【手続補正書】
【提出日】平成28年7月14日(2016.7.14)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
Ｓａｌｍｏｎｅｌｌａ  ｔｙｐｈｉ  Ｔｙ２１ａ染色体に挿入されたＳｈｉｇｅｌｌａ  ｓｏｎｎｅｉのＯ抗原生合成遺伝子領域を含むＳａｌｍｏｎｅｌｌａ  ｔｙｐｈｉ  Ｔｙ２１ａであって、
ａ）同種のＳａｌｍｏｎｅｌｌａ  ｔｙｐｈｉのＯ抗原と共に又はなしで異種のＳｈｉｇｅｌｌａ  ｓｏｎｎｅｉの１型Ｏ抗原が安定して発現され、
ｂ）毒性Ｓｈｉｇｅｌｌａ  ｓｏｎｎｅｉの攻撃感染に対して免疫防御が誘発され、
ｃ）毒性Ｓａｌｍｏｎｅｌｌａ  ｔｙｐｈｉの攻撃感染に対して免疫防御が誘発される、
前記Ｓａｌｍｏｎｅｌｌａ  ｔｙｐｈｉ  Ｔｙ２１ａ。
【請求項２】
Ｓａｌｍｏｎｅｌｌａ  ｔｙｐｈｉ  Ｔｙ２１ａ染色体に挿入されたＳｈｉｇｅｌｌａ  ｓｏｎｎｅｉのＯ抗原生合成遺伝子領域を含むＳａｌｍｏｎｅｌｌａ  ｔｙｐｈｉ  Ｔｙ２１ａであって、
ａ）同種のＳａｌｍｏｎｅｌｌａ  ｔｙｐｈｉのＯ抗原と共に異種のＳｈｉｇｅｌｌａ  ｓｏｎｎｅｉの１型Ｏ抗原が安定して発現され、
ｂ）毒性Ｓｈｉｇｅｌｌａ  ｓｏｎｎｅｉの攻撃感染に対して免疫防御が誘発され、
ｃ）毒性Ｓａｌｍｏｎｅｌｌａ  ｔｙｐｈｉの攻撃感染に対して免疫防御が誘発される、
前記Ｓａｌｍｏｎｅｌｌａ  ｔｙｐｈｉ  Ｔｙ２１ａ。
【請求項３】
該領域が、
ａ）配列番号２に示されたＤＮＡ配列、
ｂ）配列番号２に示されたＤＮＡ配列と少なくとも約９０％の配列同一性を有するＤＮＡ配列、及び
ｃ）配列番号２に示されたＤＮＡ配列の機能的変異体であるＤＮＡ配列
からなる群から選択されるＤＮＡ配列でコードされる、請求項１に記載のＴｙ２１ａ。
【請求項４】
Ｓｈｉｇｅｌｌａ種（Ｓｈｉｇｅｌｌａ  ｄｙｓｅｎｔｅｒｉａｅ、Ｓｈｉｇｅｌｌａ  ｆｌｅｘｎｅｒｉ及びＳｈｉｇｅｌｌａ  ｂｏｙｄｉｉ）、Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉセロタイプ、Ｓａｌｍｏｎｅｌｌａ  ｅｎｔｅｒｉｃａ血清型、Ｖｉｂｒｉｏ  ｃｈｏｌｅｒａｅセロタイプ、Ｅｎｔｅｒｏｂａｃｔｅｒ種、Ｙｅｒｓｉｎｉａ種及びＰｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ種からなる群から選択される細菌株由来のＯ抗原生合成遺伝子領域をさらに含む、請求項１に記載のＴｙ２１ａ。
【請求項５】
Ｓａｌｍｏｎｅｌｌａ  ｔｙｐｈｉ  Ｔｙ２１ａ染色体に挿入されたＳｈｉｇｅｌｌａ  ｄｙｓｅｎｔｅｒｉａｅ１のＯ抗原生合成遺伝子領域を含むＳａｌｍｏｎｅｌｌａ  ｔｙｐｈｉ  Ｔｙ２１ａであって、
ａ）同種のＳａｌｍｏｎｅｌｌａ  ｔｙｐｈｉのＯ抗原と共に又はなしで異種のＳｈｉｇｅｌｌａ  ｄｙｓｅｎｔｅｒｉａｅセロタイプ１のＯ抗原が安定して発現され、
ｂ）毒性Ｓｈｉｇｅｌｌａ  ｄｙｓｅｎｔｅｒｉａｅの攻撃感染に対して免疫防御が誘発され、
ｃ）毒性Ｓａｌｍｏｎｅｌｌａ  Ｔｙｐｈｉの攻撃感染に対して免疫防御が誘発される、
前記Ｓａｌｍｏｎｅｌｌａ  ｔｙｐｈｉ  Ｔｙ２１ａ。
【請求項６】
Ｓａｌｍｏｎｅｌｌａ  ｔｙｐｈｉ  Ｔｙ２１ａ染色体に挿入されたＳｈｉｇｅｌｌａ  ｄｙｓｅｎｔｅｒｉａｅ１のＯ抗原生合成遺伝子領域を含むＳａｌｍｏｎｅｌｌａ  ｔｙｐｈｉ  Ｔｙ２１ａであって、
ａ）同種のＳａｌｍｏｎｅｌｌａ  ｔｙｐｈｉのＯ抗原と共に異種のＳｈｉｇｅｌｌａ  ｄｙｓｅｎｔｅｒｉａｅセロタイプ１のＯ抗原が安定して発現され、
ｂ）毒性Ｓｈｉｇｅｌｌａ  ｄｙｓｅｎｔｅｒｉａｅの攻撃感染に対して免疫防御が誘発され、
ｃ）毒性Ｓａｌｍｏｎｅｌｌａ  Ｔｙｐｈｉの攻撃感染に対して免疫防御が誘発される、
前記Ｓａｌｍｏｎｅｌｌａ  ｔｙｐｈｉ  Ｔｙ２１ａ。
【請求項７】
該領域が、
ａ）配列番号３３に示されたＤＮＡ配列、
ｂ）配列番号３３に示されたＤＮＡ配列と少なくとも約９０％の配列同一性を有するＤＮＡ配列、及び
ｃ）配列番号３３に示されたＤＮＡ配列の機能的変異体であるＤＮＡ配列
からなる群から選択されるＤＮＡ配列でコードされる、請求項５に記載のＴｙ２１ａ。
【請求項８】
Ｓｈｉｇｅｌｌａ種（Ｓｈｉｇｅｌｌａ  ｓｏｎｎｅｉ、Ｓｈｉｇｅｌｌａ  ｆｌｅｘｎｅｒｉ及びＳｈｉｇｅｌｌａ  ｂｏｙｄｉｉ）、Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉセロタイプ、Ｓａｌｍｏｎｅｌｌａ  ｅｎｔｅｒｉｃａ血清型、Ｖｉｂｒｉｏ  ｃｈｏｌｅｒａｅセロタイプ、Ｅｎｔｅｒｏｂａｃｔｅｒ種、Ｙｅｒｓｉｎｉａ種及びＰｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ種からなる群から選択される細菌株由来のＯ抗原生合成遺伝子領域をさらに含む、請求項５に記載のＴｙ２１ａ。
【請求項９】
ｉ）配列番号１に示されたＤＮＡ配列、又はｉｉ）配列番号１に示されたＤＮＡ配列と少なくとも約９０％の配列同一性を有するＤＮＡ配列を有する、プラスミド構築物。
【請求項１０】
Ｓｈｉｇｅｌｌａ  ｓｏｎｎｅｉのＯ抗原生合成遺伝子領域をさらに含む、請求項９に記載のプラスミド構築物。
【請求項１１】
Ｓｈｉｇｅｌｌａ  ｄｙｓｅｎｔｅｒｉａｅ１のＯ抗原生合成遺伝子領域をさらに含む、請求項９に記載のプラスミド構築物。
【請求項１２】
大きな抗原性遺伝子領域を細菌の染色体中に組換え操作する方法であって、
ｉ）以下：
ｉａ）５’及び３’がそれぞれＦＲＴ部位に隣接する遺伝的選択マーカー、
ｉｂ）３’ＦＲＴ部位の下流のマルチクローニング部位、及び
ｉｃ）２つのうちの１つが５’ＦＲＴ部位の上流に位置し、２つのうちの１つがマルチクローニング部位の下流に位置する、２つの染色体相同性部位
を含むベクターに該領域をクローニングするステップ、
ｉｉ）λｒｅｄ組換えを使用して、該領域を細菌の染色体に組み込むステップ、
ｉｉｉ）遺伝的選択マーカーについて選択するステップ、並びに
ｉｖ）選択マーカーを除去するステップ
を含み、
このようにして該領域を染色体中に組換え操作する、前記方法。
【請求項１３】
抗原性遺伝子領域が約５から約２０ｋｂの長さである、請求項１２に記載の方法。
【請求項１４】
ベクターが、プラスミド、ファージ、ファスミド及びコスミド構築物からなる群から選択される、請求項１２に記載の方法。
【請求項１５】
プラスミド構築物が請求項９に記載の構築物である、請求項１４に記載の方法。
【請求項１６】
細菌の染色体がＳａｌｍｏｎｅｌｌａ  ｔｙｐｈｉ  Ｔｙ２１ａである、請求項１２に記載の方法。
【請求項１７】
遺伝的選択マーカーが抗生物質耐性マーカーである、請求項１２に記載の方法。
【請求項１８】
抗生物質耐性マーカーがカナマイシンである、請求項１７に記載の方法。
【請求項１９】
抗原性領域がＳｈｉｇｅｌｌａ  ｓｏｎｎｅｉのＯ抗原生合成遺伝子領域である、請求項１２に記載の方法。
【請求項２０】
抗原性領域がＳｈｉｇｅｌｌａ  ｄｙｓｅｎｔｅｒｉａｅ１のＯ抗原生合成遺伝子領域である、請求項１２に記載の方法。
【請求項２１】
抗原性領域がＳｈｉｇｅｌｌａ  ｆｌｅｘｎｅｒｉ２ａのＯ抗原生合成遺伝子領域である、請求項１２に記載の方法。
【請求項２２】
抗原性領域がＳｈｉｇｅｌｌａ  ｆｌｅｘｎｅｒｉ３ａのＯ抗原生合成遺伝子領域である、請求項１２に記載の方法。
【請求項２３】
該領域が、ステップｉｉの前に、約５００から約１０００ｂｐの細菌の染色体相同性領域同士の間に操作して入れられる、請求項１２に記載の方法。
【請求項２４】
カナマイシン耐性遺伝子がｐＣＰ２０での形質転換の後に誘導される組換えを介して除去される、請求項１８に記載の方法。
【請求項２５】
Ｓａｌｍｏｎｅｌｌａ  ｔｙｐｈｉ  Ｔｙ２１ａ染色体に挿入されたＳｈｉｇｅｌｌａ  ｆｌｅｘｎｅｒｉ２ａのＯ抗原生合成遺伝子領域を含むＳａｌｍｏｎｅｌｌａ  ｔｙｐｈｉ  Ｔｙ２１ａであって、
ａ）同種のＳａｌｍｏｎｅｌｌａ  ｔｙｐｈｉのＯ抗原と共に又はなしで異種のＳｈｉｇｅｌｌａ  ｆｌｅｘｎｅｒｉ２ａのＯ抗原が安定して発現され、
ｂ）毒性Ｓｈｉｇｅｌｌａ  ｆｌｅｘｎｅｒｉ２ａの攻撃感染に対して免疫防御が誘発され、
ｃ）毒性Ｓａｌｍｏｎｅｌｌａ  ｔｙｐｈｉの攻撃感染に対して免疫防御が誘発される、
前記Ｓａｌｍｏｎｅｌｌａ  ｔｙｐｈｉ  Ｔｙ２１ａ。
【請求項２６】
Ｓａｌｍｏｎｅｌｌａ  ｔｙｐｈｉ  Ｔｙ２１ａ染色体に挿入されたＳｈｉｇｅｌｌａ  ｆｌｅｘｎｅｒｉ２ａのＯ抗原生合成遺伝子領域を含むＳａｌｍｏｎｅｌｌａ  ｔｙｐｈｉ  Ｔｙ２１ａであって、
ａ）同種のＳａｌｍｏｎｅｌｌａ  ｔｙｐｈｉのＯ抗原と共に異種のＳｈｉｇｅｌｌａ  ｆｌｅｘｎｅｒｉ２ａのＯ抗原が安定して発現され、
ｂ）毒性Ｓｈｉｇｅｌｌａ  ｆｌｅｘｎｅｒｉ２ａの攻撃感染に対して免疫防御が誘発され、
ｃ）毒性Ｓａｌｍｏｎｅｌｌａ  ｔｙｐｈｉの攻撃感染に対して免疫防御が誘発される、
前記Ｓａｌｍｏｎｅｌｌａ  ｔｙｐｈｉ  Ｔｙ２１ａ。
【請求項２７】
Ｓａｌｍｏｎｅｌｌａ  ｔｙｐｈｉ  Ｔｙ２１ａ染色体に挿入されたＳｈｉｇｅｌｌａ  ｆｌｅｘｎｅｒｉ３ａのＯ抗原生合成遺伝子領域を含むＳａｌｍｏｎｅｌｌａ  ｔｙｐｈｉ  Ｔｙ２１ａであって、
ａ）同種のＳａｌｍｏｎｅｌｌａ  ｔｙｐｈｉのＯ抗原と共に又はなしで異種のＳｈｉｇｅｌｌａ  ｆｌｅｘｎｅｒｉ３ａのＯ抗原が安定して発現され、
ｂ）毒性Ｓｈｉｇｅｌｌａ  ｆｌｅｘｎｅｒｉ３ａの攻撃感染に対して免疫防御が誘発され、
ｃ）毒性Ｓａｌｍｏｎｅｌｌａ  ｔｙｐｈｉの攻撃感染に対して免疫防御が誘発される、
Ｓａｌｍｏｎｅｌｌａ  ｔｙｐｈｉ  Ｔｙ２１ａ。
【請求項２８】
Ｓａｌｍｏｎｅｌｌａ  ｔｙｐｈｉ  Ｔｙ２１ａ染色体に挿入されたＳｈｉｇｅｌｌａ  ｆｌｅｘｎｅｒｉ３ａのＯ抗原生合成遺伝子領域を含むＳａｌｍｏｎｅｌｌａ  ｔｙｐｈｉ  Ｔｙ２１ａであって、
ａ）同種のＳａｌｍｏｎｅｌｌａ  ｔｙｐｈｉのＯ抗原と共に異種のＳｈｉｇｅｌｌａ  ｆｌｅｘｎｅｒｉ３ａのＯ抗原が安定して発現され、
ｂ）毒性Ｓｈｉｇｅｌｌａ  ｆｌｅｘｎｅｒｉ３ａの攻撃感染に対して免疫防御が誘発され、
ｃ）毒性Ｓａｌｍｏｎｅｌｌａ  ｔｙｐｈｉの攻撃感染に対して免疫防御が誘発される、
Ｓａｌｍｏｎｅｌｌａ  ｔｙｐｈｉ  Ｔｙ２１ａ。
【請求項２９】
請求項１〜８及び２５〜２８のいずれか一項に記載のＳａｌｍｏｎｅｌｌａ  ｔｙｐｈｉ  Ｔｙ２１ａを生理学的に許容可能な担体と組み合わせて含む、組成物。
【請求項３０】
請求項１〜８及び２５〜２８のいずれか一項に記載のＳａｌｍｏｎｅｌｌａ  ｔｙｐｈｉ  Ｔｙ２１ａを生理学的に許容可能な担体と組み合わせて含むワクチン。
【請求項３１】
少なくとも１つの細菌性感染を予防又は治療するための医薬組成物であって、請求項１〜８及び２５〜２８のいずれか一項に記載のＳａｌｍｏｎｅｌｌａ  ｔｙｐｈｉ  Ｔｙ２１ａを含む、前記医薬組成物。
【請求項３２】
遺伝子領域が部分的に又は完全に化学合成される、請求項１〜８及び２５〜２８のいずれか一項に記載のＳａｌｍｏｎｅｌｌａ  ｔｙｐｈｉ  Ｔｙ２１ａ。
【請求項３３】
ＤＮＡ配列が部分的に又は完全に化学合成される、請求項９に記載のプラスミド構築物。
【請求項３４】
タンパク質−ＬＰＳコンジュゲート生成物を化学的に製造するために設計されている細菌株での、Ｏ抗原生合成遺伝子領域の使用。
【請求項３５】
全細胞細菌ワクチンにおいて使用するための、請求項１２〜２４のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３６】
弱毒化された生きたＳａｌｍｏｎｅｌｌａ株、Ｓｈｉｇｅｌｌａ株、Ｌｉｓｔｅｒｉａ株、Ｙｅｒｓｉｎｉａ株、Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉ株、Ｅｎｔｅｒｏｂａｃｔｅｒｉａｃｅａｅ株、原生動物株、又は別のベクター化生ワクチンにおいて使用するための、請求項１２〜２４のいずれか一項に記載の方法。