【手続補正書】
【提出日】平成27年11月30日(2015.11.30)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
１位のメチオニン残基が場合により存在しないＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：４で示されるアミノ酸配列を含む単離されたポリペプチドであって、該ポリペプチドのリシン残基の側鎖がベータ−アラニン部分に架橋している、前記単離されたポリペプチド。
【請求項２】
ポリペプチドが、該ポリペプチドのアスパラギン酸残基の側鎖に、または該ポリペプチドのグルタミン酸残基の側鎖に架橋されたグリシン部分をさらに含む、請求項１に記載の単離されたポリペプチド。
【請求項３】
ポリペプチドが、該ポリペプチドの第２のリシン残基と該ポリペプチドのアスパラギン酸残基の側鎖との架橋をさらに含む、請求項１に記載の単離されたポリペプチド。
【請求項４】
ポリペプチドが、該ポリペプチドの第２のリシン残基と該ポリペプチドのグルタミン酸残基の側鎖との架橋をさらに含む、請求項１に記載の単離されたポリペプチド。
【請求項５】
ポリペプチドが、インビトロ細胞毒性アッセイによる測定で、少なくとも約１００μｇ／ｍｌのＥＣ５０を有する、請求項１に記載の単離されたポリペプチド。
【請求項６】
ポリペプチドが、インビトロ細胞毒性アッセイによる測定で、少なくとも約１０００μｇ／ｍｌのＥＣ５０を有する、請求項５に記載の単離されたポリペプチド。
【請求項７】
１位のメチオニン残基が場合により存在しないＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：４で示されるアミノ酸配列を有する第１の単離されたポリペプチドを含む免疫原性組成物であって、ここで第１の単離されたポリペプチドのリシン残基の側鎖がベータ−アラニン部分に架橋している、免疫原性組成物。
【請求項８】
ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：６で示されるアミノ酸配列を有する第２の単離されたポリペプチドをさらに含む請求項７に記載の免疫原性組成物であって、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：６の１位のメチオニン残基が場合により存在せず、ここで第２の単離されたポリペプチドのリシン残基の側鎖がベータ−アラニン部分に架橋している、免疫原性組成物。
【請求項９】
第１のポリペプチドの第２のリシン残基の側鎖とアスパラギン酸残基の側鎖との架橋をさらに含む、請求項７に記載の免疫原性組成物。
【請求項１０】
第２のポリペプチドの第２のリシン残基の側鎖とアスパラギン酸残基の側鎖との架橋をさらに含む、請求項８に記載の免疫原性組成物。
【請求項１１】
第１のポリペプチドの第２のリシン残基の側鎖とグルタミン酸残基の側鎖との架橋をさらに含む、請求項７に記載の免疫原性組成物。
【請求項１２】
第２のポリペプチドの第２のリシン残基の側鎖とグルタミン酸残基の側鎖との架橋をさらに含む、請求項８に記載の免疫原性組成物。
【請求項１３】
第１のポリペプチドのアスパラギン酸残基の側鎖とグリシン部分との架橋をさらに含む、請求項７に記載の免疫原性組成物。
【請求項１４】
第２のポリペプチドのアスパラギン酸残基の側鎖とグリシン部分との架橋をさらに含む、請求項８に記載の免疫原性組成物。
【請求項１５】
第１のポリペプチドのグルタミン酸残基の側鎖とグリシン部分との架橋をさらに含む、請求項７に記載の免疫原性組成物。
【請求項１６】
第２のポリペプチドのグルタミン酸残基の側鎖とグリシン部分との架橋をさらに含む、請求項８に記載の免疫原性組成物。
【請求項１７】
各ポリペプチドが、インビトロ細胞毒性アッセイによる測定で、少なくとも約１０００μｇ／ｍｌのＥＣ５０を有する、請求項７に記載の免疫原性組成物。
【請求項１８】
アジュバントをさらに含む、請求項７に記載の免疫原性組成物。
【請求項１９】
１位のメチオニン残基が場合により存在しないＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：４を含むポリペプチドを発現する、組み換え細胞またはその子孫。
【請求項２０】
ポリペプチドがＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：４を含む、請求項１９に記載の組み換え細胞またはその子孫。
【請求項２１】
ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１２を含む、核酸配列を含む、請求項１９に記載の組み換え細胞またはその子孫。
【請求項２２】
ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：４５を含む、核酸配列を含む、請求項２１に記載の組み換え細胞またはその子孫。
【請求項２３】
前記の細胞がグラム陽性細菌細胞に由来する、請求項１９に記載の組み換え細胞またはその子孫。
【請求項２４】
細胞がクロストリジウム・ディフィシル細胞である、請求項１９に記載の組み換え細胞またはその子孫。
【請求項２５】
不活性化されている芽胞形成遺伝子をさらに含む、請求項２４に記載の組み換え細胞またはその子孫。
【請求項２６】
細胞がクロストリジウム・ディフィシル毒素をコードする内在性ポリヌクレオチドを欠いている、請求項２４に記載の組み換え細胞またはその子孫。
【請求項２７】
細胞がクロストリジウム・ディフィシル１３５１（ＡＴＣＣ  ４３５９３（商標））、Ｃ．ディフィシル３２３２（ＡＴＣＣ  ＢＡＡ−１８０１（商標））、Ｃ．ディフィシル７３２２（ＡＴＣＣ  ４３６０１（商標））、Ｃ．ディフィシル５０３６（ＡＴＣＣ  ４３６０３（商標））、Ｃ．ディフィシル４８１１（ＡＴＣＣ  ４３６０２（商標））、およびＣ．ディフィシルＶＰＩ  １１１８６（ＡＴＣＣ  ７０００５７（商標））からなる群に由来する、請求項２４に記載の組み換え細胞またはその子孫。
【請求項２８】
細胞がクロストリジウム・ディフィシルＶＰＩ  １１１８６細胞（ＡＴＣＣ  ７０００５７（商標））である、請求項２４に記載の組み換え細胞またはその子孫。
【請求項２９】
さらに追加の組み換えヌクレオチド配列を含む、請求項１９に記載の組み換え細胞またはその子孫。
【請求項３０】
組み換えヌクレオチド配列が変異クロストリジウム・ディフィシル毒素をコードする、請求項２９に記載の組み換え細胞またはその子孫。
【請求項３１】
組み換えヌクレオチド配列が変異クロストリジウム・ディフィシル毒素Ａをコードする、請求項２９に記載の組み換え細胞またはその子孫。
【請求項３２】
組み換えヌクレオチド配列が変異クロストリジウム・ディフィシル毒素Ｂをコードする、請求項２９に記載の組み換え細胞またはその子孫。
【請求項３３】
組み換えヌクレオチド配列が、１位のメチオニン残基が場合により存在しないＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：６を含むポリペプチドをコードする、請求項２９に記載の組み換え細胞またはその子孫。
【請求項３４】
ポリペプチドがＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：６を含む、請求項３３に記載の組み換え細胞またはその子孫。
【請求項３５】
組み換えヌクレオチド配列がＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：８２を含むポリペプチドをコードする、請求項２９に記載の組み換え細胞またはその子孫。
【請求項３６】
組み換えヌクレオチド配列がＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１４を含む、請求項２９に記載の組み換え細胞またはその子孫。
【請求項３７】
組み換えヌクレオチド配列がＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：４７を含む、請求項２９に記載の組み換え細胞またはその子孫。
【請求項３８】
１位のメチオニン残基が場合により存在しないＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：４を含むポリペプチドを含む組成物。
【請求項３９】
ポリペプチドがＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：４を含む、請求項３８に記載の組成物。
【請求項４０】
Ｔｒｉｓ緩衝剤をさらに含み、ポリペプチドが該ポリペプチドのリシン残基の側鎖が架橋しているベータ−アラニン部分をさらに含む、請求項３８に記載の組成物。
【請求項４１】
ポリペプチドが、該ポリペプチドの第２のリシン残基の側鎖と該ポリペプチドのアスパラギン酸残基の側鎖との架橋をさらに含む、請求項４０に記載の組成物。
【請求項４２】
ポリペプチドが、該ポリペプチドの第２のリシン残基と該ポリペプチドのグルタミン酸残基の側鎖との架橋をさらに含む、請求項４０に記載の組成物。
【請求項４３】
ポリペプチドが、該ポリペプチドのリシン残基の側鎖と該ポリペプチドのアスパラギン酸残基の側鎖との架橋をさらに含む、請求項３８に記載の組成物。
【請求項４４】
ポリペプチドが、該ポリペプチドのリシン残基と該ポリペプチドのグルタミン酸残基の側鎖との架橋をさらに含む、請求項３８に記載の組成物。
【請求項４５】
ポリペプチドが、該ポリペプチドのアスパラギン酸残基の側鎖に架橋したグリシン部分をさらに含む、請求項３８に記載の組成物。
【請求項４６】
ポリペプチドが、該ポリペプチドのグルタミン酸残基の側鎖に架橋したグリシン部分をさらに含む、請求項３８に記載の組成物。
【請求項４７】
１位のメチオニン残基が場合により存在しないＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：６を含む第２のポリペプチドをさらに含む、請求項３８に記載の組成物。
【請求項４８】
第２のポリペプチドがＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：６を含む、請求項４７に記載の組成物。
【請求項４９】
Ｔｒｉｓ緩衝剤をさらに含み、第２のポリペプチドが該第２のポリペプチドのリシン残基の側鎖に架橋しているベータ−アラニン部分をさらに含む、請求項４７に記載の組成物。
【請求項５０】
第２のポリペプチドが、該ポリペプチドの第２のリシン残基の側鎖と該第２のポリペプチドのアスパラギン酸残基の側鎖との架橋をさらに含む、請求項４９に記載の組成物。
【請求項５１】
第２のポリペプチドが、該ポリペプチドの第２のリシン残基と該第２のポリペプチドのグルタミン酸残基の側鎖との架橋をさらに含む、請求項４９に記載の組成物。
【請求項５２】
第２のポリペプチドが、該ポリペプチドのリシン残基の側鎖と該第２のポリペプチドのアスパラギン酸残基の側鎖との架橋をさらに含む、請求項４７に記載の組成物。
【請求項５３】
第２のポリペプチドが、該ポリペプチドのリシン残基と該第２のポリペプチドのグルタミン酸残基の側鎖との架橋をさらに含む、請求項４７に記載の組成物。
【請求項５４】
第２のポリペプチドが、該第２のポリペプチドのアスパラギン酸残基の側鎖に架橋したグリシン部分をさらに含む、請求項４７に記載の組成物。
【請求項５５】
第２のポリペプチドが、該第２のポリペプチドのグルタミン酸残基の側鎖に架橋したグリシン部分をさらに含む、請求項４７に記載の組成物。
【請求項５６】
各ポリペプチドが、インビトロ細胞毒性アッセイによる測定で、少なくとも約１００μｇ／ｍｌのＥＣ５０を有する、請求項４７に記載の組成物。
【請求項５７】
各ポリペプチドが、インビトロ細胞毒性アッセイによる測定で、少なくとも約１０００μｇ／ｍｌのＥＣ５０を有する、請求項４７に記載の組成物。
【請求項５８】
緩衝剤をさらに含む、請求項３８に記載の組成物。
【請求項５９】
安定化剤をさらに含む、請求項３８に記載の組成物。
【請求項６０】
トレハロース二水和物をさらに含む、請求項３８に記載の組成物。
【請求項６１】
界面活性剤をさらに含む、請求項３８に記載の組成物。
【請求項６２】
ポリソルベート８０をさらに含む、請求項３８に記載の組成物。
【請求項６３】
組成物が凍結乾燥されている、請求項３８に記載の組成物。
【請求項６４】
組成物が免疫原性である、請求項３８に記載の組成物。
【請求項６５】
ホルムアルデヒドを含まない、請求項３８に記載の組成物。
【請求項６６】
アジュバントをさらに含む、請求項３８に記載の組成物。
【請求項６７】
アジュバントを含まない、請求項３８に記載の組成物。
【請求項６８】
塩化ナトリウムをさらに含む、請求項３８に記載の組成物。
【請求項６９】
水をさらに含む、請求項３８に記載の組成物。
【請求項７０】
Ｔｒｉｓ緩衝剤、トレハロース二水和物、ポリソルベート８０、１位のメチオニン残基が場合により存在しないＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：４を含む第１のポリペプチド、および１位のメチオニン残基が場合により存在しないＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：６を含む第２のポリペプチドを含む組成物であって、ここで第１のポリペプチドと第２のポリペプチドがさらにそれぞれのポリペプチドのリシン残基の側鎖に架橋したベータ−アラニン部分を含み、ここで第１のポリペプチドと第２のポリペプチドがさらにそれぞれのポリペプチドの第２のリシン残基の側鎖に架橋したグリシン部分を含む、組成物。
【請求項７１】
各ポリペプチドが、インビトロ細胞毒性アッセイによる測定で、少なくとも約１０００μｇ／ｍｌのＥＣ５０を有する、請求項７０に記載の組成物。
【請求項７２】
凍結乾燥されている、請求項７０に記載の組成物。
【請求項７３】
免疫原性である、請求項７０に記載の組成物。
【請求項７４】
ホルムアルデヒドを含まない、請求項７０に記載の組成物。
【請求項７５】
アジュバントをさらに含む、請求項７０に記載の組成物。
【請求項７６】
アジュバントを含まない、請求項７０に記載の組成物。
【請求項７７】
（ａ）ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：４に示されるアミノ酸配列を含み、ここでＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：４の１位のメチオニン残基が存在せず、ここで第１のポリペプチドのリシン残基の側鎖がベータ−アラニン部分に架橋しており、ここで第１のポリペプチドは、第１のポリペプチドのアスパラギン酸残基の側鎖とグリシン部分との架橋、および第１のポリペプチドのグルタミン酸残基の側鎖とグリシン部分との架橋をさらにふくむ、第１のポリペプチド；
（ｂ）ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：６に示されるアミノ酸配列を含み、ここでＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：６の１位のメチオニン残基が存在せず、ここで第２のポリペプチドのリシン残基の側鎖がベータ−アラニン部分に架橋しており、ここで第２のポリペプチドは、第２のポリペプチドのアスパラギン酸残基の側鎖とグリシン部分との架橋および第２のポリペプチドのグルタミン酸残基の側鎖とグリシン部分との架橋とをふくむ、第２のポリペプチド；
を含む組成物。
【請求項７８】
第２のポリペプチドがデヒドロアラニン部分をさらに含む、請求項７７に記載の組成物。
【請求項７９】
免疫原性である、請求項７７に記載の組成物。
【請求項８０】
免疫学的に有効な量の第１のポリペプチドおよび免疫学的に有効な量の第２のポリペプチドを含む、請求項７７に記載の組成物。
【請求項８１】
凍結乾燥されている、請求項７７に記載の組成物。
【請求項８２】
アジュバントをさらに含む、請求項７７に記載の組成物。
【請求項８３】
水酸化アルミニウムをさらに含む、請求項７７に記載の組成物。
【請求項８４】
さらにアジュバントを含まない、請求項７７に記載の組成物。
【請求項８５】
トレハロースをさらに含む、請求項７７に記載の組成物。
【請求項８６】
ポリソルベート８０をさらに含む、請求項７７に記載の組成物。
【請求項８７】
（ａ）ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：４に示されるアミノ酸配列を含み、ここでＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：４の１位のメチオニン残基が存在せず、ここで第１のポリペプチドのリシン残基の側鎖がベータ−アラニン部分に架橋しており、ここで第１のポリペプチドの第２のリシン残基が第１のポリペプチドのアスパラギン酸残基またはグルタミン酸残基に架橋している、第１のポリペプチド；および/
（ｂ）ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：６に示されるアミノ酸配列を含み、ここでＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：６の１位のメチオニン残基が存在せず、ここで第２のポリペプチドのリシン残基の側鎖がベータ−アラニン部分に架橋しており、ここで第２のポリペプチドの第２のリシン残基が第２のポリペプチドのアスパラギン酸残基またはグルタミン酸残基に架橋している、第２のポリペプチド；
を含む組成物。
【請求項８８】
第２のポリペプチドがデヒドロアラニン部分をさらに含む、請求項８７に記載の組成物。
【請求項８９】
免疫原性である、請求項８７に記載の組成物。
【請求項９０】
免疫学的に有効な量の第１のポリペプチドおよび免疫学的に有効な量の第２のポリペプチドを含む、請求項８７に記載の組成物。
【請求項９１】
凍結乾燥されている、請求項８７に記載の組成物。
【請求項９２】
アジュバントをさらに含む、請求項８７に記載の組成物。
【請求項９３】
水酸化アルミニウムをさらに含む、請求項８７に記載の組成物。
【請求項９４】
さらにアジュバントを含まない、請求項８７に記載の組成物。
【請求項９５】
トレハロースをさらに含む、請求項８７に記載の組成物。
【請求項９６】
ポリソルベート８０をさらに含む、請求項８７に記載の組成物。