【手続補正書】
【提出日】平成17年6月21日(2005.6.21)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
ＣＬＬＤ８  ｍＲＮＡ配列を含む単離された核酸配列若しくは組換え核酸配列、若しくはそれらに相補的な配列若しくは実質的に相同な配列、又はそれらの断片。
【請求項２】
ＡＮＧＥ−ＣＬＬＤ８ハイブリッドｍＲＮＡ配列を含む単離された核酸配列若しくは組換え核酸配列、若しくはそれらに相補的な配列若しくは実質的に相同な配列、又はそれらの断片。
【請求項３】
ＣＬＬＤ７−ＣＬＬＤ８ハイブリッドｍＲＮＡ配列を含む単離された核酸配列若しくは組換え核酸配列、若しくはそれらに相補的な配列若しくは実質的に相同な配列、又はそれらの断片。
【請求項４】
ＡＮＧＥ−ＣＬＬＤ８−ＣＬＬＤ７ハイブリッドｍＲＮＡ配列を含む単離された核酸配列若しくは組換え核酸配列、若しくはそれらに相補的な配列若しくは実質的に相同な配列、又はそれらの断片。
【請求項５】
請求項１乃至４の何れかに記載の単離された核酸配列若しくは組換え核酸配列であって、前記配列がヒトポリペプチド若しくはそれに相補的な配列若しくは実質的に相同な配列又はそれらの断片をコードする、核酸配列。
【請求項６】
請求項１乃至４の何れかに記載の単離された核酸配列若しくは組換え核酸配列であって、前記配列がマウスポリペプチド若しくはそれに相補的な配列若しくは実質的に相同な配列又はそれらの断片をコードする、核酸配列。
【請求項７】
請求項１乃至６の何れかに記載の核酸配列中に単ヌクレオチド多型を有する単離された核酸配列又は組換え核酸配列。
【請求項８】
図５の配列１の一部を有し、且つ表１に列記されている図５の位置に対応する位置にＳＮＰを１以上有する、請求項７に記載されている単離された核酸配列又は組換え核酸配列。
【請求項９】
図５の１８５７５２ｂ４＿２、１８５７５２ｂ５＿３、４３２１０１７ｂ３８＿１位に対応する位置に、又は図５の４３２１０３１ｂ４３＿１位に対応する位置に、ＳＮＰを有する単離された核酸配列又は組換え核酸配列。
【請求項１０】
ストリンジェントな条件下で、請求項１乃至９の何れかの配列にハイブリダイズする単離された核酸配列又は組換え核酸配列。
【請求項１１】
表１のＳＮＰを有する対立遺伝子を識別することが可能である、請求項１０に記載の単離された核酸配列又は組換え核酸配列。
【請求項１２】
表４に記載されているプライマー配列。
【請求項１３】
請求項１乃至１１のうち何れか１項の単離された核酸配列を備えたベクターであって、請求項１乃至１１の何れかの単離された核酸配列又は組換え核酸配列をインビトロ又はインビボで発現させることができるベクター。
【請求項１４】
請求項１乃至１１の何れか１項の単離された核酸配列又は組換え核酸配列によってコードされるポリペプチド配列若しくはそれらと実質的に相同な配列又はそれらの断片。
【請求項１５】
前記ポリペプチドが翻訳後に修飾される、請求項１４に記載のポリペプチド配列。
【請求項１６】
前記ポリペプチドが分泌シグナルに作用可能に連結されている、請求項１４又は請求項１５に記載のポリペプチド配列。
【請求項１７】
請求項１４、１５、又は１６の何れか１項に記載のポリペプチド配列であって、前記ポリペプチドがヒスチジンタグを有するポリペプチド。
【請求項１８】
前記ポリペプチドが担体に連結されている、請求項１４乃至１７の何れかに記載のポリペプチド。
【請求項１９】
請求項１４乃至１８のポリペプチド又は請求項１乃至１１の何れかの単離された核酸配列に対して特異的な抗体。
【請求項２０】
請求項１４乃至１８のポリペプチドの抗原又は請求項１乃至１１の何れかの単離された核酸と反応する抗体。
【請求項２１】
前記抗体がキメラ抗体であるか、又はヒト化されており若しくは二機能性である、請求項１９又は請求項２０に記載の抗体。
【請求項２２】
試料中に存在する請求項１４乃至１８の何れかのポリペプチドを検出又は測定するためのアッセイにおける、請求項１９乃至２１の何れかの抗体の使用。
【請求項２３】
請求項１乃至１１の何れかに記載された核酸配列を調製するための方法であって、連続するヌクレオチド及び／又はオリゴヌクレオチド残基を互いに連結することを備えた方法。
【請求項２４】
請求項１４乃至１８の何れかに記載されたポリペプチドを調製するための方法であって、連続するアミノ酸及び／又はオリゴペプチド残基を互いに連結することを備えた方法。
【請求項２５】
前記ポリペプチドが無細胞系で産生される、請求項２４に記載の方法。
【請求項２６】
請求項１３のベクターを備えた宿主細胞。
【請求項２７】
請求項１３のベクターを備えた宿主細胞であって、請求項１４乃至１８に記載されたポリペプチドを作製するための宿主細胞又は請求項１４乃至１８のポリペプチドの制御若しくは分析において使用するための宿主細胞。
【請求項２８】
請求項１３のベクターを備えたヒト以外のトランスジェニック動物。
【請求項２９】
疾病をもたらす請求項１乃至１１の何れかの単離された核酸配列を備える、ヒト以外のトランスジェニック動物。
【請求項３０】
請求項１乃至１１の何れかの単離された核酸配列を実質的に発現しない、ヒト以外のトランスジェニック動物。
【請求項３１】
アトピーに対する被験体の素因若しくは感受性を診断若しくは測定する方法又は個体における疾病の重篤度を予測する方法であって、バリアント型のＡＮＧＥ、ＣＬＬＤ７、若しくはＣＬＬＤ８遺伝子、又はＡＮＧＥ、ＣＬＬＤ７、及びＣＬＬＤ８の任意の組み合わせ、又は前記遺伝子の任意のスプライスバリアントの存在を測定することを備えた方法。
【請求項３２】
ある個体がアトピー性であることを診断する方法であって、表１のＳＮＰマーカーの１以上と関連し且つ前記マーカーと連鎖不均衡にある他の任意のＳＮＰと必要に応じて関連する対立遺伝子の個体における有無を明らかにすることを備えた方法。
【請求項３３】
疾病に対する素因を診断し、又は測定する方法であって、１８５７５２ｂ４＿２、１８５７５２ｂ５＿３、又は４３２１０１７ｂ３８＿１位のＳＮＰマーカーを有する対立遺伝子の有無を明らかにすることを備え、前記対立遺伝子が存在すれば、疾病又は疾病に対する素因があると診断される方法。
【請求項３４】
異常な血清ＩｇＥレベルを有する個体を診断する方法であって、ＳＮＰマーカー１８５７５２ｂ４＿２と関連し且つ前記マーカーと連鎖不均衡にある他の任意のＳＮＰと必要に応じて関連する対立遺伝子の個体における有無を明らかにすることを備えた方法。
【請求項３５】
５ｍｍを超えるＳＴＩを個体が有することを診断する方法であって、ＳＮＰマーカー４３２１０１７ｂ３８＿１と関連し且つ前記マーカーと連鎖不均衡にある他の任意のＳＮＰと必要に応じて関連する対立遺伝子の個体における有無を明らかにすることを備えた方法。
【請求項３６】
個体がアトピー性であると診断する方法であって、ハプロタイプ１８５７５２ｂ４＿２、１８５７５２ｂ５＿３、４３２１０３１ｂ４３＿１と関連し且つこれらのマーカーのうち任意の１つと連鎖不均衡にある他の任意のＳＮＰと必要に応じて関連する対立遺伝子の個体における有無を明らかにすることを備えた方法。
【請求項３７】
請求項３１乃至３６の何れか１項に記載の方法であって、
（１）前記個体から適切な試料を準備することと、
（２）前記試料から核酸を調製することと、
（３）前記対立遺伝子の有無について前記核酸試料を分析することと、
を備えた方法。
【請求項３８】
分析に先立って、前記ＳＮＰマーカーを含む領域を増幅する、請求項３７に記載の方法。
【請求項３９】
請求項３７又は３８２に記載の方法であって、前記ＳＮＰの何れかの側の領域に、ストリンジェントな条件下で、各々がハイブリダイズするプライマーの対を使用することを備えた方法。
【請求項４０】
前記プライマーが表４に示されているオリゴヌクレオチド配列を含んでいる、請求項３９に記載の方法。
【請求項４１】
ＩｇＥ媒介性疾患、アトピー、アトピー性疾患の一形態、若しくは非アトピー性喘息を診断する方法、又は疾病の重篤度若しくは疾病に対する素因を予測する方法において使用するための、ＣＬＬＤ８のスプライスバリアント。
【請求項４２】
アトピー、アトピー性疾患の一形態を診断する方法又は疾病の重篤度若しくは疾病に対する素因を予測する方法において使用するための診断剤の製造における、ＣＬＬＤ８のスプライスバリアントの使用。
【請求項４３】
ＩｇＥ媒介性疾患、アトピー、アトピー性疾患の一形態、若しくは非アトピー性喘息を診断する方法、又は疾病の重篤度を予測する方法において使用するための請求項４２のスプライスバリアントを備えたキットであって、個体における前記スプライスバリアントの有無を測定することを備えたキット。
【請求項４４】
２以上のスプライスバリアントをアレーの形態で又はチップ上に備えた、請求項４３に記載のキット。
【請求項４５】
ＣＬＬＤ８遺伝子の活性を阻害又は増強する物質のスクリーニングにおける、図５に示されているポリヌクレオチド配列の使用。
【請求項４６】
表１のリスク対立遺伝子の有無を測定する手段を備えた疾病又は疾病に対する素因を診断するためのキットであって、前記リスク対立遺伝子が疾病若しくは疾病に対する素因又は疾病の重篤度の診断指標となるキット。
【請求項４７】
請求項７乃至１１の何れかに記載の多型を有する１以上のリスク対立遺伝子の有無を測定するための手段を備えた請求項４６に記載のキット。
【請求項４８】
疾病を治療するための化合物を同定する方法であって、（ａ）表１に列記されている位置にＳＮＰを有する単離された核酸分子を含む組織に化合物を投与することと、（ｂ）前記化合物が前記ＳＮＰの下流効果をモジュレートするかどうかを測定することを備えた方法。
【請求項４９】
喘息、アトピー、花粉症、湿疹、アトピー性皮膚炎、又はアレルギー性鼻炎又は非アトピー性喘息等のＩｇＥ媒介性疾患の予防又は治療に使用するための物質又は抗体。
【請求項５０】
喘息、アトピー、花粉症、湿疹、アトピー性皮膚炎、又はアレルギー性鼻炎又は非アトピー性喘息等のＩｇＥ媒介性疾患の予防又は治療に使用するための医薬の製造における物質の使用。
【請求項５１】
請求項１乃至１２の何れかに記載された核酸又は請求項１４乃至１８の何れかに記載のポリペプチドを含む薬学的組成物。
【請求項５２】
請求項１９乃至２１の何れかに記載された抗体を含む薬学的組成物。
【請求項５３】
被験体の疾病を予防又は治療する方法であって、ＡＮＧＥ及び／又はＣＬＬＤ７及びＣＬＬＤ８又はこれらの遺伝子のうち２以上を任意に組み合わせたもの又は前記遺伝子の任意のスプライスバリアントの前記被験体における活性、発現、半減期、又は翻訳後修飾をモジュレートすることを備えた方法。
【請求項５４】
前記疾病が、喘息、アトピー、花粉症、湿疹、アトピー性皮膚炎、又はアレルギー性鼻炎又は非アトピー性喘息等のＩｇＥ媒介性疾患である、請求項５３に記載の方法。
【請求項５５】
請求項５３又は５４に記載された疾病を治療又は予防する方法であって、１８５７５２ｂ４＿２、１８５７５ｂ５＿３、４３２１０ｂ４３＿１位、又は４３２１０１７ｂ３８＿１位にＳＮＰマーカーを有するリスク対立遺伝子の有無を測定することを備え、リスク対立遺伝子が存在すれば、前記疾病を予防、遅延、又は軽減させるために治療を施す方法。
【請求項５６】
前記発病対立遺伝子の効果をモジュレートすることができる物質を被験体に投与することを備えた、請求項５３乃至５５の何れかに記載された方法。
【請求項５７】
ＣＬＬＤ８遺伝子の発現に影響を与えることができる物質であって、個体のＩｇＥ媒介性疾患又は非アトピー性喘息を予防又は治療する方法において使用するための物質。
【請求項５８】
ＣＬＬＤ８遺伝子プロモーター、又は該遺伝子プロモーターのうち２以上を任意に組み合わせたものの活性に影響を与えることができる請求項５７に記載の物質。
【請求項５９】
ＣＬＬＤ８遺伝子、又は該遺伝子の転写物のうち２以上を任意に組み合わせたもののＲＮＡスプライシングに影響を与えることができる請求項５７又は５８に記載の物質。
【請求項６０】
ＩｇＥ媒介性疾患又は非アトピー性喘息の予防又は治療で使用するための医薬の製造における、請求項５７乃至５９の何れか１項に記載された物質の使用。
【請求項６１】
ＣＬＬＤ８遺伝子、又はこれらの遺伝子のうち２以上を任意に組み合わせたもの、又は該遺伝子の任意のスプライスバリアントの活性をモジュレートする物質を同定するスクリーニングであって、
請求項１４乃至１８の何れか１項に記載されたポリペプチド配列を準備することと、
基質を準備することと、
検査すべき物質を準備することと、
前記基質の加工を測定することによって前記検査すべき物質が前記ポリペプチドの活性をモジュレートするかどうかを測定することと、
を備えたスクリーニング。
【請求項６２】
ＣＬＬＤ８遺伝子、又はこれらの遺伝子のうち２以上を任意に組み合わせたもの、又は該遺伝子の任意のスプライスバリアントの活性をモジュレートする物質を同定するスクリーニングであって、
請求項１４乃至１８の何れか１項に記載されたポリペプチド配列を準備することと、
細胞を準備することと、
検査すべき物質を準備することと、
前記細胞の表面への接着を測定することによって前記検査すべき物質が前記ポリペプチドの活性をモジュレートするかどうかを測定することと、
を備えたスクリーニング。
【請求項６３】
前記表面がさらに別の細胞の表面である、請求項６２に記載のスクリーニング。
【請求項６４】
請求項６２又は６３の何れか１項に記載のスクリーニングであって、前記表面が非生物分子であるスクリーニング。
【請求項６５】
請求項６２乃至６４の何れか１項に記載のスクリーニングであって、前記表面が生物分子であるスクリーニング。
【請求項６６】
請求項６２乃至６５の何れか１項に記載のスクリーニングであって、前記１以上の細胞が固定化されているスクリーニング。
【請求項６７】
請求項６２乃至６６の何れか１項に記載のスクリーニングであって、前記１以上の細胞がβ−リンパ球であるスクリーニング。
【請求項６８】
前記細胞のうち１以上が、請求項１３のベクターをトランスフェクトされた細胞であるか又は請求項２６若しくは２７の宿主細胞である、請求項６２乃至６７の何れかに記載されたスクリーニング。
【請求項６９】
ＣＬＬＤ８遺伝子の活性、又はこれらの遺伝子のうち２以上を任意に組み合わせたものの活性、又は該遺伝子の任意のスプライスバリアントの活性をモジュレートする物質を同定するためのスクリーニングであって、
請求項１４乃至１８の何れか１項に記載のポリペプチドを準備することと、
検査すべき物質を準備することと、
細胞を準備することと、
前記細胞の分化又は増殖の変化を測定することと、
を備えたスクリーニング。
【請求項７０】
前記細胞が、請求項１４乃至１８の何れか１項に記載のポリペプチドを１以上発現している、請求項６９に記載のスクリーニング。
【請求項７１】
細胞の分化の変化が細胞シグナル伝達因子の発現の変化を伴う、請求項６９又は７０に記載のスクリーニング。
【請求項７２】
前記細胞シグナル伝達因子が免疫調節物質又はペプチド制御因子である、請求項７１に記載のスクリーニング。
【請求項７３】
請求項６９乃至７２の何れか１項に記載のスクリーニングであって、患者又は実験動物から採取された後に前記細胞が培養されるスクリーニング。
【請求項７４】
ＣＬＬＤ８遺伝子、又は該遺伝子のうち２以上を任意に組み合わせたもの、又は該遺伝子の任意のスプライスバリアントの活性をモジュレートする物質を同定するスクリーニングであって、
請求項２６又は２７に記載のトランスジェニック動物を準備することと、
検査すべき物質を準備することと、
検査すべき前記物質に前記トランスジェニック動物を接触させることと、
前記トランスジェニック動物の表現型の変化を検出することと、
を備えたスクリーニング。
【請求項７５】
ＣＬＬＤ８遺伝子、又は該遺伝子のうち２以上を任意に組み合わせたもの、又は該遺伝子の任意のスプライスバリアントの活性をモジュレートする物質の使用に伴う副作用を検出するためのスクリーニングであって、
請求項１４乃至１８の何れか１項に記載されたポリペプチド配列を実質的に発現していない細胞を準備することと、
検査すべき物質を準備することと、
前記検査すべき物質を前記細胞と接触させることと、
前記物質によって前記細胞にもたらされた何らかの副作用を測定することと、を備えた方法。
【請求項７６】
前記副作用が細胞分化の変化を伴う、請求項７５に記載のスクリーニング。
【請求項７７】
前記副作用が細胞増殖の変化を伴う、請求項７５に記載のスクリーニング。
【請求項７８】
請求項７５乃至７７の何れか１項に記載のスクリーニングであって、前記細胞がトランスジェニック動物の一部であるスクリーニング。
【請求項７９】
請求項７５乃至７８の何れか１項に記載のスクリーニングであって、前記副作用が表現型の変化の計測であるスクリーニング。
【請求項８０】
ＣＬＬＤ８遺伝子、又は該遺伝子のうち２以上を任意に組み合わせたもの、又は該遺伝子の任意のスプライスバリアントの活性をモジュレートする物質を同定するためのスクリーニングであって、
請求項１乃至１１の何れか１項に記載の単離された核酸配列を準備することと、
検査すべき物質を準備することと、
前記物質と前記核酸の試料との相互作用を測定することによって前記検査すべき物質が前記単離された核酸の活性をモジュレートするかを測定することと、
を備えた方法。
【請求項８１】
請求項８０に記載のスクリーニングであって、該スクリーニングが、ＣＬＬＤ８遺伝子、又は該遺伝子のうち２以上を組み合わせたもの、又は該遺伝子の任意のスプライスバリアントの転写を測定するインビトロ転写アッセイであるスクリーニング。
【請求項８２】
ＣＬＬＤ８遺伝子、又は該遺伝子のうち２以上を任意に組み合わせたもの、又は該遺伝子の任意のスプライスバリアントの活性をモジュレートする物質のスクリーニングにおける、請求項１乃至１１の何れかに記載された核酸配列又は請求項１４乃至１８の何れかに記載されたポリペプチド配列の使用。