【手続補正書】
【提出日】平成28年3月23日(2016.3.23)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
複数の抗原-MHC複合体を含む高密度ナノ粒子組成物であって、各抗原-MHC複合体がナノ粒子コアに機能的に結合しており、
(a)該抗原-MHC複合体が、胃腸管の微生物に由来する抗原と複合体化されたMHCタンパク質を含むかまたはGI関連抗原を含み、
(b)該ナノ粒子のナノ粒子コアが、1nm〜1000nm、1nm〜100nm、5nm〜50nm、または5nm〜15nmの直径の群より選択される直径を有し、かつ
(c)抗原-MHC複合体：ナノ粒子コアの比が10:1〜1000:1である、
高密度ナノ粒子組成物。
【請求項２】
前記ナノ粒子コアがナノ粒子コアの外表面上に生分解性の層をさらに含み、前記抗原-MHC複合体が該ナノ粒子コアまたは該生分解性の層に機能的に結合している、請求項1に記載の組成物。
【請求項３】
前記生分解性の層が、デキストラン、マンニトール、またはポリエチレングリコールの1種または複数種を含む、請求項2に記載の組成物。
【請求項４】
抗原-MHC複合体：ナノ粒子コアの前記比が10:1〜100:1である、請求項1〜3のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項５】
前記抗原-MHC複合体が前記ナノ粒子コアまたは前記生分解性の層に共有結合または非共有結合で連結されている、請求項1〜4のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項６】
前記抗原-MHC複合体が、5kD未満の大きさのリンカーを介して前記ナノ粒子コアまたは前記生分解性の層に共有結合で連結されている、請求項1〜5のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項７】
前記リンカーがポリエチレングリコールを含む、請求項6に記載の組成物。
【請求項８】
前記抗原が、バクテロイデス属(Bacteroides)、クロストリジウム属(Clostridium)、フゾバクテリウム属(Fusobacterium)、ユウバクテリウム属(Eubacterium)、ルミノコッカス属(Ruminococcus)、ペプトコッカス属(Peptococcus)、ペプトストレプトコッカス属(Peptostreptococcus)、もしくはビフィドバクテリウム属(Bifidobacterium)の群のうちの微生物に由来するか、または、前記抗原が、オボアルブミン、酵母マンナン、もしくはグリアジンの群のうちのタンパク質に由来するGI関連抗原である、請求項1〜7のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項９】
前記抗原が、バクテロイデス属に由来するか、またはバクテロイデス属のタンパク質、任意でバクテロイデス属インテグラーゼに由来する、請求項1〜8のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項１０】
前記抗原がバクテロイデス属インテグラーゼに由来する、請求項1〜9のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項１１】
前記抗原が、SEQ ID NO:1、4、5、6、7、または8の群のうちのペプチド配列に対して少なくとも80％の同一性を有するペプチドを含む、請求項1〜10のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項１２】
前記ナノ粒子コアが生体適合性または生体吸収性である、請求項1〜11のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項１３】
前記抗原-MHC複合体のMHCがMHCクラスI、MHCクラスII、またはそれらの組み合わせを含む、請求項1〜12のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項１４】
前記ナノ粒子コアがリポソームではない、請求項1〜13のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項１５】
前記ナノ粒子コアが、金属、金属酸化物、金属硫化物、金属セレン化物、磁性材料、ポリマー、金、鉄、または酸化鉄の1種または複数種を含む、請求項1〜14のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項１６】
前記ナノ粒子コアが、金、鉄、または酸化鉄の1種または複数種を含む、請求項1〜15のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項１７】
前記高密度組成物が複数のナノ粒子を含み、特定の総抗原-MHC複合体含有量において、前記ナノ粒子コアがより小さな直径を有するように、該ナノ粒子が選択される、請求項1〜16のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項１８】
請求項1〜17のいずれか一項に記載の組成物および担体を含む、薬学的組成物。
【請求項１９】
請求項1〜17のいずれか一項に記載の複数の高密度ナノ粒子を調製するかまたは得るための方法であって、前記抗原-MHC複合体を該ナノ粒子コアまたは該生分解性の層と複合体化させる工程を含む、方法。
【請求項２０】
SEQ ID NO:1、4、5、6、7、もしくは8の群のうちのアミノ酸配列を含む単離および精製されたポリペプチド、あるいは、SEQ ID NO:1、4、5、6、7、もしくは8に対して少なくとも約80％の配列同一性を有するポリペプチド、あるいは、SEQ ID NO:1、4、5、6、7、もしくは8をコードするかまたはSEQ ID No:1、4、5、6、7もしくは8に対して少なくとも約80％の配列同一性を有するポリペプチドをコードするポリヌクレオチドに中程度ストリンジェンシー条件から高ストリンジェンシー条件の下でハイブリダイズするポリヌクレオチドまたはその相補体によってコードされる、ポリペプチド。
【請求項２１】
請求項20に記載のポリペプチドもしくは等価物をコードする単離および精製されたポリヌクレオチド、または、約25℃〜約37℃のインキュベーション温度、約6×SSC〜約10×SSCのハイブリダイゼーションバッファー濃度、約0％〜約25％のホルムアミド濃度、および約4×SSC〜約8×SSCの洗浄液を含むストリンジェントな条件下で、該ポリヌクレオチド、その等価物、もしくはその相補体にハイブリダイズする、ポリヌクレオチド。
【請求項２２】
請求項20に記載のポリペプチドおよび担体を含む、組成物。
【請求項２３】
請求項21に記載のポリヌクレオチドおよび担体を含む、組成物。
【請求項２４】
請求項1〜17のいずれか一項に記載の高密度ナノ粒子組成物を含む、細胞または組織においてまたはそれを必要とする患者において抗炎症反応を誘導するための薬学的組成物。
【請求項２５】
請求項1〜17のいずれか一項に記載の高密度ナノ粒子組成物を含む、それを必要とする患者において炎症を治療するための薬学的組成物。
【請求項２６】
請求項1〜17のいずれか一項に記載の高密度ナノ粒子組成物を含む、それを必要とする患者のGI管において抗炎症性T細胞および/または抗炎症性細胞を蓄積するための薬学的組成物。
【請求項２７】
前記患者が、炎症性腸疾患、大腸炎、クローン病、胃腸管のアレルギー性炎症、またはセリアック病の群のうちの胃腸疾患に罹患している、請求項24〜26のいずれか一項に記載の薬学的組成物。
【請求項２８】
前記細胞または前記組織が、GI管の細胞または組織である、請求項24に記載の薬学的組成物。
【請求項２９】
前記T細胞がCD4+ T細胞またはCD8+ T細胞である、請求項26または27に記載の薬学的組成物。
【請求項３０】
前記T細胞がIL-10またはTGFβを分泌する、請求項26、27、または29のいずれか一項に記載の薬学的組成物。
【請求項３１】
前記抗炎症反応が胃腸管において誘導される、請求項24または28に記載の薬学的組成物。
【請求項３２】
炎症が胃腸管の炎症である、請求項25に記載の薬学的組成物。
【請求項３３】
以下の工程を含む、GI特異的な抗炎症性T細胞および/または抗炎症性細胞の集団の増殖をモニターするためのインビトロ方法：
(a)請求項1〜17のいずれか一項に記載の高密度ナノ粒子組成物または請求項18に記載の薬学的組成物の有効量を対象に投与した後に該対象から得られた適切な試料を、該抗原-MHC複合体を含む四量体複合体の有効量と接触させる工程であって、該患者がGI特異的な抗炎症性T細胞および/または抗炎症性細胞の集団を含有すると疑われる、工程；および
(b)該四量体複合体に結合したGI特異的な抗炎症性T細胞および/または抗炎症性細胞の数を検出および定量する工程。
【請求項３４】
工程(b)のGI特異的な抗炎症性T細胞の数を定量する工程が、フローサイトメトリーの使用を含む、請求項33に記載の方法。
【請求項３５】
細胞または組織においてまたはそれを必要とする患者において抗炎症反応を誘導するための医薬の製造における、請求項1〜17のいずれか一項に記載の高密度ナノ粒子組成物の使用。
【請求項３６】
それを必要とする患者において炎症を治療するための医薬の製造における、請求項1〜17のいずれか一項に記載の高密度ナノ粒子組成物の使用。
【請求項３７】
それを必要とする患者のGI管において抗炎症性T細胞および/または抗炎症性細胞を蓄積するための医薬の製造における、請求項1〜17のいずれか一項に記載の高密度ナノ粒子組成物の使用。
【請求項３８】
前記患者が、炎症性腸疾患、大腸炎、クローン病、胃腸管のアレルギー性炎症、またはセリアック病の群のうちの胃腸疾患に罹患している、請求項35〜37のいずれか一項に記載の使用。
【請求項３９】
前記細胞または前記組織が、GI管の細胞または組織である、請求項35に記載の使用。
【請求項４０】
前記T細胞がCD4+ T細胞またはCD8+ T細胞である、請求項37または38に記載の使用。
【請求項４１】
前記T細胞がIL-10またはTGFβを分泌する、請求項37、38、または40のいずれか一項に記載の薬学的組成物。
【請求項４２】
前記抗炎症反応が胃腸管において誘導される、請求項35または39に記載の使用。
【請求項４３】
炎症が胃腸管の炎症である、請求項36に記載の使用。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００１１
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００１１】
また本明細書に記載される組成物およびその意図した目的のために該組成物を使用するための説明書を含むか、またはその代わりに該組成物および該説明書から本質的になるか、またはなおさらに該組成物および該説明書からなるキットも提供される。
[本発明1001]
抗原-MHC複合体を含むナノ粒子であって、該複合体が、胃腸管の微生物に由来する抗原と複合体化されたかまたはGI関連抗原である抗原と複合体化されたMHCタンパク質を含む、ナノ粒子。
[本発明1002]
約1nm〜約100nm、約5nm〜約50nm、または約5nm〜約15nmの直径の群より選択される直径を有する、本発明1001のナノ粒子。
[本発明1003]
抗原-MHC複合体対ナノ粒子の比が約10：1〜約1000：1である、前記本発明のいずれかのナノ粒子。
[本発明1004]
前記抗原-MHC複合体が前記ナノ粒子に共有結合または非共有結合で連結されている、前記本発明のいずれかのナノ粒子。
[本発明1005]
前記抗原-MHC複合体が、5kD未満の大きさのリンカーを介して前記ナノ粒子に共有結合で連結されている、前記本発明のいずれかのナノ粒子。
[本発明1006]
前記抗原が、バクテロイデス属(Bacteroides)、クロストリジウム属(Clostridium)、フゾバクテリウム属(Fusobacterium)、ユウバクテリウム属(Eubacterium)、ルミノコッカス属(Ruminococcus)、ペプトコッカス属(Peptococcus)、ペプトストレプトコッカス属(Peptostreptococcus)、もしくはビフィドバクテリウム属(Bifidobacterium)の群のうちの微生物に由来するか、または、前記抗原が、オボアルブミン、酵母マンナン、もしくはグリアジンの群のうちのタンパク質に由来するGI関連抗原である、前記本発明のいずれかのナノ粒子。
[本発明1007]
前記抗原が、バクテロイデス属に由来するか、またはバクテロイデス属のタンパク質に由来する、前記本発明のいずれかのナノ粒子。
[本発明1008]
前記抗原がインテグラーゼに由来する、前記本発明のいずれかのナノ粒子。
[本発明1009]
前記抗原が、SEQ ID NO:1、4、5、6、7、または8の群のうちのペプチド配列に対して少なくとも80％の同一性を有するペプチドを含む、前記本発明のいずれかのナノ粒子。
[本発明1010]
生体適合性または生体吸収性である、前記本発明のいずれかのナノ粒子。
[本発明1011]
前記MHCがMHCクラスIまたはMHCクラスIIを含む、前記本発明のいずれかのナノ粒子。
[本発明1012]
リポソームではない、前記本発明のいずれかのナノ粒子。
[本発明1013]
本発明1001〜1012のいずれかのナノ粒子および担体を含む、組成物。
[本発明1014]
本発明1001〜1012のいずれかのナノ粒子を調製するかまたは得るための方法であって、前記抗原-MHC複合体を該ナノ粒子と複合体化させる工程を含む、方法。
[本発明1015]
SEQ ID NO:1、4、5、6、7、もしくは8の群のうちのアミノ酸配列を含む単離および精製されたポリペプチド、あるいは、SEQ ID NO:1、4、5、6、7、もしくは8に対して少なくとも約80％の配列同一性を有するポリペプチド、あるいは、SEQ ID NO:1、4、5、6、7、もしくは8をコードするかまたはSEQ ID No:1、4、5、6、7もしくは8に対して少なくとも約80％の配列同一性を有するポリペプチドをコードするポリヌクレオチドに中程度ストリンジェンシー条件から高ストリンジェンシー条件の下でハイブリダイズするポリヌクレオチドまたはその相補体によってコードされる、ポリペプチド。
[本発明1016]
本発明1015のポリペプチドもしくは等価物をコードする単離および精製されたポリヌクレオチド、または、約25℃〜約37℃のインキュベーション温度、約6×SSC〜約10×SSCのハイブリダイゼーションバッファー濃度、約0％〜約25％のホルムアミド濃度、および約4×SSC〜約8×SSCの洗浄液を含むストリンジェントな条件下で、該ポリヌクレオチド、その等価物、もしくはその相補体にハイブリダイズする、ポリヌクレオチド。
[本発明1017]
本発明1015のポリペプチドおよび担体を含む、組成物。
[本発明1018]
本発明1016のポリヌクレオチドおよび担体を含む、組成物。
[本発明1019]
細胞または組織において抗炎症反応を誘導するための方法であって、該細胞または該組織を本発明1001〜1012のいずれかのナノ粒子の有効量と接触させる工程を含む、方法。
[本発明1020]
それを必要とする患者において炎症を治療するための方法であって、本発明1001〜1012のいずれかのナノ粒子複合体の有効量を該患者に投与し、それによって炎症を治療する工程を含む、方法。
[本発明1021]
それを必要とする患者のGI管において抗炎症性T細胞および/または抗炎症性細胞を蓄積するための方法であって、本発明1001〜1012のいずれかのナノ粒子の有効量を該患者に投与し、それによって該患者を治療する工程を含む、方法。
[本発明1022]
前記患者が、炎症性腸疾患、大腸炎、クローン病、胃腸管のアレルギー性炎症、またはセリアック病の群のうちの胃腸疾患に罹患している、本発明1020または本発明1021の方法。
[本発明1023]
前記細胞または前記組織が、GI管の細胞または組織である、本発明1019の方法。
[本発明1024]
前記T細胞がCD4+ T細胞またはCD8+ T細胞である、本発明1021または1022の方法。
[本発明1025]
前記T細胞がIL-10またはTGFβを分泌する、本発明1021、1022、または1024のいずれかの方法。
[本発明1026]
前記抗炎症反応が胃腸管において誘導される、本発明1019または1023の方法。
[本発明1027]
胃腸管の炎症が治療される、本発明1020の方法。
[本発明1029]
それを必要とする患者において、腸内細菌のエピトープを標的とする細胞傷害性Tリンパ球を移入するための方法であって、本発明1001〜1012のいずれかの抗原-MHC-ナノ粒子複合体の有効量を該患者に投与する工程を含む、方法。
[本発明1030]
前記細胞傷害性Tリンパ球が、低い結合活性を有する前記腸内細菌のエピトープを認識する、本発明1029の方法。