(57)【要約】ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαレベルを低下させるためにＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチド等の抗ＳＭＡＤ７治療法を使用して対象におけるＩＢＤを処置する方法が開示されている。ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαレベルに基づいてＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチド等の抗ＳＭＡＤ７治療法を使用して対象におけるＩＢＤを処置および管理する方法も開示されている。ＩＢＤの対象が、抗ＳＭＡＤ７治療法による処置に応答性であるかまたは応答性である可能性があるか決定する方法も開示されている。ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαレベルの低下は、ＩＢＤ寛解またはＣＤＡＩスコアの減少と相関し得る。【特許請求の範囲】
【請求項１】
炎症性腸疾患（ＩＢＤ）を有する患者におけるＩＢＤを処置または管理するための方法であって、（ａ）初期用量のＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドを該患者に投与するステップと、（ｂ）該患者におけるケモカイン（Ｃ−Ｃモチーフ）リガンド２０（ＣＣＬ２０）のレベルを解析するステップと、（ｃ）ＣＣＬ２０のレベルが、ＣＣＬ２０の正常レベルを上回る場合、該初期用量より多いもしくはこれに等しいその後の用量を該患者に投与するステップ、またはＣＣＬ２０のレベルが、ＣＣＬ２０の正常レベルを下回る場合、該初期用量に等しいもしくはこれより少ないその後の用量を該患者に投与するステップとを含む方法。
【請求項２】
炎症性腸疾患（ＩＢＤ）を有する患者におけるＩＢＤを処置または管理するための方法であって、（ａ）該患者におけるＣＣＬ２０のレベルを解析するステップと、（ｂ）ＣＣＬ２０のレベルが、ＣＣＬ２０の正常レベルを上回る場合、初期用量のＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドを該患者に投与するステップとを含む方法。
【請求項３】
（ｃ）前記投与するステップ後に前記患者におけるＣＣＬ２０のレベルを解析するステップと、（ｄ）ＣＣＬ２０のレベルが、ＣＣＬ２０の正常レベルを上回る場合、前記初期用量より多いもしくはこれに等しいその後の用量を該患者に投与するステップ、またはＣＣＬ２０のレベルが、ＣＣＬ２０の正常レベルを下回る場合、該初期用量に等しいもしくはこれより少ないその後の用量を該患者に投与するステップとをさらに含む、請求項２に記載の方法。
【請求項４】
（ｃ）前記投与するステップ後に前記患者におけるＣＣＬ２０のレベルを解析するステップと、（ｄ）ＣＣＬ２０のレベルが、該投与ステップ前のＣＣＬ２０のレベルより該投与ステップ後に低い場合、前記初期用量と同じまたは該初期用量より少ないその後の用量を該患者に投与するステップ、あるいはＣＣＬ２０のレベルが、該投与ステップ前のＣＣＬ２０のレベルと比較して、該投与ステップ後に未変化であるまたは増加した場合、該初期用量と同じもしくは該初期用量より多いその後の用量を該患者に投与する、または前記処置を終了するステップとをさらに含む、請求項２に記載の方法。
【請求項５】
ＩＢＤを有する患者におけるＩＢＤを処置または管理するための方法であって、（ａ）該患者についてのＣＣＬ２０の対照レベルを確立するステップと、（ｂ）初期用量のＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドを該患者に投与するステップと、（ｃ）該患者におけるＣＣＬ２０のレベルを解析するステップと、（ｄ）ＣＣＬ２０のレベルが、該対照レベルより低い場合、該初期用量と同じまたは該初期用量より少ないその後の用量を該患者に投与するステップ、あるいはＣＣＬ２０のレベルが、該対照レベルと比較して未変化であるまたは増加した場合、該初期用量と同じもしくは該初期用量より多いその後の用量を該患者に投与する、または前記処置を終了するステップとを含む方法。
【請求項６】
前記患者が臨床寛解しており、ＣＣＬ２０のレベルが、前記投与ステップ前のＣＣＬ２０のレベルと比較して該投与ステップ後に未変化であるまたは増加した場合、前記処置を終了する、請求項４または５に記載の方法。
【請求項７】
ＣＣＬ２０のレベルが、前記投与ステップ前のＣＣＬ２０のレベルと比較して該投与ステップ後に少なくとも１０％、少なくとも２０％、少なくとも３０％、少なくとも４０％、少なくとも５０％または少なくとも７０％減少した場合、前記初期用量と同じまたは該初期用量より少ないその後の用量を前記患者に投与する、請求項４または５に記載の方法。
【請求項８】
前記投与するステップ後のＣＣＬ２０のレベルが、該投与ステップ前のＣＣＬ２０のレベルと比較して少なくとも１０％、少なくとも２０％、少なくとも３０％、少なくとも４０％、少なくとも５０％、少なくとも６０％または少なくとも７０％減少した場合、ＩＢＤを有する前記患者が、少なくとも１週間、少なくとも２週間、少なくとも３週間、少なくとも４週間、少なくとも６週間または少なくとも８週間の期間、前記ＩＢＤの臨床寛解を経験する２０％超、３０％超、４０％超、５０％超、６０％超、７０％超、８０％超、９０％超または１００％超の機会を有することを決定するステップをさらに含む、請求項４または５に記載の方法。
【請求項９】
ＩＢＤを有する前記患者における前記臨床寛解が、クローン病活動性指数（ＣＤＡＩ）＜１５０によって示される、請求項８に記載の方法。
【請求項１０】
前記臨床寛解が、前記投与ステップから約１週間、約２週間または約３週間後に観察され、少なくとも１週間、少なくとも２週間、少なくとも３週間、少なくとも４週間、少なくとも６週間または少なくとも８週間の期間維持される、請求項８に記載の方法。
【請求項１１】
ＩＢＤを有する前記患者が、前記投与ステップの１週間前に約２２０〜約４００のＣＤＡＩを有した、請求項８に記載の方法。
【請求項１２】
ＣＣＬ２０のレベルがＣＣＬ２０の正常レベルを上回る場合、前記初期用量より多いその後の用量を前記患者に投与する、またはＣＣＬ２０のレベルがＣＣＬ２０の正常レベルを下回る場合、該初期用量より少ないその後の用量を前記患者に投与する、請求項１または請求項３に記載の方法。
【請求項１３】
前記その後の用量が、最大耐用量（ＭＴＤ）に等しいまたはこれより多い場合、前記処置を終了する、請求項３または５に記載の方法。
【請求項１４】
ＣＣＬ２０のレベルが、前記投与ステップから少なくとも１日、少なくとも３日、少なくとも５日、少なくとも１週間、少なくとも２週間、少なくとも３週間、少なくとも１カ月、少なくとも２カ月、少なくとも４カ月または少なくとも６カ月後に解析される、請求項３または５に記載の方法。
【請求項１５】
ＣＣＬ２０のレベルが、前記投与ステップ直後に解析される、請求項３または５に記載の方法。
【請求項１６】
ＣＣＬ２０のレベルが、前記投与ステップから約１５日または約２８日後に解析される、請求項３または５に記載の方法。
【請求項１７】
ＣＣＬ２０の前記正常レベルが、健康対照群におけるＣＣＬ２０のレベル中央値である、請求項１または請求項２に記載の方法。
【請求項１８】
ＣＣＬ２０の前記対照レベルが、健康対照群におけるＣＣＬ２０のレベル中央値である、請求項５に記載の方法。
【請求項１９】
前記健康対照群およびＩＢＤを有する前記患者が、年齢、性別、民族起源、喫煙習慣、食習慣、ボディマスインデックス（ＢＭＩ）、および／または運動習慣に関してマッチする、請求項１７または１８に記載の方法。
【請求項２０】
ＣＣＬ２０の正常レベルが、約６ｐｇ／ｍｌ、約７ｐｇ／ｍｌ、約８ｐｇ／ｍｌ、約９ｐｇ／ｍｌ、約１０ｐｇ／ｍｌ、約１１ｐｇ／ｍｌまたは約１２ｐｇ／ｍｌである、請求項１または請求項２に記載の方法。
【請求項２１】
ＣＣＬ２０の対照レベルが、約６ｐｇ／ｍｌ、約７ｐｇ／ｍｌ、約８ｐｇ／ｍｌ、約９ｐｇ／ｍｌ、約１０ｐｇ／ｍｌ、約１１ｐｇ／ｍｌまたは約１２ｐｇ／ｍｌである、請求項５に記載の方法。
【請求項２２】
前記初期用量が、１００ｍｇ／日未満、９０ｍｇ／日未満、８０ｍｇ／日未満、７０ｍｇ／日未満、６０ｍｇ／日未満、５０ｍｇ／日未満、４０ｍｇ／日未満または３０ｍｇ／日未満である、請求項１、２または５に記載の方法。
【請求項２３】
前記初期用量が、少なくとも１０ｍｇ／日、少なくとも２０ｍｇ／日、少なくとも３０ｍｇ／日、少なくとも４０ｍｇ／日、少なくとも５０ｍｇ／日、少なくとも６０ｍｇ／日、少なくとも７０ｍｇ／日、少なくとも８０ｍｇ／日または少なくとも９０ｍｇ／日である、請求項１、２または５に記載の方法。
【請求項２４】
前記初期用量が、約１０ｍｇ／日、約２０ｍｇ／日、約３０ｍｇ／日、約４０ｍｇ／日、約５０ｍｇ／日、約６０ｍｇ／日、約７０ｍｇ／日、約８０ｍｇ／日、約９０ｍｇ／日または約１００ｍｇ／日である、請求項１、２または５に記載の方法。
【請求項２５】
前記初期用量が、１０ｍｇ／日、４０ｍｇ／日、８０ｍｇ／日または１６０ｍｇ／日である、請求項１、２または５に記載の方法。
【請求項２６】
ＣＣＬ２０レベルが正常レベルを上回る場合、前記その後の用量が、前記初期用量より少なくとも約１０ｍｇ／日、少なくとも約２０ｍｇ／日、少なくとも約３０ｍｇ／日、少なくとも約４０ｍｇ／日、少なくとも約５０ｍｇ／日、少なくとも約６０ｍｇ／日、少なくとも約７０ｍｇ／日、少なくとも約８０ｍｇ／日、少なくとも約９０ｍｇ／日、少なくとも約１００ｍｇ／日、少なくとも約１１０ｍｇ／日、少なくとも約１２０ｍｇ／日、少なくとも約１３０ｍｇ／日、少なくとも約１４０ｍｇ／日、少なくとも約１５０ｍｇ／日または少なくとも約１６０ｍｇ／日多い、請求項１または３に記載の方法。
【請求項２７】
ＣＣＬ２０レベルが対照レベルを上回る場合、前記その後の用量が、前記初期用量より少なくとも約１０ｍｇ／日、少なくとも約２０ｍｇ／日、少なくとも約３０ｍｇ／日、少なくとも約４０ｍｇ／日、少なくとも約５０ｍｇ／日、少なくとも約６０ｍｇ／日、少なくとも約７０ｍｇ／日、少なくとも約８０ｍｇ／日、少なくとも約９０ｍｇ／日、少なくとも約１００ｍｇ／日、少なくとも約１１０ｍｇ／日、少なくとも約１２０ｍｇ／日、少なくとも約１３０ｍｇ／日、少なくとも約１４０ｍｇ／日、少なくとも約１５０ｍｇ／日または少なくとも約１６０ｍｇ／日多い、請求項５に記載の方法。
【請求項２８】
ＣＣＬ２０レベルが正常レベルを下回る場合、前記その後の用量が、前記初期用量より少なくとも約１０ｍｇ／日、少なくとも約２０ｍｇ／日、少なくとも約３０ｍｇ／日、少なくとも約４０ｍｇ／日、少なくとも約５０ｍｇ／日、少なくとも約６０ｍｇ／日、少なくとも約７０ｍｇ／日または少なくとも約８０ｍｇ／日少ない、請求項１または３に記載の方法。
【請求項２９】
ＣＣＬ２０レベルが対照レベルを下回る場合、前記その後の用量が、前記初期用量より少なくとも約１０ｍｇ／日、少なくとも約２０ｍｇ／日、少なくとも約３０ｍｇ／日、少なくとも約４０ｍｇ／日、少なくとも約５０ｍｇ／日、少なくとも約６０ｍｇ／日、少なくとも約７０ｍｇ／日または少なくとも約８０ｍｇ／日少ない、請求項５に記載の方法。
【請求項３０】
前記初期用量が約１０ｍｇ／日〜１００ｍｇ／日であり、前記その後の用量が約３０ｍｇ／日〜２００ｍｇ／日である、請求項１、３または５に記載の方法。
【請求項３１】
ＩＢＤを有する前記患者におけるＣＣＬ２０のレベルが、ＩＢＤを有する該患者から得た試料において決定される、請求項１、２または５に記載の方法。
【請求項３２】
前記試料が、血液、血清または血漿試料である、請求項３１に記載の方法。
【請求項３３】
ＣＣＬ２０のレベルが、免疫化学またはヌクレオチド解析によって決定される、請求項１、２または５に記載の方法。
【請求項３４】
ＣＣＬ２０のレベルが、酵素結合免疫吸着測定法（ＥＬＩＳＡ）によって決定される、請求項３３に記載の方法。
【請求項３５】
ＩＢＤを有する前記患者における１種または複数種の追加の分析物のレベルを決定するステップをさらに含む、請求項１、２または５に記載の方法。
【請求項３６】
前記１種または複数種の追加の分析物が、インターロイキン−８（ＩＬ８）、腫瘍壊死因子α（ＴＮＦα）またはＣ反応性タンパク質（ＣＲＰ）を含む、請求項３５に記載の方法。
【請求項３７】
前記ＩＢＤが、クローン病（ＣＤ）または潰瘍性大腸炎（ＵＣ）である、請求項１、２または５に記載の方法。
【請求項３８】
ＩＢＤを有する前記患者が、活動性ＣＤを有するステロイド依存性患者である、請求項３７に記載の方法。
【請求項３９】
ＩＢＤを有する前記患者が、活動性ＣＤを有するステロイド抵抗性患者である、請求項３７に記載の方法。
【請求項４０】
前記ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドが、ＩＢＤを有する前記患者に経口投与される、請求項１、２または５に記載の方法。
【請求項４１】
前記ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドが、ヒトＳＭＡＤ７（配列番号１）の領域１０８〜１２８を標的とする、請求項１、２または５に記載の方法。
【請求項４２】
前記ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドが、ヒトＳＭＡＤ７（配列番号１）のヌクレオチド４０３、２３３、２９４、２９５、２９６、２９８、２９９または５３３を標的とする、請求項１、２または５に記載の方法。
【請求項４３】
前記ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドが、配列番号２のヌクレオチド配列（５’−ＧＴＣＧＣＣＣＣＴＴＣＴＣＣＣＣＧＣＡＧＣ−３’）を含む、請求項１、２または５に記載の方法。
【請求項４４】
前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが、次の配列：５’−ＧＴＸＧＣＣＣＣＴＴＣＴＣＣＣＸＧＣＡＧ−３’（配列番号３）を含むＳＭＡＤ７に対するアンチセンスオリゴヌクレオチドホスホロチオエートであり、Ｘが、５−メチル−２’−デオキシシチジンを含むヌクレオチドであり、ヌクレオチド間結合が、ホスホロチオエート結合である、請求項１、２または５に記載の方法。
【請求項４５】
前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが、次の配列：５’−ＧＴＸＧＣＣＣＣＴＴＣＴＣＣＣＸＧＣＡＧＣ−３’（配列番号４）を含むＳＭＡＤ７に対するアンチセンスオリゴヌクレオチドホスホロチオエートであり、Ｘが、５−メチル−２’−デオキシシチジンを含むヌクレオチドであり、ヌクレオチド間結合が、ホスホロチオエート結合である、請求項４４に記載の方法。
【請求項４６】
ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドの用量の投与後に正常を上回るＣＣＬ２０レベルを有するＩＢＤの患者におけるＩＢＤを処置または管理するための方法であって、前の用量より多いまたはこれに等しい該オリゴヌクレオチドのさらに別の用量を該患者に投与するステップを含む方法。
【請求項４７】
ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドの用量の投与後に正常を下回るＣＣＬ２０レベルを有するＩＢＤの患者におけるＩＢＤを処置または管理するための方法であって、前の用量より少ないまたはこれに等しい該オリゴヌクレオチドのさらに別の用量を該患者に投与するステップを含む方法。
【請求項４８】
正常を上回るＣＣＬ２０レベルを有するＩＢＤの患者におけるＩＢＤを処置または管理する方法であって、ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドの用量を前記患者に投与するステップを含む方法。
【請求項４９】
前記投与するステップが、ＣＣＬ２０レベル、ＩＬ８レベル、ＣＲＰレベルおよび／またはＴＮＦαレベルのいずれかが正常レベルに達するまで反復される、請求項４８に記載の方法。
【請求項５０】
前記投与するステップが、前記患者が１５０未満のＣＤＡＩスコアを達成するまで反復される、請求項４８に記載の方法。
【請求項５１】
前記投与するステップが、前記患者が臨床寛解を達成するまで反復される、請求項４８に記載の方法。
【請求項５２】
ＩＢＤの患者におけるＩＢＤの処置または管理をモニタリングする方法であって、各ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチド投与後に該患者におけるＣＣＬ２０レベルを解析するステップを含み、ＣＣＬ２０レベルの減少の非存在が、該処置または管理が有効ではないことを示す方法。
【請求項５３】
ＣＣＬ２０レベルが、ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドの各投与後に１回、２回、３回、４回、約５回、約１０回、約１５回、約２０回または約３０回解析される、請求項５２に記載の方法。
【請求項５４】
前記ＣＣＬ２０レベルが、ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチド投与の直後に、約１時間後に、約３時間後に、約６時間後に、約１２時間後に、約１日後に、約３日後に、約１週間後に、約２週間後におよび／または約１カ月後に解析される、請求項５２に記載の方法。
【請求項５５】
正常を上回るレベルのＣＣＬ２０を有するＩＢＤの患者におけるＩＢＤを処置または管理する方法であって、該患者におけるＣＣＬ２０レベルが減少するまで、該患者に投与されるＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドの量を増加させるステップを含む方法。
【請求項５６】
ＣＣＬ２０が、ＣＣＬ２０のほぼ正常レベルまたはＣＣＬ２０の正常を下回るレベルまで減少する、請求項５５に記載の方法。
【請求項５７】
ＩＢＤを有する患者におけるＩＢＤを処置または管理するための方法における使用のためのＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドであって、該方法が、該患者におけるＣＣＬ２０のレベルを解析して、ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチド投与の適切なレベルを決定するステップを含む、使用のためのＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチド。
【請求項５８】
前記方法が、（ａ）初期用量の前記ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドを前記患者に投与するステップと、（ｂ）該患者におけるＣＣＬ２０のレベルを解析するステップと、（ｃ）ＣＣＬ２０のレベルが、ＣＣＬ２０の正常レベルを上回る場合、該初期用量より多いもしくはこれに等しいその後の用量の該ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドを該患者に投与するステップ、またはＣＣＬ２０のレベルが、ＣＣＬ２０の正常レベルを下回る場合、該初期用量に等しいもしくはこれより少ないその後の用量の該ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドを該患者に投与するステップとを含む、請求項５７に記載の使用のためのＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチド。
【請求項５９】
ＩＢＤを有する患者におけるＩＢＤを処置または管理するための方法における使用のためのＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドであって、該方法が、（ａ）該患者におけるＣＣＬ２０のレベルを解析するステップと、（ｂ）ＣＣＬ２０のレベルが、ＣＣＬ２０の正常レベルを上回る場合、初期用量の該ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドを該患者に投与するステップとを含む、使用のためのＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチド。
【請求項６０】
炎症性腸疾患（ＩＢＤ）を有する患者におけるＩＢＤを処置または管理するための方法であって、（ａ）初期用量のＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドを該患者に投与するステップと、（ｂ）該患者におけるインターロイキン８（ＩＬ８）のレベルを解析するステップと、（ｃ）ＩＬ８のレベルが、ＩＬ８の正常レベルを上回る場合、該初期用量より多いもしくはこれに等しいその後の用量を該患者に投与するステップ、またはＩＬ８のレベルが、ＩＬ８の正常レベルを下回る場合、該初期用量に等しいもしくはこれより少ないその後の用量を該患者に投与するステップとを含む方法。
【請求項６１】
炎症性腸疾患（ＩＢＤ）を有する患者におけるＩＢＤを処置または管理するための方法であって、（ａ）該患者におけるＩＬ８のレベルを解析するステップと、（ｂ）ＩＬ８のレベルが、ＩＬ８の正常レベルを上回る場合、初期用量のＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドを該患者に投与するステップとを含む方法。
【請求項６２】
（ｃ）前記投与するステップ後に前記患者におけるＩＬ８のレベルを解析するステップと、（ｄ）ＩＬ８のレベルが、ＩＬ８の正常レベルを上回る場合、前記初期用量より多いもしくはこれに等しいその後の用量を該患者に投与するステップ、またはＩＬ８のレベルが、ＩＬ８の正常レベルを下回る場合、該初期用量に等しいもしくはこれより少ないその後の用量を該患者に投与するステップとをさらに含む、請求項６１に記載の方法。
【請求項６３】
ＩＢＤを有する患者におけるＩＢＤを処置または管理するための方法であって、（ａ）該患者についてのＩＬ８の対照レベルを確立するステップと、（ｂ）初期用量のＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドを該患者に投与するステップと、（ｃ）該患者におけるＩＬ８のレベルを解析するステップと、（ｄ）ＩＬ８のレベルが、該対照レベルより低い場合、該初期用量と同じまたは該初期用量より少ないその後の用量を該患者に投与するステップ、あるいはＩＬ８のレベルが、該対照レベルと比較して未変化であるまたは増加した場合、該初期用量と同じもしくは該初期用量より多いその後の用量を該患者に投与する、または該処置を終了するステップとを含む方法。
【請求項６４】
ＩＬ８のレベルが、ＩＬ８の正常レベルを上回る場合、前記初期用量より多いその後の用量を前記患者に投与する、またはＩＬ８のレベルが、ＩＬ８の正常レベルを下回る場合、該初期用量より少ないその後の用量を該患者に投与する、請求項６０または６２に記載の方法。
【請求項６５】
前記その後の用量が、最大耐用量（ＭＴＤ）に等しいまたはこれより多い場合、前記処置を終了する、請求項６２または６３に記載の方法。
【請求項６６】
ＩＬ８のレベルが、前記投与ステップから少なくとも１日、少なくとも３日、少なくとも５日、少なくとも１週間、少なくとも２週間、少なくとも３週間、少なくとも１カ月、少なくとも２カ月、少なくとも４カ月または少なくとも６カ月後に解析される、請求項６２または６３に記載の方法。
【請求項６７】
ＩＬ８のレベルが、前記投与ステップの直後に解析される、請求項６２または６３に記載の方法。
【請求項６８】
ＩＬ８のレベルが、前記投与ステップから約１５日または約２８日後に解析される、請求項６２または６３に記載の方法。
【請求項６９】
ＩＬ８の前記正常レベルが、健康対照群におけるＩＬ８のレベル中央値である、請求項６０または請求項６１に記載の方法。
【請求項７０】
ＩＬ８の前記対照レベルが、健康対照群におけるＩＬ８のレベル中央値である、請求項６３に記載の方法。
【請求項７１】
前記健康対照群およびＩＢＤを有する前記患者が、年齢、性別、民族起源、喫煙習慣、食習慣、ボディマスインデックス（ＢＭＩ）、および／または運動習慣に関してマッチする、請求項６９または７０に記載の方法。
【請求項７２】
ＩＬ８の正常レベルが、約１５ｐｇ／ｍｌ、約１６ｐｇ／ｍｌ、約１７ｐｇ／ｍｌまたは約１８ｐｇ／ｍｌである、請求項６０または請求項６１に記載の方法。
【請求項７３】
ＩＬ８の対照レベルが、約１５ｐｇ／ｍｌ、約１６ｐｇ／ｍｌ、約１７ｐｇ／ｍｌまたは約１８ｐｇ／ｍｌである、請求項６３に記載の方法。
【請求項７４】
前記初期用量が、１００ｍｇ／日未満、９０ｍｇ／日未満、８０ｍｇ／日未満、７０ｍｇ／日未満、６０ｍｇ／日未満、５０ｍｇ／日未満、４０ｍｇ／日未満または３０ｍｇ／日未満である、請求項６０、６１または６３に記載の方法。
【請求項７５】
前記初期用量が、少なくとも１０ｍｇ／日、少なくとも２０ｍｇ／日、少なくとも３０ｍｇ／日、少なくとも４０ｍｇ／日、少なくとも５０ｍｇ／日、少なくとも６０ｍｇ／日、少なくとも７０ｍｇ／日、少なくとも８０ｍｇ／日または少なくとも９０ｍｇ／日である、請求項６０、６１または６３に記載の方法。
【請求項７６】
前記初期用量が、約１０ｍｇ／日、約２０ｍｇ／日、約３０ｍｇ／日、約４０ｍｇ／日、約５０ｍｇ／日、約６０ｍｇ／日、約７０ｍｇ／日、約８０ｍｇ／日、約９０ｍｇ／日または約１００ｍｇ／日である、請求項６０、６１または６３に記載の方法。
【請求項７７】
前記初期用量が、１０ｍｇ／日、４０ｍｇ／日、８０ｍｇ／日または１６０ｍｇ／日である、請求項６０、６１または６３に記載の方法。
【請求項７８】
ＩＬ８レベルが正常レベルを上回る場合、前記その後の用量が、前記初期用量より少なくとも約１０ｍｇ／日、少なくとも約２０ｍｇ／日、少なくとも約３０ｍｇ／日、少なくとも約４０ｍｇ／日、少なくとも約５０ｍｇ／日、少なくとも約６０ｍｇ／日、少なくとも約７０ｍｇ／日、少なくとも約８０ｍｇ／日、少なくとも約９０ｍｇ／日、少なくとも約１００ｍｇ／日、少なくとも約１１０ｍｇ／日、少なくとも約１２０ｍｇ／日、少なくとも約１３０ｍｇ／日、少なくとも約１４０ｍｇ／日、少なくとも約１５０ｍｇ／日、または少なくとも約１６０ｍｇ／日多い、請求項６０または請求項６２に記載の方法。
【請求項７９】
ＩＬ８レベルが対照レベルを上回る場合、前記その後の用量が、前記初期用量より少なくとも約１０ｍｇ／日、少なくとも約２０ｍｇ／日、少なくとも約３０ｍｇ／日、少なくとも約４０ｍｇ／日、少なくとも約５０ｍｇ／日、少なくとも約６０ｍｇ／日、少なくとも約７０ｍｇ／日、少なくとも約８０ｍｇ／日、少なくとも約９０ｍｇ／日、少なくとも約１００ｍｇ／日、少なくとも約１１０ｍｇ／日、少なくとも約１２０ｍｇ／日、少なくとも約１３０ｍｇ／日、少なくとも約１４０ｍｇ／日、少なくとも約１５０ｍｇ／日、または少なくとも約１６０ｍｇ／日多い、請求項６３に記載の方法。
【請求項８０】
ＩＬ８レベルが、正常レベルを下回る場合、前記その後の用量が、前記初期用量より少なくとも約１０ｍｇ／日、少なくとも約２０ｍｇ／日、少なくとも約３０ｍｇ／日、少なくとも約４０ｍｇ／日、少なくとも約５０ｍｇ／日、少なくとも約６０ｍｇ／日、少なくとも約７０ｍｇ／日、または少なくとも約８０ｍｇ／日少ない、請求項６０または請求項６２に記載の方法。
【請求項８１】
ＩＬ８レベルが対照レベルを下回る場合、前記その後の用量が、前記初期用量より少なくとも約１０ｍｇ／日、少なくとも約２０ｍｇ／日、少なくとも約３０ｍｇ／日、少なくとも約４０ｍｇ／日、少なくとも約５０ｍｇ／日、少なくとも約６０ｍｇ／日、少なくとも約７０ｍｇ／日、または少なくとも約８０ｍｇ／日少ない、請求項６３に記載の方法。
【請求項８２】
前記初期用量が、約１０ｍｇ／日〜１００ｍｇ／日であり、前記その後の用量が、約３０ｍｇ／日〜２００ｍｇ／日である、請求項６０、６２または６３に記載の方法。
【請求項８３】
（ｃ）前記投与するステップ後に前記患者におけるＩＬ８のレベルを解析するステップと、（ｄ）ＩＬ８のレベルが、該投与ステップ前のＩＬ８のレベルより該投与ステップ後に低い場合、前記初期用量と同じまたは該初期用量より少ないその後の用量を該患者に投与するステップ、あるいはＩＬ８のレベルが、該投与ステップ前のＩＬ８のレベルと比較して、該投与ステップ後に未変化であるまたは増加した場合、該初期用量と同じもしくは該初期用量より多いその後の用量を該患者に投与する、または前記処置を終了するステップとをさらに含む、請求項６１に記載の方法。
【請求項８４】
前記患者が臨床寛解しており、ＩＬ８のレベルが、前記投与ステップ前のＩＬ８のレベルと比較して該投与ステップ後に未変化であるまたは増加した場合、前記処置を終了する、請求項６３または８３に記載の方法。
【請求項８５】
ＩＬ８のレベルが、前記投与ステップ前のＩＬ８のレベルと比較して該投与ステップ後に少なくとも１０％、少なくとも２０％、少なくとも３０％、少なくとも４０％、少なくとも５０％、または少なくとも７０％減少した場合、前記初期用量と同じまたは該初期用量より少ないその後の用量を前記患者に投与する、請求項６３または８３に記載の方法。
【請求項８６】
前記投与するステップ後のＩＬ８のレベルが、該投与ステップ前のＩＬ８のレベルと比較して少なくとも１０％、少なくとも２０％、少なくとも３０％、少なくとも４０％、少なくとも５０％、少なくとも６０％、または少なくとも７０％減少した場合、ＩＢＤを有する前記患者が、少なくとも１週間、少なくとも２週間、少なくとも３週間、少なくとも４週間、少なくとも６週間または少なくとも８週間の期間、該ＩＢＤの臨床寛解を経験する２０％超、３０％超、４０％超、５０％超、６０％超、７０％超、８０％超、９０％超または１００％超の機会を有することを決定するステップをさらに含む、請求項６３または８３に記載の方法。
【請求項８７】
ＩＢＤを有する前記患者における前記臨床寛解が、クローン病活動性指数（ＣＤＡＩ）＜１５０によって示される、請求項８６に記載の方法。
【請求項８８】
前記臨床寛解が、前記投与ステップから約１週間、約２週間または約３週間後に観察され、少なくとも１週間、少なくとも２週間、少なくとも３週間、少なくとも４週間、少なくとも６週間または少なくとも８週間の期間維持される、請求項８６に記載の方法。
【請求項８９】
ＩＢＤを有する前記患者が、前記投与ステップの１週間前に約２２０〜約４００のＣＤＡＩを有した、請求項８６に記載の方法。
【請求項９０】
ＩＢＤを有する前記患者におけるＩＬ８のレベルが、ＩＢＤを有する該患者から得た試料において決定される、請求項６０、６１または６３に記載の方法。
【請求項９１】
前記試料が、血液、血清または血漿試料である、請求項９０に記載の方法。
【請求項９２】
ＩＬ８のレベルが、免疫化学またはヌクレオチド解析によって決定される、請求項６０、６１または６３に記載の方法。
【請求項９３】
ＩＬ８のレベルが、酵素結合免疫吸着測定法（ＥＬＩＳＡ）によって決定される、請求項９２に記載の方法。
【請求項９４】
ＩＢＤを有する前記患者における１種または複数種の追加の分析物のレベルを決定するステップをさらに含む、請求項６０、６１または６３に記載の方法。
【請求項９５】
前記１種または複数種の追加の分析物が、腫瘍壊死因子アルファ（ＴＮＦα）またはＣ反応性タンパク質（ＣＲＰ）を含む、請求項９４に記載の方法。
【請求項９６】
前記ＩＢＤが、クローン病（ＣＤ）または潰瘍性大腸炎（ＵＣ）である、請求項６０、６１または６３に記載の方法。
【請求項９７】
ＩＢＤを有する前記患者が、活動性ＣＤを有するステロイド依存性患者である、請求項９６に記載の方法。
【請求項９８】
ＩＢＤを有する前記患者が、活動性ＣＤを有するステロイド抵抗性患者である、請求項９６に記載の方法。
【請求項９９】
前記ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドが、ＩＢＤを有する前記患者に経口投与される、請求項６０、６１または６３に記載の方法。
【請求項１００】
前記ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドが、ヒトＳＭＡＤ７（配列番号１）の領域１０８〜１２８を標的とする、請求項６０、６１または６３に記載の方法。
【請求項１０１】
前記ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドが、ヒトＳＭＡＤ７（配列番号１）のヌクレオチド４０３、２３３、２９４、２９５、２９６、２９８、２９９または５３３を標的とする、請求項６０、６１または６３に記載の方法。
【請求項１０２】
前記ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドが、配列番号２のヌクレオチド配列（５’−ＧＴＣＧＣＣＣＣＴＴＣＴＣＣＣＣＧＣＡＧＣ−３’）を含む、請求項６０、６１または６３に記載の方法。
【請求項１０３】
前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが、次の配列：５’−ＧＴＸＧＣＣＣＣＴＴＣＴＣＣＣＸＧＣＡＧ−３’（配列番号３）を含むＳＭＡＤ７に対するアンチセンスオリゴヌクレオチドホスホロチオエートであり、Ｘが、５−メチル−２’−デオキシシチジンを含むヌクレオチドであり、ヌクレオチド間結合が、ホスホロチオエート結合である、請求項６０、６１または６３に記載の方法。
【請求項１０４】
前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが、次の配列：５’−ＧＴＸＧＣＣＣＣＴＴＣＴＣＣＣＸＧＣＡＧＣ−３’（配列番号４）を含むＳＭＡＤ７に対するアンチセンスオリゴヌクレオチドホスホロチオエートであり、Ｘが、５−メチル−２’−デオキシシチジンを含むヌクレオチドであり、ヌクレオチド間結合が、ホスホロチオエート結合である、請求項１０３に記載の方法。
【請求項１０５】
ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドの用量の投与後に正常を上回るＩＬ８レベルを有するＩＢＤの患者におけるＩＢＤを処置または管理するための方法であって、前の用量より多いまたはこれに等しい該オリゴヌクレオチドのさらに別の用量を該患者に投与するステップを含む方法。
【請求項１０６】
ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドの用量の投与後に正常を下回るＩＬ８レベルを有するＩＢＤの患者におけるＩＢＤを処置または管理するための方法であって、前の用量より少ないまたはこれに等しい該オリゴヌクレオチドのさらに別の用量を該患者に投与するステップを含む方法。
【請求項１０７】
正常を上回るＩＬ８レベルを有するＩＢＤの患者におけるＩＢＤを処置または管理する方法であって、ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドの用量を該患者に投与するステップを含む方法。
【請求項１０８】
前記投与するステップが、ＩＬ８レベル、ＣＲＰレベルまたはＴＮＦαレベルが正常レベルに達するまで反復される、請求項１０７に記載の方法。
【請求項１０９】
前記投与するステップが、前記患者が１５０未満のＣＤＡＩスコアを達成するまで反復される、請求項１０７に記載の方法。
【請求項１１０】
前記投与するステップが、前記患者が臨床寛解を達成するまで反復される、請求項１０７に記載の方法。
【請求項１１１】
ＩＢＤの患者におけるＩＢＤの処置または管理をモニタリングする方法であって、各ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチド投与後に該患者におけるＩＬ８レベルを解析するステップを含み、ＩＬ８レベルの減少の非存在が、該処置または管理が有効ではないことを示す方法。
【請求項１１２】
ＩＬ８レベルが、ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドの各投与後に１回、２回、３回、４回、約５回、約１０回、約１５回、約２０回または約３０回解析される、請求項１１１に記載の方法。
【請求項１１３】
前記ＩＬ８レベルが、ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチド投与の直後に、約１時間後に、約３時間後に、約６時間後に、約１２時間後に、約１日後に、約３日後に、約１週間後に、約２週間後に、および／または約１カ月後に解析される請求項１１１に記載の方法。
【請求項１１４】
正常を上回るレベルのＩＬ８を有するＩＢＤの患者におけるＩＢＤを処置または管理する方法であって、該患者におけるＩＬ８レベルが減少するまで、該患者に投与されるＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドの量を増加させるステップを含む方法。
【請求項１１５】
ＩＬ８が、ＩＬ８のほぼ正常レベルまたはＩＬ８の正常を下回るレベルまで減少する、請求項１１４に記載の方法。
【請求項１１６】
炎症性腸疾患（ＩＢＤ）を有する患者におけるＩＢＤを処置または管理するための方法であって、（ａ）初期用量のＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドを該患者に投与するステップと、（ｂ）該患者における腫瘍壊死因子α（ＴＮＦα）のレベルを解析するステップと、（ｃ）ＴＮＦαのレベルが、ＴＮＦαの正常レベルを上回る場合、該初期用量より多いもしくはこれに等しいその後の用量を該患者に投与するステップ、またはＴＮＦαのレベルが、ＴＮＦαの正常レベルを下回る場合、該初期用量に等しいもしくはこれより少ないその後の用量を該患者に投与するステップとを含む方法。
【請求項１１７】
炎症性腸疾患（ＩＢＤ）を有する患者におけるＩＢＤを処置または管理するための方法であって、（ａ）該患者におけるＴＮＦαのレベルを解析するステップと、（ｂ）ＴＮＦαのレベルが、ＴＮＦαの正常レベルを上回る場合、初期用量のＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドを該患者に投与するステップとを含む方法。
【請求項１１８】
（ｃ）前記投与するステップ後に前記患者におけるＴＮＦαのレベルを解析するステップと、（ｄ）ＴＮＦαのレベルが、ＴＮＦαの正常レベルを上回る場合、前記初期用量より多いもしくはこれに等しいその後の用量を該患者に投与するステップ、またはＴＮＦαのレベルが、ＴＮＦαの正常レベルを下回る場合、該初期用量に等しいもしくはこれより少ないその後の用量を該患者に投与するステップとをさらに含む、請求項１１７に記載の方法。
【請求項１１９】
ＩＢＤを有する患者におけるＩＢＤを処置または管理するための方法であって、（ａ）該患者についてのＴＮＦαの対照レベルを確立するステップと、（ｂ）初期用量のＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドを該患者に投与するステップと、（ｃ）該患者におけるＴＮＦαのレベルを解析するステップと、（ｄ）ＴＮＦαのレベルが、該対照レベルより低い場合、該初期用量と同じまたは該初期用量より少ないその後の用量を該患者に投与するステップ、あるいはＴＮＦαのレベルが、該対照レベルと比較して未変化であるまたは増加した場合、該初期用量と同じもしくは該初期用量より多いその後の用量を該患者に投与する、または該処置を終了するステップとを含む方法。
【請求項１２０】
ＴＮＦαのレベルが、ＴＮＦαの正常レベルを上回る場合、前記初期用量より多いその後の用量を前記患者に投与する、またはＴＮＦαのレベルが、ＴＮＦαの正常レベルを下回る場合、該初期用量より少ないその後の用量を該患者に投与する、請求項１１６または請求項１１８に記載の方法。
【請求項１２１】
前記その後の用量が、最大耐用量（ＭＴＤ）に等しいまたはこれより多い場合、前記処置を終了する、請求項１１８または１１９に記載の方法。
【請求項１２２】
ＴＮＦαのレベルが、前記投与ステップから少なくとも１日、少なくとも３日、少なくとも５日、少なくとも１週間、少なくとも２週間、少なくとも３週間、少なくとも１カ月、少なくとも２カ月、少なくとも４カ月または少なくとも６カ月後に解析される、請求項１１８または１１９に記載の方法。
【請求項１２３】
ＴＮＦαのレベルが、前記投与ステップの直後に解析される、請求項１１８または１１９に記載の方法。
【請求項１２４】
ＴＮＦαのレベルが、前記投与ステップから約１５日または約２８日後に解析される、請求項１１８または１１９に記載の方法。
【請求項１２５】
ＴＮＦαの前記正常レベルが、健康対照群におけるＴＮＦαのレベル中央値である、請求項１１６または請求項１１７に記載の方法。
【請求項１２６】
ＴＮＦαの前記対照レベルが、健康対照群におけるＴＮＦαのレベル中央値である、請求項１１９に記載の方法。
【請求項１２７】
前記健康対照群およびＩＢＤを有する前記患者が、年齢、性別、民族起源、喫煙習慣、食習慣、ボディマスインデックス（ＢＭＩ）、および／または運動習慣に関してマッチする、請求項１２５または１２６に記載の方法。
【請求項１２８】
ＴＮＦαの正常レベルが、約１０ｐｇ／ｍｌ、約１５ｐｇ／ｍｌ、約１６ｐｇ／ｍｌ、約１７ｐｇ／ｍｌまたは約１８ｐｇ／ｍｌである、請求項１１６または請求項１１７に記載の方法。
【請求項１２９】
ＴＮＦαの対照レベルが、約１０ｐｇ／ｍｌ、約１５ｐｇ／ｍｌ、約１６ｐｇ／ｍｌ、約１７ｐｇ／ｍｌ、または約１８ｐｇ／ｍｌである、請求項１１９に記載の方法。
【請求項１３０】
前記初期用量が、１００ｍｇ／日未満、９０ｍｇ／日未満、８０ｍｇ／日未満、７０ｍｇ／日未満、６０ｍｇ／日未満、５０ｍｇ／日未満、４０ｍｇ／日未満または３０ｍｇ／日未満である、請求項１１６、１１７または１１９に記載の方法。
【請求項１３１】
前記初期用量が、少なくとも１０ｍｇ／日、少なくとも２０ｍｇ／日、少なくとも３０ｍｇ／日、少なくとも４０ｍｇ／日、少なくとも５０ｍｇ／日、少なくとも６０ｍｇ／日、少なくとも７０ｍｇ／日、少なくとも８０ｍｇ／日、または少なくとも９０ｍｇ／日である、請求項１１６、１１７または１１９に記載の方法。
【請求項１３２】
前記初期用量が、約１０ｍｇ／日、約２０ｍｇ／日、約３０ｍｇ／日、約４０ｍｇ／日、約５０ｍｇ／日、約６０ｍｇ／日、約７０ｍｇ／日、約８０ｍｇ／日、約９０ｍｇ／日または約１００ｍｇ／日である、請求項１１６、１１７または１１９に記載の方法。
【請求項１３３】
前記初期用量が、１０ｍｇ／日、４０ｍｇ／日、８０ｍｇ／日または１６０ｍｇ／日である、請求項１１６、１１７または１１９に記載の方法。
【請求項１３４】
ＴＮＦαレベルが正常レベルを上回る場合、前記その後の用量が、前記初期用量より少なくとも約１０ｍｇ／日、少なくとも約２０ｍｇ／日、少なくとも約３０ｍｇ／日、少なくとも約４０ｍｇ／日、少なくとも約５０ｍｇ／日、少なくとも約６０ｍｇ／日、少なくとも約７０ｍｇ／日、少なくとも約８０ｍｇ／日、少なくとも約９０ｍｇ／日、少なくとも約１００ｍｇ／日、少なくとも約１１０ｍｇ／日、少なくとも約１２０ｍｇ／日、少なくとも約１３０ｍｇ／日、少なくとも約１４０ｍｇ／日、少なくとも約１５０ｍｇ／日または少なくとも約１６０ｍｇ／日多い、請求項１１６または請求項１１８に記載の方法。
【請求項１３５】
ＴＮＦαレベルが対照レベルを上回る場合、前記その後の用量が、前記初期用量より少なくとも約１０ｍｇ／日、少なくとも約２０ｍｇ／日、少なくとも約３０ｍｇ／日、少なくとも約４０ｍｇ／日、少なくとも約５０ｍｇ／日、少なくとも約６０ｍｇ／日、少なくとも約７０ｍｇ／日、少なくとも約８０ｍｇ／日、少なくとも約９０ｍｇ／日、少なくとも約１００ｍｇ／日、少なくとも約１１０ｍｇ／日、少なくとも約１２０ｍｇ／日、少なくとも約１３０ｍｇ／日、少なくとも約１４０ｍｇ／日、少なくとも約１５０ｍｇ／日または少なくとも約１６０ｍｇ／日多い、請求項１１９に記載の方法。
【請求項１３６】
ＴＮＦαレベルが、正常レベルを下回る場合、前記その後の用量が、前記初期用量より少なくとも約１０ｍｇ／日、少なくとも約２０ｍｇ／日、少なくとも約３０ｍｇ／日、少なくとも約４０ｍｇ／日、少なくとも約５０ｍｇ／日、少なくとも約６０ｍｇ／日、少なくとも約７０ｍｇ／日または少なくとも約８０ｍｇ／日少ない、請求項１１６または請求項１１８に記載の方法。
【請求項１３７】
ＴＮＦαレベルが対照レベルを下回る場合、前記その後の用量が、前記初期用量より少なくとも約１０ｍｇ／日、少なくとも約２０ｍｇ／日、少なくとも約３０ｍｇ／日、少なくとも約４０ｍｇ／日、少なくとも約５０ｍｇ／日、少なくとも約６０ｍｇ／日、少なくとも約７０ｍｇ／日または少なくとも約８０ｍｇ／日少ない、請求項１１９に記載の方法。
【請求項１３８】
前記初期用量が、約１０ｍｇ／日〜１００ｍｇ／日であり、前記その後の用量が、約３０ｍｇ／日〜２００ｍｇ／日である、請求項１１６、１１８または１１９に記載の方法。
【請求項１３９】
（ｃ）前記投与するステップ後に前記患者におけるＴＮＦαのレベルを解析するステップと、（ｄ）ＴＮＦαのレベルが、該投与ステップ前のＴＮＦαのレベルより該投与ステップ後に低い場合、前記初期用量と同じまたは該初期用量より少ないその後の用量を該患者に投与するステップ、あるいはＴＮＦαのレベルが、該投与ステップ前のＴＮＦαのレベルと比較して、該投与ステップ後に未変化であるまたは増加した場合、該初期用量と同じもしくは該初期用量より多いその後の用量を該患者に投与する、または前記処置を終了するステップとをさらに含む、請求項１１７に記載の方法。
【請求項１４０】
前記患者が臨床寛解しており、ＴＮＦαのレベルが、前記投与ステップ前のＴＮＦαのレベルと比較して該投与ステップ後に未変化であるまたは増加した場合、前記処置を終了する、請求項１１９または１３９に記載の方法。
【請求項１４１】
ＴＮＦαのレベルが、前記投与ステップ前のＴＮＦαのレベルと比較して該投与ステップ後に少なくとも１０％、少なくとも２０％、少なくとも３０％、少なくとも４０％、少なくとも５０％または少なくとも７０％減少した場合、前記初期用量と同じまたは該初期用量より少ないその後の用量を前記患者に投与する、請求項１１９または１３９に記載の方法。
【請求項１４２】
前記投与するステップ後のＴＮＦαのレベルが、該投与ステップ前のＴＮＦαのレベルと比較して少なくとも１０％、少なくとも２０％、少なくとも３０％、少なくとも４０％、少なくとも５０％、少なくとも６０％または少なくとも７０％減少した場合、ＩＢＤを有する前記患者が、少なくとも１週間、少なくとも２週間、少なくとも３週間、少なくとも４週間、少なくとも６週間または少なくとも８週間の期間、前記ＩＢＤの臨床寛解を経験する２０％超、３０％超、４０％超、５０％超、６０％超、７０％超、８０％超、９０％超または１００％超の機会を有することを決定するステップをさらに含む、請求項１１９または１３９に記載の方法。
【請求項１４３】
ＩＢＤを有する前記患者における前記臨床寛解が、クローン病活動性指数（ＣＤＡＩ）＜１５０によって示される、請求項１４２に記載の方法。
【請求項１４４】
前記臨床寛解が、前記投与ステップから約１週間、約２週間または約３週間後に観察され、少なくとも１週間、少なくとも２週間、少なくとも３週間、少なくとも４週間、少なくとも６週間または少なくとも８週間の期間維持される、請求項１４２に記載の方法。
【請求項１４５】
ＩＢＤを有する前記患者が、前記投与ステップの１週間前に約２２０〜約４００のＣＤＡＩを有した、請求項１４２に記載の方法。
【請求項１４６】
ＩＢＤを有する前記患者におけるＴＮＦαのレベルが、ＩＢＤを有する該患者から得た試料において決定される、請求項１１６、１１７または１１９に記載の方法。
【請求項１４７】
前記試料が、血液、血清または血漿試料である、請求項１４６に記載の方法。
【請求項１４８】
ＴＮＦαのレベルが、免疫化学またはヌクレオチド解析によって決定される、請求項１１６、１１７または１１９に記載の方法。
【請求項１４９】
ＴＮＦαのレベルが、酵素結合免疫吸着測定法（ＥＬＩＳＡ）によって決定される、請求項１４８に記載の方法。
【請求項１５０】
ＩＢＤを有する前記患者における１種または複数種の追加の分析物のレベルを決定するステップをさらに含む、請求項１１６、１１７または１１９に記載の方法。
【請求項１５１】
前記１種または複数種の追加の分析物が、インターロイキン−８（ＩＬ８）またはＣ反応性タンパク質（ＣＲＰ）を含む、請求項１５０に記載の方法。
【請求項１５２】
前記ＩＢＤが、クローン病（ＣＤ）または潰瘍性大腸炎（ＵＣ）である、請求項１１６、１１７または１１９に記載の方法。
【請求項１５３】
ＩＢＤを有する前記患者が、活動性ＣＤを有するステロイド依存性患者である、請求項１５２に記載の方法。
【請求項１５４】
ＩＢＤを有する前記患者が、活動性ＣＤを有するステロイド抵抗性患者である、請求項１５２に記載の方法。
【請求項１５５】
前記ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドが、ＩＢＤを有する前記患者に経口投与される、請求項１１６、１１７または１１９に記載の方法。
【請求項１５６】
前記ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドが、ヒトＳＭＡＤ７（配列番号１）の領域１０８〜１２８を標的とする、請求項１１６、１１７または１１９に記載の方法。
【請求項１５７】
前記ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドが、ヒトＳＭＡＤ７（配列番号１）のヌクレオチド４０３、２３３、２９４、２９５、２９６、２９８、２９９または５３３を標的とする、請求項１１６、１１７または１１９に記載の方法。
【請求項１５８】
前記ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドが、配列番号２のヌクレオチド配列（５’−ＧＴＣＧＣＣＣＣＴＴＣＴＣＣＣＣＧＣＡＧＣ−３’）を含む、請求項１１６、１１７または１１９に記載の方法。
【請求項１５９】
前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが、次の配列：５’−ＧＴＸＧＣＣＣＣＴＴＣＴＣＣＣＸＧＣＡＧ−３’（配列番号３）を含むＳＭＡＤ７に対するアンチセンスオリゴヌクレオチドホスホロチオエートであり、Ｘが、５−メチル−２’−デオキシシチジンを含むヌクレオチドであり、ヌクレオチド間結合が、ホスホロチオエート結合である、請求項１１６、１１７または１１９に記載の方法。
【請求項１６０】
前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが、次の配列：５’−ＧＴＸＧＣＣＣＣＴＴＣＴＣＣＣＸＧＣＡＧＣ−３’（配列番号４）を含むＳＭＡＤ７に対するアンチセンスオリゴヌクレオチドホスホロチオエートであり、Ｘが、５−メチル−２’−デオキシシチジンを含むヌクレオチドであり、ヌクレオチド間結合が、ホスホロチオエート結合である、請求項１５９に記載の方法。
【請求項１６１】
ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドの用量の投与後に正常を上回るＴＮＦαレベルを有するＩＢＤの患者におけるＩＢＤを処置または管理するための方法であって、前の用量より多いまたはこれに等しい該オリゴヌクレオチドのさらに別の用量を該患者に投与するステップを含む方法。
【請求項１６２】
ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドの用量の投与後に正常を下回るＴＮＦαレベルを有するＩＢＤの患者におけるＩＢＤを処置または管理するための方法であって、前の用量より少ないまたはこれに等しい該オリゴヌクレオチドのさらに別の用量を該患者に投与するステップを含む方法。
【請求項１６３】
正常を上回るＴＮＦαレベルを有するＩＢＤの患者におけるＩＢＤを処置または管理する方法であって、ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドの用量を該患者に投与するステップを含む方法。
【請求項１６４】
前記投与するステップが、ＩＬ８レベル、ＣＲＰレベルまたはＴＮＦαレベルが正常レベルに達するまで反復される、請求項１６３に記載の方法。
【請求項１６５】
前記投与するステップが、前記患者が１５０未満のＣＤＡＩスコアを達成するまで反復される、請求項１６３に記載の方法。
【請求項１６６】
前記投与するステップが、前記患者が臨床寛解を達成するまで反復される、請求項１６３に記載の方法。
【請求項１６７】
ＩＢＤの患者におけるＩＢＤの処置または管理をモニタリングする方法であって、各ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチド投与後に該患者におけるＴＮＦαレベルを解析するステップを含み、ＴＮＦαレベルの減少の非存在が、該処置または管理が有効ではないことを示す方法。
【請求項１６８】
ＴＮＦαレベルが、ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドの各投与後に１回、２回、３回、４回、約５回、約１０回、約１５回、約２０回または約３０回解析される、請求項１６７に記載の方法。
【請求項１６９】
前記ＴＮＦαレベルが、ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチド投与の直後に、約１時間後に、約３時間後に、約６時間後に、約１２時間後に、約１日後に、約３日後に、約１週間後に、約２週間後におよび／または約１カ月後に解析される、請求項１６７に記載の方法。
【請求項１７０】
正常を上回るレベルのＴＮＦαを有するＩＢＤの患者におけるＩＢＤを処置または管理する方法であって、該患者におけるＴＮＦαレベルが減少するまで、該患者に投与されるＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドの量を増加させるステップを含む方法。
【請求項１７１】
ＴＮＦαが、ＴＮＦαのほぼ正常レベルまたはＴＮＦαの正常を下回るレベルまで減少する、請求項１７０に記載の方法。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
本願は、２０１４年１０月１７日に出願した米国仮出願第６２／０６５，５８６号、２０１４年１０月１７日に出願した米国仮出願第６２／０６５，５９６号および２０１４年１２月１日に出願した米国仮出願第６２／０８５，９４９号の利益を主張する。これらの出願の各々の内容全体は、本明細書中に参考として援用される。
【０００２】
本発明は、ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドを使用して炎症性腸疾患（ＩＢＤ）の処置または管理の有効性をモニタリングする方法、ならびにケモカイン（Ｃ−Ｃモチーフ）リガンド２０（ＣＣＬ２０）レベル、インターロイキン８（ＩＬ８）レベルおよび／または腫瘍壊死因子α（ＴＮＦα）レベルの解析に基づいてＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチド処置を調節する方法に関する。
【背景技術】
【０００３】
背景
炎症性腸疾患（ＩＢＤ）は、米国においておよそ百万人の患者が患う、胃腸管の慢性炎症性障害である。ＩＢＤの２種の最も一般的な形態は、クローン病（ＣＤ）および潰瘍性大腸炎（ＵＣ）である。ＣＤは、胃腸管全体に罹患し得るが、主に、回腸（小腸の遠位または下部）および大腸に罹患する。ＵＣは、主に、結腸および直腸に罹患する。ＣＤおよびＵＣの両方のための現在の処置は、アミノサリチレート（例えば、５−アミノサリチル酸、スルファサラジンおよびメサラミン）、抗生物質（例えば、シプロフロキサシンおよびメトロニダゾール）、コルチコステロイド（例えば、ブデソニドまたはプレドニゾン）、免疫抑制剤（例えば、アザチオプリンまたはメトトレキセート）および腫瘍壊死因子（ＴＮＦ）アンタゴニスト（例えば、インフリキシマブ（Ｒｅｍｉｃａｄｅ（登録商標）））を含む。これらの治療法に対する患者応答は、疾患重症度と共に変動し、活動性炎症および寛解のサイクルにわたって変動し得る。さらに、ＩＢＤのための現在の治療法の多くは、望ましくない副作用を伴う。
【０００４】
ＣＤおよびＵＣの病因は不明であるが、両者共に、腸粘膜の炎症性疾患であると考慮される。近年の研究は、ＴＧＦ−β１が、粘膜性腸炎症を制御することができる強力な免疫調節因子として作用することを実証した。ＴＧＦ−β１は、２個のサブユニット、ＴＧＦ−β１  Ｒ１およびＴＧＦ−β１  Ｒ２を含有するヘテロ二量体膜貫通型セリン／スレオニンキナーゼ受容体に結合する。リガンド結合により、ＴＧＦ−β１  Ｒ１受容体は、構成的に活性を有するＴＧＦ−β１  Ｒ２受容体によってリン酸化され、シグナルが、ＳＭＡＤファミリーに属するタンパク質によって核へと伝播される。活性化されたＴＧＦ−β１  Ｒ１は、ＳＭＡＤ２およびＳＭＡＤ３タンパク質を直接的にリン酸化し、続いてこれらは、ＳＭＡＤ４と相互作用する。ＳＭＡＤ２／ＳＭＡＤ３／ＳＭＡＤ４の複合体は、核へと転位置し、ある特定の遺伝子の転写をモジュレートする。
【０００５】
さらなる研究が、別のＳＭＡＤタンパク質、ＳＭＡＤ７も、炎症における役割を果たすことを実証した。細胞内タンパク質であるＳＭＡＤ７は、ＴＧＦ−β１  Ｒ１へのＳＭＡＤ２／ＳＭＡＤ３の結合に干渉し、これらのタンパク質のリン酸化および活性化を防止することが示された。さらに、ＳＭＡＤ７タンパク質の発現増加は、ＴＧＦ−β１媒介性シグナリングの阻害に関連する。ＩＢＤ患者由来の粘膜試料は、このような患者においてＴＧＦ−β１媒介性シグナリングが損なわれていることを示す、高レベルのＳＭＡＤ７および低下したレベルのリン酸化ＳＭＡＤ３によって特徴付けられる。
【０００６】
近年の研究は、ＩＢＤを患う患者を処置するための標的としてＳＭＡＤ７に焦点を合わせている。かかる治療法は、抗ＳＭＡＤ７アンチセンス治療法を含む。したがって、抗ＳＭＡＤ７治療法による処置に応答する可能性がある（または見込みがない）患者の同定に使用することができる予測バイオマーカーに基づく方法と、処置成功を評価する方法の必要がある。
【発明の概要】
【課題を解決するための手段】
【０００７】
本発明は、ＩＢＤの患者におけるＣＣＬ２０、ＩＬ８および／またはＴＮＦαのレベルは、ＩＢＤ疾患状態と相関し、疾患状態をモニタリングし、抗ＳＭＡＤ７治療法によるＩＢＤ処置に対する応答性を管理するための手段として使用することができることである。本発明はまた、ＩＢＤの患者におけるＣＣＬ２０、ＩＬ８および／またはＴＮＦαレベルのモニタリングおよび解析を使用して、ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチド投与の適切なレベルを決定し、ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチド処置を調節および調整することができることである。
【０００８】
処置開始直後に、処置中止直前にまたは処置中止直後に、ＩＢＤ患者が、抗ＳＭＡＤ７治療法、特に、ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドによる処置に対して応答性であるか決定できると有利であることが十分に理解されよう。本明細書に記載されている通り、ＩＢＤの患者におけるＣＣＬ２０、ＩＬ８および／またはＴＮＦαレベルのモジュレーションは、ＩＢＤを有する対象における抗ＳＭＡＤ７治療法による処置の有効性および処置に対する応答性を評価するのに有用である。さらに、疾患状態と相関するバイオマーカー、例えば、ＣＣＬ２０、ＩＬ８および／またはＴＮＦαのレベルまたはレベルの変化に基づいてＩＢＤの患者における抗ＳＭＡＤ７治療法の投与を評価およびモジュレートすることができると有利であることが十分に理解されよう。よって、本発明は、抗ＳＭＡＤ７治療法、例えば、ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドで処置されているまたはこれを投与されたことがある患者におけるＣＣＬ２０、ＩＬ８および／またはＴＮＦαのレベルを解析し、抗ＳＭＡＤ７治療法の投与の後に、解析ステップによって決定されるＣＣＬ２０、ＩＬ８および／もしくはＴＮＦαレベルまたはＣＣＬ２０、ＩＬ８および／もしくはＴＮＦαレベルの変化に基づいて投薬量レベルを調整するための方法を提供する。有利には、本発明の方法は、最終的に、有効な治療法の選択、ならびに前記治療法による処置のモニタリングおよび調整において医師を助ける。さらに、本発明の方法は、全体的な患者のコストの低下を伴って、患者のＩＢＤ処置有効性における改善をもたらす。
【０００９】
第１の態様では、本発明は、ＩＢＤを有する患者における炎症性腸疾患を処置または管理するための方法を提供する。一実施形態では、本方法は、（ａ）初期用量のＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドを患者に投与するステップと、（ｂ）患者におけるＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαのレベルを解析するステップと、（ｃ）ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαのレベルが、ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαの正常レベルを上回る場合、初期用量より多いまたはこれに等しいその後の用量を患者に投与するステップとを含む。あるいは、ステップ（ｃ）において、ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαのレベルが、ステップ（ｂ）で決定される場合に、ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαの正常レベルを下回る場合、ステップ（ｃ）は、初期用量に等しいまたはこれより少ないその後の用量を患者に投与することを含む。
【００１０】
一部の実施形態では、本発明は、ＩＢＤを処置または管理する方法における使用のためのＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドを含むことができる。例えば、一部の実施形態では、本発明は、炎症性腸疾患（ＩＢＤ）を有する患者におけるＩＢＤを処置または管理するための方法における使用のためのＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドであって、方法が、患者におけるＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαのレベルを解析して、ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチド投与の適切なレベルを決定するステップを含む、使用のためのＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドを含む。一部の実施形態では、本発明は、この使用のためのＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドを含み、ここで本方法は、（ａ）初期用量のＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドを患者に投与するステップと、（ｂ）患者におけるＣＣＬ２０、ＩＬ８、またはＴＮＦαのレベルを解析するステップと、（ｃ）ＣＣＬ２０、ＩＬ８もしくはＴＮＦαのレベルが、ＣＣＬ２０、ＩＬ８もしくはＴＮＦαの正常レベルを上回る場合、初期用量より多いもしくはこれに等しいその後の用量のＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドを患者に投与するステップ、またはＣＣＬ２０、ＩＬ８もしくはＴＮＦαのレベルが、ＣＣＬ２０、ＩＬ８もしくはＴＮＦαの正常レベルを下回る場合、初期用量に等しいもしくはこれより少ないその後の用量のＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドを患者に投与するステップとを含む。
【００１１】
本発明の別の態様では、本発明は、初期用量のＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドの投与に関して、ＩＢＤを有する患者におけるＩＢＤを処置または管理するための方法を提供する。一実施形態では、本発明は、ＩＢＤを有する患者におけるＩＢＤを処置または管理するための方法であって、（ａ）患者におけるＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαのレベルを解析するステップと、（ｂ）ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαのレベルが、ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαの正常レベルを上回る場合、初期用量のＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドを患者に投与するステップとを含む方法を提供する。特定の実施形態では、本発明は、ＩＢＤを有する患者におけるＩＢＤを処置または管理するための方法であって、（ａ）患者におけるＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαのレベルを解析するステップと、（ｂ）ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαのレベルが、０．０１ｐｇ／ｍｌ、０．１ｐｇ／ｍｌ、１ｐｇ／ｍｌ、２ｐｇ／ｍｌ、３ｐｇ／ｍｌ、４ｐｇ／ｍｌ、５ｐｇ／ｍｌ、６ｐｇ／ｍｌ、７ｐｇ／ｍｌ、８ｐｇ／ｍｌ、９ｐｇ／ｍｌ、１０ｐｇ／ｍｌ、１１ｐｇ／ｍｌ、１２ｐｇ／ｍｌ、１３ｐｇ／ｍｌ、１４ｐｇ／ｍｌ、１５ｐｇ／ｍｌ、１７．５ｐｇ／ｍｌ、２０ｐｇ／ｍｌ、２２．５ｐｇ／ｍｌ、２５ｐｇ／ｍｌ、３０ｐｇ／ｍｌまたは３５ｐｇ／ｍｌを上回る場合、初期用量のＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドを患者に投与するステップとを含む方法を提供する。
【００１２】
その上、本方法は、（ｃ）前記投与するステップ、すなわち、ステップ（ｂ）後に患者におけるＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαのレベルを解析するステップと、（ｄ）ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαのレベルが、ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαの正常レベルを上回る場合、初期用量より多いまたはこれに等しいその後の用量を患者に投与するステップとをさらに含むことができる。あるいは、ステップ（ｄ）において、ステップ（ｃ）において決定されるＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαのレベルが、ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαの正常レベルを下回る場合、ステップ（ｄ）は初期用量に等しいまたはこれより少ないその後の用量を患者に投与することを含む。一部の事例では、ステップ（ｄ）において投与されるその後の用量が、最大耐用量（ＭＴＤ）に等しいまたはこれより多い場合、本方法は、処置を終了するステップを含む。
【００１３】
一部の実施形態では、本発明は、ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαの対照レベルの確立に応じてＩＢＤを処置または管理する方法を含む。例えば、特定の実施形態では、ＩＢＤを有する患者におけるＩＢＤを処置または管理するための方法は、（ａ）患者についてのＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαの対照レベルを確立するステップと、（ｂ）初期用量のＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドを患者に投与するステップと、（ｃ）患者におけるＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαのレベルを解析するステップと、（ｄ）ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαのレベルが、対照レベルより低い場合、初期用量と同じまたは初期用量より少ないその後の用量を患者に投与するステップとを含む。あるいは、ステップ（ｃ）において決定されるＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαのレベルが、対照レベルと比較して、未変化であるまたは増加した場合、本方法は、初期用量と同じもしくは初期用量より多いその後の用量を患者に投与するまたは処置を終了するステップ（ｄ）を含む。
【００１４】
一部の実施形態では、本方法は、（ａ）患者におけるＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαのいずれかの第１のレベルを解析するステップと、（ｂ）初期用量のＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチド（ＡＯＮ）を患者に投与するステップと、（ｃ）投与するステップ後の患者におけるＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαの第２のレベルを解析するステップとを含む。本発明の一実施形態では、ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαの第２のレベルが、ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαの第１のレベルと同じまたはこれより高い場合、初期用量に等しいもしくはこれより多いその後の用量を患者に投与するおよび／または初期用量に等しいもしくはこれより高い頻度でその後の用量を患者に投与する。あるいは、ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαの第２のレベルが、ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαの第１のレベルより低い場合、初期用量に等しいもしくはこれより少ないその後の用量を患者に投与するおよび／または初期用量に等しいもしくはこれより低い頻度でその後の用量を患者に投与する。
【００１５】
本発明の一部の実施形態では、ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαの第２のレベルは、ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαの第１のレベルより高い。例えば、一部の実施形態では、ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαの第２のレベルは、ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαの第１のレベルより約１０％高い、約２０％高い、約３０％高い、約４０％高い、約５０％高い、約６０％高い、約７０％高い、約８０％高い、約９０％高い、約１００％高い、またはそれ超である。一部の実施形態では、ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαの第２のレベルは、ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαの第１のレベルより約１０％〜約２０％高い、約２０％〜約３０％高い、約３０％〜約４０％高い、約４０％〜約５０％高い、約５０％〜約６０％高い、約６０％〜約７０％高い、約７０％〜約８０％高い、約８０％〜約９０％高い、または約９０％〜約１００％高い。あるいは、一部の実施形態では、ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαの第２のレベルは、ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαの第１のレベルより低い。例えば、一部の実施形態では、ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαの第２のレベルは、ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαの第１のレベルより約１０％低い、約２０％低い、約３０％低い、約４０％低い、約５０％低い、約６０％低い、約７０％低い、約８０％低い、約９０％低い、または約１００％低い。一部の実施形態では、ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαの第２のレベルは、ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαの第１のレベルより約１０％〜約２０％低い、約２０％〜約３０％低い、約３０％〜約４０％低い、約４０％〜約５０％低い、約５０％〜約６０％低い、約６０％〜約７０％低い、約７０％〜約８０％低い、約８０％〜約９０％低い、または約９０％〜約１００％低い。
【００１６】
一部の実施形態では、本発明は、ＩＢＤを有する患者におけるＩＢＤを処置または管理するための方法であって、（ａ）初期用量のＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドを患者に投与するステップと、（ｂ）投与するステップの後に患者におけるＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαのレベルを解析するステップとを含む方法を含む。一部の実施形態では、ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαのレベルが、ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαの正常レベルを上回る場合、患者は、初期用量より多いもしくはこれに等しいその後の用量を投与されるおよび／または初期用量に等しいもしくはこれより高い頻度でその後の用量を患者に投与する。一部の実施形態では、ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαのレベルが、ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαの正常レベルを下回る場合、患者は、初期用量に等しいもしくはこれより少ないその後の用量を投与されるおよび／または初期用量に等しいもしくはこれより低い頻度でその後の用量を患者に投与する。
【００１７】
本発明の一部の実施形態では、ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαのレベルは、ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαの正常レベルより高い。例えば、一部の実施形態では、ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαのレベルは、ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαの正常レベルより約１０％高い、約２０％高い、約３０％高い、約４０％高い、約５０％高い、約６０％高い、約７０％高い、約８０％高い、約９０％高い、約１００％高い、またはそれ超である。一部の実施形態では、ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαのレベルは、ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαの正常レベルより約１０％〜約２０％高い、約２０％〜約３０％高い、約３０％〜約４０％高い、約４０％〜約５０％高い、約５０％〜約６０％高い、約６０％〜約７０％高い、約７０％〜約８０％高い、約８０％〜約９０％高い、または約９０％〜約１００％高い。一部の実施形態では、ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαのレベルは、ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαの正常レベルより低い。例えば、一部の実施形態では、ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαのレベルは、ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαの正常レベルより約１０％低い、約２０％低い、約３０％低い、約４０％低い、約５０％低い、約６０％低い、約７０％低い、約８０％低い、約９０％低い、または約１００％低い。一部の実施形態では、ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαの第２のレベルは、ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαの正常レベルより約１０％〜約２０％低い、約２０％〜約３０％低い、約３０％〜約４０％低い、約４０％〜約５０％低い、約５０％〜約６０％低い、約６０％〜約７０％低い、約７０％〜約８０％低い、約８０％〜約９０％低い、または約９０％〜約１００％低い。
【００１８】
一部の実施形態では、本発明は、ＩＢＤを有する患者におけるＩＢＤを処置または管理するための方法における使用のためのＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドであって、方法が、（ａ）患者におけるＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαのレベルを解析するステップと、（ｂ）ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαのレベルが、ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαの正常レベルを上回る場合、初期用量のＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドを患者に投与するステップとを含む、使用のためのＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドを含む。
【００１９】
ＣＣＬ２０、ＩＬ８、またはＴＮＦαのレベルは、投与するステップ（ｂ）の後の様々な時点で解析することができる。例えば、一部の実施形態では、投与するステップ（ｂ）の後、ＣＣＬ２０、ＩＬ８、またはＴＮＦαのレベルは、前記投与するステップから少なくとも１日、少なくとも３日、少なくとも５日、少なくとも１週間、少なくとも２週間、少なくとも３週間、少なくとも１カ月、少なくとも２カ月、少なくとも４カ月または少なくとも６カ月後に解析される。一部の実施形態では、ＣＣＬ２０、ＩＬ８、またはＴＮＦαのレベルは、前記投与ステップの直後に解析される。さらに他の実施形態では、ＣＣＬ２０、ＩＬ８、またはＴＮＦαのレベルは、前記投与ステップから約７日、約１０日、約１５日、約２０日、約２５日または約２８日後に解析される。
【００２０】
ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαの正常レベルまたは対照レベルは、数的参照値に基づいてまたは健康対照群におけるＣＣＬ２０、ＩＬ８、もしくはＴＮＦαのレベルに関して決定することができる。例えば、一部の実施形態では、ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαの対照レベルまたは正常レベルは、約０．０１ｐｇ／ｍｌ、約０．１ｐｇ／ｍｌ、約１ｐｇ／ｍｌ、約２ｐｇ／ｍｌ、約３ｐｇ／ｍｌ、約４ｐｇ／ｍｌ、約５ｐｇ／ｍｌ、約６ｐｇ／ｍｌ、約７ｐｇ／ｍｌ、約８ｐｇ／ｍｌ、約９ｐｇ／ｍｌ、約１０ｐｇ／ｍｌ、約１１ｐｇ／ｍｌ、約１２ｐｇ／ｍｌ、約１３ｐｇ／ｍｌ、約１４ｐｇ／ｍｌ、約１５ｐｇ／ｍｌ、約１６ｐｇ／ｍｌ、約１７ｐｇ／ｍｌ、約１７．５ｐｇ／ｍｌ、約１８ｐｇ／ｍｌ、約１９ｐｇ／ｍｌ、約２０ｐｇ／ｍｌ、約２２．５ｐｇ／ｍｌ、約２５ｐｇ／ｍｌ、約３０ｐｇ／ｍｌまたは約３５ｐｇ／ｍｌである。本発明の他の実施形態では、ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαの対照レベルまたは正常レベルは、健康対照群におけるＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαのレベル中央値として定義される。健康対照群は、患者における判断基準の同じセットにマッチする遺伝的背景、習慣および身体的特質に関する様々な判断基準に基づき定義することができる。例えば、一部の実施形態では、健康対照群およびＩＢＤを有する患者は、年齢、性別、民族起源、喫煙習慣、食習慣、ボディマスインデックス（ＢＭＩ）、レクリエーショナルドラッグ使用、医療用薬物使用、ＩＢＤに関する薬物使用および／または運動習慣に関してマッチする。患者および対照群の間でマッチし得る他の因子として、臨床判断基準（例えば、ＣＤＡＩスコア、Ｍａｙｏスコア、ＩＢＤ関連症状の重症度）、代謝、ＩＢＤ患者の個人的病歴、遺伝因子、ＩＢＤ患者の家族の病歴、環境因子（例えば、汚染物質、毒素、アレルゲン）への曝露およびライフスタイル（例えば、都市、郊外または地方勤務地および／または居住地）が挙げられるがこれらに限定されない。
【００２１】
本発明の様々な実施形態では、ＩＢＤを有する患者に投与されるＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドの初期用量は、変動し得る。例えば、一部の実施形態では、ＩＢＤを有する患者に投与されるＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドの初期用量は、５００ｍｇ／日未満、４００ｍｇ／日未満、３００ｍｇ／日未満、２００ｍｇ／日未満、１００ｍｇ／日未満、９０ｍｇ／日未満、８０ｍｇ／日未満、７０ｍｇ／日未満、６０ｍｇ／日未満、５０ｍｇ／日未満、４０ｍｇ／日未満、３０ｍｇ／日未満、２０ｍｇ／日未満または１０ｍｇ／日未満である。あるいは、他の実施形態では、初期用量は、少なくとも１ｍｇ／日、少なくとも５ｍｇ／日、少なくとも１０ｍｇ／日、少なくとも２０ｍｇ／日、少なくとも３０ｍｇ／日、少なくとも４０ｍｇ／日、少なくとも５０ｍｇ／日、少なくとも６０ｍｇ／日、少なくとも７０ｍｇ／日、少なくとも８０ｍｇ／日、少なくとも９０ｍｇ／日、少なくとも１００ｍｇ／日、少なくとも２００ｍｇ／日、少なくとも３００ｍｇ／日、少なくとも４００ｍｇ／日または少なくとも５００ｍｇ／日である。さらに他の実施形態では、初期用量は、約５ｍｇ／日、約１０ｍｇ／日、約２０ｍｇ／日、約３０ｍｇ／日、約４０ｍｇ／日、約５０ｍｇ／日、約６０ｍｇ／日、約７０ｍｇ／日、約８０ｍｇ／日、約９０ｍｇ／日、約１００ｍｇ／日、約２００ｍｇ／日、約３００ｍｇ／日、約４００ｍｇ／日または約５００ｍｇ／日である。一部の実施形態では、初期用量は、５ｍｇ／日、１０ｍｇ／日、２０ｍｇ／日、３０ｍｇ／日、４０ｍｇ／日、５０ｍｇ／日、６０ｍｇ／日、７０ｍｇ／日、８０ｍｇ／日、９０ｍｇ／日、１００ｍｇ／日、１１０ｍｇ／日、１２０ｍｇ／日、１３０ｍｇ／日、１４０ｍｇ／日、１５０ｍｇ／日、１６０ｍｇ／日、１７０ｍｇ／日、１８０ｍｇ／日、１９０ｍｇ／日または２００ｍｇ／日である。
【００２２】
本発明の一部の実施形態では、ステップ（ｂ）または（ｃ）において患者におけるＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαのレベルを解析した後、ＣＣＬ２０、ＩＬ８および／またはＴＮＦαのレベルが、ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαの正常レベルを上回る場合、本方法は、初期用量より多いその後の用量を患者に投与するステップを含むことができる。一部の実施形態では、ステップ（ｂ）または（ｃ）において患者におけるＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαのレベルを解析した後、ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαのレベルが、ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαの正常レベルを下回る場合、本方法は、初期用量より少ないその後の用量を患者に投与するステップを含むことができる。
【００２３】
本発明は、ＩＢＤを有する患者におけるＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαのレベルに基づいて、ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドの初期用量に対するＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドのその後の用量のレベルを決定するための方法も提供する。例えば、本明細書に記載されている発明の実施形態では、ＩＢＤを有する患者におけるＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαレベルが、初期投与ステップ（ａ）または（ｂ）後に正常レベルまたは対照レベルを上回る場合、ステップ（ｃ）または（ｄ）で投与されるその後の用量は、初期用量より少なくとも約５ｍｇ／日、少なくとも約１０ｍｇ／日、少なくとも約２０ｍｇ／日、少なくとも約３０ｍｇ／日、少なくとも約４０ｍｇ／日、少なくとも約５０ｍｇ／日、少なくとも約６０ｍｇ／日、少なくとも約７０ｍｇ／日、少なくとも約８０ｍｇ／日、少なくとも約９０ｍｇ／日、少なくとも約１００ｍｇ／日、少なくとも約１１０ｍｇ／日、少なくとも約１２０ｍｇ／日、少なくとも約１３０ｍｇ／日、少なくとも約１４０ｍｇ／日、少なくとも約１５０ｍｇ／日、少なくとも約１６０ｍｇ／日、少なくとも約１７０ｍｇ／日、少なくとも約１８０ｍｇ／日、少なくとも約１９０ｍｇ／日、または少なくとも約２００ｍｇ／日多い。
【００２４】
あるいは、一部の実施形態では、ＩＢＤを有する患者におけるＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαレベルが、初期投与ステップ（ａ）または（ｂ）後に対照レベルまたは正常レベルを下回る場合、ステップ（ｃ）または（ｄ）で投与されるその後の用量は、初期用量より少なくとも約５ｍｇ／日、少なくとも約１０ｍｇ／日、少なくとも約２０ｍｇ／日、少なくとも約３０ｍｇ／日、少なくとも約４０ｍｇ／日、少なくとも約５０ｍｇ／日、少なくとも約６０ｍｇ／日、少なくとも約７０ｍｇ／日、少なくとも約８０ｍｇ／日、少なくとも約９０ｍｇ／日、または少なくとも約１００ｍｇ／日少ない。さらに、一部の実施形態では、初期投与ステップ（ａ）または（ｂ）において投与される初期用量は、約１０ｍｇ／日〜１００ｍｇ／日、約５ｍｇ／日〜２００ｍｇ／日、約１０ｍｇ／日〜５０ｍｇ／日、約５０ｍｇ／日〜１００ｍｇ／日および約１００ｍｇ／日〜約２００ｍｇ／日の間であり、ステップ（ｃ）または（ｄ）において投与されるその後の用量は、約３０ｍｇ／日〜２００ｍｇ／日、約５ｍｇ／日〜３０ｍｇ／日、約２０ｍｇ／日〜５０ｍｇ／日、約５０ｍｇ／日〜１００ｍｇ／日または約１００ｍｇ／日〜２００ｍｇ／日の間である。
【００２５】
本発明は、初期投与ステップ前後の患者におけるＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαの相対レベルの比較に基づき、ＩＢＤの患者におけるＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドによる処置をモジュレートするための方法も提供する。本方法は、（ａ）患者におけるＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαのレベルを解析するステップと、（ｂ）ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαのレベルが、ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαの正常レベルを上回る場合、初期用量のＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドを患者に投与するステップと、（ｃ）前記投与するステップ後の患者におけるＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαのレベルを解析するステップと、（ｄ）ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαのレベルが、前記投与ステップ後に、前記投与ステップ前のＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαのレベルより低い場合、初期用量と同じまたは初期用量より少ないその後の用量を患者に投与するステップとを含む。あるいは、ステップ（ｄ）において、ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαのレベルが、前記投与ステップ（すなわち、ステップ（ｂ））前のＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαのレベルと比較して、前記投与ステップ後に未変化であるまたは増加した場合、ステップ（ｄ）は、初期用量より多いその後の用量を患者に投与するまたは処置を終了するステップを含む。あるいは、ステップ（ｄ）において、患者が、臨床寛解しており、ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαのレベルが、前記投与ステップ（すなわち、ステップ（ｂ））前のＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαのレベルと比較して、前記投与ステップ後に未変化であるまたは増加した場合、ステップ（ｄ）は、処置を終了するステップを含む。
【００２６】
本発明の方法に従って、（ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドの）初期投与ステップ前のＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαレベルと比較して、初期投与ステップ後に観察されるＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαレベルの変化を、例えば、ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαレベルのパーセントの変化として比較して、ＩＢＤの患者に投与されるべきＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドのその後の用量の量を決定することができる。例えば、一部の実施形態では、ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαのレベルが、前記投与ステップ（例えば、投与ステップ（ｂ））前のＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαのレベルと比較して、前記投与ステップ後に少なくとも１０％、少なくとも２０％、少なくとも３０％、少なくとも４０％、少なくとも５０％、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％または少なくとも９５％減少される場合、本方法は、初期用量と同じまたは初期用量より少ないその後の用量を患者に投与するステップ（例えば、投与ステップ（ｄ））を含む。
【００２７】
本発明は、ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαレベルの比較に基づき、例えば、ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドによる処置前後のＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαレベルのパーセント変化の比較に基づき、ＩＢＤを有する患者が、ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドによる処置後に臨床寛解を経験する確率を決定するための方法も提供する。例えば、一部の実施形態では、本明細書に記載されている方法は、投与ステップ（例えば、投与ステップ（ｂ））後のＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαのレベルが、投与ステップ前のＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαのレベルと比較して少なくとも５％、少なくとも１０％、少なくとも２０％、少なくとも３０％、少なくとも４０％、少なくとも５０％、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％または少なくとも９５％減少した場合、ＩＢＤを有する患者が、少なくとも１週間、少なくとも２週間、少なくとも３週間、少なくとも４週間、少なくとも５週間、少なくとも６週間、少なくとも７週間または少なくとも８週間の期間、ＩＢＤの臨床寛解を経験する２０％超、３０％超、４０％超、５０％超、６０％超、７０％超、８０％超、９０％超または１００％超の機会を有することを決定するステップをさらに含む。
【００２８】
本明細書に記載されている通り、臨床寛解は、参照値、例えば、クローン病活動性指数（ＣＤＡＩ）との比較により決定することができる。本発明の一部の実施形態では、ＩＢＤを有する患者における臨床寛解は、１５０未満のＣＤＡＩスコア（ＣＤＡＩ＜１５０）によって示される。
【００２９】
本発明の一部の実施形態では、臨床寛解または患者ＣＤＡＩスコアは、ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドの投与に関して所定の時点でまたは所定の時間枠内で観察することができる。例えば、一部の実施形態では、臨床寛解は、投与ステップ（例えば、投与ステップ（ｂ））から約１日、約３日、約１週間、約２週間、約３週間、約４週間、約６週間、約７週間、約８週間、約９週間または約１０週間後に観察され、少なくとも３日間、少なくとも１週間、少なくとも２週間、少なくとも３週間、少なくとも４週間、少なくとも５週間、少なくとも６週間、少なくとも７週間、少なくとも８週間、少なくとも９週間または少なくとも１０週間の期間維持される。同様に、本発明の一部の実施形態は、ＩＢＤを有する患者が、ＩＢＤの臨床寛解を経験する機会を有することを決定する方法を含み、ＩＢＤを有する患者は、投与ステップ（例えば、投与ステップ（ｂ））前の１週間、約２２０〜約４００、約１５０〜約２００、約２００〜約２５０、約２５０〜約３００、約３００〜約３５０、約３５０〜約４００、約４００〜約４５０の間または約４５０超のＣＤＡＩを有した。
【００３０】
一部の実施形態では、本発明は、正常レベルを上回るＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαを有する患者におけるＩＢＤを処置または管理する方法であって、ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドの用量を患者に投与するステップを含む方法を提供する。さらに、一部の実施形態では、本発明は、ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドの用量の投与後に、正常を上回るＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαレベルを有する患者におけるＩＢＤを処置または管理するための方法を提供し、患者は、前の用量より多いまたはこれに等しいＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドのさらに別の用量を投与される。同様に、一部の実施形態では、本発明は、ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドの用量の投与後に、正常を下回るＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαレベルを有するＩＢＤを有する患者におけるＩＢＤを処置または管理するための方法を提供する。後者の場合、本方法は、前の用量に満たないまたはこれに等しいＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドのさらに別の用量を患者に投与するステップを含む。一部の実施形態では、患者へのＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドの投与は、１種または複数種のバイオマーカー、例えば、ＣＣＬ２０、ＩＬ８、Ｃ反応性タンパク質（ＣＲＰ）またはＴＮＦαのレベルが、正常レベルに達する；患者が、１５０未満のＣＤＡＩスコアを達成する；または患者が、臨床寛解を達成するまで反復される。
【００３１】
本発明は、ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαの正常を上回るレベルを有する患者におけるＩＢＤを処置または管理する方法も提供し、患者に投与されるＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドの量は、患者におけるＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαのレベルが減少するまで増加される。かかる実施形態では、患者に投与されるＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドのレベルは、患者におけるＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαのレベルが、ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαのほぼ正常レベルへとまたはＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαの正常レベルを下回って減少するまで増加させることができる。
【００３２】
一部の実施形態では、本発明は、ＩＢＤの患者におけるＩＢＤの処置または管理をモニターする方法であって、各ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチド投与後に患者におけるＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαのレベルを解析するステップを含む方法を提供する。これらの方法を利用して、ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαのレベルの減少の非存在は、処置または管理が有効ではないことを示す。かかる実施形態では、ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαのレベルは、ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドの各投与後に、１回または複数回、例えば、２回、３回、４回、約５回、約１０回、約１５回、約２０回または約３０回解析することができる。さらに、ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチド投与の直後、約１時間後、約３時間後、約６時間後、約１２時間後、約１日後、約３日後、約１週間後、約２週間後、および／または約１カ月後にＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαのレベルを解析することができるように、ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαのレベルの測定のタイミングは、ＳＭＡＤ７オリゴヌクレオチド投与の時間に関して変動し得る。
【００３３】
本明細書に記載されている方法を使用して、ＩＢＤを有する患者におけるバイオマーカーまたは分析物、例えば、ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαのレベルを決定するために、患者から試料を得ることができる。したがって、本発明の一部の実施形態では、ＩＢＤを有する患者におけるＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαのレベルは、ＩＢＤを有する患者から得られる試料において決定される。ＣＣＬ２０、ＩＬ８もしくはＴＮＦα以外のまたはこれに加えた分析物、例えば、ＣＣＬ２０、ＴＮＦα、ＩＬ８および／またはＣＲＰが挙げられるがこれらに限定されない分析物を本発明の方法において決定することもできる。よって、本発明の一部の実施形態では、本方法は、ＩＢＤを有する患者における１つまたは複数の追加的な分析物の１種のレベルまたは複数種のレベルを決定するステップを含む。ＣＣＬ２０の分析物は、ＮＣＢＩ参照配列：ＡＣ＿０００１３４．１、ＮＣ＿０００００２．１２およびＮＣ＿０１８９１３．２によって記載されているＣＣＬ２０遺伝子のまたはこれに由来するＲＮＡ、ＤＮＡおよびタンパク質産物を含む。ＴＮＦαの分析物は、ＮＣＢＩ参照配列：ＮＧ＿００７４６２．１によって記載されているＴＮＦα遺伝子のまたはこれに由来するＲＮＡ、ＤＮＡおよびタンパク質産物を含む。ＣＲＰの分析物は、ＮＣＢＩ参照配列：ＮＧ＿０１３００７．１によって記載されているＣＲＰ遺伝子のまたはこれに由来するＲＮＡ、ＤＮＡおよびタンパク質産物を含む。ＩＬ８の分析物は、ＮＣＢＩ参照配列：ＮＧ＿０２９８８９．１によって記載されているＩＬ８遺伝子のまたはこれに由来するＲＮＡ、ＤＮＡおよびタンパク質産物を含む。
【００３４】
ＩＢＤを有する患者から得られる、目的の分析物、例えば、ＣＣＬ２０、ＴＮＦα、ＣＲＰおよび／またはＩＬ８を含有する試料は、血液、血清または血漿試料を含むことができる。試料は、組織、胃腸、粘膜、粘膜下、腸、食道、回腸、直腸またはリンパ性試料等が挙げられるがこれらに限定されない、組織試料を含むこともできる。ＩＢＤを有する患者由来の試料における目的の分析物のレベルは、様々なアッセイを使用して決定することができる。例えば、本発明の方法において、ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαおよび／または別の分析物のレベルは、免疫化学、例えば、酵素結合免疫吸着測定法（ＥＬＩＳＡ）またはヌクレオチド解析によって決定することができる。
【００３５】
本発明の方法は、様々な形態のＩＢＤを処置および管理するための方法を含む。例えば、本発明は、ＩＢＤを処置および管理するための方法を含み、ＩＢＤは、クローン病（ＣＤ）または潰瘍性大腸炎（ＵＣ）である。意図されている発明は、例えば、活動性ＣＤを有するステロイド依存性患者および活動性ＣＤを有するステロイド抵抗性患者であるＩＢＤ患者が挙げられるがこれらに限定されない患者を含む、異なる種類のＩＢＤの患者を処置するための方法も提供する。
【００３６】
本明細書に記載されている本発明の方法においてＩＢＤを有する患者に投与されるＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドは、様々な投与経路によって投与することができることが認められよう。様々な実施形態では、ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドは、経口、局所、非経口、例えば、皮下注射、吸入スプレーまたは直腸を含む、１または数種の経路により投与することができる。用語、非経口は、本明細書において使用する場合、皮下注射、膵内投与、ならびに静脈内、筋肉内、腹腔内および胸骨内の注射または注入技法を含む。好ましい実施形態では、ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドは、ＩＢＤを有する患者に経口投与することができる。
【００３７】
意図されている発明は、分解のためにＳＭＡＤ７  ＲＮＡを標的化する、ＲＮＡスプライシングに干渉する、またはＳＭＡＤ７遺伝子発現もしくはタンパク質翻訳を防止することができるＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドの投与を含む方法を提供する。本発明の意図されているＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドは、結合のためにヒトＳＭＡＤ７  ｍＲＮＡの様々な領域を標的とすることができる。例えば、ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドは、ヒトＳＭＡＤ７  ｍＲＮＡ（配列番号１）のヌクレオチド１０８〜１２８を標的とすることができる。一部の実施形態では、ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドは、ヒトＳＭＡＤ７配列（配列番号１）のヌクレオチド４０３、２３３、２９４、２９５、２９６、２９８、２９９または５３３を標的とすることができる。ヒトＳＭＡＤ７  ｍＲＮＡ配列は、ＮＣＢＩ参照配列：ＮＭ＿００５９０４．３（配列番号１）の配列である。
【００３８】
意図されているＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドの配列は、ＳＭＡＤ７  ＲＮＡを標的化することができる複数の配列から選択することができる。例えば、本発明の一部の実施形態では、ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドは、配列番号２のヌクレオチド配列（５’−ＧＴＣＧＣＣＣＣＴＴＣＴＣＣＣＣＧＣＡＧＣ−３’）を含む。本発明の一部の実施形態では、アンチセンスオリゴヌクレオチドは、アンチセンスオリゴヌクレオチドホスホロチオエート、すなわち、ヌクレオチド間結合の少なくとも一部が、患者の細胞への送達に適したホスホロチオエート結合であるオリゴヌクレオチドである。その上、本発明のアンチセンスオリゴヌクレオチドは、修飾されたヌクレオチド、例えば、修飾塩基を含有するヌクレオチド、例えば、５−メチル−２’−デオキシシチジンを含むことができる。例えば、一部の実施形態では、アンチセンスオリゴヌクレオチドは、次の配列：５’−ＧＴＸＧＣＣＣＣＴＴＣＴＣＣＣＸＧＣＡＧ−３’（配列番号３）を含む、ＳＭＡＤ７に対するアンチセンスオリゴヌクレオチドホスホロチオエートであり、Ｘは、５−メチル−２’−デオキシシチジンを含むヌクレオチドであり、ヌクレオチド間結合は、ホスホロチオエート結合である。一部の実施形態では、アンチセンスオリゴヌクレオチドは、次の配列：５’−ＧＴＸＧＣＣＣＣＴＴＣＴＣＣＣＸＧＣＡＧＣ−３’（配列番号４）を含む、ＳＭＡＤ７に対するアンチセンスオリゴヌクレオチドホスホロチオエートであり、Ｘは、５−メチル−２’−デオキシシチジンを含むヌクレオチドであり、ヌクレオチド間結合は、ホスホロチオエート結合である。特定の実施形態では、意図されているアンチセンスオリゴヌクレオチドは、配列番号４を含むアンチセンスオリゴヌクレオチドであり、２０個のヌクレオチド間結合のそれぞれが、Ｏ，Ｏ結合型ホスホロチオエート結合であり、本明細書において「モンジャーセン（Mongersen）」と称される。
【図面の簡単な説明】
【００３９】
【図１】図１は、治験において適格性に関して査定される患者の評価および治験に入ることを許可された患者の進行を示す流れ図である（治験進行は上から下へと表示）。示されている通り、治験の開始に先立ち、１８８名の患者を適格性に関して査定した。２２名の患者がスクリーニングプロセスを失格し、１６６名の患者が、０日目に治験に入ることを許可された。示されている通り、プラセボを受けるよう４２名の患者を割り当て、１０ｍｇ／日のモンジャーセンを受けるよう４１名の患者を割り当て、４０ｍｇ／日のモンジャーセンを受けるように４０名の患者を割り当て、１６０ｍｇ／日のモンジャーセンを受けるように４３名の患者を割り当てた。４１名の患者が、プラセボ群における処置を完了し、３８名の患者が、１０ｍｇ／日モンジャーセン群における処置を完了し、３９名の患者が、４０ｍｇ／日モンジャーセン群における処置を完了し、４２名の患者が、１６０ｍｇ／日モンジャーセン群における処置を完了した。割り当てられた処置を正確に完了した患者のうち、プラセボ群における３０名の患者、１０ｍｇ／日モンジャーセン群における３２名の患者、４０ｍｇ／日モンジャーセン群における３７名の患者および１６０ｍｇ／日モンジャーセン群における３９名の患者が、経過観察手順を完了した。
【００４０】
【図２Ａ】図２Ａは、２週間の臨床治験薬物処置期間後の患者における臨床寛解のパーセントを示す棒グラフである。示されている通り、プラセボ群における患者の９．５％、１０ｍｇ／日モンジャーセン群における患者の１２．２％、４０ｍｇ／日モンジャーセン群における患者の５５％および１６０ｍｇ／日モンジャーセン群における患者の６５．１％が、処置の終わりに続いて寛解に入った。グラフの下に示す数は、評価時に１５０を超えるＣＤＡＩスコアを有する各群における患者の実数および１５０未満のＣＤＡＩスコアを有する各群における患者の数を示す。４０ｍｇ／日および１６０ｍｇ／日モンジャーセン群における寛解率は、プラセボおよび１０ｍｇ／日モンジャーセン群における寛解率よりも有意に大きかった（４０ｍｇ／日および１６０ｍｇ／日モンジャーセン群の両方ｖｓ．１０ｍｇ／日またはプラセボ群のいずれかに関して、Ｐ＜０．０００１）。
【図２Ｂ】図２Ｂは、ベースラインと比較して、臨床治験の１５日目に１００ポイントＣＤＡＩスコア減少を有する各処置群における患者のパーセントを示す棒グラフである。グラフは、１６０ｍｇ／日モンジャーセン群における患者の６５．１％、４０ｍｇ／日モンジャーセン群における患者の４５％、１０ｍｇ／日モンジャーセン群における患者の２２％およびプラセボ群における患者の２６．２％が、ベースラインと比較して、１５日目に１００ポイントＣＤＡＩ減少を経験したことを示す。１００ポイント臨床応答を経験した患者のパーセンテージは、１６０ｍｇ／日および４０ｍｇ／日モンジャーセン群において、１０ｍｇ／日モンジャーセン群（それぞれＰ＜０．０００１およびＰ＝０．０２７）と比較して有意により大きかった。１００ポイント臨床応答を経験した患者のパーセンテージは同様に、１６０ｍｇ／日モンジャーセン群において、プラセボ群（Ｐ＝０．０００３）と比較して有意により大きかった。
【００４１】
【図２Ｃ】図２Ｃは、ベースラインと比較して、臨床治験の２８日目に１００ポイントＣＤＡＩスコア減少を有する各処置群における患者のパーセントを示す棒グラフである。グラフは、この判断基準に従った臨床応答が、１６０ｍｇ／日モンジャーセン群における患者の７２．１％、４０ｍｇ／日モンジャーセン群における患者の５７．５％、１０ｍｇ／日モンジャーセン群における患者の３６．６％およびプラセボ群における患者の１６．７％において観察されたことを示す。２８日目に１００ポイントＣＤＡＩ減少を経験した患者のパーセンテージは、１６０ｍｇ／日、４０ｍｇ／日および１０ｍｇ／日モンジャーセン群において、プラセボ群（図４Ｂ；それぞれ各群のプラセボと比較した、１６０ｍｇ／日群に関するＰ＜０．０００１、４０ｍｇ／日群に関するＰ＝０．０００１および１０ｍｇ／日群に関するＰ＝０．０３９）と比較して有意により大きかった。
【００４２】
【図２Ｄ】図２Ｄは、１００ポイントＣＤＡＩスコア減少に関する１２週間（８４日目）データと共に図２Ｂおよび図２Ｃのデータを示す棒グラフである。
【００４３】
【図３Ａ】図３Ａは、ベースラインと比較して、臨床治験の１５日目に７０ポイントＣＤＡＩスコア減少を有する各処置群における患者のパーセントを示す棒グラフである。グラフは、７０ポイントＣＤＡＩ減少が、１６０ｍｇ／日モンジャーセン群における患者の８１．４％、４０ｍｇ／日モンジャーセン群における患者の７２．５％、１０ｍｇ／日モンジャーセン群における患者の３４．１％およびプラセボ群における患者の３１％において実証されたことを示す。１５日目に７０ポイントＣＤＡＩスコア減少を経験した患者のパーセンテージは、１６０ｍｇ／日および４０ｍｇ／日モンジャーセン群において、１０ｍｇ／日モンジャーセン（それぞれＰ＜０．０００１およびＰ＝０．０００５）およびプラセボ群（それぞれＰ＜０．０００１およびＰ＝０．０００２）と比較して有意により大きかった。
【００４４】
【図３Ｂ】図３Ｂは、ベースラインと比較して、臨床治験の２８日目に７０ポイントＣＤＡＩスコア減少を有する各処置群における患者のパーセントを示す棒グラフである。グラフは、７０ポイントＣＤＡＩ減少が、１６０ｍｇ／日モンジャーセン群における患者の７６．７％、４０ｍｇ／日モンジャーセン群における患者の８０％、１０ｍｇ／日モンジャーセン群における患者の４８．８％およびプラセボ群における患者の２６．２％において実証されたことを示す。２８日目に７０ポイントＣＤＡＩスコア減少を経験した患者のパーセンテージは、１６０ｍｇ／日、４０ｍｇ／日および１０ｍｇ／日モンジャーセン群において、プラセボ群（それぞれＰ＜０．０００１、Ｐ＜０．０００１およびＰ＝０．０３３）と比較して有意により大きかった。
【００４５】
【図４Ａ】図４Ａは、治験１５日目に１５０未満のＣＤＡＩスコアを有する各群における患者のパーセンテージを示す棒グラフである。１６０ｍｇ／日、４０ｍｇ／日および１０ｍｇ／日モンジャーセン群ならびにプラセボ群における１５０未満のＣＤＡＩスコアを有する患者のパーセンテージは、それぞれ６７．４％、５７．５％、１４．６％および２１．４％であった。１５日目に、１５０より低いＣＤＡＩスコアを有する患者のパーセントは、１６０ｍｇ／日および４０ｍｇ／日モンジャーセン群において、１０ｍｇ／日モンジャーセン群（両群に関してＰ＜０．０００１）およびプラセボ群（それぞれＰ＜０．０００１およびＰ＝０．０００８）と比較して有意により高かった。
【００４６】
【図４Ｂ】図４Ｂは、治験２８日目に１５０未満のＣＤＡＩスコアを有する各群における患者のパーセンテージを示す棒グラフである。２８日目に、１６０ｍｇ／日、４０ｍｇ／日および１０ｍｇ／日モンジャーセン群ならびにプラセボ群における１５０未満のＣＤＡＩスコアを有する患者のパーセンテージは、それぞれ７２．１％、７０％、２９．３％および１４．３％であった。２８日目に、１５０より低いＣＤＡＩスコアを有する患者のパーセントは、１６０ｍｇ／日および４０ｍｇ／日モンジャーセン群において、１０ｍｇ／日モンジャーセン群（それぞれＰ＜０．０００１およびＰ＝０．０００２）およびプラセボ群（両群に関してＰ＜０．０００１）と比較して有意により高かった。
【００４７】
【図４Ｃ】図４Ｃは、治験８４日目に１５０未満のＣＤＡＩスコアを有する各群における患者のパーセンテージを示す棒グラフである。８４日目に、１６０ｍｇ／日、４０ｍｇ／日および１０ｍｇ／日モンジャーセン群ならびにプラセボ群における１５０未満のＣＤＡＩスコアを有する患者のパーセンテージは、それぞれ６７．４％、６２．５％、２９．３％および２１．４％であった。８４日目に、１５０より低いＣＤＡＩスコアを有する患者のパーセントは、１６０ｍｇ／日および４０ｍｇ／日モンジャーセン群において、１０ｍｇ／日モンジャーセン群（それぞれＰ＝０．０００５およびＰ＝０．００３）およびプラセボ群（両群に関してＰ＜０．０００１）と比較して有意により高かった。
【００４８】
【図５Ａ】図５Ａは、ベースラインにおいて上昇したＣＲＰレベルを有する各群における患者のパーセントを示す棒グラフである。上昇したＣＲＰレベルは、プラセボ群における患者の５９．５％、１０ｍｇ／日モンジャーセン群における患者の６５．９％、４０ｍｇ／日モンジャーセン群における患者の５５％および１６０ｍｇ／日モンジャーセン群における患者の６５．１％において観察された。
【００４９】
【図５Ｂ】図５Ｂは、臨床治験１５日目における正常化されたＣＲＰレベルを有する各群における患者のパーセントを示す棒グラフである。正常化されたＣＲＰレベルは、プラセボ群における患者の４％、ならびに１０ｍｇ／日、４０ｍｇ／日および１６０ｍｇ／日モンジャーセン群における患者のそれぞれ２２％、１８．１８％および１７．９％において観察された。
【００５０】
【図６】図６は、寛解に入ったベースラインにおいて上昇したベースラインＣＲＰレベルを有する各処置群における患者のパーセントを示す棒グラフである。ベースラインにおいて上昇したＣＲＰレベルを有する患者において、寛解に入った患者のパーセンテージは、１６０ｍｇ／日、４０ｍｇ／日および１０ｍｇ／日モンジャーセン群ならびにプラセボ群においてそれぞれ６７．９％、４５．５％、１１．１％および１２％であった。寛解に入ったベースラインにおいて上昇したＣＲＰレベルを有する患者のパーセンテージは、１６０ｍｇ／日および４０ｍｇ／日モンジャーセン群において、プラセボ群（それぞれＰ＜０．０００１およびＰ＝０．０１）と比較して有意により高かった。１６０ｍｇ／日および４０ｍｇ／日モンジャーセン群の間または１０ｍｇ／日モンジャーセンおよびプラセボ群の間で、有意差は観察されなかった。
【００５１】
【図７】図７は、治験１５日目および４週目における、３ｍｇ／ｌ未満のＣＲＰレベルを有するまたは３ｍｇ／ｌもしくはそれを超えるＣＲＰレベルを有する患者に関する、臨床寛解を有する患者のパーセンテージを示す棒グラフである。
【００５２】
【図８Ａ】図８Ａは、４０ｍｇ／日または１６０ｍｇ／日モンジャーセン処置後に臨床寛解／応答を経た個体における血清ＣＣＬ２０（ｈＣＣＬ２０）のレベルを示す一連の２つのグラフである。左のパネルは、０日目および８４日目に得た個々の測定値を示し、線は、各時点で個々の患者から得たデータをつないでいる。右のパネルは、０日目および８４日目におけるＣＣＬ２０レベルの平均値±標準誤差を示す棒グラフである。
【００５３】
【図８Ｂ】図８Ｂは、４０ｍｇ／日または１６０ｍｇ／日モンジャーセン処置後に臨床寛解／応答を経験しなかった個体における血清ＣＣＬ２０（ｈＣＣＬ２０）のレベルを示す一連のグラフである。左のパネルは、０日目および８４日目に得た個々の測定値を示し、線は、各時点で個々の患者から得たデータをつないでいる。右のパネルは、０日目および８４日目におけるＣＣＬ２０レベルの平均値±標準誤差を示す棒グラフである。
【００５４】
【図８Ｃ】図８Ｃは、４０ｍｇ／日または１６０ｍｇ／日モンジャーセン処置後に臨床寛解／応答を経た個体における、０日目および８４日目に測定した血清ＣＣＬ２０（ｈＣＣＬ２０）のレベルを示す一連の２つのグラフであり、ベースライン血清ＣＣＬ２０レベルは、１０ｐｇ／ｍｌより多い。左のパネルは、各時点で得た個々の測定値を示し、線は、個々の患者から得た０日目および８４日目におけるデータ点をつないでいる。右のパネルは、０日目および８４日目におけるＣＣＬ２０レベルの平均値±標準誤差を示す棒グラフである。
【００５５】
【図９】図９Ａ〜９Ｄは、臨床応答性のモンジャーセン処置患者（図９Ａ）、臨床非応答性のモンジャーセン処置患者（図９Ｂ）、臨床応答性のプラセボ処置患者（図９Ｃ）および臨床非応答性のプラセボ処置患者（図９Ｄ）の中でのモンジャーセンまたはプラセボ処置の０、１５、２８、および８４日目におけるＣＣＬ２０血清レベル（ｈＣＣＬ２０）を示す棒グラフである。
【００５６】
【図１０】図１０は、臨床寛解（左）または臨床応答（右）を経験した個体の中でのモンジャーセン処置の０、１５、２８、および８４日目におけるＣＣＬ２０血清レベルを示す一対のグラフである。水平バーは、各時点についての中央値を表し、各ポイントは、単一患者におけるＣＣＬ２０血清値を表す。
【００５７】
【図１１】図１１は、未刺激（Ｕｎｓｔ）対照と比べた様々な因子による刺激後のＮＣＭ４６０細胞内のＣＣＬ２０（ｈＣＣＬ２０）ｍＲＮＡ発現を示す棒グラフである。
【００５８】
【図１２Ａ】図１２Ａは、クローン病患者由来の結腸または回腸粘膜組織切片におけるＳＭＡＤ７（左パネル）、ＣＣＬ２０（中央パネル）またはＩｇＧ（アイソタイプＩｇＧ、右パネル）（褐色）およびヘマトキシリン（紫色）の免疫組織化学的染色を示す一連の画像である。画像は、４つの実験の代表である。
【００５９】
【図１２Ｂ】図１２Ｂは、ＳＭＡＤ７センス（Ｓｅｎｓｅ）またはアンチセンス（Ｓｍａｄ７  Ａｓ）オリゴヌクレオチドにより処置した結腸組織外植片における中央値および個々のＣＣＬ２０タンパク質レベルを示すグラフである。水平バーは、各群におけるＣＣＬ２０レベル中央値を表し、各データ点は、個々の外植片におけるＣＣＬ２０レベルを表す。ＳｅｎｓｅおよびＳｍａｄ７  Ａｓ列中の個々のデータ点をつないでいる各バーは、同じ患者から得た外植片のデータ点をつなぐ。
【発明を実施するための形態】
【００６０】
（詳細な説明）
本発明は、ＩＢＤを有する患者におけるＩＢＤの処置および管理に一般に有用な方法を提供する。ＩＢＤを有する患者として、ＵＣおよびＣＤ患者が挙げられるがこれらに限定されず、これは、後者のステロイド依存性およびステロイド抵抗性形態を含む。本方法は、ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチド治療法等、抗ＳＭＡＤ７治療法で処置されている患者における処置の管理の観点から特に有用である。ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチド治療法は、ＳＭＡＤ７  ｍＲＮＡ転写物に結合し、ＳＭＡＤ７  ｍＲＮＡ転写物の分解を誘導し、ＳＭＡＤ７  ｍＲＮＡ転写物のスプライシングを防止またはＳＭＡＤ７  ｍＲＮＡ転写物のタンパク質翻訳を防止することができるオリゴヌクレオチドを含む、いずれかの治療法であり得る。
【００６１】
本発明の方法は、ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドによる処置に対するＩＢＤを有する患者の応答性の予測および決定に有用である。よって、本発明の方法を使用して、ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチド処置に応答する可能性がある患者およびＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチド処置に応答する見込みがない患者を同定することができる。本明細書に記載されている方法は、患者が、ＩＢＤ処置に応答性であるか応答性ではないかに関する決定にも有用である。一般に、本発明の方法を使用して、ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドにより処置されているＩＢＤを有する患者における応答性のレベルまたは可能性があるレベルを決定することもできる。応答性のレベルまたは応答性の可能性があるレベルの決定に基づき、ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドの投与を開始、反復、維持、増加、減少または終了することができる。応答性は、バイオマーカーおよび／または他の分析物（例えば、ＣＣＬ２０、ＩＬ８、ＣＲＰ、ＴＮＦα）のレベルまたはレベル変化の解析、ＣＤＡＩスコアまたはＣＤＡＩスコアの変化、またはＩＢＤの症状の評価（例えば、体重減少、組織炎症、血便排泄）が挙げられるがこれらに限定されない、いくつかの因子を使用して決定することができる。
【００６２】
同様に、本方法は、ＩＢＤを有する患者におけるＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドによる処置の有効性および安全性の評価に有用である。例えば、本発明の方法は、ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドによる処置が、ＩＢＤの部分的または完全寛解または緩解を引き起こすのに有効であるまたは有効ではないことを示すことができる、バイオマーカー発現または疾患状態の他の指標もしくは徴候のレベルの変化を決定するステップを含むことができる。バイオマーカー発現のレベルまたはレベル変化、疾患症状、ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドの組織、血液もしくは全身レベル、または全般的な健康の指標の決定は、疾患状態の悪化または危険な薬物レベルを示すこともできる。処置（複数可）の前、その最中、その間および／またはその後における複数の指標の査定を使用して、疾患ステージ、進行および重症度をモニターすることができる。
【００６３】
本発明は、一部には、ＩＢＤ疾患状態とＣＣＬ２０、ＩＬ８およびＴＮＦαのレベルとの間の関係性の発見に基づく。特に、本発明者らは、ＣＣＬ２０、ＩＬ８およびＴＮＦαの各々のレベルが、患者が、ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドを使用したＩＢＤの処置に応答性であるか、応答性である可能性があるか、応答性ではないか、応答性ではない可能性があるかに関する決定に有用なバイオマーカーであることを発見した。
【００６４】
さらに、ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαのレベルを使用して、特に、ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドの投薬量に関して、ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドを使用した疾患処置を管理することができる。例えば、ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαのレベルを使用して、ＩＢＤを有する患者に、例えば、ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドの以前に投与された用量、例えば、初期用量に関したその後の用量における、ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドの特異的な投薬量、例えば、より高い用量またはより低い用量を与えるべきか決定することができる。よって、ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドの投与は、例えば、ＩＢＤを有する患者におけるＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαの絶対レベルまたはＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαの相対レベルに関して投薬量または頻度の観点から調整することができる。例えば、ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドの投与は、ＩＢＤを有する患者由来の試料において測定されるＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαの絶対レベルを、ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαの正常レベルと比較することにより、ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαの絶対レベルに基づき調整することができ、ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαの正常レベルは、例えば、ＩＢＤを有する患者にマッチした健康対照群におけるＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαのベンチマーク値またはレベル中央値のいずれかである。本発明の一部の実施形態では、ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドの投与は、ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαの相対レベルに基づき、例えば、ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチド投与の前および後、ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチド投与の直後およびそのさらに後、またはＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチド投与の最中および後のＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαのレベルの比較に基づき調整することができる。一部の実施形態では、ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドは、患者試料におけるＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαのレベルの比較の作製に使用される、ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαのレベルの初期検出およびＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαレベルのその後の検出の間に複数回投与することができる。
【００６５】
本発明の一部の実施形態では、処置されているＩＢＤ患者は、正常を上回るＣＣＬ２０、ＩＬ８および／またはＴＮＦαのレベルを有する患者である。一部の実施形態では、患者は、処置前に高いＣＣＬ２０、ＩＬ８および／またはＴＮＦαのレベルを有することが公知である。一部の実施形態では、ＩＢＤ患者におけるＣＣＬ２０、ＩＬ８および／またはＴＮＦαのレベルは、処置前に、処置後に、ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドの初期用量の投与前に、ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドの初期用量の投与後に、ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドのその後の用量の投与前に、および／またはＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドのその後の用量の投与後に決定される。
【００６６】
対照レベルおよび対照試料
ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαの対照レベルは、抗ＳＭＡＤ７治療法による処置前の対象から得られる試料（例えば、血液試料）におけるＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαのタンパク質またはｍＲＮＡ転写物のレベルを決定することにより決定することができる。ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαの対照レベルは、処置に対する対象の応答をモニターするためのベースラインを提供することができる。対照試料は、抗ＳＭＡＤ７治療法が初めて投与される日に（例えば、処置レジメンの１日目に）、例えば、少なくとも１種の抗ＳＭＡＤ７治療法の投与の直後に対象から得ることができる。他の実施形態では、対照試料は、抗ＳＭＡＤ７治療法の開始１日前に（例えば、処置レジメンの０日目に）対象から得ることができる。あるいは、対照試料は、抗ＳＭＡＤ７治療法の開始２、３、４、５、６、７日またはそれよりも前に対象から得ることができる。例えば、ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαの濃度の増加または減少は、処置前に（例えば、対照試料において）、処置の最中におよび／または処置後に測定して、治療法、例えば、抗ＳＭＡＤ７治療法に対する対象の応答をモニターすることができる。
【００６７】
一部の実施形態では、対照レベルは、対象における循環ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαの濃度の長期モニタリングに基づき、対象のために確立することができる。かかる事例において、対象が、抗ＳＭＡＤ７治療法による複数ラウンドの処置を受けることができることが意図される。複数ラウンドの処置後に検出される循環ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαの濃度は、対象のＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαの先の対照レベルと比較して、対象が、治療法に応答したか、および／または抗ＳＭＡＤ７治療法によるさらなる処置に応答する可能性があるか決定することができる。他の実施形態では、対象の対照またはベースラインレベルは、経時的に得られる（例えば、数日間、数週間、数カ月間または数年間の経過にわたって得られる）複数のベースライン試料から決定される循環ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαの濃度の平均測定値に基づき確立することができる。したがって、本明細書に開示されている通りに行われるいずれかの検査またはアッセイは、以前のまたは確立された対照レベルと比較することができ、例えば、対象が、抗ＳＭＡＤ７治療法による２ラウンド以上の処置を受けている場合、比較のために対象から新たな対照試料を得る必要がない場合がある。
【００６８】
ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαの正常レベルは、数的参照値に基づき、または健康対照群におけるＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαのレベルに関して決定することができる。
【００６９】
本発明の他の実施形態では、ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαの正常レベルは、健康対照群におけるＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαのレベル中央値として定義される。
【００７０】
健康対照群は、患者における判断基準の同じセットにマッチする、遺伝的背景、習慣および身体的特質に関する様々な判断基準に基づき定義することができる。例えば、一部の実施形態では、健康対照群およびＩＢＤを有する患者は、年齢、性別、民族起源、喫煙習
慣、食習慣、ボディ・マス・インデックス（ＢＭＩ）、レクリエーショナルドラッグ使用、医療用薬物使用、ＩＢＤに関する薬物使用および／または運動習慣に関してマッチする。患者および対照群の間でマッチし得る他の因子として、臨床判断基準（例えば、ＣＤＡＩスコア、Ｍａｙｏスコア、ＩＢＤ関連症状の重症度）、代謝、ＩＢＤ患者の個人的病歴、遺伝因子、ＩＢＤ患者の家族の病歴、環境因子（例えば、汚染物質、毒素、アレルゲン）への曝露およびライフスタイル（例えば、都市、郊外または地方勤務地および／または居住地）が挙げられるがこれらに限定されない。
【００７１】
一部の実施形態では、対照群は、ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドの初期用量を受ける前の、ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドによる処置を受けている患者である。一部の実施形態では、患者は、処置未経験患者である。
【００７２】
データ解釈
一部の実施形態では、抗ＳＭＡＤ７治療法の初期投与に先立ち、ＩＢＤを有する患者におけるＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαのレベルが解析され、閾値レベルと比較される。本明細書に記載されている通り、閾値レベルは、健康対照群またはＩＢＤ患者群におけるＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαのレベルに基づき確立することができる。一般に、閾値レベルは、健康対照群における正常ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαのレベル、例えば、ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαのレベルの中央値に関して高い、あるいは対照群、例えば、ＩＢＤ患者で構成された対照群におけるＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαのレベルの範囲内に収まることができる。
【００７３】
抗ＳＭＡＤ７治療法による処置に対する対象の応答性は、処置前の対象から得られる試料におけるＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαの対照レベルに関して解釈することができる。対照試料と比較して、対象から得られる試料におけるＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαの濃度の減少が見られる場合、対象は、抗ＳＭＡＤ７治療法による処置に対して感受性である（例えば、処置に対して応答性であるまたは応答する可能性がある）と同定することができる。一部の実施形態では、対象が、抗ＳＭＡＤ７治療法処置を受けているときに、試料を得ることができる。他の実施形態では、対象が、処置を受けることを中止した後に、例えば、処置を中止してから約１日間、約７日間（すなわち、約１週間）、約１４日間（すなわち、約２週間）、約２８日間、約５６日間、約７０日間および／またはそれより長い期間の後に、試料を得ることができる。好ましい実施形態では、抗ＳＭＡＤ７治療法処置を中止してから約１日後に、試料を得ることができる。
【００７４】
本発明の意図される実施形態では、試料におけるＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαの量の減少は、対象が、治療法に応答性であるおよび／または寛解に入ったまたは寛解に入る可能性があることを示すＣＤＡＩスコアと一致する。例えば、一部の実施形態では、対照レベルと比較した試料におけるＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαの量の減少は、対象における約２００未満、約１９０未満、約１８０未満、約１７０未満、約１６０未満または約１５０未満のＣＤＡＩスコアと一致する。特定の実施形態では、対照レベルと比較した試料におけるＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαの量の減少は、対象における約１５０未満のＣＤＡＩスコアと一致する。一部の実施形態では、ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαの濃度の減少と一致するＣＤＡＩスコアは、対象において少なくとも１日間、少なくとも１週間、少なくとも２週間または少なくとも１０週間維持される。
【００７５】
一部の実施形態では、ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαの濃度の減少と一致するＣＤＡＩスコアは、抗ＳＭＡＤ７治療法による処置を中止した後に観察できる。例えば、ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαの濃度の減少と一致するＣＤＡＩスコアは、抗ＳＭＡＤ７治療法による処置を中止してから約１日間、約１週間、約２週間、約１０週間、約１日間および約２週間またはそれより長い期間の後に観察することができる。一部の実施形態では、試料におけるＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαの量の減少は、対象が、治療法に応答性であるおよび／または寛解に入ったまたは寛解に入る可能性があることを示すＣＤＡＩスコアの減少と一致する。例えば、本発明の一部の実施形態では、対照レベルと比較した試料におけるＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαの量の減少は、対象における約５０、約６０、約７０、約８０、約９０、約１００、約１１０、約１２０、約１３０、約１４０または約１５０のＣＤＡＩスコアの減少と一致する。特定の実施形態では、対照レベルと比較した試料におけるＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαの量の減少は、対象における約７０〜約１００のＣＤＡＩスコアの減少と一致する。一部の実施形態では、ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαの量の減少と一致するＣＤＡＩスコアの減少は、抗ＳＭＡＤ７治療法による処置を中止した後に観察できる。例えば、ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαの量の減少と一致するＣＤＡＩスコアの減少は、抗ＳＭＡＤ７治療法による処置を中止してから約１日間、約１週間、約２週間、約３週間、約４週間、約１０週間またはそれより長い期間の後に観察することができる。一部の実施形態では、ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαの量の減少と一致するＣＤＡＩスコアの減少は、抗ＳＭＡＤ７治療法による処置を中止してから１日間または約２週間後に観察できる。
【００７６】
一部の実施形態では、ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチド等、抗ＳＭＡＤ７治療法を受けている患者は、１種または複数種の追加的なＩＢＤ治療法、例えば、ステロイドも受ける。一部の実施形態では、抗ＳＭＡＤ７治療法および１種または複数種の追加的なＩＢＤ治療法を受けている患者は、例えば、減少するＣＤＡＩスコアおよび／または減少するＣＣＬ２０、ＩＬ８もしくはＴＮＦαのレベルによって示される通り、抗ＳＭＡＤ７治療法に応答するおよび／または臨床寛解を経験する場合、１種または複数種の追加的なＩＢＤ治療法を漸減させることができる。一部の実施形態では、抗ＳＭＡＤ７治療法の投与後に臨床寛解を経験している患者（例えば、ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドによる２週間処置レジメンの完了後１５日目および２８日目の両方でＣＤＡＩ＜１５０）は、ステロイドを漸減させることができる。
【００７７】
あるいは、対照レベルと比較して、対象から得られる試料における循環ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαの濃度の変化がないまたは増加が見られる場合、対象は、抗ＳＭＡＤ７治療法による処置に対して抵抗性である（例えば、非応答性または応答する見込みがない）と同定することができる。一実施形態では、対象が、抗ＳＭＡＤ７治療法処置を受けているときに、試料を得ることができる。他の実施形態では、対象が、処置を受けることを中止した後に、例えば、処置を中止してから約１日間、約７日間（すなわち、約１週間）、約１４日間（すなわち、約２週間）、約２８日間、約５６日間、約７０日間および／またはそれよりも長い期間の後に、試料を得ることができる。好ましい実施形態では、抗ＳＭＡＤ７治療法処置を中止してから約１日後に、試料を得ることができる。
【００７８】
一部の実施形態では、１種または複数種のレスキュー治療法（例えば、ＩＬ８、ＴＮＦαまたはＣＣＬ２０阻害剤等、生物製剤および／または免疫抑制剤）が、例えば、増加するＣＤＡＩスコア（例えば、＞７０ＣＤＡＩスコア増加）および／または増加するＣＣＬ２０、ＩＬ８もしくはＴＮＦαレベル（例えば、ＣＣＬ２０、ＩＬ８もしくはＴＮＦαレベルの＞５０％増加）によって示される通り、抗ＳＭＡＤ７治療法による処置の経過において疾患の悪化を経験している患者に投与される。
【００７９】
患者ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαレベルおよび閾値ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαレベルにおける差は、抗ＳＭＡＤ７治療法に対する患者の潜在的応答性を示す。例えば、閾値ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαレベルと比べて上昇した患者ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαレベルは、患者が、抗ＳＭＡＤ７治療法に対して応答性であり得ることを示す。ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαの閾値レベルは、異なる判断基準を使用して確立することができる。一部の実施形態では、ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαの閾値レベルは、対照群における正常ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαレベル、例えば、ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαレベル中央値に関して決定される。対照群は、健康／正常対象（例えば、健康対照群）またはＩＢＤ患者群で構成され得る。
【００８０】
例えば、一部の実施形態では、ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦα閾値レベルは、正常レベルを少なくとも２倍、少なくとも３倍、少なくとも５倍、少なくとも８倍、少なくとも１０倍、少なくとも２０倍、少なくとも３０倍、少なくとも５０倍、少なくとも８０倍または少なくとも１００倍上回る。他の実施形態では、ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦα閾値レベルは、ＩＢＤ患者群におけるＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαレベル、例えば、ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαレベル中央値に関してＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαレベルの５０パーセンタイル、６０パーセンタイル、７０パーセンタイル、８０パーセンタイルまたは９０パーセンタイルにある。その上、一部の実施形態では、ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαの閾値レベルは、少なくとももしくは約１ｐｇ／ｍｌ、少なくとももしくは約２．５ｐｇ／ｍｌ、少なくとももしくは約５ｐｇ／ｍｌ、少なくとももしくは約７．５ｐｇ／ｍｌ、少なくとももしくは約１０ｐｇ／ｍｌ、少なくとももしくは約１２．５ｐｇ／ｍｌ、少なくとももしくは約１５ｐｇ／ｍｌ、少なくとももしくは約１７．５ｐｇ／ｍｌ、少なくとももしくは約２０ｐｇ／ｍｌ、少なくとももしくは約２５ｐｇ／ｍｌ、少なくとももしくは約３０ｐｇ／ｍｌ、少なくとももしくは約３５ｐｇ／ｍｌ、少なくとももしくは約４０．０ｍｇ／Ｌ、または少なくとももしくは約４５．０ｍｇ／Ｌ（例えば、血清中で測定した場合）である。
【００８１】
一部の実施形態では、対照群は、ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドの初期用量を受けている患者からなり得る。一部の実施形態では、正常ＣＣＬ２０、ＩＬ８もしくはＴＮＦαレベルまたはＣＣＬ２０、ＩＬ８もしくはＴＮＦα閾値レベルは、ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドの初期用量の投与前の患者において観察されるＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαベースラインレベルであり得る。ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαレベルはその後、患者へのＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドの初期用量またはその後の用量の投与に続いて、経時的に患者においてモニターすることができる。ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドの１または複数の投与後の患者におけるＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαレベルは、患者におけるＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαベースラインレベルと比較することができる。ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドの投薬レジメンは、患者におけるＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαレベルが、患者のＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαベースラインレベルと比べて増加するか、減少するか、一定を維持するかに応じて調整することができる。
【００８２】
抗ＳＭＡＤ７治療法
本開示は、一部には、ＳＭＡＤ７阻害剤を含む抗ＳＭＡＤ７治療法により、患者におけるＩＢＤを処置する方法を対象とする。ＳＭＡＤ７阻害剤は、ＳＭＡＤ７に結合する、それを分解する、または別段にＳＭＡＤ７安定性、生成または機能に干渉する、例えば、小結合分子、例えば、天然および合成化合物、抗体、アプタマー、イントラマー、ＲＮＡｉ（二本鎖ＲＮＡ、ｓｉＲＮＡ）ならびにＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドを含み得る。ＳＭＡＤ７阻害剤は、ＳＭＡＤ７活性、結合パートナーまたは基質に干渉し、それによってＳＭＡＤ７機能を阻害するトランケートされたおよび／または変異したＳＭＡＤ７分子も含み得る。
【００８３】
本開示は、一部には、ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドにより患者におけるＩＢＤを処置する方法も対象とする。アンチセンスオリゴヌクレオチドは、標的タンパク質（例えば、ＳＭＡＤ７）をコードするメッセンジャーＲＮＡ（ｍＲＮＡ）に相補的な短い合成オリゴヌクレオチド配列である。アンチセンスオリゴヌクレオチド配列は、ｍＲＮＡとハイブリダイズして、ＤＮＡ／ＲＮＡハイブリッド鎖を分解するＲＮａｓｅ  Ｈ等、遍在性（ubiquitary）触媒酵素の活性化をもたらし得る二本鎖ハイブリッドを産生し、これにより、タンパク質翻訳を防止する。
【００８４】
意図されるＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドは、ＳＭＡＤ７  ｍＲＮＡのいずれかの領域を標的とすることができる。ある特定の実施形態では、抗ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドは、ヒトＳＭＡＤ７  ｍＲＮＡ（例えば、配列番号１の；ＮＣＢＩ参照配列ＮＭ＿００５９０４．３）の部位４０３、２３３、２９４、２９５、２９６、２９８、２９９および／または５３３（すなわち、それぞれヌクレオチド４０３、２３３、２９４、２９５、２９６、２９８、２９９および５３３）を標的とすることができる。
【００８５】
ある特定の実施形態では、アンチセンスオリゴヌクレオチドは、次の抗ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチド５’−ＧＴＣＧＣＣＣＣＴＴＣＴＣＣＣＣＧＣＡＧＣ−３’（配列番号２）に由来し得る。
【００８６】
本明細書において、ＳＭＡＤ７を標的とするアンチセンスオリゴヌクレオチドが、ＣｐＧペアにおけるシトシン残基が５’−メチルシトシン（Ｍｅ−ｄＣと省略）で置き換えられた混合型骨格を含むことができることが意図される。メチルホスホネート結合は、アンチセンスオリゴヌクレオチドの５’および／または３’末端に置くこともできる（ＭｅＰと省略）。
【００８７】
ＳＭＡＤ７を標的とする例示的なアンチセンスオリゴヌクレオチド治療法として、以下が挙げられるがこれらに限定されない：
Ｘは、シトシンおよび５−メチルシトシンからなる群から選択される窒素含有（nitrogenous）塩基を含むヌクレオチドまたは２’−Ｏ−メチルシトシンヌクレオシドであり、Ｙは、グアニンおよび５−メチルグアニンからなる群から選択される窒素含有塩基を含むヌクレオチドまたは２’−Ｏ−メチルグアニンヌクレオシドであり、ただし、ヌクレオチドＸまたはＹの少なくとも一方が、メチル化窒素含有塩基を含む、５’−ＧＴＸＹＣＣＣＣＴＴＣＴＣＣＣＸＹＣＡＧ−３’（配列番号５）；
Ｘが５−メチル２’−デオキシシチジンである、５’−ＧＴＸＧＣＣＣＣＴＴＣＴＣＣＣＸＧＣＡＧ−３’（配列番号３）（例えば、それぞれ本明細書に参照により援用される米国特許第７，８０７，８１８号および同第６，１５９，６９７号を参照）；
Ｘが５−メチル２’−デオキシシチジンである、５’−ＧＴＸＧＣＣＣＣＴＴＣＴＣＣＣＸＧＣＡＧＣ−３’（配列番号４）；および
これらそれぞれ本明細書に参照により援用される、米国特許第８，６４８，１８６号および国際特許出願公開ＷＯ２０１０／０５４８２６に記載されているアンチセンスオリゴヌクレオチド。
【００８８】
意図されるアンチセンスオリゴヌクレオチドは、配列番号４：５’−ＧＴＣ＊ＧＣＣＣＣＴＴＣＴＣＣＣＣ＊ＧＣＡＧＣ−３’を含むアンチセンスオリゴヌクレオチドを含み、Ｃ＊は、５−メチル−２’−デオキシシチジンを表す。一部の実施形態では、意図されるアンチセンスオリゴヌクレオチドのヌクレオチド間結合の少なくとも１個が、Ｏ，Ｏ結合型ホスホロチオエートであり、例えば、配列番号４の２０個のヌクレオチド間結合のそれぞれが、Ｏ，Ｏ結合型ホスホロチオエートであり得る。特定の実施形態では、意図されるアンチセンスオリゴヌクレオチドは、配列番号４を含むアンチセンスオリゴヌクレオチドであり、２０個のヌクレオチド間結合のそれぞれが、Ｏ，Ｏ結合型ホスホロチオエート結合であり、本明細書において、「モンジャーセン」と称される。一部の実施形態では、本明細書に開示されている意図される組成物は、１〜２０個のＯ，Ｏ結合型ホスホロチオエートヌクレオチド間結合を任意選択で含むことができる、配列番号４のアンチセンスオリゴヌクレオチドの薬学的に許容される塩、例えば、ナトリウム塩を含むことができる。オリゴヌクレオチドの意図される塩は、例えば、各ホスホロチオエート結合がＮａ＋等のイオンと会合した、完全に中和された塩を含む。オリゴヌクレオチドは、天然起源の核酸塩基、糖および共有結合性ヌクレオチド間（骨格）結合、ならびに非天然起源の部分を含むことができる。異なる実施形態では、本明細書に記載されているアンチセンスオリゴヌクレオチド、例えば、配列番号２、配列番号３および配列番号４のアンチセンスオリゴヌクレオチドは、５−メチル−２’−デオキシシチジン５’−モノホスフェートおよび５−メチル−２’−デオキシシチジン５’−モノホスホロチオエートが挙げられるがこれらに限定されない、デオキシシチジンおよび／または５−メチル２’−デオキシシチジンを含むヌクレオチドを含むことができる。
【００８９】
意図されるＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドは、ＳＭＡＤ７に対して作用するオリゴヌクレオチドを含み、経口投与することができる。開示されている治療法は、ＩＢＤを患う対象に経口投与される場合、患者の腸管系に有効量のアンチセンスオリゴヌクレオチドを送達することができる、例えば、患者の終末回腸および／または右結腸に有効量のアンチセンスオリゴヌクレオチドを送達することができる。
【００９０】
本発明の一部の実施形態では、抗ＳＭＡＤ７治療（therapy）（すなわち、ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドを含む治療）は、アンチセンスオリゴヌクレオチドの経口送達に適することができ、組成物が、例えば、患者の終末回腸および右結腸にアンチセンス化合物を送達することができるような、例えば、腸溶コーティング、例えば、胃抵抗性コーティングを含む錠剤であり得る。例えば、かかる投与は、対象の腸管の罹患部分へ直接アンチセンス化合物を実質的に局所的適用する、局所的効果をもたらすことができる。かかる投与は、一部の実施形態では、アンチセンス化合物の望まれない全身吸収を実質的に回避することができる。
【００９１】
例えば、経口投与のための錠剤は、開示されているアンチセンス化合物および薬学的に許容される賦形剤を含む、顆粒を含むことができる（例えば、顆粒で少なくとも部分的に形成される）。かかる錠剤は、腸溶コーティングでコーティングすることができる。意図される錠剤は、フィラー、結合剤、崩壊剤および／または滑沢剤等、薬学的に許容される賦形剤ならびに着色料、遊離剤、コーティング剤、甘味料、ウィンターグリーン、オレンジ、キシリトール、ソルビトール、フルクトースおよびマルトデキストリン等の香味剤、および芳香剤、保存剤および／または抗酸化剤を含むことができる。
【００９２】
一部の実施形態では、意図される医薬品製剤は、意図されるアンチセンス化合物または薬学的に許容される塩および薬学的に許容されるフィラーを含む粒内相を含む。例えば、モンジャーセンおよびフィラーは、任意選択で他の賦形剤と共に一体にブレンドし、顆粒に成形することができる。一部の実施形態では、粒内相は、湿式造粒法を使用して形成することができ、例えば、ブレンドされたアンチセンス化合物およびフィラーに液体（例えば、水）を加え、次にこの組合せを乾燥、粉砕および／または篩にかけて、顆粒を産生する。当業者であれば、他のプロセスを使用して、粒内相を達成することができることを理解するであろう。
【００９３】
一部の実施形態では、意図される製剤は、粒外相を含み、これは、１種または複数種の薬学的に許容される賦形剤を含むことができ、粒内相とブレンドして、開示されている製剤を形成することができる。
【００９４】
抗ＳＭＡＤ７治療製剤は、フィラーを含む粒内相を含むことができる。例示的なフィラーとして、セルロース、ゼラチン、リン酸カルシウム、ラクトース、スクロース、グルコース、マンニトール、ソルビトール、微結晶性セルロース、ペクチン、ポリアクリレート、デキストロース、酢酸セルロース、ヒドロキシプロピルメチルセルロース、部分的アルファ化デンプン、炭酸カルシウムおよびこれらの組合せを含むものなどが挙げられるがこれらに限定されない。
【００９５】
一部の実施形態では、抗ＳＭＡＤ７治療製剤は、医薬品製剤の成分を一体に保持するために一般に機能し得る結合剤を含む、粒内相および／または粒外相を含むことができる。例示的な結合剤として、次のものが挙げられるがこれらに限定されない：デンプン、糖、セルロースまたはヒドロキシプロピルセルロース等の修飾セルロース、ラクトース、アルファ化トウモロコシデンプン、ポリビニルピロリドン、ヒドロキシプロピルセルロース、ヒドロキシプロピルメチルセルロース、低置換度ヒドロキシプロピルセルロース、カルボキシルメチルセルロースナトリウム、メチルセルロース、エチルセルロース、糖アルコールおよびこれらの組合せを含むものなど。
【００９６】
例えば、粒内相および／または粒外相を含む、意図される抗ＳＭＡＤ７治療製剤は、デンプン、セルロース、架橋ポリビニルピロリドン、デンプングリコール酸ナトリウム、カルボキシルメチルセルロースナトリウム、アルギネート、コーンスターチ、クロスカルメロース（crosmellose）ナトリウム、架橋カルボキシメチルセルロース、低置換度ヒドロキシプロピルセルロース、アラビアゴムおよびこれらの組合せを含むもの等が挙げられるがこれらに限定されない、崩壊剤を含むことができる。例えば、粒内相および／または粒外相は、崩壊剤を含むことができる。
【００９７】
一部の実施形態では、意図される抗ＳＭＡＤ７治療製剤は、開示されているアンチセンス化合物、ならびにマンニトール、微結晶性セルロース、ヒドロキシプロピルメチルセルロースおよびデンプングリコール酸ナトリウムまたはこれらの組合せから選択される賦形剤を含む粒内相と、微結晶性セルロース、デンプングリコール酸ナトリウムおよびステアリン酸マグネシウムまたはこれらの混合物のうち１種または複数種を含む粒外相とを含む。
【００９８】
一部の実施形態では、意図される抗ＳＭＡＤ７治療製剤は、滑沢剤を含むことができ、例えば、粒外相は、滑沢剤を含有することができる。滑沢剤として、タルク、シリカ、脂肪、ステアリン、ステアリン酸マグネシウム、リン酸カルシウム、二酸化ケイ素（silicone  dioxide）、ケイ酸カルシウム、リン酸カルシウム、コロイド状二酸化ケイ素、ステアリン酸金属塩、水素化植物油、コーンスターチ、安息香酸ナトリウム、ポリエチレングリコール、酢酸ナトリウム、ステアリン酸カルシウム、ラウリル硫酸ナトリウム、塩化ナトリウム、ラウリル硫酸マグネシウム、タルクおよびステアリン酸が挙げられるがこれらに限定されない。
【００９９】
一部の実施形態では、医薬品製剤は、腸溶コーティングを含む。一般に、腸溶コーティングは、消化管に沿って薬物が吸収される位置を制御する、経口薬物適用のための障壁を作製する。腸溶コーティングは、ｐＨに応じて異なる速度で崩壊するポリマーを含むことができる。腸溶コーティングは、例えば、酢酸フタル酸セルロース、メチルアクリレート−メタクリル酸コポリマー、酢酸コハク酸セルロース、フタル酸ヒドロキシルプロピルメチルセルロース、メタクリル酸メチル−メタクリル酸コポリマー、エチルアクリレート−メタクリル酸コポリマー、メタクリル酸コポリマーＣ型、ポリ酢酸ビニルフタレートおよび酢酸フタル酸セルロースを含むことができる。
【０１００】
一部の実施形態では、腸溶コーティングは、メタクリル酸、メタクリル酸／アクリル酸エステルまたはこれらの誘導体に基づくアニオン性、カチオン性または中性コポリマーを含む。一部の実施形態では、腸溶コーティングは、エチルアクリレート−メタクリル酸コポリマーを含む。市販の腸溶コーティングは、Ｏｐａｄｒｙ（登録商標）ＡＭＢ、Ａｃｒｙｌ−ＥＺＥ（登録商標）、Ｅｕｄｒａｇｉｔ（登録商標）グレードを含む。一部の実施形態では、腸溶コーティングは、意図される錠剤の重量で約５％〜約１０％、約５％〜約２０％、約８〜約１５％、約８％〜約１８％、約１０％〜約１２％または約１２％〜約１６％を構成する。
【０１０１】
例えば、重量で約０．５％〜約７０％、例えば、約０．５％〜約１０％または約１％〜約２０％のアンチセンスオリゴヌクレオチドまたはその薬学的に許容される塩（例えば、モンジャーセン）を含むまたはこれから本質的になる、抗ＳＭＡＤ７治療法（therapy）が、錠剤の形態で提供される。かかる錠剤は、例えば、重量で約０．５％〜約６０％のマンニトール、例えば、重量で約３０％〜約５０％マンニトール、例えば、重量で約４０％マンニトール；および／または重量で約２０％〜約４０％の微結晶性セルロースもしくは重量で約１０％〜約３０％の微結晶性セルロースを含むことができる。例えば、意図される錠剤は、重量で約３０％〜約６０％、例えば、約４５％〜約６５％あるいは重量で約５〜約１０％モンジャーセン、重量で約３０％〜約５０％あるいは約５％〜約１５％マンニトール、約５％〜約１５％微結晶性セルロース、約０％〜約４％または約１％〜約７％ヒドロキシプロピルメチルセルロースおよび重量で約０％〜約４％、例えば、約２％〜約４％デンプングリコール酸ナトリウムを含む粒内相を含むことができる。
【０１０２】
例示的な抗ＳＭＡＤ７治療製剤は、約１０ｍｇ〜約５００ｍｇのモンジャーセンを含むまたはこれから本質的になる剤形を含み、例えば、約１０ｍｇ、約１５ｍｇ、約２０ｍｇ、約２５ｍｇ、約３０ｍｇ、約３５ｍｇ、約４０ｍｇ、約５０ｍｇ、約６０ｍｇ、約７０ｍｇ、約８０ｍｇ、約９０ｍｇ、約１００ｍｇ、約１５０ｍｇ、約２００ｍｇまたは約２５０ｍｇのモンジャーセンを含む錠剤が、本明細書において意図されている。一実施形態では、抗ＳＭＡＤ７治療法は、重量で約０．５％〜約１０％の配列番号４によって表されるアンチセンスオリゴヌクレオチドまたはその薬学的に許容される塩；重量で約３０％〜約５０％マンニトール；および重量で約１０％〜約３０％微結晶性セルロースを含む経口使用のための錠剤であり得る。
【０１０３】
本発明の例示的な実施形態では、重量で約５０％モンジャーセン（またはその塩）、重量で約１１．５％マンニトール、重量で約１０％微結晶性セルロース、重量で約３％ヒドロキシプロピルメチルセルロースおよび重量で約２．５％デンプングリコール酸ナトリウムを含むことができる粒内相と；重量で約２０％微結晶性セルロース、重量で約２．５％デンプングリコール酸ナトリウムおよび重量で約０．５％ステアリン酸マグネシウムを含むことができる粒外相とを含む、経口投与のための薬学的に許容される錠剤が提供される。錠剤は、腸溶コーティングを含むこともできる。
【０１０４】
別の例示的な実施形態では、重量で約５％〜約１０％、例えば、約８％モンジャーセン（例えば、ヌクレオシド間結合がそれぞれＯ，Ｏ結合型ホスホロチオエート（phophorothioate）である、および／またはその塩、例えば、ナトリウム塩）、重量で約４０％マン
ニトール、重量で約８％微結晶性セルロース、重量で約５％ヒドロキシプロピルメチルセルロースおよび重量で約２％デンプングリコール酸ナトリウムを含むまたはこれから本質的になることができる粒内相と；重量で約１７％微結晶性セルロース、重量で約２％デンプングリコール酸ナトリウムおよび重量で約０．４％ステアリン酸マグネシウムを含むことができる粒外相とを含むまたはこれから本質的になる、経口投与のための薬学的に許容される錠剤が提供される。
【０１０５】
意図される錠剤は、腸溶コーティングを含むこともでき、例えば、開示されている錠剤は、重量で約１３％、約１４％、約１５％、約１６％、または約１７％の腸溶コーティング、例えば、エチルアクリレート−メタクリル酸コポリマー（例えば、ＡｃｒｙｌＥＺＥ（登録商標））を含むことができる。
【０１０６】
例えば、抗ＳＭＡＤ７治療法は、粒内相および粒外相を含む、経口使用のための薬学的に許容される錠剤の形態であり得、例えば、粒内相は、重量で約５％〜約１０％（例えば、重量で約８％）の配列番号４によって表されるアンチセンスオリゴヌクレオチドまたはその薬学的に許容される塩、重量で約４０％マンニトール、重量で約８％微結晶性セルロース、重量で約５％ヒドロキシプロピルメチルセルロースおよび重量で約２％デンプングリコール酸ナトリウムを含み、例えば、粒外相は、重量で約１７％微結晶性セルロース、重量で約２％デンプングリコール酸ナトリウムおよび重量で約０．４％ステアリン酸マグネシウムを含み、錠剤は、腸溶コーティングをさらに含むことができる。
【０１０７】
意図される製剤、例えば、錠剤は、一部の実施形態では、患者に経口投与される場合、患者におけるオリゴヌクレオチドの最小血漿濃度をもたらすことができる。別の実施形態では、意図される製剤は、患者に経口投与される場合、患者の終末回腸および／または右結腸、例えば、患者の罹患または疾患腸部位に局所的に送達される。
【０１０８】
炎症性腸疾患
本明細書に記載されている発明は、ＩＢＤを処置および管理するのに有用な方法を提供する。「炎症性腸疾患」または「ＩＢＤ」は、本明細書において使用される場合、クローン病（ＣＤ）、胃十二指腸クローン病、クローン（肉芽腫性）大腸炎、潰瘍性大腸炎（ＵＣ）、コラーゲン大腸炎、リンパ球性大腸炎、虚血性大腸炎、空置大腸炎、ベーチェット病、顕微鏡的大腸炎、潰瘍性直腸炎、直腸Ｓ状結腸炎、空回腸炎、左側大腸炎、汎大腸炎、回結腸炎、回腸炎および不確定大腸炎を含むいくつかの慢性炎症性疾患を指し得る。ＣＤおよびＵＣは、ＩＢＤの２種の最も一般的な形態である。ＩＢＤは、消化器系の自己免疫性疾患である。ＣＤは、終末回腸を含む胃腸管のいずれかの部分に局在化し得、胃腸管のあらゆる細胞型に影響し得る。ＵＣは、結腸および直腸に局在化し、粘膜の細胞のみに影響する。
【０１０９】
環境および遺伝因子の両方が、かかる因子の同一性は十分には定義されていないが、ＩＢＤにおける役割を果たすと考えられる。環境コンポネントは、経口摂取された食物および薬物への曝露によって影響される腸の菌叢の変更を含むことができる。
【０１１０】
ＩＢＤは、腹痛、嘔吐、下痢、直腸出血、重度痙攣、筋攣縮、体重減少、栄養不良、発熱、貧血、皮膚病変、関節痛、眼の炎症、肝臓障害、関節炎、壊疽性膿皮症、原発性硬化性胆管炎および非甲状腺性疾病症候群を含む症状を伴う。ＵＣを患う小児は、成長不全を患い得る。
【０１１１】
ＣＤの形態は、活動性ＣＤを含むＣＤのステロイド依存性およびステロイド抵抗性形態を含む。ＣＤのステロイド依存性形態を患うＩＢＤの患者は、ステロイド療法による処置に対して応答性であるが、ＣＤに関連する症状の発生率の増加を被ることなくステロイド療法を終了または短縮できない。ＣＤのステロイド抵抗性形態を患うＩＢＤの患者は、ステロイド療法による処置に対して応答性ではない。ＩＢＤの患者に一般的に処方および／または投与されるステロイド治療薬は、コルチコステロイド、例えば、プレドニゾン、デキサメタゾン、ヒドロコルチゾン、メチルプレドニゾロン、プレドニゾンおよびブデソニドを含む。活動性ＣＤを患うヒト患者は、ＣＤの症状、例えば、血便、体重減少および／または腹部痙攣が挙げられるがこれらに限定されない症状を活動的に患う患者である。
【０１１２】
処置および管理
本明細書に記載されている通り、「患者」は、哺乳動物、霊長類およびヒトが挙げられるがこれらに限定されない、ＩＢＤを患うまたはこれであると診断されたいずれかの動物を指す。ある特定の実施形態では、対象は、例えば、ネコ、イヌまたはウマ等、非ヒト哺乳動物であり得る。好ましい実施形態では、対象は、ヒト対象である。
【０１１３】
「ＩＢＤの患者」は、本明細書において使用する場合、ＩＢＤの症状もしくは徴候のいずれかを患う患者、ＩＢＤの症状もしくは徴候のいずれかを患い得る患者、またはＩＢＤを処置するためもしくは管理するための本発明の方法の利益を得ることができるいずれかの患者を指す。必要としている患者は、過去にＩＢＤを患ったことがある患者、またはＩＢＤを以前に処置されたことがある患者を含むことができる。ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαの発現のレベル増加を伴うＩＢＤを患う個体が、特に関連性がある。一部の実施形態では、ＩＢＤの患者は、クローン病（ＣＤ）患者である。一部の実施形態では、ＩＢＤの患者は、潰瘍性大腸炎（ＵＣ）患者である。
【０１１４】
用語「処置する」、「処置」、「処置している」などは、所望の薬理学的および／または生理学的効果を得ることを一般に意味するように本明細書において使用される。効果は、疾患および／または疾患に起因する有害効果の部分的もしくは完全な治癒の観点から治療的であり得る。用語「処置」は、本明細書において使用する場合、哺乳動物、特に、ヒトにおける疾患のいずれかの処置を網羅し、（ａ）疾患の阻害、すなわち、疾患が重症度もしくは範囲を増加させることの防止、（ｂ）疾患の軽減、すなわち、疾患の部分的もしくは完全緩解を引き起こすこと、または（ｃ）疾患の再発の防止、すなわち、疾患の症状の以前の処置成功もしくは疾患の処置後に疾患が活動性状態に戻ることの防止を含む。
【０１１５】
用語「管理する」、「管理」、「管理している」などは、疾患の症状の重症度もしくは徴候の制御または疾患を処置する手段を一般に意味するように本明細書において使用される。一般に、管理は、所望の薬理学的および／または生理学的効果を得るために使用される。効果は、疾患および／または疾患に起因する有害効果の部分的または完全治癒、または疾患の特定の症状もしくは徴候が、患者において起こらないもしくは再び起こらないまたは患者において望ましくないもしくは耐えられないレベルまで上がらないことの保証の観点から治療的であり得る。用語「管理」は、本明細書において使用される場合、哺乳動物、特に、ヒトにおける疾患のいずれかの管理を網羅し、（ａ）疾患の阻害、すなわち、疾患が重症度もしくは範囲を増加させることの防止、（ｂ）疾患の軽減、すなわち、疾患の部分的もしくは完全緩解を引き起こすこと、または（ｃ）疾患の再発の防止、すなわち、疾患の症状の以前の処置成功もしくは疾患の処置後に疾患が活動性状態に戻ることの防止を含む。「管理」は、本明細書において使用される場合、疾患に特異的な処置、例えば、ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドの投与を参照して使用することもできる。
【０１１６】
本発明の一部の実施形態では、ＩＢＤを有する患者は、抗ＳＭＡＤ７治療法、例えば、ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドの初期用量を投与される。本明細書において使用される場合「初期用量」は、一連の用量におけるＩＢＤ患者に投与される抗ＳＭＡＤ７治療法の用量を指す。一連の用量は、１または複数の用量を含むことができる。例えば、一連の用量は、抗ＳＭＡＤ７治療法の単一用量または抗ＳＭＡＤ７治療法の単一を超える用量を含むことができる。初期用量は、患者に投与されるいかなる後の用量にも先立って、患者に投与される抗ＳＭＡＤ７治療法の用量であり得る。例えば、初期用量は、処置ナイーブ患者に投与される抗ＳＭＡＤ７治療法の第１の用量であり得るがこれに限定されない。初期用量は、例えば、抗ＳＭＡＤ７治療法の任意の処置サイクルにおける第１の用量でもあり得る。初期用量は、第１の処置サイクル、第２の処置サイクル、または任意のその後の処置サイクルの第１の用量であり得る。あるいは、「初期用量」は、患者におけるＣＣＬ２０、ＩＬ８、またはＴＮＦαおよび／または別のバイオマーカー（単数または複数）のレベルの解析後に患者に投与される第１の用量であり得る、あるいは患者におけるＣＣＬ２０、ＩＬ８、またはＴＮＦαおよび／または別のバイオマーカー（単数または複数）のレベルの決定前の直近に投与された用量であり得る。
【０１１７】
本発明の一部の実施形態では、ＩＢＤを有する患者は、抗ＳＭＡＤ７治療法、例えば、ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドのその後の用量を投与される。本明細書において使用される場合、「その後の用量」は、前の用量、例えば、初期用量の投与後に、ＩＢＤを有する患者に投与される抗ＳＭＡＤ７治療法の用量を指す。よって、その後の用量は、２またはそれを超える用量を含む一連の用量においてＩＢＤを有する患者に投与することができる。さらに、一部の事例では、その後の用量が、前の用量より多くなる、それと等しくなるまたはそれより少なくなるように、その後の用量の量は、初期用量または前の用量に関して較正することができる。その後の用量の量の較正は、ＩＢＤを有する患者におけるＣＣＬ２０、ＩＬ８、もしくはＴＮＦαおよび／または別のバイオマーカー（単数または複数）のレベルまたはレベル変化、例えば：前の用量、例えば、初期用量の前もしくは後に解析されるＩＢＤを有する患者におけるＣＣＬ２０、ＩＬ８、もしくはＴＮＦαのレベル；または前の用量、例えば、初期用量の前および後のＩＢＤを有する患者におけるＣＣＬ２０、ＩＬ８、もしくはＴＮＦαのレベルの変化に基づくことができる。その後の用量は、ＩＢＤを有する患者に投与される抗ＳＭＡＤ７治療法の第１の用量、例えば、初期用量の後にＩＢＤを有する患者に投与される用量であり得る。その後の用量は、ＩＢＤを有する患者に投与される抗ＳＭＡＤ７治療法の前の用量の後に投与される用量、例えば、同じ処置ラウンドまたは異なる処置ラウンド、例えば、以前の処置ラウンドにおける前の用量の後に投与される用量でもあり得る。その後の用量は、いずれかの前の用量、例えば、その後の用量に直接先行する前の用量またはその後の用量の投与に先立ち投与される１もしくは複数の用量が続く前の用量に関して、その後の用量であり得る。
【０１１８】
本明細書において使用される場合、「クローン病活動性指数」または「ＣＤＡＩ」は、Bestら、GASTROENTEROLOGY、７０巻：４３９〜４４頁（１９７６年）によって記載される通り、ＣＤを患う患者の進行の査定に使用される測定値または指数を指す。１５０またはそれを下回るＣＤＡＩスコアは一般に、非活動性疾患に関連し、より高いスコアよりも優れた予後を示す。１５０を上回る値は一般に、活動性疾患に関連し、４５０を上回る値は、極めて重度の疾患に関連する。ＣＤＡＩスコアは、どの程度十分に患者が治療法に応答しているかの決定に使用することができ、寛解にある患者の同定に使用することができる。ある特定の実施形態では、ベンチマーク臨床応答は、対象が、少なくとも１００ポイントのＣＤＡＩスコアの減少を示すことを意味する。臨床治験において、１５０またはそれを下回るＣＤＡＩスコアは一般に、寛解に関連する。
【０１１９】
本明細書において使用される場合、「潰瘍性大腸炎疾患活動性指数」または「ＵＣＤＡＩ」は、Sutherlandら、Gastroenterology、９２巻：１８９４〜９８頁（１９８７年）によって記載されている通り、ＵＣを患う患者の進行の査定に使用される測定値または指数を指す。ＵＣＤＡＩは、排便回数、直腸出血、結腸内層の外観および疾患活動性に関する医師の評点を含むＵＣの症状に関する一連の修飾子である。これらの修飾子のそれぞれは、０〜３の数を付与され、３が最高疾患活動性である。臨床治験において、寛解は多くの場合、１またはそれに満たないＵＣＤＡＩスコアとして定義され、改善は、治験の初めにおけるスコアからの３またはそれを超えるポイントの低下である。ＵＣＤＡＩは、どの程度十分に患者が治療法に応答しているか決定するために臨床治験において使用することができ、寛解にある患者を同定するために使用することができる。ＵＣ患者における疾患重症度を測定するために他の一般的に使用される指数は、ＴｒｕｅｌｏｖｅおよびＷｉｔｔｓ指数、Ｓｔ．Ｍａｒｋの指数、単純臨床大腸炎活動性指数（Simple  Clinical  Colitis  Activity  Index）（ＳＣＣＡＩ）、Ｌｉｃｈｔｉｇｅｒ指数、潰瘍性大腸炎症状スコア（ＵＣＳＳ）およびＭａｙｏ  Ｃｌｉｎｉｃスコアを含む。
【０１２０】
本明細書において使用される場合、「寛解」または「臨床寛解」は、ＩＢＤの臨床徴候（単数または複数）または症状の低下（部分的または完全な）を指す。例えば、臨床寛解は、ＩＢＤに関連する症状、例えば、血便、体重減少もしくは組織炎症の重症度の緩和、または患者からのＩＢＤの症状の完全消失を含むことができる。本発明の実施形態では、臨床寛解は、ＣＤＡＩスコアの変化または測定値によって示され得る。例えば、約１５０未満、約１５５未満、約１６０未満、約１６５未満、約１７０未満または約１７５未満のＣＤＡＩスコアは、臨床寛解を示すことができる。臨床寛解は、ＩＢＤを有する患者へのＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドの投与後に観察することができる。臨床寛解は、ＣＤＡＩスコア等、疾患活動性指数スコアに寄与する因子を測定することにより、または客観的因子、例えば、患者由来の試料における分析物のレベルが挙げられるがこれに限定されない客観的因子の測定値により観察することができる。さらに、本発明の一部の実施形態では、臨床寛解は、投与ステップ後に観察されるおよび初期観察に続く期間に維持されるの両方である。例えば、一部の実施形態では、臨床寛解は、ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドの投与から約１週間、約２週間または約３週間後に観察され、臨床寛解の初期観察に続く少なくとも１週間、少なくとも２週間、少なくとも３週間、少なくとも４週間、少なくとも６週間または少なくとも８週間の期間維持される。
【０１２１】
本明細書において使用される場合、「ＳＭＡＤ７」（ＣＲＣＳ３、ＦＬＪ１６４８２、ＭＡＤＨ７、ＭＡＤＨ８、ＭＡＤ（マザーズ・アゲンスト・デカペンタプレジック（mothers  against  decapentaplegic）、Ｄｒｏｓｏｐｈｉｌａ）ホモログ７、ＭＡＤホモログ８、ＳＭＡＤ、マザーズ・アゲンストＤＰＰホモログ７、マザーズ・アゲンストＤＰＰホモログ８としても公知）は、Ｅｎｔｒｅｚ  ＧｅｎｅＩＤ  Ｎｏ．４０９２によって同定される遺伝子およびそのアレルバリアントによってコードされるヒトタンパク質またはｍＲＮＡ転写物のうちのいずれかを意味する。
【０１２２】
本明細書において使用される場合、「ＩＬ８」（インターロイキン−８（ＩＬ−８）；腫瘍壊死因子誘導性遺伝子１；ＮＡＦ；顆粒球走化性タンパク質１（ＧＣＰ１）；ＬＥＣＴ；ＬＵＣＴ；タンパク質３−１０Ｃ；ベータ−トロンボグロブリン様タンパク質；好中球活性化ペプチド１；好中球活性化タンパク質１（ＮＡＰ１；ＮＡＰ−１）；エモクタキン（Emoctakin）；ＧＣＰ−１；ＬＹＮＡＰ；リンパ球由来好中球活性化ペプチド；肺巨細胞癌由来走化性タンパク質；小型の誘導性サイトカインサブファミリーＢ、メンバー８；ベータ内皮細胞由来好中球活性化ペプチド；単球由来好中球走化性因子（ＭＤＮＣＦ）；単球由来好中球活性化ペプチド（ＭＯＮＡＰ）；肺胞マクロファージ走化性因子Ｉ；Ｃ−Ｘ−Ｃモチーフケモカイン８；およびケモカイン（Ｃ−Ｘ−Ｃモチーフ）リガンド８（ＣＸＣＬ８）としても公知）は、Ｅｎｔｒｅｚ  ＧｅｎｅＩＤ  Ｎｏ．３５７６によって同定される遺伝子およびそのアレルバリアントによってコードされるヒトタンパク質またはｍＲＮＡ転写物のうちのいずれかを意味する。
【０１２３】
本明細書において使用される場合、「ＣＲＰ」（Ｃ反応性タンパク質、ペントラキシン関連；ペントラキシン；およびＰＴＸ１としても公知）は、Ｅｎｔｒｅｚ  ＧｅｎｅＩＤ  Ｎｏ．１４０１によって同定される遺伝子およびそのアレルバリアントによってコードされるヒトタンパク質またはｍＲＮＡ転写物のうちのいずれかを意味する。
【０１２４】
本明細書において使用される場合、「ＴＮＦα」（腫瘍壊死因子、ＤＩＦ、腫瘍壊死因子リガンドスーパーファミリーメンバー２（ＴＮＦＳＦ２）、ＡＰＣ１タンパク質、カケクチン、腫瘍壊死因子Ａ（ＴＮＦＡ）、腫瘍壊死因子−ａ（ＴＮＦ−ａ）および腫瘍壊死因子−アルファ（ＴＮＦ−アルファ）としても公知）は、Ｅｎｔｒｅｚ  ＧｅｎｅＩＤ  Ｎｏ．７１２４によって同定される遺伝子およびそのアレルバリアントによってコードされるヒトタンパク質またはｍＲＮＡ転写物のうちのいずれかを意味する。
【０１２５】
本明細書で使用される場合、「ＣＣＬ２０」（ケモカイン（Ｃ−Ｃモチーフ）リガンド２０；ＣＫｂ４；ＬＡＲＣ；ＳＴ３８；ＭＩＰ３Ａ；Ｅｘｏｄｕｓ；マクロファージ炎症性タンパク質３アルファ（ＭＩＰ−３ａ、ＭＩＰ−３−アルファ）；ＳＣＹＡ２０；小型の誘導性サイトカインサブファミリーＡ（Ｃｙｓ−Ｃｙｓ）、メンバー２０；肝臓および活性化調節ケモカイン；小型の誘導性サイトカインＡ２０；ＣＣケモカインＬＡＲＣ；ＳＴ３８；ベータケモカインＥｘｏｄｕｓ−１；およびＣ−Ｃモチーフケモカイン２０としても公知）は、Ｅｎｔｒｅｚ  ＧｅｎｅＩＤ  Ｎｏ．６３６４によって同定される遺伝子およびそのアレルバリアントによってコードされるヒトタンパク質、またはｍＲＮＡ転写物のうちのいずれかを意味する。
【０１２６】
処置をモニターする方法
一部の実施形態では、本明細書に記載されている方法は、ＩＢＤを有する患者の処置、疾患状態または疾患状態に関連するバイオマーカーのモニタリングを必要とする。処置のモニタリングは、処置有効性および安全性の査定、ならびに処置をモジュレートする必要の評価の観点から有用であり得る。処置のモニタリングは、患者に投与されているまたは患者に投与することになるＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドの量を増加させるべきか減少させるべきかに関する評価にも有用であり得る。さらに、処置のモニタリングは、ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドの用量をモジュレートするべき、すなわち、増加または減少させるべき量または相対量の決定の観点から有用であり得る。
【０１２７】
モニタリング、例えば、ＩＢＤを有する患者におけるＣＣＬ２０、ＩＬ８、もしくはＴＮＦαのレベルのモニタリングは、ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドの初期用量の前に、その最中にまたはその後に開始することができる。さらに、モニタリングは、初期用量の後に続けることができる。例えば、モニタリングは、初期用量の投与後に行うことができる。モニタリングは、ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドのその後の用量の前に、その最中にまたはその後に行うこともできる。例えば、ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドの各用量が患者に投与された後に、ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドの各用量が患者に投与される前に、またはＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドの各用量が患者に投与される前および後に、規則的な間隔でモニタリングを行うことができるように、モニタリングは、連続的であっても不連続的であってもよい。モニタリングは、一日に複数回（例えば、一日に２回、３回、４回、約５回または約１０回）、１日に１回、一週間に複数回（例えば、一週間に２回、３回、４回、約５回または約１０回）、１週間に１回、一カ月に複数回（例えば、一カ月に２回、３回、４回、約５回または約１０回）または１カ月に１回行うことができる。本発明の方法において、モニタリングは、投与ステップと比べた様々な時間で行うことができる。例えば、一部の実施形態では、モニタリングは、投与ステップの直後に、または少なくとも１日、少なくとも３日、少なくとも５日、少なくとも１週間、少なくとも２週間、少なくとも３週間、少なくとも１カ月、少なくとも２カ月、少なくとも４カ月もしくは少なくとも６カ月後に行うことができる。一部の実施形態では、モニタリングは、投与ステップから約１５日または約２８日間後に行われる。
【０１２８】
上述の通り、本発明は、一部には、ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαのレベルを使用して、ＩＢＤを有する患者におけるＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドによる管理および処置を評価および修飾することができるという発見に基づく。よって、本発明の実施形態では、ＩＢＤを有する患者または患者由来の試料におけるＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαのレベルを理解、決定、解析または比較することが有用である。例えば、一部の事例では、ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドのレベルを増加させるべきか、減少させるべきか、動かさずにおくべきか決定するために、ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαの正常または異常レベルの閾値を理解することが有用である。本明細書に記載されている方法では、ＣＣＬ２０の正常レベルは、特異的な値、例えば、０．０１ｐｇ／ｍｌ、約０．１ｐｇ／ｍｌ、約１ｐｇ／ｍｌ、約２ｐｇ／ｍｌ、約３ｐｇ／ｍｌ、約４ｐｇ／ｍｌ、約５ｐｇ／ｍｌ、約６ｐｇ／ｍｌ、約７ｐｇ／ｍｌ、約８ｐｇ／ｍｌ、約９ｐｇ／ｍｌ、約１０ｐｇ／ｍｌ、約１１ｐｇ／ｍｌ、約１２ｐｇ／ｍｌ、約１３ｐｇ／ｍｌ、約１４ｐｇ／ｍｌ、約１５ｐｇ／ｍｌ、約１７．５ｐｇ／ｍｌ、約２０ｐｇ／ｍｌ、約２２．５ｐｇ／ｍｌ、約２５ｐｇ／ｍｌ、約３０ｐｇ／ｍｌ、または約３５ｐｇ／ｍｌの値に関係づけることができる。本明細書に記載されている方法では、ＩＬ８の正常レベルは、特異的な値、例えば、約１０ｐｇ／ｍｌ、約１２．５ｐｇ／ｍｌ、約１５ｐｇ／ｍｌ、約１６ｐｇ／ｍｌ、約１７ｐｇ／ｍｌまたは約１８ｐｇ／ｍｌ、約１９ｐｇ／ｍｌ、約２０ｐｇ／ｍｌ、または約２５ｐｇ／ｍｌの値に関係づけることができる。本明細書に記載されている方法では、ＴＮＦαの正常レベルは、特異的な値、例えば、約１０ｐｇ／ｍｌ、約１２．５ｐｇ／ｍｌ、約１５ｐｇ／ｍｌ、約１６ｐｇ／ｍｌ、約１７ｐｇ／ｍｌまたは約１８ｐｇ／ｍｌ、約１９ｐｇ／ｍｌ、約２０ｐｇ／ｍｌ、または約２５ｐｇ／ｍｌの値に関係づけることができる。一部の実施形態では、ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαの正常レベルは、様々な因子、例えば、年齢、性別、民族起源、喫煙習慣、食習慣、ボディマスインデックス（ＢＭＩ）および／または運動習慣に関して患者とマッチした健康対照群におけるＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαのレベル中央値との比較により決定することができる。
【０１２９】
ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαおよび／または他の分析物のレベルは、患者から試料を得ることにより決定することができる。本明細書に記載されている方法において、試料は、組織試料（例えば、胃腸組織試料）または体液試料（例えば、唾液試料、糞便または尿試料）であり得る。試料は、患者組織生検、例えば、粘膜組織生検、例えば、腸粘膜組織生検から得られる試料であり得る。さらに、試料は、血液、血清または血漿試料であり得る。対象由来の血液試料は、当技術分野で周知の技法を使用して得ることができる。血液試料は、末梢血単核球（ＰＭＢＣ）、ＲＢＣ枯渇全血または血清を含むことができる。ＰＢＭＣは、異なる密度勾配（例えば、フィコール密度勾配）遠心分離手順を使用して全血試料から分離することができる。例えば、全血（例えば、抗凝固剤処置した全血）を分離媒上に重層し、遠心分離する。遠心分離ステップの終わりに、次の層が上から下に視覚的に観察される：血漿／血小板、ＰＢＭＣ、分離媒および赤血球／顆粒球。
【０１３０】
処置をモニターする方法は、他の分析物（例えば、ＣＣＬ２０、ＩＬ８、ＣＲＰ、ＴＮＦα）のレベル、ＣＤＡＩスコア、臨床寛解およびＩＢＤ症状の存在または重症度が挙げられるがこれらに限定されない、他の因子をモニターする方法を含むこともできる。
【０１３１】
本発明の実施形態では、分析物（例えば、ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦα）のレベルが測定される場合、様々な方法を使用して、分析物を測定することができる。例えば、分析物、例えば、ＣＣＬ２０、ＩＬ８、ＴＮＦαまたはＣＲＰのレベルは、免疫化学および／またはヌクレオチド解析によって決定することができる。免疫化学によって分析物濃度を決定する方法として、ウエスタンブロッティング、ＥＬＩＳＡおよび免疫染色方法が挙げられるがこれらに限定されない。一部の実施形態では、免疫化学によって分析物濃度を決定する方法は、目的の分析物に結合することができる抗体、例えば、抗ＣＣＬ２０抗体、抗ＩＬ８抗体または抗ＴＮＦα抗体を使用して行われる。免疫化学によって分析物濃度を決定する方法は、バッファー、ブロッキング試薬、コンジュゲートなし一次抗体、ならびに蛍光プローブまたは基質特異的酵素等、抗体検出を可能にするタグにコンジュゲートされた一次および／または二次抗体の使用を伴い得る。
【０１３２】
ヌクレオチド解析によって分析物濃度を決定する方法として、ノーザンブロッティングおよびポリメラーゼ連鎖反応方法、例えば、定量的ポリメラーゼ連鎖反応方法等、分析物ｍＲＮＡ転写物レベルを解析する方法が挙げられるがこれらに限定されない。ヌクレオチド解析は、分析物ヌクレオチド配列（例えば、ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαのヌクレオチド配列）に結合するオリゴヌクレオチドプローブ、またはポリメラーゼ連鎖反応、例えば、定量的ポリメラーゼ連鎖反応により分析物ヌクレオチド配列を増幅することができる一対のオリゴヌクレオチドプライマーを使用して行うことができる。オリゴヌクレオチドプローブおよびオリゴヌクレオチドプライマーは、例えば、蛍光タグ等、検出可能タグに連結することができる。ヌクレオチド解析による分析物濃度の決定において、従事者は、試料における特定の分析物のｍＲＮＡ転写物濃度を評価することができる。あるいは、ヌクレオチド解析による分析物濃度の決定において、従事者は、分析物ｍＲＮＡ転写物存在量の尺度に基づき分析物タンパク質濃度を推定するために、特定の分析物のｍＲＮＡ転写物存在量および特定の分析物のタンパク質存在量の間の相関を確立することができる。
【０１３３】
特許請求されている発明の方法は、ｉｎ  ｖｉｔｒｏで行うことができるステップを含む。例えば、対象におけるＣＣＬ２０、ＩＬ８もしくはＴＮＦαレベルを測定するステップ、試料におけるＣＣＬ２０、ＩＬ８もしくはＴＮＦαのレベルを決定するステップ、および／またはＣＤＡＩスコアを決定するもしくはＣＤＡＩスコアの決定に必要な測定を行うステップをｉｎ  ｖｉｔｒｏで行うことができることが考慮される。例えば、試料におけるＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαのレベルは、ｉｎ  ｖｉｔｒｏで試料において免疫化学またはヌクレオチド解析を行うことにより決定することができる。あるいは、本発明の一部の実施形態では、ＩＢＤを有する患者におけるＣＣＬ２０、ＩＬ８もしくはＴＮＦαレベルを決定および解析するステップ、試料におけるＣＣＬ２０、ＩＬ８もしくはＴＮＦαレベルを決定および解析するステップ、ならびに／またはＣＤＡＩスコアを決定するもしくはＣＤＡＩスコアの決定に必要な測定を行うステップは、ｉｎ  ｖｉｖｏで行うことができる。
【０１３４】
免疫化学に適した抗ＩＬ８抗体は、市販されており、Ａｂｃａｍ製ヤギ抗ヒトＩＬ８（カタログ番号ａｂ１０７６９）、Ｓａｎｔａ  Ｃｒｕｚ製マウス抗ヒトＩＬ８（カタログ番号ｓｃ−７３３２１、ｓｃ−５２８７０およびｓｃ−７３０２）、Ｐｉｅｒｃｅ製マウス抗ヒトＩＬ８（３ＩＬ８−Ｈ１０）（カタログ番号Ｍ８０１）およびＳｉｇｍａ−Ａｌｄｒｉｃｈ製マウス抗ヒトＩＬ８（カタログ番号ＷＨ０００３５７６Ｍ５）抗体が挙げられるがこれらに限定されない。
【０１３５】
免疫化学に適した抗ＴＮＦα抗体は、市販されており、Ａｂｃａｍ製ウサギ抗ヒトＴＮＦα（カタログ番号ａｂ９６３５）、Ｃｅｌｌ  Ｓｉｇｎａｌｉｎｇ  Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ製ウサギ抗ヒトＴＮＦα（カタログ番号３７０７）、ａｆｆｙｍｅｔｒｉｘ  ｅＢｉｏｓｃｉｅｎｃｅ製マウス抗ヒトＴＮＦα（カタログ番号１４−７３４８−８１）およびＲｏｃｋｌａｎｄ  Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ＆Ａｓｓａｙｓ製ウサギ抗ヒトＴＮＦα（カタログ番号２０９−４０１−３０６Ｓ）抗体が挙げられるがこれらに限定されない。
【０１３６】
免疫化学に適した抗ＣＲＰ抗体は、市販されており、例えば、Ｓａｎｔａ  Ｃｒｕｚ  Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ製ヤギ抗ヒトＣＲＰポリクローナル抗体（カタログ番号ｓｃ−１８３０４およびｓｃ−１８３０６）、Ｓａｎｔａ  Ｃｒｕｚ  Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ製ウサギ抗ヒトＣＲＰポリクローナル抗体（カタログ番号ｓｃ−３００４７）、Ｓａｎｔａ  Ｃｒｕｚ  Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ製マウス抗ヒトＣＲＰモノクローナル抗体（カタログ番号ｓｃ−７０８８３）、Ｓｉｇｍａ−Ａｌｄｒｉｃｈ製マウス抗ヒトＣＲＰモノクローナル抗体（カタログ番号Ｃ１６８８−．２ＭＬ）、ａｂｃａｍ製ウサギ抗ヒトモノクローナル抗体（カタログ番号ａｂ３２４１２）、ａｂｃａｍ製マウス抗ヒトＣＲＰモノクローナル抗体（カタログ番号ａｂ１３４２６）およびＴｈｅｒｍｏ  Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ製ヤギ抗ヒトＣＲＰポリクローナル抗体（カタログ番号Ｇ０３０１−１Ｂ）等が挙げられる。
【０１３７】
免疫化学に適した抗ＣＣＬ２０抗体は、市販されており、例えば、Ｒ＆Ｄ  Ｓｙｓｔｅｍｓ製マウス抗ヒトＣＣＬ２０モノクローナル抗体（カタログ番号ＭＡＢ３６０）、Ｓｉｇｍａ  Ａｌｄｒｉｃｈ製ヤギ抗ヒトＣＣＬ２０ポリクローナル抗体（カタログ番号ＳＡＢ２５０１８０４）、Ｏｒｉｇｅｎｅ製マウス抗ヒトＣＣＬ２０モノクローナル抗体（カタログ番号ＴＡ３１６５９７）、Ｏｒｉｇｅｎｅ製ヤギ抗ヒトＣＣＬ２０ポリクローナル抗体（カタログ番号ＴＡ３１６５９６）、Ａｂｎｏｖａ製ヤギ抗ヒトＣＣＬ２０ポリクローナル抗体（カタログ番号ＰＡＢ１７２６８）、Ａｂｎｏｖａ製ウサギ抗ヒトＣＣＬ２０ポリクローナル抗体（カタログ番号ＰＡＢ１６９２５）、Ａｂｎｏｖａ製マウス抗ヒトＣＣＬ２０モノクローナル抗体（カタログ番号ＭＡＢ１３１４）、Ｓａｎｔａ  Ｃｒｕｚ  Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ製ヤギ抗ヒトＣＣＬ２０ポリクローナル抗体（カタログ番号ｓｃ−９７７５）、およびＡｂｃａｍ製ウサギ抗ヒトＣＣＬ２０ポリクローナル抗体（カタログ番号ａｂ９８２９）である。
【０１３８】
酵素結合免疫吸着測定法
一部の実施形態では、ＣＣＬ２０、ＩＬ８もしくはＴＮＦαおよび／または他の分析物濃度は、酵素結合免疫吸着測定法（ＥＬＩＳＡ）によって決定することができる。具体的には、試料、特に、血液試料、例えば、血清試料におけるＣＣＬ２０、ＩＬ８もしくはＴＮＦαおよび／または他の分析物のレベルは、ＥＬＩＳＡによって決定することができる。ＥＬＩＳＡによる分析物濃度のアッセイは、分析物タンパク質に対する少なくとも１種の抗体、例えば、少なくとも１種の抗ＣＣＬ２０抗体、抗ＩＬ８抗体もしくは抗ＴＮＦα抗体、および／または少なくとも１種の二次抗体、例えば、少なくとも１種の標識二次抗体を必要とする。一部の実施形態では、一次抗体は、例えば、蛍光標識で標識される。ある特定の実施形態では、一次抗体は標識されず、一次抗体の生物種アイソタイプ（species  isotype）に結合することができる二次抗体が、例えば、蛍光プローブまたは特異的な基質と反応しこれにより検出可能シグナルを生じることができる酵素で標識される。
【０１３９】
ＥＬＩＳＡの実施は、少なくとも１種の捕捉抗体、少なくとも１種の検出抗体および／または少なくとも１種の酵素結合もしくは蛍光標識された二次抗体を必要とする。例えば、ＥＬＩＳＡによるＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαレベルのアッセイは、捕捉抗体としてそれぞれ抗ＣＣＬ２０抗体、抗ＩＬ８抗体または抗ＴＮＦα抗体を必要とし得る。抗ＣＣＬ２０抗体、抗ＩＬ８抗体または抗ＴＮＦα抗体は、ポリスチレンマイクロタイタープレート等の固体支持体に固定化される。次に、試料、例えば、血清試料が添加され、結合した抗体と複合体形成させる。結合していない血清コンポネントは、洗浄により除去される。検出抗体、例えば、異なる抗ＣＣＬ２０抗体、抗ＩＬ８抗体または抗ＴＮＦα抗体、例えば、捕捉抗体とは異なる、それぞれＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαタンパク質の部分に結合する抗ＣＣＬ２０抗体、抗ＩＬ８抗体または抗ＴＮＦα抗体が添加され、捕捉されたＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαに結合させる。検出抗体は、直接的にまたは間接的に、例えば、検出抗体を特異的に認識する二次抗体を介して、酵素等の検出可能タグに連結される。典型的には、各ステップの間で、結合したタンパク質を含有するプレートは、洗浄バッファー、例えば、穏和な洗剤溶液で洗浄される。典型的なＥＬＩＳＡプロトコールは、プレートへのタンパク質試薬の望まれない非特異的結合をブロックするために、ウシ血清アルブミン等、非特異的に結合するタンパク質の使用を伴う、１または複数のブロッキングステップも含む。最終洗浄ステップ後に、適切な酵素基質の添加によりプレートを発色させて、試料におけるＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαタンパク質の量を示す可視シグナルを生じる。基質は、例えば、発色基質または蛍光発生基質であり得る。ＥＬＩＳＡ方法、試薬および機器は、当技術分野で周知であり、市販されている。
【０１４０】
ヌクレオチド解析
一部の実施形態では、ＣＣＬ２０、ＩＬ８もしくはＴＮＦαおよび／または他の分析物の濃度は、「ヌクレオチド解析」を行うことにより決定することができる。ヌクレオチド解析は、試料、例えば、血液試料における分析物ヌクレオチド転写物レベル（例えば、ＣＣＬ２０、ＩＬ８もしくはＴＮＦαのｍＲＮＡ転写物レベル）の解析を含むことができる。分析物転写物レベルは、ノーザンブロット、例えば、定量的ノーザンブロット；またはポリメラーゼ連鎖反応、例えば、定量的ポリメラーゼ連鎖反応により決定することができる。ノーザンブロットの実施に必要な試薬は、オリゴヌクレオチドプローブ、例えば、検出可能標識に連結されたオリゴヌクレオチドプローブを含む。検出可能標識は、蛍光標識または特異的な基質と反応することができる酵素を含むことができる。ポリメラーゼ連鎖反応の実施に必要な試薬は、特定の分析物のｍＲＮＡ転写物に特異的に結合し、ポリメラーゼ連鎖反応によって分析物のｍＲＮＡ転写物の数を増幅することができるオリゴヌクレオチドプライマーを含む。オリゴヌクレオチドプライマーを検出可能標識に連結させて、例えば、定量的ポリメラーゼ連鎖反応を可能にすることができる。定量的ポリメラーゼ連鎖反応の実施に必要な他の試薬として、対照転写物シグナル、例えば、β−チューブリン転写物シグナルを増幅することができるプライマーが挙げられるがこれに限定されない。ノーザンブロッティングおよびポリメラーゼ連鎖反応の実施に必要なバッファー、試薬（オリゴヌクレオチドプライマーおよびプローブを含む）、技法および機器は、容易に入手することができ、当技術分野で周知である。
【０１４１】
患者を選択する方法
本明細書に記載されている本発明は、一部には、ＳＭＡＤ７アンチセンス治療法に対する応答性のある程度の見込みを示す患者を選択することにより、患者を処置する方法を提供する。抗ＳＭＡＤ７治療法に対する応答性の見込みは、一部には、ＩＢＤの患者におけるＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαのレベル、例えば、ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαの既存のレベル（すなわち、ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドの初期用量の投与前の患者におけるＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαのレベル）あるいはＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドの初期用量または１もしくは複数のその後の用量の後に決定されたＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαのレベルの決定を前提とする。例えば、本発明の一部の実施形態では、患者は、絶対もしくは相対ＣＣＬ２０、ＩＬ８もしくはＴＮＦαレベル、またはＣＣＬ２０、ＩＬ８もしくはＴＮＦαレベルの変化の検出または解析後に、ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドによる処置またはさらに別の処置のために選択される。ＩＢＤの患者におけるＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαのレベルは、ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαの正常レベル、例えば、マッチした対照群におけるＣＣＬ２０、ＩＬ８もしくはＴＮＦαレベル中央値またはＣＣＬ２０、ＩＬ８もしくはＴＮＦαの絶対レベルによって定義されるＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαの正常レベルと比較することができる。
【０１４２】
一部の実施形態では、患者におけるＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαのレベルが、マッチした対照群におけるＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαの平均（average）、中央値または平均（mean）レベルと比べて１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、９０％または１００％を超えて上昇した場合、患者は、ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドによる処置またはさらに別の処置のために選択される。
【０１４３】
一部の実施形態では、患者におけるＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαのレベルが、マッチした対照群におけるＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαの平均、中央値または平均レベルと比べて２倍を超えて、３倍を超えて、４倍を超えて、５倍を超えて、６倍を超えて、７倍を超えて、８倍を超えて、９倍を超えてまたは１０倍を超えて上昇した場合、患者は、ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドによる処置またはさらに別の処置のために選択される。
【０１４４】
典型的には、ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαレベルは、試料の容量、例えば、血液または組織の容量当たりのＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαタンパク質、ペプチドまたはＲＮＡの濃度、例えば、質量の観点から測定される。よって、初期または継続処置のための患者の選択は、例えば、ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαの高い初期レベルが、ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチド処置に対する応答性の潜在力を示すことができるように、患者におけるＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαレベルに関係づけられる。さらに、高レベルのＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦα（すなわち、正常レベルを上回るＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦα）は、ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドの用量増加の必要を示すことができる一方、正常または正常を下回るレベルのＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαは、特に、１または複数の用量の後の、ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドの用量減少または用量未変化の必要を示すことができる。あるいは、反復投与後の継続した正常を上回るレベルのＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαは、患者が、処置に対して応答性ではないことを示すことができる。
【０１４５】
よって、ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαのレベルが、ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαの正常レベルを上回る場合、患者に、ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドの初期および／またはその後の用量を投与することができる。一部の実施形態では、ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαレベルは、初期用量の投与前に、正常を上回るＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαレベルであることが既に公知である。一部の実施形態では、ＩＢＤの患者におけるＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαレベルは、初期用量の投与前に決定される。一部の実施形態では、ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドの初期用量後に、ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαレベルが解析され、ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαの正常レベルを上回ると決定される場合、患者は、ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドのその後の用量、例えば初期用量より多い用量または初期用量に等しい用量を投与される。あるいは、ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαレベルが解析され、ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαの正常レベルを下回ると決定される場合、患者に、ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドのその後の用量、例えば、初期用量と等しいまたはこれより少ない用量を投与することができる。
【０１４６】
さらに他の実施形態では、ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαレベルは、ＩＢＤの患者において解析および決定することができ、続いて、ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαレベルがＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαの正常レベルを上回る場合、ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドの初期用量を患者に投与することができる。さらに、一部の実施形態では、ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドの初期用量の後に、ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαのレベルを決定することができ、ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαのレベルが、ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαの正常レベルを上回る場合、初期用量より多いまたはこれに等しいＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドのその後の用量を患者に投与することができる。あるいは、ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドの初期用量の後に、ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαのレベルを決定することができ、ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαのレベルが、ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαの正常レベルを下回る場合、初期用量より少ないまたはこれに等しいＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドのその後の用量を患者に投与することができる。
【０１４７】
さらに他の実施形態では、本発明は、ＩＢＤの患者におけるＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαレベルを解析および決定することができる；ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαレベルが、ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαの正常レベルを上回る場合、ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドの初期用量を患者に投与することができる；初期投与後にＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαのレベルが解析される；ならびに初期用量が投与された後のＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαのレベルが、初期用量が投与される前のＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαのレベルより低い場合、患者が、初期用量と同じまたは初期用量より少ないその後の用量を投与される方法を提供する。あるいは、初期用量が投与される前のＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαのレベルと比較して、初期用量が投与された後にＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαのレベルが未変化であるまたは増加した場合、患者は、初期用量と同じもしくは初期用量より多いその後の用量を投与される、または処置が終了する。
【０１４８】
よって、意図されている発明は、ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαレベルの解析および決定ならびにＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチド投与に対する患者応答性に基づく複数の処置シナリオを説明することにより、患者におけるＩＢＤを処置および管理するための異なる方法を提供する。
【０１４９】
例えば、ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドの投与後に患者におけるＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαレベルが、正常ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαレベルを上回る場合、ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドの同じ用量でまたは増加した用量で処置を続けることができる。
【０１５０】
ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドの投与後に患者におけるＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαレベルが、正常ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαレベルを下回る場合、ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドの同じ用量でまたは減少した用量で処置を続けることができる。
【０１５１】
ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドの初期用量および１または複数のその後の用量の後にＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαレベルが、正常ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαレベルを上回りまたは下回り続ける場合、処置を終了することができる。例えば、患者が寛解したため、患者が処置に対して応答性ではないため、または患者が最大耐用量を投与されてきたため、処置を終了することができる。
【０１５２】
一部の事例では、ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαレベルが、ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドの１または複数の用量の後に患者において減少する場合、これは、患者が、処置に対して応答性であることを示すことができる。このような患者において、ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドのその後の用量を投与することができるが、ただし、以前の用量（複数可）と比較して同じ用量またはより少ない用量で行う。
【０１５３】
一部の事例では、ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαレベルが、ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドの初期用量または１もしくは複数のその後の用量の後に安定であるまたは増加する場合、これは、患者が、処置に対して応答性ではないことを示すことができる。このような患者において、ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドのその後の用量を投与することができるが、以前の用量（複数可）と比較してより多い用量で行う。あるいは、例えば、用量が、最大耐用量に近づく場合、処置を中断することができる。
【０１５４】
一部の事例では、ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドの投与の後に、患者が、ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαレベル以外の臨床因子によって決定される臨床寛解を達成するが、ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαレベルは、基本的に未変化のままであるまたは正常を上回る場合、ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチド処置を終了することができる。このような場合、ＣＣＬ２０、ＩＬ８またはＴＮＦαレベルは、ＩＢＤ進行を示すことができないが、他の因子、例えば、別の炎症性疾患に起因して上昇し得る。
【実施例】
【０１５５】
次の実施例により本発明をさらに説明する。実施例は、説明目的のみのために示されており、決して本発明の範囲または内容を限定するものとして解釈するべきではない。
【０１５６】
（実施例１）
ＣＤ患者における抗ＳＭＡＤ７アンチセンス処置の安全性および有効性を評価するための第２相臨床治験の設計
第２相臨床治験を行って、ＣＤ患者における抗ＳＭＡＤ７アンチセンス処置の安全性および有効性を評価した。治験に適格な男性または女性ＣＤ患者は、１８〜７５歳であり、登録前の少なくとも１週間２２０〜４００に及ぶＣＤＡＩスコアを有した。治験に登録された患者は、終末回腸および／または右結腸に炎症性病変を有し、ステロイド依存性および／またはステロイド抵抗性であった。臨床治験において併用のメサラミンおよびステロイド療法が、これらの薬物を既に受けていた患者において安定用量で維持された。適格患者が、免疫調節物質（例えば、アザチオプリン、メルカプトプリン、メトトレキセート）を服用し続ける選択肢を有したのは、かかる治療法が、試験の処置段階開始の少なくとも６カ月前に始まり、患者が、治験登録に先立つ９０日間、抗ＴＮＦ−α抗体または他の生物製剤による処置を受けなかった場合であった。
【０１５７】
治験において評価される抗ＳＭＡＤ７治療法は、終末回腸および右結腸への抗ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドモンジャーセンの標的化局所的送達を可能にする、腸溶コーティングを含む経口剤形であった。モンジャーセンの経口剤形の活性化合物は、終末回腸および右結腸において放出されるため、胃および／または近位小腸および／または横行および／または左結腸に病変を有する患者を治験から除外した。患者は、狭窄、瘻孔もしくは肛門周囲疾患を有するまたは腸外徴候を有する場合も除外した。患者は、活動性または近年の感染症または悪性疾患の病歴を有する場合も除外した。患者は、短腸症候群をもたらす直腸結腸切除術もしくは腸切除を受けたことがある、または臨床的に有意な心電図異常もしくは臨床的に有意な検査室異常を経験したことがある場合も治験から除外した。妊娠中または授乳中の女性も除外した。治験に登録された女性患者は、試験期間を通じて２種の形態の避妊の使用を求められた。
【０１５８】
多施設ランダム化プラセボ対照二重盲検第２相臨床治験として試験を行った。書面のインフォームドコンセントを提出した後、患者は、９日間スクリーニング段階に入って、適格性および処置前測定値を決定した。地域の施設内審査委員会および倫理委員会が臨床治験プロトコールを承認した後に、イタリアおよびドイツにある１７施設のセンターにおいて適格性に関して患者をスクリーニングした。治験に適格と決定された患者を活性処置およびプラセボ群へとランダムに割り当てた。治験は、１種のプラセボ群および変動用量のモンジャーセン（１０ｍｇ／日、４０ｍｇ／日および１６０ｍｇ／日）を受ける３種の実験群を含んだ。層別化またはブロック割り付け（block  allocation）なしの独立的なコンピュータ作成されたランダム化スケジュールを使用して、患者をこれらの群に１：１：１：１比で割り当てた。活性薬物の３種の用量は、前臨床、毒物学および第１相試験によって作成されたデータに基づき選択した。４群の患者は、プラセボまたは３種の用量のモンジャーセンのうち１種のいずれかの処置を２週間（すなわち、１〜１４日目）受けた。２週間の処置後に、１５、２８および８４日目（すなわち、処置中止１日後、処置中止２週間後または処置中止１０週間後）に患者を評価した。
【０１５９】
試験は、異なる測定値を使用して、治験に登録されたＩＢＤ患者におけるモンジャーセンによる処置の有効性を決定した。１５日目における、少なくとも２週間維持される１５０未満のＣＤＡＩスコアとして定義される寛解の比率を患者において査定した。１５日目または２８日目に（すなわち、薬物処置中止からそれぞれ１日または２週間後に）評価される、少なくとも１００または７０ポイントの患者ＣＤＡＩスコアの減少として定義される臨床応答の比率も評価した。各時点（すなわち、１５、２８および８４日目）における１５０未満のＣＤＡＩスコアを有する患者の数も評価した。処置前にならびに１５、２８日目および８４日目に先行する週において、患者ＣＤＡＩスコアを測定した。処置の終わりにＣＲＰレベルの正常化（すなわち、３．０ｍｇ／リットル未満のＣＲＰ濃度）を達成した患者のパーセンテージも決定した。最後に、処置前に上昇したＣＲＰレベル（すなわち、３．０ｍｇ／リットル超）を有し、臨床寛解にも達した患者のパーセンテージを評価した。
【０１６０】
疾患悪化を経験した患者（≧７０ＣＤＡＩスコア増加）は、２週間の処置期間の後に、生物製剤および／または免疫抑制剤によるレスキュー治療法を受けることができた。６名の患者（プラセボ群２名、１０ｍｇ／日モンジャーセン群１名および１６０ｍｇ／日モンジャーセン群３名）が、２８日目の後に疾患悪化のため、生物製剤および／または免疫抑制剤によるレスキュー治療法を受け、二次エンドポイントの解析において非応答者（ＣＤＡＩ＞１５０）と考慮された。２週間の処置期間の後に臨床寛解にある患者（１５日目および２８日目の両方でＣＤＡＩ＜１５０）は、ステロイドを漸減させることができた。
【０１６１】
モンジャーセン処置の安全性も査定した。１、７、１５、２８および８４日目に、臨床、生化学的および血液学的変数の変化を査定した。ＥＬＩＳＡを使用して、患者における補体活性化をモニターした。治験において起こった有害事象（ＡＥ）の実例を、重症度に関して評価し、各ＡＥの原因（すなわち、試験薬物または手順）を決定した。ＡＥの解析は、ランダム化を経た全１６６名の患者を含んだ。
【０１６２】
臨床治験パラメータを確立し、臨床治験から得られるデータの統計解析を行う際に、次の考察を考慮に入れた。前向き一次仮説は、最高用量のモンジャーセンによる１４日間処置が、１４日間プラセボ処置よりも高い割合の臨床寛解にある患者をもたらすというものであったため、アルファエラー０．１およびベータエラー０．１による片側検定枠組みを使用して、試料サイズを決定した。最高用量のモンジャーセンを受ける群が、５０％の寛解の比率を有し、プラセボ群が、２０％の寛解率を有すると仮定した。９０％の検出力で各群の間の寛解率における有意差を検出するためには、４０名の患者が、各群に必要とされると推定された。割り当てられた処置の少なくとも１用量を受けた全ランダム化患者において、治療意図に基づく（intention-to-treat）原則に従って全有効性解析を行った。１５日目および／または２８日目に欠測一次エンドポイントデータを有する患者は、失敗として分類した。ピアソンのカイ二乗検定またはフィッシャー直接検定を使用して、寛解および奏効率を比較した。３種のモンジャーセン群のそれぞれおよびプラセボ群の間でベースラインＣＲＰレベルから変化を有する患者の割合も記載した。
【０１６３】
臨床治験における参加に関して１８８名の患者をスクリーニングし、１６６名を登録に適格と考慮した（図１）。適格患者を、１０ｍｇ／日（Ｎ＝４１）、４０ｍｇ／日（Ｎ＝
４０）もしくは１６０ｍｇ／日（Ｎ＝４３）のいずれかの用量のモンジャーセンまたはプラセボ（Ｎ＝４２）を受けるようにランダムに割り当てた。各処置群における患者の人口統計学および臨床的特徴を評価し、同様であると記述した（表１）。
【表１】
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【０１６４】
１６６名の患者のこのような群のうち、１６０ｍｇ／日モンジャーセン群における１名の患者、４０ｍｇ／日モンジャーセン群における１名の患者、１０ｍｇ／日モンジャーセン群における３名の患者およびプラセボ群における１名の患者は、薬物投与プロトコールを遵守しなかった（図１）。治験に入った１６６名の患者のうち１６０名の患者（９６．３８％）が、２週間の処置を正確に完了し、１３８名の患者（８３．１％；１６０ｍｇ／日モンジャーセン群における３９名の患者、４０ｍｇ／日モンジャーセン群における３７名の患者、１０ｍｇ／日モンジャーセン群における３２名の患者およびプラセボ群における３０名の患者）が、８４日間の経過観察期間を含む全体プロトコールを完了した（図１）。一部の患者は、ＡＥ、疾患悪化、患者による離脱要求、患者の失踪のため、または治験責任医師の判断に基づき、経過観察期間において治験から離脱した。
【０１６５】
ステロイド消費中央値における統計的有意差は、ベースラインにおける群間で検出されなかった（表１）。プラセボを受ける１名の患者および１０ｍｇ／日モンジャーセンを受ける１名の患者は、２５ｍｇ／日プレドニゾンを服用し、４０ｍｇ／日モンジャーセンを受ける１名の患者は、５ｍｇ／日プレドニゾンを服用していた。ブデソニドは、プラセボを受ける８名の患者（中央値用量６ｍｇ／日）、１０ｍｇ／日モンジャーセンを受ける６名の患者（中央値用量６ｍｇ／日）、４０ｍｇ／日モンジャーセンを受ける１２名の患者（中央値用量６ｍｇ／日）および１６０ｍｇ／日モンジャーセンを受ける９名の患者（中央値用量７．５ｍｇ／日）によって服用された。８４日目に、ステロイド・フリー寛解に達した患者のパーセンテージは、プラセボ（１／９、１１％、Ｐ＝０．０４）よりも、１６０ｍｇ／日モンジャーセン（６／９、６７％）で有意に大きかったが、１０ｍｇ／日（３／７、４３％）または４０ｍｇ／日群（６／１３、４６％）およびプラセボの間に差はなかった。
【０１６６】
（実施例２）
抗ＳＭＡＤ７治療法による処置は、ＩＢＤ患者における臨床寛解および応答を誘導する
モンジャーセンによる処置が、ＣＤ患者における寛解をもたらすか決定するために、２週間の処置期間が終わった後に、ＣＤＡＩスコアを評価した。１５日目（薬物処置中止から１日後）および２８日目（薬物処置中止から２週間後）の両方で１５０未満のＣＤＡＩスコアを有する患者は、寛解に入ったと考慮された。プラセボ群において、４２名の患者のうち４名（９．５％）が、寛解に入った。対照的に、４０ｍｇ／日および１６０ｍｇ／日モンジャーセン群におけるそれぞれ４０名の患者のうち２２名（５５％）および４３名の患者のうち２８名（６５．１％）が、寛解に入った。１０ｍｇ／日モンジャーセン群における４１名の患者のうち５名（１２．２％）が、寛解に入った（図２Ａ）。１６０ｍｇ／日および４０ｍｇ／日モンジャーセン群における寛解率は、１０ｍｇ／日モンジャーセン（両群に関してＰ＜０．０００１）およびプラセボ群（両群に関してＰ＜０．０００１）よりも有意に高かった。１６０ｍｇ／日および４０ｍｇ／日モンジャーセン群の間でまたは１０ｍｇ／日モンジャーセンおよびプラセボ群の間で寛解率に有意差はなかった。これらの結果は、抗ＳＭＡＤ７アンチセンス治療法の投与が、ＩＢＤ患者における臨床寛解の誘導に有効であることを実証した。
【０１６７】
抗ＳＭＡＤ７治療法による処置が、ＣＤ患者における臨床応答を引き起こすために有効であるか決定するために、２週間の処置期間が終わった後に（すなわち、１５日目に）患者ＣＤＡＩスコアを評価した。臨床応答は、ベースライン（すなわち、薬物処置前）と比較した、１５日目の１００ポイントＣＤＡＩスコアの減少として定義した。この判断基準に従った臨床応答は、１６０ｍｇ／日モンジャーセン群における患者の６５．１％、４０ｍｇ／日モンジャーセン群における患者の４５％、１０ｍｇ／日モンジャーセン群における患者の２２％およびプラセボ群における患者の２６．２％において実証された（図２Ｂ）。１００ポイントＣＤＡＩ減少を経験した患者のパーセンテージは、１６０ｍｇ／日および４０ｍｇ／日モンジャーセン群において、１０ｍｇ／日モンジャーセン群と比較して有意により大きかった（それぞれＰ＜０．０００１およびＰ＝０．０２７）。１００ポイント臨床応答を経験した患者のパーセンテージも、１６０ｍｇ／日モンジャーセン群において、プラセボ群と比較して有意により大きかった（Ｐ＝０．０００３）。
【０１６８】
その上、臨床治験２８日目に（処置の終わりから２週間後に）患者ＣＤＡＩスコアを評価した。臨床応答は、この場合は、ベースライン（すなわち、薬物処置前）と比較した、２８日目の１００ポイントＣＤＡＩスコアの減少として定義した。この判断基準に従った臨床応答は、１６０ｍｇ／日モンジャーセン群における患者の７２．１％、４０ｍｇ／日モンジャーセン群における患者の５７．５％、１０ｍｇ／日モンジャーセン群における患者の３６．６％およびプラセボ群における患者の１６．７％において実証された（図２Ｃ）。１００ポイントＣＤＡＩ減少を経験した患者のパーセンテージは、１６０ｍｇ／日、４０ｍｇ／日および１０ｍｇ／日モンジャーセン群において、プラセボ群と比較して有意により大きかった（図２Ｃ；１６０ｍｇ／日群に関してＰ＜０．０００１、４０ｍｇ／日群に関してＰ＝０．０００１および１０ｍｇ／日群に関してＰ＝０．０３９、それぞれ各群についてプラセボと比較）。
【０１６９】
同様に、臨床治験８４日目に（処置の終わりから１０週間後に）患者ＣＤＡＩスコアを評価した。臨床応答は、この場合は、ベースライン（すなわち、薬物処置前）と比較した、８４日目のＣＤＡＩスコアの１００ポイント減少として定義した。この判断基準に従った臨床応答は、１６０ｍｇ／日モンジャーセン群における患者の７２．１％、４０ｍｇ／日モンジャーセン群における患者の７０．０％、１０ｍｇ／日モンジャーセン群における患者の３６．６％およびプラセボ群における患者の２６．２％において実証された（図２Ｄ）。１００ポイントＣＤＡＩ減少を経験した患者のパーセンテージは、１６０ｍｇ／日および４０ｍｇ／日モンジャーセン群において、１０ｍｇ／日モンジャーセン群およびプラセボ群と比較して有意により大きかった。これらの結果は、薬物処置中止の直後（すなわち、１５日目）および２週間後（すなわち、２８日目）の両方において、抗ＳＭＡＤ７治療法による処置が、ＩＢＤ患者におけるベースラインと比較して少なくとも１００ポイントのＣＤＡＩ減少として定義される、有意な比率の臨床寛解を誘導したことを実証した。これらの結果は、薬物処置中止の直後（すなわち、１５日目）ならびに２および１０週間後（すなわち、２８日目および８４日目）の両方において、抗ＳＭＡＤ７治療法による処置が、ＩＢＤ患者におけるベースラインと比較して少なくとも１００ポイントのＣＤＡＩ減少として定義される、有意な比率の臨床寛解を誘導したことを実証した。
【０１７０】
ベースラインと比較した７０ポイントの患者におけるＣＤＡＩスコアの減少として定義される臨床応答も、臨床治験の１５および２８日目に評価した。１５日目に、７０ポイントＣＤＡＩ減少が、１６０ｍｇ／日モンジャーセン群における患者の８１．４％、４０ｍ
ｇ／日モンジャーセン群における患者の７２．５％、１０ｍｇ／日モンジャーセン群における患者の３４．１％およびプラセボ群における患者の３１％において実証された（図３Ａ）。１５日目に７０ポイントＣＤＡＩスコア減少を経験した患者のパーセンテージは、１６０ｍｇ／日および４０ｍｇ／日モンジャーセン群において、１０ｍｇ／日モンジャーセン（それぞれＰ＜０．０００１およびＰ＝０．０００５）およびプラセボ群（それぞれＰ＜０．０００１およびＰ＝０．０００２）と比較して有意により大きかった。２８日目に、７０ポイントＣＤＡＩ減少が、１６０ｍｇ／日モンジャーセン群における患者の７６．７％、４０ｍｇ／日モンジャーセン群における患者の８０％、１０ｍｇ／日モンジャーセン群における患者の４８．８％およびプラセボ群における患者の２６．２％において実証された（図３Ｂ）。２８日目に７０ポイントＣＤＡＩスコア減少を経験した患者のパーセンテージは、１６０ｍｇ／日、４０ｍｇ／日および１０ｍｇ／日モンジャーセン群において、プラセボ群（それぞれＰ＜０．０００１、Ｐ＜０．０００１およびＰ＝０．０３３）と比較して有意により大きかった。これらの結果は、薬物処置中止の直後（すなわち、１５日目）および２週間後（すなわち、２８日目）の両方において、抗ＳＭＡＤ７治療法による処置が、ＩＢＤ患者におけるベースラインと比較した少なくとも７０ポイントのＣＤＡＩ減少として定義される有意な比率の臨床寛解を誘導したことを実証した。
【０１７１】
抗ＳＭＡＤ７治療法による処置が、より長い期間にわたる１５０未満のＣＤＡＩスコアの維持をもたらすか決定するために、治験１５日目、２８日目および８４日目に、各群におけるＣＤＡＩスコアも解析した。１５日目に、１６０ｍｇ／日、４０ｍｇ／日および１０ｍｇ／日モンジャーセン群ならびにプラセボ群における１５０未満のＣＤＡＩスコアを有する患者のパーセンテージは、それぞれ６７．４％、５７．５％、１４．６％および２１．４％であった（図４Ａ）。１５日目に、１５０より低いＣＤＡＩスコアを有する患者のパーセントは、１６０ｍｇ／日および４０ｍｇ／日モンジャーセン群において、１０ｍｇ／日モンジャーセン群（両群に関してＰ＜０．０００１）およびプラセボ群（それぞれＰ＜０．０００１およびＰ＝０．０００８）と比較して有意により高かった。
【０１７２】
２８日目に、１６０ｍｇ／日、４０ｍｇ／日および１０ｍｇ／日モンジャーセン群ならびにプラセボ群における１５０未満のＣＤＡＩスコアを有する患者のパーセンテージは、それぞれ７２．１％、７０％、２９．３％および１４．３％であった（図４Ｂ）。２８日目に、１５０より低いＣＤＡＩスコアを有する患者のパーセントは、１６０ｍｇ／日および４０ｍｇ／日モンジャーセン群において、１０ｍｇ／日モンジャーセン群（それぞれＰ＜０．０００１およびＰ＝０．０００２）およびプラセボ群（両群に関してＰ＜０．０００１）と比較して有意により高かった。
【０１７３】
８４日目に、１６０ｍｇ／日、４０ｍｇ／日および１０ｍｇ／日モンジャーセン群ならびにプラセボ群における１５０未満のＣＤＡＩスコアを有する患者のパーセンテージは、それぞれ６７．４％、６２．５％、２６．８％および２１．４％であった（図４Ｃ）。８
４日目に、１５０より低いＣＤＡＩスコアを有する患者のパーセントは、１６０ｍｇ／日および４０ｍｇ／日モンジャーセン群において、１０ｍｇ／日モンジャーセン群（それぞれＰ＝０．０００５およびＰ＝０．００３）およびプラセボ群（両群に関してＰ＜０．０００１）と比較して有意により高かった。これらの結果は、抗ＳＭＡＤ７治療法によるＩＢＤ患者の処置が、薬物処置の終わりから少なくとも７０日後に、患者における１５０未満のＣＤＡＩスコアの誘導に有効であることを実証した。
【０１７４】
表２は、治験のベースライン、１５日目、２８日目および８４日目における各処置群における患者のＣＤＡＩスコアの中央値および値範囲を提示する。表２に示されている通り、４０ｍｇ／日および１６０ｍｇ／日モンジャーセン処置群におけるＣＤＡＩスコアの中央値変化は、各時点のプラセボ群と比較して有意により大きかった。いずれの時点においても、１０ｍｇ／日モンジャーセンおよびプラセボ群の間で統計的な差は観察されなかった。
【表２】
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【０１７５】
プラセボ患者の９．５％と比較して（ｐ＜０００１）、１６０ｍｇ／日モンジャーセンを受ける患者の５８．１％は、１５日目に寛解を達成し、これは、４週目（２８日間）および１２週目（８４日間）の両方で維持された。
【０１７６】
（実施例３）
抗ＳＭＡＤ７治療法による処置は、ＩＢＤ患者におけるステロイド・フリー寛解を誘導する
ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチド治療法による処置が、ステロイド・フリー寛解を容易にすることができるか決定するために、治験の終わりにステロイド・フリー臨床寛解を達成した患者の数を解析した。治験の初めに、プラセボ群における４２名のうち９名（２１．４％）の個体、１０ｍｇ／日モンジャーセン群における４１名のうち７名（１７．１％）の個体、４０ｍｇ／日モンジャーセン群における４０名のうち１３名（３２．５％）の個体および１６０ｍｇ／日モンジャーセン群における４３名のうち９名（２０．９％）の個体は、ステロイドを積極的に服用していた。治験の初めに、群間でステロイド消費中央値における有意差は存在しなかった。治験８４日目に、プラセボ群における同じ個体群と比較して（Ｐ＝０．０４；１６０ｍｇ／日、６／９個体（６７％）が、ステロイド・フリー寛解を達成、ｖｓ．プラセボ、１／９個体が、ステロイド・フリー寛解を達成）、治験開始時にステロイドを服用している１６０ｍｇ／日群におけるこれらの個体の有意により大きい割合が、ステロイド・フリー寛解を達成した。ステロイド・フリー寛解は、０ｍｇプレドニゾン経口摂取の均等物による臨床寛解（上に定義）として定義された。プラセボ群および他のモンジャーセン群の間で有意差は観察されなかった。これらの結果は、ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドによる処置が、ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチド処置に先立ちステロイドを経口摂取しているＩＢＤの個体のコホートにおけるステロイド・フリー寛解をもたらしたことを実証する。
【０１７７】
（実施例４）
抗ＳＭＡＤ７治療法による処置は、血漿バイオマーカー発現を低下させる
ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチド処置が、ＩＢＤに関連するバイオマーカーに変化をもたらすかを決定するために、治験のベースライン、１５日目および２８日目において、ＥＬＩＳＡにより患者におけるＩＬ８およびＴＮＦαのレベルを査定した。表３に示す通り、ＩＬ８およびＴＮＦαの血漿濃度は、４０ｍｇ／日および１６０ｍｇ／日モンジャーセン群において、ベースラインと比較して１５および２８日目に有意に低下した（４０ｍｇ／日および１６０ｍｇ／日モンジャーセン群におけるベースラインと比較した１５および２８日目に、Ｐ＜０．０５）。有意差は、プラセボまたは１０ｍｇ／日モンジャーセン群において観察されなかった。これらの結果は、２週間またはそれに満たないＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドによるＩＢＤの患者の処置が、有意に低下したレベルのＩＬ８およびＴＮＦαをもたらしたことを実証する。
【表３】
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【０１７８】
さらに、抗ＳＭＡＤ７治療法が、循環ＣＲＰレベルの変化を誘導することができるか決定するために、抗ＳＭＡＤ７治療法処置を始める前および処置後（すなわち、１５日目）の両方で、治験に登録された患者におけるＣＲＰのレベルを評価した。モンジャーセン処置を始める前の患者のスクリーニングは、１６６名の患者のうち１０２名（６１．４％）が、上昇したＣＲＰレベル（すなわち、３．０ｍｇ／リットル超）を有していたことを実証した。具体的には、上昇したＣＲＰレベルは、プラセボ群における４２名の患者のうち２５名（５９．５％）、１０ｍｇ／日モンジャーセン群における４１名の患者のうち２７名（６５．９％）、４０ｍｇ／日モンジャーセン群における４０名の患者のうち２２名（５５％）および１６０ｍｇ／日モンジャーセン群における４３名の患者のうち２８名（６５．１％）において観察された（図５Ａ）。１５日目における患者の評価は、正常化されたレベルのＣＲＰ（すなわち、＜３ｍｇ／リットル）を有する患者のパーセンテージが、プラセボ群における４％、ならびに１０ｍｇ／日、４０ｍｇ／日および１６０ｍｇ／日モンジャーセン群におけるそれぞれ２２％、１８．１８％および１７．９％であったことを実証した（図５Ｂ）。表４は、各処置群における、ベースラインにおいて上昇したＣＲＰレベル（＞３ｍｇ／Ｌ）を有する患者におけるＣＲＰレベル中央値およびＣＲＰレベルの範囲を示す。ベースラインにおいて上昇したＣＲＰレベルを有する患者のうち、プラセボもモンジャーセン処置も、ベースラインと比較して、１５、２８または８４日目に、ＣＲＰの中央値を有意に低下させなかった。
【表４】
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【０１７９】
これらの結果は、抗ＳＭＡＤ７治療法によるＩＢＤ患者の処置は、低濃度であっても、
プラセボ処置と比較して、正常化されたＣＲＰレベルを有する患者のパーセンテージの増加をもたらしたことを示す。
【０１８０】
その上、個々の患者由来の上昇したベースラインＣＲＰレベルおよび寛解データを解析して、抗ＳＭＡＤ７治療法による処置が、初期に上昇したＣＲＰレベル（すなわち、３．０ｍｇ／リットル超）を有する患者に寛解をもたらしたか決定した。１５日目に、上昇したベースラインＣＲＰを有する患者の中の寛解者（remitter）（ＣＤＡＩスコア＜１５０および正常化されたＣＲＰによって定義）の割合は、それぞれプラセボ、１０ｍｇ／日、４０ｍｇ／日および１６０ｍｇ／日モンジャーセン群において１／６（１６．７％）、０／４（０％）、２／１１（１８．２％）および５／２０（２５％）であった。解析は、ベースラインにおいて上昇したＣＲＰレベルを有する患者において、１６０ｍｇ／日および４０ｍｇ／日モンジャーセン群における１５および２８日目の寛解の比率（それぞれ６７．９％および４５．５％）が、プラセボ群における同じ患者カテゴリーの寛解の比率よりも有意に高かった（１２％；それぞれＰ＜０．０００１およびＰ＝０．０１；図６）ことも示した。有意差は、１６０ｍｇ／日および４０ｍｇ／日モンジャーセン群の間でまたは１０ｍｇ／日モンジャーセン群（１１．１％）およびプラセボ群の間で観察されなかった。これらの結果は、上昇したＣＲＰレベルを有するＩＢＤ患者の抗ＳＭＡＤ７処置が、プラセボによる処置と比較して、寛解の有意な増加をもたらしたことを実証した。これらの結果は、上昇したＣＲＰレベルが、患者が、抗ＳＭＡＤ７治療法による処置に応答するかまたは応答する可能性があるかに関する決定に有用な判断基準であることをさらに実証した。
【０１８１】
治験に登録された患者由来のＣＣＬ２０血清レベルも解析して、ＣＣＬ２０とモンジャーセン処置後の臨床応答および寛解との関係を調査した。ＣＣＬ２０は、市販のＥＬＩＳＡキット（Ｒ＆Ｄカタログ番号ＤＭ３Ａ００）を使用して測定した。ＣＣＬ２０の血清レベルは、モンジャーセンによる処置後に臨床寛解／応答を経た４０ｍｇ／日および１６０ｍｇ／日モンジャーセン群における患者において測定した。ＣＣＬ２０の血清レベルは、０日目および８４日目の両方で測定した（図８Ａ）。個々の患者（図８Ａ、左パネル）および平均（図８Ａ、右パネル）の両方におけるモンジャーセンによる処置は、臨床寛解／応答を経験した患者におけるＣＣＬ２０の血清レベルの減少をもたらした。
【０１８２】
ＣＣＬ２０レベルは、４０ｍｇ／日または１６０ｍｇ／日モンジャーセンによる処置後に臨床寛解／応答を経験しなかった患者においても測定した。これらの患者の中で、血清ＣＣＬ２０レベルの減少は、個別的（図８Ｂ、左パネル）または平均（図８Ｂ、右パネル）のいずれでもベースラインに対して８４日目において観察されなかった。
【０１８３】
４０ｍｇ／日または１６０ｍｇ／日モンジャーセンによる処置後に臨床寛解／応答を経験した患者の群内で、ＣＣＬ２０レベルを、１０ｐｇ／ｍｌより多いＣＣＬ２０のベースライン血清レベルを有する患者のサブセット内で解析した。個々の患者におけるモンジャーセンによる処置（図８Ｃ、左パネル）は、０日目に測定した血清ＣＣＬ２０レベルと比較して、８４日目におけるＣＣＬ２０の血清レベルの減少をもたらした。処置は、０日目に測定した血清ＣＣＬ２０レベルと比較して、８４日目におけるＣＣＬ２０の平均血清レベルの有意な減少ももたらした。（図８Ｃ、右パネル；ｐ＝０．０３５）。
【０１８４】
これらの結果は、抗ＳＭＡＤ７治療薬による処置が、ＩＢＤの患者における臨床寛解／応答およびＣＣＬ２０血清レベルの減少の両方をもたらすことができることを実証した。これらは、ＣＣＬ２０レベルの減少が患者臨床寛解／応答と相関することも実証した。
【０１８５】
血清ＣＣＬ２０レベルを、１０ｍｇ／日、４０ｍｇ／日もしくは１６０ｍｇ／日モンジャーセンまたはプラセボを受けている患者のより大きい群においても測定して、ＣＣＬ２０レベルとモンジャーセンによる処置後の臨床応答および寛解との関係をさらに調査した。血清ＣＣＬ２０レベルは、薬物処置開始後ベースライン（０日目）、２週間（１５日目）、４週間（２８日目）または１２週間（８４日目）において６４名の患者の群において測定した。薬物処置後、この群からの２５名の患者が臨床寛解し、１４名の患者が臨床応答を示し、１３名の患者が薬物処置に対して応答しなかった。プラセボ処置後、２名の患者が臨床寛解し、４名の患者が臨床応答を示し、６名の患者がプラセボ処置に対して応答しなかった。
【０１８６】
ＣＣＬ２０のベースライン血清レベル中央値を、モンジャーセンまたはプラセボによる処置後に臨床寛解または応答を示した患者（「応答者」）および臨床寛解または応答を示さなかった患者（「非応答者」）について計算した。モンジャーセンにより処置された応答者におけるベースラインにおける血清ＣＣＬ２０レベル中央値は、１３ｐｇ／ｍｌであり、範囲は２〜５５ｐｇ／ｍｌであった一方、モンジャーセンにより処置された非応答者における血清ＣＣＬ２０レベル中央値は、１５ｐｇ／ｍｌであり、範囲は５〜２７ｐｇ／ｍｌであった（データを示さず）。プラセボ処置患者の中で、ベースラインにおける血清ＣＣＬ２０レベル中央値は、応答者において１５ｐｇ／ｍｌであり、範囲は１３〜２５ｐｇ／ｍｌであり、非応答者において９ｐｇ／ｍｌであり、範囲は１０〜５０ｐｇ／ｍｌであった。
【０１８７】
６４名の患者のこの群内で、ＣＣＬ２０血清レベルを、１５ｐｇ／ｍｌまたはそれ超のＣＣＬ２０のベースライン血清レベルを示した患者においてすべての時点で評価した。ノンパラメトリック法を統計解析に使用した。２つの独立した試料についてのマンホイットニーＵ検定を使用して様々な患者群を比較した。モンジャーセン処置患者の中で、１５名の応答者および７名の非応答者が、少なくとも１５ｐｇ／ｍｌのＣＣＬ２０のベースライン血清レベルを有した。プラセボ処置患者の中で、４名の応答者および４名の非応答者が、少なくとも１５ｐｇ／ｍｌのＣＣＬ２０のベースライン血清レベルを有した。モンジャーセン処置応答者のこのサブセットの中で、血清ＣＣＬ２０レベルは、ベースラインと比較してすべての時点で有意に減少した（図９Ａ；０日目：中央値＝３１ｐｇ／ｍｌ、範囲＝１５〜５５ｐｇ／ｍｌ；１５日目：中央値＝１７ｐｇ／ｍｌ、範囲＝６〜３２ｐｇ／ｍｌ；２８日目：中央値＝１７ｐｇ／ｍｌ、範囲＝６〜３６ｐｇ／ｍｌ；および８４日目：中央値＝１４ｐｇ／ｍｌ、範囲＝７〜９０ｐｇ／ｍｌ；０日目対１５日目、ｐ＝０．００２８；０日目対２８日目、ｐ＝０．００２５；０日目対８４日目、ｐ＝０．００７）。対照的に、モンジャーセン処置非応答者（図９Ｂ；０日目：中央値＝１９ｐｇ／ｍｌ、範囲＝１５〜２７ｐｇ／ｍｌ；１５日目：中央値＝２６ｐｇ／ｍｌ、範囲＝１４〜１４９ｐｇ／ｍｌ；２８日目：中央値＝１６ｐｇ／ｍｌ、範囲＝１２〜３０ｐｇ／ｍｌ；および８４日目：中央値＝１７ｐｇ／ｍｌ、範囲＝１２〜３１ｐｇ／ｍｌ）、プラセボ処置応答者（図９Ｃ；０日目：中央値＝１６ｐｇ／ｍｌ、範囲＝１５〜２５ｐｇ／ｍｌ；１５日目：中央値＝２２ｐｇ／ｍｌ、範囲＝１４〜３３ｐｇ／ｍｌ；２８日目：中央値＝２１ｐｇ／ｍｌ、範囲＝１２〜２７ｐｇ／ｍｌ；および８４日目：中央値＝１６ｐｇ／ｍｌ、範囲＝１０〜２３ｐｇ／ｍｌ）、またはプラセボ処置非応答者（図９Ｄ；０日目：中央値＝３５ｐｇ／ｍｌ、範囲＝２７〜１３４ｐｇ／ｍｌ；１５日目：中央値＝３９ｐｇ／ｍｌ、範囲＝１７〜９５ｐｇ／ｍｌ；２８日目：中央値＝２５ｐｇ／ｍｌ、範囲＝７〜３３ｐｇ／ｍｌ；および８４日目：中央値＝４０ｐｇ／ｍｌ、範囲＝１６〜８０ｐｇ／ｍｌ）の中で、ベースラインからの血清ＣＣＬ２０レベルの有意な減少は観察されなかった。これらの結果は、ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチド処置後のＣＣＬ２０血清レベルの有意な減少は、臨床寛解および応答性と相関し、このような相関は、ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドにより処置された非応答性患者またはプラセボ処置応答者および非応答者において見出されなかったことを実証した。
【０１８８】
その上、ＣＣＬ２０血清レベルを、モンジャーセン処置後に臨床寛解を示した患者の群および臨床応答を示した患者の群のそれぞれにおいて、１５ｐｇ／ｍｌまたはそれ超のＣＣＬ２０のベースライン血清レベルを示した患者の中で別個に評価した。血清ＣＣＬ２０レベルを、１０ｍｇ／日、４０ｍｇ／日または１６０ｍｇ／日モンジャーセンまたはプラセボを受けている患者において、薬物処置開始後ベースライン（０日目）、２週間（１５日目）、４週間（２８日目）または１２週間（８４日目）において測定した。モンジャーセンによる処置は、臨床寛解を経験した患者の中でベースラインと比較して１５日目および８４日目においてＣＣＬ２０レベルの有意な減少をもたらした（図１０、左パネル；ｐ＝０．０２、０日目対１５日目；ｐ＝０．１、０日目対２８日目；およびｐ＝０．００１、０日目対８４日目）。中央値ＣＣＬ２０レベルも、モンジャーセン処置後に臨床応答を経験した患者において低下した（図１０、右パネル；ｐ＝０．３、０日目対１５日目；ｐ＝０．１、０日目対２８日目；およびｐ＝０．０６、０日目対８４日目）。図１０中の水平バーは、それぞれの時点の中央値を表し、それぞれのポイントは、単一患者におけるＣＣＬ２０血清値を表す。これらの結果は、ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチド処置後のＣＣＬ２０血清レベルの有意な減少が臨床寛解と相関し、ＣＣＬ２０血清レベル中央値の減少がＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチド処置後に臨床応答性を経験した患者において観察されることを実証した。
【０１８９】
（実施例５）
抗ＳＭＡＤ７治療法による処置は、ＩＢＤの患者において耐容性である
モンジャーセンによる処置が、安全性問題またはＡＥに関連するか決定するために、治験を通してかかる問題および事象の実例を追跡した。６名の患者において９例の重篤有害事象（ＳＡＥ）が記載された。プラセボ群の１名の患者において２例のＳＡＥが実証され、１０ｍｇ／日モンジャーセン群の３名の患者において４例のＳＡＥが実証され、４０ｍｇ／日モンジャーセン群の１名の患者において２例のＳＡＥが実証され、１６０ｍｇ／日モンジャーセン群の１名の患者において１例のＳＡＥが実証された（表５）。２例のＳＡＥは、医師によって、処置に関係するとは考慮されなかった。大部分のＳＡＥは、ＣＤに関連する合併症または症状のための入院からなった。１６０ｍｇのモンジャーセンを与えた群における１名の患者は、調理中に脚に熱傷を経験した。臨床治験の間に死亡した患者はいなかった。  
【表５】
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【０１９０】
プラセボ群における２８名の患者ならびに１０ｍｇ／日、４０ｍｇ／日および１６０ｍｇ／日モンジャーセン群におけるそれぞれ２０、２５および２１名の患者は、処置の最中またはその後にＡＥを経験した（表６）。全体的に見て、臨床治験の間に２００例のＡＥが実証された。これらは、プラセボ群における６４例のＡＥ、１０ｍｇ／日モンジャーセン群における３９例のＡＥ、４０ｍｇ／日モンジャーセン群における５０例および１６０ｍｇ／日モンジャーセン群における４７例を含んだ。ＡＥの大部分は、軽度であり、治験責任医師によって処置には関係しないと考慮された。試験におけるいずれの患者においても、バイタルサインの変化は記述されなかった。治験の際の患者において、血清補体因子の増加は観察されなかった。これらの結果は、全体的に見て、抗ＳＭＡＤ７治療法によるＩＢＤの処置が、ＡＥに関連せず、患者による十分な耐容性であることを実証する。
【表６】
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【０１９１】
（実施例６）
臨床寛解は、ベースラインＣＲＰレベルと相関した
図７に示す通り、１５日目および４週目におけるベースラインＣＲＰレベルおよび臨床寛解の間の関係性を試験した。３ｍｇ／Ｌより低いＣＲＰレベルを有する患者は、プラセボまたは１０ｍｇ／日モンジャーセンを受けた場合（それぞれ１７．６％および１４．３％）と比較して、４０ｍｇ／日または１６０ｍｇ／日モンジャーセンを受けた場合に、１５日後に増加した比率（それぞれ６６．７％および６０．０％）の寛解を示した。４０ｍｇ／日または１６０ｍｇ／日モンジャーセン（それぞれ５０．０％および７１．４％）を受けた３ｍｇ／Ｌまたはそれを超えるＣＲＰレベルを有する患者の寛解の比率は、プラセボまたは１０ｍｇ／日モンジャーセンを受けた場合（それぞれ２４．０％および１４．８％）より大きかった。
【０１９２】
４週間後に、３ｍｇ／Ｌより低いＣＲＰレベルを有し、プラセボまたは１０、４０もしくは１６０ｍｇ／日モンジャーセンを受けている患者は、それぞれ１７．６％、３５．７％、７２．２％および６６．７％の寛解率を示した。３ｍｇ／Ｌまたはそれを超えるＣＲＰレベルを有し、プラセボまたは１０、４０もしくは１６０ｍｇ／日モンジャーセンを受けている患者は、それぞれ１２．０％、２５．９％、６８．２％および７５．０％の寛解率を示した。
【０１９３】
（実施例７）
ＴＧＦβはＴＮＦα媒介性ＣＣＬ２０誘導を低下させる
結腸上皮細胞におけるＣＣＬ２０発現に対する様々な因子の効果を評価するために、ＮＣＭ４６０細胞株由来のヒト正常結腸上皮細胞を、未刺激のままにする（Ｕｎｓｔ）か、ＴＧＦβ、ＴＮＦα、インターフェロンγ（ＩＦＮγ）、もしくはインターロイキン−１７Ａ（ＩＬ１７Ａ）に個々に曝露し、またはＴＧＦβとＴＮＦα、ＴＧＦβとＩＦＮγ、もしくはＴＧＦβとＩＬ１７Ａの組合せに曝露した（図１１）。ＣＣＬ２０（ｈＣＣＬ２０）ｍＲＮＡ発現をそれぞれの群において測定した。ＴＮＦα曝露は、未刺激対照と比べてＣＣＬ２０発現の大きな増加をもたらした一方、ＴＧＦβとＴＮＦαの組合せへの曝露は、ＣＣＬ２０のはるかにより低い発現をもたらした。この結果は、ＴＧＦβ曝露がＴＮＦαのＣＣＬ２０  ｍＲＮＡ発現を誘導する能力を阻害したことを示す。
【０１９４】
（実施例８）
ＳＭＡＤ７およびＣＣＬ２０発現はクローン病患者の胃腸組織において相関する
ＳＭＡＤ７およびＣＣＬ２０がクローン病患者の胃腸組織において共発現されるか評価するために、ＣＣＬ２０およびＳＭＡＤ７発現を、クローン病の患者由来の回腸および結腸組織切片において免疫組織化学検査によって解析した。試料をクリオスタット封入剤中に包埋し、スナップ凍結させ、薄片を作製した。次にスライドにマウントした組織切片を固定および洗浄した。組織切片を、ヒトＣＣＬ２０に対するウサギポリクローナル抗体（最終希釈１：１００；Ａｂｃａｍ、Ｃａｍｂｒｉｄｇｅ、ＵＫ）およびヒトＳＭＡＤ７に対するマウスモノクローナル抗体（最終希釈１：５０；Ｒ＆Ｄ  Ｓｙｓｔｅｍｓ、Ｍｉｎｎｅａｐｏｌｉｓ、ＭＮ）とともにそれぞれ室温で３０分間および１時間インキュベートし、その後色素原として３，３’ジアミノベンジジン（Ｄａｋｏ、Ｃａｒｐｉｎｔｅｒｉａ、ＣＡ）を用いてビオチンフリー西洋ワサビペルオキシダーゼポリマー検出技術（Ｕｌｔｒａｖｉｓｉｏｎ  Ｄｅｔｅｃｔｉｏｎ  Ｓｙｓｔｅｍ、カタログ番号ＴＬ−０６０−ＨＬ、Ｔｈｅｒｍｏ  Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ、Ｗａｌｔｈａｍ、ＭＡ）を続けた。切片をヘマトキシリンで対比染色し、脱水した。アイソタイプ対照ＩｇＧ染色切片を、ＳＭＡＤ７またはＣＣＬ２０一次抗体の代わりにマウスおよびウサギ正常ＩｇＧ対照抗体（Ｒ＆Ｄ  Ｓｙｓｔｅｍｓ、Ｍｉｎｎｅａｐｏｌｉｓ、ＭＮ）を使用して、同一の免疫組織化学的条件下で調製した。染色切片を光学顕微鏡法によって解析した。アイソタイプ対照ＩｇＧ染色切片は、著しいバックグラウンド信号を示さなかった（図１２Ａ、右パネル）。クローン病患者由来の組織の染色は、ＳＭＡＤ７およびＣＣＬ２０がともに、回腸および結腸の上皮細胞において発現されることを実証した（図１２Ａ、左および中央のパネル）。
【０１９５】
ＳＭＡＤ７発現がＣＣＬ２０タンパク質発現に影響するか決定するために、ＣＣＬ２０タンパク質レベルを、ＳＭＡＤ７センスまたはアンチセンスオリゴヌクレオチドに曝露されたクローン病患者由来の粘膜結腸の（mucosal  colonic）外植片において解析した。活動性クローン病のために外科的切除を受けた６名の患者由来の炎症性結腸組織を回収し、カットして長さが３〜４ｍｍの断片にし、器官培養チャンバー（３７℃、５％  ＣＯ２／９５％  Ｏ２環境）内のＡＱＩＸ培地（Ｌｉｑｕｉｄ  ｌｉｆｅ、Ｌｏｎｄｏｎ、英国）中に浸漬した滅菌フィルター（ＥＭＤ  Ｍｉｌｌｉｐｏｒｅ、Ｍｉｌａｎ、イタリア）上に置いた。ＳＭＡＤ７アンチセンスまたは対照センスオリゴヌクレオチド（１０μｇ／ｍｌ）を３６時間にわたって外植片に添加し、試料を収集してＣＣＬ２０タンパク質解析を行った。ＣＣＬ２０レベルをＥＬＩＳＡ（Ｒ＆Ｄ  Ｓｙｓｔｅｍｓ、Ｍｉｎｎｅａｐｏｌｉｓ、ＭＮ）によって血清および培養上清において測定した。吸光度シグナルを分光光度計マルチモード検出器ＤＴＸ８８０（Ｂｅｃｋｍａｎ  Ｃｏｕｌｔｅｒ、Ｍｉｌａｎ、イタリア）により測定した。ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチド（Ｓｍａｄ７  Ａｓ）またはＳＭＡＤ７センスオリゴヌクレオチド（Ｓｅｎｓｅ）により処置された個々の患者由来の外植片におけるＣＣＬ２０タンパク質レベルの比較は、ＣＣＬ２０レベルがＳｅｎｓｅ処置と比較してＳｍａｄ７  Ａｓ処置後に有意に低下することを実証した（図１２Ｂ、ｐ＝０．０３）。図１２において、各ポイントは、単一外植片におけるＣＣＬ２０タンパク質レベルを表し、水平バーは、ＳｅｎｓｅまたはＳｍａｄ７  ＡＳオリゴヌクレオチドにより処置されたすべての外植片にわたるＣＣＬ２０タンパク質値中央値を示す。ＳｅｎｓｅおよびＳｍａｄ７  Ａｓ列における個々のデータ点をつないでいる各バーは、同じ患者から得た外植片についてのデータ点をつなぐ。これらの結果は、クローン病患者由来の結腸組織におけるＣＣＬ２０レベルが、ＳＭＡＤ７タンパク質発現を減少させるＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドによる処置後に減少することを実証した。
配列
【０１９６】
配列番号１（ＮＭ＿００５９０４．３；Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓＳＭＡＤファミリーメンバー７（ＳＭＡＤ７）、転写物バリアント１、ｍＲＮＡのコード配列ＣＤＳ（２８８〜１５６８））−モンジャーセン標的およびその誘導体の標的配列に下線を引いた（１０８〜１２８）；
【化１】
2017537973.tif 000008
【化２】
2017537973.tif 000009
【０１９７】
配列番号2
5’-GTCGCCCCTTCTCCCCGCAGC-3’
【０１９８】
配列番号3
5’-GTXGCCCCTTCTCCCXGCAG-3’
Ｘは、５−メチル２’−デオキシシチジンである
【０１９９】
配列番号4
5’-GTXGCCCCTTCTCCCXGCAGC-3’  
Ｘは、５−メチル−２’−デオキシシチジンである
【０２００】
配列番号5
5’-GTXYCCCCTTCTCCCXYCAG-3’  
Ｘは、シトシンおよび５−メチルシトシンからなる群から選択される窒素含有塩基を含むヌクレオチドまたは２’−Ｏ−メチルシトシンヌクレオシドであり、Ｙは、グアニンおよび５−メチルグアニンからなる群から選択される窒素含有塩基を含むヌクレオチドまたは２’−Ｏ−メチルグアニンヌクレオシドであり、ただし、ヌクレオチドＸまたはＹの少なくとも一方が、メチル化窒素含有塩基を含む。
【０２０１】
参照による援用
本明細書に引用されている特許文書および科学論文のそれぞれの開示全体は、すべての目的に関して参照により援用する。
【０２０２】
均等物
本発明は、その本質的な特徴から逸脱することなく、他の特異的な形態で具体化することができる。したがって、前述の実施形態は、本明細書に記載されている本発明における限定ではなく、説明的であると考慮されたい。本発明の範囲は、前述の説明ではなく添付の特許請求の範囲によって示されており、特許請求の範囲の均等の意義および範囲内のあらゆる変更が、その中に包含されることが企図される。
【図１】
2017537973.tif 000010
【図２Ａ】
2017537973.tif 000011
【図２Ｂ】
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【図２Ｃ】
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【図２Ｄ】
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【図３Ａ】
2017537973.tif 000015
【図３Ｂ】
2017537973.tif 000016
【図４Ａ】
2017537973.tif 000017
【図４Ｂ】
2017537973.tif 000018
【図４Ｃ】
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【図５Ａ】
2017537973.tif 000020
【図５Ｂ】
2017537973.tif 000021
【図６】
2017537973.tif 000022
【図７】
2017537973.tif 000023
【図８Ａ】
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【図８Ｂ】
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【図８Ｃ】
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【図９】
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【図１０】
2017537973.tif 000028
【図１１】
2017537973.tif 000029
【図１２Ａ】
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【図１２Ｂ】
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【配列表】
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【国際調査報告】
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