(57)【要約】  本発明は、アミノ酸配列中に改変を含むＡＡＶカプシドタンパク質、ならびに改変されたＡＡＶカプシドタンパク質を含むウイルスベクターを提供する。本発明は、本発明のウイルスベクターおよびウイルスカプシドをインビボで細胞にまたは対象に投与する方法もまた提供する。
2018528253.tif 000002
【特許請求の範囲】
【請求項１】
１つまたは複数のアミノ酸置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、前記１つまたは複数の置換が、前記ＡＡＶカプシドタンパク質上の１つまたは複数の抗原性部位を改変する、アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質。
【請求項２】
前記１つまたは複数の抗原性部位の前記改変が、前記１つもしくは複数の抗原性部位への抗体による結合の阻害、および／または前記ＡＡＶカプシドタンパク質を含むウイルス粒子の感染力の中和の阻害を生じる、請求項１に記載のＡＡＶカプシドタンパク質。
【請求項３】
前記１つまたは複数のアミノ酸置換が、ＡＡＶカプシドタンパク質を含むＡＡＶ−抗体複合体のペプチドエピトープマッピングおよび／またはクライオ電子顕微鏡研究によって同定された１つまたは複数の抗原性フットプリント中にある、請求項１または２に記載のＡＡＶカプシドタンパク質。
【請求項４】
ＡＡＶ１、ＡＡＶ２、ＡＡＶ３、ＡＡＶ４、ＡＡＶ５、ＡＡＶ６、ＡＡＶ７、ＡＡＶ８、ＡＡＶ９、ＡＡＶ１０、ＡＡＶ１１、ＡＡＶ１２、ＡＡＶｒｈ．８、ＡＡＶｒｈ．１０、ＡＡＶｒｈ．３２．３３、ウシＡＡＶまたはトリＡＡＶから選択されるＡＡＶ血清型のものである、請求項１から３のいずれか１項に記載のＡＡＶカプシドタンパク質。
【請求項５】
前記１つまたは複数の抗原性部位が、共通抗原性モチーフである、請求項３に記載のＡＡＶカプシドタンパク質。
【請求項６】
前記１つまたは複数の抗原性部位の前記１つまたは複数の置換が、第１のＡＡＶ血清型のカプシドタンパク質由来の１つまたは複数の抗原性部位を、前記第１のＡＡＶ血清型とは異なる第２のＡＡＶ血清型のカプシドタンパク質中に導入する、請求項１から５のいずれか１項に記載のＡＡＶカプシドタンパク質。
【請求項７】
ネイティブＡＡＶ１カプシドタンパク質のアミノ酸位置２６２〜２６８（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７（配列番号１８）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＳ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＡ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＳ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＴ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ６がＡ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ７がＳ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ１）。
【請求項８】
ネイティブＡＡＶ１カプシドタンパク質のアミノ酸位置３７０〜３７９（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｘ９Ｘ１０（配列番号１９）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＶ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＦ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＭ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＩ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＰ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ６がＱ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ７がＹ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ８がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ９がＹ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ１０がＬ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ３）。
【請求項９】
ネイティブＡＡＶ１カプシドタンパク質のアミノ酸位置４５１〜４５９（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｘ９（配列番号２０）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＮ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＱ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＳ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＳ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ６がＡ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ７がＱ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ８がＮ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ９がＫ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ４−１）。
【請求項１０】
ネイティブＡＡＶ１カプシドタンパク質のアミノ酸位置４９３〜５００（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８（配列番号２８）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＫ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＴ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＤ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＮ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＮ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ６がＮ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ７がＳ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ８がＮ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ５）。
【請求項１１】
ネイティブＡＡＶ１カプシドタンパク質のアミノ酸位置５８８〜５９７（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｘ９−Ｘ１０（配列番号３１）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＳ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＴ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＤ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＰ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＡ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ６がＴ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ７がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ８がＤ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ９がＶ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ１０がＨ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ８）。
【請求項１２】
ネイティブＡＡＶ１カプシドタンパク質のアミノ酸位置７０９〜７１０（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＡ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ２がＮ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ９−１）。
【請求項１３】
ネイティブＡＡＶ１カプシドタンパク質のアミノ酸位置７１６〜７２２（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７（配列番号４０）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＤ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＮ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＮ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＬ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ６がＹ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ７がＴ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ９−２）。
【請求項１４】
Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｘ９（配列番号２１）が、
（ａ）ＱＶＲＧ（ＡＡＶ１ｅ１、配列番号２２）である；
（ｂ）ＥＲＰＲ（ＡＡＶ１ｅ４、配列番号２３）である；
（ｃ）ＧＲＧＧ（ＡＡＶ１ｅ２、配列番号２４）である；
（ｄ）ＳＧＧＲ（ＡＡＶ１ｅ３、配列番号２５）である；
（ｅ）ＳＥＲＲ（ＡＡＶ１ｅ５、配列番号２６）である；
（ｆ）ＬＲＧＧ（ＡＡＶ１ｅ６、配列番号２７）である；または
（ｇ）ＥＲＰＲ（配列番号２３）であり、かつ５９５位におけるアミノ酸ＤがＮで置換されている（ＡＡＶ１ｅ７）、
請求項９に記載のカプシドタンパク質（ＣＡＭ４−１）。
【請求項１５】
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７（配列番号２９）が、
（ａ）ＰＧＧＮＡＴＲ（ＡＡＶ１ｅ８、配列番号３０）である；または
（ｂ）ＰＧＧＮＡＴＲ（配列番号３０）であり、かつアミノ酸４５６〜４５９がＬＲＧＧ（ＡＡＶ１ｅ１７、配列番号２７）である、
請求項１０に記載のカプシドタンパク質（ＣＡＭ５）。
【請求項１６】
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｘ９−Ｘ１０（配列番号３１）が、
（ａ）ＴＡＤＨＤＴＫＧＶＬ（ＡＡＶ１ｅ９、配列番号３２）である；
（ｂ）ＶＶＤＰＤＫＫＧＶＬ（ＡＡＶ１ｅ１０、配列番号３３）である；
（ｃ）ＡＫＤＴＧＰＬＮＶＭ（ＡＡＶ１ｅ１１、配列番号３４）である；
（ｄ）ＱＴＤＡＫＤＮＧＶＱ（ＡＡＶ１ｅ１２、配列番号３５）である；
（ｅ）ＤＫＤＰＷＬＮＤＶＩ（ＡＡＶ１ｅ１３、配列番号３６）である；
（ｆ）ＴＲＤＧＳＴＥＳＶＬ（ＡＡＶ１ｅ１４、配列番号３７）である；
（ｇ）ＶＩＤＰＤＱＫＧＶＬ（ＡＡＶ１ｅ１５、配列番号３８）である；
（ｈ）ＶＮＤＭＳＮＹＭＶＨ（ＡＡＶ１ｅ１６、配列番号３９）である；
（ｉ）ＴＡＤＨＤＴＫＧＶＬ（配列番号３２）であり、かつアミノ酸４５６〜４５９がＬＲＧＧ（ＡＡＶ１ｅ１８、配列番号２７）である；
（ｋ）ＴＡＤＨＤＴＫＧＶＬ（配列番号３２）であり、かつアミノ酸４９３〜４９９がＰＧＧＮＡＴＲ（ＡＡＶ１ｅ１９、配列番号３０）である；
（ｌ）ＴＡＤＨＤＴＫＧＶＬ（配列番号３２）であり、かつアミノ酸４５６〜４５９がＬＲＧＧ（配列番号２７）であり、アミノ酸４９３〜４９９がＰＧＧＮＡＴＲ（ＡＡＶ１ｅ２０、配列番号３０）である；
（ｍ）ＣＮＤＥＭＱＶＱＶＮ（ＡＡＶ１ｅ２１、配列番号２９７）である；
（ｎ）ＳＰＤＩＶＹＡＤＶＣ（ＡＡＶ１ｅ２２、配列番号２９８）である；
（ｏ）ＬＤＤＣＨＮＩＤＶＮ（ＡＡＶ１ｅ２３、配列番号２９９である）；
（ｐ）ＳＣＤＣＶＴＮＳＶＳ（ＡＡＶ１ｅ２４、配列番号３００）である；
（ｑ）ＴＶＤＳＮＰＹＥＶＮ（ＡＡＶ１ｅ２５、配列番号３０１）である；または
（ｒ）ＧＤＤＨＰＮＰＤＶＬ（ＡＡＶ１ｅ２６、配列番号３０２）である、
請求項１１に記載のカプシドタンパク質（ＣＡＭ８）。
【請求項１７】
ネイティブＡＡＶ２カプシドタンパク質のアミノ酸位置２６２〜２６７（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６（配列番号４１）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＳ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＱ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＳ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＡ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ６がＳ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ１）。
【請求項１８】
ネイティブＡＡＶ２カプシドタンパク質のアミノ酸位置３６９〜３７８（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｘ９−Ｘ１０（配列番号４２）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＶ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＦ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＭ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＶ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＰ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ６がＱ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ７がＹ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ８がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ９がＹ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ１０がＬ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ３）。
【請求項１９】
ネイティブＡＡＶ２カプシドタンパク質のアミノ酸位置４５０〜４５８（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｘ９（配列番号１３７）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＴ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＰ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＳ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＴ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ６がＴ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ７がＴ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ８がＱ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ９がＳ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ４−１）。
【請求項２０】
ネイティブＡＡＶ２カプシドタンパク質のアミノ酸位置４９２〜４９９（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８（配列番号１３８）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＳ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＡ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＤ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＮ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＮ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ６がＮ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ７がＳ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ８がＥ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ５）。
【請求項２１】
ネイティブＡＡＶ２カプシドタンパク質のアミノ酸位置５８７〜５９６（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｘ９−Ｘ１０（配列番号４５）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＮ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＲ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＱ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＡ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＡ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ６がＴ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ７がＡ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ８がＤ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ９がＶ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ１０がＮ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ８）。
【請求項２２】
ネイティブＡＡＶ１２カプシドタンパク質のアミノ酸位置７０８〜７０９（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＶ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ２がＮ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ９−１）。
【請求項２３】
ネイティブＡＡＶ２カプシドタンパク質のアミノ酸位置７１５〜７２１（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７（配列番号４６）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＤ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＴ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＮ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＶ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ６がＹ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ７がＳ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ９−２）。
【請求項２４】
ネイティブＡＡＶ３カプシドタンパク質のアミノ酸位置２６２〜２６７（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６（配列番号４７）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＳ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＱ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＳ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＡ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ６がＳ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ１）。
【請求項２５】
ネイティブＡＡＶ３カプシドタンパク質のアミノ酸位置３６９〜３７８（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｘ９−Ｘ１０（配列番号４８）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＶ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＦ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＭ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＶ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＰ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ６がＱ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ７がＹ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ８がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ９がＹ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ１０がＬ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ３）。
【請求項２６】
ネイティブＡＡＶ３カプシドタンパク質のアミノ酸位置４５１〜４５９（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｘ９（配列番号１３９）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＴ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＴ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＳ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＴ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ６がＴ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ７がＮ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ８がＱ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ９がＳ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ４−１）。
【請求項２７】
ネイティブＡＡＶ３カプシドタンパク質のアミノ酸位置４９３〜５００（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８（配列番号１４０）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＡ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＮ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＤ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＮ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＮ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ６がＮ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ７がＳ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ８がＮ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ５）。
【請求項２８】
ネイティブＡＡＶ３カプシドタンパク質のアミノ酸位置５８８〜５９７（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｘ９−Ｘ１０（配列番号５１）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＮ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＴ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＡ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＰ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＴ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ６がＴ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ７がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ８がＴ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ９がＶ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ１０がＮ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ８）。
【請求項２９】
ネイティブＡＡＶ３カプシドタンパク質のアミノ酸位置７０９〜７１０（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＶ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ２がＮ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ９−１）。
【請求項３０】
ネイティブＡＡＶ３カプシドタンパク質のアミノ酸位置７１６〜７２２（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７（配列番号５２）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＤ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＴ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＮ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＶ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ６がＹ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ７がＳ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ９−２）。
【請求項３１】
ネイティブＡＡＶ４カプシドタンパク質のアミノ酸位置２５３〜２６０（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８（配列番号５３）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＲ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＬ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＥ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＳ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ６がＬ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ７がＱ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ８がＳ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ１）。
【請求項３２】
ネイティブＡＡＶ４カプシドタンパク質のアミノ酸位置３６０〜３６９（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｘ９−Ｘ１０（配列番号５４）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＶ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＦ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＭ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＶ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＰ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ６がＱ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ７がＹ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ８がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ９がＹ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ１０がＣ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ３）。
【請求項３３】
ネイティブＡＡＶ４カプシドタンパク質のアミノ酸位置４４５〜４５３（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｘ９（配列番号１４１）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＴ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＴ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＬ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＮ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ６がＡ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ７がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ８がＴ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ９がＡ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ４−１）。
【請求項３４】
ネイティブＡＡＶ４カプシドタンパク質のアミノ酸位置４８７〜４９８（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｘ９−Ｘ１０−Ｘ１１−Ｘ１２（配列番号５６）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＡ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＮ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＱ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＮ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＹ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ６がＫ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ７がＩ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ８がＰ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ９がＡ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ１０がＴ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ１１がＧ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ１２がＳ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ５）。
【請求項３５】
ネイティブＡＡＶ４カプシドタンパク質のアミノ酸位置５８６〜５９５（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｘ９−Ｘ１０（配列番号５７）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＳ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＮ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＬ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＰ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＴ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ６がＶ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ７がＤ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ８がＲ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ９がＬ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ１０がＴ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ５）。
【請求項３６】
ネイティブＡＡＶ４カプシドタンパク質のアミノ酸位置７０７〜７０８（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＮ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ２がＳ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ９−１）。
【請求項３７】
ネイティブＡＡＶ４カプシドタンパク質のアミノ酸位置７１４〜７２０（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７（配列番号５８）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＤ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＡ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＡ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＫ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ６がＹ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ７がＴ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ９−２）。
【請求項３８】
ネイティブＡＡＶ５カプシドタンパク質のアミノ酸位置２４９〜２５８（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７Ｘ８−Ｘ９−Ｘ１０（配列番号５９）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＥ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＩ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＫ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＳ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ６がＳ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ７がＶ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ８がＤ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ９がＧ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ１０がＳ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ１）。
【請求項３９】
ネイティブＡＡＶ５カプシドタンパク質のアミノ酸位置３６０〜３６９（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｘ９−Ｘ１０（配列番号６０）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＶ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＦ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＴ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＬ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＰ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ６がＱ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ７がＹ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ８がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ９がＹ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ１０がＡ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ３）。
【請求項４０】
ネイティブＡＡＶ５カプシドタンパク質のアミノ酸位置４４０〜４４６（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｘ９（配列番号１４２）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＳ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＴ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＮ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＮ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＴ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ６がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ７がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ８がＶ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ９がＱ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ４−１）。
【請求項４１】
ネイティブＡＡＶ５カプシドタンパク質のアミノ酸位置４７９〜４８５（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７（配列番号６２）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＳ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＶ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＮ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＲ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ６がＡ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ７がＳ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ５）。
【請求項４２】
ネイティブＡＡＶ５カプシドタンパク質のアミノ酸位置５７７〜５８６（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｘ９−Ｘ１０（配列番号６３）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＴ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＴ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＡ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＰ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＡ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ６がＴ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ７がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ８がＴ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ９がＹ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ１０がＮ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ８）。
【請求項４３】
ネイティブＡＡＶ５カプシドタンパク質のアミノ酸位置６９７〜６９８（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＱ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ２がＦ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ９−１）。
【請求項４４】
ネイティブＡＡＶ５カプシドタンパク質のアミノ酸位置７０４〜７１０（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７（配列番号６４）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＤ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＳ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＴ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＥ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ６がＹ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ７がＲ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ９−２）。
【請求項４５】
ネイティブＡＡＶ６カプシドタンパク質のアミノ酸位置２６２〜２６８（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７（配列番号６５）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＳ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＡ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＳ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＴ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ６がＡ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ７がＳ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ１）。
【請求項４６】
ネイティブＡＡＶ６カプシドタンパク質のアミノ酸位置３７０〜３７９（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｘ９−Ｘ１０（配列番号６６）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＶ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＦ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＭ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＩ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＰ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ６がＱ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ７がＹ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ８がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ９がＹ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ１０がＬ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ３）。
【請求項４７】
ネイティブＡＡＶ６カプシドタンパク質のアミノ酸位置４５１〜４５９（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｘ９（配列番号１４３）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＮ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＱ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＳ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＳ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ６がＡ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ７がＱ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ８がＮ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ９がＫ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ４−１）。
【請求項４８】
ネイティブＡＡＶ６カプシドタンパク質のアミノ酸位置４９３〜５００（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８（配列番号１４４）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＫ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＴ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＤ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＮ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＮ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ６がＮ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ７がＳ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ８がＮ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ５）。
【請求項４９】
ネイティブＡＡＶ６カプシドタンパク質のアミノ酸位置５８８〜５９７（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｘ９−Ｘ１０（配列番号６９）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＳ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＴ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＤ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＰ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＡ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ６がＴ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ７がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ８がＤ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ９がＶ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ１０がＨ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ８）。
【請求項５０】
ネイティブＡＡＶ６カプシドタンパク質のアミノ酸位置７０９〜７１０（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＡ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ２がＮ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ９−１）。
【請求項５１】
ネイティブＡＡＶ６カプシドタンパク質のアミノ酸位置７１６〜７２２（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７（配列番号７０）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＤ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＮ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＮ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＬ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ６がＹ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ７がＴ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ９−２）。
【請求項５２】
ネイティブＡＡＶ７カプシドタンパク質のアミノ酸位置２６３〜２６９（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７（配列番号７１）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＳ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＥ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＴ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＡ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ６がＳ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ７がＴ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ１）。
【請求項５３】
ネイティブＡＡＶ７カプシドタンパク質のアミノ酸位置３７１〜３８０（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｘ９−Ｘ１０（配列番号７２）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＶ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＦ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＭ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＩ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＰ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ６がＱ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ７がＹ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ８がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ９がＹ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ１０がＬ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ３）。
【請求項５４】
ネイティブＡＡＶ７カプシドタンパク質のアミノ酸位置４５３〜４６１（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｘ９（配列番号１４５）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＮ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＰ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＴ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ６がＡ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ７がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ８がＮ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ９がＲ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ４−１）。
【請求項５５】
ネイティブＡＡＶ７カプシドタンパク質のアミノ酸位置４９５〜５０２（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８（配列番号１４６）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＬ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＤ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＱ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＮ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＮ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ６がＮ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ７がＳ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ８がＮ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ５）。
【請求項５６】
ネイティブＡＡＶ７カプシドタンパク質のアミノ酸位置５８９〜５９８（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｘ９−Ｘ１０−（配列番号７５）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＮ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＴ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＡ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＡ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＱ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ６がＴ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ７がＱ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ８がＶ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ９がＶ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ１０がＮ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ８）。
【請求項５７】
ネイティブＡＡＶ７カプシドタンパク質のアミノ酸位置７１０〜７１１（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＴ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ２がＧ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ９−１）。
【請求項５８】
ネイティブＡＡＶ７カプシドタンパク質のアミノ酸位置７１７〜７２３（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７（配列番号７６）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＤ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＳ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＱ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＶ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ６がＹ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ７がＳ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ９−２）。
【請求項５９】
ネイティブＡＡＶ８カプシドタンパク質のアミノ酸位置２６３〜２７０（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８（配列番号７７）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＮ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＴ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＳ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ６がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ７がＡ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ８がＴ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ１）。
【請求項６０】
ネイティブＡＡＶ８カプシドタンパク質のアミノ酸位置３７２〜３８１（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｘ９−Ｘ１０（配列番号７８）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＶ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＦ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＭ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＩ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＰ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ６がＱ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ７がＹ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ８がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ９がＹ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ１０がＬ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ３）。
【請求項６１】
ネイティブＡＡＶ８カプシドタンパク質のアミノ酸位置４５３〜４６１（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｘ９（配列番号１４７）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＴ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＴ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＴ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ６がＡ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ７がＮ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ８がＴ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ９がＱ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ４−１）。
【請求項６２】
ネイティブＡＡＶ８カプシドタンパク質のアミノ酸位置４９５〜５０２（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８（配列番号１４８）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＴ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＱ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＮ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＮ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ６がＮ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ７がＳ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ８がＮ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ５）。
【請求項６３】
ネイティブＡＡＶ８カプシドタンパク質のアミノ酸位置５９０〜６００（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｘ９−Ｘ１０−Ｘ１１（配列番号８１）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＮ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＴ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＡ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＰ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＱ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ６がＩ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ７がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ８がＴ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ９がＶ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ１０がＮ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ１１がＳ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ８）。
【請求項６４】
ネイティブＡＡＶ８カプシドタンパク質のアミノ酸位置７１１〜７１２（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＴ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ２がＳ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ９−１）。
【請求項６５】
ネイティブＡＡＶ８カプシドタンパク質のアミノ酸位置７１８〜７２４（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７（配列番号８２）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＮ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＴ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＥ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＶ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ６がＹ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ７がＳ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ９−２）。
【請求項６６】
ネイティブＡＡＶ９カプシドタンパク質のアミノ酸位置２６２〜２６９（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８（配列番号８３）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＮ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＳ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＴ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＳ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ６がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ７がＳ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ８がＳ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ１）。
【請求項６７】
ネイティブＡＡＶ９カプシドタンパク質のアミノ酸位置３７１〜３８０（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｘ９−Ｘ１０（配列番号８４）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＶ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＦ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＭ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＩ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＰ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ６がＱ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ７がＹ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ８がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ９がＹ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ１０がＬ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ３）。
【請求項６８】
ネイティブＡＡＶ９カプシドタンパク質のアミノ酸位置４５１〜４５９（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｘ９（配列番号１４９）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＩ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＮ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＳ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ６がＱ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ７がＮ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ８がＱ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ９がＱ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ４−１）。
【請求項６９】
ネイティブＡＡＶ９カプシドタンパク質のアミノ酸位置４９３〜５００（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８（配列番号１５０）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＶ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＴ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＱ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＮ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＮ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ６がＮ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ７がＳ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ８がＥ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ５）。
【請求項７０】
ネイティブＡＡＶ９カプシドタンパク質のアミノ酸位置５８８〜５９７（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｘ９−Ｘ１０（配列番号８７）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＱ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＡ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＱ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＡ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＱ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ６がＴ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ７がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ８がＷ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ９がＶ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ１０がＱ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ８）。
【請求項７１】
ネイティブＡＡＶ９カプシドタンパク質のアミノ酸位置７０９〜７１０（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＮ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ２がＮ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ９−１）。
【請求項７２】
ネイティブＡＡＶ９カプシドタンパク質のアミノ酸位置７１６〜７２２（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７（配列番号８８）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＮ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＴ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＥ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＶ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ６がＹ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ７がＳ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ９−２）。
【請求項７３】
ネイティブＡＡＶｒｈ１０カプシドタンパク質のアミノ酸位置２６３〜２７０（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８（配列番号８９）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＮ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＴ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＳ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ６がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ７がＳ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ８がＴ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ１）。
【請求項７４】
ネイティブＡＡＶｒｈ１０カプシドタンパク質のアミノ酸位置３７２〜３８１（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｘ９−Ｘ１０（配列番号９０）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＶ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＦ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＭ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＩ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＰ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ６がＱ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ７がＹ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ８がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ９がＹ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ１０がＬ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ３）。
【請求項７５】
ネイティブＡＡＶｒｈ１０カプシドタンパク質のアミノ酸位置４５３〜４６１（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｘ９（配列番号１５１）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＳ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＴ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＴ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ６がＡ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ７がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ８がＴ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ９がＱ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質。
【請求項７６】
ネイティブＡＡＶｒｈ１０カプシドタンパク質のアミノ酸位置４９５〜５０２（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８（配列番号１５２）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＬ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＳ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＱ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＮ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＮ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ６がＮ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ７がＳ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ８がＮ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ５）。
【請求項７７】
ネイティブＡＡＶｒｈ１０カプシドタンパク質のアミノ酸位置５９０〜５９９（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｘ９−Ｘ１０（配列番号９３）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＮ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＡ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＡ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＰ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＩ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ６がＶ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ７がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ８がＡ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ９がＶ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ１０がＮ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ８）。
【請求項７８】
ネイティブＡＡＶｒｈ１０カプシドタンパク質のアミノ酸位置７１１〜７１２（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＴ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ２がＮ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ９−１）。
【請求項７９】
ネイティブＡＡＶｒｈ１０カプシドタンパク質のアミノ酸位置７１８〜７２４（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７（配列番号９４）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＮ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＴ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＤ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＴ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ６がＹ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ７がＳ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ９−２）。
【請求項８０】
ネイティブＡＡＶｒｈ８カプシドタンパク質のアミノ酸位置２６２〜２６９（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８（配列番号９５）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＮ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＴ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＳ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ６がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ７がＳ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ８がＴ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ１）。
【請求項８１】
ネイティブＡＡＶｒｈ８カプシドタンパク質のアミノ酸位置３７１〜３８０（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｘ９−Ｘ１０（配列番号９６）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＶ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＦ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＭ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＶ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＰ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ６がＱ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ７がＹ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ８がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ９がＹ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ１０がＬ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ３）。
【請求項８２】
ネイティブＡＡＶｒｈ８カプシドタンパク質のアミノ酸位置４５１〜４５９（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｘ９（配列番号１５３）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＱ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＴ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＴ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ４がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＴ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ６がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ７がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ８がＴ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ９がＱ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ４−１）。
【請求項８３】
ネイティブＡＡＶｒｈ８カプシドタンパク質のアミノ酸位置４９３〜５００（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８（配列番号１５４）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＴ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＮ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＱ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＮ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＮ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ６がＮ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ７がＳ以外の任意のアミノ酸であり； 
Ｘ８がＮ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ５）。
【請求項８４】
ネイティブＡＡＶｒｈ８カプシドタンパク質のアミノ酸位置５８８〜５９７（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｘ９−Ｘ１０（配列番号９９）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＮ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＴ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＱ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＡ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＱ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ６がＴ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ７がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ８がＬ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ９がＶ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ１０がＨ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ８）。
【請求項８５】
ネイティブＡＡＶｒｈ８カプシドタンパク質のアミノ酸位置７０９〜７１０（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＴ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ２がＮ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ９−１）。
【請求項８６】
ネイティブＡＡＶｒｈ８カプシドタンパク質のアミノ酸位置７１６〜７２２（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７（配列番号１００）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＮ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＴ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＥ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＶ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ６がＹ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ７がＳ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ９−２）。
【請求項８７】
ネイティブＡＡＶ１０カプシドタンパク質のアミノ酸位置２６３〜２７０（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８（配列番号１０１）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＮ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＴ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＳ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ６がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ７がＳ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ８がＴ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ１）。
【請求項８８】
ネイティブＡＡＶ１０カプシドタンパク質のアミノ酸位置３７２〜３８１（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｘ９−Ｘ１０（配列番号１０２）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＶ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＦ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＭ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＩ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＰ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ６がＱ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ７がＹ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ８がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ９がＹ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ１０がＬ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ３）。
【請求項８９】
ネイティブＡＡＶ１０カプシドタンパク質のアミノ酸位置４５３〜４６１（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｘ９（配列番号１５５）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＳ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＴ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＴ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ６がＱ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ７がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ８がＴ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ９がＱ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ４−１）。
【請求項９０】
ネイティブＡＡＶ１０カプシドタンパク質のアミノ酸位置４９５〜５０２（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８（配列番号１５６）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＬ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＳ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＱ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＮ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＮ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ６がＮ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ７がＳ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ８がＮ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ５）。
【請求項９１】
ネイティブＡＡＶ１０カプシドタンパク質のアミノ酸位置５９０〜５９９（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｘ９−Ｘ１０（配列番号１０５）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＮ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＴ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＰ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＩ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ６がＶ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ７がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ８がＮ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ９がＶ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ１０がＮ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ８）。
【請求項９２】
ネイティブＡＡＶ１０カプシドタンパク質のアミノ酸位置７１１〜７１２（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＴ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ２がＮ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ９−１）。
【請求項９３】
ネイティブＡＡＶ１０カプシドタンパク質のアミノ酸位置７１８〜７２４（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７（配列番号１０６）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＮ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＴ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＥ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＴ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ６がＹ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ７がＳ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ９−２）。
【請求項９４】
ネイティブＡＡＶ１１カプシドタンパク質のアミノ酸位置２５３〜２６０（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８（配列番号１０７）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＲ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＬ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＴ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＴ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ６がＳ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ７がＳ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ８がＳ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ１）。
【請求項９５】
ネイティブＡＡＶ１１カプシドタンパク質のアミノ酸位置３６０〜３６９（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｘ９−Ｘ１０（配列番号１０８）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＶ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＦ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＭ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＶ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＰ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ６がＱ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ７がＹ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ８がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ９がＹ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ１０がＣ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ３）。
【請求項９６】
ネイティブＡＡＶ１１カプシドタンパク質のアミノ酸位置４４４〜４５２（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｘ９（配列番号１５７）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＥ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＴ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＬ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＮ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ６がＱ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ７がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ８がＮ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ９がＡ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ４−１）。
【請求項９７】
ネイティブＡＡＶ１１カプシドタンパク質のアミノ酸位置４８６〜４９７（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｘ９−Ｘ１０−Ｘ１１−Ｘ１２（配列番号１１０）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＡ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＳ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＱ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＮ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＹ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ６がＫ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ７がＩ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ８がＰ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ９がＡ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ１０がＳ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ１１がＧ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ１２がＧ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ５）。
【請求項９８】
ネイティブＡＡＶ１１カプシドタンパク質のアミノ酸位置５８５〜５９４（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｘ９−Ｘ１０（配列番号１１１）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＴ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＴ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＡ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＰ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＩ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ６がＴ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ７がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ８がＮ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ９がＶ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ１０がＴ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ８）。
【請求項９９】
ネイティブＡＡＶ１１カプシドタンパク質のアミノ酸位置７０６〜７０７（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＳ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ２がＳ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ９−１）。
【請求項１００】
ネイティブＡＡＶ１１カプシドタンパク質のアミノ酸位置７１３〜７１９（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７（配列番号１１２）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＤ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＴ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＴ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＫ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ６がＹ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ７がＴ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ９−２）。
【請求項１０１】
ネイティブＡＡＶ１２カプシドタンパク質のアミノ酸位置２６２〜２６９（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８（配列番号１１３）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＲ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＩ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＴ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＴ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ６がＡ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ７がＮ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ８がＳ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ１）。
【請求項１０２】
ネイティブＡＡＶ１２カプシドタンパク質のアミノ酸位置３６９〜３７８（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｘ９−Ｘ１０（配列番号１１４）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＶ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＦ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＭ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＶ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＰ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ６がＱ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ７がＹ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ８がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ９がＹ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ１０がＣ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ３）。
【請求項１０３】
ネイティブＡＡＶ１２カプシドタンパク質のアミノ酸位置４５３〜４６１（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｘ９（配列番号１５８）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＮ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＳ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＬ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＮ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ６がＱ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ７がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ８がＴ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ９がＡ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ４−１）。
【請求項１０４】
ネイティブＡＡＶ１２カプシドタンパク質のアミノ酸位置４９５〜５０６（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｘ９−Ｘ１０−Ｘ１１−Ｘ１２（配列番号１１６）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＡ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＮ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＱ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＮ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＹ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ６がＫ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ７がＩ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ８がＰ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ９がＡ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ１０がＳ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ１１がＧ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ１２がＧ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ５）。
【請求項１０５】
ネイティブＡＡＶ１２カプシドタンパク質のアミノ酸位置５９４〜６０３（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｘ９−Ｘ１０（配列番号１１７）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＴ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＴ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＡ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＰ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＨ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ６がＩ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ７がＡ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ８がＮ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ９がＬ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ１０がＤ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ８）。
【請求項１０６】
ネイティブＡＡＶ１２カプシドタンパク質のアミノ酸位置７１５〜７１６（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＮ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ２がＳ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ９−１）。
【請求項１０７】
ネイティブＡＡＶ１２カプシドタンパク質のアミノ酸位置７２２〜７２８（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７（配列番号１１８）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＤ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＮ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＡ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＮ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ６がＹ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ７がＨ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ９−２）。
【請求項１０８】
ネイティブＡＡＶｒｈ３２．３３カプシドタンパク質のアミノ酸位置２５３〜２６０（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８（配列番号１１９）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＲ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＬ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＴ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＴ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ６がＳ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ７がＮ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ８がＳ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ１）。
【請求項１０９】
ネイティブＡＡＶｒｈ３２．３３カプシドタンパク質のアミノ酸位置３６０〜３６９（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｘ９−Ｘ１０（配列番号１２０）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＶ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＦ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＭ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＶ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＰ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ６がＱ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ７がＹ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ８がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ９がＹ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ１０がＣ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ３）。
【請求項１１０】
ネイティブＡＡＶｒｈ３２．３３カプシドタンパク質のアミノ酸位置４４４〜４５２（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｘ９（配列番号１５９）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＥ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＴ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＬ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＮ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ６がＱ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ７がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ８がＮ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ９がＡ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ４−１）。
【請求項１１１】
ネイティブＡＡＶｒｈ３２．３３カプシドタンパク質のアミノ酸位置４８６〜４９７（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｘ９−Ｘ１０−Ｘ１１−Ｘ１２（配列番号１２２）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＡ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＳ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＱ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＮ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＹ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ６がＫ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ７がＩ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ８がＰ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ９がＡ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ１０がＳ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ１１がＧ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ１２がＧ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ５）。
【請求項１１２】
ネイティブＡＡＶｒｈ３２．３３カプシドタンパク質のアミノ酸位置５８５〜５９４（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｘ９−Ｘ１０（配列番号１２３）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＴ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＴ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＡ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＰ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＩ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ６がＴ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ７がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ８がＮ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ９がＶ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ１０がＴ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ８）。
【請求項１１３】
ネイティブＡＡＶｒｈ３２．３３カプシドタンパク質のアミノ酸位置７０６〜７０７（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＳ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ２がＳ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ９−１）。
【請求項１１４】
ネイティブＡＡＶｒｈ３２．３３カプシドタンパク質のアミノ酸位置７１３〜７１９（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７（配列番号１２４）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＤ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＴ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＴ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＫ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ６がＹ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ７がＴ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ９−２）。
【請求項１１５】
ネイティブウシＡＡＶカプシドタンパク質のアミノ酸位置２５５〜２６２（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８（配列番号１２５）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＲ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＬ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＳ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＳ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ６がＮ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ７がＡ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ８がＳ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ１）。
【請求項１１６】
ネイティブウシＡＡＶカプシドタンパク質のアミノ酸位置３６２〜３７１（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｘ９−Ｘ１０（配列番号１２６）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＶ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＦ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＭ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＶ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＰ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ６がＱ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ７がＹ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ８がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ９がＹ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ１０がＣ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ３）。
【請求項１１７】
ネイティブウシＡＡＶカプシドタンパク質のアミノ酸位置４４７〜４５５（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｘ９（配列番号１６０）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＴ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＬ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＮ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ６がＱ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ７がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ８がＮ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ９がＳ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ４−１）。
【請求項１１８】
ネイティブウシＡＡＶカプシドタンパク質のアミノ酸位置４８９〜５００（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｘ９−Ｘ１０−Ｘ１１−Ｘ１２（配列番号１２８）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＡ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＳ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＱ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＮ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＹ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ６がＫ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ７がＩ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ８がＰ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ９がＱ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ１０がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ１１がＲ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ１２がＮ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ５）。
【請求項１１９】
ネイティブウシＡＡＶカプシドタンパク質のアミノ酸位置５８８〜５９７（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｘ９−Ｘ１０（配列番号１２９）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＴ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＴ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＶ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＰ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＴ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ６がＶ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ７がＤ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ８がＤ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ９がＶ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ１０がＤ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ８）。
【請求項１２０】
ネイティブウシＡＡＶカプシドタンパク質のアミノ酸位置７０９〜７１０（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＤ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ２がＳ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ９−１）。
【請求項１２１】
ネイティブウシＡＡＶカプシドタンパク質のアミノ酸位置７１６〜７２２（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７（配列番号１３０）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＤ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＮ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＡ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＡ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ６がＹ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ７がＫ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ９−２）。
【請求項１２２】
ネイティブトリＡＡＶカプシドタンパク質のアミノ酸位置２６５〜２７２（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８（配列番号１３１）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＲ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＩ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＱ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＰ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ６がＳ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ７がＧ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ８がＧ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ１）。
【請求項１２３】
ネイティブトリＡＡＶカプシドタンパク質のアミノ酸位置３７５〜３８４（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｘ９−Ｘ１０（配列番号１３２）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＩ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＹ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＴ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＩ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＰ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ６がＱ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ７がＹ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ８がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ９がＹ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ１０がＣ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ３）。
【請求項１２４】
ネイティブトリＡＡＶカプシドタンパク質のアミノ酸位置４５４〜４６２（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｘ９（配列番号１６１）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＶ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＳ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＱ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＡ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ６がＳ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ７がＳ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ８がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ９がＲ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ４−１）。
【請求項１２５】
ネイティブトリＡＡＶカプシドタンパク質のアミノ酸位置４９６〜５０７（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｘ９−Ｘ１０−Ｘ１１−Ｘ１２（配列番号１３４）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＡ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＳ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＮ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＩ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＴ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ６がＫ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ７がＮ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ８がＮ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ９がＶ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ１０がＦ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ１１がＳ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ１２がＶ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ５）。
【請求項１２６】
ネイティブトリＡＡＶカプシドタンパク質のアミノ酸位置５９５〜６０４（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｘ９−Ｘ１０（配列番号１３５）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＶ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＴ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＰ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＴ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ６がＲ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ７がＡ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ８がＡ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ９がＶ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ１０がＮ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ８）。
【請求項１２７】
ネイティブトリＡＡＶカプシドタンパク質のアミノ酸位置７１６〜７１７（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＡ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ２がＤ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ９−１）。
【請求項１２８】
ネイティブトリＡＡＶカプシドタンパク質のアミノ酸位置７２３〜７２９（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７（配列番号１３６）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＳ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＤ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＴ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＳ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ６がＹ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ７がＳ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ９−２）。
【請求項１２９】
配列番号１（ＡＡＶ１カプシドタンパク質；ＶＰ１番号付け）の残基４８８Ｒ、４５０Ｑ、４５３Ｓ、４５４Ｇ、４５５Ｓ、４５６Ａ、４５７Ｑおよび／または５００Ｎにおけるアミノ酸置換をいずれかの組み合わせで含むＡＡＶカプシドタンパク質。
【請求項１３０】
配列番号１（ＡＡＶ１カプシドタンパク質；ＶＰ１番号付け）の残基２５６Ｌ、２５８Ｋ、２５９Ｑ、２６１Ｓ、２６３Ａ、２６４Ｓ、２６５Ｔ、２６６Ｇ、２７２Ｈ、３８５Ｓ、３８６Ｑ、５４７Ｓ、７０９Ａ、７１０Ｎ、７１６Ｄ、７１７Ｎ、７１８Ｎ、７２０Ｌおよび／または７２２Ｔにおけるアミノ酸置換をいずれかの組み合わせで含むＡＡＶカプシドタンパク質。
【請求項１３１】
配列番号５（ＡＡＶ５カプシドタンパク質；ＶＰ１番号付け）の残基２４４Ｎ、２４６Ｑ、２４８Ｒ、２４９Ｅ、２５０Ｉ、２５１Ｋ、２５２Ｓ、２５３Ｇ、２５４Ｓ、２５５Ｖ、２５６Ｄ、２６３Ｙ、３７７Ｅ、３７８Ｎ、４５３Ｌ、４５６Ｒ、５３２Ｑ、５３３Ｐ、５３５Ｎ、５３６Ｐ、５３７Ｇ、５３８Ｔ、５３９Ｔ、５４０Ａ、５４１Ｔ、５４２Ｙ、５４３Ｌ、５４６Ｎ、６５３Ｖ、６５４Ｐ、６５６Ｓ、６９７Ｑ、６９８Ｆ、７０４Ｄ、７０５Ｓ、７０６Ｔ、７０７Ｇ、７０８Ｅ、７０９Ｙおよび／または７１０Ｒにおけるアミノ酸置換を含むＡＡＶカプシドタンパク質。
【請求項１３２】
配列番号５（ＡＡＶ５カプシドタンパク質；ＶＰ１番号付け）の残基２４８Ｒ、３１６Ｖ、３１７Ｑ、３１８Ｄ、３１９Ｓ、４４３Ｎ、５３０Ｎ、５３１Ｓ、５３２Ｑ、５３３Ｐ、５３４Ａ、５３５Ｎ、５４０Ａ、５４１Ｔ、５４２Ｙ、５４３Ｌ、５４５Ｇ、５４６Ｎ、６９７Ｑ、７０４Ｄ、７０６Ｔ、７０８Ｅ、７０９Ｙおよび／または７１０Ｒにおけるアミノ酸置換をいずれかの組み合わせで含むＡＡＶカプシドタンパク質。
【請求項１３３】
配列番号６（ＡＡＶ６カプシドタンパク質；ＶＰ１番号付け）の残基２６４Ｓ、２６６Ｇ、２６９Ｎ、２７２Ｈ、４５７Ｑ、５８８Ｓおよび／または５８９Ｔにおけるアミノ酸置換をいずれかの組み合わせで含むＡＡＶカプシドタンパク質。
【請求項１３４】
配列番号８（ＡＡＶ８カプシドタンパク質；ＶＰ１番号付け）の残基４５７Ｔ、４５９Ｎ、４９６Ｇ、４９９Ｎ、５００Ｎ、５８９Ｑ、５９０Ｎおよび／または５９２Ａにおけるアミノ酸置換をいずれかの組み合わせで含むＡＡＶカプシドタンパク質。
【請求項１３５】
配列番号９（ＡＡＶ９カプシドタンパク質；ＶＰ１番号付け）の残基４５１Ｉ、４５２Ｎ、４５３Ｇ、４５４Ｓ、４５５Ｇ、４５６Ｑ、４５７Ｎおよび／または４５８Ｑにおけるアミノ酸置換をいずれかの組み合わせで含むＡＡＶカプシドタンパク質。
【請求項１３６】
配列番号Ｄのアミノ酸配列中にＳ４７２Ｒ置換を含むＡＡＶカプシドタンパク質（ＡＡＶ１ｅ２７；ＶＰ１番号付け）。
【請求項１３７】
配列番号１のアミノ酸配列中にＶ４７３Ｄ置換を含むＡＡＶカプシドタンパク質（ＡＡＶ１ｅ２８；ＶＰ１番号付け）。
【請求項１３８】
配列番号１のアミノ酸配列中にＮ５００Ｅ置換を含むＡＡＶカプシドタンパク質（ＡＡＶ１ｅ２９；ＶＰ１番号付け）。
【請求項１３９】
配列番号１のアミノ酸配列中にＡ４５６Ｔ、Ｑ４５７Ｔ、Ｎ４５８ＱおよびＫ４５９Ｓ置換を含むＡＡＶカプシドタンパク質（ＡＡＶ１ｅ３０；ＶＰ１番号付け）。
【請求項１４０】
配列番号１のアミノ酸配列中にＴ４９２ＳおよびＫ４９３Ａ置換を含むＡＡＶカプシドタンパク質（ＡＡＶ１ｅ３１；ＶＰ１番号付け）。
【請求項１４１】
配列番号１のアミノ酸配列中にＳ５８６Ｒ、Ｓ５８７Ｇ、Ｓ５８８ＮおよびＴ５８９Ｒ置換を含むＡＡＶカプシドタンパク質（ＡＡＶ１ｅ３２；ＶＰ１番号付け）。
【請求項１４２】
配列番号１のアミノ酸配列中にＡ４５６Ｔ、Ｑ４５７Ｔ、Ｎ４５８Ｑ、Ｋ４５９Ｓ、Ｔ４９２ＳおよびＫ４９３Ａ置換を含むＡＡＶカプシドタンパク質（ＡＡＶ１ｅ３３；ＶＰ１番号付け）。
【請求項１４３】
配列番号１のアミノ酸配列中にＡ４５６Ｔ、Ｑ４５７Ｔ、Ｎ４５８Ｑ、Ｋ４５９Ｓ、Ｓ５８６Ｒ、Ｓ５８７Ｇ、Ｓ５８８ＮおよびＴ５８９Ｒ置換を含むＡＡＶカプシドタンパク質（ＡＡＶ１ｅ３４；ＶＰ１番号付け）。
【請求項１４４】
配列番号１のアミノ酸配列中にＴ４９２Ｓ、Ｋ４９３Ａ、Ｓ５８６Ｒ、Ｓ５８７Ｇ、Ｓ５８８ＮおよびＴ５８９Ｒ置換を含むＡＡＶカプシドタンパク質（ＡＡＶ１ｅ３５；ＶＰ１番号付け）。
【請求項１４５】
配列番号１のアミノ酸配列中にＡ４５６Ｔ、Ｑ４５７Ｔ、Ｎ４５８Ｑ、Ｋ４５９Ｓ、Ｔ４９２Ｓ、Ｋ４９３Ａ、Ｓ５８６Ｒ、Ｓ５８７Ｇ、Ｓ５８８ＮおよびＴ５８９Ｒ置換を含むＡＡＶカプシドタンパク質（ＡＡＶ１ｅ３６；ＶＰ１番号付け）。
【請求項１４６】
配列番号９のアミノ酸配列中にＳ４５４ＶおよびＱ４５６Ｖ置換を含むＡＡＶカプシドタンパク質（ＡＡＶ９ｅ１；ＶＰ１番号付け）。
【請求項１４７】
配列番号９のアミノ酸配列中にＩ４５１Ｑ、Ｇ４５３Ｑ、Ｑ４５６ＳおよびＮ４５７Ａ、およびＱ４５９Ｎ置換を含むＡＡＶカプシドタンパク質（ＡＡＶ９ｅ２；ＶＰ１番号付け）。
【請求項１４８】
請求項１から１４７のいずれか１項に記載の１つまたは複数のアミノ酸置換をいずれかの組み合わせで含むＡＡＶカプシドタンパク質。
【請求項１４９】
請求項１から１４８のいずれか１項に記載のＡＡＶカプシドタンパク質を含むＡＡＶカプシド。
【請求項１５０】
請求項１４９に記載のＡＡＶカプシドを含むＡＡＶウイルス粒子。
【請求項１５１】
（ａ）請求項１４９に記載のＡＡＶカプシド；および
（ｂ）少なくとも１つの末端反復配列を含む核酸、
を含むウイルスベクターであって、前記核酸が、ＡＡＶカプシドによってカプシド封入されている、ウイルスベクター。
【請求項１５２】
薬学的に許容される担体中に、請求項１から１４８のいずれか１項に記載のＡＡＶカプシドタンパク質、請求項１４９に記載のＡＡＶカプシド、請求項１５０に記載のＡＡＶウイルス粒子および／または請求項１５１に記載のウイルスベクターを含む組成物。
【請求項１５３】
請求項１５１に記載のウイルスベクターまたは請求項１５２に記載の組成物と細胞を接触させるステップを含む、細胞に核酸を投与する方法。
【請求項１５４】
請求項１５１に記載のウイルスベクターまたは請求項１５２に記載の組成物を対象に投与するステップを含む、対象に核酸を送達する方法。
【請求項１５５】
前記対象が動物またはヒト対象である、請求項１５４に記載の方法。
【請求項１５６】
中和抗体を回避するＡＡＶベクターを産生する方法であって、
ａ）ＡＡＶカプシドタンパク質上の３次元抗原性フットプリントを形成する接触アミノ酸残基を同定するステップ；
ｂ）（ａ）で同定された接触アミノ酸残基のアミノ酸置換を含むＡＡＶカプシドタンパク質のライブラリーを生成するステップ；
ｃ）（ｂ）のＡＡＶカプシドタンパク質のライブラリー由来のカプシドタンパク質を含むＡＡＶ粒子を産生するステップ；
ｄ）（ｃ）のＡＡＶ粒子を、感染および複製が起こり得る条件下で細胞と接触させるステップ；
ｅ）少なくとも１回の感染サイクルを完了でき、対照ＡＡＶ粒子と同様の力価まで複製できるＡＡＶ粒子を選択するステップ；
ｆ）（ｅ）で選択されたＡＡＶ粒子を、感染および複製が起こり得る条件下で、中和抗体および細胞と接触させるステップ；ならびに
ｇ）（ｆ）の中和抗体によって中和されないＡＡＶ粒子を選択するステップ
を含む方法。
【請求項１５７】
ネイティブＡＡＶ１カプシドタンパク質のアミノ酸位置５２８〜５３４（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７（配列番号４４３）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＫ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＤ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＤ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＥ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＤ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ６がＫ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ７がＦ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ６）。
【請求項１５８】
ネイティブＡＡＶ２カプシドタンパク質のアミノ酸位置５２７〜５３３（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７（配列番号４４４）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＫ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＤ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＤ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＥ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＥ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ６がＫ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ７がＦ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ６）。
【請求項１５９】
ネイティブＡＡＶ３カプシドタンパク質のアミノ酸位置５２８〜５３４（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７（配列番号４４５）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＫ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＤ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＤ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＥ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＥ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ６がＫ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ７がＦ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ６）。
【請求項１６０】
ネイティブＡＡＶ４カプシドタンパク質のアミノ酸位置５２７〜５３３（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７（配列番号４４６）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＰ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＡ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＤ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＳ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ６がＫ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ７がＦ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ６）。
【請求項１６１】
ネイティブＡＡＶ５カプシドタンパク質のアミノ酸位置５１５〜５２１（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７（配列番号４４７）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＬ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＱ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＳ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＮ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ６がＴ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ７がＹ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ６）。
【請求項１６２】
ネイティブＡＡＶ６カプシドタンパク質のアミノ酸位置５２８〜５３４（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７（配列番号４４８）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＫ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＤ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＤ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＫ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＤ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ６がＫ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ７がＦ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ６）。
【請求項１６３】
ネイティブＡＡＶ７カプシドタンパク質のアミノ酸位置５３０〜５３６（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７（配列番号４４９）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＫ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＤ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＤ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＥ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＤ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ６がＲ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ７がＦ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ６）。
【請求項１６４】
ネイティブＡＡＶ８カプシドタンパク質のアミノ酸位置５３０〜５３６（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７（配列番号４５０）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＫ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＤ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＤ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＥ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＥ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ６がＲ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ７がＦ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ６）。
【請求項１６５】
ネイティブＡＡＶ９カプシドタンパク質のアミノ酸位置５２８〜５３４（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７（配列番号４５１）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＫ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＥ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＥ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＤ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ６がＲ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ７がＦ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ６）。
【請求項１６６】
ネイティブＡＡＶｒｈ８カプシドタンパク質のアミノ酸位置５２８〜５３４（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７（配列番号４５２）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＫ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＤ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＤ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＤ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＤ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ６がＲ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ７がＦ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ６）。
【請求項１６７】
ネイティブＡＡＶｒｈ１０カプシドタンパク質のアミノ酸位置５３０〜５３６（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７（配列番号４５３）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＫ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＤ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＤ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＥ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＥ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ６がＲ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ７がＦ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ６）。
【請求項１６８】
ネイティブＡＡＶ１０カプシドタンパク質のアミノ酸位置５３０〜５３６（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７（配列番号４５４）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＫ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＤ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＤ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＥ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＥ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ６がＲ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ７がＦ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ６）。
【請求項１６９】
ネイティブＡＡＶ１１カプシドタンパク質のアミノ酸位置５２６〜５３２（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７（配列番号４５５）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＰ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＳ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＤ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ６がＤ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ７がＦ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ６）。
【請求項１７０】
ネイティブＡＡＶ１２カプシドタンパク質のアミノ酸位置５３５〜５４１（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７（配列番号４５６）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＡ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＤ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＳ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ６がＤ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ７がＦ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ６）。
【請求項１７１】
ネイティブＡＡＶｒｈ３２．３３カプシドタンパク質のアミノ酸位置５２６〜５３２（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７（配列番号４５７）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＰ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＳ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＤ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ６がＤ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ７がＦ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ６）。
【請求項１７２】
ネイティブウシＡＡＶカプシドタンパク質のアミノ酸位置５２９〜５３５（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７（配列番号４５８）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＡ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＮ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＤ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＡ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＴ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ６がＤ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ７がＦ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ６）。
【請求項１７３】
ネイティブトリＡＡＶカプシドタンパク質のアミノ酸位置５３３〜５３９（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７（配列番号４５９）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＦ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＳ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＥ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＰ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ６がＤ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ７がＲ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ６）。
【請求項１７４】
ネイティブＡＡＶ１カプシドタンパク質のアミノ酸位置５４７〜５５２（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６（配列番号４６０）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＳ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＡ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＡ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＳ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ６がＮ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ７）。
【請求項１７５】
ネイティブＡＡＶ２カプシドタンパク質のアミノ酸位置５４６〜５５１（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６（配列番号４６１）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＳ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＥ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＫ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＴ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ６がＮ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ７）。
【請求項１７６】
ネイティブＡＡＶ３カプシドタンパク質のアミノ酸位置５４７〜５５２（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６（配列番号４６２）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＴ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＴ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＡ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＳ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ６がＮ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ７）。
【請求項１７７】
ネイティブＡＡＶ４カプシドタンパク質のアミノ酸位置５４５〜５６０（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６（配列番号４６３）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＱ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＮ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＮ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＴ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ６がＡ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ７）。
【請求項１７８】
ネイティブＡＡＶ５カプシドタンパク質のアミノ酸位置５３４〜５４１（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８（配列番号４６４）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＡ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＮ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＰ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＴ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ６がＴ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ７がＡ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ８がＴ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ７）。
【請求項１７９】
ネイティブＡＡＶ６カプシドタンパク質のアミノ酸位置５４７〜５５２（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６（配列番号４６５）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＳ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＡ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＡ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＳ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ６がＮ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ７）。
【請求項１８０】
ネイティブＡＡＶ７カプシドタンパク質のアミノ酸位置５４９〜５５４（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６（配列番号４６６）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＡ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＴ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＮ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＫ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ６がＴ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ７）。
【請求項１８１】
ネイティブＡＡＶ８カプシドタンパク質のアミノ酸位置５４９〜５５４（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６（配列番号４６７）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＮ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＡ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＡ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＲ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＤ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ６がＮ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ７）。
【請求項１８２】
ネイティブＡＡＶ９カプシドタンパク質のアミノ酸位置５４７〜５５２（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６（配列番号４６８）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＴ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＲ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＤ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ６がＮ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ７）。
【請求項１８３】
ネイティブＡＡＶｒｈ８カプシドタンパク質のアミノ酸位置５４７〜５５２（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６（配列番号４６９）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＡ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＮ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＤ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ６がＧ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ７）。
【請求項１８４】
ネイティブＡＡＶｒｈ１０カプシドタンパク質のアミノ酸位置５４９〜５５４（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６（配列番号４７０）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＡ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＫ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＤ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ６がＮ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ７）。
【請求項１８５】
ネイティブＡＡＶ１０カプシドタンパク質のアミノ酸位置５４９〜５５４（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６（配列番号４７１）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＡ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＲ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＤ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ６がＮ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ７）。
【請求項１８６】
ネイティブＡＡＶ１１カプシドタンパク質のアミノ酸位置５４４〜５４９（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６（配列番号４７２）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＶ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＴ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＮ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＴ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ６がＴ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ７）。
【請求項１８７】
ネイティブＡＡＶ１２カプシドタンパク質のアミノ酸位置５５３〜５５８（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６（配列番号４７３）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＰ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＳ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＮ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＴ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ６がＴ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ７）。
【請求項１８８】
ネイティブＡＡＶｒｈ３２．３３カプシドタンパク質のアミノ酸位置５４４〜５４９（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６（配列番号４７４）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＶ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＴ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＮ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＴ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ６がＴ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ７）。
【請求項１８９】
ネイティブウシＡＡＶカプシドタンパク質のアミノ酸位置５４７〜５５２（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６（配列番号４７５）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＩ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＴ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＧ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＮ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＴ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ６がＴ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ７）。
【請求項１９０】
ネイティブトリＡＡＶカプシドタンパク質のアミノ酸位置５５２〜５５９（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８（配列番号４７６）
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＶ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ２がＹ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ３がＤ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ４がＱ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ５がＴ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ６がＴ以外の任意のアミノ酸であり；
Ｘ７がＡ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ８がＴ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ７）。
【請求項１９１】
ネイティブＡＡＶ１カプシドタンパク質のアミノ酸位置４７２〜４７３（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＳ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ２がＶ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ４−２）。
【請求項１９２】
ネイティブＡＡＶ２カプシドタンパク質のアミノ酸位置４７１〜４７２（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＲ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ２がＤ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ４−２）。
【請求項１９３】
ネイティブＡＡＶ３カプシドタンパク質のアミノ酸位置４７２〜４７３（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＳ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ２がＬ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ４−２）。
【請求項１９４】
ネイティブＡＡＶ４カプシドタンパク質のアミノ酸位置４６６〜４６７（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＳ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ２がＮ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ４−２）。
【請求項１９５】
ネイティブＡＡＶ５カプシドタンパク質のアミノ酸位置４５８〜４５９（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＡ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ２がＮ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ４−２）。
【請求項１９６】
ネイティブＡＡＶ６カプシドタンパク質のアミノ酸位置４７２〜４７３（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＳ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ２がＶ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ４−２）。
【請求項１９７】
ネイティブＡＡＶ７カプシドタンパク質のアミノ酸位置４７４〜４７５（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＡ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ２がＥ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ４−２）。
【請求項１９８】
ネイティブＡＡＶ８カプシドタンパク質のアミノ酸位置４７４〜４７５（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＡ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ２がＮ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ４−２）。
【請求項１９９】
ネイティブＡＡＶ９カプシドタンパク質のアミノ酸位置４７２〜４７３（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＡ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ２がＶ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ４−２）。
【請求項２００】
ネイティブＡＡＶｒｈ８カプシドタンパク質のアミノ酸位置４７２〜４７３（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＡ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ２がＮ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ４−２）。
【請求項２０１】
ネイティブＡＡＶｒｈ１０カプシドタンパク質のアミノ酸位置４７４〜４７５（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＳ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ２がＡ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ４−２）。
【請求項２０２】
ネイティブＡＡＶ１０カプシドタンパク質のアミノ酸位置４７４〜４７５（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＳ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ２がＡ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ７）。
【請求項２０３】
ネイティブＡＡＶ１１カプシドタンパク質のアミノ酸位置４６５〜４６６（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＡ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ２がＦ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ４−２）。
【請求項２０４】
ネイティブＡＡＶ１２カプシドタンパク質のアミノ酸位置４７４〜４７５（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＡ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ２がＹ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ４−２）。
【請求項２０５】
ネイティブＡＡＶｒｈ３２．３３カプシドタンパク質のアミノ酸位置４６５〜４６６（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＡ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ２がＦ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ４−２）。
【請求項２０６】
ネイティブウシＡＡＶカプシドタンパク質のアミノ酸位置４６８〜４６９（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＳ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ２がＧ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ４−２）。
【請求項２０７】
ネイティブトリＡＡＶカプシドタンパク質のアミノ酸位置４７５〜４７６（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：
Ｘ１−Ｘ２
を生じる置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、
Ｘ１がＡ以外の任意のアミノ酸であり；かつ
Ｘ２がＡ以外の任意のアミノ酸である、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質（ＣＡＭ４−２）。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
［優先権の申立］
本出願は、米国特許法第１１９（ｅ）の下で、その全内容が引用することにより本明細書の一部をなすものとする２０１５年９月２８日出願の米国仮特許出願第６２／２３４，０１６号の利益を主張する。
【０００２】
［政府支援の明示］
本発明は、国立衛生研究所によって授与された助成金第ＨＬ１１２７６１号、ＨＬ０８９２２１号およびＧＭ０８２９４６号の下で、政府の支援により行われた。政府は、本発明において一定の権利を有する。
【０００３】
［発明の分野］
本発明は、アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）由来の改変されたカプシドタンパク質、ならびにそれを含むウイルスカプシドおよびウイルスベクターに関する。特に、本発明は、形質導入効率の減少なしに、中和抗体の回避の表現型を付与するためにウイルスベクター中に組み込まれ得る、改変されたＡＡＶカプシドタンパク質およびそれを含むカプシドに関する。
【背景技術】
【０００４】
ＡＡＶまたは組換えＡＡＶベクターとの自然の遭遇の際に生成される宿主由来の既存抗体は、ワクチンとしてのおよび／または遺伝子療法のためのＡＡＶベクターの初回ならびに反復投与を妨げる。血清学的研究により世界中のヒト集団における抗体の高い有病率が明らかになっており、約６７％の人々がＡＡＶ１に対する抗体を有し、７２％がＡＡＶ２に対する抗体を有し、約４０％がＡＡＶ５〜ＡＡＶ９に対する抗体を有する。
【０００５】
さらに、遺伝子療法では、遺伝子サイレンシングまたは組織変性が関与する特定の臨床的シナリオは、導入遺伝子の長期発現を持続させるために、複数回のＡＡＶベクター投与を必要とし得る。これらの問題を回避するために、抗体認識を回避する組換えＡＡＶベクター（ＡＡＶｅ）が必要とされる。本発明は、ａ）ＡＡＶベースの遺伝子療法に適切な患者の適格なコホートを拡張し、ｂ）ＡＡＶベースの遺伝子療法ベクターの複数回の反復投与を可能にする助けになる。
【０００６】
本発明は、１つまたは複数のアミノ酸置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質を含む方法および組成物を提供することによって、当該分野における以前の欠点を克服し、これらの置換は、宿主抗体を回避する能力を、これらの改変されたカプシドタンパク質を含むＡＡＶベクター中に導入する。
【発明の概要】
【０００７】
一態様では、本発明は、１つまたは複数のアミノ酸置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、これらの置換が、ＡＡＶカプシドタンパク質上の１つまたは複数の以前から存在している抗原性部位を改変する、アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質を提供する。
【０００８】
いくつかの実施形態では、これらのアミノ酸置換は、ＡＡＶ１、ＡＡＶ３、ＡＡＶ４、ＡＡＶ５、ＡＡＶ６、ＡＡＶ７、ＡＡＶ８、ＡＡＶ９、ＡＡＶ１０、ＡＡＶ１１、ＡＡＶ１２、ＡＡＶｒｈ８、ＡＡＶｒｈ１０、ＡＡＶｒｈ３２．３３、トリＡＡＶまたはウシＡＡＶに基づくカプシドを含むＡＡＶ−抗体複合体のペプチドエピトープマッピングまたはクライオ電子顕微鏡研究によって同定された抗原性フットプリント中にある。
【０００９】
いくつかの実施形態では、この改変された抗原性部位は、抗体がＡＡＶカプシドを結合または認識または中和するのを防止でき、この抗体は、ＩｇＧ（ＩｇＧ１、ＩｇＧ２ａ、ＩｇＧ２ｂ、ＩｇＧ３を含む）、ＩｇＭ、ＩｇＥまたはＩｇＡである。
【００１０】
いくつかの実施形態では、この改変された抗原性部位は、異なる動物種由来の抗体によるＡＡＶカプシドの結合または認識または中和を防止でき、この動物は、ヒト、イヌ、ネコまたはウマである。
【００１１】
いくつかの実施形態では、この改変された抗原性部位は、共通抗原性モチーフであり、ここで、特異的抗体または交差反応性抗体は、ＡＡＶカプシドを結合、認識または中和できる。
【００１２】
いくつかの実施形態では、これらの置換は、第１のＡＡＶ血清型由来の改変された抗原性部位を、この第１のＡＡＶ血清型とは異なる第２のＡＡＶ血清型のカプシドタンパク質中に導入する。
【００１３】
本発明は、本発明のＡＡＶカプシドタンパク質を含むＡＡＶカプシドもまた提供する。本発明のＡＡＶカプシドを含むウイルスベクター、ならびに薬学的に許容される担体中に本発明のＡＡＶカプシドタンパク質、ＡＡＶカプシドおよび／またはウイルスベクターを含む組成物が、本明細書でさらに提供される。
【００１４】
本発明はさらに、細胞を本発明のウイルスベクターと接触させるステップを含む、ＡＡＶカプシドに対する抗体の存在下で核酸を細胞中に導入する方法を提供する。この細胞は、対象中にあり得、いくつかの実施形態では、この対象は、ヒト対象であり得る。
【００１５】
本発明のこれらおよび他の態様は、以下に示す発明の説明においてより詳細に扱われる。
【図面の簡単な説明】
【００１６】
【図１】表５に列挙された共通抗原性モチーフ（ＣＡＭ）の構造的決定、ならびに抗原性モチーフの合理的またはコンビナトリアル操作とその後の増幅および選択とによる抗体回避性ＡＡＶカプシド（ＡＡＶｅ）の生成を介して、ＡＡＶｅ株を生成するための方法を示す図である。
【図２】表５に列挙された共通抗原性モチーフ（ＣＡＭ）内のアミノ酸残基のランダム変異誘発によるＡＡＶｅライブラリーの生成を示す図である。各共通抗原性モチーフ内の異なるアミノ酸残基をランダム化することによって生成される異なるライブラリーの理論的多様性。ＡＡＶ１ｅライブラリーの首尾よい生成を、ＡＡＶ１ｅプラスミドのＤＮＡ配列決定を介して確認した（配列番号４３９〜４４２）。黒色塗り潰し棒は、異なるＡＡＶ１ｅライブラリーのランダム化された配列の位置を示す。理論的多様性は、以下の方程式によって計算した：理論的多様性＝２０ｎ、式中、ｎは、示されたＣＡＭ内のランダム化されたアミノ酸の数である。
【図３】ＡＡＶ１ｅシリーズのインビトロ抗体中和アッセイを示す図である。形質導入効率は、ルシフェラーゼ活性によって測定した。ＡＡＶ１（左端）は、４Ｅ４（上）および５Ｈ７（下）の両方によって中和され、これら２つの抗体の５０％阻害濃度はそれぞれ、＜１：６４０００および１：１６０００である。４Ｅ４および５Ｈ７は、親ＡＡＶ１を中和する抗体である。クローンＡＡＶ１ｅ６（中央左）は、４Ｅ４中和に対して完全に抵抗性であり（最も高い抗体濃度において、形質導入レベルにおける低下が存在しない）、５Ｈ７に対して部分的に抵抗性である（１：４０００に低下した５０％阻害濃度）。クローンＡＡＶ１ｅ８（中央右）は、４Ｅ４中和および５Ｈ７中和の両方に対して完全な抵抗性を示したが、最も高い抗体濃度は、形質導入レベルに対する影響を示さなかった。ＡＡＶ１ｅ９（右端）は、５Ｈ７に対する抵抗性を示した；しかし、これは、４Ｅ４に対してはＡＡＶ１と同様に感受性である。
【図４】マウスの骨格筋中への注射の４週間後の、ＡＡＶ１ｅシリーズのインビボ抗体中和アッセイを示す図である。各ウイルスおよび処理群の代表的画像が示される。全てのウイルスは、抗体添加なしでは、同様のレベルの形質導入効率を示した。ＡＡＶ１ｅ６およびＡＡＶ１ｅ８は、４Ｅ４に対する抵抗性を示し、ＡＡＶ１ｅ９は、５Ｈ７に対する抵抗性を示す。ＡＡＶ１ｅ８は、５Ｈ７に対する部分的抵抗性もまた示す。４Ｅ４および５Ｈ７は、親ＡＡＶ１を完全に中和する抗体である。ルシフェラーゼ活性を定量し、棒グラフでまとめた（ＡＡＶ１は左端であり；ＡＡＶ１ｅ６は中央左であり；ＡＡＶ１ｅ８は中央右であり；ＡＡＶ１ｅ９は右端である）。これらの結果は、ＡＡＶ１ｅシリーズが中和抗体のサブセットを逃避できることを確認する。他のＡＡＶ株がこの操作および選択プロトコールに供され得、類似のＡＡＶｅベクターシリーズが、このアプローチを使用して任意のカプシド鋳型から生成され得る。
【図５】ＡＡＶ１ｅ６、ＡＡｖ１ｅ８およびＡＡＶ１ｅ９から得られたアミノ酸残基の合理的組み合わせによって誘導されたＡＡＶ１ｅクローンのインビトロ抗体中和アッセイを示す図である。形質導入効率は、ルシフェラーゼ活性によって測定した。ＡＡＶ１（左端）は、４Ｅ４（上）および５Ｈ７（下）の両方、ならびにポリクローナル抗体を含むヒト血清サンプルによって、完全に中和される。ヒト血清サンプルの５０％阻害希釈＞１：８００倍希釈。４Ｅ４および５Ｈ７は、親ＡＡＶ１を中和する抗体である。クローンＡＡＶ１ｅ１８（中央左）は、４Ｅ４、５Ｈ７ならびにヒト血清に対して部分的に抵抗性である。クローンＡＡＶ１ｅ１９およびＡＡＶ１ｅ２０（中央および右端）は、４Ｅ４中和および５Ｈ７中和の両方ならびにヒト血清サンプルに対して完全な抵抗性を示した。
【図６】親ＡＡＶ１、ならびに表５に列挙されたＣＡＭ領域内の残基Ｓ４７２Ｒ、Ｖ４７３ＤおよびＮ５００Ｅの合理的部位特異的変異誘発によって誘導されたＡＡＶ１ｅクローン２７、２８および２９を比較するネイティブドットブロットアッセイを示す図である。アッセイは、ＡＡＶ１ｅクローンが抗体検出を逃避する能力を決定する。ＡＤＫ１ａは、親ＡＡＶ１カプシドを検出するモノクローナル抗体である。
【図７】親ＡＡＶ１、ならびに表５に列挙されたＣＡＭ領域内の残基Ｓ４７２Ｒ、Ｖ４７３ＤおよびＮ５００Ｅの合理的部位特異的変異誘発によって誘導されたＡＡＶ１ｅクローン２７、２８および２９を比較するＥＬＩＳＡアッセイを示す図である。アッセイは、ＡＡＶ１ｅクローンが抗体検出を逃避する能力を決定する。ＡＤＫ１ａは、親ＡＡＶ１カプシドを検出するモノクローナル抗体である。
【図８】親ＡＡＶ１に対する抗カプシド抗体であるＡＤＫ１ａによる中和をＡＡＶ１ｅ２７クローンが回避する能力を示す形質導入アッセイを示す図である。
【図９】親ＡＡＶ１、および表５に概説されたＣＡＭ領域内の合理的多部位特異的変異誘発によって誘導されたクローンＡＡＶ１ｅ３０〜３６を比較するネイティブドットブロットアッセイを示す図である。アッセイは、ＡＡＶ１ｅクローンが抗体検出を逃避する能力を決定する。４Ｅ４および５Ｈ７は、抗ＡＡＶ１カプシド抗体である。
【図１０】親ＡＡＶ１、および表５に概説されたＣＡＭ領域内の合理的多部位特異的変異誘発によって誘導されたクローンＡＡＶ１ｅ３０〜３６を比較する形質導入アッセイを示す図である。アッセイは、ＡＡＶ１ｅクローンが抗体検出を逃避する能力を決定する。４Ｅ４および５Ｈ７は、親ＡＡＶ１カプシドに対するモノクローナル抗体であり、ヒト血清サンプルは、ＡＡＶ１に対するポリクローナル抗体を含む。クローンＡＡＶ１ｅ３０〜３６は、４Ｅ４を完全に逃避するが、親ＡＡＶ１は中和される。クローンＡＡＶ１ｅ３４およびＡＡＶ１ｅ３５は、５Ｈ７を逃避するかなりの能力を示すが、ＡＡＶ１ｅ３６は、５Ｈ７を回避する部分的な能力を示す。クローンＡＡＶ１ｅ３６は、ヒト患者血清サンプル中のポリクローナル抗体を逃避する（親ＡＡＶ１についての５０％中和は１：３２０希釈であるが、ＡＡＶ１ｅ３６は、１：４０希釈と１：８０希釈との間の範囲にシフトした）。
【図１１】親ＡＡＶ９、ならびに表５に概説されたＣＡＭ領域内の列挙された残基の合理的部位特異的変異誘発によって誘導されたクローンＡＡＶ９ｅ１およびＡＡＶ９ｅ２を比較するネイティブドットブロットアッセイを示す図である。アッセイは、抗体を回避するように別の血清型ＡＡＶ９を操作する能力、および抗体検出を逃避するＡＡＶ９ｅクローンの能力を確立する。ＡＤＫ９、ＨＬ２３６８、ＨＬ２３７０およびＨＬ２３７２は、親ＡＡＶ９カプシドを検出するモノクローナル抗体である。
【図１２】抗原的に向上したＡＡＶバリアントの構造ベースの進化のためのロードマップを示す図である。（Ａ）複数のモノクローナル抗体に複合体化したクライオ再構築された（ｃｒｙｏ−ｒｅｃｏｎｓｔｒｕｃｔｅｄ）ＡＡＶ１カプシドの３次元モデル。このモデルは、２回回転軸に沿って見た４つの異なるモノクローナル抗体ＡＤＫ１ａ、ＡＤＫ１ｂ、４Ｅ４、５Ｈ７のＦａｂ領域と複合体化したＡＡＶ１を示す。（Ｂ）ＲＩＶＥＭによって生成された、カプシド上の４つの抗ＡＡＶ１抗体についての接触残基および共通抗原性モチーフ（ＣＡＭ）が示される。各抗体のカラーコードは上と同じであり、さらに、抗体ＡＤＫ１ａと４Ｅ４との間、４Ｅ４と５Ｈ７との間で重複する残基を個々に着色した。（Ｃ）操作およびＡＡＶライブラリー生成のために選択したＡＡＶ１カプシド上の個々の抗原性フットプリント。３つの異なるＡＡＶライブラリーを、アデノウイルスが同時感染した血管内皮細胞上での５ラウンドの進化に供して、単一領域ＡＡＶ−ＣＡＭバリアントを得た。（Ｄ）次いで、各ライブラリーから新たに進化した抗原性フットプリントを組み合わせ、反復プロセスを介して再操作し、プールし、３サイクルにわたる第２ラウンドの指向性進化に供した。このアプローチにより、天然には出現したことがない新たなフットプリントを有する抗原的に向上したＡＡＶ−ＣＡＭバリアントが得られる。
【図１３】新規抗原性フットプリントのライブラリー多様性、指向性進化および富化の分析を示す図である。親および進化したライブラリーを、Ｉｌｌｕｍｉｎａ  ＭｉＳｅｑプラットホームを使用するハイスループット配列決定に供した。カスタムＰｅｒｌスクリプトを用いた分析後、富化されたアミノ酸配列を、親ならびに（Ａ）領域４、（Ｂ）領域５、（Ｃ）領域８および（Ｄ）組み合わされた領域５＋８の進化したライブラリーの両方について、Ｒでプロットした。各バブルは、それぞれのライブラリー中のそのバリアントについての読み取りの数に比例する面積により、別個のカプシドアミノ酸配列を示している。（Ｅ〜Ｈ）アミノ酸配列出現率を、進化に供した後の、各ライブラリー中の最も高い出現率を有する上位１０のバリアントについて計算した。百分率は、目的の抗原性領域を含む読み取りの総数に対して標準化した、進化したライブラリー中のバリアントについての読み取りの数を示す。「その他」の配列は、上位１０のヒットに含まれない全ての他の進化したライブラリーアミノ酸配列を示す。
【図１４】インビトロおよびインビボの、マウスモノクローナル抗体（ＭＡｂ）に対するＡＡＶ１および単一領域ＣＡＭバリアントの中和プロファイルを示す図である。（Ａ〜Ｃ）ハイブリドーマ培地の異なる希釈における、ＭＡｂ  ４Ｅ４、５Ｈ７およびＡＤＫ１ａに対して評価した、異なるＡＡＶ株、ＡＡＶ１、ＣＡＭ１０６、ＣＡＭ１０８およびＣＡＭ１０９。ＭＡｂと混合した異なるベクターによって媒介される相対的ルシフェラーゼ導入遺伝子発現を、抗体なしの対照に対して標準化した。エラーバーは標準偏差を示す（ｎ＝４）。（Ｄ）新たに進化した抗原性フットプリントの位置を示す、各ＣＡＭ変異体の３回回転軸のロードマップ画像−ＣＡＭ１０６、ＣＡＭ１０８およびＣＡＭ１０９。（Ｅ〜Ｈ）異なるＭＡｂと混合された、２×１０１０ｖｇの用量の、ｓｓＣＢＡ−ＬｕｃをパッケージングするＡＡＶ１、ＣＡＭ１０６、ＣＡＭ１０８およびＣＡＭ１０９ベクターを注射したマウス後肢筋肉におけるルシフェラーゼ発現。注射の４週間後の代表的生動物画像が、（Ｅ）抗体なしの対照、（Ｆ）４Ｅ４（１：５００）、（Ｇ）５Ｈ７（１：５０）および（Ｈ）ＡＤＫ１ａ（１：５）の下位群において示される。（Ｉ）親ＡＡＶ１と比較した、異なるＣＡＭバリアントによって媒介されるルシフェラーゼ活性の定量。ルシフェラーゼ活性は、Ｌｉｖｉｎｇ  Ｉｍａｇｅ  ３．２ソフトウェアによって計算されるように、光子／秒／ｃｍ２／ｓｒとして表される。エラーバーはＳ．Ｄ．を示す（ｎ＝３）。
【図１５】免疫化前のマウス抗血清におけるＡＡＶ１およびＣＡＭバリアントの中和プロファイルを示す図である。（Ａ）３回回転対象軸における、新たに進化したフットプリントを示す、各抗原的に向上したＣＡＭバリアントのロードマップ画像−ＣＡＭ１１７（領域４＋５）、ＣＡＭ１２５（領域５＋８、シアン）およびＣＡＭ１３０（領域４＋５＋８）。（Ｂ〜Ｄ）３匹の個々の動物由来の抗ＡＡＶ１マウス血清および（Ｅ）対照マウス血清を、１：５０から１：３２００の２倍増分で連続希釈し、ＡＡＶベクターと共にインビトロで共インキュベートした。点線は、ＡＡＶ形質導入の、５０％のＮＡｂ媒介性阻害を示す。実線は、抗血清の異なる希釈における、ＡＡＶ１、ＣＡＭ１１７、ＣＡＭ１２５およびＣＡＭ１３０の相対的形質導入効率を示す。エラーバーはＳ．Ｄ．を示した（ｎ＝３）。
【図１６】非ヒト霊長類抗血清におけるＡＡＶ１およびＣＡＭ１３０の中和プロファイルを示す図である。免疫化の前（ナイーブ）および後（４週間および９週間）に回収した３匹の個々のアカゲザルから回収した血清サンプルを、１：５〜１：３２０の２倍増分で連続希釈し、ＡＡＶベクターと共にインビトロで共インキュベートした。点線は、ＡＡＶ形質導入の、５０％のＮＡｂ媒介性阻害を示す。実線は、抗血清の異なる希釈における、ＡＡＶ１およびＣＡＭ１３０の相対的形質導入効率を示す。エラーバーはＳ．Ｄ．を示した（ｎ＝３）。
【図１７】個々の霊長類およびヒト血清サンプルに対するＡＡＶ１およびＣＡＭ１３０の中和プロファイルを示す図である。ＣＢＡ−ＬｕｃをパッケージングするＡＡＶ１およびＣＡＭ１３０（ＭＯＩ  １０，０００）を、臨床的に適切な排除基準を反映するように、１：５希釈で（Ａ）霊長類血清および（Ｂ）ヒト血清に対してテストした。点線は、ＡＡＶ形質導入の、５０％のＮＡｂ媒介性阻害を示す。塗り潰し棒は、ＡＡＶ１およびＣＡＭ１３０の相対的形質導入効率を示す。エラーバーはＳ．Ｄ．を示した（ｎ＝３）。
【図１８】ＣＡＭ１３０バリアントのインビボ特徴付けを示す図である。１×１０１１ｖｇ／マウス（ｎ＝５）の静脈内投与の２週間後の（Ａ）心臓および（Ｃ）肝臓における、ＡＡＶ１およびＣＡＭ１３０のルシフェラーゼ導入遺伝子発現プロファイル。点線は、モック注射対照におけるルシフェラーゼ活性の背景レベルを示す。（Ｂ）心臓および（Ｄ）肝臓におけるＡＡＶ１およびＣＡＭ１３０ベクターゲノムの体内分布。１細胞当たりのベクターゲノムコピー数を計算し、モック注射対照からの値を差し引いて、最終的な値を得た。各ドットは、単一の動物（ｎ＝５）からの２連の実験を示し、ダッシュは平均値を示す。
【図１９】ＡＡＶ１と比較したＣＡＭバリアントの物理的特性および生物学的特性を示す図である。（Ａ）ＨＥＫ２９３細胞（４枚の１５０ｍｍ培養ディッシュ）における、三重プラスミドトランスフェクションプロトコールを使用して産生した精製されたＣＡＭバリアントの力価。血管内皮細胞（ＭＢ１１４）上のＡＡＶ１と比較した、（Ｂ）単一ＣＡＭバリアントおよび（Ｃ）組み合わされたＣＡＭバリアントの形質導入プロファイル。
【図２０】目的の領域にマッピングされた配列決定読み取りを示す図である。未選択のならびに選択されたライブラリーＣＡＭ５、ＣＡＭ８、ＣＡＭ５８およびＣＡＭ４についての、目的の変異誘発された領域にマッピングされた配列決定読み取りの百分率。デマルチプレックスされたＦＡＳＴＱファイルを処理し、カスタムＰｅｒｌスクリプトを用いてマッピングした。
【図２１】未選択のおよび選択されたライブラリーにおけるリードバリアントの出現率を示す図である。目的の配列を含む読み取りを、変異誘発された領域を含む総読み取りによって除算することによって計算した、未選択のおよび選択されたライブラリーにおけるリードバリアントについてのアミノ酸配列の百分率での出現率。
【図２２】ＡＡＶ８ｅ変異体によるヒト肝細胞癌細胞Ｈｕｈ７の形質導入を示す図である。Ｈｕｈ７細胞の、ＡＡＶ８ｅ変異体ＡＡＶ８ｅ０１、ＡＡＶ８ｅ０４およびＡＡＶ８ｅ０５の形質導入効率を決定し、野生型ＡＡＶ８によるＨｕｈ７細胞の形質導入と比較した。
【図２３】ＡＡＶ８に対するマウスモノクローナル抗体による中和からのＡＡＶ８ｅ変異体の逃避を示す図である。ＡＡＶ８ｅ変異体が中和を逃避する能力を、ｍＡｂ  ＨＬ２３８１（Ａ）、ＨＬ２３８３（Ｂ）およびＡＤＫ８（Ｃ）を使用して試験した。
【発明を実施するための形態】
【００１７】
本発明は、本発明の代表的実施形態が示された添付の図面を参照してここに記載される。しかし本発明は、異なる形態で具体化してもよく、本明細書中に示される実施形態に限定されると解釈すべきではない。むしろ、これらの実施形態は、この開示が徹底的かつ完全となり、本発明の範囲を当業者に完全に伝達するように提供されるものである。
【００１８】
特に規定しない限り、本明細書中で使用される全ての技術用語および科学用語は、本発明が属する分野の当業者によって一般的に理解されるのと同じ意味を有する。本明細書中で発明の説明において使用される術語は、特定の実施形態だけを記載することを目的としており、本発明を限定することを意図しない。
【００１９】
本明細書中で言及される全ての刊行物、特許出願、特許、ＧｅｎＢａｎｋ受託番号および他の参考文献は、引用することにより本明細書の一部をなすものとする。
【００２０】
発明の説明および添付の特許請求の範囲におけるＡＡＶカプシドタンパク質中の全てのアミノ酸位置の命名は、ＶＰ１カプシドサブユニットの番号付けに関する。本明細書に記載される改変は、ＡＡＶ  ｃａｐ遺伝子中に挿入される場合、ＶＰ１、ＶＰ２および／またはＶＰ３カプシドサブユニットにおける改変を生じ得ることが、当業者によって理解される。あるいは、これらのカプシドサブユニットは、カプシドサブユニットのうち１つまたは２つだけ（ＶＰ１、ＶＰ２、ＶＰ３、ＶＰ１＋ＶＰ２、ＶＰ１＋ＶＰ３またはＶＰ２＋ＶＰ３）における改変を達成するために、独立して発現され得る。
【００２１】
［定義］
以下の用語が、本明細書中の記載および添付の特許請求の範囲において使用される。
【００２２】
単数形「ａ」、「ａｎ」および「ｔｈｅ」は、文脈が明らかに他を示さない限り、複数形も同様に含むことが意図される。
【００２３】
さらに、用語「約」は、本明細書中で使用する場合、ポリヌクレオチドまたはポリペプチド配列の長さ、用量、時間、温度などの量などの測定可能な値をいう場合、特定された量の±２０％、±１０％、±５％、±１％、±０．５％またはさらには±０．１％の変動を包含することを意味する。
【００２４】
また、本明細書中で使用する場合、「および／または」は、関連する列挙された項目のうち１つまたは複数の、任意のおよび全ての可能な組み合わせ、ならびに代替として解釈される場合（「または」）には組み合わせの欠如をいい、かつこれらを包含する。
【００２５】
文脈が他を示さない限り、本明細書中に記載される本発明の種々の特徴が任意の組み合わせで使用され得ることが、具体的に意図される。
【００２６】
さらに、本発明は、本明細書中に示される本発明のいくつかの実施形態、任意の特徴または特徴の組み合わせが排除または割愛できることも企図している。
【００２７】
例えば、特定のアミノ酸がＡ、Ｇ、Ｉ、Ｌおよび／またはＶから選択できることを本明細書が示す場合をさらに説明するために、この言葉は、各かかる下位の組み合わせが本明細書中に明示的に示されるかのように、例えばＡ、Ｇ、ＩまたはＬ；Ａ、Ｇ、ＩまたはＶ；ＡまたはＧ；Ｌのみなどの、これらのアミノ酸（複数可）の任意のサブセットからアミノ酸を選択できることもまた示す。さらに、かかる言葉は、１つまたは複数の特定されたアミノ酸が放棄され得ることもまた示す。例えば、特定の実施形態では、各かかる可能な放棄が明示的に示されるかのように、アミノ酸は、Ａ、ＧまたはＩではなく；Ａではなく；ＧまたはＶではない、など。
【００２８】
本明細書中で使用する場合、用語「低下する（ｒｅｄｕｃｅ／ｒｅｄｕｃｅｓ）」、「低下」および類似の用語は、少なくとも約１０％、１５％、２０％、２５％、３５％、５０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９７％またはそれ以上の減少を意味する。
【００２９】
本明細書中で使用する場合、用語「増強する（ｅｎｈａｎｃｅ／ｅｎｈａｎｃｅｓ）」「増強」および類似の用語は、少なくとも約１０％、１５％、２０％、２５％、５０％、７５％、１００％、１５０％、２００％、３００％、４００％、５００％またはそれ以上の増加を示す。
【００３０】
用語「パルボウイルス」は、本明細書中で使用する場合、自律複製するパルボウイルスおよびディペンドウイルス属が含まれるパルボウイルス科（Ｐａｒｖｏｖｉｒｉｄａｅ）を包含する。自律的パルボウイルスには、プロトパルボウイルス属（Ｐｒｏｔｏｐａｒｖｏｖｉｒｕｓ）、エリスロパルボウイルス属（Ｅｒｙｔｈｒｏｐａｒｖｏｖｉｒｕｓ）、ボカパルウイルス属（Ｂｏｃａｐａｒｖｉｒｕｓ）およびデンソウイルス属（Ｄｅｎｓｏｖｉｒｕｓ）の亜科のメンバーが含まれる。例示的な自律的パルボウイルスには、マウス微小ウイルス、ウシパルボウイルス、イヌパルボウイルス、ニワトリパルボウイルス、ネコ汎白血球減少症ウイルス、ネコパルボウイルス、ガチョウパルボウイルス、Ｈ１パルボウイルス、バリケンパルボウイルス、Ｂ１９ウイルス、および現在公知のまたは後に発見される任意の他の自律的パルボウイルスが含まれるが、これらに限定されない。他の自律的パルボウイルスは、当業者に公知である。例えば、ＢＥＲＮＡＲＤ  Ｎ．ＦＩＥＬＤＳら、ＶＩＲＯＬＯＧＹ、第２巻、第６９章（第４版、Ｌｉｐｐｉｎｃｏｔｔ−Ｒａｖｅｎ  Ｐｕｂｌｉｓｈｅｒｓ；Ｃｏｔｍｏｒｅら  Ａｒｃｈｉｖｅｓ  ｏｆ  Ｖｉｒｏｌｏｇｙ  ＤＯＩ  １０．１００７／ｓ００７０５−０１３−１９１４−Ｉ）を参照のこと。
【００３１】
本明細書中で使用する場合、用語「アデノ随伴ウイルス」（ＡＡＶ）には、１型ＡＡＶ、２型ＡＡＶ、３型ＡＡＶ（３Ａ型および３Ｂ型を含む）、４型ＡＡＶ、５型ＡＡＶ、６型ＡＡＶ、７型ＡＡＶ、８型ＡＡＶ、９型ＡＡＶ、１０型ＡＡＶ、１１型ＡＡＶ、１２型ＡＡＶ、１３型ＡＡＶ、ｒｈ３２．３３型ＡＡＶ、ｒｈ８型ＡＡＶ、ｒｈ１０型ＡＡＶ、トリＡＡＶ、ウシＡＡＶ、イヌＡＡＶ、ウマＡＡＶ、ヒツジＡＡＶ、および現在公知のまたは後に発見される任意の他のＡＡＶが含まれるが、これらに限定されない。例えば、ＢＥＲＮＡＲＤ  Ｎ．ＦＩＥＬＤＳら、ＶＩＲＯＬＯＧＹ、第２巻、第６９章（第４版、Ｌｉｐｐｉｎｃｏｔｔ−Ｒａｖｅｎ  Ｐｕｂｌｉｓｈｅｒｓ）を参照のこと。多数のＡＡＶ血清型およびクレードが同定されている（例えば、Ｇａｏら、（２００４）Ｊ．Ｖｉｒｏｌｏｇｙ  ７８：６３８１〜６３８８頁；Ｍｏｒｉｓら、（２００４）Ｖｉｒｏｌｏｇｙ  ３３：３７５〜３８３頁；および表１を参照のこと）。
【００３２】
ＡＡＶおよび自律的パルボウイルスの種々の血清型のゲノム配列、ならびにネイティブ末端反復（ＴＲ）、Ｒｅｐタンパク質およびカプシドサブユニットの配列が、当該分野で公知である。かかる配列は、文献中またはＧｅｎＢａｎｋなどの公的データベース中で見出され得る。例えば、ＧｅｎＢａｎｋ受託番号ＮＣ＿００２０７７、ＮＣ＿００１４０１、ＮＣ＿００１７２９、ＮＣ＿００１８６３、ＮＣ＿００１８２９、ＮＣ＿００１８６２、ＮＣ＿０００８８３、ＮＣ＿００１７０１、ＮＣ＿００１５１０、ＮＣ＿００６１５２、ＮＣ＿００６２６１、ＡＦ０６３４９７、Ｕ８９７９０、ＡＦ０４３３０３、ＡＦ０２８７０５、ＡＦ０２８７０４、Ｊ０２２７５、Ｊ０１９０１、Ｊ０２２７５、Ｘ０１４５７、ＡＦ２８８０６１、ＡＨ００９９６２、ＡＹ０２８２２６、ＡＹ０２８２２３、ＮＣ＿００１３５８、ＮＣ＿００１５４０、ＡＦ５１３８５１、ＡＦ５１３８５２、ＡＹ５３０５７９を参照でき、その開示は、パルボウイルスおよびＡＡＶの核酸配列およびアミノ酸配列を教示するために、参照により本明細書の一部をなすものとする。例えば以下もまた参照のこと：Ｓｒｉｖｉｓｔａｖａら、（１９８３）Ｊ．Ｖｉｒｏｌｏｇｙ  ４５：５５５頁；Ｃｈｉｏｒｉｎｉら、（１９９８）Ｊ．Ｖｉｒｏｌｏｇｙ  ７１：６８２３頁；Ｃｈｉｏｒｉｎｉら、（１９９９）Ｊ．Ｖｉｒｏｌｏｇｙ  ７３：１３０９頁；Ｂａｎｔｅｌ−Ｓｃｈａａｌら、（１９９９）Ｊ．Ｖｉｒｏｌｏｇｙ  ７３：９３９頁；Ｘｉａｏら、（１９９９）Ｊ．  Ｖｉｒｏｌｏｇｙ  ７３：３９９４頁；Ｍｕｒａｍａｔｓｕら、（１９９６）Ｖｉｒｏｌｏｇｙ  ２２１：２０８頁；Ｓｈａｄｅら、（１９８６）Ｊ．Ｖｉｒｏｌ．５８：９２１頁；Ｇａｏら、（２００２）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ  ９９：１１８５４頁；Ｍｏｒｉｓら、（２００４）Ｖｉｒｏｌｏｇｙ  ３３−：３７５〜３８３頁；国際特許公開公報ＷＯ  ００／２８０６１、ＷＯ  ９９／６１６０１、ＷＯ  ９８／１１２４４；および米国特許第６，１５６，３０３号；これらの開示は、パルボウイルスおよびＡＡＶの核酸配列およびアミノ酸配列を教示するために、参照により本明細書の一部をなすものとする。表１もまた参照のこと。自律的パルボウイルスおよびＡＡＶのカプシド構造は、ＢＥＲＮＡＲＤ  Ｎ．ＦＩＥＬＤＳら、ＶＩＲＯＬＯＧＹ、第２巻、第６９章および第７０章（第４版、Ｌｉｐｐｉｎｃｏｔｔ−Ｒａｖｅｎ  Ｐｕｂｌｉｓｈｅｒｓ）中により詳細に記載されている。ＡＡＶ２（Ｘｉｅら、（２００２）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．９９：１０４０５〜１０頁）、ＡＡＶ９（ＤｉＭａｔｔｉａら、（２０１２）Ｊ．Ｖｉｒｏｌ．８６：６９４７〜６９５８）、ＡＡＶ８（Ｎａｍら、（２００７）Ｊ．Ｖｉｒｏｌ．８１：１２２６０〜１２２７１）、ＡＡＶ６（Ｎｇら、（２０１０）Ｊ．Ｖｉｒｏｌ．８４：１２９４５〜１２９５７）、ＡＡＶ５（Ｇｏｖｉｎｄａｓａｍｙら、（２０１３）Ｊ．Ｖｉｒｏｌ．８７、１１１８７〜１１１９９）、ＡＡＶ４（Ｇｏｖｉｎｄａｓａｍｙら、（２００６）Ｊ．Ｖｉｒｏｌ．８０：１１５５６〜１１５７０）、ＡＡＶ３Ｂ（Ｌｅｒｃｈら、（２０１０）Ｖｉｒｏｌｏｇｙ  ４０３：２６〜３６）、ＢＰＶ（Ｋａｉｌａｓａｎら、（２０１５）Ｊ．Ｖｉｒｏｌ．８９：２６０３〜２６１４）およびＣＰＶ（Ｘｉｅら（１９９６）Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．６：４９７〜５２０頁およびＴｓａｏら、（１９９１）Ｓｃｉｅｎｃｅ  ２５１：１４５６〜６４頁）の結晶構造の説明もまた参照のこと。
【００３３】
【表１】
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【００３４】
用語「トロピズム」とは、本明細書中で使用する場合、特定の細胞または組織へのウイルスの優先的な侵入と、任意選択的に、その後の、例えば組換えウイルスについて細胞中でのウイルスゲノムが保有する配列（複数可）の発現（例えば、転写および任意選択的に翻訳）、対象の異種核酸の発現をいう。
【００３５】
当業者は、ウイルスゲノムからの異種核酸配列の転写は、例えば、誘導性プロモーターまたは他の方法で調節される核酸配列について、トランス作用因子の非存在下では開始されない場合があることを理解するであろう。ｒＡＡＶゲノムの場合、ウイルスゲノムからの遺伝子発現は、安定に組み込まれたプロウイルスから、非組み込みエピソームから、ならびに細胞内でウイルスが取り得る任意の他の形態からであり得る。
【００３６】
本明細書中で使用する場合、「全身性トロピズム」および「全身性形質導入」（および同等の用語）は、本発明のウイルスカプシドまたはウイルスベクターが、身体中の組織（例えば、脳、肺、骨格筋、心臓、肝臓、腎臓および／または膵臓）に対して、それぞれトロピズムを示すことまたはそれらの組織に形質導入することを示す。本発明の実施形態では、筋組織（例えば、骨格筋、横隔膜筋および心筋）の全身性形質導入が観察される。他の実施形態では、骨格筋組織の全身性形質導入が達成される。例えば、特定の実施形態では、身体中の本質的に全ての骨格筋が形質導入される（しかし、形質導入の効率は筋の型によって異なり得る）。特定の実施形態では、四肢筋、心筋および横隔膜筋の全身性形質導入が達成される。任意選択的に、ウイルスカプシドまたはウイルスベクターは、全身性経路（例えば、静脈内、関節内またはリンパ内などの全身性経路）を介して投与される。あるいは、他の実施形態では、カプシドまたはウイルスベクターは、局所送達される（例えば、足蹠に、筋内、皮内、皮下、外用）。
【００３７】
特に示さない限り、「効率的な形質導入」もしくは「効率的なトロピズム」または同様の用語は、適切な対照を参照することにより決定され得る（例えば、対照のそれぞれ形質導入またはトロピズムの、少なくとも約５０％、６０％、７０％、８０％、８５％、９０％、９５％またはそれ以上）。特定の実施形態では、ウイルスベクターは、骨格筋、心筋、横隔膜筋、膵臓（膵島β細胞を含む）、脾臓、胃腸管（例えば、上皮および／または平滑筋）、中枢神経系の細胞、肺、関節細胞および／または腎臓に効率的に形質導入するまたはそれらに対する効率的なトロピズムを有する。適切な対照は、所望のトロピズムプロファイルを含む種々の因子に依存する。例えば、ＡＡＶ８およびＡＡＶ９は、骨格筋、心筋および横隔膜筋に形質導入する際に高度に効率的であるが、高い効率で肝臓に形質導入するという短所もまた有する。従って、本発明は、ＡＡＶ８またはＡＡＶ９の骨格筋、心筋および／または横隔膜筋の効率的な形質導入を実証するが、肝臓についてはかなり低い形質導入効率を有する本発明のウイルスベクターを同定するために実施され得る。さらに、目的のトロピズムプロファイルは、複数の標的組織に対するトロピズムを反映し得るので、適切なベクターはいくらかのトレードオフを示し得ると理解される。例示するために、本発明のウイルスベクターは、骨格筋、心筋および／または横隔膜筋に形質導入する際に、ＡＡＶ８またはＡＡＶ９よりも効率が低い可能性があるが、それにもかかわらず、肝臓の低レベルの形質導入に起因して、非常に望ましい可能性がある。
【００３８】
同様に、ウイルスが標識組織について「効率的に形質導入しない」もしくは「効率的なトロピズムを有さない」または同様の用語であるか否かを、適切な対照を参照して決定することができる。特定の実施形態では、ウイルスベクターは、肝臓、腎臓、生殖腺および／または生殖細胞について、効率的に形質導入しない（即ち、効率的なトロピズムを有さない）。特定の実施形態では、組織（複数可）（例えば肝臓）の望ましくない形質導入は、所望の標的組織（複数可）（例えば、骨格筋、横隔膜筋、心筋および／または中枢神経系の細胞）の形質導入レベルと比較して、２０％以下、１０％以下、５％以下、１％以下、０．１％以下である。
【００３９】
本明細書中で使用する場合、用語「ポリペプチド」は、特に示さない限り、ペプチドおよびタンパク質の両方を包含する。
【００４０】
「ポリヌクレオチド」は、ヌクレオチド塩基の配列であり、ＲＮＡ、ＤＮＡまたはＤＮＡ−ＲＮＡハイブリッド配列（天然に存在するヌクレオチドおよび天然に存在しないヌクレオチドの両方を含む）であり得るが、代表的実施形態では、一本鎖または二本鎖のいずれかのＤＮＡ配列である。
【００４１】
本明細書中で使用する場合、「単離された」ポリヌクレオチド（例えば、「単離されたＤＮＡ」または「単離されたＲＮＡ」）は、天然に存在する生物またはウイルスの他の成分、例えば、そのポリヌクレオチドと一般的には関連して見出される細胞もしくはウイルスの構造成分または他のポリペプチドもしくは核酸の少なくともいくつかから少なくとも部分的に分離されたポリヌクレオチドを意味する。代表的実施形態では、「単離された」ヌクレオチドは、出発材料と比較して、少なくとも約１０倍、１００倍、１０００倍、１０，０００倍またはそれ以上富化されている。
【００４２】
同様に、「単離された」ポリペプチドとは、天然に存在する生物またはウイルスの他の成分、例えば、そのポリペプチドと一般的には関連して見出される細胞もしくはウイルスの構造成分または他のポリペプチドもしくは核酸の少なくともいくつかから少なくとも部分的に分離されたポリペプチドを意味する。代表的実施形態では、「単離された」ポリペプチドは、出発材料と比較して、少なくとも約１０倍、１００倍、１０００倍、１０，０００倍またはそれ以上富化されている。
【００４３】
本明細書中で使用する場合、ウイルスベクターを「単離する」もしくは「精製する」（または文法的等価物）とは、そのウイルスベクターが、出発材料中の他の成分の少なくともいくつかから少なくとも部分的に分離されることを意味する。代表的実施形態では、「単離された」または「精製された」ウイルスベクターは、出発材料と比較して、少なくとも約１０倍、１００倍、１０００倍、１０，０００倍またはそれ以上富化されている。
【００４４】
「治療的ポリペプチド」は、細胞または対象中のタンパク質の非存在または欠損から生じる症状を緩和、低下、予防、遅延および／または安定化できるポリペプチド、ならびに／あるいは利益、例えば、抗がん効果、または移植物生存性における改善を他の方法で対象に付与するポリペプチドである。
【００４５】
用語「治療する（ｔｒｅａｔ／ｔｒｅａｔｉｎｇ）」または「〜の治療」（およびその文法的な変形）は、対象の状態の重症度が低下され、少なくとも部分的に改善または安定化されること、および／あるいは少なくとも１つの臨床症状における幾分かの緩和、軽減、減少または安定化が達成されること、および／あるいは疾患または障害の進行の遅延が存在することを意味する。
【００４６】
用語「予防する（ｐｒｅｖｅｎｔ／ｐｒｅｖｅｎｔｉｎｇ）」および「予防」（およびその文法的な変形）とは、対象における疾患、障害および／または臨床症状（複数可）の発症の予防および／または遅延、ならびに／あるいは本発明の方法の非存在下で生じるものと比較した、疾患、障害および／または臨床症状（複数可）の発症の重症度における低下をいう。予防は、疾患、障害および／または臨床症状（複数可）の完全な非存在のように、完全であり得る。予防は部分的でもあり得、その結果、対象における疾患、障害および／または臨床症状（複数可）の出現ならびに／あるいは発症の重症度は、本発明の非存在下で生じるものよりも低くなる。
【００４７】
「治療有効」量は、本明細書中で使用する場合、いくらかの改善または利益を対象に提供するのに充分な量である。代替的に述べると、「治療有効」量は、対象における少なくとも１つの臨床症状におけるいくらかの緩和、軽減、減少または安定化を提供する量である。いくらかの利益が対象に提供される限り、治療効果は完全である必要も治癒的である必要もないことを、当業者は理解するであろう。
【００４８】
「予防有効」量は、本明細書中で使用する場合、対象における疾患、障害および／または臨床症状の発症を予防および／または遅延するのに充分な量、ならびに／あるいは本発明の方法の非存在下で生じるものと比較して、対象における疾患、障害および／または臨床症状の発症の重症度を低下および／または遅延させるのに充分な量である。いくらかの利益が対象に提供される限り、予防のレベルが完全である必要がないことを、当業者は理解するであろう。
【００４９】
用語「異種ヌクレオチド配列」および「異種核酸」は、本明細書中で互換的に使用され、ウイルス中に天然に存在しない配列をいう。一般に、異種核酸は、対象のポリペプチドまたは非翻訳ＲＮＡをコードするオープンリーディングフレームを含む（例えば、細胞または対象への送達のため）。
【００５０】
本明細書中で使用する場合、用語「ウイルスベクター」、「ベクター」または「遺伝子送達ベクター」とは、核酸送達ビヒクルとして機能し、ビリオン内にパッケージングされたベクターゲノム（例えば、ウイルスＤＮＡ［ｖＤＮＡ］）を含む、ウイルス（例えば、ＡＡＶ）粒子をいう。あるいは、いくつかの文脈では、用語「ベクター」は、ベクターゲノム／ｖＤＮＡ単独をいうために使用され得る。
【００５１】
「ｒＡＡＶベクターゲノム」または「ｒＡＡＶゲノム」は、１つまたは複数の異種核酸配列を含むＡＡＶゲノム（即ち、ｖＤＮＡ）である。ｒＡＡＶベクターは一般に、ウイルスを生成するためにシスの末端反復（複数可）（ＴＲ（複数可））だけを必要とする。それ以外の全てのウイルス配列は不可欠ではなく、トランスエレメントとして供給され得る（Ｍｕｚｙｃｚｋａ（１９９２）Ｃｕｒｒ．Ｔｏｐｉｃｓ  Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１５８：９７頁）。典型的には、ｒＡＡＶベクターゲノムは、ベクターによって効率的にパッケージングされ得る導入遺伝子のサイズを最大化するように、１つまたは複数のＴＲ配列を保持するだけである。構造タンパク質および非構造タンパク質をコードする配列は、トランスエレメントとして提供され得る（例えば、プラスミドなどのベクターから、またはその配列をパッケージング細胞中に安定に組み込むことによる）。本発明の実施形態では、ｒＡＡＶベクターゲノムは、典型的にはベクターゲノムの５’末端および３’末端に存在し、異種核酸に隣接するがそれらと連続している必要はない少なくとも１つのＴＲ配列（例えば、ＡＡＶのＴＲ配列）、任意選択的に２つのＴＲ（例えば、２つのＡＡＶ−ＴＲ）を含む。ＴＲは、互いに同じでも異なってもよい。
【００５２】
用語「末端反復」または「ＴＲ」には、ヘアピン構造を形成し、逆位末端反復として機能する（即ち、例えば複製、ウイルスパッケージング、組み込みおよび／またはプロウイルスレスキューなどの所望の機能を媒介する）、任意のウイルス末端反復または合成配列が含まれる。ＴＲは、ＡＡＶのＴＲまたは非ＡＡＶのＴＲであり得る。例えば、非ＡＡＶ−ＴＲ配列、例えば、他のパルボウイルス（例えば、イヌパルボウイルス（ＣＰＶ）、マウスパルボウイルス（ＭＶＭ）、ヒトパルボウイルスＢ−１９）または任意の他の適切なウイルス配列（例えば、ＳＶ４０複製起点として機能するＳＶ４０ヘアピン）のＴＲ配列がＴＲとして使用され得、これは、短縮、置換、欠失、挿入および／または付加によってさらに改変され得る。さらに、ＴＲは、例えば、Ｓａｍｕｌｓｋｉらに対する米国特許第５，４７８，７４５号に記載された「ダブル−Ｄ配列」などのように、部分的に合成でも完全に合成でもよい。
【００５３】
「ＡＡＶ末端反復」または「ＡＡＶ−ＴＲ」は、血清型１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３が含まれるがこれらに限定されない任意のＡＡＶ、または現在公知のまたは後に発見される任意の他のＡＡＶに由来し得る（例えば、表１を参照のこと）。末端反復が、例えば、複製、ウイルスパッケージング、組み込み、および／またはプロウイルスレスキューなどの所望の機能を媒介する限り、ＡＡＶ末端反復はネイティブ末端反復配列を有する必要はない（例えば、ネイティブのＡＡＶ−ＴＲ配列は、挿入、欠失、短縮および／またはミスセンス変異によって変更されていてもよい）。
【００５４】
本発明のウイルスベクターは、さらに、国際特許公開公報ＷＯ  ００／２８００４およびＣｈａｏら、（２０００）Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｔｈｅｒａｐｙ  ２：６１９頁に記載されるように、「標的化された」ウイルスベクター（例えば、指向性トロピズムを有する）および／または「ハイブリッド」パルボウイルス（即ち、ウイルスＴＲおよびウイルスカプシドが異なるパルボウイルスに由来するもの）であり得る。
【００５５】
本発明のウイルスベクターは、さらに、国際特許公開公報ＷＯ  ０１／９２５５１（その開示は、その全体が引用することにより本明細書の一部をなすものとする）に記載されるように、二重鎖パルボウイルス粒子であり得る。従って、いくつかの実施形態では、二本鎖（二重鎖）ゲノムが、本発明のウイルスカプシド中にパッケージングされ得る。
【００５６】
さらに、ウイルスカプシドまたはゲノムエレメントは、挿入、欠失および／または置換を含む他の改変を含み得る。
【００５７】
本明細書中で使用する場合、用語「アミノ酸」は、任意の天然に存在するアミノ酸、その改変形態および合成アミノ酸を包含する。
【００５８】
天然に存在する左旋性（Ｌ−）アミノ酸を表２に示す。
【００５９】
【表２】
2018528253.tif 000004
【００６０】
あるいは、アミノ酸は、改変されたアミノ酸残基であり得（非限定的な例を表３に示す）、および／または翻訳後修飾（例えば、アセチル化、アミド化、ホルミル化、ヒドロキシル化、メチル化、リン酸化または硫酸化（ｓｕｌｆａｔａｔｉｏｎ））によって改変されたアミノ酸であり得る。
【００６１】
【表３】
2018528253.tif 000005
【００６２】
さらに、天然に存在しないアミノ酸は、Ｗａｎｇら、（Ａｎｎｕ  Ｒｅｖ  Ｂｉｏｐｈｙｓ  Ｂｉｏｍｏｌ  Ｓｔｒｕｃｔ．３５：２２５〜４９頁（２００６））によって記載されるような「非天然」アミノ酸であり得る。これらの非天然アミノ酸は、対象の分子をＡＡＶカプシドタンパク質に化学的に連結するために有利に使用され得る。
【００６３】
＜改変されたＡＡＶカプシドタンパク質ならびにそれを含むウイルスカプシドおよびウイルスベクター＞
本発明は、アミノ酸配列中に改変(例えば、置換)を含むＡＡＶカプシドタンパク質、ならびに改変されたＡＡＶカプシドタンパク質(ＶＰ１、ＶＰ２および／またはＶＰ３)を含むウイルスカプシドおよびウイルスベクターを提供する。本発明者らは、本発明の改変が、改変されたＡＡＶカプシドタンパク質を含むウイルスベクターに、中和抗体を回避する能力が含まれるがこれに限定されない１つまたは複数の所望の特性を付与できることを発見した。従って、本発明は、従来のＡＡＶベクターと関連する制約のいくつかに取り組む。
【００６４】
従って、一態様では、本発明は、１つまたは複数のアミノ酸置換を含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、１つまたは複数の置換が、ＡＡＶカプシドタンパク質上の１つまたは複数の抗原性部位を改変する、アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質を提供する。１つまたは複数の抗原性部位の改変は、１つもしくは複数の抗原性部位への抗体による結合の阻害、および／またはこのＡＡＶカプシドタンパク質を含むウイルス粒子の感染力の中和の阻害を生じる。１つまたは複数のアミノ酸置換は、ＡＡＶカプシドタンパク質を含むＡＡＶ−抗体複合体のペプチドエピトープマッピングおよび／またはクライオ電子顕微鏡研究によって同定された１つまたは複数の抗原性フットプリント中にあり得る。いくつかの実施形態では、１つまたは複数の抗原性部位は、共通抗原性モチーフ、即ちＣＡＭである（例えば、表５を参照のこと）。本発明のカプシドタンパク質は、中和抗体を回避する表現型を有するＡＡＶウイルス粒子またはＡＡＶウイルスベクター中に存在するＡＡＶカプシドを産生するように改変される。本発明のＡＡＶウイルス粒子またはベクターは、中和抗体を回避する表現型に加えて、増強または維持された形質導入効率の表現型もまた有し得る。
【００６５】
いくつかの実施形態では、１つまたは複数の抗原性部位の１つまたは複数の置換は、第１のＡＡＶ血清型のカプシドタンパク質由来の１つまたは複数の抗原性部位を、この第１のＡＡＶ血清型とは異なる第２のＡＡＶ血清型のカプシドタンパク質中に導入し得る。
【００６６】
本発明のＡＡＶカプシドタンパク質は、ＡＡＶ１、ＡＡＶ２、ＡＡＶ３、ＡＡＶ３Ｂ、ＡＡＶ４、ＡＡＶ５、ＡＡＶ６、ＡＡＶ７、ＡＡＶ８、ＡＡＶ９、ＡＡＶ１０、ＡＡＶ１１、ＡＡＶ１２、ＡＡＶｒｈ．８、ＡＡＶｒｈ．１０、ＡＡＶｒｈ．３２．３３、ウシＡＡＶ、トリＡＡＶ、または現在公知のもしくは後に同定される任意の他のＡＡＶから選択されるＡＡＶ血清型のカプシドタンパク質であり得る。
【００６７】
本発明の改変されたＡＡＶカプシドタンパク質のいくつかの例が、本明細書に提供される。以下の実施例では、カプシドタンパク質は、記載された特異的置換を含み得、いくつかの実施形態では、記載されたものよりも少ないまたは多い置換を含み得る。例えば、いくつかの実施形態では、本発明のカプシドタンパク質は、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０個などの置換を含み得る。
【００６８】
さらに、アミノ酸残基が、野生型またはネイティブのアミノ酸配列中に存在するアミノ酸残基以外の任意のアミノ酸残基によって置換される、本明細書に記載される実施形態では、この任意の他のアミノ酸残基は、当該分野で公知の任意の天然または非天然のアミノ酸残基であり得る（例えば、表２および３を参照のこと）。いくつかの実施形態では、この置換は、保存的置換であり得、いくつかの実施形態では、この置換は、非保存的置換であり得る。
【００６９】
いくつかの実施形態では、本発明のカプシドタンパク質は、いずれかの組み合わせでのＡＡＶ１のアミノ酸残基２６２〜２６８（ＶＰ１番号付け；ＣＡＭ１）のうち１つもしくは複数（例えば、２、３、４、５、６もしくは７）、またはＡＡＶ２、ＡＡＶ３、ＡＡＶ４、ＡＡＶ５、ＡＡＶ６、ＡＡＶ７、ＡＡＶ８、ＡＡＶ９、ＡＡＶ１０、ＡＡＶ１１、ＡＡＶ１２、ＡＡＶｒｈ８、ＡＡＶｒｈ１０、ＡＡＶｒｈ３２．３３、ウシＡＡＶもしくはトリＡＡＶ中の等価なアミノ酸残基における置換を含み得る。
【００７０】
いくつかの実施形態では、本発明のカプシドタンパク質は、いずれかの組み合わせでのＡＡＶ１のアミノ酸残基３７０〜３７９（ＶＰ１番号付け；ＣＡＭ３）のうち１つもしくは複数（例えば、２、３、４、５、６、７、８、９もしくは１０）、またはＡＡＶ２、ＡＡＶ３、ＡＡＶ４、ＡＡＶ５、ＡＡＶ６、ＡＡＶ７、ＡＡＶ８、ＡＡＶ９、ＡＡＶ１０、ＡＡＶ１１、ＡＡＶ１２、ＡＡＶｒｈ８、ＡＡＶｒｈ１０、ＡＡＶｒｈ３２．３３、ウシＡＡＶもしくはトリＡＡＶ中の等価なアミノ酸残基における置換を含み得る。
【００７１】
いくつかの実施形態では、本発明のカプシドタンパク質は、いずれかの組み合わせでのＡＡＶ１のアミノ酸残基４５１〜４５９（ＶＰ１番号付け；ＣＡＭ４−１）のうち１つもしくは複数（例えば、２、３、４、５、６、７、８もしくは９）、またはＡＡＶ２、ＡＡＶ３、ＡＡＶ４、ＡＡＶ５、ＡＡＶ６、ＡＡＶ７、ＡＡＶ８、ＡＡＶ９、ＡＡＶ１０、ＡＡＶ１１、ＡＡＶ１２、ＡＡＶｒｈ８、ＡＡＶｒｈ１０、ＡＡＶｒｈ３２．３３、ウシＡＡＶもしくはトリＡＡＶ中の等価なアミノ酸残基における置換を含み得る。
【００７２】
いくつかの実施形態では、本発明のカプシドタンパク質は、ＡＡＶ１のアミノ酸残基４７２〜４７３（ＶＰ１番号付け；ＣＡＭ４−２）のうち１つもしくは複数（例えば、２）、またはＡＡＶ２、ＡＡＶ３、ＡＡＶ４、ＡＡＶ５、ＡＡＶ６、ＡＡＶ７、ＡＡＶ８、ＡＡＶ９、ＡＡＶ１０、ＡＡＶ１１、ＡＡＶ１２、ＡＡＶｒｈ８、ＡＡＶｒｈ１０、ＡＡＶｒｈ３２．３３、ウシＡＡＶもしくはトリＡＡＶ中の等価なアミノ酸残基における置換を含み得る。
【００７３】
いくつかの実施形態では、本発明のカプシドタンパク質は、いずれかの組み合わせでのＡＡＶ１のアミノ酸残基４９３〜５００（ＶＰ１番号付け；ＣＡＭ５）のうち１つもしくは複数（例えば、２、３、４、５、６、７もしくは８）、またはＡＡＶ２、ＡＡＶ３、ＡＡＶ４、ＡＡＶ５、ＡＡＶ６、ＡＡＶ７、ＡＡＶ８、ＡＡＶ９、ＡＡＶ１０、ＡＡＶ１１、ＡＡＶ１２、ＡＡＶｒｈ８、ＡＡＶｒｈ１０、ＡＡＶｒｈ３２．３３、ウシＡＡＶもしくはトリＡＡＶ中の等価なアミノ酸残基における置換を含み得る。
【００７４】
いくつかの実施形態では、本発明のカプシドタンパク質は、いずれかの組み合わせでのＡＡＶ１のアミノ酸残基５２８〜５３４（ＶＰ１番号付け；ＣＡＭ６）のうち１つもしくは複数（例えば、２、３、４、５、６もしくは７）、またはＡＡＶ２、ＡＡＶ３、ＡＡＶ４、ＡＡＶ５、ＡＡＶ６、ＡＡＶ７、ＡＡＶ８、ＡＡＶ９、ＡＡＶ１０、ＡＡＶ１１、ＡＡＶ１２、ＡＡＶｒｈ８、ＡＡＶｒｈ１０、ＡＡＶｒｈ３２．３３、ウシＡＡＶもしくはトリＡＡＶ中の等価なアミノ酸残基における置換を含み得る。
【００７５】
いくつかの実施形態では、本発明のカプシドタンパク質は、いずれかの組み合わせでのＡＡＶ１のアミノ酸残基５４７〜５５２（ＶＰ１番号付け；ＣＡＭ７）のうち１つもしくは複数（例えば、２、３、４、５もしくは６）、またはＡＡＶ２、ＡＡＶ３、ＡＡＶ４、ＡＡＶ５、ＡＡＶ６、ＡＡＶ７、ＡＡＶ８、ＡＡＶ９、ＡＡＶ１０、ＡＡＶ１１、ＡＡＶ１２、ＡＡＶｒｈ８、ＡＡＶｒｈ１０、ＡＡＶｒｈ３２．３３、ウシＡＡＶもしくはトリＡＡＶ中の等価なアミノ酸残基における置換を含み得る。
【００７６】
いくつかの実施形態では、本発明のカプシドタンパク質は、いずれかの組み合わせでのＡＡＶ１のアミノ酸残基５８８〜５９７（ＶＰ１番号付け；ＣＡＭ８）のうち１つもしくは複数（例えば、２、３、４、５、６、７、８、９もしくは１０）、またはＡＡＶ２、ＡＡＶ３、ＡＡＶ４、ＡＡＶ５、ＡＡＶ６、ＡＡＶ７、ＡＡＶ８、ＡＡＶ９、ＡＡＶ１０、ＡＡＶ１１、ＡＡＶ１２、ＡＡＶｒｈ８、ＡＡＶｒｈ１０、ＡＡＶｒｈ３２．３３、ウシＡＡＶもしくはトリＡＡＶ中の等価なアミノ酸残基における置換を含み得る。
【００７７】
いくつかの実施形態では、本発明のカプシドタンパク質は、ＡＡＶ１のアミノ酸残基７０９〜７１０（ＶＰ１番号付け；ＣＡＭ９−１）のうち１つもしくは複数（例えば、２）、またはＡＡＶ２、ＡＡＶ３、ＡＡＶ４、ＡＡＶ５、ＡＡＶ６、ＡＡＶ７、ＡＡＶ８、ＡＡＶ９、ＡＡＶ１０、ＡＡＶ１１、ＡＡＶ１２、ＡＡＶｒｈ８、ＡＡＶｒｈ１０、ＡＡＶｒｈ３２．３３、ウシＡＡＶもしくはトリＡＡＶ中の等価なアミノ酸残基における置換を含み得る。
【００７８】
いくつかの実施形態では、本発明のカプシドタンパク質は、いずれかの組み合わせでのＡＡＶ１のアミノ酸残基７１６〜７２２（ＶＰ１番号付け；ＣＡＭ９−２）のうち１つもしくは複数（例えば、２、３、４、５、６もしくは７）、またはＡＡＶ２、ＡＡＶ３、ＡＡＶ４、ＡＡＶ５、ＡＡＶ６、ＡＡＶ７、ＡＡＶ８、ＡＡＶ９、ＡＡＶ１０、ＡＡＶ１１、ＡＡＶ１２、ＡＡＶｒｈ８、ＡＡＶｒｈ１０、ＡＡＶｒｈ３２．３３、ウシＡＡＶもしくはトリＡＡＶ中の等価なアミノ酸残基における置換を含み得る。
【００７９】
本発明の特定の実施形態では、アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質が本明細書に提供され、このカプシドタンパク質は、全ての位置において、または全てではない位置のいずれかの組み合わせにおいて、ネイティブＡＡＶ１カプシドタンパク質のアミノ酸位置２６２〜２６８（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７（配列番号１８）を生じる１つまたは複数の置換を含み、Ｘ１はＳ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ２はＡ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ３はＳ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ４はＴ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ５はＧ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ６はＡ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ７はＳ以外の任意のアミノ酸である。Ｘ１〜Ｘ７のいずれも置換されない実施形態では、未置換の位置におけるアミノ酸残基は、野生型アミノ酸残基である。
【００８０】
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質もまた本明細書に提供され、このカプシドタンパク質は、全ての位置において、または全てではない位置のいずれかの組み合わせにおいて、ネイティブＡＡＶ１カプシドタンパク質のアミノ酸位置３７０〜３７９（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｘ９Ｘ１０（配列番号１９）を生じる置換を含み、Ｘ１はＶ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ２はＦ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ３はＭ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ４はＩ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ５はＰ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ６はＱ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ７はＹ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ８はＧ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ９はＹ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ１０はＬ以外の任意のアミノ酸である。
【００８１】
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質もまた本明細書に提供され、このカプシドタンパク質は、全ての位置において、または全てではない位置のいずれかの組み合わせにおいて、ネイティブＡＡＶ１カプシドタンパク質のアミノ酸位置４５１〜４５９（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｘ９（配列番号２０）を生じる置換を含み、Ｘ１はＮ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ２はＱ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ３はＳ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ４はＧ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ５はＳ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ６はＡ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ７はＱ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ８はＮ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ９はＫ以外の任意のアミノ酸である。特定の実施形態では、Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｘ９（配列番号２１）は、（ａ）ＱＶＲＧ（配列番号２２）；（ｂ）ＥＲＰＲ（配列番号２３）；（ｃ）ＧＲＧＧ（配列番号２４）；（ｄ）ＳＧＧＲ（配列番号２５）；（ｅ）ＳＥＲＲ（配列番号２６）；または（ｆ）ＬＲＧＧ（配列番号２７）であり得る。
【００８２】
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質もまた本明細書に提供され、このカプシドタンパク質は、全ての位置において、または全てではない位置のいずれかの組み合わせにおいて、ネイティブＡＡＶ１カプシドタンパク質のアミノ酸位置４９３〜５００（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８（配列番号２８）を生じる置換を含み、Ｘ１はＫ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ２はＴ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ３はＤ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ４はＮ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ５はＮ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ６はＮ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ７はＳ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ８はＮ以外の任意のアミノ酸である。特定の実施形態では、Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７（配列番号２９）は、ＰＧＧＮＡＴＲ（配列番号３０）であり得る。
【００８３】
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質もまた本明細書に提供され、このカプシドタンパク質は、全ての位置において、または全てではない位置のいずれかの組み合わせにおいて、ネイティブＡＡＶ１カプシドタンパク質のアミノ酸位置５８８〜５９７（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｘ９−Ｘ１０（配列番号３１）を生じる置換を含み、Ｘ１はＳ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ２はＴ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ３はＤ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ４はＰ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ５はＡ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ６はＴ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ７はＧ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ８はＤ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ９はＶ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ１０はＨ以外の任意のアミノ酸である。特定の実施形態では、Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｘ９−Ｘ１０（配列番号３１）は、（ａ）ＴＡＤＨＤＴＫＧＶＬ（配列番号３２）；（ｂ）ＶＶＤＰＤＫＫＧＶＬ（配列番号３３）；（ｃ）ＡＫＤＴＧＰＬＮＶＭ（配列番号３４）；（ｄ）ＱＴＤＡＫＤＮＧＶＱ（配列番号３５）；（ｅ）ＤＫＤＰＷＬＮＤＶＩ（配列番号３６）；（ｆ）ＴＲＤＧＳＴＥＳＶＬ（配列番号３７）；（ｇ）ＶＩＤＰＤＱＫＧＶＬ（配列番号３８）；または（ｈ）ＶＮＤＭＳＮＹＭＶＨ（配列番号３９）であり得る。
【００８４】
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質もまた本明細書に提供され、このカプシドタンパク質は、全ての位置において、または全てではない位置のいずれかの組み合わせにおいて、ネイティブＡＡＶ１カプシドタンパク質のアミノ酸位置７０９〜７１０（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：Ｘ１−Ｘ２を生じる置換を含み、Ｘ１はＡ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ２はＮ以外の任意のアミノ酸である。
【００８５】
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質もまた本明細書に提供され、このカプシドタンパク質は、全ての位置において、または全てではない位置のいずれかの組み合わせにおいて、ネイティブＡＡＶ１カプシドタンパク質のアミノ酸位置７１６〜７２２（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７（配列番号４０）を生じる置換を含み、Ｘ１はＤ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ２はＮ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ３はＮ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ４はＧ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ５はＬ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ６はＹ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ７はＴ以外の任意のアミノ酸である。
【００８６】
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質もまた本明細書に提供され、このカプシドタンパク質は、全ての位置において、または全てではない位置のいずれかの組み合わせにおいて、ネイティブＡＡＶ２カプシドタンパク質のアミノ酸位置２６２〜２６７（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６（配列番号４１）を生じる置換を含み、Ｘ１はＳ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ２はＱ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ３はＳ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ４はＧ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ５はＡ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ６はＳ以外の任意のアミノ酸である。
【００８７】
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質もまた本明細書に提供され、このカプシドタンパク質は、全ての位置において、または全てではない位置のいずれかの組み合わせにおいて、ネイティブＡＡＶ２カプシドタンパク質のアミノ酸位置３６９〜３７８（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｘ９−Ｘ１０（配列番号４２）を生じる置換を含み、Ｘ１はＶ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ２はＦ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ３はＭ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ４はＶ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ５はＰ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ６はＱ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ７はＹ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ８はＧ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ９はＹ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ１０はＬ以外の任意のアミノ酸である。
【００８８】
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質もまた本明細書に提供され、このカプシドタンパク質は、全ての位置において、または全てではない位置のいずれかの組み合わせにおいて、ネイティブＡＡＶ２カプシドタンパク質のアミノ酸位置４５５〜４５８（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４（配列番号４３）を生じる置換を含み、Ｘ１はＴ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ２はＴ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ３はＱ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ４はＳ以外の任意のアミノ酸である。
【００８９】
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質もまた本明細書に提供され、このカプシドタンパク質は、全ての位置において、または全てではない位置のいずれかの組み合わせにおいて、ネイティブＡＡＶ２カプシドタンパク質のアミノ酸位置４９２〜４９８（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７（配列番号４４）を生じる置換を含み、Ｘ１はＳ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ２はＡ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ３はＤ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ４はＮ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ５はＮ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ６はＮ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ７はＳ以外の任意のアミノ酸である。
【００９０】
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質もまた本明細書に提供され、このカプシドタンパク質は、全ての位置において、または全てではない位置のいずれかの組み合わせにおいて、ネイティブＡＡＶ２カプシドタンパク質のアミノ酸位置５８７〜５９６（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｘ９−Ｘ１０（配列番号４５）を生じる置換を含み、Ｘ１はＮ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ２はＲ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ３はＱ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ４はＡ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ５はＡ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ６はＴ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ７はＡ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ８はＤ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ９はＶ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ１０はＮ以外の任意のアミノ酸である。
【００９１】
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質もまた本明細書に提供され、このカプシドタンパク質は、全ての位置において、または全てではない位置のいずれかの組み合わせにおいて、ネイティブＡＡＶ１２カプシドタンパク質のアミノ酸位置７０８〜７０９（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：Ｘ１−Ｘ２を生じる置換を含み、Ｘ１はＶ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ２はＮ以外の任意のアミノ酸である。
【００９２】
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質もまた本明細書に提供され、このカプシドタンパク質は、全ての位置において、または全てではない位置のいずれかの組み合わせにおいて、ネイティブＡＡＶ２カプシドタンパク質のアミノ酸位置７１５〜７２１（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７（配列番号４６）を生じる置換を含み、Ｘ１はＤ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ２はＴ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ３はＮ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ４はＧ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ５はＶ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ６はＹ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ７はＳ以外の任意のアミノ酸である。
【００９３】
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質もまた本明細書に提供され、このカプシドタンパク質は、全ての位置において、または全てではない位置のいずれかの組み合わせにおいて、ネイティブＡＡＶ３カプシドタンパク質のアミノ酸位置２６２〜２６７（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６（配列番号４７）を生じる置換を含み、Ｘ１はＳ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ２はＱ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ３はＳ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ４はＧ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ５はＡ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ６はＳ以外の任意のアミノ酸である。
【００９４】
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質もまた本明細書に提供され、このカプシドタンパク質は、全ての位置において、または全てではない位置のいずれかの組み合わせにおいて、ネイティブＡＡＶ３カプシドタンパク質のアミノ酸位置３６９〜３７８（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｘ９−Ｘ１０（配列番号４８）を生じる置換を含み、Ｘ１はＶ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ２はＦ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ３はＭ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ４はＶ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ５はＰ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ６はＱ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ７はＹ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ８はＧ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ９はＹ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ１０はＬ以外の任意のアミノ酸である。
【００９５】
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質もまた本明細書に提供され、このカプシドタンパク質は、全ての位置において、または全てではない位置のいずれかの組み合わせにおいて、ネイティブＡＡＶ３カプシドタンパク質のアミノ酸位置４５６〜４５９（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４（配列番号４９）を生じる置換を含み、Ｘ１はＴ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ２はＮ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ３はＱ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ４はＳ以外の任意のアミノ酸である。
【００９６】
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質もまた本明細書に提供され、このカプシドタンパク質は、全ての位置において、または全てではない位置のいずれかの組み合わせにおいて、ネイティブＡＡＶ３カプシドタンパク質のアミノ酸位置４９３〜４９９（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７（配列番号５０）を生じる置換を含み、Ｘ１はＡ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ２はＮ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ３はＤ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ４はＮ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ５はＮ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ６はＮ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ７はＳ以外の任意のアミノ酸である。
【００９７】
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質もまた本明細書に提供され、このカプシドタンパク質は、全ての位置において、または全てではない位置のいずれかの組み合わせにおいて、ネイティブＡＡＶ３カプシドタンパク質のアミノ酸位置５８８〜５９７（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｘ９−Ｘ１０（配列番号５７）を生じる置換を含み、Ｘ１はＮ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ２はＴ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ３はＡ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ４はＰ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ５はＴ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ６はＴ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ７はＧ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ８はＴ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ９はＶ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ１０はＮ以外の任意のアミノ酸である。
【００９８】
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質もまた本明細書に提供され、このカプシドタンパク質は、全ての位置において、または全てではない位置のいずれかの組み合わせにおいて、ネイティブＡＡＶ３カプシドタンパク質のアミノ酸位置７０９〜７１０（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：Ｘ１−Ｘ２を生じる置換を含み、Ｘ１はＶ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ２はＮ以外の任意のアミノ酸である。
【００９９】
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質であって、このカプシドタンパク質は、全ての位置において、または全てではない位置のいずれかの組み合わせにおいて、ネイティブＡＡＶ３カプシドタンパク質のアミノ酸位置７１６〜７２２（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７（配列番号５２）を生じる置換を含み、Ｘ１はＤ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ２はＴ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ３はＮ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ４はＧ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ５はＶ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ６はＹ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ７はＳ以外の任意のアミノ酸である。
【０１００】
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質もまた本明細書に提供され、このカプシドタンパク質は、全ての位置において、または全てではない位置のいずれかの組み合わせにおいて、ネイティブＡＡＶ４カプシドタンパク質のアミノ酸位置２５３〜２６０（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８（配列番号５３）を生じる置換を含み、Ｘ１はＲ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ２はＬ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ３はＧ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ４はＥ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ５はＳ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ６はＬ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ７はＱ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ８はＳ以外の任意のアミノ酸である。
【０１０１】
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質もまた本明細書に提供され、このカプシドタンパク質は、全ての位置において、または全てではない位置のいずれかの組み合わせにおいて、ネイティブＡＡＶ４カプシドタンパク質のアミノ酸位置３６０〜３６９（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｘ９−Ｘ１０（配列番号５４）を生じる置換を含み、Ｘ１はＶ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ２はＦ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ３はＭ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ４はＶ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ５はＰ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ６はＱ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ７はＹ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ８はＧ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ９はＹ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ１０はＣ以外の任意のアミノ酸である。
【０１０２】
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質もまた本明細書に提供され、このカプシドタンパク質は、全ての位置において、または全てではない位置のいずれかの組み合わせにおいて、ネイティブＡＡＶ４カプシドタンパク質のアミノ酸位置４５０〜４５３（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４（配列番号５５）を生じる置換を含み、Ｘ１はＡ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ２はＧ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ３はＴ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ４はＡ以外の任意のアミノ酸である。
【０１０３】
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質もまた本明細書に提供され、このカプシドタンパク質は、全ての位置において、または全てではない位置のいずれかの組み合わせにおいて、ネイティブＡＡＶ４カプシドタンパク質のアミノ酸位置４８７〜４９８（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｘ９−Ｘ１０−Ｘ１１−Ｘ１２（配列番号５６）を生じる置換を含み、Ｘ１はＡ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ２はＮ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ３はＱ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ４はＮ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ５はＹ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ６はＫ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ７はＩ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ８はＰ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ９はＡ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ１０はＴ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ１１はＧ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ１２はＳ以外の任意のアミノ酸である。
【０１０４】
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質もまた本明細書に提供され、このカプシドタンパク質は、全ての位置において、または全てではない位置のいずれかの組み合わせにおいて、ネイティブＡＡＶ４カプシドタンパク質のアミノ酸位置５８６〜５９５（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｘ９−Ｘ１０（配列番号５７）を生じる置換を含み、Ｘ１はＳ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ２はＮ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ３はＬ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ４はＰ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ５はＴ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ６はＶ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ７はＤ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ８はＲ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ９はＬ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ１０はＴ以外の任意のアミノ酸である。
【０１０５】
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質もまた本明細書に提供され、このカプシドタンパク質は、全ての位置において、または全てではない位置のいずれかの組み合わせにおいて、ネイティブＡＡＶ４カプシドタンパク質のアミノ酸位置７０７〜７０８（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：Ｘ１−Ｘ２を生じる置換を含み、Ｘ１はＮ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ２はＳ以外の任意のアミノ酸である。
【０１０６】
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質もまた本明細書に提供され、このカプシドタンパク質は、全ての位置において、または全てではない位置のいずれかの組み合わせにおいて、ネイティブＡＡＶ４カプシドタンパク質のアミノ酸位置７１４〜７２０（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７（配列番号５８）を生じる置換を含み、Ｘ１はＤ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ２はＡ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ３はＡ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ４はＧ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ５はＫ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ６はＹ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ７はＴ以外の任意のアミノ酸である。
【０１０７】
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質もまた本明細書に提供され、このカプシドタンパク質は、全ての位置において、または全てではない位置のいずれかの組み合わせにおいて、ネイティブＡＡＶ５カプシドタンパク質のアミノ酸位置２４９〜２５８（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７Ｘ８−Ｘ９−Ｘ１０（配列番号５９）を生じる置換を含み、Ｘ１はＥ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ２はＩ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ３はＫ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ４はＳ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ５はＧ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ６はＳ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ７はＶ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ８はＤ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ９はＧ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ１０はＳ以外の任意のアミノ酸である。
【０１０８】
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質もまた本明細書に提供され、このカプシドタンパク質は、全ての位置において、または全てではない位置のいずれかの組み合わせにおいて、ネイティブＡＡＶ５カプシドタンパク質のアミノ酸位置３６０〜３６９（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｘ９−Ｘ１０（配列番号６０）を生じる置換を含み、Ｘ１はＶ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ２はＦ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ３はＴ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ４はＬ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ５はＰ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ６はＱ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ７はＹ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ８はＧ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ９はＹ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ１０はＡ以外の任意のアミノ酸である。
【０１０９】
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質もまた本明細書に提供され、このカプシドタンパク質は、全ての位置において、または全てではない位置のいずれかの組み合わせにおいて、ネイティブＡＡＶ５カプシドタンパク質のアミノ酸位置４４３〜４４６（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４（配列番号６１）を生じる置換を含み、Ｘ１はＮ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ２はＴ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ３はＧ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ４はＧ以外の任意のアミノ酸である。
【０１１０】
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質もまた本明細書に提供され、このカプシドタンパク質は、全ての位置において、または全てではない位置のいずれかの組み合わせにおいて、ネイティブＡＡＶ５カプシドタンパク質のアミノ酸位置４７９〜４８５（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７（配列番号６２）を生じる置換を含み、Ｘ１はＳ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ２はＧ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ３はＶ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ４はＮ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ５はＲ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ６はＡ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ７はＳ以外の任意のアミノ酸である。
【０１１１】
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質もまた本明細書に提供され、このカプシドタンパク質は、全ての位置において、または全てではない位置のいずれかの組み合わせにおいて、ネイティブＡＡＶ５カプシドタンパク質のアミノ酸位置５７７〜５８６（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｘ９−Ｘ１０（配列番号６３）を生じる置換を含み、Ｘ１はＴ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ２はＴ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ３はＡ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ４はＰ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ５はＡ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ６はＴ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ７はＧ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ８はＴ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ９はＹ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ１０はＮ以外の任意のアミノ酸である。
【０１１２】
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質もまた本明細書に提供され、このカプシドタンパク質は、全ての位置において、または全てではない位置のいずれかの組み合わせにおいて、ネイティブＡＡＶ５カプシドタンパク質のアミノ酸位置６９７〜６９８（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：Ｘ１−Ｘ２を生じる置換を含み、Ｘ１はＱ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ２はＦ以外の任意のアミノ酸である。
【０１１３】
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質もまた本明細書に提供され、このカプシドタンパク質は、全ての位置において、または全てではない位置のいずれかの組み合わせにおいて、ネイティブＡＡＶ５カプシドタンパク質のアミノ酸位置７０４〜７１０（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７（配列番号６４）を生じる置換を含み、Ｘ１はＤ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ２はＳ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ３はＴ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ４はＧ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ５はＥ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ６はＹ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ７はＲ以外の任意のアミノ酸である。
【０１１４】
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質もまた本明細書に提供され、このカプシドタンパク質は、全ての位置において、または全てではない位置のいずれかの組み合わせにおいて、ネイティブＡＡＶ６カプシドタンパク質のアミノ酸位置２６２〜２６８（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７（配列番号６５）を生じる置換を含み、Ｘ１はＳ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ２はＡ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ３はＳ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ４はＴ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ５はＧ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ６はＡ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ７はＳ以外の任意のアミノ酸である。
【０１１５】
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質もまた本明細書に提供され、このカプシドタンパク質は、全ての位置において、または全てではない位置のいずれかの組み合わせにおいて、ネイティブＡＡＶ６カプシドタンパク質のアミノ酸位置３７０〜３７９（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｘ９−Ｘ１０（配列番号６６）を生じる置換を含み、Ｘ１はＶ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ２はＦ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ３はＭ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ４はＩ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ５はＰ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ６はＱ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ７はＹ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ８はＧ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ９はＹ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ１０はＬ以外の任意のアミノ酸である。
【０１１６】
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質もまた本明細書に提供され、このカプシドタンパク質は、全ての位置において、または全てではない位置のいずれかの組み合わせにおいて、ネイティブＡＡＶ６カプシドタンパク質のアミノ酸位置４５６〜４５９（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４（配列番号６７）を生じる置換を含み、Ｘ１はＡ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ２はＱ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ３はＮ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ４はＫ以外の任意のアミノ酸である。
【０１１７】
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質もまた本明細書に提供され、このカプシドタンパク質は、全ての位置において、または全てではない位置のいずれかの組み合わせにおいて、ネイティブＡＡＶ６カプシドタンパク質のアミノ酸位置４９３〜４９９（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７（配列番号６８）を生じる置換を含み、Ｘ１はＫ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ２はＴ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ３はＤ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ４はＮ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ５はＮ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ６はＮ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ７はＳ以外の任意のアミノ酸である。
【０１１８】
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質もまた本明細書に提供され、このカプシドタンパク質は、全ての位置において、または全てではない位置のいずれかの組み合わせにおいて、ネイティブＡＡＶ６カプシドタンパク質のアミノ酸位置５８８〜５９７（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｘ９−Ｘ１０（配列番号６９）を生じる置換を含み、Ｘ１はＳ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ２はＴ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ３はＤ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ４はＰ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ５はＡ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ６はＴ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ７はＧ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ８はＤ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ９はＶ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ１０はＨ以外の任意のアミノ酸である。
【０１１９】
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質もまた本明細書に提供され、このカプシドタンパク質は、全ての位置において、または全てではない位置のいずれかの組み合わせにおいて、ネイティブＡＡＶ６カプシドタンパク質のアミノ酸位置７０９〜７１０（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：Ｘ１−Ｘ２を生じる置換を含み、Ｘ１はＡ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ２はＮ以外の任意のアミノ酸である。
【０１２０】
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質もまた本明細書に提供され、このカプシドタンパク質は、全ての位置において、または全てではない位置のいずれかの組み合わせにおいて、ネイティブＡＡＶ６カプシドタンパク質のアミノ酸位置７１６〜７２２（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７（配列番号７０）を生じる置換を含み、Ｘ１はＤ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ２はＮ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ３はＮ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ４はＧ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ５はＬ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ６はＹ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ７はＴ以外の任意のアミノ酸である。
【０１２１】
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質もまた本明細書に提供され、このカプシドタンパク質は、全ての位置において、または全てではない位置のいずれかの組み合わせにおいて、ネイティブＡＡＶ７カプシドタンパク質のアミノ酸位置２６３〜２６９（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７（配列番号７１）を生じる置換を含み、Ｘ１はＳ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ２はＥ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ３はＴ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ４はＡ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ５はＧ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ６はＳ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ７はＴ以外の任意のアミノ酸である。
【０１２２】
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質もまた本明細書に提供され、このカプシドタンパク質は、全ての位置において、または全てではない位置のいずれかの組み合わせにおいて、ネイティブＡＡＶ７カプシドタンパク質のアミノ酸位置３７１〜３８０（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｘ９−Ｘ１０（配列番号７２）を生じる置換を含み、Ｘ１はＶ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ２はＦ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ３はＭ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ４はＩ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ５はＰ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ６はＱ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ７はＹ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ８はＧ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ９はＹ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ１０はＬ以外の任意のアミノ酸である。
【０１２３】
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質もまた本明細書に提供され、このカプシドタンパク質は、全ての位置において、または全てではない位置のいずれかの組み合わせにおいて、ネイティブＡＡＶ７カプシドタンパク質のアミノ酸位置４５８〜４６１（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４（配列番号７３）を生じる置換を含み、Ｘ１はＡ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ２はＧ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ３はＮ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ４はＲ以外の任意のアミノ酸である。
【０１２４】
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質もまた本明細書に提供され、このカプシドタンパク質は、全ての位置において、または全てではない位置のいずれかの組み合わせにおいて、ネイティブＡＡＶ７カプシドタンパク質のアミノ酸位置４９５〜５０１（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７（配列番号７４）を生じる置換を含み、Ｘ１はＬ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ２はＤ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ３はＱ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ４はＮ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ５はＮ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ６はＮ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ７はＳ以外の任意のアミノ酸である。
【０１２５】
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質もまた本明細書に提供され、このカプシドタンパク質は、全ての位置において、または全てではない位置のいずれかの組み合わせにおいて、ネイティブＡＡＶ７カプシドタンパク質のアミノ酸位置５８９〜５９８（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｘ９−Ｘ１０（配列番号７５）を生じる置換を含み、Ｘ１はＮ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ２はＴ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ３はＡ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ４はＡ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ５はＱ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ６はＴ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ７はＱ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ８はＶ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ９はＶ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ１０はＮ以外の任意のアミノ酸である。
【０１２６】
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質もまた本明細書に提供され、このカプシドタンパク質は、ネイティブＡＡＶ７カプシドタンパク質のアミノ酸位置７１０〜７１１（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：Ｘ１−Ｘ２を生じる置換を含み、Ｘ１はＴ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ２はＧ以外の任意のアミノ酸である。
【０１２７】
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質もまた本明細書に提供され、このカプシドタンパク質は、全ての位置において、または全てではない位置のいずれかの組み合わせにおいて、ネイティブＡＡＶ７カプシドタンパク質のアミノ酸位置７１７〜７２３（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７（配列番号７６）を生じる置換を含み、Ｘ１はＤ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ２はＳ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ３はＱ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ４はＧ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ５はＶ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ６はＹ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ７はＳ以外の任意のアミノ酸である。
【０１２８】
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質もまた本明細書に提供され、このカプシドタンパク質は、全ての位置において、または全てではない位置のいずれかの組み合わせにおいて、ネイティブＡＡＶ８カプシドタンパク質のアミノ酸位置２６３〜２７０（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８（配列番号７７）を生じる置換を含み、Ｘ１はＮ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ２はＧ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ３はＴ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ４はＳ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ５はＧ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ６はＧ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ７はＡ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ８はＴ以外の任意のアミノ酸である。
【０１２９】
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質もまた本明細書に提供され、このカプシドタンパク質は、全ての位置において、または全てではない位置のいずれかの組み合わせにおいて、ネイティブＡＡＶ８カプシドタンパク質のアミノ酸位置３７２〜３８１（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｘ９−Ｘ１０（配列番号７８）を生じる置換を含み、Ｘ１はＶ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ２はＦ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ３はＭ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ４はＩ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ５はＰ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ６はＱ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ７はＹ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ８はＧ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ９はＹ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ１０はＬ以外の任意のアミノ酸である。
【０１３０】
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質もまた本明細書に提供され、このカプシドタンパク質は、全ての位置において、または全てではない位置のいずれかの組み合わせにおいて、ネイティブＡＡＶ８カプシドタンパク質のアミノ酸位置４５８〜４６１（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４（配列番号７９）を生じる置換を含み、Ｘ１はＡ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ２はＮ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ３はＴ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ４はＱ以外の任意のアミノ酸である。
【０１３１】
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質もまた本明細書に提供され、このカプシドタンパク質は、全ての位置において、または全てではない位置のいずれかの組み合わせにおいて、ネイティブＡＡＶ８カプシドタンパク質のアミノ酸位置４９５〜５０１（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７（配列番号８０）を生じる置換を含み、Ｘ１はＴ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ２はＧ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ３はＱ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ４はＮ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ５はＮ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ６はＮ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ７はＳ以外の任意のアミノ酸である。
【０１３２】
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質もまた本明細書に提供され、このカプシドタンパク質は、全ての位置において、または全てではない位置のいずれかの組み合わせにおいて、ネイティブＡＡＶ８カプシドタンパク質のアミノ酸位置５９０〜６００（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｘ９−Ｘ１０−Ｘ１１（配列番号８１）を生じる置換を含み、Ｘ１はＮ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ２はＴ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ３はＡ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ４はＰ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ５はＱ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ６はＩ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ７はＧ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ８はＴ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ９はＶ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ１０はＮ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ１１はＳ以外の任意のアミノ酸である。
【０１３３】
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質もまた本明細書に提供され、このカプシドタンパク質は、全ての位置において、または全てではない位置のいずれかの組み合わせにおいて、ネイティブＡＡＶ８カプシドタンパク質のアミノ酸位置７１１〜７１２（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：Ｘ１−Ｘ２を生じる置換を含み、Ｘ１はＴ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ２はＳ以外の任意のアミノ酸である。
【０１３４】
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質もまた本明細書に提供され、このカプシドタンパク質は、全ての位置において、または全てではない位置のいずれかの組み合わせにおいて、ネイティブＡＡＶ８カプシドタンパク質のアミノ酸位置７１８〜７２４（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７（配列番号８２）を生じる置換を含み、Ｘ１はＮ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ２はＴ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ３はＥ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ４はＧ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ５はＶ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ６はＹ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ７はＳ以外の任意のアミノ酸である。
【０１３５】
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質もまた本明細書に提供され、このカプシドタンパク質は、全ての位置において、または全てではない位置のいずれかの組み合わせにおいて、ネイティブＡＡＶ９カプシドタンパク質のアミノ酸位置２６２〜２６９（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８（配列番号８３）を生じる置換を含み、Ｘ１はＮ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ２はＳ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ３はＴ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ４はＳ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ５はＧ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ６はＧ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ７はＳ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ８はＳ以外の任意のアミノ酸である。
【０１３６】
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質もまた本明細書に提供され、このカプシドタンパク質は、全ての位置において、または全てではない位置のいずれかの組み合わせにおいて、ネイティブＡＡＶ９カプシドタンパク質のアミノ酸位置３７１〜３８０（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｘ９−Ｘ１０（配列番号８４）を生じる置換を含み、Ｘ１はＶ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ２はＦ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ３はＭ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ４はＩ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ５はＰ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ６はＱ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ７はＹ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ８はＧ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ９はＹ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ１０はＬ以外の任意のアミノ酸である。
【０１３７】
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質もまた本明細書に提供され、このカプシドタンパク質は、全ての位置において、または全てではない位置のいずれかの組み合わせにおいて、ネイティブＡＡＶ９カプシドタンパク質のアミノ酸位置４５６〜４５９（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４（配列番号８５）を生じる置換を含み、Ｘ１はＱ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ２はＮ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ３はＱ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ４はＱ以外の任意のアミノ酸である。
【０１３８】
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質もまた本明細書に提供され、このカプシドタンパク質は、全ての位置において、または全てではない位置のいずれかの組み合わせにおいて、ネイティブＡＡＶ９カプシドタンパク質のアミノ酸位置４９３〜４９９（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７（配列番号８６）を生じる置換を含み、Ｘ１はＶ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ２はＴ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ３はＱ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ４はＮ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ５はＮ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ６はＮ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ７はＳ以外の任意のアミノ酸である。
【０１３９】
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質もまた本明細書に提供され、このカプシドタンパク質は、全ての位置において、または全てではない位置のいずれかの組み合わせにおいて、ネイティブＡＡＶ９カプシドタンパク質のアミノ酸位置５８８〜５９７（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｘ９−Ｘ１０（配列番号８７）を生じる置換を含み、Ｘ１はＱ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ２はＡ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ３はＱ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ４はＡ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ５はＱ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ６はＴ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ７はＧ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ８はＷ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ９はＶ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ１０はＱ以外の任意のアミノ酸である。
【０１４０】
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質もまた本明細書に提供され、このカプシドタンパク質は、全ての位置において、または全てではない位置のいずれかの組み合わせにおいて、ネイティブＡＡＶ９カプシドタンパク質のアミノ酸位置７０９〜７１０（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：Ｘ１−Ｘ２を生じる置換を含み、Ｘ１はＮ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ２はＮ以外の任意のアミノ酸である。
【０１４１】
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質もまた本明細書に提供され、このカプシドタンパク質は、全ての位置において、または全てではない位置のいずれかの組み合わせにおいて、ネイティブＡＡＶ９カプシドタンパク質のアミノ酸位置７１６〜７２２（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７（配列番号８８）を生じる置換を含み、Ｘ１はＮ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ２はＴ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ３はＥ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ４はＧ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ５はＶ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ６はＹ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ７はＳ以外の任意のアミノ酸である。
【０１４２】
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質もまた本明細書に提供され、このカプシドタンパク質は、全ての位置において、または全てではない位置のいずれかの組み合わせにおいて、ネイティブＡＡＶｒｈ１０カプシドタンパク質のアミノ酸位置２６３〜２７０（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８（配列番号８９）を生じる置換を含み、Ｘ１はＮ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ２はＧ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ３はＴ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ４はＳ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ５はＧ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ６はＧ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ７はＳ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ８はＴ以外の任意のアミノ酸である。
【０１４３】
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質もまた本明細書に提供され、このカプシドタンパク質は、全ての位置において、または全てではない位置のいずれかの組み合わせにおいて、ネイティブＡＡＶｒｈ１０カプシドタンパク質のアミノ酸位置３７２〜３８１（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｘ９−Ｘ１０（配列番号９０）を生じる置換を含み、Ｘ１はＶ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ２はＦ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ３はＭ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ４はＩ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ５はＰ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ６はＱ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ７はＹ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ８はＧ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ９はＹ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ１０はＬ以外の任意のアミノ酸である。
【０１４４】
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質もまた本明細書に提供され、このカプシドタンパク質は、全ての位置において、または全てではない位置のいずれかの組み合わせにおいて、ネイティブＡＡＶｒｈ１０カプシドタンパク質のアミノ酸位置４５８〜４６１（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４（配列番号９１）を生じる置換を含み、Ｘ１はＡ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ２はＧ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ３はＴ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ４はＱ以外の任意のアミノ酸である。
【０１４５】
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質もまた本明細書に提供され、このカプシドタンパク質は、全ての位置において、または全てではない位置のいずれかの組み合わせにおいて、ネイティブＡＡＶｒｈ１０カプシドタンパク質のアミノ酸位置４９５〜５０１（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７（配列番号９２）を生じる置換を含み、Ｘ１はＬ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ２はＳ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ３はＱ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ４はＮ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ５はＮ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ６はＮ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ７はＳ以外の任意のアミノ酸である。
【０１４６】
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質もまた本明細書に提供され、このカプシドタンパク質は、全ての位置において、または全てではない位置のいずれかの組み合わせにおいて、ネイティブＡＡＶｒｈ１０カプシドタンパク質のアミノ酸位置５９０〜５９９（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｘ９−Ｘ１０（配列番号９３）を生じる置換を含み、Ｘ１はＮ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ２はＡ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ３はＡ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ４はＰ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ５はＩ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ６はＶ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ７はＧ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ８はＡ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ９はＶ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ１０はＮ以外の任意のアミノ酸である。
【０１４７】
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質もまた本明細書に提供され、このカプシドタンパク質は、全ての位置において、または全てではない位置のいずれかの組み合わせにおいて、ネイティブＡＡＶｒｈ１０カプシドタンパク質のアミノ酸位置７１１〜７１２（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：Ｘ１−Ｘ２を生じる置換を含み、Ｘ１はＴ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ２はＮ以外の任意のアミノ酸である。
【０１４８】
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質もまた本明細書に提供され、このカプシドタンパク質は、全ての位置において、または全てではない位置のいずれかの組み合わせにおいて、ネイティブＡＡＶｒｈ１０カプシドタンパク質のアミノ酸位置７１８〜７２４（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７（配列番号９４）を生じる置換を含み、Ｘ１はＮ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ２はＴ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ３はＤ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ４はＧ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ５はＴ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ６はＹ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ７はＳ以外の任意のアミノ酸である。
【０１４９】
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質もまた本明細書に提供され、このカプシドタンパク質は、全ての位置において、または全てではない位置のいずれかの組み合わせにおいて、ネイティブＡＡＶｒｈ８カプシドタンパク質のアミノ酸位置２６２〜２６９（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８（配列番号９５）を生じる置換を含み、Ｘ１はＮ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ２はＧ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ３はＴ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ４はＳ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ５はＧ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ６はＧ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ７はＳ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ８はＴ以外の任意のアミノ酸である。
【０１５０】
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質もまた本明細書に提供され、このカプシドタンパク質は、全ての位置において、または全てではない位置のいずれかの組み合わせにおいて、ネイティブＡＡＶｒｈ８カプシドタンパク質のアミノ酸位置３７１〜３８０（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｘ９−Ｘ１０（配列番号９６）を生じる置換を含み、Ｘ１はＶ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ２はＦ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ３はＭ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ４はＶ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ５はＰ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ６はＱ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ７はＹ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ８はＧ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ９はＹ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ１０はＬ以外の任意のアミノ酸である。
【０１５１】
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質もまた本明細書に提供され、このカプシドタンパク質は、全ての位置において、または全てではない位置のいずれかの組み合わせにおいて、ネイティブＡＡＶｒｈ８カプシドタンパク質のアミノ酸位置４５６〜４５９（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４（配列番号９７）を生じる置換を含み、Ｘ１はＧ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ２はＧ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ３はＴ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ４はＱ以外の任意のアミノ酸である。
【０１５２】
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質もまた本明細書に提供され、このカプシドタンパク質は、全ての位置において、または全てではない位置のいずれかの組み合わせにおいて、ネイティブＡＡＶｒｈ８カプシドタンパク質のアミノ酸位置４９３〜４９９（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７（配列番号９８）を生じる置換を含み、Ｘ１はＴ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ２はＮ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ３はＱ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ４はＮ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ５はＮ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ６はＮ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ７はＳ以外の任意のアミノ酸である。
【０１５３】
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質もまた本明細書に提供され、このカプシドタンパク質は、全ての位置において、または全てではない位置のいずれかの組み合わせにおいて、ネイティブＡＡＶｒｈ８カプシドタンパク質のアミノ酸位置５８８〜５９７（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｘ９−Ｘ１０（配列番号９９）を生じる置換を含み、Ｘ１はＮ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ２はＴ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ３はＱ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ４はＡ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ５はＱ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ６はＴ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ７はＧ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ８はＬ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ９はＶ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ１０はＨ以外の任意のアミノ酸である。
【０１５４】
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質もまた本明細書に提供され、このカプシドタンパク質は、全ての位置において、または全てではない位置のいずれかの組み合わせにおいて、ネイティブＡＡＶｒｈ８カプシドタンパク質のアミノ酸位置７０９〜７１０（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：Ｘ１−Ｘ２を生じる置換を含み、Ｘ１はＴ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ２はＮ以外の任意のアミノ酸である。
【０１５５】
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質もまた本明細書に提供され、このカプシドタンパク質は、全ての位置において、または全てではない位置のいずれかの組み合わせにおいて、ネイティブＡＡＶｒｈ８カプシドタンパク質のアミノ酸位置７１６〜７２２（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７（配列番号１００）を生じる置換を含み、Ｘ１はＮ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ２はＴ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ３はＥ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ４はＧ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ５はＶ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ６はＹ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ７はＳ以外の任意のアミノ酸である。
【０１５６】
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質もまた本明細書に提供され、このカプシドタンパク質は、全ての位置において、または全てではない位置のいずれかの組み合わせにおいて、ネイティブＡＡＶ１０カプシドタンパク質のアミノ酸位置２６３〜２７０（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８（配列番号１０１）を生じる置換を含み、Ｘ１はＮ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ２はＧ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ３はＴ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ４はＳ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ５はＧ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ６はＧ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ７はＳ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ８はＴ以外の任意のアミノ酸である。
【０１５７】
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質もまた本明細書に提供され、このカプシドタンパク質は、全ての位置において、または全てではない位置のいずれかの組み合わせにおいて、ネイティブＡＡＶ１０カプシドタンパク質のアミノ酸位置３７２〜３８１（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｘ９−Ｘ１０（配列番号１０２）を生じる置換を含み、Ｘ１はＶ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ２はＦ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ３はＭ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ４はＩ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ５はＰ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ６はＱ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ７はＹ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ８はＧ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ９はＹ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ１０はＬ以外の任意のアミノ酸である。
【０１５８】
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質もまた本明細書に提供され、このカプシドタンパク質は、全ての位置において、または全てではない位置のいずれかの組み合わせにおいて、ネイティブＡＡＶ１０カプシドタンパク質のアミノ酸位置４５８〜４６１（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４（配列番号１０３）を生じる置換を含み、Ｘ１はＱ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ２はＧ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ３はＴ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ４はＱ以外の任意のアミノ酸である。
【０１５９】
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質もまた本明細書に提供され、このカプシドタンパク質は、全ての位置において、または全てではない位置のいずれかの組み合わせにおいて、ネイティブＡＡＶ１０カプシドタンパク質のアミノ酸位置４９５〜５０１（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７（配列番号１０４）を生じる置換を含み、Ｘ１はＬ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ２はＳ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ３はＱ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ４はＮ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ５はＮ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ６はＮ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ７はＳ以外の任意のアミノ酸である。
【０１６０】
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質もまた本明細書に提供され、このカプシドタンパク質は、全ての位置において、または全てではない位置のいずれかの組み合わせにおいて、ネイティブＡＡＶ１０カプシドタンパク質のアミノ酸位置５９０〜５９９（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｘ９−Ｘ１０（配列番号１０５）を生じる置換を含み、Ｘ１はＮ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ２はＴ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ３はＧ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ４はＰ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ５はＩ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ６はＶ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ７はＧ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ８はＮ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ９はＶ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ１０はＮ以外の任意のアミノ酸である。
【０１６１】
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質もまた本明細書に提供され、このカプシドタンパク質は、全ての位置において、または全てではない位置のいずれかの組み合わせにおいて、ネイティブＡＡＶ１０カプシドタンパク質のアミノ酸位置７１１〜７１２（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：Ｘ１−Ｘ２を生じる置換を含み、Ｘ１はＴ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ２はＮ以外の任意のアミノ酸である。
【０１６２】
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質もまた本明細書に提供され、このカプシドタンパク質は、全ての位置において、または全てではない位置のいずれかの組み合わせにおいて、ネイティブＡＡＶ１０カプシドタンパク質のアミノ酸位置７１８〜７２４（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７（配列番号１０６）を生じる置換を含み、Ｘ１はＮ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ２はＴ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ３はＥ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ４はＧ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ５はＴ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ６はＹ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ７はＳ以外の任意のアミノ酸である。
【０１６３】
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質もまた本明細書に提供され、このカプシドタンパク質は、全ての位置において、または全てではない位置のいずれかの組み合わせにおいて、ネイティブＡＡＶ１１カプシドタンパク質のアミノ酸位置２５３〜２６０（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８（配列番号１０７）を生じる置換を含み、Ｘ１はＲ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ２はＬ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ３はＧ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ４はＴ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ５はＴ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ６はＳ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ７はＳ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ８はＳ以外の任意のアミノ酸である。
【０１６４】
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質もまた本明細書に提供され、このカプシドタンパク質は、全ての位置において、または全てではない位置のいずれかの組み合わせにおいて、ネイティブＡＡＶ１１カプシドタンパク質のアミノ酸位置３６０〜３６９（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｘ９−Ｘ１０（配列番号１０８）を生じる置換を含み、Ｘ１はＶ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ２はＦ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ３はＭ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ４はＶ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ５はＰ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ６はＱ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ７はＹ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ８はＧ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ９はＹ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ１０はＣ以外の任意のアミノ酸である。
【０１６５】
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質もまた本明細書に提供され、このカプシドタンパク質は、全ての位置において、または全てではない位置のいずれかの組み合わせにおいて、ネイティブＡＡＶ１１カプシドタンパク質のアミノ酸位置４４９〜４５２（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４（配列番号１０９）を生じる置換を含み、Ｘ１はＱ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ２はＧ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ３はＮ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ４はＡ以外の任意のアミノ酸である。
【０１６６】
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質もまた本明細書に提供され、このカプシドタンパク質は、全ての位置において、または全てではない位置のいずれかの組み合わせにおいて、ネイティブＡＡＶ１１カプシドタンパク質のアミノ酸位置４８６〜４９７（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｘ９−Ｘ１０−Ｘ１１−Ｘ１２（配列番号１１０）を生じる置換を含み、Ｘ１はＡ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ２はＳ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ３はＱ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ４はＮ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ５はＹ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ６はＫ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ７はＩ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ８はＰ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ９はＡ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ１０はＳ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ１１はＧ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ１２はＧ以外の任意のアミノ酸である。
【０１６７】
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質もまた本明細書に提供され、このカプシドタンパク質は、全ての位置において、または全てではない位置のいずれかの組み合わせにおいて、ネイティブＡＡＶ１１カプシドタンパク質のアミノ酸位置５８５〜５９４（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｘ９−Ｘ１０（配列番号１１１）を生じる置換を含み、Ｘ１はＴ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ２はＴ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ３はＡ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ４はＰ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ５はＩ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ６はＴ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ７はＧ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ８はＮ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ９はＶ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ１０はＴ以外の任意のアミノ酸である。
【０１６８】
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質もまた本明細書に提供され、このカプシドタンパク質は、全ての位置において、または全てではない位置のいずれかの組み合わせにおいて、ネイティブＡＡＶ１１カプシドタンパク質のアミノ酸位置７０６〜７０７（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：Ｘ１−Ｘ２を生じる置換を含み、Ｘ１はＳ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ２はＳ以外の任意のアミノ酸である。
【０１６９】
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質もまた本明細書に提供され、このカプシドタンパク質は、全ての位置において、または全てではない位置のいずれかの組み合わせにおいて、ネイティブＡＡＶ１１カプシドタンパク質のアミノ酸位置７１３〜７１９（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７（配列番号１１２）を生じる置換を含み、Ｘ１はＤ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ２はＴ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ３はＴ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ４はＧ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ５はＫ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ６はＹ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ７はＴ以外の任意のアミノ酸である。
【０１７０】
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質もまた本明細書に提供され、このカプシドタンパク質は、全ての位置において、または全てではない位置のいずれかの組み合わせにおいて、ネイティブＡＡＶ１２カプシドタンパク質のアミノ酸位置２６２〜２６９（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８（配列番号１１３）を生じる置換を含み、Ｘ１はＲ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ２はＩ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ３はＧ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ４はＴ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ５はＴ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ６はＡ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ７はＮ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ８はＳ以外の任意のアミノ酸である。
【０１７１】
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質もまた本明細書に提供され、このカプシドタンパク質は、全ての位置において、または全てではない位置のいずれかの組み合わせにおいて、ネイティブＡＡＶ１２カプシドタンパク質のアミノ酸位置３６９〜３７８（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｘ９−Ｘ１０（配列番号１１４）を生じる置換を含み、Ｘ１はＶ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ２はＦ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ３はＭ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ４はＶ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ５はＰ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ６はＱ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ７はＹ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ８はＧ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ９はＹ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ１０はＣ以外の任意のアミノ酸である。
【０１７２】
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質もまた本明細書に提供され、このカプシドタンパク質は、全ての位置において、または全てではない位置のいずれかの組み合わせにおいて、ネイティブＡＡＶ１２カプシドタンパク質のアミノ酸位置４５８〜４６１（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４（配列番号１１５）を生じる置換を含み、Ｘ１はＱ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ２はＧ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ３はＴ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ４はＡ以外の任意のアミノ酸である。
【０１７３】
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質もまた本明細書に提供され、このカプシドタンパク質は、全ての位置において、または全てではない位置のいずれかの組み合わせにおいて、ネイティブＡＡＶ１２カプシドタンパク質のアミノ酸位置４９５〜５０６（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｘ９−Ｘ１０−Ｘ１１−Ｘ１２（配列番号１１６）を生じる置換を含み、Ｘ１はＡ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ２はＮ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ３はＱ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ４はＮ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ５はＹ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ６はＫ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ７はＩ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ８はＰ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ９はＡ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ１０はＳ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ１１はＧ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ１２はＧ以外の任意のアミノ酸である。
【０１７４】
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質もまた本明細書に提供され、このカプシドタンパク質は、全ての位置において、または全てではない位置のいずれかの組み合わせにおいて、ネイティブＡＡＶ１２カプシドタンパク質のアミノ酸位置５９４〜６０１（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｘ９−Ｘ１０（配列番号１１７）を生じる置換を含み、Ｘ１はＴ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ２はＴ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ３はＡ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ４はＰ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ５はＨ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ６はＩ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ７はＡ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ８はＮ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ９はＬ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ１０はＤ以外の任意のアミノ酸である。
【０１７５】
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質もまた本明細書に提供され、このカプシドタンパク質は、全ての位置において、または全てではない位置のいずれかの組み合わせにおいて、ネイティブＡＡＶ１２カプシドタンパク質のアミノ酸位置７１５〜７１６（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：Ｘ１−Ｘ２を生じる置換を含み、Ｘ１はＮ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ２はＳ以外の任意のアミノ酸である。
【０１７６】
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質もまた本明細書に提供され、このカプシドタンパク質は、全ての位置において、または全てではない位置のいずれかの組み合わせにおいて、ネイティブＡＡＶ１２カプシドタンパク質のアミノ酸位置７２２〜７２８（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７（配列番号１１８）を生じる置換を含み、Ｘ１はＤ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ２はＮ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ３はＡ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ４はＧ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ５はＮ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ６はＹ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ７はＨ以外の任意のアミノ酸である。
【０１７７】
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質もまた本明細書に提供され、このカプシドタンパク質は、全ての位置において、または全てではない位置のいずれかの組み合わせにおいて、ネイティブＡＡＶｒｈ３２．３３カプシドタンパク質のアミノ酸位置２５３〜２６０（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８（配列番号１１９）を生じる置換を含み、Ｘ１はＲ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ２はＬ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ３はＧ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ４はＴ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ５はＴ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ６はＳ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ７はＮ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ８はＳ以外の任意のアミノ酸である。
【０１７８】
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質もまた本明細書に提供され、このカプシドタンパク質は、全ての位置において、または全てではない位置のいずれかの組み合わせにおいて、ネイティブＡＡＶｒｈ３２．３３カプシドタンパク質のアミノ酸位置３６０〜３６９（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｘ９−Ｘ１０（配列番号１２０）を生じる置換を含み、Ｘ１はＶ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ２はＦ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ３はＭ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ４はＶ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ５はＰ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ６はＱ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ７はＹ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ８はＧ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ９はＹ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ１０はＣ以外の任意のアミノ酸である。
【０１７９】
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質もまた本明細書に提供され、このカプシドタンパク質は、全ての位置において、または全てではない位置のいずれかの組み合わせにおいて、ネイティブＡＡＶｒｈ３２．３３カプシドタンパク質のアミノ酸位置４４９〜４５２（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４（配列番号１２１）を生じる置換を含み、Ｘ１はＱ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ２はＧ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ３はＮ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ４はＡ以外の任意のアミノ酸である。
【０１８０】
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質もまた本明細書に提供され、このカプシドタンパク質は、全ての位置において、または全てではない位置のいずれかの組み合わせにおいて、ネイティブＡＡＶｒｈ３２．３３カプシドタンパク質のアミノ酸位置４８６〜４９７（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｘ９−Ｘ１０−Ｘ１１−Ｘ１２（配列番号１２２）を生じる置換を含み、Ｘ１はＡ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ２はＳ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ３はＱ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ４はＮ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ５はＹ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ６はＫ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ７はＩ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ８はＰ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ９はＡ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ１０はＳ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ１１はＧ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ１２はＧ以外の任意のアミノ酸である。
【０１８１】
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質もまた本明細書に提供され、このカプシドタンパク質は、全ての位置において、または全てではない位置のいずれかの組み合わせにおいて、ネイティブＡＡＶｒｈ３２．３３カプシドタンパク質のアミノ酸位置５８５〜５９４（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｘ９−Ｘ１０（配列番号１２３）を生じる置換を含み、Ｘ１はＴ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ２はＴ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ３はＡ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ４はＰ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ５はＩ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ６はＴ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ７はＧ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ８はＮ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ９はＶ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ１０はＴ以外の任意のアミノ酸である。
【０１８２】
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質もまた本明細書に提供され、このカプシドタンパク質は、全ての位置において、または全てではない位置のいずれかの組み合わせにおいて、ネイティブＡＡＶｒｈ３２．３３カプシドタンパク質のアミノ酸位置７０６〜７０７（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：Ｘ１−Ｘ２を生じる置換を含み、Ｘ１はＳ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ２はＳ以外の任意のアミノ酸である。
【０１８３】
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質もまた本明細書に提供され、このカプシドタンパク質は、全ての位置において、または全てではない位置のいずれかの組み合わせにおいて、ネイティブＡＡＶｒｈ３２．３３カプシドタンパク質のアミノ酸位置７１３〜７１９（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７（配列番号１２４）を生じる置換を含み、Ｘ１はＤ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ２はＴ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ３はＴ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ４はＧ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ５はＫ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ６はＹ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ７はＴ以外の任意のアミノ酸である。
【０１８４】
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質もまた本明細書に提供され、このカプシドタンパク質は、全ての位置において、または全てではない位置のいずれかの組み合わせにおいて、ネイティブウシＡＡＶカプシドタンパク質のアミノ酸位置２５５〜２６２（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８（配列番号１２５）を生じる置換を含み、Ｘ１はＲ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ２はＬ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ３はＧ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ４はＳ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ５はＳ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ６はＮ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ７はＡ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ８はＳ以外の任意のアミノ酸である。
【０１８５】
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質もまた本明細書に提供され、このカプシドタンパク質は、全ての位置において、または全てではない位置のいずれかの組み合わせにおいて、ネイティブウシＡＡＶカプシドタンパク質のアミノ酸位置３６２〜３７１（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｘ９−Ｘ１０（配列番号１２６）を生じる置換を含み、Ｘ１はＶ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ２はＦ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ３はＭ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ４はＶ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ５はＰ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ６はＱ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ７はＹ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ８はＧ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ９はＹ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ１０はＣ以外の任意のアミノ酸である。
【０１８６】
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質もまた本明細書に提供され、このカプシドタンパク質は、全ての位置において、または全てではない位置のいずれかの組み合わせにおいて、ネイティブウシＡＡＶカプシドタンパク質のアミノ酸位置４５２〜４５５（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４（配列番号１２７）を生じる置換を含み、Ｘ１はＱ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ２はＧ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ３はＮ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ４はＳ以外の任意のアミノ酸である。
【０１８７】
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質もまた本明細書に提供され、このカプシドタンパク質は、全ての位置において、または全てではない位置のいずれかの組み合わせにおいて、ネイティブウシＡＡＶカプシドタンパク質のアミノ酸位置４８９〜５００（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｘ９−Ｘ１０−Ｘ１１−Ｘ１２（配列番号１２８）を生じる置換を含み、Ｘ１はＡ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ２はＳ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ３はＱ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ４はＮ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ５はＹ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ６はＫ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ７はＩ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ８はＰ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ９はＱ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ１０はＧ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ１１はＲ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ１２はＮ以外の任意のアミノ酸である。
【０１８８】
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質もまた本明細書に提供され、このカプシドタンパク質は、全ての位置において、または全てではない位置のいずれかの組み合わせにおいて、ネイティブウシＡＡＶカプシドタンパク質のアミノ酸位置５８８〜５９７（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｘ９−Ｘ１０（配列番号１２９）を生じる置換を含み、Ｘ１はＴ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ２はＴ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ３はＶ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ４はＰ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ５はＴ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ６はＶ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ７はＤ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ８はＤ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ９はＶ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ１０はＤ以外の任意のアミノ酸である。
【０１８９】
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質もまた本明細書に提供され、このカプシドタンパク質は、全ての位置において、または全てではない位置のいずれかの組み合わせにおいて、ネイティブウシＡＡＶカプシドタンパク質のアミノ酸位置７０９〜７１０（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：Ｘ１−Ｘ２を生じる置換を含み、Ｘ１はＤ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ２はＳ以外の任意のアミノ酸である。
【０１９０】
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質もまた本明細書に提供され、このカプシドタンパク質は、全ての位置において、または全てではない位置のいずれかの組み合わせにおいて、ネイティブウシＡＡＶカプシドタンパク質のアミノ酸位置７１６〜７２２（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７（配列番号１３０）を生じる置換を含み、Ｘ１はＤ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ２はＮ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ３はＡ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ４はＧ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ５はＡ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ６はＹ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ７はＫ以外の任意のアミノ酸である。
【０１９１】
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質もまた本明細書に提供され、このカプシドタンパク質は、全ての位置において、または全てではない位置のいずれかの組み合わせにおいて、ネイティブトリＡＡＶカプシドタンパク質のアミノ酸位置２６５〜２７２（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８（配列番号１３１）を生じる置換を含み、Ｘ１はＲ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ２はＩ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ３はＱ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ４はＧ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ５はＰ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ６はＳ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ７はＧ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ８はＧ以外の任意のアミノ酸である。
【０１９２】
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質もまた本明細書に提供され、このカプシドタンパク質は、全ての位置において、または全てではない位置のいずれかの組み合わせにおいて、ネイティブトリＡＡＶカプシドタンパク質のアミノ酸位置３７５〜３８４（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｘ９−Ｘ１０（配列番号１３２）を生じる置換を含み、Ｘ１はＩ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ２はＹ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ３はＴ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ４はＩ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ５はＰ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ６はＱ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ７はＹ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ８はＧ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ９はＹ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ１０はＣ以外の任意のアミノ酸である。
【０１９３】
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質もまた本明細書に提供され、このカプシドタンパク質は、全ての位置において、または全てではない位置のいずれかの組み合わせにおいて、ネイティブトリＡＡＶカプシドタンパク質のアミノ酸位置４５９〜４６２（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４（配列番号１３３）を生じる置換を含み、Ｘ１はＳ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ２はＳ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ３はＧ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ４はＲ以外の任意のアミノ酸である。
【０１９４】
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質もまた本明細書に提供され、このカプシドタンパク質は、全ての位置において、または全てではない位置のいずれかの組み合わせにおいて、ネイティブトリＡＡＶカプシドタンパク質のアミノ酸位置４９６〜５０７（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｘ９−Ｘ１０−Ｘ１１−Ｘ１２（配列番号１３４）を生じる置換を含み、Ｘ１はＡ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ２はＳ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ３はＮ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ４はＩ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ５はＴ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ６はＫ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ７はＮ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ８はＮ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ９はＶ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ１０はＦ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ１１はＳ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ１２はＶ以外の任意のアミノ酸である。
【０１９５】
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質もまた本明細書に提供され、このカプシドタンパク質は、全ての位置において、または全てではない位置のいずれかの組み合わせにおいて、ネイティブトリＡＡＶカプシドタンパク質のアミノ酸位置５９５〜６０４（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７−Ｘ８−Ｘ９−Ｘ１０（配列番号１３５）を生じる置換を含み、Ｘ１はＶ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ２はＴ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ３はＰ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ４はＧ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ５はＴ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ６はＲ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ７はＡ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ８はＡ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ９はＶ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ１０はＮ以外の任意のアミノ酸である。
【０１９６】
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質もまた本明細書に提供され、このカプシドタンパク質は、全ての位置において、または全てではない位置のいずれかの組み合わせにおいて、ネイティブトリＡＡＶカプシドタンパク質のアミノ酸位置７１６〜７１７（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：Ｘ１−Ｘ２を生じる置換を含み、Ｘ１はＡ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ２はＤ以外の任意のアミノ酸である。
【０１９７】
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）カプシドタンパク質もまた本明細書に提供され、このカプシドタンパク質は、全ての位置において、または全てではない位置のいずれかの組み合わせにおいて、ネイティブトリＡＡＶカプシドタンパク質のアミノ酸位置７２３〜７２９（ＶＰ１番号付け）に対応するアミノ酸において、アミノ酸配列：Ｘ１−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６−Ｘ７（配列番号１３６）を生じる置換を含み、Ｘ１はＳ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ２はＤ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ３はＴ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ４はＧ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ５はＳ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ６はＹ以外の任意のアミノ酸であり；Ｘ７はＳ以外の任意のアミノ酸である。
【０１９８】
Ｘ１〜Ｘ１０として同定されるいずれのアミノ酸残基も置換されない実施形態では、未置換の位置におけるアミノ酸残基は、参照アミノ酸配列の野生型アミノ酸残基である。
【０１９９】
配列番号１の残基４８８Ｒ、４５０Ｑ、４５３Ｓ、４５４Ｇ、４５５Ｓ、４５６Ａ、４５７Ｑおよび／または５００Ｎ（ＡＡＶ１カプシドタンパク質；ＶＰ１番号付け）におけるアミノ酸置換をいずれかの組み合わせで含むＡＡＶカプシドタンパク質もまた本明細書に提供される。
【０２００】
配列番号１の残基２５６Ｌ、２５８Ｋ、２５９Ｑ、２６１Ｓ、２６３Ａ、２６４Ｓ、２６５Ｔ、２６６Ｇ、２７２Ｈ、３８５Ｓ、３８６Ｑ、５４７Ｓ、７０９Ａ、７１０Ｎ、７１６Ｄ、７１７Ｎ、７１８Ｎ、７２０Ｌおよび／または７２２Ｔ（ＡＡＶ１カプシドタンパク質；ＶＰ１番号付け）におけるアミノ酸置換をいずれかの組み合わせで含むＡＡＶカプシドタンパク質もまた本明細書に提供される。
【０２０１】
配列番号５の残基２４４Ｎ、２４６Ｑ、２４８Ｒ、２４９Ｅ、２５０Ｉ、２５１Ｋ、２５２Ｓ、２５３Ｇ、２５４Ｓ、２５５Ｖ、２５６Ｄ、２６３Ｙ、３７７Ｅ、３７８Ｎ、４５３Ｌ、４５６Ｒ、５３２Ｑ、５３３Ｐ、５３５Ｎ、５３６Ｐ、５３７Ｇ、５３８Ｔ、５３９Ｔ、５４０Ａ、５４１Ｔ、５４２Ｙ、５４３Ｌ、５４６Ｎ、６５３Ｖ、６５４Ｐ、６５６Ｓ、６９７Ｑ、６９８Ｆ、７０４Ｄ、７０５Ｓ、７０６Ｔ、７０７Ｇ、７０８Ｅ、７０９Ｙおよび／または７１０Ｒ（ＡＡＶ５カプシドタンパク質；ＶＰ１番号付け）におけるアミノ酸置換を含むＡＡＶカプシドタンパク質もまた本明細書に提供される。
【０２０２】
配列番号５の残基２４８Ｒ、３１６Ｖ、３１７Ｑ、３１８Ｄ、３１９Ｓ、４４３Ｎ、５３０Ｎ、５３１Ｓ、５３２Ｑ、５３３Ｐ、５３４Ａ、５３５Ｎ、５４０Ａ、５４１Ｔ、５４２Ｙ、５４３Ｌ、５４５Ｇ、５４６Ｎ、６９７Ｑ、７０４Ｄ、７０６Ｔ、７０８Ｅ、７０９Ｙおよび／または７１０Ｒ（ＡＡＶ５カプシドタンパク質；ＶＰ１番号付け）におけるアミノ酸置換をいずれかの組み合わせで含むＡＡＶカプシドタンパク質もまた本明細書に提供される。
【０２０３】
配列番号６の残基２６４Ｓ、２６６Ｇ、２６９Ｎ、２７２Ｈ、４５７Ｑ、５８８Ｓおよび／または５８９Ｔ（ＡＡＶ６カプシドタンパク質；ＶＰ１番号付け）におけるアミノ酸置換をいずれかの組み合わせで含むＡＡＶカプシドタンパク質もまた本明細書に提供される。
【０２０４】
配列番号８の残基４５７Ｔ、４５９Ｎ、４９６Ｇ、４９９Ｎ、５００Ｎ、５８９Ｑ、５９０Ｎおよび／または５９２Ａ（ＡＡＶ８カプシドタンパク質；ＶＰ１番号付け）におけるアミノ酸置換をいずれかの組み合わせで含むＡＡＶカプシドタンパク質もまた本明細書に提供される。
【０２０５】
配列番号９の残基４５１Ｉ、４５２Ｎ、４５３Ｇ、４５４Ｓ、４５５Ｇ、４５６Ｑ、４５７Ｎおよび／または４５８Ｑ（ＡＡＶ９カプシドタンパク質；ＶＰ１番号付け）におけるアミノ酸置換をいずれかの組み合わせで含むＡＡＶカプシドタンパク質もまた本明細書に提供される。
【０２０６】
配列番号１（ＡＡＶ１カプシドタンパク質；ＶＰ１番号付け）のアミノ酸配列中にＳ４７２Ｒ置換を含むＡＡＶカプシドタンパク質もまた本明細書に提供される。
【０２０７】
配列番号１（ＡＡＶ１カプシドタンパク質；ＶＰ１番号付け）のアミノ酸配列中にＶ４７３Ｄ置換を含むＡＡＶカプシドタンパク質もまた本明細書に提供される。
【０２０８】
配列番号１（ＡＡＶ１カプシドタンパク質；ＶＰ１番号付け）のアミノ酸配列中にＮ５００Ｅ置換を含むＡＡＶカプシドタンパク質もまた本明細書に提供される。
【０２０９】
配列番号１（ＡＡＶ１カプシドタンパク質；ＶＰ１番号付け）のアミノ酸配列中にＡ４５６Ｔ、Ｑ４５７Ｔ、Ｎ４５８ＱおよびＫ４５９Ｓ置換を含むＡＡＶカプシドタンパク質もまた本明細書に提供される。
【０２１０】
配列番号１（ＡＡＶ１カプシドタンパク質；ＶＰ１番号付け）のアミノ酸配列中にＴ４９２ＳおよびＫ４９３Ａ置換を含むＡＡＶカプシドタンパク質もまた本明細書に提供される。
【０２１１】
配列番号１（ＡＡＶ１カプシドタンパク質；ＶＰ１番号付け）のアミノ酸配列中にＳ５８６Ｒ、Ｓ５８７Ｇ、Ｓ５８８ＮおよびＴ５８９Ｒ置換を含むＡＡＶカプシドタンパク質もまた本明細書に提供される。
【０２１２】
配列番号１（ＡＡＶ１カプシドタンパク質；ＶＰ１番号付け）のアミノ酸配列中にＡ４５６Ｔ、Ｑ４５７Ｔ、Ｎ４５８Ｑ、Ｋ４５９Ｓ、Ｔ４９２ＳおよびＫ４９３Ａ置換を含むＡＡＶカプシドタンパク質もまた本明細書に提供される。
【０２１３】
配列番号１（ＡＡＶ１カプシドタンパク質；ＶＰ１番号付け）のアミノ酸配列中にＡ４５６Ｔ、Ｑ４５７Ｔ、Ｎ４５８Ｑ、Ｋ４５９Ｓ、Ｓ５８６Ｒ、Ｓ５８７Ｇ、Ｓ５８８ＮおよびＴ５８９Ｒ置換を含むＡＡＶカプシドタンパク質もまた本明細書に提供される。
【０２１４】
配列番号１（ＡＡＶ１カプシドタンパク質；ＶＰ１番号付け）のアミノ酸配列中にＴ４９２Ｓ、Ｋ４９３Ａ、Ｓ５８６Ｒ、Ｓ５８７Ｇ、Ｓ５８８ＮおよびＴ５８９Ｒ置換を含むＡＡＶカプシドタンパク質もまた本明細書に提供される。
【０２１５】
配列番号１（ＡＡＶ１カプシドタンパク質；ＶＰ１番号付け）のアミノ酸配列中にＡ４５６Ｔ、Ｑ４５７Ｔ、Ｎ４５８Ｑ、Ｋ４５９Ｓ、Ｔ４９２Ｓ、Ｋ４９３Ａ、Ｓ５８６Ｒ、Ｓ５８７Ｇ、Ｓ５８８ＮおよびＴ５８９Ｒ置換を含むＡＡＶカプシドタンパク質もまた本明細書に提供される。
【０２１６】
本発明は、本発明の１つまたは複数のアミノ酸置換をいずれかの組み合わせで含むＡＡＶカプシドタンパク質をさらに提供する。例えば、本明細書に記載される任意の所与の血清型のＡＡＶカプシドタンパク質は、ＣＡＭ１、ＣＡＭ３、ＣＡＭ４−１、ＣＡＭ４−２、ＣＡＭ５、ＣＡＭ６、ＣＡＭ７、ＣＡＭ８、ＣＡＭ９−１および／またはＣＡＭ９−２（表５に列挙される）について同定されたアミノ酸残基において、単一でまたはいずれかの組み合わせで置換を含み得る。さらなる一例として、第１の血清型のＡＡＶカプシドは、第２、第３、第４のＡＡＶ血清型などであり得る異なるＡＡＶ血清型のＣＡＭ領域を規定する残基を導入するアミノ酸置換を含み得る。異なるＡＡＶ血清型のＣＡＭ領域は、いずれかの組み合わせで第１のＡＡＶ血清型上に存在し得る。この累積的アプローチは、中和抗体を回避する、可変性の抗原性表面トポロジーを示す新規ＡＡＶｅ株を生成する。特定の非限定的な一例として、ＡＡＶ１血清型のカプシドタンパク質は、当業者に認識されるように、異なる第２のＡＡＶ血清型由来の内因性または変異したＣＡＭ１領域、および異なる第３の血清型の内因性または変異したＣＡＭ３領域、および異なる第４の血清型の内因性または変異したＣＡＭ４領域などをいずれかの組み合わせで含み得る。
【０２１７】
特定の実施形態では、本発明の改変されたウイルスカプシドタンパク質は、１つのＡＡＶカプシドタンパク質由来のアミノ酸が別のＡＡＶカプシドタンパク質に置換されたＡＡＶカプシドタンパク質に限定されず、置換および／または挿入されたアミノ酸は、任意の供給源由来であり得、さらに、天然に存在するまたは部分的もしくは完全に合成であり得る。
【０２１８】
本明細書中で記載する場合、多数のＡＡＶ由来のカプシドタンパク質の核酸およびアミノ酸配列は、当該分野で公知である。従って、ネイティブＡＡＶカプシドタンパク質のアミノ酸位置に「対応する」アミノ酸は、任意の他のＡＡＶについて容易に決定できる（例えば、配列アラインメントを使用して）。
【０２１９】
本発明は、本発明の改変されたカプシドタンパク質が、現在公知のまたは後に発見される任意のＡＡＶのカプシドタンパク質を改変することによって生成され得ることを企図している。さらに、改変されるＡＡＶカプシドタンパク質は、天然に存在するＡＡＶカプシドタンパク質（例えば、表１に示されるＡＡＶ２、ＡＡＶ３ａもしくは３ｂ、ＡＡＶ４、ＡＡＶ５、ＡＡＶ８、ＡＡＶ９、ＡＡＶ１０またはＡＡＶ１１カプシドタンパク質あるいは任意のＡＡＶ）であり得るがそれらに限定されない。当業者は、ＡＡＶカプシドタンパク質に対する種々の操作が当該分野で公知であり、本発明が天然に存在するＡＡＶカプシドタンパク質の改変に限定されないことを理解するであろう。例えば、改変されるカプシドタンパク質は、天然に存在するＡＡＶ（例えば、天然に存在するＡＡＶカプシドタンパク質、例えば、ＡＡＶ２、ＡＡＶ３ａ、ＡＡＶ３ｂ、ＡＡＶ４、ＡＡＶ５、ＡＡＶ６、ＡＡＶ７、ＡＡＶ８、ＡＡＶ９、ＡＡＶ１０、ＡＡＶ１１、ＡＡＶ１２あるいは現在公知のまたは後に発見される任意の他のＡＡＶに由来する）と比較して、既に変更を有していてもよい。かかるＡＡＶカプシドタンパク質もまた、本発明の範囲内である。
【０２２０】
従って、特定の実施形態では、改変されるＡＡＶカプシドタンパク質は、天然に存在するＡＡＶに由来し得るが、カプシドタンパク質中に挿入および／または置換されたならびに／あるいは１つまたは複数のアミノ酸の欠失によって変更された、１つまたは複数の外来配列（例えば、ネイティブウイルスにとって外因性である）をさらに含み得る。
【０２２１】
従って、特定のＡＡＶカプシドタンパク質（例えば、表１に示されたＡＡＶ２、ＡＡＶ３、ＡＡＶ４、ＡＡＶ５、ＡＡＶ６、ＡＡＶ７、ＡＡＶ８、ＡＡＶ９、ＡＡＶ１０もしくはＡＡＶ１１カプシドタンパク質、または任意のＡＡＶ由来のカプシドタンパク質など）に本明細書中で言及する場合、ネイティブカプシドタンパク質ならびに本発明の改変以外の変更を有するカプシドタンパク質を包含する意図である。かかる変更には、置換、挿入および／または欠失が含まれる。特定の実施形態では、カプシドタンパク質は、ネイティブＡＡＶカプシドタンパク質配列と比較して、そこに挿入された１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９もしくは２０の、２０未満、３０未満、４０未満、５０未満、６０未満または７０未満のアミノ酸を含む（本発明の挿入以外に）。本発明の実施形態では、カプシドタンパク質は、ネイティブＡＡＶカプシドタンパク質配列と比較して、１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９もしくは２０の、２０未満、３０未満、４０未満、５０未満、６０未満または７０未満のアミノ酸置換を含む（本発明に従うアミノ酸置換以外に）。本発明の実施形態では、カプシドタンパク質は、ネイティブＡＡＶカプシドタンパク質配列と比較して、１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９もしくは２０の、２０未満、３０未満、４０未満、５０未満、６０未満または７０未満のアミノ酸の欠失を含む（本発明のアミノ酸欠失以外に）。
【０２２２】
従って、例えば用語「ＡＡＶ２カプシドタンパク質」には、ネイティブＡＡＶ２カプシドタンパク質配列を有するＡＡＶカプシドタンパク質（ＧｅｎＢａｎｋ受託番号ＡＡＣ０３７８０を参照のこと）ならびにネイティブＡＡＶ２カプシドタンパク質配列中に置換、挿入および／または欠失（上のパラグラフに記載したもの）を含むものが含まれる。
【０２２３】
特定の実施形態では、ＡＡＶカプシドタンパク質は、ネイティブＡＡＶカプシドタンパク質配列を有する、あるいはネイティブＡＡＶカプシドタンパク質配列と少なくとも約９０％、９５％、９７％、９８％または９９％類似または同一なアミノ酸配列を有する。例えば、特定の実施形態では、「ＡＡＶ２」カプシドタンパク質は、ネイティブＡＡＶ２カプシドタンパク質配列、ならびにネイティブＡＡＶ２カプシドタンパク質配列と少なくとも約９０％、９５％、９７％、９８％または９９％類似または同一な配列を包含する。
【０２２４】
２つ以上のアミノ酸配列間の配列類似性または同一性を決定する方法は、当該分野で公知である。配列類似性または同一性は、当該分野で公知の標準的な技術を使用して決定され得、この技術には、ＳｍｉｔｈおよびＷａｔｅｒｍａｎ、Ａｄｖ．Ａｐｐｌ．Ｍａｔｈ．２、４８２頁（１９８１）の局所配列同一性アルゴリズム、ＮｅｅｄｌｅｍａｎおよびＷｕｎｓｃｈ、Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．４８、４４３頁（１９７０）の配列同一性アラインメントアルゴリズム、ＰｅａｒｓｏｎおよびＬｉｐｍａｎ、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ  ８５、２４４４頁（１９８８）の類似性検索方法、これらのアルゴリズムのコンピュータ化実行（Ｗｉｓｃｏｎｓｉｎ  Ｇｅｎｅｔｉｃｓ  Ｓｏｆｔｗａｒｅ  Ｐａｃｋａｇｅ、Ｇｅｎｅｔｉｃｓ  Ｃｏｍｐｕｔｅｒ  Ｇｒｏｕｐ、５７５  Ｓｃｉｅｎｃｅ  Ｄｒｉｖｅ、Ｍａｄｉｓｏｎ、ＷＩにおけるＧＡＰ、ＢＥＳＴＦＩＴ、ＦＡＳＴＡおよびＴＦＡＳＴＡ）、Ｄｅｖｅｒｅｕｘら、Ｎｕｃｌ．Ａｃｉｄ  Ｒｅｓ．１２：３８７〜３９５頁（１９８４）に記載されるＢｅｓｔ  Ｆｉｔ配列プログラム、または検査が含まれるがこれらに限定されない。
【０２２５】
別の適切なアルゴリズムは、Ａｌｔｓｃｈｕｌら、Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．２１５：４０３〜４１０頁（１９９０）およびＫａｒｌｉｎら、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ  ９０、５８７３〜５７８７頁（１９９３）に記載されたＢＬＡＳＴアルゴリズムである。特に有用なＢＬＡＳＴプログラムは、Ａｌｔｓｃｈｕｌら、Ｍｅｔｈｏｄｓ  ｉｎ  Ｅｎｚｙｍｏｌｏｇｙ、２６６：４６０〜４８０頁（１９９６）；ｈｔｔｐ：／／ｂｌａｓｔ．ｗｕｓｔｌ／ｅｄｕ／ｂｌａｓｔ／ＲＥＡＤＭＥ．ｈｔｍｌから得られるＷＵ−ＢＬＡＳＴ−２プログラムである。ＷＵ−ＢＬＡＳＴ−２は、任意選択的にデフォルト値に設定されるいくつかの検索パラメータを使用する。これらのパラメータは、ダイナミックな値であり、特定の配列の組成および対象の配列がそれに対して検索されている特定のデータベースの構成に依存して、プログラム自体によって設定されるが、これらの値は、感度を増加させるために調整されてよい。
【０２２６】
さらに、さらなる有用なアルゴリズムは、Ａｌｔｓｃｈｕｌら、（１９９７）Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄｓ  Ｒｅｓ．２５：３３８９〜３４０２頁に報告されるｇａｐｐｅｄ  ＢＬＡＳＴである。
【０２２７】
本発明は、本発明の改変されたＡＡＶカプシドタンパク質を含む、本質的にこれからなる、またはこれからなるウイルスカプシドもまた提供する。特定の実施形態では、ウイルスカプシドは、さらに自律的パルボウイルスカプシドまたはディペンドウイルスカプシドであり得るパルボウイルスカプシドである。任意選択的に、ウイルスカプシドはＡＡＶカプシドである。特定の実施形態では、このＡＡＶカプシドは、ＡＡＶ１、ＡＡＶ２、ＡＡＶ３ａ、ＡＡＶ３ｂ、ＡＡＶ４、ＡＡＶ５、ＡＡＶ６、ＡＡＶ７、ＡＡＶ８、ＡＡＶ９、ＡＡＶ１０、ＡＡＶ１１、ＡＡＶ１２、ＡＡＶｒｈ８、ＡＡＶｒｈ１０、ＡＡＶｒｈ３２．３３、ウシＡＡＶカプシド、トリＡＡＶカプシド、または現在公知のもしくは後に同定される任意の他のＡＡＶである。ＡＡＶ血清型の非限定的なリストは、表１に示され、本発明のＡＡＶカプシドは、表１に列挙された、あるいは１つまたは複数の挿入、置換および／または欠失によって上述のいずれかから誘導された、任意のＡＡＶ血清型であり得る。
【０２２８】
改変されたウイルスカプシドは、例えば米国特許第５，８６３，５４１号に記載された「カプシドビヒクル」として使用され得る。改変されたウイルスカプシドによってパッケージングされ得、細胞中に移入され得る分子には、異種ＤＮＡ、ＲＮＡ、ポリペプチド、有機小分子、金属またはそれらの組み合わせが含まれる。
【０２２９】
異種分子は、ＡＡＶ感染において天然には見出されない分子、例えば、野生型ＡＡＶゲノムによってコードされない分子として規定される。さらに、治療的に有用な分子は、宿主標的細胞中への分子の移入のために、キメラウイルスカプシドの外側と会合し得る。かかる会合した分子には、ＤＮＡ、ＲＮＡ、有機小分子、金属、炭水化物、脂質および／またはポリペプチドが含まれ得る。本発明の一実施形態では、治療的に有用な分子は、カプシドタンパク質に共有結合される（即ち、コンジュゲート化または化学的にカップリングされる）。分子を共有結合する方法は、当業者に公知である。
【０２３０】
本発明の改変されたウイルスカプシドはまた、新規カプシド構造に対する抗体を惹起するのに用途を見出す。さらなる代替として、外因性アミノ酸配列は、細胞への抗原提示のために、例えば、外因性アミノ酸配列に対する免疫応答を生じるために対象に投与するために、改変されたウイルスカプシド中に挿入され得る。
【０２３１】
他の実施形態では、ウイルスカプシドは、対象のポリペプチドまたは機能的ＲＮＡをコードする核酸を送達するウイルスベクターの投与の前および／または同時に（例えば、互いに数分以内または数時間以内）、特定の細胞部位を遮断するために投与され得る。例えば、本発明のカプシドは、肝臓細胞上の細胞受容体を遮断するために送達され得、肝臓細胞の形質導入を低下させ得、他の標的（例えば、骨格筋、心筋および／または横隔膜筋）の形質導入を増強し得る送達ベクターが、その後にまたは同時に投与され得る。
【０２３２】
代表的実施形態によれば、改変されたウイルスカプシドは、本発明に従う改変されたウイルスベクターの前および／または同時に対象に投与され得る。さらに、本発明は、本発明の改変されたウイルスカプシドを含む組成物および医薬製剤を提供するが、任意選択的に、この組成物は、本発明の改変されたウイルスベクターもまた含む。
【０２３３】
本発明は、本発明の改変されたウイルスカプシドおよびカプシドタンパク質をコードする核酸（任意選択的に、単離された核酸）もまた提供する。核酸を含むベクター、ならびに本発明の核酸および／またはベクターを含む細胞（インビボまたは培養物中）がさらに提供される。一例として、本発明は、（ａ）本発明の改変されたＡＡＶカプシドと、（ｂ）少なくとも１つの末端反復配列を含む核酸とを含むウイルスベクターを提供し、この核酸は、ＡＡＶカプシドによってカプシド封入されている。
【０２３４】
他の適切なベクターには、ウイルスベクター（例えば、アデノウイルス、ＡＡＶ、ヘルペスウイルス、ワクシニア、ポックスウイルス、バキュロウイルスなど）、プラスミド、ファージ、ＹＡＣ、ＢＡＣなどが含まれるがこれらに限定されない。かかる核酸、ベクターおよび細胞は、例えば、本明細書中に記載される改変されたウイルスカプシドまたはウイルスベクターの生成のための試薬（例えば、ヘルパーパッケージング構築物またはパッケージング細胞）として使用され得る。
【０２３５】
本発明に従うウイルスカプシドは、例えばバキュロウイルスからの発現によるなどの、当該分野で公知の任意の方法を使用して生成され得る（Ｂｒｏｗｎら、（１９９４）Ｖｉｒｏｌｏｇｙ  １９８：４７７〜４８８頁）。
【０２３６】
本発明に従うＡＡＶカプシドタンパク質への改変は、「選択的」改変である。このアプローチは、ＡＡＶ血清型間のサブユニット全体または大きいドメインのスワップを用いる以前の研究とは対照的である（例えば、国際特許公開公報ＷＯ  ００／２８００４およびＨａｕｃｋら、（２００３）Ｊ．Ｖｉｒｏｌｏｇｙ  ７７：２７６８〜２７７４頁を参照のこと）。特定の実施形態では、「選択的」改変は、約２０、１８、１５、１２、１０、９、８、７、６、５、４または３個未満の連続アミノ酸の挿入および／または置換および／または欠失を生じる。
【０２３７】
本発明の改変されたカプシドタンパク質およびカプシドは、現在公知のまたは後に同定される任意の他の改変をさらに含み得る。
【０２３８】
例えば、本発明のＡＡＶカプシドタンパク質およびウイルスカプシドは、例えば、国際特許公開公報ＷＯ  ００／２８００４号に記載されるように、別のウイルス、任意選択的に別のパルボウイルスまたはＡＡＶ由来のカプシドサブユニットの全てまたは一部を含み得るという意味で、キメラであり得る。
【０２３９】
本発明のいくつかの実施形態では、ウイルスカプシドは、ウイルスカプシドを所望の標的組織（複数可）上に存在する細胞表面分子と相互作用するよう方向付ける標的化配列（例えば、ウイルスカプシド中に置換または挿入されたもの）を含む標的化ウイルスカプシドであり得る（例えば、国際特許公開公報ＷＯ  ００／２８００４号およびＨａｕｃｋら、（２００３）Ｊ．Ｖｉｒｏｌｏｇｙ  ７７：２７６８〜２７７４頁）；Ｓｈｉら、Ｈｕｍａｎ  Ｇｅｎｅ  Ｔｈｅｒａｐｙ  １７：３５３〜３６１頁（２００６）［ＡＡＶカプシドサブユニットの５２０位および／または５８４位におけるインテグリン受容体結合モチーフＲＧＤの挿入を記載している］；および米国特許第７，３１４，９１２号［ＡＡＶ２カプシドサブユニットのアミノ酸４４７位、５３４位、５７３位および５８７位の後にＲＧＤモチーフを含むＰ１ペプチドの挿入を記載している］を参照のこと）。挿入を許容するＡＡＶカプシドサブユニット内の他の位置は当該分野で公知である（例えば、Ｇｒｉｆｍａｎら、Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｔｈｅｒａｐｙ  ３：９６４〜９７５頁（２００１）に記載される４４９位および５８８位）。
【０２４０】
例えば、本発明のウイルスカプシドは、対象の特定の標的組織（例えば、肝臓、骨格筋、心臓、横隔膜筋、腎臓、脳、胃、腸、皮膚、内皮細胞および／または肺）に向かう比較的非効率なトロピズムを有し得る。標的化配列は、これらの低形質導入ベクター中に有利に組み込まれ得、それにより、所望のトロピズムおよび任意選択的に特定の組織（複数可）に対する選択的トロピズムをウイルスカプシドに付与する。標的化配列を含むＡＡＶカプシドタンパク質、カプシドおよびベクターは、例えば国際特許公開公報ＷＯ  ００／２８００４号中に記載されている。別の例として、低形質導入ベクターを所望の標的組織（複数可）に再方向付けする手段として、Ｗａｎｇら、（Ａｎｎｕ  Ｒｅｖ  Ｂｉｏｐｈｙｓ  Ｂｉｏｍｏｌ  Ｓｔｒｕｃｔ．３５：２２５〜４９頁（２００６））に記載される１つまたは複数の天然に存在しないアミノ酸が、直交部位において本発明のＡＡＶカプシドサブユニット中に組み込まれ得る。これらの非天然アミノ酸は、グリカン（マンノース−樹状細胞標的化）；特定のがん細胞型への標的化送達のためのＲＧＤ、ボンベシンまたはニューロペプチド；増殖因子受容体、インテグリンなどの特定の細胞表面受容体に標的化されたファージディスプレイから選択されるＲＮＡアプタマーまたはペプチドが含まれるがこれらに限定されない対象の分子をＡＡＶカプシドタンパク質に化学的に連結するために有利に使用され得る。アミノ酸を化学的に改変する方法は、当該分野で公知である（例えば、Ｇｒｅｇ  Ｔ．Ｈｅｒｍａｎｓｏｎ、Ｂｉｏｃｏｎｊｕｇａｔｅ  Ｔｅｃｈｎｉｑｕｅｓ、第１版、Ａｃａｄｅｍｉｃ  Ｐｒｅｓｓ、１９９６を参照のこと）。
【０２４１】
いくつかの実施形態では、標的化配列は、特定の細胞型（複数可）への感染を指向するウイルスカプシド配列（例えば、自律的パルボウイルスカプシド配列、ＡＡＶカプシド配列または任意の他のウイルスカプシド配列）であり得る。
【０２４２】
別の非限定的な例として、ヘパリン結合ドメイン（例えば、ＲＳウイルスヘパリン結合ドメイン）が、得られた変異体にヘパリン結合を付与するために、典型的にはＨＳ受容体に結合しないカプシドサブユニット（例えば、ＡＡＶ４、ＡＡＶ５）中に挿入または置換され得る。
【０２４３】
Ｂ１９は、その受容体としてグロボシドを使用する初代赤血球前駆細胞に感染する（Ｂｒｏｗｎら（１９９３）Ｓｃｉｅｎｃｅ  ２６２：１１４頁）。Ｂ１９の構造は、８Åの分解能まで決定されている（Ａｇｂａｎｄｊｅ−ＭｃＫｅｎｎａら（１９９４）Ｖｉｒｏｌｏｇｙ  ２０３：１０６頁）。グロボシドに結合するＢ１９カプシドの領域は、アミノ酸３９９〜４０６の間（Ｃｈａｐｍａｎら（１９９３）Ｖｉｒｏｌｏｇｙ  １９４：４１９頁）、βバレル構造ＥとＦとの間のループアウト（ｌｏｏｐｅｄ  ｏｕｔ）領域（Ｃｈｉｐｍａｎら（１９９６）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ  ９３：７５０２頁）にマップされている。従って、Ｂ１９カプシドのグロボシド受容体結合ドメインは、それを含むウイルスカプシドまたはウイルスベクターを赤血球細胞に標的化するために、本発明のＡＡＶカプシドタンパク質中に置換され得る。
【０２４４】
いくつかの実施形態では、外因性標的化配列は、改変されたＡＡＶカプシドタンパク質を含むウイルスカプシドまたはウイルスベクターのトロピズムを変更するペプチドをコードする任意のアミノ酸配列であり得る。特定の実施形態では、標的化ペプチドまたはタンパク質は、天然に存在するものであってもよく、あるいは完全にまたは部分的に合成であってもよい。例示的な標的化配列には、細胞表面受容体および糖タンパク質に結合するリガンドおよび他のペプチド、例えば、ＲＧＤペプチド配列、ブラジキニン、ホルモン、ペプチド増殖因子（例えば、上皮増殖因子、神経増殖因子、線維芽細胞増殖因子、血小板由来増殖因子、インスリン様増殖因子ＩおよびＩＩなど）、サイトカイン、メラニン細胞刺激ホルモン（例えば、α、βまたはγ）、ニューロペプチドおよびエンドルフィンなど、ならびにそれらの同族受容体へと細胞を標的化する能力を保持したその断片が含まれる。他の例示的なペプチドおよびタンパク質には、サブスタンスＰ、ケラチノサイト増殖因子、ニューロペプチドＹ、ガストリン放出ペプチド、インターロイキン２、ニワトリ卵白リゾチーム、エリスロポエチン、ゴナドリベリン、コルチコスタチン、β−エンドルフィン、ロイシンエンケファリン、リモルフィン、α−ネオエンケファリン、アンジオテンシン、ニューマジン（ｐｎｅｕｍａｄｉｎ）、血管作用性腸ペプチド、ニューロテンシン、モチリン、および上記のようなそれらの断片が含まれる。なおさらなる代替として、毒素（例えば、破傷風毒素または蛇毒、例えば、α−ブンガロトキシンなど）由来の結合ドメインが、標的化配列としてカプシドタンパク質中に置換され得る。なおさらなる代表的実施形態では、ＡＡＶカプシドタンパク質は、Ｃｌｅｖｅｓ（Ｃｕｒｒｅｎｔ  Ｂｉｏｌｏｇｙ  ７：Ｒ３１８（１９９７））に記載される「非典型的」インポート／エクスポートシグナルペプチド（例えば、線維芽細胞増殖因子−１および−２、インターロイキン１、ＨＩＶ−１  Ｔａｔタンパク質、ヘルペスウイルスＶＰ２２タンパク質など）によるＡＡＶカプシドタンパク質中への置換によって改変され得る。特定の細胞による取込みを方向付けるペプチドモチーフもまた包含され、例えば、ＦＶＦＬＰ（配列番号１６２）ペプチドモチーフは、肝臓細胞による取込みを誘発する。
【０２４５】
ファージディスプレイ技術ならびに当該分野で公知の他の技術が、対象の任意の細胞型を認識するペプチドを同定するために使用され得る。
【０２４６】
標的化配列は、受容体（例えば、タンパク質、炭水化物、糖タンパク質またはプロテオグリカン）を含む、細胞表面結合部位に標的化する任意のペプチドをコードし得る。細胞表面結合部位の例としては、ヘパラン硫酸、コンドロイチン硫酸および他のグリコサミノグリカン、ムチン上に見出されるシアル酸部分、糖タンパク質、およびガングリオシド、ＭＨＣ  Ｉ糖タンパク質、マンノース、Ｎ−アセチル−ガラクトサミン、Ｎ−アセチル−グルコサミン、フコース、ガラクトースを含めた、膜糖タンパク質上に見出される炭水化物成分などが含まれるがこれらに限定されない。
【０２４７】
特定の実施形態では、ヘパラン硫酸（ＨＳ）またはヘパリン結合ドメインが、ウイルスカプシド中に（例えば、さもなければＨＳにもヘパリンにも結合しないＡＡＶカプシドにおいて）置換される。ＨＳ／ヘパリン結合は、アルギニンおよび／またはリシンに富んだ「塩基性パッチ」によって媒介されることが当該分野で公知である。例示的な実施形態では、モチーフＢＸＸＢ（配列番号１６３）に従う配列であって、「Ｂ」が塩基性残基であり、Ｘが中性および／または疎水性である配列が使用され得る。非限定的な一例として、ＢＸＸＢは、ＲＧＮＲ（配列番号１６４）であり得る。別の非限定的な例として、ＢＸＸＢは、ネイティブＡＡＶ２カプシドタンパク質中のアミノ酸位置２６２〜２６５について、または別のＡＡＶ血清型のカプシドタンパク質中の対応する位置（複数可）において置換される。
【０２４８】
適切な標的化配列の他の非限定的な例には、Ｍｕｌｌｅｒら、Ｎａｔｕｒｅ  Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ  ２１：１０４０〜１０４６（２００３）によって同定された冠状動脈内皮細胞を標的化するペプチド（コンセンサス配列ＮＳＶＲＤＬ（Ｇ／Ｓ）（配列番号１６５）、ＰＲＳＶＴＶＰ（配列番号１６６）、ＮＳＶＳＳＸ（Ｓ／Ａ）（配列番号１６７）；Ｇｒｉｆｍａｎら、Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｔｈｅｒａｐｙ  ３：９６４〜９７５（２００１）に記載される腫瘍標的化ペプチド（例えば、ＮＧＲ、ＮＧＲＡＨＡ、配列番号１６８）；Ｗｏｒｋら、Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｔｈｅｒａｐｙ  １３：６８３〜６９３（２００６）に記載される肺または脳標的化配列（ＱＰＥＨＳＳＴ；配列番号１６９、ＶＮＴＡＮＳＴ；配列番号１７０、ＨＧＰＭＱＫＳ；配列番号１７１、ＰＨＫＰＰＬＡ；配列番号１７２、ＩＫＮＮＥＭＷ；配列番号１７３、ＲＮＬＤＴＰＭ；配列番号１７４、ＶＤＳＨＲＱＳ；配列番号１７５、ＹＤＳＫＴＫＴ；配列番号１７６、ＳＱＬＰＨＱＫ；配列番号１７７、ＳＴＭＱＱＮＴ；配列番号１７８、ＴＥＲＹＭＴＱ；配列番号１７９、ＱＰＥＨＳＳＴ；配列番号１８０、ＤＡＳＬＳＴＳ；配列番号１８１、ＤＬＰＮＫＫＴ；配列番号１８２、ＤＬＴＡＡＲＬ；配列番号１８３、ＥＰＨＱＦＮＹ；配列番号１８４、ＥＰＱＳＮＨＴ；配列番号１８５、ＭＳＳＷＰＳＱ；配列番号１８６、ＮＰＫＨＮＡＴ；配列番号１８７、ＰＤＧＭＲＴＴ；配列番号１８８、ＰＮＮＮＫＴＴ；配列番号１８９、ＱＳＴＴＨＤＳ；配列番号１９０、ＴＧＳＫＱＫＱ；配列番号１９１、ＳＬＫＨＱＡＬ；配列番号１９２およびＳＰＩＤＧＥＱ；配列番号１９３）；Ｈａｊｉｔｏｕら、ＴＣＭ  １６：８０〜８８（２００６）に記載される血管標的化配列（ＷＩＦＰＷＩＱＬ；配列番号１９４、ＣＤＣＲＧＤＣＦＣ；配列番号１９５、ＣＮＧＲＣ；配列番号１９６、ＣＰＲＥＣＥＳ；配列番号１９７、ＧＳＬ、ＣＴＴＨＷＧＦＴＬＣ；配列番号１９８、ＣＧＲＲＡＧＧＳＣ；配列番号１９９、ＣＫＧＧＲＡＫＤＣ；配列番号２００、およびＣＶＰＥＬＧＨＥＣ；配列番号２０１）；Ｋｏｉｖｕｎｅｎら、Ｊ．Ｎｕｃｌ．Ｍｅｄ．４０：８８３〜８８８（１９９９）に記載される標的化ペプチド（ＣＲＲＥＴＡＷＡＫ；配列番号２０２、ＫＧＤ、ＶＳＷＦＳＨＲＹＳＰＦＡＶＳ；配列番号２０３、ＧＹＲＤＧＹＡＧＰＩＬＹＮ；配列番号２０４、ＸＸＸＹ＊ＸＸＸ（配列番号２０５）［式中、Ｙ＊はホスホ−Ｔｙｒである］、Ｙ＊Ｅ／ＭＮＷ；配列番号２０６、ＲＰＬＰＰＬＰ；配列番号２０７、ＡＰＰＬＰＰＲ；配列番号２０８、ＤＶＦＹＰＹＰＹＡＳＧＳ；配列番号２０９、ＭＹＷＹＰＹ；配列番号２１０、ＤＩＴＷＤＱＬＷＤＬＭＫ；配列番号２１１、ＣＷＤＤ（Ｇ／Ｌ）ＷＬＣ；配列番号２１２、ＥＷＣＥＹＬＧＧＹＬＲＣＹＡ；配列番号２１３、ＹＸＣＸＸＧＰＸＴＷＸＣＸＰ；配列番号２１４、ＩＥＧＰＴＬＲＱＷＬＡＡＲＡ；配列番号２１５、ＬＷＸＸ（Ｙ／Ｗ／Ｆ／Ｈ）；配列番号２１６、ＸＦＸＸＹＬＷ；配列番号２１７、ＳＳＩＩＳＨＦＲＷＧＬＣＤ；配列番号２１８、ＭＳＲＰＡＣＰＰＮＤＫＹＥ；配列番号２１９、ＣＬＲＳＧＲＧＣ；配列番号２２０、ＣＨＷＭＦＳＰＷＣ；配列番号２２１、ＷＸＸＦ；配列番号２���２、ＣＳＳＲＬＤＡＣ；配列番号２２３、ＣＬＰＶＡＳＣ；配列番号２２４、ＣＧＦＥＣＶＲＱＣＰＥＲＣ；配列番号２２５、ＣＶＡＬＣＲＥＡＣＧＥＧＣ；配列番号２２６、ＳＷＣＥＰＧＷＣＲ；配列番号２２７、ＹＳＧＫＷＧＷ；配列番号２２８、ＧＬＳＧＧＲＳ；配列番号２２９、ＬＭＬＰＲＡＤ；配列番号２３０、ＣＳＣＦＲＤＶＣＣ；配列番号２３１、ＣＲＤＶＶＳＶＩＣ；配列番号２３２、ＣＮＧＲＣ；配列番号２３３、およびＧＳＬ）；ならびにＮｅｗｔｏｎおよびＤｅｕｔｓｃｈｅｒ、Ｐｈａｇｅ  Ｐｅｐｔｉｄｅ  Ｄｉｓｐｌａｙ  ｉｎ  Ｈａｎｄｂｏｏｋ  ｏｆ  Ｅｘｐｅｒｉｍｅｎｔａｌ  Ｐｈａｒｍａｃｏｌｏｇｙ、１４５〜１６３頁、Ｓｐｒｉｎｇｅｒ−Ｖｅｒｌａｇ、Ｂｅｒｌｉｎ（２００８）に記載される腫瘍標的化ペプチド（ＭＡＲＳＧＬ；配列番号２３４、ＭＡＲＡＫＥ；配列番号２３５、ＭＳＲＴＭＳ；配列番号２３６、ＫＣＣＹＳＬ；配列番号２３７、ＷＲＲ、ＷＫＲ、ＷＶＲ、ＷＶＫ、ＷＩＫ、ＷＴＲ、ＷＶＬ、ＷＬＬ、ＷＲＴ、ＷＲＧ、ＷＶＳ、ＷＶＡ、ＭＹＷＧＤＳＨＷＬＱＹＷＹＥ；配列番号２３８、ＭＱＬＰＬＡＴ；配列番号２３９、ＥＷＬＳ；配列番号２４０、ＳＮＥＷ；配列番号２４１、ＴＮＹＬ；配列番号２４２、ＷＩＦＰＷＩＱＬ；配列番号２４３、ＷＤＬＡＷＭＦＲＬＰＶＧ；配列番号２４４、ＣＴＶＡＬＰＧＧＹＶＲＶＣ；配列番号２４５、ＣＶＰＥＬＧＨＥＣ；配列番号２４６、ＣＧＲＲＡＧＧＳＣ；配列番号２４７、ＣＶＡＹＣＩＥＨＨＣＷＴＣ；配列番号２４８、ＣＶＦＡＨＮＹＤＹＬＶＣ；配列番号２４９、およびＣＶＦＴＳＮＹＡＦＣ；配列番号２５０、ＶＨＳＰＮＫＫ；配列番号２５１、ＣＤＣＲＧＤＣＦＣ；配列番号２５２、ＣＲＧＤＧＷＣ；配列番号２５３、ＸＲＧＣＤＸ；配列番号２５４、ＰＸＸ（Ｓ／Ｔ）；配列番号２５５、ＣＴＴＨＷＧＦＴＬＣ；配列番号２５６、ＳＧＫＧＰＲＱＩＴＡＬ；配列番号２５７、Ａ（Ａ／Ｑ）（Ｎ／Ａ）（Ｌ／Ｙ）（Ｔ／Ｖ／Ｍ／Ｒ）（Ｒ／Ｋ）；配列番号２５８、ＶＹＭＳＰＦ；配列番号２５９、ＭＱＬＰＬＡＴ；配列番号２６０、ＡＴＷＬＰＰＲ；配列番号２６１、ＨＴＭＹＹＨＨＹＱＨＨＬ；配列番号２６２、ＳＥＶＧＣＲＡＧＰＬＱＷＬＣＥＫＹＦＧ；配列番号２６３、ＣＧＬＬＰＶＧＲＰＤＲＮＶＷＲＷＬＣ；配列番号２６４、ＣＫＧＱＣＤＲＦＫＧＬＰＷＥＣ；配列番号２６５、ＳＧＲＳＡ；配列番号２６６、ＷＧＦＰ；配列番号２６７、ＬＷＸＸＡｒ［Ａｒ＝Ｙ、Ｗ、Ｆ、Ｈ）；配列番号２１６、ＸＦＸＸＹＬＷ；配列番号２６８、ＡＥＰＭＰＨＳＬＮＦＳＱＹＬＷＹＴ；配列番号２６９、ＷＡＹ（Ｗ／Ｆ）ＳＰ；配列番号２７０、ＩＥＬＬＱＡＲ；配列番号２７１、ＤＩＴＷＤＱＬＷＤＬＭＫ；配列番号２７２、ＡＹＴＫＣＳＲＱＷＲＴＣＭＴＴＨ；配列番号２７３、ＰＱＮＳＫＩＰＧＰＴＦＬＤＰＨ；配列番号２７４、ＳＭＥＰＡＬＰＤＷＷＷＫＭＦＫ；配列番号２７５、ＡＮＴＰＣＧＰＹＴＨＤＣＰＶＫＲ；配列番号２７６、ＴＡＣＨＱＨＶＲＭＶＲＰ；配列番号２７７、ＶＰＷＭＥＰＡＹＱＲＦＬ；配列番号２７８、ＤＰＲＡＴＰＧＳ；配列番号２７９、ＦＲＰＮＲＡＱＤＹＮＴＮ；配列番号２８０、ＣＴＫＮＳＹＬＭＣ；配列番号２８１、Ｃ（Ｒ／Ｑ）Ｌ／ＲＴ（Ｇ／Ｎ）ＸＸＧ（Ａ／Ｖ��ＧＣ；配列番号２８２、ＣＰＩＥＤＲＰＭＣ；配列番号２８３、ＨＥＷＳＹＬＡＰＹＰＷＦ；配列番号２８４、ＭＣＰＫＨＰＬＧＣ；配列番号２８５、ＲＭＷＰＳＳＴＶＮＬＳＡＧＲＲ；配列番号２８６、ＳＡＫＴＡＶＳＱＲＶＷＬＰＳＨＲＧＧＥＰ；配列番号２８７、ＫＳＲＥＨＶＮＮＳＡＣＰＳＫＲＩＴＡＡＬ；配列番号２８８、ＥＧＦＲ；配列番号２８９、ＲＶＳ、ＡＧＳ、ＡＧＬＧＶＲ；配列番号２９０、ＧＧＲ、ＧＧＬ、ＧＳＶ、ＧＶＳ、ＧＴＲＱＧＨＴＭＲＬＧＶＳＤＧ；配列番号２９１、ＩＡＧＬＡＴＰＧＷＳＨＷＬＡＬ；配列番号２９２、ＳＭＳＩＡＲＬ；配列番号２９３、ＨＴＦＥＰＧＶ；配列番号２９４、ＮＴＳＬＫＲＩＳＮＫＲＩＲＲＫ；配列番号２９５、ＬＲＩＫＲＫＲＲＫＲＫＫＴＲＫ；配列番号２９６、ＧＧＧ、ＧＦＳ、ＬＷＳ、ＥＧＧ、ＬＬＶ、ＬＳＰ、ＬＢＳ、ＡＧＧ、ＧＲＲ、ＧＧＨおよびＧＴＶ）が含まれる。
【０２４９】
なおさらなる実施形態では、標的化配列は、細胞中への進入を標的化する別の分子への化学的カップリングのために使用され得る（例えば、そのＲ基を介して化学的にカップリングされ得るアルギニンおよび／またはリシン残基を含み得る）ペプチドであり得る。
【０２５０】
別の実施形態として、本発明のＡＡＶカプシドタンパク質またはウイルスカプシドは、ＷＯ２００６／０６６０６６に記載される変異を含み得る。例えば、このカプシドタンパク質は、ネイティブＡＡＶ２カプシドタンパク質のアミノ酸位置２６３、７０５、７０８および／または７１６における選択的アミノ酸置換、あるいは別のＡＡＶ血清型由来のカプシドタンパク質中の対応する変化（複数可）を含み得る。
【０２５１】
さらに、またはあるいは、代表的な実施形態では、このカプシドタンパク質、ウイルスカプシドまたはベクターは、ＡＡＶ２カプシドタンパク質のアミノ酸位置２６４の直後の選択的アミノ酸挿入、または他のＡＡＶ由来のカプシドタンパク質における対応する変化を含む。「アミノ酸位置Ｘの直後」とは、示されたアミノ酸位置の直ぐ後に挿入が続くことを意図する（例えば、「アミノ酸位置２６４の後」は、２６５位における点挿入、またはより大きい挿入、例えば、２６５位〜２６８位の挿入を示す、など）。
【０２５２】
さらに、代表的な実施形態では、本発明のカプシドタンパク質、ウイルスカプシドまたはベクターは、ＰＣＴ出願公開番号ＷＯ２０１０／０９３７８４（例えば、２ｉ８）および／またはＰＣＴ出願公開番号ＷＯ２０１４／１４４２２９（例えば、二重グリカン）中に記載されるようなアミノ酸改変を含み得る。
【０２５３】
本発明のいくつかの実施形態では、本発明のカプシドタンパク質、ウイルスカプシドまたはベクターは、本発明のカプシドタンパク質、ウイルスカプシドまたはベクターが起源するＡＡＶ血清型の形質導入効率と比較して、等価または増強された形質導入効率を有し得る。本発明のいくつかの実施形態では、本発明のカプシドタンパク質、ウイルスカプシドまたはベクターは、本発明のカプシドタンパク質、ウイルスカプシドまたはベクターが起源するＡＡＶ血清型の形質導入効率と比較して、低下した形質導入効率を有し得る。本発明のいくつかの実施形態では、本発明のカプシドタンパク質、ウイルスカプシドまたはベクターは、本発明のカプシドタンパク質、ウイルスカプシドまたはベクターが起源するＡＡＶ血清型のトロピズムと比較して、等価または増強されたトロピズムを有し得る。本発明のいくつかの実施形態では、本発明のカプシドタンパク質、ウイルスカプシドまたはベクターは、本発明のカプシドタンパク質、ウイルスカプシドまたはベクターが起源するＡＡＶ血清型のトロピズムと比較して、変更されたまたは異なるトロピズムを有し得る。
【０２５４】
本発明のいくつかの実施形態では、本発明のカプシドタンパク質、ウイルスカプシドまたはベクターは、脳組織に対するトロピズムを有し得る、または脳組織に対するトロピズムを有するように操作され得る。
【０２５５】
本発明の上述の実施形態は、本明細書中に記載されるように細胞または対象に異種核酸を送達するために使用され得る。例えば、改変されたベクターは、本明細書に記載されるように、リソソーム蓄積症、例えば、ムコ多糖症障害（例えば、スライ症候群［β−グルクロニダーゼ］、ハーラー症候群［α−Ｌ−イズロニダーゼ］、シャイエ症候群［α−Ｌ−イズロニダーゼ］、ハーラー・シャイエ症候群［α−Ｌ−イズロニダーゼ］、ハンター症候群［イズロン酸スルファターゼ］、サンフィリポ症候群Ａ［ヘパランスルファミダーゼ（ｈｅｐａｒａｎ  ｓｕｌｆａｍｉｄａｓｅ）］、Ｂ［Ｎ−アセチルグルコサミニダーゼ］、Ｃ［アセチル−ＣｏＡ：α−グルコサミニドアセチルトランスフェラーゼ］、Ｄ［Ｎ−アセチルグルコサミン６−スルファターゼ］、モルキオ症候群Ａ［ガラクトース−６−硫酸スルファターゼ］、Ｂ［β−ガラクトシダーゼ］、マロトー・ラミー症候群［Ｎ−アセチルガラクトサミン−４−スルファターゼ］など）、ファブリー病（α−ガラクトシダーゼ）、ゴーシェ病（グルコセレブロシダーゼ）、または糖原貯蔵障害（例えば、ポンペ病；リソソーム酸α−グルコシダーゼ）を治療するために使用され得る。
【０２５６】
いくつかのＡＡＶカプシドタンパク質について、対応するアミノ酸位置が、ウイルス中に部分的にまたは完全に存在するかどうか、あるいは完全に存在していないかに依存して、対応する改変が挿入および／または置換となることを、当業者は理解するであろう。同様に、ＡＡＶ２以外のＡＡＶを改変する場合、特定のアミノ酸位置（複数可）は、ＡＡＶ２中の位置とは異なる位置であり得る（例えば、表４を参照のこと）。本明細書中の別の箇所で考察するように、対応するアミノ酸位置（複数可）は、周知の技術を使用して当業者に容易に明らかとなろう。
【０２５７】
いくつかの他のＡＡＶにおける対応する位置の非限定的な例は、表４に示される（位置２）。特定の実施形態では、このアミノ酸挿入または置換は、スレオニン、アスパラギン酸、グルタミン酸またはフェニルアラニンである（この位置において、それぞれスレオニン、グルタミン酸またはフェニルアラニンを有するＡＡＶを除く）。
【０２５８】
他の代表的な実施形態では、本発明の改変されたカプシドタンパク質またはウイルスカプシドは、ＷＯ２００７／０８９６３２に記載されるような１つまたは複数の変異をさらに含む（例えば、ＡＡＶ２カプシドタンパク質のアミノ酸位置５３１、または別のＡＡＶ由来のカプシドタンパク質の対応する位置におけるＥ→Ｋ変異）。
【０２５９】
さらなる実施形態では、この改変されたカプシドタンパク質またはカプシドは、ＷＯ２００９／１０８２７４に記載されるような変異を含み得る。
【０２６０】
別の可能性として、このＡＡＶカプシドタンパク質は、Ｚｈｏｎｇら（Ｖｉｒｏｌｏｇｙ  ３８１：１９４〜２０２（２００８）；Ｐｒｏｃ．Ｎａｔ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．１０５：７８２７〜３２（２００８））に記載されるような変異を含み得る。例えば、このＡＡＶカプシドタンパク質は、アミノ酸位置７３０においてＹ→Ｆ変異を含み得る。
【０２６１】
上記改変は、互いに組み合わせて、および／あるいは現在公知のまたは後に発見される任意の他の改変と組み合わせて、本発明のカプシドタンパク質またはカプシド中に取り込まれ得る。
【０２６２】
【表４】
2018528253.tif 000006
【０２６３】
本発明は、本発明の改変されたカプシドタンパク質およびカプシドを含むウイルスベクターもまた包含する。特定の実施形態では、ウイルスベクターは、パルボウイルスベクター（例えば、パルボウイルスカプシドおよび／またはベクターゲノムを含んでいる）、例えば、ＡＡＶベクター（例えば、ＡＡＶカプシドおよび／またはベクターゲノムを含んでいる）である。代表的実施形態では、ウイルスベクターは、本発明の改変されたカプシドサブユニットを含む改変されたＡＡＶカプシドとベクターゲノムとを含む。
【０２６４】
例えば、代表的実施形態では、ウイルスベクターは、（ａ）本発明の改変されたカプシドタンパク質を含む改変されたウイルスカプシド（例えば、改変されたＡＡＶカプシド）と、（ｂ）末端反復配列（例えば、ＡＡＶ−ＴＲ）を含む核酸とを含み、この末端反復配列を含む核酸は、改変されたウイルスカプシドによってカプシド封入されている。核酸は、２つの末端反復（例えば、２つのＡＡＶ−ＴＲ）を任意選択的に含み得る。
【０２６５】
代表的実施形態では、ウイルスベクターは、対象のポリペプチドまたは機能的ＲＮＡをコードする異種核酸を含む組換えウイルスベクターである。組換えウイルスベクターは、以下により詳細に記載される。
【０２６６】
特定の実施形態では、本発明のウイルスベクターは、（ｉ）改変されたカプシドタンパク質を有さないウイルスベクターによる形質導入のレベルと比較して、肝臓の低下した形質導入を有する；（ｉｉ）改変されたカプシドタンパク質を有さないウイルスベクターによって観察されたレベルと比較して、動物対象において、そのウイルスベクターによる増強された全身性形質導入を示す；（ｉｉｉ）改変されたカプシドタンパク質を有さないウイルスベクターによる移動のレベルと比較して、内皮細胞を横切る増強された移動が実証される、ならびに／あるいは改変されたカプシドタンパク質を有さないウイルスベクターによる形質導入のレベルと比較して、（ｉｖ）筋肉組織（例えば、骨格筋、心筋および／または横隔膜筋）の形質導入における選択的増強、および／または（ｖ）脳組織（例えば、ニューロン）の低下した形質導入を示す。特定の実施形態では、このウイルスベクターは、筋肉への全身性形質導入を有する、例えば、身体中の複数の骨格筋群に形質導入し、任意選択的に、心筋および／または横隔膜筋に形質導入する。
【０２６７】
本発明の改変されたカプシドタンパク質、ウイルスカプシドおよびウイルスベクターは、そのネイティブ状態において特定の位置に示されたアミノ酸を有するカプシドタンパク質、カプシドおよびウイルスベクター（即ち、変異体ではない）を排除することが、当業者に理解されるであろう。
【０２６８】
＜ウイルスベクターを生成する方法＞
本発明は、本発明のウイルスベクターを生成する方法をさらに提供する。従って、一実施形態では、本発明は、中和抗体を回避するＡＡＶベクターを産生する方法であって、ａ）ＡＡＶカプシドタンパク質上の３次元抗原性フットプリントを形成する接触アミノ酸残基を同定するステップ；ｂ）（ａ）で同定された接触アミノ酸残基のアミノ酸置換を含むＡＡＶカプシドタンパク質のライブラリーを生成するステップ；ｃ）（ｂ）のＡＡＶカプシドタンパク質のライブラリー由来のカプシドタンパク質を含むＡＡＶ粒子を産生するステップ；ｄ）（ｃ）のＡＡＶ粒子を、感染および複製が起こり得る条件下で細胞と接触させるステップ；ｅ）少なくとも１回の感染サイクルを完了でき、対照ＡＡＶ粒子と同様の力価まで複製できるＡＡＶ粒子を選択するステップ；ｆ）（ｅ）で選択されたＡＡＶ粒子を、感染および複製が起こり得る条件下で、中和抗体および細胞と接触させるステップ；ならびにｇ）（ｆ）の中和抗体によって中和されないＡＡＶ粒子を選択するステップを含む方法を提供する。接触アミノ酸残基を同定するための方法の非限定的な例には、ペプチドエピトープマッピングおよび／またはクライオ電子顕微鏡が含まれる。
【０２６９】
３次元抗原性フットプリント内の抗体接触残基の解明および同定は、さらなる選択および／またはスクリーニングを介して同定され得る抗体回避性ＡＡＶカプシドを生成するための、ランダム、合理的および／または縮重変異誘発を介したそれらの引き続く改変を可能にする。
【０２７０】
従って、さらなる実施形態では、本発明は、中和抗体を回避するＡＡＶベクターを産生する方法であって、ａ）ＡＡＶカプシドタンパク質上の３次元抗原性フットプリントを形成する接触アミノ酸残基を同定するステップ；ｂ）ランダム、合理的および／または縮重変異誘発によって、（ａ）で同定された接触アミノ酸残基のアミノ酸置換を含むＡＡＶカプシドタンパク質を生成するステップ；ｃ）（ｂ）のＡＡＶカプシドタンパク質由来のカプシドタンパク質を含むＡＡＶ粒子を産生するステップ；ｄ）（ｃ）のＡＡＶ粒子を、感染および複製が起こり得る条件下で細胞と接触させるステップ；ｅ）少なくとも１回の感染サイクルを完了でき、対照ＡＡＶ粒子と同様の力価まで複製できるＡＡＶ粒子を選択するステップ；ｆ）（ｅ）で選択されたＡＡＶ粒子を、感染および複製が起こり得る条件下で、中和抗体および細胞と接触させるステップ；ならびにｇ）（ｆ）の中和抗体によって中和されないＡＡＶ粒子を選択するステップを含む方法を提供する。
【０２７１】
接触アミノ酸残基を同定するための方法の非限定的な例には、ペプチドエピトープマッピングおよび／またはクライオ電子顕微鏡が含まれる。ランダム、合理的および／または縮重変異誘発によって、接触アミノ酸残基のアミノ酸置換を含むＡＡＶカプシドタンパク質を生成する方法は、当該分野で公知である。
【０２７２】
この網羅的アプローチは、任意のＡＡＶカプシドを改変するために適用され得るプラットホームテクノロジーを提示する。このプラットホームテクノロジーの適用により、形質導入効率の喪失なしに、元のＡＡＶカプシド鋳型に由来するＡＡＶ抗原性バリアントが得られる。１つの利点および利益として、このテクノロジーの適用は、ＡＡＶベクターを用いた遺伝子療法に適格な患者のコホートを拡張する。
【０２７３】
１つの実施形態では、本発明は、ウイルスベクターを生成する方法を提供し、この方法は、（ａ）少なくとも１つのＴＲ配列（例えば、ＡＡＶ−ＴＲ配列）を含む核酸鋳型と、（ｂ）核酸鋳型の複製およびＡＡＶカプシド中へのカプシド封入に充分なＡＡＶ配列（例えば、本発明のＡＡＶカプシドをコードするＡＡＶのｒｅｐ配列およびＡＡＶのｃａｐ配列）とを、細胞に提供するステップを含む。任意選択的に、核酸鋳型は、少なくとも１つの異種核酸配列をさらに含む。特定の実施形態では、核酸鋳型は２つのＡＡＶ  ＩＴＲ配列を含み、これらは、（存在する場合）異種核酸配列に対して５’側および３’側に位置するが、異種核酸配列と直接隣接している必要はない。
【０２７４】
核酸鋳型ならびにＡＡＶのｒｅｐおよびｃａｐ配列は、ＡＡＶカプシド内にパッケージングされた核酸鋳型を含むウイルスベクターが細胞中で生成されるような条件下で提供される。この方法は、細胞からウイルスベクターを回収するステップをさらに含み得る。ウイルスベクターは、培地からおよび／または細胞を溶解することによって回収され得る。
【０２７５】
細胞は、ＡＡＶウイルスの複製を許容する細胞であり得る。当該分野で公知の任意の適切な細胞が使用され得る。特定の実施形態では、細胞は哺乳動物細胞である。別の選択肢として、細胞は、複製欠損ヘルパーウイルスから欠失した機能を提供するトランス補完性（ｔｒａｎｓ−ｃｏｍｐｌｅｍｅｎｔｉｎｇ）パッケージング細胞株、例えば、２９３細胞または他のＥ１ａトランス補完性細胞であり得る。
【０２７６】
ＡＡＶ複製およびカプシド配列は、当該分野で公知の任意の方法によって提供され得る。現在のプロトコールは典型的に、単一のプラスミド上のＡＡＶのｒｅｐ／ｃａｐ遺伝子を発現する。ＡＡＶ複製およびパッケージング配列は、一緒に提供される必要はないが、一緒に提供するのが簡便であり得る。ＡＡＶのｒｅｐおよび／またはｃａｐ配列は、任意のウイルスベクターまたは非ウイルスベクターによって提供され得る。例えば、ｒｅｐ／ｃａｐ配列は、ハイブリッドアデノウイルスまたはヘルペスウイルスベクターによって提供され得る（例えば、欠失型アデノウイルスベクターのＥ１ａ領域またはＥ３領域中に挿入される）。ＥＢＶベクターもまた、ＡＡＶのｃａｐおよびｒｅｐ遺伝子を発現するために使用され得る。この方法の１つの利点は、ＥＢＶベクターがエピソームであるが、連続的な細胞分裂の間中、高コピー数をなおも維持することである（即ち、「ＥＢＶベースの核エピソーム（ＥＢＶ  ｂａｓｅｄ  ｎｕｃｌｅａｒ  ｅｐｉｓｏｍｅ）」と称される染色体外エレメントとして細胞中に安定に組み込まれる、Ｍａｒｇｏｌｓｋｉ（１９９２）Ｃｕｒｒ．Ｔｏｐ．Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌ．Ｉｍｍｕｎ．１５８：６７頁を参照のこと）。
【０２７７】
さらなる代替として、ｒｅｐ／ｃａｐ配列は、細胞中に安定に取り込まれ得る。
【０２７８】
典型的には、ＡＡＶのｒｅｐ／ｃａｐ配列は、これらの配列のレスキューおよび／またはパッケージングを防止するために、ＴＲと隣接していない。
【０２７９】
核酸鋳型は、当該分野で公知の任意の方法を使用して細胞に提供され得る。例えば、鋳型は、非ウイルスベクター（例えば、プラスミド）またはウイルスベクターによって供給され得る。特定の実施形態では、核酸鋳型は、ヘルペスウイルスベクターまたはアデノウイルスベクターによって供給される（例えば、欠失型アデノウイルスのＥ１ａ領域またはＥ３領域中に挿入される）。別の説明として、Ｐａｌｏｍｂｏら、（１９９８）Ｊ．Ｖｉｒｏｌｏｇｙ  ７２：５０２５頁は、ＡＡＶ−ＴＲが隣接するレポーター遺伝子を保有するバキュロウイルスベクターを記載している。ＥＢＶベクターもまた、ｒｅｐ／ｃａｐ遺伝子に関して上記したように、鋳型を送達するために使用され得る。
【０２８０】
別の代表的実施形態では、核酸鋳型は、複製するｒＡＡＶウイルスによって提供される。なお他の実施形態では、核酸鋳型を含むＡＡＶプロウイルスは、細胞の染色体中に安定に組み込まれる。
【０２８１】
ウイルス力価を増強するために、増殖性ＡＡＶ感染を促進するヘルパーウイルス機能（例えば、アデノウイルスまたはヘルペスウイルス）が、細胞に提供され得る。ＡＡＶ複製に必要なヘルパーウイルス配列は、当該分野で公知である。典型的には、これらの配列は、ヘルパーアデノウイルスベクターまたはヘルペスウイルスベクターによって提供される。あるいは、アデノウイルス配列またはヘルペスウイルス配列は、例えば、Ｆｅｒｒａｒｉら（１９９７）Ｎａｔｕｒｅ  Ｍｅｄ．３：１２９５頁、ならびに米国特許第６，０４０，１８３号および同第６，０９３，５７０号によって記載されるような、効率的なＡＡＶ生成を促進するヘルパー遺伝子の全てを保有する非感染性アデノウイルスミニプラスミドとして、別の非ウイルスベクターまたはウイルスベクターによって提供され得る。
【０２８２】
さらに、ヘルパーウイルス機能は、染色体中に埋め込まれたまたは安定な染色体外エレメントとして維持されるヘルパー配列を有するパッケージング細胞によって提供され得る。一般に、ヘルパーウイルス配列は、ＡＡＶビリオン中にパッケージングすることはできない、例えば、ヘルパーウイルス配列にＴＲは隣接していない。
【０２８３】
単一のヘルパー構築物上のＡＡＶ複製およびカプシド配列ならびにヘルパーウイルス配列（例えば、アデノウイルス配列）を提供することが有利であり得ることを、当業者は理解するであろう。このヘルパー構築物は、非ウイルス構築物でもウイルス構築物でもよい。１つの非限定的説明として、ヘルパー構築物は、ＡＡＶのｒｅｐ／ｃａｐ遺伝子を含むハイブリッドアデノウイルスまたはハイブリッドヘルペスウイルスであり得る。
【０２８４】
１つの特定の実施形態では、ＡＡＶのｒｅｐ／ｃａｐ配列およびアデノウイルスヘルパー配列は、単一のアデノウイルスヘルパーベクターによって供給される。このベクターは、核酸鋳型をさらに含み得る。ＡＡＶのｒｅｐ／ｃａｐ配列および／またはｒＡＡＶ鋳型は、アデノウイルスの欠失した領域（例えば、Ｅ１ａ領域またはＥ３領域）中に挿入され得る。
【０２８５】
さらなる実施形態では、ＡＡＶのｒｅｐ／ｃａｐ配列およびアデノウイルスヘルパー配列は、単一のアデノウイルスヘルパーベクターによって供給される。この実施形態によれば、ｒＡＡＶ鋳型は、プラスミド鋳型として提供され得る。
【０２８６】
別の例示的実施形態では、ＡＡＶのｒｅｐ／ｃａｐ配列およびアデノウイルスヘルパー配列は、単一のアデノウイルスヘルパーベクターによって提供され、ｒＡＡＶ鋳型は、プロウイルスとして細胞中に取り込まれる。あるいは、ｒＡＡＶ鋳型は、染色体外エレメント（例えば、ＥＢＶベースの核エピソーム）として細胞内で維持されるＥＢＶベクターによって提供される。
【０２８７】
さらなる例示的な実施形態では、ＡＡＶのｒｅｐ／ｃａｐ配列およびアデノウイルスヘルパー配列は、単一のアデノウイルスヘルパーによって提供される。ｒＡＡＶ鋳型は、別個の複製するウイルスベクターとして提供され得る。例えば、ｒＡＡＶ鋳型は、ｒＡＡＶ粒子または第２の組換えアデノウイルス粒子によって提供され得る。
【０２８８】
上述の方法によれば、ハイブリッドアデノウイルスベクターは典型的に、アデノウイルスの複製およびパッケージングに充分なアデノウイルスの５’および３’のシス配列（即ち、アデノウイルス末端反復およびＰＡＣ配列）を含む。ＡＡＶのｒｅｐ／ｃａｐ配列および存在する場合にはｒＡＡＶ鋳型は、アデノウイルス骨格中に埋め込まれ、５’および３’のシス配列がそれに隣接しており、その結果これらの配列は、アデノウイルスカプシド中にパッケージングされ得る。上記のように、アデノウイルスヘルパー配列およびＡＡＶのｒｅｐ／ｃａｐ配列には一般に、これらの配列がＡＡＶビリオン中にパッケージングされないように、ＴＲが隣接していない。
【０２８９】
Ｚｈａｎｇら、（（２００１）Ｇｅｎｅ  Ｔｈｅｒ．１８：７０４〜１２頁）は、アデノウイルスならびにＡＡＶのｒｅｐおよびｃａｐ遺伝子の両方を含むキメラヘルパーを記載している。
【０２９０】
ヘルペスウイルスもまた、ＡＡＶパッケージング法においてヘルパーウイルスとして使用され得る。ＡＡＶのｒｅｐタンパク質（複数可）をコードするハイブリッドヘルペスウイルスは、拡大縮小可能なＡＡＶベクター生成スキームを有利に促進し得る。ＡＡＶ−２  ｒｅｐおよびｃａｐ遺伝子を発現するハイブリッド単純ヘルペスウイルスＩ型（ＨＳＶ−１）ベクターが、Ｃｏｎｗａｙら、（１９９９）Ｇｅｎｅ  Ｔｈｅｒａｐｙ  ６：９８６頁およびＷＯ  ００／１７３７７号に記載されている。
【０２９１】
さらなる代替として、本発明のウイルスベクターは、例えばＵｒａｂｅら、（２００２）Ｈｕｍａｎ  Ｇｅｎｅ  Ｔｈｅｒａｐｙ  １３：１９３５〜４３頁によって記載されるように、ｒｅｐ／ｃａｐ遺伝子およびｒＡＡＶ鋳型を送達するためのバキュロウイルスベクターを使用して昆虫細胞中で生成され得る。
【０２９２】
混入するヘルパーウイルスを含まないＡＡＶベクターストックは、当該分野で公知の任意の方法によって得られ得る。例えば、ＡＡＶおよびヘルパーウイルスは、サイズに基づいて容易に識別され得る。ＡＡＶはまた、ヘパリン基質に対する親和性に基づいて、ヘルパーウイルスから分離され得る（Ｚｏｌｏｔｕｋｈｉｎら（１９９９）Ｇｅｎｅ  Ｔｈｅｒａｐｙ  ６：９７３頁）。任意の混入するヘルパーウイルスが複製コンピテントにならないように、欠失型複製欠損ヘルパーウイルスが使用され得る。アデノウイルス初期遺伝子発現のみがＡＡＶウイルスのパッケージングを媒介するために必要なので、さらなる代替として、後期遺伝子発現を欠くアデノウイルスヘルパーが使用され得る。後期遺伝子発現が欠損したアデノウイルス変異体は当該分野で公知である（例えば、ｔｓ１００Ｋおよびｔｓ１４９アデノウイルス変異体）。
【０２９３】
＜組換えウイルスベクター＞
本発明のウイルスベクターは、インビトロ、エクスビボおよびインビボで細胞に核酸を送達するために有用である。特に、ウイルスベクターは、哺乳動物を含む動物、細胞に核酸を送達または移入するために有利に使用され得る。
【０２９４】
対象の任意の異種核酸配列（複数可）は、本発明のウイルスベクター中で送達され得る。対象の核酸には、治療的（例えば、医療用途または獣医学用途のため）もしくは免疫原性（例えば、ワクチンのため）ポリペプチドを含むポリペプチドおよび／または機能的もしくは治療的ＲＮＡ分子をコードする核酸が含まれる。
【０２９５】
治療的ポリペプチドには嚢胞性線維症膜貫通制御タンパク質（ｃｙｓｔｉｃ  ｆｉｂｒｏｓｉｓ  ｔｒａｎｓｍｅｍｂｒａｎｅ  ｒｅｇｕｌａｔｏｒ  ｐｒｏｔｅｉｎ（ＣＦＴＲ））、ジストロフィン（ミニジストロフィンおよびマイクロジストロフィン）が含まれる、例えば、Ｖｉｎｃｅｎｔら、（１９９３）Ｎａｔｕｒｅ  Ｇｅｎｅｔｉｃｓ  ５：１３０頁；米国特許公開公報２００３０１７１３１号；国際公開公報ＷＯ／２００８／０８８８９５号、Ｗａｎｇら、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ  ９７：１３７１４〜１３７１９頁（２０００）；およびＧｒｅｇｏｒｅｖｉｃら、Ｍｏｌ．Ｔｈｅｒ．１６：６５７〜６４頁（２００８）を参照のこと）、ミオスタチンプロペプチド、フォリスタチン、アクチビンＩＩ型可溶性受容体、ＩＧＦ−１、抗炎症性ポリペプチド、例えば、ＩκＢ優性変異体、サルコスパン、ユートロフィン（Ｔｉｎｓｌｅｙら、（１９９６）Ｎａｔｕｒｅ  ３８４：３４９頁）、ミニユートロフィン、凝固因子（例えば、第ＶＩＩＩ因子、第ＩＸ因子、第Ｘ因子など）、エリスロポエチン、アンジオスタチン、エンドスタチン、カタラーゼ、チロシンヒドロキシラーゼ、スーパーオキシドジスムターゼ、レプチン、ＬＤＬ受容体、リポタンパク質リパーゼ、オルニチントランスカルバミラーゼ、β−グロビン、α−グロビン、スペクトリン、α１−アンチトリプシン、アデノシンデアミナーゼ、ヒポキサンチングアニンホスホリボシルトランスフェラーゼ、β−グルコセレブロシダーゼ、スフィンゴミエリナーゼ、リソソームヘキソサミニダーゼＡ、分岐鎖ケト酸脱水素酵素、ＲＰ６５タンパク質、サイトカイン（例えば、α−インターフェロン、β−インターフェロン、インターフェロン−γ、インターロイキン−２、インターロイキン−４、顆粒球マクロファージコロニー刺激因子、リンホトキシンなど）、ペプチド増殖因子、神経栄養因子およびホルモン（例えば、ソマトトロピン、インスリン、インスリン様増殖因子１および２、血小板由来増殖因子、上皮増殖因子、線維芽細胞増殖因子、神経増殖因子、神経栄養因子−３および−４、脳由来神経栄養因子、骨形態形成（ｂｏｎｅ  ｍｏｒｐｈｏｇｅｎｉｃ）タンパク質［ＲＡＮＫＬおよびＶＥＧＦが含まれる］、グリア由来増殖因子、形質転換増殖因子−αおよび−βなど）、リソソーム酸α−グルコシダーゼ、α−ガラクトシダーゼＡ、受容体（例えば、腫瘍壊死増殖因子α可溶性受容体）、Ｓ１００Ａ１、パルブアルブミン、アデニリルシクラーゼ６型、カルシウムハンドリングをモジュレートする分子（例えば、ＳＥＲＣＡ２Ａ、ＰＰ１のインヒビター１およびそれらの断片［例えば、ＷＯ  ２００６／０２９３１９号およびＷＯ  ２００７／１００４６５号］）、短縮型の構成的に活性なｂＡＲＫｃｔなどのＧタンパク質共役型受容体キナーゼ２型ノックダウンをもたらす分子、ＩＲＡＰなどの抗炎症性因子、抗ミオスタチンタンパク質、アスパルトアシラーゼ、モノクローナル抗体（単鎖モノクローナル抗体が含まれる；例示的なＭａｂは、Ｈｅｒｃｅｐｔｉｎ（登録商標）Ｍａｂである）、ニューロペプチドおよびその断片（例えば、ガラニン、ニューロペプチドＹ（米国特許第７，０７１，１７２号を参照のこと）、バソヒビンなどの血管新生インヒビターならびに他のＶＥＧＦインヒビター（例えば、バソヒビン２［ＷＯ  ＪＰ２００６／０７３０５２号を参照のこと］）が含まれるがこれらに限定されない。他の例示的な異種核酸配列は、自殺遺伝子産物（例えば、チミジンキナーゼ、シトシンデアミナーゼ、ジフテリア毒素、および腫瘍壊死因子）、がん療法において使用される薬物に対する耐性を付与するタンパク質、腫瘍抑制遺伝子産物（例えば、ｐ５３、Ｒｂ、Ｗｔ−１）、ＴＲＡＩＬ、ＦＡＳ−リガンド、およびそれを必要とする対象において治療効果を有する任意の他のポリペプチドをコードする。ＡＡＶベクターは、モノクローナル抗体および抗体断片、例えば、ミオスタチンに対する抗体または抗体断片を送達するためにも使用され得る（例えば、Ｆａｎｇら、Ｎａｔｕｒｅ  Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ  ２３：５８４〜５９０頁（２００５）を参照のこと）。
【０２９６】
ポリペプチドをコードする異種核酸配列には、レポーターポリペプチド（例えば酵素）をコードする異種核酸配列が含まれる。レポーターポリペプチドは当該分野で公知であり、緑色蛍光タンパク質、β−ガラクトシダーゼ、アルカリホスファターゼ、ルシフェラーゼおよびクロラムフェニコールアセチルトランスフェラーゼ遺伝子が含まれるがこれらに限定されない。
【０２９７】
任意選択的に、異種核酸は、分泌型ポリペプチド（例えば、そのネイティブ状態で分泌型ポリペプチドであるポリペプチド、または例えば当該分野で公知の分泌シグナル配列との作動可能な関連によって分泌されるように操作されたポリペプチド）をコードする。
【０２９８】
あるいは、本発明の特定の実施形態では、異種核酸は、アンチセンス核酸、リボザイム（例えば、米国特許第５，８７７，０２２号に記載される）、スプライソソーム媒介性のトランススプライシングをもたらすＲＮＡ（Ｐｕｔｔａｒａｊｕら、（１９９９）Ｎａｔｕｒｅ  Ｂｉｏｔｅｃｈ．１７：２４頁６；米国特許第６，０１３，４８７号；米国特許第６，０８３，７０２号を参照のこと）、遺伝子サイレンシングを媒介するｓｉＲＮＡ、ｓｈＲＮＡまたはｍｉＲＮＡを含む干渉ＲＮＡ（ＲＮＡｉ）（Ｓｈａｒｐら、（２０００）Ｓｃｉｅｎｃｅ  ２８７：２４３１頁を参照のこと）および「ガイド」ＲＮＡなどの他の非翻訳ＲＮＡ（Ｇｏｒｍａｎら、（１９９８）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ  ９５：４９２９頁；Ｙｕａｎらに対する米国特許第５，８６９，２４８号）などをコードし得る。例示的な非翻訳ＲＮＡには、多剤耐性（ＭＤＲ）遺伝子産物に対するＲＮＡｉ（例えば、腫瘍を治療および／もしくは予防するため、ならびに／または化学療法による損傷を予防するために心臓に投与するため）、ミオスタチンに対するＲＮＡｉ（例えば、デュシェンヌ型筋ジストロフィーのため）、ＶＥＧＦに対するＲＮＡｉ（例えば、腫瘍を治療および／または予防するため）、ホスホランバンに対するＲＮＡｉ（例えば、心血管疾患を治療するため、例えば、Ａｎｄｉｎｏら、Ｊ．Ｇｅｎｅ  Ｍｅｄ．１０：１３２〜１４２頁（２００８）およびＬｉら、Ａｃｔａ  Ｐｈａｒｍａｃｏｌ  Ｓｉｎ．２６：５１〜５５頁（２００５）を参照のこと）；ホスホランバンＳ１６Ｅなどのホスホランバン阻害分子またはドミナントネガティブ分子（例えば、心血管疾患を治療するため、例えば、Ｈｏｓｈｉｊｉｍａら  Ｎａｔ．Ｍｅｄ．８：８６４〜８７１頁（２００２）を参照のこと）、アデノシンキナーゼに対するＲＮＡｉ（例えば、癲癇のため）、ならびに病原性生物およびウイルス（例えば、Ｂ型および／またはＣ型肝炎ウイルス、ヒト免疫不全ウイルス、ＣＭＶ、単純ヘルペスウイルス、ヒトパピローマウイルスなど）に対するＲＮＡｉが含まれる。
【０２９９】
さらに、選択的スプライシングを指示する核酸配列が送達され得る。説明するために、ストロフィンエクソン５１の５’および／または３’スプライス部位に相補的なアンチセンス配列（または他の阻害配列）が、このエクソンの読み飛ばしを誘導するためにＵ１またはＵ７低分子核内（ｓｎ）ＲＮＡプロモーターと合わせて送達され得る。例えば、アンチセンス／阻害配列（複数可）に対して５’側に位置するＵ１またはＵ７  ｓｎＲＮＡプロモーターを含むＤＮＡ配列は、本発明の改変されたカプシド中にパッケージングされて送達され得る。
【０３００】
ウイルスベクターは、宿主染色体上の遺伝子座と相同性を共有し、宿主染色体上の遺伝子座と組み換わる異種核酸もまた含み得る。このアプローチは、例えば、宿主細胞中の遺伝的欠陥を修正するために利用され得る。
【０３０１】
本発明は、例えばワクチン接種のための免疫原性ポリペプチドを発現するウイルスベクターもまた提供する。核酸は、ヒト免疫不全ウイルス（ＨＩＶ）、サル免疫不全ウイルス（ＳＩＶ）、インフルエンザウイルス、ＨＩＶまたはＳＩＶのｇａｇタンパク質、腫瘍抗原、がん抗原、細菌抗原、ウイルス抗原など由来の免疫原が含まれるがこれらに限定されない、当該分野で公知の対象の任意の免疫原をコードし得る。
【０３０２】
ワクチンベクターとしてのパルボウイルスの使用は当該分野で公知である（例えば、Ｍｉｙａｍｕｒａら、（１９９４）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ  ＵＳＡ  ９１：８５０７頁；Ｙｏｕｎｇら、に対する米国特許第５，９１６，５６３号、Ｍａｚｚａｒａら、に対する米国特許第５，９０５，０４０号、米国特許第５，８８２，６５２号、Ｓａｍｕｌｓｋｉらに対する米国特許第５，８６３，５４１号を参照のこと）。抗原は、パルボウイルスカプシド中に存在し得る。あるいは、抗原は、組換えベクターゲノム中に導入された異種核酸から発現され得る。本明細書中に記載されるおよび／または当該分野で公知の対象の任意の免疫原は、本発明のウイルスベクターによって提供され得る。
【０３０３】
免疫原性ポリペプチドは、免疫応答を惹起するのに適した、ならびに／または微生物、細菌、原生動物、寄生生物、真菌および／もしくはウイルスの感染および疾患が含まれるがこれらに限定されない感染および／もしくは疾患に対して対象を保護するのに適した任意のポリペプチドであり得る。例えば、免疫原性ポリペプチドは、オルソミクソウイルス免疫原（例えば、インフルエンザウイルスヘマグルチニン（ＨＡ）表面タンパク質もしくはインフルエンザウイルス核タンパク質、またはウマインフルエンザウイルス免疫原などの、インフルエンザウイルス免疫原）もしくはレンチウイルス免疫原（例えば、ＨＩＶもしくはＳＩＶのエンベロープＧＰ１６０タンパク質、ＨＩＶもしくはＳＩＶのマトリックス／カプシドタンパク質ならびにＨＩＶもしくはＳＩＶのｇａｇ、ｐｏｌおよびｅｎｖ遺伝子産物などの、ウマ感染性貧血ウイルス免疫原、サル免疫不全ウイルス（ＳＩＶ）免疫原またはヒト免疫不全ウイルス（ＨＩＶ）免疫原）であり得る。免疫原性ポリペプチドは、アレナウイルス免疫原（例えば、ラッサ熱ウイルス核カプシドタンパク質およびラッサ熱エンベロープ糖タンパク質などのラッサ熱ウイルス免疫原）、ポックスウイルス免疫原（例えば、ワクシニアＬ１またはＬ８遺伝子産物などのワクシニアウイルス免疫原）、フラビウイルス免疫原（例えば、黄熱病ウイルス免疫原または日本脳炎ウイルス免疫原）、フィロウイルス免疫原（例えば、ＮＰおよびＧＰ遺伝子産物などの、エボラウイルス免疫原またはマールブルグウイルス免疫原）、ブニヤウイルス免疫原（例えば、ＲＶＦＶ、ＣＣＨＦおよび／またはＳＦＳウイルス免疫原）、またはコロナウイルス免疫原（例えば、ヒトコロナウイルスエンベロープ糖タンパク質などの感染性ヒトコロナウイルス免疫原、またはブタ伝染性胃腸炎ウイルス免疫原またはトリ感染性気管支炎ウイルス免疫原）でもあり得る。免疫原性ポリペプチドはさらに、ポリオ免疫原、ヘルペス免疫原（例えば、ＣＭＶ、ＥＢＶ、ＨＳＶ免疫原）ムンプス免疫原、麻疹免疫原、風疹免疫原、ジフテリア毒素もしくは他のジフテリア免疫原、百日咳抗原、肝炎（例えば、Ａ型肝炎、Ｂ型肝炎、Ｃ型肝炎など）免疫原、および／または当該分野で現在公知のまたは免疫原として後に同定される任意の他のワクチン免疫原であり得る。
【０３０４】
あるいは、免疫原性ポリペプチドは、任意の腫瘍細胞またはがん細胞の抗原であり得る。任意選択的に、腫瘍抗原またはがん抗原は、がん細胞の表面上に発現される。例示的ながんおよび腫瘍細胞の抗原は、Ｓ．Ａ．Ｒｏｓｅｎｂｅｒｇ（Ｉｍｍｕｎｉｔｙ  １０：２８１頁（１９９１））に記載されている。他の例示的ながん抗原および腫瘍抗原には、ＢＲＣＡ１遺伝子産物、ＢＲＣＡ２遺伝子産物、ｇｐ１００、チロシナーゼ、ＧＡＧＥ−１／２、ＢＡＧＥ、ＲＡＧＥ、ＬＡＧＥ、ＮＹ−ＥＳＯ−１、ＣＤＫ−４、β−カテニン、ＭＵＭ−１、カスパーゼ−８、ＫＩＡＡ０２０５、ＨＰＶＥ、ＳＡＲＴ−１、ＰＲＡＭＥ、ｐ１５、メラノーマ腫瘍抗原（Ｋａｗａｋａｍｉら、（１９９４）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ  ９１：３５１５頁；Ｋａｗａｋａｍｉら、（１９９４）Ｊ．Ｅｘｐ．Ｍｅｄ．１８０：３４７頁；Ｋａｗａｋａｍｉら、（１９９４）Ｃａｎｃｅｒ  Ｒｅｓ．５４：３１２４頁）、ＭＡＲＴ−１、ｇｐ１００  ＭＡＧＥ−１、ＭＡＧＥ−２、ＭＡＧＥ−３、ＣＥＡ、ＴＲＰ−１、ＴＲＰ−２、Ｐ−１５、チロシナーゼ（Ｂｒｉｃｈａｒｄら、（１９９３）Ｊ．Ｅｘｐ．Ｍｅｄ．１７８：４８９頁）；ＨＥＲ−２／ｎｅｕ遺伝子産物（米国特許第４，９６８，６０３号）、ＣＡ１２５、ＬＫ２６、ＦＢ５（エンドシアリン）、ＴＡＧ７２、ＡＦＰ、ＣＡ１９−９、ＮＳＥ、ＤＵ−ＰＡＮ−２、ＣＡ５０、ＳＰａｎ−１、ＣＡ７２−４、ＨＣＧ、ＳＴＮ（シアリルＴｎ抗原）、ｃ−ｅｒｂＢ−２タンパク質、ＰＳＡ、Ｌ−ＣａｎＡｇ、エストロゲン受容体、乳脂肪グロブリン、ｐ５３腫瘍抑制因子タンパク質（Ｌｅｖｉｎｅ、（１９９３）Ａｎｎ．Ｒｅｖ．Ｂｉｏｃｈｅｍ．６２：６２３頁）；ムチン抗原（国際特許公開公報ＷＯ  ９０／０５１４２号）；テロメラーゼ；核マトリックスタンパク質；前立腺酸性ホスファターゼ；パピローマウイルス抗原；および／あるいは現在公知のまたは以下のがんに関連することが後に発見される抗原：メラノーマ、腺癌腫、胸腺腫、リンパ腫（例えば、非ホジキンリンパ腫、ホジキンリンパ腫）、肉腫、肺がん、肝臓がん、結腸がん、白血病、子宮がん、乳がん、前立腺がん、卵巣がん、子宮頚がん、膀胱がん、腎臓がん、膵臓がん、脳がん、および現在公知のまたは後に同定される任意の他のがんまたは悪性状態（例えば、Ｒｏｓｅｎｂｅｒｇ、（１９９６）Ａｎｎ．Ｒｅｖ．Ｍｅｄ．４７：４８１〜９１頁を参照のこと）が含まれるがこれらに限定されない。
【０３０５】
さらなる代替として、異種核酸は、インビトロ、エクスビボまたはインビボで細胞中において生成されることが望ましい任意のポリペプチドをコードし得る。例えば、ウイルスベクターは、培養細胞中に導入され得、発現された遺伝子産物がそこから単離される。
【０３０６】
対象の異種核酸（複数可）が適切な制御配列と作動可能に関連し得ることが、当業者に理解されよう。例えば、異種核酸は、発現制御エレメント、例えば転写／翻訳制御シグナル、複製起点、ポリアデニル化シグナル、配列内リボソーム進入部位（ＩＲＥＳ）、プロモーターおよび／またはエンハンサーなどと、作動可能に関連し得る。
【０３０７】
さらに、対象の異種核酸（複数可）の調節された発現は、転写後レベルで、例えば、オリゴヌクレオチド、小分子および／または特定の部位におけるスプライシング活性を選択的に遮断する他の化合物（例えば、ＷＯ  ２００６／１１９１３７号に記載される）の存在または非存在によって、異なるイントロンの選択的スプライシングを調節することによって、達成され得る。
【０３０８】
種々のプロモーター／エンハンサーエレメントが、所望されるレベルおよび組織特異的発現に依存して使用され得ることを、当業者は理解するであろう。プロモーター／エンハンサーは、所望の発現パターンに依存して、構成的または誘導性であり得る。プロモーター／エンハンサーは、ネイティブまたは外来であり得、天然配列または合成配列であり得る。外来とは、転写開始領域が、その転写開始領域が導入される野生型宿主において見出されないものであることを意図する。
【０３０９】
特定の実施形態では、プロモーター／エンハンサーエレメントは、標的細胞または治療される対象にとってネイティブであり得る。代表的実施形態では、プロモーター／エンハンサーエレメントは、異種核酸配列にとってネイティブであり得る。プロモーター／エンハンサーエレメントは一般に、対象の標的細胞（複数可）において機能するように選択される。さらに、特定の実施形態では、プロモーター／エンハンサーエレメントは、哺乳動物のプロモーター／エンハンサーエレメントである。プロモーター／エンハンサーエレメントは、構成的でも誘導性でもよい。
【０３１０】
誘導性発現制御エレメントは典型的に、異種核酸配列（複数可）の発現の調節を提供することが望ましい適用において有利である。遺伝子送達のための誘導性プロモーター／エンハンサーエレメントは、組織特異的プロモーター／エンハンサーエレメントまたは好ましいプロモーター／エンハンサーエレメントであり得、筋特異的または好ましい（心筋、骨格筋および／または平滑筋特異的または好ましいものが含まれる）、神経組織特異的または好ましい（脳特異的または好ましいものが含まれる）、眼特異的または好ましい（網膜特異的および角膜特異的なものが含まれる）、肝臓特異的または好ましい、骨髄特異的または好ましい、膵臓特異的または好ましい、脾臓特異的または好ましい、および肺特異的または好ましいプロモーター／エンハンサーエレメントが含まれる。他の誘導性プロモーター／エンハンサーエレメントには、ホルモン誘導性エレメントおよび金属誘導性エレメントが含まれる。例示的な誘導性プロモーター／エンハンサーエレメントには、Ｔｅｔオン／オフエレメント、ＲＵ４８６誘導性プロモーター、エクジソン誘導性プロモーター、ラパマイシン誘導性プロモーターおよびメタロチオネインプロモーターが含まれるが、これらに限定されない。
【０３１１】
異種核酸配列（複数可）が標的細胞において転写され、次いで翻訳される実施形態では、特異的開始シグナルが一般に、挿入されたタンパク質コード配列の効率的な翻訳のために含まれる。ＡＴＧ開始コドンおよび隣接配列を含み得るこれらの外因性翻訳制御配列は、天然および合成の両方の、種々の起源のものであり得る。
【０３１２】
本発明に従うウイルスベクターは、分裂細胞および非分裂細胞を含む広範な細胞中に異種核酸を送達する手段を提供する。ウイルスベクターは、例えば、インビトロでポリペプチドを生成するために、またはエクスビボの遺伝子療法のために、対象の核酸をインビトロで細胞に送達するために使用され得る。ウイルスベクターは、例えば、免疫原性もしくは治療的ポリペプチドまたは機能的ＲＮＡを発現するために、それを必要とする対象に核酸を送達する方法において、さらに有用である。この様式で、ポリペプチドまたは機能的ＲＮＡは、対象中においてインビボで生成され得る。対象は、ポリペプチドの欠乏症を有するので、そのポリペプチドを必要とし得る。さらに、対象におけるポリペプチドまたは機能的ＲＮＡの生成は、いくらかの有益な効果を付与し得るので、この方法が実施され得る。
【０３１３】
ウイルスベクターは、（例えば、スクリーニング方法と合わせて、例えばポリペプチドを生成するためまたは対象に対する機能的ＲＮＡの影響を観察するためのバイオリアクタとして対象を使用して）培養細胞または対象において対象のポリペプチドまたは機能的ＲＮＡを生成するためにも使用され得る。
【０３１４】
一般に、本発明のウイルスベクターは、治療的ポリペプチドまたは機能的ＲＮＡを送達することが有利な任意の疾患状態を治療および／または予防するために、ポリペプチドまたは機能的ＲＮＡをコードする異種核酸を送達するために使用され得る。例示的な疾患状態には、嚢胞性線維症（嚢胞性線維症膜貫通制御タンパク質）および他の肺の疾患、血友病Ａ（第ＶＩＩＩ因子）、血友病Ｂ（第ＩＸ因子）、サラセミア（β−グロビン）、貧血（エリスロポエチン）および他の血液障害、アルツハイマー病（ＧＤＦ；ネプリライシン）、多発性硬化症（β−インターフェロン）、パーキンソン病（グリア細胞株由来神経栄養因子［ＧＤＮＦ］）、ハンチントン病（反復を除去するためのＲＮＡｉ）、筋萎縮性側索硬化症、癲癇（ガラニン、神経栄養因子）および他の神経学的障害、がん（エンドスタチン、アンジオスタチン、ＴＲＡＩＬ、ＦＡＳ−リガンド、インターフェロンを含むサイトカイン；ＶＥＧＦまたは多剤耐性遺伝子産物に対するＲＮＡｉを含むＲＮＡｉ、ｍｉｒ−２６ａ［例えば、肝細胞癌腫のため］）、真正糖尿病（インスリン）、デュシェンヌ型（ジストロフィン、ミニジストロフィン、インスリン様増殖因子Ｉ、サルコグリカン［例えば、α、β、γ］、ミオスタチンに対するＲＮＡｉ、ミオスタチンプロペプチド、フォリスタチン、アクチビンＩＩ型可溶性受容体、抗炎症性ポリペプチド、例えば、ＩκＢ優性変異体、サルコスパン、ユートロフィン、ミニユートロフィン、エクソン読み飛ばしを誘導するためのジストロフィン遺伝子中のスプライスジャンクションに対するアンチセンスまたはＲＮＡｉ［例えば、ＷＯ／２００３／０９５６４７号を参照のこと］、エクソン読み飛ばしを誘導するためのＵ７  ｓｎＲＮＡに対するアンチセンス［例えば、ＷＯ／２００６／０２１７２４号を参照のこと］、およびミオスタチンまたはミオスタチンプロペプチドに対する抗体または抗体断片）およびベッカー型を含む筋ジストロフィー、ゴーシェ病（グルコセレブロシダーゼ）、ハーラー病（α−Ｌ−イズロニダーゼ）、アデノシンデアミナーゼ欠乏症（アデノシンデアミナーゼ）、糖原貯蔵疾患（例えば、ファブリー病［α−ガラクトシダーゼ］およびポンペ病［リソソーム酸α−グルコシダーゼ］）および他の代謝障害、先天性肺気腫（α１−アンチトリプシン）、レッシュ・ナイハン症候群（ヒポキサンチングアニンホスホリボシルトランスフェラーゼ）、ニーマン・ピック病（スフィンゴミエリナーゼ）、テイ・サックス病（Ｔａｙ  Ｓａｃｈｓ  ｄｉｓｅａｓｅ）（リソソームヘキソサミニダーゼＡ）、メープルシロップ尿症（分岐鎖ケト酸脱水素酵素）、網膜変性疾患（ならびに眼および網膜の他の疾患；例えば、黄斑変性症についてＰＤＧＦ、および／あるいは例えばＩ型糖尿病における網膜障害を治療／予防するためのバソヒビンもしくはＶＥＧＦの他のインヒビターまたは他の血管新生インヒビター）、固形臓器の疾患、例えば脳（パーキンソン病［ＧＤＮＦ］、星状細胞腫［エンドスタチン、アンジオスタチン、および／またはＶＥＧＦに対するＲＮＡｉ］、膠芽腫［エンドスタチン、アンジオスタチン、および／またはＶＥＧＦに対するＲＮＡｉ］が含まれる）、肝臓、腎臓、うっ血性心不全また���末梢動脈疾患（ＰＡＤ）を含む心臓（例えば、プロテインホスファターゼインヒビターＩ（Ｉ−１）およびその断片（例えば、Ｉ１Ｃ）、ｓｅｒｃａ２ａ、ホスホランバン遺伝子を調節するジンクフィンガータンパク質、Ｂａｒｋｃｔ、β２アドレナリン受容体、β２アドレナリン受容体キナーゼ（ＢＡＲＫ）、ホスホイノシチド−３キナーゼ（ＰＩ３キナーゼ）、Ｓ１００Ａ１、パルブアルブミン、アデニリルシクラーゼ６型、短縮型の構成的に活性なｂＡＲＫｃｔなどのＧタンパク質共役型受容体キナーゼ２型ノックダウンをもたらす分子；カルサルシン（ｃａｌｓａｒｃｉｎ）、ホスホランバンに対するＲＮＡｉ；ホスホランバンＳ１６Ｅなどのホスホランバン阻害分子またはドミナントネガティブ分子などを送達することによる）、関節炎（インスリン様増殖因子）、関節障害（インスリン様増殖因子１および／または２）、内膜過形成（例えば、ｅｎｏｓ、ｉｎｏｓを送達することによる）、心臓移植物の生存の改善（スーパーオキシドジスムターゼ）、ＡＩＤＳ（可溶性ＣＤ４）、筋消耗（インスリン様増殖因子Ｉ）、腎臓欠損症（ｋｉｄｎｅｙ  ｄｅｆｉｃｉｅｎｃｙ）（エリスロポエチン）、貧血（エリスロポエチン）、関節炎（ＩＲＡＰおよびＴＮＦα可溶性受容体などの抗炎症性因子）、肝炎（α−インターフェロン）、ＬＤＬ受容体欠乏症（ＬＤＬ受容体）、高アンモニア血症（オルニチントランスカルバミラーゼ）、クラッベ病（ガラクトセレブロシダーゼ）、バッテン病、ＳＣＡ１、ＳＣＡ２およびＳＣＡ３を含む脊髄性大脳性運動失調症（ｓｐｉｎａｌ  ｃｅｒｅｂｒａｌ  ａｔａｘｉａｓ）、フェニルケトン尿症（フェニルアラニンヒドロキシラーゼ）、自己免疫疾患などが含まれるがこれらに限定されない。本発明はさらに、移植の成功率を増加させるためおよび／または臓器移植もしくは補助療法の負の副作用を低下させるために、臓器移植後に使用され得る（例えば、サイトカイン生成を遮断するために免疫抑制剤または阻害核酸を投与することによって）。別の例として、骨形態形成タンパク質（ＢＮＰ２、７など、ＲＡＮＫＬおよび／またはＶＥＧＦを含む）が、例えば、がん患者における破壊（ｂｒｅａｋ）または外科的除去後に、骨同種移植片と共に投与され得る。
【０３１５】
本発明は、誘導多能性幹細胞（ｉＰＳ）を生成するためにも使用され得る。例えば、本発明のウイルスベクターは、例えば成人線維芽細胞、皮膚細胞、肝臓細胞、腎細胞、脂肪細胞、心臓細胞、神経細胞、上皮細胞、内皮細胞などの非多能性細胞中に、幹細胞関連核酸（複数可）を送達するために使用され得る。幹細胞に関連する因子をコードする核酸は、当該分野で公知である。かかる幹細胞および多能性に関連する因子の非限定的な例には、Ｏｃｔ−３／４、ＳＯＸファミリー（例えば、ＳＯＸ１、ＳＯＸ２、ＳＯＸ３および／またはＳＯＸ１５）、Ｋｌｆファミリー（例えば、Ｋｌｆ１、Ｋｌｆ２、Ｋｌｆ４および／またはＫｌｆ５）、Ｍｙｃファミリー（例えば、Ｃ−ｍｙｃ、Ｌ−ｍｙｃおよび／またはＮ−ｍｙｃ）、ＮＡＮＯＧおよび／またはＬＩＮ２８が含まれる。
【０３１６】
本発明は、代謝障害、例えば、糖尿病（例えば、インスリン）、血友病（例えば、第ＩＸ因子または第ＶＩＩＩ因子）、リソソーム蓄積症、例えば、ムコ多糖症障害（例えば、スライ症候群［β−グルクロニダーゼ］、ハーラー症候群［α−Ｌ−イズロニダーゼ］、シャイエ症候群［α−Ｌ−イズロニダーゼ］、ハーラー・シャイエ症候群［α−Ｌ−イズロニダーゼ］、ハンター症候群［イズロン酸スルファターゼ］、サンフィリポ症候群Ａ［ヘパランスルファミダーゼ］、Ｂ［Ｎ−アセチルグルコサミニダーゼ］、Ｃ［アセチル−ＣｏＡ：α−グルコサミニドアセチルトランスフェラーゼ］、Ｄ［Ｎ−アセチルグルコサミン６−スルファターゼ］、モルキオ症候群Ａ［ガラクトース−６−硫酸スルファターゼ］、Ｂ［β−ガラクトシダーゼ］、マロトー・ラミー症候群［Ｎ−アセチルガラクトサミン−４−スルファターゼ］など）、ファブリー病（α−ガラクトシダーゼ）、ゴーシェ病（グルコセレブロシダーゼ）、または糖原貯蔵障害（例えば、ポンペ病；リソソーム酸α−グルコシダーゼ）を治療および／または予防するためにも実施され得る。
【０３１７】
遺伝子移入は、疾患状態のための療法を理解および提供するためのかなり有望な用途を有する。欠損した遺伝子が既知でありクローニングされている多数の遺伝性疾患が存在する。一般に、上記疾患状態は２つのクラスに入る：（劣性様式で一般に遺伝する、多くは酵素の）欠乏状態、および（調節タンパク質または構造タンパク質が関与し得、典型的には優性様式で遺伝する）バランスを欠いた状態。欠乏状態の疾患について、遺伝子移入は、補充療法のために罹患組織中に正常な遺伝子をもたらすため、ならびにアンチセンス変異を使用して疾患の動物モデルを創出するために使用され得る。バランスを欠いた疾患状態について、遺伝子移入は、モデル系において疾患状態を創出するために使用され得、このモデル系は次いで疾患状態に対抗するための試みにおいて使用され得る。従って、本発明に従うウイルスベクターは、遺伝疾患の治療および／または予防を可能にする。
【０３１８】
本発明に従うウイルスベクターは、機能的ＲＮＡをインビトロまたはインビボで細胞に提供するためにも使用され得る。細胞における機能的ＲＮＡの発現は、例えば、細胞による特定の標的タンパク質の発現を減殺し得る。従って、機能的ＲＮＡは、それを必要とする対象において特定のタンパク質の発現を減少させるために投与され得る。機能的ＲＮＡはまた、遺伝子発現および／または細胞生理学を調節するため、例えば、細胞もしくは組織培養系を最適化するために、またはスクリーニング方法において、インビトロで細胞に投与され得る。
【０３１９】
さらに、本発明に従うウイルスベクターは、診断方法およびスクリーニング方法において用途を見出し、それにより、対象の核酸が、細胞培養系において、あるいはトランスジェニック動物モデルにおいて、一過的にまたは安定に発現される。
【０３２０】
本発明のウイルスベクターは、当業者に明らかなように、遺伝子の標的化、クリアランス、転写、翻訳などを評価するためのプロトコールにおける使用が含まれるがこれらに限定されない種々の非治療的目的のためにも使用され得る。ウイルスベクターは、安全性（伝播、毒性、免疫原性など）を評価する目的のためにも使用され得る。かかるデータは、例えば、臨床的有効性の評価の前に、通常の承認プロセスの一部として、米国食品医薬品局によって検討される。
【０３２１】
さらなる態様として、本発明のウイルスベクターは、対象において免疫応答を生成するために使用され得る。この実施形態によれば、免疫原性ポリペプチドをコードする異種核酸配列を含むウイルスベクターが対象に投与され得、その免疫原性ポリペプチドに対する能動免疫応答が、対象によって開始される。免疫原性ポリペプチドは、本明細書中で上記したとおりである。いくつかの実施形態では、防御免疫応答が惹起される。
【０３２２】
あるいは、ウイルスベクターは、エクスビボで細胞に投与され得、変更された細胞が対象に投与される。異種核酸を含むウイルスベクターが細胞中に導入され、その細胞が対象に投与され、ここで、免疫原をコードする異種核酸が発現され得、対象においてその免疫原に対する免疫応答を誘導し得る。特定の実施形態では、細胞は抗原提示細胞（例えば、樹状細胞）である。
【０３２３】
「能動免疫応答」または「能動免疫」は、「免疫原との遭遇後の宿主組織および細胞の関与」を特徴とし、「これは、抗体の合成もしくは細胞媒介反応性の発生またはそれら両方を導く、リンパ細網組織における免疫担当細胞の分化および増殖に関与する。」Ｈｅｒｂｅｒｔ  Ｂ．Ｈｅｒｓｃｏｗｉｔｚ、Ｉｍｍｕｎｏｐｈｙｓｉｏｌｏｇｙ：Ｃｅｌｌ  Ｆｕｎｃｔｉｏｎ  ａｎｄ  Ｃｅｌｌｕｌａｒ  Ｉｎｔｅｒａｃｔｉｏｎｓ  ｉｎ  Ａｎｔｉｂｏｄｙ  Ｆｏｒｍａｔｉｏｎ、ＩＭＭＵＮＯＬＯＧＹ：ＢＡＳＩＣ  ＰＲＯＣＥＳＳＥＳ  １１７（Ｊｏｓｅｐｈ  Ａ．Ｂｅｌｌａｎｔｉ編、１９８５）。代替的に述べると、能動免疫応答は、感染またはワクチン接種による免疫原への曝露後に宿主によって開始される。能動免疫は受動免疫と対比され得、受動免疫は、「能動免疫された宿主から非免疫宿主への、予め形成された物質（抗体、トランスファー因子、胸腺移植片、インターロイキン−２）の移入」を介して達成される（同文献）。
【０３２４】
「防御」免疫応答または「防御」免疫は、本明細書中で使用される場合、疾患の発生率を予防するまたは低下させるという点で、免疫応答が対象にいくらかの利益を付与することを示す。あるいは、防御免疫応答または防御免疫は、疾患、特にがんまたは腫瘍の治療および／または予防において有用であり得る（例えば、がんまたは腫瘍の形成を予防することによって、がんまたは腫瘍の退縮を引き起こすことによって、および／あるいは転移を予防することによって、および／あるいは転移性小結節の増殖を予防することによって）。防御効果は、治療の利益がその任意の不利益を上回る限り、完全でも部分的でもよい。
【０３２５】
特定の実施形態では、異種核酸を含むウイルスベクターまたは細胞は、以下に記載される免疫原的有効量で投与され得る。
【０３２６】
本発明のウイルスベクターは、１つまたは複数のがん細胞抗原（または免疫学的に類似の分子）あるいはがん細胞に対する免疫応答を生成する任意の他の免疫原を発現するウイルスベクターの投与によるがん免疫療法のためにも投与され得る。説明するために、例えば、がんを有する患者を治療するために、および／または、対象においてがんの発生を予防するために、がん細胞抗原をコードする異種核酸を含むウイルスベクターを投与することによって、対象においてがん細胞抗原に対する免疫応答が生成され得る。ウイルスベクターは、本明細書中で記載されるように、インビボでまたはエクスビボ方法を使用することによって対象に投与され得る。あるいは、がん抗原は、ウイルスカプシドの一部として発現され得るか、またはウイルスカプシドと他の方法で関連し得る（例えば、上記されるように）。
【０３２７】
別の代替方法として、当該分野で公知の任意の他の治療的核酸（例えば、ＲＮＡｉ）またはポリペプチド（例えば、サイトカイン）が、がんを治療および／または予防するために投与され得る。
【０３２８】
本明細書中で使用する場合、用語「がん」は、腫瘍形成がんを包含する。同様に、用語「がん性組織」は腫瘍を包含する。「がん細胞抗原」は腫瘍抗原を包含する。
【０３２９】
用語「がん」は、当該分野で理解される意味を有し、例えば、身体の離れた部位に伝播する能力を有する組織の制御されない増殖（即ち、転移）である。例示的ながんには、メラノーマ、腺癌腫、胸腺腫、リンパ腫（例えば、非ホジキンリンパ腫、ホジキンリンパ腫）、肉腫、肺がん、肝臓がん、結腸がん、白血病、子宮がん、乳がん、前立腺がん、卵巣がん、子宮頚がん、膀胱がん、腎臓がん、膵臓がん、脳がんならびに現在公知のまたは後に同定される任意の他のがんまたは悪性状態が含まれるが、これらに限定されない。代表的実施形態では、本発明は、腫瘍形成がんを治療および／または予防する方法を提供する。
【０３３０】
用語「腫瘍」もまた、例えば、多細胞生物内の未分化細胞の異常な塊として、当該分野で理解される。腫瘍は悪性または良性であり得る。代表的実施形態では、本明細書中に開示される方法は、悪性腫瘍を予防および治療するために使用される。
【０３３１】
用語「がんを治療する」、「がんの治療」および等価な用語は、がんの重症度が低下されもしくは少なくとも部分的に排除されること、ならびに／または疾患の進行が減速されるおよび／もしくは制御されること、ならびに／または疾患が安定化されることを意図する。特定の実施形態では、これらの用語は、がんの転移が予防もしくは低下もしくは少なくとも部分的に排除されること、ならびに／または転移性小結節の増殖が予防もしくは低下もしくは少なくとも部分的に排除されることを示す。
【０３３２】
用語「がんの予防」または「がんを予防する」および等価な用語は、その方法が、がんの発症の発生率および／または重症度を、少なくとも部分的に排除または低下および／または遅延させることを意図する。代替的に述べると、対象におけるがんの発症は、尤度もしくは確率において低下され得る、および／または遅延され得る。
【０３３３】
特定の実施形態では、細胞は、がんを有する対象から取り出され得、本発明に従うがん細胞抗原を発現するウイルスベクターと接触され得る。次いで、改変された細胞が対象に投与され、それにより、がん細胞抗原に対する免疫応答が惹起される。この方法は、インビボで充分な免疫応答を開始できない（即ち、充分な量で促進抗体を生成できない）易感染性対象と共に有利に使用され得る。
【０３３４】
免疫応答は、免疫調節性サイトカイン（例えば、α−インターフェロン、β−インターフェロン、γ−インターフェロン、ω−インターフェロン、τ−インターフェロン、インターロイキン−１α、インターロイキン−１β、インターロイキン−２、インターロイキン−３、インターロイキン−４、インターロイキン５、インターロイキン−６、インターロイキン−７、インターロイキン−８、インターロイキン−９、インターロイキン−１０、インターロイキン−１１、インターロイキン１２、インターロイキン−１３、インターロイキン−１４、インターロイキン−１８、Ｂ細胞増殖因子、ＣＤ４０リガンド、腫瘍壊死因子−α、腫瘍壊死因子−β、単球走化性因子タンパク質−１、顆粒球マクロファージコロニー刺激因子およびリンホトキシン）によって増強され得ることが、当該分野で公知である。従って、免疫調節性サイトカイン（好ましくは、ＣＴＬ誘導性サイトカイン）が、ウイルスベクターと合わせて対象に投与され得る。
【０３３５】
サイトカインは、当該分野で公知の任意の方法によって投与され得る。外因性サイトカインが対象に投与され得るか、あるいはサイトカインをコードする核酸が適切なベクターを使用して対象に送達され得、サイトカインがインビボで生成され得る。
【０３３６】
＜対象、医薬製剤および投与様式＞
本発明に従うウイルスベクターおよびカプシドは、獣医学適用および医療適用の両方において用途を見出す。適切な対象には、トリおよび哺乳動物の両方が含まれる。用語「トリ」には、本明細書中で使用する場合、ニワトリ、アヒル、ガチョウ、ウズラ、シチメンチョウ、キジ、オウム、インコなどが含まれるがこれらに限定されない。用語「哺乳動物」には、本明細書中で使用する場合、ヒト、非ヒト霊長類、ウシ、ヒツジ、ヤギ、ウマ、ネコ、イヌ、ウサギなどが含まれるがこれらに限定されない。ヒト対象には、新生児、乳幼児、若年、成人および老人の対象が含まれる。
【０３３７】
代表的実施形態では、対象は、本発明の方法「を必要とする」。
【０３３８】
特定の実施形態では、本発明は、薬学的に許容される担体中に本発明のウイルスベクターおよび／またはカプシドおよび／またはカプシドタンパク質および／またはウイルス粒子を含み、任意選択的に、他の薬剤、医薬品、安定化剤、緩衝剤、担体、補助剤、希釈剤などを含む、医薬組成物を提供する。注射について、担体は典型的には液体である。他の投与方法について、担体は固体または液体のいずれかであり得る。吸入投与について、担体は呼吸用であり、任意選択的に、固体または液体の粒状形態であり得る。
【０３３９】
「薬学的に許容される」とは、毒性でなくその他の点でも望ましくない材料、即ち、その材料が、望ましくない生物学的影響をいずれも引き起こすことなしに対象に投与され得ることを意味する。
【０３４０】
本発明の一態様は、核酸をインビトロで細胞に移入する方法である。ウイルスベクターは、特定の標的細胞に適した標準的な形質導入法に従って、適切な感染多重度で細胞中に導入され得る。投与するウイルスベクターの力価は、標的細胞の型および数、ならびに特定のウイルスベクターに依存して変動し得、過度の実験なしに当業者によって決定され得る。代表的実施形態では、少なくとも約１０３感染単位、任意選択的に少なくとも約１０５感染単位が、細胞に導入される。
【０３４１】
ウイルスベクターが導入される細胞（複数可）は、任意の型の細胞であり得、神経細胞（末梢神経系および中枢神経系の細胞、特に、ニューロンおよびオリゴデンドロサイト（ｏｌｉｇｏｄｅｎｄｒｉｃｙｔｅ）などの脳細胞が含まれる）、肺細胞、眼の細胞（網膜細胞、網膜色素上皮および角膜細胞が含まれる）、上皮細胞（例えば、腸および呼吸器の上皮細胞）、筋細胞（例えば、骨格筋細胞、心筋細胞、平滑筋細胞および／または横隔膜筋細胞）、樹状細胞、膵臓細胞（膵島細胞が含まれる）、肝細胞、心筋細胞、骨細胞（例えば、骨髄幹細胞）、造血幹細胞、脾臓細胞、ケラチノサイト、線維芽細胞、内皮細胞、前立腺細胞、生殖細胞などが含まれるがこれらに限定されない。代表的実施形態では、細胞は任意の前駆細胞であり得る。さらなる可能性として、細胞は幹細胞（例えば、神経幹細胞、肝臓幹細胞）であり得る。なおさらなる代替として、細胞はがん細胞または腫瘍細胞であり得る。さらに、細胞は、上で示したような任意の種起源であり得る。
【０３４２】
ウイルスベクターは、改変された細胞を対象に投与する目的のために、インビトロで細胞中に導入され得る。特定の実施形態では、細胞は、対象から取り出されたものであり、ウイルスベクターがその細胞に導入され、次いで、その細胞が対象中に戻し投与される。エクスビボでの操作のために対象から細胞を取り出し、その後、対象中に戻し導入する方法は、当該分野で公知である（例えば、米国特許第５，３９９，３４６号を参照のこと）。あるいは、組換えウイルスベクターは、ドナー対象由来の細胞中に、培養細胞中に、または任意の他の適切な供給源由来の細胞中に導入され得、この細胞が、それを必要とする対象（即ち、「レシピエント」対象）に投与される。
【０３４３】
エクスビボ核酸送達に適した細胞は上記のとおりである。対象に投与する細胞の投薬量は、対象の年齢、状態および種、細胞の型、細胞が発現する核酸、投与様式などに応じて変動する。典型的には、少なくとも約１０２〜約１０８細胞または少なくとも約１０３〜約１０６細胞が、１投薬当たり薬学的に許容される担体中で投与される。特定の実施形態では、ウイルスベクターで形質導入された細胞は、医薬担体と組み合わせて、治療有効量または予防有効量で対象に投与される。
【０３４４】
いくつかの実施形態では、ウイルスベクターが細胞中に導入され、その細胞が、送達されたポリペプチド（例えば、導入遺伝子として発現されたまたはカプシド中の）に対する免疫原性応答を惹起するために、対象に投与され得る。典型的には、免疫原的有効量のポリペプチドを発現する細胞の量が、薬学的に許容される担体と組み合わせて投与される。「免疫原的有効量」は、医薬製剤が投与される対象において、そのポリペプチドに対する能動免疫応答を誘起するのに充分な、発現されたポリペプチドの量である。特定の実施形態では、投薬量は、防御免疫応答（上で定義した）を生成するのに充分である。免疫原性ポリペプチドを投与することの利益がその任意の不利益を上回る限り、付与される保護の程度は、完全または永続的である必要はない。
【０３４５】
従って、本発明は、本発明のウイルスベクター、ウイルス粒子および／または組成物と細胞を接触させるステップを含む、細胞に核酸を投与する方法を提供する。
【０３４６】
本発明のさらなる一態様は、本発明のウイルスベクター、ウイルス粒子および／またはウイルスカプシドを対象に投与する方法である。従って、本発明は、本発明のウイルス粒子、ウイルスベクターおよび／または組成物を対象に投与するステップを含む、対象に核酸を送達する方法もまた提供する。それを必要とするヒト対象または動物への、本発明に従うウイルスベクター、ウイルス粒子および／またはカプシドの投与は、当該分野で公知の任意の手段によってであり得る。任意選択的に、ウイルスベクター、ウイルス粒子および／またはカプシドは、薬学的に許容される担体中で、治療有効用量または予防有効用量で送達される。
【０３４７】
本発明のウイルスベクターおよび／またはカプシドはさらに、（例えば、ワクチンとして）免疫原性応答を惹起するために投与され得る。典型的には、本発明の免疫原性組成物は、薬学的に許容される担体と組み合わせて、免疫原的有効量のウイルスベクターおよび／またはカプシドを含む。任意選択的に、投薬量は、防御免疫応答（上で定義した）を生成するのに充分である。免疫原性ポリペプチドを投与することの利益がその任意の不利益を上回る限り、付与される保護の程度は、完全または永続的である必要はない。対象および免疫原は上記のとおりである。
【０３４８】
対象に投与されるウイルスベクターおよび／またはカプシドの投薬量は、投与様式、治療および／または予防される疾患または状態、個々の対象の状態、特定のウイルスベクターまたはカプシド、ならびに送達される核酸などに依存し、慣用的な様式で決定され得る。治療効果を達成するための例示的な用量は、少なくとも約１０５、１０６、１０７、１０８、１０９、１０１０、１０１１、１０１２、１０３、１０１４、１０１５形質導入単位、任意選択的に約１０８〜１０１３形質導入単位の力価である。
【０３４９】
特定の実施形態では、１回より多い投与（例えば、２回、３回、４回またはそれ以上の投与）が、例えば、毎日、週１回、月１回、年１回などの種々の間隔の期間にわたって、所望のレベルの遺伝子発現を達成するために使用され得る。
【０３５０】
例示的な投与様式には、経口、直腸、経粘膜、鼻腔内、吸入（例えば、エアロゾルを介して）、頬側（例えば、舌下）、膣、髄腔内、眼内、経皮、子宮内（または胚内）、非経口（例えば、静脈内、皮下、皮内、筋内［骨格筋、横隔膜筋および／または心筋への投与が含まれる］、皮内、胸膜内、脳内および関節内）、外用（例えば、気道表面を含む皮膚表面および粘膜表面の両方への、ならびに経皮投与）、リンパ内など、ならびに直接的な組織または臓器への注射（例えば、肝臓、骨格筋、心筋、横隔膜筋または脳への）が含まれる。投与は、腫瘍への投与であり得る（例えば、腫瘍またはリンパ節の中または近傍）。任意の所与の場合における最も適切な経路は、治療および／または予防される状態の性質および重症度、ならびに使用されている特定のベクターの性質に依存する。
【０３５１】
本発明に従う骨格筋への投与は、四肢（例えば、上腕、前腕、大腿および／または下腿）、背中、頸部、頭部（例えば、舌）、胸郭、腹部、骨盤／会陰部および／または指の骨格筋への投与が含まれるがこれらに限定されない。適切な骨格筋には、小指外転筋（手の）、小趾外転筋（足の）、母趾外転筋、第五中足骨外転筋（ａｂｄｕｃｔｏｒ  ｏｓｓｉｓ  ｍｅｔａｔａｒｓｉ  ｑｕｉｎｔｉ）、短母指外転筋、長母指外転筋、短内転筋、母趾内転筋、長内転筋、大内転筋、母指内転筋、肘筋、前斜角筋、膝関節筋、上腕二頭筋、大腿二頭筋、上腕筋、腕橈骨筋、頬筋、烏口腕筋、皺眉筋、三角筋、口角下制筋、下唇下制筋、顎二腹筋、背側骨間筋（手の）、背側骨間筋（足の）、短橈側手根伸筋、長橈側手根伸筋、尺側手根伸筋、小指伸筋、指伸筋、短趾伸筋、長趾伸筋、短母趾伸筋、長母趾伸筋、示指伸筋、短母指伸筋、長母指伸筋、橈側手根屈筋、尺側手根屈筋、短小指屈筋（手の）、短小趾屈筋（足の）、短趾屈筋、長趾屈筋、深指屈筋、浅指屈筋、短母趾屈筋、長母趾屈筋、短母指屈筋、長母指屈筋、前頭筋、腓腹筋、オトガイ舌骨筋、大殿筋、中殿筋、小殿筋、薄筋、頸腸肋筋、腰腸肋筋、胸腸肋筋、腸骨筋（ｉｌｌｉａｃｕｓ）、下双子筋、下斜筋、下直筋、棘下筋、棘間筋（ｉｎｔｅｒｓｐｉｎａｌｉｓ）、横突間筋（ｉｎｔｅｒｔｒａｎｓｖｅｒｓｉ）、外側翼突筋、外直筋、広背筋、口角挙筋、上唇挙筋、上唇鼻翼挙筋、上眼瞼挙筋、肩甲挙筋、長回旋筋（ｌｏｎｇ  ｒｏｔａｔｏｒｓ）、頭最長筋、頸最長筋、胸最長筋、頭長筋、頸長筋、虫様筋（手の）、虫様筋（足の）、咬筋、内側翼突筋、内直筋、中斜角筋、多裂筋、顎舌骨筋、下頭斜筋、上頭斜筋、外閉鎖筋、内閉鎖筋、後頭筋、肩甲舌骨筋、小指対立筋、母指対立筋、眼輪筋、口輪筋、掌側骨間筋、短掌筋、長掌筋、恥骨筋、大胸筋、小胸筋、短腓骨筋、長腓骨筋、第三腓骨筋、梨状筋、底側骨間筋、足底筋、広頸筋、膝窩筋、後斜角筋、方形回内筋、円回内筋、大腰筋、大腿方形筋、足底方形筋、前頭直筋、外側頭直筋、大後頭直筋、小後頭直筋、大腿直筋、大菱形筋、小菱形筋、笑筋、縫工筋、最小斜角筋、半膜様筋、頭半棘筋、頸半棘筋、胸半棘筋、半腱様筋、前鋸筋、短回旋筋（ｓｈｏｒｔ  ｒｏｔａｔｏｒｓ）、ヒラメ筋、頭棘筋、頸棘筋、胸棘筋、頭板状筋、頸板状筋、胸鎖乳突筋、胸骨舌骨筋、胸骨甲状筋、茎突舌骨筋、鎖骨下筋、肩甲下筋、上双子筋、上斜筋、上直筋、回外筋、棘上筋、側頭筋、大腿筋膜張筋、大円筋、小円筋、胸部の筋、甲状舌骨筋、前脛骨筋、後脛骨筋、僧帽筋、上腕三頭筋、中間広筋、外側広筋、内側広筋、大頬骨筋および小頬骨筋、ならびに当該分野で公知の任意の他の適切な骨格筋が含まれるがこれらに限定されない。
【０３５２】
ウイルスベクターおよび／またはカプシドは、静脈内投与、動脈内投与、腹腔内投与、四肢灌流、（任意選択的に、脚および／または腕の分離四肢灌流；例えば、Ａｒｒｕｄａら、（２００５）Ｂｌｏｏｄ  １０５：３４５８〜３４６４を参照のこと）、および／または直接筋内注射によって骨格筋に送達され得る。特定の実施形態では、このウイルスベクターおよび／またはカプシドは、四肢灌流によって、任意選択的に分離四肢灌流によって（例えば、静脈内または関節内投与によって）、対象（例えば、ＤＭＤなどの筋ジストロフィーを有する対象）の四肢（腕および／または脚）に投与される。本発明の実施形態では、有利なことには、本発明のウイルスベクターおよび／またはカプシドは、「水力学的」技術を使用せずに投与され得る。先行技術のベクターの（例えば、筋肉への）組織送達は、脈管構造における圧力を増加させ、ベクターが内皮細胞障壁を横断する能力を促進する、水力学的技術（例えば、大容量での静脈内／静脈内投与）によって増強される場合が多い。特定の実施形態では、本発明のウイルスベクターおよび／またはカプシドは、水力学的技術、例えば、高容量注入および／または上昇した血管内圧（例えば、正常収縮期圧よりも高い、例えば、正常収縮期圧を超える、血管内圧における５％、１０％、１５％、２０％、２５％未満またはそれに等しい増加）の非存在下で投与され得る。かかる方法は、水力学的技術と関連する副作用、例えば、浮腫、神経損傷および／またはコンパートメント症候群を低下させるまたは回避し得る。
【０３５３】
心筋への投与には、左心房、右心房、左心室、右心室および／または中隔への投与が含まれる。ウイルスベクターおよび／またはカプシドは、静脈内投与、動脈内投与、例えば、大動脈内投与、直接的心注射（例えば、左心房、右心房、左心室、右心室中への）、および／または冠状動脈灌流によって心筋に送達され得る。
【０３５４】
横隔膜筋への投与は、静脈内投与、動脈内投与および／または腹腔内投与を含む任意の適切な方法により得る。
【０３５５】
標的組織への送達は、ウイルスベクターおよび／またはカプシドを含むデポーを送達することによっても達成され得る。代表的実施形態では、ウイルスベクターおよび／またはカプシドを含むデポーは、骨格筋、心筋および／または横隔膜筋組織中に移植され、あるいは組織が、ウイルスベクターおよび／またはカプシドを含むフィルムまたは他のマトリックスと接触され得る。かかる移植可能なマトリックスまたは基材は、米国特許第７，２０１，８９８号中に記載されている。
【０３５６】
特定の実施形態では、本発明に従うウイルスベクターおよび／またはウイルスカプシドは、（例えば、筋ジストロフィー、心臓疾患［例えば、ＰＡＤまたはうっ血性心不全］を治療および／または予防するために）骨格筋、横隔膜筋および／または心筋に投与される。
【０３５７】
代表的な実施形態では、本発明は、骨格筋、心筋および／または横隔膜筋の障害を治療および／または予防するために使用される。
【０３５８】
代表的な一実施形態では、本発明は、治療または予防有効量の本発明のウイルスベクターを哺乳動物対象に投与するステップを含む、それを必要とする対象において筋ジストロフィーを治療および／または予防する方法を提供し、このウイルスベクターは、ジストロフィン、ミニジストロフィン、マイクロジストロフィン、ミオスタチンプロペプチド、フォリスタチン、アクチビンＩＩ型可溶性受容体、ＩＧＦ−１、抗炎症性ポリペプチド、例えば、ＩκＢ優性変異体、サルコスパン、ユートロフィン、マイクロジストロフィン、ラミニン−α２、α−サルコグリカン、β−サルコグリカン、γ−サルコグリカン、δ−サルコグリカン、ＩＧＦ−１、ミオスタチンもしくはミオスタチンプロペプチドに対する抗体もしくは抗体断片、および／またはミオスタチンに対するＲＮＡｉをコードする異種核酸を含む。特定の実施形態では、このウイルスベクターは、本明細書の別の箇所に記載されるように、骨格筋、横隔膜筋および／または心筋に投与され得る。
【０３５９】
あるいは、本発明は、障害（例えば、代謝障害、例えば、糖尿病［例えば、インスリン］、血友病［例えば、第ＩＸ因子または第ＶＩＩＩ因子］、ムコ多糖症障害（ｍｕｃｏｐｏｌｙｓａｃｃｈａｒｉｄｅ  ｄｉｓｏｒｄｅｒ）［例えば、スライ症候群、ハーラー症候群、シャイエ症候群、ハーラー・シャイエ症候群、ハンター症候群、サンフィリポ症候群Ａ、Ｂ、Ｃ、Ｄ、モルキオ症候群、マロトー・ラミー症候群など］またはリソソーム蓄積症、例えば、ゴーシェ病［グルコセレブロシダーゼ］もしくはファブリー病［α−ガラクトシダーゼＡ］または糖原貯蔵障害、例えば、ポンペ病［リソソーム酸αグルコシダーゼ］）を治療および／または予防するために、血液中で通常は循環するポリペプチド（例えば、酵素）または機能的ＲＮＡ（例えば、ＲＮＡｉ、ｍｉｃｒｏＲＮＡ、アンチセンスＲＮＡ）の産生のため、あるいは他の組織への全身送達のためのプラットホームとして使用される、骨格筋、心筋または横隔膜筋に核酸を送達するために実施され得る。代謝障害を治療および／または予防するための他の適切なタンパク質は、本明細書に記載されている。目的の核酸を発現させるためのプラットホームとしての筋肉の使用は、米国特許公開公報２００２／０１９２１８９号に記載されている。
【０３６０】
従って、一態様として、本発明は、治療または予防有効量の本発明のウイルスベクターを対象の骨格筋に投与するステップを含む、それを必要とする対象において代謝障害を治療および／または予防する方法をさらに包含し、このウイルスベクターは、ポリペプチドをコードする異種核酸を含み、この代謝障害は、このポリペプチドにおける欠乏症および／または欠損の結果である。例示的代謝障害およびポリペプチドをコードする異種核酸は、本明細書に記載されている。任意選択的に、このポリペプチドは分泌される（例えば、そのネイティブ状態において分泌型ポリペプチドであるポリペプチド、または当該分野で公知のように、例えば分泌シグナル配列と作動可能に付随させることによって、分泌型になるように操作されたポリペプチド）。本発明の任意の特定の理論によって限定されないが、この実施形態によれば、骨格筋への投与は、全身循環中へのポリペプチドの分泌および標的組織（複数可）への送達を生じ得る。ウイルスベクターを骨格筋に送達する方法は、本明細書により詳細に記載されている。
【０３６１】
本発明は、全身送達のためのアンチセンスＲＮＡ、ＲＮＡｉまたは他の機能的ＲＮＡ（例えば、リボザイム）を生成するためにも実施され得る。
【０３６２】
本発明は、治療または予防有効量の本発明のウイルスベクターを哺乳動物対象に投与するステップを含む、それを必要とする対象において先天性心不全またはＰＡＤを治療および／または予防する方法もまた提供し、このウイルスベクターは、例えば、筋小胞体（ｓａｒｃｏｐｌａｓｍｉｃ  ｅｎｄｏｒｅｔｉｃｕｌｕｍ）Ｃａ２＋−ＡＴＰａｓｅ（ＳＥＲＣＡ２ａ）、血管新生因子、ホスファターゼインヒビターＩ（Ｉ−１）およびその断片（例えば、Ｉ１Ｃ）、ホスホランバンに対するＲＮＡｉ；ホスホランバンＳ１６Ｅなどのホスホランバン阻害分子またはドミナントネガティブ分子、ホスホランバン遺伝子を調節するジンクフィンガータンパク質、β２アドレナリン受容体、β２アドレナリン受容体キナーゼ（ＢＡＲＫ）、ＰＩ３キナーゼ、カルサルシン（ｃａｌｓａｒｃａｎ）、βアドレナリン受容体キナーゼインヒビター（βＡＲＫｃｔ）、プロテインホスファターゼ１のインヒビター１およびその断片（例えば、Ｉ１Ｃ）、Ｓ１００Ａ１、パルブアルブミン、アデニリルシクラーゼ６型、短縮型の構成的に活性なｂＡＲＫｃｔなどのＧタンパク質共役型受容体キナーゼ２型ノックダウンをもたらす分子、Ｐｉｍ−１、ＰＧＣ−１α、ＳＯＤ−１、ＳＯＤ−２、ＥＣ−ＳＯＤ、カリクレイン、ＨＩＦ、サイモシン−β４、ｍｉｒ−１、ｍｉｒ−１３３、ｍｉｒ−２０６、ｍｉｒ−２０８および／またはｍｉｒ−２６ａをコードする異種核酸を含む。
【０３６３】
注射剤は、液体溶液もしくは懸濁液、注射の前に液体中で溶液もしくは懸濁液にするのに適した固体形態、または乳濁液のいずれかとして、従来の形態で調製され得る。あるいは、本発明のウイルスベクターおよび／またはウイルスカプシドを、全身様式ではなく局所様式で、例えば、デポー製剤または徐放性製剤で、投与し得る。さらに、ウイルスベクターおよび／またはウイルスカプシドは、外科的に移植可能なマトリックスに付着して送達され得る（例えば、米国公開公報ＵＳ−２００４−００１３６４５−Ａ１号に記載される）。
【０３６４】
本明細書に開示されるウイルスベクターおよび／またはウイルスカプシドは、任意の適切な手段によって、任意選択的に、対象が吸入する、ウイルスベクターおよび／またはウイルスカプシドから構成される呼吸域粒子のエアロゾル懸濁液を投与することによって、対象の肺に投与され得る。呼吸域粒子は、液体または固体であり得る。これらのウイルスベクターおよび／またはウイルスカプシドを含む液体粒子のエアロゾルは、任意の適切な手段によって、例えば、当業者に公知のような圧力駆動型エアロゾルネブライザーまたは超音波ネブライザーによって生成され得る。例えば、米国特許第４，５０１，７２９号を参照のこと。これらのウイルスベクターおよび／またはカプシドを含む固体粒子のエアロゾルも同様に、医薬品分野で公知の技術によって、任意の固体粒状医薬エアロゾルジェネレーターを用いて生成され得る。
【０３６５】
ウイルスベクターおよびウイルスカプシドは、ＣＮＳの組織（例えば、脳、眼）に投与され得、本発明の非存在下で観察されるものよりも広い分布のウイルスベクターまたはカプシドを有利に生じ得る。
【０３６６】
特定の実施形態では、本発明の送達ベクターは、遺伝性障害、神経変性障害、精神障害および腫瘍を含むＣＮＳの疾患を治療するために投与され得る。ＣＮＳの例示的疾患には、アルツハイマー病、パーキンソン病、ハンチントン病、カナバン病、リー病、レフサム病、トゥレット症候群、原発性側索硬化症、筋萎縮性側索硬化症、進行性筋萎縮症、ピック病、筋ジストロフィー、多発性硬化症、重症筋無力症、ビンスワンガー病、脊髄または頭部の損傷に起因する外傷、テイ・サックス病、レッシュ・ナイハン病（Ｌｅｓｃｈ−Ｎｙａｎ  ｄｉｓｅａｓｅ）、癲癇、脳梗塞、気分障害（例えば、うつ病、双極性感情障害、持続性感情障害、二次的気分障害）、統合失調症、薬物依存性（例えば、アルコール依存症および他の物質の依存性）、神経症（例えば、不安症、強迫障害、身体表現性障害、解離性障害、悲嘆、産後うつ病）、精神病（例えば、幻覚および妄想）、認知症、パラノイア、注意欠陥障害、精神性的障害、睡眠障害、疼痛性障害、摂食障害または体重障害（例えば、肥満症、悪液質、神経性食欲不振症および過食症（ｂｕｌｅｍｉａ））を含む精神障害、ならびにＣＮＳのがんおよび腫瘍（例えば、原発性腫瘍）が含まれるがこれらに限定されない。
【０３６７】
ＣＮＳの障害には、網膜、後方路（ｐｏｓｔｅｒｉｏｒ  ｔｒａｃｔ）および視神経に関与する眼科障害（例えば、網膜色素変性症、糖尿病性網膜症および他の網膜変性疾患、ぶどう膜炎、加齢性黄斑変性症、緑内障）が含まれる。
【０３６８】
全部ではないが殆どの眼科の疾患および障害は、３つの型の指標のうち１つまたは複数と関連する：（１）血管新生、（２）炎症および（３）変性。本発明の送達ベクターは、抗血管新生因子；抗炎症性因子；細胞変性を遅延させ、細胞温存（ｓｐａｒｉｎｇ）を促進し、または細胞増殖を促進する因子、および上述の組み合わせを送達するために使用され得る。
【０３６９】
例えば、糖尿病性網膜症は、血管新生によって特徴付けられる。糖尿病性網膜症は、眼内（例えば、硝子体中）または眼窩周囲（例えば、テノン下領域中）のいずれかに、１つまたは複数の抗血管新生因子を送達することによって治療され得る。１つまたは複数の神経栄養因子もまた、眼内（例えば、硝子体内）または眼窩周囲のいずれかに同時送達され得る。
【０３７０】
ぶどう膜炎は炎症に関与する。１つまたは複数の抗炎症因子が、本発明の送達ベクターの眼内（例えば、硝子体または前房）投与によって投与され得る。
【０３７１】
比較として、網膜色素変性症は、網膜変性によって特徴付けられる。代表的実施形態では、網膜色素変性症は、１つまたは複数の神経栄養因子をコードする送達ベクターの眼内（例えば、硝子体投与）によって治療され得る。
【０３７２】
加齢性黄斑変性症は、血管新生および網膜変性の両方に関与する。この障害は、１つまたは複数の神経栄養因子をコードする本発明の送達ベクターを眼内（例えば、硝子体）に、および／あるいは１つまたは複数の抗血管新生因子をコードする本発明の送達ベクターを眼内または眼窩周囲（例えば、テノン嚢下領域中）に投与することによって、治療され得る。
【０３７３】
緑内障は、眼圧の増加および網膜神経節細胞の喪失によって特徴付けられる。緑内障の治療には、本発明の送達ベクターを使用して興奮毒性損傷から細胞を保護する１つまたは複数の神経保護剤の投与が含まれる。かかる薬剤には、眼内に、任意選択的に硝子体内に送達される、Ｎ−メチル−Ｄ−アスパラギン酸（ＮＭＤＡ）アンタゴニスト、サイトカインおよび神経栄養因子が含まれる。
【０３７４】
他の実施形態では、本発明は、発作を治療するため、例えば、発作の発症、発生率または重症度を低下させるために使用され得る。発作の治療的処置の効力は、行動的手段（例えば、眼または口の震え、チック（ｔｉｃｋ））および／または電気記録手段（殆どの発作は、顕著な電気記録の異常を有する）によって評価され得る。従って、本発明は、経時的な複数の発作を特徴とする癲癇を治療するためにも使用され得る。
【０３７５】
１つの代表的実施形態では、ソマトスタチン（またはその活性断片）が、下垂体腫瘍を治療するために、本発明の送達ベクターを使用して脳に投与される。この実施形態によれば、ソマトスタチン（またはその活性断片）をコードする送達ベクターは、微量注入によって下垂体中に投与される。同様に、かかる治療は、先端巨大症（下垂体からの異常な成長ホルモン分泌）を治療するために使用され得る。ソマトスタチンの核酸（例えば、ＧｅｎＢａｎｋ受託番号Ｊ００３０６）およびアミノ酸（例えば、ＧｅｎＢａｎｋ受託番号Ｐ０１１６６；プロセシングされた活性ペプチドソマトスタチン−２８およびソマトスタチン−１４を含む）配列は、当該分野で公知である。
【０３７６】
特定の実施形態では、ベクターは、米国特許第７，０７１，１７２号に記載された分泌シグナルを含み得る。
【０３７７】
本発明の代表的実施形態では、ウイルスベクターおよび／またはウイルスカプシドは、ＣＮＳに（例えば、脳にまたは眼に）投与される。ウイルスベクターおよび／またはカプシドは、脊髄、脳幹（延髄、脳橋）、中脳（視床下部、視床、視床上部、下垂体、黒質、松果体）、小脳、終脳（線条体、後頭葉皮質、側頭葉皮質、頭頂葉皮質および前頭葉皮質、基底核、海馬ならびに扁桃体（ｐｏｒｔａａｍｙｇｄａｌａ）を含む大脳）、辺縁系、新皮質、線条体、大脳および下丘中に導入され得る。ウイルスベクターおよび／またはカプシドは、網膜、角膜および／または視神経などの眼の異なる領域にも投与され得る。
【０３７８】
ウイルスベクターおよび／またはカプシドは、送達ベクターのより分散した投与のために、脳脊髄液中に（例えば、腰椎穿刺によって）送達され得る。ウイルスベクターおよび／またはカプシドはさらに、血液脳関門が撹乱された状況（例えば、脳腫瘍または脳梗塞）において、ＣＮＳに血管内投与され得る。
【０３７９】
このウイルスベクターおよび／またはカプシドは、髄腔内、眼内、脳内、脳室内、静脈内（例えば、マンニトールなどの糖の存在下）、鼻腔内、耳内、眼内（例えば、硝子体内、網膜下、前房）および眼窩周囲（例えば、テノン下領域）送達、ならびに運動ニューロンへの逆行性送達と合わせた筋内送達が含まれるがこれらに限定されない当該分野で公知の任意の経路によって、ＣＮＳの所望の領域（複数可）に投与され得る。
【０３８０】
特定の実施形態では、ウイルスベクターおよび／またはカプシドは、ＣＮＳ中の所望の領域または区画への直接的注射（例えば、定位注射）によって、液体製剤で投与される。他の実施形態では、ウイルスベクターおよび／またはカプシドは、所望の領域への外用適用によって、またはエアロゾル製剤の鼻腔内投与によって提供され得る。眼への投与は、液滴の外用適用によるものであり得る。さらなる代替として、ウイルスベクターおよび／またはカプシドは、固体の持続放出製剤として投与され得る（例えば、米国特許第７，２０１，８９８号を参照のこと）。
【０３８１】
なおさらなる実施形態では、ウイルスベクターは、運動ニューロンに関与する疾患および障害（例えば、筋萎縮性側索硬化症（ＡＬＳ）；脊髄性筋萎縮症（ＳＭＡ）など）を治療および／または予防するための逆行性輸送に使用され得る。例えば、ウイルスベクターは、筋肉組織に送達され得、そこからニューロン中に移動し得る。
【０３８２】
本発明を説明してきたが、同内容は以下の実施例においてさらに詳細に説明され、以下の実施例は、本発明の説明目的のためだけに本明細書中に含まれるものであり、本発明を限定する意図ではない。
【実施例】
【０３８３】
［実施例１］
抗体回避性ＡＡＶベクター（ＡＡＶ１ｅクローン１〜２６）のコンビナトリアル操作および選択
抗体回避性ＡＡＶｅ変異体を生成するための方法は以下のとおりである。このアプローチの一般的な模式的記載は図１に提供される。一例として、第１のステップには、クライオ電子顕微鏡からの、ＡＡＶカプシド表面上のコンフォメーショナル３Ｄ抗原性エピトープの同定が関与する。次いで、抗原性モチーフ内の選択された残基を、縮重プライマーを使用する変異誘発に供し、各コドンをヌクレオチドＮＮＫによって置換し、遺伝子断片を、Ｇｉｂｓｏｎアセンブリおよび／またはマルチステップＰＣＲによって一まとめにする。変異した抗原性モチーフの縮重ライブラリーを含むカプシドコード遺伝子を、野生型ＡＡＶゲノム中にクローニングして元のＣａｐコードＤＮＡ配列を置き換えて、プラスミドライブラリーを得る。次いで、プラスミドライブラリーを、２９３産生細胞株中にトランスフェクトしてＡＡＶカプシドライブラリーを生成し、これらのライブラリーは次いで選択に供され得る。ＡＡＶライブラリーの首尾よい生成を、ＤＮＡ配列決定を介して確認する（図２）。中和抗体（ＮＡｂ）を逃避できる新たなＡＡＶ株について選択するために、ＡＡＶライブラリーを、異なるモノクローナル抗体、ポリクローナル抗体、または抗ＡＡＶ抗体を含む血清ありまたはなしで、アデノウイルスなどのヘルパーウイルスの存在下での、特定の細胞または組織における複数ラウンドの感染に供する。少なくとも１ラウンドの首尾よい感染および複製から回収した細胞溶解物を配列決定して、抗体中和を逃避する単一ＡＡＶ単離体を同定する。
【０３８４】
非限定的な具体的一例として、ＡＡＶ１カプシドタンパク質（ＶＰ１）上の共通抗原性モチーフを、上記のような変異誘発に供した。次いで、縮重ライブラリーを、５サイクルの感染および複製にわたり、培養物中の内皮細胞における感染に供した。細胞に、０日目にＡＡＶ１ライブラリーを感染させ、１日目にアデノウイルスを感染させ、細胞溶解物ならびに上清を感染の７日後に取得して、感染および複製のサイクルを反復した。この手順を５回反復し、その後、各ライブラリー由来の１５〜２０の単離されたクローンを、ＤＮＡ配列分析に供した（図２）。各独自の配列をＡＡＶ１ｅ（＃番号）として標識し、この番号は、具体的なクローン性単離体を示す（表６．１〜６．４）。
【０３８５】
ＡＡＶ１ｅ変異体およびそれらの中和を逃避する能力の検証のために、ＡＡＶ１中和抗体４Ｅ４（図３上）および５Ｈ７（図３下）を、９６ウェルプレート上でＤＭＥＭ＋５％ＦＢＳ中に連続希釈した。ＣＢＡ−ＬｕｃカセットをパッケージングするＡＡＶ１およびＡＡＶ１ｅクローン（５ｅ７ｖｇ／ウェル）を添加し、室温で３０分間、９６ウェルプレート上で抗体と共にインキュベートした。２９３細胞（４ｅ５細胞／ウェル）を、ウイルス＋抗体ミックス中に添加し、３７℃、５％ＣＯ２インキュベーターで４８時間インキュベートした。抗体、ウイルスおよび細胞の混合物の最終容量は、１００ｕｌである。次いで、培地を個々のウェルから廃棄し、２５ｕｌの受動溶解緩衝液で置き換えた。室温で３０分間のインキュベーション後、２５ｕｌのルシフェリンを添加し、レポーター導入遺伝子発現（形質導入効率）を、Ｖｉｃｔｏｒ３照度計を使用してアッセイした。
【０３８６】
マウスモデルにおけるインビボでのＡＡＶ１ｅ変異体の検証のために（図４）、１ｅ９ｖｇ／ｕｌの用量を、中和抗体４Ｅ４（１：５００）もしくは５Ｈ７（１：１０）と共に、またはＰＢＳと共に室温で１時間事前インキュベートした。各マウス（６〜８週齢、ＢＡＬＢ／ｃ、雌性）の後肢の各腓腹筋中に、筋内注射を介して、２０ｕｌのウイルスおよび抗体混合物（２ｅ１０ｖｇ／脚）を注射した。
【０３８７】
マウスを、イソフルランで麻酔し、生動物画像化およびルシフェラーゼレポーター発現のために、１５０ｕｌのＲｅｄｉＪｅｃｔ  Ｄ−ルシフェリン（Ｄ−ｌｕｃｉｆｅｒｃｉｎ）を異なる時間間隔で腹腔内（ＩＰ）注射した。各マウスのルシフェラーゼ活性を、Ｘｅｎｏｇｅｎ  ＩＶＩＳ  Ｌｕｍｉｎａ（登録商標）システムを使用して、注射の１分後に画像化した。生動物ルシフェラーゼ画像化を、注射の１週間後および４週間後に実施し、ルシフェラーゼ活性を定量して、ＡＡＶ１ｅクローンが中和抗体を回避する能力における差異を決定した（図４）。
【０３８８】
抗体回避特性のさらなる増強のために、ＡＡＶ１ｅクローンにおいて発見された変異をカプシド上で組み合わせて、新たなＡＡＶ１ｅ株（クローン１８〜２０）を生成した。これらのクローンを、抗体中和を回避するそれらの能力を決定するために、インビトロ形質導入アッセイに供した。クローンＡＡＶ１ｅ１８〜２０では、ＡＡＶ１に対する両方のモノクローナル抗体、またはポリクローナル抗体を含むヒト血清サンプルを逃避する能力が実証された（図５）。
【０３８９】
［実施例２］
抗体回避性ＡＡＶベクター（ＡＡＶ１ｅシリーズ２７〜３６、ＡＡＶ９ｅ１およびＡＡＶ９ｅ２）の合理的操作
現行のＷＴ  ＡＡＶベクターは、カプシド表面に対して標的化された既存の抗体を有する可能性が高く、これは、効率的な形質導入を防止する。本発明のベクターは、これらの制約を克服する。
【０３９０】
本発明は、形質導入効率を保持するＡＡＶ抗体逃避バリアントを提供する。これらは、カプシド相互作用部位およびカプシド−抗体構造に基づいて既存の抗体応答を克服するように操作され、特定の組織を標的化するためにさらに操作され得る。
【０３９１】
本発明者らは、ＡＡＶカプシドの３Ｄ構造的特徴付け、受容体結合部位、ならびにクライオ電子顕微鏡および画像再構築によって決定されたＡＡＶ−抗体複合体構造から得られた抗原性エピトープ情報に基づいて、抗ＡＡＶカプシドモノクローナルの結合および宿主抗体中和を逃避するように、ＡＡＶ１ならびにＡＡＶ９バリアントを設計した。これらのベクターは、共通抗原性モチーフ（ＣＡＭ；表５）として確立されている、カプシドの可変領域においてアミノ酸変更を含む。これらのＣＡＭ内のアミノ酸残基は、既存の免疫を克服するために、中和抗体を逃避することができる新規ＡＡＶ株（ＡＡＶｅシリーズ）を生成するために改変されており（表７および８）、これらは、前臨床動物研究およびヒト臨床試験において、ＡＡＶ形質導入の有効性にとって有害であることが報告されている。本発明者らは、ドットブロットおよびＥＬＩＳＡを含む生化学的アプローチを使用して、本明細書に記載される変異体をテストし（図６、７、９および１１）、これらの変異体が、親カプシドにおいて標的化された抗体による認識を逃避し、抗カプシド抗体の存在下での中和を逃避し（図８および１０）、遺伝子送達ベクターとしてＡＡＶ１を利用する臨床試験に参加した患者から取得した血清による有意に低下した認識を示す（図１０）ことを観察した。
【０３９２】
【表５】
2018528253.tif 000007
【０３９３】
【表６】
2018528253.tif 000008
【０３９４】
【表７】
2018528253.tif 000009
【０３９５】
【表８】
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【０３９６】
【表９】
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【０３９７】
【表１０】
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【０３９８】
【表１１】
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【０３９９】
【表１２】
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【０４００】
［実施例３］
治療的遺伝子移入のための抗原的に向上したＡＡＶバリアントの構造ベースの反復進化
細胞、ウイルスおよび抗体。ＨＥＫ２９３およびＭＢ１１４細胞を、１０％胎仔ウシ血清（ＦＢＳ）（ＴｈｅｒｍｏＦｉｓｈｅｒ、Ｗａｌｔｈａｍ、ＭＡ）、１００単位／ｍｌのペニシリンおよび１０μｇ／ｍｌのストレプトマイシン（Ｐ／Ｓ）（ＴｈｅｒｍｏＦｉｓｈｅｒ、Ｗａｌｔｈａｍ、ＭＡ）を補充したダルベッコ改変イーグル培地（ＤＭＥＭ）中で、５％ＣＯ２中３７℃で維持した。マウスアデノウイルス１（ＭＡＶ−１）を、Ａｍｅｒｉｃａｎ  Ｔｙｐｅ  Ｃｕｌｔｕｒｅ  Ｃｏｌｌｅｃｔｉｏｎ（ＡＴＣＣ、Ｍａｎｎａｓｓａｓ、ＶＡ）から購入し、１の感染多重度（ＭＯＩ）でＭＢ１１４細胞に感染させることによって増幅した。感染の６日後（およそ５０％の細胞変性効果（ＣＰＥ））に、子孫ＭＡＶ−１ウイルスを含む培地を回収し、３０００ｇで５分間遠心分離し、上清を、引き続く進化研究のために−８０℃で貯蔵した。マウス抗ＡＡＶ１モノクローナル抗体ＡＤＫ１ａ、４Ｅ４および５Ｈ７は、以前に記載されている。非特定化されたナイーブヒト血清サンプルを、Ｖａｌｌｅｙ  Ｂｉｏｍｅｄｉｃａｌ、Ｗｉｎｃｈｅｓｔｅｒ、ＶＡから購入した。アカゲザル由来のナイーブ血清は、Ｙｅｒｋｅｓ  Ｎａｔｉｏｎａｌ  Ｐｒｉｍａｔｅ  Ｃｅｎｔｅｒからであった。ＡＡＶ１カプシドでアカゲザルを筋内（Ｉ．Ｍ．）免疫することによって生成された、ＡＡＶ１カプシドに対する抗血清は、Ｏｒｅｇｏｎ  Ｎａｔｉｏｎａｌ  Ｐｒｉｍａｔｅ  Ｃｅｎｔｅｒからであった。この研究で使用した全てのマウス、ヒトおよび非ヒト霊長類血清は、使用前に５５℃で１５分間熱不活化した。
【０４０１】
組換えＡＡＶの産生、精製および定量。組換えＡＡＶベクターを、三重プラスミドプロトコールに従ってポリエチレンイミン（ＰＥＩ）を使用して、７０〜８０％コンフルエンスでＨＥＫ２９３細胞を含む４枚の１５０ｍｍディッシュをトランスフェクトすることによって産生した。ニワトリベータ−アクチンプロモーターによって駆動されるホタルルシフェラーゼをコードする一本鎖ゲノム（ｓｓＣＢＡ−Ｌｕｃ）、またはハイブリッドニワトリベータ−アクチンプロモーターによって駆動される自己相補的緑色蛍光タンパク質をコードする一本鎖ゲノム（ｓｃＣＢｈ−ＧＦＰ）をパッケージングする組換えベクターを、この方法を使用して生成した。組換えＡＡＶベクターの回収および下流の精製が関与する引き続くステップを、以前に記載したように実施した。組換えＡＡＶベクターの力価を、ＡＡＶ２逆位末端反復（ＩＴＲ）領域を増幅するプライマー５’−ＡＡＣＡＴＧＣＴＡＣＧＣＡＧＡＧＡＧＧＧＡＧＴＧＧ−３’（配列番号４７７）、５’−ＣＡＴＧＡＧＡＣＡＡＧＧＡＡＣＣＣＣＴＡＧＴＧＡＴＧＧＡＧ−３’（配列番号４７８）を用いて、定量的ＰＣＲ（ｑＰＣＲ）によって決定した。
【０４０２】
ＡＡＶ抗原性フットプリントの構造的モデル化および分析。ＡＡＶ血清型１／６、ＡＡＶ２、ＡＡＶ５、ＡＡＶ８およびＡＡＶ９の抗原性フットプリントを、異なるマウスモノクローナル抗体と複合体化したＡＡＶカプシドの以前に解明された構造を使用して決定した。ＡＡＶライブラリー生成の多様性を制限し、ＡＡＶライブラリー生成の効率を最大化するために、抗体と直接接触するアミノ酸残基だけを分析に含めた。各血清型上の接触表面残基を、Ｃｌｕｓｔａｌ  Ｏｍｅｇａソフトウェアによってアラインさせ、またはＰｙＭＯＬ（Ｓｃｈｒｏｄｉｎｇｅｒ、Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ  Ｃｉｔｙ、Ｎ．Ｙ．）を使用して構造的に重ね合わせた。構造的アラインメントにより、複数の血清型由来の抗体フットプリントが、３回回転対象軸にごく接近して、５回回転孔（５−ｆｏｌｄ  ｐｏｒｅ）の周りで、および２回回転窪み（２−ｆｏｌｄ  ｄｅｐｒｅｓｓｉｏｎ）において、重複することが明らかになった。本発明者らは、分析した抗体の１２／１８が、これらのいわゆる共通抗原性モチーフ（ＣＡＭ）と３回回転対称において直接的接触を有することを決定し、これは、この領域が重要な抗原決定基であるという概念を支持している。本研究のために、３つの別個のモノクローナル抗体（４Ｅ４、５Ｈ７およびＡＤＫ１ａ）についての抗原性フットプリントを、ＡＡＶ１カプシド（ＰＤＢ  ＩＤ：３ｎｇ９）上に可視化し、ロードマップ画像を、ＲＩＶＥＭプログラムを使用して生成した。
【０４０３】
ＡＡＶカプシドライブラリーの生成。ＡＡＶライブラリーを、上記個別のモノクローナル抗体と会合する異なる抗原性フットプリント内のアミノ酸残基の飽和変異誘発を介して操作した。簡潔に述べると、Ｇｉｂｓｏｎアセンブリのために、７０ヌクレオチドの平均長さを有する１２のオリゴを、ＩＤＴ（Ｃｏｒａｌｖｉｌｌｅ、ＩＡ）から注文した。各オリゴは、隣接するオリゴに対して少なくとも１５〜２０ｎｔ重複する相同性を含んだ。３つのオリゴは、異なる抗原性フットプリントをコードするゲノム領域内に縮重ヌクレオチド（ＮＮＫ）を含んでいる。次いで、プラスミドライブラリーを、製造業者の指示に従ってＨｉｇｈ  Ｆｉｄｅｌｉｔｙ  Ｇｉｂｓｏｎ  Ａｓｓｅｍｂｌｙ  Ｍｉｘ（ＮＥＢ、Ｉｐｓｗｉｃｈ、ＭＡ）を使用する、複数のオリゴのインビトロアセンブリによって生成した。アセンブルした断片を、Ｐｈｕｓｉｏｎ  ＨＦ（ＮＥＢ、Ｉｐｓｗｉｃｈ、ＭＡ）を使用して１０サイクルＰＣＲ増幅した、またはＢｓｐＥＩ制限部位とＳｂｆＩ制限部位との間でｐＴＲ−ＡＡＶ１＊＊プラスミド中に直接クローニングした。プラスミドｐＴＲ−ＡＡＶ１＊＊は、部位特異的変異誘発（Ａｇｉｌｅｎｔ、Ｓａｎｔａ  Ｃｌａｒａ、ＣＡ）によって導入された４９０位および４９１位（ＡＡＶ１  ＶＰ１番号付け）における２つの終止コドンと共に、ＡＡＶ２  Ｒｅｐをコードする遺伝子およびＡＡＶ１  Ｃａｐをコードする遺伝子を含む。構築物全体には、ヘルパーウイルスの同時感染の際にシュードタイプ化ＡＡＶ１ライブラリーのパッケージングおよび複製を可能にするためにＡＡＶ２逆位末端反復（ＩＴＲ）が隣接する。異なるライブラリー内の野生型ＡＡＶ１夾雑を低下させるために、ライブラリークローニングの前にＡＡＶ１＊＊カプシド遺伝子を組み込んだことに言及することは注目に値する。次いで、ライゲーション反応を、エタノール沈殿によって濃縮および精製した。精製されたライゲーション産物を、ＤＨ１０Ｂ  ｅｌｅｃｔｒｏＭａｘ（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ、Ｃａｒｌｓｂａｄ、ＣＡ）中にエレクトロポレーションし、複数の５２４５ｍｍ２バイオアッセイディッシュ（Ｃｏｒｎｉｎｇ、Ｃｏｒｎｉｎｇ、ＮＹ）上に直接プレートして、細菌懸濁液培養物からのバイアスを回避した。ｐＴＲ−ＡＡＶ１ＣＡＭライブラリー由来のプラスミドＤＮＡを、Ｍａｘｉｐｒｅｐキット（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ、Ｃａｒｌｓｂａｄ、ＣＡ）を使用して、ＬＢ寒天プレート上で増殖させたプールしたコロニーから精製した。
【０４０４】
新規ＡＡＶ  ＣＡＭ株の指向性進化。等量（各々１５μｇ）の各ｐＴＲ−ＡＡＶ１ＣＡＭライブラリーおよびＡｄヘルパープラスミドｐＸＸ６８０を、ＰＥＩを使用して、各１５０ｍｍディッシュ上で７０〜８０％コンフルエンシーでＨＥＫ２９３細胞にトランスフェクトして、ＣＡＭウイルスライブラリーを生成した。ＡＡＶ  ＣＡＭライブラリーを、既に記載した標準的な手順を使用して精製した。ＭＢ１１４細胞を、６０〜７０％コンフルエンスに達するまで１００ｍｍ組織培養ディッシュ上に一晩播種し、その後、１０００〜１０，０００の範囲のＭＯＩでＡＡＶ  ＣＡＭライブラリーを接種した。形質導入の２４時間後に、ＭＡＶ−１をヘルパーウイルスとして添加して、ＡＡＶ複製を促進した。ＭＡＶ−１（５０％  ＣＰＥ）による感染の６日後に、上清を回収し、ＤＮａｓｅ  Ｉ抵抗性ベクターゲノムを、７日目に定量した。次いで、感染の各ラウンドから取得された複製性のＡＡＶ株およびＭＡＶ−１を含む培地を、合計５ラウンドの進化にわたって、各引き続くサイクルのための接種材料として使用した。引き続く反復ラウンドの進化を、新たに進化した抗原性フットプリントの異なる順列および組み合わせを含むＡＡＶカプシドライブラリーを用いて、類似の様式で実施した。
【０４０５】
新たに進化したＡＡＶ株の同定。親および進化したＡＡＶ  ＣＡＭライブラリーの配列多様性を分析するために、ＤＮａｓｅ  Ｉ抵抗性ベクターゲノムを培地から単離し、プライマー５’−ＣＣＣＴＡＣＡＣＧＡＣＧＣＴＣＴＴＣＣＧＡＴＣＴＮＮＮＮＮｃａｇａａｃｔｃａａａａｔｃａｇｔｃｃｇｇａａｇｔ−３’（配列番号４７９）および５’−ＧＡＣＴＧＧＡＧＴＴＣＡＧＡＣＧＴＧＴＧＣＴＣＴＴＣＣＧＡＴＣＴＮＮＮＮＮｇｃｃａｇｇｔａａｔｇｃｔｃｃｃａｔａｇｃ−３’（配列番号４８０）を使用して、１０〜１８サイクルにわたってＱ５ポリメラーゼ（ＮＥＢ、Ｉｐｓｗｉｃｈ、ＭＡ）によって増幅した。マルチプレックスのためのＩｌｌｕｍｉｎａ  ＭｉＳｅｑ配列決定アダプターを、Ｐ５プライマーおよびＰ７プライマーと共にＱ５ポリメラーゼを用いるＰＣＲの第２ラウンドを通じて添加した。ＰＣＲの各ラウンド後に、産物を、ＰｕｒｅＬｉｎｋ  ＰＣＲ  Ｍｉｃｒｏ  Ｋｉｔ（ＴｈｅｒｍｏＦｉｓｈｅｒ、Ｗａｌｔｈａｍ、ＭＡ）を使用して精製した。アンプリコンの量を、Ｂｉｏａｎａｌｙｚｅｒ（Ａｇｉｌｅｎｔ）を使用して検証し、Ｑｕｂｉｔ分光計（ＴｈｅｒｍｏＦｉｓｈｅｒ、Ｗａｌｔｈａｍ、ＭＡ）を使用して濃度を定量した。次いで、ライブラリーを、製造業者の指示に従ってＭｉＳｅｑ  ３００  Ｋｉｔ  ｖ２を用いる配列決定のために調製し、ＭｉＳｅｑシステム（Ｉｌｌｕｍｉｎａ）で配列決定した。
【０４０６】
配列決定データ分析。デマルチプレックスされた読み取りを、カスタムＰｅｒｌスクリプトを介して分析した。簡潔に述べると、生配列決定ファイルを、目的の変異誘発された領域について探索し、この領域中の異なるヌクレオチド配列の頻度を計数し、各ライブラリーについて順位付けした。ヌクレオチド配列を翻訳もし、これらのアミノ酸配列を、同様に計数および順位付けした。次いで、ライブラリーを横断するアミノ酸配列頻度を、Ｒでプロットした。
【０４０７】
特徴付けのためのＡＡＶ  ＣＡＭバリアントの単離。各ライブラリーから選択されたクローンを特徴付けるために、ＤＮａｓｅ  Ｉ抵抗性ベクターゲノムを培地から単離し、ＢｓｐＥＩ部位およびＳｂｆＩ部位に隣接するプライマーを使用して、Ｐｈｕｓｉｏｎ  ＨＦ（ＮＥＢ、Ｉｐｓｗｉｃｈ、ＭＡ）によって増幅した。ＰＣＲ産物をゲル精製し、ＴＯＰＯクローニングベクター（ＴｈｅｒｍｏＦｉｓｈｅｒ、Ｗａｌｔｈａｍ、ＭＡ）中にサブクローニングし、標準的なＳａｎｇｅｒ配列決定（Ｅｔｏｎ  Ｂｉｏｓｃｉｅｎｃｅ、Ｓａｎ  Ｄｉｅｇｏ、ＣＡ）のために送り出した。独自の配列を、ＢｓｐＥＩ部位およびＳｂｆＩ部位を使用して、ＡＡＶヘルパープラスミド骨格ｐＸＲ中にサブクローニングした。独自の組換えＡＡＶ  ＣＡＭバリアントを、上記のような標準的なｒＡＡＶ産生プロトコールに従って産生した。
【０４０８】
インビトロ抗体および血清中和アッセイ。２５マイクロリットルの抗体または抗血清（個々の実験について特定したとおり）を、組織培養物処理した黒色のガラス底９６ウェルプレート（Ｃｏｒｎｉｎｇ、Ｃｏｒｎｉｎｇ、ＮＹ）中で、組換えＡＡＶベクター（ＭＯＩ  １，０００〜１０，０００）を含む等容量と混合し、室温（ＲＴ°）で３０分間インキュベートした。次いで、５０μｌの培地中合計５×１０４のＨＥＫ２９３細胞を各ウェルに添加し、これらのプレートを、５％ＣＯ２中３７℃で４８時間インキュベートした。次いで、細胞を、２５μｌの１×受動溶解緩衝液（Ｐｒｏｍｅｇａ、Ｍａｄｉｓｏｎ、ＷＩ）でＲＴで３０分間溶解させた。ルシフェラーゼ活性を、２５μｌのルシフェリン（Ｐｒｏｍｅｇａ、Ｍａｄｉｓｏｎ、ＷＩ）の添加の直後に、Ｖｉｃｔｏｒ  ３マルチラベルプレートリーダー（Ｐｅｒｋｉｎ  Ｅｌｍｅｒ、Ｗａｌｔｈａｍ、ＭＡ）で測定した。全ての読み出しを、抗体／抗血清処理なしの対照に対して標準化した。ＤＭＥＭ＋５％ＦＢＳ＋Ｐ／Ｓ中に事前に希釈した、ｓｓＣＢＡ−Ｌｕｃ導入遺伝子をパッケージングする組換えＡＡＶベクターを、このアッセイで利用した。
【０４０９】
インビボ抗体中和アッセイ。６〜８週齢の雌性ＢＡｌｂ／ｃマウス（Ｊａｃｋｓｏｎ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ、Ｂａｙ  Ｈａｒｂｏｒ、ＭＥ）の各後肢に、２０μｌの最終容量で、それぞれ１：５００希釈、１：５０希釈および１：５希釈の３つの異なるモノクローナル抗体４Ｅ４、５Ｈ７およびＡＤＫ１ａと事前混合した、ＣＢＡ−ＬｕｃをパッケージングするＡＡＶ２×１０１０を、筋内（Ｉ．Ｍ．）注射した。注射の４週間後、ルシフェラーゼ活性を、マウス１匹当たり１７５μｌのインビボ  Ｄ−ルシフェリン（１２０ｍｇ／ｋｇ  Ｎａｎｏｌｉｇｈｔ、Ｐｉｎｅｔｏｐ、ＡＺ）の腹腔内（Ｉ．Ｐ．）注射の５分後に、Ｘｅｎｏｇｅｎ  ＩＶＩＳ  Ｌｕｍｉｎａシステム（ＰｅｒｋｉｎＥｌｍｅｒ  Ｌｉｆｅ  Ｓｃｉｅｎｃｅｓ／Ｃａｌｉｐｅｒ  Ｌｉｆｅ  Ｓｃｉｅｎｃｅｓ、Ｗａｌｔｈａｍ、ＭＡ）を使用して測定した。ルシフェラーゼ活性を、光子／秒／ｃｍ２／ｓｒとして測定し、Ｌｉｖｉｎｇ  Ｉｍａｇｅ  ３．２ソフトウェア（Ｃａｌｉｐｅｒ  Ｌｉｆｅ  Ｓｃｉｅｎｃｅｓ、Ｗａｌｔｈａｍ、ＭＡ）を使用して分析した。
【０４１０】
免疫化による抗ＡＡＶ１マウス血清の生成。２０μｌのＰＢＳ中１×１０１０ｖｇのｗｔＡＡＶ１を、６〜８週齢の雌性Ｂａｌｂ／ｃマウスの各後肢に筋内注射した。全血を、注射の４週間後に心穿刺によって回収し、血清を、標準的な凝固および遠心分離プロトコールを使用して単離した。簡潔に述べると、マウス血液を、ＲＴ°で３０分間凝固させ、４℃で２０００ｇで１０分間遠心分離した。全ての血清を、５５℃で１５分間熱不活化し、−８０℃で貯蔵した。
【０４１１】
マウスにおけるＡＡＶ  ＣＡＭバリアントのインビボ特徴付け。２００μｌのＰＢＳ中１×１０１１ｖｇの用量の、ｓｃＣＢｈ−ＧＦＰ導入遺伝子カセットをパッケージングするＡＡＶベクターを、尾部静脈を介してＣ５７／Ｂｌ６マウスに静脈内（Ｉ．Ｖ．）注射した。マウスを、注射の３週間後に屠殺し、ＰＢＳ中４％のパラホルムアルデヒド（ＰＦＡ）で灌流した。心臓、脳、肝臓および腎臓を含む複数の臓器を回収した。組織を、ビブラトームＶＴ１２００Ｓ（Ｌｅｉｃａ、Ｗｅｌｚｌａｒ、Ｇｅｒｍａｎｙ）によって５０μｍの薄いスライスに薄片化し、以前に記載された標準的な免疫組織化学３，３’−ジアミノベンジジン（ＤＡＢ）染色手順を用いてＧＦＰについて染色した。３匹の異なるマウス由来の臓器１つ当たり少なくとも３つの切片を、スライドスキャンのために提出した。体内分布分析のために、１×１０１１ｖｇの、ｓｓＣＢＡ−ＬｕｃをパッケージングするＡＡＶベクターを、Ｂａｌｂ／Ｃマウスにおいて上述のようにＩ．Ｖ．注射した。注射の２週間後、マウスを屠殺し、１×ＰＢＳで灌流した。心臓、脳、肺、肝臓、脾臓、腎臓および筋肉を含む複数の臓器を回収した。ＤＮＡを、製造業者の指示に従ってＤＮｅａｓｙキット（Ｑｉａｇｅｎ、Ｈｉｌｄｅｎ、Ｇｅｒｍａｎｙ）を使用して回収した。ベクターゲノムコピー数を、ルシフェラーゼ導入遺伝子プライマー５’−ＣＣＴＴＣＧＣＴＴＣＡＡＡＡＡＡＴＧＧＡＡＣ−３’（配列番号４８１）および５’−ＡＡＡＡＧＣＡＣＴＣＴＧＡＴＴＧＡＣＡＡＡＴＡＣ−３’（配列番号４８２）を使用して、以前に記載されたように使用する定量的ＰＣＲ（ｑＰＣＲ）によって決定した。ウイルスゲノムコピー数を、各サンプル中のマウスゲノムＤＮＡに対して標準化した。組織サンプルもまた、３回の４５秒パルスにわたって２０ｈｚの周波数でＱｉａｇｅｎ  ＴｉｓｓｕｅＬｙｓｅｒＩＩを使用する１×ＰＬＢ（Ｐｒｏｍｅｇａ、Ｍａｄｉｓｏｎ、ＷＩ）中でのホモジネート化によって、ルシフェラーゼ活性アッセイのために処理した。ホモジネートをスピンダウンし、２０μｌの上清を５０μｌのルシフェリン（Ｐｒｏｍｅｇａ、Ｍａｄｉｓｏｎ、ＷＩ）と混合し、Ｖｉｃｔｏｒ  ３マルチラベルプレートリーダー（Ｐｅｒｋｉｎ  Ｅｌｍｅｒ、Ｗａｌｔｈａｍ、ＭＡ）を使用して即座に測定した。
【０４１２】
脳室内（Ｉ．Ｃ．Ｖ．）注射。出生後０日目（Ｐ０）のＣ５７／Ｂｌ６仔を、氷上で２分間麻酔し、その後、ｓｃＣＢｈ−ＧＦＰ導入遺伝子カセットをパッケージングするＡＡＶベクターによる定位Ｉ．Ｃ．Ｖ．注射を行った。３μｌのＰＢＳ中３×１０９ｖｇの用量を、ＫＯＰＦ−９００小動物定位機器（ＫＯＰＦ  ｉｎｓｔｒｕｍｅｎｔｓ、Ｔｕｊｕｎｇａ、ＣＡ）に取り付けた、２６ｓゲージ針を備えたＨａｍｉｌｔｏｎ  ７００シリーズのシリンジ（Ｓｉｇｍａ−Ａｌｄｒｉｃｈ、Ｓｔ．Ｌｏｕｉｓ、ＭＯ）を使用して、左側脳室中に注射した。全ての新生児注射を、矢状静脈洞に対して０．５ｍｍ、横静脈洞に対して２ｍｍ吻側、および１．５ｍｍの深さで実施した。ベクター投与後、マウスを、加熱ランプ下で甦生し、寝具中でこすり、その後母獣のもとに戻した。マウス脳を、ベクター投与の２週間後（Ｐ１４）に回収した。脳を、事後固定し、以前に記載されたように免疫染色した。
【０４１３】
ウエスタンブロットおよび電子顕微鏡。合計５×１０９のウイルスゲノムを、ＮｕＰＡＧＥ  ＬＤＳサンプル緩衝液（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ、Ｃａｒｌｓｂａｄ、ＣＡ）＋５０ｍＭの１，４−ジチオスレイトール（ＤＴＴ）中に再懸濁した。サンプルを、ＮｕＰＡＧＥ  ４〜１２％  Ｂｉｓ−Ｔｒｉｓ  Ｇｅｌ上で泳動し、ポリフッ化ビニリデン（ＰＶＤＦ）メンブレン（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ、Ｃａｒｌｓｂａｄ、ＣＡ）上に移した。ＡＡＶカプシドタンパク質を、マウスモノクローナル抗体Ｂ１（１：５０）、および西洋ワサビペルオキシダーゼ（ＨＲＰ）とコンジュゲート化した二次ヤギ抗マウス（Ｊａｃｋｓｏｎ  Ｉｍｍｕｎｏ  Ｒｅｓｅａｒｃｈ  Ｌａｂｓ、Ｗｅｓｔ  Ｇｒｏｖｅ、ＰＡ）を使用して検出した。ＥＭ研究のために、１×１０９ｖｇ／μｌのウイルスをＰＢＳ中で調製し、Ｆｏｒｍｖａｒ／Ｃａｒｂｏｎ  ４００メッシュ、Ｃｕグリッド（ＴＥＤ  Ｐｅｌｌａ、Ｒｅｄｄｉｎｇ、ＣＡ）上で吸収した。サンプルを、２％酢酸ウラニルで陰性染色し、Ｚｅｉｓｓ  Ｓｕｐｒａ  ２５電界放出型走査型電子顕微鏡を使用して分析した。
【０４１４】
ＡＡＶ−抗体複合体の構造的分析は、反復アプローチが新規ＡＡＶバリアントを進化させるのを可能にする。本発明者らは、抗ＡＡＶ１モノクローナル抗体の４つの異なる断片抗原結合（Ｆａｂ）領域と複合体化したＡＡＶ１カプシドの、以前に解明されたクライオ再構築された構造を分析した。３次元再構築により、このサブセットの抗体が、ＡＡＶ１カプシド表面全体をほぼマスクすることが明らかになった（図１２Ａ）。次いで、本発明者らは、これらの抗原性フットプリント内にあり、異なる抗体との直接接触に関与するカプシド表面残基のサブセットを同定した（ロードマップ画像の構築を介して）（図１２Ｂ）。さらなる分析および異なるＡＡＶ血清型との比較により、カプシド表面上の３回回転対象軸における共通抗原性フットプリントの著明なクラスタリングが明らかになった。具体的には、３つの表面領域、共通抗原性モチーフ４（ＣＡＭ４；４５６−ＡＱＮＫ−４５９、配列番号４８３）、共通抗原性モチーフ５（ＣＡＭ５；４９３−ＫＴＤＮＮＮＳ−４９９、配列番号４８４）および共通抗原性モチーフ８（ＣＡＭ８；５８８−ＳＴＤＰＡＴＧＤＶＨ−５９７、配列番号３０９）内のアミノ酸残基を、異なるＡＡＶライブラリーの飽和変異誘発および生成のために選択した。上に列挙した異なるＣＡＭは、以前に概説した可変領域（ＶＲ）４、５および８のサブセットであることに留意することが重要である。次いで、各ＡＡＶカプシドライブラリーを、親ＡＡＶ１株に対して高度に許容的な血管内皮細胞における５ラウンドの指向性進化に供した（図１２Ｃ）。新規ＡＡＶバリアントを同定し、組み合わせＡＡＶライブラリーを、後者を鋳型として使用して操作した。反復ラウンドの進化およびカプシド操作により、本研究で特徴付けた新規の抗原的に向上したＡＡＶ株が得られた（図１２Ｄ）。
【０４１５】
ＡＡＶカプシド表面上の抗原性フットプリントは、著しく柔軟であり、進化可能である。上に概説したように、ＡＡＶ  ＣＡＭ４、ＣＡＭ５およびＣＡＭ８ライブラリーを、５ラウンドの指向性進化に供した。次いで、ライブラリーを、ＭｉＳｅｑシステム（Ｉｌｌｕｍｉｎａ）を使用して配列決定し、ここで、各未選択の（親）ライブラリーは、約２×１０６の読み取りで配列決定し、選択された（進化した）ライブラリーは、約２×１０５の読み取りで配列決定した。デマルチプレックスされた読み取りを、全てのライブラリーについて、カスタムＰｅｒｌスクリプトを用いて、これらの領域に対する高い百分率の読み取りマッピングを有する、目的の変異誘発された領域について探索した（図２０〜２１）。ヌクレオチドレベルおよびアミノ酸レベルの両方において、全ての未選択のライブラリーでは、多様性が高く、および何らかの特定の配列へのバイアスは最小限であることが実証されたが、進化したライブラリーは、１つまたは複数のリードバリアントの出現率における劇的な増強を示した（図１３Ａ〜Ｃ、Ｅ〜Ｇ）。さらに、各ライブラリーについての上位１０の選択されたバリアント内で、多くのアミノ酸配列が、複数の残基において類似性を示した（図１３Ｅ〜Ｇ）。例えば、進化したＣＡＭ５ライブラリーでは、目的の変異誘発された領域にわたる配列の９７．５５％が、ＴＰＧＧＮＡＴＲ（配列番号４８５）を読み取ったが、微量のバリアントは、この配列に大きく似ていた（図１３Ｆ）。ＣＡＭ８の場合、本発明者らは、アミノ酸残基ＴＡＤＨＤＴＫＧＶ（配列番号４８６）を有するバリアントについて有意な富化（８６．６％）を観察した（図１３Ｇ）。進化したＣＡＭ４ライブラリーでは、その抗原性領域内で許容されるアミノ酸残基の範囲によって明らかなように、より高い柔軟性（ＱＶＲＧ（配列番号２２）、６９．５７％；ＥＲＰＲ（配列番号２３）、１４．０５％；ＳＧＧＲ（配列番号２５）、３．６２％）が実証された（図１３Ａ）。次いで、本発明者らは、進化したＣＡＭ５ライブラリー由来のリードエピトープおよびランダム化されたＣＡＭ８領域を有する組み合わせＡＡＶライブラリー（ＣＡＭ５８、図１３Ｄ）を生成した。興味深いことに、このライブラリーを指向性進化に供することで、ＣＡＭ８領域（９２．２７％）において、野生型ＡＡＶ１配列、即ちＳＴＤＰＡＴＧＤＶＨ（配列番号３０９）が得られた（図１３Ｈ）。配列ＤＬＤＰＫＡＴＥＶＥ（配列番号４８７）を有する二次的なバリアントもまた富化されたが（１．４％）（図１３Ｄ）、後の観察により、ＣＡＭ５領域とＣＡＭ８領域との間の相互作用によって課される進化的および構造的制約が実証されている。これらの制約を、これら新規ＣＡＭ４、５または８バリアント由来の異なるエピトープの合理的組み合わせによってさらに評価した。それにもかかわらず、これらの結果は、ＡＡＶカプシド表面上の抗原性フットプリントが、変異可能であり、感染力を維持しつつ新規フットプリントへと進化され得るという概念を裏付けている。
【０４１６】
個々に進化したＡＡＶ  ＣＡＭバリアントは、親ＡＡＶ１血清型と類似である。複数の進化したＡＡＶバリアント、具体的にはＣＡＭ１０１〜１０７（領域４）、ＣＡＭ１０８（領域５）およびＣＡＭ１０９〜１１６（領域８）を、引き続く特徴付けのために各ライブラリーから選択した。ｓｓＣＢＡ−Ｌｕｃゲノムをパッケージングする全てのＣＡＭバリアントを産生し、それらの形質導入効率を血管内皮細胞において評価した（図１９Ａ〜１９Ｃ）。最も高い形質導入効率を示した各進化したライブラリー由来の単一ＣＡＭバリアントを、さらなる特徴付けのために最終候補リストに載せた。具体的には、ＣＡＭ１０６（４５６−ＳＥＲＲ−４５９、配列番号２６）、ＣＡＭ１０８（４９２−ＴＰＧＧＮＡＴＲ−４９９、配列番号４８５）およびＣＡＭ１０９（５８８−ＴＡＤＨＤＴＫＧＶＬ−５９７、配列番号３２））は、親ＡＡＶ１と比較して、血管内皮細胞に対し、同様の形質導入効率から控えめに改善された形質導入効率までを示した。これらの観察は、抗原性フットプリントを、対応する親ＡＡＶ株の内因性の特質を維持または改善しつつ、再操作することおよび進化させることができるという概念を支持している。これらのリードＣＡＭバリアントの物理的特性のさらなる評価により、収量（ベクターゲノム力価）、カプシド形態（ＥＭ）およびパッケージング効率（満たされた粒子対空の粒子の割合）が、親ＡＡＶ１ベクターに匹敵したことが確認された（図１９Ａ〜１９Ｃ）。
【０４１７】
個々のＣＡＭバリアントは、モノクローナル抗体による中和を回避する。本発明者らは、以前に記載されたマウスモノクローナル抗体ＡＤＫ１ａ、４Ｅ４および５Ｈ７による中和を単一領域ＣＡＭバリアントが逃避する能力を最初に評価した。図１４Ａ〜Ｃに示されるように、各ＣＡＭバリアントは、別個のＮＡｂ逃避プロファイルを示す。予測されるように、親ＡＡＶ１は、異なる希釈でテストした全てのＭＡｂによって中和された。ＣＡＭ１０６およびＣＡＭ１０８バリアントは、４Ｅ４による中和に対して抵抗性であったが、ＣＡＭ１０９は、ＡＡＶ１と同様に完全に中和された（図１４Ａ）。次に、本発明者らは、ＣＡＭ１０８およびＣＡＭ１０９が共に、５Ｈ７による中和を逃避するが、ＣＡＭ１０６がＡＡＶ１と同様に５Ｈ７によって有意に影響されたことを決定した（図１４Ｂ）。ＡＤＫ１ａを用いると、ＣＡＭ１０６は、中和に対して完全に抵抗性であったが、ＣＡＭ１０８およびＣＡＭ１０９は共に、効率的に中和された（図１４Ｃ）。
【０４１８】
モノクローナル抗体に対するＣＡＭバリアントのインビボ中和プロファイル。ＣＡＭバリアントが中和を逃避する能力がインビボで再現できるかどうかをさらにテストするために、ｓｓＣＢＡ−ＬｕｃをパッケージングするＡＡＶ１およびＣＡＭバリアントを、対応するＭＡｂと混合し、マウスに筋内注射した。ＭＡｂの非存在下では、全てのＣＡＭバリアントおよびＡＡＶ１は、マウス筋肉において同様のルシフェラーゼ導入遺伝子発現を示した（図１４Ｅ）。抗体の存在下では、ＣＡＭバリアントの中和プロファイルは、インビトロ研究からの結果を裏付けた。簡潔に述べると、ＣＡＭ１０６は、ＡＤＫ１ａおよび４Ｅ４に対して抵抗性であったが、ＣＡＭ１０８は、４Ｅ４または５Ｈ７の存在下でマウス筋肉に効率的に形質導入し、ＣＡＭ１０９は、高い効率で５Ｈ７を回避する。重要なことに、マウス筋肉のＡＡＶ１形質導入は、これらの抗体のいずれかと共投与した場合、完全に消失した（図１４Ｆ〜Ｈ）。ＡＡＶ１に対して標準化した、ＣＡＭバリアントによるルシフェラーゼ導入遺伝子発現の定量的分析により、これらの観察が確認された（図１４Ｉ）。
【０４１９】
単一領域ＣＡＭバリアント上の複雑な抗原性フットプリントの反復操作。ＭＡｂ中和研究からの有望な結果に基づいて、本発明者らは、異なる進化した抗原性フットプリントを組み合わせることが、より良いＮＡｂ回避を可能にすると仮説を立てた。それを達成するために、本発明者らは、合理的変異誘発、ライブラリー生成および反復進化の組み合わせを介して、４つのバリアントを生成した。最初に、本発明者らは、ＣＡＭ１０６およびＣＡＭ１０８からの抗原性フットプリントの合理的組み合わせが、ＣＡＭ１１７と呼ばれる機能的で安定なＡＡＶバリアントを生じたことを観察した（図１５Ａ）。しかし、本発明者らは、ＣＡＭ１０８およびＣＡＭ１０９上の抗原的に向上したフットプリントを構成するアミノ酸残基が、構造的に適合性でなかった（低下したウイルス力価）ことを観察した。構造的適合性を促進するために、本発明者らは、ＣＡＭ１０８を鋳型として使用し、領域８中のアミノ酸残基の飽和変異誘発を実施することによって、新たなＡＡＶカプシドライブラリーを生成した。血管内皮細胞に対する３反復サイクルの指向性進化の後、いくつかの生存バリアントが生成された（図１５Ａ）。最初の特徴付け後、ＣＡＭ１２５（領域５、４９２−ＴＰＧＧＮＡＴＲ−４９９（配列番号４８５）；領域８、５８８−ＤＬＤＰＫＡＴＥＶＥ−５９７（配列番号４８７））を、さらなる分析のために選択した。次いで、本発明者らは、ＣＡＭ１０６由来の進化した抗原性フットプリントをＣＡＭ１２５に移植することによって、第３のバリアント（ＣＡＭ１３０）を反復して操作した。ＣＡＭ１３０バリアントは、３つの別個の抗原性フットプリント中に、領域４、４５６−ＳＥＲＲ−４５９（配列番号２６；領域５、４９２−ＴＰＧＧＮＡＴＲ−４９９（配列番号４８５）および領域８、５８８−ＤＬＤＰＫＡＴＥＶＥ−５９７（配列番号４８７）のアミノ酸残基を含む（図１５Ａ）。３つ全ての反復して操作されたバリアントＣＡＭ１１７、ＣＡＭ１２５およびＣＡＭ１３０は、力価および満たされた粒子対空の粒子の割合に関して、親ＡＡＶ１と比較して類似の物理的特質を示す（図１９Ａ〜１９Ｃ）。
【０４２０】
ＣＡＭ１１７、ＣＡＭ１２５およびＣＡＭ１３０は、事前免疫したマウス由来の中和抗血清を逃避する。抗原的に向上したＣＡＭバリアントで、血清中に見出されるポリクローナル中和抗体からの逃避が実証され得るかどうかをテストするために、本発明者らは、野生型ＡＡＶ１カプシドによる免疫化によって、マウスを血清転換した。全体として、個々のマウスから取得された抗血清は、ＡＡＶ１を効率的に中和したが、ＣＡＭ１１７、ＣＡＭ１２５およびＣＡＭ１３０は、中和に対する増加した抵抗性を示す（図１５Ｂ〜Ｄ）。簡潔に述べると、本発明者らは、２オーダーの大きさにわたる範囲の抗血清希釈（１：３２００〜１：５０）をテストして、シグモイダル中和曲線を作成した。図１５Ｂ〜Ｄで見られるように、ＡＡＶ１と比較した場合、これらのＣＡＭバリアントは、右への劇的なシフトを示し、これは、抗ＡＡＶ１血清を回避する改善された能力を示している。特に、形質導入の５０％の中和に必要な血清濃度（ＮＤ５０）は、各個々の対象において、親ＡＡＶ１と比較して、各ＣＡＭバリアントの場合において有意に高い（図１５Ｂ〜Ｄ）。さらに、本発明者らは、各反復操作／進化ステップで、ＮＡｂを回避する漸進的な能力を観察した。具体的には、最も抗原的に向上したバリアントＣＡＭ１３０は、ＮＤ５０値における８〜１６倍の改善を示す（図１５Ｂ〜Ｄ）。これらの結果は、ＡＡＶカプシド上の抗原性フットプリントが、モジュラーであり、ＮＡｂ回避を媒介するそれらの能力において累積的であるという概念を裏付けている。類似してはいるがあまり強固でない傾向が、対照としてのナイーブマウスから取得された血清の中和能に関して観察された（図１５Ｅ）。
【０４２１】
ＣＡＭ１３０は、非ヒト霊長類抗血清による中和を効率的に回避する。本発明者らのアプローチがより大きい動物モデルに移すことができるかどうかを検証するために、本発明者らは、非ヒト霊長類において生成されたＮＡｂをＡＡＶ１およびリードバリアントＣＡＭ１３０が回避する能力をテストした。簡潔に述べると、本発明者らは、３つの異なる時点−免疫化前（ナイーブ）、免疫化の４週間後および９週間後−において回収した血清を使用する中和アッセイに、ＡＡＶベクターを供した。全てのマカクは、対象１および２では４週目に最も高いレベルおよび９週目に衰退するＮＡｂ力価で、対象３では９週目に増加した効力で、免疫化後に血清転換した（図１６Ａ〜Ｉ）。さらに、免疫化前の対象１および３由来のナイーブ血清は、ＡＡＶ１を効率的に中和できた（図１６Ａおよび１６Ｇ）。本発明者らは、２オーダーの大きさにわたる範囲の抗血清希釈（１：３２０〜１：５）をテストして、以前に記載したように中和曲線を生成した。免疫化の４週間後に取得した抗血清は、ＮＤ５０＞１：３２０でＡＡＶ１を効率的に中和した。対照的に、ＣＡＭ１３０は、右への有意なシフトを示し、ＡＡＶ１と比較して、中和に対する抵抗性を４〜１６倍改善した（図１６Ｂ、１６Ｅ、１６Ｈ）。免疫化の９週間後に取得された抗血清を評価した場合、ＣＡＭ１３０の場合に、ＮＡｂに対する抵抗性における同様の傾向および増強が観察された（図１６Ｃ、１６Ｆ、１６Ｉ）。さらに、これらの結果は、ＡＡＶカプシドの抗原性が、マウスＭＡｂフットプリントから得られた構造的合図に基づいて、異なる動物種由来の中和抗体を広く逃避するように再操作できるという概念を強く支持している。
【０４２２】
ＣＡＭ１３０は、霊長類およびヒト血清中のＮＡｂを効率的に回避する。ＣＡＭ１３０が一般的な非ヒト霊長類およびヒト集団においてＮＡｂを回避できるかどうかをテストするために、本発明者らは、各々１０の対象のコホートから取得した血清サンプルをテストした。本発明者らは、血友病および全身ＡＡＶ投与を必要とする他の適応症のための進行中の臨床試験において使用される、現在義務付けられている排除基準を反映させるために、１：５の固定された血清希釈を評価した。図１７Ａで見られるように、霊長類対象ｐ−Ａおよびｐ−Ｂは、ＡＡＶ１およびＣＡＭ１３０の両方を完全に中和した高いＮＡｂ力価を示した。スペクトルの他方の終端では、対象ｐ−Ｉおよびｐ−Ｊは、ＡＡＶカプシドに対する既存の免疫を示さず、ＡＡＶ１もＣＡＭ１３０も効率的には中和しなかった。しかし、対象ｐ−Ｃ〜ｐ−Ｈについての血清サンプルは、ＡＡＶ１を効率的に中和し、未処理の対照の５０％を下回って形質導入効率を低下させた。対照的に、血清サンプルｐ−Ｃ〜ｐ−Ｈは、抗原的に向上したＣＡＭ１３０バリアントを中和できなかった。従って、ＣＡＭ１３０は、１０の血清サンプルのうち８を回避することにより、このコホートにおいて例外的なＮＡｂ回避を示す（図１７Ａ）。次いで、本発明者らは、類似のアプローチを利用して、１０のヒト対象由来の血清をテストした。臨床的に適切な排除基準（１：５希釈）を使用して、本発明者らは、ＡＡＶ１を効率的に中和した、２つの高い力価（ｈ−Ａおよびｈ−Ｂ）、６つの中間の力価（ｈ−Ｃ〜ｈ−Ｈ）および２つの控えめな力価の下位群へと、ヒト血清を分別した。ＣＡＭ１３０が、テストした８／１０サンプルについて、ヒト血清中のポリクローナルＮＡｂを回避できた点は際立っていた（図１７Ｂ）。合わせると、これらの研究は、抗原的に向上したＣＡＭ１３０バリアントが、患者コホートを有意に拡張できるという概念を強く支持している。
【０４２３】
ＣＡＭ１３０は、インビボで有利な形質導入プロファイルを示す。本発明者らは、マウスにおいて、ＣＡＭ１３０のインビボ組織トロピズム、形質導入効率および体内分布を、親ＡＡＶ１株と比較した。１×１０１１ｖｇ／マウスの用量の、ｓｃＣＢｈ−ＧＦＰをパッケージングするＡＡＶベクターを、尾部静脈を介して６〜８週齢の雌性ＢＡＬＢ／ｃマウスに静脈内注射した。注射の２週間後に、ＣＡＭ１３０は、ＡＡＶ１と比較して増強された心ＧＦＰ発現プロファイルを示したが、肝臓における差異は平凡であった。特に、より多くのＧＦＰ陽性の心筋線維が、ＡＡＶ１コホートと比較して、ＣＡＭ１３０処理した動物において検出可能である。次いで、本発明者らは、１×１０１１ｖｇ／マウスの、ｓｓＣＢＡ−ＬｕｃゲノムをパッケージングするＡＡＶベクターを、上記のように静脈内投与した。自己相補的ＣＡＭ１３０ベクターからのＧＦＰ発現とは対照的に、ｓｓＣＡＭ１３０対ＡＡＶ１処理マウスについて、心臓内のルシフェラーゼ活性における有意な差異は注目されなかった（図１８Ａ）。しかし、ルシフェラーゼ発現における控えめではあるが統計的に有意な増加が、肝臓内で観察された（図１８Ｃ）。他の主要な臓器、即ち、肺、脳、腎臓および脾臓における形質導入効率は低かった。重要なことに、ＣＡＭ１３０およびＡＡＶ１ベクターの全身体内分布において、差異は注目されなかった。以前の報告と一致して、約１０倍高いベクターゲノムコピー数が、ＣＡＭ１３０ベクターおよびＡＡＶ１ベクターの両方について、心組織と比較して肝臓において検出された（図１８Ｂおよび１８Ｄ）。
【０４２４】
ＣＡＭ１３０の効力およびトロピズムをＡＡＶ１とさらに比較するために、本発明者らは、ＣＮＳ投与後に後者２つの株の形質導入プロファイルを評価した。３×１０９ｖｇ／マウスの用量の、ｓｃＣＢｈ−ＧＦＰゲノムをパッケージングするＡＡＶ１またはＣＡＭ１３０を、新生児マウスにおいてＣＳＦ内投与によって注射した。ＡＡＶ１およびＣＡＭ１３０は共に脳内で十分に伝播し、一般的に対側性の半球よりも迅速に同側性の側に優先的に形質導入する。心組織と同様に、ＡＡＶ１と比較してより多い数のＧＦＰ陽性細胞が、ＣＡＭ１３０の場合に観察される。特に、ＣＡＭ１３０は、特に運動皮質、皮質内で、最も顕著には海馬中で、より多い数のニューロンに形質導入するようである。心およびＣＮＳ組織においてＣＡＭ１３０によって示される改善された形質導入プロファイルのための潜在的な機構（複数可）は、現在調査中の進入後輸送事象から潜在的に生じ得る。より重要なことに、これらのインビボ結果により、ＡＡＶカプシド上の抗原性フットプリントが、細胞／組織トロピズムならびに体内分布プロファイルを同時に制御し、効力を改善しつつ、ＮＡｂを効率的に回避するように操作できることが確認される。
【０４２５】
同様に、ＡＡＶ１ｅ変異体では、頭蓋内投与後に脳において強固なニューロン特異的遺伝子発現が実証される。ｓｃＧＦＰ発現カセットをパッケージングする異なるＡＡＶ１ｅベクターを、側脳室中への定位注射によってＰ０マウスの脳脊髄液中に投与した。投与したベクター用量は、３×１０９ベクターゲノム／動物であった。マウスを、注射の３週間後に屠殺し、ＤＡＢ免疫組織化学を使用して脳を処理し、小脳、嗅球、皮質および海馬におけるレポーター遺伝子発現を画像化した。
【０４２６】
［実施例４］
ＡＡＶ８ｅ抗体回避性変異体
進化した変異体ＡＡＶ８ｅ０１、ＡＡＶ８ｅ０４およびＡＡＶ８ｅ０５では、ヒト肝細胞癌細胞（Ｈｕｈ７）において、親ＡＡＶ８単離体と比較して改善された形質導入が実証される。簡潔に述べると、細胞を、細胞１つ当たり１０，０００ベクターゲノムで、異なるＡＡＶ８由来のバリアントと共に２４時間インキュベートした。ルシフェラーゼ導入遺伝子活性の定量により、ＡＡＶ８（点線）を超えるＡＡＶ８ｅ０１の形質導入効率における２ログ超の増加；ＡＡＶ８ｅ０５については１ログ超の増加、およびＡＡＶ８ｅ０４の場合には約２倍の増加が明らかになった。これらの結果は、技術水準の天然単離体と比較して、培養物中の形質転換されたヒト肝細胞の強固な形質導入を実証する新規ＡＡＶ８バリアントの生成を裏付けている。これらの結果は図２２に示される。
【０４２７】
ＡＡＶ８ｅ変異体では、ＡＡＶ８に対して特異的に生成されたマウスモノクローナル抗体による中和を逃避する能力が実証される。簡潔に述べると、ヒト肝細胞癌細胞を、中和抗体ありまたはなしで、ルシフェラーゼ導入遺伝子カセットをパッケージングする異なるＡＡＶ８ｅ変異体または野生型（ＷＴ）ＡＡＶ８ベクターと共にインキュベートした。各モノクローナル抗体（ｍＡｂ）は、ＡＡＶ８カプシド表面上に位置する異なる抗原性エピトープに対するものであった。図２３Ａ〜２３Ｃに示されるように、ＡＡＶ８ｅ０４およびＡＡＶ８ｅ０５は、異なる希釈においてテストしたｍＡｂ  ＨＬ２３８１（図２３Ａ）、ＨＬ２３８３（図２３Ｂ）およびＡＤＫ８（図２３Ｃ）による中和を逃避する。対照的に、親ＡＡＶ８株は、これらの条件下で効率的に中和される。
【０４２８】
本発明のＡＡＶ８ｅ変異体の非限定的な例は、表９に列挙される。
【０４２９】
【表１３】
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【０４３０】
上記は本発明の例示であり、本発明の限定として解釈すべきではない。本発明は、以下の特許請求の範囲によって規定され、特許請求の範囲の均等物が本明細書中に含まれる。
【０４３１】
［配列］
【化１Ａ】
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【化１Ｂ】
2018528253.tif 000017
【化１Ｃ】
2018528253.tif 000018
【化１Ｄ】
2018528253.tif 000019
【化１Ｅ】
2018528253.tif 000020
【化１Ｆ】
2018528253.tif 000021
【化１Ｇ】
2018528253.tif 000022
【化１Ｈ】
2018528253.tif 000023
【化１Ｉ】
2018528253.tif 000024
【図１】
2018528253.tif 000025
【図２】
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【図３】
2018528253.tif 000027
【図４】
2018528253.tif 000028
【図５】
2018528253.tif 000029
【図６】
2018528253.tif 000030
【図７】
2018528253.tif 000031
【図８】
2018528253.tif 000032
【図９】
2018528253.tif 000033
【図１０】
2018528253.tif 000034
【図１１】
2018528253.tif 000035
【図１２Ａ】
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【図１２Ｂ】
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【図１２Ｃ】
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【図１２Ｄ】
2018528253.tif 000039
【図１３Ａ】
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【図１３Ｂ】
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【図１３Ｃ】
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【図１３Ｄ】
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【図１３Ｅ】
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【図１３Ｆ】
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【図１３Ｇ】
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【図１３Ｈ】
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【図１４Ａ】
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【図１４Ｂ】
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【図１４Ｃ】
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【図１４Ｄ】
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【図１４Ｅ】
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【図１４Ｆ】
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【図１４Ｇ】
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【図１４Ｈ】
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【図１４Ｉ】
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【図１５Ａ】
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【図１５Ｂ】
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【図１５Ｃ】
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【図１５Ｄ】
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【図１５Ｅ】
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【図１６Ａ】
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【図１６Ｂ】
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【図１６Ｃ】
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【図１６Ｄ】
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【図１６Ｅ】
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【図１６Ｆ】
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【図１６Ｇ】
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【図１６Ｈ】
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【図１６Ｉ】
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【図１７Ａ】
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【図１７Ｂ】
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【図１８Ａ】
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【図１８Ｂ】
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【図１８Ｃ】
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【図１８Ｄ】
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【図１９Ａ】
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【図１９Ｂ】
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【図１９Ｃ】
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【図２０】
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【図２１】
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【図２２】
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【図２３Ａ】
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【図２３Ｂ】
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【図２３Ｃ】
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【配列表】
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【国際調査報告】
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