【手続補正書】
【提出日】平成18年5月26日(2006.5.26)
【手続補正１】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】特許請求の範囲
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】  化学反応を制御するカートリッジにおいて、このカートリッジは、
a)  内部に形成された少なくとも第１と第２の流路を有する本体と、
b)  この本体から延び出す反応容器とを備え、この反応容器は、
i)  反応室と、
ii)  この反応室に入口流路を介して接続される入口ポートと、
iii)  上記反応室に出口流路を介して接続される出口ポートとを有し、上記反応容器の入口ポートは、上記本体内の第１の流路に接続され、上記反応容器の出口ポートは、上記本体内の第２の流路に接続されているカートリッジ。
【請求項２】  請求項１に記載のカートリッジにおいて、上記本体は、上記第２の流路に連通してガスを逃がすベントを更に有するカートリッジ。
【請求項３】  請求項１または２に記載のカートリッジにおいて、上記本体の第１の流路内の流体を上記反応容器の入口ポートを経て上記反応室に送る差圧源を更に有するカートリッジ。
【請求項４】  請求項１乃至３のいずれか１つに記載のカートリッジにおいて、上記反応容器は、
i)  上記反応室の側壁を区画する剛な枠と、
ii)  上記反応室の主壁を形成すべく上記剛な枠に取り付けられる少なくとも１つの柔軟なシートまたは膜とを有し、上記主壁は、熱面に一致するように十分柔軟であるようなカートリッジ。
【請求項５】  請求項１乃至３のいずれか１つに記載のカートリッジにおいて、上記反応容器は、
i)  上記反応室の側壁を区画する剛な枠と、
ii)  上記反応室の対向する主壁を形成すべく上記剛な枠の対向する側面に取り付けられる第１と第２の柔軟なシートまたは膜とを有するカートリッジ。
【請求項６】  請求項５に記載のカートリッジにおいて、上記第１と第２の柔軟なシートまたは膜は、夫々ポリマー膜からなるカートリッジ。
【請求項７】  請求項４または５に記載のカートリッジにおいて、上記側壁の少なくとも２つは、透光性であるとともに、互いに角度的に偏らせられているカートリッジ。
【請求項８】  請求項１乃至７のいずれか１つに記載のカートリッジにおいて、上記反応室の厚さに対する幅の比は、少なくとも２:１であるカートリッジ。
【請求項９】  請求項１乃至８のいずれか１つに記載のカートリッジにおいて、上記反応室は、５mm以下の厚さを有するカートリッジ。
【請求項１０】  請求項１乃至９のいずれか１つに記載のカートリッジにおいて、上記反応室は、0.5〜５mmの範囲の厚さを有するカートリッジ。
【請求項１１】  請求項１乃至７のいずれか１つに記載のカートリッジにおいて、上記反応室の厚さに対する幅の比は、少なくとも４:１であるカートリッジ。
【請求項１２】  請求項１乃至７または請求項１１のいずれか１つに記載のカートリッジにおいて、上記反応室は、0.5〜２mmの範囲の厚さを有するカートリッジ。
【請求項１３】  請求項１乃至７または１１乃至１２のいずれか１つに記載のカートリッジにおいて、上記反応室は、２mm以下の範囲の厚さを有するカートリッジ。
【請求項１４】  請求項１乃至１３のいずれか１つに記載のカートリッジにおいて、上記本体は、上記反応容器の入口ポートに上記第１の流路を経て接続され、流体試料を増幅試薬と混合するための混合室を更に有するカートリッジ。
【請求項１５】  請求項１乃至１４のいずれか１つに記載のカートリッジにおいて、上記本体は、内部に形成された
i)  試料流路と、
ii)  試料流体から所望の分析対象物を分離すべく、上記第１の流路を経て上記入口ポートに接続される上記試料流路内の分離領域とを有するカートリッジ。
【請求項１６】  請求項１５に記載のカートリッジにおいて、上記本体内の分離領域は、
a)  上記試料流路に設けられ、上記試料中の細胞またはウイルスを溶解させて、これらの細胞またはウイルスから物質を解き放たせる溶解室と、
b)  上記溶解させられるべき細胞またはウイルスを捕捉すべく、上記溶解室内に設けられた少なくとも１つの固体の担体とを有するカートリッジ。
【請求項１７】  請求項１に記載のカートリッジを有する装置であって、上記反応容器は、上記反応室を区画する複数の壁を有し、少なくとも１つの壁は、柔軟なシートまたは膜からなり、上記装置は、
a)  上記シートまたは膜に接触する少なくとも１つの熱面と、
b)  上記反応室内の圧力の増加が、上記シートまたは膜を上記熱面に一致するように接触させるに十分であるように、上記反応室内の圧力を増大させる手段と、
c)  上記反応室内の温度変化を引き起こさせるべく上記熱面を加熱または冷却する少なくとも１つの熱要素とを更に有する装置。
【請求項１８】  請求項１乃至３のいずれか１つに記載のカートリッジにおいて、上記反応容器は、
i)  ２つの対向する主壁と、
ii)  上記主壁を互いに連結して、上記反応室を区画する側壁とを備え、上記側壁の少なくとも２つは、透光性で互いに角度的に偏らせられているカートリッジ。
【請求項１９】  請求項１乃至３のいずれか１つに記載のカートリッジを有する装置であって、上記反応容器は、２つの対向する主壁と、上記主壁を互いに連結して、上記反応室を区画する側壁とを備え、上記側壁の少なくとも２つは、透光性であり、上記透光性の側壁のうちの第１の側壁を介して上記反応室内の反応混合物を励起する少なくとも１つの光源と、上記反応室から上記透光性の側壁のうちの第２の側壁を介して放出される光を検出する少なくとも１つの検出器とを有する光学システムを更に備えている装置。
【請求項２０】  請求項１乃至３または８乃至１６のいずれか１つに記載のカートリッジにおいて、上記反応室の各側面は、１〜１５mmの長さを持つカートリッジ。
【請求項２１】  請求項１乃至１６のいずれか１つに記載のカートリッジにおいて、上記反応容器は、上記反応室を通る光路長が、１〜１５mmであるカートリッジ。
【請求項２２】  請求項１乃至１６のいずれか１つに記載のカートリッジにおいて、上記反応容器は、上記反応室を通る光路長が、５〜１２mmであるカートリッジ。
【請求項２３】  請求項１乃至１６のいずれか１つに記載のカートリッジにおいて、上記反応室は、体積容量が１００μリッター以下であるカートリッジ。
【請求項２４】  請求項１乃至１６のいずれか１つに記載のカートリッジにおいて、上記反応室は、体積容量が１２〜１００μリッターであるカートリッジ。
【請求項２５】  請求項１乃至１６のいずれか１つに記載のカートリッジにおいて、上記反応室の壁の少なくとも１つは、0.5mm以下の厚さであるカートリッジ。
【請求項２６】  請求項１乃至１６のいずれか１つに記載のカートリッジにおいて、上記反応室の壁の少なくとも１つは、0.003〜0.5mmの厚さであるカートリッジ。
【請求項２７】  請求項１乃至１６のいずれか１つに記載のカートリッジにおいて、上記本体内の第１と第２の流路の幅または直径は、0.4〜3.2mmであるカートリッジ。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００１１
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００１１】
図１は、好ましい実施形態のカートリッジ２０の等角投影図である。カートリッジ２０は、流体試料から核酸を分離するように設計されており、増幅および検出のために核酸を保持するように設計されている。カートリッジ２０は、頂部片２２,中央片２４および底部片２６を備える本体を有している。流体試料をカートリッジの中に導入するための入口は頂部片２２に形成されてキャップ３０によって密閉されている。また、６つの圧力ポート３２が、頂部片２２に形成されている。圧力ポート３２は、例えばポンプや真空などの圧力源からのノズルを収容するためにある。カートリッジはまた、装置(図１０で後述する)におけるカートリッジ２０の位置決めのために底部片２６から延び出る整列脚２８を有する。窪みまたは凹部３８A,３８B,３８Cは、頂部片２２および中央片２２に形成されている。この凹部は、カートリッジ２０内の流体の流れを検出するための光学センサを収容するためにある。カートリッジ２０は、更にベント３４,３６を有する。各圧力ポートと各ベントは、ベントおよび圧力ポートに対してガスが出入りするようにガスは通すが、液体は通さない疎水性の薄膜を有することが好ましい。変性アクリル樹脂共重合体の薄膜は、例えば、ゲルマンサイエンス社(ミシガン州,アン・アーバー)から市販され、また、粒子トラック腐食ポリカーボネートの薄膜は、ポリティクス社(カリフォルニア州,リバーモア)から市販されている。
【手続補正３】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０１０４
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０１０４】
図５を再度参照すると、溶解室８６の加圧は、トランスデューサ９２と溶解室８６の可撓性壁６３との間の結合を確実かつ有効なものにするので重要である。溶解室８６内の細胞あるいはウイルスを崩壊させるために、トランスデューサ９２が作動される(すなわち振動運動するようにセットされる)。溶解室８６の可撓性壁６３は、僅かな偏向によって、壁内に高圧を生じることなくトランスデューサ９２の振動を室８６内の液体に伝える。上述したように、壁６３はエラストマの膜によって形成される。この代わりに、壁は、好ましくは0.025〜0.1mmの範囲にある厚みのポリマー材の膜またはシート(例えばプリプロピレン膜)である。トランスデューサ９２は、好ましくは、室８６を超音波処理するための超音波ホーンである。室８６は、好ましくは、２０〜６０ｋＨｚの範囲にある周波数で１０〜４０秒間超音波処理される。例示のプロトコルでは、室は４７ｋＨｚの周波数で１５秒間超音波処理される。ホーンチップの振幅は、好ましくは、２０〜２５μｍの範囲にある(ピーク間で測定)。