(57)【要約】【課題】標本の種類に関わらず、簡易な構成で、熱ドリフトによる標本の指定位置のずれを正確に補正することができる顕微鏡システムを提供する。【解決手段】顕微鏡システム１は、ステージ２１１が標本ＳＰにおける複数の指定位置に移動する前に、撮像装置３がステージ２１１上の所定の位置で、少なくとも熱ドリフトに起因したステージ２１１の動きを示す指標を撮影して生成した画像データに対応する基準画像と、撮像装置３による標本ＳＰにおける複数の指定位置の撮影を１サイクルとする回数数の１サイクルが終了した後に、撮像装置３が所定の位置で指標を撮影して生成した画像データに対応する現在画像とに基づいて、指標のずれ量を算出するずれ量算出部６２５と、ずれ量算出部６２５が算出したずれ量に基づいて、撮影情報記録部６１１が記録する標本ＳＰにおける複数の指定位置を補正する補正部６２６と、を備える。【選択図】図２
2016009163.tif 000002
【特許請求の範囲】
【請求項１】
標本を載置し、水平方向に移動可能なステージと、
前記ステージと対向して配置され、前記標本を観察するための対物レンズと、
前記ステージを前記対物レンズに対して相対的に移動させるステージ駆動部と、
前記対物レンズを介して前記標本を撮影し、前記標本の画像データを生成する撮像装置と、
前記標本上における観察箇所を指定する複数の指定位置と、前記撮像装置による前記複数の指定位置それぞれの撮影順番と、前記撮像装置による前記複数の指定位置それぞれの撮影時刻と、前記撮像装置による前記複数の指定位置それぞれの撮影を繰り返すときの回数を示すサイクル数と、を対応付けた撮影情報を設定する撮影情報設定部と、
前記撮影情報設定部が設定した前記撮影情報に基づいて、前記ステージ駆動部を駆動させて前記ステージを前記複数の指定位置に順次移動させるステージ制御部と、
前記撮影情報設定部が設定した前記撮影時刻に前記撮像装置によって前記標本を撮影させる撮影制御部と、
前記ステージが前記複数の指定位置に移動する前に、前記撮像装置が前記ステージ上の所定の位置で、少なくとも熱ドリフトに起因した前記ステージの動きを示す指標を撮影して生成した画像データに対応する基準画像と、最初の１サイクルが終了した後に、前記撮像装置が前記所定の位置で前記指標を撮影して生成した画像データに対応する現在画像とに基づいて、前記指標のずれ量を算出するずれ量算出部と、
前記ずれ量算出部が算出した前記ずれ量に基づいて、前記複数の指定位置をそれぞれ補正する補正部と、
を備えたことを特徴とする顕微鏡システム。
【請求項２】
前記ステージ制御部は、前記１サイクルが終了する毎に、前記ステージ駆動部を駆動させて前記対物レンズの光軸上に前記指標が位置するように前記ステージを移動させることを特徴とする請求項１に記載の顕微鏡システム。
【請求項３】
前記ステージ制御部は、前記サイクル数の一定回数が終了する毎または前記撮像装置が前記標本を撮像して一定時間経過する毎に、前記ステージ駆動部を駆動させて前記対物レンズの光軸上に前記指標が位置するように前記ステージを前記所定の位置へ移動させることを特徴とする請求項１に記載の顕微鏡システム。
【請求項４】
前記撮像装置が順次生成した前記画像データと前記ずれ量とを対応付けて記録する記録部をさらに備え、
前記補正部は、前記サイクル数が終了した後に、前記画像データに対応付けられた前記ずれ量に基づいて、前記画像データに対応する画像内における中心が前記指定位置になるように補正することを特徴とする請求項１に記載の顕微鏡システム。
【請求項５】
前記指標は、所定の波長帯域を有する光に対して蛍光を発する蛍光物質であることを特徴とする請求項１〜４のいずれか一つに記載の顕微鏡システム。
【請求項６】
前記指標は、前記標本を収容する容器内に設けられていることを特徴とする請求項１〜５のいずれか一つに記載の顕微鏡システム。
【請求項７】
前記指標は、前記ステージ上における前記標本が載置される載置面上に設けられていることを特徴とする請求項１〜５のいずれか一つに記載の顕微鏡システム。
【請求項８】
前記指標は、同一平面内に複数設けられていることを特徴とする請求項１〜７のいずれか一つに記載の顕微鏡システム。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
本発明は、ステージ上に載置された標本を撮像することによって生成された画像データに対応する画像を表示する顕微鏡システムに関する。
【背景技術】
【０００２】
従来、生細胞等の標本を顕微鏡により観察する観察方法として、標本の指定位置を所定の時間間隔毎に撮影し、標本の画像データを生成するとともに、撮影終了後に一連の画像データを時系列に沿って繋ぎ合わせて再生表示することによって、時間的な標本の形態変化を動画として観察（以下、「タイムラプス観察」という）する方法がある。
【０００３】
このようなライムラプス観察を長時間行った場合、顕微鏡の電動部および光源の熱による熱ドリフト（膨張）が発生することで、対物レンズと標本の指定位置との相対的な位置関係がずれてしまい、あたかも標本が移動したような動画が再生表示されてしまう問題がある。
【０００４】
このため、顕微鏡に、標本のカバーガラスからの正反射と散乱光とを検出する２次元光電変換器を設け、この２次元光電変換器が検出した検出結果を用いて、標本の指定位置のずれを検出し、この検出結果に基づいて、標本の指定位置のずれを補正する技術が知られている（特許文献１を参照）。
【０００５】
また、顕微鏡に温度センサを設け、この温度センサが検出した温度に基づいて、顕微鏡の温度変化量とずれ量（熱ドリフト量）とを関連付けた関連データからずれ量を推定し、この推定した結果に基づいて、標本の指定位置のずれを補正する技術が知られている（特許文献２を参照）。
【先行技術文献】
【特許文献】
【０００６】
【特許文献１】国際公開第２０１１／００７７６８号
【特許文献２】特開２０１３−８０３０号公報
【発明の概要】
【発明が解決しようとする課題】
【０００７】
しかしながら、上述した特許文献１の技術では、２次元光電変換器が必要であるため、装置の構成が複雑になるうえ、標本のカバーガラスからの反射光および散乱光を用いるため、観察できる標本の種類が制限されてしまうという問題点があった。
【０００８】
また、上述した特許文献２の技術では、温度センサが必要であるため、装置の構成が複雑になるうえ、温度センサが検出した温度に基づいて、熱ドリフト量を推定しているため、正確性に欠けるという問題点があった。
【０００９】
本発明は、上記に鑑みてなされたものであって、標本の種類に関わらず、簡易な構成で、熱ドリフトによる標本の指定位置のずれを正確に補正することができる顕微鏡システムを提供することを目的とする。
【課題を解決するための手段】
【００１０】
上述した課題を解決し、目的を達成するために、本発明に係る顕微鏡システムは、標本を載置し、水平方向に移動可能なステージと、前記ステージと対向して配置され、前記標本を観察するための対物レンズと、前記ステージを前記対物レンズに対して相対的に移動させるステージ駆動部と、前記対物レンズを介して前記標本を撮影し、前記標本の画像データを生成する撮像装置と、前記標本上における観察箇所を指定する複数の指定位置と、前記撮像装置による前記複数の指定位置それぞれの撮影順番と、前記撮像装置による前記複数の指定位置それぞれの撮影時刻と、前記撮像装置による前記複数の指定位置それぞれの撮影を繰り返すときの回数を示すサイクル数と、を対応付けた撮影情報を設定する撮影情報設定部と、前記撮影情報設定部が設定した前記撮影情報に基づいて、前記ステージ駆動部を駆動させて前記ステージを前記複数の指定位置に順次移動させるステージ制御部と、前記撮影情報設定部が設定した前記撮影時刻に前記撮像装置によって前記標本を撮影させる撮影制御部と、前記ステージが前記複数の指定位置に移動する前に、前記撮像装置が前記ステージ上の所定の位置で、少なくとも熱ドリフトに起因した前記ステージの動きを示す指標を撮影して生成した画像データに対応する基準画像と、最初の１サイクルが終了した後に、前記撮像装置が前記所定の位置で前記指標を撮影して生成した画像データに対応する現在画像とに基づいて、前記指標のずれ量を算出するずれ量算出部と、前記ずれ量算出部が算出した前記ずれ量に基づいて、前記複数の指定位置をそれぞれ補正する補正部と、を備えたことを特徴とする。
【００１１】
また、本発明に係る顕微鏡システムは、上記発明において、前記ステージ制御部は、前記１サイクルが終了する毎に、前記ステージ駆動部を駆動させて前記対物レンズの光軸上に前記指標が位置するように前記ステージを移動させることを特徴とする。
【００１２】
また、本発明に係る顕微鏡システムは、上記発明において、前記ステージ制御部は、前記サイクル数の一定回数が終了する毎または前記撮像装置が前記標本を撮像して一定時間経過する毎に、前記ステージ駆動部を駆動させて前記対物レンズの光軸上に前記指標が位置するように前記ステージを前記所定の位置へ移動させることを特徴とする。
【００１３】
また、本発明に係る顕微鏡システムは、上記発明において、前記撮像装置が順次生成した前記画像データと前記ずれ量とを対応付けて記録する記録部をさらに備え、前記補正部は、前記サイクル数が終了した後に、前記画像データに対応付けられた前記ずれ量に基づいて、前記画像データに対応する画像内における中心が前記指定位置になるように補正することを特徴とする。
【００１４】
また、本発明に係る顕微鏡システムは、上記発明において、前記指標は、所定の波長帯域を有する光に対して蛍光を発する蛍光物質であることを特徴とする。
【００１５】
また、本発明に係る顕微鏡システムは、上記発明において、前記指標は、前記標本を収容する容器内に設けられていることを特徴とする。
【００１６】
また、本発明に係る顕微鏡システムは、上記発明において、前記指標は、前記ステージ上における前記標本が載置される載置面上に設けられていることを特徴とする。
【００１７】
また、本発明に係る顕微鏡システムは、上記発明において、前記指標は、同一平面内に複数設けられていることを特徴とする。
【発明の効果】
【００１８】
本発明に係る顕微鏡システムによれば、ずれ量算出部がステージによる標本の複数の指定位置に移動する前に、撮像装置がステージ上の所定の位置で、少なくとも熱ドリフトに起因したステージの動きを示す指標を撮影して生成した画像データに対応する基準画像と、最初の１サイクルが終了した後に、撮像装置が所定の位置で指標を撮影して生成した画像データに対応する現在画像とに基づいて、指標のずれ量を算出し、補正部がずれ量算出部によって算出されたずれ量に基づいて、撮影情報設定部によって設定された標本上における観察箇所を示す複数の指定位置それぞれを補正する。この結果、標本の種類に関わらず、簡易な構成で、熱ドリフトによる標本の指定位置のずれを正確に補正することができるという効果を奏する。
【図面の簡単な説明】
【００１９】
【図１】図１は、本発明の実施の形態１に係る顕微鏡システムの構成の一例を示す概略構成図である。
【図２】図２は、本発明の実施の形態１に係る顕微鏡システムの構成を概略的に示す模式図である。
【図３】図３は、複数の標本を収容した容器の平面図である。
【図４】図４は、本発明の実施の形態１に係る顕微鏡システムが実行する処理の概要を示すフローチャートである。
【図５】図５は、図４のセッティング処理の概要を示すフローチャートである。
【図６Ａ】図６Ａは、図４のタイムラプス処理の概要を示すフローチャートである。
【図６Ｂ】図６Ｂは、図４のタイムラプス処理の概要を示すフローチャートである。
【図６Ｃ】図６Ｃは、標本面での指定位置座標の位置ずれを示す図である。
【図６Ｄ】図６Ｄは、図４のタイムラプス処理の概要を示すタイムチャートである。
【図７】図７は、本発明の実施の形態２に係る顕微鏡システムが実行するセッティング処理の概要を示すフローチャートである。
【図８Ａ】図８Ａは、本発明の実施の形態２に係る顕微鏡システムが実行するタイムラプス処理の概要を示すフローチャートである。
【図８Ｂ】図８Ｂは、本発明の実施の形態２に係る顕微鏡システムが実行するタイムラプス処理の概要を示すフローチャートである。
【図８Ｃ】図８Ｃは、本実施の形態２に係る顕微鏡システム１が実行するタイムラプス処理の概要を示すタイムチャートである。
【図９】図９は、本発明の実施の形態３に係る顕微鏡システムの構成を概略的に示す模式図である。
【図１０Ａ】図１０Ａは、本発明の実施の形態３に係る顕微鏡システムが実行するタイムラプス処理の概要を示すフローチャートである。
【図１０Ｂ】図１０Ｂは、本発明の実施の形態３に係る顕微鏡システムが実行するタイムラプス処理の概要を示すフローチャートである。
【図１０Ｃ】図１０Ｃは、本発明の実施の形態３に係る顕微鏡システムが実行するタイムラプス処理のタイムラプス動画ファイル作成の概要を示す図である。
【図１１Ａ】図１１Ａは、本発明の実施の形態４に係る顕微鏡システムが実行するタイムラプス処理の概要を示すフローチャートである。
【図１１Ｂ】図１１Ｂは、本発明の実施の形態４に係る顕微鏡システムが実行するタイムラプス処理の概要を示すフローチャートである。
【図１２】図１２は、本発明の実施の形態１〜４の変形例１に係るステージの構成を示す上面図である。
【図１３】図１３は、本発明の実施の形態１〜４の変形例２に係る標本を収容する容器の上面図である。
【図１４】図１４は、本発明の実施の形態１〜４の変形例２に係る標本の指定位置のずれ量を補正する補正方法を模式的に示す図である。
【図１５Ａ】図１５Ａは、本発明の実施の形態１〜４の変形例３に係る標本を収容する容器中に固定された同心円形状のマーカーを示す図である。
【図１５Ｂ】図１５Ｂは、本発明の実施の形態１〜４の変形例３に係る標本を収容する容器の中に固定された、径の大きさが異なる円形状のマーカーを示す図である。
【発明を実施するための形態】
【００２０】
以下、図面を参照して、本発明を実施するための形態（以下、「実施の形態」という）について説明する。なお、以下に説明する実施の形態によって、本発明が限定されるものではない。また、以下の説明において参照する各図は、本発明の内容を理解でき得る程度に形状、大きさ、および位置関係を概略的に示してあるに過ぎない。即ち、本発明は、各図で例示された形状、大きさ、および位置関係のみに限定されるものではない。
【００２１】
（実施の形態１）
〔顕微鏡システムの構成〕
図１は、本発明の実施の形態１に係る顕微鏡システムの構成の一例を示す概略構成図である。図２は、本発明の実施の形態１に係る顕微鏡システムの構成を概略的に示す模式図である。図１および図２において、顕微鏡システム１が載置される平面をＸＹ平面とし、ＸＹ平面と垂直な方向をＺ方向として説明する。
【００２２】
図１および図２に示す顕微鏡システム１は、標本ＳＰを観察する顕微鏡装置２と、顕微鏡装置２を介して標本ＳＰを撮像し、標本ＳＰの画像データを生成する撮像装置３と、顕微鏡システム１の各種の操作の入力を受け付ける入力部４と、撮像装置３が生成した画像データに対応する画像を表示する表示部５と、顕微鏡システム１の各部を統括的に制御する顕微鏡制御装置６と、を備える。
【００２３】
〔顕微鏡装置の構成〕
まず、顕微鏡装置２の構成について説明する。顕微鏡装置２は、土台をなす本体部２０と、本体部２０の上面に取り付けられ、標本ＳＰを載置するステージ機構２１と、ステージ２１１に載置された標本ＳＰに透過照明を照射する透過照明部２２と、少なくともステージ機構２１上の標本ＳＰからの観察光を取り込む対物レンズ２３と、倍率の異なる複数の対物レンズ２３を交換可能に保持するレボルバ２４と、レボルバ２４を保持するとともに、光路Ｌ１上に配置された対物レンズ２３を光路Ｌ１に沿って上下方向に移動させて標本ＳＰに対物レンズ２３を合焦させる焦準部２５と、落射照明光を発する落射光源部２６と、互いに特性が異なる複数の光学系を保持するミラーターレット２７と、ミラーターレット２７を透過した標本ＳＰの観察光を結像して鏡筒部２９へ出射する観察光学系２８と、本体部２０の側面のうち、接眼レンズが設けられて顕微鏡装置２のユーザと対向する側面である前面側（図１を参照）に設けられた鏡筒部２９と、を備える。
【００２４】
ステージ機構２１は、ＸＹ平面内で水平方向に移動可能に構成されたステージ２１１と、ステージ２１１をＸＹ平面内で移動させるステージ駆動部２１２と、ステージ２１１の位置を検出する位置検出部２１３と、を有する。
【００２５】
ステージ２１１は、板状をなす第１部材、第２部材および第３部材が順に積層されて構成される。ステージ２１１は、第１部材を基準（固定）とし、ステージ駆動部２１２によって第２部材および第３部材を第１部材の板面を平面とする面上を移動させる。この場合において、標本ＳＰは、容器Ｄ１を介して第３部材に載置される。このとき、第２部材および第３部材は、主面に平行な平面上で互いに直交する方向に移動する。また、ステージ２１１には、開口Ｒ１が形成されている。開口Ｒ１は、第２部材および第３部材の移動に関わらず、光路Ｌ１が含まれる大きさで形成される。
【００２６】
ここで、標本ＳＰを収容する容器Ｄ１について詳細に説明する。図３は、複数の標本ＳＰを収容した容器Ｄ１の平面図である。
【００２７】
図３に示すように、タイムラプス観察に用いられる容器Ｄ１には、少なくとも熱ドリフトに起因したステージ２１１の動きを示す指標である位置情報取得用マーカーＭ１（以下、単に「マーカーＭ１」という）が設けられている。ここで、指標とは、顕微鏡装置２の熱ドリフトに起因して標本ＳＰと対物レンズ２３との相対的な位置関係のずれを検出するためのものであって、予め所定の位置のステージ２１１の位置を検出するためのものである。マーカーＭ１は、所定の波長帯域を有する光に対して発光する蛍光物質である。また、マーカーＭ１は、対物レンズ２３の視野よりも小さい。また、容器Ｄ１は、透明部材を用いて構成され、たとえばガラスボトムディッシュ、ウェルプレート、スライドガラスまたはビーカー等が用いられる。さらに、容器Ｄ１には、複数の標本ＳＰが収容されている。なお、標本ＳＰの数は、観察に合わせて適宜変更することができる。
【００２８】
ステージ駆動部２１２は、ステッピングモータや超音波モータ等を用いて構成される。ステージ駆動部２１２は、顕微鏡制御装置６の制御のもと、ステージ２１１をＸＹ平面内で移動させることによって、標本ＳＰの観察領域を移動させる。
【００２９】
位置検出部２１３は、リニアスケールやガラススケールまたはフォトインタラプタ等を用いて構成される。位置検出部２１３は、図示しないＸＹ位置の原点センサによってＸＹ平面内における所定の原点位置を検出し、この原点位置を基準としてステージ２１１のＸ位置およびＹ位置に関する位置（ＸＹ座標）を顕微鏡制御装置６へ出力する。なお、位置検出部２１３は、ステージ駆動部２１２の駆動量に基づいて、ステージ２１１の位置を検出してもよい。
【００３０】
透過照明部２２は、本体部２０に取り付けられて上方へ延びる透過照明支柱２２１と、透過照明支柱２２１の上端から透過照明支柱２２１が延びる方向と直交する方向に延びるアーム部２２２と、透過照明支柱２２１の上端付近でアーム部２２２が延びる側と反対側に設けられ、透過照明光を発する透過光源２２３ａを有する第１ランプハウス部２２３と、第１ランプハウス部２２３から出射された透過照明光を集光して標本ＳＰに結像させるコンデンサレンズ２２４と、コンデンサレンズ２２４を保持するコンデンサホルダ２２５と、透過照明支柱２２１の側面に設けられたコンデンサホルダ２２５を上下動させることによってコンデンサレンズ２２４の焦準操作を行うコンデンサ焦準操作部２２６と、を有する。
【００３１】
アーム部２２２の内部には、少なくとも透過光源２２３ａが発した透過照明光を集光する集光レンズ２２２ａと、集光レンズ２２２ａから出された透過照明光を反射してコンデンサレンズ２２４の光軸方向（光路Ｌ１方向）へ反射させるミラー２２２ｂと、が設けられている。
【００３２】
透過光源２２３ａは、ハロゲンランプ、キセノンランプまたはＬＥＤ（Light  Emitting  Diode）等によって構成される。透過光源２２３ａは、顕微鏡制御装置６の制御のもと、透過照明を発する。
【００３３】
対物レンズ２３は、倍率が異なる複数の対物レンズ、たとえば１０倍、２０倍および５０倍の比較的倍率の高い対物レンズと、２倍および５倍の低倍率の対物レンズ等がレボルバ２４に着脱自在に取り付けられる。
【００３４】
レボルバ２４は、回転自在に設けられ、対物レンズ２３を標本ＳＰの下方に配置する。レボルバ２４は、回転することによって、光路Ｌ１上に配置された標本ＳＰの観察に用いる対物レンズ２３を択一的に切り換えることで、視野内の画像の倍率を変更させる。
【００３５】
焦準部２５は、対物レンズ２３を介して入射した標本ＳＰの観察像をミラーターレット２７へ透過する一方、後述するＡＦ部２５２へ反射する透過型ミラー２５１と、透過型ミラー２５１が反射した標本ＳＰの観察像を用いて位相差ＡＦ処理またはコントラストＡＦ処理を行って対物レンズ２３の焦点を調整するためのＡＦ信号を生成するＡＦ部２５２と、ＡＦ部２５２から入力されるＡＦ信号に基づいて、レボルバ２４を上下動させることによって、対物レンズ２３の焦点を調整する焦準駆動部２５３と、を有する。
【００３６】
落射光源部２６は、落射照明光を発する落射光源２６１ａを有する第２ランプハウス部２６１と、落射光源２６１ａが発した落射照明光を集光してミラーターレット２７へ出射する投光管２６２と、を有する。投光管２６２には、少なくとも落射光源２６１ａが発した落射照明光を集光する集光レンズ２６２ａ、絞りおよびフィルタ等が設けられている。
【００３７】
ミラーターレット２７は、対物レンズ２３を介して入射する標本ＳＰの反射光若しくは透過光または第２ランプハウス部２６１から出射された落射照明光の光路を切り換える蛍光用の落射光学系２７１と、落射光学系２７１を保持するミラーユニット２７２と、特性が異なる落射光学系２７１をそれぞれ保持するミラーユニット２７２を複数収容可能なミラーカセット２７３と、ミラーカセット２７３を回転させるミラー駆動部２７４と、を有する。
【００３８】
落射光学系２７１は、落射照明光（励起光）として所定の波長の光のみを透過する励起フィルタ２７１ａと、励起光に応じた波長の光を反射して標本ＳＰへ照射するとともに、標本ＳＰからの観察光に応じた波長の光を透過するダイクロイックミラー２７１ｂと、ダイクロイックミラー２７１ｂを透過した標本ＳＰの観察光のうち所定の蛍光成分のみを透過する吸収フィルタ２７１ｃと、を有する。
【００３９】
ミラーカセット２７３は、回転可能に配置され、ミラー駆動部２７４によって回転させられることによって、所望のミラーユニット２７２を光路Ｌ１上に配置する。
【００４０】
観察光学系２８は、ミラーターレット２７を透過した標本ＳＰからの観察光（蛍光）のうち、一部の観察光を透過するとともに、残りの光を分岐して撮像装置３へハーフミラー２８１と、ハーフミラー２８１が透過した標本ＳＰの観察光を反射する第１ミラー２８２と、第１ミラー２８２が反射した標本ＳＰの観察光を反射する第２ミラー２８３と、第２ミラー２８３が反射した標本ＳＰの観察光を鏡筒部２９へ反射する第３ミラー２８４と、を有する。
【００４１】
鏡筒部２９は、第３ミラー２８５が反射した標本ＳＰの観察光を結像する結像レンズ２９１と、結像レンズ２９１が結像した標本ＳＰの観察光を集光する接眼レンズ２９２と、を有する。
【００４２】
〔撮像装置の構成〕
撮像装置３は、ハーフミラー２８１から入射した標本ＳＰの観察光を受光して光電変換を行うことによって、光を電気信号（アナログ信号）に変換する複数の画素が２次元状に配置されたＣＣＤ（Charge  Coupled  Device）またはＣＭＯＳ（Complementary  Metal  Oxide  Semiconductor）等の撮像素子と、撮像素子から出力される電気信号に増幅等の信号処理を施した後、Ａ／Ｄ変換を行うことによってデジタルの標本ＳＰの画像データに変換して顕微鏡制御装置６へ出力する信号処理部と、を用いて構成される。撮像装置３は、顕微鏡制御装置６の制御のもと、標本ＳＰを撮像する。
【００４３】
〔入力部の構成〕
入力部４は、キーボード、マウス、ジョイスティックおよび各種スイッチ等の入力デバイスを用いて構成される。入力部４は、各種入力デバイスが受け付けた操作に応じた指示信号を顕微鏡制御装置６へ出力する。
【００４４】
〔表示部の構成〕
表示部５は、顕微鏡制御装置６を介して撮像装置３が生成した画像データに対応する画像および顕微鏡システム１の各種操作情報を表示する。表示部５は、液晶または有機ＥＬ（Electro  Luminescence）等からなる表示パネルを用いて構成される。なお、表示部５の表示画面上に、外部からの物体の接触位置を検出し、この検出した位置に応じた位置信号を顕微鏡制御装置６へ出力するタッチパネルを重畳して設けてもよい。
【００４５】
〔顕微鏡制御装置の構成〕
顕微鏡制御装置６は、顕微鏡システム１に関する各種情報を記録する記録部６１と、顕微鏡システム１を構成する各部の動作を統括的に制御する制御部６２と、を備える。
【００４６】
記録部６１は、フラッシュメモリおよびＲＡＭ（Random  Access  Memory）等の半導体メモリを用いて構成される。記録部６１は、顕微鏡システム１に実行させる各種プログラム、プログラムの実行中に使用される各種データおよび撮像装置３が生成した画像データを記録する。また、記録部６１は、制御部６２の処理中の情報を一時的に記録する。さらに、記録部６１は、顕微鏡システム１において標本ＳＰのタイムラプス観察を行う際の撮影情報に関する撮影情報記録部６１１を有する。
【００４７】
制御部６２は、ＣＰＵ等を用いて構成され、入力部４が受け付けた操作信号に応じて顕微鏡システム１を構成する各部に対応するデータの転送や指示等を行って顕微鏡システム１の動作を統括的に制御する。
【００４８】
ここで、制御部６２の詳細な構成について説明する。制御部６２は、ステージ制御部６２１と、焦準制御部６２２と、画像処理部６２３と、撮影情報設定部６２４と、ずれ量算出部６２５と、補正部６２６と、撮影制御部６２７と、表示制御部６２８と、を有する。
【００４９】
ステージ制御部６２１は、入力部４から入力される指示信号に応じて、ステージ駆動部２１２を駆動させてステージ２１１を移動させる。また、ステージ制御部６２１は、顕微鏡システム１が標本ＳＰのタイムラプス観察を行う場合、撮影情報記録部６１１が記録する撮影情報に基づいて、ステージ２１１を駆動させてステージ２１１を標本ＳＰ上における観察箇所を示す複数の指定位置に順次移動させる。また、ステージ制御部６２１は、標本ＳＰのタイムラプス観察を開始する前に、ステージ２１１を移動させて対物レンズ２３の光軸上にマーカーＭ１を配置させる。
【００５０】
焦準制御部６２２は、ＡＦ部２５２から入力されるＡＦ信号に基づいて、焦準駆動部２５３を駆動させてレボルバ２４を上下方向（Ｚ方向）に移動させることによって、標本ＳＰに対する対物レンズ２３の焦点を調整する。
【００５１】
画像処理部６２３は、撮像装置３が生成した画像データに対して、所定の画像処理を行う。具体的には、画像処理部６２３は、撮像装置３が生成した画像データに対して、ホワイトバランスを調整する処理や現像処理を行う。
【００５２】
撮影情報設定部６２４は、入力部４からの指示信号に応じて、標本ＳＰ上における観察箇所を指定する複数の指定位置と、撮像装置３による複数の指定位置それぞれの撮影順番と、撮像装置３による複数の指定位置それぞれの撮影時刻（間欠時間）と、撮像装置３による複数の指定位置の撮影を繰り返すときの回数を示すサイクル数と、を対応付けた撮影情報を設定し、この設定した撮影情報を撮影情報記録部６１１に記録する。
【００５３】
ずれ量算出部６２５は、ステージ２１１が標本ＳＰの複数の指定位置に移動する前に、撮像装置３を用いて撮影して生成したマーカーＭ１の画像データに対応する基準画像と、タイムラプス観察の最初の１サイクルが終了した後に、所定の位置でマーカーＭ１を撮像装置３で撮影して生成した画像データに対応する現在画像とでパターンマッチングを行ない、マーカーＭ１のずれ量を算出する。
【００５４】
補正部６２６は、ずれ量算出部６２５が算出したずれ量に基づいて、撮影情報記録部６１１が記録する標本ＳＰ上における観察箇所を指定する複数の指定位置（ステージ２１１上における座標情報）それぞれを補正する。
【００５５】
撮影制御部６２７は、撮影情報記録部６１１が記録する撮影時刻に、撮像装置３に標本ＳＰを撮像させる。また、撮影制御部６２７は、撮像装置３の撮影を制御する。
【００５６】
表示制御部６２８は、画像処理部６２３が画像処理を施した画像データに対応する画像を表示部５に表示させる。また、表示制御部６２８は、顕微鏡システム１の各種操作を指示する操作画面を表示部５に表示させる。
【００５７】
以上の構成を有する顕微鏡システム１は、表示部５が表示する操作画面を見ながら、ユーザが入力部４を介して顕微鏡装置２の観察方法を透過観察方法または落射観察方法を設定する。その後、ユーザが入力部４を介してタイムラプス観察を行う場合、マーカーＭ１および標本ＳＰの所定の登録地点に移動させて、マーカーＭ１および標本ＳＰ上における観察箇所を指定する複数の指定位置それぞれの指定位置、撮影順番、撮影時刻（間欠時間）およびサイクル数を撮影情報記録部６１１に登録（記録）させる。この場合において、顕微鏡装置２による観察方法が落射観察方法で、標本ＳＰとマーカーＭ１の励起波長が同じでないとき、顕微鏡制御装置６は、ミラーターレット２７を回転させて、それぞれに適したミラーユニット２７２に切り換えて、標本ＳＰの指定位置およびマーカーＭ１の位置を撮影情報記録部６１１に記録する。続いて、入力部４からの指示信号に応じて、撮影情報設定部６２４は、タイムラプス観察における標本ＳＰの各指定位置、指定位置の撮影時刻、撮影順番およびサイクル数を設定した撮影情報として撮影情報記録部６１１に記録する。
【００５８】
〔顕微鏡システムの処理〕
次に、顕微鏡システム１が実行するタイムラプス観察で実行する処理について説明する。図４は、顕微鏡システム１が実行する処理の概要を示すフローチャートである。
【００５９】
図４に示すように、まず、顕微鏡システム１は、マーカーＭ１および標本ＳＰの所定の登録地点に移動させて、マーカーＭ１および標本ＳＰ上における観察箇所を指定する複数の指定位置それぞれの指定位置、撮影順番、撮影時刻（間欠時間）およびサイクル数を撮影情報記録部６１１に登録するセッティング処理を実行する（ステップＳ１０１）。なお、セッティング処理の詳細は、後述する。
【００６０】
続いて、入力部４からタイムラプス観察を開始する指示信号が入力された場合（ステップＳ１０２：Ｙｅｓ）、顕微鏡システム１は、セッティング処理で設定した内容に従って、マーカーＭ１および標本ＳＰを観察するタイムラプス処理を実行する（ステップＳ１０３）。なお、タイムラプス処理の詳細は、後述する。ステップＳ１０３の後、顕微鏡システム１は、本処理を終了する。
【００６１】
ステップＳ１０２において、入力部４からタイムラプス観察を開始する指示信号が入力されていない場合（ステップＳ１０２：Ｎｏ）、顕微鏡システム１は、本処理を終了する。
【００６２】
〔セッティング処理〕
次に、図４のステップＳ１０１で説明したセッティング処理の詳細について説明する。図５は、セッティング処理の概要を示すフローチャートである。
【００６３】
図５に示すように、撮影情報設定部６２４は、ユーザが入力部４を介して焦準部２５およびステージ２１１を操作し、標本ＳＰの所定の登録地点に移動させてタイムラプス観察を行う場所の登録地点（指定位置）を撮影情報記録部６１１へ記録（登録）する（ステップＳ２０１）。具体的には、撮影情報設定部６２４は、登録地点のＸ、Ｙ、Ｚ座標情報を撮影情報記録部６１１に記録する。より詳細には、撮影情報設定部６２４は、標本ＳＰの所定の登録地点に対して、位置検出部２１３が検出したＸおよびＹ座標およびステージ２１１の鉛直方向における高さを検出する高さ検出部（図示せず）が検出したＺ座標を撮影情報記録部６１１に記録させる。例えば、撮影情報設定部６２４は、標本ＳＰの所定の登録地点Ａ、ＢおよびＣそれぞれに対して、登録地点Ａ（Ｘａ０，Ｙａ０，Ｚａ０）、登録地点Ｂ（Ｘｂ０，Ｙｂ０，Ｚｂ０）および登録地点Ｃ（Ｘｃ０，Ｙｃ０，Ｚｃ０）を撮影情報記録部６１１に記録させる。
【００６４】
続いて、顕微鏡制御装置６は、ミラー駆動部２７４を駆動させてミラーカセット２７３を回転させてマーカーＭ１を撮影可能なマーカー撮影用の波長に切り替える（ステップＳ２０２）。具体的には、顕微鏡制御装置６は、ミラーターレット２７を制御して照明光をマーカーＭ１撮影用の波長に切り替える。
【００６５】
その後、撮影制御部６２７は、ユーザが入力部４を介して焦準部２５およびステージ２１１を操作し、撮像装置３の視野内（例えば、撮像装置３の視野中心）に移動させたマーカーＭ１を撮像装置３に撮影させる（ステップＳ２０３）。この場合、撮影情報設定部６２４は、マーカーＭ１に対して、位置検出部２１３が検出したＸおよびＹ座標および高さ検出部（図示せず）が検出したＺ座標を撮影情報記録部６１１に記録させる。例えば、撮影情報設定部６２４は、マーカーＭ１の登録地点（Ｘｍ０，Ｙｍ０，Ｚｍ０）を撮影情報記録部６１１に記録させる。さらに、撮影情報設定部６２４は、撮像装置３が撮影した画像データに対応する画像内において、マーカーＭ１の位置を記録するため、画像処理部６２３が検出した画像内におけるマーカーＭ１の画像座標（Ｐｘ０，Ｐｙ０）を撮影情報記録部６１１に記録させる。
【００６６】
続いて、撮影情報設定部６２４は、入力部４を介して入力されたタイムラプスの時間間隔、撮影時間および撮影回数を撮影情報記録部６１１に記録する（ステップＳ２０４）。例えば、撮影情報設定部６２４は、入力部４を介して入力されたＡ地点の１回目から２回目の撮影間隔ｔ、それの撮影間隔ｔをＴ時間分または繰り返す回数ｎを撮影情報記録部６１１に記録する。ステップＳ２０４の後、顕微鏡システム１は、図４のメインルーチンへ戻る。
【００６７】
〔タイムラプス処理〕
次に、図４のステップＳ１０３で説明したタイムラプス処理の詳細について説明する。図６Ａは、図４のステップＳ１０３のタイムラプス処理の概要を示すフローチャートである。図６Ｂは、図４のステップＳ１０３のタイムラプス処理の概要を示すフローチャートである。
【００６８】
図６Ａおよび図６Ｂに示すように、まず、ステージ制御部６２１は、撮影情報記録部６１１が記録する位置情報に基づいて、ステージ駆動部２１２を駆動させることによって、マーカー位置にステージ２１１を移動させる（ステップＳ３０１）。具体的には、ステージ制御部６２１は、撮影情報記録部６１１が記録するマーカーＭ１の登録地点（Ｘｍ０，Ｙｍ０，Ｚｍ０）へステージ２１１を移動させる。
【００６９】
続いて、焦準制御部６２２は、ＡＦ部２５２から入力されるＡＦ信号に基づいて、焦準部２５の鉛直方向（Ｚ方向）における位置を検出する（ステップＳ３０２）。具体的には、焦準制御部６２２は、ＡＦ部２５２から入力されるＡＦ信号に基づいて、焦準部２５の鉛直方向における位置ΔＺｍ１を検出する。
【００７０】
その後、焦準制御部６２２は、ＡＦ部２５２から入力されるＡＦ信号に基づいて、焦準駆動部２５３を駆動して焦準部２５を上下方向（Ｚ方向）に移動させることによって、対物レンズ２３の焦点をマーカーＭ１に合焦させるＡＦ処理を実行するために焦準部２５を焦点位置へ移動させる（ステップＳ３０３）。具体的には、焦準制御部６２２は、ＡＦ部２５２から入力されるＡＦ信号に基づいて、焦点位置Ｚｍ１（Ｚｍ１＝Ｚｍ０−ΔＺｍ１）へ焦準部２５を移動させる。
【００７１】
続いて、顕微鏡制御装置６は、ミラー駆動部２７４を駆動させてミラーカセット２７３を回転させてマーカーＭ１を撮影可能なマーカー撮影用の波長に切り替える（ステップＳ３０４）。具体的には、顕微鏡制御装置６は、ミラーターレット２７を制御して照明光をマーカーＭ１撮影用の波長に切り替える。
【００７２】
その後、撮影制御部６２７は、撮像装置３の視野領域内におけるマーカーＭ１を撮像装置３に撮影させる（ステップＳ３０５）。この場合において、撮影制御部６２７は、撮像装置３が容器Ｄ１内に収容されたマーカーＭ１を撮像して生成したマーキング画像データに対応するマーキング画像（基準画像）に、位置検出部２１３が検出したステージ２１１の位置情報（Ｘｍ０，Ｙｍ０）および焦準部２５の焦点位置の位置情報（Ｚｍ１）を対応付けて撮影情報記録部６１１に記録する。
【００７３】
続いて、ずれ量算出部６２５は、撮像装置３が生成したマーキング画像内におけるマーカーＭ１の画像内座標を算出して記録部６１に記録する（ステップＳ３０６）。具体的には、ずれ量算出部６２５は、撮像装置３が生成したマーキング画像からマーカーＭ１の画像内座標（Ｐｘ１，Ｐｙ１）を算出して記録部６１に記録する。
【００７４】
その後、ずれ量算出部６２５は、マーカーＭ１のずれ量を算出する（ステップＳ３０７）。具体的には、ずれ量算出部６２５は、撮像装置３が生成したマーキング画像からマーカーＭ１が移動した移動量（ドリフト量）を算出する。より詳細には、ずれ量算出部６２５は、ピクセル換算におけるマーキング画像上のマーカーＭ１のずれ量（ΔＰｘ１，ΔＰｙ１）を以下の式によって算出する。
ΔＰｘ１＝Ｐｘ１−Ｐｘ０・・・（１）
ΔＰｙ１＝Ｐｙ１−Ｐｙ０・・・（２）
【００７５】
続いて、ずれ量算出部６２５は、標本ＳＰ面におけるずれ量を算出する（ステップＳ３０８）。具体的には、ずれ量算出部６２５は、上述したステップＳ３０７で算出したマーキング画像上のずれ量（ピクセル上のずれ量）に基づいて、標本ＳＰ面でのずれ量を算出する。より詳細には、ずれ量算出部６２５は、標本ＳＰ面でのずれ量（ΔＸ１，ΔＹ１）を以下の式によって算出する。
ΔＸ１＝ΔＰｘ１×撮像装置３内の撮像素子の１画素のサイズ／対物倍率
・・・（３）
ΔＹ１＝ΔＰｙ１×撮像装置３内の撮像素子の１画素のサイズ／対物倍率
・・・（４）
具体的には、標本ＳＰ面での指定位置のずれ量（ΔＸ１，ΔＹ１）は、図６Ｃのように図示される（図６（ａ）→図６（ｂ））。このように、ずれ量算出部６２５は、ステージ２１１の移動後における標本ＳＰ面での指定位置のずれ量を算出する。
【００７６】
その後、補正部６２６は、ずれ量算出部６２５が算出したマーカーＭ１のずれ量に基づいて、撮影情報記録部６１１が記録するマーカーＭ１の座標情報を補正する（ステップＳ３０９）。具体的には、補正部６２６は、ずれ量算出部６２５が算出したマーカーＭ１のずれ量に基づいて、撮影情報記録部６１１が記録するマーカーＭ１のＸＹ座標（Ｘｍ０，Ｙｍ０）を補正する。より詳細には、補正部６２６は、ずれ量算出部６２５が算出したマーカーＭ１のずれ量に基づいて、撮影情報記録部６１１が記録するマーカーＭ１のＸＹ座標（Ｘｍ０，Ｙｍ０）を以下の式によって補正する。
Ｘｍ１＝Ｘｍ０−ΔＸ１      ・・・（５）
Ｙｍ１＝Ｙｍ０−ΔＹ１      ・・・（６）
ここで、Ｘｍ１は、補正後のマーカーＭ１のＸ座標を示し、Ｙｍ１は、補正後のマーカーＭ１のＹ座標を示す。この場合、補正部６２６は、式（５），（６）によって補正したマーカーＭ１のＸＹ座標（Ｘｍ１，Ｙｍ１）および焦準制御部６２２が検出したマーカーＭ１のＺ座標（Ｚｍ１）それぞれを撮影情報記録部６１１に記録してマーカーＭ１の座標情報を更新する（（Ｘｍ０，Ｙｍ０，Ｚｍ０）→（Ｘｍ１，Ｙｍ１，Ｚｍ１））。
【００７７】
続いて、補正部６２６は、撮影情報記録部６１１が記録するマーカーＭ１の座標情報に基づいて、登録地点（指定位置）の座標情報を補正する（ステップＳ３１０）。具体的には、補正部６２６は、上述したステップＳ３０９で補正したマーカーＭ１の座標情報に基づいて、登録地点（例えば、登録地点Ａ，ＢおよびＣ）の座標情報を補正する。より詳細には、補正部６２６は、以下の式によって登録地点Ａ〜Ｃの座標情報を補正する。
Ｘａ１＝Ｘａ０−ΔＸ１      ・・・（７）
Ｙａ１＝Ｙａ０−ΔＹ１      ・・・（８）
Ｘｂ１＝Ｘｂ０−ΔＸ１      ・・・（９）
Ｙｂ１＝Ｙｂ０−ΔＹ１      ・・・（１０）
Ｘｃ１＝Ｘｃ０−ΔＸ１      ・・・（１１）
Ｙｃ１＝Ｙｃ０−ΔＹ１      ・・・（１２）
ここで、Ｘａ１は、補正後の登録地点ＡのＸ座標を示し、Ｙａ１は、補正後の登録地点ＡのＸ座標を示し、Ｘｂ１は、補正後の登録地点ＢのＸ座標を示し、Ｙｂ１は、補正後の登録地点ＢのＸ座標を示し、Ｘｃ１は、補正後の登録地点ＣのＸ座標を示し、Ｙｃ１は、補正後の登録地点ＣのＸ座標を示す。
【００７８】
その後、ステージ制御部６２１は、撮影情報記録部６１１が記録する登録地点へステージ２１１を移動させる（ステップＳ３１１）。例えば、ステージ制御部６２１は、補正部６２６によって補正された登録地点Ａ（Ｘａ１，Ｙａ１，Ｚａ０）へステージ２１１を移動させる。
【００７９】
続いて、焦準制御部６２２は、ＡＦ部２５２から入力されるＡＦ信号に基づいて、登録地点に対する焦準部２５の鉛直方向（Ｚ方向）における位置を検出する（ステップＳ３１２）。例えば、焦準制御部６２２は、ＡＦ部２５２から入力されるＡＦ信号に基づいて、登録地点Ａに対する焦準部２５の鉛直方向における位置ΔＺａ１を検出する。
【００８０】
その後、焦準制御部６２２は、ＡＦ部２５２から入力されるＡＦ信号に基づいて、焦準駆動部２５３を駆動して焦準部２５を上下方向（Ｚ方向）に移動させることによって、対物レンズ２３の焦点をマーカーＭ１に合焦させるＡＦ処理を実行するために焦準部２５を焦点位置へ移動させる（ステップＳ３１３）。例えば、焦準制御部６２２は、ＡＦ部２５２から入力されるＡＦ信号に基づいて、登録地点Ａに対する焦点位置Ｚａ１（Ｚａ１＝Ｚａ０−ΔＺａ１）へ焦準部２５を移動させる。
【００８１】
続いて、顕微鏡制御装置６は、ミラー駆動部２７４を駆動させてミラーカセット２７３を回転させて標本ＳＰを撮影可能な波長に切り替える（ステップＳ３１４）。具体的には、顕微鏡制御装置６は、ミラーターレット２７を制御して照明光を観察用の波長に切り替える。
【００８２】
その後、撮影制御部６２７は、撮像装置３の視野領域内における標本ＳＰを撮像装置３に撮影させる（ステップＳ３１５）。例えば、撮影制御部６２７は、撮像装置３の視野領域内における標本ＳＰの登録地点Ａを撮影して登録地点Ａの画像データを生成する。
【００８３】
続いて、顕微鏡制御装置６は、撮影情報記録部６１１が記録する撮影情報に基づいて、標本ＳＰに対する全ての登録地点の撮影が終了したか否かを判断する（ステップＳ３１６）。顕微鏡制御装置６が標本ＳＰに対する全ての登録地点の撮影が終了したと判断した場合（ステップＳ３１６：Ｙｅｓ）、顕微鏡システム１は、後述するステップＳ３１７へ移行する。これに対して、顕微鏡制御装置６が標本ＳＰに対する全ての登録地点の撮影が終了していないと判断した場合（ステップＳ３１６：Ｎｏ）、顕微鏡システム１は、上述したステップＳ３１１へ戻る。
【００８４】
ステップＳ３１７において、顕微鏡制御装置６は、撮影情報記録部６１１が記録する撮影情報に基づいて、標本ＳＰに対する全ての登録地点を撮影してから登録時間が経過したか否かを判断する。顕微鏡制御装置６が標本ＳＰに対する全ての登録地点を撮影してから登録時間が経過したと判断した場合（ステップＳ３１７：Ｙｅｓ）、顕微鏡システム１は、後述するステップＳ３１８へ移行する。これに対して、顕微鏡制御装置６が標本ＳＰに対する全ての登録地点を撮影してから登録時間が経過していないと判断した場合（ステップＳ３１７：Ｎｏ）、顕微鏡システム１は、登録時間が経過するまで、この判断を続ける。
【００８５】
ステップＳ３１８において、ステージ制御部６２１は、撮影情報記録部６１１が記録するマーカーＭ１の位置情報に基づいて、ステージ駆動部２１２を駆動させることによって、マーカー位置にステージ２１１を移動させる。具体的には、ステージ制御部６２１は、撮影情報記録部６１１が記録するマーカーＭ１の登録地点（Ｘｍ１，Ｙｍ１，Ｚｍ１）へステージ２１１を移動させる。
【００８６】
続いて、焦準制御部６２２は、ＡＦ部２５２から入力されるＡＦ信号に基づいて、焦準部２５の鉛直方向における位置を検出する（ステップＳ３１９）。具体的には、焦準制御部６２２は、ＡＦ部２５２から入力されるＡＦ信号に基づいて、焦準部２５の鉛直方向における位置ΔＺｍ２を検出する。
【００８７】
その後、焦準制御部６２２は、ＡＦ部２５２から入力されるＡＦ信号に基づいて、焦準駆動部２５３を駆動して焦準部２５を上下方向（Ｚ方向）に移動させることによって、対物レンズ２３の焦点をマーカーＭ１に合焦させるＡＦ処理を実行するために焦準部２５を焦点位置へ移動させる（ステップＳ３２０）。具体的には、焦準制御部６２２は、ＡＦ部２５２から入力されるＡＦ信号に基づいて、焦点位置Ｚｍ２（Ｚｍ２＝Ｚｍ１−ΔＺｍ２）へ焦準部２５を移動させる。
【００８８】
続いて、顕微鏡制御装置６は、ミラー駆動部２７４を駆動させてミラーカセット２７３を回転させてマーカーＭ１を撮影可能なマーカー撮影用の波長に切り替える（ステップＳ３２１）。具体的には、顕微鏡制御装置６は、ミラーターレット２７を制御して照明光をマーカーＭ１撮影用の波長に切り替える。
【００８９】
その後、撮影制御部６２７は、撮像装置３の視野領域内におけるマーカーＭ１を撮像装置３に撮影させる（ステップＳ３２２）。この場合において、撮影制御部６２７は、撮像装置３が容器Ｄ１内に収容されたマーカーＭ１を撮像して生成したマーキング画像データに対応するマーキング画像（基準画像）に、位置検出部２１３が検出したステージ２１１の位置情報（Ｘｍ１，Ｙｍ１）および焦準部２５の焦点位置の位置情報（Ｚｍ２）を対応付けて撮影情報記録部６１１に記録する。
【００９０】
続いて、ずれ量算出部６２５は、撮像装置３が生成したマーキング画像内におけるマーカーＭ１の画像内座標を算出して撮影情報記録部６１１に記録する（ステップＳ３２３）。具体的には、ずれ量算出部６２５は、撮像装置３が生成したマーキング画像からマーカーＭ１の画像内座標（Ｐｘ２，Ｐｙ２）を算出して記録部６１に記録する。
【００９１】
その後、ずれ量算出部６２５は、マーカーＭ１のずれ量を算出する（ステップＳ３２４）。具体的には、ずれ量算出部６２５は、撮像装置３が生成したマーキング画像からマーカーＭ１が移動した移動量（ドリフト量）を算出する。より詳細には、ずれ量算出部６２５は、ピクセル換算におけるマーキング画像上のマーカーＭ１のずれ量（ΔＰｘ２，ΔＰｙ２）を以下の式によって算出する。
ΔＰｘ２＝Ｐｘ２−Ｐｘ１・・・（１３）
ΔＰｙ２＝Ｐｙ２−Ｐｙ１・・・（１４）
【００９２】
続いて、ずれ量算出部６２５は、標本ＳＰ面におけるずれ量を算出する（ステップＳ３２５）。具体的には、ずれ量算出部６２５は、上述したステップＳ３２４で算出したマーキング画像上のずれ量（ピクセル上のずれ量）に基づいて、標本ＳＰ面でのずれ量を算出する。より詳細には、ずれ量算出部６２５は、標本ＳＰ面でのずれ量（ΔＸ２，ΔＹ２）を以下の式によって算出する。
ΔＸ２＝ΔＰｘ２×撮像装置３内の撮像素子の１画素のサイズ／対物倍率
・・・（１５）
ΔＹ２＝ΔＰｙ２×撮像装置３内の撮像素子の１画素のサイズ／対物倍率
・・・（１６）
【００９３】
その後、補正部６２６は、ずれ量算出部６２５が算出したマーカーＭ１のずれ量に基づいて、撮影情報記録部６１１が記録するマーカーＭ１の座標情報を補正する（ステップＳ３２６）。具体的には、補正部６２６は、ずれ量算出部６２５が算出したマーカーＭ１のずれ量に基づいて、撮影情報記録部６１１が記録するマーカーＭ１のＸＹ座標（Ｘｍ２，Ｙｍ２）を補正する。より詳細には、補正部６２６は、ずれ量算出部６２５が算出したマーカーＭ１のずれ量に基づいて、撮影情報記録部６１１が記録するマーカーＭ１のＸＹ座標（Ｘｍ２，Ｙｍ２）を以下の式によって補正する。
Ｘｍ２＝Ｘｍ１−ΔＸ２      ・・・（１７）
Ｙｍ２＝Ｙｍ１−ΔＹ２      ・・・（１８）
ここで、Ｘｍ２は、補正後のマーカーＭ１のＸ座標を示し、Ｙｍ２は、補正後のマーカーＭ１のＹ座標を示す。この場合、補正部６２６は、式（１７），（１８）によって補正したマーカーＭ１のＸＹ座標（Ｘｍ２，Ｙｍ２）および焦準制御部６２２が検出したマーカーＭ１のＺ座標（Ｚｍ２）それぞれを撮影情報記録部６１１に記録してマーカーＭ１の座標情報を更新する（（Ｘｍ１，Ｙｍ１，Ｚｍ１）→（Ｘｍ２，Ｙｍ２，Ｚｍ２））。
【００９４】
続いて、補正部６２６は、撮影情報記録部６１１が記録するマーカーＭ１の座標情報に基づいて、登録地点の座標情報を補正する（ステップＳ３２７）。具体的には、補正部６２６は、上述したステップＳ３２６で補正したマーカーＭ１の座標情報に基づいて、登録地点（例えば、登録地点Ａ，ＢおよびＣ）の座標情報を補正する。より詳細には、補正部６２６は、以下の式によって登録地点Ａ〜Ｃの座標情報を補正する。
Ｘａ２＝Ｘａ１−ΔＸ２      ・・・（１９）
Ｙａ２＝Ｙａ１−ΔＹ２      ・・・（２０）
Ｘｂ２＝Ｘｂ１−ΔＸ２      ・・・（２１）
Ｙｂ２＝Ｙｂ１−ΔＹ２      ・・・（２２）
Ｘｃ２＝Ｘｃ１−ΔＸ２      ・・・（２３）
Ｙｃ２＝Ｙｃ１−ΔＹ２      ・・・（２４）
ここで、Ｘａ２は、補正後の登録地点ＡのＸ座標を示し、Ｙａ２は、補正後の登録地点ＡのＸ座標を示し、Ｘｂ２は、補正後の登録地点ＢのＸ座標を示し、Ｙｂ２は、補正後の登録地点ＢのＸ座標を示し、Ｘｃ２は、補正後の登録地点ＣのＸ座標を示し、Ｙｃ２は、補正後の登録地点ＣのＸ座標を示す。
【００９５】
その後、ステージ制御部６２１は、撮影情報記録部６１１が記録する登録地点へステージ２１１を移動させる（ステップＳ３２８）。例えば、ステージ制御部６２１は、補正部６２６によって補正された登録地点Ａ（Ｘａ２，Ｙａ２，Ｚａ１）へステージ２１１を移動させる。
【００９６】
続いて、焦準制御部６２２は、ＡＦ部２５２から入力されるＡＦ信号に基づいて、登録地点に対する焦準部２５の鉛直方向（Ｚ方向）における位置を検出する（ステップＳ３２９）。例えば、焦準制御部６２２は、ＡＦ部２５２から入力されるＡＦ信号に基づいて、登録地点Ａに対する焦準部２５の鉛直方向における位置ΔＺａ２を検出する。
【００９７】
その後、焦準制御部６２２は、ＡＦ部２５２から入力されるＡＦ信号に基づいて、焦準駆動部２５３を駆動して焦準部２５を上下方向（Ｚ方向）に移動させることによって、対物レンズ２３の焦点をマーカーＭ１に合焦させるＡＦ処理を実行するために焦準部２５を焦点位置へ移動させる（ステップＳ３３０）。例えば、焦準制御部６２２は、ＡＦ部２５２から入力されるＡＦ信号に基づいて、登録地点Ａに対する焦点位置Ｚａ２（Ｚａ２＝Ｚａ１−ΔＺａ２）へ焦準部２５を移動させる。
【００９８】
続いて、顕微鏡制御装置６は、ミラー駆動部２７４を駆動させてミラーカセット２７３を回転させて標本ＳＰを撮影可能な波長に切り替える（ステップＳ３３１）。具体的には、顕微鏡制御装置６は、ミラーターレット２７を制御して照明光を観察用の波長に切り替える。
【００９９】
その後、撮影制御部６２７は、撮像装置３の視野領域内における標本ＳＰを撮像装置３に撮影させる（ステップＳ３３２）。例えば、撮影制御部６２７は、撮像装置３の視野領域内における標本ＳＰの登録地点Ａを撮影して登録地点Ａの画像データを生成する。
【０１００】
このように、顕微鏡システム１は、図６Ｄに示すように、登録地点Ｂ，Ｃに対して、それぞれ同様にステップＳ３２８〜Ｓ３３２を繰り返し行なう。
【０１０１】
続いて、顕微鏡制御装置６は、撮影情報記録部６１１が記録する撮影情報に基づいて、標本ＳＰに対する全ての登録地点の撮影が終了したか否かを判断する（ステップＳ３３３）。顕微鏡制御装置６が標本ＳＰに対する全ての登録地点の撮影が終了したと判断した場合（ステップＳ３３３：Ｙｅｓ）、顕微鏡システム１は、後述するステップＳ３３４へ移行する。これに対して、顕微鏡制御装置６が標本ＳＰに対する全ての登録地点の撮影が終了していないと判断した場合（ステップＳ３３３：Ｎｏ）、顕微鏡システム１は、上述したステップＳ３２８へ戻る。
【０１０２】
ステップＳ３３４において、顕微鏡制御装置６は、撮影情報記録部６１１が記録する撮影情報に基づいて、標本ＳＰに対する全ての登録地点を撮影してから登録時間が経過したか否かを判断する。顕微鏡制御装置６が標本ＳＰに対する全ての登録地点を撮影してから登録時間が経過したと判断した場合（ステップＳ３３４：Ｙｅｓ）、顕微鏡システム１は、後述するステップＳ３３５へ移行する。これに対して、顕微鏡制御装置６が標本ＳＰに対する全ての登録地点を撮影してから登録時間が経過していないと判断した場合（ステップＳ３３４：Ｎｏ）、顕微鏡システム１は、登録時間が経過するまで、この判断を続ける。
【０１０３】
ステップＳ３３５において、顕微鏡制御装置６は、撮影情報記録部６１１が記録する撮影情報に基づいて、標本ＳＰに対する全ての登録地点を撮影する指定サイクルが終了したか否かを判断する。顕微鏡制御装置６が標本ＳＰに対する全ての登録地点を撮影する指定サイクルが終了したと判断した場合（ステップＳ３３５：Ｙｅｓ）、即ち、トータルの撮影時間が終了したと判断された場合、顕微鏡システム１は、後述するステップＳ３３６へ移行する。これに対して、顕微鏡制御装置６が標本ＳＰに対する全ての登録地点を撮影する指定サイクルが終了していないと判断した場合（ステップＳ３３５：Ｎｏ）、顕微鏡システム１は、上述したステップＳ３１８へ戻る。
【０１０４】
ステップＳ３３６において、画像処理部６２３は、記録部６１が記録する複数の画像データを時間的に順次繋げたタイムラプス動画を標本ＳＰの指定位置毎に生成して記録部６１に記録する。ステップＳ３３６の後、顕微鏡システム１は、図４のメインルーチンへ戻る。
【０１０５】
以上説明した本発明の実施の形態１によれば、標本の種類に関わらず、簡易な構成で、熱ドリフトによる標本の指定位置のずれを正確に補正することができる。
【０１０６】
さらに、本発明の実施の形態１によれば、１サイクル毎に、標本ＳＰ上における観察箇所を指定する複数の指定位置をそれぞれ補正するので、より正確なタイムラプス観察を行うことができる。
【０１０７】
（実施の形態２）
次に、本発明の実施の形態２について説明する。本実施の形態２に係る顕微鏡システムは、上述した実施の形態１と同様の構成を有し、実行する処理が異なる。具体的には、セッティング処理およびタイムラプス処理が異なる。このため、以下においては、本実施の形態２に係る顕微鏡システムが実行する処理について説明する。なお、上述した実施の形態１に係る顕微鏡システム１と同一の構成には同一の符号を付して説明を省略する。
【０１０８】
〔セッティング処理〕
まず、本実施の形態２に係る顕微鏡システム１が実行するセッティング処理の詳細について説明する。図７は、本実施の形態２に係る顕微鏡システム１が実行するセッティング処理の概要を示すフローチャートである。
【０１０９】
図７に示すように、撮影情報設定部６２４は、ユーザが入力部４を介して焦準部２５およびステージ２１１を操作し、標本ＳＰの所定の登録地点に移動させてタイムラプス観察を行う場所の登録地点を撮影情報記録部６１１へ記録（登録）する（ステップＳ４０１）。具体的には、撮影情報設定部６２４は、登録地点のＸ、Ｙ、Ｚ座標情報を撮影情報記録部６１１に記録する。より詳細には、撮影情報設定部６２４は、標本ＳＰの所定の登録地点に対して、位置検出部２１３が検出したＸおよびＹ座標およびステージ２１１の鉛直方向における高さを検出する高さ検出部（図示せず）が検出したＺ座標を撮影情報記録部６１１に記録させる。例えば、撮影情報設定部６２４は、標本ＳＰの所定の登録地点Ａ、Ｂ、ＣおよびＤそれぞれに対して、登録地点Ａ（Ｘａ０，Ｙａ０，Ｚａ０）、登録地点Ｂ（Ｘｂ０，Ｙｂ０，Ｚｂ０）、登録地点Ｃ（Ｘｃ０，Ｙｃ０，Ｚｃ０）および登録地点Ｄ（Ｘｄ０，Ｙｄ０，Ｚｄ０）を撮影情報記録部６１１に記録させる。
【０１１０】
続いて、顕微鏡制御装置６は、ミラー駆動部２７４を駆動させてミラーカセット２７３を回転させてマーカーＭ１を撮影可能なマーカー撮影用の波長に切り替える（ステップＳ４０２）。具体的には、顕微鏡制御装置６は、ミラーターレット２７を制御して照明光をマーカーＭ１撮影用の波長に切り替える。
【０１１１】
その後、撮影制御部６２７は、ユーザが入力部４を介して焦準部２５およびステージ２１１を操作し、撮像装置３の視野内（例えば、撮像装置３の視野中心）に移動させたマーカーＭ１を撮像装置３に撮影させる（ステップＳ４０３）。この場合、撮影情報設定部６２４は、マーカーＭ１に対して、位置検出部２１３が検出したＸおよびＹ座標および高さ検出部（図示せず）が検出したＺ座標を撮影情報記録部６１１に記録させる。例えば、撮影情報設定部６２４は、マーカーＭ１の登録地点（Ｘｍ０，Ｙｍ０，Ｚｍ０）を撮影情報記録部６１１に記録させる。さらに、撮影情報設定部６２４は、撮像装置３が撮影した画像データに対応する画像内において、マーカーＭ１の位置を記録するため、画像処理部６２３が検出した画像内におけるマーカーＭ１の画像座標（Ｐｘ０，Ｐｙ０）を撮影情報記録部６１１に記録させる。
【０１１２】
続いて、撮影情報設定部６２４は、入力部４を介して入力されたタイムラプスの時間間隔、撮影時間、撮影回数および補正回数を撮影情報記録部６１１に記録する（ステップＳ４０４）。例えば、撮影情報設定部６２４は、入力部４を介して入力されたＡ地点の１回目から２回目の撮影間隔ｔ、それの撮影間隔ｔをＴ時間分または繰り返す回数ｎおよび１サイクル中のタイムタプル観察において補正する熱ドリフトによるずれ量を補正する補正回数θを撮影情報記録部６１１に記録する。ステップＳ４０４の後、顕微鏡システム１は、図４のメインルーチンへ戻る。
【０１１３】
〔タイムラプス処理〕
次に、本実施の形態２に係る顕微鏡システム１が実行するタイムラプス処理の詳細について説明する。図８Ａは、本実施の形態２に係る顕微鏡システム１が実行するタイムラプス処理の概要を示すフローチャートである。図８Ｂは、本実施の形態２に係る顕微鏡システム１が実行するタイムラプス処理の概要を示すフローチャートである。図８Ｃは、本実施の形態２に係る顕微鏡システム１が実行するタイムラプス処理の概要を示すタイムチャートである。
【０１１４】
図８Ａ、図８Ｂ、および図８Ｃに示すように、まず、ステージ制御部６２１は、撮影情報記録部６１１が記録する位置情報に基づいて、ステージ駆動部２１２を駆動させることによって、マーカー位置にステージ２１１を移動させる（ステップＳ５０１）。具体的には、ステージ制御部６２１は、撮影情報記録部６１１が記録するマーカーＭ１の登録地点（Ｘｍ０，Ｙｍ０，Ｚｍ０）へステージ２１１を移動させる。
【０１１５】
続いて、焦準制御部６２２は、ＡＦ部２５２から入力されるＡＦ信号に基づいて、焦準部２５の鉛直方向（Ｚ方向）における位置を検出する（ステップＳ５０２）。具体的には、焦準制御部６２２は、ＡＦ部２５２から入力されるＡＦ信号に基づいて、焦準部２５の鉛直方向における位置ΔＺｍ１を検出する。
【０１１６】
その後、焦準制御部６２２は、ＡＦ部２５２から入力されるＡＦ信号に基づいて、焦準駆動部２５３を駆動して焦準部２５を上下方向（Ｚ方向）に移動させることによって、対物レンズ２３の焦点をマーカーＭ１に合焦させるＡＦ処理を実行するために焦準部２５を焦点位置へ移動させる（ステップＳ５０３）。具体的には、焦準制御部６２２は、ＡＦ部２５２から入力されるＡＦ信号に基づいて、焦点位置Ｚｍ１（Ｚｍ１＝Ｚｍ０−ΔＺｍ１）へ焦準部２５を移動させる。
【０１１７】
続いて、顕微鏡制御装置６は、ミラー駆動部２７４を駆動させてミラーカセット２７３を回転させてマーカーＭ１を撮影可能なマーカー撮影用の波長に切り替える（ステップＳ５０４）。具体的には、顕微鏡制御装置６は、ミラーターレット２７を制御して照明光をマーカーＭ１撮影用の波長に切り替える。
【０１１８】
その後、撮影制御部６２７は、撮像装置３の視野領域内におけるマーカーＭ１を撮像装置３に撮影させる（ステップＳ５０５）。この場合において、撮影制御部６２７は、撮像装置３が容器Ｄ１内に収容されたマーカーＭ１を撮像して生成したマーキング画像データに対応するマーキング画像（基準画像）に、位置検出部２１３が検出したステージ２１１の位置情報（Ｘｍ０，Ｙｍ０）および焦準部２５の焦点位置の位置情報（Ｚｍ１）を対応付けて撮影情報記録部６１１に記録する。
【０１１９】
続いて、ずれ量算出部６２５は、撮像装置３が生成したマーキング画像内におけるマーカーＭ１の画像内座標を算出して記録部６１に記録する（ステップＳ５０６）。具体的には、ずれ量算出部６２５は、撮像装置３が生成したマーキング画像からマーカーＭ１の画像内座標（Ｐｘ１，Ｐｙ１）を算出して記録部６１に記録する。
【０１２０】
その後、ずれ量算出部６２５は、マーカーＭ１のずれ量を算出する（ステップＳ５０７）。具体的には、ずれ量算出部６２５は、撮像装置３が生成したマーキング画像からマーカーＭ１が移動した移動量（ドリフト量）を算出する。より詳細には、ずれ量算出部６２５は、ピクセル換算におけるマーキング画像上のマーカーＭ１のずれ量（ΔＰｘ１，ΔＰｙ１）を上述した式（１），（２）によって算出する。
【０１２１】
続いて、ずれ量算出部６２５は、標本ＳＰ面におけるずれ量を算出する（ステップＳ５０８）。具体的には、ずれ量算出部６２５は、上述したステップＳ３０７で算出したマーキング画像上のずれ量（ピクセル上のずれ量）に基づいて、標本ＳＰ面でのずれ量を算出する。より詳細には、ずれ量算出部６２５は、標本ＳＰ面でのずれ量（ΔＸ１，ΔＹ１）を上述した式（３），（４）によって算出する。
【０１２２】
その後、補正部６２６は、ずれ量算出部６２５が算出したマーカーＭ１のずれ量に基づいて、撮影情報記録部６１１が記録するマーカーＭ１の座標情報を補正する（ステップＳ５０９）。具体的には、補正部６２６は、ずれ量算出部６２５が算出したマーカーＭ１のずれ量に基づいて、撮影情報記録部６１１が記録するマーカーＭ１のＸＹ座標（Ｘｍ０，Ｙｍ０）を補正する。より詳細には、補正部６２６は、ずれ量算出部６２５が算出したマーカーＭ１のずれ量に基づいて、撮影情報記録部６１１が記録するマーカーＭ１のＸＹ座標（Ｘｍ０，Ｙｍ０）を上述した式（５），（６）によって補正する。この場合、補正部６２６は、式（５），（６）によって補正したマーカーＭ１のＸＹ座標（Ｘｍ１，Ｙｍ１）および焦準制御部６２２が検出したマーカーＭ１のＺ座標（Ｚｍ１）それぞれを撮影情報記録部６１１に記録してマーカーＭ１の座標情報を更新する（（Ｘｍ０，Ｙｍ０，Ｚｍ０）→（Ｘｍ１，Ｙｍ１，Ｚｍ１））。
【０１２３】
続いて、補正部６２６は、撮影情報記録部６１１が記録するマーカーＭ１の座標情報に基づいて、登録地点の座標情報（指定位置）を補正する（ステップＳ５１０）。具体的には、補正部６２６は、上述したステップＳ３０９で補正したマーカーＭ１の座標情報に基づいて、登録地点（例えば、登録地点ＡおよびＢ）の座標情報を補正する。より詳細には、補正部６２６は、上述した式（７）〜（１０）によって登録地点ＡおよびＢの座標情報を補正する。
【０１２４】
その後、ステージ制御部６２１は、撮影情報記録部６１１が記録する登録地点へステージ２１１を移動させる（ステップ５１１）。例えば、ステージ制御部６２１は、図８Ｃに示すように、補正部６２６によって補正された登録地点Ａ（Ｘａ１，Ｙｂ１，Ｚａ０）へステージ２１１を移動させる。
【０１２５】
続いて、焦準制御部６２２は、ＡＦ部２５２から入力されるＡＦ信号に基づいて、登録地点に対する焦準部２５の鉛直方向（Ｚ方向）における位置を検出する（ステップＳ５１２）。例えば、焦準制御部６２２は、ＡＦ部２５２から入力されるＡＦ信号に基づいて、登録地点Ａに対する焦準部２５の鉛直方向における位置ΔＺａ１を検出する。
【０１２６】
その後、焦準制御部６２２は、ＡＦ部２５２から入力されるＡＦ信号に基づいて、焦準駆動部２５３を駆動して焦準部２５を上下方向（Ｚ方向）に移動させることによって、対物レンズ２３の焦点をマーカーＭ１に合焦させるＡＦ処理を実行するために焦準部２５を焦点位置へ移動させる（ステップＳ５１３）。例えば、焦準制御部６２２は、ＡＦ部２５２から入力されるＡＦ信号に基づいて、登録地点Ａに対する焦点位置Ｚａ１（Ｚａ１＝Ｚａ０−ΔＺａ１）へ焦準部２５を移動させる。
【０１２７】
続いて、顕微鏡制御装置６は、ミラー駆動部２７４を駆動させてミラーカセット２７３を回転させて標本ＳＰを撮影可能な波長に切り替える（ステップＳ５１４）。具体的には、顕微鏡制御装置６は、ミラーターレット２７を制御して照明光を観察用の波長に切り替える。
【０１２８】
その後、撮影制御部６２７は、撮像装置３の視野領域内における標本ＳＰを撮像装置３に撮影させる（ステップＳ５１５）。例えば、撮影制御部６２７は、撮像装置３の視野領域内における標本ＳＰの登録地点Ａを撮影して登録地点Ａの画像データを生成する。
【０１２９】
続いて、顕微鏡制御装置６は、撮影情報記録部６１１が記録する撮影情報に基づいて、標本ＳＰに対する指定の登録地点の撮影が終了したか否かを判断する（ステップＳ５１６）。具体的には、顕微鏡制御装置６は、標本ＳＰに対する登録地点ＡおよびＢの撮影が終了したか否かを判断する。撮影情報記録部６１１が記録する撮影情報に基づいて、標本ＳＰに対する指定の登録地点の撮影が終了したと判断した場合（ステップＳ５１６：Ｙｅｓ）、顕微鏡システム１は、後述するステップＳ５１７へ移行する。これに対して、標本ＳＰに対する指定の登録地点の撮影が終了していないと判断した場合（ステップＳ５１６：Ｎｏ）、顕微鏡システム１は、上述したステップＳ５１１へ戻る。
【０１３０】
ステップＳ５１７において、ステージ制御部６２１は、撮影情報記録部６１１が記録するマーカーＭ１の位置情報に基づいて、ステージ駆動部２１２を駆動させることによって、マーカー位置にステージ２１１を移動させる。具体的には、ステージ制御部６２１は、撮影情報記録部６１１が記録するマーカーＭ１の登録地点（Ｘｍ１，Ｙｍ１，Ｚｍ１）へステージ２１１を移動させる。
【０１３１】
続いて、焦準制御部６２２は、ＡＦ部２５２から入力されるＡＦ信号に基づいて、焦準部２５の鉛直方向における位置を検出する（ステップＳ５１８）。具体的には、焦準制御部６２２は、ＡＦ部２５２から入力されるＡＦ信号に基づいて、焦準部２５の鉛直方向における位置ΔＺｍ１’を検出する。
【０１３２】
その後、焦準制御部６２２は、ＡＦ部２５２から入力されるＡＦ信号に基づいて、焦準駆動部２５３を駆動して焦準部２５を上下方向（Ｚ方向）に移動させることによって、対物レンズ２３の焦点をマーカーＭ１に合焦させるＡＦ処理を実行するために焦準部２５を焦点位置へ移動させる（ステップＳ５１９）。具体的には、焦準制御部６２２は、ＡＦ部２５２から入力されるＡＦ信号に基づいて、焦点位置Ｚｍ１’（Ｚｍ１’＝Ｚｍ１−ΔＺｍ１’）へ焦準部２５を移動させる。
【０１３３】
続いて、顕微鏡制御装置６は、ミラー駆動部２７４を駆動させてミラーカセット２７３を回転させてマーカーＭ１を撮影可能なマーカー撮影用の波長に切り替える（ステップＳ５２０）。具体的には、顕微鏡制御装置６は、ミラーターレット２７を制御して照明光をマーカーＭ１撮影用の波長に切り替える。
【０１３４】
その後、撮影制御部６２７は、撮像装置３の視野領域内におけるマーカーＭ１を撮像装置３に撮影させる（ステップＳ５２１）。この場合において、この場合において、撮影制御部６２７は、撮像装置３が容器Ｄ１内に収容されたマーカーＭ１を撮像して生成したマーキング画像データに対応するマーキング画像（基準画像）に、位置検出部２１３が検出したステージ２１１の位置情報（Ｘｍ１，Ｙｍ１）および焦準部２５の焦点位置の位置情報（Ｚｍ１’）を対応付けて撮影情報記録部６１１に記録する。
【０１３５】
続いて、ずれ量算出部６２５は、撮像装置３が生成したマーキング画像内におけるマーカーＭ１の画像内座標を算出して撮影情報記録部６１１に記録する（ステップＳ５２２）。具体的には、ずれ量算出部６２５は、撮像装置３が生成したマーキング画像からマーカーＭ１の画像内座標（Ｐｘ１’，Ｐｙ１’）を算出して記録部６１に記録する。
【０１３６】
その後、ずれ量算出部６２５は、マーカーＭ１のずれ量を算出する（ステップＳ５２３）。具体的には、ずれ量算出部６２５は、撮像装置３が生成したマーキング画像からマーカーＭ１が移動した移動量（ドリフト量）を算出する。より詳細には、ずれ量算出部６２５は、ピクセル換算におけるマーキング画像上のマーカーＭ１のずれ量（ΔＰｘ１’，ΔＰｙ１’）を以下の式によって算出する。
ΔＰｘ１’＝Ｐｘ１’−Ｐｘ１・・・（２５）
ΔＰｙ１’＝Ｐｙ１’−Ｐｙ１・・・（２６）
【０１３７】
続いて、ずれ量算出部６２５は、標本ＳＰ面におけるずれ量を算出する（ステップＳ５２４）。具体的には、ずれ量算出部６２５は、上述したステップＳ５２３で算出したマーキング画像上のずれ量（ピクセル上のずれ量）に基づいて、標本ＳＰ面でのずれ量を算出する。より詳細には、ずれ量算出部６２５は、標本ＳＰ面でのずれ量（ΔＸ１’，ΔＹ１’）を以下の式によって算出する。
ΔＸ１’＝ΔＰｘ１’×撮像装置３内の撮像素子の１画素のサイズ／対物倍率
・・・（２７）
ΔＹ１’＝ΔＰｙ１’×撮像装置３内の撮像素子の１画素のサイズ／対物倍率
・・・（２８）
【０１３８】
その後、補正部６２６は、ずれ量算出部６２５が算出したマーカーＭ１のずれ量に基づいて、撮影情報記録部６１１が記録するマーカーＭ１の座標情報を補正する（ステップＳ５２５）。具体的には、補正部６２６は、ずれ量算出部６２５が算出したマーカーＭ１のずれ量に基づいて、撮影情報記録部６１１が記録するマーカーＭ１のＸＹ座標（Ｘｍ１’，Ｙｍ１’）を補正する。より詳細には、補正部６２６は、ずれ量算出部６２５が算出したマーカーＭ１のずれ量に基づいて、撮影情報記録部６１１が記録するマーカーＭ１のＸＹ座標（Ｘｍ１’，Ｙｍ１’）を以下の式によって補正する。
Ｘｍ１’＝Ｘｍ１−ΔＸ１’      ・・・（２９）
Ｙｍ１’＝Ｙｍ１−ΔＹ１’      ・・・（３０）
ここで、Ｘｍ１’は、補正後のマーカーＭ１のＸ座標を示し、Ｙｍ１’は、補正後のマーカーＭ１のＹ座標を示す。この場合、補正部６２６は、式（２９），（３０）によって補正したマーカーＭ１のＸＹ座標（Ｘｍ１’，Ｙｍ１’）および焦準制御部６２２が検出したマーカーＭ１のＺ座標（Ｚｍ１’）それぞれを撮影情報記録部６１１に記録してマーカーＭ１の座標情報を更新する（（Ｘｍ１，Ｙｍ１，Ｚｍ１）→（Ｘｍ１’，Ｙｍ１’，Ｚｍ１’））。
【０１３９】
続いて、補正部６２６は、撮影情報記録部６１１が記録するマーカーＭ１の座標情報に基づいて、登録地点の座標情報を補正する（ステップＳ５２６）。具体的には、補正部６２６は、上述したステップＳ５２５で補正したマーカーＭ１の座標情報に基づいて、登録地点（例えば、登録地点ＣおよびＤ）の座標情報を補正する。より詳細には、補正部６２６は、以下の式によって登録地点ＣおよびＤの座標情報を補正する。
Ｘｃ１＝Ｘｃ０−ΔＸ１’      ・・・（３１）
Ｙｃ１＝Ｙｃ０−ΔＹ１’      ・・・（３２）
Ｘｄ１＝Ｘｄ０−ΔＸ１’      ・・・（３３）
Ｙｄ１＝Ｙｄ０−ΔＹ１’      ・・・（３４）
ここで、Ｘｃ１は、補正後の登録地点ＣのＸ座標を示し、Ｙｃ１は、補正後の登録地点ＣのＸ座標を示し、Ｘｄ１は、補正後の登録地点ＤのＸ座標を示し、Ｙｄ１は、補正後の登録地点ＤのＸ座標を示す。
【０１４０】
その後、ステージ制御部６２１は、図８Ｃに示すように、撮影情報記録部６１１が記録する登録地点へステージ２１１を移動させる（ステップＳ５２７）。例えば、ステージ制御部６２１は、補正部６２６によって補正された登録地点Ｃ（Ｘｃ１，Ｙｃ１，Ｚａ０）へステージ２１１を移動させる。
【０１４１】
続いて、焦準制御部６２２は、ＡＦ部２５２から入力されるＡＦ信号に基づいて、登録地点に対する焦準部２５の鉛直方向（Ｚ方向）における位置を検出する（ステップＳ５２８）。例えば、焦準制御部６２２は、ＡＦ部２５２から入力されるＡＦ信号に基づいて、登録地点Ｃに対する焦準部２５の鉛直方向における位置ΔＺｃ１を検出する。
【０１４２】
その後、焦準制御部６２２は、ＡＦ部２５２から入力されるＡＦ信号に基づいて、焦準駆動部２５３を駆動して焦準部２５を上下方向（Ｚ方向）に移動させることによって、対物レンズ２３の焦点をマーカーＭ１に合焦させるＡＦ処理を実行するために焦準部２５を焦点位置へ移動させる（ステップＳ５２９）。例えば、焦準制御部６２２は、ＡＦ部２５２から入力されるＡＦ信号に基づいて、登録地点Ｃに対する焦点位置Ｚｃ１（Ｚａ１＝Ｚａ０−ΔＺａ１）へ焦準部２５を移動させる。
【０１４３】
続いて、顕微鏡制御装置６は、ミラー駆動部２７４を駆動させてミラーカセット２７３を回転させて標本ＳＰを撮影可能な波長に切り替える（ステップＳ５３０）。具体的には、顕微鏡制御装置６は、ミラーターレット２７を制御して照明光を観察用の波長に切り替える。
【０１４４】
その後、撮影制御部６２７は、撮像装置３の視野領域内における標本ＳＰを撮像装置３に撮影させる（ステップＳ５３１）。例えば、撮影制御部６２７は、撮像装置３の視野領域内における標本ＳＰの登録地点Ｃを撮影して登録地点Ｃの画像データを生成する。
【０１４５】
続いて、顕微鏡制御装置６は、撮影情報記録部６１１が記録する撮影情報に基づいて、標本ＳＰに対する指定の登録地点の撮影が終了したか否かを判断する（ステップＳ５３２）。具体的には、顕微鏡制御装置６は、標本ＳＰに対する登録地点ＣおよびＤの撮影が終了したか否かを判断する。撮影情報記録部６１１が記録する撮影情報に基づいて、標本ＳＰに対する指定の登録地点の撮影が終了したと判断した場合（ステップＳ５３２：Ｙｅｓ）、顕微鏡システム１は、後述するステップＳ５３３へ移行する。これに対して、標本ＳＰに対する指定の登録地点の撮影が終了していないと判断した場合（ステップＳ５３２：Ｎｏ）、顕微鏡システム１は、上述したステップＳ５２７へ戻る。
【０１４６】
ステップＳ５３３において、顕微鏡制御装置６は、撮影情報記録部６１１が記録する撮影情報に基づいて、標本ＳＰに対する全ての登録地点を撮影してから登録時間が経過したか否かを判断する。顕微鏡制御装置６が標本ＳＰに対する全ての登録地点を撮影してから登録時間が経過したと判断した場合（ステップＳ５３３：Ｙｅｓ）、顕微鏡システム１は、後述するステップＳ５３４へ移行する。これに対して、顕微鏡制御装置６が標本ＳＰに対する全ての登録地点を撮影してから登録時間が経過していないと判断した場合（ステップＳ５３３：Ｎｏ）、顕微鏡システム１は、登録時間が経過するまで、この判断を続ける。
【０１４７】
ステップＳ５３４において、顕微鏡制御装置６は、撮影情報記録部６１１が記録する撮影情報に基づいて、標本ＳＰに対する全ての登録地点を撮影する指定サイクルが終了したか否かを判断する。顕微鏡制御装置６が標本ＳＰに対する全ての登録地点を撮影する指定サイクルが終了したと判断した場合（ステップＳ５３４：Ｙｅｓ）、顕微鏡システム１は、後述するステップＳ５３５へ移行する。これに対して、顕微鏡制御装置６が標本ＳＰに対する全ての登録地点を撮影する指定サイクルが終了していないと判断した場合（ステップＳ５３４：Ｎｏ）、顕微鏡システム１は、上述したステップＳ５１１へ戻る。
【０１４８】
ステップＳ５３５において、画像処理部６２３は、記録部６１が記録する複数の画像データを時間的に順次繋げたタイムラプス動画を標本ＳＰの指定位置毎に生成して記録部６１に記録する。ステップＳ５３５の後、顕微鏡システム１は、図４のメインルーチンへ戻る。
【０１４９】
以上説明した本発明の実施の形態２によれば、標本の種類に関わらず、簡易な構成で、熱ドリフトによる標本の指定位置のずれを正確に補正することができる。
【０１５０】
また、本発明の実施の形態２によれば、タイムラプス観察の１サイクル中に生じる熱ドリフトの影響も小さくすることができる。
【０１５１】
（実施の形態３）
次に、本発明の実施の形態３について説明する。本実施の形態３に係る顕微鏡システムは、上述した実施の形態１に係る顕微鏡システム１の構成が異なるとともに、実行するタイムラプス処理が異なる。このため、以下においては、本実施の形態３に係る顕微鏡システムの構成を説明後、本実施の形態３に係る顕微鏡システムが実行する処理について説明する。なお、上述した実施の形態１に係る顕微鏡システム１と同一の構成には同一の符号を付して説明を省略する。
【０１５２】
〔顕微鏡システムの構成〕
図９は、本発明の実施の形態３に係る顕微鏡システムの構成を概略的に示す模式図である。図９に示す顕微鏡システム１ａは、顕微鏡装置２と、撮像装置３と、入力部４と、表示部５と、顕微鏡制御装置６ａと、を備える。
【０１５３】
顕微鏡制御装置６ａは、記録部６１と、顕微鏡システム１ａの各部を統括的に制御する制御部６２ａと、を備える。
【０１５４】
制御部６２ａは、ステージ制御部６２１と、焦準制御部６２２と、画像処理部６２３と、撮影情報設定部６２４と、ずれ量算出部６２５と、補正部６２６ａと、撮影制御部６２７と、表示制御部６２８と、を有する。
【０１５５】
補正部６２６ａは、タイムラプス観察で指定されたサイクル数が終了した後に、記録部６１が記録する各画像データに対応する画像に対応付けられたずれ量に基づいて、画像データに対応する画像内における標本ＳＰの観察箇所に対応する指定位置（登録位置）を補正する。
【０１５６】
〔タイムラプス処理〕
次に、本実施の形態３に係る顕微鏡システム１が実行するタイムラプス処理の詳細について説明する。図１０Ａは、本実施の形態３に係る顕微鏡システム１が実行するタイムラプス処理の概要を示すフローチャートである。図１０Ｂは、本実施の形態３に係る顕微鏡システム１が実行するタイムラプス処理の概要を示すフローチャートである。
【０１５７】
図１０Ａおよび図１０Ｂに示すように、まず、ステージ制御部６２１は、撮影情報記録部６１１が記録する位置情報に基づいて、ステージ駆動部２１２を駆動させることによって、マーカー位置にステージ２１１を移動させる（ステップＳ６０１）。具体的には、ステージ制御部６２１は、撮影情報記録部６１１が記録するマーカーＭ１の登録地点（Ｘｍ０，Ｙｍ０，Ｚｍ０）へステージ２１１を移動させる。
【０１５８】
続いて、焦準制御部６２２は、ＡＦ部２５２から入力されるＡＦ信号に基づいて、焦準部２５の鉛直方向（Ｚ方向）における位置を検出する（ステップＳ６０２）。具体的には、焦準制御部６２２は、ＡＦ部２５２から入力されるＡＦ信号に基づいて、焦準部２５の鉛直方向における位置ΔＺｍ１を検出する。
【０１５９】
その後、焦準制御部６２２は、ＡＦ部２５２から入力されるＡＦ信号に基づいて、焦準駆動部２５３を駆動して焦準部２５を上下方向（Ｚ方向）に移動させることによって、対物レンズ２３の焦点をマーカーＭ１に合焦させるＡＦ処理を実行するために焦準部２５を焦点位置へ移動させる（ステップＳ６０３）。具体的には、焦準制御部６２２は、ＡＦ部２５２から入力されるＡＦ信号に基づいて、焦点位置Ｚｍ１（Ｚｍ１＝Ｚｍ０−ΔＺｍ１）へ焦準部２５を移動させる。
【０１６０】
続いて、顕微鏡制御装置６は、ミラー駆動部２７４を駆動させてミラーカセット２７３を回転させてマーカーＭ１を撮影可能なマーカー撮影用の波長に切り替える（ステップＳ６０４）。具体的には、顕微鏡制御装置６は、ミラーターレット２７を制御して照明光をマーカーＭ１撮影用の波長に切り替える。
【０１６１】
その後、撮影制御部６２７は、撮像装置３の視野領域内におけるマーカーＭ１を撮像装置３に撮影させる（ステップＳ６０５）。この場合において、撮影制御部６２７は、撮像装置３が容器Ｄ１内に収容されたマーカーＭ１を撮像して生成したマーキング画像データに対応するマーキング画像（基準画像）に、位置検出部２１３が検出したステージ２１１の位置情報（Ｘｍ０，Ｙｍ０）および焦準部２５の焦点位置の位置情報（Ｚｍ１）を対応付けて撮影情報記録部６１１に記録する。
【０１６２】
続いて、ずれ量算出部６２５は、撮像装置３が生成したマーキング画像内におけるマーカーＭ１の画像内座標を算出して記録部６１に記録する（ステップＳ６０６）。具体的には、ずれ量算出部６２５は、撮像装置３が生成したマーキング画像からマーカーＭ１の画像内座標（Ｐｘ１，Ｐｙ１）を算出して記録部６１に記録する。
【０１６３】
その後、ずれ量算出部６２５は、マーカーＭ１のずれ量を算出する（ステップＳ６０７）。具体的には、ずれ量算出部６２５は、撮像装置３が生成したマーキング画像からマーカーＭ１が移動した移動量（ドリフト量）を算出する。より詳細には、ずれ量算出部６２５は、ピクセル換算におけるマーキング画像上のマーカーＭ１のずれ量（ΔＰｘ１，ΔＰｙ１）を上述した式（１），（２）によって算出する。
【０１６４】
続いて、ステージ制御部６２１は、撮影情報記録部６１１が記録する登録地点へステージ２１１を移動させる（ステップＳ６０８）。例えば、ステージ制御部６２１は、補正部６２６によって補正された登録地点Ａ（Ｘａ１，Ｙａ１，Ｚａ０）へステージ２１１を移動させる。
【０１６５】
その後、焦準制御部６２２は、ＡＦ部２５２から入力されるＡＦ信号に基づいて、登録地点に対する焦準部２５の鉛直方向（Ｚ方向）における位置を検出する（ステップＳ６０９）。例えば、焦準制御部６２２は、ＡＦ部２５２から入力されるＡＦ信号に基づいて、登録地点Ａに対する焦準部２５の鉛直方向における位置ΔＺａ１を検出する。
【０１６６】
続いて、焦準制御部６２２は、ＡＦ部２５２から入力されるＡＦ信号に基づいて、焦準駆動部２５３を駆動して焦準部２５を上下方向（Ｚ方向）に移動させることによって、対物レンズ２３の焦点をマーカーＭ１に合焦させるＡＦ処理を実行するために焦準部２５を焦点位置へ移動させる（ステップＳ６１０）。例えば、焦準制御部６２２は、ＡＦ部２５２から入力されるＡＦ信号に基づいて、登録地点Ａに対する焦点位置Ｚａ１（Ｚａ１＝Ｚａ０−ΔＺａ１）へ焦準部２５を移動させる。
【０１６７】
その後、顕微鏡制御装置６は、ミラー駆動部２７４を駆動させてミラーカセット２７３を回転させて標本ＳＰを撮影可能な波長に切り替える（ステップＳ６１１）。具体的には、顕微鏡制御装置６は、ミラーターレット２７を制御して照明光を観察用の波長に切り替える。
【０１６８】
続いて、撮影制御部６２７は、撮像装置３の視野領域内における標本ＳＰを撮像装置３に撮影させる（ステップＳ６１２）。例えば、撮影制御部６２７は、撮像装置３の視野領域内における標本ＳＰの登録地点Ａを撮影して登録地点Ａの画像データを生成する。
【０１６９】
その後、撮影制御部６２７は、撮像装置３が生成した画像データに対応する画像に、ずれ量算出部６２５が算出したマーカーＭ１のずれ量を付与して記録部６１に記録する（ステップＳ６１３）。例えば、撮影制御部６２７は、撮像装置３の視野領域内における標本ＳＰの登録地点Ａを撮影して登録地点Ａの画像データに対応する画像に、ずれ量算出部６２５がステップＳ６０７で算出したマーカーＭ１のずれ量（ΔＰｘ１，ΔＰｙ１）を付与して（対応付けて）記録部６１に記録する。
【０１７０】
続いて、顕微鏡制御装置６は、撮影情報記録部６１１が記録する撮影情報に基づいて、標本ＳＰに対する全ての登録地点の撮影が終了したか否かを判断する（ステップＳ６１４）。顕微鏡制御装置６が標本ＳＰに対する全ての登録地点の撮影が終了したと判断した場合（ステップＳ６１４：Ｙｅｓ）、顕微鏡システム１ａは、後述するステップＳ６１５へ移行する。これに対して、顕微鏡制御装置６が標本ＳＰに対する全ての登録地点の撮影が終了していないと判断した場合（ステップＳ６１４：Ｎｏ）、顕微鏡システム１ａは、上述したステップＳ６０８へ戻る。
【０１７１】
ステップＳ６１５において、顕微鏡制御装置６は、撮影情報記録部６１１が記録する撮影情報に基づいて、標本ＳＰに対する全ての登録地点を撮影してから登録時間が経過したか否かを判断する。顕微鏡制御装置６が標本ＳＰに対する全ての登録地点を撮影してから登録時間が経過したと判断した場合（ステップＳ６１５：Ｙｅｓ）、顕微鏡システム１ａは、後述するステップＳ６１６へ移行する。これに対して、顕微鏡制御装置６が標本ＳＰに対する全ての登録地点を撮影してから登録時間が経過していないと判断した場合（ステップＳ６１５：Ｎｏ）、顕微鏡システム１ａは、登録時間が経過するまで、この判断を続ける。
【０１７２】
ステップＳ６１６において、ステージ制御部６２１は、撮影情報記録部６１１が記録するマーカーＭ１の位置情報に基づいて、ステージ駆動部２１２を駆動させることによって、マーカー位置にステージ２１１を移動させる。具体的には、ステージ制御部６２１は、撮影情報記録部６１１が記録するマーカーＭ１の登録地点（Ｘｍ１，Ｙｍ１，Ｚｍ１）へステージ２１１を移動させる。
【０１７３】
続いて、焦準制御部６２２は、ＡＦ部２５２から入力されるＡＦ信号に基づいて、焦準部２５の鉛直方向における位置を検出する（ステップＳ６１７）。具体的には、焦準制御部６２２は、ＡＦ部２５２から入力されるＡＦ信号に基づいて、焦準部２５の鉛直方向における位置ΔＺｍ２を検出する。
【０１７４】
その後、焦準制御部６２２は、ＡＦ部２５２から入力されるＡＦ信号に基づいて、焦準駆動部２５３を駆動して焦準部２５を上下方向（Ｚ方向）に移動させることによって、対物レンズ２３の焦点をマーカーＭ１に合焦させるＡＦ処理を実行するために焦準部２５を焦点位置へ移動させる（ステップＳ６１８）。具体的には、焦準制御部６２２は、ＡＦ部２５２から入力されるＡＦ信号に基づいて、焦点位置Ｚｍ２（Ｚｍ２＝Ｚｍ１−ΔＺｍ２）へ焦準部２５を移動させる。
【０１７５】
続いて、顕微鏡制御装置６は、ミラー駆動部２７４を駆動させてミラーカセット２７３を回転させてマーカーＭ１を撮影可能なマーカー撮影用の波長に切り替える（ステップＳ６１９）。具体的には、顕微鏡制御装置６は、ミラーターレット２７を制御して照明光をマーカーＭ１撮影用の波長に切り替える。
【０１７６】
その後、撮影制御部６２７は、撮像装置３の視野領域内におけるマーカーＭ１を撮像装置３に撮影させる（ステップＳ６２０）。この場合において、撮影制御部６２７は、撮像装置３が容器Ｄ１内に収容されたマーカーＭ１を撮像して生成したマーキング画像データに対応するマーキング画像（基準画像）に、位置検出部２１３が検出したステージ２１１の位置情報（Ｘｍ０，Ｙｍ０）および焦準部２５の焦点位置の位置情報（Ｚｍ２）を対応付けて撮影情報記録部６１１に記録（更新）する。
【０１７７】
続いて、ずれ量算出部６２５は、撮像装置３が生成したマーキング画像内におけるマーカーＭ１の画像内座標を算出して撮影情報記録部６１１に記録する（ステップＳ６２１）。具体的には、ずれ量算出部６２５は、撮像装置３が生成したマーキング画像からマーカーＭ１の画像内座標（Ｐｘ２，Ｐｙ２）を算出して記録部６１に記録する。
【０１７８】
その後、ずれ量算出部６２５は、マーカーＭ１のずれ量を算出する（ステップＳ６２２）。具体的には、ずれ量算出部６２５は、撮像装置３が生成したマーキング画像からマーカーＭ１が移動した移動量（ドリフト量）を算出する。より詳細には、ずれ量算出部６２５は、ピクセル換算におけるマーキング画像上のマーカーＭ１のずれ量（ΔＰｘ２，ΔＰｙ２）を上述した式（１３），（１４）によって算出する。
【０１７９】
続いて、ステージ制御部６２１は、撮影情報記録部６１１が記録する登録地点へステージ２１１を移動させる（ステップＳ６２３）。例えば、ステージ制御部６２１は、撮影情報記録部６１１が記録する登録地点Ａ（Ｘａ０，Ｙａ０，Ｚａ１）へステージ２１１を移動させる。
【０１８０】
その後、焦準制御部６２２は、ＡＦ部２５２から入力されるＡＦ信号に基づいて、登録地点に対する焦準部２５の鉛直方向（Ｚ方向）における位置を検出する（ステップＳ６２４）。例えば、焦準制御部６２２は、ＡＦ部２５２から入力されるＡＦ信号に基づいて、登録地点Ａに対する焦準部２５の鉛直方向における位置ΔＺａ２を検出する。
【０１８１】
続いて、焦準制御部６２２は、ＡＦ部２５２から入力されるＡＦ信号に基づいて、焦準駆動部２５３を駆動して焦準部２５を上下方向（Ｚ方向）に移動させることによって、対物レンズ２３の焦点をマーカーＭ１に合焦させるＡＦ処理を実行するために焦準部２５を焦点位置へ移動させる（ステップＳ６２５）。例えば、焦準制御部６２２は、ＡＦ部２５２から入力されるＡＦ信号に基づいて、登録地点Ａに対する焦点位置Ｚａ２（Ｚａ２＝Ｚａ１−ΔＺａ２）へ焦準部２５を移動させる。
【０１８２】
その後、顕微鏡制御装置６は、ミラー駆動部２７４を駆動させてミラーカセット２７３を回転させて標本ＳＰを撮影可能な波長に切り替える（ステップＳ６２６）。具体的には、顕微鏡制御装置６は、ミラーターレット２７を制御して照明光を観察用の波長に切り替える。
【０１８３】
続いて、撮影制御部６２７は、撮像装置３の視野領域内における標本ＳＰを撮像装置３に撮影させる（ステップＳ６２７）。例えば、撮影制御部６２７は、撮像装置３の視野領域内における標本ＳＰの登録地点Ａを撮影して登録地点Ａの画像データを生成する。
【０１８４】
その後、撮影制御部６２７は、撮像装置３が生成した画像データに対応する画像に、ずれ量算出部６２５が算出したマーカーＭ１のずれ量を付与して記録部６１に記録する（ステップＳ６２８）。例えば、撮影制御部６２７は、撮像装置３の視野領域内における標本ＳＰの登録地点Ａを撮影して登録地点Ａの画像データに対応する画像に、ずれ量算出部６２５がステップＳ６２２で算出したマーカーＭ１のずれ量（ΔＰｘ２，ΔＰｙ２）を付与して（対応付けて）記録部６１に記録する。
【０１８５】
続いて、顕微鏡制御装置６は、撮影情報記録部６１１が記録する撮影情報に基づいて、標本ＳＰに対する全ての登録地点の撮影が終了したか否かを判断する（ステップＳ６２９）。顕微鏡制御装置６が標本ＳＰに対する全ての登録地点の撮影が終了したと判断した場合（ステップＳ６２９：Ｙｅｓ）、顕微鏡システム１ａは、後述するステップＳ６３０へ移行する。これに対して、顕微鏡制御装置６が標本ＳＰに対する全ての登録地点の撮影が終了していないと判断した場合（ステップＳ６２９：Ｎｏ）、顕微鏡システム１ａは、上述したステップＳ６１６へ戻る。
【０１８６】
ステップＳ６３０において、顕微鏡制御装置６は、撮影情報記録部６１１が記録する撮影情報に基づいて、標本ＳＰに対する全ての登録地点を撮影してから登録時間が経過したか否かを判断する。顕微鏡制御装置６が標本ＳＰに対する全ての登録地点を撮影してから登録時間が経過したと判断した場合（ステップＳ６３０：Ｙｅｓ）、顕微鏡システム１ａは、後述するステップＳ６３１へ移行する。これに対して、顕微鏡制御装置６が標本ＳＰに対する全ての登録地点を撮影してから登録時間が経過していないと判断した場合（ステップＳ６３０：Ｎｏ）、顕微鏡システム１ａは、登録時間が経過するまで、この判断を続ける。
【０１８７】
ステップＳ６３１において、顕微鏡制御装置６は、撮影情報記録部６１１が記録する撮影情報に基づいて、標本ＳＰに対する全ての登録地点を撮影する指定サイクルが終了したか否かを判断する。顕微鏡制御装置６が標本ＳＰに対する全ての登録地点を撮影する指定サイクルが終了したと判断した場合（ステップＳ６３１：Ｙｅｓ）、顕微鏡システム１ａは、後述するステップＳ６３２へ移行する。これに対して、顕微鏡制御装置６が標本ＳＰに対する全ての登録地点を撮影する指定サイクルが終了していないと判断した場合（ステップＳ６３１：Ｎｏ）、顕微鏡システム１ａは、上述したステップＳ６１６へ戻る。
【０１８８】
ステップＳ６３２において、画像処理部６２３は、撮影情報記録部６１１が記録する各画像に付与されたずれ量に基づいて、各画像の位置を補正して各登録地点（観察箇所）の複数の画像データを時間的に順次繋げたタイムラプス動画を生成する。
【０１８９】
続いて、図１０Ｃに示すように、画像処理部６３２は、各登録地点のタイムラプス動画に対して、全ての画像（で撮像装置３の撮像領域が重なっている領域（図１０Ｃの点線枠領域Ｗ１０）を残すトリミング処理を行って、各登録地点のタイムラプス動画ファイルを作成する（ステップＳ６３３）。例えば、画像処理部６３２は、画像Ａ１と画像Ａ２に対して、撮像装置３の撮像領域が重なっている領域Ｗ１０を残すトリミング処理を行う。ステップＳ６３３の後、顕微鏡システム１ａは、図４のメインルーチンへ戻る。
【０１９０】
以上説明した本発明の実施の形態３によれば、標本の種類に関わらず、熱ドリフトによる標本の指定位置のずれを補正することができる。
【０１９１】
（実施の形態４）
次に、本発明の実施の形態４について説明する。本実施の形態４に係る顕微鏡システムは、上述した実施の形態１と同様の構成を有し、指標としてのマーカーＭ１が不透明な物質が用いられる。すなわち、透過観察の顕微鏡システムである。このため、本実施の形態４に係る顕微鏡システムは、上述した実施の形態１に係る顕微鏡システム１が実行するタイムラプス処理と異なる。従って、以下においては、本実施の形態４に係る顕微鏡システムが実行するタイムラプス処理について説明する。なお、上述した実施の形態４に係る顕微鏡システム１と同一の構成には同一の符号を付して説明を省略する。
【０１９２】
〔タイムラプス処理〕
図１１Ａは、本実施の形態４に係る顕微鏡システム１が実行するタイムラプス処理の概要を示すフローチャートである。図１１Ｂは、本実施の形態４に係る顕微鏡システム１が実行するタイムラプス処理の概要を示すフローチャートである。なお、以下においては、指標としてのマーカーＭ１（不透明物質）が標本ＳＰに付与されているものとする。
【０１９３】
図１１Ａおよび図１１Ｂに示すように、まず、ステージ制御部６２１は、撮影情報記録部６１１が記録する位置情報に基づいて、ステージ駆動部２１２を駆動させることによって、マーカー位置にステージ２１１を移動させる（ステップＳ７０１）。具体的には、ステージ制御部６２１は、撮影情報記録部６１１が記録するマーカーＭ１の登録地点（Ｘｍ０，Ｙｍ０，Ｚｍ０）へステージ２１１を移動させる。
【０１９４】
続いて、焦準制御部６２２は、ＡＦ部２５２から入力されるＡＦ信号に基づいて、焦準部２５の鉛直方向（Ｚ方向）における位置を検出する（ステップＳ７０２）。具体的には、焦準制御部６２２は、ＡＦ部２５２から入力されるＡＦ信号に基づいて、焦準部２５の鉛直方向における位置ΔＺｍ１を検出する。
【０１９５】
その後、焦準制御部６２２は、ＡＦ部２５２から入力されるＡＦ信号に基づいて、焦準駆動部２５３を駆動して焦準部２５を上下方向（Ｚ方向）に移動させることによって、対物レンズ２３の焦点をマーカーＭ１に合焦させるＡＦ処理を実行するために焦準部２５を焦点位置へ移動させる（ステップＳ７０３）。具体的には、焦準制御部６２２は、ＡＦ部２５２から入力されるＡＦ信号に基づいて、焦点位置Ｚｍ１（Ｚｍ１＝Ｚｍ０−ΔＺｍ１）へ焦準部２５を移動させる。
【０１９６】
続いて、撮影制御部６２７は、撮像装置３の視野領域内におけるマーカーＭ１を撮像装置３に撮影させる（ステップＳ７０４）。この場合において、撮影制御部６２７は、撮像装置３が容器Ｄ１内に収容されたマーカーＭ１を撮像して生成したマーキング画像データに対応するマーキング画像（基準画像）に、位置検出部２１３が検出したステージ２１１の位置情報（Ｘｍ０，Ｙｍ０）および焦準部２５の焦点位置の位置情報（Ｚｍ１）を対応付けて撮影情報記録部６１１に記録する。
【０１９７】
その後、ずれ量算出部６２５は、撮像装置３が生成したマーキング画像内におけるマーカーＭ１の画像内座標を算出して記録部６１に記録する（ステップＳ７０５）。具体的には、ずれ量算出部６２５は、撮像装置３が生成したマーキング画像からマーカーＭ１の画像内座標（Ｐｘ１，Ｐｙ１）を算出して記録部６１に記録する。
【０１９８】
続いて、ずれ量算出部６２５は、マーカーＭ１のずれ量を算出する（ステップＳ７０６）。具体的には、ずれ量算出部６２５は、撮像装置３が生成したマーキング画像からマーカーＭ１が移動した移動量（ドリフト量）を算出する。より詳細には、ずれ量算出部６２５は、ピクセル換算におけるマーキング画像上のマーカーＭ１のずれ量（ΔＰｘ１，ΔＰｙ１）を上述した式（１），（２）によって算出する。
【０１９９】
その後、ずれ量算出部６２５は、標本ＳＰ面におけるずれ量を算出する（ステップＳ７０７）。具体的には、ずれ量算出部６２５は、上述したステップＳ７０６で算出したマーキング画像上のずれ量（ピクセル上のずれ量）に基づいて、標本ＳＰ面でのずれ量を算出する。より詳細には、ずれ量算出部６２５は、標本ＳＰ面でのずれ量（ΔＸ１，ΔＹ１）を上述した式（３），（４）によって算出する。
【０２００】
続いて、補正部６２６は、ずれ量算出部６２５が算出したマーカーＭ１のずれ量に基づいて、撮影情報記録部６１１が記録するマーカーＭ１の座標情報を補正する（ステップＳ７０８）。具体的には、補正部６２６は、ずれ量算出部６２５が算出したマーカーＭ１のずれ量に基づいて、撮影情報記録部６１１が記録するマーカーＭ１のＸＹ座標（Ｘｍ０，Ｙｍ０）を補正する。より詳細には、補正部６２６は、ずれ量算出部６２５が算出したマーカーＭ１のずれ量に基づいて、撮影情報記録部６１１が記録するマーカーＭ１のＸＹ座標（Ｘｍ０，Ｙｍ０）を上述した式（５），（６）によって補正する。この場合、補正部６２６は、式（５），（６）によって補正したマーカーＭ１のＸＹ座標（Ｘｍ１，Ｙｍ１）および焦準制御部６２２が検出したマーカーＭ１のＺ座標（Ｚｍ１）それぞれを撮影情報記録部６１１に記録してマーカーＭ１の座標情報を更新する（（Ｘｍ０，Ｙｍ０，Ｚｍ０）→（Ｘｍ１，Ｙｍ１，Ｚｍ１））。
【０２０１】
その後、補正部６２６は、撮影情報記録部６１１が記録するマーカーＭ１の座標情報に基づいて、登録地点の座標情報を補正する（ステップＳ７０９）。具体的には、補正部６２６は、上述したステップＳ７０８で補正したマーカーＭ１の座標情報に基づいて、登録地点（例えば、登録地点Ａ，ＢおよびＣ）の座標情報を補正する。より詳細には、補正部６２６は、上述した式（７）〜（１２）によって登録地点Ａ〜Ｃの座標情報を補正する。
【０２０２】
その後、ステージ制御部６２１は、撮影情報記録部６１１が記録する登録地点へステージ２１１を移動させる（ステップＳ７１０）。例えば、ステージ制御部６２１は、補正部６２６によって補正された登録地点Ａ（Ｘａ１，Ｙａ１，Ｚａ０）へステージ２１１を移動させる。
【０２０３】
続いて、焦準制御部６２２は、ＡＦ部２５２から入力されるＡＦ信号に基づいて、登録地点に対する焦準部２５の鉛直方向（Ｚ方向）における位置を検出する（ステップＳ７１１）。例えば、焦準制御部６２２は、ＡＦ部２５２から入力されるＡＦ信号に基づいて、登録地点Ａに対する焦準部２５の鉛直方向における位置ΔＺａ１を検出する。
【０２０４】
その後、焦準制御部６２２は、ＡＦ部２５２から入力されるＡＦ信号に基づいて、焦準駆動部２５３を駆動して焦準部２５を上下方向（Ｚ方向）に移動させることによって、対物レンズ２３の焦点をマーカーＭ１に合焦させるＡＦ処理を実行するために焦準部２５を焦点位置へ移動させる（ステップＳ７１２）。例えば、焦準制御部６２２は、ＡＦ部２５２から入力されるＡＦ信号に基づいて、登録地点Ａに対する焦点位置Ｚａ１（Ｚａ１＝Ｚａ０−ΔＺａ１）へ焦準部２５を移動させる。
【０２０５】
続いて、撮影制御部６２７は、撮像装置３の視野領域内における標本ＳＰを撮像装置３に撮影させる（ステップＳ７１３）。例えば、撮影制御部６２７は、撮像装置３の視野領域内における標本ＳＰの登録地点Ａを撮影して登録地点Ａの画像データを生成する。
【０２０６】
その後、顕微鏡制御装置６は、撮影情報記録部６１１が記録する撮影情報に基づいて、標本ＳＰに対する全ての登録地点の撮影が終了したか否かを判断する（ステップＳ７１４）。顕微鏡制御装置６が標本ＳＰに対する全ての登録地点の撮影が終了したと判断した場合（ステップＳ７１４：Ｙｅｓ）、顕微鏡システム１は、後述するステップＳ７１５へ移行する。これに対して、顕微鏡制御装置６が標本ＳＰに対する全ての登録地点の撮影が終了していないと判断した場合（ステップＳ７１４：Ｎｏ）、顕微鏡システム１は、上述したステップＳ７１０へ戻る。
【０２０７】
ステップＳ７１５において、顕微鏡制御装置６は、撮影情報記録部６１１が記録する撮影情報に基づいて、標本ＳＰに対する全ての登録地点を撮影してから登録時間が経過したか否かを判断する。顕微鏡制御装置６が標本ＳＰに対する全ての登録地点を撮影してから登録時間が経過したと判断した場合（ステップＳ７１５：Ｙｅｓ）、顕微鏡システム１は、後述するステップＳ７１６へ移行する。これに対して、顕微鏡制御装置６が標本ＳＰに対する全ての登録地点を撮影してから登録時間が経過していないと判断した場合（ステップＳ７１５：Ｎｏ）、顕微鏡システム１は、登録時間が経過するまで、この判断を続ける。
【０２０８】
ステップＳ７１６において、ステージ制御部６２１は、撮影情報記録部６１１が記録するマーカーＭ１の位置情報に基づいて、ステージ駆動部２１２を駆動させることによって、マーカー位置にステージ２１１を移動させる。具体的には、ステージ制御部６２１は、撮影情報記録部６１１が記録するマーカーＭ１の登録地点（Ｘｍ１，Ｙｍ１，Ｚｍ１）へステージ２１１を移動させる。
【０２０９】
続いて、焦準制御部６２２は、ＡＦ部２５２から入力されるＡＦ信号に基づいて、焦準部２５の鉛直方向における位置を検出する（ステップＳ７１７）。具体的には、焦準制御部６２２は、ＡＦ部２５２から入力されるＡＦ信号に基づいて、焦準部２５の鉛直方向における位置ΔＺｍ２を検出する。
【０２１０】
その後、焦準制御部６２２は、ＡＦ部２５２から入力されるＡＦ信号に基づいて、焦準駆動部２５３を駆動して焦準部２５を上下方向（Ｚ方向）に移動させることによって、対物レンズ２３の焦点をマーカーＭ１に合焦させるＡＦ処理を実行するために焦準部２５を焦点位置へ移動させる（ステップＳ７１８）。具体的には、焦準制御部６２２は、ＡＦ部２５２から入力されるＡＦ信号に基づいて、焦点位置Ｚｍ２（Ｚｍ２＝Ｚｍ１−ΔＺｍ２）へ焦準部２５を移動させる。
【０２１１】
続いて、撮影制御部６２７は、撮像装置３の視野領域内におけるマーカーＭ１を撮像装置３に撮影させる（ステップＳ７１９）。この場合において、撮影制御部６２７は、撮像装置３が容器Ｄ１内に収容されたマーカーＭ１を撮像して生成したマーキング画像データに対応するマーキング画像（基準画像）に、位置検出部２１３が検出したステージ２１１の位置情報（Ｘｍ１，Ｙｍ１）および焦準部２５の焦点位置の位置情報（Ｚｍ２）を対応付けて撮影情報記録部６１１に記録する。
【０２１２】
その後、ずれ量算出部６２５は、撮像装置３が生成したマーキング画像内におけるマーカーＭ１の画像内座標を算出して撮影情報記録部６１１に記録する（ステップＳ７２０）。具体的には、ずれ量算出部６２５は、撮像装置３が生成したマーキング画像からマーカーＭ１の画像内座標（Ｐｘ２，Ｐｙ２）を算出して記録部６１に記録する。
【０２１３】
続いて、ずれ量算出部６２５は、マーカーＭ１のずれ量を算出する（ステップＳ７２１）。具体的には、ずれ量算出部６２５は、撮像装置３が生成したマーキング画像からマーカーＭ１が移動した移動量（ドリフト量）を算出する。より詳細には、ずれ量算出部６２５は、ピクセル換算におけるマーキング画像上のマーカーＭ１のずれ量（ΔＰｘ２，ΔＰｙ２）を上述した式（１３），（１４）によって算出する。
【０２１４】
その後、ずれ量算出部６２５は、標本ＳＰ面におけるずれ量を算出する（ステップＳ７２４）。具体的には、ずれ量算出部６２５は、上述したステップＳ７２１で算出したマーキング画像上のずれ量（ピクセル上のずれ量）に基づいて、標本ＳＰ面でのずれ量を算出する。より詳細には、ずれ量算出部６２５は、標本ＳＰ面でのずれ量（ΔＸ２，ΔＹ２）を上述した式（１５），（１６）によって算出する。
【０２１５】
その後、補正部６２６は、ずれ量算出部６２５が算出したマーカーＭ１のずれ量に基づいて、撮影情報記録部６１１が記録するマーカーＭ１の座標情報を補正する（ステップＳ７２４）。具体的には、補正部６２６は、ずれ量算出部６２５が算出したマーカーＭ１のずれ量に基づいて、撮影情報記録部６１１が記録するマーカーＭ１のＸＹ座標（Ｘｍ２，Ｙｍ２）を補正する。より詳細には、補正部６２６は、ずれ量算出部６２５が算出したマーカーＭ１のずれ量に基づいて、撮影情報記録部６１１が記録するマーカーＭ１のＸＹ座標（Ｘｍ２，Ｙｍ２）を上述した式（１７），（１８）によって補正する。この場合、補正部６２６は、式（１７），（１８）によって補正したマーカーＭ１のＸＹ座標（Ｘｍ２，Ｙｍ２）および焦準制御部６２２が検出したマーカーＭ１のＺ座標（Ｚｍ２）それぞれを撮影情報記録部６１１に記録してマーカーＭ１の座標情報を更新する（（Ｘｍ１，Ｙｍ１，Ｚｍ１）→（Ｘｍ２，Ｙｍ２，Ｚｍ２））。
【０２１６】
続いて、補正部６２６は、撮影情報記録部６１１が記録するマーカーＭ１の座標情報に基づいて、登録地点の座標情報を補正する（ステップＳ７２５）。具体的には、補正部６２６は、上述したステップＳ７２４で補正したマーカーＭ１の座標情報に基づいて、登録地点（例えば、登録地点Ａ，ＢおよびＣ）の座標情報を補正する。より詳細には、補正部６２６は、上述した式（１９）〜（２４）によって登録地点Ａ〜Ｃの座標情報を補正する。
【０２１７】
その後、ステージ制御部６２１は、撮影情報記録部６１１が記録する登録地点へステージ２１１を移動させる（ステップＳ７２５）。例えば、ステージ制御部６２１は、補正部６２６によって補正された登録地点Ａ（Ｘａ２，Ｙａ２，Ｚａ１）へステージ２１１を移動させる。
【０２１８】
続いて、焦準制御部６２２は、ＡＦ部２５２から入力されるＡＦ信号に基づいて、登録地点に対する焦準部２５の鉛直方向（Ｚ方向）における位置を検出する（ステップＳ７２６）。例えば、焦準制御部６２２は、ＡＦ部２５２から入力されるＡＦ信号に基づいて、登録地点Ａに対する焦準部２５の鉛直方向における位置ΔＺａ２を検出する。
【０２１９】
その後、焦準制御部６２２は、ＡＦ部２５２から入力されるＡＦ信号に基づいて、焦準駆動部２５３を駆動して焦準部２５を上下方向（Ｚ方向）に移動させることによって、対物レンズ２３の焦点をマーカーＭ１に合焦させるＡＦ処理を実行するために焦準部２５を焦点位置へ移動させる（ステップＳ７２７）。例えば、焦準制御部６２２は、ＡＦ部２５２から入力されるＡＦ信号に基づいて、登録地点Ａに対する焦点位置Ｚａ２（Ｚａ２＝Ｚａ１−ΔＺａ２）へ焦準部２５を移動させる。
【０２２０】
その後、撮影制御部６２７は、撮像装置３の視野領域内における標本ＳＰを撮像装置３に撮影させる（ステップＳ７２８）。例えば、撮影制御部６２７は、撮像装置３の視野領域内における標本ＳＰの登録地点Ａを撮影して登録地点Ａの画像データを生成する。
【０２２１】
続いて、顕微鏡制御装置６は、撮影情報記録部６１１が記録する撮影情報に基づいて、標本ＳＰに対する全ての登録地点の撮影が終了したか否かを判断する（ステップＳ７２９）。顕微鏡制御装置６が標本ＳＰに対する全ての登録地点の撮影が終了したと判断した場合（ステップＳ７２９：Ｙｅｓ）、顕微鏡システム１は、後述するステップＳ７３０へ移行する。これに対して、顕微鏡制御装置６が標本ＳＰに対する全ての登録地点の撮影が終了していないと判断した場合（ステップＳ７２９：Ｎｏ）、顕微鏡システム１は、上述したステップＳ７２５へ戻る。
【０２２２】
ステップＳ７２９において、顕微鏡制御装置６は、撮影情報記録部６１１が記録する撮影情報に基づいて、標本ＳＰに対する全ての登録地点を撮影してから登録時間が経過したか否かを判断する。顕微鏡制御装置６が標本ＳＰに対する全ての登録地点を撮影してから登録時間が経過したと判断した場合（ステップＳ７３０：Ｙｅｓ）、顕微鏡システム１は、後述するステップＳ７３１へ移行する。これに対して、顕微鏡制御装置６が標本ＳＰに対する全ての登録地点を撮影してから登録時間が経過していないと判断した場合（ステップＳ７３０：Ｎｏ）、顕微鏡システム１は、登録時間が経過するまで、この判断を続ける。
【０２２３】
ステップＳ７３１において、顕微鏡制御装置６は、撮影情報記録部６１１が記録する撮影情報に基づいて、標本ＳＰに対する全ての登録地点を撮影する指定サイクルが終了したか否かを判断する。顕微鏡制御装置６が標本ＳＰに対する全ての登録地点を撮影する指定サイクルが終了したと判断した場合（ステップＳ７３１：Ｙｅｓ）、顕微鏡システム１は、後述するステップＳ７へ移行する。これに対して、顕微鏡制御装置６が標本ＳＰに対する全ての登録地点を撮影する指定サイクルが終了していないと判断した場合（ステップＳ７３１：Ｎｏ）、顕微鏡システム１は、上述したステップＳ７１６へ戻る。
【０２２４】
ステップＳ７３２において、画像処理部６２３は、記録部６１が記録する複数の画像データを時間的に順次繋げたタイムラプス動画を標本ＳＰの指定位置毎に生成して記録部６１に記録する。ステップＳ７３２の後、顕微鏡システム１は、図４のメインルーチンへ戻る。
【０２２５】
以上説明した本実施の形態４では、ミラーターレット２７の切り替えの処理を省略することができるので、タイムラプス処理の処理時間を短縮することができる。
【０２２６】
さらに、本実施の形態４では、標本の種類に関わらず、簡易な構成で、熱ドリフトによる標本の指定位置のずれを正確に補正することができる。
【０２２７】
（変形例１）
次に、本発明の実施の形態１〜４に係る変形例１について説明する。上述した実施の形態１〜３では、容器Ｄ１にマーカーＭ１を設けていたが、本実施の形態に係る変形例１では、標本ＳＰを載置する載置面にマーキングを設ける。
【０２２８】
図１２は、本実施の形態の変形例１に係るステージの構成を示す上面図である。図１２に示すステージ２１１ａは、対物レンズ２３の干渉回避範囲内に、開口部Ｒ１０と、透明なシート部Ｍ２が形成されている。シート部Ｍ２上には、マーカーＭ１が設けられている。
【０２２９】
以上説明した本実施の形態の変形例１によれば、容器Ｄ１で保持できない大型な標本ＳＰのタイムラプス観察を行う場合であっても、顕微鏡装置２の熱ドリフトを補正することができる。
【０２３０】
（変形例２）
次に、本発明の実施の形態に係る変形例２について説明する。上述した実施の形態１〜３では、マーカーＭ１が１箇所であったが、本実施の形態に係る変形例２では、マーカーＭ１を同一平面内に複数設けた。
【０２３１】
図１３は、本実施の形態の変形例２に係る標本を収容する容器の上面図である。図１３に示す容器Ｄ１０には、複数のマーカーＭ１ａ、マーカーＭ１ｂおよびマーカーＭ１ｃが同一平面上に設けられている。この場合において、上述したタイムラプス観察を行う処理において、マーカーＭ１を撮影するステップで全てのマーカーＭ１ａ〜マーカーＭ１ｃそれぞれを順次撮影して各マーキング画像を生成し、各マーキング画像と位置検出部２１３が各マーカーＭ１ａ〜Ｍ１ｃで検出した位置情報とを対応付けて記録部６１に記録する。ずれ量算出部６２５は、記録部６１が記録する各マーキング画像に対応する基準画像内のＭ１ａ〜Ｍ１ｃと、記録部６１が記録する最新の各マーキングに対応する現材画像内におけるＭ１ａ〜Ｍ１ｃとに基づいて、容器Ｄ１０内のドリフト量分布を算出する。
【０２３２】
具体的には、図１４に示すように、撮影情報設定部６２４が設定したマーカーＭ１ａ、マーカーＭ１ｂおよびマーカーＭ１ｃそれぞれの指定位置を（ａ，ｂ）、（ａ＋１，ｂ）、（ａ，ｂ−１）および標本ＳＰの指定位置を（ａ＋１，ｂ−０．５）とした場合において、ずれ量算出部６２５が算出したマーカーＭ１ａおよびマーカーＭ１ｂのドリフト量が（−０．１，−０．１）で、マーカーＭ１ｃのドリフト量が（−０．１，−０．２）であるとき、容器Ｄ１０内では、Ｘ方向が一様に−０．１ドットだけドリフトしている。さらに、容器Ｄ１０内では、Ｙ方向がマーカーＭ１ｂからマーカーＭ１ｃまでの距離でドリフト量が−０．１から０．２になっている。これにより、ドリフト量ｄｙ＝０．１×（Ｙ−ｂ）−０．１で分布していることがわかる。この結果、標本ＳＰの指定位置（ａ＋１，ｂ−０．５）では、ずれ量算出部６２５は、ドリフト量を（−０．１．０．１５）として算出する。
【０２３３】
以上説明した本発明の実施の形態に係る変形例２によれば、複数のマーカーＭ１ａ〜Ｍ１ｃを標本ＳＰが載置される同一平面内に複数設けたので、熱ドリフトによる標本の指定位置のずれをより正確に補正することができる。
【０２３４】
（変形例３）
次に、本発明の実施の形態に係る変形例３について説明する。図１５Ａは、本実施の形態に係る変形例３に係る標本を収容する容器中に固定された同心円形状のマーカーを示す図である。図１５Ｂは、本発明の実施の形態１〜４の変形例３に係る標本を収容する容器の中に固定された、径の大きさが異なる円形状のマーカーを示す図である。
【０２３５】
図１５Ａに示すように、容器Ｄ２０には、複数のマーカーＭ１０〜Ｍ１３が互いに径の大きさが異なる同心円の形状に形成されて設けられている。これにより、対物レンズ２３の倍率毎に複数のマーカーＭ１０〜Ｍ１３のうち、最適なマーカーを適用可能とすることができる。
【０２３６】
また、図１５Ｂに示すように、容器Ｄ２０には、互いに径の大きさが異なる複数のマーカーＭ１４〜Ｍ１８が設けられている。これにより、対物レンズ２３の倍率に合わせて、複数のマーカーＭ１０〜Ｍ１８のうち、最適なマーカーを適用することができる。
【０２３７】
以上説明した本発明の実施の形態に係る変形例３によれば、対物レンズ２３の倍率に適したマーカーＭ１０〜Ｍ１３で標本ＳＰの指定位置を補正することができる。
【０２３８】
（その他の実施の形態）
本発明では、顕微鏡装置、撮像装置、表示部、入力部および顕微鏡制御装置を備えた顕微鏡システムを例に説明したが、たとえば標本を拡大する対物レンズ、対物レンズを介して標本を撮像する撮像機能、および画像を表示する表示機能を備えた撮像装置、たとえばビデオマイクロスコープ等であっても、本発明を適用することができる。
【０２３９】
また、本発明では、マーカーとして、蛍光物質を例に説明したが、たとえば透過観察が可能なものであってもよい。この場合において、顕微鏡システムでは、マーカーを透過観察で撮像し、標本を蛍光観察で撮像すればよい。このとき、顕微鏡制御装置は、マーカーと標本との撮影の前後でミラーターレットを回転させることによって、照明の切り換えを行う。
【０２４０】
また、本発明では、顕微鏡装置として倒立型顕微鏡装置を例に説明したが、たとえば正立型顕微鏡装置であっても本発明を適用することができる。さらに、顕微鏡装置を組み込んだライン装置といった各種システムにも、本発明を適用することができる。
【０２４１】
また、本発明では、表示部、入力部および顕微鏡制御装置が別々に構成されていたが、たとえば表示部、入力部および顕微鏡制御装置が一体的に形成された携帯型端末であってもよい。
【０２４２】
なお、本明細書におけるフローチャートの説明では、「まず」、「その後」、「続いて」等の表現を用いてステップ間の処理の前後関係を明示していたが、本発明を実施するために必要な処理の順序は、それらの表現によって一意的に定められるわけではない。すなわち、本明細書で記載したフローチャートにおける処理の順序は、矛盾のない範囲で変更することができる。
【０２４３】
このように、本発明は、ここでは記載していない様々な実施の形態を含みうるものであり、特許請求の範囲によって特定される技術的思想の範囲内で種々の設計変更等を行うことが可能である。
【符号の説明】
【０２４４】
１，１ａ  顕微鏡システム
２  顕微鏡装置
３  撮像装置
４  入力部
５  表示部
６，６ａ  顕微鏡制御装置
２０  本体部
２１  ステージ機構
２２  透過照明部
２３  対物レンズ
２４  レボルバ
２５  焦準部
２６  落射光源部
２７  ミラーターレット
２８  観察光学系
２９  鏡筒部
６１  記録部
６２，６２ａ  制御部
２１１，２１１ａ  ステージ
２１２  ステージ駆動部
２１３  位置検出部
６１１  撮影情報記録部
６２１  ステージ制御部
６２２  焦準制御部
６２３  画像処理部
６２４  撮影情報設定部
６２５  ずれ量算出部
６２６，６２６ａ  補正部
６２７  撮影制御部
６２８  表示制御部
Ｄ１，Ｄ１０，Ｄ２０  容器
Ｍ１，Ｍ１０，Ｍ１ａ、Ｍ１ｂ，Ｍ１ｃ  マーキング
ＳＰ  標本
【図１】
2016009163.tif 000003
【図２】
2016009163.tif 000004
【図３】
2016009163.tif 000005
【図４】
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【図５】
2016009163.tif 000007
【図６Ａ】
2016009163.tif 000008
【図６Ｂ】
2016009163.tif 000009
【図６Ｃ】
2016009163.tif 000010
【図６Ｄ】
2016009163.tif 000011
【図７】
2016009163.tif 000012
【図８Ａ】
2016009163.tif 000013
【図８Ｂ】
2016009163.tif 000014
【図８Ｃ】
2016009163.tif 000015
【図９】
2016009163.tif 000016
【図１０Ａ】
2016009163.tif 000017
【図１０Ｂ】
2016009163.tif 000018
【図１０Ｃ】
2016009163.tif 000019
【図１１Ａ】
2016009163.tif 000020
【図１１Ｂ】
2016009163.tif 000021
【図１２】
2016009163.tif 000022
【図１３】
2016009163.tif 000023
【図１４】
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【図１５Ａ】
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【図１５Ｂ】
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