【手続補正書】
【提出日】平成17年6月2日(2005.6.2)
【手続補正１】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】特許請求の範囲
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】  ＴＳ１０ｑ２３.３と称する腫瘍抑制因子の突然変異体をコードするＤＮＡ、ＲＮＡを含む単離核酸またはその相補体であって、該突然変異体は、以下の突然変異からなる群から選ばれる：
（ａ）イントロン２の−１位がＧからＴに変化するミスセンス突然変異；
（ｂ）エクソン２の１１２および１１３位がＣＣからＴＴに変化するミスセンス突然変異；
（ｃ）エクソン５の３２３位がＴからＧに変化するミスセンス突然変異；
（ｄ）エクソン５の３３１位がＴからＧに変化するミスセンス突然変異；
（ｅ）エクソン５の３３５位がＴからＧに変化するミスセンス突然変異；
（ｆ）エクソン５の４０７位がＧからＡに変化するミスセンス突然変異；
（ｇ）エクソン５の４５５位がＴからＣに変化するミスセンス突然変異；
（ｈ）エクソン６の５１７位がＣからＴに変化するミスセンス突然変異；
（ｉ）エクソン６の５１８位がＧからＣに変化するミスセンス突然変異；
（ｌ）エクソン７の７０５位のＡが欠失するフレームシフト突然変異；および
（ｍ）エクソン７の８２３位のＧが欠失するフレームシフト突然変異。
【請求項２】  ＴＳ１０ｑ２３.３と称する腫瘍抑制因子の突然変異体をコードするＤＮＡ、ＲＮＡを含む単離核酸またはその相補体であって、該突然変異体は、以下の突然変異からなる群から選ばれる：
（ａ）腫瘍抑制因子の第３８アミノ酸がＰＲＯからＰＨＥに変化；
（ｂ）腫瘍抑制因子の第１０８アミノ酸がＬＥＵからＡＲＧに変化；
（ｃ）腫瘍抑制因子の第１１１アミノ酸がＴＲＰからＡＲＧに変化；
（ｄ）腫瘍抑制因子の第１１２アミノ酸がＬＥＵからＡＲＧに変化；
（ｅ）腫瘍抑制因子の第１３６アミノ酸がＣＹＳからＴＹＲに変化；
（ｆ）腫瘍抑制因子の第１５２アミノ酸がＬＥＵからＰＲＯに変化；
（ｇ）腫瘍抑制因子の第１７３アミノ酸がＡＲＧからＣＹＳに変化；および
（ｈ）腫瘍抑制因子の第１７３アミノ酸がＡＲＧからＰＲＯに変化。
【請求項３】  配列番号：５５のアミノ酸配列をコードするＤＮＡまたはＲＮＡを含む単離核酸。
【請求項４】  ＤＮＡが配列番号：５４のコーディング配列を含む請求項３に記載の単離核酸またはその相補体。
【請求項５】  ＤＮＡが配列番号：５６の配列をもつＤＮＡを含む単離核酸またはその相補体。
【請求項６】  ＤＮＡが配列番号：６４の配列をもつＤＮＡを含む単離核酸。
【請求項７】  相補的ＤＮＡであり、該腫瘍抑制因子をコードする該領域またはその相補体に作動可能に連結したプロモーターをさらに含む、請求項１から６のいずれかひとつに記載の核酸。
【請求項８】  該腫瘍抑制因子をコードする該領域に作動可能に連結したポリアデニル化シグナルをさらに含む、請求項７に記載の核酸。
【請求項９】  複製起点をさらに含む、請求項８に記載の核酸。
【請求項１０】  レトロウイルス、アデノウイルス、ヘルペスウイルス、ワクシニアウイルスおよびアデノ関連ウイルスよりなる群から選ばれたウイルスベクターである、請求項９に記載の核酸。
【請求項１１】  ウイルス粒子中にパッケージングされている、請求項１０に記載の核酸。
【請求項１２】  リポソーム中にパッケージングされている、請求項９に記載の核酸。
【請求項１３】  (i)患者からサンプルを採取し、次いで
(ii)該サンプルの細胞中での機能性ＴＳ１０ｑ２３.３遺伝子産物の発現を測定する
段階を含む、カウデン症候群の診断方法。
【請求項１４】  細胞が、胸、卵巣細胞、胸腺細胞および子宮内膜細胞からなる群から選ばれる、請求項１３に記載の方法。
【請求項１５】  該サンプルが組織サンプルまたは流体サンプルである、請求項１３に記載の方法。
【請求項１６】  該測定が、該サンプルからの核酸をアッセイすることを含む、請求項１３に記載の方法。
【請求項１７】  該サンプルを、該核酸を増幅するのに適した条件に供することをさらに含む、請求項１６に記載の方法。
【請求項１８】  該測定が、該サンプルをＴＳ１０ｑ２３.３に免疫学的に結合する抗体と接触させることをさらに含む、請求項１３に記載の方法。
【請求項１９】  該サンプルのタンパク質をＥＬＩＳＡに供することをさらに含む、請求項１８に記載の方法。
【請求項２０】  ＴＳ１０ｑ２３.３の発現を非カウデン症候群サンプル中でのＴＳ１０ｑ２３.３の発現と比較する工程をさらに含む、請求項１３に記載の方法。
【請求項２１】  該比較が、ＴＳ１０ｑ２３.３の発現レベルを評価することを含む、請求項２０に記載の方法。
【請求項２２】  該比較が、ＴＳ１０ｑ２３.３遺伝子、タンパク質または転写物の構造を評価することを含む、請求項２０に記載の方法。
【請求項２３】  該評価が、シーケンシング、野性型オリゴヌクレオチドハイブリダイゼーション、突然変異体オリゴヌクレオチドハイブリダイゼーション、ＳＳＣＰ、ＰＣＲおよびＲＮアーゼ保護よりなる群から選ばれる、請求項２２に記載の方法。
【請求項２４】  該評価が野性型または変異体オリゴヌクレオチドハイブリダイゼーションであり、該オリゴヌクレオチドがチップまたはウエハー上のアレイとして配置される、請求項２２に記載の方法。
【請求項２５】  カウデン症候群のサンプルがＴＳ１０Ｑｑ２３．３のコーディング配列に突然変異を含む、請求項２０に記載の方法。
【請求項２６】  突然変異がフレームシフト突然変異である、請求項２５に記載の方法。
【請求項２７】  突然変異がエクソン７にある、請求項２６に記載の方法。
【請求項２８】  突然変異がＴＳ１０Ｑｑ２３．３遺伝子産物の未成熟終結を引き起こす、請求項２７に記載の方法。
【請求項２９】  突然変異が欠失突然変異である、請求項２５に記載の方法。
【請求項３０】  欠失がエクソン８にある、請求項２９に記載の方法。
【請求項３１】  突然変異が挿入突然変異である、請求項２５に記載の方法。
【請求項３２】  挿入がエクソン２にある、請求項２５に記載の方法。
【請求項３３】  (i)患者からサンプルを採取し、次いで
(ii)該サンプルの細胞中での機能性ＴＳ１０ｑ２３.３遺伝子産物の発現を測定する
段階を含む、乳癌になりやすい患者の診断方法。
【請求項３４】  細胞が、胸、卵巣細胞、胸腺細胞および子宮内膜細胞からなる群から選ばれる、請求項３３に記載の方法。
【請求項３５】  該サンプルが組織サンプルまたは流体サンプルである、請求項３３に記載の方法。
【請求項３６】  該測定が、該サンプルからの核酸をアッセイすることを含む、請求項３３に記載の方法。
【請求項３７】  該サンプルを、該核酸を増幅するのに適した条件に供することをさらに含む、請求項３６に記載の方法。
【請求項３８】  該測定が、該サンプルをＴＳ１０ｑ２３.３に免疫学的に結合する抗体と接触させることをさらに含む、請求項３３に記載の方法。
【請求項３９】  該サンプルのタンパク質をＥＬＩＳＡに供することをさらに含む、請求項３８に記載の方法。
【請求項４０】  ＴＳ１０ｑ２３.３の発現を正常サンプル中でのＴＳ１０ｑ２３.３の発現と比較する工程をさらに含む、請求項３３に記載の方法。
【請求項４１】  該比較が、ＴＳ１０ｑ２３.３の発現レベルを評価することを含む、請求項４０に記載の方法。
【請求項４２】  該比較が、ＴＳ１０ｑ２３.３遺伝子、タンパク質または転写物の構造を評価することを含む、請求項４０に記載の方法。
【請求項４３】  該評価が、シーケンシング、野性型オリゴヌクレオチドハイブリダイゼーション、突然変異体オリゴヌクレオチドハイブリダイゼーション、ＳＳＣＰ、ＰＣＲおよびＲＮアーゼ保護よりなる群から選ばれる、請求項４２に記載の方法。
【請求項４４】  該評価が野性型または変異体オリゴヌクレオチドハイブリダイゼーションであり、該オリゴヌクレオチドがチップまたはウエハー上のアレイとして配置される、請求項４３に記載の方法。
【請求項４５】  サンプルがＴＳ１０Ｑｑ２３．３のコーディング配列に突然変異を含む、請求項３３に記載の方法。