(57)【要約】がんに対するペプチドワクチンを本明細書に記載する。特に、ＣＴＬを誘発し、したがってがん免疫療法との関連において使用するのに適している、ＳＥＭＡ５Ｂ遺伝子由来の単離されたエピトープペプチドを提供する。本発明のペプチドは、ＳＥＭＡ５Ｂ由来ペプチド、および、その改変型が元の配列の必要なＣＴＬ誘導能を保持するという条件で、１個、２個、または数個のアミノ酸が置換、欠失、挿入または付加されているそのような改変型の両方を包含する。さらに、そのようなペプチドをコードするポリヌクレオチド、および有効剤として任意のそのようなペプチドもしくはポリヌクレオチドを含む薬学的組成物を提供する。抗原提示細胞、およびそのようなペプチドを標的とした単離されたＣＴＬ、および該抗原提示細胞またはＣＴＬを誘導するための方法もまた、提供する。さらに、本発明は、ＳＥＭＡ５Ｂに由来するペプチド、該ペプチドをコードするポリヌクレオチドもしくは該ペプチドを提示する抗原提示細胞、または本発明の薬学的組成物を使用して、食道がん、ＮＳＣＬＣ、ＲＣＣおよびＳＣＬＣのようながん（腫瘍）を治療および／もしくは予防（ｐｒｏｐｈｙｌａｘｉｓ）（すなわち、予防（ｐｒｅｖｅｎｔｉｏｎ））する、ならびに／またはその転移もしくは術後のその再発を予防するための方法、ならびにＣＴＬを誘導するための方法、抗腫瘍免疫を誘導するための方法を提供する。【特許請求の範囲】
【請求項１】
以下の（ａ）または（ｂ）のアミノ酸配列を含む、細胞傷害性Ｔリンパ球（ＣＴＬ）誘導能を有する、１５アミノ酸長未満の単離されたペプチド：
（ａ）配列番号：４１、２、３、４、８、９、１０、１３、２０、４０、４７および５４からなる群より選択されるアミノ酸配列；
（ｂ）配列番号：４１、２、３、４、８、９、１０、１３、２０、４０、４７および５４からなる群より選択されるアミノ酸配列において、１個、２個、または数個のアミノ酸が置換、欠失、挿入および／または付加されているアミノ酸配列。
【請求項２】
以下の特徴の一方または両方を有する、請求項１に記載のペプチド：
（ａ）Ｎ末端から２番目のアミノ酸が、フェニルアラニン、チロシン、メチオニンまたはトリプトファンである；および
（ｂ）Ｃ末端のアミノ酸が、フェニルアラニン、ロイシン、イソロイシン、トリプトファンまたはメチオニンである。
【請求項３】
ノナペプチドまたはデカペプチドである、請求項１または２に記載のペプチド。
【請求項４】
請求項１〜３のいずれか一項に記載のペプチドをコードする単離されたポリヌクレオチド。
【請求項５】
ＣＴＬを誘導するための組成物であって、以下からなる群より選択される少なくとも１種の有効成分を含む組成物：
（ａ）請求項１〜３のいずれか一項に記載のペプチド；
（ｂ）請求項４に記載のポリヌクレオチド；
（ｃ）請求項１〜３のいずれか一項に記載のペプチドを自身の表面上に提示する、抗原提示細胞（ＡＰＣ）；および
（ｄ）請求項１〜３のいずれか一項に記載のペプチドを自身の表面上に提示するエクソソーム。
【請求項６】
がんの治療および／もしくは予防、ならびに／または術後のその再発の予防のための薬学的組成物であって、以下からなる群より選択される少なくとも１種の有効成分を含む薬学的組成物：
（ａ）請求項１〜３のいずれか一項に記載のペプチド；
（ｂ）請求項４に記載のポリヌクレオチド；
（ｃ）請求項１〜３のいずれか一項に記載のペプチドを自身の表面上に提示するＡＰＣ；
（ｄ）請求項１〜３のいずれか一項に記載のペプチドを自身の表面上に提示するエクソソーム；および
（ｅ）請求項１〜３のいずれか一項に記載のペプチドを提示する細胞を認識することができるＣＴＬ。
【請求項７】
ＨＬＡ抗原がＨＬＡ−Ａ２４である対象への投与のために製剤化される、請求項６に記載の薬学的組成物。
【請求項８】
以下からなる群より選択される段階を含む、ＣＴＬ誘導能を有するＡＰＣを誘導するための方法：
（ａ）ＡＰＣを、請求項１〜３のいずれか一項に記載のペプチドと接触させる段階；および
（ｂ）請求項１〜３のいずれか一項に記載のペプチドをコードするポリヌクレオチドをＡＰＣに導入する段階。
【請求項９】
以下からなる群より選択される段階を含む、ＣＴＬを誘導するための方法：
（ａ）ＣＤ８陽性Ｔ細胞を、ＨＬＡ抗原と請求項１〜３のいずれか一項に記載のペプチドとの複合体を自身の表面上に提示するＡＰＣと共培養する段階；
（ｂ）ＣＤ８陽性Ｔ細胞を、ＨＬＡ抗原と請求項１〜３のいずれか一項に記載のペプチドとの複合体を自身の表面上に提示するエクソソームと共培養する段階；および
（ｃ）Ｔ細胞受容体（ＴＣＲ）サブユニットの両方をコードするポリヌクレオチド、またはＴＣＲサブユニットのそれぞれをコードするポリヌクレオチドを、ＣＤ８陽性Ｔ細胞に導入する段階であって、該サブユニットによって形成されるＴＣＲは、細胞表面上の請求項１〜３のいずれか一項に記載のペプチドとＨＬＡ抗原との複合体に結合することができる、段階。
【請求項１０】
ＨＬＡ抗原と請求項１〜３のいずれか一項に記載のペプチドとの複合体を自身の表面上に提示する、単離されたＡＰＣ。
【請求項１１】
請求項８に記載の方法によって誘導される、請求項１０に記載のＡＰＣ。
【請求項１２】
請求項１〜３のいずれか一項に記載のペプチドを標的とする、単離されたＣＴＬ。
【請求項１３】
請求項９に記載の方法によって誘導される、請求項１２に記載のＣＴＬ。
【請求項１４】
がんに対する免疫応答を対象において誘導する方法であって、請求項１〜３のいずれか一項に記載のペプチドまたは該ペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む組成物を該対象に投与する段階を含む、方法。
【請求項１５】
請求項１〜３のいずれか一項に記載のペプチドに対する抗体またはその免疫学的活性断片。
【請求項１６】
請求項１〜３のいずれか一項に記載のペプチドをコードするヌクレオチド配列を含むベクター。
【請求項１７】
請求項１６に記載のベクターにより形質転換またはトランスフェクトされた宿主細胞。
【請求項１８】
請求項１〜３のいずれか一項に記載のペプチド、請求項４に記載のポリヌクレオチド、または請求項１５に記載の抗体もしくは免疫学的活性断片を含む、診断キット。
【請求項１９】
ＳＥＭＡ５Ｂ由来の断片を提示する細胞に対する特異的細胞傷害活性を有するＣＴＬを誘導する能力を有するペプチドをスクリーニングする方法であって、以下の段階を含む、方法：
（ｉ）配列番号：４１、２、３、４、８、９、１０、１３、２０、４０、４７および５４からなる群より選択される元のアミノ酸配列に対して１個、２個、または数個のアミノ酸残基を置換、欠失、挿入および／または付加することによって改変されたアミノ酸配列からなる候補配列を提供する段階；
（ｉｉ）ＳＥＭＡ５Ｂ以外のいかなる公知のヒト遺伝子産物に由来するペプチドとも実質的に有意な相同性を有さない候補配列を選択する段階；
（ｉｉｉ）段階（ｉｉ）において選択された前記候補配列からなるペプチドを抗原提示細胞と接触させる段階；
（ｉｖ）段階（ｉｉｉ）の前記抗原提示細胞をＣＤ８陽性Ｔ細胞と接触させる段階；ならびに
（ｖ）ＣＴＬ誘導能が、前記元のアミノ酸配列からなるペプチドと同じであるかまたはそれよりも高いペプチドを特定する段階。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
本発明は、生物科学の分野、より具体的にはがん療法の分野に関する。特に本発明は、がんワクチンとして有効な新規ペプチド、ならびに腫瘍の治療および／または予防のいずれかまたは両方のための薬物に関する。
【０００２】
優先権
本出願は、２０１２年１２月４日に出願された米国仮出願第６１／７３３，２７９号の恩典を主張し、その全内容は参照によって本明細書に組み入れられる。
【背景技術】
【０００３】
ＣＤ８陽性細胞傷害性Ｔリンパ球（ＣＴＬ）は、主要組織適合複合体（ＭＨＣ）クラスＩ分子上に見出される腫瘍関連抗原（ＴＡＡ）由来のエピトープペプチドを認識し、その後、腫瘍細胞を殺傷することが示されている。ＴＡＡの最初の例としてメラノーマ抗原（ＭＡＧＥ）ファミリーが発見されて以来、他の多くのＴＡＡが、主として免疫学的アプローチによって発見されている（非特許文献１、非特許文献２）。これらのＴＡＡのうちのいくつかは、現在、免疫療法の標的として臨床開発の過程にある。
【０００４】
好ましいＴＡＡは、がん細胞の増殖および生存に不可欠なＴＡＡである。そのようなＴＡＡを免疫療法の標的として用いることにより、療法によって誘発される免疫選択の結果としてのＴＡＡの欠失、突然変異、または下方制御に起因し得るがん細胞の免疫回避の詳述されているリスクが最小限に抑えられ得る。したがって、強力かつ特異的な抗腫瘍免疫応答を誘導し得る新規ＴＡＡの同定により、さらなる開発が保証される。それゆえに、様々な種類のがんに対するペプチドワクチン戦略の臨床応用が進行中である（非特許文献３〜非特許文献１０）。現在までに、これらのＴＡＡ由来ペプチドを用いた臨床試験がいくつか報告されている。残念ながら現在までに、これらのがんワクチンの治験においては低い客観的奏効率しか得られていない（非特許文献１１〜非特許文献１３）。したがって、免疫療法の標的としての使用に適した新規ＴＡＡが依然として必要とされている。
【０００５】
ＳＥＭＡ５Ｂは、神経発生中の軸索誘導に関わる分泌型および膜型タンパク質に分類されるセマフォリンタンパク質ファミリーのメンバーの１つである（非特許文献１４）。最近の研究により、セマフォリンファミリータンパク質の機能が神経系だけではなく、器官形成、血管新生およびがんの発生にも関連していることが示唆された。
【０００６】
２３，０４０遺伝子からなるｃＤＮＡマイクロアレイを用いた遺伝子発現プロファイル解析による腎細胞がん（ＲＣＣ）の分子メカニズムを明らかにする過程で、ＳＥＭＡ５Ｂは、ＲＣＣにおいて高頻度で上方制御されていることが発見された。
【０００７】
ＲＣＣ患者由来のｃＤＮＡサンプルにおけるこの遺伝子のＲＴ−ＰＣＲ解析では、ＳＥＭＡ５ＢがＲＣＣサンプルのすべてにおいて上方制御されていることが実証された。
その後の、ＳＥＭＡ５ＢのｃＤＮＡ断片をプローブとして用いたノーザンブロット解析では、ＲＣＣ組織では高発現したが、胎児脳と腎臓を除く正常ヒト組織においてはほとんど検出されなかったＳＥＭＡ５Ｂ転写産物が明らかになった（特許文献１）。
さらに、ＲＣＣ細胞株におけるｓｉＲＮＡによるＳＥＭＡ５Ｂのノックダウンは、ＲＣＣ細胞の増殖を減衰させた（非特許文献１５）。
【先行技術文献】
【特許文献】
【０００８】
【特許文献１】ＷＯ２００７／０１３５７５
【非特許文献】
【０００９】
【非特許文献１】Ｂｏｏｎ  Ｔ，Ｉｎｔ  Ｊ  Ｃａｎｃｅｒ  １９９３，５４（２）：１７７−８０
【非特許文献２】Ｂｏｏｎ  Ｔ＆ｖａｎ  ｄｅｒ  Ｂｒｕｇｇｅｎ  Ｐ，Ｊ  Ｅｘｐ  Ｍｅｄ  １９９６，１８３（３）：７２５−９
【非特許文献３】Ｈａｒｒｉｓ  ＣＣ，Ｊ  Ｎａｔｌ  Ｃａｎｃｅｒ  Ｉｎｓｔ  １９９６，８８（２０）：１４４２−５５
【非特許文献４】Ｂｕｔｔｅｒｆｉｅｌｄ  ＬＨ  ｅｔ  ａｌ．，Ｃａｎｃｅｒ  Ｒｅｓ  １９９９，５９（１３）：３１３４−４２
【非特許文献５】Ｖｉｓｓｅｒｓ  ＪＬ  ｅｔ  ａｌ．，Ｃａｎｃｅｒ  Ｒｅｓ  １９９９，５９（２１）：５５５４−９
【非特許文献６】ｖａｎ  ｄｅｒ  Ｂｕｒｇ  ＳＨ  ｅｔ  ａｌ．，Ｊ  Ｉｍｍｕｎｏｌ  １９９６，１５６（９）：３３０８−１４
【非特許文献７】Ｔａｎａｋａ  Ｆ  ｅｔ  ａｌ．，Ｃａｎｃｅｒ  Ｒｅｓ  １９９７，５７（２０）：４４６５−８
【非特許文献８】Ｆｕｊｉｅ  Ｔ  ｅｔ  ａｌ．，Ｉｎｔ  Ｊ  Ｃａｎｃｅｒ  １９９９，８０（２）：１６９−７２
【非特許文献９】Ｋｉｋｕｃｈｉ  Ｍ  ｅｔ  ａｌ．，Ｉｎｔ  Ｊ  Ｃａｎｃｅｒ  １９９９，８１（３）：４５９−６６
【非特許文献１０】Ｏｉｓｏ  Ｍ  ｅｔ  ａｌ．，Ｉｎｔ  Ｊ  Ｃａｎｃｅｒ  １９９９，８１（３）：３８７−９４
【非特許文献１１】Ｂｅｌｌｉ  Ｆ  ｅｔ  ａｌ．，Ｊ  Ｃｌｉｎ  Ｏｎｃｏｌ  ２００２，２０（２０）：４１６９−８０
【非特許文献１２】Ｃｏｕｌｉｅ  ＰＧ  ｅｔ  ａｌ．，Ｉｍｍｕｎｏｌ  Ｒｅｖ  ２００２，１８８：３３−４２
【非特許文献１３】Ｒｏｓｅｎｂｅｒｇ  ＳＡ  ｅｔ  ａｌ．，Ｎａｔ  Ｍｅｄ  ２００４，１０（９）：９０９−１５
【非特許文献１４】Ｏ'Ｃｏｎｎｏｒ  ＴＰ  ｅｔ．ａｌ．，Ｎｅｕｒａｌ  Ｄｅｖ．２００９，２３（４）１８
【非特許文献１５】Ｈｉｒｏｔａ  Ｅ．  ｅｔ．ａｌ．，Ｉｎｔ  Ｊ  Ｏｎｃｏｌ．２００６，２９（４）：７９９−８２７
【発明の概要】
【００１０】
本発明は、免疫療法の適切な標的として役立つ可能性のある新規ペプチドの発見に少なくとも一部基づいている。ＴＡＡは一般に免疫系によって「自己」として認識され、そのため多くの場合は自然免疫原性を有しないため、適切な標的の発見は依然として重要である。本発明の過程において、ＳＥＭＡ５Ｂ（典型的アミノ酸配列は、配列番号：７５、７８または８０に示す；典型的ヌクレオチド配列は、配列番号：７４、７６、７７または７９に示す（ＧｅｎＢａｎｋアクセッション番号ＮＭ＿００１０３１７０２、ＮＭ＿００１２５６３４６、ＮＭ＿００１２５６３４７またはＮＭ＿００１２５６３４８））は、食道がん、非小細胞肺癌（ＮＳＣＬＣ）、腎細胞がん（ＲＣＣ）および小細胞肺癌（ＳＣＬＣ）を例に含むがこれらに限定されないがんにおいて特異的に過剰発現されることが実証されている（表１）。したがって、本発明は、がん／腫瘍免疫療法の候補標的としてＳＥＭＡ５Ｂに着目する。
【００１１】
そのため、本発明は、少なくとも部分的には、ＳＥＭＡ５Ｂ由来のペプチドの中でＳＥＭＡ５Ｂ特異的な細胞傷害性Ｔリンパ球（ＣＴＬ）を誘導する能力を有する特異的エピトープペプチドの同定を対象としている。以下で詳述するように、健常ドナーから得られた末梢血単核細胞（ＰＢＭＣ）を、ＳＥＭＡ５Ｂ由来のＨＬＡ−Ａ＊２４０２結合候補ペプチドを用いて刺激した。その後、各候補ペプチドをパルスしたＨＬＡ−Ａ２４陽性標的細胞に対する特異的細胞傷害性を有するＣＴＬ株を樹立した。本明細書の結果は、これらのペプチドが、ＳＥＭＡ５Ｂを発現する細胞に対して強力かつ特異的な免疫応答を誘導することができるＨＬＡ−Ａ２４拘束性エピトープペプチドであることを実証している。これらの結果はさらに、ＳＥＭＡ５Ｂは免疫原性が強く、そのエピトープは、がん／腫瘍免疫療法の効果的な標的であることを示している。
【００１２】
したがって、ＨＬＡ抗原と結合することができ、かつＳＥＭＡ５Ｂ（配列番号：７５、７８または８０）由来のアミノ酸配列を含む単離されたペプチドを提供することは、本発明の１つの目的である。そのようなペプチドは、ＣＴＬ誘導能を有すると予測され、それゆえインビトロもしくはエクスビボでＣＴＬを誘導するために使用され得る、または、インビボでがん、その例には食道がん、ＮＳＣＬＣ、ＲＣＣおよびＳＣＬＣが含まれるがこれらに限定されないがんに対する免疫応答を誘導するために対象に直接投与され得る。
【００１３】
本発明のペプチドは、一般的に１５、１４、１３、１２、１１または１０アミノ酸長未満である。好ましいペプチドは、ノナペプチドおよびデカペプチドであり、より好ましくは、配列番号：２〜６９の中より選択されるアミノ酸配列を有するノナペプチドおよびデカペプチドである。これらのうち、配列番号：２、３、４、８、９、１０、１３、２０、４０、４１、４７および５４の中より選択されるアミノ酸配列を有するペプチドが特に好ましい。
【００１４】
本発明はまた、得られる改変ペプチドが元の未改変ペプチドの必要なＣＴＬ誘導能およびＨＬＡ結合能を保持するという条件で、配列番号：２〜６９の中より選択されるアミノ酸配列において、１個、２個、またはそれ以上のアミノ酸が置換、欠失、挿入および／または付加されているアミノ酸配列を有する改変ペプチドも企図する。
【００１５】
１つの態様において、元のペプチドが９ｍｅｒ（例えば、配列番号：２、３、４、８、９、１０、１３および２０のうちの１つ）の場合、改変ペプチドのサイズは、好ましくは９〜４０アミノ酸の範囲、例えば９〜２０アミノ酸の範囲、例えば９〜１５アミノ酸の範囲である。同様に、元のペプチドが１０ｍｅｒ（例えば、配列番号：４０、４１、４７および５４のうちの１つ）の場合、改変ペプチドのサイズは、好ましくは１０〜４０アミノ酸の範囲、例えば１０〜２０アミノ酸の範囲、例えば１０〜１５アミノ酸の範囲である。
【００１６】
本発明はさらに、本発明のペプチドのいずれか１種をコードする単離されたポリヌクレオチドを包含する。これらのポリヌクレオチドは、ＣＴＬ誘導能を有する抗原提示細胞（ＡＰＣ）を誘導または調製するために使用され得る。本発明のペプチドと同様に、そのようなＡＰＣはがんに対する免疫応答を誘導するために対象に投与され得る。
【００１７】
対象に投与された場合、本発明のペプチドは、各ペプチドを標的とするＣＴＬを誘導するように、ＡＰＣの表面上に提示され得る。したがって、本発明の１つの目的は、本発明の１種もしくは複数種のペプチドもしくはそのようなペプチドをコードする１種もしくは複数種のポリヌクレオチドを含む剤または組成物を提供することである。剤または組成物はＣＴＬを誘導するために使用され得る。そのような剤または組成物は、がんの治療および／もしくは予防、ならびに／またはその転移もしくは術後のその再発の予防に用いることができる。本発明によって企図される標的となるがんの例には、限定されないが、食道がん、ＮＳＣＬＣ、ＲＣＣおよびＳＣＬＣが含まれる。
【００１８】
本発明はさらに、本発明の１種または複数種のペプチドまたはポリヌクレオチドを含む、薬学的組成物または薬学的剤を企図する。薬学的組成物または薬学的剤は、がん、さらに好ましくは、原発性がんの治療および／もしくは予防、ならびに／またはその転移もしくは術後のその再発の予防における使用のために好ましくは製剤化される。本発明のペプチドまたはポリヌクレオチドの代わりにまたはそれに加えて、本発明の薬学的剤または薬学的組成物は、本発明のペプチドのいずれかを提示するＡＰＣまたはエクソソームを有効成分として含み得る。
【００１９】
本発明のペプチドまたはポリヌクレオチドは、例えば、対象由来のＡＰＣを本発明のペプチドと接触させるか、または本発明のペプチドをコードするポリヌクレオチドをＡＰＣに導入することにより、ＨＬＡ抗原と本発明のペプチドとの複合体を表面上に提示するＡＰＣを誘導するために用いることができる。そのようなＡＰＣは、標的ペプチドをその表面上に提示する細胞を特異的に認識するＣＴＬを誘導する能力を有し、がん免疫療法に有用である。したがって、本発明は、ＣＴＬ誘導能を有するＡＰＣを誘導するための方法、ならびにそのような方法によって得られるＡＰＣを包含する。
加えて、本発明はまた、ＣＴＬ誘導能を有するＡＰＣを誘導するための剤または組成物を包含し、そのような剤または組成物は、本発明のいずれかのペプチドまたはポリヌクレオチドを含む。
【００２０】
ＣＴＬを誘導するための方法を提供することは本発明のさらなる目的であり、そのような方法は、ＣＤ８陽性Ｔ細胞を、ＨＬＡ抗原と本発明のペプチドとの複合体を自身の表面上に提示するＡＰＣと共培養する段階、ＣＤ８陽性Ｔ細胞を、ＨＬＡ抗原と本発明のペプチドとの複合体を自身の表面上に提示するエクソソームと共培養する段階、またはＴ細胞受容体（ＴＣＲ）サブユニットの両方をコードするポリヌクレオチドもしくはＴＣＲサブユニットのそれぞれをコードするポリヌクレオチドを導入する段階であって、該ＴＣＲは、細胞表面上に提示された本発明のペプチドとＨＬＡ抗原との複合体に結合することができる、段階を含む。そのような方法によって得られるＣＴＬは、食道がん、ＮＳＣＬＣ、ＲＣＣ、およびＳＣＬＣを例に含むがこれらに限定されないがんの治療および／または予防において用いられ得る。したがって、本発明は、ＣＴＬを誘導するための方法、およびそのような方法によって得られたＣＴＬの両方を包含する。
ＨＬＡ抗原と本発明のペプチドとの複合体を表面上に提示する単離されたＡＰＣを提供することは、本発明のさらに別の目的である。本発明はさらに、本発明のペプチドを標的とする単離されたＣＴＬを提供する。そのようなＣＴＬはまた、細胞表面上の本発明のペプチドとＨＬＡ抗原との複合体を認識する（または、に結合する）ことができるＣＴＬとしても定義され得る。これらのＡＰＣおよびＣＴＬは、がん免疫療法に用いることができる。
【００２１】
必要とする対象において、がんに対する免疫応答を誘導するための方法を提供することは、本発明のさらに別の目的であり、そのような方法は、（ａ）本発明のペプチドまたはそのようなペプチドをコードするポリヌクレオチド、（ｂ）そのようなペプチドを提示するＡＰＣまたはエクソソーム、および（ｃ）本発明のペプチドを自身の表面上に提示するそのような細胞を認識することができるＣＴＬの中から選択される少なくとも１つの成分を含む剤または組成物を対象に投与する段階を含む。
【００２２】
本発明の１つの局面は、医薬として使用するための、本発明のペプチド、そのようなペプチドを含む剤または組成物に関する。
本発明の適用性は、これらに限定はされないが、食道がん、ＮＳＣＬＣ、ＲＣＣおよびＳＣＬＣを例に含むがんのような、ＳＥＭＡ５Ｂの過剰発現に関連する、またはＳＥＭＡ５Ｂの過剰発現から生じる多数の疾患のいずれにも及ぶ。
【００２３】
さらに具体的には、本発明は以下を提供する：
［１］以下の（ａ）または（ｂ）のアミノ酸配列を含む、細胞傷害性Ｔリンパ球（ＣＴＬ）誘導能を有する、単離されたペプチド：
（ａ）ＳＥＭＡ５Ｂの免疫学的活性断片のアミノ酸配列；
（ｂ）ＳＥＭＡ５Ｂの免疫学的活性断片のアミノ酸配列において、１個、２個または数個のアミノ酸が置換、欠失、挿入および／または付加されているアミノ酸配列、
該ペプチドによって誘導されるＣＴＬは、ＳＥＭＡ５Ｂ由来の断片を提示する細胞に対して特異的な細胞傷害活性を有する；
［２］以下の（ａ）または（ｂ）のアミノ酸配列を含む、［１］に記載のペプチド：
（ａ）配列番号：２、３、４、８、９、１０、１３、２０、４０、４１、４７および５４からなる群より選択されるアミノ酸配列；
（ｂ）配列番号：２、３、４、８、９、１０、１３、２０、４０、４１、４７および５４からなる群より選択されるアミノ酸配列において１個、２個もしくは数個のアミノ酸が置換、欠失、挿入および／もしくは付加されているアミノ酸配列；
［３］以下の特徴の一方または両方を有する［２］に記載のペプチド：
（ａ）Ｎ末端から２番目のアミノ酸が、フェニルアラニン、チロシン、メチオニンもしくはトリプトファンである；および
（ｂ）Ｃ末端のアミノ酸が、フェニルアラニン、ロイシン、イソロイシン、トリプトファンもしくはメチオニンである；
［４］ノナペプチドまたはデカペプチドである、［１］から［３］のいずれか一項に記載のペプチド；
［５］［１］から［４］のいずれか一項に記載のペプチドをコードする単離されたポリヌクレオチド；
［６］以下からなる群より選択される少なくとも１種の有効成分を含む、ＣＴＬを誘導するための組成物：
（ａ）［１］から［４］のいずれか一項に記載のペプチド；
（ｂ）［５］に記載のポリヌクレオチド；
（ｃ）［１］から［４］のいずれか一項に記載のペプチドを自身の表面上に提示する抗原提示細胞（ＡＰＣ）；および
（ｄ）［１］から［４］のいずれか一項に記載のペプチドを自身の表面上に提示するエクソソーム；
［７］がんの治療および／もしくは予防、ならびに／または術後のその再発の予防、あるいは上記のがんに対する免疫応答の誘導のための薬学的組成物であって、以下からなる群より選択される少なくとも１種の有効成分を含む、薬学的組成物：
（ａ）［１］から［４］のいずれか一項に記載のペプチド；
（ｂ）［５］に記載のポリヌクレオチド；
（ｃ）［１］から［４］のいずれか一項に記載のペプチドを自身の表面上に提示するＡＰＣ；
（ｄ）［１］から［４］のいずれか一項に記載のペプチドを自身の表面上に提示するエクソソーム；および
（ｅ）［１］から［４］のいずれか一項に記載のペプチドを提示する細胞を認識することができるＣＴＬ；
［８］ＨＬＡ抗原がＨＬＡ−Ａ２４である対象に投与するために製剤化される、［７］に記載の薬学的組成物；
［９］以下からなる群より選択される段階を含む、ＣＴＬ誘導能を有するＡＰＣを誘導するための方法：
（ａ）ＡＰＣを、［１］から［４］のいずれか一項に記載のペプチドと接触させる段階；および
（ｂ）［１］から［４］のいずれか一項に記載のペプチドをコードするポリヌクレオチドをＡＰＣに導入する段階；
［１０］以下からなる群より選択される段階を含む、ＣＴＬを誘導するための方法：
（ａ）ＣＤ８陽性Ｔ細胞を、ＨＬＡ抗原と［１］から［４］のいずれか一項に記載のペプチドとの複合体を自身の表面上に提示するＡＰＣと共培養する段階；
（ｂ）ＣＤ８陽性Ｔ細胞を、ＨＬＡ抗原と［１］から［４］のいずれか一項に記載のペプチドとの複合体を自身の表面上に提示するエクソソームと共培養する段階；および
（ｃ）Ｔ細胞受容体（ＴＣＲ）サブユニットの両方をコードするポリヌクレオチド、またはＴＣＲサブユニットのそれぞれをコードするポリヌクレオチドを、ＣＤ８陽性Ｔ細胞に導入する段階であって、該サブユニットによって形成されるＴＣＲは、細胞表面上の［１］から［４］のいずれか一項に記載のペプチドとＨＬＡ抗原との複合体に結合することができる、段階；
［１１］ＨＬＡ抗原と［１］から［４］のいずれか一項に記載のペプチドとの複合体を自身の表面上に提示する、単離されたＡＰＣ；
［１２］［９］に記載の方法によって誘導される、［１１］に記載のＡＰＣ；
［１３］［１］から［４］のいずれか一項に記載のペプチドを標的とする、単離されたＣＴＬ；
［１４］［１０］に記載の方法によって誘導される、［１３］に記載のＣＴＬ；
［１５］がんに対する免疫応答を対象において誘導する方法であって、［１］から［４］のいずれか一項に記載のペプチドまたは該ペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む組成物を該対象に投与する段階を含む、方法；
［１６］［１］から［４］のいずれか一項に記載のペプチドに対する抗体、またはその免疫学的活性断片；
［１７］［１］から［４］のいずれか一項に記載のペプチドをコードするヌクレオチド配列を含むベクター；
［１８］［１７］に記載のベクターにより形質転換またはトランスフェクトされた宿主細胞；
［１９］［１］から［４］のいずれか一項に記載のペプチド、［５］に記載のポリヌクレオチド、または［１６］に記載の抗体もしくは免疫学的活性断片を含む、診断キット；
［２０］ＳＥＭＡ５Ｂ由来の断片を提示する細胞に対する特異的細胞傷害活性を有するＣＴＬを誘導する能力を有するペプチドをスクリーニングする方法であって、以下の段階を含む方法：
（ｉ）配列番号：２、３、４、８、９、１０、１３、２０、４０、４１、４７および５４からなる群より選択される元のアミノ酸配列に対して１個、２個または数個のアミノ酸残基を置換、欠失、挿入および／または付加することによって改変されたアミノ酸配列からなる候補配列を提供する段階；
（ｉｉ）ＳＥＭＡ５Ｂ以外のいかなる公知のヒト遺伝子産物に由来するペプチドとも実質的に有意な相同性を有さない候補配列を選択する段階；
（ｉｉｉ）段階（ｉｉ）において選択された前記候補配列からなるペプチドを抗原提示細胞と接触させる段階；
（ｉｖ）段階（ｉｉｉ）の前記抗原提示細胞をＣＤ８陽性Ｔ細胞と接触させる段階；ならびに
（ｖ）ＣＴＬ誘導能が、前記元のアミノ酸配列からなるペプチドと同じであるかまたはそれよりも高いペプチドを特定する段階；
［２１］［１］から［４］のいずれか一項に記載のペプチドを含む薬学的組成物；
［２２］医薬として使用するための［１］から［４］のいずれか一項に記載のペプチド；ならびに
［２３］医薬として使用するための［５］に記載のポリヌクレオチドまたは［１７］に記載のベクター。
【００２４】
あるいは、別の態様において、本発明はまた、以下のペプチドおよびその使用法を提供する。
［１］以下の（ａ）または（ｂ）のアミノ酸配列を含む、細胞傷害性Ｔリンパ球（ＣＴＬ）誘導能を有する、１５アミノ酸長未満の単離されたペプチド：
（ａ）配列番号：４１、２、３、４、８、９、１０、１３、２０、４０、４７および５４からなる群から選択されるアミノ酸配列；
（ｂ）配列番号：４１、２、３、４、８、９、１０、１３、２０、４０、４７および５４からなる群から選択されるアミノ酸配列において、１個、２個または数個のアミノ酸が置換、欠失、挿入および／または付加されているアミノ酸配列。
［２］以下の特徴の一方または両方を有する［１］に記載のペプチド：
（ａ）Ｎ末端から２番目のアミノ酸が、フェニルアラニン、チロシン、メチオニンまたはトリプトファンである；および
（ｂ）Ｃ末端のアミノ酸が、フェニルアラニン、ロイシン、イソロイシン、トリプトファンまたはメチオニンである；
［３］ノナペプチドまたはデカペプチドである、［１］または［２］に記載のペプチド。
【００２５】
本発明のその他の目的および特徴は、添付の図面および実施例と併せて以下の詳細な説明を読むことによって、より十分に明らかになるであろう。前述の発明の概要および以下の詳細な説明はいずれも例示的な態様であり、本発明または本発明のその他の代替的な態様を限定するものではないことが理解されるべきである。
【００２６】
特に、本発明をいくつかの特定の態様を参照して本明細書において説明するが、その説明は本発明を例証するものであり、本発明を限定するものとして構成されていないことが理解されよう。添付の特許請求の範囲によって記載される本発明の精神および範囲から逸脱することなく、当業者は様々な変更および適用に想到することができる。同様に、本発明のその他の目的、特徴、利益、および利点は、本概要および以下に記載する特定の態様から明らかになり、当業者には容易に明白になるであろう。そのような目的、特徴、利益、および利点は、添付の実施例、データ、図面、およびそれらから引き出されるあらゆる妥当な推論と併せて上記から、単独で、または本明細書に組み入れられる参考文献を考慮して、明らかになるであろう。
【図面の簡単な説明】
【００２７】
本発明の様々な局面および適用は、以下の図面の簡単な説明ならびに本発明の詳細な説明およびその好ましい態様を考慮することで、当業者に明白となるであろう。
【００２８】
【図１−１】図１は、ＳＥＭＡ５Ｂ由来のペプチドを用いて誘導したＣＴＬにおけるインターフェロン（ＩＦＮ）−γ酵素結合免疫スポット（ＥＬＩＳＰＯＴ）アッセイの結果を示す、一連の写真（ａ）〜（ｍ）から構成される。ＳＥＭＡ５Ｂ−Ａ２４−９−５１２（配列番号：２）で誘導されたウェル番号＃７（ａ）、ＳＥＭＡ５Ｂ−Ａ２４−９−１０１０（配列番号：３）で誘導されたウェル番号＃３（ｂ）、ＳＥＭＡ５Ｂ−Ａ２４−９−１９６（配列番号：４）で誘導されたウェル番号＃３（ｃ）、ＳＥＭＡ５Ｂ−Ａ２４−９−７２３（配列番号：８）で誘導されたウェル番号＃４（ｄ）、ＳＥＭＡ５Ｂ−Ａ２４−９−２８０（配列番号：９）で誘導されたウェル番号＃５（ｅ）、およびＳＥＭＡ５Ｂ−Ａ２４−９−２９３（配列番号：１０）で誘導されたウェル番号＃３（ｆ）におけるＣＴＬはそれぞれ、対照と比較して強力なＩＦＮ−γ産生を示した。これらの写真のウェル上の四角は、対応するウェルからの細胞を、ＣＴＬ株を樹立するために増殖させたことを示す。対照的に、典型的な陰性データとして、ＳＥＭＡ５Ｂ−Ａ２４−９−２４７（配列番号：１）で刺激したＣＴＬからは、特異的ＩＦＮ−γ産生は観察されなかった（ｍ）。図中、「＋」は、適切なペプチドをパルスした標的細胞に対するＩＦＮ−γ産生を示し、「−」は、いずれのペプチドもパルスしていない標的細胞に対するＩＦＮ−γ産生を示す。
【００２９】
【図１−２】図１は、ＳＥＭＡ５Ｂ由来のペプチドを用いて誘導したＣＴＬにおけるインターフェロン（ＩＦＮ）−γ酵素結合免疫スポット（ＥＬＩＳＰＯＴ）アッセイの結果を示す、一連の写真（ａ）〜（ｍ）から構成される。ＳＥＭＡ５Ｂ−Ａ２４−９−４７０（配列番号：１３）で誘導されたウェル番号＃６（ｇ）、ＳＥＭＡ５Ｂ−Ａ２４−９−５５８（配列番号：２０）で誘導されたウェル番号＃３（ｈ）、ＳＥＭＡ５Ｂ−Ａ２４−１０−３５４（配列番号：４０）で誘導されたウェル番号＃４（ｉ）、ＳＥＭＡ５Ｂ−Ａ２４−１０−２９０（配列番号：４１）で誘導されたウェル番号＃６（ｊ）、ＳＥＭＡ５Ｂ−Ａ２４−１０−１０４４（配列番号：４７）で誘導されたウェル番号＃５（ｋ）およびＳＥＭＡ５Ｂ−Ａ２４−１０−４８９（配列番号：５４）で誘導されたウェル番号＃４（ｌ）におけるＣＴＬはそれぞれ、対照と比較して強力なＩＦＮ−γ産生を示した。これらの写真のウェル上の四角は、対応するウェルからの細胞を、ＣＴＬ株を樹立するために増殖させたことを示す。対照的に、典型的な陰性データとして、ＳＥＭＡ５Ｂ−Ａ２４−９−２４７（配列番号：１）で刺激したＣＴＬからは、特異的ＩＦＮ−γ産生は観察されなかった（ｍ）。図中、「＋」は、適切なペプチドをパルスした標的細胞に対するＩＦＮ−γ産生を示し、「−」は、いずれのペプチドもパルスしていない標的細胞に対するＩＦＮ−γ産生を示す。
【００３０】
【図２】図２は、ＳＥＭＡ５Ｂ−Ａ２４−９−５１２（配列番号：２）（ａ）、ＳＥＭＡ５Ｂ−Ａ２４−９−１０１０（配列番号：３）（ｂ）、ＳＥＭＡ５Ｂ−Ａ２４−９−２９３（配列番号：１０）（ｃ）およびＳＥＭＡ５Ｂ−Ａ２４−１０−２９０（配列番号：４１）（ｄ）で刺激したＣＴＬ株のＩＦＮ−γ産生を示す、一連の折れ線グラフ（ａ）〜（ｄ）から構成される。ＣＴＬが産生したＩＦＮ−γの量はＩＦＮ−γ酵素結合免疫吸着測定法（ＥＬＩＳＡ）によって測定した。結果は、それぞれのペプチドの刺激によって樹立されたＣＴＬ株が、対照と比較して強力なＩＦＮ−γ産生を示したことを実証する。図中、「＋」は、適切なペプチドをパルスした標的細胞に対するＩＦＮ−γ産生を示し、「−」は、いずれのペプチドもパルスしていない標的細胞に対するＩＦＮ−γ産生を示す。
【００３１】
【図３】図３は、ＳＥＭＡ５Ｂ−Ａ２４−９−５１２（配列番号：２）（ａ）、ＳＥＭＡ５Ｂ−Ａ２４−９−１０１０（配列番号：３）（ｂ）およびＳＥＭＡ５Ｂ−Ａ２４−１０−２９０（配列番号：４１）（ｃ）で刺激したＣＴＬ株から限界希釈によって樹立されたＣＴＬクローンのＩＦＮ−γ産生を示す、一連の折れ線グラフ（ａ）〜（ｃ）から構成される。結果は、それぞれのペプチドでの刺激によって樹立されたＣＴＬクローンが、対照と比較して強力なＩＦＮ−γ産生を示したことを実証する。図中、「＋」は、適切なペプチドをパルスした標的細胞に対するＩＦＮ−γ産生を示し、「−」は、いずれのペプチドもパルスしていない標的細胞に対するＩＦＮ−γ産生を示す。
【００３２】
【図４】図４は、ＳＥＭＡ５ＢおよびＨＬＡ−Ａ＊２４０２を発現する標的細胞に対するＣＴＬクローンの特異的ＣＴＬ活性を示す折れ線グラフである。ＨＬＡ−Ａ＊２４０２または全長ＳＥＭＡ５Ｂ遺伝子をトランスフェクトしたＣＯＳ７細胞を対照として調製した。ＳＥＭＡ５Ｂ−Ａ２４−１０−２９０（配列番号：４１）を用いて樹立されたＣＴＬクローンは、ＳＥＭＡ５ＢおよびＨＬＡ−Ａ＊２４０２の両方をトランスフェクトしたＣＯＳ７細胞に対して特異的ＣＴＬ活性を示した（菱形）。一方、ＨＬＡ−Ａ＊２４０２（三角）またはＳＥＭＡ５Ｂ（丸）のいずれかを発現する標的細胞に対しては、有意な特異的ＣＴＬ活性は検出されなかった。
【発明を実施するための形態】
【００３３】
態様の説明
本発明の態様を実施または試験するにあたって、本明細書に記載の方法および材料と類似のまたは同等のいかなる方法および材料も用いることができるが、好ましい方法、装置、および材料をここに記載する。しかしながら、本発明の材料および方法を記載する前に、これらの記載が説明のものにすぎず、限定されるものではないことが理解されるべきである。本明細書に記載の特定の大きさ、形状、寸法、材料、方法論、プロトコール等は慣例的な実験法および最適化に応じて変更可能であるため、本発明がこれらに限定されないことも理解されるべきである。さらに、本記載に使用する専門用語は特定の型または態様のみを説明する目的のためのものであり、添付の特許請求の範囲によってのみ限定される本発明の範囲を限定することは意図しない。
本明細書において言及される各出版物、特許、または特許出願の開示は、その全体が参照により本明細書に明確に組み入れられる。しかしながら、本明細書中のいかなるものも、本発明が先行発明によりそのような開示に先行する権利を与えられないと承認するものとしては解釈されるべきではない。
【００３４】
別段の定めのない限り、本明細書で使用する技術用語および科学用語はすべて、本発明が属する技術分野の当業者によって一般に理解されている用語と同じ意味を有する。矛盾する場合には、定義を含め、本明細書が優先される。加えて、材料、方法、および例は、単に例証するためのものであり、限定することは意図しない。
【００３５】
Ｉ．定義
本明細書で用いる「１つの（ａ）」、「１つの（ａｎ）」、および「その（ｔｈｅ）」という単語は、特に別段の指定のない限り「少なくとも１つ」を意味する。
物質（例えばペプチド、抗体、ポリヌクレオチド等）に関して使用する「単離された」および「精製された」という用語は、該物質が、そうでなければ天然源中に含まれ得る少なくとも１種の物質を実質的に含まないことを示す。したがって、単離または精製されたペプチドは、細胞材料、例えば糖質、脂質、またはペプチドが由来する細胞もしくは組織源からの他の混入タンパク質を実質的に含まないかまたは化学合成される場合には化学物質前駆体もしくは他の化学物質を実質的に含まないペプチドを指す。
【００３６】
「細胞材料を実質的に含まない」という用語は、ペプチドが、それが単離された細胞または組換え産生された細胞の細胞成分から分離されたペプチドの調製物を含む。したがって、細胞材料を実質的に含まないペプチドは、約３０％、２０％、１０％、または５％（乾燥重量ベースで）未満の異種タンパク質（本明細書において「混入タンパク質」とも称する）を有するポリペプチドの調製物を含む。ペプチドを組換え産生する場合、ペプチドは、好ましくは、培養培地も実質的に含まず、培養培地をペプチド調製物の容量の約２０％、１０％、または５％未満で有するペプチドの調製物を含む。ペプチドを化学合成によって生成する場合、ペプチドは、好ましくは、化学物質前駆体または他の化学物質を実質的に含まず、ペプチドの合成に関与する化学物質前駆体または他の化学物質をペプチド調製物の容量の約３０％、２０％、１０％、５％（乾燥重量ベースで）未満で有するペプチドの調製物を含む。特定のペプチド調製物が単離または精製されたペプチドを含むことは、例えば、タンパク質調製物のドデシル硫酸ナトリウム（ＳＤＳ）−ポリアクリルアミドゲル電気泳動およびゲルのクーマシーブリリアントブルー染色等の後の単一バンドの出現によって示すことができる。好ましい態様において、本発明のペプチドおよびポリヌクレオチドは、単離または精製される。
【００３７】
「ポリペプチド」、「ペプチド」、および「タンパク質」という用語は、本明細書で互換的に用いられ、アミノ酸残基のポリマーを指す。本用語は、１個もしくは複数個のアミノ酸残基が修飾された残基であり得るか、または対応する天然アミノ酸の人工的な化学的模倣体などの非天然残基であり得るアミノ酸ポリマー、ならびに天然アミノ酸ポリマーに適用される。
【００３８】
本明細書で用いる「オリゴペプチド」という用語は、２０アミノ酸残基またはそれ未満、典型的には１５アミノ酸残基またはそれ未満のアミノ酸残基から構成されるペプチドを指す。本明細書において「ノナペプチド」という用語は９アミノ酸残基から構成されるペプチドを指し、「デカペプチド」という用語は１０アミノ酸残基から構成されるペプチドを指す。
【００３９】
本明細書で使用する「アミノ酸」という用語は、天然アミノ酸および合成アミノ酸、ならびに天然アミノ酸と同様に機能するアミノ酸類似体およびアミノ酸模倣体を指す。アミノ酸は、Ｌ−アミノ酸またはＤ−アミノ酸のいずれでもよい。天然アミノ酸とは、遺伝暗号によってコードされるアミノ酸、および細胞内で翻訳後に修飾されたアミノ酸（例えば、ヒドロキシプロリン、γ−カルボキシグルタミン酸、およびＯ−ホスホセリン）である。「アミノ酸類似体」という語句は、天然アミノ酸と同じ基本化学構造（水素、カルボキシ基、アミノ基、およびＲ基に結合したα炭素）を有するが、修飾されたＲ基または修飾された骨格を有する化合物（例えば、ホモセリン、ノルロイシン、メチオニン、スルホキシド、メチオニンメチルスルホニウム）を指す。「アミノ酸模倣体」という語句は、一般的なアミノ酸とは異なる構造を有するが、同様の機能を有する化合物を指す。
アミノ酸は、本明細書において、ＩＵＰＡＣ−ＩＵＢ生化学命名法委員会（Ｂｉｏｃｈｅｍｉｃａｌ  Ｎｏｍｅｎｃｌａｔｕｒｅ  Ｃｏｍｍｉｓｓｉｏｎ）の推奨する、一般に公知の３文字表記または１文字表記で記載されてもよい。
【００４０】
「ポリヌクレオチド」、「オリゴヌクレオチド」および「核酸」という用語は、本明細書において互換的に用いられ、特に別段の指定のない限り、一般に受け入れられている１文字コードで記載される。
「剤」および「組成物」という用語は、本明細書で互換的に用いられ、特定量の特定成分を含む生成物、ならびに特定量の特定成分の組み合わせから直接または間接的に生じる任意の生成物を指す。そのような用語は、修飾語「薬学的」（「薬学的剤」および「薬学的組成物」におけるように）に関連して使用される場合には、有効成分および担体を構成する不活性成分を含む生成物、ならびに任意の２つもしくはそれ以上の成分の組み合わせ、複合体形成、もしくは凝集から、１つもしくは複数の成分の解離から、または１つもしくは複数の成分の他の種類の反応もしくは相互作用から、直接または間接的に生じる任意の生成物を包含することが意図される。したがって、本発明との関連において、「薬学的剤」および「薬学的組成物」という用語は、本発明の分子または化合物と薬学的または生理学的に許容される担体を混合することによって生成された任意の生成物を指す。
【００４１】
本明細書における「有効成分」という用語は、生物学的活性または生理的活性のある、剤または組成物中の物質を指す。特に、薬学的な剤または組成物との関連において、「有効成分」という用語は、目的の薬理学的効果を示す成分物質を指す。例えば、がんの治療または予防に用いるための薬学的な剤または組成物の場合、剤または組成物中の有効成分は、がん細胞および／または組織に対して直接的または間接的に、少なくとも１つの生物学的作用または生理的作用をもたらし得る。好ましくは、そのような作用には、がん細胞増殖を減少させることまたは阻害すること、がん細胞および／またはがん組織を損傷または殺傷することなどが含まれ得る。典型的には、有効成分の間接的効果は、がん細胞を認識または殺傷することができるＣＴＬの誘導である。製剤化される前には、「有効成分」は「バルク」、「原薬」、または「原体」とも称することができる。
【００４２】
本明細書で使用する「薬学的に許容される担体」または「生理学的に許容される担体」という語句は、液体または固体増量剤、希釈剤、賦形剤、溶媒、および封入材料を含むがこれらに限定されない、薬学的または生理学的に許容される材料、組成物、物質または媒体を意味する。
【００４３】
本発明のいくつかの薬学的な剤または組成物は、特にワクチンとして用いられる。本発明との関連において、「ワクチン」（「免疫原性組成物」とも称される）という用語は、動物に接種した際に抗腫瘍免疫を改善、増強および／または誘導する機能を有する剤または組成物を指す。
【００４４】
別段の定めのない限り、「がん」という用語は、ＳＥＭＡ５Ｂ遺伝子を過剰発現するがんまたは腫瘍を指し、その例には、食道がん、ＮＳＣＬＣ、ＲＣＣおよびＳＣＬＣが含まれるが、これらに限定されない。
別段の定めのない限り、「細胞傷害性Ｔリンパ球」、「細胞傷害性Ｔ細胞」、および「ＣＴＬ」という用語は本明細書において互換的に用いられ、特に別段の指定のない限り、非自己細胞（例えば、腫瘍／がん細胞、ウイルス感染細胞）を認識し、そのような細胞の死滅を誘導することができるＴリンパ球のサブグループを指す。
【００４５】
別段の定めのない限り、本明細書で用いる「ＨＬＡ−Ａ２４」という用語は、その例には、ＨＬＡ−Ａ＊２４０１、ＨＬＡ−Ａ＊２４０２、ＨＬＡ−Ａ＊２４０３、ＨＬＡ−Ａ＊２４０４、ＨＬＡ−Ａ＊２４０７、ＨＬＡ−Ａ＊２４０８、ＨＬＡ−Ａ＊２４２０、ＨＬＡ−Ａ＊２４２５およびＨＬＡ−Ａ＊２４８８が含まれるが、これらに限定されないサブタイプを指す。
別段の定めのない限り、本明細書で用いる「キット」という用語は、試薬と他の材料との組み合わせに関して用いられる。本明細書では、キットはマイクロアレイ、チップ、マーカー等を含み得ることが企図される。「キット」という用語は、試薬および／または材料の特定の組み合わせに限定されないことが意図される。
【００４６】
対象または患者との関連において、本明細書で用いる「対象の（または患者の）ＨＬＡ抗原はＨＬＡ−Ａ２４である」という語句は、対象または患者がＨＬＡ−Ａ２４抗原遺伝子をホモ接合的またはヘテロ接合的に保有し、ＨＬＡ−Ａ２４抗原が対象または患者の細胞においてＨＬＡ抗原として発現していることを指す。
【００４７】
本発明の方法および組成物ががんの「治療」との関連において有用である限り、治療が、対象におけるがんの大きさ、広がり、もしくは転移能の減少、生存期間の延長、転移の抑制または術後再発の抑制などの臨床的利点をもたらす場合に、治療は「有効である」と見なされる。治療を予防的に適用する場合、「有効な」とは、治療によって、がんの形成が遅延されるもしくは妨げられるか、またはがんの臨床症状が妨げられるもしくは緩和されることを意味する。有効性は、特定の腫瘍の種類を診断または治療するための任意の公知の方法と関連して決定される。
【００４８】
本発明の方法および組成物ががんの「予防（ｐｒｅｖｅｎｔｉｏｎおよびｐｒｏｐｈｙｌａｘｉｓ）」との関連において有用である限り、そのような用語は本明細書において互換的に用いられ、疾患による死亡率または罹患率の負荷を軽減させる任意の働きを指す。予防（ｐｒｅｖｅｎｔｉｏｎおよびｐｒｏｐｈｙｌａｘｉｓ）は、「第一次、第二次、および第三次の予防レベル」で行われ得る。第一次の予防（ｐｒｅｖｅｎｔｉｏｎおよびｐｒｏｐｈｙｌａｘｉｓ）は疾患の発生を回避するのに対し、第二次および第三次レベルの予防（ｐｒｅｖｅｎｔｉｏｎおよびｐｒｏｐｈｙｌａｘｉｓ）は、疾患の進行および症状の出現を予防することに加え、機能を回復させ、かつ疾患関連の合併症を減少させることによって、既存の疾患の悪影響を低下させることを目的とした働きを包含する。あるいは、予防（ｐｒｅｖｅｎｔｉｏｎおよびｐｒｏｐｈｙｌａｘｉｓ）は、特定の障害の重症度を緩和すること、例えば腫瘍の増殖および転移を減少させることを目的とした広範囲の予防的療法を含み得る。
【００４９】
本発明との関連において、がんの治療および／もしくは予防、ならびに／またはその転移もしくは術後のその再発の予防は、がん細胞の外科的切除、がん性細胞の増殖の阻害、腫瘍の退行または退縮、寛解の誘導およびがんの発生の抑制、腫瘍退縮、ならびに転移の低減または阻害、術後のがんの再発の抑制、ならびに生存期間の延長などの事象をもたらすいかなる活動も含む。がんの効果的な治療および／または予防は、死亡率を減少させ、がんを有する個体の予後を改善し、血中の腫瘍マーカーのレベルを低下させ、かつがんに伴う検出可能な症状を緩和する。例えば、症状の軽減または改善は効果的な治療および／または予防を構成し、１０％、２０％、３０％、もしくはそれ以上の軽減または安定した疾患を含む。
【００５０】
本発明との関連において、「抗体」という用語は、指定のタンパク質またはそのペプチドと特異的に反応する免疫グロブリンおよびその断片を指す。抗体には、ヒト抗体、霊長類化抗体、キメラ抗体、二重特異性抗体、ヒト化抗体、他のタンパク質または放射標識と融合させた抗体、および抗体断片が含まれ得る。さらに、本明細書において抗体は広義で使用され、具体的には完全なモノクローナル抗体、ポリクローナル抗体、少なくとも２つの完全な抗体から形成される多重特異性抗体（例えば、二重特異性抗体）を包含し、また所望の生物学的活性を示す限り、抗体断片を包含する。「抗体」は、すべてのクラス（例えば、ＩｇＡ、ＩｇＤ、ＩｇＥ、ＩｇＧ、およびＩｇＭ）を示す。
別段の定めのない限り、本明細書で使用する技術用語および科学用語はすべて、本発明が属する技術分野の当業者によって一般に理解されている用語と同じ意味を有する。
【００５１】
ＩＩ．ペプチド
以下に詳細に記載する本発明のペプチドは、「ＳＥＭＡ５Ｂペプチド」または「ＳＥＭＡ５Ｂポリペプチド」と称される場合もある。
【００５２】
ＳＥＭＡ５Ｂ由来のペプチドがＣＴＬによって認識される抗原として機能することを実証するために、ＳＥＭＡ５Ｂ（配列番号：７５）由来のペプチドを解析して、それらが、一般的に見られるＨＬＡアリルであるＨＬＡ−Ａ２４（Ｄａｔｅ  Ｙ  ｅｔ  ａｌ．，Ｔｉｓｓｕｅ  Ａｎｔｉｇｅｎｓ  ４７：９３−１０１，１９９６；Ｋｏｎｄｏ  Ａ  ｅｔ  ａｌ．，Ｊ  Ｉｍｍｕｎｏｌ  １５５：４３０７−１２，１９９５；Ｋｕｂｏ  ＲＴ  ｅｔ  ａｌ．，Ｊ  Ｉｍｍｕｎｏｌ  １５２：３９１３−２４，１９９４）によって拘束される抗原エピトープであるかどうかを判定した。
ＳＥＭＡ５Ｂ由来のＨＬＡ−Ａ２４結合ペプチドの候補を、ＨＬＡ−Ａ２４に対するそれらの結合親和性に基づいて同定した。以下の候補ペプチドを同定した：配列番号：２〜６９。
【００５３】
上記のうち、下記のペプチドをパルスした（負荷した）樹状細胞（ＤＣ）によるＴ細胞のインビトロでの刺激後、これらのペプチドによりＣＴＬの樹立に成功した：
ＳＥＭＡ５Ｂ−Ａ２４−９−５１２（配列番号：２）、ＳＥＭＡ５Ｂ−Ａ２４−９−１０１０（配列番号：３）、ＳＥＭＡ５Ｂ−Ａ２４−９−１９６（配列番号：４）、ＳＥＭＡ５Ｂ−Ａ２４−９−７２３（配列番号：８）、ＳＥＭＡ５Ｂ−Ａ２４−９−２８０（配列番号：９）、ＳＥＭＡ５Ｂ−Ａ２４−９−２９３（配列番号：１０）、ＳＥＭＡ５Ｂ−Ａ２４−９−４７０（配列番号：１３）、ＳＥＭＡ５Ｂ−Ａ２４−９−５５８（配列番号：２０）、ＳＥＭＡ５Ｂ−Ａ２４−１０−３５４（配列番号：４０）、ＳＥＭＡ５Ｂ−Ａ２４−１０−２９０（配列番号：４１）、ＳＥＭＡ５Ｂ−Ａ２４−１０−１０４４（配列番号：４７）およびＳＥＭＡ５Ｂ−Ａ２４−１０−４８９（配列番号：５４）。
【００５４】
上記に記載の樹立されたＣＴＬは、各ペプチドをパルスした標的細胞に対して強力な特異的ＣＴＬ活性を示す。これらの結果は、ＳＥＭＡ５ＢがＣＴＬによって認識される抗原であること、および上記のペプチドがＨＬＡ−Ａ２４によって拘束されるＳＥＭＡ５Ｂのエピトープペプチドであることを実証している；したがってそのようなペプチドは、ＣＴＬによる細胞毒性のための標的抗原として効果的となり得る。
【００５５】
ＳＥＭＡ５Ｂ遺伝子は、例えば食道がん、ＮＳＣＬＣ、ＲＣＣおよびＳＣＬＣを含むがん細胞およびがん組織において過剰発現され、ほとんどの正常器官においては発現されないため、免疫療法の優れた標的となる。したがって、本発明はＳＥＭＡ５Ｂ由来のＣＴＬ認識エピトープに対応するノナペプチド（９個のアミノ酸残基から構成されるペプチド）およびデカペプチド（１０個のアミノ酸残基から構成されるペプチド）を提供する。あるいは、本発明は、ＣＴＬを誘導することができるペプチドであって、ＳＥＭＡ５Ｂの免疫学的活性断片から構成される、単離されたペプチドを提供する。いくつかの態様において、本発明は、配列番号：２〜６９の中から選択されたアミノ酸配列を含むペプチドを提供し、さらに好ましいペプチドは、配列番号：２、３、４、８、９、１０、１３、２０、４０、４１、４７および５４の中から選択されたアミノ酸配列を含む。好ましい態様において、本発明のペプチドは、配列番号：２〜６９の中から選択されるアミノ酸配列、特に配列番号：２、３、４、８、９、１０、１３、２０、４０、４１、４７および５４の中から選択されるアミノ酸配列を含む、ノナペプチドあるいはデカペプチドである。本発明のペプチドの好ましい例として、配列番号：２〜６９の中から選択されるアミノ酸配列からなるペプチドが挙げられる。
【００５６】
一般的に、例えば、インターネット上で現在利用可能なソフトウェアプログラム、例えば、Ｐａｒｋｅｒ  ＫＣ  ｅｔ  ａｌ．，Ｊ  Ｉｍｍｕｎｏｌ  １９９４，１５２（１）：１６３−７５および、Ｎｉｅｌｓｅｎ  Ｍ  ｅｔ  ａｌ．，Ｐｒｏｔｅｉｎ  Ｓｃｉ  ２００３；１２：１００７−１７に記載されるソフトウェアプログラムなどを用いて、様々なペプチドとＨＬＡ抗原との間の結合親和性をインシリコで算出することができる。ＨＬＡ抗原との結合親和性を、例えば、Ｐａｒｋｅｒ  ＫＣ  ｅｔ  ａｌ．，Ｊ  Ｉｍｍｕｎｏｌ  １９９４，１５２（１）：１６３−７５，Ｋｕｚｕｓｈｉｍａ  Ｋ  ｅｔ  ａｌ．，Ｂｌｏｏｄ  ２００１，９８（６）：１８７２−８１，Ｌａｒｓｅｎ  ＭＶ  ｅｔ  ａｌ．，ＢＭＣ  Ｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓ．２００７；８：４２４，Ｂｕｕｓ  Ｓ  ｅｔ  ａｌ，Ｔｉｓｓｕｅ  Ａｎｔｉｇｅｎｓ．，６２：３７８−８４，２００３，Ｎｉｅｌｓｅｎ  Ｍ  ｅｔ  ａｌ．，Ｐｒｏｔｅｉｎ  Ｓｃｉ  ２００３；１２：１００７−１７およびＮｉｅｌｓｅｎ  Ｍ  ｅｔ  ａｌ．ＰＬｏＳ  ＯＮＥ  ２００７；２：ｅ７９６に記載されるように測定することができ、これらは、例えば、Ｌａｆｕｅｎｔｅ  ＥＭ  ｅｔ  ａｌ．，Ｃｕｒｒｅｎｔ  Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ  Ｄｅｓｉｇｎ，２００９，１５，３２０９−３２２０に要約されている。結合親和性を求めるための方法が、例えば、Ｊｏｕｒｎａｌ  ｏｆ  Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｉｃａｌ  Ｍｅｔｈｏｄｓ（１９９５，１８５：１８１−１９０）、および、Ｐｒｏｔｅｉｎ  Ｓｃｉｅｎｃｅ（２０００，９：１８３８−１８４６）に記載される。したがって、当業者はそのようなソフトウェアプログラムを使用して、ＨＬＡ抗原との高い結合親和性を有するＳＥＭＡ５Ｂ由来のそのような断片を選択することができる。したがって、本発明は、そのような公知のプログラムによってＨＬＡ抗原と結合することが決定されるであろう、ＳＥＭＡ５Ｂ由来の任意の断片から構成されるペプチドを包含する。さらに、そのようなペプチドには、全長のＳＥＭＡ５Ｂ配列からなるペプチドが含まれ得る。
【００５７】
本発明のペプチド、特に本発明のノナペプチドおよびデカペプチドは、結果として生じるペプチドがそのＣＴＬ誘導能を保持する限り、付加的なアミノ酸残基を隣接させることができる。具体的な付加的なアミノ酸残基は、それらが元のペプチドのＣＴＬ誘導能を損なわない限り、任意の種類のアミノ酸から構成され得る。したがって、本発明は、ＣＴＬ誘導能を有するペプチド、特にＳＥＭＡ５Ｂ由来のペプチドを包含する。そのようなペプチドは、例えば、約４０アミノ酸未満であり、多くの場合は約２０アミノ酸未満であり、通常は約１５アミノ酸未満である。
【００５８】
一般的に、ペプチドにおける１個、２個、数個、またはそれ以上のアミノ酸の改変はペプチドの機能に影響を及ぼさず、また、場合によっては元のペプチドの所望される機能を増強することさえあることが知られている。実際に、改変ペプチド（すなわち、元の参照配列と比較して、１個、２個、または数個のアミノ酸残基が改変された（すなわち、置換、付加、欠失、および／または挿入された）アミノ酸配列から構成されるペプチド）が、元のペプチドの生物学的活性を保持することが知られている（Ｍａｒｋ  ｅｔ  ａｌ．，Ｐｒｏｃ  Ｎａｔｌ  Ａｃａｄ  Ｓｃｉ  ＵＳＡ  １９８４，８１：５６６２−６；Ｚｏｌｌｅｒ  ａｎｄ  Ｓｍｉｔｈ，Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄｓ  Ｒｅｓ  １９８２，１０：６４８７−５００；Ｄａｌｂａｄｉｅ−ＭｃＦａｒｌａｎｄ  ｅｔ  ａｌ．，Ｐｒｏｃ  Ｎａｔｌ  Ａｃａｄ  Ｓｃｉ  ＵＳＡ  １９８２，７９：６４０９−１３）。したがって、１つの態様において、本発明のペプチドは、ＣＴＬ誘導能を有し、かつ、１個、２個、またはさらにそれ以上のアミノ酸が付加および／または置換されている配列番号：２〜６９の中より選択されるアミノ酸配列を有する。別の言い方をすれば、元のペプチドのＣＴＬ誘導能を改変ペプチドが保持するという条件で、本発明のペプチドは、ＣＴＬ誘導能と、配列番号：２〜６９の中より選択されるアミノ酸配列、好ましくは、配列番号：２、３、４、８、９、１０、１３、２０、４０、４１、４７および５４からなる群より選択されるアミノ酸配列において１個、２個、または数個のアミノ酸が、置換、欠失、挿入および／または付加されているアミノ酸配列との両方を有する。
【００５９】
当業者は、単一のアミノ酸またはアミノ酸配列全体のわずかな割合を変更する、アミノ酸配列に対する個々の改変（すなわち、欠失、挿入、付加および／または置換）が、元のアミノ酸側鎖の特性の保存をもたらす傾向があることを認識するであろう。したがって、これらは慣例的に「保存的置換」または「保存的改変」と称され、この場合、タンパク質の変化によって元のタンパク質と類似の機能を有するタンパク質が生じる。 機能的に類似しているアミノ酸を提示する保存的置換の表は、当技術分野において周知である。保存することが望ましいアミノ酸側鎖の特性の例には、例えば、疎水性アミノ酸（Ａ、Ｉ、Ｌ、Ｍ、Ｆ、Ｐ、Ｗ、Ｙ、Ｖ）、親水性アミノ酸（Ｒ、Ｄ、Ｎ、Ｃ、Ｅ、Ｑ、Ｇ、Ｈ、Ｋ、Ｓ、Ｔ）、ならびに、以下の官能基または特徴を共通して有する側鎖が含まれる：脂肪族側鎖（Ｇ、Ａ、Ｖ、Ｌ、Ｉ、Ｐ）；ヒドロキシル基含有側鎖（Ｓ、Ｔ、Ｙ）；硫黄原子含有側鎖（Ｃ、Ｍ）；カルボン酸およびアミドを含有する側鎖（Ｄ、Ｎ、Ｅ、Ｑ）；塩基含有側鎖（Ｒ、Ｋ、Ｈ）；ならびに芳香族含有側鎖（Ｈ、Ｆ、Ｙ、Ｗ）。加えて、以下の８群はそれぞれ、相互に保存的置換であるとして当技術分野で認められているアミノ酸を含む：
１）アラニン（Ａ）、グリシン（Ｇ）；
２）アスパラギン酸（Ｄ）、グルタミン酸（Ｅ）；
３）アスパラギン（Ｎ）、グルタミン（Ｑ）；
４）アルギニン（Ｒ）、リジン（Ｋ）；
５）イソロイシン（Ｉ）、ロイシン（Ｌ）、メチオニン（Ｍ）、バリン（Ｖ）；
６）フェニルアラニン（Ｆ）、チロシン（Ｙ）、トリプトファン（Ｗ）；
７）セリン（Ｓ）、スレオニン（Ｔ）；および
８）システイン（Ｃ）、メチオニン（Ｍ）（例えば、Ｃｒｅｉｇｈｔｏｎ，Ｐｒｏｔｅｉｎｓ  １９８４を参照されたい）。
【００６０】
このような保存的改変ペプチドもまた、本発明のペプチドとみなされる。しかしながら、本発明のペプチドはこれらに限定されず、得られた改変ペプチドが元の未改変ペプチドの必要なＣＴＬ誘導能を保持する限り、非保存的な改変を含み得る。さらに、改変ペプチドは、ＳＥＭＡ５Ｂの多型変異体、種間相同体、およびアリル由来のＣＴＬ誘導可能なペプチドを排除すべきではない。
【００６１】
より高い結合親和性を達成するために、本発明のペプチドに対してアミノ酸残基を挿入、置換および／または付加してもよく、あるいは本発明のペプチドからアミノ酸残基を欠失させてもよい。必要なＣＴＬ誘導能を保持するために、当業者は好ましくは少数の（例えば、１個、２個、または数個の）またはわずかな割合のアミノ酸のみを改変（すなわち、欠失、挿入、付加および／または置換）する。本明細書において、「数個」という用語は、５個またはそれ未満のアミノ酸、例えば４個、３個、またはそれ未満を意味する。改変されるアミノ酸の割合は、例えば３０％またはそれ未満、好ましくは２０％またはそれ未満、より好ましくは１５％またはそれ未満、さらにより好ましくは１０％またはそれ未満、例えば１〜５％であり得る。
【００６２】
がん免疫療法との関連で用いられる場合、本発明のペプチドは、ＨＬＡ抗原との複合体として、細胞またはエクソソームの表面上に提示され得る。したがって、ＣＴＬを誘導するだけでなく、ＨＬＡ抗原に対する高い結合親和性を保有するペプチドを選択することが好ましい。その目的のために、ペプチドをアミノ酸残基の置換、挿入、欠失および／または付加によって改変して、ＨＬＡ抗原に対する改善された結合親和性を有する改変ペプチドを得ることができる。天然に提示されるペプチドに加えて、ＨＬＡ抗原への結合によって提示されるペプチドの配列の規則性は既知であることから（Ｊ  Ｉｍｍｕｎｏｌ  １９９４，１５２：３９１３；Ｉｍｍｕｎｏｇｅｎｅｔｉｃｓ  １９９５，４１：１７８；Ｊ  Ｉｍｍｕｎｏｌ  １９９４，１５５：４３０７）、そのような規則性に基づいた改変を本発明の免疫原性ペプチドに導入してもよい。
【００６３】
例えば、高いＨＬＡ−Ａ２４結合親和性を保有するペプチドは、フェニルアラニン、チロシン、メチオニン、またはトリプトファンで置換されたＮ末端から２番目のアミノ酸を有する傾向がある。同様に、Ｃ末端アミノ酸がフェニルアラニン、ロイシン、イソロイシン、トリプトファン、またはメチオニンで置換されたペプチドも高いＨＬＡ−Ａ２４結合親和性を有する傾向がある。したがって、ＨＬＡ−Ａ２４結合親和性を高めるためには、Ｎ末端から２番目のアミノ酸をフェニルアラニン、チロシン、メチオニン、もしくはトリプトファンで置換すること、および／またはＣ末端のアミノ酸を、フェニルアラニン、ロイシン、イソロイシン、トリプトファン、もしくはメチオニンで置換することが望ましい可能性がある。したがって、配列番号のアミノ酸配列のＮ末端から２番目のアミノ酸がフェニルアラニン、チロシン、メチオニンもしくはトリプトファンで置換されている、および／または該配列番号のアミノ酸配列のＣ末端がフェニルアラニン、ロイシン、イソロイシン、トリプトファンもしくはメチオニンで置換されている、配列番号：２〜６９の中より選択されるアミノ酸配列を有するペプチドは、本発明に包含される。同様に、本発明は、配列番号：２〜６９において１個、２個または数個のアミノ酸が、置換、欠失、挿入および／または付加されているアミノ酸配列を含むペプチドであって、（ａ）Ｎ末端から２番目のアミノ酸がフェニルアラニン、チロシン、メチオニンもしくはトリプトファンである；および（ｂ）Ｃ末端アミノ酸がフェニルアラニン、ロイシン、イソロイシン、トリプトファンもしくはメチオニンである、との特徴の一方または両方を有するペプチドを包含する。好ましい態様において、本発明のペプチドは、配列番号：２〜６９のアミノ酸配列においてＮ末端から２番目のアミノ酸がフェニルアラニン、チロシン、メチオニン、もしくはトリプトファンで置換されている、および／またはＣ末端アミノ酸がフェニルアラニン、ロイシン、イソロイシン、トリプトファンもしくはメチオニンで置換されているアミノ酸配列を含む。
【００６４】
末端のアミノ酸においてだけでなく、ペプチドの潜在的なＴ細胞受容体（ＴＣＲ）認識部位においても、置換を導入することができる。いくつかの研究は、例えばＣＡＰ１、ｐ５３（２６４−２７２）、Ｈｅｒ−２／ｎｅｕ（３６９−３７７）またはｇｐ１００（２０９−２１７）など、アミノ酸置換を有するペプチドが元のものと同等であるかまたはより優れている機能を有し得ることを実証している（Ｚａｒｅｍｂａ  ｅｔ  ａｌ．Ｃａｎｃｅｒ  Ｒｅｓ．５７，４５７０−４５７７，１９９７、Ｔ．Ｋ．Ｈｏｆｆｍａｎｎ  ｅｔ  ａｌ．Ｊ  Ｉｍｍｕｎｏｌ．（２００２）；１６８（３）：１３３８−４７．，Ｓ．Ｏ．Ｄｉｏｎｎｅ  ｅｔ  ａｌ．Ｃａｎｃｅｒ  Ｉｍｍｕｎｏｌ  ｉｍｍｕｎｏｔｈｅｒ．（２００３）５２：１９９−２０６、およびＳ．Ｏ．Ｄｉｏｎｎｅ  ｅｔ  ａｌ．Ｃａｎｃｅｒ  Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ，Ｉｍｍｕｎｏｔｈｅｒａｐｙ（２００４）５３，３０７−３１４）。
【００６５】
本発明はまた、１個、２個または数個のアミノ酸の付加を本発明のペプチドのＮ末端および／またはＣ末端に対する付加とし得ることも企図する。高いＨＬＡ抗原結合親和性を有しかつＣＴＬ誘導能を保持するそのような改変ペプチドもまた、本発明に含まれる。
【００６６】
例えば、本発明は、ＣＴＬ誘導能を有し、かつ以下からなる群より選択されるアミノ酸配列を含む１５、１４、１３、１２、１１、または１０アミノ酸長未満の単離されたペプチドを提供する：
（ｉ）配列番号：２〜３９からなる群より選択されるアミノ酸配列において１個、２個、または数個のアミノ酸が改変されているアミノ酸配列；および
（ｉｉ）以下の特徴の一方または両方を有する、（ｉ）に記載のアミノ酸配列：
（ａ）前記配列番号のＮ末端から２番目のアミノ酸が、フェニルアラニン、チロシン、メチオニン、およびトリプトファンからなる群より選択されるアミノ酸であるか、またはそのアミノ酸であるように改変されている、ならびに
（ｂ）前記配列番号のＣ末端のアミノ酸が、フェニルアラニン、ロイシン、イソロイシン、トリプトファン、およびメチオニンからなる群より選択されるアミノ酸であるか、またはそのアミノ酸であるように改変されている。
【００６７】
本発明はまた、ＣＴＬ誘導能を有し、かつ以下からなる群より選択されるアミノ酸配列を含む１５、１４、１３、１２、または１１アミノ酸長未満の単離されたペプチドも提供する：
（ｉ'）配列番号：４０〜６９からなる群より選択されるアミノ酸配列において１個、２個、または数個のアミノ酸が改変されているアミノ酸配列；および
（ｉｉ'）以下の特徴の一方または両方を有する、（ｉ'）に記載のアミノ酸配列：
（ａ）前記配列番号のＮ末端から２番目のアミノ酸が、フェニルアラニン、チロシン、メチオニン、およびトリプトファンからなる群より選択されるアミノ酸であるか、またはそのアミノ酸であるように改変されている、ならびに
（ｂ）前記配列番号のＣ末端のアミノ酸が、フェニルアラニン、ロイシン、イソロイシン、トリプトファン、およびメチオニンからなる群より選択されるアミノ酸であるか、またはそのアミノ酸であるように改変されている。
これらのペプチドは、これらのペプチドをＡＰＣと接触させ、またはＡＰＣに導入した場合、ＡＰＣにおいてプロセッシングされてＡＰＣ上に（ｉ）から（ｉｉ）および（ｉ'）から（ｉｉ'）からなる群より選択されるペプチドが提示される。
【００６８】
しかしながら、ペプチド配列が、異なる機能を有する内因性または外因性タンパク質のアミノ酸配列の一部と同一である場合、自己免疫障害および／または特定の物質に対するアレルギー症状などの負の副作用が誘発される可能性がある。したがって、ペプチドの配列が別のタンパク質のアミノ酸配列と一致する状況を回避するために、利用可能なデータベースを用いて最初に相同性検索を行うことが好ましい場合がある。目的ペプチドと同一であるか、あるいは、目的ペプチドと比較して１個または２個のアミノ酸が異なるペプチドが自然界に存在しないことが相同性検索から明らかになった場合、該目的ペプチドは、そのような副作用の危険性を何ら伴うことなく、ＨＬＡ抗原とのその結合親和性を増大させるために、および／または、そのＣＴＬ誘導能を増大させるために改変することができる。
【００６９】
上記のようにＨＬＡ抗原に対する高い結合親和性を有するペプチドは、非常に効果的であると予測されるが、高い結合親和性の存在を指標として選択された候補ペプチドを、ＣＴＬ誘導能の有無についてさらに調べる。本明細書において「ＣＴＬ誘導能」という語句は、抗原提示細胞（ＡＰＣ）上に提示された場合に、細胞傷害性Ｔリンパ球（ＣＴＬ）を誘導するペプチドの能力を示す。さらに、「ＣＴＬ誘導能」は、ＣＴＬ活性化を誘導する、ＣＴＬ増殖を誘導する、ＣＴＬによる標的細胞の溶解を促進する、およびＣＴＬによるＩＦＮ−γ産生を増加させる、ペプチドの能力を含む。
【００７０】
ＣＴＬ誘導能の確認が、ヒトＭＨＣ抗原を保有するＡＰＣ（例えば、Ｂリンパ球、マクロファージおよび樹状細胞（ＤＣ））、またはより具体的にはヒト末梢血単核白血球に由来するＤＣを誘導し、ＡＰＣを試験ペプチドで刺激した後、ＡＰＣをＣＤ８陽性Ｔ細胞と混合してＣＴＬを誘導し、その後、標的細胞に対してＣＴＬによって産生および放出されたＩＦＮ−γを測定することによって達成される。反応系として、ヒトＨＬＡ抗原を発現するように作製されたトランスジェニック動物（例えば、ＢｅｎＭｏｈａｍｅｄ  Ｌ，Ｋｒｉｓｈｎａｎ  Ｒ，Ｌｏｎｇｍａｔｅ  Ｊ，Ａｕｇｅ  Ｃ，Ｌｏｗ  Ｌ，Ｐｒｉｍｕｓ  Ｊ，Ｄｉａｍｏｎｄ  ＤＪ，Ｈｕｍ  Ｉｍｍｕｎｏｌ  ２０００，６１（８）：７６４−７９，Ｒｅｌａｔｅｄ  Ａｒｔｉｃｌｅｓ，Ｂｏｏｋｓ，Ｌｉｎｋｏｕｔ  Ｉｎｄｕｃｔｉｏｎ  ｏｆ  ＣＴＬ  ｒｅｓｐｏｎｓｅ  ｂｙ  ａ  ｍｉｎｉｍａｌ  ｅｐｉｔｏｐｅ  ｖａｃｃｉｎｅ  ｉｎ  ＨＬＡ  Ａ＊０２０１／ＤＲ１  ｔｒａｎｓｇｅｎｉｃ  ｍｉｃｅ：ｄｅｐｅｎｄｅｎｃｅ  ｏｎ  ＨＬＡ  ｃｌａｓｓ  ＩＩ  ｒｅｓｔｒｉｃｔｅｄ  Ｔ（Ｈ）ｒｅｓｐｏｎｓｅに記載されるトランスジェニック動物）を用いることができる。あるいは、標的細胞を５１Ｃｒなどで放射標識することができ、標的細胞から放出された放射活性からＣＴＬの細胞傷害活性を算出することができる。あるいは、固定化したペプチドを保有する細胞の存在下で、ＣＴＬによって産生および放出されたＩＦＮ−γを測定し、抗ＩＦＮ−γモノクローナル抗体を用いて培地上の阻止帯を可視化することによって、ＣＴＬ誘導能を評価することができる。
【００７１】
上記のようにペプチドのＣＴＬ誘導能を調べた結果として、配列番号：２、３、４、８、９、１０、１３、２０、４０、４１、４７および５４によって示されるアミノ酸配列を有するそれらのペプチドの中より選択されるノナペプチドまたはデカペプチドが、ＨＬＡ抗原に対する高い結合親和性に加えて、特に高いＣＴＬ誘導能を示すことが発見された。したがって、これらのペプチドは本発明の好ましい態様として例示される。
【００７２】
さらに、相同性解析結果から、そのようなペプチドが、他のいかなる公知のヒト遺伝子産物に由来するペプチドとも有意な相同性を有していないことが実証された。このことで、免疫療法に用いた場合に、未知の、または望ましくない免疫応答が起こる可能性が低くなる。したがって、この局面からもまた、これらのペプチドは、がん患者においてＳＥＭＡ５Ｂに対する免疫を誘発させるために有用である。したがって、配列番号：２、３、４、８、９、１０、１３、２０、４０、４１、４７および５４の中から選択されるアミノ酸配列を有するペプチドは、好ましくは本発明に含有される。
【００７３】
上記の改変に加えて、本発明のペプチドは、結果として生じる連結ペプチドが、元のペプチドの必要なＣＴＬ誘導能を保持する限り、より好ましくは、必要なＨＬＡ結合能を保持する限り、他のペプチドに連結させることもできる。「他の」適切なペプチドの例には、本発明のペプチドまたは他のＴＡＡに由来するＣＴＬ誘導性ペプチドが含まれる。本発明のペプチドは、直接的またはリンカーを介して間接的に、１個あるいは複数の「他の」ペプチドに連結させることができる。ペプチド間リンカーは当技術分野で周知であり、例えばＡＡＹ（Ｐ．Ｍ．Ｄａｆｔａｒｉａｎ  ｅｔ  ａｌ．，Ｊ  Ｔｒａｎｓ  Ｍｅｄ  ２００７，５：２６）、ＡＡＡ、ＮＫＲＫ（配列番号：８１）（Ｒ．Ｐ．Ｍ．Ｓｕｔｍｕｌｌｅｒ  ｅｔ  ａｌ．，Ｊ  Ｉｍｍｕｎｏｌ．２０００，１６５：７３０８−７３１５）、またはＫ（Ｓ  Ｏｔａ，ｅｔ  ａｌ．，Ｃａｎ  Ｒｅｓ．６２，１４７１−１４７６、Ｋ．Ｓ．Ｋａｗａｍｕｒａ，ｅｔ  ａｌ．，Ｊ  Ｉｍｍｕｎｏｌ．２００２，１６８：５７０９−５７１５）を含む。
【００７４】
例えば、ＳＥＭＡ５Ｂではない腫瘍関連抗原に由来するペプチドもまた、ＨＬＡクラスＩおよび／またはクラスＩＩを介する免疫応答を増大させるために、続いてまたは同時に使用することができる。がん細胞が２種類以上の腫瘍関連遺伝子を発現し得ることは、当技術分野において周知である。したがって、特定の対象がさらなる腫瘍関連遺伝子を発現するかどうかを判定すること、そしてその後、そのような遺伝子の発現産物に由来するＨＬＡクラスＩおよび／またはＨＬＡクラスＩＩ結合ペプチドを本発明のＳＥＭＡ５Ｂ組成物またはワクチン中に含めることは、当業者の慣例的な実験法の範囲内である。
【００７５】
ＨＬＡクラスＩおよびＨＬＡクラスＩＩ結合ペプチドの例は当業者に公知であり（例えば、Ｃｏｕｌｉｅ，Ｓｔｅｍ  Ｃｅｌｌｓ  １３：３９３−４０３，１９９５を参照されたい）、本明細書に開示したものと同様の様式で本発明に関連して使用することができる。当業者は、１種もしくは複数種のＳＥＭＡ５Ｂペプチドおよび１種もしくは複数種のＳＥＭＡ５Ｂではないペプチドを含むポリペプチド、またはそのようなポリペプチドをコードする核酸を、従来の分子生物学の手順を使用して調製することができる。
【００７６】
上記の連結ペプチドを本明細書では「ポリトープ」と称し、これはすなわち、様々な配置（例えば、連鎖状、重複）で連結され得る、２つまたはそれ以上の潜在的な免疫原性ペプチドまたは免疫応答刺激性ペプチドの群である。ポリトープ（またはポリトープをコードする核酸）を標準的な免疫化プロトコールに従って例えば動物に投与して、免疫応答の刺激、増強、および／または誘発における該ポリトープの有効性を試験することができる。
【００７７】
ペプチドを直接的にまたは隣接配列の使用により連結して、ポリトープを形成することができ、ポリトープのワクチンとしての使用は当技術分野において周知である（例えば、Ｔｈｏｍｓｏｎ  ｅｔ  ａｌ．，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ  ＵＳＡ  ９２（１３）：５８４５−５８４９，１９９５；Ｇｉｌｂｅｒｔ  ｅｔ  ａｌ．，Ｎａｔｕｒｅ  Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．１５（１２）：１２８０−１２８４，１９９７；Ｔｈｏｍｓｏｎ  ｅｔ  ａｌ．，Ｊ  Ｉｍｍｕｎｏｌ．１５７（２）：８２２−８２６，１９９６；Ｔａｒｎ  ｅｔ  ａｌ．，Ｊ  Ｅｘｐ．Ｍｅｄ．１７１（ｌ）：２９９−３０６，１９９０を参照されたい）。様々な数および組み合わせのエピトープを含むポリトープを調製することができ、ＣＴＬによる認識について、および免疫応答の増大における有効性について試験することができる。
【００７８】
本発明のペプチドは、結果として生じる連結ペプチドが、元のペプチドの必要なＣＴＬ誘導能を保持する限り、他の物質に連結させることもできる。好適な物質の例には、例えば：ペプチド、脂質、糖および糖鎖、アセチル基、天然および合成のポリマー等が含まれる。ペプチドは、修飾によって元のペプチドの生物学的活性が損なわれない限り、糖鎖付加、側鎖酸化、またはリン酸化などの修飾を含み得る。このような種類の修飾は、付加的な機能（例えば、標的化機能および送達機能）を付与するために、またはペプチドを安定化するために実施し得る。
【００７９】
例えば、ペプチドのインビボ安定性を高めるために、Ｄ−アミノ酸、アミノ酸模倣体、または非天然アミノ酸を導入することが当技術分野において公知であり、この概念を本発明のペプチドに対して適合することもできる。ペプチドの安定性は、いくつかの方法でアッセイすることができる。例えば、ペプチダーゼ、ならびにヒトの血漿および血清などの様々な生物学的媒質を用いて、安定性を試験することができる（例えば、Ｖｅｒｈｏｅｆ  ｅｔ  ａｌ．，Ｅｕｒ  Ｊ  Ｄｒｕｇ  Ｍｅｔａｂ  Ｐｈａｒｍａｃｏｋｉｎ  １９８６，１１：２９１−３０２を参照されたい）。
【００８０】
さらに、上述したように、１個、２個、または数個のアミノ酸残基により置換、欠失、挿入または付加されている改変ペプチドの中から、元のペプチドと比較して同じかまたはそれよりも高い活性を有するものをスクリーニングまたは選択することができる。したがって本発明はまた、元のものと比較して同じかまたはそれよりも高い活性を有する改変ペプチドをスクリーニングまたは選択する方法を提供する。例示的方法は以下の段階を含む：
ａ：本発明のペプチドの少なくとも１個のアミノ酸残基を改変（すなわち置換、欠失、挿入および／または付加）する段階、
ｂ：段階ａで改変されたペプチドの活性を測定する段階、および
ｃ：元のペプチドと比較して同じかまたはそれよりも高い活性を有するペプチドを選択する段階。
【００８１】
好ましい態様において、本発明は、ＳＥＭＡ５Ｂ由来の断片を提示する細胞に対して特異的細胞傷害活性を有するＣＴＬを誘導するための能力を有するペプチドのスクリーニングの方法を提供し、その方法は以下の段階を含む：
（ｉ）元のアミノ酸配列に対して、１個、２個または数個のアミノ酸残基を置換、欠失、挿入および／または付加することによって改変されたアミノ酸配列からなる候補配列を提供する段階であって、元のアミノ酸配列は、配列番号：２、３、４、８、９、１０、１３、２０、４０、４１，４７および５４からなる群より選択される、段階；
（ｉｉ）ＳＥＭＡ５Ｂ以外のいかなる公知のヒト遺伝子産物由来のペプチドとも実質的に有意な相同性を有さない候補配列を選択する段階；
（ｉｉｉ）段階（ｉｉ）において選択された候補配列からなるペプチドを抗原提示細胞と接触させる段階；
（ｉｖ）段階（ｉｉｉ）の抗原提示細胞をＣＤ８陽性Ｔ細胞と接触させる段階；および
（ｖ）ＣＴＬ誘導能が、元のアミノ酸配列からなるペプチドと同じであるかもしくはそれよりも高いペプチドを特定する段階、または元のアミノ酸配列からなるペプチドと同じであるかもしくはそれよりも高いＣＴＬ誘導能を有するペプチドを特定する段階。
本明細書において、アッセイされる活性には、ＭＨＣ結合活性、およびＡＰＣまたはＣＴＬ誘導能、および細胞傷害活性が含まれ得る。好ましくは、ペプチドの活性はＣＴＬ誘導能である。
【００８２】
ＩＩＩ．ＳＥＭＡ５Ｂペプチドの調製
周知の技法を用いて、本発明のペプチドを調製することができる。例えば、組換えＤＮＡ技術または化学合成を用いて、ペプチドを合成的に調製することができる。本発明のペプチドは、個々に、または２つもしくはそれ以上のペプチドを含むより長いポリペプチドとして、合成することができる。その後ペプチドを単離、すなわち、他の天然の宿主細胞タンパク質およびそれらの断片、または他のいかなる化学物質も実質的に含まないように精製または単離することができる。
【００８３】
本発明のペプチドは、修飾によって元のペプチドの生物学的活性が損なわれない限り、糖鎖付加、側鎖酸化、またはリン酸化などの修飾を含み得る。他の例示的な修飾には、例えばペプチドの血清半減期を延長させるために用いることができる、Ｄ−アミノ酸または他のアミノ酸模倣体の組み込みが含まれる。
【００８４】
選択されたアミノ酸配列に基づいた化学合成によって、本発明のペプチドを得ることができる。例えば、該合成に採用され得る従来のペプチド合成法には、以下のものが含まれる：
（ｉ）Ｐｅｐｔｉｄｅ  Ｓｙｎｔｈｅｓｉｓ，Ｉｎｔｅｒｓｃｉｅｎｃｅ，Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ，１９６６；
（ｉｉ）Ｔｈｅ  Ｐｒｏｔｅｉｎｓ，Ｖｏｌ．２，Ａｃａｄｅｍｉｃ  Ｐｒｅｓｓ，Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ，１９７６； 
（ｉｉｉ）「ペプチド合成」（日本語）、丸善、１９７５；
（ｉｖ）「ペプチド合成の基礎と実験」（日本語）、丸善、１９８５； 
（ｖ）医薬品の開発  続第１４巻（ペプチド合成）（日本語）、広川書店、１９９１；
（ｖｉ）ＷＯ９９／６７２８８；および
（ｖｉｉ）Ｂａｒａｎｙ  Ｇ．  ＆  Ｍｅｒｒｉｆｉｅｌｄ  Ｒ．Ｂ．，Ｐｅｐｔｉｄｅｓ  Ｖｏｌ．２，"Ｓｏｌｉｄ  Ｐｈａｓｅ  Ｐｅｐｔｉｄｅ  Ｓｙｎｔｈｅｓｉｓ"，Ａｃａｄｅｍｉｃ  Ｐｒｅｓｓ，Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ，１９８０，１００−１１８。
【００８５】
あるいは、ペプチドを産生するための任意の公知の遺伝子工学的方法を採用して、本発明のペプチドを得ることもできる（例えば、Ｍｏｒｒｉｓｏｎ  Ｊ，Ｊ  Ｂａｃｔｅｒｉｏｌｏｇｙ  １９７７，１３２：３４９−５１；Ｃｌａｒｋ−Ｃｕｒｔｉｓｓ＆Ｃｕｒｔｉｓｓ，Ｍｅｔｈｏｄｓ  ｉｎ  Ｅｎｚｙｍｏｌｏｇｙ（ｅｄｓ．Ｗｕ  ｅｔ  ａｌ．）１９８３，１０１：３４７−６２）。例えば、最初に、目的のペプチドを発現可能な形態で（例えば、プロモーター配列に相当する調節配列の下流に）コードするポリヌクレオチドを有する適切なベクターを調製し、適切な宿主細胞に形質転換する。そのようなベクターおよび宿主細胞もまた、本発明によって提供される。次いで、該宿主細胞を培養して、関心対象のペプチドを産生させる。インビトロ翻訳系を採用して、ペプチドをインビトロで作製することもできる。
【００８６】
ＩＶ．ポリヌクレオチド
本発明はまた、前述の本発明のペプチドのいずれかをコードするポリヌクレオチドを提供する。これらには、天然ＳＥＭＡ５Ｂ遺伝子（ＧｅｎＢａｎｋアクセッション番号ＮＭ＿００１０３１７０２、ＮＭ＿００１２５６３４６、ＮＭ＿００１２５６３４７またはＮＭ＿００１２５６３４８（配列番号：７４、７６、７７または７９））由来のポリヌクレオチド、およびその保存的に改変されたヌクレオチド配列を有するポリヌクレオチドが含まれる。本明細書において「保存的に改変されたヌクレオチド配列」という語句は、同一のまたは本質的に同一のアミノ酸配列をコードする配列を指す。遺伝暗号の縮重のため、数多くの機能的に同一の核酸が任意の特定のタンパク質をコードする。例えば、コドンＧＣＡ、ＧＣＣ、ＧＣＧ、およびＧＣＵはすべて、アミノ酸のアラニンをコードする。したがって、あるコドンによってアラニンが指定されるあらゆる位置において、コードされるポリペプチドを変化させることなく、該コドンを、記載された対応するコドンのいずれかに変更することができる。そのような核酸の変異は「サイレント変異」であり、保存的に改変された変異の一種である。ペプチドをコードする本明細書中のあらゆる核酸配列は、該核酸のあらゆる可能なサイレント変異をも表す。核酸中の各コドン（通常メチオニンに対する唯一のコドンであるＡＵＧ、および通常トリプトファンに対する唯一のコドンであるＴＧＧを除く）を改変して、機能的に同一の分子を得ることができることを、当業者は認識するであろう。したがって、ペプチドをコードする核酸の各サイレント変異は、開示した各配列において非明示的に表されている。
【００８７】
本発明のポリヌクレオチドは、ＤＮＡ、ＲＮＡ、およびそれらの誘導体から構成され得る。当技術分野において周知の通り、ＤＮＡはＡ、Ｔ、Ｃ、およびＧなどの塩基から適切に構成され、ＲＮＡではＴはＵに置き換えられる。当業者は、非天然塩基もまたポリヌクレオチドに含まれ得ることを認識する。
【００８８】
本発明のポリヌクレオチドは、介在するアミノ酸配列を伴って、または伴わずに、本発明の複数のペプチドをコードし得る。例えば、介在するアミノ酸配列は、ポリヌクレオチドまたは翻訳されたペプチドの切断部位（例えば、酵素認識配列）を提供し得る。さらに、本発明のポリヌクレオチドは、本発明のペプチドをコードするコード配列に対する任意の付加的配列を含み得る。例えば、本発明のポリヌクレオチドは、ペプチドの発現に必要な調節配列を含む組換えポリヌクレオチドであってもよく、またはマーカー遺伝子等を有する発現ベクター（プラスミド）であってもよい。一般に、例えばポリメラーゼおよびエンドヌクレアーゼを用いる従来の組換え技法によりポリヌクレオチドを操作することによって、そのような組換えポリヌクレオチドを調製することができる。
【００８９】
組換え技法および化学合成技法のいずれを用いても、本発明のポリヌクレオチドを作製することができる。例えば、適切なベクターに挿入することによって本発明のポリヌクレオチドを作製することができ、これはコンピテント細胞にトランスフェクトした場合に発現され得る。あるいは、ＰＣＲ技法または適切な宿主内での発現を用いて、本発明のポリヌクレオチドを増幅することもできる（例えば、Ｓａｍｂｒｏｏｋ  ｅｔ  ａｌ．，Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｃｌｏｎｉｎｇ：Ａ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｍａｎｕａｌ，Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｏｒ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ，  Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ，１９８９を参照されたい）。あるいは、Ｂｅａｕｃａｇｅ  ＳＬ  ＆  Ｉｙｅｒ  ＲＰ，Ｔｅｔｒａｈｅｄｒｏｎ  １９９２，４８：２２２３−３１１；Ｍａｔｔｈｅｓ  ｅｔ  ａｌ．，ＥＭＢＯ  Ｊ  １９８４，３：８０１−５に記載されている固相技法を用いて、本発明のポリヌクレオチドを合成することもできる。
【００９０】
Ｖ．エクソソーム
本発明はさらに、本発明のペプチドとＨＬＡ抗原との間で形成される複合体を自身の表面上に提示する、エクソソームと称される細胞内小胞を提供する。エクソソームは、例えば日本特許出願特表平１１−５１０５０７号およびＷＯ９９／０３４９９に詳述されている方法を用いて調製することができ、治療および／または予防の対象となる患者から得られたＡＰＣを用いて調製することができる。本発明のエクソソームは、本発明のペプチドと同様の様式で、ワクチンとして接種することができる。
【００９１】
複合体中に含まれるＨＬＡ抗原の型は、治療および／または予防を必要とする対象のものと一致しなければならない。例えば日本人集団では、ＨＬＡ−Ａ２４、特にＨＬＡ−Ａ＊２４０２が広く一般的であり、したがってこれは日本人患者の治療に適していると考えられる。日本人および白人の間で高発現するＨＬＡ−Ａ２４型の使用は、有効な結果を得るのに好ましく、ＨＬＡ−Ａ＊２４０２のサブタイプもまた使用される。典型的には、臨床において、治療を必要とする患者のＨＬＡ抗原の型を予め調べることにより、特定の抗原に対して高レベルの結合親和性を有する、または抗原提示によるＣＴＬ誘導能を有するペプチドの適切な選択が可能となる。さらに、高い結合親和性およびＣＴＬ誘導能の両方を有するペプチドを得るために、天然のＳＥＭＡ５Ｂ部分ペプチドのアミノ酸配列に基づいて、１個、２個、または数個のアミノ酸の置換、挿入、欠失および／または付加を行うことができる。
【００９２】
本発明のエクソソームに対してＨＬＡ−Ａ２４型のＨＬＡ抗原を用いる場合、配列番号：２、３、４、８、９、１０、１３、２０、４０、４１、４７および５４の中より選択される配列を有するペプチドが特に有用である。
いくつかの態様において、本発明のエクソソームは、本発明のペプチドとＨＬＡ−Ａ２４抗原との複合体を自身の表面上に提示する。
【００９３】
ＶＩ．抗原提示細胞（ＡＰＣ）
本発明はまた、ＨＬＡ抗原と本発明のペプチドとの間で形成される複合体を自身の表面上に提示する単離された抗原提示細胞（ＡＰＣ）を提供する。ＡＰＣは、治療および／または予防の対象となる患者に由来してもよく、単独で、または本発明のペプチド、エクソソーム、もしくはＣＴＬを含む他の薬物と組み合わせて、ワクチンとして投与することができる。
【００９４】
ＡＰＣは特定の種類の細胞に限定されず、これには、リンパ球によって認識されるように自身の細胞表面上にタンパク質性抗原を提示することが知られている樹状細胞（ＤＣ）、ランゲルハンス細胞、マクロファージ、Ｂ細胞、および活性化Ｔ細胞が含まれる。ＤＣは、ＡＰＣの中で最も強力なＣＴＬ誘導活性を有する代表的なＡＰＣであるため、ＤＣは本発明のＡＰＣとして適している。
【００９５】
例えば、末梢血単球からＤＣを誘導し、次にそれらをインビトロ、エクスビボ、またはインビボで本発明のペプチドと接触させる（で刺激する）ことによって、本発明のＡＰＣを得ることができる。本発明のペプチドを対象に投与する場合、本発明のペプチドを提示するＡＰＣが該対象の体内で誘導される。したがって、本発明のＡＰＣは、本発明のペプチドを対象に投与した後、該対象からＡＰＣを回収することによって得ることができる。あるいは、本発明のＡＰＣは、対象から回収されたＡＰＣを本発明のペプチドと接触させることによって得ることもできる。
【００９６】
対象においてがんに対する免疫応答を誘導するために、本発明のＡＰＣを単独で、または本発明のペプチド、エクソソーム、もしくはＣＴＬを含む他の薬物と組み合わせて、対象に投与することができる。例えば、エクスビボ投与は以下の段階を含み得る：
ａ：第１の対象からＡＰＣを回収する段階、
ｂ：段階ａのＡＰＣを本発明のペプチドと接触させる段階、および
ｃ：段階ｂのＡＰＣを第２の対象に投与する段階。
【００９７】
第１の対象と第２の対象は同一の個体であってもよく、または異なる個体であってもよい。段階ｂによって得られるＡＰＣは、限定されないが、食道がん、ＮＳＣＬＣ、ＲＣＣおよびＳＣＬＣなどのがんを治療および／または予防するためのワクチンとして製剤化および投与することができる。
【００９８】
本発明との関連において、抗原提示細胞を誘導し得る薬学的組成物を製造するために本発明のペプチドを利用することができる。本発明はまた、抗原提示細胞を誘導するための薬学的組成物を製造するための方法または工程を提供し、該方法は、本発明のペプチドを薬学的に許容される担体とともに混合または製剤化する段階を含む。
本発明はまた、抗原提示細胞を誘導するための本発明のペプチドの使用を提供する。
【００９９】
本発明の一局面によれば、本発明のＡＰＣはＣＴＬ誘導能を有する。ＡＰＣとの関連において、「ＣＴＬ誘導能」という語句は、ＣＤ８陽性Ｔ細胞と接触した場合にＣＴＬを誘導するＡＰＣの能力を指す。さらに、「ＣＴＬ誘導能」は、ＣＴＬ活性化、ＣＴＬ増殖を誘導する、ＣＴＬによる標的細胞の溶解を促進する、およびＣＴＬによるＩＦＮ−γ産生を増強するＡＰＣの能力を含む。ＣＴＬ誘導能を有するそのようなＡＰＣは、上記の方法に加え、本発明のペプチドをコードするポリヌクレオチドをインビトロでＡＰＣに導入する段階を含む方法によって調製することができる。導入する遺伝子は、ＤＮＡまたはＲＮＡの形態であってよい。導入の方法の例には、特に限定されることなく、リポフェクション、エレクトロポレーション、およびリン酸カルシウム法などの、この分野において従来より実施されている様々な方法が含まれ、それらを使用することができる。より具体的には、Ｃａｎｃｅｒ  Ｒｅｓ  １９９６，５６：５６７２−７；Ｊ  Ｉｍｍｕｎｏｌ  １９９８，１６１：５６０７−１３；Ｊ  Ｅｘｐ  Ｍｅｄ  １９９６，１８４：４６５−７２；公表特許公報第２０００−５０９２８１号に記載されているように、それを実施することができる。遺伝子をＡＰＣに導入することによって、該遺伝子は細胞内で転写、翻訳等を受け、次いで、得られたタンパク質はＭＨＣクラスＩまたはクラスＩＩによってプロセシングされて、提示経路を経て部分ペプチドが提示される。あるいは、本発明のＡＰＣは、ＡＰＣを本発明のペプチドと単純に接触させる段階を含む方法によって調製され得る。
【０１００】
いくつかの態様において、本発明のＡＰＣは、ＨＬＡ−Ａ２４抗原と本発明のペプチドとの複合体を自身の表面上に提示する。
【０１０１】
ＶＩＩ．細胞傷害性Ｔリンパ球（ＣＴＬ）
本発明のペプチドのいずれか１種に対して誘導されたＣＴＬは、インビボでがん細胞を標的とする免疫応答を増強するため、ペプチド自体と同様の様式でワクチンとして用いることができる。したがって本発明は、本発明のペプチドのいずれか１種によって特異的に誘導または活性化された、単離されたＣＴＬを提供する。
【０１０２】
そのようなＣＴＬは、（１）本発明のペプチドを対象に投与すること、（２）対象由来のＡＰＣおよびＣＤ８陽性Ｔ細胞もしくは末梢血単核白血球をインビトロで本発明のペプチドと接触させる（で刺激する）こと、（３）ＣＤ８陽性Ｔ細胞もしくは末梢血単核白血球を、ＨＬＡ抗原と本発明のペプチドとの複合体を自身の表面上に提示するＡＰＣもしくはエクソソームとインビトロで接触させること、または（４）Ｔ細胞受容体（ＴＣＲ）サブユニットの両方をコードするポリヌクレオチド、もしくはＴＣＲサブユニットのそれぞれをコードするポリヌクレオチドをＣＤ８陽性Ｔ細胞に導入すること（そのようなサブユニットによって形成されるＴＣＲは、細胞表面上の本発明のペプチドとＨＬＡ抗原との複合体に結合することができる）、によって得ることができる。そのようなＡＰＣまたはエクソソームは上記の方法によって調製することができる。（４）の方法の詳細は、「ＶＩＩＩ．Ｔ細胞受容体（ＴＣＲ）」の章において以下に記載する。
【０１０３】
本発明のＣＴＬは、治療および／または予防の対象となる患者に由来してよく、かつ単独で投与することができ、または効果を調節する目的で本発明のペプチド、ＡＰＣもしくはエクソソームを含む他の薬物と組み合わせて投与することができる。得られたＣＴＬは、本発明のペプチド、例えば誘導に用いた同一のペプチドを提示する標的細胞に対して特異的に作用する。標的細胞は、がん細胞のようなＳＥＭＡ５Ｂを内因的に発現する細胞、またはＳＥＭＡ５Ｂ遺伝子をトランスフェクトした細胞であってよく、かつ本発明のペプチドによる刺激によって該ペプチドを細胞表面上に提示する細胞もまた、活性化されたＣＴＬの攻撃の標的として機能し得る。
【０１０４】
いくつかの態様において、本発明のＣＴＬは、ＨＬＡ−Ａ２４抗原と本発明のペプチドとの複合体を提示する細胞を認識する。ＣＴＬとの関連において、「細胞を認識する」という語句は、細胞表面上のＨＬＡ−Ａ２４抗原と本発明のペプチドとの複合体にそのＴＣＲを介して結合し、その細胞に対して特異的な細胞傷害活性を示すことを指す。本明細書において、「特異的細胞傷害活性」は、ＨＬＡ−Ａ２４抗原と本発明のペプチドとの複合体を提示する細胞に対して細胞傷害活性を示すが、他の細胞には示さないことを指す。したがって、本発明のペプチドを提示する細胞に対する特異的細胞傷害活性を示すＣＴＬは、本発明に含まれる。
【０１０５】
ＶＩＩＩ．Ｔ細胞受容体（ＴＣＲ）
本発明はまた、ＴＣＲサブユニットの両方をコードするポリヌクレオチドまたはＴＣＲサブユニットのそれぞれをコードするポリヌクレオチド（そのようなサブユニットによって形成されるＴＣＲは細胞表面上のＨＬＡ抗原と本発明のペプチドとの複合体に結合することができる）を１個または複数含む組成物を提供する。それを使用する方法もまた企図されている。そのようなＴＣＲサブユニットは、ＳＥＭＡ５Ｂを発現する腫瘍細胞に対する特異性をＴ細胞に付与するＴＣＲを形成する能力を有する。当技術分野における公知の方法を用いることにより、本発明の１種もしくは複数種のペプチドで誘導されたＣＴＬのＴＣＲサブユニットのα鎖およびβ鎖の各々をコードするポリヌクレオチドを同定することができる（国際公開公報第２００７／０３２２５５号、およびＭｏｒｇａｎ  ｅｔ  ａｌ．，Ｊ  Ｉｍｍｕｎｏｌ，１７１，３２８８（２００３））。例えば、ＴＣＲを解析するためにはＰＣＲ法が好ましい。解析のためのＰＣＲプライマーは、例えば、５'側プライマーとしての５'−Ｒプライマー（５'−ｇｔｃｔａｃｃａｇｇｃａｔｔｃｇｃｔｔｃａｔ−３'）（配列番号：７０）、および３'側プライマーとしての、ＴＣＲα鎖Ｃ領域に特異的な３−ＴＲａ−Ｃプライマー（５'−ｔｃａｇｃｔｇｇａｃｃａｃａｇｃｃｇｃａｇｃｇｔ−３'）（配列番号：７１）、ＴＣＲβ鎖Ｃ１領域に特異的な３−ＴＲｂ−Ｃ１プライマー（５'−ｔｃａｇａａａｔｃｃｔｔｔｃｔｃｔｔｇａｃ−３'）（配列番号：７２）、またはＴＣＲβ鎖Ｃ２領域に特異的な３−ＴＲβ−Ｃ２プライマー（５'−ｃｔａｇｃｃｔｃｔｇｇａａｔｃｃｔｔｔｃｔｃｔｔ−３'）（配列番号：７３）であってよいが、これらに限定されない。ＴＣＲ誘導体は、本発明のペプチドを提示する標的細胞と高い結合力で結合することができ、かつ任意で、本発明のペプチドを提示する標的細胞の効率的な殺傷をインビボおよびインビトロで媒介する。
【０１０６】
ＴＣＲサブユニットの両方をコードする１種のポリヌクレオチドまたはＴＣＲサブユニットの各々をコードする複数種のポリヌクレオチドを、適切なベクター、例えばレトロウイルスベクターに組み込むことができる。これらのベクターは当技術分野において周知である。該ポリヌクレオチドまたはそれらを有用に含むベクターを、Ｔ細胞（例えば、ＣＤ８陽性Ｔ細胞）、例えば患者由来のＴ細胞に導入することができる。有利には、本発明は、患者自身のＴ細胞（または別の哺乳動物のＴ細胞）の迅速な改変により、優れたがん細胞殺傷特性を有する改変Ｔ細胞を迅速かつ容易に作製することを可能にする容易に入手可能な組成物を提供する。
【０１０７】
本発明のペプチドに対する特異的ＴＣＲは、ＴＣＲがＴ細胞の表面上に提示された場合に、本発明のペプチドとＨＬＡ分子との複合体を特異的に認識して、本発明のペプチドとＨＬＡ抗原との複合体を提示する標的細胞に対する特異的活性をＴ細胞に付与し得るべきである。上記複合体の特異的認識は任意の公知の方法によって確認することができ、好ましい例として、ＨＬＡ分子および本発明のペプチドを用いるＨＬＡ多量体染色解析、ならびにＥＬＩＳＰＯＴアッセイが含まれる。ＥＬＩＳＰＯＴアッセイを行うことにより、細胞表面上にＴＣＲを発現するＴ細胞がそのＴＣＲによって細胞を認識すること、およびシグナルが細胞内で伝達されることを確認することができる。上述した複合体が、その複合体がＴ細胞表面上に存在する場合にそのＴ細胞に細胞傷害活性を付与することができることの確認もまた、公知の方法によって行うこともできる。好ましい方法には、例えば、クロム放出アッセイのようなＨＬＡ陽性標的細胞に対する細胞傷害活性の測定が含まれる。
【０１０８】
また、本発明は、ＴＣＲサブユニットの両方をコードするポリヌクレオチド、またはＴＣＲサブユニットのそれぞれをコードするポリヌクレオチドの形質導入によって調製されるＣＴＬを提供する。該ＴＣＲサブユニットによって形成されるＴＣＲは、ＳＥＭＡ５Ｂペプチド、例えば、ＨＬＡ−Ａ２４との関連において配列番号：２〜６９に結合することができる。
【０１０９】
形質導入されたＣＴＬは、インビボでがん細胞にホーミングすることができ、かつ周知の培養法によってインビトロで増殖させることができる（例えば、Ｋａｗａｋａｍｉ  ｅｔ  ａｌ．，Ｊ  Ｉｍｍｕｎｏｌ．，１４２，３４５２−３４６１（１９８９））。本発明のＣＴＬは、療法または防御を必要としている患者におけるがんの治療および予防のいずれかまたは両方に有用な免疫原性組成物を形成するために用いることができる（ＷＯ２００６／０３１２２１参照、その内容は参照により本明細書に組み入れられる）。
【０１１０】
ＩＸ．薬学的組成物
ＳＥＭＡ５Ｂの発現は、正常組織と比較して、食道がん、ＮＳＣＬＣ、ＲＣＣおよびＳＣＬＣを例に含むが必ずしもこれらに限定されないがんにおいて特異的に上昇するため、本発明のペプチドまたはポリヌクレオチドを、がんまたは腫瘍細胞に対する免疫応答を誘導するため、したがってがんもしくは原発性がんの治療および／もしくは予防、ならびに／またはその転移もしくは術後のその再発の予防に役立つために使用することができる。したがって、本発明は、本発明のペプチドまたはポリヌクレオチドの少なくとも１種を有効成分として含む、がんの治療および／もしくは予防のための、ならびに／またはその転移もしくは術後のその再発の予防のための製剤化された薬学的組成物または薬学的剤を提供する。あるいは、薬学的組成物または薬学的剤として使用するために、本発明のペプチドを、前述のエクソソームまたはＡＰＣなどの細胞のいずれかの表面上に発現させることができる。加えて、本発明のペプチドのいずれか１種を標的とした前述のＣＴＬもまた、本発明の薬学的組成物または薬学的剤の有効成分として使用することができる。
【０１１１】
したがって、本発明は、以下の中より選択される少なくとも１種の有効成分を含む剤または組成物を提供する：
（ａ）本発明のペプチド；
（ｂ）本明細書に開示するペプチドを発現可能な形態でコードするポリヌクレオチド；
（ｃ）本発明のＡＰＣまたはエクソソーム；および
（ｄ）本発明のＣＴＬ。
薬学的組成物または薬学的剤において、そのようなペプチド、ポリヌクレオチド、ＡＰＣおよびＣＴＬは治療的または薬学的に有効な量で存在する。
【０１１２】
本発明の薬学的組成物または薬学的剤はまた、ワクチンとしても使用される。本発明との関連において、「ワクチン」という語句（「免疫原性組成物」とも称される）は、動物に接種した際に抗腫瘍免疫を改善、増強および／または誘導する機能を有する剤または組成物を指す。換言すれば、本発明は、対象においてがんに対する免疫応答を誘導するための薬学的剤または薬学的組成物を提供する。
【０１１３】
本発明の薬学的剤または薬学的組成物は、ヒト、ならびに非限定的にマウス、ラット、モルモット、ウサギ、ネコ、イヌ、ヒツジ、ヤギ、ブタ、ウシ、ウマ、サル、ヒヒ、およびチンパンジー、特に商業的に重要な動物または家畜を含む任意の他の哺乳動物を含む対象または患者において、がんを治療および／もしくは予防するため、ならびに／またはその転移もしくは術後のその再発を予防するために用いることができる。いくつかの態様において、本発明の薬学的剤または薬学的組成物は、ＨＬＡ抗原がＨＬＡ−Ａ２４である対象への投与のために製剤化することができる。
【０１１４】
別の態様において、本発明はまた、がんもしくは腫瘍を治療および／もしくは予防する、ならびに／またはその転移もしくは術後のその再発を予防するための薬学的組成物または薬学的剤の製造における、以下の中より選択される有効成分の使用を提供する：
（ａ）本発明のペプチド；
（ｂ）本明細書に開示するペプチドを発現可能な形態でコードするポリヌクレオチド；
（ｃ）本発明のペプチドを自身の表面上に提示するＡＰＣまたはエクソソーム；および
（ｄ）本発明のＣＴＬ。
【０１１５】
あるいは、本発明はさらに、がんもしくは腫瘍の治療および／もしくは予防、ならびに／またはその転移もしくは術後のその再発の予防において使用するための、以下の中より選択される有効成分を提供する：
（ａ）本発明のペプチド；
（ｂ）本明細書に開示するペプチドを発現可能な形態でコードするポリヌクレオチド；
（ｃ）本発明のペプチドを自身の表面上に提示するＡＰＣまたはエクソソーム；および
（ｄ）本発明のＣＴＬ。
【０１１６】
あるいは、本発明はさらに、がんもしくは腫瘍を治療および／もしくは予防する、ならびに／またはその転移もしくは術後のその再発を予防するために製剤化される薬学的組成物または薬学的剤を製造するための方法または工程であって、以下の中より選択される有効成分を薬学的にまたは生理学的に許容される担体とともに製剤化する段階を含む方法または工程を提供する：
（ａ）本発明のペプチド；
（ｂ）本明細書に開示するペプチドを発現可能な形態でコードするポリヌクレオチド；
（ｃ）本発明のペプチドを自身の表面上に提示するＡＰＣまたはエクソソーム；および
（ｄ）本発明のＣＴＬ。
【０１１７】
別の態様において、本発明はまた、がんもしくは腫瘍を治療および／もしくは予防する、ならびに／またはその転移もしくは術後のその再発を予防するために製剤化される薬学的組成物または薬学的剤の製造のための方法または工程であって、以下の中より選択される有効成分と薬学的または生理学的に許容される担体とを混合する段階を含む方法または工程を提供する：
（ａ）本発明のペプチド；
（ｂ）本明細書に開示するペプチドを発現可能な形態でコードするポリヌクレオチド；
（ｃ）本発明のペプチドを自身の表面上に提示するＡＰＣまたはエクソソーム；および
（ｄ）本発明のＣＴＬ  Ｔ細胞。
【０１１８】
別の態様において、本発明はまた、がんもしくは腫瘍を治療および／もしく予防する、ならびに／またはその転移もしくは術後のその再発を予防するための方法であって、以下の中より選択される少なくとも１種の有効成分を対象に投与する段階を含む方法を提供する：
（ａ）本発明のペプチド；
（ｂ）本明細書に開示するペプチドを発現可能な形態でコードするポリヌクレオチド；
（ｃ）本発明のペプチドを自身の表面上に提示するＡＰＣまたはエクソソーム；および
（ｄ）本発明のＣＴＬ。
【０１１９】
本発明によれば、配列番号：２〜６９の中より選択されるアミノ酸配列を有するペプチドが、対象において、ＨＬＡ−Ａ２４およびＳＥＭＡ５Ｂを発現するがんに対して強力かつ特異的な免疫応答を誘導し得る候補として役立ち得るＨＬＡ−Ａ２４拘束性エピトープペプチドであることが示される。したがって、配列番号：２〜６９の中より選択されたアミノ酸配列を有するこれらのペプチドのいずれかを含む薬学的組成物または薬学的剤は、ＨＬＡ抗原がＨＬＡ−Ａ２４である対象への投与のために特に適している。そのような剤もしくは組成物におけるペプチドの量は、ＳＥＭＡ５Ｂを発現するがんを有する対象において強力かつ特異的な免疫学的応答を十分に誘導するのに効果的な量でありうる。
同じことが、これらのペプチドのいずれかをコードするポリヌクレオチド（すなわち、本発明のポリヌクレオチド）を含む薬学的組成物または薬学的剤にも当てはまる。
【０１２０】
本発明の薬学的組成物または薬学的剤により治療および／または予防することができるがんは限定されず、ＳＥＭＡ５Ｂが関与する全ての種類のがんを含み、それらの例には、食道がん、ＮＳＣＬＣ、ＲＣＣおよびＳＣＬＣが含まれるがこれらに限定されない。
【０１２１】
本発明の薬学的組成物または薬学的剤は、前述の有効成分に加えて、がん性細胞に対するＣＴＬを誘導する能力を有する他のペプチド、該他のペプチドをコードする他のポリヌクレオチド、該他のペプチドを提示する他の細胞等を含み得る。がん性細胞に対するＣＴＬを誘導する能力を有する、そのような「他の」ペプチドの例には、限定はされないが、がん特異的抗原（例えば、同定されたＴＡＡ）由来のペプチドが含まれる。
【０１２２】
必要に応じて、本発明の薬学的組成物または薬学的剤は、他の治療物質が、本発明の有効成分、例えば本発明のペプチド、ポリヌクレオチド、エクソソーム、ＡＰＣ、ＣＴＬの抗腫瘍効果を阻害しない限り、有効成分としてそのような他の治療物質を任意に含み得る。例えば、製剤は、抗炎症物質、鎮痛剤、化学療法薬等を含み得る。医薬自体に他の治療物質を含めることに加えて、本発明の医薬を、１つまたは複数の他の薬理学的組成物と連続してまたは同時に投与することもできる。医薬および薬理学的組成物の量は、例えば、使用する薬理学的組成物の種類、治療する疾患、ならびに投与のスケジュールおよび経路に依存する。
【０１２３】
当業者は、本明細書で特に言及する成分に加えて、本発明の薬学的組成物または薬学的剤が、対象となる製剤の種類を考慮した上で、当技術分野において慣例的な他の物質を含み得ることを認識するであろう。
【０１２４】
本発明の１つの態様において、本発明の薬学的組成物または薬学的剤を、例えばがんなどの治療されるべき疾患の病態を治療するのに有用な材料を含む製品およびキット中に包装することができる。該製品は、ラベルを有する本発明の薬学的組成物または薬学的剤のいずれかの容器を含み得る。適切な容器には、ボトル、バイアル、および試験管が含まれる。該容器は、ガラスまたはプラスチックなどの様々な材料から形成され得る。容器上のラベルには、組成物または剤が、疾患の１つまたは複数の状態の治療または予防のために用いられることが示されるべきである。ラベルはまた、投与等に関する指示も示し得る。
【０１２５】
本発明の薬学的組成物または薬学的剤を含むキットは、上記の容器に加えて、任意で、薬学的に許容される希釈剤を収容した第２の容器をさらに含み得る。それは、他の緩衝液、希釈剤、フィルター、注射針、シリンジ、および使用説明を記載した添付文書を含む、商業上の観点および使用者の観点から望ましい他の材料をさらに含み得る。
【０１２６】
必要に応じて、有効成分を含む１個または複数個の単位剤形を含み得るパックまたはディスペンサー装置に、本発明の薬学的な組成物または剤を包装することができる。該パックは、例えば、ブリスターパックのように金属ホイルまたはプラスチックホイルを含み得る。パックまたはディスペンサー装置には、投与に関する説明書が添付され得る。
【０１２７】
（１）有効成分としてペプチドを含む薬学的組成物：
本発明のペプチドは、薬学的組成物または薬学的剤として直接投与してもよく、または必要であれば、従来の製剤化法によって製剤化してもよい。後者の場合、本発明のペプチドに加えて、薬物に通常用いられる担体、賦形剤等が特に制限なく必要に応じて含まれ得る。そのような担体の例には、滅菌水、生理食塩水、リン酸緩衝液、培養液等が含まれるがこれらに限定されない。さらに、本発明の薬学的組成物または薬学的剤は、必要に応じて、安定剤、懸濁液、保存剤、界面活性剤等を含み得る。本発明の薬学的組成物または薬学的剤は、抗がん目的に用いることができる。
【０１２８】
インビボでＣＴＬを誘導するために、本発明のペプチドを、本発明のペプチドの２つまたはそれ以上を含む組み合わせとして調製することができる。ペプチドは、カクテルであってもよく、または標準的な技法を用いて互いに結合させてもよい。例えば、ペプチドを化学的に連結させてもよく、または単一の融合ポリペプチドとして発現させてもよい。組み合わせにおけるペプチドは、同一であってもよく、または異なっていてもよい。本発明のペプチドを投与することにより、ペプチドはＨＬＡ抗原によってＡＰＣ上に高密度で提示され、次いで、提示されたペプチドとＨＬＡ抗原との間で形成される複合体に対して特異的に反応するＣＴＬが誘導される。あるいは、ＡＰＣ（例えば、ＤＣ）を対象から取り出し、続いて本発明のペプチドで刺激して、本発明のペプチドのいずれかを自身の細胞表面上に提示するＡＰＣを得てもよい。これらのＡＰＣは、対象においてＣＴＬを誘導するために対象に再び投与することができ、結果として、腫瘍関連内皮に対する攻撃性を増大させることができる。
【０１２９】
有効成分として本発明のいずれかのペプチドを含む、がんの治療および／または予防のための薬学的組成物または薬学的剤は、細胞性免疫を効率的に確立するようにアジュバントもまた含み得る。あるいは、本発明の薬学的組成物または薬学的剤は、他の有効成分と共に投与してもよく、または顆粒内へ製剤化することによって投与してもよい。アジュバントとは、免疫学的活性を有するタンパク質と共に（または連続して）投与した場合に、該タンパク質に対する免疫応答を増強するいかなる化合物、物質または組成物をも指す。本明細書において企図されるアジュバントには、文献（Ｃｌｉｎ  Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌ  Ｒｅｖ  １９９４，７：２７７−８９）に記載されているものが含まれる。適切なアジュバントの例には、リン酸アルミニウム、水酸化アルミニウム、ミョウバン、コレラ毒素、サルモネラ毒素、ＩＦＡ（不完全フロイントアジュバント）、ＣＦＡ（完全フロイントアジュバント）、ＩＳＣＯＭａｔｒｉｘ、ＧＭ−ＣＳＦ、ＣｐＧ、Ｏ／Ｗエマルジョン等が含まれるが、これらに限定されない。
さらに、リポソーム製剤、直径数マイクロメートルのビーズにペプチドが結合している顆粒製剤、およびペプチドに脂質が結合している製剤を好都合に用いてもよい。
【０１３０】
別の態様において、本発明のペプチドはまた、薬学的に許容される塩の形態で投与してもよい。好ましい塩の例には、アルカリ金属との塩、金属との塩、有機塩基との塩、アミンとの塩、有機酸（例えば、酢酸、ギ酸、プロピオン酸、フマル酸、マレイン酸、コハク酸、酒石酸、クエン酸、リンゴ酸、シュウ酸、安息香酸、メタンスルホン酸など）との塩、および、無機酸（例えば、塩酸、リン酸、臭化水素酸、硫酸、硝酸など）との塩が含まれるがこれらに限定されない。本明細書で使用される「薬学的に許容される塩」という語句は、その化合物の生物学的な有効性および特性を保持し、かつ、塩酸、臭化水素酸、硫酸、硝酸、リン酸、メタンスルホン酸、エタンスルホン酸、ｐ−トルエンスルホン酸、サリチル酸などの無機または有機の酸または塩基との反応によって得られる塩を指す。
【０１３１】
いくつかの態様において、本発明の薬学的組成物または薬学的剤は、ＣＴＬを刺激する（ｐｒｉｍｅ）成分をさらに含み得る。脂質は、ウイルス抗原に対してインビボでＣＴＬを刺激し得る組成物として同定されている。例えば、パルミチン酸残基をリジン残基のεアミノ基およびαアミノ基に付着させ、次に本発明のペプチドに連結させることができる。次いで、脂質付加したペプチドを、ミセルもしくは粒子の状態で直接投与するか、リポソーム中に取り込ませて投与するか、またはアジュバント中に乳化させて投与することができる。脂質の他の例として、適切なペプチドに共有結合している場合、トリパルミトイル−Ｓ−グリセリルシステイニル−セリル−セリン（Ｐ３ＣＳＳ）などの大腸菌（Ｅ．ｃｏｌｉ）リポタンパク質を用いてＣＴＬを刺激することができる（例えば、Ｄｅｒｅｓ  ｅｔ  ａｌ．，  Ｎａｔｕｒｅ  １９８９，３４２：５６１−４を参照されたい）。
【０１３２】
適切な投与方法の例としては、必ずしも限定はされないが、経口、皮内、皮下、筋肉内、骨内、腹膜および静脈内注射等、ならびに全身投与または標的部位の近傍への局所投与（例えば直接注射）が含まれる。投与は、単回投与によって行うこともできるし、または複数回投与によってブーストすることもできる。ペプチドの、薬学的または治療的に効果的な量を、ＳＥＭＡ５Ｂを発現するがんの治療を必要としている対象において投与することができる。または、ＳＥＭＡ５Ｂを発現するがんまたは腫瘍に対するＣＴＬを誘導するために十分な本発明のペプチドの量が、ＳＥＭＡ５Ｂを発現しているがんを保持している対象に投与可能である。本発明のペプチドの用量は、治療される疾患、患者の年齢、体重、投与方法等に応じて適宜調整することができ、これは通常０．００１ｍｇ〜１０００ｍｇ、例えば０．０１ｍｇ〜１００ｍｇ、例えば０．１ｍｇ〜１０ｍｇ、例えば０．５ｍｇ〜５ｍｇであり、数日〜数ヶ月に１度、例えば１週間に１度投与することができる。当業者は、適切かつ最適な用量を容易に決定することができる。
【０１３３】
（２）有効成分としてポリヌクレオチドを含む薬学的組成物：
本発明の薬学的組成物または薬学的剤はまた、本明細書に開示するペプチドを発現可能な形態でコードする核酸を含み得る。本明細書において、「発現可能な形態で」という語句は、ポリヌクレオチドが、細胞に導入された場合に、抗腫瘍免疫を誘導するポリペプチドとしてインビボで発現することを意味する。例示的態様において、関心対象のポリヌクレオチドの核酸配列は、該ポリヌクレオチドの発現に必要な調節エレメントを含む。ポリヌクレオチドには、標的細胞のゲノムへの安定した挿入が達成されるように、必要なものを備えさせることができる（相同組換えカセットベクターの説明に関しては、例えばＴｈｏｍａｓ  ＫＲ＆Ｃａｐｅｃｃｈｉ  ＭＲ，Ｃｅｌｌ  １９８７，５１：５０３−１２を参照されたい）。例えば、Ｗｏｌｆｆ  ｅｔ  ａｌ．，Ｓｃｉｅｎｃｅ  １９９０，２４７：１４６５−８；米国特許第５，５８０，８５９号；第５，５８９，４６６号；第５，８０４，５６６号；第５，７３９，１１８号；第５，７３６，５２４号；第５，６７９，６４７号；およびＷＯ９８／０４７２０を参照されたい。ＤＮＡに基づく送達技術の例には、「裸のＤＮＡ」、促進された（ブピバカイン、ポリマー、ペプチド媒介性）送達、カチオン性脂質複合体、および粒子媒介性（「遺伝子銃」）または圧力媒介性の送達が含まれる（例えば、米国特許第５，９２２，６８７号を参照されたい）。
【０１３４】
ウイルスベクターまたは細菌ベクターによって、本発明のペプチドを発現させることもできる。発現ベクターの例には、ワクシニアウイルスまたは鶏痘ウイルスなどの弱毒化ウイルス宿主が含まれる。このアプローチは、例えば、ペプチドをコードするヌクレオチド配列を発現させるためのベクターとして、ワクシニアウイルスの使用を伴う。宿主に導入すると、組換えワクシニアウイルスは免疫原性ペプチドを発現し、それによって免疫応答を誘発する。免疫化プロトコールに有用なワクシニアベクターおよび方法は、例えば米国特許第４，７２２，８４８号に記載されている。別のベクターはＢＣＧ（カルメット・ゲラン桿菌）である。ＢＣＧベクターは、Ｓｔｏｖｅｒ  ｅｔ  ａｌ．，Ｎａｔｕｒｅ  １９９１，３５１：４５６−６０に記載されている。治療的な投与または免疫化に有用である多種多様な他のベクター、例えばアデノウイルスベクターおよびアデノ随伴ウイルスベクター、レトロウイルスベクター、チフス菌（Ｓａｌｍｏｎｅｌｌａ  ｔｙｐｈｉ）ベクター、無毒化炭疽毒素ベクター等が明らかである。例えば、Ｓｈａｔａ  ｅｔ  ａｌ．，Ｍｏｌ  Ｍｅｄ  Ｔｏｄａｙ  ２０００，６：６６−７１；Ｓｈｅｄｌｏｃｋ  ｅｔ  ａｌ．，Ｊ  Ｌｅｕｋｏｃ  Ｂｉｏｌ  ２０００，６８： ７９３−８０６；Ｈｉｐｐ  ｅｔ  ａｌ．，Ｉｎ  Ｖｉｖｏ  ２０００，１４：５７１−８５を参照されたい。
【０１３５】
ポリヌクレオチドの患者内への送達は、直接的であってもよく、この場合にはポリヌクレオチドを保有するベクターに患者を直接曝露し、または間接的であってもよく、この場合にはまずインビトロで細胞を関心対象のポリヌクレオチドで形質転換し、次いで該細胞を患者内に移植する。これら２つのアプローチはそれぞれ、インビボおよびエクスビボの遺伝子治療として公知である。
【０１３６】
遺伝子治療の方法の一般的な総説に関しては、Ｇｏｌｄｓｐｉｅｌ  ｅｔ  ａｌ．，Ｃｌｉｎｉｃａｌ  Ｐｈａｒｍａｃｙ  １９９３，１２：４８８−５０５；Ｗｕ  ａｎｄ  Ｗｕ，Ｂｉｏｔｈｅｒａｐｙ  １９９１，３：８７−９５；Ｔｏｌｓｔｏｓｈｅｖ，
Ａｎｎ  Ｒｅｖ  Ｐｈａｒｍａｃｏｌ  Ｔｏｘｉｃｏｌ  １９９３，３３：５７３−９６；Ｍｕｌｌｉｇａｎ，Ｓｃｉｅｎｃｅ  １９９３，２６０：９２６−３２；Ｍｏｒｇａｎ＆Ａｎｄｅｒｓｏｎ，Ａｎｎ  Ｒｅｖ  Ｂｉｏｃｈｅｍ  １９９３，６２：１９１−２１７；Ｔｒｅｎｄｓ  ｉｎ  Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ  １９９３，１１（５）：１５５−２１５を参照されたい。本発明に適用可能な、組換えＤＮＡ技術の分野において一般に公知の方法は、Ａｕｓｕｂｅｌ  ｅｔ  ａｌ．のＣｕｒｒｅｎｔ  Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ  ｉｎ  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｂｉｏｌｏｇｙ（Jｏｈｎ  Ｗｉｌｅｙ＆Ｓｏｎｓ，ＮＹ，１９９３）；およびＫｒｉｅｇｅｒのＧｅｎｅ  Ｔｒａｎｓｆｅｒ  ａｎｄ  Ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ，Ａ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｍａｎｕａｌ（Ｓｔｏｃｋｔｏｎ  Ｐｒｅｓｓ，ＮＹ，１９９０）に記載されている。
【０１３７】
ペプチドの投与と同様に、ポリヌクレオチドの投与は、経口、皮内、皮下、静脈内、筋肉内、骨内、および／または腹膜注射等で実施でき、かつ、全身投与または標的部位の近傍への局所投与（例えば直接注射）で実施できる。投与は、単回投与によって行うこともでき、または複数回投与によってブーストすることもできる。ポリヌクレオチドの、薬学的または治療的に効果的な量を、ＳＥＭＡ５Ｂを発現するがんの治療を必要としている対象に投与することができる。あるいは、ＳＥＭＡ５Ｂを発現するがんあるいは腫瘍に対するＣＴＬを誘導するために十分な本発明のポリヌクレオチドの量が、ＳＥＭＡ５Ｂを発現しているがんを保持している対象に投与可能である。適切な担体もしくは本発明のペプチドをコードしたポリヌクレオチドで形質転換された細胞におけるポリヌクレオチドの用量は、治療される疾患、患者の年齢、体重、投与方法等に応じて適宜調整することができ、これは通常０．００１ｍｇ〜１０００ｍｇ、例えば０．０１ｍｇ〜１００ｍｇ、例えば０．１ｍｇ〜１０ｍｇ、例えば０．５ｍｇ〜５ｍｇであり、数日に１度〜数ヶ月に１度、たとえば１週間に１度投与することができる。当業者は、適切かつ最適な用量を容易に決定することができる。
【０１３８】
Ｘ．ペプチド、エクソソーム、ＡＰＣ、およびＣＴＬを用いる方法
本発明のペプチドおよびポリヌクレオチドは、ＡＰＣおよびＣＴＬを調製または誘導するために使用可能である。本発明のエクソソームおよびＡＰＣもまた、ＣＴＬを調製または誘導するために使用可能である。ペプチド、ポリヌクレオチド、エクソソームおよびＡＰＣは、それらのＣＴＬ誘導能を他の化合物が阻害しない限り、該他の化合物と組み合わせて用いることができる。したがって、前述の本発明の薬学的組成物または薬学的剤のいずれかを用いてＣＴＬを調製または誘導することができる。それに加えて、前記ペプチドおよびポリヌクレオチドを含むものを用いて、以下に説明するように、ＡＰＣを調製または誘導することもできる。
【０１３９】
（１）抗原提示細胞（ＡＰＣ）を誘導する方法
本発明は、本発明のペプチドまたはポリヌクレオチドを用いて、ＣＴＬ誘導能を有するＡＰＣを誘導する方法を提供する。
本発明の方法は、ＡＰＣを本発明のペプチドとインビトロ、エクスビボ、またはインビボで接触させる段階を含む。例えば、ＡＰＣを該ペプチドとエクスビボで接触させる方法は、以下の段階を含み得る：
ａ：対象からＡＰＣを回収する段階、および
ｂ：段階ａのＡＰＣをペプチドと接触させる段階。
【０１４０】
ＡＰＣは特定の種類の細胞に限定されず、リンパ球によって認識されるように自身の細胞表面上にタンパク質性抗原を提示することが知られているＤＣ、ランゲルハンス細胞、マクロファージ、Ｂ細胞、および活性化Ｔ細胞を含む。ＡＰＣの中で最も強力なＣＴＬ誘導能を有することから、好ましくはＤＣを用いることができる。本発明のペプチドのいずれか１種を、単独で、あるいは本発明の１種もしくは複数種の他のペプチドおよび／またはＳＥＭＡ５Ｂ以外のＴＡＡ由来の１種もしくは複数種のＣＴＬ誘導性ペプチドと組み合わせて用いることができる。
【０１４１】
一方、本発明のペプチドを対象に投与すると、ＡＰＣは、ペプチドとインビボで接触し、その結果、ＣＴＬ誘導能を有するＡＰＣが対象の体内で誘導される。したがって、本発明の方法は、対象の体内においてＣＴＬ誘導能を有するＡＰＣを誘導するために本発明のペプチドを対象に投与する段階を含み得る。同様に、本発明のポリヌクレオチドを発現可能な形態で対象に投与すると、本発明のペプチドがインビボで発現してＡＰＣと接触し、その結果、ＣＴＬ誘導能を有するＡＰＣが対象の体内で誘導される。したがって、本発明の方法は、対象の体内においてＣＴＬ誘導能を有するＡＰＣを誘導するために本発明のポリヌクレオチドを対象に投与する段階を含み得る。「発現可能な形態」という語句は、「ＩＸ．薬学的組成物（２）有効成分としてポリヌクレオチドを含む薬学的組成物」の章に上述されている。
【０１４２】
さらに、本発明の方法は、本発明のポリヌクレオチドをＡＰＣに導入してＣＴＬ誘導能を有するＡＰＣを誘導する段階を含み得る。例えば、方法は以下の段階を含み得る：
ａ：対象からＡＰＣを回収する段階、および
ｂ：本発明のペプチドをコードするポリヌクレオチドを段階ａにおいて回収されたＡＰＣに導入する段階。
段階ｂは、「ＶＩ．抗原提示細胞」の章に上述したように行うことができる。
【０１４３】
あるいは、本発明の方法は、以下の段階のうちの１つを介して、ＳＥＭＡ５Ｂに対して細胞傷害活性を示すＣＴＬを特異的に誘導する抗原提示細胞（ＡＰＣ）を調製する段階を含み得る：
（ａ）ＡＰＣを、本発明のペプチドとインビトロ、エクスビボ、またはインビボで接触させる段階；および
（ｂ）本発明のペプチドをコードするポリヌクレオチドをＡＰＣに導入する段階。
【０１４４】
あるいは、本発明の方法は、ＣＴＬ誘導能を有するＡＰＣを誘導する段階を含み得、そのような方法は以下の中から選択された段階を含む：
（ａ）ＡＰＣを本発明のペプチドと接触させる段階；および
（ｂ）本発明のペプチドをコードするポリヌクレオチドをＡＰＣに導入する段階。
【０１４５】
本発明の方法は、インビトロ、エクスビボまたはインビボで実施することができる。好ましくは、本発明の方法は、インビトロまたはエクスビボで実施することができる。ＣＴＬ誘導能を有するＡＰＣの誘導に使用するＡＰＣは、好ましくは、ＨＬＡ−Ａ２４抗原を発現するＡＰＣであってよい。そのようなＡＰＣは、ＨＬＡ抗原がＨＬＡ−Ａ２４である対象から得られた末梢血単核細胞（ＰＢＭＣ）から当技術分野において周知の方法によって調製することができる。本発明の方法によって誘導したＡＰＣは、本発明のペプチドとＨＬＡ抗原（ＨＬＡ−Ａ２４抗原）との複合体を自身の表面上に提示するＡＰＣであってよい。対象においてがんに対する免疫応答を誘導するために本発明の方法によって誘導したＡＰＣを対象に投与する場合、対象は、好ましくは、ＡＰＣが由来する同一の対象である。しかしながら、対象は、該対象がＡＰＣドナーと同一のＨＬＡ型を有する限り、ＡＰＣドナーと異なる対象でもよい。
【０１４６】
別の態様において、本発明は、ＣＴＬ誘導能を有するＡＰＣの誘導に使用するための剤または組成物を提供し、そのような剤または組成物は、本発明の１種または複数種のペプチドまたはポリヌクレオチドを含む。
別の態様において、本発明は、ＡＰＣを誘導するために製剤化される剤または組成物の製造における、本発明のペプチドまたは該ペプチドをコードするポリヌクレオチドの使用を提供する。
あるいは本発明は、ＣＴＬ誘導能を有するＡＰＣの誘導に使用するための本発明のペプチドまたは該ペプチドをコードするポリペプチドをさらに提供する。
【０１４７】
（２）ＣＴＬを誘導する方法
本発明はまた、本発明のペプチド、ポリヌクレオチド、またはエクソソームもしくはＡＰＣを用いてＣＴＬを誘導するための方法を提供する。
本発明はまた、ＴＣＲサブユニットの両方をコードするポリヌクレオチド、またはＴＣＲサブユニットのそれぞれをコードするポリヌクレオチド（そのようなサブユニットによって形成されるＴＣＲは細胞表面上の本発明のペプチドとＨＬＡ抗原との複合体を認識する（に結合する）ことができる）を使用してＣＴＬを誘導するための方法を提供する。好ましくは、ＣＴＬを誘導するための方法は、以下の中より選択される少なくとも１つの段階を含み得る：
ａ：ＣＤ８陽性Ｔ細胞を、ＨＬＡ抗原と本発明のペプチドとの複合体を自身の表面上に提示する抗原提示細胞と接触させる段階
ｂ：ＣＤ８陽性Ｔ細胞を、ＨＬＡ抗原と本発明のペプチドとの複合体を自身の表面上に提示するエクソソームと接触させる段階；および
ｃ：ＴＣＲサブユニットの両方をコードするポリヌクレオチド、またはＴＣＲサブユニットのそれぞれをコードするポリヌクレオチド（そのようなサブユニットによって形成されるＴＣＲは、細胞表面上の本発明のペプチドとＨＬＡ抗原との複合体を認識する（に結合する）ことができる）を、ＣＤ８陽性Ｔ細胞に導入する段階。
【０１４８】
本発明のペプチド、ポリヌクレオチド、ＡＰＣ、またはエクソソームを対象に投与すると、該対象の体内でＣＴＬが誘導され、ＳＥＭＡ５Ｂを発現するがん細胞を標的とする免疫応答の強度が増強される。したがって本発明の方法は、本発明のペプチド、ポリヌクレオチド、ＡＰＣ、またはエクソソームを対象に投与する段階を含み得る。
【０１４９】
あるいはＣＴＬは、それらをエクスビボまたはインビトロで用いることによって誘導することもでき、ＣＴＬを誘導した後、活性化ＣＴＬを対象に戻すことができる。例えば、方法は以下の段階を含み得る：
ａ：対象からＡＰＣを回収する段階、
ｂ：段階ａのＡＰＣを本発明のペプチドと接触させる段階、および
ｃ：段階ｂのＡＰＣをＣＤ８陽性Ｔ細胞と共培養する段階。
【０１５０】
上記の段階ｃにおいてＣＤ８陽性Ｔ細胞と共培養するＡＰＣは、「ＶＩ．抗原提示細胞」の章に上述したように、本発明のポリヌクレオチドをＡＰＣに導入することによって調製することもできるが、本発明はこれに限定されず、したがってＨＬＡ抗原と本発明のペプチドとの複合体を自身の表面上に効果的に提示する任意のＡＰＣを包含する。
【０１５１】
前述のＡＰＣの代わりに、ＨＬＡ抗原と本発明のペプチドとの複合体を自身の表面上に提示するエクソソームを任意に利用し得る。すなわち、本発明は、ＨＬＡ抗原と本発明のペプチドとの複合体を自身の表面上に提示するエクソソームおよびＣＤ８陽性Ｔ細胞を共培養する段階を含み得る。そのようなエクソソームは、「Ｖ．エクソソーム」の章に上述した方法によって調製することができる。本発明の方法において適切なＡＰＣおよびエクソソームは、本発明のペプチドとＨＬＡ−Ａ２４との複合体を自身の表面上に提示する。
【０１５２】
さらに、ＣＴＬは、ＴＣＲサブユニットの両方をコードするポリヌクレオチド、またはＴＣＲサブユニットのそれぞれをコードするポリヌクレオチド（そのようなサブユニットによって形成されるＴＣＲは、細胞表面上の本発明のペプチドとＨＬＡ抗原との複合体に結合することができる）を、ＣＤ８陽性Ｔ細胞に導入することによって誘導することができる。そのような形質導入は、「ＶＩＩＩ．Ｔ細胞受容体（ＴＣＲ）」の章に上述したように行うことができる。
【０１５３】
本発明の方法は、インビトロ、エクスビボまたはインビボで実施することができる。好ましくは、本発明の方法は、インビトロまたはエクスビボで実施することができる。ＣＴＬの誘導に用いるＣＤ８陽性Ｔ細胞は、対象から得たＰＢＭＣから当技術分野において周知の方法によって調製することができる。好ましい態様において、ＣＤ８陽性Ｔ細胞のためのドナーは、ＨＬＡ抗原がＨＬＡ−Ａ２４である対象であってよい。本発明の方法によって誘導したＣＴＬは、本発明のペプチドとＨＬＡ抗原との複合体を自身の表面上に提示する細胞を認識し得るＣＴＬであってよい。そのようなＣＴＬは、本発明のペプチドをその表面上に提示する細胞に対して特異的細胞傷害活性を示すことができ、したがってＳＥＭＡ５Ｂを発現する細胞（例えばがん細胞）に対して特異的細胞傷害活性を示すことができる。対象においてがんに対する免疫応答を誘導するために本発明の方法によって誘導したＣＴＬを対象に投与する場合、対象は、好ましくは、ＣＤ８陽性Ｔ細胞が由来する同一の対象である。しかしながら、対象は、対象がＣＤ８陽性Ｔ細胞ドナーと同一のＨＬＡ型を有する限り、ＣＤ８陽性Ｔ細胞ドナーと異なる対象でもよい。
【０１５４】
加えて、本発明は、ＣＴＬを誘導するための薬学的組成物または薬学的剤を製造するための方法または工程であって、本発明のペプチドを薬学的に許容される担体とともに混合または製剤化する段階を含む方法または工程を提供する。
【０１５５】
別の態様において、本発明は、ＣＴＬを誘導するための剤または組成物であって、本発明の１種もしくは複数種のペプチド、１種もしくは複数種のポリヌクレオチド、１種もしくは複数種のＡＰＣ、および／または１種もしくは複数種のエクソソームを含む剤または組成物を提供する。
別の態様において、本発明は、ＣＴＬの誘導のために製剤化される剤または組成物の製造における、本発明のペプチド、ポリヌクレオチド、ＡＰＣまたはエクソソームの使用を提供する。
あるいは本発明は、ＣＴＬの誘導に用いられる本発明のペプチド、ポリヌクレオチド、ＡＰＣまたはエクソソームをさらに提供する。
【０１５６】
ＸＩ．免疫応答を誘導する方法
さらに本発明は、ＳＥＭＡ５Ｂに関連する疾患に対して免疫応答を誘導する方法を提供する。疾患には、がんが含まれ、その例には食道がん、ＮＳＣＬＣ、ＲＣＣおよびＳＣＬＣが含まれるが、これらに限定されない。
本発明の方法は、本発明のペプチドのいずれかまたはそれらをコードするポリヌクレオチドのいずれかを含む剤または組成物を投与する段階を含み得る。本発明の方法はまた、本発明のペプチドのいずれかを提示するエクソソームまたはＡＰＣの投与も企図する。詳細については、「ＩＸ．薬学的組成物」の項、特に本発明の薬学的組成物のワクチンとしての使用について記載している部分を参照されたい。加えて、免疫応答を誘導するために本発明の方法に使用することができるエクソソームおよびＡＰＣは、上記「Ｖ．エクソソーム」、「ＶＩ．抗原提示細胞（ＡＰＣ）」、ならびに「Ｘ．ペプチド、エクソソーム、ＡＰＣ、およびＣＴＬを用いる方法」の（１）および（２）の項において詳述している。
【０１５７】
本発明はまた、がんに対する免疫応答を誘導するための薬学的組成物または薬学的剤を製造するための方法または工程であって、本発明のペプチドを薬学的に許容される担体とともに混合または製剤化する段階を含み得る方法を提供する。
【０１５８】
あるいは、本発明の方法は、以下を含む本発明のワクチンまたは薬学的組成物もしくは薬学的剤を投与する段階を含み得る：
（ａ）本発明のペプチド；
（ｂ）本明細書に開示するペプチドを発現可能な形態でコードするポリヌクレオチド；
（ｃ）本発明のペプチドを自身の表面上に提示するＡＰＣ；
（ｄ）本発明のペプチドを自身の表面上に提示するエクソソーム；または
（ｅ）本発明のＣＴＬ。
【０１５９】
本発明との関連において、ＳＥＭＡ５Ｂを過剰発現するがんをこれらの有効成分で治療することができる。そのようながんの例には、食道がん、ＮＳＣＬＣ、ＲＣＣおよびＳＣＬＣが含まれるが、これらに限定されない。したがって、前述の有効成分のいずれかを含むワクチンまたは薬学的組成物もしくは薬学的剤を投与する前に、治療すべき対象から回収したがん性細胞または組織において、ＳＥＭＡ５Ｂの発現レベルが、同じ対象から回収した正常な細胞または組織と比較して上昇しているかどうかを確認することが好ましい。したがって１つの態様において、本発明は、ＳＥＭＡ５Ｂを（過剰）発現するがんの治療が必要とされる患者においてＳＥＭＡ５Ｂを（過剰）発現するがんを治療するための方法であって、以下の段階を含む方法を提供する：
ｉ）治療すべきがんを有する対象から得られた生物学的試料中のＳＥＭＡ５Ｂの発現レベルを決定する段階；
ｉｉ）ＳＥＭＡ５Ｂの発現レベルを正常対照と比較する段階；および
ｉｉｉ）上記の（ａ）〜（ｅ）の中より選択される少なくとも１つの成分を、正常対照と比較してＳＥＭＡ５Ｂを過剰発現するがんを有する対象に投与する段階。
【０１６０】
あるいは本発明は、ＳＥＭＡ５Ｂを過剰発現するがんを有する対象へ投与することができる、上記の（ａ）〜（ｅ）の中より選択される少なくとも１つの成分を含むワクチンまたは薬学的組成物を提供する。換言すれば、本発明はさらに、本発明のペプチドで治療すべき対象を同定するための方法であって、対象由来の生物学的試料中のＳＥＭＡ５Ｂの発現レベルを決定する段階を含み、発現レベルが、該遺伝子の正常対照レベルと比較して上昇していることにより、該対象が本発明のペプチドで治療され得るがんを有し得ることが示される方法を提供する。本発明のがんを治療する方法は、以下にさらに詳述される。
【０１６１】
ＳＥＭＡ５Ｂの転写産物または翻訳産物を含みうる限り、対象由来の任意の細胞または組織をＳＥＭＡ５Ｂ発現レベルの測定に使用することができる。適切な試料の例には、身体組織、ならびに血液、痰、および尿などの体液が含まれるが、これらに限定されない。好ましくは、対象由来の細胞または組織試料は、上皮細胞、より好ましくはがん性上皮細胞、またはがん性組織に由来する上皮細胞を含む細胞集団を含む。さらに、必要に応じて、得られた身体組織および体液から細胞を精製し、その後これを対象由来試料として用いてもよい。
【０１６２】
本発明の方法によって治療すべき対象は、好ましくは哺乳動物である。例示的な哺乳動物には、例えばヒト、非ヒト霊長類、マウス、ラット、イヌ、ネコ、ウマ、およびウシが含まれるが、これらに限定されない。
【０１６３】
本発明によれば、対象から得られた生物学的試料中のＳＥＭＡ５Ｂの発現レベルを決定することができる。ＳＥＭＡ５Ｂの発現レベルは、当技術分野で公知の方法を用いて、転写（核酸）産物レベルで決定することができる。例えば、ＳＥＭＡ５ＢのｍＲＮＡを、ハイブリダイゼーション法（例えば、ノーザンハイブリダイゼーション）によってプローブを用いて定量することができる。検出は、チップまたはアレイにおいて行うことができる。アレイの使用は、ＳＥＭＡ５Ｂの発現レベルを検出するのに好ましい。当業者は、ＳＥＭＡ５Ｂの配列情報を利用して、そのようなプローブを調製することができる。例えば、ＳＥＭＡ５ＢのｃＤＮＡをプローブとして用いることができる。必要に応じて、プローブを、色素、蛍光物質、および同位体などの適切な標識で標識してもよく、ＳＥＭＡ５Ｂの発現レベルを、ハイブリダイズした標識の強度として検出してもよい。
【０１６４】
さらに、増幅に基づく検出法（例えば、ＲＴ−ＰＣＲ）によりプライマーを用いて、ＳＥＭＡ５Ｂの転写産物を定量してもよい。そのようなプライマーは、ＳＥＭＡ５Ｂの入手可能な配列情報に基づいて調製することができる。
【０１６５】
具体的には、本発明の方法に用いられるプローブまたはプライマーは、ストリンジェントな条件下、中程度にストリンジェントな条件下、または低ストリンジェントな条件下で、ＳＥＭＡ５ＢのｍＲＮＡとハイブリダイズする。本明細書で使用する「ストリンジェントな（ハイブリダイゼーション）条件」という語句は、プローブまたはプライマーがその標的配列とはハイブリダイズするが、その他の配列とはハイブリダイズしない条件を指す。ストリンジェントな条件は配列に依存し、異なる状況下では異なる。より長い配列の特異的ハイブリダイゼーションは、短い配列よりも高い温度で観察される。一般に、ストリンジェントな条件の温度は、所定のイオン強度およびｐＨにおける特定の配列の熱融解温度（Ｔｍ）よりも約５℃低くなるように選択する。Ｔｍとは、平衡状態で、標的配列に相補的なプローブの５０％が標的配列とハイブリダイズする（所定のイオン強度、ｐＨ、および核酸濃度における）温度である。標的配列は一般に過剰に存在するため、Ｔｍでは、平衡状態でプローブの５０％が占有される。典型的には、ストリンジェントな条件とは、ｐＨ７．０〜８．３において塩濃度がナトリウムイオン約１．０Ｍ未満、典型的にはナトリウムイオン（または他の塩）約０．０１〜１．０Ｍであり、かつ温度が、短いプローブまたはプライマー（例えば、１０〜５０ヌクレオチド）に関しては少なくとも約３０℃、およびより長いプローブまたはプライマーに関しては少なくとも約６０℃である条件である。ストリンジェントな条件はまた、ホルムアミドなどの不安定化物質の添加によって達成してもよい。
【０１６６】
本発明のプローブまたはプライマーは、典型的には、実質的に精製されたオリゴヌクレオチドである。オリゴヌクレオチドは、典型的には、ストリンジェントな条件下で、少なくとも約２０００、１０００、５００、４００、３５０、３００、２５０、２００、１５０、１００、５０、または２５の連続するＳＥＭＡ５Ｂ配列を含む核酸のセンス鎖ヌクレオチド配列、またはＳＥＭＡ５Ｂ配列を含む核酸のアンチセンス鎖ヌクレオチド配列、またはそれらの配列の天然の変異体とハイブリダイズするヌクレオチド配列の領域を含む。特に、例えば、好ましい態様において、５〜５０ｂ（塩基）の長さを有するオリゴヌクレオチドを、検出すべき遺伝子を増幅するためのプライマーとして用いることができる。より好ましくは、ＳＥＭＡ５Ｂ遺伝子のｍＲＮＡまたはｃＤＮＡは、特定のサイズ、一般には１５〜３０ｂ長のオリゴヌクレオチドプローブまたはプライマーによって検出することができる。サイズは少なくとも１０ヌクレオチド、少なくとも１２ヌクレオチド、少なくとも１５ヌクレオチド、少なくとも２０ヌクレオチド、少なくとも２５ヌクレオチド、少なくとも３０ヌクレオチドの範囲であってよく、プローブおよびプライマーのサイズは５〜１０ヌクレオチド、１０〜１５ヌクレオチド、１５〜２０ヌクレオチド、２０〜２５ヌクレオチド、および２５〜３０ヌクレオチドの範囲にわたってよい。好ましい態様において、オリゴヌクレオチドプローブまたはプライマーの長さは、１５〜２５ヌクレオチドから選択することができる。そのようなオリゴヌクレオチドプローブまたはプライマーを用いることによって遺伝子を検出するためのアッセイ手順、装置、または試薬は、周知である（例えばオリゴヌクレオチドマイクロアレイまたはＰＣＲ）。これらのアッセイにおいて、プローブまたはプライマーはタグまたはリンカー配列も含み得る。さらに、プローブまたはプライマーは、検出可能な標識または捕捉することができる親和性リガンドで修飾することができる。あるいは、ハイブリダイゼーションに基づく検出手順において、数百（例えば、約１００〜２００）塩基から数千（例えば、約１０００〜２０００）塩基長を有するポリヌクレオチドも、プローブに用いることができる（例えば、ノーザンブロッティングアッセイまたはｃＤＮＡマイクロアレイ解析）。
【０１６７】
あるいは、本発明の方法によって治療すべき対象の同定のために、ＳＥＭＡ５Ｂの翻訳産物を検出することができる。例えば、ＳＥＭＡ５Ｂタンパク質（配列番号：７５、７８または８０）の量を測定することができる。翻訳産物としてＳＥＭＡ５Ｂタンパク質の量を測定する方法として、ＳＥＭＡ５Ｂタンパク質を特異的に認識する抗体を用いる免疫測定法が含まれる。抗体は、モノクローナルまたはポリクローナルであってよい。さらに、断片または改変抗体がＳＥＭＡ５Ｂタンパク質への結合能を保持する限り、抗体の任意の断片または改変物（例えば、キメラ抗体、ｓｃＦｖ、Ｆａｂ、Ｆ（ａｂ'）２、Ｆｖ等）を検出に用いることができる。これらの種類の抗体を調製する方法は、当技術分野において周知であり、任意の方法を使用して、そのような抗体およびそれらの等価物を調製することができる。
【０１６８】
ＳＥＭＡ５Ｂの発現レベルをその翻訳産物に基づいて検出する別の方法として、ＳＥＭＡ５Ｂタンパク質に対する抗体を用いる免疫組織化学的解析により、染色の強度を測定してもよい。すなわちこの測定では、強度の染色により、ＳＥＭＡ５Ｂタンパク質の存在／レベルの増加が示され、それと同時にＳＥＭＡ５Ｂの高発現レベルが示される。
【０１６９】
対象由来の試料におけるＳＥＭＡ５Ｂ遺伝子の発現レベルは、その発現レベルが、ＳＥＭＡ５Ｂの対照レベル（例えば、正常細胞中の発現レベル）から例えば１０％、２５％、もしくは５０％上昇するか；または１．１倍超、１．５倍超、２．０倍超、５．０倍超、１０．０倍超、もしくはそれ以上まで上昇する場合に、上昇していると判定され得る。
【０１７０】
対照レベルは、健常対象から予め採取し保存しておいた試料を用いることにより、がん細胞と同時に決定することができる。加えて、治療すべきがんを有する器官の非がん性領域から得られた正常細胞を、正常対照として用いてもよい。あるいは、対照レベルは、疾患状態が判明している対象に由来する試料中のＳＥＭＡ５Ｂの予め決定された発現レベルを解析することによって得られた結果に基づいて、統計的方法により決定してもよい。さらに、対照レベルは、以前に試験された細胞に由来する発現パターンのデータベースに由来し得る。さらに、本発明の一局面によれば、生物学的試料中のＳＥＭＡ５Ｂの発現レベルを、複数の参照試料から決定された複数の対照レベルと比較することもできる。対象由来の生物学的試料の組織型と類似の組織型に由来する参照試料から決定された対照レベルを用いることが好ましい。さらに、疾患状態が判明している集団におけるＳＥＭＡ５Ｂ遺伝子の発現レベルの基準値を用いることが好ましい。基準値は、当技術分野において公知の任意の方法によって得ることができる。例えば、平均値＋／−２Ｓ．Ｄ．または平均値＋／−３Ｓ．Ｄ．の範囲を、基準値として用いることができる。
【０１７１】
本発明との関連において、がん性でないと判明している生物学的試料から決定された対照レベルは、「正常対照レベル」と称される。一方、対照レベルががん性生物学的試料から決定される場合には、これは「がん性対照レベル」と称される。試料の発現レベルと対照レベルとの差を、その発現レベルが細胞のがん性状態または非がん性状態に応じて異ならないことが判明している対照核酸、例えばハウスキーピング遺伝子の発現レベルに対して正規化することができる。例示的な対照遺伝子には、β−アクチン、グリセルアルデヒド３リン酸脱水素酵素、およびリボソームタンパク質Ｐ１が含まれるが、これらに限定されない。
【０１７２】
ＳＥＭＡ５Ｂの発現レベルが正常対照レベルと比較して上昇している場合、その対象は本発明の薬学的組成物または薬学的剤を投与することにより治療すべきがんを有する対象であると同定され得る。
【０１７３】
本発明はまた、前述の薬学的組成物または薬学的剤を用いたがんの治療のための対象を選択する方法を提供し、その方法は以下の段階を含む：
ａ）がんを有する対象から得られた生物学的試料中のＳＥＭＡ５Ｂの発現レベルを決定する段階；
ｂ）段階ａ）で決定したＳＥＭＡ５Ｂの発現レベルを正常対照レベルと比較する段階；および
ｃ）ＳＥＭＡ５Ｂの発現レベルが正常対照レベルと比較して上昇している場合に、本発明の薬学的組成物または薬学的剤によるがんの治療のために該対象を選択する段階。
【０１７４】
本発明はまた、本発明の薬学的組成物または薬学的剤で治療され得るがんに罹患している、またはがんが発生するリスクのある対象を同定または判定するための診断キットを提供し、該キットはまた、がん免疫療法の効果または適用性を評価および／またはモニターするのに有用であり得る。好ましくは、がんには食道がん、ＮＳＣＬＣ、ＲＣＣおよびＳＣＬＣが含まれるが、これらに限定されない。より詳細には、キットは、対象由来の試料中のＳＥＭＡ５Ｂの発現レベルを検出するための少なくとも１種の試薬を好ましくは含み、そのような試薬は以下からなる群より選択され得る：
（ａ）ＳＥＭＡ５ＢのｍＲＮＡを検出するための試薬；
（ｂ）ＳＥＭＡ５Ｂタンパク質を検出するための試薬；および
（ｃ）ＳＥＭＡ５Ｂタンパク質の生物学的活性を検出するための試薬。
【０１７５】
ＳＥＭＡ５Ｂ  ｍＲＮＡの検出に適した試薬の例には、ＳＥＭＡ５Ｂ  ｍＲＮＡの一部に対する相補的配列を有するオリゴヌクレオチドなどの、ＳＥＭＡ５Ｂ  ｍＲＮＡに特異的に結合するか、またはＳＥＭＡ５Ｂ  ｍＲＮＡを同定する核酸が含まれる。このような種類のオリゴヌクレオチドは、ＳＥＭＡ５Ｂ  ｍＲＮＡに特異的なプライマーおよびプローブによって例示される。このような種類のオリゴヌクレオチドは、当技術分野において周知の方法に基づいて調製することができる。必要に応じて、ＳＥＭＡ５Ｂ  ｍＲＮＡを検出するための試薬を固体基質上に固定化することができる。さらに、ＳＥＭＡ５Ｂ  ｍＲＮＡを検出するための２つ以上の試薬をキット中に含めることもできる。
【０１７６】
一方、ＳＥＭＡ５Ｂタンパク質を検出するのに適した試薬の例には、ＳＥＭＡ５Ｂタンパク質に対する抗体が含まれ得る。抗体は、モノクローナルまたはポリクローナルであってよい。さらに、断片または改変抗体がＳＥＭＡ５Ｂタンパク質への結合能を保持する限り、抗体の任意の断片または改変物（例えば、キメラ抗体、ｓｃＦｖ、Ｆａｂ、Ｆ（ａｂ'）２、Ｆｖ等）を試薬として用いることもできる。ＳＥＭＡ５Ｂタンパク質を検出するためのこのような種類の抗体を調製する方法は、当該技術分野において周知であり、本発明において任意の方法を使用して、そのような抗体およびそれらの等価物を調製することができる。さらに、直接連結技法または間接標識技法により、抗体をシグナル発生分子で標識することができる。標識、および抗体を標識し、標的に対する抗体の結合を検出する方法は当該技術分野において周知であり、任意の標識および方法を本発明に使用することができる。さらに、ＳＥＭＡ５Ｂタンパク質を検出するための２つ以上の試薬をキット中に含めることもできる。
【０１７７】
キットは、前述の試薬のうちの２つ以上を含み得る。キットはさらに、ＳＥＭＡ５Ｂ  ｍＲＮＡに対するプローブまたはＳＥＭＡ５Ｂタンパク質に対する抗体を結合させるための固体基質および試薬、細胞を培養するための培地および容器、陽性および陰性対照試薬、ならびにＳＥＭＡ５Ｂタンパク質に対する抗体を検出するための二次抗体を含み得る。例えば、がんを有さない対象から得られた組織試料は、有用な対照試薬として役立ち得る。本発明のキットは、緩衝液、希釈剤、フィルター、注射針、シリンジ、および使用説明書を備えた包装封入物（例えば、文書、テープ、ＣＤ−ＲＯＭ等）を含む、商業上の観点および使用者の観点から望ましい他の材料をさらに含み得る。これらの試薬等は、ラベルを貼った容器中に保持され得る。適切な容器には、ボトル、バイアル、および試験管が含まれ得る。該容器は、ガラスまたはプラスチックなどの種々の材料から形成される。
【０１７８】
一つの態様において、試薬がＳＥＭＡ５Ｂ  ｍＲＮＡに対するプローブである場合には、該試薬を多孔性ストリップなどの固体基質上に固定化して、少なくとも１つの検出部位を形成させることができる。多孔性ストリップの測定または検出領域は、それぞれが核酸（プローブ）を含む複数の部位を含み得る。検査ストリップはまた、陰性および／または陽性対照用の部位を含み得る。あるいは、対照部位は、検査ストリップとは別のストリップ上に位置し得る。任意で、異なる検出部位は異なる量の固定化核酸を含み得る、すなわち、第１検出部位ではより多い量の固定化核酸を、および以降の部位ではより少ない量の固定化核酸を含み得る。試験試料を添加すると、検出可能なシグナルを呈する部位の数により、試料中に存在するＳＥＭＡ５Ｂ  ｍＲＮＡの量の定量的指標が提供される。検出部位は、適切に検出可能な任意の形状で構成することができ、典型的には、検査ストリップの幅全体にわたるバーまたはドットの形状である。
【０１７９】
本発明のキットは、陽性対照試料またはＳＥＭＡ５Ｂ標準試料をさらに含み得る。本発明の陽性対照試料は、ＳＥＭＡ５Ｂ陽性試料を回収し、次にそれらのＳＥＭＡ５Ｂレベルをアッセイすることによって調製することができる。あるいは、精製ＳＥＭＡ５Ｂタンパク質またはポリヌクレオチドを、ＳＥＭＡ５Ｂを発現しない細胞に添加して、陽性試料またはＳＥＭＡ５Ｂ標準試料を形成してもよい。本発明において、精製ＳＥＭＡ５Ｂは組換えタンパク質であってよい。陽性対照試料のＳＥＭＡ５Ｂレベルは、例えばカットオフ値よりも高い。
【０１８０】
１つの態様において、本発明はさらに、本発明の１種または複数種のペプチドを含む診断キットを提供する。
がんは、対象由来の試料（例えば、血液、組織）において、本発明のペプチドを使用して、本発明のペプチドに対する抗体を検出することによって診断することができる。
【０１８１】
上記のように、がんの診断は、抗ＳＥＭＡ５Ｂ抗体の量と、対応する対照試料中の抗ＳＥＭＡ５Ｂ抗体の量との差を測定することにより、実施することができる。対象由来の試料（例えば、血液試料）が、本発明のペプチドに対する抗体を含み、その抗体の量が対照レベルと比較してカットオフ値よりも高いと判定される場合に、該対象ががんに罹患していることが疑われる。
【０１８２】
別の態様において、本発明の診断キットは、本発明のペプチドおよびそれに結合するＨＬＡ分子を含み得る。抗原性ペプチドおよびＨＬＡ分子を使用して抗原特異的ＣＴＬを検出するための方法は、既に確立されている（例えば、Ａｌｔｍａｎ  ＪＤ  ｅｔ  ａｌ．，Ｓｃｉｅｎｃｅ．１９９６，２７４（５２８４）：９４−６）。したがって、腫瘍抗原特異的ＣＴＬを検出するための検出法に、本発明のペプチドとＨＬＡ分子との複合体を適用することができ、それによってがんの再発および／または転移のより早期の発見が可能になる。さらに、本発明のペプチドを有効成分として含む医薬を適用できる対象を選択するために、または医薬の治療効果を評価するために、これを使用することができる。
【０１８３】
詳細には、公知の方法に従って（例えば、Ａｌｔｍａｎ  ＪＤ  ｅｔ  ａｌ．，Ｓｃｉｅｎｃｅ．１９９６，２７４（５２８４）：９４−６を参照されたい）、放射標識されたＨＬＡ分子と本発明のペプチドとの、テトラマーなどのオリゴマー複合体を調製することができる。この複合体を用いて、例えば、がんに罹患している疑いのある対象に由来する末梢血リンパ球中の抗原ペプチド特異的ＣＴＬを定量することにより、診断を行うことができる。
【０１８４】
本発明はさらに、本明細書に記載されるペプチドエピトープを使用することによって、対象の免疫学的応答を評価するための方法および診断用の剤を提供する。本発明の１つの態様において、本明細書に記載するようなＨＬＡ−Ａ２４拘束性ペプチドを、対象の免疫応答を評価または予測するための試薬として用いることができる。評価される免疫応答は、免疫原を免疫担当細胞とインビトロまたはインビボで接触させることにより誘導される。好ましい態様において、免疫学的応答を評価するための免疫担当細胞は、末梢血、末梢血リンパ球（ＰＢＬ）、および末梢血単核細胞（ＰＢＭＣ）から選択し得る。そのような免疫担当細胞を収集または単離するための方法は当技術分野において周知である。いくつかの態様において、ペプチドエピトープを認識して結合する抗原特異的ＣＴＬの産生をもたらし得る任意の剤を、試薬として用いてもよい。ペプチド試薬を免疫原として使用することを必要としない。そのような解析に用いられるアッセイ系には、テトラマー、細胞内リンホカイン染色、およびインターフェロン放出アッセイ、またはＥＬＩＳＰＯＴアッセイなどの比較的最近の技術開発が含まれる。好ましい態様において、ペプチド試薬と接触させるための免疫担当細胞は、樹状細胞を含む抗原提示細胞であり得る。
【０１８５】
例えば、本発明のペプチドをテトラマー染色アッセイにおいて使用して、腫瘍細胞抗原または免疫原への曝露後の抗原特異的ＣＴＬの存在について末梢血単核細胞を評価することができる。ＨＬＡテトラマー複合体を使用して、抗原特異的ＣＴＬを直接可視化し（例えば、Ｏｇｇ  ｅｔ  ａｌ．，Ｓｃｉｅｎｃｅ  ２７９：２１０３−２１０６，１９９８；およびＡｌｔｍａｎ  ｅｔ  ａｌ，Ｓｃｉｅｎｃｅ  １７４：９４−９６，１９９６を参照されたい）、末梢血単核細胞の試料中の抗原特異的ＣＴＬ集団の頻度を測定することができる。本発明のペプチドを使用するテトラマー試薬は、以下に記載するように作製することができる。
【０１８６】
ＨＬＡ分子に結合するペプチドは、対応するＨＬＡ重鎖およびβ２−ミクログロブリンの存在下で再び折り畳まれて、３分子複合体を生成する。この複合体において、該重鎖のカルボキシル末端の前もってタンパク質中に作製した部位をビオチン化する。次にストレプトアビジンを該複合体に添加して、３分子複合体およびストレプトアビジンから構成されるテトラマーを形成する。蛍光標識ストレプトアビジンの手法によって、このテトラマーを使用して、抗原特異的細胞を染色することができる。次いで、この細胞を例えばフローサイトメトリーによって同定することができる。そのような解析を、診断または予後予測目的に使用することができる。この手順によって同定された細胞を治療目的に使用することもできる。
【０１８７】
本発明はまた、本発明のペプチドを含む、免疫リコール応答を評価するための試薬を提供する（例えば、Ｂｅｒｔｏｎｉ  ｅｔ  ａｌ，Ｊ．Ｃｌｉｎ．Ｉｎｖｅｓｔ．１００：５０３−５１３，１９９７、およびＰｅｎｎａ  ｅｔ  ａｌ．，Ｊ  Ｅｘｐ．Ｍｅｄ．１７４：１５６５−１５７０，１９９１を参照されたい）。例えば、治療すべきがんを有する個体から得た患者ＰＢＭＣ試料を、特異的ペプチドを用いて抗原特異的ＣＴＬの存在について解析する。ＰＢＭＣを培養し、該細胞を本発明のペプチドで刺激することによって、単核細胞を含む血液試料を評価することができる。適切な培養期間後、増殖した細胞集団を例えばＣＴＬ活性について解析することができる。
【０１８８】
ペプチドは、ワクチンの有効性を評価するための試薬として用いることもできる。免疫原をワクチン接種した患者から得られたＰＢＭＣを、例えば上記の方法のいずれかを用いて解析することができる。患者のＨＬＡ型を決定し、該患者に存在するアリル特異的分子を認識するペプチドエピトープ試薬を解析のために選択する。ワクチンの免疫原性は、ＰＢＭＣ試料中のエピトープ特異的ＣＴＬの存在によって示され得る。
【０１８９】
本発明のペプチドは、当技術分野で周知の技法を用いて抗体を作製するために使用することもでき（例えば、ＣＵＲＲＥＮＴ  ＰＲＯＴＯＣＯＬＳ  ＩＮ  ＩＭＭＵＮＯＬＯＧＹ，Ｗｉｌｅｙ／Ｇｒｅｅｎｅ，ＮＹ；およびＡｎｔｉｂｏｄｉｅｓ  Ａ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｍａｎｕａｌ，Ｈａｒｌｏｗ  ａｎｄ  Ｌａｎｅ，Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｏｒ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｐｒｅｓｓ，１９８９を参照されたい）、この抗体は、がんを診断、検出、またはモニターするための試薬として有用であり得る。そのような抗体は、ＨＬＡ分子との関連でペプチドを認識する抗体、すなわちペプチド−ＭＨＣ複合体に結合する抗体を含み得る。
【０１９０】
本発明のペプチドおよび組成物はさらなる用途をいくつか有し、そのうちの一部を本明細書に記載する。例えば、本発明は、ＳＥＭＡ５Ｂ免疫原性ポリペプチドの量によって特徴づけられる障害を診断または検出するための方法を提供する。これらの方法は、生物学的試料中でのＳＥＭＡ５Ｂペプチドの量、またはＳＥＭＡ５ＢペプチドとＨＬＡクラスＩ分子との複合体の量を測定する段階を含む。ペプチドまたはペプチドとＨＬＡクラスＩ分子との複合体の発現は、該ペプチドまたは該複合体の結合パートナーを用いてアッセイすることによって、測定または検出することができる。好ましい態様において、ペプチドまたは複合体の結合パートナーは、ペプチドを認識しかつペプチドに特異的に結合する抗体であってもよい。腫瘍生検材料などの生物学的試料中のＳＥＭＡ５Ｂの発現は、ＳＥＭＡ５Ｂプライマーを用いる標準的なＰＣＲ増幅プロトコールによって試験することもできる。腫瘍発現の例は本明細書に提示してあり、ＳＥＭＡ５Ｂ増幅のための例示的な条件およびプライマーのさらなる開示は、国際公開公報第２００３／２７３２２号に見出すことができる。
【０１９１】
好ましくは、診断法は、対象から単離された生物学的試料をＳＥＭＡ５Ｂペプチドに特異的な剤と接触させて、該生物学的試料中のＳＥＭＡ５Ｂペプチドの存在を検出する段階を含む。本明細書で使用する「接触させる」とは、剤と、生物学的試料中に存在するＳＥＭＡ５Ｂペプチドとの間の特異的相互作用が可能となるように、生物学的試料を、例えば濃度、温度、時間、イオン強度の適切な条件下で、該剤に十分に近接させて配置することを意味する。一般に、剤と生物学的試料を接触させるための条件は、分子と生物学的試料中のその同族物（例えば、タンパク質とその受容体同族物、抗体とそのタンパク質抗原同族物、核酸とその相補的配列同族物）との間の特異的相互作用を促進するための、当業者に公知の条件である。分子とその同族物との間の特異的相互作用を促進するための最適条件は、Ｌｏｗらに対して発行された米国特許第５，１０８，９２１号に記載される。
【０１９２】
本発明の診断法は、インビボおよびインビトロの一方または両方で行うことができる。したがって、生物学的試料は、本発明においてインビボまたはインビトロに位置し得る。例えば、生物学的試料はインビボの組織であってよく、かつＳＥＭＡ５Ｂ免疫原性ポリペプチドに特異的な剤を用いて、組織中のそのような分子の存在を検出することができる。あるいは、生物学的試料をインビトロで採取または単離することができる（例えば、血液試料、腫瘍生検材料、組織抽出物）。特に好ましい態様において、生物学的試料は細胞を含む試料であってよく、より好ましくは、診断または治療する対象から採取された腫瘍細胞を含む試料であってよい。
【０１９３】
あるいは、フルオレセイン標識ＨＬＡ多量体複合体で染色することによって、抗原特異的Ｔ細胞の直接的な定量を可能にする方法により、診断を行うこともできる（例えば、Ａｌｔｍａｎ，Ｊ．Ｄ．ｅｔ  ａｌ．，１９９６，Ｓｃｉｅｎｃｅ２７４：９４；Ａｌｔｍａｎ，Ｊ．Ｄ．ｅｔ  ａｌ．，１９９３，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ  ９０：１０３３０；）。細胞内リンホカイン染色、およびインターフェロン−γ放出アッセイ、またはＥＬＩＳＰＯＴアッセイもまた提供されている。テトラマー染色、細胞内リンホカイン染色、およびＥＬＩＳＰＯＴアッセイはすべて、より慣例的なアッセイより少なくとも１０倍感度が高いようである（Ｍｕｒａｌｉ−Ｋｒｉｓｈｎａ，Ｋ．ｅｔ  ａｌ．，１９９８，Ｉｍｍｕｎｉｔｙ８：１７７；Ｌａｌｖａｎｉ，Ａ．ｅｔ  ａｌ．，１９９７，Ｊ．Ｅｘｐ．Ｍｅｄ．１８６：８５９；Ｄｕｎｂａｒ，Ｐ．Ｒ．ｅｔ  ａｌ．，１９９８，Ｃｕｒｒ．Ｂｉｏｌ．８：４１３）。五量体（例えば、米国特許出願公開第２００４−２０９２９５号Ａ）、デキストラマー（ｄｅｘｔｒａｍｅｒ）（例えば、国際公開公報第０２／０７２６３号）、およびストレプタマー（ｓｔｒｅｐｔａｍｅｒ）（例えば、Ｎａｔｕｒｅ  ｍｅｄｉｃｉｎｅ  ６．６３１−６３７（２００２））を使用することもできる。
【０１９４】
例として、いくつかの態様において、本発明は、本発明のＳＥＭＡ５Ｂペプチドの少なくとも１種を投与された対象の免疫学的応答を診断または評価するための方法を提供し、該方法は以下の段階を含む：
（ａ）免疫原を、該免疫原に対して特異的なＣＴＬの誘導に適した条件下で免疫担当細胞と接触させる段階；
（ｂ）段階（ａ）で誘導されたＣＴＬの誘導レベルを検出または決定する段階；および
（ｃ）対象の免疫学的応答をＣＴＬ誘導レベルと相関させる段階。
【０１９５】
本発明との関連において、免疫原は、好ましくは、（ａ）配列番号：２〜６９のアミノ酸配列の中より選択されるＳＥＭＡ５Ｂペプチド、そのようなアミノ酸配列を有するペプチド、およびそのようなアミノ酸配列が１個、２個、またはそれ以上のアミノ酸置換によって改変されたペプチド、のうち少なくとも１つを含む。一方、免疫原特異的ＣＴＬの誘導に適した条件は当技術分野において周知である。例えば、免疫担当細胞を、免疫原特異的ＣＴＬを誘導するために免疫原の存在下でインビトロで培養してもよい。免疫原特異的ＣＴＬを誘導する目的で、任意の刺激因子を細胞培養物に添加してもよい。例えば、ＩＬ−２は、ＣＴＬ誘導のための好ましい刺激因子である。
【０１９６】
いくつかの態様において、ペプチドがん療法によって治療される対象の免疫学的応答をモニターまたは評価する段階は、治療前、治療中、および／または治療後に行うことができる。一般に、がん療法プロトコール中、免疫原性ペプチドは、治療される対象に繰り返し投与される。例えば、免疫原性ペプチドを３〜１０週間にわたって毎週投与してもよい。したがって、対象の免疫学的応答は、がん療法プロトコール中に評価またはモニターされ得る。あるいは、がん療法に対する免疫学的応答を評価またはモニターする段階が、療法プロトコールの完了時であってもよい。
【０１９７】
本発明によれば、免疫原特異的ＣＴＬの誘導が対照と比較して増強されていることにより、評価または診断される対象が、投与された免疫原に対して免疫学的に応答したことが示される。免疫学的応答を評価するのに適した対照には、例えば、免疫担当細胞をペプチドと接触させていない場合の、またはいかなるＳＥＭＡ５Ｂペプチドとも異なるアミノ酸配列（例えば、ランダムなアミノ酸配列）を有する対照ペプチドと接触させている場合の、ＣＴＬ誘導レベルが含まれ得る。１つの好ましい態様においては、対象に投与された各免疫原間で免疫学的応答を比較することにより、対象の免疫学的応答を配列特異的な様式で評価する。特に、いくつかの種類のＳＥＭＡ５Ｂペプチドについての混合物を対象に投与する場合であっても、免疫学的応答はペプチドに依存して異なる可能性がある。その場合には、各ペプチド間で免疫学的応答を比較することにより、対象がより強い応答を示すペプチドを同定することができる。
【０１９８】
ＸＩＩ．抗体
本発明はさらに、本発明のペプチドに結合する抗体を提供する。好ましい抗体は本発明のペプチドに特異的に結合し、他のペプチドとは結合しない（または弱く結合する）。あるいは、抗体は本発明のペプチドおよびその相同体に結合し得る。本発明のペプチドに対する抗体は、がんの診断および予後予測のアッセイならびに画像化方法論においても使用され得る。同様に、そのような抗体は、ＳＥＭＡ５Ｂががん患者において同じく発現または過剰発現する限り、他のがんの治療、診断、および／または予後予測において使用され得る。さらに、細胞内で発現する抗体（例えば、一本鎖抗体）は、ＳＥＭＡ５Ｂの発現が関与するがんの治療において治療的に使用することができ、このがんの例には食道がん、ＮＳＣＬＣ、ＲＣＣおよびＳＣＬＣが含まれるが、これらに限定されない。
【０１９９】
本発明はまた、配列番号：２〜６９からなる群から選択されるアミノ酸配列からなるポリペプチド、好ましくは配列番号：２、３、４、８、９、１０、１３、２０、４０、４１、４７および５４からなる群から選択されたアミノ酸配列からなるポリペプチドを含む、ＳＥＭＡ５Ｂタンパク質（配列番号：７５、７８または８０）もしくはその断片を検出および／または定量するための様々な免疫学的アッセイを提供する。そのようなアッセイは、必要に応じて、ＳＥＭＡ５Ｂタンパク質またはその断片を認識してそれと結合し得る１種または複数種の抗ＳＥＭＡ５Ｂ抗体を含み得る。本発明との関連において、ＳＥＭＡ５Ｂポリペプチドに結合する抗ＳＥＭＡ５Ｂ抗体は、好ましくは他のペプチドを除外して、配列番号：２〜６９、特に配列番号：２、３、４、８、９、１０、１３、２０、４０、４１、４７および５４からなる群から選択されたアミノ酸配列からなるポリペプチドを好ましくは認識する。抗体の結合特異性を阻害試験によって確認することができる。すなわち、解析される抗体と全長のＳＥＭＡ５Ｂポリペプチドとの間の結合が、配列番号：２〜６９のアミノ酸配列からなるいずれかの断片ポリペプチドの存在下で阻害される場合、この抗体は該断片と特異的に結合するとみなされる。本発明との関連において、そのような免疫学的アッセイは、様々な種類の放射免疫測定法、免疫クロマトグラフ技法、酵素結合免疫吸着測定法（ＥＬＩＳＡ）、酵素結合免疫蛍光測定法（ＥＬＩＦＡ）などを含むがこれらに限定されない、当技術分野で周知の様々な免疫学的アッセイ形式の範囲内で行われる。
【０２００】
本発明の免疫学的であるが非抗体性の関連アッセイには、Ｔ細胞免疫原性アッセイ（阻害性または刺激性）およびＭＨＣ結合アッセイが含まれ得る。加えて、本発明は、ＳＥＭＡ５Ｂを発現するがんを検出することができる免疫学的画像化法を企図し、そのような方法の例には、本発明の標識された抗体を使用する放射性シンチグラフィー画像化法が含まれるが、これに限定されない。そのようなアッセイは、ＳＥＭＡ５Ｂを発現するがんの検出、モニタリングおよび予後予測において臨床的に使用され、そのようながんの例には食道がん、ＮＳＣＬＣ、ＲＣＣおよびＳＣＬＣが含まれるが、これらに限定されない。
【０２０１】
本発明はまた、本発明のペプチドに結合する抗体を提供する。本発明の抗体は、例えばモノクローナル抗体またはポリクローナル抗体として任意の形態で用いることができ、これには、ウサギなどの動物を本発明のペプチドで免疫することにより得られる抗血清、すべてのクラスのポリクローナル抗体およびモノクローナル抗体、ヒト抗体、ならびに遺伝子組換えにより作製されたヒト化抗体がさらに含まれ得る。
【０２０２】
抗体を得るための抗原として用いられる本発明のペプチドは、任意の動物種に由来し得るが、好ましくはヒト、マウス、またはラットなどの哺乳動物、より好ましくはヒトに由来する。ヒト由来のペプチドは、本明細書に開示するヌクレオチド配列またはアミノ酸配列から得ることができる。
【０２０３】
本発明によれば、本発明の完全なペプチドおよび部分ペプチドが免疫化抗原として機能し得る。好適な部分ペプチドの例には、例えば、本発明のペプチドのアミノ（Ｎ）末端断片またはカルボキシ（Ｃ）末端断片が含まれる。
【０２０４】
本明細書において、抗体は、ＳＥＭＡ５Ｂペプチドの全長または断片のいずれかと反応するタンパク質と定義される。好ましい態様において、本発明の抗体は、配列番号：２〜６９からなる群より選択されるアミノ酸配列、より好ましくは配列番号：２、３、４、８、９、１０、１３、２０、４０、４１、４７および５４のアミノ酸配列を有する、ＳＥＭＡ５Ｂの断片ペプチドを認識することができる。オリゴペプチドを合成する方法は、当技術分野において周知である。合成後、免疫原として使用する前にペプチドを任意に精製してもよい。本発明との関連において、免疫原性を高めるために、オリゴペプチド（例えば、９ｍｅｒまたは１０ｍｅｒ）を担体と結合または連結させてもよい。担体として、キーホールリンペットヘモシアニン（ＫＬＨ）が周知である。ＫＬＨとペプチドを結合するための方法もまた、当技術分野において周知である。
【０２０５】
あるいは、本発明のペプチドまたはその断片をコードする遺伝子を公知の発現ベクターに挿入することができ、次にこれを用いて本明細書に記載のように宿主細胞を形質転換する。所望のペプチドまたはその断片を、任意の標準的な方法により宿主細胞の外部または内部から回収することができ、後にこれを抗原として用いることができる。あるいは、ペプチドを発現する細胞全体もしくはそれらの溶解物、または化学合成したペプチドを抗原として用いてもよい。
【０２０６】
任意の哺乳動物を抗原により免疫することができるが、細胞融合のために使用される親細胞との適合性を考慮に入れることが好ましい。一般に、齧歯目（Ｒｏｄｅｎｔｉａ）、ウサギ目（Ｌａｇｏｍｏｒｐｈａ）、または霊長目（Ｐｒｉｍａｔｅ）の動物を使用することができる。齧歯目科の動物には、例えばマウス、ラット、およびハムスターが含まれる。ウサギ目科の動物には、例えばウサギが含まれる。霊長目科の動物には、例えばカニクイザル（Ｍａｃａｃａ  ｆａｓｃｉｃｕｌａｒｉｓ）、アカゲザル、マントヒヒ、およびチンパンジーなどの狭鼻下目（Ｃａｔａｒｒｈｉｎｉ）（旧世界ザル）のサルが含まれる。
【０２０７】
動物を抗原で免疫する方法は、当技術分野で公知である。抗原の腹腔内注射または皮下注射は、哺乳動物を免疫するための標準的な方法である。より具体的には、抗原を適量のリン酸緩衝食塩水（ＰＢＳ）、生理食塩水などで希釈し、懸濁させることができる。必要に応じて、抗原懸濁液を、フロイント完全アジュバントなどの適量の標準的アジュバントと混合し、乳化した後、哺乳動物に投与することができる。その後、適量のフロイント不完全アジュバントと混合した抗原を、４〜２１日毎に数回投与することが好ましい。免疫化には、適切な担体を用いてもよい。上記のように免疫した後、血清を、所望の抗体の量の増加に関して標準的方法で調べることができる。
【０２０８】
本発明のペプチドに対するポリクローナル抗体は、血清中の所望の抗体の増加に関して調べた免疫後の哺乳動物から血液を回収し、任意の従来法により血液から血清を分離することによって、調製することができる。ポリクローナル抗体はポリクローナル抗体を含む血清を含んでよく、またポリクローナル抗体を含む画分を該血清から単離してもよい。免疫グロブリンＧまたはＭは、本発明のペプチドのみを認識する画分から、例えば、本発明のペプチドを結合させたアフィニティーカラムを用いた上で、この画分をプロテインＡまたはプロテインＧカラムを用いてさらに精製して、調製することができる。
【０２０９】
本発明との関連における使用のためのモノクローナル抗体を調製するためには、免疫細胞を、抗原で免疫した哺乳動物から回収し、上記のように血清中の所望の抗体の増大したレベルについて調べ、細胞融合に供する。細胞融合に用いる免疫細胞は、好ましくは脾臓から得ることができる。上記の免疫細胞と融合すべき他の好ましい親細胞には、例えば、哺乳動物の骨髄腫細胞、およびより好ましくは薬物による融合細胞の選択のための特性を獲得した骨髄腫細胞が含まれる。
【０２１０】
公知の方法、例えば、Ｍｉｌｓｔｅｉｎらの方法（Ｇａｌｆｒｅ  ａｎｄ  Ｍｉｌｓｔｅｉｎ，Ｍｅｔｈｏｄｓ  Ｅｎｚｙｍｏｌ  ７３：３−４６（１９８１））に従って、上記の免疫細胞および骨髄腫細胞を融合させることができる。
【０２１１】
細胞融合によって結果として得られたハイブリドーマは、それらをＨＡＴ培地（ヒポキサンチン、アミノプテリンおよびチミジンを含む培地）などの標準的な選択培地において培養することによって選択することができる。細胞培養は典型的に、ＨＡＴ培地中で、所望のハイブリドーマを除く他のすべての細胞（非融合細胞）が死滅するのに十分な期間である数日間から数週間にわたって継続する。その後、標準的な限界希釈を行い、所望の抗体を産生するハイブリドーマ細胞をスクリーニングおよびクローニングすることができる。
【０２１２】
ハイブリドーマを調製するために、非ヒト動物が抗原で免疫される上記方法に加えて、ＥＢウイルスを感染させたヒトリンパ球などのヒトリンパ球が、ペプチド、ペプチド発現細胞またはそれらの溶解物によりインビトロにおいて免疫される場合がある。次いで、免疫化されたリンパ球を、Ｕ２６６などの無限に分裂することができるヒト由来の骨髄腫細胞と融合させて、該ペプチドに結合し得る所望のヒト抗体を産生するハイブリドーマを得ることができる（特開昭６３−１７６８８号）。
【０２１３】
得られたハイブリドーマは続いてマウスの腹腔内に移植され、腹水を抽出する。得られたモノクローナル抗体は、例えば、硫酸アンモニウム沈殿、プロテインＡもしくはプロテインＧカラム、ＤＥＡＥイオン交換クロマトグラフィー、または本発明のペプチドを結合させたアフィニティーカラムにより精製することができる。本発明の抗体は、本発明のペプチドの精製および検出のためだけではなく、本発明のペプチドのアゴニストおよびアンタゴニストの候補としても使用することができる。
【０２１４】
あるいは、免疫したリンパ球などの抗体を産生する免疫細胞を癌遺伝子によって不死化し、モノクローナル抗体の調製に使用することができる。
このようにして得られるモノクローナル抗体は、遺伝子操作技法を用いて組換えにより調製することもできる（例えば、ＭａｃＭｉｌｌａｎ  Ｐｕｂｌｉｓｈｅｒｓ  ＬＴＤ（１９９０）により英国で刊行された、Ｂｏｒｒｅｂａｅｃｋ  ａｎｄ  Ｌａｒｒｉｃｋ，Ｔｈｅｒａｐｅｕｔｉｃ  Ｍｏｎｏｃｌｏｎａｌ  Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓを参照されたい）。例えば、抗体をコードするＤＮＡを、抗体を産生するハイブリドーマまたは免疫化リンパ球などの免疫細胞からクローニングし、適切なベクターに挿入した上で、宿主細胞に導入して、組換え抗体を調製することができる。本発明はまた、上記のようにして調製される組換え抗体を提供する。
【０２１５】
本発明の抗体は、本発明のペプチドの１種または複数種に結合する限り、抗体の断片または修飾抗体であってもよい。例えば、抗体断片は、Ｆａｂ、Ｆ（ａｂ'）２、Ｆｖ、または、Ｈ鎖およびＬ鎖に由来するＦｖ断片が適切なリンカーによって連結される一本鎖Ｆｖ（ｓｃＦｖ）であってよい（Ｈｕｓｔｏｎ  ｅｔ  ａｌ．，Ｐｒｏｃ  Ｎａｔｌ  Ａｃａｄ  Ｓｃｉ  ＵＳＡ８５：５８７９−８３（１９８８））。より具体的には、抗体断片は、抗体をパパインまたはペプシンなどの酵素で処理することにより作製することができる。あるいは、抗体断片をコードする遺伝子を構築し、発現ベクターに挿入し、適切な宿主細胞内で発現させることができる（例えば、Ｃｏ  ｅｔ  ａｌ．，Ｊ  Ｉｍｍｕｎｏｌ  １５２：２９６８−７６（１９９４）；Ｂｅｔｔｅｒ  ａｎｄ  Ｈｏｒｗｉｔｚ，Ｍｅｔｈｏｄｓ  Ｅｎｚｙｍｏｌ  １７８：４７６−９６（１９８９）；Ｐｌｕｃｋｔｈｕｎ  ａｎｄ  Ｓｋｅｒｒａ，Ｍｅｔｈｏｄｓ  Ｅｎｚｙｍｏｌ  １７８：４９７−５１５（１９８９）；Ｌａｍｏｙｉ，Ｍｅｔｈｏｄｓ  Ｅｎｚｙｍｏｌ  １２１：６５２−６３（１９８６）；Ｒｏｕｓｓｅａｕｘ  ｅｔ  ａｌ．，Ｍｅｔｈｏｄｓ  Ｅｎｚｙｍｏｌ  １２１：６６３−９（１９８６）；Ｂｉｒｄ  ａｎｄ  Ｗａｌｋｅｒ，Ｔｒｅｎｄｓ  Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ  ９：１３２−７（１９９１）を参照されたい）。
【０２１６】
抗体は、ポリエチレングリコール（ＰＥＧ）などの様々な分子との結合によって修飾することができる。本発明は、そのような修飾抗体を提供する。修飾抗体は、抗体を化学的に修飾することによって得ることができる。これらの修飾法は、当技術分野で慣例的である。
【０２１７】
あるいは、本発明の抗体は、非ヒト抗体に由来する可変領域とヒト抗体に由来する定常領域との間のキメラ抗体として、または非ヒト抗体に由来する相補性決定領域（ＣＤＲ）と、ヒト抗体に由来するフレームワーク領域（ＦＲ）および定常領域とを含むヒト化抗体として得ることもできる。そのような抗体は、公知の技術に従って調製することができる。ヒト化は、齧歯類のＣＤＲまたはＣＤＲ配列でヒト抗体の対応する配列を置換することによって行うことができる（例えば、Ｖｅｒｈｏｅｙｅｎ  ｅｔ  ａｌ．，Ｓｃｉｅｎｃｅ  ２３９：１５３４−１５３６（１９８８）を参照されたい）。したがって、そのようなヒト化抗体は、実質的に完全には満たないヒト可変ドメインが、非ヒト種由来の対応する配列によって置換されたキメラ抗体である。
【０２１８】
ヒトのフレームワーク領域および定常領域に加えて、ヒト可変領域をも含む完全なヒト抗体を用いることもできる。そのような抗体は、当技術分野で公知の様々な技法を用いて作製することができる。例えば、インビトロの方法には、バクテリオファージ上に提示されたヒト抗体断片の組換えライブラリーの使用が含まれる（例えば、Ｈｏｏｇｅｎｂｏｏｍ＆Ｗｉｎｔｅｒ，Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．２２７：３８１（１９９１））。同様に、ヒト免疫グロブリン遺伝子座を、内因性免疫グロブリン遺伝子が部分的または完全に不活性化されたトランスジェニック動物、例えばマウスに導入することによって、ヒト抗体を作製することもできる。このアプローチは、例えば米国特許第６，１５０，５８４号、第５，５４５，８０７号；第５，５４５，８０６号；第５，５６９，８２５号；第５，６２５，１２６号；第５，６３３，４２５号；第５，６６１，０１６号に記載されている。
【０２１９】
上記のようにして得られた抗体は、均質になるまで精製してもよい。例えば、一般的なタンパク質に対して用いられる分離法および精製法に従って、抗体の分離および精製を行うことができる。例えば、これらに限定されないが、アフィニティークロマトグラフィーなどのカラムクロマトグラフィー、フィルター、限外濾過、塩析、透析、ＳＤＳポリアクリルアミドゲル電気泳動、および等電点電気泳動の使用を適切に選択および組み合わせることによって、抗体を分離および単離することができる（Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ：Ａ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｍａｎｕａｌ．Ｅｄ  Ｈａｒｌｏｗ  ａｎｄ  Ｄａｖｉｄ  Ｌａｎｅ，Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｏｒ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ（１９８８））。プロテインＡカラムおよびプロテインＧカラムをアフィニティーカラムとして使用することができる。使用すべき例示的なプロテインＡカラムには、例えば、Ｈｙｐｅｒ  Ｄ，ＰＯＲＯＳおよび、Ｓｅｐｈａｒｏｓｅ  Ｆ．Ｆ．（Ｐｈａｒｍａｃｉａ）が含まれる。
【０２２０】
適切なクロマトグラフィー法の例には、アフィニティークロマトグラフィー以外に、例えば、イオン交換クロマトグラフィー、疎水性クロマトグラフィー、ゲル濾過、逆相クロマトグラフィー、吸着クロマトグラフィーなどが含まれる（Ｓｔｒａｔｅｇｉｅｓ  ｆｏｒ  Ｐｒｏｔｅｉｎ  Ｐｕｒｉｆｉｃａｔｉｏｎ  ａｎｄ  Ｃｈａｒａｃｔｅｒｉｚａｔｉｏｎ：Ａ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｃｏｕｒｓｅ  Ｍａｎｕａｌ．編者：Ｄａｎｉｅｌ  Ｒ．Ｍａｒｓｈａｋ  ｅｔ  ａｌ．，Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｏｒ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｐｒｅｓｓ（１９９６））。クロマトグラフィー手順は、液相クロマトグラフィー、例えばＨＰＬＣおよびＦＰＬＣによって実施することができる。
【０２２１】
例えば、吸光度の測定、酵素結合免疫吸着測定法（ＥＬＩＳＡ）、酵素免疫測定法（ＥＩＡ）、放射免疫測定法（ＲＩＡ）、および／または免疫蛍光法を用いて、本発明の抗体の抗原結合活性を測定することができる。ＥＬＩＳＡの場合、本発明の抗体をプレート上に固定化し、本発明のペプチドを該プレートに添加し、次に抗体産生細胞の培養上清または精製抗体といった所望の抗体を含有する試料を添加する。次いで、一次抗体を認識し、アルカリホスファターゼなどの酵素で標識された二次抗体を添加し、プレートをインキュベートする。続いて洗浄後に、ｐ−ニトロフェニルリン酸などの酵素基質を該プレートに添加し、吸光度を測定して、試料の抗原結合活性を評価する。抗体の結合活性を評価するために、Ｃ末端断片またはＮ末端断片などのペプチド断片を抗原として用いてもよい。本発明の抗体の活性を評価するために、ＢＩＡｃｏｒｅ（Ｐｈａｒｍａｃｉａ）を使用してよい。
【０２２２】
本発明の抗体を本発明のペプチドを含有すると考えられる試料に対して曝露し、該抗体と該ペプチドとによって形成される免疫複合体を検出または測定することによって、上記の方法によって本発明のペプチドの検出または測定が可能になる。
本発明のペプチドを検出または測定する方法はペプチドを特異的に検出または測定することができるため、この方法は、該ペプチドを使用する種々の実験において使用され得る。
【０２２３】
ＸＩＩＩ．ベクターおよび宿主細胞
本発明はまた、本発明のペプチドをコードするポリヌクレオチドが導入されたベクターおよび宿主細胞を提供する。本発明のベクターは、本発明のペプチドを発現させるための、または、遺伝子治療のために本発明のポリヌクレオチドを投与するための、宿主細胞における本発明のヌクレオチドのキャリア、とりわけ、ＤＮＡのキャリアとしての有用性が見出される。
【０２２４】
大腸菌が宿主細胞として選択され、かつ、ベクターが大腸菌（例えば、ＪＭ１０９、ＤＨ５α、ＨＢ１０１またはＸＬ１Ｂｌｕｅ）において増幅され、また、大量に生成される場合、ベクターは、大腸菌内における増幅のために適する「複製起点」と、形質転換された大腸菌を選択するために適したマーカー遺伝子（例えば、アンピシリン、テトラサイクリン、カナマイシンまたはクロラムフェニコールなどの薬物によって選択される薬物耐性遺伝子）とを有する必要がある。例えば、Ｍ１３系ベクター、ｐＵＣ系ベクター、ｐＢＲ３２２、ｐＢｌｕｅｓｃｒｉｐｔ、ｐＣＲ−Ｓｃｒｉｐｔなどを用いることができる。加えて、ｐＧＥＭ−Ｔ、ｐＤＩＲＥＣＴ、およびｐＴ７もまた上記のベクターと同様に、ｃＤＮＡのサブクローニングおよび抽出に用いることができる。ベクターを本発明のタンパク質の産生に用いる場合には、発現ベクターが使用され得る。例えば、大腸菌内で発現させる発現ベクターは、大腸菌内で増幅するために上記の特徴を有する必要がある。大腸菌（例えば、ＪＭ１０９、ＤＨ５α、ＨＢ１０１またはＸＬ１  Ｂｌｕｅなど）が宿主細胞として使用される場合、ベクターは、所望の遺伝子を大腸菌において効率的に発現させることができるプロモーター、例えば、ｌａｃＺプロモーター（Ｗａｒｄ  ｅｔ  ａｌ．，Ｎａｔｕｒｅ  ３４１：５４４−６（１９８９）；ＦＡＳＥＢ  Ｊ  ６：２４２２−７（１９９２））、ａｒａＢプロモーター（Ｂｅｔｔｅｒ  ｅｔ  ａｌ．，Ｓｃｉｅｎｃｅ  ２４０：１０４１−３（１９８８））、Ｔ７プロモーターなどを有する必要がある。この点に関して、例えば、ｐＧＥＸ−５Ｘ−１（Ｐｈａｒｍａｃｉａ）、「ＱＩＡｅｘｐｒｅｓｓシステム」（Ｑｉａｇｅｎ）、ｐＥＧＦＰ、およびｐＥＴ（この場合、宿主は好ましくはＴ７  ＲＮＡポリメラーゼを発現するＢＬ２１である）を上記のベクターの代わりに用いることができる。さらにベクターは、ペプチド分泌のためのシグナル配列を含んでもよい。ペプチドを大腸菌のペリプラズムに分泌させる例示的なシグナル配列は、ｐｅｌＢシグナル配列（Ｌｅｉ  ｅｔ  ａｌ．，Ｊ  Ｂａｃｔｅｒｉｏｌ  １６９：４３７９（１９８７））である。ベクターを標的宿主細胞に導入する手段には、例えば塩化カルシウム法およびエレクトロポレーション法が含まれる。
【０２２５】
大腸菌に加えて、例えば、哺乳動物由来の発現ベクター（例えば、ｐｃＤＮＡ３（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ）およびｐＥＧＦ−ＢＯＳ（Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄｓ  Ｒｅｓ  １８（１７）：５３２２（１９９０））、ｐＥＦ、ｐＣＤＭ８）、昆虫細胞由来の発現ベクター（例えば、「Ｂａｃ−ｔｏ−ＢＡＣバキュロウイルス発現系」（ＧＩＢＣＯ  ＢＲＬ）、ｐＢａｃＰＡＫ８）、植物由来の発現ベクター（例えば、ｐＭＨ１、ｐＭＨ２）、動物ウイルス由来の発現ベクター（例えば、ｐＨＳＶ、ｐＭＶ、ｐＡｄｅｘＬｃｗ）、レトロウイルス由来の発現ベクター（例えば、ｐＺＩｐｎｅｏ）、酵母由来の発現ベクター（例えば、「ピキア（Ｐｉｃｈｉａ）発現キット」（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ）、ｐＮＶ１１、ＳＰ−Ｑ０１）および枯草菌（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｕｂｔｉｌｉｓ）由来の発現ベクター（例えば、ｐＰＬ６０８、ｐＫＴＨ５０）を、本発明のポリペプチドを産生させるために使用することができる。
【０２２６】
ベクターを動物細胞（例えば、ＣＨＯ細胞、ＣＯＳ細胞またはＮＩＨ３Ｔ３細胞など）において発現させるために、ベクターは、そのような細胞における発現のために必要なプロモーター、例えば、ＳＶ４０プロモーター（Ｍｕｌｌｉｇａｎ  ｅｔ  ａｌ．，Ｎａｔｕｒｅ  ２７７：１０８（１９７９））、ＭＭＬＶ−ＬＴＲプロモーター、ＥＦ１αプロモーター（Ｍｉｚｕｓｈｉｍａ  ｅｔ  ａｌ．，Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄｓ  Ｒｅｓ  １８：５３２２（１９９０））、ＣＭＶプロモーターなど、および、好ましくは、形質転換体を選択するためのマーカー遺伝子（例えば、薬物（例えば、ネオマイシン、Ｇ４１８）によって選択される薬物耐性遺伝子）を有する必要がある。これらの特徴を有する公知のベクターの例には、例えばｐＭＡＭ、ｐＤＲ２、ｐＢＫ−ＲＳＶ、ｐＢＫ−ＣＭＶ、ｐＯＰＲＳＶおよびｐＯＰ１３が含まれる。
【０２２７】
本明細書中下記において、本発明が、実施例を参照して、より詳細に記載される。しかしながら、下記の材料、方法および実施例は、本発明の特定の態様を行い、または使用することにおいて当業者を助けるために役立ち得るが、本発明の態様を例示することが意図されるだけであり、したがって、本発明の範囲を限定することは決して意図されない。当業者が容易に認識するように、本明細書に記載される方法および材料と類似するか、または同等である方法および材料を、本発明を実施することまたは試験することにおいて使用することができる。
【実施例】
【０２２８】
実験１
材料および方法
細胞株
ＨＬＡ−Ａ＊２４０２陽性Ｂリンパ芽球様細胞株であるＴＩＳＩを、ＩＨＷＧ  Ｃｅｌｌ  ａｎｄ  Ｇｅｎｅ  Ｂａｎｋ（Ｓｅａｔｔｌｅ，ＷＡ）から購入した。アフリカミドリザル腎細胞株であるＣＯＳ７は、ＡＴＣＣから購入した。
【０２２９】
ＳＥＭＡ５Ｂ由来ペプチドの候補選択
ＨＬＡ−Ａ＊２４０２分子と結合するＳＥＭＡ５Ｂ由来の９ｍｅｒおよび１０ｍｅｒペプチドを、結合予測ソフトウェア「ＢＩＭＡＳ」（ｈｔｔｐ：／／ｗｗｗ−ｂｉｍａｓ．ｃｉｔ．ｎｉｈ．ｇｏｖ／ｍｏｌｂｉｏ／ｈｌａ＿ｂｉｎｄ）（Ｐａｒｋｅｒ  ｅｔ  ａｌ．（Ｊ  Ｉｍｍｕｎｏｌ  １９９４，１５２（１）：１６３−７５)、Ｋｕｚｕｓｈｉｍａ  ｅｔ  ａｌ．（Ｂｌｏｏｄ  ２００１，９８（６）：１８７２−８１））および「ＮｅｔＭＨＣ３．２」（ｈｔｔｐ：／／ｗｗｗ．ｃｂｓ．ｄｔｕ．ｄｋ／ｓｅｒｖｉｃｅｓ／ＮｅｔＭＨＣ／）（Ｂｕｕｓ  ｅｔ  ａｌ．（Ｔｉｓｓｕｅ  Ａｎｔｉｇｅｎｓ．，６２：３７８−８４，２００３）、Ｎｉｅｌｓｅｎ  ｅｔ  ａｌ．（Ｐｒｏｔｅｉｎ  Ｓｃｉ．，１２：１００７−１７，２００３，Ｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓ，２０（９）：１３８８−９７，２００４））を使用して予測した。これらのペプチドは、Ｂｉｏｓｙｎｔｈｅｓｉｓ（Ｌｅｗｉｓｖｉｌｌｅ，Ｔｅｘａｓ）により、標準的な固相合成法に従って合成され、逆相高速液体クロマトグラフィー（ＨＰＬＣ）によって精製された。該ペプチドの純度（＞９０％）および同一性を、それぞれ分析用ＨＰＬＣおよび質量分析によって決定した。ペプチドをジメチルスルホキシドに２０ｍｇ／ｍｌで溶解し、−８０℃で保存した。
【０２３０】
インビトロでのＣＴＬ誘導
単球由来の樹状細胞（ＤＣ）を抗原提示細胞として用いて、ヒト白血球抗原（ＨＬＡ）上に提示されたペプチドに対する細胞傷害性Ｔリンパ球（ＣＴＬ）応答を誘導した。他所に記載されているように、ＤＣをインビトロで作製した（Ｎａｋａｈａｒａ  Ｓ  ｅｔ  ａｌ．，Ｃａｎｃｅｒ  Ｒｅｓ  ２００３  ＪＵＬ  １５，６３（１４）：４１１２−８）。具体的には、Ｆｉｃｏｌｌ−Ｐａｑｕｅ  ｐｌｕｓ（Ｐｈａｒｍａｃｉａ）溶液によって健常なボランティア（ＨＬＡ−Ａ＊２４０２陽性）から単離した末梢血単核細胞を、プラスチック製の組織培養ディッシュ（Ｂｅｃｔｏｎ  Ｄｉｃｋｉｎｓｏｎ）へ付着させることによって分離し、それらを単球画分として濃縮した。２％の加熱非働化した自己血清（ＡＳ）を含むＡＩＭ−Ｖ培地（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ）中、１０００ＩＵ／ｍｌの顆粒球マクロファージコロニー刺激因子（Ｒ＆Ｄ  Ｓｙｓｔｅｍ）および１０００ＩＵ／ｍｌのインターロイキン（ＩＬ）−４（Ｒ＆Ｄ  Ｓｙｓｔｅｍ）の存在下で、単球が濃縮された集団を培養した。７日間の培養後、サイトカインで誘導したＤＣに、ＡＩＭ−Ｖ培地中で３７℃で３時間、３μｇ／ｍｌのβ２−ミクログロブリンの存在下で、２０μｇ／ｍｌの各合成ペプチドをパルスした。作製された細胞は、自身の細胞表面上に、ＣＤ８０、ＣＤ８３、ＣＤ８６、およびＨＬＡクラスＩＩなどのＤＣ関連分子を発現しているようであった（データは示さず）。次いで、ペプチドパルスしたこれらのＤＣをＸ線照射（２０Ｇｙ）により不活化し、ＣＤ８  Ｐｏｓｉｔｉｖｅ  Ｉｓｏｌａｔｉｏｎ  Ｋｉｔ（Ｄｙｎａｌ）を用いた陽性選択によって得られた自己ＣＤ８＋Ｔ細胞と１：２０の比率で混合した。これらの培養物を４８ウェルプレート（Ｃｏｒｎｉｎｇ）中に準備し、各ウェルは、０．５ｍｌのＡＩＭ−Ｖ／２％ＡＳ培地中に、１．５×１０４個のペプチドパルスしたＤＣ、３×１０５個のＣＤ８＋Ｔ細胞、および１０ｎｇ／ｍｌのＩＬ−７（Ｒ＆Ｄ  Ｓｙｓｔｅｍ）を含んだ。３日後、これらの培養物に、ＩＬ−２（ＣＨＩＲＯＮ）を最終濃度２０ＩＵ／ｍｌまで添加した。７日目および１４日目に、ペプチドパルスした自己ＤＣでＴ細胞をさらに刺激した。ＤＣは上記と同じ方法によって毎回調製した。２１日目に、３回目のペプチド刺激後、ペプチドパルスしたＴＩＳＩ細胞に対してＣＴＬを試験した（Ｔａｎａｋａ  Ｈ  ｅｔ  ａｌ．，Ｂｒ  Ｊ  Ｃａｎｃｅｒ  ２００１  Ｊａｎ  ５，８４（１）：９４−９；Ｕｍａｎｏ  Ｙ  ｅｔ  ａｌ．，Ｂｒ  Ｊ  Ｃａｎｃｅｒ  ２００１  Ａｐｒ  ２０，８４（８）：１０５２−７；Ｕｃｈｉｄａ  Ｎ  ｅｔ  ａｌ．，Ｃｌｉｎ  Ｃａｎｃｅｒ  Ｒｅｓ  ２００４  Ｄｅｃ  １５，１０（２４）：８５７７−８６；Ｓｕｄａ  Ｔ  ｅｔ  ａｌ．，Ｃａｎｃｅｒ  Ｓｃｉ  ２００６  Ｍａｙ，９７（５）：４１１−９；Ｗａｔａｎａｂｅ  Ｔ  ｅｔ  ａｌ．，Ｃａｎｃｅｒ  Ｓｃｉ  ２００５  Ａｕｇ，９６（８）：４９８−５０６）。
【０２３１】
ＣＴＬ増殖手順
Ｒｉｄｄｅｌｌら（Ｗａｌｔｅｒ  ＥＡ  ｅｔ  ａｌ．，Ｎ  Ｅｎｇｌ  Ｊ  Ｍｅｄ  １９９５  Ｏｃｔ  １９，３３３（１６）：１０３８−４４；Ｒｉｄｄｅｌｌ  ＳＲ  ｅｔ  ａｌ．，Ｎａｔ  Ｍｅｄ  １９９６  Ｆｅｂ，２（２）：２１６−２３）によって記載されている方法と類似の方法を用いて、ＣＴＬを培養下で増殖させた。４０ｎｇ／ｍｌの抗ＣＤ３モノクローナル抗体（Ｐｈａｒｍｉｎｇｅｎ）の存在下で、マイトマイシンＣによって不活化した２種類のヒトＢリンパ芽球様細胞株と共に、合計５×１０４個のＣＴＬを２５ｍｌのＡＩＭ−Ｖ／５％ＡＳ培地中に懸濁した。培養開始１日後に、１２０ＩＵ／ｍｌのＩＬ−２を該培養物に添加した。５、８、および１１日目に、３０ＩＵ／ｍｌのＩＬ−２を含む新たなＡＩＭ−Ｖ／５％ＡＳ培地を、該培養物に供給した（Ｔａｎａｋａ  Ｈ  ｅｔ  ａｌ．，Ｂｒ  Ｊ  Ｃａｎｃｅｒ  ２００１  Ｊａｎ  ５，８４（１）：９４−９；Ｕｍａｎｏ  Ｙ  ｅｔ  ａｌ．，Ｂｒ  Ｊ  Ｃａｎｃｅｒ  ２００１  Ａｐｒ  ２０，８４（８）：１０５２−７；Ｕｃｈｉｄａ  Ｎ  ｅｔ  ａｌ．，Ｃｌｉｎ  Ｃａｎｃｅｒ  Ｒｅｓ  ２００４  Ｄｅｃ  １５，１０（２４）：８５７７−８６；Ｓｕｄａ  Ｔ  ｅｔ  ａｌ．，Ｃａｎｃｅｒ  Ｓｃｉ  ２００６  Ｍａｙ，９７（５）：４１１−９；Ｗａｔａｎａｂｅ  Ｔ  ｅｔ  ａｌ．，Ｃａｎｃｅｒ  Ｓｃｉ  ２００５  Ａｕｇ，９６（８）：４９８−５０６）。
【０２３２】
ＣＴＬクローンの樹立
９６丸底マイクロタイタープレート（Ｎａｌｇｅ  Ｎｕｎｃ  Ｉｎｔｅｒｎａｔｉｏｎａｌ）においてＣＴＬ０．３個、１個、および３個／ウェルとなるように、希釈を行った。ＣＴＬを、１×１０４個細胞／ウェルの２種類のヒトＢリンパ芽球様細胞株、３０ｎｇ／ｍｌの抗ＣＤ３抗体、および１２５ＩＵ／ｍｌのＩＬ−２と共に、合計１５０μｌ／ウェルの５％ＡＳ含有ＡＩＭ−Ｖ培地中で培養した。１０日後、５０μｌ／ウェルのＩＬ−２を、ＩＬ−２の最終濃度が１２５ＩＵ／ｍｌに到達するように該培地に添加した。１４日目にＣＴＬ活性を試験し、上記と同じ方法を用いてＣＴＬクローンを増殖させた（Ｕｃｈｉｄａ  Ｎ  ｅｔ  ａｌ．，Ｃｌｉｎ  Ｃａｎｃｅｒ  Ｒｅｓ  ２００４  Ｄｅｃ  １５，１０（２４）：８５７７−８６；Ｓｕｄａ  Ｔ  ｅｔ  ａｌ．，Ｃａｎｃｅｒ  Ｓｃｉ  ２００６  Ｍａｙ，９７（５）：４１１−９；Ｗａｔａｎａｂｅ  Ｔ  ｅｔ  ａｌ．，Ｃａｎｃｅｒ  Ｓｃｉ  ２００５  Ａｕｇ，９６（８）：４９８−５０６）。
【０２３３】
特異的ＣＴＬ活性
特異的ＣＴＬ活性を調べるために、ＩＦＮ−γ  ＥＬＩＳＰＯＴアッセイおよびＩＦＮ−γ  ＥＬＩＳＡを行った。ペプチドパルスしたＴＩＳＩ（１×１０４個／ウェル）を刺激細胞として調製した。４８ウェル中の培養細胞を応答細胞として使用した。ＩＦＮ−γ  ＥＬＩＳＰＯＴアッセイおよびＩＦＮ−γ  ＥＬＩＳＡは、製造業者の手順に従って行った。
【０２３４】
標的遺伝子およびＨＬＡ−Ａ２４のいずれか一方または両方を強制的に発現する細胞の樹立
標的遺伝子またはＨＬＡ−Ａ＊２４０２のオープンリーディングフレームをコードするｃＤＮＡをＰＣＲによって増幅した。ＰＣＲ増幅産物を発現ベクターにクローニングした。製造業者の推奨する手順に従ってリポフェクタミン２０００（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ）を用いて、標的遺伝子ヌルおよびＨＬＡ−Ａ＊２４０２ヌル細胞株であるＣＯＳ７に該プラスミドをトランスフェクトした。トランスフェクションから２日後、トランスフェクトした細胞をベルセン（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ）を用いて回収し、ＣＴＬ活性アッセイのための刺激細胞（５×１０４細胞／ウェル）として使用した。
【０２３５】
結果
がんにおけるＳＥＭＡ５Ｂ発現の増強
ｃＤＮＡマイクロアレイを用いて様々ながんから得られた包括的遺伝子発現プロファイルデータにより、ＳＥＭＡ５Ｂ（ＧｅｎＢａｎｋアクセッション番号ＮＭ＿００１０３１７０２；配列番号：７４）の発現ががん組織において、対応する正常組織と比較して特異的に上昇していることが明らかになった。ＳＥＭＡ５Ｂの発現は、２例の食道がんのうち１例、１例のＮＳＣＬＣのうち１例、１７例のＲＣＣのうち１４例、および４例のＳＣＬＣのうち４例において確かに上昇していた（表１）。
【０２３６】
【表１】
2016502499.tif 000002
【０２３７】
ＳＥＭＡ５Ｂ由来のＨＬＡ−Ａ２４結合ペプチドの予測
表２ａおよび２ｂは、ＨＬＡ−Ａ２４に結合するＳＥＭＡ５Ｂの９ｍｅｒおよび１０ｍｅｒペプチドを、結合親和性の高い順に示す。エピトープペプチドを決定するために、ＨＬＡ−Ａ２４結合能を有する可能性がある合計６９種のペプチドを選択して調べた。
【０２３８】
【表２ａ】
2016502499.tif 000003
2016502499.tif 000004
開始位置は、ＳＥＭＡ５ＢのＮ末端からのアミノ酸残基数を示す。
結合スコアおよび解離定数［Ｋｄ（ｎＭ）］は「ＢＩＭＡＳ」および「ＮｅｔＭＨＣ３．２」から導き出している。
【０２３９】
【表２ｂ】
2016502499.tif 000005
2016502499.tif 000006
開始位置は、ＳＥＭＡ５ＢのＮ末端からのアミノ酸残基数を示す。
結合スコアおよび解離定数［Ｋｄ（ｎＭ）］は「ＢＩＭＡＳ」および「ＮｅｔＭＨＣ３．２」から導き出している。
【０２４０】
ＨＬＡ−Ａ＊２４０２拘束性のＳＥＭＡ５Ｂ由来予測ペプチドによるＣＴＬ誘導
ＳＥＭＡ５Ｂ由来のそれらのペプチドに対するＣＴＬを、「材料および方法」に記載されるプロトコールに従って作製した。ペプチド特異的なＣＴＬ活性をＩＦＮ−γのＥＬＩＳＰＯＴアッセイによって検出した（図１ａ〜ｌ）。ＳＥＭＡ５Ｂ−Ａ２４−９−５１２（配列番号：２）を用いたウェル番号＃７（ａ）、ＳＥＭＡ５Ｂ−Ａ２４−９−１０１０（配列番号：３）を用いたウェル番号＃３（ｂ）、ＳＥＭＡ５Ｂ−Ａ２４−９−１９６（配列番号：４）を用いたウェル番号＃３（ｃ）、ＳＥＭＡ５Ｂ−Ａ２４−９−７２３（配列番号：８）を用いたウェル番号＃４（ｄ）、ＳＥＭＡ５Ｂ−Ａ２４−９−２８０（配列番号：９）を用いたウェル番号＃５（ｅ）、ＳＥＭＡ５Ｂ−Ａ２４−９−２９３（配列番号：１０）を用いたウェル番号＃３（ｆ）、ＳＥＭＡ５Ｂ−Ａ２４−９−４７０（配列番号：１３）を用いたウェル番号＃６（ｇ）、ＳＥＭＡ５Ｂ−Ａ２４−９−５５８（配列番号：２０）を用いたウェル番号＃３（ｈ）、ＳＥＭＡ５Ｂ−Ａ２４−１０−３５４（配列番号：４０）を用いたウェル番号＃４（ｉ）、ＳＥＭＡ５Ｂ−Ａ２４−１０−２９０(配列番号：４１）を用いたウェル番号＃６（ｊ）、ＳＥＭＡ５Ｂ−Ａ２４−１０−１０４４（配列番号：４７）を用いたウェル番号＃５（ｋ）およびＳＥＭＡ５Ｂ−Ａ２４−１０−４８９（配列番号：５４）を用いたウェル番号＃４（ｌ）は、対照ウェルと比較して強力なＩＦＮ−γ産生を実証した。一方で、表２ａおよび表２ｂに示される他のペプチドはＨＬＡ−Ａ＊２４０２との結合活性を有する可能性があるにもかかわらず、それらのペプチドによる刺激では、特異的なＣＴＬ活性は検出されなかった。典型的な陰性データとして、ＳＥＭＡ５Ｂ−Ａ２４−９−２４７（配列番号：１）により刺激されたＣＴＬからは、特異的なＩＦＮ−γ産生は観察されなかった（ｍ）。まとめると、これらの結果は、ＳＥＭＡ５Ｂ由来の１２種の選択されたペプチドが強力なＣＴＬを誘導できたことを示す。
【０２４１】
ＳＥＭＡ５Ｂ由来ペプチドに対するＣＴＬ株およびクローンの樹立
ＩＦＮ−γ  ＥＬＩＳＰＯＴアッセイによって検出されたペプチド特異的ＣＴＬ活性を示した、ＳＥＭＡ５Ｂ−Ａ２４−９−５１２(配列番号：２）を用いたウェル番号＃７、ＳＥＭＡ５Ｂ−Ａ２４−９−１０１０(配列番号：３）を用いたウェル番号＃３、ＳＥＭＡ５Ｂ−Ａ２４−９−２９３(配列番号：１０）を用いたウェル番号＃３およびＳＥＭＡ５Ｂ−Ａ２４−１０−２９０(配列番号：４１）を用いたウェル番号＃６における細胞を増殖させ、ＣＴＬ株を樹立した。これらのＣＴＬ株のＣＴＬ活性をＩＦＮ−γのＥＬＩＳＡによって測定した（図２）。ＣＴＬ株は、ペプチドパルスしなかった標的細胞と比較して、ＳＥＭＡ５Ｂ−Ａ２４−９−５１２（配列番号：２）（ａ）、ＳＥＭＡ５Ｂ−Ａ２４−９−１０１０（配列番号：３）（ｂ）、ＳＥＭＡ５Ｂ−Ａ２４−９−２９３（配列番号：１０）（ｃ）およびＳＥＭＡ５Ｂ−Ａ２４−１０−２９０（配列番号：４１）（ｄ）ペプチドでパルスした標的細胞に対して強力なＩＦＮ−γ産生を実証した。さらに、「材料および方法」に記載した通りに、ＣＴＬ株から限界希釈によってＣＴＬクローンを樹立し、ペプチドによってパルスされた標的細胞に対するＣＴＬクローンからのＩＦＮ−γ産生をＩＦＮ−γ  ＥＬＩＳＡによって測定した。強力なＩＦＮ−γ産生は、ＳＥＭＡ５Ｂ−Ａ２４−９−５１２（配列番号：２）（ａ）、ＳＥＭＡ５Ｂ−Ａ２４−９−１０１０（配列番号：３）（ｂ）、およびＳＥＭＡ５Ｂ−Ａ２４−１０−２９０（配列番号：４１）（ｃ）で刺激したＣＴＬクローンから観察された（図３）。
【０２４２】
ＳＥＭＡ５ＢおよびＨＬＡ−Ａ＊２４０２を発現する標的細胞に対する特異的ＣＴＬ活性
ＳＥＭＡ５Ｂ−Ａ２４−１０−２９０（配列番号：４１）ペプチドに対して産生された樹立ＣＴＬ株を、ＳＥＭＡ５ＢおよびＨＬＡ−Ａ＊２４０２分子を発現する標的細胞を認識する能力に関して調べた。全長ＳＥＭＡ５ＢおよびＨＬＡ−Ａ＊２４０２遺伝子の両方をトランスフェクトしたＣＯＳ７細胞（ＳＥＭＡ５ＢおよびＨＬＡ−Ａ＊２４０２遺伝子を発現する標的細胞の特異的モデル）を刺激細胞として調製し、全長ＳＥＭＡ５ＢまたはＨＬＡ−Ａ＊２４０２のどちらか一方をトランスフェクトしたＣＯＳ７細胞を対照として使用した。図４において、ＳＥＭＡ５Ｂ−Ａ２４−１０−２９０（配列番号：４１）で刺激したＣＴＬ株は、ＳＥＭＡ５ＢおよびＨＬＡ−Ａ＊２４０２の両方を発現するＣＯＳ７細胞に対して強力なＣＴＬ活性を示した。一方、対照に対して有意な特異的ＣＴＬ活性は検出されなかった。したがって、このデータにより、ＳＥＭＡ５Ｂ−Ａ２４−１０−２９０（配列番号：４１）ペプチドが内因的にプロセシングされ、ＨＬＡ−Ａ＊２４０２分子とともに標的細胞上に発現され、ＣＴＬによって認識されたことが明確に実証される。これらの結果は、ＳＥＭＡ５Ｂに由来するこのペプチドが、ＳＥＭＡ５Ｂを発現する腫瘍を有する患者にがんワクチンを適用するために利用可能であり得ることを示した。
【０２４３】
抗原ペプチドの相同性解析
ＳＥＭＡ５Ｂ−Ａ２４−９−５１２（配列番号：２）、ＳＥＭＡ５Ｂ−Ａ２４−９−１０１０（配列番号：３）、ＳＥＭＡ５Ｂ−Ａ２４−９−１９６（配列番号：４）、ＳＥＭＡ５Ｂ−Ａ２４−９−７２３（配列番号：８）、ＳＥＭＡ５Ｂ−Ａ２４−９−２８０（配列番号：９）、ＳＥＭＡ５Ｂ−Ａ２４−９−２９３（配列番号：１０）、ＳＥＭＡ５Ｂ−Ａ２４−９−４７０（配列番号：１３）、ＳＥＭＡ５Ｂ−Ａ２４−９−５５８（配列番号：２０）、ＳＥＭＡ５Ｂ−Ａ２４−１０−３５４（配列番号：４０）、ＳＥＭＡ５Ｂ−Ａ２４−１０−２９０(配列番号：４１）、ＳＥＭＡ５Ｂ−Ａ２４−１０−１０４４（配列番号：４７）およびＳＥＭＡ５Ｂ−Ａ２４−１０−４８９（配列番号：５４）で刺激したＣＴＬは、有意かつ特異的なＣＴＬ活性を示した。これらの結果は、ＳＥＭＡ５Ｂ−Ａ２４−９−５１２（配列番号：２）、ＳＥＭＡ５Ｂ−Ａ２４−９−１０１０（配列番号：３）、ＳＥＭＡ５Ｂ−Ａ２４−９−１９６（配列番号：４）、ＳＥＭＡ５Ｂ−Ａ２４−９−７２３（配列番号：８）、ＳＥＭＡ５Ｂ−Ａ２４−９−２８０（配列番号：９）、ＳＥＭＡ５Ｂ−Ａ２４−９−２９３（配列番号：１０）、ＳＥＭＡ５Ｂ−Ａ２４−９−４７０（配列番号：１３）、ＳＥＭＡ５Ｂ−Ａ２４−９−５５８（配列番号：２０）、ＳＥＭＡ５Ｂ−Ａ２４−１０−３５４（配列番号：４０）、ＳＥＭＡ５Ｂ−Ａ２４−１０−２９０（配列番号：４１）、ＳＥＭＡ５Ｂ−Ａ２４−１０−１０４４（配列番号：４７）およびＳＥＭＡ５Ｂ−Ａ２４−１０−４８９（配列番号：５４）の配列が、ヒト免疫系を感作することが知られている他の分子に由来するペプチドと相同的であるという事実に起因する可能性がある。この可能性を排除するために、ＢＬＡＳＴアルゴリズム（ｈｔｔｐ：／／ｂｌａｓｔ．ｎｃｂｉ．ｎｌｍ．ｎｉｈ．ｇｏｖ／Ｂｌａｓｔ．ｃｇｉ）を用いて、クエリーとしてのこれらのペプチド配列に対して相同性解析を行ったが、有意な相同性を有する配列は認められなかった。相同性解析の結果は、ＳＥＭＡ５Ｂ−Ａ２４−９−５１２（配列番号：２）、ＳＥＭＡ５Ｂ−Ａ２４−９−１０１０（配列番号：３）、ＳＥＭＡ５Ｂ−Ａ２４−９−１９６（配列番号：４）、ＳＥＭＡ５Ｂ−Ａ２４−９−７２３（配列番号：８）、ＳＥＭＡ５Ｂ−Ａ２４−９−２８０（配列番号：９）、ＳＥＭＡ５Ｂ−Ａ２４−９−２９３（配列番号：１０）、ＳＥＭＡ５Ｂ−Ａ２４−９−４７０（配列番号：１３）、ＳＥＭＡ５Ｂ−Ａ２４−９−５５８（配列番号：２０）、ＳＥＭＡ５Ｂ−Ａ２４−１０−３５４（配列番号：４０）、ＳＥＭＡ５Ｂ−Ａ２４−１０−２９０（配列番号：４１）、ＳＥＭＡ５Ｂ−Ａ２４−１０−１０４４（配列番号：４７）およびＳＥＭＡ５Ｂ−Ａ２４−１０−４８９（配列番号：５４）の配列が固有のものであることを示し、したがって本発明者らの知る限りでは、これらの分子が、何らかの非関連分子に対して意図しない免疫学的応答を引き起こす可能性はほとんどない。
【０２４４】
結論として、本明細書において同定されたＳＥＭＡ５Ｂ由来の新規ＨＬＡ−Ａ＊２４０２エピトープペプチドは、がん免疫療法の分野で有用であることが見いだされ得る。
【産業上の利用可能性】
【０２４５】
本発明は、強力かつ特異的な抗腫瘍免疫応答を誘導し、かつ幅広いがんの種類に対する適用性を有し得る、ＳＥＭＡ５Ｂ由来の新規エピトープペプチドを提供する。そのようなペプチドは、ＳＥＭＡ５Ｂに関連する疾患、例えばがん、より詳細には食道がん、ＮＳＣＬＣ、ＲＣＣおよびＳＣＬＣに対するペプチドワクチンとして利用することができる。
【０２４６】
本明細書において、本発明をその特定の態様に関して詳細に説明しているが、前述の説明は本質的に例示的かつ説明的なものであって、本発明およびその好ましい態様を説明することを意図していることが理解されるべきである。慣例的な実験を通して、当業者は、その境界および限界が添付の特許請求の範囲によって定義される本発明の精神および範囲から逸脱することなく、様々な変更および改変がその中でなされ得ることを容易に認識するであろう。
【図１−１】
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【図１−２】
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【図２】
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【図３】
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【図４】
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【国際調査報告】
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