【手続補正書】
【提出日】平成28年1月28日(2016.1.28)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
試験物質に対する微生物（６）の反応を測定する方法であって、前記方法は、
培養室（１０）の第１の端部（１２）に隣接する第１の流体チャネル（２０）及び前記培養室（１０）の第２の異なる端部（１４）に隣接する第２の流体チャネル（３０）を有する流体デバイス（１）の前記培養室（１０）に配置された３Ｄ培養マトリックス（２）における前記微生物（６）の培養を実現すること（Ｓ１）、
第１の濃度の前記試験物質を含む第１の流体の流れに前記第１の流体チャネル（２０）の入力（２２）を接続すること（Ｓ２）、
前記３Ｄ培養マトリックス（２）の少なくとも一部の上の前記試験物質の濃度勾配を形成するために、前記試験物質を含まないかまたは前記第１の濃度よりも低い第２の濃度の前記試験物質を含む第２の流体の流れに前記第２の流体チャネル（３０）の入力（３２）を接続すること（Ｓ３）、及び、
前記微生物（６）が前記試験物質に対して第１の反応を示す第１の反応領域（３）と、前記微生物（６）が前記試験物質に対して第２の異なる反応を示す第２の反応領域（４）との間の前記３Ｄ培養マトリックス（２）における任意の境界領域（５）のうち、前記第１の端部（１２）及び／または前記第２の異なる端部（１４）に関連する位置に基づいて、前記試験物質に対する前記微生物（６）の反応を測定すること（Ｓ４）、を有する、
前記方法。
【請求項２】
請求項１に記載の方法において、前記反応を測定すること（Ｓ４）は、前記３Ｄ培養マトリックス（２）における前記任意の境界領域（５）のうち、前記第１の端部（１２）及び／または前記第２の異なる端部（１４）に関連する前記位置に基づいて、且つ前記境界領域（５）の幅に基づいて、前記試験物質に対する前記微生物（６）の前記反応を測定すること（Ｓ４）を含む、
前記方法。
【請求項３】
請求項１または２に記載の方法において、前記反応を測定すること（Ｓ４）は、前記３Ｄ培養マトリックス（２）における前記任意の境界領域（５）のうち、前記第１の端部（１２）及び／または前記第２の異なる端部（１４）に関連する前記位置に基づいて、且つ前記境界領域（５）の形状に基づいて、前記試験物質に対する前記微生物（６）の前記反応を測定すること（Ｓ４）を含む、
前記方法。
【請求項４】
請求項１ないし３のいずれかに記載の方法において、前記第１の流体チャネル（２０）の前記入力（２２）を接続すること（Ｓ２）は、
前記第１の濃度の前記試験物質を含む第１の流体を有する第１の流体貯蔵部（２６）に前記第１の流体チャネル（２０）の前記入力（２２）を接続すること（Ｓ１０）、及び、
前記第１の流体貯蔵部（２６）から前記第１の流体チャネル（２０）の前記入力（２２）の中に前記第１の流体をポンピングして（Ｓ１１）、前記第１の流体チャネル（２０）の出力（２４）を通して出力すること、を含み、及び、
前記第２の流体チャネル（３０）の前記入力（３２）を接続すること（Ｓ３）は、
前記試験物質を含まないかまたは前記第２の濃度の前記試験物質を含む第２の流体を有する第２の流体貯蔵部（３６）に前記第２の流体チャネル（３０）の前記入力（３２）を接続すること（Ｓ１２）、及び、
前記第２の流体貯蔵部（３６）から前記第２の流体チャネル（３０）の前記入力（３２）の中に前記第２の流体をポンピングして（Ｓ１３）、前記第２の流体チャネル（３０）の出力（３４）を通して出力すること、を含む、
前記方法。
【請求項５】
請求項１ないし４のいずれかに記載の方法は、
前記３Ｄ培養マトリックス（２）の少なくとも１つの画像を撮像すること（Ｓ２１）、及び、
前記少なくとも１の画像において前記境界領域（５）を識別すること（Ｓ２２）、をさらに有し、その中で、前記反応を測定すること（Ｓ４）は、前記少なくとも１つの画像において識別された前記境界領域（５）のうち、前記第１の端部（１２）及び／または前記第２の異なる端部（１４）に関連する前記位置に基づいて、前記試験物質に対する前記微生物（６）の前記反応を測定すること（Ｓ４）、を含む、
前記方法。
【請求項６】
請求項１ないし５のいずれかに記載の方法は、前記第１の流体の流れから前記３Ｄ培養マトリックス（２）を通過する前記第１の流体または第２の流体の流れを実質的に含んでいない前記３Ｄ培養マトリックス（２）の中への前記試験物質の拡散によって、前記３Ｄ培養マトリックス（２）の前記少なくとも一部の上に前記濃度勾配を設定すること（Ｓ３０）、をさらに有する、
前記方法。
【請求項７】
請求項１ないし６のいずれかに記載の方法において、
前記第１の流体チャネル（２０）の前記入力（２２）を接続すること（Ｓ２）は、前記第１の濃度の第１の試験物質を含み、且つ、第２の試験物質を含まないかまたは第３の濃度の前記第２の試験物質を含む前記第１の流体の流れに、前記第１の流体チャネル（２０）の前記入力（２２）を接続すること（Ｓ２）、を含み、
前記第２の流体チャネル（３０）の前記入力（３２）を接続すること（Ｓ３）は、前記第１の試験物質の第１の濃度勾配及び前記第２の試験物質の第２の濃度勾配を前記３Ｄ培養マトリックス（２）の前記少なくとも一部の上に形成するために、前記第１の試験物質を含まないかまたは前記第２の濃度の前記第１の試験物質を含み、且つ、前記第３の濃度より高い第４の濃度の前記第２の試験物質を含む前記第２の流体の流れに、前記第２の流体チャネル（３０）の前記入力（３２）を接続すること（Ｓ３）、を含み、及び、
前記反応を測定すること（Ｓ４）は、前記微生物（６）が前記第１の試験物質及び前記第２の試験物質に対して第１の反応を示す第１の反応領域（３）と、前記微生物（６）が前記第１の試験物質及び前記第２の試験物質に対して第２の異なる反応を示すそれぞれの第２の反応領域（４）との間の前記３Ｄ培養マトリックス（２）における任意の境界領域（５）のうち、前記第１の端部（１２）及び／または前記第２の異なる端部（１４）に関連するそれぞれの位置に基づいて、前記第１の試験物質及び前記第２の試験物質に対する前記微生物（６）の反応を測定すること（Ｓ４）、を含む、
前記方法。
【請求項８】
請求項１ないし６のいずれかに記載の方法において、
前記第１の流体チャネル（２０）の前記入力（２２）を接続すること（Ｓ２）は、前記第１の濃度の第１の試験物質を含み、且つ、第３の濃度の第２の試験物質を含む前記第１の流体の流れに、前記第１の流体チャネル（２０）の前記入力（２２）を接続すること（Ｓ２）、を含み、
前記第２の流体チャネル（３０）の前記入力（３２）を接続すること（Ｓ３）は、前記３Ｄ培養マトリックス（２）の前記少なくとも一部の上に前記第１の試験物質の第１の濃度勾配及び前記第２の試験物質の第２の濃度勾配を形成するために、前記第１の試験物質を含まないかまたは前記第２の濃度の前記第１の試験物質を含み、且つ、前記第２の試験物質を含まないかまたは前記第３の濃度よりも低い第４の濃度の前記第２の試験物質を含む前記第２の流体の流れに、前記第２の流体チャネル（３０）の前記入力（３２）を接続すること（Ｓ３）、を含み、及び、
前記反応を測定すること（Ｓ４）は、前記微生物（６）が前記混合物質に対して第１の反応を示す第１の反応領域（３）と、前記微生物（６）が前記混合物質に対して第２の異なる反応を示す第２の反応領域（４）との間の前記３Ｄ培養マトリックス（２）における任意の境界領域（５）のうち、前記第１の端部（１２）及び／または前記第２の異なる端部（１４）に関連する位置に基づいて、前記第１の試験物質及び前記第２の試験物質の混合物質に対する前記微生物（６）の反応を測定すること（Ｓ４）、を含む、
前記方法。
【請求項９】
請求項１ないし６のいずれかに記載の方法において、前記培養室（１０）は、前記培養室（１０）の第３の端部（１６）に隣接する第３の流体チャネル（４０）及び前記培養室（１０）の第４の異なる端部（１８）に隣接する第４の流体チャネル（５０）を備え、前記試験物質は第１の試験物質であり、前記方法は、
第３の濃度の第２の試験物質を含む第３の流体の流れに、前記第３の流体チャネル（４０）の入力を接続すること、
前記３Ｄ培養マトリックス（２）の少なくとも一部の上に前記第２の試験物質の濃度勾配を形成するために、前記第２の試験物質を含まないかまたは前記第３の濃度より低い第４の濃度の前記第２の試験物質を含む第４の流体の流れに、前記第４の流体チャネル（５０）の入力を接続すること、及び、
前記微生物（６）が前記第２の試験物質に対して第１の反応を示す第１の反応領域（３）と、前記微生物（６）が前記第２の試験物質に対して第２の異なる反応を示す第２の反応領域（４）との間の前記３Ｄ培養マトリックス（２）における任意の境界領域（５）のうち、第３の端部及び／または第４の異なる端部に関連する位置に基づいて、前記第２の試験物質に対する前記微生物（６）の反応を測定すること、をさらに有する、
前記方法。
【請求項１０】
請求項１ないし９のいずれかに記載の方法において、前記反応を測定すること（Ｓ４）は、微生物（６）を成長させる成長領域（４）と前記微生物（６）の成長を欠いている非成長領域（３）との間の前記３Ｄ培養マトリックス（２）における任意の境界領域（５）のうち、前記第１の端部（１２）及び／または前記第２の異なる端部（１４）に関連する位置に基づいて、前記試験物質に対する前記微生物（６）の感受性を測定すること（Ｓ４）、を含む、
前記方法。
【請求項１１】
請求項１０に記載の方法は、前記境界領域（５）の幅に基づいて、前記試験物質に対する前記微生物（６）の耐性を測定すること（Ｓ４０）、をさらに有する、
前記方法。
【請求項１２】
請求項１０または１１に記載の方法は、
前記３Ｄ培養マトリックス（２）の少なくとも１つの画像を撮像すること（Ｓ２１）、
前記少なくとも１つの画像において検出された光強度に基づいて、前記境界領域（５）を識別するように構成されたコンピュータ（６２）によって前記少なくとも１つの画像を処理することにより、前記少なくとも１つの画像における前記境界領域（５）を識別すること（Ｓ２２）、
前記３Ｄ培養マトリックス（２）において、前記第１の端部（１２）と前記第２の異なる端部（１４）との間の位置に対する前記検出光強度の関係を測定すること（Ｓ５０）、及び、
前記関係に基づいて、前記微生物（６）に対する前記試験物質の最小抑制濃度、ＭＩＣを測定すること（Ｓ５１）、をさらに有する、
前記方法。
【請求項１３】
請求項１２に記載の方法において、前記ＭＩＣを測定すること（Ｓ５１）は、
前記関係を表す信号においてキンクが存在する位置を識別すること（Ｓ６０）、及び、
前記３Ｄ培養マトリックス（２）における位置に対して濃度を定義する事前定義の勾配情報に基づいて、前記位置を前記試験物質の濃度に変換すること（Ｓ６１）、をさらに有する、
前記方法。
【請求項１４】
試験物質に対する微生物（６）の反応を測定するシステム（６０）であって、前記システム（６０）は、
三次元の３Ｄ培養マトリックス（２）において前記微生物（６）の培養物を収容するように構成された培養室（１０）、
前記培養室（１０）の第１の端部（１２）に隣接する第１の流体チャネル（２０）、及び、
前記培養室（１０）の第２の異なる端部（１４）に隣接する第２の流体チャネル（３０）、
を備えた流体デバイス（１）、
第１の濃度の前記試験物質を含む第１の流体を有するとともに、前記第１の流体チャネル（２０）の入力（２２）に接続されるように構成された第１の流体貯蔵部（２６）、
前記３Ｄ培養マトリックス（２）の少なくとも一部の上に前記試験物質の濃度勾配を形成するために、前記試験物質を含まないかまたは前記第１の濃度より低い第２の濃度の前記試験物質を含む第２の流体を有するとともに、前記第２の流体チャネル（３０）の入力（３２）に接続されるように構成された第２の流体貯蔵部（３６）、及び、
ｉ）前記３Ｄ培養マトリックス（２）の少なくとも１つの画像を撮像するように構成され、ｉｉ）前記微生物（６）が前記試験物質に対して第１の反応を示す第１の反応領域（３）と、前記微生物（６）が前記試験物質に対して第２の異なる反応を示す第２の反応領域（４）との間の前記３Ｄ培養マトリックス（２）における任意の境界領域（５）のうち、前記第１の端部（１２）及び／または前記第２の異なる端部（１４）に関連する位置を識別するために前記少なくとも１つの画像を処理するように構成され、且つ、ｉｉ）前記任意の境界領域（５）の前記位置に基づいて、前記試験物質に対する前記微生物（６）の反応を測定するように構成されたコンピュータ・ベースのシステム（６２、６６）、を備えた、
前記システム。
【請求項１５】
試験物質に対する微生物（６）の反応を測定する流体デバイス（１）の使用であって、前記流体デバイス（１）は、
三次元の３Ｄ培養マトリックス（２）において前記微生物（６）の培養物を収容するように構成された培養室（１０）、
前記培養室（１０）の第１の端部（１２）に隣接するとともに、第１の濃度の前記試験物質を含む第１の流体の流れを運ぶように構成された第１の流体チャネル（２０）、及び、
前記３Ｄ培養マトリックス（２）の少なくとも一部の上に前記試験物質の濃度勾配を形成するために、前記培養室（１０）の第２の異なる端部（１４）に隣接するとともに、前記試験物質を含まないかまたは前記第１の濃度より低い第２の濃度の前記試験物質を含む第２の流体の流れを運ぶように構成された第２の流体チャネル（３０）、を備え、その中で、前記使用は、前記微生物（６）が前記試験物質に対して第１の反応を示す第１の反応領域（３）と、前記微生物（６）が前記試験物質に対して第２の異なる反応を示す第２の反応領域（４）との間の前記３Ｄ培養マトリックス（２）における任意の境界領域（５）のうち、前記第１の端部（１２）及び／または前記第２の異なる端部（１４）に関連する位置に基づいて、前記試験物質に対する前記微生物（６）の前記反応を測定することを有する、
前記使用。