【手続補正書】
【提出日】平成18年3月30日(2006.3.30)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
以下：
ａ）図２のタンパク質の８個、９個、１０個、または１１個連続するアミノ酸のペプチド；
ｂ）表ＶＩＩＩからＸＸＩのペプチド；
ｃ）表ＸＸＩＩ〜ＸＬＶのペプチド；または
ｄ）表ＸＬＶＩ〜ＸＬＩＸのペプチド
を含むか、これらから本質的になるか、またはこれらからなる、組成物。
【請求項２】
図２のタンパク質に関連するタンパク質を含む、請求項１に記載の組成物。
【請求項３】
図２に示される全アミノ酸配列に対して、少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、または９９％相同である、請求項２に記載のタンパク質。
【請求項４】
前記物質は、図２のタンパク質のアミノ酸配列に由来するＣＴＬポリペプチド、またはそのアナログを含む、請求項１に記載の組成物。
【請求項５】
前記エピトープは、図２の全アミノ酸配列ではないという但し書きによってさらに限定される、請求項４に記載の組成物。
【請求項６】
前記ポリペプチドは、図２のタンパク質の全アミノ酸配列ではないという但し書きによってさらに限定される、請求項１に記載の組成物。
【請求項７】
図２のアミノ酸配列に由来する抗体ポリペプチドエピトープを含む、請求項１に記載の組成物。
【請求項８】
前記エピトープは図２の全アミノ酸配列ではないという但し書きによってさらに限定される、請求項７に記載の組成物。
【請求項９】
前記抗体エピトープは、前記ペプチドの末端までの任意の自然数の増分において図２の少なくとも５個のアミノ酸のペプチド領域を含む、請求項７に記載の組成物であって、前記エピトープは、以下：
ａ）図５の親水性プロフィールにおいて０．５を超える値を有するアミノ酸位置、
ｂ）図６のヒドロパシープロフィールにおいて０．５未満の値を有するアミノ酸位置、
ｃ）図７の利用可能残基％プロフィールにおいて０．５を超える値を有するアミノ酸位置、
ｄ）図８の平均可撓性プロフィールにおいて０．５を超える値を有するアミノ酸位置、
ｅ）図９のβ−ターンプロフィールにおいて０．５を超える値を有するアミノ酸位置、
ｆ）ａ）〜ｅ）のうちの少なくとも２つの組み合わせ、
ｇ）ａ）〜ｅ）のうちの少なくとも３つの組み合わせ、
ｈ）ａ）〜ｅ）のうちの少なくとも４つの組み合わせ、
ｉ）ａ）〜ｅ）のうちの５つの組み合わせ、
から選択されるアミノ酸位置を含む、組成物。
【請求項１０】
請求項１に記載のタンパク質をコードする、ポリヌクレオチド。
【請求項１１】
図２に示される核酸分子を含む、請求項１０に記載のポリヌクレオチド。
【請求項１２】
前記コードされるタンパク質は、図２の全アミノ酸配列ではないという但し書きによってさらに限定される、請求項１０に記載のポリヌクレオチド。
【請求項１３】
前記物質は、図２の核酸配列にコード配列を含むポリヌクレオチドを含む、請求項１１に記載の組成物。
【請求項１４】
請求項１に記載のさらなるペプチドをコードスルさらなるヌクレオチド配列をさらに含む、請求項１１に記載のポリヌクレオチド。
【請求項１５】
請求項１０に記載のポリヌクレオチドに十分に相補的なポリヌクレオチドを含む、組成物。
【請求項１６】
図２のタンパク質に対する哺乳動物免疫応答を生成するための組成物であって、該組成物は、以下：
ａ）１９１Ｐ４Ｄ１２（ｂ）関連タンパク質および／または
ｂ）該タンパク質をコードスルヌクレオチド配列、
の一部を含み、それによって免疫応答が該タンパク質に対して生成される、組成物。
【請求項１７】
請求項１６に記載の免疫応答を生成するための組成物であって、該組成物は、以下：
少なくとも１つのＴ細胞エピトープまたは少なくとも１つのＢ細胞エピトープを含む１９１Ｐ４Ｄ１２（ｂ）関連タンパク質であって、ここで該エピトープは、哺乳動物免疫系Ｔ細胞またはＢ細胞それぞれと接触し、それによって、該Ｔ細胞またはＢ細胞が、活性化される、組成物。
【請求項１８】
請求項１７に記載の組成物であって、前記免疫系細胞が、Ｂ細胞であり、それによって前記誘導されたＢ細胞が、１９１Ｐ４Ｄ１２（ｂ）関連タンパク質に対して特異的に結合する抗体を産生する、組成物。
【請求項１９】
請求項１７に記載の組成物であって、前記免疫系細胞が、細胞傷害性Ｔ細胞（ＣＴＬ）であるＴ細胞であって、それによって、前記活性化されたＣＴＬが、１９１Ｐ４Ｄ１２（ｂ）関連タンパク質を発現する自己細胞を殺傷する、組成物。
【請求項２０】
請求項１７に記載の組成物であって、前記免疫系細胞が、ヘルパーＴ細胞（ＨＴＬ）であるＴ細胞であって、それによって、前記活性化されたＨＴＬが、サイトカインを分泌し、該サイトカインが、細胞傷害性Ｔ細胞（ＣＴＬ）の細胞傷害性またはＢ細胞の抗体産生活性を助長する、組成物。
【請求項２１】
サンプル中において、１９１Ｐ４Ｄ１２（ｂ）関連タンパク質または１９１Ｐ４Ｄ１２（ｂ）関連ポリヌクレオチドの存在を検出する方法であって、該方法は、
該サンプルを、１９１Ｐ４Ｄ１２（ｂ）関連タンパク質または１９１Ｐ４Ｄ１２（ｂ）関連ポリヌクレオチドそれぞれに特異的に結合する物質と接触させる工程、および
該物質と、該１９１Ｐ４Ｄ１２（ｂ）関連タンパク質または該１９１Ｐ４Ｄ１２（ｂ）関連ポリヌクレオチドそれぞれとの複合体の存在を測定する工程、
を包含する、方法。
【請求項２２】
サンプル中の１９１Ｐ４Ｄ１２（ｂ）関連タンパク質の存在を検出するための、請求項２１に記載の方法であって、該方法は、
該サンプルを抗体またはそのフラグメントと接触させる工程であって、該抗体またはそのフラグメントのいずれかが、該１９１Ｐ４Ｄ１２（ｂ）関連タンパク質と特異的に結合する工程；および
該抗体またはそのフラグメントと１９１Ｐ４Ｄ１２（ｂ）関連タンパク質との複合体の存在を決定する工程
を包含する、方法。
【請求項２３】
癌に罹患している患者または癌に罹患していることが疑われる患者から前記サンプルを採取する工程をさらに包含する、請求項２１に記載の方法。
【請求項２４】
サンプル中の図２のｍＲＮＡのタンパク質の存在を検出するための請求項２１に記載の方法であって、該方法は、
少なくとも１つのプライマーを用いる逆転写によって該サンプルからｃＤＮＡを産生する工程；
該産生されたｃＤＮＡを、センスプライマーおよびアンチセンスプライマーとして１９１Ｐ４Ｄ１２（ｂ）ポリヌクレオチドを使用して増幅する工程であって、ここで該センスプライマーおよびアンチセンスプライマーとして使用される１９１Ｐ４Ｄ１２（ｂ）ポリヌクレオチドが、１９１Ｐ４Ｄ１２（ｂ）  ｃＤＮＡを増幅するように働く、工程；ならびに
該増幅された１９１Ｐ４Ｄ１２（ｂ）  ｃＤＮＡの存在を検出する工程
を包含する、方法。
【請求項２５】
癌に罹患している患者または癌に罹患していることが疑われる患者に由来する生物学的サンプル中の１つ以上の１９１Ｐ４Ｄ１２（ｂ）遺伝子産物をモニタリングするための、請求項２１に記載の方法であって、該方法は、
個体に由来する組織サンプル中の細胞によって発現される１つ以上の１９１Ｐ４Ｄ１２（ｂ）遺伝子産物の状態を決定する工程；
該決定された状態を、対応する正常サンプル中の１つ以上の１９１Ｐ４Ｄ１２（ｂ）遺伝子産物の状態と比較する工程；および
該正常サンプルに比較して、該サンプル中の１つ以上の１９１Ｐ４Ｄ１２（ｂ）の異常な遺伝子産物の存在を同定する工程
を包含する、方法。
【請求項２６】
請求項２５に記載の方法であって、該方法は、１９１Ｐ４Ｄ１２（ｂ）  ｍＲＮＡの増加した遺伝子産物または１９１Ｐ４Ｄ１２（ｂ）タンパク質の１つ以上が存在するか否かを決定し、それによって、前記正常組織産物に対する前記試験サンプル中の増加した遺伝子産物の１つ以上の存在が、癌の存在または状態を示す工程をさらに包含する、方法。
【請求項２７】
前記癌が、表Ｉに示される組織に存在する、請求項２６に記載の方法。
【請求項２８】
以下：
ａ）図２のタンパク質の状態を調節する物質か、または
ｂ）図２のタンパク質によって調節され、それによって図２のタンパク質を発現する細胞の状態を調節する分子、
を含有する、組成物。
【請求項２９】
生理学的に受容可能なキャリアをさらに含む、請求項２８に記載の組成物。
【請求項３０】
ヒト単位投薬形態の請求項２８に記載の組成物を含有する、薬学的組成物。
【請求項３１】
前記物質が、抗体またはそのフラグメントを含み、該抗体またはそのフラグメントが、図２のタンパク質に特異的に結合する、請求項２８に記載の組成物。
【請求項３２】
モノクローナルである、請求項３１に記載の抗体またはそのフラグメント。
【請求項３３】
ヒト抗体、ヒト化抗体またはキメラ抗体である、請求項３１に記載の抗体。
【請求項３４】
請求項３１に記載の抗体を産生する、非ヒトトランスジェニック動物。
【請求項３５】
請求項３２に記載の抗体を産生する、ハイブリドーマ。
【請求項３６】
図２のタンパク質を発現する細胞に対して細胞毒性剤または診断剤を送達するための組成物であって、該組成物は、
請求項４に記載の抗体またはそのフラグメントに結合される、細胞毒性剤または診断剤であって、ここで該細胞は、抗体−薬剤またはフラグメント−薬剤結合体に曝露される細胞毒性剤または診断剤；
を含む、組成物。
【請求項３７】
前記物質が、抗体またはそのフラグメントをコードするポリヌクレオチドを含有し、該抗体またはそのフラグメントのいずれかが、図２のタンパク質に免疫特異的に結合する、請求項２８に記載の組成物。
【請求項３８】
前記物質が、ａ）１９１Ｐ４Ｄ１２（ｂ）コード配列を有するポリヌクレオチドを切断するリボザイム、またはｂ）該リボザイムをコードする核酸分子；および、生理学的に受容可能なキャリア、を含有する、請求項２８に記載の組成物。
【請求項３９】
前記物質が、ヒトＴ細胞を含み、ここで、該Ｔ細胞が、特定のＨＬＡ分子の状況で、１９１Ｐ４Ｄ１２（ｂ）ペプチド部分配列を特異的に認識する、請求項２８に記載の組成物。
【請求項４０】
図２のタンパク質を発現する癌細胞の増殖を阻害するための組成物であって、該組成物は、請求項２８に記載の組成物を含む、組成物。
【請求項４１】
図２のタンパク質を発現する癌細胞の増殖を阻害する請求項４０に記載の組成物であって、該組成物は、抗体またはそのフラグメントを含み、該抗体またはそのフラグメントのいずれかが、１９１Ｐ４Ｄ１２（ｂ）関連タンパク質に特異的に結合する、組成物。
【請求項４２】
図２のタンパク質を発現する癌細胞の増殖を阻害する請求項４０に記載の組成物であって、該組成物は、１９１Ｐ４Ｄ１２（ｂ）関連タンパク質を含む、組成物。
【請求項４３】
図２のタンパク質を発現する癌細胞の増殖を阻害する請求項４０に記載の組成物であって、該組成物は、１９１Ｐ４Ｄ１２（ｂ）関連タンパク質に対するコード配列を含むポリヌクレオチド、または１９１Ｐ４Ｄ１２（ｂ）関連タンパク質に対するコード配列に相補的であるポリヌクレオチド、を含む、組成物。
【請求項４４】
図２のタンパク質を発現する癌細胞の増殖を阻害する請求項４０に記載の組成物であって、該組成物は、図２のタンパク質をコードするポリヌクレオチドを切断するリボザイムを含む、組成物。
【請求項４５】
図２のタンパク質および特定のＨＬＡ分子を発現する癌細胞の増殖を阻害する請求項４０に記載の組成物であって、該組成物は、
ヒトＴ細胞を含み、ここで、該Ｔ細胞が、図２のタンパク質のペプチド部分配列を特異的に認識する一方、該部分配列が、特定のＨＬＡ分子の状況下に存在する、組成物。
【請求項４６】
請求項４０に記載の組成物であって、該組成物は、単鎖モノクローナル抗体をコードするヌクレオチドを送達するベクターを含み、それによって該コードされる単鎖抗体が、図２のタンパク質を発現する癌細胞内で細胞内的に発現される、組成物。