【手続補正書】
【提出日】平成18年7月14日(2006.7.14)
【手続補正１】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】特許請求の範囲
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】  病原性細菌によって引き起こされる胃腸感染の処置または予防のための治療組成物であって、該組成物は、脊椎動物の胃腸管への投与に適切な薬学的に受容可能なキャリア内に、治療有効濃度の乳酸産生細菌の１以上の種または株を含み、ここで、該乳酸産生細菌は、該病原性細菌のコロニー形成率、および該コロニー形成に起因する潜在的な生理学的に有害な効果の両方を減少する能力を保持する、組成物。
【請求項２】  請求項１に記載の治療組成物であって、ここで、前記乳酸産生細菌の１つは、以下：Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｏａｇｕｌａｎｓ；Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｏａｇｕｌａｎｓ  Ｈａｍｍｅｒ；およびＢａｃｉｌｌｕｓ  ｂｒｅｖｉｓ亜種ｃｏａｇｕｌａｎｓ、ならびにこれらの任意の遺伝的改変株を含む群より選択される、Ｂａｃｉｌｌｕｓ種である、組成物。
【請求項３】  請求項１に記載の治療組成物であって、ここで、前記乳酸産生細菌の１つは、以下：Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ａｃｉｄｏｐｈｉｌｕｓ、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃａｓｅｉ、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ＤＤＳ−１、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ＧＧ、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｒｈａｍｎｏｓｕｓ、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｐｌａｎｔａｒｕｍ、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｒｅｕｔｅｒｉ、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｇａｓｓｅｒｉｉ、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｊｅｎｓｅｎｉｉ、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｄｅｌｂｒｕｅｋｉｉ、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｂｕｌｇａｒｉｃｕｓ、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓａｌｉｖａｒｉｕｓおよびＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｐｏｒｏｇｅｎｅｓ（またＢａｃｉｌｌｕｓ  ｃｏａｇｕｌａｎｓとしても命名される）、ならびにこれらの任意の遺伝的改変株を含む群より選択される、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ種である、組成物。
【請求項４】  請求項１に記載の治療組成物であって、ここで、前記乳酸産生細菌の１つは、以下：Ｓｐｏｒｏｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  Ｐ４４、およびその任意の遺伝的改変株を含む群より選択される、Ｓｐｏｒｏｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ種である、組成物。
【請求項５】  請求項１に記載の治療組成物であって、ここで、前記乳酸産生細菌の１つは、以下：Ｂｉｆｉｄｉｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ａｄｏｌｅｓｃｅｎｔｉｓ、Ｂｉｆｉｄｉｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ａｎｉｍａｌｉｓ、Ｂｉｆｉｄｉｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｂｉｆｉｄｕｍ、Ｂｉｆｉｄｉｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｂｉｆｉｄｕｓ、Ｂｉｆｉｄｉｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｂｒｅｖｅ、Ｂｉｆｉｄｉｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓ、Ｂｉｆｉｄｉｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓ、Ｂｉｆｉｄｉｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｌｏｎｇｕｍ、ならびにこれらの任意の遺伝的改変株を含む群より選択される、Ｂｉｆｉｄｉｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ種である、組成物。
【請求項６】  病原性細菌によって引き起こされる胃腸感染の処置または予防のための治療組成物であって、該組成物は、脊椎動物の胃腸管への投与に適切な薬学的に受容可能なキャリア内に、治療有効濃度の抗生物質、抗真菌剤および抗酵母剤を含む群より選択される抗微生物剤または抗ウイルス剤、ならびに治療有効濃度の乳酸産生細菌の１以上の種または株を含み、ここで、該乳酸産生細菌は、該病原性細菌のコロニー形成率、および該コロニー形成に起因する潜在的な生理学的に有害な効果の両方を減少する能力を保持する、組成物。
【請求項７】  請求項６に記載の治療組成物であって、ここで、前記乳酸産生細菌の１つは、以下：Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｏａｇｕｌａｎｓ；Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｏａｇｕｌａｎｓ  Ｈａｍｍｅｒ；およびＢａｃｉｌｌｕｓ  ｂｒｅｖｉｓ亜種ｃｏａｇｕｌａｎｓ、ならびにこれらの任意の遺伝的改変株を含む群より選択される、Ｂａｃｉｌｌｕｓ種である、組成物。
【請求項８】  請求項６に記載の治療組成物であって、ここで、前記乳酸産生細菌の１つは、以下：Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ａｃｉｄｏｐｈｉｌｕｓ、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃａｓｅｉ、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ＤＤＳ−１、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ＧＧ、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｒｈａｍｎｏｓｕｓ、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｐｌａｎｔａｒｕｍ、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｒｅｕｔｅｒｉ、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｇａｓｓｅｒｉｉ、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｊｅｎｓｅｎｉｉ、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｄｅｌｂｒｕｅｋｉｉ、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｂｕｌｇａｒｉｃｕｓ、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓａｌｉｖａｒｉｕｓおよびＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｐｏｒｏｇｅｎｅｓ（またＢａｃｉｌｌｕｓ  ｃｏａｇｕｌａｎｓとしても命名される）、ならびにこれらの任意の遺伝的改変株を含む群より選択される、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ種である、組成物。
【請求項９】  請求項６に記載の治療組成物であって、ここで、前記乳酸産生細菌の１つは、以下：Ｓｐｏｒｏｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  Ｐ４４、およびその任意の遺伝的改変株を含む群より選択される、Ｓｐｏｒｏｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ種である、組成物。
【請求項１０】  請求項６に記載の治療組成物であって、ここで、前記乳酸産生細菌の１つは、以下：Ｂｉｆｉｄｉｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ａｄｏｌｅｓｃｅｎｔｉｓ、Ｂｉｆｉｄｉｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ａｎｉｍａｌｉｓ、Ｂｉｆｉｄｉｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｂｉｆｉｄｕｍ、Ｂｉｆｉｄｉｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｂｉｆｉｄｕｓ、Ｂｉｆｉｄｉｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｂｒｅｖｅ、Ｂｉｆｉｄｉｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓ、Ｂｉｆｉｄｉｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓ、Ｂｉｆｉｄｉｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｌｏｎｇｕｍ、ならびにこれらの任意の遺伝的改変株を含む群より選択される、Ｂｉｆｉｄｉｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ種である、組成物。
【請求項１１】  病原性細菌によって引き起こされる胃腸感染の処置または予防のための治療組成物であって、該組成物は、脊椎動物の胃腸管への投与に適切な薬学的に受容可能なキャリア内に、治療有効濃度の抗微生物剤、およびＢａｃｉｌｌｕｓ  ｃｏａｇｕｌａｎｓの１以上の種または株を含み、ここで、該Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｏａｇｕｌａｎｓ細菌株は、該組成物における使用のために選択された抗生物質に対する抗生物質耐性または減少された抗生物質感受性を保持し、かつここで、該Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｏａｇｕｌａｎｓは、該病原性細菌のコロニー形成率、および該コロニー形成に起因する潜在的な生理学的に有害な効果の両方を減少する能力を保持する、組成物。
【請求項１２】  請求項１１に記載の治療組成物であって、ここで、前記Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｏａｇｕｌａｎｓ細菌株は、流動可能な濃縮物内の乾燥細菌細胞塊、安定化ゲル内の乾燥細菌細胞塊または安定化ペースト内の乾燥細菌細胞塊からなる群より選択される形態で、該組成物中に含まれる、組成物。
【請求項１３】  請求項１１に記載の治療組成物であって、ここで、前記Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｏａｇｕｌａｎｓ細菌株は、流動可能な濃縮物内、安定化ゲル内または安定化ペースト内で投与後に出芽する能力を保持する、乾燥細菌芽胞塊の形態である、組成物。
【請求項１４】  請求項１１に記載の治療組成物であって、ここで、該治療組成物の全投与濃度は、１日あたり約１０ｍｇ〜約１０ｇの組成物の範囲であり、そして好ましくは、１日あたり約０．１ｇ〜約５ｇの組成物の範囲である、組成物。
【請求項１５】  請求項１１に記載の治療組成物であって、ここで、該治療組成物内のＢａｃｉｌｌｕｓ  ｃｏａｇｕｌａｎｓの全投与濃度は、１日あたり約１×１０３〜約１×１０４の生存細菌または生存芽胞の範囲であり、好ましくは、１日あたり約１×１０５〜約１×１０１０の生存細菌または生存芽胞の範囲であり、そしてより好ましくは、１日あたり約５×１０８〜約１×１０９の生存細菌または生存芽胞の範囲である、組成物。
【請求項１６】  請求項１１に記載の治療組成物であって、ここで、処置されるべき前記感染は、成体内におけるものであり、かつ抗生物質耐性病原体によって引き起こされ、かつここで、該治療組成物内のＢａｃｉｌｌｕｓ  ｃｏａｇｕｌａｎｓの全投与濃度は、１日あたり約１×１０２〜約１×１０１４の生存細菌または生存芽胞の範囲であり、好ましくは、１日あたり約１×１０８〜約１×１０１０の生存細菌または生存芽胞の範囲であり、そしてより好ましくは、１日あたり約２．５×１０８〜約１×１０１０の生存細菌または生存芽胞の範囲である、組成物。
【請求項１７】  請求項１１に記載の治療組成物であって、ここで、処置されるべき前記感染は、６ヶ月齢を超える幼児における乳児突然死症候群（ＳＩＤＳ）であり、かつ抗生物質耐性病原体によって引き起こされ、かつここで、該治療組成物内のＢａｃｉｌｌｕｓ  ｃｏａｇｕｌａｎｓの全投与濃度は、１日あたり約１×１０６〜約１×１０９の生存細菌または生存芽胞の範囲であり、好ましくは、１日あたり約５×１０４〜約２．５×１０５の生存細菌または生存芽胞の範囲であり、そしてより好ましくは、１日あたり約１．５×１０５〜約２×１０５の生存細菌または生存芽胞の範囲である、組成物。
【請求項１８】  請求項１１に記載の治療組成物であって、ここで、該治療組成物は、１以上のビフィドジェニック因子をさらに含み、ここで、該ビフィドジェニックオリゴサッカライドは、フルクト−オリゴサッカライド（ＦＯＳ）、グルコ−オリゴサッカライド（ＧＯＳ）、ラフィノース、および長鎖オリゴサッカライドからなる群より選択される、組成物。
【請求項１９】  請求項１１に記載の治療組成物であって、ここで、該治療組成物は、１以上のビフィドジェニック因子をさらに含み、かつここで、該ビフィドジェニック因子は、フルクト−オリゴサッカライド（ＦＯＳ）であり、かつここで、該治療組成物内の該ビフィドジェニック因子の全投与濃度は、約１０ｍｇ／１ｇ治療組成物／日〜約２０ｇ／１ｇ治療組成物／日、好ましくは、約５０ｍｇ／１ｇ治療組成物／日〜約１０ｇ／１ｇ治療組成物／日、そしてより好ましくは、約１５０ｍｇ／１ｇ治療組成物／日〜約５ｇ／１ｇ治療組成物／日の範囲である、組成物。
【請求項２０】  前記病原性細菌が、抗生物質耐性病原性細菌である、請求項１１に記載の治療組成物。
【請求項２１】  請求項１１に記載の治療組成物であって、ここで、該治療組成物の投与の生理学的位置は、口腔；局所；膣内；経鼻；眼内；および耳内の投与位置を含む群より選択される、組成物。
【請求項２２】  請求項１１に記載の治療組成物であって、ここで、前記抗微生物剤は、抗生物質、抗真菌剤、抗ウイルス剤、および抗酵母剤を含む群より選択される、組成物。
【請求項２３】  請求項１１に記載の治療組成物であって、ここで、前記抗微生物剤は、以下：ゲンタマイシン；バンコマイシン；オキサシリン；テトラサイクリン；ニトロフラントイン；クロラムフェニコール；クリンダマイシン；トリメトプリムスルファメトキサゾール；セファロスポリン抗生物質ファミリーのメンバー；ペニシリン抗生物質ファミリーのメンバー；フルオロキノロン抗生物質ファミリーのメンバー；およびマクロライド抗生物質ファミリーのメンバーからなる群より選択される、治療有効濃度の抗生物質から構成される、組成物。
【請求項２４】  請求項１１に記載の治療組成物であって、ここで、前記抗微生物剤は、以下：クロトリマゾール、フルコナゾール、イトラコナゾール、ケトコナゾール、ミコナゾール、ナイスタチン、テルビナフィン、テルコナゾール、およびチオコナゾールからなる群より選択される、治療有効濃度の抗真菌剤から構成される、組成物。
【請求項２５】  病原性細菌によって引き起こされる胃腸感染の処置または予防のための治療組成物であって、該組成物は、脊椎動物の胃腸管への投与に適切な薬学的に受容可能なキャリア内に治療有効濃度のＢａｃｉｌｌｕｓ  ｃｏａｇｕｌａｎｓの１以上の種または株を含み、ここで、該Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｏａｇｕｌａｎｓ細菌株は、該病原性細菌のコロニー形成率、および該コロニー形成に起因する潜在的な生理学的に有害な効果の両方を減少する能力を保持する、組成物。
【請求項２６】  請求項２５に記載の治療組成物であって、ここで、前記Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｏａｇｕｌａｎｓ細菌株は、流動可能な濃縮物内の乾燥細菌細胞塊、安定化ゲル内の乾燥細菌細胞塊または安定化ペースト内の乾燥細菌細胞塊からなる群より選択される形態で、該組成物中に含まれる、組成物。
【請求項２７】  請求項２５に記載の治療組成物であって、ここで、前記Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｏａｇｕｌａｎｓ細菌株は、流動可能な濃縮物内、安定化ゲル内または安定化ペースト内で投与後に出芽する能力を保持する、乾燥細菌芽胞塊の形態である、組成物。
【請求項２８】  請求項２５に記載の治療組成物であって、ここで、該治療組成物の全投与濃度は、１日あたり約１０ｍｇ〜約１０ｇの組成物の範囲であり、そして好ましくは、１日あたり約０．１ｇ〜約５ｇの組成物の範囲である、組成物。
【請求項２９】  請求項２５に記載の治療組成物であって、ここで、該治療組成物内のＢａｃｉｌｌｕｓ  ｃｏａｇｕｌａｎｓの全投与濃度は、１日あたり約１×１０３〜約１×１０１２の生存細菌または生存芽胞の範囲であり、好ましくは、１日あたり約１×１０５〜約１×１０１０の生存細菌または生存芽胞の範囲であり、そしてより好ましくは、１日あたり約５×１０８〜約１×１０９の生存細菌または生存芽胞の範囲である、組成物。
【請求項３０】  請求項２５に記載の治療組成物であって、ここで、処置されるべき前記感染は、成体内におけるものであり、かつ抗生物質耐性病原体によって引き起こされ、かつここで、該治療組成物内のＢａｃｉｌｌｕｓ  ｃｏａｇｕｌａｎｓの全投与濃度は、１日あたり約１×１０２〜約１×１０１４の生存細菌または生存芽胞の範囲であり、好ましくは、１日あたり約１×１０８〜約１×１０１０の生存細菌または生存芽胞の範囲であり、そしてより好ましくは、１日あたり約２．５×１０８〜約１×１０１０の生存細菌または生存芽胞の範囲である、組成物。
【請求項３１】  請求項２５に記載の治療組成物であって、ここで、処置されるべき前記感染は、６ヶ月齢を超える幼児における乳児突然死症候群（ＳＩＤＳ）であり、かつ抗生物質耐性病原体によって引き起こされ、かつここで、該治療組成物内のＢａｃｉｌｌｕｓ  ｃｏａｇｕｌａｎｓの全投与濃度は、１日あたり約１×１０６〜約１×１０９の生存細菌または生存芽胞の範囲であり、好ましくは、１日あたり約５×１０４〜約２．５×１０５の生存細菌または生存芽胞の範囲であり、そしてより好ましくは、１日あたり約１．５×１０５〜約２×１０５の生存細菌または生存芽胞の範囲である、組成物。
【請求項３２】  請求項２５に記載の治療組成物であって、ここで、該治療組成物は、１以上のビフィドジェニック因子をさらに含み、ここで、該ビフィドジェニックオリゴサッカライドは、フルクト−オリゴサッカライド（ＦＯＳ）、グルコ−オリゴサッカライド（ＧＯＳ）、ラフィノース、および長鎖オリゴサッカライドからなる群より選択される、組成物。
【請求項３３】  請求項２５に記載の治療組成物であって、ここで、該治療組成物は、１以上のビフィドジェニック因子をさらに含み、かつここで、該ビフィドジェニック因子は、フルクト−オリゴサッカライド（ＦＯＳ）であり、かつここで、該治療組成物内の該ビフィドジェニック因子の全投与濃度は、約１０ｍｇ／１ｇ治療組成物／日〜約２０ｇ／１ｇ治療組成物／日、好ましくは、約５０ｍｇ／１ｇ治療組成物／日〜約１０ｇ／１ｇ治療組成物／日、そしてより好ましくは、約１５０ｍｇ／１ｇ治療組成物／日〜約５ｇ／１ｇ治療組成物／日の範囲である、組成物。
【請求項３４】  前記病原性細菌が、抗生物質耐性病原性細菌である、請求項２５に記載の治療組成物。
【請求項３５】  請求項２５に記載の治療組成物であって、ここで、該治療組成物の投与の生理学的位置は、口腔；局所；膣内；経鼻；眼内；および耳内の投与位置を含む群より選択される、組成物。
【請求項３６】  請求項２５に記載の治療組成物であって、ここで、該治療組成物は、抗生物質、抗真菌剤、抗ウイルス剤、および抗酵母剤を含む群より選択される抗微生物剤をさらに含む、組成物。
【請求項３７】  請求項２５に記載の治療組成物であって、ここで、該治療組成物は、以下：ゲンタマイシン；バンコマイシン；オキサシリン；テトラサイクリン；ニトロフラントイン；クロラムフェニコール；クリンダマイシン；トリメトプリムスルファメトキサゾール；セファロスポリン抗生物質ファミリーのメンバー；ペニシリン抗生物質ファミリーのメンバー；フルオロキノロン抗生物質ファミリーのメンバー；およびマクロライド抗生物質ファミリーのメンバーからなる群より選択される、治療有効濃度の抗生物質からさらに構成される、組成物。
【請求項３８】  請求項２５に記載の治療組成物であって、ここで、該治療組成物は、以下：クロトリマゾール、フルコナゾール、イトラコナゾール、ケトコナゾール、ミコナゾール、ナイスタチン、テルビナフィン、テルコナゾール、およびチオコナゾールからなる群より選択される、治療有効濃度の抗真菌剤からさらに構成される、組成物。
【請求項３９】  病原性細菌によって引き起こされる胃腸感染の処置または予防における使用のためのキットであって、該キットは、脊椎動物の胃腸管への投与に適切な薬学的に受容可能なキャリア内にある治療有効濃度の乳酸産生細菌の１以上の種または株を含む治療組成物を含み、ここで、該乳酸産生細菌は、該病原性細菌のコロニー形成率、および該コロニー形成に起因する潜在的な生理学的に有害な効果の両方を減少する能力を保持する、キット。
【請求項４０】  請求項３９に記載のキットであって、ここで、前記乳酸産生細菌の１つは、以下：Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｏａｇｕｌａｎｓ；Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｏａｇｕｌａｎｓ  Ｈａｍｍｅｒ；およびＢａｃｉｌｌｕｓ  ｂｒｅｖｉｓ亜種ｃｏａｇｕｌａｎｓ、ならびにこれらの任意の遺伝的改変株を含む群より選択されるＢａｃｉｌｌｕｓ種である、キット。
【請求項４１】  請求項３９に記載のキットであって、ここで、前記乳酸産生細菌の１つは、以下：Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ａｃｉｄｏｐｈｉｌｕｓ、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃａｓｅｉ、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ＤＤＳ−１、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ＧＧ、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｒｈａｍｎｏｓｕｓ、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｐｌａｎｔａｒｕｍ、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｒｅｕｔｅｒｉ、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｇａｓｓｅｒｉｉ、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｊｅｎｓｅｎｉｉ、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｄｅｌｂｒｕｅｋｉｉ、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｂｕｌｇａｒｉｃｕｓ、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓａｌｉｖａｒｉｕｓおよびＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｐｏｒｏｇｅｎｅｓ（またＢａｃｉｌｌｕｓ  ｃｏａｇｕｌａｎｓとしても命名される）、ならびにこれらの任意の遺伝的改変株を含む群より選択される、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ種である、キット。
【請求項４２】  請求項３９に記載のキットであって、ここで、前記乳酸産生細菌の１つは、以下：Ｓｐｏｒｏｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  Ｐ４４、およびその任意の遺伝的改変株を含む群より選択される、Ｓｐｏｒｏｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ種である、キット。
【請求項４３】  請求項３９に記載のキットであって、ここで、前記乳酸産生細菌の１つは、以下：Ｂｉｆｉｄｉｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ａｄｏｌｅｓｃｅｎｔｉｓ、Ｂｉｆｉｄｉｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ａｎｉｍａｌｉｓ、Ｂｉｆｉｄｉｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｂｉｆｉｄｕｍ、Ｂｉｆｉｄｉｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｂｉｆｉｄｕｓ、Ｂｉｆｉｄｉｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｂｒｅｖｅ、Ｂｉｆｉｄｉｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓ、Ｂｉｆｉｄｉｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓ、Ｂｉｆｉｄｉｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｌｏｎｇｕｍ、ならびにこれらの任意の遺伝的改変株を含む群より選択される、Ｂｉｆｉｄｉｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ種である、キット。
【請求項４４】  病原性細菌によって引き起こされる胃腸感染の処置または予防における使用のためのキットであって、該キットは、脊椎動物の胃腸管への投与に適切な薬学的に受容可能なキャリア内にある抗生物質、抗真菌剤および抗酵母剤を含む群より選択される治療有効濃度の抗微生物剤、または抗ウイルス剤と、脊椎動物の胃腸管への投与に適切な薬学的に受容可能なキャリア内にある治療有効濃度の乳酸産生細菌の１以上の種または株と、を含み、ここで、該乳酸産生細菌は、該病原性細菌のコロニー形成率および該コロニー形成に起因する潜在的な生理学的に有害な効果の両方を減少する能力を保持する、キット。
【請求項４５】  請求項４４に記載のキットであって、ここで、前記乳酸産生細菌の１つは、以下：Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｏａｇｕｌａｎｓ；Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｏａｇｕｌａｎｓ  Ｈａｍｍｅｒ；およびＢａｃｉｌｌｕｓ  ｂｒｅｖｉｓ亜種ｃｏａｇｕｌａｎｓ、ならびにこれらの任意の遺伝的改変株を含む群より選択される、Ｂａｃｉｌｌｕｓ種である、キット。
【請求項４６】  請求項４４に記載のキットであって、ここで、前記乳酸産生細菌の１つは、以下：Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ａｃｉｄｏｐｈｉｌｕｓ、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃａｓｅｉ、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ＤＤＳ−１、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ＧＧ、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｒｈａｍｎｏｓｕｓ、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｐｌａｎｔａｒｕｍ、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｒｅｕｔｅｒｉ、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｇａｓｓｅｒｉｉ、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｊｅｎｓｅｎｉｉ、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｄｅｌｂｒｕｅｋｉｉ、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｂｕｌｇａｒｉｃｕｓ、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓａｌｉｖａｒｉｕｓおよびＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｐｏｒｏｇｅｎｅｓ（またＢａｃｉｌｌｕｓ  ｃｏａｇｕｌａｎｓとしても命名される）、ならびにこれらの任意の遺伝的改変株を含む群より選択される、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ種である、キット。
【請求項４７】  請求項４４に記載のキットであって、ここで、前記乳酸産生細菌の１つは、以下：Ｓｐｏｒｏｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  Ｐ４４、およびその任意の遺伝的改変株を含む群より選択される、Ｓｐｏｒｏｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ種である、キット。
【請求項４８】  請求項４４に記載のキットであって、ここで、前記乳酸産生細菌の１つは、以下：Ｂｉｆｉｄｉｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ａｄｏｌｅｓｃｅｎｔｉｓ、Ｂｉｆｉｄｉｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ａｎｉｍａｌｉｓ、Ｂｉｆｉｄｉｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｂｉｆｉｄｕｍ、Ｂｉｆｉｄｉｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｂｉｆｉｄｕｓ、Ｂｉｆｉｄｉｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｂｒｅｖｅ、Ｂｉｆｉｄｉｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓ、Ｂｉｆｉｄｉｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓ、Ｂｉｆｉｄｉｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｌｏｎｇｕｍ、ならびにこれらの任意の遺伝的改変株を含む群より選択される、Ｂｉｆｉｄｉｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ種である、キット。
【請求項４９】  病原性細菌によって引き起こされる胃腸管感染の処置または予防における使用のためのキットであって、該キットは、脊椎動物の胃腸管への投与に適切な薬学的に受容可能なキャリア内にある治療有効濃度の抗微生物剤と、脊椎動物の胃腸管への投与に適切な薬学的に受容可能なキャリア内にある治療有効濃度のＢａｃｉｌｌｕｓ  ｃｏａｇｕｌａｎｓの１以上の種または株を含む治療組成物と、を含み、ここで、該Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｏａｇｕｌａｎｓ細菌株は、該組成物における使用のために選択された抗生物質に対する抗生物質耐性または減少された抗生物質感受性を保持し、かつここで、該Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｏａｇｕｌａｎｓは、該病原性細菌のコロニー形成率、および該コロニー形成に起因する潜在的な生理学的に有害な効果の両方を減少する能力を保持する、キット。
【請求項５０】  請求項４９に記載のキットであって、ここで、前記Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｏａｇｕｌａｎｓ細菌株は、流動可能な濃縮物内の乾燥細菌細胞塊、安定化ゲル内の乾燥細菌細胞塊または安定化ペースト内の乾燥細菌細胞塊からなる群より選択される形態で、前記組成物中に含まれる、キット。
【請求項５１】  請求項４９に記載のキットであって、ここで、前記Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｏａｇｕｌａｎｓ細菌株は、流動可能な濃縮物内、安定化ゲル内または安定化ペースト内で投与後に出芽する能力を保持する、乾燥細菌芽胞塊の形態である、キット。
【請求項５２】  請求項４９に記載のキットであって、ここで、投与に適した前記治療組成物の全濃度は、１日あたり約１０ｍｇ〜約１０ｇの組成物の範囲であり、そして好ましくは、１日あたり約０．１ｇ〜約５ｇの組成物の範囲である、キット。
【請求項５３】  請求項４９に記載の方法であって、ここで、投与に適した前記治療組成物内のＢａｃｉｌｌｕｓ  ｃｏａｇｕｌａｎｓの全濃度は、１日あたり約１×１０３〜約１×１０４の生存細菌または生存芽胞の範囲であり、好ましくは、１日あたり約１×１０５〜約１×１０１０の生存細菌または生存芽胞の範囲であり、そしてより好ましくは、１日あたり約５×１０８〜約１×１０９の生存細菌または生存芽胞の範囲である、キット。
【請求項５４】  請求項４９に記載のキットであって、ここで、処置されるべき前記感染は、成体内におけるものであり、かつ抗生物質耐性病原体によって引き起こされ、かつここで、投与に適した前記治療組成物内のＢａｃｉｌｌｕｓ  ｃｏａｇｕｌａｎｓの全濃度は、１日あたり約１×１０２〜約１×１０１４の生存細菌または生存芽胞の範囲であり、好ましくは、１日あたり約１×１０８〜約１×１０１０の生存細菌または生存芽胞の範囲であり、そしてより好ましくは、１日あたり約２．５×１０８〜約１×１０１０の生存細菌または生存芽胞の範囲である、キット。
【請求項５５】  請求項４９に記載のキットであって、ここで、処置されるべき前記感染は、６ヶ月齢を超える幼児における乳児突然死症候群（ＳＩＤＳ）であり、かつ抗生物質耐性病原体によって引き起こされ、かつここで、投与に適した前記治療組成物内のＢａｃｉｌｌｕｓ  ｃｏａｇｕｌａｎｓの全濃度は、１日あたり約１×１０６〜約１×１０９の生存細菌または生存芽胞の範囲であり、好ましくは、１日あたり約５×１０４〜約２．５×１０５の生存細菌または生存芽胞の範囲であり、そしてより好ましくは、１日あたり約１．５×１０５〜約２×１０５の生存細菌または生存芽胞の範囲である、キット。
【請求項５６】  請求項４９に記載のキットであって、ここで、前記治療組成物は、１以上のビフィドジェニック因子をさらに含み、ここで、該ビフィドジェニックオリゴサッカライドは、フルクト−オリゴサッカライド（ＦＯＳ）、グルコ−オリゴサッカライド（ＧＯＳ）、ラフィノース、および長鎖オリゴサッカライドからなる群より選択される、キット。
【請求項５７】  請求項４９に記載のキットであって、ここで、前記治療組成物は、１以上のビフィドジェニック因子をさらに含み、かつここで、該ビフィドジェニック因子は、フルクト−オリゴサッカライド（ＦＯＳ）であり、かつここで、投与に適した治療組成物内の該ビフィドジェニック因子の全濃度は、約１０ｍｇ／１ｇ治療組成物／日〜約２０ｇ／１ｇ治療組成物／日、好ましくは、約５０ｍｇ／１ｇ治療組成物／日〜約１０ｇ／１ｇ治療組成物／日、そしてより好ましくは、約１５０ｍｇ／１ｇ治療組成物／日〜約５ｇ／１ｇ治療組成物／日の範囲である、キット。
【請求項５８】  前記病原性細菌が、抗生物質耐性病原性細菌である、請求項４９に記載のキット。
【請求項５９】  請求項４９に記載のキットであって、ここで、該治療組成物の投与の生理学的位置は、口腔；局所；膣内；経鼻；眼内；および耳内の投与位置を含む群より選択される、キット。
【請求項６０】  請求項４９に記載のキットであって、ここで、前記抗微生物剤は、抗生物質、抗真菌剤、抗ウイルス剤、および抗酵母剤を含む群より選択される、キット。
【請求項６１】  請求項４９に記載のキットであって、ここで、前記抗微生物剤は、以下：ゲンタマイシン；バンコマイシン；オキサシリン；テトラサイクリン；ニトロフラントイン；クロラムフェニコール；クリンダマイシン；トリメトプリムスルファメトキサゾール；セファロスポリン抗生物質ファミリーのメンバー；ペニシリン抗生物質ファミリーのメンバー；フルオロキノロン抗生物質ファミリーのメンバー；およびマクロライド抗生物質ファミリーのメンバーからなる群より選択される、治療有効濃度の抗生物質から構成される、キット。
【請求項６２】  請求項４９に記載のキットであって、ここで、前記抗微生物剤は、以下：クロトリマゾール、フルコナゾール、イトラコナゾール、ケトコナゾール、ミコナゾール、ナイスタチン、テルビナフィン、テルコナゾール、およびチオコナゾールからなる群より選択される、治療有効濃度の抗真菌剤から構成される、キット。
【請求項６３】  病原性細菌によって引き起こされる胃腸感染の処置または予防における使用のためのキットであって、該キットは、脊椎動物の胃腸管への投与に適切な薬学的に受容可能なキャリア内にある治療有効濃度のＢａｃｉｌｌｕｓ  ｃｏａｇｕｌａｎｓの１以上の種または株を含む治療組成物を含み、ここで、該Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｏａｇｕｌａｎｓ細菌株は、該病原性細菌のコロニー形成率および該コロニー形成に起因する潜在的な生理学的に有害な効果の両方を減少する能力を保持する、キット。
【請求項６４】  請求項６３に記載のキットであって、ここで、前記Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｏａｇｕｌａｎｓ細菌株は、流動可能な濃縮物内の乾燥細菌細胞塊、安定化ゲル内の乾燥細菌細胞塊または安定化ペースト内の乾燥細菌細胞塊からなる群より選択される形態で、前記組成物中に含まれる、キット。
【請求項６５】  請求項６３に記載のキットであって、ここで、前記Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｏａｇｕｌａｎｓ細菌株は、流動可能な濃縮物内、安定化ゲル内または安定化ペースト内で投与後に出芽する能力を保持する、乾燥細菌芽胞塊の形態である、キット。
【請求項６６】  請求項６３に記載のキットであって、ここで、投与に適した前記治療組成物の全濃度は、１日あたり約１０ｍｇ〜約１０ｇの組成物の範囲であり、そして好ましくは、１日あたり約０．１ｇ〜約５ｇの組成物の範囲である、キット。
【請求項６７】  請求項６３に記載のキットであって、ここで、投与に適した前記治療組成物内のＢａｃｉｌｌｕｓ  ｃｏａｇｕｌａｎｓの全濃度は、１日あたり約１×１０３〜約１×１０４の生存細菌または生存芽胞の範囲であり、好ましくは、１日あたり約１×１０５〜約１×１０１０の生存細菌または生存芽胞の範囲であり、そしてより好ましくは、１日あたり約５×１０８〜約１×１０９の生存細菌または生存芽胞の範囲である、キット。
【請求項６８】  請求項６３に記載のキットであって、ここで、処置されるべき前記感染は、成体内におけるものであり、かつ抗生物質耐性病原体によって引き起こされ、かつここで、投与に適した前記治療組成物内のＢａｃｉｌｌｕｓ  ｃｏａｇｕｌａｎｓの全濃度は、１日あたり約１×１０２〜約１×１０１４の生存細菌または生存芽胞の範囲であり、好ましくは、１日あたり約１×１０８〜約１×１０１０の生存細菌または生存芽胞の範囲であり、そしてより好ましくは、１日あたり約２．５×１０８〜約１×１０１０の生存細菌または生存芽胞の範囲である、キット。
【請求項６９】  請求項６３に記載のキットであって、ここで、処置されるべき前記感染は、６ヶ月齢を超える幼児における乳児突然死症候群（ＳＩＤＳ）であり、かつ抗生物質耐性病原体によって引き起こされ、かつここで、投与に適した前記治療組成物内のＢａｃｉｌｌｕｓ  ｃｏａｇｕｌａｎｓの全濃度は、１日あたり約１×１０６〜約１×１０９の生存細菌または生存芽胞の範囲であり、好ましくは、１日あたり約５×１０４〜約２．５×１０５の生存細菌または生存芽胞の範囲であり、そしてより好ましくは、１日あたり約１．５×１０５〜約２×１０５の生存細菌または生存芽胞の範囲である、キット。
【請求項７０】  請求項６３に記載のキットであって、ここで、前記治療組成物は、１以上のビフィドジェニック因子をさらに含み、ここで、該ビフィドジェニックオリゴサッカライドは、フルクト−オリゴサッカライド（ＦＯＳ）、グルコ−オリゴサッカライド（ＧＯＳ）、ラフィノース、および長鎖オリゴサッカライドからなる群より選択される、キット。
【請求項７１】  請求項６３に記載のキットであって、ここで、前記治療組成物は、１以上のビフィドジェニック因子をさらに含み、かつここで、該ビフィドジェニック因子は、フルクト−オリゴサッカライド（ＦＯＳ）であり、かつここで、投与に適した該治療組成物内の該ビフィドジェニック因子の全濃度は、約１０ｍｇ／１ｇ治療組成物／日〜約２０ｇ／１ｇ治療組成物／日、好ましくは、約５０ｍｇ／１ｇ治療組成物／日〜約１０ｇ／１ｇ治療組成物／日、そしてより好ましくは、約１５０ｍｇ／１ｇ治療組成物／日〜約５ｇ／１ｇ治療組成物／日の範囲である、キット。
【請求項７２】  前記病原性細菌が、抗生物質耐性病原性細菌である、請求項６３に記載のキット。
【請求項７３】  請求項６３に記載のキットであって、ここで、前記治療組成物の投与の生理学的位置は、口腔；局所；膣内；経鼻；眼内；および耳内の投与位置を含む群より選択される、キット。
【請求項７４】  請求項６３に記載のキットであって、ここで、前記治療組成物が、抗生物質、抗真菌剤、抗ウイルス剤、および抗酵母剤を含む群より選択される抗微生物剤をさらに含む、キット。
【請求項７５】  請求項６３に記載のキットであって、ここで、前記治療組成物がさらに、以下：ゲンタマイシン；バンコマイシン；オキサシリン；テトラサイクリン；ニトロフラントイン；クロラムフェニコール；クリンダマイシン；トリメトプリムスルファメトキサゾール；セファロスポリン抗生物質ファミリーのメンバー；ペニシリン抗生物質ファミリーのメンバー；フルオロキノロン抗生物質ファミリーのメンバー；およびマクロライド抗生物質ファミリーのメンバーからなる群より選択される、治療有効濃度の抗生物質から構成される、キット。
【請求項７６】  請求項６３に記載のキットであって、ここで、前記治療組成物はさらに、以下：クロトリマゾール、フルコナゾール、イトラコナゾール、ケトコナゾール、ミコナゾール、ナイスタチン、テルビナフィン、テルコナゾール、およびチオコナゾールからなる群より選択される、治療有効濃度の抗真菌剤から構成される、キット。
【請求項７７】  病原性細菌によって引き起こされる胃腸感染の処置または予防のための治療組成物であって、該治療組成物は、脊椎動物の胃腸管への投与に適切な薬学的に受容可能なキャリア内に、治療有効濃度の抗生物質および該組成物内における使用のために選択された該抗生物質に対して抗生物質耐性または減少した抗生物質感受性を保持するＢａｃｉｌｌｕｓ  ｃｏａｇｕｌａｎｓの１以上の細菌株を含み、ここで、該Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｏａｇｕｌａｎｓ細菌株は、投与後に出芽する能力を保持する芽胞の形態である、治療組成物。
【請求項７８】  病原性細菌によって引き起こされる胃腸感染の処置または予防のための治療組成物であって、該治療組成物は、脊椎動物の胃腸管への投与に適切な薬学的に受容可能なキャリア内に、治療有効濃度の抗真菌剤および該組成物内における使用のために選択された該抗真菌剤に対して耐性または減少した感受性を保持するＢａｃｉｌｌｕｓ  ｃｏａｇｕｌａｎｓの１以上の細菌株を含み、ここで、該Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｏａｇｕｌａｎｓ細菌株は、投与後に出芽する能力を保持する芽胞の形態である、治療組成物。
【請求項７９】  病原性細菌によって引き起こされる胃腸感染の処置または予防のための治療組成物であって、該治療組成物は、脊椎動物の胃腸管への投与に適切な薬学的に受容可能なキャリア内に、治療有効濃度の抗酵母剤および該組成物内における使用のために選択された該抗酵母剤に対して耐性または減少した感受性を保持するＢａｃｉｌｌｕｓ  ｃｏａｇｕｌａｎｓの１以上の細菌株を含み、ここで、該Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｏａｇｕｌａｎｓ細菌株は、投与後に出芽する能力を保持する芽胞の形態である、治療組成物。
【請求項８０】  病原性細菌によって引き起こされる胃腸感染の処置または予防のための治療組成物であって、該治療組成物は、脊椎動物の胃腸管への投与に適切な薬学的に受容可能なキャリア内に、治療有効濃度の抗ウイルス剤および該組成物内における使用のために選択された該抗ウイルス剤に対して耐性または減少した感受性を保持するＢａｃｉｌｌｕｓ  ｃｏａｇｕｌａｎｓの１以上の細菌株を含み、ここで、該Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｏａｇｕｌａｎｓ細菌株は、投与後に出芽する能力を保持する芽胞の形態である、治療組成物。
【請求項８１】  病原性細菌によって引き起こされる胃腸感染の処置または予防における使用のためのキットであって、該キットは、脊椎動物の胃腸管への投与に適切な薬学的に受容可能なキャリア内にある治療有効濃度の抗生物質と、脊椎動物の胃腸管への投与に適切な薬学的に受容可能なキャリア内にある治療有効濃度の該キットにおける使用のために選択された該抗生物質に対して抗生物質耐性または減少した抗生物質感受性を保持するＢａｃｉｌｌｕｓ  ｃｏａｇｕｌａｎｓの１以上の細菌株と、を含み、ここで、該Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｏａｇｕｌａｎｓ細菌株は、投与後に出芽する能力を保持する芽胞の形態である、キット。
【請求項８２】  病原性細菌によって引き起こされる胃腸感染の処置または予防における使用のためのキットであって、該キットは、脊椎動物の胃腸管への投与に適切な薬学的に受容可能なキャリア内にある治療有効濃度の抗真菌剤と、脊椎動物の胃腸管への投与に適切な薬学的に受容可能なキャリア内にある治療有効濃度の該キットにおける使用のために選択された該真菌剤に対して耐性または減少した感受性を保持するＢａｃｉｌｌｕｓ  ｃｏａｇｕｌａｎｓの１以上の細菌株と、を含み、ここで、該Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｏａｇｕｌａｎｓ細菌株は、投与後に出芽する能力を保持する芽胞の形態である、キット。
【請求項８３】  病原性細菌によって引き起こされる胃腸感染の処置または予防における使用のためのキットであって、該キットは、脊椎動物の胃腸管への投与に適切な薬学的に受容可能なキャリア内にある治療有効濃度の抗酵母剤と、脊椎動物の胃腸管への投与に適切な薬学的に受容可能なキャリア内にある治療有効濃度の該キットにおける使用のために選択された該酵母剤に対して耐性または減少した感受性を保持するＢａｃｉｌｌｕｓ  ｃｏａｇｕｌａｎｓの１以上の細菌株と、を含み、ここで、該Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｏａｇｕｌａｎｓ細菌株は、投与後に出芽する能力を保持する芽胞の形態である、キット。
【請求項８４】  病原性細菌によって引き起こされる胃腸感染の処置または予防における使用のためのキットであって、該キットは、脊椎動物の胃腸管への投与に適切な薬学的に受容可能なキャリア内にある治療有効濃度の抗ウイルス剤と、脊椎動物の胃腸管への投与に適切な薬学的に受容可能なキャリア内にある治療有効濃度の該キットにおける使用のために選択された該抗ウイルス剤に対して耐性または減少した感受性を保持するＢａｃｉｌｌｕｓ  ｃｏａｇｕｌａｎｓの１以上の細菌株と、を含み、ここで、該Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｏａｇｕｌａｎｓ細菌株は、投与後に出芽する能力を保持する芽胞の形態である、キット。
【請求項８５】  抗生物質、抗真菌剤、抗酵母剤、および抗ウイルス剤を含む群から選択される抗微生物剤の先の投与と同時または該投与の後に、脊椎動物胃腸管の微生物叢を樹立または再樹立させるための組成物であって、該組成物は、脊椎動物の胃腸管への経口投与に適切な薬学的に受容可能なキャリア内で、Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｏａｇｕｌａｎｓの１以上の細菌株および１以上のビフィドジェニック因子から構成され、ここで該Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｏａｇｕｌａｎｓ細菌株は、該抗微生物剤に対して耐性または減少した感受性を保持する、組成物。
【請求項８６】  抗生物質、抗真菌剤、抗酵母剤、および抗ウイルス剤を含む群から選択される抗微生物剤の先の投与と同時または該投与の後に、脊椎動物胃腸管の微生物叢を樹立または再樹立させるためのキットであって、該キットは、脊椎動物の胃腸管への経口投与に適切な薬学的に受容可能なキャリア内にあるＢａｃｉｌｌｕｓ  ｃｏａｇｕｌａｎｓの１以上の細菌株と、脊椎動物の胃腸管への投与に適切な薬学的に受容可能なキャリア内にある１以上のビフィドジェニック因子と、を含み、ここで該Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｏａｇｕｌａｎｓ細菌株は、該抗微生物剤に対して耐性または減少した感受性を保持する、キット。
【請求項８７】  Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｏａｇｕｌａｎｓ細菌株において、抗微生物剤に対する耐性または減少した感受性を生成するための方法であって、以下：
（ｉ）該Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｏａｇｕｌａｎｓ細菌株の増殖を支持し得る寒天ベースの培地および致死下濃度の選択された抗微生物剤を含有するペトリ皿上で、該細菌株を培養する工程；
（ｉｉ）次いで、該細菌株の増殖を支持し得る寒天ベースの培地および該細菌株に対してなお致死下である増加した濃度の選択された該抗微生物剤を含有するペトリ皿上で、生存可能なコロニーを個別選択および再培養する工程；ならびに
（ｉｉｉ）該単離されたＢａｃｉｌｌｕｓ  ｃｏａｇｕｌａｎｓ細菌株が、同時に投与される組成物において利用される該抗微生物剤の治療有効濃度に近似する、該選択された抗微生物剤の濃度で、生存可能性を維持する能力を獲得する時点まで、徐々に増加する致死下濃度の該選択された抗微生物剤を利用して工程（ｉｉ）を繰り返す工程
を包含する、方法。
【請求項８８】  請求項８７に記載の方法であって、ここで、前記抗微生物剤が、以下：ゲンタマイシン；バンコマイシン；オキサシリン；テトラサイクリン；ニトロフラントイン；クロラムフェニコール；クリンダマイシン；トリメトプリムスルファメトキサゾール；セファロスポリン抗生物質ファミリーのメンバー；ペニシリン抗生物質ファミリーのメンバー；フルオロキノロン抗生物質ファミリーのメンバー；およびマクロライド抗生物質ファミリーのメンバーからなる群より選択される抗生物質である、方法。
【請求項８９】  請求項８７に記載の方法であって、ここで、前記抗微生物剤が、以下：クロトリマゾール、フルコナゾール、イトラコナゾール、ケトコナゾール、ミコナゾール、ナイスタチン、テルビナフィン、テルコナゾール、およびチオコナゾールからなる群より選択される抗真菌剤である、方法。
【請求項９０】  単離されたＢａｃｉｌｌｕｓ  ｃｏａｇｕｌａｎｓ細菌株において抗生物質耐性または減少した抗生物質感受性を生成するための方法であって、選択された抗生物質に対する耐性を付与し得るＤＮＡ配列を保持し、プラスミド媒介を伴わない該抗生物質耐性遺伝子の直接転移を可能にする接合性トランスポゾンの利用を包含する、方法。
【請求項９１】  単離されたＢａｃｉｌｌｕｓ  ｃｏａｇｕｌａｎｓ細菌株において抗生物質耐性または減少した抗生物質感受性を生成するための方法であって、選択された抗生物質に対する耐性を付与し得るＤＮＡ配列を保持するプラスミドを生成するための組換えＤＮＡベースの技術の利用、および該Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｏａｇｕｌａｎｓ細菌株を該プラスミドでトランスフェクトする工程を包含する、方法。
【請求項９２】  脊椎動物の胃腸管への経口投与に適切な薬学的に受容可能なキャリア内に、Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｏａｇｕｌａｎｓの１以上の細菌株を含む共生組成物であって、ここで該Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｏａｇｕｌａｎｓ細菌株は、約３０℃〜約６５℃の温度で増殖し得、Ｌ（＋）右旋性乳酸を産生し、約９０℃までの温度に対して耐性の芽胞を産生し、そして細菌、酵母、真菌、ウイルス、またはそれらの任意の組み合わせの増殖を阻害する共生活性を示す、共生組成物。
【請求項９３】  前記共生活性が、前記単離されたＢａｃｉｌｌｕｓ種細菌株の栄養生長から生じる、請求項９２に記載の共生組成物。
【請求項９４】  前記共生活性が、前記単離されたＢａｃｉｌｌｕｓ種細菌株によって産生される細胞外産物から生じる、請求項９２に記載の共生組成物。
【請求項９５】  共生組成物であって、該組成物は、脊椎動物の胃腸管への経口投与に適切な薬学的に受容可能なキャリア内に、抗生物質および該組成物内における使用のために選択された該抗生物質に対して抗生物質耐性または減少した抗生物質感受性を保持するＢａｃｉｌｌｕｓ  ｃｏａｇｕｌａｎｓの１以上の細菌株を含み、ここで該Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｏａｇｕｌａｎｓ細菌株は、約３０℃〜約６５℃の温度で増殖し得、Ｌ（＋）右旋性乳酸を産生し、約９０℃までの温度に対して耐性の芽胞を産生し、そして細菌、酵母、真菌、ウイルス、またはそれらの任意の組み合わせの増殖を阻害する共生活性を示す、共生組成物。
【請求項９６】  前記共生活性が、前記抗生物質および前記単離されたＢａｃｉｌｌｕｓ種細菌株の栄養生長の両方から生じる、請求項９５に記載の共生組成物。
【請求項９７】  前記共生活性が、前記抗生物質および前記単離されたＢａｃｉｌｌｕｓ種細菌株によって産生される細胞外産物の両方から生じる、請求項９５に記載の共生組成物。
【請求項９８】  病原性細菌によって引き起こされる胃腸感染の処置または予防のための組成物であって、該組成物は、脊椎動物の胃腸管への経口投与に適切な薬学的に受容可能なキャリア内に、治療有効濃度のＢａｃｉｌｌｕｓ  ｃｏａｇｕｌａｎｓ株の細胞外産物を含む、組成物。
【請求項９９】  病原性細菌によって引き起こされる胃腸感染の処置または予防のための組成物であって、該組成物は、脊椎動物の胃腸管への経口投与に適切な薬学的に受容可能なキャリア内にある治療有効濃度の抗生物質、抗真菌剤、抗酵母剤、または抗ウイルス剤を含む群から選択される抗微生物剤、および治療有効濃度のＢａｃｉｌｌｕｓ  ｃｏａｇｕｌａｎｓ株の細胞外産物を含む、組成物。
【請求項１００】  病原性細菌によって引き起こされる胃腸感染の処置または予防における使用のためのキットであって、該キットは、脊椎動物の胃腸管への経口投与に適切な薬学的に受容可能なキャリア内にある治療有効濃度の抗生物質、抗真菌剤、抗酵母剤、または抗ウイルス剤を含む群から選択される抗微生物剤と、脊椎動物の胃腸管への経口投与に適切な薬学的に受容可能なキャリア内にある治療有効濃度のＢａｃｉｌｌｕｓ  ｃｏａｇｕｌａｎｓ株の細胞外産物と、を含む、キット。
【請求項１０１】  動物の胃腸管および／または糞便における寄生生物増殖を阻害するための組成物であって、該組成物は、有効量の珪藻土および１つ以上の生存非病原性乳酸細菌を含む、組成物。
【請求項１０２】  前記珪藻土が、少なくとも８０％（重量／重量）のＭｅｌｏｓｉｒａである、請求項１０１に記載の組成物。
【請求項１０３】  前記珪藻土が、約０．１〜９５重量パーセントの量で存在する、請求項１０１に記載の組成物。
【請求項１０４】  前記珪藻土が、約１〜１０重量パーセントの量で存在する、請求項１０１に記載の組成物。
【請求項１０５】  請求項１０１に記載の組成物であって、ここで前記非病原性乳酸細菌が、以下：Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ａｃｉｄｏｐｈｉｌｕｓ、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓａｌｉｖａｒｉｕｓ、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｐｌａｎｔｅｒｕｍ、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｄｅｉｂｒｕｋｅｉｌ、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｐｏｒｅｇｅｎｅｓ、Ｓｐｏｒｏｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  Ｐ４４、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｒｈａｉｎｎｏｓｕｓ、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃａｓｅｉ、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｇａｓｓｅｒｉｌ、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｊｅｎｓｅｎｈｉ、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓａｌｉｖａｒｉｕｓ、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｒｈａｍｎｏｓｕｓ  ＣＣ、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｂｕｌｇａｒｉｃｕｓ、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｔｈｅｒｍｏｐｈｉｌｕｓ、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｆｅｒｍｅｎｔｕｒｎ、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅａｌｅ、Ｂｉｆｉｄｉｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｌｏｎｇｕｍ、Ｂｉｆｉｄｉｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｂｉｔｉｄｕｍ、Ｂｉｆｉｄｉｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｔａｎｔｕｓ、Ｂｉｆｉｄｉｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｂｉｔｉｄｕｓ、Ｂｉｆｉｄｉｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓ、Ｂｉｆｉｄｉｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｏｎ  ｇｕｍ、Ｂｉｆｉｄｉｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｂｒｅｖｅ、Ｂｉｆｉｄｉｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ａｎｉｍａｌｉｓ、Ｂｉｆｉｄｉｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ａｄｏｌｅｓｃｅｎｔｉｓ、Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｏａｇｕｌａｎｓ、Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｌａｅｖｏｌａｃｔｉｃｕｓ、およびＢａｃｉｌｌｕｓ  ｂｒｅｖｉｓ  ｓｕｂｓｐ．ｃｏａｇｕｌａｎｓからなる群から選択される、組成物。
【請求項１０６】  前記Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｏａｇｕｌａｎｓが、Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｏａｇｕｌａｎｓ亜種Ｈａｍｍｅｒである、請求項１０１に記載の組成物。
【請求項１０７】  前記細菌を、芽胞の形態で該組成物内に含む、請求項１０１に記載の組成物。
【請求項１０８】  前記細菌を、乾燥細胞塊の形態で該組成物内に含む、請求項１０１に記載の組成物。
【請求項１０９】  前記組成物が、液体、ペースト、粉末、顆粒、小丸剤、または錠剤に処方される、請求項１０１に記載の組成物。
【請求項１１０】  前記組成物が、該組成物１グラムあたり１×１０３〜１×１０１４ＣＦＵの生存細菌または生存芽胞を含む、請求項１０１に記載の組成物。
【請求項１１１】  前記組成物が、有効量のビフィドジェニックオリゴサッカライドをさらに含む、請求項１０１に記載の組成物。
【請求項１１２】  請求項１１１に記載の組成物であって、ここで、前記ビフィドジェニックオリゴサッカライドは、フルクト−オリゴサッカライド（ＦＯＳ）、グルコ−オリゴサッカライド（ＧＯＳ）、ラフィノース、および長鎖オリゴサッカライドからなる群より選択される、組成物。
【請求項１１３】  前記オリゴサッカライドが、約４〜１００糖単位のポリマー鎖長を有するポリマーを含む、請求項１１１に記載の組成物。
【請求項１１４】  前記組成物が、該組成物１グラムあたり約１０ミリグラムから約１グラムのＦＯＳを含む、請求項１１２に記載の組成物。
【請求項１１５】  前記組成物が、該組成物１グラムあたり１００ミリグラムから５００ミリグラムのＦＯＳを含む、請求項１１２に記載の組成物。
【請求項１１６】  ビタミンおよび無機質からなる群から選択される栄養補助剤をさらに含む、請求項１０１に記載の組成物。
【請求項１１７】  前記ビタミンが、ビタミンＡ、ビタミンＣ、ビタミンＥ、ビタミンＣ、ビタミンＢ−１、ビタミンＢ−２、ビタミンＢ−３、ビタミンＢ−６、ビタミンＢ−１２、ビタミンＫ、およびパントテン酸からなる群から選択される、請求項１１６に記載の組成物。
【請求項１１８】  前記無機質が、カルシウム、マグネシウム、リン、亜鉛、マンガン、銅、およびカリウムからなる群から選択される、請求項１１６に記載の組成物。
【請求項１１９】  前記無機質が、アンチモン、バリウム、ベリリウム、ビスマス、ホウ素、臭素、クロム、、コバルト、ゲルマニウム、金、ヨウ素、鉄、リチウム、ニッケル、パラジウム、白金、セレン、ケイ素、銀、ストロンチウム、スズ、チタン、タングステン、バナジウム、およびジルコニウムからなる群から選択される、請求項１１６に記載の組成物。
【請求項１２０】  前記組成物が、食品物質または調味料をさらに含む、請求項１０１に記載の組成物。
【請求項１２１】  前記組成物が、粉末食品補助剤、包装食品、液体処方物、または経口電解質維持処方物をさらに含む、請求項１０１に記載の組成物。
【請求項１２２】  前記経口電解質維持処方物が、塩化ナトリウム、クエン酸カリウム、クエン酸、またはグルコースを含む粉末である、請求項１２１に記載の組成物。
【請求項１２３】  動物の胃腸管における寄生生物感染を阻害するための、動物の消化管への投与に適した、請求項１０１に記載の組成物。
【請求項１２４】  前記投与が、前記組成物の経口摂取を包含する、請求項１２３に記載の組成物。
【請求項１２５】  前記投与が、１日あたり１００キログラムの動物体重あたり０．１〜５０グラムの前記組成物を前記消化管内に導入する工程を包含する、請求項１２３に記載の組成物。
【請求項１２６】  前記投与が、１日あたり１００キログラムの動物体重あたり約１×１０２〜約１×１０１０の生存細菌または生存芽胞を前記消化管内に導入する工程を包含する、請求項１２３に記載の組成物。
【請求項１２７】  前記投与が、１日あたり１００キログラムの動物体重あたり１×１０３〜１×１０６の生存細菌または生存芽胞を前記消化管内に導入する工程を包含する、請求項１２３に記載の組成物。
【請求項１２８】  前記投与が、１日あたり１００キログラムの動物体重あたり１×１０６〜１×１０９の生存細菌または生存芽胞を前記消化管内に導入する工程を包含する、請求項１２３に記載の組成物。
【請求項１２９】  前記投与が、１日あたり１キログラムの動物体重あたり５０ミリグラム〜１０グラムの珪藻土を前記消化管内に導入する工程を包含する、請求項１２３に記載の組成物。
【請求項１３０】  前記投与が、１日あたり１キログラムの動物体重あたり２００ミリグラム〜５００ミリグラムの珪藻土を前記消化管内に導入する工程を包含する、請求項１２３に記載の組成物。
【請求項１３１】  前記組成物が、有効量のビフィドジェニックオリゴサッカライドをさらに含む、請求項１２３に記載の方法。
【請求項１３２】  前記投与が、１日あたり１００キログラムの動物体重あたり１０ミリグラム〜２０グラムのビフィドジェニックオリゴサッカライドを前記消化管内に導入する工程を包含する、請求項１３１に記載の方法。
【請求項１３３】  前記投与が、１日あたり１００キログラムの動物体重あたり１５０ミリグラム〜５グラムのビフィドジェニックオリゴサッカライドを前記消化管内に導入する工程を包含する、請求項１３１に記載の方法。
【請求項１３４】  動物性有機質肥料において昆虫集団を減少させるための、動物の消化管への投与に適した、請求項１０１に記載の組成物。
【請求項１３５】  前記投与が、前記組成物の経口摂取を包含する、請求項１３４に記載の方法。
【請求項１３６】  前記投与が、１日あたり１００キログラムの動物体重あたり０．１〜５０グラムの前記組成物を前記消化管内に導入する工程を包含する、請求項１３４に記載の組成物。
【請求項１３７】  前記投与が、１日あたり１００キログラムの動物体重あたり１×１０２〜１×１０１０の生存細菌または生存芽胞を前記消化管内に導入する工程を包含する、請求項１３４に記載の組成物。
【請求項１３８】  前記投与が、１日あたり１００キログラムの動物体重あたり１×１０３〜１×１０６の生存細菌または生存芽胞を前記消化管内に導入する工程を包含する、請求項１３４に記載の組成物。
【請求項１３９】  前記投与が、１日あたり１００キログラムの動物体重あたり１×１０６〜１×１０９の生存細菌または生存芽胞を前記消化管内に導入する工程を包含する、請求項１３４に記載の組成物。
【請求項１４０】  前記投与が、１日あたり１キログラムの動物体重あたり５０ミリグラム〜１０グラムの珪藻土を前記消化管内に導入する工程を包含する、請求項１３４に記載の組成物。
【請求項１４１】  前記投与が、１日あたり１キログラムの動物体重あたり２００ミリグラム〜５００ミリグラムの珪藻土を前記消化管内に導入する工程を包含する、請求項１３４に記載の組成物。
【請求項１４２】  有効量のビフィドジェニックオリゴサッカライドをさらに含む、請求項１３４に記載の組成物。
【請求項１４３】  前記投与が、１日あたり１００キログラムの動物体重あたり１０ミリグラム〜２０グラムのビフィドジェニックオリゴサッカライドを前記消化管内に導入する工程を包含する、請求項１４２に記載の組成物。
【請求項１４４】  前記投与が、１日あたり１００キログラムの動物体重あたり１５０ミリグラム〜５グラムのビフィドジェニックオリゴサッカライドを前記消化管内に導入する工程を包含する、請求項１４２に記載の組成物。
【請求項１４５】  動物の胃腸管における寄生生物感染を阻害するためのシステムであって、該システムは、ラベルおよび請求項１０１に記載の組成物を有する容器を備え、ここで該ラベルは、動物の胃腸管における寄生生物感染を阻害するための該組成物の使用に関する使用説明書を含む、システム。
【請求項１４６】  動物性有機質肥料において昆虫集団を減少させるためのシステムであって、該システムは、ラベルおよび請求項１０１に記載の組成物を有する容器を備え、ここで該ラベルは、動物性有機質肥料において昆虫集団を減少させるための該組成物の使用に関する使用説明書を含む、システム。
【請求項１４７】  動物の胃腸管および／または糞便における寄生生物増殖を阻害するための組成物であって、該組成物は、有効量の珪藻土を含み、ここで該組成物中の該珪藻土が本質的に、少なくとも５０％（重量／重量）のＭｅｌｏｓｉｒａからなる、組成物。
【請求項１４８】  前記珪藻土が本質的に、少なくとも８０％（重量／重量）のＭｅｌｏｓｉｒａからなる、請求項１４７に記載の組成物。
【請求項１４９】  前記組成物が、生存非病原性乳酸産生細菌の培養物をさらに含む、請求項１４７に記載の組成物。
【請求項１５０】  動物の胃腸管内における寄生生物感染を阻害するための、動物の消化管への投与に適した、請求項１４７に記載の組成物。
【請求項１５１】  動物性有機質肥料において昆虫集団を減少させるための、動物の消化管への投与に適した、請求項１４７に記載の組成物。
【請求項１５２】  動物の胃腸管における寄生生物感染を阻害するためのシステムであって、該システムは、ラベルおよび請求項１４７に記載の組成物を有する容器を備え、ここで該ラベルは、動物の胃腸管における寄生生物感染を阻害するための該組成物の使用に関する使用説明書を含む、システム。
【請求項１５３】  動物性有機質肥料において昆虫集団を減少させるためのシステムであって、該システムは、ラベルおよび請求項１４７に記載の組成物を有する容器を備え、ここで該ラベルは、動物性有機質肥料において昆虫集団を減少させるための該組成物の使用に関する使用説明書を含む、システム。