【手続補正書】
【提出日】平成18年3月20日(2006.3.20)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
小細胞肺癌の細胞集団の細胞の増殖を阻害する方法であって、該集団をＣＸＣＲ４インヒビターと接触させることを含む、方法。
【請求項２】
小細胞肺癌の細胞集団を受容体チロシンキナーゼインヒビターと接触させることをさらに含む、請求項１に記載の方法。
【請求項３】
受容体チロシンキナーゼインヒビターがｃ−Ｋｉｔインヒビターである、請求項２に記載の方法。
【請求項４】
小細胞肺癌の対象を処置する方法であって、ＣＸＣＲ４インヒビターを該対象に投与することを含む、方法。
【請求項５】
受容体チロシンキナーゼインヒビターを対象に投与することをさらに含む、請求項４に記載の方法。
【請求項６】
受容体チロシンキナーゼインヒビターがｃ−Ｋｉｔインヒビターである、請求項５に記載の方法。
【請求項７】
対象での小細胞肺癌の転移を阻害する方法であって、ＣＸＣＲ４インヒビターを該対象に投与することを含む、方法。
【請求項８】
受容体チロシンキナーゼインヒビターを対象に投与することをさらに含む、請求項７に記載の方法。
【請求項９】
受容体チロシンキナーゼインヒビターがｃ−Ｋｉｔインヒビターである、請求項８に記載の方法。
【請求項１０】
ＣＸＣＲ４インヒビターが、小細胞肺癌を処置するために用いられ得るか否かを決定する方法であって、
ａ）肺癌細胞試料を採取すること；および
ｂ）細胞がＣＸＣＲ４を発現するか否かを決定すること；
これにより、ＣＸＣＲ４が発現する場合、ＣＸＣＲ４インヒビターが小細胞肺癌を処置するために用いられ得ることが決定されること、
を含む、方法。
【請求項１１】
ＣＸＣＲ４インヒビターと受容体チロシンキナーゼインヒビターの組合せが、小細胞肺癌を処置するために用いられ得るか否かを決定する方法であって、
ａ）肺癌細胞試料を採取すること；および
ｂ）該細胞が、ＣＸＣＲ４、および該受容体チロシンキナーゼインヒビターで阻害される受容体チロシンキナーゼを発現するか否かを決定すること；
これにより、ＣＸＣＲ４および受容体チロシンキナーゼが発現する場合、ＣＸＣＲ４インヒビターと受容体チロシンキナーゼインヒビターの組合せが、小細胞肺癌を処置するために用いられ得ることが決定されること、
を含む、方法。
【請求項１２】
受容体チロシンキナーゼインヒビターがｃ−Ｋｉｔインヒビターである、請求項１１に記載の方法。
【請求項１３】
ＣＸＣＲ４インヒビターが、小細胞肺癌の増殖または転移を阻害するために用いられ得るか否かを決定する方法であって、
ａ）肺細胞試料を採取すること；および
ｂ）該細胞がＣＸＣＲ４を発現するか否かを決定すること；
これにより、ＣＸＣＲ４が発現する場合、ＣＸＣＲ４インヒビターが、小細胞肺癌の増殖または転移を阻害するために用いられ得ることが決定されること、
を含む、方法。
【請求項１４】
ＣＸＣＲ４インヒビターと受容体チロシンキナーゼインヒビターの組合せが、小細胞肺癌の増殖または転移を阻害するために用いられ得るか否かを決定する方法であって、
ａ）肺細胞試料を採取すること；および
ｂ）該細胞が、ＣＸＣＲ４、および該受容体チロシンキナーゼインヒビターで阻害される受容体チロシンキナーゼを発現するか否かを決定すること；
これにより、ＣＸＣＲ４および受容体チロシンキナーゼが発現する場合、ＣＸＣＲ４インヒビターと受容体チロシンキナーゼインヒビターの組合せが、小細胞肺癌の増殖または転移を阻害するために用いられ得ることが決定されること、
を含む、方法。
【請求項１５】
受容体チロシンキナーゼインヒビターがｃ−Ｋｉｔインヒビターである、請求項１４に記載の方法。
【請求項１６】
ＣＸＣＲ４インヒビターと受容体チロシンキナーゼインヒビターの組合せでの処置が、小細胞肺癌の患者で続けられるべきか、または中止されるべきかを決定する方法であって、
ａ）処置期間中、腫瘍細胞を含む２つ以上の試料を患者から採取すること；
ｂ）腫瘍細胞でのＣＸＣＲ４の活性レベルを決定すること；
ｃ）腫瘍細胞でのｃ−Ｋｉｔの活性レベルを決定すること；および
ｄ）ＣＸＣＲ４および／またはｃ−Ｋｉｔの活性レベルが処置中増加しない場合、処置を続けること、
を含む、方法。
【請求項１７】
対象の処置方法で使用するための、ＣＸＣＲ４インヒビター。
【請求項１８】
小細胞肺癌の細胞集団の細胞の増殖を阻害すること、小細胞肺癌の細胞集団の細胞の移動または運動を阻害すること、小細胞肺癌の細胞集団の細胞の接着を調節すること、小細胞肺癌の細胞集団の形態的変化を阻害すること、小細胞肺癌の対象を処置すること、または対象での小細胞肺癌の転移を阻害すること、の様な方法で使用するための製剤または医薬組成物のための、ＣＸＣＲ４インヒビターの使用。
【請求項１９】
対象の処置方法、好ましくは、小細胞肺癌の細胞集団の細胞の増殖を阻害すること、小細胞肺癌の細胞集団の細胞の移動または運動を阻害すること、小細胞肺癌の細胞集団の細胞の接着を調節すること、小細胞肺癌の細胞集団の形態的変化を阻害すること、小細胞肺癌を処置すること、または小細胞肺癌の転移を阻害すること、の様な方法で同時、併用、別々、または連続使用するための、（ａ）ＣＸＣＲ４インヒビター、および（ｂ）特に、ｃ−Ｋｉｔインヒビターの様な受容体チロシンキナーゼインヒビターを含む組合せ（ここで、有効成分（ａ）および（ｂ）は、それぞれの場合で遊離形または医薬的に許容される塩の形で存在する）。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０００５
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０００５】
従って、１つの実施態様において、本発明は、小細胞肺癌の細胞集団での細胞増殖、細胞移動または運動、および形態的変化を阻害する方法を提供し、これは、該集団をＣＸＣＲ４インヒビターと接触させることを含む。別の実施態様において、本発明は、小細胞肺癌の細胞集団での細胞接着を調節する方法を提供し、これは、該集団をＣＸＣＲ４インヒビターと接触させることを含む。好ましい実施態様において、小細胞肺癌の細胞集団でのＰＩ３−Ｋ活性は、ダウンレギュレートされる。
【手続補正３】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００２２
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００２２】
ケモカインは、造血細胞の様々なサブセットを、そのＧタンパク質共役受容体との相互作用により、ホームスペシフィックな解剖学的部位へ向けるサイトカイン様小ペプチドである（Rossi, D. and Zlotnick, A. (2000) Annu. Rev. Immunol. 18:217-42； Zlotnick, A. and Yoshie, O. (2000) Immunity 12:121-7）。ＣＸＣＲ４は、７回膜貫通型のＧタンパク質共役受容体であり、かつヒト免疫不全ウイルス（ＨＩＶ）の受容体としても知られている（Bleul, C.C. et al. (1996) Nature 382:829-3； Feng, Y. et al. (1996) Science 272:872-7； Nagasawa, T. et al. (1996) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 93:14726-9）。ＣＸＣＲ４の天然のリガンドであるＳＤＦ−１αは、造血前駆細胞に対する走化活性を有するＣＸＣケモカインファミリーのメンバーである（Aiuti, A. et al. (1997) J. Exp. Med. 185:111-20； Jo, D.Y. et al. (2000) J. Clin. Invest. 105:101-11； Nagasawa, T. et al. (1994) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 91:2305-9； Nagasawa, T. (1996) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 93:14726-9）。これまでは、ケモカイン受容体およびサイトカイン受容体との相互作用の役割は、ＳＣＬＣの様な固形腫瘍のためのものであるとは明らかになっていなかった。
【手続補正４】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００２４
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００２４】
本発明の別の態様は、ＳＣＬＣの対象を処置する方法に関する。該方法は、処置が生じるように、ＣＸＣＲ４モジュレーターおよび／またはｃ−Ｋｉｔモジュレーターを対象に投与する段階を含む。好ましい実施態様において、ＣＸＣＲ４モジュレーターで処置される対象は、ＣＸＣＲ４を発現するＳＣＬＣ細胞を有する。さらに好ましい実施態様において、ＣＸＣＲ４モジュレーターおよびｃ−Ｋｉｔモジュレーターで処置される対象は、ＣＸＣＲ４およびｃ−Ｋｉｔ共に発現するＳＣＬＣ細胞を有する。本明細書で用いられる用語「処置する」または「処置」は、少なくとも１つのＳＣＬＣの有害事象、または症状（例えば、腫瘍量、腫瘍サイズ、腫瘍細胞の増殖、遊走、運動、接着、および／または形態的変化）の改善または緩和に言及する。
【手続補正５】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００４９
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００４９】
従って、別の実施態様において、本発明の単離核酸分子は、少なくとも１５ヌクレオチド長であり、かつ配列番号：１または３のヌクレオチド配列、または配列番号：１または３のヌクレオチド配列と、約６０％、好ましくは、少なくとも約７０％、より好ましくは、少なくとも約８０％、さらにより好ましくは、少なくとも約９０％、そして最も好ましくは、少なくとも約９５％、またはそれ以上相同なヌクレオチド配列を含む核酸分子とストリンジェントな条件下でハイブリダイズする。他の実施態様において、核酸分子は、少なくとも３０、５０、１００、２５０、または５００ヌクレオチド長である。本明細書で用いられる用語「ストリンジェントな条件下でハイブリダイズする」は、互いに少なくとも６０％相同なヌクレオチド配列が、典型的には、互いにハイブリダイズしたままである、ハイブリダイゼーションおよび洗浄条件について記載されることが意図されている。好ましくは、該条件は、互いに少なくとも約６５％、より好ましくは、少なくとも約７０％、そしてなおより好ましくは、少なくとも約７５％、またはそれ以上相同な配列が、典型的には、互いにハイブリダイズしたままであるようなものである。該ストリンジェントな条件は、当該技術分野の技術者に知られており、そしてCurrent Protocols in Molecular Biology, John Wiley & Sons, N.Y. (1989), 6.3.1-6.3.6でも見出される。ストリンジェントなハイブリダイゼーション条件の好ましい非制限的な例は、６×塩化ナトリウム／クエン酸ナトリウム（ＳＳＣ）中、約４５℃でのハイブリダイゼーション、続いて、０．２×ＳＳＣ、０．１％  ＳＤＳ中、５５〜６５℃での１回またはそれ以上の洗浄である。好ましくは、ストリンジェントな条件下で、配列番号：１または配列番号：３の配列とハイブリダイズする本発明の単離核酸分子は、天然に存在する核酸分子に対応する。本明細書で用いられる「天然に存在する」核酸分子は、天然で生じるヌクレオチド配列を有する（すなわち、天然タンパク質をコード化する）ＲＮＡまたはＤＮＡ分子を意味する。１つの実施態様において、核酸は、天然ヒトＣＸＣＲ４またはｃ−Ｋｉｔをコード化する。
【手続補正６】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００５１
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００５１】
従って、本発明の別の態様は、ＣＸＣＲ４またはｃ−Ｋｉｔ活性に必須でないアミノ酸残基の変化を含有するＣＸＣＲ４またはｃ−Ｋｉｔタンパク質をコード化する核酸分子に関する。アミノ酸配列が配列番号：２および４と異なる該ＣＸＣＲ４およびｃ−Ｋｉｔタンパク質は、本明細書で記載のＣＸＣＲ４またはｃ−Ｋｉｔ活性の少なくとも１つを依然保持している。１つの実施態様において、単離核酸分子は、配列番号：２または４のアミノ酸と少なくとも約６０％相同なアミノ酸配列を含み、かつ増殖または転移を調節できるタンパク質をコード化するヌクレオチド配列を含む。好ましくは、核酸分子によりコード化されるタンパク質は、配列番号：２または４のアミノ酸配列と、少なくとも約７０％相同、好ましくは、少なくとも約８０〜８５％相同、さらにより好ましくは、少なくとも約９０％、そして最も好ましくは、少なくとも約９５％相同である。
【手続補正７】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００５６
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００５６】
上記のＣＸＣＲ４またはｃ−Ｋｉｔタンパク質コード化核酸分子に加えて、本発明の別の態様は、それに対するアンチセンスである単離核酸分子に関する。「アンチセンス」核酸は、タンパク質コード化「センス」核酸に相補的、すなわち、２本鎖ｃＤＮＡ分子のコード鎖に相補的であるか、またはｍＲＮＡ配列に相補的なヌクレオチド配列を含む。従って、アンチセンス核酸は、センス核酸と水素結合し得る。該アンチセンス核酸は、ＣＸＣＲ４またはｃ−Ｋｉｔコード鎖全体と、またはその一部のみと相補的であり得る。１つの実施態様において、アンチセンス核酸分子は、ＣＸＣＲ４またはｃ−Ｋｉｔコード化ヌクレオチド配列のコード鎖の「コード領域」に対するアンチセンスである。用語「コード領域」は、アミノ酸残基に翻訳されるコドンを含むヌクレオチド配列の領域を意味する（すなわち、配列番号：１のコード領域全体が、ヌクレオチド８９〜１１４４を含み、かつ配列番号：４のコード領域全体が、ヌクレオチド２２〜２９４９を含む）。別の実施態様において、アンチセンス核酸分子は、ＣＸＣＲ４またはｃ−Ｋｉｔコード化ヌクレオチド配列のコード鎖の「非コード領域」に対するアンチセンスである。用語「非コード領域」は、アミノ酸に翻訳されない、コード領域に隣接する５’および３’配列を意味する（すなわち、５’および３’非翻訳領域としても言及される）。
【手続補正８】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００６５
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００６５】
他の実施態様において、ＣＸＣＲ４またはｃ−Ｋｉｔタンパク質は、配列番号：２または４のアミノ酸配列と実質的に相同であり、かつ上記の段落Ｉで詳細に記載された天然の対立遺伝子バリエーションまたは変異誘発により、アミノ酸配列は異なるが、配列番号：２または４のタンパク質の機能活性を維持している。従って、別の実施態様において、ＣＸＣＲ４またはｃ−Ｋｉｔタンパク質は、配列番号：２または４のアミノ酸配列と、少なくとも約５０％、好ましくは、少なくとも約６０％、より好ましくは、少なくとも約７０％、なおより好ましくは、少なくとも約８０％、さらにより好ましくは、少なくとも約９０％、そして最も好ましくは、少なくとも約９５％、またはそれ以上相同なアミノ酸配列を含むタンパク質である。
【手続補正９】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００７７
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００７７】
従って、本発明の別の態様は、抗ＣＸＣＲ４またはｃ−Ｋｉｔ抗体の使用に関する。本明細書で用いられる用語「抗体」は、免疫グロブリン分子、および免疫グロブリン分子の免疫学的に活性な部分、すなわち、ＣＸＣＲ４またはｃ−Ｋｉｔの様な抗原と特異的に結合する（免疫反応する）抗原結合部位を含有する分子を意味する。免疫グロブリン分子の免疫学的に活性な部分の例は、ペプシンの様な酵素で抗体を処理することにより生成され得る、Ｆ（ａｂ）およびＦ（ａｂ’）２フラグメントを含む。本発明は、ＣＸＣＲ４またはｃ−Ｋｉｔと結合するポリクローナルおよびモノクローナル抗体を提供する。本明細書で用いられる用語「モノクローナル抗体」または「モノクローナル抗体組成物」は、ＣＸＣＲ４またはｃ−Ｋｉｔの特定のエピトープと免疫反応できる抗原結合部位の１種類のみを含有する抗体の調製物を意味する。従って、該モノクローナル抗体組成物は、典型的には、特に、それが免疫反応するＣＸＣＲ４またはｃ−Ｋｉｔタンパク質に対する１つの結合親和性を示す。
【手続補正１０】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０１４７
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０１４７】
従って、本発明は、薬物、例えば、化学療法剤を用いて、ＳＣＬＣの増殖または転移が阻害され得るか、否かを決定する方法を提供し、これは、次の段階
ａ）肺癌細胞試料を採取すること；
ｂ）該細胞がＣＸＣＲ４を発現するか否かを決定すること；
これにより、該薬物を用いて、ＣＸＣＲ４が発現する小細胞肺癌の増殖または転移が阻害され得ることが決定されること、
を含む。さらなる実施態様において、方法は、細胞がｃ−Ｋｉｔを発現するか否かを決定すること、これにより、薬物を用いて、ＣＸＣＲ４およびｃ−Ｋｉｔが発現する小細胞肺癌の増殖または転移が阻害され得るかが決定されること、を含む。
【手続補正１１】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０１４９
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０１４９】
ＣＸＣＲ４および／またはｃ−Ｋｉｔの活性レベルを用いて、ＳＣＬＣが、行われている処置（例えば、化学療法処置）に対して抵抗性となるか否かが評価され得る。ＳＣＬＣは、もはや処置に応答して、細胞の活性特性が変化しない場合、ＣＸＣＲ４またはｃ−Ｋｉｔの活性レベルが、増加されるだろう。従って、別の実施態様において、本発明は、ＣＸＣＲ４インヒビターでの処置が、ＳＣＬＣ患者で続けられるべきか、または中止されるべきかを決定する方法を提供し、これは、
ａ）処置期間中に、細胞を含む２以上の試料を患者から採取すること；
ｂ）該細胞のＣＸＣＲの活性レベルを決定すること；および
ｃ）ＣＸＣＲ４の活性が、治療中増加しない場合、処置を続けること、
を含む。別の実施態様において、本発明は、ＣＸＣＲ４インヒビターと受容体チロシンキナーゼインヒビターの組合せでの処置が、小細胞肺癌の患者で続けられるべきか、または中止されるべきかを決定する方法を提供し、これは、
ａ）処置期間中に、細胞を含む２以上の試料を患者から採取すること；
ｂ）該細胞のＣＸＣＲ４の活性レベルを決定すること；
ｃ）該細胞のｃ−Ｋｉｔの活性レベルを決定すること；および
ｄ）処置中、ＣＸＣＲ４および／またはｃ−Ｋｉｔの活性レベルが増加しない場合、処置を続けること、
を含む。