【手続補正書】
【提出日】平成18年5月10日(2006.5.10)
【手続補正１】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】特許請求の範囲
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】  抗原に対する結合親和性を有する抗体を同定する方法であって、
（ａ）固体表面上の解析されていない抗体のマイクロアレイを、少なくとも１つの抗原と接触させること；および
（ｂ）抗原が結合する抗体を同定すること
を含んでなる、上記方法。
【請求項２】  抗原はタンパク質である、請求項１に記載の方法。
【請求項３】  抗原は無損傷細胞である、請求項１に記載の方法。
【請求項４】  抗原は細胞溶解物である、請求項１に記載の方法。
【請求項５】  タンパク質は組換え体である、請求項２に記載の方法。
【請求項６】  タンパク質は完全長である、請求項５に記載の方法。
【請求項７】  タンパク質はタンパク質断片である、請求項５に記載の方法。
【請求項８】  タンパク質断片はＥＳＴ断片によりコードされる、請求項７に記載の方法。
【請求項９】  抗体はモノクローナル抗体である、請求項１に記載の方法。
【請求項１０】  抗体はポリクローナル抗体である、請求項１に記載の方法。
【請求項１１】  抗体は抗体断片である、請求項１に記載の方法。
【請求項１２】  抗体断片は１本鎖抗体である、請求項１１に記載の方法。
【請求項１３】  抗体は組換え抗体である、請求項１に記載の方法。
【請求項１４】  抗原は検出できるように標識されている、請求項１に記載の方法。
【請求項１５】  検出可能な標識は、蛍光残基、アビジン、ストレプトアビジン、またはビオチンである、請求項１４に記載の方法。
【請求項１６】  抗原は、エピトープ標識または蛍光タンパク質を含む融合タンパク質である、請求項１に記載の方法。
【請求項１７】  抗原に対する抗体の結合親和性は、適切な希釈剤で該固体表面を反復洗浄し、そして抗原がそこからもはや放出されなくなった時に検出することにより測定される、請求項１に記載の方法。
【請求項１８】  ２つまたはそれ以上の細胞集団におけるタンパク質発現を比較する方法であって、
（ａ）固体表面上の抗体のマイクロアレイを、第１の細胞集団の細胞溶解物と接触させて、第１の結合パターンを生成すること；
（ｂ）固体表面上の抗体のマイクロアレイ又は固体表面上の抗体の複製のマイクロアレイのいずれかを、第２の細胞集団の細胞溶解物と接触させて、第２の結合パターンを生成すること；および
（ｃ）第１の結合パターンを、第２の結合パターンと比較すること
を含んでなる、上記方法。
【請求項１９】  抗体は、解析されていない抗体である、請求項１８に記載の方法。
【請求項２０】  抗体は組換え抗体である、請求項１８に記載の方法。
【請求項２１】  第１の細胞溶解物は正常細胞に由来し、そして第２の細胞溶解物は異常細胞に由来する、請求項１８に記載の方法。
【請求項２２】  異常細胞は癌細胞である、請求項２１に記載の方法。
【請求項２３】  第１の細胞溶解物は静止状態の正常細胞に由来し、そして第２の細胞溶解物は刺激状態の正常細胞に由来する、請求項１８に記載の方法。
【請求項２４】  第１と第２セットの細胞の間の差は、異なる検出可能な標識の存在である、請求項１８に記載の方法。
【請求項２５】  特異的な抗原に対する抗体の結合親和性に及ぼす結合条件の変更の効果を測定する方法であって、
（ａ）固体表面上の抗体のマイクロアレイを、第１セットの結合条件下で少なくとも１つの抗原と接触させて、第１の結合パターンを生成すること；
（ｂ）複製のマイクロアレイを、第２セットの結合条件下で抗原と接触させて、第２の結合パターンを生成すること；
（ｃ）第１と第２の結合パターンを比較すること
を含んでなる、上記方法。
【請求項２６】  結合条件の変更は、ｐＨ、温度、塩濃度、および／または継続時間の変更を含んでなる、請求項２５に記載の方法。
【請求項２７】  細胞によって産生されるタンパク質発現のパターンに基づく、細胞を性状解析する方法であって、
（ａ）固体表面上の抗体のマイクロアレイを、細胞溶解物と接触させること；および
（ｂ）溶解物の成分が結合する抗体のプロフィールを同定すること
を含んでなる、上記方法。
【請求項２８】  障害を診断する方法であって、
（ａ）障害に特徴的な１つまたはそれ以上の抗原に特異的な抗体のマイクロアレイを、被験者から得られた生物学的試料と、抗原抗体複合体の形成に適した条件下で接触させること（ここで、生物学的試料中の抗原の存在は、障害を示すであろう）；および
（ｂ）任意の抗体抗原複合体の形成を検出すること
を含んでなる、上記方法。
【請求項２９】  生物学的試料は、脳脊髄液、血液、血漿、尿、糞便、唾液、涙液、または抽出組織である、請求項２８に記載の方法。
【請求項３０】  障害は、卒中、脳出血、心筋梗塞、末梢血凝固、糖尿病、癌、アルツハイマー病、および敗血症である、請求項２９に記載の方法。
【請求項３１】  （ａ）固体表面上の抗体のマイクロアレイ；および
（ｂ）細胞溶解物を標識するための第１の試薬
を含んでなるキット。
【請求項３２】  抗体は、モノクローナル抗体、ポリクローナル抗体または抗体断片である、請求項３１に記載のキット。
【請求項３３】  抗体断片は１本鎖抗体である、請求項３２に記載のキット。
【請求項３４】  抗体は組換え抗体である、請求項３１に記載のキット。
【請求項３５】  さらに、抗原を検出するための試薬およびその使用説明書を含んでなる、請求項３１に記載のキット。
【請求項３６】  （ａ）固体表面上の抗体のマイクロアレイ；および
（ｂ）マイクロアレイの使用説明書（ここで、使用説明書は、障害の診断、細胞によって産生されるタンパク質発現のパターンに基づく細胞の性状解析、または２つまたはそれ以上の細胞集団におけるタンパク質発現の比較のためのものである）
を含んでなるキット。
【請求項３７】  抗原を検出するための試薬およびその使用説明書をさらに含んでなる、請求項３６に記載のキット。
【請求項３８】  抗体は組換え抗体である、請求項３６に記載のキット。
【請求項３９】  抗体は１本鎖抗体である、請求項３６に記載のキット。
【請求項４０】  タンパク質発現パターンを比較する方法であって、
（ａ）異なる起源に由来する核酸試料のマイクロアレイを、１つまたはそれ以上の核酸プローブと接触させること、および
（ｂ）プローブが結合する試料（単数又は複数）を同定すること
を含んでなる、上記方法。
【請求項４１】  マイクロアレイは、単一の組織型であるが、異なる種に由来する核酸試料を含んでなる、請求項４０に記載の方法。
【請求項４２】  マイクロアレイは、単一の種であるが、異なる組織型に由来する核酸試料を含んでなる、請求項４０に記載の方法。
【請求項４３】  マイクロアレイは、異なる発生段階の同じ組織型に由来する核酸試料を含んでなる、請求項４０に記載の方法。
【請求項４４】  核酸試料は、ｍＲＮＡまたはｃＤＮＡからなる、請求項４０に記載の方法。
【請求項４５】  プローブは、検出できるように標識されている、請求項４０に記載の方法。
【請求項４６】  検出可能な標識は、蛍光標識である、請求項４５に記載の方法。
【請求項４７】  第１および第２の細胞溶解物は、単一の組織型であるが、異なる種からの細胞に由来する、請求項１８に記載の方法。
【請求項４８】  第１および第２の細胞溶解物は、単一の種であるが、異なる組織型からの細胞に由来する、請求項１８に記載の方法。
【請求項４９】  第１および第２の細胞溶解物は、異なる発生段階の同じ組織型からの細胞に由来する、請求項１８に記載の方法。
【請求項５０】  マイクロアレイの使用説明書をさらに含んでなる、請求項３１に記載のキット。
【請求項５１】  使用説明書は、特異的な抗原に対する抗体の同定、２つまたはそれ以上の細胞集団におけるタンパク質発現の比較、細胞によって産生されるタンパク質発現のパターンに基づく細胞の性状解析、または抗体の結合親和性に及ぼす結合条件の変更の効果の測定のためのものである、請求項５０に記載のキット。
【請求項５２】  抗体は、解析されていない抗体である、請求項３１又は３６に記載のキット。
【請求項５３】  抗体は、解析された抗体である、請求項３１又は３６に記載のキット。
【請求項５４】  細胞溶解物を標識するための第２の試薬をさらに含んでなる、請求項３１に記載のキット。
【請求項５５】  第２の固体表面上の不連続な位置に位置した複数の抗体を含む第２のマイクロアレイをさらに含んでなる、請求項３１又は３６に記載のキット。
【請求項５６】  マイクロアレイは、０．０１ｎｇ〜１００ｎｇの抗体を含む抗体スポットを含んでなる、請求項３１又は３６に記載のキット。
【請求項５７】  マイクロアレイは、１平方センチメートル当たり２００の不連続な位置を含んでなる、請求項３１又は３６に記載のキット。
【請求項５８】  マイクロアレイは、１平方センチメートル当たり６００の不連続な位置を含んでなる、請求項３１又は３６に記載のキット。
【請求項５９】  マイクロアレイは、固体表面上の不連続な位置に位置した複数の抗体を含んでなり、抗体は第１の種のタンパク質を認識する、請求項３１又は３６に記載のキット。
【請求項６０】  マイクロアレイは、哺乳動物種のタンパク質を認識する複数の抗体を含んでなる、請求項５９に記載のキット。
【請求項６１】  マイクロアレイは、１つの細胞型に存在することが知られている１セットのタンパク質を認識する複数の抗体を含んでなる、請求項３１又は３６に記載のキット。
【請求項６２】  マイクロアレイは、１つの病原体の１セットのタンパク質を認識する複数の抗体を含んでなる、請求項３１又は３６に記載のキット。
【請求項６３】  マイクロアレイは、８個の異なる抗体を含んでなる、請求項３１又は３６に記載のキット。
【請求項６４】  マイクロアレイは、１８個の異なる抗体を含んでなる、請求項３１又は３６に記載のキット。
【請求項６５】  マイクロアレイは、３２個の異なる抗体調製物を含んでなる、請求項３１又は３６に記載のキット。
【請求項６６】  マイクロアレイは、４８個の異なる抗体調製物を含んでなる、請求項３１又は３６に記載のキット。
【請求項６７】  マイクロアレイは、９０個の異なる抗体調製物を含んでなる、請求項３１又は３６に記載のキット。
【請求項６８】  マイクロアレイは、１つより多い障害の抗原に対する複数の抗体を含んでなる、請求項３１又は３６に記載のキット。
【請求項６９】  マイクロアレイは、１０００個の異なる抗体スポットを含んでなる、請求項３１又は３６に記載のキット。
【請求項７０】  マイクロアレイは、１０００個の異なる抗体調製物を含んでなる、請求項３１又は３６に記載のキット。
【請求項７１】  マイクロアレイは、１０００個の異なる抗体を含んでなる、請求項３１又は３６に記載のキット。
【請求項７２】  第１の試薬は、第１の検出可能な標識を含んでなり、第２の試薬は、第２の検出可能な標識を含んでなる、請求項５４に記載のキット。
【請求項７３】  接触されるマイクロアレイは、マイクロアレイ上の異なるスポット上に１０００個の抗体を含んでなる、請求項１、１８、２５、２７及び２８のいずれか１項に記載の方法。
【請求項７４】  接触されるマイクロアレイは、１０００個の異なる抗体調製物を含んでなる、請求項１、１８、２５、２７及び２８のいずれか１項に記載の方法。
【請求項７５】  接触されるマイクロアレイは、１０００個の異なる抗体を含んでなる、請求項１、１８、２５、２７及び２８のいずれか１項に記載の方法。
【請求項７６】  接触されるマイクロアレイは、０．０１ｎｇ〜１００ｎｇの抗体を含む抗体スポットを含んでなる、請求項１、１８、２５、２７及び２８のいずれか１項に記載の方法。
【請求項７７】  接触されるマイクロアレイは、１平方センチメートル当たり２００の不連続な位置を含んでなる、請求項１、１８、２５、２７及び２８のいずれか１項に記載の方法。
【請求項７８】  接触されるマイクロアレイは、１平方センチメートル当たり６００の不連続な位置を含んでなる、請求項１、１８、２５、２７、２８及び４０のいずれか１項に記載の方法。
【請求項７９】  接触されるマイクロアレイは、第１の種のタンパク質を認識する抗体を含んでなる、請求項１、１８、２５、２７、２８及び４０のいずれか１項に記載の方法。
【請求項８０】  接触されるマイクロアレイは、哺乳動物種由来の抗原を認識する複数の抗体を含んでなる、請求項７９のいずれか１項に記載の方法。
【請求項８１】  接触されるマイクロアレイは、１つの細胞型に存在することが知られている１セットのタンパク質を認識する複数の抗体を含んでなる、請求項１、１８、２５、２７、２８及び４０のいずれか１項に記載の方法。
【請求項８２】  接触されるマイクロアレイは、１つの病原体の１セットのタンパク質を認識する複数の抗体を含んでなる、請求項１、１８、２５、２７、２８及び４０のいずれか１項に記載の方法。
【請求項８３】  接触されるマイクロアレイは、８個の異なる抗体を含んでなる、請求項１、１８、２５、２７、２８及び４０のいずれか１項に記載の方法。
【請求項８４】  接触されるマイクロアレイは、１８個の異なる抗体を含んでなる、請求項１、１８、２５、２７、２８及び４０のいずれか１項に記載の方法。
【請求項８５】  接触されるマイクロアレイは、３２個の異なる抗体調製物を含んでなる、請求項１、１８、２５、２７、２８及び４０のいずれか１項に記載の方法。
【請求項８６】  接触されるマイクロアレイは、４８個の異なる抗体調製物を含んでなる、請求項１、１８、２５、２７、２８及び４０のいずれか１項に記載の方法。
【請求項８７】  接触されるマイクロアレイは、９０個の異なる抗体調製物を含んでなる、請求項１、１８、２５、２７、２８及び４０のいずれか１項に記載の方法。
【請求項８８】  接触されるマイクロアレイは、１つより多い障害の抗原に対する複数の抗体を含んでなる、請求項１、１８、２５、２７、２８及び４０のいずれか１項に記載の方法。
【請求項８９】  接触されるマイクロアレイは、１０００個の異なる抗体スポットを含んでなる、請求項１、１８、２５、２７、２８及び４０のいずれか１項に記載の方法。
【請求項９０】  接触されるマイクロアレイは、１０００個の異なる抗体を含んでなる、請求項１、１８、２５、２７、２８及び４０のいずれか１項に記載の方法。
【請求項９１】  接触されるマイクロアレイは、１０００個の異なる抗体調製物を含んでなる、請求項１、１８、２５、２７、２８及び４０のいずれか１項に記載の方法。