【手続補正書】
【提出日】平成30年3月20日(2018.3.20)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
構造がＸＯ−ＣＨ２−ＳＭ−Ｂ−Ａである化合物であって、
ここで、ＸはＨ、酸に不安定な保護基、固相担体、−Ｐ（Ｏ−Ｒ１）ＮＲ２Ｒ３、−Ｐ（Ｏ）（ＯＨ）Ｈ、−Ｐ（Ｏ）（ＯＲ１）Ｈ、−Ｐ（Ｏ）（ＯＨ）２、−Ｐ（Ｏ）（ＯＨ）Ｏ−Ｐ（Ｏ）（ＯＨ）ＯＰ（Ｏ）（ＯＨ）２、またはそれらの塩であり、Ｒ１は、アルキル、置換アルキル、ヘテロアルキル、置換ヘテロアルキル、アリールまたは置換アリールであり、Ｒ２およびＲ３は、独立して、アルキル、置換アルキル、ヘテロアルキル、置換ヘテロアルキル、アリールまたは置換アリールであり、あるいは、Ｒ２およびＲ３は、結合して、環状体、縮合環、縮合環状体、または複素環を形成し、ＳＭは、天然フラノシルでない糖部位またはその類縁体であり、Ｂは、塩基部位またはその類縁体であり、Ａは、構造が−Ｃ（Ｏ）ＯＲ４の塩基部位上または該塩基部位内にある窒素に結合される部位であり、Ｒ４がｔｅｒｔ−アルキルである、化合物。
【請求項２】
ＳＭが以下の部位、すなわち、
【化１】
2017514802.tif 000001
【化２】
2017514802.tif 000002
【化３】
2017514802.tif 000003
【化４】
2017514802.tif 000004
【化５】
2017514802.tif 000005
【化６】
2017514802.tif 000006
【化７】
2017514802.tif 000007
【化８】
2017514802.tif 000008
【化９】
2017514802.tif 000009
【化１０】
2017514802.tif 000010
【化１１】
2017514802.tif 000011
【化１２】
2017514802.tif 000012
【化１３】
2017514802.tif 000013
【化１４】
2017514802.tif 000014
【化１５】
2017514802.tif 000015
【化１６】
2017514802.tif 000016
【化１７】
2017514802.tif 000017
【化１８】
2017514802.tif 000018
【化１９】
2017514802.tif 000019
【化２０】
2017514802.tif 000020
【化２１】
2017514802.tif 000021
【化２２】
2017514802.tif 000022
【化２３】
2017514802.tif 000023
【化２４】
2017514802.tif 000024
【化２５】
2017514802.tif 000025
【化２６】
2017514802.tif 000026
【化２７】
2017514802.tif 000027
【化２８】
2017514802.tif 000028
【化２９】
2017514802.tif 000029
【化３０】
2017514802.tif 000030
【化３１】
2017514802.tif 000031
【化３２】
2017514802.tif 000032
【化３３】
2017514802.tif 000033
【化３４】
2017514802.tif 000034
【化３５】
2017514802.tif 000035
【化３６】
2017514802.tif 000036
【化３７】
2017514802.tif 000037
【化３８】
2017514802.tif 000038
【化３９】
2017514802.tif 000039
から選ばれる請求項１に記載の化合物であって、
ここで、「Ｘ」は、Ｈ、保護基、固相担体であって前記Ｏと前記固相担体との間のリンカーを任意的に含む固相担体、リン含有部位またはそれらの塩であり、「Ｂ」は、核酸塩基部位または核酸塩基部位の類縁体であり、「Ａ」は、前記塩基部位上または前記塩基部位内にある１個以上の窒素原子に結合される１個以上の部位であり、構造は−Ｃ（Ｏ）ＯＲ１であり、Ｒ１はｔｅｒｔ−アルキル基であり、「Ｘ１」は、Ｈ、保護基、固相担体であって前記Ｏと前記固相担体との間のリンカーを任意的に含む固相担体、リン含有部位、またはそれらの塩であり、Ｙは、ＯＨまたはＯＲ２であり、Ｒ２は、保護基、アルキル、置換アルキル、ヘテロアルキル、置換ヘテロアルキル、アリール、または置換アリールであり、Ｚは、Ｈ、ＯＨまたはＯＲ３であり、Ｒ３は、保護基、アルキル、置換アルキル、ヘテロアルキル、置換ヘテロアルキル、アリール、または置換アリールであり、Ｒ４およびＲ５は、独立して、Ｈ、アルキル、置換アルキル、ヘテロアルキル、置換ヘテロアルキル、アリール、または置換アリールであり、「ｍ」および「ｏ」は、独立して、０、１、または２であり、「Ｒ」は、アルキル、置換アルキル、アリール、または置換アリールであり、Ｒ６は、Ｈ、アルキル、置換アルキル、ヘテロアルキル、置換ヘテロアルキル、アリール、または置換アリールであり、Ｒ７は、ＯＨ、ハライド、ＯＲ８、ＮＲ９Ｒ１０であり、Ｒ８は、アルキル、置換アルキル、アリール、ヘテロアルキル、置換ヘテロアルキル、アリール、または置換アリールであり、Ｒ９およびＲ１０は、独立して、Ｈ、アルキル、置換アルキル、アリール、ヘテロアルキル、置換ヘテロアルキル、アリール、または置換アリールである、化合物。
【請求項３】
「Ｂ」が以下の部位、すなわち、
【化４０】
2017514802.tif 000040
【化４１】
2017514802.tif 000041
【化４２】
2017514802.tif 000042
【化４３】
2017514802.tif 000043
【化４４】
2017514802.tif 000044
【化４５】
2017514802.tif 000045
【化４６】
2017514802.tif 000046
【化４７】
2017514802.tif 000047
【化４８】
2017514802.tif 000048
【化４９】
2017514802.tif 000049
【化５０】
2017514802.tif 000050
【化５１】
2017514802.tif 000051
【化５２】
2017514802.tif 000052
【化５３】
2017514802.tif 000053
【化５４】
2017514802.tif 000054
【化５５】
2017514802.tif 000055
【化５６】
2017514802.tif 000056
【化５７】
2017514802.tif 000057
【化５８】
2017514802.tif 000058
【化５９】
2017514802.tif 000059
から選ばれる請求項１に記載の化合物であって、
ここで、「Ａ」は、構造が、−Ｃ（Ｏ）ＯＲ１であり、Ｒ１は、ｔｅｒｔ―アルキル基であり、「Ｍ」は、窒素またはＣＲ３であり、Ｒ３は、Ｈ、ハロ、アルキル、置換アルキル、ヘテロアルキル、置換ヘテロアルキル、フェニル、置換フェニル、アルケニル、アルキニル、ＯＨ、ＳＨ、またはＮＲ４Ｒ５であり、Ｒ４およびＲ５は、独立して、Ｈまたはアルキルであり、Ｒ１２は、Ｈ、ハロ、アルキル、置換アルキル、ヘテロアルキル、置換ヘテロアルキル、アリール、置換アリール、アルケニル、アルキニル、ＯＨ、ＳＨ、またはＮＲ４Ｒ５であり、Ｒ４およびＲ５は、独立して、Ｈまたはアルキルであり、「Ｄ」および「Ｅ」は、独立して、ＮまたはＣＲ３であり、Ｒ３は、Ｈ、ハロ、アルキル、置換アルキル、ヘテロアルキル、置換ヘテロアルキル、アリール、置換アリール、アルケニル、アルキニル、ＯＨ、ＳＨ、またはＮＲ４Ｒ５であり、Ｒ４およびＲ５は、独立して、Ｈまたはアルキルである、化合物。
【請求項４】
「Ａ」が以下の部位、−Ｃ（ＣＨ３）３、−Ｃ（ＣＨ３）２（ＣＨ２ＣＨ３）、−Ｃ（ＣＨ３）（ＣＨ２ＣＨ３）（ＣＨ２ＣＨ２ＣＨ３）、−Ｃ（Ｒ１４）（Ｒ１５）−リンカー−ラベル、および−Ｃ（Ｒ１４）（Ｒ１５）−リンカー−［固相担体］から選ばれ、Ｒ１４およびＲ１５が、独立して、−ＣＨ３、−ＣＨ２ＣＨ３、−ＣＨ２ＣＨ２ＣＨ３、およびＣＨ（ＣＨ３）２から選ばれる、
請求項１に記載の化合物。
【請求項５】
Ｘが、Ｈ、−Ｐ（Ｏ−Ｒ１）ＮＲ２Ｒ３、−Ｐ（Ｏ）（ＯＨ）Ｏ−Ｐ（Ｏ）（ＯＨ）ＯＰ（Ｏ）（ＯＨ）２またはそれらの塩であり、Ｒ１が、アルキル、置換アルキル、アリール、または置換アリールであり、Ｒ２およびＲ３は、独立して、アルキル、置換アルキル、アリール、または置換アリールであるか、あるいはＲ２およびＲ３は、結合して、環状体、縮合環、縮合環状体、または複素環を形成する、
請求項１に記載の化合物。
【請求項６】
構造がＸＯ−ＣＨ２−ＳＭ−Ｂ−Ａである化合物であって、
ここで、ＸはＨ、酸に不安定な保護基、固相担体、−Ｐ（Ｏ−Ｒ１）ＮＲ２Ｒ３、−Ｐ（Ｏ）（ＯＨ）Ｈ、−Ｐ（Ｏ）（ＯＲ１）Ｈ、−Ｐ（Ｏ）（ＯＨ）２、−Ｐ（Ｏ）（ＯＨ）Ｏ−Ｐ（Ｏ）（ＯＨ）ＯＰ（Ｏ）（ＯＨ）２、またはそれらの塩であり、Ｒ１は、アルキル、置換アルキル、ヘテロアルキル、置換ヘテロアルキル、アリールまたは置換アリールであり、Ｒ２およびＲ３は、独立して、アルキル、置換アルキル、ヘテロアルキル、置換ヘテロアルキル、アリールまたは置換アリールであり、あるいは、Ｒ２およびＲ３は、結合して、環状体、縮合環、縮合環状体、または複素環を形成し、ＳＭは、以下の構造のフラノシル部位である糖部位またはその類縁体であり、
【化６０】
2017514802.tif 000060
Ｂは、核酸塩基またはその類縁体であり、Ａは、前記核酸塩基上または前記核酸塩基内にある窒素に結合される部位であって、構造が−Ｃ（Ｏ）ＯＲ４であり、Ｒ４は、ｔｅｒｔ−アルキルであり、
Ｙが、−ＯＰ（Ｏ−ＣＮＥ）ＮＲ１Ｒ２若しくは−ＯＰ（Ｏ）（ＯＨ）Ｈまたはそれらの塩である場合、Ｘは、酸に不安定な保護基または固相担体であり、Ｚは、ＨまたはＯＲ５であり、Ｒ５は、ヒドロキシ保護基であり、
Ｘが、−Ｐ（Ｏ−ＣＮＥ）（ＮＲ１Ｒ２）若しくは−Ｐ（Ｏ）（ＯＲ３）Ｈまたはそれらの塩である場合、Ｙは、酸に不安定なヒドロキシ保護基または固相担体であり、ＺはＨであり、
Ｘが、−Ｐ（Ｏ）（ＯＲ３）Ｈ若しくは−Ｐ（Ｏ）（ＯＨ）Ｏ［Ｐ（Ｏ）（Ｏ−）（Ｏ−）］ｎＨまたはそれらの塩であり、ｎ＝０、１または２である場合、Ｙは、ＯＨまたはＯＲ６であり、Ｒ６は、熱に不安定なヒドロキシ保護基であり、Ｚは、Ｈ、−ＯＨ、またはＯＲ６である、化合物。
【請求項７】
「Ｂ」が、以下の部位、すなわち、
【化６１】
2017514802.tif 000061
【化６２】
2017514802.tif 000062
【化６３】
2017514802.tif 000063
【化６４】
2017514802.tif 000064
【化６５】
2017514802.tif 000065
【化６６】
2017514802.tif 000066
【化６７】
2017514802.tif 000067
【化６８】
2017514802.tif 000068
【化６９】
2017514802.tif 000069
【化７０】
2017514802.tif 000070
【化７１】
2017514802.tif 000071
【化７２】
2017514802.tif 000072
【化７３】
2017514802.tif 000073
【化７４】
2017514802.tif 000074
【化７５】
2017514802.tif 000075
【化７６】
2017514802.tif 000076
【化７７】
2017514802.tif 000077
【化７８】
2017514802.tif 000078
【化７９】
2017514802.tif 000079
【化８０】
2017514802.tif 000080
から選ばれる請求項６に記載の化合物であって、
ここで、「Ａ」は、構造が、−Ｃ（Ｏ）ＯＲ１であり、Ｒ１は、ｔｅｒｔ−アルキル基であり、「Ｍ」は、窒素またはＣＲ３であり、Ｒ３は、Ｈ、ハロ、アルキル、置換アルキル、ヘテロアルキル、置換ヘテロアルキル、フェニル、置換フェニル、アルケニル、アルキニル、ＯＨ、ＳＨ、またはＮＲ４Ｒ５であり、Ｒ４およびＲ５は、独立して、Ｈまたはアルキルであり、Ｒ１２は、Ｈ、ハロ、アルキル、置換アルキル、ヘテロアルキル、置換ヘテロアルキル、アリール、置換アリール、アルケニル、アルキニル、ＯＨ、ＳＨ、またはＮＲ４Ｒ５であり、Ｒ４およびＲ５は、独立して、Ｈまたはアルキルであり、「Ｄ」および「Ｅ」は、独立して、ＮまたはＣＲ３であり、Ｒ３は、Ｈ、ハロ、アルキル、置換アルキル、ヘテロアルキル、置換ヘテロアルキル、アリール、置換アリール、アルケニル、アルキニル、ＯＨ、ＳＨ、またはＮＲ４Ｒ５であり、Ｒ４およびＲ５は、独立して、Ｈまたはアルキルである、化合物。
【請求項８】
「Ａ」が、以下の部位、−Ｃ（ＣＨ３）３、−Ｃ（ＣＨ３）２（ＣＨ２ＣＨ３）、−Ｃ（ＣＨ３）（ＣＨ２ＣＨ３）（ＣＨ２ＣＨ２ＣＨ３）、−Ｃ（Ｒ１４）（Ｒ１５）−リンカー−ラベル、および−Ｃ（Ｒ１４）（Ｒ１５）−リンカー−［固相担体］から選ばれ、Ｒ１４およびＲ１５が、独立して、−ＣＨ３、−ＣＨ２ＣＨ３、−ＣＨ２ＣＨ２ＣＨ３、およびＣＨ（ＣＨ３）２から選ばれる、
請求項６に記載の化合物。
【請求項９】
前記化合物が、以下の群、すなわち、
【化８１】
2017514802.tif 000081
【化８２】
2017514802.tif 000082
【化８３】
2017514802.tif 000083
【化８４】
2017514802.tif 000084
【化８５】
2017514802.tif 000085
【化８６】
2017514802.tif 000086
【化８７】
2017514802.tif 000087
【化８８】
2017514802.tif 000088
から選ばれる請求項６に記載の化合物であって、
ここで、「Ｘ」は、−Ｐ（Ｏ）（ＯＨ）２、−Ｐ（Ｏ）（ＯＨ）ＯＰ（Ｏ）（ＯＨ）２、−Ｐ（Ｏ）（ＯＨ）ＯＰ（Ｏ）（ＯＨ）Ｏ−Ｐ（Ｏ）（ＯＨ）２またはそれらの塩であり、「Ｚ」は、−Ｈまたは−ＯＨである、化合物。
【請求項１０】
構造が−Ｏ−ＣＨ２−ＳＭ（−Ｏ−）Ｂ−Ａであるヌクレオシドまたは修飾されたヌクレオシド類縁体を１個以上含む、オリゴヌクレオチドであって、
ここで、ＳＭは、糖部位またはその類縁体であり、Ｂは、核酸塩基部位またはその類縁体であり、Ａは、構造が−Ｃ（Ｏ）ＯＲ４である塩基部位上または塩基部位内にある窒素原子に結合される部位であり、Ｒ４が、ｔｅｒｔ−アルキルである、オリゴヌクレオチド。
【請求項１１】
前記オリゴヌクレオチドは、以下の構造であり、
【化８９】
2017514802.tif 000089
ここで、ＰＬ１およびＰＬ２は、独立して、Ｈ、または−Ｐ（Ｏ）（ＯＨ）Ｏ−若しくはその類縁体のいずれかであり、Ｎｕ１およびＮｕ２は、独立して、置換基がないか、ヌクレオシド若しくはヌクレオシド類縁体であるか、またはオリゴヌクレオチドである、請求項１０に記載のオリゴヌクレオチド。
【請求項１２】
前記オリゴヌクレオチドは、以下の構造のうちの一つであり、
【化９０】
2017514802.tif 000090
【化９１】
2017514802.tif 000091
ここで、ＰＬ１およびＰＬ２は、独立して、Ｈまたは−Ｐ（Ｏ）（ＯＨ）Ｏ−若しくはその類縁体のいずれかであり、Ｎｕ１およびＮｕ２は、独立して、置換基がないか、ヌクレオシド若しくはヌクレオシド類縁体であるか、またはオリゴヌクレオチドである、請求項１０に記載のオリゴヌクレオチド。
【請求項１３】
前記オリゴヌクレオチドは、以下のオリゴヌクレオチドの群、すなわち、
【化９２】
2017514802.tif 000092
【化９３】
2017514802.tif 000093
【化９４】
2017514802.tif 000094
【化９５】
2017514802.tif 000095
【化９６】
2017514802.tif 000096
【化９７】
2017514802.tif 000097
【化９８】
2017514802.tif 000098
【化９９】
2017514802.tif 000099
【化１００】
2017514802.tif 000100
【化１０１】
2017514802.tif 000101
【化１０２】
2017514802.tif 000102
【化１０３】
2017514802.tif 000103
【化１０４】
2017514802.tif 000104
【化１０５】
2017514802.tif 000105
から選ばれ、
ここで、ＰＬ１およびＰＬ２は、独立して、Ｈまたは−Ｐ（Ｏ）（ＯＨ）Ｏ―若しくはその類縁体のいずれかであり、Ｎｕ１およびＮｕ２は、独立して、置換基がないか、ヌクレオシド若しくはヌクレオシド類縁体であるか、またはオリゴヌクレオチドである、オリゴヌクレオチド、請求項１０に記載のオリゴヌクレオチド。
【請求項１４】
治療活性があるヌクレオシド、治療活性があるヌクレオシド類縁体、治療活性があるヌクレオチド、治療活性があるヌクレオチド類縁体、または治療活性があるオリゴヌクレオチドであって、
構造−Ｃ（Ｏ）ＯＲ４の少なくとも１個以上の部位が、前記ヌクレオシド、前記ヌクレオシド類縁体、ヌクレオチド、ヌクレオチド類縁体、またはオリゴヌクレオチド上の核酸塩基に結合されていて、Ｒ４がｔｅｒｔ−アルキルである、
治療活性があるヌクレオシド、治療活性があるヌクレオシド類縁体、治療活性があるヌクレオチド、治療活性があるヌクレオチド類縁体、または治療活性があるオリゴヌクレオチド。
【請求項１５】
以下の群、すなわち、
【化１０６】
2017514802.tif 000106
【化１０７】
2017514802.tif 000107
【化１０８】
2017514802.tif 000108
【化１０９】
2017514802.tif 000109
【化１１０】
2017514802.tif 000110
【化１１１】
2017514802.tif 000111
【化１１２】
2017514802.tif 000112
【化１１３】
2017514802.tif 000113
【化１１４】
2017514802.tif 000114
【化１１５】
2017514802.tif 000115
【化１１６】
2017514802.tif 000116
【化１１７】
2017514802.tif 000117
【化１１８】
2017514802.tif 000118
【化１１９】
2017514802.tif 000119
【化１２０】
2017514802.tif 000120
【化１２１】
2017514802.tif 000121
から選ばれ、
ここで、Ａ１、Ａ２、およびＡ３は、独立して、Ｈまたは熱に不安定な保護基であり、前記熱に不安定な保護基の少なくとも１つは、構造が−Ｃ（Ｏ）ＯＲ８であり、Ｒ８は、ｔｅｒｔ−アルキル基であり、Ｂは、核酸塩基または核酸塩基類縁体である、請求項１４に記載の治療活性があるヌクレオシド、治療活性があるヌクレオシド類縁体、治療活性があるヌクレオチド、治療活性があるヌクレオチド類縁体、または治療活性があるオリゴヌクレオチド。
【請求項１６】
以下の群、すわなち、
【化１２２】
2017514802.tif 000122
【化１２３】
2017514802.tif 000123
【化１２４】
2017514802.tif 000124
【化１２５】
2017514802.tif 000125
【化１２６】
2017514802.tif 000126
【化１２７】
2017514802.tif 000127
から選ばれる請求項１４に記載の治療活性があるヌクレオシド、治療活性があるヌクレオシド類縁体、治療活性があるヌクレオチド、治療活性があるヌクレオチド類縁体、または治療活性があるオリゴヌクレオチド。
【請求項１７】
以下の群、すなわち、構造が−Ｃ（Ｏ）ＯＲ８である少なくとも１つの熱に不安定な保護基を含み、Ｒ８がｔｅｒｔ−アルキルであるホミビルセン、および構造が−Ｃ（Ｏ）ＯＲ８である少なくとも１つの熱に不安定な保護基を含み、Ｒ８がｔｅｒｔ−アルキルであるミポメルセンから選ばれる、
請求項１４に記載の治療活性があるヌクレオシド、治療活性があるヌクレオシド類縁体、治療活性があるヌクレオチド、治療活性があるヌクレオチド類縁体、または治療活性があるオリゴヌクレオチド。
【請求項１８】
以下の構造のヌクレオチドまたはヌクレオチド類縁体を１個以上含み、
【化１２８】
2017514802.tif 000128
上記の構造１１７の置換基は以下の通り、すなわち、Ｌ１およびＬ２が、独立して、Ｈ、ヌクレオチド、ヌクレオチド類縁体、およびラベルであって、前記ヌクレオチドまたは前記ヌクレオチド類縁体の結合位置に前記ラベルを結合する結合基があってもよいラベルであり、Ｌ３が、Ｈ、−Ｃ（Ｏ）ＯＲ６０、または、ラベルであって、前記ヌクレオチドまたは前記ヌクレオチド類縁体の結合位置に前記ラベルを結合する結合基があってもよいラベルであり、Ｒ６０がｔｅｒｔ−アルキルであり、前記ラベルがＬ１、Ｌ２またはＬ３でない場合、該ラベルは、前記オリゴヌクレオチドの別のヌクレオチドに結合され、「ＳＭ」は、糖部位または糖部位の類縁体であり、「Ｂ」は、核酸塩基部位または核酸塩基部位の類縁体である、オリゴヌクレオチド結合体。
【請求項１９】
オリゴヌクレオチドを合成する方法であって、該方法は、以下のステップ、すなわち、  １）直接的に、またはリンカーによって、化合物を固相担体に結合するステップであって、
ここで、前記化合物は、以下の構造のうちの１つであり、
【化１２９】
2017514802.tif 000129
【化１３０】
2017514802.tif 000130
ここで、「Ｐ１」は保護基であり、「Ｂ」は核酸塩基または核酸塩基類縁体であり、「ＳＭ」は、糖部位または糖部位の類縁体であり、「Ａ１」は、Ｈまたは−Ｃ（Ｏ）ＯＲ４であり、Ｒ４は、ｔｅｒｔ−アルキルであり、
以下の構造のうちの１つの固相担体を提供するステップと、
【化１３１】
2017514802.tif 000131
【化１３２】
2017514802.tif 000132
ここで、Ｌ１は、リンカーであるか、または化学物質がなく、Ｓ１は固相担体であり、
２）前記固相担体を脱保護して、以下の構造のうちの１つの脱保護された化合物を提供するステップと、
【化１３３】
2017514802.tif 000133
【化１３４】
2017514802.tif 000134
ここで、Ｌ１は、リンカーであるか、または化学物質がなく、Ｓ１は固相担体であり、「Ｂ」は、核酸塩基または核酸塩基類縁体であり、「ＳＭ」は、糖部位または糖部位の類縁体であり、「Ａ１」は、Ｈまたは−Ｃ（Ｏ）ＯＲ６０（例えば、−Ｃ（Ｏ）ＯＣ（ＣＨ３）３）であり、Ｒ６０はｔｅｒｔ−アルキルであり、
３）前記脱保護された化合物とリン原子を含む部位を含んでいる化合物とを反応させるステップであって、
ここで、前記化合物は、以下の構造のうちの１つであり、
【化１３５】
2017514802.tif 000135
【化１３６】
2017514802.tif 000136
ここで、「ＰＭ」は、リン含有部位であり、「Ｐ１」は、保護基（例えば、ＤＭＴ）であり、「Ｂ」は、核酸塩基または核酸塩基類縁体であり、「ＳＭ」は、糖部位または糖部位の類縁体であり、「Ａ１」は、Ｈまたは−Ｃ（Ｏ）ＯＲ６０（例えば、−Ｃ（Ｏ）ＯＣ（ＣＨ３）３）であり、Ｒ６０はｔｅｒｔ−アルキルであり、
以下の構造のうちの１つのジヌクレオチドを提供するステップと、
【化１３７】
2017514802.tif 000137
【化１３８】
2017514802.tif 000138
ここで、「ＰＭ＊」は、前記反応後のリン含有部位であり、Ｌ１は、リンカーであるか、または化学物質がなく、Ｓ１は、固相担体であり、「Ｐ１」は、保護基であり、「Ｂ」は、核酸塩基または核酸塩基類縁体であり、「ＳＭ」は、糖部位または糖部位の類縁体であり、「Ａ１」は、Ｈまたは−Ｃ（Ｏ）ＯＲ６０であり、Ｒ６０はｔｅｒｔ−アルキルであり、
４）前記リン含有部位を化学修飾して、以下の構造のうちの１つの修飾されたダイマーを提供するステップと、
【化１３９】
2017514802.tif 000139
【化１４０】
2017514802.tif 000140
ここで、「ＰＭ＊＊」は、化学修飾されたリン含有部位であり、Ｌ１は、リンカーであるか、または化学物質がなく、Ｓ１は固相担体であり、「Ｐ１」は、保護基であり、「Ｂ」は、核酸塩基または核酸塩基類縁体であり、「ＳＭ」は、糖部位または糖部位の類縁体であり、「Ａ１」は、Ｈまたは−Ｃ（Ｏ）ＯＲ６０であり、Ｒ６０はｔｅｒｔ−アルキルであり、
５）前記ダイマーまたは修飾されたダイマーを脱保護して、以下の構造のうちの１つの脱保護されたダイマーまたは修飾されたダイマーを提供するステップと、
【化１４１】
2017514802.tif 000141
【化１４２】
2017514802.tif 000142
【化１４３】
2017514802.tif 000143
【化１４４】
2017514802.tif 000144
ここで、「ＰＭ＊」は、ダイマーを提供するための反応後のリン含有部位であり、「ＰＭ＊＊」は、化学修飾されたリン含有部位であり、Ｌ１は、リンカーであるか、または化学物質がなく、Ｓ１は、固相担体であり、「Ｂ」は核酸塩基または核酸塩基類縁体であり、「ＳＭ」は、糖部位または糖部位の類縁体であり、「Ａ１」は、Ｈまたは−Ｃ（Ｏ）Ｒ６０であり、Ｒ６０は、ｔｅｒｔ−アルキルであり、
６）ステップ「３」および「４」を繰り返して、以下の構造のうちの１つのオリゴマーまたは修飾されたオリゴマーを提供するステップと、
【化１４５】
2017514802.tif 000145
【化１４６】
2017514802.tif 000146
【化１４７】
2017514802.tif 000147
【化１４８】
2017514802.tif 000148
ここで、「Ｐ１」は保護基であり、「ＰＭ＊」はオリゴマーを提供するための反応後のリン含有部位であり、「ＰＭ＊＊」は、化学修飾されたリン含有部位であり、「Ｌ１」は、リンカーであるか、または化学物質がなく、「Ｓ１」は、固相担体であり、「Ｂ」は、核酸塩基または核酸塩基類縁体であり、「ＳＭ」は、糖部位または糖部位の類縁体であり、「Ａ１」は、Ｈまたは−Ｃ（Ｏ）ＯＲ６０であり、Ｒ６０は、ｔｅｒｔ−アルキルであり、ｎは１〜２００の範囲の整数であり、
７）前記ダイマー、修飾されたダイマー、オリゴヌクレオチドまたは修飾されたオリゴヌクレオチドを脱保護し、前記固相担体からそれを除去し、前記ＰＭ＊またはＰＭ＊＊部位を化学修飾して、以下の構造の化合物を提供するステップと、
【化１４９】
2017514802.tif 000149
ここで、「Ｑ」は、ＯまたはＳであり、ｎは、１〜２００の範囲にある整数であり、少なくとも１つの「Ａ１」は、−Ｃ（Ｏ）ＯＲ６０であり、Ｒ６０は、ｔｅｒｔ−アルキルであり、「Ｂ」は、核酸塩基または核酸塩基類縁体であり、「ＳＭ」は、糖部位または糖部位の類縁体である、を備えるオリゴヌクレオチドの合成方法。
【請求項２０】
前記固相担体に結合される化合物は、以下の構造のうちの１つであり、
【化１５０】
2017514802.tif 000150
【化１５１】
2017514802.tif 000151
ここで、「Ｐ１」は保護基であり、「Ｂ」は核酸塩基または核酸塩基類縁体であり、「Ａ１」は−Ｈまたは−Ｃ（Ｏ）ＯＲ４であり、Ｒ４は−ｔｅｒｔアルキルである、請求項１９に記載の合成方法。
【請求項２１】
前記固相担体に結合される化合物は、以下の構造のうちの１つであり、
【化１５２】
2017514802.tif 000152
【化１５３】
2017514802.tif 000153
ここで、「Ｐ１」は保護基（例えば、ＤＭＴ）であり、「Ａ１」は、−Ｈまたは−Ｃ（Ｏ）ＯＲ４であり、
【化１５４】
2017514802.tif 000154
【化１５５】
2017514802.tif 000155
ここで、「Ｐ１」は保護基であり、「Ａ１」は−Ｈまたは−Ｃ（Ｏ）ＯＲ４であり、Ｒ４は、ｔｅｒｔ−アルキルである、Ｒ４は−ｔｅｒｔアルキルである、請求項１９に記載の合成方法。
【請求項２２】
ステップ「２」において脱保護される構造は、以下の構造のうちの１つであり、
【化１５６】
2017514802.tif 000156
【化１５７】
2017514802.tif 000157
ここで、「Ｂ」は核酸塩基または核酸塩基類縁体であり、「Ａ１」は−Ｈまたは−Ｃ（Ｏ）ＯＲ４であり、Ｒ４はｔｅｒｔ−アルキルであり、Ｌ１はリンカーであるか、または化学物質がなく、Ｓ１は固相担体である、請求項１９に記載の合成方法。
【請求項２３】
ステップ「７」のオリゴマーは、以下の構造のうちの１つであり、
【化１５８】
2017514802.tif 000158
ここで、「Ａ１」は−Ｈまたは−Ｃ（Ｏ）ＯＲ６０であり、Ｒ６０はｔｅｒｔ−アルキルであり、「Ｂ」は核酸塩基または核酸塩基類縁体であり、「Ｑ」はＯまたはＳである、
請求項１９に記載の合成方法。
【請求項２４】
オリゴヌクレオチドを合成する方法であって、該方法は、以下のステップ、すなわち、
１）直接的に、またはリンカーによって、化合物を固相担体に結合するステップであって、
ここで、前記化合物は、以下の構造のうちの１つであり、
【化１５９】
2017514802.tif 000159
【化１６０】
2017514802.tif 000160
ここで、「Ｐ１」および「Ｐ２」は、独立して、保護基であり、「Ｂ」は、核酸塩基または核酸塩基類縁体であり、「ＳＭ」は、糖部位または糖部位の類縁体であり、「Ａ１」は、Ｈまたは−Ｃ（Ｏ）ＯＲ６０であり、Ｒ６０は、ｔｅｒｔ−アルキルであり、
以下の構造のうちの１つの化合物に結合される固相担体を提供するステップと、
【化１６１】
2017514802.tif 000161
【化１６２】
2017514802.tif 000162
ここで、「Ｐ１」および「Ｐ２」は、独立して、保護基であり、「Ｂ」は、核酸塩基または核酸塩基類縁体であり、「ＳＭ」は、糖部位または糖部位の類縁体であり、「Ａ１」は、Ｈまたは−Ｃ（Ｏ）ＯＲ６０であり、Ｒ６０はｔｅｒｔ−アルキルであり、Ｌ１は、リンカーであるか、または化学物質がなく、Ｓ１は、固相担体であり、
２）前記固相担体を脱保護して、以下の構造のうちの１つの脱保護された化合物を提供するステップと、
【化１６３】
2017514802.tif 000163
【化１６４】
2017514802.tif 000164
ここで、「Ｐ２」は保護基であり、「Ｂ」は核酸塩基または核酸塩基類縁体であり、「ＳＭ」は、糖部位または糖部位の類縁体であり、「Ａ１」は、Ｈまたは−Ｃ（Ｏ）ＯＲ６０であり、Ｒ６０は、ｔｅｒｔ−アルキルであり、Ｌ１はリンカーであるか、または化学物質がなく、Ｓ１は固相担体であり、
３）前記脱保護された化合物を、リン原子を含む部位を含む化合物と反応させるステップであって、
ここで、前記化合物は、以下の構造のうちの１つであり、
【化１６５】
2017514802.tif 000165
【化１６６】
2017514802.tif 000166
ここで、「Ｐ１」および「Ｐ２」は、独立して、保護基であり、「Ｂ」は、核酸塩基または核酸塩基類縁体であり、「ＳＭ」は糖部位または糖部位の類縁体であり、「Ａ１」は、Ｈまたは−Ｃ（Ｏ）ＯＲ６０（例えば、−Ｃ（Ｏ）ＯＣ（ＣＨ３）３）であり、Ｒ６０は、ｔｅｒｔ−アルキルであり、
以下の構造のうちの１つのジヌクレオチドを提供するステップと、
【化１６７】
2017514802.tif 000167
【化１６８】
2017514802.tif 000168
ここで、「Ｐ１」および「Ｐ２」は、独立して、保護基であり、「Ｂ」は、核酸塩基または核酸塩基類縁体であり、「ＳＭ」は、糖部位または糖部位の類縁体であり、「Ａ１」は、Ｈまたは−Ｃ（Ｏ）ＯＲ６０であり、Ｒ６０はｔｅｒｔ−アルキルであり、Ｌ１は、リンカーであるか、または化学物質がなく、Ｓ１は固相担体であり、
４）リン含有部位を化学修飾して、以下の構造のうちの１つの修飾されたダイマーを提供するステップと、
【化１６９】
2017514802.tif 000169
【化１７０】
2017514802.tif 000170
ここで、「Ｐ１」および「Ｐ２」は、独立して、保護基であり、「Ｂ」は、核酸塩基または核酸塩基類縁体であり、「ＳＭ」は、糖部位または糖部位の類縁体であり、「Ａ１」は、Ｈまたは−Ｃ（Ｏ）ＯＲ６０であり、Ｒ６０はｔｅｒｔ−アルキルであり、Ｌ１は、リンカーであるか、または化学物質がなく、Ｓ１は固相担体であり、
５）前記ダイマーまたは修飾されたダイマーを脱保護して、以下の構造のうちの１つの脱保護されたダイマーまたは修飾されたダイマーを提供するステップと、
【化１７１】
2017514802.tif 000171
【化１７２】
2017514802.tif 000172
【化１７３】
2017514802.tif 000173
【化１７４】
2017514802.tif 000174
ここで、「Ｐ２」は、保護基であり、「Ｂ」は核酸塩基または核酸塩基類縁体であり、「ＳＭ」は、糖部位または糖部位の類縁体であり、「Ａ１」はＨまたは−Ｃ（Ｏ）ＯＲ６０（例えば、−Ｃ（Ｏ）ＯＣ（ＣＨ３）３）であり、Ｒ６０はｔｅｒｔ−アルキルであり、Ｌ１は、リンカーであるか、または化学物質がなく、Ｓ１は固相担体であり、「ＰＭ＊」は、前記結合反応後のリン含有部位であり、「ＰＭ＊＊」は、化学修飾されたリン含有部位であり、
６）ステップ「３」および「４」を繰り返して、以下の構造のうちの１つのオリゴマーまたは修飾されたオリゴマーを提供するステップと、
【化１７５】
2017514802.tif 000175
【化１７６】
2017514802.tif 000176
【化１７７】
2017514802.tif 000177
【化１７８】
2017514802.tif 000178
ここで、「Ｐ１」および「Ｐ２」は、独立して、保護基であり、「Ｂ」は、核酸塩基または核酸塩基類縁体であり、「ＳＭ」は糖部位または糖部位の類縁体であり、「Ａ１」は、Ｈまたは−Ｃ（Ｏ）ＯＲ６０（例えば、−Ｃ（Ｏ）ＯＣ（ＣＨ３）３）であり、Ｒ６０はｔｅｒｔ−アルキルであり、Ｌ１は、リンカーであるか、または化学物質がなく、Ｓ１は、固相担体であり、「ＰＭ＊」は、前記結合反応後のリン含有部位であり、「ＰＭ＊＊」は、化学修飾されたリン含有部位であり、「ｎ」は１〜２００の範囲にある整数であり、
７）前記ダイマー、修飾されたダイマー、オリゴヌクレオチドまたは修飾されたオリゴヌクレオチドを脱保護し、前記固相担体から、それを除去し、前記ＰＭ＊またはＰＭ＊＊部位を化学修飾して、以下の構造のうちの１つの化合物を提供するステップと、
【化１７９】
2017514802.tif 000179
ここで、「ｎ」は、１〜２００の範囲にある整数であり、「Ｂ」は、核酸塩基または核酸塩基類縁体であり、「ＳＭ」は、糖部位または糖部位の類縁体であり、少なくとも１つの「Ａ１」は、−Ｃ（Ｏ）ＯＲ６０であり、Ｒ６０はｔｅｒｔ−アルキルであり、「Ｑ」はＯまたはＳである、を備えるオリゴヌクレオチドの合成方法。
【請求項２５】
前記方法のステップ「７」におけるオリゴマーは、以下の構造であり、
【化１８０】
2017514802.tif 000180
ここで、「Ａ１」は、−Ｈまたは−Ｃ（Ｏ）ＯＲ６０であり、Ｒ６０は、ｔｅｒｔ−アルキルであり、「Ｂ」は、核酸塩基または核酸塩基類縁体であり、「Ｑ」は、ＯまたはＳである、請求項２４に記載のオリゴヌクレオチドの合成方法。
【請求項２６】
ポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）を用いて、ＤＮＡを増幅する方法であって、
該方法は、
核酸塩基の環構造上または該環構造内にある窒素原子上に少なくとも１つの熱に不安定な保護基を有する、１以上のデオキシヌクレオチド三リン酸を使用することを備え、前記保護基は、構造が−Ｃ（Ｏ）ＯＲ４であり、Ｒ４は、ｔｅｒｔ−アルキルである、
ＤＮＡの増幅方法。
【請求項２７】
前記方法は、以下のステップ、すなわち、
１）ターゲットＤＮＡと、ＤＭＡポリメラーゼと、プライマーと、デオキシヌクレオチド三リン酸（ｄＮＴＰ）とを含む反応混合物を提供するステップと、ここで、１以上のｄＮＴＰは、以下の構造のうちの１つであり、
【化１８１】
2017514802.tif 000181
【化１８２】
2017514802.tif 000182
ここで、「ＴＰ」は、三リン酸であり、「Ａ１」は、−Ｃ（Ｏ）ＯＲ６０であり、Ｒ６０は、ｔｅｒｔ−アルキルであり、
【化１８３】
2017514802.tif 000183
【化１８４】
2017514802.tif 000184
ここで、「ＴＰ」は、三リン酸であり、「Ａ１」は、−Ｃ（Ｏ）ＯＲ６０であり、Ｒ６０は、ｔｅｒｔ−アルキルであり、
【化１８５】
2017514802.tif 000185
【化１８６】
2017514802.tif 000186
ここで、「ＴＰ」は、三リン酸であり、「Ａ１」は、−Ｃ（Ｏ）ＯＲ６０であり、Ｒ６０は、ｔｅｒｔ−アルキルであり、
【化１８７】
2017514802.tif 000187
ここで、「ＴＰ」は、三リン酸であり、「Ａ１」は、−Ｃ（Ｏ）ＯＲ６０であり、Ｒ６０は、ｔｅｒｔ−アルキルであり、
２）所定時間前記反応混合物を加熱し、前記ターゲットＤＮＡを変性させ、これにより、一本鎖ＤＮＡ鋳型を提供するステップと、
３）所定時間前記反応混合物の温度を下げて、これにより、プライマーを前記一本鎖ＤＮＡ鋳型にアニールすることを可能にして、プライマー−鋳型複合物を提供し、前記プライマー−鋳型複合物への前記ＤＮＡポリメラーゼの結合を可能にするステップと、
４）前記反応混合物を加熱して、５’から３’の方向に前記ｄＮＴＰを前記ＤＮＡ鋳型に添加することによって、前記ＤＮＡポリメラーゼが、前記ターゲットＤＮＡと相補的となるＤＮＡ鎖を合成することを可能にするステップと、を備え、
これにより、ＤＮＡを増幅する、
請求項２６に記載のＤＮＡの増幅方法。
【請求項２８】
ポリメラーゼ連鎖反応を用いてＤＮＡを増幅する方法であって、
前記方法は、
１個以上のプライマーであって、前記プライマーの核酸塩基の環構造上または前記環構造内にある窒素原子上の１以上の熱に不安定な保護基を有する１個以上のプライマーを用いることを備え、
前記保護基は、構造が−Ｃ（Ｏ）ＯＲ４であり、Ｒ４はｔｅｒｔ−アルキルである、
ＤＮＡの増幅方法。
【請求項２９】
前記方法は、以下のステップ、すなわち、
１）ターゲットＤＮＡと、ＤＮＡポリメラーゼと、プライマーと、デオキシヌクレオチド三リン酸とを含む反応混合物を提供するステップと、ここで、１以上のプライマーは、以下の構造であり、
【化１８８】
2017514802.tif 000188
ここで、「ｎ」は１〜５０の間の整数であり、「Ｂ」は核酸塩基であり、「Ａ」は、Ｈまたは構造が−Ｃ（Ｏ）ＯＲ６０である熱に不安定な保護基のいずれかであり、Ｒ６０はｔｅｒｔ−アルキルであるが、少なくとも１つの「Ａ」は熱に不安定な保護基であり、
２）所定時間前記反応混合物を加熱し、前記ターゲットＤＮＡを変性させ、これにより、一本鎖ＤＮＡ鋳型を提供するステップと、
３）所定時間前記反応混合物の温度を下げて、これにより、プライマーを前記一本鎖ＤＮＡ鋳型にアニールすることを可能にして、プライマー−鋳型複合物を提供し、前記プライマー−鋳型複合物への前記ＤＮＡポリメラーゼの結合を可能にするステップと、
４）前記反応混合物を加熱して、５’から３’の方向に前記ｄＮＴＰを前記ＤＮＡ鋳型に添加することによって、前記ＤＮＡポリメラーゼが、前記ターゲットＤＮＡと相補的となるＤＮＡ鎖を合成することを可能にするステップと、を備え、
これにより、ＤＮＡを増幅する、
請求項２８に記載のＤＮＡの増幅方法。
【請求項３０】
患者の病気を治療する方法であって、
前記方法は、以下のステップ、すなわち、
１）化合物を、それを必要とする患者に塗布するステップと、ここで、前記化合物は、ヌクレオチド、ヌクレオチド類縁体、ヌクレオシドまたはヌクレオシド類縁体と、１以上の熱に不安定な保護基とを含み、少なくとも１つの熱に不安定な保護基は、構造が−Ｃ（Ｏ）ＯＲ８であり、Ｒ８はｔｅｒｔ−アルキル基であり、
２）前記患者の１以上の領域に熱エネルギーを与えて、その結果、前記ヌクレオチド、ヌクレオチド類縁体、ヌクレオシド、またはヌクレオシド類縁体を熱的に脱保護するステップと、を備え、
これにより、前記病気を治療する、
患者の病気の治療方法。
【請求項３１】
塗布される化合物は、以下の構造のうちの１であり、
【化１８９】
2017514802.tif 000189
【化１９０】
2017514802.tif 000190
ここで、「Ａ１」、「Ａ２」、および「Ａ３」は、独立して、−Ｈまたは熱に不安定な保護基であるが、Ａ１、Ａ２、またはＡ３の少なくとも１つは、構造が−Ｃ（Ｏ）ＯＲ６０である熱に不安定な保護基であり、Ｒ６０は、ｔｅｒｔ−アルキルであり、「Ｂ」は核酸塩基または核酸塩基類縁体である、請求項３０に記載の患者の病気の治療方法。
【請求項３２】
患者の病気を治療する方法であって、
前記方法は、以下のステップ、すなわち、
１）化合物を、それを必要とする患者に塗布するステップと、ここで、前記化合物は、オリゴヌクレオチドと１以上の熱に不安定な保護基とを含み、前記熱に不安定な保護基の少なくとも１つは、構造が−Ｃ（Ｏ）ＯＲ８であり、Ｒ８は、ｔｅｒｔ−アルキルであり、
２）前記患者の１以上の領域に熱エネルギーを与えて、その結果、前記オリゴヌクレオチドを熱により脱保護するステップと、を備え、
これにより、前記病気を治療する、
患者の病気の治療方法。
【請求項３３】
前記オリゴヌクレオチドは、ホミビルセンまたはミポメルセンである、
請求項３２に記載の患者の病気の治療方法。
【請求項３４】
ヌクレオシドまたはヌクレオシド類縁体の三リン酸を製造する方法であって、
前記方法は、以下のステップ、すなわち、
１）以下の構造のヌクレオシドまたはヌクレオシド類縁体を含む反応混合物にモノリン薬剤を加えるステップであって、
【化１９１】
2017514802.tif 000191
ここで、ＹはＯＰ１であり、Ｐ１は保護基であり、ＺはＨまたはＯＰ２であり、Ｐ２は保護基であり、Ｂは核酸塩基または核酸塩基類縁体であり、Ａは、構造が−Ｃ（Ｏ）ＯＲ６０である熱に不安定な保護基であり、Ｒ６０は、ｔｅｒｔ−アルキルである、
以下の構造のモノリン酸化された中間体を提供するステップと、
【化１９２】
2017514802.tif 000192
ここで、ＹはＯＰ１であり、Ｐ１は保護基であり、ＺはＨまたはＯＰ２であり、Ｐ２は保護基であり、Ｂは核酸塩基または核酸塩基類縁体であり、Ａは、その構造が−Ｃ（Ｏ）ＯＲ６０である熱に不安定な保護基であり、Ｒ６０はｔｅｒｔ−アルキルであり、「ＰＭ」は、単一のリン原子を含む部位であり、
２）前記リン酸化された中間体にポリリン薬剤を加えて、以下の構造のポリリン酸化された中間体を提供するステップと、
【化１９３】
2017514802.tif 000193
ここで、ＹはＯＰ１であり、Ｐ１は保護基であり、ＺはＨまたはＯＰ２であり、Ｐ２は保護基であり、Ｂは核酸塩基または核酸塩基類縁体であり、Ａは、構造が−Ｃ（Ｏ）ＯＲ６０である熱に不安定な保護基であり、Ｒ６０はｔｅｒｔ−アルキルであり、「ＰＰ」は、複数のリン原子を含む部位であり、
３）ポリリン酸化された中間体を加水分解し、Ｐ１を除去して、以下の構造のヌクレオシド酸リン酸またはヌクレオシド類縁体の三リン酸を提供するステップと、
【化１９４】
2017514802.tif 000194
ここで、ＹはＯＰ１であり、Ｐ１は保護基であり、ＺはＨまたはＯＰ２であり、Ｐ２は保護基であり、Ｂは核酸塩基または核酸塩基類縁体であり、Ａは、構造が−Ｃ（Ｏ）ＯＲ６０である熱に不安定な保護基であり、Ｒ６０はｔｅｒｔ−アルキルである、を備えるヌクレオシドまたはヌクレオシド類縁体の三リン酸の製造方法。
【請求項３５】
ヌクレオシド、ヌクレオシド類縁体、ヌクレオチド、およびヌクレオチド類縁体を脱保護する方法であって、
保護される化合物は、構造がＸＯ−ＳＭ−Ｂ−Ａであり、「Ｘ」はＨ、保護基、固相担体、リン含有部位またはその塩であり、「ＳＭ」は、糖部位または糖部位の類縁体であり、「Ｂ」は塩基部位または塩基部位の類縁体であり、「Ａ」は、前記塩基部位上または該部位内にある１個以上の窒素原子に結合される１個以上の部位であり、構造が−Ｃ（Ｏ）Ｒ６０であり、Ｒ６０は、ｔｅｒｔ−アルキル基であり、
前記方法は、以下のステップ、すなわち、
ｐＨが７．０より大きい溶媒の存在下において、９０℃〜１００℃の範囲の温度で、４５分未満の間、前記化合物を加熱するステップを備え、
これにより、前記脱保護された化合物を提供する、
脱保護方法。
【請求項３６】
以下の構造のオリゴヌクレオチドを脱保護する方法であって、
【化１９５】
2017514802.tif 000195
ここで、「ＰＬ１」および「ＰＬ２」は、独立して、Ｈまたは−Ｐ（Ｏ）（ＯＨ）Ｏ−若しくはその類縁体のいずれかであり、「Ｎｕ１」および「Ｎｕ２」は、独立して、置換基がないか、ヌクレオシド若しくはヌクレオシド類縁体、またはオリゴヌクレオチドであり、「ＳＭ」は、糖部位または糖部位の類縁体であり、「Ｂ」は、核酸塩基または核酸塩基類縁体であり、「Ａ」は、前記核酸塩基部位上または該部位内にある１個以上の窒素原子に結合される１個以上の部位であり、構造が−Ｃ（Ｏ）ＯＲ６０であり、Ｒ６０は、ｔｅｒｔ−アルキル基であり、
前記方法は、以下のステップ、
ｐＨが７．０より大きい溶媒の存在下において、９０℃〜１００℃の範囲の温度で、４５分未満の間、前記化合物を加熱するステップを備え、
これにより、前記脱保護された化合物を提供する、
脱保護方法。
【請求項３７】
オリゴヌクレオチド合成のための装置であって、
該装置は、
ａ）前記オリゴヌクレオチドの合成のために用いられる化学薬剤を含む１以上の貯槽であって、合成室に種々の薬剤を流入させることができるシステム内に動作可能に接続される貯槽と、
ｂ）オリゴヌクレオチド合成を伴う種々の化学反応が実行される合成室への薬剤流れを誘発する機構と、
前記合成室は、その温度を制御するための内部または外部の手段を備える、
オリゴヌクレオチド合成のための装置。
【請求項３８】
前記合成室は、固相担体を含む合成カラムを備え、前記合成室の温度を制御する手段は、前記合成室内の前記薬剤の温度を制御する、
請求項３７に記載の装置。
【請求項３９】
前記合成室内の前記薬剤を加熱することは、構造−Ｃ（Ｏ）ＯＲ６０を有する基、ここで、Ｒ６０は、ｔｅｒｔ−アルキル基である、を除去することによって、前記オリゴヌクレオチドの脱保護を誘発し、ここで、Ｒ６０はｔｅｒｔ−アルキル基である、
請求項３８に記載の装置。
【請求項４０】
前記オリゴヌクレオチドを加熱することは、前記固相担体からの前記オリゴヌクレオチドの開裂を誘発させる、
請求項３９に記載の装置。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００１１
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００１１】
【図１】図１は、ポリマー（例えば、ＤＮＡオリゴマー）を合成するために使用される装置の概略図である。
【図２】図２は、オリゴヌクレオチド中でのＢｏｃ保護されたｄＣの脱保護の経時変化を示すグラフである。
【図３】図３は、オリゴヌクレオチド中でのＢｏｃ保護されたｄＡの脱保護の経時変化を示すグラフである。
【図４】図４は、オリゴヌクレオチド中でのＢｏｃ保護されたｒＣの脱保護の経時変化を示すグラフである。
【図５】図５は、オリゴヌクレオチド中でのＢｏｃ保護されたｒＡの脱保護の経時変化を示すグラフである。
【図６】図６は、Ｂｏｃ保護されたプライマーの加熱前のＨＰＬＣ測定結果を示す図である。
【図７】図７は、Ｂｏｃ保護されたプライマーの加熱前のＥＳＭＳ測定結果を示す図である。
【図８】図８は、Ｂｏｃ保護されたプライマーの加熱後のＨＰＬＣ測定結果を示す図である。
【図９】図９は、Ｂｏｃ保護されたプライマーの加熱後のＥＳＭＳ測定結果を示す図である。
【手続補正３】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０３０７
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０３０７】
上記の構造１４３および構造１４４の置換基は以下の通りである。「Ｂ」は核酸塩基または核酸塩基類縁体であり、「Ａ１」は−Ｈまたは−Ｃ（Ｏ）Ｒ４（例えば、−Ｃ（Ｏ）ＯＣ（ＣＨ３）３）である。ここで、Ｒ４はｔｅｒｔ−アルキルであり、Ｌ１はリンカーであるか、または化学物質がなく、Ｓ１は固相担体である。
【手続補正４】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０５７２
【補正方法】削除
【補正の内容】
【手続補正５】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０５７４
【補正方法】削除
【補正の内容】
【手続補正６】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０５７６
【補正方法】削除
【補正の内容】
【手続補正７】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０５７７
【補正方法】削除
【補正の内容】
【手続補正８】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０５８２
【補正方法】削除
【補正の内容】
【手続補正９】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０５８３
【補正方法】削除
【補正の内容】
【手続補正１０】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０５８５
【補正方法】削除
【補正の内容】
【手続補正１１】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０５８６
【補正方法】削除
【補正の内容】
【手続補正１２】
【補正対象書類名】図面
【補正対象項目名】図２
【補正方法】追加
【補正の内容】
【図２】
2017514802.tif 000196
【手続補正１３】
【補正対象書類名】図面
【補正対象項目名】図３
【補正方法】追加
【補正の内容】
【図３】
2017514802.tif 000197
【手続補正１４】
【補正対象書類名】図面
【補正対象項目名】図４
【補正方法】追加
【補正の内容】
【図４】
2017514802.tif 000198
【手続補正１５】
【補正対象書類名】図面
【補正対象項目名】図５
【補正方法】追加
【補正の内容】
【図５】
2017514802.tif 000199
【手続補正１６】
【補正対象書類名】図面
【補正対象項目名】図６
【補正方法】追加
【補正の内容】
【図６】
2017514802.tif 000200
【手続補正１７】
【補正対象書類名】図面
【補正対象項目名】図７
【補正方法】追加
【補正の内容】
【図７】
2017514802.tif 000201
【手続補正１８】
【補正対象書類名】図面
【補正対象項目名】図８
【補正方法】追加
【補正の内容】
【図８】
2017514802.tif 000202
【手続補正１９】
【補正対象書類名】図面
【補正対象項目名】図９
【補正方法】追加
【補正の内容】
【図９】
2017514802.tif 000203