【手続補正書】
【提出日】平成18年5月12日(2006.5.12)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
以下のアミノ酸配列からなる群より選択されるアミノ酸配列を含む単離されたタンパク質:
a) 配列番号:3、配列番号:5、配列番号:7、配列番号:9、配列番号:3の30〜1268位からなるアミノ酸配列、およびその生物学的に活性な断片からなる群より選択されるアミノ酸配列;
b) 配列番号:3とまたは配列番号:3の30〜1268位からなるアミノ酸配列と少なくとも約40%同一のアミノ酸配列であって、該アミノ酸配列が以下の生物活性:フィトエンデヒドロゲナーゼ(PD)活性、フィトエンシンターゼ(PS)活性、およびリコペンシクラーゼ(LC)活性、を有するアミノ酸配列;
c) 配列番号:5と少なくとも約40%同一のアミノ酸配列であって、該アミノ酸配列がフィトエンデヒドロゲナーゼ(PD)活性を有するアミノ酸配列;
d) 配列番号:7と少なくとも約40%同一のアミノ酸配列であって、該アミノ酸配列がフィトエンシンターゼ(PS)活性を有するアミノ酸配列;
e) 配列番号:9と少なくとも約40%同一のアミノ酸配列であって、該アミノ酸配列がリコペンシクラーゼ(LC)活性を有するアミノ酸配列。
【請求項２】
配列番号:3、配列番号:5、配列番号:7、配列番号:9、配列番号:3の30〜1268位からなるアミノ酸配列、およびその生物学的に活性な断片からなる群より選択されるアミノ酸配列を含む、請求項1記載の単離されたタンパク質。
【請求項３】
以下のアミノ酸配列からなる群より選択されるアミノ酸配列を含む、請求項1記載の単離されたタンパク質:
a) 配列番号:3とまたは配列番号:3の30〜1268位からなるアミノ酸配列と少なくとも約80%同一のアミノ酸配列であって、該アミノ酸配列が以下の生物活性:フィトエンデヒドロゲナーゼ(PD)活性、フィトエンシンターゼ(PS)活性、およびリコペンシクラーゼ(LC)活性、を有するアミノ酸配列;
b) 配列番号:5と少なくとも約80%同一のアミノ酸配列であって、該アミノ酸配列がフィトエンデヒドロゲナーゼ(PD)活性を有するアミノ酸配列;
c) 配列番号:7と少なくとも約80%同一のアミノ酸配列であって、該アミノ酸配列がフィトエンシンターゼ(PS)活性を有するアミノ酸配列;ならびに
d) 配列番号:9と少なくとも約80%同一のアミノ酸配列であって、該アミノ酸配列がリコペンシクラーゼ(LC)活性を有するアミノ酸配列。
【請求項４】
ヤブレツボカビ目の微生物に由来する、請求項1記載の単離されたタンパク質。
【請求項５】
前記の単離されたタンパク質はシゾキトリウム属の微生物に由来する、請求項1記載の単離されたタンパク質。
【請求項６】
以下のアミノ酸配列からなる群より選択されるアミノ酸配列を含む、単離されたタンパク質:
a) 配列番号:5および配列番号:7を含むアミノ酸配列;ならびに
b) (a)のアミノ酸配列と少なくとも約40%同一のアミノ酸配列であって、該アミノ酸配列が以下の生物活性:フィトエンデヒドロゲナーゼ(PD)活性およびフィトエンシンターゼ(PS)活性、を有するアミノ酸配列。
【請求項７】
配列番号:3、配列番号:5、配列番号:7、および配列番号:9からなる群より選択されるアミノ酸配列に選択的に結合する、単離された抗体。
【請求項８】
請求項1〜6のいずれか一項記載の単離されたタンパク質をコードする核酸配列を含む、単離核酸分子。
【請求項９】
転写制御配列に機能的に連結された請求項8記載の単離核酸分子を含む組換え核酸分子。
【請求項１０】
転写制御配列が組織特異的転写制御配列である、請求項9記載の組換え核酸分子。
【請求項１１】
標的化配列をさらに含む、請求項9記載の組換え核酸分子。
【請求項１２】
請求項9記載の組換え核酸分子で形質転換された組換え細胞。
【請求項１３】
生合成過程によりカロチノイドを産生させるための遺伝子改変微生物であって、該微生物が請求項9記載の組換え核酸分子で形質転換された、遺伝子改変微生物。
【請求項１４】
生合成過程によりカロチノイドを産生させるための遺伝子改変微生物であって、該微生物がカロチンシンターゼをコードする核酸分子を含み、かつカロチンシンターゼをコードする該核酸分子が該カロチンシンターゼの発現または生物活性を増加させるために改変されている遺伝子改変微生物であり、該カロチンシンターゼが請求項1記載のタンパク質を含む遺伝子改変微生物。
【請求項１５】
カロチンシンターゼをコードする核酸分子が微生物の内在性遺伝子および該カロチンシンターゼをコードする核酸分子からなる群より選択され、これにより微生物が形質転換されている、請求項14記載の遺伝子改変微生物。
【請求項１６】
カロチンシンターゼをコードする内在性遺伝子を含みかつ該カロチンシンターゼをコードする組換え核酸分子で形質転換され、該遺伝子および該組換え核酸分子のうちの一方または両方が該カロチンシンターゼの発現または生物活性を増加させるために改変された、請求項15記載の遺伝子改変微生物。
【請求項１７】
ヤブレツボカビ目の微生物である、請求項14〜16のいずれか一項記載の遺伝子改変微生物。
【請求項１８】
シゾキトリウム属の微生物である、請求項17記載の遺伝子改変微生物。
【請求項１９】
請求項14〜16のいずれか一項記載の遺伝子改変微生物を含むバイオマス。
【請求項２０】
食品および医薬品からなる群より選択される、請求項19記載のバイオマスを含む製品。
【請求項２１】
生合成過程によりカロチノイドを産生させるための遺伝子改変植物であって、該植物が請求項9記載の組換え核酸分子で形質転換された、遺伝子改変植物。
【請求項２２】
生合成過程によりカロチノイドを産生するための方法であって、請求項14〜16のいずれか一項記載の遺伝子改変微生物を発酵培地中で培養する段階を含む方法。
【請求項２３】
微生物がヤブレツボカビ目の微生物である、請求項22記載の方法。
【請求項２４】
微生物がシゾキトリウム属の微生物である、請求項23記載の方法。
【請求項２５】
生合成過程によりカロチノイドを産生するための方法であって、請求項21記載の遺伝子改変植物を増殖させる段階を含む方法。
【請求項２６】
配列番号:1、配列番号:2、配列番号:4、配列番号:6、配列番号:8、およびそれに完全に相補的な核酸配列からなる群より選択される核酸配列の少なくとも12個の連続ヌクレオチドを含む、オリゴヌクレオチド。
【請求項２７】
色素沈着がない遺伝子改変微生物であって、該微生物がカロチンシンターゼ遺伝子または機能ドメインをコードするその一部分を選択的に欠失させるかまたは不活化させるために遺伝子改変されており、該カロチンシンターゼ遺伝子が請求項9記載の核酸分子を含む遺伝子改変微生物。
【請求項２８】
カロチンシンターゼ遺伝子が配列番号:3により示される核酸配列を含む、請求項27記載の遺伝子改変微生物。
【請求項２９】
ヤブレツボカビ目の微生物である、請求項27記載の遺伝子改変微生物。
【請求項３０】
シゾキトリウム属の微生物である、請求項27記載の遺伝子改変微生物。
【請求項３１】
カロチンシンターゼ遺伝子が、その遺伝子の発現を阻害するために調節領域で改変されている、請求項27記載の遺伝子改変微生物。
【請求項３２】
カロチンシンターゼ遺伝子が、微生物が機能的なカロチンシンターゼを産生しないように部分的にまたは完全に欠失されている、請求項27記載の遺伝子改変微生物。
【請求項３３】
カロチンシンターゼ遺伝子が、該カロチンシンターゼ遺伝子にハイブリダイズして該カロチンシンターゼ遺伝子のコード領域を破壊する異種核酸配列を含む核酸配列を用いた標的相同組換えにより突然変異しているかまたは不活化している、請求項27記載の遺伝子改変微生物。
【請求項３４】
同一種の野生型微生物と比べて色素沈着が減少している遺伝子改変微生物を含むバイオマスであって、該微生物が請求項27記載の微生物であるバイオマス。
【請求項３５】
請求項34記載のバイオマスを含む食品。
【請求項３６】
生合成過程から色素沈着がない脂質を産生するための方法であって、該脂質を産生させるのに効果的な条件の下で遺伝子改変微生物を培養する段階を含む方法であり、該微生物が請求項27記載の微生物である方法。
【請求項３７】
遺伝子改変微生物の培養物から脂質を回収する段階をさらに含む、請求項36記載の方法。
【請求項３８】
遺伝子改変微生物の培養物から回収される色素沈着がない脂質であって、該微生物が請求項27記載の微生物である脂質。
【請求項３９】
食品および医薬品からなる群より選択される、請求項38記載の脂質を含む製品。
【請求項４０】
カロチノイドを産生させるのに十分な条件の下で基質を単離されたカロチンシンターゼと接触させる段階を含む、カロチノイドを産生するための方法であって、該単離されたカロチンシンターゼが請求項1〜6のいずれか一項記載のタンパク質を含む方法。