【手続補正書】
【提出日】平成27年11月9日(2015.11.9)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
対象におけるＡＤを同定または予知するための方法であって、
（ａ）前記対象からの試料を、ＩＬ６Ｒ、ＮＴＦ４、およびＵＮＣ５Ｃをコードする遺伝子から選択される遺伝子、またはその遺伝子産物内の遺伝的変異の存在または非存在を検出することができる試薬と接触させることと、
（ｂ）前記遺伝的変異の存在または非存在を決定することであって、前記遺伝的変異の存在が、前記対象がＡＤに罹患しているか、またはＡＤを発症する危険性があることを示す、決定することと、を含む、方法。
【請求項２】
前記少なくとも１つの遺伝的変異が、一塩基多型（ＳＮＰ）、対立遺伝子、ハプロタイプ、挿入、または欠失である、請求項１に記載の方法。
【請求項３】
前記遺伝的変異が、ＳＮＰである、請求項２に記載の方法。
【請求項４】
前記遺伝的変異が、前記ＩＬ６Ｒのアミノ酸配列（配列番号１）内の前記アミノ酸置換Ｄ３５８ＡをもたらすＳＮＰ、前記ＮＴＦ４のアミノ酸配列（配列番号２）内の前記アミノ酸置換Ｒ２０６ＷをもたらすＳＮＰ、および前記ＵＮＣ５Ｃのアミノ酸配列（配列番号３）内の前記アミノ酸置換Ｔ８３５ＭをもたらすＳＮＰからなる群から選択される、請求項３に記載の方法。
【請求項５】
前記遺伝的変異が、ｒｓ２２２８１４５における「Ｃ」対立遺伝子、ｒｓ１２１９１８４２７における「Ｔ」対立遺伝子、および前記ＵＮＣ５Ｃ（配列番号３）の８３５位のアミノ酸をコードするコドン内で、ＧをＡの代わりに用いるＳＮＰである、請求項４に記載の方法。
【請求項６】
前記試薬が、オリゴヌクレオチド、ＤＮＡプローブ、ＲＮＡプローブ、およびリボザイムから選択される、請求項１に記載の方法。
【請求項７】
前記試薬が、標識される、請求項６に記載の方法。
【請求項８】
前記少なくとも１つの遺伝的変異が、ＩＬ６Ｒ、ＮＴＦ４、およびＵＮＣ５Ｃから選択されるタンパク質内のアミノ酸置換、挿入、または欠失である、請求項１に記載の方法。
【請求項９】
前記少なくとも１つの遺伝的変異が、前記ＩＬ６Ｒのアミノ酸配列（配列番号１）内のＤ３５８Ａ、前記ＮＴＦ４のアミノ酸配列（配列番号２）内のＲ２０６Ｗ、および前記ＵＮＣ５Ｃのアミノ酸配列（配列番号３）内のＴ８３５Ｍから選択されるアミノ酸置換である、請求項８に記載の方法。
【請求項１０】
前記試薬が、前記遺伝的変異を含むタンパク質に特異的に結合する抗体である、請求項８に記載の方法。
【請求項１１】
前記試料が、脳脊髄液、血液、血清、痰、唾液、粘膜剥離物、組織検体、涙腺分泌物、精液、または汗のうちの１つから選択される、請求項１に記載の方法。
【請求項１２】
ステップ（ｂ）の結果が前記対象のＡＤを治療するための基礎として考慮される、請求項１に記載の方法。
【請求項１３】
前記試料中で少なくとも１つのＡＰＯＥ−ε４対立遺伝子の存在を検出することをさらに含む、請求項１に記載の方法。
【請求項１４】
前記少なくとも１つの遺伝的変異の存在が、少なくとも１つのＡＰＯＥ−ε４対立遺伝子の存在と一緒になると、少なくとも１つのＡＰＯＥ−ε４対立遺伝子を有し、前記少なくとも１つの遺伝子マーカーの存在を欠く対象と比較して、ＡＤの若年齢診断の危険性の増加を示す、請求項１３に記載の方法。
【請求項１５】
前記対象を、１つ以上の追加の遺伝子マーカーをスクリーニングすること、精神状態の検査を行うこと、または前記対象を撮像法に供することからなる群から選択される、ＡＤに関する１つ以上の追加の検出試験に供することをさらに含む、請求項１に記載の方法。
【請求項１６】
前記試料を分析して、ＡＰＯＥ修飾因子である少なくとも１つの追加の遺伝子マーカーの存在を検出することをさらに含み、前記少なくとも１つの追加の遺伝子マーカーが、前記ＩＬ６Ｒをコードする遺伝子、前記ＮＴＦ４をコードする遺伝子、前記ＵＮＣ５Ｃをコードする遺伝子、および表３に列挙される遺伝子から選択される遺伝子内にある、請求項１に記載の方法。
【請求項１７】
前記少なくとも１つの追加の遺伝子マーカーが、前記ＩＬ６Ｒのアミノ酸配列（配列番号１）内の前記アミノ酸置換Ｄ３５８ＡをもたらすＳＮＰ、前記ＮＴＦ４のアミノ酸配列（配列番号２）内の前記アミノ酸置換Ｒ２０６ＷをもたらすＳＮＰ、および前記ＵＮＣ５Ｃのアミノ酸配列（配列番号３）内の前記アミノ酸置換Ｔ８３５ＷをもたらすＳＮＰ、または表３に列挙されるＳＮＰである、請求項１６に記載の方法。
【請求項１８】
ＡＤの若年齢診断の危険性が増加している対象を同定する方法であって、
対象からの生体試料中のＩＬ６Ｒ、ＮＴＦ４、およびＵＮＣ５Ｃをコードする遺伝子から選択される遺伝子、またはその遺伝子産物内の遺伝的変異の存在もしくは非存在を決定することと、
少なくとも１つのＡＰＯＥ−ε４対立遺伝子の存在または非存在を決定することと、
前記遺伝的変異および少なくとも１つのＡＰＯＥ−ε４対立遺伝子の存在が、前記遺伝的変異および少なくとも１つのＡＰＯＥ−ε４対立遺伝子の存在を欠く対象と比較して、前記対象のＡＤの若年齢診断の危険性が増加していることを示す、方法。
【請求項１９】
対象におけるアルツハイマー病（ＡＤ）を同定または予知する方法であって、
（ａ）前記対象からの試料を、前記ＩＬ６Ｒのアミノ酸配列（配列番号１）内の前記アミノ酸置換Ｄ３５８ＡをもたらすＳＮＰ、前記ＮＴＦ４のアミノ酸配列（配列番号２）内の前記アミノ酸置換Ｒ２０６ＷをもたらすＳＮＰ、および前記ＵＮＣ５Ｃのアミノ酸配列（配列番号３）内の前記アミノ酸置換Ｔ８３５ＭをもたらすＳＮＰからなる群から選択される、１つ以上のＳＮＰの存在または非存在を検出することができる試薬と接触させることと、
（ｂ）前記試料を分析して、前記１つ以上のＳＮＰの存在を検出することであって、前記試料中の前記１つ以上のＳＮＰの存在が、前記対象がＡＤに罹患しているか、またはＡＤを発症する危険性があることを示す、検出することと、を含む、方法。
【請求項２０】
表３に列挙される前記ＳＮＰから選択される１つ以上のＳＮＰを検出することをさらに含む、請求項１９に記載の方法。
【請求項２１】
少なくとも１つのオリゴヌクレオチド検出試薬を含み、前記オリゴヌクレオチド検出試薬が、前記１つ以上のＳＮＰにおける少なくとも２つの異なる対立遺伝子のそれぞれを区別する、請求項１９に記載の方法を実行するためのキット。
【請求項２２】
前記検出が、直接配列決定、対立遺伝子特異的プローブハイブリダイゼーション、対立遺伝子特異的プライマー伸長、対立遺伝子特異的増幅、配列決定、５′ヌクレアーゼ分解、分子指標検定、オリゴヌクレオチド結紮検定、サイズ分析、および一本鎖高次構造多型からなる群から選択される過程により実行される、請求項２１に記載のキット。
【請求項２３】
前記オリゴヌクレオチド検出試薬が、基質に固定化される、請求項２１に記載のキット。
【請求項２４】
前記オリゴヌクレオチド検出試薬が、一列に配置される、請求項２３に記載のキット。
【請求項２５】
対象におけるアルツハイマー病（ＡＤ）を同定または予知する方法であって、
（ａ）前記対象からの試料を、前記ＩＬ６Ｒのアミノ酸配列（配列番号１）内の前記アミノ酸置換Ｄ３５８Ａ、前記ＮＴＦ４のアミノ酸配列内の前記アミノ酸置換Ｒ２０６Ｗ、および前記ＵＮＣ５Ｃのアミノ酸配列（配列番号３）内の前記アミノ酸置換Ｔ８３５Ｍからなる群から選択される、１つ以上のアミノ酸置換の存在または非存在を検出することができる試薬と接触させることと、
（ｂ）前記試料を分析して、前記１つ以上のアミノ酸置換の存在を検出することであって、前記試料中の前記１つ以上のアミノ酸置換の存在が、前記対象がＡＤに罹患しているか、またはＡＤを発症する危険性があることを示す、検出することと、を含む、方法。
【請求項２６】
少なくとも１つの抗体検出試薬を含み、前記抗体検出試薬が、前記１つ以上のアミノ酸置換における少なくとも２つの異なるアミノ酸のそれぞれを区別する、請求項２５に記載の方法を実行するためのキット。
【請求項２７】
ＩＬ６Ｒ、ＮＴＦ４、およびＵＮＣ５Ｃから選択される遺伝子によりコードされるタンパク質のうちの１つまたはそれらの組み合わせである、ＡＤの治療のための治療標的。