(57)【要約】      （修正有）【課題】複数の標的核酸の分析において、各標的核酸の分析用オリゴヌクレオチドに適した成分濃度で分析を行うことが可能な試薬カートリッジ、標的核酸の分析装置及び標的核酸の分析方法の提供。【解決手段】第１の標的核酸の分析用試薬のカートリッジ１は、少なくとも１つの共通試薬槽１１と、複数の濃度調整試薬槽１２と、複数の非共通試薬槽１３とを有し、共通試薬槽１１は、夫々、複数の標的核酸の分析に共通して使用可能な複数の成分を含む共通試薬が充填されており、複数の濃度調整試薬槽１２は、夫々、複数の標的核酸の分析に共通して使用可能な少なくとも１つの成分を異なる濃度で含む濃度調整試薬が充填されており、複数の非共通試薬槽１３は、夫々、特定の標的核酸を分析する分析用オリゴヌクレオチドを含む非共通試薬が充填可能である標的核酸の分析試薬カートリッジ。【選択図】図１
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【特許請求の範囲】
【請求項１】
少なくとも１つの共通試薬槽と、複数の濃度調整試薬槽と、複数の非共通試薬槽とを有し、
前記共通試薬槽は、それぞれ、複数の標的核酸の分析に共通して使用可能な複数の成分を含む共通試薬が充填されており、
前記複数の濃度調整試薬槽は、それぞれ、複数の標的核酸の分析に共通して使用可能な少なくとも１つの成分を異なる濃度で含む濃度調整試薬が充填されており、
前記複数の非共通試薬槽は、それぞれ、特定の標的核酸を分析する分析用オリゴヌクレオチドを含む非共通試薬が充填可能であることを特徴とする、標的核酸の分析用試薬カートリッジ。
【請求項２】
前記濃度調整試薬において異なる濃度で含まれる前記成分が、
前記標的核酸の分析において、前記共通試薬および前記濃度調整試薬と組み合わせて使用する前記非共通試薬の分析用オリゴヌクレオチドの種類に応じて、濃度が調整される成分である、請求項１記載のカートリッジ。
【請求項３】
前記共通試薬が、前記濃度調整試薬において異なる濃度で含まれる成分を含まない、請求項１または２記載のカートリッジ。
【請求項４】
複数の共通試薬槽と、複数の非共通試薬槽とを有し、
前記共通試薬槽は、それぞれ、複数の標的核酸の分析に共通して使用可能な複数の成分を含む共通試薬が充填されており、
前記共通試薬は、それぞれ、前記複数の成分のうち少なくとも１つの成分を異なる濃度で含み、
前記複数の非共通試薬槽は、それぞれ、特定の標的核酸を分析する分析用オリゴヌクレオチドを含む非共通試薬が充填可能であることを特徴とする、標的核酸の分析用試薬カートリッジ。
【請求項５】
前記共通試薬において異なる濃度で含まれる前記成分が、
前記標的核酸の分析において、前記共通試薬と組み合わせて使用する前記非共通試薬の分析用オリゴヌクレオチドの種類に応じて、濃度が調整される成分である、請求項４記載のカートリッジ。
【請求項６】
前記異なる濃度で含まれる成分が、マグネシウムイオン、カリウムイオン、マンガンイオン、ナトリウムイオン、およびアンモニウムイオンからなる群から選択された少なくとも１つである、請求項１から５のいずれか一項に記載のカートリッジ。
【請求項７】
前記異なる濃度で含まれる成分が、マグネシウムイオンである、請求項１から６のいずれか一項に記載のカートリッジ。
【請求項８】
前記分析用オリゴヌクレオチドが、前記標的核酸を増幅可能なプライマーである、請求項１から７のいずれか一項に記載のカートリッジ。
【請求項９】
前記分析用オリゴヌクレオチドが、さらに、前記標的核酸を検出可能なプローブを含む、請求項８記載のカートリッジ。
【請求項１０】
前記非共通試薬槽に、前記非共通試薬が予め充填されている、請求項１から９のいずれかに記載のカートリッジ。
【請求項１１】
各非共通試薬槽に充填された非共通試薬が、それぞれ、異なる標的核酸の分析用オリゴヌクレオチドを含む、請求項１から１０のいずれか一項に記載のカートリッジ。
【請求項１２】
請求項１から３および６から１１のいずれか一項に記載のカートリッジが収容されているカートリッジ収容部と、
サンプル、前記共通試薬槽に充填されている共通試薬、前記濃度調整試薬槽に充填されている少なくとも１つの濃度調整試薬、および前記非共通試薬槽に充填されている少なくとも１つの非共通試薬を混合することにより、前記標的核酸の分析系を調製する調製部と、
前記分析系を分析することにより、前記標的核酸を分析する分析部とを含むことを特徴とする、標的核酸の分析装置。
【請求項１３】
前記調製部において、前記サンプル、少なくとも２つの前記濃度調整試薬、および少なくとも１つの前記非共通試薬を混合することにより、前記分析系を調製する、請求項１２記載の分析装置。
【請求項１４】
請求項１から３および６から１１のいずれか一項に記載のカートリッジを用い、
サンプル、前記共通試薬槽に充填されている共通試薬、前記濃度調整試薬槽に充填されている少なくとも１つの濃度調整試薬、および前記非共通試薬槽に充填されている少なくとも１つの非共通試薬を混合することにより、前記標的核酸の分析系を調製する調製工程と、
前記分析系を分析することにより、前記標的核酸を分析する分析工程とを含むことを特徴とする、標的核酸の分析方法。
【請求項１５】
前記調製工程において、前記サンプル、少なくとも２つの前記濃度調整試薬、および少なくとも１つの前記非共通試薬を混合することにより、前記分析系を調製する、請求項１４記載の分析方法。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
本発明は、標的核酸の分析用試薬カートリッジ、標的核酸の分析装置、および標的核酸の分析方法に関する。
【背景技術】
【０００２】
特許文献１には、ＰＣＲ等の遺伝子解析において、共通して使用可能な共通試薬が充填された共通試薬槽と、標的核酸に応じて使用者が用意するプライマー等の分析用オリゴヌクレオチドを含む非共通試薬を充填可能な非共通試薬槽とを有する試薬カートリッジが記載されている。
【先行技術文献】
【特許文献】
【０００３】
【特許文献１】特許第５４９８９４４号
【発明の概要】
【発明が解決しようとする課題】
【０００４】
特許文献１において、前記共通試薬槽は、１つの試薬につき１つの槽が設けられ、各槽に所定濃度の試薬が充填されている。このため、ある成分について、プライマーやプローブ等の特性に合わせ、同じ試薬でも異なる濃度とすることが必要とされる場合、例えば、前記所定濃度よりも低濃度の成分が必要とされる場合、特許文献１のカートリッジは、前記成分の濃度が所定濃度であるため、前記成分のみを異なる濃度とすることが困難であった。
【０００５】
さらに、１つのサンプルに対して、複数の標的遺伝子等の複数の標的核酸を測定する場合、１つのカートリッジにおいて、各標的核酸の分析用オリゴヌクレオチドに対応した異なる成分の濃度の分析系を調製し、分析することが要求されるが、特許文献１のカートリッジでは対応が困難であった。
【０００６】
そこで、本発明は、複数の標的核酸の分析において、各標的核酸の分析用オリゴヌクレオチドに適した成分濃度で分析を行うことが可能な試薬カートリッジ、標的核酸の分析装置、および標的核酸の分析方法の提供を目的とする。
【課題を解決するための手段】
【０００７】
前記本発明の課題を解決するために、本発明の第１の標的核酸の分析用試薬カートリッジ（以下、「カートリッジ」ともいう）は、少なくとも１つの共通試薬槽と、複数の濃度調整試薬槽と、複数の非共通試薬槽とを有し、
前記共通試薬槽は、それぞれ、複数の標的核酸の分析に共通して使用可能な複数の成分を含む共通試薬が充填されており、
前記複数の濃度調整試薬槽は、それぞれ、複数の標的核酸の分析に共通して使用可能な少なくとも１つの成分を異なる濃度で含む濃度調整試薬が充填されており、
前記複数の非共通試薬槽は、それぞれ、特定の標的核酸を分析する分析用オリゴヌクレオチドを含む非共通試薬が充填可能であることを特徴とする。
【０００８】
本発明の第２のカートリッジは、複数の共通試薬槽と、複数の非共通試薬槽とを有し、
前記共通試薬槽は、それぞれ、複数の標的核酸の分析に共通して使用可能な複数の成分を含む共通試薬が充填されており、
前記共通試薬は、それぞれ、前記複数の成分のうち少なくとも１つの成分を異なる濃度で含み、
前記複数の非共通試薬槽は、それぞれ、特定の標的核酸を分析する分析用オリゴヌクレオチドを含む非共通試薬が充填可能であることを特徴とする。
【０００９】
本発明の第１の標的核酸の分析装置（以下、「分析装置」ともいう）は、前記本発明の第１のカートリッジが収容されているカートリッジ収容部と、
サンプル、前記共通試薬槽に充填されている共通試薬、前記濃度調整試薬槽に充填されている少なくとも１つの濃度調整試薬、および前記非共通試薬槽に充填されている少なくとも１つの非共通試薬を混合することにより、前記標的核酸の分析系を調製する調製部と、
前記分析系を分析することにより、前記標的核酸を分析する分析部とを含むことを特徴とする。
【００１０】
本発明の第１の標的核酸の分析方法（以下、「分析方法」ともいう）は、前記本発明の第１のカートリッジを用い、
サンプル、前記共通試薬槽に充填されている共通試薬、前記濃度調整試薬槽に充填されている少なくとも１つの濃度調整試薬、および前記非共通試薬槽に充填されている少なくとも１つの非共通試薬を混合することにより、前記標的核酸の分析系を調製する調製工程と、
前記分析系を分析することにより、前記標的核酸を分析する分析工程とを含むことを特徴とする。
【発明の効果】
【００１１】
本発明によれば、複数の標的核酸の分析において、各標的核酸の分析用オリゴヌクレオチドに適した成分濃度で反応を行うことができる。このため、本発明によれば、例えば、より優れた分析精度で標的核酸を分析できる。
【図面の簡単な説明】
【００１２】
【図１】図１（Ａ）は、実施形態１のカートリッジの構成を示す斜視図であり、（Ｂ）は、前記（Ａ）のＩ−Ｉ方向から見た断面図である。
【図２】図２（Ａ）は、実施形態２のカートリッジの構成を示す斜視図であり、（Ｂ）は、前記（Ａ）のII−II方向から見た断面図である。
【図３】図３（Ａ）は、実施形態３のカートリッジの構成を示す斜視図であり、（Ｂ）は、前記（Ａ）のIII−III方向から見た断面図である。
【図４】図４は、実施形態４の分析装置の構成を示すブロック図である。
【発明を実施するための形態】
【００１３】
本発明の第１のカートリッジは、例えば、前記濃度調整試薬において異なる濃度で含まれる前記成分が、
前記標的核酸の分析において、前記共通試薬および前記濃度調整試薬と組み合わせて使用する前記非共通試薬の分析用オリゴヌクレオチドの種類に応じて、濃度が調整される成分である。
【００１４】
本発明の第１のカートリッジは、例えば、前記共通試薬が、前記濃度調整試薬において異なる濃度で含まれる成分を含まない。
【００１５】
本発明の第２のカートリッジは、例えば、前記共通試薬において異なる濃度で含まれる前記成分が、
前記標的核酸の分析において、前記共通試薬と組み合わせて使用する前記非共通試薬の分析用オリゴヌクレオチドの種類に応じて、濃度が調整される成分である。
【００１６】
本発明の第１および第２のカートリッジは、例えば、前記異なる濃度で含まれる成分が、マグネシウムイオン、カリウムイオン、マンガンイオン、ナトリウムイオン、およびアンモニウムイオンからなる群から選択された少なくとも１つであり、好ましくは、マグネシウムイオンである。
【００１７】
本発明の第１および第２のカートリッジは、例えば、前記分析用オリゴヌクレオチドが、前記標的核酸を増幅可能なプライマーであり、好ましくは、さらに、前記標的核酸を検出可能なプローブを含む。
【００１８】
本発明の第１および第２のカートリッジは、例えば、前記非共通試薬槽に、前記非共通試薬が予め充填されている。
【００１９】
本発明の第１および第２のカートリッジは、例えば、各非共通試薬槽に充填された非共通試薬が、それぞれ、異なる標的核酸の分析用オリゴヌクレオチドを含む。
【００２０】
本発明の第１の分析装置は、例えば、前記調製部において、前記サンプル、少なくとも２つの前記濃度調整試薬、および少なくとも１つの前記非共通試薬を混合することにより、前記分析系を調製する。
【００２１】
本発明の分析方法は、例えば、前記調製工程において、前記サンプル、少なくとも２つの前記濃度調整試薬、および少なくとも１つの前記非共通試薬を混合することにより、前記分析系を調製する。
【００２２】
＜第１の標的核酸の分析用試薬カートリッジ＞
本発明の第１のカートリッジは、前述のように、少なくとも１つの共通試薬槽と、複数の濃度調整試薬槽と、複数の非共通試薬槽とを有し、前記共通試薬槽は、それぞれ、複数の標的核酸の分析に共通して使用可能な複数の成分を含む共通試薬が充填されており、前記複数の濃度調整試薬槽は、それぞれ、複数の標的核酸の分析に共通して使用可能な少なくとも１つの成分を異なる濃度で含む濃度調整試薬が充填されており、前記複数の非共通試薬槽は、それぞれ、特定の標的核酸を分析する分析用オリゴヌクレオチドを含む非共通試薬が充填可能であることを特徴とする。本発明の第１のカートリッジは、複数の濃度調整試薬槽を有し、前記複数の濃度調整試薬槽は、それぞれ、複数の標的核酸の分析に共通して使用可能な少なくとも１つの成分を異なる濃度で含む濃度調整試薬が充填されていることが特徴であり、その他の構成および条件は、特に制限されない。
【００２３】
本発明の第１のカートリッジは、前述のように、複数の濃度調整試薬槽を有し、前記複数の濃度調整試薬槽は、それぞれ、複数の標的核酸の分析に共通して使用可能な少なくとも１つの成分を異なる濃度で含む濃度調整試薬が充填されている。このため、例えば、２つの標的核酸を分析する場合、前記異なる濃度で含まれる成分（以下、「調整成分」ともいう）を、それぞれの標的核酸を分析する分析用オリゴヌクレオチドの種類に応じた最適な濃度に設定しておくことで、サンプル、前記共通試薬、最適な濃度に設定された前記濃度調整試薬、および対応する分析用オリゴヌクレオチドを含む非共通試薬を、それぞれ予め定めた量で混合することにより、前記分析用オリゴヌクレオチドに適した分析系を簡便に調製できる。また、３以上の標的核酸を分析する場合、前記調整成分のうち１つを、それぞれの標的核酸を分析する分析用オリゴヌクレオチドの種類に応じた最適な濃度のうち、最も高い成分濃度以上に設定し、別の１つを、それぞれの標的核酸を分析する分析用オリゴヌクレオチドの種類に応じた最適な濃度のうち、最も低い成分濃度以下に設定しておくことで、例えば、これら２つの調整成分を含む濃度調整試薬と、サンプル、前記共通試薬、および前記非共通試薬とを、それぞれ予め定めた量で混合することで、前記分析用オリゴヌクレオチドに適した分析系を簡便に調製できる。したがって、本発明によれば、複数の標的核酸の分析において、各標的核酸の分析用オリゴヌクレオチドに適した成分濃度で反応を行うことができる。さらに、本発明の第１のカートリッジによれば、前記調整成分が前記分析用オリゴヌクレオチドに適した分析系とすることができるため、例えば、より優れた分析精度で前記標的核酸を分析できる。
【００２４】
本発明において、分析とは、例えば、前記標的核酸の有無を判断する定性分析でもよいし、前記標的核酸の量を判断する定量分析でもよい。
【００２５】
本発明において、カートリッジの材質は、特に制限されず、例えば、プラスチック等があげられる。
【００２６】
本発明において、前記共通試薬は、複数の標的核酸の分析に共通して使用可能な複数の成分を含む。前記共通試薬が含む複数の成分は、特に制限されず、例えば、前記標的核酸の分析方法に応じて、適宜決定できる。前記分析方法がＰＣＲ等の核酸増幅方法を含む場合、前記共通試薬が含む複数の成分は、例えば、核酸増幅方法に使用される試薬があげられ、具体例として、耐熱ＤＮＡポリメラーゼ等のＤＮＡポリメラーゼ、デオキシヌクレオチド三リン酸（ｄＮＴＰ）、牛血清アルブミン等のアルブミン、アジ化ナトリウム等の防腐剤等があげられる。前記共通試薬が含む複数の成分の濃度は、特に制限されず、例えば、前記各分析方法に応じて適宜設定できる。前記共通試薬は、後述する濃度調整試薬において異なる濃度で含まれる成分を含まないことが好ましい。これにより、サンプル、前記共通試薬、前記濃度調整試薬、および前記非共通試薬を混合した分析系において、前記調整成分の濃度をより簡便に調整できる。前記共通試薬は、例えば、液体試薬でもよいし、固体試薬（乾燥試薬）でもよい。前者の場合、前記共通試薬は、例えば、溶媒に、前記共通試薬を溶解、懸濁または混合等した試薬である。前記溶媒は、特に制限されず、例えば、水、Ｔｒｉｓ−ＨＣｌ、Ｔｒｉｃｉｎｅ、ＭＥＳ、ＭＯＰＳ、ＨＥＰＥＳ、ＣＡＰＳ等の緩衝液等があげられ、具体例として、市販のＰＣＲ用緩衝液、市販のＰＣＲキットの緩衝液等があげられる。
【００２７】
本発明において、前記標的核酸は、例えば、ＤＮＡでもよいし、ＲＮＡでもよい。前記標的核酸の分析は、例えば、前記標的核酸における分析対象の分析ということもできる。前記標的核酸における分析対象は、特に制限されず、例えば、一塩基多型（ＳＮＰ）、遺伝子、遺伝子変異、ノンコーディングＲＮＡ、染色体、染色体異常等があげられる。前記遺伝子変異は、例えば、遺伝子における１以上の塩基の欠失、置換、挿入、および／または付加等があげられる。前記染色体異常は、例えば、染色体の断片化、欠失、重複、逆位、転位、転座、付着、および／または欠失等があげられる。本発明において、前記標的核酸は、例えば、１つでもよいし、複数でもよい。前者の場合、前記標的核酸は、例えば、複数の分析対象を含む。
【００２８】
本発明において、前記濃度調整試薬は、複数の標的核酸の分析に共通して使用可能な少なくとも１つの成分を異なる濃度で含む。前記調整成分は、例えば、前記標的核酸の分析において、前記共通試薬および前記濃度調整試薬と組み合わせて使用する前記非共通試薬の分析用オリゴヌクレオチドの種類に応じて、濃度が調整される成分ともいえる。前記濃度調整試薬における前記調整成分の濃度は、例えば、前記分析用オリゴヌクレオチドの塩基配列に応じて、当業者であれば、適宜設定できる。また、各濃度調整試薬間における前記調整成分の濃度比は、特に制限されず、例えば、前記分析用オリゴヌクレオチドに応じて適宜設定できる。前記調整成分の具体例としては、例えば、マグネシウムイオン、カリウムイオン、マンガンイオン、ナトリウムイオン、アンモニウムイオン等があげられ、好ましくは、マグネシウムイオンである。前記濃度調整試薬において、前記調整成分は、例えば、前記濃度調整試薬が含む塩に由来するイオンである。前記調整成分は、１つでもよいし、複数でもよい。前記濃度調整試薬の数は、複数であればよく、例えば、２〜４である。前記複数の濃度調整試薬は、それぞれ、少なくとも１つの成分を異なる濃度で含めばよく、その他の成分の濃度は、同じでもよいし、異なってもよい。前記調整成分がマグネシウムイオンの場合、各濃度調整試薬におけるマグネシウムイオンの濃度は、例えば、前記分析系における濃度が１〜１０ｍｍｏｌ／Ｌとなる濃度である。前記調整成分がカリウムイオンの場合、各濃度調整試薬におけるカリウムイオンの濃度は、例えば、前記分析系における濃度が０〜７５ｍｍｏｌ／Ｌ、０ｍｍｏｌ／Ｌを超え、７５ｍｍｏｌ／Ｌ以下となる濃度である。前記調整成分がナトリウムイオンの場合、各濃度調整試薬におけるナトリウムイオンの濃度は、例えば、前記分析系における濃度が０〜７５ｍｍｏｌ／Ｌ、０ｍｍｏｌ／Ｌを超え、７５ｍｍｏｌ／Ｌ以下となる濃度である。前記調整成分がマンガンイオンの場合、各濃度調整試薬におけるマンガンイオンの濃度は、例えば、前記分析系における濃度が０〜１ｍｍｏｌ／Ｌ、０ｍｍｏｌ／Ｌを超え、１ｍｍｏｌ／Ｌ以下となる濃度である。前記調整成分がアンモニウムイオンの場合、各濃度調整試薬におけるアンモニウムイオンの濃度は、例えば、前記分析系における濃度が５〜３０ｍｍｏｌ／Ｌとなる濃度である。前記濃度調整試薬の数が３以上の場合、いずれか２つの濃度調整試薬において、前記調整成分の濃度は、同じでもよい。前記濃度調整試薬は、例えば、液体試薬でもよいし、固体試薬（乾燥試薬）でもよい。前者の場合、前記濃度調整試薬は、例えば、溶媒に、前記濃度調整試薬を溶解、懸濁または混合等した試薬である。前記溶媒は、例えば、前述の説明を援用できる。前記溶媒は、例えば、前記共通試薬と同じでもよいし、異なってもよい。前記濃度調整試薬が固体試薬の場合、前記調整成分の濃度は、例えば、前記カートリッジにおいて、予め定められた量の溶媒に溶解、懸濁または混合等した際の濃度である。
【００２９】
本発明において、前記非共通試薬は、前記特定の標的核酸を分析する前記分析用オリゴヌクレオチドを含む。本発明において、前記分析用オリゴヌクレオチドは、特に制限されず、例えば、前記標的核酸の種類に応じて、適宜決定できる。具体例として、前記分析用オリゴヌクレオチドは、例えば、プライマーがあげられる。前記プライマーは、例えば、前記標的核酸を増幅可能なプライマーでもよいし、前記標的核酸を含むポリヌクレオチドを増幅可能なプライマーでもよく、具体例として、前記標的核酸を増幅可能なフォワードプライマーとリバースプライマーとを含むプライマーセット、前記標的核酸を含むポリヌクレオチドを増幅可能なフォワードプライマーとリバースプライマーとを含むプライマーセットがあげられる。前記分析用オリゴヌクレオチドが前記プライマーを含む場合、前記分析用オリゴヌクレオチドは、さらに、前記プライマーに加えて、または代えてプローブを含んでもよい。前記プローブは、例えば、前記標的核酸を検出可能なプローブであり、より具体的には、前記プライマーにより増幅された増幅断片において、前記標的核酸を検出可能なプローブである。前記分析用オリゴヌクレオチドが前記プライマーおよびプローブを含む場合、前記プライマーおよびプローブは、別個の非共通試薬槽に配置してもよい。前記プライマーおよび前記プローブは、例えば、それぞれ、標識物質により標識されていてもよい。本発明において、前記プライマーおよび前記プローブの塩基配列は、特に制限されず、例えば、前記標的核酸の種類およびその塩基配列等に応じて、当業者であれば、適宜設計できる。
【００３０】
前記非共通試薬は、例えば、前記共通試薬が含む、前記複数の標的核酸の分析に共通して使用可能な複数の成分の一部を含んでもよく、具体例として、前記分析方法が核酸増幅方法を含む場合、前記非共通試薬が、ｄＮＴＰを含んでもよい。この場合、前記共通試薬が、ｄＮＴＰを含まないことが好ましい。前記非共通試薬は、例えば、液体試薬でもよいし、固体試薬（乾燥試薬）でもよい。前者の場合、前記非共通試薬は、例えば、溶媒に、前記非共通試薬を溶解、懸濁または混合等した試薬である。前記溶媒は、例えば、前述の説明を援用できる。前記溶媒は、例えば、前記共通試薬および／または前記濃度調整試薬と同じでもよいし、異なってもよい。
【００３１】
以下、本発明の第１のカートリッジおよびそれを用いた分析方法について、図面を参照して、例をあげて詳細に説明する。ただし、本発明は、以下の例に限定および制限されない。また、図面においては、説明の便宜上、各部の構造は適宜簡略化して示す場合があり、各部の寸法比等は、実際とは異なり、模式的に示す場合がある。各実施形態は、特に言及しない限り、互いに組合せ可能である。
【００３２】
（実施形態１）
図１は、実施形態１のカートリッジの概略を示す図面であり、（Ａ）は、実施形態１のカートリッジの斜視図を示し、（Ｂ）は、前記（Ａ）のＩ−Ｉ方向に見た断面図である。図１（Ａ）に示すように、本実施形態のカートリッジ１は、共通試薬槽１１、濃度調整試薬槽１２、および非共通試薬槽１３を含む。また、図１（Ｂ）に示すように、共通試薬槽１１には、前記複数の標的核酸の分析に共通して使用可能な複数の成分を含む共通試薬１１１が充填されている。そして、濃度調整試薬槽１２は、濃度調整試薬槽１２ａ、１２ｂに分かれており、濃度調整試薬槽１２ａ、１２ｂには、複数の標的核酸の分析に共通して使用可能な少なくとも１つの成分を異なる濃度で含む濃度調整試薬１１２ａ、１１２ｂが、それぞれ、充填されている。さらに、非共通試薬槽１３は、非共通試薬槽１３ａ、１３ｂに分かれている。本実施形態のカートリッジ１における各槽は、一端から他端に向かって、共通試薬槽１１、濃度調整試薬槽１２ａ、１２ｂ、非共通試薬槽１３ａ、１３ｂがこの順序で配置されているが、本発明はこれに限定されず、各槽は、任意の順序で配置できる。
【００３３】
本実施形態のカートリッジ１において、共通試薬槽１１は、１つであるが、本発明はこれに限定されず、複数としてもよく、具体例として、共通試薬槽１１の数は、１〜２である。共通試薬槽１１を複数含む場合、各共通試薬槽は、同じ成分を有する共通試薬が充填されていてもよいし、異なる成分を含む共通試薬が充填されていてもよい。前記共通試薬が同じ成分を含む場合、各共通試薬において、前記同じ成分は、同じ濃度でもよいし、異なる濃度でもよい。共通試薬槽１１の容積は、特に制限されず、例えば、共通試薬槽１１に充填される共通試薬１１１の体積に応じて、適宜設定できる。
【００３４】
本実施形態のカートリッジ１において、共通試薬槽１１に充填された共通試薬１１１は、液体試薬であるが、本発明はこれに限定されず、乾燥試薬としてもよい。共通試薬１１１が液体試薬の場合、共通試薬槽１１に充填された共通試薬１１１の体積は、特に制限されず、例えば、前記標的核酸の数に応じて、適宜設定できる。
【００３５】
本実施形態のカートリッジ１において、濃度調整試薬槽１２は、２つであるが、本発明はこれに限定されず、複数であればよく、具体例として、濃度調整試薬槽１２の数は、２〜４である。濃度調整試薬槽１２ａ、１２ｂの容積は、特に制限されず、例えば、濃度調整試薬槽１２に充填される濃度調整試薬１１２ａ、１１２ｂの体積に応じて、適宜設定できる。
【００３６】
本実施形態のカートリッジ１において、濃度調整試薬槽１２ａ、１２ｂに充填された濃度調整試薬１１２ａ、１１２ｂは、液体試薬であるが、本発明はこれに限定されず、乾燥試薬としてもよい。濃度調整試薬１１２ａ、１１２ｂが液体試薬の場合、濃度調整試薬槽１２ａ、１２ｂに充填された濃度調整試薬１１２ａ、１１２ｂの体積は、特に制限されず、例えば、前記標的核酸の数に応じて、適宜設定できる。
【００３７】
本実施形態のカートリッジ１において、非共通試薬槽１３は、２つであるが、本発明はこれに限定されず、複数であればよく、具体例として、非共通試薬槽１３の数は、２〜４である。非共通試薬槽１３ａ、１３ｂの容積は、特に制限されず、例えば、非共通試薬槽１３に充填される非共通試薬１１３ａ、１１３ｂの体積に応じて、適宜設定できる。
【００３８】
本実施形態のカートリッジ１において、非共通試薬槽１３ａ、１３ｂには、前記非共通試薬が充填されていないが、本発明はこれに限定されず、前記非共通試薬が充填されていてもよい。前記非共通試薬が充填されている場合、非共通試薬槽１３ａ、１３ｂに充填された共通試薬は、それぞれ、異なる標的核酸の分析用オリゴヌクレオチドを含むことが好ましい。このように、前記標的核酸を分析する分析用オリゴヌクレオチドを含む前記非共通試薬を予め調製し、非共通試薬槽１３ａ、１３ｂに充填しておくことで、より簡便に前記標的核酸の分析が実施できる。
【００３９】
つぎに、本実施形態のカートリッジ１を用いた分析方法について、説明する。まず、カートリッジ１の非共通試薬槽１３ａ、１３ｂに、それぞれ、非共通試薬を充填する。つぎに、サンプルと、共通試薬槽１１に充填された共通試薬１１１と、濃度調整試薬１２ａ、１２ｂに充填された濃度調整試薬１１２ａ、１１２ｂの少なくとも一方と、非共通試薬槽１３ａ、１３ｂに充填された一方の非共通試薬とを混合し、第１の分析系を調製する。また、前記サンプルと、共通試薬槽１１に充填された共通試薬１１１と、濃度調整試薬１２ａ、１２ｂに充填された濃度調整試薬１１２ａ、１１２ｂの少なくとも一方と、他方の非共通試薬とを混合し、第２の分析系を調製する。
【００４０】
そして、前記第１の分析系および前記第２の分析系を分析することにより、前記標的核酸を分析する。前記標的核酸の分析方法は、特に制限されず、例えば、前記標的核酸に応じて、公知の核酸分析方法により実施できる。前記標的核酸がＤＮＡであり、前記標的核酸の分析対象がＳＮＰである場合、前記第１の分析系および前記第２の分析系について、例えば、前記非共通試薬に含まれる分析用オリゴヌクレオチドである標的核酸を増幅可能なプライマーを用いて、前記標的核酸を核酸増幅方法により増幅し、前記分析用オリゴヌクレオチドである標的核酸を検出可能なプローブを用いて、前記標的核酸およびその増幅断片について、融解曲線解析を実施することにより、分析する。
【００４１】
本実施形態のカートリッジ１は、さらに、サンプルを充填可能なサンプル槽を有してもよい。前記サンプルおよびサンプル槽の数は、特に制限されず、例えば、それぞれ、１〜４である。前記サンプル槽の容積は、特に制限されず、前記サンプルの容積に応じて、適宜決定できる。前記サンプルは、特に制限されず、例えば、生体試料等があげられる。前記生体試料は、例えば、血液（例えば、全血、白血球等の血球、血漿、血清等）、組織（例えば、大腸、肺等）、口腔内細胞（例えば、口腔粘膜等）、体細胞（例えば、爪および毛髪等）、生殖細胞、喀痰、羊水、腹膜液、尿、胃液等があげられる。また、前記生体試料としては、その他に、胃洗液、パラフィン包埋組織、培養細胞等の生体由来の試料もあげられる。
【００４２】
本実施形態のカートリッジ１は、さらに、サンプルの前処理試薬および前記前処理試薬が充填された前処理試薬槽を含んでもよい。前記前処理試薬および前処理試薬槽の数は、特に制限されず、例えば、それぞれ、１〜４である。前記前処理試薬は、例えば、前記サンプルに含まれる細胞等の細胞膜を破壊する試薬、ＤＮＡ、ＲＮＡ等の核酸を単離する試薬、ＲＮＡからＤＮＡを合成する試薬等があげられる。具体例として、前記前処理試薬は、例えば、界面活性剤、還元剤、プロテアーゼ阻害剤、ＤＮａｓｅ阻害剤、ＲＮａｓｅ阻害剤、ＲＮＡ依存性ＤＮＡポリメラーゼ等の逆転写酵素等があげられる。
【００４３】
本実施形態のカートリッジ１は、さらに、前記標的核酸の分析に関連するその他の試薬および前記その他の試薬が充填されたその他の試薬槽を含んでもよい。前記その他の試薬およびその他の試薬槽の数は、特に制限されず、例えば、それぞれ、１〜４である。前記その他の試薬は、特に制限されず、例えば、ミネラルオイル、各試薬を希釈するための希釈液等があげられる。
【００４４】
（実施形態２）
図２は、実施形態２のカートリッジの概略を示す図面であり、（Ａ）は、実施形態２のカートリッジの斜視図を示し、（Ｂ）は、前記（Ａ）のII−II方向に見た断面図である。図２において、図１と同一箇所には同一符号を付している。図２（Ａ）に示すように、カートリッジ２は、さらに、サンプル槽１４、前処理試薬槽１５、およびその他の試薬槽１６を含み、シール１７により、共通試薬槽１１、濃度調整試薬槽１２、非共通試薬槽１３、前処理試薬槽１５、およびその他の試薬槽１６の上部開口が封止され、サンプル槽１４は、上部が開口している。また、非共通試薬槽１３ａ、１３ｂには、それぞれ、非共通試薬１１３ａ、１１３ｂが、充填されている。前処理試薬槽１５は、前処理試薬槽１５ａ、１５ｂに分かれており、前処理試薬槽１５ａ、１５ｂには、前処理試薬１１５ａ、１１５ｂが、それぞれ充填されている。そして、その他の試薬槽１６には、その他の試薬１１６が、充填されている。この点を除き、本実施形態のカートリッジ２は、実施形態１のカートリッジ１と同様の構成を有し、その説明を援用できる。本実施形態のカートリッジ２によれば、例えば、前処理が必要なサンプルについても、標的核酸を分析できる。本実施形態のカートリッジ２における各槽は、一端から他端に向かって、他の試薬槽１６、共通試薬槽１１、濃度調整試薬槽１２ａ、１２ｂ、前処理試薬槽１５ａ、１５ｂ、非共通試薬槽１３ａ、１３ｂ、サンプル槽１４がこの順序で配置されているが、本発明はこれに限定されず、各槽は、任意の順序で配置できる。
【００４５】
本実施形態のカートリッジ２において、非共通試薬槽１３ａ、１３ｂには、非共通試薬１１３ａ、１１３ｂが充填されているが、本発明はこれに限定されず、非共通試薬１１３ａ、１１３ｂが充填されていなくてもよい。また、非共通試薬槽１３ａ、１３ｂに充填された非共通試薬１１３ａ、１１３ｂは、液体試薬であるが、本発明はこれに限定されず、乾燥試薬としてもよい。非共通試薬１１３ａ、１１３ｂが液体試薬の場合、非共通試薬槽１３ａ、１３ｂに充填された非共通試薬１１３ａ、１１３ｂの体積は、特に制限されず、例えば、前記標的核酸の数に応じて、適宜設定できる。
【００４６】
本実施形態のカートリッジ２は、シール１７を含むが、本発明はこれに限定されず、シール１７は、任意の構成であり、あってもよいし、なくてもよい。また、シール１７は、共通試薬槽１１、濃度調整試薬槽１２、非共通試薬槽１３、前処理試薬槽１５、およびその他の試薬槽１６の上部開口を封止しているが、本発明はこれに限定されず、シール１７は、共通試薬槽１１、濃度調整試薬槽１２、非共通試薬槽１３、サンプル槽１４、前処理試薬槽１５、およびその他の試薬槽１６のいずれか１つの上部開口を封止してもよいし、複数の上部開口を封止してもよいし、全ての上部開口を封止してもよい。シール１７が複数の上部開口を封止する場合、シール１７は、例えば、共通試薬槽１１および濃度調整試薬槽１２を封止してもよいし、共通試薬槽１１、濃度調整試薬槽１２、前処理試薬槽１５、およびその他の試薬槽１６を封止してもよい。シール１７は、特に制限されず、公知のシール部材を使用できる。
【００４７】
つぎに、本実施形態のカートリッジ２を用いた分析方法について、説明する。まず、カートリッジ２のサンプル槽１４に、サンプルを充填する。つぎに、前記サンプルを２つに分け、それぞれのサンプルについて、前記サンプルと、前処理試薬槽１５ａ、１５ｂに充填された前処理試薬１１５ａ、１１５ｂの少なくとも一方とを混合し、前記サンプルに対して前処理を行なう。そして、一方の前処理後のサンプルと、共通試薬槽１１に充填された共通試薬１１１と、濃度調整試薬１２ａ、１２ｂに充填された濃度調整試薬１１２ａ、１１２ｂの少なくとも一方と、非共通試薬槽１３ａ、１３ｂに充填された非共通試薬１１３ａ、１１３ｂの一方とを混合し、第１の分析系を調製する。また、他方の前処理後のサンプルと、共通試薬槽１１に充填された共通試薬１１１と、濃度調整試薬１２ａ、１２ｂに充填された濃度調整試薬１１２ａ、１１２ｂの少なくとも一方と、非共通試薬１１３ａ、１１３ｂの他方とを混合し、第２の分析系を調製する。そして、前記第１の分析系および前記第２の分析系に、その他の試薬槽１６に充填されたその他の試薬１１６（例えば、ミネラルオイル）を添加する。そして、前記第１の分析系および前記第２の分析系について、前記実施形態１と同様に分析する。
【００４８】
＜第２の標的核酸の分析用試薬カートリッジ＞
本発明の第２のカートリッジは、前述のように、複数の共通試薬槽と、複数の非共通試薬槽とを有し、前記共通試薬槽は、それぞれ、複数の標的核酸の分析に共通して使用可能な複数の成分を含む共通試薬が充填されており、前記共通試薬は、それぞれ、前記複数の成分のうち少なくとも１つの成分を異なる濃度で含み、前記複数の非共通試薬槽は、それぞれ、特定の標的核酸を分析する分析用オリゴヌクレオチドを含む非共通試薬が充填可能であることを特徴とする。本発明の第２のカートリッジは、前記複数の共通試薬槽を有し、前記共通試薬は、それぞれ、前記複数の成分のうち少なくとも１つの成分を異なる濃度で含むことが特徴であり、その他の構成および条件は、特に制限されない。本発明の第２のカートリッジは、前記本発明の第１のカートリッジの濃度調整試薬における調整成分を、前記共通試薬が含む。このため、本発明の第２のカートリッジは、例えば、前記本発明の第１のカートリッジの前記共通試薬が、複数であり、前記複数の共通試薬が、それぞれ、前記濃度調整試薬を含むカートリッジということもできる。本発明の第２のカートリッジは、例えば、前記本発明の第１のカートリッジの説明を援用できる。
【００４９】
本発明の第２のカートリッジは、前述のように、複数の共通試薬槽を有し、前記複数の共通試薬槽は、それぞれ、複数の標的核酸の分析に共通して使用可能な少なくとも１つの成分を異なる濃度で含む共通試薬が充填されている。このため、例えば、２つの標的核酸を分析する場合、前記調整成分を、それぞれの標的核酸を分析する分析用オリゴヌクレオチドの種類に応じた最適な濃度に設定しておくことで、サンプル、最適な濃度に設定された前記共通試薬、および対応する分析用オリゴヌクレオチドを含む非共通試薬を混合することにより、前記分析用オリゴヌクレオチドに適した分析系を簡便に調製できる。また、３以上の標的核酸を分析する場合、前記調整成分のうち一方を、それぞれの標的核酸を分析する分析用オリゴヌクレオチドの種類に応じた最適な濃度のうち、最も高い成分濃度以上に設定し、他方を、それぞれの標的核酸を分析する分析用オリゴヌクレオチドの種類に応じた最適な濃度のうち、最も低い成分濃度以下に設定しておくことで、例えば、これら２つの調整成分を含む共通試薬と、サンプル、および前記非共通試薬とを混合することで、前記分析用オリゴヌクレオチドに適した分析系を簡便に調製できる。したがって、本発明によれば、複数の標的核酸の分析において、各標的核酸の分析用オリゴヌクレオチドに適した成分濃度で反応を行うことができる。さらに、本発明の第２のカートリッジによれば、前記調整成分が前記分析用オリゴヌクレオチドに適した分析系とすることができるため、例えば、より優れた分析精度で前記標的核酸を分析できる。
【００５０】
本発明の第２のカートリッジにおいて、前記共通試薬は、複数の標的核酸の分析に共通して使用可能な複数の成分を含み、且つ前記複数の成分のうち少なくとも１つの成分を異なる濃度で含む。前記調整成分は、例えば、前記標的核酸の分析において、前記共通試薬と組み合わせて使用する前記非共通試薬の分析用オリゴヌクレオチドの種類に応じて、濃度が調整される成分ということもできる。前記調整成分は、例えば、前述の説明を援用できる。前記共通試薬の数は、複数であればよく、例えば、２〜５である。前記複数の共通試薬は、それぞれ、前記複数の成分のうち少なくとも１つの成分を異なる濃度で含めばよく、その他の成分の濃度は、同じでもよいし、異なってもよい。前記共通試薬の数が３以上の場合、いずれか２つの共通試薬において、前記調整成分の濃度は、同じでもよい。前記共通試薬は、例えば、液体試薬でもよいし、固体試薬（乾燥試薬）でもよい。前者の場合、前記共通試薬は、例えば、溶媒に、前記共通試薬を溶解、懸濁または混合等した試薬である。前記共通試薬が固体試薬の場合、前記調整成分の濃度は、例えば、前記カートリッジにおいて、予め定められた量の溶媒に溶解、懸濁または混合等した際の濃度である。
【００５１】
以下、本発明の第２のカートリッジおよびそれを用いた分析方法について、図面を参照して、例をあげて詳細に説明する。ただし、本発明は、以下の例に限定および制限されない。また、図面においては、説明の便宜上、各部の構造は適宜簡略化して示す場合があり、各部の寸法比等は、実際とは異なり、模式的に示す場合がある。
【００５２】
（実施形態３）
図３は、実施形態３のカートリッジの概略を示す図面であり、（Ａ）は、実施形態３のカートリッジの斜視図を示し、（Ｂ）は、前記（Ａ）のIII−III方向に見た断面図である。図３において、図１と同一箇所には同一符号を付している。図３（Ａ）に示すように、本実施形態のカートリッジ３は、共通試薬槽１１’および非共通試薬槽１３を含む。また、図３（Ｂ）に示すように、共通試薬槽１１’は、共通試薬槽１１’ａ、１１’ｂに分かれており、共通試薬槽１１’ａ、１１’ｂには、前記複数の標的核酸の分析に共通して使用可能な複数の成分を含み、且つ前記複数の成分のうち少なくとも１つの成分が異なる濃度である共通試薬１１１’ａ、１１１’ｂが、それぞれ、充填されている。さらに、非共通試薬槽１３は、非共通試薬槽１３ａ、１３ｂに分かれている。本実施形態のカートリッジ３における各槽は、一端から他端に向かって、共通試薬槽１１’ａ、１１’ｂ、非共通試薬槽１３ａ、１３ｂがこの順序で配置されているが、本発明はこれに限定されず、各槽は、任意の順序で配置できる。
【００５３】
本実施形態のカートリッジ３において、共通試薬槽１１’は、２つであるが、本発明はこれに限定されず、複数であればよく、具体例として、共通試薬槽１１’の数は、２〜５である。共通試薬槽１１’ａ、１１’ｂの容積は、特に制限されず、例えば、共通試薬槽１１’に充填される共通試薬１１１’ａ、１１１’ｂの体積に応じて、適宜設定できる。本実施形態のカートリッジ３は、さらに、前述のサンプル槽、前処理試薬および前処理試薬槽、ならびにその他の試薬およびその他の試薬槽のいずれか１つ以上を含んでもよく、各槽および試薬は、前述の説明を援用できる。
【００５４】
つぎに、本実施形態のカートリッジ３を用いた分析方法について、説明する。まず、カートリッジ３の非共通試薬槽１３ａ、１３ｂに、それぞれ、非共通試薬を充填する。つぎに、サンプルと、共通試薬槽１１’ａ、１１’ｂに充填された共通試薬１１１’ａ、１１１’ｂの少なくとも一方と、非共通試薬槽１３に充填された一方の非共通試薬とを混合し、第１の分析系を調製する。また、前記サンプルと、共通試薬槽１１’ａ、１１’ｂに充填された共通試薬１１１’ａ、１１１’ｂの少なくとも一方と、他方の非共通試薬とを混合し、第２の分析系を調製する。そして、前記第１の分析系および前記第２の分析系について、前記実施形態１と同様に分析する。
【００５５】
＜第１の標的核酸の分析装置＞
本発明の第１の分析装置は、前述のように、前記本発明の第１のカートリッジが収容されているカートリッジ収容部と、サンプル、前記共通試薬槽に充填されている共通試薬、前記濃度調整試薬槽に充填されている少なくとも１つの濃度調整試薬、および前記非共通試薬槽に充填されている少なくとも１つの非共通試薬を混合することにより、前記標的核酸の分析系を調製する調製部と、前記分析系を分析することにより、前記標的核酸を分析する分析部とを含むことを特徴とする。本発明の第１の分析装置は、前記本発明の第１のカートリッジが収容されているカートリッジ収容部を含むことが特徴であり、その他の構成および条件は、特に制限されない。本発明の第１の分析装置は、例えば、前記本発明の第１のカートリッジの説明を援用できる。本発明の第１の分析装置によれば、複数の標的核酸の分析において、各標的核酸の分析用オリゴヌクレオチドに適した成分濃度で反応を行うことができる。
【００５６】
以下、本発明の第１の分析装置およびそれを用いた分析方法について、図面を参照して、例をあげて詳細に説明する。ただし、本発明は、以下の例に限定および制限されない。また、図面においては、説明の便宜上、各部の構造は適宜簡略化して示す場合があり、各部の寸法比等は、実際とは異なり、模式的に示す場合がある。
【００５７】
（実施形態４）
図４は、本実施形態の分析装置の構成を示すブロック図である。図４に示すように、本実施形態の分析装置４は、中央演算処理装置（ＣＰＵ）４１、調製部であるサンプリングポンプユニット４２、およびノズル駆動ユニット４３、分析部である測定部ユニット４４、記憶装置４５、入力装置４６、ならびに出力装置４７を主要構成要素として備える。ＣＰＵ４１は、サンプリングポンプユニット４２、ノズル駆動ユニット４３、および測定部ユニット４４の動きを制御する。サンプリングポンプユニット４２は、サンプルおよび各試薬等をサンプリングするためのポンプを駆動する。ノズル駆動ユニット４３は、カートリッジの各槽にノズルを移動し、かつノズルを上下させる。測定部ユニット４４は、サンプルと各試薬とを混合した分析系の反応を分析する。反応の分析方法は、例えば、光学的方法および電気化学的方法があげられる。光学的方法の場合は、前記測定ユニット４４は、例えば、光源および受光部を含む。電気化学的方法の場合は、例えば、電極を含む。前記記憶装置４５は、分析条件情報、その他の情報および各種プログラム等が記憶されており、フラッシュメモリ、ＲＡＭおよびＲＯＭ等を適宜組み合わせて構成される。入力装置４６は、分析装置に情報を入力するためのものであり、キーボード、キーシート、ＵＳＢ等の端子、ＣＤやＣＤ−Ｒ等のドライブ等があげられる。出力装置４７は、分析結果およびその他の情報を出力するためのものであり、例えば、プリンターおよびディスプレイがあげられる。本実施例において、前記の各構成要素は一体化されていてもよいし、複数の装置に分かれて構成されていてもよい。例えば、サンプリングポンプユニット４２、ノズル駆動ユニット４３および測定部ユニット４４を備えた分析装置と、ＣＰＵ４１、記憶装置４５、入力装置４６および出力装置４７を含むパーソナルコンピュター（ＰＣ）とを組み合わせてもよい。
【００５８】
つぎに、本実施形態の分析装置を用いた分析方法について、実施形態２のカートリッジを用いた場合を例にあげて説明する。まず、サンプルが、カートリッジ２のサンプル槽１４に充填される。カートリッジ２が分析装置にセットされると、ノズル駆動ユニット４３により自動的にノズルが移動して、サンプリングポンプユニット４２によりサンプル槽１４の試料をサンプリングして、分析装置４にセットされた複数の分析槽（図示せず）に、サンプルが、それぞれ導入される。そして、自動的にノズルが移動して、シールを破って、前処理試薬１１５ａ、１１５ｂの少なくとも一方をサンプリングして、前記分析槽に導入し、前処理を行なう。つづいて、自動的にノズルが移動して、シールを破って、共通試薬１１１をサンプリングし、前記分析槽に導入し、さらに、ノズルが移動して、シールを破って、濃度調整試薬１１２ａ、１１２ｂの少なくとも一方をサンプリングし、前記分析槽に導入する。そして、自動的にノズルが移動して、シールを破って、非共通試薬１１３ａ、１１３ｂの一方をサンプリングし、前記分析槽に導入し、混合することで第１の分析系を調製後、前記サンプルを反応させる。また、非共通試薬１１３ａ、１１３ｂの他方をサンプリングする以外は同様にして、第２の分析系を調製後、前記サンプルを反応させる。前記第１の分析系および第２の分析系の反応がＰＣＲの場合は、測定部ユニット４４により温度サイクルが制御される。一定のサイクル数の反応の後、例えば、光学的手法により反応物中のプローブを検出する。なお、実施形態２のカートリッジ２を用いた場合を例にあげて説明したが、実施形態１のカートリッジ１を用いて実施してもよい。
【００５９】
＜第２の標的核酸の分析装置＞
本発明の第２の分析装置は、前記本発明の第２のカートリッジが収容されているカートリッジ収容部と、サンプル、前記共通試薬槽に充填されている少なくとも１つの共通試薬、および前記非共通試薬槽に充填されている少なくとも１つの非共通試薬を混合することにより、前記標的核酸の分析系を調製する調製部と、前記分析系を分析することにより、前記標的核酸を分析する分析部とを含むことを特徴とする。本発明の第２の分析装置は、前記本発明の第２のカートリッジが収容されているカートリッジ収容部を含むことが特徴であり、その他の構成および条件は、特に制限されない。本発明の第２の分析装置は、例えば、前記本発明の第１および第２のカートリッジならびに前記本発明の第１の標的核酸の分析装置の説明を援用できる。本発明の第２の分析装置によれば、複数の標的核酸の分析において、各標的核酸の分析用オリゴヌクレオチドに適した成分濃度で反応を行うことができる。
【００６０】
本発明の第２の分析装置は、前記本発明の第１のカートリッジに代えて、前記本発明の第２のカートリッジを用い、前記調製部が、サンプル、前記共通試薬槽に充填されている少なくとも１つの共通試薬、および前記非共通試薬槽に充填されている少なくとも１つの非共通試薬を混合することにより、前記標的核酸の分析系を調製する点を除き、前記第１の標的核酸の分析装置と同様であり、その説明を援用できる。
【００６１】
本発明の第２の分析装置は、例えば、前記調製部において、前記サンプル、少なくとも２つの前記共通試薬、および少なくとも１つの前記非共通試薬を混合することにより、前記分析系を調製する。
【００６２】
＜第１の標的核酸の分析方法＞
本発明の第１の分析方法は、前述のように、前記本発明の第１のカートリッジを用い、サンプル、前記共通試薬槽に充填されている共通試薬、前記濃度調整試薬槽に充填されている少なくとも１つの濃度調整試薬、および前記非共通試薬槽に充填されている少なくとも１つの非共通試薬を混合することにより、前記標的核酸の分析系を調製する調製工程と、前記分析系を分析することにより、前記標的核酸を分析する分析工程とを含むことを特徴とする。本発明の第１の分析方法は、前記本発明の第１のカートリッジを用いることが特徴であり、その他の工程および条件は、特に制限されない。本発明の第１の分析方法は、例えば、前記本発明の第１のカートリッジおよび前記本発明の第１の分析装置の説明を援用できる。本発明の第１の分析方法によれば、複数の標的核酸の分析において、各標的核酸の分析用オリゴヌクレオチドに適した成分濃度で反応を行うことができる。
【００６３】
＜第２の標的核酸の分析方法＞
本発明の第２の分析方法は、前記本発明の第２のカートリッジを用い、サンプル、前記共通試薬槽に充填されている少なくとも１つの共通試薬、および前記非共通試薬槽に充填されている少なくとも１つの非共通試薬を混合することにより、前記標的核酸の分析系を調製する調製工程と、前記分析系を分析することにより、前記標的核酸を分析する分析工程とを含むことを特徴とする。本発明の第２の分析方法は、前記本発明の第２のカートリッジを用いることが特徴であり、その他の工程および条件は、特に制限されない。本発明の第２の分析方法は、例えば、前記本発明の第１および第２のカートリッジ、前記本発明の第１および第２の分析装置、ならびに前記本発明の第１の分析方法の説明を援用できる。本発明の第２の分析方法によれば、複数の標的核酸の分析において、各標的核酸の分析用オリゴヌクレオチドに適した成分濃度で反応を行うことができる。
【００６４】
本発明の第２の分析方法は、例えば、前記調製工程において、前記サンプル、少なくとも２つの前記共通試薬、および少なくとも１つの前記非共通試薬を混合することにより、前記分析系を調製する。
【００６５】
つぎに、本発明の実施例について説明する。なお、本発明は、下記の実施例により何ら制限されない。
【実施例】
【００６６】
［実施例１］
異なる標的核酸の分析用オリゴヌクレオチドを用いた分析において、各分析用オリゴヌクレオチドに適したマグネシウムイオンおよびカリウムイオン濃度が異なることを確認した。
【００６７】
ＮＲＡＳ遺伝子（以下、「ＮＲＡＳ」という。）のコドン１１７の変異の分析系およびＮＲＡＳのコドン１４６の変異の分析系として、それぞれ、下記表１および２の組成の分析系を調製した。下記表１に示すように、ＮＲＡＳ  コドン１１７の分析系は、前記分析用オリゴヌクレオチドとして、ＮＲＡＳのコドン１１７の変異を含むポリヌクレオチドを増幅可能なフォワードプライマー１およびリバースプライマー１、ならびにＮＲＡＳのコドン１１７の変異を検出可能なプローブ１およびＮＲＡＳのコドン１１７の特定の変異を検出可能なプローブ２を含む分析系である。また、下記表２に示すように、ＮＲＡＳ  コドン１４６の分析系は、前記分析用オリゴヌクレオチドとして、ＮＲＡＳのコドン１４６の変異を含むポリヌクレオチドを増幅可能なフォワードプライマー２およびリバースプライマー２、ならびにＮＲＡＳのコドン１４６の変異を検出可能なプローブ３を含む分析系である。各分析系において、前記調整成分のマグネシウムイオンおよびカリウムイオンの濃度は、各分析用オリゴヌクレオチドに最適な濃度に調整されている。
【００６８】
【表１】
2017201932.tif 000003
【００６９】
【表２】
2017201932.tif 000004
【００７０】
各分析系を、遺伝子解析装置（i-densy（商標））を用いて、ＰＣＲおよび融解曲線解析を行なった。この結果、いずれの分析系においても、対象とする変異を優れた分析精度で分析できた。以上のことから、各分析用オリゴヌクレオチドに適したマグネシウムイオンおよびカリウムイオン濃度が異なることがわかった。
【００７１】
［実施例２］
異なる濃度のマグネシウムイオンをそれぞれ含む２種類の濃度調整試薬を用い、標的核酸であるＮＲＡＳ遺伝子の変異について、前記標的核酸の分析用オリゴヌクレオチドに適したマグネシウムイオン濃度で反応を行なうことができ、またより優れた分析精度で標的核酸を分析できることを確認した。
【００７２】
（１）試薬
ＤＮＡポリメラーゼ、ＢＳＡ等を含む共通試薬および異なる濃度のマグネシウムイオンを含む２種類の濃度調整試薬１、２を調製した。また、非共通試薬として、ｄＮＴＰを含む非共通試薬１〜４を調製した。非共通試薬１は、ＮＲＡＳのコドン１２および１３の変異を含むポリヌクレオチドを増幅可能なプライマー、ならびにＮＲＡＳのコドン１２および１３の変異を検出可能なプローブを含む試薬であり、非共通試薬２は、ＮＲＡＳのコドン５９および６１の変異を含むポリヌクレオチドを増幅可能なプライマー、ならびにＮＲＡＳのコドン５９および６１の変異を検出可能なプローブを含む試薬であり、非共通試薬３は、ＮＲＡＳのコドン１１７の変異を含むポリヌクレオチドを増幅可能なプライマー、ならびにＮＲＡＳのコドン１１７の変異を検出可能なプローブを含む試薬であり、非共通試薬４は、ＮＲＡＳのコドン１４６の変異を含むポリヌクレオチドを増幅可能なプライマー、ならびにＮＲＡＳのコドン１４６の変異を検出可能なプローブを含む試薬である。なお、濃度調整試薬１は、非共通試薬１および２の分析用オリゴヌクレオチドであるプライマーに応じて、前記調整成分であるマグネシウムイオンの濃度が調整された試薬である。また、濃度調整試薬２は、非共通試薬３および４の分析用オリゴヌクレオチドであるプライマーに応じて、前記調整成分であるマグネシウムイオンの濃度が調整された試薬である。
【００７３】
（２）サンプル
サンプルは、各変異を含むオリゴヌクレオチドを使用した。
【００７４】
（３）ＰＣＲおよび融解曲線解析
そして、各試薬を、それぞれ予め定めた量で組合せて分析系を調製し、前記遺伝子解析装置を用いて、ＰＣＲおよび融解曲線解析を行なった。この結果、いずれの試薬の組合せにおいても、対象とする変異は分析できた。また、非共通試薬１および２は、濃度調整試薬２と組合せた場合と比較して、濃度調整試薬１と組合せた場合の方がより優れた精度で対象とする変異を分析できた。さらに、非共通試薬３および４は、濃度調整試薬１と組合せた場合と比較して、濃度調整試薬２と組合せた場合の方がより優れた精度で対象とする変異を分析できた。これらの結果から、本発明のカートリッジによれば、複数の標的核酸の分析において、各標的核酸の分析用オリゴヌクレオチドに適した成分濃度で反応を行うことができることが分かった。また、本発明のカートリッジによれば、より優れた分析精度で標的核酸を分析できることがわかった。
【００７５】
［実施例３］
異なる濃度のマグネシウムイオンをそれぞれ含む、２種類の濃度調整試薬を用い、標的核酸であるＫＲＡＳ遺伝子（以下、「ＫＲＡＳ」という）の変異について、前記標的核酸の分析用オリゴヌクレオチドに適したマグネシウムイオン濃度で反応を行なうことができ、またより優れた分析精度で標的核酸を分析できることを確認した。
【００７６】
（１）試薬
ＤＮＡポリメラーゼ、ＢＳＡ等を含む共通試薬および異なる濃度のマグネシウムイオンを含む２種類の濃度調整試薬１、２を調製した。また、非共通試薬として、ｄＮＴＰを含む非共通試薬５〜８を調製した。非共通試薬５は、ＫＲＡＳのコドン１２および１３の変異を含むポリヌクレオチドを増幅可能なプライマー、ならびにＫＲＡＳのコドン１２および１３の変異を検出可能なプローブを含む試薬であり、非共通試薬６は、ＫＲＡＳのコドン５９および６１の変異を含むポリヌクレオチドを増幅可能なプライマー、ならびにＫＲＡＳのコドン５９および６１の変異を検出可能なプローブを含む試薬であり、非共通試薬７は、ＫＲＡＳのコドン１１７の変異を含むポリヌクレオチドを増幅可能なプライマー、ならびにＫＲＡＳのコドン１１７の変異を検出可能なプローブを含む試薬であり、非共通試薬８は、ＫＲＡＳのコドン１４６の変異を含むポリヌクレオチドを増幅可能なプライマー、ならびにＫＲＡＳのコドン１４６の変異を検出可能なプローブを含む試薬である。なお、濃度調整試薬１は、非共通試薬５および６の分析用オリゴヌクレオチドであるプライマーに応じて、前記調整成分であるマグネシウムイオンの濃度が調整された試薬である。また、濃度調整試薬２は、非共通試薬７および８の分析用オリゴヌクレオチドであるプライマーに応じて、前記調整成分であるマグネシウムイオンの濃度が調整された試薬である。
【００７７】
（２）サンプル
サンプルは、各変異を含むオリゴヌクレオチドを使用した。
【００７８】
（３）ＰＣＲおよび融解曲線解析
そして、各試薬を、それぞれ予め定めた量で組合せて分析系を調製し、前記遺伝子解析装置を用いて、ＰＣＲおよび融解曲線解析を行なった。この結果、いずれの試薬の組合せにおいても、対象とする変異は分析できた。また、非共通試薬５および６は、濃度調整試薬２と組合せた場合と比較して、濃度調整試薬１と組合せた場合の方がより優れた精度で対象とする変異を分析できた。さらに、非共通試薬７および８は、濃度調整試薬１と組合せた場合と比較して、濃度調整試薬２と組合せた場合の方がより優れた精度で対象とする変異を分析できた。これらの結果から、本発明のカートリッジによれば、複数の標的核酸の分析において、各標的核酸の分析用オリゴヌクレオチドに適した成分濃度で反応を行うことができることが分かった。また、本発明のカートリッジによれば、より優れた分析精度で標的核酸を分析できることがわかった。
【００７９】
以上、実施形態および実施例を参照して本発明を説明したが、本発明は上記実施形態および実施例に限定されるものではない。本発明の構成や詳細には、本発明のスコープ内で当業者が理解し得る様々な変更をすることができる。
【産業上の利用可能性】
【００８０】
本発明によれば、複数の標的核酸の分析において、各標的核酸の分析用オリゴヌクレオチドに適した成分濃度で反応を行うことができる。このため、本発明によれば、例えば、よりすぐれた分析精度で標的核酸を分析できる。したがって、本発明は、例えば、生命科学分野、臨床分野等において、極めて有用であるといえる。
【符号の説明】
【００８１】
１、２、３                                カートリッジ
１１、１１’、１１’ａ、１１’ｂ          共通試薬槽
１１１、１１１’ａ、１１１’ｂ            共通試薬
１２、１２ａ、１２ｂ                      濃度調整試薬槽
１１２、１１２ａ、１１２ｂ                濃度調整試薬
１３、１３ａ、１３ｂ                      非共通試薬槽
１１３、１１３ａ、１１３ｂ                非共通試薬
１４                                      サンプル槽
１５、１５ａ、１５ｂ                      前処理試薬槽
１１５、１１５ａ、１１５ｂ                前処理試薬
１６                                      その他の試薬槽
１１６                                    その他の試薬
１７                                      シール
４                                        分析装置
４１                                      ＣＰＵ
４２                                      サンプリングポンプユニット
４３                                      ノズル駆動ユニット
４４                                      測定部ユニット
４５                                      記憶装置
４６                                      入力装置
４７                                      出力装置
【図１】
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【図２】
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【図３】
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【図４】
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