(57)【特許請求の範囲】
【請求項１】
第１の処理経路および第２の処理経路を有する単一構造物を用いてサンプル中の目的のアイテムの測定を実施する方法であって、前記第２の処理経路が、複数の第２処理副経路を含み、前記副経路の各々が、別々の目的のアイテムに専用化されており、前記方法が、
（ａ）単一構造物にアクセスできるサンプルを提供する工程；
（ｂ）単一構造物の第１処理経路中にサンプルを処理するための第１コンテナを設置する工程；
（ｃ）第１処理経路の第１コンテナにサンプルを移動させる工程；
（ｄ）第１処理経路の第１コンテナに試薬を加える工程；
（ｅ）第１処理経路の第１コンテナの内容物を混合する工程；
（ｆ）第１処理経路の第１コンテナの内容物からサンプル中の目的のアイテムを分離する工程；
（ｇ）単一構造物の第１処理経路の第１コンテナから測定している目的のアイテムに専用化された第２処理経路の複数の第２処理副経路中の少なくとも１つの第２コンテナに分離したサンプル中の目的のアイテムを移動させる工程；
（ｈ）第２処理経路で第２コンテナの内容物を第１処理経路の温度とは異なる第１温度にする工程；および
（ｉ）第２処理経路の第２コンテナ中の目的のアイテムを検出する工程；
を含んでなる前記方法。
【請求項２】
さらに：
（ｊ）第２サンプルを第１処理経路の２番目の第１コンテナに移動させる工程；
（ｋ）試薬を第１処理経路の２番目の第１コンテナに加える工程；および
（ｌ）第１処理経路の２番目の第１コンテナ中の目的のアイテムを検出する工程；
を含む請求項１に記載の方法。
【請求項３】
さらに：
（ｊ）第１コンテナおよび第２コンテナの少なくとも１個に封をする工程；
を含む請求項１に記載の方法。
【請求項４】
さらに：
（ｋ）第１コンテナおよび第２コンテナの少なくとも１個から封を取り除く工程；
を含む請求項３に記載の方法。
【請求項５】
さらに：
（ｊ）少なくとも１個の第１コンテナおよび第２コンテナの内容物の夾雑物への暴露を低減する工程；
を含む請求項１に記載の方法。
【請求項６】
さらに：
（ｊ）第２処理経路で第２コンテナの内容物を第１温度とは異なる第２温度にする工程；
を含む請求項１に記載の方法。
【請求項７】
さらに：
（ｊ）第２サンプルを第１処理経路の２番目の第１コンテナに移動させる工程；
（ｋ）試薬を第１処理経路の２番目の第１コンテナに加える工程；
（ｌ）２番目の第１コンテナの内容物を単一構造物の光学フロー・セルに移動させる工程；
（ｍ）光学フロー・セルに照射する工程；および
（ｎ）光学フロー・セルのサンプル中の目的のアイテムを検出する工程；
を含む請求項１に記載の方法。
【請求項８】
移動工程（ｇ）がさらに：
（ｉ）第２コンテナを複数の第２処理副経路の少なくとも一つに移動させる工程；
を含む請求項１に記載の方法。
【請求項９】
目的のアイテムの測定が少なくとも一つの処理を含んでなる請求項１に記載の方法であって、さらに：
（ｊ）単一構造物により実施される測定を認識する工程；
（ｋ）少なくとも一つの共通の処理により単一構造物に提供したサンプルを分類する工程；および
（ｌ）分類工程（ｋ）により決定した順序で第１処理経路にサンプルを移動させる工程；
を含む前記方法。
【請求項１０】
さらに：
（ｍ）分類工程（ｋ）に基づき所与の測定に単一構造物の構成部分を割り当てる工程；
を含む請求項９に記載の方法。
【請求項１１】
さらに：
（ｍ）分類工程（ｋ）に基づき単一構造物の構成部分をデュプリケートにする工程；
を含む請求項９に記載の方法。
【発明の詳細な説明】
【０００１】
関連出願についての記述
本件出願は１９９８年１０月１４日出願の出願番号６０／１０４１９１の仮特許出願からの転換である。
【０００２】
発明の背景
以下は概してサンプル中の目的のアイテムを測定するための構造および方法に関する。より具体的には以下は、ＤＮＡ、ＲＮＡ、フラグメント、補体、ペプチド、ポリペプチド、酵素、プリオン、タンパク質、メッセンジャーＲＮＡ、トランスファーＲＮＡ、ミトコンドリアＲＮＡまたはＤＮＡ、抗体、抗原、アレルゲン、生物学的構成要素の一部、例えば細胞、ウイルス粒子等、表面タンパク質、前記のものに機能的に等価なもの等の特定の領域の全て、または一部であるかまたはそれを含んでよい目的のアイテムの測定に関する。
【０００３】
患者の健康状態に関する情報を提供するために、患者の体液のごとき患者のサンプルに関して多くの試験を実施することができる。これらの体液には血清、全血、尿、めぐい液（swabs）、血漿、脳−脊髄液、リンパ液、固形組織等がある。患者の体液に関して実施する試験により、体液中の前記のごとき目的のアイテムを測定できる。患者の体液中の目的のアイテムの測定に基づき、患者の健康状態に関する情報を得ることができる。
【０００４】
発明の要旨
本明細書に記載する一つの態様は、単一構造物を用いてサンプル中の目的のアイテムを測定する方法を提供する。単一構造物にアクセスできるようにサンプルを提供する。サンプルを処理するための第１コンテナを単一構造物の第１処理経路に設置する。サンプルを第１処理経路の第１コンテナに移す。第１処理経路の第１コンテナに試薬を加える。第１処理経路で第１コンテナの内容物を混合する。サンプル中の目的のアイテムを第１処理経路の第１コンテナの内容物から分離する。分離したサンプル中の目的のアイテムを単一構造物の第１処理経路の第１コンテナから第２処理経路の第２コンテナへ移す。第２処理経路において第２コンテナの内容物を第１処理経路の温度と異なる第１温度にする。第２コンテナの目的のアイテムを第２処理経路で検出する。
【０００５】
別法では、サンプルを単一構造物の第１処理経路の第１コンテナに移す。サンプル中の目的のアイテムを第１処理経路の第１コンテナの内容物から分離する。分離したサンプル中の目的のアイテムを単一構造物の第１処理経路の第１コンテナから第２処理経路の第２コンテナへ移す。第２処理経路において第２コンテナの内容物を第１処理経路の温度と異なる第１温度にする。目的のアイテムを第２処理経路の第２コンテナ中で検出する。
【０００６】
さらなる方法では、サンプルを単一構造物の処理経路のコンテナに移す。サンプル中の目的のアイテムを処理経路のコンテナの内容物から分離する。処理経路でコンテナの内容物を第１温度にする。コンテナの内容物を処理経路の第１温度と異なる第２温度にする。目的のアイテムを処理経路のコンテナ中で検出する。
【０００７】
さらなる方法では、サンプルを単一構造物の第１処理経路の第１コンテナに移す。サンプルを単一構造物の第１処理経路の第１コンテナから第２処理経路の第２コンテナへ移す。第２処理経路において第２コンテナの内容物を第１処理経路の温度と異なる第１温度にする。目的のアイテムを第２処理経路の第２コンテナ中で検出する。
【０００８】
さらに別の方法では、サンプルを単一構造物の処理経路のコンテナに移す。コンテナの内容物を単一構造物の処理経路の第１温度にする。コンテナの内容物を単一構造物の処理経路の第１温度と異なる第２温度にする。目的のアイテムを単一構造物の処理経路のコンテナ中で検出する。
【０００９】
図面の簡単な説明
図１は本明細書に記載する構造の透視図である；
図２は図１の構造の透視図である；
図３Ａは本明細書に記載する別の構造の全体上面図である；
図３Ｂは図３Ａに示した構造の透視図である；
図４は図３Ａおよび３Ｂの構造を用いて使用するためのサンプル列の透視図である；
図５Ａから５Ｆは図３Ａおよび３Ｂに示す構造を用いて使用するための構成部分の透視図である；
図６は図３Ａおよび３Ｂの構造を用いて使用するためのコンテナおよびキャリヤーの透視図である；
図７は図３Ａおよび３Ｂに示す構造を用いて使用するためのピペットチップ・ローダーの透視図である；
図８は図３Ａおよび３Ｂに示す構造を用いて使用するためのピペットチップ・ローダーの別の態様の透視図である；
図９は図３Ａおよび３Ｂに示す構造を用いて使用するためのコンテナ・ローダーの透視図である；
図１０は図３Ａおよび３Ｂに示す構造を用いて使用するためのコンテナ・トランスポーターの透視図である；
図１１は図１０の一部の拡大図である；
図１２Ａから１２Ｐは図１で示すコンテナの種々の態様の透視図である：
図１３は図１２Ｅのコンテナとミキサーとの連結状態を説明する；
図１４は図３Ａおよび３Ｂの処理経路との機能的な関係になるように供されたポートを示す；
図１５は図３Ａおよび３Ｂに示す構造を用いて使用するためのピペッターの分解透視図である；
図１６は図１５のピペッターのある操作を説明する；
図１７は図１５のピペッターの別の操作を説明する；
図１８は図３Ａおよび３Ｂの構造に実質的に類似する構造の等角図である；
図１９は図１８の構造に実質的に類似する構造の等角図である；
図２０は図３Ａおよび３Ｂの構造に実質的に類似する別の構造の上面図である；
図２１は図２０の構造に実質的に類似するさらなる構造の上面図である；
図２２は図２１の構造に実質的に類似するさらなる構造の上面図である；
図２３は図２２の構造に実質的に類似する別の構造の上面図である；
図２４は図２３の構造に実質的に類似するさらに別の構造の上面図である；
図２５は図３Ａおよび３Ｂの構造に類似するさらに別の構造の上面図である；
図２６は図３Ａおよび３Ｂの構造に類似するさらに別の構造の上面図である；
図２７Ａから２７Ｆは図３Ａおよび３Ｂの構造を用いて使用するためのコンテナおよびシールの透視図である；
図２８は本明細書に記載する構造を用いて使用するための光学的配置の透視図である；
図２９は本明細書に記載する構造の一部の概略図である；
図３０Ａは本明細書に記載する構造の一部の断面図である；
図３０Ｂは図３０Ａの一部の上面図である；
図３１は本明細書に記載する構造の一部の断面図である；
図３２Ａは本明細書に記載する構造の一部の断面図である；
図３２Ｂは図３２Ａの一部の上面図である；および
図３３は本明細書に記載する構造の一部の概略図である。
【００１０】
図示した態様の詳細な説明
本明細書に記載する態様はサンプル中の目的のアイテムを測定するための方法および構造物に関する。目的のアイテムはＤＮＡもしくはＲＮＡの特定の一つのもしくは複数の領域でよく、またはフラグメント、補体、ペプチド、ポリペプチド、酵素、プリオン、タンパク質、メッセンジャーＲＮＡ、トランスファーＲＮＡ、ミトコンドリアＲＮＡもしくはＤＮＡ、抗体、抗原、アレルゲン、生物学的構成要素の部分、例えば細胞、ビロン（virons）等、表面タンパク質、これらのいずれかに機能的に等価なもの、これらのいずれかの濃度またはサンプル中の別のいずれかの望ましい要素でよい。例示的な態様では、目的のアイテムを、限定はしないが、特定のＤＮＡもしくはＲＮＡ領域、抗体、または限定はしないが、ＣＴ、ＣＴ／ＧＣ、ＭＴ、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＨＰＶ、ＨＩＶ、ＣＭＶ、ＨＬＡ、ＨＴＬＶ等の抗原、および限定はしないが、感染性疾患、遺伝子マーカー、癌、心血管アイテム、薬理遺伝学アイテム等に関連するその他のアイテムから選択できる。ある態様では、目的のアイテムを、限定はしないが、ＨＣＶに対する抗体、ＨＩＶ  １／ＨＩＶ２に対する抗体、Ｂ型肝炎コア抗原に対する抗体（ＨＢｃＡｂ）、癌胎児性抗原（ＣＥＡ）、癌抗原１９−９（ＣＡ１９−９）、Ｂ型肝炎表面抗原（ＨＢｓＡｇ）、Ｂ型肝炎表面抗原に対する抗体（ＨＢｓＡｂ）、アルファ−フェトプロテイン（ＡＦＰ）、全前立腺特異抗原（全ＰＳＡ）、遊離ＰＳＡ、甲状腺刺激ホルモン（ＴＳＨ）、黄体形成ホルモン（ＬＨ）、卵胞刺激ホルモン（ＦＳＨ）、ベータ・ヒト絨毛性ゴナドトロピン（Ｂ−ｈＣＧ）、遊離サイロキシン（遊離Ｔ４）、遊離トリヨードチロニン（遊離Ｔ３）、全Ｔ４、全Ｔ３、プロジェステロン、テストステロン、エストラジオール、プロラクチン、ビタミンＢ１２（Ｂ１２）、葉酸、グリコヘモグロビン、およびフェリチンから選択できる。本質的には、ほとんど何でも目的のアイテムになり得る。
【００１１】
本明細書に記載する構造および方法を多くの異なる配置で実施することができる。理解を明確にするために、ＤＮＡ／ＲＮＡサンプル調製物、増幅、および１時間でサンプル中の目的のアイテムをおよそ１００またはそれ以上測定するか、またはサンプル調製物が分割されている場合、１時間でサンプル中の目的のアイテムをおよそ３００またはそれ以上測定する検出分析器における用途に関して構造および方法を論じる。また別に、同一の構造をイムノアッセイ分析器として、またはイムノアッセイ分析器およびＤＮＡ／ＲＮＡ分析器の両方として使用することができる。構造および方法を１時間で６００、４００、２００、５０等の測定を行う分析器のごとき別の用途に用いることができることに留意すべきである。
【００１２】
多くの構造を組合わせて、または組み込んで、例えば所与の時間内に実施する試験数（処理能力）を改変する、測定すべき目的のアイテムを調整するなどの個々の必要性に適合させることができる。例えば、所与の時間内でＹ個の測定を実施する構造のＸ個を接続して、接続された構造が１時間内でＸＹ個の測定を実施するようにできる。所望の場合、構造の起源を１９９８年３月１２日出願の同時係属米国特許出願、出願番号０９／０４１３５２に開示されるものと実質的に類似の方法で配置できる。この出願は本件出願の特許出願人に譲渡されており、それらの特許の記載は本明細書に全て包含される。
【００１３】
別の態様では、一つまたはそれ以上の構造を別の分析器、例えばイムノアッセイ分析器（例えば米国特許第５７９５７８４号、以下で引用）、血液分析器（例えば米国特許第５８９１７３４号、以下で引用）等と機能的に接続できる。
【００１４】
かかる全ての構造は実質的に同じ方法で目的のアイテムを全て同様に測定できることに注目すべきである。例えば、規定の構造により実施する測定数に関わらず、目的の全ての類似のアイテムに関する全ての測定処理工程を同一の時間枠内、例えば３６秒で実施できる。これらの構造には共通の構成部分、例えば試薬、使い捨て部材、その他の構成部分、例えば流体等、分配技術、測定工程の実行メカニズム、ソフトウェア等がある。
【００１５】
別の適用では、構造を例えばサポート用ハードウェアおよびソフトウェアと共にコンベヤ・システム等と結合させ、構造を異なる構造または臨床化学または血液分析器等のごとき分析器と共に同一の設定で用いることができる。このコンベヤ・システムは構造の中でサンプルを動かし、一つのサンプルに関して異なる測定を実施できるようにする。また、本明細書は明確にするために一つの構造のみに関して構造の操作を記載するが、同一のまたは異なる様式で、同時にまたは異なる時間のいずれかで、複数の構造を操作できることに留意すべきである。さらに、一つの操作方法の工程を別の操作方法の工程と組合わせてさらに別の操作方法に至ることができる。
【００１６】
本明細書に記載する構造または方法のいずれかを、いずれかの適当な様式で、以下の米国特許のごとき現在利用可能な文献に記載されている構造もしくは方法またはその部分と組合わせることができる。これらの特許は全て本件出願の特許出願人に譲渡されており、これらの特許の記載は全て本明細書に包含される。米国特許は：５４６８６４６、５５３６０４９、５５４３５２４、５５４５７３９、５５６５５７０、５６６９８１９、５６８２６６２、５７２３７９５、５７９５７８４、５７８３６９９、５８５６１９４、５８５９４２９、５８９１７３４および５９１５５８３である。
【００１７】
本明細書に記載する構造の構築はコスト的に効率よく目的の種々のアイテムの試料を分析するのを目的としている。構造は使用者がサンプルを構造に供給、構造に処理、例えばインキュベート、調製、溶解、溶出、分析、読み取り等をさせ、構造に処理の結果を報告させることができるようになっている。構造のサブ・コンポーネントには、２、３名前を挙げると、混合の装置および方法、サンプルおよび試薬のごとき物質の吸引および分配、インキュベーション、化学的分離、並びに検出などがある。概して、化学的自動化のための構造構築の実現には、望ましい患者のサンプルの添加法、試薬の添加法、処理能力（規定時間あたりの測定数）、夾雑物減少法、検出法、混合の程度、並びにインキュベーション温度および必要な期間のごとき多くの因子が作用する。
【００１８】
図１は比較的処理能力の低い（例えば１．５時間毎に約１回測定）構造１ａを開示する。構造１ａはベース２で取り外しできるように設置された第１コンテナ１を含んでなる。ある態様では、ベース２は前記で引用した米国特許第５７９５７８４号に開示された処理経路の構築に実質的に類似した構築を有し、この場合、図１および２で図示される構造を処理経路に沿った適当な位置に配置することができる。プローブ３を適当な原動力に結合して、所望の場合、プローブ３を多方向に動かすことができる。プローブ３を３ａの位置でプローブ３に吸引および分配機能を実行させることができる適当な構造に流動するように接続する。これらの流動機能は共通のポンプ（例えばシリンジ、蠕動ポンプ等）およびバルブ技術を使用して実行でき、これらのいくつかは今日よく知られている。テカン・ガントリー（テカンＲＳＰモデルシリーズ、テカン、スイス）、アボット・テタ−Ｚロボット（品番７８４７９、アボット・ラボラトリーズ、アボット・パーク、イリノイ州）等のごとき多くの手段の一つによりプローブ３を動かすことができる。ベース２は機械で作られて被覆されたアルミニウム等のごときいずれかの望ましい物質で作ることができる。例示的な態様では、ベース２は６０６１−Ｔ６アルミニウムで作られ、ＭＬＴ−Ａ−６３５７６  Ｉ型に仕上げられている。第１コンテナ１をいずれかの望ましい物質から作ることができ、ポリエチレン（例えばダウ３０４６０Ｍ  ＨＤＰＥまたはシェブロン９５１２）またはポリプロピレン（例えばモンテルＰＤ７０１Ｎ）、またはポリスチレン（例えばダウ６６６）で成型することができる。説明した態様では、第１コンテナ１は流体、例えばサンプルおよび試薬を、例えば約７ｍｌの量含有できる大きさになっている。図１２Ａから１２Ｐでは第１コンテナ１の種々の構築を示している。
【００１９】
図１および２で示すように、ベース２の構築は第１コンテナの種々の構築に対応またはそれを補足するために改変でき、ベース２は第１コンテナ１を受け入れ、格納式のマグネット４を収納できることに留意されたい。
【００２０】
第１コンテナ１中のサンプルの目的のアイテムの所定の測定を実施する選択された時間、第１コンテナ１に関してマグネットを動かすことができる。マグネット４の動きは測定処理の工程の実行に影響し、それにより望むとおりに選択的に自動的に工程を実行または回避できるようになる。一つの態様において、マグネット４をコンテナに相対的に近位になるように動かして、第１コンテナ１内の磁力に応答する粒子を第１コンテナ１の側壁に引き寄せ、それにより患者のサンプル中の目的の望ましいアイテムに結合できるこれらの粒子を第１コンテナの残りの患者のサンプルまたはその他の内容物から分離できる。
【００２１】
かかるマグネット４により分離する前、分離中または分離した後に、プローブ３が第１コンテナ１の内容物の一部を吸引して廃棄／洗浄リザーバ１０に移す。引き続いて分配、分離、および吸引工程を行い、目的のアイテムの測定を促進できる。マグネット分離が望ましくない、すなわちマグネット分離工程を回避する測定の期間中、マグネット４を第１コンテナ１に関して相対的に遠位になるように動かして第１コンテナ１およびその内容物に及ぼすマグネット４の磁場の影響を低減させることができる。所望の場合、目的のアイテムが結合していない磁力に応答する粒子を第１コンテナの側壁に結合でき、恐らく目的のアイテムを含んでいるであろう残りの内容物を例えばプローブ３により第１コンテナ１から除去する。
【００２２】
ある態様では、熱制御装置（加熱および／または冷却）７をベース２に提供できる。装置７は手動でまたは自動的に取り外し可能なようにベース２に接続でき、メモリを有し適当な所定の作業を実施するコンピューターのごとき適当なコントローラーにより操作でき、伝導、対流および／または放射等の現在利用可能な熱移動手段を利用できる。一つの態様において、熱制御された（加熱および／または冷却された）空気を第１コンテナ１に関して移動させて、望ましい方法で第１コンテナ１の内容物を熱制御する。
【００２３】
目的のアイテムの所定の測定を実施する種々の時間で、コンテナ８に配置されたサンプルおよびコンテナ９に含まれる試薬を例えばプローブ３により第１コンテナ１に加えることができる。複数のサンプルおよび／または試薬が望ましい場合、複数のコンテナ８および／または９のコンベア、回転ラック、その他の可動配列、できれば循環等のごときアレイを提供できる。コンテナ８および９を各々ポリスチレン（ダウ６６６）、高密度ポリエチレン（ダウ３０４６０Ｍ  ＨＤＰＥまたはシェブロン９５１２）等のような重合体のごときいずれかの適当な物質から作ることができる。
【００２４】
コンテナ８または９のいずれかの内容物の保存性を高めるために、前記で引用した米国特許第５７９５７８４号に開示されるカバーに実質的に類似したカバー３０（図５Ｃ）をコンテナ８または９のいずれかに付け加えることができる。カバー３０はレキシントン・メディカル３４８１００５ＥＰＤＭ、アボットＥＰＤＭ（アッシュランド、オハイオ州）等のごときいずれかの適当な物質から作ることができる。コンテナ８および９並びに組合わせるカバーのいくつかの構築に関しては前記で引用した米国特許第Ｄｅｓ４０１６９７号、第Ｄｅｓ４０１６９９号および第Ｄｅｓ３９７９３８号の各々に見出すことができる。コンテナ８のごときコンテナを別のコンテナまたはキャリヤーに適合させる方法は共有する米国特許第５９１５５８３号に記載されている。
【００２５】
一度サンプルおよび／または試薬を第１コンテナ１に加えると、プローブ３を廃棄／洗浄リザーバー１０に移動させ、プローブ３を流体ですすいでプローブ３を洗浄する、すなわち夾雑物に暴露する可能性を低減させる。別の態様では、プローブ３を改変して、米国特許第５２３２６６９号（本件特許の特許出願人に譲渡され、出展明示により本明細書の一部とする）に開示されるピペッター・チップのごとき使い捨てチップを組み込むことができる。ピペッター・チップの意図した使用の後、プローブ３により流体／輸送インターフェースから廃棄するためにチップを駆出できる。使い捨てチップ２８のその他の例を図５Ｆで説明する。
【００２６】
光電子増倍管、フォトダイオード等のごとき検出器に適合させるためにベース２に穴６を配置する。説明した態様では、米国特許第５７９５７８４号に開示する同様の構造に類似の様式で穴６をマグネット４と反対の位置にする。このように、標識、例えばフルオロフォア等により生じた化学ルミネセンスまたはその他のシグナルの検出のごとき類似の操作が可能である。
【００２７】
図２で説明したミキサー５もまたベース２に提供する。ミキサー５に動力を供給するドライバ５ａにミキサー５を連結し、恐らく第１コンテナ１に軌道運動を誘起し、それにより望ましい時間にで第１コンテナの内容物を混合できる。混合処理に重要な第１コンテナ１の自由度を限定するようにベース２を構築する。ベース２は混合処理に重要な自由度の調節を補助する蓋を含んでよい。図１３はミキサー５の別の構築を示す。適当なミキサーのさらなる態様は米国特許第５７９５７８４号に開示されている。
【００２８】
所望の場合、図１で示される構造１ａを改変して、所定の時間に多数の測定例えば約１００回の測定を実施できる、すなわち処理能力環境を相対的に増加させることができる。構造１ａを一つまたはそれ以上の更なる構造１ａと機能的に連結でき、その各々は一つまたはそれ以上のプローブ３、マグネット４、ミキサー５、検出器用の穴６、および熱制御装置７を有する。この態様では、測定処理期間中望ましい時間に複数の構造１ａによりマグネット４、検出器６、加熱／冷却構成部分７、ミキサー５、サンプルおよび試薬吸引および分配等を選択的に作動させることができる、すなわちこれらの構成部分により実行される工程は選択的に自動的に実施される。この配列ではサンプル中の目的のアイテムの測定を１箇所以上で、すなわち１個以上の構造１ａで行うことができ、それにより少なくとも２個のサンプルを実質的に同時に処理できる。
【００２９】
複数の構造１ａの機能的な接続を能率的にするために、コンベヤ（結合したまたはエンドレス）、回転ラック等のごとき輸送システムを用いて第１コンテナ１をある構造１ａから別のところに移動させることができる。輸送システムは前記で引用した‘７８４特許に開示された処理経路に実質的に類似してよい。（複数の）構造１ａの位置に依り、測定中所定の時間に実施するのが望ましい機能のみを提供するように輸送システムおよび／または個々の構造を提供できる。例えば比較的多くの、例えば１００個の構造１ａを一緒に機能的に接続でき、構造１ａの例えば５個のサブセットのみがミキサー５を含むことができる。
【００３０】
図３および１８は実質的に隣接して位置する複数の構造１ａを本質的に含んでなる構造１ｂを示す。この態様では、図９で説明するようにコンテナ１はコンテナ・ローダーおよびトランスポーター３５から第１処理経路１１に実質的に自動的に搭載される。別法では、‘７８４特許に記載される様式で手動的または自動的に第１コンテナ１を載せることができる。コンテナ１を恐らく選択された時間毎に、例えば３６秒毎に第１処理経路１１を通り第１処理経路１１に沿った種々の配置に至るある位置に移動させ、そこで実施される測定の目的とする形式またはプロトコルの要件に従って種々の操作、例えば試薬の添加、サンプルの添加、インキュベーション、混合、洗浄等を選択的に自動的に実施する。構造１ｂの例示的な態様では約３６秒毎に、およそ１．２インチ第１処理経路１１に沿って第１コンテナ１を移動させる。
【００３１】
第１処理経路には少なくとも１個の温度調節装置またはヒーターが含まれ、第１処理経路１１を望ましい温度に保つ。例えば複数のヒーターを用いて第１処理経路１１を一つの温度に、またはいくつかの望ましい数の温度に保つことができる。一つの態様では、ヒーターは第１処理経路１１を約３７℃に維持する。別の態様では、第１処理経路の一部を約３７℃に維持し、一方第１処理経路の別の部分を約７０℃に維持できる。
【００３２】
種々の方法を実行して第１処理経路１１を少なくとも一つの温度に加熱し、一つの温度に維持したコンテナ１を別の温度から分離できる。例えば、一つの態様では第１処理経路１１を用いてコンテナ１の第１のインキュベーション、例えば約３７℃で約２０分間の溶解、および第２のインキュベーション、例えば約５０℃で約２０分間の溶出を実施できる。第１処理経路１１で溶解および溶出の両方に用いるコンテナ１を第２温度から熱的に分離し、コンテナ１を第１温度に暴露する、またはその逆を行うことができる。
【００３３】
第１処理経路１１を適当な物質、例えばアルミニウム等から作る場合、および適当な時間に例えば伝導的に第１処理経路１１を第１温度または第２温度に加熱する場合、部材により第１温度に暴露した第１処理経路１１の部分を第２温度に暴露した第１処理経路１１の部分から熱的に隔離させることができる。この部材は物理的なバリヤ等の隔離用の物質でよい。第１温度例えば３７℃に特異的な、および第２温度例えば５０℃に特異的な第１処理経路１１の部分で測定した温度条件に基づき能動的に部材を冷却または過熱でき、それによりコンテナ１を第１または第２温度に暴露するのを適当に限定する。
【００３４】
別の態様では、第１処理経路１１を第１温度、例えば３７℃に維持する。第２温度、例えば５０℃に維持するのが望ましい第１処理経路１１の部分で少なくとも一つの別の熱エネルギー源、例えばＩＲ源等をに第１処理経路１１に熱的に結合し、必要な時間に第１処理経路の適切な部分に望ましい量の熱を供給できる。コンテナ１に存在する内容物はＩＲ源に暴露される間第２温度への温度上昇を経験し、次いでコンテナ１をＩＲ源への暴露から外すと、第１温度に熱分解する。
【００３５】
図１０および１１で説明する構造１ｂの別の態様では、一度第１コンテナ１を第１処理経路１１に設置すると、ベルト３６のピン３６ａと連動してベルト３６が第１コンテナ１を動かす。原動力３８は駆動ギア４０および従動ギア４１を介してベルト３６と連動する。原動力マウント３９は望ましい様式で原動力３８と従動ギア４１を整列させる。
【００３６】
図３Ａおよび３Ｂに戻り、コンテナ８、例えば試験管等に分配したサンプルを入力列１７を搭載したコンテナ・キャリヤ２７に搭載する。サンプルコンテナ８および連結するコンテナキャリヤ２７の実例を図６に示す。コンテナ８およびコンテナキャリヤ２７は前記で引用した米国特許第５９１５５８３号および第Ｄｅｓ．４０１６９７号に開示するコンテナに実質的に類似するものでよい。
【００３７】
入力列１７を現在入手可能なアボットＦＰＣフレキシブル・ピペッティング・センターまたは‘７８４特許に記載される共通の構造のようなサンプルハンドラーに類似して構築できる。入力列１７の実例を図４に示し、これは’７８４特許に開示されるもののようにコンベヤシステムを含んでなる。図４で説明する態様は図３Ａおよび３Ｂの構造１ｂのごとき構造がスペース１７ａに配置され、そして入力列１７および構造１ｂが協働できるように構築されている。この態様ではサンプル入力および出力列１７および１７ｂは各々区域内列１７ｃにより互いのオフセットに隣接して配置できる。
【００３８】
バーコード・リーダー２５を第１処理経路１１に隣接して配置し、バーコード・リーダー２５がコンテナ８および／またはコンテナキャリヤ２７に関連するコードを読み取る。バーコード・リーダー２５を用い、ピペッター１９が届く位置で入力列１７に配置する規定のサンプルを同定する。
【００３９】
バーコード・リーダー２５がサンプルを同定する場合、ピペッター１９がそのサンプルを入力列のコンテナ８から第１処理経路１１に配置されている第１コンテナ１に移すことができる。所定の測定様式に従って、別のアイテム、例えば試薬等をピペッター１９およびピペッター１２により第１コンテナ１に加えることができる。‘７８４特許に開示されている試薬回転ラックに類似している試薬ハンドラー１３に試薬を貯蔵する。例示的な態様では、以下に具体的に記載されている「１チューブＤＮＡ／ＲＮＡ２０−２０分サンプル調製プロトコル、１チューブ１．５時間ＰＣＲ終点プロトコル」に記載の時間にピペッター１９および１２により第１コンテナ１に試薬を加えることができる。
【００４０】
ピペッター１９および１２に加えて、適当なポンピング機構で流動するように接続した分配ノズル（明確に示してはいない）によりボトル２９、３１および３２の試薬を流体分配ノズルを介して第１コンテナ１に加えることができる。コンテナ２９、３１および３２を図５Ｅ、５Ａ、５Ｂおよび１９に示す。一つの態様では、コンテナ３１は恐らく磁力に応答できる固相微粒子を含有し、これはコンテナ３１含有物をホモジナイズする、すなわち流体媒質に粒子を再懸濁するために攪拌器を必要とする。微粒子試薬ハンドラー１８に攪拌器を組み込むことができ、図３Ａおよび３Ｂに示す。一般に知られている混合フィン、補足的にコンテナフィンおよび／またはフィン運動とりわけ方法を用いてこの再懸濁を達成できる。具体的な態様では、これもまた当該分野で一般に知られている攪拌棒および関連の装置を用いてコンテナ３１内での粒子の再懸濁を達成する。本明細書に記載されるいくつかまたは全てのコンテナを図３Ａおよび３Ｂに示される構造１ｂに設置できる。コンテナの内容物は図５Ｃで示される試薬シール３０および／または冷蔵庫を用いて保存できる。試薬の分配にさらに可動性を提供するために、第１処理経路１１に機能的に結合する試薬分配ノズルを輸送機構に組み込み、第１処理経路１１のいずれかの望ましい位置で試薬を分配させることができる。
【００４１】
しばしば第１コンテナ１の内容物を混合または攪拌するのが望ましい。ミキサー５、例えば図１３に示すミキサー５により選択した時間に第１処理経路に沿って第１コンテナの内容物を選択的、自動的に混合できる。この態様では、第１コンテナ１を構造体４４を介して機能的に連結させ、今度はこれを機能的にギヤトレイン４３に結合する。原動力４２により回転させると、第１コンテナ１に例えば軌道、循環等の運動を誘起するようにギアトレイン４３を配置する。一つの態様において、以下で具体的に記載する「１チューブＤＮＡ／ＲＮＡ２０−２０分サンプル調製プロトコル、１チューブ１．５時間ＰＣＲ終点プロトコル」に記載される時間に混合を行う。
【００４２】
図５Ｆおよび１９で示す使い捨てピペッターチップ２８を用いるようにピペッター１９および１２を配置する態様では、図７で示すローダーおよび輸送機構３３、図８で示すローダーおよび輸送機構３４またはその他の同等の配列により１個または１群のチップ２８を移動および搭載できる
ピペッター１９または１２のいずれかによりチップ２８を連結させた後、液体レベルの検知（現在利用可能ないずれかの方法により実行する）、選択した（複数の）コンテナからの吸引、および第１コンテナ１への分配を行う。ピペッター１２または１９は液体レベルおよび／または温度を検出できる装置を含むことができる。この装置には写真光学、キャパシティブ・メンバー（ｃａｐａｃｉｔｉｖｅ  ｍｅｍｂｅｒｓ）、ＩＲ、ソナー、またはその他の波動発生器などがあるが、これらに限定するものではない。分配した後、洗浄ステーション２３でチップ２８を液体で洗浄し、それにより夾雑物への暴露を低減させる。所望の場合、類似の様式で続いて第１コンテナ１への添加を行うことができる。第１コンテナへの望ましい添加を全て完了した後、第１コンテナの内容物を第１コンテナから吸引かそうでなければ除去し、別の機能、例えば遺伝子配列決定、遺伝子薬理学等を実施できる望ましい位置に分配または移動させることができる。次いで、チップ２８をピペッター１２または１９から除去でき、チップ２８廃棄物２４に配し、それにより夾雑物への暴露を低減できる。複数の試薬および唯一つサンプルまたは調製したサンプルに対して１個のチップ２８を使用することにより、操作による固体の廃棄物を減少させることができ、夾雑物の低減を望ましいレベルに維持しながらコストを軽減できる。チップ２８を含まない場合でもピペッター１２または１９で類似の工程を実施できる。
【００４３】
ミキサー５を用いる混合または第１コンテナ１に加えるその他の運動により、第１コンテナ１に含まれる流体の意図しない分配、例えばエアロゾル化を引き起こし得る。図１４は適当な配置で第１処理工程に組み込まれた構造体またはポート４５示す。ポート４５は流体圧力源、例えば真空等のごとき負の流体圧力源と流動するように接続されており、第１処理経路１１で隣接するコンテナ１からより望ましい位置に第１コンテナ１上の空気流を抜く。この方法で空気により運ばれる望ましくない夾雑物を制御された位置まで運ぶ道を作ることができる。
【００４４】
構造１ａおよび１ｂにより実施されるいくつかの方法、すなわち免疫診断および／またはＰＣＲサンプル調製法で用いる微粒子の洗浄で、例えば第１コンテナ１の内容物のいくつかがマグネット４に引き付けられ、それが維持される場合、第１コンテナ１からの未結合もしくは結合微粒子および／または第１コンテナ１のその他の構成成分の除去、排出またはピペッティングを利用できる。
【００４５】
この洗浄を行うために、少なくとも一つの洗浄ゾーン５０を第１処理経路１１に沿った適当な位置に配置する。図１６で示すようにプローブ４９が備えられた洗浄ゾーン５０内で第１コンテナ１の内容物、例えば第１コンテナからの未結合または結合微粒子を自動的に排出またはピペッティングするように構築する。１個以上例えば４個のプローブ４９が一つの洗浄ゾーン５０を含んでなる。洗浄工程例えば磁力分離、吸引、分配に関して‘７８４特許にさらに記載されている
夾雑物が例えばＤＮＡ／ＲＮＡ測定に関係する場合、図１５に示すように外部チューブ４６および内部チューブ４７でプローブ４９を形成できる。外部チューブ４６は部材４６ａを介して内部チューブ４７に関して実質的に同心円上に固定される。ある態様では部材４６ａは流体運搬の導管として機能できる。一つの態様では外部チューブ４６を流動するように洗浄流体源に接続し、内部チューブ４７を廃棄物に通じる真空源に流動的に接続する。多くの目的で例えば第１コンテナ１に保持された目的のアイテムに結合した粒子から未結合の粒子を化学的に洗浄するために、また内部チューブ４７が流体例えば排出中の第１コンテナ１の流体に接触した後、望ましくないアイテムすなわち夾雑物を内部チューブから除去するために洗浄流体を用いることができる。
【００４６】
第１コンテナ１に壁面に微粒子を引き付ける方法を改善するために、第１コンテナ１内の微粒子を第１コンテナ１の反対側に沿って第１コンテナ１に隣接して配置された２個のマグネットを含んでなるマグネットステーションに暴露できる。
【００４７】
いかなる時も、例えば洗浄中、第１コンテナ１の（複数の）側壁に引き付けられた微粒子を適当な装置例えば図１３に示すミキサー５を介して再懸濁できる。別法として、プローブ３または４９を用いて第１コンテナ１内の流体の適当な動きにより第１コンテナ内の流体および／または固体の再懸濁に影響を及ぼすことができる。かかる態様では一つまたは複数の流体の流れが、再懸濁すべき相当する流体および／または固体物質が存在すると予測される第１コンテナ１内の位置、例えばその垂直壁を指向するように、流体、例えば洗浄溶液をプローブ３または４９から分配する。この方法で図１７に示すように第１コンテナ１中で再懸濁すべき物質を第１コンテナ１内に分配できる。
【００４８】
選択した様式またはプロトコルに従って第１コンテナ１の内容物の処理を完了した後、第１コンテナ１の内容物を第１コンテナ１から移動させ、図３に示す第２コンテナ１５に置く。ピペッター１２を介して物質例えば試薬を第２コンテナ１５に加える。ついで第２コンテナ１５をシーラー２１で封をする。
【００４９】
第２コンテナ１５を相対的に急速に加熱および冷却するのが望ましい場合、第２コンテナ１５内容物の容量比に対して加熱表面を相対的に多くして、および／または第２コンテナ１５の（複数の）壁を相対的に薄くして、相対的に速い熱エネルギー移動速度を保持するように第２コンテナ１５を構築できる。
【００５０】
第１コンテナ１の内容物の第２コンテナ１５への移動を自動的に促進するために、第１チャンバーの開口部を第２チャンバーの開口部よりも相対的に大きくした第１チャンバーおよび第２チャンバーを有する第２コンテナ１５を構築できる。ピペッター１２を入れ、第１チャンバーを第１コンテナ１の内容物およびその他の試薬で充填することができる。次いで第１チャンバーの開口部をシーラー２１で封をすることができる。第２チャンバー開口部を相対的に小さくすることにより、第１チャンバーの内容物が第２チャンバーに移動するのを制限できる。別法として、コンテナをスピナー２２に移動させる前に、シーラー２１により第１レベルまで第１チャンバーの開口部に封をし、これを「ソフト・シール」と称する。この場合、スピナー２２から第２コンテナ１５を取り除いた後、シーラー２１により第１レベルとは異なる第２レベルまで第１チャンバーの開口部に封をできる。
【００５１】
遠心力により第１チャンバーの内容物を第２チャンバーに置換するように第２コンテナ１５を動かすスピナー装置２２に第２コンテナ１５を移動する。第１チャンバーの内容物を第２チャンバーに移した後、第２コンテナ１５をスピナー２２から取り外し、さらに処理するために熱移動装置に移す。別法として、ピペッターに結合した流体からの圧力により誘起した力により第２コンテナ１５を第２チャンバーまで充填することができるか、またはピペッター１２が第２コンテナ１５の第２チャンバーに入り、それにより第２チャンバー２を充填できる。
【００５２】
キャピラリーチューブまたはキャピラリー様の構築を有するチューブが望ましい熱移動速度に反応し、かかるチューブの充填により力または遠心力に典型的に関与し、液体をチューブに移動させる。別の態様では図２７Ａから２７Ｆで説明する組立部１５Ｃからなる第２コンテナ１５を用いることができる。この態様では第２コンテナ１５は開口部５７から内容物を受け入れる。第２コンテナ１５の開口部５７の口はキャピラリーチューブより相対的に大きく、遠心のごとき２次的な操作をなんらすることなく第２コンテナ１５に内容物を自動的にピペッティングできる。さらにＤＮＡ増幅する前に第２コンテナ１５に封をし、夾雑を低減できる。シール１５ｂを第２コンテナ１５に連結し、夾雑を低減させ、蒸発を調節する。シール１５ｂの外壁５８は第２コンテナ１５の内壁５９よりも相対的に小さく、第２コンテナ１５にかみ合わせたときに第２コンテナ１５の内容物が外壁５８の周りで置換できることができるようになる。この内容物の置換により液体面積比に対して熱移動が増大し、それにより比較的急速に熱移動できる。ある態様では、第２コンテナ１５に関して実質的に同心円的にシール１５ｂを配置するためにフィンが第２コンテナ１５の内壁５９に連結されるように外壁５８がフィンを含み（示されていない）、それによりシール１５ｂの外壁５８の周りの内容物が実質的に均一に置換され、熱が内容物に実質的に均一に移動する。
【００５３】
第２のコンテナ１５およびシール１５ｂを連結することができ、図２７Ｃおよび２７Ｆで示す組立部１５ｃを形成する。さらに処理するためにこの組立部１５ｃを第２処理経路または熱循環／検出モジュール１６に移動させることができる。
【００５４】
一つの態様では、ピペッター１２が３つまでの試薬およびサンプルを第２コンテナ１５に加えた後、第２コンテナ１５をスピナー装置２２に輸送する工程を行う。次いでロボットは第２コンテナ１５を第２処理経路または熱移動／検出装置１６に移動させる。装置１６は第２コンテナ１５に第１処理経路が第１コンテナ１にもたらした温度と同じかまたは異なる温度をもたらすことができる。
【００５５】
図３Ａおよび３Ｂは、第１処理経路で調製されたサンプルの処理能力がＰＣＲ処理時間およそ１時間に匹敵し、１時間あたりにおよそ１００試験の処理能力がある構造を作る１１２個の熱移動／検出モジュール１６ａからなる熱移動／検出装置１６の一つの構築を説明する。熱移動／検出装置１６を等温反応、熱循環、統合された熱移動および検出、とりわけ処理のために用いることができる。ある態様では、熱移動機能および検出機能を分離した構造で実行できる、例えば装置１６は熱移動構造および検出構造を含んでなり、隣接して、分離してまたはいずれかの適当な様式で配置できる。装置１６で検出した後、第２コンテナ１５を自動的に取り除き、ロボットにより廃棄物に捨てるかまたはさらに測定するために別の検出器に移動させる。
【００５６】
図３Ａおよび３Ｂで示す態様では、第１処理経路で単離したサンプルの調製を行い、隣接した装置１６で増幅および検出を行う。ここで、これらの二つの処理が実質的に分離されており、ＤＮＡ／ＲＮＡ化学に特異的な夾雑を低減できる。
【００５７】
サンプルを自動的に調製するための第１処理経路１１を、ロボットのごとき別の装置により増幅および検出のための装置に機能的に接続できる。
【００５８】
ある態様では、第２処理経路１６は第１処理経路１１の延長であり、それにより一つの処理経路を形成する。かかる態様では、全処理経路に沿って本明細書に記載するコンテナのいずれかを用いることができ、それによりコンテナ１からコンテナ１５に移動させる必要性を排除できる。換言すると、サンプルをサンプルコンテナ８から本明細書に記載する全ての工程を実施するために用いられる１個の処理コンテナに移すことができる。
【００５９】
構造１ａおよび１ｂに多くのその他の可能な改変を加えることができる。一つの改変では、図３Ａおよび３Ｂの第１処理経路１１は処理工程が選択的、自動的に実行される第１処理経路１１のごとき処理工程実行レーン、および処理工程が選択的、自動的に回避される、恐らく洗浄ゾーン５０を回避するために配置される処理工程回避レーンを含むことができる。‘７８４特許に記載される方法に類似の選択した様式またはプロトコルに基づいて選択した一つの処理工程実行レーンまたは処理工程回避レーンに、反応混合物を含有する第１コンテナを選択的、自動的に配置できる。
【００６０】
その他の改変では、第２コンテナ１５をキャピラリーチューブ、キャピラリーチューブの特性を有するチューブ、米国特許第Ｄｅｓ４０１７００号に記載の反応容器、反応チューブ、例えばセフェイド（サニーベール、カリフォルニア州）により供給されるもの、第１コンテナ１に類似のチューブ等にできる。熱移動／検出装置１６はペルティエー、マイクロ波、抵抗、強制空気および／または液体加熱／冷却技術を利用できる。モジュール１６もまたペルティエー、ＩＲ、マイクロ波、抵抗、強制空気および／または液体加熱／冷却技術を利用でき、セフェイド（サニーベール、カリフォルニア州）により供給されるスマート・サイクラーＴＭシステム、エム・ジェイ・リサーチ、インコーポレーティッド（ワルトハム、マサチューセッツ州）により供給されるテトラッドＴＭまたはＰＴＣ−１００ＴＭシステム、ハイベイド（フランクリン、マサチューセッツ州）により供給されるスプリントＴＭシステム、ラブネット・インターナショナル（ウッドブリッジ、ニュージャージー州）により供給されるマルチジーンＴＭシステム、ストラッタジーン・ユー・エス・エイ（ラ・ジョーラ、カリフォルニア州）により供給されるロボサイクラーＴＭ４０または９６システム、ペルキン−エルマー（フォスター・シティー、カリフォルニア州）により供給される４８０、９６００または９７００システム等の熱循環器および／または検出器部分に実質的に類似してよい。
【００６１】
構造１ａおよび１ｂをさらに改変することが可能である。かかる改変に関する以下の実例では類似の構造に共通の関連特性を利用する。
【００６２】
図２０で示す別の構造１ｃでは、熱移動／検出装置１６を図２０で示す第１処理経路１１に組み込むことができる。この場合第１コンテナ１は第１処理経路１１に残るが、望ましい様式に対応する熱ゾーンを通過する。
【００６３】
図２１で示すさらなる構造１ｄでは、第１コンテナ１を第２コンテナ１５に移し、続いて第２コンテナ１５が望ましい様式に対応する熱ゾーンを通過する。このように、第２コンテナ１５を熱移動／検出装置１６に移す前に第２コンテナ１５処理ライン１５ａで熱反応の一部を実行できる。
【００６４】
図２２で説明する別の構造１ｅでは、第２処理経路または熱移動／検出装置１６が別個に調節される第２処理副経路または熱移動／検出経路１６ｂを複数個含むことができる。熱移動／検出経路１６ｂの各々はアボット・プリズム（登録商標）機器の構築に実質的に類似した方法で特定の目的のアイテムに専念できる。
【００６５】
図２３に示すさらなる構造１ｆでは、第１コンテナ１内の容物処理を実施でき、処理した第１コンテナ１の内容物を望ましい試薬を充填した反応容器または複数のウェル（例えば９６ウェル）トレイのごときトレイ５２に移すことができる。構造１ｆはまた‘７８４特許に記載するように第１処理経路１１でバイパス領域５６を含んでもよい。トレイに封をし、手動的かまたは自動的に出力列まで動かし、熱移動／検出装置１６のごとき別の装置まで移動させることができる。この改変では、さらに処理する前にサンプル取扱い列１７において望ましい検定によりサンプルを分類することにより使用者の研究室での仕事の流れを改善させるさらなる方法を用いることができる。これにより、各検定のために異なる加熱および冷却プロトコルを要求する化学を処理する必要がある加熱および冷却装置、例えば熱移動／検出装置１６内のモジュール１６の数を統合することが可能になる。
【００６６】
構造の構成部分を越えて実施すべき測定、サンプル、試薬、容器等のごとき（複数の）アイテムを割り当てることにより本明細書に記載する構造およびその使用を最適化できる、例えば構造を規定の時間での測定数を増やすように調整できる。
【００６７】
例えば操作者がいずれかのオーダーで構造のサンプルハンドラー１７にサンプルを装填する。測定あたりのコストを軽減するために、またはとりわけ構造の信頼性を改善するために、構造内に存在するアイテムの数を減らすことができる。ある測定、例えばＤＮＡ／ＲＮＡ増幅および検出では加熱および冷却プロトコルが必要であり、これは測定によって変化する。これによりコストおよび／またはアイテムの軽減が複雑になる。これらの軽減を達成するために（複数の）構造の構成部分を越えてアイテムを割り当てることができる。
【００６８】
本明細書で記載する態様では、測定法は多くの処理、例えば三つの測定からなる。ある実例では測定が第１処理、第２処理および第３処理からなる。第１処理は全ての測定、例えばＤＮＡ／ＲＮＡサンプル調製、サンプルインキュベーション、免疫診断サンプル調製および測定等に共通し得る。第２処理、例えば増幅等は規定の測定に特異的である。第３処理、例えば検出は全て測定に共通であるか、または規定の測定に特異的でよい。
【００６９】
（複数の）構造の構成部分を越えてアイテムを割り当てるために、サンプルを同定し、次いで第２および第３処理での共通点によりグループ分けする。例えば、あるモジュール１６ａ、１６ｂ、１６ｃまたは１６ｄでは以下に記載するプロトコルＡのごとき一つのプロトコルに準じてあるＤＮＡ／ＲＮＡ検定を処理できるが、一方別のモジュール１６ａ、１６ｂ、１６ｃまたは１６ｄで以下に記載するプロトコルＢのごとき別のプロトコルに準じて別のＤＮＡ／ＲＮＡ検定を処理できる。共通の第２および第３処理により選択されたサンプルをサンプル・ハンドラー１７から処理経路１１に供給することにより、特異的な（複数の）測定に対してモジュール１６ａ、１６ｂ、１６ｃまたは１６ｄの割当を行うことができ、処理能力は増強するが、必要なモジュール１６ａ、１６ｂ、１６ｃまたは１６ｄおよびコンテナ５２の数は減少する。
【００７０】
サンプルの分類は、バーコードリーダーを有するサンプルハンドラー１７により固定されるコンテナ８のバーコードを読み取ることにより、サンプルの情報を同定することからなる。次いでコンテナ８を規定のキャリヤー２７内の別のコンテナ８と（機械的に）分類でき、次いでキャリヤー２７は第２および第３処理で共通する測定によりサンプルハンドラー１７の別のキャリヤー２７と分類できる。分類後、ピペッター１９によりコンテナ８からのサンプルをコンテナ１に移す。別法として、予め決定した分類順序に基づいてピペッター１９によりコンテナ８からのサンプルを処理経路１１のコンテナ１に選択的に移すことにより、サンプルを分類できる。
【００７１】
一度サンプルが処理経路１１のコンテナ１に在ると、測定法からなる第１処理を実行する。第１処理を終了した後、用いる特定の構造に依り、一つまたはそれ以上のモジュール１６ａ、１６ｂ、１６ｃまたは１６ｄの処理経路１１かまたは別の装置のいずれかで第２および／または第３処理を行う。
【００７２】
共通の第２および／または第３処理に準じてサンプルを分類またはグループ分けすることにより、モジュール１６ａ、１６ｂ、１６ｃまたは１６ｄの最適数を目的の所定のアイテムを決定するために割り当てることができ、すなわち目的の所定のアイテムの測定の最大数を見極めることができ、関連するサンプルを適当に分類でき、（複数の）構造のまたは構造中の構成部分またはアイテム、例えばコンテナ、試薬等を所定の（複数の）構造の二つまたはそれ以上のモジュール１６ａ、１６ｂ、１６ｃまたは１６ｄで適当にデュプリケートにできる。同様に特異的な測定プロトコルに基づいて二つまたはそれ以上のモジュール１６ａ、１６ｂ、１６ｃまたは１６ｄをデュプリケートにできる。
【００７３】
図２２はサンプルの分類結果に準じてモジュール１６ｂをデュプリケートにできる別の構造１ｅを示している。図２３および２４はモジュール１６を（複数の）構造の外部に設置できる別の構造１ｆおよび１ｇを示している。この場合分類されたサンプルを（複数の）構造１ｆおよび１ｇの外部にある複数のモジュール１６を超えてデュプリケートにできる。
【００７４】
図２０はモジュール１６が処理経路１１に組み込まれた別の構造１ｃを示している。ここではサンプルの分類により処理経路１１が第１期間で一つの測定をするようにプログラムでき、次いで第２期間で別の測定をするようにプログラムできる。
【００７５】
さらに処理する前にサンプル取扱い列１７において測定することによりサンプルを分類する適用では、比較的小さなグループ分けをするのが望ましい。グループ分けの大きさによりトレイ５２の大きさおよびそれに対応する熱移動／検出装置１６が決定される。図２６に示す構造１ｉでは、測定によりサンプルを約１２個のサンプルを含む比較的小さなグループ分けに分類できる。トレイ５２および熱循環／検出モジュール１６内の熱循環／検出モジュール１６ｃが１２個の各グループを別個の調節するモジュール１６ｃを有する１２個のグループに対応するように両方を配置する。構造１ｉは望ましい処理能力を維持するのに必要な熱循環／検出モジュール１６ｃの数を減らすことができる。
【００７６】
試験分配表を管理するために、試薬装填マップを作るために、試薬装填を示唆するために、そしてデータを管理するために、例えば構造を調節するソフトウェアを用いてさらに増強できる。
【００７７】
図２４で示すさらなる構造１ｇでは、第１コンテナ１の内容物を調製でき、調製した第１コンテナ１の内容物を別のコンテナまたはトレイに移すことができる。コンテナを出力列に移動させ、試薬添加、熱移動および検出を実行するさらなる装置に手動的または自動的に移す。
【００７８】
図２５に示すさらなる構造１ｈでは、サンプルをサンプル入力列１７に貯蔵する必要はなく、要求される熱循環／検出モジュール１６ｄの数が低減される。この構造１ｈでは第２コンテナ１５を熱循環モジュール１６ｄに移し、各モジュール１６ｄは別個に調節され、各々が検出器を有している。モジュール１６ｄは多くの配置を越えて回転ラック内の複数の、例えば約２または３個の熱ゾーンを通って第２コンテナ１５を熱移動させることができる。回転ラックのある位置に検出器が含まれる。モジュール１６ｄがさらにコンテナ１５を連続して受け入れるように設計し、一方別のコンテナ１５はモジュール１６ｄ内で処理される。別法では、モジュール１６ｄがコンテナ１５を完全に装填し、全てのコンテナを実質的に動じに処理できる。
【００７９】
モジュール１６ｄの別の態様を図３０Ａ、３０Ｂ、３１、３２Ａおよび３２Ｂで説明する。図３０Ａ、３０Ｂ、３１、３２Ａおよび３２Ｂの類似の構造を示すために共通の参照番号を用いる。これらのモジュール１６ｄの別の態様を例えばＰＣＲ生成物の熱増幅および検出に用いることができる。
【００８０】
トレイ７０は少なくとも１個の熱増幅を行うことができるコンパートメントまたはウェル７１を有する。図３０Ｂおよび３２Ｂの態様は８個のウェル７１を含むが、ウェル７１の数は望むように改変できる。ウェル７１に番号を付け、バーコード化して同定を容易にできる。この方法で、ウェル７１の位置、内容物等を例えば光学的のごとき機械的に検知できる。ある態様では、トレイ７０を関連する構造から容易に取り外すされる使い捨ての部材にできる。
【００８１】
ウェル７１は仕切り７２により少なくとも一面で結合し、ウェル７１の内容物が夾雑物に暴露するのを低減できる。さらに夾雑物への暴露を低減させるために、ウェル７１を取り外し可能なように被覆するかまたは封をできる。
【００８２】
トレイ７０はモーター７６、例えばステッピング・モーター、サーボモーター等に機能的に接続されており（図３１）、マイクロプロセッサ等により、所望の場合、ドライブ・シャフト７３により調節されに、それによりトレイ７０の回転を調節する。
【００８３】
コンテナ８の内容物を第１処理経路１１から増幅および検出用のウェル７１に移すことができる。トレイ７０およびウェル７１を望ましい熱暴露に供するために、少なくとも１個のヒーター７４をトレイ７０と熱的に連結する。複数のまたは異なる熱暴露が望ましい場合、適当な数のヒーター７４を含むことができる。図３０Ｂおよび３２Ｂに示すように、４個のヒーター７４を熱的にトレイ７０に連結するように配置し、それにより四つの異なる温度を提供するまたは異なる温度に暴露する。ヒーター７４は電気、マイクロ波、ペルティエ効果、強制空気または類似の技術を利用できる。
【００８４】
内容物をウェル７１に加える前または加えた後に、ウェル７１が望ましい温度になるようにヒーター７４を作動できる。ある態様では、ヒーター７４をトレイ７０から分離でき、トレイ７０のウェル７１に内容物を加える前かまたは加えた後のいずれかにトレイ７０がヒーター７４に機能的に接続される。
【００８５】
トレイ７０が回転するので、ウェル７１およびその内容物は隣接するヒーター７４により提供される温度に暴露されるかまたはその温度に至る。熱変化は周期的すなわち規定のパターンを繰り返すので、望ましい配列で望ましい時間のトレイ７０の回転によりウェル７１およびその内容物を望ましい（複数の）温度にできる。このように、トレイ７０は回転するので、ウェル７１およびその内容物は連続した、明確な温度ゾーンを経験できる。各ヒーター７４は実行される特定の測定により確定される、規定の反応例えば溶融、アニーリング、伸長等に特異的な温度に対応できる。
【００８６】
所定のウェル７１が所定のヒーター７４に隣接して配置されている時間をトレイ７０の回転速度により測定する。ある利用では、トレイ７０の回転または段階的動作の数が現在利用可能な熱循環器により実行される循環数に比例する。トレイ７０の回転速度は特定の時間、ウェル７１がヒーター７４に隣接して配置されるように調節できる。例えば、第１ヒーター７４はウェル７１をＤＮＡ二本鎖を解離または溶融できる温度にできる。第１ヒーター７４に隣接する第２ヒーター７４がウェル７１を相補的な鎖例えば標的とプライマー、または標的とプローブの結合を誘起する温度にすることができる。第２ヒーター７４または別のヒーター７４を用いてプライマーを酵素的にポリメラーゼ伸長でき、反応を終了させるのに十分な時間ウェル７１をそのヒーター７４に隣接して配置する。トレイ７０の回転速度、熱「面積」すなわちヒーター７４がウェル７１およびその内容物をヒーター７４に関連する温度にできるヒーター７４の面積およびヒーター７４に関連する温度を調整することにより、特定の検定のために熱循環パラメーターを最適化できる。
【００８７】
一度ウェル７１の望ましい熱暴露を完了すると、ウェル７１に存在する目的のアイテムを検出器７５により検出できる。ウェル７１に封をする場合、次いで封を取り除けるかまたは、別法として、光学的に透過できる物質でシールを作り、検出器７５がウェル７１をモニター観察し、存在する場合、目的のアイテムを検出できる。検出器７５はまたトレイ７０またはウェル７１に関連するバーコードを読み取ることもできる。
【００８８】
ウェル７１が検出器７５に関して移動するので、動的（リアルタイム）モードで検出器７５を用いて、例えばリアルタイムでウェル７１を読み取ることによりＰＣＲ生成物を検出することができる。ある態様では、ウェル７１が検出器７５に遭遇するｎ回毎に検出器７５がウェル７１を読み取ることができる。数字ｎを決定して、所定の時間、所定の閾値でウェル７１の状態を比較できる。静止点、終点の読み取りに検出器７５を用いることができる。
【００８９】
検出器７５はトレイ７０に関して静止してよく、またはトレイ７０に関して動いてよい。複数のトレイが存在する場合、次いで複数の検出器７５、例えば各トレイ７０に１個の検出器７５を用いることができる。光ファイバーを用いてウェル７１から検出器７５に光を導くことができる。
【００９０】
検出器７５は光源を用いて一つまたは複数の波長でウェル７１の内容物を照射し、それにより例えば多重検出器７５を不連続な波長で複数の波長放射強度の減少データに対応させることができる。ある態様では、検出器７５はウェル７１からの蛍光放射のごとき一つまたは複数の波長の単一の検出または平行検出を実施できる。
【００９１】
別のモジュール１６ｈを図３３に示す。このモジュール１６ｈはブロック７８内に配置された流体運搬用導管７７を含む。導管７７はブロック内でコイル７９を形成している。ブロック７８は適当な熱エネルギー伝導性構成部分で構築されており、少なくとも第１温度である第１熱ゾーン８０Ａおよび第１温度とは異なる第２温度である第２熱ゾーンを形成する。この構築物ではコイル７９のある部分がコイル７９の別の部分と異なる熱ゾーン８０Ａまたは８０Ｂにあり、一方コイル７９のある部分は同一の熱ゾーン８０Ａまたは８０Ｂにある。
【００９２】
コンテナ１、８もしくは１５の内容物または流体を第１処理経路１１から導管７７の注入口８１に移す。適当な手段、例えばポンプ、毛管現象等により流体を注入口８１からコイル７９に強制的に流す。流体はコイル７９を通って流れるので、流体が熱ゾーン８０Ａおよび８０Ｂの間を動くので、流体は異なる温度に遭遇するかまたは異なる温度に至る。
【００９３】
熱ゾーン８０Ａおよび８０Ｂに関連する温度を特異的ＰＣＲ増幅の温度に適合するように選択できる。この態様では、コイル７９を成す回転またはループの数は現在利用可能な熱循環により実行される循環数に等しい。コイル７９の流体の流れを、流体が規定時間各熱ゾーン８０Ａまたは８０Ｂに滞在するように調節する。例えばある熱ゾーン８０Ｂは流体を二本鎖ＤＮＡを解離、または溶融できる温度にできる。別の熱ゾーン８０Ａは流体上部を標的およびプライマー、または標的およびプローブのごとき相補鎖の結合を誘起する温度にできる。この同一の熱ゾーン８０Ａを用いてプライマーの酵素的ポリメラーゼ伸長が可能である。もちろん、流体が反応が終了するのに十分な時間熱ゾーン８０Ａまたは８０Ｂに暴露されるように流体の流れを調整する。検出器７５をコイル７９に隣接して設置し、前記の方法に実質的に類似の方法でコイル７９内の流体の状態をモニター観察する。
【００９４】
種々のサンプルに対応する流体を適当な別の流体、例えば空気、緩衝液等により分離された導管７７に導入できる
装置１６ではいかなる熱移動／検出モジュールをも使用できる。例えば、装置１６は、本件出願の特許出願人に譲渡されている米国特許第５５７６２１８号に記載の方法を用いることができる。‘２１８特許の記載は全て本明細書に包含される。
【００９５】
図３Ａおよび３Ｂに示されるモジュール１６ａは、図２９に示される加熱または冷却された流体を使用して第２コンテナ１５の反応内容物の熱循環を提供できる。流体をリザーバー６５で貯蔵し、熱調節器６６で加熱または冷却する。メータリング・ファンまたはポンプ６７により望ましい時間、ポート６ｅを通ってモジュール１６ａまで流体を巡らせる。第２コンテナ１５の内容物と加熱または冷却された流体の間で熱交換が行われる。モジュール１６ａに移動した流体量を測定し、第２コンテナ１５の内容物が規定の温度で留まる時間を決定する。モジュール１６ａからの流体の排出はバルブ６８および／またはさらなるポンプまたは重力を用い、ポート１６ｆを通してコンテナ６５または廃棄物に排出する。第２コンテナ１５の熱の塊、第２コンテナ１５の内容物およびコンテナ６５に含まれる測定流体がわかっている場合、第２コンテナ１５と相互作用する測定流体の温度を算出および予想でき、それにより流体と第２コンテナ１５とのインターフェースでの温度調節の必要性が低減される。
【００９６】
例えばさらにリザーバーポンプおよびポート、例えば図２９に示すポート１６ｇを加えることにより、第２コンテナ１５の内容物の温度を異なった温度にできる。急速な熱移動を強化するために、第２コンテナ１５を薄い重合フィルム製の小袋として構築できる。また、熱構成部分６９をモジュール１６ａに隣接して、および接触させて配置し、望ましい温度に調節できる。
【００９７】
第２コンテナ１５または１５ｄに対する光学検出器の配向を多くの方法で達成でき、例えばその一つを図２８で示す。第２コンテナ１５ｄは「ＹＺ」と称する第１軸平面上で少なくとも一つの第１フェース６０を含み、「ＸＹ」と称する第２軸平面上で少なくとも一つの第２フェース６１を含み得る。光源６２を第１フェース６０に隣接して設置し、光学検出器６３を第１フェース６０と反対の第２フェース６１に隣接して設置し、光源６２により目的のアイテムに結合した標識の励起を誘起し、標識からの光のごときシグナルの放出を検出器または検出器ペア６３により検出する。第１軸平面の相対位置は第２軸平面と異なり、これによりシグナル収集面積が広くなる。検出器または検出器ペア６３は単一の光ダイオード、クワドラント光ダイオード、ダイオード・アレイ、光電子増倍管、またはこれらの検出装置を組み合わせたものでよい。透過性物質例えばガラスに載せた透過性加熱構成部分６４を用いて光学を加熱構成部分と組み合わせることができ、ヒーターを第２コンテナ１５ｄの少なくとも一つの第２フェースに隣接して配置し、恐らく第２平面上に置く。ある態様では、光源６２を平面上で検出器または検出器ペア６３に対して実質的に垂直に置ける。この光学的構造形では第２コンテナ１５ｄをセフェイド（サニーベール、カリフォルニア州）が供給する反応チューブにできるか、または実質的に半球形、円球形、立方体または四面体の形の反応容器構造形でよいが、これらに限定するものではない。
【００９８】
さらなる第１コンテナ１の内容物の調製、免疫診断、および／または測定処理モジュールを一般的なロボットおよび／またはシステムプロセッサ、例えばコンピューター等に一緒に接続できることを留意すべきである。また、熱移動／検出装置１６が第１コンテナ１の内容物または、構造１ａから１ｉに機能的に結合していない別の処理経路からの、処理されたまたは処理されていないその他のサンプルを受け入れることができることも留意すべきである。
【００９９】
構造１ａから１ｉを含んでなる記載の構成部分を選択的に自動的におよび／または手動的に望ましい時間操作して目的のアイテムの望ましい測定を達成できる。望ましい結果を得るために、望ましい順序、望ましい回数、構成部分の機能を実行できる。操作方法および使用する試薬等のごときアイテムは米国特許第５２３４８０９号（この特許の記載は本明細書に全て包含される）に記載のものに実質的に類似してよい。
【０１００】
以下のＤＮＡ／ＲＮＡサンプル抽出プロトコルおよびポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）プロトコルの実施例により本出願を説明する。用いた時間、温度、容量および構成部分（容器、溶液、試薬等）は望むように調整できる。位置番号は図３Ａおよび３Ｂの構造１ｂに対応する。しかしながら、位置番号はまた‘７８４特許に記載の種々検定様式で用いたのと同じ方法の処理経路に沿った段階的な動きの番号をも示している。
【０１０１】
１チューブＤＮＡ／ＲＮＡ２０−２０分サンプル調製プロトコルおよび１チューブ１．５時間ＰＣＲ終点プロトコル
サンプル調製
０秒−
位置０にて：
機器を第１処理経路１１の第１コンテナ１に載せる。
１〜３６秒−
位置１にて：
ピペッター１９に使い捨てチップ２８をつけ、試薬貯蔵エリア１８のコンテナ３１から磁力に応答する微粒子（約０．１ｍｌ）を吸引し、これらの微粒子を位置１のコンテナ１に分配する。洗浄カップ２３にて使い捨てチップ２８を流体で洗浄する。ピペッター１９は試薬取扱いエリア１３に設置されたコンテナから別の試薬（約０．０５ｍｌ）例えば内部対照等を吸引し、その試薬を第１コンテナ１に分配し、洗浄カップ２３にて使い捨てチップ２８を流体で２回洗浄する。コンテナ８に分配したサンプル（約１ｍｌ）をピペッター１９で吸引し、第１コンテナ１に分配する。使い捨てチップ２８をピペッター１９から取り外し、チップ廃棄物２４に入れる。別法として、微粒子の分配の後に実施されるピペッターの洗浄を排除できる。この場合、実質的に同時にまたは連続して、微粒子および内部対照を吸引し、第１コンテナ１に分配する。また別に、微粒子、内部対照およびサンプルを吸引し、同時におよび／または連続して第１コンテナ１に分配する場合、液体洗浄のサブセットまたは全てを排除できる。
【０１０２】
３７〜７２秒−
位置２にて：
第１処理経路に結合した分配ノズルを試薬コンテナ、例えば図５Ｂおよび１９で示す溶解溶液が入った試薬ビン３２に流動するように接続する。室温または約３７℃のいずれかで溶解溶液約６ｍｌを第１コンテナ１に分配する。
【０１０３】
７３〜１０８秒−
位置３にて：
第１コンテナ１の内容物をキミサー５で混合する。第１コンテナ１の内容物を約３７℃でインキュベートする。
【０１０４】
１０９〜１２６０秒−
位置４〜３５にて：
約３７℃で約１９．８分間インキュベーションを続ける。第１コンテナ１の内容物を約６４８秒および１２２４秒で混合する。第１コンテナ１の内容物を周期的に混合することにより反応を増強する。
【０１０５】
１２６１〜１２９６秒−
位置３６にて：
微粒子に結合した目的のアイテムをマグネット４で第１コンテナ１の側壁で捕捉する。
【０１０６】
１２９７〜１３３２秒−
位置３７にて：
洗浄ゾーン５０を含んでなる構成部分は本明細書に記載される、磁力による分離並びにプローブ４９を用いる流体の吸引および分配からなる洗浄機能を実行する。具体的には、マグネット４により微粒子を第１コンテナ１の内容物の残りのものから分離し、プローブ４９が分離されていない第１コンテナ１の内容物を除去する。プローブ４９から第１コンテナ１に洗浄溶液（緩衝液）を分配する。プローブ４９を洗浄する。別法として、例えば位置３６および３７で別個に実行する洗浄機能を第１処理経路１１で一つの位置に組合わせることができる。
【０１０７】
１３３３〜１３６８秒−
位置３８にて：
プローブ４９が洗浄および分配機能を実行する。第１コンテナ１中でミキサー５が微粒子を流体、具体的にはこの実施例の洗浄溶液＃１に再懸濁する。別法として、図１７に関して前記するように第１コンテナ１に適当な流体を分配することにより、微粒子の再懸濁を達成できる。別に、位置３６、３７および／または３８で実施される機能を第１処理経路１１の一つの位置で組み合わせることができる。
【０１０８】
１３６９〜１４０４秒−
位置３９にて：
微粒子に結合した目的のアイテムをマグネット４を用いて第１コンテナ１の側壁で捕捉する。洗浄ゾーン５０を含んでなる構成成分が前記する、磁力による分離並びにプローブ４９を用いる吸引および分配からなる洗浄機能を実行する。具体的には、マグネット４により微粒子を第１コンテナ１の残りのものから分離し、プローブ４９が分離されていない第１コンテナ１の内容物を除去する。プローブ４９を洗浄する。別法として、例えば位置３６および３７で別個に実行される洗浄機能を第１処理経路１１の一つの位置で組合わせることができる。
【０１０９】
１４０５〜１４４０秒−
位置４０にて：
プローブ４９が洗浄および分配機能を実行する。第１コンテナ１中でミキサー５が微粒子を流体に再懸濁する。別法として、図１７に関して前記するように第１コンテナ１に適当な流体を分配することにより、微粒子の再懸濁を達成できる。位置３６、３７および／または３８で実施される機能を第１処理経路１１の一つの位置で組み合わせることができる。
【０１１０】
１４４１〜１４７６秒−
位置４１にて：
微粒子に結合した目的のアイテムをマグネット４を用いて第１コンテナ１の側壁で捕捉する。洗浄ゾーン５０を含んでなる構成部分が前記する、磁力による分離並びにプローブ４９を用いる流体の吸引および分配からなる洗浄機能を実行する。具体的には、マグネット４により微粒子を第１コンテナ１の残りのものから分離し、プローブ４９が分離されていない第１コンテナ１の内容物を除去する。プローブ４９から第１コンテナ１に洗浄溶液（緩衝液）を分配する。プローブ４９を洗浄する。別法として、例えば位置３６および３７で別個に実行される洗浄機能を第１処理経路１１の一つの位置で組合わせることができる。
【０１１１】
１４７７〜１５１２秒−
位置４２にて：
プローブ４９が洗浄および分配機能を実行する。第１コンテナ１中でミキサー５が微粒子を流体、具体的にはこの実施例の洗浄溶液＃２に再懸濁する。別法として、図１７に関して前記するように第１コンテナ１に適当な流体を分配することにより、微粒子の再懸濁を達成できる。位置３６、３７および／または３８で実施される機能を第１処理経路１１の一つの位置で組み合わせることができる。
【０１１２】
１５１３〜１５４８秒−
位置４３にて：
微粒子に結合した目的のアイテムをマグネット４を用いて第１コンテナ１の側壁で捕捉する。洗浄ゾーン５０を含んでなる構成部分が前記する、磁力による分離並びにプローブ４９を用いる流体の吸引および分配からなる洗浄機能を実行する。具体的には、マグネット４により微粒子を第１コンテナ１の残りのものから分離し、プローブ４９が分離されていない第１コンテナ１の内容物を除去する。プローブ４９から第１コンテナ１に洗浄溶液（緩衝液）を分配する。プローブ４９を洗浄する。別法として、例えば位置３６および３７で別個に実行される洗浄機能を第１処理経路１１の一つの位置で組合わせることができる。
【０１１３】
１５４９〜１５８４秒−
位置４４にて：
プローブ４９が洗浄および分配機能を実行する。第１コンテナ１中でミキサー５が微粒子を流体、具体的にはこの実施例の洗浄溶液＃２に再懸濁する。別法として、図１７に関して前記するように第１コンテナ１に適当な流体を分配することにより、微粒子の再懸濁を達成できる。
【０１１４】
１５８４〜１６２０秒−
位置４５にて：
微粒子に結合した目的のアイテムをマグネット４を用いて第１コンテナ１の側壁で捕捉する。洗浄ゾーン５０を含んでなる構成部分が前記する、磁力による分離並びにプローブ４９を用いる流体の吸引および分配からなる洗浄機能を実行する。具体的には、マグネット４により微粒子を第１コンテナ１の残りのものから分離し、プローブ４９が分離されていない第１コンテナ１の内容物を除去する。プローブ４９を洗浄する。別法として、例えば位置３６および３７で別個に実行される洗浄機能を第１処理経路１１の一つの位置で組合わせることができる。
【０１１５】
１６２１〜１６５６秒−
位置４６にて：
第１処理経路１１と機能的に結合したポンプを分配ノズルと流動するように接続し、第１処理経路１１および試薬コンテナ例えば図５Ｅおよび１９に示すコンテナ２９と流動するように結合し、流体例えば溶出試薬を第１コンテナ１に分配させる。一つの態様では溶出試薬約８０μｌを室温で、また別に約７０℃で分配する。
【０１１６】
１６５７〜２８４４秒−
位置４７〜７６にて：
第１コンテナ１の内容物を、この実施例では約３７℃で、または実質的に約５０ないし約７０℃の範囲内で、約１９．８分間インキュベートする。周期的な混合により第１コンテナの内容物の要素間での反応が増強される。溶出試薬により微粒子から目的のアイテムが溶出される。
【０１１７】
検定
２８４５〜２８８０秒−
位置７７にて：
位置７６にてピペッター１２に使い捨てピペッターチップ２８を付け、試薬貯蔵エリア１３のコンテナから第１試薬を吸引し、コンテナ処理ライン１５ａの第２コンテナ１５にその試薬を分配する。使い捨てピペットチップ２８を洗浄カップ２４の中の液体で洗浄する。ピペッター１２により試薬取扱いエリア１３のコンテナから第２試薬を吸引し、第２試薬を第２コンテナ１５に分配し、使い捨てピペットチップ２８を洗浄カップ２４で洗浄する。第３試薬を試薬取扱いエリア１３のコンテナからピペットチップ２８に吸引し目的のアイテムを含有する第１コンテナ１の内容物約５０μｌを第１処理経路１１の位置７７の第１コンテナ１からピペットチップ２８に吸引する。第３試薬および吸引した第１コンテナ１の内容物をピペットチップ２８から第２コンテナ１５に分配し、使い捨てピペットチップ２８をピペッター１２からチップ廃棄物２４に駆出させる。別法として、ピペッター１２により、または第１処理経路１１の別の分配ノズルにより位置７６で第１処理経路１１の第１コンテナ１に第３試薬を分配できる。別の態様では、吸引の間ピペッター１２を洗浄することなく第１試薬および第２試薬を完全に吸引し、実質的に同時に試薬を第２コンテナ１５に分配できる。３種の試薬の各々の容量は実質的に約１０ないし約５０μｌの範囲内でよい。規定のサンプル中一つ以上の目的のアイテムを検出するのが望ましい場合、第１コンテナ１の内容物の一部を対応する数のコンテナ１５に移すことができる。このように第１コンテナの内容物を複数回移動させるのは位置７７から、また別に位置７７およびそれに続く（複数の）位置から行うことができる。一つのサンプルから決定すべき目的のアイテムの数が比較的多い、例えば約１５である場合、ピペッター１９および／または１２によりコンテナ８および／または第１コンテナ１から複数回吸引および分配を行うことができる。
【０１１８】
２８８１〜２９１６秒−
第２コンテナ１５をコンテナ処理ライン１５ａのシーラー２１に輸送し、ここで第２コンテナ１５に封をする。封をした第２コンテナ１５をスピナー２２に移し、ここで第２コンテナ１５の上部の内容物を第２コンテナ１５の下部に動かす。
【０１１９】
２９１７〜２９５２秒−
ロボットを第２コンテナ１５と連動させ、第２コンテナ１５を熱移動／検出モジュール１６ａに置き、ここで第２コンテナ１５を熱循環に暴露し、第２コンテナ１５の目的のアイテムを検出する。
【０１２０】
２９５３〜８３５２秒−検定特異的熱循環プロトコル
第２コンテナ１５を規定の熱循環プロトコルに供した。以下はかかるプロトコルの数例の実施例である。
【０１２１】
プロトコルＡ
１．約５９℃で約３０分間；１サイクル；
２．約９５℃で約３０秒間、約５４℃で約３０秒間、約７２℃で約３０秒間；４サイクル；
３．約９０℃で約３０秒間、約５９℃で約３０秒間、約７２℃で約３０秒間；４６サイクル；
４．約９４℃で約５分間、約４５℃で約１５分間、約２５℃で約１０分間；１サイクル。
【０１２２】
プロトコルＢ
１．約９４℃で約１０分間；１サイクル；
２．約９４℃で約１分間、約５８℃で約１分；４５サイクル；
３．約５８℃で約１０分間、約９４℃で約５分間、約５５℃で約１５分間、約２５℃で維持する。
【０１２３】
プロトコルＣ
１．約９５℃で約９．５分間；１サイクル；
２．約９５℃で約３０秒間、約５９℃で約１分間；４１サイクル；
３．約９５℃で約３分間、約２５℃で約１０分間；１サイクル。
【０１２４】
８３５３〜８３８８秒−
選択した特定の熱循環プロトコルを完了した後、第２コンテナ１５の目的のアイテムを検出し、第２コンテナ１５を配置する。前記の工程の結果を報告する。
【０１２５】
本明細書に記載する態様のいずれかでは、溶解は（複数の）電気パルスの誘起またはソニケーションの使用を含み、それにより、結合前にかかるパルシングをＤＮＡ／ＲＮＡに未損傷の形態で暴露させる。
【０１２６】
前記で開示されたＤＮＡ／ＲＮＡ法またはプロトコルに加えて、構造１ａから１ｇにより免疫診断法を実施できる。例えば米国特許第５７９５７８４号は種々の方法または様式を記載しており、恐らく適当な改変を加えて前記で開示した構造１ａから１ｇで実行できる。さらに、構造１ａから１ｇでＤＮＡ／ＲＮＡ抽出物を増幅し、検出することができ、別法では、別の構造１ａまたは異なる構造、例えばさらに処理するために‘７８４特許等に開示されるものに輸送することができる。所望の場合、適当な手段により第１コンテナ１に封をできることは理解される。
【０１２７】
別の態様では、前記の処理を行った後、第１コンテナ１の内容物を第１処理経路１１の位置７６から構造上の光学フロー・セルに移すことができる。光学フロー・セルは以下の米国特許：第５５８９３９４号、第５６０１２３４号、第５６３１１６５号、第５６３１７３０号、第５６５６４９９号、第５８１２４１９号および第５８９１７３４号に記載のものに実質的に類似している。これらの特許は本件特許の特許出願人に譲渡されており、これらの特許の記載は本明細書に全て包含される。サンプル中の目的のアイテムを光学フロー・セルで検出できる。
【０１２８】
この態様の改変では、第１コンテナ１、８、１５または別のサンプル担持容器からサンプルを直接構造上のサンプル受容カップに移すことができる。サンプルを混合し、標識を含む試薬と共に適当にインキュベートできる。標識がサンプル中の細胞および／または核膜に遭遇するかまたはこれを通過するように試薬を処方し、それにより目的のアイテムがサンプル中のどこに在るかには関係なく、標識を結合させるか、そうでなければサンプル中の目的のアイテムに結合させる。標識がサンプル中の目的の要素に遭遇しない場合、例えばサンプル中に目的のアイテムが存在しない場合、またはサンプル中の目的のアイテムが全てすでに標識と結合している場合、標識または過剰の標識を適当な方法、例えば分離、洗浄等により除去できる。恐らく標識に結合する目的のアイテムを含有するサンプルを構造上の光学フロー・セルを通過させ、フロー・セルに関連する光学により標識を検出し、それにより目的のアイテムの存在を示す。
【図面の簡単な説明】
【図１】  本明細書に記載する構造の透視図である。
【図２】  図１の構造の透視図である。
【図３Ａ】  本明細書に記載する別の構造の全体上面図である。
【図３Ｂ】  図３Ａに示した構造の透視図である。
【図４】  図３Ａおよび３Ｂの構造を用いて使用するためのサンプル列の透視図である。
【図５Ａ】  図３Ａおよび３Ｂに示す構造を用いて使用するための構成部分の透視図である。
【図５Ｂ】  図３Ａおよび３Ｂに示す構造を用いて使用するための構成部分の透視図である。
【図５Ｃ】  図３Ａおよび３Ｂに示す構造を用いて使用するための構成部分の透視図である。
【図５Ｄ】  図３Ａおよび３Ｂに示す構造を用いて使用するための構成部分の透視図である。
【図５Ｅ】  図３Ａおよび３Ｂに示す構造を用いて使用するための構成部分の透視図である。
【図５Ｆ】  図３Ａおよび３Ｂに示す構造を用いて使用するための構成部分の透視図である。
【図６】  図３Ａおよび３Ｂの構造を用いて使用するためのコンテナおよびキャリヤーの透視図である。
【図７】  図３Ａおよび３Ｂに示す構造を用いて使用するためのピペットチップ・ローダーの透視図である。
【図８】  図３Ａおよび３Ｂに示す構造を用いて使用するためのピペットチップ・ローダーの別の態様の透視図である。
【図９】  図３Ａおよび３Ｂに示す構造を用いて使用するためのコンテナ・ローダーの透視図である。
【図１０】  図３Ａおよび３Ｂに示す構造を用いて使用するためのコンテナ・トランスポーターの透視図である。
【図１１】  図１０の一部の拡大図である。
【図１２Ａ】  図１で示すコンテナの態様の透視図である。
【図１２Ｂ】  図１で示すコンテナの態様の透視図である。
【図１２Ｃ】  図１で示すコンテナの態様の透視図である。
【図１２Ｄ】  図１で示すコンテナの態様の透視図である。
【図１２Ｅ】  図１で示すコンテナの態様の透視図である。
【図１２Ｆ】  図１で示すコンテナの態様の透視図である。
【図１２Ｇ】  図１で示すコンテナの態様の透視図である。
【図１２Ｈ】  図１で示すコンテナの態様の透視図である。
【図１２Ｉ】  図１で示すコンテナの態様の透視図である。
【図１２Ｊ】  図１で示すコンテナの態様の透視図である。
【図１２Ｋ】  図１で示すコンテナの態様の透視図である。
【図１２Ｌ】  図１で示すコンテナの態様の透視図である。
【図１２Ｍ】  図１で示すコンテナの態様の透視図である。
【図１２Ｎ】  図１で示すコンテナの態様の透視図である。
【図１２Ｏ】  図１で示すコンテナの態様の透視図である。
【図１３】  図１２Ｅのコンテナとミキサーとの連動状態を説明する。
【図１４】  図３Ａおよび３Ｂの処理経路との機能的な関係になるように供されたポートを示す。
【図１５】  図３Ａおよび３Ｂに示す構造を用いて使用するためのピペッターの分解透視図である。
【図１６】  図１５のピペッターのある操作を説明する。
【図１７】  図１５のピペッターの別の操作を説明する。
【図１８】  図３Ａおよび３Ｂの構造に実質的に類似する構造の等角図である。
【図１９】  図１８の構造に実質的に類似する構造の等角図である。
【図２０】  図３Ａおよび３Ｂの構造に実質的に類似する別の構造の上面図である。
【図２１】  図２０の構造に実質的に類似するさらなる構造の上面図である。
【図２２】  図２１の構造に実質的に類似するさらなる構造の上面図である。
【図２３】  図２２の構造に実質的に類似する別の構造の上面図である。
【図２４】  図２３の構造に実質的に類似するさらに別の構造の上面図である。
【図２５】  図３Ａおよび３Ｂの構造に類似するさらに別の構造の上面図である。
【図２６】  図３Ａおよび３Ｂの構造に類似するさらに別の構造の上面図である。
【図２７Ａ】  図３Ａおよび３Ｂの構造を用いて使用するためのコンテナおよびシールの透視図である。
【図２７Ｂ】  図３Ａおよび３Ｂの構造を用いて使用するためのコンテナおよびシールの透視図である。
【図２７Ｃ】  図３Ａおよび３Ｂの構造を用いて使用するためのコンテナおよびシールの透視図である。
【図２７Ｄ】  図３Ａおよび３Ｂの構造を用いて使用するためのコンテナおよびシールの透視図である。
【図２７Ｅ】  図３Ａおよび３Ｂの構造を用いて使用するためのコンテナおよびシールの透視図である。
【図２７Ｆ】  図３Ａおよび３Ｂの構造を用いて使用するためのコンテナおよびシールの透視図である。
【図２８】  本明細書に記載する構造を用いて使用するための光学的配置の透視図である。
【図２９】  本明細書に記載する構造の一部の操作の概略図である。
【図３０Ａ】  本明細書に記載する構造の一部の断面図である。
【図３０Ｂ】  図３０Ａの一部の上面図である。
【図３１】  本明細書に記載する構造の一部の断面図である。
【図３２Ａ】  本明細書に記載する構造の一部の断面図である。
【図３２Ｂ】  図３２Ａの一部の上面図である。
【図３３】  本明細書に記載する構造の一部の概略図である。
【図１】
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【図２】
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【図３Ａ】
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【図３Ｂ】
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【図４】
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【図５Ａ】
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【図５Ｂ】
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【図５Ｃ】
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【図５Ｄ】
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【図５Ｅ】
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【図５Ｆ】
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【図６】
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【図７】
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【図８】
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【図９】
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【図１０】
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【図１１】
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【図１２Ａ】
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【図１２Ｂ】
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【図１２Ｃ】
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【図１２Ｄ】
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【図１２Ｅ】
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【図１２Ｆ】
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【図１２Ｇ】
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【図１２Ｈ】
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【図１２Ｉ】
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【図１２Ｊ】
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【図１２Ｋ】
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【図１２Ｌ】
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【図１２Ｍ】
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【図１２Ｎ】
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【図１２Ｏ】
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【図１３】
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【図１４】
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【図１５】
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【図１６】
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【図１７】
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【図１８】
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【図１９】
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【図２０】
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【図２１】
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【図２２】
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【図２３】
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【図２４】
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【図２５】
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【図２６】
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【図２７Ａ】
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【図２７Ｂ】
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【図２７Ｃ】
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【図２７Ｄ】
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【図２７Ｅ】
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【図２７Ｆ】
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【図２８】
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【図２９】
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【図３０Ａ】
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【図３０Ｂ】
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【図３１】
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【図３２Ａ】
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【図３２Ｂ】
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【図３３】
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