【手続補正書】
【提出日】平成18年8月1日(2006.8.1)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
被験者に由来する生物学的試料中の卵巣子宮内膜症関連遺伝子の発現レベルを決定する段階を含む、被験者の卵巣子宮内膜症、または卵巣子宮内膜症を発症する素因を診断する方法であって、卵巣子宮内膜症関連遺伝子がOEX 234であり、該遺伝子の対照レベルと比較して発現レベルが増加すれば、被験者が卵巣子宮内膜症であるか、または同疾患を発症する危険性があることを意味する、方法。
【請求項２】
増加が、正常対照レベルより少なくとも10%大きい、請求項1記載の方法。
【請求項３】
発現レベルを、以下からなる群より選択される任意の1つの方法で決定する、請求項１記載の方法：
（a）卵巣子宮内膜症関連遺伝子のmRNAを検出する方法；
（b）卵巣子宮内膜症関連遺伝子にコードされたタンパク質を検出する方法；および
（c）卵巣子宮内膜症関連遺伝子にコードされたタンパク質の生物学的活性を検出する方法。
【請求項４】
卵巣子宮内膜症関連遺伝子プローブの、被験者由来の生物学的試料に含まれる遺伝子転写物へのハイブリダイゼーションを検出することで発現レベルを決定する、請求項3記載の方法。
【請求項５】
ハイブリダイゼーション段階をDNAアレイ上で行う、請求項4記載の方法。
【請求項６】
生物学的試料が組織試料であり、かつ上皮細胞を含む、請求項1記載の方法。
【請求項７】
生物学的試料が、子宮内膜嚢胞細胞を含む組織試料である、請求項1記載の方法。
【請求項８】
生物学的試料が、子宮内膜嚢胞に由来する上皮細胞を含む組織試料である、請求項7記載の方法。
【請求項９】
以下の段階を含む、卵巣子宮内膜症関連遺伝子の発現を変化させる化合物をスクリーニングする方法であって、卵巣子宮内膜症関連遺伝子がOEX 234である方法：
（a）卵巣子宮内膜症関連遺伝子を発現する試験細胞に試験化合物を接触させる段階；
（b）該卵巣子宮内膜症関連遺伝子の発現レベルを決定する段階；および
（c）試験化合物の非存在下と比較して発現レベルを減少させる化合物を選択する段階。
【請求項１０】
試験細胞が上皮細胞である、請求項9記載の方法。
【請求項１１】
上皮細胞が子宮内膜嚢胞から単離される、請求項10記載の方法。
【請求項１２】
以下の段階を含む、卵巣子宮内膜症関連遺伝子の発現を変化させる化合物をスクリーニングする方法であって、卵巣子宮内膜症関連遺伝子がOEX 234である方法：
（a）卵巣子宮内膜症関連遺伝子の転写調節領域の下流に連結されたレポーター遺伝子を含むベクターが導入された細胞に、試験化合物を接触させる段階；
（b）レポーター遺伝子の活性を測定する段階；および
（c）試験化合物の非存在下と比較して、レポーター遺伝子の発現レベルを減少させる化合物を選択する段階。
【請求項１３】
以下の段階を含む、卵巣子宮内膜症関連遺伝子の活性を変化させる化合物をスクリーニングする方法であって、卵巣子宮内膜症関連遺伝子がOEX 234である方法：
（a）卵巣子宮内膜症関連遺伝子にコードされたポリペプチドに試験化合物を接触させる段階；
（b）ポリペプチドと試験化合物との結合活性を検出する段階；および
（c）ポリペプチドに結合する化合物を選択する段階。
【請求項１４】
以下の段階を含む、卵巣子宮内膜症関連遺伝子の活性を変化させる化合物をスクリーニングする方法であって、卵巣子宮内膜症関連遺伝子がOEX 234である方法：
（a）卵巣子宮内膜症関連遺伝子にコードされたポリペプチドに試験化合物を接触させる段階；
（b）ポリペプチドの生物学的活性を検出する段階；および
（c）試験化合物の非存在下で検出される生物学的活性と比較して、ポリペプチドの生物学的活性を減少させる化合物を選択する段階。
【請求項１５】
OEX 234の核酸配列に結合する1つまたは複数の検出試薬を含む卵巣子宮内膜症の検査用キット。
【請求項１６】
OEX 234の核酸配列に結合する1つまたは複数の核酸を含む卵巣子宮内膜症の検査用アレイ。
【請求項１７】
被験者におけるOEX 234遺伝子の発現、または同遺伝子にコードされたポリペプチドの活性を阻害する化合物の薬学的有効量を含む、被験者の卵巣子宮内膜症を治療または予防するための組成物。
【請求項１８】
OEX 234の核酸配列にコードされたポリペプチド、または該ポリペプチドの免疫学的に活性な断片を含むワクチンの薬学的有効量を含む、被験者の卵巣子宮内膜症を治療または予防するための組成物。
【請求項１９】
OEX 234遺伝子にコードされたポリペプチドの発現または活性を減少させる化合物の薬学的有効量を含む、被験者の卵巣子宮内膜症を治療または予防するための組成物。
【請求項２０】
OEX 234の核酸配列に対するアンチセンスオリゴヌクレオチド、または低分子干渉RNAの薬学的有効量を含む、卵巣子宮内膜症を治療または予防するための組成物。
【請求項２１】
OEX 234遺伝子の任意の1つにコードされたポリペプチドに結合する抗体もしくはその断片の薬学的有効量を含む、卵巣子宮内膜症を治療または予防するための組成物。
【請求項２２】
請求項9〜14のいずれか一項記載の方法により選択される化合物の薬学的有効量を含む、卵巣子宮内膜症を治療または予防するための組成物。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００２１
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００２１】
OEX 1〜97およびOEX 186〜242の発現レベルが、卵巣子宮内膜症対照レベルと比較して増加するか同等であれば、被験者が卵巣子宮内膜症であるか、または同疾患を発症する危険性があることを意味する。これとは対照的に、OEX 98〜185の発現レベルが、正常対照レベルと比較して減少するか同等であれば、被験者が卵巣子宮内膜症であるか、または同疾患を発症する危険性があることを意味する。
【手続補正３】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００６１
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００６１】
被験者に由来する生物学的試料中に検出されるOEX 1〜97および186〜242の発現レベルが、卵巣子宮内膜症対照レベルと比較して増加するか、または同等であれば、被験者が卵巣子宮内膜症であるか、または卵巣子宮内膜症を発症する危険性があることを意味する。これとは対照的に、被験者に由来する生物学的試料中に検出されるOEX 98〜185のレベルが、卵巣子宮内膜症対照レベルと比較して減少するか、または同等であれば、被験者が卵巣子宮内膜症であるか、または卵巣子宮内膜症を発症する危険性があることを意味する。
【手続補正４】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００８８
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００８８】
任意のOEXタンパク質の生物学的活性を有するポリペプチドを単離する、当技術分野で周知の別の方法には例えばハイブリダイゼーション技術を用いる方法がある（Sambrookら（1989）Molecular Cloning、第2版、9.47-9.58、Cold Spring Harbor Lab. Press）。当業者であれば、OEXタンパク質をコードするDNA配列の全体もしくは一部と高い相同性を有するDNAを容易に単離し、OEXタンパク質の生物学的活性を有するポリペプチドを、単離されたDNAから単離することができる。OEXポリペプチドは、OEX 1〜242から選択される遺伝子の全体もしくは一部とハイブリダイズするDNAにコードされ、かつOEXタンパク質の生物学的活性を有するポリペプチドを含む。これらのポリペプチドは、ヒトに由来するタンパク質に対応する哺乳類ホモログ（例えばサル、ラット、ウサギ、およびウシの遺伝子にコードされたポリペプチド）を含む。動物に由来するOEX 1〜242から選択された遺伝子に高度に相同なcDNAを単離する際には、子宮内膜嚢胞に由来する組織を用いることが特に好ましい。