(57)【要約】一実施形態では、受容体を発現する細胞を特定の解剖学的領域、例えばリンパ節のＢ細胞領域、腸管、または皮膚にホーミングさせる受容体を発現する細胞、例えばＴ細胞が本明細書で提供される。癌などの疾患を処置するための、このような細胞、例えばＴ細胞の使用もまた、本明細書で提供される。【選択図】なし【特許請求の範囲】
【請求項１】
Ｔ細胞であって、前記Ｔ細胞により通常発現されないホーミング受容体と、キメラ抗原受容体（ＣＡＲ）とを発現する、前記Ｔ細胞。
【請求項２】
前記ホーミング受容体が、Ｂ細胞領域ホーミング受容体である、請求項１に記載のＴ細胞。
【請求項３】
前記Ｂ細胞領域ホーミング受容体が、ＣＸＣＲ５である、請求項２に記載のＴ細胞。
【請求項４】
前記ホーミング受容体が、腸管ホーミング受容体である、請求項１に記載のＴ細胞。
【請求項５】
前記腸管ホーミング受容体が、α４β７である、請求項４に記載のＴ細胞。
【請求項６】
前記腸管ホーミング受容体が、ＣＣＲ９である、請求項４に記載のＴ細胞。
【請求項７】
第２腸管ホーミング受容体を含む、請求項４に記載のＴ細胞。
【請求項８】
前記Ｔ細胞が、ビタミンＡ代謝産物の存在下において、１種以上の腸管ホーミング受容体の発現を増加させるのに十分な時間及び十分な量で活性化される、増殖される、または活性化と増殖の両方が行われる、請求項４〜７のいずれか１項に記載のＴ細胞。
【請求項９】
前記ビタミンＡ代謝産物が、レチノイン酸である、請求項８に記載のＴ細胞。
【請求項１０】
前記ホーミング受容体が、皮膚ホーミング受容体である、請求項１に記載のＴ細胞。
【請求項１１】
前記皮膚ホーミング受容体が、ＣＬＡである、請求項１０に記載のＴ細胞。
【請求項１２】
前記皮膚ホーミング受容体が、ＣＣＲ４である、請求項１０に記載のＴ細胞。
【請求項１３】
前記皮膚ホーミング受容体が、ＣＣＲ１０である、請求項１０に記載のＴ細胞。
【請求項１４】
第２皮膚ホーミング受容体を含む、請求項１０に記載のＴ細胞。
【請求項１５】
第３皮膚ホーミング受容体を含む、請求項１４に記載のＴ細胞。
【請求項１６】
前記Ｔ細胞が、ビタミンＤ代謝産物の存在下において、１種以上の皮膚ホーミング受容体の発現を増加させるのに十分な時間及び十分な量で活性化される、増殖される、または活性化と増殖の両方が行われる、請求項１０〜１５のいずれか１項に記載のＴ細胞。
【請求項１７】
前記ビタミンＤ代謝産物が、１，２６−ジヒドロキシコレカルシフェロール（１，２５（ＯＨ）２Ｄ３）である、請求項１６に記載のＴ細胞。
【請求項１８】
前記Ｔ細胞が、ＩＬ−１２の存在下において、１種以上の皮膚ホーミング受容体の発現を増加させるのに十分な時間及び十分な量で活性化される、増殖される、または活性化と増殖の両方が行われる、請求項１０〜１７のいずれか１項に記載のＴ細胞。
【請求項１９】
Ｂ細胞領域ホーミング受容体をさらに含む、請求項４〜１８のいずれか１項に記載のＴ細胞。
【請求項２０】
前記Ｂ細胞領域ホーミング受容体が、ＣＸＣＲ５である、請求項１９に記載のＴ細胞。
【請求項２１】
Ｔ細胞集団の生成方法であって、複数の前記Ｔ細胞がリンパ節のＢ細胞領域にホーミングし、Ｂ細胞領域ホーミング受容体を発現するようにＴ細胞集団を操作することを含む、前記方法。
【請求項２２】
前記受容体が、ＣＸＣＲ５である、請求項２１に記載の方法。
【請求項２３】
Ｔ細胞集団の生成方法であって、複数の前記Ｔ細胞が腸管にホーミングし、腸管ホーミング受容体を発現するようにＴ細胞集団を操作することを含む、前記方法。
【請求項２４】
前記腸管ホーミング受容体が、α４β７である、請求項２３に記載の方法。
【請求項２５】
前記腸管ホーミング受容体が、ＣＣＲ９である、請求項２３に記載の方法。
【請求項２６】
前記Ｔ細胞集団が、第２腸管ホーミング受容体を発現するように操作される、請求項２３に記載の方法。
【請求項２７】
前記Ｔ細胞集団が、ビタミンＡ代謝産物の前記存在下において、１種以上の腸管ホーミング受容体の発現を増加させるのに十分な時間及び十分な量で活性化される、増殖される、または活性化と増殖の両方が行われるステップをさらに含む、請求項２３〜２６のいずれか１項に記載の方法。
【請求項２８】
前記ビタミンＡ代謝産物が、レチノイン酸である、請求項２７に記載の方法。
【請求項２９】
Ｔ細胞集団の生成方法であって、複数の前記Ｔ細胞が皮膚組織または細胞にホーミングし、皮膚組織または細胞にホーミングする受容体を発現するようにＴ細胞集団を操作することを含む、前記方法。
【請求項３０】
前記皮膚ホーミング受容体が、ＣＬＡである、請求項２９に記載の方法。
【請求項３１】
前記皮膚ホーミング受容体が、ＣＣＲ４である、請求項２９に記載の方法。
【請求項３２】
前記皮膚ホーミング受容体が、ＣＣＲ１０である、請求項２９に記載の方法。
【請求項３３】
前記Ｔ細胞集団が、第２皮膚ホーミング受容体を発現するように操作される、請求項２９に記載の方法。
【請求項３４】
前記Ｔ細胞集団が、第３皮膚ホーミング受容体を発現するように操作される、請求項３３に記載の方法。
【請求項３５】
前記方法が、前記Ｔ細胞集団がビタミンＤ代謝産物の存在下において、１種以上の皮膚ホーミング受容体の発現を増加させるのに十分な時間及び十分な量で活性化される、増殖される、または活性化と増殖の両方が行われるステップをさらに含む、請求項２９〜３４のいずれか１項に記載の方法。
【請求項３６】
前記ビタミンＤ代謝産物が、１，２６−ジヒドロキシコレカルシフェロール（１，２５（ＯＨ）２Ｄ３）である、請求項３５に記載の方法。
【請求項３７】
前記方法が、前記Ｔ細胞集団がＩＬ−１２の前記存在下において、１種以上の皮膚ホーミング受容体の発現を増加させるのに十分な時間及び十分な量で活性化される、増殖される、または活性化と増殖の両方が行われるステップをさらに含む、請求項２９〜３６のいずれか１項に記載の方法。
【請求項３８】
前記方法が、Ｂ細胞領域ホーミング受容体を発現するように前記Ｔ細胞集団を操作するステップを含む、請求項２３〜３７のいずれか１項に記載の方法。
【請求項３９】
前記Ｂ細胞領域ホーミング受容体が、ＣＸＣＲ５である、請求項３８に記載の方法。
【請求項４０】
前記方法が、キメラ抗原受容体（ＣＡＲ）をコードするレンチウイルスベクターを投与するステップをさらに含む、請求項２１〜３９のいずれか１項に記載の方法。
【請求項４１】
個体の癌または腫瘍の処置方法であって、それを必要とする個体に（ｉ）Ｂ細胞領域ホーミング受容体と；（ｉｉ）ＣＡＲとを含むＴ細胞を投与することを含む、前記方法。
【請求項４２】
前記Ｂ細胞領域ホーミング受容体が、ＣＸＣＲ５である、請求項４１に記載の方法。
【請求項４３】
個体の腸管癌または腫瘍の処置方法であって、それを必要とする個体に（ｉ）腸管ホーミング受容体と；（ｉｉ）ＣＡＲとを含むＴ細胞を投与することを含む、前記方法。
【請求項４４】
前記腸管ホーミング受容体が、α４β７である、請求項４３に記載の方法。
【請求項４５】
前記腸管ホーミング受容体が、ＣＣＲ９である、請求項４３に記載の方法。
【請求項４６】
前記Ｔ細胞が、第２腸管ホーミング受容体を含む、請求項４３に記載の方法。
【請求項４７】
前記ＣＡＲの細胞外ドメインが、腸管腫瘍または癌と関連する抗原と結合する、請求項４３〜４６のいずれか１項に記載の方法。
【請求項４８】
個体の皮膚癌または皮膚腫瘍の処置方法であって、それを必要とする個体に（ｉ）皮膚ホーミング受容体と；（ｉｉ）ＣＡＲとを含むＴ細胞を投与することを含む、前記方法。
【請求項４９】
前記皮膚ホーミング受容体が、ＣＬＡである、請求項４８に記載の方法。
【請求項５０】
前記皮膚ホーミング受容体が、ＣＣＲ４である、請求項４８に記載の方法。
【請求項５１】
前記皮膚ホーミング受容体が、ＣＣＲ１０である、請求項４８に記載の方法。
【請求項５２】
前記Ｔ細胞が、第２皮膚ホーミング受容体を含む、請求項４８に記載の方法。
【請求項５３】
前記Ｔ細胞が、第３皮膚ホーミング受容体を含む、請求項５２に記載の方法。
【請求項５４】
前記ＣＡＲの前記細胞外ドメインが、皮膚腫瘍または癌と関連する抗原と結合する、請求項４８〜５４３のいずれか１項に記載の方法。
【請求項５５】
前記ＣＡＲの前記細胞外ドメインが、Ｈｅｒ２、前立腺幹細胞抗原（ＰＳＣＡ）、アルファ−フェトプロテイン（ＡＦＰ）、癌胎児性抗原（ＣＥＡ）、癌抗原−１２５（ＣＡ−１２５）、ＣＡ１９−９、カルレチニン、ＭＵＣ−１、上皮膜タンパク質（ＥＭＡ）、上皮腫瘍抗原（ＥＴＡ）、チロシナーゼ、黒色腫関連抗原（ＭＡＧＥ）、ＣＤ１９、ＣＤ３４、ＣＤ４５、ＣＤ９９、ＣＤ１１７、クロモグラニン、サイトケラチン、デスミン、グリア線維性酸性タンパク質（ＧＦＡＰ）、肉眼的嚢胞性疾患液体タンパク質（ＧＣＤＦＰ−１５）、ＨＭＢ−４５抗原、高分子量黒色腫関連抗原（ＨＭＷ−ＭＡＡ）、タンパク質ｍｅｌａｎ−Ａ（Ｔ細胞によって認識される黒色腫抗原；ＭＡＲＴ−１）、ｍｙｏ−Ｄ１、筋特異的アクチン（ＭＳＡ）、ニューロフィラメント、ニューロン特異的エノラーゼ（ＮＳＥ）、胎盤アルカリホスファターゼ、シナプトフィシス（ｓｙｎａｐｔｏｐｈｙｓｉｓ）、サイログロブリン、甲状腺転写因子−１、二量体形態のピルビン酸キナーゼアイソエンザイムＭ２型（腫瘍Ｍ２−ＰＫ）、異常なｒａｓタンパク質、異常なｐ５３タンパク質、ｆｕｃ−ＧＭ１、ＧＭ２（腫瘍胎児抗原−免疫原性−１；ＯＦＡ−Ｉ−１）；ＧＤ２（ＯＦＡ−Ｉ−２）、ＧＭ３、ＧＤ３、アルファ−アクチニン−４、Ｂａｇｅ−１、ＢＣＲ−ＡＢＬ、Ｂｃｒ−Ａｂｌ融合タンパク質、ベータ−カテニン、ＣＡ１５−３（ＣＡ２７．２９＼ＢＣＡＡ）、ＣＡ１９５、ＣＡ２４２、ＣＡ−５０、ＣＡＭ４３、Ｃａｓｐ−８、ｃｄｃ２７、ｃｄｋ４、ｃｄｋｎ２ａ、ｃｏａ−１、ｄｅｋ−ｃａｎ融合タンパク質、ＥＢＮＡ、ＥＦ２、エプスタインバーウイルス抗原、ＥＴＶ６−ＡＭＬ１融合タンパク質、ＨＬＡ−Ａ２、ＨＬＡ−Ａ１１、ｈｓｐ７０−２、ＫＩＡＡＯ２０５、Ｍａｒｔ２、Ｍｕｍ−１、Ｍｕｍ−２、及びＭｕｍ−３、ｎｅｏ−ＰＡＰ、ミオシンクラスＩ、ＯＳ−９、ｐｍｌ−ＲＡＲα融合タンパク質、ＰＴＰＲＫ、トリオースリン酸イソメラーゼ、Ｇａｇｅ３、４、５、６、７、ＧｎＴＶ、Ｈｅｒｖ−Ｋ−ｍｅｌ、Ｌａｇｅ−１、ＮＡ−８８、ＮＹ−Ｅｓｏ−１／Ｌａｇｅ−２、ＳＰ１７、ＳＳＸ−２、ＴＲＰ２−Ｉｎｔ２、、ｇｐ１００（Ｐｍｅｌ  １７）、チロシナーゼ、ＴＲＰ−１、ＴＲＰ−２、ＭＡＧＥ−１、ＭＡＧＥ−３、ＲＡＧＥ、ＧＡＧＥ−１、ＧＡＧＥ−２、ｐ１５（５８）、ＲＡＧＥ、、ＳＣＰ−１、Ｈｏｍ／Ｍｅｌ−４０、ＰＲＡＭＥ、ＨＥＲ−２／ｎｅｕ、Ｅ２Ａ−ＰＲＬ、Ｈ４−ＲＥＴ、ＩＧＨ−ＩＧＫ、ＭＹＬ−ＲＡＲ、ヒトパピローマウイルス（ＨＰＶ）抗原Ｅ６及びＥ７、ＴＳＰ−１８０、ｐ１８５ｅｒｂＢ２、ｐ１８０ｅｒｂＢ−３、ｃ−ｍｅｔ、ｎｍ−２３Ｈ１、ＰＳＡ、ＴＡＧ−７２−４、ＣＡ１９−９、ＣＡ７２−４、ＣＡＭ１７．１、ＮｕＭａ、１３−カテニン、Ｍｕｍ−１、ｐ１６、ＴＡＧＥ、ＰＳＭＡ、ＣＴ７、テロメラーゼ、４３−９Ｆ、５Ｔ４、７９１Ｔｇｐ７２、１３ＨＣＧ、ＢＣＡ２２５、ＢＴＡＡ、、ＣＤ６８＼ＫＰ１、ＣＯ−０２９、ＦＧＦ−５、Ｇ２５０、Ｇａ７３３（ＥｐＣＡＭ）、ＨＴｇｐ−１７５、Ｍ３４４、ＭＡ−５０、ＭＧ７−Ａｇ、ＭＯＶ１８、ＮＢ＼７０Ｋ、ＮＹ−ＣＯ−１、ＲＣＡＳ１、ＳＤＣＣＡＧ１６、ＴＡ−９０、ＴＡＡＬ６、Ｔ��Ｇ７２、ＴＬＰ、ＴＰＳ、ＣＤ１９、ＣＤ２２、ＣＤ２７、ＣＤ３０、ＣＤ７０、ＥＧＦＲｖＩＩＩ（上皮成長因子バリアントＩＩＩ）、精子タンパク質１７（Ｓｐ１７）、メソテリン、ＰＡＰ（前立腺酸性ホスファターゼ）、プロステイン、ＴＡＲＰ（Ｔ細胞受容体ガンマ代替リーディングフレームタンパク質）、Ｔｒｐ−ｐ８、ＳＴＥＡＰ１（前立腺の６回膜貫通上皮抗原１）、インテグリンαｖβ３（ＣＤ６１）、ガラクチン、ならびにＲａｌ−Ｂからなる群から選択される抗原と結合する、請求項４１〜４６または４８〜５３のいずれか１項に記載の方法。
【請求項５６】
前記Ｔ細胞が、Ｂ細胞領域ホーミング受容体をさらに含む、請求項４３〜５４のいずれか１項に記載の方法。
【請求項５７】
前記Ｂ細胞領域ホーミング受容体が、ＣＸＣＲ５である、請求項５６に記載の方法。
【請求項５８】
（ｉ）Ｂ細胞領域ホーミング受容体と；（ｉｉ）ＣＡＲとを含むＴ細胞であって、前記Ｔ細胞を癌または腫瘍の処置方法を必要とする個体に投与することを含む、個体の癌または腫瘍の処置方法に使用するための前記Ｔ細胞。
【請求項５９】
前記Ｂ細胞領域ホーミング受容体が、ＣＸＣＲ５である、請求項５８に記載の使用のためのＴ細胞。
【請求項６０】
（ｉ）腸管ホーミング受容体と；（ｉｉ）ＣＡＲとを含むＴ細胞であって、前記Ｔ細胞を腸管癌または腫瘍の処置方法を必要とする個体に投与することを含む、個体の腸管癌または腫瘍の処置方法に使用するための前記Ｔ細胞。
【請求項６１】
前記腸管ホーミング受容体が、α４β７である、請求項６０に記載の使用のためのＴ細胞。
【請求項６２】
前記腸管ホーミング受容体が、ＣＣＲ９である、請求項６０に記載の使用のためのＴ細胞。
【請求項６３】
前記Ｔ細胞が、第２腸管ホーミング受容体を含む、請求項６０に記載の使用のためのＴ細胞。
【請求項６４】
前記ＣＡＲの前記細胞外ドメインが、腸管腫瘍または癌と関連する抗原と結合する、請求項６０〜６３のいずれか１項に記載の使用のためのＴ細胞。
【請求項６５】
（ｉ）皮膚ホーミング受容体と；（ｉｉ）ＣＡＲとを含むＴ細胞であって、前記Ｔ細胞を皮膚癌または皮膚腫瘍の処置方法を必要とする個体に投与することを含む、個体の皮膚癌または皮膚腫瘍の処置方法に使用するための前記Ｔ細胞。
【請求項６６】
前記皮膚ホーミング受容体が、ＣＬＡである、請求項６５に記載の使用のためのＴ細胞。
【請求項６７】
前記皮膚ホーミング受容体が、ＣＣＲ４である、請求項６５に記載の使用のためのＴ細胞。
【請求項６８】
前記皮膚ホーミング受容体が、ＣＣＲ１０である、請求項６５に記載の使用のためのＴ細胞。
【請求項６９】
前記Ｔ細胞が、第２皮膚ホーミング受容体を含む、請求項６５に記載の使用のためのＴ細胞。
【請求項７０】
前記Ｔ細胞が、第３皮膚ホーミング受容体を含む、請求項６９に記載の使用のためのＴ細胞。
【請求項７１】
前記ＣＡＲの前記細胞外ドメインが、皮膚腫瘍または癌と関連する抗原と結合する、請求項６５〜７０のいずれか１項に記載の使用のためのＴ細胞。
【請求項７２】
前記ＣＡＲの前記細胞外ドメインが、Ｈｅｒ２、前立腺幹細胞抗原（ＰＳＣＡ）、アルファ−フェトプロテイン（ＡＦＰ）、癌胎児性抗原（ＣＥＡ）、癌抗原−１２５（ＣＡ−１２５）、ＣＡ１９−９、カルレチニン、ＭＵＣ−１、上皮膜タンパク質（ＥＭＡ）、上皮腫瘍抗原（ＥＴＡ）、チロシナーゼ、黒色腫関連抗原（ＭＡＧＥ）、ＣＤ１９、ＣＤ３４、ＣＤ４５、ＣＤ９９、ＣＤ１１７、クロモグラニン、サイトケラチン、デスミン、グリア線維性酸性タンパク質（ＧＦＡＰ）、肉眼的嚢胞性疾患液体タンパク質（ＧＣＤＦＰ−１５）、ＨＭＢ−４５抗原、高分子量黒色腫関連抗原（ＨＭＷ−ＭＡＡ）、タンパク質ｍｅｌａｎ−Ａ（Ｔ細胞によって認識される黒色腫抗原；ＭＡＲＴ−１）、ｍｙｏ−Ｄ１、筋特異的アクチン（ＭＳＡ）、ニューロフィラメント、ニューロン特異的エノラーゼ（ＮＳＥ）、胎盤アルカリホスファターゼ、シナプトフィシス（ｓｙｎａｐｔｏｐｈｙｓｉｓ）、サイログロブリン、甲状腺転写因子−１、前記二量体形態の前記ピルビン酸キナーゼアイソエンザイムＭ２型（腫瘍Ｍ２−ＰＫ）、異常なｒａｓタンパク質、異常なｐ５３タンパク質、ｆｕｃ−ＧＭ１、ＧＭ２（腫瘍胎児抗原−免疫原性−１；ＯＦＡ−Ｉ−１）；ＧＤ２（ＯＦＡ−Ｉ−２）、ＧＭ３、ＧＤ３、アルファ−アクチニン−４、Ｂａｇｅ−１、ＢＣＲ−ＡＢＬ、Ｂｃｒ−Ａｂｌ融合タンパク質、ベータ−カテニン、ＣＡ１５−３（ＣＡ２７．２９＼ＢＣＡＡ）、ＣＡ１９５、ＣＡ２４２、ＣＡ−５０、ＣＡＭ４３、Ｃａｓｐ−８、ｃｄｃ２７、ｃｄｋ４、ｃｄｋｎ２ａ、ｃｏａ−１、ｄｅｋ−ｃａｎ融合タンパク質、ＥＢＮＡ、ＥＦ２、エプスタインバーウイルス抗原、ＥＴＶ６−ＡＭＬ１融合タンパク質、ＨＬＡ−Ａ２、ＨＬＡ−Ａ１１、ｈｓｐ７０−２、ＫＩＡＡＯ２０５、Ｍａｒｔ２、Ｍｕｍ−１、Ｍｕｍ−２、及びＭｕｍ−３、ｎｅｏ−ＰＡＰ、ミオシンクラスＩ、ＯＳ−９、ｐｍｌ−ＲＡＲα融合タンパク質、ＰＴＰＲＫ、トリオースリン酸イソメラーゼ、Ｇａｇｅ３、４、５、６、７、ＧｎＴＶ、Ｈｅｒｖ−Ｋ−ｍｅｌ、Ｌａｇｅ−１、ＮＡ−８８、ＮＹ−Ｅｓｏ−１／Ｌａｇｅ−２、ＳＰ１７、ＳＳＸ−２、ＴＲＰ２−Ｉｎｔ２、、ｇｐ１００（Ｐｍｅｌ  １７）、チロシナーゼ、ＴＲＰ−１、ＴＲＰ−２、ＭＡＧＥ−１、ＭＡＧＥ−３、ＲＡＧＥ、ＧＡＧＥ−１、ＧＡＧＥ−２、ｐ１５（５８）、ＲＡＧＥ、、ＳＣＰ−１、Ｈｏｍ／Ｍｅｌ−４０、ＰＲＡＭＥ、ＨＥＲ−２／ｎｅｕ、Ｅ２Ａ−ＰＲＬ、Ｈ４−ＲＥＴ、ＩＧＨ−ＩＧＫ、ＭＹＬ−ＲＡＲ、ヒトパピローマウイルス（ＨＰＶ）抗原Ｅ６及びＥ７、ＴＳＰ−１８０、ｐ１８５ｅｒｂＢ２、ｐ１８０ｅｒｂＢ−３、ｃ−ｍｅｔ、ｎｍ−２３Ｈ１、ＰＳＡ、ＴＡＧ−７２−４、ＣＡ１９−９、ＣＡ７２−４、ＣＡＭ１７．１、ＮｕＭａ、１３−カテニン、Ｍｕｍ−１、ｐ１６、ＴＡＧＥ、ＰＳＭＡ、ＣＴ７、テロメラーゼ、４３−９Ｆ、５Ｔ４、７９１Ｔｇｐ７２、１３ＨＣＧ、ＢＣＡ２２５、ＢＴＡＡ、、ＣＤ６８＼ＫＰ１、ＣＯ−０２９、ＦＧＦ−５、Ｇ２５０、Ｇａ７３３（ＥｐＣＡＭ）、ＨＴｇｐ−１７５、Ｍ３４４、ＭＡ−５０、ＭＧ７−Ａｇ、ＭＯＶ１８、ＮＢ＼７０Ｋ、ＮＹ−ＣＯ−１、ＲＣＡＳ１、ＳＤＣＣＡＧ１６、ＴＡ−９０、ＴＡＡ��６、ＴＡＧ７２、ＴＬＰ、ＴＰＳ、ＣＤ１９、ＣＤ２２、ＣＤ２７、ＣＤ３０、ＣＤ７０、ＥＧＦＲｖＩＩＩ（上皮成長因子バリアントＩＩＩ）、精子タンパク質１７（Ｓｐ１７）、メソテリン、ＰＡＰ（前立腺酸性ホスファターゼ）、プロステイン、ＴＡＲＰ（Ｔ細胞受容体ガンマ代替リーディングフレームタンパク質）、Ｔｒｐ−ｐ８、ＳＴＥＡＰ１（前立腺の６回膜貫通上皮抗原１）、インテグリンαｖβ３（ＣＤ６１）、ガラクチン、ならびにＲａｌ−Ｂからなる前記群から選択される抗原と結合する、請求項５８〜６３または６５〜７０のいずれか１項に記載の使用のためのＴ細胞。
【請求項７３】
前記Ｔ細胞が、Ｂ細胞領域ホーミング受容体をさらに含む、請求項６０〜７１のいずれか１項に記載の使用のためのＴ細胞。
【請求項７４】
前記Ｂ細胞領域ホーミング受容体が、ＣＸＣＲ５である、請求項７３に記載の使用のためのＴ細胞。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
本出願は、２０１４年８月１２日出願の米国特許仮出願第６２／０３６，４４７号明細書の利益を主張し、その開示全体が参照によって本明細書に組み込まれる。
【０００２】
１．技術分野
本明細書における本開示は免疫学の分野に関するものであり、より具体的には、Ｔ細胞またはその他の免疫細胞の改変に関する。
【背景技術】
【０００３】
２．背景技術
Ｔ細胞は、腫瘍関連抗原または腫瘍特異的抗原を含む特異的抗原を認識し、それらと相互作用する。Ｔ細胞は腫瘍細胞を死滅させることができるため、この２５年間、Ｔ細胞、すなわち抗原特異的Ｔ細胞、または１種以上のキメラ抗原受容体（ＣＡＲ；例えば、Ｅｓｈｈａｒ、米国特許第７，７４１，４６５号明細書；Ｅｓｈｈａｒ、米国特許出願公開第２０１２／００９３８４２号明細書を参照のこと）を発現するように遺伝子改変されたＴ細胞のいずれかによる腫瘍細胞の標的化に大きな関心が寄せられてきた。しかしながら、体の必要な部分に対する標的化ＣＡＲ  Ｔ細胞の困難さを考慮すると、ＣＡＲ  Ｔ細胞のホーミングを増強する新規方法を見出すことが望ましい。
【発明の概要】
【０００４】
３．発明の概要
本明細書では、受容体を発現する細胞を特定の解剖学的領域、特定の組織、または特定の細胞型、例えばリンパ節のＢ細胞領域、腸管、または皮膚にホーミングさせる受容体を含む遺伝子改変細胞、例えば免疫細胞、例えばＴ細胞、例えばヒトＴ細胞などが提供される。特定の実施形態では、本明細書で提供される遺伝子改変細胞は、Ｔ細胞、例えば一次Ｔ細胞である。ある種の実施形態では、遺伝子改変細胞は、キメラ抗原受容体（ＣＡＲ）を発現する。いかなる特定の機構または理論にも束縛されることを望むものではないが、本明細書の遺伝子改変細胞が、受容体を発現する細胞を特定の領域にホーミングさせる受容体を発現する場合、それらは天然抗原に曝露される可能性が高く、その場合に細胞、例えばＣＡＲを発現する細胞が活性化され得ると考えられている。
【０００５】
第１の態様では、ホーミング受容体及びＣＡＲを含む、例えばそれらを発現するように操作されている細胞、例えばＴ細胞、例えば一次Ｔ細胞、またはこのような細胞の集団が、本明細書で提供される。ある種の実施形態では、ホーミング受容体は、Ｔ細胞において通常または内因的に発現されない。ある種の実施形態では、ホーミング受容体は、Ｂ細胞領域ホーミング受容体である。特定の実施形態では、Ｂ細胞領域ホーミング受容体は、ＣＸＣＲ５である。より特定の実施形態では、ホーミング受容体、例えばＢ細胞領域ホーミング受容体を含む細胞、または細胞集団は、Ｔ細胞領域ホーミング受容体、例えばＣＸＣＲ７の発現をさらに欠いている、または正常Ｔ細胞と比較した場合にＴ細胞領域ホーミング受容体の発現が減少していて、例えば細胞、もしくは細胞集団が、正常Ｔ細胞よりも低いレベルでＴ細胞ホーミング受容体を発現するように操作される。
【０００６】
ある種の実施形態では、ホーミング受容体は、腸管ホーミング受容体である。特定の実施形態では、腸管ホーミング受容体は、インテグリンα４β７（リンパ球パイエル板接着分子としても知られる）である。その他の特定の実施形態では、腸管ホーミング受容体は、ＣＣＲ９（Ｃ−Ｃケモカイン受容体９型）である。ある種の実施形態では、細胞、例えばＴ細胞、例えば一次Ｔ細胞、またはこのような細胞の集団は、２種以上の、例えば第２腸管ホーミング受容体を含み、例えばそれらを発現するように操作されていて、例えば一次Ｔ細胞は、ＣＣＲ９及びインテグリンα４β７を含む。
【０００７】
一実施形態では、腸管Ｔ細胞、またはこのような細胞の集団は、ビタミンＡ代謝産物の存在下において活性化されている、増殖されている、または活性化と増殖の両方が行われている。特定の実施形態では、ビタミンＡ代謝産物はレチノイン酸である。
【０００８】
ある種の実施形態では、ホーミング受容体は、皮膚ホーミング受容体である。特定の実施形態では、皮膚ホーミング受容体は、ＣＬＡ（皮膚リンパ球関連抗原受容体）である。その他の特定の実施形態では、皮膚ホーミング受容体は、ＣＣＲ４、ＣＣＲ８、またはＣＣＲ１０である。ある種の実施形態では、細胞、例えばＴ細胞、例えば一次Ｔ細胞、またはこのような細胞の集団は、第２皮膚ホーミング受容体を含む、例えばそれを発現するように操作されている。さらにその他の実施形態では、細胞、例えばＴ細胞、例えば一次Ｔ細胞、またはこのような細胞の集団は、第３皮膚ホーミング受容体を含む、例えばそれを発現する。さらにその他の実施形態では、細胞、例えばＴ細胞、例えば一次Ｔ細胞、またはこのような細胞の集団は、第４皮膚ホーミング受容体を含む、例えばそれを発現する。その他の実施形態では、細胞または細胞集団は、２種以上の皮膚ホーミング受容体、例えばＣＬＡ、ＣＣＲ４、ＣＣＲ８、及び／またはＣＣＲ１０のうち２種以上を含む、例えばそれらを発現する。
【０００９】
その他の実施形態では、皮膚ホーミング受容体を含む、例えばそれを発現する細胞、例えばＴ細胞、例えば一次Ｔ細胞、またはこのような細胞の集団は、ビタミンＤ代謝産物の存在下において活性化されている、増殖されている、または活性化と増殖の両方が行われている。特定の実施形態では、ビタミンＤ代謝産物は、１，２６−ジヒドロキシコレカルシフェロール（１，２５（ＯＨ）２Ｄ３）である。いくつかの実施形態では、細胞、例えばＴ細胞、例えば一次Ｔ細胞、またはこのような細胞の集団は、ＩＬ−１２の存在下において活性化されている、増殖されている、または活性化と増殖の両方が行われている。特定の実施形態では、細胞、例えばＴ細胞、例えば一次Ｔ細胞、またはこのような細胞の集団は、ＩＬ−１２及びビタミンＤ代謝産物の両方の存在下において活性化されている、増殖されている、または活性化と増殖が行われている。
【００１０】
いくつかの実施形態では、細胞、例えばＴ細胞、例えば一次Ｔ細胞、またはこのような細胞の集団は、腸管ホーミング受容体または皮膚ホーミング受容体のいずれかを含み、例えばそれを発現するように操作されていて、Ｂ細胞ホーミング受容体をさらに含む。特定の実施形態では、Ｂ細胞ホーミング受容体は、ＣＸＣＲ５である。
【００１１】
別の態様では、ホーミング受容体を発現する細胞、例えばＴ細胞、例えば一次Ｔ細胞、またはこのような細胞の集団を生成する方法が、本明細書で提供される。ある種の実施形態では、リンパ節のＢ細胞領域にホーミングする細胞、例えばＴ細胞、例えば一次Ｔ細胞、またはこのような細胞の集団を生成する方法が本明細書で提供され、この方法は、細胞または細胞集団をリンパ節のＢ細胞領域にホーミングさせるのに十分な量で、または十分なレベルでＢ細胞領域ホーミング受容体を発現するように細胞または細胞集団を操作することを含む。特定の実施形態では、Ｂ細胞領域ホーミング受容体は、ＣＸＣＲ５である。
【００１２】
ある種の実施形態では、腸管にホーミングする細胞、例えばＴ細胞、例えば一次Ｔ細胞、またはこのような細胞の集団を生成する方法が本明細書で提供され、この方法は、細胞または細胞集団を腸管にホーミングさせるのに十分な量で、または十分なレベルで腸管ホーミング受容体を発現するように細胞または細胞集団を操作することを含む。特定の実施形態では、腸管ホーミング受容体は、インテグリンα４β７である。その他の特定の実施形態では、腸管ホーミング受容体は、ＣＣＲ９である。ある種の実施形態では、細胞、例えばＴ細胞、例えば一次Ｔ細胞、またはこのような細胞の集団を生成する方法が本明細書で提供され、この方法は、追加の腸管ホーミング受容体を発現するように、例えば、第２腸管ホーミング受容体をさらに発現するように細胞または細胞集団を操作することを含む。ある種の実施形態では、本明細書で提供される方法は、細胞または細胞集団が、ビタミンＡ代謝産物の存在下において活性化される、増殖される、または活性化と増殖の両方が行われるステップをさらに含む。特定の実施形態では、ビタミンＡ代謝産物はレチノイン酸である。
【００１３】
ある種の実施形態では、皮膚にホーミングする細胞、例えばＴ細胞、例えば一次Ｔ細胞、またはこのような細胞の集団を生成する方法が本明細書で提供され、この方法は、細胞または細胞集団を皮膚にホーミングさせるのに十分な量で、または十分なレベルで皮膚ホーミング受容体を発現するように細胞または細胞集団を操作することを含む。特定の実施形態では、皮膚ホーミング受容体はＣＬＡである。その他の特定の実施形態では、皮膚ホーミング受容体は、ＣＣＲ４、ＣＣＲ８、またはＣＣＲ１０である。ある種の実施形態では、細胞、例えばＴ細胞、例えば一次Ｔ細胞、またはこのような細胞の集団を生成する方法が本明細書で提供され、この方法は、追加の皮膚ホーミング受容体を発現するように、例えば、第２皮膚ホーミング受容体をさらに発現するように細胞または細胞集団を操作することを含む。ある種の実施形態では、細胞、例えばＴ細胞、例えば一次Ｔ細胞、またはこのような細胞の集団を生成する方法が本明細書で提供され、この方法は、第３皮膚ホーミング受容体をさらに発現するように細胞または細胞集団を操作することを含む。ある種の実施形態では、細胞、例えばＴ細胞、例えば一次Ｔ細胞、またはこのような細胞の集団を生成する方法が本明細書で提供され、この方法は、第４皮膚ホーミング受容体をさらに発現するように細胞または細胞集団を操作することを含む。ある種の実施形態では、本明細書で提供される方法は、細胞または細胞集団が、ビタミンＤ代謝産物の存在下において活性化される、増殖される、または活性化と増殖の両方が行われるステップをさらに含む。特定の実施形態では、ビタミンＤ代謝産物は、１，２６−ジヒドロキシコレカルシフェロール（１，２５（ＯＨ）２Ｄ３）である。ある種の実施形態では、本明細書で提供される方法は、細胞または細胞集団が、ＩＬ−１２の存在下において活性化される、増殖される、または活性化と増殖の両方が行われるステップをさらに含む。
【００１４】
ある種の実施形態では、腸管ホーミング受容体または皮膚ホーミング受容体を発現するように操作され、かつＢ細胞領域ホーミング受容体を発現するようにさらに操作される細胞、例えばＴ細胞、例えば一次Ｔ細胞、またはこのような細胞の集団を生成する方法が、本明細書で提供される。特定の実施形態では、腸管ホーミング受容体または皮膚ホーミング受容体を発現するように操作され、かつＣＸＣＲ５を発現するようにさらに操作される細胞、例えばＴ細胞、例えば一次Ｔ細胞、またはこのような細胞の集団を生成する方法が、本明細書で提供される。
【００１５】
ある種の実施形態では、腸管ホーミング受容体または皮膚ホーミング受容体を発現するように操作される細胞、例えばＴ細胞、例えば一次Ｔ細胞、またはこのような細胞の集団を生成する方法が本明細書で提供され、この方法は、Ｔ細胞にキメラ抗原受容体（ＣＡＲ）をコードするレンチウイルスベクターを投与するステップを含む。
【００１６】
別の態様では、個体の癌または腫瘍を処置する方法が本明細書で提供され、この方法は、それを必要とする個体に（ｉ）Ｂ細胞領域ホーミング受容体；及び（ｉｉ）ＣＡＲを含むＴ細胞、またはＴ細胞集団を投与することを含む。ある種の実施形態では、Ｂ細胞領域ホーミング受容体は、ＣＸＣＲ５である。
【００１７】
ある種の実施形態では、個体の腸管癌または腫瘍を処置する方法が本明細書で提供され、この方法は、それを必要とする個体に（ｉ）腸管ホーミング受容体；及び（ｉｉ）ＣＡＲを含む、例えばそれらを発現するＴ細胞、またはＴ細胞集団を投与することを含む。特定の実施形態では、腸管ホーミング受容体は、インテグリンα４β７である。その他の特定の実施形態では、腸管ホーミング受容体は、ＣＣＲ９である。ある種の実施形態では、個体の腸管癌または腫瘍を処置する方法が本明細書で提供され、この方法は、それを必要とする個体に第２腸管ホーミング受容体をさらに含む、例えばそれをさらに発現するＴ細胞、またはＴｙリンパ球集団（Ｔｙ  Ｌｙｍｐｈｏｃｙｔｅｓ）を投与することを含む。
【００１８】
ある種の実施形態では、個体の皮膚癌または腫瘍を処置する方法が本明細書で提供され、この方法は、それを必要とする個体に（ｉ）皮膚ホーミング受容体；及び（ｉｉ）ＣＡＲを含むＴ細胞、またはＴ細胞集団を投与することを含む。特定の実施形態では、皮膚ホーミング受容体はＣＬＡである。その他の特定の実施形態では、皮膚ホーミング受容体は、ＣＣＲ４、ＣＣＲ８、またはＣＣＲ１０である。ある種の実施形態では、個体の皮膚癌または腫瘍を処置する方法が本明細書で提供され、この方法は、それを必要とする個体に第２皮膚ホーミング受容体をさらに含むＴ細胞、またはＴ細胞集団を投与することを含む。ある種の実施形態では、個体の皮膚癌または腫瘍を処置する方法が本明細書で提供され、この方法は、それを必要とする個体に第３皮膚ホーミング受容体をさらに含むＴ細胞、またはＴ細胞集団を投与することを含む。ある種の実施形態では、個体の皮膚癌または腫瘍を処置する方法が本明細書で提供され、この方法は、それを必要とする個体に第４皮膚ホーミング受容体をさらに含むＴ細胞、またはＴ細胞集団を投与することを含む。
【００１９】
ある種の実施形態では、個体の腸管癌または腫瘍を処置する方法が本明細書で提供され、この方法は、それを必要とする個体に（ｉ）腸管ホーミング受容体；及び（ｉｉ）ＣＡＲを含むＴ細胞、またはＴ細胞集団を投与することを含み、このＴ細胞、またはＴ細胞集団は、Ｂ細胞領域ホーミング受容体をさらに含む。特定の実施形態では、Ｂ細胞領域ホーミング受容体は、ＣＸＣＲ５である。ある種の実施形態では、本明細書で提供されるＴ細胞は、腸管癌または腫瘍を処置する方法に使用するためのものである。
【００２０】
ある種の実施形態では、個体の皮膚癌または腫瘍を処置する方法が本明細書で提供され、この方法は、それを必要とする個体に（ｉ）皮膚ホーミング受容体；及び（ｉｉ）ＣＡＲを含むＴ細胞、またはＴ細胞集団を投与することを含み、このＴ細胞、またはＴ細胞集団は、Ｂ細胞領域ホーミング受容体をさらに含む。特定の実施形態では、Ｂ細胞領域ホーミング受容体は、ＣＸＣＲ５である。ある種の実施形態では、本明細書で提供されるＴ細胞は、皮膚癌または腫瘍を処置する方法に使用するためのものである。
【００２１】
特定の実施形態では、個体の癌または腫瘍を処置する方法が本明細書で提供され、この方法は、それを必要とする個体に（ｉ）ホーミング受容体；及び（ｉｉ）ＣＡＲを含むＴ細胞、またはＴ細胞集団を投与することを含み、このＣＡＲの細胞外ドメインが、Ｈｅｒ２、前立腺幹細胞抗原（ＰＳＣＡ）、アルファ−フェトプロテイン（ＡＦＰ）、癌胎児性抗原（ＣＥＡ）、癌抗原−１２５（ＣＡ−１２５）、ＣＡ１９−９、カルレチニン、ＭＵＣ−１、上皮膜タンパク質（ＥＭＡ）、上皮腫瘍抗原（ＥＴＡ）、チロシナーゼ、黒色腫関連抗原（ＭＡＧＥ）、ＣＤ１９、ＣＤ３４、ＣＤ４５、ＣＤ９９、ＣＤ１１７、クロモグラニン、サイトケラチン、デスミン、グリア線維性酸性タンパク質（ＧＦＡＰ）、肉眼的嚢胞性疾患液体タンパク質（ＧＣＤＦＰ−１５）、ＨＭＢ−４５抗原、高分子量黒色腫関連抗原（ＨＭＷ−ＭＡＡ）、タンパク質ｍｅｌａｎ−Ａ（Ｔ細胞によって認識される黒色腫抗原；ＭＡＲＴ−１）、ｍｙｏ−Ｄ１、筋特異的アクチン（ＭＳＡ）、ニューロフィラメント、ニューロン特異的エノラーゼ（ＮＳＥ）、胎盤アルカリホスファターゼ、シナプトフィシス（ｓｙｎａｐｔｏｐｈｙｓｉｓ）、サイログロブリン、甲状腺転写因子−１、二量体形態のピルビン酸キナーゼアイソエンザイムＭ２型（腫瘍Ｍ２−ＰＫ）、異常なｒａｓタンパク質、異常なｐ５３タンパク質、ｆｕｃ−ＧＭ１、ＧＭ２（腫瘍胎児抗原−免疫原性−１；ＯＦＡ−Ｉ−１）；ＧＤ２（ＯＦＡ−Ｉ−２）、ＧＭ３、ＧＤ３、アルファ−アクチニン−４、Ｂａｇｅ−１、ＢＣＲ−ＡＢＬ、Ｂｃｒ−Ａｂｌ融合タンパク質、ベータ−カテニン、ＣＡ１５−３（ＣＡ２７．２９＼ＢＣＡＡ）、ＣＡ１９５、ＣＡ２４２、ＣＡ−５０、ＣＡＭ４３、Ｃａｓｐ−８、ｃｄｃ２７、ｃｄｋ４、ｃｄｋｎ２ａ、ｃｏａ−１、ｄｅｋ−ｃａｎ融合タンパク質、ＥＢＮＡ、ＥＦ２、エプスタインバーウイルス抗原、ＥＴＶ６−ＡＭＬ１融合タンパク質、ＨＬＡ−Ａ２、ＨＬＡ−Ａ１１、ｈｓｐ７０−２、ＫＩＡＡＯ２０５、Ｍａｒｔ２、Ｍｕｍ−１、Ｍｕｍ−２、及びＭｕｍ−３、ｎｅｏ−ＰＡＰ、ミオシンクラスＩ、ＯＳ−９、ｐｍｌ−ＲＡＲα融合タンパク質、ＰＴＰＲＫ、トリオースリン酸イソメラーゼ、Ｇａｇｅ３、４、５、６、７、ＧｎＴＶ、Ｈｅｒｖ−Ｋ−ｍｅｌ、Ｌａｇｅ−１、ＮＡ−８８、ＮＹ−Ｅｓｏ−１／Ｌａｇｅ−２、ＳＰ１７、ＳＳＸ−２、ＴＲＰ２−Ｉｎｔ２、、ｇｐ１００（Ｐｍｅｌ  １７）、チロシナーゼ、ＴＲＰ−１、ＴＲＰ−２、ＭＡＧＥ−１、ＭＡＧＥ−３、ＲＡＧＥ、ＧＡＧＥ−１、ＧＡＧＥ−２、ｐ１５（５８）、ＲＡＧＥ、、ＳＣＰ−１、Ｈｏｍ／Ｍｅｌ−４０、ＰＲＡＭＥ、ＨＥＲ−２／ｎｅｕ、Ｅ２Ａ−ＰＲＬ、Ｈ４−ＲＥＴ、ＩＧＨ−ＩＧＫ、ＭＹＬ−ＲＡＲ、ヒトパピローマウイルス（ＨＰＶ）抗原Ｅ６及びＥ７、ＴＳＰ−１８０、ｐ１８５ｅｒｂＢ２、ｐ１８０ｅｒｂＢ−３、ｃ−ｍｅｔ、ｎｍ−２３Ｈ１、ＰＳＡ、ＴＡＧ−７２−４、ＣＡ１９−９、ＣＡ７２−４、ＣＡＭ１７．１、ＮｕＭａ、１３−カテニン、Ｍｕｍ−１、ｐ１６、ＴＡＧＥ、ＰＳＭＡ、ＣＴ７、テロメラーゼ、４３−９Ｆ、５Ｔ４、７９１Ｔｇｐ７２、１３ＨＣＧ、ＢＣＡ２２５、ＢＴＡＡ、、ＣＤ６８＼ＫＰ１、ＣＯ−０２９、Ｆ��Ｆ−５、Ｇ２５０、Ｇａ７３３（ＥｐＣＡＭ）、ＨＴｇｐ−１７５、Ｍ３４４、ＭＡ−５０、ＭＧ７−Ａｇ、ＭＯＶ１８、ＮＢ＼７０Ｋ、ＮＹ−ＣＯ−１、ＲＣＡＳ１、ＳＤＣＣＡＧ１６、ＴＡ−９０、ＴＡＡＬ６、ＴＡＧ７２、ＴＬＰ、ＴＰＳ、ＣＤ１９、ＣＤ２２、ＣＤ２７、ＣＤ３０、ＣＤ７０、ＥＧＦＲｖＩＩＩ（上皮成長因子バリアントＩＩＩ）、精子タンパク質１７（Ｓｐ１７）、メソテリン、ＰＡＰ（前立腺酸性ホスファターゼ）、プロステイン、ＴＡＲＰ（Ｔ細胞受容体ガンマ代替リーディングフレームタンパク質）、Ｔｒｐ−ｐ８、ＳＴＥＡＰ１（前立腺の６回膜貫通上皮抗原１）、インテグリンαｖβ３（ＣＤ６１）、ガラクチン、ならびにＲａｌ−Ｂからなる群から選択される抗原と結合する。特定の実施形態では、個体の腸管癌または腫瘍を処置する方法が本明細書で提供され、この方法は、それを必要とする個体に（ｉ）腸管ホーミング受容体；及び（ｉｉ）ＣＡＲを含むＴ細胞、またはＴ細胞集団を投与することを含み、このＣＡＲの細胞外ドメインが、腸管腫瘍または癌と関連する、例えばそれにより発現される抗原と結合する。特定の実施形態では、腸管腫瘍または癌と関連する、例えばそれにより発現される抗原は、ＣＥＡ、Ｈｅｒ２、ＣＡ２４２、ＭＵＣ１、ＣＡ１２５、またはＣＡ１９−９である。特定の実施形態では、本明細書で提供されるＴ細胞は、癌または腫瘍を処置する方法に使用するためのものである。
【００２２】
その他の特定の実施形態では、個体の皮膚癌または腫瘍を処置する方法が本明細書で提供され、この方法は、それを必要とする個体に（ｉ）皮膚ホーミング受容体；及び（ｉｉ）ＣＡＲを含むＴ細胞、またはＴ細胞集団を投与することを含み、このＣＡＲの細胞外ドメインが、皮膚腫瘍または癌と関連する抗原と結合する。特定の実施形態では、皮膚腫瘍または癌と関連する、例えばそれにより発現される抗原は、ＨＭＷ−ＭＡＡ、Ｈｅｒ２、ＧＤ２、ＧＤ３、ＣＥＡ、またはＳＰＡＧ９である。その他の特定の実施形態では、本明細書で提供されるＴ細胞は、皮膚癌または腫瘍を処置する方法に使用するためのものである。
【発明を実施するための形態】
【００２３】
４．発明を実施するための形態
適応免疫応答は、リンパ節を含む二次リンパ器官で開始される。Ｂ細胞及びＴ細胞は、リンパ節の異なる領域、すなわち、それぞれリンパ節の外皮質、または濾胞に位置する「Ｂ細胞領域」、及び濾胞周囲の領域（傍皮質としても知られる）においてより散在的に分布する「Ｔ細胞領域」と称される領域に隔離される。Ｂ細胞及びＴ細胞は、それらが抗原に曝露され得るように、これらの各々の領域にＢ細胞及びＴ細胞をホーミングさせる受容体を発現する。インタクトな抗原がＢ細胞領域に存在するのに対して、Ｔ細胞領域では、抗原は樹状細胞などの抗原提示細胞により提示される。腫瘍抗原などのインタクトな抗原はまた、腫瘍の部位に存在する。
【００２４】
本明細書では、受容体を発現する細胞を特定の解剖学的領域、特定の組織、または特定の細胞型、例えばリンパ節のＢ細胞領域、腸管、または皮膚にホーミングさせる受容体を含む遺伝子改変細胞、例えば免疫細胞、例えばＴ細胞、例えばヒトＴ細胞などが提供される。特定の実施形態では、本明細書で提供される遺伝子改変細胞は、Ｔ細胞である。ある種の実施形態では、遺伝子改変細胞は、節４．４に記載されているようなキメラ抗原受容体（ＣＡＲ）を発現する。ある種の実施形態では、遺伝子改変細胞はＣＡＲを発現し、かつ１種以上のホーミング受容体、例えば、受容体を発現する細胞をリンパ節のＢ細胞領域、腸管、または皮膚にホーミングさせる受容体を内因的に発現する。いかなる特定の機構または理論にも束縛されることを望むものではないが、本明細書の遺伝子改変細胞が、受容体を発現する細胞を特定の領域にホーミングさせる受容体を発現する場合、それらは天然抗原に曝露される可能性が高く、その場合に細胞、例えばＣＡＲを発現する細胞が活性化され得ると考えられている。
【００２５】
４．１  Ｂ細胞領域ホーミング受容体を含む細胞、その作製方法、及び使用
一実施形態では、細胞をリンパ節のＢ細胞領域、例えばリンパ節の濾胞にホーミングさせる受容体を含む、例えばそれを発現するように操作されている遺伝子改変細胞、例えば免疫細胞、例えばＴ細胞、例えばヒトＴ細胞などが本明細書で提供される。このような受容体は、本明細書において「Ｂ細胞領域ホーミング受容体」と称される。特定の実施形態では、Ｂ細胞領域ホーミング受容体は、ＣＸＣＲ５、例えばヒトＣＸＣＲ５である。ＧｅｎＢａｎｋ（商標）アクセッション番号ＮＭ＿００１７１６．４及びＮＭ＿０３２９６６．２は、ヒトＣＸＣＲ５の例示的なヌクレオチド配列を提供する。ＧｅｎＢａｎｋ（商標）アクセッション番号ＮＰ＿１１６７４３．１及びＮＰ＿００１７０７．１は、ヒトＣＸＣＲ５の例示的なアミノ酸配列を提供する。ヒトホーミング受容体の例示的なヌクレオチド配列及びアミノ酸配列は、表１に見出され得る。特定の実施形態では、本明細書で提供される遺伝子改変細胞は、Ｔ細胞である。ある種の実施形態では、遺伝子改変細胞は、Ｂ細胞領域ホーミング受容体を発現し、かつ節４．４に記載されているようなＣＡＲも発現する。ある種の実施形態では、遺伝子改変細胞はＣＡＲを発現し、かつ１種以上のＢ細胞領域ホーミング受容体を内因的に発現する。
【００２６】
リンパ節のＢ細胞領域、例えばリンパ節の濾胞にホーミングする遺伝子操作されたＴ細胞を生成する方法もまた本明細書で提供され、この方法は、Ｂ細胞領域ホーミング受容体、例えばＣＸＣＲ５を発現するようにＴ細胞を操作するステップ含み、このＢ細胞領域ホーミング受容体は、細胞をリンパ節のＢ細胞領域にホーミングさせるのに十分なレベルまたは十分な量で細胞により発現される。いくつかの実施形態では、Ｂ細胞領域ホーミング受容体を発現するようにＴ細胞を操作するステップは、受容体核酸配列（複数可）、すなわち受容体（複数可）をコードする核酸配列（複数可）を含む１種以上のベクターを細胞に導入するステップを含む。特定の実施形態では、ベクターは、ヒトＣＸＣＲ５の核酸配列を含む。ある種の実施形態では、Ｂ細胞領域ホーミング受容体を発現するようにＴ細胞を操作するステップは、当業者に既知の任意の方法によって実施される。
【００２７】
Ｂ細胞領域ホーミング受容体を発現するようにＴ細胞を操作するのに有用な例示的核酸は、例えば節４．５に開示されている。
【００２８】
個体の癌または腫瘍を処置する方法も本明細書で提供され、この方法は、（ｉ）受容体を発現する細胞をリンパ節のＢ細胞領域、例えばリンパ節の濾胞にホーミングさせる受容体、及び（ｉｉ）ＣＡＲを含む、治療有効量の遺伝子改変細胞、例えばヒトＴ細胞を個体に投与することを含む。特定の実施形態では、Ｂ細胞領域ホーミング受容体は、ＣＸＣＲ５である。ある種の実施形態では、（ｉ）受容体を発現する細胞をリンパ節のＢ細胞領域、例えばリンパ節の濾胞にホーミングさせる受容体、及び（ｉｉ）ＣＡＲを含む遺伝子改変細胞、例えばヒトＴ細胞は、腫瘍細胞の増殖を抑制する。ある種の実施形態では、（ｉ）受容体を発現する細胞をリンパ節のＢ細胞領域、例えばリンパ節の濾胞にホーミングさせる受容体、及び（ｉｉ）ＣＡＲを含む遺伝子改変細胞、例えばヒトＴ細胞は、腫瘍の成長を阻害する。ある種の実施形態では、（ｉ）受容体を発現する細胞をリンパ節のＢ細胞領域、例えばリンパ節の濾胞にホーミングさせる受容体、及び（ｉｉ）ＣＡＲを含む遺伝子改変細胞、例えばヒトＴ細胞は、腫瘍細胞を死滅させる。特定の実施形態では、ＣＡＲの細胞外ドメインは、Ｈｅｒ２、前立腺幹細胞抗原（ＰＳＣＡ）、アルファ−フェトプロテイン（ＡＦＰ）、癌胎児性抗原（ＣＥＡ）、癌抗原−１２５（ＣＡ−１２５）、ＣＡ１９−９、カルレチニン、ＭＵＣ−１、上皮膜タンパク質（ＥＭＡ）、上皮腫瘍抗原（ＥＴＡ）、チロシナーゼ、黒色腫関連抗原（ＭＡＧＥ）、ＣＤ１９、ＣＤ３４、ＣＤ４５、ＣＤ９９、ＣＤ１１７、クロモグラニン、サイトケラチン、デスミン、グリア線維性酸性タンパク質（ＧＦＡＰ）、肉眼的嚢胞性疾患液体タンパク質（ＧＣＤＦＰ−１５）、ＨＭＢ−４５抗原、高分子量黒色腫関連抗原（ＨＭＷ−ＭＡＡ）、タンパク質ｍｅｌａｎ−Ａ（Ｔ細胞によって認識される黒色腫抗原；ＭＡＲＴ−１）、ｍｙｏ−Ｄ１、筋特異的アクチン（ＭＳＡ）、ニューロフィラメント、ニューロン特異的エノラーゼ（ＮＳＥ）、胎盤アルカリホスファターゼ、シナプトフィシス（ｓｙｎａｐｔｏｐｈｙｓｉｓ）、サイログロブリン、甲状腺転写因子−１、二量体形態のピルビン酸キナーゼアイソエンザイムＭ２型（腫瘍Ｍ２−ＰＫ）、異常なｒａｓタンパク質、異常なｐ５３タンパク質、ｆｕｃ−ＧＭ１、ＧＭ２（腫瘍胎児抗原−免疫原性−１；ＯＦＡ−Ｉ−１）；ＧＤ２（ＯＦＡ−Ｉ−２）、ＧＭ３、ＧＤ３、アルファ−アクチニン−４、Ｂａｇｅ−１、ＢＣＲ−ＡＢＬ、Ｂｃｒ−Ａｂｌ融合タンパク質、ベータ−カテニン、ＣＡ１５−３（ＣＡ２７．２９＼ＢＣＡＡ）、ＣＡ１９５、ＣＡ２４２、ＣＡ−５０、ＣＡＭ４３、Ｃａｓｐ−８、ｃｄｃ２７、ｃｄｋ４、ｃｄｋｎ２ａ、ｃｏａ−１、ｄｅｋ−ｃａｎ融合タンパク質、ＥＢＮＡ、ＥＦ２、エプスタインバーウイルス抗原、ＥＴＶ６−ＡＭＬ１融合タンパク質、ＨＬＡ−Ａ２、ＨＬＡ−Ａ１１、ｈｓｐ７０−２、ＫＩＡＡＯ２０５、Ｍａｒｔ２、Ｍｕｍ−１、Ｍｕｍ−２、及びＭｕｍ−３、ｎｅｏ−ＰＡＰ、ミオシンクラスＩ、ＯＳ−９、ｐｍｌ−ＲＡＲα融合タンパク質、ＰＴＰＲＫ、トリオースリン酸イソメラーゼ、Ｇａｇｅ３、４、５、６、７、ＧｎＴＶ、Ｈｅｒｖ−Ｋ−ｍｅｌ、Ｌａｇｅ−１、ＮＡ−８８、ＮＹ−Ｅｓｏ−１／Ｌａｇ���−２、ＳＰ１７、ＳＳＸ−２、ＴＲＰ２−Ｉｎｔ２、、ｇｐ１００（Ｐｍｅｌ  １７）、チロシナーゼ、ＴＲＰ−１、ＴＲＰ−２、ＭＡＧＥ−１、ＭＡＧＥ−３、ＲＡＧＥ、ＧＡＧＥ−１、ＧＡＧＥ−２、ｐ１５（５８）、ＲＡＧＥ、、ＳＣＰ−１、Ｈｏｍ／Ｍｅｌ−４０、ＰＲＡＭＥ、ＨＥＲ−２／ｎｅｕ、Ｅ２Ａ−ＰＲＬ、Ｈ４−ＲＥＴ、ＩＧＨ−ＩＧＫ、ＭＹＬ−ＲＡＲ、ヒトパピローマウイルス（ＨＰＶ）抗原Ｅ６及びＥ７、ＴＳＰ−１８０、ｐ１８５ｅｒｂＢ２、ｐ１８０ｅｒｂＢ−３、ｃ−ｍｅｔ、ｎｍ−２３Ｈ１、ＰＳＡ、ＴＡＧ−７２−４、ＣＡ１９−９、ＣＡ７２−４、ＣＡＭ１７．１、ＮｕＭａ、１３−カテニン、Ｍｕｍ−１、ｐ１６、ＴＡＧＥ、ＰＳＭＡ、ＣＴ７、テロメラーゼ、４３−９Ｆ、５Ｔ４、７９１Ｔｇｐ７２、１３ＨＣＧ、ＢＣＡ２２５、ＢＴＡＡ、、ＣＤ６８＼ＫＰ１、ＣＯ−０２９、ＦＧＦ−５、Ｇ２５０、Ｇａ７３３（ＥｐＣＡＭ）、ＨＴｇｐ−１７５、Ｍ３４４、ＭＡ−５０、ＭＧ７−Ａｇ、ＭＯＶ１８、ＮＢ＼７０Ｋ、ＮＹ−ＣＯ−１、ＲＣＡＳ１、ＳＤＣＣＡＧ１６、ＴＡ−９０、ＴＡＡＬ６、ＴＡＧ７２、ＴＬＰ、ＴＰＳ、ＣＤ１９、ＣＤ２２、ＣＤ２７、ＣＤ３０、ＣＤ７０、ＥＧＦＲｖＩＩＩ（上皮成長因子バリアントＩＩＩ）、精子タンパク質１７（Ｓｐ１７）、メソテリン、ＰＡＰ（前立腺酸性ホスファターゼ）、プロステイン、ＴＡＲＰ（Ｔ細胞受容体ガンマ代替リーディングフレームタンパク質）、Ｔｒｐ−ｐ８、ＳＴＥＡＰ１（前立腺の６回膜貫通上皮抗原１）、インテグリンαｖβ３（ＣＤ６１）、ガラクチン、ならびにＲａｌ−Ｂからなる群から選択される抗原と結合する。癌または腫瘍を処置する方法に使用するための遺伝子改変細胞もまた、本明細書で提供される。
【００２９】
４．２．腸管ホーミング受容体を含む細胞、その作製方法、及び使用
一実施形態では、受容体を発現する細胞を腸管、例えば腸管器官、組織、または細胞にホーミングさせる受容体を含む、例えばそれを発現するように操作されている遺伝子改変細胞、例えば免疫細胞、例えばＴ細胞、例えばヒトＴ細胞などが本明細書で提供される。細胞を腸管にホーミングさせるこのような受容体は、本明細書において「腸管ホーミング受容体」と称される。特定の実施形態では、本明細書で提供される遺伝子改変細胞は、Ｔ細胞である。ある種の実施形態では、腸管ホーミング受容体は、ＣＣＲ９またはインテグリンα４β７、例えば、ヒトＣＣＲ９またはヒトインテグリンα４β７である。ＧｅｎＢａｎｋ（商標）アクセッション番号ＮＭ＿０３１２００．２及びＮＭ００１２５６３６９．１は、ヒトＣＣＲ９の例示的なヌクレオチド配列を提供する。ＧｅｎＢａｎｋ（商標）アクセッション番号ＮＰ＿１１２４７７．１及びＮＰ＿００１２４３２９８．１は、ヒトＣＣＲ９の例示的なアミノ酸配列を提供する。ＧｅｎＢａｎｋ（商標）アクセッション番号ＮＭ＿０００８８５．４及びＮＭ＿０００８８９．２は、それぞれヒトα４及びヒトβ７の例示的なヌクレオチド配列を提供する。ＧｅｎＢａｎｋ（商標）アクセッション番号ＮＰ＿０００８７６．３及びＮＰ＿０００８８０．１は、それぞれヒトα４及びヒトβ７の例示的なアミノ酸配列を提供する。ヒトホーミング受容体の例示的なヌクレオチド配列及びアミノ酸配列は、表１に見出され得る。いくつかの実施形態では、遺伝子改変細胞は、第２腸管ホーミング受容体をさらに含む。いくつかの実施形態では、遺伝子改変細胞は、第１腸管ホーミング受容体を含み、この第１腸管ホーミング受容体はＣＣＲ９であり、かつ第２腸管ホーミング受容体をさらに含み、この第２腸管ホーミング受容体はインテグリンα４β７である。その他の特定の実施形態では、遺伝子改変細胞は、腸管ホーミング受容体のＣＸＣＲ３を含む。
【００３０】
ある種の実施形態では、１種以上の腸管ホーミング受容体を含有する遺伝子改変細胞は、ビタミンＡ代謝産物の存在下において増殖される、活性化される、または増殖と活性化の両方が行われる。特定の実施形態では、増殖、活性化、または増殖と活性化の両方は、インビボ、インビトロ、またはエクスビボで行われる。特定の実施形態では、ビタミンＡ代謝産物はレチノイン酸である。ある種の実施形態では、１種以上の腸管ホーミング受容体を含有する遺伝子改変細胞は、Ｂ細胞領域ホーミング受容体をさらに含む。特定の実施形態では、Ｂ細胞領域ホーミング受容体は、ＣＸＣＲ５である。ある種の実施形態では、遺伝子改変細胞は、腸管ホーミング受容体を発現し、かつ節４．４に記載されているようなＣＡＲも発現する。ある種の実施形態では、遺伝子改変細胞はＣＡＲを発現し、かつ１種以上の腸管ホーミング受容体を内因的に発現する。
【００３１】
１種以上の受容体を発現する細胞を腸管、例えば腸管器官、皮膚、または組織にホーミングさせる１種以上の受容体を含む遺伝子改変細胞、例えばヒトＴ細胞を生成する方法もまた、本明細書で提供される。ある種の実施形態では、１種以上の受容体を発現する細胞を腸管にホーミングさせる１種以上の受容体、例えばＣＣＲ９またはインテグリンα４β７を含むＴ細胞は、１種以上の腸管ホーミング受容体を発現するようにＴ細胞を操作するステップを含む方法によって生成される。いくつかの実施形態では、１種以上の腸管ホーミング受容体を発現するようにＴ細胞を操作するステップは、受容体をコードする核酸配列を含む１種以上のベクターを細胞に導入することを含む。特定の実施形態では、ベクターは、ヒトＣＣＲ９の核酸配列、ヒトインテグリンα４β７の核酸配列、またはその両方を含む。
【００３２】
ある種の実施形態では、腸管にホーミングするＴ細胞は、１種以上の腸管ホーミング受容体、例えばＣＣＲ９またはα４β７の発現を誘導する分子で細胞を処置するステップを含む方法によって生成される。特定の実施形態では、分子はビタミンＡである。
【００３３】
ある種の実施形態では、１種以上の受容体を発現する細胞を腸管にホーミングさせる１種以上の受容体を含む遺伝子改変Ｔ細胞を生成する方法は、細胞を増殖させるステップを含み、このステップは、ビタミンＡ代謝産物の存在下において実施される。ある種の実施形態では、腸管にホーミングする１種以上の受容体を含む遺伝子改変Ｔ細胞を生成する方法は、細胞を活性化させるステップを含み、このステップは、ビタミンＡ代謝産物の存在下において実施される。ある種の実施形態では、増殖及び活性化ステップの両方が、ビタミンＡ代謝産物の存在下において実施される。ある種の実施形態では、ビタミンＡ代謝産物はレチノイン酸である。ある種の実施形態では、腸管ホーミング受容体を発現するようにＴ細胞を操作するステップは、当業者に既知の任意の方法によって実施される。
【００３４】
腸管ホーミング受容体を発現するようにＴ細胞を操作するのに有用な例示的核酸は、例えば節４．５で述べられている。
【００３５】
個体の腸管癌または腫瘍を処置する方法も本明細書で提供され、この方法は、（ｉ）１種以上の受容体を発現する細胞を腸管にホーミングさせる１種以上の受容体、及び（ｉｉ）ＣＡＲを含む、治療有効量の遺伝子改変細胞、例えばヒトＴ細胞を個体に投与することを含む。ある種の実施形態では、腸管ホーミング受容体は、ＣＣＲ９またはα４β７である。いくつかの実施形態では、遺伝子改変細胞は、第２腸管ホーミング受容体をさらに含む。いくつかの実施形態では、遺伝子改変細胞は、第１腸管ホーミング受容体を含み、この第１腸管ホーミング受容体はＣＣＲ９であり、かつ第２腸管ホーミング受容体をさらに含み、この第２腸管ホーミング受容体はα４β７である。ある種の実施形態では、（ｉ）１種以上の受容体を発現する細胞を腸管にホーミングさせる１種以上の受容体、及び（ｉｉ）ＣＡＲを含む遺伝子改変細胞、例えばヒトＴ細胞は、腫瘍細胞の増殖を抑制する。ある種の実施形態では、（ｉ）１種以上の受容体を発現する細胞を腸管にホーミングさせる１種以上の受容体、及び（ｉｉ）ＣＡＲを含む遺伝子改変細胞、例えばヒトＴ細胞は、腫瘍の成長を阻害する。ある種の実施形態では、（ｉ）１種以上の受容体を発現する細胞を腸管にホーミングさせる１種以上の受容体、及び（ｉｉ）ＣＡＲを含む遺伝子改変細胞、例えばヒトＴ細胞は、腫瘍細胞を死滅させる。特定の実施形態では、腸管癌または腫瘍は、肝臓癌、胃癌、食道癌、胆嚢癌、結腸直腸癌、肛門癌、または膵臓癌である。ある種の実施形態では、ＣＡＲの細胞外ドメインは、腸管癌または腫瘍と関連する抗原と結合する。腸管癌または腫瘍を処置する方法に使用するための遺伝子改変細胞もまた、本明細書で提供される。
【００３６】
４．３．皮膚ホーミング受容体を含む細胞、その作製方法、及び使用
一実施形態では、受容体を発現する細胞を皮膚、例えば皮膚組織、または皮膚細胞にホーミングさせる受容体を含む遺伝子改変細胞、例えば免疫細胞、例えばＴ細胞、例えばヒトＴ細胞などが本明細書で提供される。特定の実施形態では、本明細書で提供される遺伝子改変細胞は、Ｔ細胞である。ある種の実施形態では、皮膚ホーミング受容体は、ＣＣＲ１０、ＣＣＲ８、ＣＣＲ４、またはＣＬＡ、例えばヒトＣＣＲ１０、ヒトＣＣＲ８、ヒトＣＣＲ４、またはヒトＣＬＡである。ＧｅｎＢａｎｋ（商標）アクセッション番号ＮＭ＿０１６６０２．２及びＡＦ２１５９８１．１は、ヒトＣＣＲ１０の例示的なヌクレオチド配列を提供する。ＧｅｎＢａｎｋ（商標）アクセッション番号ＮＰ＿０５７６８６．２及びＰ４６０９２．３は、ヒトＣＣＲ１０の例示的なアミノ酸配列を提供する。ＧｅｎＢａｎｋ（商標）アクセッション番号ＮＭ＿００５２０１．３及びＢＣ１０７１５９．１は、ヒトＣＣＲ８の例示的なヌクレオチド配列を提供する。ＧｅｎＢａｎｋ（商標）アクセッション番号ＮＰ＿００５１９２．１及びＡＡＩ０７１６０．１は、ヒトＣＣＲ８の例示的なアミノ酸配列を提供する。ＧｅｎＢａｎｋ（商標）アクセッション番号ＮＭ＿００５５０８．４は、ヒトＣＣＲ４の例示的なヌクレオチド配列を提供する。ＧｅｎＢａｎｋ（商標）アクセッション番号Ｐ５１６７９．１は、ヒトＣＣＲ４の例示的なアミノ酸配列を提供する。ＧｅｎＢａｎｋ（商標）アクセッション番号ＮＭ＿００１２０６６０９．１及びＮＭ＿００３００６．４は、ヒトＣＬＡの例示的なヌクレオチド配列を提供する。ＧｅｎＢａｎｋ（商標）アクセッション番号ＮＰ＿００１１９３５３８．１及びＮＰ＿００２９９７．２は、ヒトＣＬＡの例示的なアミノ酸配列を提供する。ヒトホーミング受容体の例示的なヌクレオチド配列及びアミノ酸配列は、表１に見出され得る。いくつかの実施形態では、遺伝子改変細胞は、第２皮膚ホーミング受容体をさらに含む。いくつかの実施形態では、遺伝子改変細胞は、第１皮膚ホーミング受容体を含み、この第１皮膚ホーミング受容体はＣＣＲ１０であり、かつ第２皮膚ホーミング受容体をさらに含み、この第２皮膚ホーミング受容体はＣＬＡである。いくつかの実施形態では、遺伝子改変細胞は、第１皮膚ホーミング受容体を含み、この第１皮膚ホーミング受容体はＣＣＲ１０であり、かつ第２皮膚ホーミング受容体をさらに含み、この第２皮膚ホーミング受容体はＣＣＲ４である。いくつかの実施形態では、遺伝子改変細胞は、第１皮膚ホーミング受容体を含み、この第１皮膚ホーミング受容体はＣＣＲ４であり、かつ第２皮膚ホーミング受容体をさらに含み、この第２皮膚ホーミング受容体はＣＬＡである。いくつかの実施形態では、遺伝子改変細胞は、第３皮膚ホーミング受容体をさらに含む。いくつかの実施形態では、遺伝子改変細胞は、第１皮膚ホーミング受容体を含み、この第１皮膚ホーミング受容体はＣＣＲ１０であり、第２皮膚ホーミング受容体をさらに含み、この第２皮膚ホーミング受容体はＣＣＲ４であり、かつ第３皮膚ホーミング受容体をさらに含み、この第３皮膚ホーミング受容体はＣＬＡである。いくつかの実施形態では、遺伝子改変細胞は、第１皮膚ホーミング受容体を含み、この第１皮膚ホーミング受容体はＣＣＲ８であり、かつ第２皮膚ホーミング受容体をさらに含み、この第２皮膚ホーミング受容体はＣＬＡ、ＣＣＲ４、またはＣＣＲ１０である。いくつかの実施形態では、遺伝子改変細胞は、第１皮膚ホーミング受容体を含み、この第１皮膚ホーミング受容体はＣＣＲ８であり、第２皮膚ホーミング受容体をさらに含み、この第２皮膚ホーミング受容体はＣＬＡ、ＣＣＲ４、またはＣＣＲ１０であり、かつ第３皮膚ホーミング受容体をさらに含み、この第３皮膚ホーミング受容体は第２皮膚ホーミング受容体とは異なり、ＣＬＡ、ＣＣＲ４、及びＣＣＲ１０からなる群から選択される。いくつかの実施形態では、遺伝子改変細胞は、第３皮膚ホーミング受容体をさらに含む。いくつかの実施形態では、遺伝子改変細胞は、第１皮膚ホーミング受容体を含み、この第１皮膚ホーミング受容体はＣＣＲ１０であり、第２皮膚ホーミング受容体をさらに含み、この第２皮膚ホーミング受容体はＣＣＲ４であり、第３皮膚ホーミング受容体をさらに含み、この第３皮膚ホーミング受容体はＣＬＡであり、かつ第４皮膚ホーミング受容体をさらに含み、この第４皮膚ホーミング受容体はＣＣＲ８である。ある種の実施形態では、遺伝子改変細胞は、１種以上の皮膚ホーミング受容体を含む。その他の特定の実施形態では、遺伝子改変細胞は、皮膚ホーミング受容体のＣＣＲ６を含む。
【００３７】
ある種の実施形態では、１種以上の皮膚ホーミング受容体を含有する遺伝子改変細胞は、ビタミンＤ代謝産物の存在下において増殖される、活性化される、または増殖と活性化の両方が行われる。特定の実施形態では、増殖、活性化、または増殖と活性化の両方は、インビボ、インビトロ、またはエクスビボで行われる。特定の実施形態では、ビタミンＤ代謝産物は、１，２５−ジヒドロキシコレカルシフェロール（１，２５（ＯＨ）２Ｄ３）である。ある種の実施形態では、１種以上の皮膚ホーミング受容体を含有する遺伝子改変細胞は、ＩＬ−１２の存在下において増殖される、活性化される、または増殖と活性化の両方が行われる。特定の実施形態では、増殖、活性化、または増殖と活性化の両方は、インビボ、インビトロ、またはエクスビボで行われる。より特定の実施形態では、１種以上の皮膚ホーミング受容体を含有する遺伝子改変細胞は、ビタミンＤ代謝産物及びＩＬ−１２の存在下において増殖される、活性化される、または増殖と活性化の両方が行われる。特定の実施形態では、増殖、活性化、または増殖と活性化の両方は、インビボ、インビトロ、またはエクスビボで行われる。ある種の実施形態では、１種以上の皮膚ホーミング受容体を含有する遺伝子改変細胞は、Ｂ細胞領域ホーミング受容体をさらに含む。特定の実施形態では、Ｂ細胞領域ホーミング受容体は、ＣＸＣＲ５である。ある種の実施形態では、遺伝子改変細胞は、皮膚ホーミング受容体を発現し、かつ節４．４に記載されているようなＣＡＲも発現する。ある種の実施形態では、遺伝子改変細胞はＣＡＲを発現し、かつ１種以上の皮膚ホーミング受容体を内因的に発現する。
【００３８】
皮膚、例えば皮膚組織または細胞にホーミングする１種以上の受容体を含む遺伝子改変細胞、例えばヒトＴ細胞を生成する方法もまた、本明細書で提供される。ある種の実施形態では、皮膚にホーミングするＴ細胞は、皮膚ホーミング受容体、例えばＣＣＲ４、ＣＣＲ８、ＣＣＲ１０、またはＣＬＡを発現するようにＴ細胞を操作するステップを含む方法によって生成される。いくつかの実施形態では、皮膚ホーミング受容体を発現するようにＴ細胞を操作するステップは、受容体核酸配列（複数可）、すなわち受容体（複数可）をコードする核酸配列（複数可）を含む１種以上のベクターを細胞に導入することを含む。特定の実施形態では、ベクターは、ヒトＣＣＲ１０の核酸配列、ヒトＣＬＡの核酸配列、またはその両方を含む。特定の実施形態では、ベクターは、ヒトＣＣＲ４の核酸配列、及び場合によりヒトＣＬＡの核酸配列を含む。特定の実施形態では、ベクターは、ヒトＣＣＲ４の核酸配列及びヒトＣＣＲ１０の核酸配列を含む。特定の実施形態では、ベクターは、ヒトＣＣＲ１０の核酸配列、ヒトＣＣＲ４の核酸配列、及びヒトＣＬＡの核酸配列を含む。特定の実施形態では、ベクターは、ヒトＣＣＲ８の核酸配列を含む。特定の実施形態では、ベクターは、ヒトＣＣＲ８の核酸配列、及び場合によりヒトＣＬＡの核酸配列を含む。特定の実施形態では、ベクターは、ヒトＣＣＲ８の核酸配列及びヒトＣＣＲ１０の核酸配列を含む。特定の実施形態では、ベクターは、ヒトＣＣＲ８の核酸配列、ヒトＣＣＲ４の核酸配列、及びヒトＣＬＡの核酸配列を含む。特定の実施形態では、ベクターは、ヒトＣＣＲ８の核酸配列、ヒトＣＣＲ１０の核酸配列、及びヒトＣＬＡの核酸配列を含む。特定の実施形態では、ベクターは、ヒトＣＣＲ８の核酸配列、ヒトＣＣＲ４の核酸配列、及びヒトＣＣＲ１０の核酸配列を含む。特定の実施形態では、ベクターは、ヒトＣＣＲ８の核酸配列、ヒトＣＣＲ４の核酸配列、ＣＣＲ１０の核酸、及びヒトＣＬＡの核酸配列を含む。
【００３９】
ある種の実施形態では、皮膚にホーミングする細胞、例えばＴ細胞は、１種以上の皮膚ホーミング受容体、例えばＣＣＲ４、ＣＣＲ１０、ＣＣＲ８、またはＣＬＡの発現を誘導する、例えばその発現を増加させる分子で細胞、例えばＴ細胞を処置するステップを含む方法によって生成される。特定の実施形態では、分子はビタミンＤである。ある種の実施形態では、皮膚ホーミング受容体発現の誘導は、細胞、例えばＴ細胞をＩＬ−１２で処置すること、例えば、細胞によるＣＣＲ４、ＣＣＲ８、ＣＣＲ１０、またはＣＬＡのうち１種以上の発現を増加させるのに十分な量で十分な時間、細胞をＩＬ−１２と接触させることにより促進される。
【００４０】
ある種の実施形態では、１種以上の受容体を発現する細胞を皮膚にホーミングさせる１種以上の受容体を含む遺伝子改変Ｔ細胞を生成する方法は、細胞を増殖させるステップを含み、このステップは、ビタミンＤ代謝産物及び場合により、ＩＬ−１２の存在下において実施される。ある種の実施形態では、１種以上の受容体を発現する細胞を腸管にホーミングさせる１種以上の受容体を含む遺伝子改変Ｔ細胞を生成する方法は、細胞を活性化させるステップを含み、このステップは、ビタミンＤ代謝産物及び場合により、ＩＬ−１２の存在下において実施される。ある種の実施形態では、増殖及び活性化ステップの両方が、ビタミンＤ代謝産物、及び場合により、ＩＬ−１２の存在下において実施される。ある種の実施形態では、ビタミンＤ代謝産物は、１，２５（ＯＨ）２Ｄ３である。ある種の実施形態では、皮膚ホーミング受容体を発現するようにＴ細胞を操作するステップは、当業者に既知の任意の方法によって実施される。
【００４１】
皮膚ホーミング受容体を発現するようにＴ細胞を操作するのに有用な例示的核酸は、例えば節４．５で述べられている。
【００４２】
個体の皮膚癌または腫瘍を処置する方法も本明細書で提供され、この方法は、（ｉ）１種以上の受容体を発現する細胞を皮膚にホーミングさせる１種以上の受容体、及び（ｉｉ）ＣＡＲを含む、治療有効量の遺伝子改変細胞、例えばヒトＴ細胞を個体に投与することを含む。ある種の実施形態では、皮膚ホーミング受容体は、ＣＣＲ１０、ＣＣＲ８、ＣＣＲ４、またはＣＬＡである。いくつかの実施形態では、遺伝子改変細胞は、第２皮膚ホーミング受容体をさらに含む。いくつかの実施形態では、遺伝子改変細胞は、第１皮膚ホーミング受容体を含み、この第１皮膚ホーミング受容体はＣＣＲ１０であり、かつ第２皮膚ホーミング受容体をさらに含み、この第２皮膚ホーミング受容体はＣＬＡである。いくつかの実施形態では、遺伝子改変細胞は、第１皮膚ホーミング受容体を含み、この第１皮膚ホーミング受容体はＣＣＲ１０であり、かつ第２皮膚ホーミング受容体をさらに含み、この第２皮膚ホーミング受容体はＣＣＲ４である。いくつかの実施形態では、遺伝子改変細胞は、第１皮膚ホーミング受容体を含み、この第１皮膚ホーミング受容体はＣＣＲ１０であり、かつ第２皮膚ホーミング受容体をさらに含み、この第２皮膚ホーミング受容体はＣＣＲ８である。いくつかの実施形態では、遺伝子改変細胞は、第１皮膚ホーミング受容体を含み、この第１皮膚ホーミング受容体はＣＣＲ４であり、かつ第２皮膚ホーミング受容体をさらに含み、この第２皮膚ホーミング受容体はＣＬＡである。いくつかの実施形態では、遺伝子改変細胞は、第１皮膚ホーミング受容体を含み、この第１皮膚ホーミング受容体はＣＣＲ４であり、かつ第２皮膚ホーミング受容体をさらに含み、この第２皮膚ホーミング受容体はＣＣＲ８である。いくつかの実施形態では、遺伝子改変細胞は、第１皮膚ホーミング受容体を含み、この第１皮膚ホーミング受容体はＣＬＡであり、かつ第２皮膚ホーミング受容体をさらに含み、この第２皮膚ホーミング受容体はＣＣＲ８である。いくつかの実施形態では、遺伝子改変細胞は、第３皮膚ホーミング受容体をさらに含む。いくつかの実施形態では、遺伝子改変細胞は、第１皮膚ホーミング受容体を含み、この第１皮膚ホーミング受容体はＣＣＲ１０であり、第２皮膚ホーミング受容体をさらに含み、この第２皮膚ホーミング受容体はＣＣＲ４であり、かつ第３皮膚ホーミング受容体をさらに含み、この第３皮膚ホーミング受容体はＣＬＡである。いくつかの実施形態では、遺伝子改変細胞は、第１皮膚ホーミング受容体を含み、この第１皮膚ホーミング受容体はＣＣＲ１０であり、第２皮膚ホーミング受容体をさらに含み、この第２皮膚ホーミング受容体はＣＣＲ４であり、かつ第３皮膚ホーミング受容体をさらに含み、この第３皮膚ホーミング受容体はＣＣＲ８である。いくつかの実施形態では、遺伝子改変細胞は、第１皮膚ホーミング受容体を含み、この第１皮膚ホーミング受容体はＣＣＲ８であり、第２皮膚ホーミング受容体をさらに含み、この第２皮膚ホーミング受容体はＣＣＲ４であり、かつ第３皮膚ホーミング受容体をさらに含み、この第３皮膚ホーミング受容体はＣＬＡである。いくつかの実施形態では、遺伝子改変細胞は、第１皮膚ホーミング受容体を含み、この第１皮膚ホーミング受容体はＣＣＲ１０であり、第２皮膚ホーミング受容体をさらに含み、この第２皮膚ホーミング受容体はＣＣＲ８であり、かつ第３皮膚ホーミング受容体をさらに含み、この第３皮膚ホーミング受容体はＣＬＡである。いくつかの実施形態では、遺伝子改変細胞は、第４皮膚ホーミング受容体をさらに含む。いくつかの実施形態では、遺伝子改変細胞は、第１皮膚ホーミング受容体を含み、この第１皮膚ホーミング受容体はＣＣＲ１０であり、第２皮膚ホーミング受容体をさらに含み、この第２皮膚ホーミング受容体はＣＣＲ４であり、第３皮膚ホーミング受容体をさらに含み、この第３皮膚ホーミング受容体はＣＬＡであり、かつ第４皮膚ホーミング受容体をさらに含み、この第４皮膚ホーミング受容体はＣＣＲ８である。ある種の実施形態では、（ｉ）１種以上の受容体を発現する細胞を皮膚にホーミングさせる１種以上の受容体、及び（ｉｉ）ＣＡＲを含む遺伝子改変細胞、例えばヒトＴ細胞は、腫瘍細胞の増殖を抑制する。ある種の実施形態では、（ｉ）１種以上の受容体を発現する細胞を皮膚にホーミングさせる１種以上の受容体、及び（ｉｉ）ＣＡＲを含む遺伝子改変細胞、例えばヒトＴ細胞は、腫瘍の成長を阻害する。ある種の実施形態では、（ｉ）１種以上の受容体を発現する細胞を皮膚にホーミングさせる１種以上の受容体、及び（ｉｉ）ＣＡＲを含む遺伝子改変細胞、例えばヒトＴ細胞は、腫瘍細胞を死滅させる。特定の実施形態では、皮膚癌または腫瘍は、黒色腫、扁平上皮癌腫、または基底細胞癌腫である。ある種の実施形態では、ＣＡＲの細胞外ドメインは、皮膚癌または腫瘍と関連する抗原と結合する。皮膚癌または腫瘍を処置する方法に使用するための遺伝子改変細胞もまた、本明細書で提供される。
【００４３】
表１．ヒトホーミング受容体の例示的なヌクレオチド配列及びアミノ酸配列。
【表１】
2017524365.tif 000002
2017524365.tif 000003
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【００４４】
４．４．キメラ抗原受容体
本明細書で提供される細胞が、上に記載されているようなホーミング受容体を含むＴ細胞である場合、このようなＴ細胞は、ある種の実施形態では、キメラ抗原受容体（ＣＡＲ）を含み得、この受容体はＴ細胞を抗原に誘導し、Ｔ細胞を刺激して抗原を提示する細胞を死滅させる人工膜結合タンパク質である。例えば、Ｅｓｈｈａｒ、米国特許第７，７４１，４６５号明細書を参照のこと。最低でも、ＣＡＲは、抗原、例えば細胞上の抗原に結合する細胞外ドメイン、膜貫通ドメイン、及び一次活性化シグナルを免疫細胞に伝達する細胞内（細胞質）シグナル伝達ドメインを含む。その他の全ての条件が満たされて、ＣＡＲが、例えばＴ細胞、例えば一次Ｔ細胞の表面上に発現され、かつＣＡＲの細胞外ドメインが抗原に結合する場合、細胞内シグナル伝達ドメインは、シグナルをＴ細胞に伝達して活性化及び／または増殖させ、抗原が細胞表面上に存在する場合、抗原を発現する細胞を死滅させる。Ｔ細胞は、最大限に活性化するために、２つのシグナル、すなわち一次活性化シグナル及び共刺激シグナルを必要とするため、典型的にはＣＡＲは、抗原と細胞外ドメインとの結合が一次活性化シグナル及び共刺激シグナルの両方の伝達をもたらすように、共刺激ドメインも含む。
【００４５】
４．４．１．一般的なＣＡＲ構造の細胞内ドメイン
ある種の実施形態では、ＣＡＲの細胞内ドメインは、Ｔ細胞の表面上に発現され、かつＴ細胞の活性化及び／もしくは増殖を誘発するタンパク質の細胞内ドメインもしくはモチーフである、またはその細胞内ドメインもしくはモチーフを含む。このようなドメインまたはモチーフは、ＣＡＲの細胞外部分への抗原の結合に応答したＴ細胞の活性化に必要である一次抗原結合シグナルを伝達することができる。典型的には、このドメインまたはモチーフは、ＩＴＡＭ（免疫受容体チロシンベース活性化モチーフ）を含む、またはＩＴＡＭである。ＣＡＲに好適なＩＴＡＭ含有ポリペプチドとしては、例えば、ゼータＣＤ３鎖（ＣＤ３ζ）またはそのＩＴＡＭ含有部分が挙げられる。特定の実施形態では、細胞内ドメインは、ＣＤ３ζ細胞内シグナル伝達ドメインである。その他の特定の実施形態では、細胞内ドメインは、リンパ球受容体鎖、ＴＣＲ／ＣＤ３複合体タンパク質、Ｆｃ受容体サブユニットまたはＩＬ−２受容体サブユニット由来のものである。
【００４６】
ある種の実施形態では、ＣＡＲは、例えばポリペプチドの細胞内ドメインの一部分として、１つ以上の共刺激ドメインまたはモチーフをさらに含む。１つ以上の共刺激ドメインまたはモチーフは、共刺激ＣＤ２７ポリペプチド配列、共刺激ＣＤ２８ポリペプチド配列、共刺激ＯＸ４０（ＣＤ１３４）ポリペプチド配列、共刺激４−１ＢＢ（ＣＤ１３７）ポリペプチド配列、もしくは共刺激誘導性Ｔ細胞共刺激（ＩＣＯＳ）ポリペプチド配列、もしくはその他の共刺激ドメインもしくはモチーフのうち１つ以上であり得る、またはそれらを含み得る。
【００４７】
膜貫通領域は、機能的ＣＡＲに組み込まれ得る任意の膜貫通領域、典型的にはＣＤ４またはＣＤ８分子由来の膜貫通領域であり得る。
【００４８】
４．４．２．ＣＡＲ細胞外ドメイン
ポリペプチドの細胞外ドメインは、関心対象の抗原に結合する。本明細書に記載されるポリペプチドのいずれかに関するある種の実施形態では、細胞外ドメインは、抗原に結合する受容体、または受容体の一部分を含む。細胞外ドメインは、例えば、抗原に結合する受容体、または受容体の一部分であってよい。ある種の実施形態では、細胞外ドメインは、抗体もしくはその抗原結合部分を含む、または抗体もしくはその抗原結合部分である。特定の実施形態では、細胞外ドメインは、単鎖Ｆｖドメインを含む、または単鎖Ｆｖドメインである。単鎖Ｆｖドメインは、例えば、柔軟なリンカーによってＶＨに連結されるＶＬを含み得、このＶＬ及びＶＨは、抗原と結合する抗体由来のものである。
【００４９】
ポリペプチドの細胞外ドメインが結合する抗原は、関心対象の任意の抗原であり得、例えば、腫瘍細胞上の抗原であり得る。腫瘍細胞は、例えば、固形腫瘍の細胞、または血液癌の細胞であってよい。抗原は、任意の腫瘍型または癌型の細胞、例えば、リンパ腫、肺癌、乳癌、前立腺癌、副腎皮質癌腫、甲状腺癌腫、上咽頭癌腫、黒色腫、例えば、悪性黒色腫、皮膚癌腫、結腸直腸癌腫、類腱腫、線維形成性小円形細胞腫瘍、内分泌腫瘍、ユーイング肉腫、末梢性未分化神経外胚葉性腫瘍、固形胚細胞腫瘍、肝芽腫、神経芽細胞腫、非横紋筋肉腫軟部組織肉腫、骨肉腫、網膜芽細胞腫、横紋筋肉腫、ウィルムス腫瘍、膠芽腫、粘液腫、線維腫、脂肪腫などの細胞上に発現される任意の抗原であり得る。より特定の実施形態では、リンパ腫は、慢性リンパ性白血病（小リンパ性リンパ腫）、Ｂ細胞前リンパ性白血病、リンパ形質細胞性リンパ腫、ワルデンシュトレームマクログロブリン血症、脾臓辺縁帯リンパ腫、形質細胞性骨髄腫、形質細胞腫、節外性辺縁帯Ｂ細胞リンパ腫、ＭＡＬＴリンパ腫、節性辺縁帯Ｂ細胞リンパ腫、濾胞性リンパ腫、マントル細胞リンパ腫、びまん性大細胞型Ｂ細胞リンパ腫、縦隔（胸腺）大細胞型Ｂ細胞リンパ腫、血管内大細胞型Ｂ細胞リンパ腫、原発性滲出液リンパ腫、バーキットリンパ腫、Ｔ細胞前リンパ性白血病、Ｔ細胞大顆粒リンパ性白血病、侵攻性ＮＫ細胞白血病、成人Ｔ細胞白血病／リンパ腫、節外性ＮＫ／Ｔ細胞リンパ腫、鼻型、腸症型Ｔ細胞リンパ腫、肝脾Ｔ細胞リンパ腫、芽球性ＮＫ細胞リンパ腫、菌状息肉腫、セザリー症候群、原発性皮膚未分化大細胞リンパ腫、リンパ腫様丘疹症、血管免疫芽球性Ｔ細胞リンパ腫、末梢性Ｔ細胞リンパ腫（非特定型）、未分化大細胞リンパ腫、ホジキンリンパ腫、または非ホジキンリンパ腫であり得る。
【００５０】
ある種の実施形態では、抗原は、腫瘍関連抗原または腫瘍特異的抗原である。様々な特定の実施形態では、限定されることなく、腫瘍関連抗原または腫瘍特異的抗原は、Ｈｅｒ２、前立腺幹細胞抗原（ＰＳＣＡ）、アルファ−フェトプロテイン（ＡＦＰ）、癌胎児性抗原（ＣＥＡ）、癌抗原−１２５（ＣＡ−１２５）、ＣＡ１９−９、カルレチニン、ＭＵＣ−１、上皮膜タンパク質（ＥＭＡ）、上皮腫瘍抗原（ＥＴＡ）、チロシナーゼ、黒色腫関連抗原（ＭＡＧＥ）、ＣＤ１９、ＣＤ３４、ＣＤ４５、ＣＤ９９、ＣＤ１１７、クロモグラニン、サイトケラチン、デスミン、グリア線維性酸性タンパク質（ＧＦＡＰ）、肉眼的嚢胞性疾患液体タンパク質（ＧＣＤＦＰ−１５）、ＨＭＢ−４５抗原、高分子量黒色腫関連抗原（ＨＭＷ−ＭＡＡ）、タンパク質ｍｅｌａｎ−Ａ（Ｔ細胞によって認識される黒色腫抗原；ＭＡＲＴ−１）、ｍｙｏ−Ｄ１、筋特異的アクチン（ＭＳＡ）、ニューロフィラメント、ニューロン特異的エノラーゼ（ＮＳＥ）、胎盤アルカリホスファターゼ、シナプトフィシス（ｓｙｎａｐｔｏｐｈｙｓｉｓ）、サイログロブリン、甲状腺転写因子−１、二量体形態のピルビン酸キナーゼアイソエンザイムＭ２型（腫瘍Ｍ２−ＰＫ）、異常なｒａｓタンパク質、または異常なｐ５３タンパク質である。
【００５１】
ある種の実施形態では、ＴＡＡまたはＴＳＡは、癌／精巣（ＣＴ）抗原、例えば、ＢＡＧＥ、ＣＡＧＥ、ＣＴＡＧＥ、ＦＡＴＥ、ＧＡＧＥ、ＨＣＡ６６１、ＨＯＭ−ＴＥＳ−８５、ＭＡＧＥＡ、ＭＡＧＥＢ、ＭＡＧＥＣ、ＮＡ８８、ＮＹ−ＥＳＯ−１、ＮＹ−ＳＡＲ−３５、ＯＹ−ＴＥＳ−１、ＳＰＡＮＸＢ１、ＳＰＡ１７、ＳＳＸ、ＳＹＣＰ１、またはＴＰＴＥである。
【００５２】
ある種のその他の実施形態では、ＴＡＡまたはＴＳＡは、炭水化物またはガングリオシド、例えば、ｆｕｃ−ＧＭ１、ＧＭ２（腫瘍胎児抗原−免疫原性−１；ＯＦＡ−Ｉ−１）；ＧＤ２（ＯＦＡ−Ｉ−２）、ＧＭ３、ＧＤ３などである。
【００５３】
ある種のその他の実施形態では、ＴＡＡまたはＴＳＡは、アルファ−アクチニン−４、Ｂａｇｅ−１、ＢＣＲ−ＡＢＬ、Ｂｃｒ−Ａｂｌ融合タンパク質、ベータ−カテニン、ＣＡ１２５、ＣＡ１５−３（ＣＡ２７．２９＼ＢＣＡＡ）、ＣＡ１９５、ＣＡ２４２、ＣＡ−５０、ＣＡＭ４３、Ｃａｓｐ−８、ｃｄｃ２７、ｃｄｋ４、ｃｄｋｎ２ａ、ＣＥＡ、ｃｏａ−１、ｄｅｋ−ｃａｎ融合タンパク質、ＥＢＮＡ、ＥＦ２、エプスタインバーウイルス抗原、ＥＴＶ６−ＡＭＬ１融合タンパク質、ＨＬＡ−Ａ２、ＨＬＡ−Ａ１１、ｈｓｐ７０−２、ＫＩＡＡＯ２０５、Ｍａｒｔ２、Ｍｕｍ−１、Ｍｕｍ−２、及びＭｕｍ−３、ｎｅｏ−ＰＡＰ、ミオシンクラスＩ、ＯＳ−９、ｐｍｌ−ＲＡＲα融合タンパク質、ＰＴＰＲＫ、Ｋ−ｒａｓ、Ｎ−ｒａｓ、トリオースリン酸イソメラーゼ、Ｇａｇｅ３、４、５、６、７、ＧｎＴＶ、Ｈｅｒｖ−Ｋ−ｍｅｌ、Ｌａｇｅ−１、ＮＡ−８８、ＮＹ−Ｅｓｏ−１／Ｌａｇｅ−２、ＳＰ１７、ＳＳＸ−２、ＴＲＰ２−Ｉｎｔ２、ｇｐ１００（Ｐｍｅｌ  １７）、チロシナーゼ、ＴＲＰ−１、ＴＲＰ−２、ＭＡＧＥ−１、ＭＡＧＥ−３、ＲＡＧＥ、ＧＡＧＥ−１、ＧＡＧＥ−２、ｐ１５（５８）、ＲＡＧＥ、、ＳＣＰ−１、Ｈｏｍ／Ｍｅｌ−４０、ＰＲＡＭＥ、ｐ５３、Ｈ−Ｒａｓ、ＨＥＲ−２／ｎｅｕ、Ｅ２Ａ−ＰＲＬ、Ｈ４−ＲＥＴ、ＩＧＨ−ＩＧＫ、ＭＹＬ−ＲＡＲ、ヒトパピローマウイルス（ＨＰＶ）抗原Ｅ６及びＥ７、ＴＳＰ−１８０、ＭＡＧＥ−４、ＭＡＧＥ−５、ＭＡＧＥ−６、ｐ１８５ｅｒｂＢ２、ｐ１８０ｅｒｂＢ−３、ｃ−ｍｅｔ、ｎｍ−２３Ｈ１、ＰＳＡ、ＴＡＧ−７２−４、ＣＡ１９−９、ＣＡ７２−４、ＣＡＭ１７．１、ＮｕＭａ、Ｋ−ｒａｓ、１３−カテニン、Ｍｕｍ−１、ｐ１６、ＴＡＧＥ、ＰＳＭＡ、ＣＴ７、テロメラーゼ、４３−９Ｆ、５Ｔ４、７９１Ｔｇｐ７２、１３ＨＣＧ、ＢＣＡ２２５、ＢＴＡＡ、ＣＤ６８＼ＫＰ１、ＣＯ−０２９、ＦＧＦ−５、Ｇ２５０、Ｇａ７３３（ＥｐＣＡＭ）、ＨＴｇｐ−１７５、Ｍ３４４、ＭＡ−５０、ＭＧ７−Ａｇ、ＭＯＶ１８、ＮＢ＼７０Ｋ、ＮＹ−ＣＯ−１、ＲＣＡＳ１、ＳＤＣＣＡＧ１６、ＴＡ−９０、ＴＡＡＬ６、ＴＡＧ７２、ＴＬＰ、ＴＰＳ、ＣＤ１９、ＣＤ２２、ＣＤ２７、ＣＤ３０、ＣＤ７０、ＧＤ２（ガングリオシドＧ２）、ＥＧＦＲｖＩＩＩ（上皮成長因子バリアントＩＩＩ）、精子タンパク質１７（Ｓｐ１７）、メソテリン、ＰＡＰ（前立腺酸性ホスファターゼ）、プロステイン、ＴＡＲＰ（Ｔ細胞受容体ガンマ代替リーディングフレームタンパク質）、Ｔｒｐ−ｐ８、ＳＴＥＡＰ１（前立腺の６回膜貫通上皮抗原１）、異常なｒａｓタンパク質、または異常なｐ５３タンパク質である。別の特定の実施形態では、腫瘍関連抗原または腫瘍特異的抗原は、インテグリンαｖβ３（ＣＤ６１）、ガラクチン、Ｋ−Ｒａｓ（Ｖ−Ｋｉ−ｒａｓ２カーステンラット肉腫ウイルス癌遺伝子）、またはＲａｌ−Ｂである。その他の腫瘍関連抗原及び腫瘍特異的抗原が、当業者に既知である。
【００５４】
ＴＳＡ及びＴＡＡに結合する抗体、及びｓｃＦｖは、それらをコードするヌクレオチド配列と同様に、当該技術分野において既知である。
【００５５】
ある特定の実施形態では、抗原は、ＴＳＡまたはＴＡＡであるとは考えられない抗原であるが、それにもかかわらず、抗原は腫瘍細胞、または腫瘍によって引き起こされる損傷と関連する。ある種の実施形態では、例えば抗原は、例えば成長因子、サイトカインまたはインターロイキン、例えば血管新生または脈管形成と関連する成長因子、サイトカイン、またはインターロイキンである。このような成長因子、サイトカイン、またはインターロイキンとしては、例えば、血管内皮成長因子（ＶＥＧＦ）、塩基性線維芽細胞成長因子（ｂＦＧＦ）、血小板由来成長因子（ＰＤＧＦ）、肝細胞成長因子（ＨＧＦ）、インスリン様成長因子（ＩＧＦ）、またはインターロイキン−８（ＩＬ−８）を挙げることができる。腫瘍はまた、腫瘍の近くに低酸素環境を作製し得る。したがって、その他の特定の実施形態では、抗原は低酸素関連因子、例えばＨＩＦ−１α、ＨＩＦ−１β、ＨＩＦ−２α、ＨＩＦ−２β、ＨＩＦ−３α、またはＨＩＦ−３βである。腫瘍はまた、正常組織に対して局部損傷を引き起こし、損傷関連分子パターン分子（ＤＡＭＰ；アラーミンとしても知られる）として知られる分子の放出を引き起こし得る。ある種のその他の特定の実施形態では、したがって、抗原はＤＡＭＰ、例えば熱ショックタンパク質、クロマチン関連タンパク質の高移動度群ボックス１（ＨＭＧＢ１）、Ｓ１００Ａ８（ＭＲＰ８、カルグラニュリンＡ）、Ｓ１００Ａ９（ＭＲＰ１４、カルグラニュリンＢ）、血清アミロイドＡ（ＳＡＡ）である、またはデオキシリボ核酸、アデノシン三リン酸、尿酸、もしくはヘパリン硫酸であり得る。
【００５６】
特定の実施形態では、癌、すなわち腸管癌、例えば肝臓癌、胃癌、食道癌、胆嚢癌、結腸直腸癌、肛門癌、または膵臓癌の場合、抗原は、腸管癌に特異的な抗原または腸管癌と関連する抗原である。特定の実施形態では、本明細書で提供されるＴ細胞は、腸管ホーミング受容体を発現し、かつ腸管癌と関連する抗原に結合する細胞外ドメインを有するＣＡＲも発現する。特定の実施形態では、ＣＡＲの細胞外ドメインは、ＣＥＡと結合する。その他の特定の実施形態では、ＣＡＲの細胞外ドメインは、Ｈｅｒ２、ＣＡ２４２、ＭＵＣ１、ＣＡ１２５、またはＣＡ１９−９と結合する。
【００５７】
特定の実施形態では、癌が皮膚癌、例えば黒色腫、扁平上皮癌腫、または基底細胞癌腫である場合、抗原は、皮膚癌に特異的な抗原または皮膚癌と関連する抗原である。特定の実施形態では、本明細書で提供されるＴ細胞は、皮膚ホーミング受容体を発現し、かつ皮膚癌と関連する抗原に結合する細胞外ドメインを有するＣＡＲも発現する。特定の実施形態では、ＣＡＲの細胞外ドメインは、ＨＭＷ−ＭＡＡと結合する。その他の特定の実施形態では、ＣＡＲの細胞外ドメインは、Ｈｅｒ２、ＧＤ２、ＧＤ３、ＣＥＡ、またはＳＰＡＧ９と結合する。
【００５８】
本明細書に記載されるポリペプチドのある種の実施形態では、細胞外ドメインは、リンカー、スペーサーまたはヒンジポリペプチド配列、例えばＣＤ２８由来の配列によって膜貫通ドメインに結合される。
【００５９】
４．５．単離核酸
一実施形態では、本明細書で提供されるポリペプチド（例えば、キメラ受容体及びホーミング受容体）をコードするポリヌクレオチド配列が、本明細書で提供される。ポリヌクレオチドは、免疫細胞、例えばＴ細胞の形質転換に好適な任意のポリヌクレオチドベクター内に含有されてよい。例えば、Ｔ細胞は、第１及び第２ポリペプチド（例えば、キメラ受容体）をコードするポリヌクレオチドを含有する、合成ベクター、レンチウイルスまたはレトロウイルスベクター、自律複製プラスミド、ウイルス（例えば、レトロウイルス、レンチウイルス、アデノウイルス、またはヘルペスウイルス）などを使用して形質転換されてよい。Ｔ細胞の形質転換に好適なレンチウイルスベクターとしては、例えば、その開示全体が参照によって本明細書に組み込まれる、米国特許第５，９９４，１３６号明細書；第６，１６５，７８２号明細書；第６，４２８，９５３号明細書；第７，０８３，９８１号明細書；及び第７，２５０，２９９号明細書に記載されているレンチウイルスベクターが挙げられるが、これらに限定されない。Ｔ細胞の形質転換に好適なＨＩＶベクターとしては、例えば、その開示全体が参照によって本明細書に組み込まれる、米国特許第５，６６５，５７７号明細書に記載されているベクターが挙げられるが、これらに限定されない。
【００６０】
例えばＴ細胞内での、本明細書で提供されるポリペプチドの産生に有用な核酸としては、ＤＮＡ、ＲＮＡ、または核酸類似体が挙げられる。核酸類似体は、塩基部分、糖部分、またはリン酸骨格において改変され得、デオキシチミジンに代わるデオキシウリジン置換、デオキシシチジンに代わる５−メチル−２’−デオキシシチジンまたは５−ブロモ−２’−デオキシシチジン置換を含み得る。糖部分の改変は、２’−Ｏ−メチルまたは２’−Ｏ−アリル糖を形成するリボース糖の２’ヒドロキシルの改変を含み得る。デオキシリボースリン酸骨格は、各塩基部分が６員モルホリノ環に連結されているモルホリノ核酸、またはデオキシリン酸骨格が偽ペプチド骨格で置換され、かつ４つの塩基が保持されているペプチド核酸を作製するように改変され得る。例えば、Ｓｕｍｍｅｒｔｏｎ  ａｎｄ  Ｗｅｌｌｅｒ（１９９７）Ａｎｔｉｓｅｎｓｅ  Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄ  Ｄｒｕｇ  Ｄｅｖ．７：１８７−１９５；及びＨｙｒｕｐ  ｅｔ  ａｌ．（１９９６）Ｂｉｏｏｒｇａｎ．Ｍｅｄ．Ｃｈａｉｎ．４：５−２３を参照のこと。加えて、デオキシリン酸骨格は、例えばホスホロチオエートもしくはホスホロジチオエート骨格、ホスホロアミダイト、またはアルキルホスホトリエステル骨格と置換され得る。
【００６１】
本明細書で提供されるポリペプチドをコードする核酸は、ベクター、例えば発現ベクターなどの一部分として宿主細胞内に導入されてよい。加えて、本明細書で提供されるポリペプチドは、このようなポリペプチドをコードする核酸で宿主細胞をトランスフェクトすることにより産生されてよく、このような核酸はベクターの一部分であってよい。特定の実施形態では、ベクターは、本明細書で提供されるポリペプチドをコードする核酸の発現を指示することができる発現ベクターである。発現ベクターの非限定的例としては、プラスミド及びウイルスベクター、例えば、複製欠損レトロウイルス、アデノウイルス、アデノ随伴ウイルス、ニューカッスル病ウイルス、ワクシニアウイルス及びバキュロウイルスなどが挙げられるが、これらに限定されない。標準的な分子生物学技術が、本明細書で提供されるポリペプチドをコードする核酸を発現ベクターに導入するために使用されてよい。
【００６２】
発現ベクターは、宿主細胞または非ヒト対象における核酸の発現に好適な形態で、本明細書で提供されるポリペプチドをコードする核酸を含む。特定の実施形態では、発現ベクターは、発現に使用される宿主細胞に基づいて選択された１つ以上の調節配列を含み、これは発現される核酸に作動可能に連結される。発現ベクターにおいて、「作動可能に連結される」とは、関心対象の核酸が、（例えば、インビトロ転写／翻訳系で、またはベクターが宿主細胞に導入されている場合の宿主細胞において）核酸の発現を可能にする方法で調節配列（複数可）に連結されるという意味を意図する。調節配列としては、プロモーター、エンハンサー及びその他の発現制御エレメント（例えば、ポリアデニル化シグナル）が挙げられる。調節配列としては、多くの種類の宿主細胞中において核酸の構成的発現を指示するもの、ある種の宿主細胞中においてのみ核酸の発現を指示するもの（例えば、組織特異的調節配列）、及び特定の薬剤による刺激時に核酸の発現を指示するもの（例えば、誘導性調節配列）が挙げられる。発現ベクターの設計は、例えば形質転換される宿主細胞の選択、所望のタンパク質発現レベルなどの因子に依存し得ることが、当業者には理解されるだろう。
【００６３】
発現ベクターは、従来の形質転換またはトランスフェクション技術により宿主細胞内に導入され得る。このような技術としては、リン酸カルシウムまたは塩化カルシウム共沈、ＤＥＡＥ−デキストラン媒介トランスフェクション、リポフェクション、及びエレクトロポレーションが挙げられるが、これらに限定されない。宿主細胞を形質転換またはトランスフェクトする好適な方法は、Ｓａｍｂｒｏｏｋ  ｅｔ  ａｌ．，１９８９，Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｃｌｏｎｉｎｇ−Ａ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｍａｎｕａｌ，２ｎｄ  Ｅｄｉｔｉｏｎ，Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｏｒ  Ｐｒｅｓｓ，Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ、及びその他の実験室用マニュアルに見出され得る。ある種の実施形態では、宿主細胞は、本明細書で提供されるポリペプチドをコードする核酸を含有する発現ベクターで一過性にトランスフェクトされる。その他の実施形態では、宿主細胞は、本明細書で提供されるポリペプチドをコードする核酸を含有する発現ベクターで安定にトランスフェクトされる。
【００６４】
４．６．細胞
ホーミング受容体が使用されてよい細胞の非限定的例としては、ナチュラルキラー（ＮＫ）細胞、樹状細胞（ＤＣ）、胎盤幹細胞（例えば、その開示全体が参照によって本明細書に組み込まれる、米国特許第７，４６８，２７６号明細書；第８，０５７，７８８号明細書及び第８，２０２，７０３号明細書に開示されている胎盤幹細胞）、臍帯血、胎盤血、末梢血、骨髄、歯髄、脂肪組織、骨軟骨組織などに由来する間葉様幹細胞；胚性幹細胞、胚性生殖細胞、神経堤幹細胞、神経幹細胞、及び分化細胞（例えば、線維芽細胞など）が挙げられるが、これらに限定されない。ホーミング受容体はまた、例えば、動物モデル実験を目的として腫瘍細胞株で使用されてよい。
【００６５】
特定の実施形態では、本明細書で提供されるポリペプチドを含む細胞は、Ｔ細胞である。本明細書で提供されるポリペプチドを含むＴ細胞は、ナイーブＴ細胞またはＭＨＣ拘束性Ｔ細胞であってよい。ある種の実施形態では、Ｔ細胞は、腫瘍浸潤リンパ球（ＴＩＬ）である。ある種の実施形態では、Ｔ細胞は、腫瘍生検材料から単離されている、または腫瘍生検材料から単離されたＴ細胞から増殖されている。ある種のその他の実施形態では、Ｔ細胞は、末梢血、臍帯血、もしくはリンパ液から単離されている、またはそれらから増殖されたＴ細胞から増殖される。
【００６６】
ある種の実施形態では、本方法で使用される免疫細胞、例えばＴ細胞は、Ｔ細胞が投与される個体にとって自己由来のものである。ある種の実施形態では、Ｔ細胞は、Ｔ細胞が投与される個体にとって同種異系のものである。同種異系Ｔ細胞がＴ細胞を調製するために使用される場合、個体における移植片対宿主病（ＧＶＨＤ）の可能性を減少させるだろうＴ細胞を選択することが好ましい。例えば、ある種の実施形態では、ウイルス特異的Ｔ細胞がＴ細胞の調製のために選択されると；このようなリンパ球は、任意のレシピエント抗原に結合し、それゆえ抗原によって活性化されるようになる本来の能力が大幅に減少すると予想されるだろう。ある種の実施形態では、同種異系Ｔ細胞のレシピエントによる拒絶は、１種以上の免疫抑制剤、例えばシクロスポリン、タクロリムス、シロリムス、シクロホスファミドなどの宿主への共投与によって減少され得る。
【００６７】
一実施形態では、Ｔ細胞を個体から入手し、次いで場合により増殖させて、次いで１種以上のホーミング受容体をコードするポリヌクレオチド、及び場合により１種以上のＣＡＲ（複数可）をコードする１種以上のポリヌクレオチドで形質転換し、次いで場合により増殖させる。別の実施形態では、Ｔ細胞を個体から入手し、次いで場合により増殖させて、次いで１種以上のホーミング受容体をコードするポリヌクレオチド、及び場合により１種以上のＣＡＲ（複数可）をコードする１種以上のポリヌクレオチドで形質転換し、次いで場合により増殖させる。ポリヌクレオチドのいずれかを含有する細胞は、１種以上の選択可能マーカーを使用して選択されてよい。
【００６８】
ある種の実施形態では、本明細書で提供されるＴ細胞のいずれも、天然のＴＣＲ複合体を形成することができる天然のＴＣＲタンパク質、例えばＴＣＲ−α及びＴＣＲ−βを発現する、またはこれらを含む。ある種のその他の実施形態では、Ｔ細胞のＴＣＲ−α及びＴＣＲ−βをコードする天然遺伝子の一方または両方が非機能的となるように改変される（例えば、一部分または全てが欠失される、突然変異が挿入されるなど）。
【００６９】
ある種の実施形態では、本明細書で提供されるＴ細胞のいずれも、腫瘍病変から単離されるもの、例えば腫瘍浸潤リンパ球であり；このようなＴ細胞は、ＴＳＡまたはＴＡＡに特異的であると予想される。
【００７０】
Ｔ細胞、ならびにＣＤ３ζシグナル伝達ドメイン及びＣＤ２８共刺激ドメインを含むポリペプチドを含むＴ細胞は、ＣＤ３及びＣＤ２８に対する抗体、例えばビーズに、または細胞培養プレートの表面に結合した抗体を使用して増殖され得；例えば、米国特許第５，９４８，８９３号明細書；第６，５３４，０５５号明細書；第６，３５２，６９４号明細書；第６，６９２，９６４号明細書；第６，８８７，４６６号明細書；及び第６，９０５，６８１号明細書を参照のこと。
【００７１】
ある種の実施形態では、抗原及び／または抗体は、Ｔ細胞が培養される培地中に遊離した状態で存在し得る、または一方もしくは両方が、固体支持体、例えば組織培養プラスチック表面、ビーズなどに結合され得る。
【００７２】
４．７．ホーミング受容体を含む細胞を使用する方法
一態様では、本明細書内の他の箇所に記載されているような１種以上のホーミング受容体及び場合により１種以上のＣＡＲを含む、本明細書で提供される細胞、例えばＴ細胞は、本明細書に記載される細胞によって標的とすることが望ましい１種以上の細胞型、例えば、死滅させるべき１種以上の細胞型を有する個体を処置するために使用される。ある種の実施形態では、死滅させるべき細胞は、癌細胞、例えば腫瘍細胞である。特定の実施形態では、癌細胞は、固形腫瘍の細胞である。特定の実施形態では、細胞は、リンパ腫、肺癌、乳癌、前立腺癌、副腎皮質癌腫、甲状腺癌腫、上咽頭癌腫、黒色腫、例えば、悪性黒色腫、皮膚癌腫、結腸直腸癌腫、類腱腫、線維形成性小円形細胞腫瘍、内分泌腫瘍、ユーイング肉腫、末梢性未分化神経外胚葉性腫瘍、固形胚細胞腫瘍、肝芽腫、神経芽細胞腫、非横紋筋肉腫軟部組織肉腫、骨肉腫、網膜芽細胞腫、横紋筋肉腫、ウィルムス腫瘍、膠芽腫、粘液腫、線維腫、脂肪腫などの細胞である。より特定の実施形態では、リンパ腫は、慢性リンパ性白血病（小リンパ性リンパ腫）、Ｂ細胞前リンパ性白血病、リンパ形質細胞性リンパ腫、ワルデンシュトレームマクログロブリン血症、脾臓辺縁帯リンパ腫、形質細胞性骨髄腫、形質細胞腫、節外性辺縁帯Ｂ細胞リンパ腫、ＭＡＬＴリンパ腫、節性辺縁帯Ｂ細胞リンパ腫、濾胞性リンパ腫、マントル細胞リンパ腫、びまん性大細胞型Ｂ細胞リンパ腫、縦隔（胸腺）大細胞型Ｂ細胞リンパ腫、血管内大細胞型Ｂ細胞リンパ腫、原発性滲出液リンパ腫、バーキットリンパ腫、Ｔ細胞前リンパ性白血病、Ｔ細胞大顆粒リンパ性白血病、侵攻性ＮＫ細胞白血病、成人Ｔ細胞白血病／リンパ腫、節外性ＮＫ／Ｔ細胞リンパ腫、鼻型、腸症型Ｔ細胞リンパ腫、肝脾Ｔ細胞リンパ腫、芽球性ＮＫ細胞リンパ腫、菌状息肉腫、セザリー症候群、原発性皮膚未分化大細胞リンパ腫、リンパ腫様丘疹症、血管免疫芽球性Ｔ細胞リンパ腫、末梢性Ｔ細胞リンパ腫（非特定型）、未分化大細胞リンパ腫、ホジキンリンパ腫、または非ホジキンリンパ腫であり得る。
【００７３】
ある種の実施形態では、本明細書に記載される改変細胞、例えば改変Ｔ細胞は、それを必要とする対象に投与されると、結果として選択されたホーミング受容体の組み合わせが、細胞、例えばＴ細胞が投与された患者集団（または亜集団）と適合するようになる。例えば、ホーミング受容体の組み合わせは、患者に存在する腫瘍型または癌型に基づいて選択される。
【００７４】
特定の実施形態では、腸管ホーミング受容体を発現するＴ細胞は、腸管腫瘍または癌を有する患者に投与される。ある種の実施形態では、腸管腫瘍または癌は、食道癌、胃癌、肝臓癌、胆嚢癌、膵臓癌、結腸直腸癌、または肛門癌である。特定の実施形態では、Ｔ細胞は、腸管腫瘍または癌と関連する抗原に結合する細胞外ドメインを有するＣＡＲをさらに含む。
【００７５】
その他の特定の実施形態では、皮膚ホーミング受容体を発現するＴ細胞は、皮膚腫瘍または癌を有する患者に投与される。ある種の実施形態では、皮膚腫瘍または癌は、黒色腫、基底細胞癌腫、または扁平上皮癌腫である。特定の実施形態では、Ｔ細胞は、皮膚腫瘍または癌と関連する抗原に結合する細胞外ドメインを有するＣＡＲをさらに含む。特定の実施形態では、ホーミング受容体を含むＴ細胞は、患者の腫瘍細胞または癌細胞で発現される抗原に結合する細胞外ドメインを有するＣＡＲも含む。
【００７６】
このような細胞、例えばＴ細胞によって治療可能な疾患または障害を有する個体、例えば癌を有する個体への投与後における細胞、例えばＴ細胞の有効性は、特定の疾患または障害に特有であって当業者には既知の、疾患または障害の進行を示す１つ以上の基準により評価され得る。一般に、このような個体への細胞の投与は、基準のうち１つ以上が、疾患状態の値もしくは範囲から正常値もしくは正常範囲に、またはそれらに向かって検出可能に、例えば有意に移行する場合、効果的である。
【００７７】
ある種の実施形態では、細胞、例えばＴ細胞は、薬学的に許容される溶液中で製剤化される。好ましい実施形態では、薬学的に許容される溶液は、生細胞の送達に好適である。特定の実施形態では、薬学的に許容される溶液は、例えば、生理食塩水（リンゲル液など）、ゼラチン、炭水化物（例えば、ラクトース、アミロース、デンプンなど）、脂肪酸エステル、ヒドロキシメチルセルロース、またはポリビニルピロリジンである。より特定の実施形態では、薬学的に許容される溶液は、細胞の添加前に滅菌される。その他のより特定の実施形態では、薬学的に許容される溶液は、補助剤、例えば潤滑剤、防腐剤、安定剤、乳化剤、浸透圧に影響を及ぼす塩、緩衝剤、及び着色剤などと混合されてよい。細胞の製剤化における使用に好適な医薬担体は、当該技術分野において既知であり、例えば、ＷＯ９６／０５３０９に記載されている。
【００７８】
ある種の実施形態では、細胞、例えばＴ細胞は、個別用量に製剤化され、この個別用量は、少なくとも、多くとも、または約１×１０４個、５×１０４個、１×１０５個、５×１０５個、１×１０６個、５×１０６個、１×１０７個、５×１０７個、１×１０８個、５×１０８個、１×１０９個、５×１０９個、１×１０１０個、５×１０１０個、または１×１０１１個のＴ細胞を含む。ある種の実施形態では、細胞、例えばＴ細胞は、個別用量に製剤化され、この個別用量は、１×１０４〜５×１０４個、５×１０４〜１×１０５個、１×１０５〜５×１０５個、５×１０５〜１×１０６個、１×１０６〜５×１０６個、５×１０６〜１×１０７個、１×１０７〜５×１０７個、５×１０７〜１×１０８個、１×１０８〜５×１０８個、５×１０８〜１×１０９個、１×１０９〜５×１０９個、５×１０９〜１×１０１０個、１×１０１０〜５×１０１０個、または５×１０１０〜１×１０１１個のＴ細胞の範囲を含む。ある種の実施形態では、細胞は、静脈内、動脈内、非経口、筋肉内、皮下、髄腔内、もしくは眼内投与、または特定の器官もしくは組織内への投与のために製剤化される。
【実施例】
【００７９】
５．実施例
５．１．実施例１：マウスＣＸＣＲ５＋ＣＡＲ  Ｔ細胞の生成及びインビボ研究
Ｔ細胞をＢ６  Ｔｈｙ１．１マウスの脾臓から入手する。ヒト化マウス抗ヒトＣＥＡ−ｓｃＦｖまたは抗ヒトＨＥＲ２−ｓｃＦｖならびにマウス共刺激細胞内ドメイン及びＣＤ３ζを含むキメラ抗原受容体（ＣＡＲ）を含むレンチウイルス構築物を生成する。ＣＡＲ  Ｔ細胞の検証を、マウスＣＸＣＬ１３走化性アッセイによる表現型の特徴付け及び機能的評価により行う。
【００８０】
インビボアッセイでは、マウスＣＸＣＲ５＋ＣＡＲ  Ｔ細胞の活性をＣＸＣＲ５−ＣＡＲ  Ｔ細胞及び非形質導入Ｔ細胞の活性と比較する。ＣＥＡ＋腸管腫瘍（またはＨＥＲ２＋乳房腫瘍）を自然に発症し得るヒトＣＥＡ（またはＨＥＲ２）トランスジェニックマウスを対象として使用する。細胞の養子移入を１回以上の用量で静脈内投与によって行う。
【００８１】
流入領域リンパ節（ＣＥＡトランスジェニックマウスの腸間膜リンパ節またはＨＥＲ２トランスジェニックマウスの腋窩リンパ節）における養子移入したＣＡＲ  Ｔ細胞の位置を検査するために、読み取りアッセイを流入領域リンパ節の免疫組織化学により行う。動物を犠牲死させて流入領域リンパ節を同定する。リンパ節を湾曲鉗子で掴み、引き抜いて結合した組織から離す。リンパ節を最適切削温度化合物内に包埋し、ドライアイス上で凍結して、次いで−８０℃で保存する。凍結切片を切削し、空気乾燥してアセトンで固定する。切片をウサギ（またはヤギ）血清を用いて室温でプレインキュベートし、その後に一次抗体（ラット抗マウスＣＤ３、ＣＤ８、ＣＤ４、ビオチン化マウス抗マウスＴｈｙ−１．１、ビオチン化ヤギ−抗ヒトＩｇＧ（Ｈ＋Ｌ））、及びビオチン化ウサギ（またはヤギ）抗ラットＩｇＧ（マウス吸着）、続いてアビジン−ペルオキシダーゼ（または蛍光色素）複合体でインキュベートする。次いで、切片を発色のためにペルオキシダーゼの基質でインキュベートする。免疫組織化学染色結果の画像を、共焦点顕微鏡を使用して得る。ドナーＴ細胞を抗マウスＴｈｙ１．１により同定し、ＣＡＲ  Ｔ細胞を抗ヒトＩｇＧで同定する。
【００８２】
流入領域リンパ節における抗原特異的免疫応答の確立を検査するために、読み取りアッセイを流入領域リンパ節から単離したＣＡＲ  Ｔ細胞のフローサイトメトリーにより行う。表面マーカーのＴｈｙ１．１、抗ヒトＩｇＧ、ＣＸＣＲ５、ＣＤ６９、及びＨＬＡ−ＤＲの表現型の特徴付けを実施する。ＣＤ６９は、活性化Ｔ細胞のマーカーである。ＨＬＡ−ＤＲは、抗原提示細胞のマーカーである。ＣＡＲ  Ｔ細胞の増殖、Ｋｉ６７発現、及び数値化をアッセイする機能的評価を行う。サイトカイン産生を、刺激時の細胞内サイトカイン染色により評価する。
【００８３】
腫瘍部位におけるＣＡＲ  Ｔ細胞の腫瘍殺傷活性を検査するために、腫瘍体積及び生存をアッセイする。腫瘍の体積を、外部キャリパーによりインビボで決定する。最大縦径（長さ）及び最大横径（幅）を決定する。キャリパー測定値に基づく腫瘍体積を、修正した楕円式：腫瘍体積＝１／２（長さ×幅２）により計算する。
【００８４】
５．２．実施例２：ヒトＣＸＣＲ５＋ＣＡＲ  Ｔ細胞の生成
Ｔ細胞をヒトＰＢＭＣから入手する。ヒト化マウス抗ヒトＣＥＡ−ｓｃＦｖまたは抗ヒトＨＥＲ２−ｓｃＦｖならびにヒト共刺激細胞内ドメイン及びＣＤ３ζで構成されるキメラ抗原受容体（ＣＡＲ）を含むレンチウイルス構築物を生成し、これを使用してＴ細胞に形質導入し、ＣＥＡ特異的ＣＡＲ  Ｔ細胞の集団を作製する。ＣＡＲ  Ｔ細胞を、ヒトＣＸＣＲ５をコードする核酸配列を含有するレンチウイルスベクターでさらに形質導入し；ＣＸＣＲ５を発現するＣＡＲ  Ｔ細胞をさらなる研究のために選択する。ＣＡＲ  Ｔ細胞の検証を、ヒトＣＸＣＬ１３走化性アッセイによる表現型の特徴付け及び機能的評価により行う。
【００８５】
５．３．実施例３：マウス腸管ホーミングＣＡＲ  Ｔ細胞の生成及びインビボ研究
Ｔ細胞をマウスの脾臓から入手する。ＣＡＲ  Ｔ細胞を、ヒト化マウス抗ヒトＣＥＡ−ｓｃＦｖならびにマウス共刺激細胞内ドメイン及びＣＤ３ζを含むＣＡＲをコードするヌクレオチド配列を含有する、上に記載されているようなレンチウイルス構築物を使用して生成する。腸管ホーミング受容体を、マウスＣＣＲ９及びα４β７核酸配列のレンチウイルス形質導入により導入する。レチノイン酸処理をＴ細胞活性化中に実施する。ＣＡＲ  Ｔ細胞の検証を、マウスＴＥＣＫ（胸腺発現ケモカイン、またはＣＣＬ２５）走化性アッセイ（Ｂｉｎｇｅｒ，ｅｔ  ａｌ．，２００９，Ｅｘｐｅｒｉｍｅｎｔａｌ  Ｃｅｌｌ  Ｒｅｓｅａｒｃｈ  ３１５：１４６８−７９）による表現型の特徴付け及び機能的評価により行う。ＴＥＣＫに対する走化性応答を、９６マルチウェル形式走化性プレートにおいて５μｍ孔径のポリカーボネート膜を使用して評価する。欠乏培地中にＴＥＣＫを含有する下部ウェルを膜によって上部ウェルから分離する。欠乏培地中のＴ細胞を上部ウェルに播種し、３７℃で２０時間インキュベートする。膜の上部に残った非遊走細胞を除去する。遊走した細胞を固定し、染色して顕微鏡で数を数える、または計数ビーズを用いてフローサイトメトリーにより数を数える。ケモカインを含まない欠乏培地を用いて陰性対照を実施し、１０％ＦＢＳを含有する細胞培養用の培地を用いて陽性対照を実施する。
【００８６】
インビボアッセイでは、ＣＥＡ＋腸管腫瘍を自然に発症し得るヒトＣＥＡトランスジェニックマウスを対象として使用する。細胞の養子移入を１回以上の用量で静脈内投与によって行う。
【００８７】
定着した腸管腫瘍における養子移入したＣＡＲ  Ｔ細胞の位置を検査するために、読み取りアッセイを腸管の免疫組織化学により行う。動物を屠殺して腸管を除去する。小腸を浸漬固定前に４〜５つに切断する。切片をウサギ（またはヤギ）血清を用いて室温でプレインキュベートし、その後に一次抗体（ラット抗マウスＣＤ３、ビオチン化マウス抗マウスＴｈｙ−１．１、ビオチン化ヤギ−抗ヒトＩｇＧ（Ｈ＋Ｌ））、及びビオチン化ウサギ（またはヤギ）抗ラットＩｇＧ（マウス吸着）、続いてアビジン−ペルオキシダーゼ（または蛍光色素）複合体でインキュベートする。次いで、切片を発色のためにペルオキシダーゼの基質でインキュベートする。免疫組織化学染色結果の画像を、顕微鏡を使用して得る。ドナーＴ細胞を抗マウスＴｈｙ１．１により同定し、ＣＡＲ  Ｔ細胞を抗ヒトＩｇＧで同定する。組織中の遊走したＣＡＲ  Ｔ細胞を検出するために腸管のｑＲＴ−ＰＣＲまたはＰＣＲも実施する。
【００８８】
腸管における抗原特異的免疫応答の確立を検査するために、読み取りアッセイを腸管から単離したＣＡＲ  Ｔ細胞のフローサイトメトリーにより行う。表面マーカーのＴｈｙ１．１、抗ヒトＩｇＧ、ＣＣＲ９、α４β７、ＣＤ６９、及びＨＬＡ−ＤＲの表現型の特徴付けを実施する。ＣＡＲ  Ｔ細胞の増殖、Ｋｉ６７発現、及び数値化をアッセイする機能的評価を行う。サイトカイン産生を、刺激時の細胞内サイトカイン染色により評価する。
【００８９】
腫瘍部位におけるＣＡＲ  Ｔ細胞の腫瘍殺傷活性を検査するために、腫瘍体積及び生存をアッセイする。
【００９０】
５．４．実施例４：ヒト腸管ホーミングＣＡＲ  Ｔ細胞の生成
Ｔ細胞をヒトＰＢＭＣから入手する。ＣＡＲ  Ｔ細胞の生成を、ヒト化マウス抗ヒトＣＥＡ−ｓｃＦｖならびにマウス共刺激細胞内ドメイン及びＣＤ３ζを含むＣＡＲを使用して実施する。ＣＡＲ  Ｔ細胞を、ヒトＣＣＲ９及びα４β７をコードする核酸配列を含有するレンチウイルスベクターでさらに形質導入し；これらのタンパク質の両方を発現するＣＡＲ  Ｔ細胞をさらなる研究のために選択する。その後のＴ細胞活性化中において、これらの２つのタンパク質を発現するが、レチノイン酸とは接触させないＣＡＲ  Ｔ細胞と比較した場合に、ＣＣＲ９及びα４β７のレベルが増加するようにＣＡＲ  Ｔ細胞をレチノイン酸と接触させる。ＣＡＲ  Ｔ細胞の検証を、ヒトＴＥＣＫ走化性アッセイによる表現型の特徴付け及び機能的評価により行う。
【００９１】
５．５．実施例５：マウス皮膚ホーミングＣＡＲ  Ｔ細胞の生成及びインビボ研究
Ｔ細胞をマウス脾臓から入手する。ＣＡＲ  Ｔ細胞の生成を、ヒト化マウス抗ヒトＨＭＷ−ＭＡＡ−ｓｃＦｖならびにマウス共刺激細胞内ドメイン及びＣＤ３ζを含むＣＡＲを使用して実施する。ＣＡＲ  Ｔ細胞を、ヒトＣＣＲ１０もしくはＣＣＲ４、及び／またはＣＬＡをコードする核酸配列を含有するレンチウイルスベクターでさらに形質導入し；これらのタンパク質の両方を発現するＣＡＲ  Ｔ細胞をさらなる研究のために選択する。ＣＡＲ  Ｔ細胞の検証を、マウスＣＣＬ２７走化性アッセイによる表現型の特徴付け及び機能的評価により行う。ＣＣＬ２７に対する走化性応答を、９６マルチウェル形式走化性プレートにおいて５μｍ孔径のポリカーボネート膜を使用して評価する。欠乏培地中にＣＣＬ２７を含有する下部ウェルを膜によって上部ウェルから分離する。欠乏培地中のＴ細胞を上部ウェルに播種し、３７℃で２０時間インキュベートする。膜の上部に残った非遊走細胞を除去する。遊走した細胞を固定し、染色して顕微鏡で数を数える、または計数ビーズを用いてフローサイトメトリーにより数を数える。ケモカインを含まない欠乏培地を用いて陰性対照を実施し、１０％ＦＢＳを含有する細胞培養用の培地を用いて陽性対照を実施する。
【００９２】
インビボアッセイでは、ＨＭＷ−ＭＡＡを発現するヒト黒色腫細胞株を移植した免疫不全マウスを対象として使用する。細胞を複数回用量の静脈内投与で養子移入により投与する。
【００９３】
定着した黒色腫における養子移入したＣＡＲ  Ｔ細胞の位置を検査するために、読み取りアッセイを免疫組織化学により行う。ドナーＴ細胞を抗ＣＤ３により同定し、ＣＡＲ  Ｔ細胞を抗マウスＩｇＧで同定する。組織中の遊走したＣＡＲ  Ｔ細胞を検出するためにｑＲＴ−ＰＣＲまたはＰＣＲも実施する。
【００９４】
黒色腫における抗原特異的免疫応答の確立を検査するために、読み取りアッセイを黒色腫から単離したＣＡＲ  Ｔ細胞のフローサイトメトリーにより行う。表面マーカーのＣＤ３、抗マウスＩｇＧ、ＣＣＲ１０（またはＣＣＲ４）、ＣＬＡ、ＣＤ６９、及びＨＬＡ−ＤＲの表現型の特徴付けを実施する。ＣＡＲ  Ｔ細胞の増殖、Ｋｉ６７発現、及び数値化をアッセイする機能的評価を行う。サイトカイン産生を、刺激時の細胞内サイトカイン染色により評価する。
【００９５】
腫瘍部位におけるＣＡＲ  Ｔ細胞の腫瘍殺傷活性を検査するために、腫瘍体積及び生存をアッセイする。
【００９６】
５．６．実施例６：ヒト皮膚ホーミングＣＡＲ  Ｔ細胞の生成
Ｔ細胞をヒトＰＢＭＣから入手する。ＣＡＲ  Ｔ細胞の生成を、ヒト化マウス抗ヒトＨＭＷ−ＭＡＡ−ｓｃＦｖならびにヒト共刺激細胞内ドメイン及びＣＤ３ζで構成されるＣＡＲを使用して実施する。腸管ホーミング受容体を、ヒトＣＣＲ１０またはＣＣＲ４、及びＣＬＡ核酸配列のレンチウイルス形質導入により導入する。１，２５（ＯＨ）２ＶＤ３及びＩＬ−１２による処置をＴ細胞活性化中に実施する。ＣＡＲ  Ｔ細胞の検証を、実施例５におけるようなヒトＣＣＬ２７走化性アッセイによる表現型の特徴付け及び機能的評価により行う。
【００９７】
５．７．実施例７：腸管腫瘍の処置
個体は、腸管腫瘍、例えば大腸腺腫性ポリポーシスを呈している。個体由来の腫瘍細胞の試験により、腫瘍細胞がＣＥＡを発現することが判明している。Ｔ細胞を個体から入手し、キメラ抗原受容体（ＣＡＲ）をコードするヌクレオチド配列を含むレンチウイルスベクターでトランスフェクトし、ヒトＣＣＲ９及び／またはα４β７核酸配列をコードするヌクレオチド配列を含む第２レンチウイルスベクターでトランスフェクトする。Ｔ細胞を、ＣＤ３＋ＣＤ２８−コーティングビーズを使用し、レチノイン酸の存在下において投与に十分な数まで増殖させる。キメラ受容体は、ＣＥＡに結合する細胞外抗原結合領域；膜貫通ドメイン；ＣＤ２８由来の細胞内共刺激ドメイン；及び細胞内ＣＤ３ζドメインを含む。個体に２００ｍＬの生理食塩水中、１０９〜１０１０個のＴ細胞を静脈内注入によって３０分間にわたり投与する。個体を腸管腫瘍のステージ及びリンパ節への転移について再評価し、生検した腸管組織の組織学を投与後３０日、６０日、及び９０日で実施する。
【００９８】
５．８．実施例８：黒色腫の処置
個体は、黒色腫を呈している。個体由来の腫瘍細胞の試験により、腫瘍細胞がＨＭＷ−ＭＡＡを発現することが判明している。Ｔ細胞を個体から入手し、キメラ抗原受容体（ＣＡＲ）をコードするヌクレオチド配列を含むレンチウイルスベクターでトランスフェクトし、ヒトＣＣＲ１０（またはＣＣＲ４）及びＣＬＡ核酸配列をコードするヌクレオチド配列を含む第２レンチウイルスベクターでトランスフェクトする。Ｔ細胞を、ＣＤ３＋ＣＤ２８−コーティングビーズを使用し、１，２５（ＯＨ）２ＶＤ３及びＩＬ−１２の存在下において投与に十分な数まで増殖させる。キメラ受容体は、ＨＭＷ−ＭＡＡに結合する細胞外抗原結合領域；膜貫通ドメイン；ＣＤ２８由来の細胞内共刺激ドメイン；及び細胞内ＣＤ３ζドメインを含む。個体に２００ｍＬの生理食塩水中、１０９〜１０１０個のＴ細胞を静脈内注入によって３０分間にわたり投与する。個体を黒色腫のステージ及びリンパ節への転移について再評価し、生検した皮膚組織の組織学的検査を投与後３０日、６０日、及び９０日で実施する。
【００９９】
等価物
本開示は、本明細書に記載される特定の実施形態により範囲が限定されるべきではない。事実、記載されているものに加えて、本明細書で提供される主題の様々な修正が、前述の記載から当業者には明らかとなるだろう。このような修正は、添付の特許請求の範囲内であることを意図する。
【０１００】
様々な刊行物、特許及び特許出願が本明細書で引用され、それらの開示全体が参照によって組み込まれる。
【０１０１】
本発明のＴ細胞は、本明細書に開示される方法に使用するためのものである。
【手続補正書】
【提出日】平成29年5月26日(2017.5.26)
【手続補正１】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】配列表
【補正方法】追加
【補正の内容】
【配列表】
2017524365000001.app
【国際調査報告】
2017524365.tif 000045
2017524365.tif 000046
2017524365.tif 000047
2017524365.tif 000048