(57)【特許請求の範囲】
【請求項１】
遺伝子パネル検査の検査依頼を管理するためにコンピュータを制御する方法であって、
前記コンピュータは、
複数の検査依頼の各々について、前記検査依頼に関する情報と前記遺伝子パネル検査における検査結果とを取得し、前記検査結果に基づいて、前記検査結果の概要を示す属性情報を取得し、
複数の前記検査依頼と前記属性情報とを各々対応させて表示するための表示情報を出力する、
方法。
【請求項２】
前記属性情報の取得において、
前記検査結果に基づいて、あらかじめ記憶された複数の属性情報の候補から属性情報を取得する、
請求項１に記載の方法。
【請求項３】
前記検査依頼に関する情報の取得と、前記属性情報の取得を、前記管理方法を実行する前記コンピュータとは別のコンピュータが実行し、
前記表示情報の出力において、
前記別のコンピュータから受け付けた複数の前記検査依頼および前記属性情報を統合する、
請求項１又は２に記載の方法。
【請求項４】
前記別のコンピュータは、第１のコンピュータと、第２のコンピュータとを含み、
前記検査依頼に関する情報を、前記第１のコンピュータから取得し、
前記属性情報を、前記第２のコンピュータが取得する、
請求項３に記載の方法。
【請求項５】
前記第１のコンピュータは、複数のコンピュータを含み、
前記検査依頼に関する情報の取得において、前記検査依頼に関する情報を、前記複数の第１のコンピュータのそれぞれから取得する、
請求項４に記載の方法。
【請求項６】
前記管理方法を実行する前記コンピュータが、クラウドコンピューティングを提供するウェブサーバを含み、
前記ウェブサーバにアクセスするコンピュータのウェブブラウザを介して、前記検査依頼に関する情報の取得と、前記属性情報の取得と、前記表示情報の出力が実行される、
請求項１又は２に記載の方法。
【請求項７】
前記属性情報が、前記検査結果における所定の遺伝子変異の有無に関する情報、および所定の遺伝子変異の種別に関する情報から選択される少なくとも１つを含む、
請求項１から６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項８】
前記所定の遺伝子変異の有無に関する情報は、前記遺伝子パネル検査の検査項目に含まれる複数の遺伝子から選択される少なくとも一つについて、変異が検出されたか否かに関する情報を含む、
請求項７に記載の方法。
【請求項９】
前記所定の遺伝子変異の種別に関する情報が、前記遺伝子パネル検査の検査項目に含まれる複数の遺伝子から選択される少なくとも一つについて、所定の種別の遺伝子変異が検出されたか否かに関する情報を含む、
請求項７または８に記載の方法。
【請求項１０】
前記所定の種別の遺伝子変異が、アクショナブル変異、および生殖細胞変異から選択される少なくとも１つを含む、
請求項９に記載の方法。
【請求項１１】
前記表示情報は、前記属性情報の種類を識別可能な表示形式で前記属性情報を表示するための情報を含む、
請求項１から１０のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１２】
前記識別可能な表示形式が、属性情報の種類に応じた色、凡例、又は閲覧者の注意を喚起するラベルによって識別する表示形式である、
請求項１１に記載の方法。
【請求項１３】
前記表示情報は、前記属性情報が前記検査依頼に対応したリスト表示となるための情報を含む、
請求項１から１２のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１４】
請求項１３に記載の方法であって、さらに、
前記属性情報に基づいた表示形式の設定を受け付け、
前記表示情報の出力において、
受け付けた設定に基づいて前記リスト表示を変更するための表示変更情報を出力する、
方法。
【請求項１５】
前記属性情報に基づいた表示形式の設定が、前記属性情報の種類に応じて複数の検査依頼を並べ替える設定である、
請求項１４に記載の方法。
【請求項１６】
前記属性情報に基づいた表示形式の設定が、所定の種類の属性情報を抽出して表示する設定である、
請求項１５に記載の方法。
【請求項１７】
前記検査依頼に対応する検査結果情報をさらに取得し、
前記表示情報が、前記検査結果情報の表示要求を受け付けるためのリンク情報を含む、請求項１から１５のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１８】
前記表示情報が、薬剤情報データベース、治験情報データベースおよび論文情報データベースから選択される少なくとも１つの情報データベースの表示要求を受け付けるためのリンク情報を含む、
請求項１から１７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１９】
前記検査依頼に関連する検体および／または検査の品質情報をさらに取得し、
前記表示情報が、取得した前記品質情報の表示要求を受け付けるためのリンク情報を含む、
請求項１から１８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２０】
前記検査依頼に関連する、生殖細胞変異情報の知得を希望するか否かを含む患者のインフォームドコンセント情報をさらに取得し、
前記表示情報が、取得した前記インフォームドコンセント情報の表示要求を受け付けるためのリンク情報を含む、
請求項１から１９のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２１】
前記表示情報が、前記属性情報のうち生殖細胞変異情報の表示の変更要求を受け付けるためのリンク情報を含む、
請求項２０記載の方法。
【請求項２２】
前記検査依頼に関連する検査結果情報をさらに取得し、
前記表示情報が、前記生殖細胞変異に関する情報の提示様式の選択要求を受け付けるためのリンク情報を含む、
請求項２０または２１に記載の方法。
【請求項２３】
前記検査依頼に関連する検査の進捗情報をさらに取得し、
前記表示情報が、取得した前記進捗情報の表示要求を受け付けるためのリンク情報を含む、
請求項１から２２いずれか一項に記載の方法。
【請求項２４】
前記検査依頼に関連する、複数の医療関係者により遺伝子情報の解釈を行う専門家会議に関する情報をさらに取得し、
前記表示情報が、取得した前記専門家会議に関する情報の表示要求を受け付けるためのリンク情報を含む、
請求項１から２３のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２５】
前記表示情報が、前記専門家会議のスケジュールの設定要求を受け付けるためのリンク情報を含む、
請求項２３に記載の方法。
【請求項２６】
遺伝子パネル検査の検査依頼を管理する管理装置であって、
制御部を備え、
前記制御部は、
複数の検査依頼の各々について、前記検査依頼に関する情報と前記遺伝子パネル検査における検査結果とを取得し、前記検査結果に基づいて、前記検査結果の概要を示す属性情報を取得し、
複数の前記検査依と前記属性情報とを各々対応させて表示するための表示情報を出力する、
前記管理装置。
【請求項２７】
前記管理装置は、クラウドコンピューティングを提供するウェブサーバであり、
前記ウェブサーバにアクセスするコンピュータのウェブブラウザを介して、前記検査依頼に関する情報の取得と、前記属性情報の取得と、前記表示情報の出力が実行される、
請求項２６に記載の管理装置。
【請求項２８】
コンピュータに
複数の検査依頼の各々について、前記検査依頼に関する情報と検査依頼に対応する遺伝子パネル検査における検査結果とを取得し、前記検査結果に基づいて、前記検査結果の概要を示す属性情報を取得するステップと、
前記複数の前記検査依頼と前記属性情報とを各々対応させて表示するための表示情報を出力するステップと、
を実行させる遺伝子パネル検査の検査依頼を管理するためのコンピュータプログラム。
【請求項２９】
遺伝子パネル検査の検査依頼を管理する管理システムであって、
制御部を備える第１のコンピュータと、
制御部を備える第２のコンピュータと、
制御部を備える管理装置と、を備え、
前記第１のコンピュータの制御部は、
複数の検査依頼に関する情報を前記管理装置に送信し、
前記第２のコンピュータの制御部は、
前記遺伝子パネル検査における検査結果を取得し、前記検査結果に基づいて、前記検査結果の概要を示す属性情報を取得し、前記管理装置に送信し、
前記管理装置の前記制御部は、
受信した複数の前記検査依頼と前記属性情報とを各々対応させて表示するための表示情報を出力する、
前記管理システム。
【請求項３０】
前記第２のコンピュータの制御部は、
複数の属性情報の候補を記憶した記憶部を備え、
記憶した複数の前記属性情報の候補から、前記検査結果に基づいて取得した前記属性情報を、前記管理装置に送信する、
請求項２９記載の管理システム。
【請求項３１】
前記第１のコンピュータは、複数のコンピュータを含み、
前記管理装置の前記制御部は、前記検査依頼に関する情報を、前記複数の第１のコンピュータのそれぞれから取得する、  請求項２９又は３０記載の管理システム。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
本明細書には、検査依頼をコンピュータにより管理する方法、遺伝子パネル検査の検査依頼を管理する管理装置、遺伝子パネル検査の検査依頼を管理するコンピュータプログラム及び遺伝子パネル検査の検査依頼を管理する管理システムが開示される。
【背景技術】
【０００２】
近年、がん治療においては、患者毎に、一度に多くの遺伝子の変異を次世代シーケンサーなどによって網羅的に調べることが可能な遺伝子パネル検査を行い、その結果に基づいて各患者に適した治療方針を策定するがんゲノム医療の研究が推進されている。
【０００３】
しかし、一般的に各患者に適した治療方針の策定に参考となる患者の電子カルテ、病理画像、および遺伝子パネル検査の各種検査結果は、医療施設内においてそれぞれ異なるシステムにて管理されている。特許文献１には、ある医療施設において分散している電子カルテ、病理画像、および遺伝子パネル検査等の検査結果などを集約し、患者の治療方針の策定を支援する情報プラットフォームが開示されている。
【先行技術文献】
【特許文献】
【０００４】
【特許文献１】特開２０１８−５３３１２３号公報
【発明の概要】
【発明が解決しようとする課題】
【０００５】
ゲノム医療において、治療方針の策定は、患者の担当医や病理医だけでなく、遺伝子カウンセラー、分子遺伝学の研究者、臨床検査技師、バイオインフォマティシャン等から構成される専門家会議を経て行われる。専門家会議においては、遺伝子パネル検査でどのような変異が検出されたのか、あるいは検出されなかったのかに応じて異なる治療方針が提案される場合がある。また、複数の検査依頼が存在する場合においては、その検査結果に応じて治療の緊急度が異なる場合がある。
【０００６】
このような状況において、今後さらなる依頼件数の増加が見込まれることからも、複数の検査依頼を扱うゲノム医療の運営全体を効率化するためのシステムが求められている。
【０００７】
そこで、本発明は、複数の検査依頼を扱うゲノム医療の運営全体を効率化するため方法を提供することを課題とする。
【課題を解決するための手段】
【０００８】
本発明のある実施形態は、（１）遺伝子パネル検査の検査依頼をコンピュータにより管理する方法に関する。前記方法では、複数の検査依頼の各々について、前記検査依頼に関する情報、および前記遺伝子パネル検査における検査結果の属性を取得し、複数の前記検査依頼と前記属性とを各々対応させて表示するための表示情報を出力する。
【０００９】
このような構成とすることにより、これまで、異なるコンピュータで管理されていた、検査依頼に関する情報と、検査結果の属性を一つのグラフィカルユーザインタフェース上に統合させて表示することができる。
【００１０】
本発明のある実施形態は、（２）遺伝子パネル検査の検査依頼を管理する管理装置（Ａ）に関する。前記管理装置（図５のＡ）は、制御部（図５の１００Ａ）を備える。前記制御部（図５の１００Ａ）は、複数の検査依頼の各々について、前記検査依頼に関する情報、および前記遺伝子パネル検査における検査結果の属性を取得し、複数の前記検査依と前記属性とを各々対応させて表示するための表示情報を出力する。
【００１１】
本発明のある実施形態は、（３）遺伝子パネル検査の検査依頼を管理するためのコンピュータプログラムに関する。前記コンピュータプログラムは、コンピュータに、複数の検査依頼の各々について、前記検査依頼に関する情報、および検査依頼に対応する遺伝子パネル検査における検査結果の属性を取得するステップ（図１９のステップＳＴ２１及び図２０のＳＴ３５）と、前記複数の前記検査依頼と前記属性とを各々対応させて表示するための表示情報を出力するステップ（図２１のステップＳＴ４０）と、を実行させる。
【００１２】
本発明のある実施形態は、（４）遺伝子パネル検査の検査依頼を管理する管理システム（図４の１０００）に関する。管理システム（図４の１０００）は、制御部（図１１の１００Ｂ）を備える第１のコンピュータ（図１１の１０Ｂ）と、制御部（図１３の１００）を備える第２のコンピュータ（図１３のＣ１１）と、制御部（図５の１００Ａ）を備える管理装置（図５のＡ）と、を備え、前記第１のコンピュータの制御部は、複数の検査依頼に関する情報を前記管理装置に送信し、前記第２のコンピュータの制御部は、前記遺伝子パネル検査における検査結果の属性を前記管理装置に送信し、前記管理装置の前記制御部は、受信した複数の前記検査依頼と前記属性とを各々対応させて表示するための表示情報を出力する。
【００１３】
上記（１）から（４）の構成とすることにより、これまで、異なるコンピュータで管理されていた、検査依頼に関する情報と、検査結果の属性を一つのグラフィカルユーザインタフェース上に統合させて表示することができる。
【発明の効果】
【００１４】
複数の検査依頼を扱うゲノム医療の運営全体を効率化することができる。
【図面の簡単な説明】
【００１５】
【図１】図１は、遺伝子パネル検査の流れを示す。
【図２】図２（ａ）は、遺伝子パネル検査依頼から属性情報の取得までの流れを示す。図２（ｂ）は、検査依頼リストの表示例を示す。
【図３】図３は、検査依頼リストの表示例を示す。
【図４】図４は、システム１０００のハードウエアの構成を示す。
【図５】図５は、統合データ管理装置Ａのハードウエアの構成を示す。
【図６】図６は、統合データ管理装置Ａの制御部の機能ブロックを示す。
【図７】図７は、マスターテーブルＭの概略を示す。
【図８】図８は、マスターテーブルＭの「患者情報」欄にリンクした病理画像テーブルＰＴの概略を示す。
【図９】図９は、マスターテーブルＭの「グループＩＤ」欄にリンクした専門家会議グループテーブルＧＴの概略を示す。
【図１０】図１０（ａ）は、役割テーブルＣＴの概略を示す。図１０（ｂ）は、閲覧可能情報テーブルＡＴの概略を示す。
【図１１】図１１は、臨床情報管理装置Ｂ１０，Ｂ２０，Ｂ３０のハードウエアの構成を示す。
【図１２】図１２は、臨床情報管理装置Ｂ１０，Ｂ２０，Ｂ３０の制御部の機能ブロックを示す。
【図１３】図１３は、検査情報管理装置Ｃ１１のハードウエアの構成を示す。
【図１４】図１４は、検査情報管理装置Ｃ１１の制御部の機能ブロックを示す。
【図１５】図１５は、各専門家会議端末Ｂ１５，Ｂ２５，Ｂ３５，Ｃ１５，ＳＰ１１，ＳＰ１５のハードウエアの構成を示す。
【図１６】図１６は、医療施設の専門家会議端末Ｂ１５，Ｂ２５，Ｂ３５の制御部の機能ブロックを示す。
【図１７】図１７は、検査施設の専門家会議端末Ｃ１５と、外部機関の専門会議端末ＳＰ１１の制御部の機能ブロックを示す。
【図１８】図１８は、事務局専門家会議端末ＳＰ１５の制御部の機能ブロックを示す。
【図１９】図１９は、システム１０００の動作の一部を示すフローチャートである。
【図２０】図２０は、システム１０００の動作の一部を示すフローチャートである。
【図２１】図２１は、システム１０００の動作の一部を示すフローチャートである。
【図２２】図２２は、システム１０００の動作の一部を示すフローチャートである。
【図２３】図２３は、検査依頼を行うためのグラフィカルユーザインタフェースＵＩａの例を示す。
【図２４】図２４は、検査管理テーブルＬの概略を示す。
【図２５】図２５は、検査の進捗情報を示すラベルの例である。
【図２６】図２６は、検体の品質情報を記録する検体品質情報入力テーブルＱの概要を示す。
【図２７】図２７は、変異解析のフローチャートを示す。
【図２８】図２８は、変異解析のフローチャートを示す。
【図２９】図２９は、変異解析において出力される検査結果の一例を示す。
【図３０】図３０（ａ）は、属性情報を取得するためのグラフィカルユーザインタフェースＵＩｃの例を示す。図３０（ｂ）は、属性情報を取得するためのグラフィカルユーザインタフェースＵＩｄの例を示す。図３０（ｃ）は、属性情報が入力された検査管理テーブルＬの例を示す。
【図３１】図３１は、属性情報を取得するためリストの例を示す。
【図３２】図３２は、検査情報管理装置Ｃ１１が、属性情報を判定するためのフローチャートを示す。
【図３３】図３３は、検査情報管理装置Ｃ１１が、属性情報を判定するためのフローチャートを示す。
【図３４】図３４（ａ）は、検出結果テーブルＧの概略を示す。図３４（ｂ）は、判定テーブルＨの概略を示す。
【図３５】図３５は、通常のレポート様式を示す。
【図３６】図３６は、偶発的所見を秘匿する必要がある場合の、レポート様式を示す。
【図３７】図３７は、レポート生成処理のフローチャートを示す。
【図３８】図３８は、統合データ管理装置Ａから出力された検査依頼リストからレポート様式を選択するための、検査依頼リスト領域ＵＩ１の例を示す。
【図３９】図３９は、統合データ管理装置Ａにおけるレポート生成処理のフローチャートを示す。
【図４０】図４０は、レポートの様式を選択させる際に表示するダイアログの例を示す。
【図４１】図４１は、統合データ管理装置Ａから出力された検査依頼リストから、専門家会議の設定を行う際の、検査依頼リスト領域ＵＩ１の例を示す。
【図４２】図４２は、統合データ管理装置Ａにおいて、専門家会議を設定するためのリンクをグラフィカルユーザインタフェースＵＩへの表示するための処理のフローチャートを示す。
【図４３】図４３は、医療施設の専門家会議端末Ｂ１５，Ｂ２５，Ｂ３５における表示処理のフローチャートを示す。
【図４４】図４４は、統合データ管理装置Ａにおいて、専門家会議を設定するため処理のフローチャートを示す。
【図４５】図４５は、会議スケジュールを表示するダイアログＵＩ５の例を示す。
【図４６】図４６は、会議スケジュールを表示するダイアログＵＩ７の例を示す。
【図４７】図４７は、統合データ管理装置Ａから出力された検査依頼リストから、品質情報を表示させるための、検査依頼リスト領域ＵＩ１の例を示す。
【図４８】図４８は、統合データ管理装置Ａにおいて、品質情報へのリンクをグラフィカルユーザインタフェースＵＩへの表示するための処理のフローチャートを示す。
【図４９】図４９は、検査施設Ｃ１の専門家会議端末Ｃ１５における表示処理のフローチャートを示す。
【図５０】図５０は、統合データ管理装置Ａから出力された検査依頼リストから、外部データベースを表示させる際の、検査依頼リスト領域ＵＩ１の例を示す。
【図５１】図５１は、統合データ管理装置Ａにおいて、外部データベースへのリンクをグラフィカルユーザインタフェースＵＩへの表示するための処理のフローチャートを示す。
【図５２】図５２は、外部施設ＳＰ１の専門家会議端末ＳＰ１１，事務局専門家会議端末ＳＰ１５における表示処理のフローチャートを示す。
【図５３】図５３は、検査依頼を行う際の認証処理の例を示す。
【図５４】図５４は、ログイン情報テーブルＰの例を示す。
【図５５】図５５は、統合データ管理装置Ａにおける検査の進捗情報の更新処理を示す。
【図５６】図５６は、検査情報管理装置Ｃ１１における検査の進捗情報の更新処理を示す。
【図５７】図５７は、役割ＩＤに応じた検査依頼リストの表示処理を示すフローチャートである。
【図５８】図５８は、事務局専門家会議端末ＳＰ１５における新規の専門家会議スケジュール枠の登録処理を示す。
【図５９】図５９は、統合データ管理装置Ａから出力された検査依頼リストから、専門家会議の設定を行う際の、検査依頼リスト領域ＵＩ１の変形例を示す。
【発明を実施するための形態】
【００１６】
以下、発明を実施するための形態を、添付の図面を参照して詳細に説明する。なお、以下の説明及び図面において、同じ符号は同じ又は類似の構成要素を示すこととし、よって、同じ又は類似の構成要素に関する説明を省略する。
【００１７】
Ｉ．実施形態の概要
本発明のある実施形態は、遺伝子パネル検査の検査依頼をコンピュータにより管理する方法に関する。
はじめに、図１〜図３を用いて本実施形態の概要を説明する。
【００１８】
患者検体の核酸配列の解析は、例えば、腫瘍細胞に対する抗がん剤の効果や、予後を予測するために、腫瘍細胞に存在する核酸の塩基配列の変異を検出する目的で行われる。
【００１９】
本明細書において「塩基配列の変異」は、ヌクレオチドの置換、挿入、欠失、遺伝子の融合などを含む概念である。塩基配列の変異には、その変異がアミノ酸の配列に影響を及ぼさない同義変異と、アミノ酸配列に影響を及ぼす非同義変異を含み得る。検出対象の変異は、非同義変異であることが好ましい。非同義変異は、タンパク質の構造異常を引き起こす変異であり、細胞の腫瘍化に関連すると考えられている。
【００２０】
また、変異は、受精前の生殖細胞に生じていたか、受精後に生じたかに応じて、２つに分類され得る。体細胞で生じた変異は体細胞変異（ｓｏｍａｔｉｃ  ｍｕｔａｔｉｏｎ）と呼ばれ、生殖細胞で生じた変異は生殖細胞変異（ｇｅｒｍｌｉｎｅ  ｍｕｔａｔｉｏｎ）と呼ばれる。体細胞変異と異なり生殖細胞変異は次世代の個体に引き継がれ得る。したがって、本実施形態の方法が適用される患者が親世代から生殖細胞変異を引き継いでいる場合、体細胞から調製される検体であっても生殖細胞変異を含むこととなる。
【００２１】
また、上記のような核酸の塩基配列変異の分類に加え、抗がん剤治療に対する反応性により、変異を分類することもできる。例えば、疾患の原因となる体細胞変異や生殖細胞変異が生じていたとしても、日本臨床腫瘍学会、日本癌治療学会及び日本癌学会が合同で発行した「次世代シークエンサー等を用いた遺伝子パネル検査に基づくがん診療ガイダンス」に示される治療効果３Ａ以上が期待できる変異は、一般的にアクショナブル変異と呼ばれることがある。
【００２２】
患者のがん組織検体を用いたがん関連遺伝子の核酸配列の解析は、患者が保有するがんに対する有効な抗がん剤等を見極める上で重要である。遺伝子パネル検査では、１回の検査で数十〜数百種の遺伝子を同時に解析することが可能である。また、遺伝子パネル検査の結果は、患者の担当医のみが解釈するのではなく、担当医の他、組織診断を行う病理医、遺伝子パネル検査を行う臨床検査技師及び／又はバイオインフォマティシャン、遺伝子変異解釈の専門家である遺伝子カウンセラー及び／又は分子遺伝学の研究者等で構成される専門家会議（エキスパートパネルとも呼ばれる）によって解釈される。また、専門家会議では、遺伝子パネル検査を受けた患者に適した治療方針が決定される。
【００２３】
遺伝子パネル検査の検査依頼は、各医療施設から行われるが、専門家会議は、各地域の１つの拠点機関が中心となって開催されることが多い。したがって、１つの専門家会議には、地域の複数の医療施設から個々に、また患者ごとに検査依頼された遺伝子パネル検査の結果が集約されることとなる。
【００２４】
したがって、数多くの遺伝子パネル検査の依頼を効率よく管理するため、本発明のある実施形態は、複数の遺伝子パネル検査の検査依頼の各々について、コンピュータを使って、前記検査依頼に関する情報、および前記遺伝子パネル検査における検査結果の概要を示す属性を取得し、複数の前記検査依頼と前記属性とを各々対応させて表示するための表示情報を出力する、遺伝子パネル検査の検査依頼を管理する方法を提供する。
図１に、本実施形態における遺伝子パネル検査の流れを示す。
【００２５】
図１では、３つの組織を例にして、遺伝子パネル検査の流れを説明する。遺伝子パネル検査に関与する第１の組織は、実際にがん患者が受診する病院等の医療施設Ｂ１である。第２の組織は、実際に遺伝子パネル検査を行う検査施設Ｃ１である。第３の組織は、専門家会議ＥＰである。３つの組織は、各組織における情報を共有するための統合データ管理装置Ａにより情報を共有し得る。
【００２６】
遺伝子パネル検査（以下、単に検査と呼ぶこともある）では、医療施設Ｂ１を腫瘍を保有する患者Ｐ１が受診し、担当医Ｈ１ａから遺伝子パネル検査の内容や流れ等について説明を受ける。説明の際には、検査において、万が一、偶発的所見、例えば生殖細胞変異が見つかった場合にその結果の知得を、患者Ｐ１やその家族が希望するか等のインフォームドコンセントの取得も行われる（図１のＩ）。
【００２７】
患者Ｐ１が遺伝子パネル検査の実施に同意した場合、担当医Ｈ１ａは、遺伝子パネル検査を依頼する（図１のＩＩ）。検査依頼に関する情報は、統合データ管理装置Ａに送信され、マスターテーブルＭに患者情報と共に記録される。検査依頼に関する情報には、検査依頼日、検査識別情報（ＩＤ）、検査パネル番号、検体種別、患者に関する情報（患者情報）等の情報が含まれうる。患者情報には、患者識別情報（ＩＤ）、患者氏名、性別、年齢、病理診断結果、患者の病歴、患者の家族歴等が含まれ得る。
【００２８】
検査が依頼されると、医療施設Ｂ１において、検査に必要な検体の採取が行われる（図１のＩＩＩ）。検体は、一人の患者につき、通常、腫瘍細胞を含む検体と非腫瘍細胞を含む検体とが採取される。検体の採取は、病理医Ｈ１ｂや臨床検査技師Ｈ３が行い得る。採取された検体は、検査施設Ｃ１に搬送される。
【００２９】
検査施設Ｃ１では、臨床検査技師Ｔ１が、検体の前処理を行い、次世代シーケンサーを用いて検体に含まれる核酸の塩基配列のシーケンシングを行い、遺伝子パネル検査を実施する（図１のＩＶ）。検査実施後、臨床検査技師Ｔ１とバイオインフォマティシャンＴ２が連携し、検査報告書（レポートとも言う）が作成される。また、この他に、検査の進捗状況を示す前処理情報等の検査状況に関する情報、検査や検体の品質に関する品質情報、検査結果の概要を示す属性情報（以下、単に「属性情報」、又は「属性」と呼ぶことがある）が生成される。属性情報には、所定の遺伝子に関する変異の有無に関する第１の属性情報と、変異の種類に関する第２の属性情報を含み得る。遺伝子パネル検査の検査結果、前処理情報、検査や検体の品質情報、属性情報は、統合データ管理装置Ａに送信され、検査依頼に関する情報、患者情報と対応づけられて、マスターテーブルＭに記録される。また、検査報告書は、紙媒体で検査を依頼した医療施設Ｂ１に返送され得る。
【００３０】
図２に、統合データ管理装置Ａから出力される表示情報を含む、グラフィカルユーザインタフェースＵＩの例を示す。図２（ａ）において、検査依頼が行われると、検査依頼に関する情報に含まれる遺伝子パネル検査が行われる。遺伝子パネル検査の検査対象の遺伝子として、例えば、ａ遺伝子、ｂ遺伝子、ｃ遺伝子、ｄ遺伝子・・・のように所定の遺伝子が含まれている。遺伝子パネル検査の結果には、属性情報が付される。図２（ｂ）において、グラフィカルユーザインタフェースＵＩは、検査依頼リストを表示する検査依頼リスト領域ＵＩ１と、表示日時を示す領域ＵＩ１０を備える。検査依頼リスト領域ＵＩ１は、個々の検査依頼を表示する個別検査依頼表示領域ＵＩ３を備える。検査依頼リスト領域ＵＩ１は、複数の個別検査依頼表示領域ＵＩ３を備え得る。検査依頼リスト領域ＵＩ１には、個々の検査の依頼日、検査依頼ＩＤ、検査状況、患者情報、結果の属性情報、結果登録状況等を示す列領域を備え得る。例えば、検査依頼ＩＤ領域には、個々の検査を識別するための検査依頼ＩＤを示すラベルが、Ｔ０１、Ｔ０２、・・・・のように付されている。個々のＩＤには、例えば、マスターテーブルＭに登録されている個々の検査依頼に関する情報へのリンクが張られている。検査状況領域は、検査施設Ｃ１から送信された「検査完了」、「前処理完了」等の検査状況を示すラベルが表示される。患者情報領域には、「登録済」、又は「未登録」のラベルが表示される。「登録済」のラベルにはマスターテーブルＭに登録されている個々の検査依頼に紐付けられた患者情報へのリンクが張られている。結果の属性情報には、検査施設Ｃ１から送信された、第１の属性情報として変異が有るか無いかを示すラベル、第２の属性情報として変異の種類を示すラベル、「アクショナブル変異」、「生殖細胞変異」、「その他」が表示され得る。結果登録領域には、検査施設Ｃ１から送信された遺伝子パネル検査の結果がマスターテーブルＭに登録されているか否かを示す「登録済」、「未登録」のラベルが表示され得る。
【００３１】
検査依頼リスト領域ＵＩ１に表示される情報が、複数の前記検査依頼と属性とを各々対応させて表示するための表示情報となる。
【００３２】
図１に戻り、医療施設Ｂ１では、担当医Ｈ１ａが、統合データ管理装置Ａから出力される検査依頼リストから、前記遺伝子パネル検査を受けた患者Ｐ１の個別検査依頼表示領域ＵＩ３にアクセスし、専門家会議の開催を要請する（図１のＶ）。担当医Ｈ１ａが、例えば、医療施設Ｂ１に備えられた専門家会議端末から統合データ管理装置Ａにアクセスすると、図３に示すグラフィカルユーザインタフェースＵＩが表示され得る。グラフィカルユーザインタフェースＵＩの検査依頼リスト領域ＵＩ１には、専門家会議の設定状況を示す設定状況領域と、開催日時領域が表示されている。設定状況領域は、会議が設定されているか否かを示す領域である。開催日時欄は、専門家会議が設定されると、そのスケジュールを表示する。専門家会議が設定されていない場合には、「未設定」のラベルが表示される。担当医Ｈ１ａは患者Ｐ１の個別検査依頼表示領域ＵＩ３から、未設定のラベルを選択することにより、専門家会議のスケジュールを設定することができる。これにより、患者Ｐ１の遺伝子パネル検査の結果についての専門家会議の開催が要請される。
【００３３】
ここで、一般的に遺伝子パネル検査が行われた場合、その結果についてはほぼ全ての患者について専門家会議が開催され、治療方針が決定される。ほぼ全てとは、例えば検査や検体の品質が検査に耐えなかった場合や、患者が死亡した場合等が除かれ得ることを意図する。
【００３４】
図１に戻る。患者Ｐ１の遺伝子パネル検査について、担当医Ｈ１ａが設定した日時に専門家会議が開催される（図１のＶＩ）。専門家会議は、一般的に専門家会議端末等を使用し、Ｗｅｂ会議等で行われ得る。専門家会議において、患者Ｐ１に対する腫瘍の治療方針が決定され、その結果がマスターテーブルＭに記録される。
【００３５】
担当医Ｈ１ａは、専門家会議で示された治療方針について患者Ｐ１に説明する（図１のＶＩＩ）。治療方針について、患者Ｐ１の同意が得られれば、治療が開始される（図１のＶＩＩＩ）。
ここで、医療施設は複数であってもよい。この場合、符号Ｂ１、Ｂ２、Ｂ３のように、各医療施設を表す。
【００３６】
塩基配列の変異は、腫瘍細胞に由来する核酸を含む検体と、非腫瘍細胞に由来する核酸を含む検体から抽出された核酸を用いて、（工程１）患者から採取された腫瘍細胞に由来する第１の核酸配列データと、同一患者から採取された非腫瘍細胞に由来する第２の核酸配列データとを取得すること；（工程２）第１の核酸配列データ、又は第１の核酸配列データと第２の核酸配列データに基づいて体細胞変異を検出すること；或いは（工程２’）第２の核酸配列データに基づいて生殖細胞変異を検出することを含む方法により検出することができる。
【００３７】
腫瘍は、良性上皮性腫瘍、良性非上皮性腫瘍、悪性上皮性腫瘍、悪性非上皮性腫瘍を含み得る。腫瘍の発生母地は、制限されない。腫瘍の発生母地として、気管、気管支又は肺等の呼吸器系組織；上咽頭、食道、胃、十二指腸、空腸、回腸、盲腸、虫垂、上行結腸、横行結腸、Ｓ状結腸、直腸又は肛門部等の消化管組織；肝臓；膵臓；膀胱、尿管又は腎臓等の泌尿器系組織；卵巣、卵管及び子宮等の女性生殖器系組織；乳腺：前立腺等の男性生殖器系組織；皮膚；視床下部、下垂体、甲状腺、副甲状腺、副腎等の内分泌系組織；中枢神経系組織；骨軟部組織；骨髄、リンパ節等の造血系組織；血管等を例示することができる。
【００３８】
検体は、患者から採取した組織、体液、排泄物、これらから調製された試料等、腫瘍細胞に由来する核酸を含む試料である。体液は、例えば、血液、骨髄液、腹水、胸水、髄液等である。排泄物は、たとえば大便、尿である。腹腔内洗浄液や大腸洗浄液など、患者の体の一部を洗浄した後に得られる液体を用いてもよい。
【００３９】
検体に含まれる核酸量は、核酸の配列を検出できる量であれば制限されない。また、非腫瘍細胞に由来する核酸配列データを取得する場合、非腫瘍細胞に由来する核酸を含む検体が用いられる。前記組織、体液等に含まれる非腫瘍細胞の濃度は、非腫瘍細胞に存在する核酸の配列を検出できる限り制限されない。ここで、腫瘍細胞が固形腫瘍に由来する場合には、非腫瘍細胞を含む検体として、例えば、末梢血、口腔粘膜組織、皮膚組織等を使用することができる。腫瘍細胞が造血系組織に由来する場合には、非腫瘍細胞を含む検体として、例えば、口腔粘膜組織、皮膚組織等を使用することができる。
前記検体は新鮮組織、新鮮凍結組織、パラフィン包埋組織等から採取することができる。検体の採取は公知の方法にしたがって行うことができる。
【００４０】
腫瘍細胞に由来する核酸を含む検体と、非腫瘍細胞に由来する核酸を含む検体とは、同一の患者から採取される。非腫瘍細胞に由来する核酸を含む試料と、腫瘍細胞に由来する核酸を含む試料とは、同時期に採取されてもよいし、異なる時期に採取されてもよい。
核酸は、ＤＮＡであってもＲＮＡであってもよい。
【００４１】
核酸配列の解析対象となる遺伝子は、ヒトゲノム上に存在する遺伝子である限り、制限されない。好ましくは、腫瘍の発症、予後、治療効果に関連する遺伝子である。
【００４２】
生殖細胞変異は、疾患に関連する変異であっても、遺伝子の配列多型であってもよい。遺伝子の「多型」は、ＳＮＶ（Ｓｉｎｇｌｅ  Ｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅ  Ｖａｒｉａｎｔ、一塩基多型）、ＶＮＴＲ（Ｖａｒｉａｂｌｅ  Ｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅ  ｏｆ  Ｔａｎｄｅｍ  Ｒｅｐｅａｔ、反復配列多型）、及びＳＴＲＰ（Ｓｈｏｒｔ  Ｔａｎｄｅｍ  Ｒｅｐｅａｔ  Ｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｓｍ、マイクロサテライト多型）などを含む。表１の左列に生殖細胞変異を検出し得る遺伝子の例を示す。表１の左列に記載の遺伝子は、それぞれ当該表の右列に示す疾患に関連する。
【００４３】
【表１】
0006883076.tif 000002
【００４４】
核酸配列データは、核酸配列を反映したデータである限り制限されない。核酸配列データは、核酸配列情報そのものであってもよいが、核酸配列の構造、核酸配列上の変異の有無を示すデータ、核酸配列に由来するタンパク質の構造を示すデータであってもよい。好ましくは、核酸配列情報そのものである。
【００４５】
核酸配列データの取得は、変異情報が取得できる方法である限り制限されない。核酸配列データの取得は、後述する次世代シーケンサーを使って核酸配列情報そのものを取得してもよいが、ＰＣＲ−Ｉｎｖａｄｅｒ法、ＰＣＲ−ＲＦＬＰ法、ＰＣＲ−ＳＳＣＰ法、サザンブロッティング法、ノーザンブロッティング法、ウエスタンブロッティング法、ＦＩＳＨ法、マイクロアレイ法、免疫染色法等により、核酸配列の構造、核酸配列上の変異の有無を示すデータ、核酸配列に由来するタンパク質の構造を示すデータを、核酸配列データとして取得してもよい。これらの核酸配列データの取得方法は、公知である。腫瘍細胞に由来する第１の核酸配列データと非腫瘍細胞に由来する第２の核酸配列データの取得方法は、同じ方法であることが好ましい。
【００４６】
体細胞変異及び生殖細胞変異の検出は、一般的な配列として報告されている参照配列データと、第１の核酸配列データ及び第２の核酸配列データとを比較することにより行うことができる。例えば、参照配列データと第１の核酸配列データとを比較する場合には、参照配列データ内の配列と異なる第１の核酸配列データ内の配列を検出することにより、第１の核酸配列データ内の変異を検出することができる。同様に、参照配列データと第２の核酸配列データとを比較する場合には、参照配列データ内の配列と異なる第２の核酸配列データ内の配列を検出することにより、第２の核酸配列データ内の変異を検出することができる。
【００４７】
図２（ｂ）及び図３においては、全ての検査依頼を一覧として表示しているが、前記一覧は、例えば、検査日、属性情報、専門家会議の設定の有無、等に応じてリスト表示を変更してもよい。
【００４８】
ＩＩ．遺伝子パネル検査の検査依頼の管理システム
１．システムの構成
図４を用いて、遺伝子パネル検査の検査依頼をコンピュータにより管理するための管理システム１０００（以下、単にシステム１０００とする）の構成について説明する。システム１０００に接続する医療施設は、複数存在し得る。ここでは３つの医療施設Ｂ１、医療施設Ｂ２、医療施設Ｂ３が接続している例を示す。システム１０００は、医療施設Ｂ１に設置された臨床情報管理装置Ｂ１０及び専門家会議端末Ｂ１５と、医療施設Ｂ２に設置された臨床情報管理装置Ｂ２０及び専門家会議端末Ｂ２５と、医療施設Ｂ３に設置された臨床情報管理装置Ｂ３０及び専門家会議端末Ｂ３５と、を備える。臨床情報管理装置Ｂ１０、専門家会議端末Ｂ１５、臨床情報管理装置Ｂ２０、専門家会議端末Ｂ２５、臨床情報管理装置Ｂ３０、及び専門家会議端末Ｂ３５は、統合データ管理装置Ａと通信可能に、有線又は無線のネットワークを介して接続されている。臨床情報管理装置Ｂ１０，Ｂ２０，Ｂ３０は、医療施設内における、検査依頼、検査結果、処方箋情報、食事情報、手術情報等のカルテ記載情報を統合的に管理する管理装置である。臨床情報管理装置Ｂ１０，Ｂ２０，Ｂ３０はそれぞれ、電子カルテデータベース（電子カルテＤＢ）Ｂ１１，Ｂ２１，Ｂ３１と、検査画像データベース（検査画像ＤＢ）Ｂ１２，Ｂ２２，Ｂ３２と、検査依頼データベース（検査依頼ＤＢ）Ｂ１３，Ｂ２３，Ｂ３３と通信可能に、有線又は無線のネットワークで接続されている。各医療施設の専門家会議端末Ｂ１５，Ｂ２５，Ｂ３５は、統合データ管理装置Ａから出力されるグラフィカルユーザインタフェースＵＩの表示や、専門家会議の開催の要請等に使用される。本実施形態において、臨床情報管理装置Ｂ１０、専門家会議端末Ｂ１５、臨床情報管理装置Ｂ２０、専門家会議端末Ｂ２５、臨床情報管理装置Ｂ３０、及び専門家会議端末Ｂ３５には、統合データ管理装置Ａにアクセスするための専用のアプリケーションがインストールされている。
【００４９】
また、システム１０００は、検査施設Ｃ１に設置された、検査情報管理装置Ｃ１１と、検査情報管理装置Ｃ１１に接続された次世代シーケンサーＣ１３と、検査施設Ｃ１の専門家会議端末Ｃ１５とを備える。検査情報管理装置Ｃ１１と、検査施設Ｃ１の専門家会議端末Ｃ１５は、統合データ管理装置Ａと通信可能に、有線又は無線のネットワークを介して接続されている。検査情報管理装置Ｃ１１は次世代シーケンサーＣ１３から取得された核酸配列データを用いて塩基配列の解析を行う。また、検査情報管理装置Ｃ１１は、検体の受領、検体及び検査の品質情報、検査の進捗状況の管理等を行う。検査施設Ｃ１の専門家会議端末Ｃ１５は、専門家会議に参加する臨床検査技師やバイオインフォマティスが、統合データ管理装置Ａから出力されるグラフィカルユーザインタフェースＵＩを表示したり、専門家会議に参加する際に使用される。
【００５０】
システム１０００は、外部施設ＳＰ１に設置された専門家会議端末ＳＰ１１を備える。外部施設ＳＰ１の専門家会議端末ＳＰ１１は、統合データ管理装置Ａと通信可能に、有線又は無線のネットワークを介して接続されている。専門家会議端末ＳＰ１１は、専門家会議に参加する遺伝子カウンセラーや分子遺伝学の研究者が、統合データ管理装置Ａから出力されるグラフィカルユーザインタフェースＵＩを表示したり、専門家会議に参加する際に使用される。ここで、外部施設は複数であってもよい。ここでは、５つの外部施設が存在する場合を例とし、外部施設ＳＰ１〜ＳＰ５で表している。また、外部施設に設置された専門家会議端末も外部施設の専門家会議端末ＳＰ１１〜ＳＰ１５で表している。また、外部施設の専門家会議端末のうちの１台、例えば専門家会議端末ＳＰ１５は、専門家会議を統率する専門家会議の事務局が使用する端末であり得る。外部施設の専門家会議端末ＳＰ１５を、事務局専門家会議端末ＳＰ１５ともよび、専門家会議スケジュールデータベースＳＤＢに新しい専門家会議スケジュール枠を登録するために使用される。
【００５１】
さらに、システム１０００は、外部機関のデータベースである薬剤情報データベース（単に、薬剤データベースや薬剤ＤＢともいう）Ｆ１１、治験情報データベース（単に、治験データベースや治験ＤＢともいう）Ｆ２１、論文情報データベース（単に、論文データベースや論文ＤＢともいう）Ｆ３１を含み得る。薬剤情報データベースＦ１１、治験データベースＦ２１、論文データベースＦ３１は、統合データ管理装置Ａと通信可能に、有線又は無線のネットワークを介して接続されている。
薬剤情報データベースＦ１１の例として、例えば、CanDL(https://candl.osu.edu/)、Cancer Genome Interpreter (https://www.cancergenomeinterpreter.org/home)、CIViC (https://civicdb.org/home)、OncoKB(https://oncokb.org/)等を挙げることができる。治験情報データベースＦ２１として、例えば、clinicaltrials.gov (https://clinicaltrials.gov/)、ＦＡＥＲＳ(https://www.fda.gov/Drugs/GuidanceComplianceRegulatoryInformation/Surveillance/AdverseDrugEffects/ucm082193.htm)を挙げることができる。論文情報データベースＦ３１として、例えば、PubMed(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/)を挙げることができる。
【００５２】
システム１０００において、遺伝子パネル検査に関する検査依頼情報や、属性情報、品質情報、専門家会議設定等を統合するのは、統合データ管理装置Ａであるため、それ以外の装置や端末は本発明において「他のコンピュータ」と呼ばれることがある。
【００５３】
２．統合データ管理装置
２−１．統合データ管理装置のハードウエアの構成
図５に、統合データ管理装置Ａ（単に、「管理装置Ａ」ともいう）のハードウエアの構成を示す。
【００５４】
統合データ管理装置Ａは、汎用コンピュータであり得る。
統合データ管理装置Ａは、制御部１００Ａと、入力部１０６Ａと、出力部１０７Ａとを備える。
【００５５】
制御部１００Ａは、後述するデータ処理を行うＣＰＵ（Ｃｅｎｔｒａｌ  Ｐｒｏｃｅｓｓｉｎｇ  Ｕｎｉｔ）１０１Ａと、データ処理を行うための一時的な記憶領域として使用するメモリ１０２Ａと、後述するプログラム及び処理データを記録する記憶装置１０３Ａと、各部の間でデータを伝送するバス１０４Ａとを備える。入力部１０６Ａ及び出力部１０７Ａは、制御部１００Ａに接続される。例示的には、入力部１０６Ａは、キーボード、マウス、タッチセンサ等を含む。出力部１０７Ａは、ディスプレイ、プリンタ、スピーカ等を含む。また、タッチセンサとディスプレイとが一体化されたタッチパネルのような、入力部及び出力部の双方の機能を有する装置を用いてもよい。Ｉ／Ｆ部１０５Ａは、制御部１００Ａが外部の装置、又はネットワークと通信するためのインタフェースである。制御部１００Ａは、Ｉ／Ｆ部１０５Ａを介して、ネットワーク９９に接続し、臨床情報管理装置Ｂ１０、医療施設Ｂ１の専門家会議端末Ｂ１５、臨床情報管理装置Ｂ２０、医療施設Ｂ１の専門家会議端末Ｂ２５、臨床情報管理装置Ｂ３０、医療施設Ｂ１の専門家会議端末Ｂ３５、検査情報管理装置Ｃ１１、検査施設Ｃ１の専門家会議端末Ｃ１５、外部施設の専門家会議端末ＳＰ１１、外部施設の専門家会議端末ＳＰ１５、外部機関のデータベースである薬剤情報データベース（薬剤情報ＤＢ）Ｆ１１、治験データベース（治験ＤＢ）Ｆ２１、及び論文データベース（論文ＤＢ）Ｆ３１と通信し得る。
【００５６】
また、記憶装置１０３Ａは、オペレーティングシステム（ＯＳ）、以下の図１９から図２２、図３２、図３３、図３９、図４２、図４４、図４８、図５１、図５５及び図５７に示す各ステップの処理を行うためのアプリケーションプログラム、及びメールソフトを、例えば実行形式で記憶装置１０３Ａに予め記録している。実行形式は、例えばプログラミング言語からコンパイラにより変換されて生成される形式である。制御部１００Ａは、記憶装置１０３Ａに記録した各プログラムを使用して、図１９から図２２、図３２、図３３、図３９、図４２、図４４、図４８、図５１、図５５及び図５７に示す各処理を行う。また、記憶装置１０３Ａには、マスターテーブルＭ及び、マスターテーブルＭにリンクする専門家会議スケジュールデータベースＳＤＢ等、後述する処理に使用される各種データベースが記録されている。制御部１００Ａは、各臨床情報管理装置、検査情報管理装置、各医療施設の専門家会議端末から送信された情報に基づいて、マスターテーブルＭ内の情報を更新する。また、制御部１００Ａは、各医療施設の専門家会議端末、検査施設Ｃ１の専門家会議端末及び各外部施設の専門家会議端末から送信された情報に基づいて、専門家会議スケジュールデータベースＳＤＢ内の情報を更新する。
【００５７】
以下の説明においては、特に断らない限り、制御部１００Ａが行う処理は、記憶装置１０３Ａ又はメモリ１０２Ａに格納されたアプリケーションプログラムに基づいて、ＣＰＵ１０１Ａが行う処理を意味する。ＣＰＵ１０１Ａはメモリ１０２Ａを作業領域として必要なデータ（処理途中の中間データ等）を揮発性に一時記憶し、記憶装置１０３Ａに解析結果等の長期保存するデータを不揮発性に適宜記憶する。
【００５８】
アプリケーションプログラムは、ＤＶＤやＵＳＢメモリなどの外部記憶媒体９８Ａからダウンロードして制御部１００Ａの記憶装置１０３Ａにインストールしてもよい。
【００５９】
２−２．統合データ管理装置の制御部の機能構成
図６に、統合データ管理装置Ａの制御部１００Ａの機能構成を示す。
統合データ管理装置Ａの制御部１００Ａは、検査依頼受信部Ａ１、検査依頼送信部Ａ３、患者情報受信部Ａ５、検査状況管理部Ａ７、品質情報管理部Ａ１１、属性情報取得部Ａ１５、レポート取得部Ａ１７、検査依頼リスト出力部Ａ１９、スケジュール受信部Ａ２０、スケジュール出力部Ａ２１、患者情報出力部Ａ２３、会議内容受信部Ａ２５、会議内容出力部Ａ２７、マスターテーブル更新部Ａ５０、薬剤情報ＤＢアクセス部Ａ３１、治験ＤＢアクセス部Ａ３３、論文ＤＢアクセス部Ａ３５、統合データベースＯＧを備える。統合データベースＯＧ内には、マスターテーブルＭ、マスターテーブルＭにリンクする各種データテーブル、及び専門家会議スケジュールデータベースＳＤＢ等が格納される。
【００６０】
検査依頼受信部Ａ１、患者情報受信部Ａ５、検査状況管理部Ａ７、品質情報管理部Ａ１１、属性情報取得部Ａ１５、レポート取得部Ａ１７、検査依頼リスト出力部Ａ１９、スケジュール受信部Ａ２０、患者情報出力部Ａ２３、会議内容受信部Ａ２５、会議内容出力部Ａ２７は、マスターテーブル更新部Ａ５０、マスターテーブルＭ内の情報を更新する。スケジュール受信部Ａ２０は、各医療施設の専門家会議端末Ｂ１５，Ｂ２５，Ｂ３５から受信した専門家会議の設定日時を専門家会議スケジュールデータベースＳＤＢに格納する。
【００６１】
スケジュール出力部Ａ２１は、各医療施設の専門家会議端末Ｂ１５，Ｂ２５，Ｂ３５，Ｃ１５，ＳＰ１１，ＳＰ１５に各医療施設の専門家会議端末Ｂ１５，Ｂ２５，Ｂ３５から受信した専門家会議の設定日時をメールソフト等で送信する。
【００６２】
薬剤情報ＤＢアクセス部Ａ３１、治験ＤＢアクセス部Ａ３３、論文ＤＢアクセス部Ａ３５は、それぞれＩ／Ｆ部１０５Ａを介して、それぞれ薬剤情報データベースＦ１１、治験データベースＦ２１、論文データベースＦ３１に接続する。
【００６３】
２−３．マスターテーブルの構成
図７に、マスターテーブルＭの一例を示す。
マスターテーブルＭには、患者の識別ラベルである「患者ＩＤ」を記録する領域と、検体の識別ラベルである「検体ＩＤ」を記録する領域と、検査依頼の識別ラベルである「検査依頼ＩＤ」を記録する領域と、遺伝子パネル検査の識別ラベルである「遺伝子パネルＩＤ」を記録する領域と、「患者氏名」を記録する領域と、「患者の性別」を記録する領域と、「患者の生年月日」を記録する領域と、患者のインフォームドコンセント情報である「患者の同意」を記録する領域と、「検査依頼日」を記録する領域と、担当医の識別ラベルである「医療関係者のユーザＩＤ」を記録する領域と、「医療関係者のユーザＩＤ」に対応する「医療関係者の氏名」を記録する領域と、専門家会議を担当するグループラベルである「グループＩＤ」を記録する領域と、検査の進捗状況を示す情報である「検査状況」を記録する領域と、患者の臨床情報に関連する情報である「患者情報」を示す領域と、遺伝子パネル検査の結果に関する情報である「検査結果」を記録する領域と、検査結果の概要であって遺伝子変異の有無の情報である「第１の属性情報」を記録する領域と、検査結果の概要であって遺伝子変異の種類に関する情報である「第２の属性情報」を記録する領域と、検体や検査の品質に関する情報である「品質情報」を記録する領域と、専門家会議を統率する事務局の識別情報である「事務局施設ＩＤ」を記録する領域と、専門家会議の「開催日時」を記録する領域とが格納される。
【００６４】
図７のマスターテーブルＭには、遺伝子パネル検査の際、一人の患者の１回の検査において、検体として腫瘍細胞を含む第１の検体と、正常細胞を含む第２の検体とを使用する例を示す。一人の患者の１回の検査で２種類の検体を用いるため、図７のマスターテーブルＭでは、「検体ＩＤ」、「検査状況」、「品質情報」を除き、１行目と２行目の個別検査依頼表示領域ＵＩ３と、３行目と４行目の個別検査依頼表示領域ＵＩ３が同じ内容となっている。
【００６５】
マスターテーブルＭの各欄には、他のデータベース、またはデータテーブルがリンクし得る。例えば、図７のマスターテーブルＭの「患者情報」の欄には、後述する図１９のステップＳＴ２において、図８に示す臨床情報管理装置Ｂ１０から統合データ管理装置Ａに送信される患者情報の一つである、検体ＩＤに対応する病理画像データを格納する病理画像テーブルＰＴがリンクしている。病理画像テーブルＰＴに格納される情報は、臨床情報管理装置Ｂ１０から統合データ管理装置Ａに送信さる。病理画像テーブルＰＴは、統合データベースＯＧに記録される。
【００６６】
図７のマスターテーブルＭの「事務局施設ＩＤ」の欄には、図９に示す専門家会議の「グループＩＤ」と、を構成するユーザの識別情報を記録した「グループを構成するユーザＩＤ」を含む専門家会議グループテーブルＧＴとがリンクしている。専門家会議グループテーブルＧＴの「グループＩＤ」は、マスターテーブルＭの「グループＩＤ」に対応する。図９の「施設ＩＤ」Ｆ０１には、２つのグループＩＤであるＧ０１とＧ０２が対応している。Ｇ０１には、ユーザＩＤ：Ｕ０１、Ｕ０２、Ｕ０３、Ｕ０４、Ｕ０５・・・で識別される構成員が登録されている。また、Ｇ０１には、ユーザＩＤ  Ｕ０１、Ｕ０４、Ｕ０６、Ｕ１０、Ｕ１１・・・で識別される構成員が登録されている。
【００６７】
さらに、図７のマスターテーブルＭの「医療関係者のユーザＩＤ」を記録する欄には、図１０（ａ）に示す各医療関係者の役割を示す役割テーブルＣＴがリンクしている。各医療関係者は、システム１０００においてユーザＩＤにより識別されている。各医療関係者の役割は、図１０（ａ）に示す役割ＩＤにより識別される。図１０（ａ）において、ユーザＩＤ：Ｕ０１には、役割を示す識別情報として役割ＩＤ「Ｒ０１」が記録されている。また、ユーザＩＤ：Ｕ０１、Ｕ０２には、「役割ＩＤ」としてＲ０２が記録されている。また、役割ＩＤに応じて、後述する検査依頼リストにおいて表示可能な情報が異なる場合がある。図１０（ａ）に示す「役割ＩＤ」には、図１０（ｂ）に示す閲覧可能情報テーブルＡＴがリンクしている。閲覧可能情報テーブルＡＴには、役割ＩＤに応じて、後述する検査依頼リストにおいて表示可能な情報のリストが格納されている。例えば、図１０（ｂ）に示す例では、システム１０００を利用するユーザ全員が閲覧することが可能な共通項目と、役割ＩＤに応じて追加閲覧が可能な追加項目とが存在している。図１０（ｂ）では、共通項目として、「検査依頼日」、「患者ＩＤ」、「属性情報」が例示されている。役割ＩＤ：Ｒ０１を有するユーザが閲覧可能な追加項目として、「会議スケジュール情報」、「検査状況」、「検査結果」、「患者情報」が例示されている。役割ＩＤ：Ｒ０２を有するユーザが閲覧可能な追加項目として、「検査状況」、「検査結果」、「薬剤情報」、「治験情報」、「論文情報」、「患者ＩＣ情報」、「患者情報」が例示されている。
専門家会議グループテーブルＧＴ、役割テーブルＣＴ、及び閲覧可能情報テーブルＡＴは、あらかじめ生成され、統合データベースＯＧに記録されている。
【００６８】
３．臨床情報管理装置
３−１．臨床情報管理装置のハードウエアの構成
図１１に、臨床情報管理装置Ｂ１０，Ｂ２０，Ｂ３０のハードウエアの構成を示す。
臨床情報管理装置Ｂ１０，Ｂ２０，Ｂ３０は、汎用コンピュータであり得る。臨床情報管理装置Ｂ１０，Ｂ２０，Ｂ３０のハードウエアの構成は、基本的には、統合データ管理装置Ａと同様である。統合データ管理装置Ａにおける制御部１００Ａ、入力部１０６Ａ、出力部１０７Ａ、ＣＰＵ１０１Ａ、メモリ１０２Ａ、記憶装置１０３Ａ、バス１０４Ａ、Ｉ／Ｆ部１０５Ａは、臨床情報管理装置Ｂ１０，Ｂ２０，Ｂ３０において、制御部１００Ｂ、入力部１０６Ｂ、出力部１０７Ｂ、ＣＰＵ１０１Ｂ、メモリ１０２Ｂ、記憶装置１０３Ｂ、バス１０４Ｂ、Ｉ／Ｆ部１０５Ｂと読み替えるものとする。
【００６９】
記憶装置１０３Ｂは、オペレーティングシステム（ＯＳ）、以下の図１９及び図５３に示す各ステップの処理を行うためのコンピュータプログラム、電子カルテデータベース（ＤＢ）Ｂ１１に格納された電子カルテを表示するためのコンピュータプログラム、検査画像データベース（ＤＢ）Ｂ１２に格納された検査画像を表示するためのコンピュータプログラム、病院等の検査依頼を行うコンピュータプログラム、遺伝子パネル検査の検査依頼を行うブラウザソフト、統合データ管理装置Ａから出力された表示情報等を表示するためのブラウザソフト等を予め記録している。また、記憶装置１０３Ｂは、電子カルテデータベース（ＤＢ）Ｂ１１、検査画像データベース（ＤＢ）Ｂ１２、検査依頼データベース（ＤＢ）Ｂ１３を格納していてもよい。
【００７０】
上述のコンピュータプログラム、及びブラウザソフトは、ＤＶＤやＵＳＢメモリなどの外部記憶媒体９８Ｂからダウンロードして記憶装置１０３Ｂにインストールしてもよい。
【００７１】
制御部１００Ｂは、Ｉ／Ｆ部１０５Ｂを介して、ネットワーク９９に接続し、統合データ管理装置Ａと通信する。
【００７２】
３−２．臨床情報管理装置の制御部の機能構成
図１２に、臨床情報管理装置Ｂ１０，Ｂ２０，Ｂ３０の制御部１００Ｂの機能構成を示す。
臨床情報管理装置Ｂ１０，Ｂ２０，Ｂ３０の制御部１００Ｂは、検査依頼情報取得部１Ｂ、検査依頼情報送信部３Ｂ、患者情報送信要求受信部５Ｂ、患者情報送信部７Ｂ、電子カルテデータベース（ＤＢ）Ｂ１１、検査画像データベース（ＤＢ）Ｂ１２、検査依頼データベース（ＤＢ）Ｂ１３を備える。電子カルテデータベース（ＤＢ）Ｂ１１、検査画像データベース（ＤＢ）Ｂ１２、検査依頼データベース（ＤＢ）Ｂ１３は、臨床情報管理装置Ｂ１０，Ｂ２０，Ｂ３０の外部にあって、通信可能に接続されていてもよい。
【００７３】
４．検査情報管理装置
４−１．検査情報管理装置のハードウエアの構成
図１３に、検査情報管理装置Ｃ１１のハードウエアの構成を示す。検査情報管理装置Ｃ１１は、汎用コンピュータであり得る。
検査情報管理装置Ｃ１１は、制御部１００と、入力部１０６と、出力部１０７とを備える。
【００７４】
制御部１００は、後述するデータ処理を行うＣＰＵ１０１と、データ処理を行うための一時的な記憶領域として使用するメモリ１０２と、後述するプログラム及び処理データを記録する記憶装置１０３と、各部の間でデータを伝送するバス１０４と、外部機器とのデータの入出力を行うＩ／Ｆ部１０５とを備える。入力部１０６及び出力部１０７は、制御部１００に接続される。例示的には、入力部１０６は、キーボード、マウス、タッチセンサ等を含む。出力部１０７は、ディスプレイ、プリンタ、スピーカ等を含む。また、タッチセンサとディスプレイとが一体化されたタッチパネルのような、入力部及び出力部の双方の機能を有する装置を用いてもよい。Ｉ／Ｆ部１０５は、制御部１００が外部の装置と通信するためのインタフェースである。
【００７５】
また、制御部１００の記憶装置１０３は、オペレーションシステムと、以下の図１９、図２０、図２７、図２８、図３７、及び図５６に示す各ステップの処理を行うためのアプリケーションプログラムを、例えば実行形式で記憶装置１０３に予め記録している。実行形式は、例えばプログラミング言語からコンパイラにより変換されて生成される形式である。制御部１００は、記憶装置１０３に記録したプログラムを使用して、核酸配列解析処理、属性情報取得処理、レポート生成処理を行う。
【００７６】
以下の説明においては、特に断らない限り、制御部１００が行う処理は、記憶装置１０３又はメモリ１０２に格納されたコンピュータプログラムに基づいて、ＣＰＵ１０１が行う処理を意味する。ＣＰＵ１０１はメモリ１０２を作業領域として必要なデータ（処理途中の中間データ等）を揮発性に一時記憶し、記憶装置１０３に解析結果等の長期保存するデータを不揮発性に適宜記憶する。
【００７７】
アプリケーションプログラムは、ＤＶＤやＵＳＢメモリなどの外部記憶媒体９８からダウンロードして制御部１００の記憶装置１０３にインストールしてもよい。
【００７８】
検査情報管理装置Ｃ１１は、ネットワーク９９を介して変異情報データベース４００および核酸配列データ記憶装置３００に接続可能である。
【００７９】
変異情報データベース４００は、外部の公開配列情報データベース及び公開既知変異情報データベースなどである。公開配列情報データベースとしては、ＮＣＢＩ  ＲｅｆＳｅｑ（ウェブページ、ｗｗｗ．ｎｃｂｉ．ｎｌｍ．ｎｉｈ．ｇｏｖ／ｒｅｆｓｅｑ／）、ＮＣＢＩ  ＧｅｎＢａｎｋ（ウェブページ、ｗｗｗ．ｎｃｂｉ．ｎｌｍ．ｎｉｈ．ｇｏｖ／ｇｅｎｂａｎｋ／）、ＵＣＳＣ  Ｇｅｎｏｍｅ  Ｂｒｏｗｓｅｒなどが挙げられる。また、公開既知変異情報データベースとしては、ＣＯＳＭＩＣデータベース（ウェブページ、ｗｗｗ．ｓａｎｇｅｒ．ａｃ．ｕｋ／ｇｅｎｅｔｉｃｓ／ＣＧＰ／ｃｏｓｍｉｃ／）、ＣｌｉｎＶａｒデータベース（ウェブページ、ｗｗｗ．ｎｃｂｉ．ｎｌｍ．ｎｉｈ．ｇｏｖ／ｃｌｉｎｖａｒ／）及びｄｂＳＮＰ（ウェブページ、ｗｗｗ．ｎｃｂｉ．ｎｌｍ．ｎｉｈ．ｇｏｖ／ＳＮＰ／）などが挙げられる。なお、変異情報データベース４００は、公開既知変異に関し、人種あるいは動物種別毎の頻度情報を含む公開既知変異情報データベースであってもよい。このような情報を有する公開既知変異情報データベースとしては、ＨａｐＭａｐ  Ｇｅｎｏｍｅ  Ｂｒｏｗｓｅｒ  ｒｅｌｅａｓｅ  ＃２８、Ｈｕｍａｎ  Ｇｅｎｅｔｉｃ  Ｖａｒｉａｔｉｏｎ  Ｂｒｏｗｓｅｒ（ウェブページ、ｗｗｗ．ｇｅｎｏｍｅ．ｍｅｄ．ｋｙｏｔｏ−ｕ．ａｃ．ｊｐ／ＳｎｐＤＢ／ｉｎｄｅｘ．ｈｔｍｌ）及び１０００  Ｇｅｎｏｍｅｓ（ウェブページ、ｗｗｗ．１０００ｇｅｎｏｍｅｓ．ｏｒｇ／）が挙げられ、これらのデータベースからは、例えば、日本人の変異頻度情報などを入手することができる。
【００８０】
次世代シーケンサーＣ１３に適用可能なシークエンシング技術の例としては、イオン半導体シークエンシング、パイロシークエンシング（ｐｙｒｏｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ）、可逆色素ターミネータを使用するシークエンシング・バイ・シンセシス（ｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ−ｂｙ−ｓｙｎｔｈｅｓｉｓ）、シークエンシング・バイ・リゲーション（ｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ−ｂｙ−ｌｉｇａｔｉｏｎ）、及びオリゴヌクレオチドのプローブ結紮によるシークエンシングなどの、１ラン当たりに多数のリード配列を取得可能なシーケンシング技術が挙げられる。次世代シーケンサーＣ１３は、核酸配列をシーケンシングし、核酸配列情報として、リード配列情報を取得する。リード配列は、シーケンシングによって得られた核酸配列である。次世代シーケンサーＣ１３は、リード配列情報を出力する。リード配列情報には、配列名、核酸配列、シーケンシングのクオリティスコア等が含まれ得る。腫瘍細胞に由来する核酸から取得されたリード配列情報が第１の核酸配列データであり、非腫瘍細胞に由来する核酸から取得されたリード配列情報が第２の核酸配列データとなる。
核酸配列データ記憶装置３００は、次世代シーケンサーＣ１３によって取得された核酸配列データを記憶するコンピュータである。
【００８１】
４−２．検査情報管理装置の制御部の機能構成
図１４に、検査情報管理装置Ｃ１１の制御部１００の機能構成を示す。
検査情報管理装置Ｃ１１の制御部１００は、検査依頼情報取得部１１、検査状況管理部１２、リード配列情報取得部１、配列決定部２、変異検出部３、属性情報取得部４、レポート生成部５、情報出力部１４、フォーム選択部９、フォームデータベース１７、品質情報取得部１６、検査管理データベースＱＣＤ、参照配列管理部１０２ａ、参照配列生成部１０２ｂ、遺伝子パネル情報データベース１２１、参照配列データベース６、及び変異データベース７を含む。
【００８２】
検査依頼情報取得部１１は、統合データ管理装置Ａから、検査依頼に関する情報を取得する。また、検査状況管理部１２は、入力部１０６から臨床検査技師Ｔ１等が入力する検体受領情報、前処理情報、検査の進捗状況等を取得する。品質情報取得部１６は、入力部１０６から臨床検査技師Ｔ１等が入力する検体の品質に関する情報を取得し、検査管理データベースＱＣＤに格納された検査管理テーブルＬに記録する。また、品質情報取得部１６は、リード配列情報取得部１が取得するシーケンシング等の検査の品質に関する情報を取得し、検査管理データベースＱＣＤに記録する。
【００８３】
５．医療施設の専門家会議端末
５−１．医療施設の専門家会議端末のハードウエアの構成
図１５に、医療施設Ｂ１，Ｂ２，Ｂ３に設置された専門家会議端末Ｂ１５，Ｂ２５，Ｂ３５のハードウエアの構成を示す。
医療施設Ｂ１，Ｂ２，Ｂ３に設置された専門家会議端末Ｂ１５，Ｂ２５，Ｂ３５は、汎用コンピュータであり得る。専門家会議端末Ｂ１５，Ｂ２５，Ｂ３５のハードウエアの構成は、基本的には、統合データ管理装置Ａと同様である。統合データ管理装置Ａにおける制御部１００Ａ、入力部１０６Ａ、出力部１０７Ａ、ＣＰＵ１０１Ａ、メモリ１０２Ａ、記憶装置１０３Ａ、バス１０４Ａ、Ｉ／Ｆ部１０５Ａは、専門家会議端末Ｂ１５，Ｂ２５，Ｂ３５において、制御部１００Ｘ、入力部１０６Ｘ、出力部１０７Ｘ、ＣＰＵ１０１Ｘ、メモリ１０２Ｘ、記憶装置１０３Ｘ、バス１０４Ｘ、Ｉ／Ｆ部１０５Ｘと読み替えるものとする。
【００８４】
記憶装置１０３Ｘは、オペレーティングシステム（ＯＳ）、以下の図２１、図２２、図４３、図２３、図２６、図３０、図３１、図３３及び図３５に示す各ステップの処理を行うためのコンピュータプログラム、統合データ管理装置Ａから出力された表示情報等を表示するためのブラウザソフト等を予め格納している。
ブラウザソフトは、ＤＶＤやＵＳＢメモリなどの外部記憶媒体９８Ｘからダウンロードして記憶装置１０３Ｘにインストールしてもよい。
制御部１００Ｘは、Ｉ／Ｆ部１０５Ｘを介して、ネットワーク９９に接続し、統合データ管理装置Ａと通信する。
【００８５】
５−２．医療施設の専門家会議端末の制御部の機能構成
図１６に、医療施設Ｂ１，Ｂ２，Ｂ３に設置された専門家会議端末Ｂ１５，Ｂ２５，Ｂ３５の制御部１００Ｘの機能構成を示す。
医療施設Ｂ１，Ｂ２，Ｂ３に設置された専門家会議端末Ｂ１５，Ｂ２５，Ｂ３５の制御部１００Ｘは、スケジュール設定部Ｘ１、スケジュール受信部Ｘ３、検査依頼リスト表示要求部Ｘ５、検査依頼リスト出力部Ｘ７、特定検査依頼リスト出力部Ｘ９、品質情報出力部Ｘ１１、外部データベース（ＤＢ）情報出力部Ｘ１３、リスト内リンク選択部Ｘ１５、会議内容取得部Ｘ１７、会議内容出力部Ｘ１９を備える。
【００８６】
６．検査施設の専門家会議端末・外部施設の専門家会議端末
６−１．検査施設の専門家会議端末・外部施設の専門家会議端末のハードウエアの構成
図１５に、検査施設Ｃ１の専門家会議端末Ｃ１５及び外部施設ＳＰ１の専門家会議端末ＳＰ１１のハードウエアの構成を示す。
【００８７】
専門家会議端末Ｃ１５及び専門家会議端末ＳＰ１１は、汎用コンピュータであり得る。専門家会議端末Ｃ１５及び専門家会議端末ＳＰ１１のハードウエアの構成は、基本的には、統合データ管理装置Ａと同様である。統合データ管理装置Ａにおける制御部１００Ａ、入力部１０６Ａ、出力部１０７Ａ、ＣＰＵ１０１Ａ、メモリ１０２Ａ、記憶装置１０３Ａ、バス１０４Ａ、Ｉ／Ｆ部１０５Ａは、検査施設Ｃ１の専門家会議端末Ｃ１５・外部施設ＳＰ１の専門家会議端末ＳＰ１１において、制御部１００Ｙ、入力部１０６Ｙ、出力部１０７Ｙ、ＣＰＵ１０１Ｙ、メモリ１０２Ｙ、記憶装置１０３Ｙ、バス１０４Ｙ、Ｉ／Ｆ部１０５Ｙと読み替えるものとする。
【００８８】
記憶装置１０３Ｙは、オペレーティングシステム（ＯＳ）、以下の図２１、図２２、図４８、及び図５２に示す各ステップの処理を行うためのコンピュータプログラム、統合データ管理装置Ａから出力された表示情報等を表示するためのブラウザソフト等を予め格納している。
【００８９】
ブラウザソフトは、ＤＶＤやＵＳＢメモリなどの外部記憶媒体９８Ｙからダウンロードして記憶装置１０３Ｙにインストールしてもよい。
【００９０】
制御部１００Ｙは、Ｉ／Ｆ部１０５Ｙを介して、ネットワーク９９に接続し、統合データ管理装置Ａと通信する。
【００９１】
６−２．検査施設の専門家会議端末・外部施設の専門家会議端末の制御部の機能構成
図１７に、検査施設Ｃ１の専門家会議端末Ｃ１５の制御部１００Ｙ及び外部施設ＳＰ１の専門家会議端末ＳＰ１１の制御部１００Ｙの機能構成を示す。
【００９２】
専門家会議端末Ｃ１５及び専門家会議端末ＳＰ１１の制御部１００Ｙは、スケジュール受信部Ｙ１、検査依頼リスト表示要求部Ｙ３、検査依頼リスト出力部Ｙ５、特定検査依頼リスト出力部Ｙ７、品質情報出力部Ｙ９、外部データベース（ＤＢ）情報出力部Ｙ１１、リスト内リンク選択部Ｙ１３を備える。
【００９３】
７．事務局専門家会議端末
７−１．事務局専門家会議端末のハードウエアの構成
図１５に、事務局専門家会議端末ＳＰ１５のハードウエアの構成を示す。
事務局専門家会議端末ＳＰ１５は、汎用コンピュータであり得る。事務局専門家会議端末ＳＰ１５のハードウエアの構成は、基本的には、統合データ管理装置Ａと同様である。統合データ管理装置Ａにおける制御部１００Ａ、入力部１０６Ａ、出力部１０７Ａ、ＣＰＵ１０１Ａ、メモリ１０２Ａ、記憶装置１０３Ａ、バス１０４Ａ、Ｉ／Ｆ部１０５Ａは、事務局専門家会議端末ＳＰ１５において、制御部１００Ｚ、入力部１０６Ｚ、出力部１０７Ｚ、ＣＰＵ１０１Ｚ、メモリ１０２Ｚ、記憶装置１０３Ｚ、バス１０４Ｚ、Ｉ／Ｆ部１０５Ｚと読み替えるものとする。
【００９４】
記憶装置１０３Ｚは、オペレーティングシステム（ＯＳ）、以下の図２１、図２２、図４８、図５２、及び図５８で説明する各ステップの処理を行うためのコンピュータプログラム、統合データ管理装置Ａから出力された表示情報等を表示するためのブラウザソフト等を予め格納している。
【００９５】
ブラウザソフトは、ＤＶＤやＵＳＢメモリなどの外部記憶媒体９８Ｚからダウンロードして記憶装置１０３Ｚにインストールしてもよい。
【００９６】
制御部１００Ｚは、Ｉ／Ｆ部１０５Ｚを介して、ネットワーク９９に接続し、統合データ管理装置Ａと通信する。
【００９７】
７−２．事務局専門家会議端末の制御部の機能構成
図１８に、事務局専門家会議端末ＳＰ１５の制御部１００Ｚの機能構成を示す。
事務局専門家会議端末ＳＰ１５の制御部１００Ｚは、スケジュール受信部Ｚ１、検査依頼リスト表示要求部Ｚ３、検査依頼リスト出力部Ｚ５、特定検査依頼リスト出力部Ｚ７、品質情報出力部Ｚ９、外部データベース（ＤＢ）情報出力部Ｚ１０、リスト内リンク選択部Ｚ１１、会議内容取得部Ｚ１３、会議内容出力部Ｚ１５、新規予約枠登録部Ｚ１７、スケジュール更新部Ｚ１９を備える。
【００９８】
８．システムの動作
図１９から図２２を用いて、遺伝子パネル検査の検査依頼の管理システム１０００の動作について説明する。
８−１．検査依頼の流れ
システム１０００において、はじめに、腫瘍を保有する患者について医療施設Ｂ１，Ｂ２，Ｂ３から、遺伝子パネル検査の依頼が行われる。
【００９９】
システム１０００に参加する医療施設は、複数存在し得るが、ここでは、医療施設Ｂ１を例にして、臨床情報管理装置Ｂ１０及び医療施設Ｂ１の専門家会議端末Ｂ１５を使用する場合を例にして動作を説明する。
【０１００】
医療施設Ｂ１に設置された臨床情報管理装置Ｂ１０の制御部１００Ｂ（以下、単に臨床情報管理装置Ｂ１０ともいう）は、図１９のステップＳＴ１において、入力部１０６Ｂからの担当医Ｈ１ａによる検査依頼開始の入力を受け付ける。このとき制御部１００Ｂは、図１２に示す検査依頼情報取得部１Ｂとして機能する。検査依頼情報取得部１Ｂの処理は、後述する。
【０１０１】
検査依頼の入力は、図２３に示すグラフィカルユーザインタフェースＵＩａを介して行われる。グラフィカルユーザインタフェースＵＩａは、依頼元の医療施設の情報を入力するための医療施設情報入力領域ＵＩａ１と、検査依頼情報を入力するための検査依頼情報入力領域ＵＩａ３と、依頼を確定するための依頼確定アイコンＵＩａ７を備え得る。医療施設情報入力領域ＵＩａ１には施設名を表示する領域ＵＩａ１１と、施設の識別情報（ＩＤ）を入力する領域ＵＩａ１３と、施設の住所を入力する領域ＵＩａ１５と、施設の連絡先を入力する領域ＵＩａ１７が設けられている。
【０１０２】
検査依頼情報入力領域ＵＩａ３には、依頼する遺伝子パネル検査を特定するための検査種別を入力する領域ＵＩａ３１と、検査を依頼する患者の担当医名を入力する領域ＵＩａ３２と、担当医の遺伝子パネル検査におけるユーザとしての識別情報を入力する領域ＵＩａ３３と、患者の識別情報（ＩＤ）を入力する領域ＵＩａ３４と、患者のインフォームドコンセントに関する情報を入力する領域ＵＩａ３５と、患者の氏名を入力する領域ＵＩａ４１と、患者の性別を入力する領域ＵＩａ４２と、患者の生年月日を入力する領域ＵＩａ４３と、遺伝子パネル検査を依頼する検査施設名を入力する領域ＵＩａ４４と、検査依頼日を入力する領域ＵＩａ５１と、専門家会議を統率する事務局となる施設名を入力する領域ＵＩａ５２、前記事務局となる施設の識別情報（ＩＤ）を入力する領域ＵＩａ５３と、腫瘍細胞に由来する核酸を含む第１の検体のＩＤを入力する領域ＵＩａ５７と、非腫瘍細胞に由来する核酸を含む第２の検体のＩＤを入力する領域ＵＩａ５８が設けられている。
【０１０３】
担当医Ｈ１ａが、臨床情報管理装置Ｂ１０の入力部１０６Ｂより、グラフィカルユーザインタフェースＵＩａの各領域の一部、又は全部に入力し、依頼確定アイコンＵＩａ７を選択すると、臨床情報管理装置Ｂ１０は、グラフィカルユーザインタフェースＵＩａに入力された内容を検査依頼に関連する情報として、統合データ管理装置Ａに送信する。この時、臨床情報管理装置Ｂ１０の制御部１００Ｂは、検査依頼情報送信部３Ｂとして機能する。
【０１０４】
統合データ管理装置Ａの制御部１００Ａ（以下、単に統合データ管理装置Ａという）は図１９のステップＳＴ２１において、臨床情報管理装置Ｂ１０から送信された検査依頼情報を、Ｉ／Ｆ部１０５Ａを介して受信する。このとき、制御部１００Ａは、検査依頼受信部Ａ１として機能する。
【０１０５】
続いて、ステップＳＴ２２において、統合データ管理装置Ａは、検査依頼情報をマスターテーブルＭに記録し、マスターテーブルＭを更新する。このとき、制御部１００Ａは、マスターテーブル更新部A５０として機能する。
【０１０６】
図１９のステップＳＴ２２のマスターテーブルＭの更新処理において、グラフィカルユーザインタフェースＵＩａから入力された検査依頼に関する情報は、例えば、以下の対応関係で、マスターテーブルＭへ反映され得る。
【０１０７】
マスターテーブルＭの「患者ＩＤ」を示す列と、患者ＩＤ入力領域ＵＩａ３４
マスターテーブルＭの「検体ＩＤ」を示す列と、第１の検体ＩＤ入力領域ＵＩａ５７及び第２の検体ＩＤ入力領域ＵＩａ５８
マスターテーブルＭの「遺伝子パネルＩＤ」領域と、検査種別入力領域ＵＩａ３１
マスターテーブルＭの「患者氏名」領域と、患者氏名入力領域ＵＩａ４１
マスターテーブルＭの「患者の性別」領域と、患者性別入力領域ＵＩａ４２
マスターテーブルＭの「患者の生年月日」領域と、患者生年月日入力領域ＵＩａ４３
マスターテーブルＭの「患者の同意」領域と、患インフォームドコンセント情報入力領域ＵＩａ３５
マスターテーブルＭの「検査依頼日」領域と、検査依頼日入力領域ＵＩａ５１、
マスターテーブルＭの「医療関係者のユーザＩＤ」領域と、担当医ユーザＩＤ入力領域ＵＩａ３３
マスターテーブルＭの「医療関係者の氏名」領域と、担当医名入力領域ＵＩａ３２
マスターテーブルＭの「事務局施設」領域と、事務局施設名入力領域ＵＩａ５２。
【０１０８】
図７に入力領域が示されていない、上記以外の検査依頼に関する情報も、マスターテーブルＭの所定の領域に格納される。
【０１０９】
ここで、マスターテーブルＭの「検査依頼ＩＤ」領域に入力される情報は、例えば、マスターテーブルＭにあらかじめ付されており、統合データ管理装置Ａが、新しい検査依頼に関する情報を取得すると、自動的に、「検査依頼ＩＤ」領域以外の同行の欄が空欄であり、検査依頼ＩＤが最も小さい番号である行の欄に、取得した新しい検査依頼に関する情報を入力することで、新たな検査依頼に関する情報とマスターテーブルＭ内の検査依頼ＩＤを対応させることができる。
【０１１０】
次に、統合データ管理装置Ａは、図１９のステップＳＴ２３において、ステップＳＴ２２で取得した検査依頼情報を、Ｉ／Ｆ部１０５Ａを介して検査情報管理装置Ｃ１１に送信する。このとき、取得した検査依頼情報の他、ステップＳＴ２２において付した検査依頼ＩＤを検査依頼情報に含めて、検査情報管理装置Ｃ１１に送信してもよい。ステップＳＴ２３において、統合データ管理装置Ａの制御部１００Ａは、検査依頼送信部Ａ３として機能する。図１９のステップＳＴ２３における送信は、統合データ管理装置ＡがマスターテーブルＭを更新したことをトリガーとして行ってもよい。また、統合データ管理装置Ａを操作するオペレータが入力部１０６Ａを介して送信要求を入力してもよい。
【０１１１】
検査情報管理装置Ｃ１１の制御部１００（以下、単に検査情報管理装置Ｃ１１ともいう）は、ステップＳＴ６１において、Ｉ／Ｆ部１０５を介して、統合データ管理装置Ａから送信された検査依頼情報を取得する。検査情報管理装置Ｃ１１は、取得した検査依頼情報を記憶装置１０３に格納する。このとき、検査情報管理装置Ｃ１１の制御部１００は、検査依頼情報取得部１１として機能する。図２４に、検査情報管理装置Ｃ１１に格納されている検査情報管理装置Ｃ１１において取得されるデータを格納するための、検査管理テーブルＬの例を示す。
図１９のステップＳＴ６１において取得された検査依頼に関する情報は、例えば、以下の対応関係で、検査管理テーブルＬへ反映され得る。
【０１１２】
検査管理テーブルＬの「患者ＩＤ」を示す列と、患者ＩＤ入力領域ＵＩａ３４
検査管理テーブルＬの「検体ＩＤ」を示す列と、第１の検体ＩＤ入力領域ＵＩａ５７及び第２の検体ＩＤ入力領域ＵＩａ５８
検査管理テーブルＬの「遺伝子パネルＩＤ」領域と、検査種別入力領域ＵＩａ３１
検査管理テーブルＬの「患者氏名」領域と、患者氏名入力領域ＵＩａ４１
検査管理テーブルＬの「患者の性別」領域と、患者性別入力領域ＵＩａ４２
検査管理テーブルＬの「患者の生年月日」領域と、患者生年月日入力領域ＵＩａ４３
検査管理テーブルＬの「患者の同意」領域と、患インフォームドコンセント情報入力領域ＵＩａ３５
検査管理テーブルＬの「検査依頼日」領域と、検査依頼日入力領域ＵＩａ５１、
検査管理テーブルＬの「医療関係者のユーザＩＤ」と、担当医ユーザＩＤ入力領域ＵＩａ３３
検査管理テーブルＬの「医療関係者の氏名」領域と、担当医名入力領域ＵＩａ３２。
【０１１３】
検査管理テーブルＬは、マスターテーブルＭと同じ構成であってもよいが、検査段階に、専門家会議の事務局や開催日時、グループＩＤ、患者情報等はなくてもよい。
【０１１４】
次に、臨床情報管理装置Ｂ１０は、図１９のステップＳＴ２において、検査依頼を行った患者の患者情報を電子カルテデータベースＢ１１又は検査画像データベースＢ１２から呼び出し、統合データ管理装置Ａに送信する。このとき、臨床情報管理装置Ｂ１０の制御部１００Ｂは、患者情報送信部７Ｂとして機能する。図１９のステップＳＴ２において送信される情報は、ステップＳＴ１において検査依頼情報を送信する際に、検査依頼情報に含めて送信されてもよい。また担当医Ｈ１ａが、入力部１０６Ｂから制御部１００Ｂに送信要求を入力してもよい。例えば、患者情報の送信は、後述する図２１のステップＳＴ８３において、担当医Ｈ１ａが行ってもよい。このとき、臨床情報管理装置Ｂ１０の制御部１００Ｂは、患者情報送信要求受信部５Ｂとして機能する（図１２）。
【０１１５】
統合データ管理装置Ａは、図１９のステップＳＴ２５において、Ｉ／Ｆ部１０５Ａを介して患者情報を受信する。このとき統合データ管理装置Ａの制御部１００は、患者情報受信部Ａ５として機能する。図１９のステップＳＴ２６において、統合データ管理装置Ａは、患者情報をマスターテーブルＭに記録し、マスターターテブルＭを更新する。患者情報は、マスターテーブルＭの「患者情報」領域に格納される。このとき統合データ管理装置Ａの制御部１００は、マスターテーブル更新部Ａ５０として機能する（図６）。
【０１１６】
図１９のステップＳＴ２、ステップＳＴ２５及びステップＳＴ２６の処理は、図１９のステップＳＴ１よりも前に行われてもよい。遅くとも、後述する専門家会議の設定（図２１のＳＴ８３）が終了する前に行われればよい。
【０１１７】
８−２．遺伝子パネル検査の流れ
遺伝子パネル検査は、検査情報管理装置Ｃ１１が検査依頼情報を受信することで開始される。医療施設Ｂ１で採取された患者の検体が、検査施設Ｃ１に搬入されると、例えば検査施設Ｃ１の臨床検査技師Ｔ１が、検査情報管理装置Ｃ１１の入力部１０６を介して、記憶装置１０３に格納された検査管理テーブルＬの検査状況の領域に検体受領済みのラベルを入力する。検査状況を示すラベルの一覧は、図２５に示す。検査状況のラベルは、検査の進捗に併せて、臨床検査技師Ｔ１により適宜入力され得る。検査情報管理装置Ｃ１１は、この入力を受け付ける。このとき検査情報管理装置Ｃ１１の制御部１００は、検査状況管理部１２として機能する（図１４）。
【０１１８】
図１９のステップＳＴ６３において、検査情報管理装置Ｃ１１は、ステップＳＴ６２において検査管理テーブルＬの検査状況を「検体受領済」に更新した旨を、検体受領情報として、統合データ管理装置Ａに送信する。このとき、検査情報管理装置Ｃ１１の制御部１００は、検査状況管理部１２として機能する（図６）。
【０１１９】
統合データ管理装置Ａは、ステップＳＴ６３において検査情報管理装置Ｃ１１が送信した検体受領情報を、ステップＳＴ２７において受信する。このとき、統合データ管理装置Ａの制御部１００Ａは、検査状況管理部Ａ７として機能する。統合データ管理装置Ａは、ステップＳＴ２７において受信した内容に基づいて、ステップＳＴ２８においてマスターテーブルＭの「検査状況」の領域を更新する。このとき、統合データ管理装置Ａの制御部１００Ａは、マスターテーブル更新部Ａ５０として機能する（図６）。ここで、検査管理テーブルＬ内の情報と、マスターテーブルＭの情報との紐付けは、例えば、検査依頼ＩＤ等、検体ＩＤ、患者ＩＤと検査依頼日等で行うことができる。図１９のステップＳＴ６３における情報の送信は、検査管理テーブルＬが更新された時に自動的に行われてもよく、臨床検査技師Ｔ１等が、入力部１０６から送信要求を入力することで行ってもよい。
【０１２０】
検査施設Ｃ１に搬入された検体は、核酸抽出処理、核酸の品質検定等の前処理が行われる。臨床検査技師Ｔ１は、検体の前処理が完了すると、図１９のステップＳＴ６４において、検査情報管理装置Ｃ１１の入力部１０６を介して、記憶装置１０３に格納された検査管理テーブルＬの検査状況の領域に図２５に示す前処理工程完了を示すラベルを入力する。検査情報管理装置Ｃ１１は、この入力を受け付ける。このとき、検査情報管理装置Ｃ１１の制御部１００は、検査状況管理部１２として機能する（図１４）。
【０１２１】
図１９のステップＳＴ６５において、検査情報管理装置Ｃ１１は、ステップＳＴ６４において、検査管理テーブルＬの検査状況を「前処理工程完了」に更新し、その検査状況の情報を、統合データ管理装置Ａに送信する。検査情報管理装置Ｃ１１の制御部１００は、検査状況管理部１２として機能する（図１４）。
【０１２２】
統合データ管理装置Ａは、図２０のステップＳＴ２９において検査情報管理装置Ｃ１１が送信した検査状況の情報に基づいて、マスターテーブルＭの「検査状況」の領域を更新する。このとき、統合データ管理装置Ａの制御部１００Ａは、マスターテーブル更新部Ａ５０として機能する（図６）。ここで、検査管理テーブルＬ内の情報と、マスターテーブルＭの情報の紐付けは、例えば、検査依頼ＩＤ等、検体ＩＤ、患者ＩＤと検査依頼日等で行うことができる。ステップＳＴ６５における情報の送信は、検査管理テーブルＬが更新された時に自動的に行われてもよく、臨床検査技師Ｔ１等が、入力部１０６から送信要求を入力することで行ってもよい。
【０１２３】
臨床検査技師Ｔ１は、次に検体の品質に関する情報を、検査情報管理装置Ｃ１１の入力部１０６を介して、記憶装置１０３に格納された検査管理テーブルＬの「品質情報」に登録する。「品質情報」の欄は、検体の品質情報を入力するための検体品質情報入力テーブルＱにリンクしている。検体品質情報入力テーブルＱの例を図２６に示す。図２６に示す検体品質情報入力テーブルＱには、抽出日と、検査依頼ＩＤと、第１の検体について抽出された核酸の絶対量を入力する「核酸抽出量」の入力欄と、抽出された核酸が過度に分解されていないかを電気泳動で評価した「電気泳動結果」の入力欄と、第２の検体について「核酸抽出量」を入力する入力欄と、「電気泳動結果」を入力する入力欄とが、少なくとも設けられている。抽出日は、核酸を抽出した日である。検体品質情報入力テーブルＱの「検体依頼ＩＤ」は、検査管理テーブルＬ及びマスターテーブルＭの「検査依頼ＩＤ」に対応している。検体品質情報入力テーブルＱに示された「検査依頼ＩＤ」がＴ０１及びＴ０２のサンプルは、第１の検体、第２の検体とも抽出された核酸量が十分であり、電気泳動結果も良好であることからシーケンシングに使用する核酸サンプルとして十分な品質を有しているといえる。しかし、「検査依頼ＩＤ」がＴ０３の第１の検体に由来する核酸サンプルは、核酸量が検出限界以下であり、十分な核酸サンプルが得られていない。このような場合には、仮にシーケンシングにより変異が検出されなかったとしても、その検査結果を採用することはできない。したがって、検体の採取をやり直す必要がある。
【０１２４】
図２０のステップＳＴ６６において、検査情報管理装置Ｃ１１は、臨床検査技師Ｔ１が入力部１０６を介して検体品質情報テーブルに入力した情報を受け付け、記憶装置１０３に記録する。このとき、検査情報管理装置Ｃ１１の制御部１００は、品質情報取得部１６として機能する（図１４）。
【０１２５】
次に、図２０のステップＳＴ６７において、検査情報管理装置Ｃ１は、ステップＳＴ６６において検体品質情報テーブルに記録された内容を、検体の品質情報として統合データ管理装置Ａに送信する。検査情報管理装置Ｃ１１の制御部１００は、情報出力部１４として機能する（図１４）。
【０１２６】
統合データ管理装置Ａは、ステップＳＴ３１において、検査情報管理装置Ｃ１１がステップＳＴ６７において送信した検体の品質情報を受信する。このとき、統合データ管理装置Ａの制御部１００Ａは、品質情報管理部Ａ１１として機能する（図６）。統合データ管理装置Ａは、ステップＳＴ３２においてマスターテーブルＭの「品質情報」の領域を更新する。このとき、統合データ管理装置Ａの制御部１００Ａは、マスターテーブル更新部Ａ５０として機能する（図６）。ここで、検査管理テーブルＬの情報と、マスターテーブルＭの情報の紐付けは、例えば、検査依頼ＩＤ等で行うことができる。ステップＳＴ６７における情報の送信は、検査管理テーブルＬが更新された時に自動的に行われてもよく、臨床検査技師Ｔ１等が、入力部１０６から送信要求を入力することで行ってもよい。
【０１２７】
次に、検査情報管理装置Ｃ１１は、図２０のステップＳＴ６８において、第１の検体から抽出された核酸サンプルと、第２の検体から抽出された核酸サンプルについて次世代シーケンサーＣ１３によるシーケンシングを行い、核酸配列の変異解析を行う。核酸配列の変異解析処理の概略を後述する。
【０１２８】
図２０のステップＳＴ６８において、シーケンシングが行われると、シーケンシング解析の品質が検査の品質管理レポート（ＱＣレポートともいう）が、次世代シーケンサーＣ１３により検査バッチ（１回のシーケンシングが１バッチであり、複数の患者の検体が１バッチでシーケンシングされる）ごとに取得され、記憶装置１０３の検査管理データベースＱＣＤに記録される。
【０１２９】
検査情報管理装置Ｃ１１は、図２０のステップＳＴ６９おいて、シーケンシングが行われた各検体に対応するＱＣレポートを、検査管理テーブルＬの各検体に対応する品質情報の欄に格納するか、対応付けることで検査の品質情報を登録する。
図２０のステップＳＴ６８及びＳＴ６９において、検査情報管理装置Ｃ１１の制御部１００は、品質情報取得部１６として機能する（図１４）。
【０１３０】
図２０のステップＳＴ７０において、検査情報管理装置Ｃ１は、ステップＳＴ６９において「品質情報」の欄に新たな検査の品質情報を登録すると、検査管理テーブルＬに記録した内容を、検査の品質情報として統合データ管理装置Ａに送信する。このとき、検査情報管理装置Ｃ１１の制御部１００は、情報出力部１４として機能する（図１４）。
【０１３１】
統合データ管理装置Ａは、図２０のステップＳＴ７０で送信された検査品質情報をステップＳＴ３３において受信し、ステップＳＴ３４においてマスターテーブルＭの「品質情報」の領域に記録し、マスターテーブルＭを更新する。このとき、統合データ管理装置Ａの制御部１００Ａは、マスターテーブル更新部Ａ５０として機能する（図６）。ここで、検査管理テーブルＬの情報と、マスターテーブルＭの情報の紐付けは、例えば、検査依頼ＩＤ等で行うことができる。図２０のステップＳＴ７０における情報の送信は、検査管理テーブルＬが更新された時に自動的に行われてもよく、臨床検査技師Ｔ１等が、入力部１０６から送信要求を入力することで行ってもよい。
【０１３２】
次に、検査情報管理装置Ｃ１１は、図２０のステップＳＴ７１において、ステップＳＴ６８において検出された変異解析の結果に基づいて、遺伝子パネル検査の検査結果の概要を示す属性情報を取得する。属性情報取得処理の詳細は、後述する。検査情報管理装置Ｃ１１は、取得した属性情報を検査管理テーブルＬの属性情報の欄に記録する。ステップＳＴ７１において、検査情報管理装置Ｃ１１の制御部１００は、属性情報取得部４として機能する（図１４）。
【０１３３】
検査情報管理装置Ｃ１１は、図２０のステップＳＴ７２において、ステップＳＴ７１において「属性情報」の欄に新たな属性情報を登録すると、検査管理テーブルＬに記録した内容を、属性情報として統合データ管理装置Ａに送信する。このとき、検査情報管理装置Ｃ１１の制御部１００は、情報出力部１４として機能する（図１４）。
【０１３４】
統合データ管理装置Ａは、図２０のステップＳＴ７２で送信された検査品質情報をステップＳＴ３５において受信し、ステップＳＴ３６においてマスターテーブルＭの「属性情報」の領域に記録し、マスターテーブルＭを更新する。ここで、検査管理テーブルＬの情報と、マスターテーブルＭの情報の紐付けは、例えば、検査依頼ＩＤ等で行うことができる。図２０のステップＳＴ７２における情報の送信は、検査管理テーブルＬが更新された時に自動的に行われてもよく、臨床検査技師Ｔ１等が、入力部１０６から送信要求を入力することで行ってもよい。
【０１３５】
次に、検査情報管理装置Ｃ１１は、図２０のステップＳＴ７３において、ステップＳＴ６８において検出された変異解析の結果に基づいて、遺伝子パネル検査の検査結果のレポートの生成処理を行う。このとき、検査情報管理装置Ｃ１１の制御部１００は、レポート生成部５として機能する（図１４）。レポート生成処理の詳細は、後述する。このとき、検査情報管理装置Ｃ１１の制御部１００は、情報出力部１４として機能する（図１４）。
【０１３６】
検査情報管理装置Ｃ１１は、図２０のステップＳＴ７３において生成したレポートを、検査管理テーブルＬの各検査依頼ＩＤに対応する検査結果の欄に格納するか、リンクを張ることで検査結果のレポートを登録する。
【０１３７】
図２０のステップＳＴ７４において、検査情報管理装置Ｃ１は、ステップＳＴ７３において「検査結果」の欄に新たな検査結果を登録すると、検査管理テーブルＬに記録した内容を、検査結果情報として統合データ管理装置Ａに送信する。
【０１３８】
統合データ管理装置Ａは、図２０のステップＳＴ７４で送信された検査結果の情報をステップＳＴ３７において受信し、ステップＳＴ３８においてマスターテーブルＭの「検査結果」の領域に記録し、マスターテーブルＭを更新する。ここで、検査管理テーブルＬの情報と、マスターテーブルＭの情報の紐付けは、例えば、検査依頼ＩＤ等で行うことができる。図２０のステップＳＴ７４における情報の送信は、検査管理テーブルＬが更新された時に自動的に行われてもよく、臨床検査技師Ｔ１等が、入力部１０６から送信要求を入力することで行ってもよい。
【０１３９】
ここで、検査情報管理装置Ｃ１１が、図２０のステップＳＴ７３において生成した、遺伝子パネル検査のレポートは、プリンタ等の出力部１０７から出力され、紙媒体としても医療施設Ｂ１に送られる。
【０１４０】
図２０において、統合データ管理装置Ａは、図１９に示すステップＳＴ２１からステップＳＴ２８及び図２０に示すステップＳＴ２９からステップＳＴ３８までの処理により、統合データ管理装置Ａとは異なる他のコンピュータである、臨床情報管理装置Ｂ１０、または第１群の臨床情報管理装置Ｂ１０、Ｂ２０、Ｂ３０から検査依頼に関する情報を取得し、また、統合データ管理装置Ａ及び臨床情報管理装置Ｂ１０、Ｂ２０、Ｂ３０とは異なる検査情報管理装置Ｃ１から、属性情報、検査結果、検体及び検査の品質管理情報を取得し、これらを統合して、図７に示すマスターテーブルＭ及びマスターテーブルにリンクしたテーブルに各情報を記録した。
【０１４１】
マスターテーブルＭに記録された情報、及びマスターテーブルＭにリンクしたテーブルに記録された情報は、図４に示す医療施設Ｂ１，Ｂ２，Ｂ３の専門家会議端末Ｂ１５，Ｂ２５，Ｂ３５、検査施設Ｃ１の専門家会議端末Ｃ１５、外部施設ＳＰ１の専門家会議端末ＳＰ１１，事務局専門家会議端末ＳＰ１５から、検査依頼リストとして又は検査一覧からのリンクとして表示が可能である。すなわち、統合データ管理装置Ａは、マスターテーブルＭに記録された情報を検査依頼リストとして、各専門家会議端末に出力することができる。また、マスターテーブルＭにリンクしたテーブルに記録された情報を検査依頼リストの対応項目に張られたリンクを介して、出力することができる。
【０１４２】
各専門家会議端末は、各端末の記憶装置に格納されたブラウザソフトを介して、検査依頼リスト及び検査依頼リストにリンクした情報を表示することができる。
検査依頼リストの例は、図２及び図３に示した通りである。
【０１４３】
（１）変異解析処理
以下、図２７及び図２８を用いて、変異解析の概要を説明する。変異解析の詳細は、米国公開特許第２０１９−１５６９１４号公報に記載の方法に従う。
【０１４４】
検査情報管理装置Ｃ１１は、第１の検体から取得された核酸サンプルから腫瘍細胞に由来する核酸配列のリード（腫瘍リード配列）を取得し、第２の検体から取得された核酸サンプルから正常細胞に由来する核酸配列のリード（正常リード配列）を取得し、変異解析に用いる。
【０１４５】
検査情報管理装置Ｃ１１は、腫瘍リード配列、及び正常リード配列から、患者が保有する腫瘍に体細胞変異があるか否かを決定する。また、正常リード配列から、患者が生殖細胞変異を保有するかを決定する。
【０１４６】
体細胞変異及び生殖細胞変異の検出は、一般的な配列として報告されている参照配列データと、腫瘍リード配列及び正常リード配列とを比較することにより行うことができる。例えば、参照配列データと第１の核酸配列データとを比較する場合には、参照配列データ内の配列と異なる腫瘍リード配列内の配列を検出することにより、腫瘍リード配列内の変異を検出することができる。同様に、参照配列データと正常リード配列を比較する場合には、参照配列データ内の配列と異なる正常リード配列内の配列を検出することにより、正常リード配列内の変異を検出することができる。また、参照配列データに代えて、米国公開特許第２０１９−１５６９１４号公報に記載の変異参照配列データを用いて、変異を検出してもよい。
【０１４７】
生殖細胞変異に関する情報は、核酸配列の解析を行った患者が保有する生殖細胞変異に関する情報である限り制限されない。例えば、生殖細胞変異に関する情報には、少なくとも変異が検出された遺伝子名を示すラベルを含み得る。好ましくは、生殖細胞変異に関する情報は、変異が検出された遺伝子名を示すラベルと検出された核酸配列情報及び／又は変異により生じるアミノ酸配列の情報を含んでいてもよい。また、Ｉ．実施形態の概要］の項で述べたように、変異が検出された遺伝子のローカス情報、参照配列情報、患者が保有する変異配列の情報を含んでいてもよい。また、生殖細胞変異に関する情報は、変異が有るか無いかを検出した情報に限られず、例えば、生殖細胞変異がある可能性を示唆する情報（例えば、モザイク変異）であってもよい。
【０１４８】
（１−１）体細胞変異の検出
図１３、図１４、及び図２７を用いて、検査情報管理装置Ｃ１１が、体細胞変異を検出するための制御部１００の動作の例を示す。
【０１４９】
図２７のステップＳＴ２０１において、検査情報管理装置Ｃ１１の制御部１００（以下、単に検査情報管理装置Ｃ１１ともいう）は、図１３に示す核酸配列データ記憶装置３００からリード配列を取得する。このとき、検査情報管理装置Ｃ１１の制御部１００は、図１４に示すリード配列情報取得部１として機能する。取得されるリード配列には、正常リード配列と、腫瘍リード配列が含まれる。
図２７のステップＳＴ２０２において、検査情報管理装置Ｃ１１は、正常リード配列と腫瘍リード配列のそれぞれを参照配列にアラインメントする。このとき、検査情報管理装置Ｃ１１の制御部１００は、図１４に示す配列決定部２として機能する。
【０１５０】
図２７のステップＳＴ２０３において、検査情報管理装置Ｃ１１は、腫瘍リードに参照配列との不一致があるか否かを判定する。腫瘍リードに参照配列との不一致がある場合（「Ｙｅｓ」の場合）、処理はＳＴ２０４に進み、正常リードに参照配列との不一致がないか否かを判定する。正常リードに参照配列との不一致がない場合（「Ｙｅｓ」の場合）、処理は、ステップＳＴ２０５に進み、腫瘍リードに存在する変異を体細胞変異と判定する。また、検査情報管理装置Ｃ１１は不一致のあったリード配列に対応する参照配列の遺伝子名、遺伝子座、不一致部位を特定する。
【０１５１】
検査情報管理装置Ｃ１１は、図２７のステップＳＴ２０６において、検出された変異に基づいて、変異データベース７を検索する。ここで、図１４の変異データベース７は、例えば、ＣＯＳＭＩＣやＣｌｉｎＶａｒなどの外部の変異情報データベース４００を基に構築される。また、一態様において、データベース中の各変異情報には、遺伝子パネルに関する情報のメタデータが付与され得る。
【０１５２】
次に、検査情報管理装置Ｃ１１は、図２７のステップＳＴ２０７において、ステップＳＴ２０６の検索結果に基づき、検出された変異にアノテーションを付与する。図２９に、検索結果とアノテーションの例を示す。図２９は、左から、変異の識別情報を示す「変異ＩＤ」、変異部位を含む染色体番号を示す「ＣＨＲＯＭ」、変異部位の位置番号を示す「ＰＯＳ」、参照配列のヌクレオチド配列を示す「ＲＥＦ」、変異配列を示す「ＡＬＴ」、具体的にどのような変異であるかを示す「Ａｎｎｏｔａｔｉｏｎ」の情報を含んでいる。本発明において、アノテーションの付与は省略可能である。
【０１５３】
検査情報管理装置Ｃ１１は、ステップＳＴ２０３において、腫瘍リードに参照配列との不一致がない（「Ｎｏ」）と判定した場合、ステップＳＴ２０８において、体細胞変異無しの判定を行い、処理を終了する。
【０１５４】
図２７のステップＳＴ２０７の後に、図２９に示す結果を出力してもよい。図２７に示すステップＳＴ２０３からステップＳＴ２０７において、検査情報管理装置Ｃ１１の制御部１００は、図１４に示す変異検出部３として機能する。
（１−２）生殖細胞変異の検出
図１３、図１４及び図２８を用いて、検査情報管理装置Ｃ１１が、生殖細胞変異を検出するための制御部１００の動作の例を説明する。
【０１５５】
図２８のステップＳＴ３０１において検査情報管理装置Ｃ１１は、図１３に示す核酸配列データ記憶装置３００からリード配列を取得する。このとき、検査情報管理装置Ｃ１１の制御部１００は、図１４のリード配列情報取得部１として機能する。取得されるリード配列には、正常リード配列が含まれる。
【０１５６】
図２８のステップＳＴ３０２において、検査情報管理装置Ｃ１１は、正常リード配列を参照配列にアラインメントする。このとき、検査情報管理装置Ｃ１１の制御部１００は、図１４に示す配列決定部２として機能する。
【０１５７】
図２８のステップＳＴ３０３において、検査情報管理装置Ｃ１１は、正常リードに参照配列との不一致があるか否かを判定する。正常リードに参照配列との不一致がある場合（「Ｙｅｓ」の場合）、変異検出部３はＳＴ３０４に進み、正常リードに存在する変異を生殖細胞変異と判定する。また、検査情報管理装置Ｃ１１は不一致のあったリード配列に対応する参照配列の遺伝子名、遺伝子座、不一致部位を特定する。
【０１５８】
検査情報管理装置Ｃ１１は、図２８のステップＳＴ３０５において、特定された変異に基づいて、図９に示す変異データベース７を検索する。
【０１５９】
次に検査情報管理装置Ｃ１１は、図２８のステップＳＴ３０６において、ステップＳＴ３０６の検索結果に基づき、検出された変異にアノテーションを付与する。このステップは、図２７のステップＳＴ２０７と同様である。
検査情報管理装置Ｃ１１は、図２８のステップＳＴ３０３において、正常リードに参照配列との不一致がない（「Ｎｏ」）と判定した場合、ステップＳＴ３０７において、生殖細胞変異無しの判定を行い、処理を終了する。図２８に示すステップＳＴ３０３からステップＳＴ３０６において、検査情報管理装置Ｃ１１の制御部１００は、図１４に示す変異検出部３として機能する。
【０１６０】
（２）属性情報取得処理
図１３、図１４、及び図３０から図３３を用いて、検査情報管理装置Ｃ１１が属性情報を取得するための動作を説明する。
【０１６１】
ここで、遺伝子パネル検査の検査項目には、一つのパネルに複数の遺伝子の変異解析が含まれている。第１の属性情報、及び第２の属性情報は、遺伝子パネル検査に含まれる。したがって、第１の属性情報は、遺伝子パネル検査に含まれる少なくとも一つの検査対象の遺伝子（所定の遺伝子ともいう）に変異が認められれば、「変異有」のラベルが付されることとなる。また、第２の属性情報についても、遺伝子パネル検査に含まれる少なくとも一つの検査対象の遺伝子（所定の遺伝子ともいう）に変異が認められれば、その変異の種類を示すラベルが付されることとなる。１回の遺伝子パネル検査において、例えば、アクショナブル変異と生殖細胞変異の両方が認められれば、両方のラベルが付されることとなる。
【０１６２】
（２−１）第１の取得形態
属性情報の第１の取得形態は臨床検査技師Ｔ１またはバイオインフォマティシャンＴ２が、検査結果に基づいて、検査結果の概要を示す属性を判定し、図１３に示す検査情報管理装置Ｃ１１の入力部１０６から判定結果を入力することによって、検査情報管理装置Ｃ１１がこの入力を受け付ける方法である。
【０１６３】
図３０に臨床検査技師Ｔ１等が、検査情報管理装置Ｃ１１に属性情報を入力するためのグラフィカルユーザインタフェースの例と、その入力例を示す。図３０（ａ）には、遺伝子パネル検査の検査対象遺伝子において、生殖細胞変異が検出されている場合のグラフィカルユーザインタフェースＵＩｃを示す。グラフィカルユーザインタフェースＵＩｃは、第１の属性情報として、検査対象遺伝子に変異が検出されたか否かを選択する選択領域ＵＩｃ１を備える。また、グラフィカルユーザインタフェースＵＩｃは、第２の属性情報として、アクショナブル変異が検出されたか否か、生殖細胞変異が検出されたか否か、その他の変異が検出されたかを選択するための選択領域ＵＩｃ２を備える。
図３０（ｂ）には、遺伝子パネル検査の検査対象遺伝子において、生殖細胞変異が検出されていない場合のグラフィカルユーザインタフェースＵＩｄを示す。図３０（ｂ）の選択領域ＵＩｄ１は、図２０（ａ）の選択領域ＵＩｃ１と同様である。図３０（ｂ）の選択領域ＵＩｄ２は、生殖細胞変異に関する入力欄がない点を除き、図２０（ａ）の選択領域ＵＩｃ２と同様である。グラフィカルユーザインタフェースＵＩｃを表示するか、グラフィカルユーザインタフェースＵＩｄを表示するかは、検査情報管理装置Ｃ１１の制御部１００が、検査結果に基づいて判定する。生殖細胞変異の開示に患者が非同意の場合、生殖細胞変異が検出されたとしても、グラフィカルユーザインタフェースＵＩｄが表示されてもよい。
【０１６４】
臨床検査技師Ｔ１等は、図１３に示す入力部１０６であるマウス等を使って、各選択領域の該当するチェックボックスを選択する。
【０１６５】
図１３に示す入力部１０６からの入力は、図３０（ｃ）に示す検査管理テーブルの第１の属性情報、及び第２の属性情報の欄に記録される。
【０１６６】
また、図１３に示す入力部１０６からの属性情報の入力は、リスト形式の属性を示すラベルの選択肢から対応する属性情報を選択することにより行われてもよい。リスト形式の選択しとして、図３１に示すプルダウン形式のグラフィカルユーザインタフェースＵＩｅを例示できる。
【０１６７】
ここで、アクショナブル変異とは、一例として、「次世代シークエンサー等を用いた遺伝子パネル検査に基づくがん診療ガイダンス」に示される治療効果のエビデンスレベル分類の３Ａ以上が期待できる変異を意図する。治療効果のエビデンスレベル分類は、１Ａ、１Ｂ、２Ａ、２Ｂ、３Ａ、３Ｂ、４の７段階に分類される。「３Ａ以上」とは、１Ａ、１Ｂ、２Ａ、２Ｂ及び３Ａのいずれかに分類される変異であることを意図する。どのような遺伝子の変異が、どのようなエビデンスレベルに分類されるかに関する情報は、「次世代シークエンサー等を用いた遺伝子パネル検査に基づくがん診療ガイダンス」の別表２＿エビデンスレベル（２０１７年８月２１日時点）から、取得することができる。
【０１６８】
（２−２）第２の取得形態
属性情報の第２の取得形態は、検査情報管理装置Ｃ１１が図２７及び図２８に示す処理により検出した変異に基づいて、属性情報を取得する方法である。図３２〜図３４を用いて、検査情報管理装置Ｃ１１が属性情報を取得する処理を説明する。
【０１６９】
図３２のステップＳＴ５０１において、検査情報管理装置Ｃ１１は、図２７及び図２８に示す処理により取得された変異情報を取得する。変異情報は、例えば図３４（ａ）に示すように、検出結果テーブルＧとして、記憶装置１０３に記録される。例えば、図３４（ａ）では、検出結果テーブルＧは、次世代シーケンサーＣ１３から取得されたデータの識別情報を示す「データＩＤ」欄と、「検査依頼ＩＤ」欄と、検査結果を格納しているフォルダへのリンクが張られた「レポートへのリンク」欄と、変異が検出された遺伝子名を示す「検出された変異」欄と、遺伝子パネルＩＤを示す「パネルＩＤ」欄とを備える。
【０１７０】
図３２のステップＳＴ５０２において、検査情報管理装置Ｃ１１は、ステップＳＴ５０１で取得された、変異情報に基づいて、結果に変異が含まれているか否かを判定する。例えば、検査情報管理装置Ｃ１１の記憶装置１０３は、予め図３４（ｂ）に示す判定テーブルを記録している。
【０１７１】
図３４（ｂ）の判定テーブルＨは、遺伝子パネルＩＤごとに作成されている。ここでは遺伝子パネルＩＤがＰ００１の例を示す。図３４（ｂ）の判定テーブルＨは、Ｐ００１の遺伝子パネルで変異を検出しうる遺伝子名が、「第１の属性情報の対象となる変異」欄に記録されている。ここでは、遺伝子変異ａ、遺伝子変異ｂ、遺伝子変異ｃ、・・・遺伝子変異ｉ、遺伝子変異ｚについて第１の属性情報、すなわち変異の有無を検出することができる。第２の属性情報の対象となる遺伝子は、「アクショナブル変異」、「生殖細胞変異」、「その他の変異」に分かれて記録されている。ここでは、「アクショナブル変異」欄には、遺伝子変異ａ、遺伝子変異ｂが記録されており、「生殖細胞変異」欄には、遺伝子変異ｈ、遺伝子変異ｉが記録されており、「その他の変異」欄には、遺伝子変異ｖ、遺伝子変異ｗ、遺伝子変異ｘが記録されている。
【０１７２】
検査情報管理装置Ｃ１１は、図３２のステップＳＴ５０２において、ステップＳＴ５０１において記録した図３４（ａ）に示す検出結果テーブルＧの「検出された変異」欄に格納された遺伝子変異ａ及び遺伝子変異ｉが、図３４（ｂ）の判定テーブルＨの「第１の属性情報の対象となる変異」欄にあるか否かを判定する。
【０１７３】
もし図３４（ｂ）の判定テーブルＨの「第１の属性情報の対象となる変異」欄に、検出結果テーブルＧの「検出された変異」欄に格納された遺伝子変異がない場合には、図３２のステップＳＴ５０２はＹＥＳとなる。この場合、検査情報管理装置Ｃ１１は、図３２のステップＳＴ５０３に進み、図３０（ｃ）に示す検査管理テーブルＬの第１の属性情報の欄に、「変異無」のラベルを付与し記録する。
【０１７４】
図３４の例では、判定テーブルＨの「第１の属性情報の対象となる変異」欄に遺伝子変異ａ及び遺伝子変異ｉがあるため、図３２のステップＳＴ５０２はＮＯとなる。この場合、検査情報管理装置Ｃ１１は、図３２のステップＳＴ５０４に進み、図３０（ｃ）に示す検査管理テーブルＬの第１の属性情報の欄に、「変異有」のラベルを付与し記録する。次に、検査情報管理装置Ｃ１１は、図３３のステップＳＴ６０１に進む。
図３３では、第２の属性情報、すなわち変異の種類を判定する。
【０１７５】
次に、検査情報管理装置Ｃ１１は、図３３のステップＳＴ６０１において、変異があった遺伝子を特定する。変異があった遺伝子の特定は、図３２のステップＳＴ５０１において記録した図３４（ａ）に示す検出結果テーブルＧの「検出された変異」欄に格納された遺伝子変異ａ及び遺伝子変異ｉが、図３４（ｂ）の判定テーブルＨの「第２の属性情報の対象となる変異」欄のどの変異の欄にあるか検索する。
【０１７６】
図３４（ａ）に示す検出結果テーブルＧの「検出された変異」欄に格納された遺伝子が、図３４（ｂ）の判定テーブルＨの「アクショナブル変異」の欄にある場合には、図３３のステップＳＴ６０２はＹＥＳとなり、検査情報管理装置Ｃ１１は、図３３のステップＳＴ６０３へ進む。そして、図３０（ｃ）に示す検査管理テーブルの「第２の属性情報」の欄に「アクショナブル変異」があることを示すラベルを付し、これを記録する。
【０１７７】
図３０（ａ）に示す検出結果テーブルＧの「検出された変異」欄に格納された遺伝子が、図３４（ｂ）の判定テーブルＨの「アクショナブル変異」の欄にない場合（図３３のステップＳＴ６０２がＮＯの場合）、及び図３３のステップＳＴ６０３の後、検査情報管理装置Ｃ１１は、図３３のステップＳＴ６０４へ進む。
【０１７８】
図３４（ｂ）の判定テーブルＨの「生殖細胞変異」の欄にある場合には、図３３のステップＳＴ６０４はＹＥＳとなり、検査情報管理装置Ｃ１１は、図３３のステップＳＴ６０５へ進む。そして、図３０（ｃ）に示す検査管理テーブルの「第２の属性情報」の欄に「生殖細胞変異」があることを示すラベルを付し、これを記録する。
【０１７９】
図３４（ａ）に示す検出結果テーブルＧの「検出された変異」欄に格納された遺伝子が、図３４（ｂ）の判定テーブルＨの「生殖細胞変異」の欄にない場合（図３３のステップＳＴ６０４がＮＯの場合）、検査情報管理装置Ｃ１１は、図３３のステップＳＴ６０６へ進む。そして、図３３のステップＳＴ６０７において、図３０（ｃ）に示す検査管理テーブルの「第２の属性情報」の欄に「その他の変異」があることを示すラベルを付し、これを記録する。
【０１８０】
属性情報取得処理によって、検査管理テーブルＬに記録された属性情報は、図２０のステップＳＴ７０において、統合データ管理装置Ａに送信される。
【０１８１】
図３２に示すステップＳＴ５０１からステップＳＴ５０４及び図３３に示すステップＳＴ６０１からＳＴ６０７において、検査情報管理装置Ｃ１１の制御部１００は、図１４に示す属性情報取得部４として機能する。
【０１８２】
（３）レポート生成処理
検査情報管理装置Ｃ１１は、図２７及び図２８に示す処理により取得した検査結果の検査報告（レポート）を生成する。遺伝子パネル検査において、生殖細胞変異は、偶発的又は補足的に見つかる変異である。検査目的以外の核酸配列の変異を、本明細書において偶発的所見と呼ぶことがある。偶発的所見や補足情報について患者に伝えるか否かについては、変異が検出された遺伝子の種類、変異の種類、変異に関連して発症する疾患の重症度、治療の可能性、生殖細胞に関する情報の知得に関する患者、その親族の意向等を踏まえ熟考する必要がある。したがって、遺伝子パネル検査においては、通常検査の前に、生殖細胞に関する情報の知得に関する患者、その親族の意向を確認するインフォームドコンセント（ＩＣ）が取得される。
【０１８３】
本実施形態においては、患者のＩＣ情報に応じてレポートの様式を変更し得る。例えば、生殖細胞変異が検出された場合に、通常レポートＲ１の様式で解析報告書を生成するか、秘匿レポートＲ２に例示されるいずれかの様式でレポートを生成するかを選択することができる。
【０１８４】
図３５を用いて、通常レポートＲ１の様式の例を説明する。通常レポートＲ１の様式は、第１の領域であるサマリレポートの領域Ｓ（以下、「サマリレポート領域Ｓ」ともいう）と、第２の領域である詳細レポートの領域ＤＴ（以下、「詳細レポート領域ＤＴ」ともいう）を含む例である。サマリレポート領域Ｓは、さらに患者や検査内容に関する情報が示される検査依頼情報の一部を示す領域Ｓ１（以下、「依頼情報領域Ｓ１」ともいう）と、検出された全ての遺伝子変異のリストが示される領域Ｓ２（以下、「変異リスト領域Ｓ２」ともいう）を含む。詳細レポート領域Ｄには、第１の検体（腫瘍細胞を含む）に由来する核酸配列において検出された遺伝子とその変異の詳細情報が示される領域ＤＴ１（以下、「遺伝子変異情報領域ＤＴ１」ともいう）と、第２の検体（非腫瘍細胞を含む）に由来する核酸配列において生殖細胞変異が検出された遺伝子とその変異の詳細情報が示される領域ＤＴ２（以下、「生殖細胞変異情報領域ＤＴ２」ともいう）を含む。
【０１８５】
図３５において、属性情報領域Ｓ１には、患者識別子（ＩＤ）、担当医名、医療施設名等の患者を識別するための情報や、遺伝子パネル等の検査項目を示す情報等が表示されうる。遺伝子変異リスト領域Ｓ２には、体細胞変異であるか生殖細胞変異であるかを問わず、検出された全ての遺伝子の変異が示され得る。図３５に示される遺伝子変異リスト領域Ｓ２の例において、ＥＧＦＲ、ＢＲＡＦ、ＢＲＣＡ１は遺伝子名を示し、Ｌ５８５Ｒ、Ｖ６００Ｅ、Ｋ１１８３Ｒは変異部位を示す。したがって、ＥＧＦＲ＿Ｌ５８５Ｒは、ＥＧＦＲ遺伝子の５８５番目のアミノ酸のコドンがロイシン（Ｌ）をコードする核酸配列からアルギニン（Ｒ）をコードする核酸配列に変異していることを示す。
サマリレポート領域Ｓは、患者、担当医、遺伝子解析のエキスパート等に示され得る領域である。
【０１８６】
遺伝子変異情報領域ＤＴ１には、変異が検出された遺伝子名、変異識別子（ＩＤ）、変異が検出された遺伝子のローカス番号（染色体番号：ＣＲＯＭと変異位置：ＰＯＳを含む）、参照配列の核酸配列（ＲＥＦ）、検出された変異配列（ＡＬＴ）、解析報告書において検出された変異を示す際のアノテーション等の情報を含み得る。
【０１８７】
生殖細胞変異情報領域ＤＴ２には、変異が検出された遺伝子名、変異識別子（ＩＤ）、変異が検出された遺伝子のローカス番号（染色体番号：ＣＲＯＭと変異位置：ＰＯＳを含む）、参照配列の核酸配列（ＲＥＦ）、検出された変異配列（ＡＬＴ）、解析報告書において検出された変異を示す際のアノテーション等の情報を含み得る。
詳細レポート領域ＤＴは、少なくとも遺伝子解析のエキスパートには提示されうる。詳細レポート領域ＤＴは、患者や担当医には提示されなくてもよい。
【０１８８】
図３５の例では、生殖細胞変異情報領域ＤＴ２に、ＢＲＣＡ１遺伝子に生殖細胞変異である「ＢＲＣＡ１＿Ｋ１１８３Ｒ」があることが示されており、また、サマリレポート領域Ｓの遺伝子変異リスト領域Ｓ２にも「ＢＲＣＡ１＿Ｋ１１８３Ｒ」が示されている。言い換えると図３５に示される通常レポートＲ１では、遺伝子変異リスト領域Ｓ２に示された生殖細胞変異である「ＢＲＣＡ１＿Ｋ１１８３Ｒ」が患者に提示されることとなる。
【０１８９】
図３６に秘匿レポートＲ２の様式の例を示す。秘匿レポートＲ２は通常レポートＲ１と同様にサマリレポート領域Ｓと、詳細レポート領域ＤＴを含む。しかし、生殖細胞変異が検出された場合であっても、サマリレポート領域Ｓと、詳細レポート領域ＤＴに生殖細胞変異に関する情報を示さない例である。例えば、秘匿レポートＲ２の様式では、変異リスト領域Ｓ２に、生殖細胞変異である「ＢＲＣＡ１＿Ｋ１１８３Ｒ」に関する情報は記載されない。また、詳細レポート領域ＤＴにも、生殖細胞詳細情報である「ＢＲＣＡ１＿Ｋ１１８３Ｒ」の詳細情報は記載されない。秘匿レポートＲ２は、サマリレポート領域Ｓと詳細レポート領域ＤＴとの両方に、生殖細胞変異に関する情報を提示しない例である。ここで秘匿レポートは、サマリレポート領域Ｓのみに生殖細胞変異に関する情報を提示しないフォームであってもよい。
【０１９０】
検査情報管理装置Ｃ１１は、図３７のステップＳＴ１４１において、臨床検査技師Ｔ１またはバイオインフォマティシャンＴ２が図１３の入力部１０６から入力したレポート出力要求を受け付ける。検査情報管理装置Ｃ１１は、図３７のステップＳＴ１４２において、図２８のステップＳＴ３０４において、生殖細胞変異があると判定した場合（図３７のステップＳＴ１４２が「Ｙｅｓ」の場合）、図３７のステップＳＴ１４３に進む。図３７のステップＳＴ１４３において、検査情報管理装置Ｃ１１は、図２４に示す検査管理テーブルＬの「患者の同意」欄を参照し、患者が生殖細胞変異の開示に同意していない場合は、生殖細胞変異に関する情報の秘匿が「要」である（図３７のステップＳＴ１４３が「Ｙｅｓ」）と判定する。図２４に示す検査管理テーブルＬの「患者の同意」欄において、患者が生殖細胞変異の開示に同意している場合には、検査情報管理装置Ｃ１１は、生殖細胞変異に関する情報の秘匿が「不要」である（図３７のステップＳＴ１４３が「Ｎｏ」）と判定する。
【０１９１】
図３７のステップＳＴ１４３が「Ｙｅｓ」の場合、検査情報管理装置Ｃ１１は、ステップＳＴ１４４に進み、フォーム選択部９を介してフォームデータベース１７から図３６に示す秘匿レポートＲ２の様式を呼び出し、レポートを生成する。
【０１９２】
図３７のステップＳＴ１４３が「Ｎｏ」の場合、検査情報管理装置Ｃ１１は、ステップＳＴ１４５に進み、フォーム選択部９を介してフォームデータベース１７から図３５に示す通常レポートＲ１の様式を呼び出し、レポートを生成する。
レポート生成後は、検査情報管理装置Ｃ１は図２０のステップＳＴ７４へ進む。図３７に示すステップＳＴ１４１から１４５において、検査情報管理装置Ｃ１１の制御部１００は、図１４に示すレポート生成部５として機能する。
【０１９３】
８−３．検査依頼リストからのレポート出力処理
図２０のステップＳ３８において、マスターテーブルＭに検査結果を記録した後、統合データ管理装置Ａは、検査依頼リストに張られたリンクから、レポートの様式を選択し、出力してもよい。
【０１９４】
図３８にレポートの様式選択へのリンクが表示された検査依頼リスト領域ＵＩ１の例を示す。例えば、図３８に示す検査依頼リスト領域ＵＩ１の検査Ｔ０２には、結果の属性情報として「変異有」、「生殖細胞変異」が表示されている。上述の通り、生殖細胞変異が確認された場合には、患者のＩＣ情報に基づいてレポートを出力する必要がある。このため、検査依頼リスト領域ＵＩ１の「ＩＣ情報」の領域に、患者ＩＣ情報が登録されていることを示す「登録済」のラベルが表示される。また、「患者情報」の領域にはレポートのフォームを選択するための「様式選択」のラベルが表示される。
【０１９５】
統合データ管理装置Ａからレポートを出力する場合、各レポートのフォームは、統合データベースＯＧに格納されている。
【０１９６】
図３９に、統合データ管理装置Ａの制御部１００Ａによるレポート生成処理の流れを示す。
【０１９７】
制御部１００Ａは、ステップＳＴ１５１において、マスターテーブルＭの、レポートを作成しようとする患者の検査依頼に対応する欄に第２の属性情報として「生殖細胞変異」のラベルが記録されているかを判定する。「生殖細胞変異」のラベルが記録されている場合（ステップＳＴ１５１において「Ｙｅｓ」の場合）には、ステップＳＴ１５２に進む。
【０１９８】
制御部１００Ａは、ステップＳＴ１５２において、マスターテーブルＭの、レポートを作成しようとする患者の検査依頼に対応する欄に患者ＩＣ情報が記録されているかを判定する。患者ＩＣ情報が記録されている場合（ステップＳＴ１５２において「Ｙｅｓ」の場合）、ステップＳＴ１５３に進む。
【０１９９】
制御部１００Ａは、ステップＳＴ１５３において、図３８に示す検査依頼リスト領域ＵＩ１の、レポートを作成しようとする患者の検査依頼に対応する欄に患者ＩＣ情報へのリンクを出力する。
【０２００】
また、制御部１００Ａは、図３９のステップＳＴ１５４において、図３８に示す検査依頼リスト領域ＵＩ１の、レポートを作成しようとする患者の検査依頼に対応する欄に、レポート様式選択画面へのリンクを出力する。
【０２０１】
ユーザは、ＩＣ情報のリンクからレポートを作成しようとする患者のＩＣ情報を表示することができ、患者が偶発的所見の結果の知得を希望しているか知ることができる。また、ユーザは、患者のＩＣ情報に併せてレポートのフォームを選択することができる。
【０２０２】
制御部１００Ａは、図３９のステップＳＴ１５５において、ユーザによる様式選択画面へのリンクの選択を受け付け、図４０に示すフォーム選択ダイアログを出力する。
【０２０３】
ユーザが図４０のダイアログ内の「Ｎｏ」アイコンＷ２３を選択すると、図３６に示す秘匿レポートＲ２の様式が選択される。ユーザが図４０のダイアログ内の「Ｙｅｓ」アイコンＷ２４を選択すると、図３５に示す通常レポートＲ１の様式が選択される。
【０２０４】
制御部１００Ａは、図３９のステップＳＴ１５６において、ユーザによる図４０に示す「Ｎｏ」アイコンＷ２３又は「Ｙｅｓ」アイコンＷ２４の選択を受け付け、ステップＳＴ１５７において選択されたフォームでレポートを出力する。
【０２０５】
８−４．検査依頼リストの表示と専門家会議設定
図２１に戻りシステム１０００の動作の続きを説明する。
図２１及び図２２に示すシステムの動作は、統合データ管理装置Ａと、医療施設Ｂ１の専門家会議端末Ｂ１５，Ｂ２５，Ｂ３５、検査施設Ｃ１の専門家会議端末Ｃ１５、専門家会議端末ＳＰ１１、及び事務局専門家会議端末ＳＰ１５との間の通信となる。
【０２０６】
図１３から図１８、図２０及び図２１を用いて、システム１０００における検査依頼リストの表示処理と専門家会議の設定処理について説明する。医療施設Ｂ１の専門家会議端末Ｂ１５と、医療施設Ｂ２の専門家会議端末Ｂ２５と、医療施設Ｂ３の専門家会議端末Ｂ３５は、処理内容が同じであるため、医療施設Ｂ１の専門家会議端末Ｂ１５を用いて処理を説明する。
【０２０７】
担当医Ｈ１ａが遺伝子パネル検査を依頼した患者の検査結果を表示する場合には、医療施設Ｂ１に備えられた医療施設Ｂ１の専門家会議端末Ｂ１５から、ブラウザソフトを介して、統合データ管理装置Ａにアクセスする。図２１のステップＳＴ８１において、図１５に示す医療施設Ｂ１の専門家会議端末Ｂ１５の制御部１００Ｘ（以下、単に「医療施設Ｂ１の専門家会議端末Ｂ１５」とする）は、入力部１０６Ｘを介して担当医Ｈ１ａから、図３に示す検査依頼リスト領域ＵＩ１の表示要求を受け付ける。そしてＩ／Ｆ部１０５Ｘを介して、統合データ管理装置Ａに検査依頼リスト領域ＵＩ１の表示要求を送信する。このとき、制御部１００Ｘは、図１６に示す検査依頼リスト表示要求部Ｘ５として機能する。
【０２０８】
統合データ管理装置Ａは、図２１に示すステップＳＴ３９において、医療施設Ｂ１の専門家会議端末Ｂ１５からの表示要求を受け付ける。続いて、統合データ管理装置Ａは、図２１に示すステップＳＴ４０において図３に示す検査依頼リスト領域ＵＩ１を出力する。このとき制御部１００Ａは、図６に示す検査依頼リスト出力部Ａ１９として機能する。
【０２０９】
医療施設Ｂ１の専門家会議端末Ｂ１５は、ステップＳＴ８２において、ディスプレイ等の出力部１０７Ｘに統合データ管理装置Ａから出力された図３に示す検査依頼リスト領域ＵＩ１をブラウザソフトを介して表示する。このとき、制御部１００Ｘは、図１６に示す検査依頼リスト出力部Ｘ７として機能する。
【０２１０】
担当医Ｈ１ａは、医療施設Ｂ１の専門家会議端末Ｂ１５から専門家会議のスケジュールを設定する。医療施設Ｂ１の専門家会議端末Ｂ１５は、ステップＳＴ８３において、担当医Ｈ１ａによる図１５に示す入力部１０６Ｘからの会議スケジュールの設定を受け付ける。このとき、制御部１００Ｘは、図１６に示すスケジュール設定部Ｘ１として機能する。専門家会議の設定処理の詳細は、後述する。
【０２１１】
統合データ管理装置Ａは、図２１に示すＳＴ４１においてスケジュール設定処理を行う。スケジュール設定処理の詳細は、後述する。このとき制御部１００Ａは、図６に示すスケジュール受信部Ａ２０として機能する。
【０２１２】
続いて、統合データ管理装置Ａは、図２１のステップＳＴ４２において、設定された専門家会議スケジュールを出力する。この出力は、例えば、メールソフトを使用した、専門家会議の各参加者への専門家会議スケジュールの送信である。このとき制御部１００Ａは、図６に示すスケジュール出力部Ａ２１として機能する。
【０２１３】
統合データ管理装置Ａから送信された専門家会議スケジュールのメールは、図２１のステップＳＴ８４において、医療施設Ｂ１の専門家会議端末Ｂ１５のメールソフトが受信する。このとき、制御部１００Ｘは、図１６に示すスケジュール受信部Ｘ３として機能する。また、図２１のステップＳＴ１０１において、専門家会議端末ＳＰ１１のメールソフトも専門家会議スケジュールのメールを受信する。このとき、図１５に示す制御部１００Ｙは、図１７に示すスケジュール受信部Ｙ１として機能する。
【０２１４】
専門家会議に先立ち、専門家会議の各参加者は、専門家会議において検討される患者の検査依頼リストを、各専門会議端末に表示することができる。
【０２１５】
以下において、医療施設Ｂ１の専門家会議端末Ｂ１５と専門家会議端末ＳＰ１１は、同様の処理により検査依頼リストを表示することができる。
【０２１６】
医療施設Ｂ１の専門家会議端末Ｂ１５と統合データ管理装置Ａとの間の通信の例を先に説明する。
【０２１７】
担当医Ｈ１ａは、医療施設Ｂ１に備えられた医療施設Ｂ１の専門家会議端末Ｂ１５から、ブラウザソフトを介して、統合データ管理装置Ａにアクセスする。
【０２１８】
図２１のステップＳＴ８５において、図１５に示す医療施設Ｂ１の専門家会議端末Ｂ１５は、入力部１０６Ｘから担当医Ｈ１ａから、図３に示す検査依頼リスト領域ＵＩ１の表示要求を受け付ける。そしてＩ／Ｆ部１０５Ｘを介して、統合データ管理装置Ａに検査依頼リスト領域ＵＩ１の表示要求を送信する。このとき、制御部１００Ｘは、図１６に示す検査依頼リスト表示要求部Ｘ５として機能する。
【０２１９】
統合データ管理装置Ａは、図２１に示すステップＳＴ４３において、医療施設Ｂ１の専門家会議端末Ｂ１５からの表示要求を受け付け、図３に示す検査依頼リスト領域ＵＩ１を出力する。このとき制御部１００Ａは、図６に示す検査依頼リスト出力部Ａ１９として機能する。
【０２２０】
医療施設Ｂ１の専門家会議端末Ｂ１５は、ステップＳＴ８６において、ディスプレイ等の出力部１０７Ｘに統合データ管理装置Ａから出力された図３に示す検査依頼リスト領域ＵＩ１をブラウザソフトを介して表示する。このとき、制御部１００Ｘは、図１６に示す検査依頼リスト出力部Ｘ７として機能する。
【０２２１】
各参加者は、自らが担当する専門家会議において担当する特定の検査依頼について、表示を要求することができる。例えば、検査依頼リストにソーティング機能や抽出機能を設け、専門家会議の「開催日時」により検査依頼リストを並べ替えたり、自らが参加する専門家会議の「グループＩＤ」で担当検査依頼を抽出してもよい。図２２に示すステップＳＴ８８は、このような特定の検査依頼の表示要求を医療施設Ｂ１の専門家会議端末Ｂ１５が行うステップである。このステップにおいて、制御部１００Ｘは、検査依頼リスト表示要求部Ｘ５として機能する。
【０２２２】
統合データ管理装置Ａは、図２２に示すステップＳＴ４５において、医療施設Ｂ１の専門家会議端末Ｂ１５からの表示要求を受け付け、図３に示す検査依頼リスト領域ＵＩ１から特定の検査依頼を出力する。このとき制御部１００Ａは、図６に示す検査依頼リスト出力部Ａ１９として機能する。特定の検査依頼の出力処理は後述する。
【０２２３】
医療施設Ｂ１の専門家会議端末Ｂ１５は、ステップＳＴ８９において、ディスプレイ等の出力部１０７Ｘに統合データ管理装置Ａから出力された図３に示す検査依頼リスト領域ＵＩ１をブラウザソフトを介して表示する。このとき、制御部１００Ｘは、図１６に示す特定検査依頼リスト出力部Ｘ９として機能する。
【０２２４】
医療施設Ｂ１の専門家会議端末Ｂ１５は、専門家会議において、図１５に示す入力部１０６Ｘからの担当医Ｈ１ａによる会議内容の入力を受け付ける（ステップＳＴ９０）。このとき制御部１００Ｘは、図１６に示す会議内容取得部Ｘ１７として機能する。続いて、ステップＳＴ９１において、医療施設Ｂ１の専門家会議端末Ｂ１５がステップＳＴ９０で受け付けた会議内容を統合データ管理装置Ａに送信する。このとき制御部１００Ｘは、図１６に示す会議内容出力部Ｘ１９として機能する。
【０２２５】
統合データ管理装置Ａは、ステップＳＴ４６において、医療施設Ｂ１の専門家会議端末Ｂ１５から送信された会議内容を受信し、ステップＳＴ４７において会議内容を検査依頼ＩＤや患者情報と対応づけて統合データベースＯＧに記録し、マスターテーブルを更新する。
【０２２６】
検査施設Ｃ１の専門家会議端末Ｃ１５、外部施設ＳＰ１の専門家会議端末ＳＰ１１、事務局専門家会議端末ＳＰ１５は、図２１及び図２２のステップＳＴ１０１からＳＴ１０７において、医療施設Ｂ１の専門家会議端末Ｂ１５が行うステップＳＴ８４からＳＴ９１と同様の処理を行う。
【０２２７】
ここで、検査施設Ｃ１の専門家会議端末Ｃ１５、外部施設ＳＰ１の専門家会議端末ＳＰ１１が行う処理については、図１５に示す医療施設Ｂ１の専門家会議端末Ｂ１５の制御部１００Ｘ、Ｉ／Ｆ部１０５Ｘ、入力部１０６Ｘ、出力部１０７Ｘは、図１５に示す検査施設Ｃ１の専門家会議端末Ｃ１５又は専門家会議端末ＳＰ１１の制御部１００Ｙ、Ｉ／Ｆ部１０５Ｙ、入力部１０６Ｙ、出力部１０７Ｙと読み替えるものとする。また、図１６に示す医療施設Ｂ１の専門家会議端末Ｂ１５の制御部１００Ｘの機能を示す、スケジュール受信部Ｘ３、検査依頼リスト表示要求部Ｘ５、検査依頼リスト出力部Ｘ７、特定検査依頼リスト出力部Ｘ９は、それぞれ図１７に示すスケジュール受信部Ｙ１、検査依頼リスト表示要求部Ｙ３、検査依頼リスト出力部Ｙ５、特定検査依頼リスト出力部Ｙ７と読み替えるものとする。
【０２２８】
事務局専門家会議端末ＳＰ１５が行う処理については、図１５に示す医療施設Ｂ１の専門家会議端末Ｂ１５の制御部１００Ｘ、Ｉ／Ｆ部１０５Ｘ、入力部１０６Ｘ、出力部１０７Ｘは、図１５に示す事務局専門家会議端末ＳＰ１５の制御部１００Ｚ、Ｉ／Ｆ部１０５Ｚ、入力部１０６Ｚ、出力部１０７Ｚと読み替えるものとする。また、図１６に示す医療施設Ｂ１の専門家会議端末Ｂ１５の制御部１００Ｘの機能を示す、スケジュール受信部Ｘ３、検査依頼リスト表示要求部Ｘ５、検査依頼リスト出力部Ｘ７、特定検査依頼リスト出力部Ｘ９、会議内容取得部Ｘ１７、会議内容出力部Ｘ１９は、図１８に示す、スケジュール受信部Ｚ１、検査依頼リスト表示要求部Ｚ３、検査依頼リスト出力部Ｚ５、特定検査依頼リスト出力部Ｚ７、会議内容取得部Ｚ１３、会議内容出力部Ｚ１５と読み替えるものとする。
【０２２９】
（１）専門家会議設定
図４１から図４６を用いて専門家会議を設定するためのグラフィカルユーザインタフェースＵＩ、図２１に示すステップＳＴ４０の検査依頼リスト出力処理、ステップＳＴ８３の専門家会議の設定処理、及びステップＳＴ４１のスケジュール設定処理の詳細について説明する。
【０２３０】
（１−１）グラフィカルユーザインタフェース
図４１には、専門家会議を設定可能な、グラフィカルユーザインタフェースＵＩの例を示す。検査依頼リスト領域ＵＩ１の「設定状況」の領域には、専門家会議のスケジュールが設定されているか否かを示す「設定済」又は「未設定」のラベルが表示されている。また、専門家会議のスケジュールが設定されている場合には、「開催日時」の領域に設定された日時が表示される。専門家会議のスケジュールが設定されていない場合には、「開催日時」の領域には「−」が示されている。
【０２３１】
（１−２）ダイアログ表示
図４２は、統合データ管理装置Ａが、図４１に示すグラフィカルユーザインタフェースＵＩの「設定状況」の欄に専門家会議を設定するためのダイアログへのリンクを表示する処理を示す。
【０２３２】
図４２のステップＳＴ２２１において、統合データ管理装置Ａは、専門家会議の設定状況が未設定であるか否かを判定する。この判定は、図７に示すマスターテーブルＭの各検査依頼ＩＤの「開催日時」欄に開催日時が入力されているか否かで判定することができる。
【０２３３】
図４２のステップＳＴ２２２において、統合データ管理装置Ａは、図７に示すマスターテーブルＭの「開催日時」欄に開催日が記録されていない場合（ステップＳＴ２２１が「Ｙｅｓ」の場合）、図４１に示すグラフィカルユーザインタフェースＵＩの「設定状況」の欄に「未設定」のラベルを出力する。「未設定」のラベルには、図４５に示すダイアログＵＩ５、又は図４６に示すダイアログＵＩ７を出力するためのリンクが張られている。
【０２３４】
図４５に示すダイアログＵＩ５には、会議スケジュールデータベースＳＤＢにあらかじめ格納されている会議スケジュールの空き枠の日時と、空き枠の日時内で設定可能な件数と、担当医Ｈ１ａが図１５に示す医療施設Ｂ１の専門家会議端末Ｂ１５の入力部１０６Ｘから選択可能なチェックボックスが表示され得る。また、図４６に示すダイアログＵＩ７には、患者氏名、性別、生年月日等の患者を特定するための患者特定情報を表示する領域ＵＩ７１と、専門家会議に参加するメンバーのリストを表示する領域ＵＩ７３と、専門家会議のスケジュール設定を行う領域ＵＩ７５と、担当医Ｈ１ａの選択により、設定を確定し、会議の各参加者にメールで会議が設定されたことを通知する会議通知アイコンＵＩ７７が表示され得る。
【０２３５】
患者氏名、性別、生年月日等は、図７に示すマスターテーブルＭの対応する領域から読み込まれる。専門家会議に参加するメンバーのリストは、図７に示すマスターテーブルＭの「グループＩＤ」の領域にリンクする専門家会議グループテーブルＧＴ（図９）から読み込まれる。専門家会議のスケジュール設定を行う領域ＵＩ７５は図４５に対応する。
【０２３６】
（１−３）医療施設の専門家会議端末側
図４３を用いて、図２１に示すステップＳＴ８３における専門家会議設定処理の具体的なステップを説明する。
【０２３７】
医療施設Ｂ１の専門家会議端末Ｂ１５は、図４３に示すステップＳＴ２３１において、統合データ管理装置Ａが図４１のステップＳＴ２２２で出力した専門家会議の設定ダイアログへのリンクを含む「未設定」のラベルをブラウザソフトを使用して表示する。
【０２３８】
医療施設Ｂ１の専門家会議端末Ｂ１５は、図４３に示すステップＳＴ２３２において、担当医Ｈ１ａによる入力部１０６Ｘからの前記リンクの選択を受け付けたかを判定する。
【０２３９】
医療施設Ｂ１の専門家会議端末Ｂ１５は、図４３に示すステップＳＴ２３２において専門家会議の設定ダイアログへのリンクの選択を受け付けた場合（「Ｙｅｓ」の場合）には、ステップＳＴ２３３へ進み、医療施設Ｂ１の専門家会議端末Ｂ１５のディスプレイ等の出力部１０７Ｘに図４５に示すダイアログＵＩ５又は図４６に示すダイアログＵＩ７を表示する。図４３に示すステップＳＴ２３２において専門家会議の設定ダイアログへのリンクの選択を受け付けていない場合（「Ｎｏ」の場合）には、待機する。
【０２４０】
医療施設Ｂ１の専門家会議端末Ｂ１５は、図４３に示すステップＳＴ２３４において、担当医Ｈ１ａによる入力部１０６Ｘからのスケジュールの選択を受け付ける。スケジュールの選択の受け付けは、担当医Ｈ１ａが入力部１０６Ｘから専門家会議の開始を希望する日時の選択用チェックボックスをチェックし、これを医療施設Ｂ１の専門家会議端末Ｂ１５が受け付けることにより行われる。
【０２４１】
図４３に示すステップＳＴ２３５において、医療施設Ｂ１の専門家会議端末Ｂ１５は、ステップＳＴ２３４において受け付けた情報を統合データ管理装置Ａに送信する。ステップＳＴ２３５におけるステップＳＴ２３４において受け付けた情報の送信は、図４５に示すチェックボックスを担当医Ｈ１ａが選択した時点で、医療施設Ｂ１の専門家会議端末Ｂ１５がこれを受け付けると同時に、統合データ管理Ａにその情報を送信してもよい。また、図４６に示すチェックボックスを担当医Ｈ１ａが選択し、会議通知アイコンＵＩ７７をさらに担当医Ｈ１ａが選択した時点で、医療施設Ｂ１の専門家会議端末Ｂ１５が、統合データ管理装置Ａにその情報を送信してもよい。
【０２４２】
（１−４）統合データ管理装置側
次に、図４４を用いて、図２１に示すステップＳＴ４１のスケジュール設定処理の具体的なステップを説明する。
【０２４３】
統合データ管理装置Ａは、図４４のステップＳＴ２４１において、医療施設Ｂ１の専門家会議端末Ｂ１５のブラウザ上から、専門家会議の設定ダイアログへのリンクが選択されたことを受け付けたか否かを判定する。医療施設Ｂ１の専門家会議端末Ｂ１５から、前記リンクの選択を受け付けた場合（図４４のステップＳＴ２４１が「Ｙｅｓ」の場合）には、統合データ管理装置Ａは、ステップＳＴ２４２へ進み、会議スケジュールデータベースＳＤＢから空き枠のあるスケジュールを取得する。次に、統合データ管理装置Aは、ステップＳＴ２４３へ進み、医療施設Ｂ１の専門家会議端末Ｂ１５にスケジュールの空き枠情報を含む図４５に示すダイアログＵＩ５又は図４６に示すダイアログＵＩ７を出力する。
【０２４４】
統合データ管理装置Ａは、図４４のステップＳＴ２４４において、医療施設Ｂ１の専門家会議端末Ｂ１５が送信した、担当医Ｈ１ａが選択したスケジュール情報を受け付け、ステップＳＴ２４５において、会議スケジュールデータベースＳＤＢに記録する。専門家会議が設定されると、統合データ管理装置Ａは、図４１に示す検査依頼リスト領域ＵＩ１の「設定状況」の欄に「設定済」のラベルを表示する。また、「開催日時」の欄に設定した専門家会議のスケジュールを表示する。
【０２４５】
（２）品質情報へのリンク
統合データ管理装置Ａは、図２１に示すステップＳＴ４３の検査依頼リスト出力処理において、図４７に示すように、検査依頼リスト領域ＵＩ１に品質情報を出力してもよい。遺伝子パネル検査において変異が検出されなかった場合、検体から適切に核酸が得られていたのか等の検体の品質に関する情報や、シーケンシングにおける反応に問題がなかったか等の検査の品質に関する情報を考慮した上で、図２７に示すステップＳＴ２０８における体細胞変異無しの判定や、図２８に示すステップＳＴ３０７における生殖細胞変異無しの判定が妥当であったか否かを、専門家会議において評価する必要がある。図４７に示すグラフィカルユーザインタフェースＵＩの表示例は専門家会議において検体や検査の適性を検討する上で有用である。
【０２４６】
図４８に、図２１に示すステップＳＴ４３の検査依頼リスト出力処理における、図４７のグラフィカルユーザインタフェースＵＩの表示処理を示す。
【０２４７】
（２−１）統合データ管理装置側
統合データ管理装置Ａは、専門家会議において検討の対象となる患者の検査依頼ＩＤに対応するマスターテーブルＭ内の図４８に示すステップＳＴ２５１において、図７に示すマスターテーブルＭの「第１の属性情報」の領域に変異がなかったことを示す「変異無」のラベルがあるか否かを判定する。
【０２４８】
統合データ管理装置Ａは、図４８に示すステップＳＴ２５１において、「変異無」のラベルがあると判定した場合（「Ｙｅｓ」の場合）、ステップＳＴ２５２に進む。
【０２４９】
次に、統合データ管理装置Ａは、図４８のステップＳＴ２５２において、検査及び検体の品質情報が取得され、図７に示すマスターテーブルＭの「品質情報」の欄に、検査及び検体の品質情報が記録されているかを確認する。
【０２５０】
統合データ管理装置Ａは、図４８のステップＳＴ２５２において、検査及び検体の品質情報が取得されていた場合（「Ｙｅｓ」の場合）、ステップＳＴ２５３に進む。
【０２５１】
統合データ管理装置Ａは、ステップＳＴ２５３において、図４７に示す検査依頼リスト領域ＵＩ１の「品質情報」の欄に出力する、品質情報が登録されていることを示す「登録済」のラベルに、図７に示すマスターテーブルＭの「品質情報」の欄へのリンクを生成する。検査依頼リスト領域ＵＩ１の「品質情報」の欄とマスターテーブルＭの「品質情報」の欄との対応は、検査依頼ＩＤや、検査依頼ＩＤに対応している検体ＩＤにより行うことができる。
【０２５２】
統合データ管理装置Ａは、図４８のステップＳＴ２５４において、ステップＳＴ２５３において生成したリンクが張られた「登録済」のラベルを出力する。
【０２５３】
統合データ管理装置Ａは、後述する検査施設Ｃ１の専門家会議端末Ｃ１５等からの、ステップＳＴ２５４において出力したリンクが張られたラベルへのアクセスを待って、図４８のステップＳＴ２５５において、リンク先の品質情報を出力する。
【０２５４】
（２−２）専門家会議端末側
専門家会議において、検査施設Ｃ１の臨床検査技師Ｔ１やバイオインフォマティシャンＴ２が主体となって、品質情報を元に遺伝子パネル検査の品質を評価する。
【０２５５】
図２１に示すステップＳＴ１０３において、専門家会議に参加する臨床検査技師Ｔ１やバイオインフォマティシャンＴ２が、検査依頼リスト領域ＵＩ１から品質情報を表示する際には、検査施設Ｃ１の専門家会議端末Ｃ１５は、図４９に示すステップＳＴ２６１において、ブラウザソフトを使って図１５に示すディスプレイ等の出力部１０７Ｙに表示された検査依頼リスト領域ＵＩ１の品質情報の欄に、統合データ管理装置Ａが、図４８のステップＳＴ２５４において出力したリンクが張られた「登録済」のラベルを表示する。
【０２５６】
図４９に示すステップＳＴ２６２において、検査施設Ｃ１の専門家会議端末Ｃ１５は、図１５に示す入力部１０６Ｙから、図４８のステップＳＴ２５４において表示したラベルの選択を受け付ける。入力部１０６Ｙからの入力は、臨床検査技師Ｔ１やバイオインフォマティシャンＴ２が行う。
【０２５７】
図４９に示すステップＳＴ２６３において、検査施設Ｃ１の専門家会議端末Ｃ１５は、統合データ管理装置Ａが、図４８のステップＳＴ２５５において出力したリンク先の品質情報を表示する。
【０２５８】
（３）外部データベースへのリンク
遺伝子パネル検査の結果、「アクショナブル変異」や「その他の変異」の第２の属性情報が付された場合には、変異が検出された遺伝子の種類や変異の部位等に応じて、専門家会議において、治療方法等に関する情報を外部データベースから検査する場合がある。
【０２５９】
統合データ管理装置Ａは、図２１に示すステップＳＴ４３の検査依頼リスト出力処理において、第２の属性情報に応じて、図５０に示すように、検査依頼リスト領域ＵＩ１の検査結果が登録されたことを示す「結果登録」と、外部情報データベース（ＤＢ）へのリンクを表示する「情報ＤＢ」の欄を出力してもよい。
【０２６０】
「結果登録」の欄には、図７に示すマスターテーブルＭの「検査結果」の欄に検査結果が登録されたことを示し、かつマスターテーブルＭの「検査結果」の欄にリンクが張られた「登録済」のラベルが表示される。図５０に示す検査依頼リスト領域ＵＩ１の「結果登録」欄と、図７に示すマスターテーブルＭの「検査結果」欄の紐付けは、検査依頼ＩＤや検査依頼ＩＤに対応する検体ＩＤにより行うことができる。
【０２６１】
「情報ＤＢ」の欄には、薬剤情報データベースサーバＦ１１へのリンクが張られている「薬剤ＤＢ」のラベルと、治験データベースサーバＦ２１へのリンクが張られている「治験ＤＢ」のラベルと、論文データベースサーバＦ３１へのリンクが張られている「論文ＤＢ」のラベルとが、第２の属性情報に応じて表示されうる。
【０２６２】
このような情報データベースへのリンクを表示することで、専門家会議への参加者が、検査依頼リスト領域ＵＩ１から、検討対象患者の遺伝子の変異情報に関する情報へアクセスすることができ、利便性が高まる。
【０２６３】
（３−１）統合データ管理装置側
図５１に、統合データ管理装置Ａにおける外部データベースへのリンクの生成処理とリンクの出力処理を示す。
【０２６４】
統合データ管理装置Ａは、図５１のステップＳＴ２７１において、図７に示すマスターテーブルＭの「検査結果」の欄に検査結果が記録されたか否かを判定する。
【０２６５】
図５１のステップＳＴ２７１において「検査結果」が記録されていない場合（「Ｎｏ」の場合）には、統合データ管理装置Ａは、マスターテーブルＭに「検査結果」が記録されるまで、待機する。これは、外部データベースにおける情報検索が、具体的な遺伝子名や変異部位に基づいて行われるため、詳細な検査結果が登録される前に、外部データベースへのリンクを表示しても情報検索ができないためである。
【０２６６】
図５１のステップＳＴ２７１において「検査結果」が記録されている場合（「Ｙｅｓ」の場合）には、統合データ管理装置Ａは、ステップＳＴ２７２に進み、図５０の検査依頼リスト領域ＵＩ１の「結果登録」欄に「登録済」ラベルを出力する。
【０２６７】
続いて、統合データ管理装置Ａは、図５１のステップＳＴ２７３に進み、図７に示すマスターテーブルＭの「第１の属性情報」の欄を参照する。統合データ管理装置Ａは、「第１の属性情報欄」に「変異有」ラベルがある場合（図５１のステップＳＴ２７３が「ＹＥＳ」の場合）には、図５１のステップＳＴ２７４に進む。統合データ管理装置Ａは、「第１の属性情報欄」に「変異有」ラベルがない場合（図５１のステップＳＴ２７３が「ＮＯ」の場合）には、処理を終了する。
【０２６８】
図５１のステップＳＴ２７４において、統合データ管理装置Ａは、図７に示すマスターテーブルＭの「第２の属性情報」を参照し、「第２の属性情報」の欄に「アクショナブル変異」及び／又は「生殖細胞変異」のラベルがあるか否かを判定する。図５１のステップＳＴ２７４において、「アクショナブル変異」及び／又は「生殖細胞変異」のラベルがある場合（「Ｙｅｓ」の場合）には、統合データ管理装置Ａは、図５１のステップＳＴ２７５に進み、「薬剤ＤＢ」及び「治験ＤＢ」のラベルを出力する。図５１のステップＳＴ２７４において、「アクショナブル変異」及び／又は「生殖細胞変異」のラベルがない場合（「Ｎｏ」の場合）には、「第２の属性情報」の欄には「その他の変異」のラベルが付される。この場合、統合データ管理装置Ａは、図５１のステップＳＴ２７６に進み、「論文ＤＢ」のラベルを出力する。
【０２６９】
「薬剤ＤＢ」、「治験ＤＢ」及び「論文ＤＢ」には、対応するサーバにアクセスするためのＵＲＬがリンクされている。各データベースのリンクは、図４に示す統合データ管理装置Ａの統合データベースＯＧに格納されている。
【０２７０】
統合データ管理装置Ａは、各専門家会議端末からの図５０に示す検査依頼リスト領域ＵＩ１の「情報ＤＢ」欄へのアクセスを待って、図５１に示すステップＳＴ２７７において、「薬剤ＤＢ」ラベル、「治験ＤＢ」ラベル又は「論文ＤＢ」ラベルのいずれかの選択を受け付ける。
続いて、統合データ管理装置Ａは、図５１に示すステップＳＴ２７８において、選択されたラベルのリンク先を出力する。
【０２７１】
（３−３）専門家会議端末側
専門家会議において、各参加者が外部データベースを参照する。
図２１に示すステップＳＴ８６及びステップＳＴ１０３において、専門家会議に各参加者が、図５０に示す検査依頼リスト領域ＵＩ１から外部データベースにアクセスする。
【０２７２】
各専門家会議端末Ｂ１５，Ｂ２５，Ｂ２３，Ｃ１５，ＳＰ１１，ＳＰ１５は、図５２に示すステップＳＴ２８１において、ブラウザソフトを使って図１５に示すディスプレイ等の出力部１０７Ｘ，１０７Ｙ，１０７Ｚに表示された検査依頼リスト領域ＵＩ１の「結果登録」欄に、統合データ管理装置Ａが、図５１のステップＳＴ２７２において出力した「登録済」のラベルを表示する。
【０２７３】
図５２に示すステップＳＴ２８２において、各専門家会議端末Ｂ１５，Ｂ２５，Ｂ２３，Ｃ１５，ＳＰ１１，ＳＰ１５は、ブラウザソフトを使って図５１のステップＳＴ２７５又はステップＳＴ２７６において出力された「薬剤ＤＢ」、「治験ＤＢ」、又は「論文ＤＢ」のラベルを含む検査依頼リスト領域ＵＩ１を表示する。
【０２７４】
図５２に示すステップＳＴ２８３において、各専門家会議端末Ｂ１５，Ｂ２５，Ｂ２３，Ｃ１５，ＳＰ１１，ＳＰ１５は、図１５に示す入力部１０６Ｘ，１０６Ｙ，１０６Ｚから、図４５１のステップＳＴ２８２において表示したラベルの選択を受け付ける。入力部１０６Ｘ，１０６Ｙ，１０６Ｚからの入力は、専門家会議の各参加者が行う。
【０２７５】
図５２に示すステップＳＴ２８４において、各専門家会議端末Ｂ１５，Ｂ２５，Ｂ２３，Ｃ１５，ＳＰ１１，ＳＰ１５は、統合データ管理装置Ａが、図５１のステップＳＴ２７８において出力したリンク先の外部データベースを表示する。
【０２７６】
９．コンピュータプログラム
図１９から図２０に示すステップＳＴ２１からステップＳＴ３８、図３２に示すステップＳＴ５０１から５０５、図３３に示すステップＳＴ６０１からＳＴ６０７、及び図５５に示すステップＳＴ３２１からステップＳＴ３３８；又は図１９から図２２に示すＳＴ２１からステップＳＴ４７、図３２に示すステップＳＴ５０１から５０５、及び図３３に示すステップＳＴ６０１からＳＴ６０７、図４２に示すステップ２２１及びステップＳＴ２２２、図４４に示すステップＳＴ２４１からステップＳＴ２４５、図４８に示すステップＳＴ２５１からステップＳＴ２５５、図５１に示すステップＳＴ２７１からステップＳＴ２７８及び図５５に示すステップＳＴ３２１からステップＳＴ３３８は、遺伝子パネル検査の検査依頼を管理するためのコンピュータプログラムとしてコンピュータ上で実行されうる。
【０２７７】
前記コンピュータプログラムは、記憶媒体等のプログラム製品として提供されうる。前記コンピュータプログラムは、ハードディスク、フラッシュメモリ等の半導体メモリ素子、光ディスク等の記憶媒体に記憶される。前記記憶媒体へのプログラムの記憶形式は、前記制御部が前記プログラムを読み取り可能である限り制限されない。前記記憶媒体への記憶は、不揮発性であることが好ましい。
【０２７８】
ＩＩＩ．その他の処理と変形例
（１）検査依頼時のユーザ認証処理
上記８−１．の「検査依頼の流れ」において言及した図１２に示す臨床情報管理装置Ｂ１０の検査依頼情報取得部１Ｂが行う図１９のステップＳＴ１の検査依頼処理の例を説明する。図５３には、図１９のステップＳＴ１のユーザ認証処理の流れを示す。
【０２７９】
図５３のステップＳＴ１１１において、担当医Ｈ１ａは、臨床情報管理装置Ｂ１０において、遺伝子パネル検査の検査依頼を行う際、統合データ管理装置Ａの統合データベースＯＧに格納されている図２３に示すグラフィカルユーザインタフェースＵＩａにアクセスするためのログインを行う。臨床情報管理装置Ｂ１０は図１１に示す入力部１０６Ｂから担当医Ｈ１ａによる処理開始の指令、例えば遺伝子パネル検査依頼のＵＲＬの選択を受け付け、ブラウザソフトを使用してログイン画面を図１１に示すディスプレイ等の出力部１０７Ｂに表示する。
【０２８０】
続いて、図５３に示すステップＳＴ１１２において、臨床情報管理装置Ｂ１０は図１１に示す入力部１０６Ｂから担当医Ｈ１ａによるユーザＩＤとパスワードの入力を受け付け、これを統合データ管理装置Ａに送信する。
【０２８１】
図４に示す統合データベースＯＧには、図５４に示すユーザＩＤとログインパスワードを記録したログイン情報テーブルが格納されている。統合データ管理装置Ａは、このログイン情報テーブルの記録情報と図５３のステップＳＴ１１２において入力された情報とを照合する。照合がとれたら、ブラウザソフトを介して、図２３に示すグラフィカルユーザインタフェースＵＩａを出力する。
【０２８２】
臨床情報管理装置Ｂ１０は、図５３におけるステップＳＴ１１３において、上記８−１．で説明した図１９のステップＳＴ１の検査依頼情報の入力の受け付けを行い、受け付けた検査依頼情報を統合データ管理装置Ａに送信する。
【０２８３】
（２）検査依頼画面の変形例
図１９のステップＳＴ１の検査依頼情報を入力する際、依頼元施設の情報、担当医に関連する情報、専門家会議を統率する事務局に関する情報等は、あらかじめ、統合データベースＯＧに記録されていてよい。図５３のステップＳＴ１１３において、図２３に示すグラフィカルユーザインタフェースＵＩａにあらかじめ記録した依頼元施設の情報、担当医に関連する情報、専門家会議を統率する事務局に関する情報等に関する情報を対応する領域に出力してもよい。
【０２８４】
（３）検査依頼ＩＤ付与の変形例
図７に示すマスターテーブルＭにおいて、「検査依頼ＩＤ」は、検査依頼を受け付けた施設が保有する発番システムが個別に発番してもよく、もしくは、検査依頼を受け付けた施設の担当者が任意に発番してもよい。
【０２８５】
（４）検査状況表示処理
上記８−２．においては、検査の進捗状況について、図１９に示すステップＳＴ６１からステップＳＴ６５、図１９に示すステップＳＴ２７、図１９に示すステップＳＴ２８、図２０に示すステップＳＴ２９及び図２０に示すステップＳＴ３０において「検体受領済」、「前処理工程完了」を例にして説明している。しかし、図４に示す「検査状況」の欄に入力されるラベルは、図５５及び図５６に検査施設Ｃ１における検査の進捗にしたがって、随時更新されうる。「検査状況」の欄に入力されうるラベルは、図２５に示す。
【０２８６】
図５５は、統合データ管理Ａにおける、図７に示すマスターテーブルＭの「検査状況」欄の更新処理を示す。図５６は、検査情報管理装置Ｃ１１における、図２４に示す検査管理テーブルＬの「検査状況」欄の更新処理を示す。
【０２８７】
統合データ管理Ａは、図５５のステップＳＴ３２１において、臨床情報管理装置Ｂ１０から送信された検査依頼情報を受信すると（図１９のステップＳＴ２１に対応）、図５５のステップＳＴ３２２において、受信した検査依頼に対応するマスターテーブルＭの「検査状況」の欄を、「検体準備中」のラベルに更新する。
【０２８８】
統合データ管理Ａは、図５５のステップＳＴ３２３において、臨床情報管理装置Ｂ１０から送信された検体発送完了の情報を受信すると、図５５のステップＳＴ３２４において、受信した検体情報に対応するマスターテーブルＭの「検査状況」の欄を、「検体搬送中」のラベルに更新する。臨床情報管理装置Ｂ１０からの検体発送完了の情報は、臨床情報管理装置Ｂ１０から、病理医Ｈ１ｂ又は臨床検査技師Ｈ３が、図１１に示す臨床情報管理装置Ｂ１０の入力部１０６ｂから、入力してもよい。
【０２８９】
検体を検査施設Ｃ１で受領すると、臨床検査技師Ｔ１はその情報を検査情報管理装置Ｃ１１に図１３の入力部１０６を介して入力する。図５６のステップＳＴ４２１において、検査情報管理装置Ｃ１１は、検体受領情報として、臨床検査技師Ｔ１による図１３の入力部１０６からの「検体受領済」のラベルの入力を受け付ける（図１９のステップＳＴ６２に対応）。図５６のステップＳＴ４２２において、検査情報管理装置Ｃ１１は、図２４に示す検査管理テーブルＬの「検査状況」を「検体受領済」のラベルに更新する（図１９のステップＳＴ６２に対応）。続いて、検査情報管理装置Ｃ１１は、図５６のステップＳＴ４２３において、更新した内容を統合データ管理装置Ａに送信する（図１９のステップＳＴ６３に対応）。
【０２９０】
統合データ管理Ａは、図５５のステップＳＴ３２５において、検査情報管理装置Ｃ１１から送信された「検体受領済」ラベルへの更新情報を、検体受領情報として受信する（図１９のステップＳＴ２７に対応）。図５５のステップＳＴ３２６において、受信した検体情報に対応するマスターテーブルＭの「検査状況」の欄を、「検体受領済」のラベルに更新する（図１９のステップＳＴ２８に対応）。
【０２９１】
検体の前処理が開始されると、臨床検査技師Ｔ１はその情報を検査情報管理装置Ｃ１１に図１３の入力部１０６を介して入力する。図５６のステップＳＴ４２４において、検査情報管理装置Ｃ１１は、検体の前処理開始情報として、臨床検査技師T1による図１３の入力部１０６からの入力を受け付ける。図５６のステップＳＴ４２５において、検査情報管理装置Ｃ１１は、図２４に示す検査管理テーブルＬの「検査状況」を「前処理中」のラベルに更新する。続いて、検査情報管理装置Ｃ１１は、図５６のステップＳＴ４２６において、更新した内容を統合データ管理装置Ａに送信する。
【０２９２】
統合データ管理Ａは、図５５のステップＳＴ３２７において、検査情報管理装置Ｃ１１から送信された「前処理中」ラベルへの更新情報を、前処理開始情報として受信する。図５５のステップＳＴ３２８において、受信した検体情報に対応するマスターテーブルＭの「検査状況」の欄を、「前処理中」のラベルに更新する。
【０２９３】
検体の前処理が完了すると、臨床検査技師Ｔ１はその情報を検査情報管理装置Ｃ１１に図１３の入力部１０６を介して入力する。図５６のステップＳＴ４２７において、検査情報管理装置Ｃ１１は、検体の前処理完了情報として、臨床検査技師Ｔ１による図１３の入力部１０６からの入力を受け付ける（図１９のステップＳＴ６４に対応）。図５６のステップＳＴ４２８において、検査情報管理装置Ｃ１１は、図２４に示す検査管理テーブルＬの「検査状況」を「前処理完了」のラベルに更新する（図１９のステップＳＴ６４に対応）。続いて、検査情報管理装置Ｃ１１は、図５６のステップＳＴ４２９において、更新した内容を統合データ管理装置Ａに送信する（図１９のステップＳＴ６５に対応）。
【０２９４】
統合データ管理Ａは、図５５のステップＳＴ３２９において、検査情報管理装置Ｃ１１から送信された「前処理完了」ラベルへの更新情報を、前処理完了情報として受信する（図２０のＳＴ２９に対応）。図５５のステップＳＴ３３０において、受信した検体情報に対応するマスターテーブルＭの「検査状況」の欄を、「前処理完了」のラベルに更新する（図２０のＳＴ３０に対応）。
【０２９５】
シーケンシングが開始されると、臨床検査技師Ｔ１はその情報を検査情報管理装置Ｃ１１に図１３の入力部１０６を介して入力する。図５６のステップＳＴ４３０において、検査情報管理装置Ｃ１１は、シーケンシング開始情報として、臨床検査技師Ｔ１による図１３の入力部１０６からの入力を受け付ける。図５６のステップＳＴ４３１において、検査情報管理装置Ｃ１１は、図２４に示す検査管理テーブルＬの「検査状況」を「シーケンシング中」のラベルに更新する。続いて、検査情報管理装置Ｃ１１は、図５６のステップＳＴ４３２において、更新した内容を統合データ管理装置Ａに送信する。
【０２９６】
統合データ管理Ａは、図５５のステップＳＴ３３１において、検査情報管理装置Ｃ１１から送信された「シーケンシング中」ラベルへの更新情報を、シーケンシング開始情報として受信する。図５５のステップＳＴ３３２において、受信した検体情報に対応するマスターテーブルＭの「検査状況」の欄を、「シーケンシング中」のラベルに更新する。
【０２９７】
シーケンシングが完了すると、臨床検査技師Ｔ１はその情報を検査情報管理装置Ｃ１１に図１３の入力部１０６を介して入力する。図５６のステップＳＴ４３３において、検査情報管理装置Ｃ１１は、シーケンシング完了情報として、臨床検査技師Ｔ１による図１３の入力部１０６からの入力を受け付ける。図５６のステップＳＴ４３４において、検査情報管理装置Ｃ１１は、図２４に示す検査管理テーブルＬの「検査状況」を「シーケンシング完了」のラベルに更新する。続いて、検査情報管理装置Ｃ１１は、図５６のステップＳＴ４３５において、更新した内容を統合データ管理装置Ａに送信する。
【０２９８】
統合データ管理Ａは、図５５のステップＳＴ３３３において、検査情報管理装置Ｃ１１から送信された「シーケンシング完了」ラベルへの更新情報を、シーケンシング開始情報として受信する。図５５のステップＳＴ３３４において、受信した検体情報に対応するマスターテーブルＭの「検査状況」の欄を、「シーケンシング完了」のラベルに更新する。
【０２９９】
シーケンシングが完了すると、臨床検査技師Ｔ１はその情報を検査情報管理装置Ｃ１１に図１３の入力部１０６を介して入力する。図５６のステップＳＴ４３３において、検査情報管理装置Ｃ１１は、シーケンシング完了情報として、臨床検査技師Ｔ１による図１３の入力部１０６からの入力を受け付ける。図５６のステップＳＴ４３４において、検査情報管理装置Ｃ１１は、図２４に示す検査管理テーブルＬの「検査状況」を「シーケンシング完了」のラベルに更新する。続いて、検査情報管理装置Ｃ１１は、図５６のステップＳＴ４３５において、更新した内容を統合データ管理装置Ａに送信する。
【０３００】
統合データ管理Ａは、図５５のステップＳＴ３３３において、検査情報管理装置Ｃ１１から送信された「シーケンシング完了」ラベルへの更新情報を、シーケンシング完了情報として受信する。図５５のステップＳＴ３３４において、受信した検体情報に対応するマスターテーブルＭの「検査状況」の欄を、「シーケンシング完了」のラベルに更新する。
【０３０１】
シーケンシングが完了すると、検査情報管理装置Ｃ１１は、シーケンシングで得られた配列情報を次世代シーケンサーＣ１３から受信し、変異解析を開始する。臨床検査技師Ｔ１はその情報を検査情報管理装置Ｃ１１に図１３の入力部１０６を介して入力する。図５６のステップＳＴ４３６において、検査情報管理装置Ｃ１１は、変異解析開始情報として、臨床検査技師Ｔ１による図１３の入力部１０６からの入力を受け付ける。図５６のステップＳＴ４３７において、検査情報管理装置Ｃ１１は、図２４に示す検査管理テーブルＬの「検査状況」を「変異解析中」のラベルに更新する。続いて、検査情報管理装置Ｃ１１は、図５６のステップＳＴ４３８において、更新した内容を統合データ管理装置Ａに送信する。
【０３０２】
統合データ管理Ａは、図５５のステップＳＴ３３５において、検査情報管理装置Ｃ１１から送信された「変異解析中」ラベルへの更新情報を、変異解析開始情報として受信する。図５５のステップＳＴ３３４において、受信した検体情報に対応するマスターテーブルＭの「検査状況」の欄を、「変異解析中」のラベルに更新する。
【０３０３】
変異解析が完了すると。臨床検査技師Ｔ１はその情報を検査情報管理装置Ｃ１１に図１３の入力部１０６を介して入力する。図５６のステップＳＴ４３９において、検査情報管理装置Ｃ１１は、変異解析完了情報として、臨床検査技師Ｔ１による図１３の入力部１０６からの入力を受け付ける。図５６のステップＳＴ４４０において、検査情報管理装置Ｃ１１は、図２４に示す検査管理テーブルＬの「検査状況」を「変異解析完了」のラベルに更新する。続いて、検査情報管理装置Ｃ１１は、図５６のステップＳＴ４４１において、更新した内容を統合データ管理装置Ａに送信する。
【０３０４】
統合データ管理Ａは、図５５のステップＳＴ３３７において、検査情報管理装置Ｃ１１から送信された「変異解析完了」ラベルへの更新情報を、変異解析完了情報として受信する。図５５のステップＳＴ３３４において、受信した検体情報に対応するマスターテーブルＭの「検査状況」の欄を、「変異解析完了」のラベルに更新する。
【０３０５】
ここで、臨床検査技師Ｔ１が検体から抽出された核酸の品質が悪いと判断した場合には図５６のステップＳＴ４２７（図１９のステップＳＴ６４）において、検体の再採取が必要であることを示す情報、例えば「検体再取得」のラベルを、マスターテーブルＭ及び検査管理テーブルＬの「検査状況」の欄に記録してもよい。
【０３０６】
また、何らかの理由で遺伝子パネル検査が中止となった場合には、検査が中止されたことを示す情報、例えば「検査中止」のラベルをマスターテーブルＭ及び検査管理テーブルＬの「検査状況」の欄に記録してもよい。
【０３０７】
（５）特定の検査依頼の出力処理
図２２に示すステップＳＴ４５において、統合データ管理装置Ａは、ユーザＩＤ、グループＩＤ、役割ＩＤに応じた、図４に示す検査依頼リスト領域ＵＩ１へのアクセス権限を設定し、前記ＩＤに応じてマスターテーブルＭに格納された個別検査依頼表示領域ＵＩ３について表示を制限することができる。また、一つの個別検査依頼ＵＩ３について検査依頼リスト領域ＵＩ１に表示する各領域についても、アクセス権限に応じて表示を変更することができる。
【０３０８】
例えば、図１０に示すように、各ユーザは、専門家会議を行うグループが決められており、それぞれグループ内で所定の役割を担っている。
【０３０９】
図７と、図１０と、図５７を用いて、特定の検査依頼の出力処理を説明する。
統合データ管理装置Ａは、図５７のステップＳＴ７０１において、各専門家会議端末からの図４に示す検査依頼リスト領域ＵＩ１への表示要求を受け付ける。
【０３１０】
統合データ管理装置Ａは、図５７のステップＳＴ７０２において、統合データベースＯＧに格納された図１０（ａ）に示す役割テーブルＣＴから、システムにログインしたユーザＩＤか当該ユーザの役割ＩＤを特定する。図１０（ｂ）の閲覧可能情報テーブルＡＴに示されているように各役割ＩＤには、検査依頼リストにおいてどのような情報を表示するかがあらかじめ決められている。
【０３１１】
統合データ管理装置Ａは、図５７のステップＳＴ７０３において、図７に示すマスターテーブルＭを参照して前記ユーザＩＤからそのユーザが属する専門家会議のグループＩＤを特定する。
【０３１２】
さらに、統合データ管理装置Ａは、図５７のステップＳＴ７０４において、図７に示すマスターテーブルＭを参照して前記グループＩＤからそのグループＩＤが対応する１つ又は複数の個別検査依頼を特定する。
【０３１３】
図５７のステップＳＴ７０５において、統合データ管理装置Ａは、図５７のステップＳＴ７０２において特定した役割に対応するＩＤに基づいて、図１０（ｂ）の閲覧可能情報テーブルＡＴに記録されている共通項目と追加項目を特定する。
【０３１４】
図５７のステップＳＴ７０６において、統合データ管理装置Ａは、を図５７のステップＳＴ７０４において特定した各個別検査依頼について、各ユーザＩＤに対応する役割ＩＤに応じた項目を検査依頼リスト領域ＵＩ１に出力する。
このような設定を行うことにより、秘匿性の高い遺伝子変異に関する情報の不要な表示を避けることができる。
【０３１５】
一方で、第２の属性情報の欄に「生殖細胞変異」のラベルが記録された場合、専門家会議に参加する医療関係者（遺伝子カウンセラー、担当医等）は、検査依頼リスト領域ＵＩ１から患者ＩＣ情報にアクセスし、患者のＩＣ情報、患者病歴、家族歴等を確認することができる。これにより、生殖細胞変異が検出された場合の、検査結果の開示方法や患者や家族への情報提供が適切となる。
【０３１６】
（６）検査依頼リストの変形例
図３に示す検査依頼リストにおいて、属性情報は、属性情報ごとに識別可能に歩湯辞されてもよい。識別可能とは、例えば、属性情報ごとにラベルの表示色を変えて表してもよい。また、属性情報は、「Ａ」、「Ｇ」、「Ｏ」等のアルファベット等の識別記号で表されてもよい。表示例は、図３において符号ＳＭで表す。
【０３１７】
特定の属性情報（変異無など）に注意を促す凡例（例えば、「！」等）を付けて表示してもよい。
【０３１８】
さらに注意を促す凡例や、ラベルの色による識別は、検査依頼リストの「検査状況」に、通常の検査の進捗とは異なるラベルが付された時、例えば「検体再取得」、「検査中止」等が記録された際に、表示してもよい。
検査依頼リストにおいて、各属性情報に対してあらかじめ優先度を設定して、属性情報の優先度に応じて検査依頼リストを表示させてもよい。
【０３１９】
（７）新たな専門家会議スケジュール枠の記録
事務局専門家会議端末ＳＰ１５は、会議スケジュールデータベースＳＤＢに、図４５及び図４６に示すダイアログに表示するための新しいスケジュール枠の記録を行う。
専門家会議を統率する施設のスタッフが、図１５に示す事務局専門家会議端末ＳＰ１５の入力部１０６Ｚから、新たな会議スケジュール枠の入力を行う。
【０３２０】
図５８のステップＳＴ８０１において、事務局専門家会議端末ＳＰ１５は、図１５に示す入力部１０６Ｚからの入力を受け付ける。このとき、事務局専門家会議端末ＳＰ１５の制御部１００Ｚは、図１８に示す新規予約枠登録部Ｚ１７として機能する。
【０３２１】
図５８のステップＳＴ８０１において、事務局専門家会議端末ＳＰ１５は、図５８のステップＳＴ８０１において入力された情報を統合データ管理装置Ａに送信する。このとき、事務局専門家会議端末ＳＰ１５の制御部１００Ｚは、図１８に示すスケジュール更新部Ｚ１８として機能する。統合データ管理装置Ａが、これを会議スケジュールデータベースＳＤＢに記録する。
（８）会議の仮予約
図４３に示すステップＳＴ２３５では、担当医Ｈ１ａがスケジュールを選択するか、会議通知アイコンＵＩ７７を選択することで、専門家会議の設定が確定する例を説明した。しかし、別の実施形態として、例えば、遺伝子パネル検査の結果が出る前に、担当医Ｈ１ａが図４５に示すダイアログＵＩ５を使って専門家会議の設定を仮予約してもよい。仮予約により、図５９の検査依頼リスト領域ＵＩ１の「設定状況」の欄に「仮予約」であることを示すラベルが表示され得る。「仮予約」のラベルには、図４６に示すダイアログＵＩ７へのリンクが張られており、担当医Ｈ１ａが「仮予約」のラベルを選択すると図４６に示すダイアログＵＩ７が医療施設Ｂ１の専門家会議端末Ｂ１５の出力部１０７Ｘに表示される。予約を確定する場合には、担当医Ｈ１ａが会議通知アイコンＵＩ７７を選択することで、専門家会議が本設定され、検査依頼リスト領域ＵＩ１の「設定状況」の欄に「設定済」のラベルが表示される。また、本設定により、専門家会議の各参加者に専門家会議のスケジュールがメール送信されうる。
（９）システム１０００の変形例１
上記実施形態において、統合データ管理装置Ａは、臨床情報管理装置Ｂ１０、Ｂ２０，Ｂ３０から検査依頼情報を取得し、検査情報管理装置Ｃ１１から属性情報を取得しているが、これらの情報を同じコンピュータから取得してもよい。例えば、臨床情報管理装置Ｂ１０、Ｂ２０，Ｂ３０が検査依頼情報を検査情報管理装置Ｃ１１に送信し、検査情報管理装置Ｃ１１が、検査依頼情報および属性情報を統合データ管理装置Ａに送信してもよい。
（１０）システム１０００の変形例２
統合データ管理装置Ａは、クラウドコンピューティングを提供するウェブサーバであってもよい。臨床情報管理装置Ｂ１０、専門家会議端末Ｂ１５、臨床情報管理装置Ｂ２０、専門家会議端末Ｂ２５、臨床情報管理装置Ｂ３０、及び専門家会議端末Ｂ３５は、ウェブサーバである統合データ管理装置Ａにウェブブラウザを介してアクセスしてもよい。すなわち、システム１０００は、統合データ管理装置Ａへのアクセスに専用のアプリケーションを必要としない、クラウドコンピューティングシステムであってもよい。
【符号の説明】
【０３２２】
Ａ  統合データ管理装置
１００Ａ  制御部
１０７Ａ  出力部
Ｂ１０，Ｂ２０，Ｂ３０  臨床情報管理装置
Ｃ１１  検査情報管理装置
Ｂ１５，Ｂ２５，Ｂ３５，Ｃ１５，ＳＰ１１，ＳＰ１５  専門家会議端末
【図１】
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【図２】
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【図３】
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【図４】
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【図５】
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【図６】
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【図７】
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【図８】
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【図９】
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【図１０】
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【図１１】
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【図１２】
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【図１３】
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【図１４】
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【図１５】
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【図１６】
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【図１７】
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【図１８】
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【図１９】
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【図２０】
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【図２１】
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【図２２】
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【図２３】
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【図２４】
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【図２５】
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【図２６】
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【図２７】
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【図２８】
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【図２９】
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【図３０】
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【図３１】
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【図３２】
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【図３３】
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【図３４】
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【図３５】
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【図３６】
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【図３７】
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【図３８】
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【図３９】
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【図４０】
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【図４１】
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【図４２】
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【図４３】
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【図４４】
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【図４５】
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【図４６】
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【図４７】
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【図４８】
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【図４９】
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【図５０】
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【図５１】
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【図５２】
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【図５３】
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【図５４】
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【図５５】
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【図５６】
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【図５７】
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【図５８】
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【図５９】
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