【手続補正書】
【提出日】平成18年3月23日(2006.3.23)
【手続補正１】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】特許請求の範囲
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】  薬理許容担体にポリペプチドを含む肺炎球菌感染を処置または予防するワクチンであって、前記ポリペプチドは、配列識別番号の１の配列に少なくとも９０％の同一性を有するαヘリックス部分を含み、また前記ポリペプチドは、コリン結合部分を含まず、前記ワクチンのポリペプチド容量は肺炎球菌感染を処置し、または予防するのに有効な量で存在することを特徴とするワクチン。
【請求項２】  前記αヘリックス部分が配列識別番号１の配列に少なくとも９５％の同一性を有することを特徴とする請求項１記載のワクチン。
【請求項３】  前記αヘリックス部分が配列識別番号１の配列に少なくとも９７％の同一性を有することを特徴とする請求項１記載のワクチン。
【請求項４】  前記αヘリックス部分のアミノ酸配列が配列識別番号１９のアミノ酸配列に少なくとも９０％の同一性を有することを特徴とする請求項１記載のワクチン。
【請求項５】  前記αヘリックス部分のアミノ酸配列が配列識別番号１９のアミノ酸配列に少なくとも９５％の同一性を有することを特徴とする請求項１記載のワクチン。
【請求項６】  前記ワクチンが中耳炎，敗血症，髄膜炎および大葉性肺炎感染を予防あるいは処置するためのものであることを特徴とする請求項１記載のワクチン。
【請求項７】  前記ワクチンが浸潤性感染のためのものであることを特徴とする請求項６記載のワクチン。
【請求項８】  前記ワクチンが肺炎連鎖球菌によりもたらされた中耳炎感染症のためのものであることを特徴とする請求項６記載のワクチン。
【請求項９】  前記ポリペプチドが配列識別番号３乃至１８のそれぞれのアミノ酸配列より成るグループから選択される部材に少なくとも９０％の同一性を有するアミノ酸配列を含むことを特徴とする請求項１記載のワクチン。
【請求項１０】  前記ポリペプチドが配列識別番号３乃至１８のそれぞれのアミノ酸配列より成るグループから選択される部材に少なくとも９５％の同一性を有するアミノ酸配列を含むことを特徴とする請求項１記載のワクチン。
【請求項１１】  配列識別番号１の配列に少なくとも９０％の同一性を有するαヘリック部分を含むポリペプチドに対して増強された抗体であって、前記ポリペプチドはコリン結合部分を含まないことを特徴とする抗体。
【請求項１２】  前記αヘリックス部分のアミノ酸配列が配列識別番号１９のアミノ酸配列に少なくとも９５％の同一性を有することを特徴とする請求項１１記載の抗体。
【請求項１３】  前記αヘリックス部分のアミノ酸配列が、
（ａ）配列識別番号１のアミノ酸、および
（ｂ）配列識別番号１９のアミノ酸配列
より成るグループから選択された部材のアミノ酸に少なくとも９０％の同一性を有することを特徴とする請求項１１記載の抗体。
【請求項１４】  前記αヘリックス部分のアミノ酸配列が、
（ａ）配列識別番号１のアミノ酸配列、および
（ｂ）配列識別番号１９のアミノ酸配列
より成るグループから選択された部材のアミノ酸配列に少なくとも９５％の同一性を有することを特徴とする請求項１１記載の抗体。
【請求項１５】  前記ポリペプチドが配列識別番号３乃至１８のそれぞれのアミノ酸配列より成るグループから選択される部材に少なくとも９５％同一性を有するアミノ酸配列を含むことを特徴とする請求項１１記載の抗体。
【請求項１６】  前記抗体が肺炎連鎖球菌感染を検出する抗体であることを特徴とする請求項１１記載の抗体。
【請求項１７】  前記抗体が肺炎連鎖球菌感染を予防およびもしくは処置するのに有効であることを特徴とする請求項１５記載の抗体。
【請求項１８】  前記抗体が肺炎球菌細菌、タイプ１乃至５，６Ａ，６Ｂ，７Ｆ，８，９Ｎ，９Ｖ，１０Ａ，１１Ａ，１２Ｆ，１４，１５Ｂ，１７Ｆ，１８Ｃ，１９Ｆ，１９Ａ，２０，２２Ｆ，２３Ｆ，および３３Ｆでもたらされる肺炎球菌感染の予防およびもしくは処置に有効であることを特徴とする請求項１５記載の抗体。
【請求項１９】
（ａ）請求項１記載のワクチン、および
（ｂ）配列識別番号３乃至１８より成るグループから選択される部材のアミノ酸配列に少なくとも９０％の同一性を有するアミノ酸配列を含むポリペプチドである免疫原に対して増強された少なくとも１個の抗体、
より成るグループから選択される部材の使用法であって、そのポリペプチドが、宿主にある肺炎球菌感染を予防し、およびまたは処置するための薬剤を製造する際にコリン結合部分を含まないことを特徴とする使用法。
【請求項２０】  配列識別番号３乃至１８のアミノ酸配列より成るグループから選択される部材に少なくとも９０％の同一性を有するアミノ酸配列を含む単離ポリペプチドであって、前記ポリペプチドは配列識別番号１の配列に少なくとも９０％の同一性を有するαヘリックス部分を含み、また前記ポリペプチドはコリン結合部分を含まないことを特徴とする単離ペプチド。
【請求項２１】
（ａ）配列識別番号３乃至１８のそれぞれのアミノ酸より成るグループらか選択される部材を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチドコード配列であって、ここで前記ポリペプチドが配列識別番号１の配列に少なくとも９０％の同一性を有するαヘリックス部分を含むもの、および
（ｂ）（ａ）の補体
より成るグループから選択される部材に少なくとも９０％の同一性を有するポリヌクレオチド配列を含み、ここで前記ポリヌクレオチドがコリン結合部分を含むポリペプチドをコードしないことを特徴とする単離ポリヌクレオチド。
【請求項２２】  前記ポリペプチドが、更にＨＰＳ領域を含まないことを特徴とする請求項１記載のワクチン。
【請求項２３】  前記αヘリックス部分が、配列識別番号１の配列を含むことを特徴とする請求項１記載のワクチン。
【請求項２４】  前記αヘリックス部分が、配列識別番号１９のアミノ酸配列を含むことを特徴とする請求項１記載のワクチン。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０００５
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０００５】
コリンリン酸と非共有結合であるコリン結合タンパク質（ＣＢＰｓ）のファミリーが肺炎球菌の表面に存在し、テイコ酸あるいはリポテイコ酸との非共有会合を持つ。このようなファミリーの例はコリン結合タンパク質Ａ（ＣｂｐＡ）であり、つまりＣＢＰの約７５キロダルトン重量型で、これはユニークＮ末端ドメイン、プロリン富化領域、およびコリン結合の原因となる多重２０アミノ酸反復よりなるＣ末端ドメインを含む。ＣｂｐＡのＮ端末部分の分節は、その三次元構造の部分としてのαヘリックスを形成する。
【手続補正３】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００２６
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００２６】
も一つの見地において、本発明はその発明の前に記載のポリペプチドをコード化するポリヌクレオチドを提供する。本発明のポリヌクレオチドはＲＮＡの形であるか、あるいはそのＤＮＡがｃＤＮＡ，ゲノムＤＮＡおよび合成ＤＮＡを含むＤＮＡの形である。ＤＮＡは二本鎖もしくは一本鎖であり、もし一本鎖である場合にはコーディング鎖あるいは非コーディング鎖（アンチセンス鎖）である。配列識別番号３−１８の少なくとも１個のアミノ酸配列を含むポリペプチド（あるいはこのようなポリペプチドのアミノ酸配列に少なくとも９０％の同一性を持つポリペプチド）をコード化するポリヌクレオチドは配列識別番号２０−３５に示されるコーディング配列の一つであり得るし、あるいは遺伝子コードの重複性あるいは縮重の結果としてコーディング配列が配列識別番号２０−３５のＤＮＡとして同じポリペプチドをコード化する異なったコーディング配列のものである。
【手続補正４】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００４１
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００４１】
このような免疫原組成物のとりわけ望ましい実施例はワクチン（あるいは診断薬もしくはワクチンとして有用な抗体を産生する免疫原）としての使用であり、ここで免疫原組成物の活性成分は下記のものよりなるグループから選択された少なくとも１個の部材よりなる分離ポリペプチドである。すなわち
（ａ）配列識別番号３−１８から選択されるアミノ酸配列、
（ｂ）（ａ）に少なくとも９０％の同一性、望ましくは（ａ）に少なくとも９５％の同一性、またより望ましくは（ａ）に少なくとも９７％の同一性を持つポリペプチド、あるいは
（ｃ）断片が配列識別番号１であるコンセンサス配列に対応する少なくとも１個のαヘリックス部分を含み、前記断片がコリン結合領域を含まない（ａ）もしくは（ｂ）の断片、
よりなるグループから選択された少なくとも１個の部材よりなる分離ポリペプチドである。望ましくは、このようなワクチンは自然タンパク質でのアミノ酸配列の一部として生じるコリン結合領域、ＨＰＳ領域のいずれも含まないポリペプチドを利用する。