(57)【要約】【課題】複数種類の糖尿病治療薬の中から患者に有効な治療薬を、患者毎の遺伝的背景に基づいて適切に判定する方法を提供する。【解決手段】被験者の遺伝子多型情報および臨床データを取得するステップ（Ｓ１）と、取得した遺伝子多型情報内に特定の遺伝子多型が存在するか否かを識別するステップ（Ｓ２）と、特定の遺伝子多型の存在の有無の情報および臨床データに基づいて、治療薬の有効性を判定するステップ（Ｓ４）とを含む。判定には、予め重回帰分析によって決定された回帰式を用いて、被験者の血中HbA1c値の推定降下度と、標準患者の血中HbA1c値の推定降下度とを計算し、被験者の推定降下度が標準患者の推定降下度よりも大きい場合に、治療薬が有効であると判定する。【選択図】図１
2016067323.tif 000002
【特許請求の範囲】
【請求項１】
演算部と記録部とを備える装置において、糖尿病治療薬の有効性を判定する方法であって、
前記記録部が、取得した被験者の遺伝子多型情報および臨床データを記録するステップと、
前記演算部が、取得した前記遺伝子多型情報内に特定の遺伝子多型が存在するか否かを識別するステップと、
前記演算部が、前記特定の遺伝子多型の存在の有無の情報および前記臨床データに基づいて、糖尿病治療薬の有効性を判定するステップと、
を含み、
前記糖尿病治療薬と前記特定の遺伝子多型との組み合わせが、
前記糖尿病治療薬がαグルコシダーゼ阻害剤（α−ＧＩ）であり、前記特定の遺伝子多型がMTRの2756Aアレルと CCR5の59029AAとを含む第１の組み合わせ、
前記糖尿病治療薬がビグアナイド剤（ＢＧ薬）であり、前記特定の遺伝子多型がALDH2の42421GGと ITGB2の1323TTと AKR1B10の-106TTとを含む第２の組み合わせ、
前記糖尿病治療薬がグリニド剤であり、前記特定の遺伝子多型がVWFの-1051GGと ALDH2の42421GGとを含む第３の組み合わせ、
前記糖尿病治療薬がインスリン製剤であり、前記特定の遺伝子多型がTHPOの5713Aアレルと CCR5の59029GGと IL10の-819TTとを含む第４の組み合わせ、
前記糖尿病治療薬がピオグリタゾン剤であり、前記特定の遺伝子多型がCCL5の-28Gアレルを含む第５の組み合わせ、または、
前記糖尿病治療薬がスルホニルウレア剤（ＳＵ薬）であり、前記特定の遺伝子多型がIL18の4383AAと MTHFRの677Cアレルとを含む第６の組み合わせ、
のいずれかである、判定方法。
【請求項２】
前記演算部が、前記判定するステップにおいて、予め重回帰分析によって決定された回帰式を用いて、前記被験者の血中HbA1c値の推定降下度と、標準患者の血中HbA1c値の推定降下度とを計算し、前記被験者の血中HbA1c値の前記推定降下度が、前記標準患者の血中HbA1c値の前記推定降下度よりも大きい場合に、前記糖尿病治療薬が有効であると判定し、
前記回帰式が、血中HbA1c値の変化量dHbA1cを目的変数とし、前記特定の遺伝子多型の前記存在の有無の情報を説明変数として、糖尿病患者データの集合を重回帰分析して得られた式であり、
前記回帰式中の前記特定の遺伝子多型の前記存在の有無の情報が、前記被験者の血中HbA1c値の前記推定降下度を計算する場合には、０または１の値であり、前記標準患者の血中HbA1c値の前記推定降下度を計算する場合には、前記標準患者が前記特定の遺伝子多型を保有している割合を意味する０から１までの間の実数値である、請求項１に記載の判定方法。
【請求項３】
前記臨床データが、前記被験者の前記糖尿病治療薬の投与経過の情報を含み、
前記投与経過の情報内に前記糖尿病治療薬の服用歴が無く、かつ、前記糖尿病治療薬が有効であると判定されている場合に、前記糖尿病治療薬を前記被験者に投与すると判定し、
前記投与経過の情報内に前記糖尿病治療薬の服用歴が有り、かつ、前記糖尿病治療薬が有効ではないと判定されている場合に、前記糖尿病治療薬を前記被験者に投与しないと判定する、請求項２に記載の判定方法。
【請求項４】
前記糖尿病治療薬と前記特定の遺伝子多型との組み合わせが前記第１の組み合わせであり、前記回帰式が、
dHbA1c＝ａ１×[MTR_2756A_Allele]＋ｂ１×[CCR5_59029AA]＋ｃ１
の形式で表され、ここで、定数ａ１、ｂ１、ｃ１は、前記重回帰分析により決定される偏回帰係数であり、[MTR_2756A_Allele]はMTRの2756Aアレルの有無に関する情報であり、[CCR5_59029AA]はCCR5の59029AAの有無に関する情報である、請求項２に記載の判定方法。
【請求項５】
前記糖尿病治療薬と前記特定の遺伝子多型との組み合わせが前記第２の組み合わせであり、前記回帰式が、
dHbA1c＝ａ２×[ALDH2_42421GG]＋ｂ２×[ITGB2_1323TT]＋ｃ２×[AKR1B10_-106TT]＋ｄ２
の形式で表され、ここで、定数ａ２、ｂ２、ｃ２、ｄ２は、前記重回帰分析により決定される偏回帰係数であり、[ALDH2_42421GG]はALDH2の42421GGの有無に関する情報であり、[ITGB2_1323TT]はITGB2の1323TTの有無に関する情報であり、[AKR1B10_-106TT]はAKR1B10の-106TTの有無に関する情報である、請求項２に記載の判定方法。
【請求項６】
前記糖尿病治療薬と前記特定の遺伝子多型との組み合わせが前記第３の組み合わせであり、前記回帰式が、
dHbA1c＝ａ３×[VWF_-1051GG]＋ｂ３×[ALDH2_42421GG]＋ｃ３
の形式で表され、ここで、定数ａ３、ｂ３、ｃ３は、前記重回帰分析により決定される偏回帰係数であり、[VWF_-1051GG]はVWFの-1051GGの有無に関する情報であり、[ALDH2_42421GG]はALDH2の42421GGの有無に関する情報である、請求項２に記載の判定方法。
【請求項７】
前記糖尿病治療薬と前記特定の遺伝子多型との組み合わせが前記第４の組み合わせであり、前記回帰式が、
dHbA1c＝ａ４×[THPO_5713A_Allele]＋ｂ４×[CCR5_59029GG]＋ｃ４×[IL10_-819TT]＋ｄ４
の形式で表され、ここで、定数ａ４、ｂ４、ｃ４、ｄ４は、前記重回帰分析により決定される偏回帰係数であり、[THPO_5713A_Allele]はTHPOの5713Aアレルの有無に関する情報であり、[CCR5_59029GG]はCCR5の59029GGの有無に関する情報であり、[IL10_-819TT]はIL10の-819TTの有無に関する情報である、請求項２に記載の判定方法。
【請求項８】
前記糖尿病治療薬と前記特定の遺伝子多型との組み合わせが前記第５の組み合わせであり、前記回帰式が、
dHbA1c＝ａ５×[CCL5_-28G Allele]＋ｂ５
の形式で表され、ここで、定数ａ５、ｂ５は、前記重回帰分析により決定される偏回帰係数であり、[CCL5_-28G Allele]はCCL5の-28Gアレルの有無に関する情報である、請求項２に記載の判定方法。
【請求項９】
前記糖尿病治療薬と前記特定の遺伝子多型との組み合わせが前記第６の組み合わせであり、前記回帰式が、
dHbA1c＝ａ６×[IL18_4383AA]＋ｂ６×[MTHFR_677C_Allele]＋ｃ６
の形式で表され、ここで、定数ａ６、ｂ６、ｃ６、ｄ６は、前記重回帰分析により決定される偏回帰係数であり、[IL18_4383AA]はIL18の4383AAの有無に関する情報であり、[MTHFR_677C_Allele]はMTHFRの677Cアレルの有無に関する情報である、請求項２に記載の判定方法。
【請求項１０】
演算部と記録部とを備え、糖尿病治療薬の有効性を判定する装置であって、
前記記録部が、取得した被験者の遺伝子多型情報および臨床データを記録し、
前記演算部が、取得した前記遺伝子多型情報内に特定の遺伝子多型が存在するか否かを識別し、
前記演算部が、前記特定の遺伝子多型の存在の有無の情報および前記臨床データに基づいて、糖尿病治療薬の有効性を判定し、
前記糖尿病治療薬と前記特定の遺伝子多型との組み合わせが、
前記糖尿病治療薬がαグルコシダーゼ阻害剤（α−ＧＩ）であり、前記特定の遺伝子多型がMTRの2756Aアレルと CCR5の59029AAとを含む第１の組み合わせ、
前記糖尿病治療薬がビグアナイド剤（ＢＧ薬）であり、前記特定の遺伝子多型がALDH2の42421GGと ITGB2の1323TTと AKR1B10の-106TTとを含む第２の組み合わせ、
前記糖尿病治療薬がグリニド剤であり、前記特定の遺伝子多型がVWFの-1051GGと ALDH2の42421GGとを含む第３の組み合わせ、
前記糖尿病治療薬がインスリン製剤であり、前記特定の遺伝子多型がTHPOの5713Aアレルと CCR5の59029GGと IL10の-819TTとを含む第４の組み合わせ、
前記糖尿病治療薬がピオグリタゾン剤であり、前記特定の遺伝子多型がCCL5の-28Gアレルを含む第５の組み合わせ、または、
前記糖尿病治療薬がスルホニルウレア剤（ＳＵ薬）であり、前記特定の遺伝子多型がIL18の4383AAと MTHFRの677Cアレルとを含む第６の組み合わせ、
のいずれかである、判定装置。
【請求項１１】
糖尿病治療薬の有効性を判定するプログラムであって、
コンピュータに、
取得した被験者の遺伝子多型情報および臨床データを記録する機能と、
取得した前記遺伝子多型情報内に特定の遺伝子多型が存在するか否かを識別する機能と、
前記特定の遺伝子多型の存在の有無の情報および前記臨床データに基づいて、糖尿病治療薬の有効性を判定する機能と、
を実現させ、
前記糖尿病治療薬と前記特定の遺伝子多型との組み合わせが、
前記糖尿病治療薬がαグルコシダーゼ阻害剤（α−ＧＩ）であり、前記特定の遺伝子多型がMTRの2756Aアレルと CCR5の59029AAとを含む第１の組み合わせ、
前記糖尿病治療薬がビグアナイド剤（ＢＧ薬）であり、前記特定の遺伝子多型がALDH2の42421GGと ITGB2の1323TTと AKR1B10の-106TTとを含む第２の組み合わせ、
前記糖尿病治療薬がグリニド剤であり、前記特定の遺伝子多型がVWFの-1051GGと ALDH2の42421GGとを含む第３の組み合わせ、
前記糖尿病治療薬がインスリン製剤であり、前記特定の遺伝子多型がTHPOの5713Aアレルと CCR5の59029GGと IL10の-819TTとを含む第４の組み合わせ、
前記糖尿病治療薬がピオグリタゾン剤であり、前記特定の遺伝子多型がCCL5の-28Gアレルを含む第５の組み合わせ、または、
前記糖尿病治療薬がスルホニルウレア剤（ＳＵ薬）であり、前記特定の遺伝子多型がIL18の4383AAと MTHFRの677Cアレルとを含む第６の組み合わせ、
のいずれかである、判定プログラム。
【請求項１２】
糖尿病治療薬の有効性を判定するプログラムを記録したコンピュータ読み取り可能な記録媒体であって、
コンピュータに、
取得した被験者の遺伝子多型情報および臨床データを記録する機能と、
取得した前記遺伝子多型情報内に特定の遺伝子多型が存在するか否かを識別する機能と、
前記特定の遺伝子多型の存在の有無の情報および前記臨床データに基づいて、糖尿病治療薬の有効性を判定する機能と、
を実現させ、
前記糖尿病治療薬と前記特定の遺伝子多型との組み合わせが、
前記糖尿病治療薬がαグルコシダーゼ阻害剤（α−ＧＩ）であり、前記特定の遺伝子多型がMTRの2756Aアレルと CCR5の59029AAとを含む第１の組み合わせ、
前記糖尿病治療薬がビグアナイド剤（ＢＧ薬）であり、前記特定の遺伝子多型がALDH2の42421GGと ITGB2の1323TTと AKR1B10の-106TTとを含む第２の組み合わせ、
前記糖尿病治療薬がグリニド剤であり、前記特定の遺伝子多型がVWFの-1051GGと ALDH2の42421GGとを含む第３の組み合わせ、
前記糖尿病治療薬がインスリン製剤であり、前記特定の遺伝子多型がTHPOの5713Aアレルと CCR5の59029GGと IL10の-819TTとを含む第４の組み合わせ、
前記糖尿病治療薬がピオグリタゾン剤であり、前記特定の遺伝子多型がCCL5の-28Gアレルを含む第５の組み合わせ、または、
前記糖尿病治療薬がスルホニルウレア剤（ＳＵ薬）であり、前記特定の遺伝子多型がIL18の4383AAと MTHFRの677Cアレルとを含む第６の組み合わせ、
のいずれかである、判定プログラムを記録したコンピュータ読み取り可能な記録媒体。
【請求項１３】
糖尿病治療薬の有効性を判定する方法であって、
被験者の遺伝子多型情報および臨床データを取得するステップと、
取得した前記遺伝子多型情報内に特定の遺伝子多型が存在するか否かを識別するステップと、
前記特定の遺伝子多型の存在の有無の情報および前記臨床データに基づいて、糖尿病治療薬の有効性を判定するステップと、
を含み、
前記糖尿病治療薬と前記特定の遺伝子多型との組み合わせが、
前記糖尿病治療薬がαグルコシダーゼ阻害剤（α−ＧＩ）であり、前記特定の遺伝子多型がMTRの2756Aアレルと CCR5の59029AAとを含む第１の組み合わせ、
前記糖尿病治療薬がビグアナイド剤（ＢＧ薬）であり、前記特定の遺伝子多型がALDH2の42421GGと ITGB2の1323TTと AKR1B10の-106TTとを含む第２の組み合わせ、
前記糖尿病治療薬がグリニド剤であり、前記特定の遺伝子多型がVWFの-1051GGと ALDH2の42421GGとを含む第３の組み合わせ、
前記糖尿病治療薬がインスリン製剤であり、前記特定の遺伝子多型がTHPOの5713Aアレルと CCR5の59029GGと IL10の-819TTとを含む第４の組み合わせ、
前記糖尿病治療薬がピオグリタゾン剤であり、前記特定の遺伝子多型がCCL5の-28Gアレルを含む第５の組み合わせ、または、
前記糖尿病治療薬がスルホニルウレア剤（ＳＵ薬）であり、前記特定の遺伝子多型がIL18の4383AAと MTHFRの677Cアレルとを含む第６の組み合わせ、
のいずれかである、判定方法。
【請求項１４】
糖尿病治療薬の有効性を判定する装置であって、
取得した被験者の遺伝子多型情報および臨床データを記録する手段と、
取得した前記遺伝子多型情報内に特定の遺伝子多型が存在するか否かを識別する手段と、
前記特定の遺伝子多型の存在の有無の情報および前記臨床データに基づいて、糖尿病治療薬の有効性を判定する手段と、
を備え、
前記糖尿病治療薬と前記特定の遺伝子多型との組み合わせが、
前記糖尿病治療薬がαグルコシダーゼ阻害剤（α−ＧＩ）であり、前記特定の遺伝子多型がMTRの2756Aアレルと CCR5の59029AAとを含む第１の組み合わせ、
前記糖尿病治療薬がビグアナイド剤（ＢＧ薬）であり、前記特定の遺伝子多型がALDH2の42421GGと ITGB2の1323TTと AKR1B10の-106TTとを含む第２の組み合わせ、
前記糖尿病治療薬がグリニド剤であり、前記特定の遺伝子多型がVWFの-1051GGと ALDH2の42421GGとを含む第３の組み合わせ、
前記糖尿病治療薬がインスリン製剤であり、前記特定の遺伝子多型がTHPOの5713Aアレルと CCR5の59029GGと IL10の-819TTとを含む第４の組み合わせ、
前記糖尿病治療薬がピオグリタゾン剤であり、前記特定の遺伝子多型がCCL5の-28Gアレルを含む第５の組み合わせ、または、
前記糖尿病治療薬がスルホニルウレア剤（ＳＵ薬）であり、前記特定の遺伝子多型がIL18の4383AAと MTHFRの677Cアレルとを含む第６の組み合わせ、
のいずれかである、判定装置。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
本発明は、糖尿病治療薬の有効性を判定する方法に関し、より詳細には、糖尿病患者毎の遺伝情報に基づいて、複数種類の糖尿病治療薬の中から患者に有効な治療薬を判定する方法に関する。
【背景技術】
【０００２】
従来から、ある疾患に対して薬物治療を行ううえで、あるひとつの薬剤が、同じ疾患を有するすべての患者に対して同様に作用するわけではないことが知られている。これを受けて、近年では、患者の遺伝的特徴に合わせて最も効率的な薬物投与を行うという、ゲノム薬理学およびオーダーメード医療の機運が高まっている。ゲノム薬理学によると、薬剤の効果が有効に作用するか否かは、患者自身が有する遺伝的背景に基づいて決まると考えられている。このようなゲノム薬理学の機運の高まりを受けて、今後は、それぞれの患者を薬剤に対するレスポンダとノンレスポンダとに識別することにより、それぞれの患者に応じた最適な薬剤の投与判定および投与計画を行うことが期待されている。
【０００３】
下記特許文献１には、薬剤の選択方法が開示されている。特許文献１の選択方法によると、前立腺肥大症患者ごとの遺伝的背景に基づいて、複数の交感神経遮断薬の中から、患者に応じた最適な薬剤を選択することができる。
【先行技術文献】
【特許文献】
【０００４】
【特許文献１】特開２００８−００５７８５号公報
【発明の概要】
【発明が解決しようとする課題】
【０００５】
このように、患者の遺伝的背景に基づいた薬剤選択の機運が高まっており、上記特許文献１に示されるように、一部の疾患については薬剤選択の方法が提案されている。しかしながら、種々の疾患のうち、近年の生活習慣病の増加により患者数も増大している糖尿病については、薬剤の治療効果と遺伝因子との関連性について、未だ十分に報告がなされていないのが実情である。
【０００６】
患者が糖尿病治療薬の服用を始めても、糖尿病の状態が改善しない場合には、複数種類の治療薬を併用して服用する必要がある。しかしながら、糖尿病治療薬は、かつてはスルホニルウレア剤（ＳＵ薬）しか存在しなかったところ、近年は糖尿病治療薬の種類が増加したため、一度でも患者が複数種類の治療薬の服用を始めてしまうと、どの治療薬による効果であるのかがわかりにくくなっていた。このため、糖尿病の患者の多くは、依然として複数種類の糖尿病治療薬を服用しており、治療薬毎に服用のタイミングが異なる点や、費用の点において、患者に多くの負担を強いていた。
【０００７】
本発明は、上記課題を解決するためになされたものであり、その目的は、複数種類の糖尿病治療薬の中から患者に有効な治療薬を、患者毎の遺伝的背景に基づいて適切に判定することにある。
【課題を解決するための手段】
【０００８】
本発明者は、上記目的を達成するために鋭意検討を進めていたところ、特定の糖尿病治療薬について、糖尿病判定の指標である血中HbA1c値に有意に関連を示す特定の遺伝子多型を見出した。
【０００９】
また、本発明者は、この知見をもとに、糖尿病患者のこのような特定の遺伝子多型の有無により、治療薬の服用後所定の期間経過後の血中HbA1cの降下度の推定が可能であることを見出し、推定に用いる回帰式を見出した。
【００１０】
すなわち、本発明は、以下に示す態様を含むものである。
【００１１】
本発明に係る第１の判定方法は、
演算部と記録部とを備える装置において、糖尿病治療薬の有効性を判定する方法であって、
前記記録部が、取得した被験者の遺伝子多型情報および臨床データを記録するステップと、
前記演算部が、取得した前記遺伝子多型情報内に特定の遺伝子多型が存在するか否かを識別するステップと、
前記演算部が、前記特定の遺伝子多型の存在の有無の情報および前記臨床データに基づいて、糖尿病治療薬の有効性を判定するステップと、
を含み、
前記糖尿病治療薬と前記特定の遺伝子多型との組み合わせが、
前記糖尿病治療薬がαグルコシダーゼ阻害剤（α−ＧＩ）であり、前記特定の遺伝子多型がMTRの2756Aアレルと CCR5の59029AAとを含む第１の組み合わせ、
前記糖尿病治療薬がビグアナイド剤（ＢＧ薬）であり、前記特定の遺伝子多型がALDH2の42421GGと ITGB2の1323TTと AKR1B10の-106TTとを含む第２の組み合わせ、
前記糖尿病治療薬がグリニド剤であり、前記特定の遺伝子多型がVWFの-1051GGと ALDH2の42421GGとを含む第３の組み合わせ、
前記糖尿病治療薬がインスリン製剤であり、前記特定の遺伝子多型がTHPOの5713Aアレルと CCR5の59029GGと IL10の-819TTとを含む第４の組み合わせ、
前記糖尿病治療薬がピオグリタゾン剤であり、前記特定の遺伝子多型がCCL5の-28Gアレルを含む第５の組み合わせ、または、
前記糖尿病治療薬がスルホニルウレア剤（ＳＵ薬）であり、前記特定の遺伝子多型がIL18の4383AAと MTHFRの677Cアレルとを含む第６の組み合わせ、
のいずれかである、判定方法である。
【００１２】
本発明に係る第２の判定方法は、第１の判定方法において、
前記演算部が、前記判定するステップにおいて、予め重回帰分析によって決定された回帰式を用いて、前記被験者の血中HbA1c値の推定降下度と、標準患者の血中HbA1c値の推定降下度とを計算し、前記被験者の血中HbA1c値の前記推定降下度が、前記標準患者の血中HbA1c値の前記推定降下度よりも大きい場合に、前記糖尿病治療薬が有効であると判定し、
前記回帰式が、血中HbA1c値の変化量dHbA1cを目的変数とし、前記特定の遺伝子多型の前記存在の有無の情報を説明変数として、糖尿病患者データの集合を重回帰分析して得られた式であり、
前記回帰式中の前記特定の遺伝子多型の前記存在の有無の情報が、前記被験者の血中HbA1c値の前記推定降下度を計算する場合には、０または１の値であり、前記標準患者の血中HbA1c値の前記推定降下度を計算する場合には、前記標準患者が前記特定の遺伝子多型を保有している割合を意味する０から１までの間の実数値である、判定方法である。
【００１３】
本発明に係る第３の判定方法は、第２の判定方法において、
前記臨床データが、前記被験者の前記糖尿病治療薬の投与経過の情報を含み、
前記投与経過の情報内に前記糖尿病治療薬の服用歴が無く、かつ、前記糖尿病治療薬が有効であると判定されている場合に、前記糖尿病治療薬を前記被験者に投与すると判定し、
前記投与経過の情報内に前記糖尿病治療薬の服用歴が有り、かつ、前記糖尿病治療薬が有効ではないと判定されている場合に、前記糖尿病治療薬を前記被験者に投与しないと判定する、判定方法である。
【００１４】
本発明に係る第４の判定方法は、第２の判定方法において、
前記糖尿病治療薬と前記特定の遺伝子多型との組み合わせが前記第１の組み合わせであり、前記回帰式が、
dHbA1c＝ａ１×[MTR_2756A_Allele]＋ｂ１×[CCR5_59029AA]＋ｃ１
の形式で表され、ここで、定数ａ１、ｂ１、ｃ１は、前記重回帰分析により決定される偏回帰係数であり、[MTR_2756A_Allele]はMTRの2756Aアレルの有無に関する情報であり、[CCR5_59029AA]はCCR5の59029AAの有無に関する情報である、判定方法である。
【００１５】
本発明に係る第５の判定方法は、第２の判定方法において、
前記糖尿病治療薬と前記特定の遺伝子多型との組み合わせが前記第２の組み合わせであり、前記回帰式が、
dHbA1c＝ａ２×[ALDH2_42421GG]＋ｂ２×[ITGB2_1323TT]＋ｃ２×[AKR1B10_-106TT]＋ｄ２
の形式で表され、ここで、定数ａ２、ｂ２、ｃ２、ｄ２は、前記重回帰分析により決定される偏回帰係数であり、[ALDH2_42421GG]はALDH2の42421GGの有無に関する情報であり、[ITGB2_1323TT]はITGB2の1323TTの有無に関する情報であり、[AKR1B10_-106TT]はAKR1B10の-106TTの有無に関する情報である、判定方法である。
【００１６】
本発明に係る第６の判定方法は、第２の判定方法において、
前記糖尿病治療薬と前記特定の遺伝子多型との組み合わせが前記第３の組み合わせであり、前記回帰式が、
dHbA1c＝ａ３×[VWF_-1051GG]＋ｂ３×[ALDH2_42421GG]＋ｃ３
の形式で表され、ここで、定数ａ３、ｂ３、ｃ３は、前記重回帰分析により決定される偏回帰係数であり、[VWF_-1051GG]はVWFの-1051GGの有無に関する情報であり、[ALDH2_42421GG]はALDH2の42421GGの有無に関する情報である、判定方法である。
【００１７】
本発明に係る第７の判定方法は、第２の判定方法において、
前記糖尿病治療薬と前記特定の遺伝子多型との組み合わせが前記第４の組み合わせであり、前記回帰式が、
dHbA1c＝ａ４×[THPO_5713A_Allele]＋ｂ４×[CCR5_59029GG]＋ｃ４×[IL10_-819TT]＋ｄ４
の形式で表され、ここで、定数ａ４、ｂ４、ｃ４、ｄ４は、前記重回帰分析により決定される偏回帰係数であり、[THPO_5713A_Allele]はTHPOの5713Aアレルの有無に関する情報であり、[CCR5_59029GG]はCCR5の59029GGの有無に関する情報であり、[IL10_-819TT]はIL10の-819TTの有無に関する情報である、判定方法である。
【００１８】
本発明に係る第８の判定方法は、第２の判定方法において、
前記糖尿病治療薬と前記特定の遺伝子多型との組み合わせが前記第５の組み合わせであり、前記回帰式が、
dHbA1c＝ａ５×[CCL5_-28G Allele]＋ｂ５
の形式で表され、ここで、定数ａ５、ｂ５は、前記重回帰分析により決定される偏回帰係数であり、[CCL5_-28G Allele]はCCL5の-28Gアレルの有無に関する情報である、判定方法である。
【００１９】
本発明に係る第９の判定方法は、第２の判定方法において、
前記糖尿病治療薬と前記特定の遺伝子多型との組み合わせが前記第６の組み合わせであり、前記回帰式が、
dHbA1c＝ａ６×[IL18_4383AA]＋ｂ６×[MTHFR_677C_Allele]＋ｃ６
の形式で表され、ここで、定数ａ６、ｂ６、ｃ６、ｄ６は、前記重回帰分析により決定される偏回帰係数であり、[IL18_4383AA]はIL18の4383AAの有無に関する情報であり、[MTHFR_677C_Allele]はMTHFRの677Cアレルの有無に関する情報である、判定方法である。
【００２０】
本発明に係る第１の判定装置は、
演算部と記録部とを備え、糖尿病治療薬の有効性を判定する装置であって、
前記記録部が、取得した被験者の遺伝子多型情報および臨床データを記録し、
前記演算部が、取得した前記遺伝子多型情報内に特定の遺伝子多型が存在するか否かを識別し、
前記演算部が、前記特定の遺伝子多型の存在の有無の情報および前記臨床データに基づいて、糖尿病治療薬の有効性を判定し、
前記糖尿病治療薬と前記特定の遺伝子多型との組み合わせが、
前記糖尿病治療薬がαグルコシダーゼ阻害剤（α−ＧＩ）であり、前記特定の遺伝子多型がMTRの2756Aアレルと CCR5の59029AAとを含む第１の組み合わせ、
前記糖尿病治療薬がビグアナイド剤（ＢＧ薬）であり、前記特定の遺伝子多型がALDH2の42421GGと ITGB2の1323TTと AKR1B10の-106TTとを含む第２の組み合わせ、
前記糖尿病治療薬がグリニド剤であり、前記特定の遺伝子多型がVWFの-1051GGと ALDH2の42421GGとを含む第３の組み合わせ、
前記糖尿病治療薬がインスリン製剤であり、前記特定の遺伝子多型がTHPOの5713Aアレルと CCR5の59029GGと IL10の-819TTとを含む第４の組み合わせ、
前記糖尿病治療薬がピオグリタゾン剤であり、前記特定の遺伝子多型がCCL5の-28Gアレルを含む第５の組み合わせ、または、
前記糖尿病治療薬がスルホニルウレア剤（ＳＵ薬）であり、前記特定の遺伝子多型がIL18の4383AAと MTHFRの677Cアレルとを含む第６の組み合わせ、
のいずれかである、判定装置である。
【００２１】
本発明に係る判定プログラムは、
糖尿病治療薬の有効性を判定するプログラムであって、
コンピュータに、
取得した被験者の遺伝子多型情報および臨床データを記録する機能と、
取得した前記遺伝子多型情報内に特定の遺伝子多型が存在するか否かを識別する機能と、
前記特定の遺伝子多型の存在の有無の情報および前記臨床データに基づいて、糖尿病治療薬の有効性を判定する機能と、
を実現させ、
前記糖尿病治療薬と前記特定の遺伝子多型との組み合わせが、
前記糖尿病治療薬がαグルコシダーゼ阻害剤（α−ＧＩ）であり、前記特定の遺伝子多型がMTRの2756Aアレルと CCR5の59029AAとを含む第１の組み合わせ、
前記糖尿病治療薬がビグアナイド剤（ＢＧ薬）であり、前記特定の遺伝子多型がALDH2の42421GGと ITGB2の1323TTと AKR1B10の-106TTとを含む第２の組み合わせ、
前記糖尿病治療薬がグリニド剤であり、前記特定の遺伝子多型がVWFの-1051GGと ALDH2の42421GGとを含む第３の組み合わせ、
前記糖尿病治療薬がインスリン製剤であり、前記特定の遺伝子多型がTHPOの5713Aアレルと CCR5の59029GGと IL10の-819TTとを含む第４の組み合わせ、
前記糖尿病治療薬がピオグリタゾン剤であり、前記特定の遺伝子多型がCCL5の-28Gアレルを含む第５の組み合わせ、または、
前記糖尿病治療薬がスルホニルウレア剤（ＳＵ薬）であり、前記特定の遺伝子多型がIL18の4383AAと MTHFRの677Cアレルとを含む第６の組み合わせ、
のいずれかである、判定プログラムである。
【００２２】
本発明に係る判定プログラムを記録したコンピュータ読み取り可能な記録媒体は、
糖尿病治療薬の有効性を判定するプログラムを記録したコンピュータ読み取り可能な記録媒体であって、
コンピュータに、
取得した被験者の遺伝子多型情報および臨床データを記録する機能と、
取得した前記遺伝子多型情報内に特定の遺伝子多型が存在するか否かを識別する機能と、
前記特定の遺伝子多型の存在の有無の情報および前記臨床データに基づいて、糖尿病治療薬の有効性を判定する機能と、
を実現させ、
前記糖尿病治療薬と前記特定の遺伝子多型との組み合わせが、
前記糖尿病治療薬がαグルコシダーゼ阻害剤（α−ＧＩ）であり、前記特定の遺伝子多型がMTRの2756Aアレルと CCR5の59029AAとを含む第１の組み合わせ、
前記糖尿病治療薬がビグアナイド剤（ＢＧ薬）であり、前記特定の遺伝子多型がALDH2の42421GGと ITGB2の1323TTと AKR1B10の-106TTとを含む第２の組み合わせ、
前記糖尿病治療薬がグリニド剤であり、前記特定の遺伝子多型がVWFの-1051GGと ALDH2の42421GGとを含む第３の組み合わせ、
前記糖尿病治療薬がインスリン製剤であり、前記特定の遺伝子多型がTHPOの5713Aアレルと CCR5の59029GGと IL10の-819TTとを含む第４の組み合わせ、
前記糖尿病治療薬がピオグリタゾン剤であり、前記特定の遺伝子多型がCCL5の-28Gアレルを含む第５の組み合わせ、または、
前記糖尿病治療薬がスルホニルウレア剤（ＳＵ薬）であり、前記特定の遺伝子多型がIL18の4383AAと MTHFRの677Cアレルとを含む第６の組み合わせ、
のいずれかである、判定プログラムを記録したコンピュータ読み取り可能な記録媒体である。
【００２３】
本発明に係る第１０の判定方法は、
糖尿病治療薬の有効性を判定する方法であって、
被験者の遺伝子多型情報および臨床データを取得するステップと、
取得した前記遺伝子多型情報内に特定の遺伝子多型が存在するか否かを識別するステップと、
前記特定の遺伝子多型の存在の有無の情報および前記臨床データに基づいて、糖尿病治療薬の有効性を判定するステップと、
を含み、
前記糖尿病治療薬と前記特定の遺伝子多型との組み合わせが、
前記糖尿病治療薬がαグルコシダーゼ阻害剤（α−ＧＩ）であり、前記特定の遺伝子多型がMTRの2756Aアレルと CCR5の59029AAとを含む第１の組み合わせ、
前記糖尿病治療薬がビグアナイド剤（ＢＧ薬）であり、前記特定の遺伝子多型がALDH2の42421GGと ITGB2の1323TTと AKR1B10の-106TTとを含む第２の組み合わせ、
前記糖尿病治療薬がグリニド剤であり、前記特定の遺伝子多型がVWFの-1051GGと ALDH2の42421GGとを含む第３の組み合わせ、
前記糖尿病治療薬がインスリン製剤であり、前記特定の遺伝子多型がTHPOの5713Aアレルと CCR5の59029GGと IL10の-819TTとを含む第４の組み合わせ、
前記糖尿病治療薬がピオグリタゾン剤であり、前記特定の遺伝子多型がCCL5の-28Gアレルを含む第５の組み合わせ、または、
前記糖尿病治療薬がスルホニルウレア剤（ＳＵ薬）であり、前記特定の遺伝子多型がIL18の4383AAと MTHFRの677Cアレルとを含む第６の組み合わせ、
のいずれかである、判定方法である。
【００２４】
本発明に係る第２の判定装置は、
糖尿病治療薬の有効性を判定する装置であって、
取得した被験者の遺伝子多型情報および臨床データを記録する手段と、
取得した前記遺伝子多型情報内に特定の遺伝子多型が存在するか否かを識別する手段と、
前記特定の遺伝子多型の存在の有無の情報および前記臨床データに基づいて、糖尿病治療薬の有効性を判定する手段と、
を備え、
前記糖尿病治療薬と前記特定の遺伝子多型との組み合わせが、
前記糖尿病治療薬がαグルコシダーゼ阻害剤（α−ＧＩ）であり、前記特定の遺伝子多型がMTRの2756Aアレルと CCR5の59029AAとを含む第１の組み合わせ、
前記糖尿病治療薬がビグアナイド剤（ＢＧ薬）であり、前記特定の遺伝子多型がALDH2の42421GGと ITGB2の1323TTと AKR1B10の-106TTとを含む第２の組み合わせ、
前記糖尿病治療薬がグリニド剤であり、前記特定の遺伝子多型がVWFの-1051GGと ALDH2の42421GGとを含む第３の組み合わせ、
前記糖尿病治療薬がインスリン製剤であり、前記特定の遺伝子多型がTHPOの5713Aアレルと CCR5の59029GGと IL10の-819TTとを含む第４の組み合わせ、
前記糖尿病治療薬がピオグリタゾン剤であり、前記特定の遺伝子多型がCCL5の-28Gアレルを含む第５の組み合わせ、または、
前記糖尿病治療薬がスルホニルウレア剤（ＳＵ薬）であり、前記特定の遺伝子多型がIL18の4383AAと MTHFRの677Cアレルとを含む第６の組み合わせ、
のいずれかである、判定装置である。
【発明の効果】
【００２５】
本発明によると、糖尿病薬の治療効果と関連性が見出された特定の遺伝子多型が、患者の遺伝子多型情報内に含まれているか否かを識別することで、複数種類の糖尿病治療薬の中から患者に有効な治療薬を判定することができ、患者毎の遺伝的背景に基づいたより適切な治療薬の判定を行うことができる。
【００２６】
すなわち、既に複数種類の糖尿病治療薬を服用している患者について本発明の判定方法を適用すると、現在服用している複数種類の治療薬のうち、血中HbA1c値を効果的に低下させる治療薬のみを判定して医師に提示することができ、これにより、既に服用している複数種類の治療薬のうち、服用する必要の無い治療薬を医師が判断する際の有用な情報を提示することができる。
【００２７】
また、初めて糖尿病治療薬を服用しようとする患者について本発明の判定方法を適用すると、実際に治療薬を処方する前に、複数種類の治療薬のそれぞれについて、血中HbA1c値の降下度を推定することが可能となる。これにより、医師が患者に治療薬を処方するにあたり、血中HbA1c値の降下に寄与する治療薬を判定して医師に提示することができる。
【図面の簡単な説明】
【００２８】
【図１】本発明に係る糖尿病治療薬の有効性を判定する装置を含むシステム全体を示すブロック図である。
【図２】判定装置が行う判定処理を示すフローチャートである。
【図３】判定装置が行うステップＳ４の判定処理を示すフローチャートである。
【発明を実施するための形態】
【００２９】
以下、本発明の実施の形態を、添付の図面を参照して詳細に説明する。なお、以下の説明および図面において、同じ符号は同じまたは類似の構成要素を示すこととし、よって、同じまたは類似の構成要素に関する説明を省略する。
【００３０】
以下の説明において、「遺伝子多型」とは、同一集団内において、一つの遺伝子座に２種類以上の対立遺伝子（アレル）が存在する遺伝子の多様性を意味する。具体的には、ある集団において一定の頻度以上で存在する遺伝子の変異を示す。ここでいう遺伝子の変異は、ＲＮＡとして転写される領域に限定されるものではなく、プロモーター、エンハンサー等の制御領域などを含むヒトゲノム上で特定しうるすべてのＤＮＡにおける変異を含むものである。ヒトゲノムＤＮＡの９９．９％は各個人間で共通しており、残る０．１％がこのような多様性の原因となり、特定の疾患に対する感受性、薬物や環境因子に対する反応性の個人差として関与し得る。遺伝子多型があっても表現型に差が出るとは限らない。なお、ＳＮＰ（一塩基多型）も遺伝子多型の一種であるが、本発明が対象とする遺伝子多型はこれに限られない。
【００３１】
「遺伝子多型セット」とは、複数の遺伝子多型の組合せをいう。ここで複数の遺伝子多型とは、異なる遺伝子座を有する２種以上の遺伝子多型を意味する。また、ここで「遺伝子多型」は、遺伝子型（Genotype）を考慮したものであって、それを含むものである。すなわち、本発明において「遺伝子多型」とは特定の遺伝子型（Genotype）を有する遺伝子多型を意味する。
【００３２】
図１は、本発明に係る糖尿病治療薬の有効性を判定する装置（以下、判定装置と記す）を含むシステム全体を示すブロック図である。図１に示すように、システムは、病院１に設置された採血手段１１およびコンピュータ１２と、分析機関２に設置された遺伝子多型解析用アレイ２１およびコンピュータ２２と、サービス提供機関３に設置された判定装置３１とを備えている。ここで、コンピュータ１２、２２、および判定装置３１は、インターネットなどの通信回線４に接続されている。
【００３３】
判定装置３１は、ＣＰＵ３２と、メモリ３３と、ハードディスクなどの記録部３４と、外部との通信を行う通信インタフェース（以下、Ｉ／Ｆと記す）部３５と、キーボードなどの操作部３６と、液晶ディスプレイなどの表示部３７と、入出力Ｉ／Ｆ部３８と、各部間でデータを交換するための内部バス３９とを備えている。記録部３４には、糖尿病薬の治療効果に関連性を有することが見出された特定の遺伝子多型の情報が、参照テーブルとして予め記録されている。
【００３４】
判定装置３１による有効性判定処理についての詳細は後述する。判定装置３１を含むシステム全体の動作を説明すると、次の通りである。
【００３５】
まず、病院１において、採血手段１１によって被験者の遺伝子（ゲノム）を抽出可能な検体（以下、被験試料と記す）が採取される。このとき、臨床データ（被験者ＩＤ、性別、糖尿病治療薬のこれまでの投与経過、採血情報（現在および過去のHbA1c値を含む）、既往歴、身体所見など）がコンピュータ１２の記録部に記録される。被験試料は、分析機関２に提供され、遺伝子多型解析用アレイ２１を用いて分析され、遺伝子型を有する遺伝子多型が検出される。遺伝子多型解析用アレイ２１は、遺伝子多型を検出するためのプローブを高密度に整列させて、シリコンウェハーやガラススライド等の支持体上に固定化したものであり、プローブとしては、特定の疾患（本発明では、糖尿病）に関連する遺伝子多型を特異的に認識して捕捉するものであればよい。
【００３６】
本発明では、遺伝子多型解析用アレイ２１を用いて検出する遺伝子多型には、判定に用いる特定の遺伝子多型の情報（参照テーブルとして予め記録されている）が少なくとも含まれていれば良く、本発明が目的とする糖尿病治療薬の有効性判定以外の他の検査を行う関係で、これら以外の遺伝子多型が含まれていても良い。遺伝子多型解析用アレイ２１を用いて検出する遺伝子多型の一例を表１に示す。表１に示す１００種類の遺伝子多型は、糖尿病に関わることが知られている遺伝子多型である。
【００３７】
【表１】
2016067323.tif 000003
【００３８】
検出された遺伝子多型情報は、一旦コンピュータ２２の記録手段に記録され、その後通信回線４を介してサービス提供機関３の判定装置３１に送信される。判定装置３１は、通信Ｉ／Ｆ部３５を介して分析機関２のコンピュータ２２から遺伝子多型情報を受信し、記録部３４に記録する。また、判定装置３１は、病院１のコンピュータ１２から臨床データを受信して、記録部３４に記録する。
【００３９】
その後、判定装置３１は、受信した遺伝子多型情報が、予め記録部３４に記録しておいた参照テーブルに含まれているか否かを検索し、その結果に応じて治療薬の投与の有効性を判定する。判定後、判定装置３１は、判定結果を、通信回線４を介して病院１のコンピュータ１２に送信する。コンピュータ１２によって受信された判定結果は、臨床データ（少なくとも被験者ＩＤ）と関連させて、コンピュータ１２の記録部に記録され、適宜呼び出されて利用（例えば、被験者に提示）される。判定結果を送信する病院１のコンピュータ１２を特定する情報は、例えば、病院１のコンピュータ１２から、臨床データに含めて送信すればよい。
【００４０】
上記の被験試料の分析に関して、被験者の遺伝子型を検出する方法であればいかなる方法も使用することができる。一般的な方法としては、被験者の血液、痰、皮膚、気管支肺胞洗浄液、その他の体液、あるいは組織等、ＤＮＡを含むものを被験試料として用いる。解析方法としては多くの方法が知られており、例えばシークエンス法、ＰＣＲ法、ＡＳＰ−ＰＣＲ法、ＴａｑＭａｎ法、インベーダーアッセイ法、ＭＡＬＤＩ−ＴＯＦ／ＭＳ法、分子ビーコン法、ライゲーション法などを例示することができる（Ｃｌｉｎ．Ｃｈｅｍ．４３：１１１４−１１２０，１９９７）。なお、シークエンス法とは、遺伝子多型を含むＤＮＡ領域を直接にシークエンスする方法である。ＰＣＲ法においては、遺伝子多型に特異的なプライマーを用いて、ある遺伝子多型のみを特異的に増幅する。ＰＣＲ法においては、最も３’側に遺伝子多型の核酸を配置するのが一般的であるが、Ａｌｌｅｌｅ  Ｓｐｅｃｉｆｉｃ  Ｐｒｉｍｅｒ（ＡＳＰ）−ＰＣＲ法のように、３’末端側から２番目に遺伝子多型を有するプライマーを配置する方法などのように、遺伝子多型をプライマーのどの領域に置くか、また、検出する遺伝子以外にどのような核酸配列を入れるかなど、プライマーのデザインには、遺伝子多型を識別できる限り特に制限はない。ＴａｑＭａｎ法において蛍光色素と消光物質により両端を標識したアレル特異的プローブを標的部位にハイブリダイズさせて、この部位を含む領域を増幅するように設計したプライマーでＰＣＲ反応を行う。プライマーからのＰＣＲ反応がこのアレル特異的プローブがハイブリダイズした領域に達すると、Ｔａｑポリメラーゼの５プライムヌクレアーゼ活性によりハイブリダイズしたプローブの５’末端に存在する蛍光色素が切断され、消光物質から離れることにより蛍光が生ずる。この手法により、アレル特異的プローブがどの程度ハイブリダイズしていたかがわかる。インベーダーアッセイ法においては、鋳型の遺伝子多型部位から５’側に特異的配列を持ち、３’側にフラップ配列を持つアレルプローブと、鋳型の遺伝子多型部位からの３’側の特異的配列を有するインベーダープローブ、さらに、フラップ配列に相補的な配列を含むＦＲＥＴプローブとの３種類のオリゴヌクレオチドを使い、ＴａｑＭａｎ法と同様の原理にてどのアレルプローブがハイブリズダイズしたかを特定できる。ＭＡＬＤＩ−ＴＯＦ／ＭＳ法においては、遺伝子多型部位に隣接するプライマーを作成してこの領域を増幅させた後、遺伝子多型部位の１塩基のみをｄｄＮＴＰを用いて増幅する。ついで、ＭＡＬＤＩ−ＴＯＦ／ＭＳを用いて、付加したｄｄＮＴＰの種類を識別することにより遺伝子多型を同定する。Ｈｙｂｒｉｇｅｎｅ法などのＤＮＡチップ法と総称される方法においては、アレイ上に遺伝子多型を含むオリゴヌクレオチドプローブを配置し、ＰＣＲ増幅させたサンプルＤＮＡとのハイブリダイゼーションを検出する。
【００４１】
図２は、判定装置３１が行う判定処理を示すフローチャートである。以下、図２のフローチャートに従って、判定装置３１による有効性判定処理を具体的に説明する。なお、以下においては、特に断らない限り、ＣＰＵ３２が行う処理として記載する。また、ＣＰＵ３２は、メモリ３３を、ワーク領域や、処理途中のデータを一時記憶する領域として使用し、必要に応じて処理途中および処理結果のデータを記録部３４に記録する。
【００４２】
ステップＳ１では、判定に用いる被験者の遺伝子多型情報および臨床データを取得する。
【００４３】
まず、分析機関２から通信回線４経由で遺伝子多型情報を取得し、記録部３４に記録する。遺伝子多型情報は、遺伝子型を有する遺伝子多型毎に付与した遺伝子多型コードとして伝送および記録され、データ形式は、例えば、依頼元の病院毎に付与した病院コードおよび被験者毎に付与した被験者ＩＤの組の各々に、複数の遺伝子多型コードｇｉ（ｉ＝１〜ｎ）が対応付けられた形式である。また、病院１から通信回線４経由で被験者の臨床データを取得し、依頼元の病院コードを付与したうえで記録部３４に記録する。
【００４４】
臨床データのデータ形式は、例えば、性別については、男性の場合変数ＳＥＸ＝１とし、女性の場合ＳＥＸ＝２として臨床データに記録する。糖尿病治療薬のこれまでの投与経過については、それぞれの治療薬について、システム上で使用する変数名を予め決定しておき、服用歴有りの場合に値を１とし、服用歴無しの場合に値を０として、変数名と値とをセットにして臨床データに記録する。例えば、糖尿病治療薬［αグルコシダーゼ阻害剤（α−ＧＩ）］＝１として臨床データに記録する。服用歴有りの場合には、服用歴の年数等の情報を合わせて記録してもよい。既往歴や身体所見についても、それぞれの病名または症状について、システム上で使用する変数名を予め決定しておき、病歴有りまたは症状有りの場合に値を１とし、病歴無しまたは症状無しの場合に値を０として、変数名と値とをセットにして臨床データに記録する。例えば、既往歴［前立腺腫瘍］＝０や、身体所見[下腿浮腫]＝１として臨床データに記録する。
【００４５】
ステップＳ２では、ステップＳ１において取得した被験者の遺伝子多型情報内に、特定の遺伝子多型が存在するか否かを識別する。
【００４６】
具体的には、一つの｛病院コード，被験者ＩＤ｝について、複数の遺伝子多型コードｇｉ（ｉ＝１〜ｎ）を記録部３４から読み出し、読み出した遺伝子多型コードｇｉが、予め記録部３４に記録しておいた参照テーブルに含まれているか否かを識別する。参照テーブルには、本発明者により糖尿病薬の治療効果（血中HbA1c値の低下）に関連性を有することが見出された特定の遺伝子多型の情報が予め記録されており、本実施形態では、例えばαグルコシダーゼ阻害剤（α−ＧＩ）と関連を有する特定の遺伝子多型として、 MTRの2756Aアレルおよび CCR5の59029AAが、遺伝子多型コードの形式で記録されている。例えば、記録部３４から遺伝子多型コードｇ１を読み出し、この遺伝子多型コードｇ１が参照テーブルに含まれているか否かを識別する。含まれていれば、この遺伝子多型コードｇ１に対応するフラグに値「１」（ｔｒｕｅ）を設定する（フラグは予め「０」（ｆａｌｓｅ）に初期化されているとする）。この識別処理を、複数の遺伝子多型コードｇｉ（ｉ＝１〜ｎ）のすべてについて実行する。
【００４７】
なお、遺伝子多型の表記について、遺伝子多型の国際的名称を表２の第３列「ＧｅｎｅＮａｍｅ（Ｉｎｔｌ．）」および第４列「Ｇｔｙｐｅ（Ｉｎｔｌ．）」に示す。後述する特許請求の範囲には、これら国際的名称にて遺伝子多型を記載している。
【００４８】
【表２】
2016067323.tif 000004
【００４９】
ステップＳ３では、ステップＳ２にて記録したフラグの値に基づいて判断し、フラグの値がすべて「０」（ｆａｌｓｅ）、すなわち、被験者の遺伝子多型情報内に、参照テーブルに記載した特定の遺伝子多型が存在していなかった場合には、この時点で有効性判定の必要性がないと判断し、ステップＳ４の処理を行わずにステップＳ５に移行する。いずれかのフラグの値が「１」（ｔｒｕｅ）であれば、所定の判定式を用いるステップＳ４の処理に移行する。
【００５０】
ステップＳ４では、ステップＳ２にて記録したフラグの値とステップＳ１にて取得した臨床データとを用い、所定の判定式に基づいて治療薬投与の有効性を判定する。
【００５１】
まず、ステップＳ４で用いる判定式について説明する。判定式には、血中HbA1c値の変化量dHbA1cを目的変数とし、特定の遺伝子多型の存在の有無の情報を説明変数とし、糖尿病患者データの集合を重回帰分析することによって決定された回帰式を用いる。回帰式の値の計算には、ステップＳ２にて識別した、特定の遺伝子多型の有無の情報であるフラグの値を使用し、この回帰式を使用して、被験者の血中HbA1c値の推定変化量dHbA1cと、判定比較用の、標準的な患者（以下、標準患者とも記す）の血中HbA1c値の推定変化量dHbA1cmeanとを算出する。標準患者とは、本実施形態では、例えば罹病期間が所定期間（２〜１０年）の２型糖尿病患者である。
血中HbA1c値の変化量dHbA1cを求める回帰式は、例えばαグルコシダーゼ阻害剤（α−ＧＩ）の場合次の通りである。
【００５２】
dHbA1c＝ａ×[MTR_2756A_Allele]＋ｂ×[CCR5_59029AA]＋ｃ            （式１）
ここで、dHbA1cは血中HbA1c値の推定変化量（単位％、NGSP国際標準値）であり、[MTR_2756A_Allele]および[CCR5_59029AA]はそれぞれ、MTRの2756Aアレルの有無およびCCR5の59029AAの有無である。
【００５３】
被験者について推定変化量を計算する場合は、[MTR_2756A_Allele]および[CCR5_59029AA]はいずれも「１」（有する）または「０」（有しない）のいずれかの値をとり、標準患者について推定変化量を計算する場合は、[MTR_2756A_Allele]および[CCR5_59029AA]は標準患者がその特定の遺伝子多型を保有している割合を意味し、いずれも０から１までの間の実数値をとる。定数ａ，ｂ，ｃは、重回帰分析によって決定される偏回帰係数であり、単位は血中HbA1c値と同じで「％」（NGSP国際標準値）である。重回帰分析については周知であるので説明を省略する。
【００５４】
後述する実験例によって決定された、実際の回帰式にて使用する偏回帰係数を各糖尿病治療薬毎に表３に示す。回帰式中の定数ａ，ｂ，ｃを決定するために行った重回帰分析の結果の一例については、後述する表４に示す。表３中、治療薬ＡＧＩがαグルコシダーゼ阻害剤（α−ＧＩ）であり、治療薬ＢＧ＿がビグアナイド剤（ＢＧ薬）であり、治療薬ＧＲＩがグリニド剤であり、治療薬ＩＮＳがインスリン製剤であり、治療薬ＩＳＥがピオグリタゾン剤であり、治療薬ＳＵがスルホニルウレア剤（ＳＵ薬）である。
【００５５】
【表３】
2016067323.tif 000005
【００５６】
αグルコシダーゼ阻害剤（α−ＧＩ）について判定する上記の式１の場合、表３中の治療薬ＡＧＩの行に示す降下係数が定数ａ、ｂであり、Ｈｂ０が定数ｃである。これら定数ａ、ｂ、ｃは重回帰分析によって決定される偏回帰係数であり、後述する表４を参照すると、定数ａ＝−１．１３６１１、定数ｂ＝−０．１８００８、定数ｃ＝８．０７０１７である。
【００５７】
次に、ステップＳ４において行う具体的な判定手順について、以下に一例を説明する。図３は、判定装置３１が行うステップＳ４の判定処理を示すフローチャートである。以下に説明する判定手順の一例では、回帰式から得られた、被験者についての血中HbA1c値の推定変化量dHbA1cと、標準患者の血中HbA1c値の推定変化量dHbA1cmeanとに基づいて治療薬の有効性を判定し、さらにこれらに、糖尿病治療薬のこれまでの投与経過の情報を含む臨床データを参照して、治療薬の投与の要否を判定する。
【００５８】
ステップＳ４１では、ステップＳ２にて記録したフラグの値と、治療薬の種類に応じた回帰式とを用いて、被験者の血中HbA1c値の推定変化量dHbA1cを計算する。
【００５９】
例えばαグルコシダーゼ阻害剤（α−ＧＩ）の場合、次の回帰式を用いる。
【００６０】
dHbA1c＝−１．１３６１１×[MTR_2756A_Allele]−０．１８００８×[CCR5_59029AA]＋８．０７０１７                （式２）
[MTR_2756A_Allele]および[CCR5_59029AA]はいずれもステップＳ２にて記録したフラグの値であり、「１」または「０」の値である。
【００６１】
ステップＳ４２では、被験者について用いたステップＳ４１と同じ回帰式を用いて、標準患者の血中HbA1c値の推定変化量dHbA1cmeanを計算する。回帰式は次のようになる。
【００６２】
dHbA1cmean＝−１．１３６１１×[MTR_2756A_Allele]−０．１８００８×[CCR5_59029AA]＋８．０７０１７                （式３）
標準患者について推定変化量を計算する場合、[MTR_2756A_Allele]および[CCR5_59029AA]には、標準患者がその特定の遺伝子多型を保有している割合を使用する。これは表３に示す「標準患者保有割合」の列に対応する値である。表３を参照すると、[MTR_2756A_Allele]＝０．９８６、[CCR5_59029AA]＝０．２８６である。
【００６３】
ステップＳ４３では、得られた被験者の血中HbA1c値の推定変化量（推定降下度）dHbA1cと、得られた標準患者の血中HbA1c値の推定変化量（推定降下度）dHbA1cmeanとに基づいて、治療薬が有効か否かを判定する。
【００６４】
具体的には、被験者の推定変化量dHbA1cと標準患者の推定変化量dHbA1cmeanとの値の大小比較を行い、被験者の推定変化量dHbA1cが標準患者の推定変化量dHbA1cmeanよりも大きい場合に、治療薬が有効であると判定し、その情報を記録部にデータとして記録する。これにより、判定対象の糖尿病治療薬を被験者が服用した際の、治療薬の有効性が判定されることとなる。
【００６５】
ステップＳ４４では、任意のステップとして、被験者のこれまでの治療薬の投与経過に基づいて、判定対象の治療薬の投与の要否を判定する。被験者の治療薬の投与経過については、ステップＳ１にて取得した臨床データに含まれている。
【００６６】
例えば、判定対象の糖尿病治療薬の服用歴が被験者に無くても、ステップＳ４３にて、判定対象の糖尿病治療薬が遺伝子的に有効であると判定されている場合、このようなケースでは、被験者がその治療薬を服用すると、血中HbA1c値を効果的に低下させることが期待され、症状の改善が期待できるので、判定対象の糖尿病治療薬を被験者に投与すると判定する。
【００６７】
一方、判定対象の糖尿病治療薬の服用歴が被験者に有るにもかかわらず、ステップＳ４３にて、判定対象の糖尿病治療薬が遺伝子的に有効ではないと判定されている場合、このようなケースでは、被験者がその治療薬を服用し続けても、血中HbA1c値を効果的に低下することは期待されず、症状の改善が期待できないので、判定対象の糖尿病治療薬を被験者に投与しないと判定する。
【００６８】
ステップＳ４５では、すべての糖尿病治療薬について判定を行ったか否かを判断し、判定が終了したと判断するまでステップＳ４１〜Ｓ４４の処理を繰り返す。すべての糖尿病治療薬について判定が終了したと判断すれば、ステップＳ４の判定処理を終了する。
【００６９】
ステップＳ５では、すべての｛病院コード，被験者ＩＤ｝について処理が終了したか否かを判断し、終了したと判断するまでステップＳ２〜Ｓ４の処理を繰り返す。
【００７０】
すべての｛病院コード，被験者ＩＤ｝について処理が終了したと判断すれば、ステップＳ６において、ステップＳ３またはＳ４にて判定した治療薬投与の有効性についての情報と、被験者ＩＤとを対応させて、通信回線４を介して、依頼元の病院コードに対応するコンピュータ１２に送信する。
【００７１】
以上の処理によって、判定装置３１による一連の有効性判定処理が完了する。なお、上記説明した判定処理は、汎用コンピュータを使用して、ハードディスクまたはＣＤ−ＲＯＭ等のコンピュータ読み取り可能な記録媒体に記録されているコンピュータプログラムを読み出し、または通信回線を介してコンピュータプログラムを取得し、それをＣＰＵが実行することによって行うことも可能である。
【００７２】
以上、本発明を特定の実施の形態によって説明したが、本発明は上記した実施の形態に限定されるものではない。
【００７３】
上記実施の形態では、種々の糖尿病治療薬のうち、αグルコシダーゼ阻害剤（α−ＧＩ）について有効性を判定し、患者への治療薬の投与の要否を判定しているが、これ以外の他の糖尿病治療薬についても同様に、治療薬の有効性を判定し、治療薬の投与の要否を判定することができる。上記実施の形態で説明したαグルコシダーゼ阻害剤（α−ＧＩ）以外の他の糖尿病治療薬については、後述する実験例にて、治療薬に関連する遺伝子多型と具体的な回帰式の偏回帰係数とを説明する。また、後述する実験例には示していないが、糖尿病治療薬であるジペプチジルペプチターゼ(DPP)IV阻害薬についても他の糖尿病治療薬と同様に、治療薬に関連する遺伝子多型と具体的な回帰式の偏回帰係数とを決定することができる。
【００７４】
また、上記実施の形態では、ステップＳ４４において治療薬の投与の要否を判定する際に、これまでの治療薬の投与経過のみに基づいて判定しているが、判定に用いる臨床データはこれに限られない。例えば、被験者のこれまでの治療薬の投与経過に加えて、被験者のこれまでの既往歴の有無や、身体所見の有無をさらに考慮して、治療薬の投与の要否を判定してもよい。さらに、判定に考慮すべき既往歴や身体所見について新たな報告がなされた場合には、それに応じて判定基準に適宜追加または変更を行えばよい。
【００７５】
また、本発明の装置は、上記した判定処理を実現可能である限り、必要に応じて他の構成を適宜追加または他の構成に置き換えた装置とすることができる。例えば、表示部３７および操作部３６に代えて、これらが一体化されたタッチパネル式の構成として実現されてもよい。
【００７６】
また、上記実施の形態では、判定に用いる被験者の遺伝子多型情報および臨床データを、通信回線４を介して取得しているが、データの取得経路はこれに限定されず、判定に用いるデータ等を何らかの記録手段（例えば、個人毎に付与したＩＣカード、メモリカードなどの携帯型記録手段）に記録しておき、これからデータ等を適宜読み出して使用してもよい。
【００７７】
また、分析機関から取得した個人の遺伝子多型情報および臨床データを、サービス提供機関のデータベースに個人ＩＤと対応させて記録しておき、各個人に個人ＩＤを通知しておけば、個人ＩＤの連絡を受けるだけで、データベースに記録されている対応する遺伝子多型情報および臨床データを用いて、再度の有効性判定処理が可能となる。
【００７８】
また、上記実施の形態では、図２および図３に示す判定処理をＣＰＵ３２が行う処理として記載しているが、ＣＰＵ３２が行う処理をそれぞれの機能に分類して、各機能毎に専用の電子回路を作製し、これら電子回路が図２および図３の判定処理を分担して実行してもよい。
【００７９】
また、上記実施の形態では、図２および図３に示す判定処理をＣＰＵ３２が行う処理として記載しているが、処理に用いるデータが例えば紙データ等で可視化されている限り、判定処理にて行う演算処理および識別処理は適宜人間が行ってもよい。
【実施例１】
【００８０】
以下、実験例の説明を通じて本発明をさらに具体的に説明する。ただし、本発明は以下の実験例により何ら限定されるものではない。
【００８１】
・調査内容
以下の実験例では、糖尿病治療薬と種々の遺伝子多型との関連性を調査した。具体的には、所定の治療薬を服用後、所定の期間（本実験例では、６ヶ月）経過後の、被験者の血中HbA1c値の変化と、糖尿病関連の遺伝子多型との関連性を調査し、所定の治療薬の血糖管理効果に影響を及ぼす遺伝因子を同定した。関連性を調査した糖尿病治療薬は次の６種類である。
【００８２】
・αグルコシダーゼ阻害剤（α−ＧＩ）
・ビグアナイド剤（ＢＧ薬）
・グリニド剤
・インスリン製剤（被験者に注射にて投与）
・ピオグリタゾン剤
・スルホニルウレア剤（ＳＵ薬）
【００８３】
・被験者
罹病期間２〜１０年の２型糖尿病患者を対象とした。調査対象とした人数を各糖尿病治療薬について示すと次の通りである。
【００８４】
・αグルコシダーゼ阻害剤（α−ＧＩ）：  ９６７人
・ビグアナイド剤（ＢＧ薬）：  ８４６人
・グリニド剤：  １５１人
・インスリン製剤：  ５５８人
・ピオグリタゾン剤：  ２５２人
・スルホニルウレア剤（ＳＵ薬）：  ７６３人
被験者を選定するにあたり、２型糖尿病患者の判定は、世界保健機構（ＷＨＯ）の判定基準に基づいて行った。すべての被験者には、本研究の趣旨および内容を十分に説明した後、書面にてインフォームド・コンセントを得た。
【００８５】
・関連性を調査した遺伝子多型
関連性を調査した遺伝子多型は、実施形態の説明中の表１に示した通りである。表１に示した１００種類の遺伝子多型は、糖尿病に関わることが知られている遺伝子多型である。
【００８６】
・調査結果
関連性を調査した６種類の糖尿病治療薬のそれぞれについて、調査結果を示す。
【００８７】
（１）αグルコシダーゼ阻害剤（α−ＧＩ）
表１に示す種々の遺伝子多型のうち、MTRの2756AアレルおよびCCR5の59029AAについて、被験者の血中HbA1c値の変化値との間に有意な関連性を見出した。具体的には、表１に示す種々の遺伝子多型について単相関係数を計算し、カイ２乗検定のｐ値を指標として、ｐ＜０．０５の条件で有意な遺伝子多型を抽出した。抽出した有意な遺伝子多型についてさらに重回帰分析を行い、独立して有意に関連すると判断される遺伝子多型を同定した。
【００８８】
次に、所定の期間（６ヶ月）経過後の被験者の血中HbA1c値の変化値を推定するために、重回帰分析により、血中HbA1c値の変化量dHbA1cを求める回帰式を決定した。重回帰分析は、αグルコシダーゼ阻害剤（α−ＧＩ）を服用した９６７人分の被験者のデータの集合について、遺伝子多型MTRの2756Aアレルの有無およびCCR5の59029AAの有無を説明変数とし、血中HbA1c値の変化量dHbA1cを目的変数として行った。得られた回帰式は次の（式４）に示す通りであり、重回帰分析の結果は次の表４に示す通りであった。
【００８９】
dHbA1c＝−１．１３６１１×[MTR_2756A_Allele]−０．１８００８×[CCR5_59029AA]＋８．０７０１７                （式４）
【表４】
2016067323.tif 000006
【００９０】
（式４）の回帰式から、遺伝子多型MTRの2756Aアレルの有無およびCCR5の59029AAの有無の情報として「１」または「０」の値を用いることで、被験者の血中HbA1c値の推定変化量dHbA1cを求めることができた。また、（式４）の回帰式から、遺伝子多型MTRの2756Aアレルの有無およびCCR5の59029AAの有無の情報として、表３に示す、標準患者がその特定の遺伝子多型を保有している割合を用いることで、標準患者の血中HbA1c値の推定変化量dHbA1cmeanを求めることができた。
【００９１】
（２）ビグアナイド剤（ＢＧ薬）
表１に示す種々の遺伝子多型のうち、ALDH2の42421GG、ITGB2の1323TT、およびAKR1B10の-106TTについて、被験者の血中HbA1c値の変化値との間に有意な関連性を見出した。（１）のαグルコシダーゼ阻害剤について示した例と同様に、重回帰分析により、所定の期間（６ヶ月）経過後の被験者の血中HbA1c値の変化量dHbA1cを求める回帰式を決定した。重回帰分析は、ビグアナイド剤（ＢＧ薬）を服用した８４６人分の被験者のデータの集合について、遺伝子多型ALDH2の42421GGの有無、ITGB2の1323TTの有無、およびAKR1B10の-106TTの有無を説明変数とし、血中HbA1c値の変化量dHbA1cを目的変数として行った。得られた回帰式は次の（式５）に示す通りであり、重回帰分析の結果は次の表５に示す通りであった。
【００９２】
dHbA1c＝−０．４４０４１×[ALDH2_42421GG]−０．３５４９８×[ITGB2_1323TT]−０．４０７３１×[AKR1B10_-106TT]＋７．３０４６５                （式５）
【表５】
2016067323.tif 000007
【００９３】
（３）グリニド剤
表１に示す種々の遺伝子多型のうち、VWFの-1051GGおよびALDH2の42421GGについて、被験者の血中HbA1c値の変化値との間に有意な関連性を見出した。（１）のαグルコシダーゼ阻害剤について示した例と同様に、重回帰分析により、所定の期間（６ヶ月）経過後の被験者の血中HbA1c値の変化量dHbA1cを求める回帰式を決定した。重回帰分析は、グリニド剤を服用した１５１人分の被験者のデータの集合について、遺伝子多型VWFの-1051GGの有無およびALDH2の42421GGの有無を説明変数とし、血中HbA1c値の変化量dHbA1cを目的変数として行った。得られた回帰式は次の（式６）に示す通りであり、重回帰分析の結果は次の表６に示す通りであった。
【００９４】
dHbA1c＝−０．３６３３２×[VWF_-1051GG]−０．６２０１７×[ALDH2_42421GG]＋６．９４４７３                （式６）
【表６】
2016067323.tif 000008
【００９５】
（４）インスリン製剤
表１に示す種々の遺伝子多型のうち、THPOの5713Aアレル、CCR5の59029GGおよびIL10の-819TTについて、被験者の血中HbA1c値の変化値との間に有意な関連性を見出した。（１）のαグルコシダーゼ阻害剤について示した例と同様に、重回帰分析により、所定の期間（６ヶ月）経過後の被験者の血中HbA1c値の変化量dHbA1cを求める回帰式を決定した。重回帰分析は、インスリン製剤を注射にて投与された５５８人分の被験者のデータの集合について、遺伝子多型THPOの5713Aアレルの有無、CCR5の59029GGの有無、およびIL10の-819TTの有無を説明変数とし、血中HbA1c値の変化量dHbA1cを目的変数として行った。得られた回帰式は次の（式７）に示す通りであり、重回帰分析の結果は次の表７に示す通りであった。
【００９６】
dHbA1c＝−０．２７５５１×[THPO_5713A_Allele]−０．２５９２９×[CCR5_59029GG]−０．２１０４１×[IL10_-819TT]＋７．８０５１４                （式７）
【表７】
2016067323.tif 000009
【００９７】
（５）ピオグリタゾン剤
表１に示す種々の遺伝子多型のうち、CCL5の-28Gアレルについて、被験者の血中HbA1c値の変化値との間に有意な関連性を見出した。（１）のαグルコシダーゼ阻害剤について示した例と同様に、重回帰分析により、所定の期間（６ヶ月）経過後の被験者の血中HbA1c値の変化量dHbA1cを求める回帰式を決定した。重回帰分析は、ピオグリタゾン剤を服用した２５２人分の被験者のデータの集合について、遺伝子多型CCL5の-28Gアレルの有無を説明変数とし、血中HbA1c値の変化量dHbA1cを目的変数として行った。得られた回帰式は次の（式８）に示す通りであり、重回帰分析の結果は次の表８に示す通りであった。
【００９８】
dHbA1c＝−０．４８２４８×[CCL5_-28G Allele]＋７．０５９６４      （式８）
【表８】
2016067323.tif 000010
【００９９】
（６）スルホニルウレア剤（ＳＵ薬）
表１に示す種々の遺伝子多型のうち、IL18の4383AAおよびMTHFRの677Cアレルについて、被験者の血中HbA1c値の変化値との間に有意な関連性を見出した。（１）のαグルコシダーゼ阻害剤について示した例と同様に、重回帰分析により、所定の期間（６ヶ月）経過後の被験者の血中HbA1c値の変化量dHbA1cを求める回帰式を決定した。重回帰分析は、スルホニルウレア剤（ＳＵ薬）を服用した７６３人分の被験者のデータの集合について、遺伝子多型IL18の4383AAの有無およびMTHFRの677Cアレルの有無を説明変数とし、血中HbA1c値の変化量dHbA1cを目的変数として行った。得られた回帰式は次の（式９）に示す通りであり、重回帰分析の結果は次の表９に示す通りであった。
【０１００】
dHbA1c＝−０．２５４８７×[IL18_4383AA]−０．１８７５６×[MTHFR_677C_Allele]＋７．５９８７９                （式９）
【表９】
2016067323.tif 000011
【符号の説明】
【０１０１】
１    病院
２    分析機関
３    サービス提供機関
４    通信回線
１１    採血手段
１２、２２    コンピュータ
２１    遺伝子多型解析用アレイ
３１    判定装置
３２    ＣＰＵ
３３    メモリ
３４    記録部
３５    通信インタフェース部
３６    操作部
３７    表示部
３８    入出力インタフェース部
３９    内部バス
【図１】
2016067323.tif 000012
【図２】
2016067323.tif 000013
【図３】
2016067323.tif 000014