【手続補正書】
【提出日】平成18年5月18日(2006.5.18)
【手続補正１】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】特許請求の範囲
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】  NEK5キナーゼポリペプチドをコードする単離、濃縮または精製された核酸分子であって、以下のヌクレオチド配列を含む核酸分子：
（a）配列番号：4で示される全長アミノ酸配列を持つポリペプチドをコードするヌクレオチド配列；
（b）ヌクレオチド配列（a）の完全相補配列であるヌクレオチド配列；
（c）配列番号：4の1〜31位、32〜283位、もしくは284〜302位のアミノ酸残基由来の配列番号：4で示される全長アミノ酸配列を持つポリペプチドをコードするヌクレオチド配列；
（d）ヌクレオチド配列（c）の完全相補配列であるヌクレオチド配列；
（e）配列番号：4で示されるアミノ酸配列の少なくとも40個の連続したアミノ酸を持つポリペプチドをコードするヌクレオチド配列；または
（f）ヌクレオチド配列（e）の完全相補配列であるヌクレオチド配列。
【請求項２】  宿主細胞において転写を開始させるのに有効なベクターまたはプロモーターをさらに含む、請求項1記載の核酸分子。
【請求項３】  哺乳動物から単離、濃縮、または精製された、請求項1記載の核酸分子。
【請求項４】  哺乳動物がヒトである、請求項3記載の核酸分子。
【請求項５】  配列番号：4で示されるアミノ酸配列を持つNEK5キナーゼポリペプチドをコードする、請求項1記載の核酸分子を含む組換え細胞。
【請求項６】  単離、濃縮、または精製されたNEK5キナーゼポリペプチドであって、以下のアミノ酸配列を含むポリペプチド：
（a）配列番号：4で示される全長アミノ酸配列；
（b）配列番号：4の1〜31位、32〜283位、もしくは284〜302位のアミノ酸残基由来の配列番号：4で示される全長アミノ酸配列；または
（c）配列番号：4の少なくとも40個の連続したアミノ酸を含む、配列番号：4で示されるアミノ酸配列。
【請求項７】  哺乳動物から単離、精製、または濃縮された、請求項6記載のキナーゼポリペプチド。
【請求項８】  哺乳動物がヒトである、請求項7記載のキナーゼポリペプチド。
【請求項９】  配列番号：4で示されるNEK5キナーゼポリペプチドである、請求項8記載のキナーゼポリペプチド。
【請求項１０】  NEK5キナーゼポリペプチドの活性を調節する物質を同定する方法であって、以下の段階を含む方法：
（a）配列番号：4で示されるアミノ酸配列の少なくとも40個の連続したアミノ酸を持つNEK5キナーゼポリペプチドを、試験物質と接触させる段階；
（b）ポリペプチドの活性を測定する段階；及び
（c）物質が、前記ポリペプチドの活性を調節するかどうかを判定する段階。
【請求項１１】  細胞中におけるNEK5キナーゼポリペプチドの活性を調節する物質を同定する方法であって、以下の段階を含む方法：
（a）配列番号：4で示されるアミノ酸配列の少なくとも40個の連続したアミノ酸を持つNEK5キナーゼポリペプチドを、細胞中で発現させる段階；
（b）該細胞に試験物質を添加する段階；及び
（c）細胞表現型の変化または該ポリペプチドと天然の結合パートナーとの相互作用を測定する段階。
【請求項１２】  疾患または障害に対する診断ツールとして、試料中に含まれるキナーゼポリペプチドをコードする核酸を検出する方法であって、以下の段階を含む方法：
（a）該試料を、キナーゼポリペプチドの核酸標的領域にハイブリダイゼーションアッセイ条件下でハイブリダイズする核酸プローブと接触させる段階であって、該プローブが、配列番号：4で示されるアミノ酸配列の少なくとも40個の連続したアミノ酸を持つNEK5キナーゼポリペプチドをコードする核酸配列を含むプローブである段階；及び
（b）該疾患の指標として、プローブ：標的領域ハイブリッドの存在または量を検出する段階。
【請求項１３】  疾患が、癌、神経変性障害、及び免疫障害からなる群より選択される、請求項11記載の方法。
【請求項１４】  疾患が癌である、請求項12記載の方法。
【請求項１５】  NEK6キナーゼポリペプチドをコードする単離、濃縮または精製された核酸分子であって、以下のヌクレオチド配列を含む核酸分子：
（a）配列番号：6で示される全長アミノ酸配列を持つポリペプチドをコードするヌクレオチド配列；
（b）ヌクレオチド配列（a）の完全相補配列であるヌクレオチド配列；
（c）配列番号：6の1〜22位もしくは23〜302位のアミノ酸残基由来の配列番号：6で示される全長アミノ酸配列を持つポリペプチドをコードするヌクレオチド配列；
（d）ヌクレオチド配列（c）の完全相補配列であるヌクレオチド配列；
（e）配列番号：6で示されるアミノ酸配列の少なくとも40個の連続したアミノ酸を持つポリペプチドをコードするヌクレオチド配列；または
（f）ヌクレオチド配列（e）の完全相補配列であるヌクレオチド配列。
【請求項１６】  宿主細胞において転写を開始させるのに有効なベクターまたはプロモーターをさらに含む、請求項15記載の核酸分子。
【請求項１７】  哺乳動物から単離、濃縮、または精製された、請求項15記載の核酸分子。
【請求項１８】  哺乳動物がヒトである、請求項17記載の核酸分子。
【請求項１９】  配列番号：6で示されるアミノ酸配列を持つNEK6キナーゼポリペプチドをコードする、請求項17記載の核酸分子を含む組換え細胞。
【請求項２０】  単離、濃縮、もしくは精製されたNEK6キナーゼポリペプチドであって、以下のアミノ酸配列を含むポリペプチド：
（a）配列番号：6で示される全長アミノ酸配列；
（b）配列番号：6の1〜22位、もしくは23〜302位のアミノ酸残基由来の配列番号：6で示される全長アミノ酸配列；または
（c）配列番号：6の少なくとも40個の連続したアミノ酸を含む、配列番号：6で示されるアミノ酸配列。
【請求項２１】  哺乳動物から単離、精製、または濃縮された、請求項20記載のキナーゼポリペプチド。
【請求項２２】  哺乳動物がヒトである、請求項21記載のキナーゼポリペプチド。
【請求項２３】  配列番号：6で示されるNEK6キナーゼポリペプチドである、請求項22記載のキナーゼポリペプチド。
【請求項２４】  NEK6キナーゼポリペプチドの活性を調節する物質を同定する方法であって、以下の段階を含む方法：
（a）配列番号：6で示されるアミノ酸配列の少なくとも40個の連続したアミノ酸を持つNEK6キナーゼポリペプチドを、試験物質と接触させる段階；
（b）ポリペプチドの活性を測定する段階；及び
（c）物質が、前記ポリペプチドの活性を調節するかどうかを判定する段階。
【請求項２５】  細胞中におけるNEK6キナーゼポリペプチドの活性を調節する物質を同定する方法であって、以下の段階を含む方法：
（a）配列番号：6で示されるアミノ酸配列の少なくとも40個の連続したアミノ酸を持つNEK6キナーゼポリペプチドを、細胞中で発現させる段階；
（b）該細胞に試験物質を添加する段階；及び
（c）細胞表現型の変化または該ポリペプチドと天然の結合パートナーとの相互作用を測定する段階。
【請求項２６】  疾患または障害に対する診断ツールとして、試料中に含まれるキナーゼポリペプチドをコードする核酸を検出する方法であって、以下の段階を含む方法：
（a）該試料を、キナーゼポリペプチドの核酸標的領域にハイブリダイゼーションアッセイ条件下でハイブリダイズする核酸プローブと接触させる段階であって、該プローブが、配列番号：6で示されるアミノ酸配列の少なくとも40個の連続したアミノ酸を持つNEK6キナーゼポリペプチドをコードする核酸配列を含むプローブである段階；及び
（b）該疾患の指標として、プローブ：標的領域ハイブリッドの存在または量を検出する段階。
【請求項２７】  疾患が、癌、神経変性障害、及び免疫障害からなる群より選択される、請求項26記載の方法。
【請求項２８】  疾患が癌である、請求項27記載の方法。
【請求項２９】  NEK4aキナーゼポリペプチドをコードする単離、濃縮または精製された核酸分子であって、以下のヌクレオチド配列を含む核酸分子：
（a）配列番号：8で示される全長アミノ酸配列を持つポリペプチドをコードするヌクレオチド配列；または
（b）ヌクレオチド配列（a）の完全相補配列であるヌクレオチド配列。
【請求項３０】  宿主細胞において転写を開始させるのに有効なベクターまたはプロモーターをさらに含む、請求項29記載の核酸分子。
【請求項３１】  哺乳動物から単離、濃縮、または精製された、請求項29記載の核酸分子。
【請求項３２】  哺乳動物がヒトである、請求項31記載の核酸分子。
【請求項３３】  請求項29記載の核酸分子を含む組換え細胞。
【請求項３４】  単離、濃縮、もしくは精製されたNEK4aキナーゼポリペプチドであって、以下のアミノ酸配列を含むポリペプチド：
（a）配列番号：8で示される全長アミノ酸配列。
【請求項３５】  哺乳動物から単離、精製、または濃縮された、請求項34記載のキナーゼポリペプチド。
【請求項３６】  哺乳動物がヒトである、請求項35記載のキナーゼポリペプチド。
【請求項３７】  NEK4aキナーゼポリペプチドの活性を調節する物質を同定する方法であって、以下の段階を含む方法：
（a）配列番号：8で示される全長アミノ酸配列を持つNEK4aキナーゼポリペプチドを、試験物質と接触させる段階；
（b）ポリペプチドの活性を測定する段階；及び
（c）物質が、前記ポリペプチドの活性を調節するかどうかを判定する段階。
【請求項３８】  細胞中におけるNEK4aキナーゼポリペプチドの活性を調節する物質を同定する方法であって、以下の段階を含む方法：
（a）配列番号：8で示されるアミノ酸配列を持つNEK4aキナーゼポリペプチドを、細胞中で発現させる段階；
（b）該細胞に試験物質を添加する段階；及び
（c）細胞表現型の変化または該ポリペプチドと天然の結合パートナーとの相互作用を測定する段階。
【請求項３９】  BUB1キナーゼポリペプチドをコードする単離、濃縮または精製された核酸分子であって、以下のヌクレオチド配列を含む核酸分子：
（a）配列番号：2で示されるアミノ酸配列を持つポリペプチドをコードするヌクレオチド配列；
（b）ヌクレオチド配列（a）の相補配列であるヌクレオチド配列；
（c）ヌクレオチド分子（a）とストリンジェントな条件下でハイブリダイズし、かつ天然のキナーゼポリペプチドをコードするヌクレオチド配列；
（d）配列番号：2の1〜785位、786〜1028位、もしくは1029〜1085位のアミノ酸残基のセグメントのすべてではないが一個もしくはそれ以上欠如することを除き、配列番号：2のアミノ酸配列を持つキナーゼポリペプチドをコードするヌクレオチド配列；
（e）ヌクレオチド配列（d）の相補配列であるヌクレオチド配列；
（f）配列番号：2の1〜785位、786〜1028位、もしくは1029〜1085位のアミノ酸残基由来の配列番号：2で示されるアミノ酸配列を持つポリペプチドをコードするヌクレオチド配列；
（g）ヌクレオチド配列（f）の相補配列であるヌクレオチド配列；
（h）N末端ドメイン、C末端触媒ドメイン、触媒ドメイン、C末端ドメイン、及びC末端テールのすべてではないが一個もしくはそれ以上欠如することを除き、配列番号：2で示されるアミノ酸配列を持つポリペプチドをコードするヌクレオチド配列；または
（i）ヌクレオチド配列（h）の相補配列であるヌクレオチド配列。
【請求項４０】  宿主細胞において転写を開始させるのに有効なベクターまたはプロモーターをさらに含む、請求項39記載の核酸分子。
【請求項４１】  哺乳動物から単離、濃縮、または精製された、請求項39記載の核酸分子。
【請求項４２】  哺乳動物がヒトである、請求項43記載の核酸分子。
【請求項４３】  試料中に含まれるキナーゼポリペプチドをコードする核酸を検出するために用いられる請求項39記載の核酸分子であって、該キナーゼポリペプチドが、配列番号：2で示されるアミノ酸配列を持つBUB1キナーゼポリペプチドからなる群より選択される、核酸分子。
【請求項４４】  配列番号：2で示されるアミノ酸配列を持つBUB1キナーゼポリペプチドをコードする、請求項39記載の核酸分子を含む組換え細胞。
【請求項４５】  単離、濃縮、もしくは精製されたBUB1キナーゼポリペプチドであって、以下のアミノ酸配列を含むポリペプチド：
（a）配列番号：2で示されるアミノ酸配列；
（b）配列番号：2の1〜785位、786〜1028位、もしくは1029〜1085位のアミノ酸残基のセグメントのすべてではないが一個もしくはそれ以上欠如することを除き、配列番号：2で示されるアミノ酸配列；
（c）配列番号：2の1〜785位、786〜1028位、もしくは1029〜1085位のアミノ酸残基由来の配列番号：2で示されるアミノ酸配列；または
（d）N末端ドメイン、C末端触媒ドメイン、触媒ドメイン、C末端ドメイン、及びC末端テールからなる群より選択されるドメインのすべてではないが一個もしくはそれ以上欠如することを除き、配列番号：2で示されるアミノ酸配列。
【請求項４６】  哺乳動物から単離、精製、または濃縮された、請求項45記載のキナーゼポリペプチド。
【請求項４７】  哺乳動物がヒトである、請求項46記載のキナーゼポリペプチド。
【請求項４８】  配列番号：2で示されるBUB1キナーゼポリペプチドである、請求項45記載のキナーゼポリペプチド。
【請求項４９】  キナーゼポリペプチドに対する、または該ポリペプチドのドメインに対する特異的結合親和性を有する抗体または抗体断片であって、該ポリペプチドが、配列番号：2で示されるアミノ酸配列を持つBUB1キナーゼポリペプチドである、抗体または抗体断片。
【請求項５０】  配列番号：2で示されるアミノ酸配列を持つBUB1キナーゼポリペプチドに対する特異的結合親和性を有する抗体を産生するハイブリドーマ。
【請求項５１】  BUB1キナーゼポリペプチドの活性を調節する物質を同定する方法であって、以下の段階を含む方法：
（a）配列番号：2で示されるアミノ酸配列を持つBUB1キナーゼポリペプチドを、試験物質と接触させる段階；
（b）ポリペプチドの活性を測定する段階；及び
（c）物質が、前記ポリペプチドの活性を調節するかどうかを判定する段階。
【請求項５２】  細胞中におけるBUB1キナーゼポリペプチドの活性を調節する物質を同定する方法であって、以下の段階を含む方法：
（a）配列番号：2で示されるアミノ酸配列を持つBUB1キナーゼポリペプチドを、細胞中で発現させる段階；
（b）該細胞に試験物質を添加する段階；及び
（c）細胞表現型の変化または該ポリペプチドと天然の結合パートナーとの相互作用を測定する段階。
【請求項５３】  配列番号：2で示されるアミノ酸配列を持つBUB1キナーゼポリペプチドの活性を調節する物質を、治療を必要とする患者に投与する段階を含む、疾患または障害を治療する方法。
【請求項５４】  疾患が癌である、請求項53記載の方法。
【請求項５５】  癌が、白血病、子宮頚癌、リンパ腫、結腸癌、肺癌、黒色腫、卵巣癌、CNS癌、前立腺癌、腎臓癌、及び乳癌からなる群より選択される、請求項54記載の方法。
【請求項５６】  物質が、インビトロでキナーゼ活性を調節する、請求項53記載の方法。
【請求項５７】  疾患または障害に対する診断ツールとして、試料中に含まれる配列番号：2で示されるBUB1キナーゼポリペプチドをコードする核酸を検出する方法であって、以下の段階を含む方法：
（a）該試料を、ハイブリダイゼーションアッセイ条件下で配列番号：1で示されるアミノ酸配列を持つbub1の核酸標的領域にハイブリダイズする核酸プローブと接触させる段階であって、該プローブが、該ポリペプチド、その断片、または該配列及び断片の相補配列をコードする核酸配列を含むプローブである段階；ならびに
（b）該疾患の指標として、プローブ：標的領域ハイブリッドの存在または量を検出する段階。
【請求項５８】  疾患が癌である、請求項57記載の方法。
【請求項５９】  癌が、白血病、子宮頚癌、リンパ腫、結腸癌、肺癌、黒色腫、卵巣癌、CNS癌、前立腺癌、腎臓癌、及び乳癌からなる群より選択される、請求項58記載の方法。
【請求項６０】  疾患または障害に対する診断ツールとして、試料中に含まれるキナーゼポリペプチドをコードする核酸を検出する方法であって、以下の段階を含む方法：
（a）該試料を、キナーゼポリペプチドの核酸標的領域にハイブリダイゼーションアッセイ条件下でハイブリダイズする核酸プローブと接触させる段階であって、該プローブが、配列番号：2で示されるアミノ酸配列を持つBUB1キナーゼポリペプチド、その断片、ならびに該配列及び断片の相補配列をコードする核酸配列を含むプローブである段階；ならびに
（b）該疾患の指標として、プローブ：標的領域ハイブリッドの存在または量を検出する段階。
【請求項６１】  疾患が、癌、神経変性障害、及び免疫障害からなる群より選択される、請求項60記載の方法。
【請求項６２】  疾患が癌である、請求項61記載の方法。
【請求項６３】  アミノ酸配列GTGCCAAGCCAGCAGATAAATを持つBUB1キナーゼポリペプチドの発現を阻害する、アンチセンスオリゴヌクレオチド。
【請求項６４】  疾患の治療のための薬物の製造における、請求項63記載のアンチセンスオリゴヌクレオチドの使用。
【請求項６５】  疾患が、癌、神経変性障害、及び免疫障害からなる群より選択される、請求項64記載の使用。
【請求項６６】  癌が、白血病、子宮頚癌、リンパ腫、結腸癌、肺癌、黒色腫、卵巣癌、CNS癌、前立腺癌、腎臓癌、及び乳癌からなる群より選択される、請求項65記載の使用。
【請求項６７】  NEK4bキナーゼポリペプチドをコードする単離、濃縮または精製された核酸分子であって、以下のヌクレオチド配列を含む核酸分子：
（a）配列番号：10で示されるアミノ酸配列を持つポリペプチドをコードするヌクレオチド配列；
（b）ヌクレオチド配列（a）の相補配列であるヌクレオチド配列；
（c）ヌクレオチド分子（a）とストリンジェントな条件下でハイブリダイズし、かつ天然のキナーゼポリペプチドをコードするヌクレオチド配列；
（d）N末端ドメイン、C末端触媒ドメイン、触媒ドメイン、C末端ドメイン、及びC末端テールのすべてではないが一個もしくはそれ以上欠如することを除き、配列番号：10で示されるアミノ酸配列を持つポリペプチドをコードするヌクレオチド配列；または
（e）ヌクレオチド配列（d）の相補配列であるヌクレオチド配列。
【請求項６８】  宿主細胞において転写を開始させるのに有効なベクターまたはプロモーターをさらに含む、請求項67記載の核酸分子。
【請求項６９】  哺乳動物から単離、濃縮、または精製された、請求項67記載の核酸分子。
【請求項７０】  哺乳動物がヒトである、請求項69記載の核酸分子。
【請求項７１】  試料中に含まれるキナーゼポリペプチドをコードする核酸を検出するために用いられる請求項67記載の核酸分子であって、該キナーゼポリペプチドが、配列番号：10で示されるアミノ酸配列を持つNEK4bキナーゼポリペプチドからなる群より選択される、核酸分子。
【請求項７２】  配列番号：10で示されるアミノ酸配列を持つNEK4bキナーゼポリペプチドをコードする、請求項67記載の核酸分子を含む組換え細胞。
【請求項７３】  単離、濃縮、もしくは精製されたNEK4bキナーゼポリペプチドであって、以下のアミノ酸配列を含むポリペプチド：
（a）配列番号：10で示されるアミノ酸配列；または
（b）N末端ドメイン、C末端触媒ドメイン、触媒ドメイン、C末端ドメイン、及びC末端テールからなる群より選択されるドメインのすべてではないが一個もしくはそれ以上欠如することを除き、配列番号：10で示されるアミノ酸配列。
【請求項７４】  哺乳動物から単離、精製、または濃縮された、請求項73記載のキナーゼポリペプチド。
【請求項７５】  哺乳動物がヒトである、請求項74記載のキナーゼポリペプチド。
【請求項７６】  配列番号：10で示されるNEK4bキナーゼポリペプチドである、請求項73記載のキナーゼポリペプチド。
【請求項７７】  キナーゼポリペプチドに対する、または該ポリペプチドのドメインに対する特異的結合親和性を有する抗体または抗体断片であって、該ポリペプチドが、配列番号：10で示されるアミノ酸配列を持つNEK4bキナーゼポリペプチドである、抗体または抗体断片。
【請求項７８】  配列番号：10で示されるアミノ酸配列を持つNEK4bキナーゼポリペプチドに対する特異的結合親和性を有する抗体を産生するハイブリドーマ。
【請求項７９】  NEK4bキナーゼポリペプチドの活性を調節する物質を同定する方法であって、以下の段階を含む方法：
（a）配列番号：10で示されるアミノ酸配列を持つNEK4bキナーゼポリペプチドを、試験物質と接触させる段階；
（b）ポリペプチドの活性を測定する段階；及び
（c）物質が、前記ポリペプチドの活性を調節するかどうかを判定する段階。
【請求項８０】  細胞中におけるNEK4bキナーゼポリペプチドの活性を調節する物質を同定する方法であって、以下の段階を含む方法：
（a）配列番号：10で示されるアミノ酸配列を持つNEK4bキナーゼポリペプチドを、細胞中で発現させる段階；
（b）該細胞に試験物質を添加する段階；及び
（c）細胞表現型の変化または該ポリペプチドと天然の結合パートナーとの相互作用を測定する段階。
【請求項８１】  配列番号：10で示されるアミノ酸配列を持つNEK4bキナーゼポリペプチドの活性を調節する物質を、治療を必要とする患者に投与する段階を含む、疾患または障害を治療する方法。
【請求項８２】  疾患または障害が、癌、神経変性障害、及び免疫障害からなる群より選択される、請求項81記載の方法。
【請求項８３】  疾患または障害が癌である、請求項82記載の方法。
【請求項８４】  物質が、NEK4bキナーゼポリペプチドのインビトロ活性を調節する、請求項81記載の方法。
【請求項８５】  調節が阻害作用である、請求項84記載の方法。
【請求項８６】  物質がアンチセンスオリゴヌクレオチドである、請求項85記載の方法。
【請求項８７】  疾患または障害に対する診断ツールとして、試料中に含まれるキナーゼポリペプチドをコードする核酸を検出する方法であって、以下の段階を含む方法：
（a）該試料を、キナーゼポリペプチドの核酸標的領域にハイブリダイゼーションアッセイ条件下でハイブリダイズする核酸プローブと接触させる段階であって、該プローブが、配列番号：10で示されるアミノ酸配列を持つNEK4bキナーゼポリペプチド、その断片、ならびに該配列及び断片の相補配列をコードする核酸配列を含むプローブである段階；ならびに
（b）該疾患の指標として、プローブ：標的領域ハイブリッドの存在または量を検出する段階。
【請求項８８】  疾患が、癌、神経変性障害、及び免疫障害からなる群より選択される、請求項87記載の方法。
【請求項８９】  疾患が癌である、請求項88記載の方法。
【請求項９０】  配列番号：10で示されるアミノ酸配列を持つNEK4bキナーゼポリペプチドの発現を阻害する、アンチセンスオリゴヌクレオチド。
【請求項９１】  オリゴヌクレオチドが、配列番号：10で示されるアミノ酸配列によってコードされるタンパク質の断片をコードする配列の相補配列である、請求項90記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド。