(57)【要約】【課題】本発明は、微生物学的な手段によって農業上有用な植物に種々の好ましい性質を付与することを目的とする。【解決手段】ラーネラ（Rahnella）属細菌をユリ科植物等の農業上有用な植物に人為的に感染させることにより、これらの植物の生育を促進し、及び／又は収量を増加させるための方法、並びに、ラーネラ（Rahnella）属細菌を含む微生物製剤。【選択図】なし【特許請求の範囲】
【請求項１】
ラーネラ（Rahnella）属に属し、農業上有用な植物体内に共生して該植物の収量を増加させる能力を有する細菌を、該植物に人為的に感染させる工程を含む、農業上有用な植物の収量を増加させる方法。
【請求項２】
ラーネラ（Rahnella）属に属し、農業上有用な植物体内に共生して該植物の生育を促進する能力を有する細菌を、該植物に人為的に感染させる工程を含む、農業上有用な植物の生育を促進する方法。
【請求項３】
農業上有用な植物が、マメ科植物、イネ科植物、ユリ科植物、アブラナ科植物、キク科植物、ナス科植物、ウリ科植物及びセリ科植物からなる群から選択される植物である、請求項１又は２に記載の方法。
【請求項４】
前記細菌が、配列番号1に示す塩基配列と97%以上の同一性を有する塩基配列を含む16S rDNAを有する、請求項１〜３のいずれか１項に記載の方法。
【請求項５】
前記細菌がRahnella sp. MYK106（受託番号NITE P-02062）、又は、農業上有用な植物体内に共生して該植物の収量を増加させる能力、及び／又は該植物の生育を促進する能力を有する、その変異株である、請求項１〜４のいずれか１項に記載の方法。
【請求項６】
ラーネラ（Rahnella）属に属し、農業上有用な植物体内に共生して該植物の収量を増加させる能力、及び／又は該植物の生育を促進する能力を有する細菌を有効成分として含有する、農業上有用な植物用の微生物製剤。
【請求項７】
農業上有用な植物が、マメ科植物、イネ科植物、ユリ科植物、アブラナ科植物、キク科植物、ナス科植物、ウリ科植物及びセリ科植物からなる群から選択される植物である、請求項６に記載の微生物製剤。
【請求項８】
前記細菌が、配列番号1に示す塩基配列と97%以上の同一性を有する塩基配列を含む16S rDNAを有する、請求項６又は７に記載の微生物製剤。
【請求項９】
前記細菌がRahnella sp. MYK106（受託番号NITE P-02062）、又は、農業上有用な植物体内に共生して該植物の収量を増加させる能力、及び／又は該植物の生育を促進する能力を有する、その変異株である、請求項６〜８のいずれか１項に記載の微生物製剤。
【請求項１０】
Rahnella sp. MYK106（受託番号NITE P-02062）、又は、農業上有用な植物体内に共生して該植物の収量を増加させる能力、及び／又は該植物の生育を促進する能力を有する、その変異株。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
本発明はエンドファイトであるRahnella属細菌を植物に人為的に感染させて該植物の生育を促進させる方法、及び該植物の収量を増加させる方法等に関する。
【背景技術】
【０００２】
これまでの化学農薬を中心とした病害虫防除技術は、効率的な食糧確保に貢献してきた。ところが近年、栽培の効率性だけでなく、安心・安全といった領域を含めた無農薬、減農薬による環境保全型農業が望まれ、それに適合した病害虫防除技術（例えば微生物農薬）や生産性の向上技術が必要とされている。
【０００３】
農業分野では、依然として、作物の生育促進には化学肥料が使用され、また、病害虫に対しては化学合成農薬が使用されている。また、一部では微生物や微生物が生産する物質を用いた微生物農薬も知られている。しかし、農薬の原体を化学合成により製造する際には、多量のエネルギーが投入されるという問題、環境への負荷が大きいという問題等がある。また、一方、現在使用されている環境負荷が小さい微生物農薬は高価であり、安定した防除効果が得られないため、品質や収量が減少してしまう問題がある。
【０００４】
このような状況において、植物に共生する微生物であるエンドファイトのなかに、病害虫の防除や収量の増加等の、植物に有益な特性を付与する微生物が報告されている（特許文献１〜９）。しかし、知られるエンドファイトの種類が少ないため、この分野での実用化のためには、実用化の可能性の高い微生物の探索と応用が求められている。
【先行技術文献】
【特許文献】
【０００５】
【特許文献１】特開2013-042695号公報
【特許文献２】特開2011-051902号公報
【特許文献３】特開2009-232721号公報
【特許文献４】特開2009-067717号公報
【特許文献５】特開2009-051771号公報
【特許文献６】特開2009-050206号公報
【特許文献７】特開2003-300805号公報
【特許文献８】特開2003-274779号公報
【特許文献９】特開2002-223747号公報
【発明の概要】
【発明が解決しようとする課題】
【０００６】
本発明は、微生物学的な手段によって農業上有用な植物に対し有益な性質を付与することを目的とする。
【０００７】
とりわけ、本発明に関わるRahnella属細菌をユリ科等の植物に定着させて生育を促す増収技術等は、これまで知られていない。
【課題を解決するための手段】
【０００８】
本発明は、以下の態様を包含する。
（１）ラーネラ（Rahnella）属に属し、農業上有用な植物体内に共生して該植物の収量を増加させる能力を有する細菌を、該植物に人為的に感染させる工程を含む、農業上有用な植物の収量を増加させる方法。
（２）ラーネラ（Rahnella）属に属し、農業上有用な植物体内に共生して該植物の生育を促進する能力を有する細菌を、該植物に人為的に感染させる工程を含む、農業上有用な植物の生育を促進する方法。
（３）農業上有用な植物が、マメ科植物、イネ科植物、ユリ科植物、アブラナ科植物、キク科植物、ナス科植物、ウリ科植物及びセリ科植物からなる群から選択される植物である、（１）又は（２）に記載の方法。
（４）前記細菌が、配列番号1に示す塩基配列と97%以上の同一性を有する塩基配列を含む16S rDNAを有する、（１）〜（３）のいずれかに記載の方法。
（５）前記細菌がRahnella sp. MYK106（受託番号NITE P-02062）、又は、農業上有用な植物体内に共生して該植物の収量を増加させる能力、及び／又は該植物の生育を促進する能力を有する、その変異株である、（１）〜（４）のいずれかに記載の方法。
（６）ラーネラ（Rahnella）属に属し、農業上有用な植物体内に共生して該植物の収量を増加させる能力、及び／又は該植物の生育を促進する能力を有する細菌を有効成分として含有する、農業上有用な植物用の微生物製剤。
（７）農業上有用な植物が、マメ科植物、イネ科植物、ユリ科植物、アブラナ科植物、キク科植物、ナス科植物、ウリ科植物及びセリ科植物からなる群から選択される植物である、（６）に記載の微生物製剤。
（８）前記細菌が、配列番号1に示す塩基配列と97%以上の同一性を有する塩基配列を含む16S rDNAを有する、（６）又は（７）に記載の微生物製剤。
（９）前記細菌がRahnella sp. MYK106（受託番号NITE P-02062）、又は、農業上有用な植物体内に共生して該植物の収量を増加させる能力、及び／又は該植物の生育を促進する能力を有する、その変異株である、（６）〜（８）のいずれかに記載の微生物製剤。
（１０）Rahnella sp. MYK106（受託番号NITE P-02062）、又は、農業上有用な植物体内に共生して該植物の収量を増加させる能力、及び／又は該植物の生育を促進する能力を有する、その変異株。
【０００９】
本明細書において「ラーネラ（Rahnella）属細菌」は、農業上有用な植物体内に共生して植物の収量を増加させる能力、及び／又は植物の生育を促進する能力を有する、エンドファイト細菌を指す。一般に、「エンドファイト」なる用語は、植物に共生する微生物をいう。
【発明の効果】
【００１０】
本発明により、微生物学的な手段、すなわちエンドファイトとして使用可能なラーネラ（Rahnella）属細菌（例えばRahnella sp. MYK106株）によって、農業上有用な植物について、該植物の生育を促進すること、及び／又は該植物の収量を増加することが可能となる。
【発明を実施するための形態】
【００１１】
１. 細菌
本発明に用いることができる細菌は、ラーネラ（Rahnella）属に属する細菌、例えばRahnella aquatilisであって、農業上有用な植物、例えば、マメ科植物、イネ科植物、ユリ科植物、アブラナ科植物、キク科植物、ナス科植物、ウリ科植物及びセリ科植物からなる群から選択される植物の体内に共生して、該植物の生育（生長）を促進する能力、及び／又は、該植物の収量を増加する能力を有する細菌であれば特に限定されない。
【００１２】
本明細書では、植物の収量は、例えば種子、葉（鱗茎を含む）、実、茎、根、花等の植物体構成成分の収量を指す。
【００１３】
本明細書では、ラーネラ（Rahnella）属細菌は、上記のいずれか１つ、又は複数の能力を植物体に付与することができるエンドファイト細菌であり、自然界から単離された細菌だけでなく、そのような細菌に突然変異処理を施して産生された変異体も包含する。
【００１４】
上記細菌の具体例として、ラーネラ（Rahnella）属細菌である、Rahnella sp. MYK106（受託番号NITE P-02062；以下では、単に「MYK106株」又は「NITE P-02062株」と称することもある）、或いは、上記のいずれか１つ又は複数の能力を有する、その変異株が挙げられる。
【００１５】
上記のRahnella sp. MYK106は、自生しているユリ科植物から単離された菌株である。Rahnella sp. MYK106は、2015年6月9日を受託日として、ブダペスト条約下の国際寄託機関である、独立行政法人製品評価技術基盤機構、特許微生物寄託センター（〒292-0818千葉県木更津市かずさ鎌足2-5-8）に本出願人により寄託され、受託番号NITE P-02062が付与されている。
【００１６】
このNITE P-02062株は、種々の細菌の属及び種について、16S rDNAの部分配列（本件の場合、Rahnella sp. MYK106（受託番号NITE P-02062）株の16S rDNAの対応する部分塩基配列（配列番号1）との比較）を用いて、相同性検索を行った結果、相同性の高い菌として、相同性が高いほうから順に、Rahnella aquatilis strain T4（Accession No.：KF465846.1、相同性： 99％）、Rahnella aquatilis strain P32（Accession No.：KF465839.1、相同性： 99％）、Rahnella sp. XL-1（Accession No.：KJ710698.1、相同性： 99％）、Rahnella aquatilis strain GABIT-M100（Accession No.：KM977991.1、相同性： 99％）、Rahnella aquatilis partial 16S rRNA gene, strain TS18 (Accession No.：FM209488.1、相同性： 99％）が認められたことから、Rahnella属に属する細菌であることが判明した。また、この結果から、MYK106株は、Rahnella aquatilisである可能性が高いと考えられた。
【００１７】
本発明で使用できる細菌としては、Rahnella属細菌であるMYK106株又は本菌株と同等の植物の生育（生長）を促進する能力及び／又は植物の収量を増加する能力を有する細菌が挙げられる。本発明で使用できる細菌として、例えば、Rahnella属に属し、上記のいずれか１つ又は複数の能力を有し、かつ、配列番号1に示す塩基配列又は該塩基配列と等価な配列を少なくとも一部分に含む16S rDNAを有する細菌、並びにRahnella属に属し、上記のいずれか１つ又は複数の能力を有し、かつ、MYK106株と同一又は実質的に同等の基質資化性等の性質を有する細菌が挙げられるがこれらには限定されない。ここで、配列番号1に示す塩基配列と等価な配列とは、配列番号1に示す塩基配列と好ましくは97%以上、98%以上、又は99%以上、さらに好ましくは99.5%以上、99.7%以上、99.8%以上、又は99.9%以上の同一性を有する塩基配列を意味する。同一性の値は、複数の塩基配列間の同一性を演算するソフトウェア（例えば、FASTA、DANASYS、及びBLAST）を用いてデフォルトの設定で算出した値を示す。また、実質的に同等の基質資化性を有するとは、MYK106株の基質資化性と比べて、資化される基質及び／又は資化されない基質が、数個以下、例えば3個以下、2個以下、又は1個異なることを意味する。
【００１８】
さらにまた、MYK106株が人為的に突然変異誘発処理されて産生されたその変異株であって、農業上有用な植物、例えばマメ科植物、イネ科植物、ユリ科植物、アブラナ科植物、キク科植物、ナス科植物、ウリ科植物及びセリ科植物からなる群から選択される植物、の体内に共生して該植物の生育を促進する能力、及び／又は該植物の収量を増加させる能力を有する変異株もまた、本発明で使用することができる。
【００１９】
本発明で使用できるRahnella属細菌を自然界から分離するときには、農業上有用な植物の根、茎、葉等の植物体構成部から、該植物に共生する細菌類を培養により分離し、上記の能力のいずれかについて、及び／又は上記の配列番号1に示す塩基配列との配列同一性等について、選抜試験を行い得る。
【００２０】
また、突然変異誘発処理を行う場合には、MYK106株に対し任意の適当な変異原を用いて突然変異が行われ得る。
【００２１】
ここで、「変異原」なる用語は、広義の意味を有し、例えば変異原作用を有する薬剤のみならずUV照射等の高エネルギー線照射のような変異原作用を有する処理も含むものとする。適当な変異原の例として、エチルメタンスルホネート、UV照射、ガンマ線照射、X線照射、重イオンビーム照射、N−メチル−N'−ニトロ−N−ニトロソグアニジン、ブロモウラシルのようなヌクレオチド塩基類似体、及びアクリジン類が挙げられるが、他の任意の効果的な変異原もまた使用され得る。
【００２２】
或いは、細菌に変異を導入する他の手段には、遺伝子組換え法を利用する方法がある。
【００２３】
本発明に用いられる細菌は、振とう培養等の通常の培養法により、Rahnella属細菌について通常使用されるような条件下で培養されうる。培養に用いる培地としては炭素源としてグルコース、シュークロース、デンプン、デキストリン等の糖類を、窒素源として硫酸アンモニウム、塩化アンモニウム、硝酸アンモニウム等のアンモニウム塩、硝酸塩等の無機窒素源、又は、酵母エキス、コーン・スティープ・リーカー、肉エキス、小麦胚芽、ポリペプトン、サトウキビ絞り粕（バカス）、ビールカス、大豆粉、米糠、魚粉等の有機窒素源を、無機塩としてリン酸一カリ、硫酸マグネシウム、硫酸マンガン、硫酸第一鉄等の、リン、カリウム、マンガン、マグネシウム、鉄等を含む塩類を、それぞれ含有する合成又は天然の培地が挙げられる。培養温度は、通常、20〜37℃、好ましくは27〜32℃で、12〜48時間、好気的条件下で行うことができる。
【００２４】
本発明の方法には、細菌の培養液をそのまま使用することができるが、細菌の培養液を膜分離、遠心分離、濾過分離等の方法により分離した、細菌の高濃度物を用いることもできる。
【００２５】
本発明の方法ではまた、細菌の培養液を乾燥させたものを使用することができる。また、細菌の培養液を活性炭、珪藻土、タルク、ゼオライト、ピートモス、パーライト、ベントナイト、モンモリナイト、バーミュキュライト等の多孔吸着体に吸着させ乾燥させたものを使用することができる。多孔吸着体は、１種類でもよいし、複数の担体を組合せて用いてもよい。乾燥方法は通常の方法でよく、例えば凍結乾燥又は減圧乾燥でよい。これらの乾燥物は乾燥後さらにボールミル等の粉砕手段で粉砕されてもよい。
【００２６】
細菌は、上記の培養液、高濃度物又は乾燥物としてそれ自体単独で本発明の用途に用いることができるが、更なる他の任意成分と組み合わせて通常の微生物製剤と同様の形態（例えば粉剤、水和剤、粒剤、乳剤、液剤、懸濁液、フロアブル剤、塗布剤等の形態）に製剤化して用いることもできる。組み合わせて使用することができる任意成分としては例えば固体担体、補助剤のような植物への適用が許容される材料が挙げられる。
【００２７】
２．農業上有用な植物
本発明の方法で使用可能な対象植物は、以下のものに限定されないが、例えばマメ科植物、イネ科植物、ユリ科植物、アブラナ科植物、キク科植物、ナス科植物、ウリ科植物及びセリ科植物からなる群から選択される農業上有用な植物が挙げられる。好ましくは、農業上有用な植物は、ユリ科植物、アブラナ科植物、キク科植物、及びナス科植物からなる群から選択される。
【００２８】
本明細書で使用される「農業上有用な植物」は、例えば野菜類、穀類植物等の作物、果樹等の農業において生産対象となる植物を指す。
【００２９】
イネ科植物としては、例えばイネ、コムギ、オオムギ、ライムギ、ライコムギ、ハトムギ、ソルガム、エンバク、トウモロコシ、サトウキビ、アワ、ヒエ等の穀類が挙げられる。イネ科植物としてはさらに、例えばシバ、バッファローグラス、バミューダグラス、ウィーピンググラス、センチピードグラス、カーペットグラス、ダリスグラス、キクユグラス、セントオーガスチングラス等の飼料又は牧草が挙げられる。
【００３０】
マメ科植物としては、例えばダイズ、アズキ、ラッカセイ、インゲンマメ、エンドウマメ、ハナマメ、ソラマメ、ササゲ、ヒヨコマメ、リョクトウ、レンズマメ、ライマメ、バンバラマメが挙げられる。
【００３１】
本明細書において、ユリ科植物は、新分類（APG体系）においてユリ科植物に分類される植物に加えて、旧分類（クロンキスト体系等）においてユリ科植物に分類されていた植物（例えばAPG体系におけるヒガンバナ科植物及びキジカクシ科植物）を包含する。本明細書におけるユリ科植物としては、例えばタマネギ（APG体系ではヒガンバナ科）、ネギ（APG体系ではヒガンバナ科）、ラッキョウ（APG体系ではヒガンバナ科）、ニンニク（APG体系ではヒガンバナ科）、ニラ（APG体系ではヒガンバナ科）、アサツキ（APG体系ではヒガンバナ科）、ユリ、アスパラガス（APG体系ではキジカクシ科）、エシャロット（APG体系ではヒガンバナ科）、ワケギ（APG体系ではヒガンバナ科）等が挙げられる。
【００３２】
アブラナ科植物としては、例えばアブラナ、カブ、チンゲンサイ、ノザワナ、カラシナ、タカナ、コブタカナ、水菜、コールラビー、ルッコラ、クレソン、タアサイ、カリフラワー、キャベツ、ケール、ハクサイ、コマツナ、ダイコン、ハツカダイコン、ブロッコリー、メキャベツ、ワサビ、セイヨウワサビ、シロイヌナズナが挙げられる。
【００３３】
キク科植物としては、例えばレタス、サニーレタス、シュンギク、キク等が挙げられる。
【００３４】
ナス科植物としては、例えばナス、トマト、ピーマン、シシトウ、トウガラシ、ジャガイモ、クコ、パプリカ、ハラペーニョ、ハバネロ等が挙げられる。
【００３５】
ウリ科植物としては、例えばキュウリ、カボチャ、ゴーヤ、スイカ、ズッキーニ、トウガン、ヘチマ、メロン、ユウガオ等が挙げられる。
【００３６】
セリ科植物としては、ニンジン、ミツバ、パセリ、セロリ、セリ、アシタバ、スープセロリ、チャーベル、フェンネル等が挙げられる。
【００３７】
３．収量増加、及び生育促進のための微生物学的方法
本発明の方法は、Rahnella属に属し、農業上有用な上記の植物の体内に共生して該植物の収量を増加する能力、及び／又は、該植物の生育を促進する能力を有する細菌を、該植物に人為的に感染させる工程を含む。
【００３８】
植物の収量を増加することは、例えば、野菜であれば、例えば葉（鱗茎を含む）、根、根茎、種子、花等の食用部分を、穀類であれば、種子を、果樹であれば、実を、それぞれ増収穫させることを意味する。
【００３９】
植物の生育（生長）を促進することは、本発明の細菌を接種しない対照と比較して植物の成長を早めることを意味する。
【００４０】
植物への施用方法としては、種子コート、幼植物への潅注、塗布、植物根部の菌液への浸漬、又は噴霧処理する方法等が挙げられる。特に、種子又は植物体に必要に応じて人為的に傷を付け、菌液の噴霧処理、塗布する方法が好ましい。その他の施用条件としては播種時、育苗期等圃場定植前に施用することが望ましい。また、さらに圃場栽培中に植物、場合により植物根部周囲の土壌、に噴霧処理することで効果の高発現が期待できる。
【００４１】
1つの例として、本発明の細菌の、植物への人為的な感染は、圃場に植えつける前の幼苗（例えば１〜4枚の本葉が出た時期の苗）に菌液を散布することにより行うことができる。散布後約1〜15日目に、苗を圃場に定植し得る。植物体内に侵入した菌がやがて、植物に共生するようになると考えられる。
【００４２】
菌液の濃度は、１×105〜1×1012個/ml、例えば１×108〜1×1010個/ml又はそれ以上であってよいが、これらの濃度範囲に限定されない。菌を懸濁する媒体は、水、緩衝液、又は培地であることが好ましい。通常、高濃度菌液を水又は培地で所定濃度に希釈して使用することができる。
【００４３】
本発明の方法は、具体的には、次の態様を含む。
【００４４】
本発明の方法は、第1の態様により、ラーネラ（Rahnella）属に属し、農業上有用な植物体内に共生して該植物の収量を増加させる能力を有する細菌を、該植物に人為的に感染させる工程を含む、農業上有用な植物の収量を増加させる方法を提供する。
【００４５】
本発明の方法は、第2の態様により、ラーネラ（Rahnella）属に属し、農業上有用な植物体内に共生して該植物の生育を促進する能力を有する細菌を、該植物に人為的に感染させる工程を含む、農業上有用な植物の生育を促進する方法を提供する。
【００４６】
本発明の方法は、上記感染工程の後に、農業上有用な植物を栽培する工程を含んでよい。農業上有用な植物の栽培は通常の方法で行うことができる。感染工程の後、いったんポット等で栽培し、その後圃場に移してもよいし、直接圃場に移して栽培工程を行ってもよい。
【００４７】
４．微生物製剤
本発明はさらに、ラーネラ（Rahnella）属に属し、農業上有用な植物体内に共生して該植物の収量を増加させる能力、及び／又は、該植物の生育を促進する能力を有する細菌を有効成分として含有する、農業上有用な植物用の微生物製剤を提供する。
【００４８】
農業上有用な植物の例は、上で具体的に例示した、マメ科植物、イネ科植物、ユリ科植物、ナス科植物、ウリ科植物、アブラナ科植物、キク科植物及びセリ科植物からなる群から選択される植物である。
【００４９】
好ましい細菌は、Rahnella sp. MYK106（受託番号NITE P-02062）、又は農業上有用な植物体内に共生して該植物の収量を増加させる能力、及び／又は、該植物の生育を促進する能力を有する、その変異株である。
【００５０】
微生物製剤は、細菌の高濃度物、細菌の培養液を乾燥させたもの等を使用することができる。また、細菌の培養液を活性炭、珪藻土、タルク、ゼオライト、ピートモス、パーライト、ベントナイト、モンモリナイト、バーミュキュライト等の多孔吸着体に吸着させ乾燥させたものを使用することができる。多孔吸着体は、１種類でもよいし、複数の担体を組合せて用いてもよい。乾燥方法は通常の方法でよく、例えば凍結乾燥、減圧乾燥でよい。これらの乾燥物は乾燥後さらにボールミル等の粉砕手段で粉砕されてもよい。
【００５１】
細菌は、上記の培養液、高濃度物又は乾燥物としてそれ自体単独で本発明の用途に用いることができるが、更なる他の任意成分と組み合わせて通常の微生物製剤と同様の形態（例えば粉剤、水和剤、粒剤、乳剤、液剤、懸濁液、フロアブル剤、塗布剤等の形態）に製剤化して用いることもできる。組み合わせて使用することができる任意成分としては例えば固体担体、補助剤のような植物への適用が許容される材料が挙げられる。
【００５２】
本発明はさらに、Rahnella sp. MYK106（受託番号NITE P-02062）、又は農業上有用な植物体内に共生して該植物の収量を増加させる能力、及び／又は、該植物の生育を促進する能力を有する、その変異株を提供する。
【００５３】
本発明の細菌は、振とう培養等の通常の培養法により、Rahnella属細菌について通常使用されるような、上記の条件下で培養されうる。
【実施例】
【００５４】
以下に、実施例を挙げて本発明をさらに具体的に説明するが、本発明の技術的範囲は、それらの実施例によって制限されないものとする。
【００５５】
［実施例１］
＜Rahnella sp. MYK106（受託番号NITE P-02062）株の取得＞
自生しているユリ科植物を採取し、切断した。切断したユリ科植物を70%エタノールに30秒、2.5%次亜塩素酸ナトリウム溶液に5分浸すことにより表面殺菌を行った。その後、植物体を乳鉢に移し滅菌した生理食塩水1mlと海砂を適量加えながら磨砕した。磨砕した上澄みを100μl、NA(Nutrient Agar)培地に塗布し、30℃、数日間培養後、シングルコロニーを単離することにより標題のMYK106株を得た。
【００５６】
［実施例２］
＜MYK106株の16SrDNA塩基配列の決定＞
１）方法
Rahnella sp. MYK106株菌体を0.85%NaCl水溶液500μlに懸濁し、遠心後に上清を除去した。菌体に滅菌水20μl、BL buffer（40ｍM Tris、1%Tween20、0.5% Nonidet P-40、1mM EDTA、pH 8.0）25μl、Proteinase K（1mg/ml）5μlを加え、軽く懸濁した。60℃、20分間放置後に105℃で5分間放置した後、遠心し、上清をDNA抽出液とした。
【００５７】
滅菌水を6.95μl、Ex Taq Buffer（20ｍM）を1μl、dNTP Mixture（dATP、dCTP、dGTP、dTTP各2.5mM）を0.8μl、Ex Taq(5units/μl)を0.05μl、100nMプライマー（5'-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3'（配列番号2）及び5'-GGCTACCTTGTTACGACTT-3'（配列番号3））を1μlずつ、滅菌水で10倍に希釈したDNA抽出液１μlを混合し、PCRを行った。反応は94℃、5分間を1サイクル、94℃、60秒間、55℃、60秒間、72℃、90秒間を35サイクル、72℃、2分間を1サイクルで実施した。
【００５８】
PCR後の溶液をアガロースゲルで電気泳動し、目的のDNA断片部分 (約1400bp)を切り出した。ゲルからDNA断片を抽出し、塩基配列の決定に使用した。
【００５９】
２）結果
決定された16SrDNAの塩基配列は、配列番号1の配列からなるものであった。
【００６０】
MYK106株について、得られた16SrDNAの塩基配列をDDBJ、EMBL、GenBankデータベースと比較した。その結果、相同性は高いほうから順に、Rahnella aquatilis strain T4（Accession No.：KF465846.1、相同性： 99％）、Rahnella aquatilis strain P32（Accession No.：KF465839.1、相同性： 99％）、Rahnella sp. XL-1（Accession No.：KJ710698.1、相同性： 99％）、Rahnella aquatilis strain GABIT-M100（Accession No.：KM977991.1、相同性： 99％）、Rahnella aquatilis partial 16S rRNA gene, strain TS18 (Accession No.：FM209488.1、相同性： 99％）であったことから、Rahnella属に属する細菌であることが判明した。また、この結果から、MYK106株は、Rahnella aquatilisである可能性が高いと考えられた。
【００６１】
［実施例３］
＜Rahnella sp. MYK106株によるタマネギの生育促進１＞
１）方法
タマネギ品種：ターボ
エンドファイト菌株：MYK106株
接種日：平成23年11月
接種方法： 1×108個／mlの菌懸濁液を、50ml/m2で圃場にてスプレーで接種した。
定植日：平成23年11月
圃場：愛知県
測定項目：収穫期に2条を2mの範囲で3箇所全量収穫し、各規格の個数および重量を調査した。
収穫調査日：平成24年6月19日
【００６２】
２）結果
全量収穫し、各規格の個数と重量の測定を行なった（表１）。大きさ、外観から2L、L、M、Sに分類された球を規格内とし、それ以外の小さいものや外観が悪いものは規格外とした。
【００６３】
収量調査の結果、MYK106処理区において平均一球重が無処理区と比較して増加し、収量比も3.3％増加した（表２）。
【００６４】
【表１】
2017186304.tif 000002
【００６５】
【表２】
2017186304.tif 000003
【００６６】
［実施例４］
＜Rahnella sp. MYK106株によるタマネギの生育促進２＞
１）方法
タマネギ品種：ターボ
エンドファイト菌株：MYK106株
接種日：平成24年11月20日
接種方法：定植前の苗の根部を、1×108個／mlの菌懸濁液に一晩浸した。
定植日：平成24年11月21日
圃場：愛知県
測定項目：収穫期に2条を2mの範囲で3箇所全量収穫し、各規格の個数および重量を調査した。
収穫調査日：平成25年6月18日
【００６７】
２）結果
全量収穫し、各規格の個数と重量の測定を行なった（表３）。大きさ、外観から2L、L、M、Sに分類された球を規格内とし、それ以外の小さいものや外観が悪いものは規格外とした。
【００６８】
収量調査の規格内収量の結果、MYK106処理区においては平均一球重が無処理区と比較して増加し、収量比も12.4％増加した（表４）。
【００６９】
【表３】
2017186304.tif 000004
【００７０】
【表４】
2017186304.tif 000005
【００７１】
［実施例５］
＜Rahnella sp. MYK106株によるタマネギの生育促進３＞
１）方法
タマネギ品種：ターボ
エンドファイト菌株：MYK106株
接種日：平成25年10月26日
接種方法：1×108個／mlの菌懸濁液を、26.7ml/m2で苗に散布した。
定植日：平成25年10月26日
圃場：愛知県
測定項目：収穫期に2条を2mの範囲で3箇所全量収穫し、各規格の個数および重量を調査した。
収穫調査日：平成26年6月6日
【００７２】
２）結果
全量収穫し、各規格の個数と重量の測定を行なった（表５）。大きさ、外観から2L、L、M、Sに分類された球を規格内とし、それ以外の小さいものや外観が悪いものは規格外とした。
【００７３】
収量調査の規格内収量の結果、MYK106処理区においては平均一球重が無処理区と比較して増加し、収量比も6.3％増加した（表６）。
【００７４】
【表５】
2017186304.tif 000006
【００７５】
【表６】
2017186304.tif 000007
【００７６】
［実施例６］
＜Rahnella sp. MYK106株によるポット試験におけるコマツナの生育促進＞
１）方法
コマツナ品種：夏楽天
エンドファイト菌株：MYK106株
試験規模：1処理区9株
5×5セル（計25セル）になるように準備したセルトレーの底に約2cm角に切った不織布を引き、タネマキ培土（タキイ種苗株式会社）を充填した。2粒／セルずつ播種し、タネマキ培土で覆土した。播種日を0日目として播種後7日目前後に間引きをして1株／セルにした。MYK106株接種区には、播種後14日を目安に本葉が2〜3枚展開したところで、1×108cells/mlに純水を用いて調整した菌液を1セルあたり10mlずつ接種した。15℃以下にならないように加温したガラス温室内で栽培し本葉が4枚以上展開するまで栽培した。その後外周を除いた9株を地際部から切断し、乾物重を測定した。
【００７７】
２）結果
27日間栽培後、無接種区を100としたときにMYK106接種区で乾物重が7.9%増加していた（表７）。
【００７８】
【表７】
2017186304.tif 000008
【００７９】
［実施例７］
＜Rahnella sp. MYK106株によるポット試験におけるレタスの生育促進＞
１）方法
レタス（品種：グリーンウェーブ）を用いる以外は、実施例６と同様に試験を行い、乾物重を測定した。
【００８０】
２）結果
24日間栽培後、無接種区を100としたときにMYK106株接種区で乾物重が27.8%増加したことが示された（表８）。
【００８１】
【表８】
2017186304.tif 000009
【００８２】
［実施例８］
＜Rahnella sp. MYK106株によるポット試験におけるネギの生育促進＞
１）方法
ネギ（品種：万能小ネギ）を用いる以外は、実施例６と同様に試験を行い、乾物重を測定した。
【００８３】
２）結果
38日間栽培後、無接種区を100としたときにMYK106株接種区で乾物重が7.7%増加していた（表９）。
【００８４】
【表９】
2017186304.tif 000010
【００８５】
［実施例９］
＜Rahnella sp. MYK106株によるポット試験におけるトマトの生育促進＞
１）方法
トマト（品種：CF桃太郎ヨーク）を用いる以外は、実施例６と同様に試験を行い、乾物重を測定した。
【００８６】
２）結果
24日間栽培後、無接種区を100としたときにMYK106株接種区で乾物重が3.3%増加した（表１０）。
【００８７】
【表１０】
2017186304.tif 000011
【００８８】
［実施例１０］
＜Rahnella sp. MYK106株によるポット試験におけるダイズの生育促進＞
１）方法
ダイズ（品種：とよまさり）を用いる以外は、実施例６と同様に試験を行い、乾物重を測定した。
【００８９】
２）結果
40日間栽培後、無接種区を100としたときにMYK106株接種区で乾物重が2.2%増加した（表１１）。
【００９０】
【表１１】
2017186304.tif 000012
【００９１】
［実施例１１］
＜Rahnella sp. MYK106株によるポット試験におけるイネの生育促進＞
１）方法
イネ（品種：コシヒカリ）を用いる以外は、実施例６と同様に試験を行い、乾物重を測定した。
【００９２】
２）結果
40日間栽培後、無接種区を100としたときにMYK106株接種区で乾物重が26.7%増加した（表１２）。
【００９３】
【表１２】
2017186304.tif 000013
【産業上の利用可能性】
【００９４】
本発明は、Rahnella属細菌を農業上有用な植物に人為的に感染させることにより、これらの植物の生育を促進し、及び／又は収量を増加させるため、農業上有用である。
【配列表】
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