【手続補正書】
【提出日】平成28年7月6日(2016.7.6)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
哺乳動物細胞中に発現された（または産生された）対応するＬＳＤタンパク質と比較して少なくとも７５％脱リン酸化された単離ヒトイズロン酸−２−スルファターゼ（ＩＤＳ）ポリペプチド。
【請求項２】
前記ヒトＩＤＳポリペプチドが少なくとも８０％脱リン酸化されている、請求項１に記載の単離ポリペプチド。
【請求項３】
前記ヒトＩＤＳポリペプチドが配列番号２と少なくとも９０％同一である、請求項１または２に記載の単離ポリペプチド。
【請求項４】
前記ヒトＩＤＳポリペプチドが１つ以上のＮ結合型オリゴマンノースグリカンを含む、請求項３に記載の単離ポリペプチド。
【請求項５】
前記ヒトＩＤＳポリペプチドが、１、２、３、４、５、６、７、または８個のＮ結合型オリゴマンノースグリカンを含む、請求項４に記載の単離ポリペプチド。
【請求項６】
前記ヒトＩＤＳポリペプチドが、イデュルスルファーゼとして少なくとも約７５％の数または量のＮ結合型オリゴマンノースグリカンを有する、請求項４または５に記載の単離ポリペプチド。
【請求項７】
前記１つ以上のＮ結合型オリゴマンノースグリカンが少なくとも７５％脱リン酸化されている、請求項４〜６のいずれかに記載の単離ポリペプチド。
【請求項８】
前記ヒトＩＤＳが、イデュルスルファーゼと比較してマンノース−６−リン酸（Ｍ６Ｐ）残基を実質的に含まない、請求項７に記載の単離ポリペプチド。
【請求項９】
Ｍ６Ｐ含有量が約１．２ｐｍｏｌ  Ｍ６Ｐ／ｐｍｏｌ  ＩＤＳタンパク質未満である、請求項８に記載の単離ポリペプチド。
【請求項１０】
Ｍ６Ｐ含有量が約０．５ｐｍｏｌ  Ｍ６Ｐ／ｐｍｏｌ  ＩＤＳタンパク質未満である、請求項９に記載の単離ポリペプチド。
【請求項１１】
Ｍ６Ｐ含有量が約０．１５ｐｍｏｌ  Ｍ６Ｐ／ｐｍｏｌ  ＩＤＳタンパク質未満である、請求項１０に記載の単離ポリペプチド。
【請求項１２】
ｐ９７結合体を形成するために請求項１〜１１のいずれかに記載の単離ＩＤＳポリペプチドに共有結合性に連結されたか作動可能に連結されたｐ９７ポリペプチドを含む結合体。
【請求項１３】
請求項１〜１１のいずれかに記載のヒトイズロン酸−２−スルファターゼ（ＩＤＳ）ポリペプチドまたは請求項１２に記載のｐ９７結合体、および薬学的に許容され得るキャリアを含む組成物。
【請求項１４】
ムコ多糖体沈着症ＩＩ型（ハンター症候群）の処置のための医薬の調製における請求項１３に記載の組成物の使用。
【請求項１５】
前記ハンター症候群が中枢神経系（ＣＮＳ）合併症を有するか、ＣＮＳ合併症を発症するリスクがある、請求項１４に記載の使用。
【請求項１６】
実質的に脱リン酸化されたヒトイズロン酸−２−スルファターゼ（ＩＤＳ）を産生する方法であって、ヒト細胞株中で前記ヒトＩＤＳを組換え的に産生する工程、組換え的に産生された前記ヒトＩＤＳを、同一のヒト細胞株中で産生された非処理ヒトＩＤＳと比較して前記ヒトＩＤＳのマンノース−６−リン酸（Ｍ６Ｐ）含有量が少なくとも約５０％、６０％、７０％、８０％、９０％、９５％、９８％、または９９％減少するのに十分な時間ホスファターゼで処理する工程を含む、方法。
【請求項１７】
前記ヒト細胞株がＨＴ−１０８０線維肉腫細胞株である、請求項１６に記載の方法。
【請求項１８】
前記ホスファターゼが仔牛腸アルカリホスファターゼ（ＣＩＰ）である、請求項１６または１７に記載の方法。
【請求項１９】
単離ヒトイズロン酸−２−スルファターゼ（ＩＤＳ）ポリペプチドであって、前記ヒトＩＤＳポリペプチドが配列番号２のアミノ酸配列またはその改変体を含むか配列番号２のアミノ酸配列またはその改変体からなり、マンノース−６−リン酸（Ｍ６Ｐ）含有量が約１．２ｐｍｏｌ  Ｍ６Ｐ／ｐｍｏｌ  ＩＤＳタンパク質未満である、単離ヒトイズロン酸−２−スルファターゼ（ＩＤＳ）ポリペプチド。
【請求項２０】
前記Ｍ６Ｐ含有量が約０．５ｐｍｏｌ  Ｍ６Ｐ／ｐｍｏｌ  ＩＤＳタンパク質未満である、請求項１９に記載の単離ポリペプチド。
【請求項２１】
前記Ｍ６Ｐ含有量が約０．１５ｐｍｏｌ  Ｍ６Ｐ／ｐｍｏｌ  ＩＤＳタンパク質または約０．１５ｐｍｏｌ  Ｍ６Ｐ／ｐｍｏｌ  ＩＤＳタンパク質未満である、請求項１９に記載の単離ポリペプチド。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００２７
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００２７】
本発明のこれらおよび他の態様は、以下の詳細な説明および添付の図面を参照した際に明らかとなるであろう。本明細書中に開示の全ての文献は、それぞれが個別に援用されたかのように、その全体が本明細書中で参考として援用される。
特定の実施形態では、本発明は、例えば、以下を提供する。
（項目１）
哺乳動物細胞中に発現された（または産生された）対応するＬＳＤタンパク質と比較して実質的に脱リン酸化された単離リソソーム蓄積症（ＬＳＤ）ポリペプチド。
（項目２）
前記ＬＳＤポリペプチドが少なくとも約７５％脱リン酸化されている、項目１に記載の単離ポリペプチド。
（項目３）
前記ＬＳＤポリペプチドが少なくとも約８０％脱リン酸化されている、項目１に記載の単離ポリペプチド。
（項目４）
前記ＬＳＤポリペプチドが１つ以上のＮ結合型オリゴマンノースグリカンを含む、前記項目のいずれか１項に記載の単離ポリペプチド。
（項目５）
前記ＬＳＤポリペプチドが、１、２、３、４、５、６、７、８、９、または１０個のＮ結合型オリゴマンノースグリカンを含む、項目１に記載の単離ポリペプチド。
（項目６）
前記ＬＳＤポリペプチドが、対応するＬＳＤタンパク質として少なくとも約７５％の数または量のＮ結合型オリゴマンノースグリカンを有する、前記項目のいずれか１項に記載の方法。
（項目７）
前記ＬＳＤポリペプチドが、哺乳動物細胞中に発現された（または産生された）対応するＬＳＤタンパク質と比較して、Ｎ結合型オリゴマンノースグリカンのマンノース−６−リン酸（Ｍ６Ｐ）残基を実質的に含まない、項目４〜６のいずれか１項に記載の単離ポリペプチド。
（項目８）
前記ＬＳＤポリペプチドが、酸性ホスファターゼまたはアルカリホスファターゼでの酵素消化によって脱リン酸化される、前記項目のいずれか１項に記載の単離ポリペプチド。
（項目９）
前記ＬＳＤポリペプチドが、以下のものの活性フラグメントおよび改変体を含む、イズロン酸−２−スルファターゼ、Ｌ−イズロニダーゼ、アスパルチルグルコサミニダーゼ、酸性リパーゼ、システイン輸送体、Ｌａｍｐ−２、α−ガラクトシダーゼＡ、酸性セラミダーゼ、α−Ｌ−フコシダーゼ、β−ヘキソサミニダーゼＡ、ＧＭ２−ガングリオシドアクチベーター（ＧＭ２Ａ）、α−Ｄ−マンノシダーゼ、β−Ｄ−マンノシダーゼ、アリールスルファターゼＡ、サポシンＢ、ノイラミニダーゼ、α−Ｎ−アセチルグルコサミニダーゼホスホトランスフェラーゼ、ホスホトランスフェラーゼγ−サブユニット、ヘパラン−Ｎ−スルファターゼ、α−Ｎ−アセチルグルコサミニダーゼ、アセチルＣｏＡ：Ｎ−アセチルトランスフェラーゼ、Ｎ−アセチルグルコサミン６−スルファターゼ、ガラクトース６−スルファターゼ、β−ガラクトシダーゼ、Ｎ−アセチルガラクトサミン４−スルファターゼ、ヒアルロノグルコサミニダーゼ、スルファターゼ、パルミトイルプロテインチオエステラーゼ、トリペプチジルペプチダーゼＩ、酸性スフィンゴミエリナーゼ、カテプシンＡ、カテプシンＫ、α−ガラクトシダーゼＢ、ＮＰＣ１、ＮＰＣ２、シアリン、およびシアル酸輸送体のうちの１つ以上から選択される、前記項目のいずれか１項に記載の単離ポリペプチド。
（項目１０）
前記ＬＳＤポリペプチドがヒトポリペプチドである、前記項目のいずれか１項に記載の単離ポリペプチド。
（項目１１）
前記ＬＳＤポリペプチドが、ヒトイズロン酸−２−スルファターゼ（ＩＤＳ）、またはその活性フラグメントもしくは改変体である、前記項目のいずれか１項に記載の単離ポリペプチド。
（項目１２）
前記ヒトＩＤＳが配列番号２と少なくとも９０％同一である、項目１１に記載の単離ポリペプチド。
（項目１３）
前記ヒトＩＤＳが１つ以上のＮ結合型オリゴマンノースグリカンを含む、項目１２に記載の単離ポリペプチド。
（項目１４）
前記ヒトＩＤＳが、１、２、３、４、５、６、７、または８個のＮ結合型オリゴマンノースグリカンを含む、項目１３に記載の単離ポリペプチド。
（項目１５）
前記ヒトＩＤＳが、哺乳動物細胞、任意選択的にヒト細胞中に産生された（発現された）対応する野生型ヒトイズロン酸−２−スルファターゼとして少なくとも約７５％の数または量のＮ結合型オリゴマンノースグリカンを有する、項目１３または１４に記載の単離ポリペプチド。
（項目１６）
前記１つ以上のＮ結合型オリゴマンノースグリカンが、哺乳動物細胞、任意選択的にヒト細胞中に産生された（発現された）対応するヒトＩＤＳのＮ結合型オリゴマンノースグリカンと比較して実質的に脱リン酸化されている、項目１３〜１５のいずれか１項に記載の単離ポリペプチド。
（項目１７）
前記１つ以上のＮ結合型オリゴマンノースグリカンが少なくとも７５％脱リン酸化されている、項目１６に記載の単離ポリペプチド。
（項目１８）
前記ヒトＩＤＳが、哺乳動物細胞中で産生された対応するＩＤＳと比較してマンノース−６−リン酸（Ｍ６Ｐ）残基を実質的に含まない、項目１６または１７に記載の単離ポリペプチド。
（項目１９）
Ｍ６Ｐ含有量が約１．２ｐｍｏｌ  Ｍ６Ｐ／ｐｍｏｌ  ＩＤＳタンパク質未満である、項目１８に記載の単離ポリペプチド。
（項目２０）
Ｍ６Ｐ含有量が約０．５ｐｍｏｌ  Ｍ６Ｐ／ｐｍｏｌ  ＩＤＳタンパク質未満である、項目１９に記載の単離ポリペプチド。
（項目２１）
Ｍ６Ｐ含有量が約０．１５ｐｍｏｌ  Ｍ６Ｐ／ｐｍｏｌ  ＩＤＳタンパク質未満である、項目２０に記載の単離ポリペプチド。
（項目２２）
前記ＬＳＤポリペプチドが、ヒトα−Ｌ−イズロニダーゼ（ＩＤＵ）またはその活性フラグメントもしくは改変体である、項目１〜１０のいずれか１項に記載の単離ポリペプチド。
（項目２３）
前記ヒトＩＤＵが配列番号３と少なくとも９０％同一である、項目２２に記載の単離ポリペプチド。
（項目２４）
前記ヒトＩＤＵが１つ以上のＮ結合型オリゴマンノースグリカンを含む、項目２２または２３に記載の単離ポリペプチド。
（項目２５）
前記ヒトＩＤＵが、１、２、３、４、５、または６個のＮ結合型オリゴマンノースグリカンを含む、項目２４に記載の単離ポリペプチド。
（項目２６）
前記ヒトＩＤＵが、哺乳動物細胞、任意選択的にヒト細胞中に産生された（発現された）対応するヒトＩＤＵとして少なくとも約７５％の数または量のＮ結合型オリゴマンノースグリカンを有する、項目２４または２５に記載の単離ポリペプチド。
（項目２７）
前記１つ以上のＮ結合型オリゴマンノースグリカンが、哺乳動物細胞、任意選択的にヒト細胞中に産生された（発現された）対応するヒトＩＤＵのＮ結合型オリゴマンノースグリカンと比較して、実質的に脱リン酸化されている、項目２４〜２６のいずれか１項に記載の単離ポリペプチド。
（項目２８）
前記１つ以上のＮ結合型オリゴマンノースグリカンが少なくとも７５％脱リン酸化されている、項目２７に記載の単離ポリペプチド。
（項目２９）
前記ヒトＩＤＵが、哺乳動物細胞中に産生された対応するＩＤＵと比較して、マンノース−６−リン酸（Ｍ６Ｐ）残基を実質的に含まない、項目２８に記載の単離ポリペプチド。
（項目３０）
前記対応するタンパク質が野生型タンパク質である、前記項目のいずれか１項に記載の単離ポリペプチド。
（項目３１）
前記対応するタンパク質がヒト細胞株中に産生されたイデュルスルファーゼである、前記項目のいずれか１項に記載の単離ポリペプチド。
（項目３２）
前記哺乳動物細胞が、ＣＨＯ細胞、ＨＥＫ２９３細胞、ＨｅＬａ細胞、およびＨＴ−１０８０線維肉腫細胞から選択される、前記項目のいずれか１項に記載の単離ポリペプチド。
（項目３３）
ｐ９７結合体を形成するために前記項目のいずれか１項に記載の実質的に脱リン酸化されたＬＳＤポリペプチドに共有結合性に連結されたか作動可能に連結されたｐ９７ポリペプチドを含む結合体。
（項目３４）
前記項目のいずれか１項に記載の単離リソソーム蓄積症（ＬＳＤ）ポリペプチドまたはｐ９７結合体を含む組成物。
（項目３５）
薬学的に許容され得るキャリアを含む、項目３４に記載の組成物。
（項目３６）
項目３４または３５に記載の組成物を被験体に投与する工程を含む、処置を必要とする被験体におけるリソソーム蓄積症（ＬＳＤ）を処置する方法。
（項目３７）
前記ＬＳＤが、１つ以上のムコ多糖体沈着症ＩＩ型（ハンター症候群）、ムコ多糖体沈着症Ｉ型（ハーラー症候群）、アスパルチルグルコサミン尿、コレステロールエステル蓄積症、ウォルマン病、シスチン蓄積症、ダノン病、ファブリー病、ファーバー脂肪肉芽腫症、ファーバー病、フコース蓄積症、ガラクトシアリドーシスＩ型／ＩＩ型、ゴーシェ病Ｉ型／ＩＩ型／ＩＩＩ型、ゴーシェ病、グロボイド細胞白質ジストロフィ（ｇｌｏｂｏｉｄ  ｃｅｌｌ  ｌｅｕｃｏｄｙｓｔｒｏｐｈｙ）、クラッベ病、糖原貯蔵障害ＩＩ、ポンぺ病、ＧＭ１−ガングリオシドーシスＩ型／ＩＩ型／ＩＩＩ型、ＧＭ２−ガングリオシドーシスＩ型、テイ・サックス病、ＧＭ２−ガングリオシドーシスＩＩ型、サンドホフ病、ＧＭ２−ガングリオシドーシス、α−マンノシドーシスＩ型／ＩＩ型、β−マンノシドーシス、異染性白質ジストロフィ（ｍｅｔａｃｈｒｏｍａｔｉｃ  ｌｅｕｃｏｄｙｓｔｒｏｐｈｙ）、ムコリピドーシスＩ型、シアリドーシスＩ型／ＩＩ型ムコリピドーシスＩＩ型／ＩＩＩ型Ｉ細胞病、ムコリピドーシスＩＩＩＣ型偽性ハーラーポリジストロフィ、ムコ多糖体沈着症ＩＩＩＡ型、サンフィリッポ症候群、ムコ多糖体沈着症ＩＩＩＢ型、ムコ多糖体沈着症ＩＩＩＣ型、ムコ多糖体沈着症ＩＩＩＤ型、ムコ多糖体沈着症ＩＶＡ型、モルキオ症候群、ムコ多糖体沈着症ＩＶＢ型、ムコ多糖体沈着症ＶＩ型、ムコ多糖体沈着症ＶＩＩ型、スライ症候群、ムコ多糖体沈着症ＩＸ型、多発性スルファターゼ欠損症、神経セロイドリポフスチノーシス、ＣＬＮ１バッテン病、ニーマン・ピック病ＮＢ型、ニーマン・ピック病、ニーマン・ピック病Ｃ１型、ニーマン・ピック病Ｃ２型、濃化異骨症、シンドラー病Ｉ型／ＩＩ型、シンドラー病、およびシアル酸蓄積症から選択される、項目３６に記載の方法。
（項目３８）
前記ＬＳＤがムコ多糖体沈着症ＩＩ型（ハンター症候群）であり、前記実質的に脱リン酸化されたＬＳＤタンパク質がヒトイズロン酸−２−スルファターゼである、項目３７に記載の方法。
（項目３９）
前記ＬＳＤがムコ多糖体沈着症Ｉ型（ハーラー症候群）であり、前記実質的に脱リン酸化されたＬＳＤタンパク質がヒトＬ−イズロニダーゼである、項目３７に記載の方法。
（項目４０）
前記ＬＳＤが中枢神経系（ＣＮＳ）合併症を有するか、前記被験体が前記ＬＳＤのＣＮＳ合併症を発症するリスクがある、項目３６〜３９のいずれか１項に記載の方法。
（項目４１）
実質的に脱リン酸化されたヒトイズロン酸−２−スルファターゼ（ＩＤＳ）を産生する方法であって、ヒト細胞株中で前記ヒトＩＤＳを組換え的に産生する工程、組換え的に産生された前記ヒトＩＤＳを、同一のヒト細胞株中で産生された非処理ヒトＩＤＳと比較して前記ヒトＩＤＳのマンノース−６−リン酸（Ｍ６Ｐ）含有量が少なくとも約５０％、６０％、７０％、８０％、９０％、９５％、９８％、または９９％減少するのに十分な時間ホスファターゼで処理する工程を含む、方法。
（項目４２）
前記ヒト細胞株がＨＴ−１０８０線維肉腫細胞株である、項目４１に記載の方法。
（項目４３）
前記ＩＤＳが、配列番号２のアミノ酸配列を含むか、配列番号２のアミノ酸配列からなる、項目４１に記載の方法。
（項目４４）
前記ホスファターゼが仔牛腸アルカリホスファターゼ（ＣＩＰ）である、項目４１に記載の方法。
（項目４５）
前記ＣＩＰがアクリルビーズに結合している、項目４４に記載の方法。
（項目４６）
前記ヒトＩＤＳをヒトｐ９７配列に融合する、項目４１〜４４のいずれか１項に記載の方法。
（項目４７）
前記ＩＤＳをヒトｐ９７ポリペプチドに結合体化する工程をさらに含む、項目４１〜４５のいずれか１項に記載の方法。
（項目４８）
単離ヒトイズロン酸−２−スルファターゼ（ＩＤＳ）ポリペプチドであって、前記ヒトＩＤＳポリペプチドが配列番号２のアミノ酸配列またはその改変体を含むか配列番号２のアミノ酸配列またはその改変体からなり、マンノース−６−リン酸（Ｍ６Ｐ）含有量が約１．２ｐｍｏｌ  Ｍ６Ｐ／ｐｍｏｌ  ＩＤＳタンパク質未満である、単離ヒトイズロン酸−２−スルファターゼ（ＩＤＳ）ポリペプチド。
（項目４９）
前記Ｍ６Ｐ含有量が約０．５ｐｍｏｌ  Ｍ６Ｐ／ｐｍｏｌ  ＩＤＳタンパク質未満である、項目４８に記載の単離ポリペプチド。
（項目５０）
前記Ｍ６Ｐ含有量が約０．１５ｐｍｏｌ  Ｍ６Ｐ／ｐｍｏｌ  ＩＤＳタンパク質または約０．１５ｐｍｏｌ  Ｍ６Ｐ／ｐｍｏｌ  ＩＤＳタンパク質未満である、項目４８に記載の単離ポリペプチド。