【手続補正書】
【提出日】平成30年8月10日(2018.8.10)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
集積装置であって、
励起エネルギーを伝播させるように構成された少なくとも１つの導波路と、
前記集積装置の表面に入射する励起エネルギーを受け取り、前記励起エネルギーを前記少なくとも１つの導波路に結合するように構成されたカプラと、
複数のピクセルと、を含み、前記複数のピクセルのうちの１つのピクセルが、
前記表面上に形成され、前記少なくとも１つの導波路から励起エネルギーを受け取るように構成された検体ウェルと、
前記検体ウェル内に位置付けられた検体からの発光を受け取り、かつ前記受け取られた発光に基づいて前記検体の識別情報を提供する信号を生成するように位置付けられた少なくとも１つのセンサと
を含む集積装置。
【請求項２】
前記信号が前記受け取られた発光の時間的パラメータを示す、請求項１に記載の集積装置。
【請求項３】
前記時間的パラメータが、前記検体からの前記発光に関連付けられる寿命である、請求項２に記載の集積装置。
【請求項４】
前記少なくとも１つのセンサは、前記検体からの発光による受け取られた光子によって生成された電荷キャリアを、少なくとも２つのビンに集約することによって前記信号を生成する、請求項１に記載の集積装置。
【請求項５】
前記少なくとも１つのセンサは、励起エネルギーのパルスが前記検体ウェルに送達された後の時間について、互いに異なる時間間隔にわたって前記電荷キャリアを前記少なくとも２つのビンに集約することと、前記互いに異なる時間間隔の各々において到来した光子の相対数を示す信号を生成することと、を行うようにさらに構成されている、請求項４に記載の集積装置。
【請求項６】
前記信号が、前記発光のスペクトルと、前記発光の特徴的波長と、前記検体の吸収スペクトルと、のうちの少なくとも１つを示す、請求項１に記載の集積装置。
【請求項７】
リフレクタ層をさらに含み、前記リフレクタ層は、前記カプラの面の付近に配置され、前記カプラを通過する励起エネルギーを前記カプラに向かって反射するように位置付けられている、請求項１に記載の集積装置。
【請求項８】
集積装置であって、
ピクセル領域であって、
複数のピクセルであって、前記複数のピクセルのうちの１つのピクセルが、
前記集積装置の表面上の検体ウェルであって、検体を受けるように構成された検体ウェルと、
前記検体ウェルからの発光を受け取るように構成された少なくとも１つのセンサとを含む複数のピクセルと、
前記検体ウェルの付近に励起エネルギーを送達する少なくとも１つの導波路と
を含むピクセル領域と、
励起源結合領域であって、
外部励起エネルギー源から励起エネルギーを受け取り、かつ前記励起エネルギーを前記導波路に結合するように構成された結合構成要素
を含む励起源結合領域と
を含む集積装置。
【請求項９】
前記検体ウェルが、複数の分子を含む検体から分子を分離するように構成される、請求項８に記載の集積装置。
【請求項１０】
前記結合構成要素が格子カプラを含む、請求項８に記載の集積装置。
【請求項１１】
前記励起源結合領域が、前記格子カプラに向かって励起エネルギーを反射するように位置付けられたリフレクタ層をさらに含む、請求項１０に記載の集積装置。
【請求項１２】
前記リフレクタ層が少なくとも１つの穴を含み、前記励起源結合領域が、前記リフレクタ層の前記少なくとも１つの穴を通じて励起エネルギーを受け取り、かつ前記受け取られた励起エネルギーの強度を測定するように位置付けられた少なくとも１つのモニタセンサをさらに含む、請求項１１に記載の集積装置。
【請求項１３】
前記受け取られた励起エネルギーの前記強度が、前記格子カプラに対する前記励起エネルギーのアラインメントプロセスのためのフィードバックループの一部として信号を提供する、請求項１２に記載の集積装置。
【請求項１４】
前記少なくとも１つのピクセルが、前記検体ウェルと前記導波路との間に、前記導波路から前記検体ウェルに励起エネルギーを結合する少なくとも１つの結合要素をさらに含む、請求項８に記載の集積装置。
【請求項１５】
前記少なくとも１つの結合要素がマイクロキャビティである、請求項１４に記載の集積装置。
【請求項１６】
前記少なくとも１つの結合要素がブルズアイ回折格子である、請求項１４に記載の集積装置。
【請求項１７】
前記少なくとも１つのピクセルが、励起エネルギーが前記少なくとも１つのセンサにより検出されるのを抑制するバッフルをさらに含む、請求項８に記載の集積装置。
【請求項１８】
前記ピクセル領域が、前記導波路と前記少なくとも１つのセンサとの間に位置付けられている、励起エネルギーを選択的にフィルタ処理するとともに前記検体ウェルからの発光エネルギーを透過させる少なくとも１つの励起フィルタをさらに含む、請求項８に記載の集積装置。
【請求項１９】
前記格子カプラが、前記導波路の方向にテーパが付けられている幅を有する、請求項８に記載の集積装置。
【請求項２０】
前記検体ウェルが、金属材料において形成されたナノアパーチャを含む、請求項８に記載の集積装置。
【請求項２１】
前記金属材料から形成される複数のリングを含む同心円リング回折格子をさらに含み、前記ナノアパーチャが前記複数のリングの最も内側のリング内に配置される、請求項２０に記載の集積装置。
【請求項２２】
前記少なくとも１つの導波路が、前記検体ウェル内の励起領域に励起エネルギーを提供するように構成され、前記励起領域内に配置された検体が、前記励起領域を照明する励起エネルギーに応答して励起エネルギーを放出する、請求項８に記載の集積装置。
【請求項２３】
前記少なくとも１つの導波路が、前記複数のピクセルのうちのピクセルの一部の各ピクセルのための検体ウェルの付近に励起エネルギーを送達するように構成される、請求項８に記載の集積装置。
【請求項２４】
前記複数のピクセルのうちの１つのピクセルが、前記少なくとも１つの導波路に結合し、かつ検体ウェルの付近に励起エネルギーを誘導するように構成された少なくとも１つの励起結合構造をさらに含む、請求項８に記載の集積装置。
【請求項２５】
前記複数のピクセルのうちの１つのピクセルが、検体ウェル内に配置された検体により放出された放出エネルギーと結合するように構成された少なくとも１つの表面エネルギー結合要素をさらに含む、請求項８に記載の集積装置。
【請求項２６】
前記検体ウェルの深さは５０ｎｍ〜５００ｎｍである、請求項８に記載の集積装置。
【請求項２７】
前記検体ウェルの側壁は、テーパ状である、請求項８に記載の集積装置。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０４２１
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０４２１】
また、本明細書で使用される語句および用語は、説明を目的としており、限定的とみなすべきではない。「包含する」、「含む」、または「有する」、「含有する」、「伴う」およびその変化形の使用は、その後に挙げられる用語およびその均等物ならびに追加の項目を包含するものとする。
＜付記＞
１．  集積装置であって、
該集積装置は、複数のピクセルを含み、前記複数のピクセルのうちの１つのピクセルが、
前記集積装置の外部の励起源から励起エネルギーを受け取るように構成された検体ウェルと、
前記検体ウェル内に位置付けられた検体からの発光を受け取り、かつ前記受け取られた発光に基づいて前記検体の識別情報を提供する信号を生成するように位置付けられた少なくとも１つのセンサと
を含む集積装置。
２．  前記信号が前記受け取られた発光の時間的パラメータを示す、付記１に記載の集積装置。
３．  前記時間的パラメータが、前記検体からの前記発光に関連付けられる寿命である、付記２に記載の集積装置。
４．  前記信号が前記発光のスペクトルを示す、付記１に記載の集積装置。
５．  前記信号が前記発光の特徴的波長を示す、付記４に記載の集積装置。
６．  前記信号および前記励起エネルギーが、前記検体の吸収スペクトルを示す、付記１に記載の集積装置。
７．  前記信号および前記励起エネルギーが、前記検体により吸収される特徴的波長を示す、付記６に記載の集積装置。
８．  集積装置であって、
ピクセル領域であって、
複数のピクセルであって、前記複数のピクセルのうちの１つのピクセルが、
前記集積装置の表面上の検体ウェルであって、検体を受けるように構成された検体ウェルと、
前記検体ウェルからの発光を受け取るように構成された少なくとも１つのセンサとを含む複数のピクセルと、
前記検体ウェルの付近に励起エネルギーを送達する少なくとも１つの導波路と
を含むピクセル領域と、
励起源結合領域であって、
外部励起エネルギー源から励起エネルギーを受け取り、かつ前記励起エネルギーを前記導波路に結合するように構成された結合構成要素
を含む励起源結合領域と
を含む集積装置。
９．  前記検体ウェルが、複数の分子を含む検体から分子を分離するように構成される、付記８に記載の集積装置。
１０．  前記結合構成要素が格子カプラを含む、付記８に記載の集積装置。
１１．  前記励起源結合領域が、前記格子カプラに向かって励起エネルギーを反射するように位置付けられたリフレクタ層をさらに含む、付記１０に記載の集積装置。
１２．  前記リフレクタ層が少なくとも１つの穴を含み、前記励起源結合領域が、前記リフレクタ層の前記少なくとも１つの穴を通じて励起エネルギーを受け取り、かつ前記受け取られた励起エネルギーの強度を測定するように位置付けられた少なくとも１つのモニタセンサをさらに含む、付記１１に記載の集積装置。
１３．  前記受け取られた励起エネルギーの前記強度が、前記格子カプラに対する前記励起エネルギーのアラインメントプロセスのためのフィードバックループの一部として信号を提供する、付記１２に記載の集積装置。
１４．  前記少なくとも１つのピクセルが、前記検体ウェルと前記導波路との間に、前記導波路から前記検体ウェルに励起エネルギーを結合する少なくとも１つの結合要素をさらに含む、付記８に記載の集積装置。
１５．  前記少なくとも１つの結合要素がマイクロキャビティである、付記１４に記載の集積装置。
１６．  前記少なくとも１つの結合要素がブルズアイ回折格子である、付記１４に記載の集積装置。
１７．  前記少なくとも１つのピクセルが、励起エネルギーが前記少なくとも１つのセンサにより検出されるのを抑制するバッフルをさらに含む、付記８に記載の集積装置。
１８．  前記ピクセル領域が、前記導波路と前記少なくとも１つのセンサとの間に位置付けられている、励起エネルギーを選択的にフィルタ処理するとともに前記検体ウェルからの発光エネルギーを透過させる少なくとも１つの励起フィルタをさらに含む、付記８に記載の集積装置。
１９．  前記格子カプラが、前記導波路の方向にテーパが付けられている幅を有する、付記８に記載の集積装置。
２０．  前記検体ウェルが、金属材料において形成されたナノアパーチャを含む、付記８に記載の集積装置。
２１．  前記金属材料から形成される複数のリングを含む同心円リング回折格子をさらに含み、前記ナノアパーチャが前記複数のリングの最も内側のリング内に配置される、付記２０に記載の集積装置。
２２．  前記少なくとも１つの導波路が、前記検体ウェル内の励起領域に励起エネルギーを提供するように構成され、前記励起領域内に配置された検体が、前記励起領域を照明する励起エネルギーに応答して励起エネルギーを放出する、付記８に記載の集積装置。
２３．  前記少なくとも１つの導波路が、前記複数のピクセルのうちのピクセルの一部の各ピクセルのための検体ウェルの付近に励起エネルギーを送達するように構成される、付記８に記載の集積装置。
２４．  前記複数のピクセルのうちの１つのピクセルが、前記少なくとも１つの導波路に結合し、かつ検体ウェルの付近に励起エネルギーを誘導するように構成された少なくとも１つの励起結合構造をさらに含む、付記８に記載の集積装置。
２５．  前記複数のピクセルのうちの１つのピクセルが、検体ウェル内に配置された検体により放出された放出エネルギーと結合するように構成された少なくとも１つの表面エネルギー結合要素をさらに含む、付記８に記載の集積装置。
２６．  システムであって、
第一の持続時間を有する励起エネルギーのパルスを放出するように構成された励起源を含む励起源モジュールと、
集積装置であって、
前記励起エネルギーのパルスに結合されると発光を放出する検体を受けるように構成された検体ウェルと、
第二の持続時間にわたり前記発光を検出するセンサであって、前記第二の持続時間が前記第一の持続時間後に発生する、センサと、
第一のエネルギー経路であって、該第一のエネルギー経路に沿って前記励起エネルギーのパルスが前記励起源からエネルギー源結合構成要素へ移動する、第一のエネルギー経路と、
第二のエネルギー経路であって、該第二のエネルギー経路に沿って前記励起エネルギーのパルスが前記エネルギー源結合構成要素から前記検体ウェルへ移動する、第二のエネルギー経路と、
第三のエネルギー経路であって、該第三のエネルギー経路に沿って前記発光が前記検体ウェルから前記センサへと移動する、第三のエネルギー経路と
を含む集積装置と
を含むシステム。
２７．  前記励起源モジュールおよび前記集積装置が取り付けられる基本機器をさらに含む、付記２６に記載のシステム。
２８．  前記励起源モジュールがヒンジピンを介して前記基本機器に蝶着される、付記２７に記載のシステム。
２９．  前記集積装置が複数のスチール製ボールをさらに含み、
前記励起源モジュールが、前記複数のスチール製ボール上に載るように構成された複数の磁化された径方向ｖ字溝を含む、付記２８に記載のシステム。
３０．  前記励起源モジュールが前記基本機器に着脱可能に取り付けられる、付記２７に記載のシステム。
３１．  前記励起源がスライドメカニズムを介して前記基本機器に取り付けられる、付記２７に記載のシステム。
３２．  前記励起源モジュールが、光のパルスの前記集積装置への入射角および／または位置を制御するように構成された少なくとも１つの傾斜可能ウィンドウを含む、付記２６に記載のシステム。
３３．  前記集積装置が少なくとも１つのモニタセンサをさらに含む、付記２６に記載のシステム。
３４．  前記励起源が、アクティブアラインメントメカニズムを介して前記エネルギー源結合構成要素に整列される、付記２６に記載のシステム。
３５．  検体における分子の存在を検出する方法であって、
複数の発光マーカのうちの１つで標識された検体を検体ウェル内に導入するステップであって、前記複数の発光マーカの少なくとも一部が異なる発光寿命値を有する、ステップと、
前記検体ウェルに光のパルスを照射するステップと、
前記検体ウェルから放出された光子の到来時間を測定するステップと、
前記光子の前記到来時間に基づいてマーカの識別を判定するステップと
を含む方法。
３６．  前記検体ウェルから放出された前記光子の波長を測定するステップと、
前記光子の前記測定された波長に基づいてマーカの識別を判定するステップと
をさらに含む、付記３５に記載の方法。
３７．  前記検体ウェルの前記照射が前記検体ウェルの付近の導波路を使用して達成されることにより、前記光のエバネッセントテールが前記検体ウェルと結合する、付記３５に記載の方法。
３８．  前記光がスターカプラを使用して前記導波路に結合される、付記３７に記載の方法。
３９．  前記光がスライス回折格子を使用して前記導波路に結合される、付記３７に記載の方法。
４０．  前記光がマルチモード干渉スプリッタを使用して前記導波路に結合される、付記３７に記載の方法。
４１．  集積装置であって、
複数の発光マーカのうちの１つで標識された検体を受けるように構成された検体ウェルであって、前記複数の発光マーカの各々が異なる発光寿命値を有する、検体ウェルと、
前記複数の発光マーカのうちの１つからの発光を複数の持続時間にわたって検出するように構成されたセンサであって、前記複数の持続時間が前記複数の発光マーカが互いに区別されるように選択される、センサと
を含む集積装置。
４２．  励起エネルギーを前記検体ウェルの付近に送達する導波路をさらに含む、付記４１に記載の集積装置。
４３．  前記励起エネルギーを外部エネルギー源から受け取り、かつ前記励起エネルギーを前記導波路に結合する格子カプラをさらに含む、付記４２に記載の集積装置。
４４．  前記格子カプラが、前記導波路の方向にテーパが付けられている幅を有する、付記４２に記載の集積装置。
４５．  前記検体ウェルが金属材料において形成されたナノアパーチャを含む、付記４１に記載の集積装置。
４６．  前記金属材料から形成された複数のリングを含む同心円リング回折格子をさらに含み、前記ナノアパーチャが前記複数のリングの最も内側のリング内に配置される、付記４５に記載の集積装置。
４７．  前記検体ウェルの付近に少なくとも１つのマイクロキャビティをさらに含み、前記少なくとも１つのマイクロキャビティが、導波路からの励起エネルギーを前記検体ウェルに結合するように構成される、付記４５に記載の集積装置。
４８．  集積装置であって、
複数の発光マーカのうちの１つで標識された検体を受けるように構成された検体ウェルであって、前記複数の発光マーカの各々が、複数のスペクトル範囲のうちの１つ内の発光を放出し、前記複数のスペクトル範囲のうちの１つで発光を放出する前記複数の発光マーカの一部がそれぞれ異なる発光寿命値を有する、検体ウェルと、
複数のセンサであって、前記複数のセンサの各センサが、複数の持続時間にわたって前記複数のスペクトル範囲のうちの１つを検出するように構成され、前記複数の持続時間が、前記複数の発光マーカの前記一部が互いに区別されるように選択される、複数のセンサと
を含む集積装置。
４９．  前記検体ウェルと前記複数のセンサとの間に配置されたパターン付きカラーフィルタをさらに含む、付記４８に記載の集積装置。
５０．  前記パターン付きカラーフィルタが、前記複数のスペクトル範囲のうちの第一のスペクトル範囲内の光を前記複数のセンサのうちの第一のセンサへと透過させ、かつ前記複数のスペクトル範囲のうちの第二のスペクトル範囲内の光を前記複数のセンサのうちの第二のセンサへと透過させる、付記４８に記載の集積装置。
５１．  システムであって、
複数の励起エネルギーを放出するように構成された複数の励起源であって、前記複数の励起源の各々が、前記複数の励起エネルギーのうちの１つのパルスを放出する、複数の励起源と、
集積装置であって、
複数の発光マーカのうちの１つで標識された検体を受けるように構成された検体ウェルであって、前記複数の発光マーカの一部が前記複数の励起エネルギーのうちの１つにより照明された後に発光を放出し、各々が異なる寿命値を有する、検体ウェルと、
前記複数の発光マーカのうちの１つからの発光を、前記複数の励起エネルギーのうちの１つのパルスの後、複数の持続時間にわたって検出するように構成されたセンサであって、前記複数の励起エネルギーのうちの１つの前記パルスのタイミングおよび前記複数の持続時間によって、前記複数の発光マーカが互いに区別される、センサと
を含む集積装置と
を含むシステム。
５２．  集積装置を形成する方法であって、
複数のセンサ領域を形成するステップであって、前記複数のセンサ領域のうちの１つのセンサ領域が複数のセンサを含む、ステップと、
複数の検体ウェルを形成するステップであって、前記複数の検体ウェルのうちの１つの検体ウェルが、前記複数のセンサ領域の対応する１つと整列する、ステップと、
前記複数の検体ウェルから離れて励起エネルギーを結合し、かつ励起エネルギーを少なくとも１つの検体ウェルに誘導するように構成された少なくとも１つの導波路を形成するステップと
を含む方法。
５３．  前記複数の検体ウェルから離れた領域において、前記集積装置の外部の少なくとも１つの励起源から励起エネルギーを受け取り、かつ前記励起エネルギーを前記少なくとも１つの導波路に結合するように構成された格子カプラを形成するステップをさらに含む、付記５２に記載の集積装置を形成する方法。
５４．  機器であって、
少なくとも１つの励起エネルギーを供給する少なくとも１つの励起源と、
前記少なくとも１つの励起源により放出された前記少なくとも１つの励起エネルギーを集積装置の結合領域に整列させる励起源位置決めシステムと、
前記集積装置上のセンサにより検出された放出エネルギーを表す少なくとも１つの読取り信号を受け取るように構成された読取り回路と
を含む機器。
５５．  前記集積装置に対する前記少なくとも１つの励起源のアラインメントを、励起エネルギーを受け取るように構成された少なくとも１つのモニタセンサからの読取り信号に基づいて調整するように構成された励起源回路をさらに含む、付記５４に記載の機器。
５６．  標的核酸分子を配列解析する方法であって、
前記標的核酸分子、重合酵素、および複数の種類のヌクレオチドまたはヌクレオチド類似体を収容する検体ウェルを含む集積装置を提供するステップであって、前記複数の種類のヌクレオチドまたはヌクレオチド類似体のうちの各種類のヌクレオチドまたはヌクレオチド類似体が複数のマーカのうちの１つで標識される、ステップと、
重合酵素の存在下で前記標的核酸分子のプライミング位置において伸長反応を実行して、前記ヌクレオチドまたはヌクレオチド類似体の少なくとも一部を、前記標的核酸分子と相補的である成長鎖内に連続的に組み込むステップであって、励起エネルギーによる励起時に、前記ヌクレオチドまたはヌクレオチド類似体を標識する前記マーカが、前記成長鎖内への組込みの際に前記検体ウェルから放出を生成し、放出寿命が前記複数の種類のヌクレオチドまたはヌクレオチド類似体について区別可能である、ステップと、
前記ヌクレオチドまたはヌクレオチド類似体を、前記放出寿命を示す、センサから受け取られた信号に基づいて識別することによって前記標的核酸分子を配列解析するステップと
を含む方法。
５７．  前記複数の種類のヌクレオチドまたはヌクレオチド類似体が４つの異なる種類のヌクレオチドまたはヌクレオチド類似体を含み、前記４つの異なる種類のヌクレオチドまたはヌクレオチド類似体に関連付けられる前記放出寿命が相互に区別可能である、付記５６に記載の方法。
５８．  前記放出寿命が、励起に使用された前記励起エネルギーの波長に基づいて区別可能である、付記５６に記載の方法。
５９．  前記重合酵素が前記検体ウェル内に固定される、付記５６に記載の方法。
６０．  前記重合酵素が前記検体ウェルの底部に固定される、付記５９に記載の方法。
６１．  前記重合酵素が、前記検体ウェルの表面に付着されるリンカーを使用して固定される、付記５９に記載の方法。
６２．  前記ヌクレオチドまたはヌクレオチド類似体が、少なくとも１つの励起エネルギー源からの励起エネルギーによる励起時に放出物を放出する、付記５６に記載の方法。
６３．  前記少なくとも１つの励起エネルギー源が、少なくとも１つの導波路を通じて前記検体ウェルに動作可能に結合されるレーザ光源であり、前記励起エネルギーが、前記レーザ光源から前記少なくとも１つの導波路を通じて前記検体ウェルに誘導される、付記６２に記載の方法。
６４．  前記検体ウェルが、複数の検体ウェルのうちの１つであり、前記複数の検体ウェルが前記集積装置の一部である、付記６２に記載の方法。
６５．  核酸配列解析の方法であって、
複数の検体ウェルと、前記複数の検体ウェルに動作可能に結合された励起エネルギー源とを含む集積装置を提供するステップであって、前記複数の検体ウェルの個々の検体ウェルが、標的核酸分子、重合酵素、およびヌクレオチドまたはヌクレオチド類似体を含み、複数のマーカのうちの１つのマーカが前記ヌクレオチドまたはヌクレオチド類似体の各々を標識する、ステップと、
前記ヌクレオチドまたはヌクレオチド類似体および前記重合酵素の存在下で前記標的核酸分子を重合反応に曝して、前記標的核酸分子と相補的である成長鎖を生成するステップであって、前記ヌクレオチドまたはヌクレオチド類似体が前記成長鎖内に組み込まれている間、前記複数のマーカが、励起源からの励起エネルギーによる励起時に放出物を放出する、ステップと、
伸張反応の実行中に前記放出物の寿命を検出するステップであって、前記放出物の前記寿命が前記複数のマーカについて区別可能である、ステップと、
前記標的核酸分子の配列を前記放出物の前記寿命に基づいて識別するステップと
を含む方法。
６６．  前記配列が、前記放出物の前記寿命を検出した後に識別される、付記６５に記載の方法。
６７．  前記複数の種類のヌクレオチドまたはヌクレオチド類似体が４つの異なる種類のヌクレオチドまたはヌクレオチド類似体を含み、前記４つの種類のヌクレオチドまたはヌクレオチド類似体に関連付けられる放出寿命が相互に区別可能である、付記６５に記載の方法。
６８．  前記放出寿命が、前記集積装置の一部であるセンサにより検出される、付記６５に記載の方法。
６９．  前記複数の種類のヌクレオチドまたはヌクレオチド類似体が４つの異なる種類のヌクレオチドまたはヌクレオチド類似体を含み、前記４つの種類のヌクレオチドまたはヌクレオチド類似体に関連付けられる吸収スペクトルが相互に区別可能である、付記６５に記載の方法。
７０．  前記複数の種類のヌクレオチドまたはヌクレオチド類似体が４つの異なる種類のヌクレオチドまたはヌクレオチド類似体を含み、前記４つの種類のヌクレオチドまたはヌクレオチド類似体に関連付けられる互いに異なる励起エネルギーに応答する放出物が相互に区別可能である、付記６５に記載の方法。
７１．  試料を解析する方法であって、
複数のピクセルを有する集積装置の表面上に前記試料を載せるステップであって、各ピクセルが、複数のマーカのうちの第一のマーカで標識された検体を受けるように構成された検体ウェルと、少なくとも１つのセンサを有するセンサ領域とを有する、ステップと、
前記集積装置を、励起エネルギーを第一のピクセルの検体ウェルに結合するための少なくとも１つの励起エネルギー源と、前記第一のピクセルの前記センサ領域の前記少なくとも１つのセンサからの読取り信号を受け取るための読取り回路とを有する機器と整列させるステップと、
前記第一のマーカを励起エネルギーで照明するステップと、
前記第一のピクセルの前記センサ領域の前記少なくとも１つのセンサからの前記読取り信号から、前記第一のマーカによる放出物から生成された放出エネルギーの寿命を検出するステップと
を含む方法。
７２．  前記複数のマーカのうちの前記第一のマーカを、前記放出エネルギーの前記寿命に基づいて識別するステップをさらに含み、前記複数のマーカの各々の１つが異なる寿命を有する、付記７１に記載の方法。
７３．  前記第一のマーカを識別することに基づいて、前記第一のマーカで標識された分子の種類を判定するステップをさらに含む、付記７２に記載の方法。
７４．  前記分子の種類がヌクレオチドであり、および前記第一のマーカが蛍光体である、付記７３に記載の方法。
７５．  前記蛍光体がリンカー分子で前記ヌクレオチドに付着される、付記７４に記載の方法。
７６．  第二の検体を標識する第二のマーカを励起エネルギーで照明するステップと、
前記第一のピクセルの前記センサ領域の前記少なくとも１つのセンサからの前記読取り信号から、前記第二のマーカにより生成された放出エネルギーの寿命を検出するステップと
をさらに含む、付記７１に記載の方法。
７７．  前記第一のマーカが第一のヌクレオチドを標識し、および前記第二のマーカが第二のヌクレオチドを標識する、付記７６に記載の方法。