(57)【特許請求の範囲】
【請求項１】
配列表の配列番号１、配列番号２、配列番号３、配列番号４または配列番号５に記載のアミノ酸配列からなる抗菌性ペプチド。
【請求項２】
請求項１に記載の抗菌性ペプチドを含有することを特徴とする抗菌剤。
【発明の詳細な説明】
【０００１】
【発明の属する技術分野】
本発明は抗菌性ペプチドおよび当該抗菌性ペプチドの設計に関する。
【０００２】
【従来の技術】
抗菌性ペプチドは幅広い抗菌スペクトルを有し、薬剤耐性菌が出現し難いと考えられていることから、ヒトおよび動物の細菌感染性疾患の予防や治療、或いは、食材などの物品に抗菌性を付与する目的に抗菌性ペプチドの利用が期待されている。
これまでに多くの抗菌性ペプチドが動植物から単離されている。例えば、タイワンカブトムシ由来の抗菌性ペプチドおよび当該抗菌性ペプチドを有効成分とする抗菌剤が開示されている（例えば特許文献１参照）。
また、サソリ毒由来の抗菌性ペプチドおよび当該抗菌性ペプチドを有効成分とする抗菌剤が開示されている（例えば特許文献２参照）。
上記記載の抗菌性ペプチドは、いずれもリジン、アルギニンおよび／またはヒスチジンなどの塩基性アミノ酸を含むもので、ペプチド分子全体の電荷が正となるカチオン性抗菌性ペプチドと呼ばれるものである。これら抗菌性ペプチドの作用原理は、抗菌性ペプチド中の正に荷電した塩基性アミノ酸部分が菌表面の膜と静電相互作用することによるものと考えられている（例えば、非特許文献１参照）。
上記の各公報に記載の抗菌性ペプチドは、何れも自然界において元々抗菌性ペプチドとして存在していたものを発見し単離したもの（或いは天然型抗菌性ペプチドのアミノ酸配列を一部改変したペプチド）であり、当該抗菌性ペプチドの抗菌活性や抗菌スペクトルを上回る抗菌性能を有するものを開発することは困難である。
【０００３】
○先行文献
【特許文献１】
特開２０００−０６３４００号公報（特許請求の範囲）
【特許文献２】
特開２００１−１８６８８７号公報（特許請求の範囲）
【非特許文献１】
Ｍ．Ｚａｓｌｏｆｆ、「Ｎａｔｕｒｅ」，２００２年，４１５巻，ｐ．３８９−３９５
【０００４】
【発明が解決しようとする課題】
本発明は、既知の抗菌性ペプチドのアミノ酸残基を置換する従前の抗菌性ペプチドの開発アプローチによらず、自然界において抗菌性ペプチドとして存在し機能しているペプチドとは異なるアミノ酸配列の抗菌性ペプチドを提供することを目的の一つとする。
【０００５】
【課題を解決するための手段】
本発明者らは、鋭意検討した結果、ペプチド分子中に２ヶ所の塩基性アミノ酸残基による配列部を持つこと、およびペプチド両末端が疎水性であるという特徴を抗菌性ペプチドの分子設計に取り入れることで、高い抗菌活性を発揮し、グラム陰性細菌、グラム陽性細菌、およびＭＲＳＡなどの薬剤耐性菌に対して幅広い抗菌スペクトルを有する抗菌性ペプチドを実現できることを見出し、本発明を完成するに至った。
本発明の設計方法によって提供される抗菌性ペプチドは、天然に存在しない人為的に合成された抗菌性ペプチドである。また、本発明によって提供される抗菌性ペプチドをコードするヌクレオチド配列および／または該配列と相補的なヌクレオチド配列を含む（典型的には該配列により実質的に構成される）天然に存在しない人為的に合成されたポリヌクレオチドが提供される。
【０００６】
本発明により、本発明の抗菌性ペプチドを成分として含有する抗菌剤が提供される。典型的には、当該抗菌剤は、用途に応じて、本発明の抗菌性ペプチドの他に製薬上許容される担体を含有する。また、本発明の抗菌性ペプチドをコードするヌクレオチド配列および／または該配列と相補的なヌクレオチド配列を含むか或いはそれら配列により実質的に構成される、天然に存在しない人為的に合成されたポリヌクレオチド（ＤＮＡセグメントまたはＲＮＡセグメントの形態であり得る）が提供される。
【０００７】
【発明の実施の形態】
以下、本発明の実施形態を説明する。
なお、本明細書において特に言及している事項（例えば抗菌性ペプチドの一次構造や鎖長）以外の事柄であって本発明の実施に必要な事柄（例えばペプチド合成、ポリヌクレオチド合成、ペプチドを成分とする薬剤の調製に関するような一般的事項など）は、有機化学、生化学、遺伝子工学、タンパク質工学、分子生物学、薬学、医学などの分野における従来技術に基づく当業者の設計事項として把握され得る。本発明は、本明細書に開示されている内容と当該分野における技術常識とに基づいて実施することができる。なお、以下の説明では、アミノ酸をＩＵＰＡＣ−ＩＵＢガイドラインで示されたアミノ酸に関する命名法に準拠した１文字表記（但し配列表では３文字表記）で表す。
【０００８】
ここで「天然に存在しない人為的に合成された抗菌性ペプチドまたはポリヌクレオチド」とは、そのペプチド鎖またはヌクレオチド鎖（全長）がそれ単独で自然界に存在するものではなく、化学合成或いは生合成（即ち遺伝子工学に基づく生産）によって人為的に製造された抗菌性ペプチドまたはポリヌクレオチドをいう。ここで「ペプチド」とは、複数のペプチド結合を有するアミノ酸ポリマーを指す用語であり、ペプチド鎖に含まれるアミノ酸残基の数によって限定されない。アミノ酸残基数が１０未満の所謂オリゴペプチドも本明細書におけるペプチドに包含される。また、「ポリヌクレオチド」とは、複数のヌクレオチドがリン酸ジエステル結合で結ばれたポリマー（核酸）を指す用語であり、ヌクレオチドの数によって限定されない。種々の長さのＤＮＡフラグメントおよびＲＮＡフラグメントが本明細書におけるポリヌクレオチドに包含される。
【０００９】
○抗菌性ペプチドの設計
１９３５年、Ｄｏｍａｇｋによって開発されたカチオン性界面活性剤である長鎖アルキル基を持つ第４アンモニウム塩が、抗菌剤として優れた特性をもち広く利用されていること、および長鎖アルキル基を持つ第４アンモニウム塩部分を分子内に２ヶ所有するという構造的特徴を持つビス型第４アンモニウム塩化合物が、第４アンモニウム塩を１つ有する化合物と比較して、抗菌力が著しく向上し、環境、ｐＨや温度などの影響に対してもほとんど受けなくなることを基礎にして、本発明の抗菌性ペプチドの設計方法を完成させた。
【００１０】
即ち、抗菌性ペプチドの末端ではない２ヶ所に塩基性アミノ酸残基部を持つこと、この塩基性アミノ酸残基部をつなぐ疎水性および／または中性のアミノ酸残基部（なお、当該塩基性アミノ酸残基部に隣接しないで塩基性アミノ酸残基を有することもある）、およびペプチドの両末端に疎水性のアミノ酸残基部を有するという特徴を抗菌性ペプチドの分子設計に取り入れることで、高い抗菌活性を発揮し、グラム陰性細菌、グラム陽性細菌、およびＭＲＳＡなどの薬剤耐性菌に対して幅広い抗菌スペクトルを有する抗菌性ペプチドを得ることが実現できた。
【００１１】
即ち、本発明によって提供される抗菌性ペプチドは、直鎖状の抗菌性ペプチドであって、以下の（１）〜（５）の特徴：
（１）．全アミノ酸残基数が１０〜２０個である；
（２）．Ｎ末端側から見たペプチド配列の中心までの配列とＣ末端側から見たペプチド配列の中心までの配列とが同一である対称型のペプチド配列を有する；
（３）．Ｎ末端部およびＣ末端部はそれぞれ１個以上の疎水性アミノ酸残基により構成される；
（４）．前記Ｎ末端部に隣接して塩基性アミノ酸残基が２個以上連続している部位があり、且つ、前記Ｃ末端部に隣接して塩基性アミノ酸残基が２個以上連続している部位がある；および
（５）．前記Ｎ末端部寄りの塩基性アミノ酸残基が２個以上連続している部位と前記Ｃ末端部寄りの塩基性アミノ酸残基が２個以上連続している部位とに挟まれたペプチド配列の中心部は、２〜８個のアミノ酸残基で構成され、ここで該中心部は疎水性アミノ酸残基および／または中性アミノ酸残基により構成されるが、例外として前記Ｎ末端部寄りおよびＣ末端部寄りそれぞれの塩基性アミノ酸残基が２個以上連続している部位に隣接しないことを条件に塩基性アミノ酸残基を含み得る；
をいずれも具備する、抗菌性ペプチドである。
【００１２】
【００１３】
【００１４】
【００１５】
本発明の抗菌性ペプチドにおける塩基性のアミノ酸残基に該当するアミノ酸としては、好ましくは前記塩基性アミノ酸残基が２個以上連続している部位は、リジンおよび／またはアルギニンにより構成される。
【００１６】
抗菌性ペプチドにおける疎水性のアミノ酸残基に該当するアミノ酸としては、バリン、ロイシン、イソロイシン、フェニルアラニン、トリプトファン、プロリン、グリシン、アラニンおよびメチオニンなどであり、好ましくはバリン、ロイシン、イソロイシン、フェニルアラニンおよびアラニンであり、更に好ましくは前記Ｎ末端部およびＣ末端部は、バリン、ロイシン、イソロイシンおよびアラニンから成る群から選択される１個以上の疎水性アミノ酸残基により構成される。
【００１７】
抗菌性ペプチドにおける疎水性および／または中性のアミノ酸残基に該当するアミノ酸としては、バリン、ロイシン、イソロイシン、フェニルアラニン、トリプトファン、グリシン、アラニン、メチオニン、セリン、トレオニン、システイン、チロシン、アスパラギンおよびグルタミンなどが例示でき、好ましくはバリン、ロイシン、イソロイシン、フェニルアラニン、トリプトファン、グリシン、アラニン、セリン、トレオニンであり、更に好ましくは前記ペプチド配列の中心部を構成する疎水性アミノ酸残基および／または中性アミノ酸残基は、バリン、トリプトファン、グリシン、アラニン、セリンおよびトレオニンから成る群から選択される１個以上の疎水性アミノ酸残基および／または中性アミノ酸残基である。
【００１８】
本発明によって提供される直鎖状の抗菌性ペプチドを設計する方法は、以下の（１）〜（５）：
（１）．全アミノ酸残基数が１０〜２０個である；
（２）．Ｎ末端側から見たペプチド配列の中心までの配列とＣ末端側から見たペプチド配列の中心までの配列とが同一である対称型のペプチド配列を有する；
（３）．Ｎ末端部およびＣ末端部はそれぞれ１個以上の疎水性アミノ酸残基により構成される；
（４）．前記Ｎ末端部に隣接して塩基性アミノ酸残基が２個以上連続している部位があり、且つ、前記Ｃ末端部に隣接して塩基性アミノ酸残基が２個以上連続している部位がある；および
（５）．前記Ｎ末端部寄りの塩基性アミノ酸残基が２個以上連続している部位と前記Ｃ末端部寄りの塩基性アミノ酸残基が２個以上連続している部位とに挟まれたペプチド配列の中心部は、２〜８個のアミノ酸残基で構成され、ここで該中心部は疎水性アミノ酸残基および／または中性アミノ酸残基により構成されるが、例外として前記Ｎ末端部寄りおよびＣ末端部寄りそれぞれの塩基性アミノ酸残基が２個以上連続している部位に隣接しないことを条件に塩基性アミノ酸残基を含み得る；
をいずれも具備するペプチド鎖を合成することを特徴とする設計方法である。
【００１９】
本発明の抗菌性ペプチドは、アミノ酸残基としてＬ型アミノ酸および／またはＤ型アミノ酸を用いることができるが、Ｌ型アミノ酸であるものが好ましい。
本発明の抗菌性ペプチドは、抗菌活性を失わない限りにおいて、アミノ酸残基の一部または全部が「抗原」になり難いという観点から直鎖状が好ましい。このような形状のペプチドはエピトープを構成し難い。
【００２０】
かかる観点から、抗菌性ペプチドとしては、直鎖状であり比較的低分子量なものであり、特にアミノ酸残基数が１０〜２０のものが好ましい。
【００２１】
また、Ｎ末端のアミノ基およびＣ末端のカルボキシル基を化学修飾することもでき、例えば、Ｎ末端のアミノ基のホルミル化またはアシル化であり、Ｃ末端のカルボキシル基のアミド化を行うことが抗菌力を高めることに有効である場合がある。Ｎ末端のアミノ基のアシル化としては、アセチル基、プロピル基、ブチル基などの低級脂肪酸によるもの、または高級脂肪酸によるものでも良く、分岐を有していてもよい。
【００２２】
【００２３】
本発明の抗菌性ペプチドは、ペプチド配列が対称型のものが好ましい。この対称型のペプチド配列とは、Ｎ末端側から見た抗菌性ペプチド配列の中心までの配列とＣ末端側から見た抗菌性ペプチド配列の中心までの配列とが同一であるペプチド配列である。例えば、
ＶＬＬＫＲＡＡＲＫＬＬＶ
のような配列をいう。即ち、Ｎ末側からは、「ＶＬＬＫＲＡ」の配列であり、Ｃ末側からは、「ＡＲＫＬＬＶ」の配列であり、ペプチド配列の中心から左右対称となっているものである。なお、アミノ酸残基数が奇数の場合は、中心のアミノ酸残基から左右対称となっているものである。
アミノ酸には、ロイシンをイソロイシンに置換しても同一の性能を示すものがあり、このようなもので置換した配列のものは、同一と見なすことができる。
【００２４】
置換同一性のアミノ酸としては、
バリンでは、イソロイシン、ロイシン
ロイシンでは、イソロイシン、バリン
イソロイシンでは、ロイシン、バリン
トリプトファンでは、チロシン
セリンでは、トレオニン
トレオニンでは、セリン
アラニンでは、グリシン、セリン
グリシンでは、アラニン
リジンでは、アルギニン
アルギニンでは、リジン
などである。
【００２５】
本発明によって提供される新規なアミノ酸配列の抗菌性ペプチドの具体例として、配列番号１、配列番号２、配列番号３、配列番号４または配列番号５に示されるアミノ酸配列から実質的に構成されるペプチドが挙げられる。これら５種のペプチドは、何れも２０アミノ酸以下（具体的には１１〜１５アミノ酸）で構成されており、直鎖形状を維持するのに好適である。また、免疫原性も低いために抗菌剤の成分（抗菌成分）として好適である。
【００２６】
本発明の抗菌性ペプチドは、一般的な化学合成法に準じて容易に製造することができる。例えば、従来公知の固相合成法または液相合成法のいずれを採用してもよい。アミノ基の保護基としてＢｏｃ（t-butyloxycarbonyl）、或いはＦｍｏｃ（9-fluorenylmethoxycarbonyl）を適用した固相合成法が好適である。
本発明の抗菌性ペプチドは、市販のペプチド合成機（例えば、Applied Biosystems社などから入手可能である。）を用いた固相合成法により、所望するアミノ酸配列、修飾（Ｃ末端アミド化など）部分を有するペプチド鎖を合成することができる。
【００２７】
本発明は、従前の抗菌性ペプチド含有抗菌剤の開発アプローチによらず、自然界において抗菌性ペプチドとして存在し機能しているペプチドとは異なるアミノ酸配列の抗菌性ペプチドおよび該ペプチドをコードするポリヌクレオチドを提供することを目的の一つとする。また、そのような抗菌性ペプチドまたは該ペプチドをコードするポリヌクレオチドを成分とする抗菌剤（薬学上の組成物）の提供を目的の一つとする。
【００２８】
或いは、遺伝子工学的手法に基づいて本発明の抗菌性ペプチドを生合成してもよい。このアプローチは、比較的鎖長の長いペプチドを製造する場合に好適である。すなわち、所望する抗菌性ペプチドのアミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列（ＡＴＧ開始コドンを含む）のＤＮＡを合成する。そして、このＤＮＡと該アミノ酸配列を宿主細胞内で発現させるための種々の調節エレメント（プロモーター、リボゾーム結合部位、ターミネーター、エンハンサー、発現レベルを制御する種々のシスエレメントを包含する）とから成る発現用遺伝子構築物を有する組換えベクターを、宿主細胞に応じて構築する。一般的な技法によって、この組換えベクターを所定の宿主細胞（例えばイースト、昆虫細胞、植物細胞、動物（哺乳類）細胞）に導入し、所定の条件で当該宿主細胞または該細胞を含む組織や個体を培養する。このことにより、目的とするペプチドを細胞内で発現、生産させることができる。そして、宿主細胞（分泌された場合は培地中）からペプチドを単離し、精製することによって、目的の抗菌性ペプチドを得ることができる。
【００２９】
本発明の抗菌性ペプチドをコードするヌクレオチド配列および／または該配列と相補的なヌクレオチド配列から実質的に構成されるポリヌクレオチドは、従来公知の方法によって容易に製造（合成）することができる。すなわち、抗菌性ペプチドのアミノ酸配列を構成する各アミノ酸残基に対応するコドンを選択し、抗菌性ペプチドのアミノ酸配列に対応するヌクレオチド配列を容易に決定することができる。ひとたびヌクレオチド配列が決定されれば、ＤＮＡ合成機などを利用して、所望するヌクレオチド配列に対応するポリヌクレオチド（一本鎖）を容易に得ることができる。さらに得られた一本鎖ＤＮＡを鋳型として用い、種々の酵素的合成手段を採用して目的の二本鎖ＤＮＡを得ることができる。
【００３０】
本発明によって提供されるポリヌクレオチドは、ＲＮＡ（ｍＲＮＡなど）の形態であってもよく、ＤＮＡの形態であってもよい。ＤＮＡは、二本鎖または一本鎖で提供され得る。一本鎖で提供される場合は、コード鎖（センス鎖）であってもよく、それと相補的な配列の非コード鎖（アンチセンス鎖）であってもよい。
本発明によって提供されるポリヌクレオチドは、種々の宿主細胞中で本発明の抗菌性ペプチドを発現させるための組換え遺伝子（発現カセット）を構築するための材料として使用することができる。
【００３１】
例えば、本発明に係る抗菌性ペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するポリヌクレオチドと、該アミノ酸配列を宿主細胞内で発現させるための種々の調節エレメント（プロモーター、リボゾーム結合部位、ターミネーター、エンハンサー、発現レベルを制御する種々のシスエレメントなどを包含する。）とを用いて外来ペプチド発現用遺伝子構築物を有する組換えベクターを構築することができる。ベクターの構成やその構築に使用される調節エレメントの種類は、目的とする宿主細胞のタイプに依存して異なり得る。組換えベクターの構築には、遺伝子工学分野でよく理解されている種々の制限酵素によるポリヌクレオチド切断技法（restriction）やポリヌクレオチド断片連結技法（ligation）が採用される。これら技法は、市販されている種々の装置類を利用することによって容易に行うことができる。なお、組換えベクターの構築方法および構築した組換えベクターの宿主細胞への導入方法などは、当該分野で従来から行われている方法をそのまま採用すればよく、かかる方法自体は特に本発明を特徴付けるものではないため、詳細な説明は省略する。
【００３２】
本発明の抗菌性ペプチドは、広い抗菌スペクトルを有していることから、抗菌剤、殺菌剤、消毒剤、防腐剤、防臭剤などの成分として好適に用いられる。例えば、細菌感染症の治療、創傷面の消毒、眼病予防、ロ腔内洗浄（例えばうがい）や練り歯磨き用の抗菌剤または殺菌剤、化粧品の防腐剤、コンタクトレンズの保存、食品の防腐剤や鮮度保持剤、台所用品、浴室用品およびトイレ用品などの静菌剤または殺菌剤、家具や衛生機器表面の殺菌剤または静菌剤などに用いることができる。また、衣類やカーテンなどの繊維製品の静菌剤または殺菌剤、壁や床の静菌剤または殺菌剤、さらには各種用水例えば工業用水、ビル管理用水および浴用水などの殺菌剤、静菌剤または防腐剤などに用いることができる。また、抗菌または殺菌作用から防臭効果も期待できる。更に、農業分野での静菌剤または殺菌剤として、例えば作物や農業資材に対する農薬などとして使用できる。また、畜産・養蜂業分野での静菌剤または殺菌剤として、例えば畜産飼料の防腐剤として、養蜂箱の静菌剤または殺菌剤などに用いることができる。また、漁業分野での静菌剤または殺菌剤として、例えば養魚場において細菌に感染した魚の治療、網や手袋などの資材の殺菌などに用いることができる。
本発明の抗菌性ペプチドは、１〜１０００μｇ／ｍｌ含有することで、上記に記載した抗菌剤、殺菌剤などに使用することができる。
【００３３】
本発明の抗菌性ペプチドを含有する抗菌剤の形態に関して特に限定はない。例えば、内用剤および外用剤の典型的な形態として、液剤、懸濁剤、乳剤、エアロゾル、泡沫剤、顆粒剤、粉末剤、錠剤、カプセル、軟膏、クリームなどが挙げられる。また、注射などに用いるため、使用直前に生理食塩水などに溶解して薬液を調製するための凍結乾燥物、造粒物とすることもできる。
【００３４】
本発明の抗菌性ペプチドを含有する抗菌剤などの製剤において、他の担体すなわち副次的成分（製薬上許容されるもの）としては、抗菌剤などの用途や形態に応じて適宜異なり得るが、種々の充填剤、増量剤、結合剤、付湿剤、表面活性剤、賦形剤、色素、香料など一般的に製剤として製造するときに用いるものが使用できる。
なお、本発明の抗菌性ペプチドおよび種々の担体を材料にして上記形態の各種薬剤を調製するプロセス自体は公知の方法に準じればよく、かかる製剤方法自体は本発明を特徴付けるものでもないため詳細な説明は省略する。
【００３５】
本発明の抗菌性ペプチドによって提供される抗菌剤は、その形態および目的に応じた方法や用量で使用することができる。例えば、液剤は、静脈内、筋肉内、皮下、皮内若しくは腹腔内への注射によって投与することができる。また、鼻腔内や気管支内に噴霧して投与してもよい。また、錠剤などの固体形態のものは経口投与することができる。このときの投与量は、目的とする菌に対する抗菌活性から算出することができる。
【００３６】
また、衛生陶器表面の消毒（殺菌）や食品の防腐目的に使用する場合は、比較的多量（例えば１〜１００ｍｇ／ｍｌ）の本発明の抗菌性ペプチドを含有する液剤を対象物の表面に直接スプレーするか、或いは、当該液剤で濡れた布や紙で対象物の表面を拭くことにより行うことができる。これらは例示にすぎず、従来の抗菌剤による農薬、医薬部外品などの抗菌剤や消毒剤と同じ形態、使用方法を適用することができる。
【００３７】
例えば、放射線治療を受けているガン患者やエイズ患者は、免疫不全症を合併症として発症し、本来の疾病それ自体の原因であることよりも細菌感染により重篤な症状をきたすことがある。本発明によって提供される抗菌性ペプチドは、細菌に選択的に抗菌作用を示すとともにヒトなどの哺乳動物に対しては毒性を有しない。このため、本発明に係る抗菌性ペプチドは、抗菌剤の成分として有用であり、本発明によって提供される抗菌剤は人体に対して安全に適用することができる。
【００３８】
再生医療の分野において、皮膚、骨、各種の臓器などの培養時における細菌感染を防止することを目的として本発明の抗菌性ペプチドを用いることができる。例えば、適当な濃度で本発明の抗菌性ペプチド単独または当該ペプチドを成分の一つとする抗菌剤を培養液中に添加することにより、培養中の組織や臓器などの細菌感染を防止することができる。
【００３９】
また、培養細胞や培養組織に対して、本発明の抗菌性ペプチドをコードするポリヌクレオチドを遺伝子治療に使用する素材として用いることができる。例えば、本発明の抗菌性ペプチドをコードする遺伝子（ＤＮＡセグメントまたはＲＮＡセグメント）を適当なベクターに組み込み、目的とする培養組織（細胞）に導入することにより、常時或いは所望する時期に培養組織（細胞）内で、本発明の抗菌性ペプチドを発現させることが可能となる。従って、本発明の抗菌性ペプチドをコードするポリヌクレオチド（ＤＮＡセグメントまたはＲＮＡセグメント）は、培養組織（細胞）の細菌感染を防止する薬剤として有用である。
【００４０】
本発明の抗菌性ペプチドをコードするポリヌクレオチドは、いわゆる遣伝子治療に使用する素材として用いることができる。例えば、本発明の抗菌性ペプチドをコードする遺伝子（ＤＮＡセグメントまたはＲＮＡセグメント）を適当なベクターに組み込み、目的とする部位に導入することにより、常時生体（細胞）内で本発明の抗菌性ペプチドを発現させることが可能となる。従って、本発明の抗菌性ペプチドをコードするポリヌクレオチド（ＤＮＡセグメントまたはＲＮＡセグメント）は、上述した患者などに対し、細菌感染を予防または治療する薬剤として有用である。
【００４１】
【実施例】
以下に説明する実施例によって、本発明を更に詳細に説明するが、本発明をかかる実施例に示すものに限定するものではない。
【００４２】
＜実施例１＞
○ペプチドの合成
下記表１に記載したペプチド（サンプル１〜５、サンプル６）を後述するペプチド合成機を用いて製造した。
【００４３】
【表１】
0004154218.tif 000002
【００４４】
上述した各ペプチド（個々のアミノ酸配列は配列表を参照）は、市販のペプチド合成機（ABI 433A peptide synthesizer (Applied Biosystems社製品)）を用いてFast MocTM protocolに従い固相合成法（Fmoc法）により合成した。なお、縮合剤としてHATU（Applied Biosystems社製品）を使用し、固相合成法に用いた樹脂およびアミノ酸はNOVA biochem社から購入したものを用いた。また、Fmoc-アミノ酸において、リジンの側鎖官能基の保護基にはtert-butoxycarbonyl (Boc)を、ヒスチジンの側鎖官能基の保護基にはtriphenylmethyl (Trt)を、アルギニンの側鎖官能基の保護基にはpentamethylchroman-6-sulfonyl (Pmc)を使用した。
アミノ酸配列のＣ末端をアミド化する場合には、固相担体として「Fmoc-PAL-Polyethylen (PEG-PS) 樹脂」 を使用した。
【００４５】
上記ペプチド合成機の合成プログラムに準じて脱保護基反応および縮合反応を反復して樹脂に結合するFmoc−アミノ酸からペプチド鎖を伸長していき、目的の鎖長の合成ペプチドを得た。
具体例としては、２０％ピペリジン／ジメチルホルムアミド(DMF)（ペプチド合成用グレード、関東化学（株）製品）によって、アミノ酸のアミノ保護基であるFmocを切断除去し、ＤＭＦで洗浄し、Fmoc−アミノ酸(-OH)各3ｅｑを反応させ、ＤＭＦで洗浄する操作を反復した。そして、ペプチド鎖の伸長反応が全て終了した後、２０％ピペリジン／ＤＭＦによりFmoc基を切断し、ＤＭＦ、メタノールの順で上記反応物を洗浄した。
側鎖官能基の脱保護と同時に樹脂からペプチドを切断した。この方法は、82.5％Trifluoroacetic acid(以下TFA)（TFA：1,2-ethandithiol：m-cresole：Thioanisole：水＝82.5：2.5：5：5：5）（以上、和光純薬）５ｍｌを加え、室温で３時間反応させた。
樹脂を除き、ジエチルエーテル中に沈殿させた後、遠心（３０００ｒｐｍ、４℃、３ｍｉｎ）しエーテル層を取り除いた。この操作を３回繰返した。最後にエーテル層を取り除いた後、ペプチドを風乾させ、純水に溶解させた。純水に溶解しないものは３０％以下のエタノール水溶液に溶解させた。その後、凍結乾燥した。
【００４６】
得られたペプチド沈殿物を真空乾燥し、高速液体クロマトグラフを用いて精製を行った。具体的には、プレカラム（Guard-Pak社製品、製品名Deltapak C18 A300）およびＣ１８逆相カラム（DAISOPAK SP-120-5-ODS-AP、20mmI.D.×250mm（DAISO））を使用し、０．１％トリフルオロ酢酸水溶液と０．１％トリフルオロ酢酸アセトニトリル溶液との混合液を溶離液に用いた。すなわち、溶離液に含まれる上記トリフルオロ酢酸アセトニトリル溶液の分量を経時的に増大させつつ（容積比で１０％から８０％への濃度勾配を設ける）、７ｍｌ／分の流速で上記カラムを用いて４０〜５０分間分離精製を行った。なお、逆相カラムから溶離したペプチドは紫外線検出器を用いて２２０ｎｍで検出し、記録チャート上にピークとして示される。また、溶離した各ペプチドの分子量をKRATOS 質量分析装置  KOMPACT MALDI III（島津製作所製）を用いてMALDI-TOF/MS（Matrix-Assisted Laser Desorption Time of Flight Mass Spectrometry：マトリックス支援レーザーイオン化−飛行時間型−質量分析)に基づいて決定した。その結果、目的のペプチドが合成・精製されていることを確認した。
【００４７】
＜実施例2＞
○合成ペプチドの抗菌活性
本発明に係る抗菌性ペプチド（サンプル１〜５）、および比較例について、下記に記載のグラム陰性細菌およびグラム陽性細菌に対する抗菌活性（最小発育阻止濃度：ＭＩＣ）を９６穴(well)マイクロプレートを用いた液体培地希釈法により求めた。
○供試菌
・グラム陽性菌
Bacillus subtilis ATCC6633
Micrococcus  luteus  IFO12708
Staphylococcus aureus IFO12732
Staphylococcus aureus IID1677(MRSA)
・グラム陰性菌
Escherichia coli IFO12713
Escherichia coli O157:H7 sakai
Klebsiella pneumoniae ATCC4352
Pseudomonas aeruginosa ATCC10145
Salmonella enteritidis IFO3313
【００４８】
ペプチド濃度が５００、２５０、１２５、６２．５、３１．３、１５．６、７．８、３．９、１．９、１．０および０．５μＭとなる液体肉汁培地（DIFCO社製品「NUTRIENT BROTH Dehydrated」）をそれぞれ作製し、９６穴マイクロプレートに１５０μｌずつ分注した。一方、ＬＢ  Ｂｒｏｔｈ，Ｌｅｎｎｏｘ（ＤＩＦＣＯ社製品）で１８時間、３７℃にて静置培養した菌液（約２×１０6ｃｅｌｌｓ／ｍＬ）を、薬剤溶液（上記ペプチド含有肉汁培地）と等量、９６穴マイクロプレートの各ウェルに接種した。接種後、３７℃の恒温器内で培養し、２４時間後の濁度により菌の生育状況を調べた。この計測時において、菌の増殖が認められない検体の最小の濃度を、本実施例におけるＭＩＣと定めた。
かかる抗菌試験に基づくサンプル１〜５および比較サンプルとして用いたＮｉｓｉｎのＭＩＣを表２に示す。
【００４９】
【表２】
0004154218.tif 000003
【００５０】
表２に示す結果から明らかなように、本発明に係るペプチド（サンプル１〜５）は、比較例とした世界中で広く利用されている既存の抗菌性ペプチドであるナイシン（Ｎｉｓｉｎ、Sigma Aldrich社より購入）と比べ、グラム陽性菌に対しては遜色のない高い抗菌力を示し、かつグラム陰性菌、薬剤耐性菌に対しても高い抗菌力を示した。
表２に示す結果より、本発明に係る抗菌性ペプチドが、グラム陰性、グラム陽性、薬剤耐性菌に対して優れた抗菌活性と広い抗菌スペクトルを有することが確かめられた。
【００５１】
＜比較例２＞
サンプル６については、Staphylococcus aureus IFO12732およびEscherichia coli IFO12713について抗菌活性を実施例２と同様にして調べたが、ＭＩＣはともに４００μg／ml以上となり、抗菌活性が認められなかった。
【００５２】
塩基性アミノ酸残基が１個であるサンプル６について抗菌活性を調べたが、抗菌活性が認められなかった。しかし、実施例２に記載のサンプル１〜５には、抗菌活性が認められることから、本発明の抗菌性ペプチドには、塩基性アミノ酸残基が２個以上連続している部位が２ヶ所存在する必要があることを示している。
【００５３】
以上、本発明の具体例を詳細に説明したが、これらは例示にすぎず、特許請求の範囲を限定するものではない。特許請求の範囲に記載の技術には、以上に例示した具体例を様々に変形、変更したものが含まれる。また、本明細書に説明した技術要素は、単独であるいは各種の組み合わせによって技術的有用性を発揮するものであり、出願時請求項記載に限定されるものではない。また、本明細書に例示した技術は複数目的を同時に達成するものであり、そのうちの一つの目的を達成すること自体で技術的有用性を持つものである。
【００５４】
【発明の効果】
本発明の抗菌性ペプチドは、グラム陰性、グラム陽性、薬剤耐性菌に対して優れた抗菌活性と広い抗菌スペクトルを有することから、抗菌剤または消毒剤などとして有用である。また、本発明の抗菌性ペプチドの設計方法により、溶解性および抗菌性ペプチド全体の荷電などをコントロールすることができることから、用途に応じた抗菌性ペプチドを得ることが可能となる。
【００５５】
【配列表フリーテキスト】
配列番号1    設計された抗菌性ペプチド。
配列番号2    設計された抗菌性ペプチド。
配列番号3    設計された抗菌性ペプチド。
配列番号4    設計された抗菌性ペプチド。
配列番号5    設計された抗菌性ペプチド。
配列番号６    設計されたペプチド。
【００５６】
【配列表】
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