【手続補正書】
【提出日】平成27年12月17日(2015.12.17)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
川崎病（KD）を有する疑いがあるかまたはKDを有する危険性がある対象に由来する生物学的サンプル中の血小板由来増殖因子C（PDGFC）の発現レベルを決定する工程を含む、対象においてKDのバイオマーカーを検出するための方法であって、参照レベルと比べて上昇したPDGFC発現によって、対象をKDのバイオマーカーを有すると見なす、方法。
【請求項２】
生物学的サンプルが血清サンプルである、請求項1に記載の方法。
【請求項３】
参照レベルが、KDを有さない対象由来のPDGFC発現レベルを示す、請求項1または2に記載の方法。
【請求項４】
KDを有する疑いがあるかまたはKDを有する危険性がある対象が、以下の症状の1つまたは複数を示す、請求項1〜3のいずれか一項に記載の方法：口腔紅斑；発疹；腫れた唇；ひび割れた唇；手の腫れ；足の腫れ；眼の発赤；ブドウ膜炎；無菌性髄膜炎；リンパ節炎；血管炎；冠動脈瘤；発熱；関節痛；関節の腫れ；または爪床、手掌、足底、および鼠径部上の皮膚剥離。
【請求項５】
KDを有する疑いがあるかまたはKDを有する危険性がある対象がアジア系である、請求項1〜4のいずれか一項に記載の方法。
【請求項６】
(i)サンプル中のPDGFC RNAの発現を決定することによってPDGFCの発現レベルを決定する、
(ii)サンプル中の少なくとも第2の遺伝子の発現レベルを決定する工程をさらに含む、
(iii)サンプル中のPDGFC発現を報告する工程をさらに含む、
(iv)対象がKDのバイオマーカーを有するかどうかを報告する工程をさらに含む、または
(v)上昇していないPDGFC発現レベルによって対象をKDのバイオマーカーを有さないと見なす、
請求項1〜5のいずれか一項に記載の方法。
【請求項７】
(i)PDGFC RNAの発現を決定することが、活性ポリペプチドをコードするPDGFC RNAの発現を決定することを含む、
(ii)PDGFC RNAの発現を決定することが、核酸ハイブリダイゼーションまたは核酸配列決定を含む、
(iii)PDGFC RNAの発現を決定することがRT-PCRを含む、または
(iv)上昇したPDGFC発現が、参照レベルと比べて約3倍〜約50倍大きいPDGFC RNAの発現である、
請求項6(i)に記載の方法。
【請求項８】
(i)第2の遺伝子がコントロール遺伝子である、または
(ii)第2の遺伝子が、LOC641518、C21orf57、UBB、FBXO7、LOC731777、BTF3、C13orf15、SFRS2B、HEMGN、HPS1、IFT52、FAM10A7、IFT52、LOC441714、IMMP2L、TMEM57、IFRD2、LOC646784、PYROXD1、MIR155HG、ZNF138、TCC39B、OR7E156P、FANCD2、XPOT、AZIN1、BLOC152、CDK2、MYL5、HRASLS2、TMCC1、EPSTI1、OASL、CEBPA、C9orf167、FHOD1、ALDH3B1、LRSAM1、SIGLEC7、SLC24A4、GAA、RRBP1、DAB2、HIST2H3C、LGALS9、GPR177、CMTM4、FBXO30、WSB2、PAPSS1、SERPINB2、ACTA2、LOC729417、ABCD1、GNB4、MITF、C1QC、CCDC24、PGM5、LOC729816、およびOLFM4からなる群より選択される、
請求項6(ii)に記載の方法。
【請求項９】
PDGFC発現を報告書において報告する、請求項6(iii)に記載の方法。
【請求項１０】
対象に由来する生物学的サンプルを分析することによって参照レベルと比べて上昇した血小板由来増殖因子C（PDGFC）発現を有すると判定された対象に投与されることを特徴とする、川崎病（KD）を治療するための薬学的組成物であって、参照レベルがKDを有さない対象由来のPDGFC発現レベルを示す、薬学的組成物。
【請求項１１】
生物学的サンプルが血清サンプルである、請求項10に記載の薬学的組成物。
【請求項１２】
(i)組成物がIgGを含む、
(ii)組成物が、アスピリンまたはコルチコステロイドを含む、
(iii)対象が、以下の症状の1つまたは複数を示す：口腔紅斑；発疹；腫れた唇；ひび割れた唇；手の腫れ；足の腫れ；眼の発赤；ブドウ膜炎；無菌性髄膜炎；リンパ節炎；血管炎；冠動脈瘤；発熱；関節痛；関節の腫れ；または爪床、手掌、足底、および鼠径部上の皮膚剥離、
(iv)上昇したPDGFC発現レベルが、上昇したPDGFC RNAの発現レベルである、
(v)対象が、参照レベルと比べて上昇したEPSTI1、OASL、CEBPA、C9orf167、FHOD1、ALDH3B1、LRSAM1、SIGLEC7、SLC24A4、GAA、RRBP1、DAB2、HIST2H3C、LGALS9、GPR177、CMTM4、FBXO30、WSB2、PAPSS1、SERPINB2、ACTA2、LOC729417、ABCD1、GNB4、MITF、C1QC、CCDC24、PGM5、LOC729816、またはOLFM4の発現を有すると判定されている、または
(vi)対象が、参照レベルと比べて減少したLOC641518、C21orf57、UBB、FBXO7、LOC731777、BTF3、C13orf15、SFRS2B、HEMGN、HPS1、IFT52、FAM10A7、IFT52、LOC441714、IMMP2L、TMEM57、IFRD2、LOC646784、PYROXD1、MIR155HG、ZNF138、TCC39B、OR7E156P、FANCD2、XPOT、AZIN1、BLOC152、CDK2、MYL5、HRASLS2、またはTMCC1の発現を有すると判定されている、
請求項10または11に記載の薬学的組成物。
【請求項１３】
(i)上昇したPDGFC RNAの発現が、活性ポリペプチドをコードするPDGFC RNAの上昇した発現である、または
(ii)上昇したPDGFC発現が、参照レベルと比べて約3倍〜約50倍大きいPDGFC RNAの発現である、
請求項12(iv)に記載の薬学的組成物。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００３１
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００３１】
[本発明1001]
川崎病（KD）を有する疑いがあるかまたはKDを有する危険性がある対象に由来する生物学的サンプル中の血小板由来増殖因子C（PDGFC）の発現レベルを決定する工程を含む、対象においてKDのバイオマーカーを検出するための方法であって、参照レベルと比べて上昇したPDGFC発現によって、対象をKDのバイオマーカーを有すると見なす、方法。
[本発明1002]
生物学的サンプルが血清サンプルである、本発明1001の方法。
[本発明1003]
KDを有する疑いがあるかまたはKDを有する危険性がある対象が、以下の症状の1つまたは複数を示す、本発明1001の方法：口腔紅斑；発疹；腫れた唇；ひび割れた唇；手の腫れ；足の腫れ；眼の発赤；ブドウ膜炎；無菌性髄膜炎；リンパ節炎；血管炎；冠動脈瘤；発熱；関節痛；関節の腫れ；または爪床、手掌、足底、および鼠径部上の皮膚剥離。
[本発明1004]
KDを有する疑いがあるかまたはKDを有する危険性がある対象がアジア系である、本発明1001の方法。
[本発明1005]
対象から生物学的サンプルを得る工程をさらに含む、本発明1001の方法。
[本発明1006]
サンプル中のPDGFC RNAの発現を決定することによってPDGFCの発現レベルを決定する、本発明1001の方法。
[本発明1007]
PDGFC RNAの発現を決定することが、活性ポリペプチドをコードするPDGFC RNAの発現を決定することを含む、本発明1006の方法。
[本発明1008]
PDGFC RNAの発現を決定することが、核酸ハイブリダイゼーションまたは核酸配列決定を含む、本発明1006の方法。
[本発明1009]
PDGFC RNAの発現を決定することがRT-PCRを含む、本発明1006の方法。
[本発明1010]
上昇したPDGFC発現が、参照レベルと比べて約3倍〜約50倍大きいPDGFC RNAの発現である、本発明1006の方法。
[本発明1011]
参照レベルが、KDを有さない対象由来のPDGFC発現レベルを示す、本発明1001の方法。
[本発明1012]
サンプル中の少なくとも第2の遺伝子の発現レベルを決定する工程をさらに含む、本発明1001の方法。
[本発明1013]
第2の遺伝子がコントロール遺伝子である、本発明1012の方法。
[本発明1014]
第2の遺伝子が、LOC641518、C21orf57、UBB、FBXO7、LOC731777、BTF3、C13orf15、SFRS2B、HEMGN、HPS1、IFT52、FAM10A7、IFT52、LOC441714、IMMP2L、TMEM57、IFRD2、LOC646784、PYROXD1、MIR155HG、ZNF138、TCC39B、OR7E156P、FANCD2、XPOT、AZIN1、BLOC152、CDK2、MYL5、HRASLS2、TMCC1、EPSTI1、OASL、CEBPA、C9orf167、FHOD1、ALDH3B1、LRSAM1、SIGLEC7、SLC24A4、GAA、RRBP1、DAB2、HIST2H3C、LGALS9、GPR177、CMTM4、FBXO30、WSB2、PAPSS1、SERPINB2、ACTA2、LOC729417、ABCD1、GNB4、MITF、C1QC、CCDC24、PGM5、LOC729816、およびOLFM4からなる群より選択される、本発明1012の方法。
[本発明1015]
サンプル中のPDGFC発現を報告する工程をさらに含む、本発明1001の方法。
[本発明1016]
PDGFC発現を報告書において報告する、本発明1015の方法。
[本発明1017]
サンプル中のPDGFC発現レベルを参照レベルと比較することによって、対象がKDのバイオマーカーを有するかどうかを判定する工程をさらに含む、本発明1001の方法。
[本発明1018]
対象がKDのバイオマーカーを有するかどうかを報告する工程をさらに含む、本発明1017の方法。
[本発明1019]
対象が上昇したPDGFC発現レベルを有さない、本発明1001の方法。
[本発明1020]
（a）対象において血小板由来増殖因子C（PDGFC）の発現を評価する工程；および
（b）対象が参照レベルと比べて上昇したPDGFC発現を示す場合、対象に抗川崎病（KD）療法を施す工程
を含む、KDを有する対象を治療するための方法。
[本発明1021]
抗KD療法がIgGの投与を含む、本発明1020の方法。
[本発明1022]
抗KD療法が、アスピリンの投与、コルチコステロイドの投与、または抗TNFα療法の実施を含む、本発明1020の方法。
[本発明1023]
前記評価する工程の前に、対象に抗KD療法を施した、本発明1020の方法。
[本発明1024]
対象が、以下の症状の1つまたは複数を示す、本発明1020の方法：口腔紅斑；発疹；腫れた唇；ひび割れた唇；手の腫れ；足の腫れ；眼の発赤；ブドウ膜炎；無菌性髄膜炎；リンパ節炎；血管炎；冠動脈瘤；発熱；関節痛；関節の腫れ；または爪床、手掌、足底、および鼠径部上の皮膚剥離。
[本発明1025]
PDGFCの発現がPDGFC RNAの発現である、本発明1020の方法。
[本発明1026]
PDGFC RNAの発現が、活性ポリペプチドをコードするPDGFC RNAの発現である、本発明1025の方法。
[本発明1027]
PDGFCの発現を評価する工程が、PDGFCの発現を測定する工程を含む、本発明1020の方法。
[本発明1028]
上昇したPDGFC発現が、参照レベルと比べて約3倍〜約50倍大きいPDGFC RNAの発現である、本発明1025の方法。
[本発明1029]
参照レベルが、KDを有さない対象由来のPDGFC発現レベルを示す、本発明1020の方法。
[本発明1030]
対象において少なくとも第2の遺伝子の発現レベルを評価する工程をさらに含む、本発明1020の方法。
[本発明1031]
少なくとも第2の遺伝子の発現を評価する工程が、少なくとも第2の遺伝子の発現を測定する工程を含む、本発明1030の方法。
[本発明1032]
第2の遺伝子がコントロール遺伝子である、本発明1030の方法。
[本発明1033]
第2の遺伝子が、LOC641518、C21orf57、UBB、FBXO7、LOC731777、BTF3、C13orf15、SFRS2B、HEMGN、HPS1、IFT52、FAM10A7、IFT52、LOC441714、IMMP2L、TMEM57、IFRD2、LOC646784、PYROXD1、MIR155HG、ZNF138、TCC39B、OR7E156P、FANCD2、XPOT、AZIN1、BLOC152、CDK2、MYL5、HRASLS2、TMCC1、EPSTI1、OASL、CEBPA、C9orf167、FHOD1、ALDH3B1、LRSAM1、SIGLEC7、SLC24A4、GAA、RRBP1、DAB2、HIST2H3C、LGALS9、GPR177、CMTM4、FBXO30、WSB2、PAPSS1、SERPINB2、ACTA2、LOC729417、ABCD1、GNB4、MITF、C1QC、CCDC24、PGM5、LOC729816、およびOLFM4からなる群より選択される、本発明1030の方法。
[本発明1034]
（a）対象に抗川崎病（KD）療法を施す工程；
（b）対象において血小板由来増殖因子C（PDGFC）の発現を評価する工程；および
（c）対象が参照レベルと比べて上昇したPDGFC発現を示す場合、対象にさらなる抗KD療法を施す工程
を含む、KDを有する対象を治療するための方法。
[本発明1035]
参照レベルと比べて上昇した血小板由来増殖因子C（PDGFC）発現を有すると判定された対象に抗川崎病（KD）療法を施す工程を含む、KDを治療するための方法。
[本発明1036]
抗KD療法がIgGの投与を含む、本発明1035の方法。
[本発明1037]
抗KD療法が、アスピリンの投与、コルチコステロイドの投与、または抗TNFα療法の実施を含む、本発明1035の方法。
[本発明1038]
対象が、以下の症状の1つまたは複数を示す、本発明1035の方法：口腔紅斑；発疹；腫れた唇；ひび割れた唇；手の腫れ；足の腫れ；眼の発赤；ブドウ膜炎；無菌性髄膜炎；リンパ節炎；血管炎；冠動脈瘤；発熱；関節痛；関節の腫れ；または爪床、手掌、足底、および鼠径部上の皮膚剥離。
[本発明1039]
上昇したPDGFC発現レベルが、上昇したPDGFC RNAの発現レベルである、本発明1035の方法。
[本発明1040]
上昇したPDGFC RNAの発現が、活性ポリペプチドをコードするPDGFC RNAの上昇した発現である、本発明1039の方法。
[本発明1041]
上昇したPDGFC発現が、参照レベルと比べて約3倍〜約50倍大きいPDGFC RNAの発現である、本発明1039の方法。
[本発明1042]
参照レベルが、KDを有さない対象由来のPDGFC発現レベルを示す、本発明1035の方法。
[本発明1043]
対象が、参照レベルと比べて上昇したEPSTI1、OASL、CEBPA、C9orf167、FHOD1、ALDH3B1、LRSAM1、SIGLEC7、SLC24A4、GAA、RRBP1、DAB2、HIST2H3C、LGALS9、GPR177、CMTM4、FBXO30、WSB2、PAPSS1、SERPINB2、ACTA2、LOC729417、ABCD1、GNB4、MITF、C1QC、CCDC24、PGM5、LOC729816、またはOLFM4の発現を有すると判定される、本発明1035の方法。
[本発明1044]
対象が、参照レベルと比べて減少したLOC641518、C21orf57、UBB、FBXO7、LOC731777、BTF3、C13orf15、SFRS2B、HEMGN、HPS1、IFT52、FAM10A7、IFT52、LOC441714、IMMP2L、TMEM57、IFRD2、LOC646784、PYROXD1、MIR155HG、ZNF138、TCC39B、OR7E156P、FANCD2、XPOT、AZIN1、BLOC152、CDK2、MYL5、HRASLS2、またはTMCC1の発現を有すると判定される、本発明1035の方法。
[本発明1045]
コンピュータによって実行されると、
（a）KDを有する疑いがあるかまたはKDを有する危険性がある対象に由来するサンプル中の血小板由来増殖因子C（PDGFC）の発現レベルに対応する情報を受け取ること；および
（b）参照レベルと比較したPDGFCの相対的な発現レベルを決定することであって、参照レベルと比べて上昇したPDGFC発現によってKDのバイオマーカーの存在が示される、PDGFCの相対的な発現レベルを決定すること
を含むオペレーションをコンピュータに行わせるコンピュータ可読コードを含む、有形のコンピュータ可読媒体。
[本発明1046]
健康な対象由来のサンプル中のPDGFCの参照発現レベルに対応する情報を受け取ることをさらに含む、本発明1045の方法。
[本発明1047]
参照レベルが前記有形のコンピュータ可読媒体中に保存されている、本発明1045の方法。
[本発明1048]
情報を受け取ることが、KDを有する疑いがあるかまたはKDを有する危険性がある対象に由来するサンプル中のPDGFCの発現レベルに対応する情報を有形のデータ保存デバイスから受け取ることを含む、本発明1045の有形のコンピュータ可読媒体。
[本発明1049]
コンピュータによって実行されると、PDGFCの相対的な発現レベルに対応する情報を有形のデータ保存デバイスへ送ることを含む1つまたは複数の追加のオペレーションをコンピュータに行わせるコンピュータ可読コードをさらに含む、本発明1045の有形のコンピュータ可読媒体。
[本発明1050]
情報を受け取ることが、KDを有する疑いがあるかまたはKDを有する危険性がある対象に由来するサンプル中のLOC641518、C21orf57、UBB、FBXO7、LOC731777、BTF3、C13orf15、SFRS2B、HEMGN、HPS1、IFT52、FAM10A7、IFT52、LOC441714、IMMP2L、TMEM57、IFRD2、LOC646784、PYROXD1、MIR155HG、ZNF138、TCC39B、OR7E156P、FANCD2、XPOT、AZIN1、BLOC152、CDK2、MYL5、HRASLS2、TMCC1、EPSTI1、OASL、CEBPA、C9orf167、FHOD1、ALDH3B1、LRSAM1、SIGLEC7、SLC24A4、GAA、RRBP1、DAB2、HIST2H3C、LGALS9、GPR177、CMTM4、FBXO30、WSB2、PAPSS1、SERPINB2、ACTA2、LOC729417、ABCD1、GNB4、MITF、C1QC、CCDC24、PGM5、LOC729816、またはOLFM4のうちの1つの発現レベルに対応する情報を受け取ることをさらに含む、本発明1045の有形のコンピュータ可読媒体。
[本発明1051]
コンピュータ可読コードが、コンピュータによって実行されると、
（c）サンプルについて、該サンプルがKDを有する対象に由来する確率を示す診断スコアを算出すること
をさらに含むオペレーションをコンピュータに行わせる、本発明1045の有形のコンピュータ可読媒体。
本発明の他の目的、特徴、および利点は以下の詳細な説明から明らかとなるであろう。しかし、本発明の精神および範囲内の様々な変更および修飾がこの詳細な説明から当業者に明らかとなるので、詳細な説明および具体例は、本発明の好ましい態様を示していると同時に、例としてのみ提供されていることが理解されるべきである。