(57)【要約】本開示は、第１のオリゴマー化合物及び第２のオリゴマー化合物を含む二本鎖を提供し、ここで、第２のオリゴマー化合物は、コンジュゲート基を含む。特定の実施形態において、二本鎖は、肝外組織及び／または肝外細胞の標的核酸の量または活性を調節する。特定の実施形態において、二本鎖は、肝組織及び／または肝細胞の標的核酸の量または活性を調節する。【選択図】なし【特許請求の範囲】
【請求項１】
第１のオリゴマー化合物及び第２のオリゴマー化合物を含む二本鎖であって、
前記第１のオリゴマー化合物は、１０〜３０個の結合されたヌクレオシドからなる第１の修飾オリゴヌクレオチドを含み、かつ前記第２のオリゴマー化合物の核酸塩基配列及び肝外核酸標的に相補的な核酸塩基配列を有し、
前記第２のオリゴマー化合物は、１０〜３０個の結合されたヌクレオシド及びコンジュゲート基からなる第２の修飾オリゴヌクレオチドを含み、
前記コンジュゲート基は、コンジュゲート部分及びコンジュゲートリンカーを含み、
前記コンジュゲート部分は、コレステロールであり、前記コンジュゲートリンカーは、少なくとも１つの切断可能部分を含む、前記二本鎖。
【請求項２】
第１のオリゴマー化合物及び第２のオリゴマー化合物を含む二本鎖であって、
前記第１のオリゴマー化合物は、１０〜３０個の結合されたヌクレオシドからなる第１の修飾オリゴヌクレオチドを含み、かつ前記第２のオリゴマー化合物の核酸塩基配列及び肝外核酸標的または肝臓核酸標的に相補的な核酸塩基配列を有し、
前記第２のオリゴマー化合物は、１０〜３０個の結合されたヌクレオシド及びコンジュゲート基からなる第２の修飾オリゴヌクレオチドを含み、
前記修飾オリゴヌクレオチドは、
５’末端の１〜４個の２’−Ｏメチル−修飾ヌクレオシド；
それぞれが非修飾ＲＮＡ糖部分を含む１０〜１５個の中央ヌクレオシド；及び
３’末端の１〜４個の２’−Ｏメチル−修飾ヌクレオシド
以外の糖モチーフを有し、
前記コンジュゲート基は、コンジュゲート部分及びコンジュゲートリンカーを含み、
前記コンジュゲート部分は、コレステロールであり、前記コンジュゲートリンカーは、少なくとも１つの切断可能部分を含む、前記二本鎖。
【請求項３】
第１のオリゴマー化合物及び第２のオリゴマー化合物を含む二本鎖であって、
前記第１のオリゴマー化合物は、１０〜３０個の結合されたヌクレオシドからなる第１の修飾オリゴヌクレオチドを含み、かつ前記第２のオリゴマー化合物の核酸塩基配列及び肝外核酸標的または肝臓核酸標的に相補的な核酸塩基配列を有し、
前記第２のオリゴマー化合物は、１０〜３０個の結合されたヌクレオシド及びコンジュゲート基からなる第２の修飾オリゴヌクレオチドを含み、
前記コンジュゲート基は、コンジュゲート部分及びコンジュゲートリンカーを含み、
前記コンジュゲート部分は、コレステロールであり、前記コンジュゲートリンカーは、少なくとも１つの切断可能部分を含む、前記二本鎖。
【請求項４】
前記肝外核酸標的が、肝臓で有意なレベルで発現していない、請求項１〜３のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項５】
前記肝外核酸標的が、肝臓で有意なレベルで発現している、請求項１〜３のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項６】
前記肝外核酸標的が、白色脂肪細胞、褐色脂肪細胞、脂肪細胞、マクロファージ、がん細胞、腫瘍細胞、平滑筋細胞、リンパ球、心筋細胞及び肺細胞から選択される少なくとも１種の肝外細胞型で発現している、請求項１〜５のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項７】
前記肝外核酸標的が、少なくとも２種の肝外細胞型で発現している、請求項１〜６のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項８】
前記肝外核酸標的が、少なくとも３種の肝外細胞型で発現している、請求項１〜７のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項９】
前記肝外核酸標的が、少なくとも４種の肝外細胞型で発現している、請求項１〜８のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項１０】
前記肝外核酸標的が白色脂肪細胞で発現している、請求項１〜９のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項１１】
前記肝外核酸標的が褐色脂肪細胞で発現している、請求項１〜１０のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項１２】
前記肝外核酸標的が脂肪細胞で発現している、請求項１〜１１のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項１３】
前記肝外核酸標的がマクロファージで発現している、請求項１〜１２のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項１４】
前記肝外核酸標的ががん細胞で発現している、請求項１〜１３のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項１５】
前記肝外核酸標的が腫瘍細胞で発現している、請求項１〜１４のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項１６】
前記肝外核酸標的が平滑筋細胞で発現している、請求項１〜１５のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項１７】
前記肝外核酸標的が心筋細胞で発現している、請求項１〜１６のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項１８】
前記肝外核酸標的がリンパ球で発現している、請求項１〜１７のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項１９】
前記肝外核酸標的が、骨格筋、心筋、平滑筋、脂肪、白色脂肪、褐色脂肪、脾臓、骨、腸、副腎、精巣、卵巣、膵臓、下垂体、前立腺、皮膚、子宮、膀胱、脳、糸球体、遠位尿細管上皮、乳房、肺、心臓、腎臓、神経節、前頭皮質、脊髄、三叉神経節、座骨神経、後根神経節、副睾丸脂肪、横隔膜及び結腸から選択される少なくとも１種の肝外組織で発現している、請求項１〜１８のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項２０】
前記肝外核酸標的が少なくとも２種の肝外組織で発現している、請求項１〜１９のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項２１】
前記肝外核酸標的が少なくとも３種の肝外組織で発現している、請求項１〜２０のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項２２】
前記肝外核酸標的が少なくとも４種の肝外組織で発現している、請求項１〜２１のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項２３】
前記肝外核酸標的が骨格筋で発現している、請求項１〜２２のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項２４】
前記肝外核酸標的が心筋で発現している、請求項１〜２３のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項２５】
前記肝外核酸標的が平滑筋で発現している、請求項１〜２４のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項２６】
前記肝外核酸標的が副睾丸脂肪で発現している、請求項１〜２５のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項２７】
前記肝外核酸標的が白色脂肪組織で発現している、請求項１〜２６のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項２８】
前記肝外核酸標的が脾臓で発現している、請求項１〜２７のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項２９】
前記肝外核酸標的が骨で発現している、請求項１〜２８のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項３０】
前記肝外核酸標的が骨髄で発現している、請求項１〜２９のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項３１】
前記肝外核酸標的が腸で発現している、請求項１〜３０のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項３２】
前記肝外核酸標的が副腎組織で発現している、請求項１〜３１のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項３３】
前記肝外核酸標的が精巣で発現している、請求項１〜３２のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項３４】
前記肝外核酸標的が卵巣で発現している、請求項１〜３３のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項３５】
前記肝外核酸標的が膵臓で発現している、請求項１〜３４のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項３６】
前記肝外核酸標的が下垂体で発現している、請求項１〜３５のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項３７】
前記肝外核酸標的が前立腺で発現している、請求項１〜３６のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項３８】
前記肝外核酸標的が皮膚で発現している、請求項１〜３７のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項３９】
前記肝外核酸標的が子宮で発現している、請求項１〜３８のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項４０】
前記肝外核酸標的が膀胱で発現している、請求項１〜３９のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項４１】
前記肝外核酸標的が脳で発現している、請求項１〜４０のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項４２】
前記肝外核酸標的が糸球体で発現している、請求項１〜４１のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項４３】
前記肝外核酸標的が遠位尿細管上皮で発現している、請求項１〜４２のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項４４】
前記肝外核酸標的が乳房で発現している、請求項１〜４３のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項４５】
前記肝外核酸標的が肺で発現している、請求項１〜４４のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項４６】
前記肝外核酸標的が心臓で発現している、請求項１〜４５のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項４７】
前記肝外核酸標的が腎臓で発現している、請求項１〜４６のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項４８】
前記肝外核酸標的が結腸で発現している、請求項１〜４７のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項４９】
前記肝外核酸標的が神経節で発現している、請求項１〜４８のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項５０】
前記肝外核酸標的が前頭皮質で発現している、請求項１〜４９のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項５１】
前記肝外核酸標的が脊髄で発現している、請求項１〜５０のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項５２】
前記肝外核酸標的が三叉神経節で発現している、請求項１〜５１のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項５３】
前記肝外核酸標的が座骨神経で発現している、請求項１〜５２のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項５４】
前記肝外核酸標的が後根神経節で発現している、請求項１〜５３のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項５５】
前記肝外核酸標的が内因性ＲＮＡ転写産物である、請求項１〜５４のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項５６】
前記ＲＮＡ転写産物がｐｒｅ−ｍＲＮＡである、請求項５５に記載の二本鎖。
【請求項５７】
前記ＲＮＡ転写産物がｍＲＮＡである、請求項５５に記載の二本鎖。
【請求項５８】
前記ＲＮＡ転写産物が毒性ＲＮＡである、請求項５５に記載の二本鎖。
【請求項５９】
前記ＲＮＡ転写産物が非コードＲＮＡである、請求項５５に記載の二本鎖。
【請求項６０】
前記ＲＮＡ転写産物がｍｉｃｒｏＲＮＡである、請求項５５に記載の二本鎖。
【請求項６１】
前記肝外核酸標的がウイルス核酸である、請求項１〜５４のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項６２】
前記肝外核酸標的が、ＡＴＧＬ、ＣＤ４０、ＴＮＦ−α、ＣＤ３６、ＤＭＰＫ、ＤＮＭ２、ＤＭＤ、ＤＵＸ４、ＬＭＮＡ、ＺＦＮ９、ＳＧＬＴ２及びＧＣＣＲから選択される、請求項１〜５８のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項６３】
前記肝外核酸標的が、アンドロゲン受容体（ＡＲ）、ＡＮＧＰＴＬ３、ＤＧＡＴ２、ｅＩＦ４Ｅ、第ＸＩ因子、ＦＧＦＲ４、ＧＣＣＲ、ＧＣＧＲ、ＧＨＲ、ＰＴＰ１Ｂ、ＳＭＲＴ、ＳＴＡＴ３、Ｔｈｅｍ１、ＴＲＰＶ４、ＦＴＯ、ＭＣ４Ｒ、ＴＭＥＭ１８、ＫＣＴＤ１５、ＧＮＰＤＡ２、ＳＨ２Ｂ１、ＭＴＣＨ２、ＮＥＧＲ１、ＢＤＮＦ、ＥＴＶ５、レプチン、レプチン受容体、ＦＡＩＭ２、ＫＣＮＭＡ１、ＭＡＦ、ＮＲＸＮ３、ＴＦＡＰ２Ｂ、ＭＳＲＡ、ＡＧＰＡＴ２、ＢＳＣＬ２、ＡＫＴ２、ＰＰＡＲγ、ＬＭＮＡ、ＺＭＰＳＴＥ２４、ＤＧＡＴ１、ＴＮＦα、ＩＬ−６、レジスチン、ＰＡＩ−１、ＴＢＣ１Ｄ１、ＭＥＴＡＰ２、ＶＥＧＦ、ＡＩＦ−１、ＪＮＫ１、ＣＢ１、ＲＩＰ１４０、ＴＩＦ２、ＡＮＧＰＴ１、ＡＮＧＰＴ２、ＥＩＦ４ＥＢＰ２、ＣＤＫ５、ＳＬＣ１３Ａ５、ペリリピン１、ペリリピン２、ペリリピン３、ペリリピン４、ＨＧＦ、ＧＤＦ３、ＴＮＫｓ、ＫＡＴＮＡ１、ＣｈＲＥＢＰ、ＡＴＦ４、ＢＡＳＰ−１、ＮＮＭＴから選択される、請求項１〜５８のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項６４】
前記肝外核酸標的が、アンドロゲン受容体（ＡＲ）、ＡＮＧＰＴＬ３、ＤＧＡＴ２、ｅＩＦ４Ｅ、第ＸＩ因子、ＦＧＦＲ４、ＧＣＣＲ、ＧＣＧＲ、ＧＨＲ、ＰＴＰ１Ｂ、ＳＭＲＴ、ＳＴＡＴ３、Ｔｈｅｍ１、ＴＲＰＶ４、ＦＴＯ、ＭＣ４Ｒ、ＴＭＥＭ１８、ＫＣＴＤ１５、ＧＮＰＤＡ２、ＳＨ２Ｂ１、ＭＴＣＨ２、ＮＥＧＲ１、ＢＤＮＦ、ＥＴＶ５、レプチン、レプチン受容体、ＦＡＩＭ２、ＫＣＮＭＡ１、ＭＡＦ、ＮＲＸＮ３、ＴＦＡＰ２Ｂ、ＭＳＲＡ、ＡＧＰＡＴ２、ＢＳＣＬ２、ＡＫＴ２、ＰＰＡＲγ、ＬＭＮＡ、ＺＭＰＳＴＥ２４、ＤＧＡＴ１、ＴＮＦα、ＩＬ−６、レジスチン、ＰＡＩ−１、ＴＢＣ１Ｄ１、ＭＥＴＡＰ２、ＶＥＧＦ、ＡＩＦ−１、ＪＮＫ１、ＣＢ１、ＲＩＰ１４０、ＴＩＦ２、ＡＮＧＰＴ１、ＡＮＧＰＴ２、ＥＩＦ４ＥＢＰ２、ＣＤＫ５、ＳＬＣ１３Ａ５、ペリリピン１、ペリリピン２、ペリリピン３、ペリリピン４、ＨＧＦ、ＧＤＦ３、ＴＮＫｓ、ＫＡＴＮＡ１、ＣｈＲＥＢＰ、ＡＴＦ４、ＢＡＳＰ−１、ＮＮＭＴのいずれか以外である、請求項１〜６１のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項６５】
前記第１の修飾オリゴヌクレオチドが、前記肝外核酸標的の核酸塩基配列に対して、前記修飾オリゴヌクレオチドの全核酸塩基配列にわたって比較したとき、少なくとも８０％相補的である核酸塩基配列を有する、請求項１〜６４のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項６６】
前記第１の修飾オリゴヌクレオチドが、前記肝外核酸標的の核酸塩基配列に対して、前記修飾オリゴヌクレオチドの全核酸塩基配列にわたって比較したとき、少なくとも９０％相補的である核酸塩基配列を有する、請求項６５に記載の二本鎖。
【請求項６７】
前記第１の修飾オリゴヌクレオチドが、前記肝外核酸標的の核酸塩基配列に対して、前記修飾オリゴヌクレオチドの全核酸塩基配列にわたって比較したとき、１００％相補的である核酸塩基配列を有する、請求項６５に記載の二本鎖。
【請求項６８】
前記第１の修飾オリゴヌクレオチドが、配列番号１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２または２３の核酸塩基配列のいずれかのうちの少なくとも８個の連続した核酸塩基を有する、請求項１〜５５のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項６９】
前記第１の修飾オリゴヌクレオチドが、配列番号１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２または２３の核酸塩基配列のいずれかのうちの少なくとも９個の連続した核酸塩基を有する、請求項１〜５５のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項７０】
前記第１の修飾オリゴヌクレオチドが、配列番号１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２または２３の核酸塩基配列のいずれかのうちの少なくとも１０個の連続した核酸塩基を有する、請求項１〜５５のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項７１】
前記第１の修飾オリゴヌクレオチドが、配列番号１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２または２３のうちのいずれかの核酸塩基配列からなる、請求項１〜５５のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項７２】
前記第１の修飾オリゴヌクレオチドが、配列番号１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２または２３の核酸塩基配列のいずれかのうちの少なくとも１２個の連続した核酸塩基を有する、請求項１〜５５のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項７３】
前記第１の修飾オリゴヌクレオチドが、いかなる２’−デオキシヌクレオシドも有していない、請求項１〜７２のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項７４】
前記第１の修飾オリゴヌクレオチドが、修飾ヌクレオシドを少なくとも１つ含む、請求項１〜７２のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項７５】
前記第１の修飾オリゴヌクレオチドが、修飾糖部分を含む修飾ヌクレオシドを少なくとも１つ含む、請求項７４に記載の二本鎖。
【請求項７６】
前記第１の修飾オリゴヌクレオチドが、二環式糖部分を含む修飾ヌクレオシドを少なくとも１つ含む、請求項７５に記載の二本鎖。
【請求項７７】
前記第１の修飾オリゴヌクレオチドが、２’−４’架橋を有する二環式糖部分を含む修飾ヌクレオシドを少なくとも１つ含み、前記２’−４’架橋は、−Ｏ−ＣＨ２−及び−Ｏ−ＣＨ（ＣＨ３）−から選択される、請求項７６に記載の二本鎖。
【請求項７８】
前記第１の修飾オリゴヌクレオチドが、修飾非二環式糖部分を含む修飾ヌクレオシドを少なくとも１つ含む、請求項７３〜７７のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項７９】
前記第１の修飾オリゴヌクレオチドが、２’−ＭＯＥまたは２’−Ｏ−メチル修飾糖部分を含む非二環式糖部分を含む修飾ヌクレオシドを少なくとも１つ含む、請求項７８に記載の二本鎖。
【請求項８０】
前記第１の修飾オリゴヌクレオチドが、糖代替物を含む修飾ヌクレオシドを少なくとも１つ含む、請求項７３〜７９のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項８１】
前記第１の修飾オリゴヌクレオチドが、モルホリノ、ＰＮＡ、Ｆ−ＨＮＡ、ＴＨＰまたは修飾ＴＨＰから選択される糖代替物を含む修飾ヌクレオシドを少なくとも１つ含む、請求項８０に記載の二本鎖。
【請求項８２】
前記第１の修飾オリゴヌクレオチドが、
１〜５個の結合された５’−ヌクレオシドからなる５’領域と、
６〜１０個の結合された中央領域ヌクレオシドからなる中央領域と、
１〜５個の結合された３’領域ヌクレオシドからなる３’領域とを有する糖モチーフを含み、
前記５’領域、前記３’領域及び前記中央領域の前記ヌクレオシドは、連続しており、前記中央領域ヌクレオシドのそれぞれは、非修飾ＤＮＡ糖部分を含む、請求項１〜７２または７４〜８１のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項８３】
前記５’領域ヌクレオシドのそれぞれ及び前記３’領域ヌクレオシドのそれぞれが修飾糖部分を含む、請求項８２に記載の二本鎖。
【請求項８４】
前記第１の修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも１つの修飾ヌクレオシド間結合を含む、請求項１〜８３のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項８５】
前記第１の修飾オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシド間結合が修飾ヌクレオシド間結合である、請求項８４に記載の二本鎖。
【請求項８６】
少なくとも１つのヌクレオシド間結合がホスホロチオエートヌクレオシド間結合である、請求項８４または８５に記載の二本鎖。
【請求項８７】
前記第１の修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも１つの非修飾ホスホジエステルヌクレオシド間結合を含む、請求項８４または８６に記載の二本鎖。
【請求項８８】
各ヌクレオシド間結合が、非修飾ホスホジエステルヌクレオシド間結合またはホスホロチオエートヌクレオシド間結合のいずれかである、請求項８７に記載の二本鎖。
【請求項８９】
各ヌクレオシド間結合がホスホロチオエートヌクレオシド間結合である、請求項８５に記載の二本鎖。
【請求項９０】
前記第１の修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも１つの修飾核酸塩基を含む、請求項１〜８９のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項９１】
前記第１の修飾核酸塩基が５−メチルシトシンである、請求項９０に記載の二本鎖。
【請求項９２】
前記第１の修飾オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシドの各核酸塩基が、非修飾核酸塩基であるか、５−メチルシトシンであるかのいずれかである、請求項１〜９１のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項９３】
前記第１の修飾オリゴヌクレオチドが、１２〜２２個の結合されたヌクレオシドからなる、請求項１〜９２のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項９４】
前記第１の修飾オリゴヌクレオチドが、１２〜２０個の結合されたヌクレオシドからなる、請求項１〜９２のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項９５】
前記第１の修飾オリゴヌクレオチドが、１４〜２０個の結合されたヌクレオシドからなる、請求項１〜９２のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項９６】
前記第１の修飾オリゴヌクレオチドが、１６〜２０個の結合されたヌクレオシドからなる、請求項１〜９２のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項９７】
前記第１の修飾オリゴヌクレオチドが、１８〜２０個の結合されたヌクレオシドからなる、請求項１〜９２のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項９８】
前記第１の修飾オリゴヌクレオチドが、２０個の結合されたヌクレオシドからなる、請求項１〜９２のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項９９】
前記第１の修飾オリゴヌクレオチドが、１９個の結合されたヌクレオシドからなる、請求項１〜９２のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項１００】
前記第１の修飾オリゴヌクレオチドが、１８個の結合されたヌクレオシドからなる、請求項１〜９２のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項１０１】
前記第１の修飾オリゴヌクレオチドが、１７個の結合されたヌクレオシドからなる、請求項１〜９２のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項１０２】
前記第１の修飾オリゴヌクレオチドが、１６個の結合されたヌクレオシドからなる、請求項１〜９２のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項１０３】
前記第２の修飾オリゴヌクレオチドが、いかなる２’デオキシヌクレオシドも有していない、請求項１〜１０２のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項１０４】
前記第２の修飾オリゴヌクレオチドが、修飾ヌクレオシドを少なくとも１つ含む、請求項１〜１０３のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項１０５】
前記第２の修飾オリゴヌクレオチドが、修飾糖部分を含む修飾ヌクレオシドを少なくとも１つ含む、請求項１０４に記載の二本鎖。
【請求項１０６】
前記第２の修飾オリゴヌクレオチドが、二環式糖部分を含む修飾ヌクレオシドを少なくとも１つ含む、請求項１０５に記載の二本鎖。
【請求項１０７】
前記第２の修飾オリゴヌクレオチドが、２’−４’架橋を有する二環式糖部分を含む修飾ヌクレオシドを少なくとも１つ含み、前記２’−４’架橋は、−Ｏ−ＣＨ２−及び−Ｏ−ＣＨ（ＣＨ３）−から選択される、請求項１０６に記載の二本鎖。
【請求項１０８】
前記第２の修飾オリゴヌクレオチドが、修飾非二環式糖部分を含む修飾ヌクレオシドを少なくとも１つ含む、請求項１０３〜１０７のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項１０９】
前記第１の修飾オリゴヌクレオチドが、２’−ＭＯＥまたは２’−Ｏ−メチル修飾を含む非二環式糖部分を含む修飾ヌクレオシドを少なくとも１つ含む、請求項１０８に記載の二本鎖。
【請求項１１０】
前記第２の修飾オリゴヌクレオチドが、２’−ＯＭｅを含むヌクレオシドを全く含まない、請求項１０３〜１０９のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項１１１】
前記第２の修飾オリゴヌクレオチドが、糖代替物を含む修飾ヌクレオシドを少なくとも１つ含む、請求項１０３〜１１０のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項１１２】
前記第２の修飾オリゴヌクレオチドが、モルホリノ、ＰＮＡ、Ｆ−ＨＮＡ、ＴＨＰまたは修飾ＴＨＰから選択される糖代替物を含む修飾ヌクレオシドを少なくとも１つ含む、請求項１１１に記載の二本鎖。
【請求項１１３】
前記第２の修飾オリゴヌクレオチドが、
１〜５個の結合された５’−ヌクレオシドからなる５’領域と、
６〜１０個の結合された中央領域ヌクレオシドからなる中央領域と、
１〜５個の結合された３’領域ヌクレオシドからなる３’領域とを含む糖モチーフを有し、
前記５’領域、前記３’領域及び前記中央領域の前記ヌクレオシドは、連続しており、前記中央領域ヌクレオシドのそれぞれは、非修飾２’−デオキシ糖部分を含む、請求項１０４〜１１２のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項１１４】
前記５’領域ヌクレオシドのそれぞれ及び前記３’領域ヌクレオシドのそれぞれが修飾糖部分を含む、請求項１１３に記載の二本鎖。
【請求項１１５】
前記第２の修飾オリゴヌクレオチドの前記５’領域ヌクレオシド及び前記３’領域ヌクレオシドが、Ｆ−ＲＮＡ修飾ヌクレオシド、２’−ＭＯＥ修飾ヌクレオシド、ＬＮＡヌクレオシド及びｃＥｔヌクレオシドから選択される、請求項１１４に記載の二本鎖。
【請求項１１６】
前記第２の修飾オリゴヌクレオチドが、２’−デオキシヌクレオシド及び２’−ＭＯＥ修飾ヌクレオシドを交互に含む糖モチーフを有する、請求項１０４〜１１２のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項１１７】
前記第２の修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも１つの修飾ヌクレオシド間結合を含む、請求項１０３〜１１６のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項１１８】
前記第２の修飾オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシド間結合が修飾ヌクレオシド間結合である、請求項１１７に記載の二本鎖。
【請求項１１９】
前記第２のオリゴヌクレオチドの少なくとも１つのヌクレオシド間結合がホスホロチオエートヌクレオシド間結合である、請求項１１７または１１８に記載の二本鎖。
【請求項１２０】
前記第２の修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも１つの非修飾ホスホジエステルヌクレオシド間結合を含む、請求項１１７または１１９に記載の二本鎖。
【請求項１２１】
前記第２のオリゴヌクレオチドの各ヌクレオシド間結合が、非修飾ホスホジエステルヌクレオシド間結合またはホスホロチオエートヌクレオシド間結合のいずれかである、請求項１２０に記載の二本鎖。
【請求項１２２】
前記第２のオリゴヌクレオチドの各ヌクレオシド間結合がホスホロチオエートヌクレオシド間結合である、請求項１１８に記載の二本鎖。
【請求項１２３】
前記第２のオリゴヌクレオチドが、非修飾ホスホジエステルヌクレオシド間結合を含む中央領域を有する、請求項１１７または１１９〜１２１のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項１２４】
前記第２のオリゴヌクレオチドが、一端または両端に、１または２個の末端ホスホロチオエート結合を有する、請求項１２３に記載の二本鎖。
【請求項１２５】
前記第２の修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも１つの修飾核酸塩基を含む、請求項１０３〜１２４のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項１２６】
前記第２の修飾核酸塩基が５−メチルシトシンである、請求項１２５に記載の二本鎖。
【請求項１２７】
前記第２の修飾オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシドの各核酸塩基が、非修飾核酸塩基であるか、５−メチルシトシンであるかのいずれかである、請求項１０３〜１２６のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項１２８】
前記第２の修飾オリゴヌクレオチドが、１２〜２２個の結合されたヌクレオシドからなる、請求項１０３〜１２７のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項１２９】
前記第２の修飾オリゴヌクレオチドが、１２〜２０個の結合されたヌクレオシドからなる、請求項１０３〜１２７のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項１３０】
前記第２の修飾オリゴヌクレオチドが、１４〜２０個の結合されたヌクレオシドからなる、請求項１０３〜１２７のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項１３１】
前記第２の修飾オリゴヌクレオチドが、１６〜２０個の結合されたヌクレオシドからなる、請求項１０３〜１２７のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項１３２】
前記第２の修飾オリゴヌクレオチドが、１８〜２０個の結合されたヌクレオシドからなる、請求項１０３〜１２７のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項１３３】
前記第２の修飾オリゴヌクレオチドが、２０個の結合されたヌクレオシドからなる、請求項１０３〜１２７のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項１３４】
前記第２の修飾オリゴヌクレオチドが、１９個の結合されたヌクレオシドからなる、請求項１０３〜１２７のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項１３５】
前記第２の修飾オリゴヌクレオチドが、１８個の結合されたヌクレオシドからなる、請求項１０３〜１２７のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項１３６】
前記第２の修飾オリゴヌクレオチドが、１７個の結合されたヌクレオシドからなる、請求項１０３〜１２７のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項１３７】
前記第２の修飾オリゴヌクレオチドが、１６個の結合されたヌクレオシドからなる、請求項１０３〜１２７のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項１３８】
前記コンジュゲートリンカーが１〜５個のリンカーヌクレオシドを含む、請求項１〜１３７のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項１３９】
前記コンジュゲートリンカーが３個のリンカーヌクレオシドを含む、請求項１３８に記載の二本鎖。
【請求項１４０】
前記３個のリンカーヌクレオシドがＴＣＡモチーフを有する、請求項１３９に記載の二本鎖。
【請求項１４１】
１〜５個のリンカーヌクレオシドがＴＣＡモチーフを含まない、請求項１３８に記載の二本鎖。
【請求項１４２】
前記コンジュゲート基がリンカーヌクレオシドを含まない、請求項１〜１３７のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項１４３】
前記コンジュゲートリンカーがヘキシルアミノ基を含む、請求項１〜１４２のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項１４４】
前記コンジュゲートリンカーがポリエチレングリコール基を含む、請求項１〜１４３のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項１４５】
前記コンジュゲートリンカーがトリエチレングリコール基を含む、請求項１〜１４４のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項１４６】
前記コンジュゲートリンカーがリン酸基を含む、請求項１〜１４５のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項１４７】
前記コンジュゲートリンカーが、
【化１】
2018528783.tif 000017
を含み、
Ｘは、前記コンジュゲート部分に直接的または間接的に結合し、
Ｙは、前記第２の修飾オリゴヌクレオチドに直接的または間接的に結合している、請求項１〜１４６のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項１４８】
ＸがＯを含む、請求項１４７に記載の二本鎖。
【請求項１４９】
Ｙがリン酸基を含む、請求項１４７または１４８に記載の二本鎖。
【請求項１５０】
前記コンジュゲートリンカーが、
【化２】
2018528783.tif 000018
を含み、
Ｘは、前記コンジュゲート部分に直接的または間接的に結合し、
Ｔ１は、結合基、ヌクレオシドまたは修飾オリゴヌクレオチドを含む、請求項１〜１４６のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項１５１】
前記コンジュゲートリンカーが、
【化３】
2018528783.tif 000019
を含み、
Ｘは、前記コンジュゲート部分に直接的または間接的に結合し、
Ｔ１は、ヌクレオチドまたは修飾オリゴヌクレオチドを含み、Ｂｘは、修飾または非修飾核酸塩基である、請求項１〜１４６のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項１５２】
前記コンジュゲート基が、前記第２の修飾オリゴヌクレオチドの５’末端で第３の修飾オリゴヌクレオチドに結合している、請求項１〜１５１のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項１５３】
前記コンジュゲート基が、前記第２の修飾オリゴヌクレオチドの５’末端で第４の修飾オリゴヌクレオチドに結合している、請求項１〜１５１のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項１５４】
前記コンジュゲート基が、前記第２の修飾オリゴヌクレオチドの５’末端で第５の修飾オリゴヌクレオチドに結合している、請求項１〜１５１のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項１５５】
前記コンジュゲート基が、前記第２の修飾オリゴヌクレオチドの３’末端で第３の修飾オリゴヌクレオチドに結合している、請求項１〜１５１のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項１５６】
前記コンジュゲート基が、前記第２の修飾オリゴヌクレオチドの３’末端で第４の修飾オリゴヌクレオチドに結合している、請求項１〜１５１のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項１５７】
前記コンジュゲート基が、前記第２の修飾オリゴヌクレオチドの３’末端で第５の修飾オリゴヌクレオチドに結合している、請求項１〜１５１のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項１５８】
前記コンジュゲート基が、前記第２の修飾オリゴヌクレオチドの５’末端で第６の修飾オリゴヌクレオチドに結合している、請求項１〜１５１のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項１５９】
前記コンジュゲート基が、前記第２の修飾オリゴヌクレオチドの３’末端で第６の修飾オリゴヌクレオチドに結合している、請求項１〜１５１のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項１６０】
前記コンジュゲート基が、前記第２の修飾オリゴヌクレオチドの非修飾ヌクレオシドに結合している、請求項１〜１５１のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項１６１】
前記コンジュゲート基が、前記第２の修飾オリゴヌクレオチドの５’末端で前記第２の修飾オリゴヌクレオチドに結合している、請求項１〜１６０のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項１６２】
前記コンジュゲート基が、前記第２の修飾オリゴヌクレオチドの３’末端で前記第２の修飾オリゴヌクレオチドに結合している、請求項１〜１６０のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項１６３】
末端基を含む、請求項１〜１６２のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項１６４】
請求項１〜１６３のいずれか一項に記載の二本鎖からなる、アンチセンス化合物。
【請求項１６５】
請求項１〜１６３のいずれか一項に記載の二本鎖を含む、アンチセンス化合物。
【請求項１６６】
ＲＮａｓｅ  Ｈアンチセンス化合物である、請求項１６４または１６５に記載のアンチセンス化合物。
【請求項１６７】
ＲＮＡｉアンチセンス化合物である、請求項１６４または１６５に記載のアンチセンス化合物。
【請求項１６８】
前記肝外核酸標的の量または活性を、標準セルアッセイで１．０ｎＭの濃度で試験したとき、少なくとも２０％減少させることができる、請求項１６４〜１６７のいずれか一項に記載のアンチセンス化合物。
【請求項１６９】
前記肝外核酸標的の量または活性を、標準セルアッセイで少なくとも４０％減少させることができる、請求項１６８に記載のアンチセンス化合物。
【請求項１７０】
前記肝外核酸標的の量または活性を、標準セルアッセイで少なくとも８０％減少させることができる、請求項１６８に記載のアンチセンス化合物。
【請求項１７１】
前記肝外核酸標的の肝外組織における量または活性を、標準動物実験で１００ｍｇ／ｋｇの用量で与えたとき、少なくとも２０％減少させることができる、請求項１６４〜１７０のいずれか一項に記載のアンチセンス化合物。
【請求項１７２】
前記肝外核酸標的の前記肝外組織における量または活性を少なくとも４０％減少させることができる、請求項１７１に記載のアンチセンス化合物。
【請求項１７３】
前記肝外核酸標的の前記肝外組織における量または活性を少なくとも８０％減少させることができる、請求項１７１に記載のアンチセンス化合物。
【請求項１７４】
前記肝外核酸標的のＲＮＡプロセシングを変更する、請求項１６４または１６５に記載のアンチセンス化合物。
【請求項１７５】
請求項１〜１６３のいずれか一項に記載の二本鎖に細胞を接触させることを含む、方法。
【請求項１７６】
請求項１６４〜１７４のいずれか一項に記載のアンチセンス化合物に細胞を接触させることを含む、方法。
【請求項１７７】
細胞中の肝外核酸標的の量または活性を調節する方法であって、前記細胞を請求項１〜１７４のいずれか一項に記載の二本鎖またはアンチセンス化合物に接触させることを含み、それにより、前記細胞中の前記肝外核酸標的の量または活性を調節する、前記方法。
【請求項１７８】
前記肝外核酸標的の前記量または活性が減少する、請求項１７７に記載の方法。
【請求項１７９】
前記細胞がｉｎ  ｖｉｔｒｏである、請求項１７５〜１７８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１８０】
前記細胞が動物内にある、請求項１７５〜１７８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１８１】
前記動物がヒトである、請求項１８０に記載の方法。
【請求項１８２】
細胞中の肝臓核酸標的の量または活性を調節する方法であって、前記細胞を請求項１〜１７４のいずれか一項に記載の二本鎖またはアンチセンス化合物に接触させることを含み、それにより、前記細胞中の前記肝臓核酸標的の量または活性を調節する、前記方法。
【請求項１８３】
前記肝外核酸標的の前記量または活性が減少する、請求項１８２に記載の方法。
【請求項１８４】
前記細胞がｉｎ  ｖｉｔｒｏである、請求項１８２または１８３に記載の方法。
【請求項１８５】
前記細胞が動物内にある、請求項１８２または１８３に記載の方法。
【請求項１８６】
前記動物がヒトである、請求項１８５に記載の方法。
【請求項１８７】
請求項１〜１６３のいずれか一項に記載の二本鎖と、薬学的に許容される担体または希釈剤とを含む、医薬組成物。
【請求項１８８】
請求項１６４〜１７４のいずれか一項に記載のアンチセンス化合物と、薬学的に許容される担体または希釈剤とを含む、医薬組成物。
【請求項１８９】
請求項１８７または１８８に記載の医薬組成物を動物に投与することを含む、方法。
【請求項１９０】
肝外核酸標的に関連する疾患を治療する方法であって、前記肝外核酸標的に関連する疾患を発症している個体またはそのリスクのある個体に、治療上有効な量の請求項１８７または１８８に記載の医薬組成物を投与することを含み、これにより、前記肝外核酸標的に関連する疾患を治療する、前記方法。
【請求項１９１】
前記肝外核酸標的が、ＡＴＧＬ、ＣＤ４０、ＣＤ３６、ＤＭＰＫ、ＤＮＭ２、ＤＭＤ、ＤＵＸ４、ＬＭＮＡ、ＺＦＮ９、ＳＧＬＴ２またはＧＣＣＲから選択される、請求項１９０に記載の方法。
【請求項１９２】
前記肝外核酸標的の転写産物が、アンドロゲン受容体（ＡＲ）、ＡＮＧＰＴＬ３、ＤＧＡＴ２、ｅＩＦ４Ｅ、第ＸＩ因子、ＦＧＦＲ４、ＧＣＣＲ、ＧＣＧＲ、ＧＨＲ、ＰＴＰ１Ｂ、ＳＭＲＴ、ＳＴＡＴ３、Ｔｈｅｍ１、ＴＲＰＶ４、ＦＴＯ、ＭＣ４Ｒ、ＴＭＥＭ１８、ＫＣＴＤ１５、ＧＮＰＤＡ２、ＳＨ２Ｂ１、ＭＴＣＨ２、ＮＥＧＲ１、ＢＤＮＦ、ＥＴＶ５、レプチン、レプチン受容体、ＦＡＩＭ２、ＫＣＮＭＡ１、ＭＡＦ、ＮＲＸＮ３、ＴＦＡＰ２Ｂ、ＭＳＲＡ、ＡＧＰＡＴ２、ＢＳＣＬ２、ＡＫＴ２、ＰＰＡＲγ、ＬＭＮＡ、ＺＭＰＳＴＥ２４、ＤＧＡＴ１、ＴＮＦα、ＩＬ−６、レジスチン、ＰＡＩ−１、ＴＢＣ１Ｄ１、ＭＥＴＡＰ２、ＶＥＧＦ、ＡＩＦ−１、ＪＮＫ１、ＣＢ１、ＲＩＰ１４０、ＴＩＦ２、ＡＮＧＰＴ１、ＡＮＧＰＴ２、ＥＩＦ４ＥＢＰ２、ＣＤＫ５、ＳＬＣ１３Ａ５、ペリリピン１、ペリリピン２、ペリリピン３、ペリリピン４、ＨＧＦ、ＧＤＦ３、ＴＮＫｓ、ＫＡＴＮＡ１、ＣｈＲＥＢＰ、ＡＴＦ４、ＢＡＳＰ−１、ＮＮＭＴから選択される、請求項１９０に記載の方法。
【請求項１９３】
前記肝外核酸標的の転写産物が、アンドロゲン受容体（ＡＲ）、ＡＮＧＰＴＬ３、ＤＧＡＴ２、ｅＩＦ４Ｅ、第ＸＩ因子、ＦＧＦＲ４、ＧＣＣＲ、ＧＣＧＲ、ＧＨＲ、ＰＴＰ１Ｂ、ＳＭＲＴ、ＳＴＡＴ３、Ｔｈｅｍ１、ＴＲＰＶ４、ＦＴＯ、ＭＣ４Ｒ、ＴＭＥＭ１８、ＫＣＴＤ１５、ＧＮＰＤＡ２、ＳＨ２Ｂ１、ＭＴＣＨ２、ＮＥＧＲ１、ＢＤＮＦ、ＥＴＶ５、レプチン、レプチン受容体、ＦＡＩＭ２、ＫＣＮＭＡ１、ＭＡＦ、ＮＲＸＮ３、ＴＦＡＰ２Ｂ、ＭＳＲＡ、ＡＧＰＡＴ２、ＢＳＣＬ２、ＡＫＴ２、ＰＰＡＲγ、ＬＭＮＡ、ＺＭＰＳＴＥ２４、ＤＧＡＴ１、ＴＮＦα、ＩＬ−６、レジスチン、ＰＡＩ−１、ＴＢＣ１Ｄ１、ＭＥＴＡＰ２、ＶＥＧＦ、ＡＩＦ−１、ＪＮＫ１、ＣＢ１、ＲＩＰ１４０、ＴＩＦ２、ＡＮＧＰＴ１、ＡＮＧＰＴ２、ＥＩＦ４ＥＢＰ２、ＣＤＫ５、ＳＬＣ１３Ａ５、ペリリピン１、ペリリピン２、ペリリピン３、ペリリピン４、ＨＧＦ、ＧＤＦ３、ＴＮＫｓ、ＫＡＴＮＡ１、ＣｈＲＥＢＰ、ＡＴＦ４、ＢＡＳＰ−１、ＮＮＭＴから選択されない、請求項１９０に記載の方法。
【請求項１９４】
肝外核酸標的に関連する疾患の少なくとも１つの症状が改善する、請求項１９０〜１９３のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１９５】
前記疾患が、糖尿病、メタボリックシンドローム、心臓病、筋ジストロフィー、筋強直性ジストロフィー、ベッカー型筋ジストロフィー、先天性筋ジストロフィー、デュシェンヌ型筋ジストロフィー、遠位型筋ジストロフィー、エメリ・ドレフュス型筋ジストロフィー、顔面肩甲上腕型筋ジストロフィー、肢帯型筋ジストロフィーまたは眼咽頭型筋ジストロフィーから選択される、請求項１９０〜１９４のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１９６】
前記肝外核酸標的の量または活性が、肝臓以外の少なくとも１種の組織種で調節される、請求項１８９〜１９５のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１９７】
前記肝外核酸標的の量または活性が、少なくとも２種の組織種で調節される、請求項１９６に記載の方法。
【請求項１９８】
前記少なくとも２種の組織種のうちの少なくとも１種が、肝臓、骨格筋、心筋、平滑筋、脂肪、白色脂肪、脾臓、骨、腸、副腎、精巣、卵巣、膵臓、下垂体、前立腺、皮膚、子宮、膀胱、脳、糸球体、遠位尿細管上皮、乳房、肺、心臓、腎臓、神経節、前頭皮質、脊髄、三叉神経節、座骨神経、後根神経節、副睾丸脂肪、横隔膜及び結腸から選択される、請求項１９７に記載の方法。
【請求項１９９】
少なくとも２種の組織種が、肝臓、骨格筋、心筋、平滑筋、脂肪、白色脂肪、脾臓、骨、腸、副腎、精巣、卵巣、膵臓、下垂体、前立腺、皮膚、子宮、膀胱、脳、糸球体、遠位尿細管上皮、乳房、肺、心臓、腎臓、神経節、前頭皮質、脊髄、三叉神経節、座骨神経、後根神経節、副睾丸脂肪、横隔膜及び結腸から選択される、請求項１９８に記載の方法。
【請求項２００】
治療上有効な量の請求項１８７または１８８に記載の医薬組成物を対象に投与することを含み、これにより、２種以上の組織中の標的核酸の量または活性を調節する、多組織疾患または病態を治療する方法。
【請求項２０１】
治療上有効な量の請求項１８７または１８８に記載の医薬組成物を対象に投与することを含み、これにより、２種以上の細胞型中の標的核酸の量または活性を調節する、疾患または病態を治療する方法。
【請求項２０２】
治療上有効な量の請求項１８７または１８８に記載の医薬組成物を対象に投与することを含み、これにより、２種以上の細胞型中の標的核酸の量または活性を調節する、多組織疾患または病態を治療する方法。
【請求項２０３】
前記２種以上の細胞型が、肝細胞、白色脂肪細胞、褐色脂肪細胞、脂肪細胞、マクロファージ、がん細胞、腫瘍細胞、平滑筋細胞、リンパ球及び心筋細胞から選択される、請求項２０１または２０２に記載の方法。
【請求項２０４】
前記医薬組成物が皮下投与される、請求項１８９〜２０３のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２０５】
前記医薬組成物が静脈内投与される、請求項１８９〜２０３のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２０６】
前記医薬組成物が非経口投与される、請求項１８９〜２０３のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２０７】
前記医薬組成物が腹腔内投与される、請求項１８９〜２０３のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２０８】
第１のオリゴマー化合物及び第２のオリゴマー化合物を含む二本鎖であって、
前記第１のオリゴマー化合物は、１０〜３０個の結合されたヌクレオシドからなる第１の修飾オリゴヌクレオチドを含み、かつ前記第２のオリゴマー化合物の核酸塩基配列及びＣＮＳまたは神経系で発現している肝外核酸標的に相補的な核酸塩基配列を有し、
前記第２のオリゴマー化合物は、１０〜３０個の結合されたヌクレオシド及びコンジュゲート基からなる第２の修飾オリゴヌクレオチドを含み、
前記コンジュゲート基は、コンジュゲート部分及びコンジュゲートリンカーを含み、
前記コンジュゲート部分は、脂質、ビタミン、ステロイド、Ｃ５〜Ｃ３０飽和アルキル基、Ｃ５〜Ｃ３０不飽和アルキル基、脂肪酸及び親油基から選択され、前記コンジュゲートリンカーは、少なくとも１つの切断可能部分を含む、前記二本鎖。
【請求項２０９】
第１のオリゴマー化合物及び第２のオリゴマー化合物を含む二本鎖であって、
前記第１のオリゴマー化合物は、１０〜３０個の結合されたヌクレオシドからなる第１の修飾オリゴヌクレオチドを含み、かつ前記第２のオリゴマー化合物の核酸塩基配列、ならびにＣＮＳまたは神経系及び肝細胞で発現している肝外核酸標的に相補的な核酸塩基配列を有し、
前記第２のオリゴマー化合物は、１０〜３０個の結合されたヌクレオシド及びコンジュゲート基からなる第２の修飾オリゴヌクレオチドを含み、
前記修飾オリゴヌクレオチドは
５’末端の１〜４個の２’−Ｏメチル−修飾ヌクレオシド；
それぞれが非修飾ＲＮＡ糖部分を含む１０〜１５個の中央ヌクレオシド；及び
３’末端の１〜４個の２’−Ｏメチル−修飾ヌクレオシド以外の糖モチーフを有し、
前記コンジュゲート基は、コンジュゲート部分及びコンジュゲートリンカーを含み、
前記コンジュゲート部分は、脂質、ビタミン、ステロイド、Ｃ５〜Ｃ３０飽和アルキル基、Ｃ５〜Ｃ３０不飽和アルキル基、脂肪酸及び親油基から選択され、前記コンジュゲートリンカーは、少なくとも１つの切断可能部分を含む、前記二本鎖。
【請求項２１０】
第１のオリゴマー化合物及び第２のオリゴマー化合物を含む二本鎖であって、
前記第１のオリゴマー化合物は、１０〜３０個の結合されたヌクレオシドからなる第１の修飾オリゴヌクレオチドを含み、かつ前記第２のオリゴマー化合物の核酸塩基配列及びＣＮＳまたは神経系で発現している肝外核酸標的または肝臓核酸標的に相補的な核酸塩基配列を有し、
前記第２のオリゴマー化合物は、１０〜３０個の結合されたヌクレオシド及びコンジュゲート基からなる第２の修飾オリゴヌクレオチドを含み、
前記コンジュゲート基は、コンジュゲート部分及びコンジュゲートリンカーを含み、
前記コンジュゲート部分は、脂質、ステロイド、Ｃ５〜Ｃ３０飽和アルキル基、Ｃ５〜Ｃ３０不飽和アルキル基、脂肪酸、及びビタミン以外の親油基から選択され、前記コンジュゲートリンカーは、少なくとも１つの切断可能部分を含む、前記二本鎖。
【請求項２１１】
前記肝外核酸標的が、肝臓で有意なレベルで発現していない、請求項２０８〜２１０のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項２１２】
前記肝外核酸標的が、肝臓で有意なレベルで発現している、請求項２０８〜２１１のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項２１３】
前記肝外核酸標的が、少なくとも２種の肝外細胞型で発現している、請求項２０８〜２１２のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項２１４】
前記肝外核酸標的が、少なくとも３種の肝外細胞型で発現している、請求項２０８〜２１３のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項２１５】
前記肝外核酸標的が、少なくとも４種の肝外細胞型で発現している、請求項２０８〜２１４のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項２１６】
前記肝外核酸標的がマクロファージで発現している、請求項２０８〜２１５のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項２１７】
前記肝外核酸標的ががん細胞で発現している、請求項２０８〜２１５のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項２１８】
前記肝外核酸標的が腫瘍細胞で発現している、請求項２０８〜２１５のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項２１９】
前記肝外核酸標的がリンパ球で発現している、請求項２０８〜２１５のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項２２０】
前記肝外核酸標的が、神経節、前頭皮質、脊髄、三叉神経節、座骨神経または後根神経節から選択される少なくとも１種の肝外組織で発現している、請求項２０８〜２１９のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項２２１】
前記肝外核酸標的が脳で発現している、請求項２０８〜２１９のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項２２２】
前記肝外核酸標的が糸球体で発現している、請求項２０８〜２１９のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項２２３】
前記肝外核酸標的が遠位尿細管上皮で発現している、請求項２０８〜２１９のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項２２４】
前記肝外核酸標的が神経節で発現している、請求項２０８〜２１９のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項２２５】
前記肝外核酸標的が前頭皮質で発現している、請求項２０８〜２１９のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項２２６】
前記肝外核酸標的が脊髄で発現している、請求項２０８〜２１９のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項２２７】
前記肝外核酸標的が三叉神経節で発現している、請求項２０８〜２１９のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項２２８】
前記肝外核酸標的が座骨神経で発現している、請求項２０８〜２１９のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項２２９】
前記肝外核酸標的が後根神経節で発現している、請求項２０８〜２１９のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項２３０】
前記肝外核酸標的が内因性ＲＮＡ転写産物である、請求項２０８〜２２９のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項２３１】
前記ＲＮＡ転写産物がｐｒｅ−ｍＲＮＡである、請求項２３０に記載の二本鎖。
【請求項２３２】
前記ＲＮＡ転写産物がｍＲＮＡである、請求項２３０に記載の二本鎖。
【請求項２３３】
前記ＲＮＡ転写産物が毒性ＲＮＡである、請求項２３０に記載の二本鎖。
【請求項２３４】
前記ＲＮＡ転写産物が非コードＲＮＡである、請求項２３０に記載の二本鎖。
【請求項２３５】
前記ＲＮＡ転写産物がｍｉｃｒｏＲＮＡである、請求項２３０に記載の二本鎖。
【請求項２３６】
前記肝外核酸標的がウイルス核酸である、請求項２０８〜２３０のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項２３７】
前記肝外核酸標的が、ＡＴＧＬ、ＣＤ４０、ＴＮＦ−α、ＣＤ３６、ＤＭＰＫ、ＤＮＭ２、ＤＭＤ、ＤＵＸ４、ＬＭＮＡ、ＺＦＮ９、ＳＧＬＴ２及びＧＣＣＲから選択される、請求項２０８〜２３６のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項２３８】
前記肝外核酸標的が、アンドロゲン受容体（ＡＲ）、ＡＮＧＰＴＬ３、ＤＧＡＴ２、ｅＩＦ４Ｅ、第ＸＩ因子、ＦＧＦＲ４、ＧＣＣＲ、ＧＣＧＲ、ＧＨＲ、ＰＴＰ１Ｂ、ＳＭＲＴ、ＳＴＡＴ３、Ｔｈｅｍ１、ＴＲＰＶ４、ＦＴＯ、ＭＣ４Ｒ、ＴＭＥＭ１８、ＫＣＴＤ１５、ＧＮＰＤＡ２、ＳＨ２Ｂ１、ＭＴＣＨ２、ＮＥＧＲ１、ＢＤＮＦ、ＥＴＶ５、レプチン、レプチン受容体、ＦＡＩＭ２、ＫＣＮＭＡ１、ＭＡＦ、ＮＲＸＮ３、ＴＦＡＰ２Ｂ、ＭＳＲＡ、ＡＧＰＡＴ２、ＢＳＣＬ２、ＡＫＴ２、ＰＰＡＲγ、ＬＭＮＡ、ＺＭＰＳＴＥ２４、ＤＧＡＴ１、ＴＮＦα、ＩＬ−６、レジスチン、ＰＡＩ−１、ＴＢＣ１Ｄ１、ＭＥＴＡＰ２、ＶＥＧＦ、ＡＩＦ−１、ＪＮＫ１、ＣＢ１、ＲＩＰ１４０、ＴＩＦ２、ＡＮＧＰＴ１、ＡＮＧＰＴ２、ＥＩＦ４ＥＢＰ２、ＣＤＫ５、ＳＬＣ１３Ａ５、ペリリピン１、ペリリピン２、ペリリピン３、ペリリピン４、ＨＧＦ、ＧＤＦ３、ＴＮＫｓ、ＫＡＴＮＡ１、ＣｈＲＥＢＰ、ＡＴＦ４、ＢＡＳＰ−１、ＮＮＭＴから選択される、請求項２０８〜２３６のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項２３９】
前記肝外核酸標的が、アンドロゲン受容体（ＡＲ）、ＡＮＧＰＴＬ３、ＤＧＡＴ２、ｅＩＦ４Ｅ、第ＸＩ因子、ＦＧＦＲ４、ＧＣＣＲ、ＧＣＧＲ、ＧＨＲ、ＰＴＰ１Ｂ、ＳＭＲＴ、ＳＴＡＴ３、Ｔｈｅｍ１、ＴＲＰＶ４、ＦＴＯ、ＭＣ４Ｒ、ＴＭＥＭ１８、ＫＣＴＤ１５、ＧＮＰＤＡ２、ＳＨ２Ｂ１、ＭＴＣＨ２、ＮＥＧＲ１、ＢＤＮＦ、ＥＴＶ５、レプチン、レプチン受容体、ＦＡＩＭ２、ＫＣＮＭＡ１、ＭＡＦ、ＮＲＸＮ３、ＴＦＡＰ２Ｂ、ＭＳＲＡ、ＡＧＰＡＴ２、ＢＳＣＬ２、ＡＫＴ２、ＰＰＡＲγ、ＬＭＮＡ、ＺＭＰＳＴＥ２４、ＤＧＡＴ１、ＴＮＦα、ＩＬ−６、レジスチン、ＰＡＩ−１、ＴＢＣ１Ｄ１、ＭＥＴＡＰ２、ＶＥＧＦ、ＡＩＦ−１、ＪＮＫ１、ＣＢ１、ＲＩＰ１４０、ＴＩＦ２、ＡＮＧＰＴ１、ＡＮＧＰＴ２、ＥＩＦ４ＥＢＰ２、ＣＤＫ５、ＳＬＣ１３Ａ５、ペリリピン１、ペリリピン２、ペリリピン３、ペリリピン４、ＨＧＦ、ＧＤＦ３、ＴＮＫｓ、ＫＡＴＮＡ１、ＣｈＲＥＢＰ、ＡＴＦ４、ＢＡＳＰ−１、ＮＮＭＴのいずれか以外である、請求項２０８〜２３８のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項２４０】
前記第１の修飾オリゴヌクレオチドが、前記肝外核酸標的の核酸塩基配列に対して、前記修飾オリゴヌクレオチドの全核酸塩基配列にわたって比較したとき、少なくとも８０％相補的である核酸塩基配列を有する、請求項２０８〜２３９のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項２４１】
前記第１の修飾オリゴヌクレオチドが、前記肝外核酸標的の核酸塩基配列に対して、前記修飾オリゴヌクレオチドの全核酸塩基配列にわたって比較したとき、少なくとも９０％相補的である核酸塩基配列を有する、請求項２４０に記載の二本鎖。
【請求項２４２】
前記第１の修飾オリゴヌクレオチドが、前記肝外核酸標的の核酸塩基配列に対して、前記修飾オリゴヌクレオチドの全核酸塩基配列にわたって比較したとき、１００％相補的である核酸塩基配列を有する、請求項２４０に記載の二本鎖。
【請求項２４３】
前記第１の修飾オリゴヌクレオチドが、配列番号１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２または２３の核酸塩基配列のいずれかのうちの少なくとも８個の連続した核酸塩基を有する、請求項２０８〜２３０のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項２４４】
前記第１の修飾オリゴヌクレオチドが、配列番号１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２または２３の核酸塩基配列のいずれかのうちの少なくとも９個の連続した核酸塩基を有する、請求項２０８〜２３０のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項２４５】
前記第１の修飾オリゴヌクレオチドが、配列番号１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２または２３の核酸塩基配列のいずれかのうちの少なくとも１０個の連続した核酸塩基を有する、請求項２０８〜２３０のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項２４６】
前記第１の修飾オリゴヌクレオチドが、配列番号１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２または２３のうちのいずれかの核酸塩基配列からなる、請求項２０８〜２３０のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項２４７】
前記第１の修飾オリゴヌクレオチドが、配列番号１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２または２３の核酸塩基配列のいずれかのうちの少なくとも１２個の連続した核酸塩基を有する、請求項２０８〜２３０のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項２４８】
前記第１の修飾オリゴヌクレオチドが、いかなる２’−デオキシヌクレオシドも有していない、請求項２０８〜２４７のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項２４９】
前記第１の修飾オリゴヌクレオチドが、修飾ヌクレオシドを少なくとも１つ含む、請求項２０８〜２４８のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項２５０】
前記第１の修飾オリゴヌクレオチドが、修飾糖部分を含む修飾ヌクレオシドを少なくとも１つ含む、請求項２４９に記載の二本鎖。
【請求項２５１】
前記第１の修飾オリゴヌクレオチドが、二環式糖部分を含む修飾ヌクレオシドを少なくとも１つ含む、請求項２５０に記載の二本鎖。
【請求項２５２】
前記第１の修飾オリゴヌクレオチドが、２’−４’架橋を有する二環式糖部分を含む修飾ヌクレオシドを少なくとも１つ含み、前記２’−４’架橋は、−Ｏ−ＣＨ２−及び−Ｏ−ＣＨ（ＣＨ３）−から選択される、請求項２５１に記載の二本鎖。
【請求項２５３】
前記第１の修飾オリゴヌクレオチドが、修飾非二環式糖部分を含む修飾ヌクレオシドを少なくとも１つ含む、請求項２４９〜２５２のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項２５４】
前記第１の修飾オリゴヌクレオチドが、２’−ＭＯＥまたは２’−Ｏ−メチル修飾糖部分を含む非二環式糖部分を含む修飾ヌクレオシドを少なくとも１つ含む、請求項２５３に記載の二本鎖。
【請求項２５５】
前記第１の修飾オリゴヌクレオチドが、糖代替物を含む修飾ヌクレオシドを少なくとも１つ含む、請求項２４８〜２５４のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項２５６】
前記第１の修飾オリゴヌクレオチドが、モルホリノ、ＰＮＡ、Ｆ−ＨＮＡ、ＴＨＰまたは修飾ＴＨＰから選択される糖代替物を含む修飾ヌクレオシドを少なくとも１つ含む、請求項２５５に記載の二本鎖。
【請求項２５７】
前記第１の修飾オリゴヌクレオチドが、
１〜５個の結合された５’−ヌクレオシドからなる５’領域と、
６〜１０個の結合された中央領域ヌクレオシドからなる中央領域と、
１〜５個の結合された３’領域ヌクレオシドからなる３’領域とを有する糖モチーフを含み、
前記５’領域、前記３’領域及び前記中央領域の前記ヌクレオシドは、連続しており、前記中央領域ヌクレオシドのそれぞれは、非修飾ＤＮＡ糖部分を含む、請求項２０８〜２５６のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項２５８】
前記５’領域ヌクレオシドのそれぞれ及び前記３’領域ヌクレオシドのそれぞれが修飾糖部分を含む、請求項２５７に記載の二本鎖。
【請求項２５９】
前記第１の修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも１つの修飾ヌクレオシド間結合を含む、請求項２０８〜２５８のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項２６０】
前記第１の修飾オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシド間結合が修飾ヌクレオシド間結合である、請求項２５９に記載の二本鎖。
【請求項２６１】
少なくとも１つのヌクレオシド間結合がホスホロチオエートヌクレオシド間結合である、請求項２５８または２５９に記載の二本鎖。
【請求項２６２】
前記第１の修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも１つの非修飾ホスホジエステルヌクレオシド間結合を含む、請求項２５９または２６１に記載の二本鎖。
【請求項２６３】
各ヌクレオシド間結合が、非修飾ホスホジエステルヌクレオシド間結合またはホスホロチオエートヌクレオシド間結合のいずれかである、請求項２６２に記載の二本鎖。
【請求項２６４】
各ヌクレオシド間結合がホスホロチオエートヌクレオシド間結合である、請求項２６１に記載の二本鎖。
【請求項２６５】
前記第１の修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも１つの修飾核酸塩基を含む、請求項２０８〜２６４のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項２６６】
前記第１の修飾核酸塩基が５−メチルシトシンである、請求項２６５に記載の二本鎖。
【請求項２６７】
前記第１の修飾オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシドの各核酸塩基が、非修飾核酸塩基であるか、５−メチルシトシンであるかのいずれかである、請求項２０８〜２６６のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項２６８】
前記第１の修飾オリゴヌクレオチドが、１２〜２２個の結合されたヌクレオシドからなる、請求項２０８〜２６７のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項２６９】
前記第１の修飾オリゴヌクレオチドが、１２〜２０個の結合されたヌクレオシドからなる、請求項２０８〜２６７のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項２７０】
前記第１の修飾オリゴヌクレオチドが、１４〜２０個の結合されたヌクレオシドからなる、請求項２０８〜２６７のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項２７１】
前記第１の修飾オリゴヌクレオチドが、１６〜２０個の結合されたヌクレオシドからなる、請求項２０８〜２６７のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項２７２】
前記第１の修飾オリゴヌクレオチドが、１８〜２０個の結合されたヌクレオシドからなる、請求項２０８〜２６７のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項２７３】
前記第１の修飾オリゴヌクレオチドが、２０個の結合されたヌクレオシドからなる、請求項２０８〜２６７のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項２７４】
前記第１の修飾オリゴヌクレオチドが、１９個の結合されたヌクレオシドからなる、請求項２０８〜２６７のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項２７５】
前記第１の修飾オリゴヌクレオチドが、１８個の結合されたヌクレオシドからなる、請求項２０８〜２６７のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項２７６】
前記第１の修飾オリゴヌクレオチドが、１７個の結合されたヌクレオシドからなる、請求項２０８〜２６７のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項２７７】
前記第１の修飾オリゴヌクレオチドが、１６個の結合されたヌクレオシドからなる、請求項２０８〜２６７のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項２７８】
前記第２の修飾オリゴヌクレオチドが、いかなる２’デオキシヌクレオシドも有していない、請求項２０８〜２７７のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項２７９】
前記第２の修飾オリゴヌクレオチドが、修飾ヌクレオシドを少なくとも１つ含む、請求項２０８〜２７７のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項２８０】
前記第２の修飾オリゴヌクレオチドが、修飾糖部分を含む修飾ヌクレオシドを少なくとも１つ含む、請求項２７９に記載の二本鎖。
【請求項２８１】
前記第２の修飾オリゴヌクレオチドが、二環式糖部分を含む修飾ヌクレオシドを少なくとも１つ含む、請求項２８０に記載の二本鎖。
【請求項２８２】
前記第２の修飾オリゴヌクレオチドが、２’−４’架橋を有する二環式糖部分を含む修飾ヌクレオシドを少なくとも１つ含み、前記２’−４’架橋は、−Ｏ−ＣＨ２−及び−Ｏ−ＣＨ（ＣＨ３）−から選択される、請求項２８１に記載の二本鎖。
【請求項２８３】
前記第２の修飾オリゴヌクレオチドが、修飾非二環式糖部分を含む修飾ヌクレオシドを少なくとも１つ含む、請求項２７９〜２８２のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項２８４】
前記第１の修飾オリゴヌクレオチドが、２’−ＭＯＥまたは２’−Ｏ−メチル修飾を含む非二環式糖部分を含む修飾ヌクレオシドを少なくとも１つ含む、請求項２８３に記載の二本鎖。
【請求項２８５】
前記第２の修飾オリゴヌクレオチドが、２’−ＯＭｅを含むヌクレオシドを全く含まない、請求項２７８〜２８４のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項２８６】
前記第２の修飾オリゴヌクレオチドが、糖代替物を含む修飾ヌクレオシドを少なくとも１つ含む、請求項２７８〜２８５のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項２８７】
前記第２の修飾オリゴヌクレオチドが、モルホリノ、ＰＮＡ、Ｆ−ＨＮＡ、ＴＨＰまたは修飾ＴＨＰから選択される糖代替物を含む修飾ヌクレオシドを少なくとも１つ含む、請求項２８６に記載の二本鎖。
【請求項２８８】
前記第２の修飾オリゴヌクレオチドが、
１〜５個の結合された５’−ヌクレオシドからなる５’領域と、
６〜１０個の結合された中央領域ヌクレオシドからなる中央領域と、
１〜５個の結合された３’領域ヌクレオシドからなる３’領域とを有する糖モチーフを含み、
前記５’領域、前記３’領域及び前記中央領域の前記ヌクレオシドは、連続しており、前記中央領域ヌクレオシドのそれぞれは、非修飾２’−デオキシ糖部分を含む、請求項２８７〜２８７のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項２８９】
前記５’領域ヌクレオシドのそれぞれ及び前記３’領域ヌクレオシドのそれぞれが修飾糖部分を含む、請求項２８８に記載の二本鎖。
【請求項２９０】
前記第２の修飾オリゴヌクレオチドの前記５’領域ヌクレオシド及び前記３’領域ヌクレオシドが、Ｆ−ＲＮＡ修飾ヌクレオシド、２’−ＭＯＥ修飾ヌクレオシド、ＬＮＡヌクレオシド及びｃＥｔヌクレオシドから選択される、請求項２８９に記載の二本鎖。
【請求項２９１】
前記第２の修飾オリゴヌクレオチドが、２’−デオキシヌクレオシド及び２’−ＭＯＥ修飾ヌクレオシドを交互に含む糖モチーフを有する、請求項２８７〜２８４のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項２９２】
前記第２の修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも１つの修飾ヌクレオシド間結合を含む、請求項２８７〜２９１のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項２９３】
前記第２の修飾オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシド間結合が修飾ヌクレオシド間結合である、請求項２９２に記載の二本鎖。
【請求項２９４】
前記第２のオリゴヌクレオチドの少なくとも１つのヌクレオシド間結合がホスホロチオエートヌクレオシド間結合である、請求項２９２または２９３に記載の二本鎖。
【請求項２９５】
前記第２の修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも１つの非修飾ホスホジエステルヌクレオシド間結合を含む、請求項２９２または２９４に記載の二本鎖。
【請求項２９６】
前記第２のオリゴヌクレオチドの各ヌクレオシド間結合が、非修飾ホスホジエステルヌクレオシド間結合またはホスホロチオエートヌクレオシド間結合のいずれかである、請求項２９５に記載の二本鎖。
【請求項２９７】
前記第２のオリゴヌクレオチドの各ヌクレオシド間結合がホスホロチオエートヌクレオシド間結合である、請求項２９４に記載の二本鎖。
【請求項２９８】
前記第２のオリゴヌクレオチドが、非修飾ホスホジエステルヌクレオシド間結合を含む中央領域を有する、請求項２９４または２９６に記載の二本鎖。
【請求項２９９】
前記第２のオリゴヌクレオチドが、一端または両端に、１または２個の末端ホスホロチオエート結合を有する、請求項２９８に記載の二本鎖。
【請求項３００】
前記第２の修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも１つの修飾核酸塩基を含む、請求項２４３〜２９９のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項３０１】
前記第２の修飾核酸塩基が５−メチルシトシンである、請求項３００に記載の二本鎖。
【請求項３０２】
前記第２の修飾オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシドの各核酸塩基が、非修飾核酸塩基であるか、５−メチルシトシンであるかのいずれかである、請求項２４３〜３０１のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項３０３】
前記第２の修飾オリゴヌクレオチドが、１２〜２２個の結合されたヌクレオシドからなる、請求項２４３〜３０２のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項３０４】
前記第２の修飾オリゴヌクレオチドが、１２〜２０個の結合されたヌクレオシドからなる、請求項２４３〜３０２のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項３０５】
前記第２の修飾オリゴヌクレオチドが、１４〜２０個の結合されたヌクレオシドからなる、請求項２４３〜３０２のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項３０６】
前記第２の修飾オリゴヌクレオチドが、１６〜２０個の結合されたヌクレオシドからなる、請求項２４３〜３０２のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項３０７】
前記第２の修飾オリゴヌクレオチドが、１８〜２０個の結合されたヌクレオシドからなる、請求項２４３〜３０２のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項３０８】
前記第２の修飾オリゴヌクレオチドが、２０個の結合されたヌクレオシドからなる、請求項２４３〜３０２のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項３０９】
前記第２の修飾オリゴヌクレオチドが、１９個の結合されたヌクレオシドからなる、請求項２４３〜３０２のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項３１０】
前記第２の修飾オリゴヌクレオチドが、１８個の結合されたヌクレオシドからなる、請求項２４３〜３０２のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項３１１】
前記第２の修飾オリゴヌクレオチドが、１７個の結合されたヌクレオシドからなる、請求項２４３〜３０２のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項３１２】
前記第２の修飾オリゴヌクレオチドが、１６個の結合されたヌクレオシドからなる、請求項２４３〜３０２のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項３１３】
前記コンジュゲートリンカーが１〜５個のリンカーヌクレオシドを含む、請求項２０８〜３１２のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項３１４】
前記コンジュゲートリンカーが３個のリンカーヌクレオシドを含む、請求項３１３に記載の二本鎖。
【請求項３１５】
前記３個のリンカーヌクレオシドがＴＣＡモチーフを有する、請求項３１４に記載の二本鎖。
【請求項３１６】
１〜５個のリンカーヌクレオシドがＴＣＡモチーフを含まない、請求項３１３に記載の二本鎖。
【請求項３１７】
前記コンジュゲート基がリンカーヌクレオシドを含まない、請求項２０８〜３１６のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項３１８】
前記コンジュゲートリンカーがヘキシルアミノ基を含む、請求項２０８〜３１７のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項３１９】
前記コンジュゲートリンカーがポリエチレングリコール基を含む、請求項２０８〜３１７のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項３２０】
前記コンジュゲートリンカーがトリエチレングリコール基を含む、請求項２０８〜３１７のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項３２１】
前記コンジュゲートリンカーがリン酸基を含む、請求項２０８〜３２１のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項３２２】
前記コンジュゲートリンカーが、
【化４】
2018528783.tif 000020
を含み、
Ｘは、前記コンジュゲート部分に直接的または間接的に結合し、
Ｙは、前記第２の修飾オリゴヌクレオチドに直接的または間接的に結合している、請求項２０８〜３１８のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項３２３】
ＸがＯを含む、請求項３２２に記載の二本鎖。
【請求項３２４】
Ｙがリン酸基を含む、請求項３２２または３２３に記載の二本鎖。
【請求項３２５】
前記コンジュゲートリンカーが、
【化５】
2018528783.tif 000021
を含み、
Ｘは、前記コンジュゲート部分に直接的または間接的に結合し、
Ｔ１は、結合基、ヌクレオシドまたは修飾オリゴヌクレオチドを含む、請求項２０８〜３１７のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項３２６】
前記コンジュゲートリンカーが、
【化６】
2018528783.tif 000022
を含み、
Ｘは、前記コンジュゲート部分に直接的または間接的に結合し、
Ｔ１は、ヌクレオチドまたは修飾オリゴヌクレオチドを含み、Ｂｘは、修飾または非修飾核酸塩基である、請求項２０８〜１１７のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項３２７】
前記コンジュゲート基が、前記第２の修飾オリゴヌクレオチドの５’末端で第３の修飾オリゴヌクレオチドに結合している、請求項２０８〜３２６のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項３２８】
前記コンジュゲート基が、前記第２の修飾オリゴヌクレオチドの５’末端で第４の修飾オリゴヌクレオチドに結合している、請求項２０８〜３２６のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項３２９】
前記コンジュゲート基が、前記第２の修飾オリゴヌクレオチドの５’末端で第５の修飾オリゴヌクレオチドに結合している、請求項２０８〜３２６のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項３３０】
前記コンジュゲート基が、前記第２の修飾オリゴヌクレオチドの３’末端で第３の修飾オリゴヌクレオチドに結合している、請求項２０８〜３２６のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項３３１】
前記コンジュゲート基が、前記第２の修飾オリゴヌクレオチドの３’末端で第４の修飾オリゴヌクレオチドに結合している、請求項２０８〜３２６のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項３３２】
前記コンジュゲート基が、前記第２の修飾オリゴヌクレオチドの３’末端で第５の修飾オリゴヌクレオチドに結合している、請求項２０８〜３２６のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項３３３】
前記コンジュゲート基が、前記第２の修飾オリゴヌクレオチドの５’末端で第６の修飾オリゴヌクレオチドに結合している、請求項２０８〜３２６のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項３３４】
前記コンジュゲート基が、前記第２の修飾オリゴヌクレオチドの３’末端で第６の修飾オリゴヌクレオチドに結合している、請求項２０８〜３２６のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項３３５】
前記コンジュゲート基が、前記第２の修飾オリゴヌクレオチドの非修飾ヌクレオシドに結合している、請求項２０８〜３２６のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項３３６】
前記コンジュゲート基が、前記第２の修飾オリゴヌクレオチドの５’末端で前記第２の修飾オリゴヌクレオチドに結合している、請求項２０８〜３２６のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
【請求項３３７】
前記コンジュゲート基が、前記第２の修飾オリゴヌクレオチドの３’末端で前記第２の修飾オリゴヌクレオチドに結合している、請求項２０８〜３２６のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
【請求項３３８】
末端基を含む、請求項２０８〜３３７のいずれか一項に記載の二本鎖。
【請求項３３９】
請求項２０８〜３３８のいずれか一項に記載の二本鎖からなる、アンチセンス化合物。
【請求項３４０】
請求項２０８〜３３８のいずれか一項に記載の二本鎖を含む、アンチセンス化合物。
【請求項３４１】
ＲＮａｓｅ  Ｈアンチセンス化合物である、請求項３３９または３４０に記載のアンチセンス化合物。
【請求項３４２】
ＲＮＡｉアンチセンス化合物である、請求項３３９または３４０に記載のアンチセンス化合物。
【請求項３４３】
前記肝外核酸標的の量または活性を、標準セルアッセイで１．０ｎＭの濃度で試験したとき、少なくとも２０％減少させることができる、請求項３３９〜３４２のいずれか一項に記載のアンチセンス化合物。
【請求項３４４】
前記肝外核酸標的の量または活性を、標準セルアッセイで少なくとも４０％減少させることができる、請求項３４３に記載のアンチセンス化合物。
【請求項３４５】
前記肝外核酸標的の量または活性を、標準セルアッセイで少なくとも８０％減少させることができる、請求項３４３に記載のアンチセンス化合物。
【請求項３４６】
前記肝外核酸標的の肝外組織における量または活性を、標準動物実験で１００ｍｇ／ｋｇの用量で与えたとき、少なくとも２０％減少させることができる、請求項３４０〜３４５のいずれか一項に記載のアンチセンス化合物。
【請求項３４７】
前記肝外核酸標的の前記肝外組織における量または活性を少なくとも４０％減少させることができる、請求項３４６に記載のアンチセンス化合物。
【請求項３４８】
前記肝外核酸標的の前記肝外組織における量または活性を少なくとも８０％減少させることができる、請求項３４６に記載のアンチセンス化合物。
【請求項３４９】
前記肝外核酸標的のＲＮＡプロセシングを変更する、請求項３３９または３４０に記載のアンチセンス化合物。
【請求項３５０】
請求項２０８〜３３８のいずれか一項に記載の二本鎖に細胞を接触させることを含む、方法。
【請求項３５１】
請求項３３９〜３５０のいずれか一項に記載のアンチセンス化合物に細胞を接触させることを含む、方法。
【請求項３５２】
細胞中の肝外核酸標的の量または活性を調節する方法であって、前記細胞を請求項２０８〜３４９のいずれか一項に記載の二本鎖またはアンチセンス化合物に接触させることを含み、それにより、前記細胞中の前記肝外核酸標的の量または活性を調節する、前記方法。
【請求項３５３】
前記肝外核酸標的の前記量または活性が減少する、請求項３５２に記載の方法。
【請求項３５４】
前記細胞がｉｎ  ｖｉｔｒｏである、請求項３５０〜３５３のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３５５】
前記細胞が動物内にある、請求項３５０〜３５３のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３５６】
前記動物がヒトである、請求項３５５に記載の方法。
【請求項３５７】
細胞中の肝臓核酸標的の量または活性を調節する方法であって、前記細胞を請求項２０８〜３４９のいずれか一項に記載の二本鎖またはアンチセンス化合物に接触させることを含み、それにより、前記細胞中の前記肝臓核酸標的の量または活性を調節する、前記方法。
【請求項３５８】
前記肝外核酸標的の前記量または活性が減少する、請求項３５７に記載の方法。
【請求項３５９】
前記細胞がｉｎ  ｖｉｔｒｏである、請求項３５７または３５８に記載の方法。
【請求項３６０】
前記細胞が動物内にある、請求項３５７または３５８に記載の方法。
【請求項３６１】
前記動物がヒトである、請求項３６０に記載の方法。
【請求項３６２】
請求項２０８〜３３８のいずれか一項に記載の二本鎖と、薬学的に許容される担体または希釈剤とを含む、医薬組成物。
【請求項３６３】
請求項３３９〜３４９のいずれか一項に記載のアンチセンス化合物と、薬学的に許容される担体または希釈剤とを含む、医薬組成物。
【請求項３６４】
請求項３６２または３６３に記載の医薬組成物を動物に投与することを含む、方法。
【請求項３６５】
肝外核酸標的に関連する疾患を治療する方法であって、前記肝外核酸標的に関連する疾患を発症している個体またはそのリスクのある個体に、治療上有効な量の請求項３６２または３６３に記載の医薬組成物を投与することを含み、これにより、前記肝外核酸標的に関連する疾患を治療する、前記方法。
【請求項３６６】
前記肝外核酸標的が、ＡＴＧＬ、ＣＤ４０、ＣＤ３６、ＤＭＰＫ、ＤＮＭ２、ＤＭＤ、ＤＵＸ４、ＬＭＮＡ、ＺＦＮ９、ＳＧＬＴ２またはＧＣＣＲから選択される、請求項３６５に記載の方法。
【請求項３６７】
前記肝外核酸標的の転写産物が、アンドロゲン受容体（ＡＲ）、ＡＮＧＰＴＬ３、ＤＧＡＴ２、ｅＩＦ４Ｅ、第ＸＩ因子、ＦＧＦＲ４、ＧＣＣＲ、ＧＣＧＲ、ＧＨＲ、ＰＴＰ１Ｂ、ＳＭＲＴ、ＳＴＡＴ３、Ｔｈｅｍ１、ＴＲＰＶ４、ＦＴＯ、ＭＣ４Ｒ、ＴＭＥＭ１８、ＫＣＴＤ１５、ＧＮＰＤＡ２、ＳＨ２Ｂ１、ＭＴＣＨ２、ＮＥＧＲ１、ＢＤＮＦ、ＥＴＶ５、レプチン、レプチン受容体、ＦＡＩＭ２、ＫＣＮＭＡ１、ＭＡＦ、ＮＲＸＮ３、ＴＦＡＰ２Ｂ、ＭＳＲＡ、ＡＧＰＡＴ２、ＢＳＣＬ２、ＡＫＴ２、ＰＰＡＲγ、ＬＭＮＡ、ＺＭＰＳＴＥ２４、ＤＧＡＴ１、ＴＮＦα、ＩＬ−６、レジスチン、ＰＡＩ−１、ＴＢＣ１Ｄ１、ＭＥＴＡＰ２、ＶＥＧＦ、ＡＩＦ−１、ＪＮＫ１、ＣＢ１、ＲＩＰ１４０、ＴＩＦ２、ＡＮＧＰＴ１、ＡＮＧＰＴ２、ＥＩＦ４ＥＢＰ２、ＣＤＫ５、ＳＬＣ１３Ａ５、ペリリピン１、ペリリピン２、ペリリピン３、ペリリピン４、ＨＧＦ、ＧＤＦ３、ＴＮＫｓ、ＫＡＴＮＡ１、ＣｈＲＥＢＰ、ＡＴＦ４、ＢＡＳＰ−１、ＮＮＭＴから選択される、請求項３６５に記載の方法。
【請求項３６８】
前記肝外核酸標的の転写産物が、アンドロゲン受容体（ＡＲ）、ＡＮＧＰＴＬ３、ＤＧＡＴ２、ｅＩＦ４Ｅ、第ＸＩ因子、ＦＧＦＲ４、ＧＣＣＲ、ＧＣＧＲ、ＧＨＲ、ＰＴＰ１Ｂ、ＳＭＲＴ、ＳＴＡＴ３、Ｔｈｅｍ１、ＴＲＰＶ４、ＦＴＯ、ＭＣ４Ｒ、ＴＭＥＭ１８、ＫＣＴＤ１５、ＧＮＰＤＡ２、ＳＨ２Ｂ１、ＭＴＣＨ２、ＮＥＧＲ１、ＢＤＮＦ、ＥＴＶ５、レプチン、レプチン受容体、ＦＡＩＭ２、ＫＣＮＭＡ１、ＭＡＦ、ＮＲＸＮ３、ＴＦＡＰ２Ｂ、ＭＳＲＡ、ＡＧＰＡＴ２、ＢＳＣＬ２、ＡＫＴ２、ＰＰＡＲγ、ＬＭＮＡ、ＺＭＰＳＴＥ２４、ＤＧＡＴ１、ＴＮＦα、ＩＬ−６、レジスチン、ＰＡＩ−１、ＴＢＣ１Ｄ１、ＭＥＴＡＰ２、ＶＥＧＦ、ＡＩＦ−１、ＪＮＫ１、ＣＢ１、ＲＩＰ１４０、ＴＩＦ２、ＡＮＧＰＴ１、ＡＮＧＰＴ２、ＥＩＦ４ＥＢＰ２、ＣＤＫ５、ＳＬＣ１３Ａ５、ペリリピン１、ペリリピン２、ペリリピン３、ペリリピン４、ＨＧＦ、ＧＤＦ３、ＴＮＫｓ、ＫＡＴＮＡ１、ＣｈＲＥＢＰ、ＡＴＦ４、ＢＡＳＰ−１、ＮＮＭＴから選択されない、請求項３６５に記載の方法。
【請求項３６９】
肝外核酸標的に関連する疾患の少なくとも１つの症状が改善する、請求項３６５〜３６８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３７０】
治療上有効な量の請求項３６２または３６３に記載の医薬組成物を対象に投与することを含み、これにより、２種以上の組織中の標的核酸の量または活性を調節する、多組織疾患または病態を治療する方法。
【請求項３７１】
治療上有効な量の請求項３６２または３６３に記載の医薬組成物を対象に投与することを含み、これにより、２種以上の細胞型中の標的核酸の量または活性を調節する、疾患または病態を治療する方法。
【請求項３７２】
治療上有効な量の請求項３６２または３６３に記載の医薬組成物を対象に投与することを含み、これにより、２種以上の細胞型中の標的核酸の量または活性を調節する、多組織疾患または病態を治療する方法。
【請求項３７３】
前記２種以上の細胞型が、肝細胞、白色脂肪細胞、褐色脂肪細胞、脂肪細胞、マクロファージ、がん細胞、腫瘍細胞、平滑筋細胞、リンパ球及び心筋細胞から選択される、請求項３７１または３７２に記載の方法。
【請求項３７４】
前記医薬組成物が皮下投与される、請求項３７０〜３７３のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３７５】
前記医薬組成物が静脈内投与される、請求項３７０〜３７３のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３７６】
前記医薬組成物が非経口投与される、請求項３７０〜３７３のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３７７】
前記医薬組成物が腹腔内投与される、請求項３７０〜３７３のいずれか一項に記載の方法。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
配列表
本出願は、電子形式の配列表とともに出願されている。配列表は、２０１６年９月２６日に作成されたサイズ８ＫｂのＣＯＲＥ０１３７ＷＯＳＥＱ＿ＳＴ２５．ｔｘｔと題するファイルとして提出される。この電子形式の配列表中の情報は、その全体が参照により本明細書に援用される。
【０００２】
本開示は、第１のオリゴマー化合物及び第２のオリゴマー化合物を含む二本鎖を提供し、ここで、第２のオリゴマー化合物は、コンジュゲート基を含む。特定の実施形態において、二本鎖は、肝外組織及び／または肝外細胞の標的核酸の量または活性を調節する。特定の実施形態において、二本鎖は、肝組織及び／または肝細胞の標的核酸の量または活性を調節する。
【背景技術】
【０００３】
アンチセンス技術の背後にある原理は、アンチセンス化合物が標的核酸にハイブリダイズし、標的核酸の量、活性及び／または機能を調節することである。例えば、ある場合には、アンチセンス化合物は、標的の転写または翻訳に変化をもたらす。このような発現の調節は、例えば、標的ｍＲＮＡの分解または占有に基づく（ｏｃｃｕｐａｎｃｙ−ｂａｓｅｄ）阻害によって達成することができる。分解によるＲＮＡ標的機能の調節の一例は、ＤＮＡ様アンチセンス化合物とのハイブリダイゼーションの際における標的ＲＮＡのＲＮａｓｅ  Ｈによる分解である。標的分解による遺伝子発現の調節の別の例は、ＲＮＡ干渉（ＲＮＡｉ）である。ＲＮＡｉは、ＲＮＡ誘導サイレンシング複合体（ＲＩＳＣ）を利用する機序を介した、アンチセンス媒介性遺伝子サイレンシングを指す。ＲＮＡ標的機能の調節の更なる例は、占有に基づく機序によるものであり、ｍｉｃｒｏＲＮＡによって自然に利用されている機序などである。ｍｉｃｒｏＲＮＡは、タンパク質をコードしているＲＮＡの発現を調節する、小さな非コードＲＮＡである。アンチセンス化合物がｍｉｃｒｏＲＮＡに結合すると、当該ｍｉｃｒｏＲＮＡのそのメッセンジャーＲＮＡ標的への結合が阻害され、それによりｍｉｃｒｏＲＮＡの機能が妨げられる。ｍｉｃｒｏＲＮＡ模倣体は、生来のｍｉｃｒｏＲＮＡ機能を高めることができる。特定のアンチセンス化合物は、ｐｒｅ−ｍＲＮＡのスプライシングを変更する。特定の機序にかかわらず、配列特異性は、アンチセンス化合物を、標的の検証及び遺伝子の機能化のためのツールとして、また、疾患の病因に関与する遺伝子の発現を選択的に調節する治療薬として魅力的なものにしている。
【０００４】
アンチセンス技術は、１つ以上の特定の遺伝子産物の発現を調節するための有効な手段であり、そのため、治療、診断及び研究の多数の用途において比類なく有用なものとなり得る。アンチセンス化合物には、ヌクレアーゼ耐性、薬物動態または標的核酸に対する親和性などの１つ以上の特性を高めるために、化学修飾ヌクレオシドが導入され得る。アンチセンス化合物であるＶｉｔｒａｖｅｎｅ（登録商標）（ホミビルセン；Ｉｓｉｓ  Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌｓ  Ｉｎｃ．（Ｃａｒｌｓｂａｄ，ＣＡ）により開発）は、１９９８年に米国食品医薬品局（ＦＤＡ）から販売認可を得た最初のアンチセンス薬物であり、現在、ＡＩＤＳ患者におけるサイトメガロウイルス（ＣＭＶ）誘導性網膜炎の治療薬となっている。別の例では、ホモ接合体性家族性高コレステロール血症（ＨｏＦＨ）の患者において低密度リポタンパク質コレステロール（ＬＤＬ−Ｃ）、アポＢ、総コレステロール（ＴＣ）及び非高密度リポタンパク質コレステロール（非ＨＤＬ−Ｃ）を減少させる、脂質低下薬剤及び脂質低下食事の補助療法として、アポＢを標的にするアンチセンスオリゴヌクレオチドであるＫＹＮＡＭＲＯ（商標）が米国食品医薬品局（ＦＤＡ）によって認可されている。
【０００５】
新しい化学修飾により、アンチセンス化合物の効力及び有効性が改善されており、経口送達の可能性が見出され、更に、皮下投与を向上させ、副作用の可能性を減少させ、患者の利便性の改善につながっている。アンチセンス化合物の効力を増加させる化学修飾は、低用量の投与を可能にするものであり、これにより、毒性の可能性が減少し、治療費全体が削減される。分解に対する耐性を増加させる修飾は、体内からのクリアランスを遅延させることにより、投与頻度を少なくすることができる。１つの化合物で異なる種類の化学修飾を組み合わせることで、化合物の有効性を更に最適化することができる。従来より、修飾オリゴヌクレオチドを含むアンチセンス化合物は、肝臓組織への良好な機能性取込みを示している。しかしながら、アンチセンス化合物の他の細胞型（cell types）への取込み及び分布の促進が依然として必要とされている。
【発明の概要】
【０００６】
対象にオリゴマー化合物を投与した後には、種々の器官、組織及び細胞が種々の量のオリゴマー化合物を受け取る。オリゴマー化合物の種々の器官、組織及び細胞への分布は、多数の因子に依存する。例えば、所与のオリゴマー化合物が血漿タンパク質に結合する程度が、所与のオリゴマー化合物の各種組織への分布に影響し得る。特定の実施形態において、所与のオリゴマー化合物が特定の細胞表面受容体に認識される程度が、所与のオリゴマー化合物の各種組織または細胞への分布に影響し得る。
【０００７】
オリゴマー化合物は、典型的に、対象への投与後、肝臓への良好な分布を示す。しかしながら、特定の実施形態において、オリゴマー化合物を対象内の他の組織に送達する必要性が存在する。例えば、脂肪組織または筋肉組織などの１つ以上の肝外組織にオリゴマー化合物を送達する必要性が存在する。特定の実施形態において、本開示は、修飾オリゴヌクレオチド及びコンジュゲート基を含むオリゴマー化合物を提供し、ここで、コンジュゲート基は、修飾オリゴヌクレオチドの１つ以上の肝外組織への送達を改善する。
【０００８】
特定の実施形態において、本開示は、第１のオリゴマー化合物及び第２のオリゴマー化合物を含む二本鎖を提供し、ここで、第２のオリゴマー化合物は、修飾オリゴヌクレオチド及びコンジュゲート基を含む。特定の実施形態において、当該二本鎖は、コンジュゲートを含まない第２のオリゴマー化合物を有する二本鎖よりも、肝外細胞中の標的核酸転写産物の量または活性を大きく調節する。
【０００９】
本開示は、以下の非限定的な番号付き実施形態を提供する。
【００１０】
実施形態１：第１のオリゴマー化合物及び第２のオリゴマー化合物を含む二本鎖であって、
第１のオリゴマー化合物は、１０〜３０個の結合されたヌクレオシドからなる第１の修飾オリゴヌクレオチドを含み、かつ第２のオリゴマー化合物の核酸塩基配列及び肝外核酸標的に相補的な核酸塩基配列を有し、
第２のオリゴマー化合物は、１０〜３０個の結合されたヌクレオシド及びコンジュゲート基からなる第２の修飾オリゴヌクレオチドを含み、
コンジュゲート基は、コンジュゲート部分及びコンジュゲートリンカーを含み、
コンジュゲート部分は、脂質、ビタミン、ステロイド、Ｃ５〜Ｃ３０飽和アルキル基、Ｃ５〜Ｃ３０不飽和アルキル基、脂肪酸及び親油基から選択され、コンジュゲートリンカーは、少なくとも１つの切断可能部分を含む、二本鎖。
【００１１】
実施形態２：第１のオリゴマー化合物及び第２のオリゴマー化合物を含む二本鎖であって、
第１のオリゴマー化合物は、１０〜３０個の結合されたヌクレオシドからなる第１の修飾オリゴヌクレオチドを含み、かつ第２のオリゴマー化合物の核酸塩基配列及び肝外核酸標的または肝臓核酸標的に相補的な核酸塩基配列を有し、
第２のオリゴマー化合物は、１０〜３０個の結合されたヌクレオシド及びコンジュゲート基からなる第２の修飾オリゴヌクレオチドを含み、
修飾オリゴヌクレオチドは、
５’末端の１〜４個の２’−Ｏメチル−修飾ヌクレオシド；
それぞれが非修飾ＲＮＡ糖部分を含む１０〜１５個の中央ヌクレオシド；及び
３’末端の１〜４個の２’−Ｏメチル−修飾ヌクレオシド以外の糖モチーフを有し、
コンジュゲート基は、コンジュゲート部分及びコンジュゲートリンカーを含み、
コンジュゲート部分は、脂質、ビタミン、ステロイド、Ｃ５〜Ｃ３０飽和アルキル基、Ｃ５〜Ｃ３０不飽和アルキル基、脂肪酸及び親油基から選択され、コンジュゲートリンカーは、少なくとも１つの切断可能部分を含む、二本鎖。
【００１２】
実施形態３：第１のオリゴマー化合物及び第２のオリゴマー化合物を含む二本鎖であって、
第１のオリゴマー化合物は、１０〜３０個の結合されたヌクレオシドからなる第１の修飾オリゴヌクレオチドを含み、かつ第２のオリゴマー化合物の核酸塩基配列及び肝外核酸標的または肝臓核酸標的に相補的な核酸塩基配列を有し、
第２のオリゴマー化合物は、１０〜３０個の結合されたヌクレオシド及びコンジュゲート基からなる第２の修飾オリゴヌクレオチドを含み、
コンジュゲート基は、コンジュゲート部分及びコンジュゲートリンカーを含み、
コンジュゲート部分は、脂質、ステロイド、Ｃ５〜Ｃ３０飽和アルキル基、Ｃ５〜Ｃ３０不飽和アルキル基、脂肪酸、及びビタミン以外の親油基から選択され、コンジュゲートリンカーは、少なくとも１つの切断可能部分を含む、二本鎖。
【００１３】
実施形態４：当該肝外核酸標的が、肝臓で有意なレベルで発現していない、実施形態１〜３のいずれかに記載の二本鎖。
【００１４】
実施形態５：当該肝外核酸標的が、肝臓で有意なレベルで発現している、実施形態１〜３のいずれかに記載の二本鎖。
【００１５】
実施形態６：当該肝外核酸標的が、白色脂肪細胞、褐色脂肪細胞、脂肪細胞、マクロファージ、がん細胞、腫瘍細胞、平滑筋細胞、リンパ球、心筋細胞及び肺細胞から選択される少なくとも１種の肝外細胞型で発現している、実施形態１〜５のいずれかに記載の二本鎖。
【００１６】
実施形態７：当該肝外核酸標的が、少なくとも２種の肝外細胞型で発現している、実施形態１〜６のいずれかに記載の二本鎖。
【００１７】
実施形態８：当該肝外核酸標的が、少なくとも３種の肝外細胞型で発現している、実施形態１〜７のいずれかに記載の二本鎖。
【００１８】
実施形態９：当該肝外核酸標的が、少なくとも４種の肝外細胞型で発現している、実施形態１〜８のいずれかに記載の二本鎖。
【００１９】
実施形態１０：当該肝外核酸標的が白色脂肪細胞で発現している、実施形態１〜９のいずれかに記載の二本鎖。
【００２０】
実施形態１１：当該肝外核酸標的が褐色脂肪細胞で発現している、実施形態１〜１０のいずれかに記載の二本鎖。
【００２１】
実施形態１２：当該肝外核酸標的が脂肪細胞で発現している、実施形態１〜１１のいずれかに記載の二本鎖。
【００２２】
実施形態１３：当該肝外核酸標的がマクロファージで発現している、実施形態１〜１２のいずれかに記載の二本鎖。
【００２３】
実施形態１４：当該肝外核酸標的ががん細胞で発現している、実施形態１〜１３のいずれかに記載の二本鎖。
【００２４】
実施形態１５：当該肝外核酸標的が腫瘍細胞で発現している、実施形態１〜１４のいずれかに記載の二本鎖。
【００２５】
実施形態１６：当該肝外核酸標的が平滑筋細胞で発現している、実施形態１〜１５のいずれかに記載の二本鎖。
【００２６】
実施形態１７：当該肝外核酸標的が心筋細胞で発現している、実施形態１〜１６のいずれかに記載の二本鎖。
【００２７】
実施形態１８：当該肝外核酸標的がリンパ球で発現している、実施形態１〜１７のいずれかに記載の二本鎖。
【００２８】
実施形態１９：当該肝外核酸標的が、骨格筋、心筋、平滑筋、脂肪、白色脂肪、褐色脂肪、脾臓、骨、腸、副腎、精巣、卵巣、膵臓、下垂体、前立腺、皮膚、子宮、膀胱、脳、糸球体、遠位尿細管上皮、乳房、肺、心臓、腎臓、神経節、前頭皮質、脊髄、三叉神経節、座骨神経、後根神経節、副睾丸脂肪、横隔膜及び結腸から選択される少なくとも１種の肝外組織で発現している、実施形態１〜１８のいずれかに記載の二本鎖。
【００２９】
実施形態２０：当該肝外核酸標的が少なくとも２種の肝外組織で発現している、実施形態１〜１９のいずれかに記載の二本鎖。
【００３０】
実施形態２１：当該肝外核酸標的が少なくとも３種の肝外組織で発現している、実施形態１〜２０のいずれかに記載の二本鎖。
【００３１】
実施形態２２：当該肝外核酸標的が少なくとも4種の肝外組織で発現している、実施形態１〜２1のいずれかに記載の二本鎖。
【００３２】
実施形態２３：当該肝外核酸標的が骨格筋で発現している、実施形態１〜２２のいずれかに記載の二本鎖。
【００３３】
実施形態２４：当該肝外核酸標的が心筋で発現している、実施形態１〜２３のいずれかに記載の二本鎖。
【００３４】
実施形態２５：当該肝外核酸標的が平滑筋で発現している、実施形態１〜２４のいずれかに記載の二本鎖。
【００３５】
実施形態２６：当該肝外核酸標的が副睾丸脂肪で発現している、実施形態１〜２５のいずれかに記載の二本鎖。
【００３６】
実施形態２７：当該肝外核酸標的が白色脂肪組織で発現している、実施形態１〜２６のいずれかに記載の二本鎖。
【００３７】
実施形態２８：当該肝外核酸標的が脾臓で発現している、実施形態１〜２７のいずれかに記載の二本鎖。
【００３８】
実施形態２９：当該肝外核酸標的が骨で発現している、実施形態１〜２８のいずれかに記載の二本鎖。
【００３９】
実施形態３０：当該肝外核酸標的が骨髄で発現している、実施形態１〜２９のいずれかに記載の二本鎖。
【００４０】
実施形態３１：当該肝外核酸標的が腸で発現している、実施形態１〜３０のいずれかに記載の二本鎖。
【００４１】
実施形態３２：当該肝外核酸標的が副腎組織で発現している、実施形態１〜３１のいずれかに記載の二本鎖。
【００４２】
実施形態３３：当該肝外核酸標的が精巣で発現している、実施形態１〜３２のいずれかに記載の二本鎖。
【００４３】
実施形態３４：当該肝外核酸標的が卵巣で発現している、実施形態１〜３３のいずれかに記載の二本鎖。
【００４４】
実施形態３５：当該肝外核酸標的が膵臓で発現している、実施形態１〜３４のいずれかに記載の二本鎖。
【００４５】
実施形態３６：当該肝外核酸標的が下垂体で発現している、実施形態１〜３５のいずれかに記載の二本鎖。
【００４６】
実施形態３７：当該肝外核酸標的が前立腺で発現している、実施形態１〜３６のいずれかに記載の二本鎖。
【００４７】
実施形態３８：当該肝外核酸標的が皮膚で発現している、実施形態１〜３７のいずれかに記載の二本鎖。
【００４８】
実施形態３９：当該肝外核酸標的が子宮で発現している、実施形態１〜３８のいずれかに記載の二本鎖。
【００４９】
実施形態４０：当該肝外核酸標的が膀胱で発現している、実施形態１〜３９のいずれかに記載の二本鎖。
【００５０】
実施形態４１：当該肝外核酸標的が脳で発現している、実施形態１〜４０のいずれかに記載の二本鎖。
【００５１】
実施形態４２：当該肝外核酸標的が糸球体で発現している、実施形態１〜４１のいずれかに記載の二本鎖。
【００５２】
実施形態４３：当該肝外核酸標的が遠位尿細管上皮で発現している、実施形態１〜４２のいずれかに記載の二本鎖。
【００５３】
実施形態４４：当該肝外核酸標的が乳房で発現している、実施形態１〜４３のいずれかに記載の二本鎖。
【００５４】
実施形態４５：当該肝外核酸標的が肺で発現している、実施形態１〜４４のいずれかに記載の二本鎖。
【００５５】
実施形態４６：当該肝外核酸標的が心臓で発現している、実施形態１〜４５のいずれかに記載の二本鎖。
【００５６】
実施形態４７：当該肝外核酸標的が腎臓で発現している、実施形態１〜４６のいずれかに記載の二本鎖。
【００５７】
実施形態４８：当該肝外核酸標的が結腸で発現している、実施形態１〜４７のいずれかに記載の二本鎖。
【００５８】
実施形態４９：当該肝外核酸標的が神経節で発現している、実施形態１〜４８のいずれかに記載の二本鎖。
【００５９】
実施形態５０：当該肝外核酸標的が前頭皮質で発現している、実施形態１〜４９のいずれかに記載の二本鎖。
【００６０】
実施形態５１：当該肝外核酸標的が脊髄で発現している、実施形態１〜５０のいずれかに記載の二本鎖。
【００６１】
実施形態５２：当該肝外核酸標的が三叉神経節で発現している、実施形態１〜５１のいずれかに記載の二本鎖。
【００６２】
実施形態５３：当該肝外核酸標的が座骨神経で発現している、実施形態１〜５２のいずれかに記載の二本鎖。
【００６３】
実施形態５４：当該肝外核酸標的が後根神経節で発現している、実施形態１〜５３のいずれかに記載の二本鎖。
【００６４】
実施形態５５：当該肝外核酸標的が内因性ＲＮＡ転写産物である、実施形態１〜５４のいずれかに記載の二本鎖。
【００６５】
実施形態５６：当該ＲＮＡ転写産物がｐｒｅ−ｍＲＮＡである、実施形態５５に記載の二本鎖。
【００６６】
実施形態５７：当該ＲＮＡ転写産物がｍＲＮＡである、実施形態５５に記載の二本鎖。
【００６７】
実施形態５８：当該ＲＮＡ転写産物が毒性ＲＮＡである、実施形態５５に記載の二本鎖。
【００６８】
実施形態５９：当該ＲＮＡ転写産物が非コードＲＮＡである、実施形態５５に記載の二本鎖。
【００６９】
実施形態６０：当該ＲＮＡ転写産物がｍｉｃｒｏＲＮＡである、実施形態５５に記載の二本鎖。
【００７０】
実施形態６１：当該肝外核酸標的がウイルス核酸である、実施形態１〜５４のいずれかに記載の二本鎖。
【００７１】
実施形態６２：当該肝外核酸標的が、ＡＴＧＬ、ＣＤ４０、ＴＮＦ−α、ＣＤ３６、ＤＭＰＫ、ＤＮＭ２、ＤＭＤ、ＤＵＸ４、ＬＭＮＡ、ＺＦＮ９、ＳＧＬＴ２及びＧＣＣＲから選択される、実施形態１〜５８のいずれかに記載の二本鎖。
【００７２】
実施形態６３：当該肝外核酸標的が、アンドロゲン受容体（ＡＲ）、ＡＮＧＰＴＬ３、ＤＧＡＴ２、ｅＩＦ４Ｅ、第ＸＩ因子、ＦＧＦＲ４、ＧＣＣＲ、ＧＣＧＲ、ＧＨＲ、ＰＴＰ１Ｂ、ＳＭＲＴ、ＳＴＡＴ３、Ｔｈｅｍ１、ＴＲＰＶ４、ＦＴＯ、ＭＣ４Ｒ、ＴＭＥＭ１８、ＫＣＴＤ１５、ＧＮＰＤＡ２、ＳＨ２Ｂ１、ＭＴＣＨ２、ＮＥＧＲ１、ＢＤＮＦ、ＥＴＶ５、レプチン、レプチン受容体、ＦＡＩＭ２、ＫＣＮＭＡ１、ＭＡＦ、ＮＲＸＮ３、ＴＦＡＰ２Ｂ、ＭＳＲＡ、ＡＧＰＡＴ２、ＢＳＣＬ２、ＡＫＴ２、ＰＰＡＲγ、ＬＭＮＡ、ＺＭＰＳＴＥ２４、ＤＧＡＴ１、ＴＮＦα、ＩＬ−６、レジスチン、ＰＡＩ−１、ＴＢＣ１Ｄ１、ＭＥＴＡＰ２、ＶＥＧＦ、ＡＩＦ−１、ＪＮＫ１、ＣＢ１、ＲＩＰ１４０、ＴＩＦ２、ＡＮＧＰＴ１、ＡＮＧＰＴ２、ＥＩＦ４ＥＢＰ２、ＣＤＫ５、ＳＬＣ１３Ａ５、ペリリピン１、ペリリピン２、ペリリピン３、ペリリピン４、ＨＧＦ、ＧＤＦ３、ＴＮＫｓ、ＫＡＴＮＡ１、ＣｈＲＥＢＰ、ＡＴＦ４、ＢＡＳＰ−１、ＮＮＭＴから選択される、実施形態１〜５８のいずれかに記載の二本鎖。
【００７３】
実施形態６４：当該肝外核酸標的が、アンドロゲン受容体（ＡＲ）、ＡＮＧＰＴＬ３、ＤＧＡＴ２、ｅＩＦ４Ｅ、第ＸＩ因子、ＦＧＦＲ４、ＧＣＣＲ、ＧＣＧＲ、ＧＨＲ、ＰＴＰ１Ｂ、ＳＭＲＴ、ＳＴＡＴ３、Ｔｈｅｍ１、ＴＲＰＶ４、ＦＴＯ、ＭＣ４Ｒ、ＴＭＥＭ１８、ＫＣＴＤ１５、ＧＮＰＤＡ２、ＳＨ２Ｂ１、ＭＴＣＨ２、ＮＥＧＲ１、ＢＤＮＦ、ＥＴＶ５、レプチン、レプチン受容体、ＦＡＩＭ２、ＫＣＮＭＡ１、ＭＡＦ、ＮＲＸＮ３、ＴＦＡＰ２Ｂ、ＭＳＲＡ、ＡＧＰＡＴ２、ＢＳＣＬ２、ＡＫＴ２、ＰＰＡＲγ、ＬＭＮＡ、ＺＭＰＳＴＥ２４、ＤＧＡＴ１、ＴＮＦα、ＩＬ−６、レジスチン、ＰＡＩ−１、ＴＢＣ１Ｄ１、ＭＥＴＡＰ２、ＶＥＧＦ、ＡＩＦ−１、ＪＮＫ１、ＣＢ１、ＲＩＰ１４０、ＴＩＦ２、ＡＮＧＰＴ１、ＡＮＧＰＴ２、ＥＩＦ４ＥＢＰ２、ＣＤＫ５、ＳＬＣ１３Ａ５、ペリリピン１、ペリリピン２、ペリリピン３、ペリリピン４、ＨＧＦ、ＧＤＦ３、ＴＮＫｓ、ＫＡＴＮＡ１、ＣｈＲＥＢＰ、ＡＴＦ４、ＢＡＳＰ−１、ＮＮＭＴのいずれか以外である、実施形態１〜６１のいずれかに記載の二本鎖。
【００７４】
実施形態６５：当該第１の修飾オリゴヌクレオチドが、肝外核酸標的の核酸塩基配列に対して、修飾オリゴヌクレオチドの全核酸塩基配列にわたって比較したとき、少なくとも８０％相補的である核酸塩基配列を有する、実施形態１〜６４のいずれかに記載の二本鎖。
【００７５】
実施形態６６：当該第１の修飾オリゴヌクレオチドが、肝外核酸標的の核酸塩基配列に対して、修飾オリゴヌクレオチドの全核酸塩基配列にわたって比較したとき、少なくとも９０％相補的である核酸塩基配列を有する、実施形態６５に記載の二本鎖。
【００７６】
実施形態６７：当該第１の修飾オリゴヌクレオチドが、肝外核酸標的の核酸塩基配列に対して、修飾オリゴヌクレオチドの全核酸塩基配列にわたって比較したとき、１００％相補的である核酸塩基配列を有する、実施形態６５に記載の二本鎖。
【００７７】
実施形態６８：当該第１の修飾オリゴヌクレオチドが、配列番号１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２または２３の核酸塩基配列のいずれかのうちの少なくとも８個の連続した核酸塩基を有する、実施形態１〜５５のいずれかに記載の二本鎖。
【００７８】
実施形態６９：当該第１の修飾オリゴヌクレオチドが、配列番号１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２または２３の核酸塩基配列のいずれかのうちの少なくとも９個の連続した核酸塩基を有する、実施形態１〜５５のいずれかに記載の二本鎖。
【００７９】
実施形態７０：当該第１の修飾オリゴヌクレオチドが、配列番号１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２または２３の核酸塩基配列のいずれかのうちの少なくとも１０個の連続した核酸塩基を有する、実施形態１〜５５のいずれかに記載の二本鎖。
【００８０】
実施形態７１：当該第１の修飾オリゴヌクレオチドが、配列番号１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２または２３のうちのいずれかの核酸塩基配列からなる、実施形態１〜５５のいずれかに記載の二本鎖。
【００８１】
実施形態７２：当該第１の修飾オリゴヌクレオチドが、配列番号１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２または２３の核酸塩基配列のいずれかのうちの少なくとも１２個の連続した核酸塩基を有する、実施形態１〜５５のいずれかに記載の二本鎖。
【００８２】
実施形態７３：当該第１の修飾オリゴヌクレオチドが、いかなる２’−デオキシヌクレオシドも有していない、実施形態１〜７２のいずれかに記載の二本鎖。
【００８３】
実施形態７４：当該第１の修飾オリゴヌクレオチドが、修飾ヌクレオシドを少なくとも１つ含む、実施形態１〜７２のいずれかに記載の二本鎖。
【００８４】
実施形態７５：当該第１の修飾オリゴヌクレオチドが、修飾糖部分を含む修飾ヌクレオシドを少なくとも１つ含む、実施形態７４に記載の二本鎖。
【００８５】
実施形態７６：当該第１の修飾オリゴヌクレオチドが、二環式糖部分を含む修飾ヌクレオシドを少なくとも１つ含む、実施形態７５に記載の二本鎖。
【００８６】
実施形態７７：当該第１の修飾オリゴヌクレオチドが、２’−４’架橋を有する二環式糖部分を含む修飾ヌクレオシドを少なくとも１つ含み、当該２’−４’架橋は、−Ｏ−ＣＨ２−及び−Ｏ−ＣＨ（ＣＨ３）−から選択される、実施形態７６に記載の二本鎖。
【００８７】
実施形態７８：当該第１の修飾オリゴヌクレオチドが、修飾非二環式糖部分を含む修飾ヌクレオシドを少なくとも１つ含む、実施形態７３〜７７のいずれかに記載の二本鎖。
【００８８】
実施形態７９：当該第１の修飾オリゴヌクレオチドが、２’−ＭＯＥまたは２’−Ｏ−メチル修飾糖部分を含む非二環式糖部分を含む修飾ヌクレオシドを少なくとも１つ含む、実施形態７８に記載の二本鎖。
【００８９】
実施形態８０：当該第１の修飾オリゴヌクレオチドが、糖代替物を含む修飾ヌクレオシドを少なくとも１つ含む、実施形態７３〜７９のいずれかに記載の二本鎖。
【００９０】
実施形態８１：当該第１の修飾オリゴヌクレオチドが、モルホリノ、ＰＮＡ、Ｆ−ＨＮＡ、ＴＨＰまたは修飾ＴＨＰから選択される糖代替物を含む修飾ヌクレオシドを少なくとも１つ含む、実施形態８０に記載の二本鎖。
【００９１】
実施形態８２：当該第１の修飾オリゴヌクレオチドが、
１〜５個の結合された５’−ヌクレオシドからなる５’領域と、
６〜１０個の結合された中央領域ヌクレオシドからなる中央領域と、
１〜５個の結合された３’領域ヌクレオシドからなる３’領域とを有する糖モチーフを含み、
５’領域、３’領域及び中央領域のヌクレオシドは、連続しており、中央領域ヌクレオシドのそれぞれは、非修飾ＤＮＡ糖部分を含む、実施形態１〜７２または７４〜８１のいずれかに記載の二本鎖。
【００９２】
実施形態８３：当該５’領域ヌクレオシドのそれぞれ及び当該３’領域ヌクレオシドのそれぞれが修飾糖部分を含む、実施形態８２に記載の二本鎖。
【００９３】
実施形態８４：当該第１の修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも１つの修飾ヌクレオシド間結合を含む、実施形態１〜８３のいずれかに記載の二本鎖。
【００９４】
実施形態８５：当該第１の修飾オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシド間結合が修飾ヌクレオシド間結合である、実施形態８４に記載の二本鎖。
【００９５】
実施形態８６：少なくとも１つのヌクレオシド間結合がホスホロチオエートヌクレオシド間結合である、実施形態８４または８５に記載の二本鎖。
【００９６】
実施形態８７：当該第１の修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも１つの非修飾ホスホジエステルヌクレオシド間結合を含む、実施形態８４または８６に記載の二本鎖。
【００９７】
実施形態８８：各ヌクレオシド間結合が、非修飾ホスホジエステルヌクレオシド間結合またはホスホロチオエートヌクレオシド間結合のいずれかである、実施形態８７に記載の二本鎖。
【００９８】
実施形態８９：各ヌクレオシド間結合がホスホロチオエートヌクレオシド間結合である、実施形態８５に記載の二本鎖。
【００９９】
実施形態９０：当該第１の修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも１つの修飾核酸塩基を含む、実施形態１〜８９のいずれかに記載の二本鎖。
【０１００】
実施形態９１：当該第１の修飾核酸塩基が５−メチルシトシンである、実施形態９０に記載の二本鎖。
【０１０１】
実施形態９２：当該第１の修飾オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシドの各核酸塩基が、非修飾核酸塩基であるか、５−メチルシトシンであるかのいずれかである、実施形態１〜９１のいずれかに記載の二本鎖。
【０１０２】
実施形態９３：当該第１の修飾オリゴヌクレオチドが、１２〜２２個の結合されたヌクレオシドからなる、実施形態１〜９２のいずれかに記載の二本鎖。
【０１０３】
実施形態９４：当該第１の修飾オリゴヌクレオチドが、１２〜２０個の結合されたヌクレオシドからなる、実施形態１〜９２のいずれかに記載の二本鎖。
【０１０４】
実施形態９５：当該第１の修飾オリゴヌクレオチドが、１４〜２０個の結合されたヌクレオシドからなる、実施形態１〜９２のいずれかに記載の二本鎖。
【０１０５】
実施形態９６：当該第１の修飾オリゴヌクレオチドが、１６〜２０個の結合されたヌクレオシドからなる、実施形態１〜９２のいずれかに記載の二本鎖。
【０１０６】
実施形態９７：当該第１の修飾オリゴヌクレオチドが、１８〜２０個の結合されたヌクレオシドからなる、実施形態１〜９２のいずれかに記載の二本鎖。
【０１０７】
実施形態９８：当該第１の修飾オリゴヌクレオチドが、２０個の結合されたヌクレオシドからなる、実施形態１〜９２のいずれかに記載の二本鎖。
【０１０８】
実施形態９９：当該第１の修飾オリゴヌクレオチドが、１９個の結合されたヌクレオシドからなる、実施形態１〜９２のいずれかに記載の二本鎖。
【０１０９】
実施形態１００：当該第１の修飾オリゴヌクレオチドが、１８個の結合されたヌクレオシドからなる、実施形態１〜９２のいずれかに記載の二本鎖。
【０１１０】
実施形態１０１：当該第１の修飾オリゴヌクレオチドが、１７個の結合されたヌクレオシドからなる、実施形態１〜９２のいずれかに記載の二本鎖。
【０１１１】
実施形態１０２：当該第１の修飾オリゴヌクレオチドが、１６個の結合されたヌクレオシドからなる、実施形態１〜９２のいずれかに記載の二本鎖。
【０１１２】
実施形態１０３：当該第２の修飾オリゴヌクレオチドが、いかなる２’デオキシヌクレオシドも有していない、実施形態１〜１０２のいずれかに記載の二本鎖。
【０１１３】
実施形態１０４：当該第２の修飾オリゴヌクレオチドが、修飾ヌクレオシドを少なくとも１つ含む、実施形態１〜１０３のいずれかに記載の二本鎖。
【０１１４】
実施形態１０５：当該第２の修飾オリゴヌクレオチドが、修飾糖部分を含む修飾ヌクレオシドを少なくとも１つ含む、実施形態１０４に記載の二本鎖。
【０１１５】
実施形態１０６：当該第２の修飾オリゴヌクレオチドが、二環式糖部分を含む修飾ヌクレオシドを少なくとも１つ含む、実施形態１０５に記載の二本鎖。
【０１１６】
実施形態１０７：当該第２の修飾オリゴヌクレオチドが、２’−４’架橋を有する二環式糖部分を含む修飾ヌクレオシドを少なくとも１つ含み、２’−４’架橋は、−Ｏ−ＣＨ２−及び−Ｏ−ＣＨ（ＣＨ３）−から選択される、実施形態１０６に記載の二本鎖。
【０１１７】
実施形態１０８：当該第２の修飾オリゴヌクレオチドが、修飾非二環式糖部分を含む修飾ヌクレオシドを少なくとも１つ含む、実施形態１０３〜１０７のいずれかに記載の二本鎖。
【０１１８】
実施形態１０９：当該第１の修飾オリゴヌクレオチドが、２’−ＭＯＥまたは２’−Ｏ−メチル修飾を含む非二環式糖部分を含む修飾ヌクレオシドを少なくとも１つ含む、実施形態１０８に記載の二本鎖。
【０１１９】
実施形態１１０：当該第２の修飾オリゴヌクレオチドが、２’−ＯＭｅを含むヌクレオシドを全く含まない、実施形態１０３〜１０９のいずれかに記載の二本鎖。
【０１２０】
実施形態１１１：当該第２の修飾オリゴヌクレオチドが、糖代替物を含む修飾ヌクレオシドを少なくとも１つ含む、実施形態１０３〜１１０のいずれかに記載の二本鎖。
【０１２１】
実施形態１１２：当該第２の修飾オリゴヌクレオチドが、モルホリノ、ＰＮＡ、Ｆ−ＨＮＡ、ＴＨＰまたは修飾ＴＨＰから選択される糖代替物を含む修飾ヌクレオシドを少なくとも１つ含む、実施形態１１１に記載の二本鎖。
【０１２２】
実施形態１１３：当該第２の修飾オリゴヌクレオチドが、
１〜５個の結合された５’−ヌクレオシドからなる５’領域と、
６〜１０個の結合された中央領域ヌクレオシドからなる中央領域と、
１〜５個の結合された３’領域ヌクレオシドからなる３’領域とを有する糖モチーフを含み、
５’領域、３’領域及び中央領域のヌクレオシドは、連続しており、中央領域ヌクレオシドのそれぞれは、非修飾２’−デオキシ糖部分を含む、実施形態１０４〜１１２のいずれかに記載の二本鎖。
【０１２３】
実施形態１１４：当該５’領域ヌクレオシドのそれぞれ及び当該３’領域ヌクレオシドのそれぞれが修飾糖部分を含む、実施形態１１３に記載の二本鎖。
【０１２４】
実施形態１１５：当該第２の修飾オリゴヌクレオチドの５’領域ヌクレオシド及び３’領域ヌクレオシドが、Ｆ−ＲＮＡ修飾ヌクレオシド、２’−ＭＯＥ修飾ヌクレオシド、ＬＮＡヌクレオシド及びｃＥｔヌクレオシドから選択される、実施形態１１４に記載の二本鎖。
【０１２５】
実施形態１１６：当該第２の修飾オリゴヌクレオチドが、２’−デオキシヌクレオシド及び２’−ＭＯＥ修飾ヌクレオシドを交互に含む糖モチーフを有する、実施形態１０４〜１１２のいずれかに記載の二本鎖。
【０１２６】
実施形態１１７：当該第２の修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも１つの修飾ヌクレオシド間結合を含む、実施形態１０３〜１１６のいずれかに記載の二本鎖。
【０１２７】
実施形態１１８：当該第２の修飾オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシド間結合が修飾ヌクレオシド間結合である、実施形態１１７に記載の二本鎖。
【０１２８】
実施形態１１９：当該第２のオリゴヌクレオチドの少なくとも１つのヌクレオシド間結合がホスホロチオエートヌクレオシド間結合である、実施形態１１７または１１８に記載の二本鎖。
【０１２９】
実施形態１２０：当該第２の修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも１つの非修飾ホスホジエステルヌクレオシド間結合を含む、実施形態１１７または１１９に記載の二本鎖。
【０１３０】
実施形態１２１：当該第２のオリゴヌクレオチドの各ヌクレオシド間結合が、非修飾ホスホジエステルヌクレオシド間結合またはホスホロチオエートヌクレオシド間結合のいずれかである、実施形態１２０に記載の二本鎖。
【０１３１】
実施形態１２２：当該第２のオリゴヌクレオチドの各ヌクレオシド間結合がホスホロチオエートヌクレオシド間結合である、実施形態１１８に記載の二本鎖。
【０１３２】
実施形態１２３：当該第２のオリゴヌクレオチドが、非修飾ホスホジエステルヌクレオシド間結合を含む中央領域を有する、実施形態１１７または１１９〜１２１のいずれかに記載の二本鎖。
【０１３３】
実施形態１２４：当該第２のオリゴヌクレオチドが、一端または両端に、１または２個の末端ホスホロチオエート結合を有する、実施形態１２３に記載の二本鎖。
【０１３４】
実施形態１２５：当該第２の修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも１つの修飾核酸塩基を含む、実施形態１０３〜１２４のいずれかに記載の二本鎖。
【０１３５】
実施形態１２６：当該第２の修飾核酸塩基が５−メチルシトシンである、実施形態１２５に記載の二本鎖。
【０１３６】
実施形態１２７：当該第２の修飾オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシドの各核酸塩基が、非修飾核酸塩基であるか、５−メチルシトシンであるかのいずれかである、実施形態１０３〜１２６のいずれかに記載の二本鎖。
【０１３７】
実施形態１２８：当該第２の修飾オリゴヌクレオチドが、１２〜２２個の結合されたヌクレオシドからなる、実施形態１０３〜１２７のいずれかに記載の二本鎖。
【０１３８】
実施形態１２９：当該第２の修飾オリゴヌクレオチドが、１２〜２０個の結合されたヌクレオシドからなる、実施形態１０３〜１２７のいずれかに記載の二本鎖。
【０１３９】
実施形態１３０：当該第２の修飾オリゴヌクレオチドが、１４〜２０個の結合されたヌクレオシドからなる、実施形態１０３〜１２７のいずれかに記載の二本鎖。
【０１４０】
実施形態１３１：当該第２の修飾オリゴヌクレオチドが、１６〜２０個の結合されたヌクレオシドからなる、実施形態１０３〜１２７のいずれかに記載の二本鎖。
【０１４１】
実施形態１３２：当該第２の修飾オリゴヌクレオチドが、１８〜２０個の結合されたヌクレオシドからなる、実施形態１０３〜１２７のいずれかに記載の二本鎖。
【０１４２】
実施形態１３３：当該第２の修飾オリゴヌクレオチドが、２０個の結合されたヌクレオシドからなる、実施形態１０３〜１２７のいずれかに記載の二本鎖。
【０１４３】
実施形態１３４：当該第２の修飾オリゴヌクレオチドが、１９個の結合されたヌクレオシドからなる、実施形態１０３〜１２７のいずれかに記載の二本鎖。
【０１４４】
実施形態１３５：当該第２の修飾オリゴヌクレオチドが、１８個の結合されたヌクレオシドからなる、実施形態１０３〜１２７のいずれかに記載の二本鎖。
【０１４５】
実施形態１３６：当該第２の修飾オリゴヌクレオチドが、１７個の結合されたヌクレオシドからなる、実施形態１０３〜１２７のいずれかに記載の二本鎖。
【０１４６】
実施形態１３７：当該第２の修飾オリゴヌクレオチドが、１６個の結合されたヌクレオシドからなる、実施形態１０３〜１２７のいずれかに記載の二本鎖。
【０１４７】
実施形態１３８：当該コンジュゲートリンカーが１〜５個のリンカーヌクレオシドを含む、実施形態１〜１３７のいずれかに記載の二本鎖。
【０１４８】
実施形態１３９：当該コンジュゲートリンカーが３個のリンカーヌクレオシドを含む、実施形態１３８に記載の二本鎖。
【０１４９】
実施形態１４０：当該３個のリンカーヌクレオシドがＴＣＡモチーフを有する、実施形態１３９に記載の二本鎖。
【０１５０】
実施形態１４１：１〜５個のリンカーヌクレオシドがＴＣＡモチーフを含まない、実施形態１３８に記載の二本鎖。
【０１５１】
実施形態１４２：当該コンジュゲート基がリンカーヌクレオシドを含まない、実施形態１〜１３７のいずれかに記載の二本鎖。
【０１５２】
実施形態１４３：当該コンジュゲートリンカーがヘキシルアミノ基を含む、実施形態１〜１４２のいずれかに記載の二本鎖。
【０１５３】
実施形態１４４：当該コンジュゲートリンカーがポリエチレングリコール基を含む、実施形態１〜１４３のいずれかに記載の二本鎖。
【０１５４】
実施形態１４５：当該コンジュゲートリンカーがトリエチレングリコール基を含む、実施形態１〜１４４のいずれかに記載の二本鎖。
【０１５５】
実施形態１４６：当該コンジュゲートリンカーがリン酸基を含む、実施形態１〜１４５のいずれかに記載の二本鎖。
【０１５６】
実施形態１４７：当該コンジュゲートリンカーが、
【化１】
2018528783.tif 000002
を含み、
Ｘは、コンジュゲート部分に直接的または間接的に結合し、
Ｙは、第２の修飾オリゴヌクレオチドに直接的または間接的に結合している、実施形態１〜１４６のいずれかに記載の二本鎖。
【０１５７】
実施形態１４８：ＸがＯを含む、実施形態１４７に記載の二本鎖。
【０１５８】
実施形態１４９：Ｙがリン酸基を含む、実施形態１４７または１４８に記載の二本鎖。
【０１５９】
実施形態１５０：当該コンジュゲートリンカーが、
【化２】
2018528783.tif 000003
を含み、
Ｘは、コンジュゲート部分に直接的または間接的に結合し、
Ｔ１は、結合基、ヌクレオシドまたは修飾オリゴヌクレオチドを含む、実施形態１〜１４６のいずれかに記載の二本鎖。
【０１６０】
実施形態１５１：当該コンジュゲートリンカーが、
【化３】
2018528783.tif 000004
を含み、
Ｘは、コンジュゲート部分に直接的または間接的に結合し、
Ｔ１は、ヌクレオチドまたは修飾オリゴヌクレオチドを含み、Ｂｘは、修飾または非修飾核酸塩基である、実施形態１〜１４６のいずれかに記載の二本鎖。
【０１６１】
実施形態１５２：当該コンジュゲート部分が親油基を含む、実施形態１〜１５１のいずれかに記載の二本鎖。
【０１６２】
実施形態１５３：当該親油基が、コレステロール、Ｃ１０〜Ｃ２６飽和脂肪酸、Ｃ１０〜Ｃ２６不飽和脂肪酸、Ｃ１０〜Ｃ２６アルキル、トリグリセリド、トコフェロールまたはコール酸から選択される、実施形態１５２に記載の二本鎖。
【０１６３】
実施形態１５４：当該コンジュゲート部分が、飽和脂肪酸または不飽和脂肪酸である、実施形態１５３に記載の二本鎖。
【０１６４】
実施形態１５５：当該コンジュゲート部分がＣ１６脂質である、実施形態１５３に記載の二本鎖。
【０１６５】
実施形態１５６：当該コンジュゲート部分がＣ１８脂質である、実施形態１５３に記載の二本鎖。
【０１６６】
実施形態１５７：当該コンジュゲート部分がＣ１６アルキルである、実施形態１５３に記載の二本鎖。
【０１６７】
実施形態１５８：当該コンジュゲート部分がＣ１８アルキルである、実施形態１５３に記載の二本鎖。
【０１６８】
実施形態１５９：当該コンジュゲート部分がコレステロールである、実施形態１５３に記載の二本鎖。
【０１６９】
実施形態１６０：当該コンジュゲート部分がトコフェロールである、実施形態１５３に記載の二本鎖。
【０１７０】
実施形態１６１：当該コンジュゲート基が、第２の修飾オリゴヌクレオチドの５’末端で第２の修飾オリゴヌクレオチドに結合している、実施形態１〜１６０のいずれかに記載の二本鎖。
【０１７１】
実施形態１６２：当該コンジュゲート基が、第２の修飾オリゴヌクレオチドの３’末端で第２の修飾オリゴヌクレオチドに結合している、実施形態１〜１６０のいずれかに記載の二本鎖。
【０１７２】
実施形態１６３：末端基を含む、実施形態１〜１６２のいずれかに記載の二本鎖。
【０１７３】
実施形態１６４：実施形態１〜１６３のいずれかに記載の二本鎖からなる、アンチセンス化合物。
【０１７４】
実施形態１６５：実施形態１〜１６３のいずれかに記載の二本鎖を含む、アンチセンス化合物。
【０１７５】
実施形態１６６：ＲＮａｓｅ  Ｈアンチセンス化合物である、実施形態１６４または１６５に記載のアンチセンス化合物。
【０１７６】
実施形態１６７：ＲＮＡｉアンチセンス化合物である、実施形態１６４または１６５に記載のアンチセンス化合物。
【０１７７】
実施形態１６８：当該肝外核酸標的の量または活性を、標準セルアッセイで１．０ｎＭの濃度で試験したとき、少なくとも２０％減少させることができる、実施形態１６４〜１６７のいずれかに記載のアンチセンス化合物。
【０１７８】
実施形態１６９：当該肝外核酸標的の量または活性を、標準セルアッセイで少なくとも４０％減少させることができる、実施形態１６８に記載のアンチセンス化合物。
【０１７９】
実施形態１７０：当該肝外核酸標的の量または活性を、標準セルアッセイで少なくとも８０％減少させることができる、実施形態１６８に記載のアンチセンス化合物。
【０１８０】
実施形態１７１：当該肝外核酸標的の肝外組織における量または活性を、標準動物実験で１００ｍｇ／ｋｇの用量で与えたとき、少なくとも２０％減少させることができる、実施形態１６４〜１７０のいずれかに記載のアンチセンス化合物。
【０１８１】
実施形態１７２：当該肝外核酸標的の肝外組織における量または活性を少なくとも４０％減少させることができる、実施形態１７１に記載のアンチセンス化合物。
【０１８２】
実施形態１７３：当該肝外核酸標的の肝外組織における量または活性を少なくとも８０％減少させることができる、実施形態１７１に記載のアンチセンス化合物。
【０１８３】
実施形態１７４：当該肝外核酸標的のＲＮＡプロセシングを変更する、実施形態１６４または１６５に記載のアンチセンス化合物。
【０１８４】
実施形態１７５：実施形態１〜１６３のいずれかに記載の二本鎖に細胞を接触させることを含む、方法。
【０１８５】
実施形態１７６：実施形態１６４〜１７４のいずれかに記載のアンチセンス化合物に細胞を接触させることを含む、方法。
【０１８６】
実施形態１７７：細胞中の肝外核酸標的の量または活性を調節する方法であって、細胞を実施形態１〜１７４のいずれかに記載の二本鎖またはアンチセンス化合物に接触させることを含み、それにより、細胞中の肝外核酸標的の量または活性を調節する、方法。
【０１８７】
実施形態１７８：当該肝外核酸標的の量または活性が減少する、実施形態１７７に記載の方法。
【０１８８】
実施形態１７９：当該細胞がｉｎ  ｖｉｔｒｏである、実施形態１７５〜１７８のいずれかに記載の方法。
【０１８９】
実施形態１８０：当該細胞が動物内にある、実施形態１７５〜１７８のいずれかに記載の方法。
【０１９０】
実施形態１８１：当該動物がヒトである、実施形態１８０に記載の方法。
【０１９１】
実施形態１８２：細胞中の肝臓核酸標的の量または活性を調節する方法であって、細胞を実施形態１〜１７４のいずれかに記載の二本鎖またはアンチセンス化合物に接触させることを含み、それにより、細胞中の肝臓核酸標的の量または活性を調節する、方法。
【０１９２】
実施形態１８３：当該肝外核酸標的の量または活性が減少する、実施形態１８２に記載の方法。
【０１９３】
実施形態１８４：当該細胞がｉｎ  ｖｉｔｒｏである、実施形態１８２または１８３に記載の方法。
【０１９４】
実施形態１８５：当該細胞が動物内にある、実施形態１８２または１８３に記載の方法。
【０１９５】
実施形態１８６：当該動物がヒトである、実施形態１８５に記載の方法。
【０１９６】
実施形態１８７：実施形態１〜１６３のいずれかに記載の二本鎖と、薬学的に許容される担体または希釈剤とを含む、医薬組成物。
【０１９７】
実施形態１８８：実施形態１６４〜１７４のいずれかに記載のアンチセンス化合物と、薬学的に許容される担体または希釈剤とを含む、医薬組成物。
【０１９８】
実施形態１８９：実施形態１８７または１８８に記載の医薬組成物を動物に投与することを含む、方法。
【０１９９】
実施形態１９０：肝外核酸標的に関連する疾患を治療する方法であって、肝外核酸標的に関連する疾患を発症している個体またはそのリスクのある個体に、治療上有効な量の実施形態１８７または１８８に記載の医薬組成物を投与することを含み、これにより、肝外核酸標的に関連する疾患を治療する、方法。
【０２００】
実施形態１９１：当該肝外核酸標的が、ＡＴＧＬ、ＣＤ４０、ＣＤ３６、ＤＭＰＫ、ＤＮＭ２、ＤＭＤ、ＤＵＸ４、ＬＭＮＡ、ＺＦＮ９、ＳＧＬＴ２またはＧＣＣＲから選択される、実施形態１９０に記載の方法。
【０２０１】
実施形態１９２：当該肝外核酸標的の転写産物が、アンドロゲン受容体（ＡＲ）、ＡＮＧＰＴＬ３、ＤＧＡＴ２、ｅＩＦ４Ｅ、第ＸＩ因子、ＦＧＦＲ４、ＧＣＣＲ、ＧＣＧＲ、ＧＨＲ、ＰＴＰ１Ｂ、ＳＭＲＴ、ＳＴＡＴ３、Ｔｈｅｍ１、ＴＲＰＶ４、ＦＴＯ、ＭＣ４Ｒ、ＴＭＥＭ１８、ＫＣＴＤ１５、ＧＮＰＤＡ２、ＳＨ２Ｂ１、ＭＴＣＨ２、ＮＥＧＲ１、ＢＤＮＦ、ＥＴＶ５、レプチン、レプチン受容体、ＦＡＩＭ２、ＫＣＮＭＡ１、ＭＡＦ、ＮＲＸＮ３、ＴＦＡＰ２Ｂ、ＭＳＲＡ、ＡＧＰＡＴ２、ＢＳＣＬ２、ＡＫＴ２、ＰＰＡＲγ、ＬＭＮＡ、ＺＭＰＳＴＥ２４、ＤＧＡＴ１、ＴＮＦα、ＩＬ−６、レジスチン、ＰＡＩ−１、ＴＢＣ１Ｄ１、ＭＥＴＡＰ２、ＶＥＧＦ、ＡＩＦ−１、ＪＮＫ１、ＣＢ１、ＲＩＰ１４０、ＴＩＦ２、ＡＮＧＰＴ１、ＡＮＧＰＴ２、ＥＩＦ４ＥＢＰ２、ＣＤＫ５、ＳＬＣ１３Ａ５、ペリリピン１、ペリリピン２、ペリリピン３、ペリリピン４、ＨＧＦ、ＧＤＦ３、ＴＮＫｓ、ＫＡＴＮＡ１、ＣｈＲＥＢＰ、ＡＴＦ４、ＢＡＳＰ−１、ＮＮＭＴから選択される、実施形態１９０に記載の方法。
【０２０２】
実施形態１９３：当該肝外核酸標的の転写産物が、アンドロゲン受容体（ＡＲ）、ＡＮＧＰＴＬ３、ＤＧＡＴ２、ｅＩＦ４Ｅ、第ＸＩ因子、ＦＧＦＲ４、ＧＣＣＲ、ＧＣＧＲ、ＧＨＲ、ＰＴＰ１Ｂ、ＳＭＲＴ、ＳＴＡＴ３、Ｔｈｅｍ１、ＴＲＰＶ４、ＦＴＯ、ＭＣ４Ｒ、ＴＭＥＭ１８、ＫＣＴＤ１５、ＧＮＰＤＡ２、ＳＨ２Ｂ１、ＭＴＣＨ２、ＮＥＧＲ１、ＢＤＮＦ、ＥＴＶ５、レプチン、レプチン受容体、ＦＡＩＭ２、ＫＣＮＭＡ１、ＭＡＦ、ＮＲＸＮ３、ＴＦＡＰ２Ｂ、ＭＳＲＡ、ＡＧＰＡＴ２、ＢＳＣＬ２、ＡＫＴ２、ＰＰＡＲγ、ＬＭＮＡ、ＺＭＰＳＴＥ２４、ＤＧＡＴ１、ＴＮＦα、ＩＬ−６、レジスチン、ＰＡＩ−１、ＴＢＣ１Ｄ１、ＭＥＴＡＰ２、ＶＥＧＦ、ＡＩＦ−１、ＪＮＫ１、ＣＢ１、ＲＩＰ１４０、ＴＩＦ２、ＡＮＧＰＴ１、ＡＮＧＰＴ２、ＥＩＦ４ＥＢＰ２、ＣＤＫ５、ＳＬＣ１３Ａ５、ペリリピン１、ペリリピン２、ペリリピン３、ペリリピン４、ＨＧＦ、ＧＤＦ３、ＴＮＫｓ、ＫＡＴＮＡ１、ＣｈＲＥＢＰ、ＡＴＦ４、ＢＡＳＰ−１、ＮＮＭＴから選択されない、実施形態１９０に記載の方法。
【０２０３】
実施形態１９４：肝外核酸標的に関連する疾患の少なくとも１つの症状が改善する、実施形態１９０〜１９３のいずれかに記載の方法。
【０２０４】
実施形態１９５：当該疾患が、糖尿病、メタボリックシンドローム、心臓病、筋ジストロフィー、筋強直性ジストロフィー、ベッカー型筋ジストロフィー、先天性筋ジストロフィー、デュシェンヌ型筋ジストロフィー、遠位型筋ジストロフィー、エメリ・ドレフュス型筋ジストロフィー、顔面肩甲上腕型筋ジストロフィー、肢帯型筋ジストロフィーまたは眼咽頭型筋ジストロフィーから選択される、実施形態１９０〜１９４のいずれかに記載の方法。
【０２０５】
実施形態１９６：当該肝外核酸標的の量または活性が、肝臓以外の少なくとも１種の組織種で調節される、実施形態１８９〜１９５のいずれかに記載の方法。
【０２０６】
実施形態１９７：当該肝外核酸標的の量または活性が、少なくとも２種の組織種で調節される、実施形態１９６に記載の方法。
【０２０７】
実施形態１９８：当該少なくとも２種の組織種のうちの少なくとも１種が、肝臓、骨格筋、心筋、平滑筋、脂肪、白色脂肪、脾臓、骨、腸、副腎、精巣、卵巣、膵臓、下垂体、前立腺、皮膚、子宮、膀胱、脳、糸球体、遠位尿細管上皮、乳房、肺、心臓、腎臓、神経節、前頭皮質、脊髄、三叉神経節、座骨神経、後根神経節、副睾丸脂肪、横隔膜及び結腸から選択される、実施形態１９７に記載の方法。
【０２０８】
実施形態１９９：少なくとも２種の組織種が、肝臓、骨格筋、心筋、平滑筋、脂肪、白色脂肪、脾臓、骨、腸、副腎、精巣、卵巣、膵臓、下垂体、前立腺、皮膚、子宮、膀胱、脳、糸球体、遠位尿細管上皮、乳房、肺、心臓、腎臓、神経節、前頭皮質、脊髄、三叉神経節、座骨神経、後根神経節、副睾丸脂肪、横隔膜及び結腸から選択される、実施形態１９８に記載の方法。
【０２０９】
実施形態２００：治療上有効な量の実施形態１８７または１８８に記載の医薬組成物を対象に投与することを含み、これにより、２種以上の組織中の標的核酸の量または活性を調節する、多組織疾患または病態を治療する方法。
【０２１０】
実施形態２０１：治療上有効な量の実施形態１８７または１８８に記載の医薬組成物を対象に投与することを含み、これにより、２種以上の細胞型中の標的核酸の量または活性を調節する、疾患または病態を治療する方法。
【０２１１】
実施形態２０２：治療上有効な量の実施形態１８７または１８８に記載の医薬組成物を対象に投与することを含み、これにより、２種以上の細胞型中の標的核酸の量または活性を調節する、多組織疾患または病態を治療する方法。
【０２１２】
実施形態２０３：当該２種以上の細胞型が、肝細胞、白色脂肪細胞、褐色脂肪細胞、脂肪細胞、マクロファージ、がん細胞、腫瘍細胞、平滑筋細胞、リンパ球及び心筋細胞から選択される、実施形態２０１または２０２に記載の方法。
【０２１３】
実施形態２０４：当該医薬組成物が皮下投与される、実施形態１８９〜２０３のいずれかに記載の方法。
【０２１４】
実施形態２０５：当該医薬組成物が静脈内投与される、実施形態１８９〜２０３のいずれかに記載の方法。
【０２１５】
実施形態２０６：当該医薬組成物が非経口投与される、実施形態１８９〜２０３のいずれかに記載の方法。
【０２１６】
実施形態２０７：当該医薬組成物が腹腔内投与される、実施形態１８９〜２０３のいずれかに記載の方法。
【発明を実施するための形態】
【０２１７】
前述の全般的な説明及び以下の詳細な説明は、いずれも例示的かつ説明的なものにすぎず、限定するものではないことを理解されたい。本明細書中、単数形の使用は、特に明記しない限り、複数を含む。本明細書で使用されるとき、「ｏｒ（または）」の使用は、別の記載がない限り、「ａｎｄ／ｏｒ（及び／または）」を意味する。更に、「ｉｎｃｌｕｄｉｎｇ（含む）」という用語ならびに「ｉｎｃｌｕｄｅｓ（含む）」及び「ｉｎｃｌｕｄｅｄ（含む）」などの他の形の使用は、限定的ではない。また、「要素」または「成分」などの用語は、特に明記しない限り、１単位を含む要素及び成分と、１つを超える下位単位を含む要素及び成分との両方を包含する。
【０２１８】
本明細書で使用される段落見出しは、単に構成上の目的であり、記載される主題の限定を意図するものではない。限定するものではないが、特許、特許出願、記事、書籍及び論文を含む、本出願に引用される全ての文献または文献の一部は、本明細書で考察される文献の一部について、またその全体が参照により明示的に本明細書に援用される。
【０２１９】
定義
特定の定義が提供されない限り、本明細書に記載される分析化学、有機合成化学及び医薬製薬化学に関して使用される用語ならびにこれらの手順及び技術は、当該技術分野においてよく知られており、一般的に使用されるものである。許容される場合、本開示を通して参照される全ての特許、出願、公開出願ならびに他の公開物及び他のデータは、その全体が参照により本明細書に援用される。
【０２２０】
特に指示がない限り、次の用語は、次の意味を有する。
【０２２１】
「２’−デオキシヌクレオシド」とは、天然に生じるデオキシリボ核酸（ＤＮＡ）に認められる、２’−Ｈ（Ｈ）フラノシル糖部分を含むヌクレオシドを意味する。特定の実施形態において、２’−デオキシヌクレオシドは、修飾核酸塩基を含み得、あるいはＲＮＡ核酸塩基（ウラシル）を含み得る。
【０２２２】
「２’−置換ヌクレオシド」または「２−修飾ヌクレオシド」とは、２’−置換されたまたは２’−修飾された糖部分を含むヌクレオシドを意味する。本明細書で使用されるとき、糖部分に関する「２’−置換」または「２−修飾」とは、ＨまたはＯＨ以外の２’−置換基を少なくとも１つ含む糖部分を意味する。
【０２２３】
「アンチセンス活性」とは、アンチセンス化合物のその標的核酸へのハイブリダイゼーションに帰する何らかの検出可能及び／または測定可能な変化を意味する。特定の実施形態において、アンチセンス活性は、標的核酸または当該標的核酸によってコードされているタンパク質の量または発現が、アンチセンス化合物の非存在下での標的核酸レベルまたは標的タンパク質レベルと比較して、減少することである。特定の実施形態において、アンチセンス活性は、ｐｒｅ−ｍＲＮＡ核酸標的のスプライシングにおける変化である。特定の実施形態において、アンチセンス活性は、標的核酸または当該標的核酸によってコードされているタンパク質の量または発現が、アンチセンス化合物の非存在下での標的核酸レベルまたは標的タンパク質レベルと比較して、増加することである。
【０２２４】
「アンチセンス化合物」とは、アンチセンスオリゴヌクレオチドと、任意選択でコンジュゲート基または末端基などの１つ以上の更なる特徴とを含む、化合物を意味する。
【０２２５】
「アンチセンスオリゴヌクレオチド」とは、（１）標的核酸に少なくとも部分的に相補的な核酸塩基配列を有し、かつ（２）細胞または動物内でアンチセンス活性をもたらすことができる、オリゴヌクレオチドを意味する。
【０２２６】
治療に関する「改善する」とは、少なくとも１つの症状が、治療のない状態における同一症状と比較して向上することを意味する。特定の実施形態において、改善は、症状の重症度もしくは頻度を減少させること、または症状の発生を遅延させること、または症状の重症度もしくは頻度の進行を遅らせることである。
【０２２７】
「二環式ヌクレオシド」または「ＢＮＡ」とは、二環式糖部分を含むヌクレオシドを意味する。本明細書で使用されるとき、「二環式糖」または「二環式糖部分」とは、２つの環を含み、第２の環が第１の環の原子中の２つを接続する架橋によって形成されることにより二環構造が形成されている、修飾糖部分を意味する。特定の実施形態において、二環式糖部分の第１の環は、フラノシル部分である。特定の実施形態において、二環式糖部分は、フラノシル部分を含まない。
【０２２８】
「分岐基」とは、少なくとも３つの基との共有結合を形成することができる、少なくとも３つの位置を有する原子団を意味する。特定の実施形態において、分岐基は、コンジュゲートリンカー及び／または切断可能部分を介して、係留リガンドをオリゴヌクレオチドに接続するための複数の反応部位を提供する。
【０２２９】
「細胞標的化部分」とは、１つ以上の特定の細胞型に結合することができる、コンジュゲート基またはコンジュゲート基の一部を意味する。
【０２３０】
「切断可能部分」とは、生理学的条件下、例えば、細胞、動物またはヒトの内部で切断される結合または原子団を意味する。
【０２３１】
オリゴヌクレオチドに関する「相補的」とは、当該オリゴヌクレオチドまたはその１つ以上の領域の核酸塩基のうちの少なくとも７０％と、別の核酸またはその１つ以上の領域の核酸塩基とが、当該オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列と他方の核酸とを逆方向に整列させたとき、互いに水素結合できることを意味する。相補的な核酸塩基とは、互いに水素結合を形成できる核酸塩基を意味する。相補的な核酸塩基対には、特に指定のない限り、アデニン（Ａ）とチミン（Ｔ）、アデニン（Ａ）とウラシル（Ｕ）、シトシン（Ｃ）とグアニン（Ｇ）、５−メチルシトシン（ｍＣ）とグアニン（Ｇ）が含まれるが、これらに限定されない。相補的なオリゴヌクレオチド及び／または核酸は、各ヌクレオシドで核酸塩基相補性を有する必要はない。むしろ、いくつかのミスマッチが許容される。本明細書で使用されるとき、オリゴヌクレオチドに関する「完全に相補的」または「１００％相補的」とは、当該オリゴヌクレオチドが、オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシドで、別のオリゴヌクレオチドまたは核酸に相補的であることを意味する。
【０２３２】
「コンジュゲート基」とは、オリゴヌクレオチドに直接的または間接的に結合している原子団を意味する。コンジュゲート基は、コンジュゲート部分と、コンジュゲート部分をオリゴヌクレオチドに結合させるコンジュゲートリンカーとを含む。
【０２３３】
「コンジュゲートリンカー」とは、コンジュゲート部分をオリゴヌクレオチドに接続させる少なくとも１つの結合を含む原子団を意味する。
【０２３４】
「コンジュゲート部分」とは、コンジュゲートリンカーを介してオリゴヌクレオチドに結合している原子団を意味する。
【０２３５】
オリゴヌクレオチドとの関係における「連続した」は、互いに直接隣接するヌクレオシド、核酸塩基、糖部分またはヌクレオシド間結合を指す。例えば、「連続した核酸塩基」とは、配列中の互いに直接隣接する核酸塩基を意味する。
【０２３６】
「二本鎖」とは、対合した２つのオリゴマー化合物を意味する。特定の実施形態において、２つのオリゴマー化合物は、相補的な核酸塩基のハイブリダイゼーションにより対合している。
【０２３７】
「肝外細胞型」とは、肝細胞ではない細胞型を意味する。
【０２３８】
「肝外核酸標的」とは、肝臓以外の組織中で発現される標的核酸を意味する。特定の実施形態において、肝外核酸標的は、肝臓で発現されないか、肝臓で有意なレベルで発現されていない。特定の実施形態において、肝外核酸標的は、肝臓外でも肝臓内でも発現される。
【０２３９】
「肝外組織」とは、肝臓以外の組織を意味する。
【０２４０】
修飾オリゴヌクレオチドに関する「完全に修飾された」とは、各糖部分が修飾されている、修飾オリゴヌクレオチドを意味する。修飾オリゴヌクレオチドに関する「一様に修飾された」とは、各糖部分が同一である、完全に修飾されたオリゴヌクレオチドを意味する。例えば、一様に修飾されたオリゴヌクレオチドのヌクレオシドは、それぞれが２’−ＭＯＥ修飾を有するが、異なる核酸塩基修飾を有し得、またヌクレオシド間結合が異なっていてもよい。
【０２４１】
「ギャップマー」とは、ＲＮａｓｅ  Ｈ切断を支援する複数のヌクレオシドを有する内側領域を含み、その内側領域が、１つ以上のヌクレオシドを有する外側領域との間に配置されたアンチセンスオリゴヌクレオチドを意味し、ここで、内側領域に含まれるヌクレオシドは、外側領域に含まれる１つ以上のヌクレオシドとは化学的に異なっている。内側領域は、「ギャップ」と呼ぶことができ、外側領域は、「ウイング」と呼ぶことができる。
【０２４２】
「ハイブリダイゼーション」とは、相補的なオリゴヌクレオチド及び／または核酸の対合またはアニーリングを意味する。特定の機序に限定されるものではないが、最も一般的なハイブリダイゼーションの機序には、ワトソン・クリック型、フーグスティーン型または逆フーグスティーン型の水素結合であり得る、相補的な核酸塩基間での水素結合が関与する。
【０２４３】
「発現または活性を阻害する」は、未処置または対照試料における活性の発現と比較した、発現または活性の低減または遮断を指し、必ずしも発現または活性の完全な排除を示すものではない。
【０２４４】
「ヌクレオシド間結合」とは、オリゴヌクレオチドにおいて、隣接するヌクレオシド間の共有結合を形成する基または結合を意味する。本明細書で使用されるとき、「修飾ヌクレオシド間結合（修飾されたヌクレオシド間結合）」とは、天然に生じるリン酸ヌクレオシド間結合以外の任意のヌクレオシド間結合を意味する。非リン酸結合は、本明細書中、修飾ヌクレオシド間結合と称する。「ホスホロチオエート結合」とは、リン酸結合の架橋していない酸素原子のうちの１つが硫黄原子で置き換えられた、修飾リン酸結合を意味する。ホスホロチオエートヌクレオシド間結合は、修飾ヌクレオシド間結合である。
【０２４５】
「リンカーヌクレオシド」とは、オリゴヌクレオチドをコンジュゲート部分に直接的または間接的に結合させるヌクレオシドを意味する。リンカーヌクレオシドは、オリゴマー化合物のコンジュゲートリンカー内に位置する。リンカーヌクレオシドは、オリゴヌクレオチドと連続していても、オリゴマー化合物のオリゴヌクレオチド部分の一部とはみなされない。
【０２４６】
化学基に関する「親油基」または「親油性」とは、水よりも脂質または有機溶媒に溶けやすく、及び／または水よりも脂質に対してより高い親和性を有する、原子団を意味する。特定の実施形態において、親油基は、脂質を含む。本明細書で使用されるとき、「脂質」とは、水に溶けないか、有機溶媒に比べて水に溶けにくい分子を意味する。特定の実施形態において、本発明の化合物は、飽和または不飽和脂肪酸、ステロイド、脂溶性ビタミン、リン脂質、スフィンゴ脂質、炭化水素、モノ、ジ、及びトリグリセリドならびにその合成誘導体から選択される脂質を含む。
【０２４７】
「非二環式修飾糖」または「非二環式修飾糖部分」とは、糖の２つの原子の間に架橋を形成して第２の環を形成しない置換基などの修飾を含む修飾糖部分を意味する。
【０２４８】
「結合されたヌクレオシド」は、連続した配列で接続されたヌクレオシドである（すなわち、結合されたヌクレオシド間に追加のヌクレオシドが存在しない）。
【０２４９】
「ミスマッチ」または「非相補的」とは、第１のオリゴマー化合物と第２のオリゴマー化合物を整列させたとき、第１のオリゴヌクレオチドの核酸塩基が第２のオリゴヌクレオチドまたは標的核酸の対応する核酸塩基と相補的でないことを意味する。
【０２５０】
「ＭＯＥ」とは、メトキシエチルを意味する。「２’−ＭＯＥ」とは、フラノシル環の２’位にある−ＯＣＨ２ＣＨ２ＯＣＨ３基を意味する。
【０２５１】
「モチーフ」とは、オリゴヌクレオチドにおける、修飾されていない及び／または修飾された糖部分、核酸塩基及び／またはヌクレオシド間結合のパターンを意味する。
【０２５２】
「多組織疾患または病態」とは、疾患または病態が２つ以上の組織に影響を及ぼすか、２つ以上の組織で生じることを意味する。多組織疾患または病態を治療する際には、２つ以上の組織種に影響を与えることが望ましい。特定の実施形態において、疾患または病態の治療は、複数の組織における疾患または病態を治療することによって改善し得る。例えば、特定の実施形態において、疾患または病態は、肝臓組織及び筋肉組織で顕在化し得る。特定の実施形態において、肝臓組織と筋肉組織の疾患または病態を治療することは、肝臓組織または筋肉組織のいずれかの疾患を治療するよりも効果的であろう。
【０２５３】
「天然に生じる」とは、自然に存在することを意味する。
【０２５４】
「核酸塩基」とは、非修飾核酸塩基または修飾核酸塩基を意味する。本明細書で使用されるとき、「非修飾核酸塩基」は、アデニン（Ａ）、チミン（Ｔ）、シトシン（Ｃ）、ウラシル（Ｕ）及びグアニン（Ｇ）である。本明細書で使用されるとき、「修飾核酸塩基」は、少なくとも１つの非修飾核酸塩基と対合できる、修飾されていないＡ、Ｔ、Ｃ、ＵまたはＧ以外の原子団である。ユニバーサル塩基は、５つの非修飾核酸塩基のいずれか１つと対合できる修飾核酸塩基である。本明細書で使用されるとき、「核酸塩基配列」とは、任意の糖またはヌクレオシド間結合修飾に関係なく、核酸またはオリゴヌクレオチド中の連続した核酸塩基の順序を意味する。
【０２５５】
「ヌクレオシド」とは、核酸塩基及び糖部分を含む化合物を意味する。核酸塩基及び糖部分は、それぞれ独立して、非修飾であるか、修飾されている。本明細書で使用されるとき、「修飾ヌクレオシド」とは、修飾核酸塩基及び／または修飾糖部分を含むヌクレオシドを意味する。修飾ヌクレオシドには、核酸塩基を欠く脱塩基ヌクレオシドが含まれる。
【０２５６】
「オリゴマー化合物」とは、オリゴヌクレオチドと、任意選択でコンジュゲート基または末端基などの１つ以上の更なる特徴とからなる化合物を意味する。
【０２５７】
「オリゴヌクレオチド」とは、ヌクレオシド間結合を介して接続された、結合されたヌクレオシドの鎖を意味し、各ヌクレオシド及びヌクレオシド間結合は、修飾されていても修飾されていなくてもよい。特に指定のない限り、オリゴヌクレオチドは、８〜５０個の結合されたヌクレオシドからなる。本明細書で使用されるとき、「修飾オリゴヌクレオチド」とは、少なくとも１つのヌクレオシドまたはヌクレオシド間結合が修飾されている、オリゴヌクレオチドを意味する。本明細書で使用されるとき、「非修飾オリゴヌクレオチド」とは、いかなるヌクレオシド修飾もヌクレオシド間修飾も含まないオリゴヌクレオチドを意味する。
【０２５８】
「薬学的に許容される担体または希釈剤」とは、動物への投与に使用するのに好適な任意の物質を意味する。このような特定の担体は、対象による経口摂取用の医薬組成物、例えば、錠剤、丸剤、糖衣錠、カプセル剤、液剤、ゲル剤、シロップ剤、スラリー剤、懸濁剤及びロゼンジ剤の製剤化を可能にする。特定の実施形態において、薬学的に許容される担体または希釈剤は、滅菌水、滅菌生理食塩水または滅菌緩衝液である。
【０２５９】
「薬学的に許容される塩」とは、オリゴマー化合物などの化合物の生理学的及び薬学的に許容される塩、すなわち、親化合物の所望の生物学的活性を保持し、かつ望ましくない毒性作用を付与しない塩を意味する。
【０２６０】
「医薬組成物」とは、対象への投与に好適な物質の混合物を意味する。例えば、医薬組成物は、アンチセンス化合物及び無菌水溶液を含み得る。特定の実施形態において、医薬組成物は、特定の細胞株におけるフリー取込みアッセイ（ｆｒｅｅ  ｕｐｔａｋｅ  ａｓｓａｙ）で活性を示す。
【０２６１】
「リン部分」とは、リン原子を含む原子団を意味する。特定の実施形態において、リン部分は、一リン酸、二リン酸もしくは三リン酸、またはモノ、ジもしくはトリホスホロチオエートを含む。
【０２６２】
「プロドラッグ」とは、体内または細胞内で異なる形態に変換される、体外にある形態の治療薬を意味する。典型的に、プロドラッグの体内での変換は、細胞もしくは組織に存在する酵素（例えば、内因性またはウイルス性酵素）もしくは化学物質の作用によって、及び／または生理学的条件によって促進される。
【０２６３】
「ＲＮＡｉ化合物」とは、少なくとも部分的に、ＲＩＳＣまたはＡｇｏ２を介して作用して、標的核酸及び／または標的核酸によってコードされているタンパク質を調節するアンチセンス化合物を意味する。ＲＮＡｉ化合物には、二本鎖ｓｉＲＮＡ、一本鎖ＲＮＡ（ｓｓＲＮＡ）、及びｍｉｃｒｏＲＮＡ（ｍｉｃｒｏＲＮＡ模倣体を含む）が挙げられるが、これらに限定されない。特定の実施形態において、ＲＮＡｉ化合物は、標的核酸の量、活性及び／またはスプライシングを調節する。ＲＮＡｉ化合物という用語は、ＲＮａｓｅ  Ｈを介して作用するアンチセンスオリゴヌクレオチドを含まない。
【０２６４】
オリゴマー化合物に関する「一本鎖」とは、第２のオリゴマー化合物と対合して二本鎖を形成しない化合物を意味する。オリゴヌクレオチドに関する「自己相補性」とは、それ自体が少なくとも部分的にハイブリダイズするオリゴヌクレオチドを意味する。１つのオリゴマー化合物からなり、そのオリゴマー化合物のオリゴヌクレオチドが自己相補性である化合物は、一本鎖化合物である。一本鎖のアンチセンス化合物またはオリゴマー化合物は、相補的なオリゴマー化合物に結合して二本鎖を形成することができ、この場合、もはや一本鎖ではない。
【０２６５】
「標準セルアッセイ」とは、実施例１に記載されるアッセイ及びその妥当な変形形態を意味する。
【０２６６】
「標準ｉｎ  ｖｉｖｏ実験」とは、実施例５に記載される手順及びその妥当な変形形態を意味する。
【０２６７】
「糖部分」とは、非修飾糖部分または修飾糖部分を意味する。本明細書で使用されるとき、「非修飾糖部分」とは、ＲＮＡに認められるような２’−ＯＨ（Ｈ）フラノシル部分（「非修飾ＲＮＡ糖部分」）またはＤＮＡに認められるような２’−Ｈ（Ｈ）部分（「非修飾ＤＮＡ糖部分」）を意味する。非修飾糖部分は、１’位、３’位及び４’位にそれぞれ１つの水素と、３’位に１つの酸素と、５’位に２つの水素とを有する。本明細書で使用されるとき、「修飾糖部分（修飾された糖部分）」または「修飾糖（修飾された糖）」とは、修飾フラノシル糖部分または糖代替物を意味する。本明細書で使用されるとき、修飾フラノシル糖部分とは、非修飾糖部分の少なくとも１つの水素の代わりに、水素以外の置換基を含む、フラノシル糖を意味する。特定の実施形態において、修飾フラノシル糖部分は、２’−置換糖部分である。このような修飾フラノシル糖部分には、二環式糖及び非二環式糖が含まれる。本明細書で使用されるとき、「糖代替物」とは、核酸塩基を、オリゴヌクレオチドのヌクレオシド間結合、コンジュゲート基または末端基などの別の基に結合させることができる、フラノシル部分ではない修飾糖部分を意味する。糖代替物を含む修飾ヌクレオシドは、オリゴヌクレオチド内の１つ以上の位置に組み込むことができ、このようなオリゴヌクレオチドは、相補的なオリゴマー化合物または核酸にハイブリダイズすることができる。
【０２６８】
「標的核酸」とは、天然に生じる特定された核酸を意味する。特定の実施形態において、標的核酸は、内因性細胞内核酸であり、限定するものではないが、ＲＮＡ転写産物、ｐｒｅ−ｍＲＮＡ、ｍＲＮＡ、ｍｉｃｒｏＲＮＡが含まれる。特定の実施形態において、標的核酸は、ウイルス核酸である。特定の実施形態において、標的核酸は、アンチセンス化合物が作用するように設計された核酸である。
【０２６９】
「標的領域」とは、アンチセンス化合物がハイブリダイズするように設計された標的核酸の部分を意味する。
【０２７０】
「ＴＣＡモチーフ」とは、核酸塩基配列ＴＣＡ（５’−３’）を有する３つのヌクレオシドを意味する。かかるヌクレオシドは、修飾糖部分及び／または修飾ヌクレオシド間結合を有し得る。特に指示がない限り、ＴＣＡモチーフのヌクレオシドは、非修飾２’−デオキシ糖部分及び非修飾ホスホジエステルヌクレオシド間結合を含む。
【０２７１】
「末端基」とは、オリゴヌクレオチドの末端に共有結合した化学基または原子団を意味する。
【０２７２】
「ＣＮＳ」とは、中枢神経系を意味する。ＣＮＳは、脊椎ならびに脳及び脳脊髄液を含む。
【０２７３】
「脳脊髄液」または「ＣＳＦ」とは、脳と脊髄の周囲の空間を満たす流体を意味する。
【０２７４】
「神経系」とは、身体の部分間で神経インパルスを伝達する、神経細胞及び繊維のネットワークを意味する。神経系は、グリア細胞及びニューロンを含む。神経系は、中枢神経系と末梢神経系を含む。
【０２７５】
Ｉ．特定のオリゴヌクレオチド
特定の実施形態において、本発明は、第１のオリゴマー化合物及び第２のオリゴマー化合物を含む二本鎖を提供する。特定の実施形態において、オリゴマー化合物は、結合されたヌクレオシドからなるオリゴヌクレオチドを含む。オリゴヌクレオチドは、非修飾オリゴヌクレオチド（ＲＮＡまたはＤＮＡ）であってもよいし、修飾オリゴヌクレオチドであってもよい。修飾オリゴヌクレオチド、例えば、第１の修飾オリゴヌクレオチドまたは第２の修飾オリゴヌクレオチドは、非修飾ＲＮＡまたはＤＮＡに対して少なくとも１つの修飾を含む（すなわち、少なくとも１つの修飾ヌクレオシド（修飾糖部分及び／または修飾核酸塩基を含む）及び／または少なくとも１つの修飾ヌクレオシド間結合を含む）。
【０２７６】
Ａ．特定の修飾ヌクレオシド
修飾ヌクレオシドは、修飾糖部分または修飾核酸塩基または修飾糖部分と修飾核酸塩基の両方を含む。
【０２７７】
１．特定の糖部分
特定の実施形態において、修飾糖部分は、非二環式修飾糖部分である。特定の実施形態において、修飾糖部分は、二環式または三環式糖部分である。特定の実施形態において、修飾糖部分は、糖代替物である。このような糖代替物は、他の種類の修飾糖部分の置換に相当する、１つ以上の置換を含み得る。
【０２７８】
特定の実施形態において、修飾糖部分は、限定するものではないが、２’位、４’位及び／または５’位での置換基を含む、１つ以上の非環式置換基を有するフラノシル環を含む、非二環式修飾糖部分である。特定の実施形態において、非二環式修飾糖部分の１つ以上の非環式置換基は、分枝状である。非二環式修飾糖部分に好適な２’−置換基の例には、２’−Ｆ、２’−ＯＣＨ３（「ＯＭｅ」または「Ｏ−メチル」）、及び２’−Ｏ（ＣＨ２）２ＯＣＨ３（「ＭＯＥ」）が挙げられるが、これらに限定されない。特定の実施形態において、２’−置換基は、ハロ、アリル、アミノ、アジド、ＳＨ、ＣＮ、ＯＣＮ、ＣＦ３、ＯＣＦ３、Ｏ−Ｃ１〜Ｃ１０アルコキシ、Ｏ−Ｃ１〜Ｃ１０置換アルコキシ、Ｏ−Ｃ１〜Ｃ１０アルキル、Ｏ−Ｃ１〜Ｃ１０置換アルキル、Ｓ−アルキル、Ｎ（Ｒｍ）−アルキル、Ｏ−アルケニル、Ｓ−アルケニル、Ｎ（Ｒｍ）−アルケニル、Ｏ−アルキニル、Ｓ−アルキニル、Ｎ（Ｒｍ）−アルキニル、Ｏ−アルキレニル−Ｏ−アルキル、アルキニル、アルカリル、アラルキル、Ｏ−アルカリル、Ｏ−アラルキル、Ｏ（ＣＨ２）２ＳＣＨ３、Ｏ（ＣＨ２）２ＯＮ（Ｒｍ）（Ｒｎ）またはＯＣＨ２Ｃ（＝Ｏ）−Ｎ（Ｒｍ）（Ｒｎ）（式中、各Ｒｍ及びＲｎは、独立して、Ｈ、アミノ保護基、または置換もしくは無置換Ｃ１〜Ｃ１０アルキルである）ならびにＣｏｏｋ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．６，５３１，５８４；Ｃｏｏｋ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．５，８５９，２２１；及びＣｏｏｋ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．６，００５，０８７に記載の２’−置換基から選択される。これらの２’−置換基の特定の実施形態は、ヒドロキシル、アミノ、アルコキシ、カルボキシ、ベンジル、フェニル、ニトロ（ＮＯ２）、チオール、チオアルコキシ、チオアルキル、ハロゲン、アルキル、アリール、アルケニル及びアルキニルから独立して選択される１つ以上の置換基で更に置換され得る。非二環式修飾糖部分に好適な４’−置換基の例には、アルコキシ（例えば、メトキシ）、アルキル及びＭａｎｏｈａｒａｎ  ｅｔ  ａｌ．，ＷＯ２０１５／１０６１２８に記載のものが挙げられるが、これらに限定されない。非二環式修飾糖部分に好適な５’−置換基の例には、５’−メチル（ＲまたはＳ）、５’−ビニル及び５’−メトキシが挙げられるが、これらに限定されない。特定の実施形態において、非二環式修飾糖は、２つ以上の非架橋型糖置換基、例えば、２’−Ｆ−５’−メチル糖部分ならびにＭｉｇａｗａ  ｅｔ  ａｌ．，ＷＯ２００８／１０１１５７及びＲａｊｅｅｖ  ｅｔ  ａｌ．，ＵＳ２０１３／０２０３８３６）に記載の修飾糖部分及び修飾ヌクレオシドを含む。
【０２７９】
特定の実施形態において、２’−置換ヌクレオシドまたは２’−非二環式修飾ヌクレオシドは、Ｆ、ＮＨ２、Ｎ３、ＯＣＦ３、ＯＣＨ３、Ｏ（ＣＨ２）３ＮＨ２、ＣＨ２ＣＨ＝ＣＨ２、ＯＣＨ２ＣＨ＝ＣＨ２、ＯＣＨ２ＣＨ２ＯＣＨ３、Ｏ（ＣＨ２）２ＳＣＨ３、Ｏ（ＣＨ２）２ＯＮ（Ｒｍ）（Ｒｎ）、Ｏ（ＣＨ２）２Ｏ（ＣＨ２）２Ｎ（ＣＨ３）２及びＮ−置換アセトアミド（ＯＣＨ２Ｃ（＝Ｏ）−Ｎ（Ｒｍ）（Ｒｎ））（式中、各Ｒｍ及びＲｎは、独立して、Ｈ、アミノ保護基、または置換もしくは無置換Ｃ１〜Ｃ１０アルキルである）から選択される非架橋型２’−置換基を含む糖部分を含む。
【０２８０】
特定の実施形態において、２’−置換ヌクレオシドまたは２’−非二環式修飾ヌクレオシドは、Ｆ、ＯＣＦ３、ＯＣＨ３、ＯＣＨ２ＣＨ２ＯＣＨ３、Ｏ（ＣＨ２）２ＳＣＨ３、Ｏ（ＣＨ２）２ＯＮ（ＣＨ３）２、Ｏ（ＣＨ２）２Ｏ（ＣＨ２）２Ｎ（ＣＨ３）２及びＯＣＨ２Ｃ（＝Ｏ）−Ｎ（Ｈ）ＣＨ３（「ＮＭＡ」）から選択される非架橋型２’−置換基を含む糖部分を含む。
【０２８１】
特定の実施形態において、２’−置換ヌクレオシドまたは２’−非二環式修飾ヌクレオシドは、Ｆ、ＯＣＨ３及びＯＣＨ２ＣＨ２ＯＣＨ３から選択される非架橋型２’−置換基を含む糖部分を含む。
【０２８２】
非二環式修飾糖部分などの修飾糖部分を含むヌクレオシドは、当該ヌクレオシドの糖部分上にある置換（複数可）の位置（複数可）によって表すことができる。例えば、２’−置換または２−修飾糖部分を含むヌクレオシドは、２’−置換ヌクレオシドまたは２−修飾ヌクレオシドと呼ばれる。
【０２８３】
特定の修飾糖部分は、第２の環を形成して二環式糖部分をもたらす、架橋型糖置換基を含む。このような特定の実施形態において、二環式糖部分は、４’フラノース環原子と２’フラノース環原子との間の架橋を含む。このような４’−２’架橋型糖置換基の例には、４’−ＣＨ２−２’、４’−（ＣＨ２）２−２’、４’−（ＣＨ２）３−２’、４’−ＣＨ２−Ｏ−２’（「ＬＮＡ」）、４’−ＣＨ２−Ｓ−２’、４’−（ＣＨ２）２−Ｏ−２’（「ＥＮＡ」）、４’−ＣＨ（ＣＨ３）−Ｏ−２’（Ｓ型配置であるとき、「拘束エチル」または「ｃＥｔ」ともいう）、４’−ＣＨ２−Ｏ−ＣＨ２−２’、４’−ＣＨ２−Ｎ（Ｒ）−２’、４’−ＣＨ（ＣＨ２ＯＣＨ３）−Ｏ−２’（「拘束ＭＯＥ」または「ｃＭＯＥ」）及びその類似体（例えば、Ｓｅｔｈ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．７，３９９，８４５、Ｂｈａｔ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．７，５６９，６８６、Ｓｗａｙｚｅ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．７，７４１，４５７及びＳｗａｙｚｅ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．８，０２２，１９３参照）、４’−Ｃ（ＣＨ３）（ＣＨ３）−Ｏ−２’及びその類似体（例えば、Ｓｅｔｈ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．８，２７８，２８３参照）、４’−ＣＨ２−Ｎ（ＯＣＨ３）−２’及びその類似体（例えば、Ｐｒａｋａｓｈ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．８，２７８，４２５参照）、４’−ＣＨ２−Ｏ−Ｎ（ＣＨ３）−２’（例えば、Ａｌｌｅｒｓｏｎ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．７，６９６，３４５及びＡｌｌｅｒｓｏｎ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．８，１２４，７４５参照）、４’−ＣＨ２−Ｃ（Ｈ）（ＣＨ３）−２’（例えば、Ｚｈｏｕ，ｅｔ  ａｌ．，Ｊ．Ｏｒｇ．Ｃｈｅｍ．，２００９，７４，１１８−１３４参照）、４’−ＣＨ２−Ｃ（＝ＣＨ２）−２’及びその類似体（例えば、Ｓｅｔｈ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．８，２７８，４２６参照）、４’−Ｃ（ＲａＲｂ）−Ｎ（Ｒ）−Ｏ−２’、４’−Ｃ（ＲａＲｂ）−Ｏ−Ｎ（Ｒ）−２’、４’−ＣＨ２−Ｏ−Ｎ（Ｒ）−２’、及び４’−ＣＨ２−Ｎ（Ｒ）−Ｏ−２’（式中、各Ｒ、Ｒａ及びＲｂは、独立して、Ｈ、保護基、またはＣ１〜Ｃ１２アルキルである）（例えば、Ｉｍａｎｉｓｈｉ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．７，４２７，６７２参照）が挙げられるが、これらに限定されない。
【０２８４】
特定の実施形態において、このような４’−２’架橋は、独立して、−［Ｃ（Ｒａ）（Ｒｂ）］ｎ−、−［Ｃ（Ｒａ）（Ｒｂ）］ｎ−Ｏ−、Ｃ（Ｒａ）＝Ｃ（Ｒｂ）−、Ｃ（Ｒａ）＝Ｎ−、−Ｃ（＝ＮＲａ）−、−Ｃ（＝Ｏ）−、−Ｃ（＝Ｓ）−、−Ｏ−、−Ｓｉ（Ｒａ）２−、−Ｓ（＝Ｏ）ｘ−及びＮ（Ｒａ）−から独立して選択される１〜４個の結合基を含み、
式中、
ｘは、０、１または２であり、
ｎは、１、２、３または４であり、
各Ｒａ及びＲｂは、独立して、Ｈ、保護基、ヒドロキシル、Ｃ１〜Ｃ１２アルキル、置換Ｃ１〜Ｃ１２アルキル、Ｃ２〜Ｃ１２アルケニル、置換Ｃ２〜Ｃ１２アルケニル、Ｃ２〜Ｃ１２アルキニル、置換Ｃ２〜Ｃ１２アルキニル、Ｃ５〜Ｃ２０アリール、置換Ｃ５〜Ｃ２０アリール、複素環基、置換複素環基、ヘテロアリール、置換ヘテロアリール、Ｃ５〜Ｃ７脂環式基、置換Ｃ５〜Ｃ７脂環式基、ハロゲン、ＯＪ１、ＮＪ１Ｊ２、ＳＪ１、Ｎ３、ＣＯＯＪ１、アシル（Ｃ（＝Ｏ）−Ｈ）、置換アシル、ＣＮ、スルホニル（Ｓ（＝Ｏ）２−Ｊ１）、またはスルホキシル（Ｓ（＝Ｏ）−Ｊ１）であり、
各Ｊ１及びＪ２は、独立して、Ｈ、Ｃ１〜Ｃ１２アルキル、置換Ｃ１〜Ｃ１２アルキル、Ｃ２〜Ｃ１２アルケニル、置換Ｃ２〜Ｃ１２アルケニル、Ｃ２〜Ｃ１２アルキニル、置換Ｃ２〜Ｃ１２アルキニル、Ｃ５〜Ｃ２０アリール、置換Ｃ５〜Ｃ２０アリール、アシル（Ｃ（＝Ｏ）−Ｈ）、置換アシル、複素環基、置換複素環基、Ｃ１〜Ｃ１２アミノアルキル、置換Ｃ１〜Ｃ１２アミノアルキルまたは保護基である。
【０２８５】
更なる二環式糖部分も、当該技術分野において知られており、例えば、Ｆｒｅｉｅｒ  ｅｔ  ａｌ．，Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄｓ  Ｒｅｓｅａｒｃｈ，１９９７，２５（２２），４４２９−４４４３、Ａｌｂａｅｋ  ｅｔ  ａｌ．，Ｊ．Ｏｒｇ．Ｃｈｅｍ．，２００６，７１，７７３１−７７４０、Ｓｉｎｇｈ  ｅｔ  ａｌ．，Ｃｈｅｍ．Ｃｏｍｍｕｎ．，１９９８，４，４５５−４５６；Ｋｏｓｈｋｉｎ  ｅｔ  ａｌ．，Ｔｅｔｒａｈｅｄｒｏｎ，１９９８，５４，３６０７−３６３０；Ｋｕｍａｒ  ｅｔ  ａｌ．，Ｂｉｏｏｒｇ．Ｍｅｄ．Ｃｈｅｍ．Ｌｅｔｔ．，１９９８，８，２２１９−２２２２；Ｓｉｎｇｈ  ｅｔ  ａｌ．，Ｊ．Ｏｒｇ．Ｃｈｅｍ．，１９９８，６３，１００３５−１００３９；Ｓｒｉｖａｓｔａｖａ  ｅｔ  ａｌ．，Ｊ．Ａｍ．Ｃｈｅｍ．Ｓｏｃ．，２００１７，１２９，８３６２−８３７９；Ｗｅｎｇｅｌ  ｅｔ  ａ．，Ｕ．Ｓ．７，０５３，２０７；Ｉｍａｎｉｓｈｉ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．６，２６８，４９０；Ｉｍａｎｉｓｈｉ  ｅｔ  ａｌ．Ｕ．Ｓ．６，７７０，７４８；Ｉｍａｎｉｓｈｉ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．ＲＥ４４，７７９；Ｗｅｎｇｅｌ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．６，７９４，４９９；Ｗｅｎｇｅｌ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．６，６７０，４６１；Ｗｅｎｇｅｌ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．７，０３４，１３３；Ｗｅｎｇｅｌ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．８，０８０，６４４；Ｗｅｎｇｅｌ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．８，０３４，９０９；Ｗｅｎｇｅｌ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．８，１５３，３６５；Ｗｅｎｇｅｌ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．７，５７２，５８２；及びＲａｍａｓａｍｙ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．６，５２５，１９１；；Ｔｏｒｓｔｅｎ  ｅｔ  ａｌ．，ＷＯ２００４／１０６３５６；Ｗｅｎｇｅｌ  ｅｔ  ａｌ．，ＷＯ１９９９／０１４２２６；Ｓｅｔｈ  ｅｔ  ａｌ．，ＷＯ２００７／１３４１８１；Ｓｅｔｈ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．７，５４７，６８４；Ｓｅｔｈ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．７，６６６，８５４；Ｓｅｔｈ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．８，０８８，７４６；Ｓｅｔｈ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．７，７５０，１３１；Ｓｅｔｈ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．８，０３０，４６７；Ｓｅｔｈ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．８，２６８，９８０；Ｓｅｔｈ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．８，５４６，５５６；Ｓｅｔｈ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．８，５３０，６４０；Ｍｉｇａｗａ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．９，０１２，４２１；Ｓｅｔｈ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．８，５０１，８０５；ならびに米国特許出願公開Ａｌｌｅｒｓｏｎ  ｅｔ  ａｌ．，ＵＳ２００８／００３９６１８及びＭｉｇａｗａ  ｅｔ  ａｌ．，ＵＳ２０１５／０１９１７２７を参照されたい。
【０２８６】
特定の実施形態において、このような二環式糖部分が組み込まれた二環式糖部分及びヌクレオシドは、異性体配置によって更に定義される。例えば、ＬＮＡヌクレオシド（本明細書に記載のもの）は、α−Ｌ配置またはβ−Ｄ配置を取り得る。
【化４】
2018528783.tif 000005
α−Ｌ−メチレンオキシ（４’−ＣＨ２−Ｏ−２’）またはα−Ｌ−ＬＮＡ二環式ヌクレオシドがアンチセンスオリゴヌクレオチド中に組み込まれており、このアンチセンスオリゴヌクレオチドは、アンチセンス活性を示した（Ｆｒｉｅｄｅｎ  ｅｔ  ａｌ．，Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄｓ  Ｒｅｓｅａｒｃｈ，２００３，２１，６３６５−６３７２）。本明細書中、二環式ヌクレオシドに関する概要は、両方の異性体配置を含む。本明細書で例示される実施形態において特定の二環式ヌクレオシド（例えば、ＬＮＡまたはｃＥｔ）の位置が特定されているとき、それらは、別の記載がない限り、β−Ｄ配置である。
【０２８７】
特定の実施形態において、修飾糖部分は、１つ以上の非架橋型糖置換基と、１つ以上の架橋型糖置換基（例えば、５’−置換及び４’−２’架橋型糖）とを含む。
【０２８８】
特定の実施形態において、修飾糖部分は、糖代替物である。このような特定の実施形態において、糖部分の酸素原子は、例えば、硫黄原子、炭素原子または窒素原子で置き換えられる。このような特定の実施形態において、このような修飾糖部分は、本明細書に記載される架橋型及び／または非架橋型置換基も含む。例えば、特定の糖代替物は、４’−硫黄原子と、２’位の置換（例えば、Ｂｈａｔ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．７，８７５，７３３及びＢｈａｔ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．７，９３９，６７７参照）及び／または５’位の置換とを含む。
【０２８９】
特定の実施形態において、糖代替物は、５原子以外の環を含む。例えば、特定の実施形態において、糖代替物は、６員テトラヒドロピラン（「ＴＨＰ」）を含む。このようなテトラヒドロピランは、更なる修飾または置換がなされてもよい。このような修飾テトラヒドロピランを含むヌクレオシドには、ヘキシトール核酸（「ＨＮＡ」）、アニトール核酸（「ＡＮＡ」）、マニトール核酸（「ＭＮＡ」）（例えば、Ｌｅｕｍａｎｎ，ＣＪ．Ｂｉｏｏｒｇ．＆Ｍｅｄ．Ｃｈｅｍ．２００２，１０，８４１−８５４参照）、フルオロＨＮＡ：
【化５】
2018528783.tif 000006
（「Ｆ−ＨＮＡ」、例えば、Ｓｗａｙｚｅ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．８，０８８，９０４；Ｓｗａｙｚｅ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．８，４４０，８０３；Ｓｗａｙｚｅ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．８，７９６，４３７；及びＳｗａｙｚｅ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．９，００５，９０６参照；Ｆ−ＨＮＡはまた、Ｆ−ＴＨＰまたは３’−フルオロテトラヒドロピランと呼ぶこともできる）及び次式を有する更なる修飾ＴＨＰ化合物を含むヌクレオシド：
【化６】
2018528783.tif 000007
（式中、独立して、当該修飾ＴＨＰヌクレオシドのそれぞれについて、
Ｂｘは、核酸塩基部分であり、
Ｔ３及びＴ４は、それぞれ独立して、当該修飾ＴＨＰヌクレオシドを残りのオリゴヌクレオチドに結合するヌクレオシド間結合基であり、あるいは、Ｔ３及びＴ４の一方は、当該修飾ＴＨＰヌクレオシドを残りのオリゴヌクレオチドに結合するヌクレオシド間結合基であり、Ｔ３及びＴ４の他方は、Ｈ、ヒドロキシル保護基、結合されたコンジュゲート基または５’もしくは３’−末端基であり、
ｑ１、ｑ２、ｑ３、ｑ４、ｑ５、ｑ６及びｑ７は、それぞれ独立して、Ｈ、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、置換Ｃ１〜Ｃ６アルキル、Ｃ２〜Ｃ６アルケニル、置換Ｃ２〜Ｃ６アルケニル、Ｃ２〜Ｃ６アルキニルまたは置換Ｃ２〜Ｃ６アルキニルであり、
Ｒ１及びＲ２のそれぞれは、独立して、水素、ハロゲン、置換または無置換アルコキシ、ＮＪ１Ｊ２、ＳＪ１、Ｎ３、ＯＣ（＝Ｘ）Ｊ１、ＯＣ（＝Ｘ）ＮＪ１Ｊ２、ＮＪ３Ｃ（＝Ｘ）ＮＪ１Ｊ２及びＣＮ（式中、ＸはＯ、ＳまたはＮＪ１であり、各Ｊ１、Ｊ２及びＪ３は独立してＨまたはＣ１〜Ｃ６アルキルである）から選択される）が挙げられるが、これらに限定されない。
【０２９０】
特定の実施形態において、式中、ｑ１、ｑ２、ｑ３、ｑ４、ｑ５、ｑ６及びｑ７がそれぞれＨである修飾ＴＨＰヌクレオシドが提供される。特定の実施形態において、ｑ１、ｑ２、ｑ３、ｑ４、ｑ５、ｑ６及びｑ７のうちの少なくとも１つは、Ｈ以外である。特定の実施形態において、ｑ１、ｑ２、ｑ３、ｑ４、ｑ５、ｑ６及びｑ７のうちの少なくとも１つは、メチルである。特定の実施形態において、Ｒ１及びＲ２の一方がＦである修飾ＴＨＰヌクレオシドが提供される。特定の実施形態において、Ｒ１はＦであり、Ｒ２はＨであり、特定の実施形態において、Ｒ１はメトキシであり、Ｒ２はＨであり、特定の実施形態において、Ｒ１はメトキシエトキシであり、Ｒ２はＨである。
【０２９１】
特定の実施形態において、糖代替物は、６個以上の原子を有し、２つ以上のヘテロ原子を有する環を含む。例えば、モルホリノ糖部分を含むヌクレオシド及びそのオリゴヌクレオチドにおける使用が報告されている（例えば、Ｂｒａａｓｃｈ  ｅｔ  ａｌ．，Ｂｉｏｃｈｅｍｉｓｔｒｙ，２００２，４１，４５０３−４５１０及びＳｕｍｍｅｒｔｏｎ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．５，６９８，６８５；Ｓｕｍｍｅｒｔｏｎ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．５，１６６，３１５；Ｓｕｍｍｅｒｔｏｎ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．５，１８５，４４４；及びＳｕｍｍｅｒｔｏｎ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．５，０３４，５０６参照）。本明細書で使用される場合、「モルホリノ」という用語は、次の構造を有する糖代替物を意味する。
【化７】
2018528783.tif 000008
特定の実施形態において、モルホリノは、例えば、上記のモルホリノ構造に種々の置換基を付加するか、上記のモルホリノ構造の種々の置換基を変更することによって、修飾されてもよい。このような糖代替物は、本明細書中、「修飾モルホリノ」ともいう。
【０２９２】
特定の実施形態において、糖代替物は、非環式部分を含む。このような非環式糖代替物を含むヌクレオシド及びオリゴヌクレオチドの例には、ペプチド核酸（「ＰＮＡ」）、非環式ブチル核酸（例えば、Ｋｕｍａｒ  ｅｔ  ａｌ．，Ｏｒｇ．Ｂｉｏｍｏｌ．Ｃｈｅｍ．，２０１３，１１，５８５３−５８６５参照）ならびにＭａｎｏｈａｒａｎ  ｅｔ  ａｌ．，ＷＯ２０１１／１３３８７６に記載のヌクレオシド及びオリゴヌクレオチドが挙げられるが、これらに限定されない。修飾ヌクレオシドに使用することができる多くの他の二環式及び三環式糖ならびに糖代替物環系は、当該技術分野において知られている。
【０２９３】
１．特定の修飾核酸塩基
特定の実施形態において、第１の修飾オリゴヌクレオチドは、非修飾核酸塩基を含むヌクレオシドを１つ以上含む。特定の実施形態において、第２の修飾オリゴヌクレオチドは、非修飾核酸塩基を含むヌクレオシドを１つ以上含む。特定の実施形態において、修飾オリゴヌクレオチド、例えば、第１の修飾オリゴヌクレオチドまたは第２の修飾オリゴヌクレオチドは、修飾核酸塩基を含むヌクレオシドを１つ以上含む。特定の実施形態において、修飾オリゴヌクレオチド、例えば、第１の修飾オリゴヌクレオチドまたは第2の修飾オリゴヌクレオチドは、脱塩基ヌクレオシドと呼ばれる、核酸塩基を含まないヌクレオシドを１つ以上含む。
【０２９４】
特定の実施形態において、修飾核酸塩基は、５−置換ピリミジン、６−アザピリミジン、アルキル置換またはアルキニル置換ピリミジン、アルキル置換プリンならびにＮ−２、Ｎ−６及びＯ−６置換プリンから選択される。特定の実施形態において、修飾核酸塩基は、２−アミノプロピルアデニン、５−ヒドロキシメチルシトシン、キサンチン、ヒポキサンチン、２−アミノアデニン、６−Ｎ−メチルグアニン、６−Ｎ−メチルアデニン、２−プロピルアデニン、２−チオウラシル、２−チオチミン及び２−チオシトシン、５−プロピニル（−Ｃ≡Ｃ−ＣＨ３）ウラシル、５−プロピニルシトシン、６−アゾウラシル、６−アゾシトシン、６−アゾチミン、５−リボシルウラシル（プソイドウラシル）、４−チオウラシル、８−ハロ、８−アミノ、８−チオール、８−チオアルキル、８−ヒドロキシル、８−アザ及び他の８−置換プリン、５−ハロ、特に、５−ブロモ、５−トリフルオロメチル、５−ハロウラシル及び５−ハロシトシン、７−メチルグアニン、７−メチルアデニン、２−Ｆ−アデニン、２−アミノアデニン、７−デアザグアニン、７−デアザアデニン、３−デアザグアニン、３−デアザアデニン、６−Ｎ−ベンゾイルアデニン、２−Ｎ−イソブチリルグアニン、４−Ｎ−ベンゾイルシトシン、４−Ｎ−ベンゾイルウラシル、５−メチル４−Ｎ−ベンゾイルシトシン、５−メチル４−Ｎ−ベンゾイルウラシル、ユニバーサル塩基、疎水性塩基、非特異的塩基、サイズ伸長塩基ならびにフッ素化塩基から選択される。更なる修飾核酸塩基には、１，３−ジアザフェノキサジン−２−オン、１，３−ジアザフェノチアジン−２−オン及び９−（２−アミノエトキシ）−１，３−ジアザフェノキサジン−２−オン（Ｇ−クランプ）などの三環式ピリミジンが含まれる。修飾核酸塩基にはまた、プリン塩基またはピリミジン塩基が他の複素環、例えば、７−デアザ−アデニン、７−デアザグアノシン、２−アミノピリジン及び２−ピリドンで置き換えられたものも含まれる。更なる核酸塩基には、Ｍｅｒｉｇａｎ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．３，６８７，８０８に開示されているもの、Ｔｈｅ  Ｃｏｎｃｉｓｅ  Ｅｎｃｙｃｌｏｐｅｄｉａ  Ｏｆ  Ｐｏｌｙｍｅｒ  Ｓｃｉｅｎｃｅ  Ａｎｄ  Ｅｎｇｉｎｅｅｒｉｎｇ，Ｋｒｏｓｃｈｗｉｔｚ，Ｊ．Ｉ．，Ｅｄ．，Ｊｏｈｎ  Ｗｉｌｅｙ＆Ｓｏｎｓ，１９９０，８５８−８５９；Ｅｎｇｌｉｓｃｈ  ｅｔ  ａｌ．，Ａｎｇｅｗａｎｄｔｅ  Ｃｈｅｍｉｅ，Ｉｎｔｅｒｎａｔｉｏｎａｌ  Ｅｄｉｔｉｏｎ，１９９１，３０，６１３；Ｓａｎｇｈｖｉ，Ｙ．Ｓ．，Ｃｈａｐｔｅｒ  １５，Ａｎｔｉｓｅｎｓｅ  Ｒｅｓｅａｒｃｈ  ａｎｄ  Ａｐｐｌｉｃａｔｉｏｎｓ，Ｃｒｏｏｋｅ，Ｓ．Ｔ．ａｎｄ  Ｌｅｂｌｅｕ，Ｂ．，Ｅｄｓ．，ＣＲＣ  Ｐｒｅｓｓ，１９９３，２７３−２８８に開示されているもの；及びＣｈａｐｔｅｒｓ  ６  ａｎｄ  １５，Ａｎｔｉｓｅｎｓｅ  Ｄｒｕｇ  Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ，Ｃｒｏｏｋｅ  Ｓ．Ｔ．，Ｅｄ．，ＣＲＣ  Ｐｒｅｓｓ，２００８，１６３−１６６  ａｎｄ  ４４２−４４３に開示されているものが含まれる。
【０２９５】
上述した修飾核酸塩基及び他の修飾核酸塩基のうちのいくつかの調製について教示する公開物には、限定するものではないが、Ｍａｎｏｈａｒａ  ｅｔ  ａｌ．，ＵＳ２００３／０１５８４０３；Ｍａｎｏｈａｒａｎ  ｅｔ  ａｌ．，ＵＳ２００３／０１７５９０６；Ｄｉｎｈ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．４，８４５，２０５；Ｓｐｉｅｌｖｏｇｅｌ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．５，１３０，３０２；Ｒｏｇｅｒｓ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．５，１３４，０６６；Ｂｉｓｃｈｏｆｂｅｒｇｅｒ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．５，１７５，２７３；Ｕｒｄｅａ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．５，３６７，０６６；Ｂｅｎｎｅｒ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．５，４３２，２７２；Ｍａｔｔｅｕｃｃｉ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．５，４３４，２５７；Ｇｍｅｉｎｅｒ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．５，４５７，１８７；Ｃｏｏｋ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．５，４５９，２５５；Ｆｒｏｅｈｌｅｒ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．５，４８４，９０８；Ｍａｔｔｅｕｃｃｉ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．５，５０２，１７７；Ｈａｗｋｉｎｓ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．５，５２５，７１１；Ｈａｒａｌａｍｂｉｄｉｓ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．５，５５２，５４０；Ｃｏｏｋ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．５，５８７，４６９；Ｆｒｏｅｈｌｅｒ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．５，５９４，１２１；Ｓｗｉｔｚｅｒ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．５，５９６，０９１；Ｃｏｏｋ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．５，６１４，６１７；Ｆｒｏｅｈｌｅｒ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．５，６４５，９８５；Ｃｏｏｋ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．５，６８１，９４１；Ｃｏｏｋ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．５，８１１，５３４；Ｃｏｏｋ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．５，７５０，６９２；Ｃｏｏｋ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．５，９４８，９０３；Ｃｏｏｋ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．５，５８７，４７０；Ｃｏｏｋ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．５，４５７，１９１；Ｍａｔｔｅｕｃｃｉ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．５，７６３，５８８；Ｆｒｏｅｈｌｅｒ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．５，８３０，６５３；Ｃｏｏｋ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．５，８０８，０２７；Ｃｏｏｋ  ｅｔ  ａｌ．，６，１６６，１９９；及びＭａｔｔｅｕｃｃｉ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．６，００５，０９６が含まれる。
【０２９６】
Ｂ．特定の修飾ヌクレオシド間結合
特定の実施形態において、修飾オリゴヌクレオチドのヌクレオシドは、任意のヌクレオシド間結合を使用して一緒に結合することができる。特定の実施形態において、第１の修飾オリゴヌクレオチドのヌクレオシドは、任意のヌクレオシド間結合を使用して一緒に結合することができる。特定の実施形態において、第２の修飾オリゴヌクレオチドのヌクレオシドは、任意のヌクレオシド間結合を使用して一緒に結合することができる。ヌクレオシド間結合基の２つの主な種類は、リン原子の有無によって定義される。代表的なリン含有ヌクレオシド間結合は、ホスホジエステル結合（「Ｐ＝Ｏ」）（非修飾結合または天然に生じる結合ともいう）、ホスホトリエステル、メチルホスホネート、ホスホロアミデートならびにホスホロチオエート（「Ｐ＝Ｓ」）及びホスホロジチオエート（「ＨＳ−Ｐ＝Ｓ」）を含有するリン酸が挙げられるが、これらに限定されない。代表的なリン非含有ヌクレオシド間結合基には、メチレンメチルイミノ（−ＣＨ２−Ｎ（ＣＨ３）−Ｏ−ＣＨ２−）、チオジエステル、チオノカルバメート（−Ｏ−Ｃ（＝Ｏ）（ＮＨ）−Ｓ−）；シロキサン（−Ｏ−ＳｉＨ２−Ｏ−）；及びＮ，Ｎ’−ジメチルヒドラジン（−ＣＨ２−Ｎ（ＣＨ３）−Ｎ（ＣＨ３）−）が挙げられるが、これらに限定されない。修飾ヌクレオシド間結合は、天然に生じるリン酸結合と比較して、オリゴヌクレオチドのヌクレアーゼ耐性を変更するために、典型的には増加させるために使用することができる。特定の実施形態において、キラル原子を有するヌクレオシド間結合は、ラセミ混合物として、または別個のエナンチオマーとして調製することができる。代表的なキラルヌクレオシド間結合には、アルキルホスホネート及びホスホロチオエートが挙げられるが、これらに限定されない。リン含有ヌクレオシド間結合及びリン非含有ヌクレオシド間結合の調製方法は、当業者によく知られている。
【０２９７】
中性ヌクレオシド間結合には、限定するものではないが、ホスホトリエステル、メチルホスホネート、ＭＭＩ（３’−ＣＨ２−Ｎ（ＣＨ３）−Ｏ−５’）、アミド−３（３’−ＣＨ２−Ｃ（＝Ｏ）−Ｎ（Ｈ）−５’）、アミド−４（３’−ＣＨ２−Ｎ（Ｈ）−Ｃ（＝Ｏ）−５’）、ホルムアセタール（３’−Ｏ−ＣＨ２−Ｏ−５’）、メトキシプロピル及びチオホルムアセタール（３’−Ｓ−ＣＨ２−Ｏ−５’）が含まれる。更なる中性ヌクレオシド間結合には、シロキサン（ジアルキルシロキサン）、カルボン酸エステル、カルボキサミド、スルフィド、スルホン酸エステル及びアミドを含む非イオン性結合が含まれる（例えば、Ｃａｒｂｏｈｙｄｒａｔｅ  Ｍｏｄｉｆｉｃａｔｉｏｎｓ  ｉｎ  Ａｎｔｉｓｅｎｓｅ  Ｒｅｓｅａｒｃｈ；Ｙ．Ｓ．Ｓａｎｇｈｖｉ  ａｎｄ  Ｐ．Ｄ．Ｃｏｏｋ，Ｅｄｓ．，ＡＣＳ  Ｓｙｍｐｏｓｉｕｍ  Ｓｅｒｉｅｓ  ５８０；Ｃｈａｐｔｅｒｓ  ３  ａｎｄ  ４，４０−６５参照）。更なる中性ヌクレオシド間結合には、Ｎ、Ｏ、Ｓ及びＣＨ２の混合構成部分を含む非イオン性結合が含まれる。
【０２９８】
Ｃ．特定のモチーフ
特定の実施形態において、第１の修飾オリゴヌクレオチドは、修飾糖を含む修飾ヌクレオシドを１つ以上含む。特定の実施形態において、第１の修飾オリゴヌクレオチドは、修飾核酸塩基を含む修飾ヌクレオシドを１つ以上含む。特定の実施形態において、第１の修飾オリゴヌクレオチドは、１つ以上の修飾ヌクレオシド間結合を含む。このような実施形態において、第１の修飾オリゴヌクレオチドの修飾、非修飾及び修飾の異なる糖部分、核酸塩基及び／またはヌクレオシド間結合は、パターンまたはモチーフを確定する。特定の実施形態において、糖部分、核酸塩基及びヌクレオシド間結合のパターンは、それぞれ互いに独立している。したがって、第１の修飾オリゴヌクレオチドは、その糖モチーフ、核酸塩基モチーフ及び／またはヌクレオシド間結合モチーフによって記載することができる（本明細書で使用されるとき、核酸塩基モチーフは、核酸塩基の配列に関係なく、核酸塩基に対する修飾を記載するものである）。
【０２９９】
特定の実施形態において、第２の修飾オリゴヌクレオチドは、修飾糖を含む修飾ヌクレオシドを１つ以上含む。特定の実施形態において、第２の修飾オリゴヌクレオチドは、修飾核酸塩基を含む修飾ヌクレオシドを１つ以上含む。特定の実施形態において、第２の修飾オリゴヌクレオチドは、１つ以上の修飾ヌクレオシド間結合を含む。このような実施形態において、第２の修飾オリゴヌクレオチドの修飾、非修飾及び修飾の異なる糖部分、核酸塩基及び／またはヌクレオシド間結合は、パターンまたはモチーフを確定する。特定の実施形態において、糖部分、核酸塩基及びヌクレオシド間結合のパターンは、それぞれ互いに独立している。したがって、第２の修飾オリゴヌクレオチドは、その糖モチーフ、核酸塩基モチーフ及び／またはヌクレオシド間結合モチーフによって記載することができる（本明細書で使用されるとき、核酸塩基モチーフは、核酸塩基の配列に関係なく、核酸塩基に対する修飾を記載するものである）。
【０３００】
特定の実施形態において、修飾オリゴヌクレオチドは、修飾糖を含む修飾ヌクレオシドを１つ以上含む。特定の実施形態において、修飾オリゴヌクレオチドは、修飾核酸塩基を含む修飾ヌクレオシドを１つ以上含む。特定の実施形態において、修飾オリゴヌクレオチドは、１つ以上の修飾ヌクレオシド間結合を含む。このような実施形態において、修飾オリゴヌクレオチドの修飾、非修飾及び修飾の異なる糖部分、核酸塩基及び／またはヌクレオシド間結合は、パターンまたはモチーフを確定する。特定の実施形態において、糖部分、核酸塩基及びヌクレオシド間結合のパターンは、それぞれ互いに独立している。したがって、修飾オリゴヌクレオチドは、その糖モチーフ、核酸塩基モチーフ及び／またはヌクレオシド間結合モチーフによって記載することができる（本明細書で使用されるとき、核酸塩基モチーフは、核酸塩基の配列に関係なく、核酸塩基に対する修飾を記載するものである）。
【０３０１】
１．特定の糖モチーフ
特定の実施形態において、オリゴヌクレオチドは、当該オリゴヌクレオチドまたはその領域に沿って所定のパターンまたは所定の糖モチーフで配置された、１種以上の修飾糖及び／または非修飾糖部分を含む。ある特定の場合、当該糖モチーフは、限定するものではないが、本明細書で論ずる糖修飾のうちのいずれかを含む。
【０３０２】
特定の実施形態において、修飾オリゴヌクレオチド、例えば、第１の修飾オリゴヌクレオチドは、２つの外側領域、すなわち「ウイング」と、中央領域または内側領域、すなわち「ギャップ」とを含むギャップマーモチーフを有する領域を含むか、当該領域からなる。ギャップマーモチーフの３つの領域（５’−ウイング、ギャップ及び３’−ウイング）は、連続するヌクレオシド配列を形成し、ここで、当該ウイングのそれぞれのヌクレオシドの糖部分の少なくともいくつかは、当該ギャップのヌクレオシドの糖部分の少なくともいくつかと異なる。具体的には、少なくとも、ギャップに最も近い各ウイングのヌクレオシド（５’−ウイングの最も３’側のヌクレオシド及び３’−ウイングの最も５’側のヌクレオシド）の糖部分は、隣接する、すなわち、ウイングとギャップとの間の境界（すなわち、ウイング／ギャップ境界）を画定するギャップヌクレオシドの糖部分とは異なる。特定の実施形態において、ギャップ内の糖部分は互いに同じである。特定の実施形態において、ギャップは、当該ギャップの１つ以上の他のヌクレオシドの糖部分とは異なる糖部分を有するヌクレオシドを１つ以上含む。特定の実施形態において、２つのウイングの糖モチーフは、互いに同じである（対称ギャップマー）。特定の実施形態において、５’−ウイングの糖モチーフは、３’−ウイングの糖モチーフとは異なる（非対称ギャップマー）。
【０３０３】
特定の実施形態において、ギャップマーのウイングは、１〜５個のヌクレオシドを含む。特定の実施形態において、ギャップマーのウイングは、２〜５個のヌクレオシドを含む。特定の実施形態において、ギャップマーのウイングは、３〜５個のヌクレオシドを含む。特定の実施形態において、ギャップマーのヌクレオシドは、全てが修飾ヌクレオシドである。
【０３０４】
特定の実施形態において、ギャップマーのギャップは、７〜１２個のヌクレオシドを含む。特定の実施形態において、ギャップマーのギャップは、７〜１０個のヌクレオシドを含む。特定の実施形態において、ギャップマーのギャップは、８〜１０個のヌクレオシドを含む。特定の実施形態において、ギャップマーのギャップは、１０個のヌクレオシドを含む。特定の実施形態において、ギャップマーのギャップの各ヌクレオシドは、非修飾２’−デオキシヌクレオシドである。
【０３０５】
特定の実施形態において、ギャップマーは、デオキシギャップマーである。このような実施形態において、各ウイング／ギャップ境界のギャップ側にあるヌクレオシドは、非修飾２’−デオキシヌクレオシドであり、各ウイング／ギャップ境界のウイング側にあるヌクレオシドは、修飾ヌクレオシドである。このような特定の実施形態において、ギャップの各ヌクレオシドは、非修飾２’−デオキシヌクレオシドである。このような特定の実施形態において、各ウイングの各ヌクレオシドは、修飾ヌクレオシドである。
【０３０６】
特定の実施形態において、第１の修飾オリゴヌクレオチド及び／または第２の修飾オリゴヌクレオチドは、完全に修飾された糖モチーフを有する領域を含むか、当該領域からなる。このような実施形態において、修飾オリゴヌクレオチドの完全に修飾された領域の各ヌクレオシドは、修飾糖部分を含む。このような特定の実施形態において、修飾オリゴヌクレオチド全体（第１の修飾オリゴヌクレオチド及び／または第２の修飾オリゴヌクレオチドのいずれか）に対する各ヌクレオシドは、修飾糖部分を含む。特定の実施形態において、修飾オリゴヌクレオチド（第１の修飾オリゴヌクレオチド及び／または第２の修飾オリゴヌクレオチドのいずれか）は、完全に修飾された糖モチーフを有する領域を含むか、当該領域からなり、ここで、完全に修飾された領域内の各ヌクレオシドは、同一の修飾糖部分を含み、これを、本明細書において一様に修飾された糖モチーフという。特定の実施形態において、完全に修飾されたオリゴヌクレオチドは、一様に修飾されたオリゴヌクレオチドである。特定の実施形態において、一様に修飾されたオリゴヌクレオチドの各ヌクレオシドは、同一の２’−修飾を含む。
【０３０７】
２．特定の核酸塩基モチーフ
特定の実施形態において、オリゴヌクレオチド（第１の修飾オリゴヌクレオチド及び／または第２の修飾オリゴヌクレオチドを含む）は、当該オリゴヌクレオチドまたはその領域に沿って所定のパターンまたは所定のモチーフで配置された、修飾核酸塩基及び／または非修飾核酸塩基を含む。特定の実施形態において、各核酸塩基は、修飾されている。特定の実施形態において、核酸塩基はいずれも修飾されていない。特定の実施形態において、各プリンまたは各ピリミジンが修飾されている。特定の実施形態において、各アデニンが修飾されている。特定の実施形態において、各グアニンが修飾されている。特定の実施形態において、各チミンが修飾されている。特定の実施形態において、各ウラシルが修飾されている。特定の実施形態において、各シトシンが修飾されている。特定の実施形態において、修飾オリゴヌクレオチド中のシトシン核酸塩基は、そのいくつかまたは全てが５−メチルシトシンである。
【０３０８】
特定の実施形態において、修飾オリゴヌクレオチド（例えば、第１の修飾オリゴヌクレオチドまたは第２の修飾オリゴヌクレオチド）は、修飾核酸塩基のブロックを含む。このような特定の実施形態において、ブロックは、オリゴヌクレオチドの３’末端にある。特定の実施形態において、ブロックは、オリゴヌクレオチドの３’末端の３ヌクレオシド以内にある。特定の実施形態において、ブロックは、オリゴヌクレオチドの５’末端にある。特定の実施形態において、ブロックは、オリゴヌクレオチドの５’末端の３ヌクレオシド以内にある。
【０３０９】
特定の実施形態において、ギャップマーモチーフを有するオリゴヌクレオチドは、修飾核酸塩基を含むヌクレオシドを含む。このような特定の実施形態において、修飾核酸塩基を含む１つのヌクレオシドは、ギャップマーモチーフを有するオリゴヌクレオチドの中央ギャップ中にある。このような特定の実施形態において、当該ヌクレオシドの糖部分は、２’−デオキシリボシル部分である。特定の実施形態において、修飾核酸塩基は、２−チオピリミジン及び５−プロピンピリミジンから選択される。特定の実施形態において、第１の修飾オリゴヌクレオチドは、ギャップマーモチーフを有する。特定の実施形態において、第１の修飾オリゴヌクレオチドはギャップマーモチーフを有し、第２の修飾オリゴヌクレオチドはギャップマーモチーフを有していない。特定の実施形態において、第１の修飾オリゴヌクレオチドはギャップマーモチーフを有し、第２の修飾オリゴヌクレオチドは完全に修飾されたモチーフを有する。
【０３１０】
３．特定のヌクレオシド間結合モチーフ
特定の実施形態において、オリゴヌクレオチド、例えば、第１の修飾オリゴヌクレオチド及び／または第２の修飾オリゴヌクレオチドは、当該オリゴヌクレオチドまたはその領域に沿って所定のパターンまたは所定のモチーフで配置された、修飾ヌクレオシド間結合及び／または非修飾ヌクレオシド間結合を含む。特定の実施形態において、本質的に、各ヌクレオシド間結合基は、リン酸ヌクレオシド間結合（Ｐ＝Ｏ）である。特定の実施形態において、修飾オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシド間結合基は、ホスホロチオエート（Ｐ＝Ｓ）である。特定の実施形態において、本質的に、第１の修飾オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシド間結合基は、リン酸ヌクレオシド間結合（Ｐ＝Ｏ）である。特定の実施形態において、第１の修飾オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシド間結合基は、ホスホロチオエート（Ｐ＝Ｓ）である。特定の実施形態において、本質的に、第２の修飾オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシド間結合基は、リン酸ヌクレオシド間結合（Ｐ＝Ｏ）である。特定の実施形態において、第２の修飾オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシド間結合基は、ホスホロチオエート（Ｐ＝Ｓ）である。特定の実施形態において、第１の修飾オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシド間結合基は、独立して、ホスホロチオエート及びリン酸ヌクレオシド間結合から選択される。特定の実施形態において、第２の修飾オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシド間結合基は、独立して、ホスホロチオエート及びリン酸ヌクレオシド間結合から選択される。特定の実施形態において、第１の修飾オリゴヌクレオチドの糖モチーフはギャップマーであり、ギャップ内のヌクレオシド間結合は全て修飾されている。このような特定の実施形態において、ウイング中のヌクレオシド間結合は、そのいくつかまたは全てが非修飾リン酸結合である。特定の実施形態において、末端ヌクレオシド間結合が修飾されている。
【０３１１】
Ｄ．特定の長さ
特定の実施形態において、オリゴヌクレオチド（修飾オリゴヌクレオチドを含む）は、様々な長さ範囲のいずれかを有し得る。特定の実施形態において、第１の修飾オリゴヌクレオチドは、様々な長さ範囲のいずれかを有し得る。特定の実施形態において、第２の修飾オリゴヌクレオチドは、様々な長さ範囲のいずれかを有し得る。特定の実施形態において、オリゴヌクレオチドは、Ｘ〜Ｙ個の結合されたヌクレオシドからなり、ここで、Ｘは、当該範囲の最小ヌクレオシド数を表し、Ｙは、当該範囲の最大ヌクレオシド数を表す。このような特定の実施形態において、Ｘ及びＹは、Ｘ≦Ｙの条件で、それぞれ独立して、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、２９、３０、３１、３２、３３、３４、３５、３６、３７、３８、３９、４０、４１、４２、４３、４４、４５、４６、４７、４８、４９及び５０から選択される。例えば、特定の実施形態において、オリゴヌクレオチドは、１２〜１３個、１２〜１４個、１２〜１５個、１２〜１６個、１２〜１７個、１２〜１８個、１２〜１９個、１２〜２０個、１２〜２１個、１２〜２２個、１２〜２３個、１２〜２４個、１２〜２５個、１２〜２６個、１２〜２７個、１２〜２８個、１２〜２９個、１２〜３０個、１３〜１４個、１３〜１５個、１３〜１６個、１３〜１７個、１３〜１８個、１３〜１９個、１３〜２０個、１３〜２１個、１３〜２２個、１３〜２３個、１３〜２４個、１３〜２５個、１３〜２６個、１３〜２７個、１３〜２８個、１３〜２９個、１３〜３０個、１４〜１５個、１４〜１６個、１４〜１７個、１４〜１８個、１４〜１９個、１４〜２０個、１４〜２１個、１４〜２２個、１４〜２３個、１４〜２４個、１４〜２５個、１４〜２６個、１４〜２７個、１４〜２８個、１４〜２９個、１４〜３０個、１５〜１６個、１５〜１７個、１５〜１８個、１５〜１９個、１５〜２０個、１５〜２１個、１５〜２２個、１５〜２３個、１５〜２４個、１５〜２５個、１５〜２６個、１５〜２７個、１５〜２８個、１５〜２９個、１５〜３０個、１６〜１７個、１６〜１８個、１６〜１９個、１６〜２０個、１６〜２１個、１６〜２２個、１６〜２３個、１６〜２４個、１６〜２５個、１６〜２６個、１６〜２７個、１６〜２８個、１６〜２９個、１６〜３０個、１７〜１８個、１７〜１９個、１７〜２０個、１７〜２１個、１７〜２２個、１７〜２３個、１７〜２４個、１７〜２５個、１７〜２６個、１７〜２７個、１７〜２８個、１７〜２９個、１７〜３０個、１８〜１９個、１８〜２０個、１８〜２１個、１８〜２２個、１８〜２３個、１８〜２４個、１８〜２５個、１８〜２６個、１８〜２７個、１８〜２８個、１８〜２９個、１８〜３０個、１９〜２０個、１９〜２１個、１９〜２２個、１９〜２３個、１９〜２４個、１９〜２５個、１９〜２６個、１９〜２９個、１９〜２８個、１９〜２９個、１９〜３０個、２０〜２１個、２０〜２２個、２０〜２３個、２０〜２４個、２０〜２５個、２０〜２６個、２０〜２７個、２０〜２８個、２０〜２９個、２０〜３０個、２１〜２２個、２１〜２３個、２１〜２４個、２１〜２５個、２１〜２６個、２１〜２７個、２１〜２８個、２１〜２９個、２１〜３０個、２２〜２３個、２２〜２４個、２２〜２５個、２２〜２６個、２２〜２７個、２２〜２８個、２２〜２９個、２２〜３０個、２３〜２４個、２３〜２５個、２３〜２６個、２３〜２７個、２３〜２８個、２３〜２９個、２３〜３０個、２４〜２５個、２４〜２６個、２４〜２７個、２４〜２８個、２４〜２９個、２４〜３０個、２５〜２６個、２５〜２７個、２５〜２８個、２５〜２９個、２５〜３０個、２６〜２７個、２６〜２８個、２６〜２９個、２６〜３０個、２７〜２８個、２７〜２９個、２７〜３０個、２８〜２９個、２８〜３０個、または２９〜３０個の結合されたヌクレオシドからなる。
【０３１２】
Ｅ．特定の修飾オリゴヌクレオチド
特定の実施形態において、上述の修飾（糖、核酸塩基、ヌクレオシド間結合）は、修飾オリゴヌクレオチド中に組み込まれる。特定の実施形態において、修飾オリゴヌクレオチドは、その修飾モチーフ及び全長によって特徴付けられる。特定の実施形態において、こうしたパラメータは、それぞれ互いに独立している。したがって、特に指定のない限り、ギャップマー糖モチーフを有するオリゴヌクレオチドの各ヌクレオシド間結合は、修飾されていても修飾されていなくてもよく、糖修飾のギャップマー修飾パターンに従っていても従っていなくてもよい。例えば、糖ギャップマーのウイング領域内のヌクレオシド間結合は、互いに同じであっても異なっていてもよく、糖モチーフのギャップ領域のヌクレオシド間結合と同じであっても異なっていてもよい。同様に、このような糖ギャップマーオリゴヌクレオチドは、糖修飾のギャップマーパターンに関係なく、１つ以上の修飾核酸塩基を含み得る。更に、特定の場合、オリゴヌクレオチドは、全体の長さまたは範囲及び２つ以上の領域（例えば、指定の糖修飾を有するヌクレオシドの領域）の長さまたは長さ範囲によって記載され、このような場合、指定範囲外の全長を有するオリゴヌクレオチドを生じる各範囲で数を選択することが可能なことがある。このような場合、両方の要素が満たされる必要がある。例えば、特定の実施形態において、修飾オリゴヌクレオチドは、１５〜２０個の結合されたヌクレオシドからなり、かつ３つの領域、Ａ、Ｂ及びＣからなる糖モチーフを有し、ここで、領域Ａは、指定の糖モチーフを有する２〜６個の結合されたヌクレオシドからなり、領域Ｂは、指定の糖モチーフを有する６〜１０個の結合されたヌクレオシドからなり領域Ｃは、指定の糖モチーフを有する２〜６個の結合されたヌクレオシドからなる。このような実施形態は、Ａ及びＣがそれぞれ６個の結合されたヌクレオシドからなり、Ｂが１０個の結合されたヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを含まない（ヌクレオシドの各数がＡ、Ｂ及びＣに関する要件内に許容される場合であっても）。これは、当該オリゴヌクレオチドの全長が２２であり、修飾オリゴヌクレオチド（２０）の全長の上限を超えるためである。本明細書において、オリゴヌクレオチドの説明が１つ以上のパラメータに関して記載されていない場合、かかるパラメータは限定されない。したがって、更なる記載なく、ギャップマー糖モチーフのみを有すると記載された修飾オリゴヌクレオチドは、任意の長さ、ヌクレオシド間結合モチーフ及び核酸塩基モチーフを有し得る。特に指定のない限り、全ての修飾は、核酸塩基配列に依存しない。
【０３１３】
Ｆ．核酸塩基配列
特定の実施形態において、オリゴヌクレオチド（非修飾または修飾オリゴヌクレオチド）は、その核酸塩基配列によって更に記載される。特定の実施形態において、オリゴヌクレオチドは、第２のオリゴヌクレオチドまたは標的核酸などの特定された参照核酸に相補的な核酸塩基配列を有する。このような特定の実施形態において、オリゴヌクレオチドのある領域は、第２のオリゴヌクレオチドまたは標的核酸などの特定された参照核酸に相補的な核酸塩基配列を有する。特定の実施形態において、オリゴヌクレオチドのある領域または全長の核酸塩基配列は、第２のオリゴヌクレオチドまたは標的核酸などの核酸に対して、少なくとも５０％、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％または１００％相補的である。
【０３１４】
ＩＩ．特定のオリゴマー化合物
特定の実施形態において、本発明は、オリゴヌクレオチド（修飾もしくは非修飾または第１の修飾オリゴヌクレオチドもしくは第２の修飾オリゴヌクレオチド）と、任意選択で１つ以上のコンジュゲート基及び／または末端基とからなる、オリゴマー化合物を提供する。コンジュゲート基は、１つ以上のコンジュゲート部分と、コンジュゲート部分をオリゴヌクレオチドに結合させるコンジュゲートリンカーとからなる。コンジュゲート基は、オリゴヌクレオチドの一末端もしくは両末端に結合され得、かつ／または任意の内側の位置に結合され得る。特定の実施形態において、コンジュゲート基は、修飾オリゴヌクレオチドのヌクレオシドの２’位に結合される。特定の実施形態において、オリゴヌクレオチドの一末端または両末端に結合されるコンジュゲート基は、末端基である。このような特定の実施形態において、コンジュゲート基または末端基は、オリゴヌクレオチドの３’末端及び／または５’末端に結合される。このような特定の実施形態において、コンジュゲート基（または末端基）は、オリゴヌクレオチドの３’末端に結合される。特定の実施形態において、コンジュゲート基は、オリゴヌクレオチドの３’末端近傍に結合される。特定の実施形態において、コンジュゲート基（または末端基）は、オリゴヌクレオチドの５’末端に結合される。特定の実施形態において、コンジュゲート基は、オリゴヌクレオチドの５’末端近傍に結合される。
【０３１５】
末端基の例には、コンジュゲート基、キャップ基、リン酸部分、保護基、修飾または非修飾ヌクレオシド、及び独立して修飾または非修飾である２つ以上のヌクレオシドが挙げられるが、これらに限定されない。
【０３１６】
Ａ．特定のコンジュゲート基
特定の実施形態において、オリゴヌクレオチド（第１の修飾オリゴヌクレオチドまたは第２の修飾オリゴヌクレオチドを含む）は、１つ以上のコンジュゲート基に共有結合している。特定の実施形態において、第２の修飾オリゴヌクレオチドは、１つ以上のコンジュゲート基に共有結合している。特定の実施形態において、第２の修飾オリゴヌクレオチドは１つ以上のコンジュゲート基に共有結合しており、第１の修飾オリゴヌクレオチドはコンジュゲート基に共有結合していない。特定の実施形態において、コンジュゲート基は、結合されるオリゴヌクレオチドの１つ以上の特性、限定するものではないが、薬力学、薬物動態、安定性、結合、吸収、組織分布、細胞分布、細胞取込み、電荷及びクリアランスなどの特性を変更する。特定の実施形態において、コンジュゲート基は、結合されるオリゴヌクレオチドに新しい特性を付与し、例えば、オリゴヌクレオチドの検出を可能にするフルオロフォアまたはレポーター基である。特定のコンジュゲート基及びコンジュゲート部分については、これまでに記載されており、例えば、コレステロール部分（Ｌｅｔｓｉｎｇｅｒ  ｅｔ  ａｌ．，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ，１９８９，８６，６５５３−６５５６）、コール酸（Ｍａｎｏｈａｒａｎ  ｅｔ  ａｌ．，Ｂｉｏｏｒｇ．Ｍｅｄ．Ｃｈｅｍ．Ｌｅｔｔ．，１９９４，４，１０５３−１０６０）、チオエーテル、例えば、ヘキシル−Ｓ−トリチルチオール（Ｍａｎｏｈａｒａｎ  ｅｔ  ａｌ．，Ａｎｎ．Ｎ．Ｙ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．，１９９２，６６０，３０６−３０９；Ｍａｎｏｈａｒａｎ  ｅｔ  ａｌ．，Ｂｉｏｏｒｇ．Ｍｅｄ．Ｃｈｅｍ．Ｌｅｔｔ．，１９９３，３，２７６５−２７７０）、チオコレステロール（Ｏｂｅｒｈａｕｓｅｒ  ｅｔ  ａｌ．，Ｎｕｃｌ．Ａｃｉｄｓ  Ｒｅｓ．，１９９２，２０，５３３−５３８）、脂肪族鎖、例えば、ドデカンジオール残基もしくはウンデシル残基（Ｓａｉｓｏｎ−Ｂｅｈｍｏａｒａｓ  ｅｔ  ａｌ．，ＥＭＢＯ  Ｊ．，１９９１，１０，１１１１−１１１８；Ｋａｂａｎｏｖ  ｅｔ  ａｌ．，ＦＥＢＳ  Ｌｅｔｔ．，１９９０，２５９，３２７−３３０；Ｓｖｉｎａｒｃｈｕｋ  ｅｔ  ａｌ．，Ｂｉｏｃｈｉｍｉｅ，１９９３，７５，４９−５４）、リン脂質、例えば、ヘキサデシル−ｒａｃ−グリセロールもしくはトリエチル−アンモニウム  １，２−ジ−Ｏ−ヘキサデシル−ｒａｃ−グリセロ−３−Ｈ−ホスホネ−ト（Ｍａｎｏｈａｒａｎ  ｅｔ  ａｌ．，Ｔｅｔｒａｈｅｄｒｏｎ  Ｌｅｔｔ．，１９９５，３６，３６５１−３６５４；Ｓｈｅａ  ｅｔ  ａｌ．，Ｎｕｃｌ．Ａｃｉｄｓ  Ｒｅｓ．，１９９０，１８，３７７７−３７８３）、ポリアミンもしくはポリエチレングリコール鎖（Ｍａｎｏｈａｒａｎ  ｅｔ  ａｌ．，Ｎｕｃｌｅｏｓｉｄｅｓ＆Ｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅｓ，１９９５，１４，９６９−９７３）またはアダマンタン酢酸、パルミチル部分（Ｍｉｓｈｒａ  ｅｔ  ａｌ．，Ｂｉｏｃｈｉｍ．Ｂｉｏｐｈｙｓ．Ａｃｔａ，１９９５，１２６４，２２９−２３７）、オクタデシルアミンもしくはヘキシルアミノ−カルボニル−オキシコレステロール部分（Ｃｒｏｏｋｅ  ｅｔ  ａｌ．，Ｊ．Ｐｈａｒｍａｃｏｌ．Ｅｘｐ．Ｔｈｅｒ．，１９９６，２７７，��２３−９３７）、トコフェロール基（Ｎｉｓｈｉｎａ  ｅｔ  ａｌ．，Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｔｈｅｒａｐｙ  Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄｓ，２０１５，４，ｅ２２０；及びＮｉｓｈｉｎａ  ｅｔ  ａｌ．，Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｔｈｅｒａｐｙ，２００８，１６，７３４−７４０）またはＧａｌＮＡｃクラスター（例えば、ＷＯ２０１４／１７９６２０）がある。
【０３１７】
１．コンジュゲート部分
コンジュゲート部分には、限定するものではないが、インターカレーター、レポーター分子、ポリアミン、ポリアミド、ペプチド、炭水化物、ビタミン部分、ポリエチレングリコール、チオエーテル、ポリエーテル、コレステロール、チオコレステロール、コール酸部分、葉酸、脂質、リン脂質、ビオチン、フェナジン、フェナントリジン、アントラキノン、アダマンタン、アクリジン、フルオレセイン、ローダミン、クマリン、フルオロフォア及び色素が含まれる。
【０３１８】
特定の実施形態において、コンジュゲート部分は、有効な薬剤物質、例えば、アスピリン、ワルファリン、フェニルブタゾン、イブプロフェン、スプロフェン、フェンブフェン、ケトプロフェン、（Ｓ）−（＋）−プラノプロフェン、カルプロフェン、ダンシルサルコシン、２，３，５−トリヨード安息香酸、フィンゴリモド、フルフェナム酸、フォリン酸、ベンゾチアジアジド、クロロチアジド、ジアゼピン、インドメチシン、バルビツール酸系薬、セファロスポリン、サルファ薬、抗糖尿病薬、抗菌性物質または抗生物質を含む。
【０３１９】
２．コンジュゲートリンカー
コンジュゲート部分は、コンジュゲートリンカーを介してオリゴヌクレオチドに結合している。特定のオリゴマー化合物において、コンジュゲートリンカーは、単一の化学結合である（すなわち、コンジュゲート部分は、単結合を介してオリゴヌクレオチドに直接結合している）。特定の実施形態において、コンジュゲートリンカーは、ヒドロカルビル鎖などの鎖構造、またはエチレングリコール、ヌクレオシドもしくはアミノ酸単位などの反復単位のオリゴマーを含む。
【０３２０】
特定の実施形態において、コンジュゲートリンカーは、アルキル、アミノ、オキソ、アミド、ジスルフィド、ポリエチレングリコール、エーテル、チオエーテル及びヒドロキシルアミノから選択される１つ以上の基を含む。このような特定の実施形態において、コンジュゲートリンカーは、アルキル基、アミノ基、オキソ基、アミド基及びエーテル基から選択される基を含む。特定の実施形態において、コンジュゲートリンカーは、アルキル基及びアミド基から選択される基を含む。特定の実施形態において、コンジュゲートリンカーは、アルキル基及びエーテル基から選択される基を含む。特定の実施形態において、コンジュゲートリンカーは、少なくとも１つのリン部分を含む。特定の実施形態において、コンジュゲートリンカーは、少なくとも１つのリン酸基を含む。特定の実施形態において、コンジュゲートリンカーは、少なくとも１つの中性コンジュゲート基を含む。
【０３２１】
特定の実施形態において、上述したコンジュゲートリンカーを含むコンジュゲートリンカーは、二官能性結合部分であり、例えば、本明細書で提供されるオリゴヌクレオチドなどの親化合物にコンジュゲート基を付加するのに有用であることが当該技術分野において知られているものである。一般に、二官能性結合部分は、少なくとも２つの官能基を含む。官能基の一方は、親化合物上の特定の部位に結合するように選択され、他方は、コンジュゲート基に結合するように選択される。二官能性結合部分に使用される官能基の例には、求核性基と反応する求電子剤及び求電子性基と反応する求核剤が挙げられるが、これらに限定されない。特定の実施形態において、二官能性結合部分は、アミノ、ヒドロキシル、カルボン酸、チオール、アルキル、アルケニル及びアルキニルから選択される１つ以上の基を含む。
【０３２２】
コンジュゲートリンカーの例には、ピロリジン、８−アミノ−３，６−ジオキサオクタン酸（ＡＤＯ）、４−（Ｎ−マレイミドメチル）シクロヘキサン−１−カルボン酸スクシンイミジル（ＳＭＣＣ）及び６−アミノヘキサン酸（ＡＨＥＸまたはＡＨＡ）が挙げられるが、これらに限定されない。他のコンジュゲートリンカーには、限定するものではないが、置換もしくは無置換Ｃ１〜Ｃ１０アルキル、置換もしくは無置換Ｃ２〜Ｃ１０アルケニル、または置換もしくは無置換Ｃ２〜Ｃ１０アルキニルが含まれ、ここで、好ましい置換基の非限定的なリストには、ヒドロキシル、アミノ、アルコキシ、カルボキシ、ベンジル、フェニル、ニトロ、チオール、チオアルコキシ、ハロゲン、アルキル、アリール、アルケニル及びアルキニルが含まれる。
【０３２３】
特定の実施形態において、コンジュゲートリンカーは、１〜１０個のリンカーヌクレオシドを含む。特定の実施形態において、コンジュゲートリンカーは、２〜５個のリンカーヌクレオシドを含む。特定の実施形態において、コンジュゲートリンカーは、正確に３個のリンカーヌクレオシドを含む。特定の実施形態において、コンジュゲートリンカーは、ＴＣＡモチーフを含む。特定の実施形態において、当該リンカーヌクレオシドは、修飾ヌクレオシドである。特定の実施形態において、当該リンカーヌクレオシドは、修飾糖部分を含む。特定の実施形態において、リンカーヌクレオシドは、非修飾である。特定の実施形態において、リンカーヌクレオシドは、プリン、置換プリン、ピリミジンまたは置換ピリミジンから選択される、任意に保護された複素環式塩基を含む。特定の実施形態において、切断可能部分は、ウラシル、チミン、シトシン、４−Ｎ−ベンゾイルシトシン、５−メチルシトシン、４−Ｎ−ベンゾイル−５−メチル−シトシン、アデニン、６−Ｎ−ベンゾイルアデニン、グアニン及び２−Ｎ−イソブチリルグアニンから選択されるヌクレオシドである。リンカーヌクレオシドは、標的組織に到達した後にオリゴマー化合物から切断されるのが通常望ましい。したがって、リンカーヌクレオシドは、典型的に、互いに結合され、かつ切断可能な結合を介してオリゴマー化合物の残りの部分に結合している。特定の実施形態において、このような切断可能な結合は、ホスホジエステル結合である。
【０３２４】
本明細書中、リンカーヌクレオシドは、オリゴヌクレオチドの一部とはみなされない。したがって、オリゴマー化合物が、指定数もしくは指定範囲の結合されたヌクレオシド及び／または参照核酸に対する指定の相補性パーセントからなるオリゴヌクレオチドを含み、また、オリゴマー化合物が、リンカーヌクレオシドを含むコンジュゲートリンカーを含むコンジュゲート基を含む、実施形態において、これらのリンカーヌクレオシドは、オリゴヌクレオチドの長さには算入されず、参照核酸に対するオリゴヌクレオチドの相補性パーセントを決定する際には使用されない。例えば、オリゴマー化合物は、（１）８〜３０個のヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドと、（２）修飾オリゴヌクレオチドのヌクレオシドに連続する１〜１０個のリンカーヌクレオシドを含むコンジュゲート基とを含み得る。このようなオリゴマー化合物中の連続する結合されたヌクレオシドの総数は、３０を超える。あるいは、オリゴマー化合物は、８〜３０個のヌクレオシドからなるオリゴヌクレオチドを含み得、コンジュゲート基を含まない。このようなオリゴマー化合物中の連続する結合されたヌクレオシドの総数は、３０以下である。特に指示がない限り、コンジュゲートリンカーは、１０個以下のリンカーヌクレオシドを含む。特定の実施形態において、コンジュゲートリンカーは、５個以下のリンカーヌクレオシドを含む。特定の実施形態において、コンジュゲートリンカーは、３個以下のリンカーヌクレオシドを含む。特定の実施形態において、コンジュゲートリンカーは、２個以下のリンカーヌクレオシドを含む。特定の実施形態において、コンジュゲートリンカーは、１個以下のリンカーヌクレオシドを含む。
【０３２５】
特定の実施形態において、コンジュゲート基がオリゴヌクレオチドから切断されるのが望ましい。例えば、特定の場合において、特定のコンジュゲート部分を含むオリゴマー化合物は、特定の細胞型によって良好に取り込まれるが、オリゴマー化合物が取り込まれた際には、コンジュゲート基が切断されて、コンジュゲートされていないオリゴヌクレオチドまたは親オリゴヌクレオチドを放出することが望ましい。したがって、特定のコンジュゲートリンカーは、１つ以上の切断可能部分を含み得る。特定の実施形態において、切断可能部分は、切断可能な結合である。特定の実施形態において、切断可能部分は、少なくとも１つの切断可能な結合を含む原子団である。特定の実施形態において、切断可能部分は、１、２、３、４または４つ以上の切断可能な結合を有する原子団を含む。特定の実施形態において、切断可能部分は、細胞内部またはリソソームなどの細胞内区画内部で、選択的に切断される。特定の実施形態において、切断可能部分は、ヌクレアーゼなどの内因性酵素によって選択的に分解される。
【０３２６】
特定の実施形態において、切断可能な結合は、アミド、エステル、エーテル、ホスホジエステルの一方もしくは両方のエステル、リン酸エステル、カルバメートまたはジスルフィドから選択される。特定の実施形態において、切断可能な結合は、ホスホジエステルの一方もしくは両方のエステルである。特定の実施形態において、切断可能部分は、リン酸またはホスホジエステルを含む。特定の実施形態において、切断可能部分は、オリゴヌクレオチドとコンジュゲート部分またはコンジュゲート基との間のリン酸結合である。
【０３２７】
特定の実施形態において、切断可能部分は、１つ以上のリンカーヌクレオシドを含むか、それらからなる。このような特定の実施形態において、１つ以上のリンカーヌクレオシドは、互いに結合され、かつ／または切断可能な結合を介してオリゴマー化合物の残りの部分に結合している。特定の実施形態において、このような切断可能な結合は、非修飾ホスホジエステル結合である。特定の実施形態において、切断可能部分は、リン酸ヌクレオシド間結合によってオリゴヌクレオチドの３’末端または５’末端ヌクレオシドのいずれかに結合され、かつリン酸またはホスホロチオエート結合によって残りのコンジュゲートリンカーまたはコンジュゲート部分に共有結合された、２’−デオキシヌクレオシドである。このような特定の実施形態において、切断可能部分は、２’−デオキシアデノシンである。
【０３２８】
ＩＩＩ．特定のアンチセンス化合物
特定の実施形態において、本発明は、標的核酸の核酸塩基配列に相補的な核酸塩基配列を有するアンチセンスオリゴヌクレオチドを含むオリゴマー化合物を含むか、それらからなる、アンチセンス化合物を提供する。特定の実施形態において、アンチセンス化合物は、一本鎖である。このような一本鎖アンチセンス化合物は、典型的に、修飾オリゴヌクレオチドと、任意選択でコンジュゲート基とを含むか、それらからなる、オリゴマー化合物を含むか、それらからなる。特定の実施形態において、アンチセンス化合物は、二本鎖である。このような二本鎖アンチセンス化合物は、標的核酸に相補的な領域を有する第１のオリゴマー化合物と、第１のオリゴマー化合物に相補的な領域を有する第２のオリゴマー化合物とを含む。このような二本鎖アンチセンス化合物の第１のオリゴマー化合物は、典型的に、修飾オリゴヌクレオチドと、任意選択でコンジュゲート基とを含むか、それらからなる。このような二本鎖アンチセンス化合物の第２のオリゴマー化合物のオリゴヌクレオチドは、修飾されていても修飾されていなくてもよい。二本鎖アンチセンス化合物のオリゴマー化合物は、その一方または両方がコンジュゲート基を含み得る。二本鎖アンチセンス化合物のオリゴマー化合物は、非相補的なオーバーハングヌクレオシドを含み得る。
【０３２９】
特定の実施形態において、アンチセンス化合物のオリゴマー化合物は、標的核酸にハイブリダイズすることができ、その結果、少なくとも１つのアンチセンス活性が生じる。特定の実施形態において、アンチセンス化合物は、１つ以上の標的核酸に選択的に作用する。このような選択的アンチセンス化合物は、１つ以上の標的核酸にハイブリダイズして、その結果１つ以上の所望のアンチセンス活性をもたらし、かつ１つ以上の非標的核酸にハイブリダイズしないまたは極めて望ましくないアンチセンス活性を生じるような形で１つ以上の非標的核酸にハイブリダイズしない核酸塩基配列を含む。
【０３３０】
特定のアンチセンス活性において、アンチセンス化合物の標的核酸へのハイブリダイゼーションは、標的核酸を切断するタンパク質の動員をもたらす。例えば、特定のアンチセンス化合物は、ＲＮａｓｅ  Ｈが媒介する標的核酸の切断をもたらす。ＲＮａｓｅ  Ｈは、ＲＮＡ：ＤＮＡ二本鎖のＲＮＡ鎖を切断する細胞エンドヌクレアーゼである。かかるＲＮＡ：ＤＮＡ二本鎖中のＤＮＡは、非修飾ＤＮＡである必要はない。特定の実施形態において、本発明は、ＲＮａｓｅ  Ｈ活性を誘起するのに十分に「ＤＮＡ様」であるアンチセンス化合物を提供する。更に、特定の実施形態において、ギャップマーのギャップ中の１つ以上の非ＤＮＡ様ヌクレオシドは、許容される。
【０３３１】
特定のアンチセンス活性において、アンチセンス化合物またはアンチセンス化合物の一部は、ＲＮＡ誘導サイレンシング複合体（ＲＩＳＣ）中に組み込まれ、最終的に標的核酸の切断をもたらす。例えば、特定のアンチセンス化合物は、アルゴノートによる標的核酸の切断をもたらす。ＲＩＳＣ中に組み込まれるアンチセンス化合物は、ＲＮＡｉ化合物である。ＲＮＡｉ化合物は、二本鎖（ｓｉＲＮＡ）または一本鎖（ｓｓＲＮＡ）であってよい。
【０３３２】
特定の実施形態において、アンチセンス化合物の標的核酸へのハイブリダイゼーションは、標的核酸を切断するタンパク質の動員をもたらさない。このような特定の実施形態において、アンチセンス化合物の標的核酸へのハイブリダイゼーションは、標的核酸のスプライシングを変化させる。特定の実施形態において、アンチセンス化合物の標的核酸へのハイブリダイゼーションは、標的核酸とタンパク質または他の核酸との間の結合相互作用の阻害をもたらす。このような特定の実施形態において、アンチセンス化合物の標的核酸へのハイブリダイゼーションは、標的核酸の翻訳を変化させる。
【０３３３】
アンチセンス活性は、直接的または間接的に観察することができる。特定の実施形態において、アンチセンス活性の観察または検出は、標的核酸もしくは当該標的核酸によってコードされているタンパク質の量の変化、核酸のスプライスバリアントもしくはタンパク質の比率の変化、及び／または細胞もしくは動物における表現型の変化に関する観察または検出を含む。
【０３３４】
ＩＶ．特定の二本鎖
特定の実施形態において、本発明は、第１の修飾オリゴヌクレオチドを含む第１のオリゴマー化合物と、第２のオリゴヌクレオチドを含む第２のオリゴマー化合物とを含む二本鎖を提供し、ここで、第１及び第２の修飾オリゴヌクレオチドは、二本鎖を形成するのに十分な相補性のある領域を含む。このような特定の実施形態において、第１の修飾オリゴヌクレオチドは、標的核酸に相補的である。このような特定の実施形態において、第１の修飾オリゴヌクレオチドは、上述したようなギャップマーである。したがって、このような実施形態において、第１のオリゴマー化合物は、標的核酸にハイブリダイズし、ＲＮａｓｅ  Ｈによる標的核酸の切断を引き起こすことができる。このような特定の実施形態において、第２のオリゴマー化合物は、第１のオリゴマー化合物の特性を、第２のオリゴマー化合物がない場合の特性と比較して、改善する。特定の実施形態において、この改善される特性は、標的組織への分布、標的細胞中への取込み、効力及び有効性のうちの１つ以上である。特定の実施形態において、標的組織は、肝臓（肝）である。特定の実施形態において、標的組織は、肝臓以外（肝外）である。特定の実施形態において、２つ以上の組織で標的を減少させるのが望ましい。このような特定の実施形態において、肝臓及び１つ以上の他の組織で標的を減少させるのが望ましい。特定の実施形態において、２つ以上の肝外組織で標的を減少させるのが望ましい。
【０３３５】
特定の実施形態において、二本鎖の第１のオリゴヌクレオチドは、ギャップマーである。このような特定の実施形態において、ギャップマーのウイングは、２’−ＭＯＥ修飾ヌクレオシドを含む。特定の実施形態において、ギャップマーのウイングは、ｃＥｔヌクレオシドを含む。特定の実施形態において、ギャップマーのウイングは、ＬＮＡヌクレオシドを含む。特定の実施形態において、ギャップマーのウイングは、少なくとも１つの２’−ＭＯＥ修飾ヌクレオシド及び少なくとも１つの二環式ヌクレオシドを含む。このような特定の実施形態において、このような二環式ヌクレオシドのそれぞれは、ＬＮＡヌクレオシド及びｃＥｔヌクレオシドから選択される。特定の実施形態において、ギャップは、７〜１０個の２’−デオキシヌクレオシドから構成される。
【０３３６】
特定の実施形態において、第２のオリゴヌクレオチドは、少なくとも１つの２’−ＭＯＥヌクレオシドを含む。特定の実施形態において、第２のオリゴヌクレオチドは、２’−ＭＯＥ及び２’−デオキシヌクレオシドを含む。特定の実施形態において、第２のオリゴヌクレオチドは、交互修飾タイプ（修飾なしを含む）の糖モチーフを有する。このような特定の実施形態において、第２のオリゴヌクレオチドの糖モチーフは、２’−ＭＯＥヌクレオシドと２’−デオキシヌクレオシドの交互の繰り返しである。特定の実施形態において、第２のオリゴヌクレオチドは、標的核酸の切断を引き起こさない点を除いて、ギャップマー（上述のもの）と類似の糖モチーフを有する。このようなギャップマー様モチーフは、中央領域と、それに隣接するウイング領域を有する。このような特定の実施形態において、中央領域は２’−デオキシヌクレオシドを含み、ウイング領域は２’−ＭＯＥ修飾ヌクレオシドを含む。第２のオリゴヌクレオチドのヌクレオシド間結合は、修飾されていてもよいし、ホスホジエステルであってもよい。特定の実施形態において、第２のオリゴヌクレオチドのヌクレオシド間結合は、ギャップマー様モチーフ（ホスホロチオエートウイング及び中央のホスホジエステル）に従う。このようなヌクレオシド間結合モチーフは、糖モチーフに従っても従わなくてもよい。ＲＮＡを含む中央領域を有する第２のオリゴヌクレオチドを含む第２のオリゴマー化合物を含む二本鎖は、本明細書において、活性の向上を示すが（第１のオリゴマー化合物単独及び二本鎖でないものと比較して）、このようなＲＮＡ含有オリゴヌクレオチドは、修飾ヌクレオシドまたはＤＮＡヌクレオシドを含むオリゴヌクレオチドと比較したとき、製造費用が高く、相対的に不安定であることに留意されたい。
【０３３７】
特定の実施形態において、第１及び第２のオリゴマー化合物のうちの少なくとも１つは、コンジュゲート基（上述のもの）を含む。典型的に、第２のオリゴマー化合物は、コンジュゲート基を含む。コンジュゲート基は、オリゴマー化合物のどちらの末端に結合されてもよい。特定の実施形態において、コンジュゲート基は、両末端に結合される。
【０３３８】
Ｖ．特定の標的核酸
特定の実施形態において、アンチセンス化合物は、標的核酸に相補的な領域を含むオリゴヌクレオチドを含むか、それらからなる。特定の実施形態において、標的核酸は、内因性ＲＮＡ分子である。特定の実施形態において、標的核酸は、タンパク質をコードする。このような特定の実施形態において、標的核酸は、ｍＲＮＡ及びｐｒｅ−ｍＲＮＡ（イントロン、エクソン及び非翻訳領域を含む）から選択される。特定の実施形態において、標的ＲＮＡは、ｍＲＮＡである。特定の実施形態において、標的核酸は、ｐｒｅ−ｍＲＮＡである。このような特定の実施形態において、標的領域は、完全にイントロン内に存在する。特定の実施形態において、標的領域は、イントロン／エクソン境界にまたがる。特定の実施形態において、標的領域は、少なくとも５０％がイントロン内に存在する。
【０３３９】
特定の実施形態において、標的核酸は、非コードＲＮＡである。このような特定の実施形態において、標的非コードＲＮＡは、長鎖非コードＲＮＡ、短鎖非コードＲＮＡ、イントロンＲＮＡ分子、ｓｎｏＲＮＡ、ｓｃａＲＮＡ、ｍｉｃｒｏＲＮＡ（ｐｒｅ−ｍｉｃｒｏＲＮＡ及び成熟ｍｉｃｒｏＲＮＡ）、リボソームＲＮＡ及びプロモーター指向性ＲＮＡから選択される。特定の実施形態において、標的核酸は、成熟ｍＲＮＡ以外の核酸である。特定の実施形態において、標的核酸は、成熟ｍＲＮＡまたはｍｉｃｒｏＲＮＡ以外の核酸である。特定の実施形態において、標的核酸は、ｍｉｃｒｏＲＮＡ以外の非コードＲＮＡである。特定の実施形態において、標的核酸は、ｍｉｃｒｏＲＮＡ以外の非コードＲＮＡまたはｐｒｅ−ｍＲＮＡのイントロン領域である。特定の実施形態において、標的核酸は、長鎖非コードＲＮＡである。特定の実施形態において、標的核酸は、他のｐｒｅ−ｍＲＮＡのスプライシングに関連する非コードＲＮＡである。特定の実施形態において、標的核酸は、核内保持非コードＲＮＡである。
【０３４０】
特定の実施形態において、本明細書に記載のアンチセンス化合物は、一塩基多型（ＳＮＰ）を含む標的核酸に相補的である。このような特定の実施形態において、アンチセンス化合物は、ＳＮＰ含有標的核酸の１つのアレルの発現を、別のアレルの調節よりも大きくまたは小さくなるように調節することができる。特定の実施形態において、アンチセンス化合物は、（ＳＮＰ）含有標的核酸に一塩基多型部位でハイブリダイズする。
【０３４１】
特定の実施形態において、アンチセンス化合物は、２つ以上の標的核酸に少なくとも部分的に相補的である。例えば、本発明のアンチセンス化合物は、ｍｉｃｒｏＲＮＡ模倣体であり得、典型的に複数の標的に結合する。
【０３４２】
Ａ．標的核酸に対する相補性／ミスマッチ
特定の実施形態において、アンチセンス化合物は、そのオリゴヌクレオチドの全長にわたって、標的核酸に相補的なアンチセンスオリゴヌクレオチドを含む。特定の実施形態において、このようなオリゴヌクレオチドは、標的核酸に対して９９％相補的である。特定の実施形態において、このようなオリゴヌクレオチドは、標的核酸に対して９５％相補的である。特定の実施形態において、このようなオリゴヌクレオチドは、標的核酸に対して９０％相補的である。特定の実施形態において、このようなオリゴヌクレオチドは、標的核酸に対して８５％相補的である。特定の実施形態において、このようなオリゴヌクレオチドは、標的核酸に対して８０％相補的である。特定の実施形態において、アンチセンスオリゴヌクレオチドは、そのオリゴヌクレオチドの全長にわたって、標的核酸に対して少なくとも８０％相補的であり、標的核酸に対して１００％または完全に相補的な領域を含む。このような特定の実施形態において、完全な相補性の領域は、６〜２０個の長さの核酸塩基である。このような特定の実施形態において、完全な相補性の領域は、１０〜１８個の長さの核酸塩基である。このような特定の実施形態において、完全な相補性の領域は、１８〜２０個の長さの核酸塩基である。
【０３４３】
特定の実施形態において、アンチセンス化合物のオリゴマー化合物は、標的核酸に対して１つ以上のミスマッチ核酸塩基を含む。このような特定の実施形態において、標的に対するアンチセンス活性は、このようなミスマッチによって低減されるが、非標的に対する活性は、大きく低減される。したがって、このような特定の実施形態において、アンチセンス化合物の選択性が改善される。特定の実施形態において、ミスマッチは、ギャップマーモチーフを有するオリゴヌクレオチド内に特異的に配置される。このような特定の実施形態において、ミスマッチは、ギャップ領域の５’末端から１、２、３、４、５、６、７または８の位置にある。このような特定の実施形態において、ミスマッチは、ギャップ領域の３’末端から９、８、７、６、５、４、３、２、１の位置にある。このような特定の実施形態において、ミスマッチは、ウイング領域の５’末端から１、２、３または４の位置にある。このような特定の実施形態において、ミスマッチは、ウイング領域の３’末端から４、３、２または１の位置にある。
【０３４４】
Ｂ．特定の組織の特定の標的核酸
特定の実施形態において、アンチセンス化合物は、標的核酸に相補的な領域を含むオリゴヌクレオチドを含むか、それらからなり、ここで、標的核酸は、肝外組織で発現する。肝外組織には、骨格筋、心筋、平滑筋、脂肪、白色脂肪、脾臓、骨、腸、副腎、精巣、卵巣、膵臓、下垂体、前立腺、皮膚、子宮、膀胱、脳、糸球体、遠位尿細管上皮、乳房、肺、心臓、腎臓、神経節、前頭皮質、脊髄、三叉神経節、座骨神経、後根神経節、副睾丸脂肪、横隔膜、膵臓及び結腸が挙げられるが、これらに限定されない。
【０３４５】
Ａ．特定の第１の修飾オリゴヌクレオチド
特定の実施形態において、特定の核酸標的を標的にするように設計された第１の修飾オリゴヌクレオチドが本明細書で開示される。以下の表Ａ及びＢは、特定の核酸転写産物に対して標的化された特定の修飾オリゴヌクレオチドについて記載する。以下の表Ａ及びＢ中、下付き文字「ｓ」はホスホロチオエートヌクレオシド間結合を表し、下付き文字「ｏ」はリン酸ヌクレオシド間結合を表し、下付き文字「ｄ」は２’−デオキシヌクレオシドを表し、下付き文字「ｅ」は２’−ＭＯＥ修飾ヌクレオシドを表し、下付き文字「ｋ」はｃＥｔ修飾ヌクレオシドを表す。以下の表Ａ及びＢ中、Ｃの前の上付き文字「ｍ」は、５−メチルシステインを表す。
【表１Ａ】
2018528783.tif 000009
【表１Ｂ】
2018528783.tif 000010
上に提供される第１の修飾オリゴヌクレオチドは、第２のオリゴマー化合物の第２の修飾オリゴヌクレオチドと対合して、二本鎖を形成することができる。
【０３４６】
Ｉ．特定の医薬組成物
特定の実施形態において、本発明は、１つ以上のアンチセンス化合物またはその塩を含む医薬組成物を提供する。このような特定の実施形態において、医薬組成物は、好適な薬学的に許容される希釈剤または担体を含む。特定の実施形態において、医薬組成物は、滅菌生理食塩液及び１つ以上のアンチセンス化合物を含む。特定の実施形態において、かかる医薬組成物は、滅菌生理食塩液及び１つ以上のアンチセンス化合物からなる。特定の実施形態において、滅菌生理食塩水は、医薬品等級の生理食塩水である。特定の実施形態において、医薬組成物は、１つ以上のアンチセンス化合物及び滅菌水を含む。特定の実施形態において、医薬組成物は、１つのアンチセンス化合物及び滅菌水からなる。特定の実施形態において、滅菌水は、医薬品等級の水である。特定の実施形態において、医薬組成物は、１つ以上のアンチセンス化合物及びリン酸緩衝生理食塩水（ＰＢＳ）を含む。特定の実施形態において、医薬組成物は、１つ以上のアンチセンス化合物及び滅菌ＰＢＳからなる。特定の実施形態において、滅菌ＰＢＳは、医薬品等級のＰＢＳである。
【０３４７】
特定の実施形態において、医薬組成物は、１つ以上のアンチセンス化合物と、１つ以上の賦形剤とを含む。このような特定の実施形態において、賦形剤は、水、食塩水、アルコール、ポリエチレングリコール、ゼラチン、ラクトース、アミラーゼ、ステアリン酸マグネシウム、タルク、ケイ酸、粘性パラフィン、ヒドロキシメチルセルロース及びポリビニルピロリドンから選択される。
【０３４８】
特定の実施形態において、アンチセンス化合物は、医薬組成物または製剤の調製のために、薬学的に許容される活性物質及び／または不活性物質と混合され得る。医薬組成物を製するための組成物及び方法は、限定するものではないが、投与経路、疾患の程度または投与される用量を含む、多くの基準に依存する。
【０３４９】
特定の実施形態において、アンチセンス化合物を含む医薬組成物は、アンチセンス化合物の任意の薬学的に許容される塩、アンチセンス化合物のエステル、または当該エステルの塩を包含する。ある特定の実施形態において、１つ以上のアンチセンスオリゴヌクレオチドを含むアンチセンス化合物を含む医薬組成物は、ヒトを含む動物に投与すると、生物学的に活性な代謝産物またはその残基を（直接的または間接的に）もたらすことができる。したがって、例えば、本開示はまた、アンチセンス化合物の薬学的に許容される塩、プロドラッグ、当該プロドラッグの薬学的に許容される塩及び他の生物学的同等物に関する。好適な薬学的に許容される塩には、ナトリウム塩及びカリウム塩が挙げられるが、これらに限定されない。特定の実施形態において、プロドラッグは、オリゴヌクレオチドに結合されたコンジュゲート基を１つ以上含み、当該コンジュゲート基は、体内で内因性ヌクレアーゼによって切断される。
【０３５０】
脂質部分は、種々の方法で核酸療法に使用されている。このような特定の方法において、アンチセンス化合物などの核酸は、カチオン性脂質と中性脂質の混合物からなる予め形成されたリポソームまたはリポプレックス中に組み込まれる。特定の方法において、モノカチオン性脂質またはポリカチオン性脂質を含むＤＮＡ複合体は、中性脂質の存在なしで形成される。特定の実施形態において、脂質部分は、特定の細胞または組織への薬剤の分布を増大するために選択される。特定の実施形態において、脂質部分は、脂肪組織への薬剤の分布を増大するために選択される。特定の実施形態において、脂質部分は、筋肉組織への薬剤の分布を増大するために選択される。
【０３５１】
特定の実施形態において、医薬組成物は、送達系を含む。送達系の例には、リポソーム及びエマルジョンが挙げられるが、これらに限定されない。特定の送達系は、疎水性化合物を含む医薬組成物などの特定の医薬組成物を調製するのに有用である。特定の実施形態において、ジメチルスルホキシドなどの特定の有機溶媒が使用される。
【０３５２】
特定の実施形態において、医薬組成物は、１つ以上の本発明の薬剤を特定の組織または細胞型に送達するように設計された１つ以上の組織特異的送達分子を含む。例えば、特定の実施形態において、医薬組成物は、組織特異的抗体で被覆されたリポソームを含む。
【０３５３】
特定の実施形態において、医薬組成物は、共溶媒系を含む。このような共溶媒系のいくつかは、例えば、ベンジルアルコール、非極性界面活性剤、水混和性有機ポリマー及び水相を含む。特定の実施形態において、このような共溶媒系は、疎水性化合物に使用される。このような共溶媒系の非限定的な例は、ＶＰＤ共溶媒系であり、これは、３％ｗ／ｖのベンジルアルコール、８％ｗ／ｖの非極性界面活性剤Ｐｏｌｙｓｏｒｂａｔｅ  ８０（商標）及び６５％ｗ／ｖのポリエチレングリコール３００を含む無水エタノール溶液である。このような共溶媒系の比率は、その溶解性及び毒性の特徴を著しく変更することなく、大きく変えることができる。更に、共溶媒の構成成分の性質を変えてもよく、例えば、Ｐｏｌｙｓｏｒｂａｔｅ  ８０（商標）の代わりに他の界面活性剤を使用することができ、ポリエチレングリコールの分画サイズを変更することができ、ポリエチレングリコールを他の生体適合性ポリマー、例えば、ポリビニルピロリドンに置き換えることができ、デキストロースの代わりに他の糖または多糖を用いることができる。
【０３５４】
特定の実施形態において、医薬組成物は、経口投与用に調製される。特定の実施形態において、医薬組成物は、頬側投与用に調製される。特定の実施形態において、医薬組成物は、注射（例えば、静脈内、皮下、筋肉内など）による投与用に調製される。このような特定の実施形態において、医薬組成物は、担体を含み、水などの水溶液、またはハンクス液、リンゲル液もしくは生理食塩緩衝液などの生理学的に適合性のある緩衝液で製剤化される。特定の実施形態において、他の成分が含まれる（例えば、溶解を助ける成分または防腐剤の役目を果たす成分）。特定の実施形態において、適切な液体担体、懸濁化剤などを使用して、注射可能な懸濁液が調製される。特定の注射用医薬組成物は、単位剤形、例えば、アンプルで提供されるか、多回投与容器で提供される。特定の注射用医薬組成物は、油性または水性ビヒクル中の懸濁液、溶液または乳濁液であり、懸濁化剤、安定化剤及び／または分散剤などの調合剤を含有し得る。注射用医薬組成物における使用に好適な特定の溶媒には、親油性溶媒及びゴマ油などの脂肪油、オレイン酸エチルまたはトリグリセリドなどの合成脂肪酸エステル、及びリポソームが含まれるが、これらに限定されない。注射用水性懸濁液が含まれ得る。
【０３５５】
非限定的な開示と参照による援用
本明細書で列挙される文献及び特許公開のそれぞれは、その全体が参照により本明細書に援用される。
【０３５６】
本明細書に記載される特定の化合物、組成物及び方法について、特定の実施形態に従って具体的に説明してきたが、以下の実施例は、本明細書に記載の化合物を例示するためにのみ提供するものであり、同化合物を限定するものではない。本出願で言及される参照文献及びＧｅｎＢａｎｋアクセッション番号などの各々は、その全体が参照により本明細書に援用される。
【０３５７】
本出願に添付する配列表は、必要に応じて、各配列を「ＲＮＡ」または「ＤＮＡ」のいずれかとして特定するが、実際には、これらの配列は、任意の組み合わせの化学修飾で修飾され得る。当業者であれば、修飾オリゴヌクレオチドを記述するための「ＲＮＡ」または「ＤＮＡ」という名称は、場合により、任意的であることを容易に認識するであろう。例えば、２’−ＯＨ糖部分及びチミン塩基を含むヌクレオシドを含むオリゴヌクレオチドは、修飾糖（ＤＮＡの１つの２’−Ｈの代わりに２’−ＯＨ）を有するＤＮＡまたは修飾塩基（ＲＮＡのウラシルの代わりにチミン（メチル化ウラシル））を有するＲＮＡと記述することができる。したがって、本明細書に記載される核酸配列は、限定するものではないが、配列表中のものを含め、天然または修飾ＲＮＡ及び／またはＤＮＡの任意の組み合わせを含有する核酸、例えば、限定するものではないが、修飾核酸塩基を有する核酸などを包含することが意図される。更なる例として、限定するものではないが、核酸塩基配列「ＡＴＣＧＡＴＣＧ」を有するオリゴマー化合物は、修飾または非修飾にかかわらず、当該核酸塩基配列を有するあらゆるオリゴマー化合物を包含し、限定するものではないが、ＲＮＡ塩基を含む化合物、例えば配列「ＡＵＣＧＡＵＣＧ」を有するもの及び「ＡＵＣＧＡＴＣＧ」などのいくつかのＤＮＡ塩基といくつかのＲＮＡ塩基を有するものならびに「ＡＴｍＣＧＡＵＣＧ」（配列中、ｍＣは、５位にメチル基を含むシトシン塩基を示す）などの他の修飾核酸塩基を有するオリゴマー化合物を含む。
【０３５８】
本明細書に記載の特定の化合物（例えば、修飾オリゴヌクレオチド）は、１つ以上の不斉中心を有することから、エナンチオマー、ジアステレオマー及び他の立体異性体構造を生じる。これらは、絶対立体化学の観点から、（Ｒ）もしくは（Ｓ）、αもしくはβ（糖アノマーなどの場合）、または（Ｄ）もしくは（Ｌ）（アミノ酸などの場合）などで定義され得る。本明細書で提供される化合物には、別の記載がない限り、そのラセミ形態及び光学的に純粋な形態を含む、全ての可能な異性体が含まれる。同様に、特に指定のない限り、全てのシス及びトランス異性体ならびに互変異性形態も含まれる。特に指示がない限り、本明細書に記載の化合物は、対応する塩形態を含むことが意図される。
【実施例】
【０３５９】
以下の実施例は、本開示の特定の実施形態を例示するものであり、限定するものではない。更に、具体的な実施形態が提供される場合、本発明者らは、その具体的な実施形態の一般的な適用を企図している。例えば、特定のモチーフを有するオリゴヌクレオチドの開示は、それと同一または類似のモチーフを有する更なるオリゴヌクレオチドについての合理的な支持を提供する。また、例えば、特定の高親和性修飾が特定の位置に現れる場合、同一位置での他の高親和性修飾も、特に指定のない限り、好適であるとみなされる。
【０３６０】
実施例１：親油性コンジュゲート基を含む二本鎖のｉｎ  ｖｉｖｏにおける作用
２つのオリゴマー化合物からそれぞれなる二本鎖を以下の表に記載する。各二本鎖のオリゴマー化合物の一方は、ヒト及びマウスの両方の肺腺癌転移関連性転写産物１（ＭＡＬＡＴ−１）の転写産物に相補的なアンチセンスオリゴヌクレオチド（Ｉｓｉｓ６２６１１２番）を含む。各二本鎖のオリゴマー化合物の他方は、オリゴヌクレオチド及び親油性コンジュゲート基を含む。ＭＡＬＡＴ−１発現に対する二本鎖の作用をｉｎ  ｖｉｖｏで試験した。野生型Ｃ５７ｂｌ／６マウスのそれぞれに、尾静脈を介して、以下の表に列挙する二本鎖、対照としてのＩｓｉｓ６２６１１２番単独、または生理食塩水ビヒクル単独の静脈内注射を投与した。各注射は、１００ｍｇ／ｋｇのアンチセンスオリゴヌクレオチド（Ｉｓｉｓ６２６１１２番）を含有した。各処置群は、４匹のマウスから構成された。注射から８日後に動物を屠殺した。肝臓、腎臓、肺、三叉神経節、前頭皮質及び脊髄におけるＭＡＬＡＴ−１  ＲＮＡ発現をＲｉｂｏＧｒｅｅｎ（Ｔｈｅｒｍｏ  Ｆｉｓｈｅｒ  Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ（Ｃａｒｌｓｂａｄ，ＣＡ））を使用してＲＴ−ｑＰＣＲにより解析し、全ＲＮＡに対して正規化した。各群の平均結果は、ビヒクル処置動物の平均結果に対して正規化したＭＡＬＡＴ−１  ＲＮＡレベルのパーセントとして以下に示す。
【表１Ｃ】
2018528783.tif 000011
上記表中の下付き文字：「ｓ」はホスホロチオエートヌクレオシド間結合を表し、「ｏ」はリン酸ヌクレオシド間結合を表し、「ｄ」は２’−デオキシヌクレオシドを表し、「ｅ」は２’−ＭＯＥ修飾ヌクレオシドを表し、「ｒ」は２’−リボヌクレオシド（２’−ヒドロキシ）を表し、「ｍ」は２’−Ｏ−メチル修飾ヌクレオシドを表す。上付き文字：Ｃの前の「ｍ」は５−メチルシステインを表す。「Ｃｈｏｌ−ＴＥＧ−」、「Ｔｏｃｏ−ＴＥＧ−」、「Ｃ１０−ＴＥＧ−」及び「Ｃ１６−ＴＥＧ−」の構造を以下に示す。
【化８】
2018528783.tif 000012
式中、「Ｃ１０−ＴＥＧ−」ではｎは１であり、「Ｃ１６−ＴＥＧ−」ではｎは７である。
【０３６１】
実施例２：親油性コンジュゲート基を含む二本鎖のｉｎ  ｖｉｖｏにおける作用
２つのオリゴマー化合物からそれぞれなる二本鎖を以下の表に記載する。各二本鎖のオリゴマー化合物の一方は、ヒト及びマウスの両方のＭＡＬＡＴ−１転写産物に相補的なアンチセンスオリゴヌクレオチド（Ｉｓｉｓ６２６１１２番またはＩｓｉｓ５５６０８９番）を含む。各二本鎖のオリゴマー化合物の他方は、オリゴヌクレオチド及び親油性コンジュゲート基を含む。ＭＡＬＡＴ−１発現に対する二本鎖の作用をｉｎ  ｖｉｖｏで試験した。野生型Ｃ５７ｂｌ／６マウスのそれぞれに、尾静脈を介して、以下の表に列挙する二本鎖、Ｉｓｉｓ６２６１１２番単独、Ｉｓｉｓ５５６０８９番単独または生理食塩水の静脈内注射を投与した。以下の表に列挙する用量は、各注射で投与されたＩｓｉｓ６２６１１２番またはＩｓｉｓ５５６０８９番の量を示す。各処置群は、３匹または４匹のマウスから構成された。注射から３日後に動物を屠殺した。心臓、マクロファージ（Ｍａｃ）、三叉神経節（ＴＧ）、座骨神経（ＳＮ）及び後根神経節（ＤＲＧ）におけるＭＡＬＡＴ−１  ＲＮＡ発現をＲｉｂｏＧｒｅｅｎ（Ｔｈｅｒｍｏ  Ｆｉｓｈｅｒ  Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ（Ｃａｒｌｓｂａｄ，ＣＡ））を使用してＲＴ−ｑＰＣＲにより解析し、全ＲＮＡに対して正規化した。各群の平均結果は、ビヒクル処置動物の平均結果に対して正規化したＭＡＬＡＴ−１  ＲＮＡレベルのパーセントとして以下に示す。
【表２】
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下付き及び上付き記号については、表１の凡例を参照されたい。下付き文字「ｋ」は、ｃＥｔ修飾二環式糖部分を表す。「Ｃｈｏｌ−ＴＥＧ−」及び「Ｔｏｃｏ−ＴＥＧ−」の構造は、実施例１に示されている。「Ｔｏｃｏ−」の構造は、以下である。
【化９】
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【０３６２】
実施例３：親油性コンジュゲート基を含む二本鎖のｉｎ  ｖｉｖｏにおける作用
２つのオリゴマー化合物からなる二本鎖を以下の表に記載する。二本鎖のオリゴマー化合物の一方は、ヒト及びマウスの筋強直性ジストロフィープロテインキナーゼ（ＤＭＰＫ）転写産物に相補的なアンチセンスオリゴヌクレオチド（Ｉｓｉｓ４８６１７８番）を含む。二本鎖のオリゴマー化合物の他方は、オリゴヌクレオチド及び親油性コンジュゲート基を含む。ＤＭＰＫ発現に対する二本鎖の作用をｉｎ  ｖｉｖｏで試験した。野生型Ｂａｌｂ−Ｃマウスのそれぞれに、以下の表に列挙する二本鎖、Ｉｓｉｓ４８６１７８番単独または生理食塩水の静脈内注射を週１回、４週間投与した。以下の表に列挙する用量は、各注射で投与されたＩｓｉｓ４８６１７８番の量を示す。各処置群は、３匹または４匹のマウスから構成された。最終注射から７日後に動物を屠殺した。肝臓、横隔膜（Ｄｉａ）、四頭筋（Ｑｕａｄ）、前脛骨筋（ＴＡ）、心臓及び腓腹筋（Ｇａｓｔ）におけるＤＭＰＫ  ｍＲＮＡ発現をＲｉｂｏＧｒｅｅｎ（Ｔｈｅｒｍｏ  Ｆｉｓｈｅｒ  Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ（Ｃａｒｌｓｂａｄ，ＣＡ））を使用してＲＴ−ｑＰＣＲにより解析し、全ＲＮＡに対して正規化した。各群の平均結果は、ビヒクル処置動物の平均結果に対して正規化したＤＭＰＫ  ＲＮＡレベルのパーセントとして以下に示す。
【表３】
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下付き及び上付き記号については、表１及び２の凡例を参照されたい。「Ｔｏｃｏ−」の構造は、実施例２に示されている。
【０３６３】
実施例４：親油性コンジュゲート基を含む二本鎖のｉｎ  ｖｉｖｏにおける作用
２つのオリゴマー化合物からなる二本鎖を以下の表に記載する。各二本鎖のオリゴマー化合物の一方は、マウスＳＣＡＲＢ１スカベンジャー受容体クラスＢメンバー１（ＳＲＢ−１）転写産物に相補的なアンチセンスオリゴヌクレオチド（Ｉｓｉｓ４４０７６２番）を含む。二本鎖のオリゴマー化合物の他方は、オリゴヌクレオチド及び親油性コンジュゲート基を含む。ＳＲＢ−１発現に対する二本鎖の作用をｉｎ  ｖｉｖｏで試験した。野生型マウスのそれぞれに、以下の表に列挙する二本鎖、Ｉｓｉｓ４４０７６２番単独または生理食塩水の静脈内注射を毎回１回投与した。以下の表に列挙する用量は、各注射で投与されたＩｓｉｓ４４０７６２番の量を示す。各処置群は、３匹または４匹のマウスから構成された。最終注射後、動物を屠殺した。肝臓におけるＳＲＢ−１  ｍＲＮＡ発現をＲｉｂｏＧｒｅｅｎ（Ｔｈｅｒｍｏ  Ｆｉｓｈｅｒ  Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ（Ｃａｒｌｓｂａｄ，ＣＡ））を使用してＲＴ−ｑＰＣＲを用いて解析し、全ＲＮＡに対して正規化した。各群の平均結果は、ビヒクル処置動物の平均結果に対して正規化したＳＲＢ−１  ＲＮＡレベルのパーセントとして以下に示す。
【表４】
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下付き及び上付き記号については、表１及び２の凡例を参照されたい。下付き文字「ｆ」は、２’−フルオロ修飾を示す。「Ｔｏｃｏ−」の構造は、実施例２に示されている。
【配列表】
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【国際調査報告】
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