【手続補正書】
【提出日】平成28年5月27日(2016.5.27)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
少なくとも１０-６Mの結合親和性でＤＬＬ−４エピトープに結合するＩｇＧクラスの完全ヒト抗体であって、
配列番号１、配列番号３、配列番号５、配列番号７、配列番号９、配列番号１１、配列番号１３、配列番号１５、配列番号１７、配列番号１９、配列番号２１、配列番号２３、配列番号２５、配列番号２７、配列番号２９、配列番号３１、配列番号３３、配列番号３５、配列番号３７、配列番号３９およびその組み合わせからなる群から選択されるアミノ酸配列と少なくとも９５％同一であるＨ鎖可変領域配列を有し、
配列番号２、配列番号４、配列番号６、配列番号８、配列番号１０、配列番号１２、配列番号１４、配列番号１６、配列番号１８、配列番号２０、配列番号２２、配列番号２４、配列番号２６、配列番号２８、配列番号３０、配列番号３２、配列番号３４、配列番号３６、配列番号３８、配列番号４０およびその組み合わせからなる群から選択されるアミノ酸配列と少なくとも９５％同一であるＬ鎖可変領域配列を有する、完全ヒト抗体。
【請求項２】
請求項１記載の完全ヒト抗体であって、配列番号１/配列番号２ (Ｃ３と称する)、配列番号３/配列番号４ (Ｃ５と称する)、配列番号５/配列番号６ (Ｃ１０と称する)、配列番号７/配列番号８ (Ｇ６と称する)、配列番号９/配列番号１０ (Ｆ１１と称する)、配列番号１１/配列番号１２ (Ｄ２と称する)、配列番号１３/配列番号１４ (Ｅ１０と称する)、配列番号１５/配列番号１６ (Ｆ１２と称する)、配列番号１７/配列番号１８ (Ｅ５と称する)、配列番号１９/配列番号２０ (Ｈ２と称する)、配列番号２１/配列番号２２ (Ａ１と称する)、配列番号２３/配列番号２４ (Ａ２と称する)、配列番号２５/配列番号２６ (Ａ１１と称する)、配列番号２７/配列番号２８ (Ｃ１２と称する)、配列番号２９/配列番号３０ (Ｄ９と称する)、配列番号３１/配列番号３２ (Ｅ３と称する)、配列番号３３/配列番号３４ (Ｅ６と称する)、配列番号３５/配列番号３６ (Ｆ１と称する)、配列番号３７/配列番号３８ (Ｆ６と称する)、配列番号３９/配列番号４０ (Ｆ１０と称する)およびその組み合わせからなる群から選択されるＨ鎖／Ｌ鎖可変領域配列を有する、完全ヒト抗体。
【請求項３】
Ｈ鎖由来の可変領域とＬ鎖由来の可変領域とを有するＦａｂ完全ヒト抗体断片であって、
配列番号１、配列番号３、配列番号５、配列番号７、配列番号９、配列番号１１、配列番号１３、配列番号１５、配列番号１７、配列番号１９、配列番号２１、配列番号２３、配列番号２５、配列番号２７、配列番号２９、配列番号３１、配列番号３３、配列番号３５、配列番号３７、配列番号３９およびその組み合わせからなる群から選択されるアミノ酸配列と少なくとも９５％同一であるＨ鎖可変領域配列を有し、
配列番号２、配列番号４、配列番号６、配列番号８、配列番号１０、配列番号１２、配列番号１４、配列番号１６、配列番号１８、配列番号２０、配列番号２２、配列番号２４、配列番号２６、配列番号２８、配列番号３０、配列番号３２、配列番号３４、配列番号３６、配列番号３８、配列番号４０およびその組み合わせからなる群から選択されるアミノ酸配列と少なくとも９５％同一であるＬ鎖可変領域配列を有する、Ｆａｂ完全ヒト抗体断片。
【請求項４】
請求項３記載の完全ヒト抗体Ｆａｂ断片であって、該抗体が、配列番号１/配列番号２、配列番号３/配列番号４、配列番号５/配列番号６、配列番号７/配列番号８、配列番号９/配列番号１０、配列番号１１/配列番号１２、配列番号１３/配列番号１４、配列番号１５/配列番号１６、配列番号１７/配列番号１８、配列番号１９/配列番号２０、配列番号２１/配列番号２２、配列番号２３/配列番号２４、配列番号２５/配列番号２６、配列番号２７/配列番号２８、配列番号２９/配列番号３０、配列番号３１/配列番号３２、配列番号３３/配列番号３４、配列番号３５/配列番号３６、配列番号３７/配列番号３８、配列番号３９/配列番号４０およびその組み合わせからなる群から選択されるＨ鎖／Ｌ鎖可変領域配列を有する、完全ヒト抗体Ｆａｂ断片。
【請求項５】
Ｈ鎖由来の可変領域とＬ鎖由来の可変領域およびＨ鎖とＬ鎖の可変領域をつなぐペプチドリンカーを有する一本鎖ヒト抗体であって、
配列番号１、配列番号３、配列番号５、配列番号７、配列番号９、配列番号１１、配列番号１３、配列番号１５、配列番号１７、配列番号１９、配列番号２１、配列番号２３、配列番号２５、配列番号２７、配列番号２９、配列番号３１、配列番号３３、配列番号３５、配列番号３７、配列番号３９およびその組み合わせからなる群から選択されるアミノ酸配列と少なくとも９５％同一であるＨ鎖可変領域配列を有し、
配列番号２、配列番号４、配列番号６、配列番号８、配列番号１０、配列番号１２、配列番号１４、配列番号１６、配列番号１８、配列番号２０、配列番号２２、配列番号２４、配列番号２６、配列番号２８、配列番号３０、配列番号３２、配列番号３４、配列番号３６、配列番号３８、配列番号４０およびその組み合わせからなる群から選択されるアミノ酸配列と少なくとも９５％同一であるＬ鎖可変領域配列を有する、一本鎖ヒト抗体。
【請求項６】
請求項５記載の完全ヒト一本鎖抗体であって、配列番号１/配列番号２、配列番号３/配列番号４、配列番号５/配列番号６、配列番号７/配列番号８、配列番号９/配列番号１０、配列番号１１/配列番号１２、配列番号１３/配列番号１４、配列番号１５/配列番号１６、配列番号１７/配列番号１８、配列番号１９/配列番号２０、配列番号２１/配列番号２２、配列番号２３/配列番号２４、配列番号２５/配列番号２６、配列番号２７/配列番号２８、配列番号２９/配列番号３０、配列番号３１/配列番号３２、配列番号３３/配列番号３４、配列番号３５/配列番号３６、配列番号３７/配列番号３８、配列番号３９/配列番号４０およびその組み合わせからなる群から選択されるＨ鎖／Ｌ鎖可変領域配列を有する、完全ヒト一本鎖抗体。
【請求項７】
Ｈ鎖可変領域とＬ鎖可変領域の両方を有する請求項５記載の完全ヒト一本鎖抗体であって、配列番号１/配列番号２、配列番号３/配列番号４、配列番号５/配列番号６、配列番号７/配列番号８、配列番号９/配列番号１０、配列番号１１/配列番号１２、配列番号１３/配列番号１４、配列番号１５/配列番号１６、配列番号１７/配列番号１８、配列番号１９/配列番号２０、配列番号２１/配列番号２２、配列番号２３/配列番号２４、配列番号２５/配列番号２６、配列番号２７/配列番号２８、配列番号２９/配列番号３０、配列番号３１/配列番号３２、配列番号３３/配列番号３４、配列番号３５/配列番号３６、配列番号３７/配列番号３８、配列番号３９/配列番号４０およびその組み合わせからなる群から選択されるＨ鎖／Ｌ鎖可変領域配列を有する、完全ヒト一本鎖抗体。
【請求項８】
有効量の抗ＤＬＬ−４ポリペプチドを投与することを含む、広範囲の哺乳類のがんの処置方法であって、
該ＤＬＬ−４ポリペプチドが、少なくとも１０-６ Mの結合親和性でＤＬＬ−４エピトープに結合するＩｇＧクラスの完全ヒト抗体、Ｈ鎖由来の可変領域とＬ鎖由来の可変領域とを有するＦａｂ完全ヒト抗体断片、Ｈ鎖由来の可変領域とＬ鎖由来の可変領域およびＨ鎖とＬ鎖の可変領域をつなぐペプチドリンカーを有する一本鎖ヒト抗体およびその組み合わせからなる群から選択され；ここで、
該完全ヒト抗体が、配列番号１、配列番号３、配列番号５、配列番号７、配列番号９、配列番号１１、配列番号１３、配列番号１５、配列番号１７、配列番号１９、配列番号２１、配列番号２３、配列番号２５、配列番号２７、配列番号２９、配列番号３１、配列番号３３、配列番号３５、配列番号３７、配列番号３９およびその組み合わせからなる群から選択されるアミノ酸配列と少なくとも９５％同一であるＨ鎖可変領域配列を有し、
配列番号２、配列番号４、配列番号６、配列番号８、配列番号１０、配列番号１２、配列番号１４、配列番号１６、配列番号１８、配列番号２０、配列番号２２、配列番号２４、配列番号２６、配列番号２８、配列番号３０、配列番号３２、配列番号３４、配列番号３６、配列番号３８、配列番号４０およびその組み合わせからなる群から選択されるアミノ酸配列と少なくとも９５％同一であるＬ鎖可変領域配列を有し;
該Ｆａｂ完全ヒト抗体断片が、配列番号１、配列番号３、配列番号５、配列番号７、配列番号９、配列番号１１、配列番号１３、配列番号１５、配列番号１７、配列番号１９、配列番号２１、配列番号２３、配列番号２５、配列番号２７、配列番号２９、配列番号３１、配列番号３３、配列番号３５、配列番号３７、配列番号３９およびその組み合わせからなる群から選択されるアミノ酸配列と少なくとも９５％同一であるＨ鎖可変領域配列を有し、
配列番号２、配列番号４、配列番号６、配列番号８、配列番号１０、配列番号１２、配列番号１４、配列番号１６、配列番号１８、配列番号２０、配列番号２２、配列番号２４、配列番号２６、配列番号２８、配列番号３０、配列番号３２、配列番号３４、配列番号３６、配列番号３８、配列番号４０およびその組み合わせからなる群から選択されるアミノ酸配列と少なくとも９５％同一であるＬ鎖可変領域配列を有し;
該一本鎖ヒト抗体が、配列番号１、配列番号３、配列番号５、配列番号７、配列番号９、配列番号１１、配列番号１３、配列番号１５、配列番号１７、配列番号１９、配列番号２１、配列番号２３、配列番号２５、配列番号２７、配列番号２９、配列番号３１、配列番号３３、配列番号３５、配列番号３７、配列番号３９およびその組み合わせからなる群から選択されるアミノ酸配列と少なくとも９５％同一であるＨ鎖可変領域配列を有し、
配列番号２、配列番号４、配列番号６、配列番号８、配列番号１０、配列番号１２、配列番号１４、配列番号１６、配列番号１８、配列番号２０、配列番号２２、配列番号２４、配列番号２６、配列番号２８、配列番号３０、配列番号３２、配列番号３４、配列番号３６、配列番号３８、配列番号４０およびその組み合わせからなる群から選択されるアミノ酸配列と少なくとも９５％同一であるＬ鎖可変領域配列を有する、処置方法。
【請求項９】
請求項８記載の広範囲の哺乳類のがんの処置方法であって、該完全ヒト抗体が、配列番号１/配列番号２、配列番号３/配列番号４、配列番号５/配列番号６、配列番号７/配列番号８、配列番号９/配列番号１０、配列番号１１/配列番号１２、配列番号１３/配列番号１４、配列番号１５/配列番号１６、配列番号１７/配列番号１８、配列番号１９/配列番号２０、配列番号２１/配列番号２２、配列番号２３/配列番号２４、配列番号２５/配列番号２６、配列番号２７/配列番号２８、配列番号２９/配列番号３０、配列番号３１/配列番号３２、配列番号３３/配列番号３４、配列番号３５/配列番号３６、配列番号３７/配列番号３８、配列番号３９/配列番号４０およびその組み合わせからなる群から選択されるＨ鎖／Ｌ鎖可変領域配列を有する、処置方法。
【請求項１０】
請求項８記載の広範囲の哺乳類のがんの処置方法であって、該完全ヒト抗体Ｆａｂ断片が、Ｈ鎖可変領域とＬ鎖可変領域の両方を有し、配列番号１/配列番号２、配列番号３/配列番号４、配列番号５/配列番号６、配列番号７/配列番号８、配列番号９/配列番号１０、配列番号１１/配列番号１２、配列番号１３/配列番号１４、配列番号１５/配列番号１６、配列番号１７/配列番号１８、配列番号１９/配列番号２０、配列番号２１/配列番号２２、配列番号２３/配列番号２４、配列番号２５/配列番号２６、配列番号２７/配列番号２８、配列番号２９/配列番号３０、配列番号３１/配列番号３２、配列番号３３/配列番号３４、配列番号３５/配列番号３６、配列番号３７/配列番号３８、配列番号３９/配列番号４０およびその組み合わせからなる群から選択されるＨ鎖／Ｌ鎖可変領域配列を有する、処置方法。
【請求項１１】
請求項８記載の広範囲の哺乳類のがんの処置方法であって、該完全ヒト一本鎖抗体が、Ｈ鎖可変領域およびＬ鎖可変領域の両方を有し、配列番号１/配列番号２、配列番号３/配列番号４、配列番号５/配列番号６、配列番号７/配列番号８、配列番号９/配列番号１０、配列番号１１/配列番号１２、配列番号１３/配列番号１４、配列番号１５/配列番号１６、配列番号１７/配列番号１８、配列番号１９/配列番号２０、配列番号２１/配列番号２２、配列番号２３/配列番号２４、配列番号２５/配列番号２６、配列番号２７/配列番号２８、配列番号２９/配列番号３０、配列番号３１/配列番号３２、配列番号３３/配列番号３４、配列番号３５/配列番号３６、配列番号３７/配列番号３８、配列番号３９/配列番号４０およびその組み合わせからなる群から選択されるＨ鎖／Ｌ鎖可変領域配列を有する、処置方法。
【請求項１２】
請求項８記載の広範囲の哺乳類のがんの処置方法であって、処置する広範囲の哺乳類のがんが、卵巣がん、結腸がん、乳がん、肺がん、骨髄腫、神経芽腫由来ＣＮＳ腫瘍、単球性白血病、Ｂ細胞由来白血病、Ｔ細胞由来白血病、Ｂ細胞由来リンパ腫、Ｔ細胞由来リンパ腫、脂肪細胞由来腫瘍およびその組み合わせからなる群から選択される、処置方法。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０００１
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０００１】
本発明は、抗ＤＬＬ−４抗体に関連するまたは由来する組成物および方法を提供する。より具体的には、本発明は、ＤＬＬ−４に結合するヒト抗体、該抗体のＤＬＬ−４結合断片および誘導体および、該断片を含む、ＤＬＬ−４-結合ポリペプチドを提供する。さらに、本発明は、抗体、抗体断片および誘導体およびポリペプチド、ならびにかかる抗体、抗体断片および誘導体およびポリペプチドの使用方法、例えば、ＤＬＬ−４-に関連する障害または症状を示す対象の処置または診断方法を提供する。
【手続補正３】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００２４
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００２４】
抗体は、血清または血漿のような、種々の抗原特異性を有する免疫グロブリンを含む供給源から入手し得る。該抗体を親和性精製に付した場合、特定の抗原特異性に富むようにすることができる。かかる抗体の富化生成物は、通常、特定の抗原に対する特異的な結合活性を有する抗体が約１０％よりも少ない状態から作製される。これらの生成物に対して親和性精製を複数回行うことで、該抗原に対する特異的な結合活性を有する抗体の割合を上昇させることができる。このように作製した抗体は、しばしば、「単一特異性」と称される。単一特異性抗体生成物は、約１０%、２０%、３０%、４０%、５０%、６０%、７０%、７５%、８０%、８５%、９０%、９５%、９７%、９９%または９９.９%の、特定の抗原に対する特異的な結合活性を有する抗体からなっていてよい。
【手続補正４】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００２７
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００２７】
一本鎖抗体(scFv)は、VL領域およびVH領域が、リンカー(例えばアミノ酸残基の合成配列) により連結して連続的な蛋白質鎖を形成し、該蛋白質が折り重なり、一価の抗原結合部位を形成できる程度に該リンカーが長い抗体である(Bird et al., 1988, Science 242:423-26およびHuston et al., 1988, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 85:5879-83)。二特異性抗体は、２つのポリペプチド鎖を含み、各ポリペプチド鎖が、同一鎖上の２つの領域間で対になるには短すぎるリンカーにより連結しているVHおよびVL領域を含むため、各ドメインが他のポリペプチド鎖上の相補的なドメインと対になることができる二価の抗体である(Holliger et al., 1993, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 90:6444-48およびPoljak et al., 1994, Structure 2:1121-23)。二特異性抗体の２つのポリペプチド鎖が同一である場合、それらが対になることにより生じる二特異性抗体は、２つの同一の抗原結合部位を有する。異なる配列を有するポリペプチド鎖は、２つの異なる抗原結合部位を有する二特異性抗体の作製に用いることができる。同様に、三特異性抗体および四特異性抗体は、それぞれ３つおよび４つのポリペプチド鎖を含み、３つおよび４つの抗原結合部位を形成する抗体であり、該抗原結合部位は同一であっても異なっていてもよい。
【手続補正５】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００３０
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００３０】
「ヒト抗体」という語は、ヒト免疫グロブリン配列由来の可変領域および定常領域を１つ以上有する抗体全てを含む。態様の一において、可変領域および定常領域は、全てヒト免疫グロブリン配列由来である（完全ヒト抗体）。これらの抗体は、例えば以下に示すような種々の方法で作製されてよく、例えば、ヒトのＨ鎖および／またはＬ鎖をコードする遺伝子から得られる抗体を発現するように遺伝的に修飾したマウスを、目的とする抗原で免疫化することにより作製することも含まれる。
【手続補正６】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００３５
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００３５】
抗体の断片または類似体は、本明細書の記載にしたがって、および当該分野で公知の技術を用いて当業者により容易に製造し得る。断片または類似体のＮ末端およびＣ末端は、機能性ドメインの境界の近くであることが好ましい。構造ドメインおよび機能性ドメインは、ヌクレオチドおよび／またはアミノ酸配列データを、公共のもしくは私有の配列データベースと比較することにより特定し得る。コンピューターによる比較方法を用いて、構造および／または機能が知られている他の蛋白質に見られる配列モチーフまたは予測される蛋白質立体構造を特定してもよい。公知の３次元構造に折りたたまれる蛋白質配列を特定する方法が知られている (Bowie et al., 1991, Science 253:164)。
【手続補正７】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００６５
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００６５】
上述の結合体は、より具体的には、式（ＩＩ）:
Ｐ--ＮＨＣＯ--(ＣＨ２)ｘ--(ＯＣＨ２ＣＨ２)ｍ--ＯＲ (II)
によって表されてよく、式中、Pは本明細書に記載の結合ポリペプチドの基であり（すなわち式（ＩＩ）に示すカルボニルとアミド結合を形成するアミノ基を含まない）； Ｒは低級アルキルであり; xは２または３であり; ｍは約４５０〜約９５０であり、結合体から結合ペプチドを引いた分子量が約１０〜約４０kDaになるように選択される。本明細書において、「ｍ」の特定の範囲は、配向について意味を持つ。「ｍ」の範囲は、いずれの場合においても、ＰＥＧ基の分子量によって厳密に決定される。当業者は、例えば、ＰＥＧ化結合ポリペプチドが、治療的にどのように用いられるか、所望の用量、循環時間、蛋白質分解に対する耐性、免疫原性および他の考慮する事項に基づいて、ＰＥＧの適当な分子量を選択し得る。
【手続補正８】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００６８
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００６８】
１０Fn３ポリペプチドのＰＥＧ化は、当該分野の最新の方法によって、例えば結合ポリペプチドと求電子活性ＰＥＧ(供給元: Shearwater Corp., USA, www.shearwatercorp.com)の反応によって行ってよい。本発明の好ましいPEG試薬は、例えば、N-ヒドロキシスクシンイミジルプロピオネート (PEG-SPA)、ブタノエート (PEG-SBA)、PEG-スクシンイミジルプロピオネートまたは分枝N-ヒドロキシスクシンイミド、例えばmPEG２-NHS (Monfardini et al., Bioconjugate Chem. 6 (1995) 62-69)である。該方法を、結合ポリペプチドのリジンのｆ−アミノ基またはＮ末端のアミノ基でのＰＥＧ化に用いてよい。
【手続補正９】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０１３８
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０１３８】
形質転換細胞は、ポリペプチドの発現を促進する条件下で培養してよく、該ポリペプチドは、慣用的な蛋白質精製手法により回収する。かかる精製手法の１つは、親和性クロマトグラフィー、例えばそこに結合しているＤＬＬ−４の全てまたは一部（例えば細胞外ドメイン）を有するマトリクスに対する親和性クロマトグラフィーの使用を含む。本明細書で使用することを考慮しているポリペプチドとしては、内在性の物質の混入を実質的に含まない、実質的に同種の組み換え哺乳類抗ＤＬＬ−４抗体ポリペプチドが挙げられる。
【手続補正１０】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０１４７
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０１４７】
本発明はさらに、多特異性抗原結合蛋白質、例えば二重特異性抗原結合蛋白質、例えば、２つの異なる抗原結合部位または領域を介して、ＤＬＬ−４の異なる２つのエピトープに結合する、またはＤＬＬ−４のエピトープと他の分子のエピトープとに結合する抗原結合蛋白質を提供する。さらに、本明細書に記載の二重特異性抗原結合蛋白質は、本明細書に記載する抗体の１つ由来のＤＬＬ−４結合部位と、他文献の引用により本明細書に包含される抗体を含む、本明細書に記載する他の抗体由来の第二のＤＬＬ−４結合領域とを含んでいてもよい。あるいは、二重特異性抗原結合蛋白質は、本明細書に記載する抗体の１つ由来の抗原結合部位と、当該分野で公知の他のＤＬＬ−４抗体、または公知の方法もしくは本明細書に記載の方法により作製した抗体由来の第二の抗原結合部位を含んでいてよい。