【手続補正書】
【提出日】平成19年11月27日(2007.11.27)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
単離された核酸分子であって、
（ａ）配列番号１または配列番号４のうちのいずれかに示されるヌクレオチド配列；
（ｂ）ＡＴＣＣ受託番号ＰＴＡ−１７５３およびＰＴＡ−１７５５中のＤＮＡインサートのヌクレオチド配列；
（ｃ）配列番号２または配列番号５のうちのいずれかに示されるポリペプチドをコードするヌクレオチド配列；
（ｄ）（ａ）〜（ｃ）のうちのいずれかの相補体に、中程度または高度にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列；および
（ｅ）（ａ）〜（ｃ）のうちのいずれかに相補的なヌクレオチド配列、
からなる群より選択されるヌクレオチド配列
を含む、単離された核酸分子。
【請求項２】
単離された核酸分子であって、
（ａ）配列番号２または配列番号５のうちのいずれかに示されるポリペプチドに少なくとも約７０％同一であるポリペプチドをコードするヌクレオチド配列であって、該コードされたポリペプチドは、配列番号２または配列番号５のうちのいずれかに示されるポリペプチドの活性を有する、ヌクレオチド配列；
（ｂ）配列番号１もしくは配列番号４のうちのいずれかに示されるヌクレオチド配列、ＡＴＣＣ受託番号ＰＴＡ−１７５３およびＰＴＡ−１７５５中のＤＮＡインサートのヌクレオチド配列、または（ａ）の、対立遺伝子改変体またはスプライス改変体をコードするヌクレオチド配列；
（ｃ）少なくとも約２５アミノ酸残基のポリペプチドフラグメントをコードする、配列番号１もしくは配列番号４のうちのいずれかのヌクレオチド配列、ＡＴＣＣ受託番号ＰＴＡ−１７５３およびＰＴＡ−１７５５中のＤＮＡインサート、（ａ）または（ｂ）の領域であって、該ポリペプチドフラグメントは、配列番号２もしくは配列番号５のうちのいずれかに示されるコードされたポリペプチドの活性を有するかまたは抗原性である、ヌクレオチド配列の領域；
（ｄ）少なくとも約１６ヌクレオチドのフラグメントを含む、配列番号１もしくは配列番号４のうちのいずれかのヌクレオチド配列、ＡＴＣＣ受託番号ＰＴＡ−１７５３およびＰＴＡ−１７５５中のＤＮＡインサート、または（ａ）〜（ｃ）のうちのいずれかの領域；
（ｅ）中程度または高度にストリンジェントな条件下で、（ａ）〜（ｄ）のうちのいずれかの相補体にハイブリダイズする、ヌクレオチド配列；ならびに
（ｆ）（ａ）〜（ｄ）のうちのいずれかに相補的なヌクレオチド配列、
からなる群より選択されるヌクレオチド配列
を含む、単離された核酸分子。
【請求項３】
単離された核酸分子であって、
（ａ）少なくとも１つの保存的アミノ酸置換を有する配列番号２または配列番号５のうちのいずれかに示されるポリペプチドをコードするヌクレオチド配列であって、該コードされたポリペプチドは、配列番号２または配列番号５のうちのいずれかに示されるポリペプチドの活性を有する、ヌクレオチド配列；
（ｂ）少なくとも１つのアミノ酸挿入を有する配列番号２または配列番号５のうちのいずれかに示されるポリペプチドをコードするヌクレオチド配列であって、該コードされたポリペプチドは、配列番号２または配列番号５のうちのいずれかに示されるポリペプチドの活性を有する、ヌクレオチド配列；
（ｃ）少なくとも１つのアミノ酸欠失を有する配列番号２または配列番号５のうちのいずれかに示されるポリペプチドをコードするヌクレオチド配列であって、該コードされたポリペプチドは、配列番号２または配列番号５のうちのいずれかに示されるポリペプチドの活性を有する、ヌクレオチド配列；
（ｄ）Ｃ末端短縮および／またはＮ末端短縮を有する配列番号２または配列番号５のうちのいずれかに示されるポリペプチドをコードするヌクレオチド配列であって、該コードされたポリペプチドは、配列番号２または配列番号５のうちのいずれかに示されるポリペプチドの活性を有する、ヌクレオチド配列；
（ｅ）アミノ酸置換、アミノ酸挿入、アミノ酸欠失、Ｃ末端短縮、およびＮ末端短縮からなる群より選択される少なくとも１つの改変を有する配列番号２または配列番号５のうちのいずれかに示されるポリペプチドをコードするヌクレオチド配列であって、該コードされたポリペプチドは、配列番号２または配列番号５のうちのいずれかに示されるポリペプチドの活性を有する、ヌクレオチド配列；
（ｆ）少なくとも約１６ヌクレオチドのフラグメントを含む（ａ）〜（ｅ）のうちのいずれかのヌクレオチド配列；
（ｇ）中程度または高度にストリンジェントな条件下で、（ａ）〜（ｆ）のうちのいずれかの相補体にハイブリダイズする、ヌクレオチド配列；ならびに
（ｈ）（ａ）〜（ｅ）のうちのいずれかに相補的なヌクレオチド配列、
からなる群より選択されるヌクレオチド配列
を含む、単離された核酸分子。
【請求項４】
請求項１、請求項２または請求項３のうちのいずれか１項に記載の核酸分子を含む、ベクター。
【請求項５】
請求項４に記載のベクターを含む、宿主細胞。
【請求項６】
真核生物細胞である、請求項５に記載の宿主細胞。
【請求項７】
原核生物細胞である、請求項５に記載の宿主細胞。
【請求項８】
Ｓｅｃｓ−１ポリペプチドを産生するための方法であって、
該ポリペプチドを発現するために適切な条件下で請求項５に記載の宿主細胞を培養する工程、および
必要に応じて、該培養物から該ポリペプチドを単離する工程
を包含する、方法。
【請求項９】
請求項８に記載の方法によって産生される、ポリペプチド。
【請求項１０】
請求項８に記載の方法であって、前記核酸分子が、前記Ｓｅｃｓ−１ポリペプチドをコードするＤＮＡに作動可能に連結された、ネイティブなＳｅｃｓ−１ポリペプチドに対するプロモーターＤＮＡ以外のプロモーターＤＮＡを含む、方法。
【請求項１１】
請求項２に記載の単離された核酸分子であって、同一性パーセントは、ＧＡＰ、ＢＬＡＳＴＮ、ＦＡＳＴＡ、ＢＬＡＳＴＡ、ＢＬＡＳＴＸ、ＢｅｓｔＦｉｔ、およびＳｍｉｔｈ−Ｗａｔｅｒｍａｎアルゴリズムからなる群より選択されるコンピュータープログラムを用いて決定される、単離された核酸分子。
【請求項１２】
化合物がＳｅｃｓ−１ポリペプチド活性またはＳｅｃｓ−１ポリペプチド産生を阻害するか否かを決定するための方法であって、
請求項５、請求項６、または請求項７のうちのいずれか１項に記載の細胞を該化合物に曝露する工程、および
該細胞におけるＳｅｃｓ−１ポリペプチド活性またはＳｅｃｓ−１ポリペプチド産生を測定する工程
を包含する、方法。
【請求項１３】
単離されたポリペプチドであって、
（ａ）配列番号２または配列番号５のうちのいずれかに示されるアミノ酸配列；および
（ｂ）ＡＴＣＣ受託番号ＰＴＡ−１７５３およびＰＴＡ−１７５５中のＤＮＡインサートによってコードされるアミノ酸配列、
からなる群より選択されるアミノ酸配列
を含む、単離されたポリペプチド。
【請求項１４】
単離されたポリペプチドであって、
（ａ）配列番号３または配列番号６のうちのいずれかに示されるアミノ酸配列であって、必要に応じてアミノ末端メチオニンをさらに含む、アミノ酸配列；
（ｂ）配列番号２または配列番号５のうちのいずれかのオルソログに対するアミノ酸配列；
（ｃ）配列番号２または配列番号５のうちのいずれかのアミノ酸配列に少なくとも約７０％同一であるアミノ酸配列であって、該ポリペプチドは、配列番号２または配列番号５のうちのいずれかに示されるポリペプチドの活性を有する、アミノ酸配列；
（ｄ）少なくとも約２５アミノ酸残基を含む配列番号２または配列番号５のうちのいずれかに示されるアミノ酸配列のフラグメントであって、該フラグメントは、配列番号２または配列番号５のうちのいずれかに示されるポリペプチドの活性を有するか、または抗原性である、フラグメント；ならびに
（ｅ）配列番号２もしくは配列番号５のうちのいずれかに示されるアミノ酸配列、ＡＴＣＣ受託番号ＰＴＡ−１７５３およびＰＴＡ−１７５５中のＤＮＡインサートによってコードされるアミノ酸配列、または（ａ）〜（ｃ）のうちのいずれかの、対立遺伝子改変体またはスプライス改変体のアミノ酸配列、
からなる群より選択されるアミノ酸配列
を含む、単離されたポリペプチド。
【請求項１５】
単離されたポリペプチドであって、
（ａ）少なくとも１つの保存的アミノ酸置換を有する配列番号２または配列番号５のうちのいずれかに示されるアミノ酸配列であって、該ポリペプチドは、配列番号２または配列番号５のうちのいずれかに示されるポリペプチドの活性を有する、アミノ酸配列；
（ｂ）少なくとも１つのアミノ酸挿入を有する配列番号２または配列番号５のうちのいずれかに示されるアミノ酸配列であって、該ポリペプチドは、配列番号２または配列番号５のうちのいずれかに示されるポリペプチドの活性を有する、アミノ酸配列；
（ｃ）少なくとも１つのアミノ酸欠失を有する配列番号２または配列番号５のうちのいずれかに示されるアミノ酸配列であって、該ポリペプチドは、配列番号２または配列番号５のうちのいずれかに示されるポリペプチドの活性を有する、アミノ酸配列；
（ｄ）Ｃ末端短縮および／またはＮ末端短縮を有する配列番号２または配列番号５のうちのいずれかに示されるアミノ酸配列であって、該ポリペプチドは、配列番号２または配列番号５のうちのいずれかに示されるポリペプチドの活性を有する、アミノ酸配列；ならびに
（ｅ）アミノ酸置換、アミノ酸挿入、アミノ酸欠失、Ｃ末端短縮、およびＮ末端短縮からなる群より選択される少なくとも１つの改変を有する配列番号２または配列番号５のうちのいずれかに示されるアミノ酸配列であって、該ポリペプチドは、配列番号２または配列番号５のうちのいずれかに示されるポリペプチドの活性を有する、アミノ酸配列、
からなる群より選択されるアミノ酸配列
を含む、単離されたポリペプチド。
【請求項１６】
請求項１、請求項２、または請求項３のうちのいずれか１項に記載の核酸分子によってコードされる単離されたポリペプチドであって、該ポリペプチドは、配列番号２または配列番号５のうちのいずれかに示されるポリペプチドの活性を有する、単離されたポリペプチド。
【請求項１７】
請求項１４に記載の単離されたポリペプチドであって、同一性パーセントは、ＧＡＰ、ＢＬＡＳＴＰ、ＦＡＳＴＡ、ＢＬＡＳＴＡ、ＢＬＡＳＴＸ、ＢｅｓｔＦｉｔ、およびＳｍｉｔｈ−Ｗａｔｅｒｍａｎアルゴリズムからなる群より選択されるコンピュータープログラムを用いて決定される、単離されたポリペプチド。
【請求項１８】
請求項１３、請求項１４、または請求項１５のうちのいずれか１項に記載のポリペプチドに特異的に結合する、選択的結合因子またはそのフラグメント。
【請求項１９】
配列番号２もしくは配列番号５のうちのいずれかに示されるアミノ酸配列を含むポリペプチド、またはそのフラグメントに特異的に結合する、請求項１８に記載の選択的結合因子またはそのフラグメント。
【請求項２０】
抗体またはそのフラグメントである、請求項１８に記載の選択的結合因子。
【請求項２１】
ヒト化抗体である、請求項１８に記載の選択的結合因子。
【請求項２２】
ヒト抗体またはそのフラグメントである、請求項１８に記載の選択的結合因子。
【請求項２３】
ポリクローナル抗体またはそのフラグメントである、請求項１８に記載の選択的結合因子。
【請求項２４】
モノクローナル抗体またはそのフラグメントである、請求項１８に記載の選択的結合因子。
【請求項２５】
キメラ抗体またはそのフラグメントである、請求項１８に記載の選択的結合因子。
【請求項２６】
ＣＤＲ接続抗体またはそのフラグメントである、請求項１８に記載の選択的結合因子。
【請求項２７】
抗イディオタイプ抗体またはそのフラグメントである、請求項１８に記載の選択的結合因子。
【請求項２８】
可変領域フラグメントである、請求項１８記載の選択的結合因子。
【請求項２９】
ＦａｂフラグメントまたはＦａｂ’フラグメントである、請求項２８に記載の可変領域フラグメント。
【請求項３０】
配列番号２または配列番号５のうちのいずれかのアミノ酸配列を有するポリペプチドに特異性を有する少なくとも１つの相補性決定領域を含む、選択的結合因子またはそのフラグメント。
【請求項３１】
検出可能標識に結合される、請求項１８に記載の選択的結合因子。
【請求項３２】
Ｓｅｃｓ−１ポリペプチドの生物学的活性を拮抗する、請求項１８に記載の選択的結合因子。
【請求項３３】
Ｓｅｃｓ−１ポリペプチド関連の疾患、状態、または障害を、処置、予防、または改善するための方法であって、
請求項１８に記載の選択的結合因子の有効量を患者に投与する工程
を包含する、方法。
【請求項３４】
配列番号２または配列番号５のうちのいずれかのアミノ酸配列を含むポリペプチドで動物を免疫することによって産生される、選択的結合因子。
【請求項３５】
請求項１、請求項２、または請求項３のうちのいずれか１項に記載のポリペプチドに結合し得る選択的結合因子を産生する、ハイブリドーマ。
【請求項３６】
請求項１８に記載の抗Ｓｅｃｓ−１抗体またはフラグメントを用いて、Ｓｅｃｓ−１ポリペプチドの量を検出または定量するための方法。
【請求項３７】
請求項１３、請求項１４、または請求項１５のうちのいずれか１項に記載のポリペプチド、および薬学的に受容可能な処方剤を含む、組成物。
【請求項３８】
前記薬学的に受容可能な処方剤が、キャリア、アジュバント、溶解剤、安定剤、または抗酸化剤である、請求項３７に記載の組成物。
【請求項３９】
前記ポリペプチドが、配列番号３または配列番号６のうちのいずれかに示されるアミノ酸配列を含む、請求項３７に記載の組成物。
【請求項４０】
請求項１３、請求項１４、または請求項１５のうちのいずれか１項に記載のポリペプチドの誘導体を含む、ポリペプチド。
【請求項４１】
水溶性ポリマーを用いて共有結合的に改変された、請求項４０に記載のポリペプチド。
【請求項４２】
請求項４１に記載のポリペプチドであって、前記水溶性ポリマーが、ポリエチレングリコール、モノメトキシポリエチレングリコール、デキストラン、セルロース、ポリ−（Ｎ−ビニルピロリドン）ポリエチレングリコール、プロピレングリコールホモポリマー、ポリプロピレンオキシド／エチレンオキシドコポリマー、ポリオキシエチル化ポリオール、およびポリビニルアルコールからなる群より選択される、ポリペプチド。
【請求項４３】
請求項１、請求項２、または請求項３のうちのいずれか１項に記載の核酸分子および薬学的に受容可能な処方剤を含む、組成物。
【請求項４４】
前記核酸分子が、ウイルスベクター中に含まれる、請求項４３に記載の組成物。
【請求項４５】
請求項１、請求項２、または請求項３のうちのいずれか１項に記載の核酸分子を含む、ウイルスベクター。
【請求項４６】
異種アミノ酸配列に融合された、請求項１３、請求項１４、または請求項１５のうちのいずれか１項に記載のポリペプチドを含む、融合ポリペプチド。
【請求項４７】
前記異種アミノ酸配列が、ＩｇＧ定常ドメインまたはそのフラグメントである、請求項４６に記載の融合ポリペプチド。
【請求項４８】
医学的状態を処置、予防、または改善するための方法であって、
請求項１３、請求項１４、もしくは請求項１５のうちのいずれか１項に記載のポリペプチド、または請求項１、請求項２、もしくは請求項３のうちのいずれか１項に記載の核酸によってコードされるポリペプチドを患者に投与する工程
を包含する、方法。
【請求項４９】
処置、予防または改善される前記医学的状態が、造血障害、骨粗しょう症、大理石骨病、骨形成不全症、ページエット病、歯周病、高カルシウム血症、急性糸球体腎炎、慢性糸球体腎炎、癌、糖尿病、肥満、または悪液質である、請求項４８に記載の方法。
【請求項５０】
被験体において病的状態または病的状態に対する感受性を診断するための方法であって、
（ａ）サンプル中の、請求項１３、請求項１４、もしくは請求項１５のうちのいずれか１項に記載のポリペプチド、または請求項１、請求項２、もしくは請求項３のうちのいずれか１項に記載の核酸分子によってコードされるポリペプチドの、発現の存在または発現量を決定する工程；および
（ｂ）該ポリペプチドの発現の存在または発現量に基づいて、病的状態または病的状態に対する感受性を診断する工程、
を包含する、方法。
【請求項５１】
デバイスであって、
（ａ）移植に適した膜；および
（ｂ）該膜内にカプセル化された細胞であって、該細胞は、請求項１３、請求項１４、もしくは請求項１５のうちのいずれか１項に記載のタンパク質を分泌する、細胞；
を備え、
該膜は、該タンパク質に対して透過性であり、そして該細胞に有害な物質に対して不透過性である、デバイス。
【請求項５２】
Ｓｅｃｓ−１ポリペプチドに結合する化合物を同定するための方法であって、
（ａ）請求項１３、請求項１４、もしくは請求項１５のうちのいずれか１項に記載のポリペプチドを、化合物と接触させる工程；および
（ｂ）該化合物に対する該Ｓｅｃｓ−１ポリペプチドの結合の程度を決定する工程、
を包含する、方法。
【請求項５３】
前記化合物に結合した場合に、前記ポリペプチドの活性を決定する工程をさらに包含する、請求項５２に記載の方法。
【請求項５４】
動物においてポリペプチドのレベルを調節するための方法であって、
請求項１、請求項２、または請求項３のうちのいずれか１項に記載の核酸分子を該動物に投与する工程
を包含する、方法。
【請求項５５】
請求項１、請求項２、または請求項３のうちのいずれか１項に記載の核酸分子を含む、トランスジェニック非ヒト哺乳動物。
【請求項５６】
化合物がＳｅｃｓ−１ポリペプチド活性またはＳｅｃｓ−１ポリペプチド産生を阻害するか否かを決定するための方法であって、
請求項５５に記載のトランスジェニック哺乳動物を該化合物に曝露する工程、および
該哺乳動物におけるＳｅｃｓ−１ポリペプチド活性またはＳｅｃｓ−１ポリペプチド産生を測定する工程
を包含する、方法。