(57)【要約】      （修正有）【課題】抗Ｎｏｔｃｈ３抗体、抗Ｎｏｔｃｈ３抗体−薬物コンジュゲート、ならびにその調製および使用方法の提供。【解決手段】特定の配列からなるアミノ酸配列で示されるＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３を含む、重鎖可変領域並びに特定の配列からなるアミノ酸配列で示されるＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３を含む、軽鎖可変領域を含む、Ｎｏｔｃｈ３に結合する単離抗体又はその抗原結合性断片。式：Ａｂ−（Ｌ−Ｄ）ｐで表される抗体薬物コンジュゲート又はその薬学的に許容できる塩。（Ａｂは前記の抗体又はその抗原結合性断片；Ｌはリンカー；Ｄは薬物；ｐは１〜１２の整数）【選択図】なし【特許請求の範囲】
【請求項１】
配列番号１３で示される重鎖可変領域のＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３を含む、重鎖可変領域、ならびに配列番号２５で示される軽鎖可変領域のＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３を含む、軽鎖可変領域を含む、Ｎｏｔｃｈ３に結合する単離抗体またはその抗原結合性断片。
【請求項２】
配列番号３７で示される重鎖可変領域のＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３を含む重鎖可変領域、ならびに配列番号４９で示される軽鎖可変領域のＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３を含む軽鎖可変領域を含む、単離抗体またはその抗原結合性断片。
【請求項３】
式：
Ａｂ−（Ｌ−Ｄ）ｐ
の抗体−薬物コンジュゲートまたはその薬学的に許容できる塩であって、
式中、
（ａ）Ａｂは、請求項１または２のいずれか一項に記載の抗体またはその抗原結合性断片であり、
（ｂ）Ｌ−Ｄは、リンカー−薬物部分であり、式中、Ｌはリンカーであり、Ｄは薬物であり、
（ｃ）ｐは、１から１２の整数である、
抗体−薬物コンジュゲートまたはその薬学的に許容できる塩。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
関連出願
本願は、２０１２年１１月７日に出願された米国仮出願第６１／７２３，７７２号および２０１３年１０月１１日に出願された米国仮出願第６１／８８９，７４４号の利益を請求するものであり、これらの出願は、その全体が参照により本明細書に組み込まれている。
【０００２】
配列表
本願は、ＥＦＳ−Ｗｅｂを介して電子的に出願され、電子的に提出されたテキスト形式の配列表を含む。テキストファイルは、２０１３年１０月１１日に作成され、６１ＫＢのサイズを有する、「ＰＣ０７１９８０Ａ＿Ｓｅｑｕｅｎｃｅ＿Ｌｉｓｔｉｎｇ．ｔｘｔ」というタイトルの配列表を含有する。このテキストファイルに含有される配列表は明細書の一部であり、その全体が参照により本明細書に組み込まれている。
【０００３】
技術分野
本発明は、抗Ｎｏｔｃｈ３抗体および抗Ｎｏｔｃｈ３抗体−薬物コンジュゲートに関する。本発明はさらに、がんを処置するためのこのような抗体および抗体−薬物コンジュゲートの使用方法に関する。
【背景技術】
【０００４】
Ｎｏｔｃｈシグナル伝達は、細胞外受容体とリガンドとの相互作用によって引き起こされる。Ｎｏｔｃｈ受容体は、リガンド誘発性のタンパク質分解によって引き起こされるシグナル伝達カスケードを介して、多細胞生物における正常な細胞増殖、細胞分化、および細胞死を制御する。部位Ｓ１でのフーリン様プロテアーゼ切断の後、成熟Ｎｏｔｃｈヘテロ二量体は細胞膜内に移動し、そこで、前記二量体は、３つのＬｉｎ１２／Ｎｏｔｃｈ反復（ＬＮＲ−Ａ、Ｂ、Ｃ）およびヘテロ二量体化（ＨＤ）ドメインからなる膜近傍の負調節領域（ＮＲＲ）によって、自己阻害状態に維持される。ＨＤドメインは、部位Ｓ１での切断後に、Ｎ末端（ＨＤ１）半分およびＣ末端（ＨＤ２）半分に分けられる。不確定な機構を介して、細胞外ＥＧＦ反復領域へのＤｅｌｔａ／Ｓｅｒｒａｔｅ／Ｌａｇ−２（ＤＳＬ）ファミリーのリガンドの結合は、この阻害を軽減させ、２つのさらなる切断事象を誘発する。第１に、ＡＤＡＭ型のメタロプロテイナーゼは、ＨＤ−２ドメインのＣ末端領域に近い部位Ｓ２での切断を仲介し、それによって細胞外ドメイン（ＥＣＤ）を細胞表面から放出させ、前記ドメインは次いで、リガンド発現細胞内へのトランスエンドサイトーシスを受ける。次に、ガンマセクレターゼは、膜貫通ドメイン内の部位Ｓ３での切断を仲介し、前記膜貫通ドメインは、Ｎｏｔｃｈの細胞内ドメイン（Ｎｏｔｃｈ−ＩＣＤ）を膜から放出し、核への前記細胞内ドメインの移動を可能にし、標的遺伝子の転写を活性化する（Ｂｒａｙ，Ｓ．、Ｎａｔｕｒｅ  Ｒｅｖｉｅｗｓ  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｃｅｌｌ  Ｂｉｏｌｏｇｙ、２００６、ｖｏｌｕｍｅ  ７、６７８〜６８９）。
【０００５】
自己阻害コンホメーションにあるヒトＮｏｔｃｈ２−ＮＲＲドメインのＸ線結晶構造は、メタロプロテアーゼＳ２部位を覆い隠すＮＲＲ内のＬＮＲ反復とヘテロ二量体化ドメインとの間の大きな相互作用を明らかにし、このことは、実質的なコンホメーションの動きがリガンドによる活性化の間に前記部位を暴露するために必須であることを示唆している（Ｇｏｒｄｏｎ，Ｗ．Ｒ．ら、Ｎａｔｕｒｅ  Ｓｔｒｕｃｔｕｒａｌ  ＆  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｂｉｏｌｏｇｙ、２００７、ｖｏｌｕｍｅ  １４、２９５〜３００）。試験は、ＮＲＲ内の相互作用の安定化がリガンド誘発性のＮｏｔｃｈ活性化を予防しうることを示唆する。Ｎｏｔｃｈ自己阻害コンホメーションについての構造情報の利用可能性によって、療法剤、特にＮｏｔｃｈシグナル伝達を標的化する抗体の開発の新たな機会が得られた（Ｌｉ，Ｋ．ら、Ｊｏｕｒｎａｌ  ｏｆ  Ｂｉｏｌｏｇｉｃａｌ  Ｃｈｅｍｉｓｔｒｙ、２００８、ｖｏｌｕｍｅ  ２８３、８０４６〜８０５４；Ａｓｔｅ−Ａｍｅｚａｇａ，Ｍら、ＰＬＯＳ  ＯＮＥ、２０１０、ｖｏｌｕｍｅ  ５、ｅ９０９４；Ｗｕ，Ｙ．ら、Ｎａｔｕｒｅ、２０１０、ｖｏｌｕｍｅ  ４６４、１０５２〜１０５７）。
【０００６】
哺乳動物細胞では、４つの既知のＮｏｔｃｈ受容体が存在する。Ｎｏｔｃｈ−１、−２、−３、および−４は、胚および成体の組織における発現の広範な重複するパターンを有し、造血幹細胞の特異化、Ｔ細胞の成長、腸陰窩細胞の特異化、および血管の成長の間の非冗長な役割を満たす。Ｎｏｔｃｈ３は、血管平滑筋細胞（ｖＳＭＣ）、様々な胸腺細胞亜集団、および成長中の神経系で主に発現する。その制限された組織分布と一致して、マウスＮｏｔｃｈ３の標的化された欠失は、胚性致死性様Ｎｏｔｃｈ１およびＮｏｔｃｈ２の欠失をもたらさない。その代わり、Ｎｏｔｃｈ３ヌルマウスは、生存可能であるが、ｖＳＭＣの成熟および分化に欠陥を有する（Ｄｏｍｅｎｇａ，Ｖ．ら、Ｇｅｎｅｓ  ａｎｄ  Ｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔ、２００４、ｖｏｌｕｍｅ  １８、２７３０〜２７３５）。
【０００７】
Ｎｏｔｃｈの活性化は、多くの状況で発がん性であり、構成的に活性な、４つの全てのＮｏｔｃｈホモログの細胞内形態は、ｉｎ  ｖｉｔｒｏで、およびトランスジェニックマウスモデルで、がん遺伝子として機能する。最近の試験は、Ｎｏｔｃｈ３が様々なヒト固形腫瘍で増幅および過剰発現することが多く、かつ、ヒトがんにおけるＮｏｔｃｈ３などの発達的シグナル伝達経路の過剰発現がそれらを腫瘍形成の主要なメディエーターとして関与させることを示す。いくつかの戦略が、がんにおける治療目的でＮｏｔｃｈシグナル伝達をブロックするために開発中であるが、当技術分野で、がんを処置するためのさらに強力かつ効果的な抗Ｎｏｔｃｈ標的療法が依然として必要とされている。
【発明の概要】
【発明が解決しようとする課題】
【０００８】
抗体−薬物コンジュゲート（ＡＤＣ）は、高親和性抗体の特異性および標的化と、治療剤、例えば、細胞傷害性剤、生物学的応答修飾因子、酵素、アポトーシス誘発剤、およびラジオアイソトープの細胞傷害性とを組み合わせる。抗体からの治療剤の放出は、リソソームへの抗体−薬物コンジュゲートの輸送および局在化を要する可能性があり、Ｎｏｔｃｈ３−ＥＣＤおよびＮｏｔｃｈ３−ＩＣＤの両方はリソソーム分解を受け、こうして、Ｎｏｔｃｈ３を結合する抗体は、リソソームへ輸送されると予想される（Ｊｉａ  Ｌら、Ｉｎｔｅｒｎａｔｉｏｎａｌ  Ｊｏｕｒｎａｌ  ｏｆ  Ｂｉｏｃｈｅｍｉｓｔｒｙ  ａｎｄ  Ｃｅｌｌ  Ｂｉｏｌｏｇｙ、２００９、ｖｏｌｕｍｅ  ４１、２５９４〜２５９８）。本発明は、がんの処置における診断および治療的使用において未だ対処されていない臨床的必要性を満たす、新規な抗Ｎｏｔｃｈ３抗体および抗体−薬物コンジュゲートを提供する。
【課題を解決するための手段】
【０００９】
本発明は、抗Ｎｏｔｃｈ３抗体および抗体−薬物コンジュゲート（ＡＤＣ）を提供する。本発明は、がんを処置するためのこのような抗Ｎｏｔｃｈ３抗体および抗体−薬物コンジュゲートの使用方法も提供する。
【００１０】
一実施形態では、本発明は、配列番号１３のＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３、ならびに配列番号２５のＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３を有する軽鎖可変領域を有する、Ｎｏｔｃｈ３に結合する単離抗体またはその抗原結合性断片を提供する。
【００１１】
別の実施形態では、本発明は、（ａ）細胞内に内部移行する、（ｂ）Ｎｏｔｃｈ３シグナル伝達を阻害しない、または（ｃ）Ｎｏｔｃｈ３シグナル伝達を活性化しない、Ｎｏｔｃｈ３に結合する単離抗体またはその抗原結合性断片を提供する。さらなる実施形態では、本発明は、（ａ）Ｎｏｔｃｈ３  ＮＲＲのＬＮＲ−ＣドメインおよびＨＤ−１ドメインに結合する、（ｂ）Ｎｏｔｃｈ３  ＮＲＲを自己阻害性コンホメーションに維持しない、または（ｃ）Ｓ２切断を阻害しない、Ｎｏｔｃｈ３に結合する単離抗体またはその抗原結合性断片を提供する。
【００１２】
さらなる実施形態では、本発明は、（ａ）配列番号１５または１６を含む重鎖ＣＤＲ１、（ｂ）配列番号１９または２０を含む重鎖ＣＤＲ２、（ｃ）配列番号２３を含む重鎖ＣＤＲ３、（ｄ）配列番号２７を含む軽鎖ＣＤＲ１、（ｅ）配列番号２９を含む軽鎖ＣＤＲ２、および（ｆ）配列番号３１を含む軽鎖ＣＤＲ３を有する、Ｎｏｔｃｈ３に結合する単離抗体またはその抗原結合性断片を提供する。
【００１３】
本発明は、配列番号１３に少なくとも９０％同一な重鎖可変領域アミノ酸配列または配列番号２５に少なくとも９０％同一な軽鎖可変領域アミノ酸配列を有する、Ｎｏｔｃｈ３に結合する単離抗体またはその抗原結合性断片も提供する。
【００１４】
本発明は、配列番号１３の重鎖可変領域アミノ酸配列を有する、Ｎｏｔｃｈ３に結合する単離抗体またはその抗原結合性断片、および配列番号２５の軽鎖可変領域アミノ酸配列を有する、Ｎｏｔｃｈ３に結合する単離抗体またはその抗原結合性断片も提供する。本発明は、配列番号３３の重鎖アミノ酸配列を有する、Ｎｏｔｃｈ３に結合する単離抗体またはその抗原結合性断片、および配列番号３５の軽鎖アミノ酸配列を有する、Ｎｏｔｃｈ３を結合する単離抗体またはその抗原結合性断片も提供する。
【００１５】
別の実施形態では、本発明は、配列番号３７のＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３を含む重鎖可変領域、ならびに配列番号４９のＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３を有する軽鎖可変領域を有する、Ｎｏｔｃｈ３に結合する単離抗体またはその抗原結合性断片を提供する。
【００１６】
さらなる実施形態では、本発明は、（ａ）配列番号３９または４０を含む重鎖ＣＤＲ１、（ｂ）配列番号４３または４４を含む重鎖ＣＤＲ２、（ｃ）配列番号４７を含む重鎖ＣＤＲ３、（ｄ）配列番号５１を含む軽鎖ＣＤＲ１、（ｅ）配列番号５３を含む軽鎖ＣＤＲ２、および（ｆ）配列番号５５を含む軽鎖ＣＤＲ３を有する、Ｎｏｔｃｈ３に結合する単離抗体またはその抗原結合性断片を提供する。
【００１７】
本発明は、配列番号３７に少なくとも９０％同一な重鎖可変領域アミノ酸配列、または配列番号４９に少なくとも９０％同一な軽鎖可変領域アミノ酸配列を有する、Ｎｏｔｃｈ３に結合する単離抗体またはその抗原結合性断片も提供する。
【００１８】
本発明は、配列番号３７の重鎖可変領域アミノ酸配列を有する、Ｎｏｔｃｈ３に結合する単離抗体またはその抗原結合性断片、および配列番号４９の軽鎖可変領域アミノ酸配列を有する、Ｎｏｔｃｈ３に結合する単離抗体またはその抗原結合性断片も提供する。本発明は、配列番号５７の重鎖アミノ酸配列を有する、Ｎｏｔｃｈ３に結合する単離抗体またはその抗原結合性断片、および配列番号５９の軽鎖アミノ酸配列を有する、Ｎｏｔｃｈ３に結合する単離抗体またはその抗原結合性断片も提供する。
【００１９】
本発明はさらに、本発明の抗体またはその抗原結合性断片とＮｏｔｃｈ３への特異的結合について競合する単離抗体を提供する。
【００２０】
本発明はさらに、本発明の任意の抗体またはその抗原結合性断片にコンジュゲートする細胞傷害性剤を有する抗体−薬物コンジュゲートを提供する。
【００２１】
別の実施形態では、本発明は、式：Ａｂ−（Ｌ−Ｄ）ｐの抗体−薬物コンジュゲートまたはその薬学的に許容できる塩であって、式中、Ａｂは、Ｎｏｔｃｈ３に結合する抗体またはその抗原結合性断片であり、Ｌ−Ｄは、リンカー−薬物部分であり、式中、Ｌはリンカーであり、Ｄは薬物であり、ｐは、１から約１２の整数である、抗体−薬物コンジュゲートまたはその薬学的に許容できる塩を提供する。
【００２２】
さらなる実施形態では、本発明は、式：Ａｂ−（Ｌ−Ｄ）ｐの抗体−薬物コンジュゲートまたはその薬学的に許容できる塩であって、式中、Ａｂは、本発明の任意の抗体またはその抗原結合性断片であり、Ｌ−Ｄは、リンカー−薬物部分であり、式中、Ｌはリンカーであり、Ｄは薬物であり、ｐは、１から約１２の整数である、抗体−薬物コンジュゲートまたはその薬学的に許容できる塩を提供する。
【００２３】
別の実施形態では、本発明は、Ｌがｖｃ、ｍｃ、ｍｅ、およびＭａｌＰｅｇ６Ｃ２からなる群から選択される、抗体−薬物コンジュゲートを提供する。
【００２４】
別の実施形態では、本発明は、Ｄが、（ａ）０１０１（２−メチルアラニル−Ｎ−［（３Ｒ，４Ｓ，５Ｓ）−３−メトキシ−１−｛（２Ｓ）−２−［（１Ｒ，２Ｒ）−１−メトキシ−２−メチル−３−オキソ−３−｛［（１Ｓ）−２−フェニル−１−（１，３−チアゾール−２−イル）エチル］アミノ｝プロピル］ピロリジン−１−イル｝−５−メチル−１−オキソヘプタン−４−イル］−Ｎ−メチル−Ｌ−バリンアミド）、（ｂ）６７８０（２−メチルアラニル−Ｎ−［（３Ｒ，４Ｓ，５Ｓ）−１−｛（２Ｓ）−２−［（１Ｒ，２Ｒ）−３−｛［（１Ｓ，２Ｒ）−１−ヒドロキシ−１−フェニルプロパン−２−イル］アミノ｝−１−メトキシ−２−メチル−３−オキソプロピル］ピロリジン−１−イル｝−３−メトキシ−５−メチル−１−オキソヘプタン−４−イル］−Ｎ−メチル−Ｌ−バリンアミド）、（ｃ）０１３１（２−メチル−Ｌ−プロリル−Ｎ−［（３Ｒ，４Ｓ，５Ｓ）−１−｛（２Ｓ）−２−［（１Ｒ，２Ｒ）−３−｛［（１Ｓ）−１−カルボキシ−２−フェニルエチル］アミノ｝−１−メトキシ−２−メチル−３−オキソプロピル］ピロリジン−１−イル｝−３−メトキシ−５−メチル−１−オキソヘプタン−４−イル］−Ｎ−メチル−Ｌ−バリンアミドトリフルオロ酢酸塩）、（ｄ）３３７７（Ｎ，２−ジメチルアラニル−Ｎ−｛（１Ｓ，２Ｒ）−４−｛（２Ｓ）−２−［（１Ｒ，２Ｒ）−３−｛［（１Ｓ）−１−カルボキシ−２−フェニルエチル］アミノ｝−１−メトキシ−２−メチル−３−オキソプロピル］ピロリジン−１−イル｝−２−メトキシ−１−［（１Ｓ）−１−メチルプロピル］−４−オキソブチル｝−Ｎ−メチル−Ｌ−バリンアミドトリフルオロ酢酸塩）、および（ｅ）８２６１（２−メチルアラニル−Ｎ−［（３Ｒ，４Ｓ，５Ｓ）−１−｛（２Ｓ）−２−［（１Ｒ，２Ｒ）−３−｛［（１Ｓ）−１−カルボキシ−２−フェニルエチル］アミノ｝−１−メトキシ−２−メチル−３−オキソプロピル］ピロリジン−１−イル｝−３−メトキシ−５−メチル−１−オキソヘプタン−４−イル］−Ｎ−メチル−Ｌ−バリンアミド）からなる群から選択される、抗体−薬物コンジュゲートを提供する。
【００２５】
本発明はさらに、Ｌ−Ｄが、式：
【００２６】
【化１】
2017186337.tif 000002
を有するｖｃ０１０１、
および式：
【００２７】
【化２】
2017186337.tif 000003
を有するｖｃ６７８０
からなる群から選択される、抗体−薬物コンジュゲートを提供する。
【００２８】
別の実施形態では、本発明は、Ａｂが、（ａ）配列番号１３のＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３を有する重鎖可変領域、ならびに（ｂ）配列番号２５のＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３を有する軽鎖可変領域を含む、抗体−薬物コンジュゲートを提供する。
【００２９】
本発明はさらに、Ａｂが、（ａ）配列番号１５を含む重鎖ＣＤＲ１、（ｂ）配列番号１９を含む重鎖ＣＤＲ２、（ｃ）配列番号２３を含む重鎖ＣＤＲ３、（ｄ）配列番号２７を含む軽鎖ＣＤＲ１、（ｅ）配列番号２９を含む軽鎖ＣＤＲ２、および（ｆ）配列番号３１を含む軽鎖ＣＤＲ３を含む、抗体−薬物コンジュゲートを提供する。
【００３０】
別の実施形態では、本発明は、Ａｂが、（ａ）配列番号３７のＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３を含む重鎖可変領域、ならびに（ｂ）配列番号４９のＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３を含む軽鎖可変領域を含む、抗体−薬物コンジュゲートを提供する。
【００３１】
本発明はさらに、Ａｂが、（ａ）配列番号３９を含む重鎖ＣＤＲ１、（ｂ）配列番号４３を含む重鎖ＣＤＲ２、（ｃ）配列番号４７を含む重鎖ＣＤＲ３、（ｄ）配列番号５１を含む軽鎖ＣＤＲ１、（ｅ）配列番号５３を含む軽鎖ＣＤＲ２、および（ｆ）配列番号５５を含む軽鎖ＣＤＲ３を含む、抗体−薬物コンジュゲートを提供する。
【００３２】
本発明はさらに、Ａｂが、ＫａｂａｔのＥＵインデックスによる、（ａ）配列番号６１で示されるＬ４４３位での１つのアミノ酸置換、ならびに（ｂ）配列番号６５で示されるＬ４４３位およびＫ３９２位での２つのアミノ酸置換からなる群から選択される、改変されたヒトＩｇＧ１重鎖定常ドメイン（Ｃｙ）ポリペプチドを含む、抗体−薬物コンジュゲートを提供する。
【００３３】
本発明はさらに、Ａｂが、ＫａｂａｔのＥＵインデックスによる、配列番号６３で示されるκＫ１８３位での１つのアミノ酸置換を有する、改変されたヒトカッパ軽鎖定常ドメイン（ＣＫ）ポリペプチドを含む、抗体−薬物コンジュゲートを提供する。
【００３４】
本発明はさらに、本発明の任意の抗体もしくはその抗原結合性断片、または本発明の任意の抗体−薬物コンジュゲート、および薬学的に許容できる担体を有する医薬組成物を提供する。
【００３５】
さらに、本発明は、それを必要とする患者においてＮｏｔｃｈ３の発現に関連する状態を処置する方法であって、本発明の任意の抗体−薬物コンジュゲートまたは医薬組成物を患者に投与するステップを含む、方法を提供する。本発明は、がんが固形腫瘍がんである、がんを処置する方法も提供する。さらに、本発明は、肺がん、乳がん、卵巣がん、胃がん、食道がん、子宮頚がん、頭頚部がん、膀胱がん、肝臓がん、皮膚がん、および肉腫を含むがそれだけに限らない固形腫瘍がんを処置する方法を提供する。本発明は、がんが、Ｔ細胞悪性腫瘍、Ｔ細胞白血病、Ｔ細胞リンパ腫、Ｔ細胞急性リンパ芽性白血病、多発性骨髄腫、Ｂ細胞悪性腫瘍、骨髄性悪性腫瘍、急性骨髄性白血病、および慢性骨髄性白血病を含むがそれだけに限らない血液がんである、がんを処置する方法も提供する。
【００３６】
本発明は、療法で使用するための本発明の任意の抗体−薬物コンジュゲートまたは医薬組成物を提供する。本発明はさらに、がんが固形腫瘍がんである、療法で使用するための本発明の任意の抗体−薬物コンジュゲートまたは医薬組成物を提供する。本発明は、固形腫瘍がんが、肺がん、乳がん、卵巣がん、胃がん、食道がん、子宮頚がん、頭頚部がん、膀胱がん、肝臓がん、皮膚がん、および肉腫を含むがそれだけに限らない、療法で使用するための本発明の任意の抗体−薬物コンジュゲートまたは医薬組成物も提供する。本発明は、がんが、Ｔ細胞悪性腫瘍、Ｔ細胞白血病、Ｔ細胞リンパ腫、Ｔ細胞急性リンパ芽性白血病、多発性骨髄腫、Ｂ細胞悪性腫瘍、骨髄性悪性腫瘍、急性骨髄性白血病、および慢性骨髄性白血病を含むがそれだけに限らない血液がんである、療法で使用するための本発明の任意の抗体−薬物コンジュゲートまたは医薬組成物も提供する。本発明はさらに、療法用医薬の製造における本発明の任意の抗体−薬物コンジュゲートの使用を提供する。本発明はさらに、Ｎｏｔｃｈ３発現がんを処置するためのものである、本発明の任意の抗体−薬物コンジュゲートの使用を提供する。
【００３７】
本発明はさらに、本発明のＮｏｔｃｈ３抗体またはその抗原結合性断片をコードする核酸、前記核酸を含むベクター、および前記ベクターを含む宿主細胞を提供する。本発明は、本発明のＮｏｔｃｈ３抗体を生産するための方法であって、上述したベクターを含む宿主細胞を培養するステップと、細胞培養物から抗体を回収するステップとを含む、方法も提供する。
【００３８】
別の実施形態では、本発明は、本発明の抗体−薬物コンジュゲートを生産するための方法であって、ＬをＤに連結するステップと、Ｌ−Ｄを本発明の培養物から回収した抗体にコンジュゲートするステップと、抗体−薬物コンジュゲートを精製するステップとを含む、方法を提供する。
【００３９】
本発明はさらに、Ｎｏｔｃｈ３に特異的に結合する本発明の抗体またはその抗原結合性断片を有する抗体−薬物コンジュゲートを提供する。
【００４０】
さらなる実施形態では、本発明は、がんを有する対象が本発明の任意の抗体−薬物コンジュゲートに応答するか否かを予測するための方法であって、対象に由来する生体試料がＮｏｔｃｈ３を発現するか否かを判定するステップによる、方法を提供する。
【００４１】
本発明はさらに、生体試料中のＮｏｔｃｈ３のレベルを判定する方法であって、がんを有すると疑われる対象に由来する試料を本発明の任意の抗体またはその抗原結合性断片と接触させるステップと、試料に対してＮｏｔｃｈ３の細胞表面レベルを判定するステップと、Ｎｏｔｃｈ３の細胞表面レベルを参照対象または標準物質のものと比較するステップとを含む、方法を提供する。
【図面の簡単な説明】
【００４２】
【図１】ＡｖｉおよびＨｉｓタグを有する、組換えの、Ｓ１切断された、ヘテロ二量体のＮｏｔｃｈ３  ＮＲＲタンパク質免疫原の概略図を示す図である。
【図２】精製されたヒトおよびマウスＮｏｔｃｈ３  ＮＲＲ組換えタンパク質のアミノ酸配列およびヌクレオチド配列を示す図である。
【図３】ｒ２８抗体およびｒ７５抗体の可変領域のアミノ酸配列およびヌクレオチド配列を示す図である（ＣＤＲに下線が引かれている）。
【図４Ａ】ｈｕ２８  ＶＨ  １．０およびＣＤＲ（ＫａｂａｔおよびＣｈｏｔｈｉａ）のアミノ酸配列およびヌクレオチド配列を示す図である。
【図４Ｂ】ｈｕ２８  ＶＬ  １．０およびＣＤＲ（ＫａｂａｔおよびＣｈｏｔｈｉａ）のアミノ酸配列およびヌクレオチド配列を示す図である。
【図４Ｃ】ｈｕ２８  ＨＣ  １．０およびＬＣ  １．０のアミノ酸配列およびヌクレオチド配列を示す図である。
【図５Ａ】ｈｕ７５  ＶＨ１．９およびＣＤＲ（ＫａｂａｔおよびＣｈｏｔｈｉａ）のアミノ酸配列およびヌクレオチド配列を示す図である。
【図５Ｂ】ｈｕ７５  ＶＬ１．３およびＣＤＲ（ＫａｂａｔおよびＣｈｏｔｈｉａ）のアミノ酸配列およびヌクレオチド配列を示す図である。
【図５Ｃ】ｈｕ７５  ＨＣ１．９およびＬＣ１．３のアミノ酸配列およびヌクレオチド配列を示す図である。
【図６】抗Ｎｏｔｃｈ３抗体ｃｈ２８およびｃｈ７５のエピトープマッピングのための組換えヒトＮｏｔｃｈ１  ＮＲＲおよびＮｏｔｃｈ３  ＮＲＲドメイン交換キメラ構築物を示す図である。
【図７】Ｄ１１Ｂ８抗体を用いるＮｏｔｃｈ３陽性細胞系および陰性細胞系のウェスタンブロット分析を示す図である。
【図８Ａ】０時間目での、ＭＤＡ−ＭＢ−４６８乳がん細胞における、抗Ｎｏｔｃｈ３抗体ｈｕ７５−Ａｌｅｘａ４８８の細胞膜局在化、およびｐＨｒｏｄｏ（商標）レッドデキストランでの酸性小胞の標識を示す図である。
【図８Ｂ】５時間目での、ＭＤＡ−ＭＢ−４６８乳がん細胞における、抗Ｎｏｔｃｈ３抗体ｈｕ７５−Ａｌｅｘａ４８８の細胞内輸送、およびｐＨｒｏｄｏ（商標）レッドデキストランとの共局在化（矢印）を示す図である。
【図８Ｃ】０時間目での、ＭＤＡ−ＭＢ−４６８乳がん細胞における、抗Ｎｏｔｃｈ３抗体ｈｕ２８−ＤｙＬｉｇｈｔ６５０の細胞膜局在化、およびｐＨｒｏｄｏ（商標）レッドデキストランでの酸性小胞の標識（細胞内点）を示す図である。
【図８Ｄ】８時間目での、ＭＤＡ−ＭＢ−４６８乳がん細胞における、抗Ｎｏｔｃｈ３抗体ｈｕ２８−ＤｙＬｉｇｈｔ６５０の細胞内輸送、およびｐＨｒｏｄｏ（商標）レッドデキストランとの共局在化（矢印）を示す図である。
【図８Ｅ】経時的な、ＭＤＡ−ＭＢ−４６８細胞における、ｈｕ２８−ＤｙＬｉｇｈｔ６５０およびｐＨｒｏｄｏ（商標）レッドデキストラン蛍光標識の重複または共局在化の程度を実証する、ピアソンの相関係数を示す図である。
【図９】抗Ｎｏｔｃｈ３  ｈｕ２８およびｈｕ７５で処置したＨＣＣ２４２９細胞およびＭＤＡ−ＭＢ−４６８細胞を用いるＳ２切断アッセイのウェスタンブロット分析を示す図である。Ｍ．Ｗ．＝分子量。
【図１０】抗Ｎｏｔｃｈ３  ｈｕ２８−ｖｃ０１０１でのＯＶＣＡＲ３卵巣がん細胞の処置が、ホスホヒストンＨ３染色によって同定された有糸分裂細胞における微小管（抗アルファチューブリン抗体で染色された）を破壊することを示す図である。
【図１１】２〜３匹のマウス（Ｍ）から回収された異種移植片に由来するＮｏｔｃｈ３−ＥＣＤのウェスタンブロット分析を示す図である。
【図１２】３７６２２Ａ１  ＮＳＣＬＣ患者由来の異種移植片モデルにおける、５ｍｇ／ｋｇの用量のシスプラチンと比較した、３ｍｇ／ｋｇの用量の抗Ｎｏｔｃｈ３  ｈｕ２８−ｖｃ０１０１およびｈｕ７５−ｖｃ０１０１の有効性を示す図である。
【図１３Ａ】ＭＤＡ−ＭＢ−４６８乳房モデルにおける抗Ｎｏｔｃｈ３  ｈｕ２８−ｖｃ０１０１の有効性を示す図である。
【図１３Ｂ】ＭＤＡ−ＭＢ−４６８乳房モデルにおける抗Ｎｏｔｃｈ３  ｈｕ７５−ｖｃ０１０１の有効性を示す図である。
【図１４Ａ】ＭＤＡ−ＭＢ−４６８乳房モデルにおける抗Ｎｏｔｃｈ３  ｈｕ２８−ｖｃ６７８０の有効性を示す図である。
【図１４Ｂ】ＭＤＡ−ＭＢ−４６８乳房モデルにおける抗Ｎｏｔｃｈ３  ｈｕ７５−ｖｃ６７８０の有効性を示す図である。
【図１５】ＯＶＣＡＲ３卵巣モデルにおける抗Ｎｏｔｃｈ３  ｈｕ２８−ｖｃ０１０１の有効性を示す図である。
【図１６Ａ】ＨＣＣ２４２９肺異種移植片における、５ｍｇ／ｋｇで投薬されたラット−ヒトキメラ抗Ｎｏｔｃｈ３抗体−薬物コンジュゲートの有効性を示す図である。
【図１６Ｂ】ＭＤＡ−ＭＢ−４６８乳房異種移植片における、５ｍｇ／ｋｇで投薬されたラット−ヒトキメラ抗Ｎｏｔｃｈ３抗体−薬物コンジュゲートの有効性を示す図である。
【図１６Ｃ】ＭＤＡ−ＭＢ−４６８乳房異種移植片における、５ｍｇ／ｋｇで投薬されたラット−ヒトキメラ抗Ｎｏｔｃｈ３抗体−薬物コンジュゲートの有効性を示す図である。
【図１６Ｄ】Ｎ８７胃異種移植片における、５ｍｇ／ｋｇで投薬されたラット−ヒトキメラ抗Ｎｏｔｃｈ３抗体−薬物コンジュゲートの有効性を示す図である。
【図１６Ｅ】Ｎ８７胃異種移植片における、５ｍｇ／ｋｇで投薬されたラット−ヒトキメラ抗Ｎｏｔｃｈ３抗体−薬物コンジュゲートの有効性を示す図である。
【図１７Ａ】単一システイン変異体ｈｕ２８  ＨＣ  １．０  Ｌ４４３Ｃおよびｈｕ２８  ＬＣ  １．０  κＫ１８３Ｃのアミノ酸配列およびヌクレオチド配列を示す図である。
【図１７Ｂ】二重システイン変異体ｈｕ２８  ＨＣ  １．０  Ｌ４４３Ｃ／Ｋ３９２Ｃのアミノ酸配列およびヌクレオチド配列を示す図である。
【発明を実施するための形態】
【００４３】
本発明は、がんを処置するための抗Ｎｏｔｃｈ３抗体またはその抗原結合性断片、および抗体−薬物コンジュゲート（ＡＤＣ）を提供する。本発明がより容易に理解されるために、ある特定の用語および一般的な技法を最初に定義する。
【００４４】
本開示で使用されるすべてのアミノ酸の略語は、連邦規則法典第３７巻§１．８２２（ｄ）（１）に示された米国特許商標庁によって認められているものである。
【００４５】
本明細書で別段の定義のない限り、本発明に関連して使用される科学用語および技術用語は、当業者によって一般に理解される意味を有するものとする。さらに、脈絡による別段の要求のない限り、単数形の用語は、複数存在することを含むものとし、複数形の用語は、単数形を含むものとする。一般に、本明細書に記載の細胞および組織培養、分子生物学、免疫学、微生物学、遺伝学、ならびにタンパク質および核酸化学、ならびにハイブリダイゼーションに関連して使用される命名法、ならびにこれらの技法は、当技術分野で周知であり、一般に使用されるものである。
【００４６】
本発明の方法および技法は一般に、別段の指定のない限り、当技術分野で周知であり、かつ本明細書全体にわたって引用され、論じられている様々な一般的な、およびより具体的な参考文献に記載されている従来法に従って実施される。例えば、Ｓａｍｂｒｏｏｋ  Ｊ．＆Ｒｕｓｓｅｌｌ  Ｄ．、Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｃｌｏｎｉｎｇ：Ａ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｍａｎｕａｌ、３版、Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｏｒ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｐｒｅｓｓ、Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｏｒ、Ｎ．Ｙ．（２０００）、Ａｕｓｕｂｅｌら、Ｓｈｏｒｔ  Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ  ｉｎ  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｂｉｏｌｏｇｙ：Ａ  Ｃｏｍｐｅｎｄｉｕｍ  ｏｆ  Ｍｅｔｈｏｄｓ  ｆｒｏｍ  Ｃｕｒｒｅｎｔ  Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ  ｉｎ  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｂｉｏｌｏｇｙ、Ｗｉｌｅｙ，Ｊｏｈｎ＆Ｓｏｎｓ，  Ｉｎｃ．（２００２）、ＨａｒｌｏｗおよびＬａｎｅ、Ｕｓｉｎｇ  Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ：Ａ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｍａｎｕａｌ、Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｏｒ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｐｒｅｓｓ、Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｏｒ、Ｎ．Ｙ．（１９９８）、ならびにＣｏｌｉｇａｎら、Ｓｈｏｒｔ  Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ  ｉｎ  Ｐｒｏｔｅｉｎ  Ｓｃｉｅｎｃｅ、Ｗｉｌｅｙ，Ｊｏｈｎ＆Ｓｏｎｓ，Ｉｎｃ．（２００３）を参照。
【００４７】
「Ｎｏｔｃｈ３」または「Ｎｏｔｃｈ−３」は、ヒトＮｏｔｃｈ３タンパク質の天然のもの、バリアント、アイソフォーム、および種ホモログを指す。天然のヒトＮｏｔｃｈ３タンパク質は、例えば、リーダーペプチド、大きな上皮成長因子（ＥＧＦ）様反復領域、３つのＬｉｎ１２反復、Ｎ末端ヘテロ二量体化ドメイン（ＨＤ−１）、Ｃ末端ヘテロ二量体化ドメイン（ＨＤ−２）、膜貫通（ＴＭ）配列、および細胞内ドメイン（Ｎｏｔｃｈ３ＩＣＤ）から構成される。全長ヒトＮｏｔｃｈ３のＮＣＢＩ／ＧｅｎＢａｎｋ受託番号は、ＮＭ＿０００４３５．２である。
【００４８】
本明細書において用いられる「Ｎｏｔｃｈ３負調節領域」または「Ｎｏｔｃｈ３  ＮＲＲ」は、別段の指定のない限り、３つのＬｉｎ１２ドメインと、３つのＬｉｎ１２ドメインの間に位置する１つまたは複数のアミノ酸配列と、さらにＮｏｔｃｈ３のＨＤ１ドメインおよびＨＤ２ドメインとからなる、Ｎｏｔｃｈ３の任意の天然または合成ポリペプチド領域を指す。一実施形態では、「Ｎｏｔｃｈ３  ＮＲＲ」は、３つのＬｉｎ１２ドメインと２つのヘテロ二量体化ドメインＨＤ−１およびＨＤ−２とを含み、Ｎｏｔｃｈ３のＨＤ−１ドメインおよびＨＤ−２ドメインは共有結合しており、フーリン様プロテアーゼによって未だ切断されていない（Ｓ１切断の前）。別の実施形態では、「Ｎｏｔｃｈ３  ＮＲＲ」は、３つのＬｉｎ１２ドメインと２つのヘテロ二量体化ドメインＨＤ−１およびＨＤ−２とを含み、ＨＤ−１ドメインおよびＨＤ−２ドメインは、非共有結合している（Ｓ１切断の後）。この実施形態の一態様では、ＨＤ−２ドメイン内のＳ２部位は、ＡＤＡＭ型のメタロプロテアーゼによって切断されていない。この実施形態の別の特定の態様では、ＨＤ−２ドメイン内のＳ２部位は、ＡＤＡＭ型のメタロプロテアーゼによって切断されているところであるか、または既に切断されている（Ｇｏｒｄｏｎ，Ｗ．Ｒ．ら、Ｎａｔｕｒｅ  Ｓｔｒｕｃｔｕｒａｌ  ＆  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｂｉｏｌｏｇｙ、２００７、ｖｏｌｕｍｅ  １４、２９５〜３００）。
【００４９】
「抗体」または「Ａｂ」は、免疫グロブリン分子であって、この免疫グロブリン分子の可変領域内に位置した少なくとも１つの抗原認識部位によって標的、例えば、炭水化物、ポリヌクレオチド、脂質、ポリペプチドなどに特異的に結合することができる、免疫グロブリン分子である。本明細書において、用語「抗体」は、インタクトなポリクローナルまたはモノクローナル抗体だけでなく、所与の抗原（例えば、標的Ｎｏｔｃｈ３）に特異的に結合する能力を維持しているインタクトな抗体の任意の抗原結合性部分（例えば、「抗原結合性断片」）、またはその単鎖、抗体を含む融合タンパク質、および抗原認識部位を含む免疫グロブリン分子の任意の他の修飾された配置、例えば、限定することなく、Ｆａｂ断片、Ｆａｂ’断片、Ｆ（ａｂ’）２断片、Ｆｄ断片、Ｆｖ断片、単一ドメイン抗体（ｄＡｂ）断片、単離された相補性決定領域（ＣＤＲ）、単鎖（ｓｃＦｖ）および単一ドメイン抗体（例えば、サメおよびラクダ抗体）、マキシボディ、ミニボディ、イントラボディ、ダイアボディ、トリアボディ、テトラボディ、ｖ−ＮＡＲ、ならびにビス−ｓｃＦｖを包含する（例えば、Ｈｏｌｌｉｎｇｅｒ  ａｎｄ  Ｈｕｄｓｏｎ、２００５、Ｎａｔｕｒｅ  Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ  ２３（９）：１１２６〜１１３６を参照）。抗体には、任意のクラスの抗体、例えば、ＩｇＧ、ＩｇＡ、もしくはＩｇＭ（またはこれらのサブクラス）などが含まれ、抗体は、任意の特定のクラスのものである必要はない。その重鎖の定常領域の抗体アミノ酸配列に応じて、免疫グロブリンは、異なるクラスに割り当てることができる。免疫グロブリンの５つの主要なクラス：ＩｇＡ、ＩｇＤ、ＩｇＥ、ＩｇＧ、およびＩｇＭが存在し、これらのいくつかは、サブクラス（アイソタイプ）、例えば、ＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３、ＩｇＧ４、ＩｇＡ１、およびＩｇＡ２にさらに分類されうる。免疫グロブリンの異なるクラスに対応する重鎖（ＨＣ）定常領域は、アルファ、デルタ、イプシロン、ガンマ、およびミューとそれぞれ呼ばれる。免疫グロブリンの異なるクラスのサブユニット構造および３次元配置は、周知である。
【００５０】
「単離抗体」は、異なる抗原特異性を有する他の抗体を実質的に含まない抗体を指す（例えば、Ｎｏｔｃｈ３を特異的に結合する単離抗体は、Ｎｏｔｃｈ３以外の抗原を特異的に結合する抗体を実質的に含まない）。Ｎｏｔｃｈ３を特異的に結合する単離抗体は、しかし、他の種に由来する他の抗原、例えばＮｏｔｃｈ３分子に対する交差反応性を有しうる。さらに、単離抗体は、他の細胞物質および／または化学物質を実質的に含まない可能性がある。
【００５１】
抗体の「可変領域」は、単独で、または組み合わせて、抗体軽鎖の可変領域（ＶＬ）または抗体重鎖の可変領域（ＶＨ）を指す。当技術分野で公知であるように、重鎖および軽鎖の可変領域はそれぞれ、超可変領域としても公知である３つの相補性決定領域（ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３）によって接続された４つのフレームワーク領域（ＦＲ：ｆｒａｍｅｗｏｒｋ  ｒｅｇｉｏｎ）からなり、抗体の抗原結合性部位の形成に寄与する。特にＣＤＲ領域の外側（すなわち、フレームワーク領域内）のアミノ酸残基内に置換を有する、対象可変領域のバリアントが望まれる場合、適切なアミノ酸置換、好ましくは保存的アミノ酸置換は、対象可変領域を、対象可変領域と同じカノニカルクラス内のＣＤＲ１およびＣＤＲ２配列を含有する他の抗体の可変領域と比較することによって同定することができる（ＣｈｏｔｈｉａおよびＬｅｓｋ、Ｊ  Ｍｏｌ  Ｂｉｏｌ、１９６（４）：９０１〜９１７、１９８７）。対象ＣＤＲに隣接するようにＦＲを選択するとき、例えば、抗体をヒト化または最適化するとき、同じカノニカルクラス内のＣＤＲ１およびＣＤＲ２配列を含有する抗体に由来するＦＲが好適である。
【００５２】
可変ドメインの「ＣＤＲ」は、Ｋａｂａｔ、Ｃｈｏｔｈｉａ、ＫａｂａｔおよびＣｈｏｔｈｉａの両方の蓄積、ＡｂＭ、接触、ならびに／もしくはコンホメーション定義の定義、または当技術分野で周知のＣＤＲの決定の任意の方法に従って同定される可変領域内のアミノ酸残基である。抗体ＣＤＲは、Ｋａｂａｔらによって最初に定義された超可変領域として同定することができる。例えば、Ｋａｂａｔら、１９９２、Ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ  ｏｆ  Ｐｒｏｔｅｉｎｓ  ｏｆ  Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｉｃａｌ  Ｉｎｔｅｒｅｓｔ、５版、Ｐｕｂｌｉｃ  Ｈｅａｌｔｈ  Ｓｅｒｖｉｃｅ、ＮＩＨ、Ｗａｓｈｉｎｇｔｏｎ  Ｄ．Ｃ．を参照。ＣＤＲの位置は、Ｃｈｏｔｈｉａらによって最初に記載された構造的ループ構造としても同定することができる。例えば、Ｃｈｏｔｈｉａら、１９８９、Ｎａｔｕｒｅ、３４２：８７７〜８８３を参照。ＣＤＲ同定の他の手法には、ＫａｂａｔとＣｈｏｔｈｉａの折衷であり、Ｏｘｆｏｒｄ  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ製ＡｂＭ抗体モデル化ソフトウェア（現在ではＡｃｃｅｌｒｙｓ（登録商標））を使用して導出される「ＡｂＭ定義」、またはＭａｃＣａｌｌｕｍら、１９９６、Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．、２６２：７３２〜７４５に示された、観察される抗原接触に基づくＣＤＲの「接触定義」がある。ＣＤＲの「コンホメーション定義」として本明細書で呼ばれる別の手法では、ＣＤＲの位置は、抗原結合にエンタルピー的寄与をする残基として同定されうる。例えば、Ｍａｋａｂｅら、２００８、Ｊｏｕｒｎａｌ  ｏｆ  Ｂｉｏｌｏｇｉｃａｌ  Ｃｈｅｍｉｓｔｒｙ、２８３：１１５６〜１１６６を参照。さらに他のＣＤＲ境界定義は、上記手法の１つに厳密に従わない場合があるが、特定の残基もしくは残基の群、またはさらにはＣＤＲ全体が抗原結合に著しく影響を与えないという予測または実験的知見を踏まえて、短く、または長くなっていることがあるものの、それでもやはりＫａｂａｔ  ＣＤＲの少なくとも一部と重複する。本明細書において、ＣＤＲは、手法の組合せを含めて当技術分野で公知の任意の手法によって定義されるＣＤＲを指すことができる。本明細書で使用される方法は、これらの手法のいずれかによって定義されるＣＤＲを利用することができる。１つを超えるＣＤＲを含有する任意の所与の実施形態について、ＣＤＲは、Ｋａｂａｔ、Ｃｈｏｔｈｉａ、拡張、ＡｂＭ、接触、および／またはコンホメーション定義のいずれかに従って定義されうる。
【００５３】
本明細書で互換的に使用される用語「ＩｇＧ  Ｆｃ領域」、「Ｆｃ領域」、「Ｆｃドメイン」、および「Ｆｃ」は、ＩｇＧ分子のパパイン消化によって得られる結晶化可能断片に相関するＩｇＧ分子の一部を指す。Ｆｃ領域は、ジスルフィド結合によって連結されたＩｇＧ分子の２本の重鎖のＣ末端の半分からなる。これは、抗原結合性活性をまったく有さないが、炭水化物部分、ならびに補体およびＦｃＲｎ受容体を含めたＦｃ受容体の結合部位を含有する（以下を参照）。Ｆｃ断片は、第２の定常ドメインＣＨ２全体（Ｋａｂａｔ番号付けシステムによるヒトＩｇＧ１の残基２３１〜３４０）、および第３の定常ドメインＣＨ３（残基３４１〜４４７）を含有する。
【００５４】
本明細書で互換的に使用される用語「改変されたＦｃポリペプチド」、「改変されたＦｃ領域」、および「改変されたＦｃ」は、少なくとも１つの変異、例えば、アミノ酸置換を含み、コンジュゲーションのための部位を導入しているＦｃポリペプチドまたはその部分を意味する。好ましくは、変異は、その位置で天然に存在するアミノ酸残基の代わりにシステインを導入し、この場合変異は、Ｆｃに１つの部分をコンジュゲートするための反応部位（例えば、反応性スルフヒドリル基）を作り出す。
【００５５】
用語「モノクローナル抗体」または「ｍＡｂ」は、例えば、任意の真核生物、原核生物、またはファージクローンを含めた単一のコピーまたはクローンから得られるが、それが生成される方法から得られない抗体を指す。好ましくは、本発明のモノクローナル抗体は、均質または実質的に均質な集団内に存在する。
【００５６】
「ヒト化」抗体は、非ヒト免疫グロブリンに由来する最小配列を含有するキメラ免疫グロブリン、免疫グロブリン鎖、またはこれらの断片（Ｆｖ、Ｆａｂ、Ｆａｂ’、Ｆ（ａｂ’）２、もしくは抗体の他の抗原結合性部分配列など）である非ヒト（例えば、ラット）抗体の形態を指す。好ましくは、ヒト化抗体は、レシピエントの相補性決定領域（ＣＤＲ）に由来する残基が、所望の特異性、親和性、および能力を有する非ヒト種（ドナー抗体）、例えば、マウス、ラット、またはウサギなどのＣＤＲに由来する残基によって置き換えられているヒト免疫グロブリン（レシピエント抗体）である。
【００５７】
「ヒト抗体または完全ヒト抗体」は、ヒト抗体遺伝子を担持するトランスジェニックマウスまたはヒト細胞に由来する抗体を指す。
【００５８】
用語「キメラ抗体」は、可変領域配列が１つの種に由来し、定常領域配列が別の種に由来する抗体、例えば、可変領域配列がラット抗体に由来し、定常領域配列がヒト抗体に由来する抗体などを指すように意図されている。
【００５９】
「治療剤」は、がん細胞または活性化免疫細胞に対して細胞傷害性効果、細胞増殖抑制効果、および／または免疫調節効果を発揮する作用物質である。治療剤の例としては、細胞傷害性剤、化学療法剤、細胞増殖抑制剤、および免疫調節剤がある。
【００６０】
「化学療法剤」は、がんの処置において有用な化学化合物である。
【００６１】
「細胞傷害性効果」は、標的細胞の枯渇、排除、および／または死滅を指す。「細胞傷害性剤」は、細胞に対して細胞傷害性効果および／または細胞増殖抑制効果を有する作用物質を指す。
【００６２】
「細胞増殖抑制効果」は、細胞増殖の阻害を指す。「細胞増殖抑制剤」は、細胞に対する細胞増殖抑制効果を有し、それによって細胞の特定のサブセットの増殖および／または拡張を阻害する作用物質を指す。
【００６３】
「抗体−薬物コンジュゲート」または「ＡＤＣ（ａｎｔｉｂｏｄｙ−ｄｒｕｇ  ｃｏｎｊｕｇａｔｅ）」は、Ｎｏｔｃｈ３に結合し、細胞傷害性剤、細胞増殖抑制剤、および／または治療剤とコンジュゲートされている抗体誘導体を含めた抗体またはこれらの抗体断片を指す。
【００６４】
「抗Ｎｏｔｃｈ３抗体−薬物コンジュゲート」または「抗Ｎｏｔｃｈ３−ＡＤＣ」は、リンカー（Ｌ）を介して薬物（Ｄ）に連結された本明細書に記載の抗Ｎｏｔｃｈ３抗体またはその抗原結合性断片を指す。
【００６５】
「リンカー（Ｌ）」は、抗体の薬物への直接的または間接的連結を記述する。リンカーの抗体への付着は、様々な方法で、例えば、表面リシン、酸化された炭水化物への還元的カップリング、および鎖間ジスルフィド連結を還元することによって遊離されたシステイン残基などによって達成されうる。ヒドラゾン、ジスルフィド、およびペプチドベース連結を含めた様々な抗体−薬物コンジュゲート連結系が当技術分野で公知である。
【００６６】
「薬物（Ｄ）」は、生物学的または検出可能な活性を有する任意の物質、例えば、治療剤、検出可能標識、結合剤など、およびｉｎ  ｖｉｖｏで活性剤に代謝されるプロドラッグである。薬物、ペイロード、および化合物という用語は、互換的に使用される。
【００６７】
「Ｌ−Ｄ」は、リンカー（Ｌ）に連結した薬物（Ｄ）から生じるリンカー薬物部分である。
【００６８】
用語「エピトープ」は、抗体の抗原結合性領域の１つまたは複数において抗体によって認識され得、結合されうる分子の部分を指す。エピトープは、分子の化学的に活性な表面基、例えば、アミノ酸または糖側鎖などからなり、特定の３次元構造特性および特定の帯電特性を有することが多い。用語「抗原エピトープ」は、本明細書において、当技術分野で周知の任意の方法、例えば、慣例的なイムノアッセイによって判定される場合に抗体が特異的に結合することができるポリペプチドの部分として定義される。「非直線エピトープ」または「立体構造エピトープ」は、エピトープに特異的な抗体が結合する抗原タンパク質内に非連続的なポリペプチド（またはアミノ酸）を含む。抗原上の所望のエピトープが決定されると、例えば、本明細書に記載の技法を使用してそのエピトープに対する抗体を生成することが可能である。発見プロセスの間に、抗体の生成および特徴付けにより、望ましいエピトープについての情報を解明することができる。この情報から、次いで同じエピトープへの結合について抗体を競合的にスクリーニングすることが可能である。これを実現する一手法は、競合および交差競合試験を行って、互いに競合または交差競合する抗体、例えば、抗原への結合について競合する抗体を見つけることである。
【００６９】
用語「結合親和性（ＫＤ）」は、本明細書において、特定の抗原−抗体相互作用の解離速度を指すように意図されている。ＫＤは、「オフ速度（ｋｄ）」とも呼ばれる解離の速度と結合速度または「オン速度（ｋａ）」の比である。したがってＫＤは、ｋｄ／ｋａに等しく、モル濃度（Ｍ）として表される。ＫＤが小さいほど結合の親和性がより強いことになる。したがって、１μＭのＫＤは、１ｎＭのＫＤと比較して弱い結合親和性を示す。抗体のＫＤ値は、当技術分野で十分確立した方法を使用して判定されうる。抗体のＫＤを判定するための一方法は、Ｂｉａｃｏｒｅ（登録商標）システムなどのバイオセンサーシステムを一般に使用する表面プラズモン共鳴を使用することによるものである。
【００７０】
標的（例えば、Ｎｏｔｃｈ３タンパク質）に「優先的に結合する」または「特異的に結合する」（本明細書で互換的に使用される）抗体、抗体コンジュゲート、またはポリペプチドは、当技術分野で良く理解されている用語であり、このような特異的または優先的な結合を判定する方法も当技術分野で周知である。分子は、それが、別の細胞または物質とするよりも、特定の細胞または物質と、より頻繁に、より迅速に、より優れた持続時間で、かつ／またはより優れた親和性で反応または関連する場合、「特異的結合」または「優先的結合」を示すと言われる。抗体は、それが、他の物質に結合するよりも、より優れた親和性、アビディティで、より容易に、かつ／またはより優れた持続時間で結合する場合、標的に「特異的に結合する」または「優先的に結合する」。例えば、Ｎｏｔｃｈ３エピトープに特異的にまたは優先的に結合する抗体は、それが他のＮｏｔｃｈ３エピトープまたは非Ｎｏｔｃｈ３エピトープに結合するよりも、このエピトープを、より優れた親和性、アビディティで、より容易に、かつ／またはより優れた持続時間で結合する抗体である。この定義を読むことによって、例えば、第１の標的に特異的にまたは優先的に結合する抗体（または部分またはエピトープ）が、第２の標的に特異的にまたは優先的に結合しうるかまたはしえないことも理解される。このように、「特異的結合」または「優先的結合」は、排他的な結合を（含むことはできるが）必ずしも要しない。一般に、必ずしもそうである必要はないが、結合への言及は優先的結合を意味する。「ＥＣ５０」は、結合能力の大きさであり、ベースラインと最大との間の中間の応答を生じさせるのに必要とされる抗体または抗体−薬物コンジュゲートの半最大有効濃度として定義される。
【００７１】
「薬学的に許容できる塩」は、本明細書において、分子または巨大分子の薬学的に許容できる有機塩または無機塩を指す。
【００７２】
用語「効力」は、生物活性の大きさであり、実施例９および１２にそれぞれ記載したようにＮｏｔｃｈ３依存性レポーター遺伝子活性またはＮｏｔｃｈ３陽性細胞株の増殖を５０％阻害するのに必要とされる抗原Ｎｏｔｃｈ３に対する抗体または抗体薬物コンジュゲートのＩＣ５０または阻害濃度と称されうる。
【００７３】
語句「有効量」または「治療有効量」は、本明細書において、所望の治療結果を実現するのに必要な量（投与量で、かつ緒時間にわたる、かつ緒手段の投与についての）を指す。有効量は、対象に治療上の利益を付与するのに必要である、活性剤の少なくとも最低量であるが、有毒な量未満である。
【００７４】
本発明の抗体の生物活性に関して本明細書で使用される用語「阻害する」または「中和する」は、例えば、それだけに限らないが、生物活性を含めた阻害されているものの進行または重症度を実質的に相殺し、禁止し、防止し、抑制し、遅延させ、妨害し、排除し、停止させ、低減し、または後退させる抗体の能力を意味する。
【００７５】
抗体に関して本明細書で使用される用語「競合する」は、第１の抗体またはその抗原結合性断片が、第２の抗体またはその抗原結合性断片の結合と十分に類似した様式でエピトープに結合し、その結果、第１の抗体のその同族エピトープとの結合の結果が、第２の抗体の非存在下での第１の抗体の結合と比較して、第２の抗体の存在下で検出可能な程度に減少することを意味する。あるいは、第２の抗体のそのエピトープへの結合がまた、第１の抗体の存在下で検出可能な程度に減少してもよいが、そうである必要はない。すなわち、第１の抗体は、第２の抗体が第１の抗体のそのそれぞれのエピトープへの結合を阻害することなく、第２の抗体のそのエピトープへの結合を阻害することができる。しかし、各抗体が他の抗体のその同族エピトープまたはリガンドとの結合を、同じ程度であっても、より大きい程度であっても、より小さい程度であっても検出可能な程度に阻害する場合、抗体は、これらのそれぞれのエピトープの結合を互いに「交差競合する」と言われる。競合および交差競合抗体の両方が本発明によって包含されている。このような競合または交差競合が起こる機構（例えば、立体障害、コンホメーション変化、または共通エピトープもしくはその断片への結合）にかかわらず、当業者は、本明細書に提供される教示に基づいて、このような競合および／または交差競合抗体は、包含され、本明細書に開示の方法に関して有用でありうることを理解する。
【００７６】
用語「ポリヌクレオチド」または「核酸分子」は、本明細書において、ＤＮＡ分子およびＲＮＡ分子を含むように意図されている。核酸分子は、一本鎖であっても二本鎖であってもよいが、好ましくは二本鎖ＤＮＡである。
【００７７】
本発明の抗体をコードするポリヌクレオチドとして、以下、すなわち、バリアントのコード配列のみ、バリアントのコード配列と機能性ポリペプチドなどの追加のコード配列、あるいはシグナル配列もしくは分泌配列またはプロタンパク質配列、抗体のコード配列と非コード配列、例えば、抗体のコード配列の５’および／もしくは３’のイントロンまたは非コード配列などを挙げることができる。用語「抗体をコードするポリヌクレオチド」は、バリアントの追加のコード配列を含むポリヌクレオチドを包含するが、追加のコード配列および／または非コード配列を含むポリヌクレオチドも包含する。特定の宿主細胞／発現系について最適化されたポリヌクレオチド配列は、所望のタンパク質のアミノ酸配列から容易に得ることができることが当技術分野で公知である（ＧＥＮＥＡＲＴ  ＡＧ、Ｒｅｇｅｎｓｂｕｒｇ、ドイツを参照）。
【００７８】
「宿主細胞」には、ポリヌクレオチドインサートを組み込むためのベクターのレシピエントでありうる、またはそれであった個々の細胞または細胞培養物が含まれる。宿主細胞には、単一宿主細胞の子孫が含まれ、子孫は、天然の、偶発的な、または意図的な変異に起因して最初の親細胞と必ずしも完全に同一でない場合がある（モルフォロジーにおいて、またはゲノムＤＮＡ補体において）。宿主細胞には、本発明のポリヌクレオチドをｉｎ  ｖｉｖｏでトランスフェクトされた細胞が含まれる。
【００７９】
用語「ベクター」は、宿主細胞内で対象とする１種または複数の遺伝子または配列を送達し、好ましくは発現することができるコンストラクトを意味する。ベクターの例としては、それだけに限らないが、ウイルスベクター、裸のＤＮＡまたはＲＮＡ発現ベクター、プラスミド、コスミドまたはファージベクター、カチオン性縮合剤に付随したＤＮＡまたはＲＮＡ発現ベクター、リポソーム内に被包されたＤＮＡまたはＲＮＡ発現ベクター、および産生細胞などのある特定の真核細胞がある。
【００８０】
用語「発現制御配列」は、核酸の転写を指示する核酸配列を意味する。発現制御配列は、プロモーター、例えば、構成的プロモーターもしくは誘導プロモーターなど、またはエンハンサーでありうる。発現制御配列は、転写される核酸配列に作動可能に連結されている。
【００８１】
本発明の抗体をコードするポリヌクレオチドは一般に、当技術分野で公知の天然に付随した、または非相同のプロモーター領域を含む、抗体コード配列に作動可能に連結された発現制御ポリヌクレオチド配列を含むことになる。好ましくは、発現制御配列は、真核生物宿主細胞を形質転換し、またはトランスフェクトすることができるベクター内の真核生物プロモーター系であるが、原核生物宿主の制御配列も使用されうる。ベクターが適切な宿主細胞株に組み込まれると、宿主細胞は、ヌクレオチド配列を発現するのに、かつ望まれる場合、抗体の収集および精製に適した条件下で増殖される。好適な真核細胞株としては、ＣＨＯ細胞株、様々なＣＯＳ細胞株、ＨｅＬａ細胞、骨髄腫細胞株、形質転換Ｂ細胞、またはヒト胚腎臓細胞株がある。最も好適な宿主細胞は、ＣＨＯ細胞株である。
【００８２】
抗体
本発明の抗体は、当技術分野で周知の技法、例えば、組換え技術、ファージディスプレイ技術、合成技術、もしくはこのような技術の組合せ、または当技術分野で容易に分かる他の技術を使用して生産することができる（例えば、Ｊａｙａｓｅｎａ，Ｓ．Ｄ．、Ｃｌｉｎ．Ｃｈｅｍ．、４５：１６２８〜５０（１９９９）、およびＦｅｌｌｏｕｓｅ，Ｆ．Ａ．ら、Ｊ．ＭｏＩ．Ｂｉｏｌ．、３７３（４）：９２４〜４０（２００７）を参照）。
【００８３】
本発明の一実施形態は、配列番号１３と少なくとも９０％、９２％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、または９９％同一である第１のアミノ酸配列、および配列番号２５と少なくとも９０％、９２％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、または９９％同一である第２のアミノ酸配列を含む抗体と同じＮｏｔｃｈ３エピトープに特異的に結合する抗体である。
【００８４】
本発明の別の実施形態は、配列番号３７と少なくとも９０％、９２％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、または９９％同一である第１のアミノ酸配列、および配列番号４９と少なくとも９０％、９２％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、または９９％同一である第２のアミノ酸配列を含む抗体と同じＮｏｔｃｈ３エピトープに特異的に結合する抗体である。
【００８５】
いくつかの実施形態では、抗体またはその抗原結合性断片は、Ｎｏｔｃｈ３に特異的に結合し、この抗体またはその抗原結合性断片は、配列番号１３と少なくとも９０％、９２％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、または９９％同一である第１のアミノ酸配列、および配列番号２５と少なくとも９０％、９２％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、または９９％同一である第２のアミノ酸を含む抗体の結合について競合する。
【００８６】
いくつかの実施形態では、抗体またはその抗原結合性断片は、Ｎｏｔｃｈ３に特異的に結合し、この抗体またはその抗原結合性断片は、配列番号３７と少なくとも９０％、９２％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、または９９％同一である第１のアミノ酸配列、および配列番号４９と少なくとも９０％、９２％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、または９９％同一である第２のアミノ酸配列を含む抗体の結合について競合する。
【００８７】
薬物の抗体へのコンジュゲーション
薬物は、抗体のコンジュゲーションポイントと反応性である基を有し、またはこの基を含むように修飾されている。例えば、薬物は、アルキル化（例えば、抗体のイプシロン−アミノ基リシンまたはＮ末端における）、酸化された炭水化物の還元的アミノ化、ヒドロキシル基とカルボキシル基との間のエステル交換、アミノ基またはカルボキシル基におけるアミド化、およびチオールへのコンジュゲーションによって付着させることができる。いくつかの実施形態では、１抗体分子当たりにコンジュゲートされる薬物の数、ｐは、平均で１〜１２、１〜１１、１〜１０、１〜９、１〜８、１〜７、１〜６、１〜５、１〜４、１〜３、または１〜２の範囲となる。いくつかの実施形態では、ｐは、平均で２〜１２、２〜１１、２〜１０、２〜９、２〜８、２〜７、２〜６、２〜５、２〜４、または２〜３の範囲となる。他の実施形態では、ｐは、平均で１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１または１２である。いくつかの実施形態では、ｐは、約１〜約１２、約１〜約１１、約１〜約１０、約１〜約９、約１〜約８、約１〜約７、約１〜約６、約１〜約５、約１〜約４、約１〜約３、または約１〜約２の範囲となる。いくつかの実施形態では、ｐは、約２〜約１２、約２〜約１１、約２〜約１０、約２〜約９、約２〜約８、約２〜約７、約２〜約６、約２〜約５、約２〜約４、または約２〜約３の範囲となる。コンジュゲーションに使用されうる化学反応の例については、例えば、Ｃｕｒｒｅｎｔ  Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ  ｉｎ  Ｐｒｏｔｅｉｎ  Ｓｃｉｅｎｃｅ（Ｊｏｈｎ  Ｗｉｌｅｙ＆Ｓｏｎｓ，Ｉｎｃ．）、１５章（Ｃｈｅｍｉｃａｌ  Ｍｏｄｉｆｉｃａｔｉｏｎｓ  ｏｆ  Ｐｒｏｔｅｉｎｓ）を参照。
【００８８】
リンカー
リンカーは、薬物および抗体を連結して抗体薬物コンジュゲート（ＡＤＣ）を形成するために用いることができる、二官能性の化合物である。このようなコンジュゲートは、例えば、腫瘍関連抗原に対するイムノコンジュゲートの形成において有用である。このようなコンジュゲートは、腫瘍細胞への細胞傷害性薬の選択的送達を可能にする。適当なリンカーとしては、例えば、切断可能および切断不可能リンカーがある。切断可能リンカーは一般に、細胞内条件下で切断に対して感受性である。適当な切断可能リンカーとしては、例えば、細胞内プロテアーゼ、例えば、リソソームプロテアーゼまたはエンドソームプロテアーゼなどによって切断可能なペプチドリンカーがある。例示的な実施形態では、リンカーは、ジペプチドリンカー、例えば、バリン−シトルリン（ｖａｌ−ｃｉｔ）、フェニルアラニン−リシン（ｐｈｅ−ｌｙｓ）リンカー、またはマレイミドカプロニック−バリン−シトルリン−ｐ−アミノベンジルオキシカルボニル（ｖｃ）リンカーなどでありうる。別のリンカーは、スルホスクシンイミジル−４−［Ｎ−マレイミドメチル］シクロヘキサン−１−カルボキシラート（ｓｍｃｃ）である。スルホ−ｓｍｃｃコンジュゲーションは、スルフヒドリル（チオール、−ＳＨ）と反応するマレイミド基を介して起こり、一方、そのスルホ−ＮＨＳエステルは、一級アミンに対して反応性である（リシンおよびタンパク質またはペプチドＮ末端において見つかるように）。さらに別のリンカーは、マレイミドカプロイル（ｍｃ）である。他の適当なリンカーには、ヒドラゾンリンカーなどの特定のｐＨまたはｐＨ範囲で加水分解性のリンカーが含まれる。追加の適当な切断可能リンカーとしては、ジスルフィドリンカーがある。例えば、ｍｃリンカーなど、リンカーは、薬物が放出されるために抗体が細胞内に分解されなければならない程度に抗体に共有結合的に結合されている場合がある。
【００８９】
本発明のリンカーは、マレイミドカプロニック−バリン−シトルリン−ｐ−アミノベンジルオキシカルボニル（ｖｃ）、マレイミドカプロイル（ｍｃ）、ｍｅおよびＭａｌＰｅｇ６Ｃ２を含む。
【００９０】
改変されたＦｃポリペプチド
抗体の重鎖のＣＨ２もしくはＣＨ３ドメインの表面または軽鎖の定常ドメインにおそらく存在する、または別の方法でアクセス可能なある特定の残基は、天然に存在する野生型アミノ酸、例えば、システインとの置換に適しており、したがって、参照により本明細書に組み込まれている国際公開第ＷＯ／２０１３／０９３８０９号で記載されているように、様々な作用物質にコンジュゲートすることができる部位を改変するのに有用であることが以前に報告されている。
【００９１】
アミノ酸修飾は、当技術分野で公知の任意の方法によって行うことができ、多くのこのような方法は、当業者にとって周知であり、常法である。例えば、限定するものではないが、アミノ酸置換、欠失、および挿入は、任意の周知のＰＣＲベースの技法を使用して達成されうる。アミノ酸置換は、部位特異的変異誘発によって行われうる（例えば、ＺｏｌｌｅｒおよびＳｍｉｔｈ、１９８２、Ｎｕｃｌ．Ａｃｉｄｓ  Ｒｅｓ．、１０：６４８７〜６５００、ならびにＫｕｎｋｅｌ、１９８５、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ  ＵＳＡ、８２：４８８を参照）。
【００９２】
いくつかの実施形態では、本開示の改変されたＦｃポリペプチドを、抗体またはその抗原結合性断片を調製するのに使用することができ、その結果、抗体またはその断片は、それによって改変されたＦｃ領域を含み、これは、多種多様な部分を改変された残基（すなわち、野生型無修飾Ｆｃと比較して置換されたアミノ酸）においてコンジュゲートするのに使用することができる。
【００９３】
いくつかの実施形態では、本開示の改変されたカッパ軽鎖定常ポリペプチドを、抗体またはその抗原結合性断片を調製するのに使用することができ、その結果、抗体またはその断片は、それによってアミノ酸変異またはその断片を含む改変されたＣＬ領域を含み、これは、多種多様な部分を改変されたアミノ酸残基においてコンジュゲートするのに使用することができる。
【００９４】
例えば、システイン残基のＦｃポリペプチド内の単一の置換は、通常、ＩｇＧ抗体分子のホモ二量体の性質に起因して結果として生じるＩｇＧ抗体内の２つの対応する残基をディスプレイすることに留意されるべきである。したがって、本発明の結果として生じる改変されたＩｇＧ抗体は、薬物または化合物にコンジュゲートする目的のために少なくとも１、２、３、４、またはそれ以上の反応基をディスプレイすることができる。一実施形態では、置換の１つまたは複数は、システイン残基とのものであり、得られる改変された抗体は、薬物または化合物にコンジュゲートする目的のために少なくとも１、２、３、４、またはそれ以上のチオール基をディスプレイすることができる。
【００９５】
いくつかの実施形態では、本発明の改変されたＦｃポリペプチドは、抗体の重鎖の４４３位、および３９２位から選択される１つまたは複数の置換を含み、ここで定常領域の番号方式は、Ｋａｂａｔら（上記）に示されたＥＵインデックスのものである。
【００９６】
いくつかの実施形態では、改変されたＦｃポリペプチドは、配列番号６１に示す１つのアミノ酸置換（Ｌ４４３Ｃ）を含む。別の実施形態では、改変されたＦｃポリペプチドは、配列番号６５に示す２つのアミノ酸置換（Ｌ４４３Ｃ／Ｋ３９２Ｃ）を含む。
【００９７】
改変されたＣκポリペプチド
本発明の抗Ｎｏｔｃｈ３抗体は、親、天然、または野生型抗体の、軽鎖定常領域の番号方式がＫａｂａｔら（１９９１、ＮＩＨ  Ｐｕｂｌｉｃａｔｉｏｎ  ９１−３２４２、Ｎａｔｉｏｎａｌ  Ｔｅｃｈｎｉｃａｌ  Ｉｎｆｏｒｍａｔｉｏｎ  Ｓｅｒｖｉｃｅ、Ｓｐｒｉｎｇｆｉｅｌｄ、ＶＡ、以下「Ｋａｂａｔ」）で示されたＫａｂａｔ番号付けシステムのものである抗体軽鎖の１、２、または３個のアミノ酸が、別のアミノ酸（天然および非天然／合成アミノ酸を含む）と置換された改変された抗体軽鎖定常領域（ＬＣ）またはその断片を包含しうる。
【００９８】
他の実施形態では、多くの抗体の二量体の性質（例えば、ＩｇＧは、２本の軽鎖および２本の重鎖を含み、各重鎖は、Ｆｃポリペプチドを含む）に起因して、本発明の抗体は、少なくとも１つの改変されたＦｃポリペプチドを含むことができ、少なくとも１つの改変された軽鎖定常ポリペプチドをさらに含むことができ、それによって１つがＦｃポリペプチド内であり、別のものがＬＣポリペプチド内である少なくとも２つの部位特異的コンジュゲーション部位をもたらす。
【００９９】
いくつかの実施形態では、本発明の改変されたＣｋポリペプチドは、抗体の軽鎖の１８３位での少なくとも１つの置換を含む。いくつかの実施形態では、改変されたＣｋポリペプチドは、配列番号６３に示す１つのアミノ酸置換（κＫ１８３Ｃ）を含む。
【０１００】
がんのための療法
腫瘍、転移を含むがそれだけに限らない、がん、または制御されていない細胞増殖を特徴とする他の疾患もしくは障害は、本発明の抗体もしくはその抗原結合性断片、または抗体−薬物コンジュゲート（ＡＤＣ）の投与によって処置または予防されうる。
【０１０１】
例示的な抗Ｎｏｔｃｈ３抗体またはその抗原結合性断片、および抗体−薬物コンジュゲートは、Ｎｏｔｃｈ３が参照対象または標準物質（例えば、非がん性組織または正常組織）と比べて発現または過剰発現されるがんを処置するのに有用である。本明細書に記載の方法によるＮｏｔｃｈ３発現がんの処置または予防は、このような処置を必要とする対象に有効量の抗Ｎｏｔｃｈ３抗体もしくはその抗原結合性断片、および／または抗体−薬物コンジュゲートを投与することによって実現されうる。いくつかの実施形態では、細胞傷害性剤にコンジュゲートされた抗Ｎｏｔｃｈ３全長抗体またはその抗原結合性断片が投与されることになる。いくつかの例示的な実施形態では、本発明の抗Ｎｏｔｃｈ３抗体−薬物コンジュゲートは、（ｉ）Ｎｏｔｃｈ３発現がん細胞に結合し、かつ（ｉｉ）細胞傷害性効果または細胞増殖抑制効果を発揮して、例えば、Ｎｏｔｃｈ３発現がん細胞の増殖を阻害し、またはＮｏｔｃｈ３発現がん細胞を死滅させる。
【０１０２】
他の実施形態では、抗Ｎｏｔｃｈ３抗体もしくはその抗原結合性断片、および／または抗Ｎｏｔｃｈ３抗体−薬物コンジュゲートは、別の治療剤と同時投与され、または別の治療剤と順次投与される。いくつかの実施形態では、抗Ｎｏｔｃｈ３抗体もしくはその抗原結合性断片、および／または抗Ｎｏｔｃｈ３抗体−薬物コンジュゲートは、標準治療化学療法剤を含めた化学療法剤と同時投与され、または順次投与される。
【０１０３】
いくつかの実施形態では、他の治療剤は、処置される特定の疾患の標準治療であり、または処置される特定の疾患の救済レジメンの一部である作用物質となる。抗がん剤および化学療法レジメンとしては、例えば、抗ＣＤ５２抗体（例えば、アレムツズマブ）、抗ＣＤ２０抗体（例えば、リツキシマブ）、および抗ＣＤ４０抗体（例えば、ＳＧＮ４０）を含めた抗がん抗体、例えば、ＣＨＯＰ（シクロホスファミド、ドキソルビシン、ビンクリスチン、およびプレドニゾン）、ＣＶＰ（シクロホスファミド、ビンクリスチン、およびプレドニゾン）、ＲＣＶＰ（リツキシマブ＋ＣＶＰ）、ＲＣＨＯＰ（リツキシマブ＋ＣＨＯＰ）、ＲＩＣＥ（リツキシマブ＋イホスファミド、カルボプラチン、エトポシド）、ＲＤＨＡＰ（リツキシマブ＋デキサメタゾン、シタラビン、シスプラチン）、ＲＥＳＨＡＰ（リツキシマブ＋エトポシド、メチルプレドニゾロン、シタラビン、シスプラチン）、ゲムシタビン、アスパラギナーゼを伴った、または伴わないビンクリスチン、プレドニゾン、およびアントラサイクリンを用いた組合せ療法、ダウノルビシン、ビンクリスチン、プレドニゾン、およびアスパラギナーゼを用いた組合せ療法、テニポシドおよびＡｒａ−Ｃ（シタラビン）を用いた組合せ療法、メトトレキセートおよびロイコボリンを用いた組合せ療法、ブレオマイシン、ドキソルビシン、エトポシド、メクロレタミン、プレドニゾン、ビンブラスチン、およびビンクリスチンを用いた組合せ療法、低分子阻害剤、ならびに例えば、ボルテゾミブを含めたプロテオソーム阻害剤を含めた化学療法レジメンがある。
【０１０４】
いくつかの実施形態では、それを必要とする患者に、放射線処置、および任意選択により別の治療剤と組み合わせて有効量の抗Ｎｏｔｃｈ３抗体もしくはその抗原結合性断片、および／または抗Ｎｏｔｃｈ３抗体−薬物コンジュゲートを投与するステップを含む、方法によりがんを処置する。いくつかの実施形態では、抗Ｎｏｔｃｈ３抗体もしくはその抗原結合性断片、および／または抗Ｎｏｔｃｈ３抗体−薬物コンジュゲートは、抗がん剤（例えば、化学療法剤）および／または放射線療法とともに同時にまたは順次投与される。いくつかの実施形態では、化学療法剤または放射線療法は、本発明の化合物を投与する少なくとも１時間、５時間、１２時間、１日、１週間、１カ月、数カ月（例えば、最大３カ月）前または後に投与される。
【０１０５】
一般に、抗Ｎｏｔｃｈ３抗体および／または抗Ｎｏｔｃｈ３抗体−薬物コンジュゲートの投与では、初回候補投与量は、約２ｍｇ／ｋｇでありうる。本発明の目的のために、典型的な１日投与量は、上述の要素に応じて、約３μｇ／ｋｇから、３０μｇ／ｋｇまで、３００μｇ／ｋｇまで、３ｍｇ／ｋｇまで、３０ｍｇ／ｋｇまで、１００ｍｇ／ｋｇまで、またはそれ以上の範囲でありうる。例えば、約１ｍｇ／ｋｇ、約２．５ｍｇ／ｋｇ、約５ｍｇ／ｋｇ、約１０ｍｇ／ｋｇ、および約２５ｍｇ／ｋｇの投与量を用いることができる。数日間またはそれ以上にわたる反復投与では、状態に応じて、処置は、症状の所望の抑制が生じるまで、または、例えば、腫瘍の増殖／進行もしくはがん細胞の転移を阻害するもしくは遅延させるまでに、十分な治療レベルが実現されるまで、持続される。例示的な投薬レジメンは、約２ｍｇ／ｋｇの初回投薬を投与するステップと、その後の、約１ｍｇ／ｋｇの抗Ｎｏｔｃｈ３抗体もしくは抗Ｎｏｔｃｈ３抗体−薬物コンジュゲートの弱い維持投薬、または隔週の約１ｍｇ／ｋｇの維持投薬を投与するステップとを含む。他の例示的な投薬レジメンは、増大投薬（例えば、１ｍｇ／ｋｇの初回投薬、および、毎週の、またはより長い期間の、１回または複数回のより多い用量までの漸増的な増大）を投与するステップを含む。他の投薬レジメンも、開業医が実現を望む薬物動態低下のパターンに応じて有用でありうる。例えば、いくつかの実施形態では、１週間に１から４回の投薬が検討される。他の実施形態では、１カ月に１回または２カ月に１回または３カ月に１回、ならびに１週間に１回、２週間に１回、および３週間に１回の投薬が検討される。この療法の進捗は、慣例的な技法およびアッセイによって監視しうる。投薬レジメン（使用される抗Ｎｏｔｃｈ３抗体または抗Ｎｏｔｃｈ３抗体−薬物コンジュゲートを含む）は、経時的に変化しうる。
【０１０６】
本発明の目的のために、抗Ｎｏｔｃｈ３抗体または抗Ｎｏｔｃｈ３抗体−薬物コンジュゲートの適切な投与量は、採用される抗Ｎｏｔｃｈ３抗体または抗Ｎｏｔｃｈ３抗体−薬物コンジュゲート（またはその組成物）、処置する症状のタイプおよび重症度、作用物質が治療目的で投与されるか否か、以前の療法、患者の病歴および作用物質への応答、投与される作用物質についての患者のクリアランス率、ならびに担当医の裁量に応じる。臨床医は、投与量が所望の結果を実現する量に達するまで、またそれ以上まで、抗Ｎｏｔｃｈ３抗体または抗Ｎｏｔｃｈ３抗体−薬物コンジュゲートを投与することができる。用量および／または頻度は、処置の過程にわたって変化しうるが、一定のままでもよい。経験的考察、例えば半減期が、投与量の決定に一般に寄与する。例えば、ヒト免疫系、例えばヒト化抗体または完全ヒト抗体と競合する抗体を、抗体の半減期を延ばすため、および抗体が宿主免疫系によって攻撃されるのを防ぐために用いることができる。投与の頻度は、療法の過程にわたって決定および調節することができ、必ずしもそうである必要ではないが、一般に、症状の処置および／または抑制および／または改善および／または遅延、例えば、腫瘍の増殖の阻害または遅延などに基づく。あるいは、抗Ｎｏｔｃｈ３抗体または抗Ｎｏｔｃｈ３抗体−薬物コンジュゲートの持続連続放出製剤が適切でありうる。持続放出を実現するための様々な製剤およびデバイスは、当技術分野で公知である。
【０１０７】
一実施形態では、抗Ｎｏｔｃｈ３抗体または抗Ｎｏｔｃｈ３抗体−薬物コンジュゲートの投与量は、抗Ｎｏｔｃｈ３抗体またはその抗Ｎｏｔｃｈ３抗体−薬物コンジュゲートの１回または複数回の投与を受けている個体において経験的に決定することができる。個体は、抗Ｎｏｔｃｈ３抗体またはＮｏｔｃｈ３アンタゴニストの所与の漸増的な投与量を投与される。有効性を評価するために、疾患の指標を追跡することができる。
【０１０８】
本発明の方法による抗Ｎｏｔｃｈ３抗体または抗Ｎｏｔｃｈ３抗体−薬物コンジュゲートの投与は、例えば、レシピエントの生理的状態、投与の目的が治療的なものであるか予防的なものであるか、および熟練した医師に公知の他の要素に応じて、連続的または間欠的でありうる。抗Ｎｏｔｃｈ３抗体または抗Ｎｏｔｃｈ３抗体−薬物コンジュゲートの投与は、事前選択された期間にわたり基本的に連続的でありえ、または一連の間隔のあいた投薬でありうる。
【０１０９】
いくつかの実施形態では、２つ以上の抗Ｎｏｔｃｈ３抗体または抗Ｎｏｔｃｈ３抗体−薬物コンジュゲートが存在しうる。少なくとも１つの、少なくとも２つの、少なくとも３つの、少なくとも４つの、少なくとも５つの異なる、またはそれ以上の抗Ｎｏｔｃｈ３抗体または抗Ｎｏｔｃｈ３抗体−薬物コンジュゲートが存在しうる。一般に、これらの抗Ｎｏｔｃｈ３抗体または抗Ｎｏｔｃｈ３抗体−薬物コンジュゲートは、互いに悪影響を及ぼさない相補的な活性を有しうる。例えば、以下の抗Ｎｏｔｃｈ３抗体の１つまたは複数を用いることができる：Ｎｏｔｃｈ３上の１つのエピトープに対する第１の抗Ｎｏｔｃｈ３抗体、およびＮｏｔｃｈ３上の異なるエピトープに対する第２の抗Ｎｏｔｃｈ３抗体。
【０１１０】
本発明の抗Ｎｏｔｃｈ３抗体もしくはその抗原結合性断片、および／または抗Ｎｏｔｃｈ３抗体−薬物コンジュゲートは、選択された投与モード、および薬学的に許容できる賦形剤または添加剤、例えば、緩衝液、界面活性剤、防腐剤、可溶化剤、等張化剤、安定化剤、担体などにとって適切であるように製剤化された投与用医薬組成物の形態でありうる。Ｒｅｍｉｎｇｔｏｎ’ｓ  Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ  Ｓｃｉｅｎｃｅｓ、Ｍａｃｋ  Ｐｕｂｌｉｓｈｉｎｇ  Ｃｏ．、Ｅａｓｔｏｎ  Ｐａ．、第１８版、１９９５には、開業医に一般に公知の製剤技法の概要が示されている。
【０１１１】
これらの医薬組成物は、がんを処置するための一般に意図された目的を実現する当技術分野で公知の任意の手段によって投与することができる。一実施形態では、投与経路は、それだけに限らないが、静脈内、筋肉内、腹腔内、皮下、および関節内の注射および注入を含む投与モードを指すと本明細書で定義された非経口である。投与される投与量は、レシピエントの年齢、健康、および体重、もしあれば同時処置の種類、処置の頻度、ならびに望まれる効果の性質に依存することになる。
【０１１２】
本発明の範囲内の組成物には、抗Ｎｏｔｃｈ３抗体もしくはその抗原結合性断片、および／または抗Ｎｏｔｃｈ３抗体−薬物コンジュゲートが、がんを処置するための所望の医学的効果を実現するのに有効な量で存在するすべての組成物が含まれる。個々の必要性は、患者によって変動しうるが、成分のすべての有効量の最適範囲の判定は、通常の技術の臨床医の能力の範囲内である。
【０１１３】
診断
本発明の抗体またはその抗原結合性断片は、ｉｎ  ｖｉｔｒｏまたはｉｎ  ｖｉｖｏで生体試料中のＮｏｔｃｈ３を検出するのにも使用されうる。一実施形態では、本発明の抗Ｎｏｔｃｈ３抗体またはその抗原結合性断片は、組織内または組織に由来する細胞内のＮｏｔｃｈ３のレベルを判定するのに使用される。一実施形態では、組織は患部組織である。いくつかの実施形態では、組織は、腫瘍またはその生検材料である。一実施形態では、組織内または患者に由来する生検材料内のＮｏｔｃｈ３のレベルを、本発明の抗体またはその抗原結合性断片を使用したイムノアッセイで判定することができる。組織またはその生検材料は、患者から切除することができ、凍結または固定することができる。同じ方法を使用して、Ｎｏｔｃｈ３タンパク質の他の性質、例えば、細胞表面レベルのそのレベル、または細胞局在化などを判定することができる。
【０１１４】
上述した方法は、がんを有することが分かっている、または有すると疑われる対象におけるがんを診断するのに使用することができ、患者において測定されたＮｏｔｃｈ３のレベルを参照対象または標準物質のものと比較する。次いで前記方法を使用して、腫瘍がＮｏｔｃｈ３を発現するか否かを判定することができ、それは、腫瘍が本発明の抗体−薬物コンジュゲートを用いた処置に十分応答することを示唆しうる。本発明の一実施形態では、腫瘍は、Ｎｏｔｃｈ３が発現される、肺がん、乳がん、卵巣がん、胃がん、食道がん、子宮頚がん、頭頚部がん、膀胱がん、肝臓がん、皮膚がん、および肉腫を含むがそれだけに限らない固形腫瘍がん、または、Ｔ細胞悪性腫瘍、Ｔ細胞白血病、Ｔ細胞リンパ腫、Ｔ細胞急性リンパ芽性白血病、多発性骨髄腫、Ｂ細胞悪性腫瘍、骨髄性悪性腫瘍、急性骨髄性白血病、および慢性骨髄性白血病を含むがそれだけに限らない血液がん、ならびにＮｏｔｃｈ３が主に発現される未だ判定されていない他のがんである。
【０１１５】
本発明の一実施形態は、Ｎｏｔｃｈ３発現がんを処置する方法であって、生体試料中のＮｏｔｃｈ３のレベルを判定するステップと、本発明の抗体−薬物コンジュゲートを対象に投与するステップとを含み、前記判定するステップが、がんを有すると疑われる対象から得られた試料を抗Ｎｏｔｃｈ３抗体またはその抗原結合性断片と接触させるサブステップと、試料中のＮｏｔｃｈ３の細胞表面レベルを判定するサブステップと、Ｎｏｔｃｈ３の細胞表面レベルを参照対象または標準物質のものと比較するサブステップとを含む、方法である。本方法は、がんを有すると疑われる対象に由来する試料を得るステップを任意選択により含みうる。
【０１１６】
本発明の別の実施形態は、Ｎｏｔｃｈ３発現がんを処置する方法であって、生体試料中のＮｏｔｃｈ３のレベルを判定するステップと、本発明の抗体−薬物コンジュゲートを対象に投与するステップとを含み、前記判定するステップががんを有すると疑われる対象から得られた試料をｉｎ  ｓｉｔｕハイブリダイゼーション（ＩＳＨ）にかけるサブステップと、試料中のＮｏｔｃｈ３  ｍＲＮＡのレベルを判定するサブステップと、Ｎｏｔｃｈ３  ｍＲＮＡのレベルを参照対象または標準物質のものと比較するサブステップとを含む、方法である。本方法は、がんを有すると疑われる対象から試料を得るステップを任意選択により含みうる。
【０１１７】
本発明はさらに、研究用途または診断的適用で使用するためにさらに標識されるモノクローナル抗体、ヒト化抗体、およびこれらのエピトープ結合性断片を提供する。いくつかの実施形態では、標識は、放射標識、フルオロフォア、発色団、造影剤、または金属イオンである。
【０１１８】
標識抗体またはこれらのエピトープ結合性断片ががんを有すると疑われる対象に投与され、対象の体内の標識の分布が測定または監視される、診断のための方法も提供される。
【０１１９】
キット
本発明は、例えば、記載した細胞傷害性コンジュゲート、および特定の細胞型を死滅させるために細胞傷害性コンジュゲートを使用するための指示書を含むキットも含む。指示書は、ｉｎ  ｖｉｔｒｏ、ｉｎ  ｖｉｖｏ、またはｅｘ  ｖｉｖｏで細胞傷害性コンジュゲートを使用するための指示を含みうる。一般に、キットは、細胞傷害性コンジュゲートを含有するコンパートメントを有することになる。細胞傷害性コンジュゲートは、凍結乾燥形態、液体形態、またはキット内に含められるように修正可能な他の形態でありうる。キットは、キット内の指示書に記載された方法を実行するのに必要とされる追加の要素、例えば、凍結乾燥粉末を再構成するための滅菌溶液、患者に投与する前に細胞傷害性コンジュゲートと組み合わせるための追加の作用物質、およびコンジュゲートを患者に投与するのに役立つツールなども含有しうる。
【０１２０】
上記に、または以下の実施例において引用したすべての刊行物および特許文書は、それぞれがそのように個々に表されているのと同じ程度に、すべての目的に関してその全体が参照により本明細書に組み込まれている。
【０１２１】
本発明を、以下の実施例を参照してさらに記載するが、本発明は、このような実施例に限定されないことが理解されるべきである。
【０１２２】
本発明を実施するための特定の態様の以下の実施例は、例示的な目的のみで提供されており、決して本発明の範囲を限定するように意図されていない。
【実施例】
【０１２３】
（実施例１）
組換えＮｏｔｃｈ３タンパク質免疫原の生成
Ｎ末端にシグナルペプチドを有し、Ｃ末端にＡｖｉおよびＨｉｓ６タグを有する、ヒトＮｏｔｃｈ３  ＮＲＲ領域をコードするｃＤＮＡ構築物を、発現ベクターｐＳＭＥＤ２内にクローニングした。これらの構築物を、チャイニーズハムスター卵巣（ＣＨＯ）細胞内に一過性にトランスフェクトし、馴化培地内の分泌タンパク質を、ＳＤＳ−ＰＡＧＥで分析した。Ｓ１切断部位でのプロセシングの後、Ｎｏｔｃｈ３  ＮＲＲドメインの約２６ｋＤａ（ＬＮＲ−Ａ、Ｂ、Ｃ、およびＨＤ１）のＮ末端半分および約１２ｋＤａ（ＨＤ２およびＡｖｉ＿Ｈｉｓタグ）のＣ末端半分は、図１に示すように、非共有結合による相互作用を介して関連したままであり、ヘテロ二量体複合体を形成している。Ｎｏｔｃｈ３  ＮＲＲのＳ１プロセシングは、ＣＨＯ細胞から調製された試料中で約５０％以下であると判定された。Ｓ１切断部位でのプロセシングを増強するために、Ｎｏｔｃｈ３  ＮＲＲ発現構築物をＣＨＯ−ＰＡＣＥ細胞内にトランスフェクトし（Ｈａｒｒｉｓｏｎら、Ｓｅｍｉｎ  Ｈｅｍａｔｏｌ．１９９８、４月、３５（２  Ｓｕｐｐｌ  ２）：４〜１０）、Ｎｏｔｃｈ３  ＮＲＲの最も高い発現および完全なプロセシングを有する安定な細胞系を選択した。これらの細胞系の培養物を、そこからＮｏｔｃｈ３  ＮＲＲタンパク質が精製された馴化培地の収集のためにスケールアップした。
【０１２４】
精製ヒトおよびマウスＮｏｔｃｈ３  ＮＲＲ＿Ａｖｉ＿Ｈｉｓタグタンパク質（以下「Ｎｏｔｃｈ３  ＮＲＲ組換えタンパク質」）のアミノ酸配列およびヌクレオチド配列を図２に示す。小文字は、Ａｖｉ＿Ｈｉｓタグを表す。ＳＤＳ−ＰＡＧＥ分析は、精製タンパク質の９０％超が、予測されたＮｏｔｃｈ３  ＮＲＲ  Ｎ末端およびＣ末端ペプチドサイズに正しく切断されたことを示した（データは示されていない）。
【０１２５】
（実施例２）
ラット抗Ｎｏｔｃｈ３抗体の生成およびクローニング
Ａ．免疫化およびハイブリドーマの生成
Ｓｐｒａｇｕｅ−Ｄａｗｌｅｙラットを、フロイント完全アジュバント中の２０μｇのヒト（配列番号１）およびマウス（配列番号３）Ｎｏｔｃｈ３組換えタンパク質を含有する混合物で、皮下注射によって免疫化した。免疫化は、２週間の間隔で１２週間にわたり反復した。初回注射の後０日目、３５日目、４９日目、および６３日目の収集された血清試料を、酵素結合免疫吸着アッセイ（ＥＬＩＳＡ）によって、循環抗Ｎｏｔｃｈ３抗体力価活性について試験した。最適な力価に達したら、タンパク質混合物の最終用量を、最適な抗体力価を有するラットに、それが脾細胞の収集のために屠殺される４日前に、静脈内注射した（尾静脈）。ラットに由来する全脾細胞（２×１０８）を、ＰＥＧ１５００を用いて、マウス骨髄腫細胞系Ｐ３Ｘ６３．Ａｇ８．６５３（２．５×１０７）と融合した。融合細胞を９６ウェルプレート内に蒔き（０．２ｍＬ／ウェル）、ＨＡＴ選択（５×１０−４Ｍヒポキサンチン、１．６×１０−５Ｍチミジン、４×１０−４Ｍアミノプテリン、および２０％熱不活化ＦＣＳを含有するＲＰＭＩ１６４０）にかけた。
【０１２６】
融合の１４日後、ハイブリドーマ上清を回収し、Ｎｏｔｃｈ３結合活性の存在について試験した。２匹の親ラットクローン２８および７５（以下それぞれｒ２８およびｒ７５）は、ＥＬＩＳＡによって、ヒトＮｏｔｃｈ３  ＮＲＲ組換えタンパク質への結合活性を示し、細胞ベースのＥＬＩＳＡによって、０．１〜１ｎＭの抗体濃度で１以上のＯ．Ｄ．４５０ｎＭ値で、ヒト全長Ｎｏｔｃｈ３を安定的に過剰発現するＵ−２  ＯＳ細胞の細胞表面への結合活性を示した。さらに、ｒ２８は、ＥＬＩＳＡによって、マウスＮｏｔｃｈ３  ＮＲＲ組換えタンパク質への結合活性を示し、細胞ベースのＥＬＩＳＡによって、０．１〜１ｎＭの抗体濃度で１以上のＯ．Ｄ．４５０ｎＭ値で、マウス全長Ｎｏｔｃｈ３を安定的に過剰発現するＵ−２  ＯＳ細胞の細胞表面への結合活性を示したが、ｒ７５は示さなかった。
【０１２７】
Ｂ．抗Ｎｏｔｃｈ３抗体のクローニングおよび配列決定
ｒ２８およびｒ７５の可変領域を、さらなる分析のためにサブクローニングした。サブクローンに由来するＲＮＡを抽出し、発現した抗体に由来する可変領域ＤＮＡ配列を、ＲＴ−ＰＣＲクローニングを介して得た。１から５００万個のサブクローニングされたハイブリドーマ細胞を、ＱＩＡＧＥＮ  ＲＮＡｅａｓｙ  Ｍｉｎｉキットを用いて、全ＲＮＡの単離のためにホモジナイズした。第１の鎖のｃＤＮＡを、次いで、ＳｕｐｅｒＳｃｒｉｐｔ  ＩＩＩ  ＲＴキット（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ）を用いて生産した。抗Ｎｏｔｃｈ３  ＩｇＧの可変領域の二本鎖ｃＤＮＡをその後に生成し、以下に記載するように、ラットＩｇＧ重鎖（ＩｇＧ１、２ａ、２ｂ）および軽鎖（カッパまたはラムダ）定常領域に由来するプライマーを用いるＰＣＲによって増幅した。ＰＣＲサイクル条件：９５℃で１分を１サイクル、９５℃で１分、６３℃で１分、および７２℃で１分を２５サイクル。得られたＲＴ−ＰＣＲ産物をＴＯＰＯ−Ｂｌｕｎｔクローニングベクター（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ）内にクローニングし、慣例的な方法によって配列決定した。ｒ２８およびｒ７５の可変領域のアミノ酸配列およびヌクレオチド配列を図３に示す。ＣＤＲに下線が引かれている。
【０１２８】
（実施例３）
キメラ抗Ｎｏｔｃｈ３抗体の生成および特徴付け
ｒ２８およびｒ７５に由来する可変領域ｃＤＮＡを、ラット可変重鎖（ＶＨ）をインフレームでヒトＩｇＧ１（ｈＩｇＧ１）と融合し、ラット可変軽鎖（ＶＬ）をヒトカッパと融合した、哺乳動物発現ベクター内にサブクローニングした。ラット−ヒトキメラ抗体２８および７５（以下それぞれｃｈ２８およびｃｈ７５）を、ＨＥＫ２９３細胞内での一過性トランスフェクションによってこれらの構築物から生成し、さらに分析した。
【０１２９】
ｃｈ２８およびｃｈ７５を、組換えタンパク質ＥＬＩＳＡで結合活性について試験した。精製されたヒトまたはマウスＮｏｔｃｈ３  ＮＲＲ組換えタンパク質を、１μｇ／ｍｌの濃度のＭｇ／Ｃａを有する１００μｌ  ＰＢＳ中で、一晩、ＣｏＳｔａｒ  ｈｉ−ｂｏｕｎｄ  ９６ウェルＥＬＩＳＡプレート上に被覆した。プレートをＰＢＳ−Ｍｇ／Ｃａで洗浄し、ＰＢＳ−Ｍｇ／Ｃａ中の１％ＢＳＡで１時間ブロックした。ブロック溶液をプレートからデカンテーションし、ブロック溶液中の抗体の１：３連続希釈物をプレートにアプライした。室温で１時間のインキュベーションの後、プレートをＰＢＳ−Ｍｇ／Ｃａで再び洗浄し、その後、ブロック緩衝液中に希釈（１：２０，０００）されたＨＲＰ（ホースラディッシュペルオキシダーゼ）コンジュゲート二次抗体をアプライした。試験した一次抗体がラットＩｇＧであった場合、二次抗体はヤギ抗ラットＩｇＧ  Ｆｃ（Ｂｅｔｈｙｌ  Ｂｉｏｔｅｃｈ）であり、一次抗体がヒトＩｇＧであった場合、二次抗体はヤギ抗ヒトＩｇＧ  Ｆｃ（Ｓｏｕｔｈｅｒｎ  Ｂｉｏｔｅｃｈ）であった。
【０１３０】
二次抗体との１時間のインキュベーションの後、プレートを上記のように再び洗浄し、ＴＭＢ基質溶液を添加した。１０分間、発色反応をさせ、その後、停止溶液である０．１８Ｍ  Ｈ２ＳＯ４を添加した。Ｏ．Ｄ．４５０ｎＭでの吸光度を測定し、データを、Ｍｉｃｒｏｓｏｆｔ  ＥｘｃｅｌおよびＧｒａｐｈｐａｄ−Ｐｒｉｓｍソフトウェアでプロットおよび分析した。ｃｈ２８およびｃｈ７５は、ヒトＮｏｔｃｈ３  ＮＲＲ組換えタンパク質への強力な結合活性を示し、１ｎＭ以下のＥＣ５０を有し、ｃｈ２８は、１ｎＭ以下のＥＣ５０で、マウスＮｏｔｃｈ３  ＮＲＲ組換えタンパク質への強力な結合活性も示したが、ｃｈ７５は示さなかった。ｃｈ２８およびｃｈ７５を、以下に記載するような、さらなる細胞ベースのＥＬＩＳＡのために選択した。
【０１３１】
（実施例４）
ヒト化
ｒ２８およびｒ７５を、さらなる発展のためにヒト化するために選択した。ヒト化を、ヒト受容体フレームワークである、重鎖についてのＤＰ−５４および軽鎖についてのＤＰＫ９上へのＣＤＲグラフティングによって行い、その後、ヒト受容体フレームワーク内での選択復帰突然変異を行って、親ラット抗体の完全な活性を回復させた。表１は、異なるバリアントについてのヒト受容体フレームワーク内での選択復帰突然変異を示す。
【０１３２】
【表１】
2017186337.tif 000004
【０１３３】
選択復帰突然変異を有する、ヒト受容体フレームワークＤＰ−５４およびＤＰＫ９上へのｒ２８およびｒ７５のグラフト化ＣＤＲドナー配列を含有するｃＤＮＡを、Ｇｅｎｅｗｉｚによって合成した。合成されたｃＤＮＡ産物をサブクローニングし、哺乳動物発現ベクターｐＳＭＥＤ２およびｐＳＭＥＮ３内で、重鎖についてのヒトＩｇＧ１重鎖定常領域および軽鎖についてのヒトカッパと、インフレームでそれぞれ融合した。
【０１３４】
ヒト化ｒ２８バリアントＶＨ１．０／ＶＬ１．０（以下ｈｕ２８）は、ｃｈ２８の抗原結合エピトープおよび親和性を完全に保持しており、ｃｈ２８で観察された強力なシグナル伝達阻害活性を欠いていた。ｈｕ２８のＶＨ領域およびＶＬ領域のＣＤＲは、ｒ２８のＶＨ領域およびＶＬ領域のＣＤＲとそれぞれ同一である。ヒト化ｒ７５バリアントＶＨ１．９／ＶＬ１．３（以下ｈｕ７５）は、ｃｈ７５の抗原結合エピトープおよび親和性、ならびにｃｈ７５で観察された強力なシグナル伝達阻害活性を完全に保持していた。ｈｕ７５のＶＨ領域のＣＤＲ２およびＣＤＲ３は、ｒ７５のＶＨ領域のＣＤＲ２およびＣＤＲ３とそれぞれ同一である。ｈｕ７５のＶＨ領域のＣＤＲ１は、１つの復帰突然変異Ｖ３４Ｍを含有する。ｈｕ７５のＶＬ領域のＣＤＲは、ｒ２８のＶＬ領域のＣＤＲと同一である。図４Ａ〜図４Ｃは、同定されたＣＤＲ（ＫａｂａｔおよびＣｈｏｔｈｉａ）とともにｈｕ２８のアミノ酸配列およびヌクレオチド配列を示し、図５Ａ〜図５Ｃは、同定されたＣＤＲ（ＫａｂａｔおよびＣｈｏｔｈｉａ）とともにｈｕ７５のアミノ酸配列およびヌクレオチド配列を示す。
【０１３５】
ｒ２８およびｈｕ２８ならびにｒ７５およびｈｕ７５についてのヒト受容体フレームワークのＶＨ領域およびＶＬ領域のアラインメントを、表２に示す。Ｋａｂａｔ  ＣＤＲには下線が引かれている。ラット配列とヒト化配列との間のフレームワークの残基における差は、小文字によって示されている。ｒ２８およびｈｕ２８の可変領域についてのヒト受容体フレームワークの間の相同性は、ＶＨでは７３％であり、ＶＬでは７６％である。ｒ７５およびｈｕ７５の可変領域についてのヒト受容体フレームワークの間の相同性は、ＶＨでは４６％であり、ＶＬでは６４％である。Ｋａｂａｔ  ＣＤＲには下線が引かれている。
【０１３６】
【表２】
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【０１３７】
（実施例５）
ｈｕ２８およびｈｕ７５の特徴付け
Ａ．細胞ベースのＥＬＩＳＡ
ヒト化ｈｕ２８およびｈｕ７５、ならびにラット−ヒトキメラｃｈ２８およびｃｈ７５、抗Ｎｏｔｃｈ３抗体を、細胞ベースのＥＬＩＳＡにおいて、細胞表面Ｎｏｔｃｈ３結合についてスクリーニングした。細胞表面上にヒトまたはマウス全長Ｎｏｔｃｈ３タンパク質を安定的に過剰発現するＵ−２  ＯＳ細胞（以下、それぞれＵ２ＯＳ／ｈＮｏｔｃｈ３およびＵ２ＯＳ／ｍＮｏｔｃｈ３）を、ＥＬＩＳＡアッセイの前日に、９６ウェルプレート（白色不透明、ＢＤ／ＶＷＲ）内に５０，０００個細胞／ウェルで蒔いた。ＥＬＩＳＡの日に、培養培地をウェルから除去し、連続希釈した（ブロック緩衝液中に１：３）抗体溶液をプレートにアプライした。プレートを室温で２時間インキュベートし、その後、ＰＢＳ−Ｍｇ／Ｃａで洗浄した。ＨＲＰ−コンジュゲート二次抗体を次いでアプライし、組換えタンパク質ＥＬＩＳＡのために上記のように細胞とともに１時間インキュベートした。プレートをＰＢＳ−Ｍｇ／Ｃａで洗浄し、その後、Ｐｉｃｏ−Ｃｈｅｍｉｌｕｍｉｎｅｓｃｅｎｔ発色キット（Ｔｈｅｒｍａｌ  Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ）で発色させ、化学発光の測定を製造者の指示に従って行った。データのプロッティングおよび分析を、Ｍｉｃｒｏｓｏｆｔ  ＥｘｃｅｌおよびＧｒａｐｈｐａｄ−Ｐｒｉｓｍソフトウェアで行った。ＥＣ５０（ｎＭ）値を、細胞表面Ｎｏｔｃｈ３結合ＥＬＩＳＡから計算し、表３に示した。
【０１３８】
データは、ｈｕ２８が、Ｕ２ＯＳ／ｈＮｏｔｃｈ３細胞の細胞表面上に発現している全長ヒトＮｏｔｃｈ３への結合においてｃｈ２８に類似していることを実証する。さらに、データは、Ｕ２ＯＳ／ｍＮｏｔｃｈ３細胞の細胞表面上に発現しているマウスＮｏｔｃｈ３へのｃｈ２８の交差反応性を完全に保持していたことを実証する。データは、ｈｕ７５が、Ｕ２ＯＳ／ｈＮｏｔｃｈ３細胞の細胞表面上に発現している全長ヒトＮｏｔｃｈ３への結合においてｃｈ７５に類似していることも実証する。さらに、データは、ｈｕ７５が、ヒトＮｏｔｃｈ３へのｃｈ７５の特異性を完全に保持していたことを実証するが、Ｕ２ＯＳ／ｍＮｏｔｃｈ３細胞の細胞表面上に発現しているマウスＮｏｔｃｈ３への交差反応性は観察されなかった。Ｎ／Ｂは、結合なしを表す。
【０１３９】
【表３】
2017186337.tif 000006
【０１４０】
Ｂ．競合ＥＬＩＳＡ
競合ＥＬＩＳＡを、細胞表面に発現した全長ヒトＮｏｔｃｈ３上のｈｕ２８およびｃｈ２８ならびにｈｕ７５およびｃｈ７５について行った。９６ウェル細胞培養プレートに、Ｕ２ＯＳ／ｈＮｏｔｃｈ３細胞（細胞培養プレート、Ｃｏ−ｓｔａｒ）を播種した。０．８ｎＭ  ｃｈ２８（ビオチン化）抗体またはｃｈ７５（ビオチン化）抗体の存在下の、連続希釈した（ブロック緩衝液中に１：３）抗体溶液を、プレートにアプライした。２時間のインキュベーションの後、プレートを上記のように洗浄し、ブロック緩衝液中に１：５，０００で希釈されたＨＲＰ−コンジュゲートストレプトアビジン（Ｓｏｕｔｈｅｒｎ  Ｂｉｏｔｅｃｈ）をアプライした。ストレプトアビジンとの３０分のインキュベーションの後、プレートを再び洗浄し、その後、ＴＭＢ溶液で１０分、発色させた。発色反応を、０．１８Ｍ  Ｈ２ＳＯ４を添加することによって停止させ、４５０ｎＭでの吸光度を測定した。データのプロッティングおよび分析を、Ｍｉｃｒｏｓｏｆｔ  ＥｘｃｅｌおよびＧｒａｐｈｐａｄ−Ｐｒｉｓｍソフトウェアで行った。
【０１４１】
表４は、Ｕ２ＯＳ／ｈＮｏｔｃｈ３細胞の細胞表面上に発現している全長ヒトＮｏｔｃｈ３への結合についての競合ＥＬＩＳＡに由来するＥＣ５０（ｎＭ）値を示す。データは、ｈｕ２８が、非標識ｒ２８に類似のＥＣ５０値を有することを示し、このことは、ｈｕ２８および非標識ｃｈ２８が、Ｕ２ＯＳ／ｈＮｏｔｃｈ３細胞の細胞表面上に発現している全長ヒトＮｏｔｃｈ３への結合について、ビオチン化ｃｈ２８と競合することを実証している。データは、ｈｕ２８が、ｃｈ２８と同一のまたは非常に類似の、Ｕ２ＯＳ／ｈＮｏｔｃｈ３細胞の細胞表面上に発現している全長ヒトＮｏｔｃｈ３上のエピトープに結合することを示す。
【０１４２】
データはさらに、ｈｕ７５が、非標識ｃｈ７５に類似のＥＣ５０値を有することを示し、このことは、ｈｕ７５および非標識ｃｈ７５が、Ｕ２ＯＳ／ｈＮｏｔｃｈ３細胞の細胞表面上に発現している全長ヒトＮｏｔｃｈ３への結合について、ビオチン化ｃｈ７５と競合することを実証している。データは、ｈｕ７５が、ｃｈ７５と同一のまたは非常に類似の、Ｕ２ＯＳ／ｈＮｏｔｃｈ３細胞の細胞表面上に発現している全長ヒトＮｏｔｃｈ３上のエピトープに結合することを示す。
【０１４３】
【表４】
2017186337.tif 000007
【０１４４】
Ｃ．他のヒトＮｏｔｃｈホモログへの結合の特異性
Ｎｏｔｃｈ受容体ファミリーの他のメンバーは、生物学的方法において重要な役割を有する。例えば、Ｎｏｔｃｈ１またはＮｏｔｃｈ２の欠如は、マウスモデルで胚の死亡をもたらす。逆に、Ｎｏｔｃｈ４の欠如は、マウスモデルで検出可能な表現型をもたらさない。Ｎｏｔｃｈ３  ＮＲＲ領域の最も近いホモログは、Ｎｏｔｃｈ１およびＮｏｔｃｈ２であり（約５０％の相同性）、Ｎｏｔｃｈ４はより遠いホモログである（約３０％の相同性）。Ｎｏｔｃｈファミリーの他のメンバー、特にＮｏｔｃｈ１および２への、抗Ｎｏｔｃｈ３抗体の交差反応性は、患者における望ましくない影響をもたらしうる。したがって、他のＮｏｔｃｈファミリーメンバーへの、ｒ２８およびｈｕ２８、ならびにｒ７５およびｈｕ７５の潜在的な交差反応性を評価した。
【０１４５】
ヒトＩｇＧ１  Ｆｃ断片と融合した、ヒトＮｏｔｃｈ１およびＮｏｔｃｈ２  ＮＲＲ領域をコードする発現構築物を、ＣＨＯ−ＰＡＣＥ細胞内に安定的に導入した。ＮＲＲ−Ｆｃ融合体を発現するこれらの細胞に由来する馴化培地を収集した。ヒトＮｏｔｃｈ２  ＮＲＲ−ＦｃおよびヒトＮｏｔｃｈ１  ＮＲＲ−Ｆｃを、タンパク質Ａ親和性によって精製し、その後、サイズ排除クロマトグラフィー（ＳＥＣ）によって精製した。精製された調製物を、１ｍＭ  ＣａＣｌ２を有するＴＢＳ中に透析し、９９％超の純度になるまで、分析ＳＥＣで分析した。
【０１４６】
表５に示すように、ｒ２８およびｈｕ２８、ならびにｒ７５およびｈｕ７５は、すべて、ヒトＮｏｔｃｈ２  ＮＲＲ−Ｆｃ融合タンパク質への検出可能な結合を欠いていた。さらに、ｈｕ２８およびｈｕ７５も、全長ヒトＮｏｔｃｈ１  ＮＲＲ−Ｆｃへの検出可能な結合を欠いていた。このことは、ｈｕ２８およびｈｕ７５がＮｏｔｃｈ１またはＮｏｔｃｈ２と交差反応しないことを実証する。Ｎ／Ｂは、結合なしを表す。
【０１４７】
【表５】
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【０１４８】
Ｄ．ヒトＮｏｔｃｈ３  ＮＲＲへの結合親和性
抗Ｎｏｔｃｈ３  ＮＲＲの相互作用の動力学定数を、表面プラズモン共鳴（Ｂｉａｃｏｒｅ（登録商標）Ｔ１００、Ｂｉａｃｏｒｅ  Ｉｎｃ．、ピスカタウェイ、ニュージャージー州）によって判定した。ＣＭ５チップのフローセルを、１０ｍＭグリシン、ｐＨ５．０中の約１０，０００応答単位（ＲＵ）の抗ヒトＩｇＧ−Ｆｃ（Ｂｉａｃｏｒｅ（登録商標））で、１０μｌ／分で６００秒、固定した。１０μｇ／ｍｌ抗Ｎｏｔｃｈ３抗体ｃｈ２８およびｈｕ２８、ならびにｃｈ７５およびｈｕ７５を、１ｍＭ  ＣａＣｌ２を有するＴＢＳ中に希釈し、１０μｌ／分で捕捉した。１００μｌ／分での、４濃度のヒトＮｏｔｃｈ３  ＮＲＲ組換えタンパク質（３．７〜１００ｎＭ）およびゼロ濃度（ランニング緩衝液）の関連を、１ｍＭ  ＣａＣｌ２を有するＴＢＳ中で３分、記録した。複合体の解離を、１０分測定した。チップの表面を、３Ｍ  ＭｇＣｌ２および３ｍＭ  ＥＧＴＡを６０秒、１０μｌ／分で注入することによって再生した。参照および緩衝液のシグナルを差し引いた後に得られた曲線は、Ｂｉａｃｏｒｅ（登録商標）Ｔ１００  Ｅｖａｌｕａｔｉｏｎ  Ｓｏｆｔｗａｒｅ（Ｂｉａｃｏｒｅ（登録商標））で、１：１ラングミュア結合モデルに適合した。
【０１４９】
Ｋａ、Ｋｄ、およびＫＤを表６に示す。動力学的分析は、ｃｈ２８およびｈｕ２８について、類似のｋａ（オン）速度およびｋｄ（オフ）速度を示す。さらに、ｃｈ７５よりもｈｕ７５について、より高いｋａ（オン）速度およびより低いｋｄ（オフ）速度が観察され、その結果、ｈｕ７５についてより低いＫＤ値が得られた。
【０１５０】
【表６】
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【０１５１】
Ｄ．熱安定性
タンパク質またはタンパク質ドメインの熱安定性とタンパク質またはタンパク質ドメインの全体的な安定性との間に正の相関がある。タンパク質またはタンパク質ドメインの融点がより高いと、製造可能性が改善され、保存可能期間がより長くなることが多い。示差走査熱量測定（ＤＳＣ）を用いて、ｈｕ２８およびｈｕ７５対ｃｈ２８およびｃｈ７５の熱安定性をそれぞれ評価した。タンパク質試料を、２５０μｌの体積に０．３ｍｇ／ｍｌまで、ＰＢＳ中に希釈した。対応する製剤緩衝液ブランクを、参照試料に用いた。両試料を、８℃に設定したＭｉｃｒｏＣａｌ  ＴｈｅｒｍｏＶａｃ  Ｓａｍｐｌｅ  Ｄｅｇａｓｓｉｎｇ  ａｎｄ  Ｔｈｅｒｍｏｓｔａｔ（Ｍｉｃｒｏｃａｌ，Ｉｎｃ．、ノーサンプトン、マサチューセッツ州）を用いて、完全に脱気した。試料を、ＭｉｃｒｏＣａｌ  ＶＰ−ＤＳＣ  Ｃａｐｉｌｌａｒｙ  Ｃｅｌｌ  ＭｉｃｒｏＣａｌｏｒｉｍｔｅｒ（ＭｉｃｒｏＣａｌ，Ｉｎｃ．、ノーサンプトン、マサチューセッツ州）の適切なセルに分注した。試料を１５℃で４分平衡化し、次いで、１時間当たり１００℃の速度で１００℃までスキャンした。２０秒のフィルタリング時間を選択した。生のデータをベースライン補正し、タンパク質濃度を正規化した。Ｏｒｉｇｉｎ  Ｓｏｆｔｗａｒｅ（ＯｒｉｇｉｎＬａｂ  Ｃｏｒｐｏｒａｔｉｏｎ、ノーサンプトン、マサチューセッツ州）を用いて、データを、適切な数の転移を有するＭＮ２−Ｓｔａｔｅ  Ｍｏｄｅｌにフィットさせた。
【０１５２】
以下の表７に示すように、ｈｕ２８およびｈｕ７５の両方は、ｃｈ２８およびｃｈ７５とそれぞれ比較して、それらのＦａｂ領域（すべて７７℃超）において、より高い融点によって示されるように、より高い熱安定性を有していた。
【０１５３】
【表７】
2017186337.tif 000010
【０１５４】
（実施例６）
ドメイン交換キメラ構築物
実施例３に記載したように、ｈｕ２８およびｈｕ７５の両方は、Ｎｏｔｃｈ１タンパク質との交差反応性を欠いていた。Ｎｏｔｃｈ１およびＮｏｔｃｈ３  ＮＲＲについてのドメイン交換キメラ構築物を、抗Ｎｏｔｃｈ３  ｃｈ２８およびｃｈ７５抗体のエピトープマッピングのために調製した。Ｃ末端Ｆｃ融合体（ヒトＩｇＧ１  Ｆｃ断片）を有するヒトＮｏｔｃｈ１−Ｎｏｔｃｈ３（以下、Ｎｏｔｃｈ１−３）ＮＲＲ領域ドメイン交換キメラをコードする発現構築物を、ＣＨＯ−ＰＡＣＥに個別にトランスフェクトし、各キメラを発現する安定なプールを確立した。安定なプールに由来する馴化培地を、タンパク質Ａ親和性クロマトグラフィーにアプライし、その後、キメラ融合タンパク質の精製のためにサイズ排除クロマトグラフィー（ＳＥＣ）を行った。精製された調製物を、１ｍＭ  ＣａＣｌ２を有するＴＢＳ中に透析し、分析ＳＥＣで分析した。図６は、組換えＮＲＲキメラタンパク質が、ヒトＦｃ（示されていない）に融合した様々なＮｏｔｃｈ１（灰色で示されている）ドメインおよびＮｏｔｃｈ３（黒で示されている）ドメインからなることを示している。
【０１５５】
Ｎｏｔｃｈ１−３ＮＲＲドメイン交換キメラへのｃｈ２８およびｃｈ７５の相対的結合能力を、実施例３および５に記載したようにＥＬＩＳＡで試験した。Ｎｏｔｃｈ１−３ＮＲＲドメイン交換キメラを、１ｕｇ／ｍｌでＥＬＩＳＡプレート上に被覆し、その後、０．９ｍＭ  Ｍｇ２＋およびＣａ２＋を有するＰＢＳ中の１％ＢＳＡでブロックした。ｃｈ２８およびｃｈ７５を次いで、ブロックしたプレートに、ブロック緩衝液中に５ｕｇ／ｍｌ希釈でアプライした。１時間のインキュベーションの後、プレートを、０．９ｍＭ  Ｍｇ２＋およびＣａ２＋を有するＰＢＳで洗浄し、その後、ＨＲＰとコンジュゲートした二次ヤギ抗ヒトＦｃ抗体をアプライし、プレート上でインキュベートした。再び洗浄した後、プレートをＴＭＢで発色させ、発色反応を、０．１８Ｍ  Ｈ２ＳＯ４を添加することによって停止させた。Ｏ．Ｄ．４５０ｎＭをプレートリーダーで読み、相対的結合能力を、Ｏ．Ｄ．値によって示した。
【０１５６】
図６に示すように、Ｎｏｔｃｈ３  ＮＲＲのドメインへのｃｈ２８およびｃｈ７５のエピトープ結合プロファイルは異なる。より具体的には、Ｎｏｔｃｈ３  ＮＲＲへのｃｈ２８の結合は、ＬＮＲ−ＣドメインおよびＨＤ−１ドメインに、より依存しており、一方、ｃｈ７５は、ＬＮＲ−Ａドメインと、ＨＤ−１ドメインおよびＤ−２ドメインの両方とに、より依存していた。ｃｈ２８およびｃｈ７５についての観察された結合プロファイルは、抗体のシグナル伝達阻害活性と一致していた。特に、ｃｈ２８のみが、Ｎｏｔｃｈ３  ＮＲＲ領域をＮｏｔｃｈ３シグナル伝達の活性化の阻害に必要な自己阻害性コンホメーションに維持しない、Ｎｏｔｃｈ３  ＮＲＲヘテロ二量体（ＨＤ−１）のＮ末端と相互作用した。逆に、ｃｈ７５は、Ｎｏｔｃｈ３  ＮＲＲ領域を自己阻害性コンホメーションに維持し、それによってＮｏｔｃｈ３シグナル伝達の活性化を阻害する、Ｎｏｔｃｈ３  ＮＲＲヘテロ二量体のＨＤ−１ドメインおよびＨＤ−２ドメインの両方と相互作用した。
【０１５７】
（実施例７）
Ｎｏｔｃｈ３発現がん細胞系の同定
Ｎｏｔｃｈ３の発現を、ウェスタンブロット分析によってがん細胞系のパネルにおいて判定して、抗Ｎｏｔｃｈ３抗体および抗Ｎｏｔｃｈ３抗体−薬物コンジュゲートのさらなる分析および試験のためにＮｏｔｃｈ３陽性細胞を同定した。パネルは、ＨＣＣ２４２９肺がん細胞系、ＯＶＣＡＲ３卵巣がん細胞系、ＭＤＡ−ＭＢ−４６８乳がん細胞系、Ｎ８７胃がん細胞系、ならびに以下Ｕ２ＯＳ／ｈＮｏｔｃｈ３およびＭＤＡＭＢ４６８／ｈＮｏｔｃｈ３とそれぞれ呼ばれるＵ−２  ＯＳ細胞およびＭＤＡ−ＭＢ−４６８細胞を含むヒトＮｏｔｃｈ３を過剰発現するように改変された細胞系を含む。Ｎｏｔｃｈ３を、標準的なウェスタンブロット手順を用いて、ウサギモノクローナル抗Ｎｏｔｃｈ３抗体Ｄ１１Ｂ８（Ｃｅｌｌ  Ｓｉｇｎａｌｉｎｇ  Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ）またはマウスモノクローナル１Ｇ５（Ａｂｎｏｖａ）で検出した。
【０１５８】
Ｄ１１Ｂ８抗Ｎｏｔｃｈ３抗体は、ヒトＮｏｔｃｈ３タンパク質のＣ末端尾部内のＧｌｕ２３１２を囲むピトープに結合し、切断されていない全長Ｎｏｔｃｈ３（約２７０ｋＤａ）と、（約８０〜９０ｋＤａの）Ｎｏｔｃｈ３タンパク質断片を含有する切断されたＣ末端ドメインとの両方を認識する。図７に示すように、約８０〜９０ｋＤａの分子量のＮｏｔｃｈ３バンドは、ＴＭＩＣ（膜貫通および細胞内ドメイン）タンパク質分解断片および／またはＮＥＸＴ（Ｎｏｔｃｈ細胞外トランケーション）タンパク質分解断片に相当する。１Ｇ５抗体は、Ｎｏｔｃｈ３細胞外ドメイン（ＥＣＤ）のアミノ酸４７〜１５６内のエピトープを結合し、切断されていない全長（約２７０ｋＤａ）と切断されたＮ末端断片（約２１０ｋＤａ）との両方を認識する（データは示されていない）。
【０１５９】
図７に示すように、Ｎｏｔｃｈ３−ＥＣＤ（データは示されていない）と、Ｎｏｔｃｈ３タンパク質断片を含有する切断されたＣ末端ドメインとの両方は、ＨＣＣ２４２９、ＯＶＣＡＲ３、ＭＤＡ−ＭＢ−４６８、Ｎ８７、ＭＤＡＭＢ４６８／ｈＮｏｔｃｈ３、およびＵ２ＯＳ／ｈＮｏｔｃｈ３で検出された。さらに、Ｎｏｔｃｈ３は、ＳＷ９００肺がん細胞系において検出されず、したがって、Ｎｏｔｃｈ３陰性対照細胞系に相当する。
【０１６０】
（実施例８）
抗Ｎｏｔｃｈ３抗体の内部移行および輸送
抗Ｎｏｔｃｈ３抗体−薬物コンジュゲートは、一連の細胞傷害性剤にコンジュゲートされたペプチド切断可能なマレイミドカプロニック−バリン−シトルリン−ｐ−アミノベンジルオキシカルボニル（ｖｃ）リンカーまたは切断不可能なチオエーテルベースのマレイミドカプロイル（ｍｃ）リンカーからなる。抗体からのペイロードの放出は、ｍｃ連結ペイロードを放出するための抗体の完全な異化のためにｖｃ型のリンカーまたは後期リソソームを切断するための、タンパク質分解酵素、例えばカテプシンＢを有するリソソームへの抗体−薬物コンジュゲートの輸送および局在化を要する。リソソーム小胞への抗Ｎｏｔｃｈ３抗体の内部移行および細胞内輸送を、間接的および直接的な免疫蛍光顕微鏡法ベースのアッセイによって監視した。抗Ｎｏｔｃｈ３抗体の細胞内輸送を直接的に視覚化するために、それらを蛍光染料にコンジュゲートし、ｐＨｒｏｄｏ（商標）レッドデキストラン（Ｌｉｆｅ  Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ）の存在下で生細胞とともにインキュベートして、リソソームなどの酸性小胞を染色した。生細胞の画像化を行って、蛍光標識した抗体とリソソームおよび他の酸性小胞との共局在化を同定した。さらに、間接的な免疫蛍光顕微鏡法ベースのアッセイを細胞に対して行って、抗Ｎｏｔｃｈ３抗体およびＬＡＭＰ１、すなわちリソソーム関連タンパク質の共局在化を確認した。
【０１６１】
Ａ．内部移行およびリソソーム輸送
ＨＣＣ２４２９細胞またはＭＤＡ−ＭＢ−４６８細胞を、カバー＃１．５ホウケイ酸無菌スライド（Ｔｈｅｒｍｏ  Ｆｉｓｈｅｒ  Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ  Ｉｎｃ．）を有するＬａｂ  Ｔｅｃ  ＩＩ  ４区画化カバーガラスで培養した。１日目に、ｐＨｒｏｄｏ（商標）レッドデキストラン（Ｌｉｆｅ  Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ）を１０μｇ／ｍｌの濃度で培地に添加し、１６時間インキュベートして、リソソームなどの酸性小胞を染色した。２日目に、細胞をＨＢＳＳ＋＋（Ｇｉｂｃｏ  Ｌｉｆｅ  Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ）で２回洗浄した。抗Ｎｏｔｃｈ３抗体ｈｕ７５をＡｌｅｘａ  Ｆｌｕｏｒ  ４８８にコンジュゲートし（以下「ｈｕ７５−Ａｌｅｘａ４８８」）（Ｌｉｆｅ  Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ  Ｐｒｏｔｅｉｎ  Ｌａｂｅｌｉｎｇキット）、ｈｕ２８を、製造者の指示に従って、ＤｙＬｉｇｈｔ６５０マレイミド試薬に直接的にコンジュゲートした（以下「ｈｕ２８−ＤｙＬｉｇｈｔ６５０」）（Ｔｈｅｒｍｏ  Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ）。Ｈｕ７５−Ａｌｅｘａ４８８またはｈｕ２８−ＤｙＬｉｇｈｔ６５０標識抗体を、２％ウシ血清アルブミン（ＢＳＡ）／ＨＢＳＳ＋＋中で５μｇ／ｍｌの濃度で、２５分、湿った氷の上で、細胞に添加した。細胞を、氷冷したＨＢＳＳ＋＋で氷上で２回洗浄し、２％ＢＳＡ／ＨＢＳＳ＋＋中に置き、ｅＸｃｅｌｏｎ  Ｅｖｏｌｖｅ  ５１２カメラ（Ｐｈｏｔｏｍｅｔｒｉｃｓ）ならびに温度、湿度、および５％ＣＯ２制御のためのＸＬ  Ｓ  Ｓｅｒｉｅｓチャンバ（Ｚｅｉｓｓ）を備えた回転ディスクＣＳＵ−Ｘ１Ｍ  ５０００顕微鏡（横河電機株式会社）で、５分から１２〜１８時間、画像化した。画像を５分ごとに捕捉し、Ｚｅｎ  ＣＺＩファイルフォーマット（Ｚｅｉｓｓ）を用いて組み合わせた。ピアソンの相関係数を、Ｖｏｌｏｃｉｔｙ  ｖ６．３ソフトウェア（ＰｅｒｋｉｎＥｌｍｅｒ）を用いて計算して、ｈｕ２８−ＤｙＬｉｇｈｔ６５０とｐＨｒｏｄｏ（商標）レッドデキストランとの間の共局在化の程度を判定した。
【０１６２】
細胞を生細胞の画像化のために調製すると、評価可能な最も早い時点は、セットアップおよび画像取得のための機器設定の最適化に起因して、１０分であった。細胞を、加湿した、３７℃、５％ＣＯ２のチャンバに置いたおよそ１０分後、図８に示すように、ｈｕ７５−Ａｌｅｘａ４８８を、細胞表面で、および細胞内部のいくつかの点様構造内で観察することができた。この結果は、抗Ｎｏｔｃｈ３抗体ｈｕ７５が、Ｎｏｔｃｈ３受容体を細胞膜で結合すると迅速に内部移行されることを示す。早期の時点（１０分から約６５分）で、細胞内の抗Ｎｏｔｃｈ３抗体ｈｕ７５−Ａｌｅｘａ４８８およびｐＨｒｏｄｏ（商標）レッドデキストランで染色された酸性小胞は、共局在化しない個別の点として現れた。図８Ｂ中の矢印によって示されるように、約７０分の時点以降、抗Ｎｏｔｃｈ３抗体ｈｕ７５およびｐＨｒｏｄｏ（商標）レッドデキストラン標識小胞は、同一の個別の点様構造に共局在化した。このデータは、図８Ｂで示されるように、抗Ｎｏｔｃｈ３抗体ｈｕ７５が、ＨＣＣ２４２９細胞（データは示されていない）およびＭＤＡ−ＭＢ−４６８細胞を発現するＮｏｔｃｈ３において、リソソームなどの酸性小胞に内部移行され、輸送されたことを示唆する。
【０１６３】
細胞を、加湿した、３７℃、５％ＣＯ２のチャンバに置いた約１０分後に、図８Ｃに示すように、ｈｕ２８−ＤｙＬｉｇｈｔ６５０を細胞表面で観察することができた。細胞内の抗Ｎｏｔｃｈ３抗体ｈｕ２８−ＤｙＬｉｇｈｔ６５０およびｐＨｒｏｄｏ（商標）レッドデキストラン染色酸性小胞は、図８Ｄ中の矢印によって示されるように、個別の点として現れ、時間とともに次第に共局在化した。ピアソンの相関係数（ＰＣＣ）を計算して、ＭＤＡ−ＭＢ−４６８細胞内のｈｕ２８−ＤｙＬｉｇｈｔ６５０とｐＨｒｏｄｏ（商標）レッドデキストラン蛍光標識との間の重複または共局在化の程度を経時的に判定した。ＰＣＣの数値が高いほど、ｈｕ２８−ＤｙＬｉｇｈｔ６５０とｐＨｒｏｄｏ（商標）レッドデキストラン蛍光標識との間の共局在化の程度が大きい。図８Ｅは、約３６０分までの共局在化の一定の増大を実証し、ｈｕ２８−ＤｙＬｉｇｈｔ６５０とｐＨｒｏｄｏ（商標）レッドデキストランとの間の最大の共局在化は、約４２０分で生じ、その後停滞期となる。データは、抗Ｎｏｔｃｈ３抗体ｈｕ２８−ＤｙＬｉｇｈｔ６５０が、Ｎｏｔｃｈ３を発現するＭＤＡ−ＭＢ−４６８細胞において、リソソームなどの酸性小胞に内部移行され、輸送されたことを示唆する。
【０１６４】
Ｂ．リソソーム関連膜タンパク質１（ＬＡＭＰ１）との共局在化
ＨＣＣ２４２９細胞またはＭＤＡ−ＭＢ−４６８細胞を、カバー＃１．５ホウケイ酸無菌スライド（Ｔｈｅｒｍｏ  Ｆｉｓｈｅｒ  Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ  Ｉｎｃ．）を有するＬａｂ  Ｔｅｃ  ＩＩ  ４区画化カバーガラスで培養した。結合および内部移行のアッセイのために、細胞をＨＢＳＳ＋＋で２回洗浄し、コンジュゲートしていない抗Ｎｏｔｃｈ３抗体ｈｕ７５およびｈｕ２８を、２％ウシ血清アルブミン（ＢＳＡ）／ＨＢＳＳ＋＋中で１０μｇ／ｍｌの濃度で、２５分、氷上で、細胞に添加した。０分の時点での膜結合を視覚化するために、対照細胞を氷冷したＨＢＳＳ＋＋で洗浄し、次いで、ＰＢＳ中の４％パラホルムアルデヒド中で１０分固定した。抗体の内部移行のために、細胞を氷冷したＨＢＳＳ＋＋で２回洗浄し、次いで、事前に温めた完全成長培地を細胞に添加し、加湿した、３７℃、５％ＣＯ２のインキュベーター内部に置いた。細胞をインキュベーターから取り出し、洗浄し、５分から１８時間の複数の時点で、先のように固定した。細胞を次いでＰＢＳで３回洗浄し、ＰＢＳ中の０．３％Ｔｒｉｔｏｎ  Ｘ−１００で１０分、透過処理した。細胞をＰＢＳで３回、各時点で５分、洗浄し、次いで、３％ＢＳＡ／ＰＢＳ中で１時間ブロックした。抗ＬＡＭＰ−１マウスモノクローナル抗体（Ｈ４Ａ３、Ａｂｃａｍ）を２％ＢＳＡ／ＰＢＳ中に１：１００で添加し、一晩、４℃でインキュベーションした。細胞をＰＢＳで２回、各時点で５分洗浄し、次いで、二次ヤギ抗ヒトＡｌｅｘａ  Ｆｌｕｏｒ  ４８８およびヤギ抗マウスＡｌｅｘａ  Ｆｌｕｏｒ  ５５５（Ｌｉｆｅ  ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ）を、４５分、暗所で添加した。細胞をＰＢＳで３回洗浄し、Ｚｅｉｓｓ  ＬＳＭ５１０共焦点顕微鏡またはＣＳＵ−Ｘ１Ｍ５０００（横河電機株式会社）回転ディスク共焦点顕微鏡で画像化した。
【０１６５】
氷上で抗Ｎｏｔｃｈ３抗体とともにインキュベートし、次いで即座に固定した対照細胞において、ｈｕ２８およびｈｕ７５の両方は、Ｎｏｔｃｈ３発現細胞の細胞表面で局在化し、染色は細胞内部で観察されなかった。対照細胞において、リソソームは抗ＬＡＭＰ１抗体で染色され、抗Ｎｏｔｃｈ３抗体ｈｕ２８およびｈｕ７５と共局在化しなかった細胞の内部で個別の点様構造として現れた。３７℃で９０分のインキュベーションの後、抗Ｎｏｔｃｈ３抗体ｈｕ２８およびｈｕ７５は、抗ＬＡＭＰ１抗体と共局在化した細胞の内部で点様構造で観察された。３７℃でのインキュベーションの後、抗Ｎｏｔｃｈ３抗体ｈｕ２８およびｈｕ７５の細胞膜染色は低減し、結果的に検出不可能となった。このデータは、抗Ｎｏｔｃｈ３抗体ｈｕ２８およびｈｕ７５が、氷上での細胞とのインキュベーションの後に細胞表面を結合し、次いで、温度依存性の内部移行を３７℃で受けたことを示唆した。内部移行すると、抗Ｎｏｔｃｈ３抗体ｈｕ２８およびｈｕ７５は、ＬＡＭＰ１タンパク質と共局在化し、このことは、それらがリソソームに特異的に輸送されたことを示す（データは示されていない）。
【０１６６】
（実施例９）
細胞ベースのアッセイでのＮｏｔｃｈ３シグナル伝達に対する抗Ｎｏｔｃｈ３抗体の影響
Ｎｏｔｃｈ３シグナル伝達は、リガンド誘発性のタンパク質分解によって開始される。部位Ｓ１でのフーリン様プロテアーゼ切断の後の成熟Ｎｏｔｃｈ３ヘテロ二量体は、膜近傍の負調節領域（ＮＲＲ）によって自己阻害状態に維持される。ＤＬＬ４またはＪａｇｇｅｄ１などのリガンドの、Ｎｏｔｃｈ３−ＥＣＤへの結合は、ＡＤＡＭ型のメタロプロテイナーゼおよびガンマセクレターゼによってそれぞれ触媒される、部位Ｓ２およびＳ３での２つの連続するさらなる切断を誘発する。後者の切断は、Ｎｏｔｃｈ３細胞内ドメイン（ＮＩＣＤ３）を放出し、その核への移動を可能にし、ＣＳＬタンパク質についてのコンセンサスＤＮＡ結合部位モチーフを含有する標的遺伝子の転写を活性化する。
【０１６７】
抗Ｎｏｔｃｈ３キメラ抗体ｃｈ２８−ｈｕＩｇＧ１およびｃｈ７５−ｈｕＩｇＧ１、ならびにヒト化抗体ｈｕ２８およびｈｕ７５の、Ｎｏｔｃｈ３シグナル伝達を阻害する能力を、Ｎｏｔｃｈ３依存性レポーター遺伝子共培養アッセイで試験した。抗Ｎｏｔｃｈ３抗体をＮｏｔｃｈ３レポーター細胞とともにプレインキュベートし、次いで、Ｎｏｔｃｈ３シグナル伝達を活性化させるためのＤＬＬ４−ＨＥＫ２９３細胞または対照としての親ＨＥＫ２９３細胞と共培養した。
【０１６８】
Ａ．Ｎｏｔｃｈ３レポーター遺伝子共培養アッセイのための細胞系の構築
Ｎｏｔｃｈ３レポーター細胞系を生成するために、一連の３回の連続的で安定なトランスフェクションを、Ｕ−２  ＯＳヒト骨肉腫細胞系（ＡＴＣＣ、マナサス、バージニア州）で行った。第１のトランスフェクションは、ｐＣＭＶ６−Ｅｎｔｒｙ−Ｍｙｃ−Ｆｌａｇバックボーン（Ｏｒｉｇｅｎｅ）ベースの全長ヒトＮｏｔｃｈ３の発現についてのベクターを使用し、Ｎｏｔｃｈ３インサートの正確なＤＮＡ配列を確認した。ＴｒａｎｓＩＴ−ＬＴ１トランスフェクション試薬（Ｍｉｒｕｓ、マディソン、ウィスコンシン州）でのトランスフェクションの後、Ｕ−２  ＯＳ細胞をＧ４１８において選択し、およびクローン系を単離した。第２に、安定なＮｏｔｃｈ３発現Ｕ−２  ＯＳクローンを、ＣＳＬエンハンサー配列（ＣＧＴＧＧＧＡＡＡＡＴ）の８個のタンデムコピーを含有するｐＧＬ４．２７［ｌｕｃ２Ｐ／ｍｉｎＰ／Ｈｙｇｒｏ］ベクター（Ｐｒｏｍｅｇａ、マディソン、ウィスコンシン州）でリトランスフェクトし、ハイグロマイシンＢおよびＧ４１８において選択し、クローン系を単離した。８×ＣＳＬホタルルシフェラーゼレポーター構築物は、活性化されたＮｏｔｃｈシグナル伝達に対して応答性である（例えば、Ｊｅｆｆｒｉｅｓら、Ｍｏｌ．Ｃｅｌｌ．Ｂｉｏｌ．２２（１１）：３９２７〜３９４１、２００２を参照）。第３に、ヒトＮｏｔｃｈ３  ８×ＣＳＬホタルルシフェラーゼＵ−２  ＯＳ細胞に、Ｃｉｇｎａｌ  Ｌｅｎｔｉ  Ｒｅｎｉｌｌａ  Ｃｏｎｔｒｏｌ（ｌｕｃ）（Ｑｉａｇｅｎ、カリフォルニア州）レンチウイルス粒子を形質導入し、ピューロマイシン、ハイグロマイシンＢ、およびＧ４１８において選択し、クローン系を単離した。Ｃｉｇｎａｌ  Ｌｅｎｔｉ  Ｒｅｎｉｌｌａ対照（ｌｕｃ）ベクターは、ＣＭＶプロモーターから構成的に発現しており内部対照として役立つ、ウミシイタケルシフェラーゼ遺伝子をコードしていた。３つの安定なトランスフェクトをされたＵ−２  ＯＳ系（以下「Ｎｏｔｃｈ３レポーター細胞」と呼ばれる）を、１０％ＦＢＳ、１×ペニシリン／ストレプトマイシン／Ｌ−グルタミン（Ｇｉｂｃｏ）、０．２５ｍｇ／ｍｌ  Ｇ４１８スルファート、０．３ｍｇ／ｍｌハイグロマイシンＢ、および０．００１ｍｇ／ｍｌピューロマイシンを含有するＭｃＣｏｙ’ｓ  ５Ａ培地（Ｇｉｂｃｏ、グランドアイランド、ニューヨーク州）において維持した。
【０１６９】
リガンド発現細胞を生成するために、ＨＥＫ２９３細胞（ＡＴＣＣ）を、ヒトＤＬＬ４の発現のためのベクターでトランスフェクトした。ベクターは、ｐＣＭＶ６−ＡＣ−ＨＡ−Ｈｉｓバックボーン（Ｏｒｉｇｅｎｅ、ロックビル、メリーランド州）ベースのものであり、ＤＬＬ４インサートの正確なＤＮＡ配列を確認した。トランスフェクションの後、ＨＥＫ２９３細胞を０．５ｍｇ／ｍｌ  Ｇ４１８において選択し、クローン系を単離し、増幅させ、ＤＬＬ４発現について分析した。Ｕ−２  ＯＳ細胞におけるＤＬＬ４発現が高く、Ｎｏｔｃｈ３レポーター活性の誘発が高いクローンを用いて、抗Ｎｏｔｃｈ３抗体の阻害効果を評価した。
【０１７０】
ホタルルシフェラーゼに由来する発光の読み取りを、内部対照であるウミシイタケルシフェラーゼの読み取りで割って、シグナルを正規化した（以下「Ｆ／Ｒ比」と呼ばれる）。Ｎｏｔｃｈ３シグナル伝達の誘発が何倍であるかを計算するために、ＤＬＬ４−ＨＥＫ２９３共培養レポーターアッセイから生じたＦ／Ｒ比を、親ＨＥＫ２９３共培養物に由来するＦ／Ｒ比で割って、相対的ルシフェラーゼ単位（ＲＬＵ）または活性と名付けた。
【０１７１】
Ｂ．レポーター遺伝子共培養アッセイ
ヒトＮｏｔｃｈ３レポーター細胞をトリプシン処理し、５０％の完全ＭｃＣｏｙ’ｓ  ５Ａ培地（１０％ＦＢＳおよびペニシリン、ストレプトマイシンを有するＭｃＣｏｙ’ｓ  ５Ａ、Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ）および５０％の完全ＭＥＭ培地（１０％ＦＢＳおよびペニシリン、ストレプトマイシンを有するＭＥＭ、Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ）からなるアッセイ培地中の培養プレートから回収し、計数した。細胞の適切な希釈物を、同一の培地で作製して、連続希釈した（完全ＭｃＣｏｙ’ｓ  ５Ａ培地中で１：３）抗体溶液またはハイブリドーマ培養上清の存在下で、９６ウェル培養プレート（白色不透明、ＢＤ／ＶＷＲ）上で４５μｌ／ウェルの全体積中で１０，０００個細胞／ウェルとなるようにした。細胞および抗体希釈物の混合物を、無菌フード内のプレート上で、室温で１時間インキュベートし、その後、３０，０００個／４５μｌヒトＤＬＬ４−ＨＥＫ２９３細胞を各ウェルに添加した。ｈＤＬＬ４−ＨＥＫ２９３細胞を添加した後、プレートをさらに、２０時間、インキュベーター内でインキュベートし、Ｄｕａｌ−Ｇｌｏルシフェラーゼアッセイ系（Ｐｒｏｍｅｇａ）を用いて、ホタルルシフェラーゼおよび内部対照であるウミシイタケルシフェラーゼの活性を、製造者の指示に従って測定した。データを、Ｍｉｃｒｏｓｏｆｔ  ＥｘｃｅｌおよびＧｒａｐｈｐａｄ−Ｐｒｉｓｍソフトウェアでプロットおよび分析した。
【０１７２】
ヒトＮｏｔｃｈ３レポーター共培養アッセイにおけるｃｈ７５−ｈｕＩｇＧ１およびｈｕ７５の滴定は、用量依存的にＮｏｔｃｈ３シグナル伝達の強力な阻害を実証した。表８は、ヒトＮｏｔｃｈ３レポーター細胞におけるＮｏｔｃｈ３依存性シグナル伝達に対する、ｃｈ７５−ｈｕＩｇＧ１抗体およびｈｕ７５抗体の阻害活性を示す。ｃｈ７５−ｈｕＩｇＧ１およびｈｕ７５は、ヒトＮｏｔｃｈ３依存性シグナル伝達レポーターアッセイにおいて類似の中和活性を示した。したがって、ｈｕ７５は、ｃｈ７５−ｈｕＩｇＧ１の阻害活性を完全に保持していた。ｃｈ２８−ｈｕＩｇＧ１とｈｕ２８との両方は、対照であるｃｈ２Ｈ６−ｈｕＩｇＧ１抗体およびｈｕＮｅｇ８．８抗体に類似のレベルでＮｏｔｃｈ３シグナル伝達を弱く阻害した。このことは、ｃｈ２８−ｈｕＩｇＧ１およびｈｕ２８の阻害活性が非特異的であったことを示す。さらに、データは、抗Ｎｏｔｃｈ３抗体ｃｈ２８−ｈｕＩｇＧ１およびｈｕ２８がＮｏｔｃｈ３シグナル伝達を阻害せず、したがってｃｈ７５−ｈｕＩｇＧ１およびｈｕ７５と機能的に異なることを実証する。
【０１７３】
【表８】
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【０１７４】
ｃｈ７５−ｈｕＩｇＧ１バリアントおよびｈｕ７５バリアントのＩＣ５０（ｎＭ）値を、Ｎｏｔｃｈ３レポーター遺伝子共培養アッセイのＮｏｔｃｈ３依存性シグナル伝達の阻害から計算した。図９に示すように、２つまたは３つの独立した実験に由来するＩＣ５０（ｎＭ）データを平均化した。ｈｕ７５とｃｈ７５−ｈｕＩｇＧ１との両方は低いＩＣ５０値を有し、このことは、これらがＮｏｔｃｈ３シグナル伝達の強力な阻害剤であることを示す。
【０１７５】
【表９】
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【０１７６】
Ｃ．メタロプロテアーゼによる部位２切断に対する抗Ｎｏｔｃｈ３抗体の影響
Ｎｏｔｃｈ３のＮＲＲドメインへの抗Ｎｏｔｃｈ３抗体ｈｕ７５の結合はＳ２切断の減少を伴うが、ｈｕ２８の結合は付随しないことを確認するために、ウェスタンブロット分析を行った。ウサギモノクローナル抗Ｎｏｔｃｈ３抗体Ｄ１１Ｂ８（Ｃｅｌｌ  Ｓｉｇｎａｌｉｎｇ  Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ）は、Ｓ１およびＳ２タンパク質分解性切断事象の産物であるＮｏｔｃｈ３  Ｃ末端断片を認識する。ＮＲＲドメイン交換実験によって実証されたように、抗Ｎｏｔｃｈ３抗体ｈｕ７５は、部位１（Ｓ１）でのフーリン切断によって分離されるＮＲＲの２つの非共有結合した領域上に位置するＬＮＲ−Ａドメイン、ＨＤ−１ドメイン、およびＨＤ−２ドメインに同時に結合した。抗Ｎｏｔｃｈ３抗体ｈｕ２８は、Ｓ１部位に対してＮ末端であるＮＲＲドメインの線状の共有結合している領域であるＬＮＲ−ＣドメインおよびＨＤ１ドメインに結合した。阻害抗体は、ＮＲＲドメインを自己阻害性コンホメーションに安定化することによって、Ｓ２切断されたＮｏｔｃｈ３の検出を減少させ、それによってＳ２切断を予防することが予想され、一方、非阻害抗体は、Ｓ２切断に対する影響を有すると予想されない。
【０１７７】
Ｎｏｔｃｈ３受容体の部位２（Ｓ２）切断を、Ｃ末端ドメイン内のＧｌｕ２３１２を囲むエピトープを認識するＤ１１Ｂ８（Ｃｅｌｌ  Ｓｉｇｎａｌｉｎｇ  Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ）抗体を用いるタンパク質のウェスタンブロット分析によって評価した。ＨＣＣ２４２９およびＭＤＡ−ＭＢ−４６８乳がん細胞を用いて、Ｓ２切断に対する阻害性抗Ｎｏｔｃｈ３抗体ｈｕ７５および非阻害性抗Ｎｏｔｃｈ３抗体ｈｕ２８の影響を試験した。アッセイのために、１〜２．５×１０６個の細胞を完全成長培地に蒔いた。Ｈｕ７５、ｈｕ２８、およびｈｕＮｅｇ８．８対照抗体を、５μｇ／ｍｌの濃度で添加した。細胞を３７℃で、５％ＣＯ２インキュベーター内で２４時間インキュベートし、次いで、緩衝液中に直接溶解した。抽出物を、７．５％ポリアクリルアミドゲル（Ｂｉｏ−Ｒａｄ基準ゲル）上で変性ＳＤＳ−ＰＡＧＥによって分離し、ｉＢｌｏｔ  Ｇｅｌ転移系（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ）を用いてニトロセルロース紙に転移させた。Ｎｏｔｃｈ３を、標準的なウェスタンブロット手順を用いて、Ｄ１１Ｂ８抗体およびローディング対照としての抗ＧＡＰＤＨ（Ｓｉｇｍａ）で検出した。
【０１７８】
図９は、Ｓ２切断アッセイのウェスタンブロット分析を示す。未処置のおよび対照ｈｕＮｅｇ８．８処置したＨＣＣ２４２９細胞およびＭＤＡ−ＭＢ−４６８細胞において、２４時間、Ｓ１切断されたＣ末端Ｎｏｔｃｈ３タンパク質断片とＳ２切断されたＣ末端Ｎｏｔｃｈ３タンパク質断片との両方は、予想通り、Ｄ１１Ｂ８抗体を用いるウェスタンブロット分析によって検出することができた。さらに、阻害性抗Ｎｏｔｃｈ３抗体ｈｕ７５で処置した細胞において、Ｓ１切断されたＮｏｔｃｈ３  Ｃ末端断片は検出されたが、Ｓ２切断された断片は検出されず、このことは、メタロプロテアーゼ切断がｈｕ７５によってブロックされたことを示す。さらに、非阻害性抗Ｎｏｔｃｈ３抗体ｈｕ２８で処置された細胞において、Ｓ１切断されたＮｏｔｃｈ３  Ｃ末端断片とＳ２切断されたＮｏｔｃｈ３  Ｃ末端断片との両方が検出され、このことは、ｈｕ２８が受容体のタンパク質分解を阻害しないことを示す。したがって、ｈｕ２８は、実施例５で実証されるように、高い親和性でＮｏｔｃｈ３−ＮＲＲに結合し、細胞表面上に発現した全長Ｎｏｔｃｈ３への高い結合活性を有していたが、Ｎｏｔｃｈ３シグナル伝達を阻害せず、このことは、ｈｕ２８が、ｈｕ７５を含む阻害性抗Ｎｏｔｃｈ３−ＮＲＲ抗体と機能的に異なることを示す。
【０１７９】
（実施例１０）
化合物の合成
化合物０１０１、６７８０、０１３１、３３７７、および８２６１を、参照により本明細書に組み込まれる国際公開第ＷＯ／２０１３／０７２８１３号に記載されている方法に従って調製した。
【０１８０】
Ａ．化合物０１０１（スキーム中の＃５４）についての実験
２−メチルアラニル−Ｎ−［（３Ｒ，４Ｓ，５Ｓ）−３−メトキシ−１−｛（２Ｓ）−２−［（１Ｒ，２Ｒ）−１−メトキシ−２−メチル−３−オキソ−３−｛［（１Ｓ）−２−フェニル−１−（１，３−チアゾール−２−イル）エチル］アミノ｝プロピル］ピロリジン−１−イル｝−５−メチル−１−オキソヘプタン−４−イル］−Ｎ−メチル−Ｌ−バリンアミド（＃５４）の調製
【０１８１】
【化３】
2017186337.tif 000013
【０１８２】
ステップ１．  Ｎ−［（９Ｈ−フルオレン−９−イルメトキシ）カルボニル］−２−メチルアラニル−Ｎ−［（３Ｒ，４Ｓ，５Ｓ）−３−メトキシ−１−｛（２Ｓ）−２−［（１Ｒ，２Ｒ）−１−メトキシ−２−メチル−３−オキソ−３−｛［（１Ｓ）−２−フェニル−１−（１，３−チアゾール−２−イル）エチル］アミノ｝プロピル］ピロリジン−１−イル｝−５−メチル−１−オキソヘプタン−４−イル］−Ｎ−メチル−Ｌ−バリンアミド（＃５３）の合成。一般的な手順Ｄ（以下）に従って、ジクロロメタン（２０ｍＬ、０．１Ｍ）、およびＮ，Ｎ−ジメチルホルムアミド（３ｍＬ）、アミン＃１９（２．５ｇ、３．４ｍｍｏｌ、１．２当量）、ＨＡＴＵ（１．２９ｇ、３．３８ｍｍｏｌ、１．２当量）
【０１８３】
【化４】
2017186337.tif 000014
およびトリエチルアミン（１．５７ｍＬ、１１．３ｍｍｏｌ、４当量）中の＃３２（２．０５ｇ、２．８３ｍｍｏｌ、１当量）から所望の粗材料を合成し、これをシリカゲルクロマトグラフィー（勾配：ヘプタン中０％〜５５％のアセトン）によって精製し、＃５３（２．４２ｇ、７４％）を固体として生成した。LC-MS: m/z 965.7 [M+H+], 987.6 [M+Na+], 保持時間 = 1.04分; HPLC (プロトコルA): m/z 965.4
[M+H+], 保持時間 = 11.344分 (純度 > 97%); 1H NMR (400MHz, DMSO-d6), 回転異性体と推定される, 特徴的シグナル: δ 7.86-7.91 (m, 2H),
[7.77 (d, J=3.3Hz)および7.79 (d, J=3.2Hz), 計1H], 7.67-7.74 (m, 2H), [7.63 (d, J=3.2Hz)および7.65 (d, J=3.2Hz),
計1H],
7.38-7.44 (m, 2H), 7.30-7.36 (m, 2H), 7.11-7.30 (m, 5H), [5.39 (ddd, J=11.4,
8.4, 4.1Hz)および5.52 (ddd, J=11.7, 8.8, 4.2Hz), 計1H], [4.49 (dd, J=8.6, 7.6Hz)および4.59 (dd, J=8.6,
6.8Hz), 計1H], 3.13, 3.17, 3.18および3.24 (4 s, 計6H), 2.90および3.00 (2 br s, 計3H), 1.31および1.36 (2 br s, 計6H), [1.05 (d, J=6.7Hz)および1.09 (d, J=6.7Hz), 計3H].
【０１８４】
ステップ２．  ２−メチルアラニル−Ｎ−［（３Ｒ，４Ｓ，５Ｓ）−３−メトキシ−１−｛（２Ｓ）−２−［（１Ｒ，２Ｒ）−１−メトキシ−２−メチル−３−オキソ−３−｛［（１Ｓ）−２−フェニル−１−（１，３−チアゾール−２−イル）エチル］アミノ｝プロピル］ピロリジン−１−イル｝−５−メチル−１−オキソヘプタン−４−イル］−Ｎ−メチル−Ｌ−バリンアミド（＃５４）の合成
一般的な手順Ａ（以下）に従って、ジクロロメタン（１０ｍＬ、０．０７Ｍ）中の＃５３（７０１ｍｇ、０．７２６ｍｍｏｌ）から、所望の粗材料を合成し、これをシリカゲルクロマトグラフィーによって精製した（勾配：ジクロロメタン中０％〜１０％のメタノール）。残渣をジエチルエーテルおよびヘプタンで希釈し、真空で濃縮して、＃５４（４０６ｍｇ、７５％）を白色固体として得た。LC-MS: m/z 743.6 [M+H+], 保持時間 = 0.70分; HPLC (プロトコルA): m/z 743.4 [M+H+],
保持時間 =
6.903分,
(純度 >
97%); 1H NMR (400MHz, DMSO-d6), 回転異性体と推定される, 特徴的シグナル: δ  [8.64 (br d,
J=8.5Hz)および8.86 (br d, J=8.7Hz), 計1H], [8.04 (br d, J=9.3Hz)および8.08 (br d, J=9.3Hz), 計1H], [7.77 (d, J=3.3Hz)および7.80 (d, J=3.2Hz), 計1H], [7.63 (d, J=3.3Hz)および7.66 (d, J=3.2Hz), 計1H], 7.13-7.31 (m, 5H), [5.39 (ddd, J=11, 8.5, 4Hz)および5.53 (ddd, J=12,
9, 4Hz), 計1H], [4.49 (dd, J=9, 8Hz)および4.60 (dd, J=9, 7Hz), 計1H], 3.16, 3.20, 3.21および3.25 (4 s, 計6H), 2.93および3.02 (2 br s, 計3H), 1.21 (s, 3H), 1.13および1.13 (2 s, 計3H), [1.05 (d, J=6.7Hz)および1.10 (d, J=6.7Hz), 計3H], 0.73-0.80 (m, 3H).
【０１８５】
Ｂ．化合物６７８０（概略図における＃１１２）についての実験
２−メチルアラニル−Ｎ−［（３Ｒ，４Ｓ，５Ｓ）−１−｛（２Ｓ）−２−［（１Ｒ，２Ｒ）−３−｛［（１Ｓ，２Ｒ）−１−ヒドロキシ−１−フェニルプロパン−２−イル］アミノ｝−１−メトキシ−２−メチル−３−オキソプロピル］ピロリジン−１−イル｝−３−メトキシ−５−メチル−１−オキソヘプタン−４−イル］−Ｎ−メチル−Ｌ−バリンアミド（＃１１２）の調製
【０１８６】
【化５】
2017186337.tif 000015
【０１８７】
ステップ１．  ｔｅｒｔ−ブチル（２Ｓ）−２−［（１Ｒ，２Ｒ）−３−｛［（１Ｓ，２Ｒ）−１−ヒドロキシ−１−フェニルプロパン−２−イル］アミノ｝−１−メトキシ−２−メチル−３−オキソプロピル］ピロリジン−１−カルボキシラート（＃１０９）の合成。ジクロロメタン（２１ｍＬ、０．３Ｍ）およびＮ−Ｎ−ジメチルホルムアミド（３ｍＬ）中の＃１１溶液（２．００ｇ、６．９６ｍｍｏｌ、１当量）に、ＨＡＴＵ（３２７０ｍｇ、８．３５ｍｍｏｌ、１．２当量）を添加した。２分後、アミン（１Ｒ，２Ｓ）−（＋）−ノルエフェドリン（１．０７ｍｇ、６．９６ｍｍｏｌ、１当量）およびトリエチルアミン（１．９４ｍＬ、１３．９ｍｍｏｌ、２当量）を添加した。２時間後、反応混合物を酢酸エチル（１００ｍＬ）で希釈し、１Ｍ塩酸水溶液およびブラインで洗浄し、硫酸ナトリウムで脱水し、濾過し、真空で濃縮し、シリカゲルクロマトグラフィー（勾配：ヘプタン中０％から６０％の酢酸エチル）によって精製し、＃１０９（２．１８ｇ、７４％）を白色固体として生成した。LC-MS: m/z 321.3 [(M-Boc)+H+], 保持時間 = 3.14分; 1H NMR
(400MHz, DMSO-d6), 回転異性体と推定される, 特徴的シグナル: δ 7.64 (d, J=8.6Hz, 1H), 7.24-7.33 (m, 4H), 7.15-7.21 (m, 1H), 5.35
(br d, J=5Hz, 1H), 4.45 (br dd, J=5, 5Hz, 1H), 3.91-4.00 (m, 1H), 3.30-3.39 (m,
1H), 3.26 (s, 3H), 2.94-3.07 (m, 1H), 2.04-2.14 (m, 1H), 1.46-1.78 (m, 4H),
1.40 (s, 9H), 0.97-1.04 (m, 6H).
【０１８８】
ステップ２．  （２Ｒ，３Ｒ）−Ｎ−［（１Ｓ，２Ｒ）−１−ヒドロキシ−１−フェニルプロパン−２−イル］−３−メトキシ−２−メチル−３−［（２Ｓ）−ピロリジン−２−イル］プロパンアミドトリフルオロ酢酸塩（＃１１０）の合成。一般的な手順Ｃ（以下）に従って、０℃で、＃１０９（４１４ｍｇ、０．９８４ｍｍｏｌ、１当量）、ジオキサン（５ｍＬ、０．２Ｍ）、およびジオキサン中の４Ｍ塩化水素溶液（１５ｍＬ、６０ｍｍｏｌ、６０当量）から、所望の粗化合物を合成し、これを逆相クロマトグラフィーによって精製し（方法Ｃ）、＃１１０（１２０ｍｇ、３４％）を粘性の液体として得た。LC-MS: m/z 321.1 [M+H+], 保持時間 = 0.55分; 1H NMR
(400MHz, DMSO-d6), 特徴的シグナル: δ 7.90 (d, J=8.6Hz, 1H), 7.28-7.36 (m, 4H), 7.20-7.27 (m, 1H), 4.46
(d, J=6.2Hz, 1H), 3.48 (dd, J=8.6, 2.3Hz, 1H), 3.38 (s, 3H), 2.92-3.16 (m, 3H),
2.24-2.35 (m, 1H), 1.49-1.88 (m, 4H), 1.09 (d, J=6.6Hz, 3H), 1.01 (d, J=6.6Hz,
3H).
【０１８９】
ステップ３．  Ｎ−［（９Ｈ−フルオレン−９−イルメトキシ）カルボニル］−２−メチルアラニル−Ｎ−［（３Ｒ，４Ｓ，５Ｓ）−１−｛（２Ｓ）−２−［（１Ｒ，２Ｒ）−３−｛［（１Ｓ，２Ｒ）−１−ヒドロキシ−１−フェニルプロパン−２−イル］アミノ｝−１−メトキシ−２−メチル−３−オキソプロピル］ピロリジン−１−イル｝−３−メトキシ−５−メチル−１−オキソヘプタン−４−イル］−Ｎ−メチル−Ｌ−バリンアミド（＃１１１）の合成。一般的な手順Ｄ（以下）に従って、＃３２（１４０ｍｇ、０．２３０ｍｍｏｌ、１当量）、
【０１９０】
【化６】
2017186337.tif 000016
＃１１０（１１０ｍｇ、０．２５３ｍｍｏｌ、１．１当量）、ジクロロメタン（３ｍＬ、０．０８Ｍ）、Ｎ−Ｎ−ジメチルホルムアミド（０．５ｍＬ）、ＨＡＴＵ（９６．２ｍｇ、０．２５３ｍｍｏｌ、１．１当量）、およびトリエチルアミン（９６μＬ、０．６９ｍｍｏｌ、３当量）から、所望の粗生成物を合成し、これを、シリカゲルクロマトグラフィー（勾配：ヘプタン中０％から４０％のアセトン）によって精製し、＃１１１（２２０ｍｇ、９５％）を得た。LC-MS: m/z 912.4 [M+H+], 935.4 [M+Na+], 保持時間 = 2.15分; HPLC (プロトコルB): m/z 912.5
[M+H+], 934.5 [M+Na+], 保持時間 = 10.138分 (純度 >94%); 1H
NMR (400MHz, DMSO-d6), 回転異性体と推定される, 特徴的シグナル: δ 7.89 (d, J=7.8Hz, 2H), 7.66-7.75 (m, 2H), 7.41 (dd, J=7.4, 7.4Hz,
2H), 7.12-7.20 (m, 1H), [5.33 (d, J=4.7Hz)および5.38 (d, J=4.7Hz), 計1H], 3.15, 3.18, 3.22および3.23 (4 s, 計6H), 1.30, 1.33, 1.36および1.39 (4 s, 計6H), 0.95-1.06 (m, 6H).
【０１９１】
ステップ４．  ２−メチルアラニル−Ｎ−［（３Ｒ，４Ｓ，５Ｓ）−１−｛（２Ｓ）−２−［（１Ｒ，２Ｒ）−３−｛［（１Ｓ，２Ｒ）−１−ヒドロキシ−１−フェニルプロパン−２−イル］アミノ｝−１−メトキシ−２−メチル−３−オキソプロピル］ピロリジン−１−イル｝−３−メトキシ−５−メチル−１−オキソヘプタン−４−イル］−Ｎ−メチル−Ｌ−バリンアミド（＃１１２）の合成。一般的な手順Ａ（以下）に従って、ジクロロメタン（５ｍＬ、０．０５Ｍ）中の＃１１１（２１０ｍｇ、０．２３０ｍｍｏｌ）およびジエチルアミン（５ｍＬ）から、所望の粗材料を合成し、これを、シリカゲルクロマトグラフィー（勾配：ジクロロメタン中０％から１０％のメタノール）によって精製し、油および固体の混合物を得た。ジエチルエーテルおよびヘプタンを添加し、混合物を真空で濃縮し、＃１１２（８１ｍｇ、５１％）を白色固体として生成した。LC-MS: m/z 690.4 [M+H+], 保持時間 = 1.10分; HPLC (プロトコルA): m/z 690.5
[M+H+], 712.4 [M+Na+], 保持時間 = 7.229分 (純度 > 90%); 1H
NMR (400MHz, DMSO-d6), 回転異性体と推定される, 特徴的シグナル: δ [7.62 (br d, J=8Hz), 7.88 (br d, J=8Hz), 8.07 (br d, J=9Hz)および8.11 (br d,
J=9Hz), 計2H], 7.15-7.34 (m, 5H), [5.34 (d, J=4Hz)および5.41 (d, J=5Hz), 計1H], 3.18, 3.21,
3.23および3.25
(4 s, 計6H),
2.93および3.08
(2 br s, 計3H), 1.15, 1.18, 1.21および1.25 (4 s, 計6H).
【０１９２】
Ｃ．一般的な手順
一般的な手順Ａ：ジエチルアミンまたはピペリジンを用いるＦｍｏｃの除去。ジクロロメタンまたはＮ−Ｎ−ジメチルホルムアミド（ＤＭＦとも呼ばれる）中のＦｍｏｃ含有化合物の溶液に、等体積のジエチルアミンまたはピペリジンを添加した。反応の進行を、ＬＣ−ＭＳ（またはＨＰＬＣまたはＴＬＣ）によって監視した。溶媒を真空で除去し、いくつかのケースでは、残渣をヘプタンと１から４回共沸させた。残渣は、通常、ジクロロメタンおよび少量のメタノールで希釈し、その後、シリカ上で還元させ、ジクロロメタン（または他の適切な溶媒混合物）中のメタノールで溶出しながらシリカゲル上でクロマトグラフィーによって精製し、所望の材料を得た（または粗材料をそのまま用いた）。
【０１９３】
一般的な手順Ｃ：ジオキサン中の塩酸を用いるＢｏｃの除去またはｔｅｒｔ−ブチルエステル（ｔ−Ｂｕエステルとも呼ばれる）の切断。ジオキサン（または、いくつかのケースでは、溶液なし、もしくは他の関連する溶媒）中のＢｏｃ含有化合物またはｔｅｒｔ−ブチルエステル含有化合物の溶液のいずれかに、ジオキサン中の４Ｍ塩酸溶液を添加した。反応の進行を、ＬＣ−ＭＳ（またはＨＰＬＣまたはＴＬＣ）によって監視した。反応物を真空で濃縮し、いくつかのケースでは、ヘプタンと１から４回共沸させた。
【０１９４】
一般的な手順Ｄ：Ｏ−（７−アザベンゾトリアゾール−１−イル）−Ｎ，Ｎ，Ｎ’，Ｎ’−テトラメチルウロニウムヘキサフルオロホスファート（ＨＡＴＵ）とのカップリング。ジクロロメタン、Ｎ−Ｎ−ジメチルホルムアミド（ＤＭＦとも呼ばれる）、または両方の混合物中のアミン（１．０当量）および酸（１．０〜２．０当量）の撹拌溶液に、ＨＡＴＵ（１．０〜２．０当量）を添加し、その後、トリエチルアミン（２．０〜４．０当量）またはジイソプロピルエチルアミン（２．０〜４．０当量、ヒューニッヒ塩基とも呼ばれる）を添加した。反応の進行を、ＬＣ−ＭＳ（またはＨＰＬＣまたはＴＬＣ）によって監視し、反応は、通常、３時間以内に完了した。溶媒を真空で除去した。残渣を、シリカゲルもしくは逆相クロマトグラフィーによって精製し、またはいくつかのケースではヘプタンと３回共沸させ、少量の酢酸エチルで希釈し、その後、シリカまたはＣ１８結合シリカ上で還元させ、シリカゲルまたは逆相クロマトグラフィーによって精製した。
【０１９５】
Ｄ．他の化合物
本発明で使用したさらなる化合物は、国際公開第ＷＯ／２０１３／０７２８１３号に記載されており、また以下に示されている。
【０１９６】
本明細書では、化合物０１３１、または２−メチル−Ｌ−プロピル−Ｎ−［（３Ｒ，４Ｓ，５Ｓ）−１−｛（２Ｓ）−２−［（１Ｒ，２Ｒ）−３−｛［（１Ｓ）−１−カルボキシ−２−フェニルエチル］アミノ｝−１−メトキシ−２−メチル−３−オキソプロピル］ピロリジン−１−イル｝−３−メトキシ−５−メチル−１−オキソヘプタン−４−イル］−Ｎ−メチル−Ｌ−バリンアミドトリフルオロ酢酸塩（＃１１８）は、以下の式を有する。
【０１９７】
【化７】
2017186337.tif 000017
【０１９８】
本明細書では、化合物３３７７、またはＮ，２−ジメチルアラニル−Ｎ−｛（１Ｓ，２Ｒ）−４−｛（２Ｓ）−２−［（１Ｒ，２Ｒ）−３−｛［（１Ｓ）−１−カルボキシ−２−フェニルエチル］アミノ｝−１−メトキシ−２−メチル−３−オキソプロピル］ピロリジン−１−イル｝−２−メトキシ−１−［（１Ｓ）−１−メチルプロピル］−４−オキソブチル｝−Ｎ−メチル−Ｌ−バリンアミドトリフルオロ酢酸塩（＃１１５）は、以下の式を有する。
【０１９９】
【化８】
2017186337.tif 000018
【０２００】
本明細書では、化合物８２６１、または２−メチルアラニル−Ｎ−［（３Ｒ，４Ｓ，５Ｓ）−１−｛（２Ｓ）−２−［（１Ｒ，２Ｒ）−３−｛［（１Ｓ）−１−カルボキシ−２−フェニルエチル］アミノ｝−１−メトキシ−２−メチル−３−オキソプロピル］ピロリジン−１−イル｝−３−メトキシ−５−メチル−１−オキソヘプタン−４−イル］−Ｎ−メチル−Ｌ−バリンアミド（＃６９）は、以下の式を有する。
【０２０１】
【化９】
2017186337.tif 000019
【０２０２】
（実施例１１）
抗Ｎｏｔｃｈ３抗体−薬物コンジュゲート（ＡＤＣ）の調製
本発明のＡＤＣは、化学化合物に結合するための反応部位を有するリンカーのセクションを使用し、抗体のための反応部位を有するリンカー単位の別のセクションを導入して調製した。一態様では、リンカー単位は、抗体などの抗体単位に存在する求核基と反応性である求電子基を有する反応部位を有する。抗体の有用な求核基としては、それだけに限らないが、スルフヒドリル、ヒドロキシル、およびアミノ基がある。抗体の求核基のヘテロ原子は、リンカー単位の求電子基と反応性であり、リンカー単位への共有結合を形成する。リンカーの有用な求電子基としては、それだけに限らないが、マレイミドおよびハロアセトアミド基がある。
【０２０３】
リンカー単位は、抗体単位に存在する求電子基と反応性である求核基を有する反応部位を有する。抗体の求電子基は、リンカー単位に付着するための好都合な部位を提供する。抗体の有用な求電子基としては、それだけに限らないが、アルデヒドおよびケトンカルボニル基がある。リンカー単位の求核基のヘテロ原子は、抗体の求電子基と反応し、抗体への共有結合を形成することができる。リンカー単位の有用な求核基としては、それだけに限らないが、ヒドラジド、オキシム、アミノ、ヒドラジン、チオセミカルバゾン、ヒドラジンカルボキシラート、およびアリールヒドラジドがある。
【０２０４】
本明細書では、「ＭａｌＣ−」としても知られている「ｍｃ−」は、以下を指す。
【０２０５】
【化１０】
2017186337.tif 000020
【０２０６】
本明細書では、「ｍｃＶａｌＣｉｔＰＡＢＣ−」または「ＭａｌＣＶａｌＣｉｔＰＡＢＣ−」としても知られている「ｖｃ−」は、以下を指す。
【０２０７】
【化１１】
2017186337.tif 000021
【０２０８】
本明細書では、「ｍｅ−」は、以下を指す。
【０２０９】
【化１２】
2017186337.tif 000022
【０２１０】
本明細書では、「ＭａｌＰｅｇ６Ｃ２−」は、以下に示す「ＭａｌＰｅｇＸＣ２−」を指し、式中、Ｘ＝６である。
【０２１１】
【化１３】
2017186337.tif 000023
【０２１２】
本発明のＡＤＣは、トリス（２−カルボキシエチル）ホスフィン（ＴＣＥＰ）を用いた抗体の部分的還元を介し、その後、還元されたシステイン残基を所望のマレイミド末端リンカー−ペイロードと反応させることによって調製した。具体的には、抗体は、１００ｍＭ  ＨＥＰＥＳ（４−（２−ヒドロキシエチル）−１−ピペラジンエタンスルホン酸緩衝液）、ｐＨ７．０、および１ｍＭジエチレントリアミン五酢酸（ＤＴＰＡ）中の約２．３〜３．０倍モル過剰のトリス（２−カルボキシエチル）ホスフィン（ＴＣＥＰ）を、３７℃で２時間にわたって添加することによって部分的に還元した。次いで所望のリンカー−ペイロードを、約７〜８のリンカー−ペイロード／抗体モル比で反応混合物に添加し、１５％ｖ／ｖジメチルアセトアミド（ＤＭＡ）の存在下で、２５℃でさらに１時間反応させた。１時間のインキュベーション期間の後、３倍過剰なＮ−マレイミドを添加して未反応チオールをキャッピングし、１５分反応させた後、６倍過剰なＬ−Ｃｙｓを添加していずれの未反応リンカー−ペイロードもクエンチした。反応混合物を、リン酸緩衝溶液（ＰＢＳ）、ｐＨ７．４中で、４℃で一晩透析し、ＳＥＣ（ＡＫＴＡエクスプローラー、Ｓｕｐｅｒｄｅｘ  ２００）を介して精製した。スクシンイミド環の加水分解をさらに、精製されたＡＤＣを１００ｍＭホウ酸緩衝液、ｐＨ９．２中で２４〜７２時間、３７℃でインキュベートすることを介して実現した。開環を、液体クロマトグラフィーエレクトロスプレーイオン化タンデム質量分析法（ＬＣ−ＥＳＩ  ＭＳ）を介して監視し、サイズ排除クロマトグラフィー（ＳＥＣ）を介して精製した。ＡＤＣを、純度用ＳＥＣ、疎水性相互作用クロマトグラフィー（ＨＩＣ）、および液体クロマトグラフィーエレクトロスプレーイオン化タンデム質量分析法（ＬＣ−ＥＳＩ  ＭＳ）を介してさらに特徴付けて、薬物−抗体比（ローディング）を計算した。タンパク質濃度は、ＵＶ分光光度計を介して判定した。
【０２１３】
ｖｃ０１０１（システイン残基を介する抗体Ｘへのコンジュゲーションを示す）
【０２１４】
【化１４】
2017186337.tif 000024
【０２１５】
ｖｃ６７８０（システイン残基を介する抗体Ｘへのコンジュゲーションを示す）
【０２１６】
【化１５】
2017186337.tif 000025
【０２１７】
ヒト化抗Ｎｏｔｃｈ抗体ｈｕ２８およびｈｕ７５、ならびにラット−ヒトキメラ抗Ｎｏｔｃｈ抗体ｃｈ２８およびｃｈ７５を、表１０に示す様々なリンカー−ペイロードの組合せにコンジュゲートさせた。ＡＤＣおよびその要素を、本発明の方法に従って、かつ国際公開第ＷＯ／２０１３／０７２８１３号に従って調製した。
【０２１８】
【表１０】
2017186337.tif 000026
【０２１９】
（実施例１２）
抗Ｎｏｔｃｈ３抗体およびＡＤＣの結合活性および特異性
Ａ．細胞ベースのＥＬＩＳＡ
コンジュゲートしていない抗Ｎｏｔｃｈ３抗体、抗Ｎｏｔｃｈ３  ＡＤＣ、および陰性対照抗体（ｈｕＮｅｇ８．８）を、細胞ベースのＥＬＩＳＡにおいて、Ｎｏｔｃｈ３発現細胞系に対する細胞表面結合活性についてスクリーニングした。過剰発現Ｎｏｔｃｈ３細胞系Ｕ２ＯＳ／ｈＮｏｔｃｈ３、ならびに内因性Ｎｏｔｃｈ３発現細胞系ＨＣＣ２４２９およびＭＤＡ−ＭＢ−４６８を、ＥＬＩＳＡアッセイの前日に、９６ウェルプレート（白色不透明、ＢＤ／ＶＷＲ）内にそれぞれ５０，０００、２０万、および１０万個細胞／ウェルで蒔いた。ＥＬＩＳＡの日に、培養培地をウェルから取り除き、連続希釈した（塩化カルシウムおよび塩化マグネシウム（Ｃａ／Ｍｇ）および１％ＢＳＡを有するＤＰＢＳ中に１：３）抗体およびＡＤＣ溶液をプレートにアプライした。プレートを室温で２時間インキュベートし、その後、Ｃａ／Ｍｇおよび１％ＢＳＡを有するＤＰＢＳで洗浄した。ＨＲＰ−コンジュゲート二次抗体を次いでアプライし、細胞と１時間インキュベートした。プレートをＣａ／Ｍｇおよび１％ＢＳＡを有するＤＰＢＳで洗浄し、その後、Ｐｉｃｏ−Ｃｈｅｍｉｌｕｍｉｎｅｓｃｅｎｔ発色キット（Ｔｈｅｒｍａｌ  Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ）で発色させ、化学発光の測定を製造者の指示に従って行った。データのプロッティングおよび分析を、Ｍｉｃｒｏｓｏｆｔ  ＥｘｃｅｌおよびＧｒａｐｈｐａｄ−Ｐｒｉｓｍソフトウェアで行った。
【０２２０】
表１１は、コンジュゲートしていない抗Ｎｏｔｃｈ３抗体ｈｕ２８およびｈｕ７５、ならびに抗Ｎｏｔｃｈ３  ＡＤＣ  ｈｕ２８−ｖｃ０１０１、ｈｕ２８−ｖｃ６７８０、ｈｕ７５−ｖｃ０１０１、およびｈｕ７５−ｖｃ６７８０についての細胞表面Ｎｏｔｃｈ３結合ＥＬＩＳＡに由来する２から４の独立した実験について計算された、ＥＣ５０（ｎＭ）値および標準偏差（ＳＤ）を示す。データは、ｈｕ２８−ＡＤＣおよびｈｕ７５−ＡＤＣが、Ｕ２ＯＳ／ｈＮｏｔｃｈ３細胞、ＨＣＣ２４２９細胞、およびＭＤＡ−ＭＢ−４６８細胞の細胞表面上に発現している全長ヒトＮｏｔｃｈ３への結合において、コンジュゲートしていない抗体ｈｕ２８およびｈｕ７５にそれぞれ類似していることを実証する。さらに、データは、ｈｕ２８抗体およびｈｕ７５抗体への様々なリンカー−ペイロードのコンジュゲーションが結合特性に影響しなかったかまたはそれを改変しなかったことを実証する。さらに、データは、ｈｕ２８、およびｈｕ２８−ｖｃ０１０１とｈｕ２８−ｖｃ６７８０との両方が、それらのＥＣ５０値がｈｕ７５およびｈｕ７５−ｖｃ０１０１およびｈｕ７５−ｖｃ６７８０よりも低いことによって実証されるように、細胞表面Ｎｏｔｃｈ３について、より高い結合能力を有することを実証する。陰性対照、すなわち、コンジュゲートしていないｈｕＮｅｇ８．８抗体は、試験した細胞系のいずれも結合しなかった。結合を欠いていた（ＬＢ）対照抗体では、ＥＣ５０値は、示されたように、生じなかった。（ＳＤ＝標準偏差）
【０２２１】
【表１１】
2017186337.tif 000027
【０２２２】
Ｂ．フローサイトメトリー
コンジュゲートしていない抗Ｎｏｔｃｈ３抗体ｈｕ２８およびｈｕ７５を、フローサイトメトリーによって、Ｎｏｔｃｈ３発現細胞系への細胞表面結合活性について試験した。蛍光活性化細胞選別（ＦＡＣＳ）分析を、標準的な手順に従って行った。細胞を、塩化カルシウムおよび塩化マグネシウムを有するＨＢＳＳ（本明細書ではＨＢＳＳ＋＋と呼ばれる）中ですすぎ、ＥＤＴＡを有さないトリプシンを用いて回収し、ＦＢＳを含有する培地で中和した。細胞を、氷上で３０分、４μｇ／ｍＬ抗Ｎｏｔｃｈ３抗体ｈｕ２８およびｈｕ７５と、３％ＨＩＣＳ（加熱不活化されたウシ血清）を含有するＨＢＳＳ＋＋中でインキュベートした。細胞を、冷たいＨＢＳＳ＋＋、３％ＨＩＣＳ緩衝液で３回洗浄した。細胞を、アロフィコシアニンにコンジュゲートしたＡｆｆｉｎｉＰｕｒｅ  Ｆ（ａｂ’）２断片ヤギ抗ヒトＩｇＧ、Ｆｃ断片二次抗体（Ｊａｃｋｓｏｎ  ＩｍｍｕｎｏＲｅｓｅａｒｃｈ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｉｅｓ，Ｉｎｃ．、ウェストグローブ、ペンシルベニア州）中で１０μｇ／ｍＬで３０分、氷上で、暗所で、インキュベートした。細胞を、冷たいＨＢＳＳ＋＋／３％ＨＩＣＳ緩衝液で１回洗浄した。細胞を、ＨＢＳＳ＋＋／３％ＨＩＣＳ、２５ｍＭ  ＨＥＰＥＳ、１ｍＭ  ＭｇＣｌ２、および２５μｇ／ｍｌ  ＤＮａｓｅＩ中に再懸濁した。７−ＡＡＤ（７−アミノ−アクチノマイシンＤ）を、生存不可能細胞を排除するために添加した。生細胞を、ＢＤ  ＦＡＣＳＣａｌｉｂｕｒフローサイトメーター（ＢＤ  Ｂｉｏｓｃｉｅｎｃｅｓ、サンノゼ、カリフォルニア州）で分析した。チャネルＦＬ−４に由来する平均蛍光強度（ＭＦＩ）を、ＦｌｏｗＪｏフローサイトメトリー分析ソフトウェア（Ａｓｈｌａｎｄ、ＯＲ）で計算した。
【０２２３】
表１２は、Ｎｏｔｃｈ３発現細胞系のパネルへの、ＦＡＣＳ分析による、コンジュゲートしていない抗Ｎｏｔｃｈ３抗体ｈｕ２８およびｈｕ７５の結合活性を示す。Ｕ−２  ＯＳ細胞系を、Ｎｏｔｃｈ３陰性／低対照細胞系として用いた。ｈｕ２８とｈｕ７５との両方は、Ｕ−２  ＯＳへの低レベルの結合を有しており、これは、陰性対照ｈｕＮｅｇ８．８よりもごくわずかに高かった。さらに、データは、ｈｕ２８およびｈｕ７５が、Ｎｏｔｃｈ３過剰発現細胞Ｕ２ＯＳ／ｈＮｏｔｃｈ３およびＭＤＡＭＢ４６８／ｈＮｏｔｃｈ３、ならびにＮｏｔｃｈ３を内因的に発現する細胞ＭＤＡ−ＭＢ−４６８、ＨＣＣ２４２９、およびＯＶＣＡＲ３に特異的に結合したことを実証する。さらに、データは、細胞ベースのＥＬＩＳＡによる結合活性の観察に類似して、すべてのＮｏｔｃｈ３発現細胞系へのｈｕ２８の結合活性が、ｈｕ７５よりも優れていたことを実証する。
【０２２４】
【表１２】
2017186337.tif 000028
【０２２５】
（実施例１３）
Ｉｎ  ｖｉｔｒｏ細胞傷害性アッセイ
抗Ｎｏｔｃｈ３  ＡＤＣの影響を、ＭＴＳ細胞生存能力指標（Ｐｒｏｍｅｇａ、マディソン、ウィスコンシン州）を用いて、１）Ｎｏｔｃｈ３タンパク質を内因的に発現する細胞系：ＨＣＣ２４２９（肺がん）、ＯＶＣＡＲ３（卵巣がん）、およびＭＤＡ−ＭＢ−４６８（乳がん）、２）全長ヒトＮｏｔｃｈ３タンパク質を過剰発現するように改変された細胞系：ＭＤＡ−ＭＢ−４６８／ｈＮｏｔｃｈ３およびＵ２ＯＳ／ｈＮｏｔｃｈ３、ならびに３）陰性対照細胞系（ＳＷ９００）について評価した。これらの細胞系を、本発明の様々なリンカー−ペイロードの組合せにコンジュゲートした、ラット−ヒトキメラ抗Ｎｏｔｃｈ３抗体ｃｈ２８およびｃｈ７５、ならびにヒト化抗Ｎｏｔｃｈ３抗体ｈｕ２８およびｈｕ７５を含む、増大濃度の抗Ｎｏｔｃｈ３  ＡＤＣと培養した。抗Ｎｏｔｃｈ３−ＡＤＣについての特異性対照として、非標的化対照ＡＤＣ（ｈｕＮｅｇ８．８−ＡＤＣまたはｃｈ２Ｈ６−ＡＤＣ）も、同一の細胞系について試験した。４日後、各培養物の生存能力を評価した。ＩＣ５０値を、ＸＬフィットｖ４．２を有するロジスティック非線形回帰、モデル＃２０３（ＩＤＢＳ、ギルフォード、サリー、ＵＫ）によって計算し、ｎｇＡｂ／ｍＬとして表した。薬物抗体比（ＤＡＲ）も得た。
【０２２６】
表１３は、ラット−ヒトキメラ抗Ｎｏｔｃｈ３  ＡＤＣ処置のＩＣ５０（ｎｂＡｂ／ｍＬ）値を示す。２〜４の個別の反復を伴う実験では、平均ＩＣ５０値を、平均の標準誤差（Ｓ．Ｅ．Ｍ．）とともに計算した。データは、様々なリンカー−ペイロードを有するラット−ヒトキメラ抗Ｎｏｔｃｈ３  ＡＤＣが、Ｎｏｔｃｈ３発現および過剰発現がん細胞系ＨＣＣ２４２９、ＯＶＣＡＲ３、ＭＤＡ−ＭＢ−４６８、ＭＤＡ−ＭＢ−４６８／ｈＮｏｔｃｈ３、Ｕ２ＯＳ／ｈＮｏｔｃｈ３において活性であり、細胞死を誘発したことを実証する。非標的化対照ＡＤＣは、いずれも、潜在能力を欠いており（ＬＰ）、したがって、ＩＣ５０値は、示されたように、生じず、または試験した最高用量でごくわずかに活性であった。対照ＡＤＣのＩＣ５０値以上のＩＣ５０値を有する抗Ｎｏｔｃｈ３  ＡＤＣは、ｉｎ  ｖｉｔｒｏでの潜在能力を欠くと考えられ、ＬＰとして特定された。
【０２２７】
【表１３】
2017186337.tif 000029
【０２２８】
表１４は、ヒト化抗Ｎｏｔｃｈ３  ＡＤＣ処置のＩＣ５０（ｎｂＡｂ／ｍＬ）値を示す。ＨＣＣ２４２９細胞系およびＭＤＡ−ＭＢ−４６８／ｈＮｏｔｃｈ３細胞系は、２回の個別の反復を有していた。データは、様々なリンカー−ペイロードを有するヒト化抗Ｎｏｔｃｈ３  ＡＤＣが、Ｎｏｔｃｈ３発現および過剰発現がん細胞系ＨＣＣ２４２９、ＯＶＣＡＲ３、ＭＤＡ−ＭＢ−４６８、ＭＤＡ−ＭＢ−４６８／ｈＮｏｔｃｈ３、Ｕ２ＯＳ／ｈＮｏｔｃｈ３において活性であり、細胞死を誘発したが、Ｎｏｔｃｈ３発現を欠く陰性対照細胞系ＳＷ９００においてはそうではなかったことを実証する。非標的化対照ＡＤＣは、いずれも、潜在能力を欠いており（ＬＰ）、したがってＩＣ５０値は、示されたように、生じず、または試験した最高用量でごくわずかに活性であった。対照ＡＤＣのＩＣ５０値以上のＩＣ５０値を有する抗Ｎｏｔｃｈ３  ＡＤＣは、ｉｎ  ｖｉｔｒｏでの潜在能力を欠くと考えられ、ＬＰとして特定された。コンジュゲートしていないヒト化抗Ｎｏｔｃｈ３抗体ｈｕ２８およびｈｕ７５は、ＨＣＣ２４２９またはＭＤＡＭＢ４６８／ｈＮｏｔｃｈ３の生存能力に影響せず、このことは、細胞傷害性がペイロードに特異的に関与しうることを示す（データは示されていない）。
【０２２９】
【表１４】
2017186337.tif 000030
【０２３０】
ｓｉＲＮＡでのＮｏｔｃｈ３のノックダウンを用いて、抗Ｎｏｔｃｈ３  ＡＤＣのｉｎ  ｖｉｔｒｏでの細胞傷害性がＮｏｔｃｈ３タンパク質の発現に対して依存性であることを確認した。ｓｉＲＮＡのトランスフェクションを、ＯＮ−ＴＡＲＧＥＴプラスＳＭＡＲＴプールヒトＮｏｔｃｈ３（Ｌ−０１１０９３−００）、ＯＮ−ＴＡＲＧＥＴプラスＣｏｎｔｒｏｌ  Ｎｏｎ−Ｔａｒｇｅｔｉｎｇプール（Ｄ−００１８１０−１０）（Ｔｈｅｒｍｏ  Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ    Ｄｈａｒｍａｃｏｎ）、およびリポフェクタミンＲＮＡｉＭＡＸ試薬（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ）を用いて生じさせた。ＨＣＣ２４２９細胞、ＯＶＣＡＲ３細胞、およびＭＤＡ−ＭＢ−４６８／ｈＮｏｔｃｈ３細胞の２から２．５×１０６個の細胞を、トランスフェクションの前日に、抗生物質を有さない成長培地中の１０ｃｍの皿に蒔いた。翌日、抗生物質を有さない新鮮な培地を添加した。ｓｉＲＮＡおよびリポフェクタミンＲＮＡｉＭＡＸをＯＰＴＩ−ＭＥＭ培地に希釈し、製造者の明細書に従って用いた。細胞系のそれぞれに、対照およびＮｏｔｃｈ３  ｓｉＲＮＡをトランスフェクトした。細胞を、２４時間、加湿した３７℃、５％ＣＯ２のインキュベーター内で、トランスフェクション混合物とともにインキュベートした。２４時間後、細胞をトリプシン処理し、ＭＴＳ細胞生存能力指標（Ｐｒｏｍｅｇａ、マディソン、ウィスコンシン州）を用いる評価のために蒔いた。
【０２３１】
細胞系に応じて、細胞を、次いで、処置の２４時間前に、ウェル当たり２，５００から５，０００個細胞の密度で播種した。細胞を、３倍連続希釈したヒト化抗Ｎｏｔｃｈ３  ＡＤＣで、３セット、１０濃度（範囲０〜３０μｇＡｂ／ｍｌ）で処置した。相対的細胞生存能力を、処置の９６時間後に、未処置対照に対するパーセンテージとして判定した。ＩＣ５０値を、ＸＬフィットｖ４．２を有するロジスティック非線形回帰、モデル＃２０３（ＩＤＢＳ、ギルフォード、サリー、ＵＫ）によって計算し、ｎｂＡｂ／ｍＬとして表した。２回の個別の反復を伴う実験では、平均ＩＣ５０値を、平均の標準誤差（Ｓ．Ｅ．Ｍ．）とともに計算した。対照およびＮｏｔｃｈ３  ｓｉＲＮＡ処置細胞から調製された抽出物に対するウェスタンブロット分析を行って、Ｎｏｔｃｈ３ノックダウンが最大１４４時間まで生じたことを確認した（データは示されていない）。ｓｉＲＮＡノックダウンの後にＮｏｔｃｈ３を発現した細胞系（本明細書では対照ｓｉＲＮＡと呼ばれる）またはＮｏｔｃｈ３発現が低減した細胞系（本明細書ではＮｏｔｃｈ３  ｓｉＲＮＡと呼ばれる）を、増大濃度のヒト化抗Ｎｏｔｃｈ３  ＡＤＣと培養した。抗Ｎｏｔｃｈ３  ＡＤＣについての特異性対照として、非標的化対照ＡＤＣ（ｈｕＮｅｇ８．８−ＡＤＣ）も、同一の細胞系について試験した。４日後、各培養物の生存能力を評価した。ＩＣ５０値を、ＸＬフィットｖ４．２を有するロジスティック非線形回帰、モデル＃２０３（ＩＤＢＳ、ギルフォード、サリー、ＵＫ）によって計算し、ｎｂＡｂ／ｍＬとして表した。薬物抗体比（ＤＡＲ）も得た。
【０２３２】
表１５は、対照ｓｉＲＮＡまたはＮｏｔｃｈ３  ｓｉＲＮＡ処置したがん細胞系のパネルのヒト化抗Ｎｏｔｃｈ３  ＡＤＣ処置のＩＣ５０（ｎｇＡｂ／ｍＬ）値を示す。データは、様々なリンカー−ペイロードを有するヒト化抗Ｎｏｔｃｈ３  ＡＤＣが、Ｎｏｔｃｈ３発現がん細胞系（対照ｓｉＲＮＡ）において活性であり、細胞死を誘発したことを実証する。ｓｉＲＮＡノックダウンの後にＮｏｔｃｈ３の発現が低減した細胞（Ｎｏｔｃｈ３  ｓｉＲＮＡ）では、ＩＣ５０値は対照ｓｉＲＮＡよりも大きく、このことは、Ｎｏｔｃｈ３発現の低減が抗Ｎｏｔｃｈ３  ＡＤＣの細胞傷害性の低減を伴うことを示す。対照ＡＤＣは潜在能力を欠いており（ＬＰ）、したがって、ＩＣ５０値は、示されたように、生じず、または試験した最高用量でごくわずかに活性であった。データはさらに、ヒト化抗Ｎｏｔｃｈ３  ＡＤＣがＮｏｔｃｈ３発現および過剰発現がん細胞系に対して細胞死を特異的に誘発したことを実証する。観察された細胞傷害性は、Ｎｏｔｃｈ３発現に依存性であり、それは、同一の細胞に対するＮｏｔｃｈ３  ｓｉＲＮＡのノックダウンが抗Ｎｏｔｃｈ３  ＡＤＣによる細胞死を低減させたためである。したがって、ヒト化抗Ｎｏｔｃｈ３  ＡＤＣは、それらのｉｎ  ｖｉｔｒｏ細胞傷害性について、Ｎｏｔｃｈ３発現に依存性であった。
【０２３３】
【表１５】
2017186337.tif 000031
【０２３４】
（実施例１４）
抗Ｎｏｔｃｈ３  ＡＤＣの活性機構のＩｎ  ｖｉｔｒｏでの評価
Ａ．微小管の抗Ｎｏｔｃｈ３  ＡＤＣ破壊
Ｎｏｔｃｈ３−ＡＤＣからのペイロードの内部移行および細胞内放出の後、放出されたペイロードの推定される活性機構は、細胞分裂に必要な微小管の破壊であり、それによって、細胞サイクルの停止、アポトーシスおよび細胞死の誘発をもたらす。この活性機構を確認するために、ＯＶＣＡＲ３卵巣がん細胞を、ｈｕ２８−ｖｃ０１０１、ｈｕＮｅｇ８．８−ｖｃ０１０１（対照ＡＤＣ）で処置し、または未処置のままとし、次いで、微小管をマークするための抗アルファチューブリン抗体、および有糸分裂をしているまたは停止している細胞を同定するための抗ホスホヒストンＨ３抗体での染色による、免疫蛍光分析にかけた。
【０２３５】
ＯＶＣＡＲ３細胞を、カバー＃１．５ホウケイ酸無菌スライド（Ｔｈｅｒｍｏ  Ｆｉｓｈｅｒ  Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ  Ｉｎｃ．）を有するＬａｂ  Ｔｅｃ  ＩＩ４区画化カバーガラスに播種した。翌日、細胞を１．０μｇ／ｍｌ  ｈｕ２８−ｖｃ０１０１、対照ｈｕＮｅｇ８．８−ｖｃ０１０１で処置し、または未処置のままとした。４８時間後、細胞をＨＢＳＳ＋＋で２回洗浄し、４％パラホルムアルデヒド内で１０分固定した。細胞をＰＢＳで３回洗浄し、０．５％Ｔｒｉｔｏｎ  Ｘ−１００で２分間、透過処理した。細胞をＰＢＳで３回洗浄した後、細胞を、３％ＢＳＡ／ＰＢＳで３０分、室温でブロックした。細胞を次いで、２％ＢＳＡ／ＰＢＳ中で１：１００の抗ホスホヒストンＨ３（Ｓｅｒ１０）（Ｃｅｌｌ  Ｓｉｇｎａｌｉｎｇ）および２μｇ／ｍｌ抗アルファチューブリン（Ｍｉｌｌｉｐｏｒｅ）と、２時間、室温でインキュベートした。２時間後、細胞をＰＢＳで２回洗浄し、次いで、１：５００希釈のヤギ抗マウスＡｌｅｘａ  Ｆｌｕｏｒ  ４８８およびヤギ抗ウサギ５５５と、４５分、室温でインキュベートした。細胞をＰＢＳで２回洗浄し、試料をＬＳＭ７１０共焦点顕微鏡（Ｚｅｉｓｓ）で画像化した。
【０２３６】
図１０に示すように、細胞サイクルの有糸分裂相にある未処置のＯＶＣＡＲ３細胞は、抗アルファチューブリン染色によって実証されるように、ホスホヒストンＨ３について陽性に染色され、正常な二極紡錘体装置を含有していた。ｈｕ２８−ｖｃ０１０１での処置は、ホスホヒストンＨ３染色された細胞におけるその異常な形態学で実証されるように、有糸分裂紡錘体装置の構造を破壊したが、対照ｈｕＮｅｇ８．８−ｖｃ０１０１はしなかった。データは、ｈｕ２８−ｖｃ０１０１が、有糸分裂から完全な細胞分裂までの間に必要な微小管を破壊することによって、細胞増殖を阻害したことを実証する。
【０２３７】
Ｂ．アポトーシスの抗Ｎｏｔｃｈ３  ＡＤＣの誘発
カスパーゼ−３およびカスパーゼ−７（カスパーゼ−３／７）プロテアーゼは、哺乳動物細胞での後期アポトーシス事象の仲介の原因となるプログラム細胞死機構の主要なメンバーである。カスパーゼ−３／７の活性を、Ｎｏｔｃｈ３−ＡＤＣで処置したＮｏｔｃｈ３発現細胞系で測定した。
【０２３８】
ＯＶＣＡＲ３細胞、ＨＣＣ２４２９細胞、およびＭＤＡ−ＭＢ−４６８／ｈＮｏｔｃｈ３細胞を、不透明白色の組織培養プレートに播種し、一晩インキュベートした。ＯＶＣＡＲ３およびＨＣＣ２４２９を１．１μｇ／ｍｌの、またＭＤＡ−ＭＢ−４６８／ｈＮｏｔｃｈ３細胞を１μｇ／ｍｌのｈｕ２８−ｖｃ０１０１およびｈｕＮｅｇ８．８−ｖｃ０１０（対照ＡＤＣ）で処置した。４８時間のインキュベーションの後、細胞を、カスパーゼ−Ｇｌｏ３／７試薬（Ｐｒｏｍｅｇａ＃Ｇ８０９０）で２時間、室温で処置した。発光をルミノメーターで測定し、バックグラウンドを差し引いた後、値を相対発光単位として報告した。
【０２３９】
表１６は、ｈｕ２８−ｖｃ０１０１が、Ｎｏｔｃｈ３発現細胞系ＭＤＡ−ＭＢ−４６８／ｈＮｏｔｃｈ３細胞、ＨＣＣ２４２９細胞、およびＯＶＣＡＲ３細胞で、対照Ｎｅｇ８．８−ｖｃ０１０１処置細胞の２〜３倍、カスパーゼ−３／７の活性を誘発したことを示す。したがって、ｈｕ２８−ｖｃ０１０１は、アポトーシスを誘発することによって細胞の成長を阻害する。
【０２４０】
【表１６】
2017186337.tif 000032
【０２４１】
（実施例１５）
Ｎｏｔｃｈ３の免疫組織化学
抗Ｎｏｔｃｈ３  ＡＤＣの影響を、異種移植されたヒト腫瘍細胞の細胞膜での検出可能なレベルのＮｏｔｃｈ３発現を有する前臨床モデルで評価した。Ｎｏｔｃｈ３を発現する前臨床モデルを同定するために、抗Ｎｏｔｃｈ３抗体を用いる免疫組織化学（以下「ＩＨＣ」）を、３７６２２Ａ１  ＮＳＣＬＣ（患者由来）異種移植片モデル、ＨＣＣ２４２９肺がん異種移植片モデル、ＭＤＡ−ＭＢ−４６８乳がん異種移植片モデル、およびＮ８７胃がん異種移植片モデルを含む、異種移植片モデルのパネルで行った。
【０２４２】
各異種移植片に由来する組織断片を、標準的な組織学的手順を用いて、ホルマリン固定およびパラフィン包埋（ＦＦＰＥ）した。５ミクロンのＦＦＰＥ切片を切断し、脱ワックスし、蒸留水に水和させた。抗原を、圧力鍋中のＥＤＴＡ緩衝液、ｐＨ８．０中で回復させた。内因性ペルオキシダーゼを、３．０％Ｈ２Ｏ２で１０分、ブロックした。切片を、ＤＡＫＯ  Ｐｒｏｔｅｉｎブロックと２０分インキュベートした。１：２０００希釈のウサギ抗Ｎｏｔｃｈ３（Ｄ１１Ｂ８、Ｃｅｌｌ  Ｓｉｇｎａｌｉｎｇ  Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ）を、切片に１時間、室温で、アプライした。Ｓｉｇｎａｌｓｔａｉｎ  Ｂｏｏｓｔ抗ウサギＩｇＧ−ＨＲＰポリマー（Ｃｅｌｌ  Ｓｉｇｎａｌｉｎｇ  Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ）を、切片に３０分、室温で、アプライした。ＤＡＢを用いて、５分、発色させた。切片をマイヤーヘマトキシリン中で簡単に対比染色し、脱水和し、澄明化し、カバースリップした。表１７は、０が陰性であり４が最高強度である０〜４のスケールでスコア付けされた染色強度および染色分布のグレードを示す。
【０２４３】
【表１７】
2017186337.tif 000033
【０２４４】
表１８に示すように、Ｎｏｔｃｈ３タンパク質を、３７６２２Ａ１  ＮＳＣＬＣ異種移植片、ＨＣＣ２４２９異種移植片、ＭＤＡ−ＭＢ−４６８異種移植片、およびＮ８７異種移植片に由来する細胞の細胞膜（Ｍｅｍ）上、ならびに細胞質（Ｃｙｔｏ）および／または核（Ｎｕｃ）内で検出した。データは、ＨＣＣ２４２９異種移植片とＮ８７異種移植片との両方が７６〜１００％の細胞の細胞膜で、Ｎｏｔｃｈ３タンパク質の均質な分布を有していたことを実証する。さらに、データは、３７６２２Ａ１  ＮＳＣＬＣ異種移植片およびＭＤＡ−ＭＢ−４６８異種移植片が、５１〜７５％の細胞で、細胞膜でのＮｏｔｃｈ３タンパク質の不均質な分布を有していたことを実証する。さらに、Ｄ１１Ｂ８抗体でのいくつかの上皮腫瘍細胞の核におけるＮｏｔｃｈ３  Ｃ末端細胞内ドメインの検出は、Ｎｏｔｃｈ３シグナル伝達がこれらの細胞において活性であったことを示唆する。
【０２４５】
【表１８】
2017186337.tif 000034
【０２４６】
図１１に示すように、ウェスタンブロット分析は、ｉｎ  ｖｉｖｏ有効性試験に用いられた異種移植片のパネルでのＮｏｔｃｈ３発現レベルを確認した。細胞外ドメインの約２１０ｋＤａのＮｏｔｃｈ３タンパク質断片（以下、Ｎｏｔｃｈ３−ＥＣＤ）を、マウスモノクローナル抗Ｎｏｔｃｈ３抗体１Ｇ５（Ａｂｎｏｖａ）を用いて、ＨＣＣ２４２９異種移植片、ＭＤＡ−ＭＢ−４６８異種移植片、Ｎ８７異種移植片、および３７６２２Ａ１異種移植片の抽出物で検出した。したがって、抗Ｎｏｔｃｈ３抗体Ｄ１１Ｂ８を用いるＩＨＣに由来するデータは、ヒト上皮腫瘍細胞の細胞膜でのＮｏｔｃｈ３を実証し、抗Ｎｏｔｃｈ３抗体１Ｇ５を用いるウェスタンブロット分析は、抗Ｎｏｔｃｈ３  ＡＤＣの標的であるＮＲＲドメインを含有するＮｏｔｃｈ３−ＥＣＤの発現を実証した。
【０２４７】
（実施例１６）
Ｉｎ  ｖｉｖｏ腫瘍異種移植片モデル
ヒト化抗Ｎｏｔｃｈ３抗体ｈｕ２８およびｈｕ７５、ならびにラット−ヒトキメラ抗Ｎｏｔｃｈ３抗体ｃｈ２８およびｃｈ７５を、様々なリンカー−ペイロードの組合せにコンジュゲートし、３７６２２Ａ１非小細胞肺がん（ＮＳＣＬＣ）異種移植片モデル、ＨＣＣ２４２９肺がん異種移植片モデル、ＭＤＡ−ＭＢ−４６８乳がん異種移植片モデル、およびＮ８７胃がん異種移植片モデルで試験した。以下に記載する各モデルについて、第１の用量は、０日目に投与した。腫瘍を少なくとも１週間に１回測定し、それらの体積を、式：腫瘍体積（ｍｍ３）＝０．５×（腫瘍幅２）（腫瘍長）で計算した。最大１０匹の動物、最低６匹の動物を含む各処置群について、平均腫瘍体積（±Ｓ．Ｅ．Ｍ．）を計算した。
【０２４８】
Ａ．  ３７６２２Ａ１患者由来のＮＳＣＬＣ異種移植片
適切な同意手順（Ａｓｔｅｒａｎｄ）に従って得た、新たに再切除した３７６２２Ａ１  ＮＳＣＬＣ腫瘍の断片から確立されたヒト腫瘍異種移植片のｉｎ  ｖｉｖｏでの成長に対する抗Ｎｏｔｃｈ３  ＡＤＣの影響を、免疫不全マウスで試験した。３７６２２Ａ１  ＮＳＣＬＣ患者由来の異種移植片を、ヌード（Ｎｕ／Ｎｕ）雌マウスにおいて、動物ごとに、断片として、ｉｎ  ｖｉｖｏで、皮下で通過させた。腫瘍が１５０から３００ｍｍ３の体積に達したら、それらを段階付けして、様々な処置群の間で腫瘍サイズが確実に均一になるようにした。３７６２２Ａ１  ＮＳＣＬＣ患者由来の異種移植片モデルに、４日ごとに４回（Ｑ４ｄ×４）、ＰＢＳビヒクル、ヒト化抗Ｎｏｔｃｈ３  ＡＤＣ、対照ｈｕＮｅｇ−８．８  ＡＤＣ、およびシスプラチンを、表１９に示す用量で、静脈内に投薬した。図１２は、シスプラチン（５ｍｇ／ｋｇ）およびＰＢＳビヒクルと比較した、３ｍｇ／ｋｇ用量でのｖｃ０１０１リンカー−ペイロードを有するＡＤＣの、表１９のデータのグラフを示す。
【０２４９】
シスプラチンは、がんの処置で用いられる白金ベースの抗がん剤であり、標準治療療法と考えられている。シスプラチンはＤＮＡを架橋し、それによって、アポトーシスおよび細胞成長の阻害を誘発する。データは、抗Ｎｏｔｃｈ３  ＡＤＣ  ｈｕ２８−ｖｃ０１０１、ｈｕ２８−ｖｃ６７８０、ｈｕ７５−ｖｃ０１０１、およびｈｕ７５−ｖｃ６７８０が、３７６２２Ａ１  ＮＳＣＬＣ患者由来の異種移植片腫瘍の成長を阻害したことを実証する。３ｍｇ／ｋｇ用量のｈｕ２８−ｖｃ０１０１は、この試験において試験された最も強力なＡＤＣであり、８４日目までに、依然として試験中の９匹の動物のうち４匹が腫瘍を有さないままであった。さらに、データは、抗Ｎｏｔｃｈ３  ＡＤＣが対照ｈｕＮｅｇ８．８−ＡＤＣよりも強力に腫瘍の成長を阻害したことを示す。さらに、データは、抗Ｎｏｔｃｈ３  ＡＤＣがシスプラチンよりも強力に腫瘍の成長を阻害したことを示し、このことは、白金ベースの標準治療化学療法剤よりも優れた潜在能力を示す（図１２）。
【０２５０】
【表１９】
2017186337.tif 000035
【０２５１】
Ｂ．  ＨＣＣ２４２９肺異種移植片
類似のｉｎ  ｖｉｖｏ実験を、上記のように、ＨＣＣ２４２９肺がん細胞系で行った。異種移植片を生成するために、ヌード（Ｎｕ／Ｎｕ）雌マウスに、５０％マトリゲル（ＢＤ  Ｂｉｏｓｃｉｅｎｃｅｓ）中の３．５×１０６個のＨＣＣ２４２９細胞を皮下で移植した。腫瘍が２００から４００ｍｍ３の体積に達したら、腫瘍を段階付けして、様々な処置群の間で腫瘍質量が確実に均一になるようにした。ＨＣＣ２４２９肺モデルに、Ｑ４ｄ×４で、ＰＢＳビヒクル、ヒト化抗Ｎｏｔｃｈ３  ＡＤＣ、および対照ｈｕＮｅｇ−８．８  ＡＤＣを、表２０および２１に示す用量で、静脈内に投薬した。データは、抗Ｎｏｔｃｈ３  ＡＤＣ  ｈｕ２８−ｖｃ０１０１、ｈｕ２８−ｖｃ６７８０、ｈｕ７５−ｖｃ０１０１、およびｈｕ７５−ｖｃ６７８０が、用量依存的にＨＣＣ２４２９肺異種移植片の成長を阻害したことを実証する。さらに、データは、抗Ｎｏｔｃｈ３  ＡＤＣが、ｖｃ０１０１リンカー−ペイロードを有する抗Ｎｏｔｃｈ３  ＡＤＣでは１および３ｍｇ／ｋｇ用量で、またｖｃ６７８０リンカー−ペイロードを有する抗Ｎｏｔｃｈ３  ＡＤＣでは３および１０ｍｇ／ｋｇ用量で、対照ｈｕＮｅｇ８．８−ＡＤＣよりも強力に腫瘍の成長を阻害したことを示す。さらに、データは、３ｍｇ／ｋｇ用量のｈｕ２８−ｖｃ０１０１が、１０ｍｇ／ｋｇ用量のｈｕ２８−ｖｃ６７８０よりも強力であったことを実証する。
【０２５２】
【表２０】
2017186337.tif 000036
【０２５３】
【表２１】
2017186337.tif 000037
【０２５４】
ＨＣＣ２４２９肺モデルにも、図１６Ａに示すように、Ｑ４ｄ×４で、ＰＢＳビヒクル、ラット−ヒトキメラ抗Ｎｏｔｃｈ３  ＡＤＣ、および対照ｈｕＮｅｇ−８．８  ＡＤＣを、５ｍｇ／ｋｇ用量で静脈内に投薬した。データは、切断不可能な（ｍｃ）および切断可能な（ｖｃ）リンカーならびに様々なペイロードの組合せを有する抗Ｎｏｔｃｈ３  ＡＤＣが、ＨＣＣ２４２９肺異種移植片の成長を阻害したことを実証する。さらに、データは、ラット−ヒトキメラ抗Ｎｏｔｃｈ３  ＡＤＣが、対照ｈｕＮｅｇ８．８−ＡＤＣよりも強力に腫瘍の成長を阻害したことを示す。さらに、データは、ｖｃ０１０１リンカー−ペイロードを有するラット−ヒトキメラ抗Ｎｏｔｃｈ３  ＡＤＣが、試験した他の抗Ｎｏｔｃｈ３  ＡＤＣよりも強力であったことを実証する。
【０２５５】
さらなるｉｎ  ｖｉｖｏ実験を、コンジュゲートしていないラット−ヒトキメラ抗Ｎｏｔｃｈ３抗体ｃｈ７５−ｈＩｇＧ１を用いてＨＣＣ２４２９肺がん細胞系で行って、ｃｈ７５−ｈＩｇＧ１のＮｏｔｃｈ３シグナル伝達阻害が抗Ｎｏｔｃｈ３  ｈｕ７５−ＡＤＣの観察された潜在能力に寄与しているか否かを判定した。異種移植片を生成するために、ヌード（Ｎｕ／Ｎｕ）雌マウスに、５０％マトリゲル（ＢＤ  Ｂｉｏｓｃｉｅｎｃｅｓ）中の３．５×１０６個のＨＣＣ２４２９細胞を皮下で移植した。腫瘍が７５から２００ｍｍ３の体積に達したら、腫瘍を段階付けして、様々な処置群の間で腫瘍質量が確実に均一になるようにした。
【０２５６】
ＨＣＣ２４２９肺モデルに、Ｑ４ｄ×４で、ＰＢＳビヒクル、ラット−ヒトキメラ抗Ｎｏｔｃｈ３抗体、ｃｈ７５−ｈＩｇＧ１、およびヒト化抗Ｎｏｔｃｈ１抗体ｈｕ４３８  ＶＨ１．１／ＶＬ１．８を、表２２で示す用量で、静脈内に投薬した。８匹の動物から、各処置群についての平均腫瘍質量（±ＳＥＭ）を計算し、対照ＰＢＳビヒクル群と比較した。分散分析（ＡＮＯＶＡ）に基づくＰ値を計算して、Ｅｘｃｅｌ内蔵の統計機能を用いて、抗Ｎｏｔｃｈ処置と対照ＰＢＳとの観察された成長阻害の統計的有意性を判定した。パーセント（％）成長阻害値を、ビヒクル処置したマウスと比較して、薬物処置したマウスについて、式１００×｛１−［（処置１４日目−処置０日目）／（対照１４日目−対照０日目）］｝を用いて、試験の最終日の測定値から計算した。
【０２５７】
データは、抗Ｎｏｔｃｈ１ヒト化抗体ｈｕ４３８  ＶＨ１．１／ＶＬ１．８が腫瘍の成長を５７％阻害し、コンジュゲートしていないラット−ヒトキメラ抗Ｎｏｔｃｈ３抗体ｃｈ７５−ｈＩｇＧ１がＰＢＳビヒクル処置した腫瘍と比較して腫瘍の成長を阻害しなかったことを実証する。さらに、データは、ｃｈ７５抗体と生成したＮｏｔｃｈ３  ＡＤＣでの、ＨＣＣ２４２９異種移植片における、表２０、２１、および図１６Ａで報告された、観察された腫瘍成長阻害が、シグナル伝達阻害に起因するものではなかったことを実証する。
【０２５８】
【表２２】
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【０２５９】
Ｃ．  ＭＤＡ−ＭＢ−４６８乳房異種移植片
類似のｉｎ  ｖｉｖｏ実験を、上記のように、ＭＤＡ−ＭＢ−４６８乳がん細胞系で行った。ＭＤＡ−ＭＢ−４６８細胞は、トリプルネガティブ乳がん（ＴＮＢＣ）基底細胞様サブタイプと分類され、これは、それらがエストロゲン受容体、プロゲステロン受容体、およびヒト上皮成長因子受容体２（ＨＥＲ２）の発現を欠くためである（Ｌｅｈｍａｎｎ，ＢＤら、Ｊ  Ｃｌｉｎ  Ｉｎｖｅｓｔ．２０１１；１２１（７）：２７５０〜２７６７）。異種移植片を生成するために、雌ＳＣＩＤ無毛非近交（ＳＨＯ）マウスに、哺乳動物脂肪パッド中の５０％マトリゲル（ＢＤ  Ｂｉｏｓｃｉｅｎｃｅｓ）を含有する１０×１０６個のＭＤＡ−ＭＢ−４６８細胞を正所に移植した。腫瘍が２５０から４５０ｍｍ３の体積に達したら、腫瘍を段階付けして、様々な処置群の間で腫瘍質量が確実に均一になるようにした。ＭＤＡ−ＭＢ−４６８乳房モデルに、Ｑ４ｄ×４で、ＰＢＳビヒクル、ヒト化抗Ｎｏｔｃｈ３  ＡＤＣ、および対照ｈｕＮｅｇ−８．８  ＡＤＣを、表２３および表２４に示す用量で、静脈内に投薬した。図１３Ａおよび図１３Ｂは、対照ｈｕＮｅｇ−８．８  ＡＤＣおよびＰＢＳビヒクルと比較した、ｖｃ０１０１リンカー−ペイロードを有する抗Ｎｏｔｃｈ３  ＡＤＣの、表２３のデータのグラフを示す。図１４Ａおよび図１４Ｂは、対照ｈｕＮｅｇ−８．８  ＡＤＣおよびＰＢＳビヒクルと比較した、ｖｃ６７８０リンカー−ペイロードを有する抗Ｎｏｔｃｈ３  ＡＤＣの、表２４のデータのグラフを示す。
【０２６０】
データは、抗Ｎｏｔｃｈ３  ＡＤＣ  ｈｕ２８−ｖｃ０１０１、ｈｕ２８−ｖｃ６７８０、ｈｕ７５−ｖｃ０１０１、およびｈｕ７５−ｖｃ６７８０が用量依存的にＭＤＡ−ＭＢ−４６８乳房異種移植片の成長を阻害したことを実証する。さらに、データは、抗Ｎｏｔｃｈ３  ＡＤＣが、ｖｃ０１０１リンカー−ペイロードを有するＡＤＣでは１および３ｍｇ／ｋｇの用量で、またｖｃ６７８０リンカー−ペイロードを有するＡＤＣでは１、３、および１０ｍｇ／ｋｇの用量で、対照ｈｕＮｅｇ８．８−ＡＤＣよりも強力に腫瘍の成長を阻害したことを示す。さらに、データは、ｖｃ０１０１リンカー−ペイロードを有する１ｍｇ／ｋｇ用量の抗Ｎｏｔｃｈ３  ＡＤＣが、ｖｃ６７８０リンカー−ペイロードを有する３ｍｇ／ｋｇ用量の抗Ｎｏｔｃｈ３  ＡＤＣよりも強力であったことを実証する。
【０２６１】
【表２３−１】
2017186337.tif 000039
【０２６２】
【表２３−２】
2017186337.tif 000040
【０２６３】
【表２４−１】
2017186337.tif 000041
【０２６４】
【表２４−２】
2017186337.tif 000042
【０２６５】
ＭＤＡ−ＭＢ−４６８乳がんモデルにも、図１６Ｂおよび図１６Ｃに示すように、Ｑ４ｄ×４で、ＰＢＳビヒクル、ラット−ヒトキメラ抗Ｎｏｔｃｈ３  ＡＤＣ、および対照ｈｕＮｅｇ−８．８  ＡＤＣを、５ｍｇ／ｋｇ用量で静脈内に投薬した。データは、切断不可能な（ｍｃ）および切断可能な（ｖｃ）リンカーならびに様々なペイロードの組合せを有するラット−ヒトキメラ抗Ｎｏｔｃｈ３  ＡＤＣが、ＭＤＡ−ＭＢ−４６８乳房異種移植片の成長を阻害したことを実証する。さらに、データは、ラット−ヒトキメラ抗Ｎｏｔｃｈ３  ＡＤＣが、対照ｈｕＮｅｇ８．８−ＡＤＣよりも強力に腫瘍の成長を阻害したことを示す。さらに、データは、ｖｃ０１０１リンカー−ペイロードを有するラット−ヒトキメラ抗Ｎｏｔｃｈ３  ＡＤＣが、試験した他のラット−ヒトキメラ抗Ｎｏｔｃｈ３  ＡＤＣよりも強力であったことを実証する。
【０２６６】
ＭＤＡ−ＭＢ−４６８乳がんモデルを用いて、ｈｕ２８−ｖｃ０１０１のｉｎ  ｖｉｖｏでの活性機構を試験した。ｈｕ２８−ｖｃ０１０１の薬力学を、ＡＤＣ処置した異種移植片において有糸分裂マーカーであるホスホヒストンＨ３で染色することによって、細胞レベルで視覚化した。ヒストンＨ３を、細胞サイクルの有糸分裂相の間のクロマチン内のＳｅｒ−１０残基上でリン酸化した（以下「ｐＨＨ３」）。
【０２６７】
ＭＤＡ−ＭＢ−４６８乳房異種移植片を有するマウスに、単回の３ｍｇ／ｋｇ用量の抗Ｎｏｔｃｈ３  ＡＤＣ  ｈｕ２８−ｖｃ０１０１、ｈｕＮｅｇ−８．８−ｖｃ０１０１（対照ＡＤＣ）、またはＰＢＳを静脈内で投与した。３つの異種移植片を、６、２４、および９６時間後に回収し、標準的な免疫組織化学のために処理した。５マイクロメートル厚の、ホルマリン固定されパラフィン包埋された組織切片を、キシレン置換で脱パラフィン化し、段階付けされたアルコールから蒸留水までで再水和した。抗原性部位を暴露させるために、組織切片を、圧力鍋（Ｒｅｔｒｉｅｖｅｒ、Ｅｌｅｃｔｒｏｎ  Ｍｉｃｒｏｓｃｏｐｙ  Ｓｃｉｅｎｃｅｓ）内の１０ｍＭクエン酸緩衝液、ｐＨ６．０（Ｌａｂｖｉｓｉｏｎ）中で加熱し、室温まで冷却した。内因性ペルオキシダーゼ活性を、３％過酸化水素で１５分、不活化した。非特異的なタンパク質相互作用を、ＵＶ  Ｂｌｏｃｋ（Ｌａｂｖｉｓｉｏｎ）との１０分のインキュベーションによってブロックした。組織切片を抗ｐＨＨ３抗体と１時間インキュベートし、Ｓｉｇｎａｌｓｔａｉｎ  Ｂｏｏｓｔ  Ｒｅａｇｅｎｔ（８１１４、Ｃｅｌｌ  Ｓｉｇｎａｌｉｎｇ  Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ）で３０分検出し、ＤＡＢ＋（ＤＡＫＯ）で５分、発色させた。全切片をヘマトキシリンＱＳ（Ｖｅｃｔｏｒ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｉｅｓ）で対比染色し、水道水で洗浄し、段階付けされたアルコール中で脱水し、キシレン置換で澄明化し、Ｐｅｒｍｏｕｎｔ  Ｍｏｕｎｔｉｎｇ  Ｍｅｄｉｕｍ（ＦｉｓｈｅｒＣｈｅｍｉｃａｌｓ、フェアローン、ニュージャージー州）でマウントした。
【０２６８】
免疫組織化学的に染色されたスライドを画像分析によって評価した。スライドを、Ｈａｍａｍａｔｓｕ  ＮａｎｏＺｏｏｍｅｒ自動スライドスキャナを用いて、２０倍で画像化した。デジタル化されると、仮想のスライドを、Ｄｅｆｉｎｉｅｎｓ  Ｔｉｓｓｕｅ  Ｓｔｕｄｉｏソフトウェアを用いて分析した。各異種移植片切片を局所的にセグメント化し、細胞充実度および形態学に基づいて分類した。個別の核を異種移植片の生存可能領域内で同定し、陽性度を、それぞれの核の茶色色原体の平均強度を用いて判定した。データは、以下の方程式：（ｐＨＨ３陽性核（生存可能領域）の数／核（生存可能領域）の総数）×１００を用いて計算されるパーセント（％）ｐＨＨ３陽性度として表される。統計的有意性の判定を、両側Ｔ検定を用いて、Ｇｒａｐｈ  Ｐａｄ  Ｐｒｉｓｍで、２４時間の時点のＰＢＳ対照と比較して、各処置群および時点について判定した。
【０２６９】
微小管阻害剤様ｈｕ２８−ｖｃ０１０１と生成したＡＤＣは、クロマチン内のＳｅｒ−１０残基上でヒストンＨ３がリン酸化されると、細胞サイクルの有糸分裂相において増殖細胞を停止させると予想される。ＡＤＣ処置した異種移植片でのｐＨＨ３染色の蓄積は、がん細胞が有糸分裂において停止したことを示す。表２５は、抗Ｎｏｔｃｈ３  ｈｕ２８−ｖｃ０１０１およびｈｕＮｅｇ−８．８−ｖｃ０１０１（対照ＡＤＣ）で処置したＭＤＡ−ＭＢ−４６８異種移植片ならびに未処置のＭＤＡ−ＭＢ−４６８異種移植片におけるｐＨＨ３染色細胞のパーセンテージを含有する。データは、ｈｕ２８−ｖｃ０１０１が、ＰＢＳ対照と比較して、処置後２４時間および９６時間でのＭＤＡ−ＭＤ−４６８がん細胞におけるｐＨＨ３染色された核のパーセンテージで統計的に有意な２倍の増大をもたらしたが、対照ｈｕＮｅｇ８．８−ｖｃ０１０１はもたらさなかったことを実証する。データは、抗Ｎｏｔｃｈ３  ｈｕ２８−ｖｃ０１０１が、ｉｎ  ｖｉｖｏでの腫瘍の成長を、細胞サイクルの有糸分裂相で細胞を停止させることによって、少なくとも部分的に阻害し、こうして増殖を防ぐことを示す。
【０２７０】
【表２５】
2017186337.tif 000043
【０２７１】
Ｄ．  Ｎ８７胃異種移植片
類似のｉｎ  ｖｉｖｏ実験を、上記のように、Ｎ８７胃がん細胞系で行った。異種移植片を生成するために、ヌード（Ｎｕ／Ｎｕ）雌マウスに、５０％マトリゲル（ＢＤ  Ｂｉｏｓｃｉｅｎｃｅｓ）中の８×１０６個のＮ８７細胞を皮下で移植した。腫瘍が２５０から４５０ｍｍ３の体積に達したら、腫瘍を段階付けして、様々な処置群の間で腫瘍質量が確実に均一になるようにした。Ｎ８７胃モデルに、Ｑ４ｄ×４で、ＰＢＳビヒクル、ヒト化抗Ｎｏｔｃｈ３  ＡＤＣ、対照ｈｕＮｅｇ−８．８  ＡＤＣ、およびシスプラチンを、表２６および２７に示す用量で、静脈内に投薬した。データは、抗Ｎｏｔｃｈ３  ＡＤＣ  ｈｕ２８−ｖｃ０１０１、ｈｕ２８−ｖｃ６７８０、ｈｕ７５−ｖｃ０１０１、およびｈｕ７５−ｖｃ６７８０が、用量依存的にＮ８７胃異種移植片の成長を阻害したことを実証する。さらに、データは、抗Ｎｏｔｃｈ３  ＡＤＣが、ｖｃ０１０１リンカー−ペイロードを有するＡＤＣでは１、３、５ｍｇ／ｋｇ用量で、またｖｃ６７８０リンカー−ペイロードを有するＡＤＣでは３および１０ｍｇ／ｋｇ用量で、対照ｈｕＮｅｇ８．８−ＡＤＣよりも強力に腫瘍の成長を阻害したことを示す。１３３日目までに、ｈｕ２８−ｖｃ０１０１の５ｍｇ／ｋｇ用量群は、腫瘍を有さない９匹の動物のうち６匹を含有し、ｈｕ７５−ｖｃ０１０１は９匹の動物のうち４匹を有し、対照ｈｕＮｅｇ８−８−ｖｃ０１０１は、腫瘍を有さない８匹の動物のうち１匹を有していた。さらに、データは、ｖｃ０１０１リンカー−ペイロードを有するＡＤＣが、シスプラチン標準治療療法およびｖｃ６７８０リンカー−ペイロードを有するＡＤＣよりも全体として強力であったことを実証する。
【０２７２】
【表２６−１】
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【０２７３】
【表２６−２】
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【０２７４】
【表２７】
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【０２７５】
Ｎ８７胃モデルにも、図１６Ｄに示すように、Ｑ４ｄ×４で、ＰＢＳビヒクル、ラット−ヒトキメラ抗Ｎｏｔｃｈ３  ＡＤＣ、および対照ｈｕＮｅｇ−８．８  ＡＤＣを、５ｍｇ／ｋｇ用量で静脈内に投薬した。データは、切断不可能な（ｍｃ）および切断可能な（ｖｃ）リンカーならびに様々なペイロードの組合せを有するラット−ヒトキメラ抗Ｎｏｔｃｈ３  ＡＤＣが、Ｎ８７胃異種移植片の成長を阻害したことを実証する。さらに、データは、ラット−ヒトキメラ抗Ｎｏｔｃｈ３  ＡＤＣが、対照ｈｕＮｅｇ８．８−ＡＤＣよりも強力に腫瘍の成長を阻害したことを示す。さらに、データは、ｖｃ０１０１リンカー−ペイロードを有するラット−ヒトキメラ抗Ｎｏｔｃｈ３  ＡＤＣが、試験した他の抗Ｎｏｔｃｈ３  ＡＤＣよりも強力であったことを実証する。
【０２７６】
Ｎ８７胃モデルにも、図１６Ｅに示すように、Ｑ４ｄ×４で、ＰＢＳビヒクル、ならびにラット−ヒトキメラ抗Ｎｏｔｃｈ３  ＡＤＣ  ｃｈ２８−ｍｃ０１３１、ｃｈ７５−ｍｃ０１３１、ｃｈ２８−ｍ（Ｈ２Ｏ）ｃ−０１３１、およびｃｈ７５−ｍ（Ｈ２Ｏ）ｃ−０１３１を、５ｍｇ／ｋｇ用量で静脈内に投薬した。データは、ｍｃ０１３１リンカー−ペイロードおよびｍ（Ｈ２Ｏ）ｃ−０１３１リンカー−ペイロードを有するラット−ヒトキメラ抗Ｎｏｔｃｈ３  ＡＤＣが、Ｎ８７胃異種移植片の成長を阻害したことを実証する。さらに、データは、ｍ（Ｈ２Ｏ）ｃ−０１３１リンカー−ペイロードを有するラット−ヒトキメラ抗Ｎｏｔｃｈ３  ＡＤＣが、ｍｃ０１３１リンカー−ペイロードを有するラット−ヒトキメラ抗Ｎｏｔｃｈ３  ＡＤＣよりも強力であったことを実証する。
【０２７７】
Ｅ．  ＯＶＣＡＲ３卵巣異種移植片
類似のｉｎ  ｖｉｖｏ実験を、上記のように、ＯＶＣＡＲ３卵巣細胞系で行った。異種移植片を生成するために、ＳＣＩＤ無毛非近交（ＳＨＯ）雌マウスに、５０％マトリゲル（ＢＤ  Ｂｉｏｓｃｉｅｎｃｅｓ）中の５×１０６個のＯＶＣＡＲ３細胞を皮下で移植した。腫瘍が１２０から２９０ｍｍ３の体積に達したら、腫瘍を段階付けして、様々な処置群の間で腫瘍質量が確実に均一になるようにした。ＯＶＣＡＲ３モデルに、Ｑ４ｄ×４で、ＰＢＳビヒクル、ヒト化抗Ｎｏｔｃｈ３  ＡＤＣ  ｈｕ２８−ｖｃ０１０１、および対照ＡＤＣ  ｈｕＮｅｇ−８．８−ｖｃ０１０１を、静脈内で投薬し、Ｑ７ｄ×４でパクリタキセル（３０ｍｇ／ｋｇを１日に２回）を、Ｑ７ｄ×８でカルボプラチンを、表２８に示す用量で、腹腔内で投薬した。図１５および表２８は、ｈｕ２８−ｖｃ０１０１が用量依存的にＯＶＣＡＲ３卵巣異種移植片の成長を阻害したことを実証する。さらに、データは、ｈｕ２８−ｖｃ０１０１が、対照ｈｕＮｅｇ８．８−ｖｃ０１０１およびカルボプラチン標準治療化学療法よりも強力に腫瘍の成長を阻害したことを示す。さらに、データは、Ｑ４ｄ×４で３ｍｇ／ｋｇで投薬されたｈｕ２８−ｖｃ０１０１が、ＳＨＯマウスでのパクリタキセルの最大耐量であるＱ７ｄ×４で６０ｍｇ／ｋｇで投薬されたパクリタキセルに類似の潜在能力を有していたことを実証する。
【０２７８】
【表２８−１】
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【０２７９】
【表２８−２】
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【０２８０】
（実施例１７）
部位特異的コンジュゲーションのためのシステイン変異体の生成
先の実施例に記載した抗Ｎｏｔｃｈ３  ＡＤＣを、標的抗体のシステインアミノ酸残基へのリンカー−ペイロードの慣例的な非特異的コンジュゲーションを介して生成した。抗体へのリンカー−ペイロードの部位特異的コンジュゲーションは、均質な薬物ローディングを容易にするため、および、慣例的なコンジュゲーション方法によって生成されるいくつかのＡＤＣで観察されうる、潜在的に改変した抗原結合または薬物動態特性を有するＡＤＣ亜集団を避けるために行った。１つのこのような部位特異的コンジュゲーション戦略は、標的抗体のアミノ酸配列内の特異的部位でシステイン残基を導入するように設計されている。定常重鎖および定常軽鎖内の多くのアミノ酸位置が、国際公開第ＷＯ／２０１３／０９３８０９号に記載されているように同定されており、ｈｕ２８抗体内の特異的アミノ酸部位でシステイン残基と置換されている。
【０２８１】
部位特異的システイン置換を、Ｌ４４３位およびＫ３９２位で、ＦｃポリペプチドまたはヒトＩｇＧ１重鎖定常ドメイン（Ｃｙ）内に改変した（本明細書では、Ｌ４４３ＣおよびＫ３９２Ｃ）。部位特異的システイン置換を、Ｋ１８３位のヒトカッパ（κ）軽鎖定常ドメイン（Ｃκ）ポリペプチド内に改変した（本明細書ではκＫ１８３Ｃ）。システイン変異体のＣＤＲは、親野生型ｈｕ２８と同一のままであった。図１７Ａおよび図１７Ｂは、記載された部位特異的システイン置換を有するｈｕ２８抗体のアミノ酸配列およびヌクレオチド配列を示す。ｈｕ２８抗体におけるシステイン置換は、以下の抗体：ｈｕ２８−（Ｌ４４３Ｃ）、ｈｕ２８−（Ｌ４４３Ｃ／Ｋ３９２Ｃ）、およびｈｕ２８−（Ｌ４４３Ｃ／κＫ１８３Ｃ）の生成をもたらした。すべてのシステイン変異は、国際公開第ＷＯ／２０１３／０９３８０９号に記載されているような部位特異的変異生成によって構築された。これらの突然変異抗体のための発現構築物は、ＣＨＯ細胞での安定な発現のための、部位特異的組込み（ＳＳＩ）発現ベクター（Ｌｏｎｚａ）で生成した。システイン変異抗体を発現するトランスフェクトされたＣＨＯ細胞の安定なプールを確立し、馴化培地を生成した。標準的なタンパク質Ａ親和性精製と、その後のサイズ排除クロマトグラフィーとを採用して、先の実施例に記載したように、馴化培地から抗Ｎｏｔｃｈ３システイン変異抗体を精製した。
【０２８２】
（実施例１８）
システイン変異体の特徴付け
コンジュゲートしていないシステイン変異体ヒト化抗Ｎｏｔｃｈ３抗体を、先の実施例に記載したように、細胞ベースのＥＬＩＳＡで、Ｎｏｔｃｈ３発現細胞系への細胞表面結合活性についてスクリーニングした。表２９は、コンジュゲートしていないシステイン変異体ｈｕ２８−（Ｌ４４３Ｃ）、ｈｕ２８−（Ｌ４４３／Ｋ３８２）、およびｈｕ２８−（Ｌ４４３／κＫ１８３Ｃ）についての細胞表面Ｎｏｔｃｈ３結合ＥＬＩＳＡから計算されたＥＣ５０（ｎＭ）値を示す。データは、システイン変異抗体が、Ｕ２ＯＳ／ｈＮｏｔｃｈ３細胞、ＨＣＣ２４２９細胞、およびＯＶＣＡＲ３細胞の細胞表面に発現した全長ヒトＮｏｔｃｈ３への結合において、親野生型ｈｕ２８抗体に類似のＥＣ５０値を有することを実証する。さらに、データは、ヒト化ｈｕ２８抗体の重鎖または重鎖と軽鎖との両方の定常領域内へのシステインアミノ酸の置換が、それらの結合特性に影響しなかったかまたはそれを改変しなかったことを実証する。陰性対照ｈｕＮｅｇ８．８抗体は、試験した細胞系のいずれも結合しなかった。結合を欠いていた（ＬＢ）対照抗体では、ＥＣ５０値は、示されたように、生じなかった。
【０２８３】
【表２９】
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【０２８４】
（実施例１９）
システイン変異体ＡＤＣのＩｎ  ｖｉｔｒｏ細胞傷害性アッセイ
抗Ｎｏｔｃｈ３  ｈｕ２８システイン変異抗体へのマレイミド機能化リンカー−ペイロードのコンジュゲーションを、１００ｍＭ  ＨＥＰＥＳ（４−（２−ヒドロキシエチル）−１−ピペラジンエタンスルホン酸緩衝液）、ｐＨ７．０中の、１００倍モル過剰のトリス（２−カルボキシエチル）ホスフィン（ＴＣＥＰ）、および１ｍＭジエチレントリアミン五酢酸（ＤＴＰＡ）中で、２時間、３７℃で、完全に還元し、その後、脱塩して過剰なＴＣＥＰを除去することを介して実現した。還元された抗体を、２ｍＭデヒドロアスコルビン酸（ＤＨＡ）、１００ｍＭ  ＨＥＰＥＳ、ｐＨ７．０、および１ｍＭ  ＤＴＰＡ中で、１６時間、４℃でインキュベートして、鎖間ジスルフィド結合を再形成させた。脱塩の後、ｖｃ０１０１リンカー−ペイロードを約７のリンカー−ペイロード／抗体モル比で反応混合物に添加し、さらに１時間、２５℃で、１５％ｖ／ｖジメチルアセトアミド（ＤＭＡ）の存在下で反応させた。１時間のインキュベーション時間の後、６倍過剰なＬ−Ｃｙｓを添加して、あらゆる未反応のリンカー−ペイロードをクエンチした。反応混合物を、リン酸緩衝溶液（ＰＢＳ）、ｐＨ７．４中で、４℃で一晩透析し、ＳＥＣ（ＡＫＴＡ  ｅｘｐｌｏｒｅｒ、Ｓｕｐｅｒｄｅｘ  ２００）を介して精製した。ＡＤＣを、純度用ＳＥＣ、疎水性相互作用クロマトグラフィー（ＨＩＣ）、および液体クロマトグラフィーエレクトロスプレーイオン化タンデム質量分析法（ＬＣ−ＥＳＩ  ＭＳ）を介してさらに特徴付けて、薬物−抗体比（ローディング）を計算した。タンパク質濃度を、ＵＶ分光光度計を介して判定した。さらなるコンジュゲーション技法は、国際公開第ＷＯ／２０１３／０９３８０９号に記載されている。
【０２８５】
この方法は、抗Ｎｏｔｃｈ３システイン変異体ＡＤＣ：ｈｕ２８−（Ｌ４４３Ｃ）−ｖｃ０１０１およびｈｕ２８−（Ｌ４４３Ｃ／κＫ１８３Ｃ）−ｖｃ０１０１を生成した。抗Ｎｏｔｃｈ３システイン変異体ＡＤＣの活性を、先の実施例に記載したように、ＭＴＳ細胞生存能力指標を用いて、Ｎｏｔｃｈ３タンパク質を内因的に発現する細胞系であるＨＣＣ２４２９（肺がん）およびＯＶＣＡＲ３（卵巣がん）に対して評価した。
【０２８６】
表３０は、抗Ｎｏｔｃｈ３システイン変異体ＡＤＣ処置のＩＣ５０（ｎｇＡｂ／ｍＬ）値を示す。データは、ＤＡＲ＝３．９であるｈｕ２８−（Ｌ４４３Ｃ／κＫ１８３Ｃ）−ｖｃ０１０１が活性であり、ＤＡＲ＝３．９である野生型ｈｕ２８−ｖｃ０１０１  ＡＤＣに類似の潜在能力を有していたこと、および両方がＮｏｔｃｈ３発現がん細胞系ＨＣＣ２４２９およびＯＶＣＡＲ３で細胞死を誘発したことを実証する。データはさらに、ＤＡＲ＝２である単一システイン変異体ｈｕ２８−（Ｌ４４３）−ｖｃ０１０１およびＤＡＲ＝４である非標的化対照ｈｕＮｅｇ８．８  ＡＤＣが、試験した最高用量でごくわずかに活性であったことを実証する。
【０２８７】
【表３０】
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【０２８８】
（実施例２０）
システイン変異体ＡＤＣのＩｎ  ｖｉｖｏでの有効性
類似のｉｎ  ｖｉｖｏ実験を、先の実施例に記載したように、ＯＶＣＡＲ３卵巣細胞系を用いて、抗Ｎｏｔｃｈ３システイン変異体ＡＤＣで行った。ＯＶＣＡＲ３モデルに、Ｑ４ｄ×４で、ＰＢＳビヒクル、ｈｕ２８−ｖｃ０１０１、抗ｈｕ２８−（Ｌ４４３Ｃ）−ｖｃ０１０１、ｈｕ２８−（Ｌ４４３Ｃ／κＫ１８３Ｃ）−ｖｃ０１０１、および対照ｈｕＮｅｇ−８．８  ＡＤＣを、表３１に示す用量で、静脈内に投薬した。データは、二重システイン変異体ｈｕ２８−（Ｌ４４３Ｃ／κＫ１８３Ｃ）−ｖｃ０１０１が、３ｍｇ／ｋｇ用量で、野生型ｈｕ２８−ｖｃ０１０１に類似の活性で、ＯＶＣＡＲ３卵巣異種移植片の成長を阻害したが、１ｍｇ／ｋｇ用量ではそれほどでもなかったことを実証する。データはさらに、ＤＡＲ＝２である単一システイン変異体ｈｕ２８−（Ｌ４４３Ｃ）−ｖｃ０１０１がｉｎ  ｖｉｖｏで効果的であったが、１ｍｇ／ｋｇ用量および３ｍｇ／ｋｇ用量の両方では、野生型ｈｕ２８−ｖｃ０１０１およびｈｕ２８−（Ｌ４４３Ｃ／κＫ１８３Ｃ）−ｖｃ０１０１ほどには活性でなかったことを実証する。データは、部位特異的コンジュゲーションによって生成した抗Ｎｏｔｃｈ３システイン変異体ＡＤＣが、ｉｎ  ｖｉｖｏで効果的であり、腫瘍の成長を阻害することを示す。
【０２８９】
【表３１−１】
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【０２９０】
【表３１−２】
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【図１】
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【図２】
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【図３】
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【図４−１】
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【図４−２】
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【図４−３】
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【図５−１】
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【図５−２】
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【図５−３】
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【図６】
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【図７】
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【図８−１】
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【図８−２】
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【図８−３】
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【図９】
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【図１０】
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【図１１】
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【図１２】
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【図１３】
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【図１４】
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【図１５】
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【図１６−１】
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【図１６−２】
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【図１６−３】
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【図１６−４】
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【図１６−５】
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【図１７−１】
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【図１７−２】
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【配列表】
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