【手続補正書】
【提出日】平成25年2月8日(2013.2.8)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
被験体が膵管腺癌に罹患しているのか、もしくは膵管腺癌を発症する危険性があるのかを診断するのを補助する方法であって、前記被験体の膵臓由来の生体試料における少なくとも１つのｍｉＲ遺伝子産物のレベルを測定する手順を含み、
前記生体試料における前記ｍｉＲ遺伝子産物のレベルが対照試料における対応するｍｉＲ遺伝子産物のレベルに比べて変化することによって、前記被験体が膵管腺癌に羅患していることか、もしくは膵管腺癌を発症する危険性があることのいずれかであることが示され、
前記ｍｉＲ遺伝子産物が、
ＭＩＲ−０３４ｂ、ＭＩＲ−０９２−２−Ｐ、ＭＩＲ−０９６−Ｐ、ＭＩＲ−１２９−２、ＭＩＲ−１３０ａ−Ｐ、ＭＩＲ−１３３ｂ、ＭＩＲ−１３９、ＭＩＲ−１８８ｂ−Ｐ、ＭＩＲ−１９２、ＭＩＲ−２００ａ−Ｐ、ＭＩＲ−２０４、ＭＩＲ−２１０、ＭＩＲ−２９９−Ｐ、ＭＩＲ−３０２ｄ、ＭＩＲ−３３７、ＭＩＲ−３７１、ＭＩＲ−３７８、ＭＩＲ−３８３、ＭＩＲ−４２２ｂ、ＭＩＲ−４２３、ＭＩＲ−３７５、ｌｅｔ−７ａ−２−Ｐ、ｌｅｔ−７ｂ、ｌｅｔ−７ｃ、ｌｅｔ−７ｄ、ｌｅｔ−７ｆ−１、ｌｅｔ−７ｉ、ＭＩＲ−００１−２、ＭＩＲ−００７−１、ＭＩＲ−０１５ａ、ＭＩＲ−０１５ｂ、ＭＩＲ−０１６−１、ＭＩＲ−０１９ｂ−１−Ｐ、ＭＩＲ−０２１、ＭＩＲ−０２３ａ、ＭＩＲ−０２４−１，２、ＭＩＲ−０２７ａ、ｂ、ＭＩＲ−０２９ａ、ｃ、ＭＩＲ−０３０ｄ、ＭＩＲ−０３２、ＭＩＲ−０９２−１、ＭＩＲ−０９８、ＭＩＲ−０９９ａ、ＭＩＲ−１００、ＭＩＲ−１０７、ＭＩＲ−１２５ｂ−１、ＭＩＲ−１２６、ＭＩＲ−１２８ａ、ＭＩＲ−１３２、ＭＩＲ−１３６、ＭＩＲ−１４２−Ｐ、ＭＩＲ−１４５−Ｐ、ＭＩＲ−１５２、ＭＩＲ−１５５、ＭＩＲ−１８１ａ，ｃ、ＭＩＲ−１９６ａ−２、ＭＩＲ−２１２、ＭＩＲ−２１３、ＭＩＲ−２１５、ＭＩＲ−２１８−１，２、ＭＩＲ−２２１、ＭＩＲ−２２２−Ｐ、ＭＩＲ−３０１、ＭＩＲ−３２８、ＭＩＲ−３３１−Ｐ、ＭＩＲ−３４５、ＭＩＲ−３６７、ＭＩＲ−３７６、ＭＩＲ−４２４、ｌｅｔ−７ｅ、ｌｅｔ−７ｆ、ｌｅｔ−７ｇ、ＭＩＲ−００９＊、ＭＩＲ−０１０ａ、ＭＩＲ−０１０ｂ、ＭＩＲ−０１６、ＭＩＲ−０１７−３ｐ、ＭＩＲ−０１７−５ｐ、ＭＩＲ−０１８、ＭＩＲ−０２０、ＭＩＲ−０２２、ＭＩＲ−０２３ｂ、ＭＩＲ−０２４、ＭＩＲ−０２６ａ、ＭＩＲ−０２８、ＭＩＲ−０２９ｂ、ＭＩＲ−０３０ｅ−３ｐ、ＭＩＲ−０３１、ＭＩＲ−０３４ａ、ＭＩＲ−０３４ｃ、ＭＩＲ−０９３、ＭＩＲ−０９９ｂ、ＭＩＲ−１０１、ＭＩＲ−１０３、ＭＩＲ−１０６ｂ、ＭＩＲ−１２５ａ、ＭＩＲ−１２６＊ＭＩＲ−１２７、ＭＩＲ−１３０ａ、ＭＩＲ−１３５ｂ、ＭＩＲ−１４０、ＭＩＲ−１４２−３ｐ、ＭＩＲ−１４２−５ｐ、ＭＩＲ−１４３、ＭＩＲ−１４５、ＭＩＲ−１４６、ＭＩＲ−１４６ｂ、ＭＩＲ−１４８ａ、ＭＩＲ−１４８ｂ、ＭＩＲ−１４９、ＭＩＲ−１５０、ＭＩＲ−１８１ｂ、ＭＩＲ−１８１ｄ、ＭＩＲ−１８３、ＭＩＲ−１８６、ＭＩＲ−１８９、ＭＩＲ−１９０、ＭＩＲ−１９１、ＭＩＲ−１９３、ＭＩＲ−１９４、ＭＩＲ−１９５、ＭＩＲ−１９６ａ  ＭＩＲ−１９９ａ＊、ＭＩＲ−１９９ａ、ＭＩＲ−１９９ｂ、ＭＩＲ−２００ａ、ＭＩＲ−２００ｂ、ＭＩＲ−２０３、ＭＩＲ−２１４、ＭＩＲ−２１６＊、ＭＩＲ−２１７、ＭＩＲ−２１８、ＭＩＲ−２２２、ＭＩＲ−２２３、ＭＩＲ−２９６、ＭＩＲ−３２４−３ｐ、ＭＩＲ−３２４−５ｐ、ＭＩＲ−３３０、ＭＩＲ−３３１、ＭＩＲ−３３８、ＭＩＲ−３３９、ＭＩＲ−３４０、ＭＩＲ−３４２、ＭＩＲ−３４６、ＭＩＲ−３６１、ＭＩＲ−３７０、ＭＩＲ−３７２、ＭＩＲ−３７４、ＭＩＲ−３７６ａ、ＭＩＲ−３７７、ＭＩＲ−３７９、ＭＩＲ−３８２、ＭＩＲ−４２５およびそれらの組み合わせからなる群から選択され���、方法。
【請求項２】
前記ｍｉＲ遺伝子産物が、ｌｅｔ−７ｂ、ｌｅｔ−７ｃ、ｌｅｔ−７ｄ、ｌｅｔ−７ｆ−１、ｌｅｔ−７ｉ、ＭＩＲ−０１５ａ、ＭＩＲ−０１５ｂ、ＭＩＲ−０１６−１、ＭＩＲ−０２１、ＭＩＲ−０２３ａ、ＭＩＲ−０２４、ＭＩＲ−０２４−１，２、ＭＩＲ−０２７ａ、ｂ、ＭＩＲ−０９６−Ｐ、ＭＩＲ−０９８、ＭＩＲ−０９９ａ、ＭＩＲ−１００、ＭＩＲ−１２５ｂ−１、ＭＩＲ−１２６、ＭＩＲ−１３２、ＭＩＲ−１３５ｂ、ＭＩＲ−１４２−Ｐ、ＭＩＲ−１４５−Ｐ、ＭＩＲ−１４８ａ、ＭＩＲ−１５２、ＭＩＲ−１５５、ＭＩＲ−１８１ａ、ｃ、ＭＩＲ−１９６ａ、ＭＩＲ−１９６ａ−２、ＭＩＲ−２１０、ＭＩＲ−２１２、ＭＩＲ−２１３、ＭＩＲ−２１７、ＭＩＲ−２１８−１、２、ＭＩＲ−２２１、ＭＩＲ−２２２−Ｐ、ＭＩＲ−２２３、ＭＩＲ−３０１、ＭＩＲ−３３１−Ｐ、ＭＩＲ−３４５、ＭＩＲ−３７５、ＭＩＲ−３７６からなる群から選択される、請求項１に記載の方法。
【請求項３】
前記少なくとも１つのｍｉＲ遺伝子産物が、ＭＩＲ−０９２−２−Ｐ、ＭＩＲ−０９６−Ｐ、ＭＩＲ−１２９−２、ＭＩＲ−１３３ｂ、ＭＩＲ−１３９、ＭＩＲ−１４８ａ、ＭＩＲ−１８８ｂ−Ｐ、ＭＩＲ−２０４、ＭｌＲ−２１６＊、ＭｌＲ−２１７、ＭＩＲ−２９９−Ｐ、ＭＩＲ−３３７、ＭＩＲ−３７１、ＭＩＲ−３７７、ＭＩＲ−３８３およびＭＩＲ−３７５またはそれらの組み合わせからなる群から選択され、前記ｍｉＲ遺伝子産物のレベルが前記対照試料における対応するｍｉＲ遺伝子産物のレベルに比べて減少することによって、前記被験体が膵管腺癌に羅患していることか、もしくは膵管腺癌を発症する危険性があることのいずれかであることが示される、請求項１に記載の方法。
【請求項４】
前記少なくとも１つのｍｉＲ遺伝子産物が、ＭＩＲ−１４８ａ、ＭＩＲ−２１７、ＭＩＲ−０９６−Ｐまたは３７５である、請求項３に記載の方法。
【請求項５】
前記少なくとも１つのｍｉＲ遺伝子産物が、ｌｅｔ−７ａ−２−Ｐ、ｌｅｔ−７ｂ、ｌｅｔ−７ｃ、ｌｅｔ−７ｄ、ｌｅｔ−７ｆ−１、ｌｅｔ−７ｉ、ＭＩＲ−００１−２、ＭＩＲ−００７−１、ＭＩＲ−０１５ａ、ＭＩＲ−０１５ｂ、ＭＩＲ−０１６−１、ＭＩＲ−０１９ｂ−ｌ−Ｐ、ＭＩＲ−０２１、ＭＩＲ−０２３ａ、ＭＩＲ−０２４−１，２、ＭＩＲ−０２７ａ、ｂ、ＭＩＲ−０２９ａ、ｃ、ＭＩＲ−０３０ｄ、ＭＩＲ−０３２、ＭＩＲ−０９２−１、ＭｌＲ−０９８、ＭＩＲ−０９９ａ、ＭＩＲ−１００、ＭＩＲ−１０７、ＭＩＲ−１２５ｂ−１、ＭＩＲ−１２６、ＭＩＲ−１２８ａ、ＭＩＲ−１３２、ＭＩＲ−１３６、Ｍ１Ｒ−１４２−Ｐ、ＭＩＲ−１４５−Ｐ、ＭＩＲ−１５２、ＭＩＲ−１５５、ＭＩＲ−１８１ａ、ｃ、ＭＩＲ−１９６ａ−２、ＭＩＲ−２１２、ＭＩＲ−２１３、ＭＩＲ−２１５、ＭＩＲ−２１８−１、２、ＭＩＲ−２２１、ＭＩＲ−２２２−Ｐ、ＭＩＲ−３０１、ＭＩＲ−３２８、ＭＩＲ−３３１−Ｐ、ＭＩＲ−３４５、ＭＩＲ−３６７、ＭＩＲ−３７６、ＭＩＲ−４２４、ｌｅｔ−７ｅ、ｌｅｔ−７ｆ、ｌｅｔ−７ｇ、ｌｅｔ−７ｉ、ＭＩＲ−００９＊、ＭＩＲ−０１０ａ、ＭＩＲ−０１０ｂ、ＭＩＲ−０１６、ＭＩＲ−０１７−３ｐ、ＭＩＲ−０１７−５ｐ、ＭＩＲ−０１８、ＭＩＲ−０２０、ＭＩＲ−０２２、ＭＩＲ−０２３ｂ、ＭＩＲ−０２４、ＭＩＲ−０２６ａ、ＭＩＲ−０２８、ＭＩＲ−０２９ｂ、ＭＩＲ−０３０ｅ−３ｐ、ＭＩＲ−０３１、ＭＩＲ−０３４ａ、ＭＩＲ−０３４ｃ、ＭＩＲ−０９３、ＭＩＲ−０９９ｂ、ＭＩＲ−１０１、ＭＩＲ−１０３、ＭＩＲ−１０６ｂ、ＭＩＲ−１２５ａ、ＭＩＲ−１２６＊、ＭＩＲ−１２７、ＭＩＲ−１３０ａ、ＭＩＲ−１３５ｂ、ＭＩＲ−１４０、ＭＩＲ−１４２−３ｐ、ＭＩＲ−１４２−５ｐ、ＭＩＲ−１４３、ＭＩＲ−１４５、ＭＩＲ−１４６、ＭＩＲ−１４６ｂ、ＭＩＲ−１４８ｂ、ＭＩＲ−１４９、ＭＩＲ−１５０、ＭＩＲ−１８ｌｂ、ＭＩＲ−１８ｌｄ、ＭＩＲ−１８３、ＭＩＲ−１８６、ＭＩＲ−１８９、ＭＩＲ−１９０、ＭＩＲ−１９１、ＭＩＲ−１９３、ＭＩＲ−１９４、ＭＩＲ−１９５、ＭＩＲ−１９６ａ、ＭＩＲ−１９９ａ＊、ＭＩＲ−１９９ａ、ＭＩＲ−１９９ｂ、ＭＩＲ−２００ａ、ＭＩＲ，２００ｂ、ＭＩＲ−２０３、ＭＩＲ−２１０、ＭｌＲ−２１４、ＭＩＲ−２１８、ＭＩＲ−２２２、ＭＩＲ−２２３、ＭＩＲ−２９６、ＭＩＲ  ３２４−３ｐ、ＭＩＲ  ３２４−５ｐ、ＭＩＲ  ３３０、Ｍ１Ｒ  ３３１、ＭＩＲ−３３８、ＭＩＲ−３３９、ＭＩＲ−３４０、ＭＩＲ−３４２、ＭＩＲ−３４６、ＭＩＲ  ３６１、ＭＩＲ−３７０、ＭＩＲ−３７２、ＭＩＲ−３７４、ＭＩＲ−３７６ａ、ＭＩＲ−３７９、ＭＩＲ−３８２、およびＭＩＲ−４２５、またはそれらの組み合わせからなる群から選択され、前記ｍｉＲ遺伝子産物のレベルが前記対照試料における対応するｍｉＲ遺伝子産物のレベルに比べて増加することによって、前記被験体が膵管腺癌に羅患していることか、もしくは膵管腺癌を発症する危険性があることのいずれかであることが示される、請求項１に記載の方法。
【請求項６】
前記少なくとも１つのｍｉＲ遺伝子産物が、ｌｅｔ−７ｂ、ｌｅｔ−７ｃ、ｌｅｔ  ７ｄ、ｌｅｔ−７ｆ−ｌ、ｌｅｔ−７ｉ、ＭＩＲ−００７−１、ＭＩＲ−０１５ａ、ＭＩＲ−０１５ｂ、ＭＩＲ−０１６−１、ＭＩＲ−０２１、ＭＩＲ−０２３ａ、ＭＩＲ−０２４、ＭＩＲ−０２４−１、２、ＭＩＲ−０２７ａ、ｂ、ＭＩＲ−０３０ｄ、ＭＩＲ−０９８、ＭＩＲ−０９９ａ、ＭＩＲ−１００、ＭＩＲ−１２５ｂ−ｌ、ＭＩＲ−１２６、ＭＩＲ−１３２、ＭＩＲ−１３５ｂ、ＭＩＲ−１４２−Ｐ、ＭＩＲ−１４５−Ｐ、ＭＩＲ−１５２、ＭＩＲ−１５５、ＭＩＲ−１８ｌａ、ｃ、ＭＩＲ−１９６ａ、ＭＩＲ−１９６ａ−２、ＭＩＲ−２１０、ＭＩＲ−２１２、ＭＩＲ−２１３、ＭＩＲ−２１８−１、２、ＭＩＲ−２２１、ＭＩＲ−２２２−Ｐ、ＭＩＲ−２２３、ＭＩＲ−３０１、ＭＩＲ−３３１−Ｐ、ＭＩＲ−３４５、およびＭＩＲ−３７６、またはそれらの組み合わせからなる群から選択される、請求項５に記載の方法。
【請求項７】
前記少なくとも１つのｍｉＲ遺伝子産物が、ｌｅｔ−７ｂ；ｌｅｔ−７ｄ；１ｅｔ−７ｆ；ｌｅｔ−７ｉ、ＭＩＲ−０１５ａ；ＭＩＲ−０１５ｂ；ＭＩＲ−０１６−１；ＭＩＲ−０２１；ＭＩＲ−０２３ａ、ＭＩＲ−０２４、ＭＩＲ−１００；ＭＩＲ−１２５ｂ；ＭＩＲ−１３２、ＭＩＲ−１５５、ＭＩＲ−１８ｌａ、ＭＩＲ−１８１ｃ；ＭＩＲ−２１２；ＭＩＲ−２２１；ＭＩＲ−３０１；およびＭＩＲ−３７６ａ、またはそれらの組み合わせからなる群から選択される、請求項５に記載の方法。
【請求項８】
前記少なくとも１つのｍｉＲ遺伝子産物が、ｌｅｔ−７ａ−２−Ｐ、ｌｅｔ−７ｂ、ｌｅｔ−７ｃ、ｌｅｔ−７ｄ、ｌｅｔ−７ｆ−ｌ、ｌｅｔ−７ｉ、ＭＩＲ−０１５ｂ、ＭＩＲ−０１９ｂ−１−Ｐ、ＭＩＲ−０９８、ＭＩＲ−１２８ａ、ＭＩＲ−１３６、ＭＩＲ−１５２、ＭＩＲ−１５５、ＭＩＲ−１８ｌａ、ＭＩＲ−１９６ａ−２、ＭＩＲ−２１２、ＭＩＲ−２１５、ＭｌＲ−２１８−１、ＭｌＲ−２１８−２、ＭＩＲ−３０１、ＭＩＲ−３２８、ＭＩＲ−３３１−Ｐ、およびＭＩＲ−４２４からなる群から選択される、請求項５に記載の方法。
【請求項９】
前記少なくとも１つのｍｉＲ遺伝子産物が、ｌｅｔ−７ｂ、ｌｅｔ−７ｄ、ｌｅｔ−７ｆ−ｌ、ｌｅｔ−７ｉ、ＭＩＲ−１５５、ＭＩＲ−１８１ａ、ＭＩＲ−２１２、およびＭＩＲ−３０１からなる群から選択される、請求項５に記載の方法。
【請求項１０】
前記少なくとも１つのｍｉＲ遺伝子産物が、ＭＩＲ−０２１、ＭＩＲ−０２４、ＭＩＲ−１３５ｂ、ＭＩＲ−１５５、ＭＩＲ−１９６ａ、ＭＩＲ−２１０、またはＭＩＲ−２２３である、請求項５に記載の方法。
【請求項１１】
被験体が膵管腺癌に罹患しているのか、もしくは膵管腺癌を発症する危険性があるのかを診断するのを補助する方法であって、
（ａ）前記被験体由来の試験試料における複数のｍｉＲ遺伝子産物の発現レベルを検定して、前記試験試料のｍｉＲ発現プロファイルを得る手順；
（ｂ）前記試験試料の前記ｍｉＲ発現プロファイルを、対照試料から作成された対応するｍｉＲ発現プロファイルと比較する手順であって、前記試験試料の前記ｍｉＲ発現プロファイルと前記対照試料の前記ｍｉＲ発現プロファイルとの差によって、前記被験体が膵管腺癌に羅患していることか、もしくは膵管腺癌を発症する危険性があることのいずれかが示される、手順
を含む、方法。
【請求項１２】
前記複数のｍｉＲ遺伝子産物が、ＭＩＲ−０２１、ＭＩＲ−０２４、ＭＩＲ−０９６−Ｐ、ＭＩＲ−１３５ｂ、ＭＩＲ−１４８ａ、ＭＩＲ−１５５、ＭＩＲ−１９６ａ；ＭＩＲ  ２１０、ＭＩＲ−２１７、ＭＩＲ−２２３、およびＭＩＲ−３７５からなる群から選択される１または複数のｍｉＲ遺伝子産物を含む、請求項１１に記載の方法。
【請求項１３】
前記対照試料が、正常膵臓組織から得られるものである、請求項１１に記載の方法。
【請求項１４】
前記ｍｉＲ遺伝子産物が、ｍｉＲＮＡ前駆体である、請求項１１に記載の方法。
【請求項１５】
前記ｍｉＲ遺伝子産物が、成熟型ｍｉＲＮＡである、請求項１１に記載の方法。
【請求項１６】
前記ｍｉＲ遺伝子産物の前記レベルが、増幅に基づく検定を用いて測定される、請求項１５に記載の方法。
【請求項１７】
前記ｍｉＲ遺伝子産物の前記レベルが、ハイブリダイゼーションに基づく検定を用いて測定される、請求項１５に記載の方法。
【請求項１８】
前記ｍｉＲ遺伝子産物の前記レベルが、前記試料中の対応するｍｉＲ遺伝子コピーを測定することによって判定される、請求項１５に記載の方法。
【請求項１９】
前記生体試料は、膵組織、膵腫瘍、膵臓細胞または膵液を含む、請求項１８に記載の方法。
【請求項２０】
被験体における膵管腺癌の進行を抑制する治療レジメンの有効性の判定を補助する方法であって、前記被験体の膵臓は対照細胞に比べてアップレギュレートされた、ダウンレギュレートされた、またはその両方のｍｉＲ遺伝子産物レベルを有し、
前記被験体へ前記治療レジメンを施す前の前記被験体の膵臓から得られた第１の試験試料中、および前記被験体へ前記治療レジメンを施した後の前記被験体の膵臓から得られた第２の試験試料中の、前記アップレギュレートまたはダウンレギュレートされたｍｉＲ遺伝子産物のレベルを判定し、比較する手順
を含み、
前記第１の試験試料と比較して前記第２の試験試料において前記アップレギュレートされたｍｉＲ遺伝子産物のレベルが低いこと、または前記ダウンレギュレートされたｍｉＲ遺伝子産物レベルが高いことによって、前記治療レジメンが前記被験体における膵管腺癌の進行抑制に効果的であることが示される、手順
を含む、方法。
【請求項２１】
抗膵管腺癌剤の同定を補助する方法であって、
（ａ）膵管腺癌細胞を含む生体試料において過剰発現または過小発現する少なくとも１つのｍｉＲ遺伝子産物の発現レベルを測定し、これにより前記ｍｉＲ遺伝子産物の試験前の発現レベルについてのデータを作成する手順；
（ｂ）前記生体試料に試験剤を接触させる手順；
（ｃ）手順（ｂ）の後に前記生体試料における前記ｍｉＲ遺伝子産物の発現レベルを測定し、これにより試験後の発現レベルについてのデータを作成する手順；および
（ｄ）前記ｍｉＲ遺伝子産物の試験後の発現レベルを試験前の発現レベルと比較する手順であって、前記過剰発現ｍｉＲ遺伝子産物の前記試験後の発現レベルが低下することによって、または前記過小発現ｍｉＲ遺伝子産物の前記試験後の発現レベルが上昇することによって、前記試験剤が抗膵管腺癌性を有することが示される、手順
を含む、方法。