【手続補正書】
【提出日】平成18年4月7日(2006.4.7)
【手続補正１】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】特許請求の範囲
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】  Ｎ−末端コリン結合プロテインＡ切端形のアミノ酸配列を含む単離されたポリペプチド。
【請求項２】  前記アミノ酸配列が配列番号１で示される、そのフラグメント、変異体、変種、類似体または誘導体を含む請求項１の単離ポリペプチド。
【請求項３】  前記アミノ酸配列が配列番号３で示される、そのフラグメント、変異体、変種、類似体または誘導体を含む請求項１の単離ポリペプチド。
【請求項４】  前記アミノ酸配列が配列番号６で示される請求項１の単離ポリペプチド。
【請求項５】  前記アミノ酸配列が配列番号７で示される、そのフラグメント、変異体、変種、類似体または誘導体を含む請求項１の単離ポリペプチド。
【請求項６】  前記アミノ酸配列が配列番号９で示される、そのフラグメント、変異体、変種、類似体または誘導体を含む請求項１の単離ポリペプチド。
【請求項７】  配列番号２４に示すアミノ酸を有するＮ−末端コリン結合プロテインＡ切端形のアミノ酸配列を含む単離ポリペプチドであって、その三次元構造が表示されている前記単離ポリペプチド。
【請求項８】  前記三次元構造が天然の蛋白質に存在するものと一致する請求項７の単離ポリペプチド。
【請求項９】  前記ポリペプチドが完全長コリン結合プロテインＡをヒドロキシルアミンで切断することによって生成される請求項７の単離ポリペプチドであって、前記ヒドロキシルアミンがアミノ酸４７５で前記コリン結合プロテインＡを切断し、それによって前記Ｎ−末端コリン結合プロテインＡ切端形が生成される前記単離ポリペプチド。
【請求項１０】  請求項１のポリペプチドの単離類似体。
【請求項１１】  前記類似体がＮ−末端メチオニンまたはＮ−末端ポリヒスチジンを有するアミノ酸配列を含む請求項１０の単離ポリペプチド。
【請求項１２】  前記フラグメントが前記ポリペプチドの蛋白分解消化生成物である請求項１の単離ポリペプチド。
【請求項１３】  Ｎ−末端コリン結合プロテインＡ切端形のアミノ酸配列を含む単離ポリペプチドであって、レクチン活性を有し、さらにコリンに結合しない前記単離ポリペプチド。
【請求項１４】  Ｎ−末端コリン結合プロテインＡ切端形のアミノ酸配列を含む単離免疫原性ポリペプチド。
【請求項１５】  前記アミノ酸配列が配列番号１で示される、そのフラグメント、変異体、変種、類似体または誘導体を含む請求項１４の免疫原性ポリペプチド。
【請求項１６】  前記アミノ酸配列が配列番号３で示される、そのフラグメント、変異体、変種、類似体または誘導体を含む請求項１４の免疫原性ポリペプチド。
【請求項１７】  前記アミノ酸配列が配列番号７で示される、そのフラグメント、変異体、変種、類似体または誘導体を含む請求項１４の免疫原性ポリペプチド。
【請求項１８】  前記アミノ酸配列が配列番号９で示される、そのフラグメント、変異体、変種、類似体または誘導体を含む請求項１４の免疫原性ポリペプチド。
【請求項１９】  Ｎ−末端コリン結合プロテインＡ切端形のアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする単離された核酸。
【請求項２０】  前記核酸が配列番号１２で示される、そのフラグメント、変異体、変種、類似体または誘導体を含む請求項１９の単離核酸。
【請求項２１】  前記核酸が配列番号１４で示される、そのフラグメント、変異体、変種、類似体または誘導体を含む請求項１９の単離核酸。
【請求項２２】  前記核酸が配列番号１７で示される、そのフラグメント、変異体、変種、類似体または誘導体を含む請求項１９の単離核酸。
【請求項２３】  前記核酸が配列番号１９で示される、そのフラグメント、変異体、変種、類似体または誘導体を含む請求項１９の単離核酸。
【請求項２４】  前記核酸がＤＮＡである請求項１９の単離核酸。
【請求項２５】  前記核酸がｃＤＮＡである請求項１９の単離核酸。
【請求項２６】  前記核酸がゲノムＤＮＡである請求項１９の単離核酸。
【請求項２７】  前記核酸がＲＮＡである請求項１９の単離核酸。
【請求項２８】  ＲＮＡ転写プロモーターに機能できるように連結された請求項１９の単離核酸。
【請求項２９】  請求項１９の核酸分子を含むベクター。
【請求項３０】  前記プロモーターが細菌、酵母、昆虫または哺乳類のプロモーターを含む請求項２９のベクター。
【請求項３１】  前記ベクターがプラスミド、コスミド、酵母人工染色体（ＹＡＣ）、バクテリオファージまたは真核細胞ウイルスＤＮＡである請求項３０のベクター。
【請求項３２】  適切なホスト細胞中に請求項３０のベクターを含むポリペプチド製造用ホストベクター系。
【請求項３３】  前記ホスト細胞が原核細胞または真核細胞を含む請求項３２のホストベクター系。
【請求項３４】  請求項１９の核酸を含む細胞株。
【請求項３５】  以下の工程を含む精製形ポリペプチドを得る方法：
（ａ）請求項１９のベクターを適切なホスト細胞に導入し；
（ｂ）生じたホスト細胞を培養して、前記ポリペプチドを製造し；
（ｃ）工程（ｂ）で製造されたポリペプチドを回収し；さらに
（ｄ）工程（ｃ）で回収されたポリペプチドを精製する。
【請求項３６】  請求項１または７のポリペプチドと特異的に結合できる抗体。
【請求項３７】  前記抗体がモノクローナル抗体である請求項３６の抗体。
【請求項３８】  前記抗体がポリクローナル抗体である請求項３６の抗体。
【請求項３９】  前記抗体がキメラ（二特異性）抗体である請求項３６の抗体。
【請求項４０】  ある量の請求項１のポリペプチドおよび医薬的に許容できる担体または希釈剤を含む医薬組成物。
【請求項４１】  ある量の請求項４０の医薬組成物を非ヒト対象者に投与し、それによって免疫反応を誘発することを含む、肺炎球菌に暴露されたかまたは感染した前記非ヒト対象者で免疫反応を誘発する方法。
【請求項４２】  肺炎球菌の付着を防ぐために有効なある量の請求項４０の医薬組成物を非ヒト対象者に投与し、それによって肺炎球菌の感染を予防することを含む、前記非ヒト対象者で肺炎球菌による感染を予防する方法。
【請求項４３】  前記医薬組成物が気道または鼻咽頭に輸送される請求項４２の方法。
【請求項４４】  請求項３６の抗体および医薬的に許容できる担体または賦形剤を含む医薬組成物のある量を非ヒト対象者に投与し、それによって肺炎球菌の感染を予防することを含む、前記非ヒト対象者で肺炎球菌による感染を予防する方法。
【請求項４５】  請求項１のポリペプチドおよび医薬的に許容できるアジュバントまたは担体を含むワクチン。
【請求項４６】  前記ポリペプチドが、配列番号：１、３−７、９−１１、２２および２３のいずれかに示すアミノ酸配列を有する請求項４５のワクチン。
【請求項４７】  前記ポリペプチドが、図２に示すＮ−末端コリン結合プロテインＡ切端形のアミノ酸配列を含む請求項４５のワクチン。
【請求項４８】  図２に示す保存領域を含むアミノ酸配列を有するポリペプチドおよび医薬的に許容できるアジュバントまたは担体を含むワクチン。
【請求項４９】  前記保存領域が１５８から１７２；３００から３２１；３３１から３３９；３５５から３６５；３６７から３７４；３７９から３８９；４０９から４２７；および４３０から４４７のアミノ酸配列から選択される請求項４８のワクチン。
【請求項５０】  請求項１のポリペプチドをコードする単離核酸および医薬的に許容できるアジュバントまたは担体を含むワクチン。
【請求項５１】  請求項１９の単離核酸および医薬的に許容できるアジュバントまたは担体を含むワクチン。
【請求項５２】  請求項２９のベクターおよび医薬的に許容できるアジュバントまたは担体を含むワクチン。
【請求項５３】  請求項４５−５１または５２のいずれかのワクチンの治療的に有効な量を非ヒト対象者に投与し、それによって前記非ヒト対象者を治療する、肺炎球菌に感染したかまたは暴露された非ヒト対象者を治療する方法。