(57)【特許請求の範囲】
【請求項１】
下記のアミノ酸配列（ａ）〜（ｃ）よりなる群から選ばれる少なくとも１種の変異麻疹ウイルスＨタンパク抗原からなる変異麻疹ウイルス抗原。
（ａ）配列番号１０に記載のアミノ酸配列；
（ｂ）配列番号３又は配列番号１１に記載のアミノ酸配列；及び
（ｃ）配列番号４又は配列番号１２に記載のアミノ酸配列。
【請求項２】
変異麻疹ウイルスＨタンパク抗原をコードする下記の塩基配列（ａ）〜（ｃ）よりなる群から選ばれる少なくとも１種の塩基配列からなる変異麻疹ウイルス遺伝子。
（ａ）配列番号１０に記載のアミノ酸配列をコードする塩基配列；
（ｂ）配列番号３又は配列番号１１に記載のアミノ酸配列をコードする塩基配列；及び
（ｃ）配列番号４又は配列番号１２に記載のアミノ酸配列をコードする塩基配列。
【請求項３】
配列番号２の１７６番〜３１６番アミノ酸を配列番号１２のアミノ酸配列で置換することによって得られる、組み換え変異麻疹ウイルス抗原。
【請求項４】
配列番号２の１７６番〜３１６番アミノ酸をコードする塩基配列を、配列番号１２のアミノ酸配列をコードする塩基配列で置換することによって得られる、組み換え変異麻疹ウイルス遺伝子。
【発明の詳細な説明】
技術分野
本発明は、変異麻疹ウイルス抗原及びそれをコードする遺伝子に関する。更に詳細には、変異麻疹ウイルス株のＨタンパク抗原及びＦタンパク抗原から選ばれる少なくとも１種のタンパク抗原を含有する変異麻疹ウイルス抗原、ならびにそれら変異麻疹ウイルス抗原をそれぞれコードする遺伝子に関する。本発明の変異麻疹ウイルス抗原又はこれをコードする変異麻疹ウイルス遺伝子を用いると、流行株麻疹ウイルスに適合した弱毒生麻疹ワクチン又は遺伝子ワクチン、さらに流行株麻疹ウイルスによる感染を的確に検出できる診断剤を、効率的且つ経済的に提供することが可能である。
従来技術
（１）病原性：麻疹ウイルスは、麻疹の病原体であり、全世界に広く分布している。このウイルスは伝染性が極めて高く、ヒトに飛沫感染すると、主に呼吸器系と細網内皮組織を犯し、急性疾患を生じる。罹患すると、高熱、カタル、発疹など全身にわたる症状を呈し、重症例では細菌性肺炎、中耳炎、急性脳炎を合併する。尚、１９９６年の世界での麻疹の推計患者数は約４２００万人、推計死亡者数は約１０１万人である［“The World Health Report 1997”，p．15，WHO（World Health Organization）1997年発行］。この様に麻疹は極めて重視すべき伝染病であり、ワクチンによる麻疹根絶は今や全世界で望まれている。この様な状況に呼応し、世界保健機構（ＷＨＯ）による予防接種拡大計画（EPI:Expanded Program on Immunization）の一環として、麻疹の制圧を２０１０年とする目標の下で、麻疹根絶計画は既に着手されている。
（２）形態とゲノム構造：国際ウイルス分類委員会の第６回報告によれば、麻疹ウイルスはモノネガウイルス目パラミクソウイルス科モルビリウイルス属に属する。ビリオンは、直径が約１５０ｎｍのほぼ球形であり、脂質二重膜からなるエンベロープを有する。そのエンベロープの全面にはＨ（hemagglutinin）タンパクとＦ（fusion）タンパクとがスパイク状に突起し、その基底はエンベロープ下面のMatrix膜タンパクで支持されている。エンベロープ内側に存在するヌクレオキャプシドは、麻疹ウイルスゲノムである全長約１６ｋｂの線状単鎖（−）センス（いわゆるmononega）の遺伝子ＲＮＡとタンパクからなる。該遺伝子ＲＮＡは、３’末端から５’末端方向に順に、Ｎ（nucleocapsid-assoiciated proteins），Ｐ／Ｃ／Ｖ（phosphoprotein/C protein/Vprotein:tricistronic gene)，Ｍ（matrix protein），F（fusion protein），Ｈ（hemagglutinin protein）及びＬ（large putative polymerase protein）をそれぞれコードしている（“Virus Taxonomy：Sixth Report of the International Committee of Taxonomy of Viruses”，Archives of Virology，Supplement 10，pp．268-270，及びpp．271-272，1995）。
（３）従来の弱毒生麻疹ワクチン株ウイルス：従来の弱毒麻疹ウイルス株としては、例えば、次の株が知られている：ＣＡＭ−７０，Schwarz FF8，ＡＩＫ−Ｃ，ＡＩＫ−ＨＤＣ，ＴＤ９７，Moraten，Connaught，Schwarz，Edmonston B，Edmonston-Zagreb，Leningrad-16，Shanghai-191，Changchum-47，及びBeijing（“Vaccines”、第２版，pp．238-239，S.A.Plotokin及びE.A.Mortimer著，W.B.Saunders Company，1994年発行）。尚、ワクチン株ウイルスはいずれも、生ワクチンの有効成分としての安全性と有効性とを確保するために、分離株（野生の麻疹ウイルス）の継代に用いる宿主細胞、培養温度、培地のｐＨや組成等の条件を多様に工夫し、これ等の諸条件を組合せて継代を重ねることにより弱毒化された宿主域変異株あるいは温度変異株のウイルスである。
（４）予防：麻疹予防のワクチンは、１９６０年代前半から実用に供され始めた。かかる初期の頃には、不活化麻疹ウイルスを有効成分して含有する不活化ワクチン（Ｋ；“killed virus vaccine”の略）が主に使用されていた。しかし、該ワクチンは、免疫効果が不十分な上に、重症の異型麻疹を誘発したため、１９６０年代後半に入り、弱毒麻疹ウイルスを有効成分として用いる生ワクチン（Ｌ；“live virus vaccine”の略）が次第に広く使用され始めた。この間、ＫＬ併用が行われたこともあるが、１９７０年代以降は、これらを一層弱毒化した高度弱毒生ワクチン（FL：further attenuated live vaccine）が世界で広く市販され、実用に供されている。尚、これ等の生ワクチンはいずれも、前述（３）の弱毒生麻疹ワクチン株ウイルスを有効成分として用いるものである。
（５）麻疹のワクチンと診断に関する課題：従来の弱毒生麻疹ワクチンによる免疫持続につき、１９７０年代前半頃から疑義が生じていた。これは、いわゆる二次ワクチン免疫不全（secondary vaccine failure）や修飾麻疹（modified measles）に関する報告であり、ワクチン接種を受けているにも拘らず麻疹に再感染し、自然感染とは異なる症状（通常は自然感染に比べ軽症であるが、稀に重症例）が観察されている。この様な再感染例は、１９８０年代後半から世界各地で散発し、１９９０年代には頻繁に報告されている。従って、再感染の予防と感染ウイルスの鑑別は、世界各国の国民のみならず、前述のＷＨＯによる世界の麻疹根絶計画の上からも、急務且つ必須の検討課題である。しかし、現在流行している麻疹ウイルスの予防に有効なワクチンや診断剤は未だ知られていない。
発明の概要
本発明の筆頭発明者は、３０余年に渡り、麻疹の臨床、疫学及びワクチン学の研究のみならず、ワクチン株、流行株、新鮮分離株等の多様な麻疹ウイルスに関して、ウイルス学及び免疫学の観点から研究を進めると共に、これ等の各ウイルス株の遺伝子を解析した。そして、従来の強毒株と、変異株である強毒株及び流行株との間の抗原性又は免疫原性の差異を確認し、かかる差異の要因を特定すべく鋭意研究を行った。その結果、変異株は、ＨタンパクとＦタンパクの各タンパクをコードする遺伝子の特定領域において、アミノ酸置換を伴う変異を有するという驚くべき知見を得た。更に本発明者らは、Ｈタンパク及びＦタンパクそれぞれの変異領域が変異麻疹ウイルス抗原として有用であることを知見した。本発明は、この新規な知見に基いて完成されたものである。
従って、本発明の主なる１つの目的は、流行株麻疹ウイルスワクチンや診断剤の作成に有効な変異麻疹ウイルスＨタンパク抗原及び変異麻疹ウイルスＦタンパク抗原から選ばれる少なくとも１種のタンパク抗原を含有する変異麻疹ウイルス抗原を提供することにある。
本発明の他の１つの目的は、流行株麻疹ウイルスに対する遺伝子ワクチンや診断剤の作成に有効な変異麻疹ウイルスＨタンパク抗原をコードする遺伝子及び変異麻疹ウイルスＦタンパク抗原をコードする遺伝子から選ばれる少なくとも１種の遺伝子を含有する変異麻疹ウイルス遺伝子を提供することにある。
本発明の上記及び他の諸目的、諸特徴並びに諸利益は、添付の配列表を参照しながら述べる次の詳細な説明及び請求の範囲の記載から明らかになる。
次に、本発明の基本的特徴を更に明らかにするために、本発明の完成に至る経緯を追いながら、本発明に包含される技術的諸特徴について説明する。
配列表の簡単な説明
以下に述べる各配列番号のアミノ酸配列において、左側端部がＮ−末端であり、右側端部がＣ−末端である。
配列番号１は、弱毒麻疹ウイルスＣＡＭ−７０株のＨタンパクをコードする遺伝子ＲＮＡに対応するｃＤＮＡの塩基配列と、該配列がコードするＨタンパクの全長アミノ酸配列であり；
配列番号２は、弱毒麻疹ウイルスＣＡＭ−７０株のＨタンパクの全長アミノ酸配列であり；
配列番号３は、配列番号２の第９３番〜第６１６番のアミノ酸からなる断片ペプチドのアミノ酸配列であり；
配列番号４は、配列番号２の第１７６番〜第３１６番のアミノ酸からなる断片ペプチドのアミノ酸配列であり；
配列番号５は、配列番号２の第１７２番〜第１７８番のアミノ酸からなる断片ペプチドのアミノ酸配列であり；
配列番号６は、配列番号２の第２３８番〜第２４４番のアミノ酸からなる断片ペプチドのアミノ酸配列であり；
配列番号７は、配列番号２の第２７７番〜第２８２番のアミノ酸からなる断片ペプチドのアミノ酸配列であり；
配列番号８は、配列番号２の第３０１番〜第３０７番のアミノ酸からなる断片ペプチドのアミノ酸配列であり；
配列番号９は、強毒麻疹ウイルスＮＡ株のＨタンパクをコードする遺伝子ＲＮＡに対応するｃＤＮＡの塩基配列と、該配列がコードするＨタンパクの全長アミノ酸配列であり；
配列番号１０は、強毒麻疹ウイルスＮＡ株のＨタンパクの全長アミノ酸配列であり、
配列番号１１は、配列番号１０の第９３番〜第６１６番のアミノ酸からなる断片ペプチドのアミノ酸配列であり；
配列番号１２は、配列番号１０の第１７６番〜第３１６番のアミノ酸からなる断片ペプチドのアミノ酸配列であり；
配列番号１３は、配列番号１０の第１７２番〜第１７８番のアミノ酸からなる断片ペプチドのアミノ酸配列であり；
配列番号１４は、配列番号１０の第２３８番〜第２４４番のアミノ酸からなる断片ペプチドのアミノ酸配列であり；
配列番号１５は、配列番号１０の第２７７番〜第２８２番のアミノ酸からなる断片ペプチドのアミノ酸配列であり；
配列番号１６は、配列番号１０の第３０１番〜第３０７番のアミノ酸からなる断片ペプチドのアミノ酸配列であり；
配列番号１７は、弱毒麻疹ウイルスＣＡＭ−７０株のＦタンパクをコードする遺伝子ＲＮＡに対応するｃＤＮＡの塩基配列と、該配列がコードするＦタンパクの全長アミノ酸配列であり；
配列番号１８は、弱毒麻疹ウイルスＣＡＭ−７０株のＦタンパクの全長アミノ酸配列であり；
配列番号１９は、強毒麻疹ウイルスＮＡ株のＦタンパクをコードする遺伝子ＲＮＡに対応するｃＤＮＡの塩基配列と、該配列がコードするＦタンパクの全長アミノ酸配列であり；
配列番号２０は、強毒麻疹ウイルスＮＡ株のＦタンパクの全長アミノ酸配列である。
発明の詳細な発明
本発明の１つの態様によれば、下記の（Ｉ）変異麻疹ウイルスＨタンパク抗原及び（ＩＩ）変異麻疹ウイルスＦタンパク抗原よりなる群から選ばれる少なくとも１種のタンパク抗原を含有する変異麻疹ウイルス抗原が提供される。
（Ｉ）下記のアミノ酸配列（ａ）〜（ｆ）：
（ａ）配列番号２又は配列番号１０に記載のアミノ酸配列；
（ｂ）配列番号３又は配列番号１１に記載のアミノ酸配列；
（ｃ）配列番号４又は配列番号１２に記載のアミノ酸配列；
（ｄ）配列番号５、配列番号６、配列番号７又は配列番号８に記載のアミノ酸配列、あるいは配列番号１３、配列番号１４、配列番号１５又は配列番号１６に記載のアミノ酸配列；
（ｅ）配列番号２又は配列番号１０に記載のアミノ酸配列の第１７４番、第１７６番、第２４３番、第２７９番、又は第３０２番のアミノ酸を含み、且つ該アミノ酸に隣接する少なくとも６個のアミノ酸の配列からなる断片；及び
（ｆ）配列番号２又は配列番号１０に記載のアミノ酸配列の第９３番、第１５７番、第１６９番、第１７５番、第２１１番、第２５２番、第２７６番、第２８４番、第２８５番、第２９６番、第３１６番、第３３８番、第３８７番、第４１６番、第４５５番、第４８１番、第４８４番、第５０５番、第５４６番、第５９２番、第６００番、第６０３番、又は第６１６番のアミノ酸を含み、且つ該アミノ酸に隣接する少なくとも６個のアミノ酸の配列からなる断片よりなる群から選ばれる少なくとも１種の変異麻疹ウイルスＨタンパク抗原。
（ＩＩ）下記のアミノ酸配列（ｇ）と（ｈ）：
（ｇ）配列番号１８又は配列番号２０に記載のアミノ酸配列；及び
（ｈ）配列番号１８又は配列番号２０に記載のアミノ酸配列の第１１番、第５２番、第１０７番、第１６５番、第３９８番、第４１７番、又は第５２３番のアミノ酸を含み、且つ該アミノ酸に隣接する少なくとも６個のアミノ酸の配列からなる断片よりなる群ら選ばれる少なくとも１種の変異麻疹ウイルスＦタンパク抗原。
次に、本発明の理解を容易にするために、まず本発明の基本的特徴及び好ましい態様を列挙する。
１．下記の（Ｉ）変異麻疹ウイルスＨタンパク抗原及び（ＩＩ）変異麻疹ウイルスＦタンパク抗原よりなる群から選ばれる少なくとも１種のタンパク抗原を含有する変異麻疹ウイルス抗原。
（Ｉ）下記のアミノ酸配列（ａ）〜（ｆ）：
（ａ）配列番号２又は配列番号１０に記載のアミノ酸配列；
（ｂ）配列番号３又は配列番号１１に記載のアミノ酸配列；
（ｃ）配列番号４又は配列番号１２に記載のアミノ酸配列；
（ｄ）配列番号５、配列番号６、配列番号７又は配列番号８に記載のアミノ酸配列、あるいは配列番号１３、配列番号１４、配列番号１５又は配列番号１６に記載のアミノ酸配列；
（ｅ）配列番号２又は配列番号１０に記載のアミノ酸配列の第１７４番、第１７６番、第２４３番、第２７９番、又は第３０２番のアミノ酸を含み、且つ該アミノ酸に隣接する少なくとも６個のアミノ酸の配列からなる断片；及び
（ｆ）配列番号２又は配列番号１０に記載のアミノ酸配列の第９３番、第１５７番、第１６９番、第１７５番、第２１１番、第２５２番、第２７６番、第２８４番、第２８５番、第２９６番、第３１６番、第３３８番、第３８７番、第４１６番、第４５５番、第４８１番、第４８４番、第５０５番、第５４６番、第５９２番、第６００番、第６０３番、又は第６１６番のアミノ酸を含み、且つ該アミノ酸に隣接する少なくとも６個のアミノ酸の配列からなる断片よりなる群から選ばれる少なくとも１種の変異麻疹ウイルスＨタンパク抗原。
（ＩＩ）下記のアミノ酸配列（ｇ）と（ｈ）：
（ｇ）配列番号１８又は配列番号２０に記載のアミノ酸配列；及び
（ｈ）配列番号１８又は配列番号２０に記載のアミノ酸配列の第１１番、第５２番、第１０７番、第１６５番、第３９８番、第４１７番、又は第５２３番のアミノ酸を含み、且つ該アミノ酸に隣接する少なくとも６個のアミノ酸の配列からなる断片よりなる群ら選ばれる少なくとも１種の変異麻疹ウイルスＦタンパク抗原。
２．下記の（Ｉ）の変異麻疹ウイルスＨタンパク抗原をコードする遺伝子及び（ＩＩ）変異麻疹ウイルスＦタンパク抗原をコードする遺伝子よりなる群から選ばれる少なくとも１種の遺伝子を含有する変異麻疹ウイルス遺伝子。
（Ｉ）下記の塩基配列（ａ）〜（ｆ）：
（ａ）配列番号２又は配列番号１０に記載のアミノ酸配列をコードする塩基配列；
（ｂ）配列番号３又は配列番号１１に記載のアミノ酸配列をコードする塩基配列；
（ｃ）配列番号４又は配列番号１２に記載のアミノ酸配列をコードする塩基配列；
（ｄ）配列番号５、配列番号６、配列番号７又は配列番号８に記載のアミノ酸配列をコードする塩基配列、あるいは配列番号１３、配列番号１４、配列番号１５又は配列番号１６に記載のアミノ酸配列をコードする塩基配列；
（ｅ）配列番号２又は配列番号１０に記載のアミノ酸配列の第１７４番、第１７６番、第２４３番、第２７９番、又は第３０２番アミノ酸を含み、且つ該アミノ酸に隣接する少なくとも６個のアミノ酸の配列からなる断片をコードする塩基配列；及び
（ｆ）配列番号２又は配列番号１０に記載のアミノ酸配列の第９３番、第１５７番、第１６９番、第１７５番、第２１１番、第２５２番、第２７６番、第２８４番、第２８５番、第２９６番、第３１６番、第３３８番、第３８７番、第４１６番、第４５５番、第４８１番、第４８４番、第５０５番、第５４６番、第５９２番、第６００番、第６０３番、又は第６１６番のアミノ酸を含み、且つ該アミノ酸に隣接する少なくとも６個のアミノ酸の配列からなる断片をコードする塩基配列よりなる群から選ばれる少なくとも１種の変異麻疹ウイルスＨタンパク抗原をコードする遺伝子。
（ＩＩ）下記の塩基配列（ｇ）と（ｈ）：
（ｇ）配列番号１８又は配列番号２０に記載のアミノ酸配列をコードする塩基配列；及び
（ｈ）配列番号１８又は配列番号２０に記載のアミノ酸配列の第１１番、第５２番、第１０７番、第１６５番、第３９８番、第４１７番、又は第５２３番のアミノ酸を含み、且つ該アミノ酸に隣接する少なくとも６個のアミノ酸の配列からなる断片をコードする塩基配列よりなる群ら選ばれる少なくとも１種の変異麻疹ウイルスＦタンパク抗原をコードする遺伝子。
３．配列番号２に示したＣＡＭ−７０株のＨタンパク質の一部を、配列番号１０に示したＮＡ株のＨタンパク質の対応する部分で置換することによって得られる、組み換え変異麻疹ウイルス抗原。
４．配列番号２の１７６番〜３１６番アミノ酸を配列番号１２のアミノ酸配列で置換することを特徴とする、前記３項に記載の組み換え変異麻疹ウイルス抗原。
５．配列番号２に示したＣＡＭ−７０株のＨタンパク質をコードする塩基配列の一部を、配列番号１０に示したＮＡ株のＨタンパク質をコードする塩基配列の対応する部分で置換することによって得られる、組み換え変異麻疹ウイルス遺伝子。
６．配列番号２の１７６番〜３１６番アミノ酸をコードする塩基配列を配列番号１２のアミノ酸配列をコードする塩基配列で置換することを特徴とする、前記５項に記載の組み換え変異麻疹ウイルス遺伝子。
以下、本発明について具体的に説明する。
尚、本発明において、ＤＮＡ塩基配列中のＡはアデニン、Ｃはシトシン、Ｇはグアニン、Ｔはチミンを示す。
また、本発明において、アミノ酸配列中のＡｌａはアラニン、Ａｒｇはアルギニン、Ａｓｎはアスパラギン、Ａｓｐはアスパラギン酸、Ｃｙｓはシステイン、Ｇｌｎはグルタミン、Ｇｌｕはグルタミン酸、Ｇｌｙはグリシン、Ｈｉｓはヒスチジン、Ｉｌｅはイソロイシン、Ｌｅｕはロイシン、Ｌｙｓはリジン、Ｍｅｔはメチオニン、Ｐｈｅはフェニルアラニン、Ｐｒｏはプロリン、Ｓｅｒはセリン、Ｔｈｒはスレオニン、Ｔｒｐはトリプトファン、Ｔｙｒはチロシン、Ｖａｌはバリンである。
初めに、本発明の基本的特徴を更に明らかにするために、本発明の完成に至る経緯を追いながら、本発明に包含される技術的諸特徴について説明する。
従来の生ワクチンは全て、１９５０〜１９６０年代に流行したウイルスを弱毒化した株で製造されている。従って、従来のワクチン株ウイルスの抗原性は、約半世紀前の流行株のものである。
一方、近年及び最近の流行株ウイルスは、ウイルス感染が成立するための細胞へのビリオンの吸着・侵入に関与するＨタンパク遺伝子及びＦタンパク遺伝子に変異を有することが確認された。特に、Ｈタンパク遺伝子の変異は、該タンパクを構成する全６１７個のアミノ酸の配列の特定領域における１７〜１９個のアミノ酸の置換をもたらし、タンパクの立体構造を変化させるため、抗原変異（antigenic variation）が生じている。かかる抗原変異は、Ｈタンパクの抗原不連続変異（antigenic shift)に匹敵するほど大きく重大だと判断される。
そして、流行株の抗原変異（antigenic variation）は、前述の二次ワクチン免疫不全や修飾麻疹をもたらす重視すべき因子であることを知見した。
上記の知見に基づき、変異した麻疹ウイルスのゲノム、特にＨタンパク遺伝子及びＦタンパク遺伝子、並びにこれ等がコードする変異抗原（全長タンパク又はその断片ペプチド）を提供することに成功した。
更に、上記の遺伝子、変異抗原、そのエピトープ等の、次の（ｉ）〜（iii）の用途を開発することに成功した。
（ｉ）生ワクチン株ウイルスゲノムの改造：従来の生ワクチン株ウイルスのＨタンパク遺伝子を、流行株ウイルスのＨタンパク遺伝子と置換した組換えウイルスを作出する。これにより、流行株の抗原性に見合った生ワクチン用の弱毒ウイルス株が迅速に得られる。換言すれば、かかる組換えウイルスは、流行株感染の予防に優れた適格なワクチンの有効成分として用いることができる。この方法の更なる利点は、その経済性にある。即ち、ウイルスの弱毒化に要する時間・労力・経費等が大幅に短縮且つ節減できることである。尚、従来のウイルスの弱毒化方法は、前述の通り定まった方法がないため、主にウイルス継代によるものであり、生ワクチン用の弱毒株を確立するまでに少なくとも数年〜約１０年を要していた。
（ii）遺伝子ワクチン（gene vaccine）用の有効成分の作出：流行株ウイルスのＨタンパク遺伝子及びＦタンパク遺伝子を、種々のベクター、例えば、プラスミドベクター、コスミドベクター、ファージベクター、シャトルベクター、非増殖型のウイルスベクター等に挿入連係することにより作出する。
例えば、非増殖型ウイルスゲノムに上記Ｈタンパク遺伝子及びＦタンパク遺伝子のｃＤＮＡを挿入連係して作出した非増殖型組換えウイルスは、遺伝子ワクチンあるいはＤＮＡワクチンの有効成分として、従来の生麻疹ワクチンと同様に体液性及び細胞性の両免疫を誘導する。特筆すべきことに、このようなワクチンは経鼻接種が可能である。
また、流行株ウイルスのＨタンパク遺伝子の変異領域を含むｃＤＮＡ断片を、例えばプラスミドベクターに挿入連係することにより、naked DNAを調製する。かかるＤＮＡは、麻疹予防のＤＮＡワクチンないしは遺伝子ワクチンの有効成分として使用できる。
（iii）流行株に最適な診断剤の調製：流行株ウイルスのＨタンパク遺伝子及びＦタンパク遺伝子の変異を考慮してＰＣＲプライマーを合成する。かかるプライマーは、流行麻疹ウイルス株を同定すると共に、強毒株と弱毒株とを鑑別するための遺伝子診断剤として使用できる。
また、該遺伝子がコードする変異抗原（全長タンパク又はその断片ペプチド）を調製すると共に、そのエピトープを化学合成する。これ等は、流行麻疹の最適な診断用抗原として提供される。
次に、本発明の変異麻疹ウイルス抗原及び変異麻疹ウイルス遺伝子の調製、調製された抗原と遺伝子のワクチンや診断剤としての利用について説明する。
［Ｉ］変異麻疹ウイルス抗原及び変異麻疹ウイルス遺伝子の調製
（１）種々の麻疹ウイルス抗原の抗原解析：抗原解析には中和試験、ＨＩ（hemagglutination inhibition）試験、ＰＡ（passive agglutination）法、モノクローナル抗体を用いる酵素免疫測定法や蛍光抗体法等が採用できる。これ等のうち、特に中和反応による抗体価の測定結果に基づく解析は必須であり、マイクロプレートを用いるＵedaの変法（Biken Journal，14，155-160，1971）に従って行うことができる。
抗原解析に用いる抗体としては、血清、例えば、麻疹患者血清、以下に示す麻疹ウイルスに対するマウス免疫血清等を用いる。
抗原（攻撃ウイルス）を選択する際に特に留意すべき点は、過去から現在にいたる様々な麻疹ウイルス株を使用することである。例えば、１９５０〜１９６０代の流行株（過去の強毒株）の代表として田辺、Edmonston等、かかる株を弱毒化することにより確立された前述の生ワクチン株（従来の弱毒株）としては、ＣＡＭ−７０、Edmonston B等、更に、最近の流行株（強毒株）としては、１９９０年代に入り世界各地で分離されている麻疹ウイルス株を用いることができる。例えば、本発明者らが多様な材料から分離したＦ−ｔ［再感染者の咽喉拭い液（throat swab）から１９９１年に分離］、Ｆ−ｂ［再感染者の血液（blood）から１９９１年に分離］、Ｕ−ｔ（ワクチン未接種患者のthroat swabから１９９１年に分離）、Ｕ−ｂ（ワクチン未接種患者のbloodから１９９１年に分離）、Ｍｏｍｏ（患者から１９９５年に分離）、ＮＡ（患者から１９９６年に分離）等が挙げられる。
尚、上記のウイルス株について以下、屡々、（  ）内のように略記する：田辺（Tana）、Edmonston（Edmo）、ＣＡＭ−７０（CAM）、及びＭｏｍｏ（MO）。
（２）遺伝子の塩基配列に基づく変異領域の検出と遺伝子がコードするアミノ酸配列の解読：上述（１）の各麻疹ウイルス株のゲノムを用いて行う。先ず、ウイルスゲノムＲＮＡを抽出の後、プライマーを用いてｃＤＮＡを作成し、その塩基配列をＰＣＲを用いる直接シークエンス法により決定する。シークエンスと共にホモロジー検索を行い、変異領域を特定する。
次に、上記の変異領域から、Univeral Codeに基づきアミノ酸配列を判読し、そのアミノ酸配列について演繹的解析を行う。疎水性パターンの解析、及びタンパクの二次構造の決定（Chou-Fasman 解析）には、解析ソフトDNASIS-Mac（version 3.6）［日本国、日立ソフトウェアエンジニアリング（株）社製］を用いることができる。また、エピトープの決定には、解析ソフトEpitope Advisor［日本国、（株）富士通九州システムエンジニアリング（ＦＱＳ）社製］を用いることができる。
（３）変異麻疹ウイルス抗原及びそれをコードする遺伝子：本発明者等は、上記（１）の抗原解析や（２）の塩基及びアミノ酸配列の分析に基づき、近年の麻疹ウイルス流行株において、過去の強毒株や従来の弱毒麻疹生ワクチン株との比較から、アミノ酸置換が存在する領域をＨタンパク及びＦタンパクに見出し、更に、麻疹ウイルス流行株のワクチンや診断に有用な抗原を特定した。本発明の変異麻疹ウイルス抗原は、弱毒麻疹ウイルス株であるＣＡＭ−７０又は流行麻疹ウイルス株であるＮＡ株のＨタンパク及びＦタンパクの全長又は断片である。いずれのアミノ酸配列も本願発明者らによって初めて開示されたものである。具体的には、本発明の麻疹ウイルス抗原は、次に示す（Ｉ）変異麻疹ウイルスＨタンパク抗原及び（ＩＩ）変異麻疹ウイルスＦタンパク抗原よりなる群から選ばれる少なくとも一種のタンパク抗原を含有する抗原である。
（Ｉ）下記のアミノ酸配列（ａ）〜（ｆ）：
（ａ）配列番号２又は配列番号１０に記載のアミノ酸配列；
（ｂ）配列番号３又は配列番号１１に記載のアミノ酸配列；
（ｃ）配列番号４又は配列番号１２に記載のアミノ酸配列；
（ｄ）配列番号５、配列番号６、配列番号７又は配列番号８に記載のアミノ酸配列、あるいは配列番号１３、配列番号１４、配列番号１５又は配列番号１６に記載のアミノ酸配列；
（ｅ）配列番号２又は配列番号１０に記載のアミノ酸配列の第１７４番、第１７６番、第２４３番、第２７９番、又は第３０２番のアミノ酸を含み、且つ該アミノ酸に隣接する少なくとも６個のアミノ酸の配列からなる断片；及び
（ｆ）配列番号２又は配列番号１０に記載のアミノ酸配列の第９３番、第１５７番、第１６９番、第１７５番、第２１１番、第２５２番、第２７６番、第２８４番、第２８５番、第２９６番、第３１６番、第３３８番、第３８７番、第４１６番、第４５５番、第４８１番、第４８４番、第５０５番、第５４６番、第５９２番、第６００番、第６０３番、又は第６１６番のアミノ酸を含み、且つ該アミノ酸に隣接する少なくとも６個のアミノ酸の配列からなる断片よりなる群から選ばれる少なくとも１種の変異麻疹ウイルスＨタンパク抗原。
（ＩＩ）下記のアミノ酸配列（ｇ）と（ｈ）：
（ｇ）配列番号１８又は配列番号２０に記載のアミノ酸配列；及び
（ｈ）配列番号１８又は配列番号２０に記載のアミノ酸配列の第１１番、第５２番、第１０７番、第１６５番、第３９８番、第４１７番、又は第５２３番のアミノ酸を含み、且つ該アミノ酸に隣接する少なくとも６個のアミノ酸の配列からなる断片よりなる群ら選ばれる少なくとも１種の変異麻疹ウイルスＦタンパク抗原。
本発明の変異麻疹ウイルス抗原に含有されるタンパク抗原のうち、（ａ）及び（ｇ）はそれぞれＨタンパク及びＦタンパクであり、（ｂ）〜（ｆ）及び（ｈ）はペプチド（断片）である。更に、（ｄ）に記載した４種の断片、即ち、配列番号２又は１０に記載の全長６１７個のアミノ酸の配列のアミノ酸番号で特定される第１７２〜１７８番、第２３８〜２４４番、第２７７〜２８２番、及び第３０１〜３０７番は、本発明者らによって開示されたＨタンパクのエピトープである。（ａ）〜（ｄ）及び（ｇ）については、具体的な配列を配列表に示した。いずれの抗原も、配列表のアミノ酸配列を基に化学合成することができる（実施例５を参照）。
本発明の変異麻疹ウイルス抗原は、上記の全長タンパク及びその断片ペプチドから選ばれるタンパク抗原を少なくとも１種含有するものであり、タンパク抗原は使用目的に応じて適宜選択することができる。又、複数の抗原を組み合わせて使用することもできる。
更に、本発明の他の１つの態様によれば、上記の変異麻疹ウイルス抗原をコードする遺伝子が提供される。具体的には、次に示す（Ｉ）変異麻疹ウイルスＨタンパク抗原をコードする遺伝子及び（ＩＩ）変異麻疹ウイルスＦタンパク抗原をコードする遺伝子よりなる群から選ばれる少なくとも一種の遺伝子を含有する変異麻疹ウイルス遺伝子が提供される。
（Ｉ）下記の塩基配列（ａ）〜（ｆ）：
（ａ）配列番号２又は配列番号１０に記載のアミノ酸配列をコードする塩基配列；
（ｂ）配列番号３又は配列番号１１に記載のアミノ酸配列をコードする塩基配列；
（ｃ）配列番号４又は配列番号１２に記載のアミノ酸配列をコードする塩基配列；
（ｄ）配列番号５、配列番号６、配列番号７又は配列番号８に記載のアミノ酸配列をコードする塩基配列、あるいは配列番号１３、配列番号１４、配列番号１５又は配列番号１６に記載のアミノ酸配列をコードする塩基配列；
（ｅ）配列番号２又は配列番号１０に記載のアミノ酸配列の第１７４番、第１７６番、第２４３番、第２７９番、又は第３０２番アミノ酸を含み、且つ該アミノ酸に隣接する少なくとも６個のアミノ酸の配列からなる断片をコードする塩基配列；及び
（ｆ）配列番号２又は配列番号１０に記載のアミノ酸配列の第９３番、第１５７番、第１６９番、第１７５番、第２１１番、第２５２番、第２７６番、第２８４番、第２８５番、第２９６番、第３１６番、第３３８番、第３８７番、第４１６番、第４５５番、第４８１番、第４８４番、第５０５番、第５４６番、第５９２番、第６００番、第６０３番、又は第６１６番のアミノ酸を含み、且つ該アミノ酸に隣接する少なくとも６個のアミノ酸の配列からなる断片をコードする塩基配列よりなる群から選ばれる少なくとも１種の変異麻疹ウイルスＨタンパク抗原をコードする遺伝子。
（ＩＩ）下記の塩基配列（ｇ）と（ｈ）：
（ｇ）配列番号１８又は配列番号２０に記載のアミノ酸配列をコードする塩基配列；及び
（ｈ）配列番号１８又は配列番号２０に記載のアミノ酸配列の第１１番、第５２番、第１０７番、第１６５番、第３９８番、第４１７番、又は第５２３番のアミノ酸を含み、且つ該アミノ酸に隣接する少なくとも６個のアミノ酸の配列からなる断片をコードする塩基配列よりなる群ら選ばれる少なくとも１種の変異麻疹ウイルスＦタンパク抗原をコードする遺伝子。
本発明の変異麻疹ウイルス抗原をコードする遺伝子は、変異麻疹ウイルス抗原である全長タンパク又はその断片ペプチドをコードする遺伝子であれば特に限定されず、ＣＡＭ−７０又はＮＡ株のゲノムＲＮＡの塩基配列に限定されるものではない。変異麻疹ウイルス遺伝子としては、配列番号１、９、１７及び１９に記載のｃＤＮＡを使用することもできるし、又、変異麻疹ウイルス抗原のアミノ酸配列を基に塩基配列を合成することもできる。
本発明の変異麻疹ウイルス遺伝子は、上記の変異麻疹ウイルス抗原をコードする遺伝子から選ばれる遺伝子を少なくとも１種含有するものであり、含有される遺伝子は、使用目的に応じて適宜選択することができる。本発明の変異麻疹ウイルス抗原と同様に、本発明の変異麻疹ウイルス遺伝子は、弱毒株の遺伝子及び流行株の遺伝子を包含する。本発明の開示を基に、例えば、流行株に有効な生ワクチンの作成が可能になる｛後述の［II］（１）及び実施例２と３を参照｝。又、複数の遺伝子を組み合わせて用いる場合には、遺伝子を連係して用いることもできる｛後述の［II］（２）及び実施例４を参照｝。
上記の配列からなる本発明の抗原及びそれをコードする遺伝子は、強毒・弱毒の鑑別マーカーとして有用であり、更に従来のワクチンの改良及び診断剤の開発に極めて重要、且つ有用である。
［II］本発明の変異麻疹ウイルス抗原及び変異麻疹ウイルス遺伝子のワクチンや診断剤としての用途
（１）流行株に対して有効な生ワクチンの作成：生ワクチン株ウイルスと流行株ウイルスとの間で遺伝子を置換した組換え体ウイルスを作成する。生ワクチン株としては、従来技術に記載した種々の株を用いることができるが、少なくとも１０年以上の長期にわたり、生ワクチンの有効成分として世界各地で使用され、その安全性と有効性が公認されている株、例えばＣＡＭ−７０の使用が好ましい。
流行株としては、その遺伝子変異に基づく抗原変異が生ワクチン株ウイルスの抗原性と比較した際に顕著で広い流行株ウイルスから適宜選択して用いる。詳しくは、分離頻度が高く、且つ、流行している地域範囲が広く、抗原変異が特殊ではなく普遍的な最近の流行株、例えば本発明者らが１９９５〜１９９６年に分離したＭＯ株又はＮＡ株の採用が好ましい。
置換する遺伝子としては、上記［Ｉ］（３）に列記した抗原をコードする遺伝子から適宜選択し、単独又はこれ等を組合せて用いることができる。しかし、組換えによる弱毒から強毒への復帰の防止、組換え工程の簡易化等を考慮すると、（c）に記載の第１７６〜３１６番のＨタンパク断片（即ち、配列番号４のペプチドと配列番号１２のペプチド）をコードする遺伝子の採用が好ましい。この領域におけるアミノ酸置換は流行株に固有のものであり、弱毒株には存在しない。従って、この領域を用いることにより、弱毒株に固有の配列（即ち、弱毒化の要因となりうる配列）を変化させることなく、弱毒ウイルスに流行株のエピトープを導入することが可能である。
組換えウイルスの作成には、単鎖（−）センスのＲＮＡウイルス（モノネガウイルス）ゲノムの遺伝子組換えに係るRadeckeらの方法（EMBO Journal，Vol．14，No．23，pp．5773-5784，1995）、又は本発明者らによるその変法に従って行うことができる。
Radeckeらの方法（reverse genetics）を次に示す。初めに、株化細胞２９３（American Type Culture Collection寄託番号ATCC CRL-1573）にT7 RNAポリメラーゼ及び麻疹ウイルスのＮとＰ両タンパクの各遺伝子をベクターを用いて移入し、これ等の各遺伝子を発現する形質転換体（即ち、helper cell）を作出する。次に、Ｔ７プロモーターの支配下で麻疹ウイルスのＬタンパク（polymerase）を発現する発現ベクター（以下、“V1”と呼ぶ）を構築する。更に、ＣＡＭ−７０ウイルスの全長ゲノムの（＋）センスＲＮＡのｃＤＮＡを調製し、該ｃＤＮＡから前述したアミノ酸置換をコードする領域を制限酵素により切除し、その切断部位に流行株ＭＯ又はＮＡのウイルスゲノムから調製した対応領域（ＤＮＡ）を挿入連係の後、得られる組換えｃＤＮＡをプスミドpBluescript SK 及び KS（英国、Stratagene Ltd．社製）に挿入連係すると共に、該組換えｃＤＮＡがＴ７フアージＲＮＡポリメラーゼにより転写されるよう調製したベクター（以下、“Vo”と呼ぶ）を構築する。VoとV1とを前記のhelper cellに同時感染導入（co-transfection）させた後、該細胞を培養すれば、組換え体ウイルスを得ることができる。感染細胞内での組換え体ウイルスの増殖は、シンシチゥムを生じるCPE（cytopathic effect)の判定や、置換領域がコードするタンパクのエピトープに対するモノクーナル抗体を用いた蛍光抗体法による検鏡にて確認することができる。
上述の方法を用いることにより、ＣＡＭ−７０のＨタンパクのアミノ酸番号第１７６〜３１６番（配列番号４）をコードする遺伝子が、ＭＯ又はＮＡ株のＨタンパクのアミノ酸番号第１７６〜３１６番（配列番号１２）をコードする遺伝子と置換された、ＣＡＭ−７０株の組換え体弱毒麻疹ウイルスが得られる。
更に、Radeckeらの方法の変法について述べる。この変法は、helper cellを要しないよう工夫されているので、培養宿主として任意の感受性細胞を使用することができる。使用する細胞としては、未確認因子や癌原性等の迷入を避けるため、生ワクチン株ウイルスの培養宿主として安全性が確認且つ公認されている細胞、例えば、ＭＲＣ−５、ＷＩ−３８の採用が好ましい。先ず、ＣＡＭ−７０のＮ、Ｐ、及びＬタンパク各遺伝子の発現ベクターを、プラスミドpcDNA3.1（+）及びpcDNA3.1（-）（カナダ国、Invitrogen社製）を用いて予め作成しておく。例えば、pcDNA3.1（-）にＣＡＭ−７０のＮ、Ｐ、及びＬタンパク各遺伝子をそれぞれ個別にpcDNA3.1（-）の制限酵素サイトに挿入連係し各発現ベクターを構築する。T7 RNA polymeraseを発現させるにはrecombinant MVA（以下“recMVA”と略記する；FEBS Letter，vol．371，no．1，pp．9-12，1995）を用いることができる。そして、この３種の発現ベクターと前述の発現ベクターVoとを、予めrecMVAを感染させたＭＲＣ−５又はＷＩ−３８細胞にco-transfectionさせた後、約３５〜３８℃で培養すれば、目的とする組換え弱毒麻疹ウイルスが得られる。かかるウイルスの増殖は、前述と同様にCPE判定やmonoclonal蛍光抗体法等を用いる検鏡により確認することができる。また、得られたウイルスの抗原性あるいは免疫原性の適格性は、前述（１）の抗原解析により確認することができる。
（２）遺伝子免疫用の有効成分の作出：非増殖型アデノウイルスのゲノムに、流行株ウイルスの遺伝子を挿入連係することにより、非増殖型組換えアデノウイルスを作成することができる。このような組換えウイルスは、遺伝子免疫の有効成分として有用である。組換えウイルスの作成には、斉藤らが開発したCOS-TPC法［細胞工学（Cell Technology），vol．13，no．8，pp．757-763，1994］を用いることができる。
この方法では、ヒトアデノウイルス５型ゲノムDNA-TPC（viral DNA-Terminal Protein Complex）と、その非増殖型アデノウイルスゲノムのほぼ全長を有するコスミドカセット（pAdex1；米国特許第５，７００，４７０号）とを使用する。この非増殖型ウイルスは、ヒトアデノウイルス５型に由来し、その増殖に必須の遺伝子E1AとE1Bとを欠損しているため、これ等の遺伝子を恒常的に産生する２９３細胞以外では増殖できない。更にこのウイルスは、CTL（Cytotoxic T Lymphocyte）によるウイルス抗原の認識を拮抗抑制するE3タンパクをコードする遺伝子をも欠損されていて、CTLによる細胞性免疫の成立が期待できるように工夫されている。
用いる麻疹ウイルス遺伝子としては、上記［Ｉ］（３）に列記した抗原をコードする遺伝子から適宜選択し、単独又はこれ等を組合せて用いることができる。しかし、感染（ウイルスの細胞への吸着と侵入）防御に係る免疫原性を高める上では、（a）に記載の全長Ｈタンパク（配列番号２又は１０）と（g）に記載の全長Ｆタンパク（配列番号１８又は２０）をそれぞれコードする遺伝子を組合わせて使用することが好ましい。
具体的には、上記Ｈタンパク遺伝子とＦタンパク遺伝子cDNA（例えば、配列番号９と配列番号１９の塩基配列）を調製し（5'から3'方向に連係する際の組合せはＨＦ又はＦＨ）、これをコスミドカセットpAdex1のE1A・E1B欠損サイトに挿入連係し、pAdex1/HF又はpAdex1/FHとする。一方、アデノ親株ウイルスからDNA-TPCを抽出した後、これを制限酵素Eco T22I（日本国、Takara Shuzo Co．，Ltd．，社製）で消化して切断産物DNA-TPC/EcoT22Iを得る。次に、
pAdex1/HF又はpAdex1/FHと、DNA-TPC/EcoT22Iとをリン酸カルシウム法によリ２９３細胞にco-transfectionさせると、相同組換えが生じ、麻疹ウイルスＨタンパク遺伝子及びＦタンパク遺伝子を有する非増殖型組換えアデノウイルスが得られる。このウイルスが麻疹ウイルスのＨ及びＦ両タンパク遺伝子を保有することは、例えば、このウイルスを感染させたHela細胞について、かかるタンパクに対するmonoclonal抗体を用いる蛍光抗体法により確認することができる。
（３）麻疹ワクチンの製造：前述［II］（１）の組換え弱毒麻疹ウイルスをシードウイルスとして用い、弱毒生麻疹ワクチンを製造することができる。例えば、該組換えウィルスを、感受性細胞、例えばニワトリ胚細胞で培養してウイルス浮遊液を得た後、これを低速遠心にかけ、更に、濾過することにより細胞を除去し、ワクチン原液を調製する。かかるワクチン原液を、適当な培地、例えば、ＢＭＥ培地（Eagle's Basal Medium）で希釈し、ワクチン中のウイルス含量が抗体産生に必要な量、例えば、5,000TCID50/0.5ml（Median Tissue Culture Infective Dose）以上になるように調整する。その際、ウイルス安定化剤を添加混合することもできる。次に、適当な容積、例えば、約１〜２０ｍｌ容のバイアルに調製したワクチン溶液を分注し、密栓・密封の後、ワクチンとして使用に供する。かかるワクチンは、液状のみならず、分注後に凍結乾燥を行い、乾燥製剤として使用に供することができる。尚、製造したワクチン製剤は、その品質を保証するために、使用前に安全性と有効性に関する種々の検定を行う必要がある。かかる検定は、薬事法（昭和３５年法律第１４５号）及び平成５年・厚生省告示第２１７号「生物学的製剤基準」に定める「乾燥弱毒生麻疹ワクチン」の規程に準拠して行う。ワクチンは、例えば、１ドーズ約０．２５〜０．５ｍ１を皮下接種して用いる。
前記［II］（２）の非増殖型組換えウイルスは、２９３細胞で量産することができる。２９３細胞の培養液から、上記のワクチン製剤と同様にして、最終ウイルス含量が２９３細胞において１０6〜１０8ＰＦＵ／ｍｌ（Plaque-Forming Unit）になるよう調整した液状あるいは乾燥製剤を調製し、遺伝子ワクチンの有効成分として提供することができる。該製剤は、１ドーズ約０．２５〜０．５ｍｌを皮下、筋肉内又は経鼻接種して用いることができるが、接種の簡易化を考慮すると、特に経鼻接種が好ましい。
（４）診断剤の調製：診断用抗原としては、上述［Ｉ］（３）に列記した抗原（全長タンパク又はその断片ペプチド）を、単独又は組合せて用いることができる。組合せとしては、抗原スペクトルを広げる意味で、異なるエピトープを包含する抗原を組合せる方が好ましい。本発明の診断用抗原は、例えば、沈降反応、凝集反応、中和反応、蛍光抗体法、酵素免疫測定法、ラジオイムノアッセイ等の抗原として提供できる。また、これ等を動物、例えば、ウサギ、モルモット、マウス等の腹腔内、皮下や筋肉内に接種することにより、免疫血清や抗体等を作成することもできる。この抗体は、例えば、各種診断法において、抗原検出用抗体として提供することができる。
尚、この発明に係る診断用の抗原や抗体は、診断剤中の含量が、抗原抗体反応を生じるに必要な量となるよう希釈調整して使用する。
更に、上述［Ｉ］（３）に列記した抗原をコードする遺伝子を単独又は組合せて、例えば、遺伝子診断におけるプローブ試薬や同定試薬として使用することもできる。本願に開示した弱毒株や流行株ウイルスのＨタンパクやＦタンパクの配列（例えば、配列番号２、１０、１８及び２０）、又はそれらをコードする遺伝子の配列（例えば、配列番号１、９、１７及び１９）を基にＰＣＲプライマーを設計することができる。得られたＰＣＲプライマーはＰＣＲを用いた診断用の試薬として提供することができる。
発明を実施するための最良の形態
以下、実施例に基づいて本発明をより詳細に説明するが、本発明は、これらの実施例に何ら限定されるものではない。
実施例１
抗原解析と遺伝子解析を次の通り行い、過去の流行株（強毒株）、従来の生ワクチン株（弱毒株）及び最近の流行株（強毒株）の三者間における塩基配列とアミノ酸配列の相違をそれぞれ判定する。また、変異抗原のアミノ酸配列を特定すると共に、そのエピトープを決定する。
（１）抗原解析
中和抗体価の測定（１）：マイクロプレートを用いるＵedaの変法により測定する。攻撃ウイルスにはワクチン株ＣＡＭ−７０と流行株Ｍｏｍｏを、また、ウイルスの培養にはＢ９５ａ細胞を用いる。検体には１９９４〜１９９６年の間に麻疹ＣＡＭ−７０ワクチンの接種を受けた小児から得たワクチン接種前及び接種１〜２か月後の血清のうち、豊島株（１９５９年分離）のＨＩ抗原で測定したＨＩ抗体価が８倍の血清１１検体（Ａ群）と６４倍の血清１４検体（Ｂ群）とを用い、１検体につき２列のウェルを用いる。
ウェル内に培地を分注し、その培地を用いて血清を２０μｌずつ２倍に段階希釈する。これに２０μｌの攻撃ウイルス（ウイルス感染価を10 TCID50/20μlに調整済）を添加混合し、３７℃で１時間反応させる。次に、各ウェルにＢ９５ａ細胞を１００μlずつ分注の後、１週間培養する。中和抗体価の測定は、ＣＰＥの有無を判定することにより行う。その結果を以下に記載する：
Ａ群：合計１１検体のうち、９例（９／１１；８１．８％）の相対抗体価（流行株／ワクチン株）は１／２以下であり、特に、これ等９例のうち６例（６／１１；５４．５％）では、ワクチン株に対する抗体価が２．６〜３．６（数値はｌｏｇ2）であるにも拘らず、流行株に対する抗体価は０（数値はｌｏｇ2）未満であり検出されない。尚、残り２例の相対抗体価は１である。
Ｂ群：合計１４検体中、１０例（１０／１４；７１．４％）の相対抗体価（流行株／ワクチン株）は１／２〜１／８と低く、残り４例のそれは約１である。以上の結果、相対抗体価（流行株／ワクチン株）が１／２以下の例が高頻度に検出されるため、最近の流行株麻疹ウイルスの中和ないしは感染に関与する抗原（ＨとＦの両タンパク）に変異があると判定する。
中和抗体価の測定（２）：ＮＡ株Ｈタンパクのマウス免疫血清に対する中和抗体価を、次の記載以外は、上記（１）と同様にして測定する。攻撃ウイルスには、ＣＡＭ−７０、田辺、及びＮＡの３株を用いる。マウス免疫血清は次のように作成する。４週齢ＢＡＬＢ／Ｃマウス１０匹の各々に、ＮＡ株Ｈタンパク発現ベクターpcDNA3.1（-）/H(naked DNA）を１００μｌずつ筋肉内接種し、その２週間後に同じ接種を再び行い追加免疫する。比較対照としての５匹のマウスには生理的食塩水を接種する。追加免疫から４週間後に、各マウスから個別に採血し、これ等を免疫マウス血清とする。尚、上記naked DNAは、後述の実施例３に付随し、ＮＡ株Ｈタンパク発現ベクターとして構築したプスミドpcDNA3.1（-）/Hを大腸菌で増幅し、その培養液から精製して調製する。
測定の結果、各攻撃ウイルスによる平均中和抗体価（ｌｏｇ2）は、ＮＡ株では４．０、ＣＡＭ−７０株では３．８、及び田辺株では４．０である。この結果と前記（１）の結果に基づき、流行株ＮＡの抗原スペクトルは、ワクチン株及び過去の流行株のこれ等に比べて広く、且つ、これ等を包含すると判定する。
（２）遺伝子解析
Ｈタンパク及びＦタンパクの両遺伝子の塩基配列の決定：Ｉsegawaらの方法（Mol．Cell．Prob．，6，467-475，1992）に従って行う。表２及び表３に記載の各麻疹ウイルスを感染させたＢ９５ａ細胞からChirgwinらのGTC/CsCl法（Biochemistry，18，5294-5299，1979）によりＲＮＡを抽出の後、６ｍｅｒのランダムプライマーを用いてｃＤＮＡを作成する。次いで、Ｅdmonston株の遺伝子ｃＤＮＡの塩基配列（Virology，vol，173，no．2，pp．415-425，1989）を参考にして合成した特異的プライマー（表１）を使用し、ＰＣＲを用いる直接シークエンス法により塩基配列を決定すると共に、Universal Codeに基づきアミノ酸配列を判読し、遺伝子変異によるアミノ酸の置換を特定する。その結果を表２、表３、配列番号１，２，９，１０，１７〜２０にそれぞれ示す。
0004043054.tif 000002
0004043054.tif 000003
0004043054.tif 000004
Ｈタンパク二次構造の決定：上記で得たアミノ酸配列をコンピータ解析することにより、Ｈタンパクの二次構造を決定した。解析ソフトにはDNASIS-Mac（version 3.6）［日本国、日立ソフトウェアエンジニアリング（株）社製］を用い、疎水性パターンの解析及びChor-Fasman解析を行う。その結果、配列番号２に記載のＨタンパク全長アミノ酸配列のアミノ酸番号第１番〜第６１７番のうち、第１７６番〜第３１６番及び第３１７番〜第６１６番の領域の二次構造においては、ワクチン株と流行株との間で、エピトープの位置の逆転（flip-flop）している［即ち、ワクチン株（例えばＣＡＭ−７０）と流行株（例えばＭＯやＮＡ）の解析像を左右に並べると、両像は互いに鏡像（線対称）の関係になる様に大きく変化している］。一方、Ｆタンパクには、上記した鏡像（線対称）の関係にある様な変化は見られない。
Ｈタンパクの変異エピトープの解析：更に、エピトープ解析ソフトEpitope Advisor［日本国、（株）富士通九州システムエンジニアリング（FQS）社製］を用い、上記ワクチン株と流行株の変異（アミノ酸置換）が集中している領域に着目し、そのエピトープ解析を行う。その結果から、配列番号２及び１０に記載のアミノ酸番号、第１７２〜１７８番、第２３８〜２４４番、第２７７〜２８２番、及び第３０１〜３０７番の４領域が変異したエピトープであると確認される。
実施例２
弱毒生ワクチン株ウイルスゲノムの改造：前述Radeckeらの方法（reverse genetics）により、ワクチン株ＣＡＭ−７０のＨタンパクの一部を流行株Ｍｏｍｏのそれと置換した組換え体ウイルスＣＡＭ−７０を作成する。置換領域は、配列番号１に記載の塩基配列の第５２６番から第９４８番の塩基（アミノ酸番号第１７６番〜第３１６番）からなる領域（４２３塩基）を含む各ウイルス株ゲノムｃＤＮＡの制限酵素HinfI断片とする。得られた組換えウイルスの抗原性の確認は、ＣＡＭ−７０及びＭｏｍｏ両株のモノクローナル抗体を用いる蛍光抗体法と酵素免疫測定法により行う。
実施例３
弱毒生ワクチン株ウィルスゲノムの改造：Radeckeらの方法の変法を用いる以外は実施例２の方法と同様にして、ワクチン株ＣＡＭ−７０のＨタンパクの一部を流行株ＮＡの対応する配列と置換した組換え体ウイルスを作成する。
先ず、ＣＡＭ−７０株ウイルスゲノムＲＮＡを抽出の後、ＲＴ−ＰＣＲ（reverse transcript-PCR）によりｃＤＮＡを調製し、そのｃＤＮＡから、プライマーを用いることにより、ＣＡＭ−７０株ウイルスのＮ、Ｐ及びＬ各タンパクをコードする遺伝子をクローニングする。（以下、これ等のクローンをそれぞれ、pcDNA3.1（-）/N、pcDNA3.1（-）/P、及びpcDNA3.1（-）/Lと呼ぶ）。これ等は大腸菌で増幅の後、保存し、次の工程に供する。
また、プラスミドpBluescript SK 及び KSを用い、上記と同様の方法によって、ＣＡＭ−７０株ウイルス全長ゲノムＲＮＡのｃＤＮＡの中で、Ｈタンパク遺伝子の一部に対応するＮＡ株の配列と置換した遺伝子ｃＤＮＡをクローニングする。得られたクローンは、以下、pBluescript/MVと呼び、培養・保存し、次の工程に供する。尚、置換する配列は、配列番号１に記載のＣＡＭ−７０株Ｈタンパク遺伝子の塩基配列第５２６番から第９４８番（４２３塩基；アミノ酸番号第１７６番〜第３１６番）からなる領域と、配列番号９に記載のＮＡ株の対応領域（５２６番から第９４８番の塩基）との間で行う。
上記のpcDNA3.1（-）/N，pcDNA3.1（-）/P，pcDNA3.1（-）/L，及びpBluescript/MVを、前述recMVAを予め感染させたＭＲＣ−５にco-transfectionさせ、３７℃での培養により、組換え体ウイルスを得る。これより得られた組みえ体ウイルスの抗原性の確認は、ＣＡＭ−７０及びＮＡ両株のモノクローナル抗体を用いる蛍光抗体法と酵素免疫測定法により行う。このウイルスは、抗原性が流行株のそれと同等であり、しかも、弱毒株であるので、弱毒生麻疹ワクチンの有効成分として提供することができる。
実施例４
遺伝子免疫ワクチン用の有効成分の作出：前述の斉藤らの方法により、非増殖型組換えアデノウイルスを作出する。該ウイルスゲノムに挿入連係する遺伝子は、配列番号９と配列番号１９にそれぞれ記載のＮＡ株のＨ及びＦ各タンパクをコードする遺伝子ｃＤＮＡを組合わせて連係し用いる。連係は、ＦとＨが融合タンパクとして発現されるよう、５’から３’方向にＦ−Ｈの順に行い、このｃＤＮＡを制限酵素SwaIで開裂したコスミドカセットpAdex1のE1A・E1B欠損サイトに挿入連係し、pAdex1/FHを得る。
尚、ＨとＦ各遺伝子のｃＤＮＡは、ＮＡ株ゲノムＲＮＡから、各遺伝子に対応するプライマーを用いるＲＴ−ＰＣＲにより各々調製する。また、pAdex1/FHは、λファージでパッケージングし、大腸菌で増幅・保存し、次の工程に供する。
次に、親株アデノウイルスＤＮＡ−ＴＰＣを、その感染細胞からＣｓＣｌ超遠心法により抽出精製の後、制限酵素Eco T22Iで消化し、切断産物DNA-TPC/Eco T22Iを得る。次に、リン酸カルシウム法により、上記のpAdex1/FHとDNA-TPC/Eco T22Iとを培養した２９３細胞にco-transfectionさせ、３７℃で１８時間培養し、相同組換えを起こさせる。これにより、ＮＡ株のＨ及びＦ両タンパク遺伝子を保有する非増殖型組換えアデノウイルスを作出する。該ウィルスとその増殖は、その感受性宿主である２９３細胞において、ＮＡ株のＨ及びＦ各タンパクに対するmonoclonal抗体を用いる蛍光抗体法により選別且つ確認する。
実施例５
診断剤の調製：次のアミノ酸配列、「Leu Glu Ala Arg Ala Thr Asn」、「Asn Leu Ser Ser Lys Gly Ser」、「Glu Gln Ser Val Ser Asn」、及び「His Arg Glu Asp Ser Ile Thr」をそれぞれ、ペプチドシンセサイザー（米国、モデルABI 432A，Perkin-Elmer社製）を用いて合成し、麻疹ウイルス流行株の感染を鑑別し、且つ同定するための抗原として使用する。
産業上の利用可能性
本発明の変異麻疹ウイルス抗原又はこれをコードする変異麻疹ウイルス遺伝子を用いると、流行株麻疹ウイルスに適合した弱毒生麻疹ワクチン又は遺伝子ワクチン、さらに流行株麻疹ウイルスによる感染を的確に検出できる診断剤を、効率的且つ経済的に提供することが可能である。
配列表
配列番号：１
配列の長さ：１８５４
配列の型：核酸
鎖の数：一本鎖
トポロジー：直鎖状
配列の種類：cDNA to genomic RNA encoding H Protein
起源
生物名：麻疹ウイルス（measles virus）
株名：弱毒麻疹ウイルスＣＡＭ−７０株
配列
0004043054.tif 000005
0004043054.tif 000006
0004043054.tif 000007
0004043054.tif 000008
配列番号：２
配列の長さ：６１７
配列の型：アミノ酸
鎖の数：一本鎖
トポロジー：直鎖状
配列の種類：ペプチド（Ｈタンパク質）
起源
生物名：麻疹ウイルス（measles virus）
株名：弱毒麻疹ウイルスＣＡＭ−７０株
配列
0004043054.tif 000009
0004043054.tif 000010
0004043054.tif 000011
配列番号：３
配列の長さ：５２４
配列の型：アミノ酸
鎖の数：一本鎖
トポロジー：直鎖状
配列の種類：ペプチド
起源
生物名：麻疹ウイルス（measles virus）
株名：弱毒麻疹ウイルスＣＡＭ−７０株
配列
0004043054.tif 000012
0004043054.tif 000013
0004043054.tif 000014
配列番号：４
配列の長さ：１４１
配列の型：アミノ酸
鎖の数：一本鎖
トポロジー：直鎖状
配列の種類：ペプチド
起源
生物名：麻疹ウイルス（measles virus）
株名：弱毒麻疹ウイルスＣＡＭ−７０株
配列
0004043054.tif 000015
配列番号：５
配列の長さ：７
配列の型：アミノ酸
鎖の数：一本鎖
トポロジー：直鎖状
配列の種類：ペプチド
起源
生物名：麻疹ウイルス（measles virus）
株名：弱毒麻疹ウイルスＣＡＭ−７０株
配列
0004043054.tif 000016
配列番号：６
配列の長さ：７
配列の型：アミノ酸
鎖の数：一本鎖
トポロジー：直鎖状
配列の種類：ペプチド
起源
生物名：麻疹ウイルス（measles virus）
株名：弱毒麻疹ウイルスＣＡＭ−７０株
配列
0004043054.tif 000017
配列番号：７
配列の長さ：６
配列の型：アミノ酸
鎖の数：一本鎖
トポロジー：直鎖状
配列の種類：ペプチド
起源
生物名：麻疹ウイルス（measles virus）
株名：弱毒麻疹ウイルスＣＡＭ−７０株
配列
0004043054.tif 000018
配列番号：８
配列の長さ：７
配列の型：アミノ酸
鎖の数：一本鎖
トポロジー：直鎖状
配列の種類：ペプチド
起源
生物名：麻疹ウイルス（measles virus）
株名：弱毒麻疹ウイルスＣＡＭ−７０株
配列
0004043054.tif 000019
配列番号：９
配列の長さ：１８５４
配列の型：核酸
鎖の数：一本鎖
トポロジー：直鎖状
配列の種類：cDNA to genomic RNA encoding H protein
起源
生物名：麻疹ウイルス（measles virus）
株名：強毒麻疹ウイルスＮＡ株
配列
0004043054.tif 000020
0004043054.tif 000021
0004043054.tif 000022
0004043054.tif 000023
配列番号：１０
配列の長さ：６１７
配列の型：アミノ酸
トポロジー：一本鎖
配列の種類：ペプチド（Ｈタンパク質）
起源
生物名：麻疹ウイルス（measles virus）
株名：強毒麻疹ウイルスＮＡ
配列
0004043054.tif 000024
0004043054.tif 000025
0004043054.tif 000026
配列番号：１１
配列の長さ：５２４
配列の型：アミノ酸
鎖の数：一本鎖
トポロジー：直鎖状
配列の種類：ペプチド
起源
生物名：麻疹ウイルス（measles virus）
株名：強毒麻疹ウイルスＮＡ株
配列
0004043054.tif 000027
0004043054.tif 000028
0004043054.tif 000029
配列番号：１２
配列の長さ．：１４１
配列の型：アミノ酸
鎖の数：一本鎖
トポロジー：直鎖状
配列の種類：ペプチド
起源
生物名：麻疹ウイルス（measles virus）
株名：強毒麻疹ウイルスＮＡ株
配列
0004043054.tif 000030
配列番号：１３
配列の長さ：７
配列の型：アミノ酸
鎖の数：一本鎖
トポロジー：直鎖状
配列の種類：ペプチド
起源
生物名：麻疹ウイルス（measles virus）
株名：強毒麻疹ウイルスＮＡ株
配列
0004043054.tif 000031
配列番号：１４
配列の長さ：７
配列の型：アミノ酸
鎖の数：一本鎖
トポロジー：直鎖状
配列の種類：ペプチド
起源
生物名：麻疹ウイルス（measles virus）
株名：強毒麻疹ウイルスＮＡ株
配列
0004043054.tif 000032
配列番号：１５
配列の長さ：６
配列の型：アミノ酸
鎖の数：一本鎖
トポロジー：直鎖状
配列の種類：ペプチド
起源
生物名：麻疹ウイルス（measles virus）
株名：強毒麻疹ウイルスＮＡ株
配列
0004043054.tif 000033
配列番号：１６
配列の長さ：７
配列の型：アミノ酸
鎖の数：一本鎖
トポロジー：直鎖状
配列の種類：ペプチド
起源
生物名：麻疹ウイルス（measles virus）
株名：強毒麻疹ウイルスＮＡ株
配列
0004043054.tif 000034
配列番号：１７
配列の長さ：１６５３
配列の型：核酸
鎖の数：一本鎖
トポロジー：直鎖状
配列の種類：cDNA to genomic RNA encoding F Protein
起源
生物名：麻疹ウイルス（measles virus）
株名：弱毒麻疹ウイルスＣＡＭ−７０株
配列
0004043054.tif 000035
0004043054.tif 000036
0004043054.tif 000037
0004043054.tif 000038
配列番号：１８
配列の長さ：５５０
配列の型：アミノ酸
鎖の数：一本鎖
配列の種類：ペプチド（Ｆタンパク質）
起源
生物名：麻疹ウイルス（measles virus）
株名：弱毒麻疹ウイルスＣＡＭ−７０株
配列
0004043054.tif 000039
0004043054.tif 000040
0004043054.tif 000041
配列番号：１９
配列の長さ：１６５３
配列の型：核酸
鎖の数：一本鎖
トポロジー：直鎖状
配列の種類：cDNA to genomic RNA encoding F Protein
起源
生物名：麻疹ウイルス（measles virus）
株名：強毒麻疹ウイルスＮＡ株
配列
0004043054.tif 000042
0004043054.tif 000043
0004043054.tif 000044
0004043054.tif 000045
配列番号：２０
配列の長さ：５５０
配列の型：アミノ酸
トポロジー：一本鎖
配列の種類：ペプチド（Ｆタンパク）
起源
生物名：麻疹ウイルス（measles virus）
株名：強毒麻疹ウイルスＮＡ株
配列
0004043054.tif 000046
0004043054.tif 000047
0004043054.tif 000048