【手続補正書】
【提出日】平成17年9月1日(2005.9.1)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
サンプルを構成する少なくとも１つの分子種であって、それぞれ色素によって示される分子種の量を、ビデオ顕微鏡システムにおいて決定する方法であって、
広帯域カラー画像取込デバイスによってサンプルの画像を画像データとして取り込むステップと、
画像のピクセルにおける赤色、緑色、青色の各チャネル毎のサンプルの光学密度を、画像データから決定して、該ピクセルに対する対応する光学密度行列を形成するステップと、
光学密度行列に相対的吸収係数行列の逆行列を掛けて、該ピクセルに対しての終結行列を形成するステップであって、相対的吸収係数行列は、サンプルとは独立に、赤色、緑色、青色の各チャネル毎の各色素に対しての相対的吸収係数を含み、終結行列は、それぞれの色素によって示される各分子種の量を含むステップと
を含む定量ビデオ顕微鏡法。
【請求項２】
赤色、緑色、青色の各チャネル毎に光源が発した光の初期光度を決定するステップと、
サンプルとは独立に、光源により各色素に光を当てるステップと、
赤色、緑色、青色の各チャネル毎に各色素を透過した光の透光度を決定するステップと、
各色素の光学密度を決定するために、赤色、緑色、青色の各チャネル毎に光の初期光度の光の透光度に対する比の自然対数を決定するステップと、
相対的吸収係数行列を形成するために、最も高い光学密度を有するチャネルを基準として、各色素毎に、赤色、緑色、青色の各チャネル毎に光学密度をノーマライズするステップと
により、サンプルとは独立に、各色素の相対的吸収係数を決定するステップを更に含む請求項１に記載の定量ビデオ顕微鏡法。
【請求項３】
サンプルの光学密度を決定するステップが、
光源によりサンプルに光を当て、赤色、緑色、青色の各チャネル毎にサンプルを透過した光の透光度を決定するステップと、
光学密度行列を形成するために、赤色、緑色、青色の各チャネル毎に光の初期光度のサンプルを透過した光の透光度に対する比の自然対数を決定するステップと
を更に含む請求項２に記載の定量ビデオ顕微鏡法。
【請求項４】
前記サンプルの画像を取り込むステップが、サンプルの画像をＲＧＢカメラおよびＲＧＢ構成スキャナの少なくとも１つの赤色、緑色、青色の各チャネル毎の画像データとして取り込むステップを更に含む請求項１に記載の定量ビデオ顕微鏡法。
【請求項５】
ケーラー照明条件においてサンプルに光を当てるステップと、ビデオ顕微鏡システムにおける色収差を補正するステップとを更に含む請求項１に記載の定量ビデオ顕微鏡法。
【請求項６】
マーカ色素を含む第一の色素によって少なくとも１つの分子種を、対比染色試薬を含む第二の色素によって他の分子種を示すステップを更に含む請求項１に記載の定量ビデオ顕微鏡法。
【請求項７】
請求項１〜６のいずれかに記載の方法を実行可能な少なくとも１つの実行可能部を有するコンピュータソフトウェアプログラム製品。
【請求項８】
サンプルを構成する少なくとも１つの分子種であって、それぞれ色素によって示される分子種の量を決定するためビデオ顕微鏡システムであって、
サンプルの画像を画像データとして取り込むことが出来るように構成された広帯域カラー画像取込デバイスと；
カラー画像取込デバイスに動作可能に連動したコンピュータデバイスであって、
画像のピクセルにおける赤色、緑色、青色の各チャネル毎のサンプルの光学密度を、サンプルの画像データから決定して、該ピクセルに対する対応する光学密度行列を形成するように構成された処理部と、
光学密度行列に、相対的吸収係数行列の逆行列を掛けて、該ピクセルに対しての終結行列を形成するように構成された処理部であって、相対的吸収係数行列は、サンプルとは独立に、各色素に対しての赤色、緑色、青色の各チャネル毎の相対的吸収係数を含み、終結行列は、それぞれの色素によって示される各分子種の量を含む処理部と
を含むコンピュータデバイスと；
を含む定量ビデオ顕微鏡システム。
【請求項９】
画像取込デバイスが、スキャナおよび顕微鏡に動作可能に連動したカラーカメラの少なくとも１つを含む請求項８に記載の定量ビデオ顕微鏡システム。
【請求項１０】
画像取込デバイスに向けられ、赤色、緑色、青色の各チャネル毎に初期光度を有する光を放出するように構成された光源を更に含む請求項８に記載の定量ビデオ顕微鏡システム。
【請求項１１】
光源が、サンプルに光を当てるように構成されており、
光学密度を決定するための処理部が、
赤色、緑色、青色の各チャネル毎にサンプルを透過した光の透光度の測定を命令するように、および
光の初期光度の光の透光度に対する比の自然対数を計算して、赤色、緑色、青色の各チャネル毎にサンプルの光学密度を決定し、光学密度行列を形成するように
更に構成されている請求項１０に記載の定量ビデオ顕微鏡システム。
【請求項１２】
コンピュータデバイスが、各色素毎に相対的吸収係数行列を決定するための処理部であって、
サンプルとは独立に、光源に対して、各色素に光を当てることを命令するように、
赤色、緑色、青色の各チャネル毎に各色素を透過した光の透光度の測定を命令するように、
赤色、緑色、青色の各チャネル毎に、光の初期光度の光の透光度に対する比の自然対数を決定して、各色素毎に光学密度を決定するように、および
最も高い光学密度を有するチャネルを基準として、各色素毎に、赤色、緑色、青色の各チャネル毎に光学密度をノーマライズして、相対的吸収係数行列を形成するように
構成された処理部を更に含む請求項１０に記載の定量ビデオ顕微鏡システム。
【請求項１３】
コンピュータデバイスが、
複数の色素に対しての赤色、緑色、青色の各チャネル毎の相対的吸収係数を記憶するように構成された記憶媒体であって、サンプルに含まれる分子種を示す色素が、該複数の色素から選ばれる、記憶媒体と、
記憶媒体から各色素のそれぞれの相対的吸収係数を取り出して、前記複数の色素から選ばれたサンプルに含まれる分子種を示す色素に基づいて、対応する相対的吸収係数行列を形成するように構成された処理部と、
相対的吸収係数行列の逆行列を計算するように構成された処理部と
を更に含む請求項８に記載の定量ビデオ顕微鏡システム。
【請求項１４】
光源が、ケーラー照明条件を実現するように更に構成されており、画像取込デバイスが、色収差を補正するように更に構成されている請求項１０に記載の定量ビデオ顕微鏡システム。
【請求項１５】
サンプルを構成する少なくとも１つの分子種であって、それぞれ色素によって示される分子種の量を、サンプルの画像から、決定するためビデオ顕微鏡システムであって、
サンプルの拡大画像を形成するように構成された顕微鏡と；
赤色、緑色、青色のチャネルを有し、該拡大画像からデジタル画像を形成することが出来るように該顕微鏡に動作可能に連動したＲＧＢカメラと；
ＲＧＢカメラに動作可能に連動したコンピュータデバイスであって、
デジタル画像のピクセルにおける赤色、緑色、青色の各チャネル毎のサンプルの光学密度を決定して、該ピクセルに対する対応する光学密度行列を形成するように構成された処理部と、
光学密度行列に、相対的吸収係数行列の逆行列を掛けて、デジタル画像の該ピクセルに対しての終結行列を形成するように構成された処理部であって、相対的吸収係数行列は、サンプルとは独立に、各色素に対しての赤色、緑色、青色の各チャネル毎の相対的吸収係数を含み、終結行列は、それぞれの色素によって示される各分子種の量を含む処理部と
を含むコンピュータデバイスと；
を含む定量ビデオ顕微鏡システム。
【請求項１６】
ＲＧＢカメラに向けられ、赤色、緑色、青色の各チャネル毎に初期光度を有する光を放出するように構成された光源を更に含む請求項１５に記載の定量ビデオ顕微鏡システム。
【請求項１７】
光源が、サンプルに光を当てるように構成されており、光学密度を決定するための処理部が、
ＲＧＢカメラの赤色、緑色、青色の各チャネル毎にサンプルを透過した光の透光度を決定するように、および
光の初期光度の光の透光度に対する比の自然対数を決定して、赤色、緑色、青色の各チャネル毎にサンプルの光学密度を決定し、光学密度行列を形成するように
更に構成されている請求項１６に記載の定量ビデオ顕微鏡システム。
【請求項１８】
コンピュータデバイスが、
サンプルとは独立に、光源に対して、光源により各色素に光を当てることを命令するように、
ＲＧＢカメラの赤色、緑色、青色の各チャネル毎に各色素を透過した光の透光度の決定を命令するように、
各色素の光学密度を決定するために、赤色、緑色、青色の各チャネル毎に光の初期光度の光の透光度に対する比の自然対数を決定するように、および
最も高い光学密度を有するチャネルを基準として、各色素毎に、赤色、緑色、青色の各チャネル毎に光学密度をノーマライズして、赤色、緑色、青色の各チャネル毎にそれぞれの相対的吸収係数を決定し、相対的吸収係数行列を形成するように
構成された処理部を更に含む請求項１６に記載の定量ビデオ顕微鏡システム。
【請求項１９】
複数の色素に対しての赤色、緑色、青色の各チャネル毎の相対的吸収係数を記憶するように構成された記憶媒体であって、サンプルに含まれる分子種を示す色素が、該複数の色素から選ばれる、記憶媒体と、
記憶媒体から各色素のそれぞれの相対的吸収係数を取り出して、前記複数の色素から選ばれたサンプルに含まれる分子種を示す色素に基づいて、対応する相対的吸収係数行列を形成するように構成された処理部と、
相対的吸収係数行列の逆行列を計算するように構成された処理部と
を更に含む請求項１５に記載の定量ビデオ顕微鏡システム。
【請求項２０】
光源が、ケーラー照明条件を実現するように更に構成されており、顕微鏡、ＲＧＢカメラおよびコンピュータデバイスの中の少なくとも１つが、色収差を補正するように更に構成されている請求項１６に記載の定量ビデオ顕微鏡システム。
【請求項２１】
画像取込デバイスの画像取込用構成部品に動作可能に連動した拡大対物レンズによって検出可能な光を放出するための光源を含み、画像を作り出すように構成されたビデオ顕微鏡システムにおいて色収差を補正するための方法であって、
画像取込用構成部品の中心座標を基準にして拡大対物レンズの中心座標を決定するステップと、
光源によって放出された光から選ばれた複数の光波長について、該複数の波長から選ばれた平均波長の倍率を基準にして該複数の波長の各々の倍率を決定するステップと、
拡大対物レンズまたは画像取込用構成部品を調整することなしに、拡大対物レンズの中心座標が画像取込用構成部品の中心座標に対応し、各波長の倍率が中間波長の倍率に対応するように画像を調整するステップと、
を含むビデオ顕微鏡システムにおける色収差補正方法。
【請求項２２】
光源と拡大対物レンズとの間に、開口部から成る較正グリッドを有するスライドを更に配置するステップと、
前記複数の波長の各々に対して、ｘ軸とｙ軸とを有する直交座標系に関して前記グリッドの画像を形成するステップと、
前記複数の波長の各々の画像から、前記グリッドの各開口部毎に直交座標系に関して中心座標を決定するステップと、
平均波長の画像を基準画像として指定するステップと、
基準画像を基に各画像についてグリッドの各開口部毎に、直交座標系に関してそれぞれの画像における開口部の中心座標と基準画像における対応する開口部の中心座標との間の差分を、ｘ軸に沿った微分成分とｙ軸に沿った微分成分として表して決定するステップと、
ｘの関数としてｘ軸に沿った微分とｙの関数としてｙ軸に沿った微分のそれぞれについて、再現誤差を最小化する線形方程式を決定するステップと、
線形方程式を、ｘの関数としてｘ軸に沿った微分とｙの関数としてｙ軸に沿った微分のそれぞれについて、ｘ軸に沿った微分とｙ軸に沿った微分をそれぞれの線形方程式の中でゼロに設定した上で解くことにより、拡大対物レンズの中心座標を決定するステップと、
拡大対物レンズの中心までの距離の関数としてｘ軸に沿った微分とｙ軸に沿った微分の二乗和の平方根から成る再現誤差を最小化するための線形方程式を決定するステップと
を更に含む請求項２１に記載の方法。
【請求項２３】
基準画像の倍率を基準にして、複数の波長のそれぞれについて画像の倍率を供するために、拡大対物レンズの中心までの距離の関数として線形方程式の傾きを決定するステップを更に含む請求項２２に記載の方法。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００１５
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００１５】
第２の技術によれば、カラーＣＣＤデジタルカメラが使用されるが、この場合、サンプルの３つのグレー階調画像が同時に取り込まれてデジタル化される。各グレー階調画像はカラーＣＣＤカメラの赤色、緑色、青色（ＲＧＢ）にそれぞれ対応する。次に画像は、ＲＧＢ立方体の特定の領域に位置するピクセルに解析を制限することによって、ＲＧＢ色空間において直接解析されるが、この特定の領域は対応するトレーニングデータベースからのピクセルも含む。代わりに、画像は、ＲＧＢ色空間の数学的変換が実行された後、例えばＨＬＳ（Hue, Luminance or Saturation）空間等のＣＩＥ（International Commission on Illumination）によって定められた多くの色空間の１つにおいて解析される。代わりに、一部のカメラ製造業者は、特定のターゲッティング波長用の狭帯域フィルタが通常のＲＧＢフィルタと置き換わった特殊ＣＣＤカメラを製造する。こうした場合において、このカメラでは或るシーンの３つのスペクトル成分の高速画像取込を同時に並行して行うことができる。しかしながら、このように修正されたカメラは特定のスペクトル解析パラメータに制約されることがある。というのは、フィルタは交換することができず、それ故にサンプルに使用される染色の独特な組み合わせに対処することができるようになっていないからである。従って、この第２の技術は一般的には、興味のある（分子）種とサンプルの他の部分との間のコントラストの検出、あるいは狭帯域上でのサンプルの解析に基づくものである。
米国特許第6,007,996号明細書(McNamara et al.)に記載のような分光計は、分析に必要な画像データを集めるために、特定の組み合わせの色素と干渉計とを用いる場合がる。当該明細書('996)には、特定の組み合わせの色素を供するように、特定の方法に応じて選択された蛍光色素を必要とするイメージング技術が記載されている。狭帯域幅（所定の波長範囲、またはスペクトル強度の線形的な組み合わせの所定のセット）を検査するように構成されている干渉計は、標本を分析する必要があり、スペクトルデータ採取装置および色素の選択は、染色剤の各々に関連したスペクトル成分を採取できるものでなければならない。したがって、当該干渉計には、各フレームが干渉計デバイスの狭帯域幅スペクトル分解能をカバーするように、検査する波長範囲における一連の測定インクリメントにおいて、サンプルの複数のフレームが取得されることが必要である。このように、各サンプルについて複数のフレームが当該波長範囲にわたって集められなければならず、変換されたＲＧＢイメージを得るために、ＣＣＤアレイのスペクトル（波長）範囲において、光学シグナルを含む複数のフレームを積分することによって、画像は各色素に応じて分割される。
国際公開第98/55026号パンフレット(Youvan et al.)には、エピ蛍光顕微鏡内にてドナー分子とアクセプター分子との間で生ずる蛍光共鳴エネルギー移動（ＦＲＥＴ）の量を可視化し、定量化するための画像化ハードウェア、ソフトウエア、検量器および方法、ならびに画像を擬似着色に着色し、ドナー（青）、アクセプター（緑）およびＦＲＥＴ（赤）からの放射測定的に修正された蛍光放射を表す画素を表示するアルゴリズムの使用であって、直交正規化変換（フォースター等式）を用いて、ドナー、アクセプターおよびＦＲＥＴシグナルを固有の赤、緑および青チャネルに変換するものが記載されている。
比色分析を行う際に、例えば、色等の収差を補正するために、イメージングシステムの特性に対処しなければならない。この点に関して、多くの解決策は、例えばコストにおいて有利でなく、問題を完全には解決することができないかもしれないハードウェアによるものに向けられている。例えば、米国特許第5,717,518号明細書(Shafer et al.)にあっては、１つまたは複数のレンズ要素および１つまたは複数の反射（鏡）要素の組み合わせを従事用いるカタディオプトリックイメージング光学により、色収差を補正する。カタディオプトリックイメージングを用いる光学システムは、最終画像における画像歪と色収差の高度な補正能力を備え、中間画像に光の焦点が合うように選択された曲率と位置を有する。屈折性表面を有する単一の材料の複数のレンズ要素を有するフォーカスレンズ群を有する。対物レンズ群は、色収差を補正するために、中間画像の近傍に配置される。カタディオプトリック群は、最終画像の近傍に、凹型の球状反射部と、平面またはほぼ平面の反射部（反射性にコートされたレンズ要素）とを有し、両反射要素は、中央の光学的開口部を有する。カタディオプトリック群は、中間画像から最終画像へと光の焦点を合わせる。実際には、カタディオプトリックイメージングシステムは、画像データアウトプットを得るために、リレーレンズまたはレンズシステムを介して、ビデオまたはＣＣＤアレーカメラの開口部へと導入された、拡大イメージをサンプルから集められた光から形成する顕微鏡対物レンズと統合されることができる。
同様に、米国特許第5,734,498号明細書(Krasieva et al.)は、光学顕微鏡のコンデンサーの莫大なセットを完全に置き換える、安定なマトリクス中に発色団および／または発光体を有する従来の光学顕微鏡のための照明要素を開示し、ケーラー照明に充分に匹敵する照明を提供する。黒白写真におけるコントラストを調整するために、カラーコントラストフィルターを用いることができ、最も一般的に用いられるカラーコントラストフィルターは緑である。これは、対物収差は、緑色の波長の近傍で最も効率的に補われ、また、緑色のフィルターにより、色収差による画像の明瞭さの欠失が回避される、または少なくとも改善されるためである。
さらに、米国特許第5,016,173号明細書(Kenet et al.)は、インビボで視覚的に到達可能な体の表面をモニターする装置および方法を開示し、システム検証の方法およびコンピュータビジョンを総合的に取り扱い、表面または表面化の、解剖学的、生理学的または病理学的構造体または工程の特徴を、定量化および／または分類する。解剖学的表面は光（可視光、赤外光および／または紫外光、構造光または均一光）により刺激され、後に、目的の表面からの反射光または放射光のデジタルイメージ（多重分解能、多重視野および／または多重スペクトル）の定量的分析が行われる。
【手続補正３】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００１７
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００１７】
上記課題及び他の課題は、一の実施の形態において、標本を含む少なくとも１つの分子種であって、それぞれ色素によって示される分子種の量を決定する方法を提供する本発明によって解決される。分子種の量は広帯域カラー画像取込デバイス（broadband color image acquisition device）によって画像データとして取り込まれた標本の画像から決定される。最初に、標本の光学密度（optical density）が、画像の特定のピクセルにおける赤色、緑色、青色の各チャネル毎に決定される。その後、当該ピクセルに対しての対応する光学密度行列が形成される。次に、この光学密度行列には相対的吸収係数行列（relative absorption coefficient matrix）の逆行列が掛けられ、当該ピクセルに対しての終結行列（resultant matrix）が形成される。相対的吸収係数行列は、標本とは独立に、赤色、緑色、青色の各チャネル毎の各色素の相対的吸収係数を含む。こうして終結行列は、当該ピクセルに対して、それぞれの色素によって示される各分子種の量を含む。
【手続補正４】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００１８
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００１８】
各分子種の量はサンプルのカラー画像から決定される。本発明の一の実施の形態において、ＲＧＢカメラおよび関連するフレームグラバ（frame grabber）またはカラースキャナ等の広帯域カラー画像取込デバイスが、サンプルの画像を取り込むために使用される。次に画像は、エンプティフィールド（白）リファレンスとブラック（黒）フィールド画像に基づいてバランスをとり、ノーマライズされ、場合によってはシェーディングが補正される。画像はまたチャネル毎に色収差が補正される。続いて、サンプルの光学密度が、画像の特定のピクセルにおける赤色、緑色、青色の各チャネル毎に、測定された透過光(transmitted light)から決定される。その後、当該ピクセルに対しての対応する光学密度行列が形成され、次いでサンプルに存在する色素の相対的吸収係数行列の逆行列が掛けられ、各色素からの光学密度への寄与を表す当該ピクセルに対しての終結行列が形成される。相対的吸収係数行列は、赤色、緑色、青色の各チャネル毎に、サンプル調製手順で使用される各々の色素の相対的吸収係数を含むので、終結行列は、当該ピクセルに対してそれぞれの色素によって示される各分子種の量（濃度に比例して表される）を含む。
【手続補正５】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００２４
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００２４】
以下、添付図面を参照して、本発明の実施の好ましい態様を詳細に説明する。しかしながら、本発明は多くの異なった形式で実施されてよく、ここに述べられる態様に限定されるものと解してはならない。むしろこれらの態様は本開示が周到かつ完全なものとなり、かつ当業者に対して本発明の範囲を十分に明示するものとなるように提供される。図面においては全体を通じて同一または類似の符号が同一または類似の要素に付される。
この点において、本発明の実施の形態によると、サンプルを構成する少なくとも１つの分子種であって、それぞれ色素によって示される分子種の量を決定する方法が提供される。第一に、サンプルの画像が、広帯域カラー画像取込デバイスにより、画像データとして取り込まれる。サンプルの光学密度を、画像の特定のピクセルにおいて赤色、緑色、青色の各チャネル毎に決定する。その後、当該ピクセルに対して、対応する光学密度行列が形成される。光学密度行列に相対的吸収係数行列を掛けて、当該ピクセルに対しての終結行列を形成する。相対的吸収係数行列は、サンプルとは独立に、赤色、緑色、青色の各チャネル毎に、各色素に対しての相対的吸収係数を有する。終結行列は、当該ピクセルにおける、それぞれの色素によって示される各分子種の量を有する。
さらに、本発明の他の有利な側面によると、サンプルを構成する少なくとも１つの分子種であって、それぞれ色素によって示される分子種の量を、サンプルの画像から決定するためビデオ顕微鏡システムが提供される。当該システムは、サンプルの画像を画像データとして取り込むことが出来るように構成された広帯域カラー画像取込デバイスと、当該画像取込デバイスに動作可能に連動したコンピュータデバイスとを有する。当該コンピュータデバイスは、当該画像のピクセルにおける赤色、緑色、青色の各チャネル毎のサンプルの光学密度を、サンプルの画像データから決定して、該ピクセルに対して、対応する光学密度行列を形成するように構成された処理部を有する。コンピュータデバイスの他の処理部は、光学密度行列に、相対的吸収係数行列の逆行列を掛けて、当該画像の当該ピクセルに対しての終結行列を形成するように構成されている。相対的吸収係数行列は、サンプルとは独立に、各色素に対しての赤色、緑色、青色の各チャネル毎の相対的吸収係数を有する。終結行列は、当該ピクセルにおける、それぞれの色素によって示される各分子種の量を含む。
さらに、本発明の他の有利な側面によると、画像取込デバイスの画像取込用構成部品に動作可能に連動した拡大対物レンズによって検出可能な光を放出するための光源を含み、画像を作り出すように構成されたビデオ顕微鏡システムにおいて色収差を補正するための方法が提供される。第一に、拡大対物レンズの中心座標が、画像取込用構成部品の中心座標を基準にして決定される。光源によって放出された光から選ばれた複数の光波長について、当該複数の波長から選ばれた平均波長の倍率を基準にして、当該複数の波長の各々について、倍率が決定される。当該画像は、拡大対物レンズまたは画像取込用構成部品を調整することなしに、拡大対物レンズの中心座標が画像取込用構成部品の中心座標に対応し、各波長の倍率が中間波長の倍率に対応するように調整される。
【手続補正６】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００２５
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００２５】
画像解析によって生体サンプルを評価するためのプラットフォームは、汎用の画像アナライザからより高度に特化した専用の「病理学用ワークステーション（pathology workstation）」へとますますシフトしてきている。こうしたワークステーションは一般的に、病理学者に可能な最良の結果を決定するために必要な情報を提供するのに必要とされる多くのツールをしばしば組み合わせて、ルーチンワークを円滑にするように設計されている。図１に、本発明の実施の一態様に基づいて、こうしたワークステーションの一例を定量顕微鏡システム１００として示す。システム１００は一般的に、光源２００と拡大対物レンズ２５０を有する顕微鏡１５０と、カメラ３００と、コンピュータデバイス３５０と、カメラ３００とコンピュータデバイス３５０の間を結ぶデータ・リンク４００と、を具備する。顕微鏡１５０は、例えば独国のツァイス（ZEISS）社が製造する顕微鏡Axioplan（もしくはAxiovert）、あるいは明視野方式光源を有する類似の顕微鏡でよい。カメラ３００は顕微鏡１５０に動作可能に連動しており、一例として、例えばインディアナ州ミシガン市（Michigan City, IN）に所在するDageMTI社が製造するモデル番号DC-330EのDage-MTI社製ＲＧＢ・３ＣＣＤカメラまたは類似のＲＧＢカメラといった３ＣＤＤ・ＲＧＢカメラでよい。一般的に、こうしたカメラ３００は画像の取込を円滑に行うための関連するフレームグラバ（図示されていない）も含むが、便宜上ここではカメラ３００とフレームグラバの両方をまとめて「カメラ３００」と呼ぶことにする。場合によっては、カメラ３００は、例えば３ＣＣＤチップまたはそれに相当するものを有する線形フラットスキャナに置き換わることがある。例えば、ニコン（Nikon）社が製造するモデル番号Super CoolScan 4000 EDのスキャナが低解像度イメージングに使用されてよい。注意として、必要なシステム１００の異なる構成も考えられるが、本発明はここではカメラ３００および関連する顕微鏡１５０を使って話を進める。従って、当業者であれば、ここに詳述される本発明を具現化するためのこれらの異なる構成に付随する能力と方法論を理解して正しく評価するであろう。
【手続補正７】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００２６
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００２６】
カメラ３００は一般的には拡大対物レンズ２５０を通してサンプル５００の画像４５０を取り込むように構成され、この場合、画像４５０は対応する画像データを有するデジタル画像を更に包含することがある（ここではまとめて「画像４５０」と呼ぶことにする）。画像４５０は一般的には全体として取り込まれ、対応する画像データは視野（field of view）の赤色（Ｒ）チャネル５５０、緑色（Ｇ）チャネル６００、青色（Ｂ）チャネル６５０から構成される。データ伝送リンク４００は画像４５０をコンピュータデバイス３５０に伝送することが出来るように構成され、このときコンピュータデバイス３５０は更に、赤色チャネル５５０、緑色チャネル６００，青色チャネル６５０の各チャネルに関して画像４５０を解析することが出来るように構成される。