【手続補正書】
【提出日】平成17年2月16日(2005.2.16)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
ａ）配列番号２ｎ（ｎは１〜８６の整数である）からなる群から選択されるアミノ酸配列を持つ成熟型；
ｂ）配列番号２ｎ（ｎは１〜８６の整数である）からなる群から選択されるアミノ酸配列を持つ成熟型の変異体、但し、成熟型中の任意のアミノ酸は、成熟型の配列中のアミノ酸残基の１５％未満が変更を受けるという条件で異なるアミノ酸に変更されている；
ｃ）配列番号２ｎ（ｎは１〜８６の整数である）からなる群から選択されるアミノ酸配列；
ｄ）配列番号２ｎ（ｎは１〜８６の整数である）からなる群から選択されるアミノ酸配列を持つ変異体、但し、選択された配列で特定される任意のアミノ酸は、配列中のアミノ酸残基の１５％未満が変更を受けるという条件で異なるアミノ酸に変更されている；および
ｅ）ａ）ないしｄ）のいずれかのフラグメント
からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む、単離ポリペプチド。
【請求項２】
配列番号２ｎ（ｎは１〜８６の整数である）からなる群から選択される配列を持つ天然に存在する対立遺伝子変異体である、請求項１に記載のポリペプチド。
【請求項３】
対立遺伝子変異体が、配列番号２ｎ（ｎは１〜８６の整数である）からなる群から選択される核酸配列から１個のヌクレオチドだけ異なる核酸配列の翻訳物であるアミノ酸配列を含む、請求項２に記載のポリペプチド。
【請求項４】
請求項１に記載された変異体ポリペプチドであり、選択された配列中で特定される任意のアミノ酸が保存的置換を生じるように変更されている、請求項１に記載のポリペプチド。
【請求項５】
請求項１に記載のポリペプチドおよび医薬的に許容され得る担体を含む、医薬組成物。
【請求項６】
請求項５に記載の医薬組成物を一つまたはそれ以上の容器内に含む、キット。
【請求項７】
ヒトの疾患に関連する症候群を処置する医薬の製造における治療物質の使用であって、疾患が請求項１に記載のポリペプチドに関連する病変から選択され、治療物質が請求項１に記載のポリペプチドである、使用。
【請求項８】
試料中の請求項１に記載のポリペプチドの存在または量を測定する方法であって、
（ａ）試料を用意すること；
（ｂ）ポリペプチドに免疫特異的に結合する抗体に試料を導入すること；および
（ｃ）ポリペプチドに結合した抗体の存在または量を測定し、それにより試料中のポリペプチドの存在または量を測定すること
を含む、方法。
【請求項９】
第１の哺乳動物の対象中の請求項１に記載のポリペプチドの変化したレベルと関連する疾患の存在または素因を測定する方法であって、
ａ）第１の哺乳動物の対象由来の試料におけるポリペプチドの発現レベルを測定すること；および
ｂ）ステップ（a）の試料中のポリペプチドの量を、疾患または素因を有さないことが知られている第２の哺乳動物の対象由来の対照試料中に存在するポリペプチドの量と比較すること
を含み、対照試料に比較するときの第１の対象中のポリペプチドの発現レベルの変化は、疾患の存在または素因を示す、方法。
【請求項１０】
請求項１に記載のポリペプチドに結合する物質を同定する方法であって：
（ａ）ポリペプチドを物質に導入すること；および
（ｂ）物質がポリペプチドに結合するか否かを測定すること
を含む、方法。
【請求項１１】
物質が細胞の受容体または下流のエフェクターである、請求項１０に記載の方法。
【請求項１２】
病変の処置に用いるための潜在的治療剤を同定する方法であって、病変は請求項１に記載のポリペプチドの異常な発現または異常な生理学的相互作用に関係し、その方法は：
（ａ）請求項１に記載のポリペプチドを発現し、かつポリペプチドに起因する性質または機能を有する細胞を用意すること；
（ｂ）細胞を候補物質を含む組成物と接触させること；および
（ｃ）物質がポリペプチドに起因する性質または機能を変化させるか否かを測定すること
を含み；
それにより、もし物質の存在下に観察される変化が、細胞を物質を含まない組成物と接触させたときには観察されなければ、物質は潜在的治療剤として同定される、方法。
【請求項１３】
請求項１に記載のポリペプチドに関連する病変の活性または潜在活性のモジュレーター、または素因をスクリーニングする方法であって、その方法は：
ａ）請求項１に記載のポリペプチドに関連する病変のリスクが増大している被検動物に試験化合物を投与すること、但し、被検動物は請求項１に記載のポリペプチドを組換え的に発現している；
ｂ）ステップ（ａ）の化合物の投与後に被検動物中のポリペプチドの活性を測定すること；および
ｃ）被検動物中のタンパク質の活性を、ポリペプチドを投与されていない対照動物におけるポリペプチドの活性と比較すること、但し、対照動物と比べた被検動物におけるポリペプチドの活性の変化は、試験化合物が請求項１に記載のポリペプチドに関連する病変の潜在活性または素因のモジュレーターであることを示す；
を含む方法。
【請求項１４】
被検動物が試験タンパク質の導入遺伝子を発現するか、または野生型被検動物に比べて増加したレベルのプロモーターの制御下に導入遺伝子を発現する組換え被検動物であり、但し、プロモーターは導入遺伝子の天然の遺伝子プロモーターでない、請求項１３に記載の方法。
【請求項１５】
請求項１に記載のポリペプチドの活性を調整する方法であって、ポリペプチドの活性を調整するのに十分な量でポリペプチドに結合する化合物と共に請求項に記載のポリペプチドを発現する細胞試料を導入することを含む、方法。
【請求項１６】
請求項１に記載のポリペプチドに関連する病変を処置または予防する方法であって、そのような処置または予防が望まれる対象に、対象における病変を処置または予防するために十分な量で請求項１に記載のポリペプチドを投与することを含む、方法。
【請求項１７】
対象がヒトである、請求項１６に記載の方法。
【請求項１８】
哺乳動物の病的状態を処置する方法であって、病的状態を軽減するのに十分な量でポリペプチドを哺乳動物に投与することを含み、ポリペプチドは、配列番号２ｎ（ｎは１〜８６の整数である）からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むポリペプチドに少なくとも９５％同一なアミノ酸配列を有するポリペプチドまたはその生物学的に活性なフラグメントである、方法。
【請求項１９】
ａ）配列番号２ｎ（ｎは１〜８６の整数である）を与えられたアミノ酸配列を持つ成熟型；
ｂ）配列番号２ｎ（ｎは１〜８６の整数である）からなる群から選択されるアミノ酸配列を持つ成熟型の変異体であり、選択された配列の成熟型中の任意のアミノ酸が、成熟型の配列中のアミノ酸残基の１５％未満が変更を受けるという条件で異なるアミノ酸に変更されている、変異体；
ｃ）配列番号２ｎ（ｎは１〜８６の整数である）からなる群から選択されるアミノ酸配列；
ｄ）配列番号２ｎ（ｎは１〜８６の整数である）からなる群から選択されるアミノ酸配列の変異体であり、選択された配列中の特定されるアミノ酸が、配列中のアミノ酸残基の１５％未満が変更を受けるという条件で異なるアミノ酸に変更されている、変異体；
ｅ）配列番号２ｎ（ｎは１〜８６の整数である）からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むポリペプチドの少なくとも一部分、または選択された配列の任意のアミノ酸が、配列においてアミノ酸残基の１０％未満が変更を受けるという条件で異なるアミノ酸に変更されている、ポリペプチドの任意の変異体をコードする核酸のフラグメント；および
ｆ）核酸分子のいずれかの相補的分子（complement）
からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする核酸配列を含む、単離核酸分子。
【請求項２０】
核酸分子が天然に存在する対立遺伝子の核酸変異体のヌクレオチド配列を含む、請求項１９に記載の核酸分子。
【請求項２１】
変異体ポリペプチドをコードする請求項１９に記載の核酸分子であって、変異体ポリペプチドは、天然に存在するポリペプチド変異体のポリペプチド配列を有する、核酸分子。
【請求項２２】
請求項１９に記載の核酸分子であって、核酸分子が配列番号２ｎ−１（ｎは１〜８６の整数である）からなる群から選択される核酸配列から１個のヌクレオチドだけ異なる、核酸分子。
【請求項２３】
請求項１９に記載の核酸分子であって、
ａ）配列番号２ｎ−１（ｎは１〜８６の整数である）からなる群から選択されるヌクレオチド配列
ｂ）配列番号２ｎ−１（ｎは１〜８６の整数である）からなる群から選択されるヌクレオチド配列中で一つまたはそれ以上のヌクレオチドが、選択された配列からなる群から選択されるものから、ヌクレオチドの１５％未満が変更を受けるという条件で異なるヌクレオチドに変更されているヌクレオチド配列；
ｃ）配列番号２ｎ−１（ｎは１〜８６の整数である）からなる群から選択される配列を持つ核酸フラグメント；および
ｄ）配列番号２ｎ−１（ｎは１〜８６の整数である）からなる群から選択されるヌクレオチド配列中で一つまたはそれ以上のヌクレオチドが、選択された配列からなる群から選択されるものから、ヌクレオチドの１５％未満が変更を受けるという条件で異なるヌクレオチドに変更されている核酸フラグメント
からなる群から選択されるヌクレオチド配列を含む、核酸分子。
【請求項２４】
請求項１９に記載の核酸分子であって、核酸分子が配列番号２ｎ−１（ｎは１〜８６の整数である）からなる群から選択されるヌクレオチド配列、または該ヌクレオチド配列の相補的配列（complement）に厳密な条件下でハイブリダイズする、核酸分子。
【請求項２５】
請求項１９に記載の核酸分子であって、選択されたヌクレオチド配列のコード配列中で特定される任意のヌクレオチドが、選択された配列からなる群から選択されるものから、選択されたコード配列中のヌクレオチドの１５％未満が変更を受けるという条件で異なるヌクレオチドに変更されているヌクレオチド配列、第１のポリヌクレオチドの相補的分子である単離された第２のポリヌクレオチド、またはそれらのいずれかのフラグメントを含む、核酸分子。
【請求項２６】
請求項１９に記載の核酸分子を含むベクター。
【請求項２７】
核酸分子に機能し得るように結合されたプロモーターをさらに含む、請求項２６に記載のベクター。
【請求項２８】
請求項２７に記載のベクターを含む細胞。
【請求項２９】
請求項１９に記載の核酸分子の存在または量を試料中で測定する方法であって：
（ａ）試料を用意すること；
（ｂ）核酸分子に結合するプローブに試料を導入すること；および
（ｃ）核酸分子に結合したプローブの存在または量を測定し、それにより試料中の核酸分子の存在または量を測定すること
を含む、方法。
【請求項３０】
核酸分子の存在または量が、細胞または組織のタイプに対するマーカーとして使用される、請求項２９に記載の方法。
【請求項３１】
細胞または組織のタイプが癌性である、請求項３０に記載の方法。
【請求項３２】
第１の哺乳動物の対象における請求項１９に記載の核酸分子の変化したレベルと関連する疾患の存在または素因を測定する方法であって：
ａ）第１の哺乳動物の対象由来の試料における核酸の量を測定すること；および
ｂ）ステップ（ａ）の試料中の核酸の量を、疾患または素因を有さないことが知られている第２の哺乳動物の対象由来の対照試料中に存在する核酸の量と比較すること；
を含み；
対照試料に比較するときの第１の対象における核酸のレベルの変化は、疾患の存在または素因を示す、方法。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００１４
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００１４】
もう一つの態様では、本発明は、配列番号２ｎ（ｎは１〜８６の整数である）からなる群より選択したアミノ酸配列を有するポリペプチドに関連する病変の活性または潜在活性のモジュレーター、または素因をスクリーニングする方法を含む。その方法は、本発明のポリペプチドに関連する病変のリスクが増大している被検動物に試験化合物を投与すること、但し、被検動物は請求項１に記載のポリペプチドを組換え的に発現している；試験化合物の投与後に被検動物中のポリペプチドの活性を測定すること；および被検動物中のタンパク質の活性を、ポリペプチドを投与されていない対照動物におけるポリペプチドの活性と比較すること、但し、対照動物と比べた被検動物におけるポリペプチドの活性の変化は、試験化合物が請求項１に記載のポリペプチドに関連する病変の潜在活性または素因のモジュレーターであることを示す、を含む。遺伝子組換えの被検動物は、試験タンパク質の導入遺伝子を発現するか、または野生型被検動物に比べて増加したレベルのプロモーターの制御下に導入遺伝子を発現し得る。プロモーターは、導入遺伝子の本来の遺伝子プロモーターであってもなくてもよい。