(57)【要約】  本開示の態様は、例えば、膜結合型銅輸送ＡＴＰアーゼ及び可溶性銅トランスポーターなど、宿主細胞での銅輸送に関与する１つ又は２つ以上のタンパク質の発現レベルを操作することによる、宿主細胞から分泌される銅酵素の発現の改良方法に関する。本開示は、そのような改良された宿主細胞と、目的とする１つ又は２つ以上の銅酵素を含む改良された宿主細胞由来の生成物とを含む組成物も提供する。【選択図】図１Ａ
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【特許請求の範囲】
【請求項１】
宿主細胞からの銅酵素の産生方法であって、
銅酵素を発現する宿主細胞で銅金属シャペロンを過剰発現させることと、
前記銅酵素を産生するのに十分な条件下で前記宿主細胞を培養することと、を含み、
前記宿主細胞が、実質的に同じ培養条件下で培養されたときに前記銅金属シャペロンを過剰発現しない対応する宿主細胞と比較して、増加した量の前記銅酵素を産生する、方法。
【請求項２】
前記銅酵素が、前記宿主細胞から分泌される、請求項１に記載の方法。
【請求項３】
前記銅酵素が、溶解性多糖モノオキシゲナーゼ（ＬＰＭＯ）、ラッカーゼ、チロシナーゼ、アミンオキシダーゼ、ビリルビンオキシダーゼ、カテコールオキシダーゼ、ドーパミンβ−モノオキシゲナーゼ、ガラクトースオキシダーゼ、ヘキソースオキシダーゼ、Ｌ−アスコルビン酸オキシダーゼ、ペプチジルグリシンモノオキシゲナーゼ、ポリフェノールオキシダーゼ、ケルセチン２，３−ジオキシゲナーゼ、及びスーパーオキシドジスムターゼからなる群から選択される、請求項１又は２に記載の方法。
【請求項４】
前記銅酵素が、前記宿主細胞に内因性である、請求項１〜３のいずれか一項に記載の方法。
【請求項５】
前記銅酵素が、前記宿主細胞に異種性である、請求項１〜３のいずれか一項に記載の方法。
【請求項６】
前記銅酵素及び／又は前記銅金属シャペロンの発現が、前記宿主細胞由来のプロモーターによって制御される、請求項１〜５のいずれか一項に記載の方法。
【請求項７】
前記宿主細胞が、トリコデルマ・リーゼイ（T. reesei）細胞であり、前記プロモーターが、トリコデルマ・リーゼイ由来のピルビン酸キナーゼ（ｐｋｉ）又はセロビオヒドロラーゼＩ（ｃｂｈ１）プロモーターである、請求項６に記載の方法。
【請求項８】
前記宿主細胞が、少なくとも１つの追加の銅酵素を発現し、前記少なくとも１つの追加の銅酵素の産生レベルが、実質的に同じ培養条件下で前記銅金属シャペロンを過剰発現しない対応する宿主細胞と比較して増加している、請求項１〜７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項９】
前記銅金属シャペロンが、膜結合型銅輸送ＡＴＰアーゼである、請求項１〜８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１０】
前記膜結合型銅輸送ＡＴＰアーゼが、配列番号６と少なくとも６０％同一であるアミノ酸配列を含む、請求項９に記載の方法。
【請求項１１】
前記膜結合型銅輸送ＡＴＰアーゼが、表２に列記されるものから選択される、請求項９又は１０に記載の方法。
【請求項１２】
前記銅金属シャペロンが、可溶性銅トランスポーターである、請求項１〜８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１３】
前記可溶性銅トランスポーターが、配列番号３と少なくとも６０％同一であるアミノ酸配列を含む、請求項１２に記載の方法。
【請求項１４】
前記可溶性銅トランスポーターが、表１に列記されるものから選択される、請求項１２又は１３に記載の方法。
【請求項１５】
前記宿主細胞で第２の銅金属シャペロンを過剰発現させることを更に含む、請求項１〜１４のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１６】
前記第１の銅金属シャペロンが、配列番号６と少なくとも６０％同一であるアミノ酸配列を含む膜結合型銅輸送ＡＴＰアーゼであり、前記第２の銅金属シャペロンが、配列番号３と少なくとも６０％同一であるアミノ酸配列を含む可溶性銅トランスポーターである、請求項１５に記載の方法。
【請求項１７】
前記宿主細胞が、糸状菌宿主細胞である、請求項１〜１６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１８】
前記糸状菌宿主が、アスペルギルス、アクレモニウム、アウレオバシジウム、ボーベリア、セファロスポリウム、セリポリオプシス、ケトミウム・ペシロマイセス、クリソスポリウム、クラビセプス、コキオボラス、クリプトコッカス、シアツス、エンドチア、エンドチア・ムコール、フザリウム、ギロクラディウム、フミコーラ、マグナポルテ、ミセリオフトラ、ミロテシウム、ムコール、ニューロスポラ、ファネロカエテ、ポドスポラ、ペシロマイセス、ペニシリウム、ピリキュラリア、リゾムコール、リゾプス、シゾフィラム、スタゴノスポラ、タラロマイセス、トリコデルマ、サーモマイセス、サーモアスカス、チエラビア、トリポクラジウム、トリコフィトン、トラメテス、及びプレウロタスからなる群から選択される、請求項１７に記載の方法。
【請求項１９】
前記糸状菌宿主細胞が、トリコデルマ・リーゼイ、アスペルギルス・ニガー、アスペルギルス・オリザエ、又はタラロマイセス・エメルソニ宿主細胞である、請求項１７に記載の方法。
【請求項２０】
前記過剰発現させることが、前記宿主細胞での転写因子Ｍａｃ１の発現を増加させることを含む、請求項１〜１９のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２１】
前記Ｍａｃ１の発現を増加させることが、Ｍａｃ１発現ベクターを前記宿主細胞に導入することを含む、請求項２０に記載の方法。
【請求項２２】
宿主細胞の銅毒性の低減方法であって、
宿主細胞で銅金属シャペロンを過剰発現させることを含み、前記宿主細胞が、前記銅金属シャペロンを過剰発現しない対応する宿主細胞と比較して低減された銅毒性を有する、方法。
【請求項２３】
前記宿主細胞が、銅酵素を過剰発現する、請求項２２に記載の方法。
【請求項２４】
細胞培養ブロス中の銅濃度の低減方法であって、
銅を含む細胞培養培地で銅金属シャペロンを過剰発現する宿主細胞を培養して、細胞培養ブロスを産生することを含み、結果として生じる細胞培養ブロス中の銅濃度が、実質的に同じ培養条件下で実質的に同じ細胞培養培地で培養されたときに前記銅金属シャペロンを過剰発現しない対応する宿主細胞から得られる細胞培養ブロスの銅濃度と比較して減少している、方法。
【請求項２５】
組換え宿主細胞であって、
銅酵素をコードする第１のポリヌクレオチドと、
銅金属シャペロンをコードする第２のポリヌクレオチドと、を含み、
前記銅酵素が、前記宿主細胞で発現し、前記銅金属シャペロンが、前記宿主細胞で過剰発現し、
前記銅酵素の発現レベルが、実質的に同じ培養条件下で前記銅金属シャペロンを過剰発現しない対応する宿主細胞と比較して、前記宿主細胞で増加している、組換え宿主細胞。
【請求項２６】
前記銅酵素が、前記宿主細胞から分泌される、請求項２５に記載の組換え宿主細胞。
【請求項２７】
前記銅酵素が、溶解性多糖モノオキシゲナーゼ（ＬＰＭＯ）、ラッカーゼ、チロシナーゼ、アミンオキシダーゼ、ビリルビンオキシダーゼ、カテコールオキシダーゼ、ドーパミンβ−モノオキシゲナーゼ、ガラクトースオキシダーゼ、ヘキソースオキシダーゼ、Ｌ−アスコルビン酸オキシダーゼ、ペプチジルグリシンモノオキシゲナーゼ、ポリフェノールオキシダーゼ、ケルセチン２，３−ジオキシゲナーゼ、及びスーパーオキシドジスムターゼからなる群から選択される、請求項２５又は２６に記載の組換え宿主細胞。
【請求項２８】
前記銅酵素が、表３に列記されるものから選択される、請求項２７に記載の組換え宿主細胞。
【請求項２９】
前記銅酵素が、前記宿主細胞に異種性である、請求項２５〜２８のいずれか一項に記載の組換え宿主細胞。
【請求項３０】
前記銅酵素及び／又は前記銅金属シャペロンの発現が、前記宿主細胞のプロモーターによって制御される、請求項２５〜２９のいずれか一項に記載の組換え宿主細胞。
【請求項３１】
宿主細胞が、トリコデルマ・リーゼイであり、前記プロモーターが、トリコデルマ・リーゼイ由来のｐｋｉ又はｃｂｈ１プロモーターである、請求項３０に記載の組換え宿主細胞。
【請求項３２】
前記第２のポリヌクレオチドが、配列番号６と少なくとも６０％同一であるアミノ酸配列を含む膜結合型銅輸送ＡＴＰアーゼをコードする、請求項２５〜３１のいずれか一項に記載の組換え宿主細胞。
【請求項３３】
前記第２のポリヌクレオチドが、配列番号３と少なくとも６０％同一であるアミノ酸配列を含む可溶性銅トランスポーターをコードする、請求項２５〜３２のいずれか一項に記載の組換え宿主細胞。
【請求項３４】
前記宿主細胞が、第２の銅金属シャペロンをコードする第３のポリヌクレオチドを更に含む、請求項２５〜３３のいずれか一項に記載の組換え宿主細胞。
【請求項３５】
前記第１の銅金属シャペロンが、配列番号６と少なくとも６０％同一であるアミノ酸配列を含む膜結合型銅輸送ＡＴＰアーゼであり、前記第２の銅金属シャペロンが、配列番号３と少なくとも６０％同一であるアミノ酸配列を含む可溶性銅トランスポーターである、請求項３４に記載の組換え宿主細胞。
【請求項３６】
前記組換え宿主細胞が、糸状菌宿主細胞である、請求項２５〜３５のいずれか一項に記載の組換え宿主細胞。
【請求項３７】
前記糸状菌宿主が、アスペルギルス、アクレモニウム、アウレオバシジウム、ボーベリア、セファロスポリウム、セリポリオプシス、ケトミウム・ペシロマイセス、クリソスポリウム、クラビセプス、コキオボラス、クリプトコッカス、シアツス、エンドチア、エンドチアムコール、フザリウム、ギロクラディウム、フミコーラ、マグナポルテ、ミセリオフトラ、ミロテシウム、ムコール、ニューロスポラ、ファネロカエテ、ポドスポラ、ペシロマイセス、ペニシリウム、ピリキュラリア、リゾムコール、リゾプス、シゾフィラム、スタゴノスポラ、タラロマイセス、トリコデルマ、サーモマイセス、サーモアスカス、チエラビア、トリポクラジウム、トリコフィトン、トラメテス、及びプレウロタスからなる群から選択される、請求項３６に記載の組換え宿主細胞。
【請求項３８】
前記糸状菌宿主細胞が、トリコデルマ・リーゼイ、アスペルギルス・ニガー、アスペルギルス・オリザエ、又はタラロマイセス・エメルソニ宿主細胞である、請求項３６に記載の組換え宿主細胞。
【請求項３９】
前記組換え宿主細胞が、Ｍａｃ１を過剰発現し、Ｍａｃ１の過剰発現が、前記宿主細胞での前記銅金属シャペロンの過剰発現をもたらす、請求項２５〜３８のいずれか一項に記載の組換え宿主細胞。
【請求項４０】
請求項２５〜３９のいずれか一項に記載の組換え宿主細胞の培養物から得られる上清。
【請求項４１】
請求項１〜２４のいずれか一項に記載の方法を使用して得られる上清。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
（関連出願の相互参照）
本出願は、参照により全体が本明細書に援用される、２０１４年８月１５日に出願された米国仮特許出願第６２／０３８，０９５号の優先権を主張するものである。
【０００２】
（配列表）
米国特許法施行規則第１．５２条に従う、ＥＦＳにより提出された配列表が、参照により本明細書に援用される。ＥＦＳにより提出された配列表のテキストファイルは、２０１５年７月１０日に作成されたファイル「４０４５６ＷＯＰＣＴ＿ＳＴ２５．ｔｘｔ」を含み、４４キロバイトのサイズである。
【０００３】
（発明の分野）
本開示の態様は、例えば、膜結合型銅輸送ＡＴＰアーゼ及び可溶性銅トランスポーターなど、１つ又は２つ以上の銅金属シャペロンの発現量を操作することにより、宿主細胞から分泌される銅酵素の発現の改良方法に関する。本開示は、そのような改良された宿主細胞と、目的とする１つ又は２つ以上の銅酵素を含有する改良された宿主細胞から作製された生成物とを含む組成物も提供する。
【背景技術】
【０００４】
銅は、多くの酵素（ここでは銅酵素と称する）の重要なコファクターである、酸化還元活性を有する遷移金属である。しかしながら、細胞内の遊離銅の濃度は、その毒性のため、低濃度に保たれなければならない。すなわち、全細胞中の銅の０．０１％未満が細胞質内に遊離しており、大部分の銅は、その細胞毒性作用を防止するために、メタロチオネインにより結合、キレート化される。更に、細胞の区画の違いにより銅濃度が異なり、ミトコンドリアでは細胞質より銅濃度が高く、またゴルジ体よりも濃度が高い。
【０００５】
このような酵素を過剰発現させるように設計された組換え宿主細胞において、１つ又は２つ以上の機能性銅酵素を産生するための工業的環境において、細胞内の遊離銅の利用可能性は限られている。上記のような細胞内の銅の偏りにより、この問題は、銅酵素を分泌させる際に特に顕著となる。しかしながら、宿主細胞を培養しながら正しいバランスを維持できる量で追加の銅を供給すること、すなわち、宿主細胞に毒性を与えることなく、機能性の銅酵素の分泌生産を促進することは、技術的にかなり困難である。
【０００６】
宿主細胞からの銅酵素の生産に関連する問題に加えて、製造プラントからの廃液中の許容銅濃度も規制されている。すなわち、銅酵素の培養生産プロセスに添加できる銅の量にも限度が存在する。
【発明の概要】
【発明が解決しようとする課題】
【０００７】
以上より、組み換え宿主細胞を開発し、当該宿主細胞を用いて培養プロセスにおいて銅酵素の生産を向上させる方法に対するニーズが存在する。
【課題を解決するための手段】
【０００８】
本発明の態様は、少なくとも部分的には、望ましい組み換え宿主細胞（例えば糸状菌宿主細胞）における１つ又は２つ以上の銅金属シャペロンの発現増加により、宿主細胞における銅酵素の分泌生産を向上させることができる、という発見に基づく。したがって、１つ又は２つ以上の銅金属シャペロンの発現が増加した組み換え宿主細胞が本明細書で提供され、当該細胞は、実質的に同じ培養条件下で１つ又は２つ以上の銅金属シャペロンの発現増加を示さない親である宿主細胞と比較し、銅酵素の産生／分泌能が向上している。銅酵素をこれらの宿主細胞から産生する方法、並びにそのような宿主細胞から産生される銅酵素を含有する組成物も提供される。
【０００９】
本発明の組成物及び方法において用いられる分泌される銅酵素の例としては、限定されないが、溶解性多糖モノオキシゲナーゼ（ＬＰＭＯ）、ラッカーゼ、チロシナーゼ、アミンオキシダーゼ、ビリルビンオキシダーゼ、カテコールオキシダーゼ、ドーパミンベータ−モノオキシゲナーゼ、ガラクトースオキシダーゼ、ヘキソースオキシダーゼ、Ｌ−アスコルビン酸オキシダーゼ、ペプチジルグリシンモノオキシゲナーゼ、ポリフェノールオキシダーゼ、ケルセチン２，３−ジオキシゲナーゼ及びスーパーオキシドジスムターゼが挙げられる。
【００１０】
本発明の態様には、限定されないが、以下のものが含まれる。
１．宿主細胞からの銅酵素の産生方法であって、銅酵素を発現する宿主細胞で銅金属シャペロンを過剰発現させることと、銅酵素を産生するのに十分な条件下で前記宿主細胞を培養することと、を含み、前記宿主細胞が、実質的に同じ培養条件下で培養されたときに前記銅金属シャペロンを過剰発現しない対応する宿主細胞と比較して、増加した量の前記銅酵素を産生する、方法。
２．前記銅酵素が、前記宿主細胞から分泌される、態様１に記載の方法。
３．前記銅酵素が、溶解性多糖モノオキシゲナーゼ（ＬＰＭＯ）、ラッカーゼ、チロシナーゼ、アミンオキシダーゼ、ビリルビンオキシダーゼ、カテコールオキシダーゼ、ドーパミンβ−モノオキシゲナーゼ、ガラクトースオキシダーゼ、ヘキソースオキシダーゼ、Ｌ−アスコルビン酸オキシダーゼ、ペプチジルグリシンモノオキシゲナーゼ、ポリフェノールオキシダーゼ、ケルセチン２，３−ジオキシゲナーゼ、及びスーパーオキシドジスムターゼからなる群から選択される、態様１又は２に記載の方法。
４．前記銅酵素が、前記宿主細胞に内因性である、態様１〜３のいずれかに記載の方法。
５．前記銅酵素が、前記宿主細胞に異種性である、態様１〜４のいずれかに記載の方法。
６．前記銅酵素及び／又は前記銅金属シャペロンの発現が、前記宿主細胞由来のプロモーターによって制御される、態様１〜５のいずれかに記載の方法。
７．前記宿主細胞が、トリコデルマ・リーゼイ（T. reesei）細胞であり、前記プロモーターが、トリコデルマ・リーゼイ由来のピルビン酸キナーゼ（ｐｋｉ）又はセロビオヒドロラーゼＩ（ｃｂｈ１）プロモーターである、態様６に記載の方法。
８．前記宿主細胞が、少なくとも１つの追加の銅酵素を発現し、前記少なくとも１つの追加の銅酵素の産生レベルが、実質的に同じ培養条件下で前記銅金属シャペロンを過剰発現しない対応する宿主細胞と比較して増加している、態様１〜７のいずれかに記載の方法。
９．前記銅金属シャペロンが、膜結合型銅輸送ＡＴＰアーゼである、態様１〜８のいずれかに記載の方法。
１０．前記膜結合型銅輸送ＡＴＰアーゼが、配列番号６と少なくとも６０％同一であるアミノ酸配列を含む、態様９に記載の方法。
１１．前記膜結合型銅輸送ＡＴＰアーゼが、表２に列記されるものから選択される、態様９又は１０に記載の方法。
１２．前記銅金属シャペロンが、可溶性銅トランスポーターである、態様１〜８のいずれか１つに記載の方法。
１３．前記可溶性銅トランスポーターが、配列番号３と少なくとも６０％同一であるアミノ酸配列を含む、態様１２に記載の方法。
１４．前記可溶性銅トランスポーターが、表１に列記されるものから選択される、態様１２又は１３に記載の方法。
１５．前記宿主細胞で第２の銅金属シャペロンを過剰発現させることを更に含む、態様１〜１４のいずれかに記載の方法。
１６．前記第１の銅金属シャペロンが、配列番号６と少なくとも６０％同一であるアミノ酸配列を含む膜結合型銅輸送ＡＴＰアーゼであり、前記第２の銅金属シャペロンが、配列番号３と少なくとも６０％同一であるアミノ酸配列を含む可溶性銅トランスポーターである、態様１５に記載の方法。
１７．前記宿主細胞が、糸状菌宿主細胞である、態様１〜１６のいずれかに記載の方法。
１８．前記糸状菌宿主が、アスペルギルス、アクレモニウム、アウレオバシジウム、ボーベリア、セファロスポリウム、セリポリオプシス、ケトミウム・ペシロマイセス、クリソスポリウム、クラビセプス、コキオボラス、クリプトコッカス、シアツス、エンドチア、エンドチア・ムコール、フザリウム、ギロクラディウム、フミコーラ、マグナポルテ、ミセリオフトラ、ミロテシウム、ムコール、ニューロスポラ、ファネロカエテ、ポドスポラ、ペシロマイセス、ペニシリウム、ピリキュラリア、リゾムコール、リゾプス、シゾフィラム、スタゴノスポラ、タラロマイセス、トリコデルマ、サーモマイセス、サーモアスカス、チエラビア、トリポクラジウム、トリコフィトン、トラメテス、及びプレウロタスからなる群から選択される、態様１７に記載の方法。
１９．前記糸状菌宿主細胞が、トリコデルマ・リーゼイ、アスペルギルス・ニガー、アスペルギルス・オリザエ、又はタラロマイセス・エメルソニ宿主細胞である、態様１７に記載の方法。
２０．前記過剰発現させることが、前記宿主細胞での転写因子Ｍａｃ１の発現を増加させることを含む、態様１〜１９のいずれかに記載の方法。
２１．前記Ｍａｃ１の発現を増加させることが、Ｍａｃ１発現ベクターを宿主細胞に導入することを含む、態様２０に記載の方法。
２２．宿主細胞の銅毒性の低減方法であって、宿主細胞で銅金属シャペロンを過剰発現させることを含み、前記宿主細胞が、前記銅金属シャペロンを過剰発現しない対応する宿主細胞と比較して低減された銅毒性を有する、方法。
２３．前記宿主細胞が、銅酵素を過剰発現する、態様２２に記載の方法。
２４．細胞培養ブロス中の銅濃度の低減方法であって、銅を含む細胞培養培地で銅金属シャペロンを過剰発現する宿主細胞を培養して、細胞培養ブロスを産生することを含み、結果として生じる細胞培養ブロス中の銅濃度が、実質的に同じ培養条件下で実質的に同じ細胞培養培地で培養されたときに前記銅金属シャペロンを過剰発現しない対応する宿主細胞から得られる細胞培養ブロスの銅濃度と比較して減少している、前記方法。
２５．組換え宿主細胞であって、銅酵素をコードする第１のポリヌクレオチドと、銅金属シャペロンをコードする第２のポリヌクレオチドと、を含み、前記銅酵素が、前記宿主細胞で発現し、前記銅金属シャペロンが、前記宿主細胞で過剰発現し、前記銅酵素の発現レベルが、実質的に同じ培養条件下で前記銅金属シャペロンを過剰発現しない対応する宿主細胞と比較して、前記宿主細胞で増加している、組換え宿主細胞。
２６．前記銅酵素が、前記宿主細胞から分泌される、態様２５に記載の組換え宿主細胞。
２７．前記銅酵素が、溶解性多糖モノオキシゲナーゼ（ＬＰＭＯ）、ラッカーゼ、チロシナーゼ、アミンオキシダーゼ、ビリルビンオキシダーゼ、カテコールオキシダーゼ、ドーパミンβ−モノオキシゲナーゼ、ガラクトースオキシダーゼ、ヘキソースオキシダーゼ、Ｌ−アスコルビン酸オキシダーゼ、ペプチジルグリシンモノオキシゲナーゼ、ポリフェノールオキシダーゼ、ケルセチン２，３−ジオキシゲナーゼ、及びスーパーオキシドジスムターゼからなる群から選択される、態様２５に記載の組換え宿主細胞。
２８．前記銅酵素が、表３に列記されるものから選択される、態様２７に記載の組換え宿主細胞。
２９．前記銅酵素が、前記宿主細胞に異種性である、態様２５〜２８のいずれか１つに記載の組換え宿主細胞。
３０．前記銅酵素及び／又は前記銅金属シャペロンの発現が、前記宿主細胞のプロモーターによって制御される、態様２５〜２９のいずれか１つに記載の組換え宿主細胞。
３１．宿主細胞が、トリコデルマ・リーゼイであり、前記プロモーターが、トリコデルマ・リーゼイ由来のｐｋｉ又はｃｂｈ１プロモーターである、態様３０に記載の組換え宿主細胞。
３２．前記第２のポリヌクレオチドが、配列番号６と少なくとも６０％同一であるアミノ酸配列を含む膜結合型銅輸送ＡＴＰアーゼをコードする、態様２５〜３１のいずれか１つに記載の組換え宿主細胞。
３３．前記第２のポリヌクレオチドが、配列番号３と少なくとも６０％同一であるアミノ酸配列を含む可溶性銅トランスポーターをコードする、態様２５〜３２のいずれか１つに記載の組換え宿主細胞。
３４．前記宿主細胞が、第２の銅金属シャペロンをコードする第３のポリヌクレオチドを更に含む、態様２５〜３３のいずれか１つに記載の組換え宿主細胞。
３５．前記第１の銅金属シャペロンが、配列番号６と少なくとも６０％同一であるアミノ酸配列を含む膜結合型銅輸送ＡＴＰアーゼであり、前記第２の銅金属シャペロンが、配列番号３と少なくとも６０％同一であるアミノ酸配列を含む可溶性銅トランスポーターである、態様３４に記載の組換え宿主細胞。
３６．前記組換え宿主細胞が、糸状菌宿主細胞である、態様２５〜３５のいずれか１つに記載の組換え宿主細胞。
３７．前記糸状菌宿主が、アスペルギルス、アクレモニウム、アウレオバシジウム、ボーベリア、セファロスポリウム、セリポリオプシス、ケトミウム・ペシロマイセス、クリソスポリウム、クラビセプス、コキオボラス、クリプトコッカス、シアツス、エンドチア、エンドチア・ムコール、フザリウム、ギロクラディウム、フミコーラ、マグナポルテ、ミセリオフトラ、ミロテシウム、ムコール、ニューロスポラ、ファネロカエテ、ポドスポラ、ペシロマイセス、ペニシリウム、ピリキュラリア、リゾムコール、リゾプス、シゾフィラム、スタゴノスポラ、タラロマイセス、トリコデルマ、サーモマイセス、サーモアスカス、チエラビア、トリポクラジウム、トリコフィトン、トラメテス、及びプレウロタスからなる群から選択される、態様３６に記載の組換え宿主細胞。
３８．前記糸状菌宿主細胞が、トリコデルマ・リーゼイ、アスペルギルス・ニガー、アスペルギルス・オリザエ、又はタラロマイセス・エメルソニ宿主細胞である、態様３６に記載の組換え宿主細胞。
３９．前記組換え宿主細胞が、Ｍａｃ１を過剰発現し、Ｍａｃ１の過剰発現が、前記宿主細胞での前記銅金属シャペロンの過剰発現をもたらす、態様２５〜３８のいずれかに記載の組換え宿主細胞。
４０．態様２５〜３９の一つに記載の組換え宿主細胞の培養物から得られる上清。
４１．態様１〜２１のいずれか一つに記載の方法を使用して得られる上清。
【図面の簡単な説明】
【００１１】
当業者であれば、以下に係る図面が説明のみを目的とするものであると理解するであろう。
【００１２】
当該図面は、いかなる形であれ、本教示の範囲を限定することを目的とするものではない。
【図１Ａ】トリコデルマ・リーゼイ由来の銅金属シャペロンの発現構築物の概略図を示す。膜結合型銅トランスポーターＡＴＰアーゼの発現構築物。
【図１Ｂ】トリコデルマ・リーゼイ由来の銅金属シャペロンの発現構築物の概略図を示す。細胞質の（可溶性）銅トランスポーターの発現構築物。これらの銅の金属シャペロン遺伝子を、構成的ピルビン酸キナーゼ（ｐｋｉ）プロモーターを用い、またＣＢＨ１遺伝子由来のターミネーターを含ませた形で発現させた。選択マーカー（ｈｐｈＲ）であるハイグロマイシン耐性遺伝子を用いて、上記のプラスミドを有する形成転換体を選抜した。ＡｍｐＲは、細菌細胞内でのプラスミドの伝播に用いられるアンピシリン耐性遺伝子である。
【図１Ｃ】トリコデルマ・リーゼイ由来の銅金属シャペロンの発現構築物の概略図を示す。トリコデルマ・リーゼイチロシナーゼ（アミノ酸配列：配列番号９）を過剰発現させるための発現ベクターを示す。ｃｂｈ１プロモーター及びそれに続くｃｂｈ１転写ターミネーターにより、チロシナーゼを転写させた。
【図２】チロシナーゼ過剰産生株の１４Ｌスケールの培養における、細胞外タンパク質発現のＳＤＳ−ＰＡＧＥによる分析を示す。培養時間を時間単位で下部に示し、銅のフィードの開始を上の矢印で示す。チロシナーゼ及びエンドグルカナーゼ６タンパク質のバンドを左側（各々Ｔｙｒ及びＥＧ６）で示す。銅含有チロシナーゼ酵素は、６９時間以内に産生のピークを示し、残りの時間では蓄積量が減少した。対照的に、銅を含有しないエンドグルカナーゼ６（ＥＧ６）酵素は、全時間経過において蓄積を示した。
【図３】銅濃度の増加によるチロシナーゼ発現に対する効果を示す。銅の量の増加（各レーンの下部に示す）によるチロシナーゼ（Ｔｙｒ）の発現を示すＳＤＳ−ＰＡＧＥである。図示されるように、増殖培地中の硫酸銅の量の増加によりチロシナーゼ合成が減少した。
【図４】０〜１０００μＭの範囲の銅濃度で培養した２つの異なるチロシナーゼ過剰産生株（Ａ及びＣ、各々上図及び下図の株に該当）の分析を示す。タンパク質産生への副作用のない銅の最高濃度は、約１５μＭであった。１５μＭ以上の銅濃度によりチロシナーゼ産生レベルが減少した。基質としてチロシンを用い、生成物の形成を検出することにより、培養上清に存在するチロシナーゼ活性を測定した（２８６ｎｍ（白色バー）及び４７０ｎｍ（黒色バー））。
【図５】チロシナーゼ活性のスポットアッセイを用いて、高濃度の銅（６ｍＭ）の存在下で培養したこれらの株で見られるチロシナーゼ活性を検出したが、チロシナーゼは検出できなかった。チロシナーゼ活性は株Ａ（レーン８のウェル）及びＣ（レーン１のウェル）のコントロールウェル（点線で示す）では検出できなかった。株Ａ及びＣが、膜結合型銅輸送ＡＴＰアーゼの発現プラスミド（レーン２〜７のウェル）又は細胞質（可溶性）銅トランスポーターの発現プラスミド（レーン９〜１２のウェル）で再度形質転換されたとき、これらの株のチロシナーゼ産生能が回復した。すなわち、これらのいずれの銅金属シャペロンの発現でも、銅毒性を低減でき、チロシナーゼ銅酵素の発現をもたらした。このアッセイにおいてチロシナーゼ活性は、１０μＬの培養上清及び２００μＬの１０％スキムミルク（３５℃に予熱）をマイクロタイタープレートに添加し、３５℃で少なくとも１０分間混合物をインキュベートすることにより検出した。チロシナーゼが存在し活性を示すとき、ミルクは白色から赤色に変化した。プラスの記号は、赤色が検出されたウェルを示す。
【図６】Ｃｅｒｒｅｎａ  ｕｎｉｃｏｌｏｒ由来の銅メタロプロテインラッカーゼＤの発現ベクター構築物を示す。ラッカーゼＤ遺伝子が、ｃｂｈ１プロモーターから転写され、ＣＢＨ１シグナル配列を経てｃｂｈ１転写ターミネーターに至る。成熟型のラッカーゼＤの配列を配列番号１０に示す。
【図７Ａ】銅金属シャペロンを過剰発現するか又はしないラッカーゼＤ過剰発現株（株３２Ａ）におけるラッカーゼＤ産生の解析を示す。株３２Ａ（最も左のバー、１００％で設定）、並びに株３２Ａ由来であり、細胞質トランスポーター及び膜結合型銅輸送ＡＴＰアーゼを過剰発現する（図１Ａ及び１Ｂに示される発現ベクターで形質転換された）株（＃４６、＃４７、及び＃４８）におけるラッカーゼＤの相対的発現量を示す。
【図７Ｂ】銅金属シャペロンを過剰発現するか又はしないラッカーゼＤ過剰発現株（株３２Ａ）におけるラッカーゼＤ産生の解析を示す。株３２Ａ（最も左のバー、１００％で設定）、並びに株３２Ａ由来であり、膜結合型銅輸送ＡＴＰアーゼを過剰発現する（図１Ａに示される発現ベクターで形質転換された）株（＃２、＃１６、＃２９、＃３０、及び＃３１）におけるラッカーゼＤの相対的発現量を示す。
【図７Ｃ】銅金属シャペロンを過剰発現するか又はしないラッカーゼＤ過剰発現株（株３２Ａ）におけるラッカーゼＤ産生の解析を示す。株３２Ａ（最も左のバー、１００％で設定）、並びに株３２Ａ由来であり、細胞質銅トランスポーターを過剰発現する（図１Ｂの発現ベクターで形質転換された）株（＃５、＃２２、＃２７、及び＃３５）におけるラッカーゼＤの相対的発現量を示す。
【発明を実施するための形態】
【００１３】
細胞質型（可溶性）及び膜結合型の銅金属シャペロンはいずれも、銅と結合して細胞内の所定の部位へ銅を輸送する機能を示し、当該部位において、銅メタロプロテイン（例えば銅酵素）として銅が取り込まれ得る（Ｏ’Ｈａｌｌｏｒａｎら、Ｍｅｔａｌｌｏｃｈａｐｅｒｏｎｅｓ，ａｎ  ｉｎｔｒａｃｅｌｌｕｌａｒ  ｓｈｕｔｔｌｅ  ｓｅｒｖｉｃｅ，ｆｏｒ  ｍｅｔａｌ  ｉｏｎｓ．２０００  ＪＢＣ：２７５（３３）：２５０５７〜２５０６０、及びＲｏｂｉｎｓｏｎら、Ｃｏｐｐｅｒ  Ｍｅｔａｌｌｏｃｈａｐｅｒｏｎｅｓ  ２０１０  Ａｎｎｕ．Ｒｅｖ．Ｂｉｏｃｈｅｍ．７９：５３７〜６２を参照）。分泌型の銅酵素の場合、細胞質型の銅トランスポーター（例えば酵母Ａｔｘ１ポリペプチド及びその相同体）及びゴルジ膜結合型銅パーミアーゼ（例えば酵母Ｃｃｃ２ポリペプチド及びその相同体）を含む多様な銅金属シャペロンが、ゴルジ複合体のルーメンへの銅の輸送を行う。ゴルジ体には、銅は発現／フォールディング／分泌プロセスの間に銅酵素に取り込まれ得る。（Ｈｕｆｆｍａｎら、Ｅｎｅｒｇｅｔｉｃｓ  ｏｆ  Ｃｏｐｐｅｒ  Ｔｒａｆｆｉｃｋｉｎｇ  ｂｅｔｗｅｅｎ  Ａｔｘ１  ｍｅｔａｌｌｏｃｈａｐｅｒｏｎｅ  ＆  ｔｈｅ  ｉｎｔｒａｃｅｌｌｕｌａｒ  Ｃｏｐｐｅｒ  ｔｒａｎｓｐｏｒｔｅｒ，Ｃｃｃ２．２０００  ＪＢＣ  ２７５（２５）．１８６１１〜１８６１４を参照）。銅金属シャペロンは、分析されている全ての真核生物間で高度に保存されている。
【００１４】
本教示は、宿主細胞における銅酵素の分泌が、１つ又は２つ以上の銅金属シャペロンの過剰発現によって改善できるという発見に基づく。したがって、本教示は、１つ又は２つ以上の銅金属シャペロン（例えば、可溶性銅トランスポーター、膜結合型銅トランスポーター、又はその両方）を過剰発現させることにより、宿主細胞（例えば糸状菌）におけるタンパク質分泌を増加させる方法を提供する。本教示は、分泌の増加を目的とする銅金属シャペロン及び銅酵素を含む発現用の宿主（例えば糸状菌）も提供する。
【００１５】
本発明の組成物及び方法をより詳細に説明する前に、本発明の組成物及び方法は、記載される特定の態様に限定されず、ゆえに、当然ながら適宜変形され得ることを理解すべきである。本明細書で使用される専門用語は、特定の実施形態を記載するという目的でのみ使用されるものであり、制限を意図するものではなく、したがって、本発明の組成物及び方法の範囲は、添付の特許請求の範囲によってのみ制限されることもまた理解されるであろう。
【００１６】
値の範囲が示される場合、間にある各値、文脈により別途明確に規定されない限り下限の単位の１０分の１まで、その範囲の上限と下限との間及びその規定の範囲内の任意の別の規定の値又は間にある値が、本発明の組成物及び方法の範囲内に包含されることが理解される。これらのより小さい範囲の上限及び下限は、独立してそれらのより小さい範囲に含まれてもよく、規定の範囲内の任意の明確に除外されている限界に従って、やはり本発明の組成物及び方法の範囲内に包含される。規定の範囲が上限若しくは下限のいずれか又は両方を含む場合、これらの含まれる上限若しくは下限のいずれか又は両方を除外する範囲もまた本発明の組成物及び方法に含まれる。
【００１７】
本明細書において、ある特定の範囲は、用語「約」が前に来る数値で示される。用語「約」は、本明細書において、その後に続く正確な数、並びにその用語の後に続く数に近い又は近似の数を文字で支持するために使用される。ある数が具体的に列挙されている数に近い又は近似の数であるかどうかを決定するとき、その近い又は近似する列挙されていない数は、それが提示されている文脈において、具体的に列挙されている数の実質的な同値を示す数であり得る。例えば、ある数値に関して、用語「約」は、その用語が文脈において別途明確に定義されていない限り、その数値の−１０％〜＋１０％の範囲を指す。別の例では、語句「約６のｐＨ値」は、そのｐＨ値が別途明確に定義されていない限り、５．４〜６．６のｐＨ値を指す。
【００１８】
本明細書において提供する項目は、明細書全体を参照することにより有することができる、本組成物及び方法の種々の態様又は実施形態を限定するものではない。したがって、すぐ下に定義される用語は、明細書全体を参照することにより、一層完全に定義される。
【００１９】
本明細書は、説明の簡略化のため、幾つかセクションで構成されているが、読者であれば、１つのセクションでなされた説明が他のセクションでも適用され得ることを理解するであろう。この方法では、本開示の異なる節で使用される項目は、限定的なものとして解釈されるべきではない。
【００２０】
別途定義されない限り、本明細書で使用される全ての技術及び科学用語は、本組成物及び方法の属する技術分野の当業者により一般に理解される意味と同様の意味を持つ。本組成物及び方法を実施又は試験する上で、本明細書に記載されるものと同様又は同等の任意の方法及び材料もまた使用することができるが、代表的な例示の方法及び材料を以下に記載する。
【００２１】
本明細書において引用されている全ての出版物及び特許は、それぞれの個々の出版物又は特許が参照により援用されると具体的かつ個々に示された場合と同様に、本明細書に参照により援用され、関連の出版物が引用された方法及び／又は材料を開示及び記述するために、参照により本明細書に援用される。任意の出版物の引用は、出願日の前のその開示に関するものであり、本発明の組成物及び方法が先行発明のためにそのような出版物に先行する権利を有さないことを承認するものと解釈されるべきではない。更に、示されている出版日は、実際の出版日とは異なる場合があり、それぞれ別個に確認する必要があるであろう。
【００２２】
この発明を実施するための形態に従い、以下の略記及び定義を適用する。なお、単数形「ａ」、「ａｎ」、及び「ｔｈｅ」には、内容によって明らかに指示がない限り、複数の指示対象が含まれることに留意されたい。よって、例えば、「酵素（an enzyme）」という場合には、複数のこうした酵素が含まれ、「投入量（the dosage）」という場合には、当業者には既知の１つ又は２つ以上の投入量及びその当量が含まれる。
【００２３】
特許請求の範囲は、任意選択的な要素を除外するように作成され得ることに更に留意されたい。したがって、この記述は、請求項の構成要素の列挙、又は「消極的（negative）」限定の使用に関連して、「だけ（solely）」、「のみ（only）」などのような排他的な用語を使用するための先行する根拠として役立つことを意図する。
【００２４】
本明細書で使用される用語「〜から本質的になる（consisting essentially of）」は、その用語の後の成分が、前記成分の作用又は活性に寄与又は干渉しない、全組成物の３０重量％未満の全量の他の既知の成分の存在下にある、組成物を指すことに更に留意されたい。
【００２５】
本明細書で使用される用語「含む（comprising）」は、用語「含む」の後の成分を含むが、これらに限定されないことを意味することにもまた留意されたい。用語「含む」の後の成分は、必要又は必須であるが、その成分を含む組成物は、他の必須でない又は任意選択的な成分も更に含み得る。
【００２６】
本明細書で使用される用語「〜からなる（consisting of）」は、用語「〜からなる」の後の成分を含み、これらに限定されることを意味することにもまた留意されたい。用語「〜からなる」の後の成分はしたがって、必要又は必須であり、他の成分は組成物中に存在しない。
【００２７】
本開示を読めば当業者には明らかとなるように、本明細書において記述及び例示されている個々の実施形態のそれぞれは、本明細書において記載されている本発明の組成物及び方法の範囲又は趣旨から逸脱することなく、他のいくつかの実施形態のいずれかの特徴と容易に分離し、又はそれと組み合わせることができる別個の成分及び特徴を有する。任意の列挙されている方法は、列挙されている事象の順序で又は論理的に可能な任意の他の順序で行うことができる。
【００２８】
定義
「コード配列」という用語は、本発明では、プロモーターを含む適切な制御配列の制御下に置かれたとき、ポリペプチドに翻訳され得るメッセンジャーＲＮＡに転写される核酸配列として定義する。コード配列は例えば、一つのオープンリーディングフレーム、又はイントロンによって分離された幾つかのオープンリーディングフレームを有してもよい。例えば、コード配列は、ｃＤＮＡ、ゲノムＤＮＡ、合成ＤＮＡ、又は組換えＤＮＡであってもよい。ＤＮＡコード配列は一般に、開始コドン（例えばＡＴＧ）で始まり、停止コドン（例えばＴＡＡ、ＴＡＧ、及びＴＧＡ）で終わる。
【００２９】
本明細書で使用される「銅金属シャペロン」又は「銅シャペロン」は、細胞内において、銅を必須とする金属酵素（また銅酵素とも呼ばれる）への銅の輸送及び／又は取り込みを促進するタンパク質である。銅金属シャペロンには、細胞質性（又は可溶性）の銅トランスポーター（例えば配列番号３及び表１）、膜結合型銅トランスポーター（例えば配列番号１２、１３、１４、及び１５、それらの相同体、並びに、その銅輸送活性を保持する少なくとも６０％、７０％、８０％、８１％、８２％、８３％、８４％、８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、又は９９％の同一性を有する配列）、膜結合型輸送ＡＴＰアーゼ（例えば配列番号６及び表２）が含まれる。後者には、宿主細胞から分泌されるタンパク質に銅を輸送する、ゴルジ膜に存在する銅金属シャペロンが含まれる（また、「銅パーミアーゼ」、「銅トランスポーターＡＴＰアーゼ」などとも呼ばれる）。
【００３０】
「銅酵素」は、１つ又は２つ以上の銅原子を含むあらゆる金属酵素を指す。その例としては、限定されないが、溶解性多糖モノオキシゲナーゼ（ＬＰＭＯ）、ラッカーゼ、チロシナーゼ、アミンオキシダーゼ、ビリルビンオキシダーゼ、カテコールオキシダーゼ、ドーパミンβ−モノオキシゲナーゼ、ガラクトースオキシダーゼ、ヘキソースオキシダーゼ、Ｌ−アスコルビン酸オキシダーゼ、ペプチジルグリシンモノオキシゲナーゼ、ポリフェノールオキシダーゼ、ケルセチン２，３−ジオキシゲナーゼ、及びスーパーオキシドジスムターゼが挙げられる。
【００３１】
「由来の」の用語は、「〜に起源を有する」、「〜から得た」、「〜から得られる」、「〜から単離した」、及び「〜から作製した」の用語を包含するものであり、一般に、１つの特定の材料が、その起源を別の特定の材料に有するか、又は別の特定の材料を参照して記載できる特徴を有することを指す。
【００３２】
本明細書で使用される用語「ＤＮＡ構築物」は、少なくとも２つの隣接するＤＮＡポリヌクレオチド断片を含むポリヌクレオチドを意味する。
【００３３】
ポリヌクレオチド又はポリペプチドに関する用語「内因性」は、宿主細胞中に天然に存在するポリヌクレオチド又はポリペプチドを指す。
【００３４】
「発現」という用語は、核酸配列に基づいてポリペプチドが産生される過程を指す。このプロセスは、転写と翻訳の両方を含む。
【００３５】
本明細書で使用される場合、「発現ベクター」は、１つ又は２つ以上の特定のポリペプチドをコードするＤＮＡ配列を含むＤＮＡ構築物を意味し、当該配列は、適切な宿主で当該１つ又は２つ以上のポリペプチドの発現に影響を及ぼし得る適切な制御配列と作動可能に連結される。このような調節配列として、転写に作用するプロモーター、転写を調節するための任意のオペレーター配列、ｍＲＮＡ上の適切なリボソーム結合部位をコードしている配列、並びに転写及び翻訳の終結を調節する配列を挙げることができる。異なる細胞タイプを、異なる発現ベクターとともに使用してもよい。枯草菌（Bacillus subtilis）で用いられるベクター用の典型的なプロモーターはＡｐｒＥプロモーターであり、ストレプトマイセス・リビダンスで用いられる典型的なプロモーターはＡ４プロモーター（アスペルギルス・ニガー由来）であり、大腸菌（E. coli）で用いられる典型的なプロモーターはＬａｃプロモーターであり、サッカロマイセス・セレビシエで用いられる典型的なプロモーターはＰＧＫ１であり、アスペルギルス・ニガーで用いられる典型的なプロモーターはｇｌａＡであり、トリコデルマ・リーゼイ用の典型的なプロモーターはｐｋｉ及びｃｂｈＩが挙げられる。ベクターは、プラスミド、ファージ粒子、又は単純に潜在的なゲノムインサートであってよい。ベクターは、好適な宿主に形質転換すると、宿主ゲノムとは独立して複製及び機能できるようになり、あるいは好適な条件下でゲノム自体に組み込まれ得る。本明細書において、プラスミド及びベクターは、互換的に使用されることがある。しかしながら、本発明の組成物及び方法は、同等の機能を果たし、当技術分野において公知である、又は公知となる他の形態の発現ベクターを含むことを意図する。よって、広範な種類の宿主／発現ベクターの組合せを、本明細書に記載のＤＮＡ配列を発現させるのに用いることができる。
【００３６】
有用な発現ベクターは、例えば、染色体の、非染色体以外の、及び合成ＤＮＡ配列のセグメントからなってもよく、例えば様々な公知のＳＶ４０誘導体及び公知の細菌プラスミド（例えばｃｏｌＥ１、ｐＣＲ１、ｐＢＲ３２２、ｐＭｂ９、ｐＵＣ  １９及びそれらの誘導体等の大腸菌由来プラスミド）、広宿主域プラスミド（例えばＲＰ４）、バクテリオファージＤＮＡ（例えばＮＭ９８９などの多くのバクテリオファージの誘導体）、及び他のＤＮＡファージ（例えばＭ１３）、及び一本鎖ＤＮＡファージ、酵母プラスミド（例えば２プラスミド又はその誘導体）、真核細胞用のベクター（例えば動物細胞用のベクター）、及びプラスミドとバクテリオファージＤＮＡとの組合せ由来のベクター（例えばバクテリオファージＤＮＡ又は他の発現制御配列を用いるために改良されたプラスミド）が挙げられる。本発明の組成物及び方法に係る発現ベクターを用いた発現技術は当業者に公知であり、その概略は、例えばＳａｍｂｒｏｏｋら、「Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｃｌｏｎｉｎｇ：Ａ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｍａｎｕａｌ」，Ｓｅｃｏｎｄ  Ｅｄｉｔｉｏｎ，Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｏｒ  Ｐｒｅｓｓ（１９８９）に記載されている。多くの場合、本明細書に記載のＤＮＡ配列を含むそのような発現ベクターが、取り込みイベントを通じて特定の種のゲノムへ直接挿入されることによって、単細胞宿主に形質転換する（例えば、Ｂｅｎｎｅｔｔ  ＆  Ｌａｓｕｒｅ，「Ｍｏｒｅ  Ｇｅｎｅ  Ｍａｎｉｐｕｌａｔｉｏｎｓ  ｉｎ  Ｆｕｎｇｉ」，Ａｃａｄｅｍｉｃ  Ｐｒｅｓｓ，Ｓａｎ  Ｄｉｅｇｏ，ｐｐ．７０〜７６（１９９１）、及びその中で宿主菌への標的特異的なゲノム挿入に関して引用される記事を参照）。
【００３７】
用語「糸状菌」は、エウミコチニア亜門に属する全ての糸状の形態の種を指す（Ａｌｅｘｏｐｏｕｌｏｓ，Ｃ．Ｊ．（１９６２），ＩＮＴＲＯＤＵＣＴＯＲＹ  ＭＹＣＯＬＯＧＹ，Ｗｉｌｅｙ，Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋを参照）。これらの真菌類は、キチン質、グルカン及び他の複合多糖から構成される細胞壁を有する栄養菌糸によって特徴づけられる。本教示の糸状菌は、形態学的に、生理学的に、及び遺伝学的に、酵母とは区別される。糸状菌の栄養生長は菌糸の伸展によるものであり、炭素の異化は絶対好気性である。糸状菌には、エウミコチニア亜門に属する全ての糸状の形態の種（特にＰｅｚｉｚｏｍｙｃｏｔｉｎａ種）が含まれる。糸状菌の親細胞は、限定されないが、トリコデルマ属（例えば、トリコデルマ・ロンギブラキアタム、トリコデルマ・ビリデ、トリコデルマ・コニンギ、トリコデルマ・ハルジアナム）、ペニシリウム属、フミコーラ属（フミコーラ・インソレンス及びフミコーラ・グリセア等）、クリソスポリウム属（クリソスポリウム・ルクノウェンス等）、ミセリオフトラ属、グリオクラジウム属、アスペルギルス属、フザリウム属、ニューロスポラ属、ヒポクレア属（例えば、ヒポクレアジェコリナ）及びエメリセラ属の種の細胞であってもよい。本明細書で使用される場合、用語「トリコデルマ」又は「トリコデルマ属」は、従来トリコデルマ属と分類されていたか、又はトリコデルマ属と現在分類されているあらゆる菌株のことを指す。具体的実施形態では、ＧＨ６１酵素は非糸状菌の細胞由来であり得る。ＧＨ６１Ａ酵素の例としては、ヒポクレア・ジェコリナ（トリコデルマ・リーゼイ）、ヒポクレア・ルーファ、ヒポクレア・オリエンタリス、ヒポクレア・アトロビリディス、ヒポクレア・ビレンス、エメリセラ・ニデュランス、アスペルギルス・テレウス、アスペルギルス・オリザエ、アスペルギルス・ニガー、アスペルギルス・カワチ、アスペルギルス・フラバス、アスペルギルス・クラバタス、ゲウマノミセス・グラミニス、トリコデルマ・サツリスポラム、ニューロスポラ・テトラスペルマ、ニューロスポラ・クラッサ、ニューロスポラ・フミゲート、ネオサルトリヤ・フミゲート、ネオサルトリヤ・フィシェリ、チエラビア・テレストリス、及びチエラビア・ヘテロタリカに存在する酵素が挙げられる。
【００３８】
「異種」という用語は、通常は相互に関係していない要素のことを指す。たとえば、組み換え宿主細胞が異種タンパク質を産生する場合には、当該タンパク質は、同じ野生型の宿主細胞で産生されず、異種プロモーターは、野生型の宿主細胞に内因性の核酸には存在しないプロモーターであり、また異種のコード配列に作動可能に連結したプロモーターは、通常野生型の宿主細胞において作動可能に連結していないコード配列に作動可能に連結したプロモーターである。
【００３９】
「異種」核酸構築物、又は配列は、それが発現される細胞に対して生来のものではない配列の一部を有する。制御配列に関して、異種は、今ではその発現を制御している同一の遺伝子を制御するように、天然では機能しない制御配列（すなわち、プロモーター又はエンハンサー）を指す。通常、異種核酸配列は、それらが存在する細胞又は遺伝子の一部にとって内因性ではなく、感染、トランスフェクション、形質転換、マイクロインジェクション、電気穿孔法又はこれらに類するものにより、細胞に添加されている。「異種」核酸構築物は、生来の細胞に見られる制御配列／ＤＮＡコード配列の組み合わせと同じ又は異なる制御配列／ＤＮＡコード配列を含有し得る。
【００４０】
用語「相同体」又は「相同な」は、ある生体分子が、対象となるアミノ酸配列又は対象となるヌクレオチド配列に対して、一定の同一性を有することを意味する。相同配列は、従来公知の配列アラインメントツール（例えばＣｌｕｓｔａｌ、ＢＬＡＳＴなど）を使用して、対象となる配列と少なくとも７５％、８０％、８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、又は９９％の同一性を有するアミノ酸又は核酸配列を含む配列として取得する。典型的には、対象となる酵素の相同体は、対象となる酵素と同じ／類似する活性部位残基を含み、及び／又は、特に明記しない限り類似する酵素活性を示す。
【００４１】
配列アラインメントを実施し、配列同一性を決定する方法は、当業者には既知であり、過度の実験を行わずとも実施することができ、同一性の値の計算は明確に得ることができるであろう。例えば、Ａｕｓｕｂｅｌら編、Ｃｕｒｒｅｎｔ  Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ  ｉｎ  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｂｉｏｌｏｇｙ，Ｃｈａｐｔｅｒ  １９（１９９５）（Ｇｒｅｅｎｅ  Ｐｕｂｌｉｓｈｉｎｇ  ａｎｄ  Ｗｉｌｅｙ−Ｉｎｔｅｒｓｃｉｅｎｃｅ，Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ）、及びＡＬＩＧＮプログラム（Ｄａｙｈｏｆｆ、Ａｔｌａｓ  ｏｆ  Ｐｒｏｔｅｉｎ  Ｓｅｑｕｅｎｃｅ  ａｎｄ  Ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ  ５：Ｓｕｐｐｌ．３（１９７８）（Ｎａｔｉｏｎａｌ  Ｂｉｏｍｅｄｉｃａｌ  Ｒｅｓｅａｒｃｈ  Ｆｏｕｎｄａｔｉｏｎ，Ｗａｓｈｉｎｇｔｏｎ，Ｄ．Ｃ．）を参照。配列のアラインメント及び配列同一性の決定のために、幾つかのアルゴリズムが利用でき、かかるアルゴリズムとしては、例えば、Ｎｅｅｄｌｅｍａｎらの相同性アラインメントアルゴリズム（Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．４８：４４３（１９７０））、Ｓｍｉｔｈらの局所的相同性アルゴリズムＡｄｖ．Ａｐｐｌ．Ｍａｔｈ．２：４８２（１９８１））、Ｐｅａｒｓｏｎらの類似性検索方法（Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．８５：２４４４（１９８８））、Ｓｍｉｔｈ−Ｗａｔｅｒｍａｎアルゴリズム（Ｍｅｔｈ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．７０：１７３〜１８７（１９９７））、並びにＢＬＡＳＴＰ、ＢＬＡＳＴＮ及びＢＬＡＳＴＸアルゴリズム（Ａｌｔｓｃｈｕｌら、Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．２１５：４０３〜４１０（１９９０））が挙げられる。
【００４２】
これらのアルゴリズムを用いたコンピュータ化されたプログラムも利用でき、かかるプログラムとしては、限定されないが、ＡＬＩＧＮ若しくはＭｅｇａｌｉｇｎ（ＤＮＡＳＴＡＲ）ソフトウェア、又はＷＵ−ＢＬＡＳＴ−２（Ａｌｔｓｃｈｕｌら、Ｍｅｔｈ．Ｅｎｚｙｍ．，２６６：４６０〜４８０（１９９６））、又はＧＡＰ、ＢＥＳＴＦＩＴ、ＢＬＡＳＴ、ＦＡＳＴＡ及びＴＦＡＳＴＡ（Ｇｅｎｅｔｉｃｓ  Ｃｏｍｐｕｔｉｎｇ  Ｇｒｏｕｐ（ＧＣＧ）のパッケージ、バージョン８、マディソン、ウィスコンシン、ＵＳＡにて利用可能）、及びＩｎｔｅｌｌｉｇｅｎｅｔｉｃｓ社（マウンテンビュー、カリフォルニア）のＰＣ／ＧｅｎｅプログラムのＣＬＵＳＴＡＬが挙げられる。当業者は、比較されている配列の長さにわたる最大のアラインメントを得るために必要とされるアルゴリズムを含む、アラインメントを評価するための適切なパラメータを決定することができる。好ましくは、配列同一性は、プログラムにより決定されるデフォルトパラメータを使用して決定される。具体的には、配列同一性は、以下のデフォルトパラメータにより、Ｃｌｕｓｔａｌ  Ｗ（Ｔｈｏｍｐｓｏｎ  Ｊ．Ｄ．ら、Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄｓ  Ｒｅｓ．２２：４６７３〜４６８０（１９９４））により決定できる：
【００４３】
【表１】
2017525359.tif 000003
【００４４】
本明細書で使用される場合、用語「宿主細胞」又は「宿主株」は、特定の目的（例えば特定の遺伝子の発現、ベクターの伝播など）に適する細胞を意味する。具体的実施形態では、宿主細胞は、本発明の組成物及び方法に係る目的とする１つ又は２つ以上のタンパク質をコードするポリヌクレオチド配列（例えば、銅酵素及び／又は１つ又は２つ以上の銅金属シャペロンをコードするポリヌクレオチド配列）を含む発現ベクターを有する。宿主細胞には、原核及び真核生物が含まれ、目的のポリペプチド／酵素（又は複数のポリペプチド／酵素）の発現、及び／又はベクターの伝播にとり有用ないかなる形質転換可能な微生物も含まれる。宿主細胞の例としては、限定されないが、バチルス属、ストレプトマイセス属、エシェリチア属、トリコデルマ属、アスペルギルス属、サッカロミセス属等の細胞種が挙げられる。具体的態様では、宿主細胞は、組み換え宿主細胞（すなわち天然には存在しない細胞（下記の「組換え体」の定義を参照））である。
【００４５】
細胞へ核酸配列を挿入するという文脈における「導入された」という用語は、当技術分野において公知の「遺伝子導入」、「形質転換」、又は「形質導入」を意味する。
【００４６】
本明細書で使用される場合、アミノ酸又はヌクレオチド配列に関する「配列同一性パーセント（％）」は、目的とする配列（例えば金属シャペロンタンパク質の配列）中のアミノ酸残基又はヌクレオチドと同一な、候補配列中のアミノ酸残基又はヌクレオチドの占めるパーセンテージとして定義される。その際には、配列を並べ、必要に応じてギャップを挿入して最適なアラインメント（最大の配列同一性（％））とし、また配列同一性の一部としていかなる保存的置換も考慮しない。
【００４７】
「精製された」又は「単離された」又は「富化された（enriched）」は、生体分子（例えば、ポリペプチド又はポリヌクレオチド）が、それが自然界において関連している自然発生成分の一部又は全てから分離されることによって、その天然の状態から改変されたことを意味する。かかる単離又は精製は、イオン交換クロマトグラフィー、アフィニティクロマトグラフィー、疎水性分離、透析、プロテアーゼ処理、硫安沈殿又は他のタンパク質塩析、遠心分離、サイズ排除クロマトグラフィー、濾過、精密濾過、ゲル電気泳動又は勾配分離などの当技術分野において承認されている分離技術によって達成されて、最終組成物において望ましくない細胞全体、細胞残屑、不純物、外来タンパク質、又は酵素を除去する。更に、精製され若しくは単離された生体分子組成物（例えば精製されたポリペプチド）に、別の成分（例えば活性化剤、抗阻害剤、好適なイオン、ｐＨ調製化合物又は他の酵素又は化学物質）を添加して追加の有利な性質を付与することができる。
【００４８】
本明細書で使用される場合、「微生物」は、細菌、真菌、ウイルス、原虫、及び他の微生物又は微小な生物を指す。
【００４９】
用語「核酸」及び「ポリヌクレオチド」は交換可能に用いられ、ＤＮＡ、ＲＮＡ、ｃＤＮＡ、それらの一本鎖体若しくは二本鎖体及び化学修飾体が含まれる。遺伝暗号は退縮を有するため、複数のコドンが特定のアミノ酸をコードする際に用いられることもあり、ゆえに本発明には、特定のアミノ酸配列をコードする全てのポリヌクレオチドが含まれる。
【００５０】
「作動可能に連結している」の用語は、複数の要素の配置が、それらの機能的関連を可能にしていることを指す。例えば、配列の転写制御の場合は、プロモーターはコード配列に作動可能に連結し、またシグナル配列が宿主細胞の分泌システムを通じてタンパク質に指示する場合は、シグナル配列はタンパク質と作動可能に連結する。
【００５１】
本明細書で使用される場合、「ポリペプチド」及び「酵素」という用語は互換的に使用されて、ペプチド結合により連結されたアミノ酸残基を含む任意の長さのポリマーを指す。アミノ酸残基については従来の一文字又は三文字コードが本明細書でも使用される。ポリマーは直鎖又は分枝鎖であってよく、修飾されたアミノ酸を含んでもよく、非アミノ酸によって中断されてもよい。当該用語はまた、天然に又は介入により修飾されたアミノ酸ポリマーが含まれ、例えば、ジスルフィド結合の形成、グリコシル化、リピド化、アセチル化、リン酸化又は他のあらゆる操作若しくは修飾（例えば標識物質とのコンジュゲート）が含まれる。例えば、アミノ酸の１つ又は２つ以上の類似体（例えば、非天然アミノ酸などを含む）を含有するポリペプチド、並びに当技術分野において公知の他の修飾物も定義に含まれる。
【００５２】
用語「プロモーター」は、本発明では細胞内で下流のポリヌクレオチドの転写を指令する核酸として定義される。具体的な場合では、当該ポリヌクレオチドはコード配列を含んでもよく、プロモーターは翻訳可能なＲＮＡへのコード配列の転写を誘導し得る。
【００５３】
用語「組換え」は、生体成分又は組成物（例えば、細胞、核酸、ポリペプチド／酵素、ベクターなど）に関連して使用される場合、生体成分又は組成物が天然では見られない形態であることを示す。換言すれば、生体成分又は組成物は、人間の介入によって、天然の形態から変化させられている。例えば、組み換え細胞（又は宿主細胞）には、その天然の親細胞（すなわち非組み換え細胞）に存在しない１つ又は２つ以上の遺伝子を発現する細胞、１つ又は２つ以上の天然の遺伝子をその天然の親細胞とは異なる量で発現する細胞、及び／又はその天然の親細胞とは異なる条件下で１つ又は２つ以上の天然の遺伝子を発現する細胞が含まれる。組み換え核酸は、１つ又は２つ以上のヌクレオチドにより天然の配列と異なってもよく、異種配列（例えば異種プロモーター、非天然若しくは変異型シグナル配列をコードする配列など）と作動可能に連結してもよく、イントロン配列を欠いてもよく、及び／又は単離された形態であってもよい。組換えポリペプチド／酵素は、天然の配列とは１つ又は２つ以上のアミノ酸が異なっていてもよく、異種配列と融合されていてもよく、短縮されている若しくはアミノ酸の内部欠失を有していてもよく、天然の細胞には見られない様式で（例えば、ポリペプチドをコードする発現ベクターが細胞中に存在することによりポリペプチドを過剰発現する組換え細胞から）発現してもよく、かつ／又は単離された形態であってもよい。いくつかの実施形態では、組換えポリヌクレオチド又はポリペプチド／酵素は、対応する野生型と同一であるが、非天然形態（例えば、単離された又は富化された形態）である配列を有することが強調される。
【００５４】
用語「シグナル配列」は、タンパク質のＮ末端部分に存在し、細胞外への成熟型タンパク質の分泌を促進する一連のアミノ酸のことを指す。細胞外タンパク質の成熟型は、分泌プロセスの際に切断されるシグナル配列は有していない。
【００５５】
用語「ベクター」は本発明では、１つ又は２つ以上のタイプの細胞に導入される核酸配列を輸送するよう設計されたポリヌクレオチドとして定義される。ベクターには、クローニングベクター、発現ベクター、シャトルベクター、プラスミド、バクテリオファージ又はウイルス粒子、ＤＮＡ構築物、発現カセットなどが含まれる。発現ベクター及びカセットは、調節配列（例えばプロモーター、シグナル配列、コード配列及び転写ターミネーター）を有してもよい。
【００５６】
「実質的に同じ培養条件」等の用語は、第１の宿主細胞が、第２の宿主細胞と同じ又はほとんど同じに培養されることにより、第１及び第２の宿主細胞の性能又は特徴において有意な比較が可能である条件を意味する。実質的に同じであり得るパラメータには、温度、ｐＨ、銅濃度、時間、撹拌、培地等が含まれる。比較用の宿主細胞の培養を「実質的に同じ培養条件」下で実施する際の設定は、当業者の技量の範囲内である。
【００５７】
用語「形質転換された」、「安定に形質転換された」及び「トランスジェニック」は、ゲノム中に組み込まれたか、又は複数世代を通して維持されるエピソームとして保持される非天然の（例えば異種）核酸配列を有する細胞のことを指す。
【００５８】
ラッカーゼ（ＩＵＢＭＢ酵素番号：ＥＣ  １．１０．３．２）は、多くの植物、菌類及び微生物に存在する銅含有オキシダーゼ酵素である。ラッカーゼは、フェノールに類似する分子に作用し、１電子酸化を触媒する。ラッカーゼは、モノリグノール（天然に生じるフェノールのファミリー）の酸化的カップリングを促進することによって、リグニン形成に役割を果たし得る。ラッカーゼは、ウリシオールオキシダーゼ、ウルシオールオキシダーゼ、及びｐ−ジフェノールオキシダーゼと称されることもある。
【００５９】
チロシナーゼ（ＩＵＢＭＢ酵素番号：ＥＣ  １．１４．１８．１）は、広範囲な種類のバクテリア、菌類、プラント、昆虫、甲殻類及び哺乳類に存在するタイプＩＩＩ銅タンパク質であり、幾つかの色素分子（例えばベタレイン及びメラニン）の合成に関与する。チロシナーゼは、モノフェノールモノオキシゲナーゼ、フェノラーゼ、モノフェノールオキシダーゼ、クレゾラーゼ、モノフェノラーゼ、チロシン−ドーパオキシダーゼ、モノフェノールモノオキシダーゼ、モノフェノールジヒドロキシフェニルアラニン、オキシゲンオシキドレダクターゼ、Ｎ−アセチル−６−ヒドロキシトリプトファンオキシダーゼ、モノフェノール−ジヒドロキシ−Ｌ−フェニルアラニンオキシゲンオキシドレダクターゼ、ｏ−ジフェノール、Ｏ２オキシドレダクターゼ、及びフェノールオキシダーゼと称されることもある。
【００６０】
「ＧＨ６１」若しくは「ＧＨ６１酵素」、又は「ＡＡ９」若しくは「ＡＡ９酵素」などは、ＡＡ９として最近分類が改訂されたグリコシドヒドロラーゼ６１ファミリー（ＧＨ６１）に属する酵素を意味する。ＡＡ９（従前はＧＨ６１）タンパク質は、銅依存性の溶解性多糖モノオキシゲナーゼ（ＬＰＭＯ）である。ＡＡ９ファミリーの説明及びＡＡ９酵素のリストは、ｗｗｗ．ｃａｚｙ．ｏｒｇのＣａｒｂｏｈｙｄｒａｔｅ−Ａｃｔｉｖｅ  Ｅｎｚｙｍｅ  Ｄａｔａｂａｓｅ（ＣＡＺｙ）に存在する（またＬｏｍｂａｒｄ  Ｖ，Ｇｏｌａｃｏｎｄａ  Ｒａｍｕｌｕ  Ｈ，Ｄｒｕｌａ  Ｅ，Ｃｏｕｔｉｎｈｏ  ＰＭ，Ｈｅｎｒｉｓｓａｔ  Ｂ（２０１４）Ｔｈｅ  Ｃａｒｂｏｈｙｄｒａｔｅ−ａｃｔｉｖｅ  ｅｎｚｙｍｅｓ  ｄａｔａｂａｓｅ（ＣＡＺｙ）ｉｎ  ２０１３．Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄｓ  Ｒｅｓ  ４２：Ｄ４９０〜Ｄ４９５．［ＰＭＩＤ：２４２７０７８６］を参照）。具体的態様では、ＡＡ９酵素はトリコデルマ・リーゼイ由来であり、配列番号１１で示されるアミノ酸配列、又はそれと少なくとも６０％、７０％、８０％、８１％、８２％、８３％、８４％、８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、若しくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列、そのアレル変異体、又はＬＰＭＯ活性を保持するその断片である。異なる種由来のＧＨ６１／ＡＡ９ファミリーのメンバーのリスト受託番号（Ｇｅｎｂａｎｋ及びＵｎｉｐｒｏｔ）を表３に示す。
【００６１】
組成物及び方法：
本教示は、宿主細胞における銅酵素の分泌が、１つ又は２つ以上の銅金属シャペロンの過剰発現によって改善できるという発見に基づく。したがって、本教示は、１つ又は２つ以上の銅金属シャペロン（例えば、可溶性銅トランスポーター、膜結合型銅トランスポーター、又はその両方）を過剰発現させることにより、宿主細胞（例えば糸状菌）におけるタンパク質分泌を増加させる方法を提供する。本教示は、分泌の増加を目的とする銅金属シャペロン及び銅酵素を含む発現用の宿主（例えば糸状菌）も提供する。
【００６２】
本教示の一態様では、宿主細胞において目的とする銅酵素とともに銅金属シャペロンを過剰発現させることによって、宿主における目的の銅酵素の分泌／産生を増加させるための方法が提供される。本教示の銅金属シャペロンは、銅輸送に関与するいかなる適切なタンパク質であってもよい。幾つかの実施形態では、銅金属シャペロンは、銅輸送機能が全長の銅金属シャペロンに対して実質的に同じか又は強化された、銅金属シャペロンの断片であり得る。
【００６３】
様々な実施形態では、本教示の態様において有用な銅金属シャペロンは、あらゆる細胞質内／可溶性、又は膜結合型銅トランスポーターも包含する。幾つかの実施形態では、銅金属シャペロンは、表１及び２に示される銅トランスポーター、並びにその誘導体若しくは相同体から、例えば当業者に周知の機能的若しくは構造的類似性の観点から選択される。例えば、本発明の具体的態様は、配列番号３のアミノ酸配列と同一であるか、又は実質的に同一（例えば、少なくとも５０％、６０％、７０％、８０％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又はそれ以上の同一性（％）を有する）１つ又は２つ以上の可溶性銅トランスポーターの使用を含む。更に、本発明の特定の態様は、配列番号６、１２、１３、１４、又は１５のアミノ酸配列と同一であるか、又は実質的に同一の（例えば、少なくとも５０％、６０％、７０％、８０％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又はそれ以上の同一性（％）を有する）、１つ又は２つ以上の膜結合型銅トランスポーターの使用を含む。本発明で詳述されるように、銅酵素分泌の向上を示す宿主細胞は、１つ又は２つ以上の膜結合型銅トランスポーター、１つ又は２つ以上の可溶性銅トランスポーター、又は膜結合型及び可溶性銅トランスポーターの組合せを発現することができる。
【００６４】
一般に、１つ又は２つ以上の銅金属シャペロンは、宿主細胞で１つ又は２つ以上の望ましい銅酵素とともに宿主細胞で過剰発現し、その際、銅金属シャペロン及び銅酵素の発現は、それら自身に作動可能に連結しているプロモーターの制御下にある。幾つかの実施形態では、銅金属シャペロン及び／又は銅酵素は、目的の宿主細胞に本来存在するプロモーターの制御下で発現されるか、あるいは、当該銅金属シャペロン及び／又は銅酵素は、目的の宿主細胞にとり異種であるプロモーターの制御下で発現される。幾つかの実施形態では、銅の金属シャペロン及び／又は銅酵素は、構成的プロモーターの制御下で発現され、一方、他の実施形態では、銅の金属シャペロン及び／又は銅酵素は、誘導性プロモーターの制御下で発現される。宿主細胞において銅金属シャペロン（すなわち１つ又は２つ以上の銅金属シャペロン）及び銅酵素（すなわち１つ又は２つ以上の銅酵素）を発現するためにプロモーターのあらゆる組合せが使用され得る点に留意すべきである。例えば、１つ又は２つ以上の銅金属シャペロンが異種の構成的プロモーターの制御下で発現する一方で、１つ又は２つ以上の銅酵素が天然の誘導性プロモーターの制御下で発現される（又はその逆もあり得る）。幾つかの実施形態では、作動可能に連結しているプロモーターは、改良された天然のプロモーター（例えば、プロモーターの転写活性が強化された、変異を有する天然のプロモーター）であってもよい。
【００６５】
具体的実施形態では、１つ又は２つ以上の銅金属シャペロンの過剰発現は、宿主細胞の１つ又は２つ以上の銅金属シャペロンの生来のプロモーターの転写リプレッサー又はインデューサーの発現を変化させることによって実現できる。例えば、銅金属シャペロンの転写リプレッサーの発現を宿主細胞において減少させることができ、逆に、銅金属シャペロンの転写インデューサー（又はアクチベーター）の発現を宿主細胞において増加させることができる。１つの例では、銅金属シャペロンの転写アクチベーターであるＭａｃ１（金属結合アクチベーター１：酵母の銅不足誘導性転写因子）の発現により、銅金属シャペロンの過剰発現、宿主細胞内での増加をもたらすことができる。転写活性剤（例えばＭａｃ１）の発現の増加は、宿主細胞に転写因子の発現カセット又は発現ベクターを導入することにより実現できる。
【００６６】
本明細書で使用される場合、用語「プロモーター」は、作動可能に連結しているコード配列（例えば遺伝子、ｃＤＮＡ又は合成されたコード配列）の直接の転写を制御する核酸配列のことを指す。プロモーターは、転写開始部位の近傍の必要な核酸配列を含むことができ、例えばポリメラーゼＩＩ型プロモーターの場合、ＴＡＴＡエレメントである。プロモーターは、他の転写及び翻訳調節核酸配列と共に、全体として調節配列と称され、作動可能に連結されるコード配列の発現を制御する。一般には、調節配列は、限定されないが、プロモーター配列、リボソーム結合部位、転写開始部位及び終結配列、翻訳開始及び終結配列、並びにエンハンサー又はアクチベーター配列を有する。調節配列は通常、コード配列が発現される宿主細胞に適するものであり、それにより認識される。
【００６７】
構成的プロモーターは、大部分の環境的及び増殖的条件下で活性を有するプロモーターである。誘導性若しくは抑制的プロモーターは、環境的若しくは増殖的制御下で活性を有するプロモーターである。プロモーターは、当業者に公知のように、限定されないが、例えば炭素、窒素又は他の栄養利用可能性、温度、ｐＨ、浸透圧、重金属の存在、阻害剤の濃度、ストレス、又はそれらの組合せなどの環境的要因の変化によって誘導若しくは抑制が可能である。プロモーターは、当業者に公知のように、例えば特定の炭素源のレベル、特定のエネルギー源のレベル、特定の代謝物質のレベル、又はそれらの組合せなどの代謝因子によって誘導若しくは抑制が可能である。
【００６８】
適切なプロモーターの非限定的な例としては、Ｐ．ｃｈｒｙｓｏｇｅｎｕｍのｃｂｈ１、ｃｂｈ２、ｅｇｌ１、ｅｇｌ２、ｅｇｌ３、ｅｇｌ４、ｅｇｌ５、ｘｙｎ１及びｘｙｎ２抑制性酸性ホスファターゼ遺伝子（ｐｈｏＡ）プロモーター（Ｇｒａｅｓｓｌｅら、Ａｐｐｌｉｅｄ  ａｎｄ  Ｅｎｖｉｒｏｎｍｅｎｔａｌ  Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌｏｇｙ（１９９７），６３（２），７５３〜７５６を参照）、グルコース抑制性ＰＣＫ１プロモーター（Ｌｅｕｋｅｒら、Ｇｅｎｅ（１９９７），１９２（２），２３５〜２４０を参照）、マルトース誘導性、グルコース抑制性ＭＲＰ１プロモーター（Ｍｕｎｒｏら、Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌｏｇｙ（２００１），３９（５），１４１４〜１４２６を参照）、メチオニン抑制性ＭＥＴ３プロモーター（Ｌｉｕら、Ｅｕｋａｒｙｏｔｉｃ  Ｃｅｌｌ（２００６），５（４），６３８〜６４９を参照）が挙げられる。
【００６９】
本教示に有用な誘導性プロモーターの例は、トリコデルマ・リーゼイのｃｂｈ１プロモーターであり、そのヌクレオチド配列はＧｅｎＢａｎｋ受託番号Ｄ８６２３５として寄託されている。他の典型的なプロモーターは、セルラーゼ酵素をコードする遺伝子の制御に関与するプロモーター（例えばｃｂｈ２、ｅｇｌ１、ｅｇｌ２、ｅｇｌ３、ｅｇｌ５、ｘｙｎ１及びｘｙｎ２）である。
【００７０】
本教示では、銅金属シャペロンを用いることにより、宿主において適切な銅酵素の分泌／産生を増加させることができる。分泌される銅酵素は通常、最初に宿主細胞で発現したとき、シグナル配列（例えば、タンパク質又はポリペプチドを細胞内の分泌経路へと導くアミノ酸配列タグ）と作動可能に連結されている。シグナル配列は、銅酵素にとり固有のシグナル配列（すなわち野生型酵素に存在するシグナル配列）か、又は異種シグナル配列（すなわち組み換え法により目的とする成熟型銅酵素に作動可能に連結された、異なる分泌タンパク質由来のシグナル配列）であってもよい。いかなる公知の、又は後で発見された適切なシグナル配列も使用でき、例えば、アスペルギルス・ニガーのグルコアミラーゼ又はアスパラギン酸プロテアーゼ由来のシグナル配列、又はリゾムコール・ミエヘイ又はトリコデルマ・リーゼイのアスパラギン酸プロテアーゼ又はセルラーゼ由来のシグナル配列、（例えば、トリコデルマ・リーゼイのセロビオヒドロラーゼＩ、セロビオヒドロラーゼＩＩ、エンドグルカナーゼＩ、エンドグルカナーゼＩＩ、又はエンドグルカナーゼＩＩＩ）が例示される。
【００７１】
本教示では、銅金属シャペロンをあらゆる宿主において用いることにより、宿主における目的の銅酵素の分泌を増加させることができる。幾つかの実施形態では、発現宿主は糸状菌である。一般に、「糸状菌」は、エウミコチニア亜門に属する糸状の形態の真核微生物である。これらの菌類は、キチン、β−グルカン及び他の複合多糖から構成される細胞壁を有する栄養菌糸によって特徴づけられる。様々な実施形態では、本教示の糸状菌は、酵母とは形態学的、生理学的及び遺伝学的に区別される。幾つかの実施形態では、本教示の糸状菌としては、限定されないが、アスペルギルス、アクレモニウム、アウレオバシジウム、ボーベリア、セファロスポリウム、セリポリオプシス、ケトミウム・ペシロマイセス、クリソスポリウム、クラビセプス、コキオボラス、クリプトコッカス、シアツス、エンドチア、エンドチア・ムコール、フザリウム、ギロクラディウム、フミコーラ、マグナポルテ、ミセリオフトラ、ミロテシウム、ムコール、ニューロスポラ、ファネロカエテ、ポドスポラ、ペシロマイセス、ペニシリウム、ピリキュラリア、リゾムコール、リゾプス、シゾフィラム、スタゴノスポラ、タラロマイセス、トリコデルマ、サーモマイセス、サーモアスカス、チエラビア、トリポクラジウム、トリコフィトン、トラメテス、及びプレウロタス属が挙げられる。幾つかの実施形態では、本教示の糸状菌としては、限定されないが、アスペルギルス・ニードランス、アスペルギルス・ニガー、アスペルギルス・アワモリ、アスペルギルス・オリザエ、ヒポクレア・ジェコリナ、ニューロスポラ・クラッサ、トリコデルマ・リーゼイ、及びトリコデルマ・ビリデが挙げられる。
【００７２】
本教示の別の態様は、銅金属シャペロン及び目的とする銅酵素を発現する発現宿主を提供する。幾つかの実施形態では、本教示の発現宿主は、銅酵素をコードする第１ポリヌクレオチドと、銅金属シャペロンをコードする第２ポリヌクレオチドを含む。幾つかの実施形態では、前記発現宿主は更に、例えば、第２ポリヌクレオチドによってコードされるものと異なる第２の銅金属シャペロンをコードする第３ポリヌクレオチドを含む。更に、前記宿主細胞は、例えば、第１ポリヌクレオチドによってコードされるものと異なる目的とする第２の銅酵素をコードする第４ポリヌクレオチドを更に含んでもよい。具体的実施形態では、１つ又は２つ以上の銅酵素及び１つ又は２つ以上の銅金属シャペロンをコードするポリヌクレオチドは、（例えば形質転換によって）宿主細胞に導入される組み換え発現カセットであり、この点については以下に詳細に説明する。
【００７３】
幾つかの実施形態では、目的の銅酵素は、融合ポリペプチドとして産生されてもよい。幾つかの実施形態では、目的の銅酵素は、糸状菌から効率的に分泌されるポリペプチドと融合させることにより、分泌を促進し、以降の精製／同定を容易にし、安定性向上させることが可能となる。
【００７４】
一般に、本教示の発現宿主中の、１つ又は２つ以上の銅金属シャペロン及び／又は１つ又は２つ以上の銅酵素をコードする１つ又は２つ以上のポリヌクレオチドは、発現宿主のゲノム構造内、例えば発現宿主の染色体に遺伝的に挿入若しくは導入され得るか、又は染色体外に存在して、例えば、ベクターが有する選抜マーカーの選抜条件下で、発現宿主細胞内で複製可能ベクターとして存在することができる。
【００７５】
分泌性の銅酵素の産生／分泌は、例えば酵素活性又は存在する酵素の量を検出するアッセイによって、サンプル（例えば培地）から直接測定することができる。免疫学的方法（例えばウエスタンブロット又はＥＬＩＳＡ）を用いることにより、質的及び量的に、分泌性の銅酵素の発現を評価することができる。そのような方法の詳細は当業者に公知であり、そのような方法を行うため試薬が多数市販されている。
【００７６】
表１．トリコデルマ・リーゼイの可溶性（細胞質）銅トランスポーターと相同性を有するタンパク質のリスト（配列番号３）。表１は、受託番号（ＵＮＩＰＲＯＴ）、生物、及び配列番号３との配列同一性を示す。タンパク質の配列データベースＵＮＩＰＲＯＴを、アミノ酸配列の基として用いた。配列同一性は、ＮＣＢＩ／ＢＬＡＳＴのウェブサイトのＵｎｉｐｒｏｔデータベースに対する、標準的なタンパク質−タンパク質ＢＬＡＳＴ（ｂｌａｓｔｐ）を用いて決定した。
【表２−１】
2017525359.tif 000004
【００７７】
（表１の続き）
【表２−２】
2017525359.tif 000005
【００７８】
表２：膜結合型トリコデルマ・リーゼイ銅輸送ＡＴＰアーゼ（又は銅パーミアーゼ）（配列番号６）に対して相同な配列。表２は、受託番号（ＵＮＩＰＲＯＴ）、生物、及び配列番号６との配列同一性を示す。タンパク質の配列データベースＵＮＩＰＲＯＴを、アミノ酸配列の基として用いた。配列同一性は、ＮＣＢＩ／ＢＬＡＳＴのウェブサイトのＵｎｉｐｒｏｔデータベースに対する、標準的なタンパク質−タンパク質ＢＬＡＳＴ（ｂｌａｓｔｐ）を用いて決定した。
【表３−１】
2017525359.tif 000006
【００７９】
（表２の続き）
【表３−２】
2017525359.tif 000007
【００８０】
表３：銅酵素の例は、当初はグリコシドヒドロラーゼ６１（ＧＨ６１）ファミリーとして分類されていたが、現在はＡＡ９（銅依存性溶解性多糖モノオキシゲナーゼ（ＬＰＭＯ））として分類されている。
【表４−１】
2017525359.tif 000008
【００８１】
（表３の続き）
【表４−２】
2017525359.tif 000009
【００８２】
（表３の続き）
【表４−３】
2017525359.tif 000010
【００８３】
有用性
本発明で詳述される組成物及び方法は、銅酵素の生産に多くの利益をもたらす。例えば、本開示の態様は、銅酵素の産生向上を産業的に応用することを可能にし、例えば、商業的に有用な製品（例えばセルロース系エタノール）の製造において銅酵素をセルロース系バイオマス処理に用いることが挙げられる。他の銅酵素（例えばラッカーゼ及びチロシナーゼ）の産生量の向上も産業的価値（例えば洗剤、バイオ燃料及び食品用途への使用）を高めるものである。
【００８４】
更に、本開示の組成物及び方法は、銅酵素の産生において使用される銅の量の低減を可能にし、それにより培養プロセスからの排水中の銅濃度を低減させ、ゆえに工場排水におけるこの金属の排出基準を満たすことの一助となる。
【００８５】
本発明の組成物及び方法の他の態様及び実施形態は、上記の説明及び以下の実施例より明らかとなるであろう。
【実施例】
【００８６】
本教示の態様を実施例を参照して更に説明するが、そられはいかなる形であれ本教示を限定するものと解釈すべきでない。
【００８７】
実施例１：チロシナーゼ発現細胞に対する銅の影響
トリコデルマ・リーゼイチロシナーゼ（配列番号９）の過剰発現用の発現ベクターを構築し（図１Ｃ）、トリコデルマ・リーゼイ宿主細胞を形質転換した。トリコデルマ・リーゼイチロシナーゼをコードするＤＮＡ配列の発現を誘導するプロモーターをｃｂｈ１プロモーターとした。これらの形質転換された宿主細胞からの分泌タンパク質の発現量を、１４Ｌの培養において測定した。グルコースが枯渇するまで、細胞をフラスコ中、３４℃及びｐＨ  ３．５の条件で前培養した。グルコース／ソホロースのフィードを開始した後、温度が３４℃から２８℃へ推移し、ｐＨが３．５から４へ推移した。（グルコース／ソホロースはｃｂｈ１プロモーターの誘導物質である）。撹拌、圧力及びエアフローを調節して溶存酸素（％）を一定にした。（酵素産生の速度に応じて）培養を約２００時間行った。図２中、上記のチロシナーゼ発現宿主細胞の１４Ｌスケール培養による細胞外タンパク質の発現をＳＤＳ−ＰＡＧＥにより解析した。培養時間を時間単位で下に示し、培養中の銅フィードの開始を上向きの矢印で示す。分泌された酵素チロシナーゼ及びエンドグルカナーゼ６のゲル中のバンドを左側（各々Ｔｙｒ及びＥＧ６）で示す。銅含有チロシナーゼ酵素は、６９時間以内にピーク産生を示し、その後、残りの時間において蓄積が減少した。対照的に、銅を含有しないエンドグルカナーゼ６（ＥＧ６）酵素は、全時間経過において蓄積を示した。これは、銅含有酵素の発現効率が、時間経過とともに、非銅含有酵素と比較し低下したことを示すものである。
【００８８】
チロシナーゼの発現向上を試みるため、チロシナーゼ過剰発現宿主細胞を、様々な量の銅において培養した。図３は、銅の量（各レーンの下部に示す）を増加させた場合の、チロシナーゼ（Ｔｙｒ）発現のＳＤＳ−ＰＡＧＥ解析を示す。この図に示されるように、増殖培地中に存在する硫酸銅の量の増加により、宿主細胞におけるチロシナーゼ産生は、増加ではなくむしろ減少した。このパターンは、チロシナーゼを過剰発現する２つの独立した宿主細胞株におけるチロシナーゼ活性のアッセイにおいても確認された（図４）。図４中、チロシナーゼ過剰発現株Ａ及びＣ（各々上部及び下部のパネル）を、０〜１０００μＭの範囲の銅濃度で培養し、基質としてチロシンを用い、２８６ｎｍ（白色バー）及び４７０ｎｍ（黒色バー）における生成物の形成を検出することにより、培養上清のチロシナーゼ活性を測定した。タンパク質産生への副作用に至らなかった最大の銅濃度は約１５μＭである。追加の銅が分泌経路に適切に導入されず、そのためチロシナーゼ分泌の低下及び／又は細胞毒性に至らなかったと予想される。
【００８９】
実施例２：銅金属シャペロンの過剰発現による、チロシナーゼ発現の増加
トリコデルマ・リーゼイ由来の可溶性銅トランスポーター及び膜結合型銅輸送ＡＴＰアーゼの合成遺伝子を、公知の配列との相同性により同定し、更に合成した（ＧｅｎｅＡｒｔ（登録商標）、Ｌｉｆｅ  Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ）。これらの２つのトリコデルマ・リーゼイの銅金属シャペロンの発現ベクターを構築し、それらの過剰発現が実施例１の宿主細胞においてチロシナーゼ発現を向上させ得るか否かの決定に用いた。図１Ａ〜１Ｂは、細胞質（可溶性）銅トランスポーターの発現構築物（１Ａ）、及び膜結合型銅輸送ＡＴＰアーゼの発現構築物（１Ｂ）の概略図を表す。これらの銅シャペロン遺伝子は、構成的ピルビン酸キナーゼ（ｐｋｉ）プロモーターと、ＣＢＨ１遺伝子由来のターミネーターを用いて発現させた。
【００９０】
図５は、低い／検出不可能な程度のチロシナーゼ発現に至る銅濃度（６ｍＭ）下で培養したチロシナーゼ過剰発現細胞由来のチロシナーゼ活性に関するスポットアッセイの結果を示す。このアッセイにおいてチロシナーゼ活性は、１０μＬの培養上清及び２００μＬの１０％スキムミルク（３５℃まで予熱）をマイクロタイタープレートに添加し、３５℃で１０分（又はそれ以上）の間、混合物をインキュベートすることにより検出した。チロシナーゼが存在し、活性を有するとき、ミルクは白色から赤色に変化した。プラスの記号は、顕著な赤色のウェルを示す。
【００９１】
予想どおり、チロシナーゼ活性はコントロール株Ａ（レーン８のウェル）及び株Ｃ（レーン１のウェル）で検出できなかった（点線で大枠を示す）。しかしながら、これらの株が膜結合型銅輸送ＡＴＰアーゼ（レーン２〜７のウェル）又は細胞質（可溶性）銅トランスポーター（レーン９〜１２のウェル）のプラスミドで再形質転換されたとき、株Ａ及びＣのチロシナーゼ産生能は回復した。このように、これらのいずれの銅シャペロンの発現においても、チロシナーゼ銅酵素の発現が顕著に増加した。
【００９２】
実施例３：銅金属シャペロンの過剰発現による、ラッカーゼの発現の増加：
図６は、Ｃｅｒｒｅｎａ  ｕｎｉｃｏｌｏｒ由来の銅金属タンパク質であるラッカーゼＤの発現ベクター構築物を示す（ＣＢＨ１シグナル配列及びｃｂｈ１転写ターミネーターを有し、ｃｂｈ１プロモーターから転写される）。成熟型のラッカーゼＤの配列を配列番号１０に示す。
【００９３】
図７Ａ〜７Ｃは、上記の銅金属シャペロンの一方又は両方の過剰発現の有無における、ラッカーゼＤ過剰発現株（株３２Ａ）におけるラッカーゼＤ産生の分析結果を示す（図１で表されるベクターから発現される配列番号３及び６）。図７Ａは、株３２Ａ（最も左のバー、１００％で設定）、並びに株３２Ａ由来であり、細胞質トランスポーター及び膜結合型銅輸送ＡＴＰアーゼを過剰発現する（図１Ａ及び１Ｂの発現ベクターで形質転換された）株（＃４６、＃４７、及び＃４８）におけるラッカーゼＤの相対的発現量を示す。図７Ｂは、株３２Ａ（最も左のバー、１００％で設定）、並びに株３２Ａ由来であり、膜結合型銅輸送ＡＴＰアーゼを過剰発現する（図１Ａの発現ベクターで形質転換された）株（＃２、＃１６、＃２９、＃３０、及び＃３１）におけるラッカーゼＤの相対的発現量を示す。図７Ｃは、株３２Ａ（最も左のバー、１００％で設定）、並びに株３２Ａ由来であり、細胞質銅トランスポーターを過剰発現する（図１Ｂの発現ベクターで形質転換された）株（＃５、＃２２、＃２７、及び＃３５）におけるラッカーゼＤの相対的発現量を示す。形成転換体を５日間マイクロタイタープレートで培養し、ラッカーゼ発現をＡＢＴＳアッセイ（ＡＢＴＳ＝２，２’−アジノ−ビス（３−エチルベンゾチアゾリン−６−スルホン酸））を用いて測定した。ＡＢＴＳアッセイにおいて、１０μＬの５日間液体培地を新しいプレートに移し、１５０μＬの１００ｍＭ  ＮａＯＡｃ（ｐＨ５）及び２０μＬの４．５ｍＭ  ＡＢＴＳを添加した。分光光度計を用い、２０秒の間隔で５分間にわたり、最大ＯＤ４２０値を測定した。このデータは、膜結合型銅輸送ＡＴＰアーゼのみの発現、又は、細胞質（可溶性）銅トランスポーターとの組合せによる発現が、ラッカーゼＤの産生を大幅に向上させたことを示す。
【００９４】
上記組成物及び方法は、一部の詳細において理解の明確化の目的のために例示及び実施例により説明したが、添付の特許請求の範囲の趣旨又は範囲から逸脱することなくこれに一定の変更及び修正を加えることができることは、本明細書の教示を考慮すれば当業者であれば容易に理解される。
【００９５】
したがって、上記記載は単に本組成物及び方法の原理を述べたに過ぎない。当業者であれば、ここに明瞭に記載され又は示されていなくとも、本組成物及び方法の原理を含み、各請求項の趣旨及び範囲内で様々な態様を考案できることを理解されたい。更に、本明細書に記載される全ての例及び暫定的な言い回しは、本組成物及び方法の原理並びに当該技術分野の進歩に寄与する本発明者らの思想が読者によって理解されるのを助けるためのものであり、そのように具体的に記載した例及び条件に限定されるものではないと解釈されるべきである。また、本明細書において、本組成物及び方法の原理、態様、及び実施形態を記載するすべての表現、並びにその具体例は、その構成及び機能の両方の均等物を包含することを意図している。更に、そのような均等物が、現在知られている均等物と、将来創出される均等物、すなわち構成のいかんにかかわらず同じ機能をもたらすよう創出された任意の均等物の両方を包含することを意図している。本発明の組成物及び方法の範囲は、したがって、本明細書に示され、記載された例示的実施形態に限定することを意図するものではない。
【００９６】
（表４）
配列リスト：
【表５−１】
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【００９７】
（表４の続き）
【表５−２】
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【００９８】
（表４の続き）
【表５−３】
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【００９９】
（表４の続き）
【表５−４】
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【図１Ａ】
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【図１Ｂ】
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【図１Ｃ】
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【図２】
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【図３】
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【図４】
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【図５】
2017525359.tif 000021
【図６】
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【図７Ａ】
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【図７Ｂ】
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【図７Ｃ】
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【配列表】
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【国際調査報告】
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2017525359.tif 000027
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