【手続補正書】
【提出日】平成18年2月7日(2006.2.7)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
ＡＩＤＳまたはＨＩＶ関連障害を処置し得る候補化合物を同定するための方法であって、以下：
ｉ）以下：
ａ）配列番号８、配列番号２、配列番号４、配列番号６、配列番号１０、配列番号１２、配列番号１４、配列番号１６、配列番号１８、配列番号２０、配列番号２２、配列番号２４、配列番号２６、配列番号２８、配列番号３０、配列番号３２、配列番号３４、配列番号３６、配列番号３８、配列番号４０、配列番号４２、配列番号４４、配列番号４６、配列番号４８、配列番号５０または配列番号５２のアミノ酸配列と少なくとも９５％同一なアミノ酸配列を含むポリペプチド；
ｂ）配列番号７、配列番号１、配列番号３、配列番号５、配列番号９、配列番号１１、配列番号１３、配列番号１５、配列番号１７、配列番号１９、配列番号２１、配列番号２３、配列番号２５、配列番号２７、配列番号２９、配列番号３１、配列番号３３、配列番号３５、配列番号３７、配列番号３９、配列番号４１、配列番号４３、配列番号４５、配列番号４７、配列番号４９または配列番号５１のヌクレオチド配列を含む核酸と少なくとも９５％同一なヌクレオチド配列を含む核酸分子によりコードされるポリペプチド；
ｃ）配列番号８、配列番号２、配列番号４、配列番号６、配列番号１０、配列番号１２、配列番号１４、配列番号１６、配列番号１８、配列番号２０、配列番号２２、配列番号２４、配列番号２６、配列番号２８、配列番号３０、配列番号３２、配列番号３４、配列番号３６、配列番号３８、配列番号４０、配列番号４２、配列番号４４、配列番号４６、配列番号４８、配列番号５０または配列番号５２のアミノ酸配列を含むポリペプチド；および
ｄ）配列番号７、配列番号１、配列番号３、配列番号５、配列番号９、配列番号１１、配列番号１３、配列番号１５、配列番号１７、配列番号１９、配列番号２１、配列番号２３、配列番号２５、配列番号２７、配列番号２９、配列番号３１、配列番号３３、配列番号３５、配列番号３７、配列番号３９、配列番号４１、配列番号４３、配列番号４５、配列番号４７、配列番号４９または配列番号５１に示されるヌクレオチド配列によりコードされるポリペプチド
からなる群より選択されるポリペプチドを含むサンプルを試験化合物に、該化合物の該ポリペプチドへの結合に適切な条件下で組み合わせる工程；ならびに
ｉｉ）該試験化合物が、該ポリペプチドに結合することを検出することによって、該ポリペプチドに結合する化合物を同定する工程
を包含し、それによって、ＡＩＤＳまたはＨＩＶ関連障害を処置し得る化合物を同定する、方法。
【請求項２】
ＡＩＤＳまたはＨＩＶ関連障害を処置し得る候補化合物を同定するための方法であって、以下：
ｉ）以下：
ａ）配列番号８、配列番号２、配列番号４、配列番号６、配列番号１０、配列番号１２、配列番号１４、配列番号１６、配列番号１８、配列番号２０、配列番号２２、配列番号２４、配列番号２６、配列番号２８、配列番号３０、配列番号３２、配列番号３４、配列番号３６、配列番号３８、配列番号４０、配列番号４２、配列番号４４、配列番号４６、配列番号４８、配列番号５０または配列番号５２のアミノ酸配列と少なくとも９５％同一なアミノ酸配列を含むポリペプチド；
ｂ）配列番号７、配列番号１、配列番号３、配列番号５、配列番号９、配列番号１１、配列番号１３、配列番号１５、配列番号１７、配列番号１９、配列番号２１、配列番号２３、配列番号２５、配列番号２７、配列番号２９、配列番号３１、配列番号３３、配列番号３５、配列番号３７、配列番号３９、配列番号４１、配列番号４３、配列番号４５、配列番号４７、配列番号４９または配列番号５１のヌクレオチド配列を含む核酸と少なくとも９５％同一なヌクレオチド配列を含む核酸分子によりコードされるポリペプチド；
ｃ）配列番号８、配列番号２、配列番号４、配列番号６、配列番号１０、配列番号１２、配列番号１４、配列番号１６、配列番号１８、配列番号２０、配列番号２２、配列番号２４、配列番号２６、配列番号２８、配列番号３０、配列番号３２、配列番号３４、配列番号３６、配列番号３８、配列番号４０、配列番号４２、配列番号４４、配列番号４６、配列番号４８、配列番号５０または配列番号５２のアミノ酸配列を含むポリペプチド；および
ｄ）配列番号７、配列番号１、配列番号３、配列番号５、配列番号９、配列番号１１、配列番号１３、配列番号１５、配列番号１７、配列番号１９、配列番号２１、配列番号２３、配列番号２５、配列番号２７、配列番号２９、配列番号３１、配列番号３３、配列番号３５、配列番号３７、配列番号３９、配列番号４１、配列番号４３、配列番号４５、配列番号４７、配列番号４９または配列番号５１に示されるヌクレオチド配列によりコードされるポリペプチド
からなる群より選択されるポリペプチドを含むサンプルを試験化合物に、該化合物が該ポリペプチドの活性を調節するのに適切な条件下で組み合わせる工程；ならびに
ｉｉ）該試験化合物が、該ポリペプチドの活性を調節することを検出する能力を評価する工程
を包含し、それによって、ＡＩＤＳまたはＨＩＶ関連障害を処置し得る化合物を同定する、方法。
【請求項３】
ＡＩＤＳまたはＨＩＶ関連障害を処置し得る化合物を同定するための方法であって、以下：
ｉ）以下：
ａ）配列番号７、配列番号１、配列番号３、配列番号５、配列番号９、配列番号１１、配列番号１３、配列番号１５、配列番号１７、配列番号１９、配列番号２１、配列番号２３、配列番号２５、配列番号２７、配列番号２９、配列番号３１、配列番号３３、配列番号３５、配列番号３７、配列番号３９、配列番号４１、配列番号４３、配列番号４５、配列番号４７、配列番号４９または配列番号５１のヌクレオチド配列と少なくとも９５％同一なヌクレオチド配列を含む核酸分子；
ｂ）配列番号７、配列番号１、配列番号３、配列番号５、配列番号９、配列番号１１、配列番号１３、配列番号１５、配列番号１７、配列番号１９、配列番号２１、配列番号２３、配列番号２５、配列番号２７、配列番号２９、配列番号３１、配列番号３３、配列番号３５、配列番号３７、配列番号３９、配列番号４１、配列番号４３、配列番号４５、配列番号４７、配列番号４９または配列番号５１のヌクレオチド配列を含む核酸分子；
ｃ）配列番号８、配列番号２、配列番号４、配列番号６、配列番号１０、配列番号１２、配列番号１４、配列番号１６、配列番号１８、配列番号２０、配列番号２２、配列番号２４、配列番号２６、配列番号２８、配列番号３０、配列番号３２、配列番号３４、配列番号３６、配列番号３８、配列番号４０、配列番号４２、配列番号４４、配列番号４６、配列番号４８、配列番号５０または配列番号５２のアミノ酸配列と少なくとも９５％同一なアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする核酸分子；および
ｄ）配列番号８、配列番号２、配列番号４、配列番号６、配列番号１０、配列番号１２、配列番号１４、配列番号１６、配列番号１８、配列番号２０、配列番号２２、配列番号２４、配列番号２６、配列番号２８、配列番号３０、配列番号３２、配列番号３４、配列番号３６、配列番号３８、配列番号４０、配列番号４２、配列番号４４、配列番号４６、配列番号４８、配列番号５０または配列番号５２のアミノ酸配列をコードする核酸分子
からなる群より選択されるポリヌクレオチドを発現する細胞を試験化合物に組み合わせる工程；ならびに
ｉｉ）該試験化合物が、該核酸分子の該発現を調節する能力を評価する工程
を包含し、それによってＡＩＤＳまたはＨＩＶ関連障害を処置し得る化合物を同定する、方法。
【請求項４】
ウイルス複製を調節し得る候補化合物を同定するための方法であって、以下：
ｉ）以下：
ａ）配列番号８、配列番号２、配列番号４、配列番号６、配列番号１０、配列番号１２、配列番号１４、配列番号１６、配列番号１８、配列番号２０、配列番号２２、配列番号２４、配列番号２６、配列番号２８、配列番号３０、配列番号３２、配列番号３４、配列番号３６、配列番号３８、配列番号４０、配列番号４２、配列番号４４、配列番号４６、配列番号４８、配列番号５０または配列番号５２のアミノ酸配列と少なくとも９５％同一なアミノ酸配列を含むポリペプチド；
ｂ）配列番号７、配列番号１、配列番号３、配列番号５、配列番号９、配列番号１１、配列番号１３、配列番号１５、配列番号１７、配列番号１９、配列番号２１、配列番号２３、配列番号２５、配列番号２７、配列番号２９、配列番号３１、配列番号３３、配列番号３５、配列番号３７、配列番号３９、配列番号４１、配列番号４３、配列番号４５、配列番号４７、配列番号４９または配列番号５１のヌクレオチド配列を含む核酸と少なくとも９５％同一なヌクレオチド配列を含む核酸分子によりコードされるポリペプチド；
ｃ）配列番号８、配列番号２、配列番号４、配列番号６、配列番号１０、配列番号１２、配列番号１４、配列番号１６、配列番号１８、配列番号２０、配列番号２２、配列番号２４、配列番号２６、配列番号２８、配列番号３０、配列番号３２、配列番号３４、配列番号３６、配列番号３８、配列番号４０、配列番号４２、配列番号４４、配列番号４６、配列番号４８、配列番号５０または配列番号５２のアミノ酸配列を含むポリペプチド；および
ｄ）配列番号７、配列番号１、配列番号３、配列番号５、配列番号９、配列番号１１、配列番号１３、配列番号１５、配列番号１７、配列番号１９、配列番号２１、配列番号２３、配列番号２５、配列番号２７、配列番号２９、配列番号３１、配列番号３３、配列番号３５、配列番号３７、配列番号３９、配列番号４１、配列番号４３、配列番号４５、配列番号４７、配列番号４９または配列番号５１に示されるヌクレオチド配列によりコードされるポリペプチド
からなる群より選択されるポリペプチドを含むサンプルを試験化合物に、該化合物の該ポリペプチドへの結合に適切な条件下で組み合わせる工程；ならびに
ｉｉ）該試験化合物が、該ポリペプチドに結合することを検出し、それによって、該ポリペプチドに結合する化合物を同定する工程
を包含し、それによって、ウイルス複製を調節し得る化合物を同定する、方法。
【請求項５】
ウイルス複製を調節し得る候補化合物を同定するための方法であって、以下：
ｉ）以下：
ａ）配列番号８、配列番号２、配列番号４、配列番号６、配列番号１０、配列番号１２、配列番号１４、配列番号１６、配列番号１８、配列番号２０、配列番号２２、配列番号２４、配列番号２６、配列番号２８、配列番号３０、配列番号３２、配列番号３４、配列番号３６、配列番号３８、配列番号４０、配列番号４２、配列番号４４、配列番号４６、配列番号４８、配列番号５０または配列番号５２のアミノ酸配列と少なくとも９５％同一なアミノ酸配列を含むポリペプチド；
ｂ）配列番号７、配列番号１、配列番号３、配列番号５、配列番号９、配列番号１１、配列番号１３、配列番号１５、配列番号１７、配列番号１９、配列番号２１、配列番号２３、配列番号２５、配列番号２７、配列番号２９、配列番号３１、配列番号３３、配列番号３５、配列番号３７、配列番号３９、配列番号４１、配列番号４３、配列番号４５、配列番号４７、配列番号４９または配列番号５１のヌクレオチド配列を含む核酸と少なくとも９５％同一なヌクレオチド配列を含む核酸分子によりコードされるポリペプチド；
ｃ）配列番号８、配列番号２、配列番号４、配列番号６、配列番号１０、配列番号１２、配列番号１４、配列番号１６、配列番号１８、配列番号２０、配列番号２２、配列番号２４、配列番号２６、配列番号２８、配列番号３０、配列番号３２、配列番号３４、配列番号３６、配列番号３８、配列番号４０、配列番号４２、配列番号４４、配列番号４６、配列番号４８、配列番号５０または配列番号５２のアミノ酸配列を含むポリペプチド；および
ｄ）配列番号７、配列番号１、配列番号３、配列番号５、配列番号９、配列番号１１、配列番号１３、配列番号１５、配列番号１７、配列番号１９、配列番号２１、配列番号２３、配列番号２５、配列番号２７、配列番号２９、配列番号３１、配列番号３３、配列番号３５、配列番号３７、配列番号３９、配列番号４１、配列番号４３、配列番号４５、配列番号４７、配列番号４９または配列番号５１に示されるヌクレオチド配列によりコードされるポリペプチド
からなる群より選択されるポリペプチドを含むサンプルを試験化合物に、該試験化合物が該ポリペプチドの活性を調節するのに適切な条件下で組み合わせる工程；ならびに
ｉｉ）該試験化合物が該ポリペプチドの活性を調節する能力を評価する工程
を包含し、それによって、ウイルス複製を調節し得る化合物を同定する、方法。
【請求項６】
ウイルス複製を調節し得る化合物を同定するための方法であって、以下：
ｉ）以下：
ａ）配列番号７、配列番号１、配列番号３、配列番号５、配列番号９、配列番号１１、配列番号１３、配列番号１５、配列番号１７、配列番号１９、配列番号２１、配列番号２３、配列番号２５、配列番号２７、配列番号２９、配列番号３１、配列番号３３、配列番号３５、配列番号３７、配列番号３９、配列番号４１、配列番号４３、配列番号４５、配列番号４７、配列番号４９または配列番号５１のヌクレオチド配列と少なくとも９５％同一なヌクレオチド配列を含む核酸分子；
ｂ）配列番号７、配列番号１、配列番号３、配列番号５、配列番号９、配列番号１１、配列番号１３、配列番号１５、配列番号１７、配列番号１９、配列番号２１、配列番号２３、配列番号２５、配列番号２７、配列番号２９、配列番号３１、配列番号３３、配列番号３５、配列番号３７、配列番号３９、配列番号４１、配列番号４３、配列番号４５、配列番号４７、配列番号４９または配列番号５１のヌクレオチド配列を含む核酸分子；
ｃ）配列番号８、配列番号２、配列番号４、配列番号６、配列番号１０、配列番号１２、配列番号１４、配列番号１６、配列番号１８、配列番号２０、配列番号２２、配列番号２４、配列番号２６、配列番号２８、配列番号３０、配列番号３２、配列番号３４、配列番号３６、配列番号３８、配列番号４０、配列番号４２、配列番号４４、配列番号４６、配列番号４８、配列番号５０または配列番号５２のアミノ酸配列と少なくとも９５％同一なアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする核酸分子；および
ｄ）配列番号８、配列番号２、配列番号４、配列番号６、配列番号１０、配列番号１２、配列番号１４、配列番号１６、配列番号１８、配列番号２０、配列番号２２、配列番号２４、配列番号２６、配列番号２８、配列番号３０、配列番号３２、配列番号３４、配列番号３６、配列番号３８、配列番号４０、配列番号４２、配列番号４４、配列番号４６、配列番号４８、配列番号５０または配列番号５２のアミノ酸配列をコードする核酸分子
からなる群より選択されるポリヌクレオチドを発現する細胞を試験化合物に組み合わせる工程；ならびに
ｉｉ）該試験化合物が、該核酸分子の該発現を調節する能力を評価する工程
を包含し、それによってウイルス複製を調節し得る化合物を同定する、方法。
【請求項７】
前記化合物が、低分子、ペプチド、および抗体からなる群より選択される、請求項１、２、４または５に記載の方法。
【請求項８】
前記化合物が、アンチセンス核酸分子である、請求項３または６に記載の方法。
【請求項９】
前記ポリペプチドが、異種アミノ酸配列をさらに含む、請求項１、２、４または５に記載の方法。
【請求項１０】
前記サンプルが、細胞または単離されたポリペプチドである、請求項１、２、４、または５に記載の方法。
【請求項１１】
前記細胞が、Ｔ細胞である、請求項１０に記載の方法。
【請求項１２】
ＡＩＤＳもしくはＨＩＶ関連障害を有するか、ＡＩＤＳもしくはＨＩＶ関連障害を発症する危険のある被験体を同定するためのキットであって、
第１増幅プライマーおよび第２増幅プライマー
を備え、
該第１増幅プライマーは、配列番号７、配列番号１、配列番号３、配列番号５、配列番号９、配列番号１１、配列番号１３、配列番号１５、配列番号１７、配列番号１９、配列番号２１、配列番号２３、配列番号２５、配列番号２７、配列番号２９、配列番号３１、配列番号３３、配列番号３５、配列番号３７、配列番号３９、配列番号４１、配列番号４３、配列番号４５、配列番号４７、配列番号４９または配列番号５１のうちの少なくとも２５連続したヌクレオチド配列であり；
該第２増幅プライマーは、配列番号７、配列番号１、配列番号３、配列番号５、配列番号９、配列番号１１、配列番号１３、配列番号１５、配列番号１７、配列番号１９、配列番号２１、配列番号２３、配列番号２５、配列番号２７、配列番号２９、配列番号３１、配列番号３３、配列番号３５、配列番号３７、配列番号３９、配列番号４１、配列番号４３、配列番号４５、配列番号４７、配列番号４９または配列番号５１の相補体に由来する少なくとも２５連続したヌクレオチド配列である、
キット。
【請求項１３】
ＡＩＤＳもしくはＨＩＶ関連障害を有するか、ＡＩＤＳもしくはＨＩＶ関連障害を発症する危険のある被験体を同定するためのキットであって、該キットは、以下：
ａ）配列番号８、配列番号２、配列番号４、配列番号６、配列番号１０、配列番号１２、配列番号１４、配列番号１６、配列番号１８、配列番号２０、配列番号２２、配列番号２４、配列番号２６、配列番号２８、配列番号３０、配列番号３２、配列番号３４、配列番号３６、配列番号３８、配列番号４０、配列番号４２、配列番号４４、配列番号４６、配列番号４８、配列番号５０または配列番号５２のアミノ酸配列と少なくとも９５％同一なアミノ酸配列を含むポリペプチド；
ｂ）配列番号７、配列番号１、配列番号３、配列番号５、配列番号９、配列番号１１、配列番号１３、配列番号１５、配列番号１７、配列番号１９、配列番号２１、配列番号２３、配列番号２５、配列番号２７、配列番号２９、配列番号３１、配列番号３３、配列番号３５、配列番号３７、配列番号３９、配列番号４１、配列番号４３、配列番号４５、配列番号４７、配列番号４９または配列番号５１のヌクレオチド配列を含む核酸と少なくとも９５％同一なヌクレオチド配列を含む核酸分子によりコードされるポリペプチド；
ｃ）配列番号８、配列番号２、配列番号４、配列番号６、配列番号１０、配列番号１２、配列番号１４、配列番号１６、配列番号１８、配列番号２０、配列番号２２、配列番号２４、配列番号２６、配列番号２８、配列番号３０、配列番号３２、配列番号３４、配列番号３６、配列番号３８、配列番号４０、配列番号４２、配列番号４４、配列番号４６、配列番号４８、配列番号５０または配列番号５２のアミノ酸配列を含むポリペプチド；および
ｄ）配列番号７、配列番号１、配列番号３、配列番号５、配列番号９、配列番号１１、配列番号１３、配列番号１５、配列番号１７、配列番号１９、配列番号２１、配列番号２３、配列番号２５、配列番号２７、配列番号２９、配列番号３１、配列番号３３、配列番号３５、配列番号３７、配列番号３９、配列番号４１、配列番号４３、配列番号４５、配列番号４７、配列番号４９または配列番号５１に示されるヌクレオチド配列によりコードされるポリペプチド
からなる群より選択されるポリペプチド、および該ポリペプチドに選択的に結合し得る抗体を備える、キット。
【請求項１４】
請求項１、２、３、４、５または６で同定された化合物を含む、ＡＩＤＳまたはＨＩＶ関連障害を有する被験体を処置するための薬学的組成物。