【手続補正書】
【提出日】平成28年3月7日(2016.3.7)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
組換えキメラタンパク質であって、
哺乳動物スカベンジャーレセプター由来の病原体認識モジュール；および
アンカードメイン
を含む、タンパク質。
【請求項２】
前記病原体認識モジュールと前記アンカードメインとの間にリンカーをさらに含む、請求項１に記載のタンパク質。
【請求項３】
前記リンカーは、約２〜約１５アミノ酸の配列である、請求項２に記載のタンパク質。
【請求項４】
前記リンカーは、少なくとも２つの異なるアミノ酸を含む、請求項２に記載のタンパク質。
【請求項５】
前記少なくとも２つの異なるアミノ酸は、アラニン、ヒスチジン、およびグリシンからなる群より選択される、請求項４に記載のタンパク質。
【請求項６】
アフィニティータグをさらに含む、請求項１に記載のタンパク質。
【請求項７】
前記アフィニティータグは、ヘマグルチニン、ＡｖｉＴａｇ、Ｖ５、Ｍｙｃ、Ｔ７、ＦＬＡＧ、ＨＳＶ、ＶＳＶ−Ｇ、６−Ｈｉｓ、ビオチン、およびＳＴＲＥＰからなる群より選択される、請求項６に記載のタンパク質。
【請求項８】
前記病原体認識モジュールは、Ｃ末端にあり、前記アンカードメインは、哺乳動物スカベンジャーレセプターに由来する、請求項１に記載のタンパク質。
【請求項９】
前記病原体認識モジュールは、哺乳動物クラスＡスカベンジャーレセプターに由来する、請求項８に記載のタンパク質。
【請求項１０】
前記アンカードメインは、免疫グロブリンのＦｃ領域である、請求項１に記載のタンパク質。
【請求項１１】
前記アンカードメインは、前記病原体認識モジュールとは異なる哺乳動物スカベンジャーレセプターに由来する、請求項１に記載のタンパク質。
【請求項１２】
前記アンカードメインは、哺乳動物クラスＡスカベンジャーレセプターに由来するα−ヘリックスコイルドコイルドメインである、請求項１に記載のタンパク質。
【請求項１３】
前記病原体認識モジュールは、ＳＲＣＲドメイン、コラーゲン様ドメインＥ、システインリッチドメイン、Ｃタイプレクチン様ドメイン（ＣＴＬＤ）、リソソーム膜タンパク質（ＬＡＭＰ）様ドメイン、ムチン様ドメイン、もしくはＥＧＦ様ドメインである、請求項８に記載のタンパク質。
【請求項１４】
シグナルペプチドをさらに含む、請求項１に記載のタンパク質。
【請求項１５】
請求項１に記載のタンパク質をコードする、核酸配列。
【請求項１６】
請求項１に記載のタンパク質をコードする核酸配列を含む、ベクター。
【請求項１７】
請求項１に記載のタンパク質をコードする核酸配列を含むベクターを含む、宿主細胞。
【請求項１８】
キメラタンパク質および薬学的に受容可能なキャリアを含む薬学的組成物であって、ここで該キメラタンパク質は、スカベンジャーレセプター由来の病原体認識モジュール；およびアンカードメインを含む、薬学的組成物。
【請求項１９】
固相および該固相に固定化されたキメラタンパク質を含むアフィニティー媒体であって、
ここで該キメラタンパク質は、スカベンジャーレセプター由来の病原体認識モジュール；およびアンカードメインを含み、該アンカードメインは、該固相に結合する、アフィニティー媒体。
【請求項２０】
病原体もしくは病原体由来分子と関連する疾患を処置するための組成物であって、
該組成物は、アフィニティー媒体を含み、
該アフィニティー媒体は、固相および該固相に固定化されたキメラタンパク質を含み、
該キメラタンパク質は、（ｉ）スカベンジャーレセプター由来の病原体認識モジュールおよび（ｉｉ）アンカードメインを含み、
生物学的サンプルが、該アフィニティー媒体と接触させられて、該病原体もしくは病原体由来分子が該アフィニティー媒体に結合させられることを特徴とする、組成物。
【請求項２１】
病原性因子に対する試験アフィニティー媒体の効力を決定するための方法であって、該方法は、
該病原性因子を含む生物学的サンプルと該試験アフィニティー媒体の病原体認識モジュールとを接触させる工程；および
該病原性因子と該病原体認識モジュールとの間の結合の量を検出する工程、
を包含する、方法。
【請求項２２】
前記病原性因子と前記試験アフィニティー媒体の病原体認識モジュールとの間の結合の量と、参照とを比較する工程をさらに包含する、請求項２１に記載の方法。
【請求項２３】
病原体もしくは病原体由来分子と関連する疾患の予防もしくは処置のための医薬であって、該医薬は、局所適用に適したキャリア中にキメラタンパク質を含む、医薬。
【請求項２４】
組換えキメラタンパク質であって、
シグナルペプチド；
少なくとも１つのアフィニティータグ；
リンカー；
哺乳動物スカベンジャーレセプター由来の病原体認識モジュール；および
アンカードメイン
からなる、組換えキメラタンパク質。
【請求項２５】
前記病原体認識モジュールおよび前記アンカードメインは、異なる哺乳動物スカベンジャーレセプターに由来する、請求項２４に記載の組換えキメラタンパク質。
【請求項２６】
結合した病原体もしくは病原体由来分子の存在を、患者が該病原体もしくは該病原体由来分子と関連する疾患を有することの指標とする方法であって、該方法は、
固相および該固相上の固定空間に固定したキメラタンパク質を含むアフィニティー媒体を受容する工程であって、該キメラタンパク質は、（ｉ）スカベンジャーレセプター由来の病原体認識モジュールおよび（ｉｉ）アンカードメインを含む、工程；
該患者から得られた生物学的サンプルと該アフィニティー媒体とを接触させて、任意の病原体もしくは病原体由来分子を該固定空間に結合させる工程；ならびに
該固定空間を、任意の結合した病原体もしくは病原体由来分子の存在について試験する工程、
を包含する、方法。
【請求項２７】
前記試験する工程は、任意の結合した病原体もしくは病原体由来分子を標識プローブとハイブリダイズさせることによって行われる、請求項２６に記載の方法。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００２３
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００２３】
これらおよび他の非限定的な特徴は、以下でより詳細に記載される。
特定の実施形態では、例えば以下が提供される：
（項目１）
組換えキメラタンパク質であって、
哺乳動物スカベンジャーレセプター由来の病原体認識モジュール；および
アンカードメイン
を含む、タンパク質。
（項目２）
前記病原体認識モジュールと前記アンカードメインとの間にリンカーをさらに含む、項目１に記載のタンパク質。
（項目３）
前記リンカーは、約２〜約１５アミノ酸の配列である、項目２に記載のタンパク質。
（項目４）
前記リンカーは、少なくとも２つの異なるアミノ酸を含む、項目２に記載のタンパク質。
（項目５）
前記少なくとも２つの異なるアミノ酸は、アラニン、ヒスチジン、およびグリシンからなる群より選択される、項目４に記載のタンパク質。
（項目６）
アフィニティータグをさらに含む、項目１に記載のタンパク質。
（項目７）
前記アフィニティータグは、ヘマグルチニン、ＡｖｉＴａｇ、Ｖ５、Ｍｙｃ、Ｔ７、ＦＬＡＧ、ＨＳＶ、ＶＳＶ−Ｇ、６−Ｈｉｓ、ビオチン、およびＳＴＲＥＰからなる群より選択される、項目６に記載のタンパク質。
（項目８）
前記病原体認識モジュールは、Ｃ末端にあり、前記アンカードメインは、哺乳動物スカベンジャーレセプターに由来する、項目１に記載のタンパク質。
（項目９）
前記病原体認識モジュールは、哺乳動物クラスＡスカベンジャーレセプターに由来する、項目８に記載のタンパク質。
（項目１０）
前記アンカードメインは、免疫グロブリンのＦｃ領域である、項目１に記載のタンパク質。
（項目１１）
前記アンカードメインは、前記病原体認識モジュールとは異なる哺乳動物スカベンジャーレセプターに由来する、項目１に記載のタンパク質。
（項目１２）
前記アンカードメインは、哺乳動物クラスＡスカベンジャーレセプターに由来するα−ヘリックスコイルドコイルドメインである、項目１に記載のタンパク質。
（項目１３）
前記病原体認識モジュールは、ＳＲＣＲドメイン、コラーゲン様ドメインＥ、システインリッチドメイン、Ｃタイプレクチン様ドメイン（ＣＴＬＤ）、リソソーム膜タンパク質（ＬＡＭＰ）様ドメイン、ムチン様ドメイン、もしくはＥＧＦ様ドメインである、項目８に記載のタンパク質。
（項目１４）
シグナルペプチドをさらに含む、項目１に記載のタンパク質。
（項目１５）
項目１に記載のタンパク質をコードする、核酸配列。
（項目１６）
項目１に記載のタンパク質をコードする核酸配列を含む、ベクター。
（項目１７）
項目１に記載のタンパク質をコードする核酸配列を含むベクターを含む、宿主細胞。
（項目１８）
キメラタンパク質および薬学的に受容可能なキャリアを含む薬学的組成物であって、ここで該キメラタンパク質は、スカベンジャーレセプター由来の病原体認識モジュール；およびアンカードメインを含む、薬学的組成物。
（項目１９）
固相および該固相に固定化されたキメラタンパク質を含むアフィニティー媒体であって、
ここで該キメラタンパク質は、スカベンジャーレセプター由来の病原体認識モジュール；およびアンカードメインを含み、該アンカードメインは、該固相に結合する、アフィニティー媒体。
（項目２０）
病原体もしくは病原体由来分子と関連する疾患を処置するための方法であって、該方法は、
固相および該固相に固定化されたキメラタンパク質を含むアフィニティー媒体を受容する工程であって、該キメラタンパク質は、（ｉ）スカベンジャーレセプター由来の病原体認識モジュールおよび（ｉｉ）アンカードメインを含む、工程と；
生物学的サンプルと該アフィニティー媒体とを接触させて、該病原体もしくは病原体由来分子を該アフィニティー媒体に結合させる工程、
とを包含する、方法。
（項目２１）
病原性因子に対する試験アフィニティー媒体の効力を決定するための方法であって、該方法は、
該病原性因子を含む生物学的サンプルを受容する工程；
該生物学的サンプルと該試験アフィニティー媒体の病原体認識モジュールとを接触させる工程；および
該病原性因子と該病原体認識モジュールとの間の結合の量を検出する工程、
を包含する、方法。
（項目２２）
前記病原性因子と前記試験アフィニティー媒体の病原体認識モジュールとの間の結合の量と、参照とを比較する工程をさらに包含する、項目２１に記載の方法。
（項目２３）
病原体もしくは病原体由来分子と関連する疾患の予防もしくは処置のための医薬であって、該医薬は、局所適用に適したキャリア中にキメラタンパク質を含む、医薬。
（項目２４）
組換えキメラタンパク質であって、
シグナルペプチド；
少なくとも１つのアフィニティータグ；
リンカー；
哺乳動物スカベンジャーレセプター由来の病原体認識モジュール；および
アンカードメイン
からなる、組換えキメラタンパク質。
（項目２５）
前記病原体認識モジュールおよび前記アンカードメインは、異なる哺乳動物スカベンジャーレセプターに由来する、項目２４に記載の組換えキメラタンパク質。
（項目２６）
患者が病原体もしくは病原体由来分子と関連する疾患を有するかどうかを診断するための方法であって、該方法は、
固相および該固相上の固定空間に固定したキメラタンパク質を含むアフィニティー媒体を受容する工程であって、該キメラタンパク質は、（ｉ）スカベンジャーレセプター由来の病原体認識モジュールおよび（ｉｉ）アンカードメインを含む、工程；
該患者から得られた生物学的サンプルを受容する工程；
該生物学的サンプルと該アフィニティー媒体とを接触させて、任意の病原体もしくは病原体由来分子を該固定空間に結合させる工程；ならびに
該固定空間を、任意の結合した病原体もしくは病原体由来分子の存在について試験する工程、
を包含する、方法。
（項目２７）
前記試験する工程は、任意の結合した病原体もしくは病原体由来分子を標識プローブとハイブリダイズさせることによって行われる、項目２６に記載の方法。