(57)【要約】【課題】本発明は、腫瘍学的及び神経学的障害を含めた、種々の疾患及び障害に対して治療有益性を提供する、ジンクフィンガードメインを破壊することに関する新規のアプローチを対象とする。【解決手段】  本発明は、少なくとも１つのパーキンリガーゼジンクフィンガーを破壊する化合物の治療有効量をそれを必要とする対象に投与する工程によってパーキンリガーゼを活性化する方法及び組成物を対象とする。本発明はまた、パーキンリガーゼの活性化に関連した疾患又は状態の発症を処置する及び／又は低減させる方法も対象とする。【選択図】図１【特許請求の範囲】
【請求項１】
少なくとも１つのパーキンリガーゼジンクフィンガーを破壊する化合物の治療有効量をそれを必要とする対象に投与する工程を含み、前記化合物が亜鉛イオンと配位結合することができ、及び／又はシステインと結合又は反応することができる、パーキンリガーゼを活性化する方法。
【請求項２】
前記活性化されたパーキンリガーゼが１つ又は複数の腫瘍の増殖を抑制する及び／又は１つ又は複数の腫瘍の転移を予防する、請求項１に記載の方法。
【請求項３】
前記活性化されたパーキンリガーゼがドーパミンニューロンの保護をもたらす、請求項１に記載の方法。
【請求項４】
前記化合物が、損傷したミトコンドリアを排除すること、細胞ストレス時に細胞生存率を高めること、腫瘍の形質転換を低下させること、及び細胞のアルファ−シヌクレインを軽減することからなる群からから選択される１つ又は複数の機能を有する、請求項２に記載の方法。
【請求項５】
前記対象ががんであると診断されている、請求項２に記載の方法。
【請求項６】
前記がんが、膠芽腫、小細胞肺癌、乳がん又は前立腺がんである、請求項５に記載の方法。
【請求項７】
前記対象が神経変性疾患であると診断されている、請求項３に記載の方法。
【請求項８】
前記神経変性疾患がパーキンソン病、認知症、筋萎縮性側索硬化症（ALS）及びハンチントン舞踏病である、請求項７に記載の方法。
【請求項９】
前記認知症が、レビー小体（DLB）、多系統萎縮症（MSA）又は進行性核上性麻痺（PSP）を伴う認知症である、請求項８に記載の方法。
【請求項１０】
前記亜鉛イオンに配位結合し得る化合物が、一座配位子、二座配位子、又は三座配位子である、請求項１に記載の方法。
【請求項１１】
前記亜鉛イオンに配位結合し得る化合物が、パーキンリガーゼ中の少なくとも１つのジンクフィンガーの構造を実質的に破壊する、請求項１０に記載の方法。
【請求項１２】
前記少なくとも１つのジンクフィンガーのアミノ酸残基が、ヒトパーキンリガーゼのＲ０のアミノ酸１４１〜２１６、ＩＢＲのアミノ酸３２８〜３７７、及びＲ２のアミノ酸４１５〜４６５からなる群から選択される１つ又は複数のドメインに対応するか又はこれらの中でアライメントをとる、請求項１１に記載の方法。
【請求項１３】
前記少なくとも１つのジンクフィンガーが４つのシステイン残基を含む、請求項１２に記載の方法。
【請求項１４】
パーキンリガーゼの活性化がユビキチン化を変化させる、請求項１に記載の方法。
【請求項１５】
前記化合物が、アルキル化剤、酸化剤、ミカエル受容体、別の不飽和構造物である、及び／又はジスルフィドを有する、請求項１に記載の方法。
【請求項１６】
前記化合物が、前記パーキンリガーゼ中の少なくとも１つのジンクフィンガーの構造を実質的に破壊する、請求項１５に記載の方法。
【請求項１７】
前記少なくとも１つのジンクフィンガーのアミノ酸残基が、ヒトパーキンリガーゼのＲ０のアミノ酸１４１〜２１６、ＩＢＲのアミノ酸３２８〜３７７、及びＲ２のアミノ酸４１５〜４６５からなる群から選択される１つ又は複数のドメインに対応するか又はこれらの中でアライメントをとる、請求項１６に記載の方法。
【請求項１８】
前記ジンクフィンガーが４つのシステイン残基を含む、請求項１７に記載の方法。
【請求項１９】
前記パーキンリガーゼを活性化させる工程が、アルツハイマー認知症、パーキンソン病、ハンチントン舞踏病、筋萎縮性側索硬化症（ALS）、フリードライヒ運動失調症、脊髄小脳変性症、多系統萎縮症、ＰＳＰ、タウオパチー、びまん性レビー小体病、レビィ小体痴呆、α−シヌクレインの異常蓄積を特徴とする任意の障害、老化プロセスの障害、脳卒中、細菌感染症、ウイルス感染症、ミトコンドリア関連疾患、精神遅滞、難聴、盲目、糖尿病、肥満、心血管疾患、多発性硬化症、シェーグレン症候群、ループス、偽落屑緑内障を含めた緑内障、レーバー遺伝性視神経萎縮症、及びリューマチ性関節炎からなる群から選択される１つ又は複数の疾患又は病気の発症を処置するか又は低減させる、請求項１に記載の方法。
【請求項２０】
前記細菌感染症がマイコバクテリウム感染症である、請求項１９に記載の方法。 
【請求項２１】
前記ウイルス感染症がＣ型肝炎感染症である、請求項１９に記載の方法。  
【請求項２２】
前記ミトコンドリア関連疾患が、アルパース病、バース症候群／ＬＩＣ（致命的な乳児性心筋症）、β酸化欠陥、カルニチン−アシル−カルニチン欠損症、カルニチン欠損症、クレアチン欠損症症候群、コエンザイムＱ１０欠損症、複合体Ｉ欠損症、複合体ＩＩ欠損症、複合体ＩＩＩ欠損症、複合体ＩＶ欠損症／ＣＯＸ欠損症、複合体Ｖ欠損症、ＣＰＥＯ、ＣＰＴ  Ｉ欠損症、ＣＰＴ  ＩＩ欠損症、ＫＳＳ、乳酸アシドーシス、ＬＢＳＬ−白質ジストロフィー、ＬＣＡＤ、ＬＣＨＡＤ、リー病又は症候群、ルフト病、ＭＡＤ／グルタル酸尿症ＩＩ型、ＭＣＡＤ、ＭＥＬＡＳ、ＭＥＲＲＦ、ＭＩＲＡＳ、ミトコンドリア細胞症、ミトコンドリアＤＮＡ欠失、ミトコンドリア脳症、ミトコンドリアミオパシー、ＭＮＧＩＥ、ＮＡＲＰ、ピアソン症候群、ピルビン酸カルボキシラーゼ欠損症、ピルビン酸デヒドロゲナーゼ欠損症、ＰＯＬＧ突然変異体、呼吸鎖関連疾患、ＳＣＡＤ、ＳＣＨＡＤ及びＶＬＣＡＤからなる群の１つ又は複数から選択される、請求項１９に記載の方法。
【請求項２３】
少なくとも１つのパーキンリガーゼジンクフィンガーを破壊する化合物又はその塩の有効量及び薬学的に許容される担体を含み、前記化合物又はその塩が亜鉛イオンと配位結合することができ、及び／又はシステインと結合又は反応することができる、対象においてパーキンリガーゼを活性化する医薬組成物。
【請求項２４】
固体、粉末、液体及びゲルからなる群から選択される製剤中に存する、請求項２３に記載の医薬組成物。
【請求項２５】
前記化合物が表１、表２の化合物、ＡＨ００１及び／又はＡＨ００７からなる群から選択される、請求項２３に記載の医薬組成物。
【請求項２６】
前記化合物がシステインのチオール基と結合するか又は反応する、請求項１に記載の方法。
【請求項２７】
前記システインがヒトパーキンリガーゼのＣ５９及びＣ３７７からなる群の１つ又は複数から選択される、請求項１に記載の方法。
【請求項２８】
前記システインがヒトパーキンリガーゼのＣ３７７である、請求項１に記載の方法。
【請求項２９】
前記化合物が、
【化１】
2017538699.tif 000040
又はその薬学的に許容される塩である、請求項１に記載の方法。
【請求項３０】
前記少なくとも１つのジンクフィンガーのアミノ酸残基が、ヒトパーキンリガーゼのＣ５９及びＣ３７７からなる群から選択される１つ又は複数のアミノ酸に対応するか又はこれらの中でアライメントをとる、請求項１６に記載の方法。
【請求項３１】
前記少なくとも１つのジンクフィンガーのアミノ酸残基が、ヒトパーキンリガーゼのＣ３７７に対応するか又はこれとアライメントをとる、請求項１６に記載の方法。
【請求項３２】
前記化合物が、ＩＢＲドメイン（アミノ酸３２８〜３７７）中に存在する少なくとも１つのジンクフィンガーの構造を実質的に破壊する、請求項１７に記載の方法。
【請求項３３】
パーキンリガーゼを活性化する上で、リン酸化ユビキチン（ｐＵＢ）と相乗的に作用する化合物を、それを必要とする対象に投与する工程を含む、パーキンリガーゼを活性化する方法。
【請求項３４】
前記化合物の治療有効量が少なくとも１つのパーキンリガーゼジンクフィンガーを破壊し、前記化合物が亜鉛イオンと配位結合することができ、及び／又はシステインと結合又は反応することができる、請求項３３の方法。
【請求項３５】
前記化合物が、前記パーキンリガーゼ中の少なくとも１つのジンクフィンガーの構造を実質的に破壊する、請求項３３に記載の方法。
【請求項３６】
前記少なくとも１つのジンクフィンガーのアミノ酸残基が、ヒトパーキンリガーゼのＲ０のアミノ酸１４１〜２１６、ＩＢＲのアミノ酸３２８〜３７７、及びＲ２のアミノ酸４１５〜４６５からなる群から選択される１つ又は複数のドメインに対応するか又はこれらの中でアライメントをとる、請求項３５に記載の方法。
【請求項３７】
前記化合物が、ＩＢＲドメイン（アミノ酸３２８〜３７７）中に存在する少なくとも１つのジンクフィンガーの構造を実質的に破壊する、請求項３６に記載の方法。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
関連出願の相互参照 
[1]  本出願は、それらの開示全体が参照により本明細書に組み込まれる、２０１５年１０月５日に出願された米国仮出願第６２／２３７，４００号、２０１５年９月２２日に出願された米国仮出願第０２／２２２，００８号、及び２０１４年１２月５日に出願された米国仮出願第６２／０８７，９７２号の優先権の利益を主張するものである。
【０００２】
[2]  本発明は、治療上の有益性のために、ジンクフィンガードメインを破壊することによりパーキンリガーゼを活性化する方法に関する。
【背景技術】
【０００３】
[3]  ユビキチン−プロテアソーム経路系（UPS）は、重要な調節タンパク質を調節し、ミスフォールドしたタンパク質又は異常なタンパク質を分解する、極めて重要な経路である。ＵＰＳは、複数の細胞プロセスにとって中心的なものであり、欠陥又は不均衡があると、種々の疾患の病因を招く。ユビキチンによるタンパク質の翻訳後修飾は、生物学のほとんどあらゆる面から、タンパク質安定性及び活性を調節し、多くの機能の基盤となる基本的な細胞機構である。特定のタンパク質基質へのユビキチンの共有結合はＥ３ユビキチンリガーゼの作用により実現される。これらのリガーゼは、５００を超える様々なタンパク質を含み、それらのＥ３機能活性の構造的要素が規定する複数のクラスに分類される。具体的には、ＨＥＣＴリガーゼ及びＲＩＮＧリガーゼの双方が、活性化ユビキチンをチオエステルから基質上のリジン残基のｅ−アミノ基に転移させるが、ＨＥＣＴリガーゼはユビキチンと中間体チオエステル結合を形成する活性部位システインを有し、一方、ＲＩＮＧリガーゼはＥ２から基質へのユビキチンの直接転移を可能にする足場として機能する。近年の証拠は、ＲＩＮＧリガーゼのサブファミリー、ＲＩＮＧ−ｂｅｔｗｅｅｎ−ＲＩＮＧ（RBR）ファミリーが、標準ＲＩＮＧドメインに加えて触媒システイン残基１、２を含有することができることを示唆している。（Rileyら  2013. Nat Commun. 4:1982、「Rileyら」、全体が参照により本明細書に組み込まれている。）
【０００４】
[4]  脱ユビキチン化タンパク質及びユビキチン特異的プロテアーゼ（DUB及びUSP）及びＥ３リガーゼはＵＰＳにおいて決定的な役割を果たす。これらのタンパク質は、特殊化した官能基に対するユビキチン（Ub）の結合を安定化させる融通性のあるジンクフィンガー（Znf）によってサポートされる。
【０００５】
[5]  パーキンは、特定の基質へのユビキチンの共有結合の際に機能するＲＩＮＧ−ｂｅｔｗｅｅｎ−ＲＩＮＧ  Ｅ３リガーゼであり、パーキンにおける変異は、パーキンソン病、がん及びマイコバクテリウム感染症に関係する。パーキンについての個々のＲＩＮＧドメインは、Ｚｎイオンを配位結合させる特定の残基並びに古典的なＥ２結合ドメインを規定する標準的なＲＩＮＧクロスブレース構造に対するそれらの関係性について、多くの議論の対象とされてきた。Ｒ０は、新規ドメイン構造であるが、Ｅ３ＲＩＮＧドメインよりもジンクフィンガードメインにより類似している（Rileyら  2013. Nat Commun. 4:1982）。
【０００６】
[6]  多くの薬物発見プログラムがＵＰＳに集中しているが、一方、酵素的タンパク質の活性部位に対する選択性及びその部位への直接的なアクセスを欠いていたので、ほとんど成功しなかった。本発明は、腫瘍学的及び神経学的障害を含めた、種々の疾患及び障害に対して治療有益性を提供する、ジンクフィンガードメインを破壊することに関する新規のアプローチを対象とする。
【発明の概要】
【発明が解決しようとする課題】
【０００７】
[7]  本発明は、治療有益性のために、リガーゼのＺｎＦドメイン中の亜鉛イオン及び／又はシステイン残基に結合することによって、ＵＰＳにおけるリガーゼの構造及び／又は機能を調整することに関する。この機構は、Ｕｂの尾部を受ける、リガーゼの活性部位への結合とは、はっきりと異なる。本発明は、低分子をパーキンＺｎＦドメイン中の亜鉛イオンに配位結合させることによって、又は低分子をパーキンＺｎＦドメイン中のシステイン残基と化学的に反応させることによって、パーキンリガーゼを活性化する方法を対象とする。亜鉛イオンへの低分子の配位結合はＺｎＦドメインから亜鉛イオンを脱離させても脱離させなくてもよい。低分子とシステイン残基との化学反応は可逆的であってもまた非可逆的であってもよい。
【課題を解決するための手段】
【０００８】
[8]  本発明の特定の実施形態にはパーキンリガーゼを活性化する方法が含まれる。特定の一実施形態では、パーキンリガーゼは、少なくとも１つのパーキンリガーゼジンクフィンガーを破壊する化合物の治療有効量を対象に投与する工程によって活性化され得る。別の実施形態では、化合物はＺｎイオンと配位結合することができ、及び／又はシステインと結合又は反応することができる。ある特定の一実施形態では、化合物はシステインのチオール基と反応することができる。
【０００９】
[9]  別の実施形態では、活性化されたパーキンリガーゼは１つ又は複数の腫瘍を抑制する。別の特定の実施形態では、活性化されたパーキンリガーゼはドーパミンニューロンの保護をもたらす。
【００１０】
[10]  Ｚｎイオンに配位結合することができる化合物としては、それらに限定されないが、一座配位子、二座配位子、又は三座配位子がある。システイン残基中のチオール基と反応することができる化合物としては、それらに限定されないが、アルキル化剤、酸化剤、ミカエル受容体、別の不飽和構造物、又はジスルフィドがある。
【００１１】
[11]  特定の実施形態では、化合物は、損傷したミトコンドリアを排除し、細胞ストレス時に細胞生存率を高め、腫瘍の形質転換を低下させ及び／又は細胞のアルファ−シヌクレインを軽減する。ある特定の実施形態では、対象はがんであると診断されている。ある特定の実施形態では、がんは、膠芽腫、小細胞肺癌、乳がん又は前立腺がんである。
【００１２】
[12]  一部の実施形態では、患者は神経変性疾患であると診断されている。
【００１３】
[13]  特定の実施形態では、神経変性疾患はパーキンソン病、認知症、筋萎縮性側索硬化症（ALS）又はハンチントン舞踏病である。さらなる実施形態では、認知症は、レビー小体（DLB）、多系統萎縮症（MSA）又は進行性核上性麻痺（PSP）を伴う認知症である。
【００１４】
[14]  本発明の他の実施形態では、化合物は、パーキンリガーゼ中の少なくとも１つのジンクフィンガーの構造を実質的に破壊する。ある特定の実施形態では、少なくとも１つのジンクフィンガーは、Ｒ０のアミノ酸１４１〜２１６、ＩＢＲのアミノ酸３２８〜３７７、及びＲ２のアミノ酸４１５〜４６５が規定するドメインからなる群の１つ又は複数から選択される。ある特定の一実施形態では、少なくとも１つのジンクフィンガーのアミノ酸残基は、ヒトパーキンリガーゼのＲ０のアミノ酸１４１〜２１６、ＩＢＲのアミノ酸３２８〜３７７、及びＲ２のアミノ酸４１５〜４６５からなる群から選択される１つ又は複数のドメインに対応するか又はこれらの中でアライメントをとる。さらなる実施形態では、ジンクフィンガーは４つのシステイン残基を含む。特定の一実施形態では、化合物は亜鉛キレート剤であってもよい。
【００１５】
[15]  別の特定の実施形態では、化合物は１つ又は複数のシステイン残基と結合することができるか又は反応することができる。別の特定の実施形態では、化合物は、ヒトパーキンリガーゼのＣ５９及びＣ３７７からなる群から選択される１つ又は複数のシステイン残基と結合することができるか又は反応することができる。
【００１６】
[16]  一実施形態では、化合物はパーキンリガーゼ中の少なくとも１つのジンクフィンガーの構造を実質的に破壊する。別の実施形態では、パーキンリガーゼ中のジンクフィンガーは、ヒトパーキンリガーゼのＲ０のアミノ酸１４１〜２１６、ＩＢＲのアミノ酸３２８〜３７７、及びＲ２のアミノ酸４１５〜４６５からなる群から選択される１つ又は複数のドメイン内に存在することができる。別の特定の実施形態では、実質的に破壊されているジンクフィンガーはパーキンリガーゼのＩＢＲのアミノ酸３２８〜３７７中に存在する。
【００１７】
[17]  別の実施形態では、化合物は、パーキンリガーゼを活性化する上で、リン酸化ユビキチン（ｐＵＢ）と相乗的に作用することができる。
【００１８】
[18]  ある特定の実施形態では、パーキンリガーゼの活性化がユビキチン化を変化させる。
【００１９】
[19]  別の実施形態では、パーキンリガーゼを活性化させる工程が、アルツハイマー認知症、パーキンソン病、ハンチントン舞踏病、筋萎縮性側索硬化症（ALS）、フリードライヒ運動失調症、脊髄小脳変性症、多系統萎縮症、ＰＳＰ、タウオパチー、びまん性レビー小体病、レビィ小体痴呆、α−シヌクレインの異常蓄積を特徴とする任意の障害、老化プロセスの障害、脳卒中、細菌感染症、ウイルス感染症、ミトコンドリア関連疾患、精神遅滞、難聴、盲目、糖尿病、肥満、心血管疾患、多発性硬化症、シェーグレン症候群、ループス、偽落屑緑内障を含めた緑内障、レーバー遺伝性視神経萎縮症、及びリューマチ性関節炎からなる群から選択される１つ又は複数の疾患又は病気の発症を処置するか又は低減させる。
【００２０】
[20]  特定の一実施形態では、細菌感染症はマイコバクテリウム感染症である。別の特定の実施形態では、ウイルス感染症はＣ型肝炎感染症である。別の特定の実施形態では、ミトコンドリア関連疾患は、アルパース病、バース症候群／ＬＩＣ（致命的な乳児性心筋症）、β酸化欠陥、カルニチン−アシル−カルニチン欠損症、カルニチン欠損症、クレアチン欠損症症候群、コエンザイムＱ１０欠損症、複合体Ｉ欠損症、複合体ＩＩ欠損症、複合体ＩＩＩ欠損症、複合体ＩＶ欠損症／ＣＯＸ欠損症、複合体Ｖ欠損症、ＣＰＥＯ、ＣＰＴ  Ｉ欠損症、ＣＰＴ  ＩＩ欠損症、ＫＳＳ、乳酸アシドーシス、ＬＢＳＬ−白質ジストロフィー、ＬＣＡＤ、ＬＣＨＡＤ、リー病又は症候群、ルフト病、ＭＡＤ／グルタル酸尿症ＩＩ型、ＭＣＡＤ、ＭＥＬＡＳ、ＭＥＲＲＦ、ＭＩＲＡＳ、ミトコンドリア細胞症、ミトコンドリアＤＮＡ欠失、ミトコンドリア脳症、ミトコンドリアミオパシー、ＭＮＧＩＥ、ＮＡＲＰ、ピアソン症候群、ピルビン酸カルボキシラーゼ欠損症、ピルビン酸デヒドロゲナーゼ欠損症、ＰＯＬＧ突然変異体、呼吸鎖関連疾患、ＳＣＡＤ、ＳＣＨＡＤ及びＶＬＣＡＤからなる群の１つ又は複数から選択される
【００２１】
[21]  本発明の別の実施形態には、がんの発症を処置する及び／又は低減させる方法が含まれる。特定の一実施形態には、少なくとも１つのパーキンリガーゼジンクフィンガーを破壊し且つパーキンリガーゼの活性を誘導する化合物の治療有効量を、それを必要とする対象に投与する工程が含まれ、ここで、化合物はＺｎイオンと配位結合することができ、及び／又はシステイン中のチオール基と反応することができる。別の特定の実施形態では、パーキンリガーゼを活性化する工程が１つ又は複数の腫瘍を抑制する。別の実施形態では、化合物は損傷したミトコンドリアを排除し、細胞ストレス時に細胞生存率を高め、腫瘍の形質転換を低下させ及び／又は細胞のα−シヌクレインを軽減する。別の実施形態では、がんは、膠芽腫、小細胞肺癌、乳がん又は前立腺がんである。
【００２２】
[22]  本発明の別の実施形態には、パーキンソン病の発症を処置する及び／又は低減させる方法が含まれる。パーキンソン病の発症を処置する及び／又は低減させるための特定の一実施形態には、少なくとも１つのパーキンリガーゼジンクフィンガーを破壊し且つパーキンリガーゼの活性を誘導する化合物の治療有効量を、それを必要とする対象に投与する工程が含まれ、ここで、化合物はＺｎイオンと配位結合することができ、及び／又はシステイン中のチオール基と反応することができる。
【００２３】
[23]  一部の実施形態では、パーキンリガーゼ活性化は、ユビキチンの共有結合により基質タンパク質を修飾するパーキンの能力によって規定されるような、ユビキチン化を変化させ、基質タンパク質は、パーキンそれ自身、又はミトフュージョン１若しくは２などの別のタンパク質、ＦＢＷ７又はパーキンリガーゼの他の公開されている基質である。
【００２４】
[24]  本発明の別の実施形態には、医薬製剤が含まれる。特定の一実施形態では、医薬製剤はパーキンリガーゼを活性化する。別の特定の実施形態では、医薬製剤は、少なくとも１つのパーキンリガーゼジンクフィンガーを破壊する化合物若しくはその塩の有効量及び薬学的に許容される担体を含むことができ、ここで、化合物又はその塩はＺｎイオンと配位結合することができ、及び／又はシステイン中のチオール基と反応することができる。別の特定の実施形態では、化合物は、ヒトパーキンリガーゼのＣ５９及びＣ３７７からなる群から選択される１つ又は複数のシステイン残基と結合することができるか、又は反応することができる。特定の一実施形態では、医薬組成物は固体、粉末、液体及びゲルからなる群から選択される製剤中に存する。
【図面の簡単な説明】
【００２５】
【図１】[25]Ｎ，Ｎ‘−（１−フェニル−１Ｈ−１，２，４−トリアゾール−３，５−ジイル）ジベンズアミド、キレート剤化合物（AH001と特定又は表２の化合物７６）が、活性部位反応型ユビキチンビニルスルフォンプローブでのパーキンリガーゼ反応を高めることを示す図である。
【図２】[26]６−ベンジル−２，５−ジメチル−３−フェニルピラゾロ［１，５−ａ］ピリミジン−７−チオール、求電子剤及びキレート剤化合物（AH007と特定又は表２の化合物７７）が、活性部位反応型ユビキチンビニルスルフォンプローブでのパーキンリガーゼ反応を高めることを示す図である。
【図３】[27]化合物Ｎ，Ｎ‘−（１−フェニル−１Ｈ−１，２，４−トリアゾール−３，５−ジイル）ジベンズアミド、キレート剤化合物（AH001）が、自己ユビキチン化アッセイにおいてパーキン活性を高めることを示す図である。
【図４Ａ】[28]ｐＵＢを伴うＮ‘−（１−フェニル−１Ｈ−１，２，４−トリアゾール−３，５−ジイル）ジベンズアミド（AH001）が、自己ユビキチン化アッセイにおいてパーキン活性を相乗的に高め、低濃度のｐＵＢによるパーキンの活性化を可能とすることを示す図である。
【図４Ｂ】[28]ｐＵＢを伴うＮ‘−（１−フェニル−１Ｈ−１，２，４−トリアゾール−３，５−ジイル）ジベンズアミド（AH001）が、自己ユビキチン化アッセイにおいてパーキン活性を相乗的に高め、低濃度のｐＵＢによるパーキンの活性化を可能とすることを示す図である。
【図５】[29]６−ベンジル−２，５−ジメチル−３−フェニルピラゾロ［１，５−ａ］ピリミジン−７−チオール、求電子剤化合物（AH007）が、自己ユビキチン化アッセイにおいてパーキン活性を高めることを示す図である。
【発明を実施するための形態】
【００２６】
[30]  刊行物、特許及び特許出願すべては、その中の図面及び付属書を含めた、各個々の刊行物、特許若しくは特許出願、図面又は付属書が具体的に且つ個々にあらゆる目的で全体として参照によって本明細書に組み入れられることが指示された場合と同じ程度に、あらゆる目的で全体として参照によって本明細書に組み入れられる。
【００２７】
定義
[31]  薬学上許容される塩には、塩基として機能する活性化合物を無機酸又は有機酸と反応させて塩を、例えば、塩酸塩、硫酸塩、リン酸塩、メタンスルホン酸塩、カンファースルホン酸塩、シュウ酸塩、マレイン酸塩、コハク酸塩、クエン酸塩、ギ酸塩、臭化水素酸塩、安息香酸塩、酒石酸塩、フマル酸塩、サリチル酸塩、マンデル酸塩、炭酸塩等を形成することによって得られるものが挙げられる。当業者であればさらに、酸付加塩を、いくつかの公知の方法のいずれかにより当該化合物を適当な無機酸又は有機酸と反応させることよって調製してもよいことを認識するであろう。
【００２８】
[32]  「処置する」という用語は、対象における状態の少なくとも１つの症状を緩和すること、和らげること、遅延させること、低減させること、反転すること、改善すること又は管理することの１つ又は複数を意味する。「処置する」という用語はまた、発病（すなわち、状態の臨床症状に先立つ期間）を停止すること、遅延させること、又は状態を進行させる又は悪化させるリスクを低減させることの１つ又は複数も意味し得る。
【００２９】
[33]  「有効量」は、ある状況、障害又は状態を処置するために患者に投与した際、そのような処置を達成するのに十分である、本発明に記載の製剤の量を意味する。「有効量」は、活性成分、状況、障害又は処置される状態及びその重症度、及び処置される哺乳類の年齢、体重、身体状態及び応答性によって異なるであろう。
【００３０】
[34]  用量又は量に対して適用される「治療上有効な」という用語は、それを必要とする患者に投与した後、所望の臨床的利益を生じるのに十分な、化合物又は医薬製剤のその量を指す。
【００３１】
[35]  本明細書で参照される重量パーセント（すなわち、「重量％」及び「ｗｔ．％」及びｗ／ｗ）はすべて、特に指示されない限り、医薬組成物の総重量に対して測定されている。
【００３２】
[36]  本明細書で使用されるとき、「実質的に」又は「実質的な」は、作用、特徴、特性、状況、構造、品目（item）又は結果の完全な又はほぼ完全な程度又は度合いを指す。例えば、「実質的に」内包されている物体は、物体が完全に内包されている又はほぼ完全に内包されていることのいずれかを意味する。絶対的な完全性からの偏差の正確な許容される度合いは、場合によっては、特定の状況に左右され得る。しかし、一般的にいえば、達成の近似とは、絶対的で且つ全体的な達成が得られた場合と同じ全体的な結果が得られるようにすることである。「実質的に」の使用は、作用、特徴、特性、状況、構造、品目又は結果の完全な又はほぼ完全な欠損を指す否定的な意味合いに使用される場合も同等に適用可能である。例えば、他の活性剤を「実質的に含まない」組成物は、他の活性剤を完全に欠いているか又は、他の活性剤を完全に欠いている場合と効果が同一であるように他の活性剤をほぼ完全に欠いている。言い換えれば、ある成分又は要素又は別の活性剤を「実質的に含まない」組成物は、測定可能なその効果がない限り、そのような品目をなお含有してもよい。
【００３３】
[37]  本明細書で使用するとき、２つ以上のタンパク質／アミノ酸配列の「アライメント」は、ｗｗｗ．ｅｂｉ．ａｃ．ｕｋ／Ｔｏｏｌｓ／ｍｓａ／ｃｌｕｓｔａｌｗ２／で入手可能である、アライメントプログラムＣｌｕｓｔａｌＷ２を使用して行われ得る。ペアワイズアライメントに対して次のデフォルトパラメータを使用することができる：タンパク質重み行列＝Ｇｏｎｎｅｔ；ギャップ開始＝１０；ギャップ伸長＝０．１。
【００３４】
[38]  本明細書で使用する「ユビキチン−プロテアソーム経路系（UPS）」は、ユビキチン−プロテアソーム経路に関連し、酵母から哺乳動物までに保存され、真核細胞においてほとんどの短寿命のタンパク質を標的とした分解に必要である。標的としては、制御された細胞分裂のためにタイムリーな破壊が極めて重要な細胞周期調節タンパク質、並びに小胞体内で適切に折りたたむことができないタンパク質が挙げられる。ユビキチン修飾は、３種の酵素によって行われるＡＴＰ依存性プロセスである。「ユビキチン活性化酵素」（E1）は、高度に保存された７６個のアミノ酸のタンパク質であるユビキチンとチオエステル結合を形成する。この反応により、ユビキチンの「ユビキチン結合酵素」（E2）へのその後の結合が可能となり、続いてユビキチンのカルボキシ末端と基質タンパク質上のリジン残基の間のイソペプチド結合を形成する。後者の反応は、「ユビキチンリガーゼ」（E3）を必要とする。Ｅ３リガーゼは、単一サブユニット酵素又は多サブユニット酵素であることができる。場合によっては、ユビキチン結合ドメイン及び基質結合ドメインは、アダプタータンパク質又は淘汰によって結合させられる別々のポリペプチド上に存在する。多数のＥ３リガーゼは、それぞれが基質タンパク質のサブセットのみを修飾することができるという点において特異性をもたらす。さらなる特異性が、それに限定されないが、リン酸化を含めた基質タンパク質の翻訳後修飾によって実現される。モノユビキチン化の影響には、細胞内局在化における変化がある。しかし、ポリユビキチン鎖を生じる複数回のユビキチン化サイクルが、分解のためにタンパク質をプロテアソームに標的化するのに必要である。多サブユニット２６Ｓプロテアソームは、ポリユビキチン化された基質を認識し、折りたたみを解いて、小ペプチドへと分解する。反応はプロテアソーム複合体の円筒状コア内で起こり、ペプチド結合加水分解において触媒求核剤としてコアトレオニン残基が用いられる。多ユビキチン鎖受容体の形態で、複合体のさらなる層が、ポリユビキチン化ステップと分解ステップとの間に介在する可能性があることが示された。これらの受容体は、ポリユビキチン化基質のサブセットと反応し、２６Ｓプロテアソームによる基質の認識を助け、それによって基質の分解を促進する。この経路は、細胞恒常性においてのみならず、ヒト疾患においても重要である。ユビキチン／プロテアソーム依存性の分解が細胞分裂周期及び細胞増殖の制御において用いられることが多いことから、プロテアソーム阻害剤が潜在的ながん治療薬に発展することが期待されていることを、研究者らは見出していた。
【００３５】
[39]  ユビキチン−プロテアソーム系によるタンパク質分解は、細胞内タンパク質の非リソソームタンパク質分解の主要経路である。この系は、細胞周期の進行、分裂、発生及び分化、アポトーシス、細胞輸送の調節、並びに免疫応答及び炎症応答の調整などの、種々の基本的な細胞プロセスにおいて重要な役割を演じている。この系の中心的要素は標的タンパク質に対するユビキチンの共有結合による連結（covalent linkage）であり、次いで、このタンパク質は２６Ｓプロテアソーム、すなわちアデノシン三リン酸依存性、多触媒性プロテアーゼによって認識される。この分解プロセスの標的の内に、損傷した、酸化した、又はミスフォールドしたタンパク質並びに多数の極めて重要な細胞機能を制御する調節タンパク質がある。このシステムの異常が、細胞恒常性の調節障害及び複数の疾患の発症を招く（Wangら,  Cell Mol Immunol. 2006 Aug; 3（4）:255-61）。
【００３６】
[40]  本明細書で使用される「パーキンリガーゼ」又は「パーキン」は、ヒトにおいてＰＡＲＫ２遺伝子によってコードされるタンパク質に関連する（Kitada T, Asakawa S, Hattori N, Matsumine H, Yamamura Y, Minoshima S, Yokochi M, Mizuno Y, Shimizu N （1998年4月）. 「Mutations in the parkin gene cause autosomal recessive juvenile parkinsonism」. Nature 392 （6676）: 605-608. doi:10.1038/33416. PMID 9560156.  Matsumine H, Yamamura Y, Hattori N, Kobayashi T, Kitada T, Yoritaka A, Mizuno Y （1998年4月）. 「A microdeletion of D6S305 in a family of autosomal recessive juvenile parkinsonism （PARK2）」. Genomics 49 （1）: 143-146. doi:10.1006/geno.1997.5196. PMID 9570960）。このタンパク質は、多重タンパク質のＥ３ユビキチンリガーゼ複合体の構成成分であり、この複合体は、分解のためのタンパク質標的化を媒介するユビキチン−プロテアソーム系の一部である。ＰＡＲＫ２遺伝子における突然変異は、常染色体劣性若年性パーキンソン病（AR-JP）として公知の家族型のパーキンソン病を引き起こすことが知られている。
【００３７】
[41]  本明細書で使用する「リガーゼ」は、２つ以上の化合物又は生体分子を、新しい化学結合でこれらを一緒に結合させることによって合体させることを触媒することができる酵素である。その２つのものの「ライゲーション」とは、より大きな化合物又は生体分子の１つに従属している小さな化学基の加水分解を通常伴っている反応であり、又はこの酵素は２つの化合物を一緒に連結させることを触媒し、例えば、Ｃ−Ｏ、Ｃ−Ｓ、Ｃ−Ｎ基などの合体を触媒する酵素である。ユビキチン−タンパク質（E3）リガーゼは、ユビキチン化に向けたタンパク質を選択する高度に多様な酵素の大きなファミリーである。
【００３８】
[42]  「Ｕｂリガーゼ」は、腫瘍学、炎症及び感染性疾患に関する病因に関与している。Ｅ３リガーゼに関してＲＩＮＧ−ｂｅｔｗｅｅｎ−ＲＩＮＧ（ＲＢＲ）ファミリーに属するＥ３リガーゼは、標準的なＲＩＮＧドメインと通常ＨＥＣＴ  Ｅ３リガーゼに限定されている触媒的システイン残基との双方を含み、「ＲＩＮＧ／ＨＥＣＴハイブリッド型」酵素と名付けられた。パーキンにおける変異は、パーキンソン病、がん及びマイコバクテリウム感染症に関係している。パーキンは、ミトコンドリアの完全性においてある役割を有する神経保護タンパク質と理解されている。ヒトの遺伝的データから、パーキンソン病（PD）の発病の機構としてパーキン活性の喪失の関与が示されている。
【００３９】
[43]  本明細書で使用する「ジンクフィンガー（ZnF）ドメイン」は、機能活性を安定化させるために亜鉛イオンを配位結合させることを特徴とするタンパク質構造に関連する。ＺｎＦは、ＵＰＳにおいてＵｂの結合、脱ユビキチン化酵素（DUB）、及びリガーゼ（E3）を安定化させる。
【００４０】
[44]  本明細書で使用する「配位子」は、配位子の１つ又は複数の原子によって金属に結合し、キレート配位子と称されることが多い。２つの部位を介して結合する配位子は、２座として分類され、３つの部位を介して結合するリガンドは、３座として分類される。「かみ合い角度」とは、二座配位キレートの２つの結合の間の角度を指す。キレート配位子は、有機リンカーによってドナー基を連結することで通常は形成される。古典的な二座配位子はエチレンジアミンであるが、このエチレンジアミンは２つのアンモニア基とエチレン（−ＣＨ２ＣＨ２−）リンカーとの連結によってもたらされる。多座配位子の古典的な例は六座キレート化剤EDTAであるが、これは６つの部位を介して結合することができ、いくつかの金属を完全に包囲する。キレート系の結合親和性は、キレート角度又はかみ合い角度によって左右される。通常、多くの配位子は２個以上の原子上に孤立電子対を有するので、複数の部位を介して金属イオンと結合することが可能である。一部の配位子が、同一原子を介するが異なる数の孤立電子対で金属中心に結合することができる。金属配位子結合の結合順序は、金属配位子結合角度（M-X-R）によって部分的に識別することができる。この結合角度は、その角度が曲がっている程度に関してさらに論議もあるが、線形である又は曲がっていると称されることが多い。例えば、イオン形態にあるイミド配位子は、３つの孤立電子対を有する。１つの孤立電子対はシグマＸドナーとして使用され、他の２つの孤立電子対はＬタイプのパイドナーとして利用可能である。双方の孤立電子対がπ結合において使用されている場合、Ｍ−Ｎ−Ｒの形状は線形である。しかし、これらの孤立電子対の一方又は双方が非結合性である場合、Ｍ−Ｎ−Ｒ結合は曲がっており、そしてこの曲がりの程度は、π結合がいくつそこに存在し得るかを語っている。窒素原子、酸素原子、及び硫黄原子などのいくつかのヘテロ原子が亜鉛と相互作用することがわかり、亜鉛とこれらのヘテロ原子との間の理想的な距離が決定された。カルボン酸塩は、一座配位相互作用及び二座配位相互作用の双方を介して亜鉛に結合したが、ヒドロキサメートは、主に二座配位様式で結合した。これらの結果は、標的タンパク質中の亜鉛と相互作用する可能性を有する新たな阻害剤の設計において助けとなる。事実上、あらゆる分子及びあらゆるイオンは、金属に対して配位子として働くことができる（又は金属「に配位結合」することができる）。一座配位子には、事実上すべての陰イオン及びすべての単純なルイス塩基が含まれる。したがって、ハロゲン化物及び擬ハロゲン化物は重要な陰イオン性配位子であり、一方、アンモニア、一酸化炭素、及び水は特に一般的な電荷中性配位子である。単純な有機化学種もまた、極めて一般的であり、それらはアニオン性で（ＲＯ−及びＲＣＯ２−）又は中性（Ｒ２Ｏ、Ｒ２Ｓ、Ｒ３−ｘＮＨｘ、及びＲ３Ｐ）であり得る。多座配位子の錯体は、キレート錯体と呼ばれる。これらは一座配位子に由来する錯体よりも安定である傾向にある。この高められた安定性、キレート効果は通常エントロピーの影響が原因とされ、このことは、多数の配位子を単一の多座配位子によって置換するのに好都合である。キレート��位子は、中心的原子を少なくとも部分的に包囲し且つこれに結合している大きな環を形成するとき、中心的原子を大きな環の中心に残す。その多座性がリジッドであればあるほど、高ければ高いほど、この大環状錯体はより不活性となる。
【００４１】
[45]  本明細書で使用する「キレート剤」は、キレート（金属原子又はイオンが、例えば、金属原子を含有するヘテロ環を形成するように、配位子上の２以上の点で配位子に結合している、配位結合化合物）を形成することによって化学活性を抑制する結合剤に関連する。
【００４２】
[46]  本明細書で使用する「キレート化」は、イオン及び分子が金属イオンと結合する特定の方法に関連する。国際純正応用化学連合（IUPAC）に準拠すると、キレート化には、多座（多重結合）配位子と単一の中心的原子との間の２つ以上の別個の配位結合の形成又は存在が関与する。通常、これらの配位子は有機化合物であり、キーラント（chelant）、キレート剤（chelator）、キレート化剤（chelating agent）、又は封鎖剤と呼ばれる。
【００４３】
[47]  本明細書で使用する「求電子剤」とは、電子が豊富な中心に引きつけられる種に関連する。化学において、求電子剤は電子に引きつけられる試薬である。求電子剤は、求核剤に結合するために電子対を受け入れることによって化学反応に参加する。求電子剤は電子を受容するので、ルイス酸である。ほとんどの求電子剤は、正に荷電しているか、部分的に正の電荷を保有する原子を有するか、又は電子の八重項を有さない原子を有する。
【００４４】
[48]  以下の説明には、本発明を理解する上で有用であり得る情報が含まれている。本明細書で提供されている情報のいずれもが先行技術であること又は現在請求されている発明に関連していること、あるいは具体的又は暗示的に参照されている出版物いずれもが先行技術であることを認めるものではない。
【００４５】
[49]  ユビキチン−タンパク質（E3）リガーゼは、ユビキチン化に向けて種々のタンパク質を選択する酵素の大きなファミリーである。「Ｕｂリガーゼ」と呼ばれる、これらのユビキチンリガーゼは、それらに限定されないが、がん、炎症及び感染性疾患を含めた、種々の疾患及び状態においてある役割を有することが知られている。
【００４６】
[50]  １つの特定のＵｂリガーゼはパーキンリガーゼである。パーキンリガーゼは、多重タンパク質の「Ｅ３」ユビキチンリガーゼ複合体の構成成分であり、この複合体は、分解のためタンパク質の標的化を媒介するユビキチン−プロテアソーム系の一部である。パーキンリガーゼの特定の機能は不明であるが、パーキンリガーゼにおける変異は、パーキンソン病、がん及びマイコバクテリウム感染症などの種々の疾患に関係している。したがって、パーキンリガーゼは治療介入向けの魅力的な目標である。
【００４７】
[51]  さらに、当分野で公知のリガーゼを調節するための種々の公知の方法が存在する。多くのリガーゼ、特にユビキチン−プロテアソーム経路系（UPS）に関与するリガーゼは、そのリガーゼ中の重要なタンパク質結合領域を安定化させるジンクフィンガー（ZnF）ドメインを有することが知られている。
【００４８】
[52]  ＺｎＦドメインは亜鉛イオンを配位結合させ、この配位結合はタンパク質の機能的活性を安定化させる。ＺｎＦドメインを備えるタンパク質によってもたらされる機能的活性として、ユビキチンの認識、ＤＮＡの調節、例えば転写及び修復、及び細胞レドックスセンサーとしての作用などの重要な細胞シグナル伝達経路の調節を挙げることができる。ＺｎＦドメインへ亜鉛が結合することは、又はただ単に亜鉛がＺｎＦドメインといかに相互作用するかを調節することは、ＵＰＳに関与しているリガーゼにとって必須である。
【００４９】
[53]  パーキンリガーゼは１つ又は複数のＺｎＦドメインを有することが知られている。本発明はパーキンリガーゼ中のＺｎＦドメインを調整するための２つの異なる方法に焦点を当てている。本発明の一つの戦略は、ＺｎＦドメインに結合し、したがって亜鉛の結合を許さない、又はＺｎＦドメインからＺｎ又はＺｎ２＋などの亜鉛の解離を引き起こすキレート化化合物を使用することを含む。
【００５０】
[54]  本発明の別の戦略は、ＺｎＦドメイン中のシステインアミノ酸残基と結合するか又はそれと反応する化合物を使用することを含む。１つ又は複数のシステイン残基（ヒスチジン残基の支援を伴う場合もある）が、亜鉛イオンへの結合のために及び／又はそれに配位結合するために、ＺｎＦドメイン中に必須である。亜鉛イオン（通常はＺｎ２＋）は複数のシステイン残基又はヒスチジン残基と配位結合することができる。ドメイン中に存在するシステイン残基が多ければ多いほど、ＺｎＦドメインにはより融通性がある。パーキンリガーゼなどのリガーゼは、そのＺｎＦドメイン中に亜鉛と配位結合している複数のシステイン残基を有すると考えられている。パーキンリガーゼのＺｎＦドメインにおけるこの融通性は、ドメインが可逆的であることを可能にすると考えられ、したがってパーキンリガーゼを調節するための考えられる１つの機構である。
【００５１】
[55]  したがって、本発明は、求電子性の特性、キレート化特性又は求電子性特性とキレート化特性との双方を持つ１つ又は複数の薬剤又は１つ又は複数の化合物の使用に関し、このような薬剤又は化合物は、亜鉛イオン及び／又はパーキンリガーゼ中のシステイン残基と相互作用することができ、したがってパーキンリガーゼの活性を調節する。具体的には、パーキンリガーゼのＺｎＦドメインの少なくとも１つにおいて亜鉛イオンが配位結合するのを許さないことで、その活性が誘導されると考えられる。したがって、本発明は、Ｚｎのキレート化に続いてＺｎＦドメインからのＺｎを除去することによって、又はＺｎを所定の位置に保持しているシステインアミノ酸での求電子攻撃を介してパーキンリガーゼを活性化する方法を対象とする。
【００５２】
[56]  したがって、本発明の一実施形態では、パーキンリガーゼを活性化する方法には、少なくとも１つのパーキンリガーゼジンクフィンガーを破壊する１つ又は複数の化合物の治療有効量を、それを必要とする対象に投与する工程が含まれる。別の実施形態において、パーキンリガーゼを活性化する方法には、少なくとも１つのパーキンリガーゼジンクフィンガーを破壊する２種以上の化合物を対象に投与する工程が含まれる。
【００５３】
[57]  特定の一実施形態では、本発明の化合物は、求電子剤又はキレート剤とすることができる。別の実施形態では、本発明の化合物は、求電子剤及びキレート剤の双方として機能することができる。例えば、本発明の化合物は、ある官能基がキレート化特性を有する複数の官能基、及び求電子特性を有するある官能基を含むことができる。
【００５４】
[58]  別の特定の実施形態では、化合物は表１及び表２の化合物又はそれらの塩若しくはエステルからなる群の１つ又は複数から選択される。特定の理論に制限されないが、表１又は表２の化合物の少なくとも一部はキレート剤、求電子剤又は双方であり得ると考えられる。例えば、表２からの化合物７６及び化合物９７はキレート剤として働くが、表２の化合物１１３はチオール反応性求電子剤として働くと考えられる。別の例では、表１及び表２からの化合物は求電子剤及び求核剤として双方として働くことができる。例えば、表２の化合物９１及び化合物１０７は、双方ともキレート剤であるが、チオール反応性求電子剤としてもおそらく働くことができる。したがって、別の特定の実施形態では、本発明の化合物は、表１及び表２の化合物又はそれらの塩若しくはエステルからなる群の１つ又は複数から選択される、求電子剤、キレート剤又は求電子剤及びキレート剤の双方である。
【００５５】
[59]  別の実施形態では、表１及び表２の化合物又はそれらの塩若しくはエステルは、パーキンリガーゼと結合し且つこれを活性化する。例えば、化合物Ｎ，Ｎ‘−（１−フェニル−１Ｈ−１，２，４−トリアゾール−３，５−ジイル）ジベンズアミド（AH001）、キレート剤化合物及び６−ベンジル−２，５−ジメチル−３−フェニルピラゾロ［１，５−ａ］ピリミジン−７−チオール（AH007）、求核剤及びキレート剤化合物の双方が独立して、活性部位反応型ユビキチンビニルスルフォンプローブでのパーキンリガーゼ反応を増加させる。実施例２〜３を参照されたい。したがって、キレート剤及び／又は求電子剤の双方が、パーキンリガーゼと結合し且つこれを活性化することができる。
【００５６】
[60]  別の実施形態では、化合物は、２−（４−ベンジルピペラジン−１−イル）−Ｎ−［（２−ヒドロキシ−３−プロプ−２−エニル−フェニル）メチリデンアミノ］アセトアミド（又はPac-1と呼ぶ）又はその塩若しくはエステルとすることができる。特定の理論に制限されないが、Ｐａｃ−１の構造は、下の表２で化合物１１４として提供されているが、キレート剤であると考えられ、パーキンリガーゼの反応を高める能力も有し得る。別の実施形態では、Ｐａｃ−１、又はその塩は、また、求電子剤であり得るし、及び／又はキレート剤及び求核剤の双方であり得る。
【００５７】
[61]  別の実施形態では、化合物はＰａｃ−１の誘導体又は類似体とすることができる。特定の一実施形態では、化合物は、それら開示の全体が参照により本明細書に組み込まれる、ＰＣＴ出願公開第ＷＯ２０１０／０９１３８２号、ＷＯ２０１３／１３１０８９号、ＷＯ２０１３／１２４４０７号、ＷＯ２０１４／０２２８５８号、米国出願公開第ＵＳ２０１５／０２１０６５９号、ＵＳ２０１５／０２３１１３２号、ＵＳ２０１４／００７３６０９号、ＵＳ２０１５００１７２６４号、ＵＳ２０１５／００９９７５９号、米国特許第８，９１６，７０５号、米国特許第９，１０２，６６１号、米国特許第８，５９２，５８４号、及び米国特許第８，７７８，９４５号、に記載の化合物とすることができる。
【００５８】
[62]  特定の一例では、活性部位反応型プローブアッセイ及び質量分光分析によって、表１及び／又は表２の一部の候補化合物がヒトパーキンリガーゼ中の複数のシステイン残基と結合又は反応することができることが示されている。例えば、質量分光分析によって、ＡＨ００７は、パーキンリガーゼの少なくともシステイン残基５９（Ｃ５９）及びシステイン残基３７７（Ｃ３７７）に結合することが示されている。
【００５９】
[63]  したがって、特定の一実施形態では、パーキンリガーゼを活性化する方法には、少なくとも１つのパーキンリガーゼジンクフィンガーを破壊する１つ又は複数の化合物の治療有効量を、それを必要とする対象に投与する工程が含まれる。特定の一実施形態では、１つ又は複数の化合物は、表１及び／又は表２から選択され、又はそれらの塩若しくはエステルである。別の実施形態では、化合物は、キレート剤であっても、求電子剤であっても、キレート剤及び求電子剤の双方であってもよい。
【００６０】
[64]  別の実施形態では、１つ又は複数の化合物は、Ｚｎイオンと配位結合することができ、及び／又は１つ又は複数のシステイン残基と結合することができるか又は反応することができる。特定の一実施形態では、Ｚｎイオンは、Ｚｎ＋イオンでもＺｎ２＋イオンでもいずれでもよい。別の実施形態では、Ｚｎイオンに配位結合することができる化合物は、一座配位子、二座配位子、又は三座配位子である。
【００６１】
[65]  別の実施形態では、化合物は、２つ以上のシステイン残基におけるチオール基と結合することができ、及び／又は反応することができる。別の実施形態では、化合物は、２つのシステイン残基におけるチオール基と結合することができ、及び／又は反応することができる。別の実施形態では、化合物は、３つのシステイン残基におけるチオール基と結合することができ、及び／又は反応することができる。別の実施形態では、化合物は、４つのシステイン残基におけるチオール基と結合することができ、及び／又は反応することができる。別の実施形態では、化合物は、ヒトパーキンリガーゼのアミノ酸１４１〜２２５、アミノ酸２３８〜２９３、アミノ酸３１３〜３７７、及びアミノ酸４１８〜４４９からなる群から選択される１つ又は複数のドメイン中の１つ又は複数のシステイン残基と結合することができ、及び／又は反応することができる。ｈｔｔｐ：／／ｗｗｗ．ｕｎｉｐｒｏｔ．ｏｒｇ／ｕｎｉｐｒｏｔ／Ｏ６０２６０を参照されたい。
【００６２】
[66]  別の特定の実施形態では、化合物は、ヒトパーキンリガーゼのＣ１８２、Ｃ２５８及びＣ３７７からなる群から選択される１つ又は複数のシステイン残基と結合することができるか又は反応することができる。別の特定の実施形態では、化合物は、ヒトパーキンリガーゼのＣ５９及びＣ３７７からなる群から選択される１つ又は複数のシステイン残基と結合することができるか又は反応することができる。特定の一実施形態では、化合物は、ヒトパーキンリガーゼのＣ３７７と反応することができる。別の特定の実施形態では、化合物はＡＨ００７である。
【００６３】
[67]  別の実施形態では、化合物は、パーキンリガーゼ、パーキンリガーゼ誘導体、又はパーキンリガーゼ相同体の１つ又は複数の残基から選択される１つ又は複数のシステイン残基と結合することができるか又は反応することができ、このようなシステイン残基はヒトパーキンリガーゼのＣ１８２、Ｃ２５８及び／又はＣ３７７に対応する又はそれらとアライメントをとる。別の実施形態では、化合物は、パーキンリガーゼ、パーキンリガーゼ誘導体、又はパーキンリガーゼ相同体の１つ又は複数の残基から選択される１つ又は複数のシステイン残基と結合することができるか又は反応することができ、このようなシステイン残基はヒトパーキンリガーゼのＣ５９及び／又はＣ３７７に対応する又はそれらとアライメントをとる。別の特定の実施形態では、化合物はＡＨ００７である。
【００６４】
[68]  ＩＢＲドメインは、パーキン活性の調節において重要な役割を演じることができるとも考えられている。Ｒ０ドメインは、上記のように、パーキンリガーゼを調節するための１つの考えられる機構に関与する可能性のある少なくとも１つのＺｎＦドメインを含むと考えられている。したがって、特定の一実施形態では、ＩＢＲドメイン中に存在する少なくとも１つのＺｎＦドメイン（アミノ酸３２８〜３７７）の構造は、それを必要とする対象に化合物を投与することによって実質的に破壊することができる。別の実施形態では、表１及び／又は表２から選択される１つ又は複数の化合物、又はそれらの塩若しくはエステルは、ＩＢＲドメイン（アミノ酸３２８〜３７７）中に存在する少なくとも１つのＺｎＦドメインの構造を実質的に破壊することができる。
【００６５】
[69]  別の実施形態では、化合物は、ＺｎＦドメイン中又は近傍の任意のヒスチジン残基を含めたシステイン残基と結合することができ、及び／又は反応することができる。
【００６６】
[70]  別の実施形態において、化合物は、パーキンリガーゼ中の少なくとも１つのジンクフィンガー（又はZnFドメイン）の構造を実質的に破壊することができる。別の実施形態において、本発明の化合物は、パーキンリガーゼ中の１つ又は複数のＺｎＦドメインを破壊することができる。
【００６７】
[71]  Ｒｉｌｅｙらは、Ｚｎ配位結合残基（表３（配列番号１）に提供され、且つhttp://www.ncbi.nlm.nih.gov/ nuccore/NM_004562.2において特定されるアミノ酸配列）を持つ複数の機能領域を含む、４６５個のアミノ酸のヒトパーキンリガーゼについて記載している。Ｒｉｌｅｙらは、Ｒ０、Ｒ１、ＩＢＲ及びＲ２と命名された４つのドメインについて論じている。以前、Ｒ０、Ｒ１及びＲ２は、ＲＩＮＧドメインと命名されていた。しかし、Ｒｉｌｅｙらは、Ｒ０、ＩＢＲ及びＲ２ドメインが実際の又は従前のＲＩＮＧドメインであるかどうか問題にしている：すなわち、「Ｒ０は新規ドメイン構造であるが、Ｅ３  ＲＩＮＧドメインに比べＺｎフィンガードメインにより類似している」。Ｒｉｌｅｙらはまた、ＩＢＲドメインもＲ２ドメインもどちらも、ＲＩＮＧドメインに通常伴うクロスブレース構造を有さないので、標準的なＲＩＮＧドメインモチーフに似ていないことも記述している。さらに、Ｒ０、ＩＢＲ及びＲ２のドメインの分析からは、これらの亜鉛中心に脆弱性がある可能性が示されている。したがって、Ｒ０、ＩＢＲ及びＲ２ドメインは、パーキンリガーゼの活性を調節するための理想的なドメイン候補となりそうである。Ｒ０、ＩＢＲ及びＲ２ドメインとは、それぞれヒトパーキンリガーゼのアミノ酸１４１〜２１６、アミノ酸３２８〜３７７及びアミノ酸４１５〜４６５をいう。
【００６８】
[72]  したがって、特定の一実施形態では、実質的に破壊され得る少なくとも１つのジンクフィンガーは、ヒトパーキンリガーゼのアミノ酸１４１〜２１６、アミノ酸３２８〜３７７、及びアミノ酸４１５〜４６５からなる群から選択される１つ又は複数のドメインに対応するか又はそれらとアライメントをとる。別の特定の実施形態では、少なくとも１つのジンクフィンガー由来のアミノ酸は、ヒトパーキンリガーゼ由来のＲ０、ＩＢＲ及びＲ２ドメインの１つ又は複数とのアライメントにおいて重複することができる。
【００６９】
[73]  別の特定の実施形態では、実質的に破壊され得る少なくとも１つのジンクフィンガーは、ヒトパーキンリガーゼのアミノ酸１４１〜２２５、アミノ酸２３８〜２９３、アミノ酸３１３〜３７７、及びアミノ酸４１８〜４４９からなる群から選択される１つ又は複数のドメインに対応するか、又はそれとアライメントをとる。ｈｔｔｐ：／／ｗｗｗ．ｕｎｉｐｒｏｔ．ｏｒｇ／ｕｎｉｐｒｏｔ／Ｏ６０２６０を参照されたい。
【００７０】
[74]  特定の一実施形態では、パーキンリガーゼ中のジンクフィンガーの少なくとも１つは、１、２、３又は４個のシステイン残基を含む。別の実施形態では、少なくとも１つのジンクフィンガーの破壊は、パーキンリガーゼの活性を誘導する。別の実施形態では、パーキンリガーゼ中のジンクフィンガーの少なくとも１つは、ヒトパーキンリガーゼのアミノ酸１４１〜２２５、アミノ酸２３８〜２９３、アミノ酸３１３〜３７７、及びアミノ酸４１８〜４４９由来の１、２、３又は４個のシステイン残基を含む。例えば、特定の一実施形態において、化合物は、ヒトパーキンリガーゼのＣ１８２、Ｃ２５８及びＣ３７７からなる群から選択される１つ又は複数のシステイン残基に結合すること又は反応することによって、１つ又は複数のジンクフィンガーと反応し、したがって破壊することができる。
【００７１】
[75]  本発明の方法にはまた、１つ又は複数の化合物の治療有効量をそれを必要とする対象に投与することによってパーキンリガーゼの自己ユビキチン化を活性化させる工程が含まれる。特定の一実施形態では、１つ又は複数の化合物は、少なくとも１つのパーキンリガーゼジンクフィンガーを破壊する。別の例では、表１及び／又は表２の化合物を使用して、パーキンリガーゼの自己ユビキチン化を活性化することができる。別の実施形態では、表１及び／又は表２の化合物を他の化合物に加えて使用して、パーキンリガーゼの自己ユビキチン化を活性化してもよい。例えば、パーキンの内因性細胞レギュレーターであるリン酸化ユビキチン（pUB）をパーキンリガーゼに添加してもよく、これによってパーキンリガーゼ及びその自己ユビキチン化を活性化することができる。一実施形態では、パーキンリガーゼを活性化する上でホスホユビキチン（pUB）と相乗的に作用する、表１及び／又は表２の１つ又は複数の化合物又はそれらの塩及びエステルを、それを必要とする対象に投与することができる。実施例５を参照されたい。別の実施形態では、１つ又は複数の化合物をｐＵＢとともに投与して、パーキンリガーゼの活性化及び／又はその自己ユビキチン化を相乗的に高めることができる。別の実施形態では、化合物は、キレート剤及び／又は求電子剤であってもよい。特定の一実施形態では、１つ又は複数の化合物は、表１及び／又は表２から選択され、又はそれらの塩若しくはエステルである。
【００７２】
[76]  別の特定の実施形態では、パーキンリガーゼを活性化させることによって、アルツハイマー認知症、パーキンソン病、ハンチントン舞踏病、筋萎縮性側索硬化症（ALS）、フリードライヒ運動失調症、脊髄小脳変性症、多系統萎縮症、ＰＳＰ、タウオパチー、びまん性レビー小体病、レビィ小体痴呆、α−シヌクレインの異常蓄積を特徴とする任意の障害、老化プロセスの障害、脳卒中、細菌感染症、ウイルス感染症、ミトコンドリア関連疾患、精神遅滞、難聴、盲目、糖尿病、肥満、心血管疾患、多発性硬化症、シェーグレン症候群、ループス、偽落屑緑内障を含めた緑内障、レーバー遺伝性視神経萎縮症、及びリューマチ性関節炎からなる群から選択される１つ又は複数の疾患又は病気の発症を処置するか又は低減させる。
【００７３】
[77]  特定の一実施形態では、細菌感染症はマイコバクテリウム感染症である。別の特定の実施形態では、ウイルス感染症は、ＨＩＶ、Ｂ型肝炎感染症又はＣ型肝炎感染症である。本発明の別の実施形態には、がんの発症を処置する及び／又は低減させる方法が含まれ、具体的には、少なくとも１つのパーキンリガーゼジンクフィンガーを破壊し且つパーキンリガーゼの活性を誘導する１つ又は複数の化合物の治療有効量をそれを必要とする対象に投与する工程が含まれる。特定の一実施形態では、活性化されたパーキンリガーゼは、１つ又は複数の腫瘍の増殖を抑制し、及び／又は１つ又は複数の腫瘍の転移を防止する。
【００７４】
[78]  別の実施形態では、がんは、急性リンパ芽球性白血病、急性骨髄性白血病、副腎皮質癌、ＡＩＤＳ関連がん、カポジ肉腫、リンパ腫、肛門がん、虫垂がん、星細胞腫、小児非定型奇形腫／骨芽細胞腫瘍、基底細胞癌、皮膚がん（非メラノーマ）、小児胆汁管がん、肝外膀胱がん、骨がん、ユーイング肉腫ファミリー腫瘍、骨肉腫及び悪性線維性組織球腫、脳幹グリオーマ、脳腫瘍、胚芽腫、胚細胞腫瘍、頭蓋咽頭腫、上衣腫、気管支腫瘍、バーキットリンパ腫（非ホジキンリンパ腫）、カルチノイド腫瘍、未知の原発性胃腸癌、心臓の（心臓）腫瘍、リンパ腫、原発性の子宮頸がん、小児がん、脊索腫、慢性リンパ球性白血病、慢性骨髄性白血病、慢性骨髄増殖性新生物結腸がん、結腸直腸がん、皮膚Ｔ細胞リンパ腫、非浸潤性乳管癌、子宮内膜がん、上衣腫、食道癌、感覚神経芽腫、ユーイング肉腫、頭蓋外胚細胞腫瘍、性腺外胚細胞腫瘍、肝臓外胆管がん、眼がん、眼内黒色腫、網膜芽腫、骨の繊維性組織球腫、悪性、及び骨肉腫、胆嚢がん、胃の（胃）がん、消化管カルチノイド腫瘍、胃腸間質腫瘍、性腺外がん、卵巣がん、精巣がん、妊娠性絨毛疾患、神経膠腫、脳幹がん、毛状細胞白血病、頭頸部がん、心臓がん、肝細胞（肝臓）がん、組織球増殖症、ランゲルハンス細胞がん、ホジキンリンパ腫、下咽頭がん、眼内黒色腫、膵島腫瘍、膵神経内分泌腫瘍、カポジ肉腫、腎臓がん、腎細胞がん、ウィルムス腫瘍及び他の小児腎腫瘍、ランゲルハンス細胞組織球増殖症、喉頭がん、白血病、慢性リンパ球性がん、慢性骨髄性がん、毛状細胞がん、口唇がん及び口腔がん、肝がん（原発性）、非浸潤性小葉癌（LCIS）、肺がん、非小細胞性がん、小細胞性がん、リンパ腫、皮膚Ｔ細胞（菌状息肉腫及びセザリー症候群）、ホジキンがん、非ホジキンがん、マクログロブリン血症、ワルデンストローム、男性乳がん、骨の悪性線維性組織球腫及び骨肉腫、黒色腫、眼球内（眼）がん、メルケル細胞癌、中皮腫、悪性、原発不明の転移性扁平頸部がん、ＮＵＴ遺伝子関連正中管癌、口腔がん、多発性内分泌腫瘍症候群、多発骨髄腫／形質細胞腫瘍、菌状息肉腫、骨髄異形成症候群、骨髄異形成／骨髄増殖性新生物、骨髄性白血病、慢性、骨髄球性白血病、急性、骨髄腫多発性、慢性骨髄増殖性腫瘍、鼻腔及び副鼻腔がん、上咽頭がん、神経芽細胞腫、非ホジキンリンパ腫、非小細胞性肺がん、口腔がん、口腔内がん、唇及び中咽頭がん、骨肉腫及び骨の悪性線維性組織球腫、上皮がん、低悪性度腫瘍、膵臓がん、膵神経内分泌腫瘍（膵島細胞腫瘍）、乳頭腫症、傍神経節腫、副甲状腺がん、陰茎がん、咽頭がん、褐色細胞腫、下垂体腫瘍、形質細胞新生物／多発性骨髄腫、胸膜肺芽腫、原発性中枢神経系リンパ腫、直腸がん、腎細胞（腎臓）がん、網膜芽細胞腫、横紋筋肉腫、唾液腺がん、肉腫、ユーイングがん、カポジがん、骨肉腫（骨がん）、軟組織がん、子宮がん、セザリー症候群、皮膚がん、小児期黒色腫、メルケル細胞癌、非黒色腫、小細胞性肺がん、小腸がん、軟部組織肉腫、扁平上皮細胞癌、皮膚がん（非黒色腫）、原発不明の小児期扁平上皮頸部がん、転移性がん、胃（胃の）がん、Ｔ細胞リンパ腫、皮膚がん、精巣がん、咽頭がん、胸腺腫及び胸腺癌、甲状腺がん、腎盂及び尿管の移行上皮がん、原発不明の��児期の癌、小児期の珍しいがん、尿道がん、子宮がん、子宮内膜がん、子宮肉腫、膣がん、外陰がん、ワルデンストロームマクログロブリン血症、ウィルムス腫瘍、及び婦人科のがんからなる群の１つ又は複数から選択することができる。
【００７５】
[79]  特定の一実施形態では、がんは、膠芽腫、小細胞肺癌、乳がん又は前立腺がんである。別の実施形態では、パーキンリガーゼの投与が対象における１つ又は複数の腫瘍を抑制する。
【００７６】
[80]  別の実施形態では、化合物は損傷したミトコンドリアを排除し、細胞ストレス時に細胞生存率を高め、腫瘍の形質転換を低下させ及び／又は細胞のアルファ−シヌクレインを軽減する。
【００７７】
[81]  別の実施形態では、本発明の方法には、具体的には、少なくとも１つのパーキンリガーゼジンクフィンガーを破壊し且つパーキンリガーゼの活性を誘導する１つ又は複数の化合物の治療有効量をそれを必要とする対象に投与する工程によって、パーキンソン病の発症を処置する及び／又は低減させる工程が含まれ、ここで、化合物はＺｎイオンと配位結合することができ、及び／又はシステイン中のチオール基と反応することができる。別の実施形態では、１つ又は複数の化合物は、損傷したミトコンドリアを排除し、細胞ストレス時に細胞生存率を高め及び／又は細胞のアルファ−シヌクレインを軽減する。「Ｓｏｍａｔｉｃ  Ｍｕｔａｔｉｏｎｓ  ｏｆ  ｔｈｅ  Ｐａｒｋｉｎｓｏｎ‘ｓ  ｄｉｓｅａｓｅ−ａｓｓｏｃｉａｔｅｄ  ｇｅｎｅ  ＰＡＲＫ２  ｉｎ  ｇｌｉｏｂｌａｓｔｏｍａ  ａｎｄ  ｏｔｈｅｒ  ｈｕｍａｎ  ｍａｌｉｇｎａｎｃｉｅｓ」（Nature Genetics Jan 2010 42（1）77-82）。
【００７８】
[82]  別の実施形態では、パーキンリガーゼ活性化はユビキチン化を変化させる。具体的には、ユビキチン化の改変は、ユビキチンの共有結合により基質タンパク質を修飾するパーキンの能力によって引き起こされるが、基質タンパク質はパーキンそれ自身であり、又はミトフュージョン１若しくは２などの別のタンパク質、ＦＢＷ７又はパーキンリガーゼの他の公開されている基質である。
【００７９】
[83]  特定の一実施形態では、本発明の方法には、がんの発症を処置する及び／又は低減させる工程が含まれ、少なくとも１つのパーキンリガーゼジンクフィンガーを破壊し且つパーキンリガーゼの活性を誘導する化合物の治療有効量をそれを必要とする対象に投与する工程を含み、ここで、化合物は亜鉛イオンと配位結合することができ、及び／又はシステインと結合又は反応することができる。特定の一実施形態では、化合物は表１若しくは表２由来であり又はその塩若しくはエステルである。特定の一実施形態では、パーキンリガーゼは、１つ又は複数の腫瘍の増殖を抑制し、及び／又は１つ又は複数の腫瘍の転移を防止する。別の実施形態では、化合物は、損傷したミトコンドリアを排除し、細胞ストレス時に細胞生存率を高め、腫瘍の形質転換を低下させ及び細胞のアルファ−シヌクレインを軽減する。別の実施形態では、がんは、膠芽腫、小細胞肺癌、乳がん又は前立腺がんである。
【００８０】
[84]  別の実施形態では、がんの発症を処置する及び／又は低減させるための化合物は、一座配位子、二座配位子、又は三座配位子としてＺｎイオンに配位結合することができる。別の実施形態では、がんの発症を処置する及び／又は低減させるための化合物は、パーキンリガーゼ中の少なくとも１つのジンクフィンガーの構造を破壊する実質的にＺｎイオンに配位結合することができる。別の実施形態では、少なくとも１つのジンクフィンガーのアミノ酸残基は、ヒトパーキンリガーゼのＲ０のアミノ酸１４１〜２１６、ＩＢＲのアミノ酸３２８〜３７７、及びＲ２のアミノ酸４１５〜４６５からなる群から選択される１つ又は複数のアミノ酸ドメインに対応するか又はこれらとアライメントをとる。別の実施形態では、化合物は、ＩＢＲドメイン（アミノ酸３２８〜３７７）中に存在する少なくとも１つのジンクフィンガーの構造を実質的に破壊する。別の実施形態では、ジンクフィンガーは４つのシステイン残基を含む。別の実施形態では、パーキンリガーゼ活性化はユビキチン化を変化させる。別の実施形態では、化合物はシステインのチオール基と結合するか又は反応する。別の実施形態では、システインは、ヒトパーキンリガーゼのＣ５９及びＣ３７７からなる群の１つ又は複数から選択される。別の実施形態では、システインはヒトパーキンリガーゼのＣ３７７である。別の実施形態では、化合物はＡＨ００１及び／又はＡＨ００７である。
【００８１】
[85]  別の実施形態では、がんの発症を処置する及び／又は低減させるための化合物は、アルキル化剤、酸化剤、ミカエル受容体、別の不飽和構造物である、及び／又はジスルフィドを有する。特定の一実施形態では、この化合物はまた、パーキンリガーゼ中の少なくとも１つのジンクフィンガーの構造を実質的に破壊する。別の実施形態では、少なくとも１つのジンクフィンガーのアミノ酸残基は、ヒトパーキンリガーゼのＲ０のアミノ酸１４１〜２１６、ＩＢＲのアミノ酸３２８〜３７７、及びＲ２のアミノ酸４１５〜４６５からなる群から選択される１つ又は複数のアミノ酸ドメインに対応するか又はこれらとアライメントをとる。別の実施形態では、ジンクフィンガーは４つのシステイン残基を含む。
【００８２】
[86]  特定の一実施形態では、本発明の方法には、パーキンソン病の発症を処置する及び／又は低減させる工程が含まれ、少なくとも１つのパーキンリガーゼジンクフィンガーを破壊し且つパーキンリガーゼの活性を誘導する化合物の治療有効量をそれを必要とする対象に投与する工程を含み、ここで、化合物は亜鉛イオンと配位結合することができ、及び／又はシステインと結合又は反応することができる。特定の一実施形態では、化合物は表１若しくは表２由来であり又はその塩若しくはエステルである。特定の一実施形態では、化合物は、損傷したミトコンドリアを排除し、細胞ストレス時に細胞生存率を高め及び／又は細胞のアルファ−シヌクレインを軽減する。別の実施形態では、亜鉛イオンに配位結合することができる化合物は、一座配位子、二座配位子、又は三座配位子である。別の実施形態では、少なくとも１つのジンクフィンガーのアミノ酸残基は、ヒトパーキンリガーゼのＲ０のアミノ酸１４１〜２１６、ＩＢＲのアミノ酸３２８〜３７７、及びＲ２のアミノ酸４１５〜４６５からなる群から選択される１つ又は複数のアミノ酸ドメインに対応するか又はこれらとアライメントをとる。別の実施形態では、化合物は、ＩＢＲドメイン（アミノ酸３２８〜３７７）中に存在する少なくとも１つのジンクフィンガーの構造を実質的に破壊する。別の実施形態では、ジンクフィンガーは４つシステイン残基を含む。別の実施形態では、パーキンリガーゼ活性化はユビキチン化を変化させる。別の実施形態では、化合物はシステインのチオール基と結合するか又は反応する。別の実施形態では、システインは、ヒトパーキンリガーゼのＣ５９及びＣ３７７からなる群の１つ又は複数から選択される。別の実施形態では、システインはヒトパーキンリガーゼのＣ３７７である。別の実施形態では、化合物はＡＨ００１及び／又はＡＨ００７である。
【００８３】
[87]  別の実施形態では、パーキンリガーゼ活性化はユビキチン化を変化させ、ここで、ユビキチン化の改変は、ユビキチンの共有結合により基質タンパク質を修飾するパーキンの能力によって引き起こされるが、基質タンパク質はパーキンそれ自身であり、又はミトフュージョン１若しくは２などの別のタンパク質、ＦＢＷ７又はパーキンリガーゼの他の公開されている基質である。特定の一実施形態では、化合物がパーキンリガーゼの活性化を誘導する。別の実施形態では、化合物は表１若しくは表２由来であり又はその塩若しくはエステルである。別の実施形態では、化合物は、アルキル化剤、酸化剤、ミカエル受容体、別の不飽和構造物である、及び／又はジスルフィドを有する。別の実施形態では、化合物は、パーキンリガーゼ中の少なくとも１つのジンクフィンガーの構造を実質的に破壊する。別の実施形態では、少なくとも１つのジンクフィンガーのアミノ酸残基は、ヒトパーキンリガーゼのＲ０のアミノ酸１４１〜２１６、ＩＢＲのアミノ酸３２８〜３７７、及びＲ２のアミノ酸４１５〜４６５からなる群から選択される１つ又は複数のアミノ酸ドメインに対応するか又はこれらとアライメントをとる。別の実施形態では、化合物は、ＩＢＲドメイン（アミノ酸３２８〜３７７）中に存在する少なくとも１つのジンクフィンガーの構造を実質的に破壊する。別の実施形態では、ジンクフィンガーは４つのシステイン残基を含む。別の実施形態では、パーキンリガーゼ活性化はユビキチン化を変化させる。別の実施形態では、化合物はシステインのチオール基と結合するか又は反応する。別の実施形態では、システインは、ヒトパーキンリガーゼのＣ５９及びＣ３７７からなる群の１つ又は複数から選択される。別の実施形態では、システインはヒトパーキンリガーゼのＣ３７７である。別の実施形態では、化合物はＡＨ００１及び／又はＡＨ００７である。
【００８４】
[88]  タンパク質は、細胞の構造的及び生化学的要件を満たすように構築され、一方、単に破壊及び空間的な管理だけではなく、より多くの目的に作用する高度に調節されたプロセスにおいても分解される。タンパク質は、そのＮ末端に存在するアミノ酸の性質によって決定される、様々な半減期を有する。一部は長寿命となり、一方、他方は速やかに分解されてしまう。タンパク質分解は、細胞がミスフォールドした又は損傷したタンパク質を廃棄することを可能とするとともに、細胞周期に関与するタンパク質などの、細胞内の必須タンパク質の濃度を微調整することも可能とする。このような迅速で、高度に特異的な分解は、標的タンパク質に１つ又は複数のユビキチン分子を付加することによって実現されることができる。このプロセスはユビキチン化と呼ばれている。
【００８５】
[89]  ユビキチン化は、細胞の生存及び分化並びに自然免疫及び適応免疫を含めた、多血症の生理学的プロセスにとって極めて重要である。近年、シグナル伝達経路におけるユビキチンの分子作用、及びユビキチン系が改変すると異なるヒト疾患がどのように発症するのかを理解するのに、かなりの進歩が成し遂げられた。ユビキチン化が、がん、メタボリックシンドローム、神経変性疾患、自己免疫、炎症性障害、感染症及び筋ジストロフィーの発病及び進行においてある役割を演じていることがわかってきた（Popovicら  Nature Medicine 20, 1242-1253 （2014））。
【００８６】
[90]  本発明の一部の実施形態は、それらに限定されないが、神経膠腫（オリゴデンログリオーマ（oligodenrogliomas））、混合神経膠腫及び神経膠芽細胞腫）、肺がん、乳がん、前立腺がん、卵巣がんなどの固形癌、及び腫瘍におけるウォーバーグ効果（ウォーバーグ効果を防ぐパーキン活性の回復）に伴う疾患又は障害の１つ又は複数の症状を処置する、予防する、又は寛解させる方法に関する。ヒトの遺伝的及び病理学データは、価値の高い目標としてパーキンタンパク質を支持している。十分な活性化パーキンがない場合、次いでドーパミンニューロンの細胞死と損失とが起こる（「Familial Parkinson Disease Gene Product, Parkin, Is a Ubiquitin-Protein Ligase」 Nature Genetics 25, 302-305、2000年7月1日）。
【００８７】
[91]  本発明のさらなる実施形態は、それらに限定されないが、アルツハイマー認知症、パーキンソン病、ハンチントン舞踏病、筋萎縮性側索硬化症（ALS）、フリードライヒ運動失調症、脊髄小脳変性症、多系統萎縮症、ＰＳＰ、タウオパチー、びまん性レビー小体病、レビィ小体痴呆、α−シヌクレインの異常蓄積を特徴とする任意の障害、老化プロセスの障害、脳卒中を含む神経疾患又は神経障害に伴う１つ又は複数の症状を処置する、予防する、又は寛解させる方法に関する。
【００８８】
[92]  本発明の他の実施形態は、それらに限定されないが、精神遅滞、難聴、盲目、糖尿病、肥満、心血管疾患、並びに多発性硬化症、シェーグレン症候群、ループス、偽落屑緑内障を含めた緑内障、レーバー遺伝性視神経萎縮症、リューマチ性関節炎などの自己免疫疾患に伴う１つ又は複数の症状を処置する、予防する、又は寛解させる方法に関する。
【００８９】
[93]  本発明による本発明のさらなる実施形態は、それらに限定されないが、以下のミトコンドリア関連疾患又はカプセルに伴う１つ又は複数の症状を処置する、予防する、又は寛解させる方法に関する：
・  アルパース病
・  バース症候群／ＬＩＣ（致命的な乳児性心筋症）
・  β酸化欠陥
・  カルニチン−アシル−カルニチン欠損症
・  カルニチン欠損症
・  クレアチン欠損症症候群
・  コエンザイムＱ１０欠損症
・  複合体Ｉ欠損症
・  複合体ＩＩ欠損症
・  複合体ＩＩＩ欠損症
・  複合体ＩＶ欠損症／ＣＯＸ欠損症
・  複合体Ｖ欠損症
・  ＣＰＥＯ
・  ＣＰＴ  Ｉ欠損症
・  ＣＰＴ  ＩＩ欠損症
・  ＫＳＳ
・  乳酸アシドーシス
・  ＬＢＳＬ−白質ジストロフィー
・  ＬＣＡＤ
・  ＬＣＨＡＤ
・  リー病又は症候群
・  ルフト病
・  ＭＡＤ／グルタル酸尿症ＩＩ型
・  ＭＣＡＤ
・  ＭＥＬＡＳ
・  ＭＥＲＲＦ
・  ＭＩＲＡＳ
・  ミトコンドリア細胞症
・  ミトコンドリアＤＮＡ欠失
・  ミトコンドリア脳症
・  ミトコンドリアミオパシー
・  ＭＮＧＩＥ
・  ＮＡＲＰ
・  ピアソン症候群
・  ピルビン酸カルボキシラーゼ欠損症
・  ピルビン酸デヒドロゲナーゼ欠損症
・  ＰＯＬＧ突然変異体
・  呼吸鎖
・  ＳＣＡＤ
・  ＳＣＨＡＤ
・  ＶＬＣＡＤ。
【００９０】
[94]  パーキン活性の上昇は、損傷したミトコンドリア（赤色）を排除し、細胞ストレス時に細胞生存率を高め、腫瘍の形質転換を低下させ及び細胞のα−シヌクレインを軽減する。パーキンから亜鉛を脱離させる、多重で多様なパーキン活性化化合物が同定された。ＺｎＦのたたみこみがほどかれた後に活性化することは他の公知のＺｎＦタンパク質に類似している。
【００９１】
[95]  本発明にはまた、対象においてパーキンリガーゼを活性化する医薬組成物も含まれる。特定の一実施形態では、医薬組成物は、少なくとも１つのパーキンリガーゼジンクフィンガーを破壊する１つ又は複数の化合物又はそれらの塩を含む。特定の一実施形態では、１つ又は複数の化合物又はそれらの塩は、Ｚｎイオンと配位結合することができ、及び／又はシステイン中の少なくとも１つのチオール基と反応することができる。特定の一実施形態では、医薬組成物は表１及び表２の化合物からなる群から選択される１つ又は複数の化合物を含み得る。
【００９２】
[96]  別の実施形態では、本発明における化合物、方法及び医薬組成物は次の薬物種の１つ又は複数に由来し得る：８−ヒドロキシキノリン；アルファ−ヒドロキシケトン；アミノメチルベンゾイミダゾール；アミノメチルインドール；バルビツレート；ベンゾイソチアゾロン、カルボキシレート、ジチオビスベンズアミド、ジチオカルバメート、ホルムアミド、ヒドラジド、ヒドロキサメート、ヒドロキシピリジノン／ヒドロキシピラノン、ヒドロキシスルホンアミド、イミダゾール、ケトン水和物、Ｎ−アシルオルト−フェニレンジアミン、Ｎ−ヒドロキシ尿素、Ｏ−置換ホスファメート、ホスファメート、ホスホン、スルファメート、スルファミド、スルホジイミン、スルホンアミド、チアジアジン、チアジアゾロチオネン、及びチオール。例えば、表１の以下のリストは代表的であるが、本発明において使用し得る可能な化合物の網羅的リストではない。
【００９３】
【表１−１】
2017538699.tif 000002
【００９４】
【表１−２】
2017538699.tif 000003
【００９５】
【表１−３】
2017538699.tif 000004
【００９６】
【表１−４】
2017538699.tif 000005
【００９７】
【表１−５】
2017538699.tif 000006
【００９８】
【表１−６】
2017538699.tif 000007
【００９９】
【表１−７】
2017538699.tif 000008
【０１００】
【表１−８】
2017538699.tif 000009
【０１０１】
【表１−９】
2017538699.tif 000010
【０１０２】
【表１−１０】
2017538699.tif 000011
【０１０３】
【表１−１１】
2017538699.tif 000012
【０１０４】
【表１−１２】
2017538699.tif 000013
【０１０５】
【表１−１３】
2017538699.tif 000014
【０１０６】
【表２−１】
2017538699.tif 000015
【０１０７】
【表２−２】
2017538699.tif 000016
【０１０８】
【表２−３】
2017538699.tif 000017
【０１０９】
【表２−４】
2017538699.tif 000018
【０１１０】
【表２−５】
2017538699.tif 000019
【０１１１】
【表２−６】
2017538699.tif 000020
【０１１２】
【表２−７】
2017538699.tif 000021
【０１１３】
【表２−８】
2017538699.tif 000022
【０１１４】
【表２−９】
2017538699.tif 000023
【０１１５】
【表２−１０】
2017538699.tif 000024
【０１１６】
【表２−１１】
2017538699.tif 000025
【０１１７】
【表２−１２】
2017538699.tif 000026
【０１１８】
【表２−１３】
2017538699.tif 000027
【０１１９】
【表２−１４】
2017538699.tif 000028
【０１２０】
【表２−１５】
2017538699.tif 000029
【０１２１】
【表２−１６】
2017538699.tif 000030
【０１２２】
【表３−１】
2017538699.tif 000031
【０１２３】
【表３−２】
2017538699.tif 000032
【０１２４】
【表３−３】
2017538699.tif 000033
【０１２５】
【表３−４】
2017538699.tif 000034
【０１２６】
【表３−５】
2017538699.tif 000035
【０１２７】
【表３−６】
2017538699.tif 000036
【０１２８】
【表３−７】
2017538699.tif 000037
【０１２９】
【表３−８】
2017538699.tif 000038
【０１３０】
【表４】
2017538699.tif 000039
【０１３１】
[97]  本発明はまた、少なくとも１つのパーキンリガーゼジンクフィンガーを破壊する薬剤の有効用量を含む、対象においてパーキンリガーゼを活性化するための医薬製剤にも関し、ここで、薬剤若しくは化合物は亜鉛イオンを配位結合することができ、又は薬剤若しくは化合物はシステイン中のチオール基と反応することができる。
【０１３２】
[98]  本発明のさらなる実施形態は、薬学的に許容される賦形剤又はアジュバントをさらに含む医薬製剤を対象とする。
【０１３３】
[99]  本発明の方法には、対象への組成物の投与に関して臨床的に許容される任意の経路が含まれる。種々の様態では、投与の経路は全身性であり、例えば経口又は注射による。薬剤若しくは化合物、又はそれらの薬学的に許容される塩若しくは誘導体は、経口的に、鼻腔内に、経皮的に、肺に、吸入的に、頬粘膜に、舌下に、腹腔内に、皮下に、筋内に、静脈内に、直腸に、胸膜内に、髄腔内に、門脈内に、及び非経口的に投与される。代替的に又は加えて、投与の経路は局所的であり、例えば、局部的、腫瘍内及び腫瘍周辺である。一部の実施形態では、化合物は経口投与される。
【０１３４】
[100]  他の実施形態では、本明細書に開示の薬剤は静脈内経路で投与される。さらなる実施形態では、非経口投与はボーラスで又は注入によって供給されてもよい。
【０１３５】
[101]  組成物を投与する方法は、一部では、原因及び／又は部位に依存する。当業者であれば投与についてある特定の経路の利点を理解するであろう。
【０１３６】
[102]  方法には、薬剤又は化合物（又は薬剤又は化合物を含む組成物）の有効量、例えば、処置すべき状態、例えば腫瘍学的障害及び神経学的障害の症状を、全体的に又は一部、緩和する、寛解する、又は予防するのに有効な量を投与して、所望の生物学的応答を達成する工程が含まれる。
【０１３７】
[103]  種々の態様では、投与された、表１及び／又は表２に示されている構造式のいずれか１つの化合物、又はその塩若しくはエステルの量は、約０．００１ｍｇ／ｋｇ〜約１００ｍｇ／ｋｇ体重である（例えば、約０．０１ｍｇ／ｋｇ〜約１０ｍｇ／ｋｇ又は約０．１ｍｇ／ｋｇ〜約５ｍｇ／ｋｇ）。
【０１３８】
[104]  薬学的に許容される混合物中の開示された化合物の濃度は、投与すべき化合物の用量、用いる化合物の薬力学特性、及び投与の経路を含めて、複数の因子に依存して変動するであろう。薬剤は、単一用量又は繰返し用量で投与することができる。本発明の化合物を活用する投与計画は患者のタイプ、人種、年齢、体重、性別及び医療状態；処置される状態の重篤度；投与経路；患者の腎臓及び肝臓の機能；及び使用される特定の化合物又はその塩を含む種々の因子に従い選択される。処置薬は、患者の総合的な健康状態、並びに選択された化合物の剤形及び投与経路を含めた、いくつかの因子に応じて１日１回又はより頻繁に投与することができる。専門の医師又は獣医師は状態の進行を防止、対抗又は停止するのに必要な薬物の有効量を容易に決定し且つ処方することができる。
【０１３９】
[105]  本発明の化合物又は組成物は、単回又は多回単位剤形で製造することができ及び／又は投与することができる。
【０１４０】
[106]  本発明のさらなる実施形態は、表１及び／又は表２に示されている構造式のいずれか１つの化合物、及び薬学的に許容される担体、例えば、薬学的に許容される賦形剤、担体、結合剤、及び／又は希釈剤を含む組成物に関する。
【０１４１】
[107]  本発明の開示された化合物の製剤及び投与技法については、Ｒｅｍｉｎｇｔｏｎ：ｔｈｅ  Ｓｃｉｅｎｃｅ  ａｎｄ  Ｐｒａｃｔｉｃｅ  ｏｆ  Ｐｈａｒｍａｃｙ、１９版、Ｍａｃｋ  Ｐｕｂｌｉｓｈｉｎｇ  Ｃｏ．、Ｅａｓｔｏｎ、ＰＡ（１９９５）に見出すことができる。
【０１４２】
[108]  他の実施形態では、本明細書に記載の化合物、及びそれらの薬学的に許容される塩、溶媒和物、水和物、及びプロドラッグは、薬学的に許容される担体又は希釈剤と組み合わせて医薬製剤中で使用される。適切な薬学的に許容される担体としては、不活性な固体充填剤又は希釈剤及び滅菌水溶液又は滅菌有機溶液が挙げられる。任意選択により、組成物は１つ又は複数のさらなる治療剤を含む。化合物は、本明細書に記載の範囲で所望の投与量を提供するのに十分な量でこのような医薬組成物中に存在することになる。
【０１４３】
[109]  ある特定の実施形態では、本発明の組成物は、医薬組成物中に従来見出される他の補助的な構成成分を、それらの業界確立使用量レベルで、さらに含有することができる。したがって、例えば、組成物は、例えば、鎮痒薬、収斂薬、局所麻酔薬、又は抗炎症剤のような、適合性のある、薬学的に活性なさらなる材料を含有してもよく、あるいは、本発明の組成物を種々の剤形に物理的に製剤化するのに有用な、染料、香味剤、保存剤、抗酸化剤、乳白剤、増粘剤及び安定剤などの、さらなる材料を含有してもよい。しかし、このような材料は、添加されたときに、本発明の組成物の構成成分の生物活性を過度に妨げるべきではない。製剤を滅菌してもよく、所望される場合、補助的な薬剤、例えば、製剤のオリゴヌクレオチドと有害に相互作用しない、潤滑剤、保存剤、安定剤、湿潤剤、乳化剤、浸透圧に影響を及ぼすための塩、緩衝剤、着色物質、香味物質及び／又は芳香物質等と混合してもよい。
【０１４４】
[110]  ある特定の実施形態では、本発明の医薬組成物には１つ又は複数の賦形剤が含まれる。ある特定のこのような実施形態では、賦形剤は、水、塩類溶液、アルコール、ポリエチレングリコール、ゼラチン、ラクトース、アミラーゼ、ステアリン酸マグネシウム、タルク、ケイ酸、粘性パラフィン、ヒドロキシメチルセルロース及びポリビニルピロリドンから選択される。
【０１４５】
[111]  ある特定の実施形態では、本発明の医薬組成物は、それらに限定されないが、混合、溶解、造粒、糖衣形成、微粒子化、乳化、カプセル化、封入、又は錠剤化プロセスを含めた、公知の技法を使用して調製される。
【０１４６】
[112]  さらなる実施形態は、製剤が固体、粉末、液体及びゲルからなる群から選択される、医薬製剤に関する。
【０１４７】
[113]  ある特定の実施形態では、本発明の医薬組成物は、液体（例えば、懸濁液、エリキシル剤及び／又は溶液）である。このような実施形態のいくつかでは、液体医薬組成物は、それらに限定されないが、水、グリコール、油、アルコール、香味剤、保存剤、及び着色剤を含めた、当分野で公知の成分を使用して調製される。
【０１４８】
[114]  ある特定の実施形態では、本発明の医薬組成物は、固体（例えば、粉末、錠剤及び／又はカプセル）である。このような実施形態のいくつかでは、固体医薬組成物は、それらに限定されないが、デンプン、糖、希釈剤、造粒剤、滑沢剤、結合剤、及び崩壊剤を含めた、当業界で公知の１つ又は複数の成分を含む医薬組成物。
【０１４９】
[115]  ある特定の実施形態では、本発明の医薬組成物は、デポ製剤として製剤される。ある特定のこのようなデポ製剤は、非デポ製剤よりも一般には長時間作用型である。ある特定の実施形態では、このような製剤は移植によって（例えば、皮下に又は筋肉内に）又は筋肉内注射によって投与される。ある特定の実施形態では、デポ製剤は、適切なポリマー性若しくは疎水性材料（例えば許容される油中の乳濁液）又はイオン交換樹脂を使用して、又は難溶性誘導体として、例えば難溶性塩として調製される。
【０１５０】
[116]  ある特定の実施形態では、本発明の医薬組成物は、送達システムを含む。送達システムの例としては、それらに限定されないが、リポソーム及び乳濁液が挙げられる。ある特定の送達システムは、疎水性化合物を含むものを含めたある特定の医薬組成物を調製するのに有用である。ある特定の実施形態では、ジメチルスルホキシドなどのある特定の有機溶媒が使用される。
【０１５１】
[117]  ある特定の実施形態では、本発明の医薬組成物は、共溶媒系を含む。このような共溶媒系のいくつかには、例えば、ベンジルアルコール、非極性界面活性剤、水混和性有機ポリマー、及び水相が含まれる。ある特定の実施形態では、このような共溶媒系は疎水性化合物に使用される。このような共溶媒系の非限定的例はＶＰＤ共溶媒系であるが、これは、ベンジルアルコール３％ｗ／ｖ、非極性界面活性剤ポリソルベート８０の８％ｗ／ｖ、及びポリエチレングリコール３００  ６５％ｗ／ｖを含む無水アルコール溶液である。共溶媒系の溶解度及び毒性特性を大幅に改変することなく、このような共溶媒系の割合をかなり変えることができる。さらに、共溶媒成分の同一性が変更されてもよい：例えば、ポリソルベート８０の代わりに、他の界面活性剤を使用してもよく；ポリエチレングリコールのフラクションサイズを変更してもよく；他の生体適合性ポリマー、例えば、ポリビニルピロリドンがポリエチレングリコールに置き代わってもよく；他の糖類又は多糖類をデキストロースと交換してもよい。
【０１５２】
[118]  ある特定の実施形態では、本発明の医薬組成物は、徐放システムを含む。このような徐放性システムの非限定的例は、固体疎水性ポリマーの半透性マトリックスである。ある特定の実施形態では、徐放性システムは、その化学的性質に応じて、数時間、数日、数週間又は数カ月の期間にわたり医薬品を放出し得る。
【０１５３】
[119]  ある特定の実施形態では、本発明の医薬組成物は、経口投与用に調製される。このような実施形態のいくつかでは、医薬組成物は、１つ又は複数の薬剤と薬学的に許容される担体とを組み合わせることにより製剤化される。このような担体のいくつかによって、医薬組成物を、錠剤、丸剤、糖衣錠、カプセル剤、液剤、ゲル剤、シロップ剤、スラリー、懸濁剤など、対象による経口摂取向けに製剤化することができる。適切な賦形剤としては、それらに限定されないが、ラクトース、スクロース、マンニトール、又はソルビトールを含めた糖類などの充填剤；例えば、トウモロコシデンプン、コムギデンプン、コメデンプン、ジャガイモデンプン、ゼラチン、トラガカントゴム、メチルセルロース、ヒドロキシプロピルメチルセルロース、カルボキシメチルセルロースナトリウムなどのセルロース調製物、及び／又はポリビニルピロリドン（PVP）が挙げられる。ある特定の実施形態では、このような混合物を任意選択により粉砕し、補助的な薬剤を任意選択により添加する。ある特定の実施形態では、医薬組成物を成形して、錠剤又は糖衣錠コアを得る。ある特定の実施形態では、崩壊剤（例えば、架橋ポリビニルピロリドン、寒天、又はアルギン酸若しくはアルギン酸ナトリウムなどのその塩）が添加される。
【０１５４】
[120]  ある特定の実施形態では、糖衣錠コアにコーティングが施されている。ある特定のこのような実施形態では、濃縮糖液を使用してもよく、この濃縮糖液は任意選択により、アラビアゴム、タルク、ポリビニルピロリドン、カルボポルゲル、ポリエチレングリコール、及び／又は二酸化チタン、ラッカー溶液、及び適切な有機溶媒又は溶媒混合物を含んでもよい。染料又は色素を、錠剤又は糖衣錠のコーティングに添加してもよい。
【０１５５】
[121]  ある特定の実施形態では、経口投与用医薬組成物はゼラチン製のプッシュフィットカプセルである。このようなプッシュフィットカプセルのいくつかは、１つ又は複数の、ラクトースなどの充填剤、デンプンなどの結合剤、及び／又はタルク若しくはステアリン酸マグネシウムなどの滑沢剤、及び任意選択により安定剤とともに、混合物中に本発明の１つ又は複数の医薬品を含む。ある特定の実施形態では、経口投与用医薬組成物は、ゼラチンとグリセロール又はソルビトールなどの可塑剤とで作られた密閉ソフトカプセルである。ある特定のソフトカプセルでは、本発明の１つ又は複数の医薬品は、脂肪油、液体パラフィン、又は液体ポリエチレングリコールなどの適切な液体中に溶解されていても懸濁されていてもよい。さらに、安定剤が添加されていてもよい。
【０１５６】
[122]  ある特定の実施形態では、医薬組成物は頬粘膜投与用に調製される。このような医薬組成物のいくつかは、慣用の方法で製剤化された錠剤又はロゼンジである。
【０１５７】
[123]  ある特定の実施形態では、医薬組成物は、注射（例えば、静脈内、皮下、筋肉内など）による投与向けに調製される。このような実施形態のいくつかでは、医薬組成物は担体を含み、且つ水又は、ハンクス液、リンゲル液若しくは生理食塩緩衝液などの生理学的に適合する緩衝剤などの水溶液として製剤化される。ある特定の実施形態では、他の成分（例えば、溶解を補助する成分又は保存剤として機能する成分）が含まれる。ある特定の実施形態では、注射用懸濁剤は、適切な液体担体、懸濁化剤などを使用して調製される。ある特定の注射用医薬組成物は、例えば、アンプル又は分割投与容器に入った単位剤形で提供される。ある特定の注射用医薬組成物は、油性又は水性ビヒクル中の、懸濁液、溶液、又は乳濁液であり、懸濁化剤、安定化剤及び／又は分散剤などの製剤化剤を含んでもよい。注射用医薬組成物での使用に適したある特定の溶媒としては、それらに限定されないが、親油性溶媒及びゴマ油などの脂肪油、オレイン酸エチル又はトリグリセリドなどの合成脂肪酸エステル、及びリポソームが挙げられる。水性注射用懸濁剤は、カルボキシルメチルセルロースナトリウム、ソルビトール、又はデキストランなどの、懸濁剤の粘性を高める物質を含んでもよい。任意選択により、このような懸濁剤はまた、高濃縮溶液の調製を可能とするために、医薬品の溶解度を高める適切な安定剤又は薬剤を含んでもよい。
【０１５８】
[124]  ある特定の実施形態では、医薬組成物は経粘膜投与用に調製される。このような実施形態のいくつかでは、浸透されるバリアに適した浸透剤が製剤に使用される。そのような浸透剤は当分野において周知である。
【０１５９】
[125]  ある特定の実施形態では、医薬組成物は吸入投与用に調製される。このような吸入用医薬組成物のいくつかは、加圧パック又はネブライザー中のエアロゾルスプレーの形態で調製される。このような医薬組成物のいくつかは噴射剤を、例えば、ジクロロジフルオロメタン、トリクロロフルオロメタン、ジクロロテトラフルオロエタン、二酸化炭素又は他の適切なガスを含む。加圧エアロゾルを使用するある特定の実施形態では、投与単位は、ある一定の量を送達するバルブを使用して決定することができる。ある特定の実施形態では、吸入器又は通気器に使用するためのカプセル及びカートリッジを製剤化することができる。このような製剤のいくつかは、本発明の医薬品とラクトース又はデンプンなどの適切な粉末基剤との粉末混合物を含む。
【０１６０】
[126]  ある特定の実施形態では、医薬組成物は、坐剤や停留浣腸などの直腸投与用に調製される。このような医薬組成物のいくつかは、カカオ脂及び／又は他のグリセリドなどの公知の成分を含む。
【０１６１】
[127]  ある特定の実施形態では、医薬組成物は局部投与用に調製される。このような医薬組成物のいくつかは、軟膏剤又はクリーム剤などの低刺激性保湿基剤を含む。例示的な適切な軟膏基剤としては、それらに限定されないが、ワセリン、揮発性シリコーン添加ワセリン、及びラノリン、並びに油中水型乳剤が挙げられる。例示的な適切なクリーム基剤としては、それらに限定されないが、コールドクリーム及び親水性軟膏が挙げられる。
【０１６２】
[128]  ある特定の実施形態では、治療有効量は、疾患の症状を予防、緩和、若しくは寛解するか、又は処置対象の生存を延長するのに十分である。治療有効量は、当業者の能力内で十分に決定される。
【０１６３】
[129]  ある特定の実施形態では、本発明の１つ又は複数の化合物はプロドラッグとして製剤化される。ある特定の実施形態では、プロドラッグは、インビボ投与されると、生物学的、薬学的、又は治療学上さらに活性な形態に化学的に変換される。ある特定の実施形態では、プロドラッグは、対応する活性型のものよりも投与が容易であることから、有用である。例えば、ある特定の例では、プロドラッグは、対応する活性型のものよりも（例えば、経口投与により）生物学的に利用されやすい。ある特定の例では、プロドラッグは、対応する活性型のものと比較して改善された溶解度を有することができる。ある特定の実施形態では、プロドラッグは、対応する活性型ものよりも水への溶解度が低い。ある特定の例では、このようなプロドラッグは、水への溶解度が移動性に対して不利益である場合、細胞膜を越えて優れた伝達を有する。ある特定の実施形態では、プロドラッグはエステルである。ある特定のこのような実施形態では、エステルは投与されると、カルボン酸に代謝的に加水分解される。ある特定の例では、カルボン酸を含む化合物は、対応する活性型である。ある特定の実施形態では、プロドラッグは、酸性基に結合した短いペプチド（ポリアミノ酸）を含む。このような実施形態のいくつかにおいて、ペプチドは投与されると切断されて、対応する活性型を形成する。
【０１６４】
[130]  ある特定の実施形態では、プロドラッグは、活性化合物がインビボ投与で再生成するように、薬学的に活性な化合物を修飾することにより製造される。プロドラッグは、薬物の代謝的安定性若しくは輸送特性を変化させるように、副作用若しくは毒性を覆い隠すように、薬物の香味を改善するように、又は薬物の他の特徴若しくは特性を変化させるように設計されうる。当業者であれば、薬学的に活性な化合物を知れば、インビボにおける薬力学的プロセス及び薬物代謝に関する知識に基づいて、その化合物のプロドラッグを設計することができる（例えば、Nogrady （1985）Medicinal Chemistry A Biochemical Approach, Oxford University Press, New York、388〜392頁を参照されたい）。
【０１６５】
[131]  これまで、概略的に本発明を説明してきたが、以下の実施例を参照することにより、同様のことがより容易に理解されるであろう。以下の実施例は説明のためであって、本発明を限定するためのものではない。
【実施例】
【０１６６】
実施例１：パーキン活性化剤の同定
アッセイ原理：
[132]  活性部位反応型プローブ（ABP）と酵素中の活性部位システインとの非可逆反応に基づいたアッセイ。ＡＢＰはＮ末端にエピトープタグ（例えばHAタグ）、及びＣ末端に反応基を持つユビキチン部分からなる。パーキン−ＲＢＲ（w/o  R0阻害性ドメイン）の活性は、パーキン−Ｒ０ＲＢＲの活性又は全長パーキンの活性よりも有意に高い。パーキンへのＡＢＰの共有結合は、時間分解蛍光共鳴エネルギー転移（TR-FRET）によってモニターすることができる。
−  パーキン−Ｒ０ＲＢＲ、全長パーキン→低ＴＲ−ＦＲＥＴシグナル（陰性対照）
−  パーキンＲＢＲ→高ＴＲ−ＦＲＥＴシグナル（陽性対照）
パーキン−Ｒ０ＲＢＲの活性又は全長パーキンの活性を高める化合物は、ＴＲ−ＦＲＥＴシグナルの高まりによって同定することができる。
戦略：パーキン−Ｒ０ＲＢＲ、全長パーキン及びパーキン−ＲＢＲのＮ末端Ｈｉｓ−ＳＵＭＯタグ付け構築物の使用。（Evotec Slides製；Rileyら  2013. Nat Commun. 4:1982及びE3x Bioにより提供された情報に基づく；交付申請）
【０１６７】
構築物：
[133]
−  Ｒｉｌｅｙらにより記載のようにＥ．ｃｏｌｉにおけるＮ末端Ｈｉｓ６−ＳＵＭＯ−タグ（SENP1プロテアーゼを使用して精製時に潜在的に除去可能）を持つ全長パーキン（１−４６５）、Ｒ０ＲＢＲ（１４１−４６５）及びＲＢＲ（２３８−４６５）の発現
−  ＴＲ−ＦＲＥＴアッセイを可能とするＮ末端Ｈｉｓ６−タグ→Ｎ末端Ｈｉｓ６−ＳＵＭＯ−タグをその上になお有する精製タンパク質の使用。
−  小規模の試験をすべての構築物に対して実施して、どちらの構築物が、全長パーキン又はＲ０ＲＢＲが良好な収率をもたらしてＨＴＳアッセイを円滑化するかを評価する。
【０１６８】
フェーズ１：タンパク質の産生
[134]
−  Ｅ．ｃｏｌｉにおける発現に対してコドン最適化された、Ｎ末端Ｈｉｓ６−ＳＵＭＯを持つ全長パーキン、Ｈｉｓ６−ＳＵＭＯ−Ｒ０ＲＢＲ及びＨｉｓ６−ＳＵＭＯ−ＲＢＲについてサードパーティーにより遺伝子合成を開始し、適切な発現ベクターにサブクローニングする。
−  ウエスタンブロットにて小規模の試験発現を評価して、可溶性タンパク質の収率を推定する。
−  ＲＢＲ構築物並びに全長パーキン構築物又はＲ０ＲＢＲ構築物のいずれかをＢＬ２１（DE3）に形質転換し、Ｒｉｌｅｙらにより概略されているように、６〜２４Ｌの規模で発現させる（小規模の試験発現の成果に応じて）
−  Ｒｉｌｅｙら＊により記載されているように、すなわち、ＩＭＡＣ、ＭｏｎｏＱ及びサイズ排除であるが、ＲＢＲ構築物およそ１０ｍｇ並びに全長パーキン構築物又はＲ０ＲＢＲ構築物のいずれかを精製。
【０１６９】
フェーズ２：アッセイの展開
[135]  
−  目標：１，５３６−ウエルアッセイプレート形式に堅牢な一次スクリーニングアッセイをセットアップする
−  合理的なダイナミックレンジで３８４−ウエル形式にアッセイを確立する（例えばR0阻害性ドメイン＋／−のパーキンを使用して）
−  アッセイを最適化する（例えば、アッセイ構成成分の濃度、緩衝剤、添加物、試薬添加の順序、及びインキュベーション温度に関して）
−  時間経過試験を実行して最適インキュベーション時間を決める
−  アッセイの堅牢性を実証する（目標：Z’>0.5）
−  リードアウトの安定性を実証する
−  ＤＭＳＯ耐性を試験する
−  Ｕｂ力価測定によって（ＡＢＰと競合する）、パーキンＲＢＲドメインを使用して（w/o  R0阻害性ドメイン）得られたアッセイシグナルの特異性を実証する
−  ３８４−ウエルスクリーニングプレート形式から最終的な１，５３６−ウエルスクリーニングプレート形式へとアッセイを移す；アッセイをＥＶＯｓｃｒｅｅｎ（商標）Ｍａｒｋ  ＩＩＩ  ＨＴＳプラットフォームに適合させる
−  必要な場合、このような高密度プレート形式におけるアッセイ堅牢性を最適化するために（目標：Z’>0.5）且つハイスループットスクリーニング（HTS）に対するアッセイ適合性を実証するために、アッセイ条件を微調整する
−  スクリーニング条件下でのアッセイ試薬の安定性を経時的に確認する
−  プレート間の及び日毎のアッセイ堅牢性を実証する
−  スクリーニング及びヒットプロファイリング向けに必要とされるすべてのアッセイ試薬の量を推定し且つ調達する。
【０１７０】
フェーズ３：スクリーニング
[136]  マーカーライブラリースクリーニング（MLS）
−  ３回反復で２点濃度にて、一次スクリーニングアッセイに対して、およそ２．５ｋの代表的なリード的化合物（lead-like compound）の多様なマーカーライブラリーのプレスクリーニング
−  ３シグマ法を使用するＭＬＳ及びヒットデフィニションの統計学的解析（プレートをベースとした、化合物フリーのＤＭＳＯウエルの走査に対して）
−  一次スクリーニング向けの最適な化合物濃度の選択
一次スクリーニング（PS）：
−  １つの均一な化合物濃度での、一次スクリーニングアッセイ（n=1）に対しておよそ７５，０００のリード的化合物のスクリーニング；取り決められた再スクリーニング基準に満たない化合物プレートの再スクリーニング（例えばZ’>0.5）
−  ３シグマ法を使用する一次スクリーニングに関するヒットデフィニション（プレートをベースとした、化合物フリーのＤＭＳＯウエルの走査に対して）
−  一次スクリーニングの統計学的解析→一次ヒット化合物（パーキン活性化剤）
ヒットの確認（HC）：
−  ヒット確認向けの最大でおよそ７５０の一次ヒットの１セットの選択
−  選択された化合物のチェリーピッキング及び試験向けのリフォーマッティング
−  化合物スクリーニング濃度での、一次スクリーニングアッセイに対して選択されたｃｐｄの再試験（n=3）
−  ヒット確認キャンペーンの統計学的解析→確認された低分子パーキン活性化剤の同定
フェーズ４：ヒットプロファイリング（HP）：
−  ヒットプロファイリング向けの最大でおよそ２５０の確認されたヒット化合物の１セットの選択
−  選択された化合物のチェリーピッキング及び濃度−反応試験向けのリフォーマッティング
−  一次スクリーニングアッセイに対して１１点化合物希釈系列の濃度−反応試験（n=2）
−  濃度反応曲線の自動データフィッティング及びその結果得られるＩＣ５０値の算出
−  化合物の同一性及び純度を確認するためのヒット化合物のＬＣ／ＭＳ検査
−  活性なヒット化合物の構造活性相関分析（SAR）
−  確認され且つプロファイリングされた低分子パーキン活性化剤。
【０１７１】
実施例２：ユビキチンビニルスルフォンプローブを使用する活性部位反応型プローブアッセイ
[137]  パーキンリガーゼの活性部位システインに非可逆的に結合するユビキチンビニルスルフォンプローブを使用することができる。パーキンへのプローブの共有結合は、ＴＲ−ＦＲＥＴによってモニターすることができる。候補活性化化合物は、ＴＲ−ＦＲＥＴシグナルが増加するので、パーキンリガーゼの活性を高めることによって同定することができる。活性化化合物のスクリーニングは、以下のように対照と区別することができる：
１００％活性化シグナル＝ＤＭＳＯ中の熱活性化パーキン＋１００ｎＭの対照活性化剤。０％活性化シグナル＝熱活性化パーキン＋ＤＭＳＯ単独。パーキン活性化剤は０％活性化シグナルのＴＲ−ＦＲＥＴシグナルの増加によって同定することができる。
【０１７２】
[138]  アッセイ条件：
材料：
アッセイプレート：白色３８４ウエルプレート（Corning 3572）
酵素：パーキン−Ｈｉｓタグ付き２０３μＭ（１０．５ｍｇ／ｍｌ）
プローブ：ユビキチンビニルスルフォン（HA-Ub-VS  Boston Biochem U-212）
ＤＭＳＯ：ＤＭＳＯ（Sigma cat # D4540 -100ML）
反応緩衝液：５０ｍＭ  ＨＥＰＥＳ（ｐＨ８．５）、１５０ｍＭ  ＮａＣｌ、０．０１％Ｔｗｅｅｎ２０、０．１％ＢＳＡ
検出緩衝液：５０ｍＭ  ＨＥＰＥＳ（ｐＨ８．５）、１５０ｍＭ  ＮａＣｌ、０．０１％Ｔｗｅｅｎ２０、０．１％ＢＳＡ、８００ｍＭ  ＫＦ
検出試薬Ａ：検出バッファー中に２．６ｎＭの抗６ＨＩＳ−Ｅｕクリプテート及び４０ｎＭの抗ＨＡ−ＸＬ６６５
Ｅｕクリプテート：抗６ＨＩＳ−Ｅｕクリプテート（CisBio 61HISKLA）
ＸＬ６６５：抗ＨＡ−ＸＬ６６５（CisBio 610HAXLA）
酵素反応（活性化剤単独とともに、１５分プレインキュベーションのパーキン）
パーキン：４０ｎＭ
ＨＡ−Ｕｂ−ＶＳプローブ：７０ｎＭ
活性化剤／ＤＭＳＯ：２×  活性化剤候補物／２％ＤＭＳＯ
反応時間：６０分
温度：２２℃
総容量：１０μｌの反応
検出反応
上の酵素反応１０μｌを取り、以下の条件下での検出試薬Ａ１０μｌを添加する：
反応時間：６０分
温度：２２℃
総容量：２０μｌ
【０１７３】
[139]  アッセイ手順：
１）  酵素反応緩衝液（５００μｌ／１．５ｍｌチューブ：Ｅｐｐｅｎｄｏｒｆ  Ｔｈｅｒｍｏｍｉｘｅｒで５分間、５８℃で４００ｒｐｍ、必要となるまで氷上に放置）中でパーキンを熱活性化する。
２）  アッセイプレートウエルに、Ｂｒａｖｏの使用による８４．５ｎＭパーキンの反応緩衝液４．８μｌをロードする。
３）  ＨＰ  Ｄ−３００コンパウンドディスペンサーを使用して、ＤＭＳＯ中の２００×の活性化剤候補物０．２μｌを供給する。最高２００×  濃度=２０μｍ、次いで２倍希釈。
４）  スピン１０００ｒｐｍ、室温にて、２分。
５）  プレートを室温にて１５分間インキュベートする。
６）  Ｂｒａｖｏの使用により、１４０ｎＭ  ＨＡ−Ｕｂ−ＶＳプローブの反応緩衝液５μｌを添加する。
７）  スピン１０００ｒｐｍ、室温にて、２分。
８）  プレートを室温にて６０分間インキュベートする。
９）  ２．６ｎＭ抗６ＨＩＳ−Ｅｕクリプテート及び４０ｎＭ抗ＨＡ−ＸＬ６６５の検出緩衝液１０μｌを添加する。
１０）  スピン１０００ｒｐｍ、室温にて、２分。
１１）  プレートを室温にて６０分間インキュベートする。
１２）  Ｐｅｒｋｉｎ  Ｅｌｍｅｒ  Ｅｎｖｉｓｉｏｎ装置でプレートを読み取る。
【０１７４】
[140]  データ解析：データはＣＳＶファイルで読み取ることができる。これらのＣＳＶファイルには２つの表があり、それぞれ、６５５ｎｍ（チャネル1）波長の値及び６１５ｎｍ（チャネル2）の波長の値である。データはＨＴＲＦ比=（チャネル1/チャネル2）＊１０，０００に変換されている。
【０１７５】
[141]  すべての０μＭ対照（DMSO単独）の平均＝ＢＫＧＤ（バックグラウンド−０％活性化）。各ＨＴＲＦ比値からＢＫＧＤを差し引く＝ＨＴＲＦ−ＢＫＧＤ。ＤＭＳＯ対照におけるすべての１００μＭ１００ｎＭ対照活性化剤の平均値=Ｍａｘ（１００％活性化）。次いで次の式を使用して、次のように各ウエル／候補物についての％活性化を算出する：％活性化=（HTRF-BKGD/Max）＊１００。
【０１７６】
[142]  次いで、候補化合物について７５％未満の活性化が見られる場合、化合物力価測定の％活性化を用いて、活性化ＥＣ５０又は最高の％活性化を見出すことができる。
【０１７７】
実施例３：候補求電子剤及びキレート剤化合物による活性部位反応型プローブアッセイ
[143]  活性部位反応型プローブアッセイを表１及び／又は表２の種々の化合物を用いて上の実施例２のように行った。少なくとも２つの化合物が、活性部位反応型プローブであるユビキチン−ビニルスルホンによるパーキン活性の増加を示した。図１に示すように、Ｎ，Ｎ‘−（１−フェニル−１Ｈ−１，２，４−トリアゾール−３，５−ジイル）ジベンズアミド、キレート剤化合物（AH001）は活性部位反応型ユビキチン−ビニルスルホンプローブでのパーキンリガーゼ反応を高める。
【０１７８】
[144]  同様に、図２に示すように、６−ベンジル−２，５−ジメチル−３−フェニルピラゾロ［１，５−ａ］ピリミジン−７−チオール、求電子剤及びキレート剤化合物（AH007）は活性部位反応型ユビキチン−ビニルスルホンプローブでのパーキンリガーゼ反応を高める。この例は、キレート剤も求電子剤もパーキンリガーゼ活性を調節する及び／又は高めることができることを、実証している。
【０１７９】
実施例４：パーキンｐＵＢの自己ユビキチン化アッセイ
[145]  パーキンｐＵＢの自己ユビキチン化アッセイを使用して、それ自身を自己ユビキチン化するパーキンの能力を活性化する候補化合物の効能を評価する。
【０１８０】
[146]  このアッセイの原理は、Ｅ３リガーゼパーキンは標的タンパク質へのユビキチンの転移を触媒するが、それ自身を自己ユビキチン化する能力も有することである。アッセイに添加されたリン酸化ユビキチン（pUb）は、低分子活性剤によってパーキンがＥ１−Ｅ２カスケード反応を介して自己ユビキチン化することを可能とする状態にパーキンを変化させる。Ｅｕクリプテートユビキチン及びＨｉｓタグ付きパーキンに結合している抗６Ｈｉｓ−ｄ２を使用すると、Ｅｕクリプテートユビキチンがパーキン上に自己ユビキチン化されるとき、ＴＲ−ＦＲＥＴによってモニタリングすることができるシグナルが得られる。
【０１８１】
[147]  実施例２及び実施例３における活性部位反応型プローブアッセイと同様に、活性化化合物を対照と区別することができるスクリーニングは次のとおりである：
１００％活性化シグナル＝ｐＵｂ活性化パーキン＋ＤＭＳＯ中の４０ｎＭ対照活性化剤。
０％活性化シグナル＝ｐＵｂ活性化パーキン＋ＤＭＳＯ単独。
パーキン活性剤は０％活性化シグナルのＴＲ−ＦＲＥＴシグナルの増加により同定することができる。
材料：
アッセイプレート：白色３８４ウエルプレート（Corning 3572）
酵素１：５μＭ  Ｅ１（ユビキチン活性化酵素／UBE1  Boston Biochem E-305）
酵素２：２５μＭ  Ｅ２（UBcH7/Ube2L3  Boston Biochem E2-640）
酵素３：パーキン−Ｈｉｓタグ付き２０３μＭ（１０．５ｍｇ／ｍｌ）Ａｎ２Ｈによって供給される。
ｐＵＢ：２３０μＭ（２ｍｇ／ｍｌ）リン酸化ユビキチン（S65）（Boston Biochem U-102）Ａｎ２Ｈによって供給される。
Ｅｕクリプテート試薬：１．７７μＭユビキチンＥｕ（CisBio 61UBIKLA）２５０μｌの蒸留水で再構成する。
ＤＭＳＯ：ＤＭＳＯ（Sigma cat # D4540 -100ML）
ＰＦ−１２７：Ｐｌｕｒｏｎｉｃ  Ｆ−１２７（Fisher Scientific 50-310-494）
反応緩衝液：５０ｍＭ  ＨＥＰＥＳ、５０ｍＭ  Ｎａｃｌ、１ｍＭ  ＭｇＣｌ２、０．００５％Ｔｗｅｅｎ２０、０．１％  ＰＦ−１２７、ｐＨ８．５
検出緩衝液：５０ｍＭ  ＨＥＰＥＳ、５０ｍＭ  Ｎａｃｌ、８００ｍＭ  ＫＦ、５ｍＭ  ＥＤＴＡ、０．００５％Ｔｗｅｅｎ２０、０．１％  ＰＦ−１２７、ｐＨ８．５
検出試薬Ｚ：検出緩衝液中の１３．４ｎＭ抗６Ｈｉｓ−ｄ２
ｄ２試薬：２．６７μＭ抗６Ｈｉｓ−ｄ２（CisBio 61HISDLA）２５０μｌの蒸留水で再構成する。
【０１８２】
[148]  アッセイ条件：
１０μｌ酵素反応（pUB及び活性化剤単独とともに、１５分プレインキュベーションのパーキン）
パーキン：１９６ｎＭ
ｐＵｂ：３９２ｎＭ
活性化剤／ＤＭＳＯ：１×  活性化剤／１％ＤＭＳＯ
Ｅ１：５ｎＭ
Ｅ２：５０ｎＭ
ユビキチンＥｕ：８．８ｎＭ
反応時間：１２０分
温度：２２℃
総容量：１０μｌ反応
【０１８３】
[149]  検出反応
上の酵素反応の１０μｌを取り、以下の条件下で検出試薬Ｚ１０μｌを添加する：
反応時間：６０分
温度：２２℃
総容量：２０μｌ
【０１８４】
[150]  アッセイ手順：
１）  Ｂｒａｖｏの使用によって、アッセイプレートウエルに４００．０ｎＭパーキン、８００ｎＭ  ｐＵｂの反応緩衝液４．９μｌをロードする。
２）  ＨＰ  Ｄ−３００コンパウンドディスペンサーの使用によって、ＤＭＳＯ中の１００×の活性化剤候補物０．１μｌを供給する。最高１００×  濃度＝１００μｍ、次いで２倍希釈。各化合物及び対照を二連ウエルで添加する。
３）  スピン１０００ｒｐｍ、室温にて、２分。
４）  プレートを室温にて１５分間インキュベートする。
５）  Ｂｒａｖｏの使用によって、１０ｎＭ  Ｅ１、１００ｎＭ  Ｅ２、１７．６ｎＭユビキチンＥｕ及び２ｍＭ  ＡＴＰの反応緩衝液５μｌを添加する。
６）  スピン１０００ｒｐｍ、室温にて、２分。
７）  プレートを室温にて１２０分間インキュベートする。
８）  Ｂｒａｖｏの使用によって、１３，４ｎＭ抗ｈｉｓ  ｄ２の検出緩衝液１０μｌを添加する。
９）  スピン１０００ｒｐｍ、室温にて、２分。
１０）  プレートを室温にて６０分間インキュベートする。
１１）  Ｐｅｒｋｉｎ  Ｅｌｍｅｒ  Ｅｎｖｉｓｉｏｎ装置でプレートを読み取る。
【０１８５】
[151]  データ解析：データはＣＳＶファイルで読み取ることができる。これらのＣＳＶファイルには２つの表があり、それぞれ、６５５ｎｍ（チャネル1）波長の値及び６１５ｎｍ（チャネル2）の波長の値である。データはＨＴＲＦ比=（チャネル1/チャネル2）＊１０，０００に変換されている。
【０１８６】
[152]  すべての０μＭ対照（DMSO単独）の平均＝ＢＫＧＤ（バックグラウンド−０％活性化）。各ＨＴＲＦ比値からＢＫＧＤを差し引く＝ＨＴＲＦ−ＢＫＧＤ。ＤＭＳＯ対照におけるすべての１００μＭ対照活性化剤の平均値=Ｍａｘ（１００％活性化）。次いで次の式を使用して、次のように各ウエル/候補物についての％活性化を算出する：％活性化=（HTRF-BKGD/Max）＊１００。
【０１８７】
[153]  次いで、候補化合物について７５％未満の活性化が見られる場合、化合物力価測定の％活性化を用いて、活性化ＥＣ５０又は最高の％活性化を見出すことができる。
【０１８８】
実施例５：候補電子求核剤及びキレート剤化合物によるパーキンｐＵＢ自己ユビキチン化アッセイ
[154]  パーキンｐＵＢ自己ユビキチン化アッセイを、表１及び／又は表２の種々の化合物を使用して上の実施例４のように行った。少なくとも２つの化合物が、活性部位反応型プローブであるユビキチン−ビニルスルホンによるパーキン活性の増加を示した。図３に示すように、Ｎ，Ｎ‘−（１−フェニル−１Ｈ−１，２，４−トリアゾール−３，５−ジイル）ジベンズアミド、キレート剤化合物（AH001）は自己ユビキチン化アッセイにおいてパーキン活性を高める。さらに、図４に示すように、ｐＵＢを伴うＮ，Ｎ‘−（１−フェニル−１Ｈ−１，２，４−トリアゾール−３，５−ジイル）ジベンズアミド（AH001）は自己ユビキチン化アッセイにおいてパーキン活性化を相乗的に高める。
【０１８９】
[155]  同様に、図５に示すように、６−ベンジル−２，５−ジメチル−３−フェニルピラゾロ［１，５−ａ］ピリミジン−７−チオール、求電子剤（AH007）は自己ユビキチン化アッセイにおいてパーキン活性を高める。この例は、キレート剤も求電子剤も自己ユビキチン化アッセイにおいてパーキンリガーゼ活性を調節する及び／又は高めることができることを、実証している。
【０１９０】
実施例６：残基Ｃ５９及びＣ３７７はパーキンへのモジュレーター結合にとって極めて重要である
[156]  パーキンリガーゼをＡＨ００７化合物とともにインキュベートし、次いで、タンパク質分解消化を行ってパーキンリガーゼの断片を作製した後に、混合物をタンデム質量分光分析に付した。ＡＨ００７を結合した化合物を含む、パーキンの特定の断片を同定し、化合物に対するパーキンの特異的結合残基を明らかにすることを目標とした。化合物Ａｎ２Ｈ０７はまた、質量分析によって分析すると断片化される。したがって、パーキンの特定の残基に結合している、化合物ＡＨ００７の特徴的な断片も同定することができる。
【０１９１】
[157]  これらのフラグメントは、ＡＨ００７の予想される分子量のうち結合している低分子を示すフラグメントサイズにおける変化に対して特徴づけられた。質量分析データによって、パーキンリガーゼの２つの特定残基においてＡＨ００７の３つの特定フラグメントが同定された。データによって、パーキンリガーゼのシステイン残基３７７（Ｃ３７７）に結び付いたＡＨ００７化合物の２５３．０８〜２５６．０９の断片及びＣ３７７に結び付いたＡＨ００７化合物の３４３．１４〜３４６．１４の断片が同定された。データによってまた、パーキンリガーゼのシステイン残基５９（Ｃ５９）に結び付いたＡＨ００７化合物の２５３．０８〜２５６．０９の断片も同定された。したがって、ＡＨ００７化合物とともにインキュベートしたパーキンリガーゼの質量分析のデータによって、化合物はパーキンリガーゼの２つの特定の部位Ｃ５９及びＣ３７７に結合する及び／又は結び付くことが示されている。ＡＨ００７化合物の濃度がパーキンリガーゼを有する混合物中で劇的に高められた場合でも、残基Ｃ５９及びＣ３７７がこの２つのみが観察された一貫した部位であり、したがって可能な結合の他の多数の部位にまさる両部位の特異性が示唆された。また、少なくともＣ３７７はヒトパーキンリガーゼのＺｎＦドメインに組み込まれていると考えられ、したがってこのことは、融通性のあるパーキンリガーゼＺｎＦドメイン中のシステイン残基が低分子候補物による結合及び／又は干渉に対して脆弱であるという理論と一致する。Ｃ５９及び／又はＣ３７７を含むパーキンのペプチド断片は、さらなる調整剤の結合アッセイ及び選択をさらに設計するために有用であろう。
【０１９２】
[158]  本明細書で論じる刊行物は、本出願の出願日前のそれらの開示について示すにすぎない。本発明に先行発明によるこのような刊行物に先行する権利がないことを承認するとして解釈されるものは本明細書には存在しない。
【０１９３】
[159]  本発明は、これの提案された特定の実施形態に関連して説明されてきたが、さらなる変形が可能であることが理解されるであろう。本出願は、本発明の原理に一般に従い、並びに、本発明が関与する技術内の公知の又は通例の実施に付属し、且つ上に示した及び次の添付の請求の範囲に示す本質的な特色に適用されるであろう本開示からのそのような逸脱を含む、本発明の変形、使用又は適用を包含することを意図している。
【図１】
2017538699.tif 000041
【図２】
2017538699.tif 000042
【図３】
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【図４Ａ】
2017538699.tif 000044
【図４Ｂ】
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【図５】
2017538699.tif 000046
【配列表】
2017538699000001.app
【国際調査報告】
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2017538699.tif 000048
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