(57)【要約】  感染の原因となる大腸菌株の検出のためのアッセイ。本発明は、生物学的試料を感染の原因となる大腸菌株の存在に関してスクリーニングするための核酸生成物及び対応する方法を提供する。
2016533750.tif 000002
【特許請求の範囲】
【請求項１】
試料中の１又は２以上の感染の原因となる大腸菌の存在又は非存在を検出するための方法であって、
前記試料を１又は２以上のウェルに適用するステップと、
前記試料中に存在する核酸を前記ウェル内で前記プローブと接触させるステップと、
１又は２以上の前記プローブに結合した試料核酸の存在又は非存在を検出するステップと
を含み、
前記１又は２以上のウェルが、
ａ．大腸菌ＳＴ６９の領域１（配列番号３１）及び領域２（配列番号３２）の核酸配列によって定義される核酸標的配列に結合し、かつ前記標的配列の対応する１０個の連続するヌクレオチドの配列に対して少なくとも８０％の相補性を有する少なくとも１０個の連続するヌクレオチドを含む第１のプローブ、
ｂ．大腸菌ＳＴ７３の領域１（配列番号１）及び領域２（配列番号２）の核酸配列によって定義される核酸標的配列に結合し、かつ前記標的配列の対応する１０個の連続するヌクレオチドの配列に対して少なくとも８０％の相補性を有する少なくとも１０個の連続するヌクレオチドを含む第２のプローブ、
ｃ．大腸菌ＳＴ９５の領域１〜９（配列番号３〜１１）の核酸配列によって定義される核酸標的配列に結合し、かつ前記標的配列の対応する１０個の連続するヌクレオチドの配列に対して少なくとも８０％の相補性を有する少なくとも１０個の連続するヌクレオチドを含む第３のプローブ、
ｄ．大腸菌ＳＴ１２７の領域１〜７（配列番号２４〜３０）の核酸配列によって定義される核酸標的配列に結合し、かつ前記標的配列の対応する１０個の連続するヌクレオチドの配列に対して少なくとも８０％の相補性を有する少なくとも１０個の連続するヌクレオチドを含む第４のプローブ、
ｅ．大腸菌ＳＴ１３１の領域１〜１２（配列番号１２〜２３）の核酸配列によって定義される核酸標的配列に結合し、かつ前記標的配列の対応する１０個の連続するヌクレオチドの配列に対して少なくとも８０％の相補性を有する少なくとも１０個の連続するヌクレオチドを含む第５のプローブ
を含み、
１又は２以上の前記プローブに結合した試料核酸の前記存在が、１又は２以上の前記感染の原因となる大腸菌由来の核酸が前記試料内に存在することの確認となり、１又は２以上の前記プローブに結合した試料核酸の前記非存在が、前記感染の原因となる大腸菌由来の核酸が前記試料に存在しないことの確認となる、前記方法。
【請求項２】
ａ．第１のウェルが第１のプローブを含み、第２〜第５のプローブが前記第１のウェル中に実質的に存在しておらず、
ｂ．第２のウェルが第２のプローブを含み、第１、第３〜第５のプローブが前記第２のウェル中に実質的に存在しておらず、
ｃ．第３のウェルが第３のプローブを含み、第１〜第２及び第４〜第５のプローブが第３のウェル中に実質的に存在しておらず、
ｄ．第４のウェルが第４のプローブを含み、第１〜第３及び第５のプローブが第４のウェル中に実質的に存在しておらず、
ｅ．第５のウェルが第５のプローブを含み、第１〜第４のプローブが第５のウェル中に実質的に存在していない、請求項１に記載の方法。
【請求項３】
プローブがタグ及び／又は標識を含む、請求項１又は２に記載の方法。
【請求項４】
タグ及び／又は標識が、増幅産物がタグ付け／標識されるようにプローブの伸長中に組み込まれる、請求項３に記載の方法。
【請求項５】
プローブが異なる標識又はタグで標識される、請求項３又は４に記載の方法。
【請求項６】
各プローブがそのそれぞれのウェル内に固定されている、請求項１〜５のいずれかに記載の方法。
【請求項７】
固定が永久的又は一時的である、請求項６に記載の方法。
【請求項８】
標的核酸配列のアレイであって、
ａ．大腸菌ＳＴ６９の領域１及び領域２の核酸標的配列（配列番号３１及び３２）であり、前記標的核酸配列がその少なくとも１０個の連続するヌクレオチドを含む核酸標的配列、並びに
ｂ．大腸菌ＳＴ７３の領域１及び領域２の核酸標的配列（配列番号１及び２）であり、前記標的核酸配列がその少なくとも１０個の連続するヌクレオチドを含む核酸標的配列、並びに
ｃ．大腸菌ＳＴ９５の領域１〜９の核酸標的配列（配列番号３〜１１）であり、前記標的核酸配列がその少なくとも１０個の連続するヌクレオチドを含む核酸標的配列、並びに
ｄ．大腸菌ＳＴ１２７の領域１〜７の核酸標的配列（配列番号２４〜３０）であり、前記標的核酸配列がその少なくとも１０個の連続するヌクレオチドを含む核酸標的配列、並びに
ｅ．大腸菌ＳＴ１３１の領域１〜１２の核酸標的配列（配列番号１２〜２３）であり、前記標的核酸配列がその少なくとも１０個の連続するヌクレオチドを含む核酸標的配列
によって定義される、標的核酸配列のアレイ。
【請求項９】
感染の原因となる大腸菌の存在又は非存在の検出において使用するための請求項８に記載の標的核酸配列のアレイ。
【請求項１０】
ａ．大腸菌ＳＴ６９の領域１及び領域２の核酸標的配列（配列番号３１及び３２）、並びに
ｂ．大腸菌ＳＴ７３の領域１及び領域２の核酸標的配列（配列番号１及び２）、並びに
ｃ．大腸菌ＳＴ９５の領域１〜９の核酸標的配列（配列番号３〜１１）、並びに
ｄ．大腸菌ＳＴ１２７の領域１〜７の核酸標的配列（配列番号２４〜３０）、並びに
ｅ．大腸菌ＳＴ１３１の領域１〜１２の核酸標的配列（配列番号１２〜２３）
によって定義される標的配列の対応する１０個の連続するヌクレオチドの配列に少なくとも８０％の相補性を有する少なくとも１０個の連続するヌクレオチドを含む、核酸プローブ配列のセット。
【請求項１１】
ａ．大腸菌ＳＴ６９の領域１及び領域２の核酸標的配列（配列番号３１及び３２）、又は
ｂ．大腸菌ＳＴ７３の領域１及び領域２の核酸標的配列（配列番号１及び２）、又は
ｃ．大腸菌ＳＴ９５の領域１〜９の核酸標的配列（配列番号３〜１１）、又は
ｄ．大腸菌ＳＴ１２７の領域１〜７の核酸標的配列（配列番号２４〜３０）、又は
ｅ．大腸菌ＳＴ１３１の領域１〜１２の核酸標的配列（配列番号１２〜２３）
によって定義される標的配列の対応する２０個の連続するヌクレオチドの配列に少なくとも８０％の相補性を有する少なくとも２０個の連続するヌクレオチドを含む、プローブ核酸配列。
【請求項１２】
ａ．大腸菌ＳＴ６９の領域１及び領域２の核酸標的配列（配列番号３１及び３２）、並びに
ｂ．大腸菌ＳＴ７３の領域１及び領域２の核酸標的配列（配列番号１及び２）、並びに
ｃ．大腸菌ＳＴ９５の領域１〜９の核酸標的配列（配列番号３〜１１）、並びに
ｄ．大腸菌ＳＴ１２７の領域１〜７の核酸標的配列（配列番号２４〜３０）、並びに
ｅ．大腸菌ＳＴ１３１の領域１〜１２の核酸標的配列（配列番号１２〜２３）
によって定義される標的配列の対応する２０個の連続するヌクレオチドの配列に少なくとも８０％の相補性を有する少なくとも２０個の連続するヌクレオチドを含む、核酸プローブ配列のセット。
【請求項１３】
感染の原因となる大腸菌の存在又は非存在の検出において使用するための請求項１０〜１２のいずれかに記載の核酸プローブ配列のセット又はプローブ核酸配列。
【請求項１４】
ａ．大腸菌ＳＴ６９の領域１及び領域２の核酸標的配列（配列番号３１及び３２）、並びに
ｂ．大腸菌ＳＴ７３の領域１及び領域２の核酸標的配列（配列番号１及び２）、並びに
ｃ．大腸菌ＳＴ９５の領域１〜９の核酸標的配列（配列番号３〜１１）、並びに
ｄ．大腸菌ＳＴ１２７の領域１〜７の核酸標的配列（配列番号２４〜３０）、並びに
ｅ．大腸菌ＳＴ１３１の領域１〜１２の核酸標的配列（配列番号１２〜２３）
によって定義される標的核酸配列によってコードされるポリペプチドマーカーのアレイ。
【請求項１５】
感染の原因となる大腸菌の存在又は非存在の検出において使用するための請求項１４に記載のポリペプチドマーカー。
【請求項１６】
請求項１〜７のいずれかに記載の方法において使用するための、少なくとも５個のウェルを含む検査カードであって、第１のウェルが第１のプローブを含み、第２のウェルが第２のプローブを含み、第３のウェルが第３のプローブを含み、第４のウェルが第４のプローブを含み、第５のウェルが第５のプローブを含む、検査カード。
【請求項１７】
ａ．第１のウェルが第１のプローブを含み、第２〜第５のプローブが前記第１のウェル中に実質的に存在しておらず、
ｂ．第２のウェルが第２のプローブを含み、第１、第３〜第５のプローブが前記第２のウェル中に実質的に存在しておらず、
ｃ．第３のウェルが第３のプローブを含み、第１〜第２及び第４〜第５のプローブが前記第３のウェル中に実質的に存在しておらず、
ｄ．第４のウェルが第４のプローブを含み、第１〜第３及び第５のプローブが前記第４のウェル中に実質的に存在しておらず、
ｅ．第５のウェルが第５のプローブを含み、第１〜第４のプローブが前記第５のウェル中に実質的に存在していない、請求項１６に記載の検査カード。
【請求項１８】
プローブがそれぞれのウェルの表面に固定され、好ましくは前記プローブが前記それぞれのウェルの表面に吸着した凍結乾燥形態で存在する、請求項１６又は１７に記載の検査カード。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
本発明は、生物学的試料を感染の原因となる大腸菌の存在に関してスクリーニングするための核酸生成物及び対応する方法に関する。
【背景技術】
【０００２】
大腸菌の株の中には、ほ乳類の腸内フローラのような共生状態を逸脱し、病原性が高くなって腸の内部及び外部両方に疾患を引き起こす可能性があるものがある。これらの病原性株は、下痢原生又は腸外病原性大腸菌（ＥｘＰＥＣ）のいずれかに大別される。ＥｘＰＥＣ株は、影響はともあれ腸内で生存する能力を保持しているが、尿管、血液及び中枢神経系を含むその他の宿主部位に散在して定着する能力も備え、無症候性細菌尿から膀胱炎及び腎盂腎炎、さらには多臓器系不全を伴う敗血症性ショックに至る臨床的に様々な重症度の疾患を引き起こす。
【０００３】
尿路感染症（ＵＴＩ）は、罹患率の高い一般的な細菌感染である。しかし、尿路疾患性大腸菌がこれらの感染の主要な原因で、急性の市中感染性無併発性感染の７０〜９０％、無症候性細菌尿の８５％及び反復性膀胱炎の６０％超に関与する。大腸菌はまた、菌血症の最大原因の代表であり、英国におけるその年間症例数は３００００を超え、２０％を超える死亡率を示すことから、臨床診療で見られる最も一般的で解決が困難な細菌性疾患の１つとなっている。さらに、抗生物質耐性株数が増加し抗生物質耐性機構がますます広まるために、治療はあまりうまくいっていない。
【０００４】
ＥｘＰＥＣ株の抗生物質耐性（胃腸疾患を引き起こす株とは異なる）について関心が高まっている。大腸菌は、歴史的に見て腸内細菌科の中で抗生物質に対して最も感受性のあるメンバーの１つであったが、今では最も耐性のあるものの１つとなっている。ここ１０年、ＥｘＰＥＣ株は、憂慮すべきことに抗生物質耐性を獲得する傾向が特に強くなってきており、今では２０％を超える菌血症単離物がフルオロキノロンに（主にＤＮＡジャイレースにおける変異による）、１０％を超える単離物が第３世代セファロスポリンに（様々な広域スペクトルβ−ラクタマーゼ、ＥＳＢＬ、特にＣＴＸ−Ｍ型の産生による）耐性を示し、ヨーロッパ全体で繰り返し発生している。これによってカルバペネムに対する依存がますます高まり、次にはこれらの最も活性のある抗グラム陰性菌抗生物質に対する耐性が生じる。
【０００５】
Multi-locus sequence typing（ＭＬＳＴ）などの最近のＤＮＡをベースにした遺伝子型同定法によって、これらのＥｘＰＥＣ系列の理解はさらに深まった。２０００〜２０１０年に様々な英国施設から単離された菌血症を引き起こす大腸菌２０００株超をスクリーニングすることによって、それらの単離物の中で５つのＳＴ型（例えば、ＳＴ６９、ＳＴ７３、ＳＴ９５、ＳＴ１２７及びＳＴ１３１）のみが一貫して優性であることが示された。これらは合わせて、研究にかかった１０年間を通じて一貫して菌血症の症例の３０〜６０％に関与していた。興味深いことに、それらの抗生物質耐性特性は著しく異なっていた。これらＳＴ型のうち４つ（ＳＴ６９、ＳＴ７３、ＳＴ９５及びＳＴ１２７）はほとんどの抗生物質に対して比較的に感受性を残していたが、５番目のＳＴ１３１は１０年間の研究の間に広範な種類の抗生物質に対して耐性の増加を示した。２００３〜２００４年から開始して、この特定のＳＴ型に属する単離物は主にβ−ラクタム、フルオロキノロン及びアミノグリコシドに対して耐性であった。実際に、最後の単離物は世界的に出現している大腸菌の系列であり、しばしばＥＳＢＬ生成物、特にＣＴＸ−Ｍ−１５及びフルオロキノロン及びアミノグリコシドに対する耐性が含まれる幅広い抗菌薬耐性特性のため現在熱心に調査が行われている。ヒト大腸菌感染の数多くの調査において、大腸菌ＳＴ１３１群は尿路感染症の症例全体の大部分、及び多重的な抗菌薬耐性表現型を示す症例の８０〜９０％まで、特に第３世代セファロスポリンに耐性を示す症例の原因となることが繰り返し報告されている。ＳＴ１３１クローンのバリアントはよくＣＴＸ−Ｍ−１５  ＥＳＢＬをコードするプラスミドを有するが、その他のβ−ラクタマーゼが多く同定されており、このクローンはうまく広範に散在するだけでなく、局所的に優勢なプラスミドを巧みに獲得することが示唆される。
【０００６】
トリ病原性大腸菌（ＡＰＥＣ）のクローン群として認識されている大腸菌ＳＴ９５は、宿主種が異なってもＡＰＥＣ及びヒトＥｘＰＥＣ単離物内で優勢であることが見いだされた。大腸菌ＳＴ６９は、カリフォルニア州バークレーで発生した腸外感染の大流行において初めて同定され、その間の全ＵＴＩの１１％、抗菌薬耐性ＵＴＩの５２％を占めていた。その後、ＳＴ６９は通常、散発的なヒト疾患の原因として世界中で同定され、この群に属する単離物は、アモキシシリン、トリメトプリム及びスルファメトキサゾールに対する耐性を付随することが多かった。
【０００７】
最近公表された研究では、イングランドの北西部において（Gibreel TM et al 2012）、ＳＴ７３、ＳＴ１３１、ＳＴ６９、ＳＴ９５及びＳＴ１２７に属する大腸菌単離物はそれぞれ、ヒト尿路感染症の１６．６、１３．３、９、６．３及び３．６％（合わせて約５０％）に関与していた。これらの発見は、血流感染から得られた、英国国民レベルのより代表的な単離物の収集に基づく我々の結果とほぼ一致していた。カナダ、フランス及び合衆国におけるその他の国際的な分子疫学的研究も、単離物の中でも尿路感染症又は菌血症を引き起こすこれら５種類のＳＴ型の普及を指摘した。
【０００８】
限られた数の大腸菌ＳＴが集団的に大腸菌尿路及び血流感染の大部分に関与する。これらのＳＴは、抗生物質に対する感受性が異なっている。特定のＳＴの迅速な同定を利用すれば、患者に行われる経験的療法が特定のＳＴに適合し得るように調整することができるだろう。
【０００９】
ＳＴは、研究室間で容易に比較可能な一貫した結果をもたらすMulti-locus sequence typing（ＭＬＳＴ）をベースにして定義される。しかし、ＭＬＳＴは実施に時間がかかり（６〜８時間）、多大な労力も必要で、費用も高価である。これらの制限に取り組み、このような試験をより多数の細菌学研究室に適するようにするためには、代わりとなる分子スクリーニング戦略が必要である。スクリーニングＰＣＲ検査は、国際的に散在したＳＴ１３１クローンに属する単離物を特に同定するために記載されたことがある。しかし、このアッセイは、ｐａｂＢ遺伝子における２つの一塩基多形の検出に基づいており、多くの対立遺伝子特異的ＰＣＲのように、信頼性及び特異性の問題をはらんでいる。別の方法で、これらの大腸菌ＳＴの迅速な同定に利用可能な市販の検査法又は同等のアッセイはない。したがって、より効率的な同定システムが必要である。
【００１０】
抗生物質感受性特性によって著しく異なるこれらのＳＴを迅速に同定することによって、時間のかかる耐性記録（antibiogram）（１８〜２４時間）を待っている間に治療の選択肢を迅速に整えることが可能となる。この選択肢は、狭いスペクトラムの抗生物質に応答し得る大腸菌に感染した患者を同定することによって、最も強力な抗生物質（カルバペネムなど）のいくつかの過剰使用を防止するために寄与し得る。例えば、カルバペネムに依存しすぎないことによって、この戦略はこれら最終手段である抗生物質に対する耐性を拡散してしまう選択圧力を抑えることができるだろう。
【００１１】
本発明は、単一の単離された試料における特定の大腸菌株を標的とし、同定するための迅速なマルチプレックスＰＣＲアッセイを提供することによって、前記で確認した問題を解決する。
【先行技術文献】
【非特許文献】
【００１２】
【非特許文献１】Gibreel TM et al 2012
【発明の概要】
【発明が解決しようとする課題】
【００１３】
特定の大腸菌ＳＴ系列プローブを迅速且つ確実に同定し、それらを検証することによって、本発明はまた、単一の単離された試料における特定の大腸菌株を標的とする迅速なマルチプレックスＰＣＲアッセイを提供する。
【００１４】
Genbankデータベースに蓄積された３００個の公式に利用可能なゲノム配列の配列分析を使用して、内部では保存されているが、５つの主要なＳＴ型とＳＴ系列（ＭＬＳＴタイピング様式によって１つ又は２つの遺伝子座型が異なった系列）それぞれのゲノムとの間で異なっている配列特異的ＤＮＡ領域を同定した。各ＳＴで同定された特異的な領域の数は、表１に詳細を示したように２〜１２で変化している。これらのＳＴ特異的領域の５つを迅速なマルチプレックスＰＣＲアッセイの開発のために標的として選択し（最初の例）、それらの感受性及び特異性を評価した。
【００１５】
５つの選択された領域を標的とするＳＴ特異的プライマーは、単一のＰＣＲ反応における検出を容易にするために、サイズの異なる断片を増幅するように設計した。増幅された産物の予測サイズは、ＳＴ６９、ＳＴ９５、ＳＴ１３１、ＳＴ１２７及びＳＴ７３特異的標的それぞれについて１０４、２００、３１０、４０４及び４９０ｂｐであった（表２）。１０個のプライマーそれぞれを最終濃度０．２μΜで含有する増幅反応混合物は、鋳型として精製ゲノムＤＮＡを使用し、以下のサイクル条件で実施した；９４℃で３分の最初の変性ステップ、９４℃で３０秒を３０回、６０℃で３０秒及び７２℃で３０秒並びに７２℃で５分の最終ステップ。アッセイは、ＭＬＳＴ型の公知の５３２個の単離物を使用して評価した；このように組み入れたＳＴ型の異なる単離物は、表３に詳細を示したように３つの異なる国々のヒト、ウシ又はブタから得られた。ＳＴ又はＳＴ複合体６９（ｎ＝１９）、７３（ｎ＝５７）、９５（ｎ＝２３）、１２７（ｎ＝１１）及び１３１（ｎ＝４８）に属する単離物は全て予測された生成物のサイズを増幅し、ＰＣＲアッセイによって対応するＳＴ群に全て正確に割り当てた（表３）。その他の異なるＳＴ型に属する残りの単離物（ｎ＝３７４）は、結果的にそれぞれＳＴ９５（ｎ＝２）、ＳＴ７３（ｎ＝１）及びＳＴ１２７（ｎ＝１）に間違って同定された２つのＳＴ１２、１つのＳＴ１０５６及び１つの新たに同定されたＳＴ型（ＭＬＳＴデータベースのＳＴ型に割り当てられなかった対立遺伝子の組み合わせ）以外はＰＣＲ産物がなかった。要約すると、アッセイによって５つの主要なＳＴ型全てを全体的な正確度９９．２５％で同定することが可能であった。
【００１６】
本発明は、単一の単離された試料における感染の原因となる多数の大腸菌株の存在又は非存在を検出するための簡単な１工程アッセイを提供することによって、前記で確認した１又は２以上の問題を解決する。
【課題を解決するための手段】
【００１７】
より詳細には、試料中の１又は２以上の感染の原因となる大腸菌の存在又は非存在を検出するための方法を提供する。前記方法が、前記試料を１又は２以上のウェルに適用するステップと、前記試料中に存在する核酸を前記ウェル内で前記プローブと接触させるステップと、１又は２以上の前記プローブに結合した試料核酸の存在又は非存在を検出するステップとを含み、前記１又は２以上のウェルが、核酸標的配列に結合する第１のプローブであって、前記核酸標的配列が大腸菌ＳＴ６９の領域１（配列番号３１）及び領域２（配列番号３２）の核酸配列によって定義され、前記第１のプローブが前記標的配列の対応する１０個の連続するヌクレオチド配列に対して少なくとも８０％の相補性を有する少なくとも１０個の連続するヌクレオチドを含む、前記第１のプローブ、核酸標的配列に結合する第２のプローブであって、前記核酸標的配列が大腸菌ＳＴ７３の領域１（配列番号１）及び領域２（配列番号２）の核酸配列によって定義され、前記第２のプローブが前記標的配列の対応する１０個の連続するヌクレオチド配列に対して少なくとも８０％の相補性を有する少なくとも１０個の連続するヌクレオチドを含む、前記第２のプローブ、核酸標的配列に結合する第３のプローブであって、前記核酸標的配列が大腸菌ＳＴ９５の領域１〜９（配列番号３〜１１）の核酸配列によって定義され、前記第３のプローブが前記標的配列の対応する１０個の連続するヌクレオチド配列に対して少なくとも８０％の相補性を有する少なくとも１０個の連続するヌクレオチドを含む、前記第３のプローブ、核酸標的配列に結合する第４のプローブであって、前記核酸標的配列が大腸菌ＳＴ１２７の領域１〜７（配列番号２４〜３０）の核酸配列によって定義され、前記第４のプローブが前記標的配列の対応する１０個の連続するヌクレオチド配列に対して少なくとも８０％の相補性を有する少なくとも１０個の連続するヌクレオチドを含む、前記第４のプローブ、核酸標的配列に結合する第５のプローブであって、前記核酸標的配列が大腸菌ＳＴ１３１の領域１〜１２（配列番号１２〜２３）の核酸配列によって定義され、前記第５のプローブが前記標的配列の対応する１０個の連続するヌクレオチド配列に対して少なくとも８０％の相補性を有する少なくとも１０個の連続するヌクレオチドを含む、前記第５のプローブを含み、１又は２以上の前記プローブに結合した試料核酸の前記存在が、１又は２以上の前記感染の原因となる大腸菌由来の核酸が試料内に存在することの確認となり、１又は２以上の前記プローブに結合した試料核酸の前記非存在が、前記感染の原因となる大腸菌由来の核酸が試料に存在しないことの確認となる。
【００１８】
さらなる実施形態では、第１のウェルは第１のプローブを含み、第２〜第５のプローブは第１のウェル中に実質的に存在しておらず、第２のウェルは第２のプローブを含み、第１、第３〜第５のプローブは第２のウェル中に実質的に存在しておらず、第３のウェルは第３のプローブを含み、第１〜第２及び第４〜第５のプローブは第３のウェル中に実質的に存在しておらず、第４のウェルは第４のプローブを含み、第１〜第３及び第５のプローブは第４のウェル中に実質的に存在しておらず、第５のウェルは第５のプローブを含み、第１〜第４のプローブは第５のウェル中に実質的に存在していない。
【００１９】
一実施形態では、プローブはタグ及び／又は標識を含む。前記タグ及び／又は標識は、増幅産物がタグ付け／標識されるようにプローブの伸長中に組み込まれる。プローブは、異なる標識又はタグで標識され得る。各プローブは、それぞれのウェル内に固定することができ、前記固定は永久的又は一時的であってもよい。
【００２０】
一実施形態では、標的核酸配列のアレイを提供する。アレイは、大腸菌ＳＴ６９の領域１及び領域２の核酸標的配列（配列番号３１及び３２）であり、前記標的核酸配列がそれらの少なくとも１０個の連続するヌクレオチドを含む核酸標的配列、並びに大腸菌ＳＴ７３の領域１及び領域２の核酸標的配列（配列番号１及び２）であり、前記標的核酸配列がそれらの少なくとも１０個の連続するヌクレオチドを含む核酸標的配列、並びに大腸菌ＳＴ９５の領域１〜９の核酸標的配列（配列番号３〜１１）であり、前記標的核酸配列がそれらの少なくとも１０個の連続するヌクレオチドを含む核酸標的配列、並びに大腸菌ＳＴ１２７の領域１〜７の核酸標的配列（配列番号２４〜３０）であり、前記標的核酸配列がそれらの少なくとも１０個の連続するヌクレオチドを含む核酸標的配列、並びに大腸菌ＳＴ１３１の領域１〜１２の核酸標的配列（配列番号１２〜２３）であり、前記標的核酸配列がそれらの少なくとも１０個の連続するヌクレオチドを含む核酸標的配列によって定義される。
【００２１】
一実施形態では、標的核酸配列のアレイは感染の原因となる大腸菌の存在又は非存在の検出において使用するために提供する。
【００２２】
一実施形態では、標的配列の対応する１０個の連続するヌクレオチド配列に少なくとも８０％の相補性を有する少なくとも１０個の連続するヌクレオチドを含む核酸プローブ配列のセットを提供する。核酸プローブ配列は、大腸菌ＳＴ６９の領域１及び領域２の核酸標的配列（配列番号３１及び３２）、並びに大腸菌ＳＴ７３の領域１及び領域２の核酸標的配列（配列番号１及び２）、並びに大腸菌ＳＴ９５の領域１〜９の核酸標的配列（配列番号３〜１１）、並びに大腸菌ＳＴ１２７の領域１〜７の核酸標的配列（配列番号２４〜３０）、並びに大腸菌ＳＴ１３１の領域１〜１２の核酸標的配列（配列番号１２〜２３）によって定義される。
【００２３】
別の実施形態では、標的配列の対応する２０個の連続するヌクレオチド配列に少なくとも８０％の相補性を有する少なくとも２０個の連続するヌクレオチドを含むプローブ核酸配列を提供する。プローブ核酸配列は、大腸菌ＳＴ６９の領域１及び領域２の核酸標的配列（配列番号３１及び３２）又は大腸菌ＳＴ７３の領域１及び領域２の核酸標的配列（配列番号１及び２）又は大腸菌ＳＴ９５の領域１〜９の核酸標的配列（配列番号３〜１１）又は大腸菌ＳＴ１２７の領域１〜７の核酸標的配列（配列番号２４〜３０）又は大腸菌ＳＴ１３１の領域１〜１２の核酸標的配列（配列番号１２〜２３）によって定義される。
【００２４】
一実施形態では、標的配列の対応する２０個の連続するヌクレオチド配列に少なくとも８０％の相補性を有する少なくとも２０個の連続するヌクレオチドを含む核酸プローブ配列のセットを提供する。核酸プローブ配列のセットは、大腸菌ＳＴ６９の領域１及び領域２の核酸標的配列（配列番号３１及び３２）、並びに大腸菌ＳＴ７３の領域１及び領域２の核酸標的配列（配列番号１及び２）、並びに大腸菌ＳＴ９５の領域１〜９の核酸標的配列（配列番号３〜１１）、並びに大腸菌ＳＴ１２７の領域１〜７の核酸標的配列（配列番号２４〜３０）、並びに大腸菌ＳＴ１３１の領域１〜１２の核酸標的配列（配列番号１２〜２３）によって定義される。
【００２５】
別の実施形態では、標的核酸配列によってコードされるポリペプチドマーカーのアレイを提供する。このアレイは、大腸菌ＳＴ６９の領域１及び領域２の核酸標的配列（配列番号３１及び３２）、並びに大腸菌ＳＴ７３の領域１及び領域２の核酸標的配列（配列番号１及び２）、並びに大腸菌ＳＴ９５の領域１〜９の核酸標的配列（配列番号３〜１１）、並びに大腸菌ＳＴ１２７の領域１〜７の核酸標的配列（配列番号２４〜３０）、並びに大腸菌ＳＴ１３１の領域１〜１２の核酸標的配列（配列番号１２〜２３）によって定義される。ポリペプチドマーカーは感染の原因となる大腸菌の存在又は非存在の検出において使用するために提供する。
【００２６】
一実施形態では、本発明の方法で使用するための検査カードを提供する。前記検査カードは少なくとも５個のウェルを含み、第１のウェルは第１のプローブを含み、第２のウェルは第２のプローブを含み、第３のウェルは第３のプローブを含み、第４のウェルは第４のプローブを含み、第５のウェルは第５のプローブを含む。第１のウェルが第１のプローブを含み、第２〜第５のプローブは第１のウェル中に実質的に存在しておらず、第２のウェルが第２のプローブを含み、第１、第３〜第５のプローブは第２のウェル中に実質的に存在しておらず、第３のウェルが第３のプローブを含み、第１〜第２及び第４〜第５のプローブは第３のウェル中に実質的に存在しておらず、第４のウェルが第４のプローブを含み、第１〜第３及び第５のプローブは第４のウェル中に実質的に存在しておらず、第５のウェルが第５のプローブを含み、第１〜第４のプローブは第５のウェル中に実質的に存在していない、検査カードが提供される。プローブはそれぞれのウェルの表面に固定し、好ましくはプローブはそれぞれのウェルの表面に吸着した凍結乾燥形態で存在する。
【００２７】
出願人が取り組んできた従来技術の重要な１つの問題は、単一のアッセイ条件（すなわち、シングルプレックス形式）内で互いに適合する（すなわち、正確な結合特異性を保持する）丈夫なプローブセットを提供することである。本発明の方法に関連した１つの特有の利点は速度である。例えば、本発明の方法は通常約３０分で完了する。この速度は、本発明はＰＣＲを粗抽出物に実施することが可能で、それによって増幅前のゲノムＤＮＡ抽出ステップを省略できるという事実のおかげである。対照的に、伝統的なＰＣＲ増幅及び超高速高分解能アガロース電気泳動を利用する既存のマルチプレックスアッセイは、実施に少なくとも約１時間かかる。
【００２８】
本発明のユニプレックス（別名シングルプレックス）アッセイ法に関連した別の利点は感度が高いことで、試料中の個別の大腸菌の存在又は非存在が簡単に測定できることに加えて、試料中の大腸菌（例えば、細菌負荷）の定量的検出が可能である。
【００２９】
試料中の大腸菌株は、各標的について負荷較正を行うことができる。これによって、試料中の各大腸菌株の特定の負荷量を定量することができる。有利なことに、本発明のこの特性によって、多数の株が存在する試料中において優勢な株を測定することができる。例えば、本発明のユニプレックスアッセイ法では、多数の株が存在する試料中において優勢な大腸菌株を確認することが可能である。さらに、本発明の方法は、経時的に試料中の大腸菌株の定量的検出を可能にし、これは特定の株の細菌負荷に変動がある場合特に有用である。
【００３０】
さらに、既存の系が膜上で行われるハイブリダイゼーションを使用するのに対し、本発明のアッセイ方法は閉鎖（例えば、無菌）系で行われ、したがって汚染の可能性が抑えられるのでさらなる利点となっている。
【００３１】
プローブ１〜５はそれぞれ以下のＳＴ系列の大腸菌の高感度検出を可能にする。
１）ＳＴ６９
２）ＳＴ７３
３）ＳＴ９５
４）ＳＴ１２７
５）ＳＴ１３１
【００３２】
したがって、前記で定義した方法は、任意の１又は２以上の前記感染の原因となる大腸菌株をユニプレックス（別名シングルプレックス）アッセイ形式で検出するための迅速なアッセイを提供する。同様に、前記方法は、前記感染の原因となる大腸菌株全てが試料中に存在しないことを１回の（ユニプレックス）アッセイで確認するための迅速なアッセイを提供する。ユニプレックスアッセイとは、多数の個々の検出ウェルアッセイのそれぞれを同じアッセイ条件下で、及び／又は実質的に同時に実施することを意味する。使用するとき、単一の試料を検査カードに適用し、次に試料を各試験ウェルに投入する。
【００３３】
一実施形態では、検査カードは前記の６番目又は７番目のウェル（及び対応するプローブ）の１つ又は両方を含むことができる。選択的に「対照」プローブ／プローブ標的を使用してもよい。前記「対照」プローブは、以上に記載した実施形態のいずれかと組み合わせて使用することができる。
【００３４】
対照プローブ６〜７はそれぞれ、
６）大腸菌バクテリオファージＭＳ２（ＭＳ２  ＩＣ）、及び
７）ヒトリボヌクレアーゼＰ遺伝子（ＲＮアーゼＰ）の高感度検出を可能にする。
【００３５】
１又は２以上の「対照」プローブが存在することにより、アッセイが他の点で通常通り実施されていることを（実質的に同時に）確認することができる。例えば、試料は核酸を抽出する前に大腸菌バクテリオファージＭＳ２（ＭＳ２  ＩＣ）でスパイクする。バクテリオファージＭＳ２プローブを使用して試料中のバクテリオファージＭＳ２核酸を検出することにより、ユニプレックスアッセイに伴う様々な段階が首尾よく完了していることを確認することが可能になる。バクテリオファージＭＳ２は、単純に内部対照の一例を提供するものであり、任意の適切な代替物も本発明の方法と共に使用することができる。
【００３６】
一実施形態では、検査カードはヒトリボヌクレアーゼＰ遺伝子（ＲＮアーゼＰ）の検出を可能にするプローブを含む。試料中におけるヒトＲＮアーゼＰ核酸が存在することにより、ヒト生物学的材料が収集されたことが示される。或いは、その他のヒトゲノムマーカーをプローブ標的として使用して、それらの対応するプローブを検査カードに含めることができる。
【００３７】
本発明のアッセイ方法には核酸増幅ステップを含めることができ、この場合、本発明の各プローブは１対の（フォワード及びリバース）プライマーを組み合わせて使用し、前記プライマー対が協同して１本の標的核酸を増幅し、その後検出ステップ中にプローブが（それらに結合することによって）認識する。例として、プライマー１ｆ（フォワード）及び１ｒ（リバース）は第１のプローブと協調し、使用するとき３つの核酸配列全てが第１のウェルに含まれる。同じことがプライマー２ｆ及び２ｒと第２のプローブの組み合わせ（第２のウェル内）からプライマー７ｆ及び７ｒと第７のプローブの組み合わせ（第７のウェル内）に当てはまる。
【００３８】
本発明のプライマー配列の例を表２、４及び５に例示し、以下においても説明する。
【００３９】
プライマー１ｆには、GGCAACAAGCATAAA（配列番号３３）に少なくとも８０％の配列同一性を有する核酸配列が含まれ、プライマー１ｒにはAGGGCGTTCAGAATC（配列番号３４）に少なくとも８０％の配列同一性を有する核酸配列が含まれる。
【００４０】
プライマー２ｆには、TTCCATTTCCCATGA（配列番号３５）に少なくとも８０％の配列同一性を有する核酸配列が含まれ、プライマー２ｒにはTGCATACCATTTAAG（配列番号３６）に少なくとも８０％の配列同一性を有する核酸配列が含まれる。
【００４１】
プライマー３ｆには、GCTGCGTTGCCTTTC（配列番号３７）に少なくとも８０％の配列同一性を有する核酸配列が含まれ、プライマー３ｒにはATAGCGGTCGATTAC（配列番号３８）に少なくとも８０％の配列同一性を有する核酸配列が含まれる。
【００４２】
プライマー４ｆには、TTCTCAATCTCTTCC（配列番号３９）に少なくとも８０％の配列同一性を有する核酸配列が含まれ、プライマー４ｒにはCTCTGTCCCAATTCC（配列番号４０）に少なくとも８０％の配列同一性を有する核酸配列が含まれる。
【００４３】
プライマー５ｆには、ATTCCATCGCAAGAC（配列番号４１）に少なくとも８０％の配列同一性を有する核酸配列が含まれ、プライマー５ｒにはAATGTCCGGGATTAT（配列番号４２）に少なくとも８０％の配列同一性を有する核酸配列が含まれる。
【００４４】
生物学的試料は通常、患者から採取した試料（すなわち、生体外及び／又は単離された試料）である。一実施形態では、核酸抽出ステップを試料に実施することができ、従来の核酸抽出プロトコルは当業界では周知である。次に、抽出した核酸試料を、ウェルのそれぞれに（したがって、前記ウェル内のプローブそれぞれに）接触するように加える。別の実施形態では、患者から採取した試料を直接ウェルに加える。
【００４５】
本発明の核酸「ハイブリダイゼーション反応」（一緒に作用するプローブ及びプライマーを含む）ステップは通常、５０〜７０℃（例えば、５５〜６５℃又は５６〜６４℃又は５７〜６３℃又は５８〜６２℃又は５９〜６１℃又は約６０℃）の温度で実施する。通常前記温度を１０〜３０秒（例えば、１５〜２５秒又は１７〜２３秒又は１９〜２１秒又は約２０秒）の時間維持する。核酸増幅ステップを本発明の方法に含める場合、前記「ハイブリダイゼーション反応」（開始時に過剰に添加したプローブ及びプライマーを含む）ステップを好ましくは増幅ステップの各サイクルに含める。
【００４６】
核酸増幅ステップを使用する場合、このステップは通常、９０〜１００℃（例えば、９２〜９８℃又は９４〜９６℃又は約９５℃）の温度で０．１〜１０秒間（例えば、０．５〜５秒又は０．７〜２秒又は約１秒）の通常の時間に亘って、その後５０〜７０℃（例えば、５５〜６５℃又は５７〜６３℃又は５９〜６１℃又は約６０℃）の温度に低下させて１０〜３０秒間（例えば、１５〜２５秒又は１７〜２３秒又は１９〜２１秒又は約２０秒）に亘って実施する。核酸増幅ステップを使用する場合、前記ステップには通常、３５〜５５サイクル（例えば、４０〜５０サイクル又は４４〜４６サイクル又は約４５サイクル）が含まれる。通常逆転写ステップを最初に４０〜６０℃（例えば、４５〜５５℃又は４８〜５２℃又は約５０℃）の温度で３〜７分（例えば、４〜６分又は約５分）に亘って使用する。
【００４７】
一実施形態では、この方法はApplied Biosystems 7900HT（ハイスループット）計器で実施することができる。例として、前記計器は、例えば、１枚の検査カード上に存在する８つの別個のカラムによって８つの異なる試料を並行して分析することを可能にする、３８４ウェル検査カード（別名プレート）ＲＴ−ＰＣＲプラットフォームを使用することが可能である−図１参照。各カラムは４８個の個々の標的ウェルを含むことができ、それによって各試料を（実質的に同時に）７つの異なる大腸菌株（２つの「対照」ウェルを使用するので、実際には５つの大腸菌株）に関してスクリーニングすることが可能である。代わりの機器及び系（対応する検査カードを含む）が市販されており、本発明において同じように応用できる。
【００４８】
一実施形態では、この方法はＲＴ−ＰＣＲなどのＰＣＲを使用する。
【００４９】
使用するとき、試料（通常、抽出した核酸試料）を２〜５倍濃縮緩衝液（例えば、ＰＣＲ緩衝液、反応混合物とも称する）と混合する。例えば、試料Χμｌを同じ体積（Χμｌ）の２倍濃縮緩衝液と混合する。次に、試料（緩衝液を含む）を各ウェルに適用する、通常０．１〜５０μｌ、又は０．５〜３０μｌ、又は０．５〜２０μｌ、又は０．５〜１０μｌ、又は１〜５μｌの範囲の体積を各ウェルに入れる。好ましくは約０．５μｌ、１μｌ、２μｌ、３μｌ、４μｌ又は５μｌの試料（緩衝液を含む）を各ウェルに入れる。
【００５０】
一実施形態では、検査カードを提供する。別の実施形態では、検査カードはなく、試料を１又は２以上のウェルに適用する。
【００５１】
本発明のウェルは、本明細書では試料を保持するための体積を提供するいかなる構造も包含するものとする。
【００５２】
カラム状に配置されたウェルを含む検査カード（例えば、図１参照）の場合、試料（緩衝液を含む）は簡単に各カラム上部のリザーバーに適用し、その後検査カードを遠心分離器で遠心して試料及び試薬混合物（前記で確認した範囲の体積）を各カラムに形成されたウェルそれぞれに送り込むことができる。AB7900HT系の場合、各ウェルは通常４８個のウェルを含むので、試料は遠心によって前記４８個のウェルそれぞれに送り込むことによって適用する。より詳細には、最高８個の試料を各カラムの上部にある８個のリザーバーに（例えば、フィンピペットで）それぞれ添加することができる。図１に関して、小さなポッドは別々のアッセイウェルを示しており、ポッドは順に対応するプローブ（及び対応するプライマーであってもよい）を含む。例示した検査カードは、流路毎に４８個のウェル（ポッドとも称する）が存在する構成を示しており、使用するとき、各ウェルは通常、カラム状の流路に遠心によって送り込むことによって最終的に１μｌの反応体積を受け入れる。
【００５３】
各ウェルは本発明の特定のプローブ型１種を含む（及び対応するプライマー対を含んでいてもよい）。一実施形態では、前記プローブは凍結乾燥形態でウェル中に存在している。したがって、一旦液体試料がウェル表面に適用されると、凍結乾燥したプローブ（対応するプライマー対を含んでいてもよい）が再水和して、それによって液体媒体内で検出ステップを進行させることが可能となる。
【００５４】
本発明のウェルは、前記ウェル中で実施されるアッセイの妥当な液体体積（試料及び緩衝液／反応混合物）よりも少し多くを保持するように設計する。各ウェルは１個のプローブ型が１個のウェルに位置できるように別々になっており、それによって特定の標的大腸菌株の存在又は非存在を検出する方法が可能となる。試料を検査カードに適用した後、プローブを含有するウェル全てを１又は２以上のフィルム／シートを使用することによって密封し、それによってウェル間の液体（及び潜在的にプローブ）の偶発的な移動を防止する。本発明のウェルは、検査カードと同じ水平な平面に位置していてもよいが、同様に前記平面の上又は下に位置していてもよい。
【００５５】
マルチプレックス反応セットアップの標準的なバッテリーと比較して、本発明は両反応構成の操作において時間及び資源を節約し、多数の計器によるデータ照合を可能にする。
【００５６】
本発明はまた、以上に記載した方法で使用するための検査カードを提供する。一実施形態では、検査カードはプラスティック材料から形成される。使用者を支援するために、検査カードは、例えば、通常の使用において使用者によって保持されるような実質的に水平な位置において、カード（適用した試料を含む）の重量を支持するために十分な剛性を有するべきである。
【００５７】
検査カードは（遠心によって送り込むことによって試料を適用することができるカラム状形式に配置してもよい）複数のウェルを含み、少なくとも７個のウェルが設けられ、第１のウェルは第１のプローブを含み、第２のウェルは第２のプローブを含み、第３のウェルは第３のプローブを含み、第４のウェルは第４のプローブを含み、第５のウェルは第５のプローブを含み、第６のウェルは本明細書で定義したような本発明の第７のプローブを含む。各ウェルは通常、（複数の）本発明の１つの特定のプローブのみを含む。例として、一実施形態では、第１のプローブは第１のウェル中に存在し（しかし通常その他のウェルのいずれにも存在しない）、第２のプローブは第２のウェル中に存在する（しかし通常その他のウェルのいずれにも存在しない）などである。
【００５８】
各プローブには対応するプライマー対が付随していてもよい。したがって、第１のウェルは、第１のプローブに加えて対応する第１のフォワード及びリバースプライマーの対を含んでいてもよい。各ウェルは通常（複数の）本発明の１つの特定のプライマー対のみを含む。例として、一実施形態では、第１のプライマー対（及び第１のプローブ）は第１のウェル中に存在するが、通常その他のウェルのいずれにも存在せず、第２のプライマー対（及び第２のプローブ）は第２のウェル中に存在するが、通常その他のウェルのいずれにも存在しない、などである。或いは、単一のウェル中に２以上のプローブが存在していてもよい（その対応するプライマー対も存在していてもよい）。
【００５９】
各プローブはそれぞれのウェル内に固定することができ、前記固定は永久的（例えば、任意の市販の化学架橋試薬によって導入されてもよい共有結合を介して）又は一時的（例えば、水素結合などの非共有結合又はイオン結合を介して）であってもよい。例えば、第１のプローブは第１のウェル内に固定することができ、第２のプローブは第２のウェル内に固定することができる、などである。それぞれのプローブを固定すると検査カードの取り扱いが容易になり、貯蔵安定性が高まり、ウェル間でプローブが移動する危険性が最小限に抑えられる。プローブは、ウェル内に存在する表面に、例えば、ウェルの壁などに単純に吸着させることによってウェル内に固定することが好ましい。したがって、一実施形態では、プローブを含有する溶液を調製し、ウェルの表面に適用し、次いでウェルの表面上で乾燥させる。ウェル表面に適用する前に、従来の安定化化合物（例えば、糖）をプローブ含有溶液に添加してもよい。
【００６０】
検査カードには、１又は２以上のウェルを追加して含めることができる。非定型大腸菌株を検出するために前述の検査カード実施形態のそれぞれはさらに、１又は２以上のウェルを含んでいてもよい。前述の検査カード実施形態のそれぞれはさらに、１又は２以上の「対照」ウェルを含んでいてもよい。
【００６１】
一実施形態では、標的核酸配列によってコードされるポリペプチドマーカー及びそれらを検出するための方法を提供する。このようなポリペプチドマーカーは、抗体、ＨＰＬＣ、質量分析の使用を含む従来のタンパク質検出方法によって検出することができる。一実施形態では、本発明のポリペプチドマーカーの長さは少なくともアミノ酸１０個である。一実施形態では、本発明のポリペプチドマーカー長さは少なくともアミノ酸２０、３０、４０、５０、６０、７０、８０、９０又は１００個である。
【００６２】
定義の項
少なくとも８０％の配列同一性に関しては、（本明細書で提示したありとあらゆる核酸配列及び／又は本明細書で提示したありとあらゆる配列番号に対して）少なくとも８２％、少なくとも８４％、少なくとも８６％、少なくとも８８％、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％及び１００％の配列同一性を含む。
【００６３】
本明細書を通じて使用したヌクレオチドの１文字表記コードは以下を意味する。
Ａ  アデニン
Ｃ  シトシン
Ｇ  グアニン
Ｔ  チミン
Ｕ  ウラシル
Ｉ  イノシン
Ｘ  イノシン
Ｒ  グアニン又はアデニン
Ｙ  チミン又はシトシン
Ｋ  グアニン又はチミン
Ｍ  アデニン又はシトシン
Ｓ  グアニン又はシトシン
Ｗ  アデニン又はチミン
Ｂ  アデニンではない
Ｄ  シトシンではない
Ｈ  グアニンではない
Ｖ  チミンではない
Ｎ  任意の核酸塩基
【００６４】
本明細書で提示した核酸配列は全て５’から３’（左から右）の方向で表される。
【００６５】
本発明のプローブは、問題の標的大腸菌株に存在する標的核酸配列にハイブリダイズするように設計する。結合条件は高レベルの特異性がもたらされる、すなわち、プローブのハイブリダイゼーションが「ストリンジェント条件」下で生じるようにすることが好ましい。一般的に、ストリンジェント条件は、規定のイオン強度及びｐＨでの特定の配列の熱融点（Ｔｍ）よりも約５℃低くなるように選択する。Ｔｍは、標的（又は相補的な）配列の５０％が完全に一致したプローブにハイブリダイズする（規定のイオン強度及びｐＨでの）温度である。これに関して、本発明のプローブのＴｍは、ｐＨ７で約０．０２Ｍ以下の塩濃度で、例えば、６０℃超、例えば約７０℃である。
【００６６】
予め混合された緩衝液溶液は市販されており（例えば、CLONTECH Laboratories, Inc.社製EXPRESSHYB Hybridisation Solution）、ハイブリダイゼーションは製造者の指示に従って実施することができる。
【００６７】
本発明のプローブは自己相補性（Self-complementarity）及び二量体形成（プローブ−プローブ結合）を最小限に抑えるためにスクリーニングし、ヒトＤＮＡとの相同性が最小になるように選択する。選択方法は通常、候補プローブ配列とヒトＤＮＡとを比較し、相同性が５０％を上回るならばそのプローブを不合格にすることである。この選択方法の目的は、混入するヒトＤＮＡ配列に対するプローブのアニーリングを抑え、したがってアッセイの特異性を高めることである。
【００６８】
本明細書で記載したいかなるプローブもタグ及び／又は標識を含むことができる。タグ及び／又は標識は、例えば、本明細書で記載したプローブの中央に向かって、又は５’若しくは３’末端に向かって、又は５’若しくは３’末端に、例えば、５’末端に（互いに独立して）位置していてもよい。
【００６９】
したがって、タグ付け／標識されたプローブが標的核酸のハイブリダイゼーションした後に、タグ／標識は標的核酸に結びつく。或いは、増幅ステップを使用する場合、プローブは本発明の方法においてプライマーとして作用することもでき、したがってプライマーが伸長するにつれてタグ／標識が増幅産物に組み込まれてもよい。
【００７０】
適切な標識の例には、放射標識又は蛍光若しくは有色分子、酵素マーカー又は色素原マーカー、例えば、プローブのハイブリダイゼーションによって可視の色変化を生じる色素などの検出可能な標識が含まれる。例として、標識はジゴキシゲニン、フルオレセイン−イソチオシアネート（ＦＩＴＣ）、Ｒ−フィコエリトリン、Alexa 532又は Ｃｙ３であってもよい。プローブは、好ましくはFam標識（例えば、５’Fam標識）、及び／又は副溝結合剤（ＭＧＢ）を含有する。標識は、写真若しくはＸ線フィルムへの露光などによって直接的に検出されるレポーター分子であってもよい。或いは、標識は直接的には検出できないが、間接的に、例えば、２段階の系で検出することができる。間接的な標識検出の一例は、抗体と標識との結合である。
【００７１】
適切なタグの例には、「相補体／抗相補体対」が含まれる。「相補体／抗相補体対」という用語は、適切な条件下で非共有的に結びついた安定な対を形成する、同一でない部分を意味する。適切なタグの例には、ビオチン及びストレプトアビジン（又はアビジン）が含まれる。例として、ビオチンタグはストレプトアビジンを使用して捕捉することができ、ストレプトアビジンはビーズ（例えば、磁気ビーズ）又は膜などの基質又は支持体にコーティングすることができる。同様に、ストレプトアビジンタグはビオチンを使用して捕捉することができ、ビオチンはビーズ（例えば、磁気ビーズ）又は膜などの基質又は支持体にコーティングすることができる。相補体／抗相補体対のその他の例には、受容体／リガンド対、抗体／抗原（又はハプテン若しくはエピトープ）対などが含まれる。別の例は、相補的配列に結合する核酸配列タグである。後者は、それ自体予め標識することもでき、別々に標識された表面（例えば、ビーズ）に付着させることもできる。後者の実施形態の例は、周知のLuminex（登録商標）ビーズ系である。その他のタグ及び捕捉分子の対の例には、受容体／リガンド対及び抗体／抗原（又はハプテン若しくはエピトープ）対が含まれる。その後、相補体／抗相補体対の解離が所望される場合、相補体／抗相補体対の結合親和性は、例えば、１０９Ｍ−１未満である。
【００７２】
本発明のプローブは異なる標識又はタグで標識することができ、それによって本発明の方法で使用するとき各プローブを別々に同定することが可能になる。
【００７３】
任意の従来の方法を使用して核酸タグを本発明のプローブ（例えば、プローブの５’末端の規定の結合領域）に結合させることができる。或いは、本発明の核酸プローブ（予め結合させた核酸タグを有する）は、供給業者によって構築されたものであってもよい。
【００７４】
試料は、例えば、血液、痰、鼻及び喉スワブ、気管支肺胞洗浄液、気管吸引物、鼻咽頭吸引物、肺組織試料、脳脊髄液、考古学的試料、糞便試料などの臨床試料である（又は臨床試料由来である）。試料は、好ましくはヒト組織／試料であるか、又はそれらから得られた試料（例えば、核酸抽出試料）である。
【００７５】
増幅ステップを使用する場合、このステップは当業界で公知の方法及びプラットフォーム、例えば、ＰＣＲ（例えば、Life Technologies社製「Fast DNA Polymerase」の使用）、例えば、リアルタイムＰＣＲ、ブロックベースＰＣＲ、リガーゼ連鎖反応、ガラスキャピラリー、ループ介在性等温増幅を含む等温増幅法、ローリングサークル増幅、転写介在性増幅、核酸配列をベースにした増幅、ＲＮＡ技術のシグナル介在性増幅、鎖置換増幅、等温多置換増幅、ヘリカーゼ依存性増幅、単一プライマー等温増幅及び環状ヘリカーゼ依存性増幅を使用して実施することができる。
【００７６】
使用する場合、増幅は任意の増幅プラットフォームを使用して実施することができ、こうしてアッセイのこの実施形態の利点は、独立していて、いかなる特定の計器にも縛られないプラットフォームであることである。
【００７７】
一実施形態では、一般的な増幅ステップ（例えば、検出前）を用いて試料中に存在する標的核酸の量を増加させることができる。この実施形態では、通常ＰＣＲ増幅プライマーを使用して、本発明のヌクレオチド標的を含有する標的／相補的核酸の約１００〜４００塩基対領域を増幅する。適切なポリメラーゼ及びＤＮＡ前駆体（ｄＡＴＰ、ｄＣＴＰ、ｄＧＴＰ及びｄＴＴＰ）の存在下では、フォワード及びリバースプライマーが５’から３’の方向に伸長し、それによって標的核酸の個々の鎖と相補的な新たな核酸鎖の合成が開始される。それによって、プライマーによって標的核酸配列の増幅が駆動され、それにより前記標的核酸配列を含む増幅産物が生成する。
【００７８】
一実施形態では、本発明のプローブがプライマーとしての機能を果たす増幅ステップを使用することができる。この実施形態では、プローブ（プライマーとして働く）は、３’末端方向から（すなわち、５’から３’）伸長する。得られた増幅産物は通常、標的／相補的核酸の１００〜４００塩基対領域を含む。この実施形態は、前述のものなどの一般的な増幅ステップと併せて使用することができる。
【００７９】
検出ステップは、任意の公知の手段によって実施することができる。これに関して、プローブ又は増幅産物はタグ付け及び／又は標識されていてもよく、したがって検出方法は前記タグ及び／又は標識を検出することを含んでもよい。
【００８０】
一実施形態では、プローブはタグ及び／又は標識を含んでいてもよい。したがって、一実施形態では、タグ付け／標識されたプローブと標的核酸のハイブリダイゼーションの後に、タグ／標識が標的核酸と結びつくようになる。したがって、一実施形態では、アッセイは、タグ／標識を検出し、タグ／標識の存在と大腸菌核酸の存在とを関連づけることを含んでいてもよい。
【００８１】
一実施形態では、タグ及び／又は標識はプローブの伸長中に組み込まれてもよい。そうする間に増幅産物がタグ付け／標識され、したがって、アッセイには、タグ／標識を検出し、タグ／標識の存在と増幅産物の存在、したがって大腸菌核酸の存在との関連づけが含まれていてもよい。
【００８２】
例として、一実施形態では、増幅産物は増幅方法の一部としてタグ／標識を組み込むことができ（例えば、ビオチン−ｄＮＴＰなどのタグ付け／標識されたｄＮＴＰを介して）、アッセイはさらに、検出可能なタグ／標識（例えば、Ｒ−フィコエリトリンなどの蛍光標識）を含む前記タグと相補的な結合パートナー（例えば、ストレプトアビジン）の使用を含んでいてもよい。このようにして、増幅された産物に検出可能なタグ／標識（例えば、Ｒ−フィコエリトリンなどの蛍光標識）を組み込む。
【００８３】
一実施形態では、プローブ及び／又は増幅産物は、増幅産物の捕捉を可能にするためにさらなるタグ／標識（相補体成分として）を含んでいてもよい。
【００８４】
例として、抗相補体捕捉成分が前記さらなるタグ／標識（相補体成分）に結合し、それによってプローブ及び／又は増幅産物の捕捉を可能にする「相補体／抗相補体」対を使用することができる。適切な「相補体／抗相補体」のパートナーの例は本明細書の始めの方で記載しており、核酸配列の相補的な対、相補的な抗体−抗原対などである。抗相補体捕捉成分は、基質又は固体支持体に付着させる（例えば、コーティングする）ことができ、適切な基質／支持体の例には膜及び／又はビーズ（例えば、磁気若しくは蛍光ビーズ）が含まれる。捕捉方法は当業界では周知である。例えば、Luminex（登録商標）ビーズを使用することができる。或いは、ビーズ（及び捕捉し、タグ付け／標識された増幅産物）は当業界で公知の従来技術を使用して容易に濃縮し、試料から分離することができるので、磁気ビーズの使用が有利であり得る。
【００８５】
固定によって、抗相補体捕捉成分（又はプローブ）に物理的な位置が与えられ、捕捉成分／プローブを所望する位置に固着させ、及び／又はプローブの回収又は分離を容易にするために役立ち得る。支持体は、例えば、ガラス又はプラスティックから形成された剛性固体支持体、例えば、ビーズ（例えば、蛍光若しくは磁気ビーズ）などであってもよい。或いは、支持体は、ナイロン又はニトロセルロース膜などの膜であってもよい。３Ｄマトリクス、例えば、ポリアクリルアミド又はＰＥＧゲルはまた、本発明で使用するために適切な支持体である。支持体／プラットフォームへの固定は、様々な従来手段によって実現することができる。例として、ナイロン膜などの支持体への固定は、ＵＶ架橋結合によって実現することができる。或いは、ビオチンで標識した分子は、ストレプトアビジンコーティング基質に結合させることができ（逆の場合も同じである）、アミノリンカーを用いて調製した分子はシラン処理した表面に固定することができる。固定の別の手段は、例えば、３’又は５’末端のポリＴ尾部又はポリＣ尾部を介する。前記固定技術は、本発明のプローブ成分（及び存在するならば、プライマー対成分）にも同様に当てはまる。
【００８６】
一実施形態では、本発明のプローブには、核酸配列タグ／標識（例えば、各プローブに、標的／相補的核酸に結合するプローブの定義された配列の５’末端に結合させた）が含まれる。より詳細には、プローブのそれぞれに異なる核酸配列タグ／標識が設けられ、前記タグ／標識のそれぞれがビーズの表面上に存在する相補的核酸配列に（特異的に）結合する。異なるタグ／標識のそれぞれは、独自に同定可能なビーズ上に位置するその相補的配列の対応物に結合する（その他のタグの相補的配列のパートナーのいずれにも結合しない）。この点に関して、ビーズは、例えば、特定の波長の蛍光によって独自に同定可能である。したがって、使用するとき、本発明のプローブは標的核酸（試料中に存在する場合）に結合する。その後、結合したプローブ（のみ）を１又は２以上の標識されたｄＮＴＰ（例えば、ビオチン−ｄＣＴＰなどのビオチン標識ｄＮＴＰ）の存在下で（３’方向に）伸長させることが可能である。
【００８７】
伸長したプライマーは、標識されたｄＮＴＰ（例えば、ストレプトアビジン標識Ｒ−フィコエリトリンなどのストレプトアビジン標識フルオロフォア）に対する結合パートナーの対応物と接触することができ、この結合パートナーの対応物は伸長したプライマーに組み込まれたそれらの標識ｄＮＴＰに結合する。その後、標識された伸長プライマーは、独自に同定可能なビーズ上に存在するそれらの核酸の対応物と結合させることによって同定することができる。次に、後者を（例えば、波長放射によって存在するビーズの種類を決定するために）「呼び出し」、プライマー伸長の性質（したがって、存在する標的／相補的核酸の種類）を決定することができる。
【図面の簡単な説明】
【００８８】
【図１】例えば、１枚の検査カード上に存在する８つの別個のカラムによって８つの異なる試料を並行して分析することを可能にする、３８４ウェル検査カード（別名プレート）ＲＴ−ＰＣＲプラットフォームを使用することが可能である、Applied Biosystems 7900HT（ハイスループット）計器を示す図である。
【発明を実施するための形態】
【００８９】
第１のプローブは、TTACGACCCAAAGCGAGGCAT（配列番号４３）に対して少なくとも８０％の配列同一性を有する核酸配列を含む。
【００９０】
第２のプローブは、TCCGATGTAACCTGCAACTACGCG（配列番号４４）に対して少なくとも８０％の配列同一性を有する核酸配列を含む。
【００９１】
第３のプローブは、TCAGTGCAAGCTGGCATAGCACTA（配列番号４５）に対して少なくとも８０％の配列同一性を有する核酸配列を含む。
【００９２】
第４のプローブは、ACCAAGGTTCCGCTCTTGATCGAA（配列番号４６）に対して少なくとも８０％の配列同一性を有する核酸配列を含む。
【００９３】
第５のプローブは、AACTGTTGTAGTGGGCCTGTTCCA（配列番号４７）に対して少なくとも８０％の配列同一性を有する核酸配列を含む。
【００９４】
プライマー１ｆは、TCTGGAGGCAACAAGCATAAA（配列番号４８）に少なくとも８０％の配列同一性を有する核酸配列を含み、プライマー１ｒはAGAGAAAGGGCGTTCAGAATC（配列番号４９）に少なくとも８０％の配列同一性を有する核酸配列を含む。
【００９５】
プライマー２ｆは、TCGCATTCCATTTCCCATGA（配列番号５０）に少なくとも８０％の配列同一性を有する核酸配列を含み、プライマー１ｒはCGGCGTTGCATACCATTTAAG（配列番号５１）に少なくとも８０％の配列同一性を有する核酸配列を含む。
【００９６】
プライマー３ｆは、GATATTGCTGCGTTGCCTTTC（配列番号５２）に少なくとも８０％の配列同一性を有する核酸配列を含み、プライマー３ｒはGTAGCTTCATAGCGGTCGATTAC（配列番号５３）に少なくとも８０％の配列同一性を有する核酸配列を含む。
【００９７】
プライマー４ｆは、ACCAGCATTCTCAATCTCTTCC（配列番号５４）に少なくとも８０％の配列同一性を有する核酸配列を含み、プライマー４ｒはGGACTTACTCTGTCCCAATTCC（配列番号５５）に少なくとも８０％の配列同一性を有する核酸配列を含む。
【００９８】
プライマー５ｆは、ACCCATTCCATCGCAAGAC（配列番号５６）に少なくとも８０％の配列同一性を有する核酸配列を含み、プライマー５ｒはGCGTCAATGTCCGGGATTAT（配列番号５７）に少なくとも８０％の配列同一性を有する核酸配列を含む。
【００９９】
配列相同性／同一性
パーセント同一性を決定するには、限定はしないが、網羅的方法、局所的方法及び、例えば、区域からアプローチする方法などのハイブリッド法を含む様々な配列アラインメント法のいずれかを使用することができる。パーセント同一性を決定するためのプロトコルは、当業界の範囲内の所定の手法である。網羅的方法は、分子の最初から最後まで配列をアラインメントし、個々の残基対のスコアを合計し、ギャップペナルティを課すことによって最良のアラインメントを決定する。非限定的な例には、以下のものが含まれる。例えば、CLUSTAL W：例えば、Julie D. Thompson et al.、CLUSTAL W: Improving the Sensitivity of Progressive Multiple Sequence Alignment Through Sequence Weighting, Position- Specific Gap Penalties and Weight Matrix Choice, 22 (22) Nucleic Acids Research 4673-4680 (1994)を参照されたい；及び反復改良、例えば、Osamu Gotoh, Significant Improvement in Accuracy of Multiple Protein. Sequence Alignments by Iterative Refinement as Assessed by Reference to Structural Alignments, 264(4) J. Mol. Biol. 823-838 (1996)を参照されたい。局所的方法は、入力した配列全てが共有する１又は２以上の保存されたモチーフを同定することによって配列をアラインメントする。非限定的な方法には、以下のものが含まれる。例えば、Match-box、例えば、Eric Depiereux and Ernest Feytmans, Match-Box: A Fundamentally New Algorithm for the Simultaneous Alignment of Several Protein Sequences, 8(5) CABIOS 501-509 (1992)を参照されたい；ギブズサンプリング、例えば、C. E. Lawrence et al., Detecting Subtle Sequence Signals: A Gibbs Sampling Strategy for Multiple Alignment, 262 (5131) Science 208-214 (1993)を参照されたい；Align-M、例えば、Ivo Van Walle et al., Align-M - A New Algorithm for Multiple Alignment of Highly Divergent Sequences, 20 (9) Bioinformatics: 1428-1435 (2004)を参照されたい。このように、パーセント配列同一性は従来の方法によって決定する。例えば、Altschul et al., Bull. Math. Bio. 48: 603-16, 1986及びHenikoff and Henikoff, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 89: 10915-19, 1992を参照されたい。
【０１００】
配列間のパーセント相補性を決定するために同じ方法を利用することができる。この場合、相補的塩基対間、例えば、１ヌクレオチドと相補的ヌクレオチドのアラインメント間のパーセント同一性を決定する。
【０１０１】
前記で提供した特定の配列のバリアントは、配列バリアントと前記で提供した特定の参照配列との間で異なるヌクレオチドの数を列挙することによって代わりに定義することができる。したがって、一実施形態では、配列は前記で提供した特定の配列とはヌクレオチド位置が２以下、例えば、ヌクレオチド位置が１以下異なるヌクレオチド配列を含んでいてもよい（又はそれから構成されてもよい）。保存された置換が好ましい。
【０１０２】
例として、プローブ配列バリアントは、（配列番号１）、（配列番号２）、（配列番号３）、（配列番号４）又は（配列番号５）から選択される核酸配列を含んでいてもよい。
【０１０３】
前記で言及した配列の断片（及び前記で定義したそれらの配列バリアント）はまた、例えば、本明細書で記載した規定の配列の１０、９、８、７、６、５、４、３、２又は１塩基対を含む断片を使用することができる。
【０１０４】
【表１】
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【０１０５】
【表２】
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【０１０６】
【表３】
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【０１０７】
【表４】
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【０１０８】
【表５】
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【０１０９】
表１で同定した特異的ＳＴ系列標的の配列
ＳＴ７３＿領域−１（配列番号１）
TCGTAATTCTTTTTAATATCCTTATAAAATAATTGTTTTAAATGGTGGTATTTAAACCACCATTTTGTTCTTAATTTTTGTATAAAGACCAGGTACGTTCTAGTATTTTTAATGCAGCAGGTAACTGCTCAATCATTTTACCAGAAACTTCATAATCGCTTTCTTTGTTGTTTAATGGATTAACAGCAACGTAGGAAATCGTTGATGTTGGCTTAATTATTTTAAAAACTTCCTTTGCAGATTCACCATAGATGAAAGGTAACTTTGAATTAATAGAGATTTCTTGTTTATCGACCATAAACCTGGTAATAGCAGAGAAATGAGTCTCCCCATGACTTATAACATAGCCTTTCGGAACGTTAATTTCTTTCAGCTCAGGAATATACTGAACATAAAACTGTAAATCTTTCACATAGCAAAATTTTGCACTACTATCATTATTCTTCGATTTACGGTTTTCGCATTCCATTTCCCATGAAAATAGTCCGTCTCCGATGTAACCTGCAACTACGCGTCCATGACTTAAATGGTATGCAACGCCGTCAACAGTGCCTTGCTCTTCTGAAGAAAAACTGAATTCTTTATTTTCTTCATTATACGGACTGATAGAACAAACTATCTTTCCTTGAGGAAAAATTGGTCTTTTGGTGAATAACATATCCTCCGACAAAATGGTAAAACCATCAATGGTGGTAATTGTTTTTTTAATTAAATACTCACTGCAATTGACTTCCTTTAAGGCTTCTTGTTTTTGAGCCCATGATAATTCTGCAGTTGTTAATTTACGATAAAATTTTTCAGTGTAACTTTCAGCCGCCGCAAAGTGTGACAGTGACGATAAAACAATAATTCCCATGAATGTTTTTTTCATGTATATATCCTTATAGGTATGCTTATCAAATAATTCAATGGAAGTATATCGATAAAAATAAAGCCGAACATGTTAATAAACATACTCGGCTTTATTTTCGGAATTACACCCCTATTGTT
ＳＴ７３＿領域−２（配列番号２）
TTACTTCACCACTTCCATCAGCTTACTGAAGCTATCCACTACGTCATACTTCACGTTTTCTGGAGCAAACGTCTTGTTAACCGCATCGAAGAACTTACGGGCACATTTAATCTTGGTGGCTTCAATAGGCCGTAAATCCAGTGACGACATCGAGCCCTTGGTCTCAGCAACGAAATACACATGCTTGACCGAGCCTTCTTTGAAGGAAATAGCCCAGTCGGGGTTGTAATCGCCGACAGGGGTTGGGATCAGAAAACCACGTGGCAACTTGGCATATACCACCACATCCTTGCTGGTATCCAACTCTTCGACGAACTTGCGCTCAATTGCAGAGTCGGTAAGCACGTAATCATAGATGTGATTTTGCAATTTATTCCCAGCCTTACTGAGATCCTGTTTGCTCTGACCCGTGGTAAAGATGTCCAAATCAAACTTGTCTTCTAGCGTGTCATAGGCCAGATGCTCGATGATGACATTGGCCTTTTGTTCGTTGACCAAGCGAATGACTTCGGCAATGAAACTTTCCGGGTTGCTCTTGAATTGCGCGAAGACGTCAGCATGGAGACCTTTTAGAATTTCGGCAATGGTTCGTCTTGTAAGCAAAGTCCCCTCTGATAACTTACCAATCAAGTCGTACTGCACAGCGGAGTGGATAGAGGCGGTGTGCGATTCTGTTTCGGTAACTTTCAGCTCGAAGGCGATACCCTTTTTGAGGTCATCGTAAGTTGCCGTATCAGCCTGCTTGCCACGGTGAATGGTGTATTGTAACGGCGTTACTCGTAACCCAGCATTCTTATCATTGAGCGCCTTGATCGCATTGTTCACTAGCTCAACATCATCAAACAGTACGCTGTAGGTAGCTTTGCGATTGATTCGCCCCCACAGCGCTTTGAACTCCTGCTTTTCAAAGTTGGCGTTGGTCTGCAGTCTTTTGGGCTTGCGTCCATCTTCTACCTGCATGAGCTGGCTTTCGCTGAATACGCTGTTAATCAGCTGGAATACCTGCTCTGCATAGGGCTGCAGCTCGTCCGGCAATGCCTCTAATGTGCCGTCTTTCTTAGCTTGGTGGTATTTCTCTGTGATATTGCGCTTCTTATCGACGTAGCCATTCTGGATCAGATAAAACTCGATGTCCGTGGCTTGGTCGTCCGAGACCGTAATCGGGCCTTCCTTCGTGTTCAGCATCTTGCCCGTGAAGTAGGCCTTGTCCGCCACACGCGGGCGAGCAGACAAGGAGTCGCTAATGTCCTTCTGCAAGGCGGTCACGAAGTCCTTGTAACTTTCGCTGGCCACAACTGTCAGTACGTTAATGTCATGAACAATGGATGGGTGATCCATGCGTTCACCATTTTGATTGACGGACAAACGCAGGCCGCGCCCGACCTCTTGGCGGCGTGAAATGGTGTTATCACTATGCTTGAGTGTGCAGATAACAAACACGTTGGGGTTATCCCAGCCCTCACGTAAGGCCGAGTGTGAGAAGATAAAACGCACCGGCTCAGCTAGTGATAATAACCGTTCCTTGTCTTTGAGGATTAGATCATAAGCATCTACGTCATCCGACAAGCCCGCATTTTCACCGCGCGCAGCGGCTTTGGGATCTGTGAGGCGCTTGCTCTTCTTGTCGATGGAAAAGTAGCCGCTATGCGTCTTATCGGCCGCAATGCGGCGTAGATATTTAGCATAAGGGGCATCCCCCTCCATAAACCCATTATCAAACACTTCTTGAATGTGCTTAGCGTACTCCTCTTCAAATATTTTTGCGTACTCTCCCTTTTCATCGACAGCGGAGTAGTCCCGGTACCTGGCCACTTCGTCAATAAAGAACAACGAGAGAACCTTCACCCCTTTATCGAAGAGCTCCATCTCCTTATCAAAGTGCGCCTTGATCGTCTCACGGATCTGAATGCGGCGCAGCGCTATCTCGGAAATATCACCAATCACATCACCCACCGTCAGTTCTACGCCATTGGTAAAGCTCAAGGTGTCCGTATTGGCATTGATGTCCGATACCACAAACCCATCGCGGTATTGATCCAGCTCGTTCGATAGCACAAACAGATTGTCACCCTTACCCAGTTTGCGAGTGACGCGCTTGATGTTTCCACCGCTGAGTTTCTGTTCGAACTCTACAACCGCTACTGGCGGTTTTTTGTTTGAGATTTCGATGGATTGTAAATAGAGATAGGCATTGGTTCCCGCCAGTCCCTTCACCGAGATACCACGCACCTCAATCTTCTTCACCAGCTTCTGGTTGTAGGCATCGAGCGCATCTAGGCGGTGAATTTTGTTGTGTGTGGTCTTGTGTGTAGCGGAATAGCGCAACACCATCAACGGGTTGAAATTAGCCAAGGAATCTAGGGTCTTGCCCCCCTCCATCCGCTGCGGCTCATCGAGGATCAAGATGGGTCGGTTTGCGCTGATCACATCGATCGGGCGACGTGACTGAAAATCATCGAGCGCTTCATAGATACGGCGGTTATCTTTGCCAGTGGCGTTAAACGCTTGTACGTTGATCACCATGACATTGATACCGGCATCTGAGGAGAAACTCTCCAGATGGTGCAGCTGCTTAGAGTTGTAAATAAAGAAGCGTGCCTTCTTGTGATAGGTCTCCTGAAAGTGCTCGGCCGTGATTTCCAACGACTTGGCTACGCCCTCGCGGATGGCAATGCTCGGCACCACTATGACGAACTTGCTCCAGCCGTACTGTTTGTTCAGTTCGAAGACTGTCTTGATGTAGCAATAGGTCTTGCCAGTACCCGTTTCCATCTCGATATCAAGATTTAGCTTGGCGACCTTGGTCTTGACCAAGCTCTCCGACAACGGCAGATTTTGCTGGCGCTGCACCTGCTGGATGTTATCAAGCAATGCAACCTCACTAAGGGTTAGCTCAGCATTTTTAAAACCAGTATCTACCGCAAACAGATCACCCATACCGTTTTTGGTATTACCAGGGTCAAGGCGATAGCTCATGGCCGCATCAGAGGCCGGTGGCTGCCCCTGAAAAATATCGACGACCGCCTGCACTGCGGCAGCCTGATAGGGTTGATGTTTGAATTTAAGCTTCATTGCACCGTCCCCCTCAGATACATTTTACTTCGGTGACAGGCGACATGAGCTTGAAAATCTGCTCGACATTGATCTTGACCGCACTGTTCTTAAAGCCCGCGTCGCGGAACACAACGCGCAGCGGCTGCAGTTTGGCCAGTTCCTTCACGAAGGTTTCGTCAATGCTGCCACTGGCGTCGAAGCAGGCGGTAAGCACATTGCCATCGACAAAGAACACGTCTTTACCTTGGATGGACTGCTTGGCGATAGGCAGGGCCAGATCGACGCCCCAATCCAGCATTACTTGGAACAGCAGATCCTCAGGCGTGCGATCAGGCTTGATGTTGTCAACAAACAAGTCGAGATTGGCTTTTTCCAGCACATCGGGGCTGTAGTAGACGTCAGCCATGTTCGATGTATCGACTTTAAGCAGGCGAAATCCTAAGTCAAGTTCCGTATTTCTTGTAGCCAATATTTCTGAAAATTCTTCTCTAATTTTTTTTGCAGCTCTCCGAATGCGATTTTTTCCAATCTCCGAAACTACTGAGTATCCAAGTTTTTTGGCTTCAGACTTCTCGTCACATTCCTCGGGCAATTGAACCATTATGAATCGACGATTTGCCCCATCTTCCGCATTCAAAAGCATAAGTGCATGCGCCGCCGTGCACGAGCCAGCGAAGAAGTCGATCAATATATCGTCATTCTTGCAAATTGATTGAATTAGTCTCTTTGCTACCTGAACCGGTTTCGGTGTATCAAAAGGAATTTTAAGGTCAGCAAGCAAAGCGTCGTCACTGCCACCGTAATAAAGTAGAGAAGGGATATTTTCGAATAAATTGTCATTCAGCCGATATTTTCTTGTTGGCTGCGTCTTCTCGTCTGGACCGAAAATAATCAACCCTGACTTCAAGAGTTCTTGCATTGTTGCAGGAGGGTTTCGCCACCCACGCTCAGGAACAGGGCACTCCTTCCCTGTTACAGGATGAATTAGCGGAATGAAATAATCTTCCGGTGCTTTTTTCTTATTCGGCCACGCCATAGAAACCGGACGGAAGACGTCGCCATTGTCATCGATTTGATTATATGCCTTTTCCCCCCCAGTTAGATCTTGCTGGTTTACCCAATCTTTGTATTCTTTCCTTGCTTTTTCAGTTACCCCGCCCTCCTTGCTAAGAATCTGCTTGGCTTTTGCAAGCATTTTTCCTGCATTCTCTTTTGGTCGCTGGAACTCGCAGGTTGTCTTGAAGAATTCTCGATCTTTGCAGTAAATACAAATTAGCTCATGCTGCTGCGCGACACCTGTGGCATCACCTTTTGGATTTCTCTTATCCCACACAATAGTTCCGAGATTATTCTTCTCACCATATATTTCTGCCAGAAGCTTCTCCAGGTTGGGATATTCATTCTCATCAATATGAATTACGATTAATCCATCATCTCGTAGCAAGTTGCGCGATAACTTTAGTCTCGAATACATCATGGACAGCCAGTCTGAGTGAAAGCGCCCGCTTGTTTCGGGGTTGGCTGTTAAGCGGTTTCCTTCTCTATCCACCTGATTTGAACGAAGAAAAAACTCAGAGACCTCGTCTACAAAATCGTCGGCGTAAACAAAATCGTTTCCCGTGTTGTACGGCGGGTCGATATAGACCATCTTGATTTTGCCAAGATAATTTTCCTGAAGCAGCTTCAGCGCGTCGAGATTATCTCCCTCGATAAAGATATTCTTGGTAGTGTCGAAGTTGACGCTCTCTTCAATGTGTTCGCCTTTTGAATTTTTTGTCGTACGTACTGGACGGAGCGTCTTTGCAATCGGTGCATTTGCAGTGAGCAGTGCCTCGCGCTTACCAGGCCAATTCAGCTGGTAGCGTTCCTGCGGCCCTTCTACAATCGAATCAGACAGTTCCTGGCGCAATTGGTCAAAATCCACTGCCAGCTTCACGCTACCATCC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TCTTCGATGCGGGTGACGACGAAATCCCGAAACTCTCTACTCTTGCGATCAAAGGCCCGTACGTGCCAGCGCAGGCCGGTATCAACCAAGGCAAAGGGCACAATTACCCGCTTGGACTCGCCGCTGCTCATCGAGTGGTAGCGGATGGCGACGGGTCGCTTAGCGTGGATTCCTCGGCAAATCGTGGCTAACACATCCATTTTGGGAATGCTTAGGGCTGCGGGGGATTCGCATGGTAGCA
GTGCCTGCATTGAGCCATTCACTCCATCGCCAAAACCGAGAGACAGCGCCGACAGAATGCGCAGCGATGCGTGCTCGAATAACGGGGAGAACTCCTGACCGATGCGATAGATCTTGTTGCTACCATCGAAGGTGATGTTATGCGGCACAATTTCCCGGTATAAAGCCAAATCGCGAGTCGCCCCTGCCGGAGCCACACCGAAGCGCTCAATCAGATCTGGGCGACCGATCTCACCGAAGAAGTAGAGCCGAAAATCGATGTAGGCCAGCCGATCGCGCTGGACCAGACTCAAGTCTTCAAGCCGCTTAGGAGGGGAACTAGACATGAATAATCACTATATAGGAAAATGAAAATTGAATACGGTAATCCATAAAGAGCCATGGTTGTAATCAAATTGATGACAATCATGCATTAATACTTATGTAACAGCAAGAAATGATGTCTTAAACGTAGACAATAATCGTATTGGCCGTGTTTCTATGATTGTAAAAGC
ＳＴ９５＿領域−１（配列番号３）
GTGGTTGTCCGCTTTGTGCCAATAGCGGACATTGCTGGCTCATGGTATGTTAGTTTAAGGAGGCAGGTTATGCTCTGTATTTCGCTGTGGTATAATAGTTGCGCAATTGATACAAGGGAGCGTTACATCGTGAAAATTGTTTTCGAGGTTAATGGAAAGAAAGTTCCACTAAAATCTTTAAAATACATAAGCAAAAAAGATCAACTCGAAGTAATGAAAAACTGGTTCTTTGAAAACTTTGAAGATCCGGCAAATGCTTGTCCGTATGAAAGTAGAGAAGGTGGCTATGCTTACATATATGGCGGGCCGTATGATGCGAGCGAAGAACTACAATCCATCTTCGGTCAATATGTTAAATCTGAGTATATTGAGGAATTAGTAGATGAATTACAAACACAATGTTTTGACTGGTCTGGAAACTCAAATAATATAGATGATTGGTACGATGATGATATCTACGACGCTGTAACGTCTTCCGGTAATCCGTATTTAAAATTCATTGATAATATCGATAAAATAAAAAAACTTGCAAAAGATAAAACTGAACAACAGCAAAAAAACCACTTGCTTAGTTTGCTCTACACGAATGTTATTACAGCTTTGGAAACGCTTTATGTTGAGCTATTCATTAATTCTATAGAGAAAGATGATGTCTACATAGCCAATTGTATAGAAAAAGGTAAGACTGAATTTAAAGTAAGCAAAGATATTGCTGCGTTGCCTTTCAAGGGTGAACCCATCGAGAAAATTAGGGGAGAGCTAATCAGGTCAATCAAGGAACACTTGATCAGTGCAAGCTGGCATAGCACTAAAAAGGTAATCGACCGCTATGAAGCTACATTCGATATAAAAGTACAAAAAGACTGTCCGATAGAAGCTATTGAATTGGCAACCCTCAATCGAAATCACTTAGTGCATCGTGGTGGAAAGGATAAAGAAGGGAACCTCGTAGTGATTACAGACCAGGATCTTGAAACGCTGATTGAAAATGCATCGAACCTGGCAATTATGCTCTACAACAGTTTAAATGTAGCAACGAATAAAACCACCATTTTGCAACCAGATGACAAACCGTTCATTCATGAATTTTAATAGCGCAGGTCATACATGGATATTCGCACACGAAAGACAAAATTTTTAGAGTCGTTAGATTCAACTGAAGTGATACGCAAAGCAGTAAGTCTCGCTATAGATTGCATTATTGATAATCATAATAGTAATGAAGATACCCCCTTAGTTATTACCAGCTATGATGATCTCTGTAGAATCCAGGTGCTAAATTATGTACAGGAGTTTTGCGAAGCTGCATTCCCTGATATGGATGAATATTACTTTAGTCCTAACATACTTCGCATCAACGGCAAGACTAGTGAAGAAGCTTGTATTAACTTAATTAAACTCTTAAGAAGTACAAAAGGCATGCTATTCTGGTCCGATGCCCCATCGTGGTTCGCTAGCCTCCCCGACGGATTATTCCATGTTGTTAACATTGATCAAAAAATCGTTACTCGCGGCCTTAATAAGAAAAACTCTAAGCCGACAATAATCAATAAAGATTACAGTGTAGATACACTACTATCAGAGCTATTTTTGAATGGCGCACACATGGAGCAACCCAACGTACACAACGTTTCTGAGGGAAACATGAAGTTCTATGATGAATGCCATGCTGGATTAATCAGACCAATACCCGCTCCAATAGGCGCGTCATACGATGAAGAGATCACAATTAATTCTCCAGATTGGCAAAAGCTCGCGTGTGTAGCTTTACGCCGCTATCAGTCGAAGGAATGTCATGACGGAATGCAATGGGATACAACCGATCATGGTTGGACTGATGTAATCGCGTATCCATTCGTCGAAGAAATACAATCAATGGATAATAGTGGTTATCGACAATGTTTAGTTGGGCTGGTCACAATAAACAATTCAAATGCAAATTCTCCGTACCTATCTACCGTTTGGATACATCCATTTTATCGCAGGAGAGGGTTATTAAGTAAGTTATGGCCAAAATTACAAGAGTTATATGGAAGTAACTTCGAAATTGAGCGACCTAATGAAAATATGAAAGCATTTCTGAAAAGTGCGAAACACGCAGATTACTAATTTATGAATCAGTCTGTGGAGTTAGGGTTGGTGTCAACAAGTAGGGTAAGAGCCTCAACGTGATGCTATGCCGACCTGCTCCCTGAGAATTCACACAGAAGGCTGCTAGCAA
ＳＴ９５＿領域−２（配列番号４）
TTATTGCGTGAGCTTCGCATGATAGCTGGAGCATCTCTTGTCATCACTAATTAGCTCCGCTTTATCCGTTCTTGCCCATATTATATTTCTTTTTATTATTTTTGCTGGATTACCGGCTGCTGCACACATAGATGGCACATCTTTAGTTACAATACTCCCATACCCAATGACAGATCCGCTTCCAACAGATACTCCTTTCATTATAGAGACATTTCTCCCTACCCATACGTAACTAGATATAATGATATCTTTTGCCCAATTAATCCTTTTTTTGCTATGAATATCAAATATAGGATGCCCATCTGATGCACGCAAAATAACATCTCTTGCTATCAT
ＳＴ９５＿領域−３（配列番号５）
TAACAGATGTGAGCGTTTGCTATGAGCGATATATAGTCATTCGTACCCTCCGATACTAATCATCACAGAAATTAATATATTCATTCCTTACTGAAAAGCTATGAAGTAGATATATAGGATTGGGGCGCGTATGGCACTGGACAGTTATGCATCTCCGAATATTATTCCGGAGCTAAGACAACCGAATGCCGCAGCAGGTAAGATCACGCTAGGGGGGCTGGACAGAATGGCTGTTACGCCCAGTGTGAAGAAAAGAAGGCTAAGTATGGTAGAATTTCCATACGCACAGACCTTGTTATCCGACTATACAGCCTGGAAGGCACTATGACAAATCTACAACTGGAAGAAAGATTTAGGGCGCTTGAGAAAGATTACGATGCGCTCATTTCCACAAAATATACTGCGCAGAACGTTCTCACTCACACTATGGAAACCTATGTTGATTCTGGTAAATATAAAAACTGGATCGCCAGAGTGAAAAAGTTAATAGAGGACAGCTACGGAAAAGAGTCTGATTATTACAATGACTTCAATACTGTAAACAGCAGGTGGTCTTCTAATTACAATACACTGATCAAAAGTTATAAACCGTTGTTTGATGCGGCGAGAGATGATCTTGCGCACTCTGCTGTCAGTACTAATACTCCTCAAGAAGGTTCGCCGCTGAGCCTCGTACTTAATATTCTTAACAGGTTTCCGACCTTTGTTCGCCAGTTAAAGAGGCGGTACAACGGCCGTGCGCCGCTTGAAGTTAATGATGAGTATGACGTACAGGATTTGATTTATGCACTGCTGACGCTTCATTTTAATGATATTAGGGCGGAAGAGTATACCCCCAGCTTTGCGGGCGCGGCCTCAAGACAGGACTTTCTTTTGAAAAAAGAGAAAATTGTGATAGAGGTGAAGAAAACCCGTGAATCTCTGGGAGCGGGTAAAGTTGGTGGAGAGTTGCTTATTGATATGGCGCGCTACCGCGCTCACCAAGACTGCGATACGTTGATCTTGTTTGTATATGACCCGGATTGCTACATAAATAATCCTTTGGGCGTGAAAACCGATCTGGAATCTAAAGACGCGGAAGGAAAAGTGAAGGTTGTTATTGCGCAGTTCTGACACGCTTAAGTGTCACCTTACAGGATTAGGTTTGCGGCCGTGCCAGCAGGACGAGCATGAAAAAGGCCGCTGGCACGGCCGGATTTGTCATCTTTGCCAGGTCAAATCAAAATCTACGTGAAAATCCGCAGGCTTAAGCTCGCAACTGCCACCACGCCCAATTAACGACGTTATGTTTACAACGTTTGAACCTGTTGAGATGGCAAGTTGAGTGTCATCTGTAAACGTGATGATTAGCATTTCAGTCTGATGAACCTGTACTCCAGTTTTCTGAAAACCAATCTGGACAGATTTCACCGTTTTCCCAACCATTTCACGGGCTTGATTGATAGAGTAATTAGCTTCAACTTGTAGGTCATTCCTGAACTTGGGTAGTGTCATTTTACATCCTCTTTAGTGAAGTTTTCGCTATTTAAATCAGCAGCATTCCTTTTAAATCACTGGCATGTCAGCAGTGGATAGTCTGAGTGTAACGTCCAGTGAGGGGAATAAATATTGGTCAGACTTTGCACAAAAGAGCCAACTATCGCGGGCTCTCTCTCATCATGTGCGAAAATTGACCACAATATGAAATCCAGTTCCATTCCGAAAT
ＳＴ９５＿領域−４（配列番号６）
TTTAAAGTGGGATCTAACTCTAATAATTTAAAAAATTTAATTGGGTCTTGATATTAATCACATAGACTCAATGCTCTTTAGTTCTTACATAGGTGGTTGTATTATGAGTATCCCCAGTTTAGATGTTCATAAAGTTGTTAAGTGCGCAGAGCATAAAAAGGCTTTAGATGCAATATCTCTCAAACTTAAGAATAACATTATTGACTCAAGCTCTGAATACGATTTTCTTGGCGACACAATAATTTTCAATAAAGATAAAAAAATAGGTTAACCCTCAAACTTTCAACATATGAACTAGAACTTATTTTCAAAGAAACACTGCTAGTCATTGATGAAGCTCCTGTATTGAAGTTTGCTGCCATTGACCCAACCGATGAAAATAACAACGAGCTGATTGATTTATTTTTATCCAAAGGTGGATTTATTTATATTAGAGAATACAAATCCGAGCCACATTATGAGTATGGCGACACTTCTCTATTTTTACATATACTTGACGCTACTCTTAAAGAGCTTAAATCTGCAAACAAAATATCCTATTAAATAAATTTTTGCTAACATAGCCCCGCGCCATGACAAGATTTTCTGTTCTAGATGCAAGGGCTATGTGTGAATATCTATAAACAAAAACCCCATCCGGTGATTTTTGTCATTTTTTAGCCATCTCAATTGCGGCATCAAAAAGTCGTTCAAGAATAAAATCAGGGTACTGTAATTTTTCTTGCTCGATATGAAGCTCATAAATTTTCCCTTCCCACTCCCATTTAAAATTAAATCCAGAAGCAGAAGGTGCGAAATGTGTTTTAGCTTTAGGGTTAGCGTAACCAGCAACAGTCAACACATCAAACTTAAAATCTTGAGGTTTAATACGCATAATCATATCCTTTGCCAAGTTCATCATTATTCTTCGCGATTATAAAACAATGAATAAAATCATTAAAGCATAGACGTTAAATATCCTCAAAATGTGATTAGTTGGGACATTGCGTCCTGATATACTCCTGCAAGTAATTGACCTGTGAGGTTATCTTGTCGATTCCACTTCGGAGACGGTAATAATGGAGTTCAGCATCTGCTGTAAGTCTAGGGCTTTCTCCATCGCCCATGCCGCTGGCTCCGGTCGTTGACTTTGTACAGGTGGCGGCGACTTGCAGGCGCTTATGCCCAGCAGAAACATCAGCACGAAGACTTTCGATAGTCGCATTAGCATCAGCAAGCTCCTTTGTATATCTGGCATCGAGTTCAGCTACATTACGTTGACGCTTCTGCATATCAGCGATGATGGATGTGGCTTTATCGCGCTGTACTTTGTAGACGATGGCGTCATCACGGTAATTATCAACAGCCCATGACAAGCAGACGATGATGCAGATAACCAGAGCGGATATAATCACCGTTACTCTGCTCATACCTGAATCTCTTTGACCGTTCCGCCGGCTTCTTTGAATTTTGCAATCAGGCTGTCAGCCTTATGCTCAAACTGACCATAACCAGCTCCCGGCAGTGAAGCCCAGATATTGCTGCAACGGTCGATAGCCTGACGAATATCACCGCGATCAATCATCGGTAAAGCACCACGCTCTTTAATCTGCTGCAGTGCAACAGCATCCTGGCTTTTTGGAGAGAAGTCTTTCAGTCCAAGCTGTTTACGGTATGCATCCCACCAGCGGGAAAGAAGCTGGTAGCGCCCGGCAGCCGTTGATTTGAGTTTTGGGTTTAGCGTGACAAGTCTGCGAGGGTGATCGGAGTAATCAGTGAATATTTCTCCGCCCACAATGACGTCATAACCATGATTACGTGTCGGTTGTAGCCCATTATCCGTTCCTTCTGACCAGGCCACCATATCGAGGAAAGCTTTACGCTGAGGATTAAGATTTTGCATTTTTCACCCCTGTCAGTCGTTCCCAGAAGTACGTCAGTGCAACCGAACCCATCGCACCACTAATCCCCGCAGTTGCGAGAATCATGTAAATACTGAATCCACTTTCGATACTGATTAGGCCACCAATAACACCGGTGAATCCTGATACAACTATCTGAGCGAGGGCATTTATCCAGCTCCACGTTGCTTTACTCTGCTTCACATCAATCAGGTAACGGACAAGCCCCCCCCAACCTGCGATGATCAGCAAAACAAGCCAGAACGCTCCGGCAAGATTCTCTTTTTCGTGCATATGAATAGCCGCAGTTTCGCCTCCGACAGAAAATCGGAGCGTGAAATGATATGTTGATTTATTATTAATTCGAAAATTACATTCTAATTCATCAGGCATTGATGATTTTATAATAATAAAGGCCGTTCGTTACGGCCTTTATTATTGATATTTATTTTACATCCCAAGGTAGTTCCTCAAGAGAGAAGACTAATTCATTATCAATAATTTCGTATTCTGCATAACCTTCAACCTCTCCTGAGAAGTTATTGTCAACGCATCCTTCATAATAGCTATATGGTGCTATAAAGTGAAACCCATATTCATCTATCTCTGTGATTTCAAAATTGTAGTAATCGTAAGAATATCGAATATCATCATCAGAAATAGAACTAAGTACATAGTTATTAAATTTATCGGAATGCTTAACGATAAGTTCTGACAACGCGTCAAGATTCTCTGGAGAGATATTTCCTAACGGTAATCTGTACTCAACGGCATTAATCAT
ＳＴ９５＿領域−５（配列番号７）
TTATTTTAAGTCATTATGCCAATCGTCTACTGTTTGAAACCAAATTTTTAACCTTTGCATAAAGGTACGATCCTTTTTGGGAGGGTGGTACCTTTGAAAAGAAGTATGTAACGCTTCGATAACTCCCATACAAGCATCAATTACTTCTTGTGCTTTAACCGGGCGATCGGCATCTGAAAGCTTGTGAGCGACCTCACAATCCAGAGTTGCTTTCTCTAGTACAGATGAGAACACCTCGTCAGGTATATACAGTCCTCTGCTTTCCAAAATGCAAATCAGTTTGGAAACTTGTTGAGCTTTAGCCAAGATAGTTAACAAGTATGAAACAGAAGCCTTTGTTCTATCCTTTTGCAACCTTAACAATCGATGCTTTGATGCTCTAATTTTAGGTTGAGTTGTCTGACTGAGCCAATAGTTAGAAGAAATATCAGAAATTTCAATAACTAACTTTGAAATAGCATCAATAATTGATTTCGATTCAGAACGTGTCGCCAGTTTTACAGAATTATTGTACGCAACTCGCCATCCAATGAAAACTAAGCAGACGCTAACTACTGTGATACACCACGAATACTGTCCTATTTGTGCTACTAATGACATTGGTTCCGTACTGATCAACTATCGCCTCTTATACTCTTTCTGGTTGTGCTAAATCAATAAATTTATCAATCTGTTCTTTGTAGAACGGAACATCACTTTTTATAATCAAACGTGCTTTAACGTTGGCTTTAGGTATCCCTTCCTTACGGATGAGACCTCCAAACGCCTCTTCTAAGAAAGAGGAACCAACACCCAGTGCTATACCGCGAAAATCAACCACAATCTCCTGTTCAGTACCCTTCAGCGCAGGCACCAAAAACTCTCTACGAAATCTTTCCGCACTGTGTGGGCTATCCGTTGTGTAACGTCCGAAAGGTGTTCTGGAGAACTCCTTCGCTATGACGATATTTCTCATAAAATCATCTCCTGGGAACCAGCGACCATTGTAGTAAAGTACCCGGTATGTACTCAGCTAGCTTCTCACATCGAGGACTACTGTCATTAGAATTATAGCTATAACGAGCCCTTCCTGTTAGTATCAGAAGTGTCTCATTATCCTCACAACCTGCCCCAATAGGTCTCTTGATATCTTCAGAGCCATTTCCCCGTCCGGAACCAACAAAGCGGGATTCCCCTACTAACATAGCTCTTTCCACAGAAGATACTTCGTTTTGAATGCTATGACCATCACCATTAGGCACGAAACTTCTATAAATCCCCAATCCAAGGTCACAAACGATAAAAACGACTTTATTTTCATCACGATTGAACCAAGCGCACTGCCACCATCGTTTACCTTTGAGAAGCTGAATATCTGACTCGAACCCCTCATCTTCATACGCATGATGAGAAACATTGAGCAAAGCTTCACTAATCGCTGTCAGCAGTAAGCCTAACTGTTCATTATTAAGCAGAGCACTTTTCTGCAGCATGAGTACTGTTTCAACAATATGCTCGTAAGGTTCGACAGCTGACTGAAAGTATCGTTCCTCCCTCGTAAGTGCATTCAGTTTCTCTTCTGTGCCAGCAAGCAAAGCACGAGCAAGTCCAGTACCAACGATCCATCTATGCCCAGATGGGTTATCATCCTTTTTAGGCCATTTAAAACGTATAAAATTAGGGTCCCGGGTTAAAAATTGAGCTCTATTTACTATGGCAAAGAACAGTACCGATGCCGCAGCTGAGGCAAATTTTACCTTGGACAAATCAACTATAACTCGACCTTTATTTTTTACTCCAATCGATTCAATCGAGTTGATGAAGTTCAATGTCCCAGCCCTAGAATCATCTGAGTAAATGCAAAATTTGCTTGGGGGTACCAGTATGGTCAT
ＳＴ９５＿領域−６（配列番号８）
ATGACATCGACGATGCATATGGACAGGGCCGATAAGAATAAAGTTGGCACCGTTGAAATTGAGGATCTACGGGTTATTCCGGTTATTTTTCTGCCCGGAGTCATGGGTTCAAACCTTATGGATAAGAAAGGAAAATCCATCTGGCGATATGATGACTCTATGAGTCTGATGGGCTGGTCACTACCTACATCAGGACCAAAAGAGAGGAAAAGATTATTGCATCCTGACAGGGTGGAGGTCGATAATCGTGGGAGAATTCCCGCACCTCCGGATGCCCAAGAAAAACTTATTCAGTTAGGTCAACAATATCCGGAGGACCCATCCGATAAAGAAGCAATGGATAATTACACTCAGGCAGTACGTGACATTTTGGATAATATAGAGCCAGAAGCGAAATTATTTGGTTCAAGAAAAGATCGCGGCTGGGGAGAGGTTGCAAATGCTAGCTACGGTTCCTTTCTCGATGTATTACAAACAGCATTGTACCGGGACAAACCTACAAAGAAAGGTGAGACGTTAAGTGCGACCTACCAGCAACTACTCGATGTACCTTTGGGTTTGGAGTATGGTCCTGACTCACTTGATGAAGAGTATCTTGAAGTCATAAGGTTGTATCAATTTCCGGTCCATGTCGTTGGCTATAACTGGCTTGGTTCTAATATGCTCTCAGCAATCAGACTACAAGAACAGATCAAGAAAATTGTTGGAGGCTATCAAAAACGAGGAATGAAATGCCATAAAGTTATTCTGGTTACGCATTCAATGGGAGGACTAGTGGCAAGGTACTTTTCAGAGTGTCTTTCGGGGAATACGGATGTCTACGGTATTGTTCATGGCGTATTACCATCAATTGGTGCTGCGGCGACATATACCCGAATGAAACGTGGAACTGAAAACCCAGAGTCAAATCCGGAAGGGTATGTTATCAGTCATATCTTAGGTCGTAATGCAGCTGAAATGGTAGCTGTTTTTTCCCAGTCGCCAGGACCAATGGAATTACTACCCATGAATGATTATGGTGAAGAGTGGCTTAATATTGTCGATCGTGATGGTAGTACATTAACGCTCCCTAAAAATCTTCCCATTAAAGAAGGTATTGCCCCCGAAGAACGCACCTACGCTGAACTTTATCTAAATAGAGAAAATTGGTGGAAATTGGTGGATGAGAATCTATTGAATCCTTTTAATACTTCATTAAATCAAAAGCAAATTGATACTGATTGGAATATATATGAAAATTTAATTACTGAGAGTGTCAATCCATTTCATAAGCAAATTGCTGGAAAATATCATATCAATACTTACTCTTTCTATGGGAGAGCGAAATTGGGAGATATTCCTGAAGCGCATTTAACGCAGGAAAATGTTCTTTGGAAAGGCTCATTATCAATGGGAAAAAAAAGTGATATATCTTTAGAACCAAAATTCATTGATGGTCGTCTTGATTTAAATGAAGTTGGTAACATTAGAACTATTAAGGATGAATTTTCTCCTGAAGAACAGGCGTGGGAAATAAATACTGACGACGGTGATACATATGTTAAGATAGGACAGCGTTTTACATTACGAGACTCTTGTGAAAACGGGGATGGTACAGTACCTCTTCGTGCAGGACAAATCGTACACAAGAACATCCTAGAGCGTTTGGCTGTACAGGTTTCTCACGAGGCTGCTTATCGAAATCCCGTTAGTCAGGCATTTGCATTACGTTCTATTATAAAAATAGCTCAGGAGGTAAAAAAGGATGGTAAAATGTCATACTCTGATTAACCGTAGAAATAAATGTCTGCTGATTGTTTTTATAGTCCTTATTGGATGGATTATATTCAGACCTAAAGCATATACTTATTCACTAAATGATAAAGAAAAAGAGATGCTCATAATGTTATCACAACATCCTGAAACTCGGTACTTTGGATTTTATTCCATAGAACTTCCGGCTGATTACAAACCAACAGGAATGGTTATGTTCATACAAGGATCGGCGATGATCCCTGTAGAAACAAAGCTACAATATTATCCTCCTTTTCTGCAATATATGACACGATATGAGGCAGAACTAAAAAACACCTCAGCATTAGATCCACTGGATACGCCTTATTTGAAGCAAGTTCACCCACTAAGTCCACCTATGAATGGAGTCATTTTTGAACGAATGAAAGCGAAATACACCCCAGATTTTGCACGAGTATTGGATGCATGGAAATGGGAAAATGGCGTTACGTTTTCAGTAAAAATAGAAGCTAAAGATGGTAGAGCAACCCGCTATGATGGAATTAGTAAGATTGCCGAATACAGTTATGGATATAATATTCCAGAAAAAAAAGTACAGTTACTTACTATTCTTTCAGGACTACAACCTCGTGCAGATAACCAACCCCCATCAGAAAATAAATTGGCGATACAATATGCACAGGTTGACGCTTCACTACTTGGAGAGTATGAATTATCTGTAGATTATAAAAATAGCAATAATATTAAAATAAGTTTGCAGACGGATAATAATAGTTATATTGACTCATTATTAGATATAAGATATCCGAGTAATGGAAACAGAGCATGGTATAACTCTATATAAAGGTCGTAAGAAAATTAATGGTCTGGAGATATCTGAATGGTGGGTTCGTAAGCAAATAATGTTGAACTCAGAACCATCACGAGATTATGAATTCAATCTGGCAATCCATGAGGATAAGAAAAACAACAAACAGTTATTAAAACTTGTTATGAATTACAGTGTTGACATCTTACACGCTGACAATGCATTAACTGAACATGAACTGATGGCGCTGTGGGAAAGTATAACAGGGACAATTAAATATCATCCCACGCAGTGGTAAAGCAGATAATCAGAACAGTCTGGAGATATCGGAATATACTCGTGGTACTTCAAGTTGCATGGTACGCACAAGGCCCTTGTCGGAAAGGGCTTGGGCTACAGAACTCATTTACGTGCATCTTCAAGTTTATCGGGTATAGTAGATTAAACAGCAGATCACGCTAAGTACTGACCCGCTGCAAAATTACAGGTTTTATCTGACAGTCCATGATGATAAAAAGAATGGTGGTCAACGGTTAATACTTACGATGACTTATAGCATCAGACCTTCTGAATTCAAAAGAAGTCTTAACCGAACATGAACTGGTTGCCGTGTTGCAGCAAATGACCAGTACGCTGAAATACCCCCTCTCACAAAACATAAAGATAATGGTATCTCATTTATATCAATGACCGGGAATAGGCAACTATACTTTCATTTTTTAAATTATTTTCCTGTTGTAAATAAATCAGAGGTAAAAATTA
ＳＴ９５＿領域−７（配列番号９）
ATGGCAATGGGAACAGGCTACTTTCTGGTCAGGGGGGACAAAACCACCTGCGGCGGGAAGATTATTGAAGGCGCGGACGACCATACGATCATGGGTATCCCACAGGCACGGGATATGGATCGGGTCACCTGCGGCAGATATCCGGGAATGTTTATTATTGTGGGCGGCGTGCCGGAAACGGATATTCACGGCAGGCTGATGGCGGGATCTCTGGACAGCCAGAGCAGTTGCCCGTGCAAGGCGCGGTTTATTGCGTCAATGATGGATGATACCTATGAAACGGATGACGGGGGAAGCGAGCCGGAACAACATGCGCAGTCGGCGAGGAAAAATCTGACTTCCGGTAATCCAGATAAAAAATACAGTCATCAGATAAAACTTCAACATGGCGAAAATAATGTTAGTGTACAGGACATACCTTATGTCTTTATCCTAAATAATAACATGTCTCTCAGTGGCAAGACTAATCAGGATGGCGAGACTGAGAGAATATATACAGATACTGCTCAAAAGGTAATTGCACTTACAGGAAAACTGGCTGATTCCTGGCTGAAAAGAGGGAAAAATTTTGGTTCATTAAAAGAAATTGACAATAGAAAGATCGAATTAACAACTGAAGAGAATGAACCTGTAAAATATGTCAACTGGATTAATGGGCGTGATTATATTGTGATTGTGGCGGCCAGAACAGCCGTAACAAACTGGATAGGAATGGAGGACTCAAAAGGAAATCAGTATCGATTTATAAATTGTGGATTAGAACAATTACAACAGTTTCCTCCAGCCAGTAAACAGGATTCCAGTTCGCAGCGAATTATGGTGGTTTTTTCGCTTGGGTATACGCAAAAAGATATTGATAGAATTAATGATTATACTAAAGCGCACGATGGAAGAATTATCTATGTCAAGAATAAGGATGAATTAGTTTCATTCCTGAATCAACGCAAAGAAAAAGGAAGAGTGATTAAGGAACTGGTTATTCTGTGCCACGGTGTTATTAAAACAGCTTCATATCATTATCATCATGAAGACAAGGATATTGAAAAAAATGGAATGTTTAAACATGAAGATATTGCAGCAGTTCACGAGTCAGTTTTTGATTATGATGCCCATGTGACAACATATGCCTGTCGGGCCGGTATCTCAGATGGTGATAAAGATTTTTCCGGGAAGGATGATGCAGGGCAAAAGGACAGCCCGGCACAGAAAATGGCTGATAACTGGGATGTCATGGTTAAAGCGTTTGAGATGAGATCGGACTACAGTCTGGCTTATGGGACAGGCAAGGAAATTAAAGAAGCTCAGGAATATGGTAGTGTGGTAGAAAAATATAAAAAAGATATAGATATGTATAATAAAGAAAAAGCAAAGGGGAATACTGAAGTTTCCCCTCCAGTGAAACCAGAGGGATATGATGAGAAATCAAAACGCCATGCAGATGTTACTACCAGAGACAAAAATGAAAAGTCTGGCGGAGGACCAATAGCTCCTAATGGTGCATGGCATATGCCAAGAACAGGGGATTCGCCGAAAGGGCTGAAAAGCGGGTTACAGGATTATCAGCCTGAGGAGTGGGTTCAATAATGTTCTTAAAAAGAAAATGGTATTACGCAGTGACGACATCTGTCGTCATTACTTTGTGTGGTGGAGGATATTATATGTACAGGCAAGAATATCAGATGGTTGTCACTGTACCAACTGCTGACGCGAACGATCCCAACTGGCCAAATAAAAGGATACAGTTTGATACCAGCGAATGGCTACAGCAACTTCAATATATTAAAATAGATGATCATTATATATTGAATACTCAATATACTCCAATTGCTAATTTGGATGACTTTGGTATTACATTAAAATTACAGAACGCATTAAATGGGTCGGATAAAAGACTTCCTGCACTATATGGCCTTGCTGAGATGGATGCTCAGAAATTTAAAGACCTGATGCGCGGTAAAATTAAATGTGAATATCTGAGGACGACATTTGATGCGGAAACATTAAAGCCTGTCAATGATTATTTCCTTATTTCTTTTACTTATAAAGATAAGTGGTATGAATTTGAGACAGAAAGAAAAATATCTAAAACAAGTGATGATGGGTATTTTTTGTGGGCATTTGATAATACTGTCCACGAAGCAGGCTATTGGCATAACACAGATCCGGCTGCGTATTCCTATAGAGATTACCAGAATGGTAAGGCTGTGAAATAAGTGTCAGGATACTCAGGCGGCGGTACTGTGCGATACGCAGCTTAGTTTGGATTACTGATTGTATTGTGGCCTATATTGAAGCAGCTCAGCAGGAATTTGTTGAGAAAGCCAGAGAGACTGCAGATGATATCTGGGACTTGGGAACTATGTGGGCAAAAAATGTGCTAATTAAAGGAAGGGAGGTACTGGAGCATGAGGTGAAGTAATATCTAAGAGAAAATCTTGATAATATAATTAAGTGGGGACTAAATTAGAGATGAATATTCAGGCAATAAAAGAAA
ＳＴ９５＿領域−８（配列番号１０）
ATGATTGTAGGTAAAACACCGCATACTACAGCTATTTCTCTGATGCCGGGAATGTCACCTGAAGCACTTATGCAACAAGTAAAAACCATACTCAATCCTGATGTAGAAACAATCATATTTACGGATATTTATGGCGGCACACCTTCAAATATCGCCTACCTTCTTTCACGAGAATTTCCCATTCGCTGCATCAGCGGTGTCAATCTGGCAATGTTAATTGAAGCCAACATGTTACAGGATTCTGACGAAGAACAGTCCTTTGATGAATATATTCAGCATATACATGATGCTGGTAAAGAGATGATTCAAACTTATTGTTTTAATAAAGGATGATAAACTATGAGTATAGTACATGCCCGTATTGATTACCGTTTAATTCATGGACAAGTCATAACAAAATGGCTAAAAAGGAGTGATGCAAATAAAATAATTGTTATTGATGATCCCTTGTCACGCGATCCTTTCCTGGCTGAAGTCTATAAGATGGCAGCGCCAAGTGGTGTTGAAGTCATAATGACCTCCATTGAAGATACGTTACAACGCTGGAACAGCAATAGTTTCTATGAAGGTAAATTACTAATTCTTTTCAAATCGATCGATTCTGCATTAAAAACTATACAAGGTGGTTTGATGTTAGAGGAATTACAAGTCGGTGGTGTTGAAAATACTCCGGGAAGAAAAATTGTCTTTAACCAAATATCACTCAACCACGAAGATGCCGACAAACTTCAAATCATCGAAGATAAGAATATCAAAGTTTATTTCCAAACTATTCCTGAAGAAGATCCTGCCAGCCTACAAAAAATCAAAAATAAGTTACCTTAATTAAGGAGAGGAGCTTATGTCTATTTTTACAGCAGCAATGATTGCCCTGGTATATTGGATATCCCAAGCAAAAGTATGGTACGGCTTTTCTATTATGCGTATGCCATTATCGATAGCACCTATTATGGGACTCATCTTTAATGATATGCCAACTGCTTTATCTGTTGGGGCCACCTTACAGATGATCTATATCGGGAGTATTGCCCCGGGAGGAAATCCTCCTGCAGATGAAGGTCTAGCCTCGTGTATAGCAATTCCAATTGCACTTACCGCAGGTATTAAACCAGAAATTGCTATCTCTTTGGCTATTCCACTGGGATTGCTCGGCGTTGTTCTGGAAAACGTACGTAAAACACTGAATACCACATTTATCCACATGGCTGATCGCTACGCAGAAAAAGGTGATATAAAAGGCATCCAACGCGCAGCCACAATATATCCTCTCCTGTTAGCCTTTCCGATGCGTTTTGTACCGGTATTCATCGCCTGCCTGTATGGCCCGGATGCCATTGCCTCTTTTGTAAACCTGCTTCCCGCCTGGTCGACGAATGGCCTGGCAATTGCCGGTAATATTCTGCCTGCACTCGGTTTTGCGATAACCATAATTGTTATCGGTAAGAAACAATACATCCCTCTGTTCATTATTGGCTTTTTCCTCGTGACCTATTCAGGCTTGAATACCATTGGCATCTCTATTTTTGGACTCTGTGCCGTCCTCTTATATATGCAGTCACAAAATACAAAAGGAACTAAAAATGGATAATATAATTGAGTCAGGATACTCAGAATCCTCCCCTATTACGAAAAGAGACGTTCAGATTGTTTGGCTAAAATGGCACGCGTTCTCTGAAACATCATTGAACTTTGAACGTTTACAAGCACTGGCATTTTGCAATGCAATGACAGGCGTATTGGCGAAGCTATACCCAGATGAAAAAGATCTCGCCAAAGCCTTACAGCGCCATTTAACCATGTTCAACACACAGGCTAACTGGGGCTCGGTTATCGCTGGTATTAGTATTGCACTGGAGGAAAAAGCCGCCCAGGAATCAGAAGAACAACGTGAATCAACAACACAACTTGTTACGGGTTTAAAAACTGGTCTTATGGGGCCTGTATCGGGTATTGGTGACACGTTAGACTTTGGTACATTGCGTCCCATTGTTATTGGTGTCTGTATCCCGTTTGTTATTCAGGGATATGTTATTGCTGCACTTCTCCCCCTGATTTACCAGGTTAGTTATATGTTCTTCGCCAGTCGATTTGCTCTTAATATCGGCTATAAAAAAGGGAAAGAGTCAATTCTGGAAATCTTGCATTCCGGGAGCATACATCGAATTATCGAAGGTGCTGGAATGTTCGGGCTGTTGATGATGGGGGCGCTTTCAGCAACGTATGTAAAAATTAAGACGCCATTGCATATTACAACCGGCGGTGGCAATACCATTGTCTTACAGGATATGCTAGATAAAATTGTCCCTAACATGTTGCCACTTATTGCCGTGTTGGGTATTTATTTTTACATACAAAAATGTGGCCCTCATTTCTTACGTATTCTGGTCACTATTCTTGTTTTGAGTCTTGCATTTTCTTTCTTTGGCCTTTTATAAAATGAAAAAGATAATTATCACTCCCCGGCCTTTTGTGGGTAAAGGCAAGGTCTATATTGATAAGTTAAAATCCGCAGGTTATCAAGTTGAATGTAATAACAGTGGAGGTCGATATAGCAAGGAAGAACTCATCGAGAAAATTAAAGACGCGAATGCCATTATCACCGGAAACGATCCTCTGAGCAGAGAAGTTATTGATCAGGCAAAAAACCTGAAGGTTATTTCAAAATATGGCGTAGGGTTAGATAACATAGATGTCGATTACGCAAATAGTAAAGACATCGTGGTACATAAAGCTCTTAATGCTAACTCTATTTCTGTTGCAGAAATGACCATTCTGATGATGCTCTCCAGTTCCCGAAAATATGTTGAAATCGAGAGTCAGGCAAGAAATGGTAAGGACATCAGGCTTGTCGGGTATGAGCTATATCAAAAAAATCTGGGATTAATTGGACTTGGTGCAATTGGTCAACATGTTGCTCATATTGCTCATTCTATGGGAATGACGATTACTGCTCATGATCCTCATATTGATAAAAGCAAGGTTCCATCCTATATAGAACTTAAATCACCTGATGAAATATATCAGTACAGCGATGTAATTTCTCTGCATTTACCTTTACTGGACAGTACTCGCAATATAATTAACGACTCTGTATTTGAGAAAATGAAATCTTCGGCTATTTTAATCAATACAGCCAGGGGTGGATTGGTCGATGAGAAAAGTTTATATACCGCACTTAGCAATCAGAAAATTGCTTTTGCCAGTGAAGATATTGAACTGAGAGAACGTTCAAAAGAACTCACCGAACTTAAAAATTATTCTATTACCCCTCATGCCGCTTCATTTACCGATGAGGCCGACCATAACACAATGCAAATTTCTATTAAAAACGTATTACAGGAACTGGAGAAAGAGTAATGAAAGAGCTCAAAGGGATTATTACCGCAATGGTAACGCCTTTCGATGAAACGGAAAAAATGGATATCACTGCGGCGAAAAAAATGGCGCGCTGGTTAGTAGATAATGGTGTTCATGGTTTATTCATTTGCGGAACTAATGGTGAATTCCATTTGCTTTCCGATGACGAAAAAGTTGAGTTAACAAAAGCCGTCGTTGAAGAGGTCGGTAATGAAGTTACCATTTGTGCAGGTGCTGGGTGCTGCAGCACAAAACAAACCATCGAATTGACTAAACGGTTAGTTGATGCGGGTGCCGATTATATTTCTGTTGTCACGCCGTACTATCTGGTACCAAATCAGGAAGATTTATACCGTCACTATTACGATATTGCCTTTAGCACAACAGCCCCCATCATTCTCTATAACCTGCCGGGCCAGACAGGATTAAGCATCGAATACGAAACGGCAAATCGTTTAGCCGATATCAAAAATATCGTAGCGATAAAAGACAGTAGCGGTAAATTCGAAGTCCAGAAACAGTATCTGGAAATCGCTAAACATAAAAACTTTAAGGTATTAAACGGCTCTGACTCGTTAATGCTGGATGCATTTAAAGAAGGTTCTGTGGCTGCTGTCGCTGCAACGTCGAATGTTCTGCCTACGATTGAAGTCGATTTATATAATTACTTCATGGCCGGTGAAATGGAGAAGGCGCAGGAAGAGCGTAATAAAATGGATGCACTGCGCATGACGATCAAGAAAATGACCGCGCCTGCAGTAATGAAGGAAGCATTAAACCTGATGGGTGTGAAGGCAGGTATTACACGTAGACCAATTCATATGCCAAACGACGCGATCGTTGAAGACATCAAGGAAATGTTGAAAGGCTATAATTTCCTGTAAAGGACAAATGCCGGATGTATCTCTTGTCCTACAAGATAGCGTAAACAAAAACCCCCGGACTCAAATCCAGGGGTTATCTGTGGCAACTTAACGCGCTGCGCGAT
ＳＴ９５＿領域−９（配列番号１１）
ACTTTGAACATCCACTCGATCTTCGTCTACTTCCGGTTTAT
ＳＴ１３１＿領域−１（配列番号１２）
TTATTTGACCGTGACCTGTCCGTTCATAAGTAGAGGGAGGAGCCAGTCGCGGAGTTGGATTAAATGACTATTCTCTTGAGTGTTTGATGCCAGTTTATTATAAATTGGCATCATTTTATTCTCGAATAACGCCACAACATCAGGAGTGGGGCATATGATTTCACAATTAGTGATATGCGTATTGGTCAGGTTATTAATATTAGTTCCCAAGCACTGATTGTTTATATAAGACTTAAACCATTTCGATTGCAGGAATGTATTTATAAAATAAAATGCATGTTTTTTTTCGAAATAATACACGCCATTCTTCCCTACATGCTCCTTACTACCACTTGACATCACGATCAATATGTCAAATTTATTTAGCATTTGATTAACGTTTACTCTACTAGAAGGAATGAAGACTAAATCATCAATATCAACATTATTTCCCGTCACATTTGTAGCGCGAAGAATGCCTATCGTATCTTTATCATCCTGAGTTCGAACATCCTCTTTGCTATAAGTAACGCCACGATCTAACTCAATAAACTTACCAAGAATGGAGTCATTCCAACCTGCCGGAATTTCCCGTTTCAGCGTGGCGTTATACTCCATCTTCCCGCCGGAGGTTTTATACGGTTTTCCGTTGGCATCAGGGAAATCAAACTGTACAAACCAGTAGTCATACAGTGTTTTCGCCATCGCTTCCAGTTCCGTGTTGATGCGGTTGTTGAGGGCGATTTTTTTATCAATAACACTAAGAATAGTCACCAATTTTTCTTGACATTCAATTTCTTCAGGTATCCTGACTGGATATTCTTTTAAAGAAACTAGATCAACTCCAGTTTGTCCTCCGGTTCTGGCAGATAATTTATCAACATATTGGAAAACAGAGTCTTGCTTCAAAAAATAGTATAAAAAATCACGACTTACACCTTCTTTAGGTATAACCTTCAGCAAGGCAACGTTATATGCTCCTTTCAATCCGCGACATATTTGAAAAATTGGGGGACCATACCTACCAATCATAATATCGAATTCATCACAAAATTTCTTCGTCGACGATATTGGTATATACGTGGGAAATGCATCCGTTTTGTAATCACGCGTCTGGATCAACCTGACATATCCAGGTTTAGATACATAAATAAATTGAGATTTTGGAGGTTGACTTCCTCCGACAAAATCACATACATCTTTAATTTTCAGATAATTAAATTTCAT
ＳＴ１３１＿領域−２（配列番号１３）
TTACCAGCAGACAAAGCCACCATCGACCACCAGATCCACACCCGTGCAGAACGACGCCGCATCGCTGGCAAGGAACAGCGCTGGACCCGCCATCTCTTCCACTTTCGCCATCCGTTGAATCGGCGTCTGGCTTTCAAACTCCCGAGTCTGATGTACCATTTCAGGTCGTGTATTCATTGGTGTCGCGGTATATCCTGGGCTGATTGAGTTCACGCGGATCCCCTTACTCACCCATTCCATCGCAAGACTTTTAGATAAATGAATCACGCCGGCTTTGGAACTGTTGTAGTGGGCCTGTTCCAGACCACGATTGACAATAATCCCGGACATTGACGCAATATTTATAATCGAACCGTCTCCGTTCTCTACCATTAACTCAGCTTCCGCCTTACAGGAATTCCACACACCAGTCAGGTTGATATCGATAACGCGTTGCCATTGCTCGCTTTCCATCTCCAGCGCCGGGTTTGCGTTAGCGATTCCAGCGGCGTTTACGGCAATATCCAGACGACCAAAATGTGTTTTTGCCAGAGCGACTGCTGCGCGAAGATCTCTCAATTCCCGAACATCGCCCGTGTAATACAAGGCTTGTCCGCCAAGTGCTTCGATATGATTAACCGTCTCTTTGAGTCCGCCATCTTCCCGTAGATCAAAACACACCACTCGTGCGCCTGCGCTGGCTAAAGCCAGAGCGATCATTTGTCCGATACCGCTACCTGCGCCAGTGACAAAGGCGACGCGATCGTGGAGATCAAACAATTGTTGAGCAAAATCTTTTGCGATCATTTTGATATCTCTCTTAGTAGCCCGCAGGGGCATTACGACATAATCAGGCCGCCGTCGATGTTGATGGTTTGACCGGTGAGATAACGCGCATCGTCAGAGGCGAGGAAGGCAACCAGTCCGGCAACATCTTCAGGTTTACCGGCACGCTTCATCGGAATACCTTCCACCCATTCCGCCATAAGCTCGCCTTTGCCATAACGCTTGTCATCGGTACTGAGAATTTCTCCCCATACGCGGTCGTTGTAGTCCCACATTTCGCTTTCGATAATACCCGGGCAGAAGGCGTTAACAGTGATATTCCACTGCGCTAACTCGTGCACCAGGCTTTGCGTAATGCCGATCACACCCATTTTGCTGGCTGCATAGTGTGGGGTATAGATAAACCCCTGACGTCCCTGGCCAGAAGAGGTGTTGATCAGGCAGCCGTGATTCTGTTTCACCATATATTTGGCTGCTTCCCGGCAGCAGAGCCAGACTGCCGTAGTGTTCACCGCCAGCACTTTTTCGAAATCAGCAGCCGGCATTCGATCAAAATAATCGATGGTGATAATGCCTGCATTCTGAATGGAAACATCGATGCTGCCAAAACGTGCAGCCGCTTGTTCATAGAGTGCCTGTACTTGCGCTTCATCTGTCACATCGACTTCTAATGACAAAATGTCAGCCTGATAACATTGGCGCAGTTGCTCTGCAGTTTCATGTACGCGTTCAGCGTTAGAAACCATCACCAGATTTGCGCCATCGCGGGCGAAGCGTTCAGCGATCCCGGCCCCAATTCCCCGGCATGCCCCGGTAATAACTACAGTCTTACCCTGAAAATTACGTTGCATATTTTTTCCCCTGTATAAGCCGGGCAATTTAATGCCCGGTGGAATGATGTTAATTAACTGGAAAGCGGTTTTACGGCAGGTGCGGCGGCCATCTTTTCTTCATGGCGACGCATCAAAATGACTTTGTTTTGCAATTTTTGCTGGAACTGATCGACCACCACGGCGGTGACGATAACGAGGCCTTTAATGACCATTTGCCAGAAGTCACTGACACCCATCATCACCATGCCATCGGCGAGGAAGACAATGACAAAGGCACCGATAATCGAGCCAGAGACACGTCCCCGACCACCCGCCAGTGCAGTTCCACCAAGAACCGTGGCGCCAATAGCATCCATTTCGAACATATTGCCGGTCATTGGGTGAGCAGTTTGCAGCTGCGAGGCAACAATCAAACCGACAAATGCGGCGCATAACCCGGAGAACGCATAGACGAACACTTTAACTTTTACGATGGGGACGCCTGCCAGTCGCGCGGCAGATTCATTGCCACCAATGGCATAGATATAACGACCGAGCGGCGTTTTAGTCGTGATCCAGTAGCCTAAAATCAAAAAGCCAATCATCAGCCAGATTGGTAGATAAATGCCTAAAAACGTGCCAGAACCAAGGGTGGCGAAACCCGTGTTGCCCAGCGTTTCCATGCCGTTGAGATTGGGATAAGTGCTGCCGTCATTAAACAGCAGGGCAGAGCCACGAGCGACGTACATCATACCGAGGGTGCAGATAAAGGGCGCGACACCAAAGCGGGTGATTACCGCGCCATTCACCAGTCCCACTAAAATGCCAAATACCGCCACGCAGAGGATCACTTCCGGCACGTTGAAGAAAATAATATTGCCGCTCCACAATGGCAGGCCGTTTGTTAGAAGAGCCCCGGCAACCATTCCGCAGATCCCCGCTACCGCGCCGACGGAAAGATCGATGCCGCCGGTCAGGATCACCAGCGTCATTCCGATTGCCAGCAGCCCGGTAATCGCAACGTGTTGAGTCATGATCAACAGGTTAGAGGCTGTCAGGAAGTTAGGCACCATCACGCTAAAGAAGGCGATCACTAATAGCAGAGCGATAAACGTTCTGGCCTTCAACAGGTACATATAGATCATATATTTCTGATTCAT
ＳＴ１３１＿領域−３（配列番号１４）
TTACTCGCCTCCCGCCCTGGCTATTTTCGCAGGCGTTATATCCGGGATAGTTTGCGGAATATCCCATGCAGAAAATACGCCATAAACCTGAACCGTTTCCCCGGTTTTAAGCTTTGCCGACTGAATCATATTGATGGCTTGCTCATTGATAGCACGACCATATTCACCAAATAAAACCTGATCGTTAAAATGCTCATAGCTTGCACCTTTATATGCATCTCGCAGAAGCGTGCCGCGAAGAGTTGGCCCCGTCTGCACGACAATATTTGTGCCGCTGATATCTGTGATGGTCATTTTTCCGCTACGGGATTTCGCATCAATATTGGTGATGCTACCTTCGACCTTAACGTAGAAAATACACGGGTTTTCTTCCTGAGAACGATAGCCCAGCGTTTTACAGGCAGCATCGACATCTTTTTCTGCCTGTAGCGCCGCCATTAACTCCGCAACCGGACGCGCATTTTCTACCACCTGCGGCACGATGTTTTTCTGCCAGGTCTGATCGATATTTGCCATATGAGGATTAGGCGGGGATTTGAGATCGGCAAGTTCCTGCTGCGAGACGATGCGACATCCACCCAGGCTCAGAATTGCCAGCGCCAGCCAGACTTTTTTATCCATAATATTCTCCTCTGCGCCCTCATTGTGAGGGCGCAACGACCTGGGATCAGGATTTGATATTGAAATCCTGGACTTTATCTGCGTTATCTTTGGTTATCAGAATGCCGCGGAACATCACCCGCTGTTTGGCTGGTTTAACTCCTTTTTGCAGGTAATTATCCAGATCGGTAACACCCTGCGCGGCAATGGCTTGTGCTTGTAACATCACGGTAGCCTGCAATGATTCGGCTTTCACGGCATCGCGCTCATCGTTACTGCCATCAATGCCGACAACAATAACGTCATTGCGATTGGCGGCTTTCAGTGCTGCGATAGCTCCCAGTGCAACCGGACCATTACCACAAATCACCCCTTTAACATCGGGATGGGCTTGCAGAATACTGTCCATTATTCGTTTGCCATCAATTAACGTGCCTTTGGCATCTTGCTTCGCCACGCTGACCATTTCAGGGAACTGGTCAATAACCTGGTGGAAAGATTTCGAGCGAGTTACGCAATTATTATCAGCAAGATTACAGGTGAGTTCGGCATATTTTCCTTTCTCTCCCATTTTCTCGACAAATGCGTTGGCAACTTCCGAGCCAGCCTGGAAGTTATTATGGGTAATTTGCACCAGTGCAACATCATCCACAGGTATTTCGCGATTAATTAATATAACGGGAATACCTGCTTTTTTTGCTTTTTCAATGGCTGCAACACTGGCAGTGGAGTCGGCATTATCTAAAATAATGCCCTGAACTTTTTTACCAATTGCAGTATCGATCAGTTCATTCTGTTTTTTGACATCTTCACCATGAGAAAGAATGGTCGTTTTATATCCCAGTTGCTGGGCTTTTTCACTGGCACCTTTCGCTTCCGAGGCGTAATAAGGATTATCCAGTGAATTGACCATAATCATAATGGTTCCTTTTTCTACCGCATGAGCAGAAAAAGAAAGAGCAGTCAGGGTCGCAGCGGTTAACAGTGTTAAACGTAATTTCAGAAACAACGTAAAGCCTGAATTATTTATGGGCCGGTATTCTCCTTACGTTGGTTAGTCTTGTTCGTCAAATTGACGATGCCGGTTTCCATAATGTTCTGTTTACCGCATGACGCCACTCCTGCCATCTCTTTTGCAGTCGCTGATGACGCGCCATGTCCGGTTTAAATTCACTGTGTTCAGTTAATAACGCTTTTAAATCTGCAACGGTACCGGGGATAAGCGCTTTGCGGGCGAGCAGGCCCGCACCAATGGCTGAAAGCTCTGGCACATCACTGCACATCACCGGGCAACCCAGCAGATCCGCCTGATATTGCATCAACCAGTCATTTTTGGTCGGGCCGCCATCCACCATTAACGCCGATAAGTGAAAATCATCATGCTGTTGCATTGCCTCCACTACATCTGCAATTTGATAAGTGATTGATTCCAGTGCGGCACGAATCAAATGCGCGCGCTTTACGCCACGGCTTAAGCCACACACCACGCCGCGAGCGCTGTCATCCCACCATGGCGCGCCCAGGCCAGTGAGAGCAGGAACAAAATAAACACCCATAGTCGAATCCACTGAGGCTGGCAGGGTATTCAGTTCGAGGGCCAGCTCCGCGTCTGTCAGTTCACTTAAACCGGTGCTGTCAGCCATCCATGCCACGGCATCGCCGGTGTGGGGGATATTTCCTTCCAGACCGTAAATAATATTTTCGCCATCATGCCAGGCAATGGTTGTGGCAAGTGTGGCGATATCACACTGAGCAGAGTTGACGGGGGCCATGACGGAAGAACCGGTCCCATAGGTCGCTTTCACACATCCCGCTTCTCCCAACGCATGACCAAAAAGAGCGGCGTGAGAATCGCCCACCATCGCCATGACGGGAATACCATCCGGAATTGTTTTAAGCCCTCGGGTATAACCGAACAGGCCACTGGAAGGTTTAATTTCTGGCAATGCAGCGCGTGGAATGTGAAACAACGCCAGCATTTCCTCATCCCACTCGCCTGTTTTCAGGTTAAGTAATTGAGTTCGCGCGGCGTTAGAGTAGTCGCAGCAAAATGAATCGCCAGCAGTCAAGTTCCATAGCAACCAGGCATCAATGGTGCCGAGACAAATTTCACCCTGGTCGGCAAGTTGCACACCCTCAGGTGTAGATTCCAGTAGCCAACGCATCTTGGACGCGGAAAATAGCGGGGCGATAGGAAGACCCGTAGTCGTTTTAATTTGCTGCTCTTTGCCCTCGCGACGCAGTGTTTCACAAAACTCGGCACTGCGCGTGCATTGCCAGGTAATCGCCGCATTGAGTGGTTTTCCACTCTGACGATACCAGCCGATAGCCGTTTCACGCTGATTACTGATAGCCAGAGCCGCTACATTTTCTGCCCCCACGTGGTTGATGGCCTGGGCAATAACATCAAGCGAGGCAGAGATTAACGCTTCCCCGGATTGCTCAACCCAGCCTTCACGTGGCGTCTGAATAGCCAGTGGTTGAGAAAACTTCGCCACCACGTTACCGAAACCATCAAGTGCGATGGCTTTTGCATTGGTGGTACCCTCATCCAACGCAATAACGAACTCTTTATTTCCTGCAAACATAGGTAGTCTCCTGAGTCACATTGCATCCTGGCGTGGAAGGAGATGAGGCGTTCCTCATGGTCACGTTATTACTTCATCAGGCCCTGCTGTGACATTTTGTGTTAAGGCATGAATATATATTCGATACTGATTATTTATTTATACCTTAGCCAGATTATTCTTCCTGAGCTAGAGAAAAAATCATCAAATGTGCTGGCTATCACACTTAGAAGCGTGGTGACAGGGTGAGAAAGCCTCGAGAAACAGGATTGTTGAATCCTTTCAGTTTATTGATATTAAAGGCTTTTTAAGCAATCACCTTTGCGAGAAGATTTTTTCGCAAAGGCGGGCAGAAGAAAGGGAGGAGAGGATTAATCCGCAATCAGCATTCTGGCGGTGGGGAAATCAGTGATCAAAACATCAATATAACCACCCTGCATGGCGCCTTTGATGGCGGCAACTTTGTCTTTGCCGCCCGCCAGTGCCACCACATTCGGGCATTTTTTGATTTTATCCAGTGCCATACCAATCACTGGATCTTCATCGTCCTGCAACACGGGCTGACCATGTTTATCGTAGTAGTGCAGGCAGATATCGCCCACAGCACCGCGATCCGCTAGTACCTGTAACATATCCTCGTGATAATAGTTGCCCGAGGTTTTTAGCAACTGCGAGGGTTCAAGGATACCGATGCCGACAATGGCGATATCGACGTCGTCAAATCTGGCGATAACGTCAGCCACATCCTGGCTTGCCACCAGGCGTTTTTTCTCTTCTACCGAACCTTCAATGCTTTGAGAAGGAAGCAACCAGGCTTCGCAATTCAGATGCTGGGCCAGGGTCTGTGTCAAAATAGTTGCCTGCACATTGCCGTTTGGCCCCACGCCGCCCAGCAGCTGAATAACGCCGCTGGCTTTTAAGTTTTGGGCGTGAACTTCATCGACCATCGCGCGAATCGTAGAACTCCACGAAGAGACGCCAATGAAATCTTTTGGCCTTAAACGCGTTTCCAGATAGTGCGCGGCGGCAGAGCCGATGGCGCGTTTAATGGTGTGATCACTGGCATCATCTTCGGTATCGACAACAATCGCTTGTTTAATGCCGTAACGCTCTTCAATGCCTTTTTCCAGATTGAGAAAGATATTTGACGGCTGGACAACGCTGATTTTAACCACGCCTTCTTTCTGGCAACGGGTTAGCGCTCTGGATATAAATGACTGAGAAAGCGAGAGAAGTTGGGCGATGTCAGACTGTTTTCGCCCCTCAAGATAGTAAAGAGTGGCGATCTTCACCAGTAGCCGCTGTTCATCCTGCTTAGCCATATATTTCCCCGTAAATCATTAACGTACCGCCCTTATCTTAGAGGCTTTTATCATACGCGAAAAAAGAAGACAGTTAAGTGTGATGGAGTTCTAACTTTAACCAATCCTTAAAATCAGCGATGGACAAAAATAAAAAACAGGCGGCATAATTGAATAAAGAATCATTATTGAATATATATTCAAGATGATATCAGGTCAACTGATGATTACCCGGACATGTAACTGACGGTGTAAGGAGGCAGAATGTTCCTGAGTATGATGCAGCAGCGTAAGTCTTGCCGCGCAACGCCCTGGGATTTCTGGTTTTTTTAGTCCCCGGTGGAATAAATATTCCATGTTGAAAATAAATTCAGAGGTATTAAATGAATCCCTATAGCTATGATATCCAGACCCTTGAGCGTAAAGCGCGGGCGGTACGCCGCCATATCGTGCGCTTAAATGCCAATAGCCCGGCAGGTGGACACACCGGGGCCGATCTCTCTCAGGTTGAATTACTGACCGCACTCTATTTTCGTATTCTCAATGTCGCACCGGATCGCCTTCACGACGATGACCGGGATATATACATTCAGTCAAAAGGCCATGCTGTTGGATGTTACTACTGCGTGCTGGCGGAAGCAGGATTCTTCCCACTGGAATGGCTTTCCACTTATCAGCAGCCAAATTCACACTTACCCGGCCATCCGGTTCGGCAAAAAACGCCAGGTATTGAACTGAATACCGGAGCACTGGGGCATGGTTTCCCTGTGGCTGTAGGACTTGCGCTGGCGGCGAAAAAAAGTCAAAGCCGTCGTCGTATCTTCTTAATTACTGGCGATGGTGAGCTGGCTGAGGGCAGTAACTGGGAAGCTGCACTGGCGGCGGCGCATTACGGGCTTGATAACCTGGTCATTATTAATGACAAAAATAATCTGCAATTAGCCGGGCCAACGCGCGAAATCATGAACACCGATCCTCTGGCAGAGAAATGGCTGGCATTCGGTATGCAGGTTACTGAATGTCAGGGCAATGATATGGCTTCGGTTGTCGCGACGCTTGAAGAGCTTAAACAGGAAGGCAAACCGAATGTGGTGATTGCCCACACCACTAAAGGGGCAGGCATTTCCTTTATACAAGGGCGTGCGGAATGGCATCACCGGGTGCCGAAAGGCGATGAAATTGAACAGGCACTGGAGGAACTCAAAGATGCGTAACAGTGAACATCTGGCAAATGTGATGGTTCAGGCGTTTATCGATGCCGTAAATGAGGGGATCGATTTGGTGCCTGTGGTGGCTGATTCAACGTCTACGGCAAAAATTGCTCCCTTTATTAAGCAATTCCCTGACCGACTGGTGAATGTGGGTATTGCCGAACAGAGCATGGTTGGTACAGCTGCCGGGCTGGCGCTGGGCGGCAAGGTGGCTGTTACCTGCAATGCCGCGCCGTTTCTTATCGCTCGCGCTAACGAGCAAATCAAGGTTGATGTCTGCTACAACTTTACCAACGTAAAATTGTTCGGTCTGAATGCCGGGGCGAGTTATGGACCGCTGGCGAGCACGCATCATGCGATTGATGACATTGCGGTTATGCGTGGTTTCGGCAATATTCAAATCTTTGCCCCGTCTTCACCGCGGGAGTGCCGTCAGGTGATTGATTATGCTCTTCGCTATCAGGGGCCTGTTTATATCCGTATGGACGGTAAAGCCCTGCCGGAAATCCACGATGAGGACTACCGATTTGTACCAGGTGCCGTGGTGACTTTGCGCGAGGGCAGCGAACTGGCGCTGGTAGCCACAGGCTCTACCGTTCATGAAGTGGTCGATGCCGCAGAACTTTTAGCGCAGTCTGGTATCGCGGCTACAGTTGTCAGCGTACCGTCGATTCGCCCATGCGACACCAAAGCATTGCTGGCAGCGTTAAAAGGATGCAAAGCAGTGATGACGGTTGAAGAGCATAACGTCAATGGCGGCCTTGGTAGCCTGGTCGCGGAAGTGTTGGCAGAGGCCGGAACGGGGATCACATTAAAACGCGCAGGCATTATGGATGGAGAATATGCCGCAGCGGCGGATCGTGGGTGGTTGCGTCAGCATCATGGATTTGATGCTGCCGGAATTGCAGCTCAGGCACGGGAAATGCTTTGA
ＳＴ１３１＿領域−４（配列番号１５）
AAGCATTTCGATGGCATATAAGGAGTATTACGCGCTACATATTACGGAAACCAATTCTTTCTTATAAAAACTATAGAAAAATTACATCCGAACTGGTAAAGTGATTAAATAAAGTCCTAATTTTACTACTGAAATGGTATCTTTATTTAAAGATCTTTGCTTTATATACCAATTTTTTAACGCCCTGACAGGAGTAAACAA
ＳＴ１３１＿領域−５（配列番号１６）
ATTGGTAGAGAATTTTGCAAATCTGGTTTTGTAAACGTTAAATCAGCAGCGCACTGATAAACATCCAGATCTGATTCATGGCTAATTGTTCTGACATTTTCTACAGAAATACGCACATCCTTATCCAGTTTCATCCCTTTCTCGATTGTCTTTCTTGCAATATCCCCGACCAGATTTTTTGCATCATCACTACTACATTTTGGCGTTTTCTCGCCGCAGCCAGCCAGCAAACCAGCAGCAATTAATACCAGAAGTATTGCTCTTTTCATCTGTAGTTCCTTCGTAAATTAATGATACTTTTATTTCTTATTAAATAGACCATCCATTGCGCCTGCCGCAGAAGCCCCGCAGTATCCCTCGCAACCACGTGTCATAATGCTGGCCTTACCGTTTGTCAGTTCACTAATTACTGCAACACACTCGCTGGCATTGTCATTCCAGACCCAGCGACGCTTCTGACTTTCTCCGGCAGCTATTTGCTGTGCTGTCCCCTCCATATTGCATACGCCCGAACCATCCCCCGTTGAGGCATTAATGTTGAATTCAGCGTTATTCTGTCCCGGATGCAGGGTTAGAACCGCTCCGGGTTTTACGTACTGCGCTGCTGCGACTGGTAGCGTTATGGCTGCCATGAATAAGGCCAACAGTTTTCTGTTCATTAATTAATTCCCTGTTAAGTGATACGGATGTTTTTGGTGATTTTCCCCAGTGCCAGCGGTCTGCGTTTTTCCACAAAGAAATAAACGACGTTGAATGCAGACTTGCGATGATTCCCTCGACCAAGAGAGGGCCAGTTGCGGAAGGATTCAATCTGTTCTTCTGAATAGGGTGTGTCAGAGAAATCAAACAGCACAAGCAAGGCTTTGCCGTCATGTTTCATCAATTTCTTTACTTCTGTACTGTTGACGGTCGCAGAGACATTGGAACGTGCCGCAGTTGGTTTACGTACTGCAAACTCAACGGCCACATCGTCAATGACAAAATCAATGTAACCGTGCCCGGATACAGTTCCTGGCAGTTTGCTTTTTACTTCCGGTGAGACGTTATCTGCAAACCAACCCAGCAAATAGCAACGTACCAGAGGCAGTAATTCCCGCTCGCTACATTCGTTCAGACGCAGGGTTTTGACGAACTCCCTGCGATAAAGAGAACTGAAAAAATACTCAAAGCATTCCGTTATTTCAGTGATGGTGGTTGCCATGGTTGCATCCTTTACCTGCTATTAGGTCCATTTTTAAGGGCATACCTTTCCGGCCATAATGTTTCCGGTGTCGTATCCAGAGCCCCGGCAATAATGCGCTCAGCTCTGGGATAATGACGCTCTAAGGCGTTATTTAATGTCCGTGGCGCAAGGCCGTGACTGCGTGACAGTAACGCCAGCGTTAACCCTCGCTTGTGAAGTGCTGCCACAATATCGGCACGATGCCAGTTCCCTGAACTTCCTTTGATTTGCTTTTTCTGCGATGCTGTTGAGTTACGCACAGTATTAACTCCATGGAATCAGTACATGGATATTAAATGCGAATAAAAGATACCTTTCAAGTTCTTTTGGTATCTATTTATTGGTTTTCATATTAACGCATTGATATCTGGTGAAATTTATATGAGCAGTAAGAGAACAGTTTCGGCTATACCTACTCATCCTGAAGCTTCTGTTGAAGAGGCTAAAGACTGGCTGACAGCAGAGGAATTCACTCATATTGAGGGGATGCCGGGCACTGCGCGTGGCGCCAGGATGCGCTTGGAAAAGCTGGCATCCCTGCACCCGGAAATACGTCGTAAAAGGACTGCCGGGAAAGGTGTGGTTTACCATATTAGCGCAGCCACAATGTCGCTTGATGATGAGAGAAACAGGGCTAAGGGCGAAGCGTTTACTCTCAACGACAGTGATCGCCAGCTAAGCCTCTGGGTGCAGCTGTATCGCAATATGTCGCCAGCTTCGCGGGCGCAACTGATGGAGCAGGCCCTCAGGCTGGTAAAGGACGATCTGATGTCTCAGGGGCCCAATGTTTCTGAACTGGCGGTACAAATCATGAAGCTGCCCGAAGATGAGCGTAAGCGCCTCTTTGAAAAGCTGAACGGGAAGGTGTGATAGCGTCAGTTTTCCGCCATGCCAGACAGAAGGAACCACCCCGGAATCCTGACCTGTCTGACATGGCAGAATGGAAAGTATGCCATCACTTAATAATGAATAAAAACCTATTGCCAGTTATTTCATTGCTGAACCACATATTAGTTTCTCTTTGTTACTATTTGCATAAAAAGTATATTTTTGATATAATAATATTGCTGGTGAACTATATTTTACCCAGTCAGTACGTTGTCATGCACTTACCATTTATTAGGTGATTAAACCCCACCTGTGCTGGTGCAGACATAACGTCTTATCAGAATATATTGAACAGGAAAATCACTGATGAATATTGTCCATCAGGAAGGGCTAGCTATGCCCGTCGATCAGGAATTAATAAATATCATATTAAATGAAGCGGGAAATCCACCGCCGCATAAAGCCAAAATTACAGCCGTCAGTCTGTTATTTAAAGACCTGAGTTACAGCGCTGAAAAGGGTGGTTACCATCCTGTCGAAATACGGATTATTTCACGCAATGATGAATGGTATTTTGATTACATTACCGACTTCAGTTATATGGGGACGGTATACCCCGAACTTGAAAAGGAAATTGATATCAGCTGGAGTCAGCAATATGTCTTTCTTGCTTATGTTGGTGACCTGCCTGTTAACGCCGGAAGGGAGCTGTTTGAACTCTGGCAATCCAACTTTATTCAGTATCACGGCATGAACATCTACACCATTACCGTTCTCTGGGAAAGCTAATCCCCCTGTACTAACCATCACTAATTTATGGGGAATTATCTGTGACGACTGACAGAGGGATACGTGCGTCTCAACAGGGCGAACTGGACTGTCTTTGCGGTGCTTATTGCGTGGTTAACATGCTGAGCTGGCTGTATGACGGCAGGGTGAAACGACGCCCGTTAATGAACTGGCTTATTCAGACTTATCAGCAGCGCTGGCCTTTGCATGAATGGCTGACTGAAGGAATTGAAGAAGACCGCTTAGACTGGTTAATAGCTCAGGTGTTGCAGAAAGGGCATTACCGCCGCCAGTTCCCGGTTGAAATCACCAGACCCTTTGCAGGGAAGCGGGGGTTAACAGACGGGCGGCTGTTCAGGGAAATGCAGCGGTTTCTTGACGTCACTGACCACTCTCGCCTGATTATGCTCAGCGACCAGTTTCACTGGTCCCTTCTGGTCAAAATGGACGAAGAAATGCTCTGCTTCTTCGACAGCAACGGGCGAACCACCATGCCCCGTAAAGCTTTCTCCCTGCGTACTGGCGTAACCCGCCGCCAGCTGTTTCCAGACGCCATTTACTTCATTGAACGGGAGTTCTGACATGACCATGTTTACCCAGCGTGAAACCCGTATCCTTGACCAGGCGCGTGACATTATTAGCCGGTACTACCAGCGTGGGGTTCAACTCTGTTCCCCTGATGATGTTCGACGGTGCGTGATGGTTGAGCTGGCACCGCTTGAACATGAAGAGTTTGGCATCATCCTACTCGATAATCATAATCAGCTGCTGCACCGCGAAATCCTGTTCAGGGGTACGCTAAACTCGGTCAGCGTTCACCCCCGTGAAGTTATTAAGCGTGTGCTGAAACATAACGCCGCCGCCGTCATCCTTGTCCATAATCACCCCAGCGGCGAGCCTGAACCCAGCCGGTGTGACATCCAGTTGACCAAAAAGCTTCAGGAGCTGCTGGAAATACTGGATGTGCGGTTACTTGATCACTTTATCGTGGCAGGAACTGAAACGGTGTCGATGGCTGAGCGAGGACTGGTGTGATGCTGAAAGTTACTTGGTTTAATGTACGTTATTGCGGGTTACGCGCATGAGCAGGACAGCGTTGCGTCAGGTCGTGCCGGTGGTGCAAACCACCGTGTTCGATGCGTATATTGTCGGTCTGGCCCCCTCGGGACGGCGAGGTATCACCAGCCTGTTAAACCGCAGCGCCAGCATACTTAAACACGGTGCGGATGCAGCAGACTATCCGTGGGAACAACTTAACTACGCCGCCGTTGCCAAAGTGCGCGCGGCACTGCTGGATGACGGTTACGCCGTGTCATCGGTCAACATGGCGCTGTCAGCACTCCGGGGCGTAGCGCAGACGGCCTTTAACCTCAATTACATGGATGCCGAAACGCTGGCACGTATCCGGTCAGTTAAGCGCGTGAGCGGCGATGTCCAGCGCAAGGGAAGGGCGCTGGGCAGGCAGGAAATCCGGGTACTGATTCAGGCTGCAAAACAGCATCCGCAATCTGTACGGCGCTGTCGCGATGTCGCCATTGTGCTGATGCTTTGCGGAACGGGCCTGCGGGCCGGGGAACTGGTTAAACTTGAGCGCCGGGACTATGACAACGGCATCCTGACGGTGAGGCAAGGGAAGGGGCGTAAATACCGTGAAATTCACGTGGCGGATGCGGTGGACAAGGCTATTCGTGCGTGGCTGAAAGTTGGCGCAGACGAGGCTGACAGTGCGTTGTTTAGGCGAATTCAGCGCAGTGGTAAGGTCGCAAGCCAACCGCTGACTACGACCGGGTTAACGGGTATCCTGGCTGAGTTACAGCAAACGGCAGGTATAGCACGTTTTACCCCGCATGATATGCGGCGCACCTTCATCACCCGTTTGCTGGAGCAGGGCGTGGATATCAATACCGTCCGCCAGTTGGCAGGCCACAGCGACATATCCACGACGACGCGCTATGACTGTCGTGGTGATACTATGAAGATCAGTGCCAGCAAGCGCATCAGATGTTTTTAGCAGTTGAGGCGTTGCCAGACTCGGTTTCAGTTTCATCTTCAGCACTCAACCGCGCGTACTTTTGATTCTGGATGTTAATTTGTGCATTGATATTTTCAGGCTGAAGCATCCACGCAACATCCTCACGCGCCCATTCTTTACCGTCAGAGA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ＳＴ１３１＿領域−６（配列番号１７）
TTAAAACGCGGTTGGGTGAATTCCATATTCACCGTTTGATCCATACCCTATGCGATACATCAAAGTACGATCTGTTGTCACCTTGCCCGCTTGTTCGCTCATGCCACCACCACATACTCCTTTTGGCCACGCGCTGAAGACATGATCACCAATCGTTGGGTATACAACGACTTTCTGAGCTGTACCTAAATCTGCCACCTCTTTACCATCAACATAAACACGGGAAAAACACGCGCTTCCAAAGAAACCCGAGTCACGCTTGATGATCACCTCTCCCGTACCGTCTCGTTTTTCGAGTAACGCGGTACTGATAATTTGTTTTTCAGGAACAGGAGTGGCTTGTTCATTTGAGACAGGTTTTGTAGCACAACCGACAAGAGCAAGCATAATCCCACAGGCAAGACCATTTTTAACGACCATGTTTGAAAACTCCCAATATTAAAAATATGTCAGCATCTAACGATAACAACGTTCAGCACCAGAGACTCTTCGTTCTCCGGCTTACGCCTAAAAATATCGCAGGTGCCGTTTGCAGTCGACATCTGTTAATACTAAATTCATACCGCCACCGGCTCGCCGAGCCCATTTACTCCAGAGACAGCCGAACCGAAAAACCGTTTTCAGCGAGCGTCAGACTCAGTGTGTTGATAGTCCAGTCCCGGTCCTCCTCGGTCCCGAAACCTTGAGTTGTGACTTTGCATTCTGCTGTCAGCGACACTAAATCGAGCGTCGCTGGCGTCGTGTACGTCATAGAGAACTCTTTTTTAGCTGCACCGCCCTTGAGCCCTGGTGCAGCTTCTTTCGCTGCGTCGAGCGACGGCTCAACTGCCGGCCATTCAATGACAGGATCGCCGCCACTACCTTGTCCGCAATTCTTTGATCTGCCCAGTTGCTGTGTCGTGATATTTAATCAGATACGTCGGTTCCGGATTTTCGCCACCGCTACCACTATCGCCACTTTGTCCATTTCTCGAATAGCCCCAGCTGGAGTTATCACGACGAGTTAGCGTGTAGTGCTGGAGCGGAGCACCGCTAACAGATTCGCCCGCGCCGCGCGGCAGGAATATCCAGTACCCGCCCGCGGGTTTACTCACCGCATCGAATCTCGTTGCGAGCCGCGACATCAGGTGCATATCTGACTCGCCGACCTGATCGAGTTGCGTGATAACATTGTCTGCAAACCGCTTTGATACGCGTGGTTTTAGCCCATTATCGCTCGCTATTGTCGCAACGATATCGCTGACAGTGACGTCGCTCCAGGAACGAGTCTTTTTGCTCTGAACTGTCGGAGATCCTTTTGCTGCGTTCATCGGAGCCGCTTTTGCTGTGAAATCAACTACCCGGGGTTCACCGCCACTGCTAGCACCGTCAACGATGTATATCCCTTTATCAATTATCTGATTACCGAAACCGAGCCCAATACTGATTTTTACTCCGCGGGCCGGAATTTTCAGAGTTTCAGAAACTATTGCTACGCGGAGTTCGTCTGTCTGTTTACTGGAGCCGCCGTAATCTGTCAGCGTGATATTGATCAAACCTTTTCTTATTTTATCCGTGATGTTTTTATTATCAGCAGATATATAAAAATTAGGTTTCCACGCCTCCACGCCAGTATTTACGTAATCACTCATTCATCAATCCCATAATTGCGTTTCTTTTTTAACCGGCTCTGGTTCGATATCTGGTAAAACAATTTTTTCTCCAGCACGAAACACGGCACACATATCCGTTACGCCGTAATTCGAAACCTGATATAAAACAGTCTCTGTCGTTTTTGACGCTCTCCCGTAGACCGCAAGGCAGATCTGATCGAGACGGTCACCGTCCCGTGTAGTGTATGTAATCATTTGGGGCCCCATTAATTAAAAGGATTTCATAATGAGAATTAATTTTAGTAGTCGGAGAGGTATTAGTATTTCGGCGTCAAAAAAAATACCATCAGGTTGTTTTACATTTATGTTCGTAGTTTTTTTTATTATTTTTATACTTGTTAAGTGCTCTGGTAGCGCTTGATTTTGTATTAATCTAGCGAAGCTCCATAATATTCGAGCGTGAGTGAAAAGTCCTGCGATTTAGGTGTTCCGCCCATCAAAAAGCTGTTTTGCGTTTCAGTTAGTTCTCGCAGCACCCAGTACCCTTTCACCTCCCCGGTCCCCAGCACTAGCTGCTGGGGTTCTCCCGTGTTCCCGAGCGCTCGCAAATCTGTCAACAGGCCGACGCCGCACCCGTCAAGAAATAAAGCGTTTATCTTTCCATCGATAGTAATTGTGGGGTTCGGTCGTCCGGTTATCTGCAACGCGTCGTTTTTCCCGAATCGTGTTTGCTGAGCCCAGCGCCAGGCGTCACTACGTTGCAGTTTGTTGTACGCTACTGTTGATATAGCAAAAATGAAATCACCCAGGCCGAGCATGATATCCTCAGCACCGTTTATTGCATCACTCATTGTCACCCCGCCGCAGCTGGTTTATCAAACATCGCGCCACGATTGTACGAACTCGCAGCCTGTCTCAGTCCATCGAGCACCCCCGACGCTGCAGATTGTTGTATTGACTGCGGATCTGTCGCACCGACAATATTGATTTCGATTTTATTGTTTTGCTCCGGCGCAGGTGTCGAGACTGCCTGCTTCAACGTATCAATATTTAACGTCGACGAATCCAGTGCTGCAGGCGCGGTATTTTTATTTACCATCCCGGATAATGGATTAACAAACGCGAGCATTGATTCTGCCTGAGATTTTGCCTGTTCTTGCCGTTCTGGATGCCGCATATTTTCGACAGCCTCTTCGGCTTTTGCCTTCGCAATATTATCAGCAGTCAATCCAGCGTTCGGTGAATATTTACCTCCCGAATCCATAAACTCTTGATATGCCCGATTATATTCGTCATTATAAGTTTTCTGTTCTTCATCTGATTTTTCATCCGGAATAAGCCACTCCAGTTTCTTTACGACAGCCCATATAATCTTCCCGAATTTGACGCAACCTTCTCCAAAATTGACGATGCCATCCCACATTTTTTTCATATTTTCTGGTTTTACCCACTCAGTAATTGTGCTGACAAAACCACCCTGATTATCCTTAAACCAGGATGTAAATGTTTCACGTACTGAGTCAAACGTCGGCGCGAGTTCCCCCCCGATTTTACCGAGTGTATCTGCAAGTCCCGACGTAATAGAGCCCCACAGATTTGTCACTGATACATGCGCACGCGCCGCCCCTTCCGCACCCTCTTTTGTTAACAAATTCGACTTTTGCGCGTCAGACATTGTCTGTTCCCAGCTTTTACCCGTCGCCTTCATATACGTCATGATCTTATTAGCCTCGCCCCCCATGAGCTGGTCAGCGAGGCTCGCCGCTTGCTTCTCATCTTTCATTTCAGAGATGCGACGCATAACCTCATTAAACTGTTTTTCCCGATCCCAGCCAGCCATTCGTTTTTTCGTCAGGCCAATTTGAAATAACATGGGATTCAGGCTTTTTTCGTTTCCGATTTCGCCGATTTTATTTGTAAGTTCTTCAGACAAATCCCCGATATTTTCGCCGTTCAGGCCCGCGGCTTTACCAATATTTTCCCACGCAGCGTATTTTTCGACGCCAACGCCGTAGGACTTCGCCAGACCGAGTTTTTCTGACGTCTCTGCATTCATTGCCAGCGCACCAGCTGCAGCACCGCCAATGAGCCCTGCCGCGCCAAGTGTCCCCCATTTGATACCCCGCCCCGTAGCCCTCACCGCACCTGCGGCGGCTCCTCCGCCCCATTTTGCAGCTCCTTTTGCGCGACCCGTCCACTTCTCCAGCCGCTGTTTTTTAGCAAGTTGAGTATTCAGCGCCTCCTGGTCCTGCGTTGTCGCTTTTATTCGACGGTCCAGCTTTTGATACTGAGCAGATAAATCAGAAACGTCTTTACCTGCCAGTTTCATTGCTGCGATTTTGTCTTTTAATTTATCCTGACTTTTCGTTAATTTCCCGACAGTAGACGACGTCTGCCGAATCGCATCATTGAGTTCTGTTGTACCGCGACGAAACGACGGGTCTATTCGCCCACCGAATACAACCTGCGTTTTAAAGTTTTGAGAAATAGCCATCGATTTTCATGACCTCGTTTACATAGAAATTAAAAACCCGGTACGGCAGGTCCATTTGCGTATCGGGCGGGATGGCAAGTTTTTTCGCAATAAACGGAATCAGAATAACTATATCTGATGTCGGTCTTTCGGAGGCTTTACCAGTTCGTTAAATGCGGCCTCCATTTGATCGTAATCGCACGCAGGCAGTGCATATAAATCCTCACGCTCCAGATTTGCCAGGCGCGCCAGCATTGTCGCTGTCCGCTCTTCAAGACCACTTTTATCGTTACTGAACATAATGCGGTCGCGTAATTTTGGTTCGCGAATAGTAATTGTATCGCGGCTCTCCCCCTTAATAATAAACGGGCGAGAGAGCGTAATAGTCATACTGTCTAATAATGATTCCATTTTATTTGCCTTTTAATATACATGGAGAATACGAGCAACGCCCGCAAGAACGTCAACACCATTAATTACTCGTTTCATTTTTGCAGGATGAATCTCGTAAATAATTTTTCCATTTTGAACTCGTTTATAATAGCTCGGCGCAATCGTTACTGATTGCCCAACTGCTGATTTTGAATCAGTCCCCTGCGCGTCATCAGTAATCGCCGTAATAAGCCCCTCATATGTATCAATACGTTCAAAATTGACACCGTAATTGTCAGTATATGCACTTCGAATTTCGAACCTTGTTTTAGCACCTGGTATTAATCCCAAATACCCCATCACACCAGAATCGGAGCCAGAGACTTTAAAACTGGCTGACATTTTCTCCATTCCCCCGTCCAGAGTGATAGCTGTATCCATAGCGCCCGTCTTAAAATCATCTTCGATTATTTTCATATCGACGGGAGTGTATTCAGTGCAATTTAAAACTCGTTCTCCCTGGACGAACAACGCAAATGCACGATAGGTGTTACTATCTGCCA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TCAGTTACCTTAATCTGTTGAATGTGTGCCGCCTTAAAACAAAAAGGCGGCCTCTCGTTAAAGTAAATTACCCTATTTTCCACCAAGGCATGAAGCCTCTGCCCCGGTTGAATCAATACAACCACCGTTCGCAGTAGTAATCTTCGTACCCGGCGCGATCATCACGTGTTTAATACTGCTGCCGTCAGCGCGAGTCGCTTCGGTGTATGTCGAATGTGTGCAGCCTGCCAGCGTGAAGAACGCGACAGCTAAGAGAAGTTTTTTCACGTTTTACCTACGCTTCTGAGATAGATTTCTCAGCATTCACCAATGGAAGTGATTGTGGAACATCCGTTTGACCTGCTGGCCAGCGGTAGCCTGTTACGCGGGAACGAGGAAAAGCTTTGATATTTACTTCATCTGCCTGGTTGCCCCCCAAAATCATTAAATCCCCGGCGGCATTTTTCCCGACAACAAAGCCGACGTGACCACCGCCAGACCGAGACAGAATAGCAATGCATCCATAGGCGGGTTCCTTCAGTTCATTACCCCAATCGAGATAAGAATTCGCAGACTCAAAACGCGTTGAGCGAATACCCGCACGTTCCAGCATTGCCCCGGTGAAAGCAGCGCACCACGGTGTTTCGTCATCCTTAATGCCGCCGCGTTTGATATCTTTCCAGTACTGCACAATTTCTGCAGCATGTTGCTTCCCTTTCATTTCCCGAATGCCGAGGTTTTTTCGAGCCTCGATTAGCCATTTAGGATCCGTCATTACCTGTCTCCTGTTATTTTTGAAATATTCCCTCGTGCCCGCCAGACAGCAATACAGATGGTGAGGTTGAGAAAGAACTCTGCGGGATCAACCTGCGTATATTTCCCGTAAAAAATTCGTAGGGCTATCCACGCAGCAGACAGAATCGCGAGGTAAGCAGTTAGTGAGATGAAAAAACGATAGCGGCCTGTTTTTTGAAAAAACATCAACCGTAGTGCCAACATCAGACAAATAATTGCATTGGCATTGATGAGGACAGAGTGCAGGGTCATTATTTCATCCCCTTATCTGATTTCCATAAACGAGCTTGTGACATGATCCGCAACAGTGATGTAACGCTGATTACTGATGCAACCAGTGCACCAATGGCGGGAGAGACTTTTACTGTTACGGGAGGGTTCAGGTGACTCAGCACCGCGTTCAGAATACCGGTAATGATGGCTGACGCTGTCTCAGCGCAATACACACCGCCAACAAACGAAATGAGTGCGAAAATAACCTGCTTCCAGAATCGATGCTGCCCGGACGACAACACATAGAGAGCTGCGCCTGCCAGCGCACAGATCATCACTGCAGGTGTTGCCTCAGGAAATAACGCAGCAAACGTCACCCCCGCCGAGCCAGCAGCAACGCCAGCGGTTAGAGGTTCAGACATGATTTTTCCTGATTCAGAAACGACAAAACCCCGCCGTGGCGAGGTTCTTAGAAATTTGGCAACATACCAAATTAGCGTCAAATATGGCCTATTTTGTTCGTTTTTGCAAGCATTATACGCAAACGTCGTCTAAATGGTTCTGATAATGATGCAAAGTTGCAAGAAGTGCCACTTCATCAAGTGCTCTCACCGCCTCTTTCATTCCTACCCAGTGCAGGGAGTATGTTTCGCACCAGGTGGAACGAGAAACCGACAGCATTCCTGCTAGGGTAGATCCGGCCATCTCCTTAAAATCCTCGCGTTTATTTGCTGCTGCGACCGCCTGCACGGACAACCACACCAACGAAAGCAGGCGCTTAACTACTTTTCTCTGAGTTGACGCGGGGATGTTTCCTTTATAGCGACTCCAGACAGCCTCACAAATAGCTGTTTGGTGTTTGAATGCCAGGTTACCACCGTAGCAATAACGCAACCACGCTTGCTGACTTGCATCCAGCGAGTTCACAGAACGCCGCCAGGATGAATCAGCAAATTCAAAATCACTCATCGGCGGCGCGGGGCGACGTCTGCTGAAACTTTCCAGAGCGTAAACTGGCGTAACCAGAGCATCAACGGTCCGGTCCTCCAGCTGCACACGGTGAATATGTTTGCGTGGGTATGCGTTTTTGTCTGCCGGTGGGTGCTCACACAATGCTTCCAGTTGCCCCTTAGAACCACCAGACAAATCCCGCAATGCAGCGCGCAGTTTTATGCGGGTATATTCCAATAAATACTCGTTACTCATCAGATAAACTCCTCATCGCGCCAGATAGCCAGTGTTCTGAAAACTCCCTCAGCGTGCATCAACAACAATGAGTCGTGCTCGTAATCCGTTTTTGTACGTCCGTCGATGGCATCGTGACACGCACTGCAGGCGATAGCGCCCTGCATATCGTGAGGTTTGATGGCTGTGCCGCACGTTCCGGCGAGACGATAATGAGCCAGTACGCTGGTTTCAGGATTGTGATTGCACACACCGGGGATACGCACAGTACAAGCGCGACTGCGTGCAGCTTTTCTCAGGTCGATTTTTTTCATGATGTGTAATCCAGCAGCTGCGCGGCGGCATTTTCAGCGGCCTCCTGAGAGGCAAATGTGCGGAACAAAATATAATTCCACAGCACATCTAAAACGGCTGAATACAGTTGACCGAACTCAAGATCGTCCATCGCTGCAAACGAGATTGAACGAGGTACGCGCATCAAACTGCCGTCTGGCATCTGATGAACGTCATAAAACCCAGCTTCCATAATCGCCCATGCGCGAAACGCCTCGAACGACTTCACCGCACTGATACTCCCCGCGCGCTTTTCCGACTCATCGAGAAGATACTGATCAGCCAGCTCTGCCATGACATCACCGTGTCCACCGTAATACGCCAGTAACTTAACGTAGCCGTGAACCAGTTCGCGCTCCGCAGGAGAAATAGCCCCTCCGGACGGATGCCAGTAATCAAAGCCCAGGTTGAGAAGTGAGAAAAATTTACGATGAAACGCGGGATTACGCGCCTGTTTGAAATCTGCATACACAACAGCACCTGGTTTGACTCGTTCAGTCAACCAGCGTTGCGTGTCTGGTGTCGCGGGTATTAGCGAACCGCCGGATACCCTGATAAATGAATGCTGCGCCATGGTTAACTCCAGGTGGCGCGGCAGTGTTCAGAAAATGATGCCGGGTGTTCAATCCAGCACCGATATTATACCGTGTTTTACGCGTCAGGGGGTGTAATAGTATATCCAGCTATTTCTGCCAACTCGAGAAACGCCATCAGGCTGGCAATCCGCTCATCATCGGTCAGAACACGCACACCAACGATGTGTCCGTCCTTACGCTTGATAACAGCCCGGCATGTTTCCGGTAGTTCGCCTATAGATTCTTGAATATTCAT
ＳＴ１３１＿領域−７（配列番号１８）
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ＳＴ１３１＿領域−８（配列番号１９）
AGATAACAGAGGGAAGTTTAACCTCCCTCTTGCAAATAGT
ＳＴ１３１＿領域−９（配列番号２０）
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ＳＴ１３１＿領域−１０（配列番号２１）
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ＳＴ１３１＿領域−１１（配列番号２２）
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ＳＴ１３１＿領域−１２（配列番号２３）
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GGTGATGGAACAATGAAATACAAACGGTGGGTGCGTGCGGAAGTCGTAATCATCAAACAATGTGCGGGCAGCATGACAGTTGAACGTATAGGGCAGCTTATTGGCAGAACCGGTGCAGCGGTACGCACAAAAGCGCGCGAGCTGAAAATCTGTATGTATCTGCGGGGTAATTATCACCAGTCAGTGAAATACCTCCAGGAAGATATCGAGCTGGCAAGGGAATTACATCAGTCGGGTATTAATCGCCAGGATATCGCAGAAAAACTCGAAATGCCGATCGGAGCGGTGAATCAGTTTGTTTATTTTGAGCGGAGAATTTCATGAAAGAACTTTTTCTTGCATTTGTGCCCCGGTTTATTAATGACCAGATCGCACTGACTGATAATGGTGAACAATATGAAATTGCCTGCAGCATGGTGGATGTGAATCCTGGCGAACGGTATGACGCGATGTGTGACCTGAAAATATTTACCTGGCTGGGTTGGGCTATTCCGTGTGGAGAACCAACCAATATTCGTCCGTTTGAGAGCAGGGAGGCTGTATGA
ＳＴ１２７＿領域−１（配列番号２４）
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ＳＴ１２７＿領域−２（配列番号２５）
CTATTCTAAGTCTTCCTCATCAACATCACTATCATAAGGAAAGAGTGTAACTTCTTCCTCTGGTATAATCGGCTCGCAGGCCTGAAGTTTATCGTTATCGACAAAACTGGTAGCCATAATACTGTTCTTGAAATTATTGTCACTTATCCATTCAGAATTCCAAACATGCTCATGAGGCCTATCGTGAACGCCAGAAACGATAGAGCAAAGCGTCTCTTTATATTCAATATCTCTGTTAATATGATAGGAGATACGTTGCAGCCAGATATCTAAAATCCCAGTACCTAAGATAGGTTTAAACTTATCTTTGATCTGTTTGAGCAACTCTAATTTCTCTACGTCATTATCTACAAACTTTAATACATTACTCAACACTAACGCACAAGATGAAAATGTTCTTGGATTATTAATCATTAGATCAGAAATAATACTGACTATCGCTCGAACCTCCTCCTTTATGCTACTCATGCGTTCTAAACGCTTATTTATCTTAGCAAGATAGGCTTCAAGCTGACCTGAATTTTTATACTTACGAGAAAAGATAACAAGCTTCAAAAGAGTCTTTTGAATAGTTGTGGCATTAACACTTCTTCCAAATACCATCAACGCTTCTTGTTTATCTGGTTTCATTGAACCAAGGACTAAATCTTCAGTAAGTGAAGTTTTAGAAGCATTAAGCTGTAGCCCTAACCCTTGCAGAATAACAGTTAGATGTCTCGCTATCGCCTCTGCATCCTCTTTACTATTTGTGAAGATTCTATAATCGTCTCGATATCGAATGATATGATAGTCATTGATATTCTGGCTTTCGAGTTTCTGCCCAAGCAACTCATCAGCATAACCAAGAACGATTTCCGCAATAAAATCCATAAGGGCAGAACCTTGAGGAATGCCGTTAGTCTGCCCCCATCGCATCTGTCGTAAGGCATAATCAATTTGGTCTCCAAGATTTCTACCTGCTCCTCTTGCTGCTTTAGCATCTTCTTTTGTGTAAATTGCCCAAGGTATGGAATGGGTATAAATTGATGGATAAAAATTTGCGATATCAGTACTGAACAGGTATTTAAACTGAAGAGATTTATTGATAGATTCTTGTTCAACATCACGCCACCATCCTGATACAGCTTTTGCCTTATCAGAAACTCCATCTTCTTCAGATTCTCTTGGAAGGCTTGCACACACAATTTTTGTATTGCTTTGGAACTCACCAAACCTTTCAAGCAAGAGTTGCCATGATTCATCTTCCGTTATTTTATGGACAAGATGAACGTAAATTGCAGGATGAATTAATTCGAATGGTCGCCAACAATAGTGGCCATCTTTATTCGTTTGTAAGATATAGTTGTCAACGACGGATGAAAAGTGATCCAC
ＳＴ１２７＿領域−３（配列番号２６）
GTGTGGATCACTATTGCACCGTTCGTGACAATAGTTAACATTATCGAAATCGCATGCTTTTTTGTAACCGATATCATTAATACCGTTTTGCTTTTGTTCGAGAGCATTTTTCACTGCGAGCAGAAGAGGCGCAAAGTCAAAATAAGCAGGAAGTGCAAAACTACAATAGCTCTTGTGCTTCAAGAAAAAGCTTCTTGCGCTCTCTGCTGTCATTGCGGTAATCAATGTCATGAATACTAACCCTAATTATTACTTTTGAGTCTCTATTAAACACTCCTTTGAACTTAATGTCTTATGTTGAGCCACTAAAACGCATCAATGGTCACAATTCTGCTCATCAGTTTTCACTCAATAGTATCAGAGATATACTATTACCCTTCTTACAACGCTTATTTATTGGCCAACCATCATCCCATTGATAAATGATCTATCAATGGGATGATAGAACCGCTTTTATTCGAAGCGTTGTTCGCGCATCTCATCCTCCTGCTGCTCTTGCAACTTTTCATGTTCTATCCAATCGTTTAATTTCTCGGAAACAATTCTAGCTGCCGCAGCAATATCTGTACGCTCATGCTCTATTAATCTACTAATAGTATTTGCTCTGGGTTGCATTACGTTAACTCGACTTCCCCACCAAGATGTCGGTGTTACGCGATAAGCGAATTCTTCCAGTACGGCCTTTGGCACAGGAGCTGCTTCAAGGAAGCGAATCGCTGAAACCTGCATTGTGACCTTATCCAAATCATCCCCCACAGACCAAAGGCGGATACCCTTTGCGAGAGGTGCCCATACATTAATATCGTTTCGAGTAAGACACCATTCGATCAATACATTCACGTCGATATTCGCGATAGGGGACTCTGTCACATCATCATAATGGATAAAATGAATACGTCGTTGTTGCTGTTCTTCTGTCCCTTCAAAAATACGAGAGAGGAACGCTTCTGGCATTGATGCCGCAGTCATCTTTATAGTGTCTTCAAACGAATGAATACAGCCATACTGTTCATCAACAACAGCAAAGATCGTATTTAACCACTCTAACTTCCCCGCCTCGTTGCCTTCGAGACGCAATATGGCACCAACAACACATTCCATGCCGTAATCCATTCCCCCAGCGGAATCATTGTGCTCTCTTTTGAACCTCTGGATTGCAGCTTTCAATCCTATTTGAAGCAGATCAAAGCCAAGAGTACTCGAACCGTCTTTCTGGTCACTTAACTTCATGCTTAAAGCTTCCAAAATAACATCATCGCCATTTGGCATACTTAAAAGCCTGTGAGCAAGATCAACAATGCGCGGCTCTGGCAAATGAGCGTATTGGTCTCCCCAAAGAATTTGTCCATACATTGACGGCATGATGTCGGGGTCATCTAAAAGAGCCAAACAGCGATCCAAGTCAGTTTCAGTGAATTCTCGCCAAGGATGTAAATAAACAATTCCGTATCGCAACTCAGGATGACGCACACATTGATCGAGAAATTCTTGGGCTAATATTGAATCAATAGTATCTGTCTCGTCGATAAAGCCACGGATAACTGCAAAATCCTTTTGAGAACCGGTTTGTATATCCAAATAAGCAACGAGTTGTTGCCAACACTCCCGTAGGTCAAGTGCCCCTCTTGCTAAACCTTGACCAAATTTAACACGGTAGGGCATCCCCCCCACCAAGAACAGATTAGGCCCCAACTCATCAAGCGTATGCTGAGATGACGCGAAATCCTGCCCCAATTGATAAGCTTTAGAGTCAAGGTATGTCCTAAGATTAGCGAACTTATTAGGTTCATCAGGAGAAGTATCGGCACTAAATGCCAAATAATCGCGTCCGTTACTTAATACATAAGCCATTATTTCCGGAACCAAGTCATGTGGTTCTAACTCACTCTCCAGAGCGACAAGATCGCTTGGCAACGGCTCTAAATCTTCGATATCTCTGCGCTTGGTGTAATCAAAATATATCGTTGAACGAACGGCCTTCCATCCTTCAACCCACGGATAGTAAGAATGTAATTTGTGAGCAGCATCAATGAGCATTGTCCTGGCAGCCTCTTGACGCCATATTGATCGAAAAGCCCTCGCTAAAAGCTGCCGCGCAGTTTCCTCAACCGCAGGAATTCCGCAAGTTCCTGCATTAACCGCAACTTCAATGAATGCACTACGCCATTCAACAAGTTCTTCATAGGTTGGTTGAAAACCATAATCTCTTGGTCGTGCACCAAACTCATTAGCCCCGAACCCCGTCCAAGGTGGGCCGCTGAGGGCTGTTGAAAGCATCATAAGGCCCAATTCTTTGCGTCCAACGACGTCTGATGAAAGGCATTGTTTCAAAATTGCAAGGCGCTGGTCTAAAGAGGCCTGTGTACCAGACAGGTATGGCTGATAAAGCCTCTTGATCTTACCCCGTACAGAGTCATGGTTGTTGTTTTCAACCTCATAATCTACCGCATGAATTAGCAGCCTGACGCAACGTTCAAAAGTTTCCGGTTCATATGCCAACGATTGCAGGAGATTGAACATAGTTGTCCGTCGTAGACTGTAACGCCGTTCCATACCTTTAAAGTCAGATGAAGTAAGCTCTTCTTCAATCCTGTTGAGAAGTGTTTCAGGCGCAACCGGACCGATGTATGCCAACATTTGTATTGATGCATCATCCAACTCAGTTCCTCGTCCAAGCAAATCTCCTGGTTGAAGCCACGCTTCAACGATTTCTTTCGCTACAGCGTGTTCATGGAGCAATCCTAGCCGGTGTGCGAATGATATTAATAAACGTTGGCGACCGGGAGCTTCAAAGGTGTCTCTGAGTTCATGAACGGGGATGCTATCAAGTGCCGATGCAGCTAGCTTGTTTGCAATAGCATGAGGTAGAACAGCCCGCCAATTAGCTCTTTTCTGGATAACGTGACGGTTCAGTAAATTAGTAACTGTTTTGAATAACTGCCTGTAGGAGTACCCGCCGAGTGAGCCTAACGCCTCCAATTCGTTAATCCCGCCTTCACTGGTTGAGATGGAGAAGGAATACACTAAGGACAATATTTCAGCTTGTTCCCGCAGATCATCATCGGGATCATTACGCTGCTCAAAAAGGCGGTTAAACAACTGTGCATCAGACAATTGAGCTAGACTTTCACCCTCTTCTACCCTCTCTGCTATTGCCAAGGATACACGTGCATTCCCATCAGCAAACGCTGCTATTCTACGGGCATTGTGATGGCCTATACGGGGGAAGCGACGAATCAAAAGCTGTTCAGCTACCTCCGGTCCAAACGCCTCTATGCGGATTACCTCGGTTGTTTGCGGTTTATCGTCCCTAATATCGTATTCGATGGTAATAAGTCTTACCTTGTTACCTACGGCTGATATCTTACCTGCCAATAAAGAGTGTAGTGCTGATGGGCAATTATCGAGGATCATAATAGCTCGTCGATCTTCGACAATAAGCCGCTCCAGCATAGCCGTTGCCGAGGGGGCTGGGTCAGCACCTGTATCAACATAGATTACAGAGGTTCTATCTAGAGGGTCAGATCCAACCGATTCATCAAAAAGTGCCTGAACGATCCGAGTCTTACCTACACCAGACAATCCTGTTATGCGAATAGCTTTTTTAGTAGAACGGATTAGTTCTCGCATCGGATTGATAGCATCTTCAATGCTAAGCTTCTGCCCTTGCCCTGATGGAAGAGTGACCGTGACTCCAGGAGCTAAGATTAGAGTGTCTACGACGCCATTGGGAGGATTACTCCACGCACCGTATGGCTGCCAGCCTGAATATCCCTGTCCGAGTATCCCTTTTACCCACAACATAACTGACGGATGCTGGCGTAACCATTGAGTCAGTTTCGAGCGATCAAAGAAGTCGAGATGGATATTGCCATTATTTGGCTCATCCTTAACTGCTTCCTGCATTGCTTGCAGGCGTTTCATCTTAGAAATAGGAGAACAATCATCACTGAGGCAGACAATTACGTATCCTCCTCTTTTAGAAACTTGCTCAGAGATTAACGGTAGTAATCCTTGTTCAGTTTCCATTTCATTCTTGATCGCGGACGCACTCATCGAAGGCTTCTTGGCCTGAAAGATCGTGTCGGGCCTCTCGATAAACCCTGTACTTAGTTTGTCGATAGGAACCTGAACATGAACGTCAATTCCTCCGTCTGGTGCATTGATGGAACCAGACCAATTAACCCATGCGGGACTGTGGCCATGAGCTGCTACCTCTGCCTCAGCAAGACGAGCAGTCAACTCTTCAAGTTGACTATCGGTGAGTCGGAGTAATTCATCTTTCTCAATGTCAAAGATCGCCACATCCAAACCTTAGTAAAATTATTACGGCCACAGTCAGATTTAGCCTCCTAGTCTAACTAAAGTTGAAAGAGTTGTCCGCTGAACTGCCCATAACCATAGAAAAACGTTGAAGTTATTGGGAAGCGTCGGCTTAGGCAATATCGTTAATCATGCCCGCAACTGGCTTAACGCCAGCATGCAGATGGGATTTAGCTCTAATCTTCAATGAATGACGGTCTAAACTGACTCAGGTAAAGGGGGAGGCATCTACCTCCCCTGTGATTTGCTCTTACTGTGATAGTTCCTTTTCACTCAGAAAACGAGCACGACGGTTACAGGTCACTTTTGTTCTGGCTTGCCGAATGCTTGATTTAGCCAACATTGCAGGATTAACAAAGTGTTCATCTAAGCATTGTCGGGCAATCGCGAAGTCGTAGGCTAAACTCAACTCTCGCATTACATTACCCGCCTGAACTCTTGCTCCTCGTTCAACAATACTGTTAACCAACTCCACCACATCCTTACGCGTAACAGCCATAGCTTCCATATGCCCCAGCACTCTGATGGCATCGCCTTCCAGAGTTCTCCGGCACTCTTTCTGGCCTTTAACTTTGCGTGCGCCACGGATCAGCTTACCATCAGAGTCTTTACGGTCCTCAATCCTCTCCGTCAGATATAACTCGACTACATCTTTGACTGTTACAGGCTTCTGCTTA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ＳＴ１２７＿領域−４（配列番号２７）
TCAGTTTACGCTTACCCATTCATAAATACGCGGTAATGTTAATACTACACTCTCCTCCGAGTAAACAGTTGCGAACTTCTGCTGTGCGCTCATAGCAGACCTTGCAGGTCTTCCGACGGTCCGCTTCGTGCCAGGGGCAGACATAGATAAAGCATGCTCTGCATGAATCATTGAGGAGATAGTCACTCTTGAAATGTAAATCCCCTGGAATTCTCACCATTCCATAACTGGTATTTGTAAGCTTTAGTATGATATAAATATTATTTTATGGATTTTAAGAAAAACCAATAAAAGTTCTATTTTTTTTATAAATGGAGAACAAAGATGAATAATGGCGAAGATAAAAAAACAGCTTTCTTGATAAAGGATTAGAAATATCCAAACCTATCGCAGGATTATTTTCTTCTGCAATCGGTGGCGGTATAGCGGGGTCTTCAGGAGGTATGCCTGGAGTCGTTATAGGGGCGGTTGCATATTACCTTGCAGATGTTAGTAATCGAGGGTTATCTCGGATTCAAGAAAATAGAGCATTAACTGCGCTAAATATCGCATCTCGAGAAATCGAAAAAAATTAACTTACAGCAGAACAGTAGAGATATGGCTAGTGACCTCTGCGTATAGACATTTTTTTTAACATAACCACACACATATATTATATCAATATATTATTGTTAATCAAAGCACTGCTGAGTGCTTGCATTGTAATACTTTCAGGTGAATATCTGTGCCAGTAAAGCTTCACCTTTTGCTCAAACTCTGGACTCAGATTTATAATTTTACCGGAAGCAAGTTCAAAGCTTATTTGTTGTTTAGGTATCATACAACATGCCAGGTGTTGTAATAACATTGTGACATATGCTTCTGAGGAAGATACAATATGACTTTGTAGCGTTCCTGGCACCAACCCAAAATATTGCTGCAAAAATTTATGATGCATATCTGTATCATGATTAAAGGATACAATCGGGGCCTTTAATAAATTTTCCTTTGATACGCCCTGGCTGAAATATCTGGAATAAAACTCTGGTGTTGCACAAAAAATATAATCGAGAGACCCAACATAATCACATAGCCCGCCAATGATTGCCTGCGGCTGAGAACTGATACAACCTACAACCTCTCCTTTTAACAGACGCTTAAGGTTTTTATTTTCATCATCCACTTTTATATCCAGTCTTATAGATGGATTTTTTAAAAAAACACACAAGGCAGGAATTAGCCATGTTGCCAGCGTGTCAGAATTCACTGCGATCGGAATGGTCACAATGCTTTTATTTGCATCAAGGTTCAATACATCATGCTCGAATATATTAACATGATATAGCAGTCCTGCTAATTTCTGACCATAATCAGTTAAATGTGGAGGTGAAGTACGAGTAATTAACTGAACACCGCACTGATTTTCAAGTTTTTTTATTTTCTGAGATATTGCCGATTGTGAAATACCAAGAATTCGGGCCGCTCTGTAAAACCCTTTTTGCTTGATAACGAGATCAAGATTTTTTAACAATGAATAATCAATAAAGTTTCTCATTTGCAT
ＳＴ１２７＿領域−５（配列番号２８）
TAGATATTTGACCCCGGACTGATGATCACCATCAGTCCGGGTTAATAT
ＳＴ１２７＿領域−６（配列番号２９）
TATTTCTTCCCCTCCGGTTATTTTGTTTTCATACTGATTATTACCACACATCTGTTACAAAGCAAGGGGGACATTATAAGCATGATCTTATAATCAGATTATTATTATTAATTTTTAATTATAACATATGTATTCTGTGAACTAGTTGTTTCAATCAATTCATCTGAAATCGATAAAGAACTGCATGGAAAGTTGAATCAACCAAGAAAGATATCACACGAAATCACCTCGTTCAGGGAGGTGACATTTGCTATAAAAATGAACAGGAAATGCTGTGAGGAGGGAACATAAATACTATTCATGTACCGCCATACAGGAGATTTTATTGTGTAGATATTCTTTGATATAATCTCTGGGGCCAATACTAAACTCTTTCTTAAAAGAATAATTAAAAGAGGATGATGAACTGTAGCCTAACTCTATTGCAATTTTTTTTATCTTATCATTATTTTGTATTTTGCTTATAGCTTTCAATAATTTTATCCAGTTATAAAATTGATATAATCCTGTCCCGGTGTACCTCCTGAAAATCCGCTTAAGATAGTCCTCCTGTAAATAAACACTTGCGGCCAGTTCACGAATCGTTGTAGTATTATTATTCAGCATATTAAGAACAGTCAGTCTGACTCTGACATCAGTATTATCATCTGCGATAAAATCAATCAACTTCATCTCCAGTAGTGATAATATAAGTGTAACCGATACTTTCCCATTAATAGATGGAGTAATATTTCCAATTGTTATTTTTTCTCCTGTTATTTTAAATATTCTGTCTATTGTTTTTTTTATTGTTTTTGAATATGCAAAATAGTGCGTATTTTCAGAAGTATTCTGAAAAGATGTAATTTCTTTTCTTGTCAGTGTAACACTATAATAAATGTTATTGTCATAGCCAAAGTGGTTTAAAACTATTAAACCCGCATCATTAAATCCCAGTTCTTGTGGAGAATACAATAACCGAATATGAGGGGAAAGGACTTCTTTTATAAAAGAAAATACTGTCATATACAACCTCAATATATCTTATACTAACTGTATTTGCTATGTAACTTTAACATGCATTCAGTTATCAGAGATATTCTATCAAAATGGTATTATTTTACACACGCAGATATGCCTGTTAACAATTATTTATGTTTTACACATTAAGCTCGACAAGCTTATTGCGAGAATAACTTCCTCACAACAAACTTGTCGAATATTACAGAT
ＳＴ１２７＿領域−７（配列番号３０）
TAATTTTATCCTCTTTAGCCAAAGATTTATTAATAATTAACTTCCTCAATGACATATTTAGTATTTACTTATAGTAATTCGATGATGTGATATTGATCATGAAAATTTTATTAAGCACGAACCTTTAGTTTTGCATTTTAGATATAGTTATATATTCTGGATAAAGTTCAGTTTTTTGTTTTGTGATGTATTTACTCAAGAATTTCCTTATGCATAATTTCTTCGCTATGAAGCATGGAGCGAAGAATACTTATTCTGTAATCTCTTGTTTTATTCCGAAGATATGTAAGTGTGAAACCTGCCAGCACTGCTTGTTATACCAATTTCTTGCAAGACAACTGAGAACCTTTCAAAATCAGATGGAGTTCTAATGAATTCAAACTTCGTA
ＳＴ６９＿領域−１（配列番号３１）
TTAGAGAACCTTAGACTGTTCTGGGAACCAGTTATTAATTATATGTCTTCGACAGACTTTAGATATTTCAAATACCTGTCGTGACACTAATGCACCATCAGGATGGCGCTGGTCAGGTATGTCATTTTCTATGTCATAAAAATTATGCGTTATTTCTGGGGGAAAGAAAACGTTTTTGTCTAAAGGCACGCTTGCATAGGGATTATAATACACATGCAAACCATCAAAATGAGTTTCCTTGTAGTCCCTTGTTCGGCACATTACAATATCCGCGCCAACAACCTCATTGTTGTAGAATTGTCGCTTCGTAGTAACATAATGGTCAGGACCAAGTTTTCTCGTATGAGAACCTTCGTTCTTCATACCTTCATTGGCAATAAAAACATTCACATCAAGAGCTCGGAATCTCGTATATCGGACATATCGATCGACCCGACTCTGAACGATAGCCTTACCAAAAGTACCTGTCGTTGAAAACACGATAGCACTGATTTCTTTGTATGAGTCATTTGTAAAAATACCTAAAGGTATTTCAGTGTCTTCATTTTTTTTAATCGATAAAACCCTTCTTTGCCTACCATTTACTAAATCTCTCATCGTAGGTTCTTCAATGCCAAACAATACCCGGTTAATGATTGTATTATTCTGGGTTAAAGATAGATCTGAATCAAATGGGGCCAATGCTAACACAAAAGGCTTACCGATTACATGTTCCATTGTTGAGTATGGGAACTTCTTACCATTAATTCCGGTAAAGAGATCGCGCTTATCTTTAATTTTCCCAAGAAGTTTTAGCGTAGATTGATGCTTAAACTTAGCTTCACTGAAAATTTCACTGACTGGCGGTTTATGGGGCTTGTCAGAGACCATAGCCTCTACGTTAAATTTATAACCTAATGGCGTGCTAACACAAAAATCAGGACTGTCTTTTGTATAGTCAACCGAATACCCCAAACGAATAAACATCTCATTTAGATATAATTCCCACATAGAAGAATTAAAGGTAGTCTGAAATTCGTTAATAAATTTAGTTTGTTCACCACTGCGTTCCAGTAATCCGCGTCCCCATGATTGGATCACCGCCCTAACAGGAGCAAGTTTAGGATCTGTGTAGATTGTTTTAAAATTGTGATTTAGTTTATTTCTAGCTATTTTTGTTGAGAAGAGATCCATTATTTACCTCTATAAACACTTTGTAAAACTAAACATGTGTATTTTACTGCGCTGATTGTCGAACATATGCTTCAAATTGTAATGCGGTATTCTACATCAGAAAAACCTCTTTTATATTTTCCTCATTAAATTTATTTACACCGAAAAATAGCCGCATGAATCATGTCTGAACAGATGAACTTCTCTAATATAGCCTAAATACCTACGACTGCGCTATAAAGAGGGAACCTCAAGCACTAATAGCACAAAGAAAATATGCGAACACAAATTTGACGCGAAACTATGACTTAGATAGGATGAATCTAGGTGGTGATGGTCACCTGGCGCCTGTCTCGCAAAGCAATAGCCCATCGTTCAGAAGTATACCAAATACTTGGCCGCCATCCATTATGACGCTGCCCGGTTAGCAGGCTATCGGTATCCAAAGCGTTACTTTATTGGAGGTACAGCCATGTCTGACTATTCATACCTAAGCATTCTTAAAACGTGCGCTAAAAAGCTGGCTCGCATTCAGAAAATTAAGCTTTCCAAAGCACTCGAAATCGTTGCCCGTGACGCGAAATTCACCAGCTACCATGAGCTGTCCGAAGTCGCAAAACGTGCCCCGCTAGAACAACGGCTGGTTTTCGCTGCAATAGGCGAAGATACTCAAGAGGATGTGATTTATCGCGATGAGATTTTTTATGCCATAGACCGCGAGGTGGAAGATATGCTCTCCGGCGACATAGCGGAAACAAACGCCTATGGTTTTAGCATAGAGAATCTGGAGGCAACAAGCATAAATTACGACCCAAAGCGAGGCATTCTGGTCGTCCAAGTCATATTTGATTATCAGGGTGAACAAGATTCTGAACGCCCTTTCTCTGGTTCGTCCTTTGAAATTGTTGCGAAAATGGAGCTACTTCTTCGCGACAATGTATGGAGCCTCGTAGAAAATAGTCTGGAATTGACCTCTGTTAATTCAAATGTCGATAATGACTGGTACGATTAAGACATATAACAGTAGGAGGCATTCCAAATTTTTGGCGGAGTGCCTTTTTAGTAACTATATCCAGATGAAATCATCGAGTTATCACATGAGCATCCATCTTACGTGTACTCAAAACACTTATGGGCTTCTAAATTCAGGAAGTCCCTACTCCGCTTGCTGGCGCTTCTTTGAGCCTCGTGGCGTCCATATACACCAATTAGGCCAGACCATGCTCAAACAACTTGTCGAGAAATGCTATGTGCAAAAACCACTGGACATGTTCTCGATGACAGCAGGCAAACTAACTGGGCTTGATCAATCTGGGCCTAAACTGGCTTCCATCATATGCAGAGGGATAGAGCAGGCCAAAGATGTACAACTCGGAGAGTTACTTTTTGCCTGCGGTATCTATGGTGTGGAAGAAGAAGAAGCCTGGTTACTAGCTAAAAGATTCAGTAATCTTGAGGCCTTGTATGGTGCCAGCATAGATTCTCTGATGAGTTATAACCTTCTTAATGAGGCAGTAGCTGTCAATACGTATAACTTCTTCCGTCATCCGCTCAATGTGTCGGCTCTTAACGAGTTACAAACAGAAGGTGGATTGAAGGTGCGCCATGGATAGAATTAACACCAAGGCTGTGCCCGGCCTTTTATCTATGCAACGTAGCCGATGACAGTTAACGGTGAGACAGCAACACCTGTTGTAACATGTTTGTACTCGTGCATTGCCATCCGTAGGCCTAAACATATCTGACTCCCACAGGATGGGGATAAAATACAACATTTGCATTTTCAATTTGTTATCGAAAAATCATTAGTCCTGATGGGAAATAATATCTTCCCGGACTAATGATTTTCTATCCGGACTCCACTTTTTTATCCGGGCCTATACCTCCCCTCATCGTTCCGCGCTATAACCGCTCCGACACTCTGTTCCCGTCCCGTGAGGTGCAATCATGAAAACCAGTGCAGACAGTAACGATGCTTTTCCCGAAAGCGGCAACGTGCGTATGCGGCAGGTAGTCCAGTTTCTGGCGATGAGTGAATCGTCGGTTTACCGCCTGATTAAAAACACCGACTTTCCCCGCCCCGTCCACCTCTCTTCCCGACTGGTGGTCTTCGATGCTGCTGAAATCCGTCAGTGGCAACAGCGCCGCGCCGCCATCCGTTAATCCACGCTCAGGGATGAGCCGACTGATACCCCGTCATGAAACGCGCCCCTTTTCTCTGTAAGCAGTCTCCGGACCGCACGCTCGAAGTGGTGATCCTTGCCGGAAGCCTGGCATGGGAGACCTCACACGTGTGGCGAAAAGATCCCGACCGGGAAGATGATGTTCCCCCGATGGTACTCGGCCCGGATGAACTGGCCGATCTGAGCAATCTGACCATTATCAGGCCCGACACGCTCTACGTCCGGGTACTTCGCACCGGCGATATCAGTGAAGAAGAGCTGCTGAAAATTGCCGTAAAACTGGCGCACGCGGGCGTGCAGATGGCCCGGCTGATGACCCCTGACGGTGAGTTACTGGAGAACTGGACCGGACAGCTTGAACGCCTGCGACAGGAAAGACCTTCTGACATCCTGCCGGATCACTTCCGCCTCGATGAAGAAGCACTGTGGTTTGATAAGCTCACCGAACGGCGCGACGGTGAAAGCGATGTCCAGCCCCAGCGCATCTGTTCCCCTCTGCGCGTCACTGCCATCACCTGCGACAGCCATGACGGCAGCTATGGCCGCCTGCTGGAATGGCACACCACCACCGGGCAATTGCGGCGCTGGGCCATGCCGATGGCGATGCTCAGCGGCAACGGCGAGGAGCTGAGGCGCATTCTGCTGGAGAACGGCCTGACCTATATCTCCACCCGCCCTGCCCTGCGCAGTCTGCTGTGCGAATATATCTCGCGGTCACTCCCCGGACGCCGGGTCACCTGCGCGGAGAAAACCGGCTGGCACAACGGCGTGTACGTGCTGCCGGATGAGGTTATCGGTCCCGATGGCGACAACGTCATTCTCCAGGGCAGCCACTACCTGACTGGCGGCTTTGCACAATCCGGTACGCTGGCAGAGTGGCAGGAGCAGGTCGCCGCGCTCTGTGCAGGCAATTCACGGCTGGTCTTTGCCGTCTGCTGTGCGCTGGCCGCCCCGCTGCTGCGCCTGACAGGAACGGGCGGCGGAGGCTTTCATCTGCGCGGTGAGTCCACTGACGGTAAGACCACGGTGATGAAAGTGGCCGCTTCCGTCTGTGGCGGGACGGATTACTGGCACTCCTGGCGGGCCACCGGGAATGCGCTGGAAGGAATTGCCAGCCGCCACAACGATGCCCTGCTGCCACTTGATGAACTGCGCGAAGTGGACCCGCGTGAGGCCGGGATGATTGCCTATATGCTGGCGAACGGACAGGGCAAGGGGCGCGCCCGCACCGATGGCGAAGTGCGTAACCGCAGGCACTGGACGCTGCTGCTGTTCTCCACCGGGGAGCTGTCGCTGGCGGAACACACCGAATGCGCCGGGGAGCGCCTCTACGCCGGGATGGACGTGCGCATGGTACAAATCCCCAGCGACACCGGGCAGCATGGTTCGTTTGAGCAGTTGCACGGGTTTGCCAGCGGCCAGCAGTTCGCCGATACTCTCTGCGACCGGGTGGCCCGCTTCCACGGCACCGCCTTTCGTGCCTGGCTGGCCTTCCTCACCAGCGACCTGGACGCCAGCACCACGCTGGCGAGAGAGTTACTTCGCCGCTACCAGACCGCCCTGATGCCGGACAACGCCGGAAACCAGGTGCAGCGCATCGTGGCCCGTTTTGCCCTGCTGGCGGTGGCCGGGGAGATAGCGACACTGAACGGTATCACGGGCTGG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ACTGATACTGGGTTTGAGGACATACCGTCTTTTAGTTCACGAAGGATTTCGTTAAGTCTTTCTCGATTTTCTACTGCCATAAAATTTTCTCCATGTAGGTTGTCGGCTACTGTTAGGTTTCAATCTTGATTCAGGCTTCTCACGCTTTTTTTAAAATCTGGACAACGAGGCTGCACTGACTTTTTCAGCTCACCTCAGATTGCACCATCCCATACACATAGCTCAGATTCCTAATGTTCAGTATAAGGAGGCCAGAATACGAATTGCCCTTACCGCTAGTGCCAGCGCGTTGAGTTTAGTAGATGCCTTATTCATTTAGAATTTGATAAAAATACAAGACTCGGACAACAAGCTGCAATATTAATCGTTATTTTTCCACTCGAGGCCCACCGTCCGTTTCTGGCACAGGGCTGCTGTTGCAGCCCTGAAAACCTTAGACTTCAATCGATTCAAAGATCTCTAATGCATCATCTACTTCAATACCCAGATAACGGACTGTGCTTTCCAGTTTCTTATGGCCCAACAGAAGTTGGATCACCCGAAGATTCTTAGTTTTCTTGTAGATAAAGTAGGGTTTTGTTCTTCTCATGGAACGTGTGCTGTAAAGCGAATCTTCGAGACCAAGCTTTCCTGCCCACCCATGAAAGATTCGGTTGTATTGTAGGGTTGATATGTGCTGATTAGTTCCGATACGAGACCGGAACAAGAAGTCTTTATTGTGCAAATAATCAAGCTTTATCAATGCAGCAATAGCTTCTCTTGTTCCTTTGGTTATCTCAAATTGCACAGGGCTACCGGTTTTCTGTTGCAACACCGTTGCTCTGCTTGAAACCAAGCGACCATATGCCACATCAGATACTTTGAGTTTGACCAGATCACAGCCTCGAAGCTTACTGTCCAGGGCCATATTGAACAGAGCTAAATCGCGCGTTTTGCCTTCCAGTTCAAGCCGGATTCGGGTCCCCCAGATATGAGATATCTGAAGTGGTCTTTTTTGGCCGATGATACGGTCTTTGTTCCACGGTGACGTGTTCATACTCAAATCTCCTGCAATGTGGGAGATTTGAGTATGGTTGTCCCTTATGAGCGCAGGCTGTGTGAAAACACTCACCAA
ＳＴ６９＿領域−２（配列番号３２）
TTACAAATCTGCTTGATGAGGACGATATACTGGATACCAAATATTACTGCAACAAAGAACTTCACTGTTTTTGTCAGAAATAAAAATCGTAATTTCCATATCATCCCAACCTTTAACATCTCTGACTACCATCCATAATGGAATATCAAGGCCGTATGATTTCATACCATCAGGAAGAAATTTAATAGCAGTGATTTTGTATGCCAGCGAGCCATTAAGATTATACTTTTTACAATATTTTTCTGCTATCGAATTCACTTTGTTTTCAGTAAGAATAGGAGCGATTATTTTATTATTCATGAGACTCCACATTGCTGTAAATAAAGAATAATTTCAACTTGCATTTCCACTAACTCACCAAAATTTTCAAAGCATAACTCACAAGGGAAATCACCGACATCATCGGAAAATATACCAAAATCATGAATGAGAATATAAATTTTTAGGCTGTTGCGGTCAAGAAAAGCTACACTCCCATCGCCAAAACTGCCAACAGGAAAAGGATCAATGTTGTTCAATAATGGATATTCTTTTTTATAATCTTCCCATTGTTGCAAAAATAGAGGGTAATATCTGTCCAGATCCTTCAAAGTATAAATTTGAGGATCGACAAAATGACATGCGCCAAAATGAGACAATAACTGCCGATAGTCTTTTGGAATATGTGTTGCGTATTTATCCTCAAATAAAAGAAGGTTATCTTCAGTTTCCGGAGCGGTTACGCAACCTGTAAGTCCTGTTGTTTTTACGGCAGGCCAGGCGGTTTCTAAAATTTGAAACATTTTTTCCAT
【図１】
2016533750.tif 000034
【配列表】
2016533750000001.app
【手続補正書】
【提出日】平成27年6月26日(2015.6.26)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
試料中の１又は２以上の感染の原因となる大腸菌の存在又は非存在を検出するための方法であって、
前記試料を１又は２以上のウェルに適用するステップと、
前記試料中に存在する核酸を前記ウェル内で前記プローブと接触させるステップと、
１又は２以上の前記プローブに結合した試料核酸の存在又は非存在を検出するステップと
を含み、
前記１又は２以上のウェルのそれぞれが、
ａ．大腸菌ＳＴ６９の領域１（配列番号３１）及び領域２（配列番号３２）の核酸配列によって定義される核酸標的配列に結合し、かつ前記標的配列の対応する１０個の連続するヌクレオチドの配列に対して少なくとも８０％の相補性を有する少なくとも１０個の連続するヌクレオチドを含む第１のプローブ、
ｂ．大腸菌ＳＴ７３の領域１（配列番号１）及び領域２（配列番号２）の核酸配列によって定義される核酸標的配列に結合し、かつ前記標的配列の対応する１０個の連続するヌクレオチドの配列に対して少なくとも８０％の相補性を有する少なくとも１０個の連続するヌクレオチドを含む第２のプローブ、
ｃ．大腸菌ＳＴ９５の領域１〜９（配列番号３〜１１）の核酸配列によって定義される核酸標的配列に結合し、かつ前記標的配列の対応する１０個の連続するヌクレオチドの配列に対して少なくとも８０％の相補性を有する少なくとも１０個の連続するヌクレオチドを含む第３のプローブ、
ｄ．大腸菌ＳＴ１２７の領域１〜７（配列番号２４〜３０）の核酸配列によって定義される核酸標的配列に結合し、かつ前記標的配列の対応する１０個の連続するヌクレオチドの配列に対して少なくとも８０％の相補性を有する少なくとも１０個の連続するヌクレオチドを含む第４のプローブ、
ｅ．大腸菌ＳＴ１３１の領域１〜１２（配列番号１２〜２３）の核酸配列によって定義される核酸標的配列に結合し、かつ前記標的配列の対応する１０個の連続するヌクレオチドの配列に対して少なくとも８０％の相補性を有する少なくとも１０個の連続するヌクレオチドを含む第５のプローブ
のうちの少なくとも１つを含み、
１又は２以上の前記プローブに結合した試料核酸の前記存在が、１又は２以上の前記感染の原因となる大腸菌由来の核酸が前記試料内に存在することの確認となり、１又は２以上の前記プローブに結合した試料核酸の前記非存在が、前記感染の原因となる大腸菌由来の核酸が前記試料に存在しないことの確認となる、前記方法。
【請求項２】
ａ．第１のウェルが第１のプローブを含み、第２〜第５のプローブが前記第１のウェル中に実質的に存在しておらず、
ｂ．第２のウェルが第２のプローブを含み、第１、第３〜第５のプローブが前記第２のウェル中に実質的に存在しておらず、
ｃ．第３のウェルが第３のプローブを含み、第１〜第２及び第４〜第５のプローブが第３のウェル中に実質的に存在しておらず、
ｄ．第４のウェルが第４のプローブを含み、第１〜第３及び第５のプローブが第４のウェル中に実質的に存在しておらず、
ｅ．第５のウェルが第５のプローブを含み、第１〜第４のプローブが第５のウェル中に実質的に存在していない、請求項１に記載の方法。
【請求項３】
プローブがタグ及び／又は標識を含む、請求項１又は２に記載の方法。
【請求項４】
タグ及び／又は標識が、増幅産物がタグ付け／標識されるようにプローブの伸長中に組み込まれる、請求項３に記載の方法。
【請求項５】
プローブが異なる標識又はタグで標識される、請求項３又は４に記載の方法。
【請求項６】
各プローブがそのそれぞれのウェル内に固定されている、請求項１〜５のいずれかに記載の方法。
【請求項７】
固定が永久的又は一時的である、請求項６に記載の方法。
【請求項８】
標的核酸配列のアレイであって、
ａ．大腸菌ＳＴ６９の領域１及び領域２の核酸標的配列（配列番号３１及び３２）であり、前記標的核酸配列がその少なくとも１０個の連続するヌクレオチドを含む核酸標的配列、並びに
ｂ．大腸菌ＳＴ７３の領域１及び領域２の核酸標的配列（配列番号１及び２）であり、前記標的核酸配列がその少なくとも１０個の連続するヌクレオチドを含む核酸標的配列、並びに
ｃ．大腸菌ＳＴ９５の領域１〜９の核酸標的配列（配列番号３〜１１）であり、前記標的核酸配列がその少なくとも１０個の連続するヌクレオチドを含む核酸標的配列、並びに
ｄ．大腸菌ＳＴ１２７の領域１〜７の核酸標的配列（配列番号２４〜３０）であり、前記標的核酸配列がその少なくとも１０個の連続するヌクレオチドを含む核酸標的配列、並びに
ｅ．大腸菌ＳＴ１３１の領域１〜１２の核酸標的配列（配列番号１２〜２３）であり、前記標的核酸配列がその少なくとも１０個の連続するヌクレオチドを含む核酸標的配列
によって定義される、標的核酸配列のアレイ。
【請求項９】
感染の原因となる大腸菌の存在又は非存在の検出において使用するための請求項８に記載の標的核酸配列のアレイ。
【請求項１０】
ａ．大腸菌ＳＴ６９の領域１及び領域２の核酸標的配列（配列番号３１及び３２）、並びに
ｂ．大腸菌ＳＴ７３の領域１及び領域２の核酸標的配列（配列番号１及び２）、並びに
ｃ．大腸菌ＳＴ９５の領域１〜９の核酸標的配列（配列番号３〜１１）、並びに
ｄ．大腸菌ＳＴ１２７の領域１〜７の核酸標的配列（配列番号２４〜３０）、並びに
ｅ．大腸菌ＳＴ１３１の領域１〜１２の核酸標的配列（配列番号１２〜２３）
によって定義される標的配列の対応する１０個の連続するヌクレオチドの配列に少なくとも８０％の相補性を有する少なくとも１０個の連続するヌクレオチドを含む、核酸プローブ配列のセット。
【請求項１１】
ａ．大腸菌ＳＴ６９の領域１及び領域２の核酸標的配列（配列番号３１及び３２）、又は
ｂ．大腸菌ＳＴ７３の領域１及び領域２の核酸標的配列（配列番号１及び２）、又は
ｃ．大腸菌ＳＴ９５の領域１〜９の核酸標的配列（配列番号３〜１１）、又は
ｄ．大腸菌ＳＴ１２７の領域１〜７の核酸標的配列（配列番号２４〜３０）、又は
ｅ．大腸菌ＳＴ１３１の領域１〜１２の核酸標的配列（配列番号１２〜２３）
によって定義される標的配列の対応する２０個の連続するヌクレオチドの配列に少なくとも８０％の相補性を有する少なくとも２０個の連続するヌクレオチドを含む、プローブ核酸配列。
【請求項１２】
ａ．大腸菌ＳＴ６９の領域１及び領域２の核酸標的配列（配列番号３１及び３２）、並びに
ｂ．大腸菌ＳＴ７３の領域１及び領域２の核酸標的配列（配列番号１及び２）、並びに
ｃ．大腸菌ＳＴ９５の領域１〜９の核酸標的配列（配列番号３〜１１）、並びに
ｄ．大腸菌ＳＴ１２７の領域１〜７の核酸標的配列（配列番号２４〜３０）、並びに
ｅ．大腸菌ＳＴ１３１の領域１〜１２の核酸標的配列（配列番号１２〜２３）
によって定義される標的配列の対応する２０個の連続するヌクレオチドの配列に少なくとも８０％の相補性を有する少なくとも２０個の連続するヌクレオチドを含む、核酸プローブ配列のセット。
【請求項１３】
感染の原因となる大腸菌の存在又は非存在の検出において使用するための請求項１０〜１２のいずれかに記載の核酸プローブ配列のセット又はプローブ核酸配列。
【請求項１４】
ａ．大腸菌ＳＴ６９の領域１及び領域２の核酸標的配列（配列番号３１及び３２）、並びに
ｂ．大腸菌ＳＴ７３の領域１及び領域２の核酸標的配列（配列番号１及び２）、並びに
ｃ．大腸菌ＳＴ９５の領域１〜９の核酸標的配列（配列番号３〜１１）、並びに
ｄ．大腸菌ＳＴ１２７の領域１〜７の核酸標的配列（配列番号２４〜３０）、並びに
ｅ．大腸菌ＳＴ１３１の領域１〜１２の核酸標的配列（配列番号１２〜２３）
によって定義される標的核酸配列によってコードされるポリペプチドマーカーのアレイ。
【請求項１５】
感染の原因となる大腸菌の存在又は非存在の検出において使用するための請求項１４に記載のポリペプチドマーカーのアレイ。
【請求項１６】
請求項１〜７のいずれかに記載の方法において使用するための、少なくとも５個のウェルを含む検査カードであって、第１のウェルが第１のプローブを含み、第２のウェルが第２のプローブを含み、第３のウェルが第３のプローブを含み、第４のウェルが第４のプローブを含み、第５のウェルが第５のプローブを含む、検査カード。
【請求項１７】
ａ．第１のウェルが第１のプローブを含み、第２〜第５のプローブが前記第１のウェル中に実質的に存在しておらず、
ｂ．第２のウェルが第２のプローブを含み、第１、第３〜第５のプローブが前記第２のウェル中に実質的に存在しておらず、
ｃ．第３のウェルが第３のプローブを含み、第１〜第２及び第４〜第５のプローブが前記第３のウェル中に実質的に存在しておらず、
ｄ．第４のウェルが第４のプローブを含み、第１〜第３及び第５のプローブが前記第４のウェル中に実質的に存在しておらず、
ｅ．第５のウェルが第５のプローブを含み、第１〜第４のプローブが前記第５のウェル中に実質的に存在していない、請求項１６に記載の検査カード。
【請求項１８】
プローブがそれぞれのウェルの表面に固定され、好ましくは前記プローブが前記それぞれのウェルの表面に吸着した凍結乾燥形態で存在する、請求項１６又は１７に記載の検査カード。
【国際調査報告】
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