【手続補正書】
【提出日】平成28年9月12日(2016.9.12)
【手続補正１】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０５０３
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０５０３】
発現の調節が、薬物誘導性心臓毒性の発生との相関が薬物(例えば、心臓毒性を引き起こすことが知られるか、または心臓毒性を引き起こす危険性があることが知られる薬物)を用いる処置中に早期に、心臓毒性の生理的徴候の前の心臓毒性を発症する危険性があると被験体を同定するのに有用であるとさらに検証されるマーカーを検出することができる。薬物を用いる被験体の処置を、それに応じて終了する、および/または代替的な処置を推奨する、処方するもしくは施すことができる。
等価物：
当業者であれば、日常的なものを超えない実験を用いて、本明細書に記載の特定の実施形態および方法に対する等価物を認識するか、または確認することができる。そのような等価物は、以下の特許請求の範囲により包含されることが意図される。  本発明の実施形態として、例えば以下を挙げることができる。
(1)  被験体における心血管疾患を診断するための方法であって、
(i)被験体に由来する生物試料中のCCDC47、HMOX1、PTX3、PAI1、IL27、IGFBP7、Emmprin、CFL2、EDIL3、NUCB1、PE D18:0-20:3/D18:1-20:2/D16:0-22:3; PE D18:0-22:5/D18:1-22:4; PE D16:1-22:6; PE P18:1-18:1/P18:0-18:2/P16:0-20:2; LPC 20:3; およびPC-LI-183-D18:22-22:6からなる群から選択される1種以上の心血管疾患(CVD)関連バイオマーカーのレベルを検出すること；ならびに
(ii)被験体に由来する生物試料中の1種以上のCVD関連バイオマーカーのレベルを、対照試料中の対応する1種以上のCVD関連バイオマーカーのレベルと比較すること
を含み、対照試料と比較した生物試料中の1種以上のCVD関連バイオマーカーのレベルの変化が、被験体が心血管疾患に罹患していることを示す、前記方法。
(2)  被験体が心血管疾患を発症する危険性が高いと同定するための方法であって、
(i)被験体に由来する生物試料中のCCDC47、HMOX1、PTX3、PAI1、IL27、IGFBP7、Emmprin、CFL2、EDIL3、NUCB1、PE D18:0-20:3/D18:1-20:2/D16:0-22:3; PE D18:0-22:5/D18:1-22:4; PE D16:1-22:6; PE P18:1-18:1/P18:0-18:2/P16:0-20:2; LPC 20:3; およびPC-LI-183-D18:22-22:6からなる群から選択される1種以上の心血管疾患(CVD)関連バイオマーカーのレベルを検出すること；ならびに
(ii)被験体に由来する生物試料中の1種以上のCVD関連バイオマーカーのレベルを、対照試料中の対応する1種以上のバイオマーカーのレベルと比較すること
を含み、対照試料と比較した生物試料中の1種以上のCVD関連バイオマーカーのレベルの変化が、被験体が心筋症を発症する危険性が高いことを示す、前記方法。
(3)  被験体における心血管疾患をモニタリングするための方法であって、
(i)心血管疾患を有する被験体から第1の時間で得られた第1の生物試料中のCCDC47、HMOX1、PTX3、PAI1、IL27、IGFBP7、Emmprin、CFL2、EDIL3、NUCB1、PE D18:0-20:3/D18:1-20:2/D16:0-22:3; PE D18:0-22:5/D18:1-22:4; PE D16:1-22:6; PE P18:1-18:1/P18:0-18:2/P16:0-20:2; LPC 20:3; およびPC-LI-183-D18:22-22:6からなる群から選択される1種以上の心血管疾患(CVD)関連バイオマーカーのレベルを検出すること；
(ii)第1の時間よりも後である第2の時間で被験体から得られた第2の生物試料中の1種以上のCVD関連バイオマーカーのレベルを検出すること；ならびに
(iii)第2の試料中の1種以上のCVD関連バイオマーカーのレベルと、第1の試料中の1種以上のCVD関連バイオマーカーのレベルとを比較すること
を含み、第1の試料と比較した第2の試料中の1種以上のCVD関連バイオマーカーのレベルの変化が、被験体におけるCVD状態の変化を示す、前記方法。
(4)  被験体における心血管疾患の処置をモニタリングするための方法であって、
(i)被験体に処置レジメンの少なくとも一部を施す前に被験体から得られた第1の生物試料中のCCDC47、HMOX1、PTX3、PAI1、IL27、IGFBP7、Emmprin、CFL2、EDIL3、NUCB1、PE D18:0-20:3/D18:1-20:2/D16:0-22:3; PE D18:0-22:5/D18:1-22:4; PE D16:1-22:6; PE P18:1-18:1/P18:0-18:2/P16:0-20:2; LPC 20:3; およびPC-LI-183-D18:22-22:6からなる群から選択される1種以上の心血管疾患(CVD)関連バイオマーカーのレベルを検出すること；
(ii)被験体に処置レジメンの少なくとも一部を施した後に被験体から得られた第2の生物試料中の1種以上のCVD関連バイオマーカーのレベルを検出すること；ならびに
(iii)第1の試料中の1種以上のCVD関連バイオマーカーのレベルと、第2の試料中の1種以上のCVD関連バイオマーカーのレベルとを比較すること
を含み、第1の試料と比較した第2の試料中の1種以上のCVD関連バイオマーカーのレベルの正常化が、処置レジメンが被験体における心血管疾患を処置するのに有効であることを示す、前記方法。
(5)  心血管疾患が心筋症を含む、(1)〜(4)のいずれかに記載の方法。
(6)  心筋症が拡張型心筋症、肥大型心筋症、拘束型心筋症、および催不整脈性右室異形成からなる群から選択される少なくとも1つの状態である、(5)に記載の方法。
(7)  心筋症が、QT期間の増大、不整脈、心筋虚血、高血圧と血栓塞栓性合併症、心筋機能障害、心筋症、心不全、心房細動、心筋症と心不全、心不全とLV機能障害、心房粗動と心房細動、心臓弁損傷と心不全からなる群から選択される少なくとも1つの状態を含む、(5)または(6)に記載の方法。
(8)  心筋症が遺伝性心筋症である、(5)〜(7)のいずれかに記載の方法。
(9)  心筋症が後天性心筋症である、(5)〜(7)のいずれかに記載の方法。
(10)  後天性心筋症が被験体における1種以上のさらなる疾患または状態との併存疾患である、(9)に記載の方法。
(11)  被験体における1種以上のさらなる疾患または状態が、冠動脈性心疾患、心臓発作、高血圧、糖尿病、甲状腺疾患、ウイルス性肝炎、HIV1、心筋の炎症を起こすウイルス感染、ヘモクロマトーシス、サルコイドーシス、アミロイドーシス、および結合組織障害からなる群から選択される、(10)に記載の方法。
(12)  後天性心筋症が心臓毒への被験体の曝露の結果である、(9)に記載の方法。
(13)  心臓毒が環境性心臓毒である、(12)に記載の方法。
(14)  心臓毒が心臓毒性薬である、(12)に記載の方法。
(15)  心臓毒性薬が、過剰のアルコール、アンフェタミン、抗がん剤、化学療法剤、糖尿病薬、神経薬、抗炎症薬、ビスホスホネート、およびTNFアンタゴニストからなる群から選択される、(14)に記載の方法。
(16)  抗がん剤が、シスプラチン、ドキソルビシン、ダウノルビシン、アントラサイクリン、5-フルオロウラシル、トラスツズマブまたはゲムシタビンからなる群から選択される、(15)に記載の方法。
(17)  糖尿病薬が、ロシグリタゾン、ピオグリタゾン、トログリタゾンおよびカベルゴリンからなる群から選択される、(15)に記載の方法。
(18)  心臓毒性薬がペルゴリドまたはスマトリプタンである、(14)に記載の方法。
(19)  心血管疾患が心不全を含む、(1)〜(4)のいずれかに記載の方法。
(20)  1種以上のCVD関連バイオマーカーが、Emmprin、HMOX1、IGFBP7、CCDC47、PTX3、IL27、PAI1、CFL2、EDIL3、およびNUCB1からなる群から選択される、(1)〜(19)のいずれかに記載の方法。
(21)  1種以上のCVD関連バイオマーカーがCCDC47またはHMOX1を含む、(1)〜(19)のいずれかに記載の方法。
(22)  1種以上のCVD関連バイオマーカーがCCDC47およびHMOX1を含む、(1)〜(19)のいずれかに記載の方法。
(23)  1種以上のCVD関連バイオマーカーがPTX3をさらに含む、(21)または(22)に記載の方法。
(24)  1種以上のCVD関連バイオマーカーがPAI1をさらに含む、(21)または(22)に記載の方法。
(25)  1種以上のCVD関連バイオマーカーが、PE D18:0-20:3/D18:1-20:2/D16:0-22:3; PE D18:0-22:5/D18:1-22:4; PE D16:1-22:6; PE P18:1-18:1/P18:0-18:2/P16:0-20:2; LPC 20:3; およびPC-LI-183-D18:22-22:6からなる群から選択される少なくとも1種の脂質バイオマーカーをさらに含む、(1)〜(24)のいずれかに記載の方法。
(26)  脂質がPC-Li-183-D18:2-22:6を含む、(25)に記載の方法。
(27)  1種以上のCVD関連バイオマーカーが、1A69、1C17、ACBD3、ACLY、ACTR2、ANXA6、ANXA7、AP2A1、ARCN1、ASNA1、ATAD3A、ATP5A、ATP5B、ATP5D、ATP5F1、ATP5H、ATPIF1、BSG、C14orf166、CA2D1、CAPN1、CAPZA2、CARS、CCDC22、CCDC47、CCT7、CLIC4、CMPK1、CNN2、CO1A2、CO6A1、COTL1、COX6B1、CRTAP、CS010、CTSA、CTSB、CYB5、DDX1、DDX17、DDX18、DLD、EDIL3、EHD2、EIF4A3、ENO2、EPHX1、ETFA、FERMT2、FINC、FKB10、FKBP2、FLNC、G3BP2、GOLGA3、GPAT1、GPSN2、GRP75、GRP78、HMOX1、HNRNPD、HNRNPH1、HNRPG、HPX、HSP76、HSP90AB1、HSPA1A、HSPA4、HSPA9、IBP7、IDH1、IQGAP1、ITB1、ITGB1、KARS、KIF5B、KPNA3、KPNB1、LAMC1、LGALS1、LMO7、M6PRBP1、MACF1、MAP1B、MARS、MDH1、MPR1、MTHFD1、MYH10、NCL、NHP2L1、NUCB1、OLA1、P08621、P3H1、P4HA2、P4HB、SEC61A1 (P61619)、PAI1、PAPSS2、PCBP2、PDCD6、PDIA1、PDIA3、PDIA3、PDIA4、PDLIM7、PEBP1、PFKM、PH4B、PLIN2、POFUT1、PRKDC、PSMA1、PSMA7、PSMD12、PSMD3、PSMD4、PSMD6、PSME2、PTBP1、Q9BQE5、Q9Y262、RAB1B、RP515A、RPL32、RPL7A、RPL8、RPS25、RPS6、RRAS2、RRP1、SAR1B、SDHA、SENP1、SEPT11、SEPT7、SERPH、SERPINE1、SFRS2、SH3BGRL、SNRPB、SNX12、SOD1、SPRC、ST13、SUB1、SYNCRIP、TAGLN、TAZ、TGM2、TIMP1、TLN1、TPM4、TRAP1、TSP1、TTLL12、TXNDC12、UBA1C、UGDH、UGP2、UQCRH、VAMP3、およびVAPAからなる群から選択される少なくとも1種のCVD関連バイオマーカーをさらに含む、(1)〜(26)のいずれかに記載の方法。
(28)  1種以上のCVD関連バイオマーカーがCCDC47を含む、(1)〜(27)のいずれかに記載の方法。
(29)  1種以上のCVD関連バイオマーカーがEDIL3を含む、(1)〜(27)のいずれかに記載の方法。
(30)  1種以上のCVD関連バイオマーカーがEmmprinを含む、(1)〜(27)のいずれかに記載の方法。
(31)  1種以上のCVD関連バイオマーカーがHMOX1を含む、(1)〜(27)のいずれかに記載の方法。
(32)  1種以上のCVD関連バイオマーカーがNUCB1を含む、(1)〜(27)のいずれかに記載の方法。
(33)  1種以上のCVD関連バイオマーカーがEmmprin、HMOX1、IGFBP7、CCDC47、PTX3、IL27、およびPAI1を含む、(1)〜(27)のいずれかに記載の方法。
(34)  1種以上のCVD関連バイオマーカーがEmmprin、IGFBP7、CCDC47、PTX3、IL27、およびPAI1を含む、(1)〜(27)のいずれかに記載の方法。
(35)  1種以上のCVD関連バイオマーカーがEmmprin、HMOX1、CCDC47、PTX3、IL27、およびPAI1を含む、(1)〜(27)のいずれかに記載の方法。
(36)  1種以上のCVD関連バイオマーカーがHMOX1、IGFBP7、CCDC47、PTX3、IL27、およびPAI1を含む、(1)〜(27)のいずれかに記載の方法。
(37)  1種以上のCVD関連バイオマーカーがEmmprin、HMOX1、IGFBP7、PTX3、IL27、およびPAI1を含む、(1)〜(27)のいずれかに記載の方法。
(38)  1種以上のCVD関連バイオマーカーがEmmprin、HMOX1、IGFBP7、CCDC47、IL27、およびPAI1を含む、(1)〜(27)のいずれかに記載の方法。
(39)  1種以上のCVD関連バイオマーカーがEmmprin、HMOX1、IGFBP7、CCDC47、PTX3、およびIL27を含む、(1)〜(27)のいずれかに記載の方法。
(40)  1種以上のCVD関連バイオマーカーがEmmprin、HMOX1、IGFBP7、CCDC47、およびPTX3を含む、(1)〜(27)のいずれかに記載の方法。
(41)  1種以上のCVD関連バイオマーカーがEmmprin、HMOX1、IGFBP7、およびCCDC47を含む、(1)〜(27)のいずれかに記載の方法。
(42)  1種以上のCVD関連バイオマーカーがEmmprin、HMOX1およびIGFBP7を含む、(1)〜(27)のいずれかに記載の方法。
(43)  1種以上のCVD関連バイオマーカーがEmmprinおよびHMOX1を含む、(1)〜(27)のいずれかに記載の方法。
(44)  1種以上のCVD関連バイオマーカーがEDIL3、NUCB1、CFL2およびPTX3を含む、(1)〜(27)のいずれかに記載の方法。
(45)  1種以上のCVD関連バイオマーカーがNUCB1、CFL2およびPTX3を含む、(1)〜(27)のいずれかに記載の方法。
(46)  1種以上のCVD関連バイオマーカーがNUCB1およびPTX3を含む、(1)〜(27)のいずれかに記載の方法。
(47)  1種以上のCVD関連バイオマーカーがNUCB1およびCFL2を含む、(1)〜(27)のいずれかに記載の方法。
(48)  対照試料中のレベルと比較した生物試料中のPTX3、PAI1、EDIL3、およびNUCB1からなる群から選択される少なくとも1種のCVD関連マーカーのレベルの低下が、被験体が心血管疾患に罹患しているか、またはそれを発症する危険性が高いことを示す、(1)〜(2)および(5)〜(47)のいずれかに記載の方法。
(49)  正常な対照と比較したHMOX1、IL27、IGFBP7、Emmprin、CFL2、およびCCDC47からなる群から選択される少なくとも1種のCVD関連マーカーのレベルの増加が、被験体が心血管疾患に罹患しているか、またはそれを発症する危険性が高いことを示す、(1)〜(2)および(5)〜(47)のいずれかに記載の方法。
(50)  対照試料中のレベルと比較した生物試料中のPE D18:0-20:3/D18:1-20:2/D16:0-22:3、LPC20:3、および18:0-20:3からなる群から選択される少なくとも1種のCVD関連マーカーのレベルの低下が、被験体が心血管疾患に罹患しているか、またはそれを発症する危険性が高いことを示す、(1)〜(2)および(5)〜(47)のいずれかに記載の方法。
(51)  第1の試料中のレベルと比較した第2の試料中のPTX3、PAI1、EDIL3、およびNUCB1からなる群から選択される少なくとも1種のCVD関連マーカーのレベルの増加が、被験体の心血管疾患状態が改善したか、または処置レジメンが心血管疾患を処置するのに有効であることを示す、(3)〜(4)および(5)〜(47)のいずれかに記載の方法。
(52)  第1の試料中のレベルと比較した第2の試料中のHMOX1、IL27、IGFBP7、Emmprin、CFL2、およびCCDC47からなる群から選択される少なくとも1種のCVD関連マーカーのレベルの低下が、被験体の心血管疾患状態が改善したか、または処置レジメンが心血管疾患を処置するのに有効であることを示す、(3)〜(4)および(5)〜(47)のいずれかに記載の方法。
(53)  第1の試料中のレベルと比較した第2の試料中のPE D18:0-20:3/D18:1-20:2/D16:0-22:3、LPC20:3、および18:0-20:3からなる群から選択される少なくとも1種のCVD関連マーカーのレベルの増加が、被験体の心血管疾患状態が改善したか、または処置レジメンが心血管疾患を処置するのに有効であることを示す、(3)〜(4)および(5)〜(47)のいずれかに記載の方法。
(54)  心血管疾患(CVD)関連バイオマーカーのセットを検出するための方法であって、
(i)CCDC47、HMOX1、PTX3、PAI1、IL27、IGFBP7、Emmprin、CFL2、EDIL3、NUCB1、PE D18:0-20:3/D18:1-20:2/D16:0-22:3; PE D18:0-22:5/D18:1-22:4; PE D16:1-22:6; PE P18:1-18:1/P18:0-18:2/P16:0-20:2; LPC 20:3; およびPC-LI-183-D18:22-22:6を含むCVD関連バイオマーカーのセットの2種以上のCVD関連バイオマーカーのレベルについて、被験体に由来する生物試料を分析すること；
(ii)生物試料中の2種以上のCVD関連バイオマーカーのそれぞれを検出することによって、CVD関連バイオマーカーのセットを検出すること
を含む、前記方法。
(55)  2種以上のCVD関連バイオマーカーが、Emmprin、HMOX1、IGFBP7、CCDC47、PTX3、IL27、PAI1、CFL2、EDIL3、およびNUCB1からなる群から選択される、(54)に記載の方法。
(56)  2種以上のCVD関連バイオマーカーがCCDC47またはHMOX1を含む、(54)に記載の方法。
(57)  2種以上のCVD関連バイオマーカーがCCDC47およびHMOX1を含む、(54)に記載の方法。
(58)  2種以上のCVD関連バイオマーカーがPTX3をさらに含む、(56)または(57)に記載の方法。
(59)  2種以上のCVD関連バイオマーカーがPAI1をさらに含む、(56)または(57)に記載の方法。
(60)  2種以上のCVD関連バイオマーカーがPE D18:0-20:3/D18:1-20:2/D16:0-22:3; PE D18:0-22:5/D18:1-22:4; PE D16:1-22:6; PE P18:1-18:1/P18:0-18:2/P16:0-20:2; LPC 20:3; およびPC-LI-183-D18:22-22:6からなる群から選択される少なくとも2種の脂質バイオマーカーをさらに含む、(54)〜(59)のいずれかに記載の方法。
(61)  脂質がPC-Li-183-D18:2-22:6を含む、(60)に記載の方法。
(62)  2種以上のCVD関連バイオマーカーが、1A69、1C17、ACBD3、ACLY、ACTR2、ANXA6、ANXA7、AP2A1、ARCN1、ASNA1、ATAD3A、ATP5A、ATP5B、ATP5D、ATP5F1、ATP5H、ATPIF1、BSG、C14orf166、CA2D1、CAPN1、CAPZA2、CARS、CCDC22、CCDC47、CCT7、CLIC4、CMPK1、CNN2、CO1A2、CO6A1、COTL1、COX6B1、CRTAP、CS010、CTSA、CTSB、CYB5、DDX1、DDX17、DDX18、DLD、EDIL3、EHD2、EIF4A3、ENO2、EPHX1、ETFA、FERMT2、FINC、FKB10、FKBP2、FLNC、G3BP2、GOLGA3、GPAT1、GPSN2、GRP75、GRP78、HMOX1、HNRNPD、HNRNPH1、HNRPG、HPX、HSP76、HSP90AB1、HSPA1A、HSPA4、HSPA9、IBP7、IDH1、IQGAP1、ITB1、ITGB1、KARS、KIF5B、KPNA3、KPNB1、LAMC1、LGALS1、LMO7、M6PRBP1、MACF1、MAP1B、MARS、MDH1、MPR1、MTHFD1、MYH10、NCL、NHP2L1、NUCB1、OLA1、P08621、P3H1、P4HA2、P4HB、SEC61A1 (P61619)、PAI1、PAPSS2、PCBP2、PDCD6、PDIA1、PDIA3、PDIA3、PDIA4、PDLIM7、PEBP1、PFKM、PH4B、PLIN2、POFUT1、PRKDC、PSMA1、PSMA7、PSMD12、PSMD3、PSMD4、PSMD6、PSME2、PTBP1、Q9BQE5、Q9Y262、RAB1B、RP515A、RPL32、RPL7A、RPL8、RPS25、RPS6、RRAS2、RRP1、SAR1B、SDHA、SENP1、SEPT11、SEPT7、SERPH、SERPINE1、SFRS2、SH3BGRL、SNRPB、SNX12、SOD1、SPRC、ST13、SUB1、SYNCRIP、TAGLN、TAZ、TGM2、TIMP1、TLN1、TPM4、TRAP1、TSP1、TTLL12、TXNDC12、UBA1C、UGDH、UGP2、UQCRH、VAMP3、およびVAPAからなる群から選択される少なくとも1種のCVD関連バイオマーカーをさらに含む、(54)〜(60)のいずれかに記載の方法。
(63)  2種以上のCVD関連バイオマーカーがCCDC47を含む、(54)〜(62)のいずれかに記載の方法。
(64)  2種以上のCVD関連バイオマーカーがEDIL3を含む、(54)〜(62)のいずれかに記載の方法。
(65)  2種以上のCVD関連バイオマーカーがEmmprinを含む、(54)〜(62)のいずれかに記載の方法。
(66)  2種以上のCVD関連バイオマーカーがHMOX1を含む、(54)〜(62)のいずれかに記載の方法。
(67)  2種以上のCVD関連バイオマーカーがNUCB1を含む、(54)〜(62)のいずれかに記載の方法。
(68)  2種以上のCVD関連バイオマーカーがEmmprin、HMOX1、IGFBP7、CCDC47、PTX3、IL27、およびPAI1を含む、(54)〜(62)のいずれかに記載の方法。
(69)  2種以上のCVD関連バイオマーカーがEmmprin、IGFBP7、CCDC47、PTX3、IL27、およびPAI1を含む、(54)〜(62)のいずれかに記載の方法。
(70)  2種以上のCVD関連バイオマーカーがEmmprin、HMOX1、CCDC47、PTX3、IL27、およびPAI1を含む、(54)〜(62)のいずれかに記載の方法。
(71)  2種以上のCVD関連バイオマーカーがHMOX1、IGFBP7、CCDC47、PTX3、IL27、およびPAI1を含む、(54)〜(62)のいずれかに記載の方法。
(72)  2種以上のCVD関連バイオマーカーがEmmprin、HMOX1、IGFBP7、PTX3、IL27、およびPAI1を含む、(54)〜(62)のいずれかに記載の方法。
(73)  2種以上のCVD関連バイオマーカーがEmmprin、HMOX1、IGFBP7、CCDC47、IL27、およびPAI1を含む、(54)〜(62)のいずれかに記載の方法。
(74)  2種以上のCVD関連バイオマーカーがEmmprin、HMOX1、IGFBP7、CCDC47、PTX3、およびIL27を含む、(54)〜(62)のいずれかに記載の方法。
(75)  2種以上のCVD関連バイオマーカーがEmmprin、HMOX1、IGFBP7、CCDC47、およびPTX3を含む、(54)〜(62)のいずれかに記載の方法。
(76)  2種以上のCVD関連バイオマーカーがEmmprin、HMOX1、IGFBP7、およびCCDC47を含む、(54)〜(62)のいずれかに記載の方法。
(77)  2種以上のCVD関連バイオマーカーがEmmprin、HMOX1およびIGFBP7を含む、(54)〜(62)のいずれかに記載の方法。
(78)  2種以上のCVD関連バイオマーカーがEmmprinおよびHMOX1を含む、(54)〜(62)のいずれかに記載の方法。
(79)  2種以上のCVD関連バイオマーカーがEDIL3、NUCB1、CFL2 およびPTX3を含む、(54)〜(62)のいずれかに記載の方法。
(80)  2種以上のCVD関連バイオマーカーがNUCB1、CFL2およびPTX3を含む、(54)〜(62)のいずれかに記載の方法。
(81)  2種以上のCVD関連バイオマーカーがNUCB1およびPTX3を含む、(54)〜(62)のいずれかに記載の方法。
(82)  2種以上のCVD関連バイオマーカーがNUCB1およびCFL2を含む、(54)〜(62)のいずれかに記載の方法。
(83)  生物試料中の1種以上のCVD関連マーカーのレベルの検出または決定が、生物試料の成分を単離することを含む、(1)〜(82)のいずれかに記載の方法。
(84)  生物試料中の1種以上のCVD関連マーカーのレベルの検出または決定が、生物試料の成分を標識することを含む、(1)〜(82)のいずれかに記載の方法。
(85)  生物試料中の1種以上のCVD関連マーカーのレベルの検出または決定が、生物試料を加工することを含む、(1)〜(82)のいずれかに記載の方法。
(86)  生物試料中の1種以上のCVD関連マーカーのレベルの検出または決定が、検出しようとするCVD関連マーカーを、CVD関連マーカー結合剤と接触させることを含む、(1)〜(82)のいずれかに記載の方法。
(87)  生物試料中の1種以上のCVD関連マーカーのレベルの検出または決定が、検出しようとするCVD関連マーカーと、CVD関連マーカー結合剤との複合体を形成させることを含む、(1)〜(82)のいずれかに記載の方法。
(88)  生物試料中の1種以上のCVD関連マーカーのレベルの検出または決定が、1種以上のCVD関連マーカーのそれぞれを、CVD関連マーカー結合剤と接触させることを含む、(1)〜(82)のいずれかに記載の方法。
(89)  生物試料中の1種以上のCVD関連マーカーのレベルの検出または決定が、1種以上のCVD関連マーカーのそれぞれと、CVD関連マーカー結合剤との複合体を形成させることを含む、(1)〜(82)のいずれかに記載の方法。
(90)  生物試料中の1種以上のCVD関連マーカーのレベルの検出または決定が、検出しようとするCVD関連マーカーを固相表面に結合させることを含む、(1)〜(82)のいずれかに記載の方法。
(91)  検出方法における使用のための試薬のパネルであって、パネルが少なくとも2つの検出試薬を含み、それぞれの検出試薬が、CCDC47、HMOX1、PTX3、PAI1、IL27、IGFBP7、Emmprin、CFL2、EDIL3、NUCB1、PE D18:0-20:3/D18:1-20:2/D16:0-22:3; PE D18:0-22:5/D18:1-22:4; PE D16:1-22:6; PE P18:1-18:1/P18:0-18:2/P16:0-20:2; LPC 20:3; およびPC-LI-183-D18:22-22:6からなる群から選択される2種以上の心血管疾患(CVD)関連バイオマーカーを含むCVD関連バイオマーカーのセットの少なくとも1種のCVD関連マーカーの検出にとって特異的である、前記パネル。
(92)  2種以上のCVD関連バイオマーカーが、Emmprin、HMOX1、IGFBP7、CCDC47、PTX3、IL27、PAI1、CFL2、EDIL3、およびNUCB1からなる群から選択される、(91)に記載のパネル。
(93)  2種以上のCVD関連バイオマーカーが、CCDC47またはHMOX1を含む、(91)に記載のパネル。
(94)  2種以上のCVD関連バイオマーカーが、CCDC47およびHMOX1を含む、(91)に記載のパネル。
(95)  2種以上のCVD関連バイオマーカーが、PTX3をさらに含む、(93)または(94)に記載のパネル。
(96)  2種以上のCVD関連バイオマーカーが、PAI1をさらに含む、(93)または(94)に記載のパネル。
(97)  2種以上のCVD関連バイオマーカーが、PE D18:0-20:3/D18:1-20:2/D16:0-22:3; PE D18:0-22:5/D18:1-22:4; PE D16:1-22:6; PE P18:1-18:1/P18:0-18:2/P16:0-20:2; LPC 20:3;およびPC-LI-183-D18:22-22:6からなる群から選択される少なくとも1種の脂質バイオマーカーをさらに含む、(91)〜(96)のいずれかに記載のパネル。
(98)  脂質がPC-Li-183-D18:2-22:6を含む、(97)に記載のパネル。
(99)  2種以上のCVD関連バイオマーカーが、1A69、1C17、ACBD3、ACLY、ACTR2、ANXA6、ANXA7、AP2A1、ARCN1、ASNA1、ATAD3A、ATP5A、ATP5B、ATP5D、ATP5F1、ATP5H、ATPIF1、BSG、C14orf166、CA2D1、CAPN1、CAPZA2、CARS、CCDC22、CCDC47、CCT7、CLIC4、CMPK1、CNN2、CO1A2、CO6A1、COTL1、COX6B1、CRTAP、CS010、CTSA、CTSB、CYB5、DDX1、DDX17、DDX18、DLD、EDIL3、EHD2、EIF4A3、ENO2、EPHX1、ETFA、FERMT2、FINC、FKB10、FKBP2、FLNC、G3BP2、GOLGA3、GPAT1、GPSN2、GRP75、GRP78、HMOX1、HNRNPD、HNRNPH1、HNRPG、HPX、HSP76、HSP90AB1、HSPA1A、HSPA4、HSPA9、IBP7、IDH1、IQGAP1、ITB1、ITGB1、KARS、KIF5B、KPNA3、KPNB1、LAMC1、LGALS1、LMO7、M6PRBP1、MACF1、MAP1B、MARS、MDH1、MPR1、MTHFD1、MYH10、NCL、NHP2L1、NUCB1、OLA1、P08621、P3H1、P4HA2、P4HB、SEC61A1 (P61619)、PAI1、PAPSS2、PCBP2、PDCD6、PDIA1、PDIA3、PDIA3、PDIA4、PDLIM7、PEBP1、PFKM、PH4B、PLIN2、POFUT1、PRKDC、PSMA1、PSMA7、PSMD12、PSMD3、PSMD4、PSMD6、PSME2、PTBP1、Q9BQE5、Q9Y262、RAB1B、RP515A、RPL32、RPL7A、RPL8、RPS25、RPS6、RRAS2、RRP1、SAR1B、SDHA、SENP1、SEPT11、SEPT7、SERPH、SERPINE1、SFRS2、SH3BGRL、SNRPB、SNX12、SOD1、SPRC、ST13、SUB1、SYNCRIP、TAGLN、TAZ、TGM2、TIMP1、TLN1、TPM4、TRAP1、TSP1、TTLL12、TXNDC12、UBA1C、UGDH、UGP2、UQCRH、VAMP3、およびVAPAからなる群から選択される少なくとも1種のCVD関連バイオマーカーをさらに含む、(91)〜(98)のいずれかに記載のパネル。
(100)  2種以上のCVD関連バイオマーカーが、CCDC47を含む、(91)〜(99)のいずれかに記載のパネル。
(101)  2種以上のCVD関連バイオマーカーが、EDIL3を含む、(91)〜(99)のいずれかに記載のパネル。
(102)  2種以上のCVD関連バイオマーカーが、Emmprinを含む、(91)〜(99)のいずれかに記載のパネル。
(103)  2種以上のCVD関連バイオマーカーが、HMOX1を含む、(91)〜(99)のいずれかに記載のパネル。
(104)  1種以上のCVD関連バイオマーカーが、NUCB1を含む、(91)〜(99)のいずれかに記載のパネル。
(105)  2種以上のCVD関連バイオマーカーが、Emmprin、HMOX1、IGFBP7、CCDC47、PTX3、IL27、およびPAI1を含む、(91)〜(99)のいずれかに記載のパネル。
(106)  2種以上のCVD関連バイオマーカーが、Emmprin、IGFBP7、CCDC47、PTX3、IL27、およびPAI1を含む、(91)〜(99)のいずれかに記載のパネル。
(107)  2種以上のCVD関連バイオマーカーが、Emmprin、HMOX1、CCDC47、PTX3、IL27、およびPAI1を含む、(91)〜(99)のいずれかに記載のパネル。
(108)  2種以上のCVD関連バイオマーカーが、HMOX1、IGFBP7、CCDC47、PTX3、IL27、およびPAI1を含む、(91)〜(99)のいずれかに記載のパネル。
(109)  2種以上のCVD関連バイオマーカーが、Emmprin、HMOX1、IGFBP7、PTX3、IL27、およびPAI1を含む、(91)〜(99)のいずれかに記載のパネル。
(110)  2種以上のCVD関連バイオマーカーが、Emmprin、HMOX1、IGFBP7、CCDC47、IL27、およびPAI1を含む、(91)〜(99)のいずれかに記載のパネル。
(111)  2種以上のCVD関連バイオマーカーが、Emmprin、HMOX1、IGFBP7、CCDC47、PTX3、およびIL27を含む、(91)〜(99)のいずれかに記載のパネル。
(112)  2種以上のCVD関連バイオマーカーが、Emmprin、HMOX1、IGFBP7、CCDC47、およびPTX3を含む、(91)〜(99)のいずれかに記載のパネル。
(113)  2種以上のCVD関連バイオマーカーが、Emmprin、HMOX1、IGFBP7、およびCCDC47を含む、(91)〜(99)のいずれかに記載のパネル。
(114)  2種以上のCVD関連バイオマーカーが、Emmprin、HMOX1およびIGFBP7を含む、(91)〜(99)のいずれか一項に記載のパネル。
(115)  2種以上のCVD関連バイオマーカーが、EmmprinおよびHMOX1を含む、(91)〜(99)のいずれかに記載のパネル。
(116)  2種以上のCVD関連バイオマーカーが、EDIL3、NUCB1、CFL2およびPTX3を含む、(91)〜(99)のいずれかに記載のパネル。
(117)  2種以上のCVD関連バイオマーカーが、NUCB1、CFL2およびPTX3を含む、(91)〜(99)のいずれかに記載のパネル。
(118)  2種以上のCVD関連バイオマーカーが、NUCB1およびPTX3を含む、(91)〜(99)のいずれかに記載のパネル。
(119)  2種以上のCVD関連バイオマーカーが、NUCB1およびCFL2を含む、(91)〜(99)のいずれかに記載のパネル。
(120)  (1)〜(90)のいずれかに記載の方法における(91)〜(119)のいずれかに記載のパネルの使用。
(121)  被験体における心血管疾患の診断、モニタリング、または特性評価のためのキットであって、
CCDC47、HMOX1、PTX3、PAI1、IL27、IGFBP7、Emmprin、CFL2、EDIL3、NUCB1、PE D18:0-20:3/D18:1-20:2/D16:0-22:3; PE D18:0-22:5/D18:1-22:4; PE D16:1-22:6; PE P18:1-18:1/P18:0-18:2/P16:0-20:2; LPC 20:3; およびPC-LI-183-D18:22-22:6からなる群から選択される少なくとも1種のCVD関連マーカーのレベルを検出するのに特異的な少なくとも1種の試薬
を含む、前記キット。
(122)  1種以上のCVD関連バイオマーカーがEmmprin、HMOX1、IGFBP7、CCDC47、PTX3、IL27、PAI1、CFL2、EDIL3、およびNUCB1からなる群から選択される、(121)に記載のキット。
(123)  1種以上のCVD関連バイオマーカーがCCDC47またはHMOX1を含む、(121)に記載のキット。
(124)  1種以上のCVD関連バイオマーカーがCCDC47およびHMOX1を含む、(121)に記載のキット。
(125)  1種以上のCVD関連バイオマーカーがPTX3をさらに含む、(123)または(124)に記載のキット。
(126)  1種以上のCVD関連バイオマーカーがPAI1をさらに含む、(123)または(124)に記載のキット。
(127)  1種以上のCVD関連バイオマーカーが、PE D18:0-20:3/D18:1-20:2/D16:0-22:3; PE D18:0-22:5/D18:1-22:4; PE D16:1-22:6; PE P18:1-18:1/P18:0-18:2/P16:0-20:2; LPC 20:3; およびPC-LI-183-D18:22-22:6からなる群から選択される少なくとも1種の脂質バイオマーカーをさらに含む、(121)〜(126)のいずれかに記載のキット。
(128)  脂質がPC-Li-183-D18:2-22:6を含む、(127)に記載のキット。
(129)  1種以上のCVD関連バイオマーカーが、1A69、1C17、ACBD3、ACLY、ACTR2、ANXA6、ANXA7、AP2A1、ARCN1、ASNA1、ATAD3A、ATP5A、ATP5B、ATP5D、ATP5F1、ATP5H、ATPIF1、BSG、C14orf166、CA2D1、CAPN1、CAPZA2、CARS、CCDC22、CCDC47、CCT7、CLIC4、CMPK1、CNN2、CO1A2、CO6A1、COTL1、COX6B1、CRTAP、CS010、CTSA、CTSB、CYB5、DDX1、DDX17、DDX18、DLD、EDIL3、EHD2、EIF4A3、ENO2、EPHX1、ETFA、FERMT2、FINC、FKB10、FKBP2、FLNC、G3BP2、GOLGA3、GPAT1、GPSN2、GRP75、GRP78、HMOX1、HNRNPD、HNRNPH1、HNRPG、HPX、HSP76、HSP90AB1、HSPA1A、HSPA4、HSPA9、IBP7、IDH1、IQGAP1、ITB1、ITGB1、KARS、KIF5B、KPNA3、KPNB1、LAMC1、LGALS1、LMO7、M6PRBP1、MACF1、MAP1B、MARS、MDH1、MPR1、MTHFD1、MYH10、NCL、NHP2L1、NUCB1、OLA1、P08621、P3H1、P4HA2、P4HB、SEC61A1 (P61619)、PAI1、PAPSS2、PCBP2、PDCD6、PDIA1、PDIA3、PDIA3、PDIA4、PDLIM7、PEBP1、PFKM、PH4B、PLIN2、POFUT1、PRKDC、PSMA1、PSMA7、PSMD12、PSMD3、PSMD4、PSMD6、PSME2、PTBP1、Q9BQE5、Q9Y262、RAB1B、RP515A、RPL32、RPL7A、RPL8、RPS25、RPS6、RRAS2、RRP1、SAR1B、SDHA、SENP1、SEPT11、SEPT7、SERPH、SERPINE1、SFRS2、SH3BGRL、SNRPB、SNX12、SOD1、SPRC、ST13、SUB1、SYNCRIP、TAGLN、TAZ、TGM2、TIMP1、TLN1、TPM4、TRAP1、TSP1、TTLL12、TXNDC12、UBA1C、UGDH、UGP2、UQCRH、VAMP3、およびVAPAからなる群から選択される少なくとも1種のCVD関連バイオマーカーをさらに含む、(121)〜(128)のいずれかに記載のキット。
(130)  1種以上のCVD関連バイオマーカーがCCDC47を含む、(121)〜(129)のいずれかに記載のキット。
(131)  1種以上のCVD関連バイオマーカーがEDIL3を含む、(121)〜(129)のいずれかに記載のキット。
(132)  1種以上のCVD関連バイオマーカーがEmmprinを含む、(121)〜(129)のいずれかに記載のキット。
(133)  1種以上のCVD関連バイオマーカーがHMOX1を含む、(121)〜(129)のいずれかに記載のキット。
(134)  1種以上のCVD関連バイオマーカーがNUCB1を含む、(121)〜(129)のいずれかに記載のキット。
(135)  1種以上のCVD関連バイオマーカーがEmmprin、HMOX1、IGFBP7、CCDC47、PTX3、IL27、およびPAI1を含む、(121)〜(129)のいずれかに記載のキット。
(136)  1種以上のCVD関連バイオマーカーがEmmprin、IGFBP7、CCDC47、PTX3、IL27、およびPAI1を含む、(121)〜(129)のいずれかに記載のキット。
(137)  1種以上のCVD関連バイオマーカーがEmmprin、HMOX1、CCDC47、PTX3、IL27、およびPAI1を含む、(121)〜(129)のいずれかに記載のキット。
(138)  1種以上のCVD関連バイオマーカーがHMOX1、IGFBP7、CCDC47、PTX3、IL27、およびPAI1を含む、(121)〜(129)のいずれかに記載のキット。
(139)  1種以上のCVD関連バイオマーカーがEmmprin、HMOX1、IGFBP7、PTX3、IL27、およびPAI1を含む、(121)〜(129)のいずれかに記載のキット。
(140)  1種以上のCVD関連バイオマーカーがEmmprin、HMOX1、IGFBP7、CCDC47、IL27、およびPAI1を含む、(121)〜(129)のいずれかに記載のキット。
(141)  1種以上のCVD関連バイオマーカーがEmmprin、HMOX1、IGFBP7、CCDC47、PTX3、およびIL27を含む、(121)〜(129)のいずれかに記載のキット。
(142)  1種以上のCVD関連バイオマーカーがEmmprin、HMOX1、IGFBP7、CCDC47、およびPTX3を含む、(121)〜(129)のいずれかに記載のキット。
(143)  1種以上のCVD関連バイオマーカーがEmmprin、HMOX1、IGFBP7、およびCCDC47を含む、(121)〜(129)のいずれかに記載のキット。
(144)  1種以上のCVD関連バイオマーカーがEmmprin、HMOX1およびIGFBP7を含む、(121)〜(129)のいずれかに記載のキット。
(145)  1種以上のCVD関連バイオマーカーがEmmprinおよびHMOX1を含む、(121)〜(129)のいずれかに記載のキット。
(146)  1種以上のCVD関連バイオマーカーがEDIL3、NUCB1、CFL2およびPTX3を含む、(121)〜(129)のいずれかに記載のキット。
(147)  1種以上のCVD関連バイオマーカーがNUCB1、CFL2およびPTX3を含む、(121)〜(129)のいずれかに記載のキット。
(148)  1種以上のCVD関連バイオマーカーがNUCB1およびPTX3を含む、(121)〜(129)のいずれかに記載のキット。
(149)  1種以上のCVD関連バイオマーカーがNUCB1およびCFL2を含む、(121)〜(129)のいずれかに記載のキット。
(150)  心血管疾患を処置するための化合物を同定する方法であって、
(i)試験細胞を取得すること；
(ii)試験細胞を試験化合物と接触させること；
(iii)試験細胞中の、CCDC47、HMOX1、PTX3、PAI1、IL27、IGFBP7、Emmprin、CFL2、EDIL3、NUCB1、PE D18:0-20:3/D18:1-20:2/D16:0-22:3; PE D18:0-22:5/D18:1-22:4; PE D16:1-22:6; PE P18:1-18:1/P18:0-18:2/P16:0-20:2; LPC 20:3;およびPC-LI-183-D18:22-22:6からなる群から選択される1種以上の心血管疾患(CVD)関連バイオマーカーのレベルを決定すること；
(iv)試験細胞中の1種以上のCVD関連バイオマーカーのレベルを、試験化合物により接触していない対照細胞と比較すること；ならびに
(v)試験細胞中の1種以上のCVD関連バイオマーカーのレベルを調節する試験化合物を選択することによって、被験体におけるCVDを処置するための化合物を同定すること
を含む、前記方法。
(151)  心臓毒性を引き起こすか、または引き起こす危険性がある薬剤を同定する方法であって、
(i)第1の細胞を試験薬剤と接触させること；
(ii)試験薬剤と接触した第1の細胞中の、CCDC47、HMOX1、PTX3、PAI1、IL27、IGFBP7、Emmprin、CFL2、EDIL3、NUCB1、PE D18:0-20:3/D18:1-20:2/D16:0-22:3; PE D18:0-22:5/D18:1-22:4; PE D16:1-22:6; PE P18:1-18:1/P18:0-18:2/P16:0-20:2; LPC 20:3; およびPC-LI-183-D18:22-22:6からなる群から選択される1種以上のCVD関連バイオマーカーのレベルを検出すること；ならびに
(iii)第1の細胞中の1種以上のCVD関連バイオマーカーのレベルを、試験薬剤と接触していない対照細胞である第2の細胞中の対応する1種以上のCVD関連バイオマーカーのレベルと比較すること
を含み、第2の細胞と比較した第1の細胞中の1種以上のCVD関連バイオマーカーのレベルの調節が、試験薬剤が心臓毒性を引き起こすか、または引き起こす危険性がある薬剤であることを示す、前記方法。
(152)  薬物誘導性心臓毒性の防止、軽減または処置のための救助剤を同定するための方法であって、
(i)第1の細胞を心臓毒性剤と接触させること；
(ii)第2の細胞を心臓毒性剤および候補救助剤と接触させること；
(iii)心臓毒性剤と接触した第1の細胞中の、CCDC47、HMOX1、PTX3、PAI1、IL27、IGFBP7、Emmprin、CFL2、EDIL3、NUCB1、PE D18:0-20:3/D18:1-20:2/D16:0-22:3; PE D18:0-22:5/D18:1-22:4; PE D16:1-22:6; PE P18:1-18:1/P18:0-18:2/P16:0-20:2; LPC 20:3; およびPC-LI-183-D18:22-22:6からなる群から選択される1種以上のCVD関連バイオマーカーのレベルを検出すること；
(iv)心臓毒性剤および候補救助剤と接触した第2の細胞中の1種以上のCVD関連バイオマーカーのレベルを検出すること；ならびに
(v)第2の細胞中の1種以上のCVD関連バイオマーカーのレベルを、第1の細胞中の対応する1種以上のCVD関連バイオマーカーのレベルと比較すること
を含み、第1の細胞と比較した第2の細胞中の1種以上のCVD関連バイオマーカーのレベルの調節が、候補救助剤が薬物誘導性心臓毒性の防止、軽減または処置のための救助剤であることを示す、前記方法。
(153)  第1および/または第2の細胞中の1種以上のCVD関連バイオマーカーのレベルを、心臓毒性剤または候補救助剤と接触していない対照細胞中の1種以上のCVD関連バイオマーカーのレベルと比較することをさらに含む、(152)に記載の方法。
(154)  対照細胞と比較した第2の細胞中の1種以上のCVD関連バイオマーカーのレベルの正常化が、候補救助剤が薬物誘導性心臓毒性の防止、軽減または処置のための救助剤であることを示す、(153)に記載の方法。
(155)  1種以上のCVD関連バイオマーカーが、Emmprin、HMOX1、IGFBP7、CCDC47、PTX3、IL27、PAI1、CFL2、EDIL3、およびNUCB1からなる群から選択される、(150)〜(154)のいずれかに記載の方法。
(156)  1種以上のCVD関連バイオマーカーがCCDC47またはHMOX1を含む、(150)〜(154)のいずれかに記載の方法。
(157)  1種以上のCVD関連バイオマーカーがCCDC47およびHMOX1を含む、(150)〜(154)のいずれかに記載の方法。
(158)  1種以上のCVD関連バイオマーカーがPTX3をさらに含む、(156)または(157)に記載の方法。
(159)  1種以上のCVD関連バイオマーカーがPAI1をさらに含む、(156)または(157)に記載の方法。
(160)  1種以上のCVD関連バイオマーカーが、PE D18:0-20:3/D18:1-20:2/D16:0-22:3; PE D18:0-22:5/D18:1-22:4; PE D16:1-22:6; PE P18:1-18:1/P18:0-18:2/P16:0-20:2; LPC 20:3; およびPC-LI-183-D18:22-22:6からなる群から選択される少なくとも1種の脂質バイオマーカーをさらに含む、(150)〜(159)のいずれかに記載の方法。
(161)  脂質がPC-Li-183-D18:2-22:6を含む、(160)に記載の方法。
(162)  1種以上のCVD関連バイオマーカーが、1A69、1C17、ACBD3、ACLY、ACTR2、ANXA6、ANXA7、AP2A1、ARCN1、ASNA1、ATAD3A、ATP5A、ATP5B、ATP5D、ATP5F1、ATP5H、ATPIF1、BSG、C14orf166、CA2D1、CAPN1、CAPZA2、CARS、CCDC22、CCDC47、CCT7、CLIC4、CMPK1、CNN2、CO1A2、CO6A1、COTL1、COX6B1、CRTAP、CS010、CTSA、CTSB、CYB5、DDX1、DDX17、DDX18、DLD、EDIL3、EHD2、EIF4A3、ENO2、EPHX1、ETFA、FERMT2、FINC、FKB10、FKBP2、FLNC、G3BP2、GOLGA3、GPAT1、GPSN2、GRP75、GRP78、HMOX1、HNRNPD、HNRNPH1、HNRPG、HPX、HSP76、HSP90AB1、HSPA1A、HSPA4、HSPA9、IBP7、IDH1、IQGAP1、ITB1、ITGB1、KARS、KIF5B、KPNA3、KPNB1、LAMC1、LGALS1、LMO7、M6PRBP1、MACF1、MAP1B、MARS、MDH1、MPR1、MTHFD1、MYH10、NCL、NHP2L1、NUCB1、OLA1、P08621、P3H1、P4HA2、P4HB、SEC61A1 (P61619)、PAI1、PAPSS2、PCBP2、PDCD6、PDIA1、PDIA3、PDIA3、PDIA4、PDLIM7、PEBP1、PFKM、PH4B、PLIN2、POFUT1、PRKDC、PSMA1、PSMA7、PSMD12、PSMD3、PSMD4、PSMD6、PSME2、PTBP1、Q9BQE5、Q9Y262、RAB1B、RP515A、RPL32、RPL7A、RPL8、RPS25、RPS6、RRAS2、RRP1、SAR1B、SDHA、SENP1、SEPT11、SEPT7、SERPH、SERPINE1、SFRS2、SH3BGRL、SNRPB、SNX12、SOD1、SPRC、ST13、SUB1、SYNCRIP、TAGLN、TAZ、TGM2、TIMP1、TLN1、TPM4、TRAP1、TSP1、TTLL12、TXNDC12、UBA1C、UGDH、UGP2、UQCRH、VAMP3、およびVAPAからなる群から選択される少なくとも1種のCVD関連バイオマーカーをさらに含む、(150)〜(161)のいずれかに記載の方法。
(163)  1種以上のCVD関連バイオマーカーがCCDC47を含む、(150)〜(162)のいずれかに記載の方法。
(164)  1種以上のCVD関連バイオマーカーがEDIL3を含む、(150)〜(162)のいずれかに記載の方法。
(165)  1種以上のCVD関連バイオマーカーがEmmprinを含む、(150)〜(162)のいずれかに記載の方法。
(166)  1種以上のCVD関連バイオマーカーがHMOX1を含む、(150)〜(162)のいずれかに記載の方法。
(167)  1種以上のCVD関連バイオマーカーがNUCB1を含む、(150)〜(162)のいずれかに記載の方法。
(168)  1種以上のCVD関連バイオマーカーがEmmprin、HMOX1、IGFBP7、CCDC47、PTX3、IL27、およびPAI1を含む、(150)〜(162)のいずれかに記載の方法。
(169)  1種以上のCVD関連バイオマーカーがEmmprin、IGFBP7、CCDC47、PTX3、IL27、およびPAI1を含む、(150)〜(162)のいずれかに記載の方法。
(170)  1種以上のCVD関連バイオマーカーがEmmprin、HMOX1、CCDC47、PTX3、IL27、およびPAI1を含む、(150)〜(162)のいずれかに記載の方法。
(171)  1種以上のCVD関連バイオマーカーがHMOX1、IGFBP7、CCDC47、PTX3、IL27、およびPAI1を含む、(150)〜(162)のいずれかに記載の方法。
(172)  1種以上のCVD関連バイオマーカーがEmmprin、HMOX1、IGFBP7、PTX3、IL27、およびPAI1を含む、(150)〜(162)のいずれかに記載の方法。
(173)  1種以上のCVD関連バイオマーカーがEmmprin、HMOX1、IGFBP7、CCDC47、IL27、およびPAI1を含む、(150)〜(162)のいずれかに記載の方法。
(174)  1種以上のCVD関連バイオマーカーがEmmprin、HMOX1、IGFBP7、CCDC47、PTX3、およびIL27を含む、(150)〜(162)のいずれかに記載の方法。
(175)  1種以上のCVD関連バイオマーカーがEmmprin、HMOX1、IGFBP7、CCDC47、およびPTX3を含む、(150)〜(162)のいずれかに記載の方法。
(176)  1種以上のCVD関連バイオマーカーがEmmprin、HMOX1、IGFBP7、およびCCDC47を含む、(150)〜(162)のいずれかに記載の方法。
(177)  1種以上のCVD関連バイオマーカーがEmmprin、HMOX1およびIGFBP7を含む、(150)〜(162)のいずれかに記載の方法。
(178)  1種以上のCVD関連バイオマーカーがEmmprinおよびHMOX1を含む、(150)〜(162)のいずれかに記載の方法。
(179)  1種以上のCVD関連バイオマーカーがEDIL3、NUCB1、CFL2およびPTX3を含む、(150)〜(162)のいずれかに記載の方法。
(180)  1種以上のCVD関連バイオマーカーがNUCB1、CFL2およびPTX3を含む、(150)〜(162)のいずれかに記載の方法。
(181)  1種以上のCVD関連バイオマーカーがNUCB1およびPTX3を含む、(150)〜(162)のいずれかに記載の方法。
(182)  1種以上のCVD関連バイオマーカーがNUCB1およびCFL2を含む、(150)〜(162)のいずれかに記載の方法。
(183)  細胞が心臓細胞である、(150)〜(182)のいずれかに記載の方法。
(184)  細胞が心筋細胞または糖尿病心筋細胞である、(150)〜(182)のいずれかに記載の方法。
(185)  接触がin vitroで行われる、(150)〜(184)のいずれかに記載の方法。
(186)  接触がin vivoで行われる、(150)〜(184)のいずれかに記載の方法。
【手続補正２】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
被験体における心血管疾患を診断するための方法であって、
(i)被験体に由来する生物試料中の1種以上の心血管疾患(CVD)関連バイオマーカーのレベルを検出すること；ならびに
(ii)被験体に由来する生物試料中の1種以上のCVD関連バイオマーカーのレベルを、対照試料中の対応する1種以上のCVD関連バイオマーカーのレベルと比較すること
を含み、1種以上のCVD関連バイオマーカーが、コイルドコイルドメイン含有47(CCDC47)を含み、また対照試料と比較した生物試料中の1種以上のCVD関連バイオマーカーのレベルの変化が、被験体が心血管疾患に罹患していることを示す、前記方法。
【請求項２】
被験体が心血管疾患を発症する危険性が高いと同定するための方法であって、
(i)被験体に由来する生物試料中の1種以上の心血管疾患(CVD)関連バイオマーカーのレベルを検出すること；ならびに
(ii)被験体に由来する生物試料中の1種以上のCVD関連バイオマーカーのレベルを、対照試料中の対応する1種以上のバイオマーカーのレベルと比較すること
を含み、1種以上のCVD関連バイオマーカーが、コイルドコイルドメイン含有47(CCDC47)を含み、また対照試料と比較した生物試料中の1種以上のCVD関連バイオマーカーのレベルの変化が、被験体が心筋症を発症する危険性が高いことを示す、前記方法。
【請求項３】
被験体における心血管疾患をモニタリングするための方法であって、
(i)心血管疾患を有する被験体から第1の時間で得られた第1の生物試料中の1種以上の心血管疾患(CVD)関連バイオマーカーのレベルを検出すること；
(ii)第1の時間よりも後である第2の時間で被験体から得られた第2の生物試料中の1種以上のCVD関連バイオマーカーのレベルを検出すること；ならびに
(iii)第2の試料中の1種以上のCVD関連バイオマーカーのレベルと、第1の試料中の1種以上のCVD関連バイオマーカーのレベルとを比較すること
を含み、1種以上のCVD関連バイオマーカーが、コイルドコイルドメイン含有47(CCDC47)を含み、また第1の試料と比較した第2の試料中の1種以上のCVD関連バイオマーカーのレベルの変化が、被験体におけるCVD状態の変化を示す、前記方法。
【請求項４】
被験体における心血管疾患の処置をモニタリングするための方法であって、
(i)被験体に処置レジメンの少なくとも一部を施す前に被験体から得られた第1の生物試料中の1種以上の心血管疾患(CVD)関連バイオマーカーのレベルを検出すること；ならびに
(ii)被験体に処置レジメンの少なくとも一部を施した後に被験体から得られた第2の生物試料中の1種以上のCVD関連バイオマーカーのレベルを検出すること；ならびに
(iii)処置レジメンの少なくとも一部を施す前に得られた第1の試料中の1種以上のCVD関連バイオマーカーのレベルと、第2の試料中の処置レジメンの少なくとも一部を施した後に得られた1種以上のCVD関連バイオマーカーのレベルとを比較すること
を含み、1種以上のCVD関連バイオマーカーが、コイルドコイルドメイン含有47(CCDC47)を含み、また第1の試料中の処置レジメンの少なくとも一部で処置する前に得られた1種以上のCVD関連バイオマーカーのレベルと比較した、第2の試料中の処置レジメンの少なくとも一部を施した後に得られた1種以上のCVD関連バイオマーカーのレベルの正常化が、処置レジメンが被験体における心血管疾患を処置するのに有効であることを示す、前記方法。
【請求項５】
心血管疾患が心筋症を含む、請求項１〜４のいずれか一項に記載の方法。
【請求項６】
心筋症が拡張型心筋症、肥大型心筋症、拘束型心筋症、および催不整脈性右室異形成からなる群から選択される少なくとも1つの状態である、請求項５に記載の方法。
【請求項７】
心筋症が、QT期間の増大、不整脈、心筋虚血、高血圧と血栓塞栓性合併症、心筋機能障害、心筋症、心不全、心房細動、心筋症と心不全、心不全とLV機能障害、心房粗動と心房細動、心臓弁損傷と心不全からなる群から選択される少なくとも1つの状態を含む、請求項５または６に記載の方法。
【請求項８】
心筋症が遺伝性心筋症または後天性心筋症である、請求項５〜７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項９】
後天性心筋症が被験体における1種以上のさらなる疾患または状態との併存疾患である、請求項８に記載の方法。
【請求項１０】
被験体における1種以上のさらなる疾患または状態が、冠動脈性心疾患、心臓発作、高血圧、糖尿病、甲状腺疾患、ウイルス性肝炎、HIV1、心筋の炎症を起こすウイルス感染、ヘモクロマトーシス、サルコイドーシス、アミロイドーシス、および結合組織障害からなる群から選択される、請求項９に記載の方法。
【請求項１１】
後天性心筋症が心臓毒への被験体の曝露の結果である、請求項８に記載の方法。
【請求項１２】
心臓毒が環境性心臓毒または心臓毒性薬である、請求項１１に記載の方法。
【請求項１３】
心臓毒性薬が、過剰のアルコール、アンフェタミン、抗がん剤、化学療法剤、糖尿病薬、神経薬、抗炎症薬、ビスホスホネート、TNFアンタゴニスト、ペルゴリドおよびスマトリプタンからなる群から選択される、請求項１２に記載の方法。
【請求項１４】
抗がん剤が、シスプラチン、ドキソルビシン、ダウノルビシン、アントラサイクリン、5-フルオロウラシル、トラスツズマブおよびゲムシタビンからなる群から選択される、請求項１３に記載の方法。
【請求項１５】
糖尿病薬が、ロシグリタゾン、ピオグリタゾン、トログリタゾンおよびカベルゴリンからなる群から選択される、請求項１３に記載の方法。
【請求項１６】
心血管疾患が心不全を含む、請求項１〜４のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１７】
1種以上のCVD関連バイオマーカーが、Emmprin、HMOX1、IGFBP7、PTX3、IL27、PAI1、CFL2、EDIL3、およびNUCB1からなる群から選択されるCVD関連バイオマーカーをさらに含む、請求項１〜１６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１８】
1種以上のCVD関連バイオマーカーがHMOX1をさらに含む、請求項１〜１６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１９】
1種以上のCVD関連バイオマーカーがPTX3をさらに含む、請求項１８に記載の方法。
【請求項２０】
1種以上のCVD関連バイオマーカーがPAI1をさらに含む、請求項１８に記載の方法。
【請求項２１】
1種以上のCVD関連バイオマーカーが、PE D18:0-20:3/D18:1-20:2/D16:0-22:3; PE D18:0-22:5/D18:1-22:4; PE D16:1-22:6; PE P18:1-18:1/P18:0-18:2/P16:0-20:2; LPC 20:3; およびPC-LI-183-D18:22-22:6からなる群から選択される少なくとも1種の脂質バイオマーカーをさらに含む、請求項１〜２０のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２２】
脂質がPC-Li-183-D18:2-22:6を含む、請求項２１に記載の方法。
【請求項２３】
1種以上のCVD関連バイオマーカーが、1A69、1C17、ACBD3、ACLY、ACTR2、ANXA6、ANXA7、AP2A1、ARCN1、ASNA1、ATAD3A、ATP5A、ATP5B、ATP5D、ATP5F1、ATP5H、ATPIF1、BSG、C14orf166、CA2D1、CAPN1、CAPZA2、CARS、CCDC22、CCDC47、CCT7、CLIC4、CMPK1、CNN2、CO1A2、CO6A1、COTL1、COX6B1、CRTAP、CS010、CTSA、CTSB、CYB5、DDX1、DDX17、DDX18、DLD、EDIL3、EHD2、EIF4A3、ENO2、EPHX1、ETFA、FERMT2、FINC、FKB10、FKBP2、FLNC、G3BP2、GOLGA3、GPAT1、GPSN2、GRP75、GRP78、HMOX1、HNRNPD、HNRNPH1、HNRPG、HPX、HSP76、HSP90AB1、HSPA1A、HSPA4、HSPA9、IBP7、IDH1、IQGAP1、ITB1、ITGB1、KARS、KIF5B、KPNA3、KPNB1、LAMC1、LGALS1、LMO7、M6PRBP1、MACF1、MAP1B、MARS、MDH1、MPR1、MTHFD1、MYH10、NCL、NHP2L1、NUCB1、OLA1、P08621、P3H1、P4HA2、P4HB、SEC61A1 (P61619)、PAI1、PAPSS2、PCBP2、PDCD6、PDIA1、PDIA3、PDIA3、PDIA4、PDLIM7、PEBP1、PFKM、PH4B、PLIN2、POFUT1、PRKDC、PSMA1、PSMA7、PSMD12、PSMD3、PSMD4、PSMD6、PSME2、PTBP1、Q9BQE5、Q9Y262、RAB1B、RP515A、RPL32、RPL7A、RPL8、RPS25、RPS6、RRAS2、RRP1、SAR1B、SDHA、SENP1、SEPT11、SEPT7、SERPH、SERPINE1、SFRS2、SH3BGRL、SNRPB、SNX12、SOD1、SPRC、ST13、SUB1、SYNCRIP、TAGLN、TAZ、TGM2、TIMP1、TLN1、TPM4、TRAP1、TSP1、TTLL12、TXNDC12、UBA1C、UGDH、UGP2、UQCRH、VAMP3、およびVAPAからなる群から選択される少なくとも1種のCVD関連バイオマーカーをさらに含む、請求項１〜２２のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２４】
1種以上のCVD関連バイオマーカーがEDIL3をさらに含む、請求項１〜２３のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２５】
1種以上のCVD関連バイオマーカーがEmmprinをさらに含む、請求項１〜２３のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２６】
1種以上のCVD関連バイオマーカーがNUCB1をさらに含む、請求項１〜２３のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２７】
正常な対照と比較したCCDC47のレベルの増加が、被験体が心血管疾患に罹患しているか、またはそれを発症する危険性が高いことを示す、請求項１〜２および５〜２６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２８】
第1の試料中のレベルと比較した第2の試料中のCCDC47のレベルの低下が、被験体の心血管疾患状態が改善したか、または処置レジメンが心血管疾患を処置するのに有効であることを示す、請求項３〜４および５〜２６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２９】
心血管疾患(CVD)関連バイオマーカーのセットを検出するための方法であって、
(i)CCDC47、ならびにHMOX1、PTX3、PAI1、IL27、IGFBP7、Emmprin、CFL2、EDIL3、NUCB1、PE D18:0-20:3/D18:1-20:2/D16:0-22:3; PE D18:0-22:5/D18:1-22:4; PE D16:1-22:6; PE P18:1-18:1/P18:0-18:2/P16:0-20:2; LPC 20:3; およびPC-LI-183-D18:22-22:6の1種以上を含むCVD関連バイオマーカーのセットの2種以上のCVD関連バイオマーカーのレベルについて、被験体に由来する生物試料を分析すること；
(ii)生物試料中の2種以上のCVD関連バイオマーカーのそれぞれを検出することによって、CVD関連バイオマーカーのセットを検出すること
を含む、前記方法。
【請求項３０】
検出方法における使用のための試薬のパネルであって、パネルが少なくとも2つの検出試薬を含み、それぞれの検出試薬が、コイルドコイルドメイン含有47(CCDC47)、ならびにHMOX1、PTX3、PAI1、IL27、IGFBP7、Emmprin、CFL2、EDIL3、NUCB1、PE D18:0-20:3/D18:1-20:2/D16:0-22:3; PE D18:0-22:5/D18:1-22:4; PE D16:1-22:6; PE P18:1-18:1/P18:0-18:2/P16:0-20:2; LPC 20:3; およびPC-LI-183-D18:22-22:6からなる群から選択される1種以上の心血管疾患(CVD)関連バイオマーカーを含むCVD関連バイオマーカーのセットの少なくとも1種のCVD関連マーカーの検出にとって特異的である、前記パネル。
【請求項３１】
1種以上のCVD関連バイオマーカーが、Emmprin、HMOX1、IGFBP7、PTX3、IL27、PAI1、CFL2、EDIL3、およびNUCB1からなる群から選択される、請求項３０に記載のパネル。
【請求項３２】
1種以上のCVD関連バイオマーカーが、HMOX1を含む、請求項３０に記載のパネル。
【請求項３３】
1種以上のCVD関連バイオマーカーが、PTX3をさらに含む、請求項３２に記載のパネル。
【請求項３４】
1種以上のCVD関連バイオマーカーが、PAI1をさらに含む、請求項３２に記載のパネル。
【請求項３５】
1種以上のCVD関連バイオマーカーが、PE D18:0-20:3/D18:1-20:2/D16:0-22:3; PE D18:0-22:5/D18:1-22:4; PE D16:1-22:6; PE P18:1-18:1/P18:0-18:2/P16:0-20:2; LPC 20:3;およびPC-LI-183-D18:22-22:6からなる群から選択される少なくとも1種の脂質バイオマーカーをさらに含む、請求項３０〜３４のいずれか一項に記載のパネル。
【請求項３６】
脂質がPC-Li-183-D18:2-22:6を含む、請求項３５に記載のパネル。
【請求項３７】
1種以上のCVD関連バイオマーカーが、1A69、1C17、ACBD3、ACLY、ACTR2、ANXA6、ANXA7、AP2A1、ARCN1、ASNA1、ATAD3A、ATP5A、ATP5B、ATP5D、ATP5F1、ATP5H、ATPIF1、BSG、C14orf166、CA2D1、CAPN1、CAPZA2、CARS、CCDC22、CCDC47、CCT7、CLIC4、CMPK1、CNN2、CO1A2、CO6A1、COTL1、COX6B1、CRTAP、CS010、CTSA、CTSB、CYB5、DDX1、DDX17、DDX18、DLD、EDIL3、EHD2、EIF4A3、ENO2、EPHX1、ETFA、FERMT2、FINC、FKB10、FKBP2、FLNC、G3BP2、GOLGA3、GPAT1、GPSN2、GRP75、GRP78、HMOX1、HNRNPD、HNRNPH1、HNRPG、HPX、HSP76、HSP90AB1、HSPA1A、HSPA4、HSPA9、IBP7、IDH1、IQGAP1、ITB1、ITGB1、KARS、KIF5B、KPNA3、KPNB1、LAMC1、LGALS1、LMO7、M6PRBP1、MACF1、MAP1B、MARS、MDH1、MPR1、MTHFD1、MYH10、NCL、NHP2L1、NUCB1、OLA1、P08621、P3H1、P4HA2、P4HB、SEC61A1 (P61619)、PAI1、PAPSS2、PCBP2、PDCD6、PDIA1、PDIA3、PDIA3、PDIA4、PDLIM7、PEBP1、PFKM、PH4B、PLIN2、POFUT1、PRKDC、PSMA1、PSMA7、PSMD12、PSMD3、PSMD4、PSMD6、PSME2、PTBP1、Q9BQE5、Q9Y262、RAB1B、RP515A、RPL32、RPL7A、RPL8、RPS25、RPS6、RRAS2、RRP1、SAR1B、SDHA、SENP1、SEPT11、SEPT7、SERPH、SERPINE1、SFRS2、SH3BGRL、SNRPB、SNX12、SOD1、SPRC、ST13、SUB1、SYNCRIP、TAGLN、TAZ、TGM2、TIMP1、TLN1、TPM4、TRAP1、TSP1、TTLL12、TXNDC12、UBA1C、UGDH、UGP2、UQCRH、VAMP3、およびVAPAからなる群から選択される少なくとも1種のCVD関連バイオマーカーをさらに含む、請求項３０〜３５のいずれか一項に記載のパネル。
【請求項３８】
1種以上のCVD関連バイオマーカーが、EDIL3を含む、請求項３０〜３７のいずれか一項に記載のパネル。
【請求項３９】
1種以上のCVD関連バイオマーカーが、Emmprinを含む、請求項３０〜３７のいずれか一項に記載のパネル。
【請求項４０】
1種以上のCVD関連バイオマーカーが、NUCB1を含む、請求項３０〜３７のいずれか一項に記載のパネル。
【請求項４１】
請求項１〜４のいずれか一項に記載の方法における請求項３０〜４０のいずれか一項に記載のパネルの使用。
【請求項４２】
被験体における心血管疾患の診断、モニタリング、または特性評価のためのキットであって、
コイルドコイルドメイン含有47(CCDC47)を含む少なくとも1種のCVD関連マーカーのレベルを検出するのに特異的な少なくとも1種の試薬
を含む、前記キット。
【請求項４３】
1種以上のCVD関連バイオマーカーが、Emmprin、HMOX1、IGFBP7、PTX3、IL27、PAI1、CFL2、EDIL3、およびNUCB1からなる群から選択される、少なくとも1種のCVD関連マーカーをさらに含む、請求項４２に記載のキット。
【請求項４４】
1種以上のCVD関連バイオマーカーがHMOX1をさらに含む、請求項４２に記載のキット。
【請求項４５】
1種以上のCVD関連バイオマーカーがPTX3をさらに含む、請求項４４に記載のキット。
【請求項４６】
1種以上のCVD関連バイオマーカーがPAI1をさらに含む、請求項４４に記載のキット。
【請求項４７】
1種以上のCVD関連バイオマーカーが、PE D18:0-20:3/D18:1-20:2/D16:0-22:3; PE D18:0-22:5/D18:1-22:4; PE D16:1-22:6; PE P18:1-18:1/P18:0-18:2/P16:0-20:2; LPC 20:3; およびPC-LI-183-D18:22-22:6からなる群から選択される少なくとも1種の脂質バイオマーカーをさらに含む、請求項４２〜４６のいずれか一項に記載のキット。
【請求項４８】
脂質がPC-Li-183-D18:2-22:6を含む、請求項４７に記載のキット。
【請求項４９】
1種以上のCVD関連バイオマーカーが、1A69、1C17、ACBD3、ACLY、ACTR2、ANXA6、ANXA7、AP2A1、ARCN1、ASNA1、ATAD3A、ATP5A、ATP5B、ATP5D、ATP5F1、ATP5H、ATPIF1、BSG、C14orf166、CA2D1、CAPN1、CAPZA2、CARS、CCDC22、CCDC47、CCT7、CLIC4、CMPK1、CNN2、CO1A2、CO6A1、COTL1、COX6B1、CRTAP、CS010、CTSA、CTSB、CYB5、DDX1、DDX17、DDX18、DLD、EDIL3、EHD2、EIF4A3、ENO2、EPHX1、ETFA、FERMT2、FINC、FKB10、FKBP2、FLNC、G3BP2、GOLGA3、GPAT1、GPSN2、GRP75、GRP78、HMOX1、HNRNPD、HNRNPH1、HNRPG、HPX、HSP76、HSP90AB1、HSPA1A、HSPA4、HSPA9、IBP7、IDH1、IQGAP1、ITB1、ITGB1、KARS、KIF5B、KPNA3、KPNB1、LAMC1、LGALS1、LMO7、M6PRBP1、MACF1、MAP1B、MARS、MDH1、MPR1、MTHFD1、MYH10、NCL、NHP2L1、NUCB1、OLA1、P08621、P3H1、P4HA2、P4HB、SEC61A1 (P61619)、PAI1、PAPSS2、PCBP2、PDCD6、PDIA1、PDIA3、PDIA3、PDIA4、PDLIM7、PEBP1、PFKM、PH4B、PLIN2、POFUT1、PRKDC、PSMA1、PSMA7、PSMD12、PSMD3、PSMD4、PSMD6、PSME2、PTBP1、Q9BQE5、Q9Y262、RAB1B、RP515A、RPL32、RPL7A、RPL8、RPS25、RPS6、RRAS2、RRP1、SAR1B、SDHA、SENP1、SEPT11、SEPT7、SERPH、SERPINE1、SFRS2、SH3BGRL、SNRPB、SNX12、SOD1、SPRC、ST13、SUB1、SYNCRIP、TAGLN、TAZ、TGM2、TIMP1、TLN1、TPM4、TRAP1、TSP1、TTLL12、TXNDC12、UBA1C、UGDH、UGP2、UQCRH、VAMP3、およびVAPAからなる群から選択される少なくとも1種のCVD関連バイオマーカーをさらに含む、請求項４２〜４８のいずれか一項に記載のキット。
【請求項５０】
1種以上のCVD関連バイオマーカーがEDIL3をさらに含む、請求項４２〜４９のいずれか一項に記載のキット。
【請求項５１】
1種以上のCVD関連バイオマーカーがEmmprinをさらに含む、請求項４２〜４９のいずれか一項に記載のキット。
【請求項５２】
1種以上のCVD関連バイオマーカーがNUCB1をさらに含む、請求項４２〜４９のいずれか一項に記載のキット。
【請求項５３】
1種以上のCVD関連バイオマーカーがEmmprin、HMOX1、IGFBP7、PTX3、IL27、およびPAI1をさらに含む、請求項４２〜４９のいずれか一項に記載のキット。
【請求項５４】
1種以上のCVD関連バイオマーカーがEmmprin、IGFBP7、PTX3、IL27、およびPAI1をさらに含む、請求項４２〜４９のいずれか一項に記載のキット。
【請求項５５】
1種以上のCVD関連バイオマーカーがEmmprin、HMOX1、PTX3、IL27、およびPAI1をさらに含む、請求項４２〜４９のいずれか一項に記載のキット。
【請求項５６】
1種以上のCVD関連バイオマーカーがHMOX1、IGFBP7、PTX3、IL27、およびPAI1をさらに含む、請求項４２〜４９のいずれか一項に記載のキット。
【請求項５７】
1種以上のCVD関連バイオマーカーがEmmprin、HMOX1、IGFBP7、PTX3、IL27、およびPAI1をさらに含む、請求項４２〜４９のいずれか一項に記載のキット。
【請求項５８】
1種以上のCVD関連バイオマーカーがEmmprin、HMOX1、IGFBP7、IL27、およびPAI1をさらに含む、請求項４２〜４９のいずれか一項に記載のキット。
【請求項５９】
1種以上のCVD関連バイオマーカーがEmmprin、HMOX1、IGFBP7、PTX3、およびIL27をさらに含む、請求項４２〜４９のいずれか一項に記載のキット。
【請求項６０】
1種以上のCVD関連バイオマーカーがEmmprin、HMOX1、IGFBP7、およびPTX3をさらに含む、請求項４２〜４９のいずれか一項に記載のキット。
【請求項６１】
1種以上のCVD関連バイオマーカーがEmmprin、HMOX1、およびIGFBP7をさらに含む、請求項４２〜４９のいずれか一項に記載のキット。
【請求項６２】
1種以上のCVD関連バイオマーカーがEmmprin、HMOX1およびIGFBP7をさらに含む、請求項４２〜４９のいずれか一項に記載のキット。
【請求項６３】
1種以上のCVD関連バイオマーカーがEmmprinおよびHMOX1をさらに含む、請求項４２〜４９のいずれか一項に記載のキット。
【請求項６４】
1種以上のCVD関連バイオマーカーがEDIL3、NUCB1、CFL2およびPTX3をさらに含む、請求項４２〜４９のいずれか一項に記載のキット。
【請求項６５】
1種以上のCVD関連バイオマーカーがNUCB1、CFL2およびPTX3をさらに含む、請求項４２〜４９のいずれか一項に記載のキット。
【請求項６６】
1種以上のCVD関連バイオマーカーがNUCB1およびPTX3をさらに含む、請求項４２〜４９のいずれか一項に記載のキット。
【請求項６７】
1種以上のCVD関連バイオマーカーがNUCB1およびCFL2をさらに含む、請求項４２〜４９のいずれか一項に記載のキット。
【請求項６８】
心血管疾患を処置するための化合物を同定する方法であって、
(i)試験細胞を取得すること；
(ii)試験細胞を試験化合物と接触させること；
(iii)試験細胞中の1種以上の心血管疾患(CVD)関連バイオマーカーのレベルを検出すること；
(iv)試験細胞中のコイルドコイルドメイン含有47(CCDC47)を含む1種以上のCVD関連バイオマーカーのレベルを、試験化合物により接触していない対照細胞と比較すること；ならびに
(v)試験細胞中の1種以上のCVD関連バイオマーカーのレベルを調節する試験化合物を選択することによって、被験体におけるCVDを処置するための化合物を同定すること
を含む、前記方法。
【請求項６９】
心臓毒性を引き起こすか、または引き起こす危険性がある薬剤を同定する方法であって、
(i)第1の細胞を試験薬剤と接触させること；
(ii)試験薬剤と接触した第1の細胞中の1種以上のCVD関連バイオマーカーのレベルを検出すること；ならびに
(iii)第1の細胞中の1種以上のCVD関連バイオマーカーのレベルを、試験薬剤と接触していない対照細胞である第2の細胞中の対応する1種以上のCVD関連バイオマーカーのレベルと比較すること
を含み；
1種以上のCVD関連バイオマーカーがコイルドコイルドメイン含有47(CCDC47)を含み、第2の細胞と比較した第1の細胞中の1種以上のCVD関連バイオマーカーのレベルの調節が、試験薬剤が心臓毒性を引き起こすか、または引き起こす危険性がある薬剤であることを示す、前記方法。
【請求項７０】
薬物誘導性心臓毒性の防止、軽減または処置のための救助剤を同定するための方法であって、
(i)第1の細胞を心臓毒性剤と接触させること；
(ii)第2の細胞を心臓毒性剤および候補救助剤と接触させること；
(iii)心臓毒性剤と接触した第1の細胞中の1種以上のCVD関連バイオマーカーのレベルを検出すること；
(iv)心臓毒性剤および候補救助剤と接触した第2の細胞中の、コイルドコイルドメイン含有47(CCDC47)を含む1種以上のCVD関連バイオマーカーのレベルを検出すること；ならびに
(v)第2の細胞中の1種以上のCVD関連バイオマーカーのレベルを、第1の細胞中の対応する1種以上のCVD関連バイオマーカーのレベルと比較すること
を含み、第1の細胞と比較した第2の細胞中の1種以上のCVD関連バイオマーカーのレベルの調節が、候補救助剤が薬物誘導性心臓毒性の防止、軽減または処置のための救助剤であることを示す、前記方法。
【請求項７１】
第1および/または第2の細胞中の1種以上のCVD関連バイオマーカーのレベルを、心臓毒性剤または候補救助剤と接触していない対照細胞中の1種以上のCVD関連バイオマーカーのレベルと比較することをさらに含む、請求項７０に記載の方法。
【請求項７２】
対照細胞と比較した第2の細胞中の1種以上のCVD関連バイオマーカーのレベルの正常化が、候補救助剤が薬物誘導性心臓毒性の防止、軽減または処置のための救助剤であることを示す、請求項７１に記載の方法。
【請求項７３】
1種以上のCVD関連バイオマーカーが、Emmprin、HMOX1、IGFBP7、PTX3、IL27、PAI1、CFL2、EDIL3、およびNUCB1からなる群から選択される、請求項６８〜７２のいずれか一項に記載の方法。
【請求項７４】
1種以上のCVD関連バイオマーカーがHMOX1をさらに含む、請求項６８〜７２のいずれか一項に記載の方法。
【請求項７５】
1種以上のCVD関連バイオマーカーがPTX3をさらに含む、請求項７４に記載の方法。
【請求項７６】
1種以上のCVD関連バイオマーカーがPAI1をさらに含む、請求項７４に記載の方法。
【請求項７７】
1種以上のCVD関連バイオマーカーが、PE D18:0-20:3/D18:1-20:2/D16:0-22:3; PE D18:0-22:5/D18:1-22:4; PE D16:1-22:6; PE P18:1-18:1/P18:0-18:2/P16:0-20:2; LPC 20:3; およびPC-LI-183-D18:22-22:6からなる群から選択される少なくとも1種の脂質バイオマーカーをさらに含む、請求項６８〜７６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項７８】
脂質がPC-Li-183-D18:2-22:6を含む、請求項７７に記載の方法。
【請求項７９】
1種以上のCVD関連バイオマーカーが、1A69、1C17、ACBD3、ACLY、ACTR2、ANXA6、ANXA7、AP2A1、ARCN1、ASNA1、ATAD3A、ATP5A、ATP5B、ATP5D、ATP5F1、ATP5H、ATPIF1、BSG、C14orf166、CA2D1、CAPN1、CAPZA2、CARS、CCDC22、CCDC47、CCT7、CLIC4、CMPK1、CNN2、CO1A2、CO6A1、COTL1、COX6B1、CRTAP、CS010、CTSA、CTSB、CYB5、DDX1、DDX17、DDX18、DLD、EDIL3、EHD2、EIF4A3、ENO2、EPHX1、ETFA、FERMT2、FINC、FKB10、FKBP2、FLNC、G3BP2、GOLGA3、GPAT1、GPSN2、GRP75、GRP78、HMOX1、HNRNPD、HNRNPH1、HNRPG、HPX、HSP76、HSP90AB1、HSPA1A、HSPA4、HSPA9、IBP7、IDH1、IQGAP1、ITB1、ITGB1、KARS、KIF5B、KPNA3、KPNB1、LAMC1、LGALS1、LMO7、M6PRBP1、MACF1、MAP1B、MARS、MDH1、MPR1、MTHFD1、MYH10、NCL、NHP2L1、NUCB1、OLA1、P08621、P3H1、P4HA2、P4HB、SEC61A1 (P61619)、PAI1、PAPSS2、PCBP2、PDCD6、PDIA1、PDIA3、PDIA3、PDIA4、PDLIM7、PEBP1、PFKM、PH4B、PLIN2、POFUT1、PRKDC、PSMA1、PSMA7、PSMD12、PSMD3、PSMD4、PSMD6、PSME2、PTBP1、Q9BQE5、Q9Y262、RAB1B、RP515A、RPL32、RPL7A、RPL8、RPS25、RPS6、RRAS2、RRP1、SAR1B、SDHA、SENP1、SEPT11、SEPT7、SERPH、SERPINE1、SFRS2、SH3BGRL、SNRPB、SNX12、SOD1、SPRC、ST13、SUB1、SYNCRIP、TAGLN、TAZ、TGM2、TIMP1、TLN1、TPM4、TRAP1、TSP1、TTLL12、TXNDC12、UBA1C、UGDH、UGP2、UQCRH、VAMP3、およびVAPAからなる群から選択される少なくとも1種のCVD関連バイオマーカーをさらに含む、請求項６８〜７８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項８０】
1種以上のCVD関連バイオマーカーがEDIL3をさらに含む、請求項６８〜７９のいずれか一項に記載の方法。
【請求項８１】
1種以上のCVD関連バイオマーカーがEmmprinをさらに含む、請求項６８〜７９のいずれか一項に記載の方法。
【請求項８２】
1種以上のCVD関連バイオマーカーがHMOX1をさらに含む、請求項６８〜７９のいずれか一項に記載の方法。
【請求項８３】
1種以上のCVD関連バイオマーカーがNUCB1をさらに含む、請求項６８〜７９のいずれか一項に記載の方法。
【請求項８４】
細胞が心臓細胞である、請求項６８〜８３のいずれか一項に記載の方法。
【請求項８５】
細胞が心筋細胞または糖尿病心筋細胞である、請求項６８〜８３のいずれか一項に記載の方法。
【請求項８６】
接触がin vitroで行われる、請求項６８〜８３のいずれか一項に記載の方法。
【請求項８７】
接触がin vivoで行われる、請求項６８〜８３のいずれか一項に記載の方法。