【誤訳訂正書】
【提出日】平成25年11月28日(2013.11.28)
【誤訳訂正１】
【訂正対象書類名】明細書
【訂正対象項目名】０００８
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【０００８】
（連結エピトープ）
連結エピトープは、２つの他のエピトープの並列に起因して作製されるエピトープとして定義される。新たなエピトープは、第１エピトープに由来するＣ末端セクション、及び第２エピトープに由来するＮ末端セクションから構成される。連結エピトープの作製は、以下の理由から、クラスＩ拘束エピトープ及びクラスＩＩ拘束エピトープについての多重エピトープミニ遺伝子ワクチンの設計における潜在的問題である。第１に、ＨＬＡトランスジェニック実験動物において免疫原性について代表的に試験される、ヒトエピトープから構成されるか又はヒトエピトープを含むミニ遺伝子を開発する場合、マウスエピトープの作製は、所望でない免疫優性効果を生じ得る。第２に、ヒトＨＬＡクラスＩ分子又はヒトＨＬＡクラスＩＩ分子についての意図しない新たなエピトープの作製は、ワクチンレシピエントにおいて、標的によって誘導されるＴ細胞応答である、感染細胞又は腫瘍によって発現されない、新たなＴ細胞特異性を惹起し得る。これらの応答は、当然無関係及び無効であり、そして所望でない免疫優性効果を生じることによって、逆効果でさえあり得る。
【誤訳訂正２】
【訂正対象書類名】明細書
【訂正対象項目名】０００９
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【０００９】
連結エピトープの存在は、種々の異なる実験状況において実証されている。Ｇｅｆｔｅｒ及び共同実験者は最初に、２つの異なるクラスＩＩ拘束エピトープが並列しており、そして共直線的に合成された系における効果を実証した［Ｐｅｒｋｉｎｓら，Ｊ  Ｉｍｍｕｎｏｌ，第１４６巻（７）：２１３７−４４（１９９１）：非特許文献９］。この効果は、極めて顕著であるので、エピトープの免疫系認識はこれらの新たな連結エピトープによって完全に「サイレンス」になり得る［Ｗａｎｇら，Ｃｅｌｌ  Ｉｍｍｕｎｏｌ，第１４３巻（２）：２８４−９７（１９９２）：非特許文献１０］。連結エピトープに対するヘルパーＴ細胞もまた、合成リポペプチドを用いた免疫の結果としてヒトにおいて観察された。この合成リポペプチドは、ＨＬＡ−Ａ２拘束ＨＢＶ由来免疫優性ＣＴＬエピトープ及びユニバーサル破傷風トキソイド由来ＨＴＬエピトープから構成されていた［Ｌｉｖｉｎｇｓｔｏｎら，Ｊ  Ｉｍｍｕｎｏｌ，第１５９巻（３）：１３８３−９２（１９９７）：非特許文献１１］。従って、連結エピトープの作製は、ポリエピトープ構築物の設計における主な考慮事項である。
【誤訳訂正３】
【訂正対象書類名】明細書
【訂正対象項目名】００１０
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【００１０】
本発明は、この問題と取り組み、かつ連結エピトープの出現を回避又は最少化する方法を提供する。
【誤訳訂正４】
【訂正対象書類名】明細書
【訂正対象項目名】００１６
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【００１６】
ＨＬＡクラスＩＩペプチド複合体もまた、ＨＬＡクラスＩプロセシングとは異なる複雑な一連の事象の結果として生成される。このプロセシング経路は、インバリアント鎖（Ｉｉ）との会合、特化された区画へのその輸送、ＣＬＩＰへのＩｉの分解及びＨＬＡ−ＤＭによって触媒されたＣＬＩＰ除去を含む（概説については［Ｂｌｕｍら，Ｃｒｉｔ  Ｒｅｖ  Ｉｍｍｕｎｏｌ，第１７巻（５−６）：４１１−７（１９９７）：非特許文献３５；Ａｒｎｄｔら，Ｉｍｍｕｎｏｌ  Ｒｅｓ，第１６巻（３）：２６１−７２（１９９７）：非特許文献３６］を参照のこと）。さらに、Ｉｉ分解において種々のカテプシン一般、ならびに特にカテプシンＳ及びカテプシンＬの潜在的に重大な役割が存在する［Ｎａｋａｇａｗａら，Ｉｍｍｕｎｉｔｙ，第１０巻（２）：２０７−１７（１９９９）：非特許文献３７］。しかし、機能的エピトープの生成に関して、このプロセスは、いくらか選択性が低いようであり［Ｃｈａｐｍａｎ  Ｈ．Ａ．，Ｃｕｒｒ  Ｏｐｉｎ  Ｉｍｍｕｎｏｌ，第１０巻（１）：９３−１０２（１９９８）：非特許文献３８］、そして多くのサイズのペプチドがＭＨＣクラスＩＩに結合し得る［Ｈｕｎｔら，Ｓｃｉｅｎｃｅ，第２５６巻（５０６５）：１８１７−２０（１９９２）：非特許文献３９］。大部分又は全ての可能なペプチドは、生成されるようである［Ｍｏｕｄｇｉｌら，Ｊ  Ｉｍｍｕｎｏｌ，第１５９巻（６）：２５７４−９（１９９７）：非特許文献４０；及びＴｈｏｍｓｏｎら，Ｊ  Ｖｉｒｏｌ，第７２巻（３）：２２４６−５２（１９９８）：非特許文献４１］。従って、隣接領域の問題と比較して、連結エピトープの生成は、特定の実施形態において、より深刻な懸念であり得る。
【誤訳訂正５】
【訂正対象書類名】明細書
【訂正対象項目名】００１９
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【００１９】
１つの局面において、本発明は、複数のＨＬＡエピトープを含むかつＨＬＡクラスＩプロセシング経路に提示される、ポリエピトープ構築物を設計するための方法を提供する。この方法は、以下の工程を包含する：（ｉ）この複数のＨＬＡエピトープをソートして連結エピトープの数を最小化する工程；（ｉｉ）このポリエピトープ構築物に含まれるＨＬＡエピトープのＣ＋１位に、以下からなる群より選択される隣接アミノ酸残基を導入する工程：Ｋ、Ｒ、Ｎ、Ｑ、Ｇ、Ａ、Ｓ、Ｃ及びＴ；（ｉｉｉ）このポリエピトープ構築物に含まれる２つのエピトープ間に１以上のアミノ酸スペーサー残基を導入する工程であって、このスペーサーは、ＣＴＬ又はＨＴＬ連結エピトープの発生を妨げる、工程；及び（ｉｖ）最小数の連結エピトープ、最小数のアミノ酸スペーサー残基、及び各ＨＬＡエピトープに対するＣ＋１位での最大数のＫ、Ｒ、Ｎ、Ｇ、Ａ、Ｓ、Ｃ又はＴを有する、１以上のポリエピトープ構築物を選択する工程。いくつかの実施形態において、これらのスペーサー残基は、公知のＨＬＡクラスＩＩ一次アンカー残基ではない残基から独立して選択される。特定の実施形態において、このスペーサー残基の導入は、ＨＴＬエピトープの発生を妨げる。このようなスペーサーは、しばしば、Ｇ、Ｐ及びＮからなる群より独立して選択される、少なくとも５アミノ酸残基を含む。いくつかの実施形態において、スペーサーは、ＧＰＧＰＧである。
【誤訳訂正６】
【訂正対象書類名】明細書
【訂正対象項目名】００５２
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【００５２】
「最適化された」ポリエピトープ構築物は、連結エピトープの発生を最小化するためのエピトープのソート、エピトープのＣ末端又はＮ末端に隣接する隣接残基の挿入、及び連結エピトープの発生を防止するためか又は隣接残基を提供するためのスペーサー残基のさらなる挿入による構築物の増加した免疫原性又は抗原性をいう。最適化されたポリエピトープ構築物の免疫原性又は抗原性における増加は、最適化されたパラメータに基いて構築されていないポリエピトープ構築物と比較して測定される。そして当該分野で公知のアッセイ（例えば、トランスジェニック動物における免疫原性の評価、ＥＬＩＳＰＯＴ、インターフェロンγ遊離アッセイ、テトラマー染色、クロム遊離アッセイ、及び樹状細胞に対する提示）が用いられる。
【誤訳訂正７】
【訂正対象書類名】明細書
【訂正対象項目名】００６３
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【００６３】
「スペーサー」は、ポリエピトープ構築物の２つのエピトープ間に挿入されて連結エピトープの発生を防ぐ配列をいう。ＨＬＡ  クラスＩＩエピトープについて、スペーサーは、５アミノ酸又はそれ以上の長さであり、そしてスペーサー配列中のアミノ酸残基（例えば、Ｇ、Ｐ、又はＮ）は、代表的にはＨＬＡクラスＩＩモチーフの一次アンカー残基であることが知られていない（例えば、ＰＣＴ／ＵＳ００／１９７７４）。
【誤訳訂正８】
【訂正対象書類名】明細書
【訂正対象項目名】００７５
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【００７５】
ポリエピトープ構築物を設計する際に、以下を考慮する：
（ｉ）ポリエピトープ構築物中へ取り込まれるエピトープがソートされて、形成される連結エピトープの数を最小化する順序を提供する。いくつかの実施形態では、ソートは、コンピューターにより行われる。好ましくは、エピトープの順位付けの際の第２の考慮すべきこととして、エピトープが、ＣＴＬ免疫原性を生成するエピトープのＮ末端の残基が、別のＣＴＬエピトープのＣ末端に並べられるように、配置される。
【誤訳訂正９】
【訂正対象書類名】明細書
【訂正対象項目名】００７７
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【００７７】
（ｉｉｉ）スペーサー配列をエピトープの間に挿入して、連結エピトープの発生を防ぐ。特定の実施形態では、スペーサー配列はまた、残基がＣＴＬエピトープのＣ末端に隣接するように、リンカーのＮ末端で免疫原性を生じる残基を含み得る。
【誤訳訂正１０】
【訂正対象書類名】明細書
【訂正対象項目名】００７８
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【００７８】
ＨＴＬ連結エピトープを防ぐ特定の実施形態では、任意の公知のＨＬＡクラスＩＩアンカー残基に対応しないアミノ酸残基からなるスペーサーが用いられる（例えば、二者択一のＧ残基及びＰ残基（ＧＰスペーサー）は、２つのＨＴＬエピトープ間に含まれる）。
【誤訳訂正１１】
【訂正対象書類名】明細書
【訂正対象項目名】００８６
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【００８６】
（連結モチーフの最小化）
ポリエピトープ構築物を設計する際の考慮すべきことの１つは、エピトープをお互いに隣接して配置する場合の連結エピトープの不慮の生成である。ミニ遺伝子におけるこのようなエピトープの存在は、ミニ遺伝子の能力に有意に影響し得る。この望まれない効果を防ぐためのストラテジーは、ポリエピトープワクチン又はミニ遺伝子ワクチンの開発への適用のために、本明細書中で開示される。連結エピトープは、初めに、エピトープをソートすることにより最小化されて、連結エピトープの数が最小化される順序を特定する。このようなソート手順は、コンピューター、又は目（必要な場合、すなわち、ポリエピトープ構築物に含まれるエピトープの数に依存して）を用いて行われ得る。
【誤訳訂正１２】
【訂正対象書類名】明細書
【訂正対象項目名】００８７
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【００８７】
例えば、パターンを見つけ出すコンピュータプログラム（例えば、Ｐａｎｏｒａｍａ）は、多重エピトープミニ遺伝子の設計に使用され得る。多くの異なるエピトープ配列が、特定のミニ遺伝子構築物を設計する際に考慮され得れ得る。コンピュータプログラムは、入力として、考慮される特定のセットのエピトープ、及びこれらのモチーフを保有する任意の連結エピトープが存在するか否かを評価するために走査されるモチーフを受け入れる。例えば、プログラムは、ミニ遺伝子の形成をシミュレートし得、ユーリスティック（ｅｕｒｉｓｔｉｃ）コンピュータアルゴリズムにおいて、連結モチーフの存在を避けるか又は最小化するためにエピトープ対を調べる。このプログラムは、例えば、１秒当たり６×１０5（約５０万）のミニ遺伝子の構成を評価し得る。あまり好ましくない代替物（より時間を消費するので）として、非コンピュータ援助分析が実行され得る。
【誤訳訂正１３】
【訂正対象書類名】明細書
【訂正対象項目名】００８８
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【００８８】
先のパラグラフに記載されるように、コンピュータプログラムを使用する１０−エピトープ構築物の完全な分析は、１０の階乗（約３．６×１０6）の組み合わせを調べることが必要であり、６秒間で完了し得る。１４−エピトープ構築物は、２日で完全に分析され得る。しかし、分析時間は、より大きなミニ遺伝子が考慮されるので、非常に迅速に増加する。完全な分析は、必要とされず、プログラムは、任意の所望の長さの時間で実行され得る。この場合において、最小の数の連結エピトープを提供する構成が提供される。
【誤訳訂正１４】
【訂正対象書類名】明細書
【訂正対象項目名】００８９
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【００８９】
このタイプのアプローチの結果の例は、表２に提示される。２５のエピトープを組み込むＨＣＶ１ミニ遺伝子に含まれる同じエピトープの１０個の異なるランダムな組合せにおける連結モチーフの数（２日間のコンピュータ分析の結果であった）を、表に提示した。非最適化組合せにおいて、多数のＡ２、Ａ１１及びＫbモチーフが、２５〜３８の範囲、平均３１で見出された。比較して、２つのこのような連結モチーフのみが、ＨＣＶ１ミニ遺伝子組合せに提示される。結論として、コンピュータプログラムは、ミニ遺伝子構築物に提示される連結モチーフの数を効果的に最小化するために利用され得る。
【誤訳訂正１５】
【訂正対象書類名】明細書
【訂正対象項目名】００９１
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【００９１】
（クラスＩＩ連結エピトープの除去及びクラスＩＩ制限応答についてのインビボの試験）
連結エピトープを除く際のさらなるエレメントとして、スペーサー配列が、並列した場合に連結エピトープを作製する２つのエピトープ間に挿入され得る。
【誤訳訂正１６】
【訂正対象書類名】明細書
【訂正対象項目名】００９２
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【００９２】
ＨＴＬエピトープについての連結エピトープの問題を補正するために、少なくとも５個のアミノ酸の長さのスペーサーを２つのエピトープ間に挿入する。このようなスペーサーに組み込まれるアミノ酸残基は、好ましくは、ＨＬＡクラスＩＩ結合モチーフのいずれに対しても一次アンカー残基であることが公知ではないアミノ酸残基である。このような残基には、Ｇ、Ｐ、及びＮが挙げられる。好ましい実施形態において、配列ＧＰＧＰＧを有するスペーサーが２つのエピトープ間に挿入される。以前の研究によって、ＧＰスペーサーがクラスＩＩ結合相互作用を破壊する際に特に効果的であることが示された［Ｓｅｔｔｅら、Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．，１４３：１２６８−７３（１９８９）］。全ての公知のヒトクラスＩＩ結合モチーフ及びマウスＩＡb（ＨＬＡトランスジェニックマウスによって発現されるクラスＩＩ）は、４つの残基が離れて配置される、この主要なアンカー位置におけるＧ又はＰのいずれかに寛容ではない。このアプローチは、いずれのクラスＩＩ制限エピトープも連結エピトープとして形成され得ないことを事実上保証する。
【誤訳訂正１７】
【訂正対象書類名】明細書
【訂正対象項目名】００９４
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【００９４】
第１の構築物は、直線的に配置された４つの異なるエピトープを組込み、一方、第２の構築物は、ＧＰＧＰＧスペーサーを組み込む。三つの潜在的連結エピトープに対応する合成ペプチドをまた合成した。
【誤訳訂正１８】
【訂正対象書類名】明細書
【訂正対象項目名】００９５
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【００９５】
２ナノモルのこれらの異なる構築物がＩＡb陽性マウス内の種々のエピトープに対する増殖性の応答についてプライムする能力を試験し、そして等モル量のプールの同じペプチド（３マイクログラムのそれぞれのペプチド）によって誘発される応答と比較した。詳細には、３匹のマウスのグループに、ＣＦＡエマルジョンを注射し、注射の１１日後、それらのリンパ節細胞をインビトロでさらに３日間培養し、そしてチミジン取り込みを、２４時間の培養において測定した。高親和性ＩＡb結合能力に基づいて予期されるように、全ての４つのエピトープが良好な増殖応答を誘導したことが見出された（図２ｂ）。４．９〜１７．９の範囲の刺激指数（ＳＩ）値は、これらのペプチドがプールに注入された場合に観測された。しかし、同じエピトープを組み込む直線状ポリペプチドが試験される場合、Ｐｏｌ３３５に対して指向される応答が失われる。これは、Ｇａｇ１７１及びＰｏｌ３３５にわたる連結エピトープに対して指向される応答の出現と関連した。ＧＰＧＰＧスペーサーの使用は、おそらく、連結エピトープを破壊することによって、この問題を除去し、そしてＰｏｌ３３５応答を回復した。観測される応答は、単離されたペプチドのプールで観測されたものと同じ大きさであった。
【誤訳訂正１９】
【訂正対象書類名】明細書
【訂正対象項目名】００９６
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【００９６】
これらの結果は、複数ＨＩＶ誘導クラスＩＩエピトープに対する応答が同時に誘導され得ることを示し、これらはまた、ＨＴＬエピトープ候補を組み込む種々の構築物の免疫原性を調査するためにどうのようにＩＡb／ＤＲ交差反応性が利用され得るかを示す。最後に、これらは、適切なスペーサーが、クラスＩＩ連結エピトープを効果的に破壊するように使用され得、これらは、それ以外に効果的なワクチン免疫原性を干渉しないことを示す。
【誤訳訂正２０】
【訂正対象書類名】明細書
【訂正対象項目名】００９７
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【００９７】
クラスＩ制限応答の場合において、天然に存在する連結エピトープ及びエピトープ特異的応答の結果としての阻害の１つのケースが、ＭｃＭｉｃｈａｅｌ及び共同研究者によって提示された［Ｔｕｓｓｅｙら、Ｉｍｍｕｎｉｔｙ、第３巻（１）：６５−７７（１９９５）］。クラスＩについての連結エピトープの問題を取り組むために、類似の分析が実行され得る。例えば、特定のコンピュータプログラムを使用して、選択されたマウスモチーフについて及び最も一般的なヒトクラスＩ  ＨＬＡ  Ａ及びＢモチーフについてスクリーニングすることによって、潜在的なクラスＩ制限連結エピトープを同定する。
【誤訳訂正２１】
【訂正対象書類名】明細書
【訂正対象項目名】００９８
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【００９８】
スペーサー配列もまた、同様にＣＴＬ連結エピトープを妨げるために使用され得る。しばしば、Ａ又はＧのような非常に少しの残基が好ましいスペーサー残基である。Ｇはまた、ＨＬＡクラスＩ結合モチーフの好ましい一次アンカー残基（例えば、ＰＣＴ／ＵＳ００／２４８０２を参照のこと）として比較的まれに存在する。これらのスペーサーは、種々の長さであり得、例えば、スペーサー配列は、代表的には、１、２、３、４、５、６、７又は８アミノ酸残基の長さであり得、時々、それより長い。より短い長さは、しばしば、ポリエピトープ構築物を作製する際に物理的束縛のため、好ましい。
【誤訳訂正２２】
【訂正対象書類名】明細書
【訂正対象項目名】０１１９
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【０１１９】
（ポリエピトープ構築物のソート及び最適化）
本発明を使用してポリエピトープ構築物を開発するために、ポリエピトープ構築物に含めるためのエピトープは、本明細書中で規定されるパラメーターを使用してソート及び最適化される。ソート及び最適化は、コンピューターを使用して、又は少数のエピトープの場合には、コンピューターを使用せずに実施され得る。
【誤訳訂正２３】
【訂正対象書類名】明細書
【訂正対象項目名】０１２０
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【０１２０】
コンピューターによる最適化は、代表的に、以下のように実施され得る。以下は、エピトープの組み合わせを同定及び最適化するコンピューター化システム（すなわち、連結エピトープの最小数、及び隣接残基の最大数を提供する）の例を提供する。
【誤訳訂正２４】
【訂正対象書類名】明細書
【訂正対象項目名】０１２１
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【０１２１】
エピトープのソートの１つの構成要素は、「Ｊｕｎｃｔｉｏｎａｌ  Ａｎａｌｙｚｅｒ」である。例えば、このプログラムは、その操作のためのプログラムを特定するテキストファイルを使用する。５つのタイプの入力データがこのプログラムに与えられる：１）処理するペプチドのセット；２）Ｃ＋１位及びＮ−１位に現れる場合の各アミノ酸の重量のセット；３）連結の検出において使用するモチーフのセット：４）各対のペプチド環に挿入されるアミノ酸の最大数；５）プログラムの作動を制御するための他の値。このプログラムは、ペプチドの全ての可能な対を評価し、そして連結の数、Ｃ＋１及びＮ−１の重量を計算し、そしてそれらを所定の式に従って合わせる。現在、この式は、この２つの重量の積÷連結の数である。連結の数がゼロである場合、この積を０．５で割る。ペプチド部位を評価するための他の式は、いつでもこのプログラムに容易に加えられ得る。このプログラムからの出力は、最大機能結果を生じる挿入をペプチドの各対について列挙するテキストファイルである。このファイルはまた、ペプチドの元のリスト及びプロセシングの次の工程を行う２つのプログラムのいずれかの作動を制御するコマンドを含む。これら２つのプログラムは、「Ｅｘｈａｕｓｔｉｖｅ  Ｊ  Ｓｅａｒｃｈ」及び「Ｓｔｏｃｈａｓｔｉｃ  Ｊ  Ｓｅａｒｃｈ」である。
【誤訳訂正２５】
【訂正対象書類名】明細書
【訂正対象項目名】０１２３
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【０１２３】
このプログラムは以下のように作動し得る：
これらのパラメーターを、このプログラムに入力する：
１．ソートするエピトープ。
２．上記のような、アミノ酸Ｃ＋１及びＮ−１の「重量」。
３．連結エピトープを検出するためのモチーフ。
４．最大スペーシング残基。
５．プログラム選択肢を制御するパラメーター。
【誤訳訂正２６】
【訂正対象書類名】明細書
【訂正対象項目名】０１２４
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【０１２４】
Ｊｕｎｃｔｉｏｎａｌ  Ａｎａｌｙｚｅｒ  Ｐｒｏｇｒａｍは、次いで、以下を実行する：
１．全てのエピトープ対を生成する。
２．ペプチドの各対について、連結エピトープの最小数及びスペーシング残基のＣ＋１及びＮ−１の寄与による最大効果を生じる挿入のセットを決定する。
３．各対の最適スペーシング残基及び最適連結の値を出力する。
【誤訳訂正２７】
【訂正対象書類名】明細書
【訂正対象項目名】０２３４
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【０２３４】
選択されたエピトープについて、さらなる改変もまた導入される。特に、エピトープのＣ末端及びＮ末端に他の残基スペーサーを導入することの効力もまた研究される。実施例１０に記載のミニ遺伝子ワクチンの分析結果によると、研究された残基は、さらに、例えば、Ｇ、Ｑ、Ｗ、Ｓ及びＴを含み得る。連結エピトープがこれらの改変によって作製される場合、連結エピトープを排除する代替的エピトープ順序が、本明細書中に記載されるように、合理的に設計される。すべての第二世代構築物を、本明細書中に記載のように、抗原性及び免疫原性について試験する。
【誤訳訂正２８】
【訂正対象書類名】明細書
【訂正対象項目名】０２３６
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【０２３６】
これらのミニ遺伝子ワクチンは、ａ）最少の推定連結エピトープが提示され；及びｂ）以前のミニ遺伝子ワクチンにおいて機能的ではなかったエピトープが、ここで、より有効な新規の状況下にあるように設計される。
【誤訳訂正２９】
【訂正対象書類名】明細書
【訂正対象項目名】０２３７
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【０２３７】
ＨＴＬミニ遺伝子ワクチンについて、「第一世代」ミニ遺伝子ワクチンから得られるデータを、連結エピトープ、及びミニ遺伝子内のエピトープ位置、ならびにスペーサー（例えば、ＧＰＧＰＧスペーサー）に対する近接性に関しての傾向について研究する。特定の傾向が検出された場合、第二世代のミニ遺伝子ワクチンを、これらの傾向に基づいて設計する。あるいは、最適以下の活性を生ずるミニ遺伝子の場合、他の標的ストラテジー（例えば、Ｉｉ及びＬＡＭＰに基づくもの）の潜在的有効性を再評価し、そして標的なし及び単純なリーダー配列標的に対して比較する。
【誤訳訂正３０】
【訂正対象書類名】明細書
【訂正対象項目名】０２４８
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【０２４８】
非刺激及び刺激されたペプチドの両方の培養物を評価する。いくらかの応答が、刺激されていない培養物において検出され得るが、より弱い応答／エピトープは、１つ又は２つのインビトロ刺激を必要とし得る。アッセイ手順を、以下のように実施し得る。例えば、約５０個のクラスＩ拘束エピトープに対する応答がアッセイされる場合、約７個のペプチドの７個のプールが使用され得る。ペプチドのプールもまた、再刺激のために使用される。ＰＡＤＲＥエピトープに対する応答もまた測定する。ポジティブな結果を生じるペプチドプールの場合、個々のペプチドをアッセイして、観察された応答を担うエピトープを同定する。ポジティブコントロールとしては、破傷風トキソイド全体及び／又はマイトジェンＰＨＡ、ならびにインフルエンザウイルス由来エピトープのプールが挙げられる。潜在的連結エピトープもまた合成され、そして単一プールとして試験される。
【誤訳訂正３１】
【訂正対象書類名】特許請求の範囲
【訂正対象項目名】全文
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
複数のＨＬＡエピトープを含み、ＨＬＡクラスＩプロセシング経路に提示されるポリエピトープ構築物を設計するための方法であって、
（ｉ）前記複数のＨＬＡエピトープを、連結エピトープの数が最小になるようにソートする工程；
（ii）Ｋ、Ｒ、Ｎ、Ｑ、Ｇ、Ａ、Ｓ、ＣおよびＴからなる群から選択される隣接アミノ酸残基を、該ポリエピトープ構築物に含まれるＨＬＡエピトープのＣ＋１位に導入する工程；
（iii）該ポリエピトープ構築物に含まれる２つのエピトープの間に、ＣＴＬ連結エピトープまたはＨＴＬ連結エピトープの出現を妨げるように、１つ以上のアミノ酸スペーサー残基を導入する工程；および
（iv）連結エピトープの数が最小であり、アミノ酸スペーサー残基の数が最小であり、各ＨＬＡエピトープのＣ＋１位に存在するＫ、Ｒ、Ｎ、Ｇ、Ａ、Ｓ、ＣまたはＴの数が最大である１つ以上のポリエピトープ構築物を選択する工程、を含み、
前記アミノ酸スペーサー残基により形成されるスペーサーが、Ｇ、ＰおよびＮからなる群より独立して選択される少なくとも５アミノ酸残基を含む、方法。
【請求項２】
ＨＴＬエピトープの出現を妨げるように前記スペーサー残基を導入する、請求項１に記載の方法。
【請求項３】
前記スペーサーがＧＰＧＰＧである、請求項２に記載の方法。
【請求項４】
前記隣接アミノ酸残基が、ＣＴＬエピトープのＣ＋１位に導入される、請求項１に記載の方法。
【請求項５】
前記隣接アミノ酸残基が、Ｋ、Ｒ、Ｎ、ＧおよびＡからなる群から選択される、請求項１に記載の方法。
【請求項６】
前記隣接アミノ酸残基が、前記スペーサーアミノ酸残基に隣接する、請求項１に記載の方法。
【請求項７】
前記ポリエピトープ構築物に含まれるＨＬＡエピトープのＣ末端に隣接するＨＬＡエピトープのＮ末端残基を、Ｋ、Ｒ、Ｎ、Ｇ、およびＡからなる群から選択される残基で置換する工程をさらに包む、請求項１に記載の方法。
【請求項８】
前記ポリエピトープ構築物の構造を予測する工程をさらに含むと共に、
前記選択工程において１つ以上のポリエピトープ構築物を選択する際に、細胞に導入されてＨＬＡプロセシング経路によってプロセシングされた場合に、エピトープの全てがＨＬＡプロセシング経路によってプロセシングされるポリエピトープ構築物を選択する、請求項１に記載の方法。
【請求項９】
請求項１〜８の何れか一項に記載の方法を用いて調製される、ポリエピトープ構築物。
【請求項１０】
前記ポリエピトープ構築物に含まれるエピトープが、ミニ遺伝子によってコードされる、請求項９に記載のポリエピトープ構築物。
【請求項１１】
複数のＨＬＡエピトープペプチドおよび複数のスペーサーアミノ酸を含む、ポリエピトープ構築物であって、ここで：
ａ．該ＨＬＡエピトープペプチドが、８〜１３アミノ酸長のクラスＩ  ＨＬＡエピトープペプチドであり；
ｂ．該スペーサーアミノ酸の組み合わせが、１以上の該ＨＬＡエピトープペプチド間に配置され；
ｃ．該スペーサーアミノ酸が、１〜８アミノ酸長であり；
ｄ．１以上のスペーサーアミノ酸の組み合わせが、他のスペーサーアミノ酸の組み合わせに含まれるアミノ酸配列とは異なるアミノ酸配列を含み；そして
ｅ．該スペーサーアミノ酸の組み合わせの各々が、エピトーププロセシングを最適化し、そして連結エピトープを最小化し、
ｆ．前記アミノ酸スペーサー残基により形成されるスペーサーは、Ｇ、ＰおよびＮからなる群より独立して選択される、少なくとも５アミノ酸残基を含む、ポリエピトープ構築物。
【請求項１２】
前記複数のＨＬＡエピトープペプチドが、複数のＨＬＡエピトープ核酸によってコードされ、前記複数のスペーサーアミノ酸が、複数のスペーサー核酸によってコードされる、請求項１１に記載のポリエピトープ構築物。