【手続補正書】
【提出日】平成18年1月11日(2006.1.11)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
同一の条件下で増殖される同遺伝子系親株における収量及び生産性に比較して、注目の生成物の改良された収量及び生産性を提供するrpoB−遺伝子によりコードされるRNA−ポリメラーゼのβ−サブユニットにおける少なくとも１つのアミノ酸の置換をもたらす少なくとも１つの変異を含んで成り、ここで前記少なくとも１つのアミノ酸の置換が、配列番号２の位置469,478, 482,485もしくは487のいずれかで、又はいずれかのユーバクテリア（eubacteria）RNA−ポリメラーゼβ−サブユニットファミリーメンバーにおける同等の位置に存在することを特徴とする単離された変異体ユーバクテリア；但し、前記の少なくとも１つのアミノ酸置換がQ469K又はQ469Rから成るバチルス・ズブチリス（Bacillus subtilis）除く。
【請求項２】
前記少なくとも１つのアミノ酸の置換が、Q469R, A478D, A478V, H482R, H482P, R485H, 又は S487Lを含んで成る請求項１記載の単離された変異体ユーバクテリア。
【請求項３】
前記少なくとも１つのアミノ酸の置換が、配列番号２の位置469もしくは478で、又はいずれかのユーバクテリアRNA−ポリメラーゼβ−サブユニットファミリーメンバーにおける同等の位置でいずれかのランダム置換を含んで成る請求項１記載の単離された変異体ユーバクテリア。
【請求項４】
前記少なくとも１つのアミノ酸の置換が、配列番号２の位置469,478, 及び/又は 487で、あるいはいずれかのユーバクテリアRNA−ポリメラーゼβ−サブユニットファミリーメンバーにおける同等の位置でいずれかの置換を含んで成る請求項１記載の単離された変異体ユーバクテリア。
【請求項５】
前記少なくとも１つのアミノ酸の置換が、Q469R, A478D, 及び/又は S487Lを含んで成る請求項１〜４のいずれか１項記載の単離された変異体ユーバクテリア。
【請求項６】
前記少なくとも１つのアミノ酸の置換が、Q469R, 又はA478Dを含んで成る請求項１〜５のいずれか１項記載の単離された変異体ユーバクテリア。
【請求項７】
前記ユーバクテリアからのRpoBタンパク質が、配列番号２の位置461〜500のアミノ酸配列に対して、前記タンパク質の同等の領域内で少なくとも80％相同である請求項１〜６のいずれか１項記載の単離された変異体ユーバクテリア。
【請求項８】
前記ユーバクテリアからのRpoBタンパク質が、配列番号２の位置461〜500のアミノ酸配列に対して、前記タンパク質の同等の領域内で少なくとも90％相同である請求項１〜７のいずれか１項記載の単離された変異体ユーバクテリア。
【請求項９】
前記細菌が、グラム陽性細菌を含んで成る請求項１〜８のいずれか１項記載の単離された変異体ユーバクテリア。
【請求項１０】
前記細菌が、バチルスsp.（Bacillus sp.） を含んで成る請求項１〜９のいずれか１項記載の単離された変異体ユーバクテリア。
【請求項１１】
前記細菌が、バチルス・アルカロフィラス（Bacillus alkalophilus）、バチルス・アミロリケファシエンス（Bacillus amyloliquefaciens）、バチルス・ブレビス（Bacillus brevis）、バチルス・サーキュランス（Bacillus circulans）、バチルス・クラウジ（Bacillus clausii）、バチルス・コアギュランス（Bacillus coagulans）、バチルス・ラウタス（Bacillus lautus）、バチルス・レンタス（Bacillus lentus）、バチルス・リケニホルミス（Bacillus licheniformis）、バチルス・メガテリウム（Bacillus megaterium）、バチルス・ステアロサーモフィラス（Bacillus stearothermophilus）、バチルス・サブチリス（Bacillus subtilis）及びバチルス・スリンジエンシス（Bacillus thuringiensis）を含んで成る請求項１〜10のいずれか１項記載の単離された変異体ユーバクテリア。
【請求項１２】
前記細菌が、バチルス・レンタス、バチルス・リケニホルミス、バチルス・アミロリケファシエンス、バチルス・クラウジ、バチルス・ステアロサーモフィラス及びバチルス・サブチリスを含んで成る請求項１〜11のいずれか１項記載の単離された変異体ユーバクテリア。
【請求項１３】
前記細菌が、バチルス・リケニホルミスである請求項１〜12のいずれか１項記載の単離された変異体ユーバクテリア。
【請求項１４】
前記注目の生成物が、遺伝子又は代謝経路の生成物である請求項１〜13のいずれか１項記載の単離された変異体ユーバクテリア。
【請求項１５】
前記遺伝子がオペロンを含んで成る請求項14記載の単離された変異体ユーバクテリア。
【請求項１６】
前記遺伝子が、前記変異体ユーバクテリウムに対して外因性であるか又は内因性である請求項15記載の単離された変異体ユーバクテリア。
【請求項１７】
前記遺伝子が、少なくとも２つのコピーで存在する請求項15〜16のいずれか１項記載の単離された変異体ユーバクテリア。
【請求項１８】
前記遺伝子が、少なくとも10個のコピーで存在する請求項15〜17のいずれか１項記載の単離された変異体ユーバクテリア。
【請求項１９】
前記遺伝子が、少なくとも100個のコピーで存在する請求項14〜18のいずれか１項記載の単離された変異体ユーバクテリア。
【請求項２０】
前記注目の生成物が、ポリペプチド、ビタミン、アミノ酸、抗生物質、炭水化物又は界面活性剤を含んで成る請求項１〜19のいずれか１項記載の単離された変異体ユーバクテリア。
【請求項２１】
前記注目の生成物が、ポリペプチド、好ましくは酵素である請求項20記載の単離された変異体ユーバクテリア。
【請求項２２】
前記酵素が、オキシドレダクターゼ（EC1）、トランスフェラーゼ（EC2）、ヒドロラーゼ（EC3）、リアーゼ（EC4）、イソメラーゼ（EC5）及びリガーゼ（EC6）から成る酵素種類の群から選択された種類の酵素である請求項21記載の単離された変異体ユーバクテリア。
【請求項２３】
前記酵素が、アミノペプチダーゼ、アミラーゼ、アミログルコシダーゼ、マンナナーゼ、カルボヒドラーゼ、カルボキシペプチダーゼ、カタラーゼ、セルラーゼ、キチナーゼ、クチナーゼ、シクロデキストリングリコシルトランスフェラーゼ、デオキシリボヌクレアーゼ、エステラーゼ、ガラクトシダーゼ、β−ガラクトシダーゼ、グルコアミラーゼ、グルコースオキシダーゼ、グルコシダーゼ、ハロペルオキシダーゼ、ヘミセルラーゼ、インバーターゼ、イソメラーゼ、ラッカーゼ、リガーゼ、リパーゼ、リアーゼ、マンノシダーゼ、オキシダーゼ、ペクチナーゼ、ペルオキシダーゼ、フィターゼ、フェノールオキシダーゼ、ポリフェノールオキシダーゼ、プロテアーゼ、リボヌクレアーゼ、トランスフェラーゼ、トランスグルタミナーゼ又はキシラナーゼから成る酵素活性の群から選択された活性を有する酵素である請求項21又は22記載の単離された変異体ユーバクテリア。
【請求項２４】
前記酵素が、アミラーゼ又はマンナナーゼである請求項23記載の単離された変異体ユーバクテリア。
【請求項２５】
前記注目の生成物が、セルロース結合ドメイン、スターチ結合ドメイン、抗体、抗菌ペプチド、ホルモン又は融合ポリペプチドを含んで成るポリペプチドである請求項20記載の単離された変異体ユーバクテリア。
【請求項２６】
前記注目の生成物が、炭水化物、好ましくはヒアルロン酸である請求項20記載の単離された変異体ユーバクテリア。
【請求項２７】
前記ユーバクテリアが、組換えユーバクテリア請求項１〜26のいずれか１項記載の単離された変異体ユーバクテリア。
【請求項２８】
前記注目の生成物が、組換えポリペプチドである請求項27記載の単離された変異体ユーバクテリア。
【請求項２９】
前記ポリペプチドが、組込みの部位でいずれの抗生物質耐性マーカー遺伝子も残さないで変異体ユーバクテリア宿主染色体上に組み込まれる遺伝子によりコードされる請求項28記載の単離された変異体ユーバクテリア。
【請求項３０】
前記注目の生成物の変更された生成が、同一の条件下で増殖される同遺伝子系親株における通常のレベルの少なくとも５％〜1000％以上である請求項１〜29のいずれか１項記載の単離された変異体ユーバクテリア。
【請求項３１】
前記注目の生成物の変更された生成が、同一の条件下で増殖される同遺伝子系親株における通常のレベルの少なくとも５％〜500％以上である請求項１〜30のいずれか１項記載の単離された変異体ユーバクテリア。
【請求項３２】
前記注目の生成物の変更された生成が、同一の条件下で増殖される同遺伝子系親株における通常のレベルの少なくとも５％〜250％以上である請求項１〜31のいずれか１項記載の単離された変異体ユーバクテリア。
【請求項３３】
前記注目の生成物の変更された生成が、改良された収率又は改良された生産性を包含する請求項１〜32のいずれか１項記載の単離された変異体ユーバクテリア。
【請求項３４】
前記注目の生成物が、分泌されるか、膜結合されるか、又は細胞内に存在する請求項１〜33のいずれか１項記載の単離された変異体ユーバクテリア。
【請求項３５】
変異体ユーバクテリアにおいて少なくとも１つの注目の生成物の生成方法であって、適切な培地において請求項１〜34のいずれか１項記載の変異体ユーバクテリアを培養し、それにより、前記生成物を生成することを含んで成る方法。
【請求項３６】
前記注目の生成物を単離するか又は精製することをさらに含んで成る請求項35記載の方法。
【請求項３７】
少なくとも１つの注目の生成物を生成するためへの請求項１〜34のいずれか１項記載の変異体ユーバクテリアの使用であって、適切な培地において前記変異体ユーバクテリアを培養し、それにより、前記生成物を生成することを含んで成る使用。
【請求項３８】
前記注目の生成物を単離するか又は精製することをさらに含んで成る請求項37記載の使用。