【手続補正書】
【提出日】平成17年11月8日(2005.11.8)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
以下の配列：
Ｆｒ１−ＣＤＲ１−Ｆｒ２−ＣＤＲ２−Ｆｒ３−ＣＤＲ３−Ｆｒ４
（配列中、
【化１】
2005514063.tif 000001
【表１】
2005514063.tif 000002
である）
からなるイヌ重鎖可変ドメインポリペプチド。
【請求項２】
以下の配列：
Ｆｒ１−ＣＤＲ１−Ｆｒ２−ＣＤＲ２−Ｆｒ３−ＣＤＲ３−Ｆｒ４
（配列中、
【化２】
2005514063.tif 000003
である）
からなる請求項１に記載のイヌ重鎖可変ドメインポリペプチド。
【請求項３】
以下の配列：
Ｆｒ１−ＣＤＲ１−Ｆｒ２−ＣＤＲ２−Ｆｒ３−ＣＤＲ３−Ｆｒ４
（配列中、
【表２】
2005514063.tif 000004
である）
からなる請求項１に記載のイヌ重鎖可変ドメインポリペプチド。
【請求項４】
ＣＤＲがすべてイヌ抗体由来である、請求項１〜３のいずれか一項に記載のイヌ重鎖可変ドメインポリペプチド。
【請求項５】
ＣＤＲがすべて同一の非イヌ抗体由来である、請求項１〜３のいずれか一項に記載のイヌ重鎖可変ドメインポリペプチド。
【請求項６】
２つのＣＤＲが同一の非イヌ抗体由来であり、第３のＣＤＲがイヌＣＤＲである、請求項１〜３のいずれか一項に記載のイヌ重鎖可変ドメインポリペプチド。
【請求項７】
前記イヌＣＤＲがＣＤＲ１である、請求項６に記載のイヌ重鎖可変ドメインポリペプチド。
【請求項８】
ＣＤＲ１が
ａ）Ｃ’２Ｃ’３Ｃ’４Ｃ’５Ｃ’６Ｃ’７Ｃ’８Ｃ’９Ｃ’１０Ｃ’１１であって、
【表３】
2005514063.tif 000005
である、
ｂ）次の
【表４】
2005514063.tif 000006
からなる群から選択される、
ｃ）Ｃ’１Ｃ’２Ｃ’３Ｃ’４Ｃ’５Ｃ’６Ｃ’７Ｃ’８Ｃ’９Ｃ’１０であって、
【表５】
2005514063.tif 000007
である、
ｄ）ＧＹＴＦＴＤＹＹＭＨおよびＧＹＩＦＩＤＱＹＭＨからなる群から選択される、
ｅ）Ｃ’１Ｃ’２Ｃ’３Ｃ’４Ｃ’５Ｃ’６Ｃ’７Ｃ’８Ｃ’９Ｃ’１０であって、
【表６】
2005514063.tif 000008
である、
ｆ）ＧＳＶＴＤＩＨＹＷＳおよびＧＳＶＮＳＧＹＹＷＳからなる群から選択される、または
ｇ）マウス１５Ａ２抗体ＣＤＲ１、ＳＧＹＳＦＴＤＹＦＭＮである、
請求項１〜３のいずれか一項に記載のイヌ重鎖可変ドメインポリペプチド。
【請求項９】
ＣＤＲ２が
ａ）Ｃ’’１Ｃ’’２Ｃ’’３Ｃ’’４Ｃ’’５Ｃ’’６Ｃ’’７Ｃ’’８Ｃ’’９Ｃ’’１０Ｃ’’１１Ｃ’’１２Ｃ’’１３Ｃ’’１４Ｃ’’１５Ｃ’’１６Ｃ’’１７であって、
【表７】
2005514063.tif 000009
である、
ｂ）次の
【表８】
2005514063.tif 000010
からなる群から選択される、
ｃ）Ｃ’’１Ｃ’’２Ｃ’’３Ｃ’’４Ｃ’’５Ｃ’’６Ｃ’’７Ｃ’’８Ｃ’’９Ｃ’’１０Ｃ’’１１Ｃ’’１２Ｃ’’１３Ｃ’’１４Ｃ’’１５Ｃ’’１６であって、
【表９】
2005514063.tif 000011
である、
ｄ）ＩＤＰＥＤＧＴＴＳＹＡＱＫＦＱＧおよびＩＤＰＥＤＤＴＴＧＹＡＱＫＦＱＧからなる群から選択される、
ｅ）Ｃ’’１Ｃ’’２Ｃ’’３Ｃ’’４Ｃ’’５Ｃ’’６Ｃ’’７Ｃ’’８Ｃ’’９Ｃ’’１０Ｃ’’１１Ｃ’’１２Ｃ’’１３Ｃ’’１４Ｃ’’１５Ｃ’’１６であって、
【表１０】
2005514063.tif 000012
である、
ｆ）ＹＷＲＧＧＴＮＨＮＰＡＦＱＥＲＩおよびＹＷＳＧＴＴＨＹＮＰＴＦＱＧＲＩからなる群から選択される、または
ｇ）マウス１５Ａ２抗体ＣＤＲ２、ＲＩＮＰＦＮＧＤＰＦＹＮＱＫＦＫＧである、
請求項１〜３のいずれか一項に記載のイヌ重鎖可変ドメインポリペプチド。
【請求項１０】
ＣＤＲ３が
ａ）Ｃ’’’１Ｃ’’’２Ｃ’’’３Ｃ’’’４Ｃ’’’５Ｃ’’’６Ｃ’’’７Ｃ’’’８Ｃ’’’９Ｃ’’’１０Ｃ’’’１１Ｃ’’’１２Ｃ’’’１３Ｃ’’’１４Ｃ’’’１５Ｃ’’’１６Ｃ’’’１７Ｃ’’’１８Ｃ’’’１９Ｃ’’’２０であって、
【表１１】
2005514063.tif 000013
である、
ｂ）次の
【表１２】
2005514063.tif 000014
からなる群から選択される、
ｃ）ＧＧＳＲＰＦＮＡＦＧ、ＫＷＲＹＹＧＳＱＤ、ＤＩＷＤＦＤおよびＹＩＹＧＹＡＡＹＬＤからなる群から選択される、
ｄ）ＮＳＤおよびＬＹＲＳＮＹＬＬＤからなる群から選択される、または
ｅ）マウス１５Ａ２抗体ＣＤＲ３、ＦＹＹＧＲＹＹＡＭＤＹである、
請求項１〜３のいずれか一項に記載のイヌ重鎖可変ドメインポリペプチド。
【請求項１１】
ＣＤＲ１がマウス１５Ａ２抗体ＣＤＲ１、ＳＧＹＳＦＴＤＹＦＭＮであるか、
ＣＤＲ２がマウス１５Ａ２抗体ＣＤＲ２、ＲＩＮＰＦＮＧＤＰＦＹＮＱＫＦＫＧであるか、
ＣＤＲ３がマウス１５Ａ２抗体ＣＤＲ３、ＦＹＹＧＲＹＹＡＭＤＹである
のうち少なくともいずれかである、請求項１〜３のいずれか一項に記載のイヌ重鎖可変ドメインポリペプチド。
【請求項１２】
【化３】
2005514063.tif 000015
であるイヌ重鎖可変ドメインポリペプチド。
【請求項１３】
請求項１〜１２のいずれか一項に記載のイヌ重鎖可変ドメインポリペプチドをコードする核酸であって、各コドンが、該ポリペプチドの対応するアミノ酸をコードする遺伝暗号のいずれかのコドンであることを特徴とする核酸。
【請求項１４】
イヌ重鎖可変ドメインをコードする核酸であって、（ａ）表ＮＨ７４中の核酸のうちの１つの、フレームワークをコードする核酸配列、および（ｂ）１つまたは複数の保存的ヌクレオチド置換を含む、表ＮＨ７４中の核酸のうちの１つの、フレームワークをコードする核酸配列、から選択されるフレームワークをコードする配列からなる核酸。
【請求項１５】
イヌ重鎖可変ドメイン
【化４】
2005514063.tif 000016
をコードする、請求項１３または１４に記載の核酸。
【請求項１６】
【化５】
2005514063.tif 000017
であるイヌ軽鎖可変ドメインポリペプチド。
【請求項１７】
請求項１６に記載のイヌ軽鎖可変ドメインポリペプチドをコードする核酸であって、各コドンが、該ポリペプチドの対応するアミノ酸をコードする遺伝暗号のいずれかのコドンであり得る核酸。
【請求項１８】
請求項１〜１２のいずれか一項に記載のイヌ重鎖可変ドメインポリペプチドからなる重鎖可変ドメインと、軽鎖可変ドメインと、からなる抗体。
【請求項１９】
重鎖可変ドメインと、請求項１６に記載のイヌ軽鎖可変ドメインポリペプチドからなる軽鎖可変ドメインと、からなる抗体。
【請求項２０】
請求項１６に記載の軽鎖可変ドメインからさらになる、請求項１８に記載の抗体。
【請求項２１】
請求項１８または２０に記載の抗体の断片であって、前記抗体が特異的に結合する抗原に特異的に結合する断片。
【請求項２２】
イヌ可変ドメイン核酸配列を作製する方法であって、
ａ）イヌ生体サンプルを、イヌ定常領域配列に相補的な第１の遺伝子特異的アンチセンスプライマーと、第１の遺伝子特異的アンチセンスプライマーが相補的である配列の５’側のイヌ定常領域内の配列に相補的な第２の遺伝子特異的配列とを用いる５’ＲＡＣＥ（Ｒａｐｉｄ Ａｍｐｌｉｆｉｃａｔｉｏｎ ｏｆ ｃＤＮＡ Ｅｎｄｓ）に供する工程、および
ｂ）５’ＲＡＣＥ増幅したイヌ可変ドメインを特徴とする配列を含む、工程ａ）の５’ＲＡＣＥによって生産された核酸を単離する工程
からなり、
該イヌ生体サンプルが少なくとも１つのイヌ免疫グロブリンをコードするポリ（Ａ）＋ＲＮＡを含むことを特徴とする方法。
【請求項２３】
イヌ可変ドメイン核酸を作製する方法であって、
ａ）ドナー免疫グロブリンフレームワークまたは可変領域アミノ酸配列を、イヌ免疫グロブリンの収集物中の対応する配列と比較する工程と、
ｂ）ドナー免疫グロブリン配列と少なくとも６０％相同なイヌ免疫グロブリン（アクセプター免疫グロブリン）を、収集物から選択する工程と、
ｃ）アクセプター免疫グロブリンの１つ、２つまたは３つのＣＤＲを、ドナー免疫グロブリンの対応するＣＤＲと置換する工程と
からなる方法。
【請求項２４】
イヌ可変ドメイン核酸を作製する方法であって、アクセプターイヌ免疫グロブリンの少なくとも１つのフレームワークアミノ酸（第１のアミノ酸）を、ドナー免疫グロブリンの対応するアミノ酸（第２のアミノ酸）に置換することからなり、
ａ）第１のアミノ酸がその位置では稀であり、かつ、第２のアミノ酸がイヌ免疫グロブリン配列のその位置では一般的であるか稀である、
ｂ）第１のアミノ酸がＣＤＲと直接隣接している、
ｃ）該アクセプター免疫グロブリンのアミノ酸または該ドナー免疫グロブリンの対応するアミノ酸が、三次元免疫グロブリンモデルにおいてＣＤＲの約６Å以内にあると推定され、該免疫グロブリンが結合する抗原と相互作用するか、または対応するドナーもしくはアクセプター免疫グロブリンのＣＤＲと相互作用する、あるいは
ｄ）該アクセプター免疫グロブリンのイヌフレームワーク領域中のアミノ酸がドナー免疫グロブリンの対応するアミノ酸と異なっている、
ことを特徴とし、かつ
ドナーおよびアクセプター免疫グロブリンが互いに６０％より高い相同性を有し、少なくとも１つの共通の抗原と結合することを特徴とする方法。
【請求項２５】
前記アクセプターイヌ免疫グロブリンが、請求項１８〜２０のいずれか一項に記載の免疫グロブリンから選択される、請求項２４に記載の方法。
【請求項２６】
前記アクセプターイヌ免疫グロブリンが、請求項１６に記載の軽鎖可変ドメインからなる、請求項２４または２５に記載の方法。
【請求項２７】
請求項２５〜２６のいずれか一項に記載の方法にしたがって生産されるイヌ免疫グロブリン。
【請求項２８】
ＩｇＥ媒介性の疾患に罹患しているイヌを治療する方法であって、前記イヌに、前記疾患と関係している１つまたは複数の症状を軽減または排除するのに十分な量の請求項１８〜２１のいずれか一項に記載のイヌ化抗体またはその結合断片を投与することからなる方法。