【手続補正書】
【提出日】平成28年1月21日(2016.1.21)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
第１の抗原性ポリペプチドをコードする第１のヌクレオチド配列を含む単離ポリヌクレオチドであって、第１の抗原性ポリペプチドが、
ａ．第１の発癌性ウイルスポリペプチドのアミノ酸配列と少なくとも７０％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、
ｂ．免疫能を有する宿主において第１の発癌性ウイルスポリペプチドに対する免疫応答を惹起することが可能であり、
ｃ．免疫能を有する宿主において非発癌性である、
単離ポリヌクレオチド。
【請求項２】
第１の抗原性ポリペプチドが、
配列番号２のアミノ酸配列と少なくとも８５％の配列同一性を有するアミノ酸配列であって、
(i) Ｌ５０での点変異、
(ii) Ｅ１４８での点変異、
(iii) Ｔ１４９での点変異、
(iv) Ｑ１５０での点変異、及び
(v) Ｌ１５１での点変異、
からなる群から選択される１つ又は複数の変異を有するアミノ酸配列を含む、請求項１に記載の単離ポリヌクレオチド。
【請求項３】
第２の抗原性ポリペプチドをコードする第２のヌクレオチド配列を含み、第２の抗原性ポリペプチドが、
ａ．配列番号４のアミノ酸配列と少なくとも８５％の配列同一性を有するアミノ酸配列であって、
(i) Ｈ２での点変異、
(ii) Ｅ４６での点変異、及び
(iii) Ｌ６７での点変異、
からなる群から選択される１つ又は複数の変異を有するアミノ酸配列を含み、
ｂ．免疫能を有する宿主において第２の発癌性ウイルスポリペプチドに対する免疫応答を惹起することが可能であり、
ｃ．免疫能を有する宿主において非発癌性である、
請求項１又は２に記載のポリヌクレオチド。
【請求項４】
第１のヌクレオチド配列が、
ａ．Ｌ５０での点変異、
ｂ．Ｅ１４８での点変異、
ｃ．Ｔ１４９での点変異、
ｄ．Ｑ１５０での点変異、及び
ｅ．Ｌ１５１での点変異、
からなる群から選択されるすべての変異を有する配列番号２をコードする、請求項１〜３のいずれか１項に記載のポリヌクレオチド。
【請求項５】
第２のヌクレオチド配列が、
ａ．Ｈ２での点変異、
ｂ．Ｃ２４での点変異、
ｃ．Ｅ４６での点変異、及び
ｄ．Ｌ６７での点変異、
からなる群から選択されるすべての変異を有する配列番号４をコードする、請求項１〜４のいずれか１項に記載のポリヌクレオチド。
【請求項６】
第１のヌクレオチド配列が配列番号２９をコードし、第２のヌクレオチド配列が配列番号３０をコードする、請求項１〜５のいずれか１項に記載のポリヌクレオチド。
【請求項７】
ａ．薬学的に許容可能な担体、及び
ｂ．請求項１〜６のいずれか１項に記載のポリヌクレオチド
を含む組成物。
【請求項８】
薬学的に許容可能な担体がアデノウイルスエンベロープである、請求項７に記載の組成物。
【請求項９】
対象における第１の発癌性ウイルスポリペプチドを発現する細胞を殺すための医薬の製造における、請求項１〜６のいずれか１項に記載のポリヌクレオチド又は請求項７若しくは８に記載の組成物の使用。
【請求項１０】
前記細胞が新生物の一部である、請求項９に記載の使用。
【請求項１１】
前記新生物が悪性である、請求項１０に記載の使用。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０００４
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０００４】
いくつかの実施形態において、単離ポリヌクレオチドが提供される。単離ポリヌクレオチドは、第１の抗原性ポリペプチドをコードする第１のヌクレオチド配列を含み得る。ここで第１の抗原性ポリペプチドは、第１の発癌性ウイルスポリペプチドのアミノ酸配列と少なくとも７０％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、免疫能を有する宿主（immune-competent host）において第１の発癌性ウイルスポリペプチドに対する免疫応答を惹起可能であり、免疫能を有する宿主において非発癌性である。いくつかの実施形態において、ポリヌクレオチドは、第２の抗原性ポリペプチドをコードする第２のヌクレオチド配列を含む。ここで第２の抗原性ポリペプチドは、第２の発癌性ウイルスポリペプチドのアミノ酸配列と少なくとも７０％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、免疫能を有する宿主において第２の発癌性ウイルスポリペプチドに対する免疫応答を惹起可能であり、免疫能を有する宿主において非発癌性である。
【手続補正３】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０００８
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０００８】
いくつかの実施形態において、組成物が提供される。組成物は、薬学的に許容可能な担体及び本明細書において提供されるポリヌクレオチドを含む。ポリヌクレオチドは、第１の抗原性ポリペプチドをコードする第１のヌクレオチド配列を含み得る。ここで第１の抗原性ポリペプチドは、第１の発癌性ウイルスポリペプチドのアミノ酸配列と少なくとも７０％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、免疫能を有する宿主において第１の発癌性ウイルスポリペプチドに対する免疫応答を惹起可能であり、免疫能を有する宿主において非発癌性である。いくつかの実施形態において、ポリヌクレオチドは、第２の抗原性ポリペプチドをコードする第２のヌクレオチド配列を含む。ここで第２の抗原性ポリペプチドは、第２の発癌性ウイルスポリペプチドのアミノ酸配列と少なくとも７０％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、免疫能を有する宿主において第２の発癌性ウイルスポリペプチドに対する免疫応答を惹起可能であり、免疫能を有する宿主において非発癌性である。
【手続補正４】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００１３
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００１３】
いくつかの実施形態において、対象における第１の発癌性ウイルスポリペプチドを発現する細胞を殺すための方法が提供される。この方法は、第１の発癌性ウイルスペプチドに対する免疫応答を惹起するのに十分な量で組成物を対象に投与することを含む。ここで組成物は、薬学的に許容可能な担体及び本明細書において提供されるポリヌクレオチドを含み、免疫応答は細胞において細胞傷害効果を引き起こすのに有効である。ポリヌクレオチドは、第１の抗原性ポリペプチドをコードする第１のヌクレオチド配列を含み得る。ここで第１の抗原性ポリペプチドは、第１の発癌性ウイルスポリペプチドのアミノ酸配列と少なくとも７０％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、免疫能を有する宿主において第１の発癌性ウイルスポリペプチドに対する免疫応答を惹起可能であり、免疫能を有する宿主において非発癌性である。いくつかの実施形態において、ポリヌクレオチドは、第２の抗原性ポリペプチドをコードする第２のヌクレオチド配列を含む。ここで第２の抗原性ポリペプチドは、第２の発癌性ウイルスポリペプチドのアミノ酸配列と少なくとも７０％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、免疫能を有する宿主において第２の発癌性ウイルスポリペプチドに対する免疫応答を惹起可能であり、免疫能を有する宿主において非発癌性である。
【手続補正５】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００２１
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００２１】
本明細書に開示される様々な実施形態は、免疫能を有する宿主において発癌性ウイルスポリペプチドに対する免疫応答を惹起するが、免疫能を有する宿主において非発癌性である、抗原性ポリペプチドに関する。また本明細書において提供されるのは、かかる抗原性ポリペプチドをコードする配列を含むポリヌクレオチド、かかるポリヌクレオチドを含む組成物、及び使用方法である。
【手続補正６】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００２３
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００２３】
本明細書において、抗原性ポリペプチドとは、免疫能を有する宿主内に存在するときに免疫応答を誘発するポリペプチドである。本明細書において、免疫能を有する宿主とは、細胞傷害（例えば、細胞傷害性Ｔ細胞媒介性細胞傷害又は抗体媒介性細胞傷害）をもたらす免疫応答を生成可能な動物である。
【手続補正７】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００３６
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００３６】
ある実施形態において、本明細書において提供されるポリヌクレオチド及び薬学的に許容可能な担体を含む組成物が、免疫能を有する宿主への導入（例えば、経腸的、経皮的、静脈内、皮下、又は筋肉内導入）のために製剤される。使用の際、組成物は、発癌性ウイルスポリペプチドをコードするゲノムを有するウイルスによる感染の危険性がある免疫能を有する宿主に投与される。いくつかの実施形態において、組成物は、かかるウイルスにすでに感染しているか、又は発癌性ウイルスポリペプチドを発現する細胞（例えば、癌細胞）を有する、免疫能を有する宿主に投与される。
【手続補正８】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００３７
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００３７】
免疫能を有する宿主に投与される際、一実施形態によれば、本明細書において提供される組成物は、発癌性ウイルスポリペプチドを発現する細胞に対し細胞傷害性免疫応答を誘発する。いくつかの実施形態において、本明細書において提供される組成物の投与は、対象において発癌性ウイルスポリペプチドの発現に関連する癌を治療する、寛解させる、及び／又は予防するために使用できる。いくつかの実施形態において、本明細書において提供される組成物の投与は、発癌性ウイルスポリペプチドを発現する細胞の集団の減少をもたらし得る。発癌性ウイルスポリペプチドを発現する細胞の集団の減少は、任意の適切な手段、例えば、発癌性ウイルスポリペプチドを発現する細胞を含む腫瘍のサイズの変化を測定すること、又は発癌性ウイルスポリペプチドを発現する循環癌細胞の数の変化を測定すること等を使用して測定できる。いくつかの実施形態において、発癌性ウイルスポリペプチドの発現と関連する癌を罹患する対象の集団に対する、本明細書において提供される組成物の投与は、本明細書において提供される組成物が投与されないことを除いて同様に処置された対照集団と比較して、より長期の平均生存期間をもたらし得る。