【手続補正書】
【提出日】平成26年10月2日(2014.10.2)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
少なくとも４０個の連続するアミノ酸を含む非構造組換えポリマー（ＵＲＰ）であって、ここで、
（ａ）該ＵＲＰに含まれるグリシン（Ｇ）、アスパラギン酸（Ｄ）、アラニン（Ａ）、セリン（Ｓ）、スレオニン（Ｔ）、グルタミン酸（Ｅ）、およびプロリン（Ｐ）の残基の総和は、該ＵＲＰの全体のアミノ酸の約８０％より多くを構成し；かつ
（ｂ）該ＵＲＰのアミノ酸のうち少なくとも５０％は、Ｃｈｏｕ−Ｆａｓｍａｎアルゴニズムによって決定される二次構造には存在せず；かつ
（ｃ）該ＵＲＰは、−４以下のＴエピトープスコアを有し；かつ
（ｄ）該ＵＲＰは、３種、４種、５種、または６種の異なる型のアミノ酸のみを含み；かつ
（ｅ）該ＵＲＰは、５％より多くのグルタミン酸、および２％未満のリジンまたはアルギニンを含む、
ポリマー。
【請求項２】
少なくとも４０個の連続するアミノ酸を含む非構造組換えポリマー（ＵＲＰ）であって、ここで、
（ａ）該ＵＲＰに含まれるグリシン（Ｇ）、アスパラギン酸（Ｄ）、アラニン（Ａ）、セリン（Ｓ）、スレオニン（Ｔ）、グルタミン酸（Ｅ）、およびプロリン（Ｐ）の残基の総和は、該ＵＲＰの全体のアミノ酸の約８０％より多くを構成し；かつ
（ｂ）該ＵＲＰのアミノ酸のうち少なくとも５０％は、Ｃｈｏｕ−Ｆａｓｍａｎアルゴニズムによって決定される二次構造には存在せず；かつ
（ｃ）該ＵＲＰは、−４以下のＴエピトープスコアを有し；かつ
（ｄ）該ＵＲＰは、３種、４種、５種、または６種の異なる型のアミノ酸のみを含み；かつ
（ｅ）該ＵＲＰに含まれるセリン（Ｓ）は、該ＵＲＰの全体のアミノ酸の約２０％より多くを構成する、
ポリマー。
【請求項３】
前記ＵＲＰが非天然アミノ酸配列を含む、請求項１または２に記載のＵＲＰ。
【請求項４】
異種タンパク質への前記ＵＲＰの取り込みの際に、該異種タンパク質は、該ＵＲＰが欠損している対応するタンパク質と比較して、少なくとも２倍長い血清半減期を示す、請求項１または２に記載のＵＲＰ。
【請求項５】
異種タンパク質への前記ＵＲＰの取り込みにより、サイズ排除クロマトグラフィによって概算したとき見かけのタンパク質の分子量の少なくとも２倍の増加をもたらす、請求項１または２に記載のＵＲＰ。
【請求項６】
グリシン（Ｇ）、アスパラギン酸（Ｄ）、アラニン（Ａ）、セリン（Ｓ）、スレオニン（Ｔ）、グルタミン酸（Ｅ）、およびプロリン（Ｐ）からなる群より単独で選択されるアミノ酸の任意の１つの型が、前記ＵＲＰの全体のアミノ酸の約２０％より多くを構成する、請求項１に記載のＵＲＰ。
【請求項７】
グリシン（Ｇ）、アスパラギン酸（Ｄ）、アラニン（Ａ）、セリン（Ｓ）、スレオニン（Ｔ）、グルタミン酸（Ｅ）、およびプロリン（Ｐ）からなる群より単独で選択されるアミノ酸の任意の１つの型が、前記ＵＲＰの全体のアミノ酸の約３０％より多くを構成する、請求項１または２に記載のＵＲＰ。
【請求項８】
前記ＵＲＰが約１００個より多くの連続するアミノ酸を含む、請求項１または２に記載のＵＲＰ。
【請求項９】
前記ＵＲＰが約２００個より多くの連続するアミノ酸を含む、請求項１または２に記載のＵＲＰ。
【請求項１０】
前記ＵＲＰが、少なくとも４種の異なる型のアミノ酸を含む、請求項１または２に記載のＵＲＰ。
【請求項１１】
前記ＵＲＰが、グリシン（Ｇ）またはグルタミン酸（Ｅ）を含む、請求項２に記載のＵＲＰ。
【請求項１２】
機能モジュールに融合した請求項１または２に記載の１種以上のＵＲＰを含むタンパク質であって、該１種以上のＵＲＰは該機能モジュールに関して異種であり、そして該タンパク質は、該ＵＲＰが欠損している対応するタンパク質と比較して、少なくとも２倍延長される血清半減期を示す、タンパク質。
【請求項１３】
前記機能モジュールが、エフェクターモジュール、結合モジュール、Ｎ末端モジュールおよびＣ末端モジュールから選択される、請求項１２に記載のタンパク質。
【請求項１４】
前記機能モジュールが、結合モジュールである、請求項１３に記載のタンパク質。
【請求項１５】
前記機能モジュールが、エフェクターモジュールである、請求項１３に記載のタンパク質。
【請求項１６】
複数の結合モジュールを含み、個々の該結合モジュールが同じまたは異なる標的に対する結合特異性を示す、請求項１４に記載のタンパク質。
【請求項１７】
凝集体中のＵＲＰの全長が約２００アミノ酸を超える、請求項１２に記載のタンパク質。
【請求項１８】
１個以上の結合モジュールを含み、該結合モジュールが、システインの骨格内対合によって形成されるジスルフィド含有骨格を含む、請求項１２に記載のタンパク質。
【請求項１９】
前記エフェクターモジュールが細胞傷害性である、請求項１５に記載のタンパク質。
【請求項２０】
前記結合モジュールが標的分子に特異的であり、該標的が、細胞表面タンパク質、分泌タンパク質、細胞質ゾルタンパク質、および核タンパク質からなる群より選択される、請求項１４に記載のタンパク質。
【請求項２１】
標的分子に特異的な結合モジュールを含み、該標的がイオンチャネルである、請求項１２に記載のタンパク質。
【請求項２２】
請求項１、２、または１２に記載のＵＲＰをコードするコード配列を含む組換えポリヌクレオチド。
【請求項２３】
請求項２２に記載の組換えポリヌクレオチドを含む宿主細胞。
【請求項２４】
請求項２２に記載の組換えポリヌクレオチドを含むベクター。
【請求項２５】
タンパク質の血清半減期を増加させる方法であって：
該タンパク質を１つ以上の非構造組換えポリマー（ＵＲＰ）と融合させる工程であって、該ＵＲＰは少なくとも約４０個の連続するアミノ酸を含み、そして、
（ａ）該ＵＲＰに含まれるグリシン（Ｇ）、アスパラギン酸（Ｄ）、アラニン（Ａ）、セリン（Ｓ）、スレオニン（Ｔ）、グルタミン酸（Ｅ）、およびプロリン（Ｐ）の残基の総和は、該ＵＲＰの全体のアミノ酸の約８０％より多くを構成し；かつ
（ｂ）該ＵＲＰのアミノ酸のうち少なくとも５０％は、Ｃｈｏｕ−Ｆａｓｍａｎアルゴニズムによって決定される二次構造には存在せず；かつ
（ｃ）該ＵＲＰは、−４以下のＴエピトープスコアを有し；かつ
（ｄ）該ＵＲＰは、３種、４種、５種、または６種の異なる型のアミノ酸のみを含み；かつ
（ｅ）該ＵＲＰは、５％より多くのグルタミン酸、および２％未満のリジンまたはアルギニンを含む、
工程を包含する方法。
【請求項２６】
タンパク質の血清半減期を増加させる方法であって：
該タンパク質を１つ以上の非構造組換えポリマー（ＵＲＰ）と融合させる工程であって、該ＵＲＰは少なくとも約４０個の連続するアミノ酸を含み、そして、
（ａ）該ＵＲＰに含まれるグリシン（Ｇ）、アスパラギン酸（Ｄ）、アラニン（Ａ）、セリン（Ｓ）、スレオニン（Ｔ）、グルタミン酸（Ｅ）、およびプロリン（Ｐ）の残基の総和は、該ＵＲＰの全体のアミノ酸の約８０％より多くを構成し；かつ
（ｂ）該ＵＲＰのアミノ酸のうち少なくとも５０％は、Ｃｈｏｕ−Ｆａｓｍａｎアルゴニズムによって決定される二次構造には存在せず；かつ
（ｃ）該ＵＲＰは、−４以下のＴエピトープスコアを有し；かつ
（ｄ）該ＵＲＰは、３種、４種、５種、または６種の異なる型のアミノ酸のみを含み；かつ
（ｅ）該ＵＲＰに含まれるセリン（Ｓ）は、該ＵＲＰの全体のアミノ酸の約２０％より多くを構成する、
工程を包含する方法。
【請求項２７】
前記タンパク質の血清半減期を少なくとも２倍延長する、請求項２５または２６に記載の方法。
【請求項２８】
前記ＵＲＰが非天然アミノ酸配列を含む、請求項２５または２６に記載の方法。
【請求項２９】
前記ＵＲＰが、Ｃｈｏｕ−Ｆａｓｍａｎアルゴニズムによって決定される二次構造を実質的に欠いている、請求項２５または２６に記載の方法。
【請求項３０】
前記ＵＲＰに含まれるグリシン残基が、該ＵＲＰの全体のアミノ酸の少なくとも約５０％を構成する、請求項２５または２６に記載の方法。
【請求項３１】
前記ＵＲＰが反復配列を含む、請求項２５または２６に記載の方法。
【請求項３２】
前記タンパク質が、薬学的に活性なタンパク質である、請求項２５または２６に記載の方法。
【請求項３３】
前記タンパク質が、結合モジュール、エフェクターモジュール、多量体化モジュール、Ｃ末端モジュール、およびＮ末端モジュールからなる群より選択される１つ以上のモジュールを含む、請求項２５または２６に記載の方法。
【請求項３４】
前記ＵＲＰが、グリシン（Ｇ）、アスパラギン酸（Ｄ）、アラニン（Ａ）、セリン（Ｓ）、スレオニン（Ｔ）、グルタミン酸（Ｅ）、およびプロリン（Ｐ）からなる群より選択される３種、４種、５種、または６種の異なる型のアミノ酸のみを含む、請求項２５または２６に記載の方法。
【請求項３５】
前記薬学的に活性なタンパク質が、サイトカイン、増殖因子、酵素、受容体、マイクロプロテイン、ホルモン、エリスロポエチン、アデノシンデイミナーゼ、アスパラギナーゼ、アルギナーゼ、インターフェロン、成長ホルモン、成長ホルモン放出ホルモン、Ｇ−ＣＳＦ、ＧＭ−ＣＳＭ、インスリン、ヒルジン、ＴＮＦ−受容体、ウリカーゼ、ラスブリカーゼ、アキソキン、ＲＮアーゼ、ＤＮアーゼ、ホスファターゼ、シュードモナスエキソトキシン、リシン、ゲロニン、デスモテプラーゼ、ラロニダーゼ、トロンビン、血液凝固酵素、ＶＥＧＦ、プロトロピン、ソマトロピン、アルテプラーゼ、インターロイキン、第ＶＩＩ因子、第ＶＩＩＩ因子、第Ｘ因子、第ＩＸ因子、ドルナーゼ、グルコセレブロシダーゼ、ホリトロピン、グルカゴン、甲状腺刺激ホルモン、ネシリチド、アルテプラーゼ、テリパラチド、アガルシダーゼ、ラロニダーゼ、メチオニナーゼからなる群より選択される、請求項２５または２６に記載の方法。
【請求項３６】
グリシン（Ｇ）、アスパラギン酸（Ｄ）、アラニン（Ａ）、セリン（Ｓ）、スレオニン（Ｔ）、グルタミン酸（Ｅ）、およびプロリン（Ｐ）からなる群より単独で選択されるアミノ酸の任意の１つの型が、前記ＵＲＰの全体のアミノ酸の約２０％より多くを構成する、請求項２５に記載の方法。