【手続補正書】
【提出日】平成30年6月18日(2018.6.18)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
生体試料内の染色体領域および／またはＤＮＡ領域の検出によるインサイチュハイブリダイゼーションによる相互に異なる少なくとも２つの染色体異常の検出方法であって、
前記インサイチュハイブリダイゼーションを間期インサイチュハイブリダイゼーションとして実施すること
それぞれ第１検出標識で標識された相互に異なる少なくとも３本の座位特異的ハイブリダイゼーションプローブを用いて前記インサイチュハイブリダイゼーションを実施し、特に、少なくとも１点の混合シグナルを生成するために前記座位特異的ハイブリダイゼーションプローブのうちの少なくとも１つを、前記各座位特異的ハイブリダイゼーションプローブに関して前記第１検出標識とは異なる少なくとも１種の追加検出標識で標識し、それによりシグナルパターンを生じさせること、および
前記シグナルパターンを用いて存在する染色体異常を特定すること、および／または存在する染色体異常を染色体領域および／またはＤＮＡ領域に割り当てること、
前記ハイブリダイゼーションプローブが前記検出標識で直接標識されていること
を特徴とする前記方法。
【請求項２】
前記染色体異常が相互無関係の染色体異常であり、且つ／または前記染色体異常が相互的染色体異常ではない、請求項１に記載の方法。
【請求項３】
少なくとも１種の追加検出標識を用いて追加の座位特異的ハイブリダイゼーションプローブの標識を行い、追加の検出標識で標識された前記座位特異的ハイブリダイゼーションプローブがシグナルパターンとして相互に異なる混合シグナルをそれぞれ生成し、且つ／または少なくとも１種の追加検出標識を用いて追加の座位特異的ハイブリダイゼーションプローブの標識を行い、少なくとも１種の追加検出標識で標識されている各座位特異的ハイブリダイゼーションプローブによって染色体領域および／またはＤＮＡ領域に特異的な混合シグナルがシグナルパターンとして生成され、且つ／または
少なくとも２本の追加の座位特異的ハイブリダイゼーションプローブを前記第１検出標識とは異なる少なくとも１種の追加検出標識で標識し、且つ／または染色体領域および／またはＤＮＡ領域に特異的な混合シグナルが少なくとも２本の追加の座位特異的ハイブリダイゼーションプローブによってシグナルパターンとして生成される
請求項１または請求項２に記載の方法。
【請求項４】
それぞれ２本の座位特異的ハイブリダイゼーションプローブが染色体部分に隣接し、染色体部分に隣接するそれぞれ２本の前記座位特異的ハイブリダイゼーションプローブを相互に異なる検出標識で標識し、それによりそれぞれ染色体部分、特に切断点領域に隣接する前記座位特異的ハイブリダイゼーションプローブが、シグナルパターンとして融合シグナルを生成する請求項１から請求項３のいずれか１項に記載の方法。
【請求項５】
一つの染色体部分毎にそれぞれ２本の座位特異的ハイブリダイゼーションプローブが隣接する少なくとも６本の異なる座位特異的ハイブリダイゼーションプローブを使用し、且つ
各隣接染色体部分、ならびに／または検出される各染色体領域および／もしくはＤＮＡ領域が、シグナルパターンとして融合および混合シグナルによって特定および／または割り当てられ得るように第１検出標識とは異なる少なくとも１種の追加検出標識で追加の座位特異的ハイブリダイゼーションプローブの標識を行う、
請求項４に記載の方法。
【請求項６】
（ａ）検出標識Ａで標識された第１座位特異的ハイブリダイゼーションプローブおよび検出標識Ｂで標識された第２座位特異的ハイブリダイゼーションプローブが染色体部分に隣接し、且つ、インサイチュハイブリダイゼーションによって生成される前記シグナルパターンにおいて融合シグナルＡ−Ｂを生成し、
（ｂ）２〜１２本の追加の座位特異的ハイブリダイゼーションプローブがさらに６か所の染色体部分に隣接し、同様に、一つの染色体部分に隣接する２本の座位特異的ハイブリダイゼーションプローブの１つずつを検出標識Ａで標識し、且つ、一つの染色体部分に隣接する２本の座位特異的ハイブリダイゼーションプローブの１つずつを検出標識Ｂで標識し、それにより染色体部分にそれぞれ隣接する前記座位特異的ハイブリダイゼーションプローブがインサイチュハイブリダイゼーションによって生成される前記シグナルパターンにおいて融合シグナルＡ−Ｂを生成し、且つ、
（ｃ）前記座位特異的ハイブリダイゼーションプローブのうちの少なくとも１つのプローブを少なくとも１種の追加検出標識Ｘで標識し、それにより少なくとも１種の追加検出標識で標識された前記座位特異的ハイブリダイゼーションプローブがインサイチュハイブリダイゼーションによって生成される前記シグナルパターンにおいて融合および混合シグナルＡ−Ｂ／Ｘを生成し、
染色体異常の場合での前記融合および混合シグナルＡ−Ｂ／Ｘは、インサイチュハイブリダイゼーションによって生成される前記シグナルパターンにおいて混合シグナルＡ／Ｘおよび／または混合シグナルＢ／Ｘに変化し、且つ／または
染色体異常の場合での前記融合シグナルＡ−Ｂは、インサイチュハイブリダイゼーションによって生成される前記シグナルパターンにおいて単独のシグナルＡおよび／またはシグナルＢに変化し、
それにより、前記インサイチュハイブリダイゼーションによって生成された前記シグナルパターンを用いて染色体異常を２本の座位特異的ハイブリダイゼーションプローブが隣接する染色体領域および／またはＤＮＡ領域および／または染色体部分に割り当て、
第１ステップにおいて、前記第１検出標識によって生成された前記融合シグナルが検出および／または分析され、そして後続のステップにおいて単独のシグナルが生じる場合は前記混合シグナルの検出および／または分析と検出された染色体領域および／またはＤＮＡ領域への前記混合シグナルの割り当てを行い、且つ／またはコンピューター支援分析により前記シグナルパターンの検出を行う、
請求項４または請求項５に記載の方法。
【請求項７】
前記座位特異的ハイブリダイゼーションプローブが、検出予定の前記染色体領域および／またはＤＮＡ領域をそれぞれ包含する複数の核酸断片（「プローブ断片」）によってそれぞれ形成される、請求項１から請求項６のいずれか１項に記載の方法。
【請求項８】
（ｉ）ハイブリダイゼーション特異的プローブの個々の核酸断片がたった１種の検出標識で標識され、且つ、
（ｉｉ）ハイブリダイゼーション特異的プローブの個々の核酸断片が相互に異なる複数の検出標識で標識され、
前記可能性（ｉ）と（ｉｉ）の組合せによっても混合シグナルが生じる、
請求項１から請求項７のいずれか１項に記載の方法。
【請求項９】
前記インサイチュハイブリダイゼーションが前記ハイブリダイゼーションプローブの直接標識によって行われ、且つ前記インサイチュハイブリダイゼーションが、蛍光色素の標識によって行われる、
請求項１から請求項８のいずれか１項に記載の方法。
【請求項１０】
インサイチュハイブリダイゼーションにより、相互に異なる少なくとも２つの染色体異常を検出するための組成物であって、それぞれ第１検出標識で標識された相互に異なる少なくとも３本の座位特異的ハイブリダイゼーションプローブを含み、且つ、前記の各座位特異的ハイブリダイゼーションプローブに関して、前記座位特異的ハイブリダイゼーションプローブのうちの少なくとも１本のプローブが前記第１検出標識とは異なる少なくとも１種の追加検出標識で標識されており、
前記ハイブリダイゼーションプローブが前記検出標識で直接標識されている前記組成物。
【請求項１１】
染色体異常と関連する疾患であって、悪性腫瘍、好ましくは癌腫、肉腫、および／または白血病から選択される疾患の診断および／または予後判定に使用される組成物であって、
それぞれ第１検出標識で標識された相互に異なる少なくとも３本の座位特異的ハイブリダイゼーションプローブを含み、且つ、前記の各座位特異的ハイブリダイゼーションプローブに関して、前記座位特異的ハイブリダイゼーションプローブのうちの少なくとも１本のプローブが前記第１検出標識とは異なる少なくとも１種の追加検出標識で標識されており、
前記ハイブリダイゼーションプローブが前記検出標識で直接標識されている前記組成物。
【請求項１２】
インサイチュハイブリダイゼーションにより、特に請求項１から請求項９のいずれか１項に記載の方法により染色体異常を検出するための請求項１０に記載の組成物の使用。
【請求項１３】
それぞれ第１検出標識で標識された相互に異なる少なくとも３本の座位特異的ハイブリダイゼーションプローブであって、前記の各座位特異的ハイブリダイゼーションプローブに関して、前記座位特異的ハイブリダイゼーションプローブのうちの少なくとも１本のプローブが前記第１検出標識とは異なる少なくとも１種の追加検出標識で標識されている前記座位特異的ハイブリダイゼーションプローブの、染色体異常と関連する疾患、特に悪性腫瘍、好ましくは癌腫、肉腫、および／または白血病、特に好ましくは肺腫瘍、リンパ腫、白血病、肉腫、乳癌、および／または結腸癌の診断および／または予後判定のための好ましくは請求項１から請求項９のいずれか１項に記載の方法の範囲内での使用。
【請求項１４】
インサイチュハイブリダイゼーションにより相互に異なる少なくとも２つの染色体異常を検出するためのキットであって、それぞれ第１検出標識で標識された相互に異なる少なくとも３本の座位特異的ハイブリダイゼーションプローブを含み、前記の各ハイブリダイゼーションプローブに関して、前記座位特異的ハイブリダイゼーションプローブのうちの少なくとも１本のプローブが前記第１検出標識とは異なる少なくとも１種の追加検出標識で標識されており、
前記ハイブリダイゼーションプローブが前記検出標識で直接標識されている前記キット。
【請求項１５】
相互に異なる少なくとも３本の前記座位特異的ハイブリダイゼーションプローブが共通の組成物内に存在する、請求項１４に記載のキット。