(57)【要約】データの可視化をもたらすための方法が提供される。本方法は、複数の反応部位からの蛍光発光値に関連する複数のデータ点を受信することを含む。この蛍光発光値は、第１の種類の色素及び第２の種類の色素に関する情報を含む。本方法は、複数の反応部位の場所の表現内に、第１の種類の色素に関連する複数のデータ点の第１の部分を表示することと、同表現内に、第２の種類の色素に関連する複数のデータ点の第２の部分を表示することと、をさらに含む。本方法は、散布図の表示内に、複数のデータ点の第１の部分を表示することをさらに含む。この散布図は、第１の色素に関連する蛍光値をｙ軸上に、及び第２の色素に関連する蛍光値をｘ軸上に示す。本方法は、散布図の表示内に、複数のデータ点の第２の部分を表示することを含む。【選択図】図２
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【特許請求の範囲】
【請求項１】
データの可視化をもたらすための方法であって、
第１の指標を用いて、第１のデータ品質レベルの複数のデータ点の第１の部分を生成することと、
第２の指標を用いて、品質閾値によって決定される第２のデータ品質レベルの前記複数のデータ点の第２の部分を生成することと、
前記複数のデータ点が得られた場所の表現内に、前記複数のデータ点の前記第１の部分及び第２の部分を表示することと、
前記複数のデータ点の前記第１の部分及び前記第２の部分を含む前記表現とともにヒストグラムを表示することと、を含む、前記方法。
【請求項２】
前記品質閾値が調整されることにより、前記複数のデータ点の前記第１の部分及び前記第２の部分が調整される、請求項１に記載の前記方法。
【請求項３】
前記第１の指標が、１つの色であり、前記第２の指標が、第２の色である、請求項１に記載の前記方法。
【請求項４】
前記第１のデータ品質レベル及び第２のデータ品質レベルそれぞれが、ある範囲のデータ品質値を含む、請求項１に記載の前記方法。
【請求項５】
前記複数のデータ点が、基板の複数の反応部位からの蛍光発光を表現する、請求項１に記載の前記方法。
【請求項６】
前記蛍光発光が、標的核酸の陽性または陰性増幅を示す、請求項５に記載の前記方法。
【請求項７】
前記ヒストグラムが、蛍光発光値によってビニングされた多数のデータ点を表示する、請求項１に記載の前記方法。
【請求項８】
データの可視化をもたらすためのシステムであって、
メモリと、
プロセッサであって、
第１の指標を用いて、第１のデータ品質レベルの複数のデータ点の第１の部分を生成するため、
第２の指標を用いて、品質閾値によって決定される第２のデータ品質レベルの前記複数のデータ点の第２の部分を生成するため、
前記複数のデータ点が得られた場所の表現内に、前記複数のデータ点の前記第１の部分及び第２の部分を表示するため、
前記複数のデータ点の前記第１の部分及び前記第２の部分を含む前記表現とともにヒストグラムを表示するため、のプロセッサと、を備える、前記システム。
【請求項９】
前記品質閾値が調整されることにより、前記複数のデータ点の前記第１の部分及び前記第２の部分が調整される、請求項８に記載の前記システム。
【請求項１０】
前記第１の指標が、１つの色であり、前記第２の指標が、第２の色である、請求項８に記載の前記システム。
【請求項１１】
前記第１のデータ品質レベル及び第２のデータ品質レベルそれぞれが、ある範囲のデータ品質値を含む、請求項８に記載の前記システム。
【請求項１２】
前記複数のデータ点が、基板の複数の反応部位からの蛍光発光を表現する、請求項８に記載の前記システム。
【請求項１３】
前記蛍光発光が、標的核酸の陽性または陰性増幅を示す、請求項１２に記載の前記システム。
【請求項１４】
前記ヒストグラムが、蛍光発光値によってビニングされた多数のデータ点を表示する、請求項８に記載の前記システム。
【請求項１５】
データの可視化をもたらすための、プロセッサによって実行可能な命令で符号化されたコンピュータ可読記憶媒体であって、前記命令が、
第１の指標を用いて、第１のデータ品質レベルの複数のデータ点の第１の部分を生成するため、
第２の指標を用いて、品質閾値によって決定される第２のデータ品質レベルの前記複数のデータ点の第２の部分を生成するため、
前記複数のデータ点が得られた場所の表現内に、前記複数のデータ点の前記第１の部分及び第２の部分を表示するため、
前記複数のデータ点の前記第１の部分及び前記第２の部分を含む前記表現とともにヒストグラムを表示するため、の命令を含む、前記コンピュータ可読記憶媒体。
【請求項１６】
前記品質閾値が調整されることにより、前記複数のデータ点の前記第１の部分及び前記第２の部分が調整される、請求項１５に記載の前記コンピュータ可読記憶媒体。
【請求項１７】
前記第１の指標が、１つの色であり、前記第２の指標が、第２の色である、請求項１５に記載の前記コンピュータ可読記憶媒体。
【請求項１８】
前記第１のデータ品質レベル及び第２のデータ品質レベルそれぞれが、ある範囲のデータ品質値を含む、請求項１５に記載の前記コンピュータ可読記憶媒体。
【請求項１９】
前記複数のデータ点が、基板の複数の反応部位からの蛍光発光を表現する、請求項１５に記載の前記コンピュータ可読記憶媒体。
【請求項２０】
前記蛍光発光が、標的核酸の陽性または陰性増幅を示す、請求項１９に記載の前記コンピュータ可読記憶媒体。
【請求項２１】
前記ヒストグラムが、蛍光発光値によってビニングされた多数のデータ点を表示する、請求項１５に記載の前記コンピュータ可読記憶媒体。
【請求項２２】
データの可視化をもたらすための方法であって、
複数の反応部位からの蛍光発光値に関連する複数のデータ点を受信することであって、前記蛍光発光値が、第１の種類の色素及び第２の種類の色素に関する情報を含む、受信することと、
前記複数の反応部位の場所の表現内に、前記第１の種類の色素に関連する前記複数のデータ点の第１の部分を表示することと、
前記表現内に、前記第２の種類の色素に関連する前記複数のデータ点の第２の部分を表示することと、
散布図の表示内に、前記複数のデータ点の前記第１の部分を表示することであって、前記散布図が、前記第１の色素に関連する蛍光値をｙ軸上に、及び前記第２の色素に関連する蛍光値をｘ軸上に示す、表示することと、
前記散布図の表示内に、前記複数のデータ点の前記第２の部分を表示することと、を含む、前記方法。
【請求項２３】
前記第１の種類の色素からの蛍光発光の存在が、第１の標的核酸の増幅を示し、前記第２の種類の色素からの蛍光発光の存在が、第２の標的核酸の増幅を示す、請求項２２に記載の前記方法。
【請求項２４】
前記第１の種類の色素及び前記第２の種類の色素の検出に関連する前記複数のデータ点の第３の部分を表示することをさらに含み、前記第１の種類の色素及び前記第２の種類の色素に関連するデータ点が、前記第１の標的核酸及び前記第２の標的核酸の増幅を示す、請求項２３に記載の前記方法。
【請求項２５】
データの可視化をもたらすためのシステムであって、
メモリと、
プロセッサであって、
複数の反応部位からの蛍光発光値に関連する複数のデータ点を受信することであって、前記蛍光発光値が、第１の種類の色素及び第２の種類の色素に関する情報を含む、受信することと、
前記複数の反応部位の場所の表現内に、前記第１の種類の色素に関連する複数のデータ点の第１の部分を表示することと、
前記表現内に、前記第２の種類の色素に関連する前記複数のデータ点の第２の部分を表示することと、
散布図の表示内に、前記複数のデータ点の前記第１の部分を表示することであって、前記散布図が、前記第１の色素に関連する蛍光値をｙ軸上に、及び前記第２の色素に関連する蛍光値をｘ軸上に示す、表示することと、
前記散布図の表示内に、前記複数のデータ点の前記第２の部分を表示することと、のためのプロセッサと、を備える、前記システム。
【請求項２６】
前記第１の種類の色素からの蛍光発光の存在が、第１の標的核酸の増幅を示し、前記第２の種類の色素からの蛍光発光の存在が、第２の標的核酸の増幅を示す、請求項２５に記載の前記システム。
【請求項２７】
前記第１の種類の色素及び前記第２の種類の色素の検出に関連する前記複数のデータ点の第３の部分を表示することをさらに含み、前記第１の種類の色素及び前記第２の種類の色素に関連するデータ点が、前記第１の標的核酸及び前記第２の標的核酸の増幅を示す、請求項２６に記載の前記システム。
【請求項２８】
データの可視化をもたらすための、プロセッサによって実行可能な命令で符号化されたコンピュータ可読記憶媒体であって、前記命令が、
複数の反応部位からの蛍光発光値に関連する複数のデータ点を受信することであって、前記蛍光発光値が、第１の種類の色素及び第２の種類の色素に関する情報を含む、受信することと、
前記複数の反応部位の場所の表現内に、前記第１の種類の色素に関連する複数のデータ点の第１の部分を表示することと、
前記表現内に、前記第２の種類の色素に関連する前記複数のデータ点の第２の部分を表示することと、
散布図の表示内に、前記複数のデータ点の前記第１の部分を表示することであって、前記散布図が、前記第１の色素に関連する蛍光値をｙ軸上に、及び前記第２の色素に関連する蛍光値をｘ軸上に示す、表示することと、
前記散布図の表示内に、前記複数のデータ点の前記第２の部分を表示することと、のための命令を含む、前記コンピュータ可読記憶媒体。
【請求項２９】
前記第１の種類の色素からの蛍光発光の存在が、第１の標的核酸の増幅を示し、前記第２の種類の色素からの蛍光発光の存在が、第２の標的核酸の増幅を示す、請求項２８に記載の前記コンピュータ可読記憶媒体。
【請求項３０】
前記第１の種類の色素及び前記第２の種類の色素の検出に関連する前記複数のデータ点の第３の部分を表示することであって、前記第１の種類の色素及び前記第２の種類の色素に関連するデータ点が、前記第１の標的核酸及び前記第２の標的核酸の増幅を示す、表示すること、のための命令をさらに含む、請求項２９に記載の前記コンピュータ可読記憶媒体。
【発明の詳細な説明】
【背景技術】
【０００１】
生物学的及び生化学的反応用のシステムは、そのような反応をリアルタイムで監視、測定、及び／または分析するために使用されてきた。そのようなシステムは、シーケンシング、遺伝子型判定、ポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）、及び他の生化学的反応において、進行を監視するため及び定量的データを提供するために一般的に使用される。
【０００２】
現在、試験または実験当たりより多くの反応を提供するという需要が高まっており、かつてないほど多くの反応を同時に実行することを可能にする機器が生み出されている。試験または実験における試料採取部位の数の増加により、かつてないほど少ない試料体積を提供するマイクロタイタープレート及び他のサンプルフォーマットがもたらされた。さらに、デジタルＰＣＲ（ｄＰＣＲ）等の技術は、多数の試験試料の全てまたは大部分に０または１つの標的ヌクレオチド配列を含有するより小さい試料体積に対する需要を高めている。
【０００３】
デジタルＰＣＲは、希少な対立遺伝子の濃度を検出及び定量するため、核酸試料の絶対定量を提供するため、ならびに核酸濃度における小さい倍変化を測定するために使用することができる。一般的に、複製物の数を増加させると、ｄＰＣＲの結果の正確性及び再現性が増加する。
【０００４】
ｄＰＣＲにおいて、比較的少数の標的ポリヌクレオチド配列またはヌクレオチド配列を含有する溶液は、各試料が、概して、標的ヌクレオチド配列の１つの分子を含有するか、または標的ヌクレオチド配列を全く含有しないかのいずれかとなるように、多数の少量の試験試料に分割することができる。ＰＣＲプロトコル、手順、または実験において、試料が後に熱サイクルにかけられる場合、標的ヌクレオチド配列を含有する試料は、増幅され、陽性検出信号を生成する一方で、標的ヌクレオチド配列を含有しない試料は、増幅されず、検出信号を生成しない。
【０００５】
さらなる分析のために、ｄＰＣＲ実験から収集されたデータのおびただしい数のデータ点をユーザに有用な様式で体系化及び可視化することは、困難である。
【発明の概要】
【課題を解決するための手段】
【０００６】
例示的な一実施形態において、データの可視化をもたらすための方法が提供される。本方法は、複数の反応部位からの蛍光発光値に関連する複数のデータ点を受信することを含む。この蛍光発光値は、第１の種類の色素及び第２の種類の色素に関する情報を含む。本方法は、複数の反応部位の場所の表現内に、第１の種類の色素に関連する複数のデータ点の第１の部分を表示することと、同表現内に、第２の種類の色素に関連する複数のデータ点の第２の部分を表示することと、をさらに含む。本方法は、散布図の表示内に、複数のデータ点の第１の部分を表示することをさらに含む。この散布図は、第１の色素に関連する蛍光値をｙ軸上に、及び第２の色素に関連する蛍光値をｘ軸上に示す。本方法は、散布図の表示内に、複数のデータ点の第２の部分を表示することを含む。
【図面の簡単な説明】
【０００７】
【図１】本明細書に記載される種々の実施形態が実装され得る例示的な演算システムを示す。
【図２】本明細書に記載される種々の実施形態によるチップ表現及びヒストグラムを含むデータの可視化を示す。
【図３】本明細書に記載される種々の実施形態によるチップ表現及びヒストグラムを含むデータの可視化を示す。
【図４】本明細書に記載される種々の実施形態によるチップ表現及びヒストグラムを含むデータの可視化を示す。
【図５】本明細書に記載される種々の実施形態によるスライダーバーを示す。
【図６】本明細書に記載される種々の実施形態によるチップ表現及びヒストグラムを含むデータの可視化を示す。
【図７】本明細書に記載される種々の実施形態によるチップ表現及び散布図を含むデータの可視化を示す。
【図８】本明細書に記載される種々の実施形態によるチップ表現及び散布図を含むデータの可視化を示す。
【図９】本明細書に記載される種々の実施形態によるチップ表現及び散布図を含むデータの可視化を示す。
【図１０】本明細書に記載される種々の実施形態によるチップ表現及び散布図を含むデータの可視化を示す。
【図１１】本明細書に記載される種々の実施形態による散布図を含むデータの可視化を示す。
【図１２】本明細書に記載される種々の実施形態による散布図を含むデータの可視化を示す。
【図１３】本明細書に記載される種々の実施形態による散布図を含むデータの可視化を示す。
【発明を実施するための形態】
【０００８】
本発明のより完全な理解を提供するために、以下の説明は、特定の構成、パラメータ、例等の数多くの具体的な詳細について記述する。しかしながら、そのような説明は、本発明の範囲に対する制約であることを意図するものではなく、例示的な実施形態のよりよい説明を提供することを意図するものであることを理解されたい。
【０００９】
種々の実施形態において、本明細書に記載されるデバイス、機器、システム、及び方法は、１つ以上の種類の該当する生体成分を検出するために使用されてもよい。これらの該当する生体成分は、限定されないが、ＤＮＡ配列（細胞フリーＤＮＡを含む）、ＲＮＡ配列、遺伝子、オリゴヌクレオチド、分子、タンパク質、バイオマーカー、細胞（例えば、血中循環腫瘍細胞）、または任意の他の好適な標的生体分子を含む、任意の好適な生物学的標的であってもよい。
【００１０】
種々の実施形態において、そのような生体成分は、胎児診断、多重ｄＰＣＲ、ウイルス検出及び定量標準、遺伝子型決定、配列決定の検証、突然変異検出、遺伝子組換え生物の検出、稀少対立遺伝子の検出、及びコピー数多型等の用途において、種々のＰＣＲ、ｑＰＣＲ、及び／またはｄＰＣＲの方法ならびにシステムとともに使用されてもよい。本開示の実施形態は、一般に、多数の小体積試料の生物学的反応を監視または測定するためのデバイス、機器、システム、及び方法を対象とする。本明細書において使用される場合、試料は、例えば、試料体積または反応体積と称されてもよい。
【００１１】
一般に、多数の試料が処理される定量的ポリメラーゼ連鎖反応（ｑＰＣＲ）に適用可能であるが、任意の好適なＰＣＲ法が、本明細書に記載される種々の実施形態に従って使用され得ることを理解されたい。好適なＰＣＲ法は、限定されないが、例えば、デジタルＰＣＲ、対立遺伝子特異的ＰＣＲ、非対称ＰＣＲ、ライゲーション媒介ＰＣＲ、多重ＰＣＲ、ネステッドＰＣＲ、ｑＰＣＲ、ゲノムウォーキング、及びブリッジＰＣＲを含む。
【００１２】
以下に記載されるように、本明細書に記載される種々の実施形態によれば、反応部位は、限定されないが、例えば、貫通孔、ウェル、窪み、スポット、空洞、試料保持領域、及び反応チャンバを含んでもよい。
【００１３】
さらに、本明細書で使用される場合、熱サイクルは、例えば、サーマルサイクラー、等温増幅、熱対流、赤外線媒介による熱サイクル、またはヘリカーゼ依存増幅を使用することを含んでもよい。いくつかの実施形態において、チップは、内蔵型加熱要素と統合されてもよい。種々の実施形態において、チップは、半導体と統合されてもよい。
【００１４】
種々の実施形態によれば、標的の検出は、限定されないが、例えば、単独でまたは組み合わせて、蛍光検出、陽イオンもしくは陰イオンの検出、ｐＨ検出、電圧検出、または電流検出であってもよい。
【００１５】
本明細書に記載される種々の実施形態は、特にデジタルＰＣＲ（ｄＰＣＲ）に適している。デジタルＰＣＲにおいて、比較的少数の標的ポリヌクレオチド配列またはヌクレオチド配列を含有する溶液は、各試料が、概して、標的ヌクレオチド配列の１つの分子を含有するか、または標的ヌクレオチド配列を全く含有しないかのいずれかとなるように、多数の少量の試験試料に分割することができる。ＰＣＲプロトコル、手順、または実験において、試料が後に熱サイクルにかけられる場合、標的ヌクレオチド配列を含有する試料は、増幅され、陽性検出信号を生成する一方で、標的ヌクレオチド配列を含有しない試料は、増幅されず、検出信号を生成しない。ポアソン統計を用いて、元の溶液中の標的ヌクレオチド配列の数を、陽性検出信号を生成する試料の数と相関させることができる。
【００１６】
典型的なｄＰＣＲプロトコル、手順、または実験を行うために、最初の試料溶液を、単純かつ費用対効果の高い様式で、それぞれが数ナノリットル、１ナノリットルもしくはほぼ１ナノリットル、または１ナノリットル未満の体積を有する何万または何十万もの試験試料に分割できることが有利である。標的ヌクレオチド配列の数は非常に少ない場合があるため、そのような状況では、最初の溶液の全含有量が複数の反応部位に考慮され、含まれることも重要であり得る。
【００１７】
本明細書に記載される実施形態は、最初の試料溶液を、試料溶液の全て、または本質的に全てを説明する様式で複数の反応部位に分布させることにより、これら及び他のｄＰＣＲ設計上の制約を解決する。
【００１８】
種々の実施形態において、本明細書に記載されるデバイス、機器、システム、及び方法は、１つ以上の種類の該当する生体成分を検出するために使用されてもよい。これらの該当する生体成分は、限定されないが、ＤＮＡ配列、ＲＮＡ配列、遺伝子、オリゴヌクレオチド、または細胞（例えば、血中循環腫瘍細胞）を含んでもよい。種々の実施形態において、そのような生体成分は、胎児診断、多重ｄＰＣＲ、ウイルス検出及び定量標準、遺伝子型決定、配列決定の検証、突然変異検出、遺伝子組換え生物の検出、稀少対立遺伝子の検出、及びコピー数多型等の用途において、種々のＰＣＲ、ｑＰＣＲ、及び／またはｄＰＣＲの方法ならびにシステムとともに使用されてもよい。
【００１９】
前述のように、デジタルＰＣＲ技術全般は、数千のデータ点を生成する。これは、ユーザが、有用なデータまたは良質なデータの予備的指標等のそれらの実験についての情報を、迅速かつ容易に知るためにデータを可視化できるようにするのに有用である。新たなグラフィック技術は、人がデータを検討し操作することを可能にするために必要とされる。
【００２０】
本教示の種々の実施形態において、データは、特有の場所で表示されてもよい。例えば、データは、２次元（ｘ、ｙ座標）でユーザに表示されてもよい。データはまた、良品質のものから粗悪品質のものまで、データを示す品質値がユーザに明白であるように、表示されてもよい。なおも他の実施形態において、データと関連付けられる異なる色素が、表示されてもよい。例えば、ＦＡＭ色素と関連付けられるデータ及びＶＩＣ色素と関連付けられるデータは、ユーザが結果を可視化できるように、示されてもよい。他の実施形態において、プロセシングシステムがデータ点と関連付けられると決定した陽性及び陰性コールが、可視化され得る。
【００２１】
当業者であれば、種々の実施形態の動作が、必要に応じて、ハードウェア、ソフトウェア、ファームウェア、またはそれらの組み合わせを使用して実装され得ることを理解するであろう。例えば、いくつかのプロセスは、ソフトウェア、ファームウェア、またはハードワイヤードロジックの制御下で、プロセッサまたは他のデジタル回路を使用して実行することができる。（本明細書における「ロジック」という用語は、記載される機能を実行する当業者によって理解されるように、固定ハードウェア、プログラム可能ロジック、及び／またはそれらの適切な組み合わせを指す。）ソフトウェア及びファームウェアは、コンピュータ可読媒体に格納することができる。当業者には周知であるように、アナログ回路を使用して他のいくつかのプロセスを実装することができる。さらに、メモリまたは他の記憶装置、及び通信コンポーネントが、本発明の実施形態に利用されてもよい。
【００２２】
図１は、サーマルサイクラーシステム（図示せず）の実施形態が利用し得る、種々
の実施形態に従って処理機能を実行するために利用され得るコンピュータシステム１００を示すブロック図である。演算システム１００は、プロセッサ１０４等の１つ以上のプロセッサを含むことができる。プロセッサ１０４は、例えば、マイクロプロセッサ、コントローラ、または他の制御ロジック等の汎用または専用の処理エンジンを使用して実装することができる。この例では、プロセッサ１０４は、バス１０２または他の通信媒体に接続される。
【００２３】
さらに、図１の演算システム１００は、ラックマウントコンピュータ、メインフレーム、スーパーコンピュータ、サーバ、クライアント、デスクトップコンピュータ、ラップトップコンピュータ、タブレットコンピュータ、携帯用通信デバイス（例えば、ＰＤＡ、携帯電話、スマートフォン、パームトップ等）、クラスタグリッド、ネットブック、組込みシステム等の多数の形態のうちのいずれか、または所与のアプリケーションもしくは環境に望ましいかもしくは適切であり得る任意の他の種類の専用もしくは汎用の計算デバイスにおいて具現化することができることを理解されたい。また、演算システム１００は、クライアント／サーバ環境及び１つ以上のデータベースサーバ、またはＬＩＳ／ＬＩＭＳインフラストラクチャーとの統合を含む従来のネットワークシステムを含むことができる。ローカルエリアネットワーク（ＬＡＮ）またはワイドエリアネットワーク（ＷＡＮ）を含む、またワイヤレス及び／もしくは有線コンポーネントを含む、多数の従来のネットワークシステムが当該技術分野において既知である。また、クライアント／サーバ環境、データベースサーバ、及びネットワークは、当該技術分野において十分に立証されている。
【００２４】
演算システム１００は、バス１０２または情報を伝達するための他の通信機構、及び情報を処理するためにバス１０２に連結されたプロセッサ１０４を含んでもよい。
【００２５】
演算システム１００はまた、プロセッサ１０４によって実行されるべき命令を格納するためにバス１０２に連結された、ランダムアクセスメモリ（ＲＡＭ）または他の動的メモリであり得るメモリ１０６を含む。メモリ１０６はまた、プロセッサ１０４によって実行されるべき命令の実行中に一次変数または他の中間情報を格納するために使用されてもよい。演算システム１００はさらに、プロセッサ１０４への静的情報及び命令を格納するために、バス１０２に連結された読み出し専用メモリ（ＲＯＭ）１０８または他の静的記憶装置を含む。
【００２６】
演算システム１００はまた、情報及び命令を格納するために提供され、バス１０２に連結された、磁気ディスク、光ディスク、または、ソリッドステートドライブ（ＳＳＤ）等の記憶装置１１０を含んでもよい。記憶装置１１０は、メディアドライブ及び取り外し可能なストレージインターフェースを含んでもよい。メディアドライブは、ハードディスクドライブ、フロッピー（登録商標）ディスクドライブ、磁気テープドライブ、光ディスクドライブ、ＣＤもしくはＤＶＤドライブ（ＲもしくはＲＷ）、フラッシュドライブ、または他の取り外し可能なもしくは固定式のメディアドライブ等の、固定式または取り外し可能な記憶媒体をサポートするためのドライブまたは他の機構を含んでもよい。これらの例が示すように、記憶媒体は、特定のコンピュータソフトウェア、命令、またはデータが格納されたコンピュータ可読記憶媒体を含んでもよい。
【００２７】
代替の実施形態において、記憶装置１１０は、コンピュータプログラムまたは他の命令もしくはデータを演算システム１００にロードすることを可能にするための他の同様の手段を含んでもよい。そのような手段は、例えば、プログラムカートリッジ及びカートリッジインターフェース等の取り外し可能な記憶部及びインターフェース、取り外し可能なメモリ（例えば、フラッシュメモリまたは他の取り外し可能なメモリモジュール）及びメモリスロット、ならびに記憶装置１１０から演算システム１００にソフトウェア及びデータを転送することを可能にする他の取り外し可能な記憶部及びインターフェースを含んでもよい。
【００２８】
演算システム１００はまた、通信インターフェース１１８も含むことができる。通信インターフェース１１８は、演算システム１００と外付けデバイスとの間でソフトウェア及びデータを転送することを可能にするために使用することができる。通信インターフェース１１８の例としては、モデム、ネットワークインターフェース（イーサネット（登録商標）または他のＮＩＣカード等）、通信ポート（例えば、ＵＳＢポート、ＲＳ−２３２Ｃシリアルポート等）、ＰＣＭＣＩＡスロット及びカード、ブルートゥース等が挙げられ得る。通信インターフェース１１８を介して転送されるソフトウェア及びデータは、通信インターフェース１１８によって受信可能な電子的、電磁的、光学的、または他の信号であり得る信号の形態である。これらの信号は、無線媒体、ワイヤもしくはケーブル、光ファイバ、または他の通信媒体等のチャネルを介して、通信インターフェース１１８によって送信及び受信されてもよい。チャネルのいくつかの例として、電話回線、携帯電話リンク、ＲＦリンク、ネットワークインターフェース、ローカルまたはワイドエリアネットワーク、及び他の通信チャネルが挙げられる。
【００２９】
演算システム１００は、コンピュータのユーザに情報を表示するために、バス１０２を介して陰極線管（ＣＲＴ）または液晶ディスプレイ（ＬＣＤ）等の表示部１１２に連結されてもよい。英数字及び他のキーを含む入力デバイス１１４は、例えば、プロセッサ１０４に情報及びコマンド選択を伝達するために、バス１０２に連結される。入力デバイスはまた、タッチスクリーン入力機能を伴って構成されるＬＣＤディスプレイ等の表示部であってもよい。別の種類のユーザ入力デバイスは、プロセッサ１０４に方向情報及びコマンド選択を伝達するため、ならびに表示部１１２上でカーソルの動きを制御するための、マウス、トラックボール、またはカーソル方向キー等のカーソル制御部１１６である。この入力デバイスは、典型的には、第１の軸（例えば、ｘ）及び第２の軸（例えば、ｙ）の２つの軸において２つの自由度を有し、デバイスが平面内における位置を特定することを可能にする。演算システム１００は、データ処理を提供し、またそのようなデータに信頼のレベルを提供する。本教示の実施形態の特定の実装と一致して、データ処理及び信頼値は、メモリ１０６に収容されている１つ以上の命令の１つ以上のシーケンスを実行するプロセッサ１０４に応答して、演算システム１００によって提供される。そのような命令は、記憶装置１１０等の別のコンピュータ可読媒体からメモリ１０６に読み込むことができる。メモリ１０６に収容された命令のシーケンスの実行は、本明細書に記載されるプロセス状態をプロセッサ１０４に実施させる。代替として、本教示の実施形態を実装するために、ソフトウェア命令の代わりに、またはソフトウェア命令と組み合わせて、ハードワイヤード回路が使用されてもよい。よって、本教示の実施形態の実装は、ハードウェア回路及びソフトウェアのいずれか特定の組み合わせに限定されない。
【００３０】
本明細書において使用される「コンピュータ可読媒体」及び「コンピュータプログラム製品」という用語は、１つ以上のシーケンスまたは１つ以上の命令を実行のためにプロセッサ１０４に提供することに関与する任意の媒体を一般的に指す。そのような命令は、一般的に「コンピュータプログラムコード」（コンピュータプログラムまたは他のグループの形態にグループ分けされてもよい）と称され、実行されると、演算システム１００が本発明の実施形態の特徴または機能を実施できるようにする。これら及び他の形態のコンピュータ可読媒体は、限定されないが、非揮発性媒体、揮発性媒体、及び伝送媒体を含む多くの形態をとることができる。非揮発性媒体は、例えば、ソリッドステート、光学または磁気ディスク、例えば、記憶装置１１０を含む。揮発性媒体は、メモリ１０６等の動的メモリを含む。伝送媒体は、バス１０２を含むワイヤを含む、同軸ケーブル、銅線、及び光ファイバを含む。
【００３１】
一般的な形態のコンピュータ可読媒体は、例えば、フロッピー（登録商標）ディスク、フレキシブルディスク、ハードディスク、磁気テープ、もしくは任意の他の磁気媒体、ＣＤ−ＲＯＭ、任意の他の光学媒体、パンチカード、紙テープ、穴のパターンを有する他の物理的媒体、ＲＡＭ、ＰＲＯＭ、及びＥＰＲＯＭ、ＦＬＡＳＨ−ＥＰＲＯＭ、任意の他のメモリチップもしくはカートリッジ、本明細書において後述される搬送波、またはコンピュータが読み取ることができる任意の他の媒体を含む。
【００３２】
種々の形態のコンピュータ可読媒体が、１つ以上の命令の１つ以上のシーケンスを実行のためにプロセッサ１０４に搬送することに関与してもよい。例えば、命令は、最初に遠隔コンピュータの磁気ディスクに搬送されてもよい。遠隔コンピュータは、その動的メモリに命令をロードし、モデムを使用して、電話回線を通して命令を送信することができる。演算システム１００にローカルなモデムは、電話回線上でデータを受信し、赤外線送信機を使用してそのデータを赤外線信号に変換することができる。バス１０２に連結された赤外線検出機は、赤外線信号中に搬送されるデータを受信し、そのデータをバス１０２に配置することができる。バス１０２は、データをメモリ１０６に搬送し、そこからプロセッサ１０４が命令を読み出して実行する。メモリ１０６によって受信された命令は、プロセッサ１０４による実行の前または後のいずれかに、記憶装置１１０に任意選択的に格納されてもよい。
【００３３】
上記は、明確にする目的で、異なる機能ユニット及びプロセッサに言及して本発明の実施形態を説明してきたことを理解されたい。しかしながら、本発明を損ねることなく、異なる機能ユニット、プロセッサ、またはドメイン間で、いずれの好適な機能配分が用いられてもよいことは明白であろう。例えば、別々のプロセッサまたはコントローラによって行われるべく示された機能は、同じプロセッサまたはコントローラによって行われてもよい。よって、特定の機能ユニットへの言及は、厳密な論理的または物理的な構造または編成を示すのではなく、単に、記載される機能を提供するための好適な手段への言及であると見なされるべきである。
【００３４】
連続変数による色分け
本教示の種々の実施形態によれば、ユーザは、例えば、ＦＡＭ及びＶＩＣの統計的分布を検査するために、品質値別でのデータの空間分布を閲覧することができる。その後、ユーザは、品質値を用いてデータを選択することができる。
【００３５】
品質値は、データの品質を示す、プロセッサによって決定される数値であってもよい。品質値は、実験が成功したかどうかを決定するための手がかりとするようユーザが使用し得る、信頼値を示し得る。例えば、反応において明確に増幅された標的核酸は、増幅が成功した場合に予想される信号を生成し得る。この反応からのデータには、ユーザが、データが信頼できるものであるという信頼性を有してもよいことを示す、良好な品質値が割り当てられ得る。一方で、粗悪品質を示す品質値は、プロセッサが、増幅が生じたかどうかを決定できたことを示し得るが、誤差が存在した恐れがあることを示し得る他の指標が存在する。したがって、粗悪品質を示す品質値は、データがそれほど信頼できるものではない場合があることをユーザに示すことができる。
【００３６】
種々の実施形態によれば、品質値は、インジケータによって示され得る。インジケータは、種々の実施形態において、色であってもよい。例としては、良好な品質値は、緑色で示され得、粗悪品質値は、赤色で示され得、このうち緑及び赤の異なる明度が、さまざまな品質値を示し得る。
【００３７】
このシステムは、空間フォーマットで品質値及び関連付けられるインジケータを表示し得る。例えば、図２に示されるように、空間フォーマットは、チップ２００の表現内にデータを表示し得る。よって、各データ点は、チップ上で、信号が得られた相対的な場所に表示される。ユーザは次いで、チップ全体にわたってデータ品質を可視化することができる。
【００３８】
図２の例において、チップ表現２００は、２次元グリッド内で、品質値に割り当てられた色で位置を色付けする。チップ表現２００の下の色付きバーは、高品質データ２１０のインジケータ及び低品質データ２１４のインジケータを示す。良好な品質のデータ２１２は、チップ表現２００内に、緑色で示される。粗悪品質データ２１６は、チップ表現２００内に、赤色で示される。ユーザは、品質値閾値２１２を超える品質値を有するデータのみを示すように、データの表示を変更する品質値閾値２１２を設定することができる。図２に示される例において、０．０２を超える品質値を有するデータが表示される。０．０２未満の品質値を有するデータは、チップ表現２００内で表示されず、白の背景として見える。
【００３９】
図２はまた、種々の実施形態において、ユーザに表示され得るヒストグラム図２０２を示す。ヒストグラム図は、単独で、またはチップ表現２００とともに閲覧されてもよい。ＦＡＭヒストグラム図２２０は、品質値ならびにデータのコールを示す。このデータのコールは、システムが、データが標的核酸の陽性または陰性増幅を表現する、と決定したかどうかを意味する。ＶＩＣヒストグラム図２３０は、ＶＩＣと関連付けられる標的核酸の複数の反応部位からのデータの陽性または陰性コールを示すが、ＦＡＭヒストグラム図２２０は、ＦＡＭと関連付けられる標的核酸の複数の反応部位からのデータの陽性または陰性コールを示す。ＦＡＭヒストグラム図２２０及びＶＩＣヒストグラム図２３０のｘ軸は、反応部位の蛍光値を示し、ｙ軸は、特定の蛍光値を有する多数の反応部位を示す。陽性コールは、より高い蛍光値を有するが、陰性コールは、低蛍光値を有する。よって、２つのピーク（１つの陰性コール、及び１つの陽性コール）は、一般に、ユーザによって可視化することができる。
【００４０】
ＦＡＭヒストグラム図２２０及びＶＩＣヒストグラム図２３０はまた、データの品質値をユーザに示す。良好な品質のデータは、緑色のインジケータによって示され得、粗悪品質のデータは、赤色インジケータによって示され得る。
【００４１】
前述のように、ＦＡＭヒストグラム図２２０及びＶＩＣヒストグラム図２３０とともにチップ表現２００を表示することは、ユーザが、情報を計算するために使用したデータのセットを調整することができるように、データの品質ならびに陽性及び陰性コールについての情報をユーザに提供し得る。例えば、ユーザは、陽性及び陰性コールを有するデータの品質のバランスをとると同時に、粗悪品質のデータをそれらの実験から除外することができる。このようにして、ユーザは、データセットの信頼性及び信頼度に関して判断を下すことができる。チップ表現２００、ＦＡＭヒストグラム図２２０、及びＶＩＣヒストグラム図２３０は、品質閾値２１２のユーザの調整を示すように動的に変更されてもよい。
【００４２】
図３は、品質閾値３１２が０．３８まで上昇される場合の、図２に可視化されたものと同じデータを示す。０．３８より低い品質値を有するデータがもはや表示されないため、より多くのデータ点に白の背景色が割り当てられていることが観察できる。この割り当ての結果として、より濃厚な赤である点（より低い品質）が図上で排除されることになる。
【００４３】
図２に戻って参照すると、ＦＡＭ及びＶＩＣヒストグラム図２２０、２３０は、ＦＡＭ及びＶＩＣの統計的分布を示す。ヒストグラムに示される色は、品質値を符号化している。ＦＡＭヒストグラム図２２０における所与のビンの、そのビンに関するＦＡＭ区間内の点については、より高い品質値を有する点の総計が、ビンのグラフのコラム内の下方に示され、より低い品質値を有する点の総計が、ビンのグラフのコラム内の上方に示される。こうすることにより、品質閾値が変化するときのＦＡＭの統計的分布への影響を理解することが容易になる。例えば、品質閾値を上昇させることによって、図２のヒストグラムの上方に重なる赤味がかったフリンジは、図３に示されるように、上方の黄色がかったフリンジのみを残して除外される。
【００４４】
離散変数による色分け
種々の実施形態によれば、図４は、陽性及び陰性コールの空間分布ならびにＦＡＭ及びＶＩＣデータの間の陽性及び陰性コールの統計的分布の表示を示す。この例において、インジケータを使用して、反応部位からのデータ点のコールをユーザに表示する。例えば、色インジケータは、空間フォーマット（チップ表現４００）、及びＦＡＭヒストグラム図４２０及びＶＩＣヒストグラム図４３０のコールに対して表示される。チップ表現４００、ＦＡＭヒストグラム図４２０、及びＶＩＣヒストグラム図４３０は、個別に、または互いに並んで表示され得る。
【００４５】
図４において、ＦＡＭコールは、第１のインジケータ４０２によって示され、ＶＩＣコールは、第２のインジケータ４０４によって示され、ＦＡＭ及びＶＩＣ信号のいずれも含む反応部位は、第３のインジケータ４０６によって示され、陰性コールは、第４のインジケータ４０８によるインジケータである。いくつかの実施形態におけるインジケータは、異なる色であってもよい。
【００４６】
図４の例において、チップ表現４００は、チップ表現４００の領域４１２内に、ＦＡＭ及びＶＩＣ信号を有するいくつかのデータ点が存在することを示している。領域４１２は、チップ表現４００の中央に、ストリップになるように現れる。さらに、ほとんどのＶＩＣコールは、チップ表現４００の領域４１０内に、現れる。領域４１４は、いくつかの陰性コールを示す。ｄＰＣＲにおいて、想定されることは、コールのこれらの種類の全て（ＶＩＣについて陽性、ＦＡＭについて陽性、ＶＩＣ及びＦＡＭについて陽性、及び陰性コール）は、図４に示されるような種々の領域内に集中するよりもむしろ、基板にわたって均一に分布されているべきである。このようにして、ユーザは、コールの種類を可視化することができ、おそらく、このデータセットには何か問題が存在するという結論に達することができる。さらに、その後、ユーザは、ＦＡＭヒストグラム図４２０及びＶＩＣヒストグラム４３０を見て、このデータセット内にいくつかの誤差が存在しているというそれらの結論を確認することができる。ＦＡＭ及びＶＩＣヒストグラム図４２０及び４３０は、ユーザによって調整可能なスライダーボタン４３２も含む。ユーザは、図４の表示を閲覧すると、プロセッサが、陽性及び陰性コールを決定するように使用した蛍光閾値が正確でないことを認識し得る。その後、ユーザは、蛍光閾値が存在するべきであるとユーザが考えるところにスライダーボタンを調整し得、その後、プロセッサが、結果を再計算する。スライダーボタン４３２は、図５に示される。
【００４７】
図４に戻って参照すると、ＶＩＣヒストグラム図４３０上のスライダーボタン４３２は、不正確な位置にあるように現れている。ユーザは、陽性及び陰性コールを決定するための蛍光閾値が前に設定されたものよりも低い蛍光レベルにあるように、スライダーボタン４３２を選択し得、それを左側に調整し得る。図６は、より正確な蛍光閾値を示す。
【００４８】
散布図
本教示の種々の実施形態によれば、データの統計的特徴はまた、散布図を用いて示すことができる。例えば、散布図を用いて、品質値、ならびにＶＩＣ及びＦＡＭ蛍光コールが、可視化されてもよい。図７は、チップ表現７００及び散布図７２０を示す。チップ表現７００及び散布図７２０は、別個にならびに互いに並んで表示され得る。
【００４９】
散布図７２０は、ＦＡＭ蛍光値を示すｙ軸及びＶＩＣ蛍光値を示すｘ軸を有する。反応部位からのデータが増幅を示さない場合、ＦＡＭ及びＶＩＣ蛍光は、最小値になっているべきである。したがって、データ点は、散布図７２０の左下の隅に表示される。データ点クラスタ７２２は、陰性コールになるか、またはそのそれぞれの反応部位に関して増幅を有しないかを決定し得る、データを示す。
【００５０】
反応部位が、ＦＡＭ色素で標識された標的核酸の増幅のみを有した場合、ＦＡＭの蛍光値（ｙ軸）は、存在するが、ＶＩＣ信号（ｘ軸）は、最小化される。よって、ＦＡＭ蛍光を発光する反応部位と関連付けられるデータ点は、散布図７２０の左上の隅に表示される。データクラスタ７２４は、ＦＡＭ蛍光を発光する反応部位と関連付けられるデータ点を示す。
【００５１】
同様に、反応部位が、ＶＩＣで標識された標的核酸のみの増幅を有した場合、ＶＩＣ蛍光値（ｘ軸）が有意である一方で、ＦＡＭ蛍光値（ｙ軸）は、最小化される。よって、ＶＩＣ蛍光を発光する反応部位と関連付けられるデータ点は、散布図７２０の右下の隅に表示される。データクラスタ７２６は、ＶＩＣ蛍光を発光する反応部位と関連付けられるデータ点を示す。
【００５２】
反応部位が、ＦＡＭと関連付けられる標的核酸及びＶＩＣと関連付けられる標的核酸のいずれも含有した場合、ＦＡＭ及びＶＩＣ蛍光信号のいずれも、有意である。したがって、ＦＡＭ及びＶＩＣのいずれも発光する反応部位と関連付けられるデータ点は、散布図７２０の右上の隅に表示される。したがって、データクラスタ７２８は、ＦＡＭ及びＶＩＣ蛍光を発光する反応部位と関連付けられるデータ点を示す。
【００５３】
図７は、表示されたデータが、０の品質レベルを超えていることも示す。品質閾値は、ユーザによって変更されてもよい。図８は、品質閾値８０２が０．３８に設定されたため、０．３８を超える品質値を有するデータ点を示す。品質閾値８０２未満のデータ点は、チップ表現８００及び散布図８２０からも除外される。
【００５４】
図９は、チップ図８００及び散布図８２０に表示される同様のデータを示すが、各データ点の陽性または陰性コールを示すように、インジケータが変更された。図９において、ＦＡＭコールは、第１のインジケータ９０２によって示され、ＶＩＣコールは、第２のインジケータ９０４によって示され、ＦＡＭ及びＶＩＣ信号のいずれも含む反応部位は、第３のインジケータ９０６によって示され、陰性コールは、第４のインジケータ９０８によるインジケータであり、コールが、プロセッサによって決定され得なかった反応部位は、第５のインジケータ９１０によって示される。いくつかの実施形態におけるインジケータは、異なる色であってもよい。
【００５５】
散布図９２０は、ＦＡＭ蛍光値を示すｙ軸及びＶＩＣ蛍光値を示すｘ軸を有する。反応部位からのデータが増幅を示さない場合、ＦＡＭ及びＶＩＣ蛍光は、最小値になっているべきである。したがって、データ点は、散布図９２０の左下の隅に表示される。データ点クラスタ９２２は、陰性コールになるか、またはそのそれぞれの反応部位に関して増幅を有しないかを決定し得る、データを示す。データクラスタ９２２内のデータ点は、大部分が、第４のインジケータ９０８を示す。
【００５６】
反応部位が、ＦＡＭ色素で標識された標的核酸の増幅のみを有した場合、ＦＡＭの蛍光値（ｙ軸）は、存在するが、ＶＩＣ信号（ｘ軸）は、最小化される。よって、ＦＡＭ蛍光を発光する反応部位と関連付けられるデータ点は、散布図９２０の左上の隅に表示される。データクラスタ９２４は、ＦＡＭ蛍光を発光する反応部位と関連付けられるデータ点を示す。データクラスタ９２４内のデータ点は、大部分が、第１のインジケータ９０２を示す。
【００５７】
同様に、反応部位が、ＶＩＣで標識された標的核酸のみの増幅を有した場合、ＶＩＣ蛍光値（ｘ軸）が有意である一方で、ＦＡＭ蛍光値（ｙ軸）は、最小化される。よって、ＶＩＣ蛍光を発光する反応部位と関連付けられるデータ点は、散布図９２０の右下の隅に表示される。データクラスタ９２６は、ＶＩＣ蛍光を発光する反応部位と関連付けられるデータ点を示す。データクラスタ９２６内のデータ点は、大部分が、第２のインジケータ９０４を示す。
【００５８】
反応部位が、ＦＡＭと関連付けられる標的核酸及びＶＩＣと関連付けられる標的核酸のいずれも含有した場合、ＦＡＭ及びＶＩＣ蛍光信号のいずれも、有意である。したがって、ＦＡＭ及びＶＩＣのいずれも発光する反応部位と関連付けられるデータ点は、散布図９２０の右上の隅に表示される。したがって、データクラスタ９２８は、ＦＡＭ及びＶＩＣ蛍光を発光する反応部位と関連付けられるデータ点を示す。データクラスタ９２８内のデータ点は、大部分が、第３のインジケータ９０８を示す。
【００５９】
散布図９２０を利用するユーザは、コールが正確に割り当てられたかどうかを決定し得る。
【００６０】
図１０は、コールが不正確に割り当てられたことが明らかなコールによる色を示す。図中の点の各クラスタは、大部分が、コールが正確に割り当てられた場合、１つのインジケータ種を示すべきである。クラスタ１００２において、少なくとも２つの異なるインジケータが顕著である。したがって、ユーザは、表示されたデータセットに問題が存在する恐れがあると判断可能であり得る。
【００６１】
図１１はまた、別の散布図１１００を示す。データクラスタ１１０２及びデータクラスタ１１０４のいずれも、少なくとも２つのインジケータの相当量を有する。散布図１１００を閲覧しているユーザは、コールが正確ではないか、またはデータを生成した実験に誤差が存在したと決定することができる。
【００６２】
本開示の種々の実施形態は、データ内の異常を迅速に見極める能力をユーザに所与する。例えば、ユーザには、例えば、図２において、低品質値が、ヒストグラム全体にわたって分布されていなかったが、チップ表現２００の１つの領域またはヒストグラム図２２０及び２３０の１つの領域に局所化された場合、それらの実験手順に関連する体系的課題が存在したことが、警告されるであろう。同様に、図３に示されるようなコールの分布は、データまたは実験におけるいくつかの誤差なしでは起こらない。したがって、本開示の実施形態は、データ点の大量の可視化を可能にし、ユーザにデータからの有用な情報を迅速かつ容易に決定させる。
【００６３】
さらに、本開示の実施形態は、ユーザが品質値に基づいてデータを閲覧できるようにする。このようにして、品質に基づいてデータを拒否した因果関係が、想定され得、迅速に観察され得る。
【００６４】
高密度の２次元の散布図を閲覧する際の１つの否定的側面は、点が、互いの上方にプロットされていることである。このことは、割り当てられた１つの値を有する点が、別のかつ割り当てられた不正確な値を有する点を完全に隠すことができたことを意味する。図１１は、明確に分離された点の４つのクラスタが存在し、各クラスタが、均一の色を有するべきである場合を示している。図の上方の対照は、隠された点の問題を回避する機構を提供する。図１１において、「全て」の選択肢１１０６が、選択されている。このことは、全てのデータ点が、前景に存在し、点に割り当てられたコールを囲み、かつ無効にするように使用されるグラフィックツールによって影響されることを意味する。
【００６５】
図１２は、「増幅なし」の選択肢１２０２が選択されている場合、表示されるデータ点を示している。陰性コール、または標的核酸の増幅なしの点のみが決定されたものが、表示されている。
【００６６】
図１３は、「ＦＡＭ」の選択肢１３０２が選択されている同様のデータを示す。図１２及び１３を比較すると、多数の「増幅なし」の点が、図１２に隠れていることが明白である。全ての「増幅なし」の点を前景に持ってくることによって、これらの全てが、曝露され、グラフィックツールを用いて、コール割り当てを無効にするために起動される。「増幅なし」のコールを初期に割り当てられた全ての点が、修正されたことを、ユーザに保証することができる（１度ユーザがそのようにした場合）。その後、ユーザは、必要に応じて他のコールを選択し、コールを修正するように継続するであろう。全てのコールの種類を通じて移動した後、全てのコールが正確であることをユーザに保証することができる。
【００６７】
種々の実施形態による方法及びシステムは、ユーザが、他の方法を用いてあらゆるデータ点を分析するのに必要な時間及び手間をかけることなく、品質及びコールを迅速かつ容易に閲覧できるようにする。ユーザが、「全て」の選択肢が選択される図１１に示される選択肢のみを有しようとした場合、ユーザは、領域内に不正確なコールとして現れ、その領域に正確なコール値を割り当てるかどうかにかかわらず、点の各領域を囲むことが義務付けられるであろう。１回に１つのコールを前景に持ってくるのみの選択肢を有することによって、ユーザは、グラフの小さい部分において手動の修正を実施するのみで十分な場合がある。図１３には、「ＦＡＭ」コールの場合に関して、修正される必要がある点の２つの小さい領域のみが、示されている。
【００６８】
特定の例示的な実施形態、例、及び用途に関して本発明について説明してきたが、当業者には、本発明から逸脱することなく、種々の修正及び変更がなされ得ることは明白である。
【図５】
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【図１】
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【図２】
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【図３】
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【図４】
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【図６】
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【図７】
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【図８】
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【図９】
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【図１０】
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【図１１】
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【図１２】
2016530876.tif 000014
【図１３】
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【国際調査報告】
2016530876.tif 000016
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2016530876.tif 000018