【手続補正書】
【提出日】平成28年3月25日(2016.3.25)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
培養皿上の微生物のコロニーの位置を決定し、前記コロニーを選択し、前記選択されたコロニー内の微生物をＭＡＬＤＩを使用して同定する方法であって、
−  培養皿上の微生物のコロニーの位置を決定し、前記コロニーを選択する自動化されたステップと、
−  微生物の前記選択されたコロニーの試料を得る自動化されたステップと、
−  微生物の前記選択されたコロニーの前記試料の少なくとも一部をターゲットプレート上に付着させる自動化されたステップと、
−  微生物の前記選択されたコロニーの前記試料の同定のために、前記試料を有する前記ターゲットプレートを、ＭＡＬＤＩを実行する装置内に移送する自動化されたステップと
を含むことを特徴とする方法。
【請求項２】
微生物の前記選択されたコロニーの前記試料の少なくとも一部をターゲットプレート上に付着させる前記ステップは、微生物の前記選択されたコロニーの前記得られた試料を前記ターゲットプレート上に直接置くことによって実行されることを特徴とする請求項１に記載の方法。
【請求項３】
微生物の前記選択されたコロニーの前記試料の少なくとも一部をターゲットプレート上に付着させる前記ステップは、
−  前記得られた試料を、ある量の懸濁液媒質を含む懸濁液管内に移す自動化されたステップと、
−  前記得られた試料の少なくとも一部分を前記懸濁液媒質中へ移すことによって試料懸濁液を調製する自動化されたステップと、
−  前記試料懸濁液の滴を得る自動化されたステップと、
−  試料懸濁液の前記滴を前記ターゲットプレート上に移す自動化されたステップと
によって実行されることを特徴とする請求項１に記載の方法。
【請求項４】
−  微生物の前記選択されたコロニーの第２の試料を得る自動化されたステップと、
−  微生物の前記選択されたコロニーの前記第２の試料を移送し、微生物の前記選択されたコロニーの前記第２の試料の少なくとも一部を前記試験培養皿上に付着させる自動化されたステップと、
−  前記試験培養皿を、感受性試験または他の追加の分析を実行する装置へ移送する自動化されたステップと
をさらに含むことを特徴とする請求項２に記載の方法。
【請求項５】
−  前記試料懸濁液の第２の滴を得る自動化されたステップと、
−  試料懸濁液の前記第２の滴を試験培養皿上に付着させる自動化されたステップと、
−  前記試験培養皿を、感受性試験または他の追加の分析を実行する装置へ移送する自動化されたステップと
をさらに含むことを特徴とする請求項３に記載の方法。
【請求項６】
前記ターゲットプレート上に付着させた前記試料の部分の上に、ＭＡＬＤＩマトリックス溶液の滴を置く自動化されたステップをさらに含むことを特徴とする請求項２に記載の方法。
【請求項７】
前記ターゲットプレート上に付着させた試料懸濁液の前記滴の上に、ＭＡＬＤＩマトリックス溶液の滴を置く自動化されたステップをさらに含むことを特徴とする請求項３に記載の方法。
【請求項８】
ＭＡＬＤＩマトリックス溶液の前記滴がその上に置かれる前に、前記ターゲットプレート上に付着させた試料懸濁液の前記滴を乾燥させることを特徴とする請求項７に記載の方法。
【請求項９】
微生物の選択されたコロニーに対する処理命令が、微生物の前記コロニーの試料の懸濁液を調製することを示している場合に、微生物の試料の懸濁液を自動調製するステップを含み、微生物の試料の懸濁液を自動調製する前記ステップは、
−  第１の採取ツールを用意し、採取ツールを保持する採取ツールホルダを備える位置決めデバイスを用意する自動化されたステップであって、前記位置決めデバイスは、それぞれ、前記培養皿上の微生物の前記選択されたコロニーの前記得られた位置の上方の開始位置に採取ツールを配置し、採取ツールを前記培養皿に向かって自動的に下げ、採取ツールを自動的に上げて前記培養皿から離し、採取ツールを移送位置に配置するように構成されている自動化されたステップと、
−  前記位置決めデバイスの前記採取ツールホルダ内に前記第１の採取ツールを配置する自動化されたステップと、
−  前記位置決めデバイスによって、前記第１の採取ツールを、前記培養皿上の微生物の前記選択されたコロニーの前記得られた位置の上方の前記開始位置に配置し、前記第１の採取ツールを前記培養皿に向かって自動的に下げ、前記微生物と接触させて、前記微生物の試料を採取し、前記微生物の前記試料を有する前記第１の採取ツールを自動的に上げて、前記培養皿から離し、前記移送位置に置く自動化されたステップと、
−  懸濁液管を保持する懸濁液管ホルダを用意する自動化されたステップと、
−  前記懸濁液管ホルダ内に懸濁液管を配置する自動化されたステップと、
−  前記懸濁液管ホルダ内に保持された懸濁液管内に懸濁液媒質を自動的に分与する自動懸濁液媒質分与器を用意する自動化されたステップと、
−  前記自動分与器によって、前記懸濁液管ホルダ内に保持された前記懸濁液管内に、懸濁液媒質の初期量を自動的に供給する自動化されたステップと、
−  それぞれ、前記位置決めデバイスの前記移送位置から、前記懸濁液管ホルダ内に保持された懸濁液管の上方の位置へ、採取ツールを自動的に移送し、採取ツールを下げて懸濁液管内に含まれる懸濁液媒質の中に入れ、採取ツールを上げて懸濁液管内に含まれる懸濁液媒質から離し、前記懸濁液管ホルダ内に保持された懸濁液管の上方の待機位置に採取ツールを配置する移送デバイスを用意する自動化されたステップと、
−  前記懸濁液管ホルダ内に保持された懸濁液管内に含まれる懸濁液媒質の濁度の測定を実行する濁度計を用意する自動化されたステップと、
−  測定された濁度を示す最終測定値を提供する自動化されたステップと、
−  前記位置決めデバイス、前記移送デバイス、前記自動懸濁液媒質分与器および前記濁度計に通信可能に接続されて、それぞれ、前記位置決めデバイスの移動、前記移送デバイスの移動、前記自動懸濁液媒質分与器の動作および前記濁度計の動作を自動的に制御するコントローラを用意する自動化されたステップと
を含み、
−  前記コントローラは、
ａ）前記最終測定値を、前記コントローラの記憶装置に予め記憶された第１のしきい値と比較し、大きい場合には、前記自動懸濁液媒質分与器が前記懸濁液管内に懸濁液媒質の追加の量を供給することをもたらし、前記第１のしきい値と同一であるかもしくは前記第１のしきい値よりも小さく、かつ前記コントローラの前記記憶装置に予め記憶された第２のしきい値であって、前記第１のしきい値が、前記第２のしきい値に等しいかもしくは前記第２のしきい値よりも大きい、前記第２のしきい値と同一であるかもしくは前記第２のしきい値よりも大きい場合には、さらなる処理のために前記懸濁液を含む前記懸濁液管を前記懸濁液管ホルダから取り外すことができることを知らせる信号を提供する
ことを特徴とする請求項３に記載の方法。
【請求項１０】
前記微生物を含む培養皿をステージ上に自動的に配置し、前記ステージから自動的に除去する自動培養皿配置／除去デバイスを用意するステップと、前記自動培養皿配置／除去デバイスに前記コントローラが通信可能に接続されて前記自動培養皿配置／除去デバイスの動作を制御するように前記コントローラを構成するステップと
を含み、前記微生物を含む培養皿を前記ステージ上に配置する前記ステップは、前記コントローラの制御下で自動的に実行されることを特徴とする請求項９に記載の方法。
【請求項１１】
前記コントローラは、さらなる処理のために前記懸濁液を含む前記懸濁液管を前記懸濁液管ホルダから取り外すことができることを知らせる前記信号が提供された後にのみ、前記自動培養皿配置／除去デバイスによって培養皿が前記ステージから自動的に除去されることが許されるように構成されていることを特徴とする請求項１０に記載の方法。
【請求項１２】
懸濁液管を前記懸濁液管ホルダ内に自動的に配置し、前記懸濁液管ホルダから自動的に取り外す自動懸濁液管配置／取外しデバイスを用意するステップと、前記自動懸濁液管配置／取外しデバイスに前記コントローラが通信可能に接続されて前記自動懸濁液管配置／取外しデバイスの動作を制御するように前記コントローラを構成するステップと
を含み、懸濁液管を前記懸濁液管ホルダ内に配置する前記ステップは、前記コントローラの制御下で自動的に実行されることを特徴とする請求項９に記載の方法。
【請求項１３】
コントローラは、さらなる処理のために懸濁液を含む懸濁液管を懸濁液管ホルダから取り外すことができることを知らせる信号が提供された後にのみ、自動懸濁液管配置／取外しデバイスによって懸濁液管ホルダが前記懸濁液管ホルダから自動的に取り外されるように構成されていることを特徴とする請求項１に記載の方法。
【請求項１４】
前記懸濁液管上に識別マークを提供するステップと、前記懸濁液管の前記識別マークを、微生物の前記選択されたコロニーがそれから得られた前記培養皿のアイデンティティへのリンクを有する前記懸濁液の特性とともに、中央制御コンピュータの前記記憶装置に記憶するステップと
を含むことを特徴とする請求項９に記載の方法。
【請求項１５】
微生物の選択されたコロニーに対する処理命令が、微生物の前記選択されたコロニーの前記得られた試料を前記ターゲットプレート上に直接置くことを示している場合に以下の自動化されたステップ、すなわち：
−  第１の採取ツールを用意し、採取ツールを保持する採取ツールホルダを備える位置決めデバイスを用意する自動化されたステップであり、前記位置決めデバイスは、それぞれ、前記培養皿上の微生物の前記選択されたコロニーの前記得られた位置の上方の開始位置に採取ツールを配置し、採取ツールを前記培養皿に向かって自動的に下げ、採取ツールを自動的に上げて前記培養皿から離し、採取ツールを移送位置に配置するように構成されている自動化されたステップ、
−  前記位置決めデバイスの前記採取ツールホルダ内に前記第１の採取ツールを配置する自動化されたステップ、
−  前記位置決めデバイスによって、前記第１の採取ツールを、前記培養皿上の微生物の前記選択されたコロニーの前記得られた位置の上方の前記開始位置に配置し、前記第１の採取ツールを前記培養皿に向かって自動的に下げ、前記微生物と接触させて、前記微生物の試料を採取し、前記微生物の前記試料を有する前記第１の採取ツールを自動的に上げて、前記培養皿から離し、前記移送位置に置く自動化されたステップ、
−  ターゲットプレートを保持するターゲットプレートホルダを用意する自動化されたステップであり、前記ターゲットプレートは複数の付着スポットを有する自動化されたステップ、
−  前記ターゲットプレートホルダ内にターゲットプレートを配置する自動化されたステップ、
−  前記位置決めデバイスの前記移送位置から、前記ターゲットプレートの前記付着スポットのうちの１つの付着スポットの上方の位置へ、前記採取ツールを自動的に移送し、前記採取ツールを、前記採取ツール上に存在する微生物の前記コロニーの前記試料が前記ターゲットプレートと接触するような態様で下げ、前記採取ツールを、微生物の前記コロニーの前記試料が前記付着スポット上に付着するような態様で、特に、前記ターゲットプレートの前記付着スポットのうちの前記１つの付着スポットの最大でほぼ半分を覆うような態様で、前記ターゲットプレートの平面に平行な平面内で移動させる移送デバイスを用意する自動化されたステップ、および
−  前記採取ツールを前記ターゲットプレートから上げる自動化されたステップと
を含むことを特徴とする請求項２に記載の方法。
【請求項１６】
前記ターゲットプレート上に識別マークを提供し、任意選択で、前記ターゲットプレートの前記付着スポット上に識別マークを提供するステップと、前記ターゲットプレートおよび前記付着スポットの前記識別マークを、微生物の前記選択されたコロニーがそれから得られた前記培養皿のアイデンティティへのリンクを有する懸濁液の特性とともに、中央制御コンピュータの記憶装置に記憶するステップと
を備えることを特徴とする請求項１５に記載の方法。
【請求項１７】
微生物の試料の懸濁液を自動調製する請求項９に記載の方法であって、懸濁液管を前記懸濁液管ホルダ内に自動的に配置し、前記懸濁液管ホルダから自動的に取り外す自動懸濁液管配置／取外しデバイスを用意するステップと、前記自動懸濁液管配置／取外しデバイスに前記コントローラが通信可能に接続されて前記自動懸濁液管配置／取外しデバイスの動作を制御するように前記コントローラを構成するステップと
を含み、懸濁液管を前記懸濁液管ホルダ内に配置する前記ステップは、前記コントローラの制御下で自動的に実行されることを特徴とする方法。
【請求項１８】
微生物の試料の懸濁液を自動調製する請求項１７に記載の方法であって、前記コントローラは、さらなる処理のために前記懸濁液を含む前記懸濁液管を前記懸濁液管ホルダから取り外すことができることを知らせる前記信号が提供された後にのみ、前記自動懸濁液管配置／取外しデバイスによって懸濁液管ホルダが前記懸濁液管ホルダから自動的に取り外されるように構成されていることを特徴とする方法。
【請求項１９】
微生物の試料の懸濁液を自動調製する請求項９に記載の方法または方法のステップを実行する、微生物の試料の懸濁液を自動調製する装置であって、
−  前記微生物を含む培養皿用のステージと、
−  第１の採取ツールおよび追加的な採取ツール、ならびに採取ツールを保持する採取ツールホルダを備える位置決めデバイスであって、前記位置決めデバイスは、それぞれ、前記培養皿の上方の開始位置に採取ツールを配置し、採取ツールを前記培養皿に向かって自動的に下げ、採取ツールを自動的に上げて前記培養皿から離し、採取ツールを移送位置に配置するように構成されている第１の採取ツールおよび追加的な採取ツールならびに位置決めデバイスと、
−  懸濁液管を保持する懸濁液管ホルダと、
−  前記懸濁液管ホルダ内に保持された懸濁液管内に懸濁液媒質を自動的に分与する自動懸濁液媒質分与器と、
−  それぞれ、前記位置決めデバイスの前記移送位置から、前記懸濁液管ホルダ内に保持された懸濁液管の上方の位置へ、採取ツールを自動的に移送し、採取ツールを下げて懸濁液管内に含まれる懸濁液媒質の中に入れ、採取ツールを上げて懸濁液管内に含まれる懸濁液媒質から離し、前記懸濁液管ホルダ内に保持された懸濁液管の上方の待機位置に採取ツールを配置する移送デバイスと、
−  前記懸濁液管ホルダ内に保持された懸濁液管内に含まれる懸濁液媒質の濁度の測定を実行し、測定された濁度を示す最終測定値を提供する濁度計と、
−  前記位置決めデバイス、前記移送デバイス、前記自動懸濁液媒質分与器および前記濁度計に通信可能に接続されて、それぞれ、前記位置決めデバイスの移動、前記移送デバイスの移動、前記自動懸濁液媒質分与器の動作および前記濁度計の動作を自動的に制御するコントローラとを備え、
−  前記コントローラは、
ａ）前記最終測定値が、前記コントローラの記憶装置に予め記憶された第１のしきい値よりも大きいかどうかを判定し、そうである場合にはステップｂ）を実行するように前記コントローラは構成されており、または、前記最終測定値が、前記第１のしきい値と同一であるかもしくは前記第１のしきい値よりも小さく、かつ前記コントローラの前記記憶装置に予め記憶された第２のしきい値であって、前記第１のしきい値は、前記第２のしきい値に等しいかもしくは前記第２のしきい値よりも大きい、前記第２のしきい値と同一であるかもしくは前記第２のしきい値よりも大きいかどうかを判定し、そうである場合にはステップｃ）を実行するように前記コントローラは構成されており、または前記最終測定値が前記第２のしきい値よりも小さいかどうかを判定し、そうである場合にはステップｄ）を実行するように前記コントローラは構成されており、
ｂ）前記自動懸濁液媒質分与器を制御して、前記懸濁液管内に、懸濁液媒質の追加の量を供給し、
ｃ）さらなる処理のために前記懸濁液を含む前記懸濁液管を前記懸濁液管ホルダから取り外すことができることを知らせる信号を提供し、または
ｄ）前記追加的な採取ツールを、前記位置決めデバイスの前記採取ツールホルダ内に配置し、前記位置決めデバイスによって、前記追加的な採取ツールを、前記培養皿の上方の前記開始位置に配置し、前記追加的な採取ツールを前記培養皿に向かって自動的に下げ、前記微生物と接触させて、前記微生物の追加の試料を採取し、前記微生物の前記試料を有する前記追加的な採取ツールを自動的に上げて、前記培養皿から離し、前記移送位置に置き、前記移送デバイスによって、前記微生物の前記追加の試料を有する前記追加的な採取ツールを、前記位置決めデバイスの前記移送位置から、前記懸濁液管ホルダ内に保持された前記懸濁液管の上方の位置へ自動的に移送し、前記微生物の前記追加の試料を有する前記追加的な採取ツールを下げて、前記懸濁液管内に含まれる前記懸濁液媒質の中に入れ、それによって、その中に前記試料を浸し、前記懸濁液管ホルダ内に保持された前記懸濁液管内に含まれる前記懸濁液媒質の濁度を前記濁度計によって測定し、測定された濁度を示す追加の最終測定値を提供し、ステップａ）を実行するように構成されている
ことを特徴とする装置。
【請求項２０】
請求項１９に記載の微生物の試料の懸濁液を自動調製する装置であって、前記コントローラは、前記懸濁液管ホルダ内に保持された前記懸濁液管内に含まれる前記懸濁液媒質の濁度を前記濁度計によって測定するステップが、前記懸濁液管内に含まれる前記懸濁液媒質の中に前記採取ツールが浸される前に開始されるような態様で前記濁度計を制御するように構成されていることを特徴とする装置。