【手続補正書】
【提出日】平成27年11月30日(2015.11.30)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
ＥｒｂＢ３核酸配列中のＥｒｂＢ３変異に特異的に結合することができる試薬を含む、ＥｒｂＢ３消化管癌検出薬。
【請求項２】
前記ＥｒｂＢ３核酸配列が、配列番号３または１を含む、請求項１に記載の癌検出薬。
【請求項３】
前記試薬が、式
2015500638.tif 000001
のポリヌクレオチドを含み、式中、
Ｘは任意の核酸であり、ａは約０〜約２５０であり、
ＹはＥｒｂＢ３変異コドンであり、
Ｚは任意の核酸であり、ｂは約０〜約２５０である、請求項１に記載の癌検出薬。
【請求項４】
前記変異コドンが、（ｉ）配列番号２の１０４、８０９、２３２、２６２、２８４、３２５、８４６、９２８、６０、１１１、１３５、２９５、４０６、４５３、４９８、１０８９、および１１６４からなる群から選択される位置のアミノ酸、または（ｉｉ）１９３位の終止コドンをコードする、請求項３に記載の癌検出薬。
【請求項５】
対象から得られる生体試料においてＥｒｂＢ３をコードする核酸配列中の変異を検出することを含む、前記対象におけるＥｒｂＢ３消化管癌の存在を決定する方法であって、前記変異が、前記ＥｒｂＢ３アミノ酸配列の少なくとも１つの位置にアミノ酸変化をもたらし、前記変異が、前記対象におけるＥｒｂＢ３消化管癌を示す、方法。
【請求項６】
アミノ酸変化をもたらす前記変異が、配列番号２の１０４、８０９、２３２、２６２、２８４、３２５、８４６、９２８、６０、１１１、１３５、２９５、４０６、４５３、４９８、１０８９、１１６４、および１９３からなる群から選択される位置に存在する、請求項５に記載の方法。
【請求項７】
対象から得られる生体試料においてＥｒｂＢ３をコードする核酸配列中のアミノ酸変異の存在または不在を検出することを含む、前記対象におけるＥｒｂＢ３癌の存在を決定する方法であって、前記変異が、配列番号２の１０４、８０９、２３２、２６２、２８４、３２５、８４６、９２８、６０、１１１、１３５、２９５、４０６、４５３、４９８、１０８９、１１６４、１９３、４９２、および７１４からなる群から選択される少なくとも１つの位置にアミノ酸変化をもたらし、前記変異の存在が、前記対象におけるＥｒｂＢ３癌を示す、方法。
【請求項８】
対象におけるＥｒｂＢ３癌の存在に基づいて医薬が投与される対象を選択することをさらに含む、請求項５または７に記載の方法。
【請求項９】
前記医薬が、ＥｒｂＢ阻害剤である、請求項８に記載の方法。
【請求項１０】
前記ＥｒｂＢ阻害剤が、ＥＧＦＲ拮抗薬、ＥｒｂＢ２拮抗薬、ＥｒｂＢ３拮抗薬、ＥｒｂＢ４拮抗薬、およびＥＧＦＲ／ＥｒｂＢ３拮抗薬からなる群から選択される、請求項９に記載の方法。
【請求項１１】
前記阻害剤が、低分子阻害剤である、請求項１０に記載の方法。
【請求項１２】
前記拮抗薬が、拮抗薬抗体である、請求項１０に記載の方法。
【請求項１３】
前記抗体が、モノクローナル抗体、二重特異性抗体、キメラ抗体、ヒト抗体、ヒト化抗体、および抗体断片からなる群から選択される、請求項１２に記載の方法。
【請求項１４】
前記消化管癌が、胃癌または結腸癌である、請求項１に記載の検出薬または請求項５に記載の方法。
【請求項１５】
前記ＥｒｂＢ３癌が、胃癌、結腸癌、食道癌、直腸癌、盲腸癌、非小細胞肺（ＮＳＣＬＣ）腺癌、ＮＳＣＬＣ（扁平上皮癌）、腎癌、黒色腫、卵巣、大細胞肺癌、小細胞肺癌（ＳＣＬＣ）、肝細胞癌（ＨＣＣ）、肺癌、および膵臓癌からなる群から選択される、請求項７に記載の方法。
【請求項１６】
（ｉ）必要とする対象を特定すること、および／または（ｉｉ）必要とする対象から試料を得ることをさらに含む、請求項５または７に記載の方法。
【請求項１７】
前記検出が、前記変異を増幅するか、または配列決定することと、前記変異またはその配列を検出することと、を含む、請求項５または７に記載の方法。
【請求項１８】
前記増幅が、増幅プライマーまたは増幅プライマー対を、前記試料から単離された核酸鋳型と混合することを含む、請求項１７に記載の方法。
【請求項１９】
前記プライマーまたはプライマー対が、前記変異の近位にあるか、またはそれを含む領域に相補的であるか、または部分的に相補的であり、前記核酸鋳型上でポリメラーゼによる核酸重合を開始することができる、請求項１８に記載の方法。
【請求項２０】
ポリメラーゼおよび前記核酸鋳型を含むＤＮＡ重合反応において前記プライマーまたはプライマー対を伸長させて増幅産物を生成することをさらに含む、請求項１８に記載の方法。
【請求項２１】
前記変異が、前記生体試料から単離されたゲノムＤＮＡ中の前記変異を配列決定すること、前記変異もしくはその増幅産物をアレイにハイブリダイズすること、前記変異もしくはその増幅産物を制限酵素で消化すること、または前記変異のリアルタイムＰＣＲ増幅のうちの１つ以上を含むプロセスにより検出される、請求項１７に記載の方法。
【請求項２２】
前記生体試料から単離された核酸中の前記変異を部分的または完全に配列決定することを含む、請求項１７に記載の方法。
【請求項２３】
前記増幅が、ポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）、逆転写酵素ＰＣＲ（ＲＴ−ＰＣＲ）、またはリガーゼ連鎖反応（ＬＣＲ）を、前記ＰＣＲ、ＲＴ−ＰＣＲ、またはＬＣＲにおける鋳型としての前記生体試料から単離された核酸を用いて行うことを含む、請求項１７に記載の方法。
【請求項２４】
必要とする対象における消化管癌を治療するための医薬であって、
前記対象から得られる生体試料においてＥｒｂＢ３をコードする核酸配列中の変異を検出する方法であって、前記変異が、前記ＥｒｂＢ３アミノ酸配列の少なくとも１つの位置にアミノ酸変化をもたらし、前記変異が、前記対象におけるＥｒｂＢ３消化管癌を示す、方法により、ＥｒｂＢ３消化管癌を有することが決定された前記対象に投与される医薬。
【請求項２５】
アミノ酸変化をもたらす前記変異が、配列番号２の１０４、８０９、２３２、２６２、２８４、３２５、８４６、９２８、６０、１１１、１３５、２９５、４０６、４５３、４９８、１０８９、１１６４、および１９３からなる群から選択される位置に存在する、請求項２４に記載の医薬。
【請求項２６】
対象におけるＥｒｂＢ３癌を治療するための医薬であって、
前記対象から得られる生体試料においてＥｒｂＢ３をコードする核酸配列中のアミノ酸変異の存在または不在を検出する方法であって、前記変異が、配列番号２の１０４、８０９、２３２、２６２、２８４、３２５、８４６、９２８、６０、１１１、１３５、２９５、４０６、４５３、４９８、１０８９、１１６４、１９３、４９２、および７１４からなる群から選択される少なくとも１つの位置にアミノ酸変化をもたらし、前記変異の存在が、前記対象におけるＥｒｂＢ３癌を示す、方法により、ＥｒｂＢ３癌を有することが決定された対象に投与される医薬。
【請求項２７】
ＥｒｂＢ阻害剤である、請求項２４または２６に記載の医薬。
【請求項２８】
前記ＥｒｂＢ阻害剤が、ＥＧＦＲ拮抗薬、ＥｒｂＢ２拮抗薬、ＥｒｂＢ３拮抗薬、ＥｒｂＢ４拮抗薬、およびＥＧＦＲ／ＥｒｂＢ３拮抗薬からなる群から選択される、請求項２７に記載の医薬。
【請求項２９】
前記拮抗薬が、低分子阻害剤である、請求項２８に記載の医薬。
【請求項３０】
前記拮抗薬が、拮抗薬抗体である、請求項２８に記載の医薬。
【請求項３１】
前記抗体が、モノクローナル抗体、二重特異性抗体、キメラ抗体、ヒト抗体、ヒト化抗体、および抗体断片からなる群から選択される、請求項３０に記載の医薬。
【請求項３２】
前記消化管癌が、胃癌または結腸癌である、請求項２４に記載の医薬。
【請求項３３】
前記ＥｒｂＢ３癌が、胃癌、結腸癌、食道癌、直腸癌、盲腸癌、結腸直腸癌、非小細胞肺（ＮＳＣＬＣ）腺癌、ＮＳＣＬＣ（扁平上皮癌）、腎癌、黒色腫、卵巣癌、大細胞肺癌、小細胞肺癌（ＳＣＬＣ）、肝細胞癌（ＨＣＣ）、肺癌、および膵臓癌からなる群から選択される、請求項２６に記載の医薬。