【手続補正書】
【提出日】平成29年12月1日(2017.12.1)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
Wnt経路インヒビターによる処置に反応性または非反応性である可能性のあるヒト乳房腫瘍を同定する方法であって、Wnt経路インヒビターが、
2017501137.tif 000001
を含む重鎖CDR1、
2017501137.tif 000002
を含む重鎖CDR2、
2017501137.tif 000003
を含む重鎖CDR3、
2017501137.tif 000004
を含む軽鎖CDR1、
2017501137.tif 000005
を含む軽鎖CDR2、および
2017501137.tif 000006
を含む軽鎖CDR3を含む、ヒトFZD1、FZD2、FZD5、FZD7、およびFZD8に特異的に結合する抗体であり、
方法が、
(a)乳房腫瘍から採取された試料中のバイオマーカーサインの各バイオマーカーの発現レベルを測定する工程であって、該サインがバイオマーカーFBXW2、CCND2、RHOU、CTBP2、WIF1、およびDKK1を含む、工程；および
(b)該バイオマーカーの発現レベルに基づき、該腫瘍を、処置に反応性または非反応性である可能性があるとして同定する工程
を含む、前記方法。
【請求項２】
ヒト乳房腫瘍を、Wnt経路インヒビターによる処置に反応性または非反応性である可能性があるとして分類する方法であって、Wnt経路インヒビターが、
2017501137.tif 000007
を含む重鎖CDR1、
2017501137.tif 000008
を含む重鎖CDR2、
2017501137.tif 000009
を含む重鎖CDR3、
2017501137.tif 000010
を含む軽鎖CDR1、
2017501137.tif 000011
を含む軽鎖CDR2、および
2017501137.tif 000012
を含む軽鎖CDR3を含む、ヒトFZD1、FZD2、FZD5、FZD7、およびFZD8に特異的に結合する抗体であり、
方法が、
(a)乳房腫瘍から採取された試料中のバイオマーカーサインの各バイオマーカーの発現レベルを測定する工程であって、該サインがバイオマーカーFBXW2、CCND2、RHOU、CTBP2、WIF1、およびDKK1を含む、工程；および
(b)該バイオマーカーの発現に基づき、該腫瘍を、処置に反応性または非反応性である可能性があるとして分類する工程
を含む、前記方法。
【請求項３】
Wnt経路インヒビターによる処置に対するヒト乳房腫瘍の反応性を判定する方法であって、Wnt経路インヒビターが、
2017501137.tif 000013
を含む重鎖CDR1、
2017501137.tif 000014
を含む重鎖CDR2、
2017501137.tif 000015
を含む重鎖CDR3、
2017501137.tif 000016
を含む軽鎖CDR1、
2017501137.tif 000017
を含む軽鎖CDR2、および
2017501137.tif 000018
を含む軽鎖CDR3を含む、ヒトFZD1、FZD2、FZD5、FZD7、およびFZD8に特異的に結合する抗体であり、
方法が、
(a)乳房腫瘍から採取された試料中のバイオマーカーサインの各バイオマーカーの発現レベルを測定する工程であって、該サインがバイオマーカーFBXW2、CCND2、RHOU、CTBP2、WIF1、およびDKK1を含む、工程；および
(b)該バイオマーカーの発現に基づき処置に対する該腫瘍の反応性を判定する工程
を含む、前記方法。
【請求項４】
Wnt経路インヒビターによる処置に反応する可能性のある、乳がんを有する患者を同定する方法であって、Wnt経路インヒビターが、
2017501137.tif 000019
を含む重鎖CDR1、
2017501137.tif 000020
を含む重鎖CDR2、
2017501137.tif 000021
を含む重鎖CDR3、
2017501137.tif 000022
を含む軽鎖CDR1、
2017501137.tif 000023
を含む軽鎖CDR2、および
2017501137.tif 000024
を含む軽鎖CDR3を含む、ヒトFZD1、FZD2、FZD5、FZD7、およびFZD8に特異的に結合する抗体であり、
方法が、
(a)患者の乳房腫瘍から採取された試料中のバイオマーカーサインの各バイオマーカーの発現レベルを測定する工程であって、該サインがバイオマーカーFBXW2、CCND2、RHOU、CTBP2、WIF1、およびDKK1を含む、工程；および
(b)該バイオマーカーの発現レベルに基づき処置に反応する可能性のある患者を同定する工程
を含む、前記方法。
【請求項５】
Wnt経路インヒビターによる処置のための乳がんを有する患者を選択する方法であって、Wnt経路インヒビターが、
2017501137.tif 000025
を含む重鎖CDR1、
2017501137.tif 000026
を含む重鎖CDR2、
2017501137.tif 000027
を含む重鎖CDR3、
2017501137.tif 000028
を含む軽鎖CDR1、
2017501137.tif 000029
を含む軽鎖CDR2、および
2017501137.tif 000030
を含む軽鎖CDR3を含む、ヒトFZD1、FZD2、FZD5、FZD7、およびFZD8に特異的に結合する抗体であり、
方法が、
(a)患者の乳房腫瘍から採取された試料中のバイオマーカーサインの各バイオマーカーの発現レベルを測定する工程であって、該バイオマーカーサインがバイオマーカーFBXW2、CCND2、RHOU、CTBP2、WIF1、およびDKK1を含む、工程；および
(b)該バイオマーカーの発現レベルに基づき処置のための患者を選択する工程
を含む、前記方法。
【請求項６】
各バイオマーカーの発現が、PCRに基づくアッセイ、qPCRアッセイ、マイクロアレイ、またはRNA配列決定により測定される、請求項1〜5のいずれか一項に記載の方法。
【請求項７】
FBXW2、CCND2、RHOU、CTBP2、WIF1、およびDKK1の発現レベルが、SEQ ID NO:62〜79からなる群より選択されるポリヌクレオチドを用いて測定される、請求項1〜5のいずれか一項に記載の方法。
【請求項８】
FBXW2、CCND2、RHOU、CTBP2、WIF1、およびDKK1の発現レベルが、
(a) SEQ ID NO:62のフォワードプライマー、SEQ ID NO:63のリバースプライマー、およびSEQ ID NO:64を含むプローブ；
(b) SEQ ID NO:65のフォワードプライマー、SEQ ID NO:66のリバースプライマー、およびSEQ ID NO:67を含むプローブ；
(c) SEQ ID NO:68のフォワードプライマー、SEQ ID NO:69のリバースプライマー、およびSEQ ID NO:70を含むプローブ；
(d) SEQ ID NO:71のフォワードプライマー、SEQ ID NO:72のリバースプライマー、およびSEQ ID NO:73を含むプローブ；
(e) SEQ ID NO:74のフォワードプライマー、SEQ ID NO:75のリバースプライマー、およびSEQ ID NO:76を含むプローブ；ならびに
(f) SEQ ID NO:77のフォワードプライマー、SEQ ID NO:78のリバースプライマー、およびSEQ ID NO:79を含むプローブ
を用いて測定される、請求項7に記載の方法。
【請求項９】
Wnt経路インヒビターが、SEQ ID NO:7を含む重鎖可変領域およびSEQ ID NO:8を含む軽鎖可変領域を含む抗体である、請求項1〜8のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１０】
Wnt経路インヒビターが、PTA-9541としてATCCに寄託したプラスミドによりコードされる重鎖可変領域および軽鎖可変領域を含む抗体である、請求項1〜8のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１１】
抗体が、モノクローナル抗体、組換え抗体、キメラ抗体、二重特異性抗体、ヒト化抗体、ヒト抗体、または抗原結合部位を含む抗体フラグメントである、請求項1〜10のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１２】
Wnt経路インヒビターが、抗体OMP-18R5である、請求項1〜8のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１３】
乳房腫瘍または乳がんがHER2陰性乳房腫瘍である、請求項1〜12のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１４】
乳房腫瘍または乳がんが、三種陰性乳がん(TNBC)腫瘍である、請求項1〜12のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１５】
Wnt経路インヒビターによる処置が、1つまたは複数の追加の治療剤との併用である、請求項1〜14のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１６】
追加の治療剤が化学療法剤である、請求項15に記載の方法。
【請求項１７】
追加の治療剤がパクリタキセルである、請求項15に記載の方法。
【請求項１８】
追加の治療剤がnab結合型パクリタキセル(ABRAXANE)である、請求項15に記載の方法。
【請求項１９】
試料が組織試料または腫瘍生検材料である、請求項1〜18のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２０】
試料がホルマリン固定パラフィン包埋(FFPE)試料である、請求項1〜19のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２１】
Wnt経路インヒビターによる処置に反応する可能性があると同定された患者における乳がんを処置するための、有効量のWnt経路インヒビターを含む、薬剤であって、Wnt経路インヒビターが、
2017501137.tif 000031
を含む重鎖CDR1、
2017501137.tif 000032
を含む重鎖CDR2、
2017501137.tif 000033
を含む重鎖CDR3、
2017501137.tif 000034
を含む軽鎖CDR1、
2017501137.tif 000035
を含む軽鎖CDR2、および
2017501137.tif 000036
を含む軽鎖CDR3を含む、ヒトFZD1、FZD2、FZD5、FZD7、およびFZD8に特異的に結合する抗体であり、
該同定が、
(i)患者の乳がんから採取された試料中のバイオマーカーサインの各バイオマーカーの発現レベルを測定する工程であって、該サインがバイオマーカーFBXW2、CCND2、RHOU、CTBP2、WIF1、およびDKK1を含む、工程；および
(ii)該バイオマーカーの発現レベルに基づき処置に反応する可能性がある患者を同定する工程
を含む、薬剤。
【請求項２２】
各バイオマーカーの発現が、PCRに基づくアッセイ、qPCRアッセイ、マイクロアレイ、またはRNA配列決定により測定される、請求項21に記載の薬剤。
【請求項２３】
FBXW2、CCND2、RHOU、CTBP2、WIF1、およびDKK1の発現レベルが、SEQ ID NO:62〜79からなる群より選択されるポリヌクレオチドを用いて測定される、請求項21に記載の薬剤。
【請求項２４】
FBXW2、CCND2、RHOU、CTBP2、WIF1、およびDKK1の発現レベルが、
(a) SEQ ID NO:62のフォワードプライマー、SEQ ID NO:63のリバースプライマー、およびSEQ ID NO:64を含むプローブ；
(b) SEQ ID NO:65のフォワードプライマー、SEQ ID NO:66のリバースプライマー、およびSEQ ID NO:67を含むプローブ；
(c) SEQ ID NO:68のフォワードプライマー、SEQ ID NO:69のリバースプライマー、およびSEQ ID NO:70を含むプローブ；
(d) SEQ ID NO:71のフォワードプライマー、SEQ ID NO:72のリバースプライマー、およびSEQ ID NO:73を含むプローブ；
(e) SEQ ID NO:74のフォワードプライマー、SEQ ID NO:75のリバースプライマー、およびSEQ ID NO:76を含むプローブ；ならびに
(f) SEQ ID NO:77のフォワードプライマー、SEQ ID NO:78のリバースプライマー、およびSEQ ID NO:79を含むプローブ
を用いて測定される、請求項23に記載の薬剤。
【請求項２５】
Wnt経路インヒビターが、SEQ ID NO:7を含む重鎖可変領域およびSEQ ID NO:8を含む軽鎖可変領域を含む抗体である、請求項21〜24のいずれか一項に記載の薬剤。
【請求項２６】
Wnt経路インヒビターが、PTA-9541としてATCCに寄託したプラスミドによりコードされる重鎖可変領域および軽鎖可変領域を含む抗体である、請求項21〜24のいずれか一項に記載の薬剤。
【請求項２７】
抗体が、モノクローナル抗体、組換え抗体、キメラ抗体、二重特異性抗体、ヒト化抗体、ヒト抗体、または抗原結合部位を含む抗体フラグメントである、請求項21〜26のいずれか一項に記載の薬剤。
【請求項２８】
Wnt経路インヒビターが、抗体OMP-18R5である、請求項21〜24のいずれか一項に記載の薬剤。
【請求項２９】
乳房腫瘍または乳がんがHER2陰性乳房腫瘍である、請求項21〜28のいずれか一項に記載の薬剤。
【請求項３０】
乳房腫瘍または乳がんが、三種陰性乳がん(TNBC)腫瘍である、請求項21〜28のいずれか一項に記載の薬剤。
【請求項３１】
1つまたは複数の追加の治療剤と併用して用いられる、請求項21〜30のいずれか一項に記載の薬剤。
【請求項３２】
追加の治療剤が化学療法剤である、請求項31に記載の薬剤。
【請求項３３】
追加の治療剤がパクリタキセルである、請求項31に記載の薬剤。
【請求項３４】
追加の治療剤がnab結合型パクリタキセル(ABRAXANE)である、請求項31に記載の薬剤。
【請求項３５】
試料が組織試料または腫瘍生検材料である、請求項21〜34のいずれか一項に記載の薬剤。
【請求項３６】
試料がホルマリン固定パラフィン包埋(FFPE)試料である、請求項21〜35のいずれか一項に記載の薬剤。
【請求項３７】
乳房腫瘍試料または乳がん試料中のFBXW2、CCND2、RHOU、CTBP2、WIF1、およびDKK1を検出するためのキットであって、SEQ ID NO:62〜79からなる群より選択されるポリヌクレオチドを含む、前記キット。
【請求項３８】
(a) SEQ ID NO:62のフォワードプライマー、SEQ ID NO:63のリバースプライマー、およびSEQ ID NO:64を含むプローブ；
(b) SEQ ID NO:65のフォワードプライマー、SEQ ID NO:66のリバースプライマー、およびSEQ ID NO:67を含むプローブ；
(c) SEQ ID NO:68のフォワードプライマー、SEQ ID NO:69のリバースプライマー、およびSEQ ID NO:70を含むプローブ；
(d) SEQ ID NO:71のフォワードプライマー、SEQ ID NO:72のリバースプライマー、およびSEQ ID NO:73を含むプローブ；
(e) SEQ ID NO:74のフォワードプライマー、SEQ ID NO:75のリバースプライマー、およびSEQ ID NO:76を含むプローブ；ならびに
(f) SEQ ID NO:77のフォワードプライマー、SEQ ID NO:78のリバースプライマー、およびSEQ ID NO:79を含むプローブ
を含む、請求項37に記載のキット。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００３６
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００３６】
本発明の局面または態様が、マーカッシュ群または他の選択肢の群の形で記載されている場合、本発明は、列挙された群全体をまとめて包含するだけではなく、その群の各メンバーも個別に包含し、主群の考えうる部分群も全て包含し、群のメンバーの1つまたは複数を欠く主群も包含する。本発明は、請求項に係る発明における群メンバーのいずれかの1つまたは複数の明示的な排除も、想定している。
[本発明1001]
以下の工程を含む、患者における乳がんを処置する方法：
(a)患者がWnt経路インヒビターによる処置に反応する可能性があるかどうかを同定する工程であって、Wnt経路インヒビターが、
2017501137.tif 000037
を含む重鎖CDR1、
2017501137.tif 000038
を含む重鎖CDR2、
2017501137.tif 000039
を含む重鎖CDR3、
2017501137.tif 000040
を含む軽鎖CDR1、
2017501137.tif 000041
を含む軽鎖CDR2、および
2017501137.tif 000042
を含む軽鎖CDR3を含む、ヒトFZD1、FZD2、FZD5、FZD7、およびFZD8に特異的に結合する抗体であり、
該同定が、
(i)患者の乳がんの試料を得る工程；
(ii)該試料中のバイオマーカーサインの各バイオマーカーの発現レベルを測定する工程であって、該サインがバイオマーカーFBXW2、CCND2、RHOU、CTBP2、WIF1、およびDKK1を含む、工程；および
(iii)該バイオマーカーの発現レベルに基づき処置に反応する可能性がある患者を同定する工程
を含む、工程；ならびに
(b)処置に反応する可能性がある患者に有効量のWnt経路インヒビターを投与する工程。
[本発明1002]
Wnt経路インヒビターによる処置に反応性または非反応性である可能性のあるヒト乳房腫瘍を同定する方法であって、Wnt経路インヒビターが、
2017501137.tif 000043
を含む重鎖CDR1、
2017501137.tif 000044
を含む重鎖CDR2、
2017501137.tif 000045
を含む重鎖CDR3、
2017501137.tif 000046
を含む軽鎖CDR1、
2017501137.tif 000047
を含む軽鎖CDR2、および
2017501137.tif 000048
を含む軽鎖CDR3を含む、ヒトFZD1、FZD2、FZD5、FZD7、およびFZD8に特異的に結合する抗体であり、
方法が、
(a)乳房腫瘍の試料を得る工程；
(b)該試料中のバイオマーカーサインの各バイオマーカーの発現レベルを測定する工程であって、該サインがバイオマーカーFBXW2、CCND2、RHOU、CTBP2、WIF1、およびDKK1を含む、工程；および
(c)該バイオマーカーの発現レベルに基づき、該腫瘍を、処置に反応性または非反応性である可能性があるとして同定する工程
を含む、前記方法。
[本発明1003]
ヒト乳房腫瘍を、Wnt経路インヒビターによる処置に反応性または非反応性である可能性があるとして分類する方法であって、Wnt経路インヒビターが、
2017501137.tif 000049
を含む重鎖CDR1、
2017501137.tif 000050
を含む重鎖CDR2、
2017501137.tif 000051
を含む重鎖CDR3、
2017501137.tif 000052
を含む軽鎖CDR1、
2017501137.tif 000053
を含む軽鎖CDR2、および
2017501137.tif 000054
を含む軽鎖CDR3を含む、ヒトFZD1、FZD2、FZD5、FZD7、およびFZD8に特異的に結合する抗体であり、
方法が、
(a)乳房腫瘍の試料を得る工程；
(b)該試料中のバイオマーカーサインの各バイオマーカーの発現レベルを測定する工程であって、該サインがバイオマーカーFBXW2、CCND2、RHOU、CTBP2、WIF1、およびDKK1を含む、工程；および
(c)該バイオマーカーの発現に基づき、該腫瘍を、処置に反応性または非反応性である可能性があるとして分類する工程
を含む、前記方法。
[本発明1004]
Wnt経路インヒビターによる処置に対するヒト乳房腫瘍の反応性を判定する方法であって、Wnt経路インヒビターが、
2017501137.tif 000055
を含む重鎖CDR1、
2017501137.tif 000056
を含む重鎖CDR2、
2017501137.tif 000057
を含む重鎖CDR3、
2017501137.tif 000058
を含む軽鎖CDR1、
2017501137.tif 000059
を含む軽鎖CDR2、および
2017501137.tif 000060
を含む軽鎖CDR3を含む、ヒトFZD1、FZD2、FZD5、FZD7、およびFZD8に特異的に結合する抗体であり、
方法が、
(a)乳房腫瘍の試料を得る工程；
(b)該試料中のバイオマーカーサインの各バイオマーカーの発現レベルを測定する工程であって、該サインがバイオマーカーFBXW2、CCND2、RHOU、CTBP2、WIF1、およびDKK1を含む、工程；および
(c)該バイオマーカーの発現に基づき処置に対する該腫瘍の反応性を判定する工程
を含む、前記方法。
[本発明1005]
Wnt経路インヒビターによる処置に反応する可能性のある、乳がんを有する患者を同定する方法であって、Wnt経路インヒビターが、
2017501137.tif 000061
を含む重鎖CDR1、
2017501137.tif 000062
を含む重鎖CDR2、
2017501137.tif 000063
を含む重鎖CDR3、
2017501137.tif 000064
を含む軽鎖CDR1、
2017501137.tif 000065
を含む軽鎖CDR2、および
2017501137.tif 000066
を含む軽鎖CDR3を含む、ヒトFZD1、FZD2、FZD5、FZD7、およびFZD8に特異的に結合する抗体であり、
方法が、
(a)患者の乳房腫瘍の試料を得る工程；
(b)該試料中のバイオマーカーサインの各バイオマーカーの発現レベルを測定する工程であって、該サインがバイオマーカーFBXW2、CCND2、RHOU、CTBP2、WIF1、およびDKK1を含む、工程；および
(c)該バイオマーカーの発現レベルに基づき処置に反応する可能性のある患者を同定する工程
を含む、前記方法。
[本発明1006]
Wnt経路インヒビターによる処置のための乳がんを有する患者を選択する方法であって、Wnt経路インヒビターが、
2017501137.tif 000067
を含む重鎖CDR1、
2017501137.tif 000068
を含む重鎖CDR2、
2017501137.tif 000069
を含む重鎖CDR3、
2017501137.tif 000070
を含む軽鎖CDR1、
2017501137.tif 000071
を含む軽鎖CDR2、および
2017501137.tif 000072
を含む軽鎖CDR3を含む、ヒトFZD1、FZD2、FZD5、FZD7、およびFZD8に特異的に結合する抗体であり、
方法が、
(a)患者の乳房腫瘍の試料を得る工程；
(b)該試料中のバイオマーカーサインの各バイオマーカーの発現レベルを測定する工程であって、該バイオマーカーサインがバイオマーカーFBXW2、CCND2、RHOU、CTBP2、WIF1、およびDKK1を含む、工程；および
(c)該バイオマーカーの発現レベルに基づき処置のための患者を選択する工程
を含む、前記方法。
[本発明1007]
各バイオマーカーの発現が、PCRに基づくアッセイ、qPCRアッセイ、マイクロアレイ、またはRNA配列決定により測定される、本発明1001〜1006のいずれかの方法。
[本発明1008]
FBXW2、CCND2、RHOU、CTBP2、WIF1、およびDKK1の発現レベルが、SEQ ID NO:62〜79からなる群より選択されるポリヌクレオチドを用いて測定される、本発明1001〜1006のいずれかの方法。
[本発明1009]
FBXW2、CCND2、RHOU、CTBP2、WIF1、およびDKK1の発現レベルが、
(a) SEQ ID NO:62のフォワードプライマー、SEQ ID NO:63のリバースプライマー、およびSEQ ID NO:64を含むプローブ；
(b) SEQ ID NO:65のフォワードプライマー、SEQ ID NO:66のリバースプライマー、およびSEQ ID NO:67を含むプローブ；
(c) SEQ ID NO:68のフォワードプライマー、SEQ ID NO:69のリバースプライマー、およびSEQ ID NO:70を含むプローブ；
(d) SEQ ID NO:71のフォワードプライマー、SEQ ID NO:72のリバースプライマー、およびSEQ ID NO:73を含むプローブ；
(e) SEQ ID NO:74のフォワードプライマー、SEQ ID NO:75のリバースプライマー、およびSEQ ID NO:76を含むプローブ；ならびに
(f) SEQ ID NO:77のフォワードプライマー、SEQ ID NO:78のリバースプライマー、およびSEQ ID NO:79を含むプローブ
を用いて測定される、本発明1008の方法。
[本発明1010]
Wnt経路インヒビターが、SEQ ID NO:7を含む重鎖可変領域およびSEQ ID NO:8を含む軽鎖可変領域を含む抗体である、本発明1001〜1009のいずれかの方法。
[本発明1011]
Wnt経路インヒビターが、PTA-9541としてATCCに寄託したプラスミドによりコードされる重鎖可変領域および軽鎖可変領域を含む抗体である、本発明1001〜1009のいずれかの方法。
[本発明1012]
抗体が、モノクローナル抗体、組換え抗体、キメラ抗体、二重特異性抗体、ヒト化抗体、ヒト抗体、または抗原結合部位を含む抗体フラグメントである、本発明1001〜1011のいずれかの方法。
[本発明1013]
Wnt経路インヒビターが、抗体OMP-18R5である、本発明1001〜1009のいずれかの方法。
[本発明1014]
乳房腫瘍または乳がんがHER2陰性乳房腫瘍である、本発明1001〜1013のいずれかの方法。
[本発明1015]
乳房腫瘍または乳がんが、三種陰性乳がん(TNBC)腫瘍である、本発明1001〜1013のいずれかの方法。
[本発明1016]
Wnt経路インヒビターによる処置が、1つまたは複数の追加の治療剤との併用である、本発明1001〜1015のいずれかの方法。
[本発明1017]
追加の治療剤が化学療法剤である、本発明1016の方法。
[本発明1018]
追加の治療剤がパクリタキセルである、本発明1016の方法。
[本発明1019]
追加の治療剤がnab結合型パクリタキセル(ABRAXANE)である、本発明1016の方法。
[本発明1020]
試料が組織試料または腫瘍生検材料である、本発明1001〜1019のいずれかの方法。
[本発明1021]
試料がホルマリン固定パラフィン包埋(FFPE)試料である、本発明1001〜1020のいずれかの方法。
[本発明1022]
乳房腫瘍試料または乳がん試料中のFBXW2、CCND2、RHOU、CTBP2、WIF1、およびDKK1を検出するためのキットであって、SEQ ID NO:62〜79からなる群より選択されるポリヌクレオチドを含む、前記キット。
[本発明1023]
(a) SEQ ID NO:62のフォワードプライマー、SEQ ID NO:63のリバースプライマー、およびSEQ ID NO:64を含むプローブ；
(b) SEQ ID NO:65のフォワードプライマー、SEQ ID NO:66のリバースプライマー、およびSEQ ID NO:67を含むプローブ；
(c) SEQ ID NO:68のフォワードプライマー、SEQ ID NO:69のリバースプライマー、およびSEQ ID NO:70を含むプローブ；
(d) SEQ ID NO:71のフォワードプライマー、SEQ ID NO:72のリバースプライマー、およびSEQ ID NO:73を含むプローブ；
(e) SEQ ID NO:74のフォワードプライマー、SEQ ID NO:75のリバースプライマー、およびSEQ ID NO:76を含むプローブ；ならびに
(f) SEQ ID NO:77のフォワードプライマー、SEQ ID NO:78のリバースプライマー、およびSEQ ID NO:79を含むプローブ
を含む、本発明1022のキット。