【手続補正書】
【提出日】平成18年5月8日(2006.5.8)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
タンパク質二次元電気泳動を行う方法であって、
少なくとも1種のタンパク質を含有する混合物を正味電荷が中性であるか又は電荷がない色素で前標識する工程であって、前記タンパク質が前記色素のタンパク質リンカー基にカップリングして前標識したタンパク質を形成することにより前標識される、前記工程; 及び
前記前標識したタンパク質を前記混合物から二次元電気泳動条件下で分離する工程
を含む、前記方法。
【請求項２】
前記色素が
【化１】
2006505767.tif 000001
［式中、Yはスルホニルハライド、SO2-、又は存在しないであり; ZはNR3-又は存在しないであり; R1は各々独立して水素、C1-C30アルキル基、スルホネート、ヒドロキシル、スルフヒドリル、置換アミン及び第四級アミンからなる群より選ばれた置換基を有するC0-C4アルキル基であり、いずれか2つの隣接したR1が融合して環構造を形成し、その環構造は、任意により、その中にヘテロ原子を有してもよく、また、それから伸びているペンダント基を有してもよく、そのペンダント基は各々独立して水素、C1-C8アルキル、スルホネート、ヒドロキシル、スルフヒドリル、置換アミン及び第四級アミンからなる群より選ばれた置換基を有するC0-C4アルキル基より選ばれ; R3はH、単環式脂肪族炭化水素、炭水化物、C1-C6アルキル又はC1-C6アシルであり; R2は存在しない、単環式脂肪族炭化水素、炭水化物、アリール、(CH2)m(ここで、mは1〜12の整数である。)の形のアルキル鎖、R4((CH2)nO)oR4(ここで、nは1〜6の整数であり、oは1〜4の整数であり、R4は各々独立してC1-C6アルキル又は存在しないである。)の形のポリアルキレングリコール鎖、又はR2の不活性置換基含有誘導体(ここで、不活性置換基はC1-C6アルキル、カルボニル、アミン及びスルフヒドリルからなる群より選ばれ、又は存在しないである。)であり、AはNR3-又は存在しないであり、ここで、基Y、Z、R2、Aの少なくとも1つは存在し、Lはタンパク質リンカー基である。］
である、請求項１記載の方法。
【請求項３】
前記色素が
【化２】
2006505767.tif 000002
［式中、Yはスルホニルハライド、SO2-、又は存在しないであり; ZはNR3-又は存在しないであり; R1は各々独立して水素、C1-C30アルキル基、スルホネート、ヒドロキシル、スルフヒドリル、置換アミン及び第四級アミンからなる群より選ばれた置換基を有するC0-C4アルキル基であり、いずれか2つの隣接したR1又はR1とR5、R6、R7又はR8の基の1つとが融合して環構造を形成し、その環構造は、任意により、その中にヘテロ原子を有してもよく、また、それから伸びているペンダント基を有してもよく、そのペンダント基は各々独立して水素、C1-C8アルキル、スルホネート、ヒドロキシル、スルフヒドリル、置換アミン及び第四級アミンからなる群より選ばれた置換基を有するC0-C4アルキル基より選ばれ; R3はH、単環式脂肪族炭化水素、炭水化物、C1-C6アルキル又はC1-C6アシルであり; R2は存在しない、単環式脂肪族炭化水素、炭水化物、アリール、(CH2)m(ここで、mは1〜12の整数である。)の形のアルキル鎖、R4((CH2)nO)oR4(ここで、nは1〜6の整数であり、oは1〜4の整数であり、R4は各々独立してC1-C6アルキル又は存在しないである。)の形のポリアルキレングリコール鎖、又はR2の不活性置換基含有誘導体(ここで、不活性置換基はC1-C6アルキル、カルボニル、アミン及びスルフヒドリルからなる群より選ばれ、又はすべて存在しない。)であり、AはNR3-又は存在しないであり、ここで、基Y、Z、R2、Aの少なくとも1つは存在し、R5、R6、R7、R8 の各々が独立してH又はC1-C6アルキルであり、Lはタンパク質リンカー基である。］
である、請求項１記載の方法。
【請求項４】
下記式を有する化合物。
【化３】
2006505767.tif 000003
［式中、YはSO2-であり; ZはNR3-であり; R1は各々独立して水素、C1-C30アルキル基、スルホネート、ヒドロキシル、スルフヒドリル、置換アミン及び第四級アミンからなる群より選ばれた置換基を有するC0-C4アルキル基であり、いずれか2つの隣接したR1が融合して環構造を形成し、その環構造は、任意により、その中にヘテロ原子を有してもよく、また、それから伸びているペンダント基を有してもよく、そのペンダント基は各々独立して水素、C1-C8アルキル、スルホネート、ヒドロキシル、スルフヒドリル、置換アミン及び第四級アミンからなる群より選ばれた置換基を有するC0-C4アルキル基より選ばれ; R3はH、単環式脂肪族炭化水素、炭水化物、C1-C6アルキル又はC1-C6アシルであり; R2は存在しない、単環式脂肪族炭化水素、炭水化物、アリール、R4((CH2)nO)oR4(ここで、nは1〜6の整数であり、oは1〜4の整数であり、R4は各々独立してC1-C6アルキル又は存在しないである。)の形のポリアルキレングリコール鎖、又はR2の不活性置換基含有誘導体(ここで、不活性置換基はC1-C6アルキル、カルボニル、アミン及びスルフヒドリルからなる群より選ばれる。)であり、AはNR3-であり、Lはタンパク質リンカー基である。］
【請求項５】
下記式を有する化合物。
【化４】
2006505767.tif 000004
［式中、YはSO2-であり; ZはNR3-であり; R1は各々独立して水素、C1-C30アルキル基、スルホネート、ヒドロキシル、スルフヒドリル、置換アミン及び第四級アミンからなる群より選ばれた置換基を有するC0-C4アルキル基であり、いずれか2つの隣接したR1又はR1とR5、R6、R7又はR8の基の1つが融合して環構造を形成し、その環構造は、任意により、その中にヘテロ原子を有してもよく、また、それから伸びているペンダント基を有してもよく、そのペンダント基は各々独立して水素、C1-C8アルキル、スルホネート、ヒドロキシル、スルフヒドリル、置換アミン及び第四級アミンからなる群より選ばれた置換基を有するC0-C4アルキル基より選ばれ; R3はH、単環式脂肪族炭化水素、炭水化物、C1-C6アルキル又はC1-C6アシルであり; R2は存在しない、単環式脂肪族炭化水素、炭水化物、アリール、R4((CH2)nO)oR4(ここで、nは1〜6の整数であり、oは1〜4の整数であり、R4は各々独立してC1-C6アルキル又は存在しないである。)の形のポリアルキレングリコール鎖、又はR2の不活性置換基含有誘導体(ここで、不活性置換基はC1-C6アルキル、カルボニル、アミン及びスルフヒドリルからなる群より選ばれる。)であり、AはNR3-、又は存在しないであり、ここで、基Y、Z、R2、Aの少なくとも1つは存在し、R5、R6、R7、R8の各々は独立してH又はC1-C6アルキルであり、Lはタンパク質リンカー基である。］
【請求項６】
タンパク質二次元電気泳動を行う改良法であって、混合物がタンパク質を含有し、該タンパク質が一次元電気泳動法によって該混合物から部分的に分離され、ここで、改良が該タンパク質を異性体的に精製した色素で前標識することにある、前記改良法。
【請求項７】
タンパク質を標識するための請求項４記載の化合物の使用。
【請求項８】
タンパク質を標識するための請求項５記載の化合物の使用。