【手続補正書】
【提出日】平成28年6月3日(2016.6.3)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
KabatもしくはChothia付番スキームによる重鎖もしくは軽鎖残基L22、L7、H25、H40、H19、及びH70、EU付番スキームによる重鎖残基H404、H121、H180、H136、及びH190からなる群から選択される特異的部位で1以上の非天然アミノ酸残基を有するポリペプチド鎖を含む抗体、又はその翻訳後修飾変異体。
【請求項２】
KabatもしくはChothia付番スキームによる重鎖もしくは軽鎖残基L22、L7、H25、及びH40、EU付番スキームによる重鎖残基H404、H121、H180、H136、及びH190からなる群から選択される特異的部位で1以上の非天然アミノ酸残基を有するポリペプチド鎖を含む、請求項１記載の抗体、又はその翻訳後修飾変異体。
【請求項３】
KabatもしくはChothia付番スキームによる軽鎖残基L22、及びL7、EU付番スキームによる重鎖残基H404、H121、H180、及びH136からなる群から選択される特異的部位で1以上の非天然アミノ酸残基を有するポリペプチド鎖を含む、請求項１記載の抗体、又はその翻訳後修飾変異体。
【請求項４】
配列番号1との少なくとも70％、80％、もしくは90％の相同性を有し、かつ配列番号1による代表的な重鎖ポリペプチドの残基407、124、183、139、25、40、193、19、もしくは71に対応する部位からなる群から選択される特異的部位で1以上の非天然アミノ酸残基を有するポリペプチド鎖を含む、請求項１記載の抗体、又はその翻訳後修飾変異体。
【請求項５】
配列番号2との少なくとも70％、80％、もしくは90％の相同性を有し、かつ配列番号2による代表的な軽鎖ポリペプチドの残基22、及び7に対応する部位からなる群から選択される特異的部位で1以上の非天然アミノ酸残基を有するポリペプチド鎖を含む、請求項１記載の抗体、又はその翻訳後修飾変異体。
【請求項６】
前記ポリペプチド鎖が、α、δ、ε、及びμからなる群から選択されるタイプの重鎖である、請求項１〜５のいずれか一項記載の抗体。
【請求項７】
前記ポリペプチド鎖が、λ及びκから選択されるタイプの軽鎖である、請求項１〜６のいずれか一項記載の抗体。
【請求項８】
IgA、IgA、IgA2、IgD、IgE、IgG、IgG1、IgG2、IgG3、及びIgMからなる群から選択されるクラス又はサブクラスのものである、請求項１〜７のいずれか一項記載の抗体。
【請求項９】
前記非天然アミノ酸残基が、アミノ、カルボキシ、アセチル、ヒドラジノ、ヒドラジド、セミカルバジド、スルファニル、アジド、及びアルキニルからなる群から選択される部分を含む、請求項１〜８のいずれか一項記載の抗体。
【請求項１０】
各々の非天然アミノ酸残基が、下記式
【化１】
2015518905.tif 000001
(式中、各々のLは、独立に、二価のリンカーであり;かつ
各々のRは、独立に、官能基である)
によるものである、請求項1〜9のいずれか一項記載の抗体。
【請求項１１】
Rが、反応基、治療的部分、又は標識部分である、請求項10記載の抗体。
【請求項１２】
各々のRが、アミノ、カルボキシ、アセチル、ヒドラジノ、ヒドラジド、セミカルバジド、スルファニル、アジド、及びアルキニルからなる群から選択される反応基である、請求項10記載の抗体。
【請求項１３】
各々のLが、結合、アルキレン、置換アルキレン、ヘテロアルキレン、置換ヘテロアルキレン、アリーレン、置換アリーレン、ヘテロアリーレン、及び置換ヘテロアリーレンからなる群から選択される二価のリンカーである、請求項10記載の抗体。
【請求項１４】
1以上の治療的部分又は標識部分に連結された請求項1〜13のいずれか一項記載の抗体を含む、抗体コンジュゲート。
【請求項１５】
1以上の薬物又はポリマーに連結された前記抗体を含む、請求項14記載の抗体コンジュゲート。
【請求項１６】
1以上の標識部分に連結された前記抗体を含む、請求項14記載の抗体コンジュゲート。
【請求項１７】
1以上の単鎖結合ドメイン(scFv)に連結された前記抗体を含む、請求項14記載の抗体コンジュゲート。
【請求項１８】
前記抗体が、1以上のリンカーを介して前記1以上の治療的部分又は標識部分に連結されている、請求項14〜17のいずれか一項記載の抗体コンジュゲート。
【請求項１９】
実質的に純粋である、請求項1〜18のいずれか一項記載の抗体を含む組成物。
【請求項２０】
前記抗体が、前記組成物の全抗体質量の少なくとも95質量％である、請求項1〜19のいずれか一項記載の抗体を含む組成物。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００６５
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００６５】
置換のための部位特異的位置は、当業者に公知の任意の抗体命名法を用いて記載することができる。Kabat付番体系において、これらの位置は、重鎖残基
【化１】
2015518905.tif 000002
にある。言い換えると、本明細書に提供されるのは、Kabat残基
【化２】
2015518905.tif 000003
から選択される1以上の位置に1以上の非天然アミノ酸を含む抗体である。
【手続補正３】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００６６
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００６６】
ある実施態様において、本明細書に提供されるのは、Kabat残基
【化３】
2015518905.tif 000004
から選択される1以上の位置に1以上の非天然アミノ酸を含む抗体である。
【手続補正４】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００６７
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００６７】
ある実施態様において、本明細書に提供されるのは、Kabat残基
【化４】
2015518905.tif 000005
から選択される1以上の位置に1以上の非天然アミノ酸を含む抗体である。
【手続補正５】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００６８
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００６８】
ある実施態様において、本明細書に提供されるのは、Kabat残基H005、及びH084；並びにEU残基H118、H132、H136、H239、H293、H334、H355、H359、及びH389から選択される1以上の位置に1以上の非天然アミノ酸を含む抗体である。
【手続補正６】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００６９
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００６９】
ある実施態様において、本明細書に提供されるのは、Kabat残基
【化５】
2015518905.tif 000006
から選択される1以上の位置に1以上の非天然アミノ酸を含む抗体である。
【手続補正７】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００７０
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００７０】
ある実施態様において、本明細書に提供されるのは、Kabat残基H042、及びH065；並びにEU残基H138、H155、H174、H176、H177、H219、H238、H243、H262、H264、H265、H278、H342、H356、H358、H360、H383、H384 H404、及びH436から選択される1以上の位置に1以上の非天然アミノ酸を含む抗体である。
【手続補正８】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００７１
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００７１】
ある実施態様において、本明細書に提供されるのは、H292〜H301、H303、及びH305に対応するEU残基から選択される1以上の位置に1以上の非天然アミノ酸を含む抗体である。
【手続補正９】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００７２
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００７２】
Chothia付番体系において、これらの位置は、重鎖残基
【化６】
2015518905.tif 000007
にある。言い換えると、本明細書に提供されるのは、Chothia残基
【化７】
2015518905.tif 000008
から選択される1以上の位置に1以上の非天然アミノ酸を含む抗体である。
【手続補正１０】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００７３
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００７３】
ある実施態様において、本明細書に提供されるのは、Chothia残基
【化８】
2015518905.tif 000009
から選択される1以上の位置に1以上の非天然アミノ酸を含む抗体である。
【手続補正１１】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００７４
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００７４】
ある実施態様において、本明細書に提供されるのは、Chothia残基H005、及びH084；並びにEU残基H118、H132、H136、H239、H293、H334、H342、H355、H359、H389、及びH404から選択される1以上の位置に1以上の非天然アミノ酸を含む抗体である。
【手続補正１２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００７５
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００７５】
ある実施態様において、本明細書に提供されるのは、H292〜H301、H303、及びH305に対応するEU残基から選択される1以上の位置に1以上の非天然アミノ酸を含む抗体である。
【手続補正１３】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００７６
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００７６】
ある実施態様において、本明細書に提供されるのは、Chothia残基
【化９】
2015518905.tif 000010
から選択される1以上の位置に1以上の非天然アミノ酸を含む抗体である。
【手続補正１４】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００７７
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００７７】
ある実施態様において、本明細書に提供されるのは、Chothia残基H042、及びH065；並びにEU残基H138、H155、H174、H176、H177、H219、H238、H243、H262、H264、H265、H278、H342、H356、H358、H360、H383、H384、H404、及びH436から選択される1以上の位置に1以上の非天然アミノ酸を含む抗体である。
【手続補正１５】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００７８
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００７８】
ある実施態様において、本明細書に提供されるのは、Kabat又はChothia付番スキームによる、残基
【化１０】
2015518905.tif 000011
から選択される1以上の位置に1以上の非天然アミノ酸を含む抗体である。
【手続補正１６】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００７９
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００７９】
ある実施態様において、本明細書に提供されるのは、Kabat又はChothia付番スキームによる、残基L043、L049、L056、L057、L060、L067、及びL068；並びにEU付番スキームによる、残基L109、L112、L114、L144、L153、L156、L157、L168、L184、L202、L203、及びL206から選択される1以上の位置に1以上の非天然アミノ酸を含む抗体である。ある実施態様において、本明細書に提供されるのは、Kabat又はChothia付番スキームによる、残基L043、L049、L056、L057、L060、L067、及びL068；並びにEU付番スキームによる、残基L109、L112、L114、L144、L153、L156、L168、L184、L202、及びL203から選択される1以上の位置に1以上の非天然アミノ酸を含む抗体である。ある実施態様において、本明細書に提供されるのは、Kabat又はChothia付番スキームによる、残基L043、L049、L056、L057、L060、L067、及びL068；並びにEU付番スキームによる、残基L109、L144、L153、L156、L184、L202、及びL203から選択される1以上の位置に1以上の非天然アミノ酸を含む抗体である。ある実施態様において、本明細書に提供されるのは、Kabat又はChothia付番スキームによる、残基L049、L056、L057、L060、及びL067；並びにEU付番スキームによる、残基L109、L153、L202、及びL203から選択される1以上の位置に1以上の非天然アミノ酸を含む抗体である。
【手続補正１７】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００８０
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００８０】
ある実施態様において、本明細書に提供されるのは、Kabat又はChothia付番スキームによる、残基
【化１１】
2015518905.tif 000012
から選択される1以上の位置に1以上の非天然アミノ酸を含む抗体である。ある実施態様において、本明細書に提供されるのは、Kabat又はChothia付番スキームによる、残基
【化１２】
2015518905.tif 000013
から選択される1以上の位置に1以上の非天然アミノ酸を含む抗体である。ある実施態様において、本明細書に提供されるのは、Kabat又はChothia付番スキームによる、残基
【化１３】
2015518905.tif 000014
から選択される1以上の位置に1以上の非天然アミノ酸を含む抗体である。ある実施態様において、本明細書に提供されるのは、Kabat又はChothia付番スキームによる、残基H023、及びH084；並びにEU付番スキームによる、残基H118、H119、H135、H136、H160、H162、H195、H219、H282、H296、H267、H293、H297、H298、H303、H305、H334、H340、H341、H392、及びH438、H442から選択される1以上の位置に1以上の非天然アミノ酸を含む抗体である。
【手続補正１８】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００８１
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００８１】
ある実施態様において、本明細書に提供されるのは、Kabat又はChothia付番スキームによる、残基
【化１４】
2015518905.tif 000015
から選択される1以上の位置に1以上の非天然アミノ酸を含む抗体である。ある実施態様において、本明細書に提供されるのは、Kabat又はChothia付番スキームによる、残基H042、H003、H007、H014、H016、H019、H025、H040、H043、H052、H053、H056、H070、H082A、H100、H110、及びH112；並びにEU付番スキームによる、残基H121、H180、H190、H192、H214、H216、H221、H222、H225、H227、H230、H231、H232、及びH236から選択される1以上の位置に1以上の非天然アミノ酸を含む抗体である。ある実施態様において、本明細書に提供されるのは、Kabat又はChothia付番スキームによる、残基H042、H003、H007、H014、H016、H019、H025、H040、H043、H052、H070、H082A、H100、H110、及びH112；並びにEU付番スキームによる、残基H121、H180、H190、H192、H214、H216、H221、H222、H225、H227、H230、H231、H232、及びH236から選択される1以上の位置に1以上の非天然アミノ酸を含む抗体である。ある実施態様において、本明細書に提供されるのは、Kabat又はChothia付番スキームによる、残基H007、H014、H019、H025、H040、H043、H052、H070、H100、H110、及びH112；並びにEU付番スキームによる、残基H121、H180、H214、H216、H222、H227、H230、H231、H232、及びH236から選択される1以上の位置に1以上の非天然アミノ酸を含む抗体である。
【手続補正１９】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００８２
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００８２】
ある実施態様において、本明細書に提供されるのは、Kabat又はChothia付番スキームによる、残基
【化１５】
2015518905.tif 000016
から選択される1以上の位置に1以上の非天然アミノ酸を含む抗体である。ある実施態様において、本明細書に提供されるのは、Kabat又はChothia付番スキームによる、残基マイナス1、L003、L005、L007、L008、L009、L010、L016、L017、L018、L020、L022、L026、L027、L045、L058、L063、L065、L066、L070、L077、L079、及びL107；並びにEU付番スキームによる、残基L142、L143、L152、L171、L182、L188、L199、及びL201から選択される1以上の位置に1以上の非天然アミノ酸を含む抗体である。ある実施態様において、本明細書に提供されるのは、Kabat又はChothia付番スキームによる、残基(-)L001、L003、L005、L007、L008、L009、L016、L017、L018、L020、L022、L026、L027、L045、L058、L063、L065、L066、L070、L077、L079、及びL107；並びにEU付番スキームによる、残基L142、L152、L171、L182、L188、及びL199から選択される1以上の位置に1以上の非天然アミノ酸を含む抗体である。ある実施態様において、本明細書に提供されるのは、Kabat又はChothia付番スキームによる、残基マイナス1、L005、L007、L008、L016、L017、L018、L020、L022、L027、L045、L058、L063、L077、L079、及びL107；並びにEU付番スキームによる、残基L142、L152、L182、L188、及びL199から選択される1以上の位置に1以上の非天然アミノ酸を含む抗体である。ある実施態様において、本明細書に提供されるのは、Kabat又はChothia付番スキームによる、残基(-)L001、L016、及びL063；並びにEU付番スキームによる、残基L199から選択される1以上の位置に1以上の非天然アミノ酸を含む抗体である。
【手続補正２０】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００８３
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００８３】
ある実施態様において、本明細書に提供されるのは、Kabat又はChothia付番スキームによる、残基H019、H025、H051、H070、H098、H110、及びH112；並びにEU付番スキームによる、残基H121、H136、H180、H187、H190、H214、H216、H221、及びH222から選択される1以上の位置に1以上の非天然アミノ酸を含む抗体である。
【手続補正２１】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００８４
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００８４】
ある実施態様において、本明細書に提供されるのは、Kabat又はChothia付番スキームによる、残基(-)L001、L007、L008、L016、L022、L063、L014、及びL070；並びにEU付番スキームによる、残基L138、L142、L143、及びL152から選択される1以上の位置に1以上の非天然アミノ酸を含む抗体である。
【手続補正２２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００８５
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００８５】
ある実施態様において、本明細書に提供されるのは、Kabat又はChothia付番スキームによる、残基H019、H025、H051、H070、H077、H079、H098、H110、及びH112；並びにEU付番スキームによる、残基H121、H136、H180、H187、H190、H214、H216、H221、及びH222から選択される1以上の位置に1以上の非天然アミノ酸を含む抗体である。
【手続補正２３】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００８６
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００８６】
ある実施態様において、本明細書に提供されるのは、Kabat又はChothia付番スキームによる、残基(-)L001、L007、L008、L016、L022、L063、及びL070；並びにEU付番スキームによる、残基L138、L142、L143、L152、及びL201から選択される1以上の位置に1以上の非天然アミノ酸を含む抗体である。
【手続補正２４】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０１１７
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０１１７】
したがって、ある実施態様において、本明細書に提供されるのは、重鎖もしくは軽鎖残基EU HC-F404、EU HC-K121、EU HC-Y180、EU HC-F241、KabatもしくはChothia LC-T22、KabatもしくはChothia LC-S7、EU LC-N152、EU HC-S136、KabatもしくはChothia HC-S25、KabatもしくはChothia HC-A40、EU HC-S119、EU HC-S190、EU HC-K222、KabatもしくはChothia HC-R19、KabatもしくはChothia HC-Y52、もしくはKabatもしくはChothia HC-S70からなる群から選択される1以上の位置に1以上の非天然アミノ酸を含む抗体、又はその翻訳後修飾変異体である。
【手続補正２５】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０１１８
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０１１８】
ある実施態様において、本明細書に提供されるのは、重鎖又は軽鎖残基EU HC-F404、EU HC-K121、EU HC-Y180、EU HC-F241、KabatもしくはChothia LC-T22、KabatもしくはChothia LC-S7、EU LC-N152、EU HC-S136、KabatもしくはChothia HC-S25、KabatもしくはChothia HC-A40、EU HC-S119、EU HC-S190、及びEU HC-K222からなる群から選択される1以上の位置に1以上の非天然アミノ酸を含む抗体、又はその翻訳後修飾変異体である。
【手続補正２６】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０１１９
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０１１９】
ある実施態様において、本明細書に提供されるのは、重鎖又は軽鎖残基EU HC-F404、EU HC-K121、EU HC-Y180、EU HC-F241、KabatもしくはChothia LC-T22、KabatもしくはChothia LC-S7、EU LC-N152、及びEU HC-S136からなる群から選択される1以上の位置に1以上の非天然アミノ酸を含む抗体、又はその翻訳後修飾変異体である。