(57)【要約】  本発明は、毒性マイコバクテリア（ｍｙｃｏｂａｃｔｅｒｉａ）によって、例えば結核菌（Ｍｙｃｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｔｕｂｅｒｃｕｌｏｓｉｓ）、アフリカ型結核菌（Ｍｙｃｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ａｆｒｉｃａｎｕｍ）、ウシ型結核菌（Ｍｙｃｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｂｏｖｉｓ）、ネズミ型結核菌（Ｍｙｃｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｍｉｃｒｏｔｉ）、マイコバクテリウム・カネッティ（Ｍｙｃｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｃａｎｅｔｔｉｉ）、マイコバクテリウム・ピンニペディ（Ｍｙｃｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｐｉｎｎｉｐｅｄｉｉ）又はマイコバクテリウム・ムンギ（Ｍｙｃｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｍｕｎｇｉ）によって引き起こされる感染に対するワクチンなどの、融合タンパク質、抗原カクテル及び免疫学的組成物を対象とする。融合タンパク質、抗原カクテル、及び免疫学的組成物は、ＥＳＡＴ−６分泌系１（ＥＳＸ−１）によって分泌されるタンパク質を基にするものであり、最も免疫優性の結核菌（Ｍ．ｔｕｂｅｒｃｕｌｏｓｉｓ）（ＭＴＢ）抗原の一部である。【選択図】図６
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【特許請求の範囲】
【請求項１】
融合タンパク質又は抗原カクテルにおいて、
ａ）配列番号１（Ｒｖ３８８１）、配列番号２（ＥＳＡＴ−６）、配列番号３（Ｒｖ３６１４ｃ）、配列番号４（Ｒｖ３６１５ｃ）、配列番号５（Ｒｖ３６１６ｃ）及び配列番号６（Ｒｖ３８４９）、若しくは
ｂ）配列番号２（ＥＳＡＴ６）、配列番号３（Ｒｖ３６１４ｃ）、配列番号６（Ｒｖ３８４９）及び配列番号８（Ｒｖ３８７２）、若しくは
ｃ）配列番号２（ＥＳＡＴ６）、配列番号３（Ｒｖ３６１４ｃ）、配列番号９（Ｒｖ３６１５の一部）、配列番号６（Ｒｖ３８４９）及び配列番号８（Ｒｖ３８７２）、若しくは
ｄ）配列番号１（Ｒｖ３８８１）、配列番号２（ＥＳＡＴ−６）、配列番号３（Ｒｖ３６１４ｃ）、配列番号５（Ｒｖ３６１６ｃ）及び配列番号６（Ｒｖ３８４９）、若しくは
ｅ）配列番号２（ＥＳＡＴ６）、配列番号６（Ｒｖ３８４９）及び配列番号８（Ｒｖ３８７２）、若しくは
ｆ）配列番号１（Ｒｖ３８８１）、配列番号２（ＥＳＡＴ−６）、配列番号５（Ｒｖ３６１６ｃ）及び配列番号６（Ｒｖ３８４９）、若しくは
ｇ）配列番号１（Ｒｖ３８８１）、配列番号２（ＥＳＡＴ−６）及び配列番号６（Ｒｖ３８４９）、若しくは
これらと少なくとも８０％の配列同一性があり、同時に免疫原性があるアミノ酸配列アナログ、
から選択されるアミノ酸配列を含むことを特徴とする融合タンパク質又は抗原カクテル。
【請求項２】
請求項１に記載の融合タンパク質又は抗原カクテルにおいて、前記アミノ酸配列アナログが、前記配列と少なくとも９０％、又はより好ましくは９５％の配列同一性があることを特徴とする融合タンパク質又は抗原カクテル。
【請求項３】
請求項１又は２に記載の融合タンパク質において、硫黄架橋形成及びタンパク質凝集を回避するために、システインが別のアミノ酸で置換されていることを特徴とする融合タンパク質。
【請求項４】
請求項３に記載の融合タンパク質において、前記システインがセリンで置換されていることを特徴とする融合タンパク質。
【請求項５】
請求項１乃至４の何れか１項に記載の融合タンパク質において、融合パートナー同士がリンカー分子で結合していることを特徴とする融合タンパク質。
【請求項６】
請求項５に記載の融合タンパク質において、配列番号７（Ｈ７４）、配列番号９（Ｈ１６４）、配列番号１０（Ｈ１７４）、配列番号１１（Ｈ２６４）、配列番号１２（Ｈ２７４）、配列番号１３（Ｈ３７４）又は配列番号１４（Ｈ７８）のアミノ酸配列を伴うことを特徴とする融合タンパク質。
【請求項７】
毒性マイコバクテリア（ｍｙｃｏｂａｃｔｅｒｉａ）によって、例えば結核菌（Ｍｙｃｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｔｕｂｅｒｃｕｌｏｓｉｓ）、アフリカ型結核菌（Ｍｙｃｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ａｆｒｉｃａｎｕｍ）又はウシ型結核菌（Ｍｙｃｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｂｏｖｉｓ）によって引き起こされる感染に対するワクチン接種用の医薬組成物を調製するためであることを特徴とする、請求項１乃至７の何れか１項に記載の融合タンパク質又は抗原カクテルの使用。
【請求項８】
請求項１乃至６の何れか１項に記載の融合タンパク質又は抗原カクテルを含むことを特徴とするワクチン。
【請求項９】
請求項８に記載のワクチンにおいて、アジュバントをさらに含むことを特徴とするワクチン。
【請求項１０】
請求項９に記載のワクチンにおいて、前記アジュバントが、カチオン性リポソーム（例えばジメチルジオクタデシルアンモニウムブロミド（ＤＤＡ））、Ｑｕｉｌ  Ａ、ｐｏｌｙ  ｌ：Ｃ、水酸化アルミニウム、フロイント不完全アジュバント、ＩＦＮ−γ、ＩＬ−２、ＩＬ−１２、モノホスホリルリピドＡ（ＭＰＬ）、トレハロースジミコラート（ＴＤＭ）、トレハロースジベヘナート（ＴＤＢ）、ムラミルジペプチド（ＭＤＰ）及びモノミコリルグリセロール（ＭＭＧ）又はこれらの組合せからなる群から選択されることを特徴とするワクチン。
【請求項１１】
毒性マイコバクテリア（ｍｙｃｏｂａｃｔｅｒｉａ）によって、例えば、結核菌（Ｍｙｃｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｔｕｂｅｒｃｕｌｏｓｉｓ）、アフリカ型結核菌（Ｍｙｃｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ａｆｒｉｃａｎｕｍ）又はウシ型結核菌（Ｍｙｃｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｂｏｖｉｓ）によって引き起こされる結核に対してヒトを含む動物を免疫する方法において、請求項８乃至１０の何れか１項に記載のワクチンを前記動物に投与するステップを含むことを特徴とする方法。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
本発明は、結核菌（Ｍ．ｔｕｂｅｒｃｕｌｏｓｉｓ）由来の、Ｅｓｘ−１が関与するポリペプチドに基づいた、新規な免疫原性組成物を開示する。
【背景技術】
【０００２】
結核菌（Ｍ．ｔｕｂｅｒｃｕｌｏｓｉｓ）に対する免疫は、幾つかの基本的特徴、即ち、特異的に感作されたＴリンパ球が防御を仲介し、最も重要なメディエーター分子がインターフェロンγ（ＩＦＮ−γ）のようである、ということを特徴とする。
【０００３】
結核菌（Ｍ．ｔｕｂｅｒｃｕｌｏｓｉｓ）は、新規なＴＢワクチンの生成に関係する可能性のある数種のタンパク質を保有し、分泌もする。１９９８年に、Ｃｏｌｅ  ｅｔ  ａｌ．は、結核菌（Ｍ．ｔｕｂｅｒｃｕｌｏｓｉｓ）の全ゲノム配列を発表し、約４０００のオープンリーディングフレームの存在を予測した１。しかし、重要なことであるが、この配列情報は、ｉｎ  ｖｉｖｏでＤＮＡが翻訳され、タンパク質として発現するかどうかを予測するために使用することはできない。ゲノム配列は、ＲＮＡ発現解析用のＤＮＡアレイをデザインするため、及びプロテオーム研究において、発現したタンパク質を同定するために広く使用されてきた。発現データの量は膨大で、ｉｎ  ｓｉｌｉｃｏ予測ツールの進歩はめざましいが、得られた配列が免疫原性の分子をコードするであろうと確実に予測することは今なお不可能である。結核菌（Ｍ．ｔｕｂｅｒｃｕｌｏｓｉｓ）の感染中又は感染後に、ある分子が免疫系に認識されるかどうかを判定する唯一の方法は、その分子を生成し、本明細書に記載する適切なアッセイでそれを試験することである。
【０００４】
現在臨床試験中の新規なＴＢワクチンが数種ある。しかし、これらは主に感染の初期段階で発現する限定数の抗原に基づく標準的な予防ワクチンである。発現動態の直接的な結果として、Ｔ細胞に提示されるエピトープパターンは経時で極端に変化し、これは、新規なワクチンがいかにデザインされるべきであるかを示唆する。例えば、一時的に発現した初期の抗原、Ａｇ８５Ｂについては、２つの別個のＴ細胞移入試験によって、感染から３〜４週間後にＡｇ８５ＢはもはやＴ細胞に提示されておらず、結果として、感染の時点でもその後の時点でも、Ａｇ８５Ｂに特異的なサイトカイン、ケモカインなどは産生されないことが示された２、３。したがって、宿主との長期的な共存を確立する慢性疾患には、ワクチン接種をし、感染の短期間にのみ発現するタンパク質中のエピトープに特異的な記憶Ｔ細胞を誘導する価値は限られている。
【０００５】
したがって、ワクチンの開発には、感染の後期に多く発現する抗原を同定し、その中で、免疫原性があり、防御に貢献できるものを選択し、この特異的なタンパク質のサブセットをＴＢワクチンに含めることがきわめて重要である。そうすることによって、ワクチンの効力及びエピトープの適用範囲を改善することが可能であるだけでなく、潜伏感染を標的にすることも可能となる。
【０００６】
マイコバクテリア（Ｍｙｃｏｂａｃｔｅｒｉａ）の分泌系は、タンパク質の細胞外環境への排出を担っている。結核菌（Ｍｙｃｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｔｕｂｅｒｃｕｌｏｓｉｓ）の６−ｋＤａ初期分泌抗原性標的（ｅａｒｌｙ  ｓｅｃｒｅｔｏｒｙ  ａｎｔｉｇｅｎｉｃ  ｔａｒｇｅｔ）（ＥＳＡＴ−６）及び１０−ｋＤａ培養濾液抗原（ｃｕｌｔｕｒｅ  ｆｉｌｔｒａｔｅ  ａｎｔｉｇｅｎ）（ＣＦＰ−１０）は、ＥＳＡＴ−６分泌系１（ＥＳＸ−１）によって分泌されるタンパク質であり、最も免疫優性の結核菌（Ｍ．ｔｕｂｅｒｃｕｌｏｓｉｓ）（ＭＴＢ）抗原の一部である。このような属性により、これらは結核（ＴＢ）ワクチンの開発に重要となる。この知見に基づき、発明者らは、ＥＳＸ−１が関与する他のタンパク質を、有望なＴＢワクチン抗原として試験した。
【発明の概要】
【０００７】
本発明は、Ｅｓｘ−１が関与するポリペプチドから選択される結核菌（Ｍ．ｔｕｂｅｒｃｕｌｏｓｉｓ）抗原を含む、融合タンパク質又は抗原カクテルの使用による、結核菌群の種（結核菌（Ｍ．ｔｕｂｅｒｃｕｌｏｓｉｓ）、ウシ型結核菌（Ｍ．ｂｏｖｉｓ）、アフリカ型結核菌（Ｍ．ａｆｒｉｃａｎｕｍ）、ネズミ型結核菌（Ｍ．ｍｉｃｒｏｔｉ）、Ｍ・カネッティ（Ｍ．ｃａｎｅｔｔｉｉ）、Ｍ・ピンニペディ（Ｍ．ｐｉｎｎｉｐｅｄｉｉ）、マイコバクテリウム・ムンギ（Ｍｙｃｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｍｕｎｇｉ））が引き起こす感染の予防及び処置に関する。融合タンパク質又は抗原カクテルは、ワクチンに入れて、好ましくはアジュバント及び／又は免疫調節剤とともに使用される。
【０００８】
本発明は、融合タンパク質又は抗原カクテルにおいて、
ａ）Ｈ７４＝配列番号１（Ｒｖ３８８１）、配列番号２（ＥＳＡＴ−６）、配列番号３（Ｒｖ３６１４ｃ）、配列番号４（Ｒｖ３６１５ｃ）、配列番号５（Ｒｖ３６１６ｃ）及び配列番号６（Ｒｖ３８４９）、若しくは
ｂ）Ｈ１６４＝配列番号２（ＥＳＡＴ６）、配列番号３（Ｒｖ３６１４ｃ）、配列番号６（Ｒｖ３８４９）及び配列番号８（Ｒｖ３８７２）、若しくは
ｃ）Ｈ７８＝配列番号２（ＥＳＡＴ６）、配列番号３（Ｒｖ３６１４ｃ）、配列番号１５（Ｒｖ３６１５の一部）、配列番号６（Ｒｖ３８４９）及び配列番号８（Ｒｖ３８７２）、若しくは
ｄ）Ｈ１７４＝配列番号１（Ｒｖ３８８１）、配列番号２（ＥＳＡＴ−６）、配列番号３（Ｒｖ３６１４ｃ）、配列番号５（Ｒｖ３６１６ｃ）及び配列番号６（Ｒｖ３８４９）、若しくは
ｅ）Ｈ２６４＝配列番号２（ＥＳＡＴ６）、配列番号６（Ｒｖ３８４９）及び配列番号８（Ｒｖ３８７２）、若しくは
ｆ）Ｈ２７４＝配列番号１（Ｒｖ３８８１）、配列番号２（ＥＳＡＴ−６）、配列番号５（Ｒｖ３６１６ｃ）及び配列番号６（Ｒｖ３８４９）、若しくは
ｇ）Ｈ３７４＝配列番号１（Ｒｖ３８８１）、配列番号２（ＥＳＡＴ−６）及び配列番号６（Ｒｖ３８４９）、若しくは
これらと少なくとも８０％の配列同一性があり、同時に免疫原性があるアミノ酸配列アナログ、
から選択されるアミノ酸配列を含む融合タンパク質又は抗原カクテルを開示する。
【０００９】
本発明に係る融合タンパク質中のシステインは、硫黄（ｓｕｌｈｕｒ）架橋形成及びタンパク質凝集を回避するために、別のアミノ酸で置換されていることが好ましい。好ましい置換アミノ酸はセリンである。
【００１０】
本発明に係る融合タンパク質の融合パートナー同士は、好ましくはリンカー分子で結合して、タンパク質フォールディング及び二量体形成を可能にする。
【００１１】
好ましい実施形態は、配列番号７（Ｈ７４）、配列番号９（Ｈ１６４）、配列番号１０（Ｈ１７４）、配列番号１１（Ｈ２６４）、配列番号１２（Ｈ２７４）、配列番号１３（Ｈ３７４）又は配列番号１４（Ｈ７８）を含む融合タンパク質である。
【００１２】
本発明の別の実施形態は、本発明に係る抗原カクテル、例えば、配列番号１−６、配列番号２、３、６及び８、配列番号２、３、１５、６及び８、配列番号１、２、３、５及び６、配列番号２、６及び８、配列番号１、２、５及び６、又は配列番号１、２及び６といった上記のアミノ酸配列を、ポリペプチドを一緒に融合せずに使用することである。
【００１３】
さらなる実施形態において、本発明は、上記で定義した融合タンパク質又は抗原カクテルを含む免疫原性組成物を、好ましくはワクチンの形態で開示する。
【００１４】
別の実施形態において、本発明は、毒性マイコバクテリア（ｍｙｃｏｂａｃｔｅｒｉａ）によって、例えば、結核菌（Ｍｙｃｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｔｕｂｅｒｃｕｌｏｓｉｓ）、アフリカ型結核菌（Ｍｙｃｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ａｆｒｉｃａｎｕｍ）、ウシ型結核菌（Ｍｙｃｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｂｏｖｉｓ）、ネズミ型結核菌（Ｍ．ｍｉｃｒｏｔｉ）、Ｍ・カネッティ（Ｍ．ｃａｎｅｔｔｉｉ）、Ｍ・ピンニペディ（Ｍ．ｐｉｎｎｉｐｅｄｉｉ）又はマイコバクテリウム・ムンギ（Ｍｙｃｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｍｕｎｇｉ）によって引き起こされる結核に対して、ヒトを含む動物を免疫する方法を開示し、当該方法は、上記で定義したポリペプチド、本発明に係る免疫原性組成物、又は本発明に係るワクチンを動物に投与するステップを含む。
【００１５】
本発明に係るワクチン、免疫原性組成物及び医薬組成物は、毒性マイコバクテリウム（ｍｙｃｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）に感染していない対象に予防的に、又は毒性マイコバクテリウム（ｍｙｃｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）に既に感染している対象に治療的に使用することができる。
【００１６】
定義
ポリペプチド
本発明における「ポリペプチド」という用語は、その通常の意味を有するものとする。それは、全長タンパク質、オリゴペプチド、短鎖ペプチド及びこれらのフラグメントを含む任意の鎖長のアミノ酸鎖であり、アミノ酸残基同士は共有ペプチド結合で結合している。
【００１７】
ポリペプチドは、グリコシル化されること、脂質付加されること（例えば、Ｍｏｗａｔ  ｅｔ  ａｌ．１９９１に記載されているパルミトイルオキシスクシンイミドでの化学的脂質付加、又はＬｕｓｔｉｇ  ｅｔ  ａｌ．１９７６に記載されているドデカノイルクロリドでの化学的脂質付加）、補欠分子族を含むこと、又は追加のアミノ酸、例えば精製タグ（例えばｈｉｓタグ）又はシグナルペプチドを含有することにより、化学修飾され得る。精製タグは、高純度のタンパク質製剤を得るために使用され、例えば、Ｈｉｓタグは、Ｎ末端に使用されるとメチオニンを第１のアミノ酸として、その後に６〜８個のヒスチジンを含み、Ｃ末端に使用されると、６〜８個のヒスチジン、その後に終止コドンを含む。Ｎ末端に使用されると、ポリペプチド融合体をコードする遺伝子におけるメチオニン開始コドンは、翻訳開始部位の誤りを回避するために除去することができる。遺伝子が、選択的な開始コドンＧＵＧ又はＵＵＧのうち１つを含有する場合に同様のことが当てはまる。ＧＵＧ又はＵＵＧは、それぞれ通常はバリン及びロイシンをコードするが、開始コドンとしては、メチオニン又はホルミルメチオニンとして翻訳される。
【００１８】
各ポリペプチドは、特異的な核酸配列によってコードされている。当然のことながら、係る配列は、そのアナログ及び変異形を含み、これらにおいて、係る核酸配列は、１種又は複数種の核酸の置換、挿入、付加又は欠失によって修飾されている。置換は、コドン使用頻度におけるサイレント置換が好ましく、これはアミノ酸配列には何ら変化をもたらさないであろうが、タンパク質の発現を増強するために導入してもよい。
【００１９】
分泌系
タイプＶＩＩ分泌系（Ｔ７ＳＳ）は、細菌の分泌系において最近発見され、結核菌（Ｍｙｃｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｔｕｂｅｒｃｕｌｏｓｉｓ）において最初に同定されたものである。対応する遺伝子群は、ＥＳＸ（ＥＳＡＴ−６分泌系）領域と呼称された４〜６。結核菌（Ｍ．ｔｕｂｅｒｃｕｌｏｓｉｓ）Ｈ３７Ｒｖのゲノムは、遺伝子重複イベントを通して進化し、Ｔ７ＳＳ分泌機構の構成要素を含む５つの遺伝子群を含有する。これらの群は、ＥＳＡＴ−６分泌系（ＥＳＸ）１〜５と呼ばれる。ＥＳＸ系は、従来のシグナルペプチドを欠くタンパク質を分泌することが示されている。さらに、ＥＳＸ１〜５によって分泌されるタンパク質の大部分は分泌について相互依存に従う７。
【００２０】
Ｅｓｘ−ファミリー
Ｒｖ３０１７ｃ（ｅｓｘＲ）を除き、ＥＳＡＴ−６ファミリータンパク質をコードする遺伝子は、結核菌（Ｍ．ｔｕｂｅｒｃｕｌｏｓｉｓ）Ｈ３７Ｒｖ染色体上の１１座で、縦列対で配列され、ｐｅ−ｐｐｅ遺伝子対がそれに先行する場合が多い。それらは、アミノ酸約１００個の鎖長でＥＳＸ１〜５系によって分泌されるタンパク質をコードする。
【００２１】
本明細書を通して、文脈上他の意味が要求されない限り、「含む（ｃｏｍｐｒｉｓｅ）」という単語、又はその変形、例えば、「含む（ｃｏｍｐｒｉｓｅｓ）」又は「含む（ｃｏｍｐｒｉｓｉｎｇ）」などは、記載した要素若しくは整数、又は要素若しくは整数の群の包含を意味するが、他の要素若しくは整数、又は要素若しくは整数の群の何れの排除も意味するものではないことが理解されるであろう。
【００２２】
免疫原性のポリペプチドとは、毒性マイコバクテリウム（ｍｙｃｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）に現在感染している、又は過去に感染した生体試料又は個体において免疫応答を誘導するポリペプチドと定義される。
【００２３】
免疫応答は、以下の方法のうち１つによってモニターすることができる。
・ｉｎ  ｖｉｔｒｏ細胞応答は、毒性マイコバクテリア（ｍｙｃｏｂａｃｔｅｒｉａ）に現在感染している、又は過去に感染した動物又はヒトから取り出したリンパ球からの、ＩＦＮ−γなどの関連するサイトカインの放出によって、又はこれらのＴ細胞の増殖の検出によって測定される。ポリペプチド又は免疫原性部分を、ウェル当たり１×１０５個の細胞〜３×１０５個の細胞を含む懸濁液に添加することによって実施される誘導。血液、脾臓、肝臓又は肺から単離される細胞、及び懸濁液１ｍｌ当たり２０μｇ以下の濃度になるポリペプチド又は免疫原性部分の添加、並びに２日〜５日実施される刺激。細胞増殖のモニタリングには、放射性標識したチミジンで細胞をパルス標識し、インキュベーションの１６〜２２時間後、液体シンチレーション計数による増殖の検出。バックグラウンドプラス２標準偏差より高い応答である陽性応答。ＩＦＮ−γの放出は、当業者に周知のＥＬＩＳＡ法によって測定することができる。バックグラウンドプラス２標準偏差より高い応答である陽性応答。ＩＦＮ−γ以外のサイトカイン、例えば、ＩＬ−１２、ＴＮＦ−α、ＩＬ−４、ＩＬ−５、ＩＬ−１０、ＩＬ−６、ＴＧＦ−βは、ポリペプチドに対する免疫学的応答をモニターする際に関連し得る。サイトカイン（例えばＩＦＮ−γ）の存在を測定する別のさらに高感度な方法はＥＬＩＳＰＯＴ法であり、血液、脾臓、肝臓又は肺から単離された細胞を１〜４×１０６個の細胞／ｍｌの好ましい濃度に希釈し、１ｍｌ当たり２０μｇ以下の濃度になるポリペプチド又は免疫原性部分の存在下で１８〜２２時間インキュベートする。その後、細胞懸濁液を１〜２×１０６／ｍｌに希釈し、抗ＩＦＮ−γでコートしたＭａｘｉｓｏｒｐプレートに移し、好ましくは４〜１６時間インキュベートする。ＩＦＮ−γを産生する細胞を、標識した抗ＩＦＮ−γ二次抗体及びスポットを生じさせる関連の基質の使用によって判定し、解剖顕微鏡を使用してこれを計数することができる。関連するサイトカインをコードするｍＲＮＡの存在を、ＰＣＲ技術の使用によって判定することも実現可能である。通常、例えばＰＣＲ、ＥＬＩＳＰＯＴ又はＥＬＩＳＡを利用して、１種又は複数種のサイトカインを測定することになろう。当業者には理解されるであろうが、特定のポリペプチドによって誘導されるこれらのサイトカインの何れかの量における有意な増加又は減少は、ポリペプチドの免疫学的な活性の評価に使用することができる。
【００２４】
・ｉｎ  ｖｉｔｒｏ細胞応答は、免疫のある個体又は結核菌（Ｍ．ｔｕｂｅｒｃｕｌｏｓｉｓ）に感染した個人に由来するＴ細胞株を使用することによって測定することもでき、この場合、Ｔ細胞株は、生マイコバクテリア（ｍｙｃｏｂａｃｔｅｒｉａ）、細菌細胞からの抽出物、又はＩＬ−２を添加した１０〜２０日間の培養濾液で誘導されたものである。懸濁液１ｍｌ当たり２０μｇ以下のポリペプチドを、ウェル当たり１×１０５個の細胞〜３×１０５個の細胞を含有するＴ細胞株に添加することによって実施される誘導、及び２〜６日実施されるインキュベーション。ＩＦＮ−γの誘導又は別の関連するサイトカインの放出は、ＥＬＩＳＡで測定する。Ｔ細胞の刺激は、上記の放射性標識したチミジンを使用して細胞増殖を測定することによってモニターすることもできる。両アッセイについて、バックグラウンドプラス２標準偏差より高い応答である陽性応答。
【００２５】
・１００μｇ以下のポリペプチド又は免疫原性部分の皮内注射又は局所施用貼付剤を、毒性マイコバクテリウム（Ｍｙｃｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）に顕性感染又は不顕性感染している個体に施した後、陽性ＤＴＨ応答として測定することができるｉｎ  ｖｉｖｏ細胞応答、注射又は施用の７２〜９６時間後に少なくとも５ｍｍの直径を有する陽性応答。
【００２６】
・ｉｎ  ｖｉｔｒｏ体液性応答は、免疫のある、又は感染した個体における特定の抗体応答によって測定される。抗体の存在は、ＥＬＩＳＡ技術又はウェスタンブロットによって判定することができ、この場合、ポリペプチド又は免疫原性部分は、ニトロセルロース膜又はポリスチレン表面に吸収される。血清をＰＢＳ中に１：１０〜１：１００で希釈し、吸収されたポリペプチドに添加するのが好ましく、インキュベーションを１〜１２時間実施する。標識した二次抗体の使用により、ＯＤを測定することによって、例えばＥＬＩＳＡによって特定の抗体の存在を判定することができ、陽性応答は、バックグラウンドプラス２標準偏差より高い応答、或いはウェスタンブロットにおける視覚応答である。
【００２７】
・別の関連するパラメーターは、アジュバント中のポリペプチドを伴うワクチン接種の後、又はＤＮＡワクチン接種の後に誘導される、動物モデルにおける防御の測定である。好適な動物モデルには、毒性マイコバクテリウム（Ｍｙｃｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）の感染に曝露させた、霊長類、モルモット又はマウスが含まれる。防御が誘導されたことの読み取り情報は、非ワクチン接種の動物と比較して標的器官における細菌負荷の減少、非ワクチン接種の動物と比較して生存期間の長期化、及び非ワクチン接種の動物と比較して体重減少幅の減少とすることができよう。
【００２８】
免疫原性部分
本発明の好ましい実施形態において、ポリペプチドは、ポリペプチドの免疫原性部分、例えば、Ｂ細胞又はＴ細胞に対するエピトープを含む。ポリペプチドの免疫原性部分はポリペプチドの一部であり、動物又はヒトにおいて、及び／又は本明細書に記載する生物学的アッセイの何れかによって測定される生体試料において、免疫応答を引き出す。ポリペプチドの免疫原性部分は、Ｔ細胞エピトープ又はＢ細胞エピトープであり得る。免疫原性部分は、ポリペプチドの１個又は数個の比較的小さい部分に関連している可能性があり、ポリペプチド配列全体にわたって分散していたり、ポリペプチドの特定の部分に位置していたりする可能性がある。数種のポリペプチドについては、エピトープが、ポリペプチドの全配列にわたる全域に分散していることが示されている（Ｒａｖｎ  ｅｔ  ａｌ  １９９９）。
【００２９】
免疫応答中に認識される、関連するＴ細胞エピトープを同定するために、「総当たり（ｂｒｕｔｅ  ｆｏｒｃｅ）」法を使用することが可能である。即ち、Ｔ細胞エピトープは直鎖状であるため、ポリペプチドの欠失変異体が系統的に構築されれば、例えばこの欠失変異体に、例えば本明細書に記載するＩＦＮ−γアッセイを施すことによって、ポリペプチドのどの領域が免疫認識に不可欠であるかがわかるであろう。別の方法では、ＭＨＣクラスＩＩエピトープの検出のために、オーバーラップオリゴペプチドを、好ましくは合成の、例えばポリペプチド由来の鎖長がアミノ酸残基２０個のものを利用する。これらのペプチドは、生物学的アッセイ（例えば、本明細書に記載するＩＦＮ−γアッセイ）で試験することができ、このうち幾つかは、ペプチド中にＴ細胞エピトープが存在する証拠として、陽性応答（且つこれによって免疫原性の）を示すであろう。ＭＨＣクラスＩエピトープの検出については、結合が見込まれるペプチドを予測することが可能であり（Ｓｔｒｙｈｎ  ｅｔ  ａｌ．１９９６）、その後、これらのペプチドを合成で生成し、関連する生物学的アッセイ、例えば、本明細書に記載するＩＦＮ−γアッセイでこれらを試験することが可能である。ポリペプチド由来の、好ましくは鎖長が例えばアミノ酸残基８〜１１個のペプチド。Ｂ細胞エピトープは、例えばＨａｒｂｏｅ  ｅｔ  ａｌ  １９９８に記載されている、対象のポリペプチドを含むオーバーラップペプチドに対するＢ細胞の認識を解析することによって判定することができる。
【００３０】
Ｔ細胞エピトープの最小鎖長は少なくともアミノ酸６個であることが示されているが、係るエピトープが、これより長い長さのアミノ酸で構成されることは普通である。
【００３１】
ポリペプチドの免疫原性部分は、遺伝学的に異型遺伝子のヒト集団の広範部（高頻度）にも少数部（低頻度）にも認識され得る。さらに、高い免疫学的応答（優性）を誘導する免疫原性部分もあれば、それより低いが、それでもなお重要な応答（準優性）を誘導する免疫原性部分もある。高頻度＞＜低頻度は、広範に分布したＭＨＣ分子（ＨＬＡタイプ）に結合する免疫原性部分に関連するか、又は複数のＭＨＣ分子によるものでありさえする可能性がある（Ｋｉｌｇｕｓ  ｅｔ  ａｌ．１９９１，Ｓｉｎｉｇａｇｌｉａ  ｅｔ  ａｌ  １９８８）。
【００３２】
しかし、結核に対する新規なワクチン用の候補分子を提供するという状況において、準優勢（ｓｕｂｄｏｍｉｎａｔ）エピトープは、優勢（ｄｏｍｉｎａｔ）エピトープと同様に関連した重要性をもつ。なぜなら、係るエピトープは、準優性であっても防御を誘導できることが示されている（国際公開公報第２００８０００２６１号）からである。
【００３３】
本発明のポリペプチドの共通の特徴は、実施例で例示するとおりの免疫学的応答を誘導する能力である。当然のことながら、置換、挿入、付加又は欠失によって生成する本発明のポリペプチドの変異体も、本明細書に記載するアッセイの何れかによって測定される免疫原性がある。
【００３４】
融合タンパク質
「融合タンパク質」という用語は、任意の長さ及び配列のアミノ酸リンカー／スペーサーを伴って、又は伴わずに融合した、結核菌（Ｍ．ｔｕｂｅｒｃｕｌｏｓｉｓ）由来の順不同の２つ以上の免疫原性のポリペプチド又はそのアナログのことと理解される。下流生成でのタンパク質凝集を回避するために、融合タンパク質中の全てのシステインが任意のアミノ酸で置換され得るが、セリンは、その構造がシステインと類似性が高いため、好ましい置換基である。
【００３５】
リンカー
リンカー又はスペーサーは、融合タンパク質中のポリペプチドパートナー同士の間に生じる短鎖ペプチド配列である。リンカーは、グリシン及びセリンのような可動性残基から構成されることが多いため、隣接するタンパク質ドメイン同士は互いに対して、分泌／産生中の独立した固有のフォールディングのために自由に動く。２つの隣接するドメインが、互いを立体的に干渉しないように確実にする必要がある場合、長めのリンカーが使用される。
【００３６】
パラログ、オルソログ（ｏｒｔｏｌｏｇｕｅ）及びホモログ
「パラログ」という用語は、祖先が共通で、その後１つ又は複数の重複事象が生じたために、ある程度の相同性をもつタンパク質又は遺伝子のことであると理解される。パラログはゲノム内の重複が関連する遺伝子であり、一方、共通祖先遺伝子から種分化によって進化した異なる種における相同遺伝子であるオルソログ。ホモログという用語は、種分化の事象によって分離した遺伝子間の関係に適用される（オルソログ）か、又は遺伝子重複の事象によって分離した遺伝子間の関係に適用される（パラログ）。
【００３７】
アナログ
配列アナログという用語は、互いが構造的且つ免疫原性的に類似しているが、アミノ酸組成において異なるポリペプチドを意味する。
【００３８】
ワクチン
本発明の別の部分は、本発明に係る融合タンパク質を含むワクチン組成物に関する。融合タンパク質本発明が動物に認識される有効なワクチンは、動物モデルにおいて、毒性マイコバクテリウム（Ｍｙｃｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）の感染に曝露させた後、非ワクチン接種の動物と比較して、標的器官において細菌負荷を減少させ、生存期間を長期化させ、且つ／又は体重減少幅を減少させることが可能であろう。
【００３９】
係るワクチン組成物は、その最適性能を確保するために、免疫学的に且つ薬学的に許容できる担体、ビヒクル又はアジュバントを含むことが好ましい。
【００４０】
好適な担体は、ポリペプチドが疎水性非共有相互作用によって結合するポリマー、例えばポリスチレンなどのプラスチック、若しくはポリペプチドが共有結合するポリマー、例えば多糖など、又はポリペプチド、例えばウシ血清アルブミン、オボアルブミン又はキーホールリンペットヘモシアニンからなる群から選択される。好適なビヒクルは、希釈剤及び懸濁化剤からなる群から選択される。アジュバントは、カチオン性リポソーム（例えばジメチルジオクタデシルアンモニウムブロミド（ＤＤＡ））、Ｑｕｉｌ  Ａ、ｐｏｌｙ  ｌ：Ｃ、水酸化アルミニウム、フロイント不完全アジュバント、ＩＦＮ−γ、ＩＬ−２、ＩＬ−１２、モノホスホリルリピドＡ（ＭＰＬ）、トレハロースジミコラート（ＴＤＭ）、トレハロースジベヘナート（ＴＤＢ）、ムラミルジペプチド（ＭＤＰ）及びモノミコリルグリセロール（ＭＭＧ）又はこれらの組合せからなる群から選択されるのが好ましい。
【００４１】
ワクチンにアジュバント効果を実現する他の方法には、水酸化アルミニウム又はリン酸アルミニウムなどの作用剤（ａｌｕｍ）、糖の合成ポリマー（Ｃａｒｂｏｐｏｌ）の使用が含まれ、熱処理によるワクチン中のタンパク質の凝集、アルブミンに対するペプシン処理（Ｆａｂ）抗体での再活性化による凝集、Ｃ．パルバム（Ｃ．ｐａｒｖｕｍ）などの細菌細胞又はグラム陰性菌のエンドトキシン若しくはリポ多糖成分との混合物、生理学的に許容できる油性ビヒクル中乳剤、例えばマンニドモノオレイン酸（Ａｒａｃｅｌ  Ａ）、又は遮断代用物（ｂｌｏｃｋ  ｓｕｂｓｔｉｔｕｔｅ）として使用されるペルフルオロカーボンの２０パーセント溶液（Ｆｌｕｏｓｏｌ−ＤＡ）を伴う乳剤を使用することもできる。他の可能性として、サイトカイン又は合成ＩＦＮ−γ誘導物質、例えばｐｏｌｙ  ｌ：Ｃなどの免疫調節物質を、上記のアジュバントと組み合わせて使用することが挙げられる。
【００４２】
アジュバント効果を実現する別の興味深い可能性は、Ｇｏｓｓｅｌｉｎ  ｅｔ  ａｌ．，１９９２（これを参照によって本明細書に組み込む）に記載されている技術を使用することである。端的に言えば、本発明の抗原などの関係する抗原は、単球／マクロファージ上のＦｃγ受容体に対して、抗体にコンジュゲートされ得る（又は抗原は抗体フラグメントに結合する）。
【００４３】
ワクチンは、投薬製剤に適合した方法で、治療的に有効で免疫原性が見込まれる量で投与される。投与する量は処置する対象、例えば、個体の免疫系が免疫応答を開始する能力、及び所望される防御の程度などに応じて決まる。好適な投与量範囲は、１ワクチン接種につき数百マイクログラムの活性成分で、順番に、好ましい範囲は約０．１μｇ〜１０００μｇ、例えば約１μｇ〜３００μｇの範囲、特に約１０μｇ〜５０μｇの範囲である。初回投与及び追加接種に好適なレジメンも不定であるが、代表的なものは、初回投与の後の次の接種又は他の投与である。
【００４４】
施用方法は多種多様であり得る。従来のワクチン投与方法の何れかが適用可能である。従来の方法には、固形の生理学的に許容できる基剤で、又は生理学的に許容できる分散液での経口施用、注射などによって非経腸的に、などが含まれると考えられる。ワクチンの投与量は投与経路に依存するであろうし、ワクチン接種される個人の年齢、及び重要性は低いが、ワクチン接種される個人の体の大きさに応じて変化するであろう。
【００４５】
ワクチンは、慣用的には、注射によって、例えば皮下又は筋肉内に非経腸的に投与される。他の投与形態に好適なさらなる製剤には、坐剤、及び場合により経口製剤が含まれる。坐剤については、従来の結合剤及び担体として、例えば、ポリアルカレン（ｐｏｌｙａｌｋａｌｅｎｅ）グリコール又はトリグリセリドを挙げることができる。係る坐剤は、活性成分を０．５％〜１０％、好ましくは１〜２％の範囲で含有する混合物から形成され得る。経口製剤として、例えば、医薬品グレードの、マンニトール、ラクトース、デンプン、ステアリン酸マグネシウム、サッカリンナトリウム、セルロース、炭酸マグネシウムなどのような、通常使用される賦形剤が挙げられる。これらの組成物は、溶液剤、懸濁剤、錠剤、丸剤、カプセル剤、徐放製剤又は散剤の形態をとり、１０〜９５％の、好ましくは２５〜７０％の活性成分を含有するのが有利である。
【００４６】
多くの場合、ワクチンを複数回投与することが必要になるであろう。特に、ワクチンは、毒性マイコバクテリア（ｍｙｃｏｂａｃｔｅｒｉａ）の感染を予防するため、且つ／又は確立したマイコバクテリア感染症を処置するために投与することができる。感染を予防するために投与する場合、ワクチンは、感染症の確定的な臨床徴候又は症状が現れる前に予防的に与えられる。
【００４７】
本発明は、毒性マイコバクテリア（ｍｙｃｏｂａｃｔｅｒｉａ）によって引き起こされるＴＢに対して、ヒトを含む動物を免疫する方法にも関し、当該方法は、本発明のポリペプチド、若しくは上記の本発明のワクチン組成物、又は上記の生ワクチンを動物に投与するステップを含む。
【００４８】
治療ワクチン
本発明は、ワクチンとして投与されると、実験動物において結核菌（Ｍ．ｔｕｂｅｒｃｕｌｏｓｉｓ）感染症の重症度を減少させ、又は以前の感染の再活性化を予防するその能力に基づいて、治療ワクチンとして使用するための本発明の融合タンパク質の使用にも関する。治療ワクチン用に使用される組成物は、ワクチンについて上に記載したとおりに調製することができる。
【００４９】
ＥＳＸ−１が関与するポリペプチドを含む融合タンパク質
マイコバクテリア（Ｍｙｃｏｂａｃｔｅｒｉａ）の分泌系は、細胞外環境へ、又は直接的に宿主細胞中へ、毒性因子を排出することを担っており、このため、細菌の毒性及び生存にきわめて重要な役割をする。ＥＳＸ−１分泌系の一部は、弱毒化ウシ型結核菌（Ｍ．ｂｏｖｉｓ）ＢＣＧ及び病原性マイコバクテリア種の比較ゲノム解析中に同定された８。主なゲノムの差異の１つは、ウシ型結核菌（Ｍ．ｂｏｖｉｓ）ゲノムにおける、分泌抗原ＣＦＰ１０及びＥＳＡＴ−６をコードする領域を含んだ大幅な欠失であった。この領域は、毒性に特に寄与することが観察され、この領域を修復すると、ＥＳＡＴ−６の分泌が可能になっただけでなく、ウシ型結核菌（Ｍ．ｂｏｖｉｓ）ＢＣＧにおいて毒性が増大した４。
【００５０】
ＥＳＸ−１分泌系は、結核菌（Ｍ．ｔｕｂｅｒｃｕｌｏｓｉｓ）群内の全ての病原性マイコバクテリア（ｍｙｃｏｂａｃｔｅｒｉａ）を含む成長の遅いマイコバクテリア（ｍｙｃｏｂａｃｔｅｒｉａ）の中で保存され、ｉｎ  ｖｉｖｏでのマイコバクテリア（ｍｙｃｏｂａｃｔｅｒｉａ）の生存に必要である。分泌されたエフェクター分子の機能は、肉芽腫形成及びファゴソーム成熟の開始に必要であり、ファゴソームからの脱出、細胞溶解及び細胞間伝播、カスパーゼ活性化によるアポトーシス並びにＴＬＲ２シグナル伝達の妨害による免疫調節に必須である６、９。
【００５１】
今日では、ＥＳＸ−１分泌系は、３つの異なる座、即ちＥＳＸ−１の座、ｅｓｐＡオペロン、及び転写制御因子ＥｓｐＲの座によってコードされていることがわかっている１０、１１。ＥＳＸ−１分泌に関与している構成成分の正確な数は今なお議論中であり、異なるマイコバクテリア種間で変化するようである。現在のところ、以下の結核菌（Ｍｙｃｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｔｕｂｅｒｃｕｌｏｓｉｓ）遺伝子のＥＳＸ−１系に対する関係性が示されている。ｅｓｐＲ、ｅｓｐＡ、ｅｓｐＢ、ｅｓｐＣ、ｅｓｐＤ、ｅｓｐＦ、ｅｓｘＡ、ｅｓｘＢ、ｍｙｃＰ１、ＰＥ３５、Ｒｖ３８６２（ＷｈｉＢ６）、Ｒｖ３８６６、Ｒｖ３８６８、Ｒｖ３８６９、Ｒｖ３８７０、Ｒｖ３８７１、Ｒｖ３８７６、Ｒｖ３８７７、Ｒｖ３８７９ｃ、Ｒｖ３８８１ｃ、Ｒｖ３８８２ｃ、並びにＭＣＥ１タンパク質ＭｃｅｌＢ、Ｍｃｅ１Ｃ、ＭＣｅ１Ｆ及びＲｖ０１７７１２、１３。
【００５２】
実験的に検証された６つのＥＳＸ−１の基質、Ｒｖ３６１６ｃ（ＥｓｐＡ）、Ｒｖ３６１５ｃ（ＥｓｐＣ）、Ｒｖ３８４９（ＥｓｐＲ）、ＥＳＡＴ−６、ＣＦＰ−１０及びＲｖ３８８１ｃ（ＥｓｐＢ）は、分泌に対して互いに相互依存している７。
【００５３】
ＥＳＸ−１が分泌する既知の全ての基質は、例えば感染の直後に下方制御されるＡｇ８５及び他の代謝関連の抗原とは対照的に、感染の様々な段階で発現性の高い、強力な抗原である。
【００５４】
ＥＳＸ−１が関与する多くのタンパク質の、感染中の様々な時点での発現性の高さ、及び免疫原性の高さを考慮して、ＥＳＸ−１が関与する６つを基にＨ７４骨格の融合タンパク質を作製した。
【００５５】
Ｈ７４融合タンパク質は、実験的に証明された３つのＥＳＸ−１基質（ＥＳＡＴ−６、ＥｓｐＲ、ＥｓｐＣ）とＥＳＸ−１が関与する３つの分泌タンパク質（ＥｓｐＤ、ＥｓｐＡ、ＥｓｐＢ）とからなる。Ｈ７４融合物中のタンパク質の順序は、ＥｓｐＢ、ＥＳＡＴ−６、Ｒｖ３６１４、ＥｓｐＣ、ＥｓｐＡ、ＥｓｐＲであるが、他の何れの順序を使用してもよい。Ｈ７４はアミノ酸１３１９個からなり、理論的分子量は１３７，９１７ｇ／ｍｏｌであり、等電点は４．７７である。結核菌（Ｍｙｃｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｔｕｂｅｒｃｕｌｏｓｉｓ）染色体からコードされる野生型配列において、ＥｓｐＤ、ＥｓｐＣ及びＥｓｐＲには１つのシステインがある。リフォールディング中の硫黄架橋形成及びタンパク質凝集を伴う問題を回避するため、３つ全てのシステインはアミノ酸セリンで置換されている。
【００５６】
Ｈ７４中の個々のタンパク質についての情報：
ＥＳＡＴ−６（Ｒｖ３８７５）は、ＣＦＰ１０と一緒に、ヘテロ二量体としてＥＳＸ−１によって分泌される１４。
ＥｓｐＲ（Ｒｖ３８４９）は、それ自身の発現の転写活性化因子であり、ｅｓｐＡ（Ｒｖ３６１６ｃ）、Ｃ及びＤを含むオペロンである。ＥｓｐＲタンパク質は、ＥＳＸ−１によって分泌される１５。
ＥｓｐＣ（Ｒｖ３６１５ｃ）の遺伝子発現は、ＥｓｐＲによって制御される。ＥｓｐＣは、ＥＳＸ−１によって分泌される１１。
ＥｓｐＤ（Ｒｖ３６１４ｃ）の遺伝子発現は、ＥｓｐＲによって制御される。ＥｓｐＤは、ｅｓｐＣ及びｅｓｐＡと共転写される。ＥｓｐＤの分泌ではなく発現は、ＥｓｘＡの分泌に必要である。ＥｓｐＤは、ＥｓｐＡ〜ＥｓｐＣの複合体を安定化させる。ＥｓｐＤの分泌は、ＥＳＸ−１系を必要とするだけというわけではない１６。
ＥｓｐＡ（Ｒｖ３６１６）の遺伝子発現は、ＥｓｐＲによって制御される。ＥｓｐＡは、ＥＳＸ−１によって分泌される７。
ＥｓｐＢ（Ｒｖ３８８１）は、ＥＳＸ−１によって分泌される（Ｘｕ，２００７  ＃９１２；ＭｃＬａｕｇｈｌｉｎ，２００７  ＃５９１）。
【００５７】
Ｈ７８中の個々のタンパク質についての情報：
ＥＳＡＴ−６（Ｒｖ３８７５）は、ＣＦＰ１０と一緒に、ヘテロ二量体としてＥＳＸ−１によって分泌される１４。
ＥｓｐＤ（Ｒｖ３６１４ｃ）の遺伝子発現は、ＥｓｐＲによって制御される。ＥｓｐＤは、ｅｓｐＣ及びｅｓｐＡと共転写される。ＥｓｐＤの分泌ではなく発現は、ＥｓｘＡの分泌に必要である。ＥｓｐＤは、ＥｓｐＡ〜ＥｓｐＣの複合体を安定化させる。ＥｓｐＤの分泌は、ＥＳＸ−１系を必要とするだけというわけではない１６。
ＥｓｐＣ（Ｒｖ３６１５ｃ）タンパク質配列のアミノ酸１−５６。ｅｓｐＣの遺伝子発現は、ＥｓｐＲによって制御される。ＥｓｐＣタンパク質は、ＥＳＸ−１によって分泌される１１。
ＥｓｐＲ（Ｒｖ３８４９）は、それ自身の発現の転写活性化因子であり、ｅｓｐＡ（Ｒｖ３６１６ｃ）、Ｃ及びＤを含むオペロンである。ＥｓｐＲタンパク質は、ＥＳＸ−１によって分泌される１５。
ＰＥ３５（Ｒｖ３８７２）は分泌ＰＥタンパク質である。遺伝子ｐｅ３５（Ｒｖ３８７２）を不活性化するとＣＦＰ−１０及びＥＳＡＴ−６の発現が損なわれ、これは調節における役割を示唆するものである。
【図面の簡単な説明】
【００５８】
【図１】図１は、ワクチン接種後の、抗原特異的免疫応答を示している。動物に、ＣＡＦ０１アジュバント中に配合された融合タンパク質Ｈ７４又はＨ５６の何れかをワクチン接種し、その後、Ｔ細胞応答の強度及び特異性を測定した。Ｈ７４のうちの６つを組み合わせたタンパク質又はＨ５６のうちの３つを組み合わせたタンパク質に対する応答を、血液から単離したＰＢＭＣ（Ａ及びＣ）又は脾細胞（ｓｐｅｌｏｃｙｔｅｓ）（Ｂ及びＤ）について、これらの細胞を２μｇのＨ７４又はＨ５６の何れかの抗原プールで刺激することによって定量した。抗原特異性は、２つのワクチンについて（Ｅ及びＦ）、２μｇのそれぞれの単一の抗原で再刺激することによって測定した。読み出し情報は、３日間ｉｎ  ｖｉｔｒｏ刺激をした後の培養上清についてＥＬＩＳＡによって測定された分泌されたＩＦＮ−γである。
【図２】図２は、ワクチンで誘導されたＴ細胞の多機能性及び防御効力を示している。ワクチン抗原で刺激した後に、ＩＦＮ−γ、ＴＮＦ−α、又はＩＬ−２のサイトカインの少なくとも１つを産生可能なワクチン特異的ＣＤ４  Ｔ細胞の頻度を、フローサイトメトリを使用して測定した（Ａ）。ＰＢＳ刺激コントロールを差し引いた。個々のＣＤ４  Ｔ細胞について前記３つのサイトカインのサイトカイン発現プロファイルを測定し、三重、二重、及び単サイトカイン産生Ｔ細胞の頻度を群当たりそれぞれ４匹の動物について表に示した。３つのサイトカインについて全部で７つの組み合わせがある。円グラフは、ワクチン接種した各群についてのサイトカイン産生サブタイプの分布を示している（Ｂ）。６つ全ての円グラフに同じ色分けを使用している。結核菌（Ｍｙｃｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｔｕｂｅｒｃｕｌｏｓｉｓ）でエアロゾル曝露した後、それぞれの動物の肺の中の細菌負荷を測定し、群間で比較した（Ｃ）。群の統計比較には、一元配置ＡＮＯＶＡ及びテューキーの多重比較事後検定を行った（＊＊＊ｐ＜０．００１；＊＊ｐ＜０．０１；＊ｐ＜０．０５）。平均及びＳＥＭを各群について示す。
【図３】図３は、Ｈ７４ワクチンの広い範囲の用量でＢＣＧに対する防御が改善し得ることを示している。（Ａ）結核菌（Ｍ．ｔｂ）株エルドマン（Ｅｒｄｍａｎ）感染１２週間後のマウス群における結核菌（Ｍｙｃｏｂａｃｔｅｒｉａｌ  ｔｕｂｅｒｃｕｌｏｓｉｓ）の数を測定した。動物に、ＢＣＧのみ、又はＢＣＧに続いて３カ月後にＣＡＦ０１アジュバント中に配合されたＨ７４のワクチンを接種した。関連するＨ７４ワクチン用量を特定するために、Ｈ７４の５つの異なる用量（０．０１μｇ乃至２５μｇ）を試験した。一元配置分散分析（ＡＮＯＶＡ）及びテューキーの多重比較検定に基づいて、ワクチン接種された全ての群が、生理食塩水コントロール（黒丸、ｐ＜０．００１）と比べて有意に低いＣＦＵ数であったことが示された。０．１、１、及び５μｇのＨ７４でワクチン接種した群は、ＢＣＧのみをワクチン接種した群（赤丸）よりもＣＦＵが低いにも関わらず、その差は有意ではなかった。（Ｂ）０．１又は５μｇのＨ７４を用いた繰り返し実験では、Ｈ７４が、事前のＢＣＧ接種で予防した動物におけるＣＦＵ負荷を有意に低減させたことが示された（＊、ｐ＜０．０５、ＢＣＧのみをワクチン接種した群との比較）。
【図４】図４は、Ｈ６４及びＨ７４が、ＢＣＧワクチンを補助することが可能であり、結核菌（Ｍｔｂ）の臨床的分離株に対して長期的な防御を誘導し得ることを示している。結核菌（Ｍ．ｔｂ）株北京（Ｂｅｉｊｉｎｇ）（Ａ）又はカザフスタン（Ｋａｚａｋｈｓｔａｎ）（Ｂ）の何れかで感染した２４週間後のマウス群における結核菌（Ｍｙｃｏｂａｃｔｅｒｉａｌ  ｔｕｂｅｒｃｕｌｏｓｉｓ）の数を測定した。両実験では、動物に、ＢＣＧのみ、又はＢＣＧに続いて２カ月後にＣＡＦ０１アジュバント中に配合された２μｇのＨ６４又はＨ７４、の何れかのワクチンを接種した。ＢＣＧをＨ６４又はＨ７４の何れかで補助するワクチンを接種した群からの動物でのみ、細菌負荷が、一元配置分散分析（ＡＮＯＶＡ）及びテューキーの多重比較検定に基づいて、統計的に有意に低減していた（ｐ＜０．０５）。
【図５】図５は、Ｈ７４が、結核菌（Ｍ．ｔｂ）曝露を防ぎ、ＢＣＧと同時に注射すると、ＢＣＧを補助して防御を改善し得ることを示している。マウス群に、ＢＣＧを１回、Ｈ７４／ＣＡＦ０１を３回、又はＢＣＧ及びＨ７４／ＣＡＦ０１（異なる２つの部位に注射）を１回と続くＨ７４／ＣＡＦ０１を２回、の何れかのワクチンを接種した。結核菌（Ｍ．ｔｂ）株エルドマン（Ｅｒｄｍａｎ）感染の６週間後に細菌負荷を測定した。全てのワクチンで有意な防御が得られたが（ｐ＜０．００１）、最初のワクチン接種時にＢＣＧ及びＨ７４の両方を注射した場合では、何れのワクチンそのままのものよりも有意に改善された防御が誘導された（ｐ＜０．００１）。
【図６】図６は、Ｈ６４又はＨ７８ワクチンの接種後のＴ細胞応答を示している。Ｈ６４又はＨ７８をワクチン接種したマウスからの脾臓細胞（ｓｐｌｅｅｎ  ｃｅｌｌｓ）を、それぞれの動物から単離し、２μｇ／ｍｌのＥＳＡＴ−６、Ｒｖ３６１４ｃ、Ｒｖ３６１５ｃ、又はＲｖ３８６５の何れかで、３７℃で６時間刺激した。その後、細胞を、洗浄し、表面マーカーＣＤ４及びＣＤ４４、及びサイトカインＩＦＮ−ｇ、ＴＮＦ-ａ、ＩＬ−２、及びＩＬ−１７に対する蛍光標識された抗体で染色した。標識されたマーカー及びサイトカインの発現を、フローサイトメトリにより測定した。ＣＤ４及びＣＤ４４の高発現についてゲーティングした後に、活性化されたＴ細胞の亜群におけるサイトカイン産生細胞の頻度をプロットした。
【発明を実施するための形態】
【００５９】
実施例
実施例１：Ｈ７４融合タンパク質−予防ＴＢワクチン接種モデルにおける免疫応答及び防御。
ＣＢ６Ｆ１マウスの各群に、０．０１、０．１、１、５、又は２５μｇの融合タンパク質Ｈ７４又は５μｇの融合タンパク質Ｈ５６の何れかを３回ワクチン接種した。両タンパク質は、注射前にリポソーム系アジュバントＣＡＦ０１中に配合した。コントロール群には、等しい体積の塩水（２００μＬ）を３回注射、又は２００μＬのＢＣＧ（５×１０７ＣＦＵ／ｍＬ）を１回ワクチン接種した。ワクチン接種の間隔は２週間とし、３回目のワクチン接種から３週間後に、ＰＢＭＣ及び脾細胞（ｓｐｌｅｎｏｃｙｔｅｓ）を単離し、ワクチンが誘導したＴ細胞応答を測定した。単離した細胞（５×１０６個／ウェル）を、２つの融合タンパク質中に存在する個々のタンパク質２μｇ又は融合タンパク質２μｇで３日間インキュベートし、分泌されたＩＦＮ−ｇを培地中でＥＬＩＳＡによって測定した（図１Ａ−Ｆ）。Ｈ５６をワクチン接種したコントロール動物では、Ｈ５６タンパク質及びＡｇ８５Ｂの認識が強く、ＥＳＡＴ−６の認識は中程度である。Ｈ７４をワクチン接種した動物は、Ｒｖ３８８１ｃに特異的な応答が強く、Ｒｖ３８４９ｃ及びＲｖ３６１６ｃに対する応答は中程度である。この近交系マウスでは、Ｒｖ３６１５ｃ又はＲｖ３６１４ｃに対する応答はない。生理食塩水を注射した動物に応答はなく、これらの応答はワクチンに特異的であることが確認された。Ｈ７４応答の強さは、１又は５μｇの何れかのＨ７４タンパク質を接種された動物において組織に依存して最も強かった（図１Ａ及びＢ）。しかし、０．１μｇの低用量のＨ７４でも、Ｈ５６タンパク質５μｇでのワクチン接種よりも高いＩＦＮ-γ放出が得られた。脾臓Ｔ細胞によって産生された更なるサイトカインを見てみると、応答しているＴ細胞の頻度は、１μｇのＨ７４群で最大であったが、この場合もやはり、０．０１μｇのＨ７４が、５μｇのＨ５６よりも高い応答であった（図２Ａ）。ワクチン用量とＴ細胞の多機能性に関して、ＩＬ−２産生Ｔ細胞の相対比率とＨ７４ワクチン用量との間には逆相関関係があった（図２Ｂ）。
【００６０】
３回目のワクチン接種から６週間後に、全ての動物に毒性結核菌（Ｍ．ｔｕｂｅｒｃｕｌｏｓｉｓ）株エルドマン（Ｅｒｄｍａｎ）をエアロゾルで曝露した。曝露から１２週間後に全てのマウスを安楽死させ、個々の動物の肺における細菌数を、肺ホモジネートの希釈物をプレーティングし、コロニーの数を計数することによって求めた（図２Ｃ）。３つのＨ７４ワクチン用量及びＢＣＧの全てにおいて、生理食塩水コントロール群に比べて有意な保護が誘導された。重要なことに、コントロールワクチンＨ５６では、この時間点における統計上レベルでの保護は誘導されなかった。
【００６１】
実施例２：ＢＣＧに対する補助ワクチンとしてのＨ７４及びＨ６４融合タンパク質。コントロール動物以外の全てのＣＢ６Ｆ１マウスにＢＣＧをワクチン接種した。
ワクチン接種用の最適なＨ７４用量を決定するために、ＢＣＧワクチン接種動物群に、ＢＣＧワクチンに加えて、リポソーム系アジュバントＣＡＦ０１中に配合した融合タンパク質Ｈ７４を、様々な用量で３回ワクチン接種した。最初のＨ７４ワクチン接種は、ＢＣＧワクチン接種の３カ月後に行った。コントロール動物には、一定体積の塩水（ＢＣＧ無し、Ｈ７４無し）を４回注射又はＢＣＧを１回ワクチン接種した。Ｈ７４ワクチン接種間の間隔は２週間であった。３回目のワクチン接種から６週間後に、動物に、毒性結核菌（Ｍ．ｔｕｂｅｒｃｕｌｏｓｉｓ）エルドマン（Ｅｒｄｍａｎ）をエアロゾルで曝露した。１２週間後に全てのマウスを安楽死させ、個々の動物の肺における細菌数を、肺ホモジネートの希釈物をプレーティングし、コロニーの数を計数することによって求めた（図３Ａ及びＢ）。
【００６２】
０．１μｇ乃至５μｇのＨ７４用量は、ＢＣＧのみでワクチン接種した動物と比べて、わずかに少ないＣＦＵ数で同等レベルの防御を誘導している。全てのワクチン接種群は、生理食塩水コントロールと比べて有意な防御を誘導した（ｐ＜０．００１）。０．１μｇ及び５μｇのＨ７４のＨ７４ワクチン接種用量のみを含む再実験（図３Ｂ）でも、結果は同様であった。全てのワクチン接種動物は、有意に低い細菌負荷（ｐ＜０．００１）を有していたが、今度はＨ７４補助群も、ＢＣＧのみでワクチン接種した群より有意に低いＣＦＵを有していた。ＢＣＧ補助ワクチンとしてのＨ７４及びＨ６４を比較するために、動物に、ＢＣＧワクチンを接種し、２カ月後に、上記のように０．１μｇのＨ６４／ＣＡＦ０１又はＨ７４／ＣＡＦ０１の何れかでワクチン接種した。この実験では、動物に、３回目のＨ６４又はＨ７４ワクチン接種から６週間後に臨床的結核菌（Ｍｔｂ）分離株北京（Ｂｅｉｊｉｎｇ）（図４Ａ）又は臨床的結核菌（Ｍ．ｔｂ）分離株カザフスタン（Ｋａｚａｋｈｓｔａｎ）（図４Ｂ）を曝露した。感染２４週間後に、それぞれの肺における細菌負荷を計数した。この遅い時間点では、何れの分離株に対するＢＣＧの防御効力も有意ではなかった。しかし、ＢＣＧをＨ６４又はＨ７４で補助することによって、結核菌（Ｍ．ｔｂ）の両臨床的単離株に対する有意な防御が得られた（ｐ＜０．００１）。
【００６３】
実施例３：Ｈ７４は、最初のワクチン接種がＢＣＧワクチン接種と同じ時点であっても、ＢＣＧを補助することができる。
この実験には、４つのワクチン接種群及び１つの生理食塩水コントロール群がある。１のワクチン接種群には、ＢＣＧのみを接種し、もう１群には、５μｇのＨ７４／ＣＡＦ０１を３回接種した。残りの２群には、初回のワクチン接種として、一の注射器でＢＣＧをワクチン接種し、別の注射器でＨ７４／ＣＡＦ０１又はＣＡＦ０１の何れかをワクチン接種した（並行ワクチン接種：ｓｉｄｅ−ｂｙ−ｓｉｄｅ  ｖａｃｃｉｎａｔｉｏｎ）。２回目及び３回目のワクチン接種では、Ｈ７４／ＣＡＦ０１又はＣＡＦ０１をそれぞれ接種した。３回目のワクチン接種から６週間後に、全てのマウスに結核菌（Ｍｔｂ）株エルドマン（Ｅｒｄｍａｎ）を曝露し、６週間後に上記と同じように肺におけるＣＦＵ数を測定した（図５）。全てのワクチンで有意な防御が誘導され（ｐ＜０．００１）、ＢＣＧ、ＢＣＧ：ＣＡＦ０１、及びＨ７４についてのレベルは同様であった。しかし、ＢＣＧ：Ｈ７４及び２回のＨ７４の追加免疫（ｂｏｏｓｔ）を接種した群の動物は、他のワクチン接種群、すなわちＢＣＧ、ＢＣＧ：ＣＡＦ０１、及びＨ７４よりも、肺における細菌が有意に少なかった（ｐ＜０．００１）。
【００６４】
実施例４：Ｈ７８及びＨ６４ワクチン接種は、融合タンパク質内の主要な抗原に対して同等のＴ細胞応答を誘導する。
Ｈ６４融合タンパク質は、結核菌（Ｍｙｃｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｔｕｂｅｒｃｕｌｏｓｉｓ）に由来する６つのタンパク質を含む。そのうちの２つ、Ｒｖ３８６５及びＲｖ３６１５は、ＴＢ患者内で高い頻度及び特異性で認識され、従って、来たるＴＢ診断キットにおけるタンパク質抗原として重要な価値を有する。抗原が重複するため、Ｈ６４ワクチンの世界規模での使用は、この診断キットに支障をきたす。この問題を避けるために、Ｈ６４からＲｖ３８６５の全長及びＲｖ３６１５タンパク質の半分を除去して、Ｈ７８と命名した僅かに短い融合タンパク質を作成した。Ｈ６４とＨ７８の免疫応答を誘導する能力を比較するために、動物群に、ＣＡＦ０１アジュバントに配合した２μｇのＨ６４又はＨ７８の何れかを３回ワクチン接種又は生理食塩水を３回注射した。３回目のワクチン接種から３週間後に、各群の動物３匹を安楽死させ、フローサイトメトリにより、脾臓細胞における最も重要な抗原に対するＴ細胞応答を測定した（図６）。Ｈ６４及びＨ７８の両方は、予期された抗原パターンを誘導している。Ｈ６４は、調べた４つの抗原（ＥＳＡＴ−６、Ｒｖ３６１５ｃ、Ｒｖ３６１４ｃ、及びＲｖ３８６５）全てに対するＴ細胞応答を誘導した。予期された通り、Ｈ７８でワクチン接種された動物においてＲｖ３８６５に対する応答はなかったが、極めて重要なことに、Ｈ７８がＲｖ３６１５ｃタンパク質の半分を欠損しているにも関わらず、Ｈ６４でワクチン接種された動物において見られたものと同様のＴ細胞頻度を持つＲｖ３６１５ｃに対する特異的応答がまだあった。
【００６５】
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【図１】
2017513860.tif 000003
【図２】
2017513860.tif 000004
【図３】
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【図４】
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【図５】
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【図６】
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【配列表】
2017513860000001.app
【国際調査報告】
2017513860.tif 000009
2017513860.tif 000010
2017513860.tif 000011
2017513860.tif 000012
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