【手続補正書】
【提出日】平成28年1月5日(2016.1.5)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
抗血管形成治療薬に対する対象の応答性を予測する方法であって、
表２Ａにおける２５個のバイオマーカーまたは表２Ｂにおける４５個のバイオマーカーの発現レベルを、前記対象から得た癌組織の検査試料において測定して試料発現スコアを決定すること、
前記試料発現スコアを閾値発現スコアと比較すること、および
前記試料発現スコアが前記閾値発現スコア以上であるかまたは下回るかに基づいて、前記対象を抗血管形成治療薬に対してそれぞれ応答性または非応答性であると分類すること
を含む前記方法。
【請求項２】
前記癌が卵巣癌，神経膠芽腫または乳癌である、請求項１に記載の方法。
【請求項３】
前記の試料発現値が、各バイオマーカーの発現レベルを測定し、対応するウェイトによって前記発現レベルを乗算することにより決定され、各バイオマーカーの前記ウェイトは対応する表２Ａおよび２Ｂに記載されたものである、請求項１または２に記載の方法。
【請求項４】
測定されるバイオマーカーは表２Ａに記載される２５個の遺伝子であり、
前記試料発現スコアは、前記２５個のバイオマーカーの各々の発現レベルを測定し、対応するウェイトによって前記発現レベルを乗算することにより決定され、各バイオマーカーの前記ウェイトは表２Ａに記載されたものである、
請求項１または２に記載の方法。
【請求項５】
測定されるバイオマーカーは表２Ｂに記載される４５個の遺伝子であり、
前記試料発現スコアは、前記４５個のバイオマーカーの各々の発現レベルを測定し、対応するウェイトによって前記発現レベルを乗算することにより決定され、各バイオマーカーの前記ウェイトは表２Ｂに記載されたものである、
請求項１または２に記載の方法。
【請求項６】
前記抗血管形成治療薬が、ＶＥＧＦ経路標的化治療薬、アンジオポエチン‐ＴＩＥ２経路阻害剤、内在性血管形成阻害剤、または免疫調節剤である、請求項１、２、４、および５のいずれか１項に記載の方法。
【請求項７】
前記ＶＥＧＦ経路標的化治療薬は、ベバシズマブ（アバスチン）、アフィバーセプト（Ａｆｉｂｅｒｃｅｐｔ）（ＶＥＧＦトラップ）、ＩＭＣ−１１２１Ｂ（ラムシルマブ）、イマチニブ（グリベック）、ソラフェニブ（ネクサバール）、ゲフィチニブ（イレッサ）、スニチニブ（スーテント）、エルロチニブ、チボジニブ（Ｔｉｖｏｚｉｎｉｂ）、セディラニブ（レセンチン（Ｒｅｃｅｎｔｉｎ））、パゾパニブ（ヴォトリエント）、ＢＩＢＦ１１２０（バルガテフ（Ｖａｒｇａｔｅｆ））、ドビチニブ（Ｄｏｖｉｔｉｎｉｂ）、セマクサニブ（スーゲン（Ｓｕｇｅｎ））、アキシチニブ（ＡＧ０１３７３６）、バンデタニブ（ザクチマ（Ｚａｃｔｉｍａ））、ニロチニブ（タシグナ（Ｔａｓｉｇｎａ））、ダサチニブ（スプリセル）、バタラニブ、モテサニブ、ＡＢＴ−８６９、ＴＫＩ−２５８、およびそれらの組合せから選択される、請求項６に記載の方法。
【請求項８】
前記アンジオポエチン‐ＴＩＥ２経路阻害剤は、ＡＭＧ−３８６、ＰＦ−４８５６８８４ＣＶＸ−０６０、ＣＥＰ−１１９８１、ＣＥ−２４５６７７、ＭＥＤＩ−３６１７、ＣＶＸ−２４１、トラスツズマブ（ハーセプチン）またはそれらの組合せから選択される、請求項６に記載の方法。
【請求項９】
前記内在性血管形成阻害剤は、トンボスポンジン（Ｔｈｏｍｂｏｓｐｏｎｄｉｎ）、エンドスタチン、タムスタチン、カンスタチン（Ｃａｎｓｔａｔｉｎ）、アレスチン、アンギオスタチン、バソスタチン、インターフェロンαまたはそれらの組合せから選択される、請求項６に記載の方法。
【請求項１０】
前記免疫調節剤は、サリドマイド、レナリドマイドおよびそれらの組合せから選択される、請求項６に記載の方法。
【請求項１１】
前記予測は、標準治療および／または抗血管形成治療薬を用いた治療に関してなされ、前記抗血管形成治療薬は、アジュバント療法またはネオアジュバント療法において使用される、請求項１〜１０のいずれか１項に記載の方法。
【請求項１２】
前記癌は卵巣癌であって前記対象は先立って標準プラチナタキサン系細胞傷害性化学療法による処置を受けているか、または、抗血管形成治療薬がアジュバント療法もしくはネオアジュバント療法において使用される、請求項１〜１１のいずれか１項に記載の方法。
【請求項１３】
癌を有する対象の予後を決定する方法であって、
表２Ａにおける２５個のバイオマーカーまたは表２Ｂにおける４５個のバイオマーカーの発現レベルを、前記対象から得た癌組織の検査試料において測定して試料発現スコアを決定すること、
前記試料発現スコアを閾値発現スコアと比較すること、および
前記試料発現スコアが前記閾値発現スコア以上であるかまたは下回るかに基づいて、前記対象をそれぞれ不良または良好な予後を有するものであると分類すること、を含む方法。
【請求項１４】
前記癌が卵巣癌，神経膠芽腫または乳癌である、請求項１３に記載の方法。
【請求項１５】
前記試料発現値が、各バイオマーカーの発現レベルを測定し、対応するウェイトによって前記発現レベルを乗算することにより決定され、各バイオマーカーの各ウェイトは、対応する表２Ａおよび２Ｂに記載されたものである、請求項１３または１４に記載の方法。
【請求項１６】
測定される前記バイオマーカーが、表２Ａにおける２５個の遺伝子であり、前記試料発現値は、前記２５個のバイオマーカーの各々の発現レベルを測定し、対応するウェイトによって前記発現レベルを乗算することにより決定され、各バイオマーカーの前記ウェイトは表２Ａに示されたものである、請求項１３または１４に記載の方法。
【請求項１７】
測定される前記バイオマーカーが、表２Ｂにおける４５個の遺伝子であり、前記試料発現値は、前記４５個のバイオマーカーの各々の発現レベルを測定し、対応するウェイトによって前記発現レベルを乗算することにより決定され、各バイオマーカーの前記ウェイトは表２Ｂに示されたものである、請求項１３または１４に記載の方法。
【請求項１８】
前記対象は標準治療の化学療法による処置を受けた対象である、請求項１３〜１７のいずれか１項に記載の方法。
【請求項１９】
前記対象は、先立って癌の外科的切除を受けた対象である、請求項１３〜１７のいずれか１項に記載の方法。
【請求項２０】
前記癌は神経膠芽腫である、請求項１３〜１９のいずれか１項に記載の方法。
【請求項２１】
生存率が予後の測定値とされる、請求項１３〜２０のいずれか１項に記載の方法。
【請求項２２】
標準治療の癌療法に対する対象の応答性を予測する方法であって、
表２Ａにおける２５個のバイオマーカーまたは表２Ｂにおける４５個のバイオマーカーの発現レベルを、前記対象から得た癌組織の検査試料において測定して試料発現スコアを決定すること、
前記試料発現スコアを閾値発現スコアと比較すること、および
前記試料発現スコアが前記閾値発現スコア以上であるかまたは下回るかに基づいて、前記対象を標準治療の癌療法に対してそれぞれ応答性または非応答性であると分類すること
を含む前記方法。
【請求項２３】
前記癌が卵巣癌，神経膠芽腫または乳癌である、請求項２２に記載の方法。
【請求項２４】
前記の試料発現値が、各バイオマーカーの発現レベルを測定し、対応するウェイトによって前記発現レベルを乗算することにより決定され、各バイオマーカーの前記ウェイトは対応する表２Ａおよび２Ｂに記載されたものである、請求項２２または２３に記載の方法。
【請求項２５】
測定されるバイオマーカーは表２Ａに記載される２５個の遺伝子であり、
前記試料発現値は、前記２５個のバイオマーカーの各々の発現レベルを測定し、対応するウェイトによって前記発現レベルを乗算することにより決定され、各バイオマーカーの前記ウェイトは表２Ａに記載されたものである、
請求項２２〜２４のいずれか１項に記載の方法。
【請求項２６】
測定されるバイオマーカーは表２Ｂに記載される４５個の遺伝子であり、
前記試料発現値は、前記４５個のバイオマーカーの各々の発現レベルを測定し、対応するウェイトによって前記発現レベルを乗算することにより決定され、各バイオマーカーの前記ウェイトは表２Ｂに記載されたものである
請求項２２〜２４のいずれか１項に記載の方法。
【請求項２７】
前記癌は卵巣癌であって前記標準治療は標準プラチナタキサン系細胞傷害性化学療法である、請求項２２〜２６のいずれか１項に記載の方法。