【誤訳訂正書】
【提出日】平成18年7月28日(2006.7.28)
【誤訳訂正１】
【訂正対象書類名】特許請求の範囲
【訂正対象項目名】全文
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
線維性狭窄疾患により特徴付けられたクローン病の臨床サブタイプの診断を補助するか、またはそれに対する感受性を予測する方法であって、該方法は、
個体における、ＮＯＤ２／ＣＡＲＤ１５座に連鎖された線維性狭窄素因対立遺伝子の存在または不在を決定する工程
を包含し、
ここで、該線維性狭窄素因対立遺伝子の存在が、線維性狭窄疾患により特徴付けられたクローン病の該臨床サブタイプの診断またはそれに対する感受性の予測となる、
方法。
【請求項２】
前記クローン病の臨床サブタイプが、小腸罹患とは独立した線維性狭窄疾患によって特徴付けられる、請求項１に記載の方法。
【請求項３】
前記線維性狭窄素因対立遺伝子が、前記ＮＯＤ２／ＣＡＲＤ１５座内に位置する、請求項１に記載の方法。
【請求項４】
前記線維性狭窄素因対立遺伝子によってコードされたＮＯＤ２／ＣＡＲＤ１５ポリペプチドによるＮＦ−κＢ活性化が、野生型ＮＯＤ２／ＣＡＲＤ１５ポリペプチドによるＮＦ−κＢ活性化に比較して減少される、請求項３に記載の方法。
【請求項５】
前記線維性狭窄素因対立遺伝子が、前記ＮＯＤ２／ＣＡＲＤ１５座のコード領域中に位置する、請求項３に記載の方法。
【請求項６】
前記線維性狭窄素因対立遺伝子が、ＮＯＤ２／ＣＡＲＤ１５の残基７４４〜１０２０をコードする領域中に位置する、請求項５に記載の方法。
【請求項７】
前記線維性狭窄素因対立遺伝子が、ＳＮＰ８、ＳＮＰ１２、およびＳＮＰ１３から選択されるＳＮＰでの「２」対立遺伝子である、請求項５に記載の方法。
【請求項８】
前記線維性狭窄素因対立遺伝子が、ＳＮＰ１３での「２」対立遺伝子である、請求項７に記載の方法。
【請求項９】
前記線維性狭窄素因対立遺伝子が、前記ＮＯＤ２／ＣＡＲＤ１５座の非コード領域中に位置する、請求項３に記載の方法。
【請求項１０】
前記線維性狭窄素因対立遺伝子が、ＪＷ１、ＪＷ１５、およびＪＷ１６改変型対立遺伝子から選択される、請求項９に記載の方法。
【請求項１１】
前記線維性狭窄素因対立遺伝子が、前記ＮＯＤ２／ＣＡＲＤ１５座のプロモーター領域中に位置する、請求項９に記載の方法。
【請求項１２】
前記線維性狭窄素因対立遺伝子が、ＪＷ１７およびＪＷ１８改変型対立遺伝子から選択される対立遺伝子である、請求項１１に記載の方法。
【請求項１３】
請求項１に記載の方法であって、該方法が、
前記個体における、ＮＯＤ２／ＣＡＲＤ１５座に連鎖された少なくとも２つの線維性狭窄素因対立遺伝子の存在または不在を決定する工程
を包含し、
ここで、該線維性狭窄素因対立遺伝子の１つ以上の存在が、線維性狭窄疾患により特徴付けられたクローン病の臨床サブタイプの診断またはこれに対する感受性の予測となる、方法。
【請求項１４】
前記少なくとも２つの線維性狭窄素因対立遺伝子が、ＳＮＰ８、ＳＮＰ１２、およびＳＮＰ１３から選択されるＳＮＰでの「２」対立遺伝子である、請求項１３に記載の方法。
【請求項１５】
請求項１４に記載の方法であって、該方法が、前記個体における
（ｉ）ＳＮＰ８での「２」対立遺伝子、
（ｉｉ）ＳＮＰ１２での「２」対立遺伝子、および
（ｉｉｉ）ＳＮＰ１３での「２」対立遺伝子
の存在または不在を決定する工程
を包含し、
ここで、該ＳＮＰ８、ＳＮＰ１２、およびＳＮＰ１３での「２」対立遺伝子の１つ以上の存在が、線維性狭窄疾患により特徴付けられたクローン病の臨床サブタイプの診断またはこれに対する感受性の予測となる、
方法。
【請求項１６】
前記線維性狭窄素因対立遺伝子が、少なくとも２のオッズ比および１より大きな下位９５％信頼限界で、前記線維性狭窄疾患により特徴付けられたクローン病の臨床サブタイプに関連している、請求項１に記載の方法。
【請求項１７】
請求項１に記載の方法であって、前記個体における前記線維性狭窄素因対立遺伝子の存在または不在を示す報告を作成する工程をさらに包含する、方法。
【請求項１８】
請求項１に記載の方法であって、前記個体における、前記線維性狭窄疾患により特徴付けられたクローン病の臨床サブタイプの存在または不在を示す報告を作成する工程をさらに包含する、方法。
【請求項１９】
前記線維性狭窄素因対立遺伝子の存在または不在を決定する工程が、前記個体からの核酸の酵素的増幅を包含する、請求項１に記載の方法。
【請求項２０】
前記増幅がポリメラーゼ連鎖反応増幅である、請求項１９に記載の方法。
【請求項２１】
前記ポリメラーゼ連鎖反応増幅が、１つ以上の蛍光標識プローブを用いて実施される、請求項２０に記載の方法。
【請求項２２】
前記ポリメラーゼ連鎖反応増幅が、ＤＮＡ浅溝結合剤を含む１つ以上のプローブを用いて実施される、請求項２０に記載の方法。
【請求項２３】
個体におけるクローン病の繊維性狭窄サブタイプのための治療の最適化を補助する方法であって、該方法が、
該個体における、ＮＯＤ２／ＣＡＲＤ１５座に連鎖された線維性狭窄素因対立遺伝子の存在または不在を決定する工程
を包含する、方法。
【誤訳訂正２】
【訂正対象書類名】明細書
【訂正対象項目名】００３７
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【００３７】
本発明の方法はまた、ＳＮＰ１２「２」対立遺伝子である線維性狭窄素因対立遺伝子を用いて実施され得る。本明細書中で使用される用語「ＳＮＰ１２」は、ＮＯＤ２／ＣＡＲＤ１５遺伝子におけるエキソン８内の一ヌクレオチド多型を意味し、これは、ＮＯＤ２／ＣＡＲＤ１５タンパク質のアミノ酸９０８をコードするトリプレット内で生じる。「１」対立遺伝子（グアニン（ｇ）がＡＣ００７７２８配列の１２８，３７７位に存する）は、一般のまたは「野生型」ＳＮＰ１２対立遺伝子であり、アミノ酸９０８のグリシンをコードするトリプレット内で生じる。ＳＮＰ１２の「２」対立遺伝子（シトシン（ｃ）がＡＣ００７７２８配列の１２８，３７７位に存する）は、稀な改変型であり、これは、ＮＯＤ２／ＣＡＲＤ１５タンパク質のアミノ酸９０８にグリシン（Ｇ）からアルギニン（Ｒ）への置換を生じる。ＳＮＰ１２でのこの稀な「２」対立遺伝子は、「Ｇ９０８Ｒ」または「９０８Ｒ」と表示され、また、Ｈｕｇｏｔら，前出、２００１の先の番号付けシステムに基づいて「Ｇ８８１Ｒ」とも表示され得る。ＳＮＰ１２は、ＮＯＤ２／ＣＡＲＤ１５遺伝子のロイシンリッチ反復領域内に位置する。ＳＮＰ１２のＮＣＢＩ  ＳＮＰ  ＩＤ番号はｒｓ２０６６８４５であり、これは、本明細書中に参考として援用される。
【誤訳訂正３】
【訂正対象書類名】明細書
【訂正対象項目名】００９４
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【００９４】
【表５】
2006500016.tif 000001
（実施例ＩＶ）
（ＮＯＤ２／ＣＡＲＤ１５座における稀な改変型対立遺伝子はコホート２においてクローン病の線維性狭窄サブタイプと関連している）
本実施例は、コホート２において、ＮＯＤ２／ＣＡＲＤ１５座のＳＮＰ８、ＳＮＰ１２、またはＳＮＰ１３での「２」対立遺伝子が、線維性狭窄疾患と有意に関連していることを実証する。
【誤訳訂正４】
【訂正対象書類名】明細書
【訂正対象項目名】００９６
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【００９６】
【表６】
2006500016.tif 000002
（実施例Ｖ）
（ＮＯＤ２／ＣＡＲＤ１５座における稀な改変型対立遺伝子はコホート１およびコホート２を表す組み合わせコホートにおいてクローン病の線維性狭窄サブタイプと関連している）
本実施例は、コホート１およびコホート２を表す組み合わせコホートにおいて、ＳＮＰ８、ＳＮＰ１２、またはＳＮＰ１３での「２」対立遺伝子が、線維性狭窄疾患と有意に関連していることを実証する。