(57)【要約】      （修正有）【課題】パーム油の生産に関して高収量であるアブラヤシ植物を取得する方法を提供する。【解決手段】親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のタンパク質レベルを決定するステップと、親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のタンパク質レベルと参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のタンパク質レベルとの間に差があるかを決定するステップと、差に基づいて親アブラヤシ植物の後代を選択して高収量のアブラヤシ植物を取得するステップとを含む、高収量のアブラヤシ植物を取得する方法。試験アブラヤシ植物の油収量を予測する方法及び高収量のアブラヤシ植物を取得するためのキット。【選択図】なし【特許請求の範囲】
【請求項１】
（ｉ）親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のタンパク質レベルを決定するステップであって、前記タンパク質が、５−メチルテトラヒドロプテロイルトリグルタミン酸ホモシステインメチルトランスフェラーゼ、アブシジン酸ストレス熟成タンパク質、アクチン６、アクチンＥ、ビオチンカルボキシラーゼ前駆体、コーヒー酸Ｏ−メチルトランスフェラーゼ、カタラーゼ２、リシナス・コムニス保存仮想的タンパク質オルソログ、フィブリリン様タンパク質、フラボドキシン様キノンレダクターゼ１、フルクトースビスホスフェートアルドラーゼ、グリセルアルデヒド３−リン酸デヒドロゲナーゼ、Ｈ０８２５Ｇ０２．１１オルソログ、リブロース−１，５−ビスホスフェートカルボキシラーゼ／オキシゲナーゼ大サブユニット、Ｌｅａ１Ｐ、メチオニンシンターゼタンパク質、ミトコンドリアペルオキシレドキシン、Ｏｓ０２ｇ０７５３３００オルソログ、Ｏｓ０５ｇ０４８２７００オルソログ、Ｏｓ１２ｇ０１６３７００オルソログ、ＯＳＪＮＢｂ００８５Ｆ１３．１７オルソログ、オストレオコッカス・ルシマリヌスＣＣＥ９９０１予測タンパク質オルソログ、フィスコミトレラ・パテンス亜種パテンス予測タンパク質オルソログ、ポプルス・トリコカルパ予測タンパク質オルソログ、ヴィティス・ヴィニフェラ仮想的タンパク質アイソフォーム１オルソログ、新生ポリペプチド関連複合体α、プロリンイミノペプチダーゼ、タンパク質トランスポーター、オリザ・サティバ・ジャポニカ群推定ＮＢＳ−ＬＲＲ病害抵抗性タンパク質ホモログオルソログ、Ｒａｎ  ＧＴＰアーゼ結合タンパク質、葉緑体トリオースリン酸イソメラーゼ、Ｖ型プロトンＡＴＰアーゼ触媒サブユニットＡ、リボヌクレアーゼ活性制御因子Ａ、レトロエレメントｐｏｌポリタンパク質様オルソログ、リボソームタンパク質Ｌ１０、短鎖型デヒドロゲナーゼ、温度誘導性リポカリン及びピセア・シトケンシス未知タンパク質オルソログからなる群から選択されるステップと、
（ｉｉ）親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中の前記タンパク質レベルと参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中の前記タンパク質レベルとの間に差があるかを決定するステップと、
（ｉｉｉ）前記差に基づいて親アブラヤシ植物の後代を選択して高収量のアブラヤシ植物を取得するステップと
を含む、高収量のアブラヤシ植物を取得する方法。
【請求項２】
５−メチルテトラヒドロプテロイルトリグルタミン酸ホモシステインメチルトランスフェラーゼが配列番号１を含み、アブシジン酸ストレス熟成タンパク質が配列番号２を含み、アクチン６が配列番号３を含み、アクチンＥが配列番号４を含み、ビオチンカルボキシラーゼ前駆体が配列番号５を含み、コーヒー酸Ｏ−メチルトランスフェラーゼが配列番号６を含み、カタラーゼ２が配列番号７を含み、リシナス・コムニス保存仮想的タンパク質オルソログが配列番号８を含み、フィブリリン様タンパク質が配列番号９を含み、フラボドキシン様キノンレダクターゼ１が配列番号１０を含み、フルクトースビスホスフェートアルドラーゼが配列番号１１を含み、グリセルアルデヒド３−リン酸デヒドロゲナーゼが配列番号１２を含み、Ｈ０８２５Ｇ０２．１１オルソログが配列番号１３を含み、リブロース−１，５−ビスホスフェートカルボキシラーゼ／オキシゲナーゼ大サブユニットが配列番号１４を含み、Ｌｅａ１Ｐが配列番号１５を含み、メチオニンシンターゼタンパク質が配列番号１６を含み、ミトコンドリアペルオキシレドキシンが配列番号１７を含み、Ｏｓ０２ｇ０７５３３００オルソログが配列番号１８を含み、Ｏｓ０５ｇ０４８２７００オルソログが配列番号１９を含み、Ｏｓ１２ｇ０１６３７００オルソログが配列番号２０を含み、ＯＳＪＮＢｂ００８５Ｆ１３．１７オルソログが配列番号２１を含み、オストレオコッカス・ルシマリヌスＣＣＥ９９０１予測タンパク質オルソログが配列番号２２を含み、フィスコミトレラ・パテンス亜種パテンス予測タンパク質オルソログが配列番号２３を含み、ポプルス・トリコカルパ予測タンパク質オルソログが配列番号２４を含み、ヴィティス・ヴィニフェラ仮想的タンパク質アイソフォーム１オルソログが配列番号２５を含み、新生ポリペプチド関連複合体αが配列番号２６を含み、プロリンイミノペプチダーゼが配列番号２７を含み、タンパク質トランスポーターが配列番号２８を含み、オリザ・サティバ・ジャポニカ群推定ＮＢＳ−ＬＲＲ病害抵抗性タンパク質ホモログオルソログが配列番号２９を含み、Ｒａｎ  ＧＴＰアーゼ結合タンパク質が配列番号３０を含み、葉緑体トリオースリン酸イソメラーゼが配列番号３１を含み、Ｖ型プロトンＡＴＰアーゼ触媒サブユニットＡが配列番号３２を含み、リボヌクレアーゼ活性制御因子Ａが配列番号３３を含み、レトロエレメントｐｏｌポリタンパク質様オルソログが配列番号３４を含み、リボソームタンパク質Ｌ１０が配列番号３５を含み、短鎖型デヒドロゲナーゼが配列番号３６を含み、温度誘導性リポカリンが配列番号３７を含み、ピセア・シトケンシス未知タンパク質オルソログが配列番号３８を含む、請求項１に記載の方法。
【請求項３】
前記差が、受粉後１１〜１３週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中の５−メチルテトラヒドロプテロイルトリグルタミン酸ホモシステインメチルトランスフェラーゼのレベルが受粉後１１〜１３週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中の５−メチルテトラヒドロプテロイルトリグルタミン酸ホモシステインメチルトランスフェラーゼのレベルより高いことである、請求項１又は２に記載の方法。
【請求項４】
前記差が、受粉後１１〜１３週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のアブシジン酸ストレス熟成タンパク質のレベルが受粉後１５〜１９週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のアブシジン酸ストレス熟成タンパク質のレベルより高いことである、請求項１又は２に記載の方法。
【請求項５】
前記差が、受粉後１５〜１７週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のアクチン６のレベルが受粉後１５〜１７週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のアクチン６のレベルより低いことである、請求項１又は２に記載の方法。
【請求項６】
前記差が、受粉後１５〜１９週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のアクチンＥのレベルが受粉後１１〜１３週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のアクチンＥのレベルより高いことである、請求項１又は２に記載の方法。
【請求項７】
前記差が、受粉後１５〜１９週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のビオチンカルボキシラーゼ前駆体のレベルが受粉後１１〜１３週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のビオチンカルボキシラーゼ前駆体のレベルより高いことである、請求項１又は２に記載の方法。
【請求項８】
前記差が、受粉後１１〜１７週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のコーヒー酸Ｏ−メチルトランスフェラーゼのレベルが受粉後１１〜１７週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のコーヒー酸Ｏ−メチルトランスフェラーゼのレベルより低いことである、請求項１又は２に記載の方法。
【請求項９】
前記差が、受粉後１１〜１９週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のカタラーゼ２のレベルが受粉後１１〜１９週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のカタラーゼ２のレベルより高いことである、請求項１又は２に記載の方法。
【請求項１０】
前記差が、受粉後１５〜１７週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のリシナス・コムニス保存仮想的タンパク質オルソログのレベルが受粉後１５〜１７週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のリシナス・コムニス保存仮想的タンパク質オルソログのレベルより高いことである、請求項１又は２に記載の方法。
【請求項１１】
前記差が、受粉後１１〜１３週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のフィブリリン様タンパク質のレベルが受粉後１１〜１３週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のフィブリリン様タンパク質のレベルより高いことである、請求項１又は２に記載の方法。
【請求項１２】
前記差が、受粉後１１〜１９週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のフラボドキシン様キノンレダクターゼ１のレベルが受粉後１１〜１９週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のフラボドキシン様キノンレダクターゼ１のレベルより低いことである、請求項１又は２に記載の方法。
【請求項１３】
前記差が、受粉後１５〜１７週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のフルクトースビスホスフェートアルドラーゼのレベルが受粉後１５〜１７週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のフルクトースビスホスフェートアルドラーゼのレベルより高いことである、請求項１又は２に記載の方法。
【請求項１４】
前記差が、受粉後１５〜１７週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のグリセルアルデヒド３−リン酸デヒドロゲナーゼのレベルが受粉後１５〜１７週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のグリセルアルデヒド３−リン酸デヒドロゲナーゼのレベルより低いことである、請求項１又は２に記載の方法。
【請求項１５】
前記差が、受粉後１５〜１７週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のＨ０８２５Ｇ０２．１１オルソログのレベルが受粉後１５〜１７週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のＨ０８２５Ｇ０２．１１オルソログのレベルより低いことである、請求項１又は２に記載の方法。
【請求項１６】
前記差が、受粉後１７〜１９週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のリブロース−１，５−ビスホスフェートカルボキシラーゼ／オキシゲナーゼ大サブユニットのレベルが受粉後１７〜１９週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のリブロース−１，５−ビスホスフェートカルボキシラーゼ／オキシゲナーゼ大サブユニットのレベルより高いことである、請求項１又は２に記載の方法。
【請求項１７】
前記差が、受粉後１５〜１７週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のＬｅａ１Ｐのレベルが受粉後１５〜１７週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のＬｅａ１Ｐのレベルより高いことである、請求項１又は２に記載の方法。
【請求項１８】
前記差が、受粉後１５〜１７週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のメチオニンシンターゼタンパク質のレベルが受粉後１５〜１７週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のメチオニンシンターゼタンパク質のレベルより低いことである、請求項１又は２に記載の方法。
【請求項１９】
前記差が、受粉後１１〜１７週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のミトコンドリアペルオキシレドキシンのレベルが受粉後１１〜１７週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のミトコンドリアペルオキシレドキシンのレベルより高いことである、請求項１又は２に記載の方法。
【請求項２０】
前記差が、受粉後１５〜１７週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のＯｓ０２ｇ０７５３３００オルソログのレベルが受粉後１５〜１７週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のＯｓ０２ｇ０７５３３００オルソログのレベルより高いことである、請求項１又は２に記載の方法。
【請求項２１】
前記差が、受粉後１５〜１７週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のＯｓ０５ｇ０４８２７００オルソログのレベルが受粉後１５〜１７週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のＯｓ０５ｇ０４８２７００オルソログのレベルより低いことである、請求項１又は２に記載の方法。
【請求項２２】
前記差が、受粉後１５〜１９週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のＯｓ１２ｇ０１６３７００オルソログのレベルが受粉後１１〜１３週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のＯｓ１２ｇ０１６３７００オルソログのレベルより高いことである、請求項１又は２に記載の方法。
【請求項２３】
前記差が、受粉後１５〜１７週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のＯＳＪＮＢｂ００８５Ｆ１３．１７オルソログのレベルが受粉後１５〜１７週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のＯＳＪＮＢｂ００８５Ｆ１３．１７オルソログのレベルより低いことである、請求項１又は２に記載の方法。
【請求項２４】
前記差が、受粉後１５〜１７週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のオストレオコッカス・ルシマリヌスＣＣＥ９９０１予測タンパク質オルソログのレベルが受粉後１５〜１７週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のオストレオコッカス・ルシマリヌスＣＣＥ９９０１予測タンパク質オルソログのレベルより高いことである、請求項１又は２に記載の方法。
【請求項２５】
前記差が、受粉後１１〜１３週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のフィスコミトレラ・パテンス亜種パテンス予測タンパク質オルソログのレベルが受粉後１１〜１３週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のフィスコミトレラ・パテンス亜種パテンス予測タンパク質オルソログのレベルより低いことである、請求項１又は２に記載の方法。
【請求項２６】
前記差が、受粉後１１〜１７週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のポプルス・トリコカルパ予測タンパク質オルソログのレベルが受粉後１１〜１７週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のポプルス・トリコカルパ予測タンパク質オルソログのレベルより低いことである、請求項１又は２に記載の方法。
【請求項２７】
前記差が、受粉後１１〜１３週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のヴィティス・ヴィニフェラ仮想的タンパク質アイソフォーム１オルソログのレベルが受粉後１１〜１３週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のヴィティス・ヴィニフェラ仮想的タンパク質アイソフォーム１オルソログのレベルより高いことである、請求項１又は２に記載の方法。
【請求項２８】
前記差が、受粉後１１〜１９週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中の新生ポリペプチド関連複合体αのレベルが受粉後１１〜１９週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中の新生ポリペプチド関連複合体αのレベルより高いことである、請求項１又は２に記載の方法。
【請求項２９】
前記差が、受粉後１５〜１９週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のプロリンイミノペプチダーゼのレベルが受粉後１５〜１９週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のプロリンイミノペプチダーゼのレベルより高いことである、請求項１又は２に記載の方法。
【請求項３０】
前記差が、受粉後１１〜１３週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のタンパク質トランスポーターのレベルが受粉後１１〜１３週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のタンパク質トランスポーターのレベルより低いことである、請求項１又は２に記載の方法。
【請求項３１】
前記差が、受粉後１５〜１７週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のオリザ・サティバ・ジャポニカ群推定ＮＢＳ−ＬＲＲ病害抵抗性タンパク質ホモログオルソログのレベルが受粉後１５〜１７週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のオリザ・サティバ・ジャポニカ群推定ＮＢＳ−ＬＲＲ病害抵抗性タンパク質ホモログオルソログのレベルより低いことである、請求項１又は２に記載の方法。
【請求項３２】
前記差が、受粉後１１〜１３週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のＲａｎ  ＧＴＰアーゼ結合タンパク質のレベルが受粉後１１〜１３週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のＲａｎ  ＧＴＰアーゼ結合タンパク質のレベルより高いことである、請求項１又は２に記載の方法。
【請求項３３】
前記差が、受粉後１５〜１７週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中の葉緑体トリオースリン酸イソメラーゼのレベルが受粉後１５〜１７週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中の葉緑体トリオースリン酸イソメラーゼのレベルより低いことである、請求項１又は２に記載の方法。
【請求項３４】
前記差が、受粉後１５〜１７週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のＶ型プロトンＡＴＰアーゼ触媒サブユニットＡのレベルが受粉後１５〜１７週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のＶ型プロトンＡＴＰアーゼ触媒サブユニットＡのレベルより低いことである、請求項１又は２に記載の方法。
【請求項３５】
前記差が、受粉後１５〜１９週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のリボヌクレアーゼ活性制御因子Ａのレベルが受粉後１１〜１３週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のリボヌクレアーゼ活性制御因子Ａのレベルより高いことである、請求項１又は２に記載の方法。
【請求項３６】
前記差が、受粉後１１〜１３週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のレトロエレメントｐｏｌポリタンパク質様オルソログのレベルが受粉後１１〜１３週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のレトロエレメントｐｏｌポリタンパク質様オルソログのレベルより低いことである、請求項１又は２に記載の方法。
【請求項３７】
前記差が、受粉後１１〜１３週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のリボソームタンパク質Ｌ１０のレベルが受粉後１１〜１３週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のリボソームタンパク質Ｌ１０のレベルより低いことである、請求項１又は２に記載の方法。
【請求項３８】
前記差が、受粉後１５〜１９週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中の短鎖型デヒドロゲナーゼのレベルが受粉後１１〜１３週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中の短鎖型デヒドロゲナーゼのレベルより高いことである、請求項１又は２に記載の方法。
【請求項３９】
前記差が、受粉後１５〜１７週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中の温度誘導性リポカリンのレベルが受粉後１５〜１７週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中の温度誘導性リポカリンのレベルより高いことである、請求項１又は２に記載の方法。
【請求項４０】
前記差が、受粉後１５〜１７週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のピセア・シトケンシス未知タンパク質オルソログのレベルが受粉後１５〜１７週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のピセア・シトケンシス未知タンパク質オルソログのレベルより高いことである、請求項１又は２に記載の方法。
【請求項４１】
（ｉ）親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中の少なくとももう１つ他のタンパク質のレベルを決定するステップと、
（ｉｉ）親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中の前記他のタンパク質のレベルと参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中の前記他のタンパク質のレベルとの間に差があるかを決定するステップと、
（ｉｉｉ）前記他のタンパク質のレベルに関する差にも基づいて親アブラヤシ植物の後代を選択して高収量のアブラヤシ植物を取得するステップと
をさらに含む、請求項１又は２に記載の方法。
【請求項４２】
前記差が二次元蛍光ディファレンスゲル電気泳動、抗体に基づく検出、イムノブロット検出及びドットブロット検出からなる群から選択される技術により決定される、請求項１又は２に記載の方法。
【請求項４３】
親アブラヤシ植物がｄｕｒａ育種用親株であり、
後代がｄｕｒａ育種用親株及びｔｅｎｅｒａ農業生産植物からなる群から選択されるアブラヤシ植物を含み、
高収量のアブラヤシ植物がｄｕｒａ育種用親株及びｔｅｎｅｒａ農業生産植物からなる群から選択される、
請求項１〜４２のいずれか一項に記載の方法。
【請求項４４】
親アブラヤシ植物がｔｅｎｅｒａ育種用親株であり、
後代がｔｅｎｅｒａ育種用親株、ｐｉｓｉｆｅｒａ育種用親株及びｔｅｎｅｒａ農業生産植物からなる群から選択されるアブラヤシ植物を含み、
高収量のアブラヤシ植物がｔｅｎｅｒａ育種用親株及びｔｅｎｅｒａ農業生産植物からなる群から選択される、
請求項１〜４２のいずれか一項に記載の方法。
【請求項４５】
（ｉ）請求項１〜４４のいずれか一項に記載の方法により高収量のアブラヤシ植物を取得するステップと、
（ｉｉ）高収量のアブラヤシ植物の果実からパーム油を分離するステップと
を含む、高収量のアブラヤシ植物からパーム油を取得する方法。
【請求項４６】
（ｉ）試験アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のタンパク質レベルを決定するステップであって、前記タンパク質が、５−メチルテトラヒドロプテロイルトリグルタミン酸ホモシステインメチルトランスフェラーゼ、アブシジン酸ストレス熟成タンパク質、アクチン６、アクチンＥ、ビオチンカルボキシラーゼ前駆体、コーヒー酸Ｏ−メチルトランスフェラーゼ、カタラーゼ２、リシナス・コムニス保存仮想的タンパク質オルソログ、フィブリリン様タンパク質、フラボドキシン様キノンレダクターゼ１、フルクトースビスホスフェートアルドラーゼ、グリセルアルデヒド３−リン酸デヒドロゲナーゼ、Ｈ０８２５Ｇ０２．１１オルソログ、リブロース−１，５−ビスホスフェートカルボキシラーゼ／オキシゲナーゼ大サブユニット、Ｌｅａ１Ｐ、メチオニンシンターゼタンパク質、ミトコンドリアペルオキシレドキシン、Ｏｓ０２ｇ０７５３３００オルソログ、Ｏｓ０５ｇ０４８２７００オルソログ、Ｏｓ１２ｇ０１６３７００オルソログ、ＯＳＪＮＢｂ００８５Ｆ１３．１７オルソログ、オストレオコッカス・ルシマリヌスＣＣＥ９９０１予測タンパク質オルソログ、フィスコミトレラ・パテンス亜種パテンス予測タンパク質オルソログ、ポプルス・トリコカルパ予測タンパク質オルソログ、ヴィティス・ヴィニフェラ仮想的タンパク質アイソフォーム１オルソログ、新生ポリペプチド関連複合体α、プロリンイミノペプチダーゼ、タンパク質トランスポーター、オリザ・サティバ・ジャポニカ群推定ＮＢＳ−ＬＲＲ病害抵抗性タンパク質ホモログオルソログ、Ｒａｎ  ＧＴＰアーゼ結合タンパク質、葉緑体トリオースリン酸イソメラーゼ、Ｖ型プロトンＡＴＰアーゼ触媒サブユニットＡ、リボヌクレアーゼ活性制御因子Ａ、レトロエレメントｐｏｌポリタンパク質様オルソログ、リボソームタンパク質Ｌ１０、短鎖型デヒドロゲナーゼ、温度誘導性リポカリン及びピセア・シトケンシス未知タンパク質オルソログからなる群から選択されるステップと、
（ｉｉ）試験アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中の前記タンパク質レベルと参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中の前記タンパク質レベルとの間に差があるかを決定するステップと、
（ｉｉｉ）前記差に基づいて試験アブラヤシ植物の油収量を予測するステップと
を含む、試験アブラヤシ植物の油収量を予測する方法。
【請求項４７】
５−メチルテトラヒドロプテロイルトリグルタミン酸ホモシステインメチルトランスフェラーゼが配列番号１を含み、アブシジン酸ストレス熟成タンパク質が配列番号２を含み、アクチン６が配列番号３を含み、アクチンＥが配列番号４を含み、ビオチンカルボキシラーゼ前駆体が配列番号５を含み、コーヒー酸Ｏ−メチルトランスフェラーゼが配列番号６を含み、カタラーゼ２が配列番号７を含み、リシナス・コムニス保存仮想的タンパク質オルソログが配列番号８を含み、フィブリリン様タンパク質が配列番号９を含み、フラボドキシン様キノンレダクターゼ１が配列番号１０を含み、フルクトースビスホスフェートアルドラーゼが配列番号１１を含み、グリセルアルデヒド３−リン酸デヒドロゲナーゼが配列番号１２を含み、Ｈ０８２５Ｇ０２．１１オルソログが配列番号１３を含み、リブロース−１，５−ビスホスフェートカルボキシラーゼ／オキシゲナーゼ大サブユニットが配列番号１４を含み、Ｌｅａ１Ｐが配列番号１５を含み、メチオニンシンターゼタンパク質が配列番号１６を含み、ミトコンドリアペルオキシレドキシンが配列番号１７を含み、Ｏｓ０２ｇ０７５３３００オルソログが配列番号１８を含み、Ｏｓ０５ｇ０４８２７００オルソログが配列番号１９を含み、Ｏｓ１２ｇ０１６３７００オルソログが配列番号２０を含み、ＯＳＪＮＢｂ００８５Ｆ１３．１７オルソログが配列番号２１を含み、オストレオコッカス・ルシマリヌスＣＣＥ９９０１予測タンパク質オルソログが配列番号２２を含み、フィスコミトレラ・パテンス亜種パテンス予測タンパク質オルソログが配列番号２３を含み、ポプルス・トリコカルパ予測タンパク質オルソログが配列番号２４を含み、ヴィティス・ヴィニフェラ仮想的タンパク質アイソフォーム１オルソログが配列番号２５を含み、新生ポリペプチド関連複合体αが配列番号２６を含み、プロリンイミノペプチダーゼが配列番号２７を含み、タンパク質トランスポーターが配列番号２８を含み、オリザ・サティバ・ジャポニカ群推定ＮＢＳ−ＬＲＲ病害抵抗性タンパク質ホモログオルソログが配列番号２９を含み、Ｒａｎ  ＧＴＰアーゼ結合タンパク質が配列番号３０を含み、葉緑体トリオースリン酸イソメラーゼが配列番号３１を含み、Ｖ型プロトンＡＴＰアーゼ触媒サブユニットＡが配列番号３２を含み、リボヌクレアーゼ活性制御因子Ａが配列番号３３を含み、レトロエレメントｐｏｌポリタンパク質様オルソログが配列番号３４を含み、リボソームタンパク質Ｌ１０が配列番号３５を含み、短鎖型デヒドロゲナーゼが配列番号３６を含み、温度誘導性リポカリンが配列番号３７を含み、ピセア・シトケンシス未知タンパク質オルソログが配列番号３８を含む、請求項４６に記載の方法。
【請求項４８】
（ｉ）試験アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中の少なくとももう１つ他のタンパク質のレベルを決定するステップと、
（ｉｉ）試験アブラヤシ植物の中果皮組織中の前記他のタンパク質のレベルと参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中の前記他のタンパク質のレベルとの間に差があるかを決定するステップと、
（ｉｉｉ）前記他のタンパク質のレベルに関する差にも基づいて試験アブラヤシ植物の油収量を予測するステップと
をさらに含む、請求項４６又は４７に記載の方法。
【請求項４９】
５−メチルテトラヒドロプテロイルトリグルタミン酸ホモシステインメチルトランスフェラーゼ、アブシジン酸ストレス熟成タンパク質、アクチン６、アクチンＥ、ビオチンカルボキシラーゼ前駆体、コーヒー酸Ｏ−メチルトランスフェラーゼ、カタラーゼ２、リシナス・コムニス保存仮想的タンパク質オルソログ、フィブリリン様タンパク質、フラボドキシン様キノンレダクターゼ１、フルクトースビスホスフェートアルドラーゼ、グリセルアルデヒド３−リン酸デヒドロゲナーゼ、Ｈ０８２５Ｇ０２．１１オルソログ、リブロース−１，５−ビスホスフェートカルボキシラーゼ／オキシゲナーゼ大サブユニット、Ｌｅａ１Ｐ、メチオニンシンターゼタンパク質、ミトコンドリアペルオキシレドキシン、Ｏｓ０２ｇ０７５３３００オルソログ、Ｏｓ０５ｇ０４８２７００オルソログ、Ｏｓ１２ｇ０１６３７００オルソログ、ＯＳＪＮＢｂ００８５Ｆ１３．１７オルソログ、オストレオコッカス・ルシマリヌスＣＣＥ９９０１予測タンパク質オルソログ、フィスコミトレラ・パテンス亜種パテンス予測タンパク質オルソログ、ポプルス・トリコカルパ予測タンパク質オルソログ、ヴィティス・ヴィニフェラ仮想的タンパク質アイソフォーム１オルソログ、新生ポリペプチド関連複合体α、プロリンイミノペプチダーゼ、タンパク質トランスポーター、オリザ・サティバ・ジャポニカ群推定ＮＢＳ−ＬＲＲ病害抵抗性タンパク質ホモログオルソログ、Ｒａｎ  ＧＴＰアーゼ結合タンパク質、葉緑体トリオースリン酸イソメラーゼ、Ｖ型プロトンＡＴＰアーゼ触媒サブユニットＡ、リボヌクレアーゼ活性制御因子Ａ、レトロエレメントｐｏｌポリタンパク質様オルソログ、リボソームタンパク質Ｌ１０、短鎖型デヒドロゲナーゼ、温度誘導性リポカリン及びピセア・シトケンシス未知タンパク質オルソログからなる群から選択されるタンパク質を検出するための抗体と、
参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織の抽出物と
を含む、高収量のアブラヤシ植物を取得するためのキット。
【請求項５０】
５−メチルテトラヒドロプテロイルトリグルタミン酸ホモシステインメチルトランスフェラーゼが配列番号１を含み、アブシジン酸ストレス熟成タンパク質が配列番号２を含み、アクチン６が配列番号３を含み、アクチンＥが配列番号４を含み、ビオチンカルボキシラーゼ前駆体が配列番号５を含み、コーヒー酸Ｏ−メチルトランスフェラーゼが配列番号６を含み、カタラーゼ２が配列番号７を含み、リシナス・コムニス保存仮想的タンパク質オルソログが配列番号８を含み、フィブリリン様タンパク質が配列番号９を含み、フラボドキシン様キノンレダクターゼ１が配列番号１０を含み、フルクトースビスホスフェートアルドラーゼが配列番号１１を含み、グリセルアルデヒド３−リン酸デヒドロゲナーゼが配列番号１２を含み、Ｈ０８２５Ｇ０２．１１オルソログが配列番号１３を含み、リブロース−１，５−ビスホスフェートカルボキシラーゼ／オキシゲナーゼ大サブユニットが配列番号１４を含み、Ｌｅａ１Ｐが配列番号１５を含み、メチオニンシンターゼタンパク質が配列番号１６を含み、ミトコンドリアペルオキシレドキシンが配列番号１７を含み、Ｏｓ０２ｇ０７５３３００オルソログが配列番号１８を含み、Ｏｓ０５ｇ０４８２７００オルソログが配列番号１９を含み、Ｏｓ１２ｇ０１６３７００オルソログが配列番号２０を含み、ＯＳＪＮＢｂ００８５Ｆ１３．１７オルソログが配列番号２１を含み、オストレオコッカス・ルシマリヌスＣＣＥ９９０１予測タンパク質オルソログが配列番号２２を含み、フィスコミトレラ・パテンス亜種パテンス予測タンパク質オルソログが配列番号２３を含み、ポプルス・トリコカルパ予測タンパク質オルソログが配列番号２４を含み、ヴィティス・ヴィニフェラ仮想的タンパク質アイソフォーム１オルソログが配列番号２５を含み、新生ポリペプチド関連複合体αが配列番号２６を含み、プロリンイミノペプチダーゼが配列番号２７を含み、タンパク質トランスポーターが配列番号２８を含み、オリザ・サティバ・ジャポニカ群推定ＮＢＳ−ＬＲＲ病害抵抗性タンパク質ホモログオルソログが配列番号２９を含み、Ｒａｎ  ＧＴＰアーゼ結合タンパク質が配列番号３０を含み、葉緑体トリオースリン酸イソメラーゼが配列番号３１を含み、Ｖ型プロトンＡＴＰアーゼ触媒サブユニットＡが配列番号３２を含み、リボヌクレアーゼ活性制御因子Ａが配列番号３３を含み、レトロエレメントｐｏｌポリタンパク質様オルソログが配列番号３４を含み、リボソームタンパク質Ｌ１０が配列番号３５を含み、短鎖型デヒドロゲナーゼが配列番号３６を含み、温度誘導性リポカリンが配列番号３７を含み、ピセア・シトケンシス未知タンパク質オルソログが配列番号３８を含む、請求項４９に記載のキット。
【請求項５１】
親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のタンパク質レベルと参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織の抽出物におけるタンパク質レベルとの間に差があるかを決定するための抗体の使用を指示する説明書をさらに含む、請求項４９又は５０に記載のキット。
【請求項５２】
親アブラヤシ植物の後代を差に基づいて選択して高収量のアブラヤシ植物を取得することを指示する説明書をさらに含む、請求項５１に記載のキット。
【請求項５３】
少なくとももう１つ他のタンパク質を検出する少なくとももう１つ他の抗体をさらに含む、請求項４９又は５０に記載のキット。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
本出願は高収量の植物を取得する方法に関し、より詳細にはパーム油の生産に関して高収量であるアブラヤシ植物を取得する方法に関する。
【背景技術】
【０００２】
アフリカのアブラヤシであるエレイス・ギニエンシス・ジャック（Ｅｌａｅｉｓ  ｇｕｉｎｅｅｎｓｉｓ  Ｊａｃｑ．）は重要な油糧作物である。アブラヤシ植物は雌雄同株、すなわち単一の植物が雄花と雌花の両方を生じ、雄花及び雌花の花序が連続して交替で現れることを特徴とする。雄花の花序は多数の小穂で形成され、１０００００個をはるかに上回る花をつけることが可能である。アブラヤシは天然では昆虫及び風により異花受粉する。雌花の花序は刺のある小穂上についた数千個の花を含有する肉穂花序である。一房は５００〜４０００個の果実を実らせる。アブラヤシの果実は球形から卵形又は細長い形状の固着性核果であり、外果皮、パーム油を含有する中果皮及び核を取り囲む内果皮から構成される。
【０００３】
アブラヤシは高収量であるため、及びその高品質の油のために重要である。収量の点では、アブラヤシは最も高収量の油糧作物で、近年の平均収量は１ヘクタール当たり１年間で３．６７トンであり、最良の後代では１ヘクタール当たり１年間でおよそ１０トンを生産することが知られている。アブラヤシはまた、油生産のために太陽光エネルギーを利用することで知られている最も効率的な植物でもある。品質の点では、アブラヤシは中果皮の中で生成されるパーム油及び核の中で生成されるパーム核油の両方のために栽培される。パーム油は特にバランスのとれた油で、飽和脂肪酸（≒５５％、４５％のパルミチン酸を包含する）及び不飽和脂肪酸（≒４５％）をほぼ等しい割合で有し、βカロテンを包含する。パーム核油は中果皮油よりも飽和されている。両者の遊離脂肪酸量は少ない。現在のパーム油及びパーム核油の合計生産量は１年間でおよそ５０００万トンであり、世界人口及び１人当たりの油脂消費の増加と共に、需要は将来実質的に増加することが予想される。
【０００４】
アブラヤシは最も高収量の油糧作物であるが、現在のアブラヤシ作物は理論的な最大値を大きく下回った生産量である。さらに、より高収量の後代を産生する交配に用いるための見込みのある高収量ヤシを同定する従来の方法は、何年間にもわたるヤシの栽培及びそのヤシによる油生産量の測定を必要とし、時間及び労働の両方について集約的である。加えて、油生産用アブラヤシの繁殖のための従来の育種技術もまた時間及び労働集約的であるが、その理由は特に、最も生産的でそれ故に商業的に関連のあるヤシは、直接的なハイブリッド交配による繁殖を非実用的なものとするハイブリッドの表現型を呈するためである。したがって、高収量のヤシを取得して同定する改良された方法を通じたアブラヤシの収量改良への要求が存在する。
【０００５】
遺伝子導入のアプローチは、植物収量増加への要求についての一般的問題に対する見込みのある解決策を提案する。例えば、他生物由来の有害生物耐性遺伝子導入による大豆及びトウモロコシなどの作物の遺伝子導入改変は、作物収量を増加させる手段として今や広く知られている。さらに、植物中で特定タンパク質の活性を増加させる又は産生することにより植物収量を増加させる方法もまた、例えばＳｃｈｏｎら、国際公開第２０１０／０４６２２１号により開示されている。しかしながら、作物の遺伝子導入改変は個体及び生態系に対する意図しない有害作用についての潜在的な懸念を生じさせる。
【０００６】
プロテオミクスはゲノムを補完するタンパク質の研究を包含するものであり、植物収量増加についての一般的問題に対する見込みのある解決策をまた提案する。例えば、ディファレンスゲル電気泳動（「ＤＩＧＥ」）解析は、Ｍａｃｋｉｎｔｏｓｈら、３  Ｐｒｏｔｅｏｍｉｃｓ  ２２７３〜８８ページ（２００３年）により記載されているように鋭敏な蛍光標識色素を利用する二次元ゲル電気泳動に相当するものであり、イネ及びヒマワリのタンパク質発現解析において、それぞれＴｅｓｈｉｍａら、Ｒｅｇｕｌａｔｏｒｙ  Ｔｏｘｉｃｏｌｏｇｙ＆Ｐｈａｒｍａｃｏｌｏｇｙ（印刷中の論文）及びＨａｊｄｕｃｈら、６  Ｊｏｕｒｎａｌ  ｏｆ  Ｐｒｏｔｅｏｍｅ  Ｒｅｓｅａｒｃｈ  ３２３２〜４１ページ（２００７年）により記載されているように、成功裏に利用されている。イネにおいては、このアプローチは１つの栽培品種を他と区別するため、またアレルゲンタンパク質の発現を比較するために用いられた。ヒマワリにおいては、種子油の特性におけるいくつかの手掛かりがさらなる調査に向けて同定されている。しかしながら、イネ、ヒマワリ及びアブラヤシの遺伝学及び代謝における多くの差、並びにタンパク質発現の高度に特異的な性質を前提とすれば、イネ及びヒマワリにおけるこれらの研究は、高収量のヤシを取得して同定する改良された方法を通じたアブラヤシの収量改良に関して有用であると予想されないであろう。
【発明の開示】
【０００７】
高収量のアブラヤシ植物を取得する方法が提供される。本方法は、親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のタンパク質レベルを決定するステップを含む。タンパク質は５−メチルテトラヒドロプテロイルトリグルタミン酸ホモシステインメチルトランスフェラーゼ、アブシジン酸ストレス熟成タンパク質、アクチン６、アクチンＥ、ビオチンカルボキシラーゼ前駆体、コーヒー酸Ｏ−メチルトランスフェラーゼ、カタラーゼ２、リシナス・コムニス（Ｒｉｃｉｎｕｓ  ｃｏｍｍｕｎｉｓ）保存仮想的タンパク質オルソログ、フィブリリン様タンパク質、フラボドキシン様キノンレダクターゼ１、フルクトースビスホスフェートアルドラーゼ、グリセルアルデヒド３−リン酸デヒドロゲナーゼ、Ｈ０８２５Ｇ０２．１１オルソログ、リブロース−１，５−ビスホスフェートカルボキシラーゼ／オキシゲナーゼ大サブユニット、Ｌｅａ１Ｐ、メチオニンシンターゼタンパク質、ミトコンドリアペルオキシレドキシン、Ｏｓ０２ｇ０７５３３００オルソログ、Ｏｓ０５ｇ０４８２７００オルソログ、Ｏｓ１２ｇ０１６３７００オルソログ、ＯＳＪＮＢｂ００８５Ｆ１３．１７オルソログ、オストレオコッカス・ルシマリヌス（Ｏｓｔｒｅｏｃｏｃｃｕｓ  ｌｕｃｉｍａｒｉｎｕｓ）ＣＣＥ９９０１予測タンパク質オルソログ、フィスコミトレラ・パテンス亜種パテンス（Ｐｈｙｓｃｏｍｉｔｒｅｌｌａ  ｐａｔｅｎｓ  ｓｕｂｓｐ．ｐａｔｅｎｓ）予測タンパク質オルソログ、ポプルス・トリコカルパ（Ｐｏｐｕｌｕｓ  ｔｒｉｃｈｏｃａｒｐａ）予測タンパク質オルソログ、ヴィティス・ヴィニフェラ（Ｖｉｔｉｓ  ｖｉｎｉｆｅｒａ）仮想的タンパク質アイソフォーム１オルソログ、新生ポリペプチド関連複合体α、プロリンイミノペプチダーゼ、タンパク質トランスポーター、オリザ・サティバ・ジャポニカ（Ｏｒｙｚａ  ｓａｔｉｖａ  Ｊａｐｏｎｉｃａ）群推定ＮＢＳ−ＬＲＲ病害抵抗性タンパク質ホモログオルソログ、Ｒａｎ  ＧＴＰアーゼ結合タンパク質、葉緑体トリオースリン酸イソメラーゼ、Ｖ型プロトンＡＴＰアーゼ触媒サブユニットＡ、リボヌクレアーゼ活性制御因子Ａ、レトロエレメントｐｏｌポリタンパク質様オルソログ、リボソームタンパク質Ｌ１０、短鎖型デヒドロゲナーゼ、温度誘導性リポカリン及びピセア・シトケンシス（Ｐｉｃｅａ  ｓｉｔｃｈｅｎｓｉｓ）未知タンパク質オルソログからなる群から選択される。本方法は、親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のタンパク質レベルと参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のタンパク質レベルとの間に差があるかを決定するステップをまた含む。本方法は、差に基づいて親アブラヤシ植物の後代を選択して高収量のアブラヤシ植物を取得するステップをまた含む。
【０００８】
試験アブラヤシ植物の油収量を予測する方法もまた提供される。本方法は試験アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のタンパク質レベルを決定するステップを含む。タンパク質は５−メチルテトラヒドロプテロイルトリグルタミン酸ホモシステインメチルトランスフェラーゼ、アブシジン酸ストレス熟成タンパク質、アクチン６、アクチンＥ、ビオチンカルボキシラーゼ前駆体、コーヒー酸Ｏ−メチルトランスフェラーゼ、カタラーゼ２、リシナス・コムニス保存仮想的タンパク質オルソログ、フィブリリン様タンパク質、フラボドキシン様キノンレダクターゼ１、フルクトースビスホスフェートアルドラーゼ、グリセルアルデヒド３−リン酸デヒドロゲナーゼ、Ｈ０８２５Ｇ０２．１１オルソログ、リブロース−１，５−ビスホスフェートカルボキシラーゼ／オキシゲナーゼ大サブユニット、Ｌｅａ１Ｐ、メチオニンシンターゼタンパク質、ミトコンドリアペルオキシレドキシン、Ｏｓ０２ｇ０７５３３００オルソログ、Ｏｓ０５ｇ０４８２７００オルソログ、Ｏｓ１２ｇ０１６３７００オルソログ、ＯＳＪＮＢｂ００８５Ｆ１３．１７オルソログ、オストレオコッカス・ルシマリヌスＣＣＥ９９０１予測タンパク質オルソログ、フィスコミトレラ・パテンス亜種パテンス予測タンパク質オルソログ、ポプルス・トリコカルパ予測タンパク質オルソログ、ヴィティス・ヴィニフェラ仮想的タンパク質アイソフォーム１オルソログ、新生ポリペプチド関連複合体α、プロリンイミノペプチダーゼ、タンパク質トランスポーター、オリザ・サティバ・ジャポニカ群推定ＮＢＳ−ＬＲＲ病害抵抗性タンパク質ホモログオルソログ、Ｒａｎ  ＧＴＰアーゼ結合タンパク質、葉緑体トリオースリン酸イソメラーゼ、Ｖ型プロトンＡＴＰアーゼ触媒サブユニットＡ、リボヌクレアーゼ活性制御因子Ａ、レトロエレメントｐｏｌポリタンパク質様オルソログ、リボソームタンパク質Ｌ１０、短鎖型デヒドロゲナーゼ、温度誘導性リポカリン及びピセア・シトケンシス未知タンパク質オルソログからなる群から選択される。本方法は、試験アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のタンパク質レベルと参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のタンパク質レベルとの間に差があるかを決定するステップをまた包含する。本方法は、差に基づいて試験アブラヤシ植物の油収量を予測するステップをまた包含する。
【０００９】
高収量のアブラヤシ植物を取得するためのキットもまた提供される。本キットは５−メチルテトラヒドロプテロイルトリグルタミン酸ホモシステインメチルトランスフェラーゼ、アブシジン酸ストレス熟成タンパク質、アクチン６、アクチンＥ、ビオチンカルボキシラーゼ前駆体、コーヒー酸Ｏ−メチルトランスフェラーゼ、カタラーゼ２、リシナス・コムニス保存仮想的タンパク質オルソログ、フィブリリン様タンパク質、フラボドキシン様キノンレダクターゼ１、フルクトースビスホスフェートアルドラーゼ、グリセルアルデヒド３−リン酸デヒドロゲナーゼ、Ｈ０８２５Ｇ０２．１１オルソログ、リブロース−１，５−ビスホスフェートカルボキシラーゼ／オキシゲナーゼ大サブユニット、Ｌｅａ１Ｐ、メチオニンシンターゼタンパク質、ミトコンドリアペルオキシレドキシン、Ｏｓ０２ｇ０７５３３００オルソログ、Ｏｓ０５ｇ０４８２７００オルソログ、Ｏｓ１２ｇ０１６３７００オルソログ、ＯＳＪＮＢｂ００８５Ｆ１３．１７オルソログ、オストレオコッカス・ルシマリヌスＣＣＥ９９０１予測タンパク質オルソログ、フィスコミトレラ・パテンス亜種パテンス予測タンパク質オルソログ、ポプルス・トリコカルパ予測タンパク質オルソログ、ヴィティス・ヴィニフェラ仮想的タンパク質アイソフォーム１オルソログ、新生ポリペプチド関連複合体α、プロリンイミノペプチダーゼ、タンパク質トランスポーター、オリザ・サティバ・ジャポニカ群推定ＮＢＳ−ＬＲＲ病害抵抗性タンパク質ホモログオルソログ、Ｒａｎ  ＧＴＰアーゼ結合タンパク質、葉緑体トリオースリン酸イソメラーゼ、Ｖ型プロトンＡＴＰアーゼ触媒サブユニットＡ、リボヌクレアーゼ活性制御因子Ａ、レトロエレメントｐｏｌポリタンパク質様オルソログ、リボソームタンパク質Ｌ１０、短鎖型デヒドロゲナーゼ、温度誘導性リポカリン及びピセア・シトケンシス未知タンパク質オルソログからなる群から選択されるタンパク質を検出するための抗体を含む。本キットは参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織の抽出物をまた含む。
【００１０】
開示される方法及びキットはプロテオミクスの有利な組み合わせに基づいていて、現行のアブラヤシ育種集団における高収量特性及び低収量特性のマーカーを同定し、それ故に高収量ヤシの同定ペース及び従来の育種技術を上昇させ、より高収量の後代を産生する。適用としては高収量の後代産生において用いるための高収量の親ヤシ植物を同定すること及び試験ヤシのパーム油収量を予測することが挙げられ、いずれの場合も何年間にもわたってヤシから油収量データを収集する必要はない。また、本方法及びキットは従来の育種技術への適用によく適しており、それ故に遺伝子導入に頼ることなく高収量ヤシの取得ペースを上昇させるための基礎を提供するものだが、本方法及びキットは組織培養又は遺伝子導入アプローチによるアブラヤシの繁殖効率の改良にもまた適用され得る。
【図面の簡単な説明】
【００１１】
【図１】いずれも受粉後１２週に試験された高収量ヤシＨ２及び低収量ヤシｈ１の中果皮タンパク質に相当する二次元蛍光ディファレンスゲル電気泳動（「ＤＩＧＥ」）解析ゲルのスキャン画像を示す図である。
【図２】いずれも受粉後１２週に試験された高収量ヤシＨ４及び低収量ヤシｈ６の中果皮タンパク質に相当するＤＩＧＥ解析ゲルのスキャン画像を示す図である。
【図３】いずれも受粉後１２週に試験された高収量ヤシＨ６及び低収量ヤシｈ９の中果皮タンパク質に相当するＤＩＧＥ解析ゲルのスキャン画像を示す図である。
【図４】いずれも受粉後１６週に試験された高収量ヤシＨ２及び低収量ヤシｈ１の中果皮タンパク質に相当するＤＩＧＥ解析ゲルのスキャン画像を示す図である。
【図５】いずれも受粉後１６週に試験された高収量ヤシＨ４及び低収量ヤシｈ６の中果皮タンパク質に相当するＤＩＧＥ解析ゲルのスキャン画像を示す図である。
【図６】いずれも受粉後１６週に試験された高収量ヤシＨ６及び低収量ヤシｈ９の中果皮タンパク質に相当するＤＩＧＥ解析ゲルのスキャン画像を示す図である。
【図７】いずれも受粉後１８週に試験された高収量ヤシＨ２及び低収量ヤシｈ１の中果皮タンパク質に相当するＤＩＧＥ解析ゲルのスキャン画像を示す図である。
【図８】いずれも受粉後１８週に試験された高収量ヤシＨ４及び低収量ヤシｈ６の中果皮タンパク質に相当するＤＩＧＥ解析ゲルのスキャン画像を示す図である。
【図９】いずれも受粉後１８週に試験された高収量ヤシＨ６及び低収量ヤシｈ９の中果皮タンパク質に相当するＤＩＧＥ解析ゲルのスキャン画像を示す図である。
【図１０Ａ】本明細書で同定された４５個の固有の差次的発現タンパク質の配列リストを示す図であり、１文字アミノ酸形式で略記されている。
【図１０Ｂ】本明細書で同定された４５個の固有の差次的発現タンパク質の配列リストを示す図であり、１文字アミノ酸形式で略記されている。
【図１０Ｃ】本明細書で同定された４５個の固有の差次的発現タンパク質の配列リストを示す図であり、１文字アミノ酸形式で略記されている。
【図１０Ｄ】本明細書で同定された４５個の固有の差次的発現タンパク質の配列リストを示す図であり、１文字アミノ酸形式で略記されている。
【図１０Ｅ】本明細書で同定された４５個の固有の差次的発現タンパク質の配列リストを示す図であり、１文字アミノ酸形式で略記されている。
【図１０Ｆ】本明細書で同定された４５個の固有の差次的発現タンパク質の配列リストを示す図であり、１文字アミノ酸形式で略記されている。
【図１０Ｇ】本明細書で同定された４５個の固有の差次的発現タンパク質の配列リストを示す図であり、１文字アミノ酸形式で略記されている。
【図１０Ｈ】本明細書で同定された４５個の固有の差次的発現タンパク質の配列リストを示す図であり、１文字アミノ酸形式で略記されている。
【図１０Ｉ】本明細書で同定された４５個の固有の差次的発現タンパク質の配列リストを示す図であり、１文字アミノ酸形式で略記されている。
【図１０Ｊ】本明細書で同定された４５個の固有の差次的発現タンパク質の配列リストを示す図であり、１文字アミノ酸形式で略記されている。
【図１０Ｋ】本明細書で同定された４５個の固有の差次的発現タンパク質の配列リストを示す図であり、１文字アミノ酸形式で略記されている。
【図１０Ｌ】本明細書で同定された４５個の固有の差次的発現タンパク質の配列リストを示す図であり、１文字アミノ酸形式で略記されている。
【図１０Ｍ】本明細書で同定された４５個の固有の差次的発現タンパク質の配列リストを示す図であり、１文字アミノ酸形式で略記されている。
【発明を実施するための最良の形態】
【００１２】
本出願は高収量のアブラヤシ植物を取得する方法、試験アブラヤシ植物の油収量を予測する方法及び高収量のアブラヤシ植物を取得するためのキットに関する。本明細書で開示されるように、アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のタンパク質レベルは高収量のアブラヤシ植物取得のため及び試験アブラヤシ植物の油収量予測のために用いられ得る。この点において有用なタンパク質としては、５−メチルテトラヒドロプテロイルトリグルタミン酸ホモシステインメチルトランスフェラーゼ、アブシジン酸ストレス熟成タンパク質、アクチン６、アクチンＥ、ビオチンカルボキシラーゼ前駆体、コーヒー酸Ｏ−メチルトランスフェラーゼ、カタラーゼ２、リシナス・コムニス保存仮想的タンパク質オルソログ、フィブリリン様タンパク質、フラボドキシン様キノンレダクターゼ１、フルクトースビスホスフェートアルドラーゼ、グリセルアルデヒド３−リン酸デヒドロゲナーゼ、Ｈ０８２５Ｇ０２．１１オルソログ、リブロース−１，５−ビスホスフェートカルボキシラーゼ／オキシゲナーゼ大サブユニット、Ｌｅａ１Ｐ、メチオニンシンターゼタンパク質、ミトコンドリアペルオキシレドキシン、Ｏｓ０２ｇ０７５３３００オルソログ、Ｏｓ０５ｇ０４８２７００オルソログ、Ｏｓ１２ｇ０１６３７００オルソログ、ＯＳＪＮＢｂ００８５Ｆ１３．１７オルソログ、オストレオコッカス・ルシマリヌスＣＣＥ９９０１予測タンパク質オルソログ、フィスコミトレラ・パテンス亜種パテンス予測タンパク質オルソログ、ポプルス・トリコカルパ予測タンパク質オルソログ、ヴィティス・ヴィニフェラ仮想的タンパク質アイソフォーム１オルソログ、新生ポリペプチド関連複合体α、プロリンイミノペプチダーゼ、タンパク質トランスポーター、オリザ・サティバ・ジャポニカ群推定ＮＢＳ−ＬＲＲ病害抵抗性タンパク質ホモログオルソログ、Ｒａｎ  ＧＴＰアーゼ結合タンパク質、葉緑体トリオースリン酸イソメラーゼ、Ｖ型プロトンＡＴＰアーゼ触媒サブユニットＡ、リボヌクレアーゼ活性制御因子Ａ、レトロエレメントｐｏｌポリタンパク質様オルソログ、リボソームタンパク質Ｌ１０、短鎖型デヒドロゲナーゼ、温度誘導性リポカリン及びピセア・シトケンシス未知タンパク質オルソログが挙げられる。したがって、本出願は親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中の上記タンパク質のうちの１つのレベルを決定するステップと、親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のタンパク質レベルと参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のタンパク質レベルとの間に差があるかを決定するステップと、差に基づいて親アブラヤシ植物の後代を選択して高収量のアブラヤシ植物を取得するステップとを含む、高収量のアブラヤシ植物を取得する方法を提供する。さらに、本出願は試験アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中の上記タンパク質のうちの１つのレベルを決定するステップと、試験アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のタンパク質レベルと参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のタンパク質レベルとの間に差があるかを決定するステップと、差に基づいて試験アブラヤシ植物の油収量を予測するステップとを含む、試験アブラヤシ植物の油収量を予測する方法を提供する。加えて、本出願は上記タンパク質の１つを検��する抗体と参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織の抽出物とを含む、高収量のアブラヤシ植物を取得するためのキットを提供する。
【００１３】
定義
本明細書で用いられる用語「親アブラヤシ植物」は、本明細書で開示される高収量のアブラヤシ植物を取得する方法を実施する過程又は本明細書で開示される高収量のアブラヤシ植物を取得するためのキットを用いる過程の中で後代が産生された、産生される又は産生されるであろうアブラヤシ植物を意味する。
【００１４】
本明細書で用いられる用語「試験アブラヤシ植物」は、本明細書で開示される植物の油収量を予測する方法を実施する過程の中でその果実の中果皮組織中のタンパク質レベルを決定するステップに供された、供される又は供されるであろうアブラヤシ植物を意味する。
【００１５】
本明細書で用いられる用語「参照アブラヤシ植物」は、アブラヤシの収量特性の決定における比較のための基礎として用いられるアブラヤシ植物を意味する。参照アブラヤシ植物は、特定の適用の状況に依存して、例えばパーム油産生量が高い、平均的な又は低いアブラヤシ植物であり得る。例えば、参照アブラヤシ植物は１ヘクタール当たり１年間で１０、９、８、７、６、５、４、３、２又は１トンのヤシを生産するアブラヤシ植物であり得る。
【００１６】
本明細書で開示される方法及びキットに関して本明細書で用いられる用語「高収量の」、「低収量の」及び「油収量」は、パーム油植物の果実の中果皮組織中のパーム油の収量を言う。
【００１７】
本明細書で用いられる用語「ホモログ」及び「相同の」は、高度に類似したＤＮＡ配列を持つ２以上の遺伝子又は高度に類似したアミノ酸配列を持つ２以上のタンパク質を言う。かかる遺伝子又はタンパク質は、例えば６０％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％又はより大きい配列同一性を共有することに基づいて相同であると考えられてもよい。用語「ホモログ」及び「相同の」は、遺伝子若しくはタンパク質が単一の種に由来し、それ故に種の構造的及び機能的に類似した遺伝子若しくはタンパク質を表すことができるものであっても、又は異なる種に由来し、それ故に共通の祖先に由来するオルソロガスな遺伝子若しくはタンパク質を表すことができるものであっても、かかる高度に類似した遺伝子又はタンパク質を包含する。
【００１８】
高収量のアブラヤシ植物を取得する方法
上記のように、高収量のアブラヤシ植物を取得する方法が提供される。本方法は（ｉ）親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のタンパク質レベルを決定するステップと、（ｉｉ）親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のタンパク質レベルと参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のタンパク質レベルとの間に差があるかを決定するステップと、（ｉｉｉ）差に基づいて親アブラヤシ植物の後代を選択して高収量のアブラヤシ植物を取得するステップとを含む。
【００１９】
タンパク質
本方法に従うと、タンパク質は５−メチルテトラヒドロプテロイルトリグルタミン酸ホモシステインメチルトランスフェラーゼ、アブシジン酸ストレス熟成タンパク質、アクチン６、アクチンＥ、ビオチンカルボキシラーゼ前駆体、コーヒー酸Ｏ−メチルトランスフェラーゼ、カタラーゼ２、リシナス・コムニス保存仮想的タンパク質オルソログ、フィブリリン様タンパク質、フラボドキシン様キノンレダクターゼ１、フルクトースビスホスフェートアルドラーゼ、グリセルアルデヒド３−リン酸デヒドロゲナーゼ、Ｈ０８２５Ｇ０２．１１オルソログ、リブロース−１，５−ビスホスフェートカルボキシラーゼ／オキシゲナーゼ大サブユニット、Ｌｅａ１Ｐ、メチオニンシンターゼタンパク質、ミトコンドリアペルオキシレドキシン、Ｏｓ０２ｇ０７５３３００オルソログ、Ｏｓ０５ｇ０４８２７００オルソログ、Ｏｓ１２ｇ０１６３７００オルソログ、ＯＳＪＮＢｂ００８５Ｆ１３．１７オルソログ、オストレオコッカス・ルシマリヌスＣＣＥ９９０１予測タンパク質オルソログ、フィスコミトレラ・パテンス亜種パテンス予測タンパク質オルソログ、ポプルス・トリコカルパ予測タンパク質オルソログ、ヴィティス・ヴィニフェラ仮想的タンパク質アイソフォーム１オルソログ、新生ポリペプチド関連複合体α、プロリンイミノペプチダーゼ、タンパク質トランスポーター、オリザ・サティバ・ジャポニカ群推定ＮＢＳ−ＬＲＲ病害抵抗性タンパク質ホモログオルソログ、Ｒａｎ  ＧＴＰアーゼ結合タンパク質、葉緑体トリオースリン酸イソメラーゼ、Ｖ型プロトンＡＴＰアーゼ触媒サブユニットＡ、リボヌクレアーゼ活性制御因子Ａ、レトロエレメントｐｏｌポリタンパク質様オルソログ、リボソームタンパク質Ｌ１０、短鎖型デヒドロゲナーゼ、温度誘導性リポカリン及びピセア・シトケンシス未知タンパク質オルソログからなる群から選択される。
【００２０】
いくつかの実施形態において、５−メチルテトラヒドロプテロイルトリグルタミン酸ホモシステインメチルトランスフェラーゼは配列番号１を含み、アブシジン酸ストレス熟成タンパク質は配列番号２を含み、アクチン６は配列番号３を含み、アクチンＥは配列番号４を含み、ビオチンカルボキシラーゼ前駆体は配列番号５を含み、コーヒー酸Ｏ−メチルトランスフェラーゼは配列番号６を含み、カタラーゼ２は配列番号７を含み、リシナス・コムニス保存仮想的タンパク質オルソログは配列番号８を含み、フィブリリン様タンパク質は配列番号９を含み、フラボドキシン様キノンレダクターゼ１は配列番号１０を含み、フルクトースビスホスフェートアルドラーゼは配列番号１１を含み、グリセルアルデヒド３−リン酸デヒドロゲナーゼは配列番号１２を含み、Ｈ０８２５Ｇ０２．１１オルソログは配列番号１３を含み、リブロース−１，５−ビスホスフェートカルボキシラーゼ／オキシゲナーゼ大サブユニットは配列番号１４を含み、Ｌｅａ１Ｐは配列番号１５を含み、メチオニンシンターゼタンパク質は配列番号１６を含み、ミトコンドリアペルオキシレドキシンは配列番号１７を含み、Ｏｓ０２ｇ０７５３３００オルソログは配列番号１８を含み、Ｏｓ０５ｇ０４８２７００オルソログは配列番号１９を含み、Ｏｓ１２ｇ０１６３７００オルソログは配列番号２０を含み、ＯＳＪＮＢｂ００８５Ｆ１３．１７オルソログは配列番号２１を含み、オストレオコッカス・ルシマリヌスＣＣＥ９９０１予測タンパク質オルソログは配列番号２２を含み、フィスコミトレラ・パテンス亜種パテンス予測タンパク質オルソログは配列番号２３を含み、ポプルス・トリコカルパ予測タンパク質オルソログは配列番号２４を含み、ヴィティス・ヴィニフェラ仮想的タンパク質アイソフォーム１オルソログは配列番号２５を含み、新生ポリペプチド関連複合体αは配列番号２６を含み、プロリンイミノペプチダーゼは配列番号２７を含み、タンパク質トランスポーターは配列番号２８を含み、オリザ・サティバ・ジャポニカ群推定ＮＢＳ−ＬＲＲ病害抵抗性タンパク質ホモログオルソログは配列番号２９を含み、Ｒａｎ  ＧＴＰアーゼ結合タンパク質は配列番号３０を含み、葉緑体トリオースリン酸イソメラーゼは配列番号３１を含み、Ｖ型プロトンＡＴＰアーゼ触媒サブユニットＡは配列番号３２を含み、リボヌクレアーゼ活性制御因子Ａは配列番号３３を含み、レトロエレメントｐｏｌポリタンパク質様オルソログは配列番号３４を含み、リボソームタンパク質Ｌ１０は配列番号３５を含み、短鎖型デヒドロゲナーゼは配列番号３６を含み、温度誘導性リポカリンは配列番号３７を含み、ピセア・シトケンシス未知タンパク質オルソログは配列番号３８を含む。
【００２１】
上記のタンパク質は、例えば脂質代謝、非脂質代謝及び代謝以外の機能など、機能に従って分類され得る。例えば、ビオチンカルボキシラーゼ前駆体及びフルクトースビスホスフェートアルドラーゼは主に脂質代謝において機能する。対照的に、５−メチルテトラヒドロプテロイルトリグルタミン酸ホモシステインメチルトランスフェラーゼ、コーヒー酸Ｏ−メチルトランスフェラーゼ、カタラーゼ２、グリセルアルデヒド３−リン酸デヒドロゲナーゼ、リブロース−１，５−ビスホスフェートカルボキシラーゼ／オキシゲナーゼ大サブユニット、メチオニンシンターゼタンパク質、プロリンイミノペプチダーゼ、Ｒａｎ  ＧＴＰアーゼ結合タンパク質、葉緑体トリオースリン酸イソメラーゼ及びＶ型プロトンＡＴＰアーゼ触媒サブユニットＡは主に非脂質代謝において機能する。また対照的に、残りのタンパク質であるアブシジン酸ストレス熟成タンパク質、アクチン６、アクチンＥ、リシナス・コムニス保存仮想的タンパク質オルソログ、フィブリリン様タンパク質タンパク質、フラボドキシン様キノンレダクターゼ１、Ｈ０８２５Ｇ０２．１１オルソログ、Ｌｅａ１Ｐ、ミトコンドリアペルオキシレドキシン、Ｏｓ０２ｇ０７５３３００オルソログ、Ｏｓ０５ｇ０４８２７００オルソログ、Ｏｓ１２ｇ０１６３７００オルソログ、ＯＳＪＮＢｂ００８５Ｆ１３．１７オルソログ、オストレオコッカス・ルシマリヌスＣＣＥ９９０１予測タンパク質オルソログ、フィスコミトレラ・パテンス亜種パテンス予測タンパク質オルソログ、ポプルス・トリコカルパ予測タンパク質オルソログ、ヴィティス・ヴィニフェラ仮想的タンパク質アイソフォーム１オルソログ、新生ポリペプチド関連複合体α、タンパク質トランスポーター、オリザ・サティバ・ジャポニカ群推定ＮＢＳ−ＬＲＲ病害抵抗性タンパク質ホモログオルソログ、リボヌクレアーゼ活性制御因子Ａ、レトロエレメントｐｏｌポリタンパク質様オルソログ、リボソームタンパク質Ｌ１０、短鎖型デヒドロゲナーゼ、温度誘導性リポカリン及びピセア・シトケンシス未知タンパク質オルソログは主に非代謝的能力において機能する。
【００２２】
したがっていくつかの実施形態において、タンパク質はビオチンカルボキシラーゼ前駆体及びフルクトースビスホスフェートアルドラーゼからなる群から選択される、主に脂質代謝において機能するタンパク質である。さらにいくつかの実施形態において、タンパク質は５−メチルテトラヒドロプテロイルトリグルタミン酸ホモシステインメチルトランスフェラーゼ、コーヒー酸Ｏ−メチルトランスフェラーゼ、カタラーゼ２、グリセルアルデヒド３−リン酸デヒドロゲナーゼ、リブロース−１，５−ビスホスフェートカルボキシラーゼ／オキシゲナーゼ大サブユニット、メチオニンシンターゼタンパク質、プロリンイミノペプチダーゼ、Ｒａｎ  ＧＴＰアーゼ結合タンパク質、葉緑体トリオースリン酸イソメラーゼ及びＶ型プロトンＡＴＰアーゼ触媒サブユニットＡからなる群から選択される、主に非脂質代謝において機能するタンパク質である。加えていくつかの実施形態において、タンパク質はアブシジン酸ストレス熟成タンパク質、アクチン６、アクチンＥ、リシナス・コムニス保存仮想的タンパク質オルソログ、フィブリリン様タンパク質タンパク質、フラボドキシン様キノンレダクターゼ１、Ｈ０８２５Ｇ０２．１１オルソログ、Ｌｅａ１Ｐ、ミトコンドリアペルオキシレドキシン、Ｏｓ０２ｇ０７５３３００オルソログ、Ｏｓ０５ｇ０４８２７００オルソログ、Ｏｓ１２ｇ０１６３７００オルソログ、ＯＳＪＮＢｂ００８５Ｆ１３．１７オルソログ、オストレオコッカス・ルシマリヌスＣＣＥ９９０１予測タンパク質オルソログ、フィスコミトレラ・パテンス亜種パテンス予測タンパク質オルソログ、ポプルス・トリコカルパ予測タンパク質オルソログ、ヴィティス・ヴィニフェラ仮想的タンパク質アイソフォーム１オルソログ、新生ポリペプチド関連複合体α、タンパク質トランスポーター、オリザ・サティバ・ジャポニカ群推定ＮＢＳ−ＬＲＲ病害抵抗性タンパク質ホモログオルソログ、リボヌクレアーゼ活性制御因子Ａ、レトロエレメントｐｏｌポリタンパク質様オルソログ、リボソームタンパク質Ｌ１０、短鎖型デヒドロゲナーゼ、温度誘導性リポカリン及びピセア・シトケンシス未知タンパク質オルソログからなる群から選択される、主に非代謝的能力において機能するタンパク質である。
【００２３】
タンパク質レベルの決定
親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中の上記タンパク質のうちの１つのレベルは、例えば中果皮タンパク質の粗調製物、最小限に精製された調製物、又は高度に精製された調製物などの中果皮組織からのタンパク質調製物中で決定されることができる。調製物としては、総中果皮タンパク質、又は例えば可溶性タンパク質、不溶性タンパク質、ｐＨ４〜７の間に等電点を持つタンパク質若しくはより高い若しくはより低い等電点を持つタンパク質などの中果皮タンパク質のサブセットを挙げることができる。中果皮組織自体は由来する果実の特定の発達ステージにおいて、例えば受粉後１１〜１９週、受粉後１１〜１７週、受粉後１５〜１９週、受粉後１１〜１３週、受粉後１５〜１７週、受粉後１７〜１９週、受粉後１２週、受粉後１６週又は受粉後１８週などの受粉の後（「受粉後」）の任意の時点で、取得され、試験されることができる。タンパク質のレベルは、例えば中果皮組織質量当たりのタンパク質質量のように完全に定量的に、又は例えば参照のシグナル強度に対するタンパク質のシグナル強度のように相対的に表されてもよい。
【００２４】
いくつかの実施形態において、親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のタンパク質レベルを決定するステップは、例えばイムノブロット、ドットブロット又は酵素結合免疫吸着測定法といった抗体に基づく検出により、当該技術分野で周知の方法に従って実施される。抗体に基づく検出は、例えばタンパク質に対して作られたモノクローナル抗体又はポリクローナル抗体を用いて実施されることができる。抗体は当該技術分野で周知の方法により調製されてもよく、又は商業販売業者から取得されてもよい。抗体に基づく検出は定量的に実施されてもよい。
【００２５】
いくつかの実施形態において、親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のタンパク質レベルを決定するステップは、例えばサンプル中の総タンパク質のＣｙＤｙｅ標識、その後の例えばＤＩＧＥ分取ゲル解析などの分離及びタンパク質検出といった蛍光に基づく検出により、公知の方法に従って実施される。
【００２６】
いくつかの実施形態において、レベルは２個以上の上記タンパク質について決定される。例えばいくつかの実施形態において、レベルは上記タンパク質の２〜３８個の組み合わせについて決定される。また例えばいくつかの実施形態において、レベルは上記タンパク質の２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、２９、３０、３１、３２、３３、３４、３５、３６、３７又は３８個の組み合わせについて決定される。上記タンパク質の２個の組み合わせについてのレベル決定に関する例として、いくつかの実施形態において、レベルは５−メチルテトラヒドロプテロイルトリグルタミン酸ホモシステインメチルトランスフェラーゼ及び以下の１つについて決定される。アブシジン酸ストレス熟成タンパク質、アクチン６、アクチンＥ、ビオチンカルボキシラーゼ前駆体、コーヒー酸Ｏ−メチルトランスフェラーゼ、カタラーゼ２、リシナス・コムニス保存仮想的タンパク質オルソログ、フィブリリン様タンパク質、フラボドキシン様キノンレダクターゼ１、フルクトースビスホスフェートアルドラーゼ、グリセルアルデヒド３−リン酸デヒドロゲナーゼ、Ｈ０８２５Ｇ０２．１１オルソログ、リブロース−１，５−ビスホスフェートカルボキシラーゼ／オキシゲナーゼ大サブユニット、Ｌｅａ１Ｐ、メチオニンシンターゼタンパク質、ミトコンドリアペルオキシレドキシン、Ｏｓ０２ｇ０７５３３００オルソログ、Ｏｓ０５ｇ０４８２７００オルソログ、Ｏｓ１２ｇ０１６３７００オルソログ、ＯＳＪＮＢｂ００８５Ｆ１３．１７オルソログ、オストレオコッカス・ルシマリヌスＣＣＥ９９０１予測タンパク質オルソログ、フィスコミトレラ・パテンス亜種パテンス予測タンパク質オルソログ、ポプルス・トリコカルパ予測タンパク質オルソログ、ヴィティス・ヴィニフェラ仮想的タンパク質アイソフォーム１オルソログ、新生ポリペプチド関連複合体α、プロリンイミノペプチダーゼ、タンパク質トランスポーター、オリザ・サティバ・ジャポニカ群推定ＮＢＳ−ＬＲＲ病害抵抗性タンパク質ホモログオルソログ、Ｒａｎ  ＧＴＰアーゼ結合タンパク質、葉緑体トリオースリン酸イソメラーゼ、Ｖ型プロトンＡＴＰアーゼ触媒サブユニットＡ、リボヌクレアーゼ活性制御因子Ａ、レトロエレメントｐｏｌポリタンパク質様オルソログ、リボソームタンパク質Ｌ１０、短鎖型デヒドロゲナーゼ、温度誘導性リポカリン及びピセア・シトケンシス未知タンパク質オルソログ。他の実施形態において、レベルは上記タンパク質の他の可能な組み合わせ各々について決定される。
【００２７】
タンパク質レベルの間の差の決定
親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中の上記タンパク質のうちの１つのレベルと参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のタンパク質レベルとの間に差があるかを決定するステップは、例えば上記のような抗体又は蛍光に基づく検出により決定されたそれぞれのタンパク質レベルを比較してそれらの間の差について調べることにより実施されることができる。いくつかの実施形態において、かかる比較は、例えば親アブラヤシの中果皮組織中のタンパク質レベルが参照アブラヤシ植物のレベルより、例えば１．１倍、１．２５倍、１．５倍、２倍、４倍又はそれ以上の倍率を超えて、例えば＜０．０２５、＜０．０５又は＜０．１のｐ値を伴って高い（或いは低い）ことに基づいて、生物学的及び／又は統計的に有意な差を明らかにするものと考えられる。当業者に明らかであるように、比較はシグナル強度を決定して比較するためのソフトウェアの使用により、例えばＩｍａｇｅ  Ｑｕａｎｔソフトウェア（バージョン６．０、Ａｍｅｒｓｈａｍ  ＢｉｏＳｃｉｅｎｃｅｓ）、続いてデサイダー（ＤｅＣｙｄｅｒ）（商標）２Ｄソフトウェアバージョン６．５（Ａｍｅｒｓｈａｍ  ＢｉｏＳｃｉｅｎｃｅｓ）を用いた生物学的変動解析の使用により、容易になることがある。
【００２８】
いくつかの実施形態において、親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のタンパク質レベルと参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のタンパク質レベルとの間の差は、受粉後１１〜１３週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中の５−メチルテトラヒドロプテロイルトリグルタミン酸ホモシステインメチルトランスフェラーゼのレベルが受粉後１１〜１３週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中の５−メチルテトラヒドロプテロイルトリグルタミン酸ホモシステインメチルトランスフェラーゼのレベルより高いことである。例えばいくつかの実施形態において、差は、受粉後１２週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中の５−メチルテトラヒドロプテロイルトリグルタミン酸ホモシステインメチルトランスフェラーゼのレベルが受粉後１２週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中の５−メチルテトラヒドロプテロイルトリグルタミン酸ホモシステインメチルトランスフェラーゼのレベルより高いことである。
【００２９】
いくつかの実施形態において、親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のタンパク質レベルと参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のタンパク質レベルとの間の差は、受粉後１１〜１３週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のアブシジン酸ストレス熟成タンパク質のレベルが受粉後１５〜１９週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のアブシジン酸ストレス熟成タンパク質のレベルより高いことである。例えばいくつかの実施形態において、差は、受粉後１２週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のアブシジン酸ストレス熟成タンパク質のレベルが受粉後１６週又は１８週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のアブシジン酸ストレス熟成タンパク質のレベルより高いことである。
【００３０】
いくつかの実施形態において、親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のタンパク質レベルと参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のタンパク質レベルとの間の差は、受粉後１５〜１７週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のアクチン６のレベルが受粉後１５〜１７週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のアクチン６のレベルより低いことである。例えばいくつかの実施形態において、差は、受粉後１６週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のアクチン６のレベルが受粉後１６週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のアクチン６のレベルより低いことである。
【００３１】
いくつかの実施形態において、親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のタンパク質レベルと参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のタンパク質レベルとの間の差は、受粉後１５〜１９週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のアクチンＥのレベルが受粉後１１〜１３週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のアクチンＥのレベルより高いことである。例えばいくつかの実施形態において、差は、受粉後１６週又は１８週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のアクチンＥのレベルが受粉後１２週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のアクチンＥのレベルより高いことである。
【００３２】
いくつかの実施形態において、親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のタンパク質レベルと参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のタンパク質レベルとの間の差は、受粉後１５〜１９週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のビオチンカルボキシラーゼ前駆体のレベルが受粉後１１〜１３週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のビオチンカルボキシラーゼ前駆体のレベルより高いことである。例えばいくつかの実施形態において、差は、受粉後１６週又は１８週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のビオチンカルボキシラーゼ前駆体のレベルが受粉後１２週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のビオチンカルボキシラーゼ前駆体のレベルより高いことである。
【００３３】
いくつかの実施形態において、親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のタンパク質レベルと参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のタンパク質レベルとの間の差は、受粉後１１〜１７週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のコーヒー酸Ｏ−メチルトランスフェラーゼのレベルが受粉後１１〜１７週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のコーヒー酸Ｏ−メチルトランスフェラーゼのレベルより低いことである。例えばいくつかの実施形態において、差は、受粉後１２週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のコーヒー酸Ｏ−メチルトランスフェラーゼのレベルが受粉後１２週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のコーヒー酸Ｏ−メチルトランスフェラーゼのレベルより低いことである。また例えばいくつかの実施形態において、差は、受粉後１６週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のコーヒー酸Ｏ−メチルトランスフェラーゼのレベルが受粉後１６週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のコーヒー酸Ｏ−メチルトランスフェラーゼのレベルより低いことである。
【００３４】
いくつかの実施形態において、親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のタンパク質レベルと参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のタンパク質レベルとの間の差は、受粉後１１〜１９週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のカタラーゼ２のレベルが受粉後１１〜１９週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のカタラーゼ２のレベルより高いことである。例えばいくつかの実施形態において、差は、受粉後１２週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のカタラーゼ２のレベルが受粉後１２週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のカタラーゼ２のレベルより高いことである。また例えばいくつかの実施形態において、差は、受粉後１８週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のカタラーゼ２のレベルが受粉後１８週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のカタラーゼ２のレベルより高いことである。
【００３５】
いくつかの実施形態において、親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のタンパク質レベルと参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のタンパク質レベルとの間の差は、受粉後１５〜１７週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のリシナス・コムニス保存仮想的タンパク質オルソログのレベルが受粉後１５〜１７週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のリシナス・コムニス保存仮想的タンパク質オルソログのレベルより高いことである。例えばいくつかの実施形態において、差は、受粉後１６週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のリシナス・コムニス保存仮想的タンパク質オルソログのレベルが受粉後１６週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のリシナス・コムニス保存仮想的タンパク質オルソログのレベルより高いことである。
【００３６】
いくつかの実施形態において、親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のタンパク質レベルと参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のタンパク質レベルとの間の差は、受粉後１１〜１３週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のフィブリリン様タンパク質のレベルが受粉後１１〜１３週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のフィブリリン様タンパク質のレベルより高いことである。例えばいくつかの実施形態において、差は、受粉後１２週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のフィブリリン様タンパク質のレベルが受粉後１２週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のフィブリリン様タンパク質のレベルより高いことである。
【００３７】
いくつかの実施形態において、親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のタンパク質レベルと参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のタンパク質レベルとの間の差は、受粉後１１〜１９週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のフラボドキシン様キノンレダクターゼ１のレベルが受粉後１１〜１９週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のフラボドキシン様キノンレダクターゼ１のレベルより低いことである。例えばいくつかの実施形態において、差は、受粉後１２週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のフラボドキシン様キノンレダクターゼ１のレベルが受粉後１２週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のフラボドキシン様キノンレダクターゼ１のレベルより低いことである。また例えばいくつかの実施形態において、差は、受粉後１８週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のフラボドキシン様キノンレダクターゼ１のレベルが受粉後１８週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のフラボドキシン様キノンレダクターゼ１のレベルより低いことである。
【００３８】
いくつかの実施形態において、親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のタンパク質レベルと参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のタンパク質レベルとの間の差は、受粉後１５〜１７週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のフルクトースビスホスフェートアルドラーゼのレベルが受粉後１５〜１７週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のフルクトースビスホスフェートアルドラーゼのレベルより高いことである。例えばいくつかの実施形態において、差は、受粉後１６週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のフルクトースビスホスフェートアルドラーゼのレベルが受粉後１６週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のフルクトースビスホスフェートアルドラーゼのレベルより高いことである。
【００３９】
いくつかの実施形態において、親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のタンパク質レベルと参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のタンパク質レベルとの間の差は、受粉後１５〜１７週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のグリセルアルデヒド３−リン酸デヒドロゲナーゼのレベルが受粉後１５〜１７週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のグリセルアルデヒド３−リン酸デヒドロゲナーゼのレベルより低いことである。例えばいくつかの実施形態において、差は、受粉後１６週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のグリセルアルデヒド３−リン酸デヒドロゲナーゼのレベルが受粉後１６週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のグリセルアルデヒド３−リン酸デヒドロゲナーゼのレベルより低いことである。
【００４０】
いくつかの実施形態において、親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のタンパク質レベルと参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のタンパク質レベルとの間の差は、受粉後１５〜１７週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のＨ０８２５Ｇ０２．１１オルソログのレベルが受粉後１５〜１７週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のＨ０８２５Ｇ０２．１１オルソログのレベルより低いことである。例えばいくつかの実施形態において、差は、受粉後１６週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のＨ０８２５Ｇ０２．１１オルソログのレベルが受粉後１６週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のＨ０８２５Ｇ０２．１１オルソログのレベルより低いことである。
【００４１】
いくつかの実施形態において、親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のタンパク質レベルと参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のタンパク質レベルとの間の差は、受粉後１７〜１９週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のリブロース−１，５−ビスホスフェートカルボキシラーゼ／オキシゲナーゼ大サブユニットのレベルが受粉後１７〜１９週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のリブロース−１，５−ビスホスフェートカルボキシラーゼ／オキシゲナーゼ大サブユニットのレベルより高いことである。例えばいくつかの実施形態において、差は、受粉後１８週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のリブロース−１，５−ビスホスフェートカルボキシラーゼ／オキシゲナーゼ大サブユニットのレベルが受粉後１８週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のリブロース−１，５−ビスホスフェートカルボキシラーゼ／オキシゲナーゼ大サブユニットのレベルより高いことである。
【００４２】
いくつかの実施形態において、親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のタンパク質レベルと参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のタンパク質レベルとの間の差は、受粉後１５〜１７週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のＬｅａ１Ｐのレベルが受粉後１５〜１７週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のＬｅａ１Ｐのレベルより高いことである。例えばいくつかの実施形態において、差は、受粉後１６週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のＬｅａ１Ｐのレベルが受粉後１６週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のＬｅａ１Ｐのレベルより高いことである。
【００４３】
いくつかの実施形態において、親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のタンパク質レベルと参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のタンパク質レベルとの間の差は、受粉後１５〜１７週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のメチオニンシンターゼタンパク質のレベルが受粉後１５〜１７週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のメチオニンシンターゼタンパク質のレベルより低いことである。例えばいくつかの実施形態において、差は、受粉後１６週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のメチオニンシンターゼタンパク質のレベルが受粉後１６週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のメチオニンシンターゼタンパク質のレベルより低いことである。
【００４４】
いくつかの実施形態において、親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のタンパク質レベルと参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のタンパク質レベルとの間の差は、受粉後１１〜１７週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のミトコンドリアペルオキシレドキシンのレベルが受粉後１１〜１７週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のミトコンドリアペルオキシレドキシンのレベルより高いことである。例えばいくつかの実施形態において、差は、受粉後１２週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のミトコンドリアペルオキシレドキシンのレベルが受粉後１２週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のミトコンドリアペルオキシレドキシンのレベルより高いことである。また例えばいくつかの実施形態において、差は、受粉後１６週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のミトコンドリアペルオキシレドキシンのレベルが受粉後１６週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のミトコンドリアペルオキシレドキシンのレベルより高いことである。
【００４５】
いくつかの実施形態において、親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のタンパク質レベルと参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のタンパク質レベルとの間の差は、受粉後１５〜１７週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のＯｓ０２ｇ０７５３３００オルソログのレベルが受粉後１５〜１７週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のＯｓ０２ｇ０７５３３００オルソログのレベルより高いことである。例えばいくつかの実施形態において、差は、受粉後１６週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のＯｓ０２ｇ０７５３３００オルソログのレベルが受粉後１６週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のＯｓ０２ｇ０７５３３００オルソログのレベルより高いことである。
【００４６】
いくつかの実施形態において、親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のタンパク質レベルと参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のタンパク質レベルとの間の差は、受粉後１５〜１７週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のＯｓ０５ｇ０４８２７００オルソログのレベルが受粉後１５〜１７週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のＯｓ０５ｇ０４８２７００オルソログのレベルより低いことである。例えばいくつかの実施形態において、差は、受粉後１６週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のＯｓ０５ｇ０４８２７００オルソログのレベルが受粉後１６週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のＯｓ０５ｇ０４８２７００オルソログのレベルより低いことである。
【００４７】
いくつかの実施形態において、親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のタンパク質レベルと参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のタンパク質レベルとの間の差は、受粉後１５〜１９週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のＯｓ１２ｇ０１６３７００オルソログのレベルが受粉後１１〜１３週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のＯｓ１２ｇ０１６３７００オルソログのレベルより高いことである。例えばいくつかの実施形態において、差は、受粉後１６週又は１８週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のＯｓ１２ｇ０１６３７００オルソログのレベルが受粉後１２週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のＯｓ１２ｇ０１６３７００オルソログのレベルより高いことである。
【００４８】
いくつかの実施形態において、親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のタンパク質レベルと参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のタンパク質レベルとの間の差は、受粉後１５〜１７週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のＯＳＪＮＢｂ００８５Ｆ１３．１７オルソログのレベルが受粉後１５〜１７週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のＯＳＪＮＢｂ００８５Ｆ１３．１７オルソログのレベルより低いことである。例えばいくつかの実施形態において、差は、受粉後１６週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のＯＳＪＮＢｂ００８５Ｆ１３．１７オルソログのレベルが受粉後１６週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のＯＳＪＮＢｂ００８５Ｆ１３．１７オルソログのレベルより低いことである。
【００４９】
いくつかの実施形態において、親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のタンパク質レベルと参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のタンパク質レベルとの間の差は、受粉後１５〜１７週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のオストレオコッカス・ルシマリヌスＣＣＥ９９０１予測タンパク質オルソログのレベルが受粉後１５〜１７週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のオストレオコッカス・ルシマリヌスＣＣＥ９９０１予測タンパク質オルソログのレベルより高いことである。例えばいくつかの実施形態において、差は、受粉後１６週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のオストレオコッカス・ルシマリヌスＣＣＥ９９０１予測タンパク質オルソログのレベルが受粉後１６週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のオストレオコッカス・ルシマリヌスＣＣＥ９９０１予測タンパク質オルソログのレベルより高いことである。
【００５０】
いくつかの実施形態において、親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のタンパク質レベルと参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のタンパク質レベルとの間の差は、受粉後１１〜１３週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のフィスコミトレラ・パテンス亜種パテンス予測タンパク質オルソログのレベルが受粉後１１〜１３週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のフィスコミトレラ・パテンス亜種パテンス予測タンパク質オルソログのレベルより低いことである。例えばいくつかの実施形態において、差は、受粉後１２週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のフィスコミトレラ・パテンス亜種パテンス予測タンパク質オルソログのレベルが受粉後１２週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のフィスコミトレラ・パテンス亜種パテンス予測タンパク質オルソログのレベルより低いことである。
【００５１】
いくつかの実施形態において、親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のタンパク質レベルと参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のタンパク質レベルとの間の差は、受粉後１１〜１７週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のポプルス・トリコカルパ予測タンパク質オルソログのレベルが受粉後１１〜１７週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のポプルス・トリコカルパ予測タンパク質オルソログのレベルより低いことである。例えばいくつかの実施形態において、差は、受粉後１２週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のポプルス・トリコカルパ予測タンパク質オルソログのレベルが受粉後１２週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のポプルス・トリコカルパ予測タンパク質オルソログのレベルより低いことである。また例えばいくつかの実施形態において、差は、受粉後１６週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のポプルス・トリコカルパ予測タンパク質オルソログのレベルが受粉後１６週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のポプルス・トリコカルパ予測タンパク質オルソログのレベルより低いことである。
【００５２】
いくつかの実施形態において、親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のタンパク質レベルと参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のタンパク質レベルとの間の差は、受粉後１１〜１３週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のヴィティス・ヴィニフェラ仮想的タンパク質アイソフォーム１オルソログのレベルが受粉後１１〜１３週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のヴィティス・ヴィニフェラ仮想的タンパク質アイソフォーム１オルソログのレベルより高いことである。例えばいくつかの実施形態において、差は、受粉後１２週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のヴィティス・ヴィニフェラ仮想的タンパク質アイソフォーム１オルソログのレベルが受粉後１２週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のヴィティス・ヴィニフェラ仮想的タンパク質アイソフォーム１オルソログのレベルより高いことである。
【００５３】
いくつかの実施形態において、親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のタンパク質レベルと参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のタンパク質レベルとの間の差は、受粉後１１〜１９週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中の新生ポリペプチド関連複合体αのレベルが受粉後１１〜１９週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中の新生ポリペプチド関連複合体αのレベルより高いことである。例えばいくつかの実施形態において、差は、受粉後１２週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中の新生ポリペプチド関連複合体αのレベルが受粉後１２週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中の新生ポリペプチド関連複合体αのレベルより高いことである。また例えばいくつかの実施形態において、差は、受粉後１８週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中の新生ポリペプチド関連複合体αのレベルが受粉後１８週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中の新生ポリペプチド関連複合体αのレベルより高いことである。
【００５４】
いくつかの実施形態において、親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のタンパク質レベルと参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のタンパク質レベルとの間の差は、受粉後１５〜１９週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のプロリンイミノペプチダーゼのレベルが受粉後１５〜１９週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のプロリンイミノペプチダーゼのレベルより高いことである。例えばいくつかの実施形態において、差は、受粉後１６週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のプロリンイミノペプチダーゼのレベルが受粉後１６週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のプロリンイミノペプチダーゼのレベルより高いことである。また例えばいくつかの実施形態において、差は、受粉後１８週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のプロリンイミノペプチダーゼのレベルが受粉後１８週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のプロリンイミノペプチダーゼのレベルより高いことである。
【００５５】
いくつかの実施形態において、親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のタンパク質レベルと参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のタンパク質レベルとの間の差は、受粉後１１〜１３週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のタンパク質トランスポーターのレベルが受粉後１１〜１３週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のタンパク質トランスポーターのレベルより低いことである。例えばいくつかの実施形態において、差は、受粉後１２週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のタンパク質トランスポーターのレベルが受粉後１２週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のタンパク質トランスポーターのレベルより低いことである。
【００５６】
いくつかの実施形態において、親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のタンパク質レベルと参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のタンパク質レベルとの間の差は、受粉後１５〜１７週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のオリザ・サティバ・ジャポニカ群推定ＮＢＳ−ＬＲＲ病害抵抗性タンパク質ホモログオルソログのレベルが受粉後１５〜１７週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のオリザ・サティバ・ジャポニカ群推定ＮＢＳ−ＬＲＲ病害抵抗性タンパク質ホモログオルソログのレベルより低いことである。例えばいくつかの実施形態において、差は、受粉後１６週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のオリザ・サティバ・ジャポニカ群推定ＮＢＳ−ＬＲＲ病害抵抗性タンパク質ホモログオルソログのレベルが受粉後１６週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のオリザ・サティバ・ジャポニカ群推定ＮＢＳ−ＬＲＲ病害抵抗性タンパク質ホモログオルソログのレベルより低いことである。
【００５７】
いくつかの実施形態において、親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のタンパク質レベルと参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のタンパク質レベルとの間の差は、受粉後１１〜１３週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のＲａｎ  ＧＴＰアーゼ結合タンパク質のレベルが受粉後１１〜１３週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のＲａｎ  ＧＴＰアーゼ結合タンパク質のレベルより高いことである。例えばいくつかの実施形態において、差は、受粉後１２週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のＲａｎ  ＧＴＰアーゼ結合タンパク質のレベルが受粉後１２週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のＲａｎ  ＧＴＰアーゼ結合タンパク質のレベルより高いことである。
【００５８】
いくつかの実施形態において、親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のタンパク質レベルと参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のタンパク質レベルとの間の差は、受粉後１５〜１７週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中の葉緑体トリオースリン酸イソメラーゼのレベルが受粉後１５〜１７週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中の葉緑体トリオースリン酸イソメラーゼのレベルより低いことである。例えばいくつかの実施形態において、差は、受粉後１６週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中の葉緑体トリオースリン酸イソメラーゼのレベルが受粉後１６週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中の葉緑体トリオースリン酸イソメラーゼのレベルより低いことである。
【００５９】
いくつかの実施形態において、親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のタンパク質レベルと参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のタンパク質レベルとの間の差は、受粉後１５〜１７週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のＶ型プロトンＡＴＰアーゼ触媒サブユニットＡのレベルが受粉後１５〜１７週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のＶ型プロトンＡＴＰアーゼ触媒サブユニットＡのレベルより低いことである。例えばいくつかの実施形態において、差は、受粉後１６週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のＶ型プロトンＡＴＰアーゼ触媒サブユニットＡのレベルが受粉後１６週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のＶ型プロトンＡＴＰアーゼ触媒サブユニットＡのレベルより低いことである。
【００６０】
いくつかの実施形態において、親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のタンパク質レベルと参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のタンパク質レベルとの間の差は、受粉後１５〜１９週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のリボヌクレアーゼ活性制御因子Ａのレベルが受粉後１１〜１３週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のリボヌクレアーゼ活性制御因子Ａのレベルより高いことである。例えばいくつかの実施形態において、差は、受粉後１６週又は１８週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のリボヌクレアーゼ活性制御因子Ａのレベルが受粉後１２週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のリボヌクレアーゼ活性制御因子Ａのレベルより高いことである。
【００６１】
いくつかの実施形態において、親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のタンパク質レベルと参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のタンパク質レベルとの間の差は、受粉後１１〜１３週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のレトロエレメントｐｏｌポリタンパク質様オルソログのレベルが受粉後１１〜１３週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のレトロエレメントｐｏｌポリタンパク質様オルソログのレベルより低いことである。例えばいくつかの実施形態において、差は、受粉後１２週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のレトロエレメントｐｏｌポリタンパク質様オルソログのレベルが受粉後１２週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のレトロエレメントｐｏｌポリタンパク質様オルソログのレベルより低いことである。
【００６２】
いくつかの実施形態において、親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のタンパク質レベルと参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のタンパク質レベルとの間の差は、受粉後１１〜１３週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のリボソームタンパク質Ｌ１０のレベルが受粉後１１〜１３週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のリボソームタンパク質Ｌ１０のレベルより低いことである。例えばいくつかの実施形態において、差は、受粉後１２週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のリボソームタンパク質Ｌ１０のレベルが受粉後１２週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のリボソームタンパク質Ｌ１０のレベルより低いことである。
【００６３】
いくつかの実施形態において、親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のタンパク質レベルと参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のタンパク質レベルとの間の差は、受粉後１５〜１９週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中の短鎖型デヒドロゲナーゼのレベルが受粉後１１〜１３週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中の短鎖型デヒドロゲナーゼのレベルより高いことである。例えばいくつかの実施形態において、差は、受粉後１６週又は１８週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中の短鎖型デヒドロゲナーゼのレベルが受粉後１２週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中の短鎖型デヒドロゲナーゼのレベルより高いことである。
【００６４】
いくつかの実施形態において、親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のタンパク質レベルと参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のタンパク質レベルとの間の差は、受粉後１５〜１７週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中の温度誘導性リポカリンのレベルが受粉後１５〜１７週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中の温度誘導性リポカリンのレベルより高いことである。例えばいくつかの実施形態において、差は、受粉後１６週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中の温度誘導性リポカリンのレベルが受粉後１６週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中の温度誘導性リポカリンのレベルより高いことである。
【００６５】
いくつかの実施形態において、親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のタンパク質レベルと参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のタンパク質レベルとの間の差は、受粉後１５〜１７週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のピセア・シトケンシス未知タンパク質オルソログのレベルが受粉後１５〜１７週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のピセア・シトケンシス未知タンパク質オルソログのレベルより高いことである。例えばいくつかの実施形態において、差は、受粉後１６週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のピセア・シトケンシス未知タンパク質オルソログのレベルが受粉後１６週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のピセア・シトケンシス未知タンパク質オルソログのレベルより高いことである。
【００６６】
いくつかの実施形態において、親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のタンパク質レベルと参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のタンパク質レベルとの間の差は、２個以上の上記タンパク質について決定される。例えばいくつかの実施形態において、差は、上記タンパク質の２〜３８個の組み合わせについて決定される。また例えばいくつかの実施形態において、差は、上記タンパク質の２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、２９、３０、３１、３２、３３、３４、３５、３６、３７又は３８個の組み合わせで、例えば可能な組み合わせ各々について決定される。
【００６７】
後代の選択
親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のタンパク質レベルと参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のタンパク質レベルとの間の差に基づいて親アブラヤシ植物の後代を選択して高収量のアブラヤシ植物を取得するステップは、例えば、繁殖のための親アブラヤシ植物を差に基づいて選択し、その植物と、例えば上記タンパク質のうちの１つに関して同一又は類似した差をまた呈するなどの別のアブラヤシ植物とを従来の育種技術により交配して、高収量のアブラヤシ植物に相当する後代を取得することにより実施されることができる。
【００６８】
当該技術分野で周知であるように、果実型は育種及び商業的なパーム油生産に関して重要な、アブラヤシにおける一遺伝子性の特性である。具体的には、商業的な油生産用ヤシ（「商業的植栽材料」又は「農業生産植物」とも呼ばれる）を産生するため、２つの別個の果実型のいずれかを有するアブラヤシが交配を通じた育種及び種の生産において一般的に用いられる。第一の果実型はｄｕｒａ（遺伝子型：ｓｈ＋  ｓｈ＋）で、果実重量の２８〜３５％に相当する厚い殻を特徴とし、果実核の周囲に黒色の繊維輪がない。ｄｕｒａ果実については、果実に対する中果皮の比率は５０〜６０％まで変動し、房重量に比例する抽出可能な油含量は１８〜２４％である。第二の果実型はｐｉｓｉｆｅｒａ（遺伝子型：ｓｈ−  ｓｈ−）で、殻がないことを特徴とし、殻の痕跡は小さい核の周囲にある繊維輪により表される。したがってｐｉｓｉｆｅｒａ果実については、果実に対する中果皮の比率は９０〜１００％である。房に対する中果皮油の比率はｄｕｒａに匹敵して１６〜２８％である。Ｐｉｓｉｆｅｒａはしかしながら、房の大部分が発達の初期ステージで発育が止まるために通常は雌性不稔である。
【００６９】
ｄｕｒａとｐｉｓｉｆｅｒａとの交配は、第三の果実型ｔｅｎｅｒａ（遺伝子型：ｓｈ＋  ｓｈ−）を有するヤシを生じさせる。Ｔｅｎｅｒａ果実は果実重量の８〜１０％の薄い殻を持ち、この殻は０．５〜４ｍｍの厚さに相当し、殻の周囲には特徴的な黒色の繊維輪がある。ｔｅｎｅｒａ果実については、果実に対する中果皮の比率は比較的高く、６０〜８０％の範囲内である。商業的なｔｅｎｅｒａヤシは一般にｄｕｒａよりも多くの果実房を生じるが、平均の房重量は低い。房に対する抽出可能な油の比率は２０〜３０％の範囲内で、３つの果実型の中で最も高く、それ故にｔｅｎｅｒａは商業的植栽材料として典型的に用いられる。
【００７０】
東南アジアにおいて用いられるＤｕｒａヤシの育種集団としてはＳｅｒｄａｎｇ  Ａｖｅｎｕｅ、Ｕｌｕ  Ｒｅｍｉｓ（いくつかのＳｅｒｄａｎｇ  Ａｖｅｎｕｅ  マテリアルを組み入れたものである）、Ｊｏｈｏｒ  Ｌａｂｉｓ及びＤｅｌｉ  Ｄｕｍｐｙを包含するＥｌｍｉｎａ  ｅｓｔａｔｅが挙げられるが、これら全てはＤｅｌｉ  ｄｕｒａに由来するものである。種生産のために用いられるＰｉｓｉｆｅｒａの育種集団は一般にＹａｎｇａｍｂｉ、ＡＶＲＯＳ、Ｂｉｎｇａ及びＵＲＴとしてグループ分けされる。他のｄｕｒａ集団及びｐｉｓｉｆｅｒａ集団はアフリカ及び南アメリカにおいて用いられる。
【００７１】
したがっていくつかの実施形態において、親アブラヤシ植物はＤｅｌｉ  ｄｕｒａ、Ｓｅｒｄａｎｇ  Ａｖｅｎｕｅ  ｄｕｒａ、Ｕｌｕ  Ｒｅｍｉｓ  ｄｕｒａ、Ｊｏｈｏｒ  Ｌａｂｉｓ  ｄｕｒａ、Ｅｌｍｉｎａ  ｅｓｔａｔｅ  ｄｕｒａ及びＤｅｌｉ  Ｄｕｍｐｙ  ｄｕｒａからなる群から選択されるｄｕｒａヤシである。或いはいくつかの実施形態において、親アブラヤシ植物はＹａｎｇａｍｂｉ  ｐｉｓｉｆｅｒａ、ＡＶＲＯＳ  ｐｉｓｉｆｅｒａ、Ｂｉｎｇａ  ｐｉｓｉｆｅｒａ及びＵＲＴ  ｐｉｓｉｆｅｒａからなる群から選択されるｐｉｓｉｆｅｒａヤシである。
【００７２】
アブラヤシの育種は第一に、優れたｔｅｎｅｒａ商業的植栽材料生産のための改良された親のｄｕｒａ育種系統ヤシ及びｐｉｓｉｆｅｒａ育種系統ヤシを選択することを目的とする。かかる材料は、クローン繁殖のための組織培養の使用が開発され続けているものの、大部分は種の形態である。一般に、親ｄｕｒａ育種集団は選択されたｄｕｒａヤシ間の交配により産生される。果実型の一遺伝子性遺伝に基づいて、結果として生じるヤシの１００％がｄｕｒａである。数年間の収量記録並びに房特性及び果実特性の確認の後、ｄｕｒａは表現型に基づいて育種のために選択される。対照的に、ｐｉｓｉｆｅｒａヤシは普通は雌性不稔であり、それ故にその育種集団は選択されたｔｅｎｅｒａ間の交配により、又は選択されたｔｅｎｅｒａと選択されたｐｉｓｆｅｒａとの交配により産生される必要がある。ｔｅｎｅｒａ×ｔｅｎｅｒａの交配は２５％のｄｕｒａ、５０％のｔｅｎｅｒａ及び２５％のｐｉｓｉｆｅｒａを産生する。ｔｅｎｅｒａ×ｐｉｓｉｆｅｒａの交配は５０％のｔｅｎｅｒａ及び５０％のｐｉｓｉｆｅｒａを産生する。ｐｉｓｉｆｅｒａの収量についての潜在能力は次いで精鋭のｄｕｒａとの後代試験により、すなわちｄｕｒａとｐｉｓｉｆｅｒａとを交配してｔｅｎｅｒａを産生し、次いでｔｅｎｅｒａ果実の収量表現型を経時的に決定することにより、間接的に決定される。この後代試験により、良好な一般的組み合わせ能力を有するｐｉｓｉｆｅｒａがそのｔｅｎｅｒａ後代の性能に基づいて選択される。選択された親の間での異系交配もまた、後代が次の育種サイクルに進められるのに伴って実施される。この異系交配は新しい遺伝子を育種プログラム中に導入して遺伝的ばらつきを増加させることを可能にする。この一般的な方式を用いる場合、優先選択目標としては、高い生果実房収量及び房に対する油の高比率（薄い殻、厚い中果皮）の点からの単位面積当たりの高い油収量、高い早期収量（早熟）並びに良好な油品質が他の特性の中から挙げられる。
【００７３】
したがっていくつかの実施形態において、親アブラヤシ植物はｄｕｒａ育種用親株であり、後代はｄｕｒａ育種用親株及びｔｅｎｅｒａ農業生産植物からなる群から選択されるアブラヤシ植物を含み、高収量のアブラヤシ植物はｄｕｒａ育種用親株及びｔｅｎｅｒａ農業生産植物からなる群から選択される。例えばいくつかの実施形態において、本方法は改良されたｄｕｒａ育種系統を産生する目的で実施されるが、この場合は親のｄｕｒａ育種用親株が別のｄｕｒａ育種用親株と交配され、高収量のアブラヤシ植物がｄｕｒａ育種用親株でもある後代の中から直接的に取得される。また例えばいくつかの実施形態において、本方法は改良されたｔｅｎｅｒａ農業生産植物を産生する目的で実施されるが、この場合は親のｄｕｒａ育種用親株がｐｉｓｉｆｅｒａ育種用親株と交配され、高収量のアブラヤシ植物がｔｅｎｅｒａ農業生産植物である後代の中から直接的に取得される。
【００７４】
或いはいくつかの実施形態において、親アブラヤシ植物はｔｅｎｅｒａ育種用親株であり、後代はｔｅｎｅｒａ育種用親株、ｐｉｓｉｆｅｒａ育種用親株及びｔｅｎｅｒａ農業生産植物からなる群から選択されるアブラヤシ植物を含み、高収量のアブラヤシ植物はｔｅｎｅｒａ育種用親株及びｔｅｎｅｒａ農業生産植物からなる群から選択される。例えばいくつかの実施形態において、本方法は改良されたｔｅｎｅｒａ育種系統を産生する目的で実施されることができるが、この場合は親のｔｅｎｅｒａ育種用親株が別のｔｅｎｅｒａ育種用親株と交配され、ｔｅｎｅｒａ高収量ヤシ植物が、２５％がｄｕｒａ、５０％がｔｅｎｅｒａ、そして２５％がｐｉｓｉｆｅｒａである後代の中から直接的に取得される。また例えばいくつかの実施形態において、本方法は改良されたｔｅｎｅｒａ農業生産植物を産生する目的で実施されるが、この場合は親のｔｅｎｅｒａ育種用親株がｐｉｓｉｆｅｒａ育種用親株と交配され、５０％がｔｅｎｅｒａで５０％がｐｉｓｉｆｅｒａに相当する後代が産み出される。この交配の結果として生じるｐｉｓｉｆｅｒａが同様にｔｅｎｅｒａ農業生産植物産生のためのｐｉｓｉｆｅｒａ育種系統として用いられ得る。
【００７５】
後代植物は従来のアプローチにより栽培されることができ、例えば苗はポリエチレンバッグ内で前育苗及び育苗設定で栽培され、およそ１２ヶ月間育てられ、次いで苗として植えられてもよく、さらなる栽培のために高収量を呈することが知られる又は予測される後代が選ばれることを伴う。
【００７６】
以上から明らかであるように、親アブラヤシ植物の後代を選択するステップはまた、親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中の２個以上のタンパク質のレベルと参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のタンパク質レベルとの間の差に基づいて、高収量のアブラヤシ植物が取得されてもよい。例えばいくつかの実施形態において、選択するステップは上記タンパク質の２〜３８個の組み合わせに関する差に基づく。また例えばいくつかの実施形態において、選択するステップは上記タンパク質の２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、２９、３０、３１、３２、３３、３４、３５、３６、３７又は３８個の組み合わせ、例えば可能な組み合わせ各々に関する差に基づく。
【００７７】
追加タンパク質
いくつかの実施形態において、１個又は２個以上の上記タンパク質に関する差を決定することに加えて、１７．６ｋＤａクラスＩ小熱ショックタンパク質、ＡＢＣ１ファミリータンパク質、グルタチオンペルオキシダーゼ、グルタチオンＳ−トランスフェラーゼ、グルタチオン−Ｓ−トランスフェラーゼθ、ホスホリパーゼＤ及びＶＩＥＲ  Ｆ−ボックスタンパク質２からなる群から選択される１個又は複数の追加タンパク質に関する差もまた決定される。いくつかの実施形態において、１７．６ｋＤａクラスＩ小熱ショックタンパク質は配列番号３９を含み、ＡＢＣ１ファミリータンパク質は配列番号４０を含み、グルタチオンペルオキシダーゼは配列番号４１を含み、グルタチオンＳ−トランスフェラーゼは配列番号４２を含み、グルタチオン−Ｓ−トランスフェラーゼθは配列番号４３を含み、ホスホリパーゼＤは配列番号４４を含み、ＶＩＥＲ  Ｆ−ボックスタンパク質２は配列番号４５を含む。
【００７８】
いくつかの実施形態において、親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中の追加タンパク質のレベルと参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中の追加タンパク質のレベルとの間の差は、受粉後１５〜１９週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中の１７．６ｋＤａクラスＩ小熱ショックタンパク質のレベルが受粉後１１〜１３週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中の１７．６ｋＤａクラスＩ小熱ショックタンパク質のレベルより高いことである。例えばいくつかの実施形態において、差は、受粉後１６週又は１８週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中の１７．６ｋＤａクラスＩ小熱ショックタンパク質のレベルが受粉後１２週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中の１７．６ｋＤａクラスＩ小熱ショックタンパク質のレベルより高いことである。
【００７９】
いくつかの実施形態において、親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中の追加タンパク質のレベルと参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中の追加タンパク質のレベルとの間の差は、受粉後１５〜１７週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のＡＢＣ１ファミリータンパク質のレベルが受粉後１５〜１７週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のＡＢＣ１ファミリータンパク質のレベルより高いことである。例えばいくつかの実施形態において、差は、受粉後１６週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のＡＢＣ１ファミリータンパク質のレベルが受粉後１６週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のＡＢＣ１ファミリータンパク質のレベルより高いことである。
【００８０】
いくつかの実施形態において、親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中の追加タンパク質のレベルと参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中の追加タンパク質のレベルとの間の差は、受粉後１５〜１７週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のグルタチオンペルオキシダーゼのレベルが受粉後１５〜１７週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のグルタチオンペルオキシダーゼのレベルより高いことである。例えばいくつかの実施形態において、差は、受粉後１６週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のグルタチオンペルオキシダーゼのレベルが受粉後１６週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のグルタチオンペルオキシダーゼのレベルより高いことである。
【００８１】
いくつかの実施形態において、親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中の追加タンパク質のレベルと参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中の追加タンパク質のレベルとの間の差は、受粉後１１〜１９週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のグルタチオンＳ−トランスフェラーゼのレベルが受粉後１１〜１９週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のグルタチオンＳ−トランスフェラーゼのレベルより低いことである。例えばいくつかの実施形態において、差は、受粉後１２週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のグルタチオンＳ−トランスフェラーゼのレベルが受粉後１２週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のグルタチオンＳ−トランスフェラーゼのレベルより低いことである。また例えばいくつかの実施形態において、差は、受粉後１６週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のグルタチオンＳ−トランスフェラーゼのレベルが受粉後１６週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のグルタチオンＳ−トランスフェラーゼのレベルより低いことである。さらなる例として、いくつかの実施形態において、差は、受粉後１８週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のグルタチオンＳ−トランスフェラーゼのレベルが受粉後１８週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のグルタチオンＳ−トランスフェラーゼのレベルより低いことである。
【００８２】
いくつかの実施形態において、親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中の追加タンパク質のレベルと参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中の追加タンパク質のレベルとの間の差は、受粉後１７〜１９週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のグルタチオン−Ｓ−トランスフェラーゼθのレベルが受粉後１７〜１９週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のグルタチオン−Ｓ−トランスフェラーゼθのレベルより高いことである。例えばいくつかの実施形態において、差は、受粉後１８週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のグルタチオン−Ｓ−トランスフェラーゼθのレベルが受粉後１８週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のグルタチオン−Ｓ−トランスフェラーゼθのレベルより高いことである。
【００８３】
いくつかの実施形態において、親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中の追加タンパク質のレベルと参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中の追加タンパク質のレベルとの間の差は、受粉後１５〜１７週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のホスホリパーゼＤのレベルが受粉後１５〜１７週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のホスホリパーゼＤのレベルより低いことである。例えばいくつかの実施形態において、差は、受粉後１６週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のホスホリパーゼＤのレベルが受粉後１６週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のホスホリパーゼＤのレベルより低いことである。
【００８４】
いくつかの実施形態において、親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中の追加タンパク質のレベルと参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中の追加タンパク質のレベルとの間の差は、受粉後１７〜１９週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のＶＩＥＲ  Ｆ−ボックスタンパク質２のレベルが受粉後１７〜１９週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のＶＩＥＲ  Ｆ−ボックスタンパク質２のレベルより高いことである。例えばいくつかの実施形態において、差は、受粉後１８週である親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のＶＩＥＲ  Ｆ−ボックスタンパク質２のレベルが受粉後１８週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のＶＩＥＲ  Ｆ−ボックスタンパク質２のレベルより高いことである。
【００８５】
パーム油を取得する方法
高収量のアブラヤシ植物からパーム油を取得する方法もまた開示される。本方法は上で説明された高収量のアブラヤシ植物を取得するステップと、高収量のアブラヤシ植物の果実からパーム油を分離するステップとを包含する。パーム油を分離するステップは、例えば果実房を収穫した後、２４時間以内に新鮮で傷んでいない果実から油を抽出するなどの従来のアプローチにより実施されることができる。
【００８６】
試験アブラヤシ植物の油収量を予測する方法
上記のように、試験アブラヤシ植物の油収量を予測する方法もまた提供される。本方法は（ｉ）試験アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のタンパク質レベルを決定するステップと、（ｉｉ）試験アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のタンパク質レベルと参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のタンパク質レベルとの間に差があるかを決定するステップと、（ｉｉｉ）差に基づいて試験アブラヤシ植物の油収量を予測するステップとを含む。
【００８７】
高収量のアブラヤシ植物を取得する方法において有用であるとして上で記載されたタンパク質は、試験アブラヤシ植物の油収量を予測する方法においてもまた有用である。
【００８８】
試験アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のタンパク質レベルを決定するステップは、親アブラヤシ植物ではなく試験アブラヤシ植物の果実に関して決定される点を除いて、例えば二次元蛍光ディファレンスゲル電気泳動、抗体に基づく検出、イムノブロット検出若しくはドットブロット検出に基づいて、及び／又は２個以上のタンパク質に関してといったように上記と同様に実施されることができる。
【００８９】
試験アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のタンパク質レベルと参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のタンパク質レベルとの間に差があるかを決定するステップは上記のように、例えば、試験アブラヤシ植物の中果皮組織のタンパク質レベルが参照アブラヤシ植物のレベルより、例えば１．１倍、１．２５倍、１．５倍、２倍、４倍又はそれ以上の倍率を超えて、例えば＜０．０２５、＜０．０５又は＜０．１のｐ値を伴って高い（或いは低い）ことに基づいて、また実施されることができる。さらに、差は特異的なタンパク質各々に関する上記の特異的な差のいずれかに基づいてもよく、例えばいくつかの実施形態において、試験アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のタンパク質レベルと参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のタンパク質レベルとの間の差は、受粉後１１〜１３週である試験アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中の５−メチルテトラヒドロプテロイルトリグルタミン酸ホモシステインメチルトランスフェラーゼのレベルが受粉後１１〜１３週である参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中の５−メチルテトラヒドロプテロイルトリグルタミン酸ホモシステインメチルトランスフェラーゼのレベルより高いことである。加えて、差は２個以上のタンパク質のレベルに関して決定されてもよい。
【００９０】
予測ステップは、例えば試験アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のタンパク質レベルと参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のタンパク質レベルとの間の差の量に基づいて、及び／又はタンパク質発現レベルと収量との間の相関に基づいて実施されてもよい。予測ステップはまた、例えば２個以上のタンパク質レベルに関する差に基づいて実施されてもよい。
【００９１】
高収量のアブラヤシ植物を取得するためのキット
上記のように、高収量のアブラヤシ植物を取得するためのキットもまた提供される。本キットは（ｉ）タンパク質を検出するための抗体と、（ｉｉ）参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織の抽出物とを含む。高収量のアブラヤシ植物を取得する方法において有用であるとして上で記載されたタンパク質は、高収量のアブラヤシ植物を取得するためのキットにおいてもまた有用である。また上記のように、上記タンパク質に対する抗体は当該技術分野で周知の方法により調製されてもよく、又は商業販売業者から取得されてもよい。
【００９２】
いくつかの実施形態において、本キットは、親アブラヤシ植物の果実の中果皮組織中のタンパク質レベルと参照アブラヤシ植物の果実の中果皮組織の抽出物におけるタンパク質レベルとの間に差があるかを決定するための抗体の使用を指示する説明書をさらに含む。かかる差があるかを決定するステップもまた上記のように実施されることができる。いくつかの実施形態において、本キットは、親アブラヤシ植物の後代を差に基づいて選択して高収量のアブラヤシ植物を取得することを指示する説明書をもまたさらに含む。親アブラヤシ植物の後代を選択するステップもまた上記のように実施されることができる。加えていくつかの実施形態において、本キットは、少なくとももう１つ他のタンパク質を検出する少なくとももう１つ他の抗体をさらに含む。
【実施例】
【００９３】
以下の実施例は例証の目的のためのもので、特許請求の範囲を限定することが意図されるものではない。
【００９４】
実施例１
タンパク質の二次元ディファレンスゲル電気泳動及び同定
目的
目的は、アブラヤシの中果皮組織中で差次的に発現しているタンパク質を高収量特性及び低収量特性をまたいで、並びに果実の発達時間をまたいで同定することを包含した。
【００９５】
方法
スクリーニング集団：
アブラヤシ植物の２つのスクリーニング集団として、各々３個体のヤシ植物からなる高収量のスクリーニング集団及び低収量のスクリーニング集団が用いられた。スクリーニング集団はＳｅｒｄａｎｇ  Ａｖｅｎｕｅ  ｄｕｒａ（少なくとも７５％はＳｅｒｄａｎｇ  Ａｖｅｎｕｅ  ｄｕｒａである）とＡＶＲＯＳ  ｐｉｓｉｆｅｒａ（少なくとも７５％はＡＶＲＯＳ  ｐｉｓｉｆｅｒａである）との交配に由来したものであり、ｔｅｎｅｒａ後代が産み出された。より具体的には、高収量スクリーニング集団は比較的多量、具体的には１ヘクタール当たり１年間で１０トンを超える量のパーム油を産み出すことが予め決定されていたアブラヤシ植物集団に由来して、それ故にＨ表現型とも呼ばれる高収量の表現型を持つものであった。低収量スクリーニング集団は比較的少量、具体的には１ヘクタール当たり１年間で６トンを下回る量のパーム油を産み出すことが予め決定されていたアブラヤシ植物集団に由来したものであり、それ故にｈ表現型とも呼ばれる低収量の表現型を持っていた。高収量集団及び低収量集団の収量決定は信頼できるアブラヤシ生産者により収集された４年間の統計データにより定義された。高収量スクリーニング集団について、高収量ヤシ３つがＨ２、Ｈ４及びＨ６と命名された。低収量スクリーニング集団について、低収量ヤシ３つがｈ１、ｈ６及びｈ９と命名された。
【００９６】
比較：
スクリーニング集団の３つの高収量ヤシ及び３つの低収量ヤシは各々、受粉後１２週（時間「ａ」）、受粉後１６週（時間「ｂ」）及び受粉後１８週（時間「ｃ」）の３時点にまたがってサンプリングされ、以下の比較に提供された。
１．高収量（１２週）対低収量（１２週）（「Ｈａ対ｈａ」とも呼ばれる）
２．高収量（１６週）対低収量（１６週）（「Ｈｂ対ｈｂ」とも呼ばれる）
３．高収量（１８週）対低収量（１８週）（「Ｈｃ対ｈｃ」とも呼ばれる）
４．高収量（１２週）対高収量（１６週）（「Ｈａ対Ｈｂ」とも呼ばれる）
５．高収量（１２週）対高収量（１８週）（「Ｈａ対Ｈｃ」とも呼ばれる）
６．低収量（１２週）対低収量（１６週）（「ｈａ対ｈｂ」とも呼ばれる）
７．低収量（１２週）対低収量（１８週）（「ｈａ対ｈｃ」とも呼ばれる）
【００９７】
具体的には、中果皮組織は各々のヤシの小果実から各時点において取得された。参考までに、胚乳における油の貯蔵は受粉後およそ１２週で開始して受粉後１６週までにほぼ完了し、一方、中果皮における油の貯蔵は受粉後およそ１５週で開始して受粉後およそ２０週である果実の成熟まで続く。受粉後１２週、１６週及び１８週の時点は、受粉後１２週は胚乳での油貯蔵の開始が示されるが中果皮での油貯蔵の開始には先行しており、受粉後１６週は受粉後の油生合成の始動に続いて中果皮における転写物の発現レベルが最も高い時点であることが示され、受粉後１８週は果実が成熟するにつれて転写物の発現が減少すると予想されるであろう時を示すという理由で選ばれた。
【００９８】
タンパク質サンプルの調製：
総中果皮タンパク質のサンプルは、受粉後１２週、１６週及び１８週である３つの高収量ヤシ植物各々及び３つの低収量ヤシ植物各々からのアブラヤシ小果実から、Ｈｅら、７  Ｆｏｒｅｓｔｒｙ  Ｓｔｕｄｉｅｓ  ｉｎ  Ｃｈｉｎａ  ２０、２０〜２３ページ（２００５年）のタンパク質抽出の改変された方法に基づいて抽出された。タンパク質サンプルは２−Ｄ細胞溶解バッファー（７Ｍ尿素、２Ｍチオ尿素及び４％ＣＨＡＰＳを含有する３０ｍＭ  Ｔｒｉｓ−ＨＣｌ、ｐＨ８．８）中に再懸濁された。混合液は４℃で超音波処理され、続いて室温で３０分間振とうされた。サンプルは１４０００ｒｐｍで３０分間遠心分離され、上清が収集された。上清画分のタンパク質濃度はＢｉｏ−Ｒａｄタンパク質アッセイ方法（Ｂｒａｄｆｏｒｄ、１９７６年）を用いて測定された。
【００９９】
内部標準：
内部標準は、各サンプルからのタンパク質、すなわち３つの高収量ヤシ及び３つの低収量ヤシ各々からの受粉後１２週、１６週及び１８週の３つの時点各々での総中果皮タンパク質を等量混合することにより作られた。内部標準は異なるゲルをまたがったタンパク質パターンの照合及び正規化に用いられ、それによってゲル間変動の問題を打ち消した。このアプローチはサンプル間の差について、関連する統計的有意差を伴う正確な定量化を可能とした。サンプル間のタンパク質の定量的な比較は、各タンパク質スポットの同じゲル内の内部標準に対する相対的変化に基づいてなされた。
【０１００】
ＣｙＤｙｅ標識：
各サンプルについて、３０μｇのタンパク質が１．０μｌの希釈されたＣｙＤｙｅと共に混合され、暗所において氷上に３０分間維持された。対比較からの各サンプルはそれぞれＣｙ３及びＣｙ５で標識された。内部標準はＣｙ２で標識された。標識反応は１．０μｌの１０ｍＭリジンを各サンプルに添加し、暗所において氷上でさらに１５分間インキュベートすることにより停止された。３つの標識サンプルは次いで互いに混合された。２×２−Ｄサンプルバッファー（８Ｍ尿素、４％ＣＨＡＰＳ、２０ｍｇ／ｍｌ  ＤＴＴ、２％ｐｈａｒｍａｌｙｔｅ及び微量のブロモフェノールブルー）、１００μｌのｄｅ−ｓｔｒｅａｋ溶液及び再水和バッファー（７Ｍ尿素、２Ｍチオ尿素、４％ＣＨＡＰＳ、２０ｍｇ／ｍｌ  ＤＴＴ、１％ｐｈａｒｍａｌｙｔｅ及び微量のブロモフェノールブルー）が総体積が２５０μｌになるように標識混合液に添加された。サンプルはよく混合されてスピンダウンされた。次いでサンプルはストリップホルダー内に収容された固定化ｐＨ勾配ゲル（「ＩＰＧ」）ストリップ上にロードされた。
【０１０１】
ディファレンスゲル電気泳動のゲル：
ディファレンスゲル電気泳動（「ＤＩＧＥ」）の解析ゲルは実験の後半部分でのゲル解析を促進するため、適切なサンプル対を含有するように設計された。以下のようなサンプル対を有する合計９個のＤＩＧＥゲルが生成された。
ゲル１：Ｈ２ａ、ｈ１ａ及び内部標準
ゲル２：Ｈ４ａ、ｈ６ａ及び内部標準
ゲル３：Ｈ６ａ、ｈ９ａ及び内部標準
ゲル４：Ｈ２ｂ、ｈ１ｂ及び内部標準
ゲル５：Ｈ４ｂ、ｈ６ｂ及び内部標準
ゲル６：Ｈ６ｂ、ｈ９ｂ及び内部標準
ゲル７：Ｈ２ｃ、ｈ１ｃ及び内部標準
ゲル８：Ｈ４ｃ、ｈ６ｃ及び内部標準
ゲル９：Ｈ６ｃ、ｈ９ｃ及び内部標準
したがって、ゲル１〜３、４〜６及び７〜９はそれぞれ受粉後１２週、１６週及び１８週の高収量ヤシ対低収量ヤシの比較に相当する。
【０１０２】
等電点電気泳動及びＳＤＳ−ポリアクリルアミドゲル電気泳動：
標識サンプルをｐＨ４〜７のＩＰＧストリップ上にロードした後、等電点電気泳動（「ＩＥＦ」）はＡｍｅｒｓｈａｍ  ＢｉｏＳｃｉｅｎｃｅｓの公知のプロトコールである２−Ｄ  Ｅｌｅｃｔｒｏｐｈｏｒｅｓｉｓ：Ｐｒｉｎｃｉｐｌｅｓ  ａｎｄ  Ｍｅｔｈｏｄｓ、４３〜７２ページ（２００４年）に従って行われた。ＩＥＦが終了した後、ＩＰＧストリップは調製したての平衡バッファー１（６Ｍ尿素、３０％グリセロール、２％ＳＤＳ、微量のブロモフェノールブルー及び１０ｍｇ／ｍｌ  ＤＴＴを含有する５０ｍＭ  Ｔｒｉｓ−ＨＣｌ、ｐＨ８．８）中で１５分間、穏やかに振とうしながらインキュベートされた。次いでＩＰＧストリップは調製したての平衡バッファー２（６Ｍ尿素、３０％グリセロール、２％ＳＤＳ、微量のブロモフェノールブルー及び４５ｍｇ／ｍｌ  ＤＴＴを含有する５０ｍＭ  Ｔｒｉｓ−ＨＣｌ、ｐＨ８．８）中で１０分間、穏やかに振とうしながらすすがれた。ＩＰＧストリップはＳＤＳ−ポリアクリルアミドゲル電気泳動（「ＳＤＳ−ＰＡＧＥ」）ゲル泳動バッファー中ですすがれ、次いで１２％ＳＤＳ−ＰＡＧＥゲルへと移された。ＳＤＳ−ＰＡＧＥゲルは１５℃で、色素の先端がゲルから流出するまで泳動された。
【０１０３】
画像のスキャン及びデータ解析：
ゲル画像はＳＤＳ−ＰＡＧＥ後、Ｔｙｐｈｏｏｎ  ＴＲＩＯ（Ａｍｅｒｓｈａｍ  ＢｉｏＳｃｉｅｎｃｅｓ）をその公知の使用方法に従って用いることにより、直ちにスキャンされた。スキャンされた画像は次いでＩｍａｇｅ  Ｑｕａｎｔソフトウェア（バージョン６．０、Ａｍｅｒｓｈａｍ  ＢｉｏＳｃｉｅｎｃｅｓ）、続いてデサイダー（商標）２Ｄソフトウェアバージョン６．５（Ａｍｅｒｓｈａｍ  ＢｉｏＳｃｉｅｎｃｅｓ）を用いた生物学的変動解析（「ＢＶＡ」）により解析された。
【０１０４】
結果
２Ｄ−ＤＩＧＥ解析ゲルからの結果：
２Ｄ−ＤＩＧＥ解析ゲルからの結果は図１〜９に示され、それぞれ（１）Ｈ２ａ対ｈ１ａ、（２）Ｈ４ａ対ｈ６ａ、（３）Ｈ６ａ対ｈ９ａ、（４）Ｈ２ｂ対ｈ１ｂ、（５）Ｈ４ｂ対ｈ６ｂ、（６）Ｈ６ｂ対ｈ９ｂ、（７）Ｈ２ｃ対ｈ１ｃ、（８）Ｈ４ｃ対ｈ６ｃ、及び（９）Ｈ６ｃ対ｈ９ｃの比較に相当している。
【０１０５】
ＤＩＧＥ解析ゲルはゲル交差ＢＶＡ解析に下のように用いられた。
ｉ）Ｈｂ対ｈｂ、（Ｈ２ｂ、Ｈ４ｂ、Ｈ６ｂ）対（ｈ１ｂ、ｈ６ｂ、ｈ９ｂ）に相当
ｉｉ）Ｈａ対ｈａ、（Ｈ２ａ、Ｈ４ａ、Ｈ６ａ）対（ｈ１ａ、ｈ６ａ、ｈ９ａ）に相当
ｉｉｉ）Ｈｃ対ｈｃ、（Ｈ２ｃ、Ｈ４ｃ、Ｈ６ｃ）対（ｈ１ｃ、ｈ６ｃ、ｈ９ｃ）に相当
ｉｖ）Ｈａ対Ｈｂ対Ｈｃ、（Ｈ２ａ、Ｈ４ａ、Ｈ６ａ）対（Ｈ２ｂ、Ｈ４ｂ、Ｈ６ｂ）対（Ｈ２ｃ、Ｈ４ｃ、Ｈ６ｃ）に相当
ｖ）ｈａ対ｈｂ対ｈｃ、（ｈ１ａ、ｈ６ａ、ｈ９ａ）対（ｈ１ｂ、ｈ６ｂ、ｈ９ｂ）対（ｈ１ｃ、ｈ６ｃ、ｈ９ｃ）に相当
【０１０６】
比較のため複数ゲルを照合してタンパク質存在量変化の統計解析を行うことに基づいて、ＢＶＡ解析はタンパク質スポットの差次的な発現を正確に指し示すことを実現する。このＢＶＡ解析において統計的有意差を決定する目的で、サンプルサイズが小さい（ｎ＝３）ことからｐ値＜０．１が各ゲル−ゲル間比較について適用された。このＢＶＡ解析で見出された差次的に発現したタンパク質の数は発現比が＞１．５倍に変化したものに絞られた。相当するゲル中のタンパク質スポットは、人工的な条斑のない良好な品質／解像度を持つスポットであることを確認するため、目視でクロスチェックされた。選別されたスポットは続いて質量分析（「ＭＳ」）を通じた同定のために採取された。
【０１０７】
これらの方法に従って、図１〜９に丸印で囲まれ計数されているタンパク質スポットとして示されるように、８４個のタンパク質スポットが差次的に発現したものとして、上記２Ｄ−ＤＩＧＥ解析の１つ以上における２Ｄ−ＤＩＧＥ  ＢＶＡ解析から検出された。
【０１０８】
８４個のスポットはＭＡＬＤＩ−ＴｏＦ／ＴｏＦを通じた質量分析同定のためにさらに６１個のスポットに絞られた。この絞り込みで実行された選択判断基準はｉ）ＤＩＧＥゲル上でのスポットの可視性、ｉｉ）１．５倍を超えるタンパク質発現の差、及びｉｉｉ）タンパク質アイソフォームの出現に基づくものであった。ＤＩＧＥゲル上で明瞭に見えなかった、１．５倍を下回る発現変化であった、又は既に同定されているアイソフォームに基づく重複があった候補スポットは、さらなる解析のために選択されなかった。
【０１０９】
２Ｄ−ＤＩＧＥ分取ゲル：
３つの分取ゲルが３つのＣｙＤｙｅ標識を用いて泳動された。個々のヤシからの総タンパク質サンプルは同定の目的のために混合されたが、その理由は個々のサンプルが十分なタンパク質を包含しなかったためである。分取ゲル用に選ばれたサンプルは下のものである。
ゲル１：Ｈ４ａ、ｈ６ａ、他のＨａ／ｈａの混合物
ゲル２：Ｈ４ｂ、ｈ６ｂ、他のＨｂ／ｈｂの混合物
ゲル３：Ｈ２ｃ、ｈ１ｃ、他のＨｃ／ｈｃの混合物
【０１１０】
分取ゲルは６１個の対象タンパク質スポット全てをスポット採取するために用いられた。採取された各スポットについて、相当するタンパク質の同一性がＭＳにより決定された。具体的には、各タンパク質はＭＡＬＤＩ−ＴｏＦ／ＴｏＦに供され、そのペプチド断片のアミノ酸配列が決定され、配列は最も近いホモログ同定のためにＮＣＢＩ非重複データベースと比較され、最も近いホモログの同一性に基づいて同一性がタンパク質に割り当てられた。
【０１１１】
この同一性解析は、表１に示されるようにアブラヤシ又は他の生物において以前に同定されたタンパク質と相同であり、かつ表２に示されるように高収量ヤシ若しくは低収量ヤシに関して及び／又は受粉後１２週、１６週若しくは１８週の時点をまたがって差次的に発現していて、それ故にアブラヤシにおいて高収量特性／低収量特性に関連している、アブラヤシタンパク質に相当する４５個の固有のタンパク質を同定する結果となった。具体的には、６１個のタンパク質スポットのうち、８個が信頼性のない照合をもたらした、すなわち８個のタンパク質スポット各々とＮＣＢＩ非重複データベースにおける最も近い相同タンパク質との間の照合用信頼性指数スコアは８０％未満であった。これら８個のタンパク質スポットはそれ以上考慮されなかった。さらに８個のタンパク質スポットが繰り返しの同定をもたらした、すなわち他のタンパク質スポットに関して同定が重複した。これら８個のタンパク質スポットもまたそれ以上考慮されなかった。残りの４５個の固有のタンパク質同定は以下のアブラヤシタンパク質に相当する。配列番号１を含む５−メチルテトラヒドロプテロイルトリグルタミン酸ホモシステインメチルトランスフェラーゼ、配列番号２を含むアブシジン酸ストレス熟成タンパク質、配列番号３を含むアクチン６、配列番号４を含むアクチンＥ、配列番号５を含むビオチンカルボキシラーゼ前駆体、配列番号６を含むコーヒー酸Ｏ−メチルトランスフェラーゼ、配列番号７を含むカタラーゼ２、配列番号８を含むリシナス・コムニス保存仮想的タンパク質オルソログ、配列番号９を含むフィブリリン様タンパク質、配列番号１０を含むフラボドキシン様キノンレダクターゼ１、配列番号１１を含むフルクトースビスホスフェートアルドラーゼ、配列番号１２を含むグリセルアルデヒド３−リン酸デヒドロゲナーゼ、配列番号１３を含むＨ０８２５Ｇ０２．１１オルソログ、配列番号１４を含むリブロース−１，５−ビスホスフェートカルボキシラーゼ／オキシゲナーゼ大サブユニット、配列番号１５を含むＬｅａ１Ｐ、配列番号１６を含むメチオニンシンターゼタンパク質、配列番号１７を含むミトコンドリアペルオキシレドキシン、配列番号１８を含むＯｓ０２ｇ０７５３３００オルソログ、配列番号１９を含むＯｓ０５ｇ０４８２７００オルソログ、配列番号２０を含むＯｓ１２ｇ０１６３７００オルソログ、配列番号２１を含むＯＳＪＮＢｂ００８５Ｆ１３．１７オルソログ、配列番号２２を含むオストレオコッカス・ルシマリヌスＣＣＥ９９０１予測タンパク質オルソログ、配列番号２３を含むフィスコミトレラ・パテンス亜種パテンス予測タンパク質オルソログ、配列番号２４を含むポプルス・トリコカルパ予測タンパク質オルソログ、配列番号２５を含むヴィティス・ヴィニフェラ仮想的タンパク質アイソフォーム１オルソログ、配列番号２６を含む新生ポリペプチド関連複合体α、配列番号２７を含むプロリンイミノペプチダーゼ、配列番号２８を含むタンパク質トランスポーター、配列番号２９を含むオリザ・サティバ・ジャポニカ群推定ＮＢＳ−ＬＲＲ病害抵抗性タンパク質ホモログオルソログ、配列番号３０を含むＲａｎ  ＧＴＰアーゼ結合タンパク質、配列番号３１を含む葉緑体トリオ��スリン酸イソメラーゼ、配列番号３２を含むＶ型プロトンＡＴＰアーゼ触媒サブユニットＡ、配列番号３３を含むリボヌクレアーゼ活性制御因子Ａ、配列番号３４を含むレトロエレメントｐｏｌポリタンパク質様オルソログ、配列番号３５を含むリボソームタンパク質Ｌ１０、配列番号３６を含む短鎖型デヒドロゲナーゼ、配列番号３７を含む温度誘導性リポカリン、配列番号３８を含むピセア・シトケンシス未知タンパク質オルソログ、配列番号３９を含む１７．６ｋＤａクラスＩ小熱ショックタンパク質、配列番号４０を含むＡＢＣ１ファミリータンパク質、配列番号４１を含むグルタチオンペルオキシダーゼ、配列番号４２を含むグルタチオンＳ−トランスフェラーゼ、配列番号４３を含むグルタチオン−Ｓ−トランスフェラーゼθ、配列番号４４を含むホスホリパーゼＤ、及び配列番号４５を含むＶＩＥＲ  Ｆ−ボックスタンパク質２。４５個のタンパク質の配列は図１０Ａ〜Ｍに提供される。注目すべきことに、配列番号１、３〜６、８〜１２、１７〜２１、２４〜２８、３１〜３３、３５〜４１、４３及び４４は、相当するｍＲＮＡ転写物のヌクレオチド配列を決定することにより推定される完全長タンパク質のアミノ酸配列に相当し、これらタンパク質自体はＭＳにより決定されるタンパク質の様々な非連続ペプチド断片のアミノ酸配列に基づいて同定された。対照的に、配列番号２、７、１３〜１６、２２、２３、２９、３０、３４、４２及び４５は、非完全長の、すなわち相当する完全長タンパク質のＮ末端若しくはＣ末端の配列が決定されていないタンパク質配列、又はＭＳにより決定されるタンパク質の様々な非連続ペプチド断片のアミノ酸配列に相当する。
【０１１２】
実施例２
４５個の固有の差次的発現タンパク質の機能
実施例１で同定された４５個の固有の差次的発現タンパク質は、表１に示されるように、予測される分子機能、経路関係及び酵素分類に基づいて注釈を付けられた。驚くべきことに、４５個のタンパク質のうち、３個のみが機能的に脂質代謝に関連している。３個のタンパク質はホスホリパーゼＤ、ビオチンカルボキシラーゼ前駆体及びフルクトースビスホスフェートアルドラーゼである。さらに１７個のみがいわゆるＫＥＧＧ経路、すなわち炭水化物、アミノ酸、脂質、ヌクレオチド、エネルギー又は二次代謝物の代謝においてそこに属するタンパク質が役割を果たす経路へのマッピングに成功したが、このマッピングはｈｔｔｐ：／／ｗｗｗ．ｇｅｎｏｍｅ．ｊｐ／ｋｅｇ／ｐａｔｈｗａｙ，ｈｔｍｌにて利用可能である（最終アクセスは２０１０年１１月）、ＫＥＧＧ（Ｋｙｏｔｏ  Ｅｎｃｙｃｌｏｐｅｄｉａ  ｏｆ  Ｇｅｎｅｓ  ａｎｄ  Ｇｅｎｏｍｅｓ）経路データベースに従ったものである。１７個のタンパク質としては、上記３個の脂質代謝タンパク質と、５−メチルテトラヒドロプテロイルトリグルタミン酸ホモシステインメチルトランスフェラーゼ、コーヒー酸Ｏ−メチルトランスフェラーゼ、カタラーゼ２、グリセルアルデヒド３−リン酸デヒドロゲナーゼ、リブロース−１，５−ビスホスフェートカルボキシラーゼ／オキシゲナーゼ大サブユニット、メチオニンシンターゼタンパク質、プロリンイミノペプチダーゼ、Ｒａｎ  ＧＴＰアーゼ結合タンパク質、葉緑体トリオースリン酸イソメラーゼ、Ｖ型プロトンＡＴＰアーゼ触媒サブユニットＡ、グルタチオンペルオキシダーゼ、グルタチオンＳ−トランスフェラーゼ、グルタチオン−Ｓ−トランスフェラーゼθ及びＶＩＥＲ  Ｆ−ボックスタンパク質２が挙げられる。残りの２８個の差次的発現タンパク質は油の生合成に関与することは知られていなかった。残りのタンパク質としては、アブシジン酸ストレス熟成タンパク質、アクチン６、アクチンＥ、リシナス・コムニス保存仮想的タンパク質オルソログ、フィブリリン様タンパク質、フラボドキシン様キノンレダクターゼ１、Ｈ０８２５Ｇ０２．１１オルソログ、Ｌｅａ１Ｐ、ミトコンドリアペルオキシレドキシン、Ｏｓ０２ｇ０７５３３００オルソログ、Ｏｓ０５ｇ０４８２７００オルソログ、Ｏｓ１２ｇ０１６３７００オルソログ、ＯＳＪＮＢｂ００８５Ｆ１３．１７オルソログ、オストレオコッカス・ルシマリヌスＣＣＥ９９０１予測タンパク質オルソログ、フィスコミトレラ・パテンス亜種パテンス予測タンパク質オルソログ、ポプルス・トリコカルパ予測タンパク質オルソログ、ヴィティス・ヴィニフェラ仮想的タンパク質アイソフォーム１オルソログ、新生ポリペプチド関連複合体α、タンパク質トランスポーター、オリザ・サティバ・ジャポニカ群推定ＮＢＳ−ＬＲＲ病害抵抗性タンパク質ホモログオルソログ、リボヌクレアーゼ活性制御因子Ａ、レトロエレメントｐｏｌポリタンパク質様オルソログ、リボソームタンパク質Ｌ１０、短鎖型デヒドロゲナーゼ、温度誘導性リポカリン、ピセア・シトケンシス未知タンパク質オルソログ、１７．６ｋＤａクラスＩ小熱ショックタンパク質及びＡＢＣ１ファミリータンパク質が挙げられる。
【０１１３】
実施例３
様々な４５個の固有の差次的発現タンパク質のドットブロットに基づく検出
目的
目的は、実施例１のＤＩＧＥ実験から取得されたタンパク質の導出を高収量アブラヤシ及び低収量アブラヤシのより大きな集団において検証することを包含した。
【０１１４】
方法
サンプル：６つの時点、すなわち受粉後１２週、１４週、１６週、１８週、２０週及び２２週にまたがって取得された、８個の高収量ヤシ及び８個の低収量ヤシの中果皮組織が用いられた。
【０１１５】
抗体：４５個の固有の差次的発現タンパク質のうち２７個に対する抗体が表３に指し示すように様々な供給者から取得された。
【０１１６】
タンパク質の抽出（ＴＣＡ抽出）：−２０℃で予め冷却されたＴＣＡ抽出バッファー（１０％ＴＣＡ（１０ｇ）、０．００７％ＤＴＴ（７０ｍｇ）及びアセトン（最終容量１００ｍｌになるように）を含有し、−２０℃で保存された）（０．２ｇ＋０．５ｍｌ）は微細な粉末形態の中果皮サンプルに添加された。サンプルは小型のプラスチックの粉砕機を用いてさらに粉砕された。サンプルは混合され、よくすりつぶされた。次いで新たに１ｍｌのバッファーが添加されて、サンプルは−２０℃で１時間インキュベートされた。サンプルは次いで最大速度（１３．２ｇ）で４℃において１５分間遠心分離に供された。チューブは氷上に静置され、上清がピペットを用いて除去された。１．８ｍｌ量の洗浄バッファー（０．００７％ＤＴＴ（７０ｍｇ）及びアセトン（最終容量１００ｍｌになるように）を含有し、−２０℃で保存された）が添加され、ペレットは再懸濁されてピペットチップを用いて押しつぶされた。サンプルは次いで−２０℃で１時間インキュベートされた。サンプルは最大速度で４℃において１５分間、再び遠心分離に供された。上清が除去され、洗浄ステップは合計３回繰り返された。サンプル粉末は氷上で３０分間風乾された。乾燥粉末は次いで５００μｌの溶解／ＵＳＢバッファー（９Ｍ尿素（５．４ｇ）、４％ＣＨＡＰＳ（０．４ｇ）、１％ＤＴＴ（０．１ｇ）、１％両性電解質ｐＨ３〜１０（２５０μｌ）、３５ｍＭ  Ｔｒｉｓ  Ｂａｓｅ（０．０４２４ｇ）、滅菌ＭｉｌｌｉＱ水（最終容量１０ｍｌになるように）を含有し、全て０．２μｍ孔径の膜を通じて濾過されて−２０℃で保存された）に再懸濁された。サンプルは３７℃で１時間、連続振とうしながらインキュベートされた。サンプルは最大速度で室温において１５分間遠心分離に供された。上清はきれいなチューブに移されて−８０℃で保存された。ペレットはさらなる使用のためのバックアップとして−８０℃で保存された。タンパク質をペレットからさらに溶出するため、追加で５００μｌの溶解／ＵＳＢバッファーを添加し、その後にペレットを室温で１時間振とうしながらインキュベートし、バックアップの上清をきれいなマイクロ遠心チューブに移し、最後に−８０℃で保存することが可能である。
【０１１７】
タンパク質の定量（Ｂｒａｄｆｏｒｄアッセイ）：タンパク質ストックの５倍希釈に相当するサンプルが定量化のために調製された。ＢＳＡストック濃度は１．４μｇ／μｌであった。２倍段階希釈で６点が標準曲線を作成するのに用いられた。サンプルについて取得された濃度は０．２４４μｇ／μｌ（最低）〜２．９３４μｇ／μｌ（最高）の範囲であった。タンパク質ストックの濃度を決定することで、終濃度０．２μｇ／μｌの作業ストック（３３０μｌ）が膜上へのドットブロットのためにＰＢＳバッファー（＋１０％グリセロール）を用いて調製された。
【０１１８】
ドットブロットスクリーニング：
３８６ピンのレプリケーターを用いたドットブロットアレイ：各ブロットについて、ニトロセルロース膜が２．９５×４．６インチに切断され、シングルウェルプレート上に貼られた。プレートは別の空プレートの上部で膜が積み重ねられ、次いでスタンプガイドが両プレートにわたって積み重ねられた。タンパク質サンプルは２つの濃度、０．２０μｇ／μｌ及び０．０２μｇ／μｌ（１０×希釈）に調製された。レプリケーターは３８６ウェルプレート内に浸され、旋回された。レプリケーターは持ち上げられて、ガイドピンはスタンプガイド上のガイドスロットに入れられた。ブロットは次いでスタンプされ、扇風乾燥された。膜が完全に乾燥したら、スタンプ手順は合計５回繰り返された（レプリケーターのピンは０．２μｌのサンプルを運搬するため、０．２０μｇ又は０．０２μｇのタンパク質をそれぞれのスポット上にスタンプすることに等しい）、膜は各処置の後に扇風乾燥された。膜は次いで一晩風乾された。膜はプレートから除去され、サイズを切り下げられた。膜は元の保護紙の間に挟まれた状態で維持され、気密容器中で乾燥環境下で使用まで保存された。
【０１１９】
スクリーニングのための調製：個々の膜はガラススライド上に、スライド毎に２個ずつ、背面が内向きに面するように切り抜かれた。切り抜かれた膜は冷０．１％ＰＢＳ−Ｔ（ｐＨ７．４）で満たされた容器内に浸され、速度およそ７でマグネチックスターラー上で４０分間撹拌された。０．１％ＰＢＳ−Ｔは冷０．０５％ＰＢＳ−Ｔで置換され、洗浄が１５分間続けられた。０．０５％ＰＢＳ−Ｔは新しい冷０．０５％ＰＢＳ−Ｔで置換され、撹拌が７分間続けられた後、置換ステップ及び撹拌ステップが繰り返された。
【０１２０】
抗体のインキュベーション：膜は清浄で適切なサイズのインキュベーション容器内に敷かれ、膜の下に閉じ込められた泡は全て除去された。１ｍｌ量のＰＢＳ−Ｔ  ０．０５％が何もない膜上にピペットで移され、１ｍｌの抗体が相当する膜上でＰＢＳ−Ｔ  ０．０５％中で希釈された。膜は振とうされ、膜表面全体が覆われたことが確実にされた。容器は湿った状態を維持するため、ラップフィルムで包む前に湿ったｃ折タオルで覆われた。膜は次いで、個々の抗体に最適な条件に応じて、Ｂｅｌｌｙ  Ｄａｎｃｅｒ実験室用振とう機上で４℃で一晩又は室温で２〜３時間インキュベートされた。用いられた血清はさらなる実験のために保持されるか、又はオートクレーブされるためにボトル内に廃棄された。膜はガラススライド上に切り抜かれた。膜は冷０．０５％ＰＢＳ−Ｔ中で１５分間洗浄され、次いで新しい０．０５％ＰＢＳ−Ｔ中で２回、各々の回で７分間洗浄された。膜は清潔なインキュベーション容器内に再び敷かれ、膜の下に泡が閉じ込められていないことが確実にされた。０．０５％ＰＢＳ−Ｔ中で希釈された１ｍｌ量の二次抗体が各々の膜に添加された。バックグラウンドのシグナルを伴う二次抗体について、１％ＢＳＡを用いて室温で４０分間振とうしながら前吸着が行われた。容器は上と同様のパターンで覆われ、Ｂｅｌｌｙ  Ｄａｎｃｅｒ実験室用振とう機上で室温において２．５時間インキュベートされた。二次抗体は廃棄され、次いで上述の洗浄ステップが１５分間、７分間及び７分間、各々の回で新しい冷０．０５％ＰＢＳ−Ｔを用いて繰り返された。
【０１２１】
顕色及び記録：膜はインキュベーション容器内に再び敷かれ、膜の下に泡が閉じ込められていないことが確実にされ、残存０．０５％ＰＢＳ−Ｔは全て膜からはじいて飛ばされた。新しいＮＢＴ／ＢＣＩＰは製造業者のガイドラインに従ってアルカリホスファターゼ（ＡＰ）バッファー（１００ｍＭ  Ｔｒｉｓ［ｐＨ９．０］、１５０ｍＭ  ＮａＣｌ、１ｍＭ  ＭｇＣｌ２）を用いて調製された。１．５ｍｌ量のＮＢＴ／ＢＣＩＰ溶液が各々の膜に添加され、その後Ｂｅｌｌｙ  Ｄａｎｃｅｒ実験室用振とう機上で陽性対照の紫色が良好に顕色されるまで（およそ３０〜４５分）インキュベートされた。反応は次いで膜を水中ですすいで浸すことにより停止された。顕色された膜はＨＰ紙スキャナーをＨＰ  Ｄｉｒｅｃｔｏｒソフトウェアと共に（膜が湿っているうちに）用いることによりスキャンされ、結果の画像はＴＩＦＦ形式で保存された。設定は（ａ）ハイライト：２５５、（ｂ）シャドー：５０、（ｃ）中間色：２．００、（ｄ）シャープ化：中、（ｅ）解像度：１５０、及び（ｆ）ホワイトレベル：２４０であった。スキャンされた画像はＡｄｏｂｅ  Ｐｈｏｔｏｓｈｏｐ  Ｃ８４  Ｅｘｔｅｎｄｅｄ＆Ｏｌｙｍｐｕｓ  Ｍｉｃｒｏソフトウェアを用いることによりさらに加工され、スポット濃度が自動的に取り込まれてＭｉｃｒｏｓｏｆｔ  Ｅｘｃｅｌスプレッドシートへと変換された。ドットブロットイムノアッセイから生じたデータはＭａｎｎ  Ｗｈｉｔｎｅｙ統計検定を用いて解析された。
【０１２２】
結果
ドットブロットイムノアッセイの結果は、表４に示されるように、アッセイに供された２７個のタンパク質のうち１１個について発現の有意な差を指し示した。具体的には、受粉後１２週に試験された中果皮において、コーヒー酸Ｏ−メチルトランスフェラーゼ、葉緑体トリオースリン酸イソメラーゼ、ＡＢＣ１ファミリータンパク質、新生ポリペプチド関連複合体α、グルタチオンペルオキシダーゼ及びフルクトースビスホスフェートアルドラーゼのタンパク質が差次的に発現していることが見出された。受粉後１４週に試験された中果皮において、新生ポリペプチド関連複合体α及びリボソームタンパク質Ｌ１０が高収量ヤシと低収量ヤシとの間で差次的に発現していることが見出された。受粉後１６週に試験された中果皮において、葉緑体トリオースリン酸イソメラーゼが差次的に発現していた。受粉後２０週に試験された中果皮において、グルタチオン−Ｓ−トランスフェラーゼθ及びフィスコミトレラ・パテンス亜種パテンス予測タンパク質オルソログが高収量及び低収量の中果皮において差次的に発現していた。そして受粉後２２週に試験された中果皮において、リブロース−１，５−ビスホスフェートカルボキシラーゼ／オキシゲナーゼタンパク質大サブユニット及び１７．６ｋＤａクラスＩ小熱ショックタンパク質が高収量ヤシと低収量ヤシとの間で差次的に発現していた。
【産業上の利用可能性】
【０１２３】
本明細書に開示される方法及びキットは高収量のアブラヤシの取得及び試験アブラヤシ植物の油収量の予測に有用であり、それ故に商業的なパーム油生産の改良に有用である。
【０１２４】
【表１−１】
2013099311.tif 000002
【表１−２】
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【表１−３】
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【表１−４】
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【表１−５】
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【表１−６】
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【０１２５】
【表２−１】
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【表２−２】
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【表２−３】
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【表２−４】
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【表２−５】
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【表２−６】
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【０１２６】
【表３】
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【０１２７】
【表４】
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【図１０Ａ】
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【図１０Ｂ】
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【図１０Ｃ】
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【図１０Ｄ】
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【図１０Ｅ】
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【図１０Ｆ】
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【図１０Ｇ】
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【図１０Ｈ】
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【図１０Ｉ】
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【図１０Ｊ】
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【図１０Ｋ】
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【図１０Ｌ】
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【図１０Ｍ】
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【図１】
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【図２】
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【図３】
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【図４】
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【図５】
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【図６】
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【図７】
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【図８】
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【図９】
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【配列表】
2013099311000001.app
【外国語明細書】
2013099311000001.pdf