【手続補正書】
【提出日】平成28年10月31日(2016.10.31)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
哺乳動物被験体の生体液サンプルにおける内因性抗ＡｐｏＡ−Ｉ抗体を検出する方法であって、
（ａ）哺乳動物被験体由来の生体液サンプルを用意する工程と、
（ｂ）前記生体液サンプルを、少なくとも１つのアポリポタンパク質Ａ−Ｉ（ＡｐｏＡ−Ｉ）のエピトープの模倣ペプチドがカップリングされた固体マトリックスと接触させる工程であって、
ここで、前記模倣ペプチドが、配列番号：８またはその変異体、配列番号：９またはその変異体、配列番号：１５またはその変異体、配列番号：１６またはその変異体、配列番号：１７またはその変異体、配列番号：１９またはその変異体、配列番号：２０またはその変異体、配列番号：２５またはその変異体であり、
前記模倣ペプチドの変異体が、前記模倣ペプチドの抗ＡｐｏＡ−Ｉ抗体への特異的結合能が損なわれることなく、その配列の１、２、３、４、５または６アミノ酸が置換、欠失、および／または化学修飾されていること以外は、前記模倣ペプチドと同一のアミノ酸配列であり、
前記結合が、前記生体液サンプルに存在する抗ＡｐｏＡ−Ｉ抗体が、抗原−抗体相互作用により、少なくとも１つの前記模倣ペプチドに結合するのに十分な条件下でなされる工程と、
（ｃ）前記固体マトリックスの表面から未結合の抗体を除去する工程と、そして
（ｄ）前記固体マトリックスに結合している抗原−抗体複合体の存在を検出する工程と
を少なくとも含んでなり、
前記複合体の存在により、前記生体液サンプルが内因性抗ＡｐｏＡ−Ｉ抗体を含むことが示されることを特徴とする、方法。
【請求項２】
前記抗原抗体複合体の存在が、前記被験体が心血管疾患を患っていることを示す、請求項１に記載の方法。
【請求項３】
前記抗原抗体複合体の存在が、前記被験体が、急性胸痛、急性冠症候群、関節リウマチ、全身性エリテマトーデス、重度の頚動脈狭窄症、末期腎疾患または歯周炎を患っていることを示す、請求項１に記載の方法。
【請求項４】
アポリポタンパク質Ａ−Ｉ（ＡｐｏＡ−Ｉ）のエピトープの模倣ペプチドであって、当該模倣ペプチドが、
（ａ）１５〜８０アミノ酸長のアミノ酸配列を有し、
（ｂ）下記：
（ｉ）配列番号：２５、配列番号：８、配列番号：９、配列番号：１５、配列番号：１６、配列番号：１７、配列番号：１９、または配列番号：２０、
（ｉｉ）配列番号：２５、配列番号：８、配列番号：９、配列番号：１５、配列番号：１６、配列番号：１７、配列番号：１９、または配列番号：２０の変異体であって、これらの配列は、前記模倣ペプチドの抗ＡｐｏＡ−Ｉ抗体への特異的結合能が損なわれることなく、その配列の１、２、３、４、５または６アミノ酸が置換、欠失、および／または化学修飾されていること以外は、前記配列番号：２５、配列番号：８、配列番号：９、配列番号：１５、配列番号：１６、配列番号：１７、配列番号：１９、または配列番号：２０の配列のいずれか１つと同一のアミノ酸配列である変異体、または
（ｉｉｉ）（ｉ）および／または（ｉｉ）のアミノ酸配列の２つの任意の組み合わせ
のいずれか１つを含むアミノ酸配列
からなり、かつ
（ｃ）前記（ｂ）のアミノ酸配列の少なくとも２つの非連続アミノ酸間の内部架橋を有し、
さらに、当該模倣ペプチドは、抗ＡｐｏＡ−Ｉ抗体に特異的に結合することができるものであることを特徴とする、模倣ペプチド。
【請求項５】
前記（ｂ）のアミノ酸配列が、配列番号：８、配列番号：９、またはそれらの変異体から選択されるものである、請求項４に記載の模倣ペプチド。
【請求項６】
前記（ｃ）の内部架橋が、前記ペプチド配列のｎ位およびｎ＋４位の２つのアミノ酸Ｘａａ間に形成されるラクタム架橋であり、ｎ位のＸａａが、式（Ｉ）：−ＮＨ−Ｃ（Ｈ）（Ｒ）−Ｃ（Ｏ）−（式中、Ｒは、ｎ＋４位の後続残基に連結するラクタム架橋−（ＣＨ２）２−ＣＯ−ＮＨ−（ＣＨ２）４−である）の修飾アミノ酸であり、ｎ＋４位のＸａａが、式（Ｉ）：−ＮＨ−Ｃ（Ｈ）（Ｒ’）−Ｃ（Ｏ）−（式中、Ｒ’は、前記ｎ位のＸａａからラクタム架橋に連結する単結合である）の修飾アミノ酸である、請求項５に記載の模倣ペプチド。
【請求項７】
前記（ｃ）の内部架橋が、前記ペプチド配列のｎ位およびｎ＋７位の２つのアミノ酸Ｘａａを連結する炭化水素ステープルであり、ｎ位のＸａａが、式（Ｉ）：−ＮＨ−Ｃ（ＣＨ３）（Ｒ）−Ｃ（Ｏ）−（式中、Ｒは、ｎ＋７位の後続Ｘａａに連結する炭化水素ステープル−（ＣＨ２）６−ＣＨ＝ＣＨ−（ＣＨ２）３−である）の修飾アラニンであり、ｎ＋７位のＸａａが、式（Ｉ）：−ＮＨ−Ｃ（ＣＨ３）（Ｒ’）−Ｃ（Ｏ）−（式中、Ｒ’は、前記ｎ位のＸａａから炭化水素ステープルに連結する単結合である）の修飾アラニンである、請求項４に記載の模倣ペプチド。
【請求項８】
前記（ｃ）の内部架橋が、前記ペプチド配列のｎ位およびｎ＋４位の２つのアミノ酸Ｘａａを連結する炭化水素ステープルであり、ｎ位のＸａａが、式（Ｉ）：−ＮＨ−Ｃ（ＣＨ３）（Ｒ）−Ｃ（Ｏ）−（式中、Ｒは、ｎ＋４位の後続Ｘａａに連結する炭化水素ステープル−（ＣＨ２）３−ＣＨ＝ＣＨ−（ＣＨ２）３−である）の修飾アラニンであり、ｎ＋４位のＸａａが、式（Ｉ）：−ＮＨ−Ｃ（ＣＨ３）（Ｒ’）−Ｃ（Ｏ）−（式中、Ｒ’は、前記ｎ位のＸａａから炭化水素ステープルに連結する単結合である）の修飾アラニンである、請求項４に記載の模倣ペプチド。
【請求項９】
請求項４に記載の模倣ペプチドであって、下記（ｉ）〜（ｉｖ）のいずれか１つである、模倣ペプチド：
（ｉ）ｂ）のアミノ酸配列が配列番号：１９を含み、ｃ）の内部架橋が、１９位のグルタミン酸（Ｅ）および２３位のリジン（Ｋ）を連結するラクタム架橋であり、前記位置が、ｂ）のアミノ酸配列に関するものである；
（ｉｉ）ｂ）のアミノ酸配列が配列番号：１５を含み、ｃ）の内部架橋が、１６位の（Ｒ）−２−（７’−オクテニル）−アラニンおよび２３位の（Ｓ）−２−（４’−ペンテニル）−アラニンを連結する炭化水素ステープルであり、前記位置が、ｂ）のアミノ酸配列に関するものである；
（ｉｉｉ）ｂ）のアミノ酸配列が配列番号：１６を含み、ｃ）の内部架橋が、１３位の（Ｓ）−２−（４’−ペンテニル）−アラニンおよび１７位の（Ｓ）−２−（４’−ペンテニル）−アラニンを連結する炭化水素ステープルであり、前記位置が、ｂ）のアミノ酸配列に関するものである；
（ｉｖ）ｂ）のアミノ酸配列が配列番号：１７を含み、ｃ）の内部架橋が、９位の（Ｒ）−２−（７’−オクテニル）−アラニンおよび１６位の（Ｓ）−２−（４’−ペンテニル）−アラニンを連結する炭化水素ステープルであり、前記位置が、ｂ）のアミノ酸配列に関するものである。
【請求項１０】
配列番号：９またはその変異体である、請求項４に記載の模倣ペプチド。
【請求項１１】
アセチル化Ｎ末端に遊離アミノ基を有し、アミド化Ｃ末端に遊離カルボキシ基を有する、請求項４〜１０のいずれか一項に記載の模倣ペプチド。
【請求項１２】
医薬として用いられる、請求項４〜１１に記載の模倣ペプチド。
【請求項１３】
少なくとも１つの請求項４〜１１のいずれか一項に記載の模倣ペプチドを含んでなる、医薬組成物。
【請求項１４】
ＡｐｏＡ−Ｉに関連する疾患の予防または治療に用いられる、請求項１３に記載の医薬組成物。
【請求項１５】
前記模倣ペプチドが請求項１０に記載の模倣ペプチドである、請求項１４に記載の医薬組成物。
【請求項１６】
心血管疾患用バイオマーカーとして、生体液サンプルにおける抗ＡｐｏＡ−Ｉ抗体を検出するためのキットであって、少なくとも１つの請求項４〜１１のいずれか一項に記載の模倣ペプチド、その変異体、またはそれらの組み合わせを含んでなる、キット。
【請求項１７】
模倣ペプチドが請求項４〜１１のいずれか一項に記載の模倣ペプチドである、請求項１〜３のいずれか一項に記載の方法。