【手続補正書】
【提出日】平成30年6月4日(2018.6.4)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
少なくとも１つの、少なくとも２つの、少なくとも３つの、少なくとも４つの、少なくとも５つの、又は全ての：（ｉ）Ｓｐｈ３  ＧＨドメインを含む可溶性タンパク質、（ｉｉ）ＰｅｌＡ  ＧＨドメインを含む可溶性タンパク質、（ｉｉｉ）ＢｐｓＢ  ＧＨドメインを含む可溶性タンパク質、（ｉｖ）ＰｇａＢ  ＧＨドメインを含む可溶性タンパク質、（ｖ）ＰｓｌＧグリコシルヒドロラーゼ（ＧＨ）ドメインを含む可溶性タンパク質、及び（ｖｉ）Ｅｇａ３  ＧＨドメインを含む可溶性タンパク質、又はそれらのオーソログを含む、バイオフィルム関連感染症の治療剤又は予防剤。
【請求項２】
a)  前記Ｓｐｈ３  ＧＨドメインを含む可溶性タンパク質が、アクセッション番号ＥＡＬ９２７８６．１でジェンバンクに寄託されているＳｐｈ３配列のアミノ酸５２〜２９８又はそのグリコシルヒドロラーゼバリアントを含む、
b)  前記Ｓｐｈ３  ＧＨドメインオーソログを含む可溶性タンパク質が、アクセッション番号ＥＡＷ０９３７９．１でジェンバンクに寄託されているＳｐｈ３配列のアミノ酸５４〜３０４又はそのグリコシルヒドロラーゼバリアントを含む、
c)  前記Ｓｐｈ３  ＧＨドメインオーソログを含む可溶性タンパク質が、アクセッション番号ＥＡＡ６３５２３．１でジェンバンクに寄託されているＳｐｈ配列のアミノ酸４３〜２９９又はそのグリコシルヒドロラーゼバリアントを含む、
d)  前記ＰｅｌＡ  ＧＨドメインを含む可溶性タンパク質が、アクセッション番号ＡＡＧ０６４５２．１でジェンバンクに寄託されているＰｅｌＡ配列のアミノ酸４７〜３０３若しくはアクセッション番号ＡＡＹ９２２４４．２でジェンバンクに寄託されているＰｅｌＡ配列のアミノ酸３５〜２９１又はそれらのグリコシルヒドロラーゼバリアントを含む、
e)  前記ＰｅｌＡ  ＧＨドメインオーソログを含むタンパク質が、アクセッション番号ＣＡＱ６２２０１．１でジェンバンクに寄託されているＲａｇＡ配列のアミノ酸６１〜３１７若しくはアクセッション番号ＡＢＢ３２１９１．１でジェンバンクに寄託されているＰｅｌＡ配列のアミノ酸２３〜２７７又はそれらのグリコシルヒドロラーゼバリアントを含む、
f)  前記ＢｐｓＢ  ＧＨドメインを含む可溶性タンパク質が、アクセッション番号ＣＡＥ３２２６５．１でジェンバンクに寄託されているＢｐｓＢ配列のアミノ酸３１８〜６７０若しくはアミノ酸２７〜７０１又はそれらのグリコシルヒドロラーゼバリアントを含む、
g)  前記ＰｇａＢ  ＧＨドメインを含む可溶性タンパク質が、アクセッション番号ＡＡＣ７４１０８．１でジェンバンクに寄託されているＰｇａＢ配列のアミノ酸３１０〜６７２若しくはアミノ酸２２〜６７２又はそれらのグリコシルヒドロラーゼバリアントを含む、
h)  前記ＰｓｌＧ  ＧＨドメインを含む可溶性タンパク質が、アクセッション番号ＡＡＧ０５６２５．１でジェンバンクに寄託されているＰｓｌＧ配列のアミノ酸３１〜４４２又はそのグリコシルヒドロラーゼバリアントを含む、及び／又は
i)  前記Ｅｇａ３  ＧＨドメインを含む可溶性タンパク質が、アクセッション番号ＥＡＬ９２７８７．１でジェンバンクに寄託されているＥｇａ３配列のアミノ酸４６〜３１８又はそのグリコシルヒドロラーゼバリアントを含む請求項１に記載の治療剤又は予防剤。
【請求項３】
前記バイオフィルム関連感染症が、前記動物における創傷、熱傷後感染、角膜炎、生物義装具、又は留置医療装置感染の結果であり、
前記バイオフィルム関連感染症が前記動物の肺にあり、前記動物が慢性肺疾患又は肺感染症をもつか、又は
前記バイオフィルム関連感染症が前記植物又は植物部位の表面にある、請求項１又は２記載の治療剤又は予防剤。
【請求項４】
前記バイオフィルム関連感染症の前記バイオフィルムが、Ｐｅｌ依存性、Ｐｓｌ依存性、ＰＮＡＧ依存性、及び／若しくはＧＡＧ依存性バイオフィルムであり、並びに／又は
前記バイオフィルム関連感染症が、P. aeruginosa、S. aureus、E. coli、Candida spp.、Aspergillus spp.、Acinetobacter spp.、T. asahii、B. cineria、及び／若しくはFusarium spp.によって引き起こされる請求項３記載の治療剤又は予防剤。
【請求項５】
抗菌剤をさらに含む請求項１〜４のいずれか一項に記載の治療剤又は予防剤。
【請求項６】
前記少なくとも１つの可溶性タンパク質がベクターによって発現される、
前記ベクターが、前記バイオフィルムの細菌に侵入できるファージベクターである、又は
前記ベクターが、前記バイオフィルムの真菌に侵入できるマイコウイルスベクターである、請求項１〜５のいずれか一項に記載の治療剤又は予防剤。
【請求項７】
留置医療装置又はインプラントにおけるバイオフィルム形成を防止する方法であって、少なくとも１つの、少なくとも２つの、少なくとも３つの、少なくとも４つの、少なくとも５つの、又はすべての：（ｉ）Ｓｐｈ３  ＧＨドメインを含む可溶性タンパク質、（ｉｉ）ＰｅｌＡ  ＧＨドメインを含む可溶性タンパク質、（ｉｉｉ）ＢｐｓＢ  ＧＨドメインを含む可溶性タンパク質、（ｉｖ）ＰｇａＢ  ＧＨドメインを含む可溶性タンパク質、（ｖ）ＰｓｌＧグリコシルヒドロラーゼ（ＧＨ）ドメインを含む可溶性タンパク質、及び（ｖｉ）Ｅｇａ３  ＧＨドメインを含む可溶性タンパク質、又はそのオーソログで、それらを必要としている動物に使用する前に、前記装置を被覆することを含む方法。
【請求項８】
a)  前記Ｓｐｈ３  ＧＨドメインを含む可溶性タンパク質が、アクセッション番号ＥＡＬ９２７８６．１でジェンバンクに寄託されているＳｐｈ３配列のアミノ酸５２〜２９８又はそのグリコシルヒドロラーゼバリアントを含む、
b)  前記Ｓｐｈ３  ＧＨドメインオーソログを含む可溶性タンパク質が、アクセッション番号ＥＡＷ０９３７９．１でジェンバンクに寄託されているＳｐｈ３配列のアミノ酸５４〜３０４又はそのグリコシルヒドロラーゼバリアントを含む、
c)  前記Ｓｐｈ３  ＧＨドメインオーソログを含む可溶性タンパク質が、アクセッション番号ＥＡＡ６３５２３．１でジェンバンクに寄託されているＳｐｈ配列のアミノ酸４３〜２９９又はそのグリコシルヒドロラーゼバリアントを含む、
d)  前記ＰｅｌＡ  ＧＨドメインを含む可溶性タンパク質が、アクセッション番号ＡＡＧ０６４５２．１でジェンバンクに寄託されているＰｅｌＡ配列のアミノ酸４７〜３０３若しくはアクセッション番号ＡＡＹ９２２４４．２でジェンバンクに寄託されているＰｅｌＡ配列のアミノ酸３５〜２９１、又はそれらのグリコシルヒドロラーゼバリアントを含む、
e)  前記ＰｅｌＡ  ＧＨドメインを含む可溶性タンパク質オーソログが、アクセッション番号ＣＡＱ６２２０１．１でジェンバンクに寄託されているＲａｇＡ配列のアミノ酸６１〜３１７若しくはアクセッション番号ＡＢＢ３２１９１．１でジェンバンクに寄託されているＰｅｌＡ配列のアミノ酸２３〜２７７、又はそれらのグリコシルヒドロラーゼバリアントを含む、
f)  前記ＢｐｓＢ  ＧＨドメインを含む可溶性タンパク質が、アクセッション番号ＣＡＥ３２２６５．１でジェンバンクに寄託されているＢｐｓＢ配列のアミノ酸３１８〜６７０若しくはアミノ酸２７〜７０１又はそれらのグリコシルヒドロラーゼバリアントを含む、
g)  前記ＰｇａＢ  ＧＨドメインを含む可溶性タンパク質が、アクセッション番号ＡＡＣ７４１０８．１でジェンバンクに寄託されているＰｇａＢ配列のアミノ酸３１０〜６７２若しくはアミノ酸２２〜６７２又はそれらのグリコシルヒドロラーゼバリアントを含む、
h)  前記ＰｓｌＧ  ＧＨドメインを含む可溶性タンパク質が、アクセッション番号ＡＡＧ０５６２５．１でジェンバンクに寄託されているＰｓｌＧ配列のアミノ酸３１〜４４２又はそのグリコシルヒドロラーゼバリアントを含む、及び／又は
i)  前記Ｅｇａ３  ＧＨドメインを含む可溶性タンパク質が、アクセッション番号ＥＡＬ９２７８７．１でジェンバンクに寄託されているＥｇａ３配列のアミノ酸４６〜３１８又はそのグリコシルヒドロラーゼバリアントを含む、請求項７記載の方法。
【請求項９】
前記留置医療装置又はインプラントがカテーテル、静脈内チューブ、人工関節又は生物義装具である、請求項７又は８記載の方法。
【請求項１０】
前記バイオフィルムが、Ｐｅｌ依存性、Ｐｓｌ依存性、ＰＮＡＧ依存性、及び／又はＧＡＧ依存性バイオフィルムである、及び／又は
前記バイオフィルムがP. aeruginosa、S. aureus、E. coli、S. epidermidis、Y. pestis、B. pertussis、Burkholderia spp.、Candida spp.、Aspergillus spp.、Acinetobacter spp.、及びFusarium spp.によって引き起こされる、請求項７〜９のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１１】
前記留置医療装置又はインプラントを抗菌剤で被覆することをさらに含む請求項７〜１０のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１２】
バイオフィルム形成の影響を受けやすい非医療用表面のバイオフィルム形成を処理又はする方法であって、少なくとも１つの、少なくとも２つの、少なくとも３つの、少なくとも４つの、少なくとも５つの、又はすべての：（ｉ）Ｓｐｈ３  ＧＨドメインを含む可溶性タンパク質、（ｉｉ）ＰｅｌＡ  ＧＨドメインを含む可溶性タンパク質、（ｉｉｉ）ＢｐｓＢ  ＧＨドメインを含む可溶性タンパク質、（ｉｖ）ＰｇａＢ  ＧＨドメインを含む可溶性タンパク質、（ｖ）ＰｓｌＧグリコシルヒドロラーゼ（ＧＨ）ドメインを含む可溶性タンパク質、及び（ｖｉ）Ｅｇａ３  ＧＨドメインを含む可溶性タンパク質、又はそのオーソログで、それらを必要としている動物に使用する前に、前記表面を塗布すること又は前記表面を被覆することを含む方法。
【請求項１３】
a)  前記Ｓｐｈ３  ＧＨドメインを含む可溶性タンパク質が、アクセッション番号ＥＡＬ９２７８６．１でジェンバンクに寄託されているＳｐｈ３配列のアミノ酸５２〜２９８又はそのグリコシルヒドロラーゼバリアントを含む、
b)  前記Ｓｐｈ３  ＧＨドメインオーソログを含む可溶性タンパク質が、アクセッション番号ＥＡＷ０９３７９．１でジェンバンクに寄託されているＳｐｈ３配列のアミノ酸５４〜３０４又はそのグリコシルヒドロラーゼバリアントを含む、
c)  前記Ｓｐｈ３  ＧＨドメインオーソログを含む可溶性タンパク質が、アクセッション番号ＥＡＡ６３５２３．１でジェンバンクに寄託されているＳｐｈ配列のアミノ酸４３〜２９９又はそのグリコシルヒドロラーゼバリアントを含む、
d)  前記ＰｅｌＡ  ＧＨドメインを含む可溶性タンパク質が、アクセッション番号ＡＡＧ０６４５２．１でジェンバンクに寄託されているＰｅｌＡ配列のアミノ酸４７〜３０３若しくはアクセッション番号ＡＡＹ９２２４４．２でジェンバンクに寄託されているＰｅｌＡ配列のアミノ酸３５〜２９１又はそれらのグリコシルヒドロラーゼバリアントを含む、
e)  前記ＰｅｌＡ  ＧＨドメインを含む可溶性タンパク質オーソログが、アクセッション番号ＣＡＱ６２２０１．１でジェンバンクに寄託されているＲａｇＡ配列のアミノ酸６１〜３１７若しくはアクセッション番号ＡＢＢ３２１９１．１でジェンバンクに寄託されているＰｅｌＡ配列のアミノ酸２３〜２７７、又はそれらのグリコシルヒドロラーゼバリアントを含む、
f)  前記ＢｐｓＢ  ＧＨドメインを含む可溶性タンパク質が、アクセッション番号ＣＡＥ３２２６５．１でジェンバンクに寄託されているＢｐｓＢ配列のアミノ酸３１８〜６７０若しくはアミノ酸２７〜７０１又はそれらのグリコシルヒドロラーゼバリアントを含む、
g)  前記ＰｇａＢ  ＧＨドメインを含む可溶性タンパク質が、アクセッション番号ＡＡＣ７４１０８．１でジェンバンクに寄託されているＰｇａＢ配列のアミノ酸３１０〜６７２若しくはアミノ酸２２〜６７２又はそれらのグリコシルヒドロラーゼバリアントを含む、
h)  前記ＰｓｌＧ  ＧＨドメインを含む可溶性タンパク質が、アクセッション番号ＡＡＧ０５６２５．１でジェンバンクに寄託されているＰｓｌＧ配列のアミノ酸３１〜４４２又はそのグリコシルヒドロラーゼバリアントを含む、及び／又は
i)  前記Ｅｇａ３  ＧＨドメインを含む可溶性タンパク質が、アクセッション番号ＥＡＬ９２７８７．１でジェンバンクに寄託されているＥｇａ３配列のアミノ酸４６〜３１８又はそのグリコシルヒドロラーゼバリアントを含む、請求項１２に記載の方法。
【請求項１４】
前記バイオフィルム関連感染症の前記バイオフィルムが、Ｐｅｌ依存性、Ｐｓｌ依存性、ＰＮＡＧ依存性、及び／又はＧＡＧ依存性バイオフィルムである、並びに／又は
前記バイオフィルムが、P. aeruginosa、S. aureus、E. coli、S. epidermidis、Y. pestis、B. pertussis、Burkholderia spp.、Candida spp.、Aspergillus spp.、Acinetobacter spp.、及び／若しくはFusarium spp.によって引き起こされる請求項１２又は１３記載の方法。
【請求項１５】
抗菌剤と併用投与する又は抗菌剤で被覆することをさらに含む請求項１２〜１４のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１６】
少なくとも１つの、少なくとも２つの、少なくとも３つの、少なくとも４つの、少なくとも５つの、又はすべての：（ｉ）Ｓｐｈ３  ＧＨドメインを含む可溶性タンパク質、（ｉｉ）ＰｅｌＡ  ＧＨドメインを含む可溶性タンパク質、（ｉｉｉ）ＢｐｓＢ  ＧＨドメインを含む可溶性タンパク質、（ｉｖ）ＰｇａＢ  ＧＨドメインを含む可溶性タンパク質、（ｖ）ＰｓｌＧグリコシルヒドロラーゼ（ＧＨ）ドメインを含む可溶性タンパク質、及び（ｖｉ）Ｅｇａ３  ＧＨドメインを含む可溶性タンパク質、又はそのオーソログで被覆された留置医療装置又はインプラント。
【請求項１７】
a)  前記Ｓｐｈ３  ＧＨドメインを含む可溶性タンパク質が、アクセッション番号ＥＡＬ９２７８６．１でジェンバンクに寄託されているＳｐｈ３配列のアミノ酸５２〜２９８又はそのグリコシルヒドロラーゼバリアントを含む、
b)  前記Ｓｐｈ３  ＧＨドメインオーソログを含む可溶性タンパク質が、アクセッション番号ＥＡＷ０９３７９．１でジェンバンクに寄託されているＳｐｈ３配列のアミノ酸５４〜３０４又はそのグリコシルヒドロラーゼバリアントを含む、
c)  前記Ｓｐｈ３  ＧＨドメインオーソログを含む可溶性タンパク質が、アクセッション番号ＥＡＡ６３５２３．１でジェンバンクに寄託されているＳｐｈ配列のアミノ酸４３〜２９９又はそのグリコシルヒドロラーゼバリアントを含む、
d)  前記ＰｅｌＡ  ＧＨドメインを含むタンパク質が、アクセッション番号ＡＡＧ０６４５２．１でジェンバンクに寄託されているＰｅｌＡ配列のアミノ酸４７〜３０３若しくはアクセッション番号ＡＡＹ９２２４４．２でジェンバンクに寄託されているＰｅｌＡ配列のアミノ酸３５〜２９１又はそれらのグリコシルヒドロラーゼバリアントを含む、
e)  前記ＰｅｌＡ  ＧＨドメインを含む可溶性タンパク質オーソログが、アクセッション番号ＣＡＱ６２２０１．１でジェンバンクに寄託されているＲａｇＡ配列のアミノ酸６１〜３１７若しくはアクセッション番号ＡＢＢ３２１９１．１でジェンバンクに寄託されているＰｅｌＡ配列のアミノ酸２３〜２７７、又はそれらのグリコシルヒドロラーゼバリアントを含む、
f)  前記ＢｐｓＢ  ＧＨドメインを含むタンパク質が、アクセッション番号ＣＡＥ３２２６５．１でジェンバンクに寄託されているＢｐｓＢ配列のアミノ酸３１８〜６７０若しくはアミノ酸２７〜７０１又はそれらのグリコシルヒドロラーゼバリアントを含む、
g)  前記ＰｇａＢ  ＧＨドメインを含むタンパク質が、アクセッション番号ＡＡＣ７４１０８．１でジェンバンクに寄託されているＰｇａＢ配列のアミノ酸３１０〜６７２若しくはアミノ酸２２〜６７２又はそれらのグリコシルヒドロラーゼバリアントを含む、
h)  前記ＰｓｌＧ  ＧＨドメインを含むタンパク質が、アクセッション番号ＡＡＧ０５６２５．１でジェンバンクに寄託されているＰｓｌＧ配列のアミノ酸３１〜４４２又はそのグリコシルヒドロラーゼバリアントを含む、及び／又は
i)  前記Ｅｇａ３  ＧＨドメインを含む可溶性タンパク質が、アクセッション番号ＥＡＬ９２７８７．１でジェンバンクに寄託されているＥｇａ３配列のアミノ酸４６〜３１８又はそのグリコシルヒドロラーゼバリアントを含む、請求項１６に記載の留置医療装置又はインプラント。
【請求項１８】
前記装置又はインプラントがさらに抗菌剤で被覆される請求項１７又は１８に記載の留置医療装置又はインプラント。
【請求項１９】
前記留置医療装置がカテーテル、静脈内チューブ、人工関節又は生物義装具である請求項１７〜１９のいずれか一項に記載の留置医療装置又はインプラント。
【請求項２０】
前記バイオフィルムが、Ｐｅｌ依存性、Ｐｓｌ依存性、ＰＮＡＧ依存性、及び／又はＧＡＧ依存性バイオフィルムである、並びに／又は
前記バイオフィルムが、P. aeruginosa、S. aureus、E. coli、S. epidermidis、Y. pestis、B. pertussis、Burkholderia spp.、Candida spp.、Aspergillus spp.、Acinetobacter spp.及び／若しくはFusarium spp.によって引き起こされる請求項１７〜１９のいずれか一項に記載の留置医療装置又はインプラント。