【手続補正書】
【提出日】平成30年3月23日(2018.3.23)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
インテグリンベータ７アンタゴニストを含む治療に対する胃腸炎症性障害に罹患している患者の応答を予測する方法であって、
患者から生物学的試料を入手すること；
ＧＺＭＡ、ＫＬＲＢ１、ＦＯＸＭ１、ＣＣＤＣ９０Ａ、ＣＣＬ４、ＣＰＡ２、ＣＸＣＲ６、ＤＤＯ、ＥＣＨ１、ＦＡＭ１２５Ｂ、ＦＡＳＬＧ、ＦＧＦ９、ＧＰＲ１５、ＧＺＭＢ、ＫＣＮＭＡ１、ＰＨＦ１４、ＴＩＦＡＢ、ＴＭＥＭ２００Ａ、ＴＭＩＧＤ２、及びＳＬＣ８Ａ３から選択される、試料中の少なくとも一つ、少なくとも二つ、少なくとも三つ、又は少なくとも四つの高発現予測遺伝子（「ＨＥＰＧ」）のｍＲＮＡ発現のレベルを測定すること；
試料中で検出されたｍＲＮＡ発現レベルを測定されたＨＥＰＧの各々の基準レベルに対して比較すること；及び
測定されたＨＥＰＧのそれぞれについての各基準レベルと比較して、ＨＥＰＧのそれぞれについてのｍＲＮＡ発現のレベルが上昇していると測定された場合に、患者が治療に応答するであろうと予測すること
を含む方法。
【請求項２】
インテグリンベータ７アンタゴニスト治療に対する胃腸炎症性障害患者の応答性を予測する方法であって、患者からの生物学的試料中の、ＧＺＭＡ、ＫＬＲＢ１、ＦＯＸＭ１、ＣＣＤＣ９０Ａ、ＣＣＬ４Ｌ１．２、ＣＰＡ２、ＣＸＣＲ６、ＤＤＯ、ＥＣＨ１、ＦＡＭ１２５Ｂ、ＦＡＳＬＧ、ＦＧＦ９、ＧＰＲ１５、ＧＺＭＢ、ＫＣＮＭＡ１、ＰＨＦ１４、ＴＩＦＡＢ、ＴＭＥＭ２００Ａ、ＴＭＩＧＤ２、及びＳＬＣ８Ａ３から選択される少なくとも一つ、少なくとも二つ、少なくとも三つ、又は少なくとも四つのＨＥＰＧのｍＲＮＡの発現レベルを測定することを含み、ここで測定されたＨＥＰＧのそれぞれについての各基準レベルと比較して、測定されたＨＥＰＧのそれぞれの上昇したｍＲＮＡ発現レベルが、患者をインテグリンベータ７アンタゴニスト治療に応答する可能性が高い者と同定する方法。
【請求項３】
胃腸炎症性障害に罹患している患者をインテグリンベータ７アンタゴニストを含む治療に応答する可能性が高いと同定する方法であって、
（ａ）患者からの生物学的試料中の、ＧＺＭＡ、ＫＬＲＢ１、ＦＯＸＭ１、ＣＣＤＣ９０Ａ、ＣＣＬ４、ＣＰＡ２、ＣＸＣＲ６、ＤＤＯ、ＥＣＨ１、ＦＡＭ１２５Ｂ、ＦＡＳＬＧ、ＦＧＦ９、ＧＰＲ１５、ＧＺＭＢ、ＫＣＮＭＡ１、ＰＨＦ１４、ＴＩＦＡＢ、ＴＭＥＭ２００Ａ、ＴＭＩＧＤ２、及びＳＬＣ８Ａ３から選択される少なくとも一つ、少なくとも二つ、少なくとも三つ、又は少なくとも四つのＨＥＰＧのｍＲＮＡ発現のレベルを測定すること；
（ｂ）（ａ）において測定された各ＨＥＰＧのｍＲＮＡ発現のレベルを測定された各ＨＥＰＧのそれぞれについての基準レベルに対して比較すること；及び
（ｃ）（ａ）において測定された各ＨＥＰＧのｍＲＮＡ発現のレベルが測定されたＨＥＰＧのそれぞれについての各基準レベルよりも高い場合、患者を、インテグリンベータ７アンタゴニストを含む治療に応答する可能性がより高いと同定すること
を含む方法。
【請求項４】
胃腸炎症性障害を有する患者を治療する方法であって、
（ａ）患者からの生物学的試料中の、ＧＺＭＡ、ＫＬＲＢ１、ＦＯＸＭ１、ＣＣＤＣ９０Ａ、ＣＣＬ４、ＣＰＡ２、ＣＸＣＲ６、ＤＤＯ、ＥＣＨ１、ＦＡＭ１２５Ｂ、ＦＡＳＬＧ、ＦＧＦ９、ＧＰＲ１５、ＧＺＭＢ、ＫＣＮＭＡ１、ＰＨＦ１４、ＴＩＦＡＢ、ＴＭＥＭ２００Ａ、ＴＭＩＧＤ２、及びＳＬＣ８Ａ３から選択される少なくとも一つ、少なくとも二つ、少なくとも三つ、又は少なくとも四つのＨＥＰＧのｍＲＮＡ発現のレベルを測定すること；
（ｂ）（ａ）において測定された各ＨＥＰＧのｍＲＮＡ発現のレベルを測定されたＨＥＰＧのそれぞれについての基準レベルに対して比較すること；
（ｃ）（ａ）において測定された各ＨＥＰＧのｍＲＮＡ発現のレベルが測定されたＨＥＰＧのそれぞれについての各基準レベルよりも高い場合、患者を、インテグリンベータ７アンタゴニストを含む治療に応答する可能性がより高いと同定すること；及び
（ｄ）（ａ）において測定された各ＨＥＰＧのｍＲＮＡ発現のレベルが測定されたＨＥＰＧのそれぞれについての各基準レベルよりも高い場合、治療法を施し、それにより胃腸炎症性障害を治療すること
を含む方法。
【請求項５】
インテグリンベータ７アンタゴニストを含む治療に対する胃腸炎症性障害に罹患している患者の応答を予測する方法であって、
患者から生物学的試料を入手すること；
ＳＬＣ８Ａ３、ＴＮＦＳＦ１５、ＢＥＳＴ２、ＣＣＬ２、ＣＣＬ３、ＣＣＬ３Ｌ１／３、ＣＰＡ３、ＦＧＦ７、ＨＡＭＰ、ＩＬ１Ａ、ＩＬ１８ＲＡＰ、ＩＮＨＢＡ、ＬＩＦ、ＬＭＯ４、ＬＲＲＣ４、ＭＬＫ７．ＡＳ１、ＭＴ１Ｍ、ＭＵＣＬ１、ＭＸ１、ＰＭＣＨ、ＲＥＭ２、ＳＳＴＲ２、ＴＭ４ＳＦ４、ＴＭＥＭ１５４、ＵＲＯＳ、ＶＮＮ２、及びＶＮＮ３から選択される、試料中の少なくとも一つ、少なくとも二つ、又は少なくとも三つの低発現予測遺伝子（「ＬＥＰＧ」）のｍＲＮＡ発現のレベルを測定すること；
試料中で測定されたＬＥＰＧの各々のｍＲＮＡ発現レベルを測定されたＬＥＰＧの各々の基準レベルに対して比較すること；及び
測定されたＬＥＰＧのそれぞれについての各基準レベルと比較して、測定されたＬＥＰＧのそれぞれについてのｍＲＮＡ発現のレベルが減少していると測定された場合に、患者が治療に応答するであろうと予測すること
を含む方法。
【請求項６】
インテグリンベータ７アンタゴニスト治療に対する胃腸炎症性障害患者の応答性を予測する方法であって、患者からの生物学的試料中の、ＳＬＣ８Ａ３、ＴＮＦＳＦ１５、ＢＥＳＴ２、ＣＣＬ２、ＣＣＬ３、ＣＣＬ３Ｌ１／３、ＣＰＡ３、ＦＧＦ７、ＨＡＭＰ、ＩＬ１Ａ、ＩＬ１８ＲＡＰ、ＩＮＨＢＡ、ＬＩＦ、ＬＭＯ４、ＬＲＲＣ４、ＭＬＫ７．ＡＳ１、ＭＴ１Ｍ、ＭＵＣＬ１、ＭＸ１、ＰＭＣＨ、ＲＥＭ２、ＳＳＴＲ２、ＴＭ４ＳＦ４、ＴＭＥＭ１５４、ＵＲＯＳ、ＶＮＮ２、及びＶＮＮ３から選択される少なくとも一つ、少なくとも二つ、又は少なくとも三つのＬＥＰＧのｍＲＮＡの発現レベルを測定することを含み、ここで測定されたＬＥＰＧのそれぞれについての各基準レベルと比較して、測定されたＬＥＰＧのそれぞれの減少したｍＲＮＡ発現レベルが、患者を、インテグリンベータ７アンタゴニスト治療に応答する可能性が高い者と同定する方法。
【請求項７】
胃腸炎症性障害に罹患している患者をインテグリンベータ７アンタゴニストを含む治療に応答する可能性が高いと同定する方法であって、
（ａ）患者からの生物学的試料中の、ＳＬＣ８Ａ３、ＴＮＦＳＦ１５、ＢＥＳＴ２、ＣＣＬ２、ＣＣＬ３、ＣＣＬ３Ｌ１／３、ＣＰＡ３、ＦＧＦ７、ＨＡＭＰ、ＩＬ１Ａ、ＩＬ１８ＲＡＰ、ＩＮＨＢＡ、ＬＩＦ、ＬＭＯ４、ＬＲＲＣ４、ＭＬＫ７．ＡＳ１、ＭＴ１Ｍ、ＭＵＣＬ１、ＭＸ１、ＰＭＣＨ、ＲＥＭ２、ＳＳＴＲ２、ＴＭ４ＳＦ４、ＴＭＥＭ１５４、ＵＲＯＳ、ＶＮＮ２、及びＶＮＮ３から選択される少なくとも一つ、少なくとも二つ、又は少なくとも三つのＬＥＰＧのｍＲＮＡ発現のレベルを測定すること；
（ｂ）（ａ）において測定されたＬＥＰＧの各々のｍＲＮＡ発現のレベルを測定されたＬＥＰＧのそれぞれについての基準レベルに対して比較すること；及び
（ｃ）（ａ）において測定されたＬＥＰＧの各々のｍＲＮＡ発現のレベルが測定されたＬＥＰＧのそれぞれについての各基準レベルよりも低い場合、患者を、インテグリンベータ７アンタゴニストを含む治療に応答する可能性がより高いと同定すること
を含む方法。
【請求項８】
胃腸炎症性障害を有する患者を治療する方法であって、
（ａ）患者からの生物学的試料中の、ＳＬＣ８Ａ３、ＴＮＦＳＦ１５、ＢＥＳＴ２、ＣＣＬ２、ＣＣＬ３、ＣＣＬ３Ｌ１／３、ＣＰＡ３、ＦＧＦ７、ＨＡＭＰ、ＩＬ１Ａ、ＩＬ１８ＲＡＰ、ＩＮＨＢＡ、ＬＩＦ、ＬＭＯ４、ＬＲＲＣ４、ＭＬＫ７．ＡＳ１、ＭＴ１Ｍ、ＭＵＣＬ１、ＭＸ１、ＰＭＣＨ、ＲＥＭ２、ＳＳＴＲ２、ＴＭ４ＳＦ４、ＴＭＥＭ１５４、ＵＲＯＳ、ＶＮＮ２、及びＶＮＮ３から選択される少なくとも一つ、少なくとも二つ、又は少なくとも三つのＬＥＰＧのｍＲＮＡ発現のレベルを測定すること；
（ｂ）（ａ）において測定されたＬＥＰＧの各々のｍＲＮＡ発現のレベルを測定されたＬＥＰＧのそれぞれについての基準レベルに対して比較すること；
（ｃ）（ａ）において測定されたＬＥＰＧの各々のｍＲＮＡ発現のレベルが測定されたＬＥＰＧのそれぞれについての各基準レベルよりも低い場合、患者を、インテグリンベータ７アンタゴニストを含む治療に応答する可能性がより高いと同定すること；及び
（ｄ）（ａ）において測定されたＬＥＰＧの各々のｍＲＮＡ発現のレベルが測定されたＬＥＰＧのそれぞれについての各基準レベルよりも低い場合、治療法を施し、それにより胃腸炎症性障害を治療すること
を含む方法。
【請求項９】
インテグリンベータ７アンタゴニストを含む治療に対する胃腸炎症性障害に罹患している患者の応答を予測する方法であって、
（ａ）患者から生物学的試料を入手すること；
（ｂ）ＧＺＭＡ、ＫＬＲＢ１、ＦＯＸＭ１、ＣＣＤＣ９０Ａ、ＣＣＬ４、ＣＰＡ２、ＣＸＣＲ６、ＤＤＯ、ＥＣＨ１、ＦＡＭ１２５Ｂ、ＦＡＳＬＧ、ＦＧＦ９、ＧＰＲ１５、ＧＺＭＢ、ＫＣＮＭＡ１、ＰＨＦ１４、ＴＩＦＡＢ、ＴＭＥＭ２００Ａ、ＴＭＩＧＤ２、及びＳＬＣ８Ａ３から選択される、試料中の少なくとも一つ、少なくとも二つ、少なくとも三つ、又は少なくとも四つのＨＥＰＧのｍＲＮＡ発現のレベルを測定し、試料中で検出されたｍＲＮＡ発現レベルを測定されたＨＥＰＧのそれぞれについての基準レベル（「ＨＥＰＧ基準レベル」）に対して比較することを含み；更に
（ｃ）ＳＬＣ８Ａ３、ＴＮＦＳＦ１５、ＢＥＳＴ２、ＣＣＬ２、ＣＣＬ３、ＣＣＬ３Ｌ１／３、ＣＰＡ３、ＦＧＦ７、ＨＡＭＰ、ＩＬ１Ａ、ＩＬ１８ＲＡＰ、ＩＮＨＢＡ、ＬＩＦ、ＬＭＯ４、ＬＲＲＣ４、ＭＬＫ７．ＡＳ１、ＭＴ１Ｍ、ＭＵＣＬ１、ＭＸ１、ＰＭＣＨ、ＲＥＭ２、ＳＳＴＲ２、ＴＭ４ＳＦ４、ＴＭＥＭ１５４、ＵＲＯＳ、ＶＮＮ２、及びＶＮＮ３から選択される、試料中の少なくとも一つ、少なくとも二つ、又は少なくとも三つのＬＥＰＧのｍＲＮＡ発現のレベルを測定し、試料中で検出されたｍＲＮＡ発現レベルを測定されたＬＥＰＧのそれぞれについての基準レベル（「ＬＥＰＧ基準レベル」）に対して比較すること；及び
（ｄ）（ｂ）で測定されたＨＥＰＧの各々のｍＲＮＡ発現のレベルがＨＥＰＧ基準レベルと比較して上昇していると測定された場合、及び（ｃ）で測定されたＬＥＰＧの各々のｍＲＮＡ発現のレベルがＬＥＰＧ基準レベルと比較して減少していると測定された場合、患者が治療に応答するであろうと予測すること
を含む方法。
【請求項１０】
インテグリンベータ７アンタゴニスト治療に対する胃腸炎症性障害患者の応答性を予測する方法であって、
（ａ）患者からの生物学的試料中の、ＧＺＭＡ、ＫＬＲＢ１、ＦＯＸＭ１、ＣＣＤＣ９０Ａ、ＣＣＬ４、ＣＰＡ２、ＣＸＣＲ６、ＤＤＯ、ＥＣＨ１、ＦＡＭ１２５Ｂ、ＦＡＳＬＧ、ＦＧＦ９、ＧＰＲ１５、ＧＺＭＢ、ＫＣＮＭＡ１、ＰＨＦ１４、ＴＩＦＡＢ、ＴＭＥＭ２００Ａ、ＴＭＩＧＤ２、及びＳＬＣ８Ａ３から選択される少なくとも一つ、少なくとも二つ、少なくとも三つ、又は少なくとも四つのＨＥＰＧのｍＲＮＡ発現レベルを測定することを含み；
更に
（ｂ）患者からの生物学的試料中の、ＳＬＣ８Ａ３、ＴＮＦＳＦ１５、ＢＥＳＴ２、ＣＣＬ２、ＣＣＬ３、ＣＣＬ３Ｌ１／３、ＣＰＡ３、ＦＧＦ７、ＨＡＭＰ、ＩＬ１Ａ、ＩＬ１８ＲＡＰ、ＩＮＨＢＡ、ＬＩＦ、ＬＭＯ４、ＬＲＲＣ４、ＭＬＫ７．ＡＳ１、ＭＴ１Ｍ、ＭＵＣＬ１、ＭＸ１、ＰＭＣＨ、ＲＥＭ２、ＳＳＴＲ２、ＴＭ４ＳＦ４、ＴＭＥＭ１５４、ＵＲＯＳ、ＶＮＮ２、及びＶＮＮ３から選択される少なくとも一つ、少なくとも二つ、又は少なくとも三つのＬＥＰＧのｍＲＮＡ発現レベルを測定することを含み；
ここで、測定されたＨＥＰＧのそれぞれについての基準レベルと比較した、（ａ）において測定されたＨＥＰＧの各々の上昇したｍＲＮＡ発現レベル、及び測定されたＬＥＰＧのそれぞれについての基準レベルと比較した、（ｂ）において測定されたＬＥＰＧの各々の減少したｍＲＮＡ発現レベルが、患者を、インテグリンベータ７アンタゴニスト治療に応答する可能性が高い者と同定する方法。
【請求項１１】
胃腸炎症性障害に罹患している患者をインテグリンベータ７アンタゴニストを含む治療に応答する可能性が高いと同定する方法であって、
（ａ）患者からの生物学的試料中の、ＧＺＭＡ、ＫＬＲＢ１、ＦＯＸＭ１、ＣＣＤＣ９０Ａ、ＣＣＬ４、ＣＰＡ２、ＣＸＣＲ６、ＤＤＯ、ＥＣＨ１、ＦＡＭ１２５Ｂ、ＦＡＳＬＧ、ＦＧＦ９、ＧＰＲ１５、ＧＺＭＢ、ＫＣＮＭＡ１、ＰＨＦ１４、ＴＩＦＡＢ、ＴＭＥＭ２００Ａ、ＴＭＩＧＤ２、及びＳＬＣ８Ａ３から選択される少なくとも一つ、少なくとも二つ、少なくとも三つ、又は少なくとも四つのＨＥＰＧのｍＲＮＡ発現のレベルを測定すること；
（ｂ）（ａ）において測定されたＨＥＰＧの各々のｍＲＮＡ発現のレベルを測定されたＨＥＰＧのそれぞれについての基準レベル（「ＨＥＰＧ基準レベル」）に対して比較することを含み；更に
（ｃ）患者からの生物学的試料中の、ＳＬＣ８Ａ３、ＴＮＦＳＦ１５、ＢＥＳＴ２、ＣＣＬ２、ＣＣＬ３、ＣＣＬ３Ｌ１／３、ＣＰＡ３、ＦＧＦ７、ＨＡＭＰ、ＩＬ１Ａ、ＩＬ１８ＲＡＰ、ＩＮＨＢＡ、ＬＩＦ、ＬＭＯ４、ＬＲＲＣ４、ＭＬＫ７．ＡＳ１、ＭＴ１Ｍ、ＭＵＣＬ１、ＭＸ１、ＰＭＣＨ、ＲＥＭ２、ＳＳＴＲ２、ＴＭ４ＳＦ４、ＴＭＥＭ１５４、ＵＲＯＳ、ＶＮＮ２、及びＶＮＮ３から選択される少なくとも一つ、少なくとも二つ、又は少なくとも三つのＬＥＰＧのｍＲＮＡ発現のレベルを測定すること；
（ｄ）（ｃ）において測定されたＬＥＰＧの各々のｍＲＮＡ発現のレベルを測定されたＬＥＰＧのそれぞれについての基準レベル（「ＬＥＰＧ基準レベル」）に対して比較すること；及び
（ｅ）（ａ）において測定されたＨＥＰＧの各々のｍＲＮＡ発現のレベルがＨＥＰＧ基準レベルより高く、（ｃ）において測定されたＬＥＰＧの各々のｍＲＮＡ発現のレベルがＬＥＰＧ基準レベルより低い場合、患者を、インテグリンベータ７アンタゴニストを含む治療に応答する可能性がより高いと同定すること
を含む方法。
【請求項１２】
胃腸炎症性障害を有する患者を治療する方法であって、
（ａ）患者からの生物学的試料中の、ＧＺＭＡ、ＫＬＲＢ１、ＦＯＸＭ１、ＣＣＤＣ９０Ａ、ＣＣＬ４、ＣＰＡ２、ＣＸＣＲ６、ＤＤＯ、ＥＣＨ１、ＦＡＭ１２５Ｂ、ＦＡＳＬＧ、ＦＧＦ９、ＧＰＲ１５、ＧＺＭＢ、ＫＣＮＭＡ１、ＰＨＦ１４、ＴＩＦＡＢ、ＴＭＥＭ２００Ａ、ＴＭＩＧＤ２、及びＳＬＣ８Ａ３から選択される少なくとも一つ、少なくとも二つ、少なくとも三つ、又は少なくとも四つのＨＥＰＧのｍＲＮＡ発現のレベルを測定すること；
（ｂ）（ａ）において測定されたＨＥＰＧの各々のｍＲＮＡ発現のレベルを測定されたＨＥＰＧのそれぞれについての基準レベル（「ＨＥＰＧ基準レベル」）に対して比較することを含み；更に
（ｃ）患者からの生物学的試料中の、ＳＬＣ８Ａ３、ＴＮＦＳＦ１５、ＢＥＳＴ２、ＣＣＬ２、ＣＣＬ３、ＣＣＬ３Ｌ１／３、ＣＰＡ３、ＦＧＦ７、ＨＡＭＰ、ＩＬ１Ａ、ＩＬ１８ＲＡＰ、ＩＮＨＢＡ、ＬＩＦ、ＬＭＯ４、ＬＲＲＣ４、ＭＬＫ７．ＡＳ１、ＭＴ１Ｍ、ＭＵＣＬ１、ＭＸ１、ＰＭＣＨ、ＲＥＭ２、ＳＳＴＲ２、ＴＭ４ＳＦ４、ＴＭＥＭ１５４、ＵＲＯＳ、ＶＮＮ２、及びＶＮＮ３から選択される少なくとも一つ、少なくとも二つ、又は少なくとも三つのＬＥＰＧのｍＲＮＡ発現のレベルを測定すること；
（ｄ）（ｃ）において測定されたＬＥＰＧの各々のｍＲＮＡ発現のレベルを測定されたＬＥＰＧのそれぞれについての基準レベル（「ＬＥＰＧ基準レベル」）に対して比較すること；及び
（ｅ）（ａ）において測定されたＨＥＰＧの各々のｍＲＮＡ発現のレベルがＨＥＰＧ基準レベルより高く、（ｃ）において測定されたＬＥＰＧの各々のｍＲＮＡ発現のレベルがＬＥＰＧ基準レベルより低い場合、患者を、インテグリンベータ７アンタゴニストを含む治療に応答する可能性がより高いと同定すること；及び
（ｆ）（ａ）において測定されたＨＥＰＧの各々のｍＲＮＡ発現のレベルがＨＥＰＧ基準レベルより高く、（ｃ）において測定されたＬＥＰＧの各々のｍＲＮＡ発現のレベルがＬＥＰＧ基準レベルより低い場合、治療法を施し、それにより胃腸炎症性障害を治療すること
を含む方法。
【請求項１３】
更なるＨＥＰＧのｍＲＮＡ発現レベルを測定することを更に含み、更なるＨＥＰＧがＩＴＧＡＥである、請求項９−１２の何れか一項に記載の方法。
【請求項１４】
少なくとも一つ、少なくとも二つ、少なくとも三つ、又は少なくとも四つのＨＥＰＧが、ＧＺＭＡ、ＫＬＲＢ１、ＦＯＸＭ１、ＳＬＣ８Ａ３、及びＥＣＨ１から選択される、請求項１−４の何れか一項に記載の方法。
【請求項１５】
更なるＨＥＰＧのｍＲＮＡ発現レベルを測定することを更に含み、更なるＨＥＰＧがＩＴＧＡＥである、請求項１−４又は１４の何れか一項に記載の方法。
【請求項１６】
少なくとも一つ、少なくとも二つ、又は少なくとも三つのＬＥＰＧがＳＬＣ８Ａ３、ＴＮＦＳＦ１５、ＢＥＳＴ２、及びＣＣＬ２から選択される、請求項５−８の何れか一項に記載の方法。
【請求項１７】
少なくとも一つ、少なくとも二つ、少なくとも三つ、又は少なくとも四つのＨＥＰＧがＧＺＭＡ、ＫＬＲＢ１、ＦＯＸＭ１、ＳＬＣ８Ａ３、及びＥＣＨ１から選択され、少なくとも一つ、少なくとも二つ、又は少なくとも三つのＬＥＰＧがＳＬＣ８Ａ３、ＴＮＦＳＦ１５、ＢＥＳＴ２、ＶＮＮ２、及びＣＣＬ２から選択される、請求項９−１２の何れか一項に記載の方法。
【請求項１８】
更なるＨＥＰＧのｍＲＮＡ発現レベルを測定することを更に含み、更なるＨＥＰＧがＩＴＧＡＥである、請求項１７に記載の方法。
【請求項１９】
少なくとも一つ、少なくとも二つ、又は少なくとも三つのＬＥＰＧがＳＬＣ８Ａ３、ＶＮＮ２、及びＴＮＦＳＦ１５から選択される、請求項１８に記載の方法。
【請求項２０】
インテグリンベータ７アンタゴニストの１０５ｍｇが４週ごとに１回皮下投与される、請求項４、８又は１２の何れか一項に記載の方法。
【請求項２１】
インテグリンベータ７アンタゴニストの２１０ｍｇの初回用量が皮下投与され、続いて初回用量の２週間後にインテグリンベータ７アンタゴニストの２１０ｍｇの第一の後続用量が皮下投与され、初回用量の４週間後にインテグリンベータ７アンタゴニストの２１０ｍｇの第二の後続用量が皮下投与され、初回用量の８週間後にインテグリンベータ７アンタゴニストの２１０ｍｇの第三の後続用量が皮下投与され、初回用量の１２週間後にインテグリンベータ７アンタゴニストの２１０ｍｇの第四の後続用量が皮下投与される、請求項４、８、又は１２の何れか一項に記載の方法。
【請求項２２】
胃腸炎症性障害が炎症性腸疾患である、請求項１−２１の何れか一項に記載の方法。
【請求項２３】
炎症性腸疾患が潰瘍性大腸炎又はクローン病である、請求項２２に記載の方法。
【請求項２４】
炎症性腸疾患が潰瘍性大腸炎であり、応答が臨床応答、粘膜治癒及び寛解から選択される、請求項２３に記載の方法。
【請求項２５】
生物学的試料が腸組織及び末梢全血から選択される、請求項１−２４の何れか一項に記載の方法。
【請求項２６】
ｍＲＮＡ発現レベルがＲＮＡ配列決定法、マイクロアレイ又はＰＣＲ法によって測定される、請求項２５に記載の方法。
【請求項２７】
ＰＣＲ法がｑＰＣＲを含む、請求項２６に記載の方法。
【請求項２８】
測定がＧＺＭＡ、ＫＬＲＢ１、ＦＯＸＭ１、ＣＣＤＣ９０Ａ、ＣＣＬ４、ＣＰＡ２、ＣＸＣＲ６、ＤＤＯ、ＥＣＨ１、ＦＡＭ１２５Ｂ、ＦＡＳＬＧ、ＦＧＦ９、ＧＰＲ１５、ＧＺＭＢ、ＫＣＮＭＡ１、ＰＨＦ１４、ＴＩＦＡＢ、ＴＭＥＭ２００Ａ、ＴＭＩＧＤ２、ＳＬＣ８Ａ３のうちの一又は複数のｍＲＮＡを増幅することを含み、任意で更に、ＩＴＧＡＥを増幅すること、及び増幅されたｍＲＮＡを検出すること、それにより増幅されたｍＲＮＡのレベルを測定することを含む、請求項２７に記載の方法。
【請求項２９】
測定がＳＬＣ８Ａ３、ＴＮＦＳＦ１５、ＢＥＳＴ２、ＣＣＬ２、ＣＣＬ３、ＣＣＬ３Ｌ１／３、ＣＰＡ３、ＦＧＦ７、ＨＡＭＰ、ＩＬ１Ａ、ＩＬ１８ＲＡＰ、ＩＮＨＢＡ、ＬＩＦ、ＬＭＯ４、ＬＲＲＣ４、ＭＬＫ７．ＡＳ１、ＭＴ１Ｍ、ＭＵＣＬ１、ＭＸ１、ＰＭＣＨ、ＲＥＭ２、ＳＳＴＲ２、ＴＭ４ＳＦ４、ＴＭＥＭ１５４、ＵＲＯＳ、ＶＮＮ２、ＶＮＮ３のうちの一又は複数のｍＲＮＡを増幅すること、及び増幅されたｍＲＮＡを検出すること、それにより増幅されたｍＲＮＡのレベルを測定することを含む、請求項２７に記載の方法。
【請求項３０】
基準レベルの各々が中央値である、請求項１−８の何れか一項に記載の方法。
【請求項３１】
ＨＥＰＧ基準レベルが中央値であり、ＬＥＰＧ基準レベルが中央値である、請求項９−１２の何れか一項に記載の方法。
【請求項３２】
患者が以前に抗ＴＮＦ治療薬により治療されていない、請求項１−３１の何れか一項に記載の方法。
【請求項３３】
インテグリンベータ７アンタゴニストの投与が次の（１）から（３）の一つ以上をもたらす、請求項２４に記載の方法：（１）ＭＣＳがベースラインから３ポイント減少及び３０％低下と、直腸出血サブスコアが≧１ポイント減少又は絶対直腸出血スコアが０もしくは１、（２）内視鏡検査サブスコアが０又は１、（３）＞１の個々のサブスコアなしでＭＣＳ≦２。
【請求項３４】
インテグリンベータ７アンタゴニストを用いる治療的処置に対する可能性のある応答者及び非応答者に患者を層別化するために、胃腸炎症性障害に罹患している患者から得られた生物学的試料中の、ＧＺＭＡ、ＫＬＲＢ１、ＦＯＸＭ１、ＣＣＤＣ９０Ａ、ＣＣＬ４Ｌ１．２、ＣＰＡ２、ＣＸＣＲ６、ＤＤＯ、ＥＣＨ１、ＦＡＭ１２５Ｂ、ＦＡＳＬＧ、ＦＧＦ９、ＧＰＲ１５、ＧＺＭＢ、ＫＣＮＭＡ１、ＰＨＦ１４、ＴＩＦＡＢ、ＴＭＥＭ２００Ａ、ＴＭＩＧＤ２、及びＳＬＣ８Ａ３から選択される少なくとも一つ、少なくとも二つ、少なくとも三つ、又は少なくとも四つのマーカーのｍＲＮＡレベルを決定するためのキットの使用。
【請求項３５】
キットがＧＺＭＡ、ＫＬＲＢ１、ＦＯＸＭ１、ＳＬＣ８Ａ３、及びＥＣＨ１から選択される少なくとも一つ、少なくとも二つ、少なくとも三つ、又は少なくとも四つのマーカーのｍＲＮＡレベルを決定するためである、請求項３４に記載の使用。
【請求項３６】
キットがＩＴＧＡＥのｍＲＮＡレベルを更に決定するためである、請求項３４又は請求項３５に記載の使用。
【請求項３７】
インテグリンベータ７アンタゴニストを用いる治療的処置に対する可能性のある応答者及び非応答者に患者を層別化するための、胃腸炎症性障害に罹患している患者から得られた生物学的試料中の、ＳＬＣ８Ａ３、ＴＮＦＳＦ１５、ＢＥＳＴ２、ＣＣＬ２、ＣＣＬ３、ＣＣＬ３Ｌ１／３、ＣＰＡ３、ＦＧＦ７、ＨＡＭＰ、ＩＬ１Ａ、ＩＬ１８ＲＡＰ、ＩＮＨＢＡ、ＬＩＦ、ＬＭＯ４、ＬＲＲＣ４、ＭＬＫ７．ＡＳ１、ＭＴ１Ｍ、ＭＵＣＬ１、ＭＸ１、ＰＭＣＨ、ＲＥＭ２、ＳＳＴＲ２、ＴＭ４ＳＦ４、ＴＭＥＭ１５４、ＵＲＯＳ、ＶＮＮ２、及びＶＮＮ３から選択される少なくとも一つ、少なくとも二つ、又は少なくとも三つのマーカーのｍＲＮＡレベルを決定するためのキットの使用。
【請求項３８】
キットがＳＬＣ８Ａ３、ＴＮＦＳＦ１５、ＢＥＳＴ２、及びＣＣＬ２から選択される少なくとも一つ、少なくとも二つ、又は少なくとも三つのマーカーのｍＲＮＡレベルを決定するためである、請求項３７に記載の使用。
【請求項３９】
キットがＩＴＧＡＥのｍＲＮＡレベルを更に決定するためである、請求項３７又は請求項３８に記載の使用。
【請求項４０】
（ａ）患者から得られた試料中の、ＧＺＭＡ、ＫＬＲＢ１、ＦＯＸＭ１、ＣＣＤＣ９０Ａ、ＣＣＬ４Ｌ１．２、ＣＰＡ２、ＣＸＣＲ６、ＤＤＯ、ＥＣＨ１、ＦＡＭ１２５Ｂ、ＦＡＳＬＧ、ＦＧＦ９、ＧＰＲ１５、ＧＺＭＢ、ＫＣＮＭＡ１、ＰＨＦ１４、ＴＩＦＡＢ、ＴＭＥＭ２００Ａ、ＴＭＩＧＤ２、及びＳＬＣ８Ａ３から選択される少なくとも一つ、少なくとも二つ、少なくとも三つ、又は少なくとも四つのマーカーのｍＲＮＡレベルを測定するための試薬；及び
（ｂ）（ｉ）少なくとも一つ、少なくとも二つ、少なくとも三つ、又は少なくとも四つのマーカーのｍＲＮＡレベルを測定するため、（ｉｉ）少なくとも一つ、少なくとも二つ、少なくとも三つ、又は少なくとも四つのマーカーのレベルを基準レベルと比較するため、及び（ｉｉｉ）比較に基づいてインテグリンベータ７アンタゴニスト応答者又はインテグリンベータ７アンタゴニスト非応答者のカテゴリに患者を層別化するための説明書
を含む、胃腸炎症性障害に罹患している患者を層別化するためのキット。
【請求項４１】
患者から得られた試料中の、ＧＺＭＡ、ＫＬＲＢ１、ＦＯＸＭ１、ＳＬＣ８Ａ３、及びＥＣＨ１から選択される少なくとも一つ、少なくとも二つ、少なくとも三つ、又は少なくとも四つのマーカーのｍＲＮＡレベルを測定するための試薬を含む、請求項４０に記載のキット。
【請求項４２】
患者から得られた試料中のＩＴＧＡＥのｍＲＮＡレベルを測定するための試薬を更に含む、請求項４０又は請求項４１に記載のキット。
【請求項４３】
（ａ）患者から得られた生物学的試料中の、ＳＬＣ８Ａ３、ＴＮＦＳＦ１５、ＢＥＳＴ２、ＣＣＬ２、ＣＣＬ３、ＣＣＬ３Ｌ１／３、ＣＰＡ３、ＦＧＦ７、ＨＡＭＰ、ＩＬ１Ａ、ＩＬ１８ＲＡＰ、ＩＮＨＢＡ、ＬＩＦ、ＬＭＯ４、ＬＲＲＣ４、ＭＬＫ７．ＡＳ１、ＭＴ１Ｍ、ＭＵＣＬ１、ＭＸ１、ＰＭＣＨ、ＲＥＭ２、ＳＳＴＲ２、ＴＭ４ＳＦ４、ＴＭＥＭ１５４、ＵＲＯＳ、ＶＮＮ２、及びＶＮＮ３から選択される少なくとも一つ、少なくとも二つ、又は少なくとも三つのマーカーのｍＲＮＡレベルを測定するための試薬；及び
（ｂ）（ｉ）少なくとも一つ、少なくとも二つ、又は少なくとも三つのマーカーのｍＲＮＡレベルを測定するため、（ｉｉ）少なくとも一つ、少なくとも二つ、又は少なくとも三つのマーカーのレベルを基準レベルと比較するため、及び（ｉｉｉ）比較に基づいてインテグリンベータ７アンタゴニスト応答者又はインテグリンベータ７アンタゴニスト非応答者のカテゴリに患者を層別化するための説明書
を含む、胃腸炎症性障害に罹患している患者を層別化するためのキット。
【請求項４４】
患者から得られた試料中の、ＳＬＣ８Ａ３、ＴＮＦＳＦ１５、ＢＥＳＴ２、及びＣＣＬ２から選択される少なくとも一つ、少なくとも二つ、又は少なくとも三つのマーカーのｍＲＮＡレベルを測定するための試薬を含む、請求項４３に記載のキット。
【請求項４５】
患者から得られた試料中の、ＩＴＧＡＥのｍＲＮＡレベルを測定するための試薬を更に含む、請求項４３又は請求項４４に記載のキット。
【請求項４６】
インテグリンベータ７アンタゴニストがモノクローナル抗ベータ７抗体である、請求項１−３３の何れか一項に記載の方法、又は請求項３４−３９の何れか一項に記載の使用、又は請求項４０−４５の何れか一項に記載のキット。
【請求項４７】
抗ベータ７抗体がキメラ抗体、ヒト抗体、及びヒト化抗体から選択される、請求項４６に記載の方法。
【請求項４８】
抗ベータ７抗体が抗体断片である、請求項４７に記載の方法。
【請求項４９】
抗ベータ７抗体が６つの超可変領域（ＨＶＲ）を含み、ここで
（ｉ）ＨＶＲ−Ｌ１がアミノ酸配列Ａ１−Ａ１１を含み、Ａ１−Ａ１１がＲＡＳＥＳＶＤＴＹＬＨ（配列番号１）；ＲＡＳＥＳＶＤＳＬＬＨ（配列番号７）、ＲＡＳＥＳＶＤＴＬＬＨ（配列番号８）、又はＲＡＳＥＳＶＤＤＬＬＨ（配列番号９）又は配列番号１、７、８又は９の変異体（配列番号２６）であり、アミノ酸Ａ２がＡ、Ｇ、Ｓ、Ｔ、及びＶからなる群から選択され、かつ／又はアミノ酸Ａ３がＳ、Ｇ、Ｉ、Ｋ、Ｎ、Ｐ、Ｑ、Ｒ、及びＴからなる群から選択され、かつ／又はＡ４がＥ、Ｖ、Ｑ、Ａ、Ｄ、Ｇ、Ｈ、Ｉ、Ｋ、Ｌ、Ｎ、及びＲからなる群から選択され、かつ／又はアミノ酸Ａ５がＳ、Ｙ、Ａ、Ｄ、Ｇ、Ｈ、Ｉ、Ｋ、Ｎ、Ｐ、Ｒ、Ｔ、及びＶからなる群から選択され、かつ／又はアミノ酸Ａ６がＶ、Ｒ、Ｉ、Ａ、Ｇ、Ｋ、Ｌ、Ｍ、及びＱからなる群から選択され、かつ／又はアミノ酸Ａ７がＤ、Ｖ、Ｓ、Ａ、Ｅ、Ｇ、Ｈ、Ｉ、Ｋ、Ｌ、Ｎ、Ｐ、Ｓ、及びＴからなる群から選択され、かつ／又はアミノ酸Ａ８がＤ、Ｇ、Ｎ、Ｅ、Ｔ、Ｐ及びＳからなる群から選択され、かつ／又はアミノ酸Ａ９がＬ、Ｙ、Ｉ及びＭからなる群から選択され、かつ／又はアミノ酸Ａ１０がＬ、Ａ、Ｉ、Ｍ、及びＶからなる群から選択され、かつ／又はアミノ酸Ａ１１がＨ、Ｙ、Ｆ、及びＳからなる群から選択され；
（ｉｉ）ＨＶＲ−Ｌ２がアミノ酸配列Ｂ１−Ｂ８を含み、Ｂ１−Ｂ８がＫＹＡＳＱＳＩＳ（配列番号２）、ＲＹＡＳＱＳＩＳ（配列番号２０）、又はＸａａＹＡＳＱＳＩＳ（配列番号２１、Ｘａａは任意のアミノ酸を表す）又は配列番号２、２０又は２１の変異体（配列番号２７）であり、アミノ酸Ｂ１がＫ、Ｒ、Ｎ、Ｖ、Ａ、Ｆ、Ｑ、Ｈ、Ｐ、Ｉ、Ｌ、Ｙ及びＸａａ（Ｘａａは任意のアミノ酸を表す）からなる群から選択され、かつ／又はアミノ酸Ｂ４がＳ及びＤからなる群から選択され、かつ／又はアミノ酸Ｂ５がＱ及びＳからなる群から選択され、かつ／又はアミノ酸Ｂ６がＳ、Ｄ、Ｌ、及びＲからなる群から選択され、かつ／又はアミノ酸Ｂ７がＩ、Ｖ、Ｅ、及びＫからなる群から選択され；
（ｉｉｉ）ＨＶＲ−Ｌ３がアミノ酸配列Ｃ１−Ｃ９を含み、Ｃ１−Ｃ９がＱＱＧＮＳＬＰＮＴ（配列番号３）又は配列番号３の変異体（配列番号２８）であり、アミノ酸Ｃ８がＮ、Ｖ、Ｗ、Ｙ、Ｒ、Ｓ、Ｔ、Ａ、Ｆ、Ｈ、Ｉ、Ｌ、及びＭからなる群から選択され；
（ｉｖ）ＨＶＲ−Ｈ１がアミノ酸配列Ｄ１−Ｄ１０を含み、Ｄ１−Ｄ１０がＧＦＦＩＴＮＮＹＷＧ（配列番号４）であり；
（ｖ）ＨＶＲ−Ｈ２がアミノ酸配列Ｅ１−Ｅ１７を含み、Ｅ１−Ｅ１７がＧＹＩＳＹＳＧＳＴＳＹＮＰＳＬＫＳ（配列番号５）、又は配列番号５の変異体（配列番号２９）であり、アミノ酸Ｅ２がＹ、Ｆ、Ｖ、及びＤからなる群から選択され、かつ／又はアミノ酸Ｅ６がＳ及びＧからなる群から選択され、かつ／又はアミノ酸Ｅ１０がＳ及びＹからなる群から選択され、かつ／又はアミノ酸Ｅ１２がＮ、Ｔ、Ａ、及びＤからなる群から選択され、かつ／又はアミノ酸１３がＰ、Ｈ、Ｄ、及びＡからなる群から選択され、かつ／又はアミノ酸Ｅ１５がＬ及びＶからなる群から選択され、かつ／又はアミノ酸Ｅ１７がＳ及びＧからなる群から選択され；かつ
（ｖｉ）ＨＶＲ−Ｈ３がアミノ酸配列Ｆ２−Ｆ１１を含み、Ｆ２−Ｆ１１がＭＴＧＳＳＧＹＦＤＦ（配列番号６）又はＲＴＧＳＳＧＹＦＤＦ（配列番号１９）であるか；又はアミノ酸配列Ｆ１−Ｆ１１を含み、Ｆ１−Ｆ１１がＡＭＴＧＳＳＧＹＦＤＦ（配列番号１６）、ＡＲＴＧＳＳＧＹＦＤＦ（配列番号１７）、又はＡＱＴＧＳＳＧＹＦＤＦ（配列番号１８）、又は配列番号６、１６、１７、１８又は１９の変異体（配列番号３０）であり、アミノ酸Ｆ２がＲ、Ｍ、Ａ、Ｅ、Ｇ、Ｑ、Ｓであり、かつ／又はアミノ酸Ｆ１１がＦ及びＹからなる群から選択される、請求項４７に記載の方法。
【請求項５０】
抗ベータ７抗体が、３つの重鎖超可変領域（ＨＶＲ−Ｈ１−Ｈ３）配列と３つの軽鎖超可変領域（ＨＶＲ−Ｌ１−Ｌ３）配列を含み、ここで、
（ｉ）ＨＶＲ−Ｌ１は配列番号７、配列番号８又は配列番号９を含み；
（ｉｉ）ＨＶＲ−Ｌ２は配列番号２を含み；
（ｉｉｉ）ＨＶＲ−Ｌ３は配列番号３を含み；
（ｉｖ）ＨＶＲ−Ｈ１は配列番号４を含み；
（ｖ）ＨＶＲ−Ｈ２は配列番号５を含み；かつ
（ｖｉ）ＨＶＲ−Ｈ３は配列番号６、配列番号１６、配列番号１７又は配列番号１９を含む、請求項４９に記載の方法。
【請求項５１】
抗ベータ７抗体が、配列番号３１のアミノ酸配列を含む可変軽鎖と配列番号３２のアミノ酸配列を含む可変重鎖を含む、請求項５０に記載の方法。
【請求項５２】
抗ベータ７抗体がエトロリズマブである、請求項５１に記載の方法。