【手続補正書】
【提出日】平成17年8月24日(2005.8.24)
【手続補正１】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】特許請求の範囲
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】  単離された核酸分子であって、以下：
（ａ）配列番号２のアミノ酸残基−２６〜２３７をコードするヌクレオチド配列；
（ｂ）配列番号２のアミノ酸残基−２５〜２３７をコードするヌクレオチド配列；
（ｃ）配列番号２のアミノ酸残基１〜２３７をコードするヌクレオチド配列；
（ｄ）ＡＴＣＣ受託番号２０９１９９に含まれるｃＤＮＡクローンによりコードされる完全なアミノ酸配列を有するフォリスタチン−３ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列；
（ｅ）ＡＴＣＣ受託番号２０９１９９に含まれるｃＤＮＡクローンによりコードされるＮ末端メチオニンを除く完全なアミノ酸配列を有するフォリスタチン−３ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列；
（ｆ）ＡＴＣＣ受託番号２０９１９９に含まれるｃＤＮＡクローンによりコードされるアミノ酸配列を有する成熟フォリスタチン−３ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列；および
（ｇ）上記の（ａ）、（ｂ）、（ｃ）、（ｄ）、（ｅ）、または（ｆ）におけるヌクレオチド配列のいずれかに相補的なヌクレオチド配列、
からなる群より選択される配列と少なくとも９５％同一のヌクレオチド配列を有するポリヌクレオチドを含む、単離された核酸分子。
【請求項２】  前記ヌクレオチド配列が、配列番号１である、請求項１に記載の核酸分子。
【請求項３】  前記ヌクレオチド配列が、配列番号１の残基１９〜８０７である、請求項１に記載の核酸分子。
【請求項４】  前記ヌクレオチド配列が、配列番号１の残基２２〜８０７である、請求項１に記載の核酸分子。
【請求項５】  前記ヌクレオチド配列が、配列番号１の残基９７〜８０７である、請求項１に記載の核酸分子。
【請求項６】  単離された核酸分子であって、以下：
（ａ）配列番号２の残基ｎ〜２３７のアミノ酸配列を含有するポリペプチドをコードするヌクレオチド配列であって、ここでｎは、−２６〜１２の範囲の整数である、ヌクレオチド配列；
（ｂ）配列番号２の残基−２６〜ｍのアミノ酸配列を含有するポリペプチドをコードするヌクレオチド配列であって、ここでｍは、２０７〜２３７の範囲の整数である、ヌクレオチド配列；
（ｃ）配列番号２の残基ｎ〜ｍからなるアミノ酸配列を有するポリペプチドをコードするヌクレオチド配列であって、ここでｎおよびｍは、上記（ａ）および（ｂ）にそれぞれ規定される整数である、ヌクレオチド配列；
（ｄ）ＡＴＣＣ受託番号２０９１９９に含まれるｃＤＮＡクローンによりコードされる完全なフォリスタチン−３アミノ酸配列の部分からなるポリペプチドをコードするヌクレオチド配列であって、ここで該部分は１〜約３７アミノ酸をＡＴＣＣ受託番号２０９１９９に含まれるｃＤＮＡクローンによりコードされる該完全なアミノ酸配列のアミノ末端から除く、ヌクレオチド配列；
（ｅ）ＡＴＣＣ受託番号２０９１９９に含まれるｃＤＮＡクローンによりコードされる完全なフォリスタチン−３アミノ酸配列の部分からなるポリペプチドをコードするヌクレオチド配列であって、ここで該部分は１〜約２０アミノ酸をＡＴＣＣ受託番号２０９１９９に含まれるｃＤＮＡクローンによりコードされる該完全なアミノ酸配列のカルボキシ末端から除く、ヌクレオチド配列；ならびに
（ｆ）ＡＴＣＣ受託番号２０９１９９に含まれるｃＤＮＡクローンによりコードされる完全なフォリスタチン−３アミノ酸配列の部分からなるポリペプチドをコードするヌクレオチド配列であって、ここで該部分は上記（ｄ）および（ｅ）における任意のアミノ末端欠失およびカルボキシ末端欠失の組合せを含む、ヌクレオチド配列、
からなる群より選択される配列と少なくとも９５％同一のヌクレオチド配列を有するポリヌクレオチドを含む、単離された核酸分子。
【請求項７】  請求項１に記載の核酸分子であって、ここで前記ポリヌクレオチドがＡＴＣＣ受託番号２０９１９９に含まれるｃＤＮＡクローンの完全なヌクレオチド配列を有する、核酸分子。
【請求項８】  請求項１に記載の核酸分子であって、ここで前記ポリヌクレオチドがＡＴＣＣ受託番号２０９１９９に含まれるｃＤＮＡクローンによりコードされるＮ末端メチオニンを除いて完全なアミノ酸配列を有するフォリスタチン−３ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有する、核酸分子。
【請求項９】  請求項１に記載の核酸分子であって、ここで前記ポリヌクレオチドがＡＴＣＣ受託番号２０９１９９に含まれるｃＤＮＡクローンによりコードされるアミノ酸配列を有する成熟フォリスタチン−３ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有する、核酸分子。
【請求項１０】  ストリンジェントなハイブリダイゼーション条件下で、請求項１に記載の（ａ）、（ｂ）、（ｃ）、（ｄ）、（ｅ）、（ｆ）、または（ｇ）のヌクレオチド配列と同一のヌクレオチド配列を有するポリヌクレオチドにハイブリズするポリヌクレオチドを含む単離された核酸分子であって、ここでハイブリダイズする該ポリヌクレオチドはストリンジェントなハイブリダイゼーション条件下で、Ａ残基のみまたはＴ残基のみからなるヌクレオチド配列を有するポリヌクレオチドにハイブイダイズしない、核酸分子。
【請求項１１】  請求項１に記載の（ａ）、（ｂ）、（ｃ）、（ｄ）、（ｅ）、または（ｆ）のアミノ酸配列を有するフォリスタチン−３ポリペプチドのエピトープ保有部分のアミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む、単離された核酸分子。
【請求項１２】  フォリスタチン−３ポリペプチドのエピトープ保有部分をコードする、請求項１１に記載の単離された核酸分子であって、ここで該部分のアミノ酸配列は、以下：Ｌｅｕ−１４〜Ａｌａ−２０、Ｓｅｒ−４６〜Ｉｌｅ−５５、Ｇｌｙ−８８〜Ｐｒｏ−９７、Ｇｌｙ−１１３〜Ｌｅｕ−１３３、Ａｒｇ−１３８〜Ｇｌｕ−１４６、Ｐｒｏ−１７７〜Ｔｈｒ−１９１、およびＧｌｙ−２１９〜約Ｖａｌ−２３７、からなる配列番号２の配列の群から選択される、核酸分子。
【請求項１３】  請求項１に記載のポリヌクレオチドを含む、組換えベクター。
【請求項１４】  遺伝子発現を制御する調節配列と作動可能に結合した請求項１または６のいずれかに記載のポリヌクレオチドを含む、組換えベクター。
【請求項１５】  請求項１または６のいずれかに記載のポリヌクレオチドを含む、遺伝子操作された宿主細胞。
【請求項１６】  遺伝子発現を制御する調節配列と作動可能に結合した請求項１または６のいずれかのポリヌクレオチドを含む、遺伝的に操作された宿主細胞。
【請求項１７】  フォリスタチン−３ポリペプチドを産生する方法であって、以下：
（ａ）該ポリペプチドを産生するために適切な条件下で請求項１６に記載の遺伝子操作された宿主細胞を培養する工程；および
（ｂ）該ポリペプチドを回収する工程、
を包含する、方法。
【請求項１８】  請求項１７に記載の方法によって得られるフォリスタチン−３ポリペプチド。
【請求項１９】  単離されたポリペプチドであって、以下：
（ａ）配列番号２のアミノ酸残基−２６〜２３７；
（ｂ）配列番号２のアミノ酸残基−２５〜２３７；
（ｃ）配列番号２のアミノ酸残基１〜２３７；
（ｄ）ＡＴＣＣ受託番号２０９１９９に含まれるｃＤＮＡクローンによりコードされる全長フォリスタチン−３ポリペプチドのアミノ酸配列；
（ｅ）ＡＴＣＣ受託番号２０９１９９に含まれるｃＤＮＡクローンによりコードされる、Ｎ末端を除く全長フォリスタチン−３ポリペプチドのアミノ酸配列；および
（ｆ）ＡＴＣＣ受託番号２０９１９９に含まれるｃＤＮＡクローンによりコードされる成熟フォリスタチン−３ポリペプチドのアミノ酸配列、
からなる群より選択される配列と少なくとも９５％同一のアミノ酸配列を含む、単離されたポリペプチド。
【請求項２０】  フォリスタチン−３タンパク質のエピト−プ保有部分を含む単離されたポリペプチドであって、ここで該部分は以下：
配列番号２のアミノ酸残基Ｌｅｕ−１４〜Ａｌａ−２０を含むポリペプチド；
配列番号２のアミノ酸残基Ｓｅｒ−４６〜Ｉｌｅ−５５を含むポリペプチド；
配列番号２のアミノ酸残基Ｇｌｙ−８８〜Ｐｒｏ−９７を含むポリペプチド；
配列番号２のアミノ酸残基Ｇｌｙ１１３〜Ｌｅｕ−１３３を含むポリペプチド；
配列番号２のアミノ酸残基Ａｒｇ−１３８〜Ｇｌｕ−１４６を含むポリペプチド；
配列番号２のアミノ酸残基Ｐｒｏ−１７７〜Ｔｈｒ−１９１を含むポリペプチド；および
配列番号２のアミノ酸残基Ｇｌｙ−２１９〜Ｖａｌ−２３７を含むポリペプチド、
からなる群から選択される、単離されたポリペプチド。
【請求項２１】  請求項１８または１９のいずれかに記載のフォリスタチン−３ポリペプチドに特異的に結合する、単離された抗体。
【請求項２２】  単離された核酸分子であって、以下：
（ａ）配列番号４に記載のヌクレオチド配列；
（ｂ）配列番号５に記載のヌクレオチド配列；
（ｃ）配列番号６に記載のヌクレオチド配列；
（ｄ）配列番号７に記載のヌクレオチド配列；
（ｅ）配列番号８に記載のヌクレオチド配列；
（ｆ）配列番号９に記載のヌクレオチド配列；
（ｇ）配列番号１０に記載のヌクレオチド配列；
（ｈ）配列番号１１に記載のヌクレオチド配列；
（ｉ）図１Ａ、１Ｂ、および１Ｃ（配列番号１）に示される配列の部分のヌクレオチド配列であって、ここで該部分はヌクレオチド１〜５００の少なくとも５０の連続するヌクレオチドを含む、ヌクレオチド配列；
（ｊ）図１Ａ、１Ｂ、および１Ｃ（配列番号１）に示される配列の部分のヌクレオチド配列であって、ここで該部分は配列番号１のヌクレオチド１００〜５００、２００〜５００、３００〜５００、４００〜５００、１００〜４００、２００〜４００、３００〜４００、１００〜３００、２００〜３００、１００〜２００、１００〜２４９５、２５０〜２４９５、５００〜２４９５、１０００〜２４９５、１５００〜２４９５、２０００〜２４９５、１００〜２０００、２５０〜２０００、５００〜２０００、１０００〜２０００、１５００〜２０００、１００〜１５００、２５０〜１５００、５００〜１５００、１０００〜１５００、１００〜１０００、２５０〜１０００および５００〜１０００からなる、ヌクレオチド配列；ならびに
（ｋ）上記（ａ）〜（ｊ）のいずれかのヌクレオチド配列と相補的なヌクレオチド配列、
からなる群より選択される配列と少なくとも９５％同一の配列を有するポリヌクレオチドを含む、単離された核酸分子。
【請求項２３】  異種ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドと融合する請求項１に記載の単離された核酸分子。
【請求項２４】  異種ポリペプチドと融合している、請求項１９に記載の単離されたポリペプチド。
【請求項２５】  検出方法であって、以下：
請求項１に記載の核酸における変異の存在または非存在を決定する工程
を包含する、方法。
【請求項２６】  検出方法であって、以下：
生物学的サンプル中の請求項１９に記載のポリペプチドの存在または発現量を決定する工程
を包含する、方法。
【請求項２７】  フォリスタチン−３活性を増強または阻害し得る化合物を同定する方法であって、以下：
（ａ）請求項１９に記載のポリペプチドを、候補化合物と接触させる工程；および
（ｂ）活性についてアッセイする工程、
を包含する、方法。
【請求項２８】  請求項１５または１６のいずれかに記載の遺伝子操作された宿主細胞であって、該宿主細胞は、原核細胞、真核細胞、動物細胞、哺乳動物細胞、昆虫細胞、植物細胞、真菌細胞、ＣＯＳ細胞、ＣＨＯ細胞、またはＥ．ｃｏｌｉ細胞である、遺伝子操作された宿主細胞。
【請求項２９】  請求項１８または１９のいずれかに記載のポリペプチドであって、該ポリペプチドはポリエチレングリコールに対して標識されているか、改変されているか、または融合されている、ポリペプチド。
【請求項３０】  請求項２１に記載の抗体であって、該抗体によって結合される前記タンパク質は、グリコシル化されている、抗体。
【請求項３１】  ポリクローナル、モノクローナル、キメラ、一本鎖、ヒト、ヒト化、またはＦａｂフラグメントである、請求項２１または３０のいずれかに記載の抗体。