【手続補正書】
【提出日】平成28年9月26日(2016.9.26)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
アメリカンタイプカルチャーコレクション（ＡＴＣＣ）にＡＴＣＣ特許寄託番号第ＰＴＡ−１３１８１号で寄託されているハイブリドーマによって産生される単離された抗体もしくは該単離された抗体の単離された抗原結合断片であって、配列番号４を含むウロプラキンＩＩに特異的に結合する、単離された抗体もしくはその単離された抗原結合断片。
【請求項２】
アメリカンタイプカルチャーコレクション（ＡＴＣＣ）にＡＴＣＣ特許寄託番号第ＰＴＡ−１３１８１号で寄託されているハイブリドーマ細胞。
【請求項３】
請求項２に記載のハイブリドーマ細胞であって、さらに該ハイブリドーマ細胞によって産生される抗体もしくはその抗原結合断片を含有するハイブリドーマ細胞。
【請求項４】
請求項１に記載のモノクローナル抗体を生産する方法であって、以下：
ウロプラキンＩＩを特異的に認識することができるモノクローナル抗体を産生する、アメリカンタイプカルチャーコレクション（ＡＴＣＣ）にＡＴＣＣ特許寄託番号第ＰＴＡ−１３１８１号で寄託されている前記ハイブリドーマを培養する工程；および
該ハイブリドーマに該モノクローナル抗体を産生させる工程、
を包含する方法。
【請求項５】
請求項１に記載の単離された抗体もしくはその単離された抗原結合断片と、少なくとも１つの追加の単離された抗体もしくはその単離された抗原結合断片とを含有する組成物であって、該少なくとも１つの追加の単離された抗体もしくはその単離された抗原結合断片は、ＧＡＴＡ−３、ｐ６３、ウロプラキンＩＩＩ、ＰＡＸ８、ＮＫＸ３．１、ＰＳＡおよびｐ４０からなる群より選択される抗原に特異的に結合する、組成物。
【請求項６】
請求項５に記載の組成物であって、前記単離された抗体もしくはその単離された抗原結合断片と、前記少なくとも１つの追加の単離された抗体もしくはその単離された抗原結合断片とは、以下：
−ウロプラキンＩＩおよびＧＡＴＡ−３；
−ウロプラキンＩＩおよびｐ６３；
−ウロプラキンＩＩおよびウロプラキンＩＩＩ；
−ウロプラキンＩＩおよびＰＡＸ８；
−ウロプラキンＩＩおよびＮＫＸ３．１；
−ウロプラキンＩＩおよびＰＳＡ；
−ウロプラキンＩＩ、ウロプラキンＩＩＩおよびＧＡＴＡ−３；
−ウロプラキンＩＩ、ＰＡＸ８およびＰＳＡ；
−ウロプラキンＩＩ、ＰＡＸ８およびＮＫＸ３．１；ならびに
−ウロプラキンＩＩおよびｐ４０、
からなる群より選択されるタンパク質にそれぞれ特異的に結合する、組成物。
【請求項７】
標識と結合体化された請求項１に記載の単離された抗体もしくはその単離された抗原結合断片。
【請求項８】
請求項７に記載の抗体であって、前記標識は、放射性元素、磁性粒子、放射性同位体、蛍光色素、酵素、毒素、信号、色素、検出酵素、西洋ワサビペルオキシダーゼ（ＨＲＰ）、アルカリホスファターゼ（ＡＰ）、β−ガラクトシダーゼ、色素原、ＦＡＳＴ  ＲＥＤ、３，３’−ジアミノベンジジン、３−アミノ−９−エチルカルバゾール、５−ブロモ−４−クロロ−３−インドリルホスフェート、３，３’，５，５’−テトラメチルベンジジン、５−ブロモ−４−クロロ−３−インドリル−β−Ｄ−グルクロニドおよびそれらの任意の組み合わせからなる群より選択される、抗体。
【請求項９】
請求項１に記載の単離された抗体もしくはその単離された抗原結合断片；および
ウロプラキンＩＩ抗原に結合した場合の該請求項１に記載の単離された抗体もしくはその単離された抗原結合断片の抗体検出試薬
を含む、キット。
【請求項１０】
生物学的サンプル中のウロプラキンＩＩを検出する方法であって、
（ａ）請求項９に記載のキットを提供する工程；ならびに
（ｂ）前記単離された抗体もしくは前記その単離された抗原結合断片のウロプラキンＩＩ抗原との結合を、
（ｉ）該生物学的サンプルを、アメリカンタイプカルチャーコレクション（ＡＴＣＣ）にＡＴＣＣ特許寄託番号第ＰＴＡ−１３１８１号で寄託されているハイブリドーマによって産生される前記単離された抗体もしくはその単離された抗原結合断片と接触させる工程であって、該抗体もしくはその抗原結合断片は、配列番号４を含むウロプラキンＩＩに特異的に結合して複合体を形成する、工程；および
（ｉｉ）該キットにおいて提供される前記抗体検出試薬により該複合体を検出する工程
の工程を含むイムノアッセイであって、免疫組織化学（ＩＨＣ）、ＦＦＰＥのＩＨＣ、凍結組織切片のＩＨＣ、免疫細胞化学およびＥＬＩＳＡからなる群より選択されるイムノアッセイによって検出する工程；
を包含する、方法。
【請求項１１】
前記生物学的サンプルは、血液、尿、尿路上皮組織、移行細胞組織および膀胱組織を包含する、請求項１０に記載の方法。
【請求項１２】
前記生物学的サンプルは、正常組織、新生物性組織、膀胱組織、腎臓組織、卵巣組織、甲状腺組織、子宮内膜組織、腎性組織、扁桃腺組織、膵臓組織、結腸組織、リンパ節組織、胃組織、前立腺組織、肺組織および胸部組織からなる群より選択される、請求項１０に記載の方法。
【請求項１３】
配列番号５、６および７として示される重鎖可変領域相補性決定領域（ＣＤＲ）配列と、配列番号８、９および１０あるいは配列番号１１、１２および１３として示される軽鎖可変領域ＣＤＲ配列とを含む、ウロプラキンＩＩに特異的に結合する、抗体もしくはその断片。
【請求項１４】
配列番号４からなるアミノ酸配列に特異的に結合する、抗体もしくはその断片。
【請求項１５】
配列番号４の残基を含むアミノ酸配列を有する少なくとも１つのポリペプチドに特異的に結合する、請求項１３に記載の抗体もしくはその断片。
【請求項１６】
配列番号２または配列番号３の核酸配列によってコードされるアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域と、配列番号１の核酸配列によってコードされるアミノ酸配列を含む重鎖可変領域とを含む、請求項１３に記載の抗体もしくはその断片。
【請求項１７】
少なくとも２つの抗体もしくはその断片を含む組成物であって、該少なくとも２つの抗体もしくはその断片のうちの少なくとも１つは、請求項１３に記載のＣＤＲ領域を有する抗体もしくはその断片を含む、組成物。
【請求項１８】
前記少なくとも２つの抗体もしくはその断片のうちの少なくとも他の１つは、ＧＡＴＡ−３、ｐ６３、ウロプラキンＩＩＩ、ＰＡＸ８、ＮＫＸ３．１、ＰＳＡ、ｐ４０およびその任意の組み合わせからなる群より選択される抗原に特異的に結合する、請求項１７に記載の組成物。
【請求項１９】
前記少なくとも２つの抗体もしくはその断片は、
−ウロプラキンＩＩおよびＧＡＴＡ−３；
−ウロプラキンＩＩおよびｐ６３；
−ウロプラキンＩＩおよびウロプラキンＩＩＩ；
−ウロプラキンＩＩおよびＰＡＸ８；
−ウロプラキンＩＩおよびＮＫＸ３．１；
−ウロプラキンＩＩおよびＰＳＡ；
−ウロプラキンＩＩ、ウロプラキンＩＩＩおよびＧＡＴＡ−３；
−ウロプラキンＩＩ、ＰＡＸ８およびＰＳＡ；
−ウロプラキンＩＩ、ＰＡＸ８およびＮＫＸ３．１；ならびに
−ウロプラキンＩＩおよびｐ４０、
からなる群より選択されるタンパク質にそれぞれ特異的に結合する、請求項１７に記載の組成物。
【請求項２０】
前記少なくとも２つの抗体もしくはその断片は、少なくとも２種の異なった生物種に由来する、請求項１７に記載の組成物。
【請求項２１】
前記少なくとも２種の異なった生物種は、マウス、ウサギ、ヤギ、ウマ、ニワトリ、ヒトおよびそれらの任意の組み合わせからなる群より選択される、請求項２０に記載の組成物。
【請求項２２】
前記少なくとも２つの抗体もしくはその断片は、二重染色手順を包含する、請求項１７に記載の組成物。
【請求項２３】
前記少なくとも２つの抗体もしくはその断片は、異なる可視化の結果を提供することが可能である、請求項１７に記載の組成物。
【請求項２４】
前記可視化の結果は色彩の結果を包含する、請求項２３に記載の組成物。
【請求項２５】
モノクローナル抗体を含む、請求項１３に記載の抗体
【請求項２６】
前記モノクローナル抗体は、マウスモノクローナル抗体、ウサギモノクローナル抗体、ヤギモノクローナル抗体、ウマモノクローナル抗体、ニワトリモノクローナル抗体、ヒト化モノクローナル抗体、キメラ抗体およびそれらの任意の組み合わせからなる群より選択される、請求項２５に記載の抗体。
【請求項２７】
単離された抗体を含む、請求項１３に記載の抗体。
【請求項２８】
前記抗体の断片は、抗体の抗原結合断片を含む、請求項１３に記載の抗体。
【請求項２９】
前記抗体もしくはその断片に結合された標識をさらに含む、請求項１３に記載の抗体。
【請求項３０】
前記標識は、放射性元素、磁性粒子、放射性同位体、蛍光色素、酵素、毒素、信号、色素、検出酵素、西洋ワサビペルオキシダーゼ（ＨＲＰ）、アルカリホスファターゼ（ＡＰ）、β−ガラクトシダーゼ、色素原、ＦＡＳＴ  ＲＥＤ、３，３’−ジアミノベンジジン、３−アミノ−９−エチルカルバゾール、５−ブロモ−４−クロロ−３−インドリルホスフェート、３，３’，５，５’−テトラメチルベンジジン、５−ブロモ−４−クロロ−３−インドリル−β−Ｄ−グルクロニドおよびそれらの任意の組み合わせからなる群より選択される、請求項２９に記載の抗体。
【請求項３１】
生物学的サンプル中のウロプラキンＩＩを検出する方法であって、以下：
−生物学的サンプルを請求項１３に記載の抗体もしくはその断片と接触させる工程；および
−抗体検出要素を用いて該抗体もしくは該その断片と該生物学的サンプル中の抗原との結合を検出する工程、
を包含する、方法。
【請求項３２】
前記生物学的サンプルは、血液、尿、尿路上皮組織、移行細胞組織、正常組織、新生物性組織、膀胱組織、腎臓組織、卵巣組織、甲状腺組織、子宮内膜組織、腎性組織、扁桃腺組織、膵臓組織、結腸組織、リンパ節組織、胃組織、前立腺組織、肺組織および胸部組織からなる群より選択される、請求項３１に記載の方法。
【請求項３３】
前記検出は免疫組織化学（ＩＨＣ）、ＦＦＰＥのＩＨＣ、凍結組織切片のＩＨＣ、免疫細胞化学およびＥＬＩＳＡからなる群より選択される方法を包含する、請求項３１に記載の方法。
【請求項３４】
配列番号２または配列番号３の核酸配列によってコードされるアミノ酸配列と少なくとも約９０％同一であるアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域を含む、請求項１３に記載の抗体もしくはその断片。
【請求項３５】
配列番号１の核酸配列によってコードされるアミノ酸配列と少なくとも約９０％同一であるアミノ酸配列を含む重鎖可変領域を含む、請求項１３に記載の抗体もしくはその断片。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００１０
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００１０】
抗ＵＰＩＩ抗体（例えば、マウスモノクローナル抗ＵＰＩＩ抗体ＢＣ２１）は、組織サンプル中のＵＰＩＩの検出に有用であり得、おそらくいくつかの顕著な、しかし予期せぬ利点を現在知られている抗ＵＰＩＩＩ抗体に対してもち得る。伝統的な免疫組織化学手順中で用いられる際、抗ＵＰＩＩ抗体（例えば、マウスモノクローナル抗ＵＰＩＩ抗体ＢＣ２１）は、公知の抗ＵＰＩＩＩ抗体の特異性とおそらく同様の特異性をもって、ＵＰＩＩの膜もしくは細胞質における染色をもたらし得る。しかしながら、抗ＵＰＩＩ抗体（例えばＢＣ２１）は、おそらく過去のＵＰＩＩＩ抗体と比較して向上した感度を示し得、それにより顕著な進歩を提供し得る。抗ＵＰＩＩ抗体（例えばＢＣ２１）を用いることで、サンプルの分析は簡単にされ得、そして、腫瘍細胞におけるＵＰＩＩの発現は容易に同定可能とされ得、それ以外の場合では診断が難しいもしくは不可能でさえある場合において診断が可能になる。
例えば、本発明は、以下の項目を提供する。
（項目１）
アメリカンタイプカルチャーコレクション（ＡＴＣＣ）にＡＴＣＣ特許寄託番号第ＰＴＡ−１３１８１号で寄託されているハイブリドーマによって産生される抗体もしくはその断片。
（項目２）
アメリカンタイプカルチャーコレクション（ＡＴＣＣ）にＡＴＣＣ特許寄託番号第ＰＴＡ−１３１８１号で寄託されているハイブリドーマ細胞。
（項目３）
項目２に記載のハイブリドーマ細胞であって、さらに該ハイブリドーマ細胞によって産生される抗体もしくはその断片を含有するハイブリドーマ細胞。
（項目４）
項目１に記載のモノクローナル抗体を生産する方法であって、以下：
ウロプラキンＩＩを特異的に認識することができるモノクローナル抗体を産生する前記ハイブリドーマを培養する工程；および
該ハイブリドーマに該モノクローナル抗体を産生させる工程、
を包含する方法。
（項目５）
配列番号１、配列番号２および配列番号３からなる群より選択される核酸配列にコードされるアミノ酸配列のポリペプチドを含有する抗体もしくはその断片。
（項目６）
抗ウロプラキンＩＩ抗体もしくはその断片であって、配列番号２もしくは配列番号３の核酸配列にコードされるアミノ酸配列を含有する軽鎖可変領域、および配列番号１の核酸配列にコードされるアミノ酸配列を含有する重鎖可変領域を含有する該抗体もしくは該その断片。
（項目７）
配列番号１、配列番号２および配列番号３からなる群より選択される核酸配列にコードされるアミノ酸配列と少なくとも約７０％の同一性を有するアミノ酸配列を含有する抗体。
（項目８）
配列番号１、配列番号２および配列番号３からなる群より選択される配列と少なくとも約７０％の同一性を有する核酸配列を含有する、単離および精製された核酸配列。
（項目９）
項目７もしくは８に記載の配列であって、前記少なくとも約７０％の同一性は、配列番号１に対する少なくとも約７０％の同一性ならびに配列番号２もしくは配列番号３に対する少なくとも約７０％の同一性を包含する配列。
（項目１０）
項目９に記載の配列であって、前記少なくとも約７０％の同一性は、少なくとも約７１％、少なくとも約７２％、少なくとも約７３％、少なくとも約７４％、少なくとも約７５％、少なくとも約７６％、少なくとも約７７％、少なくとも約７８％、少なくとも約７９％、少なくとも約８０％、少なくとも約８１％、少なくとも約８２％、少なくとも約８３％、少なくとも約８４％、少なくとも約８５％、少なくとも約８６％、少なくとも約８７％、少なくとも約８８％、少なくとも約８９％、少なくとも約９０％、少なくとも約９１％、少なくとも約９２％、少なくとも約９３％、少なくとも約９４％、少なくとも約９５％、少なくとも約９６％、少なくとも約９７％、少なくとも約９８％、および少なくとも約９９％からなる群から選択される割合を包含する配列。
（項目１１）
配列番号４の残基を含有するアミノ酸配列を有する少なくとも１つのポリペプチドに特異的に結合する、抗体もしくはその断片。
（項目１２）
少なくとも２つの抗体もしくはその断片を含有する組成物であって、該少なくとも２つの抗体もしくはその断片のうちの少なくとも１つが少なくともウロプラキンＩＩに特異的に結合する、組成物。
（項目１３）
項目１２に記載の組成物であって、少なくともウロプラキンＩＩに特異的に結合する前記少なくとも２つの抗体もしくはその断片のうちの前記少なくとも１つは、前記少なくとも２つの抗体もしくはその断片のうちのウロプラキンＩＩに特異的に結合し、そして、染色された細胞の１％より大きい陽性を指示するカットオフ値を有する、少なくとも１つを包含する、組成物。
（項目１４）
項目１２に記載の組成物であって、少なくともウロプラキンＩＩに特異的に結合する前記少なくとも２つの抗体もしくはその断片のうちの前記少なくとも１つは、ウロプラキンＩＩに特異的に結合し、そして、以下：
−染色された細胞の約２％より大きい；
−染色された細胞の約３％より大きい；
−染色された細胞の約４％より大きい；
−染色された細胞の約５％より大きい；
−染色された細胞の約６％より大きい；
−染色された細胞の約７％より大きい；
−染色された細胞の約８％より大きい；
−染色された細胞の約９％より大きい；および
−染色された細胞の約１０％より大きい、からなる群から選択される陽性を指示するカットオフ値を有する、前記少なくとも２つの抗体もしくはその断片のうちの少なくとも１つを包含する、組成物。
（項目１５）
項目１２に記載の組成物であって、前記少なくとも２つの抗体もしくはその断片のうちの、前記少なくとも１つは、配列番号２もしくは配列番号３の核酸配列にコードされるアミノ酸配列を含有する軽鎖可変領域および配列番号１の核酸配列にコードされるアミノ酸配列を含有する重鎖可変領域を含有する、組成物。
（項目１６）
項目１２に記載の組成物であって、前記少なくとも２つの抗体もしくはその断片のうちの前記少なくとも１つは、配列番号２もしくは配列番号３の核酸配列にコードされるアミノ酸配列と少なくとも約７０％の同一性を有するアミノ酸配列を含有する軽鎖可変領域および配列番号１の核酸配列にコードされるアミノ酸配列と少なくとも約７０％の同一性を有するアミノ酸配列を含有する重鎖可変領域を含有する、組成物。
（項目１７）
項目１６に記載の組成物であって、前記少なくとも約７０％の同一性は、少なくとも約７１％、少なくとも約７２％、少なくとも約７３％、少なくとも約７４％、少なくとも約７５％、少なくとも約７６％、少なくとも約７７％、少なくとも約７８％、少なくとも約７９％、少なくとも約８０％、少なくとも約８１％、少なくとも約８２％、少なくとも約８３％、少なくとも約８４％、少なくとも約８５％、少なくとも約８６％、少なくとも約８７％、少なくとも約８８％、少なくとも約８９％、少なくとも約９０％、少なくとも約９１％、少なくとも約９２％、少なくとも約９３％、少なくとも約９４％、少なくとも約９５％、少なくとも約９６％、少なくとも約９７％、少なくとも約９８％、および少なくとも約９９％からなる群から選択される割合を包含する、組成物。
（項目１８）
項目１２に記載の組成物であって、前記少なくとも２つの抗体もしくはその断片のうちの前記少なくとも１つは、配列番号４の残基を包含するアミノ酸配列を有する少なくとも１つのポリペプチドに特異的に結合する、組成物。
（項目１９）
項目１２に記載の組成物であって、前記少なくとも２つの抗体もしくはその断片のうちの前記少なくとも１つは、配列番号４の残基に対する少なくとも７０％の配列同一性を有するアミノ酸配列を有する少なくとも１つのポリペプチドに特異的に結合する、組成物。
（項目２０）
項目１９に記載の組成物であって、前記少なくとも約７０％の同一性は、少なくとも約７１％、少なくとも約７２％、少なくとも約７３％、少なくとも約７４％、少なくとも約７５％、少なくとも約７６％、少なくとも約７７％、少なくとも約７８％、少なくとも約７９％、少なくとも約８０％、少なくとも約８１％、少なくとも約８２％、少なくとも約８３％、少なくとも約８４％、少なくとも約８５％、少なくとも約８６％、少なくとも約８７％、少なくとも約８８％、少なくとも約８９％、少なくとも約９０％、少なくとも約９１％、少なくとも約９２％、少なくとも約９３％、少なくとも約９４％、少なくとも約９５％、少なくとも約９６％、少なくとも約９７％、少なくとも約９８％、および少なくとも９９％からなる群から選択される割合を包含する、組成物。
（項目２１）
項目１２に記載の組成物であって、前記少なくとも２つの抗体もしくはその断片のうちの前記少なくとも１つは、アメリカンタイプカルチャーコレクション（ＡＴＣＣ）にＡＴＣＣ特許寄託番号第ＰＴＡ−１３１８１号で寄託されているハイブリドーマによって産生される抗体もしくはその断片を含む、組成物。
（項目２２）
項目１２に記載の組成物であって、１次抗体混合物を含有する、組成物。
（項目２３）
項目１２に記載の組成物であって、前記少なくとも２つの抗体もしくはその断片は、少なくとも２種の異なった生物種に由来する、組成物。
（項目２４）
項目２３に記載の組成物であって、前記少なくとも２種の異なった生物種は、マウス、ウサギ、ヤギ、ウマ、ニワトリ、ヒトおよびそれらの任意の組み合わせからなる群より選択される、組成物。
（項目２５）
項目１２に記載の組成物であって、前記少なくとも２つの抗体もしくはその断片は、二重染色手順を包含する、組成物。
（項目２６）
項目１２に記載の組成物であって、前記少なくとも２つの抗体もしくはその断片は、異なる可視化の結果を提供することが可能である、組成物。
（項目２７）
項目２６に記載の組成物であって、前記可視化の結果は色彩の結果を包含する、組成物。
（項目２８）
項目１２に記載の組成物であって、前記少なくとも２つの抗体もしくはその断片のうちの前記抗原に特異的に結合する抗体もしくはその断片でない少なくとも１つの抗体もしくはその断片は、ＧＡＴＡ−３、ｐ６３、ウロプラキンＩＩＩ、ＰＡＸ８、ＮＫＸ３．１、ＰＳＡ、ｐ４０およびその任意の組み合わせからなる群より選択される抗原に特異的に結合する組成物。
（項目２９）
項目１２に記載の組成物であって、前記少なくとも２つの抗体もしくはその断片は、以下：
−ウロプラキンＩＩおよびＧＡＴＡ−３；
−ウロプラキンＩＩおよびｐ６３；
−ウロプラキンＩＩおよびウロプラキンＩＩＩ；
−ウロプラキンＩＩおよびＰＡＸ８；
−ウロプラキンＩＩおよびＮＫＸ３．１；
−ウロプラキンＩＩおよびＰＳＡ；
−ウロプラキンＩＩ、ウロプラキンＩＩＩおよびＧＡＴＡ−３；
−ウロプラキンＩＩ、ＰＡＸ８およびＰＳＡ；
−ウロプラキンＩＩ、ＰＡＸ８およびＮＫＸ３．１；ならびに
−ウロプラキンＩＩおよびｐ４０、
からなる群より選択されるタンパク質にそれぞれ特異的に結合する、組成物。
（項目３０）
項目１２に記載の組成物であって、尿路上皮癌検出組成物、腎細胞癌検出組成物、前立腺癌検出組成物およびそれらの任意の組み合わせからなる群より選択される検出組成物を含有する、組成物。
（項目３１）
ウロプラキンＩＩに特異的に結合し、そして、染色された細胞の１％より大きい陽性を指示するカットオフ値を有する、モノクローナル抗体もしくはその断片。
（項目３２）
項目３１に記載のモノクローナル抗体もしくはその断片であって、前記陽性を指示するカットオフ値が以下：
−染色された細胞の約２％より大きい；
−染色された細胞の約３％より大きい；
−染色された細胞の約４％より大きい；
−染色された細胞の約５％より大きい；
−染色された細胞の約６％より大きい；
−染色された細胞の約７％より大きい；
−染色された細胞の約８％より大きい；
−染色された細胞の約９％より大きい；および
−染色された細胞の約１０％より大きい、
からなる群から選択される、モノクローナル抗体もしくはその断片。
（項目３３）
項目５、６、１１、１２もしくは３１のいずれかに記載の抗体であって、該抗体もしくはその断片はアメリカンタイプカルチャーコレクションにＡＴＣＣ特許寄託番号第ＰＴＡ−１３１８１号で寄託されているハイブリドーマ細胞によって産生される、抗体。
（項目３４）
項目１、３、１１もしくは３１のいずれかに記載の抗体であって、該抗体もしくはその断片は、配列番号１、配列番号２および配列番号３からなる群より選択される核酸配列にコードされるアミノ酸配列のポリペプチドを含有する、抗体。
（項目３５）
項目１、３、１１もしくは３１のいずれかに記載の抗体であって、該抗体もしくはその断片は、配列番号１および配列番号２または配列番号３の核酸配列にコードされるアミノ酸配列のポリペプチドを含有する、抗体。
（項目３６）
項目１、３、１１もしくは３１のいずれかに記載の抗体であって、該抗体もしくはその断片は、配列番号１および配列番号２または配列番号３の核酸配列にコードされるアミノ酸配列に対する少なくとも約７０％の同一性を有するポリペプチドを含有する、抗体。
（項目３７）
項目１、３、１１もしくは３１のいずれかに記載の抗体であって、該抗体もしくはその断片は、配列番号１および配列番号２もしくは配列番号３の核酸配列にコードされるアミノ酸配列に対する少なくとも約７０％の同一性を有するポリペプチドを含有する、抗体。
（項目３８）
項目１、３、５もしくは３１のいずれかに記載の抗体であって、該抗体もしくはその断片は、配列番号４の残基を含有するアミノ酸配列を有する少なくとも１つのポリペプチドに特異的に結合する、抗体。
（項目３９）
項目１、３、５もしくは３１のいずれかに記載の抗体であって、該抗体もしくはその断片は、配列番号４の残基に対する少なくとも約７０％の同一性を有するアミノ酸配列を有する少なくとも１つのポリペプチドに特異的に結合する、抗体。
（項目４０）
項目３９に記載の抗体であって、前記少なくとも約７０％の同一性は、少なくとも約７１％、少なくとも約７２％、少なくとも約７３％、少なくとも約７４％、少なくとも約７５％、少なくとも約７６％、少なくとも約７７％、少なくとも約７８％、少なくとも約７９％、少なくとも約８０％、少なくとも約８１％、少なくとも約８２％、少なくとも約８３％、少なくとも約８４％、少なくとも約８５％、少なくとも約８６％、少なくとも約８７％、少なくとも約８８％、少なくとも約８９％、少なくとも約９０％、少なくとも約９１％、少なくとも約９２％、少なくとも約９３％、少なくとも約９４％、少なくとも約９５％、少なくとも約９６％、少なくとも約９７％、少なくとも約９８％、および少なくとも９９％からなる群から選択される割合を包含する、抗体。
（項目４１）
項目１、３、５、６、１１、１２もしくは３１のいずれかに記載の抗体であって、該抗体はモノクローナル抗体を含有する、抗体。
（項目４２）
項目４１に記載の抗体であって、前記モノクローナル抗体は染色された細胞の１％より大きい陽性を指示するカットオフ値を有する、抗体。
（項目４３）
項目４２に記載の抗体であって、前記陽性を指示するカットオフ値が以下：
−染色された細胞の約２％より大きい；
−染色された細胞の約３％より大きい；
−染色された細胞の約４％より大きい；
−染色された細胞の約５％より大きい；
−染色された細胞の約６％より大きい；
−染色された細胞の約７％より大きい；
−染色された細胞の約８％より大きい；
−染色された細胞の約９％より大きい；および
−染色された細胞の約１０％より大きい、
からなる群より選択される、抗体。
（項目４４）
項目４１に記載の抗体であって、前記モノクローナル抗体は、マウスモノクローナル抗体、ウサギモノクローナル抗体、ヤギモノクローナル抗体、ウマモノクローナル抗体、ニワトリモノクローナル抗体、ヒト化モノクローナル抗体、キメラ抗体およびそれらの任意の組み合わせからなる群より選択される、抗体。
（項目４５）
項目１、３、５、６、１１、１２もしくは３１のいずれかに記載の抗体であって、該抗体はポリクローナル抗体を包含する、抗体。
（項目４６）
項目４５に記載の抗体であって、前記ポリクローナル抗体は、ウサギポリクローナル抗体、マウスポリクローナル抗体、ヤギポリクローナル抗体、ウマポリクローナル抗体、ニワトリポリクローナル抗体、ヒト化ポリクローナル抗体およびそれらの任意の組み合わせからなる群より選択される、抗体。
（項目４７）
項目１、３、５、６、１１、１２もしくは３１のいずれかに記載の抗体であって、該抗体は単離された抗体を包含する、抗体。
（項目４８）
項目１、３、５、６、１１、１２もしくは３１のいずれかに記載の抗体であって、前記抗体の断片は抗体の抗原結合断片を包含する、抗体。
（項目４９）
項目１、３、５、６、１１、１２もしくは３１のいずれかに記載の抗体であって、さらに前記抗体もしくはその断片に結合された標識を含有する、抗体。
（項目５０）
標識と結合体化された項目１、３、５、６、１１、１２もしくは３１に記載の抗体もしくはその断片を含有する、癌診断剤。
（項目５１）
項目４９に記載の抗体であって、前記標識は、放射性元素、磁性粒子、放射性同位体、蛍光色素、酵素、毒素、信号、色素、検出酵素、西洋ワサビペルオキシダーゼ（ＨＲＰ）、アルカリホスファターゼ（ＡＰ）、β−ガラクトシダーゼ、色素原、ＦＡＳＴ  ＲＥＤ、３，３’−ジアミノベンジジン、３−アミノ−９−エチルカルバゾール、５−ブロモ−４−クロロ−３−インドリルホスフェート、３，３’，５，５’−テトラメチルベンジジン、５−ブロモ−４−クロロ−３−インドリル−β−Ｄ−グルクロニドおよびそれらの任意の組み合わせからなる群より選択される、抗体。
（項目５２）
項目５０に記載の抗体であって、前記標識は、放射性元素、磁性粒子、放射性同位体、蛍光色素、酵素、毒素、信号、色素、検出酵素、西洋ワサビペルオキシダーゼ（ＨＲＰ）、アルカリホスファターゼ（ＡＰ）、β−ガラクトシダーゼ、色素原、ＦＡＳＴ  ＲＥＤ、３，３’−ジアミノベンジジン、３−アミノ−９−エチルカルバゾール、５−ブロモ−４−クロロ−３−インドリルホスフェート、３，３’，５，５’−テトラメチルベンジジン、５−ブロモ−４−クロロ−３−インドリル−β−Ｄ−グルクロニドおよびそれらの任意の組み合わせからなる群より選択される、抗体。
（項目５３）
診断のもしくは予後の検査キットであって以下：
−項目１、３、５、６、１１、１２もしくは３１に記載の抗体もしくはその断片；および
−抗原に結合した場合の該抗体もしくは該その断片の抗体検出要素、
を含有する、検査キット。
（項目５４）
項目５３のキットを用いて生物学的サンプル中のウロプラキンＩＩを検出する方法であって、以下：
−生物学的サンプルを前記抗体もしくはその断片と接触させる工程；および
−前記抗体検出要素を用いて該抗体もしくは該その断片と該生物学的サンプル中の抗原との結合を検出する工程、
を包含する、方法。
（項目５５）
項目１、３、５、６もしくは１１のいずれかに記載の抗体であって、前記抗体もしくは前記その断片はウロプラキンＩＩに特異的に結合する、抗体。
（項目５６）
癌を検出するための項目１、３、５、６、１１もしくは３１に記載の抗体もしくはその断片または組成物の使用。
（項目５７）
癌の診断もしくは予後のための項目１、３、５、６、１１もしくは３１に記載の抗体もしくはその断片または組成物の使用。
（項目５８）
癌の治療の転帰を予想するための項目１、３、５、６、１１もしくは３１に記載の抗体もしくはその断片または組成物の使用。
（項目５９）
項目１、３、５、６、１１もしくは３１のいずれかに記載の抗体もしくはその断片または組成物の、癌の治療の有効性を評価するための使用。
（項目６０）
癌の再発を予想するための項目１、３、５、６、１１もしくは３１に記載の抗体もしくはその断片または組成物の使用。
（項目６１）
項目５６に記載の抗体もしくはその断片または組成物であって、前記抗体もしくはその断片または組成物の前記使用が、自動化染色装置上で行われる、抗体もしくはその断片または組成物。
（項目６２）
項目５６に記載の抗体もしくはその断片または組成物であって、前記検出が手動で行われる、抗体もしくはその断片または組成物。
（項目６３）
項目５６に記載の抗体もしくはその断片または組成物であって、前記検出が自動で行われる、抗体もしくはその断片または組成物。
（項目６４）
項目５６に記載の抗体もしくはその断片または組成物であって、前記検出が画像解析によって行われる、抗体もしくはその断片または組成物。
（項目６５）
生物学的サンプルに対して項目１、３、５、６、１１、１２もしくは３１の抗体もしくはその断片が結合するタンパク質を検出する方法であって、生物学的サンプルを該抗体もしくはその断片と接触させる工程；および該生物学的サンプル中の該タンパク質に結合した該抗体もしくはその断片の存在を検出する工程、を包含する方法。
（項目６６）
項目６５に記載の方法であって、前記生物学的サンプルは、血液、尿、尿路上皮組織、移行細胞組織および膀胱組織を包含する、方法。
（項目６７）
項目６５に記載の方法であって、前記生物学的サンプルは、正常組織、新生物性組織、膀胱組織、腎臓組織、卵巣組織、甲状腺組織、子宮内膜組織、腎性組織、扁桃腺組織、膵臓組織、結腸組織、リンパ節組織、胃組織、前立腺組織、肺組織および胸部組織からなる群より選択される、方法。
（項目６８）
項目６５に記載の方法であって、前記タンパク質に結合した抗体もしくはその断片の前記存在を検出する前記工程は、自動化染色装置上で行われる、方法。
（項目６９）
項目６５に記載の方法であって、前記タンパク質に結合した抗体もしくはその断片の前記存在を検出する前記工程が手動で行われる、方法。
（項目７０）
項目６５に記載の方法であって、前記タンパク質に結合した抗体もしくはその断片の前記存在を検出する前記工程が自動で行われる、方法。
（項目７１）
項目６５に記載の方法であって、前記タンパク質に結合した抗体もしくはその断片の前記存在を検出する前記工程はが画像解析によって行われる、方法。
（項目７２）
項目６５に記載の方法であって、前記検出は免疫組織化学（ＩＨＣ）、ＦＦＰＥのＩＨＣ、凍結組織切片のＩＨＣ、免疫細胞化学およびＥＬＩＳＡからなる群より選択される方法を包含する、方法。
（項目７３）
生物学的サンプル中の少なくとも２つの異なるタンパク質を検出する方法であって、以下：
−該生物学的サンプルと、少なくとも２つの抗体もしくはその断片を含有する組成物とを接触させる工程であって、該少なくとも２つの抗体もしくはその断片のうちの少なくとも１つが少なくともウロプラキンＩＩに特異的に結合して抗原−抗体複合体を形成する工程；および
−該抗原−抗体複合体を検出する工程、
を包含する、方法。
（項目７４）
項目７３に記載の方法であって、少なくともウロプラキンＩＩに特異的に結合する前記少なくとも２つの抗体もしくはその断片のうちの前記少なくとも１つは、少なくともウロプラキンＩＩに特異的に結合し、そして、染色された細胞の１％より大きい陽性を指示するカットオフ値を有する該少なくとも２つの抗体もしくはその断片のうちの少なくとも１つを包含する、方法。
（項目７５）
項目７４に記載の方法であって、陽性を指示するカットオフ値は以下：
−染色された細胞の約２％より大きい；
−染色された細胞の約３％より大きい；
−染色された細胞の約４％より大きい；
−染色された細胞の約５％より大きい；
−染色された細胞の約６％より大きい；
−染色された細胞の約７％より大きい；
−染色された細胞の約８％より大きい；
−染色された細胞の約９％より大きい；および
−染色された細胞の約１０％より大きい、
からなる群より選択される、方法。
（項目７６）
項目７３に記載の方法であって、前記少なくとも２つの抗体もしくはその断片は、少なくとも１つの第一の１次抗体および少なくとも１つの第二の１次抗体を包含する、方法。
（項目７７）
項目７３に記載の方法であって、前記少なくとも２つの抗体もしくはその断片のうちの前記少なくとも１つは、配列番号２もしくは配列番号３の核酸配列にコードされるアミノ酸配列を含有する軽鎖可変領域および配列番号１の核酸配列にコードされるアミノ酸配列を含有する重鎖可変領域を含有する、方法。
（項目７８）
項目７３に記載の方法であって、前記少なくとも２つの抗体もしくはその断片のうちの前記少なくとも１つは、配列番号２もしくは配列番号３の核酸配列にコードされるアミノ酸配列と少なくとも約７０％の同一性を有するアミノ酸配列を含有する軽鎖可変領域および配列番号１の核酸配列にコードされるアミノ酸配列と少なくとも約７０％の同一性を有するアミノ酸配列を含有する重鎖可変領域を含有する、方法。
（項目７９）
項目７８に記載の方法であって、前記少なくとも約７０％の同一性は、少なくとも約７１％、少なくとも約７２％、少なくとも約７３％、少なくとも約７４％、少なくとも約７５％、少なくとも約７６％、少なくとも約７７％、少なくとも約７８％、少なくとも約７９％、少なくとも約８０％、少なくとも約８１％、少なくとも約８２％、少なくとも約８３％、少なくとも約８４％、少なくとも約８５％、少なくとも約８６％、少なくとも約８７％、少なくとも約８８％、少なくとも約８９％、少なくとも約９０％、少なくとも約９１％、少なくとも約９２％、少なくとも約９３％、少なくとも約９４％、少なくとも約９５％、少なくとも約９６％、少なくとも約９７％、少なくとも約９８％、および少なくとも約９９％からなる群から選択される割合を包含する、方法。
（項目８０）
項目７３に記載の方法であって、前記少なくとも２つの抗体もしくはその断片のうちの前記少なくとも１つは、配列番号４の残基を包含するアミノ酸配列を有する少なくとも１つのポリペプチドに特異的に結合する、方法。
（項目８１）
項目７３に記載の方法であって、前記少なくとも２つの抗体もしくはその断片のうちの前記少なくとも１つは、配列番号４の残基に対する少なくとも約７０％の配列同一性を有するアミノ酸配列を有する少なくとも１つのポリペプチドに特異的に結合する、方法。
（項目８２）
項目８１に記載の方法であって、前記少なくとも約７０％の同一性は、少なくとも約７１％、少なくとも約７２％、少なくとも約７３％、少なくとも約７４％、少なくとも約７５％、少なくとも約７６％、少なくとも約７７％、少なくとも約７８％、少なくとも約７９％、少なくとも約８０％、少なくとも約８１％、少なくとも約８２％、少なくとも約８３％、少なくとも約８４％、少なくとも約８５％、少なくとも約８６％、少なくとも約８７％、少なくとも約８８％、少なくとも約８９％、少なくとも約９０％、少なくとも約９１％、少なくとも約９２％、少なくとも約９３％、少なくとも約９４％、少なくとも約９５％、少なくとも約９６％、少なくとも約９７％、少なくとも約９８％、および少なくとも９９％からなる群から選択される割合を包含する、方法。
（項目８３）
項目７３に記載の方法であって、前記少なくとも２つの抗体もしくはその断片のうちの前記少なくとも１つは、アメリカンタイプカルチャーコレクション（ＡＴＣＣ）にＡＴＣＣ特許寄託番号第ＰＴＡ−１３１８１号で寄託されているハイブリドーマによって産生される抗体もしくはその断片を包含する、方法。
（項目８４）
項目７３に記載の方法であって、前記組成物は、１次抗体混合物を含有する、方法。
（項目８５）
項目７３に記載の方法であって、前記少なくとも２つの抗体もしくはその断片は、少なくとも２種の異なった生物種に由来する、方法。
（項目８６）
項目８５に記載の方法であって、前記少なくとも２種の異なった生物種は、マウス、ウサギ、ヤギ、ウマ、ニワトリ、ヒトおよびそれらの任意の組み合わせからなる群より選択される、方法。
（項目８７）
項目７３に記載の方法であって、さらに前記生物学的サンプルの二重染色工程を包含する、方法。
（項目８８）
項目７３に記載の方法であって、さらに異なる可視化の結果を提供する工程を包含する、方法。
（項目８９）
項目８８に記載の方法であって、前記可視化の結果は色彩の結果を包含する、方法。
（項目９０）
項目７３に記載の方法であって、前記少なくとも２つの抗体もしくはその断片は、以下：
−ウロプラキンＩＩおよびＧＡＴＡ−３；
−ウロプラキンＩＩおよびｐ６３；
−ウロプラキンＩＩおよびウロプラキンＩＩＩ；
−ウロプラキンＩＩおよびＰＡＸ８；
−ウロプラキンＩＩおよびＮＫＸ３．１；
−ウロプラキンＩＩおよびＰＳＡ；
−ウロプラキンＩＩ、ウロプラキンＩＩＩおよびＧＡＴＡ−３；
−ウロプラキンＩＩ、ＰＡＸ８およびＰＳＡ；
−ウロプラキンＩＩ、ＰＡＸ８およびＮＫＸ３．１；ならびに
−ウロプラキンＩＩおよびｐ４０、
からなる群より選択されるタンパク質にそれぞれ特異的に結合する、方法。
（項目９１）
項目７３に記載の方法であって、前記抗原−抗体複合体を検出する前記工程は、前記サンプル上で少なくとも２つの抗原−抗体複合体の形成を検出する工程であって、前記第一の抗体はウロプラキンＩＩに特異的に結合し、前記第二の抗体はＧＡＴＡ−３、ｐ６３、ウロプラキンＩＩＩ、ＰＡＸ８、ＮＫＸ３．１、ＰＳＡ、ｐ４０およびその任意の組み合わせからなる群より選択される抗原に特異的に結合する工程を包含する、方法。
（項目９２）
動物もしくはヒト中のウロプラキンＩＩタンパク質を検出するイムノアッセイ法であって、下記：
−試験される動物もしくはヒトから組織を得る工程；
−該組織を項目１、３、５、６、１１、１２もしくは３１に記載の抗体もしくはその断片と、該組織にウロプラキンＩＩタンパク質が存在した場合に該抗体もしくはその断片が該タンパク質に結合するような量および条件で接触させる工程；ならびに
−該結合した抗体の存在を検出する工程、
を包含する、イムノアッセイ法。
（項目９３）
項目９２に記載の、動物もしくはヒト中のウロプラキンＩＩタンパク質を検出するイムノアッセイ法であって、さらに前記組織を固定または凍結する工程を包含する、イムノアッセイ法。
（項目９４）
項目９３に記載の、動物もしくはヒト中のウロプラキンＩＩタンパク質を検出するイムノアッセイ法であって、前記固定もしくは凍結された組織を、ウロプラキンＩＩのエピトープを露出させるために処理する工程をさらに包含する、イムノアッセイ法。
（項目９５）
項目９２に記載の、ウロプラキンＩＩタンパク質を検出するイムノアッセイ法であって、さらに免疫組織化学（ＩＨＣ）、ＦＦＰＥのＩＨＣ、凍結組織切片のＩＨＣ、免疫細胞化学およびＥＬＩＳＡからなる群より選択される方法を用いて前記動物もしくはヒト中の前記ウロプラキンＩＩを検出する工程を包含する、イムノアッセイ法。
（項目９６）
ウロプラキンＩＩタンパク質に特異的に結合する抗体の単離された調製物であって、該抗体は配列番号４（該ウロプラキンＩＩタンパク質の３６−５０残基）のペプチド中のエピトープに結合する、調製物。
【手続補正３】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００２８
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００２８】
実施態様において、抗体もしくはそのフラグメントもしくは単離および精製された核酸配列まで、配列番号１および／もしくは配列番号２および／もしくは配列番号３の核酸配列にコードされるアミノ酸配列と少なくとも約７０％の同一性を有するアミノ酸配列をもち得る。抗体もしくはそのフラグメントは、配列番号４の残基と少なくとも約７０％の同一性を有するアミノ酸配列を有するポリペプチドの少なくとも１つ以上と特異的に結合し得る。少なくとも約７１％、少なくとも約７２％、少なくとも約７３％、少なくとも約７４％、少なくとも約７５％、少なくとも約７６％、少なくとも約７７％、少なくとも約７８％、少なくとも約７９％、少なくとも約８０％、少なくとも約８１％、少なくとも約８２％、少なくとも約８３％、少なくとも約８４％、少なくとも約８５％、少なくとも約８６％、少なくとも約８７％、少なくとも約８８％、少なくとも約８９％、少なくとも約９０％、少なくとも約９１％、少なくとも約９２％、少なくとも約９３％、少なくとも約９４％、少なくとも約９５％、少なくとも約９６％、少なくとも約９７％、少なくとも約９８％およびおそらく少なくとも約９９％等にいたるまでの、他の割合が挙げられ得るがそれに限定されない。
重鎖および軽鎖の可変領域の配列を、当業者にとって公知のソフトウェアを用いてコンピュータ処理し、相補性決定領域（ＣＤＲ）を生成することができる。したがって、重鎖の可変領域の配列である配列番号１は、配列番号５（ＣＤＲ１）、配列番号６（ＣＤＲ２）および配列番号７（ＣＤＲ３）のＣＤＲ配列をもたらす。軽鎖の可変領域の配列である配列番号２は、配列番号８（ＣＤＲ１）、配列番号９（ＣＤＲ２）および配列番号１０（ＣＤＲ３）のＣＤＲ配列をもたらす。軽鎖の可変領域の配列である配列番号３は、配列番号１１（ＣＤＲ１）、配列番号１２（ＣＤＲ２）および配列番号１３（ＣＤＲ３）のＣＤＲ配列をもたらす。
【手続補正４】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】配列表
【補正方法】変更
【補正の内容】
【配列表】
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