【手続補正書】
【提出日】平成28年3月11日(2016.3.11)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
患者が、ＶＥＧＦアンタゴニストによる治療に応答する可能性があるかどうかを決定する方法であって、
（ａ）患者に対するＶＥＧＦアンタゴニストの任意の投与前に患者から得られた生物学的試料中で、以下の遺伝子、ＤＬＬ４、アンジオポエチン２（Ａｎｇｐｔ２）、ＮＯＳ２、第Ｖ因子、第ＶＩＩＩ因子（ＡＨＦ）、ＥＧＦＬ７、ＥＦＮＡ３、ＰＧＦ、ＡＮＧＰＴＬ１、ＳＥＬＰ、Ｃｏｘ２、フィブロネクチン（ＦＮ＿ＥＩＩＩＢ）、ＥＳＭ１、及びストローマ由来増殖因子（ＳＤＦ１）の少なくとも一の発現を検出すること、
（ｂ）少なくとも一遺伝子の発現レベルを少なくとも一遺伝子の参照発現レベルに対して比較することであって、ここで、患者試料中における少なくとも一遺伝子の発現のレベルの参照レベルに対する変化は、ＶＥＧＦアンタゴニストによる治療に応答する可能性のある患者を同定する、比較すること、及び
（ｃ）患者がＶＥＧＦアンタゴニストによる治療に応答する可能性が増加していることを患者に知らせること
を含む方法。
【請求項２】
患者に対して抗癌治療の治療効果を最適化する方法であって、
（ａ）患者に対するＶＥＧＦアンタゴニストの任意の投与前に患者から得られた生物学的試料中で、以下の遺伝子、ＤＬＬ４、アンジオポエチン２（Ａｎｇｐｔ２）、ＮＯＳ２、第Ｖ因子、第ＶＩＩＩ因子（ＡＨＦ）、ＥＧＦＬ７、ＥＦＮＡ３、ＰＧＦ、ＡＮＧＰＴＬ１、ＳＥＬＰ、Ｃｏｘ２、フィブロネクチン（ＦＮ＿ＥＩＩＩＢ）、ＥＳＭ１、及びストローマ由来増殖因子（ＳＤＦ１）の少なくとも一の発現を検出すること、
（ｂ）少なくとも一遺伝子の発現レベルを少なくとも一遺伝子の参照発現レベルに対して比較することであって、ここで、患者試料中における少なくとも一遺伝子の発現のレベルの参照レベルに対する変化は、ＶＥＧＦアンタゴニストによる治療に応答する可能性のある患者を同定する、比較すること、及び
（ｃ）患者に対して、抗癌療法にはＶＥＧＦアンタゴニストが含まれるとする推奨を提供すること
を含む方法。
【請求項３】
ＶＥＧＦアンタゴニストの少なくとも一用量を受けた患者は、ＶＥＧＦアンタゴニストによる治療に応答するであろうかどうかをモニタリングする方法であって、
（ａ）ＶＥＧＦアンタゴニストの少なくとも一用量の投与の後に患者から得られた生物学的試料中で、以下の遺伝子、ＤＬＬ４、アンジオポエチン２（Ａｎｇｐｔ２）、ＮＯＳ２、第Ｖ因子、第ＶＩＩＩ因子（ＡＨＦ）、ＥＧＦＬ７、ＥＦＮＡ３、ＰＧＦ、ＡＮＧＰＴＬ１、ＳＥＬＰ、Ｃｏｘ２、フィブロネクチン（ＦＮ＿ＥＩＩＩＢ）、ＥＳＭ１、及びストローマ由来増殖因子（ＳＤＦ１）の少なくとも一の発現を検出すること、
（ｂ）患者に対するＶＥＧＦアンタゴニストの投与前に患者から得られた生物学的試料中の少なくとも一遺伝子の発現レベルである、参照発現レベルに対して、少なくとも一遺伝子の発現レベルを比較することであって、ここで、試料中における少なくとも一遺伝子の発現のレベルの参照レベルに対する変化は、ＶＥＧＦアンタゴニストによる治療に応答するであろう患者を同定する、比較すること、及び
（ｃ）患者がＶＥＧＦアンタゴニストによる治療に応答する可能性が増加していることを患者に知らせること
を含む方法。
【請求項４】
患者は、ＶＥＧＦアンタゴニストに対する応答性について試験されている患者の集団の中におり、参照レベルは、患者の集団における少なくとも一遺伝子の発現レベルの中央値である、請求項１又は２に記載の方法。
【請求項５】
患者から得られた生物学的試料中の少なくとも一遺伝子の発現は、ｍＲＮＡを測定することにより検出される、請求項１から３の何れか一項に記載の方法。
【請求項６】
患者から得られた生物学的試料中の少なくとも一遺伝子の発現は、血漿タンパク質レベルを測定することにより検出される、請求項１から３の何れか一項に記載の方法。
【請求項７】
生物学的試料は腫瘍組織である、請求項１から３の何れか一項に記載の方法。
【請求項８】
患者は血管新生障害を有する、請求項１から３の何れか一項に記載の方法。
【請求項９】
患者は、結腸直腸癌、乳癌、肺癌、神経膠芽腫、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される癌を有する、請求項８に記載の方法。
【請求項１０】
患者へＶＥＧＦアンタゴニストを投与することを更に含む、請求項１から３の何れか一項に記載の方法。
【請求項１１】
治療を検討されている患者の集団の特定の患者のための治療を選択するための方法であって、
（ａ）患者に対するＶＥＧＦアンタゴニストの任意の投与前に患者から得られた生物学的試料中で、以下の遺伝子、ＤＬＬ４、アンジオポエチン２（Ａｎｇｐｔ２）、ＮＯＳ２、第Ｖ因子、第ＶＩＩＩ因子（ＡＨＦ）、ＥＧＦＬ７、ＥＦＮＡ３、ＰＧＦ、ＡＮＧＰＴＬ１、ＳＥＬＰ、Ｃｏｘ２、フィブロネクチン（ＦＮ＿ＥＩＩＩＢ）、ＥＳＭ１、及びストローマ由来増殖因子（ＳＤＦ１）の少なくとも一の発現を検出すること、
（ｂ）少なくとも一遺伝子の発現レベルを少なくとも一遺伝子の参照発現レベルに対して比較することであって、ここで、患者試料中における少なくとも一遺伝子の発現のレベルの参照レベルに対する変化は、ＶＥＧＦアンタゴニストによる治療に応答する可能性のある患者を同定する、比較すること、及び
（ｃ）患者がＶＥＧＦアンタゴニストによる治療に応答する可能性があると同定される場合、ＶＥＧＦアンタゴニストを含む治療を選択し、ＶＥＧＦアンタゴニストを含む選択された治療法を患者に推奨するか、又は
（ｄ）患者がＶＥＧＦアンタゴニストによる治療に応答する可能性があると同定されない場合、ＶＥＧＦアンタゴニストを含まない治療を選択し、ＶＥＧＦアンタゴニストを含まない選択された治療法を患者に推奨すること
を含む方法。
【請求項１２】
ＶＥＧＦアンタゴニストの少なくとも一用量を受けた患者のための治療を選択する方法であって、
（ａ）ＶＥＧＦアンタゴニストの投与の後に患者から得られた生物学的試料中で、以下の遺伝子、ＤＬＬ４、アンジオポエチン２（Ａｎｇｐｔ２）、ＮＯＳ２、第Ｖ因子、第ＶＩＩＩ因子（ＡＨＦ）、ＥＧＦＬ７、ＥＦＮＡ３、ＰＧＦ、ＡＮＧＰＴＬ１、ＳＥＬＰ、Ｃｏｘ２、フィブロネクチン（ＦＮ＿ＥＩＩＩＢ）、ＥＳＭ１、及びストローマ由来増殖因子（ＳＤＦ１）の少なくとも一の発現を検出すること、
（ｂ）患者に対するＶＥＧＦアンタゴニストの投与前に患者から得られた生物学的試料中の少なくとも一遺伝子の発現レベルである、参照発現レベルに対して、少なくとも一遺伝子の発現レベルを比較することであって、ここで、患者試料中における少なくとも一遺伝子の発現のレベルの参照レベルに対する変化は、ＶＥＧＦアンタゴニストによる治療に応答する可能性のある患者を同定する、比較すること、
（ｃ）少なくとも一遺伝子の発現レベルの変化がＶＥＧＦアンタゴニストの投与後に得られた試料中で検出される場合、ＶＥＧＦアンタゴニストを含む治療を選択し、ＶＥＧＦアンタゴニストを含む選択された治療を患者に推奨するか、又は
（ｄ）少なくとも一遺伝子の発現レベルの変化がＶＥＧＦアンタゴニストの投与後に得られた試料中で検出されない場合、ＶＥＧＦアンタゴニストを含まない治療を選択し、ＶＥＧＦアンタゴニストを含まない選択された治療を患者に推奨すること
を含む方法。
【請求項１３】
患者は、治療を考慮される患者の集団の中におり、参照レベルは、患者の集団における少なくとも一遺伝子の発現レベルの中央値である、請求項１１に記載の方法。
【請求項１４】
患者試料中における少なくとも一遺伝子の発現のレベルの変化は、参照レベルに対する増加である、請求項１から３、１１及び１２の何れか一項に記載の方法。
【請求項１５】
患者試料中における少なくとも一遺伝子の発現のレベルの変化は、参照レベルに対する減少である、請求項１から３、１１及び１２の何れか一項に記載の方法。
【請求項１６】
患者からの生物学的試料中の前記遺伝子の少なくとも第二の発現を検出することを更に含む、請求項１から３、１１及び１２の何れか一項に記載の方法。
【請求項１７】
患者からの生物学的試料中の前記遺伝子の少なくとも第三の発現を検出することを更に含む、請求項１６に記載の方法。
【請求項１８】
患者からの生物学的試料中の前記遺伝子の少なくとも第四の発現を検出することを更に含む、請求項１７に記載の方法。
【請求項１９】
（ｄ）の治療は、抗腫瘍剤、化学療法剤、成長阻害剤、細胞毒性剤、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される薬剤である、請求項１１又は１２に記載の方法。
【請求項２０】
（ｅ）患者が、ＶＥＧＦアンタゴニストでの治療に応答する可能性があるとして同定される場合、患者にＶＥＧＦアンタゴニストの有効量を投与することを更に含む、請求項１１又は１２に記載の方法。
【請求項２１】
少なくとも第二の薬剤の有効量を投与することを更に含む、請求項２０に記載の方法。
【請求項２２】
第二の薬剤は、抗腫瘍剤、化学療法剤、成長阻害剤、細胞毒性剤、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される、請求項２１に記載の方法。
【請求項２３】
患者における血管新生障害を診断するための方法であって、
（ａ）患者に対するＶＥＧＦアンタゴニストの任意の投与前に患者から得られた試料中で、以下の遺伝子、ＤＬＬ４、アンジオポエチン２（Ａｎｇｐｔ２）、ＮＯＳ２、第Ｖ因子、第ＶＩＩＩ因子（ＡＨＦ）、ＥＧＦＬ７、ＥＦＮＡ３、ＰＧＦ、ＡＮＧＰＴＬ１、ＳＥＬＰ、Ｃｏｘ２、フィブロネクチン（ＦＮ＿ＥＩＩＩＢ）、ＥＳＭ１、及びストローマ由来増殖因子（ＳＤＦ１）の少なくとも一の発現を検出すること、
（ｂ）少なくとも一遺伝子又はバイオマーカーの発現レベルを少なくとも一遺伝子の参照レベルに対して比較することであって、ここで、患者試料中における少なくとも一遺伝子の発現のレベルの参照レベルに対する変化は、血管新生障害を有する患者を同定する、比較すること、及び
（ｃ）患者が血管新生障害を有することを患者に知らせること
を含む方法。
【請求項２４】
血管新生障害を有すると同定された場合、患者にＶＥＧＦアンタゴニストを投与することを更に含む、請求項２３に記載の方法。
【請求項２５】
ＶＥＧＦアンタゴニストが抗ＶＥＧＦ抗体である、請求項１から３、１０、２０及び２４の何れか一項に記載の方法。
【請求項２６】
抗ＶＥＧＦ抗体がベバシズマブである、請求項２５に記載の方法。
【請求項２７】
患者が、ＶＥＧＦアンタゴニストによる治療から利益を得るかどうかを決定するためのキットであって、
（ａ）以下の遺伝子、ＤＬＬ４、アンジオポエチン２（Ａｎｇｐｔ２）、ＮＯＳ２、第Ｖ因子、第ＶＩＩＩ因子（ＡＨＦ）、ＥＧＦＬ７、ＥＦＮＡ３、ＰＧＦ、ＡＮＧＰＴＬ１、ＳＥＬＰ、Ｃｏｘ２、フィブロネクチン（ＦＮ＿ＥＩＩＩＢ）、ＥＳＭ１、及びストローマ由来増殖因子（ＳＤＦ１）の少なくとも一の発現レベルを決定することができるポリペプチド又はポリヌクレオチド、及び
（ｂ）ＤＬＬ４、アンジオポエチン２（Ａｎｇｐｔ２）、ＮＯＳ２、第Ｖ因子、第ＶＩＩＩ因子（ＡＨＦ）、ＥＧＦＬ７、ＥＦＮＡ３、ＰＧＦ、ＡＮＧＰＴＬ１、ＳＥＬＰ、Ｃｏｘ２、フィブロネクチン（ＦＮ＿ＥＩＩＩＢ）、ＥＳＭ１、及びストローマ由来増殖因子（ＳＤＦ１）の少なくとも一の発現レベルを決定するポリペプチド又はポリヌクレオチドの使用のための説明書
を含み、ここで参照レベルに対する少なくとも一遺伝子の発現のレベルの変化は、患者はＶＥＧＦアンタゴニストによる治療から利益を受けることを示す、キット。