【手続補正書】
【提出日】平成17年10月6日(2005.10.6)
【手続補正１】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】特許請求の範囲
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】  以下に記載のヌクレオチド配列を含む単離された、核酸：
配列番号１、配列番号２、配列番号３、配列番号５、配列番号６、配列番号７、配列番号８、配列番号９、配列番号１０、配列番号１１、配列番号１２、配列番号１３、配列番号１５、配列番号１６、配列番号１７、配列番号１８、配列番号２１、配列番号２３、配列番号２５、配列番号２６、配列番号２７、配列番号２９、配列番号３０、配列番号３１、配列番号３３、配列番号３４、配列番号３５、配列番号３６、配列番号３７、配列番号３８、配列番号３９、配列番号４０、配列番号４１、配列番号４２、配列番号４３、配列番号４４、配列番号４５、配列番号４６、配列番号４８、配列番号４９、配列番号５０、配列番号５１、配列番号５２、配列番号５６、配列番号５７、配列番号５８、配列番号５９、配列番号６１、配列番号６２、配列番号６３、配列番号６６、配列番号６７、配列番号６８、配列番号７０、配列番号７１、配列番号７３、配列番号７４、配列番号７６、配列番号７７、配列番号７８、配列番号７９、配列番号８０、配列番号８１、配列番号８３、配列番号８４、配列番号８５、配列番号８６、配列番号８７、配列番号８８、配列番号８９、配列番号９１、配列番号９４、配列番号９５、配列番号９６、配列番号９７、配列番号９８、配列番号９９、配列番号１００、配列番号１０１、配列番号１０２、配列番号１０３、配列番号１０４、配列番号１０５、配列番号１０６、配列番号１０７、配列番号１０８、配列番号１１２、配列番号１２０、配列番号１２１、配列番号１２２、配列番号１２３、配列番号１２４、配列番号１２５、配列番号１２６および配列番号１２７。
【請求項２】  請求項１に記載のヌクレオチド配列の少なくとも２０の連続するヌクレオチドを含む、核酸。
【請求項３】  請求項１に記載のヌクレオチド配列の少なくとも３０の連続するヌクレオチドを含む、核酸。
【請求項４】  請求項１に記載のヌクレオチド配列の少なくとも４０の連続するヌクレオチドを含む、核酸。
【請求項５】  以下に記載のヌクレオチド配列を含む遺伝子によりコードされたタンパク質をコードする単離された、核酸：
配列番号１、配列番号２、配列番号３、配列番号５、配列番号６、配列番号７、配列番号８、配列番号９、配列番号１０、配列番号１１、配列番号１２、配列番号１３、配列番号１５、配列番号１６、配列番号１７、配列番号１８、配列番号２１、配列番号２３、配列番号２５、配列番号２６、配列番号２７、配列番号２９、配列番号３０、配列番号３１、配列番号３３、配列番号３４、配列番号３５、配列番号３６、配列番号３７、配列番号３８、配列番号３９、配列番号４０、配列番号４１、配列番号４２、配列番号４３、配列番号４４、配列番号４５、配列番号４６、配列番号４８、配列番号４９、配列番号５０、配列番号５１、配列番号５２、配列番号５６、配列番号５７、配列番号５８、配列番号５９、配列番号６１、配列番号６２、配列番号６３、配列番号６６、配列番号６７、配列番号６８、配列番号７０、配列番号７１、配列番号７３、配列番号７４、配列番号７６、配列番号７７、配列番号７８、配列番号７９、配列番号８０、配列番号８１、配列番号８３、配列番号８４、配列番号８５、配列番号８６、配列番号８７、配列番号８８、配列番号８９、配列番号９１、配列番号９４、配列番号９５、配列番号９６、配列番号９７、配列番号９８、配列番号９９、配列番号１００、配列番号１０１、配列番号１０２、配列番号１０３、配列番号１０４、配列番号１０５、配列番号１０６、配列番号１０７、配列番号１０８、配列番号１１２、配列番号１２０、配列番号１２１、配列番号１２２、配列番号１２３、配列番号１２４、配列番号１２５、配列番号１２６および配列番号１２７、またはこれらのホモログ。
【請求項６】  請求項１または５に記載の核酸を含む、宿主細胞。
【請求項７】  請求項１または５に記載の核酸とストリンジェントな条件下で選択的にハイブリダイズする核酸を含む、核酸。
【請求項８】  エキソン内の領域を有する核酸であって、該領域が、請求項１または５に記載の核酸と少なくとも５０％の相同性を有する、核酸。
【請求項９】  エキソン内の領域を有する核酸であって、該領域が、請求項１または５に記載の核酸と少なくとも６０％の相同性を有する、核酸。
【請求項１０】  エキソン内の領域を有する核酸であって、該領域が、請求項１または５に記載の核酸と少なくとも７０％の相同性を有する、核酸。
【請求項１１】  エキソン内の領域を有する核酸であって、該領域が、請求項１または５に記載の核酸と少なくとも８０％の相同性を有する、核酸。
【請求項１２】  エキソン内の領域を有する核酸であって、該領域が、請求項１または５に記載の核酸と少なくとも９０％の相同性を有する、核酸。
【請求項１３】  エキソン内の領域を有する核酸であって、該領域が、請求項１または５に記載の核酸と少なくとも９５％の相同性を有する、核酸。
【請求項１４】  請求項１または５に記載の核酸によりコードされたアミノ酸配列を含む、ポリペプチド。
【請求項１５】  以下に記載のヌクレオチド配列を含む遺伝子の調節領域を含む、核酸：
配列番号１、配列番号２、配列番号３、配列番号５、配列番号６、配列番号７、配列番号８、配列番号９、配列番号１０、配列番号１１、配列番号１２、配列番号１３、配列番号１５、配列番号１６、配列番号１７、配列番号１８、配列番号２１、配列番号２３、配列番号２５、配列番号２６、配列番号２７、配列番号２９、配列番号３０、配列番号３１、配列番号３３、配列番号３４、配列番号３５、配列番号３６、配列番号３７、配列番号３８、配列番号３９、配列番号４０、配列番号４１、配列番号４２、配列番号４３、配列番号４４、配列番号４５、配列番号４６、配列番号４８、配列番号４９、配列番号５０、配列番号５１、配列番号５２、配列番号５６、配列番号５７、配列番号５８、配列番号５９、配列番号６１、配列番号６２、配列番号６３、配列番号６６、配列番号６７、配列番号６８、配列番号７０、配列番号７１、配列番号７３、配列番号７４、配列番号７６、配列番号７７、配列番号７８、配列番号７９、配列番号８０、配列番号８１、配列番号８３、配列番号８４、配列番号８５、配列番号８６、配列番号８７、配列番号８８、配列番号８９、配列番号９１、配列番号９４、配列番号９５、配列番号９６、配列番号９７、配列番号９８、配列番号９９、配列番号１００、配列番号１０１、配列番号１０２、配列番号１０３、配列番号１０４、配列番号１０５、配列番号１０６、配列番号１０７、配列番号１０８、配列番号１１２、配列番号１２０、配列番号１２１、配列番号１２２、配列番号１２３、配列番号１２４、配列番号１２５、配列番号１２６および配列番号１２７、またはこれらのホモログ。
【請求項１６】  請求項１５に記載の調節領域を含む構築物であって、該調節領域がレポーター遺伝子に機能的に連結されている、構築物。
【請求項１７】  被験体におけるウイルス感染を減少または阻害する組成物であって、以下に記載の核酸：
配列番号１、配列番号２、配列番号３、配列番号４、配列番号５、配列番号６、配列番号７、配列番号８、配列番号１１、配列番号１２、配列番号１３、配列番号１４、配列番号１５、配列番号１６、配列番号１７、配列番号１８、配列番号１９、配列番号２０、配列番号２１、配列番号２２、配列番号２３、配列番号２４、配列番号２５、配列番号３０、配列番号３１、配列番号３２、配列番号３３、配列番号３４、配列番号３５、配列番号３７、配列番号３８、配列番号３９、配列番号４０、配列番号４１、配列番号４２、配列番号４３、配列番号４４、配列番号４５、配列番号４６、配列番号４７、配列番号４８、配列番号４９、配列番号５０、配列番号５１、配列番号５２、配列番号５３、配列番号５４、配列番号５５、配列番号５６、配列番号５７、配列番号５８、配列番号５９、配列番号６０、配列番号６１、配列番号６２、配列番号６３、配列番号６４、配列番号６５、配列番号６６、配列番号６７、配列番号６８、配列番号６９、配列番号７０、配列番号７１、配列番号７２、配列番号７３、配列番号７４、配列番号７５、配列番号７６、配列番号７７、配列番号７８、配列番号７９、配列番号８０、配列番号８１、配列番号８２、配列番号８３、配列番号８４、配列番号８５、配列番号８６、配列番号８７、配列番号８８、配列番号８９、配列番号９０、配列番号９１、配列番号９２、配列番号９３、配列番号９５、配列番号９６、配列番号９７、配列番号９８、配列番号９９、配列番号１００、配列番号１０１、配列番号１０２、配列番号１０３、配列番号１０４、配列番号１０５、配列番号１０６、配列番号１０７、配列番号１０８、配列番号１０９、配列番号１１０、配列番号１１１、配列番号１１２、配列番号１１３、配列番号１１４、配列番号１１５、配列番号１１６、配列番号１１７、配列番号１１８、配列番号１１９、配列番号１２０、配列番号１２１、配列番号１２２、配列番号１２３、配列番号１２４、配列番号１２５、配列番号１２６または配列番号１２７、あるいはそれらのホモログを含む遺伝子によりコードされた遺伝子産物の発現または機能化を阻害し、それにより該ウイルス感染を処置する、ある量の化合物を含む、組成物。
【請求項１８】  請求項１７に記載の組成物であって、ここで前記遺伝子が以下からなる群由来の遺伝子産物をコードする核酸から選択されるか、または前記遺伝子産物が以下からなる群から選択される、組成物：
トリステトラプロリン（ヒトＺＦＰ−３６）、６−ピルボイルテトラヒドロプテリンシンターゼ、真核生物ＤｎａＪ様タンパク質、ＩＤ３（ＤＮＡ結合３のインヒビター）、Ｎ−アセチルグルコサミニルトランスフェラーゼＩ（ｍＧＡＴ−１）、卵割刺激因子（ＣＳＴＦ２）、ＴＡＫ１結合タンパク質、ヒト亜鉛転写因子ＺＰＦ２０７、Ｄｌｘ２、Ｓｍａｄ７（Ｍａｄ関連タンパク質）、およびＰ糖タンパク質（ｍｄｒ１ｂ）。
【請求項１９】  前記被験体がヒトである、請求項１７に記載の組成物。
【請求項２０】  被験体におけるウイルス感染を減少または阻害する細胞を生成するための方法であって、選択された細胞において、以下に記載の核酸：
配列番号１、配列番号２、配列番号３、配列番号４、配列番号５、配列番号６、配列番号７、配列番号８、配列番号１１、配列番号１２、配列番号１３、配列番号１４、配列番号１５、配列番号１６、配列番号１７、配列番号１８、配列番号１９、配列番号２０、配列番号２１、配列番号２２、配列番号２３、配列番号２４、配列番号２５、配列番号３０、配列番号３１、配列番号３２、配列番号３３、配列番号３４、配列番号３５、配列番号３７、配列番号３８、配列番号３９、配列番号４０、配列番号４１、配列番号４２、配列番号４３、配列番号４４、配列番号４５、配列番号４６、配列番号４７、配列番号４８、配列番号４９、配列番号５０、配列番号５１、配列番号５２、配列番号５３、配列番号５４、配列番号５５、配列番号５６、配列番号５７、配列番号５８、配列番号５９、配列番号６０、配列番号６１、配列番号６２、配列番号６３、配列番号６４、配列番号６５、配列番号６６、配列番号６７、配列番号６８、配列番号６９、配列番号７０、配列番号７１、配列番号７２、配列番号７３、配列番号７４、配列番号７５、配列番号７６、配列番号７７、配列番号７８、配列番号７９、配列番号８０、配列番号８１、配列番号８２、配列番号８３、配列番号８４、配列番号８５、配列番号８６、配列番号８７、配列番号８８、配列番号８９、配列番号９０、配列番号９１、配列番号９２、配列番号９３、配列番号９５、配列番号９６、配列番号９７、配列番号９８、配列番号９９、配列番号１００、配列番号１０１、配列番号１０２、配列番号１０３、配列番号１０４、配列番号１０５、配列番号１０６、配列番号１０７、配列番号１０８、配列番号１０９、配列番号１１０、配列番号１１１、配列番号１１２、配列番号１１３、配列番号１１４、配列番号１１５、配列番号１１６、配列番号１１７、配列番号１１８、配列番号１１９、配列番号１２０、配列番号１２１、配列番号１２２、配列番号１２３、配列番号１２４、配列番号１２５、配列番号１２６または配列番号１２７、あるいはこれらのホモログを含む内因性遺伝子を、該遺伝子の機能的遺伝子産物を産生し得ない変異遺伝子または該遺伝子の機能的遺伝子産物を減少した量で産生する変異遺伝子にエキソビボで変異させる工程を包含する、方法。
【請求項２１】  前記細胞が造血細胞である、請求項２０に記載の方法。
【請求項２２】  前記被験体がヒトである、請求項２０に記載の方法。
【請求項２３】  前記細胞が前記被験体由来である、請求項２０に記載の方法。
【請求項２４】  ウイルス感染を処置または予防する効力について化合物をスクリーニングする方法であって、以下：
配列番号１、配列番号２、配列番号３、配列番号４、配列番号５、配列番号６、配列番号７、配列番号８、配列番号１１、配列番号１２、配列番号１３、配列番号１４、配列番号１５、配列番号１６、配列番号１７、配列番号１８、配列番号１９、配列番号２０、配列番号２１、配列番号２２、配列番号２３、配列番号２４、配列番号２５、配列番号３０、配列番号３１、配列番号３２、配列番号３３、配列番号３４、配列番号３５、配列番号３７、配列番号３８、配列番号３９、配列番号４０、配列番号４１、配列番号４２、配列番号４３、配列番号４４、配列番号４５、配列番号４６、配列番号４７、配列番号４８、配列番号４９、配列番号５０、配列番号５１、配列番号５２、配列番号５３、配列番号５４、配列番号５５、配列番号５６、配列番号５７、配列番号５８、配列番号５９、配列番号６０、配列番号６１、配列番号６２、配列番号６３、配列番号６４、配列番号６５、配列番号６６、配列番号６７、配列番号６８、配列番号６９、配列番号７０、配列番号７１、配列番号７２、配列番号７３、配列番号７４、配列番号７５、配列番号７６、配列番号７７、配列番号７８、配列番号７９、配列番号８０、配列番号８１、配列番号８２、配列番号８３、配列番号８４、配列番号８５、配列番号８６、配列番号８７、配列番号８８、配列番号８９、配列番号９０、配列番号９１、配列番号９２、配列番号９３、配列番号９５、配列番号９６、配列番号９７、配列番号９８、配列番号９９、配列番号１００、配列番号１０１、配列番号１０２、配列番号１０３、配列番号１０４、配列番号１０５、配列番号１０６、配列番号１０７、配列番号１０８、配列番号１０９、配列番号１１０、配列番号１１１、配列番号１１２、配列番号１１３、配列番号１１４、配列番号１１５、配列番号１１６、配列番号１１７、配列番号１１８、配列番号１１９、配列番号１２０、配列番号１２１、配列番号１２２、配列番号１２３、配列番号１２４、配列番号１２５、配列番号１２６または配列番号１２７に記載の核酸あるいはそのホモログを含む細胞性遺伝子、および該細胞中の該ウイルスの複製に必要であるが該細胞の生存に必要ではない遺伝子産物を機能的にコードする細胞性遺伝子を含有する細胞に該化合物を投与する工程、ならびに産生される該遺伝子産物のレベルおよび／または活性を検出する工程を包含する方法であって、ここで、該遺伝子産物および／または遺伝子産物の活性の減少または除去が該ウイルス感染を処置または予防するために有効な化合物を示す、方法。
【請求項２５】  ウイルス感染を減少または阻害することについて化合物をスクリーニングする方法であって、該化合物を、請求項１６に記載の構築物を含む細胞に投与する工程、および産生された前記レポーター遺伝子の産物のレベルを検出する工程を包含し、該レポーター遺伝子産物の減少または除去が、該ウイルス感染を減少または阻害するための化合物を示す、方法。
【請求項２６】  ウイルス感染を処置または予防する効力について化合物をスクリーニングする方法であって、以下：
配列番号１、配列番号２、配列番号３、配列番号４、配列番号５、配列番号６、配列番号７、配列番号８、配列番号１１、配列番号１２、配列番号１３、配列番号１４、配列番号１５、配列番号１６、配列番号１７、配列番号１８、配列番号１９、配列番号２０、配列番号２１、配列番号２２、配列番号２３、配列番号２４、配列番号２５、配列番号３０、配列番号３１、配列番号３２、配列番号３３、配列番号３４、配列番号３５、配列番号３７、配列番号３８、配列番号３９、配列番号４０、配列番号４１、配列番号４２、配列番号４３、配列番号４４、配列番号４５、配列番号４６、配列番号４７、配列番号４８、配列番号４９、配列番号５０、配列番号５１、配列番号５２、配列番号５３、配列番号５４、配列番号５５、配列番号５６、配列番号５７、配列番号５８、配列番号５９、配列番号６０、配列番号６１、配列番号６２、配列番号６３、配列番号６４、配列番号６５、配列番号６６、配列番号６７、配列番号６８、配列番号６９、配列番号７０、配列番号７１、配列番号７２、配列番号７３、配列番号７４、配列番号７５、配列番号７６、配列番号７７、配列番号７８、配列番号７９、配列番号８０、配列番号８１、配列番号８２、配列番号８３、配列番号８４、配列番号８５、配列番号８６、配列番号８７、配列番号８８、配列番号８９、配列番号９０、配列番号９１、配列番号９２、配列番号９３、配列番号９５、配列番号９６、配列番号９７、配列番号９８、配列番号９９、配列番号１００、配列番号１０１、配列番号１０２、配列番号１０３、配列番号１０４、配列番号１０５、配列番号１０６、配列番号１０７、配列番号１０８、配列番号１０９、配列番号１１０、配列番号１１１、配列番号１１２、配列番号１１３、配列番号１１４、配列番号１１５、配列番号１１６、配列番号１１７、配列番号１１８、配列番号１１９、配列番号１２０、配列番号１２１、配列番号１２２、配列番号１２３、配列番号１２４、配列番号１２５、配列番号１２６または配列番号１２７に記載の核酸、あるいはそのホモログを含有する細胞性遺伝子の遺伝子産物と、該化合物とを接触させる工程、および該遺伝子産物の機能を検出する工程を包含し、該機能の減少または除去がウイルス機能の減少または阻害のための化合物を示す、方法。
【請求項２７】  被験体において細胞における悪性表現型を抑制する組成物であって、配列番号９、配列番号１０、配列番号２６、配列番号２７、配列番号２８、配列番号２９、配列番号３６または配列番号９４に記載の核酸、あるいはそれらのホモログを含む遺伝子によりコードされた遺伝子産物の発現または機能化を阻害し、それにより悪性表現型を抑制する、ある量の化合物を含む、組成物。
【請求項２８】  ウイルス感染を処置することにおける効力について化合物をスクリーニングする方法であって、該化合物を遺伝子産物を機能的にコードする細胞性遺伝子を含有する細胞に投与する工程であって、ここで該遺伝子産物の過剰発現が該ウイルスの複製を阻害するが該細胞の生存を妨げない、工程、および、該生成された遺伝子産物のレベルを検出する工程を包含し、該遺伝子産物の増加が該ウイルス感染の処置に効果的な化合物を示す、方法。
【請求項２９】  細胞において悪性表現型を抑制し得る化合物についてスクリーニングする方法であって、該化合物を、配列番号９、配列番号１０、配列番号２６、配列番号２７、配列番号２８、配列番号２９、配列番号３６または配列番号９４に記載の核酸、あるいはそれらのホモログを含む遺伝子によりコードされた遺伝子産物を機能的にコードする核酸を含有する細胞に投与する工程、および該生成された遺伝子産物のレベルを検出する工程を包含し、該遺伝子産物の増加が該悪性表現型を抑制するために有効な化合物を示す、方法。