【手続補正書】
【提出日】平成28年5月18日(2016.5.18)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
IL-6に特異的に結合する抗体またはその抗原結合断片であって、該抗体または該抗原結合断片のCDRは、IL-6に該抗体または該抗原結合断片が結合するとIL-6上のF229空隙またはF279空隙と相互作用する少なくとも1つのアミノ酸残基を含み、該F229空隙は、結合するとIL-6RのF229残基がIL6と相互作用するIL-6上の部位を含み、かつ、該F279空隙は、結合するとIL-6RのF279残基がIL6と相互作用するIL-6上の部位を含む、前記抗体またはその抗原結合断片。
【請求項２】
VLドメインを含む、請求項1に記載の抗体または抗原結合断片であって、F229空隙と相互作用する前記アミノ酸残基が、該VLドメイン上の、Kabatによる位置番号30のアミノ酸である、前記抗体または抗原結合断片。
【請求項３】
前記位置番号30のアミノ酸がチロシンである、請求項2に記載の抗体または抗原結合断片。
【請求項４】
VHドメインを含む、請求項1または2に記載の抗体または抗原結合断片であって、F279空隙と相互作用する前記アミノ酸残基が、該VHドメイン上の、Kabatによる位置番号99のアミノ酸である、前記抗体または抗原結合断片。
【請求項５】
前記位置番号99のアミノ酸がバリンである、請求項4に記載の抗体または抗原結合断片。
【請求項６】
以下のアミノ酸配列の少なくとも一つを含むVHドメインを含む、請求項1〜5のいずれか一項に記載の抗体または抗原結合断片：
(a) SEQ ID NO:497〜500、543、544、566、567、および568からなる群より選択されるHCDR3アミノ酸配列；
(b) SEQ ID NO:501〜507および545〜554からなる群より選択されるHCDR2アミノ酸配列；ならびに
(c) SEQ ID NO:508〜512および555〜562からなる群より選択されるHCDR1アミノ酸配列。
【請求項７】
以下のアミノ酸配列の少なくとも一つを含むVLドメインを含む、請求項1〜6のいずれか一項に記載の抗体または抗原結合断片：
(a) SEQ ID NO:513〜524および563からなる群より選択されるLCDR3アミノ酸配列；
(b) SEQ ID NO:525〜535および564からなる群より選択されるLCDR2アミノ酸配列；ならびに
(c) SEQ ID NO:536〜542および565からなる群より選択されるLCDR1アミノ酸配列。
【請求項８】
以下のVHドメインならびにVLドメインの少なくとも一つを含む、請求項1〜7のいずれか一項に記載の抗体または抗原結合断片：
(a) SEQ ID NO:1〜232および569〜571からなる群より選択されるアミノ酸配列を有するVHドメイン；ならびに
(b) SEQ ID NO:233〜496からなる群より選択されるアミノ酸配列を有するVLドメイン。
【請求項９】
IL-6に特異的に結合する抗体またはその抗原結合断片であって、IL-6に該抗体または該抗原結合断片が結合するとIL-6上のF229空隙と相互作用するアミノ酸およびIL-6に該抗体または該抗原結合断片が結合するとIL-6上のF279空隙と相互作用するアミノ酸の少なくとも一つを含むヒトカノニカル折り畳み構造の組み合わせを含む、前記抗体またはその抗原結合断片。
【請求項１０】
IL-6上のF229空隙またはF279空隙と相互作用する前記ヒトカノニカル折り畳み構造の組み合わせが、以下の少なくとも一つを含む、請求項9記載の抗体または抗原結合断片：
(a) 1-1、1-2、1-3、1-4、1-6、2-1、3-1、および3-5からなる群より選択されるヒトカノニカル折り畳み構造の組み合わせに対応するカノニカル折り畳み構造の組み合わせを形成する超可変ループH1およびH2;
(b) 11-7、13-7(A、B、C)、14-7 (A、B)、12-11、14-11、12-12、2-1、3-1、4-1、および6-1からなる群より選択されるヒトカノニカル折り畳み構造の組み合わせに対応するカノニカル折り畳み構造の組み合わせを形成する超可変ループL1およびL2; 
(c) ヒト1ACY抗体構造に見出されるヒトカノニカル折り畳み構造の3-1の組み合わせに対応するカノニカル折り畳み構造の組み合わせを形成する超可変ループH1およびH2;
(d) ヒト3MUG抗体構造に見出されるヒトカノニカル折り畳み構造の6λ-1の組み合わせに対応するカノニカル折り畳み構造の組み合わせを形成する超可変ループL1およびL2; ならびに
(e)該ヒト3MUG抗体構造に見出されるヒトカノニカル折り畳み構造の6λ-1-5の組み合わせに対応するカノニカル折り畳み構造の組み合わせを形成する超可変ループL1、L2、およびL3。
【請求項１１】
以下の性質の少なくとも一つを有する、請求項1〜10のいずれか一項に記載の抗体または抗原結合断片：
(a) IL-6受容体へのIL-6の結合を阻害する;
(b) IL-6受容体へのgp130の結合を阻害する;
(c) ヒトおよびカニクイザル(cynomolgus monkey) IL-6に特異的に結合する;
(d) IL-6に特異的に結合するラクダ科動物抗体由来の少なくとも1つのCDRを含む;
(e) 約10.0未満のEpiBase(登録商標)スコアを特徴とする;
(f) HEK293細胞において一過性発現により少なくとも20 mg/mlで発現される;
(g) 65℃超の融解温度(Tm)を示す;
(h) 0.1 pM未満のIC50でB9ハイブリドーマ細胞のIL-6誘導性増殖を阻害する;
(i) 表面プラズモン共鳴によって測定された2×10-5 s-1未満のオフ速度でヒトIL-6に結合する;
(j)ラクダ科動物親抗体よりも高い融解温度を有する、該ラクダ科動物親抗体の生殖細胞系列化された変種である;
(k) その後の親和性成熟なしのラマ(Lama)の通常型抗体由来の少なくとも1つのCDRを含む;
(l) 天然のIgG1 Fcの形式でカニクイザルへ静脈内投与された場合に、少なくとも9日、または少なくとも15日の血清中半減期を有する;あるいは
(m) 親結合分子の生殖細胞系列化された変種であり、該結合分子がVHドメインおよびVLドメインを含み、かつ該結合分子の該VHドメインおよび該VLドメインの一方もしくは両方が、非ヒト親抗体の対応するVHドメインおよびVLドメインと比べてフレームワーク領域にわたり合計1〜10個のアミノ酸置換を含み; かつ/またはVHドメインおよびVLドメインを含み、該結合分子の該VHドメインもしくは該VLドメインの一方もしくは両方が、フレームワーク領域FR1、FR2、FR3、およびFR4にわたって1つまたは複数の対応するヒトVHドメインまたはVLドメインとの90%またはそれ以上の配列同一性を示す。
【請求項１２】
SEQ ID NO:1〜232および569〜571からなる群より選択されるアミノ酸配列を有するVHドメインを含み、少なくとも1つのグルタミンがグルタミン酸に変更されている、請求項1〜11のいずれか一項に記載の抗体または抗原結合断片。
【請求項１３】
SEQ ID NO:152のアミノ酸配列を含むVHドメイン、および
SEQ ID NO:416のアミノ酸配列を含むVLドメイン
を含む、IL-6に特異的に結合する抗体またはその抗原結合断片。
【請求項１４】
SEQ ID NO: 508の HCDR1アミノ酸配列、
SEQ ID NO: 501の HCDR2アミノ酸配列、および
SEQ ID NO: 497の HCDR3アミノ酸配列
を含む、IL-6に特異的に結合する抗体またはその抗原結合断片。
【請求項１５】
SEQ ID NO: 536の LCDR1アミノ酸配列、および
SEQ ID NO: 513の LCDR3アミノ酸配列
を含む、IL-6に特異的に結合する抗体またはその抗原結合断片。
【請求項１６】
SEQ ID NO: 525の LCDR2アミノ酸配列
を含む、IL-6に特異的に結合する抗体またはその抗原結合断片。
【請求項１７】
SEQ ID NO: 508の HCDR1アミノ酸配列、
SEQ ID NO: 501の HCDR2アミノ酸配列、
SEQ ID NO: 497の HCDR3アミノ酸配列、
SEQ ID NO: 536の LCDR1アミノ酸配列、
SEQ ID NO: 525の LCDR2アミノ酸配列、および
SEQ ID NO: 513の LCDR3アミノ酸配列
を含む、IL-6に特異的に結合する抗体またはその抗原結合断片。
【請求項１８】
IL-6受容体へのIL-6の結合を阻害する、請求項13〜17のいずれか一項に記載の抗体または抗原結合断片。
【請求項１９】
親結合分子の生殖細胞系列化された変種であり、該結合分子がVHドメインおよびVLドメインを含み、かつ該結合分子の該VHドメインおよび該VLドメインの一方もしくは両方が、非ヒト親抗体の対応するVHドメインおよびVLドメインと比べてフレームワーク領域にわたり合計1〜10個のアミノ酸置換を含み; かつ/またはVHドメインおよびVLドメインを含み、該結合分子の該VHドメインもしくは該VLドメインの一方もしくは両方が、フレームワーク領域FR1、FR2、FR3、およびFR4にわたって1つまたは複数の対応するヒトVHドメインまたはVLドメインとの90%またはそれ以上の配列同一性を示す、請求項13〜17のいずれか一項に記載の抗体または抗原結合断片。
【請求項２０】
(i) IL-6への結合に関して請求項13〜17記載の抗体と競合するか、または
(ii) IL-6上の、請求項13〜17記載の抗体と同じエピトープに結合する、
抗体またはその抗原結合断片。
【請求項２１】
二重変異H433K/N434Fを有するヒトFcドメインを含む、請求項1〜20のいずれか一項に記載の抗体または抗原結合断片。
【請求項２２】
請求項1〜20のいずれか一項に記載の抗体または抗原結合断片および薬学的に許容される担体を含む、薬学的組成物。
【請求項２３】
請求項1〜20のいずれか一項に記載の抗体または抗原結合断片を含む、IL-6関連疾患またはIL-6関連障害を処置するための薬学的組成物であって、その処置を必要とする対象に投与される、前記薬学的組成物。
【請求項２４】
請求項1〜20のいずれか一項に記載の抗体または抗原結合断片をコードする、単離された核酸。
【請求項２５】
請求項24に記載の核酸を含む、組換え発現ベクター。
【請求項２６】
請求項25に記載の組換え発現ベクターをインビトロで含む、宿主細胞。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００３４
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００３４】
別の局面において、本発明は、本発明の組換え発現ベクターを含む宿主細胞を提供する。
[本発明1001]
IL-6に特異的に結合し、少なくとも1つの抗体CDRを含む結合分子であって、該CDRが少なくとも1つのアミノ酸残基を含み、該結合分子がIL-6に結合すると該アミノ酸残基がIL-6上のF229空隙またはF279空隙に埋め込まれる、結合分子。
[本発明1002]
Kabatによる位置番号30のアミノ酸を有するVLドメインを含み、前記結合分子がIL-6に結合すると該アミノ酸がIL-6上のF229空隙に埋め込まれる、本発明1001の結合分子。
[本発明1003]
前記位置番号30のアミノ酸がチロシンである、本発明1002の結合分子。
[本発明1004]
Kabatによる位置番号99のアミノ酸を有するVHドメインを含み、前記結合分子がIL-6に結合すると該アミノ酸がIL-6上のF279空隙に埋め込まれる、前記本発明のいずれかの結合分子。
[本発明1005]
前記位置番号99のアミノ酸がバリンである、本発明1004の結合分子。
[本発明1006]
抗体またはその抗原結合断片である、前記本発明のいずれかの結合分子。
[本発明1007]
SEQ ID NO:497〜500、543、544、566、567、および568からなる群より選択されるHCDR3アミノ酸配列を含むVHドメインを含む、前記本発明のいずれかの結合分子。
[本発明1008]
前記VHが、SEQ ID NO:501〜507および545〜554からなる群より選択されるHCDR2アミノ酸配列をさらに含む、本発明1007の結合分子。
[本発明1009]
前記VHが、SEQ ID NO:508〜512および555〜562からなる群より選択されるHCDR1アミノ酸配列をさらに含む、本発明1007または1008の結合分子。
[本発明1010]
SEQ ID NO:513〜524および563からなる群より選択されるLCDR3アミノ酸配列を含むVLドメインをさらに含む、本発明1007〜1009のいずれかの結合分子。
[本発明1011]
前記VLドメインが、SEQ ID NO:525〜535および564からなる群より選択されるLCDR2アミノ酸配列をさらに含む、本発明1010の結合分子。
[本発明1012]
前記VLドメインが、SEQ ID NO:536〜542および565からなる群より選択されるLCDR1アミノ酸配列をさらに含む、本発明1010または1011の結合分子。
[本発明1013]
SEQ ID NO:1〜232および569〜571からなる群より選択されるアミノ酸配列を有するVHドメインを含む、本発明1006の結合分子。
[本発明1014]
SEQ ID NO:233〜496からなる群より選択されるアミノ酸配列を有するVLドメインを含む、本発明1006の結合分子。
[本発明1015]
SEQ ID NO:1〜232および569〜571からなる群より選択されるアミノ酸配列を有するVHドメイン; ならびにSEQ ID NO:233〜496からなる群より選択されるアミノ酸配列を有するVLドメインを含む、本発明1006の結合分子。
[本発明1016]
VHドメインおよびVLドメインを含み、該VHドメインが超可変ループH1、H2、およびH3を含み、VHドメインポリペプチドが、超可変ループL1、L2、およびL3を含むVLドメインと対合し、超可変ループH1〜H3およびL1〜L3の少なくとも1つが、IL-6抗原によるラマ(Lama)種の能動免疫によって該ラマ種の通常型抗体から得られる、前記本発明のいずれかの結合分子。
[本発明1017]
(a) 前記超可変ループH1、H2、L1、L2、およびL3の少なくとも1つが、ヒト抗体において存在するH1、H2、L1、L2、もしくはL3超可変ループの対応するカノニカル折り畳み構造と同一もしくは実質的に同一である予測されたもしくは実際のカノニカル折り畳み構造を示し;
(b) 超可変ループH1およびH2がそれぞれ、対応するヒトカノニカル折り畳み構造と同一もしくは実質的に同一である予測されたもしくは実際のカノニカル折り畳み構造を示し;
(c) 超可変ループL1、L2、およびL3がそれぞれ、該対応するヒトカノニカル折り畳み構造と同一もしくは実質的に同一である予測されたもしくは実際のカノニカル折り畳み構造を示し;
(d) 超可変ループH1およびH2が、ヒト生殖細胞系列VHドメインに存在することが公知であるカノニカル折り畳み構造の対応する組み合わせと同一もしくは実質的に同一である予測されたもしくは実際のカノニカル折り畳み構造の組み合わせを形成し;
(e) 超可変ループH1およびH2が、1-1、1-2、1-3、1-4、1-6、2-1、3-1、および3-5からなる群より選択されるヒトカノニカル折り畳み構造の組み合わせに対応するカノニカル折り畳み構造の組み合わせを形成し;
(f) 超可変ループL1およびL2が、ヒト生殖細胞系列VLドメインに存在することが公知であるカノニカル折り畳み構造の対応する組み合わせと同一もしくは実質的に同一である予測されたもしくは実際のカノニカル折り畳み構造の組み合わせを形成し;
(g) 超可変ループL1およびL2が、11-7、13-7(A、B、C)、14-7 (A、B)、12-11、14-11、12-12、2-1、3-1、4-1、および6-1からなる群より選択されるヒトカノニカル折り畳み構造の組み合わせに対応するカノニカル折り畳み構造の組み合わせを形成し;
(h) 超可変ループH1およびH2が、ヒト1ACY抗体構造に見出されるヒトカノニカル折り畳み構造の3-1の組み合わせに対応するカノニカル折り畳み構造の組み合わせを形成し;
(i) 超可変ループL1およびL2が、ヒト3MUG抗体構造に見出されるヒトカノニカル折り畳み構造の6λ-1の組み合わせに対応するカノニカル折り畳み構造の組み合わせを形成し; かつ/または
(j) 超可変ループL1、L2、およびL3が、該ヒト3MUG抗体構造に見出されるヒトカノニカル折り畳み構造の6λ-1-5の組み合わせに対応するカノニカル折り畳み構造の組み合わせを形成する、
本発明1016の結合分子。
[本発明1018]
(a) IL-6受容体へのIL-6の結合を阻害するか;
(b) IL-6受容体へのgp130の結合を阻害するか;
(c) ヒトおよびカニクイザル(cynomolgus monkey) IL-6に特異的に結合するか;
(d) IL-6に特異的に結合するラクダ科動物抗体由来の少なくとも1つのCDRを含むか;
(e) 約10.0未満のEpiBase(登録商標)スコアを特徴とするか;
(f) HEK293細胞において一過性発現により少なくとも20 mg/mlで発現されるか;
(g) 65℃超の融解温度(Tm)を示すか;
(h) 0.1 pM未満のIC50でB9ハイブリドーマ細胞のIL-6誘導性増殖を阻害するか;
(i) 2×10-5 s-1未満のオフ速度(表面プラズモン共鳴によって測定されたkオフ)でヒトIL-6に結合するか;
(j)ラクダ科動物親抗体よりも高い融解温度を有する、該ラクダ科動物親抗体の生殖細胞系列化された変種であるか;
(k) その後の親和性成熟なしの前記ラマの通常型抗体由来の少なくとも1つのCDRを含むか;
(l) 天然のIgG1 Fcの形式でカニクイザルへ静脈内投与された場合に、少なくとも9日、好ましくは少なくとも15日の血清中半減期を有するか; あるいは
(m) 親結合分子の生殖細胞系列化された変種であり、該結合分子がVHドメインおよびVLドメインを含み、かつ該結合分子の該VHドメインおよび該VLドメインの一方もしくは両方が、非ヒト親抗体の対応するVHドメインおよびVLドメインと比べてフレームワーク領域にわたり合計1〜10個のアミノ酸置換を含み; かつ/またはVHドメインおよびVLドメインを含み、該結合分子の該VHドメインもしくは該VLドメインの一方もしくは両方が、フレームワーク領域FR1、FR2、FR3、およびFR4にわたって1つまたは複数の対応するヒトVHドメインまたはVLドメインとの90%またはそれ以上の配列同一性を示す、
前記本発明のいずれかの結合分子。
[本発明1019]
SEQ ID NO:1〜232および569〜571からなる群より選択されるアミノ酸配列を有するVHドメインを含み、少なくとも1つのグルタミンがグルタミン酸に変更されている、前記本発明のいずれかの結合分子。
[本発明1020]
二重変異H433K/N434Fを有するヒトFcドメインを含む、前記本発明のいずれかの結合分子。
[本発明1021]
前記本発明のいずれかの結合分子および1つまたは複数の薬学的に許容される担体を含む、薬学的組成物。
[本発明1022]
IL-6関連疾患またはIL-6関連障害を処置する方法であって、その処置を必要とする対象に、本発明1021の薬学的組成物の有効量を投与する段階を含む、方法。
[本発明1023]
前記本発明のいずれかの結合分子をコードする、単離された核酸。
[本発明1024]
本発明1023の核酸を含む、組換え発現ベクター。
[本発明1025]
本発明1024の組換え発現ベクターを含む、宿主細胞。