【手続補正書】
【提出日】平成17年7月25日(2005.7.25)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
がんに罹患し、且つＭＲＰ１遺伝子の１以上の変異アレルをがん性組織に有する患者を治療するための医薬組成物であって、変異アレルを有する患者を治療するのに十分であるイリノテカンの量を含み、該量が、ＭＲＰ１遺伝子の患者のアレルを考慮せずに投与される量と比較して増やされるか又は減らされる、前記組成物。
【請求項２】
がんが、結直腸がん、子宮頚がん、胃がん、肺がん、悪性神経膠腫、卵巣がん、又は膵臓がんである、請求項１に記載の組成物。
【請求項３】
（１）１以上の変異アレルが患者のＭＲＰ１遺伝子産物の発現を低下させるものであり、よって患者へ投与されるイリノテカンの量が毒性を避けるために減らされる；又は
（２）１以上の変異アレルが患者のＭＲＰ１遺伝子産物の発現を増加させるものであり、よって患者へ投与されるイリノテカンの量が効力を高めるために増やされる、請求項２に記載の組成物。
【請求項４】
１以上の変異アレルがＭＲＰ１遺伝子のプロモーター領域にある、請求項３に記載の組成物。
【請求項５】
１以上の変異アレルがＭＲＰ１遺伝子のコード領域にある、請求項３に記載の組成物。
【請求項６】
１以上の変異アレルがＭＲＰ１遺伝子のプロモーター領域にもコード領域にもない、請求項３に記載の組成物。
【請求項７】
１以上の変異アレルがＭＲＰ１遺伝子のプロモーター領域とコード領域の両方にある、請求項３に記載の組成物。
【請求項８】
１以上の変異アレルが：
（ａ）配列番号１６９、１７０、１７３、１７４、１７７、１７８、１８１、１８２、１８５、１８６、１８９、１９０、１９３、１９４、１９７、１９８、２０１、２０２、２０５、２０６、２０９、２１０、２１３、２１４、２１７、２１８、２２１、２２２、２２５、２２６、２２９、２３０、２３３、２３４、２３７、２３８、２４１、２４２、２４５、２４６、２４９、２５０、２５３、２５４、２５７、２５８、２６１、２６２、２６５、２６６、２６９、２７０、２７３、２７４、２７７、２７８、２８１、２８２、２８５、２８６、２８９、２９０、２９３、２９４、２９７、２９８、３０１、３０２、３０５、３０６、３０９、３１０、３１３、３１４、３１７、３１８、３２１、３２２、３２５、３２６、３２９、３３０、３３３、及び／又は３３４のいずれか１つの核酸配列を有するポリヌクレオチド；
（ｂ）配列番号６００、６０２、及び／又は６０４のいずれか１つのアミノ酸配列を有するポリペプチドをコードするポリヌクレオチド；
（ｃ）多剤耐性タンパク質１（ＭＲＰ１）遺伝子へハイブリダイズすることが可能なポリヌクレオチドであって、ＭＲＰ１遺伝子（受入番号：ＧＩ：７２０９４５１）の５７９９８、５７８５３、５３２８２、及び／又は３９５０８位に対応する位置に少なくとも１つのヌクレオチドの置換又は欠失、又はＭＲＰ１遺伝子（受入番号：ＡＣ０２６４５２）の１３７６６７、１３７６４７、１３７７１０、１２４６６７、及び／又は３８６４６位に対応する位置に少なくとも１つのヌクレオチドの置換又は欠失、又はＭＲＰ１遺伝子（受入番号：ＡＣ００３０２６）の２７２５８、２７１５９、３４２１８、３４２１５、５５４７２、及び／又は３４２０６〜３４２０７位に対応する位置に少なくとも１つのヌクレオチドの置換又は欠失、又はＭＲＰ１遺伝子（受入番号：Ｕ９１３１８）の２１１３３、１４００８、１８０６７、１７９７０、１７９００、及び／又は１８１９５位に対応する位置に少なくとも１つのヌクレオチドの置換又は欠失、又はＭＲＰ１遺伝子（受入番号：ＡＦ０２２８３０）の７９、８８、及び／又は２４９位に対応する位置に少なくとも１つのヌクレオチドの置換又は欠失、又はＭＲＰ１遺伝子（受入番号：ＡＦ０２２８３１）の９５及び／又は２５９位に対応する位置に少なくとも１つのヌクレオチドの置換又は欠失、又はＭＲＰ１遺伝子（受入番号：ＡＣ０２５２７７）の１５０７２７及び／又は３３５５１位に対応する位置に少なくとも１つのヌクレオチドの置換又は欠失、又はＭＲＰ１遺伝子（受入番号：ＡＦ０２２８２８）の１７４位に対応する位置に少なくとも１つのヌクレオチドの置換又は欠失、又はＭＲＰ１遺伝子（受入番号：ＡＦ０２２８２９）の２４８及び／又は２５８位に対応する位置に少なくとも１つのヌクレオチドの置換又は欠失、又はＭＲＰ１遺伝子（受入番号：Ｕ０７０５０）の１８８４、１６２５、１１６３、３８１、２３３、１８９、４４０、及び／又は１７２０〜１７２３位に対応する位置に少なくとも１つのヌクレオチドの置換又は欠失、又はＭＲＰ１遺伝子（受入番号：Ｕ０７０５０）の９２６９２７、及び／又は４３７／４３８位に対応する位置に少なくとも１つのヌクレオチドの挿入、又はＭＲＰ１遺伝子（受入番号：ＡＣ００３０２６）の５５１５６／５５１５７位に対応する位置に少なくとも１つのヌクレオチドの挿入を有している、前記ポリヌクレオチド；
（ｄ）ＭＲＰ１遺伝子へハイブリダイズすることが可能なポリヌクレオチドであって、ＭＲＰ１遺伝子（受入番号：Ｕ９１３１８）の２１１３３、１４００８、及び／又は１８１９５位に対応する位置、又はＭＲＰ１遺伝子（受入番号：ＡＣ００３０２６）の２７２５８及び／又は３４２１８位に対応する位置、又はＭＲＰ１遺伝子（受入番号：ＡＦ０２２８３０）の７９位に対応する位置、又はＭＲＰ１遺伝子（受入番号：ＧＩ：７２０９４５１）の５７９９８及び／又は５７８５３位に対応する位置、又はＭＲＰ１遺伝子（受入番号：ＡＣ０２６４５２）の１３７６６７及び／又は１３７６４７位に対応する位置、又はＭＲＰ１遺伝子（受入番号：ＡＣ０２５２７７）の１５０７２７及び／又は３３５５１位に対応する位置、又はＭＲＰ１遺伝子（受入番号：ＡＦ０２２８２９）の２４８位に対応する位置、又はＭＲＰ１遺伝子（受入番号：Ｕ０７０５０）の１８８４、１６２５、２３３、及び／又は１８９位に対応する位置にＡ、ＭＲＰ１遺伝子（受入番号：ＧＩ：７２０９４５１）の３９５０８位に対応する位置、又はＭＲＰ１遺伝子（受入番号：Ｕ９１３１８）の１７９００、１８０６７、及び／又は１８１９５位に対応する位置、又はＭＲＰ１遺伝子（受入番号：ＡＦ０２２８２８）の１７４位に対応する位置、又はＭＲＰ１遺伝子（受入番号：Ｕ０７０５０）の４４０及び／又は１１６３位に対応する位置にＴ、ＭＲＰ１遺伝子（受入番号：ＡＦ０２２８３０）の８８位に対応する位置、又はＭＲＰ１遺伝子（受入番号：ＡＦ０２２８３１）の９５位に対応する位置、又はＭＲＰ１遺伝子（受入番号：ＡＣ００３０２６）の２７１５９、５５４７２、及び／又は３４２１５位に対応する位置、又はＭＲＰ１遺伝子（受入番号：ＡＣ０２６４５２）の１２４６６７及び／又は３８６４６位に対応する位置、又はＭＲＰ１遺伝子（受入番号：ＧＩ：７２０９４５１）の５３２８２位に対応する位置、又はＭＲＰ１遺伝子（受入番号：ＡＣ０２６４５２）の１３７７１０位に対応する位置にＣ、ＭＲＰ１遺伝子（受入番号：ＡＦ０２２８３０）の２４９位に対応する位置、又はＭＲＰ１遺伝子（受入番号：ＡＦ０２２８２９）の２５８位に対応する位置、又はＭＲＰ１遺伝子（受入番号：ＡＦ０２２８３１）の２５９位に対応する位置、又はＭＲＰ１遺伝子（受入番号：Ｕ０７０５０）の３８１位に対応する位置にＧ、ＭＲＰ１遺伝子（受入番号：Ｕ９１３１８）の１７９７０位に対応する位置にＴの欠失、又はＭＲＰ１遺伝子（受入番号：ＡＣ００３０２６）の３４２０６〜３４２０７位に対応する位置にＡＴの欠失、又はＭＲＰ１遺伝子（受入番号：Ｕ０７０５０）の１７２０〜１７２３位に対応する位置にＧＧＴＡの欠失、ＭＲＰ１遺伝子（受入番号：Ｕ０７０５０）の９２６／９２７位に対応する位置にＴの挿入、及び／又はＭＲＰ１遺伝子（受入番号：Ｕ０７０５０）の４３７／４３８位に対応する位置にＴＣＣＴＴＣＣの挿入、ＭＲＰ１遺伝子（受入番号：ＡＣ００３０２６）の５５１５６／５５１５７位に対応する位置にＴＧＧＧＧＣの挿入を有している、前記ポリヌクレオチド；
（ｅ）ＭＲＰ１ポリペプチド又はその断片をコードするポリヌクレオチドあって、前記ポリペプチドは、ＭＲＰ１ポリペプチド（受入番号：Ｇ２８２８２０６）の６００、６０２、及び／又は６０４位に対応する位置でアミノ酸置換を含む、前記ポリヌクレオチド；
（ｆ）ＭＲＰ１ポリペプチド又はその断片をコードするポリヌクレオチドであって、前記ポリペプチドは、ＭＲＰ１ポリペプチド（受入番号：Ｇ２８２８２０６）の２３９位に対応する位置でＰｈｅからＣｙｓへ、及び／又はＭＲＰ１ポリペプチド（受入番号：Ｇ２８２８２０６）の４３３位に対応する位置でＡｒｇからＳｅｒへ、及び／又はＭＲＰ１ポリペプチド（受入番号：Ｇ２８２８２０６）の７２３位に対応する位置でＡｒｇからＧｌｎへのアミノ酸置換を含む、前記ポリヌクレオチド；
から成る群より選択されるポリヌクレオチドを含む、請求項３に記載の組成物。
【請求項９】
１以上の変異アレルが：
（ａ）配列番号１８１、２０９、２１７、２０５、２７７、２８１、３０１、３２５、２２９、１９３、３１３、２９３、又は２５３のいずれか１つの核酸配列を有するポリヌクレオチド；
（ｂ）配列番号６００のアミノ酸配列を有するポリペプチドをコードするポリヌクレオチド；
（ｃ）ＭＲＰ１遺伝子へハイブリダイズすることが可能なポリヌクレオチドであって、ＭＲＰ１遺伝子（受入番号：ＡＣ０２６４５２）の１３７６４７位、ＭＲＰ１遺伝子（受入番号：ＡＦ０２２８３１）の９５位、ＭＲＰ１遺伝子（受入番号：ＧＩ：７２０９４５１）の５３２８２位、ＭＲＰ１遺伝子（受入番号：ＡＦ０２２８３０）の２４９位、ＭＲＰ１遺伝子（受入番号：ＡＦ０２２８３１）の２５９位、ＭＲＰ１遺伝子（受入番号：ＡＣ０２６４５２）の１２４６６７位、ＭＲＰ１遺伝子（受入番号：Ｕ０７０５０）の３８１、４４０、１６２５位、ＭＲＰ１遺伝子（受入番号：ＡＣ００３０２６）の３４２１８位、ＭＲＰ１遺伝子（受入番号：Ｕ９１３１８）の１８０６７又は１７９００位に対応する位置に置換、又はＭＲＰ１遺伝子（受入番号：Ｕ０７０５０）の９２６／９２７位に対応する位置に少なくとも１つのヌクレオチドの挿入を有している、前記ポリヌクレオチド；
（ｄ）ＭＲＰ１遺伝子へハイブリダイズすることが可能なポリヌクレオチドであって、ＭＲＰ１遺伝子（受入番号：ＡＣ０２６４５２）の１３７６４７位、ＭＲＰ１遺伝子（受入番号：Ｕ９１３１８）の１８０６７又は１７９００位、ＭＲＰ１遺伝子（受入番号：Ｕ０７０５０）の４４０位に対応する位置にＴ、ＭＲＰ１遺伝子（受入番号：ＡＦ０２２８３１）の９５位、ＭＲＰ１遺伝子（受入番号：ＡＣ０２６４５２）の１２４６６７位に対応する位置にＣ、ＭＲＰ１遺伝子（受入番号：ＧＩ：７２０９４５１）の５３２８２位、ＭＲＰ１遺伝子（受入番号：ＡＦ０２２８３０）の２４９位、ＭＲＰ１遺伝子（受入番号：ＡＦ０２２８３１）の２５９位、ＭＲＰ１遺伝子（受入番号：Ｕ０７０５０）の３８１位に対応する位置にＧ、又はＭＲＰ１遺伝子（受入番号：ＡＣ００３０２６）の３４２１８位、又はＭＲＰ１遺伝子（受入番号：Ｕ０７０５０）の１６２５位に対応する位置にＡ、又はＭＲＰ１遺伝子（受入番号：Ｕ０７０５０）の９２６／９２７位に対応する位置にＴの挿入を有している、前記ポリヌクレオチド；
（ｅ）ＭＲＰ１ポリペプチド又はその断片をコードするポリヌクレオチドあって、前記ポリペプチドは、ＭＲＰ１ポリペプチド（受入番号：Ｇ２８２８２０６）の３２９位に対応する位置でアミノ酸置換を含む、前記ポリヌクレオチド；並びに
（ｆ）ＭＲＰ１ポリペプチド又はその断片をコードするポリヌクレオチドであって、前記ポリペプチドは、ＭＲＰ１ポリペプチド（受入番号：Ｇ２８２８２０６）の３２９位に対応する位置でＰｈｅからＣｙｓへのアミノ酸置換を含む、前記ポリヌクレオチド；
から成る群より選択されるポリヌクレオチドを含む、請求項８に記載の組成物。
【請求項１０】
１以上の変異アレルが患者のＭＲＰ１遺伝子産物の発現を低下させるものであり、よって患者へ投与されるイリノテカンの量が減らされる、請求項８に記載の組成物。
【請求項１１】
１以上の変異アレルが患者のＭＲＰ１遺伝子産物の発現を増加させるものであり、よって患者へ投与されるイリノテカンの量が増やされる、請求項８に記載の組成物。
【請求項１２】
１以上の変異アレルが患者のＭＲＰ１遺伝子産物の発現を低下させるものであり、よって患者へ投与されるイリノテカンの量が減らされる、請求項９に記載の組成物。
【請求項１３】
１以上の変異アレルが患者のＭＲＰ１遺伝子産物の発現を増加させるものであり、よって患者へ投与されるイリノテカンの量が増やされる、請求項９に記載の組成物。
【請求項１４】
患者がＭＲＰ１遺伝子の１以上の変異アレルを有するかどうかを決定することを含む、イリノテカンを用いた治療に対して患者に中毒反応のリスクがあるかどうかを決定する方法。
【請求項１５】
患者に投与すべきイリノテカンの量を減らすことをさらに含む、請求項１４に記載の方法。
【請求項１６】
がん罹患患者へイリノテカンを投与するための最適治療方式を決定する方法であって：
（１）該患者がＭＲＰ１遺伝子の１以上の変異アレルを有するかどうかを決定すること；
（２）変異アレルの１以上を有する患者において、イリノテカンの量を、ＭＲＰ１遺伝子の患者のアレルを考慮せずに投与される量と比較して増やすか又は減らすことを含む、前記方法。
【請求項１７】
ＭＲＰ１遺伝子産物の発現レベルが一般集団より低い場合はイリノテカンへの高い感受性を示すようなＭＲＰ１遺伝子の１以上の変異アレルを有する患者においてがんを治療するための医薬組成物であって、減らした量のイリノテカンを含む、前記組成物。
【請求項１８】
ＭＲＰ１遺伝子産物の発現レベルが一般集団より高い場合はイリノテカンへの耐性又は耐性素質を示すようなＭＲＰ１遺伝子の１以上の変異アレルを有する患者においてがんを治療するための医薬組成物であって、増やした量のイリノテカンを含む、前記組成物。
【請求項１９】
耐性又は耐性素質を示す変異アレルを有する患者がＭＲＰ１阻害剤による治療対象である、請求項１８に記載の組成物。
【請求項２０】
ＭＲＰ１阻害剤が、ＳＤＺ−ＰＳＣ  ８３３、ＳＤＺ  ２８０−４４６、ＭＫ５７１、ＭＳ２０９（キノロン誘導体）、ＰＡＫ−１０４ｐ、ベラパミル、ベンズブロマロン、ジピリダモール、フロセミド、γ−ＧＳ（ナフチル）システイニル−グリシンジエチルエステル、ゲニステイン、キニジン、リファンピシン、ＲＵ４８６、スルフィンピラゾンから成る群より選択される、請求項１９に記載の組成物。
【請求項２１】
ＭＲＰ１遺伝子産物の、患者から採取したがん性細胞における発現レベルの変化をアッセイすることによって治療の間に患者をモニターし、それによりＭＲＰ１遺伝子産物の発現レベルの増加を、組成物中に含有するイリノテカンの量の増加により補填する、請求項１７に記載の組成物。
【請求項２２】
患者のがんを治療するための体内投与用医薬組成物であって、有効量のイリノテカンを含み、ここで治療方式は、患者のＭＲＰ１遺伝子の遺伝子型に基づいて変更される、前記組成物。
【請求項２３】
がんに罹患し、且つＭＲＰ１遺伝子の１以上の変異アレルを有する患者の集団を治療するための医薬組成物であって、変異アレルを有する患者を治療するのに十分であるイリノテカンの量を含み、該量が、ＭＲＰ１遺伝子の患者のアレルを考慮せずに投与される量と比較して増やされるか又は減らされる、前記組成物。
【請求項２４】
がんに罹患している患者においてイリノテカンへの感受性を予測する方法であって、該患者がＭＲＰ１遺伝子の１以上の変異アレルを有するかどうかを決定することを含み、該アレルは、患者から採取したがん性細胞が少量又は多量のＭＲＰ１遺伝子産物を発現することを示し、それにより低い発現はイリノテカンへの高い感受性を示し、高い発現はイリノテカンへの耐性又は耐性素質を示す、前記方法。
【請求項２５】
耐性又は耐性素質を示す遺伝子型を有する患者がＭＲＰ１阻害剤による治療対象である、請求項２４に記載の方法。
【請求項２６】
ＭＲＰ１阻害剤が、ＳＤＺ−ＰＳＣ  ８３３、ＳＤＺ  ２８０−４４６、ＭＫ５７１、ＭＳ２０９（キノロン誘導体）、ＰＡＫ−１０４ｐ、ベラパミル、ベンズブロマロン、ジピリダモール、フロセミド、γ−ＧＳ（ナフチル）システイニル−グリシンジエチルエステル、ゲニステイン、キニジン、リファンピシン、ＲＵ４８６、スルフィンピラゾンから成る群より選択される、請求項２５に記載の方法。
【請求項２７】
耐性又は耐性素質を示す遺伝子型を有する患者を、患者から採取したがん性細胞におけるＭＲＰ１遺伝子産物の発現レベルをアッセイすることによって、治療の間にモニターする、請求項２６に記載の方法。
【請求項２８】
（ａ）配列番号１６９、１７０、１７３、１７４、１７７、１７８、１８１、１８２、１８５、１８６、１８９、１９０、１９３、１９４、１９７、１９８、２０１、２０２、２０５、２０６、２０９、２１０、２１３、２１４、２１７、２１８、２２１、２２２、２２５、２２６、２２９、２３０、２３３、２３４、２３７、２３８、２４１、２４２、２４５、２４６、２４９、２５０、２５３、２５４、２５７、２５８、２６１、２６２、２６５、２６６、２６９、２７０、２７３、２７４、２７７、２７８、２８１、２８２、２８５、２８６、２８９、２９０、２９３、２９４、２９７、２９８、３０１、３０２、３０５、３０６、３０９、３１０、３１３、３１４、３１７、３１８、３２１、３２２、３２５、３２６、３２９、３３０、３３３、及び／又は３３４のいずれか１つの核酸配列を有するポリヌクレオチド；
（ｂ）配列番号６００、６０２、及び／又は６０４のいずれか１つのアミノ酸配列を有するポリペプチドをコードするポリヌクレオチド；
（ｃ）多剤耐性タンパク質１（ＭＲＰ１）遺伝子へハイブリダイズすることが可能なポリヌクレオチドであって、ＭＲＰ１遺伝子（受入番号：ＧＩ：７２０９４５１）の５７９９８、５７８５３、５３２８２、及び／又は３９５０８位に対応する位置に少なくとも１つのヌクレオチドの置換又は欠失、又はＭＲＰ１遺伝子（受入番号：ＡＣ０２６４５２）の１３７６６７、１３７６４７、１３７７１０、１２４６６７、及び／又は３８６４６位に対応する位置に少なくとも１つのヌクレオチドの置換又は欠失、又はＭＲＰ１遺伝子（受入番号：ＡＣ００３０２６）の２７２５８、２７１５９、３４２１８、３４２１５、５５４７２、及び／又は３４２０６〜３４２０７位に対応する位置に少なくとも１つのヌクレオチドの置換又は欠失、又はＭＲＰ１遺伝子（受入番号：Ｕ９１３１８）の２１１３３、１４００８、１８０６７、１７９７０、１７９００、及び／又は１８１９５位に対応する位置に少なくとも１つのヌクレオチドの置換又は欠失、又はＭＲＰ１遺伝子（受入番号：ＡＦ０２２８３０）の７９、８８、及び／又は２４９位に対応する位置に少なくとも１つのヌクレオチドの置換又は欠失、又はＭＲＰ１遺伝子（受入番号：ＡＦ０２２８３１）の９５及び／又は２５９位に対応する位置に少なくとも１つのヌクレオチドの置換又は欠失、又はＭＲＰ１遺伝子（受入番号：ＡＣ０２５２７７）の１５０７２７及び／又は３３５５１位に対応する位置に少なくとも１つのヌクレオチドの置換又は欠失、又はＭＲＰ１遺伝子（受入番号：ＡＦ０２２８２８）の１７４位に対応する位置に少なくとも１つのヌクレオチドの置換又は欠失、又はＭＲＰ１遺伝子（受入番号：ＡＦ０２２８２９）の２４８及び／又は２５８位に対応する位置に少なくとも１つのヌクレオチドの置換又は欠失、又はＭＲＰ１遺伝子（受入番号：Ｕ０７０５０）の１８８４、１６２５、１１６３、３８１、２３３、１８９、４４０、及び／又は１７２０〜１７２３位に対応する位置に少なくとも１つのヌクレオチドの置換又は欠失、又はＭＲＰ１遺伝子（受入番号：Ｕ０７０５０）の９２６９２７、及び／又は４３７／４３８位に対応する位置に少なくとも１つのヌクレオチドの挿入、又はＭＲＰ１遺伝子（受入番号：ＡＣ００３０２６）の５５１５６／５５１５７位に対応する位置に少なくとも１つのヌクレオチドの挿入を有している、前記ポリヌクレオチド；
（ｄ）ＭＲＰ１遺伝子へハイブリダイズすることが可能なポリヌクレオチドであって、ＭＲＰ１遺伝子（受入番号：Ｕ９１３１８）の２１１３３、１４００８、及び／又は１８１９５位に対応する位置、又はＭＲＰ１遺伝子（受入番号：ＡＣ００３０２６）の２７２５８及び／又は３４２１８位に対応する位置、又はＭＲＰ１遺伝子（受入番号：ＡＦ０２２８３０）の７９位に対応する位置、又はＭＲＰ１遺伝子（受入番号：ＧＩ：７２０９４５１）の５７９９８及び／又は５７８５３位に対応する位置、又はＭＲＰ１遺伝子（受入番号：ＡＣ０２６４５２）の１３７６６７及び／又は１３７６４７位に対応する位置、又はＭＲＰ１遺伝子（受入番号：ＡＣ０２５２７７）の１５０７２７及び／又は３３５５１位に対応する位置、又はＭＲＰ１遺伝子（受入番号：ＡＦ０２２８２９）の２４８位に対応する位置、又はＭＲＰ１遺伝子（受入番号：Ｕ０７０５０）の１８８４、１６２５、２３３、及び／又は１８９位に対応する位置にＡ、ＭＲＰ１遺伝子（受入番号：ＧＩ：７２０９４５１）の３９５０８位に対応する位置、又はＭＲＰ１遺伝子（受入番号：Ｕ９１３１８）の１７９００、１８０６７、及び／又は１８１９５位に対応する位置、又はＭＲＰ１遺伝子（受入番号：ＡＦ０２２８２８）の１７４位に対応する位置、又はＭＲＰ１遺伝子（受入番号：Ｕ０７０５０）の４４０及び／又は１１６３位に対応する位置にＴ、ＭＲＰ１遺伝子（受入番号：ＡＦ０２２８３０）の８８位に対応する位置、又はＭＲＰ１遺伝子（受入番号：ＡＦ０２２８３１）の９５位に対応する位置、又はＭＲＰ１遺伝子（受入番号：ＡＣ００３０２６）の２７１５９、５５４７２、及び／又は３４２１５位に対応する位置、又はＭＲＰ１遺伝子（受入番号：ＡＣ０２６４５２）の１２４６６７及び／又は３８６４６位に対応する位置、又はＭＲＰ１遺伝子（受入番号：ＧＩ：７２０９４５１）の５３２８２位に対応する位置、又はＭＲＰ１遺伝子（受入番号：ＡＣ０２６４５２）の１３７７１０位に対応する位置にＣ、ＭＲＰ１遺伝子（受入番号：ＡＦ０２２８３０）の２４９位に対応する位置、又はＭＲＰ１遺伝子（受入番号：ＡＦ０２２８２９）の２５８位に対応する位置、又はＭＲＰ１遺伝子（受入番号：ＡＦ０２２８３１）の２５９位に対応する位置、又はＭＲＰ１遺伝子（受入番号：Ｕ０７０５０）の３８１位に対応する位置にＧ、ＭＲＰ１遺伝子（受入番号：Ｕ９１３１８）の１７９７０位に対応する位置にＴの欠失、又はＭＲＰ１遺伝子（受入番号：ＡＣ００３０２６）の３４２０６〜３４２０７位に対応する位置にＡＴの欠失、又はＭＲＰ１遺伝子（受入番号：Ｕ０７０５０）の１７２０〜１７２３位に対応する位置にＧＧＴＡの欠失、ＭＲＰ１遺伝子（受入番号：Ｕ０７０５０）の９２６／９２７位に対応する位置にＴの挿入、及び／又はＭＲＰ１遺伝子（受入番号：Ｕ０７０５０）の４３７／４３８位に対応する位置にＴＣＣＴＴＣＣの挿入、ＭＲＰ１遺伝子（受入番号：ＡＣ００３０２６）の５５１５６／５５１５７位に対応する位置にＴＧＧＧＧＣの挿入を有している、前記ポリヌクレオチド；
（ｅ）ＭＲＰ１ポリペプチド又はその断片をコードするポリヌクレオチドあって、前記ポリペプチドは、ＭＲＰ１ポリペプチド（受入番号：Ｇ２８２８２０６）の６００、６０２、及び／又は６０４位に対応する位置でアミノ酸置換を含む、前記ポリヌクレオチド；
（ｆ）ＭＲＰ１ポリペプチド又はその断片をコードするポリヌクレオチドであって、前記ポリペプチドは、ＭＲＰ１ポリペプチド（受入番号：Ｇ２８２８２０６）の２３９位に対応する位置でＰｈｅからＣｙｓへ、及び／又はＭＲＰ１ポリペプチド（受入番号：Ｇ２８２８２０６）の４３３位に対応する位置でＡｒｇからＳｅｒへ、及び／又はＭＲＰ１ポリペプチド（受入番号：Ｇ２８２８２０６）の７２３位に対応する位置でＡｒｇからＧｌｎへのアミノ酸置換を含む、前記ポリヌクレオチド；
から成る群より選択されるポリヌクレオチドを含む変異アレルがあるゲノムを有する被検者において、結直腸がん、子宮頚がん、胃がん、肺がん、悪性神経膠腫、卵巣がん、及び膵臓がんを治療するための医薬組成物の調製へのイリノテカン又はその誘導体の使用。
【請求項２９】
前記ポリヌクレオチドに含まれるヌクレオチドの欠失、付加、及び／又は置換が、対応する野生型アレルに比べて変異アレルの発現を改変させる、請求項２８に記載の使用。
【請求項３０】
前記発現の改変が発現の低下又は増加である、請求項２９に記載の使用。
【請求項３１】
前記ポリヌクレオチドに含まれるヌクレオチドの欠失、付加、及び／又は置換が対応する野生型アレルによりコードされるポリペプチドに比べて変異アレルによりコードされるポリペプチドの活性を改変させる、請求項２８に記載の使用。
【請求項３２】
前記活性の改変が活性の低下又は増加である、請求項３１に記載の使用。
【請求項３３】
前記被検者が動物である、請求項２８〜３２のいずれか１項に記載の使用。
【請求項３４】
前記被検者がマウスである、請求項３３に記載の使用。
【請求項３５】
前記被検者がヒトである、請求項２８〜３２のいずれか１項に記載の使用。
【請求項３６】
前記ヒトがアフリカ人かアジア人である、請求項３５に記載の使用。
【請求項３７】
結直腸がん、子宮頚がん、胃がん、肺がん、悪性神経膠腫、卵巣がん、及び膵臓がんに罹患している被検者に適正な療法を選択する方法であって：
（ａ）被検者から入手した試料中の前記被検者のゲノムにおける請求項２８で特定される変異アレルが存在するか否かを決定すること；及び
（ｂ）（ａ）で得られた結果に基づいて前記被検者に適正な療法を選択することを含む、前記方法。
【請求項３８】
がんに罹患し、且つＭＲＰ１遺伝子の１以上の変異アレルを有する患者に投与するイリノテカンの量を決定する方法であって、患者のＭＲＰ１遺伝子のアレルを考慮して量を増やすか又は減らすことを含む、前記方法。