【手続補正書】
【提出日】平成28年9月23日(2016.9.23)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
試料データを作成するための方法であって、
ｉ）一組の光子を、光源から、短いバーストで放出することであって、前記バーストが、約１，０００，０００分の５秒間〜約１秒間にわたり持続し、前記光子のうちの少なくとも一部が、前記試料に接触する、ことと、
ｉｉ）少なくとも１つの光子を画像センサーにより回収して、試料データを創出することであって、前記回収される光子が、前記試料に接触した光子であり、前記画像センサーは、前記光源と並んでいない、ことと、
ｉｉｉ）前記試料データを処理して、前記試料中の核酸のバイナリー定量化をもたらすことと、
ｉｖ）核酸の前記バイナリー定量化を解析して、前記試料に関連する結論記載を作成することと
を含む方法。
【請求項２】
放出される前記一組の光子の強度が、前記短いバーストの時間の長さの間で一定でない、請求項１に記載の方法。
【請求項３】
前記試料と関連する前記データが、蛍光データ、比色データ、半透明データ、または不透明データの存在または非存在を捕捉する１つの画像または一組の画像である、請求項１に記載の方法。
【請求項４】
前記試料データを処理することが、サイズの弁別、形状の弁別、１つの基準もしくは一組の基準との比較、または単一の画像内の色による比較を活用して、前記試料中の核酸のディジタル定量化をもたらすことをさらに含む、請求項１に記載の方法。
【請求項５】
前記試料データを処理することが、
ｉ）試料と関連する前記データを検討し、以下の特徴的な閾値ａ〜ｅ：
ａ）少なくとも１つのアライメント特徴が存在し、かつ／または正確な配向性にあること、
ｂ）前記試料と関連する前記データが、焦点の合った画像を含むこと、
ｃ）前記画像と関連する前記データにより、アッセイの適正な利用が確認されること、
ｄ）前記画像が、意図される試料のグラフィック描示を含むこと、
ｅ）前記試料の寸法が、意図される寸法と一致すること、
ｆ）前記試料が、意図される一連のコンテナーにわたり、単一のコンテナー内に分布したこと
のうちの少なくとも１つずつについて測定すること、および
ｉｉ）前記特徴的な閾値のうちの１または複数が満たされない場合は、全ての特徴的な閾値を超えるように要求されるパラメータを調整し、満たされなかった特徴的な閾値が満たされるまで、請求項１の全てのステップを繰り返すこと
をさらに含む、請求項１に記載の方法。
【請求項６】
前記試料データ処理を処理することを、ローカルコンピュータにより行う、請求項１に記載の方法。
【請求項７】
前記試料データ処理を処理することを、前記データを異なるデバイスへと転送して、処理することにより行う、請求項１に記載の方法。
【請求項８】
前記試料が、前記光子に接触する前に、核酸増幅反応を起こす、請求項１に記載の方法。
【請求項９】
前記核酸増幅反応が、ループ媒介増幅（ＬＡＭＰ）反応である、請求項８に記載の方法。
【請求項１０】
前記方法が、約５５〜６５℃で、または５５〜６５℃の温度範囲で実施される、請求項９に記載の方法。
【請求項１１】
前記試料のうちの少なくとも一部が、少なくとも２つ以上のコンテナーを含むアレイへと分配され、前記画像が、各コンテナーの位置由来の光学データを含む、請求項８〜１０のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１２】
前記アレイが、ＳｌｉｐＣｈｉｐである、請求項１１に記載の方法。
【請求項１３】
前記画像センサーが、セルフォーンまたはタブレットコンピュータの一部である、請求項８に記載の方法。
【請求項１４】
以下のステップ：
ａ）セルフォーンを使用する、蛍光領域の検出、
ｂ）モバイルハンドヘルドデバイスを使用する、蛍光領域の検出、
ｃ）単一分子からの増幅産物に対応する蛍光領域の検出、
ｄ）モバイル通信デバイスと統合されたコンパクトフラッシュ（登録商標）を使用して、蛍光を励起するステップ、
ｅ）画像および／または処理された画像および／または結果として得られるデータを、中央コンピュータへと伝送するステップ、
ｆ）色チャネルの組合せを使用する、画像のバックグラウンド補正、
ｇ）１または複数のフィルタリングアルゴリズムを使用することによる蛍光領域の増強、
ｈ）１または複数の形状を使用して、画像忠実度を決定する形状検出、
ｉ）１または複数の形状を使用して、解析されるべき前記領域を決定する形状検出ステップ、
ｊ）１または複数のアルゴリズムを使用して、陽性領域を決定する形状検出、
ｋ）前記中央コンピュータ上で、画像および／またはデータを処理および／または解析するステップ、
ｌ）前記画像および／またはデータを、任意選択でアーカイブ化するステップ、
ｍ）情報を前記モバイルデバイスへと返送するステップ、
ｎ）画像および／または処理された画像および／または結果として得られるデータを、使用者へと伝送するステップ、
ｏ）画像および／または処理された画像および／または結果として得られるデータを、第３者へと伝送するステップ、
ｐ）ポアソン統計解析を適用して、蛍光領域および非蛍光領域の数を定量化するステップ、ならびに
ｑ）ポアソン統計解析を適用して、蛍光領域および非蛍光領域の数に基づき、濃度を定量化するステップ
のうちの少なくとも１つをさらに含む、請求項１に記載の方法。
【請求項１５】
前記光が、フィルタリングされる、請求項１に記載の方法。
【請求項１６】
前記光は、少なくとも１つ、２つ、３つ、４つのフィルターのセット、またはこれらの任意の組み合わせによってフィルタリグされる、請求項１５に記載の方法。
【請求項１７】
前記解析工程が、第２の色チャネルから収集されたデータを使用して、画像のバックグラウンド補正を実施する、請求項１に記載の方法。
【請求項１８】
蛍光領域および非蛍光領域の数を定量化するために、ポアソン統計解析が、ソフトウェアのアルゴリズムによって適用される、請求項１４に記載の方法。
【請求項１９】
前記データ解析を、クラウドベースのサービスを介して、遠隔に位置する中央コンピュータを介して、またはこれらの任意の組合せを介してローカルで行う、請求項１に記載の方法。
【請求項２０】
前記試料データを収集するときに、ポータブルディジタルデバイスが角度を付けた位置に傾けられるため、前記画像センサーは、前記光源と並んでいない、請求項１に記載の方法。
【請求項２１】
試料データを作成するためのデバイスであって、
ｉ）一組の光子を、短いバーストで放出する光源であって、前記バーストが、約１，０００，０００分の５秒間〜約１秒間にわたり持続し、前記光子のうちの少なくとも一部が前記試料に接触する、光源と、
ｉｉ）前記試料に接触した前記光子のうちの少なくとも一部を回収して、前記試料と関連するデータを創出する、前記光源と並んでいない画像センサーと、
ｉｉｉ）前記試料データを処理して、前記試料中の核酸のバイナリー定量化をもたらすように構成されたプロセッサー、または、前記試料データを、前記試料中の核酸のバイナリー定量化をもたらすように構成された異なるデバイスへと伝送するための無線接続と、
ｉｖ）核酸の前記バイナリー定量化を解析して、前記試料に関連する結論記載を作成するように構成されたプロセッサーと
を含むデバイス。
【請求項２２】
少なくとも１つ、２つ、３つ、４つのフィルターのセット、またはこれらの任意の組合せをさらに含む、請求項２１に記載のデバイス。
【請求項２３】
前記フィルターが、蛍光フィルターを含む、請求項２２に記載のデバイス。
【請求項２４】
前記蛍光フィルターが、ダイクロイックフィルターおよび／またはロングパスフィルターを含む、請求項２３に記載のデバイス。
【請求項２５】
前記ダイクロイックフィルターの透過率が、約３９０〜４８０ｎｍまたは３９０〜４８０ｎｍにおいて、８５％を超え、かつ、約５４０〜７５０ｎｍまたは５４０〜７５０ｎｍにおいて、１％未満でありうる、請求項２４に記載のデバイス。
【請求項２６】
前記ロングパスフィルターのブロッキングが５ＯＤを超え得、かつ、約５３０〜７５０ｎｍまたは５３０〜７５０ｎｍの波長における透過率が９０％を超えうる、請求項２５に記載のデバイス。
【請求項２７】
前記光源が、カメラフラッシュである、請求項２１に記載のデバイス。
【請求項２８】
前記画像センサーが、ＣＣＤまたはＣＭＯＳである、請求項２１に記載のデバイス。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００５９
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００５９】
一部の実施形態では、前記キットが、バーコードなど、マシンで読取り可能な標識をさらに含む。一部の実施形態では、前記標識が、前記試料の形状、試料サイズ、試料種類、試料の配向性、前記試料を得た生物、前記標識に近接する試料の数、またはさらなるデータ解析のための命令に関連するコード化された情報を含む。本発明のキットの一部の実施形態では、前記核酸増幅反応成分が、前記小型コンテナーのうちの少なくとも１つの中に配置される。一部の実施形態では、本明細書に記載のキットは、本明細書に記載のデバイスをさらに含む。
本発明は、例えば、以下を提供する。
（項目１）
試料データを作成するための方法であって、
ｉ）一連の光子を、光源から、短いバーストで放出するステップであり、前記バーストが、約１，０００，０００分の５秒間〜約１秒間にわたり持続し、前記光子のうちの少なくとも一部が、前記試料に接触するステップと、
ｉｉ）少なくとも１つの光子を画像センサーにより回収して、試料データを創出するステップであり、前記回収される光子が、前記試料に接触した光子であるステップと、
ｉｉｉ）前記試料データを処理して、前記試料中の核酸のバイナリー定量化をもたらすステップと、
ｉｖ）核酸の前記バイナリー定量化を解析して、前記試料に関連する結論記載を作成するステップと
を含む方法。
（項目２）
前記試料中の核酸の前記定量化を使用して、前記試料の非核酸成分を検出する、項目１に記載の方法。
（項目３）
前記非核酸成分が、細胞、タンパク質、およびウイルスを含む群から選択される、項目２に記載の方法。
（項目４）
前記回収される光子が、前記光源から、短いバーストで放出された前記光子のうちの１つである、項目１に記載の方法。
（項目５）
前記光子が、可視光スペクトル内の光子を含む、項目１に記載の方法。
（項目６）
前記光子が、ＵＶスペクトル内の光子を含む、項目１に記載の方法。
（項目７）
前記光源が、カメラフラッシュまたはフラッシュバルブである、項目１に記載の方法。
（項目８）
前記光源が、キセノンフラッシュである、項目１に記載の方法。
（項目９）
前記光源が、発光ダイオード（ＬＥＤ）である、項目１に記載の方法。
（項目１０）
前記画像センサーが、ＣＭＯＳである、項目１に記載の方法。
（項目１１）
前記画像センサーが、ＣＣＤである、項目１に記載の方法。
（項目１２）
放出される前記一連の光子の強度が、前記短いバーストの時間の長さの間で一定でない、項目１に記載の方法。
（項目１３）
前記試料と関連する前記データが、過去の時点または基準試料に対する、前記試料の光学的特性の変化を捕捉する１つの画像または複数の画像のセットである、項目１に記載の方法。
（項目１４）
前記試料と関連する前記データが、蛍光データの存在または非存在を捕捉する１つの画像または複数の画像のセットである、項目１に記載の方法。
（項目１５）
前記蛍光データが、光子が蛍光色素から放出される結果である、項目１４に記載の方法。
（項目１６）
前記蛍光色素が、ＳＹＴＯ９である、項目１５に記載の方法。
（項目１７）
前記蛍光色素が、カルセインである、項目１５に記載の方法。
（項目１８）
前記試料と関連する前記データが、比色データの存在または非存在を捕捉する１つの画像または複数の画像のセットである、項目１に記載の方法。
（項目１９）
前記試料と関連する前記データが、半透明データの存在または非存在を捕捉する１つの画像または複数の画像のセットである、項目１に記載の方法。
（項目２０）
前記試料と関連する前記データが、有色データと対比した半透明データの存在または非存在を捕捉する１つの画像または複数の画像のセットである、項目１に記載の方法。
（項目２１）
前記試料と関連する前記データが、不透明データの存在または非存在を捕捉する１つの画像または複数の画像のセットである、項目１に記載の方法。
（項目２２）
前記試料と関連する前記データが、完全に同時に捕捉される単一の画像である、項目１に記載の方法。
（項目２３）
前記試料と関連する前記データが、複数の空間的に隔離されたコンパートメントからの測定値を含み、前記コンパートメントの各々が、前記試料の一部を含む、項目１に記載の方法。
（項目２４）
前記データを処理するステップが、サイズの弁別、形状の弁別、１つの基準もしくは一連の基準との比較、または単一の画像内の色による比較を活用して、前記試料中の核酸のディジタル定量化をもたらすことをさらに含む、項目１に記載の方法。
（項目２５）
前記データを処理するステップが、
ｉ）試料と関連する前記データを検討し、以下の特徴的な閾値ａ〜ｅ：
ａ）少なくとも１つのアライメント特徴が存在し、かつ／または正確な配向性にあること、
ｂ）前記試料と関連する前記データが、焦点の合った画像を含むこと、
ｃ）前記画像と関連する前記データにより、アッセイの適正な利用が確認されること、
ｄ）前記画像が、意図される試料のグラフィック描示を含むこと、
ｅ）前記試料の寸法が、意図される寸法と一致すること、
ｆ）前記試料が、意図される一連のコンテナーにわたり、単一のコンテナー内に分布すること
のうちの少なくとも１つずつについて測定すること、および
ｉｉ）前記特徴的な閾値のうちの１または複数が満たされない場合は、全ての特徴的な閾値を超えるように要求されるパラメータを調整し、満たされなかった特徴的な閾値が満たされるまで、項目１の全てのステップを繰り返すこと
をさらに含む、項目１に記載の方法。
（項目２６）
前記データ処理ステップを、ローカルコンピュータにより行う、項目１に記載の方法。
（項目２７）
前記データ処理ステップを、前記データを異なるデバイスへと転送して、処理することにより行う、項目１に記載の方法。
（項目２８）
前記試料に接触した、前記放出された光子のうちの少なくとも１つの波長が、蛍光に起因してシフトしている、項目１に記載の方法。
（項目２９）
結論記載が、疾患についての記載である、項目１に記載の方法。
（項目３０）
前記結論記載により、遺伝子障害の存在または非存在が記載される、項目２９に記載の方法。
（項目３１）
前記結論記載が、ウイルス負荷の定量化である、項目２９に記載の方法。
（項目３２）
前記結論記載が、ウイルス感染の存在または非存在についての診断である、項目２９に記載の方法。
（項目３３）
前記結論記載が、少なくとも１つの細菌種の定量化である、項目２９に記載の方法。
（項目３４）
前記結論記載が、細菌感染の存在または非存在についての診断である、項目２９に記載の方法。
（項目３５）
結論記載が、前記試料中の遺伝子の前記定量化である、項目１に記載の方法。
（項目３６）
結論記載が、前記試料中の遺伝子または核酸配列の存在または非存在を決定している、項目１に記載の方法。
（項目３７）
結論記載が、前記試料中の遺伝子の存在または非存在を決定している、項目３６に記載の方法。
（項目３８）
結論記載が、前記試料中のＤＮＡ配列またはＲＮＡ配列の存在または非存在を決定している、項目３９に記載の方法。
（項目３９）
結論記載が、前記試料中の遺伝子内の突然変異または核酸配列内の突然変異の存在または非存在を決定している、項目１に記載の方法。
（項目４０）
結論記載が、前記試料中の遺伝子または核酸配列内の突然変異の前記定量化である、項目１に記載の方法。
（項目４１）
前記遺伝子または核酸配列が、植物由来である、項目３７から４０に記載の方法。
（項目４２）
前記遺伝子または核酸配列が、ヒト由来である、項目３７から４０に記載の方法。
（項目４３）
前記遺伝子または核酸配列が、ウイルス由来である、項目３７から４０に記載の方法。
（項目４４）
前記遺伝子または核酸配列が、細菌由来である、項目３７から４０に記載の方法。
（項目４５）
非一過性のコンピュータで読取り可能な媒体データベース内で、前記結論記載および他の情報を表示し、かつ／または関連付けるステップをさらに含む、項目１に記載の方法。
（項目４６）
前記他の情報が、前記試料を回収した生物についての情報である、項目４５に記載の方法。
（項目４７）
患者名、年齢、体重、身長、試料回収の時点、試料の種類、試料回収および／もしくはデータ収集に関するＧＰＳ位置データ、または医療記録、項目４６に記載の方法。
（項目４８）
前記結論記載を表示するステップをさらに含む、項目１に記載の方法。
（項目４９）
前記結論記載を、前記使用者へと表示する、項目４８に記載の方法。
（項目５０）
前記結論記載を、異なるデバイスへと送信する、項目４８に記載の方法。
（項目５１）
前記試料が、少なくとも１つの核酸を含む、項目１に記載の方法。
（項目５２）
前記核酸が、ヒトから得られる、項目５１に記載の方法。
（項目５３）
前記核酸が、植物または植物種子から得られる、項目５１に記載の方法。
（項目５４）
前記核酸が、動物から得られる、項目５１に記載の方法。
（項目５５）
前記核酸が、細菌から得られる、項目５１に記載の方法。
（項目５６）
前記核酸が、ウイルスから得られる、項目５１に記載の方法。
（項目５７）
前記核酸が、合成核酸である、項目５１に記載の方法。
（項目５８）
前記核酸が、未知の供給源に由来する、項目５１に記載の方法。
（項目５９）
前記試料が、バーコードなど、マシンで読取り可能な標識をさらに含む、項目１に記載の方法。
（項目６０）
前記標識が、前記試料の形状、試料サイズ、試料の種類、試料の配向性、前記試料を得た生物、前記標識に近接する試料の数、またはさらなるデータ解析のための命令に関連するコード化された情報を含む、項目５９に記載の方法。
（項目６１）
前記試料が、前記光子に接触する前に、核酸増幅反応を起こす、項目１に記載の方法。
（項目６２）
前記核酸増幅反応が、ループ媒介増幅（ＬＡＭＰ）反応である、項目６１に記載の方法。
（項目６３）
前記核酸増幅反応が、ＰＣＲ反応である、項目６１に記載の方法。
（項目６４）
前記方法が、約５５〜６５℃で、または５５〜６５℃の温度範囲で実施される、項目６２に記載の方法。
（項目６５）
前記試料のうちの少なくとも一部が、少なくとも２つ以上のコンテナーを含むアレイへと分配され、前記画像が、各コンテナーの位置由来の光学データを含む、項目６１から６４に記載の方法。
（項目６６）
前記光学データが、蛍光シグナルまたは蛍光シグナルの欠如である、項目６５に記載の方法。
（項目６７）
前記アレイが、ＳｌｉｐＣｈｉｐである、項目６５に記載の方法。
（項目６８）
増幅される前記核酸がＲＮＡである、項目６１に記載の方法。
（項目６９）
試料内の核酸の前記ディジタル定量化についての前記解析が、
ｉ）反応が、５７℃〜６３℃の間の温度範囲内で生じること、
ｉｉ）１５分間〜１．５時間の間の反応時間、
ｉｉｉ）湿度が、０％〜１００％の間であること、および
ｉｖ）バックグラウンド光が、０〜６ルクスの間であること
からなる群から選択される反応パラメータのうちの少なくとも１つについて、前記試料についての一貫した結論記載をもたらす、項目６１に記載の方法。
（項目７０）
前記試料についての前記一貫した結論記載が、前記反応パラメータのうちの少なくとも２つについての結論記載である、項目６９に記載の方法。
（項目７１）
前記試料についての前記一貫した結論記載が、前記反応パラメータのうちの少なくとも３つについての結論記載である、項目６９に記載の方法。
（項目７２）
前記試料についての前記一貫した結論記載が、前記反応パラメータのうちの４つについての結論記載である、項目６９に記載の方法。
（項目７３）
前記画像センサーが、セルフォーンまたはタブレットコンピュータの一部である、項目６１に記載の方法。
（項目７４）
以下のステップ：
ａ）セルフォーンを使用する、蛍光領域の検出、
ｂ）モバイルハンドヘルドデバイスを使用する、蛍光領域の検出、
ｃ）単一分子からの増幅産物に対応する蛍光領域の検出、
ｄ）モバイル通信デバイスと統合されたコンパクトフラッシュ（登録商標）を使用して、蛍光を励起するステップ、
ｅ）画像および／または処理された画像および／または結果として得られるデータを、中央コンピュータへと伝送するステップ、
ｆ）色チャネルの組合せを使用する、画像のバックグラウンド補正、
ｇ）１または複数のフィルタリングアルゴリズムを使用することによる蛍光領域の増強、
ｈ）１または複数の形状を使用して、画像忠実度を決定する形状検出、
ｉ）１または複数の形状を使用して、解析されるべき前記領域を決定する形状検出ステップ、
ｊ）１または複数のアルゴリズムを使用して、陽性領域を決定する形状検出、
ｋ）前記中央コンピュータ上で、画像および／またはデータを処理および／または解析するステップ、
ｌ）前記画像および／またはデータを、任意選択でアーカイブ化するステップ、
ｍ）情報を前記モバイルデバイスへと返送するステップ、
ｎ）画像および／または処理された画像および／または結果として得られるデータを、前記使用者へと伝送するステップ、
ｏ）画像および／または処理された画像および／または結果として得られるデータを、第３者へと伝送するステップ、
ｐ）ポアソン統計解析を適用して、蛍光領域および非蛍光領域の数を定量化するステップ、ならびに
ｑ）ポアソン統計解析を適用して、蛍光領域および非蛍光領域の数に基づき、濃度を定量化するステップ
のうちの少なくとも１つをさらに含む、項目１に記載の方法。
（項目７５）
前記光源が、少なくとも１００，０００ルクスまたはそれより強い光強度を有する、項目１に記載の方法。
（項目７６）
前記光が、内蔵カメラを含有するモバイルフォーンまたは内蔵カメラを含有するタブレットから放出される、項目１に記載のポータブルディジタルデバイス。
（項目７７）
前記光が、フィルタリングされる、項目１に記載の方法。
（項目７８）
フィルターが、フィルターのセットを含む、項目７７に記載の方法。
（項目７９）
前記フィルターのセットが、少なくとも１つ、２つ、３つ、４つのフィルター、またはこれらの任意の組合せを含む、項目７８に記載の方法。
（項目８０）
フィルターが、蛍光フィルターを含む、項目７７に記載の方法。
（項目８１）
前記蛍光フィルターが、ダイクロイックフィルターおよび／またはロングパスフィルターを含む、項目８０に記載の方法。
（項目８２）
前記ダイクロイックフィルターの透過率が、３９０〜４８０ｎｍまたはその近辺において、８５％を超え得、かつ、５４０〜７５０ｎｍまたはその近辺において、１％未満でありうる、項目８１に記載の方法。
（項目８３）
前記ロングパスフィルターのブロッキングが５ＯＤを超え得、かつ、５３０〜７５０ｎｍまたはその近辺の波長における透過率が９０％を超えうる、項目８１に記載の方法。
（項目８４）
前記解析工程が、１分間未満かかりうる、項目１に記載の方法。
（項目８５）
前記解析工程が、第２の色チャネルから収集されたデータを使用して、画像のバックグラウンド補正を実施する、項目１に記載の方法。
（項目８６）
ソフトウェアのアルゴリズムが、ポアソン統計解析を適用して、蛍光領域および非蛍光領域の数を定量化しうる、項目８５に記載の方法。
（項目８７）
前記データ解析を、クラウドベースのサービスを介して、遠隔に位置する中央コンピュータを介して、またはこれらの任意の組合せを介してローカルで行う、項目１に記載の方法。
（項目８８）
前記方法が、核酸を検出するための用途をもたらす、項目１に記載の方法。
（項目８９）
写真を撮影するときに、ポータブルディジタルデバイスを、角度を付けた位置に傾ける、項目１に記載の方法。
（項目９０）
試料データを作成するためのデバイスであって、
ｉ）一連の光子を、短いバーストで放出する光源であり、前記バーストが、約１，０００，０００分の５秒間〜約１秒間にわたり持続し、前記光子のうちの少なくとも一部が前記試料に接触する光源と、
ｉｉ）前記試料のうちの少なくとも一部に接触した前記光子を回収して、前記試料と関連するデータを創出する、前記光源と並んでいない画像センサーと、
ｉｉｉ）前記試料データを処理して、前記試料中の核酸のバイナリー定量化をもたらすように構成されたプロセッサー、または前記試料データを、前記試料中の核酸のバイナリー定量化をもたらすように構成された、異なるデバイスへと伝送するための無線接続と、
ｉｖ）核酸の前記バイナリー定量化を解析して、前記試料に関連する結論記載を作成するように構成されたプロセッサーと
を含むデバイス。
（項目９１）
フィルターをさらに含む、項目９０に記載のデバイス。
（項目９２）
前記フィルターのセットが、少なくとも１つ、２つ、３つ、４つのフィルター、またはこれらの任意の組合せを含む、項目９１に記載のデバイス。
（項目９３）
前記フィルターが、蛍光フィルターを含む、項目９２に記載のデバイス。
（項目９４）
前記蛍光フィルターが、ダイクロイックフィルターおよび／またはロングパスフィルターを含む、項目９３に記載のデバイス。
（項目９５）
前記ダイクロイックフィルターの透過率が、約３９０〜４８０ｎｍまたは３９０〜４８０ｎｍにおいて、８５％を超え、かつ、約５４０〜７５０ｎｍまたは５４０〜７５０ｎｍにおいて、１％未満でありうる、項目９４に記載のデバイス。
（項目９６）
前記ロングパスフィルターのブロッキングが５ＯＤを超え得、かつ、５３０〜７５０ｎｍまたはその近辺の波長における透過率が９０％を超えうる、項目９５に記載のデバイス。
（項目９７）
前記結論記載を表示するスクリーンをさらに含む、項目９０に記載のデバイス。
（項目９８）
前記光源が、カメラフラッシュである、項目９０に記載のデバイス。
（項目９９）
前記画像センサーが、ＣＣＤまたはＣＭＯＳである、項目９０に記載のデバイス。
（項目１００）
ｉ）複数の小型コンテナーと、
ｉｉ）核酸増幅反応成分と、
ｉｉｉ）使用のための指示書と
を含むコンテナーを含むキット。
（項目１０１）
前記複数の小型コンテナーが、ＳｌｉｐＣｈｉｐである、項目１００に記載のキット。
（項目１０２）
バーコードなど、マシンで読取り可能な標識をさらに含む、項目１００に記載のキット。
（項目１０３）
前記標識が、前記試料の形状、試料サイズ、試料種類、試料の配向性、前記試料を得た生物、前記標識に近接する試料の数、またはさらなるデータ解析のための命令に関連するコード化された情報を含む、項目１０２に記載のキット。
（項目１０４）
前記核酸増幅反応成分が、前記小型コンテナーのうちの少なくとも１つの中に配置される、項目１００に記載のキット。
（項目１０５）
項目９０に記載のデバイスをさらに含む、項目１００から１０４に記載のキット。