【手続補正書】
【提出日】平成28年1月27日(2016.1.27)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
複数の試料について自動化されたアッセイを実行する方法であって、前記方法が、
第１ワークステーションと第２ワークステーションとを含む自動化装置を用意する工程であって、前記第１ワークステーション及び前記第２ワークステーションのそれぞれが複数の異なる自動化アッセイワークフローに従って複数の試料を受け取って処理するように構成され、異なる各自動化アッセイワークフローが、関連した固有のアッセイ定義又はユーザ定義プロトコルファイルを有する工程と、
２つの別個のアッセイワークフローが自動化装置での同時処理に関して互いにコンパチブルであるかインコンパチブルであるかを判断する工程と、
前記アッセイがコンパチブルである場合に、前記別個のアッセイワークフローを前記装置で同時に実行する工程とを含むことを特徴とする、方法。
【請求項２】
前記アッセイ定義又はユーザ定義プロトコルファイルが、第１レベルコンパチビリティインデックス値を含み、前記判断工程が、
（ａ）利用可能なアッセイの第１リストから第１アッセイを選択する工程と、
（ｂ）利用可能な他の複数のアッセイのどれが前記第１アッセイと同じ第１レベルコンパチビリティインデックス値を含むアッセイ定義ファイル又はユーザ定義プロトコルファイルを有するかを評価する工程とを含み、
同じ第１レベルコンパチビリティインデックス値が、第１レベルコンパチビリティを示す、請求項１に記載の方法。
【請求項３】
前記評価工程が、
（ｂ１）前記第１アッセイの第１コンパチビリティインデックス値とは異なる第１レベルコンパチビリティインデックス値を有するアッセイを特定する工程と、
（ｂ２）第２アッセイの第２リストを用意する工程とを含み、
前記第２リストでは前記第１アッセイの第１コンパチビリティインデックス値とは異なる第１レベルコンパチビリティインデックス値を有するアッセイが除外される、請求項２に記載の方法。
【請求項４】
各アッセイ定義ファイル又はユーザ定義プロトコルファイルが、第２レベルコンパチビリティインデックス値を含み、前記判断工程が更に、
（ｃ）利用可能な他の複数のアッセイのどれが前記第１アッセイと同じ第２レベルコンパチビリティインデックス値を含むアッセイ定義ファイル又はユーザ定義プロトコルファイルを有するかを評価する工程を含み、
同じ第２レベルコンパチビリティインデックス値が、第２レベルコンパチビリティを示す、請求項２に記載の方法。
【請求項５】
前記評価工程が、
（ｃ１）前記第１アッセイの第２コンパチビリティインデックス値とは異なる第２レベルコンパチビリティインデックス値を有するアッセイを特定する工程と、
（ｃ２）第２アッセイの第２リストを用意する工程とを含み、
前記第２リストでは前記第１アッセイの第２コンパチビリティインデックス値とは異なる第２レベルコンパチビリティインデックス値を有するアッセイが除外される、請求項４に記載の方法。
【請求項６】
前記第１レベルコンパチビリティが、２つのアッセイを同時に単一のワークスステーションで実行するコンパチビリティを含み、前記第１レベルコンパチビリティが、インキュベーション時間、溶解時間、試薬体積、試薬タイプ、インキュベーション温度、溶解温度、ワークステーション時間要求、規制区分、ビジネス上考慮すべき事柄及びこれらの組み合わせから成る群から選択されるパラメータに基づいて判断される、請求項２〜５のいずれか一項に記載の方法。
【請求項７】
前記第２レベルコンパチビリティが、２つのアッセイを同時に前記自動化装置で実行するコンパチビリティを含み、前記第２レベルコンパチビリティが、規制区分、ワークフローのインコンパチビリティ、ビジネス上考慮すべき事柄及びこれらの組み合わせから成る群から選択されるパラメータに基づいて判断される、請求項４〜６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項８】
前記装置が、前記第１レベルコンパチビリティインデックス値が異なる場合、インコンパチブルなアッセイを同じワークステーション内で同時に実行することを妨げる、請求項６に記載の方法。
【請求項９】
前記２つの別個のアッセイワークフローが、同じワークステーションで実行される、請求項８に記載の方法。
【請求項１０】
前記装置が、異なる第２コンパチビリティインデックス値を有するアッセイを同時に実行することを妨げられている、請求項７に記載の方法。
【請求項１１】
２つのアッセイが、同じ第１レベルコンパチビリティインデックス値を有し、かつ異なる第２レベルコンパチビリティインデックス値を有する、請求項４〜１０のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１２】
前記第２レベルコンパチビリティインデックス値における違いが、ビジネス上の理由を含む、請求項１１に記載の方法。
【請求項１３】
前記第２レベルコンパチビリティインデックス値における違いが、規制区分を含む、請求項１１に記載の方法。
【請求項１４】
前記アッセイがコンパチブルである場合、前記方法が、以下の工程：
（ｄ）アッセイ特有試料作製スクリプトを装置で開始する工程、
（ｅ）消耗品パッケージ上の識別表示を装置に保存された一連のアッセイ特有識別データと比較する工程、
（ｆ）装置でアッセイ特有カートリッジ装填スクリプトを開始する工程、
（ｇ）装填されたカートリッジにおける蛍光比を装置に保存された一連のアッセイ特有蛍光比データと比較して、前記カートリッジがうまく装填されたか否かを判断する工程、
（ｈ）アッセイ特有反応スクリプトを装置で開始する工程、
（ｉ）アッセイ特有データ分析アルゴリズムを装置で開始する工程、
（ｊ）１つ以上のアッセイ特有リザルトアルゴリズム又はスクリプトに基づいてアッセイに対する最終判断を導き出す工程、
の１つ以上を更に含む、請求項１に記載の方法。
【請求項１５】
前記アッセイのうち１つのアッセイが、ポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）、転写増幅（ＴＭＡ）、オリゴヌクレオチドライゲーション法（ＯＬＡ）、リガーゼ連鎖反応（ＬＣＲ）、ローリングサークル増幅（ＲＣＡ）、鎖置換増幅（ＳＤＡ）及びハイブリダイゼーション反応から選択される群から選択される反応を含む、請求項１４に記載の方法。
【請求項１６】
第１ワークステーションと第２ワークステーションとを含む自動化装置と、
プロセッサと、
ストレージ容量と、
自動化されたアッセイを実行するためのプログラムと
を含む自動化されたアッセイを実行するためのシステムであって、
前記第１ワークステーション及び前記第２ワークステーションのそれぞれは複数の異なる自動化アッセイワークフローに従って複数の試料を受け取って処理するように構成され、異なる各自動化アッセイワークフローは、関連した固有のアッセイ定義ファイル又はユーザ定義プロトコルファイルを有し、
前記プログラムが、
２つの別個のアッセイワークフローが自動化装置での同時処理に関して互いにコンパチブルであるかインコンパチブルであるかを判断する工程と、
前記アッセイがコンパチブルである場合に、前記別個のアッセイワークフローを前記装置で同時に実行する工程とのための命令を含むことを特徴とする、システム。
【請求項１７】
前記アッセイ定義ファイル又はユーザ定義プロトコルファイルが、第１レベルコンパチビリティインデックス値を含み、前記判断工程が、
（ａ）利用可能なアッセイの第１リストから第１アッセイを選択する工程と、
（ｂ）利用可能な他の複数のアッセイのどれが前記第１アッセイと同じ第１レベルコンパチビリティインデックス値を含むアッセイ定義ファイル又はユーザ定義プロトコルファイルを有するかを評価する工程とを含み、
同じ第１レベルコンパチビリティインデックス値が、第１レベルコンパチビリティを示す、請求項１６に記載のシステム。
【請求項１８】
前記評価工程が、
（ｂ１）前記第１アッセイの第１コンパチビリティインデックス値とは異なる第１レベルコンパチビリティインデックス値を有するアッセイを特定する工程と、
（ｂ２）第２アッセイの第２リストを用意する工程とを含み、
前記第２リストでは前記第１アッセイの第１コンパチビリティインデックス値とは異なる第１レベルコンパチビリティインデックス値を有するアッセイが除外される、請求項１７に記載のシステム。
【請求項１９】
各アッセイ定義ファイル又はユーザ定義プロトコルファイルが、第２レベルコンパチビリティインデックス値を含み、前記判断工程が更に、
（ｃ）利用可能な他の複数のアッセイのどれが前記第１アッセイと同じ第２レベルコンパチビリティインデックス値を含むアッセイ定義ファイル又はユーザ定義プロトコルファイルを有するかを評価する工程を含み、
同じ第２レベルコンパチビリティインデックス値が、第２レベルコンパチビリティを示す、請求項１７に記載のシステム。
【請求項２０】
前記評価工程が、
（ｃ１）前記第１アッセイの第２コンパチビリティインデックス値とは異なる第２レベルコンパチビリティインデックス値を有するアッセイを特定する工程と、
（ｃ２）第２アッセイの第２リストを用意する工程とを含み、
前記第２リストでは前記第１アッセイの第２コンパチビリティインデックス値とは異なる第２レベルコンパチビリティインデックス値を有するアッセイが除外される、請求項１９に記載のシステム。
【請求項２１】
前記第１レベルコンパチビリティが、２つのアッセイを同時に単一のワークスステーションで実行するコンパチビリティを含み、前記第１レベルコンパチビリティが、インキュベーション時間、溶解時間、試薬体積、試薬タイプ、インキュベーション温度、溶解温度、ワークステーション時間要求、規制区分、ビジネス上考慮すべき事柄及びこれらの組み合わせから成る群から選択されるパラメータに基づいて判断される、請求項１７〜２０のいずれか一項に記載のシステム。
【請求項２２】
前記第２レベルコンパチビリティが、２つのアッセイを同時に前記自動化装置で実行するコンパチビリティを含み、前記第２レベルコンパチビリティが、規制区分、ワークフローのインコンパチビリティ、ビジネス上考慮すべき事柄及びこれらの組み合わせから成る群から選択されるパラメータに基づいて判断される、請求項１９〜２１のいずれか一項に記載のシステム。
【請求項２３】
前記装置が、第１レベルコンパチビリティインデックス値が異なる場合、インコンパチブルなアッセイを同じワークステーション内で同時に実行することを妨げる、請求項２１に記載のシステム。
【請求項２４】
前記２つの別個のアッセイワークフローが、同じワークステーションで実行される、請求項２３に記載のシステム。
【請求項２５】
前記装置が、異なる第２コンパチビリティインデックス値を有するアッセイを同時に実行することを妨げられている、請求項２２に記載のシステム。
【請求項２６】
２つのアッセイが、同じ第１レベルコンパチビリティインデックス値を有し、かつ異なる第２レベルコンパチビリティインデックス値を有する、請求項１９〜２５のいずれか一項に記載のシステム。
【請求項２７】
前記第２レベルコンパチビリティインデックス値における違いが、ビジネス上の理由を含む、請求項２６に記載のシステム。
【請求項２８】
前記第２レベルコンパチビリティインデックス値における違いが、規制区分を含む、請求項２６に記載のシステム。
【請求項２９】
前記アッセイがコンパチブルである場合、前記プログラムが以下のもの、
（ｄ）アッセイ特有試料作製スクリプトを装置で開始すること、
（ｅ）消耗品パッケージ上の識別表示を装置に保存された一連のアッセイ特有識別データと比較すること、
（ｆ）装置でアッセイ特有カートリッジ装填スクリプトを開始すること、
（ｇ）装填されたカートリッジにおける蛍光比を装置に保存された一連のアッセイ特有蛍光比データと比較して、前記カートリッジがうまく装填されたか否かを判断すること、
（ｈ）アッセイ特有反応スクリプトを装置で開始すること、
（ｉ）アッセイ特有データ分析アルゴリズムを装置で開始すること、
（ｊ）１つ以上のアッセイ特有リザルトアルゴリズム又はスクリプトに基づいてアッセイに対する最終判断を導き出すこと、
の１つ以上のための命令を更に含む、請求項１６に記載のシステム。
【請求項３０】
前記アッセイのうち１つのアッセイが、ポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）、転写増幅（ＴＭＡ）、オリゴヌクレオチドライゲーション法（ＯＬＡ）、リガーゼ連鎖反応（ＬＣＲ）、ローリングサークル増幅（ＲＣＡ）、鎖置換増幅（ＳＤＡ）及びハイブリダイゼーション反応から選択される群から選択される反応を含む、請求項２９に記載のシステム。
【請求項３１】
前記システムが、バーコードリーダーを更に含む、請求項１６に記載のシステム。
【請求項３２】
前記識別表示が、バーコードを含む、請求項２９に記載のシステム。
【請求項３３】
複数のコンパチブルな別個のアッセイを単一の自動化装置で同時に実行する方法であって、前記方法が、別個の各アッセイについて、
第１ワークステーションと第２ワークステーションとを含む自動化装置を用意する工程であって、前記第１ワークステーション及び前記第２ワークステーションのそれぞれが複数の異なる自動化アッセイワークフローに従って複数の試料を受け取って処理するように構成され、異なる各自動化アッセイワークフローが、第１レベルコンパチビリティインデックス値及び第２レベルコンパチビリティインデックス値を含む関連した固有のアッセイ定義ファイル又はユーザ定義プロトコルファイルを有する工程と、
利用可能なアッセイの第１リストから第１アッセイを選択する工程と、
利用可能な他の複数のアッセイのどれが前記第１アッセイと同じ第１レベルコンパチビリティインデックス値を含むアッセイ定義ファイル又はユーザ定義プロトコルファイルを有するかを評価する工程であって、同じ第１レベルコンパチビリティインデックス値が、前記自動化装置の同じワークステーション上での同時処理についてのコンパチビリティを示す工程と、
利用可能な他の複数のアッセイのどれが前記第１アッセイと同じ第２レベルコンパチビリティインデックス値を含むアッセイ定義ファイル又はユーザ定義プロトコルファイルを有するかを評価する工程であって、同じ第２レベルコンパチビリティインデックス値が、自動化装置での同時処理についてのコンパチビリティを示す工程と、
前記アッセイがコンパチブルである場合に、前記別個のアッセイワークフローを同時に前記装置で実行する工程と
を含むことを特徴とする、方法。
【請求項３４】
前記第１及び第２のワークステーションのそれぞれが、前記自動化装置によって同時処理される複数の試料を保持するために構成されたラックを含む、請求項１〜１５及び３３のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３５】
前記第１及び第２のワークステーションのそれぞれが、前記自動化装置によって同時処理される複数の試料を保持するために構成されたラックを含む、請求項１６〜３２のいずれか一項に記載のシステム。