【手続補正書】
【提出日】平成17年12月27日(2005.12.27)
【手続補正１】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】特許請求の範囲
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】  単離された核酸分子であって、以下：
（ａ）配列番号２のアミノ酸１〜９５０からなるポリペプチドをコードするポリヌクレオチド；
（ｂ）配列番号２のアミノ酸２〜９５０からなるポリペプチドをコードするポリヌクレオチド；
（ｃ）配列番号２のアミノ酸２９〜９５０からなるポリペプチドをコードするポリヌクレオチド；
（ｄ）配列番号２のアミノ酸３０〜９５０からなるポリペプチドをコードするポリヌクレオチド；
（ｅ）ＡＴＣＣ受託番号２０９５８１に含まれるｃＤＮＡクローンによってコードされるアミノ酸配列を有するＭＥＴＨ１ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列からなるポリヌクレオチド；
（ｆ）ＡＴＣＣ受託番号２０９５８１に含まれるｃＤＮＡクローンによってコードされるアミノ酸配列を有する成熟ＭＥＴＨ１ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列からなるポリヌクレオチド；
（ｇ）配列番号４のアミノ酸１〜８９０を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチド；
（ｈ）配列番号４のアミノ酸２〜８９０を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチド；
（ｉ）配列番号４のアミノ酸２４〜８９０を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチド；
（ｊ）配列番号４のアミノ酸１１２〜８９０を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチド；
（ｋ）ＡＴＣＣ受託番号２０９５８２に含まれるｃＤＮＡクローンによってコードされるアミノ酸配列を有するＭＥＴＨ２ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチド；
（ｌ）ＡＴＣＣ受託番号２０９５８２に含まれるｃＤＮＡクローンによってコードされるアミノ酸配列を有する成熟ＭＥＴＨ２ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチド；
（ｍ）（ｇ）、（ｈ）、（ｉ）、（ｊ）、（ｋ）、または（ｌ）のポリヌクレオチドを改変することによって生成されるポリヌクレオチド改変体であって、ここで：
（ｉ）該改変は、ヌクレオチドの挿入、欠失もしくは置換、またはそれらの任意の組み合わせを含み；かつ
（ｉｉ）該改変の数は、改変されてないポリヌクレオチドに存在するヌクレオチドの総数の５％以下である、ポリヌクレオチド；
（ｎ）配列番号４のアミノ酸２１４〜４３９をコードするポリヌクレオチド；
（ｏ）配列番号４のアミノ酸４４０〜５２９をコードするポリヌクレオチド；
（ｐ）配列番号４のアミノ酸５３０〜５８３をコードするポリヌクレオチド；
（ｑ）配列番号４のアミノ酸８３７〜８９０をコードするポリヌクレオチド；
（ｒ）配列番号４のアミノ酸２８０〜６０６をコードするポリヌクレオチド；
（ｓ）配列番号４のアミノ酸５２９〜５４８をコードするポリヌクレオチド；および
（ｔ）（ａ）、（ｂ）、（ｃ）、（ｄ）、（ｅ）、（ｆ）、（ｇ）、（ｈ）、（ｉ）、（ｊ）、（ｋ）、（ｌ）、（ｍ）、（ｎ）、（ｏ）、（ｐ）、（ｑ）、（ｒ）、（ｓ）、または（ｔ）の任意のヌクレオチド配列と相補的なヌクレオチド配列、
からなる群から選択されるポリヌクレオチドを含む、単離された核酸分子。
【請求項２】 配列番号４のＭＥＴＨ２ポリペプチドのエピトープ保有部分のアミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む、単離された核酸分子。
【請求項３】  単離された核酸分子であって、以下：
（ａ）配列番号３のコード領域の５０連続ヌクレオチド、ただし該ヌクレオチド配列は、配列番号１９〜２２、２４、４２〜７７またはそれらのサブフラグメントのいずれでもない、ヌクレオチド；および
（ｂ）（ａ）のヌクレオチド配列に相補的なヌクレオチド配列、
からなる群から選択されるポリヌクレオチドを含む、単離された核酸分子。
【請求項４】  請求項１に記載の単離された核酸分子を、プロモーターに作動可能に連結してベクターに挿入する工程を含む、組換えベクターの作製方法。
【請求項５】  請求項４に記載の方法により作製された、組換えベクター。
【請求項６】  請求項５に記載の組換えベクターを宿主細胞に導入する工程を包含する、組換え宿主細胞の作製方法。
【請求項７】  請求項６に記載の方法によって作製された、組換え宿主細胞。
【請求項８】  ＭＥＴＨ１ポリペプチドまたはＭＥＴＨ２ポリペプチドを産生するための組換え方法であって、該ポリペプチドが発現されるような条件下で請求項７に記載の組換え宿主細胞を培養する工程、および該ポリペプチドを回収する工程を包含する、方法。
【請求項９】  単離されたポリペプチドであって、以下：
（ａ）配列番号２のアミノ酸１〜９５０；
（ｂ）配列番号２のアミノ酸２〜９５０；
（ｃ）配列番号２のアミノ酸２９〜９５０；
（ｄ）配列番号２のアミノ酸３０〜９５０；
（ｅ）ＡＴＣＣ受託番号２０９５８１に含まれるｃＤＮＡクローンによってコードされるアミノ酸配列を有するＭＥＴＨ１ポリペプチドのアミノ酸配列；および
（ｆ）ＡＴＣＣ受託番号２０９５８１に含まれるｃＤＮＡクローンによってコードされるアミノ酸配列を有する成熟ＭＥＴＨ１ポリペプチドのアミノ酸配列；
からなる群から選択されるアミノ酸配列からなる、単離されたポリペプチド。
【請求項１０】  単離されたポリペプチドであって、以下：
（ａ）配列番号４のアミノ酸１〜８９０；
（ｂ）配列番号４のアミノ酸２〜８９０；
（ｃ）配列番号４のアミノ酸２４〜８９０；
（ｄ）配列番号４のアミノ酸１１２〜８９０；
（ｅ）ＡＴＣＣ受託番号２０９５８２に含まれるＭＥＴＨ２ｃＤＮＡクローンによってコードされるアミノ酸配列を有するＭＥＴＨ２ポリペプチドのアミノ酸配列；
（ｆ）ＡＴＣＣ受託番号２０９５８２に含まれるＭＥＴＨ２ｃＤＮＡクローンによってコードされるアミノ酸配列を有する成熟ＭＥＴＨ２ポリペプチドのアミノ酸配列；
（ｇ）（ａ）、（ｂ）、（ｃ）、（ｄ）、（ｅ）、または（ｆ）のポリペプチドを改変することにより作製されるポリペプチド改変体のアミノ酸配列であって、ここで：
（ｉ）該改変は、アミノ酸の挿入、欠失もしくは置換、またはそれらの任意の組み合わせを含み；かつ
（ｉｉ）該改変の数は、改変されてないアミノ酸配列に存在するアミノ酸の総数の５％以下である、アミノ酸配列；
（ｈ）配列番号４のアミノ酸２１４〜４３９；
（ｉ）配列番号４のアミノ酸４４０〜５２９；
（ｊ）配列番号４のアミノ酸５３０〜５８３；
（ｋ）配列番号４のアミノ酸８３７〜８９０；
（ｌ）配列番号４のアミノ酸２８０〜６０６；
（ｍ）配列番号４のアミノ酸５２９〜５４８；
（ｎ）（ａ）、（ｂ）、（ｃ）、（ｄ）、（ｅ）、（ｆ）、（ｇ）、（ｈ）、（ｉ）、（ｊ）、（ｋ）、（ｌ）または（ｍ）、のポリペプチドのいずれか１つのエピトープ保有部分のアミノ酸配列、
からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む、単離されたポリペプチド。
【請求項１１】  組換え宿主細胞で産生される、請求項９または１０に記載の単離されたポリペプチド。
【請求項１２】  前記組換え宿主細胞が哺乳動物である、請求項１１に記載の単離されたポリペプチド。
【請求項１３】  ＭＥＴＨ１ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドからなる単離された核酸分子であって、ここで１〜５０の保存的アミノ酸置換を除けば、該ポリペプチドは以下：
（ａ）配列番号２のアミノ酸約１〜約９５０；
（ｂ）配列番号２のアミノ酸約２〜約９５０；
（ｃ）配列番号２のアミノ酸約２９〜約９５０；
（ｄ）配列番号２のアミノ酸約３０〜約９５０；
（ｅ）ＡＴＣＣ受託番号２０９５８１に含まれるｃＤＮＡクローンによってコードされるＭＥＴＨ１ポリペプチドのアミノ酸配列；および
（ｆ）ＡＴＣＣ受託番号２０９５８１に含まれるｃＤＮＡクローンによってコードされる成熟ＭＥＴＨ１ポリペプチドのアミノ酸配列；
からなる群から選択される配列を有する、単離された核酸分子。
【請求項１４】 ＭＥＴＨ２ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む単離された核酸分子であって、ここで１〜５０の保存的アミノ酸置換を除けば、該ポリペプチドは以下：
（ａ）配列番号４のアミノ酸約１〜約８９０；
（ｂ）配列番号４のアミノ酸約２〜約８９０；
（ｃ）配列番号４のアミノ酸約２４〜約８９０；
（ｄ）配列番号４のアミノ酸約１１２〜約８９０；
（ｅ）ＡＴＣＣ受託番号２０９５８２に含まれるｃＤＮＡクローンによってコードされるＭＥＴＨ２ポリペプチドのアミノ酸配列；および
（ｆ）ＡＴＣＣ受託番号２０９５８２に含まれるｃＤＮＡクローンによってコードされる成熟ＭＥＴＨ２ポリペプチドのアミノ酸配列
からなる群から選択される配列を有する、単離された核酸分子。
【請求項１５】  単離されたポリペプチドであって、該ポリペプチドは、１〜５０の保存的アミノ酸置換を除き、以下：
（ａ）配列番号２のアミノ酸約１〜約９５０；
（ｂ）配列番号２のアミノ酸約２〜約９５０；
（ｃ）配列番号２のアミノ酸約２９〜約９５０；
（ｄ）配列番号２のアミノ酸約３０〜約９５０；
（ｅ）ＡＴＣＣ受託番号２０９５８１に含まれるｃＤＮＡクローンによってコードされるアミノ酸配列を有するＭＥＴＨ１ポリペプチドのアミノ酸配列；および
（ｆ）ＡＴＣＣ受託番号２０９５８１に含まれるｃＤＮＡクローンによってコードされるアミノ酸配列を有する成熟ＭＥＴＨ１ポリペプチドのアミノ酸配列；
からなる群から選択されるアミノ酸配列からなる、単離されたポリペプチド。
【請求項１６】 単離されたポリペプチドであって、ここで１〜５０の保存的アミノ酸置換を除けば、該ポリペプチドは以下：
（ａ）配列番号４のアミノ酸約１〜約８９０；
（ｂ）配列番号４のアミノ酸約２〜約８９０；
（ｃ）配列番号４のアミノ酸約２４〜約８９０；
（ｄ）配列番号４のアミノ酸約１１２〜約８９０；
（ｅ）ＡＴＣＣ受託番号２０９５８２に含まれるｃＤＮＡクローンによってコードされるアミノ酸配列を有するＭＥＴＨ２ポリペプチドのアミノ酸配列；
（ｆ）ＡＴＣＣ受託番号２０９５８２に含まれるｃＤＮＡクローンによってコードされるアミノ酸配列を有する成熟ＭＥＴＨ２ポリペプチドのアミノ酸配列；および
（ｇ）（ａ）、（ｂ）、（ｃ）、（ｄ）、（ｅ）または（ｆ）、のポリペプチドのいずれか１つのエピトープ保有部分のアミノ酸配列、
からなる群から選択される配列を有する、単離されたポリペプチド。
【請求項１７】  単離された核酸分子であって、以下：
（ａ）配列番号２のアミノ酸１〜９５０からなるポリペプチドをコードするポリヌクレオチド；
（ｂ）配列番号２のアミノ酸２〜９５０からなるポリペプチドをコードするポリヌクレオチド；
（ｃ）配列番号２のアミノ酸２９〜９５０からなるポリペプチドをコードするポリヌクレオチド；
（ｄ）配列番号２のアミノ酸３０〜９５０からなるポリペプチドをコードするポリヌクレオチド；
（ｅ）ＡＴＣＣ受託番号２０９５８１に含まれるｃＤＮＡクローンによってコードされるアミノ酸配列を有するＭＥＴＨ１ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列からなるポリヌクレオチド；
（ｆ）ＡＴＣＣ受託番号２０９５８１に含まれるｃＤＮＡクローンによってコードされるアミノ酸配列を有する成熟ＭＥＴＨ１ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列からなるポリヌクレオチド；
（ｇ）配列番号４のアミノ酸１〜８９０を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチド；
（ｈ）配列番号４のアミノ酸２〜８９０を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチド；
（ｉ）配列番号４のアミノ酸２４〜８９０を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチド；
（ｊ）配列番号４のアミノ酸１１２〜８９０を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチド；
（ｋ）ＡＴＣＣ受託番号２０９５８２に含まれるｃＤＮＡクローンによってコードされるアミノ酸配列を有するＭＥＴＨ２ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチド；
（ｌ）ＡＴＣＣ受託番号２０９５８２に含まれるｃＤＮＡクローンによってコードされるアミノ酸配列を有する成熟ＭＥＴＨ２ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチド；および
（ｍ）（ａ）、（ｂ）、（ｃ）、（ｄ）、（ｅ）、（ｆ）、（ｇ）、（ｈ）、（ｉ）、（ｊ）、（ｋ）、または（ｌ）のヌクレオチド配列のいずれかに相補的なヌクレオチド配列、からなる群から選択されるポリヌクレオチドと少なくとも９５％同一であるポリヌクレオチドを含み、
ここで
該同一性％は、以下のパラメーター：Ｍａｔｒｉｘ＝Ｕｎｉｔａｒｙ、ｋ−ｔｕｐｌｅ＝４、ミスマッチペナルティー＝１、連結ペナルティー＝３０、無作為化群長さ＝０、カットオフスコア＝１、ギャップペナルティー＝５、ギャップサイズペナルティー＝０．０５、ウインドウサイズ＝５００または対象ヌクレオチド配列長のいずれか短い方、でＦＡＳＴＤＢコンピュータープログラムを用いて算出される、単離された核酸分子。
【請求項１８】  単離されたポリペプチドであって、以下：
（ａ）配列番号２のアミノ酸約１〜約９５０；
（ｂ）配列番号２のアミノ酸約２〜約９５０；
（ｃ）配列番号２のアミノ酸約２９〜約９５０；
（ｄ）配列番号２のアミノ酸約３０〜約９５０；
（ｅ）ＡＴＣＣ受託番号２０９５８１に含まれるｃＤＮＡクローンによってコードされるアミノ酸配列を有するＭＥＴＨ１ポリペプチドのアミノ酸配列；
（ｆ）ＡＴＣＣ受託番号２０９５８１に含まれるｃＤＮＡクローンによってコードされるアミノ酸配列を有する成熟ＭＥＴＨ１ポリペプチドのアミノ酸配列；
からなる群から選択されるアミノ酸配列を有するポリペプチドと９５％同一性を有するポリペプチドからなり、
ここで
該同一性％は、以下のパラメーター：Ｍａｔｒｉｘ＝ＰＡＭ  ０、ｋ−ｔｕｐｌｅ＝２、ミスマッチペナルティー＝１、連結ペナルティー＝２０、無作為化群長さ＝０、カットオフスコア＝１、ギャップペナルティー＝５、ギャップサイズペナルティー＝０．０５、ウインドウサイズ＝５００または対象アミノ酸配列長のいずれか短い方、でＦＡＳＴＤＢコンピュータープログラムを用いて算出される、単離されたポリペプチド。
【請求項１９】  単離されたポリペプチドであって、以下：
（ａ）配列番号４のアミノ酸約１〜約８９０；
（ｂ）配列番号４のアミノ酸約２〜約８９０；
（ｃ）配列番号４のアミノ酸約２４〜約８９０；
（ｄ）配列番号４のアミノ酸約１１２〜約８９０；
（ｅ）ＡＴＣＣ受託番号２０９５８２に含まれるｃＤＮＡクローンによってコードされるアミノ酸配列を有するＭＥＴＨ２ポリペプチドのアミノ酸配列；および
（ｆ）ＡＴＣＣ受託番号２０９５８２に含まれるｃＤＮＡクローンによってコードされるアミノ酸配列を有する成熟ＭＥＴＨ２ポリペプチドのアミノ酸配列；
からなる群から選択されるアミノ酸配列を有するポリペプチドと９５％同一性を有するポリペプチドを含み、
ここで
該同一性％は、以下のパラメーター：Ｍａｔｒｉｘ＝ＰＡＭ  ０、ｋ−ｔｕｐｌｅ＝２、ミスマッチペナルティー＝１、連結ペナルティー＝２０、無作為化群長さ＝０、カットオフスコア＝１、ギャップペナルティー＝５、ギャップサイズペナルティー＝０．０５、ウインドウサイズ＝５００または対象アミノ酸配列長のいずれか短い方、でＦＡＳＴＤＢコンピュータープログラムを用いて算出される、単離されたポリペプチド。
【請求項２０】  新脈管形成を阻害するための医薬における請求項９または１０に記載のポリペプチドの使用。
【請求項２１】  配列番号４のアミノ酸配列ｍ〜ｎを含むポリペプチドであって、ここでｍは１〜８９０の整数であり、かつｎは、１０〜８９０の整数である、ポリペプチド。