【手続補正書】
【提出日】平成18年3月8日(2006.3.8)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
マイコバクテリア分泌酸性ホスファターゼ遺伝子のプロモーターまたはプロモーターフラグメントを含む単離ＤＮＡ配列であって、前記プロモーターまたはプロモーターフラグメントは目的のヌクレオチド配列の発現の調節に十分であり、且つ低ｐＨ条件下で誘導可能である、単離ＤＮＡ配列。
【請求項２】
前記プロモーターまたはプロモーターフラグメントは、結核菌（Ｍｙｃｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｔｕｂｅｒｃｕｌｏｓｉｓ）ｓａｐＭプロモーターまたはプロモーターフラグメント、Ｍｙｃｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ・ｂｏｖｉｓ  ｓａｐＭプロモーターまたはプロモーターフラグメント、Ｍｙｃｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ・ａｖｉｕｍ  ｓａｐＭプロモーターまたはプロモーターフラグメント、およびＭｙｃｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ・ｍａｒｉｎｕｍ  ｓａｐＭプロモーターまたはプロモーターフラグメントからなる群から選択される、請求項１に記載の単離ＤＮＡ配列。
【請求項３】
目的のヌクレオチド配列の発現の調節に十分であり、且つ低ｐＨ条件下で誘導可能であるプロモーターまたはプロモーターフラグメントを含む単離ＤＮＡ配列であって、前記プロモーターまたはプロモーターフラグメントは、高ストリンジェンシーハイブリダイゼーション条件下で、結核菌（Ｍｙｃｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｔｕｂｅｒｃｕｌｏｓｉｓ）ｓａｐＭプロモーター（配列番号１）、Ｍｙｃｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ・ｂｏｖｉｓ  ｓａｐＭプロモーター（配列番号２）、Ｍｙｃｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ・ａｖｉｕｍ  ｓａｐＭプロモーター（配列番号３）、およびＭｙｃｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ・ｍａｒｉｎｕｍ  ｓａｐＭプロモーター（配列番号４）からなる群から選択されるｓａＭプロモーターとハイブリダイズする、単離ＤＮＡ配列。
【請求項４】
請求項１、請求項２、または請求項３に記載の単離ＤＮＡ配列を含む発現ベクター。
【請求項５】
請求項４に記載のベクターで形質転換された宿主細胞。
【請求項６】
（ａ）目的のヌクレオチド配列の発現の調節に十分であるマイコバクテリア分泌酸性ホスファターゼのプロモーターまたはプロモーターフラグメントと、
（ｂ）前記プロモーターまたはプロモーターフラグメントに作動可能に連結された目的のヌクレオチド配列と、
（ｃ）転写終結領域とを含む、転写カセット。
【請求項７】
前記マイコバクテリア分泌酸性ホスファターゼプロモーターまたはプロモーターフラグメントは、結核菌（Ｍｙｃｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｔｕｂｅｒｃｕｌｏｓｉｓ）ｓａｐＭプロモーター（配列番号１）、Ｍｙｃｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ・ｂｏｖｉｓ  ｓａｐＭプロモーター（配列番号２）、Ｍｙｃｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ・ａｖｉｕｍ  ｓａｐＭプロモーター（配列番号３）、およびＭｙｃｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ・ｍａｒｉｎｕｍ  ｓａｐＭプロモーター（配列番号４）からなる群から選択される、請求項６に記載の転写カセット。
【請求項８】
マイコバクテリア分泌酸性ホスファターゼＮ末端シグナル配列をさらに含む、請求項６または請求項７に記載の転写カセット。
【請求項９】
前記マイコバクテリア分泌酸性ホスファターゼＮ末端シグナル配列は、結核菌（Ｍｙｃｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｔｕｂｅｒｃｕｌｏｓｉｓ）ｓａｐＭ  Ｎ末端シグナル配列（配列番号５）、Ｍｙｃｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ・ｂｏｖｉｓ  ｓａｐＭ  Ｎ末端シグナル配列（配列番号６）、Ｍｙｃｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ・ａｖｉｕｍ  ｓａｐＭ  Ｎ末端シグナル配列（配列番号７）、およびＭｙｃｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ・ｍａｒｉｎｕｍ  ｓａｐＭ  Ｎ末端シグナル配列（配列番号８）からなる群から選択される、請求項８に記載の転写カセット。
【請求項１０】
（ａ）生体サンプルをマイコバクテリア分泌酸性ホスファターゼに特異的な抗体の存在について分析することを含み、
前記マイコバクテリア分泌酸性ホスファターゼに特異的な抗体の検出は、病原性マイコバクテリア感染または病原性菌類感染の存在を示す、病原性マイコバクテリア感染または病原性菌類感染の検出方法。
【請求項１１】
前記マイコバクテリア分泌酸性ホスファターゼは、結核菌（Ｍｙｃｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｔｕｂｅｒｃｕｌｏｓｉｓ）ＳａｐＭ（配列番号１０）、Ｍｙｃｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ・ｂｏｖｉｓ  ＳａｐＭ（配列番号１２）、Ｍｙｃｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ・ａｖｉｕｍ  ＳａｐＭ（配列番号１４）、およびＭｙｃｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ・ｍａｒｉｎｕｍ  ＳａｐＭ（配列番号１６）からなる群から選択される、請求項１０に記載の方法。
【請求項１２】
（ａ）生体サンプルをマイコバクテリア分泌酸性ホスファターゼをコードする核酸の存在について分析することを含み、
前記マイコバクテリア分泌酸性ホスファターゼをコードする前記核酸の検出は、病原性マイコバクテリア感染または病原性菌類感染の存在を示す、病原性マイコバクテリア感染または病原性菌類感染の検出方法。
【請求項１３】
前記マイコバクテリア分泌酸性ホスファターゼをコードする前記核酸は、結核菌（Ｍｙｃｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｔｕｂｅｒｃｕｌｏｓｉｓ）ｓａｐＭ、Ｍｙｃｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ・ｂｏｖｉｓ  ｓａｐＭ、Ｍｙｃｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ・ａｖｉｕｍ  ｓａｐＭ、およびＭｙｃｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ・ｍａｒｉｎｕｍ  ｓａｐＭからなる群から選択される、請求項１２に記載の方法。
【請求項１４】
（ａ）生体サンプルをマイコバクテリア分泌酸性ホスファターゼ活性の存在について分析することを含み、
前記マイコバクテリア分泌酸性ホスファターゼ活性の検出が、病原性マイコバクテリア感染または病原性菌類感染の存在を示す、病原性マイコバクテリア感染または病原性菌類感染の検出方法。
【請求項１５】
前記マイコバクテリア分泌酸性ホスファターゼ活性が、結核菌（Ｍｙｃｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｔｕｂｅｒｃｕｌｏｓｉｓ）ＳａｐＭ活性、Ｍｙｃｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ・ｂｏｖｉｓ  ＳａｐＭ活性、Ｍｙｃｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ・ａｖｉｕｍ  ＳａｐＭ活性、およびＭｙｃｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ・ｍａｒｉｎｕｍ  ＳａｐＭ活性からなるマイコバクテリア群から選択される、請求項１４に記載の方法。
【請求項１６】
（ａ）マイコバクテリア分泌酸性ホスファターゼプロモーターまたはプロモーターフラグメントを含む核酸構築物であって、前記プロモーターまたはプロモーターフラグメントが測定可能なシグナルを産生することができるレポーター遺伝子に作動可能に連結されている核酸構築物を用意することと、
（ｂ）試験化合物を用意することと、
（ｃ）前記試験化合物に前記核酸構築物を曝露することと、
（ｄ）前記レポーター遺伝子によって産生される前記シグナルを測定することとを含み、前記試験化合物の非存在下と比較した前記試験化合物の存在下で産生された前記シグナルの変化は前記試験化合物が前記マイコバクテリア分泌酸性ホスファターゼの産生を調整することができることを示す、マイコバクテリア分泌酸性ホスファターゼ産生を調整することができる化合物のスクリーニング方法。
【請求項１７】
前記マイコバクテリア分泌酸性ホスファターゼプロモーターまたはプロモーターフラグメントは、結核菌（Ｍｙｃｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｔｕｂｅｒｃｕｌｏｓｉｓ）ｓａｐＭプロモーターまたはプロモーターフラグメント、Ｍｙｃｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ・ｂｏｖｉｓ  ｓａｐＭプロモーターまたはプロモーターフラグメント、Ｍｙｃｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ・ａｖｉｕｍ  ｓａｐＭプロモーターまたはプロモーターフラグメント、およびＭｙｃｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ・ｍａｒｉｎｕｍ  ｓａｐＭプロモーターまたはプロモーターフラグメントからなる群から選択される、請求項１６に記載の方法。
【請求項１８】
（ａ）マイコバクテリア分泌酸性ホスファターゼ、前記マイコバクテリア分泌酸性ホスファターゼの基質、および試験化合物を含む混合物をインキュベートすることと、
（ｂ）前記マイコバクテリア分泌酸性ホスファターゼ活性を測定することとを含み、
前記試験化合物の非存在下と比較した前記試験化合物の存在下での活性の変化は前記試験化合物が前記分泌酸性ホスファターゼ活性を調整することができることを示す、マイコバクテリア分泌酸性ホスファターゼ活性を調整することができる化合物のスクリーニング方法。
【請求項１９】
前記マイコバクテリア分泌酸性ホスファターゼは、結核菌（Ｍｙｃｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｔｕｂｅｒｃｕｌｏｓｉｓ）ＳａｐＭ、Ｍｙｃｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ・ｂｏｖｉｓ  ＳａｐＭ、Ｍｙｃｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ・ａｖｉｕｍ  ＳａｐＭ、およびＭｙｃｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ・ｍａｒｉｎｕｍ  ＳａｐＭからなる群から選択される、請求項１８に記載の方法。
【請求項２０】
（ａ）マイコバクテリア分泌酸性ホスファターゼを分泌するＭｙｃｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ細胞を試験化合物に曝露することと、
（ｂ）前記Ｍｙｃｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ細胞によって分泌された前記マイコバクテリア分泌酸性ホスファターゼの量を測定することとを含み、
前記試験化合物の非存在下と比較した前記試験化合物の存在下でのマイコバクテリア分泌酸性ホスファターゼ分泌の変化が前記試験化合物が前記マイコバクテリア分泌酸性ホスファターゼ分泌を調整することができることを示す、マイコバクテリア分泌酸性ホスファターゼの分泌を調整することができる化合物のスクリーニング方法。
【請求項２１】
前記マイコバクテリア分泌酸性ホスファターゼは、結核菌（Ｍｙｃｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｔｕｂｅｒｃｕｌｏｓｉｓ）ＳａｐＭ、Ｍｙｃｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ・ｂｏｖｉｓ  ＳａｐＭ、Ｍｙｃｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ・ａｖｉｕｍ  ＳａｐＭ、およびＭｙｃｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ・ｍａｒｉｎｕｍ  ＳａｐＭからなる群から選択される、請求項２０に記載の方法。
【請求項２２】
（ａ）マイコバクテリア分泌酸性ホスファターゼと、
（ｂ）前記マイコバクテリア分泌酸性ホスファターゼに特異的な少なくとも１つの抗体と、
（ｃ）前記抗体の検出に必要な１つまたは複数の試薬を含む、病原性マイコバクテリア疾患または感染の検出用キット。
【請求項２３】
前記マイコバクテリア分泌酸性ホスファターゼは、結核菌（Ｍｙｃｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｔｕｂｅｒｃｕｌｏｓｉｓ）ＳａｐＭ、Ｍｙｃｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ・ｂｏｖｉｓ  ＳａｐＭ、Ｍｙｃｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ・ａｖｉｕｍ  ＳａｐＭ、およびＭｙｃｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ・ｍａｒｉｎｕｍ  ＳａｐＭからなる群から選択される、請求項２２に記載のキット。
【請求項２４】
（ａ）配列番号１〜配列番号４、または配列番号９、配列番号１１、配列番号１３、配列番号１５の配列と相補的であり、相補的ヌクレオチド配列と特異的にハイブリダイズできる核酸配列由来の連続ヌクレオチドを含むオリゴヌクレオチドと、
（ｂ）前記オリゴヌクレオチドの相補核酸配列へのハイブリダイゼーションのための試薬を含む、病原性マイコバクテリア疾患または感染の検出用キット。
【請求項２５】
マイコバクテリア分泌酸性ホスファターゼまたはそのポリペプチドフラグメントと特異的に結合することができる抗体。
【請求項２６】
前記マイコバクテリア分泌酸性ホスファターゼは、結核菌（Ｍｙｃｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｔｕｂｅｒｃｕｌｏｓｉｓ）ＳａｐＭ（配列番号１０）、Ｍｙｃｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ・ｂｏｖｉｓ  ＳａｐＭ（配列番号１２）、Ｍｙｃｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ・ａｖｉｕｍ  ＳａｐＭ（配列番号１４）、およびＭｙｃｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ・ｍａｒｉｎｕｍ  ＳａｐＭ（配列番号１６）からなる群から選択される、請求項２５に記載の抗体。
【請求項２７】
請求項２６に記載の抗体を含む、Ｍｙｃｏｂａｃｔｅｒｉｕｍによる攻撃に対して哺乳動物を治療または予防するためのワクチンまたは免疫原性組成物。
【請求項２８】
請求項１、請求項２、または請求項３に記載の単離ＤＮＡ配列を含む、Ｍｙｃｏｂａｃｔｅｒｉｕｍによる攻撃に対して哺乳動物を治療または予防するためのワクチンまたは免疫原性組成物。
【請求項２９】
結核菌（Ｍｙｃｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｔｕｂｅｒｃｕｌｏｓｉｓ）ＳａｐＭ、Ｍｙｃｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ・ｂｏｖｉｓ  ＳａｐＭ、Ｍｙｃｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ・ａｖｉｕｍ  ＳａｐＭ、Ｍｙｃｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ・ｍａｒｉｎｕｍ  ＳａｐＭ、またはそのポリペプチドフラグメントからなる群から選択されるマイコバクテリア分泌酸性ホスファターゼを含む、Ｍｙｃｏｂａｃｔｅｒｉｕｍによる攻撃に対して哺乳動物を治療または予防するためのワクチンまたは免疫原性組成物。
【請求項３０】
ＳａｐＭポリペプチドを含み且つ病原性マイコバクテリアの培養物中で自然に混合される他のタンパク質または糖タンパク質を実質的に含まない、被験体の病原性マイコバクテリア疾患または感染の検出に有用な抗原性組成物。