグリルカルニチン、2-メチルブチリルカルニチン、プロピオニルカルニチン、X-12749、およびその組み合わせからなる群より選択される1種類または複数種の代謝産物を含む、本発明1049の方法。
[本発明1057]
特定された障害がCbl Cであり、異常なレベルを有する低分子の特定されたサブセットが、メチルマロン酸、ホモシステイン、2-メチルシトラート、シスタチオニン、2-メチルマロニルカルニチン、プロピオニルカルニチン、X-12749、X-17677、およびその組み合わせからなる群より選択される1種類または複数種の代謝産物を含む、本発明1049の方法。
[本発明1058]
特定された障害がシトルリン血症であり、異常なレベルを有する低分子の特定されたサブセットが、シトルリン、アルギニノコハク酸、ホモシトルリン、3-ウレイドプロピオナート、N-アセチルアラニン、フェニルアセタート、フェニルアセチルグルタミン、4-ウレイドブチラート、N-カルバモイルアスパルタート、グアニジノアセタート、尿素、4-グアニジノブタノアート、N-アセチルアルギニン、ヒプラート、オルニチン、2-メチルヒプラート、フェニルアセチルグリシン、4-フェニルブチラート、クレアチニン、オロタート、3,4-ジヒドロキシフェニルアセタート、ホモアルギニン、グアニジノスクシナート、γ-グルタミルフェニルアラニン、γ-グルタミルイソロイシン、トリプトファン、1,5-アンヒドログルシトール(1,5-AG)、N-アセチル-シトルリン、X-12681、X-19684、X-20598、X-18446、X-20588、およびその組み合わせからなる群より選択される1種類または複数種の代謝産物を含む、本発明1049の方法。
[本発明1059]
特定された障害がカルニチンパルミトイルトランスフェラーゼ2欠損症(CPTII)であり、異常なレベルを有する低分子の特定されたサブセットが、カルニチン、アシルカルニチン、N-オクタノイルグリシン(C8エステル)、セバカート(C8)、カプラート(C10)、カプリラート(C8)、オクタノイルカルニチン、ヘキサノイルカルニチン、およびその組み合わせからなる群より選択される1種類または複数種の代謝産物を含む、本発明1049の方法。
[本発明1060]
特定された障害がシスチン症であり、異常なレベルを有する低分子の特定されたサブセットが、システイン、cys-gly(酸化型)、1,5-アンヒドログルシトール(1,5-AG)、グリココレナートスルファート、4-アセチルフェノールスルファート、クレゾールグルクロニド、エリスリトール、バニリルマンデラート、N2,N2-ジメチル-グアノシン、フェニルアセチルグルタミン、X-12846、X-12303、X-19145、X-12216、X-17717、X-15667、X-12119、X-11315、X-12731、X-12705、X-17685、X-18371、およびその組み合わせからなる群より選択される1種類または複数種の代謝産物を含む、本発明1049の方法。
[本発明1061]
特定された障害がジヒドロピリミジンデヒドロゲナーゼ欠損症であり、異常なレベルを有する低分子の特定されたサブセットが、ウラシル、チミン、シチジン、5,6-ジヒドロウラシル、4-ウレイドブチラート、3-ウレイドプロピオナート、ウリジン、オロタート、N-カルバモイルアスパルタート、およびその組み合わせからなる群より選択される1種類または複数種の代謝産物を含む、本発明1049の方法。
[本発明1062]
特定された障害がグルタル酸尿症1型であり、異常なレベルを有する低分子の特定されたサブセットが、グルタラート(ペンタンジオアート)、グルタリルカルニチン(C5)、3-ヒドロキシグルタラート、グルタコナート、3-メチルグルタリルカルニチン、2-アミノアジパート、X-12364、X-15674、およびその組み合わせからなる群より選択される1種類または複数種の代謝産物を含む、本発明1049の方法。
[本発明1063]
特定された障害がグアニジノ酢酸メチルトランスフェラーゼ(GAMT)欠損症であり、異常なレベルを有する低分子の特定されたサブセットが、クレアチン、3-(4-ヒドロキシフェニル)ラクタート、1,3-ジパルミトイルグリセロール、グアニジノアセタート、クレアチニン、システインs-スルファート、X-19602、X-12906、X-13007、X-10458、およびその組み合わせからなる群より選択される1種類または複数種の代謝産物を含む、本発明1049の方法。
[本発明1064]
特定された障害が3-ヒドロキシ-3-メチルグルタル酸尿症(HMG CoAリアーゼ欠損症)であり、異常なレベルを有する低分子の特定されたサブセットが、3-メチルグルタリルカルニチン(C6)、β-ヒドロキシイソバレラート、β-ヒドロキシイソバレロイルカルニチン、グルタリルカルニチン(C5)、アルギニルプロリン、1-ステアロイルグリセロホスホエタノールアミン、o-クレゾールスルファート、3-メチルクロトニルグリシン、アジパート、グルタラート(ペンタンジオアート)、オクタデカンジオアート(C18)、ヘキサデカンジオアート(C16)、テトラデカンジオアート(C14)、ドデカンジオアート(C12)、イソバレラート、アセチルカルニチン、パルミトイルカルニチン、ヘキサノイルカルニチン、ミリストイルカルニチン、ヘキセンジオイルカルニチン、X-17715、X-12741、X-16134、X-10593、X-12688、およびその組み合わせからなる群より選択される1種類または複数種の代謝産物を含む、本発明1049の方法。
[本発明1065]
特定された障害がホロカルボキシラーゼ合成酵素欠損症であり、異常なレベルを有する低分子の特定されたサブセットが、β-ヒドロキシイソバレラート、3-メチルクロトニルグリシン、β-ヒドロキシイソバレロイルカルニチン(C5)、プロピオニルグリシン(C3)、3-ヒドロキシプロパノアート、チグロイルグリシン、スクシニルカルニチン、2-メチルシトラート、3-ヒドロキシイソブチラート、ラクタート、3-ヒドロキシ-2-エチルプロピオナート、イソブチリルグリシン、α-ヒドロキシイソバレロイルカルニチン、3-メチル-2-オキソブチラート、3-メチル-2-オキソバレラート、3-ヒドロキシ-2-メチルブチラート、4-メチル-2-オキソペンタノアート、マロニルカルニチン、α-ヒドロキシイソバレラート、2-ヒドロキシ-3-メチルバレラート、プロピオニルカルニチン、チグリルカルニチン、イソバレリルカルニチン、ヒドロキシブチリルカルニチン、スクシナート、2-メチルマロニルカルニチン、α-ヒドロキシイソカプロアート、ビオチン、およびその組み合わせからなる群より選択される1種類または複数種の代謝産物を含む、本発明1049の方法。
[本発明1066]
特定された障害がホモシスチン尿症であり、異常なレベルを有する低分子の特定されたサブセットが、ホモシステイン、システイン、メチオニン、他のアミノ酸、γ-グルタミルメチオニン、5-メチルチオアデノシン(MTA)、S-アデノシルホモシステイン(SAH)、N1-メチルアデノシン、グリシルプロリン、1-エイコセノイルグリセロホスホエタノールアミン(20:1n9)、1-メチルニコチンアミド、N-アセチル-アスパルチル-グルタマート(NAAG)、ピリドキサール、2-ヒドロキシイソブチラート、アシソガ、カルノシン、3-メトキシチロシン、2-ヒドロキシデカノアート、δ-トコフェロール、α-CEHC(2,5,7,8-テトラメチル-2-(2'-カルボキシエチル)-6-ヒドロキシクロマン)スルファート、N-アセチルトリプトファン、アデニン、コルチゾール、X-19350、X-18965、X-15649、X-17303、X-18897、X-11564、X-18891、X-12748、X-18918、X-18905、X-18606、X-16574、X-18895、X-18907、X-19455、X-18909、X-19574、X-12110、X-20676、X-11360、X-18920、およびその組み合わせからなる群より選択される1種類または複数種の代謝産物を含む、本発明1049の方法。
[本発明1067]
特定された障害がイソ吉草酸血症であり、異常なレベルを有する低分子の特定されたサブセットが、イソバレラート(C5)、イソバレリルグリシン、イソバレリルカルニチン(C5)、バレラート;バレリルカルニチン、β-ヒドロキシイソバレラート、フェニルカルニチン、β-ヒドロキシブチラート、3-メチルクロトニルグリシン、α-ヒドロキシブチラート、X-16577、X-14331、およびその組み合わせからなる群より選択される1種類または複数種の代謝産物を含む、本発明1049の方法。
[本発明1068]
特定された障害がリジン尿性タンパク質不耐症であり、異常なレベルを有する低分子の特定されたサブセットが、オルニチン、アルギニン、リジン、アスパラギン、N6-アセチルリジン、グルタミン、N2-アセチルリジン、N-アセチルアルギニン、γ-グルタミルグルタミン、プロリン、S-メチルシステイン、2-ヒドロキシデカノアート、1-メチルイミダゾールアセタート、2-アミノヘプタノアート、3-メチルグルタリルカルニチン、グルタリルカルニチン、N6-トリメチルリジン、5-(ガラクトシルヒドロキシ)-L-リジン、X-15636、17654、X-12193、X-12425、およびその組み合わせからなる群より選択される1種類または複数種の代謝産物を含む、本発明1049の方法。
[本発明1069]
特定された障害が中鎖アシルCoAデヒドロゲナーゼ欠損症であり、異常なレベルを有する低分子の特定されたサブセットが、アシルカルニチン、カルニチン、有機酸、N-オクタノイルグリシン、カプロアート(6:0)、カプリラート(8:0)、ヘプタノアート(7:0)、ドデカンジオアート、デカノイルカルニチン、N-パルミトイルタウリン、ペラルゴナート(9:0)、デオキシカルニチン、O-メチルカテコールスルファート、1-ステアロイルグリセロホスホコリン(18:0)、1-マルガロイルグリセロホスホコリン(17:0)、1-ドコサペンタエノイルグリセロホスホコリン(22:5n3)、4-オクテンジオアート、アジパート、ヘプタノイルグリシン、3-メチルアジパート、2-ヒドロキシグルタラート、α-CEHC(2,5,7,8-テトラメチル-2-(2'-カルボキシエチル)-6-ヒドロキシクロマン)スルファート、X-11521(考えられる実験式:C15H27NO4および構造:2-オクテノイルカルニチン)、X-15646、X-12802、X-11478、X-11440(考えられる二硫酸ヒドロキシプレグネン-ジオールまたは二硫酸プレグナノロン-ジオール)、X-15486、X-18913、メチルヘキサノイルグルタミン、X-13837、X-18946、X-11861、X-18888、X-18922、X-17438、X-18916、X-16674、X-12824、およびその組み合わせからなる群より選択される1種類または複数種の代謝産物を含む、本発明1049の方法。
[本発明1070]
特定された障害がメチルマロン酸血症であり、異常なレベルを有する低分子の特定されたサブセットが、メチルマロナート、メチルマロニルCoA、2-メチルマロニルカルニチン、プロピオニルカルニチン(C3)、チグリルカルニチン、2-メチルブチリルカルニチン(C5)、2-メチルシトラート、スクシニルカルニチン、プロピオニルグリシン、3-ヒドロキシプロパノアート、バレリルカルニチン、イソバレリルカルニチン、スクシナート、チグロイルグリシン、β-ヒドロキシイソバレロイルカルニチン、β-ヒドロキシイソバレラート、イソブチリルカルニチン、3-ヒドロキシ-2-エチルプロピオナート、ブチリルカルニチン、3-メチルグルタリルカルニチン、メチルスクシナート、3-メチル-2-オキソバレラート、3-メチル-2-オキソブチラート、X-12749、X-17564、X-12114、およびその組み合わせからなる群より選択される1種類または複数種の代謝産物を含む、本発明1049の方法。
[本発明1071]
特定された障害がモリブデン補因子欠損症または亜硫酸酸化酵素欠損症であり、異常なレベルを有する低分子の特定されたサブセットが、キサンチン、S-スルホシステイン、チオスルファート、5-HETE、ロイコトリエンB4、13-HODE+9-HODE、12-HETE、ウラート、およびその組み合わせからなる群より選択される1種類または複数種の代謝産物を含む、本発明1049の方法。
[本発明1072]
特定された障害がメープルシロップ尿症であり、異常なレベルを有する低分子の特定されたサブセットが、ロイシン、イソロイシン、バリン、2-ヒドロキシ-3-メチルバレラート、α-ヒドロキシイソバレラート、イソバレリルカルニチン、2-アミノヘプタノアート、4-メチル-2-オキソペンタノアート、1-リノレノイルグリセロホスホコリン(18:3n3)、2-リノレノイルグリセロホスホコリン(18:3n3)、1-ミリストイルグリセロホスホコリン(14:0)、2-ミリストイルグリセロホスホコリン、二硫酸5α-アンドロスタン-3α,17β-ジオール、バリン、3-メチル-2-オキソブチラート、イソバレラート、イソブチリルカルニチン、3-ヒドロキシイソブチラート、2-メチルブチリルカルニチン、β-ヒドロキシイソバレロイルカルニチン、アロ-イソロイシン、3-メチル-2-オキソバレラート、β-ヒドロキシイソバレラート、スクシナート、アセチルカルニチン、2-メチルシトラート、チグロイルグリシン、チグリルカルニチン、ヒドロキシブチリルカルニチン、α-ヒドロキシイソカプロアート、X-13581、X-17690、X-13689(グルクロニドコンジュゲート)、およびその組み合わせからなる群より選択される1種類または複数種の代謝産物を含む、本発明1049の方法。
[本発明1073]
特定された障害がオルニチントランスカルバミラーゼ欠損症であり、異常なレベルを有する低分子の特定されたサブセットが、オロタート、シトルリン、アルギニン、フェニルアセチルグルタミン、ステアリドナート(18:4n3)、3-ウレイドプロピオナート、2-メチルヒプラート、2-ヒドロキシフェニルアセタート、フェニルカルニチン、ヒプラート、フェニルプロピオニルグリシン、ベンゾアート、メチル-4-ヒドロキシベンゾアート、4-フェニルブチラート、2-ペンタンアミド-3-フェニルプロパン酸、フェニルアセタート、フェニルアセチルグリシン、trans-4-ヒドロキシプロリン、pro-ヒドロキシ-pro、尿素、フェニルラクタート(PLA)、グアニジノスクシナート、オルニチン、X-20598、X-20588、およびその組み合わせからなる群より選択される1種類または複数種の代謝産物を含む、本発明1049の方法。
[本発明1074]
特定された障害がプロピオン酸血症であり、異常なレベルを有する低分子の特定されたサブセットが、プロピオナート、プロピオニルグリシン(C3)、2-メチルシトラート、3-ヒドロキシプロパノアート、プロピオニルカルニチン(C3)、1-ペンタデカノイルグリセロホスホコリン(15:0)、チグロイルグリシン、スクシニルカルニチン、グルタリルカルニチン(C5)、3-メチルグルタリルカルニチン(C6)、チグリルカルニチン、ブチリルカルニチン、2-メチルマロニルカルニチン、β-ヒドロキシイソバレラート、X-12819、およびその組み合わせからなる群より選択される1種類または複数種の代謝産物を含む、本発明1049の方法。
[本発明1075]
特定された障害がフェニルケトン尿症(PKU)であり、異常なレベルを有する低分子の特定されたサブセットが、フェニルアラニン、γ-グルタミルフェニルアラニン、フェニルラクタート、N-アセチルフェニルアラニン、フェニルピルバート、γ-グルタミルチロシン、3-メトキシチロシン、4-ヒドロキシフェニルピルバート、p-クレゾールスルファート、カテコールスルファート、フェニルアセチルグルタミン、フェニルアラニルアルギニン、バリルフェニルアラニン、ヒスチジルフェニルアラニン、フェニルアラニルセリン、ロイシルフェニルアラニン、スレオニルフェニルアラニン、フェニルアラニルアラニン、フェニルアラニルグリシン、フェニルアラニルグルタメート、フェニルアラニルフェニルアラニン、アスパルチルフェニルアラニン、トリプトフィルフェニルアラニン、フェニルアラニルイソロイシン、グリシルフェニルアラニン、フェニルアラニルロイシン、フェニルアラニルアスパルタート、o-クレゾールスルファート、フェニルアセチルグリシン、X-16283、X-15497、およびその組み合わせからなる群より選択される1種類または複数種の代謝産物を含む、本発明1049の方法。
[本発明1076]
特定された障害がコハク酸セミアルデヒドデヒドロゲナーゼ欠損症であり、異常なレベルを有する低分子の特定されたサブセットが、γ-アミノブチラート(GABA)、スクシンイミド、およびその組み合わせからなる群より選択される1種類または複数種の代謝産物を含む、本発明1049の方法。
[本発明1077]
特定された障害がスクシニルアデノシンリアーゼ欠損症であり、異常なレベルを有する低分子の特定されたサブセットが、N6-スクシニルアデノシン、キサントシン、2'-デオキシグアノシン、2'-デオキシイノシン、アデニン、およびその組み合わせからなる群より選択される1種類または複数種の代謝産物を含む、本発明1049の方法。
[本発明1078]
特定された障害がチミジンホスホリラーゼ欠損症であり、異常なレベルを有する低分子の特定されたサブセットが、チミジン、2'-デオキシウリジン、5,6-ジヒドロチミン、5-メチルウリジン(リボチミジン);ヒプラート、2-リノレオイルグリセロホスホコリン、4-メチルカテコールスルファート、1-アラキドイルグリセロホスホコリン(20:0)、タウロリトコラート3-スルファート、グリコリトコラートスルファート、イミダゾールプロピオナート、X-13862、X-19330、X-20620、X-12170、およびその組み合わせ、およびその組み合わせからなる群より選択される1種類または複数種の代謝産物を含む、本発明1049の方法。
[本発明1079]
特定された障害がトリメチルリジンヒドロキシラーゼε欠損症であり、異常なレベルを有する低分子の特定されたサブセットが、N-6-トリメチルリジン、1-アラキドノイルグリエルコホスファート、X-16574、X-12822、X-15136、およびその組み合わせからなる群より選択される1種類または複数種の代謝産物を含む、本発明1049の方法。
[本発明1080]
特定された障害がチロシン血症であり、異常なレベルを有する低分子の特定されたサブセットが、チロシン、3-(4-ヒドロキシフェニル)ラクタート、4-ヒドロキシフェニルピルバート、3-(3-ヒドロキシフェニル)プロピオナート、4-ヒドロキシフェニルアセタート、フェニルラクタート(PLA)、X-13581、およびその組み合わせからなる群より選択される1種類または複数種の代謝産物を含む、本発明1049の方法。
[本発明1081]
特定された障害が超長鎖アシルCoAデヒドロゲナーゼ欠損症であり、異常なレベルを有する低分子の特定されたサブセットが、ミリストイルカルニチン、ステアロイルカルニチン(C18)、パルミトイルカルニチン(C16)、オレオイルカルニチン(C18)、ミリストレアート(14:1n5)、リノレオイルカルニチン、9-メチル尿酸、キシルロース、アラキドナート(20:4n6)、ドコサヘキサエノアート(DHA;22:6n3)、エイコサペンタン酸(EPA)、5,8-テトラデカジエン酸、1-ドコサヘキサエノイル-GPC(22:6;DHA-GPC)、X-18739(2-テトラデセノイルカルニチンの考えられる異性体)、およびその組み合わせからなる群より選択される1種類または複数種の代謝産物を含む、本発明1049の方法。
[本発明1082]
特定された障害がキサンチン尿症であり、異常なレベルを有する低分子の特定されたサブセットが、キサンチン、ウラート、クレアチン、ヒポキサンチン、キサントシン、2'-デオキシイノシン、イノシン、N2-メチルグアノシン、クレアチニン、およびその組み合わせからなる群より選択される1種類または複数種の代謝産物を含む、本発明1049の方法。
[本発明1083]
特定された障害がX連鎖性クレアチン輸送体であり、異常なレベルを有する低分子の特定されたサブセットが、グリシルロイシン、2-ヒドロキシオクタノアート、1,6-アンヒドログルコース、クレアチン、X-11483、X-18943、X-17422、X-17761、X-17335、およびその組み合わせからなる群より選択される1種類または複数種の代謝産物を含む、本発明1049の方法。
[本発明1084]
特定された障害がアミノ酸代謝および輸送の障害であり、異常なレベルを有する低分子の特定されたサブセットが、N-アセチルアラニン、アスパルタート、グルタラート(ペンタンジオアート)、グルタリルカルニチン(C5)、3-ヒドロキシグルタラート、グルタコナート、フェニルアラニン、N-アセチルフェニルアラニン、フェニルピルバート、フェニルラクタート(PLA)、フェニルアセタート、フェニルアセチルグリシン、フェニルアセチルグルタミン、4-ヒドロキシフェニルピルバート、3-(4-ヒドロキシフェニル)ラクタート、p-クレゾールスルファート、o-クレゾールスルファート、3-メトキシチロシン、ロイシン、4-メチル-2-オキソペンタノアート、イソバレラート、イソバレリルグリシン、イソバレリルカルニチン(C5)、3-メチルクロトニルグリシン、β-ヒドロキシイソバレラート、β-ヒドロキシイソバレロイルカルニチン、3-メチルグルタリルカルニチン(C6)、α-ヒドロキシイソバレラート、イソロイシン、アロ-イソロイシン、3-メチル-2-オキソバレラート、2-メチルブチリルカルニチン(C5)、チグリルカルニチン、チグロイルグリシン、2-ヒドロキシ-3-メチルバレラート、3-ヒドロキシ-2-エチルプロピオナート、バリン、3-メチル-2-オキソブチラート、イソブチリルカルニチン、3-ヒドロキシイソブチラート、α-ヒドロキシイソカプロアート、ホモシステイン、シスタチオニン、アルギニン、尿素、オルニチン、プロリン、シトルリン、アルギニノスクシナート、ホモアルギニン、ホモシトルリン、N-アセチルアルギニン、N-δ-アセチルオルニチン、trans-4-ヒドロキシプロリン、pro-ヒドロキシ-pro、クレアチン、クレアチニン、4-グアニジノブタノアート、グアニジノスクシナート、γ-グルタミルフェニルアラニン、γ-グルタミルチロシン、アラニルアラニン、アルギニルプロリンアスパルチルフェニルアラニン、グリシルフェニルアラニン、ヒスチジルフェニルアラニン、イソロイシルアスパルタート、ロイシルフェニルアラニン、フェニルアラニルアラニン、フェニルアラニルアルギニン、フェニルアラニルアスパルタート、フェニルアラニルグルタマート、フェニルアラニルグリシン、フェニルアラニルイソロイシン、フェニルアラニルロイシンフェニルアラニルフェニルアラニン、フェニルアラニルセリン、ピログルタミルバリン、スレオニルフェニルアラニン、トリプトフィルフェニルアラニン、バリルフェニルアラニン、フルクトース、ソルボース、スクシニルカルニチン、スクシナート、2-メチルシトラート、バレラート、ステアリドナート(18:4n3)、アジパート、ドデカンジオアート(C12)、テトラデカンジオアート(C14)、ヘキサデカンジオアート(C16)、オクタデカンジオアート(C18)、2-アミノヘプタノアート、2-リノレノイルグリセロホスホコリン(18:3n3)、2-メチルマロニルカルニチン、ブチリルカルニチン、プロピオニルカルニチン(C3)、プロピオニルグリシン(C3)、メチルマロニルCoA、メチルマロン酸、アセチルカルニチン、ヒドロキシブチリルカルニチン、バレリルカルニチン、ヘキサノイルカルニチン、ミリストイルカルニチン、パルミトイルカルニチン(C16)、ヘキセンジオイルカルニチン、3-ヒドロキシプロパノアート、1-ミリストイルグリセロホスホコリン(14:0)、2-ミリストイルグリセロホスホコリン、1-ペンタデカノイルグリセロ���スホコリン(15:0)、1-リノレノイルグリセロホスホコリン(18:3n3)、1-ステアロイルグリセロホスホエタノールアミン、1,3-ジパルミトイルグリセロール、二硫酸5α-アンドロスタン-3α,17β-ジオール、オロタート、ウリジン、ウラシル、3-ウレイドプロピオナート、ヒプラート、カテコールスルファート、フェニルカルニチン、プロピオナート、5-ヒドロキシトリプトファン、5-メチルチオアデノシン(MTA)、β-アラニン、ジメチルアルギニン(SDMA+ADMA)、グルタミン、N-アセチルアスパルタート(NAA)、N-アセチル-β-アラニン、トリプトファン、チロシン、2-ピロリドン、γ-グルタミルロイシン、O-スルホ-L-チロシン、パルミトイル-スフィンゴミエリン、γ-グルタミルイソロイシン、システインs-スルファート、2-アミノアジパート、フェニルアセチルグルタミン、3,4-ジヒドロキシフェニルアセタート、フェニルプロピオニルグリシン、2-ペンタンアミド-3-フェニルプロパン酸、2-ヒドロキシフェニルアセタート、N-アセチルロイシン、メチルスクシナート、エチルマロナート、グアニジノアセタート、β-ヒドロキシブチラート、N-カルバモイルアスパルタート、4-ウレイドブチラート、ヒプラート、2-メチルヒプラート、ベンゾアート、メチル-4-ヒドロキシベンゾアート、4-フェニルブチラート、およびその組み合わせからなる群より選択される1種類または複数種の代謝産物を含む、本発明1049の方法。
[本発明1085]
特定された障害が脂肪酸酸化障害であり、異常なレベルを有する低分子の特定されたサブセットが、キシルロース、カプロアート(6:0)、ヘプタノアート(7:0)、カプリラート(C8)、ペラルゴナート(9:0)、カプラート(C10)、ミリストレアート(14:1n5)、エイコサペンタン酸(EPA)、ドコサヘキサエノアート(DHA;22:6n3)、アラキドナート(20:4n6)、スベラート(オクタンジオアート)、セバカート(C8)、ドデカンジオアート(C12)、ヘキサノイルグリシン(C6)、N-オクタノイルグリシン、ヘキサノイルカルニチン、オクタノイルカルニチン、デカノイルカルニチン、cis-4-デセノイルカルニチン、ミリストイルカルニチン、パルミトイルカルニチン(C16)、ステアロイルカルニチン(C18)、オレオイルカルニチン(C18)、デオキシカルニチン、カルニチン、3-ヒドロキシデカノアート、5-ヒドロキシヘキサノアート、N-パルミトイルタウリン、1-マルガロイルグリセロホスホコリン(17:0)、1-ステアロイルグリセロホスホコリン(18:0)、1-ドコサペンタエノイルグリセロホスホコリン(22:5n3)、9-メチル尿酸、α-CEHC(2,5,7,8-テトラメチル-2-(2'-カルボキシエチル)-6-ヒドロキシクロマン)スルファート、O-メチルカテコールスルファート、5,8-テトラデカジエン酸、メチルヘキサノイルグルタミン、7-デヒドロコレステロール、コレスタノール、N6-トリメチルリジン、ブチリルグリシン、1-ドコサヘキサエノイル-GPC(22:6DHA-GPC)、2-ヒドロキシグルタラート、3-メチルアジパート、4-オクテンジオアート、ヘプタノイルグリシン、およびその組み合わせからなる群より選択される1種類または複数種の代謝産物を含む、本発明1049の方法。
[本発明1086]
特定された障害がアセトアミノフェン誘導毒性であり、異常なレベルを有する低分子の特定されたサブセットが、2-ヒドロキシアセトアミノフェンスルファート、2-メトキシアセトアミノフェンスルファート、3-(システイン-S-イル)アセトアミノフェン、4-アセトアミノフェンスルファート、4-アセトアミドフェノール、p-アセトアミドフェニルグルクロニス、グリコヒオコラート、クリコケノデオキシコラート、タウロコラート、タウロケノデオキシコラート、グルタチオン、およびその組み合わせからなる群より選択される1種類または複数種の代謝産物を含む、本発明1049の方法。
[本発明1087]
特定された障害が糖尿病であり、異常なレベルを有する低分子の特定されたサブセットが、1,5-アンヒドログルシトール(1,5-AG)、2-ヒドロキシブチラート(AHB)、3-ヒドロキシブチラート、グルコース、グリシン、イソロイシン、ロイシン、バリン、およびその組み合わせからなる群より選択される1種類または複数種の代謝産物を含む、本発明1049の方法。
[本発明1088]
特定された障害が肝機能不全であり、異常なレベルを有する低分子の特定されたサブセットが、グリココラート、グリコケノデオキシコラート、タウロコラート、タウロケノデオキシコラート、およびその組み合わせからなる群より選択される1種類または複数種の代謝産物を含む、本発明1049の方法。
[本発明1089]
特定された障害がサルコシン血症であり、異常なレベルを有する低分子の特定されたサブセットが、ジメチルグリシン、ベタイン、コリン、グリシン、サルコシン、およびその組み合わせからなる群より選択される1種類または複数種の代謝産物を含む、本発明1049の方法。
[本発明1090]
特定された障害がクエン酸輸送体欠損症であり、異常なレベルを有する低分子の特定されたサブセットが、α-ケトグルタラート、スクシナート、フマラート、マラート、グルタマート、シトラート、およびその組み合わせからなる群より選択される1種類または複数種の代謝産物を含む、本発明1049の方法。
[本発明1091]
特定された障害が高オルニチン・ホモシトルリン・高アンモニア血症であり、異常なレベルを有する低分子の特定されたサブセットが、ウラシル、3-ウレイドプロピオナート、オロタート、グルタミン、N-アセチル-β-アラニン、ウリジン、N-アセチルアスパルタート(NAA)、ジメチルアルギニン(SDMA+ADMA)、5-メチルチオアデノシン(MTA)、β-アラニン、4-ウレイドブチラート、ホモシトルリン、オルニチン、およびその組み合わせからなる群より選択される1種類または複数種の代謝産物を含む、本発明1049の方法。
[本発明1092]
特定された障害が芳香族アミノ酸デカルボキシラーゼ欠損症であり、異常なレベルを有する低分子の特定されたサブセットが、チロシン、フェニルアラニン、トリプトファン、3-メトキシチロシン、5-ヒドロキシトリプトファン、L-ドーパ、ホモバニラート、5-ヒドロキシインドールアセタート、バニル乳酸、およびその組み合わせからなる群より選択される1種類または複数種の代謝産物を含む、本発明1049の方法。
[本発明1093]
特定された障害がスミス・レムリ・オピッツ症候群であり、異常なレベルを有する低分子の特定されたサブセットが、コレスタノール、7-デヒドロコレステロール、およびその組み合わせからなる群より選択される1種類または複数種の代謝産物を含む、本発明1049の方法。
[本発明1094]
特定された障害が原発性カルニチン欠損症であり、異常なレベルを有する低分子の特定されたサブセットが、N6-トリメチルリジン、カルニチン、およびその組み合わせからなる群より選択される1種類または複数種の代謝産物を含む、本発明1049の方法。
[本発明1095]
特定された障害がシトリン欠損症であり、異常なレベルを有する低分子の特定されたサブセットが、オロタート、シトルリン、およびその組み合わせからなる群より選択される1種類または複数種の代謝産物を含む、本発明1049の方法。
[本発明1096]
特定された障害がABAT欠損症であり、異常なレベルを有する低分子の特定されたサブセットが、2-ピロリドン、GABA、およびその組み合わせからなる群より選択される1種類または複数種の代謝産物を含む、本発明1049の方法。
[本発明1097]
特定された障害がGLUT1欠損症であり、異常なレベルを有する低分子の特定されたサブセットが、フルクトース、マンノース、プロリルヒドロキシプロリン、ヒドロキシプロリン、グリシルプロリン、N-アセチルノイラミナート、ジメチルアルギニン(ADMA+SDMA)、グルタミン、γ-グルタミルグルタミン、N-アセチル-アスパルチル-グルタマート(NAAG)、N-アセチルグルタミン、エチルマロナート、クレアチン、グルコース、およびその組み合わせからなる群より選択される1種類または複数種の代謝産物を含む、本発明1049の方法。
[本発明1098]
特定された障害がMGAであり、異常なレベルを有する低分子の特定されたサブセットが、3-メチルグルタリルカルニチン、3-メチルグルタコン酸、3-メチルグルタル酸、およびその組み合わせからなる群より選択される1種類または複数種の代謝産物を含む、本発明1049の方法。
[本発明1099]
特定された障害がSCAD欠損症であり、異常なレベルを有する低分子の特定されたサブセットが、ブチリルグリシン、エチルマロナート、ブチリルカルニチン、メチルスクシナート、およびその組み合わせからなる群より選択される1種類または複数種の代謝産物を含む、本発明1049の方法。
[本発明1100]
特定された障害がウロカナーゼ欠損症であり、異常なレベルを有する低分子の特定されたサブセットが、cis-ウロカナート、trans-ウロカナート、イミダゾールプロピオナート、およびその組み合わせからなる群より選択される1種類または複数種の代謝産物を含む、本発明1049の方法。
[本発明1101]
特定された障害が3-ヒドロキシイソブチリル-CoA加水分解酵素欠損症であり、異常なレベルを有する低分子の特定されたサブセットが、3-ヒドロキシイソブチラート、イソブチリルグリシン、およびその組み合わせからなる群より選択される1種類または複数種の代謝産物を含む、本発明1049の方法。
[本発明1102]
特定された障害が高シュウ酸尿症であり、異常なレベルを有する低分子の特定されたサブセットが、オキサラート、グリコラート、およびその組み合わせからなる群より選択される1種類または複数種の代謝産物を含む、本発明1049の方法。
[本発明1103]
特定された障害がBBOX欠損症であり、異常なレベルを有する低分子の特定されたサブセットが、ヘキサデカンジオアート(C16)、ドコサジオアート、エイコサノジオアート、オクタデカンジオアート(C18)、ドデカンジオアート(C12)、2-アミノオクタノアート、2-アミノヘプタノアート、α-ヒドロキシイソカプロアート、イソバレラート(C5)、デカノイルカルニチン(C10)、cis-4-デセノイルカルニチン、パルミトイルカルニチン(C16)、オレオイルカルニチン(C18)、ラウリルカルニチン(C12)、ミリストレオイルカルニチン、ミリストイルカルニチン、グリセロール、3-ヒドロキシミリスタート、2-ヒドロキシデカノアート、3-ヒドロキシラウラート、3-ヒドロキシセバカート、3-ヒドロキシオクタノアート、3-ヒドロキシデカノアート、ペラルゴナート(9:0)、カプロアート(6:0)、およびその組み合わせからなる群より選択される1種類または複数種の代謝産物を含む、本発明1049の方法。
[本発明1104]
複数の疾患または障害について疾患または障害を発症するリスクが高いかどうか個々の対象をスクリーニングするための方法であって、以下の工程:
個々の対象から試料を入手する工程;
試料中にある複数種の低分子それぞれの存在または非存在およびレベルに関する情報を含む試料の低分子プロファイルを作成する工程;
複数種の低分子のいずれかが試料中で異常なレベルを有するかどうか確かめるために、該試料の低分子プロファイルと、複数種の低分子それぞれのレベルの標準範囲を含む参照低分子プロファイルとを比較する工程であって、該試料中にある低分子の異常なレベルが、該低分子の標準範囲外にあるレベルである、工程;
試料中にある複数種の低分子のいずれかの異常なレベルを有する低分子プロファイルについて、それぞれの低分子が試料中で異常なレベルを有する、低分子のサブセットを特定する工程；
ここで、該比較および特定が、計算装置のプロセッサ上で動作する分析機能を用いて行われ;
試料中にある複数種の低分子のいずれかの異常なレベルを有する低分子プロファイルについて、該低分子の特定されたサブセットの異常なレベルに基づいてデータベースから診断情報を得る工程であって、データベースが、複数の疾患および障害それぞれについて、複数種の低分子のうちの1種類または複数種の低分子の異常なレベルを、疾患または障害に関する情報と関連付ける情報を含む、工程;
試料中にある複数種の低分子のいずれかの異常なレベルを有する低分子プロファイルについて、得られた診断情報を記憶する工程であって、記憶された診断情報が、異常なレベルを有する低分子の特定されたサブセットと関連付けられた疾患または障害を発症するリスクが高いことの特定を含む、工程;ならびに
試料中にある複数種の低分子のいずれの異常なレベルも有さない低分子プロファイルについて、異常なレベルが検出されなかったことを示す情報を記憶する工程
を含み、
それによって、複数の疾患および障害について疾患または障害を発症するリスクが高いかどうか個々の対象をスクリーニングする、方法。
[本発明1105]
複数の疾患または障害がアセトアミノフェン過剰投与および糖尿病を含む、本発明1104の方法。
[本発明1106]
複数の疾患または障害がアセトアミノフェン過剰投与を含み、2-ヒドロキシアセトアミノフェンスルファート、2-メトイアセトアミノフェンスルファート、2-(システイン-S-イル)アセトアミノフェン、4-アセトアミノフェンスルファート、4-アセトアミドールフェノール、p-アセトアミドフェニルグルクロニド、およびその組み合わせからなる群より選択される1種類または複数種の低分子の異常なレベル、ならびにグリコヒオコラート、グリコケノデオキシコラート、タウロコラート、タウオルケノデオキシコラート、およびその組み合わせからなる群より選択される1種類または複数種の低分子の異常なレベルが、アセトアミノフェン過剰投与のリスクが高いことを示す、本発明1104の方法。
[本発明1107]
複数の疾患または障害が糖尿病を含み、2-ヒドロキシブチラート、3-ヒドロキシブチラート、1,5-アンヒドログルシトール、グリシン、イソロイシン、ロイシン、バリン、およびその組み合わせからなる群より選択される1種類または複数種の低分子の異常なレベルが、糖尿病を発症するリスクが高いことを示す、本発明1104の方法。
[本発明1108]
複数の疾患または障害が肝臓疾患を含み、グリココラート、グリコケノデオキシコラート、タウロコラート、タウロケノデオキシコラート、およびその組み合わせからなる群より選択される1種類または複数種の低分子の異常なレベルが、肝機能が損なわれていること、および肝臓疾患を発症するリスクが高いことを示す、本発明1104の方法。
[本発明1109]
複数の疾患または障害が代謝疾患を含み、1,5-アンドログルシトール(1,5AG)、1-リノレオイルグリセロホスホコリン(18:2n6、LGCP)、2-ヒドロキシブチラート(AHB)、3-ヒドロキシブチラート(BHBA)、3-ヒドロキシイソブチラート、3-メチル-2-オキソブチラート、3-メチル-2-オキソバレラート、4-メチル-2-オキソペンタノアート、アラニン、フルクトース、グルコース、グルタマート、グリシン、イソレロイシン、ロイシン、マンノース、オレアート(18:1n9)、パルムリトイルカルニチン、フェニルアラニン、セリン、チロシン、バリン、およびその組み合わせからなる群より選択される1種類または複数種の低分子の異常なレベルが、代謝疾患のリスクを示す、本発明1104の方法。
[本発明1110]
複数の疾患または障害が心血管機能不全を含み、アデノシン、アゼラート、コルセトロール、クレアチニン、ドデカンジオアート、ヘキサデカンジオアート、ヒスチジン、オクタデカンジオアート、フェニルアラニン、セバカート、テトラデカンジオアート、ウラート、およびその組み合わせからなる群より選択される1種類または複数種の低分子の異常なレベルが、心血管機能不全のリスクを示す、本発明1104の方法。
[本発明1111]
複数の疾患または障害が腎機能不全を含み、3-インドキシルスルファート、3-メチルヒチジン、4-アセトアミドブタノアート、アラビトール、C-グリコシルトリプトファン、クレアチニン、エルトリトール、インドールアセタート、キヌレニン、ラソステロール、ミオイノシトール、N2,N2-ジメチルグアノシン、N-アセチルアラニン、N-アセチルセリン、N-アセチルスレオニン、N-ホルミルメチオニン、フィルアセチルグルタミン、プソイドウリジン、スクシニルカルニチン、trans-4-ヒドロキシプロリン、トリプトファン、尿素、およびその組み合わせからなる群より選択される1種類または複数種の低分子の異常なレベルが、腎機能不全のリスクを示す、本発明1104の方法。
[本発明1112]
複数の疾患または障害が肺機能不全を含み、ルボキシ-4-メチル-5-プロピル-2-フラノプロパノアート、3-フィルプロピオナート(ヒドロシンナマート)、α-トコフェロール、アスパラギン、ベンゾアート、ビリルビン(Z,Z)、ブチリルカルニチン、γ-グルタミルバリン、グリセラート、グリシン、インドエプロピオナート、N-アセチルグリシン、プロリン、プソイドウリジン、ピリドキサート、セリン、スクシニルカルニチン、トレオナート、およびその組み合わせからなる群より選択される1種類または複数種の低分子の異常なレベルが、肺機能不全のリスクを示す、本発明1104の方法。
[本発明1113]
複数の疾患または障害が炎症を含み、13-HODE+9-HODE、アラキドナート(20:4n6)、コルチゾール、ドコサヘキサエノアート(DHA、22:6n3)、エイコサペンタエノアート(EPA、20:5n3)、キヌレナート、キヌレニン、キノリナート、およびその組み合わせからなる群より選択される1種類または複数種の低分子の異常なレベルが、炎症を示す、本発明1104の方法。
[本発明1114]
複数の疾患または障害がホルモンアンバランスを含み、硫酸プレグネノロン、一硫酸21-ヒドロキシプレグネノロン、二硫酸21-ヒドロキシプレグネノロン、5-プレグネン-3b,17-ジオール-20-オン3-スルファート、一硫酸5α-プレグナン-3β,20α-ジオール、二硫酸5α-プレグナン-3β,20α-ジオール、プレグナンジオール-3-グルクロニド、コルチゾール、コルチコステロン、11-デヒドロコルチコステロン、コルチゾン、硫酸デヒドロイソアンドロステロン(DHEA-S)、16a-ヒドロキシDHEA 3-スルファート、硫酸エピアンドロステロン、硫酸アンドロステロン、一硫酸5α-アンドロスタン-3α,17α-ジオール、二硫酸5α-アンドロスタン-3α,17α-ジオール、エチオコラノロングルクロニド、11-ケトエチオコラノロングルクロニド、一硫酸4-アンドロステン-3β,17β-ジオール、二硫酸4-アンドロステン-3β,17β-ジオール、硫酸テストステロン、一硫酸5α-アンドロスタン-3α,17β-ジオール、二硫酸5α-アンドロスタン-3α,17β-ジオール、一硫酸5α-アンドロスタン-3β,17β-ジオール、二硫酸5α-アンドロスタン-3β,17β-ジオール、エストロン3-スルファート、チロキシン、およびその組み合わせからなる群より選択される1種類または複数種の低分子の異常なレベルが、ホルモンアンバランスのリスクを示す、本発明1104の方法。
[本発明1115]
複数の疾患または障害が酸化ストレスを含み、13-HODE+9-HODE、5-オキソプロリン、アラントイン、α-トコフェロール、アンセリン、ビリルビン(Z,Z)、ビリベルジン、cys-gly,酸化型、システイン-グルタチオンジスルフィド、システイン、γ-トコフェロール、ヒポキサンチン、メチオニンスルホン、メチオニンスルホキシド、トレオナート、ウラート、およびその組み合わせからなる群より選択される1種類または複数種の低分子の異常なレベルが、酸化ストレスのリスクを示す、本発明1104の方法。
[本発明1116]
複数の疾患または障害がミトコンドリア機能不全を含み、ホモシトルリン、ロイシン、4-メチル-2-オキソペンタノアート、イソバレラート、イソバレリルグリシン、イソバレリルカルニチン、β-ヒドロキシイソバレラート、β-ヒドロキシイソバレロイルカルニチン、α-ヒドロキシイソバレロイルカルニチン、3-メチルグルタコナート、α-ヒドロキシイソバレラート、メチルスクシナート、イソロイシン、3-メチル-2-オキソバレラート、2-メチルブチリルカルニチン(C5)、チグリルカルニチン、チグロイルグリシン、2-ヒドロキシ-3-メチルバレラート、3-ヒドロキシ-2-エチルプロピオナート、エチルマロナート、バリン、3-メチル-2-オキソブチラート、イソブチリルカルニチン、イソブチリルグリシン、3-ヒドロキシイソブチラート、α-ヒドロキシイソカプロアート、アゼラート(ノナンジオアート)、セバカート(デカンジオアート)、ドデカンジオアート、テトラデカンジオアート、ヘキサデカンジオアート、オクタデカンジオアート、ホルミルメチオニン、アラニン、ラクタート、シトラート、α-ケトグルタラート、スクシニルカルニチン、スクシナート、フマラート、マラート、パルミトイルカルニチン、ステアロイルカルニチン、オレオイルカルニチン、BHBA、およびその組み合わせからなる群より選択される1種類または複数種の低分子の異常なレベルが、ミトコンドリア機能不全のリスクを示す、本発明1104の方法。
[本発明1117]
複数の疾患または障害がストレス反応を含み、コルチゾール、コルチゾン、グルコース、チロキシン、およびその組み合わせからなる群より選択される1種類または複数種の低分子の異常なレベルが、ストレス増加を示す、本発明1104の方法。
[本発明1118]
複数の疾患または障害が代謝老化を含み、ルボキシ-4-メチル-5-プロピル-2-フラノプロアノアート、C-グリコシルトリプトファン、シトラート、シトルリン、クレアチニン、硫酸デヒドロイソアンドロステロン(DHEA-S)、エイコサペンタエノアート(EPA、20:5n3)、エリスリトール、グルコース、グルタマート、グリシン、ロイシン、ミオイノシトール、パルミトレオイルスフィンゴミエリン、p-クレゾールスルファート、フェニルアセチルグタミン、プソイドウリジン、およびその組み合わせからなる群より選択される1種類または複数種の低分子の異常なレベルが、代謝老化増加のリスクを示す、本発明1104の方法。
[本発明1119]
複数の疾患または障害がマイクロバイオームアンバランスを含み、3-(3-ヒドロキシフェニル)プロピオナート、3-(4-ヒドロキシフェニル)ラクタート、3-(4-ヒドロキシフェニル)プロピオナート、3-(3-(スルホオキシ)フェニル)プロパン酸、3-ヒドロキシヒプラート、3-インドキシルスルファート、3-フェニルプロピオナート(ヒドロシンナマート)、4-エチルフェニルスルファート、4-ヒドロキシヒプラート、4-ヒドロキシフェニルピルバート、4-ビニルフェノールスルファート、5-ヒドロキシインドールアセタート、ケノデオキシコラート、コラート、デオキシコラート、グリココレナートスルファート、グルコデオキシコラート、グリコホコラート、グリコリトコラート、グリコリトコラートスルファート、グリコウルソデオキシコラート、ヒプラート、ヒオデオキシコラート、インドールアセタート、インドールアセチルグルタミン、インドールブチラート、インドールラクト、インドールプロイオナート、p-クレオソールスルファート、o-クレオソールスルファート、p-クレゾール-グルクロニド、フェノールスルファート、フェニルアセタート、フェニルアセチルグタミン、フェニルラクタート(PLA)、タウロコレナートスルファート、タウロデオキシコラート、タウロリトコラート3-スルファート、タウロウルソデオキシコラート、ウルソデオキシコラート、およびその組み合わせからなる群より選択される1種類または複数種の低分子の異常なレベルが、マイクロバイオームアンバランスのリスクを示す、本発明1104の方法。
[本発明1120]
複数の疾患または障害が多量栄養素アンバランスを含み、ヒスチジン、イソロイシン、ロイシン、バリン、リジン、メチオニン、フェニルアラミン、トリプトファン、スレオニン、アラニン、アルギニン、アスパルタート、システイン、グルタマート、グルタミン、グリシン、プロリン、セリン、チロシン、アスパラギン、コリン、リノレナート[αまたはγ;(18:3n3または6)]、リノレアート(18:2n6)、およびその組み合わせからなる群より選択される1種類または複数種の低分子の異常なレベルが、多量栄養素アンバランスのリスクを示す、本発明1104の方法。
[本発明1121]
複数の疾患または障害が大気汚染曝露を含み、α-トコフェロール、アスパラギン、ベンゾアート、グリセラート、グリシン、N-アセチルグリシン、セリン、トレオナート、およびその組み合わせからなる群より選択される1種類または複数種の低分子の異常なレベルが、大気汚染への曝露を示す、本発明1104の方法。
【手続補正３】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０４２０
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０４２０】
G.肺機能
肺機能を示す代謝産物を、対象に由来する生物学的試料(血漿、尿)中で測定した。測定した代謝産物は、カルボキシ-4-メチル-5-プロピル-2-フラノプロパノアート、3-フィルプロピオナート(phylpropionate)(ヒドロシンナマート)、α-トコフェロール、アスパラギン、ベンゾアート、ビリルビン(Z,Z)、ブチリルカルニチン、γ-グルタミルバリン、グリセラート、グリシン、インドエプロピオナート(indoepropionate)、N-アセチルグリシン、プロリン、プソイドウリジン、ピリドキサート、セリン、スクシニルカルニチン、およびトレオナートであった。分析測定値を用いて肺機能スコア(スケール0〜100)を作成した。このような分析の結果を報告書にまとめた。報告書の例を図23に図示した。
【手続補正４】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０４２６
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０４２６】
M.代謝老化
代謝老化を示す代謝産物を、対象に由来する生物学的試料(血漿、尿)中で測定した。測定した代謝産物は、カルボキシ-4-メチル-5-プロピル-2-フラノプロパノアート、C-グリコシルトリプトファン、シトラート、シトルリン、クレアチニン、硫酸デヒドロイソアンドロステロン(DHEA-S)、エイコサペナエノアート(eicosapenaenoate)(EPA、20:5n3)、エリスリトール、グルコース、グルタマート、グリシン、ロイシン、ミオイノシトール、パルミトレオイルスフィンゴミエリン、p-クレゾールスルファート、フェニルアセチルグルタミン、およびプソイドウリジンであった。分析測定値を用いて代謝年齢スコア(スケール0〜100)を作成した。この値は対象の代謝年齢を示し、暦年齢に関係して全体的な代謝の健康状態を示す。このような分析の結果を報告書にまとめた。報告書の例を図23に図示した。