【手続補正書】
【提出日】平成18年7月13日(2006.7.13)
【手続補正１】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】特許請求の範囲
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】  以下からなる群より選択されるメンバーと少なくとも９５％同一のヌクレオチド配列を含有する、単離されたポリヌクレオチド：
（ａ）配列番号２の残基１〜２０７として示されるポリペプチドをコードするヌクレオチド配列；
（ｂ）配列番号２の残基２〜２０７として示されるポリペプチドをコードするヌクレオチド配列；
（ｃ）配列番号２の残基２８〜２０７として示されるポリペプチドをコードするヌクレオチド配列；
（ｄ）配列番号２の残基３０〜２０７として示されるポリペプチドをコードするヌクレオチド配列；
（ｅ）配列番号２の残基１６５〜１８３として示されるポリペプチドをコードするヌクレオチド配列；
（ｆ）クローンＨＫＡＰＩ１５に含まれるヒトｃＤＮＡによってコードされる完全ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列；
（ｇ）クローンＨＫＡＰＩ１５に含まれるヒトｃＤＮＡによってコードされる完全ポリペプチドをＮ末端メチオニンを除いてコードするヌクレオチド配列；
（ｈ）クローンＨＫＡＰＩ１５に含まれるヒトｃＤＮＡによってコードされる成熟ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列；および
（ｉ）上記の（ａ）、（ｂ）、（ｃ）、（ｄ）、（ｅ）、（ｆ）、（ｇ）または（ｈ）における任意のヌクレオチド配列に相補的なヌクレオチド配列。
【請求項２】  以下からなる群より選択される核酸配列を含む、単離されたポリヌクレオチド：
（ａ）配列番号２の残基１〜２０７として示されるポリペプチドの生物学的に活性なフラグメントをコードするヌクレオチド配列；および
（ｂ）（ａ）のヌクレオチド配列に相補的なヌクレオチド配列。
【請求項３】  前記ポリヌクレオチドが、配列番号２の１６５〜１８３位のアミノ酸配列を有するＫＤＩポリペプチドをコードする図１におけるヌクレオチド配列（配列番号１）を有する、請求項１に記載の核酸分子。
【請求項４】  前記ポリヌクレオチドが、配列番号２の２８〜２０７位のアミノ酸配列を有するＫＤＩポリペプチドをコードする図１におけるヌクレオチド配列（配列番号１）を有する、請求項１に記載の核酸分子。
【請求項５】  以下からなる群より選択される配列と少なくとも９５％同一のヌクレオチド配列を有するポリヌクレオチドを含有する、単離された核酸分子：
（ａ）配列番号２の残基ｎ〜２０７のアミノ酸配列を含有するポリペプチドをコードするヌクレオチド配列であって、ここで、ｎは１〜５９の範囲の整数である、ヌクレオチド配列；
（ｂ）配列番号２の残基１〜ｍのアミノ酸配列を含有するポリペプチドをコードするヌクレオチド配列であって、ここで、ｍは１８３〜２０７の範囲の整数である、ヌクレオチド配列；
（ｃ）配列番号２の残基ｎ〜ｍからなるアミノ酸配列を有するポリペプチドをコードするヌクレオチド配列であって、ここで、ｎおよびｍは、それぞれ、上記（ａ）および（ｂ）において規定される整数である、ヌクレオチド配列；
（ｄ）クローンＨＫＡＰＩ１５におけるヒトｃＤＮＡによってコードされるポリペプチドをコードするヌクレオチド配列であって、ここで、該ポリペプチドはそのＮ末端から１と５８との間のアミノ酸を欠く、ヌクレオチド配列；
（ｅ）クローンＨＫＡＰＩ１５におけるヒトｃＤＮＡによってコードされるポリペプチドをコードするヌクレオチド配列であって、ここで、該ポリペプチドはそのＣ末端から１と２３との間のアミノ酸を欠く、ヌクレオチド配列；および
（ｆ）クローンＨＫＡＰＩ１５におけるヒトｃＤＮＡによってコードされるポリペプチドをコードするヌクレオチド配列であって、ここで、該ポリペプチドは上記（ｄ）および（ｅ）に記載のＮ末端欠失およびＣ末端欠失の任意の組み合わせを有する、ヌクレオチド配列。
【請求項６】  請求項１に記載の（ａ）、（ｂ）、（ｃ）、（ｄ）、（ｅ）、（ｆ）、（ｇ）または（ｈ）におけるヌクレオチド配列と同一のヌクレオチド配列を有するポリヌクレオチドに、ストリンジェントなハイブリダイゼーション条件下でハイブリダイズするポリヌクレオチドを含む、単離された核酸分子であって、ここでハイブリダイズする該ポリヌクレオチドは、Ａ残基のみまたはＴ残基のみからなるヌクレオチド配列を有するポリヌクレオチドに、ストリンジェントなハイブリダイゼーション条件下でハイブリダイズしない、核酸分子。
【請求項７】  請求項１に記載の（ａ）、（ｂ）、（ｃ）、（ｄ）、（ｅ）、（ｆ）または（ｇ）におけるアミノ酸配列を有するＫＤＩポリペプチドのエピトープ保有部分のアミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む、単離された核酸分子。
【請求項８】  以下からなる群より選択されるＫＤＩポリペプチドのエピトープ保有部分をコードする核酸配列を含む、請求項７に記載の単離された核酸分子：配列番号２の約Ｓｅｒ４９〜約Ｓｅｒ５４のアミノ酸残基を含有するポリペプチド；配列番号２の約Ｃｙｓ５９〜約Ａｌａ６５のアミノ酸残基を含有するポリペプチド；配列番号２の約Ｐｒｏ７８〜約Ｔｙｒ８８のアミノ酸残基を含有するポリペプチド；配列番号２の約Ｈｉｓ１０１〜約Ｇｌｎ１１３のアミノ酸残基を含有するポリペプチド；配列番号２のＧｌｎ１２０〜約Ｇｌｕ１２３のアミノ酸残基を含有するポリペプチド；配列番号２のＣｙｓ１２８〜約Ｐｒｏ１５５のアミノ酸残基を含有するポリペプチド；配列番号２の約Ｌｅｕ１６０〜約Ａｒｇ１６８のアミノ酸残基を含有するポリペプチド；配列番号２の約Ａｓｎ１７１〜約Ａｓｐ１８０のアミノ酸残基を含有するポリペプチド；配列番号２の約Ｖａｌ１８６〜約Ｃｙｓ１９３のアミノ酸残基を含有するポリペプチド；および配列番号２のＰｈｅ２０４〜約Ｌｙｓ２０７のアミノ酸残基を含有するポリペプチド。
【請求項９】  請求項１〜８のうちのいずれか１項に記載の単離された核酸分子をベクターに挿入する工程を包含する、組換えベクターを生成するための方法。
【請求項１０】  請求項９に記載の方法によって生成される、組換えベクター。
【請求項１１】  請求項１〜８のうちのいずれか１項に記載のポリペプチドを用いて細胞を遺伝子操作する工程、または請求項１０に記載の組換えベクターを宿主細胞に導入する工程を包含する、組換え宿主細胞を作製するための方法。
【請求項１２】  請求項１１に記載の方法によって産生される、組換え宿主細胞。
【請求項１３】  ＫＤＩポリペプチドを生成するための組換え方法であって、該ポリペプチドが発現されるような条件下で請求項１２に記載の組換え宿主細胞を培養する工程、および該ポリペプチドを回収する工程を包含する、方法。
【請求項１４】  以下からなる群より選択されるメンバーと少なくとも９５％同一のアミノ酸配列を含む、単離されたＫＤＩポリペプチド；
（ａ）配列番号２の残基１〜２０７として示されるポリペプチド；
（ｂ）配列番号２の残基２〜２０７として示されるポリペプチド；
（ｃ）配列番号２の残基２８〜２０７として示されるポリペプチド；
（ｄ）配列番号２の残基１６５〜１８３として示されるポリペプチド；
（ｅ）クローンＨＫＡＰＩ１５に含まれるヒトｃＤＮＡによりコードされる完全ポリペプチド；
（ｆ）クローンＨＫＡＰＩ１５に含まれるヒトｃＤＮＡによりコードされる、Ｎ末端メチオニンを除く完全ポリペプチド；
（ｇ）クローンＨＫＡＰＩ１５に含まれるヒトｃＤＮＡによりコードされる成熟ポリペプチド；
【請求項１５】  ＫＤＩタンパク質のエピトープ保有部分を含有する単離されたポリペプチドであって、ここで該部分が以下からなる群より選択される、ポリペプチド：配列番号２の約Ｓｅｒ４９〜約Ｓｅｒ５４のアミノ酸残基を含有するポリペプチド；配列番号２の約Ｃｙｓ５９〜約Ａｌａ６５のアミノ酸残基を含有するポリペプチド；配列番号２の約Ｐｒｏ７８〜約Ｔｙｒ８８のアミノ酸残基を含有するポリペプチド；配列番号２の約Ｈｉｓ１０１〜約Ｇｌｎ１１３のアミノ酸残基を含有するポリペプチド；配列番号２のＧｌｎ１２０〜約Ｇｌｕ１２３のアミノ酸残基を含有するポリペプチド；配列番号２のＣｙｓ１２８〜約Ｐｒｏ１５５のアミノ酸残基を含有するポリペプチド；配列番号２の約Ｌｅｕ１６０〜約Ａｒｇ１６８のアミノ酸残基を含有するポリペプチド；配列番号２の約Ａｓｎ１７１〜約Ａｓｐ１８０のアミノ酸残基を含有するポリペプチド；配列番号２の約Ｖａｌ１８６〜約Ｃｙｓ１９３のアミノ酸残基を含有するポリペプチド；および配列番号２のＰｈｅ２０４〜約Ｌｙｓ２０７のアミノ酸残基を含有するポリペプチド。
【請求項１６】  請求項１４に記載のＫＤＩポリペプチドに対して特異的に結合する、単離された抗体。
【請求項１７】  配列番号１の少なくとも５０連続するヌクレオチドと少なくとも９５％同一であるヌクレオチド配列を有するポリヌクレオチドを含有する、単離された核酸分子。
【請求項１８】  配列番号２の残基１〜２０７として示されるポリペプチドの生物学的に活性なフラグメントのアミノ酸配列を含有する、単離されたポリペプチド。
【請求項１９】  医学的状態を予防、処置または寛解するための、治療的に有効な量の請求項１４に記載のポリペプチドを含有する、薬学的組成物。
【請求項２０】  患者においてウイルス感染を処置するための、請求項１９に記載の組成物。
【請求項２１】 請求項１〜８のうちのいずれか１項に記載の単離されたポリヌクレオチドであって、該ポリヌクレオチドは、ＤＮＡまたはＲＮＡである、ポリヌクレオチド。
【請求項２２】 請求項１〜８のうちのいずれか１項に記載の単離されたポリヌクレオチドであって、該ポリヌクレオチドは、二本鎖または一本鎖である、ポリヌクレオチド。
【請求項２３】 異種ポリヌクレオチドに融合された、請求項１〜８のうちのいずれか１項に記載の単離されたポリヌクレオチド。
【請求項２４】 請求項２３に記載の単離されたポリヌクレオチドであって、前記異種ポリヌクレオチドは、異種ポリペプチドをコードする、ポリヌクレオチド。
【請求項２５】 請求項２４に記載の異種ポリペプチドであって、該異種ポリペプチドは、請求項１〜８のうちのいずれか１項に記載のポリヌクレオチドによってコードされるポリペプチドに融合されている、ポリペプチド。
【請求項２６】 請求項１〜８のうちのいずれか１項に記載のポリヌクレオチドであって、該ポリヌクレオチドは標識されている、ポリヌクレオチド。
【請求項２７】 請求項１０に記載の組換えベクターであって、前記ポリヌクレオチドは、調節制御配列に対して作動可能に連結されている、ベクター。
【請求項２８】 請求項１０または２７に記載のベクターを含む、組換え宿主細胞。
【請求項２９】 請求項１〜８のうちのいずれか１項に記載のポリヌクレオチドを用いて遺伝子操作された、組換え宿主細胞。
【請求項３０】 請求項１２、２８、または２９のうちのいずれか１項に記載の組換え宿主細胞であって、前記ポリヌクレオチドは、異種調節制御配列に作動可能に連結されている、宿主細胞。
【請求項３１】 請求項１２、２８、または２９のうちのいずれか１項に記載の組換え宿主細胞であって、該宿主細胞は、原核生物細胞、真核生物細胞、細菌細胞、昆虫細胞、Ｅ．ｃｏｌｉ細胞、Ｓｆ９細胞、ＣＯＳ細胞、ＣＨＯ細胞、真菌細胞、または酵母細胞である、宿主細胞。
【請求項３２】 ＫＤＩポリペプチドを産生するための組換え方法であって、該方法は、
請求項２８〜３１のうちのいずれか１項に記載の宿主細胞を、前記ポリペプチドが発現されるような条件下で培養する工程、および
該ポリペプチドを回収する工程、
を包含する、方法。
【請求項３３】 ポリペプチドを産生するための方法であって、該方法は、
請求項１〜８のうちのいずれか１項に記載のポリヌクレオチドによってコードされるポリペプチドを発現させる工程、および
該ポリペプチドを回収する工程、
を包含する、方法。
【請求項３４】 請求項１４または１５のいずれかに記載のポリペプチドであって、該ポリペプチドは、標識されているか、改変されているか、またはポリエチレングリコールと融合されている、ポリペプチド。
【請求項３５】 請求項３４に記載のポリペプチドであって、前記標識は、放射性同位体標識である、ポリペプチド。
【請求項３６】 請求項１４、１５、３４、または３５のうちのいずれか１項に記載のポリペプチドであって、該ポリペプチドは、異種ポリペプチドに融合されている、ポリペプチド。
【請求項３７】 請求項３６に記載のポリペプチドであって、該ポリペプチドは、ＩｇＧ  Ｆｃ領域に融合されている、ポリペプチド。
【請求項３８】 請求項１４、１５、または３４〜３７のうちのいずれか１項に記載のポリペプチドであって、該ポリペプチドは、固定されている、ポリペプチド。
【請求項３９】 請求項１６に記載の単離された抗体であって、該抗体は、ポリクローナル抗体、モノクローナル抗体、キメラ抗体、単鎖抗体、ヒト化抗体、またはＦａｂフラグメントである、抗体。
【請求項４０】 請求項１４または１５に記載のポリペプチドのアンタゴニストであって、該アンタゴニストは、該ポリペプチドの活性を阻害または消失させ得る請求項１６もしくは３９に記載の抗体であるか、または請求項１〜８のうちのいずれか１項に記載のポリヌクレオチドに結合し得て該ポリヌクレオチドの発現を阻害し得るアンチセンス分子もしくは三重鎖らせん形成分子である、アンタゴニスト。
【請求項４１】 組成物であって、
請求項１〜８のうちのいずれか１項に記載のポリヌクレオチド、請求項１４もしくは１５に記載のポリペプチド、請求項１６もしくは３９に記載の抗体、または請求項４０に記載のアンタゴニスト
を含む、組成物。
【請求項４２】 薬学的組成物であって、
請求項１〜８のうちのいずれか１項に記載のポリヌクレオチド、請求項１４もしくは１５に記載のポリペプチド、請求項１６もしくは３９に記載の抗体、または請求項４０に記載のアンタゴニストと、
必要に応じて、薬学的に受容可能なキャリアと、
を含む、薬学的組成物。
【請求項４３】 診断組成物であって、
請求項１〜８のうちのいずれか１項に記載のポリヌクレオチド、請求項１４もしくは１５に記載のポリペプチド、または請求項１６もしくは３９に記載の抗体
を含む、診断組成物。
【請求項４４】 化学療法後のインターフェロン活性を阻害するため、または骨髄前駆体細胞もしくは造血前駆体細胞の増殖を刺激するための、薬学的組成物の調製のための請求項４０に記載のアンタゴニストの使用。
【請求項４５】 免疫系における障害を診断するのを補助するためのインビトロ方法であって、該方法は、
（ａ）個体の細胞または体液における請求項１４または１５に記載のポリペプチドの遺伝子発現レベルをアッセイする工程；および
（ｂ）該アッセイした遺伝子発現レベルが、標準的遺伝子発現レベルと比較して増加しているかまたは減少しているかを決定する工程；
を包含し、該レベルは、該免疫系における障害を診断するために使用され得る、方法。
【請求項４６】 請求項１４または１５に記載のポリペプチドに対する結合タンパク質を同定するための方法であって、該方法は、
（ａ）該ポリペプチドを、候補結合タンパク質を含む調製物と接触させる工程；および
（ｂ）該調製物からのタンパク質を、該ポリペプチドに結合する結合タンパク質として同定する工程；
を包含する、方法。
【請求項４７】 請求項１４または１５に記載のポリペプチドのアンタゴニストを同定するための方法であって、該方法は、
（ａ）該ポリペプチドを、候補分子の存在下および非存在下においてＫＤＩレセプター分子と接触させる工程；ならびに
（ｂ）該ＫＤＩレセプター分子に対する該ポリペプチドの結合が、該候補分子の非存在下と比較して該候補分子の存在下において減少し、かつ該候補分子の結合が該ＫＤＩレセプター分子のポリペプチドの効果を誘発しない場合に、該候補分子をアンタゴニストとして同定する工程；
を包含する、方法。
【請求項４８】 請求項１４または１５に記載のポリペプチドのアゴニストを同定するための方法であって、該方法は、
（ａ）該ポリペプチドを、候補分子の存在下および非存在下においてＫＤＩレセプター分子と接触させる工程；ならびに
（ｂ）該ＫＤＩレセプター分子に対する該ポリペプチドの結合が、該候補分子の非存在下と比較して該候補分子の存在下において減少し、かつ該候補分子の結合が該ポリペプチドと同じまたは密接に関連する効果を該結合分子に対して誘発する場合に、該候補分子をアゴニストとして同定する工程；
を包含する、方法。
【請求項４９】 薬学的組成物を作製するための方法であって、該方法は、
請求項４６〜４８のうちのいずれか１項に記載の方法の工程；
さらに、工程（ｂ）において同定された候補分子を薬学的に受容可能な形態にて処方する工程；
を包含する、方法。
【請求項５０】 ＫＤＩに結合する化合物をスクリーニングするための方法における、請求項１〜８のうちのいずれか１項に記載のポリヌクレオチド、請求項１４もしくは１５に記載のポリペプチド、または請求項１６もしくは３９に記載の抗体の使用。
【請求項５１】 ＫＤＩのアンタゴニストである化合物をスクリーニングするための方法における、請求項１〜８のうちのいずれか１項に記載のポリヌクレオチド、請求項１４もしくは１５に記載のポリペプチド、または請求項１６もしくは３９に記載の抗体の使用。
【請求項５２】 ＫＤＩのアゴニストである化合物をスクリーニングするための方法における、請求項１〜８のうちのいずれか１項に記載のポリヌクレオチド、請求項１４もしくは１５に記載のポリペプチド、または請求項１６もしくは３９に記載の抗体の使用。
【請求項５３】 請求項１〜８のうちのいずれか１項に記載のポリヌクレオチドに結合する化合物を検出する方法、請求項１４もしくは１５に記載のポリペプチドに結合する化合物を検出する方法、または請求項１６もしくは３９に記載の抗体に結合する化合物を検出する方法における、請求項１〜８のうちのいずれか１項に記載のポリヌクレオチド、請求項１４もしくは１５に記載のポリペプチド、または請求項１６もしくは３９に記載の抗体の使用。