【手続補正書】
【提出日】平成28年2月12日(2016.2.12)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
対照の組織または細胞と比較して、セリンヒドロキシメチルトランスフェラーゼ２（ＳＨＭＴ２）を過剰発現すると決定された腫瘍または腫瘍細胞の増殖または生存を阻害するための、グリシン開裂系（ＧＣＳ）阻害剤を含む組成物。
【請求項２】
対照の組織または細胞と比較してセリンヒドロキシメチルトランスフェラーゼ２（ＳＨＭＴ２）を過剰発現すると決定された腫瘍または腫瘍細胞を処置するための、グリシン開裂系（ＧＣＳ）阻害剤を含む組成物。
【請求項３】
前記腫瘍細胞が、脳腫瘍細胞、膀胱腫瘍細胞、乳房腫瘍細胞、頸部腫瘍細胞、結腸直腸腫瘍細胞、胚性腫瘍細胞、胃腫瘍細胞、生殖細胞腫瘍細胞、頭頸部腫瘍細胞、血液系腫瘍細胞、腎臓腫瘍細胞、メラノーマ細胞、中皮腫瘍細胞、卵巣腫瘍細胞、卵黄嚢腫瘍細胞または肉腫細胞である、請求項１または２に記載の前記使用のための組成物。
【請求項４】
前記腫瘍が、脳腫瘍、膀胱腫瘍、乳房腫瘍、頸部腫瘍、結腸直腸腫瘍、胚性腫瘍、胃腫瘍、生殖細胞腫瘍、頭頸部腫瘍、血液系腫瘍、腎臓腫瘍、メラノーマ、中皮腫瘍、卵巣腫瘍、卵黄嚢腫瘍または肉腫である、請求項１または２に記載の前記使用のための組成物。
【請求項５】
前記腫瘍または腫瘍細胞が、多形神経膠芽腫（ＧＢＭ）またはＧＢＭ細胞である、請求項１または２に記載の前記使用のための組成物。
【請求項６】
前記腫瘍または腫瘍細胞が、前記対照の組織または細胞と比較して少なくとも２倍の増加したＳＨＭＴ２発現を有する、請求項１または２に記載の前記使用のための組成物。
【請求項７】
前記腫瘍または腫瘍細胞は、ＳＨＭＴ２が、前記がんにおいて過剰発現される遺伝子の上位１％以内にあるがんである、請求項１または２に記載の前記使用のための組成物。
【請求項８】
前記腫瘍細胞が、腫瘍幹細胞またはヒト腫瘍細胞である、請求項１または２に記載の前記使用のための組成物。
【請求項９】
前記ＧＣＳ阻害剤が、グリシン脱水素酵素（ＧＬＤＣ）阻害剤、グリシン開裂系タンパク質Ｈ（ＧＣＳＨ）阻害剤、アミノメチルトランスフェラーゼ（ＡＭＴ）阻害剤またはジヒドロリポアミド脱水素酵素（ＤＬＤ）阻害剤である、請求項１〜８のいずれか一項に記載の前記使用のための組成物。
【請求項１０】
前記ＧＣＳ阻害剤が、低分子；ＲＮＡｉ剤；あるいはシステアミンまたはその塩、アナログもしくはプロドラッグを含む、請求項１〜９のいずれか一項に記載の前記使用のための組成物。
【請求項１１】
前記腫瘍または腫瘍細胞を、ＳＨＭＴ２を過剰発現すると同定することが、前記腫瘍または腫瘍細胞におけるＳＨＭＴ２ポリペプチドレベルまたはＳＨＭＴ２活性をインビトロで測定することにより決定される、請求項１〜１０のいずれか一項に記載の前記使用のための組成物。
【請求項１２】
ＳＨＭＴ２ポリペプチドレベルを測定することが、免疫組織化学（ＩＨＣ）による、請求項１１に記載の前記使用のための組成物。
【請求項１３】
前記腫瘍または腫瘍細胞を、ＳＨＭＴ２を過剰発現すると同定することが、前記腫瘍または腫瘍細胞におけるＳＨＭＴ２  ｍＲＮＡレベルをインビトロで測定することによって決定される、請求項１〜１０のいずれか一項に記載の前記使用のための組成物。
【請求項１４】
前記腫瘍または腫瘍細胞を、ＳＨＭＴ２を過剰発現すると同定することが、前記腫瘍または腫瘍細胞における前記ＳＨＭＴ２遺伝子の少なくとも一部を含む染色体領域のコピー数をインビトロで測定することにより決定される、請求項１〜１０のいずれか一項に記載の前記使用のための組成物。
【請求項１５】
前記腫瘍または腫瘍細胞を、ＳＨＭＴ２を過剰発現すると同定することが、マイクロアレイに基づくメタ解析によって決定される、請求項１〜１０のいずれか一項に記載の前記使用のための組成物。
【請求項１６】
前記ＳＨＭＴ２レベルを測定することが、前記腫瘍または腫瘍細胞を含む試料について決定される、請求項１１〜１５のいずれか一項に記載の前記使用のための組成物。
【請求項１７】
前記対照が、（ａ）非腫瘍組織もしくは非腫瘍細胞、または（ｂ）ＧＣＳ阻害剤に非感受性の腫瘍もしくは腫瘍細胞である、請求項１〜１６のいずれか一項に記載の前記使用のための組成物。
【請求項１８】
ＳＨＭＴ２の過剰発現を、ＧＣＳ阻害剤に対する腫瘍または腫瘍細胞の感受性の指標とする方法であって、前記方法は：
（ａ）腫瘍または腫瘍細胞におけるセリンヒドロキシメチルトランスフェラーゼ２（ＳＨＭＴ２）の発現レベルを決定すること、および
（ｂ）対照の組織または細胞における発現レベルに対して測定されたレベルを比較すること
を含み、ここで、前記対照の組織または細胞と比較して増加したＳＨＭＴ２の発現は、前記腫瘍または腫瘍細胞を、前記ＧＣＳ阻害剤に対し感受性である見込みが増加していると同定する、方法。
【請求項１９】
ＳＨＭＴ２の過剰発現を、腫瘍を有する被験体が、ＧＣＳ阻害剤での処置に適した候補であるかの指標とする方法であって、前記方法は：
（ａ）前記腫瘍におけるセリンヒドロキシメチルトランスフェラーゼ２（ＳＨＭＴ２）の発現レベルを決定すること、および
（ｂ）対照の組織または細胞における発現レベルに対して測定されたレベルを比較すること
を含み、ここで、前記対照の組織または細胞と比較して増加したＳＨＭＴ２の発現は、前記腫瘍を有する前記被験体を、前記ＧＣＳ阻害剤での処置に適した候補と同定する、方法。
【請求項２０】
ＳＨＭＴ２の前記発現レベルが、前記腫瘍または腫瘍細胞におけるＳＨＭＴ２ポリペプチドレベルまたはＳＨＭＴ２活性をインビトロでを測定することにより決定される、請求項１８または１９に記載の方法。
【請求項２１】
前記ＳＨＭＴ２ポリペプチドレベルを測定することが、免疫組織化学（ＩＨＣ）による、請求項２０に記載の方法。
【請求項２２】
ＳＨＭＴ２の前記発現が、前記腫瘍または腫瘍細胞におけるＳＨＭＴ２  ｍＲＮＡレベルをインビトロで測定することによって決定される、請求項１８または１９に記載の方法。
【請求項２３】
ＳＨＭＴ２の前記増加した発現レベルが、前記対照の組織または細胞と比較して少なくとも２倍またはそれより多くである、請求項１８または１９に記載の方法。
【請求項２４】
ＳＨＭＴ２の前記発現レベルが、マイクロアレイに基づくメタ解析によって決定される、請求項１８または１９に記載の方法。
【請求項２５】
ＳＨＭＴ２レベルを測定することが、前記腫瘍または腫瘍細胞を含む試料について決定される、請求項１８〜２４のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２６】
ＳＨＭＴ２の前記対照レベルが、（ａ）非腫瘍組織もしくは非腫瘍細胞におけるレベル、または（ｂ）前記ＧＬＣ阻害剤に非感受性の腫瘍もしくは腫瘍細胞におけるレベルである、請求項１８〜２５のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２７】
前記腫瘍または腫瘍細胞が、脳腫瘍、膀胱腫瘍、乳房腫瘍、頸部腫瘍、結腸直腸腫瘍、胚性腫瘍、胃腫瘍、生殖細胞腫瘍、頭頸部腫瘍、血液系腫瘍、腎臓腫瘍、メラノーマ、中皮腫瘍、卵巣腫瘍、卵黄嚢腫瘍または肉腫である、請求項１８〜２６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２８】
抗腫瘍剤を同定する方法であって、前記方法は、
腫瘍または腫瘍細胞を候補抗腫瘍被験薬剤とインビトロで接触させることであって、前記腫瘍または腫瘍細胞が、セリンヒドロキシメチルトランスフェラーゼ２（ＳＨＭＴ２）を過剰発現することが決定されていること、および
前記腫瘍または腫瘍細胞の生存、増殖、成長、維持または転移が阻害されるかを決定すること
を含む、方法。
【請求項２９】
前記腫瘍または腫瘍細胞が、対照の組織または細胞と比較して少なくとも２倍にＳＨＭＴ２を過剰発現する、請求項２８に記載の方法。
【請求項３０】
前記被験薬剤がＧＣＳの阻害剤であるかを決定することをさらに含む、請求項２８または２９に記載の方法。
【請求項３１】
前記被験薬剤がＧＬＤＣ、ＧＣＳＨ、ＡＭＴまたはＤＬＤを阻害するかを決定することを含む、請求項３０に記載の方法。
【請求項３２】
前記被験薬剤が、抗体、ＲＮＡｉまたは低分子である、請求項２８〜３１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３３】
前記腫瘍または腫瘍細胞が、脳腫瘍、膀胱腫瘍、乳房腫瘍、頸部腫瘍、結腸直腸腫瘍、胚性腫瘍、胃腫瘍、生殖細胞腫瘍、頭頸部腫瘍、血液系腫瘍、腎臓腫瘍、メラノーマ、中皮腫瘍、卵巣腫瘍、卵黄嚢腫瘍または肉腫である、請求項２８〜３２のいずれか一項に記載の方法。