【誤訳訂正書】
【提出日】平成30年4月26日(2018.4.26)
【誤訳訂正１】
【訂正対象書類名】明細書
【訂正対象項目名】０００６
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【０００６】
概要
一実施形態において、１又は２以上の可動式フローセルを有する核酸配列決定を行う装置を操作するための方法が提供される。該方法は、入口ポート及び出口ポートを備えた流路を有するフローセル提供すること、及び、第一液体試薬で該入口ポートから該出口ポートまでの流路を満たすこと、を含む。該方法は、入口通路及び出口通路を備えたステーションブロックを提供すること、並びに、入口通路と流体連通している入口ポートと出口通路と流体連通している出口ポートに配置するために該ステーションブロック上にフローセルを置くことも含んでいる。該方法は、ガス状の泡を入口ポートへ導入し、該ガス状の泡を、流路を通って、出口通路へと移動するため、及び、第二液体試薬で流路を満たすために、入口通路から入口ポートへ第二液体試薬を運搬すること、及び、ステーションブロックからフローセルを取り除くことも含んでいる。
【誤訳訂正２】
【訂正対象書類名】明細書
【訂正対象項目名】０００７
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【０００７】
他の実施態様において、１又は２以上の可動性フローセルを有する核酸配列決定装置を操作するための他の方法が提供される。この実施態様は、入口ポートと出口ポートを備えた流路を有するフローセルを提供し、第一入口通路と第一出口通路を備えた第一ステーションブロックを提供すること、及び、第二入口通路と第二出口通路を備えた第二ステーションブロックを提供することを含んでいる。該工程は、第一入口通路と流体連通した入口ポート及び第一出口通路と流体連通した出口ポートに配置するために第一ステーションブロック上にフローセルを置くこと、第一液体試薬で流路を満たすために、第一入口通路から該入口ポートへ第一液体試薬をくみ上げること、及び、該ステーションブロックから該フローセルを除去することを含んでいる。該方法は、第二入口通路と流体連通した入口ポート及び第二流路と流体連通した出口ポートに配置するために、第二ステーションブロック上にフローセルを置くこと、ガス状の泡を入口ポートへと導入し、ガス状の泡を入口ポートから第二出口通路へと移動するため、及び、第二液体試薬で流路を満たすために、第二入口通路から入口ポートへ第二液体試薬をくみ上げること、及び、第一ステーションブロックからフローセルを除去すること、をさらに含んでいる。
【誤訳訂正３】
【訂正対象書類名】明細書
【訂正対象項目名】００１３
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【００１３】
主要な処理チャンバ１００は、回転モータ１０８によって回転される回転台１０６を含んでいる。回転台１０６は、フローセル１１０を円形経路の周辺の様々な処理ステーション、例えば、１又は２以上のステーションブロック１１２及び撮像ステーション１１４等、に運搬するために構成されている。回転台１０６及び回転モータ１０８は、アクチュエータ１１８によって垂直方向に駆動されるエレベータプラットフォーム１１６の上に据え付けられてもよい。回転台１０６は、ステーションブロック１１２の上部でフローセル１１０と正確に向きが合わせられると、ステーションブロック１１２上のフローセル１１０に配置するために、アクチュエータ１１８は、回転台１０６を下部へ移動する。エレベータプラットフォーム１１６は、ステーションブロック１１２の上部にフローセル１１０を固定するために、１又は２以上のクランプ１２０、例えば、バネ付きプランジャ等を含んでも良い。
【誤訳訂正４】
【訂正対象書類名】明細書
【訂正対象項目名】００１５
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【００１５】
それぞれのステーションブロック１１２は、例えば、加熱、冷却、液体試薬の導入、アイドリング等の１又は２以上の操作を実行するために構成されてもよい。１又は２以上のステーションブロック１１２は、フローセル１１０中を液体試薬が通過するために構成される。この終わりに、試薬チャンバ１０２が、１又は２以上の試薬コンテナ１３２、及び１又は２以上の廃棄コンテナ１３４を保持する。それぞれの試薬コンテナ１３２は、供給ホース１３６のシステムによって、１又は２以上のステーションブロック１１２に連結される。１又は２以上のポンプ１３８（例えば、シリンジポンプ、ペリスタポンプ等）は、試薬をステーションブロック１１２に運搬するために使用される。この場合、単一のポンプ１３８は、吸引ホース１４０のシステムによってステーションブロック１１２と連結される。ポンプ１３８は、廃棄ホース１４２によって、使用した試薬を廃棄コンテナ１３４へと運搬する。
【誤訳訂正５】
【訂正対象書類名】明細書
【訂正対象項目名】００１９
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【００１９】
図３は、一過性に可動式のフローセル１１０を載せるためのステーションブロック１１２を図示する。ステーションブロック１１２は入口ホース３０２から試薬を受け入れる入口通路３０２、及び使用した試薬を出口ホース３０６へ導く出口通路３０４を含む。ステーションブロック１１２の上部表面は、フローセル１１０を受けるために構成されており、好適には、平坦に加工される。もし望まれるなら、ステーションブロック１１２とフローセル１１０は、ステーションブロック１１２上の所望の場所にフローセル１１０を配置するのを助けるための対応する構造（例えば、ピン及び穴）を含んでも良い。ステーションブロック１１２の上部表面は、Ｇｏｒｄｏｎらに記載される様に、１又は２以上のシール、例えば、入口経路３００及び出口経路３０４の周囲に径方向に間隔を空けて配置された内部及び外部Ｏリング３０８、３１０等を含んでもよい。ステーションブロック１１２もまた、ステーションブロックを所望の温度に維持するために、ワイヤ３１４等を介して電源と通信している抵抗加熱、又は、熱電加熱／冷却温度制御エレメント３１２を含んでもよい。熱電対（図示しない）は、ステーションブロックの温度フィードバック制御を提供するために、ステーションブロック１１２若しくは温度制御エレメント３１２に組み込まれる、又は関係付けられてもよい。
【誤訳訂正６】
【訂正対象書類名】明細書
【訂正対象項目名】００２３
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【００２３】
先行する着想とは逆に、１又は２以上の試薬の流れの間のフローセル１１０に気泡を故意に導入することは、研究されている核酸の集団が、気泡によって「殺され」たり、置換されたり、又は除去されたりするいかなるリスクを克服する特に有益な効果を備えうる。この集団のサイズは、最小限度であってもよく、実質的に検出感度以下でさえあってもよいと考えられてもいる。
【誤訳訂正７】
【訂正対象書類名】明細書
【訂正対象項目名】００２９
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【００２９】
図４の実施態様において、気体スペース４０６は、フローセル１１０がステーションブロック１１２の上に載せられる前に、液体試薬４００の一部を蒸発することによる従来のステーションブロックを使用することによって形成されてもよい。通常の使用において、１又は２以上のステーションブロック１１２は、典型的には摂氏３７度〜７０度（華氏９８度〜１５８度）の間の温度まで加熱されてもよい。このような場合、しかしながら、加熱されたステーションブロック１１２は、一般的には常に使用され、そして、一つのフローセル１１０を除去し、それを他と置き換えるのにかかるのと同じ時間だけ、使用されない。このように、通常の使用においては、新しいフローセル１１０がステーションブロック１１２の上に置かれる前に、液体試薬４００の適切な量を蒸発させるのに不十分な時間である（そして、もし蒸発させるための時間があれば、泡の産生を防止するために再充填を必要とする問題が想定される）。
【誤訳訂正８】
【訂正対象書類名】明細書
【訂正対象項目名】００３２
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【００３２】
気体スペース４０６を作製するための他の代表的な実施態様は、図７に示される。本明細書では、ステーションブロック１１２は、入口通路３００と流体連通するように配置された可変容量チャンバ７００を含む。可変容量チャンバ７００の容積は、ピストン７０２によって制御される。ピストン７０２は、ソレノイド（ｓｏｌｅｎｏｉｄ）若しくは駆動モータ等の専用の駆動装置によって、又は、他の手段によって操作されてもよい。使用において、フローセル１１０がステーションブロック１１２から除去される度に、ピストン７０２は、可変容量チャンバ７００の容積を拡大するために動かされ、それによって、入口通路３００中の液体試薬４００の一部を可変容量チャンバ７００へと送り出し、そして、入口通路３００には気体スペース４０６が残る。これは、ポンプ１３８が、フローセル１１０への液体試薬４００の流動を開始するために操作する前、その間、又はその後に実施されうる。ピストン７０２は、フローセル１１０が移動されるまで、可変容量チャンバ７００を収縮状態に維持し、その後、回転が再び開始する。可変容量チャンバ７００が、シリンジ様の装置、ピストンやクランプ等によって圧縮される柔軟な嚢（ｂｌａｄｄｅｒ）を含んでもよいことはいうまでもない。
【誤訳訂正９】
【訂正対象書類名】特許請求の範囲
【訂正対象項目名】全文
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
少なくとも以下の工程：
入口ポート及び出口ポートを備えた流路を含むフローセルの、該入口ポートから該出口ポートまで、第一液体試薬で、該流路を充填すること；
入口通路及び出口通路を備えたステーションブロックの上に該フローセルを載せ、該入口通路と流体連通した該入口ポート及び該出口通路と流体連通した該出口ポートを配置させること；
気泡を該入口ポートへ導入すること；
該入口通路から該入口ポートへ第二液体試薬を移動させ、該気泡を、該流路を通って該出口通路へと移動させること、及び、第二液体試薬で該通路を充填すること；及び、
該ステーションブロックから該フローセルを除くこと、
を上記順番で含み、
ここで、該気泡を該入口ポートへと導入することが：
該ステーションブロック上に該フローセルを載せる前に、該入口通路の上端において、気体スペースを提供すること；及び、
該フローセルを該ステーションブロックに載せる際に、該気体スペースに気体を捕捉し、それによって該気泡を形成すること、
を含む、１又は２以上の可動式フローセルを備えた核酸配列決定装置を操作する方法。
【請求項２】
該気泡を該入口ポートへと導入することが、該第二液体試薬を該入口ポートへ移動させ、該第二試薬の前の該入口ポートへ該気泡を移動させること、をさらに含む、請求項１に記載の方法。
【請求項３】
該入口通路の該先端における該気体スペースを提供することが、該ステーションブロック上に該フローセルを載せる前に、該第二液体試薬の一部を蒸発すること、を含む、請求項１に記載の方法。
【請求項４】
該第二液体試薬の該一部を蒸発することが、７．５〜１５秒の期間、華氏１４０度〜１５０度の温度で、該ステーションブロックを加熱すること、を含む、請求項３に記載の方法。
【請求項５】
該入口通路の該先端に該気体スペースを提供することが、該ステーションブロック上に該フローセルを載せる前に、加圧した気体を該入口通路へ運搬すること、を含む、請求項１に記載の方法。
【請求項６】
該入口通路の該先端に該気体スペースを提供することが、該ステーションブロック上に該フローセルを載せる前に、該入口通路の該先端から該第二液体試薬の一部を排出すること、を含む、請求項１に記載の方法。
【請求項７】
該入口通路の該先端に該気体スペースを提供することが、該ステーションブロック上に該フローセルを載せる前に、該入口通路の該先端から該第二液体試薬の一部を汲み上げること、を含む、請求項１に記載の方法。
【請求項８】
該入口通路の該先端から該第二液体試薬の一部を汲み上げることが、可変容量チャンバを用いて該第二液体試薬の該一部を除去すること、を含む、請求項７に記載の方法。
【請求項９】
該入口通路から該入口ポートへ該第二液体試薬を移動させ、該気泡を、該流路を通って該出口通路へと移動させること、及び、該第二液体試薬で該流路を充填することが、該出口通路の下流に配置された吸い上げポンプを操作すること、を含む、請求項１に記載の方法。
【請求項１０】
少なくとも以下の工程：
第一入口通路及び第一出口通路を備えた第一ステーションブロック上に、入口ポート及び出口ポートを備えた流路を含むフローセルを載せ、該第一入口通路と流体連通した該入口ポート及び該第一出口通路と流体連通した該出口ポートを配置させること；
該第一入口通路から該入口ポートへ、第一液体試薬を汲み上げて、該流路を該第一液体試薬で満たすこと；
該第一ステーションブロックから該第一フローセルを除去すること；
第二入口通路及び第二出口通路を備えた第二ステーションブロック上に該フローセルを載せ、該第二入口通路と流体連通した該入口ポート及び該第二出口通路と流体連通した該出口ポートを配置させること；
気泡を該入口ポートへ導入すること；
該第二入口通路から該入口ポートへ第二液体試薬を汲み上げて、該気泡を、該流路を通って該第二出口通路へ移動させること、及び、第二液体試薬で該流路を充填すること；及び、
該第二ステーションブロックから該フローセルを除くこと、
を上記順番で含み、
ここで該気泡を該入口ポートへ導入することが：
該第二ステーションブロック上に該フローセルを載せる前に、該第二入口通路の上端に気体スペースを提供すること；及び
該第二ステーションブロックへ該フローセルを載せる際に、該気体スペースにガスを捕捉し、それによって該気泡を形成すること、
を含む、１又は２以上の可動式フローセルを備えた核酸配列決定装置を操作する方法。
【請求項１１】
該気泡を該入口ポートへ導入することが、該第二液体試薬を該入口ポートへ汲み上げ、該第二液体試薬の前の該入口ポートへ該気泡を移動すること、をさらに含む、請求項１０に記載の方法。
【請求項１２】
該入口通路の該先端の気体スペースを提供することが、該第二ステーションブロック上に該フローセルを載せる前に、該第二液体試薬の一部を蒸発すること、を含む、請求項１０に記載の方法。
【請求項１３】
該第二液体試薬の一部を蒸発することが、７．５〜１５秒の期間、華氏１４０度〜１５０度の温度で、該ステーションブロックを加熱すること、を含む、請求項１２に記載の方法。
【請求項１４】
該第二入口通路の該先端に該気体スペースを提供することが、該第二ステーションブロック上に該フローセルを載せる前に、加圧した気体を該入口通路へ運搬すること、を含む、請求項１０に記載の方法。
【請求項１５】
該第二入口通路の該先端に該気体スペースを提供することが、該第二ステーションブロック上に該フローセルを載せる前に、該第二入口通路の該先端から該第二液体試薬の一部を吸い取ること、を含む、請求項１０に記載の方法。
【請求項１６】
該第二入口通路の該先端に該気体スペースを提供することが、該第二ステーションブロック上に該フローセルを載せる前に、該第二入口通路の該先端から該第二液体試薬の一部を汲み上げること、を含む、請求項１０に記載の方法。
【請求項１７】
該第二入口通路の該先端から該第二液体試薬の一部を汲み上げることが、可変容量チャンバを用いて該第二液体試薬の一部を除去すること、を含む、請求項１６に記載の方法。
【請求項１８】
該第二入口通路から該入口ポートへ第二液体試薬を汲み上げて、該気泡を、該流路を通って該第二出口通路へ移動させること、及び、第二液体試薬で該流路を充填することが、該第二出口通路の下流に配置された汲み上げポンプを操作すること、を含む、請求項１０に記載の方法。
【請求項１９】
第一液体試薬を汲み上げる工程、及び、第二液体試薬を汲み上げる工程が、第一出口通路及び第二出口通路に流体連通された一つの汲み上げポンプを操作すること、を含む、請求項１０に記載の方法。