【手続補正書】
【提出日】平成17年10月24日(2005.10.24)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
被験者がＩＬ−１炎症性ハプロタイプと関連している疾患または状態を有するかどうか、あるいは発症する素因があるかどうかを検査する方法であって、前記被験者から採取した試料において、ＩＬ−１Ａ ＳＮＰ＃２（ＩＬＡ２）；ＩＬ−１Ａ ＳＮＰ＃１１（ＩＬＡ１１）；ＩＬ−１Ａ ＳＮＰ＃１５（ＩＬＡ１５）；ＩＬ−１Ａ ＳＮＰ＃１７（ＩＬＡ１７）；ＩＬ−１Ａ ＳＮＰ＃２５（ＩＬＡ２５）；ＩＬ−１Ａ ＳＮＰ＃３１（ＩＬＡ３１）；ＩＬ−１Ｂ ＳＮＰ＃１（ＩＬＢ１）；ＩＬ−１Ｂ ＳＮＰ＃４（ＩＬＢ４）；ＩＬ−１Ｂ ＳＮＰ＃１０（ＩＬＢ１０）；ＩＬ−１Ｂ ＳＮＰ＃１４（ＩＬＢ１４）；ＩＬ−１Ｂ ＳＮＰ＃１５（ＩＬＢ１５）；ＩＬ−１Ｂ ＳＮＰ＃２４（ＩＬＢ２４）；ＩＬ−１Ｂ ＳＮＰ＃３０（ＩＬＢ３０）；ＩＬ−１Ｂ ＳＮＰ＃３７（ＩＬＢ３７）；ＩＬ−１Ｂ ＳＮＰ＃３８（ＩＬＢ３８）；ＩＬ−１Ｆ８ ＳＮＰ＃１２２（Ｓ１２２）；ＩＬ−１Ｆ６ ＳＮＰ＃５１１（Ｓ５１１）；ＩＬ−１Ｆ６ ＳＮＰ＃４９７（Ｓ４９７）；ＩＬ−１Ｆ７ ＳＮＰ＃００２（Ｓ０００２）；ＩＬ−１Ｆ５ ＳＮＰ＃１３（ＩＬＬ１３）；ＩＬ−１Ｆ５ ＳＮＰ＃１５（ＩＬＬ１５）；ＩＬ−１Ｆ５ ＳＮＰ＃１７（ＩＬＬ１７）；ＩＬ−１Ｆ５ ＳＮＰ＃２８（ＩＬＬ２８）；ＩＬ−１Ｆ５ ＳＮＰ＃４９（ＩＬＬ４９）；ＩＬ−１ＲＮ ＳＮＰ＃１５（ＲＡ１５）；ＩＬ−１ＲＮ ＳＮＰ＃２１（ＲＡ２１）；ＩＬ−１ＲＮ ＳＮＰ＃２５（ＲＡ２５）；ＩＬ−１ＲＮ ＳＮＰ＃３１（ＲＡ３１）；ＩＬ−１ＲＮ ＳＮＰ＃３４（ＲＡ３４）；ＩＬ−１ＲＮ ＳＮＰ＃３５（ＲＡ３５）；ＩＬ−１ＲＮ ＳＮＰ＃３９（ＲＡ３９）；ＩＬ−１ＲＮ ＳＮＰ＃４４（ＲＡ４４）；ＩＬ−１ＲＮ ＳＮＰ＃６３（ＲＡ６３）；ＩＬ−１ＲＮ ＳＮＰ＃７７（ＲＡ７７）；ＩＬ−１ＲＮ ＳＮＰ＃７８（ＲＡ７８）；ＩＬ−１ＲＮ ＳＮＰ＃７９（ＲＡ７９）；ＩＬ−１ＲＮ ＳＮＰ＃８１（ＲＡ８１）；ＩＬ−１ＲＮ ＳＮＰ＃８９（ＲＡ８９）；ＩＬ−１Ａ ＳＮＰ＃１；ＩＬ−１Ａ ＳＮＰ＃３；ＩＬ−１Ａ ＳＮＰ＃５；ＩＬ−１Ａ ＳＮＰ＃１０；ＩＬ−１Ａ ＳＮＰ＃１２；ＩＬ−１Ａ ＳＮＰ＃１４；ＩＬ−１Ａ ＳＮＰ＃１６；ＩＬ−１Ａ ＳＮＰ＃１９；ＩＬ−１Ａ ＳＮＰ＃２６；ＩＬ−１Ａ ＳＮＰ＃３２；ＩＬ−１Ａ ＳＮＰ＃３４；ＩＬ−１Ｂ ＳＮＰ＃２；ＩＬ−１Ｂ ＳＮＰ＃３；ＩＬ−１Ｂ ＳＮＰ＃５；ＩＬ−１Ｂ ＳＮＰ＃６；ＩＬ−１Ｂ ＳＮＰ＃７；ＩＬ−１Ｂ ＳＮＰ＃８；ＩＬ−１Ｂ ＳＮＰ＃９；ＩＬ−１Ｂ ＳＮＰ＃１７；ＩＬ−１Ｆ５ ＳＮＰ＃５；ＩＬ−１Ｆ５ ＳＮＰ＃７；ＩＬ−１Ｆ５ ＳＮＰ＃９；ＩＬ−１Ｆ５ ＳＮＰ＃１０；ＩＬ−１Ｆ５ ＳＮＰ＃１１；ＩＬ−１Ｆ５ ＳＮＰ＃１４；ＩＬ−１Ｆ５ ＳＮＰ＃２２；ＩＬ−１Ｆ５ ＳＮＰ＃２３；ＩＬ−１Ｆ５ ＳＮＰ＃２４；ＩＬ−１Ｆ５ ＳＮＰ＃２７；ＩＬ−１Ｆ５ ＳＮＰ＃２９；ＩＬ−１Ｆ５ ＳＮＰ＃３５；ＩＬ−１Ｆ５ ＳＮＰ＃３６；ＩＬ−１Ｆ５ ＳＮＰ＃３８；ＩＬ−１Ｆ５ ＳＮＰ＃４０；ＩＬ−１Ｆ５ ＳＮＰ＃４３；ＩＬ−１Ｆ５ ＳＮＰ＃４５；ＩＬ−１Ｆ５ ＳＮＰ＃４８；ＩＬ−１Ｆ５ ＳＮＰ＃５０；ＩＬ−１Ｆ５ ＳＮＰ＃５１；ＩＬ−１Ｆ５ ＳＮＰ＃５４；ＩＬ−１Ｆ５ ＳＮＰ＃５６；ＩＬ−１Ｆ５ ＳＮＰ＃５７； ＩＬ−１ＲＮ ＳＮＰ＃��４；ＩＬ−１ＲＮ ＳＮＰ＃１９；ＩＬ−１ＲＮ ＳＮＰ＃２２；ＩＬ−１ＲＮ ＳＮＰ＃３０；ＩＬ−１ＲＮ ＳＮＰ＃３６；ＩＬ−１ＲＮ ＳＮＰ＃３７；ＩＬ−１ＲＮ ＳＮＰ＃３８；ＩＬ−１ＲＮ ＳＮＰ＃４０；ＩＬ−１ＲＮ ＳＮＰ＃４３；ＩＬ−１ＲＮ ＳＮＰ＃６２；ＩＬ−１ＲＮ ＳＮＰ＃６４；ＩＬ−１ＲＮ ＳＮＰ＃７６；およびＩＬ−１ＲＮ ＳＮＰ＃８２より成る群から選択されるＩＬ−１対立遺伝子を検出する工程を含むことを特徴とする方法。
【請求項２】
少なくとも２つの対立遺伝子を検出することを特徴とする請求項１記載の方法。
【請求項３】
前記２つの対立遺伝子が、少なくとも０．５の連鎖不平衡値（Ｄ'）を有することを特徴とする請求項２記載の方法。
【請求項４】
前記２つの対立遺伝子が、少なくとも０．６の連鎖不平衡値（Ｄ'）を有することを特徴とする請求項２記載の方法。
【請求項５】
前記２つの対立遺伝子が、少なくとも０．７の連鎖不平衡値（Ｄ'）を有することを特徴とする請求項２記載の方法。
【請求項６】
前記２つの対立遺伝子が、少なくとも０．８の連鎖不平衡値（Ｄ'）を有することを特徴とする請求項２記載の方法。
【請求項７】
前記２つの対立遺伝子が、少なくとも０．９の連鎖不平衡値（Ｄ'）を有することを特徴とする請求項２記載の方法。
【請求項８】
被験者がＩＬ−１炎症性ハプロタイプ表現型と関連する疾患または状態を有するかどうか、あるいは発症する素因があるかどうかを検査する方法であって、前記被験者から採取した試料において、ＩＬ−１Ａ ＳＮＰ＃２（ＩＬＡ２）；ＩＬ−１Ａ ＳＮＰ＃１１（ＩＬＡ１１）；ＩＬ−１Ａ ＳＮＰ＃１５（ＩＬＡ１５）；ＩＬ−１Ａ ＳＮＰ＃１７（ＩＬＡ１７）；ＩＬ−１Ａ ＳＮＰ＃２５（ＩＬＡ２５）；ＩＬ−１Ａ ＳＮＰ＃２６（ＩＬＡ２６）；ＩＬ−１Ａ ＳＮＰ＃３１（ＩＬＡ３１）；ＩＬ−１Ｂ ＳＮＰ＃１（ＩＬＢ１）；ＩＬ−１Ｂ ＳＮＰ＃４（ＩＬＢ４）；ＩＬ−１Ｂ ＳＮＰ＃１０（ＩＬＢ１０）；ＩＬ−１Ｂ ＳＮＰ＃１４（ＩＬＢ１４）；ＩＬ−１Ｂ ＳＮＰ＃１５（ＩＬＢ１５）；ＩＬ−１Ｂ ＳＮＰ＃２４（ＩＬＢ２４）；ＩＬ−１Ｂ ＳＮＰ＃２５（ＩＬＢ２５）；ＩＬ−１Ｂ ＳＮＰ＃３０（ＩＬＢ３０）；ＩＬ−１Ｂ ＳＮＰ＃３７（ＩＬＢ３７）；ＩＬ−１Ｂ ＳＮＰ＃３８（ＩＬＢ３８）；ＩＬ−１Ｆ８ ＳＮＰ＃１２２（Ｓ１２２）；ＩＬ−１Ｆ６ ＳＮＰ＃５１１（Ｓ５１１）；ＩＬ−１Ｆ６ ＳＮＰ＃４９７（Ｓ４９７）；ＩＬ−１Ｆ７ ＳＮＰ＃００２（Ｓ０００２）；ＩＬ−１Ｆ５ ＳＮＰ＃１３（ＩＬＬ１３）；ＩＬ−１Ｆ５ ＳＮＰ＃１５（ＩＬＬ１５）；ＩＬ−１Ｆ５ ＳＮＰ＃１７（ＩＬＬ１７）；ＩＬ−１Ｆ５ ＳＮＰ＃２８（ＩＬＬ２８）；ＩＬ−１Ｆ５ ＳＮＰ＃４９（ＩＬＬ４９）；ＩＬ−１ＲＮ ＳＮＰ＃１５（ＲＡ１５）；ＩＬ−１ＲＮ ＳＮＰ＃２１（ＲＡ２１）；ＩＬ−１ＲＮ ＳＮＰ＃２５（ＲＡ２５）；ＩＬ−１ＲＮ ＳＮＰ＃３１（ＲＡ３１）；ＩＬ−１ＲＮ ＳＮＰ＃３４（ＲＡ３４）；ＩＬ−１ＲＮ ＳＮＰ＃３５（ＲＡ３５）；ＩＬ−１ＲＮ ＳＮＰ＃３９（ＲＡ３９）；ＩＬ−１ＲＮ ＳＮＰ＃４４（ＲＡ４４）；ＩＬ−１ＲＮ ＳＮＰ＃６１（ＲＡ６１）；ＩＬ−１ＲＮ ＳＮＰ＃６３（ＲＡ６３）；ＩＬ−１ＲＮ ＳＮＰ＃７７（ＲＡ７７）；ＩＬ−１ＲＮ ＳＮＰ＃７８（ＲＡ７８）；ＩＬ−１ＲＮ ＳＮＰ＃７９（ＲＡ７９）；ＩＬ−１ＲＮ ＳＮＰ＃８１（ＲＡ８１）；ＩＬ−１ＲＮ ＳＮＰ＃８９（ＲＡ８９）；およびＩＬＧＮ ＳＮＰ＃Ａ−８８９より成る群から選択されるＩＬ−１ハプロタイプの特徴的なパターンを検出する工程を含むことを特徴とする方法。
【請求項９】
前記ＩＬ−１ハプロタイプが、ｈａｐ１パターンを含むことを特徴とする請求項８記載の方法。
【請求項１０】
ｈａｐ１パターンＴ_Ｔ_Ｃ／２_２_１の３つの対立遺伝子を検出することを含むことを特徴とする請求項８記載の方法。
【請求項１１】
前記ＩＬ−１ハプロタイプが、ｈａｐ２パターンを含むことを特徴とする請求項８記載の方法。
【請求項１２】
ｈａｐ２パターンＧ_Ｃ_Ｔ／１_１_２の３つの対立遺伝子を検出することを含むことを特徴とする請求項８記載の方法。
【請求項１３】
前記ＩＬ−１ハプロタイプが、ｈａｐ３パターンを含むことを特徴とする請求項８記載の方法。
【請求項１４】
ｈａｐ３パターンＧ_Ｃ_Ｃ／１_１_１の３つの対立遺伝子を検出することを含むことを特徴とする請求項８記載の方法。
【請求項１５】
前記ＩＬ−１ハプロタイプが、ｈａｐ４パターンを含むことを特徴とする請求項８記載の方法。
【請求項１６】
ｈａｐ４パターンＣ_Ｃ_Ｃ／１_１_１の３つの対立遺伝子を検出することを含むことを特徴とする請求項８記載の方法。
【請求項１７】
ＩＬ−１Ａ ＳＮＰ＃１−６、９−１９、２４−２６および３０−３４、ＩＬ−１Ｂ ＳＮＰ＃１−１０、１４、１５、１７、１９、２４、２５、３０、３５、３７および３８、ならびにＩＬ−１ＲＮ ＳＮＰ＃１４、１５、１８、１９、２１、２２、２５、２６、２９−４０、４２−４４、６１−６８、７６−８２および８９より成る群から選択されるＳＮＰ配列またはその相補鎖の連続した少なくとも１２ヌクレオチドの新規核酸を含む、ＩＬ−１多型を検出するためのＩＬ−１ポリヌクレオチド配列。
【請求項１８】
前記新規核酸配列が、ＩＬ−１Ａ ＳＮＰ＃１−６、９−１９、２４−２６および３０−３４、ＩＬ−１Ｂ ＳＮＰ＃１−１０、１４、１５、１７、１９、２４、２５、３０、３５、３７および３８、ならびにＩＬ−１ＲＮ ＳＮＰ＃１４、１５、１８、１９、２１、２２、２５、２６、２９−４０、４２−４４、６１−６８、７６−８２および８９より成る群から選択されるＳＮＰ配列またはその相補鎖の連続した少なくとも１４ヌクレオチドを含むことを特徴とする請求項１７記載のＩＬ−１ポリヌクレオチド配列。
【請求項１９】
前記新規核酸配列が、ＩＬ−１Ａ ＳＮＰ＃１−６、９−１９、２４−２６および３０−３４、ＩＬ−１Ｂ ＳＮＰ＃１−１０、１４、１５、１７、１９、２４、２５、３０、３５、３７および３８、ならびにＩＬ−１ＲＮ ＳＮＰ＃１４、１５、１８、１９、２１、２２、２５、２６、２９−４０、４２−４４、６１−６８、７６−８２および８９より成る群から選択されるＳＮＰ配列またはその相補鎖の連続した少なくとも１７ヌクレオチドを含むことを特徴とする請求項１７記載のＩＬ−１ポリヌクレオチド配列。
【請求項２０】
前記ＳＮＰ配列が：ＩＬ−１Ａ ＳＮＰ＃１；ＩＬ−１Ａ ＳＮＰ＃２（ＩＬＡ２）；ＩＬ−１Ａ ＳＮＰ＃３；ＩＬ−１Ａ ＳＮＰ＃４；ＩＬ−１Ａ ＳＮＰ＃９；ＩＬ−１Ａ ＳＮＰ＃１０；ＩＬ−１Ａ ＳＮＰ＃１１（ＩＬＡ１１）；ＩＬ−１Ａ ＳＮＰ＃１４；ＩＬ−１Ａ ＳＮＰ＃１５（ＩＬＡ１５）；ＩＬ−１Ａ ＳＮＰ＃１６；ＩＬ−１Ａ ＳＮＰ＃１９；ＩＬ−１Ａ ＳＮＰ＃２４；ＩＬ−１Ａ ＳＮＰ＃２５（ＩＬＡ２５）；ＩＬ−１Ａ ＳＮＰ＃２６（ＩＬＡ２６）；ＩＬ−１Ａ ＳＮＰ＃３０；ＩＬ−１Ａ ＳＮＰ＃３１（ＩＬＡ３１）；ＩＬ−１Ａ ＳＮＰ＃３３；およびＩＬ１Ａ ＳＮＰ＃３４；より成る群から選択されるＩＬ−１Ａ ＳＮＰであることを特徴とする請求項１７から１９いずれか１項記載のＩＬ−１ポリヌクレオチド配列。
【請求項２１】
前記ＳＮＰ配列が：ＩＬ−１Ｂ ＳＮＰ＃１（ＩＬＢ１）；ＩＬ−１Ｂ ＳＮＰ＃２；ＩＬ−１Ｂ ＳＮＰ＃３；ＩＬ−１Ｂ ＳＮＰ＃４（ＩＬＢ４）；ＩＬ−１Ｂ ＳＮＰ＃５；ＩＬ−１Ｂ ＳＮＰ＃６；ＩＬ−１Ｂ ＳＮＰ＃７；ＩＬ−１Ｂ ＳＮＰ＃８；ＩＬ−１Ｂ ＳＮＰ＃９；ＩＬ−１Ｂ ＳＮＰ＃１７（ＩＬＢ１７）；ＩＬ−１Ｂ ＳＮＰ＃１９；ＩＬ−１Ｂ ＳＮＰ＃３５；およびＩＬ１Ｂ ＳＮＰ＃３８（ＩＬＢ３８）；より成る群から選択されるＩＬ−１Ｂ ＳＮＰであることを特徴とする請求項１７から１９いずれか１項記載のＩＬ−１ポリヌクレオチド配列。
【請求項２２】
前記ＳＮＰ配列が：ＩＬ−１ＲＮｉｃ ＳＮＰ＃１４；ＩＬ−１ＲＮｉｃ ＳＮＰ＃１８；ＩＬ−１ＲＮｉｃ ＳＮＰ＃２１（ＲＡ２１）；ＩＬ−１ＲＮｉｃ ＳＮＰ＃２２；ＩＬ−１ＲＮｉｃ ＳＮＰ＃２６；ＩＬ−１ＲＮｉｃ ＳＮＰ＃；２９；ＩＬ−１ＲＮｉｃ ＳＮＰ＃３０；ＩＬ−１ＲＮｉｃ ＳＮＰ＃３１（ＲＡ３１）；ＩＬ−１ＲＮｉｃ ＳＮＰ＃３２；ＩＬ−１ＲＮｉｃ ＳＮＰ＃３３；ＩＬ−１ＲＮｉｃ ＳＮＰ＃３４（ＲＡ３４）；ＩＬ−１ＲＮｉｃ ＳＮＰ＃３５（ＲＡ３５）；ＩＬ−１ＲＮｉｃ ＳＮＰ＃３６；ＩＬ−１ＲＮｉｃ ＳＮＰ＃３７；ＩＬ−１ＲＮｉｃ ＳＮＰ＃３８；ＩＬ−１ＲＮｉｃ ＳＮＰ＃４０；ＩＬ−１ＲＮｉｃ ＳＮＰ＃４２；ＩＬ−１ＲＮｉｃ ＳＮＰ＃４３；ＩＬ−１ＲＮｉｃ ＳＮＰ＃６５；ＩＬ−１ＲＮｉｃ ＳＮＰ＃６７；ＩＬ−１ＲＮｉｃ ＳＮＰ＃；６８；およびＩＬ−１ＲＮｉｃ ＳＮＰ＃８２；より成る群から選択されるＩＬ−１ＲＮｉｃ ＳＮＰであることを特徴とする請求項１７から１９いずれか１項記載のＩＬ−１ポリヌクレオチド配列。
【請求項２３】
前記ＳＮＰ配列が：ＩＬ−１ＲＮｓｅｃ ＳＮＰ＃６７；ＩＬ−１ＲＮｓｅｃ ＳＮＰ＃６８；ＩＬ−１ＲＮｓｅｃ ＳＮＰ＃８２；およびＩＬ−１ＲＮｓｅｃ ＳＮＰ＃９３；より成る群から選択されるＩＬ−１ＲＮｓｅｃ ＳＮＰであることを特徴とする請求項１７から１９いずれか１項記載のＩＬ−１ポリヌクレオチド配列。
【請求項２４】
請求項１７、１８、または１９のいずれかに記載の少なくとも２つのポリヌクレオチドを含むことを特徴とするＩＬ−１遺伝子型決定のためのキット。
【請求項２５】
ＩＬ−１Ａ ＳＮＰ＃１；ＩＬ−１Ａ ＳＮＰ＃２（ＩＬＡ２）；ＩＬ−１Ａ ＳＮＰ＃３；ＩＬ−１Ａ ＳＮＰ＃４；ＩＬ−１Ａ ＳＮＰ＃９；ＩＬ−１Ａ ＳＮＰ＃１０；ＩＬ−１Ａ ＳＮＰ＃１１（ＩＬＡ１１）；ＩＬ−１Ａ ＳＮＰ＃１４；ＩＬ−１Ａ ＳＮＰ＃１５（ＩＬＡ１５）；ＩＬ−１Ａ ＳＮＰ＃１６；ＩＬ−１Ａ ＳＮＰ＃１９；ＥＬ−１Ａ ＳＮＰ＃２４；ＩＬ−１Ａ ＳＮＰ＃２５（ＩＬＡ２５）；ＩＬ−１Ａ ＳＮＰ＃２６（ＩＬＡ２６）；ＩＬ−１Ａ ＳＮＰ＃３０；ＩＬ−１Ａ ＳＮＰ＃３１（ＩＬＡ３１）；ＩＬ−１Ａ ＳＮＰ＃３３；ＩＬ−１Ａ ＳＮＰ＃３４；ＩＬ１Ｂ ＳＮＰ＃１（ＩＬＢ１）；ＩＬ−１Ｂ ＳＮＰ＃２；ＩＬ−１Ｂ ＳＮＰ＃３；ＩＬ−１Ｂ ＳＮＰ＃４（ＩＬＢ４）；ＩＬ−１Ｂ ＳＮＰ＃５；ＩＬ−１Ｂ ＳＮＰ＃６；ＩＬ−１Ｂ ＳＮＰ＃７；ＩＬ−１Ｂ ＳＮＰ＃８；ＩＬ−１Ｂ ＳＮＰ＃９；ＩＬ−１Ｂ ＳＮＰ＃１７；ＩＬ−１Ｂ ＳＮＰ＃１９；ＩＬ１Ｂ ＳＮＰ＃３５；ＩＬ−１Ｂ ＳＮＰ＃３８（ＩＬＢ３８）；ＩＬ−１ＲＮｉｃ ＳＮＰ＃１４；ＩＬ−１ＲＮｉｃ ＳＮＰ＃１４；ＩＬ−１ＲＮｉｃ ＳＮＰ＃１８；ＩＬ−１ＲＮｉｃ ＳＮＰ＃２１；ＩＬ−１ＲＮｉｃ ＳＮＰ＃２２；ＩＬ−１ＲＮｉｃ ＳＮＰ＃２６；ＩＬ−１ＲＮｉｃ ＳＮＰ＃；２９；ＩＬ−１ＲＮｉｃ ＳＮＰ＃３０；ＩＬ−１ＲＮｉｃ ＳＮＰ＃；３１；ＩＬ−１ＲＮｉｃ ＳＮＰ＃３２；ＩＬ−１ＲＮｉｃ ＳＮＰ＃３３；ＩＬ−１ＲＮｉｃ ＳＮＰ＃３４；ＩＬ−１ＲＮｉｃ ＳＮＰ＃３５；ＩＬ−１ＲＮｉｃ ＳＮＰ＃３６；ＩＬ−１ＲＮｉｃ ＳＮＰ＃３７；ＩＬ−１ＲＮｉｃ ＳＮＰ＃３８；ＩＬ−１ＲＮｉｃ ＳＮＰ＃４０；ＩＬ−１ＲＮｉｃ ＳＮＰ＃４２；ＩＬ−１ＲＮｉｃ ＳＮＰ＃４３；ＩＬ−１ＲＮｉｃ ＳＮＰ＃６５；ＩＬ−１ＲＮｉｃ ＳＮＰ＃６７；ＩＬ−１ＲＮｉｃ ＳＮＰ＃；６８；ＩＬ−１ＲＮｉｃ ＳＮＰ＃８２；ＩＬ−１ＲＮｓｅｃ ＳＮＰ＃６７；ＩＬ−１ＲＮｓｅｃ ＳＮＰ＃６８；ＩＬ−１ＲＮｓｅｃＳＮＰ＃８２；およびＩＬ−１ＲＮｓｅｃ ＳＮＰ＃９３；より成る群から選択される連続した少なくとも１２ヌクレオチドからなる少なくとも２つのポリヌクレオチドを含むことを特徴とするＩＬ−１遺伝子型決定のためのキット。
【請求項２６】
ＩＬ−１多型と関連する疾患または障害を有するかあるいは発症する素因がある個体のための適当な治療薬を選択する方法であって：
前記個体から採取した試料において、ＩＬ−１Ａ ＳＮＰ＃２（ＩＬＡ２）；ＩＬ−１Ａ ＳＮＰ＃１１（ＩＬＡ１１）；ＩＬ−１Ａ ＳＮＰ＃１５（ＩＬＡ１５）；ＩＬ−１Ａ ＳＮＰ＃１７（ＩＬＡ１７）；ＩＬ−１Ａ ＳＮＰ＃２５（ＩＬＡ２５）；ＩＬ−１Ａ ＳＮＰ＃３１（ＩＬＡ３１）；ＩＬ−１Ｂ ＳＮＰ＃１（ＩＬＢ１）；ＩＬ−１Ｂ ＳＮＰ＃４（ＩＬＢ４）；ＩＬ−１Ｂ ＳＮＰ＃１０（ＩＬＢ１０）；ＩＬ−１Ｂ ＳＮＰ＃１４（ＩＬＢ１４）；ＩＬ−１Ｂ ＳＮＰ＃１５（ＩＬＢ１５）；ＩＬ−１Ｂ ＳＮＰ＃２４（ＩＬＢ２４）；ＩＬ−１Ｂ ＳＮＰ＃３０（ＩＬＢ３０）；ＩＬ−１Ｂ ＳＮＰ＃３７（ＩＬＢ３７）；ＩＬ−１Ｂ ＳＮＰ＃３８（ＩＬＢ３８）；ＩＬ−１Ｆ８ ＳＮＰ＃１２２（Ｓ１２２）；ＩＬ−１Ｆ６ ＳＮＰ＃５１１（Ｓ５１１）；ＩＬ−１Ｆ６ ＳＮＰ＃４９７（Ｓ４９７）；ＩＬ−１Ｆ７ ＳＮＰ＃００２（Ｓ０００２）；ＩＬ−１Ｆ５ ＳＮＰ＃１３（ＩＬＬ１３）；ＩＬ−１Ｆ５ ＳＮＰ＃１５（ＩＬＬ１５）；ＩＬ−１Ｆ５ ＳＮＰ＃１７（ＩＬＬ１７）；ＩＬ−１Ｆ５ ＳＮＰ＃２８（ＩＬＬ２８）；ＩＬ−１Ｆ５ ＳＮＰ＃４９（ＩＬＬ４９）；ＩＬ−１ＲＮ ＳＮＰ＃１５（ＲＡ１５）；ＩＬ−１ＲＮ ＳＮＰ＃２１（ＲＡ２１）；ＩＬ−１ＲＮ ＳＮＰ＃２５（ＲＡ２５）；ＩＬ−１ＲＮ ＳＮＰ＃３１（ＲＡ３１）；ＩＬ−１ＲＮ ＳＮＰ＃３４（ＲＡ３４）；ＩＬ−１ＲＮ ＳＮＰ＃３５（ＲＡ３５）；ＩＬ−１ＲＮ ＳＮＰ＃３９（ＲＡ３９）；ＩＬ−１ＲＮ ＳＮＰ＃４４（ＲＡ４４）；ＩＬ−１ＲＮ ＳＮＰ＃６３（ＲＡ６３）；ＩＬ−１ＲＮ ＳＮＰ＃７７（ＲＡ７７）；ＩＬ−１ＲＮ ＳＮＰ＃７８（ＲＡ７８）；ＩＬ−１ＲＮ ＳＮＰ＃７９（ＲＡ７９）；ＩＬ−１ＲＮ ＳＮＰ＃８１（ＲＡ８１）；ＩＬ−１ＲＮ ＳＮＰ＃８９（ＲＡ８９）；ＩＬ−１Ａ ＳＮＰ＃１；ＩＬ−１Ａ ＳＮＰ＃３；ＩＬ−１Ａ ＳＮＰ＃５；ＩＬ−１Ａ ＳＮＰ＃１０；ＩＬ−１Ａ ＳＮＰ＃１２；ＩＬ−１Ａ ＳＮＰ＃１４；ＩＬ−１Ａ ＳＮＰ＃１６；ＩＬ−１Ａ ＳＮＰ＃１９；ＩＬ−１Ａ ＳＮＰ＃２６；ＩＬ−１Ａ ＳＮＰ＃３２；ＩＬ−１Ａ ＳＮＰ＃３４；ＩＬ−１Ｂ ＳＮＰ＃２；ＩＬ−１Ｂ ＳＮＰ＃３；ＩＬ−１Ｂ ＳＮＰ＃５；ＩＬ−１Ｂ ＳＮＰ＃６；ＩＬ−１Ｂ ＳＮＰ＃７；ＩＬ−１Ｂ ＳＮＰ＃８；ＩＬ−１Ｂ ＳＮＰ＃９；ＩＬ−１Ｂ ＳＮＰ＃１７；ＩＬ−１Ｆ５ ＳＮＰ＃５；ＩＬ−１Ｆ５ ＳＮＰ＃７；ＩＬ−１Ｆ５ ＳＮＰ＃９；ＩＬ−１Ｆ５ ＳＮＰ＃１０；ＩＬ−１Ｆ５ ＳＮＰ＃１１；ＩＬ−１Ｆ５ ＳＮＰ＃１４；ＩＬ−１Ｆ５ ＳＮＰ＃２２；ＩＬ−１Ｆ５ ＳＮＰ＃２３；ＩＬ−１Ｆ５ ＳＮＰ＃２４；ＩＬ−１Ｆ５ ＳＮＰ＃２７；ＩＬ−１Ｆ５ ＳＮＰ＃２９；ＩＬ−１Ｆ５ ＳＮＰ＃３５；ＩＬ−１Ｆ５ ＳＮＰ＃３６；ＩＬ−１Ｆ５ ＳＮＰ＃３８；ＩＬ−１Ｆ５ ＳＮＰ＃４０；ＩＬ−１Ｆ５ ＳＮＰ＃４３；ＩＬ−１Ｆ５ ＳＮＰ＃４５；ＩＬ−１Ｆ５ ＳＮＰ＃４８；ＩＬ−１Ｆ５ ＳＮＰ＃５０；ＩＬ−１Ｆ５ ＳＮＰ＃５１；ＩＬ−１Ｆ５ ＳＮＰ＃５４；ＩＬ−１Ｆ５ ＳＮＰ＃５６；ＩＬ−１Ｆ５ ＳＮＰ＃５７； ＩＬ−１ＲＮ ＳＮＰ＃１４；ＩＬ−１ＲＮ ＳＮＰ＃１９；ＩＬ−１ＲＮ ＳＮＰ＃２２；ＩＬ−１ＲＮ ＳＮＰ＃３０；ＩＬ−１ＲＮ ＳＮＰ＃３６；ＩＬ−１ＲＮ ＳＮＰ＃３７；ＩＬ−１ＲＮ ＳＮＰ＃３８；ＩＬ−１ＲＮ ＳＮＰ＃４０；ＩＬ−１ＲＮ ＳＮＰ＃４３；ＩＬ−１ＲＮ ＳＮＰ＃６２；ＩＬ−１ＲＮ ＳＮＰ＃６４；ＩＬ−１ＲＮ ＳＮＰ＃７６；およびＩＬ−１ＲＮ ＳＮＰ＃８２より成る群から選択されるＩＬ−１対立遺伝子を検出することによってＩＬ−１炎症性ハプロタイプを検出し；さらに
前記検出されたＩＬ−１炎症性ハプロタイプを補正する治療薬を選択する；工程を含むことを特徴とする方法。
【請求項２７】
少なくとも２つの対立遺伝子を検出することを特徴とする請求項２６記載の方法。
【請求項２８】
前記２つの対立遺伝子が、少なくとも０．５の連鎖不平衡値（Ｄ'）を有することを特徴とする請求項２７記載の方法。
【請求項２９】
前記２つの対立遺伝子が、少なくとも０．６の連鎖不平衡値（Ｄ'）を有することを特徴とする請求項２７記載の方法。
【請求項３０】
前記２つの対立遺伝子が、少なくとも０．７の連鎖不平衡値（Ｄ'）を有することを特徴とする請求項２７記載の方法。
【請求項３１】
前記２つの対立遺伝子が、少なくとも０．８の連鎖不平衡値（Ｄ'）を有することを特徴とする請求項２７記載の方法。
【請求項３２】
前記２つの対立遺伝子が、少なくとも０．９の連鎖不平衡値（Ｄ'）を有することを特徴とする請求項２７記載の方法。
【請求項３３】
ｈａｐ１ ＩＬ−１ハプロタイプを検出することを含むことを特徴とする請求項２６記載の方法。
【請求項３４】
炎症性疾患表現型を有する個体を治療するのに特定の治療薬が有効であるかどうかを特定する方法であって：
前記個体から採取した試料において、ＩＬ−１Ａ ＳＮＰ＃２（ＩＬＡ２）；ＩＬ−１Ａ ＳＮＰ＃１１（ＩＬＡ１１）；ＩＬ−１Ａ ＳＮＰ＃１５（ＩＬＡ１５）；ＩＬ−１Ａ ＳＮＰ＃１７（ＩＬＡ１７）；ＩＬ−１Ａ ＳＮＰ＃２５（ＩＬＡ２５）；ＩＬ−１Ａ ＳＮＰ＃３１（ＩＬＡ３１）；ＩＬ−１Ｂ ＳＮＰ＃１（ＩＬＢ１）；ＩＬ−１Ｂ ＳＮＰ＃４（ＩＬＢ４）；ＩＬ−１Ｂ ＳＮＰ＃１０（ＩＬＢ１０）；ＩＬ−１Ｂ ＳＮＰ＃１４（ＩＬＢ１４）；ＩＬ−１Ｂ ＳＮＰ＃１５（ＩＬＢ１５）；ＩＬ−１Ｂ ＳＮＰ＃２４（ＩＬＢ２４）；ＩＬ−１Ｂ ＳＮＰ＃３０（ＩＬＢ３０）；ＩＬ−１Ｂ ＳＮＰ＃３７（ＩＬＢ３７）；ＩＬ−１Ｂ ＳＮＰ＃３８（ＩＬＢ３８）；ＩＬ−１Ｆ８ ＳＮＰ＃１２２（Ｓ１２２）；ＩＬ−１Ｆ６ ＳＮＰ＃５１１（Ｓ５１１）；ＩＬ−１Ｆ６ ＳＮＰ＃４９７（Ｓ４９７）；ＩＬ−１Ｆ７ ＳＮＰ＃００２（Ｓ０００２）；ＩＬ−１Ｆ５ ＳＮＰ＃１３（ＩＬＬ１３）；ＩＬ−１Ｆ５ ＳＮＰ＃１５（ＩＬＬ１５）；ＩＬ−１Ｆ５ ＳＮＰ＃１７（ＩＬＬ１７）；ＩＬ−１Ｆ５ ＳＮＰ＃２８（ＩＬＬ２８）；ＩＬ−１Ｆ５ ＳＮＰ＃４９（ＩＬＬ４９）；ＩＬ−１ＲＮ ＳＮＰ＃１５（ＲＡ１５）；ＩＬ−１ＲＮ ＳＮＰ＃２１（ＲＡ２１）；ＩＬ−１ＲＮ ＳＮＰ＃２５（ＲＡ２５）；ＩＬ−１ＲＮ ＳＮＰ＃３１（ＲＡ３１）；ＩＬ−１ＲＮ ＳＮＰ＃３４（ＲＡ３４）；ＩＬ−１ＲＮ ＳＮＰ＃３５（ＲＡ３５）；ＩＬ−１ＲＮ ＳＮＰ＃３９（ＲＡ３９）；ＩＬ−１ＲＮ ＳＮＰ＃４４（ＲＡ４４）；ＩＬ−１ＲＮ ＳＮＰ＃６３（ＲＡ６３）；ＩＬ−１ＲＮ ＳＮＰ＃７７（ＲＡ７７）；ＩＬ−１ＲＮ ＳＮＰ＃７８（ＲＡ７８）；ＩＬ−１ＲＮ ＳＮＰ＃７９（ＲＡ７９）；ＩＬ−１ＲＮ ＳＮＰ＃８１（ＲＡ８１）；ＩＬ−１ＲＮ ＳＮＰ＃８９（ＲＡ８９）；ＩＬ−１Ａ ＳＮＰ＃１；ＩＬ−１Ａ ＳＮＰ＃３；ＩＬ−１Ａ ＳＮＰ＃５；ＩＬ−１Ａ ＳＮＰ＃１０；ＩＬ−１Ａ ＳＮＰ＃１２；ＩＬ−１Ａ ＳＮＰ＃１４；ＩＬ−１Ａ ＳＮＰ＃１６；ＩＬ−１Ａ ＳＮＰ＃１９；ＩＬ−１Ａ ＳＮＰ＃２６；ＩＬ−１Ａ ＳＮＰ＃３２；ＩＬ−１Ａ ＳＮＰ＃３４；ＩＬ−１Ｂ ＳＮＰ＃２；ＩＬ−１Ｂ ＳＮＰ＃３；ＩＬ−１Ｂ ＳＮＰ＃５；ＩＬ−１Ｂ ＳＮＰ＃６；ＩＬ−１Ｂ ＳＮＰ＃７；ＩＬ−１Ｂ ＳＮＰ＃８；ＩＬ−１Ｂ ＳＮＰ＃９；ＩＬ−１Ｂ ＳＮＰ＃１７；ＩＬ−１Ｆ５ ＳＮＰ＃５；ＩＬ−１Ｆ５ ＳＮＰ＃７；ＩＬ−１Ｆ５ ＳＮＰ＃９；ＩＬ−１Ｆ５ ＳＮＰ＃１０；ＩＬ−１Ｆ５ ＳＮＰ＃１１；ＩＬ−１Ｆ５ ＳＮＰ＃１４；ＩＬ−１Ｆ５ ＳＮＰ＃２２；ＩＬ−１Ｆ５ ＳＮＰ＃２３；ＩＬ−１Ｆ５ ＳＮＰ＃２４；ＩＬ−１Ｆ５ ＳＮＰ＃２７；ＩＬ−１Ｆ５ ＳＮＰ＃２９；ＩＬ−１Ｆ５ ＳＮＰ＃３５；ＩＬ−１Ｆ５ ＳＮＰ＃３６；ＩＬ−１Ｆ５ ＳＮＰ＃３８；ＩＬ−１Ｆ５ ＳＮＰ＃４０；ＩＬ−１Ｆ５ ＳＮＰ＃４３；ＩＬ−１Ｆ５ ＳＮＰ＃４５；ＩＬ−１Ｆ５ ＳＮＰ＃４８；ＩＬ−１Ｆ５ ＳＮＰ＃５０；ＩＬ−１Ｆ５ ＳＮＰ＃５１；ＩＬ−１Ｆ５ ＳＮＰ＃５４；ＩＬ−１Ｆ５ ＳＮＰ＃５６；ＩＬ−１Ｆ５ ＳＮＰ＃５７； ＩＬ−１ＲＮ ＳＮＰ＃１４；ＩＬ−１ＲＮ ＳＮＰ＃１９；ＩＬ−１ＲＮ ＳＮＰ＃２２；ＩＬ−１ＲＮ ＳＮＰ＃３０；ＩＬ−１ＲＮ ＳＮＰ＃３６；ＩＬ−１ＲＮ ＳＮＰ＃３７；ＩＬ−１ＲＮ ＳＮＰ＃３８；ＩＬ−１ＲＮ ＳＮＰ＃４０；ＩＬ−１ＲＮ ＳＮＰ＃４３；ＩＬ−１ＲＮ ＳＮＰ＃６２；ＩＬ−１ＲＮ ＳＮＰ＃６４；ＩＬ−１ＲＮ ＳＮＰ＃７６；およびＩＬ−１ＲＮ ＳＮＰ＃８２より成る群から選択されるＩＬ−１対立遺伝子を検出することによってＩＬ−１ハプロタイプを検出する；
前記個体における炎症性表現型を検出する；
前記個体を前記治療薬で治療する；および
前記治療薬によって前記個体における炎症性表現型が減少または緩和されているかどうかを特定する；工程を含み、
前記治療薬によって前記個体の炎症性表現型が減少または緩和されていれば、前記治療薬がその検出されたＩＬ−１ハプロタイプを有する個体を治療するのに有効であることを特徴とする方法。
【請求項３５】
前記治療薬が栄養補助食品であることを特徴とする請求項３４記載の方法。
【請求項３６】
前記ＩＬ−１ ハプロタイプが、ｈａｐ１、ｈａｐ２、ｈａｐ３、およびｈａｐ４より成る群から選択されることを特徴とする請求項３４または３５記載の方法。
【請求項３７】
ＩＬ−１Ａ ＳＮＰ＃１；ＩＬ−１Ａ ＳＮＰ＃２（ＩＬＡ２）；ＩＬ−１Ａ ＳＮＰ＃３；ＩＬ−１Ａ ＳＮＰ＃４；ＩＬ−１Ａ ＳＮＰ＃９；ＩＬ−１Ａ ＳＮＰ＃１０；ＩＬ−１Ａ ＳＮＰ＃１１（ＩＬＡ１１）；ＩＬ−１Ａ ＳＮＰ＃１４；ＩＬ−１Ａ ＳＮＰ＃１５（ＩＬＡ１５）；ＩＬ−１Ａ ＳＮＰ＃１６；ＩＬ−１Ａ ＳＮＰ＃１９；ＩＬ−１Ａ ＳＮＰ＃２４；ＩＬ−１Ａ ＳＮＰ＃２５（ＩＬＡ２５）；ＩＬ−１Ａ ＳＮＰ＃２６（ＩＬＡ２６）；ＩＬ−１Ａ ＳＮＰ＃３０；ＩＬ−１Ａ ＳＮＰ＃３１（ＩＬＡ３１）；ＩＬ−１Ａ ＳＮＰ＃３３；およびＩＬ−１Ａ ＳＮＰ＃３４；ＩＬ−１Ｂ ＳＮＰ＃１（ＩＬＢ１）；ＩＬ−１Ｂ ＳＮＰ＃２；ＩＬ−１Ｂ ＳＮＰ＃３；ＩＬ−１Ｂ ＳＮＰ＃４（ＩＬＢ４）；ＩＬ−１Ｂ ＳＮＰ＃５；ＩＬ−１Ｂ ＳＮＰ＃６；ＩＬ−１Ｂ ＳＮＰ＃７；ＩＬ−ＩＢ ＳＮＰ＃８；ＩＬ−１Ｂ ＳＮＰ＃９；ＩＬ−１Ｂ ＳＮＰ＃１７；ＩＬ−１Ｂ ＳＮＰ＃１９；ＩＬ−１Ｂ ＳＮＰ＃３５；およびＩＬ−１Ｂ ＳＮＰ＃３８；ＩＬ−１ＲＮｉｃ ＳＮＰ＃１４；ＩＬ−１ＲＮｉｃ ＳＮＰ＃１８；ＩＬ−１ＲＮｉｃ ＳＮＰ＃２１（ＲＡ２１）；ＩＬ−１ＲＮｉｃ ＳＮＰ＃２２；ＩＬ−１ＲＮｉｃ ＳＮＰ＃２６；ＩＬ−１ＲＮｉｃ ＳＮＰ＃；２９；ＩＬ−１ＲＮｉｃ ＳＮＰ＃３０；ＩＬ−１ＲＮｉｃ ＳＮＰ＃；３１（ＲＡ３１）；ＩＬ−１ＲＮｉｃ ＳＮＰ＃３２；ＩＬ−１ＲＮｉｃ ＳＮＰ＃３３；ＩＬ−１ＲＮｉｃ ＳＮＰ＃３４（ＲＡ３４）；ＩＬ−１ＲＮｉｃ ＳＮＰ＃３５（ＲＡ３５）；ＩＬ−１ＲＮｉｃ ＳＮＰ＃３６；ＩＬ−１ＲＮｉｃ ＳＮＰ＃３７；ＩＬ−１ＲＮｉｃ ＳＮＰ＃３８；ＩＬ−１ＲＮｉｃ ＳＮＰ＃４０；ＩＬ−１ＲＮｉｃ ＳＮＰ＃４２；ＩＬ−１ＲＮｉｃ ＳＮＰ＃４３；ＩＬ−１ＲＮｉｃ ＳＮＰ＃６５；ＩＬ−１ＲＮｉｃ ＳＮＰ＃６７；ＩＬ−１ＲＮｉｃ ＳＮＰ＃；６８；および ＩＬ−１ＲＮｉｃ ＳＮＰ＃８２；ＩＬ−１ＲＮｓｅｃ ＳＮＰ＃６７；ＩＬ−１ＲＮｓｅｃ ＳＮＰ＃６８；ＩＬ−１ＲＮｓｅｃ ＳＮＰ＃８２；およびＩＬ−１ＲＮｓｅｃ ＳＮＰ＃９３；より成る群から選択される少なくとも１つのＩＬ−１対立遺伝子を検出することを特徴とする請求項３６記載の方法。