(57)【要約】本発明は、ＩｇＧシステインプロテアーゼ活性を示す新規なポリペプチド、並びにそのインビボ及びエクスビボでの使用に関する。ポリペプチドの使用としては、ＩｇＧによって媒介される疾患及び状態を予防又は治療するための方法、並びにＩｇＧを解析するための方法が挙げられる。【選択図】図１８
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【特許請求の範囲】
【請求項１】
ＩｇＧシステインプロテアーゼ活性を有し、配列番号４又は５の配列の変異体を含むポリペプチドであって、該変異体が：
（ａ）配列番号４又は５に対して少なくとも５０％同一であり；
（ｂ）前記変異体配列中の、配列番号３の１０２位に対応する位置にシステイン（Ｃ）を有し；及び場合により
（ｃ）前記変異体配列中の、配列番号３の９２位、２７２位、２９４位及び２９６位に対応する位置に、それぞれ、リジン（Ｋ）、ヒスチジン（Ｈ）、アスパラギン酸（Ｄ）及びアスパラギン酸（Ｄ）を有し；
前記ポリペプチドは、ヒトＩｇＧの切断において、ＩｄｅＺよりも有効であり、及び／又は、ヒトＩｇＧの切断において、少なくともＩｄｅＳと同程度に有効である、ポリペプチド。
【請求項２】
配列番号４又は５の配列の前記変異体が：
（１）前記変異体中の、配列番号３の１３８位に対応する位置に、正に荷電したアミノ酸を有し、場合により、前記正に荷電したアミノ酸がアルギニン（Ｒ）又はリジン（Ｋ）であり；及び／又は
（２）前記変異体中の、配列番号３の１３９位に対応する位置に、正に荷電したアミノ酸を有し、場合により、前記正に荷電したアミノ酸がアルギニン（Ｒ）又はリジン（Ｋ）であり；及び／又は
（３）連続配列ＤＤＹＱＲＮＡＴＥＡ  ＹＡＫＥＶＰＨＱＩＴを含まず；及び／又は
（４）以下の改変：
ｉ．前記変異体中の、配列番号３の６４位及び６５位に対応する位置における、ロイシン（Ｌ）及びスレオニン（Ｔ）残基の欠失；
ｉｉ．前記変異体中の、配列番号３の７０位に対応する位置における、アルギニン（Ｒ）に代わるスレオニン（Ｔ）；
ｉｉｉ．前記変異体中の、配列番号３の７１位に対応する位置における、チロシン（Ｙ）の欠失；
ｉｖ．  前記変異体中の、配列番号３の７２位に対応する位置における、アスパラギン（Ｎ）に代わるグルタミン（Ｑ）；
ｖ．前記変異体中の、配列番号３の７３位に対応する位置における、アスパラギン（Ｎ）に代わるグリシン（Ｇ）；
ｖｉ．前記変異体中の、配列番号３の６７位に対応する位置における、グルタミン酸（Ｅ）に代わるアラニン（Ａ）；
ｖｉｉ．前記変異体中の、配列番号３の６８位に対応する位置における、グルタミン（Ｑ）に代わるアスパラギン（Ｎ）
の少なくとも１つを有する、請求項１に記載のポリペプチド。
【請求項３】
配列番号４又は５の配列の前記変異体が、それぞれ配列番号４又は５に対して少なくとも８０％、９０％、９５％又は９９％同一であり、及び／又は、同じアッセイにおいて測定した場合、前記ポリペプチドが、ＩｄｅＳよりも免疫原性が低く、好ましくはＩｄｅＺ又はＩｄｅＳ／Ｚよりも免疫原性が高くない、請求項１又は２に記載のポリペプチド。
【請求項４】
配列番号６〜２５のいずれか１つの配列を含むか、又はそれからなり、場合により、前記配列が、メチオニンをＮ末端に、及び／又はヒスチジンタグをＣ末端に、更に含む、上記請求項のいずれか１項に記載のポリペプチド。
【請求項５】
同じアッセイにおいて測定した場合、前記ポリペプチドが、ヒトＩｇＧの切断において、ＩｄｅＺよりも少なくとも２．０倍有効である、上記請求項のいずれか１項に記載のポリペプチド。
【請求項６】
ＩｄｅＳよりも免疫原性が低く、好ましくは、同じアッセイにおいて測定した場合、前記ポリペプチドの免疫原性が、ＩｄｅＳの免疫原性の８５％以下である、上記請求項のいずれか１項に記載のポリペプチド。
【請求項７】
上記請求項のいずれか１項のポリペプチドをコードする核酸配列を含む、ポリヌクレオチド又は発現ベクター。
【請求項８】
請求項７のポリヌクレオチド又は発現ベクターを含む宿主細胞であって、好ましくは細菌細胞、最も好ましくはＥ．コリの細胞である、宿主細胞。
【請求項９】
請求項１〜６のいずれか１項に記載のポリペプチド及び少なくとも１つの医薬的に許容可能な担体又は希釈剤を含む、組成物。
【請求項１０】
ヒト又は動物の身体の治療において使用するための、請求項１〜６のいずれか１項に記載のポリペプチド。
【請求項１１】
被験体における疾患又は状態を予防又は治療するための方法であって、請求項１〜６のいずれか１項に記載のポリペプチドを、被験体に、予防有効量又は治療有効量で被験体に投与することを含む、方法。
【請求項１２】
前記疾患又は状態が、病原性ＩｇＧ抗体によって全体的又は部分的に媒介される疾患又は状態であり、好ましくは、前記疾患又は状態が表Ｄに列挙されている、請求項１１に記載の方法。
【請求項１３】
ＩｇＧを切断するための方法であって、ＩｇＧシステインプロテアーゼ活性が生じることを可能にする条件下で、ＩｇＧを含有する試料と、請求項１〜６のいずれか１項に記載のポリペプチドとを接触させることを含む、方法。
【請求項１４】
エクスビボで実施される、及び／若しくはＦｃ及びＦａｂ断片を生成するために実施される、並びに／又は、試料が、請求項１２に記載の疾患又は状態に罹患している被験体から採取された血液試料である、請求項１３に記載の方法。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
発明の分野
本発明は、ＩｇＧシステインプロテアーゼ活性を示す新規なポリペプチド、並びにそのインビボ及びエクスビボでの使用に関する。ポリペプチドの使用としては、ＩｇＧによって媒介される疾患及び状態を予防又は治療するための方法、及びＩｇＧを解析するための方法が挙げられる。
【背景技術】
【０００２】
発明の背景
ＩｄｅＳ（Ｓ．ピオゲネス（Ｓ．ｐｙｏｇｅｎｅｓ）の免疫グロブリンＧ分解酵素（Ｉｍｍｕｎｏｇｌｏｂｕｌｉｎ  Ｇ−ｄｅｇｒａｄｉｎｇ  ｅｎｚｙｍｅ  ｏｆ  Ｓ．  ｐｙｏｇｅｎｅｓ））は、ヒトの病原体であるＳ．ピオゲネスによって産生される細胞外システインプロテアーゼである。ＩｄｅＳは、最初に血清型Ｍ１のＡ群連鎖球菌株から単離されたが、今では、試験されたすべてのＡ群連鎖球菌株において、ｉｄｅｓ遺伝子が同定されている。ＩｄｅＳは、程度の非常に高い基質特異性を有し、その、同定された唯一の基質がＩｇＧである。ＩｄｅＳは、ヒトＩｇＧの全てのサブクラスの、重鎖下部のヒンジ領域において、タンパク質分解による１回切断を触媒する。ＩｄｅＳは、これに相当する、様々な動物におけるＩｇＧのいくつかのサブクラスの重鎖の切断も触媒する。ＩｄｅＳは、２段階の機構を介して、ＩｇＧを、Ｆｃ及びＦ（ａｂ’）２の断片に効率的に切断する。第１段階では、ＩｇＧの一方の（第１の）重鎖が切断されて、非共有的に結合したＦｃ分子を有する、１回切断されたＩｇＧ（ｓｃＩｇＧ）分子が生成される。ｓｃＩｇＧ分子は、事実上、原型ＩｇＧ分子の残りの（第２の）重鎖を保持する中間産物である。該メカニズムの第２段階においては、この第２の重鎖が、ＩｄｅＳによって切断され、Ｆ（ａｂ’）２断片及びホモダイマーのＦｃ断片が遊離する。これらは、生理学的条件下で一般的に観察される産物である。還元条件下で、Ｆ（ａｂ’）２断片は、２つのＦａｂ断片に解離する場合があり、ホモダイマーのＦｃは、その構成要素のモノマーに解離する場合がある。
【発明の概要】
【０００３】
発明の要旨
ＩｄｅＳのＩｇＧ切断能力は、例えば、ＩｇＧ解析のために用いられ得る、Ｆａｂ及びＦｃの断片を生成するための方法において、エクスビボでの有用性を有することが示されている。例えば、国際特許出願公開第２００３０５１９１４号及び国際特許出願公開第２００９０３３６７０号を参照。ＩｄｅＳは、疾患を媒介するか、又はそうでなければ、望ましくない、ＩｇＧ分子の、インビボでの切断が可能であるため、治療剤としての、インビボでの有用性も有することが示されている。例えば、国際特許出願公開第２００３０５１９１４号、国際特許出願公開第２００６１３１３４７号及び国際特許出願公開第２０１３１１０９４６号を参照。ＩｄｅＳは、ＩｇＧによって全体的又は部分的に媒介される、任意の疾患又は状態に対する治療法として用いられ得る。多くの自己免疫疾患は、供与された臓器の急性拒絶反応のように、ＩｇＧが、全体的又は部分的に媒介する。
【０００４】
しかしながら、ＩｄｅＳは免疫原性タンパク質である。つまり、ＩｄｅＳが治療薬として用いられる場合、ＩｄｅＳを受容する被験体の免疫系は、頻繁にそれに応答する。ＩｄｅＳに対する免疫系の応答は、典型的には、ＩｄｅＳに特異的な抗体の産生を伴う。これらの抗体は、本明細書では、ＩｄｅＳに特異的な抗薬物抗体（ＡＤＡ）又は「ＩｄｅＳ特異的ＡＤＡ」と言われる場合がある。一般的に、ＩｄｅＳに対する免疫応答、及び特にＩｄｅＳ特異的ＡＤＡの産生は、関連する２タイプの問題を引き起こし得る。第１に、ＩｄｅＳの有効性は、例えば、ＡＤＡ結合により、減少し得、同じ効果を挙げるために、より高い用量又は反復用量が必要となる可能性がある。この効果を有するＡＤＡは、「中和作用を有する（ｎｅｕｔｒａｌｉｓｉｎｇ）ＡＤＡ」と呼ばれ得る。第２に、ＡＤＡ及びＩｄｅＳの免疫複合体によって誘発される高炎症応答等の、望ましくないか、又は有害でさえある、合併症があり得る。ある特定の被験体においては、ＩｄｅＳに特異的なＡＤＡの量が多いほど、これらの問題が生じる可能性が高い。患者におけるＩｄｅＳ特異的ＡＤＡ分子の存在及び量は、薬剤特異的ＣＡＰ  ＦＥＩＡ（ＩｍｍｕｎｏＣＡＰ）試験、又は患者からの血清試料に対して行われた力価アッセイ等の任意の好適な方法によって決定され得る。臨床医によって決定された閾値を上回れば、患者におけるＩｄｅＳ特異的ＡＤＡ分子の量によりＩｄｅＳの投与が不可能になり得るか、又はより高い用量のＩｄｅＳが必要であることが示され得る。かかる、より高い用量は、結果として、患者におけるＩｄｅＳ特異的ＡＤＡ分子の量の増加をもたらし、それによってＩｄｅＳの更なる投与が不可能になり得る。
【０００５】
ＩｄｅＳは、扁桃炎及び連鎖球菌性咽頭炎等の、一般的な感染の原因となる、Ｓ．ピオゲネスの病原性因子である。従って、ほとんどのヒト被験体は、この関係でＩｄｅＳに遭遇して、血流中に抗ＩｄｅＳ抗体を有する可能性がある。ＩｄｅＳ特異的ＡＤＡは、無作為なヒト被験体由来の血清試料において、日常的に検出される（以前の連鎖球菌感染による可能性が高い）。数千人のドナーの血清プールから抽出されたＩｇＧの調製物であるＩＶＩｇ（静脈内免疫グロブリン（Ｉｎｔｒａｖｅｎｏｕｓ  Ｉｍｍｕｎｏｇｌｏｂｕｌｉｎ））調製物においても同様である。最初のＩｄｅＳ投与前に、被験体がＩｄｅＳ特異的ＡＤＡを有していなくても、その後に、かかる分子が産生される可能性がある。従って、ある任意の被験体に対する、ＩｄｅＳの免疫原性に関連する問題は、治療としてのＩｄｅＳの使用に対する障害を提示しているようである。特に反復投与が必要な場合、これらの問題は、ＩｄｅＳの用量の増加を必要とし、且つ／又はＩｄｅＳによる治療を全く不可能にする場合がある。このタイプの問題に対する既存のアプローチには、例えば、免疫原性を低下させるための、治療剤のペグ化（ＰＥＧｙｌａｔｉｏｎ）又は治療剤と免疫抑制剤との共投与が含まれる。
【０００６】
本発明者らは、全く異なるアプローチを採用した。本発明者らは、ＩｄｅＳの配列を解析し、それを、ＩｄｅＳとおおよそ６６％の同一性を有するタンパク質、ＩｄｅＺの配列と比較した。ＩｄｅＺは、主にウマに見られる細菌のストレプトコッカス・エクイ亜種ズーエピデミカス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ  ｅｑｕｉ  ｓｓｐ  ｚｏｏｅｐｉｄｅｍｉｃｕｓ）によって産生される、ＩｇＧシステインプロテアーゼである。ＩｄｅＺはヒトの病原体ではないので、ヒト被験体は、典型的には、血漿中に、このタンパク質に対する抗体を有しない。しかしながら、ＩｄｅＺには、あるレベルで、ヒトＩｇＧに対するＩｇＧシステインプロテアーゼ活性（ＩｄｅＳのそれよりもかなり低い）がある。本発明者らは、顕著な免疫原性増大をもたらさずに、ヒトＩｇＧに対するその活性を向上させる、ＩｄｅＺの配列中の位置を調査した。この調査のための開始点として、本発明者らは、ＩｄｅＺの配列及びＩｄｅＳと８１．７％の同一性及びＩｄｅＺと８１％の同一性を有する、本発明者らによって設計された、新規ハイブリッド配列の両方を用いた。このハイブリッド配列は、本明細書では、ＩｄｅＳ／Ｚと言われる場合がある。
【０００７】
ＩｄｅＳの全配列は、ＮＣＢＩ参照配列番号（Ｒｅｆｅｒｅｎｃｅ  Ｓｅｑｕｅｎｃｅ  ｎｏ）ＷＰ＿０１０９２２１６０．１として公に入手可能であり、本明細書では、配列番号１として示されている。この配列は、Ｎ末端のメチオニンに続く２８アミノ酸の分泌シグナル配列を含む。Ｎ末端のメチオニン及びシグナル配列（Ｎ末端における合計２９アミノ酸）は、通常除去されて、成熟ＩｄｅＳタンパク質を形成し、その配列はＧｅｎｂａｎｋ受入番号ＡＤＦ１３９４９．１として公に入手可能であり、本明細書では、配列番号２として示されている。
【０００８】
ＩｄｅＺの全配列は、ＮＣＢＩ参照配列番号ＷＰ＿０１４６２２７８０．１として公に利用可能であり、本明細書では、配列番号３として示されている。この配列は、Ｎ末端のメチオニンに続く、３３アミノ酸の分泌シグナル配列を含む。Ｎ末端のメチオニン及びシグナル配列（Ｎ末端における合計３４アミノ酸）は、通常除去されて、成熟ＩｄｅＺタンパク質を形成し、その配列は、本明細書では配列番号４として示されている。
【０００９】
本発明者らにより設計されたＩｄｅＳ／Ｚハイブリッドの配列は、ＩｄｅＺに基づいたＮ末端部分を有し、Ｎ末端のメチオニン及びシグナル配列（Ｎ末端における合計３４個のアミノ酸）は伴わない。この配列は、本明細書では配列番号５として示されている。
【００１０】
本発明者らは、本明細書に記載の通りに改変された場合に、ヒトＩｇＧに対するＩｇＧシステインプロテアーゼ活性が、ＩｄｅＺと比較して増加した新規ポリペプチドをもたらす、ＩｄｅＺ及びＩｄｅＳ／Ｚハイブリッドの配列内の位置を同定することができた。本発明のポリペプチドの、ヒトＩｇＧに対するＩｇＧシステインプロテアーゼ活性は、好ましくは、少なくともＩｄｅＳの、ヒトＩｇＧに対するＩｇＧシステインプロテアーゼ活性と同程度に高い。本発明のポリペプチドは、特にＩｇＧがＩｇＧ２アイソタイプである場合、ＩｇＧ分子の、第２鎖よりも第１鎖の切断においてより有効であり得る（図１８における模式図参照）。本発明のポリペプチドは、ＩｇＧ２よりも、ＩｇＧ１の切断においてより有効であり得る。本発明のポリペプチドは、典型的には、ＩｄｅＳよりも免疫原性が低く、好ましくは、免疫原性が、ＩｄｅＺやＩｄｅＳ／Ｚと同程度であり得る。
【００１１】
特に明記しない限り、本明細書に開示されるポリペプチドにおける、アミノ酸位置の番号付けに関する全ての言及は、配列番号３において、Ｎ末端から開始する、対応する位置の番号付けに基づく。従って、配列番号４及び５は、配列番号３のＮ末端メチオニン及び３３アミノ酸のシグナル配列を欠くので、配列番号４及び５のＮ末端のアスパラギン酸（Ｄ）残基は、３５位として言及される（これが、配列番号３における、対応する位置であるため）。この番号付けスキームを適用すると、ＩｄｅＳのＩｇＧシステインプロテアーゼ活性にとって最も重要な残基は、１０２位のシステイン（Ｃ）（配列番号４及び５のＮ末端から６８番目の残基）である。ＩｇＧシステインプロテアーゼ活性にとって重要な可能性のある他の残基は、配列番号３の９２位のリジン（Ｋ）、２７２位のヒスチジン（Ｈ）並びに２９４位及び２９６位のそれぞれのアスパラギン酸（Ｄ）である。これらは、それぞれ、配列番号４のＮ末端から５８番目、２３８番目、２６０番目及び２６２番目、また配列番号５のＮ末端から５８番目、２３６番目、２５８番目及び２６０番目の残基である。
【００１２】
従って、本発明によれば、ＩｇＧシステインプロテアーゼ活性を有し、配列番号４又は５の配列の変異体を含むポリペプチドであって、該変異体が：
（ａ）配列番号４又は５に対して少なくとも５０％同一であり；
（ｂ）前記変異体配列中の、配列番号３の１０２位に対応する位置にシステイン（Ｃ）を有し；及び場合により
（ｃ）前記変異体配列中の、配列番号３の９２位、２７２位、２９４位及び２９６位に対応する位置に、それぞれ、リジン（Ｋ）、ヒスチジン（Ｈ）、アスパラギン酸（Ｄ）及びアスパラギン酸（Ｄ）を有し；
前記ポリペプチドは、ヒトＩｇＧの切断において、ＩｄｅＺよりも有効であり、及び／又は、ヒトＩｇＧの切断において、少なくともＩｄｅＳと同程度に有効である、ポリペプチドが提供される。
好ましくは、配列番号４又は５の前記変異体は：
（１）前記変異体中の、配列番号３の１３８位に対応する位置に、正に荷電したアミノ酸を有し、場合により、前記正に荷電したアミノ酸がアルギニン（Ｒ）又はリジン（Ｋ）であり；及び／又は
（２）前記変異体中の、配列番号３の１３９位に対応する位置に、正に荷電したアミノ酸を有し、場合により、前記正に荷電したアミノ酸がアルギニン（Ｒ）又はリジン（Ｋ）であり；及び／又は
（３）連続配列ＤＤＹＱＲＮＡＴＥＡ  ＹＡＫＥＶＰＨＱＩＴを含まず；及び／又は
（４）以下の改変：
ｉ．前記変異体中の、配列番号３の６４位及び６５位に対応する位置における、ロイシン（Ｌ）及びスレオニン（Ｔ）残基の欠失；
ｉｉ．前記変異体中の、配列番号３の７０位に対応する位置における、アルギニン（Ｒ）に代わるスレオニン（Ｔ）；
ｉｉｉ．前記変異体中の、配列番号３の７１位に対応する位置における、チロシン（Ｙ）の欠失；
ｉｖ．前記変異体中の、配列番号３の７２位に対応する位置における、アスパラギン（Ｎ）に代わるグルタミン（Ｑ）；
ｖ．前記変異体中の、配列番号３の７３位に対応する位置における、アスパラギン（Ｎ）に代わるグリシン（Ｇ）；
ｖｉ．前記変異体中の、配列番号３の６７位に対応する位置における、グルタミン酸（Ｅ）に代わるアラニン（Ａ）；
ｖｉｉ．前記変異体中の、配列番号３の６８位に対応する位置における、グルタミン（Ｑ）に代わるアスパラギン（Ｎ）の少なくとも１つを有する。
（４）の、少なくとも１つの改変は、通常、上記の選択肢ｉ〜ｖｉｉから選択される。本発明のポリペプチドは、配列番号４又は５のアミノ酸配列の変異体を含み得、該変異体は、選択肢ｉ〜ｖｉｉの少なくとも２つ、３つ、４つ、５つ、６つ又は７つ全ての改変を有する。
【００１３】
本発明は、本発明のポリペプチドをコードするか又は発現させるポリヌクレオチド、発現ベクター又は宿主細胞も提供する。
【００１４】
本発明は、被験体における、ＩｇＧ抗体によって媒介される疾患又は状態を治療又は予防する方法であって、治療有効量又は予防有効量の本発明のポリペプチドを、被験体に投与することを含む、方法も提供する。該方法は、典型的には、被験体への、前記ポリペプチドの複数回投与を含み得る。
【００１５】
本発明は、患者、典型的には、ＩｇＧ抗体によって媒介される疾患又は状態に罹患している患者、から採取された血液をエクスビボで処理する方法であって、血液と、本発明のポリペプチドとを接触させることを含む、方法も提供する。
【００１６】
本発明は、治療又は治療剤の、被験体への利益を向上させるための方法であって、該方法が、（ａ）被験体に、本発明のポリペプチドを投与すること；（ｂ）続いて、被験体に、前記治療を施し又は前記治療剤を投与することを含み；
−  前記治療が、臓器移植（若しくは前記治療剤が抗体）、ウイルスベクター等の遺伝子治療、欠損した、酵素、増殖因子若しくは凝固因子等の内因性因子についての置換、又は細胞治療であり；
−  投与される前記ポリペプチドの量は、被験体の血漿中に存在する実質的に全てのＩｇＧ分子を切断するのに十分であり；且つ
−  工程（ａ）及び（ｂ）は、被験体の血漿中に存在する実質的にすべてのＩｇＧ分子を切断するのに十分な時間間隔で隔てられる、方法も提供する。
【００１７】
本発明は、ＩｇＧと本発明のポリペプチドとを、好ましくはエクスビボで、接触させることを含む、ＩｇＧの、Ｆｃ、Ｆａｂ又はＦ（ａｂ’）２断片を生成する方法も提供する。
【００１８】
本発明による方法を実施するためのキットも提供される。
【図面の簡単な説明】
【００１９】
【図１】図１及び２は、コントロールと比較した、本発明のポリペプチドの効力（ＩｇＧの切断における有効性）を測定するための、代表的なアッセイの結果を示す。
【図２】図１及び２は、コントロールと比較した、本発明のポリペプチドの効力（ＩｇＧの切断における有効性）を測定するための、代表的なアッセイの結果を示す。
【図３】図３は、ＩｇＧ１と、本発明のポリペプチド又はコントロールとのインキュベーションによって生成された切断産物を可視化するために用いられた、代表的なＳＤＳ−ＰＡＧＥゲルの結果を示す。
【図４】図４は、ＩＶＩｇと、本発明のポリペプチド又はコントロールとのインキュベーションによって生成された切断産物を可視化するために用いられた、代表的なＳＤＳ−ＰＡＧＥゲルの結果を示す。
【図５】図５は、ＩｇＧ１と、本発明の更なるポリペプチド又はコントロールとのインキュベーションによって生成された切断産物を可視化するために用いられた、代表的なＳＤＳ−ＰＡＧＥゲルの結果を示す。
【図６】図６は、ＩｇＧ２と、本発明のポリペプチド又はコントロールとのインキュベーションによって生成された切断産物を可視化するために用いられた、代表的なＳＤＳ−ＰＡＧＥゲルの結果を示す。
【図７】図７は、ＩＶＩｇと、本発明のポリペプチド又はコントロールとのインキュベーションによって生成された切断産物を可視化するために用いられた、代表的なＳＤＳ−ＰＡＧＥゲルの結果を示す。
【図８】図８は、コントロールと比較した、本発明のポリペプチドの、ＩｄｅＳ特異的抗体による認識のレベルを測定するための、代表的な競合アッセイの結果を示す。
【図９】図９は、コントロールと比較した、本発明のポリペプチドの、ＩｄｅＳ特異的抗体による認識のレベルを測定するための、代表的な競合アッセイの結果を示す。
【図１０】図１０は、コントロールと比較した、本発明のポリペプチドの、ＩｄｅＳ特異的抗体による認識のレベルを測定するための、代表的な滴定アッセイの結果を示す。
【図１１】図１１は、コントロールと比較した、本発明のポリペプチドの、ＩｄｅＳ特異的抗体による認識のレベルを測定するための、代表的な滴定アッセイの結果を示す。
【図１２】図１２は、種々のＩｇＧシステインプロテアーゼポリペプチドによる、ＩｇＧ１の切断についての、代表的な滴定曲線を示す。
【図１３】図１３は、種々のＩｇＧシステインプロテアーゼポリペプチドによる、ＩｇＧ２の切断についての、代表的な滴定曲線を示す。
【図１４】図１４は、ＩｇＧと、本発明のポリペプチド又はコントロールとのインキュベーションによって（ｂｙ  ｉｎｃｕｂａｔｉｏｎ  ＩｇＧ  ｗｉｔｈ  ｐｏｌｙｐｅｐｔｉｄｅｓ  ｏｆ  ｔｈｅ  ｉｎｖｅｎｔｉｏｎ  ｏｒ  ｃｏｎｔｒｏｌｓ．）生成された切断産物を可視化するために用いられた、代表的なＳＤＳ−ＰＡＧＥの結果を示す。
【図１５】図１５は、ＩｇＧと、本発明のポリペプチド又はコントロールとのインキュベーションによって生成された切断産物を可視化するために用いられた、代表的なＳＤＳ−ＰＡＧＥの結果を示す。
【図１６】図１６は、ＩＶＩｇと、本発明のポリペプチド又はコントロールとのインキュベーションによって生成された切断産物を可視化するために用いられた、代表的なＳＤＳ−ＰＡＧＥの結果を示す。
【図１７】図１７は、ＩＶＩｇと、本発明のポリペプチド又はコントロールとのインキュベーションによって生成された切断産物を可視化するために用いられた、代表的なＳＤＳ−ＰＡＧＥの結果を示す。
【図１８】図１８  本発明のポリペプチドによる、免疫グロブリン切断の模式図。
【図１９】図１９は、代表的な、ＡＤＡ結合部位と本発明のポリペプチド又はコントロールとの競合（％）の結果を示す。
【図２０】図２０は、代表的な、ＡＤＡ結合部位と本発明のポリペプチド又はコントロールとの更なる競合（％）の結果を示す。
【図２１】図２１は、インビボでのヒトＩｇＧの切断において、本発明のポリペプチドの有効性を測定するために用いられた、代表的な有効性ＥＬＩＳＡの結果を示す。
【図２２】図２２は、本発明のポリペプチドによって、インビボで生成されたＩｇＧ切断産物を可視化するために用いられた、代表的なＳＤＳ−ＰＡＧＥの結果を示す。
【発明を実施するための形態】
【００２０】
配列の簡単な説明
配列番号１は、Ｎ末端メチオニン及びシグナル配列を含むＩｄｅＳの全配列である。ＮＣＢＩ参照配列番号ＷＰ＿０１０９２２１６０．１としても開示されている。
配列番号２は、Ｎ末端メチオニン及びシグナル配列を欠く、ＩｄｅＳの成熟配列である。Ｇｅｎｂａｎｋ受入番号ＡＤＦ１３９４９．１としても開示されている。
配列番号３は、Ｎ末端メチオニン及びシグナル配列を含む、ＩｄｅＺの全配列である。ＮＣＢＩ参照配列番号ＷＰ＿０１４６２２７８０．１としても開示されている。
配列番号４は、Ｎ末端メチオニン及びシグナル配列を欠く、ＩｄｅＺの成熟配列である。
配列番号５は、本発明者らによって設計されたハイブリッドＩｄｅＳ／Ｚの配列である。Ｎ末端は、Ｎ末端メチオニン及びシグナル配列を欠くＩｄｅＺに基づいている。
配列番号６〜２５は、本発明の例示的なポリペプチドの配列である。
配列番号２６は、本明細書でコントロールとして用いられるＩｄｅＳポリペプチドの配列である。追加のＮ末端メチオニン及びヒスチジンタグを伴う、配列番号２の配列（内部標準のｐＣＡＲＴ１２４）を含む。
配列番号２７は、本明細書でコントロールとして用いられるＩｄｅＺポリペプチドの配列である。追加のＮ末端メチオニン及びヒスチジンタグを伴う、配列番号４の配列（内部標準のｐＣＡＲＴ１４４）を含む。
配列番号２８は、本明細書でコントロールとして用いられるＩｄｅＳ／Ｚポリペプチドの配列である。追加のＮ末端メチオニン及びヒスチジンタグを伴う、配列番号５の配列（内部標準のｐＣＡＲＴ１４５）を含む。
配列番号２９は、配列番号３の６３位〜７３位に対応する連続配列ＰＬＴＰＥＱＦＲＹＮＮである。
配列番号３０は、配列番号１の５８位〜６５位に対応する連続配列ＰＰＡＮＦＴＱＧである。
配列番号３１は、配列番号３の３５位〜５４位に対応する連続配列ＤＤＹＱＲＮＡＴＥＡＹＡＫＥＶＰＨＱＩＴである。
配列番号３２は、配列番号１の３０位〜４９位に対応する連続配列ＤＳＦＳＡＮＱＥＩＲＹＳＥＶＴＰＹＨＶＴである。
配列番号３３〜５５は、本明細書に開示されるポリペプチドをコードするヌクレオチド配列である。
【００２１】
発明の詳細な説明
開示された生成物及び方法の異なる用途は、当該技術分野の特定のニーズに合わせて調整され得ることが理解されるべきである。本明細書で用いられる用語は、本発明の特定の実施形態を説明するためのみのものであり、限定することを意図するものではないことが理解されるべきである。
【００２２】
更に、本明細書及び添付の特許請求の範囲で用いられる場合、単数形「ａ」、「ａｎ」及び「ｔｈｅ」は、その内容が特に明確に指示しない限り、複数の指示対象を含む。従って、例えば、「ポリペプチド」への言及は、「ポリペプチド（複数）」を含む、などとなる。
【００２３】
「ポリペプチド」は、本明細書においては、その最も広い意味において、２つ以上のサブユニットのアミノ酸、アミノ酸類似体、又は他のペプチド模倣体の化合物を指すために用いられる。従って、用語「ポリペプチド」は、短いペプチド配列、また並びにより長いポリペプチド及びタンパク質を含む。本明細書で用いられる場合、用語「アミノ酸」は、Ｄ又はＬの光学異性体の両方、並びにアミノ酸類似体及びペプチド模倣体を含む、天然及び／若しくは非天然又は合成のアミノ酸のいずれかを指す。
【００２４】
用語「患者」及び「被験体」は交換可能に用いられ、典型的には、ヒトを指す。ＩｇＧへの言及は、特に断らない限り、典型的にはヒトＩｇＧを指す。
【００２５】
本明細書で引用された全ての刊行物、特許及び特許出願は、上記のものか下記のものかにかかわらず、参照によりその全体が、本明細書に組み込まれる。
【００２６】
ポリペプチドの機能的特徴
本発明は、ＩｇＧシステインプロテアーゼ活性を有する新規ポリペプチドに関し、前記ポリペプチドは、ヒトＩｇＧの切断において、ＩｄｅＺよりも有効である。ヒトＩｇＧに対する、本発明のポリペプチドのＩｇＧシステインプロテアーゼ活性は、好ましくは、ヒトＩｇＧに対する、ＩｄｅＳのＩｇＧシステインプロテアーゼ活性と少なくとも同程度に高い。更に、本発明のポリペプチドは、典型的には、ＩｄｅＳよりも免疫原性が低く、好ましくは、免疫原性が、ＩｄｅＺやＩｄｅＳ／Ｚと同程度であり得る。本発明のポリペプチドに対するコントロール又は比較の関係において、「ＩｄｅＳ」、「ＩｄｅＺ」及び「ＩｄｅＳ／Ｚ」は、それぞれ、配列番号２、４及び５のアミノ酸配列からなるポリペプチドを指す。代替的に、又は追加的に、コントロール又は比較として用いられる場合、「ＩｄｅＳ」、「ＩｄｅＺ」及び「ＩｄｅＳ／Ｚ」は、それぞれ、標準的な細菌発現系における発現及びそれからの単離を促進するために、付加的な、メチオニン（Ｍ）残基をＮ末端に、及び／又はタグをＣ末端に伴う、配列番号２、４及び５のアミノ酸配列（ｔｈｅ  ｓｅｑｕｅｎｃｅ  ｔｈｅ  ａｍｉｎｏ  ａｃｉｄ  ｓｅｑｕｅｎｃｅ  ｏｆ）を含むポリペプチドを指し得る。好適なタグとしては、ポリペプチドのＣ末端に直接連結され得るか、又は３つ、４つ又は５つのグリシン残基等の任意の好適なリンカー配列によって間接的に連結され得るヒスチジンタグが挙げられる。ヒスチジンタグは、典型的には６つのヒスチジン残基からなるが、これよりも長く、典型的には、最大７つ、８つ、９つ、１０個又は２０個のアミノ酸で、又はこれよりも短く、例えば５つ、４つ、３つ、２つ又は１つのアミノ酸であり得る。本明細書で用いられる例示的なＩｄｅＳポリペプチドの配列は、配列番号２２として示されているコントロールである（ｉｓ  ａ  ｃｏｎｔｒｏｌ  ｉｓ  ｐｒｏｖｉｄｅｄ  ａｓ  ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２２）。このポリペプチドは、追加のＮ末端メチオニン及びヒスチジンタグを有する配列番号２の配列を含み、本明細書ではｐＣＡＲＴ１２４と言われる場合がある。本明細書で用いられる、例示的なＩｄｅＺポリペプチドの配列は、配列番号２３として示されているコントロールである（ｉｓ  ａ  ｃｏｎｔｒｏｌ  ｉｓ  ｐｒｏｖｉｄｅｄ  ａｓ  ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２３）。このポリペプチドは、追加のＮ末端メチオニン及びヒスチジンタグを有する配列番号４の配列を含み、本明細書ではｐＣＡＲＴ１４４と言われる場合がある。本明細書で用いられる、例示的なＩｄｅＳ／Ｚポリペプチドの配列は、配列番号２４として示されているコントロールである（ｉｓ  ａ  ｃｏｎｔｒｏｌ  ｉｓ  ｐｒｏｖｉｄｅｄ  ａｓ  ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２４）。このポリペプチドは、追加のＮ末端メチオニン及びヒスチジンタグを有する配列番号５の配列を含み、本明細書ではｐＣＡＲＴ１４５と言われる場合がある。
【００２７】
ＩｇＧシステインプロテアーゼ活性は、任意の好適な方法によって、例えば、ポリペプチドを、ＩｇＧを含有する試料とインキュベーションし、ＩｇＧ切断産物の存在を判断することによって評価され得る。有効性は、中和抗体等の阻害剤の存在下又は非存在下で評価され得る。しかしながら、本明細書における有効性は、特に断らない限り、通常、かかる阻害剤の非存在下で評価される有効性を意味する。好適な方法は実施例に記載されている。ＩｇＧの切断におけるポリペプチドの有効性は、本明細書において、ポリペプチドの「効力」と言われる場合がある。本発明のポリペプチドの効力は、好ましくは、同じアッセイで測定したＩｄｅＺの効力より少なくとも２．０倍大きい。或いは、本発明のポリペプチドの効力は、好ましくは、同じアッセイで測定したＩｄｅＳの効力と少なくとも同等である。本発明のポリペプチドの効力は、同じアッセイで測定したＩｄｅＳの効力より、少なくとも１．５倍、２．０倍、２．５倍、３．０倍、４．０倍、４．５倍、５．０倍、６．０倍、７．０倍、７．５倍又は８．０倍大きい場合がある。本発明のポリペプチドの効力は、好ましくは、同じアッセイで測定したＩｄｅＳの効力より少なくとも２．０倍、より好ましくは少なくとも３．０又は４．０倍、最も好ましくは少なくとも８．０倍大きい。
【００２８】
本発明のポリペプチドは、典型的には、ＩｄｅＳよりも免疫原性が低いので、ヒトＩｇＧに対するシステインプロテアーゼ活性に関しては、ＩｄｅＺの効力に対する効力の増加及び／又はＩｄｅＳの効力と同等の効力が、許容される、最低の水準である。しかしながら、ＩｄｅＳと比較した、効力の増加は、望ましい向上である。かかる効力の増加により、典型的には、より高い用量のＩｄｅＳと同じ治療効果を目的として、より低い用量の本発明のポリペプチドの使用が可能となる。該より低い用量により、ＩｄｅＳと比較して、本発明のポリペプチドの、より多くの反復投与も可能になり得る。これは、より低い用量の使用では、免疫系が、より低い濃度で存在する薬剤に応答する可能性が低く、又はそれほど激しく応答しないため、治療剤の、免疫原性に関連する問題を軽減するからである。
【００２９】
ポリペプチドの効力を評価するためのアッセイである、ＩｇＧの切断における、ポリペプチドの有効性を評価するためのアッセイは、当該技術分野で周知であり、任意の好適なアッセイが用いられ得る。好適なアッセイとしては、実施例に記載されるもの等の、ＥＬＩＳＡに基づくアッセイが挙げられる。かかるアッセイにおいて、アッセイプレートのウェルは、典型的には、ウシ血清アルブミン（ＢＳＡ）等の抗体標的でコーティングされる。本実施例では、次いで、試験するポリペプチドの試料がウェルに加えられ、続いてＢＳＡに特異的な抗体である標的特異的抗体の試料が加えられる。ポリペプチド及び抗体が、ＩｇＧシステインプロテアーゼ活性に好適な条件下で相互作用させられる。好適な間隔の後、アッセイプレートが洗浄され、標的特異的抗体に特異的に結合する検出抗体が、標的特異的抗体への結合に好適な条件下で加えられる。検出抗体は、各ウェル中で標的に結合している、任意の無傷標的特異的抗体に結合する。洗浄後、ウェル中に存在する検出抗体の量は、そのウェルに結合した標的特異的抗体の量に比例する。検出抗体は、標識又は別のレポーター系（酵素等）に直接的又は間接的に結合され得、各ウェル中に残っている検出抗体の量が決定され得る。ウェル中に存在した、試験したポリペプチドの効力が高いほど、残存する無傷標的特異的抗体は少なく、従って検出抗体が少なくなる。典型的には、試験したポリペプチドの効力が、ＩｄｅＳの効力と直接比較され得るように、ある特定のアッセイプレート上の少なくとも１つのウェルは、試験するポリペプチドの代わりにＩｄｅＳを含む。比較のために、ＩｄｅＺ及びＩｄｅ／Ｚも含められ得る。
【００３０】
他のアッセイは、試験したポリペプチドによるＩｇＧの切断から生じるＩｇＧの断片を、直接可視化及び／又は定量することによって、試験したポリペプチドの効力を決定し得る。このタイプのアッセイも、実施例に記載されている。かかるアッセイでは、典型的には、ＩｇＧの試料が、滴定シリーズにおける種々の濃度の試験ポリペプチドと（又はコントロールとしてＩｄｅＳ、ＩｄｅＺ及びＩｄｅＳ／Ｚの１つ以上と）インキュベーションされる。次いで、各濃度でのインキュベーションから生じる生成物が、ゲル電気泳動を用いて、例えばＳＤＳ−ＰＡＧＥにより、分離される。次いで、ＩｇＧ全体及びＩｇＧの切断から生じる断片が、サイズによって同定され得、好適な色素による染色強度によって定量化され得る。切断断片の量が多いほど、ある特定の濃度で試験したポリペプチドの効力は大きい。本発明のポリペプチドは、典型的には、ＩｄｅＺ及び／又はＩｄｅＳよりも低い濃度（滴定シリーズにおける、より低いポイント（ｐｏｉｎｔ））で、検出可能な量の切断断片を生成する。各切断イベントから生じる、種々の断片の量も決定され得るので、このタイプのアッセイは、ＩｇＧ分子の第１又は第２の重鎖の切断において、より有効である試験ポリペプチドの同定も可能にし得る。本発明のポリペプチドは、特にＩｇＧがＩｇＧ２アイソタイプである場合、ＩｇＧ分子の、第２の鎖よりも第１の鎖の切断において、より有効であり得る（図１８の模式図参照）。本発明のポリペプチドは、ＩｇＧ２よりも、ＩｇＧ１の切断においてより有効であり得る。
【００３１】
このタイプのアッセイは、また、ＩｄｅＳ特異的ＡＤＡの存在が本発明のポリペプチドの効力を低下させ得る程度を決定するために、適合され得る。適合されたアッセイにおいては、ＩｇＧの試料を試験ポリペプチドと（又はコントロールとしてのＩｄｅＳと）インキュベーションする際に、ＩｄｅＳ特異的ＡＤＡを含有する血清又はＩＶＩｇ調製物が、反応溶媒と共に含められる。好ましくは、本発明のポリペプチドの効力は、ＡＤＡの存在によって影響されないか、又は同じアッセイにおいて、ＩｄｅＳの効力よりも、ＡＤＡの存在によってあまり減少しない。言い換えれば、好ましくは、本発明のポリペプチドに対するＩｄｅＳ特異的ＡＤＡの中和効果は、同じアッセイで測定される、ＩｄｅＳに対する、ＩｄｅＳ特異的ＡＤＡの中和効果と同じか、又はそれより低い。
【００３２】
上記の通り、本発明のポリペプチドは、典型的には、ＩｄｅＳよりも免疫原性が低い。即ち、本発明のポリペプチドは、同等の用量又は濃度で存在し、同じアッセイで測定される場合、ＩｄｅＳと同じか、又は好ましくはより低い免疫応答をもたらし得る。本発明のポリペプチドの免疫原性は、典型的には、同じアッセイで測定したＩｄｅＳの免疫原性の、５０％以下、４５％以下、４０％以下、３５％以下、３０％以下、又は２５％以下である。好ましくは、本発明のポリペプチドの免疫原性は、同じアッセイで測定したＩｄｅＳの免疫原性の２５％以下である。
【００３３】
ポリペプチドの免疫原性を評価するためのアッセイも、当該技術分野で周知であり、任意の好適なアッセイが用いられ得る。ポリペプチドの免疫原性を、ＩｄｅＳの免疫原性と比較して評価するための好ましいアッセイは、ＩｄｅＳに特異的なＡＤＡが、本発明のポリペプチドにも結合する程度を評価することを含む。このタイプのアッセイは実施例に記載されている。
【００３４】
かかるアッセイの１つは、ＩｄｅＳ特異的ＡＤＡへの結合についての、ＩｄｅＳと試験ポリペプチドとの間の競合についての試験を含む。典型的には、アッセイプレートのウェルがＩｄｅＳでコーティングされ、続いて、プレインキュベーションされた、ＩｄｅＳ特異的ＡＤＡを含有する溶液（例、ＩＶＩｇ調製物）、及び試験ポリペプチド（又はコントロールとしてのＩｄｅＳ）の混合物が投与される。プレインキュベーションは、タンパク質とＡＤＡとの間の高親和性結合のみが可能となるように、ＩｇＧシステインプロテアーゼ活性の阻害剤、例、ヨード酢酸（ｉｏｄｏａｃｅｔｉｃ  ａｃｉｄ）（ＩＨＡｃ）の存在下、及び高塩濃度で行われる。プレインキュベーションした混合物は、ＩｄｅＳでコーティングしたウェルと相互作用させられる。試験ポリペプチドに結合していないＩｄｅＳ特異的ＡＤＡは、いずれも、ウェル上のＩｄｅＳに結合する。好適な間隔の後、アッセイプレートが洗浄され、ＩｇＧに特異的に結合する検出抗体が、結合に好適な条件下で加えられる。検出抗体は、各ウェル中の、ＩｄｅＳに結合した任意のＡＤＡに結合する。洗浄後、ウェル中に存在する検出抗体の量は、試験ポリペプチドに結合していたＡＤＡの量に反比例する。検出抗体は、各ウェル中に残存する検出抗体の量が決定され得るように、標識又は別のレポーター系（酵素等）に直接的又は間接的に結合され得る。典型的には、ＡＤＡの、試験したポリペプチドへの結合を、ＩｄｅＳへの結合と直接的に比較し得るように、ある特定のアッセイプレート上の少なくとも１つのウェルで、試験するポリペプチドの代わりに、プレインキュベーションした、ＩＶＩｇ及びＩｄｅＳの混合物が試験され、ＩｄｅＺ及び／又はＩｄｅＳ／Ｚも、更なるコントロールとして含められ得る。
【００３５】
別の好適なアッセイは、種々の濃度のＩｄｅＳ特異的ＡＤＡ、例、ＩＶＩｇ調製物の滴定シリーズが、試験ポリペプチドに結合する程度を、コントロールとしてのＩｄｅＳ及び／又はＩｄｅＺと比較して、試験することを含む。好ましくは、本発明のポリペプチドは、結合が検出可能となるためには、ＩｄｅＳへの結合が検出可能なＡＤＡ濃度と比べて、より高濃度のＡＤＡが必要となる。かかるアッセイは、実施例に記載されている。かかるアッセイは、典型的には、アッセイプレートのウェルを試験ポリペプチド又はコントロールでコーティングすること、続いて各ウェルを滴定シリーズからの種々の濃度のＩｄｅＳ特異的ＡＤＡとインキュベーションすることを含む。インキュベーションは、タンパク質とＡＤＡとの間の高親和性結合のみが可能になるように、ＩｇＧシステインプロテアーゼ活性の阻害剤、例、ヨード酢酸（ＩＨＡｃ）の存在下、及び高塩濃度で行われる。好適な間隔の後、アッセイプレートが洗浄され、ＩｇＧ  Ｆ（ａｂ’）２に特異的に結合する検出抗体が、結合に好適な条件下で加えられる。検出抗体は、各ウェル中の試験ポリペプチド又はＩｄｅＳに結合した任意のＡＤＡに結合する。洗浄後、ウェルに存在する検出抗体の量は、試験ポリペプチド又はコントロールに結合したＡＤＡの量に正比例する。各ウェルに残っている検出抗体の量が決定され得るように、検出抗体は、標識又は別のレポーター系（酵素等）に直接的又は間接的に結合され得る。ある特定のアッセイプレートにおける少なくとも１つのウェルが、ブランクとしての、ＡＤＡを欠く緩衝液とインキュベーションされ、試験ウェルにおける結合の検出のための閾値レベルが設定される。
【００３６】
ポリペプチドの構造的特徴
本節は、前節で概説した機能的特徴に付加的に生かされる（ａｐｐｌｙ  ｉｎ  ａｄｄｉｔｉｏｎ  ｔｏ）、本発明のポリペプチドの構造的特徴を示す。
【００３７】
本発明のポリペプチドは、典型的には、長さが、少なくとも１００、１５０、２００、２５０、２６０、２７０、２８０、２９０、３００又は３１０アミノ酸である。本発明のポリペプチドは、典型的には、長さが４００、３５０、３４０、３３０、３２０又は３１５アミノ酸以下である。上に列挙した下限のいずれかが、上に列挙した上限のいずれかと組み合わされて、本発明のポリペプチドの長さについての範囲が提供され得ることが理解される。例えば、ポリペプチドは、長さが１００〜４００アミノ酸、又は長さが２５０〜３５０アミノ酸であり得る。ポリペプチドは、好ましくは、長さが２９０〜３２０アミノ酸、最も好ましくは、長さが３００〜３１５アミノ酸である。
【００３８】
本発明のポリペプチドの一次構造（アミノ酸配列）は、ＩｄｅＺ又はＩｄｅＳ／Ｚの一次構造に、具体的にはそれぞれ配列番号４又は５のアミノ酸配列に基づく。本発明のポリペプチドの配列は、配列番号４又は５のアミノ酸配列と少なくとも５０％同一である、配列番号４又は５のアミノ酸配列の変異体を含む。変異体配列は、配列番号４又は５の配列と少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、好ましくは少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％又は少なくとも９９％同一であり得る。変異体は、本明細書で同定された１つ以上の特定の改変を含むことを除いて、配列番号４又は５の配列と同一であり得る。配列番号４又は５の配列に対する同一性は、配列番号４又は５に示される配列の少なくとも５０個、少なくとも１００個、少なくとも２００個、少なくとも３００個又はそれ以上の連続したアミノ酸の領域にわたって、又はより好ましくは配列番号４又は５の全長にわたって測定され得る。
【００３９】
アミノ酸の同一性は、任意の好適なアルゴリズムを用いて算出され得る。例えば、ＰＩＬＥＵＰ及びＢＬＡＳＴアルゴリズムは、例えば、Ａｌｔｓｃｈｕｌ  Ｓ．Ｆ．（１９９３）Ｊ  Ｍｏｌ  Ｅｖｏｌ  ３６：２９０−３００；Ａｌｔｓｃｈｕｌ，Ｓ，Ｆ  ｅｔ  ａｌ（１９９０）Ｊ  Ｍｏｌ  Ｂｉｏｌ  ２１５：４０３−１０に記載の通り、（典型的にはそれらの初期設定で）相同性を算出し、又は配列を整列する（ｌｉｎｅ  ｕｐ）（均等又は対応する配列を同定する等）ために使用され得る。ＢＬＡＳＴ解析を行うためのソフトウェアは、Ｎａｔｉｏｎａｌ  Ｃｅｎｔｅｒ  ｆｏｒ  Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ  Ｉｎｆｏｒｍａｔｉｏｎ（ｈｔｔｐ：／／ｗｗｗ．ｎｃｂｉ．ｎｌｍ．ｎｉｈ．ｇｏｖ／）によって公に利用可能である。このアルゴリズムは、データベース配列中の同一の長さのワードとアライメントされた場合に、ある正の値の（ｐｏｓｉｔｉｖｅ−ｖａｌｕｅｄ）閾値スコアＴに一致するか、又はこれを満たすかのいずれかの、クエリ配列（ｑｕｅｒｙ  ｓｅｑｕｅｎｃｅ）中の長さＷの短いワードを同定することにより、最初に、スコアの高い配列ペア（ｈｉｇｈ  ｓｃｏｒｉｎｇ  ｓｅｑｕｅｎｃｅ  ｐａｉｒ，ＨＳＰ）を同定することを含む。Ｔは、近傍ワードスコア閾値（ｎｅｉｇｈｂｏｕｒｈｏｏｄ  ｗｏｒｄ  ｓｃｏｒｅ  ｔｈｒｅｓｈｏｌｄ）と呼ばれる（Ａｌｔｓｃｈｕｌ  ｅｔ  ａｌ、上記）。これらの最初の近傍ワードのヒットは、それらを含有するＨＳＰを発見する検索を開始するためのシードとして機能する。累積アライメントスコア（ｃｕｍｕｌａｔｉｖｅ  ａｌｉｇｎｍｅｎｔ  ｓｃｏｒｅ）が増加し得る限り、該ワードヒットが、各配列に沿って両方向に伸長される。ワードヒットの各方向への伸長は、以下の場合に停止する：累積アライメントスコアがその最大達成値（ｍａｘｉｍｕｍ  ａｃｈｉｅｖｅｄ  ｖａｌｕｅ）から量Ｘだけ低下するとき；１以上の負のスコアの残基アライメント（ｒｅｓｉｄｕｅ  ａｌｉｇｎｍｅｎｔ）の累積に起因して累積スコアがゼロ以下になるとき；又はいずれかの配列の端部に到達するとき。ＢＬＡＳＴアルゴリズムのパラメータＷ，Ｔ及びＸは、アラインメントの感度（ｓｅｎｓｉｔｉｖｉｔｙ）及び速度を決定する。ＢＬＡＳＴプログラムは、初期設定として、ワード長（Ｗ）１１、ＢＬＯＳＵＭ６２スコアリングマトリックス（Ｈｅｎｉｋｏｆｆ  ａｎｄ  Ｈｅｎｉｋｏｆｆ（１９９２）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ  ８９：１０９１５−１０９１９参照）アライメント（Ｂ）５０、期待値（Ｅ）１０、Ｍ＝５、Ｎ＝４、及び両鎖の比較を使用する。
【００４０】
ＢＬＡＳＴアルゴリズムは、２配列間の類似性の統計解析を行う（例、Ｋａｒｌｉｎ  ａｎｄ  Ａｌｔｓｃｈｕｌ（１９９３）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ  ９０：５８７３−５７８７参照）。ＢＬＡＳＴアルゴリズムによって提供される類似性の１基準（ｍｅａｓｕｒｅ）は、ポリヌクレオチド又はアミノ酸の２配列間の一致が偶然に起こる確率の目安を提供する、最小合計確率（ｓｍａｌｌｅｓｔ  ｓｕｍ  ｐｒｏｂａｂｉｌｉｔｙ，Ｐ（Ｎ））である。ある配列が、別の配列と類似であるとみなされるのは、例えば、第１の配列と第２の配列との比較において、最小合計確率が約１未満である場合、好ましくは約０．１未満である場合、より好ましくは約０．０１未満である場合、及び最も好ましくは約０．００１未満である場合である。或いは、ＵＷＧＣＧパッケージは、同一性を算出するために用いられ得るＢＥＳＴＦＩＴプログラム（例えば、その初期設定で用いられる）を提供する（Ｄｅｖｅｒｅｕｘ  ｅｔ  ａｌ（１９８４）Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄｓ  Ｒｅｓｅａｒｃｈ  １２：３８７−３９５）。
【００４１】
本発明のポリペプチドの配列は、アミノ酸の付加、欠失又は置換等の改変が、配列番号４又は５の配列に対してなされる、配列番号４又は５のアミノ酸配列の変異体を含む。特に明記しない限り、改変は、好ましくは保存的アミノ酸置換である。保存的置換は、アミノ酸を、類似の化学構造、類似の化学的特性又は類似の側鎖の嵩の、他のアミノ酸で置換する。導入されるアミノ酸は、それらが置換するアミノ酸に類似の極性、親水性、疎水性、塩基性度、酸性度、中性度又は電荷を有し得る。或いは、保存的置換は、前から存在する芳香族又は脂肪族のアミノ酸の代わりに芳香族又は脂肪族である別のアミノ酸を導入し得る。保存的なアミノ酸の変化は当該技術分野で周知であり、以下の表Ａ１に記載の通りの、２０の主要アミノ酸の特性に従って選択され得る。アミノ酸が同様の極性を有する場合、これは、表Ａ２における、アミノ酸側鎖についてのハイドロパシースケールを参照することによって決定され得る。
【００４２】
【表１】
2018510622.tif 000003
【００４３】
【表２】
2018510622.tif 000004
【００４４】
本発明のポリペプチドのアミノ酸配列は、配列番号４又は５のアミノ酸配列の変異体を含む。しかしながら、配列番号４又は５のアミノ酸配列における特定の残基は、好ましくは、前記変異体配列内に保持される。例えば、前記変異体配列は、典型的には、ＩｇＧシステインプロテアーゼ活性に必要とされることが知られている特定の残基を保持する。従って、配列番号３の１０２位のシステインは、本発明のポリペプチドのアミノ酸配列中に保持されなければならない（配列番号４又は５の６８番目の残基）。場合により、配列番号３の９２位のリシン（Ｋ）、２７２位のヒスチジン（Ｈ）、並びに２９４位及び２９６位のそれぞれのアスパラギン酸（Ｄ）も保持される。これらは、それぞれ、配列番号４のＮ末端から５８番目、２３８番目、２６０番目及び２６２番目の残基、並びに配列番号５のＮ末端から５８番目、２３６番目、２５８番目及び２６０番目である。従って、本発明のポリペプチドは、典型的には、配列番号３の１０２位に対応する前記変異配列の位置にシステイン（Ｃ）を有する、配列番号２のアミノ酸配列の変異体を含み；且つ場合により、前記変異体配列中の、配列番号３の９２位、２７２位、２９４位及び２９６位に対応する位置に、それぞれ、リジン（Ｋ）、ヒスチジン（Ｈ）、アスパラギン酸（Ｄ）及びアスパラギン酸（Ｄ）を有する。
【００４５】
上記の構造上の制約から始めて、本発明者らは、ＩｄｅＳの三次元モデルを評価することにより、ＩｄｅＳの機能的特性を調節するための改変用に、特定の位置を同定した。本発明者らは以下のことを同定した：
（１）配列番号３の１３８位のアスパラギン（Ｎ）を、正に荷電したアミノ酸で置換することにより、この変化を組み込んだポリペプチドの効力が増強される。従って、本発明のポリペプチドは、配列番号３の１３８位に対応する前記変異体中の位置に、正に荷電したアミノ酸を有する、配列番号４又は５のアミノ酸配列の変異体を含み得る。一般的な、正に荷電したアミノ酸が上記の表Ａ１に同定されている。正に荷電したアミノ酸は、好ましくはアルギニン（Ｒ）又はリジン（Ｋ）である。従って、この特定の改変は、本明細書では用語「Ｎ１３８Ｒ／Ｋ」によって同定され得る。
（２）配列番号３の１３９位のアスパラギン（Ｎ）を、正に荷電したアミノ酸で置換することにより、この変化を組み込んだポリペプチドの効力が増強される。従って、本発明のポリペプチドは、配列番号３の１３９位に対応する前記変異体中の位置に正に荷電したアミノ酸を有する、配列番号４又は５のアミノ酸配列の変異体を含み得る。一般的な、正に荷電したアミノ酸は、上記の表Ａに同定されている。正に荷電したアミノ酸は、好ましくはアルギニン（Ｒ）又はリジン（Ｋ）である。従って、この特定の改変は、本明細書では用語「Ｎ１３９Ｒ／Ｋ」によって同定され得る。
（３）配列番号３のＮ末端の最初の２０残基を欠失させることは、効力に悪影響を及ぼすことなく、この変化を組み込むポリペプチドの効力を増強し得、及び／又は免疫原性を低下させ得る。配列番号３のＮ末端の最初の２０残基は、連続配列ＤＤＹＱＲＮＡＴＥＡＹＡＫＥＶＰＨＱＩＴからなる。従って、本発明のポリペプチドは、連続配列ＤＤＹＱＲＮＡＴＥＡＹＡＫＥＶＰＨＱＩＴを含まない、配列番号４又は５のアミノ酸配列の変異体を含み得る。即ち、配列番号４又は５のＮ末端の最初の２０残基は、配列番号４又は５の前記変異体には存在しなくてもよい。配列番号４及び５の最初の２０残基は、配列番号３の３５位〜５４位に対応する。従って、この特定の改変は、本明細書では用語「Ｄ３５＿Ｔ５４ｄｅｌ」によって同定され得る。
（４）配列番号３の６３位〜７３位に対応する領域は、本発明のポリペプチドのＩｇＧシステインプロテアーゼ活性にとって重要である。この領域における改変は、主に、ポリペプチドの、第２のＩｇＧ重鎖を切断する能力を向上させるが、それは、第１のＩｇＧ重鎖の切断も増強する。具体的には、この領域内の１以上の残基を、ＩｄｅＳの相当領域における、対応する残基（又は対応する残基と類似の特徴を有するアミノ酸）を選択して改変することにより、本発明のポリペプチドの効力が増大する。ＩｄｅＳにおける相当領域は、配列番号１の５８位〜６５位に対応する。以下のアラインメントは、配列番号１の５８位〜６５位と並列した、配列番号３の６３位〜７３位を示す。
６３ＰＬＴＰＥＱＦＲＹＮＮ７３    （ＩｄｅＺの領域、配列番号３）
５８Ｐ−−ＰＡＮＦＴ−ＱＧ６５    （ＩｄｅＳの領域、配列番号１）
「−」は残基がないことを示す
従って、本発明のポリペプチドは、配列番号４又は５のアミノ酸配列の変異体を含み得、その変異体は、以下の改変の少なくとも１つを有し得る：
ｉ．前記変異体中の、配列番号３の６４位及び６５位に対応する位置における、ロイシン（Ｌ）及びスレオニン（Ｔ）残基の欠失；
ｉｉ．前記変異体中の、配列番号３の７０位に対応する位置における、アルギニン（Ｒ）に代わるスレオニン（Ｔ）；
ｉｉｉ．前記変異体中の、配列番号３の７１位に対応する位置における、チロシン（Ｙ）の欠失；
ｉｖ．前記変異体中の、配列番号３の７２位に対応する位置における、アスパラギン（Ｎ）に代わるグルタミン（Ｑ）；
ｖ．前記変異体中の、配列番号３の７３位に対応する位置における、アスパラギン（Ｎ）に代わるグリシン（Ｇ）；
ｖｉ．前記変異体中の、配列番号３の６７位に対応する位置における、グルタミン酸（Ｅ）に代わるアラニン（Ａ）；
ｖｉｉ．前記変異体中の、配列番号３の６８位に対応する位置における、グルタミン（Ｑ）に代わるアスパラギン（Ｎ）。
選択肢ｉ〜ｖｉｉからの少なくとも１つの改変は、通常、上記の選択肢ｉ〜ｖから選択される。本発明のポリペプチドは、配列番号４又は５のアミノ酸配列の変異体を含み得、該変異体は、ｉ〜ｖの少なくとも２つ、３つ、４つ、又は５つ全ての改変を有する。好ましくは、前記変異体は、４つの改変ｉｉ〜ｖの全てのうち少なくとも１つ、２つ、３つを有し、且つ場合により改変ｉも存在する。特に好ましい前記変異体においては、改変ｉ〜ｖの全てが存在する。
【００４６】
従って、まとめると、本発明のポリペプチドは、配列番号４又は５の配列の変異体を含み、該変異体は：
（ａ）配列番号４又は５に対して少なくとも５０％同一であり；
（ｂ）前記変異体配列中の、配列番号３の１０２位に対応する位置にシステイン（Ｃ）を有し；及び場合により
（ｃ）前記変異体配列中の、配列番号３の９２位、２７２位、２９４位及び２９６位に対応する位置に、それぞれ、リジン（Ｋ）、ヒスチジン（Ｈ）、アスパラギン酸（Ｄ）及びアスパラギン酸（Ｄ）を有する。
好ましくは、配列番号４又は５の前記変異体は：
（１）前記変異体中の、配列番号３の１３８位に対応する位置に、正に荷電したアミノ酸を有し、場合により、前記正に荷電したアミノ酸がアルギニン（Ｒ）又はリジン（Ｋ）であり；及び／又は
（２）前記変異体中の、配列番号３の１３９位に対応する位置に、正に荷電したアミノ酸を有し、場合により、前記正に荷電したアミノ酸がアルギニン（Ｒ）又はリジン（Ｋ）であり；及び／又は
（３）連続配列ＤＤＹＱＲＮＡＴＥＡ  ＹＡＫＥＶＰＨＱＩＴを含まず；及び／又は
（４）以下の改変：
ｉ．前記変異体中の、配列番号３の６４位及び６５位に対応する位置における、ロイシン（Ｌ）及びスレオニン（Ｔ）残基の欠失；
ｉｉ．前記変異体中の、配列番号３の７０位に対応する位置における、アルギニン（Ｒ）に代わるスレオニン（Ｔ）；
ｉｉｉ．前記変異体中の、配列番号３の７１位に対応する位置における、チロシン（Ｙ）の欠失；
ｉｖ．前記変異体中の、配列番号３の７２位に対応する位置における、アスパラギン（Ｎ）に代わるグルタミン（Ｑ）；
ｖ．前記変異体中の、配列番号３の７３位に対応する位置における、アスパラギン（Ｎ）に代わるグリシン（Ｇ）；
ｖｉ．前記変異体中の、配列番号３の６７位に対応する位置における、グルタミン酸（Ｅ）に代わるアラニン（Ａ）；
ｖｉｉ．前記変異体中の、配列番号３の６８位に対応する位置における、グルタミン（Ｑ）に代わるアスパラギン（Ｎ）
の少なくとも１つを有し、
少なくとも１つの（４）の改変は、通常、選択肢ｉ〜ｖから選択され、好ましくは、選択肢ｉｉ〜ｖの全てが、場合により選択肢ｉも伴い、存在する。
【００４７】
本発明のポリペプチドは、典型的には、配列番号４又は５のアミノ酸配列の変異体を含み、該変異体は、上記の（１）〜（４）の改変の少なくとも１つ、２つ、３つ又は４つ全てを含む。前記変異体は、（１）〜（４）の改変の２つ又は３つの任意の組み合わせを含み得る。好ましい変異体は、改変（３）並びに改変（１）及び（２）の少なくとも１つを含む。或いは、変異体は、上記の（１）〜（３）の改変のいずれも含まない場合がある。
【００４８】
本発明者らは、上記の改変の任意の組み合わせに代えて、又はそれに加えて適用され得る、配列番号４又は５の配列に対する特定の他の改変が、本発明のポリペプチド効力を増大させ、及び／又はＩｄｅＳ特異的ＡＤＡによる本発明のポリペプチドの認識を低下させ得ることも究明した。従って、上記の改変に代えて、又はそれに加えて、本発明のポリペプチドは：
（Ａ）置換が、配列番号３の８４位、９３位、９５位、９７位、１３７位、１４０位、１４７位、１５０位、１６２位、１６５位、１６６位、１７１位、１７４位、２０５位、２２６位、２３７位、２３９位、２４３位、２５０位、２５１位、２５４位、２５５位、２８２位、２８８位、３１２位、３１５位、３４７位、３４９位に対応する位置の１以上においてなされ、及び／又は配列番号３の３６位〜５３位に対応する連続配列が、配列番号２の３１位〜４８位における連続配列で置換されている（この変化が「Ｄ３６＿Ｉ５３置換Ｓ３１＿Ｖ４８−配列番号２」と言われる場合がある）、配列番号４の配列の変異体；
又は
（Ｂ）置換が、７７位、９３位、９５位、９９位、１４０位、１４１位、１４７位、１５０位、１６２位、１７１位、１７４位、１７５位、１７６位、１７７位、２０６位、２２４位、２３７位、２４１位、２４２位、２４５位、２４６位、２４９位、２５３位、２６７位、２８０位、２８６位、３１０位、３１１位、３１３位、３４４位、３４５位、３４６位、３４７位に対応する、１以上の位置においてなされる、配列番号５の配列の変異体
を含み得る。
【００４９】
前記変異体（Ａ）は、列挙された位置の全て、又は列挙された位置の１つ以上の任意の組み合わせにおける置換を含み得るが、典型的には、これらの位置の１２個、１１個又は１０個以下の置換を含む。
【００５０】
前記変異体（Ｂ）は、列挙された位置の全て、又は列挙された位置の１つ以上の任意の組み合わせにおける置換を含み得るが、典型的には、これらの位置の３０個以下の置換を含む。
【００５１】
置換は、典型的には、存在するアミノ酸を、種々の特性を有する別のアミノ酸で置換する。例えば、荷電していないアミノ酸は、荷電したアミノ酸で置換され得、逆もまた同様である。これらの位置における好ましい置換は、以下の表Ｂ１及びＢ２に１文字コードを用いて記載されている：
【００５２】
【表３】
2018510622.tif 000005
【００５３】
【表４】
2018510622.tif 000006
【００５４】
表Ｂ１及びＢ２中の置換の各々は、各行ごとに、左から右へ、第１列、第２列及び第３列の項目を組み合わせることによって得られる用語を用いて、本明細書で言及され得る。例えば、表Ｂ１の第１行における置換は、本明細書では「Ｈ８４Ｎ」と言われる場合があり、第２行における置換は「Ａ９３Ｔ」と言われる場合がある、という具合である。表Ｂ１における具体的な改変「Ｄ２２６Ｎ」及び表Ｂ２における「Ｄ２２４Ｎ」は、配列番号３の２２４位〜２２６位の連続したＲＧＤ配列である、ＩｄｅＺ及びＩｄｅＳ／Ｚの配列における既知の細胞接着モチーフを破壊することを意図している。
【００５５】
以下の表Ｃ１及びＣ２に、本発明の特定の例示的なポリペプチドのアミノ酸配列を製造するためになされた改変をまとめる。
【００５６】
【表５】
2018510622.tif 000007
【００５７】
【表６】
2018510622.tif 000008
【００５８】
配列番号１〜５の各々のアミノ酸配列を、以下に完全に再掲し、続いて表Ｃ１及びＣ２に記載した本発明の例示的ポリペプチドの各々のアミノ酸配列を示す。
【００５９】
【化１−１】
2018510622.tif 000009
【００６０】
【化１−２】
2018510622.tif 000010
【００６１】
【化１−３】
2018510622.tif 000011
【００６２】
本発明のポリペプチドは、配列番号６〜２５のいずれか１つの配列を含み、それから実質的になり、又は、それからなり得る。配列番号６〜２５のそれぞれは、場合により、メチオニンをＮ末端に、及び／又は、ヒスチジンタグをＣ末端に、更に含み得る。ヒスチジンタグは、好ましくは６つのヒスチジン残基からなる。ヒスチジンタグは、好ましくは、３×グリシン残基又は５×グリシン残基のリンカーによって、Ｃ末端に連結される。
【００６３】
ポリペプチドの製造
本明細書に開示される通りのポリペプチドは、任意の好適な手段によって製造され得る。例えば、ポリペプチドは、Ｆｍｏｃ固相化学、Ｂｏｃ固相化学又は溶液相ペプチド合成等の、当該技術分野で公知の標準的技術を用いて直接的に合成され得る。或いは、ポリペプチドは、細胞、典型的には細菌細胞を、前記ポリペプチドをコードする核酸分子又はベクターで形質転換することによって製造され得る。細菌宿主細胞における発現によるポリペプチドの製造は、以下に記載され、実施例に例示される。本発明は、本発明のポリペプチドをコードする核酸分子及びベクターを提供する。本発明は、かかる核酸又はベクターを含む宿主細胞も提供する。本明細書に開示されるポリペプチドをコードする、例示的なポリヌクレオチド分子は、配列番号３３〜５５として示される。これらの配列の各々は、３’末端にＮ末端メチオニンのコドン（ＡＴＧ）を含み、５’末端の終止コドン（ＴＡＡ）の前に、３×グリシンのリンカー及び６×ｈｉｓのヒスチジンタグのコドンを含み、それらは場合により除去され得る。
【００６４】
用語「核酸分子」及び「ポリヌクレオチド」は、本明細書では交換可能に用いられ、任意の長さのヌクレオチド（デオキシリボヌクレオチド若しくはリボヌクレオチドのいずれか又はそれらの類似体）のポリマー形態を指す。ポリヌクレオチドの非限定的な例としては、遺伝子、遺伝子断片、メッセンジャーＲＮＡ（ｍＲＮＡ）、ｃＤＮＡ、組換えポリヌクレオチド、プラスミド、ベクター、任意の配列の単離されたＤＮＡ、任意の配列の単離されたＲＮＡ、核酸プローブ及びプライマーが挙げられる。本発明のポリヌクレオチドは、単離又は実質的に単離された形態で提供され得る。実質的に単離されるとは、周囲の任意の培地から、ポリペプチドが実質的に単離されているが完全ではない場合があることを意味する。ポリヌクレオチドは、それらの意図される使用を妨げない担体又は希釈剤と混合され得、依然として実質的に単離されているとみなされ得る。選択されたポリペプチドを「コードする」核酸配列は、適切な調節配列の制御下（例えば、発現ベクター中）に置かれた場合に、インビボで転写され（ＤＮＡの場合）、ポリペプチドに翻訳される（ｍＲＮＡの場合）核酸分子である。コード配列の境界は、５’（アミノ）末端の開始コドン及び３’（カルボキシ）末端の翻訳停止コドンによって決定される。本発明の目的のためには、かかる核酸配列としては、ウイルス、原核生物又は真核生物のｍＲＮＡ由来のｃＤＮＡ、ウイルス又は原核生物のＤＮＡ又はＲＮＡ由来のゲノム配列、更には合成ＤＮＡ配列が挙げられ得るが、これらに限定されない。転写終結配列が、コード配列の３’に位置し得る。
【００６５】
ポリヌクレオチドは、Ｓａｍｂｒｏｏｋ  ｅｔ  ａｌ  （１９８９，Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｃｌｏｎｉｎｇ−ａ  ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  ｍａｎｕａｌ；Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｏｒ  Ｐｒｅｓｓ）における例に記載されている通りの、当該技術分野で周知の方法に従って合成され得る。本発明の核酸分子は、挿入された配列に作動可能に連結された制御配列を含む発現カセットの形態で提供され得、従ってインビボでの本発明のポリペプチドの発現を可能にする。これらの発現カセットは、典型的には、次にベクター（例、プラスミド又は組換えウイルスベクター）内に提供される。かかる発現カセットは、宿主被験体に直接的に投与され得る。或いは、本発明のポリヌクレオチドを含むベクターが、宿主被験体に投与され得る。好ましくは、ポリヌクレオチドは、遺伝子ベクターを用いて調製及び／又は投与される。好適なベクターは、十分な量の遺伝情報を運搬することができ、本発明のポリペプチドを発現させることができる、任意のベクターであり得る。
【００６６】
従って、本発明は、かかるポリヌクレオチド配列を含む発現ベクターを含む。かかる発現ベクターは、分子生物学の分野において日常的に構築されており、本発明のペプチドの発現を可能にするために、例えばプラスミドＤＮＡ及び適切なイニシエーター、プロモーター、エンハンサー及び他のエレメント、例えば必要であり得るポリアデニル化シグナル等の使用を含み得、これらは適正な方向性で配置される。他の好適なベクターは、当業者には明らかである。これに関する更なる例として、我々は、Ｓａｍｂｒｏｏｋ  ｅｔ  ａｌを引用する。
【００６７】
本発明は、本発明のポリペプチドを発現するように改変された細胞も含む。かかる細胞としては、典型的には、細菌細胞、例えばＥ．コリ、等の原核細胞が挙げられる。かかる細胞は、本発明のポリペプチドを製造するための通常の方法を用いて培養され得る。
【００６８】
ポリペプチドは、それらの製造、単離又は精製を促進するために、誘導体化又は修飾され得る。例えば、細菌宿主細胞における組換え発現によって、本発明のポリペプチドが製造される場合、ポリペプチドの配列は、発現を向上させるために、Ｎ末端に更なるメチオニン（Ｍ）残基を含み得る。別の例として、本発明のポリペプチドは、分離手段に直接且つ特異的に結合できるリガンドの付加によって誘導体化又は修飾され得る。或いは、ポリペプチドは、結合対の一方のメンバーの付加によって誘導体化又は修飾され得、分離手段は、結合対の他方のメンバーの付加によって誘導体化又は修飾される試薬を含む。任意の好適な結合対が用いられ得る。本発明において使用するためのポリペプチドが、結合対の一方のメンバーの付加によって誘導体化又は修飾される好ましい実施形態においては、ポリペプチドは、好ましくはヒスチジンタグ付き又はビオチンタグ付きである。典型的には、ヒスチジン又はビオチンのタグのアミノ酸コード配列が、遺伝子レベルで含められ、ポリペプチドはＥ．コリで組換え発現する。ヒスチジン又はビオチンのタグは、典型的には、ポリペプチドのいずれかの末端に、好ましくはＣ末端に存在する。それは、ポリペプチドに直接的に連結されてもよく、３つ、４つ又は５つのグリシン残基等の任意の好適なリンカー配列によって間接的に連結されてもよい。ヒスチジンタグは、典型的には６つのヒスチジン残基からなるが、これよりも長く、典型的には、最大７つ、８つ、９つ、１０個又は２０個のアミノ酸又はこれよりも短く、例えば５つ、４つ、３つ、２つ又は１つのアミノ酸であり得る。
【００６９】
ポリペプチドのアミノ酸配列は、例えば安定性を高めるために、天然に存在しないアミノ酸を含むように改変され得る。ポリペプチドが合成手段によって製造される場合、かかるアミノ酸は製造中に導入され得る。ポリペプチドは、また、合成又は組換えでの製造のいずれかに続けて改変され得る。ポリペプチドは、また、Ｄ−アミノ酸を用いて製造され得る。かかる場合、アミノ酸は、ＣからＮの向きで逆の順序で連結される。これは、かかるポリペプチドを製造するための技術分野において慣用的である。
【００７０】
当該技術分野においては、多くの側鎖修飾が知られており、ポリペプチドが、本明細書で特定され得る通りの、更に必要とされる任意の活性又は特性を保持することを条件として、ポリペプチドの側鎖に対してなされ得る。ポリペプチドは、化学的に修飾（例、翻訳後修飾）され得ることも理解される。例えば、それらはグリコシル化、リン酸化され得、又は修飾アミノ酸残基を含み得る。
【００７１】
ポリペプチドは、ＰＥＧ化されていてもよい。本発明のポリペプチドは、実質的に単離された形態であり得る。それは、意図される使用を妨げない担体又は希釈剤と混合され得、依然として実質的に単離されているとみなされ得る。また、それは、実質的に精製された形態であり得、その場合、一般に、少なくとも９０％、例、少なくとも９５％、９８％又は９９％のタンパク質を、標品中に含む。
【００７２】
ポリペプチドを含む組成物及び製剤
別の態様においては、本発明は、本発明のポリペプチドを含む組成物を提供する。例えば、本発明は、本発明の１以上のポリペプチド及び少なくとも１つの医薬的に許容可能な担体又は希釈剤を含む組成物を提供する。担体（複数可）は、組成物の他の成分と適合し、組成物が投与される被験体に有害ではないという意味で「許容可能」でなければならない。典型的には、担体及び最終組成物は、無菌で、発熱物質（ｐｙｒｏｇｅｎ）フリーである。
【００７３】
好適な組成物の製剤化は、全てが、当業者に容易に利用可能である、標準的な医薬処方化学及び方法論を用いて行われ得る。例えば、薬剤は、１以上の医薬的に許容可能な賦形剤又はビヒクルと組み合わせられ得る。湿潤剤又は乳化剤、ｐＨ緩衝物質、還元剤等の補助物質が、賦形剤又はビヒクル中に存在し得る。好適な還元剤としては、システイン、チオグリセロール、チオレデューシン（ｔｈｉｏｒｅｄｕｃｉｎ）、グルタチオン等が挙げられる。賦形剤、ビヒクル及び補助物質は、一般に、組成物を受容する個体において免疫応答を誘導せず、過度の毒性を伴わずに投与され得る医薬品である。医薬的に許容可能な賦形剤としては、水、生理食塩水、ポリエチレングリコール、ヒアルロン酸、グリセロール、チオグリセロール及びエタノール等の液体が挙げられるが、これらに限定されない。医薬的に許容可能な塩、例えば、塩酸塩、臭化水素酸塩、リン酸塩、硫酸塩等の鉱酸塩；及び酢酸塩、プロピオン酸塩、マロン酸塩、安息香酸塩等の有機酸の塩も、それに含められ得る。医薬的に許容可能な賦形剤、ビヒクル及び補助物質の詳細な検討は、Ｒｅｍｉｎｇｔｏｎ’ｓ  Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ  Ｓｃｉｅｎｃｅｓ（Ｍａｃｋ  Ｐｕｂ．Ｃｏ．，Ｎ．Ｊ．１９９１）において入手可能である。
【００７４】
かかる組成物は、ボーラス投与又は連続的投与に好適な形態で調製、包装又は販売され得る。注射用組成物は、アンプル等で、単位投与形態で、又は保存剤を含有する複数用量容器で、調製、包装又は販売され得る。組成物としては、懸濁液、溶液、油性又は水性ビヒクル中の乳液、ペースト、及び埋め込み可能な徐放性又は生分解性製剤が挙げられるが、これらに限定されない。かかる組成物は、懸濁化剤、安定化剤又は分散剤が挙げられるが、これらに限定されない１以上の追加の成分を更に含み得る。非経口投与用組成物の一実施形態においては、有効成分は、好適なビヒクル（例えば、滅菌の発熱物質フリーの水）で再構成するために、乾燥形態（例えば、粉末又は顆粒）で提供され、後に再構成された組成物が非経口投与される。組成物は、滅菌注射用の、水性又は油性の懸濁液又は溶液の形態で調製、包装又は販売され得る。この懸濁液又は溶液は、公知技術に従って製剤化され得、有効成分に加えて、本明細書に記載の分散剤、湿潤剤又は懸濁化剤等の追加成分を含み得る。かかる滅菌注射用製剤は、例えば、水又は１，３−ブタンジオール等の、非毒性の、非経口的に許容可能な希釈剤又は溶媒を用いて調製され得る。他の許容可能な希釈剤及び溶媒としては、リンゲル液、等張性塩化ナトリウム溶液、及び合成モノ又はジグリセリド等の固定油が挙げられるが、これらに限定されない。
【００７５】
非経口投与可能な、他の有用な組成物としては、有効成分を、微結晶形態で、リポソーム調製物で、又は生分解性ポリマー系の成分として、含むものが挙げられる。持続的な放出又は埋め込みのための組成物は、乳液、イオン交換樹脂、難溶性ポリマー又は難溶性塩等の、医薬的に許容可能なポリマー又は疎水性材料を含み得る。組成物は、例えば、皮内、皮下、経皮、筋肉内、動脈内、腹腔内、関節内、骨内又は他の適切な投与経路を含む、任意の好適な経路による投与に好適であり得る。好ましい組成物は、静脈内注入による投与に好適である。
【００７６】
ポリペプチドの使用方法
本発明は、種々の方法における本発明のポリペプチドの使用を提供する。例えば、本発明のポリペプチドは、バイオテクノロジーに有用なツールを提供し得る。ポリペプチドは、ＩｇＧ、特にヒトＩｇＧの特異的なエクスビボ切断のために用いられ得る。かかる方法においては、ポリペプチドは、特異的システインプロテアーゼ活性を生じさせる条件下で、ＩｇＧを含有する試料とインキュベーションされ得る。国際公開第２００３０５１９１４号及び国際公開第２００９０３３６７０号に記載されたもの等の、任意の好適な方法を用いて、特定の切断が確認され得、切断産物が単離され得る。従って、該方法は、特に、Ｆｃ及びＦ（ａｂ’）２の断片を生成するために用いられ得る。次いで、本発明のポリペプチドによるＩｇＧの切断から生じるＦ（ａｂ’）２断片に対する（例えば、２−メルカプトエタノールアミン又はシステアミンで）還元工程を実施することによって、Ｆａｂ断片が製造され得る。
【００７７】
該方法は、また、試料中のＩｇＧを検出若しくは解析するため、又は試料からＩｇＧを除去するために用いられ得る。試料中のＩｇＧを検出するための方法は、典型的には、ＩｇＧ特異的結合及び切断を可能にする条件下で、ポリペプチドを、試料とインキュベーションすることを含む。ＩｇＧの存在は、特異的ＩｇＧ切断産物の検出によって確認され得、それがその後解析され得る。
【００７８】
本発明によるポリペプチドはまた、治療又は予防において用いられ得る。治療的適用においては、ポリペプチド又は組成物は、既に疾患又は状態に罹患している被験体に、状態又はその１以上の症状を治癒、緩和又は部分的に食い止めるのに十分な量で、投与される。かかる治療的処置は、疾患の症状の重症度の低下、又は症状のない期間の頻度若しくは持続の増加をもたらし得る。これを達成するのに十分な量は、「治療有効量」と定義される。予防的適用においては、ポリペプチド又は組成物は、症状の発症を予防又は遅延させるのに十分な量で、疾患又は状態の症状をまだ示さない被験体に投与される。かかる量は、「予防有効量」と定義される。被験体は、任意の好適な手段によって、疾患又は状態を発症する危険性があると同定されている場合がある。従って、本発明は、ヒト又は動物の身体の治療において使用するための、本発明のポリペプチドも提供する。被験体における疾患又は状態の予防方法又は治療方法であって、本発明のポリペプチドを、被験体に、予防有効量又は治療有効量で投与することを含む、方法も、本明細書において提供される。ポリペプチドは、免疫抑制剤と共投与され得る。ポリペプチドは、好ましくは、静脈内注入によって投与されるが、例えば、皮内、皮下、経皮、筋肉内、動脈内、腹腔内、関節内、骨内又は他の適切な投与経路を含む任意の好適な経路によって投与され得る。投与される前記ポリペプチドの量は、０．０１ｍｇ／ｋｇ体重〜２ｍｇ／ｋｇ体重、０．０４〜２ｍｇ／ｋｇ体重、０．１２ｍｇ／ｋｇ体重〜２ｍｇ／ｋｇ体重、好ましくは０．２４ｍｇ／ｋｇ〜２ｍｇ／ｋｇ体重、最も好ましくは１ｍｇ／ｋｇ〜２ｍｇ／ｋｇ体重であり得る。ポリペプチドは、ポリペプチドに結合することができる、被験体血清中のＡＤＡの量が、臨床医によって決定された閾値を超えなければ、同一被験体に対して、複数時に投与され得る。ポリペプチドに結合することができる、被験体血清中のＡＤＡの量は、薬剤特異的ＣＡＰ  ＦＥＩＡ（ＩｍｍｕｎｏＣＡＰ）試験又は力価アッセイ等の任意の好適な方法によって決定され得る。
【００７９】
本発明のポリペプチドは、病原性ＩｇＧ抗体によって媒介される疾患又は状態の治療又は予防に特に有用であり得る。従って、本発明は、病原性ＩｇＧ抗体によって媒介される疾患又は状態の治療又は予防において使用するための、本発明のポリペプチドを提供する。本発明は、個体に、本発明のポリペプチドを投与することを含む、病原性ＩｇＧ抗体によって媒介される疾患又は状態を治療又は予防する方法も提供する。該方法は、前記ポリペプチドの反復投与を含み得る。本発明は、病原性ＩｇＧ抗体によって媒介される疾患又は状態、特に病原性ＩｇＧ抗体によって全体的又は部分的に媒介される自己免疫疾患を治療又は予防するための医薬の製造において使用するための、本発明のポリペプチドも提供する。
【００８０】
病原性抗体は、典型的には、抗体によって全体的又は部分的に媒介される、自己免疫疾患又は他の状態において標的とされる抗原に特異的であり得る。表Ｄは、かかる疾患及び関連する抗原のリストを示す。本発明のポリペプチドは、これらの疾患又は状態のいずれかを治療するために用いられ得る。該ポリペプチドは、病原性ＩｇＧ抗体によって全体的又は部分的に媒介される自己免疫疾患の治療又は予防に特に有効である。
【００８１】
【表７−１】
2018510622.tif 000012
【００８２】
【表７−２】
2018510622.tif 000013
【００８３】
【表７−３】
2018510622.tif 000014
【００８４】
別の実施形態においては、本発明のポリペプチドは、治療又は治療剤の、被験体への利益を向上させる方法において用いられ得る。該方法は、本明細書では、工程（ａ）及び（ｂ）と呼ばれる２つの工程を含む。
【００８５】
工程（ａ）は、被験体に、本発明のポリペプチドを投与することを含む。投与されるポリペプチドの量は、好ましくは、被験体の血漿中に存在する実質的に全てのＩｇＧ分子を切断するのに十分である。工程（ｂ）は、引き続いて、被験体に、前記治療を施すか、又は治療剤を投与することを含む。工程（ａ）及び（ｂ）は、好ましくは、被験体の血漿中に存在する実質的にすべてのＩｇＧ分子の切断が生じるのに十分な時間間隔で隔てられる。前記間隔は、典型的には、少なくとも３０分、また多くとも２１日であり得る。
【００８６】
利益が向上する治療剤は、典型的には、がん又は別の疾患の治療のために投与される抗体である。治療剤は、ＩＶＩｇであり得る。本実施形態の文脈において、本発明は、代替的に、被験体におけるがん又は別の疾患を治療するための方法であって、（ａ）被験体に、本発明のポリペプチドを投与すること；及び（ｂ）その後、前記被験体に、治療有効量の抗体を投与すること（前記がん又は前記他の疾患の治療である）を含み；ここで：
−  投与される前記ポリペプチドの量は、被験体の血漿中に存在する実質的に全てのＩｇＧ分子を切断するのに十分である；及び
−  工程（ａ）及び（ｂ）は、少なくとも２時間、また多くとも２１日の時間間隔で隔てられる
方法を提供するものとして記述され得る。
【００８７】
言い換えれば、本発明は、がん又は他の疾患の治療のための、かかる方法において使用するためのポリペプチドも提供する。本発明は、かかる方法による、がん又は別の疾患を治療するための医薬の製造における、医薬の使用も提供する。がんは、急性リンパ芽球性白血病、急性骨髄性（ｍｙｅｌｏｉｄ）白血病、副腎皮質がん、ＡＩＤＳ関連がん、ＡＩＤＳ関連リンパ腫、肛門がん、虫垂がん、星細胞腫（小児小脳又は小児大脳）、基底細胞がん、胆管がん（肝外）、膀胱がん、骨がん、骨肉腫／悪性線維性組織球腫、脳幹グリオーマ、脳がん、脳腫瘍（小脳星細胞腫）、脳腫瘍（大脳星細胞腫／悪性グリオーマ）、脳腫瘍（上衣腫）、脳腫瘍（髄芽腫）、脳腫瘍（テント上原始神経外胚葉性腫瘍）、脳腫瘍（視覚路及び視床下部グリオーマ）、乳がん、気管支アデノーマ／カルチノイド、バーキットリンパ腫、カルチノイド腫瘍、カルチノイド腫瘍（消化管）、原発不明のがん腫、中枢神経系リンパ腫、小脳星細胞腫、大脳星細胞腫／悪性グリオーマ、子宮頸がん、慢性リンパ球性白血病、慢性骨髄性（ｍｙｅｌｏｇｅｎｏｕｓ）白血病、慢性骨髄増殖性疾患、結腸がん、皮膚Ｔ細胞リンパ腫、線維形成性小円形細胞腫瘍、子宮内膜がん、上衣腫、食道がん、ユーイングファミリー腫瘍におけるユーイング肉腫、頭蓋外胚細胞腫瘍、小児性、性腺外胚細胞腫瘍、肝外胆管がん、眼がん（眼球内黒色腫）、眼がん（網膜芽細胞腫）、胆嚢がん、胃（ｇａｓｔｒｉｃ（ｓｔｏｍａｃｈ））がん、消化管カルチノイド腫瘍、消化管間質腫瘍（ＧＩＳＴ）、胚細胞腫瘍（頭蓋外、性腺外、又は卵巣）、妊娠性トロホブラスト腫瘍、脳幹のグリオーマ、グリオーマ（小児性大脳星細胞腫）、グリオーマ（小児性視覚路及び視床下部）、胃カルチノイド、有毛細胞白血病、頭頸部がん、心臓がん、肝細胞（肝臓）がん、ホジキンリンパ腫、下咽頭がん、視床下部及び視覚路グリオーマ、眼球内黒色腫、島細胞がん（膵内分泌部）、カポジ肉腫、腎臓がん（腎細胞がん）、咽頭がん、白血病、白血病（急性リンパ芽球性）（急性リンパ性白血病とも呼ばれる）、白血病（急性骨髄性（ｍｙｅｌｏｉｄ））（急性骨髄性（ｍｙｅｌｏｇｅｎｏｕｓ）白血病とも呼ばれる）、白血病（慢性リンパ性）（慢性リンパ性白血病とも呼ばれる）、白血病（慢性骨髄性（ｍｙｅｌｏｇｅｎｏｕｓ））（慢性骨髄性（ｍｙｅｌｏｇｅｎｏｕｓ）白血病とも呼ばれる）、白血病（有毛細胞）、口唇及び口腔がん、脂肪肉腫、肝臓がん（原発性）、肺がん（非小細胞）、肺がん（小細胞）、リンパ腫、リンパ腫（ＡＩＤＳ関連）、リンパ腫（バーキット）、リンパ腫（皮膚Ｔ細胞）、リンパ腫（ホジキン）、リンパ腫（非ホジキン）（ホジキンリンパ腫を除く全てのリンパ腫の古い分類）、リンパ腫（原発性中枢神経系）、マクログロブリン血症（ワルデンシュトレーム）、骨の悪性線維性組織球腫／骨肉腫、髄芽腫、黒色腫、黒色腫（眼内（眼））、メルケル細胞がん、中皮腫（成人悪性）、中皮腫、原発不明を含む転移性扁平上皮頸部がん、口腔がん、多発性内分泌腫瘍症候群、多発性骨髄腫／形質細胞腫瘍、菌状息肉腫、骨髄異形成症候群、骨髄異形成／骨髄増殖性疾患、骨髄性（ｍｙｅｌｏｇｅｎｏｕｓ）白血病（慢性）、骨髄性（ｍｙｅｌｏｉｄ）白血病（成人急性）、骨髄性（ｍｙｅｌｏｉｄ）白血病（小児急性）、骨髄腫（多発性）（骨髄のがん）、骨髄増殖性疾患、鼻腔及び副鼻腔のがん、上咽頭がん、神経芽細胞腫、非ホジキンリンパ腫、非小細胞肺がん、口腔がん、口腔咽頭がん、骨肉腫／骨の悪性線維性組織球腫、卵巣がん、卵巣上皮がん（表層上皮・間質性腫瘍）、卵巣胚細胞腫瘍、卵巣低悪性度腫瘍、膵臓がん、膵臓がん（島細胞）、副鼻腔及び鼻腔のがん、副甲状腺がん、陰茎がん、咽頭がん、褐色細胞腫、松果体星細胞腫、松果体胚腫、松果体芽腫及びテント上原始神経外胚葉性腫瘍、下垂体アデノーマ、形質細胞腫／多発性骨髄腫、胸膜肺芽腫、原発性中枢神経系リンパ腫、前立腺がん、直腸がん、腎細胞がん（腎臓がん）（腎盂及び尿管）、移行上皮がん、網膜芽細胞腫、横紋筋肉腫、唾液腺がん、肉腫、ユーイングファミリー腫瘍、カポジ肉腫、肉腫（軟組織）、肉腫（子宮）、セザリー症候群、皮膚がん（非黒色腫性）、皮膚がん（黒色腫）、皮膚がん腫（メルケル細胞）、小細胞肺がん、小腸がん、軟組織肉腫、扁平上皮細胞がん、原発不明を含む扁平上皮頸部がん（転移性）、胃がん、テント上原始神経外胚葉性腫瘍、Ｔ細胞リンパ腫（皮膚性）（菌状息肉腫及びセザリー症候群を参照）、精巣がん、咽頭がん、胸腺腫、胸腺腫及び胸腺がん、甲状腺がん、甲状腺がん、腎盂及び尿管の移行上皮がん、トロホブラスト腫瘍、尿管及び腎盂移行上皮がん、尿道がん、子宮がん（子宮内膜）、子宮肉腫、腟がん、視覚路及び視床下部のグリオーマ、外陰がん、ワルデンシュトレームマクログロブリン血症、並びにウィルムス腫瘍（腎臓がん）であり得る。
【００８８】
がんは、好ましくは、前立腺がん、乳がん、膀胱がん、結腸がん、直腸がん、膵臓がん、卵巣がん、肺がん、子宮頸がん、子宮内膜がん、腎臓（腎臓細胞）がん、食道がん、甲状腺がん、皮膚がん、リンパ腫、黒色腫又は白血病である。
【００８９】
工程（ｂ）において投与される抗体は、好ましくは、上記のがんのタイプの１つ以上に関連する腫瘍抗原に特異的である。該方法における使用のための抗体に関して、対象の標的としては、ＣＤ２、ＣＤ３、ＣＤ１９、ＣＤ２０、ＣＤ２２、ＣＤ２５、ＣＤ３０、ＣＤ３２、ＣＤ３３、ＣＤ４０、ＣＤ５２、ＣＤ５４、ＣＤ５６、ＣＤ６４、ＣＤ７０、ＣＤ７４、ＣＤ７９、ＣＤ８０、ＣＤ８６、ＣＤ１０５、ＣＤ１３８、ＣＤ１７４、ＣＤ２０５、ＣＤ２２７、ＣＤ３２６、ＣＤ３４０、ＭＵＣ１６、ＧＰＮＭＢ、ＰＳＭＡ、Ｃｒｉｐｔｏ、ＥＤ−Ｂ、ＴＭＥＦＦ２、ＥｐｈＡ２、ＥｐｈＢ２、ＦＡＰ、ａｖインテグリン、メソセリン、ＥＧＦＲ、ＴＡＧ−７２、ＧＤ２、ＣＡ１Ｘ、５Ｔ４、α４β７インテグリン、Ｈｅｒ２が挙げられる。他の標的は、ＩＬ−１〜ＩＬ−１３のインターロイキン類、腫瘍壊死因子α及びβ、インターフェロンα、β及びγ、腫瘍増殖因子ベータ（ＴＧＦ−β）、コロニー刺激因子（ＣＳＦ）及び顆粒球単球コロニー刺激因子（ＧＭＣＳＦ）等のサイトカインである。Ｈｕｍａｎ  Ｃｙｔｏｋｉｎｅｓ：Ｈａｎｄｂｏｏｋ  ｆｏｒ  Ｂａｓｉｃ  ＆  Ｃｌｉｎｉｃａｌ  Ｒｅｓｅａｒｃｈ（Ａｇｇｒａｗａｌ  ｅｔ  ａｌ．ｅｄｓ．，Ｂｌａｃｋｗｅｌｌ  Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ，Ｂｏｓｔｏｎ，ＭＡ  １９９１）を参照。他の標的は、ホルモン、酵素、及びアデニルシクラーゼ、グアニルシクラーゼ、及びホスホリパーゼＣ等の細胞内及び細胞間メッセンジャーである。対象の他の標的は、ＣＤ２０及びＣＤ３３等の白血球抗原である。薬物も対象の標的であり得る。標的分子は、ヒトの、哺乳動物の又は細菌のであり得る。他の標的は、微生物病原体（ウイルス性及び細菌性の両方）及び腫瘍由来のタンパク質、糖タンパク質及び炭水化物等の抗原である。更に他の標的は、米国特許第４，３６６，２４１号に記載されている。
【００９０】
抗体は、直接的又は間接的に、細胞傷害性部分又は検出可能な標識に結合され得る。抗体は、当該技術分野で公知の、様々な方法のうちの１つ以上を用いて、１つ以上の投与経路を介して投与され得る。投与の経路及び／又は様式は、所望の結果に依存して変わる。抗体についての好ましい投与経路としては、静脈内、筋肉内、皮内、腹腔内、皮下、脊髄又は他の非経口の、例えば注射又は注入による投与経路が挙げられる。語句「非経口投与」は、本明細書で用いられる場合、通常は、経腸及び局所投与以外の、注射による投与様式を意味する。或いは、抗体は、非経口でない経路（局所、表皮又は粘膜等の投与経路）を介して投与され得る。腫瘍周辺、腫瘍近傍（ｊｕｘｔａｔｕｍｏｒａｌ）、腫瘍内、病巣内、病巣周辺、腔内注入、膀胱内投与（ｉｎｔｒａｖｅｓｉｃｌｅ  ａｄｍｉｎｉｓｔｒａｔｉｏｎ）、及び吸入を含む局所投与も好ましい。
【００９１】
好適な、本発明の抗体の投与量は、熟練した医師により決定され得る。抗体の実際の投与量レベルは、患者に対して毒性がなく、特定の患者、組成及び投与様式に関して、所望の治療応答を達成するのに有効な量の有効成分を得るように変化させられ得る。選択された投与量レベルは、使用される特定の抗体の活性、投与経路、投与時期、抗体の排出速度、治療の継続期間、用いられる特定の組成物と組み合わせて用いられる他の薬物、化合物及び／又は材料、治療される患者の年齢、性別、体重、状態、全般的な健康状態及び以前の病歴、並びに医学分野において周知の同様の要因を含む、様々な薬物動態学的因子に依存する。
【００９２】
抗体の好適な用量は、例えば、治療される患者の体重１ｋｇあたり約０．１μｇ〜約１００ｍｇの範囲中であり得る。例えば、好適な投与量は、約１μｇ／ｋｇ〜約１０ｍｇ／ｋｇ体重／日又は約１０μｇ／ｋｇ〜約５ｍｇ／ｋｇ体重／日であり得る。
【００９３】
投与計画は、所望の最適応答（例、治療応答）を提供するように調節され得る。例えば、単一のボーラスが投与され得、又は方法の工程（ｂ）は、工程（ｓｔｅｓｐ）（ａ）及び（ｂ）の間の、必要な間隔を超えないという条件で、経時的に投与される分割用量をいくつか含み得るか、若しくは、治療状況の緊急適応があれば、用量が、比例的に減少又は増加され得る。投与の容易さ及び投与量の均一性のためには、非経口組成物を、単位投与形態で製剤化することが、特に好都合である。単位投与形態は、本明細書で用いられる場合、治療される被験体のための単位投与量として適した、物理的に別個の単位（各単位は、所望の治療効果を生じるように算出された所定量の活性化合物（必要とされる医薬的担体を伴う）を含有する）を指す。
【００９４】
工程（ｂ）の抗体は、化学療法又は放射線療法と併用して投与され得る。該方法は、追加の抗がん抗体又は他の治療剤の投与を更に含み得、これは、単一の組成物で、又は併用療法の一部としての別個の組成物で、工程（ｂ）の抗体と共に投与され得る。例えば、工程（ｂ）の抗体は、他の薬剤の前に、その後に、又はそれと同時に、投与され得る。
【００９５】
抗体は、アバゴボマブ（Ａｂａｇｏｖｏｍａｂ）、アブシキシマブ（Ａｂｃｉｘｉｍａｂ）、アクトクスマブ（Ａｃｔｏｘｕｍａｂ）、アダリムマブ（Ａｄａｌｉｍｕｍａｂ）、アデカツムマブ（Ａｄｅｃａｔｕｍｕｍａｂ）、アフェリモマブ（Ａｆｅｌｉｍｏｍａｂ）、アフツズマブ（Ａｆｕｔｕｚｕｍａｂ）、アラシズマブペゴール（Ａｌａｃｉｚｕｍａｂ  ｐｅｇｏｌ）、ＡＬＤ５１８、アレムツズマブ（Ａｌｅｍｔｕｚｕｍａｂ）、アリロクマブ（Ａｌｉｒｏｃｕｍａｂ）、アルツモマブペンテト酸（Ａｌｔｕｍｏｍａｂ  ｐｅｎｔｅｔａｔｅ）、アマツキシマブ（Ａｍａｔｕｘｉｍａｂ）、アナツモマブマフェナトクス（Ａｎａｔｕｍｏｍａｂ  ｍａｆｅｎａｔｏｘ）、アンルキンズマブ（Ａｎｒｕｋｉｎｚｕｍａｂ）、アポリズマブ（Ａｐｏｌｉｚｕｍａｂ）、アルシツモマブ（Ａｒｃｉｔｕｍｏｍａｂ）、アセリズマブ（Ａｓｅｌｉｚｕｍａｂ）、アチヌマブ（Ａｔｉｎｕｍａｂ）、アツリズマブ（Ａｔｌｉｚｕｍａｂ）（＝トシリズマブ）、アトロリムマブ（Ａｔｏｒｏｌｉｍｕｍａｂ）、バピネウズマブ（Ｂａｐｉｎｅｕｚｕｍａｂ）、バシリキシマブ（Ｂａｓｉｌｉｘｉｍａｂ）、バビツキシマブ（Ｂａｖｉｔｕｘｉｍａｂ）、ベクツモマブ（Ｂｅｃｔｕｍｏｍａｂ）、ベリムマブ（Ｂｅｌｉｍｕｍａｂ）、ベンラリズマブ（Ｂｅｎｒａｌｉｚｕｍａｂ）、ベルチリムマブ（Ｂｅｒｔｉｌｉｍｕｍａｂ）、ベシレソマブ（Ｂｅｓｉｌｅｓｏｍａｂ）、ベバシズマブ（Ｂｅｖａｃｉｚｕｍａｂ）、ベズロトクスマブ（Ｂｅｚｌｏｔｏｘｕｍａｂ）、ビシロマブ（Ｂｉｃｉｒｏｍａｂ）、ビマグルマブ（Ｂｉｍａｇｒｕｍａｂ）、ビバツズマブメルタンシン（Ｂｉｖａｔｕｚｕｍａｂ  ｍｅｒｔａｎｓｉｎｅ）、ブリナツモマブ（Ｂｌｉｎａｔｕｍｏｍａｂ）、ブロソズマブ（Ｂｌｏｓｏｚｕｍａｂ）、ブレンツキシマブベドチン（Ｂｒｅｎｔｕｘｉｍａｂ  ｖｅｄｏｔｉｎ）、ブリアキヌマブ（Ｂｒｉａｋｉｎｕｍａｂ）、ブロダルマブ（Ｂｒｏｄａｌｕｍａｂ）、カナキヌマブ（Ｃａｎａｋｉｎｕｍａｂ）、カンツズマブメルタンシン（Ｃａｎｔｕｚｕｍａｂ  ｍｅｒｔａｎｓｉｎｅ）、カンツズマブラブタンシン（Ｃａｎｔｕｚｕｍａｂ  ｒａｖｔａｎｓｉｎｅ）、カプラシズマブ（Ｃａｐｌａｃｉｚｕｍａｂ）、カプロマブペンデチド（Ｃａｐｒｏｍａｂ  ｐｅｎｄｅｔｉｄｅ）、カルルマブ（Ｃａｒｌｕｍａｂ）、カツマキソマブ（Ｃａｔｕｍａｘｏｍａｂ）、ＣＣ４９、セデリズマブ（Ｃｅｄｅｌｉｚｕｍａｂ）、セルトリズマブペゴール（Ｃｅｒｔｏｌｉｚｕｍａｂ  ｐｅｇｏｌ）、セツキシマブ（Ｃｅｔｕｘｉｍａｂ）、Ｃｈ．１４．１８、シタツズマブボガトクス（Ｃｉｔａｔｕｚｕｍａｂ  ｂｏｇａｔｏｘ）、シクスツムマブ（Ｃｉｘｕｔｕｍｕｍａｂ）、クラザキズマブ（Ｃｌａｚａｋｉｚｕｍａｂ）、クレノリキシマブ（Ｃｌｅｎｏｌｉｘｉｍａｂ）、クリバツズマブテトラキセタン（Ｃｌｉｖａｔｕｚｕｍａｂ  ｔｅｔｒａｘｅｔａｎ）、コナツムマブ（Ｃｏｎａｔｕｍｕｍａｂ）、コンシズマブ（Ｃｏｎｃｉｚｕｍａｂ）、クレネズマブ（Ｃｒｅｎｅｚｕｍａｂ）、ＣＲ６２６１、ダセツズマブ（Ｄａｃｅｔｕｚｕｍａｂ）、ダクリズマブ（Ｄａｃｌｉｚｕｍａｂ）、ダロツズマブ（Ｄａｌｏ��ｕｚｕｍａｂ）、ダラツムマブ（Ｄａｒａｔｕｍｕｍａｂ）、デムシズマブ（Ｄｅｍｃｉｚｕｍａｂ）、デノスマブ（Ｄｅｎｏｓｕｍａｂ）、デツモマブ（Ｄｅｔｕｍｏｍａｂ）、ドルリモマブアリトクス（Ｄｏｒｌｉｍｏｍａｂ  ａｒｉｔｏｘ）、ドロジツマブ（Ｄｒｏｚｉｔｕｍａｂ）、デュリゴツマブ（Ｄｕｌｉｇｏｔｕｍａｂ）、デュピルマブ（Ｄｕｐｉｌｕｍａｂ）、デュシギツマブ（Ｄｕｓｉｇｉｔｕｍａｂ）、エクロメキシマブ（Ｅｃｒｏｍｅｘｉｍａｂ）、エクリズマブ（Ｅｃｕｌｉｚｕｍａｂ）、エドバコマブ（Ｅｄｏｂａｃｏｍａｂ）、エドレコロマブ（Ｅｄｒｅｃｏｌｏｍａｂ）、エファリズマブ（Ｅｆａｌｉｚｕｍａｂ）、エフングマブ（Ｅｆｕｎｇｕｍａｂ）、エロツズマブ（Ｅｌｏｔｕｚｕｍａｂ）、エルシリモマブ（Ｅｌｓｉｌｉｍｏｍａｂ）、エナバツズマブ（Ｅｎａｖａｔｕｚｕｍａｂ）、エンリモマブペゴール（Ｅｎｌｉｍｏｍａｂ  ｐｅｇｏｌ）、エノキズマブ（Ｅｎｏｋｉｚｕｍａｂ）、エノチクマブ（Ｅｎｏｔｉｃｕｍａｂ）、エンシツキシマブ（Ｅｎｓｉｔｕｘｉｍａｂ）、エピツモマブシツキセタン（Ｅｐｉｔｕｍｏｍａｂ  ｃｉｔｕｘｅｔａｎ）、エプラツズマブ（Ｅｐｒａｔｕｚｕｍａｂ）、エルリズマブ（Ｅｒｌｉｚｕｍａｂ）、エルツマキソマブ（Ｅｒｔｕｍａｘｏｍａｂ）、エタラシズマブ（Ｅｔａｒａｃｉｚｕｍａｂ）、エトロリズマブ（Ｅｔｒｏｌｉｚｕｍａｂ）、エボロクマブ（Ｅｖｏｌｏｃｕｍａｂ）、エキスビビルマブ（Ｅｘｂｉｖｉｒｕｍａｂ）、ファノレソマブ（Ｆａｎｏｌｅｓｏｍａｂ）、ファラリモマブ（Ｆａｒａｌｉｍｏｍａｂ）、ファルレツズマブ（Ｆａｒｌｅｔｕｚｕｍａｂ）、ファシヌマブ（Ｆａｓｉｎｕｍａｂ）、ＦＢＴＡ０５、フェルビズマブ（Ｆｅｌｖｉｚｕｍａｂ）、フェザキヌマブ（Ｆｅｚａｋｉｎｕｍａｂ）、フィクラツズマブ（Ｆｉｃｌａｔｕｚｕｍａｂ）、フィギツムマブ（Ｆｉｇｉｔｕｍｕｍａｂ）、フランボツマブ（Ｆｌａｎｖｏｔｕｍａｂ）、フォントリズマブ（Ｆｏｎｔｏｌｉｚｕｍａｂ）、フォラルマブ（Ｆｏｒａｌｕｍａｂ）、フォラビルマブ（Ｆｏｒａｖｉｒｕｍａｂ）、フレソリムマブ（Ｆｒｅｓｏｌｉｍｕｍａｂ）、フルラヌマブ（Ｆｕｌｒａｎｕｍａｂ）、フツキシマブ（Ｆｕｔｕｘｉｍａｂ）、ガリキシマブ（Ｇａｌｉｘｉｍａｂ）、ガニツマブ（Ｇａｎｉｔｕｍａｂ）、ガンテネルマブ（Ｇａｎｔｅｎｅｒｕｍａｂ）、ガビリモマブ（Ｇａｖｉｌｉｍｏｍａｂ）、ゲムツズマブオゾガマイシン（Ｇｅｍｔｕｚｕｍａｂ  ｏｚｏｇａｍｉｃｉｎ）、ゲボキズマブ（Ｇｅｖｏｋｉｚｕｍａｂ）、ギレンツキシマブ（Ｇｉｒｅｎｔｕｘｉｍａｂ）、グレムバツムマブベドチン（Ｇｌｅｍｂａｔｕｍｕｍａｂ  ｖｅｄｏｔｉｎ）、ゴリムマブ（Ｇｏｌｉｍｕｍａｂ）、ゴミリキシマブ（Ｇｏｍｉｌｉｘｉｍａｂ）、ＧＳ６６２４、イバリズマブ（Ｉｂａｌｉｚｕｍａｂ）、イブリツモマブチウキセタン（Ｉｂｒｉｔｕｍｏｍａｂ  ｔｉｕｘｅｔａｎ）、イクルクマブ（Ｉｃｒｕｃｕｍａｂ）、イゴボマブ（Ｉｇｏｖｏｍａｂ）、イムシロマブ（Ｉｍｃｉｒｏｍａｂ）、イムガツズマブ（Ｉｍｇａｔｕｚｕｍａｂ）、インクラクマブ（Ｉｎｃｌａｃｕｍａｂ）、インダツキシマブラブタンシン（Ｉｎｄａｔｕｘｉ��ａｂ  ｒａｖｔａｎｓｉｎｅ）、インフリキシマブ（Ｉｎｆｌｉｘｉｍａｂ）、インテツムマブ（Ｉｎｔｅｔｕｍｕｍａｂ）、イノリモマブ（Ｉｎｏｌｉｍｏｍａｂ）、イノツズマブオゾガマイシン（Ｉｎｏｔｕｚｕｍａｂ  ｏｚｏｇａｍｉｃｉｎ）、イピリムマブ（Ｉｐｉｌｉｍｕｍａｂ）、イラツムマブ（Ｉｒａｔｕｍｕｍａｂ）、イトリズマブ（Ｉｔｏｌｉｚｕｍａｂ）、イキセキズマブ（Ｉｘｅｋｉｚｕｍａｂ）、ケリキシマブ（Ｋｅｌｉｘｉｍａｂ）、ラベツズマブ（Ｌａｂｅｔｕｚｕｍａｂ）、ラムパリズマブ（Ｌａｍｐａｌｉｚｕｍａｂ）、レブリキズマブ（Ｌｅｂｒｉｋｉｚｕｍａｂ）、レマレソマブ（Ｌｅｍａｌｅｓｏｍａｂ）、レルデリムマブ（Ｌｅｒｄｅｌｉｍｕｍａｂ）、レキサツムマブ（Ｌｅｘａｔｕｍｕｍａｂ）、リビビルマブ（Ｌｉｂｉｖｉｒｕｍａｂ）、リゲリズマブ（Ｌｉｇｅｌｉｚｕｍａｂ）、リンツズマブ（Ｌｉｎｔｕｚｕｍａｂ）、リリルマブ（Ｌｉｒｉｌｕｍａｂ）、ロデルシズマブ（Ｌｏｄｅｌｃｉｚｕｍａｂ）、ロルボツズマブメルタンシン（Ｌｏｒｖｏｔｕｚｕｍａｂ  ｍｅｒｔａｎｓｉｎｅ）、ルカツムマブ（Ｌｕｃａｔｕｍｕｍａｂ）、ルミリキシマブ（Ｌｕｍｉｌｉｘｉｍａｂ）、マパツムマブ（Ｍａｐａｔｕｍｕｍａｂ）、マスリモマブ（Ｍａｓｌｉｍｏｍａｂ）、マブリリムマブ（Ｍａｖｒｉｌｉｍｕｍａｂ）、マツズマブ（Ｍａｔｕｚｕｍａｂ）、メポリズマブ（Ｍｅｐｏｌｉｚｕｍａｂ）、メテリムマブ（Ｍｅｔｅｌｉｍｕｍａｂ）、ミラツズマブ（Ｍｉｌａｔｕｚｕｍａｂ）、ミンレツモマブ（Ｍｉｎｒｅｔｕｍｏｍａｂ）、ミツモマブ（Ｍｉｔｕｍｏｍａｂ）、モガムリズマブ（Ｍｏｇａｍｕｌｉｚｕｍａｂ）、モロリムマブ（Ｍｏｒｏｌｉｍｕｍａｂ）、モタビズマブ（Ｍｏｔａｖｉｚｕｍａｂ）、モキセツモマブパスドトクス（Ｍｏｘｅｔｕｍｏｍａｂ  ｐａｓｕｄｏｔｏｘ）、ムロモナブ−ＣＤ３（Ｍｕｒｏｍｏｎａｂ−ＣＤ３）、ナコロマブタフェナトクス（Ｎａｃｏｌｏｍａｂ  ｔａｆｅｎａｔｏｘ）、ナミルマブ（Ｎａｍｉｌｕｍａｂ）、ナプツモマブエスタフェナトクス（Ｎａｐｔｕｍｏｍａｂ  ｅｓｔａｆｅｎａｔｏｘ）、ナルナツマブ（Ｎａｒｎａｔｕｍａｂ）、ナタリズマブ（Ｎａｔａｌｉｚｕｍａｂ）、ネバクマブ（Ｎｅｂａｃｕｍａｂ）、ネシツムマブ（Ｎｅｃｉｔｕｍｕｍａｂ）、ネレリモマブ（Ｎｅｒｅｌｉｍｏｍａｂ）、ネスバクマブ（Ｎｅｓｖａｃｕｍａｂ）、ニモツズマブ（Ｎｉｍｏｔｕｚｕｍａｂ）、ニボルマブ（Ｎｉｖｏｌｕｍａｂ）、ノフェツモマブメルペンタン（Ｎｏｆｅｔｕｍｏｍａｂ  ｍｅｒｐｅｎｔａｎ）、オビヌツズマブ（Ｏｂｉｎｕｔｕｚｕｍａｂ）、オカラツズマブ（Ｏｃａｒａｔｕｚｕｍａｂ）、オクレリズマブ（Ｏｃｒｅｌｉｚｕｍａｂ）、オデュリモマブ（Ｏｄｕｌｉｍｏｍａｂ）、オファツムマブ（Ｏｆａｔｕｍｕｍａｂ）、オララツマブ（Ｏｌａｒａｔｕｍａｂ）、オロキズマブ（Ｏｌｏｋｉｚｕｍａｂ）、オマリズマブ（Ｏｍａｌｉｚｕｍａｂ）、オナルツズマブ（Ｏｎａｒｔｕｚｕｍａｂ）、オポルツズマブモナトクス（Ｏｐｏｒｔｕｚｕｍａｂ  ｍｏｎａｔｏｘ）、オレゴボマブ（Ｏｒｅｇｏｖｏｍａｂ）、オルチクマブ（Ｏｒｔｉｃｕｍａｂ）、オテリキシズマブ（Ｏｔｅｌｉｘｉｚｕ���ａｂ）、オキセルマブ（Ｏｘｅｌｕｍａｂ）、オザネズマブ（Ｏｚａｎｅｚｕｍａｂ）、オゾラリズマブ（Ｏｚｏｒａｌｉｚｕｍａｂ）、パギバキシマブ（Ｐａｇｉｂａｘｉｍａｂ）、パリビズマブ（Ｐａｌｉｖｉｚｕｍａｂ）、パニツムマブ（Ｐａｎｉｔｕｍｕｍａｂ）、パノバクマブ（Ｐａｎｏｂａｃｕｍａｂ）、パルサツズマブ（Ｐａｒｓａｔｕｚｕｍａｂ）、パスコリズマブ（Ｐａｓｃｏｌｉｚｕｍａｂ）、パテクリズマブ（Ｐａｔｅｃｌｉｚｕｍａｂ）、パトリツマブ（Ｐａｔｒｉｔｕｍａｂ）、ペムツモマブ（Ｐｅｍｔｕｍｏｍａｂ）、ペラキズマブ（Ｐｅｒａｋｉｚｕｍａｂ）、ペルツズマブ（Ｐｅｒｔｕｚｕｍａｂ）、ペキセリズマブ（Ｐｅｘｅｌｉｚｕｍａｂ）、ピジリズマブ（Ｐｉｄｉｌｉｚｕｍａｂ）、ピナツズマブベドチン（Ｐｉｎａｔｕｚｕｍａｂ  ｖｅｄｏｔｉｎ）、ピンツモマブ（Ｐｉｎｔｕｍｏｍａｂ）、プラクルマブ（Ｐｌａｃｕｌｕｍａｂ）、ポラツズマブベドチン（Ｐｏｌａｔｕｚｕｍａｂ  ｖｅｄｏｔｉｎ）、ポネズマブ（Ｐｏｎｅｚｕｍａｂ）、プリリキシマブ（Ｐｒｉｌｉｘｉｍａｂ）、プリトキサキシマブ（Ｐｒｉｔｏｘａｘｉｍａｂ）、プリツムマブ（Ｐｒｉｔｕｍｕｍａｂ）、ＰＲＯ１４０、クイリズマブ（Ｑｕｉｌｉｚｕｍａｂ）、ラコツモマブ（Ｒａｃｏｔｕｍｏｍａｂ）、ラドレツマブ（Ｒａｄｒｅｔｕｍａｂ）、ラフィビルマブ（Ｒａｆｉｖｉｒｕｍａｂ）、ラムシルマブ（Ｒａｍｕｃｉｒｕｍａｂ）、ラニビズマブ（Ｒａｎｉｂｉｚｕｍａｂ）、ラキシバクマブ（Ｒａｘｉｂａｃｕｍａｂ）、レガビルマブ（Ｒｅｇａｖｉｒｕｍａｂ）、レスリズマブ（Ｒｅｓｌｉｚｕｍａｂ）、リロツムマブ（Ｒｉｌｏｔｕｍｕｍａｂ）、リツキシマブ（Ｒｉｔｕｘｉｍａｂ）、ロバツムマブ（Ｒｏｂａｔｕｍｕｍａｂ）、ロレデュマブ（Ｒｏｌｅｄｕｍａｂ）、ロモソズマブ（Ｒｏｍｏｓｏｚｕｍａｂ）、ロンタリズマブ（Ｒｏｎｔａｌｉｚｕｍａｂ）、ロベリズマブ（Ｒｏｖｅｌｉｚｕｍａｂ）、ルプリズマブ（Ｒｕｐｌｉｚｕｍａｂ）、サマリズマブ（Ｓａｍａｌｉｚｕｍａｂ）、サリルマブ（Ｓａｒｉｌｕｍａｂ）、サツモマブペンデチド（Ｓａｔｕｍｏｍａｂ  ｐｅｎｄｅｔｉｄｅ）、セクキヌマブ（Ｓｅｃｕｋｉｎｕｍａｂ）、セリバンツマブ（Ｓｅｒｉｂａｎｔｕｍａｂ）、セトキサキシマブ（Ｓｅｔｏｘａｘｉｍａｂ）、セビルマブ（Ｓｅｖｉｒｕｍａｂ）、シブロツズマブ（Ｓｉｂｒｏｔ
ｕｚｕｍａｂ）、シファリムマブ（Ｓｉｆａｌｉｍｕｍａｂ）、シルツキシマブ（Ｓｉｌｔｕｘｉｍａｂ）、シムツズマブ（Ｓｉｍｔｕｚｕｍａｂ）、シプリズマブ（Ｓｉｐｌｉｚｕｍａｂ）、シルクマブ（Ｓｉｒｕｋｕｍａｂ）、ソラネズマブ（Ｓｏｌａｎｅｚｕｍａｂ）、ソリトマブ（Ｓｏｌｉｔｏｍａｂ）、ソネプシズマブ（Ｓｏｎｅｐｃｉｚｕｍａｂ）、ソンツズマブ（Ｓｏｎｔｕｚｕｍａｂ）、スタムルマブ（Ｓｔａｍｕｌｕｍａｂ）、スレソマブ（Ｓｕｌｅｓｏｍａｂ）、スビズマブ（Ｓｕｖｉｚｕｍａｂ）、タバルマブ（Ｔａｂａｌｕｍａｂ）、タカツズマブテトラキセタン（Ｔａｃａｔｕｚｕｍａｂ  ｔｅｔｒａｘｅｔａｎ）、タドシズマブ（Ｔａｄｏｃｉｚｕｍａｂ）、タリズマブ（Ｔａｌｉｚｕｍａｂ）、タネズマブ（Ｔａｎｅｚｕｍａｂ）、タプリツモマブパプトクス（Ｔａｐｌｉｔｕｍｏｍａｂ  ｐａｐｔｏｘ）、テフィバズマブ（Ｔｅｆｉｂａｚｕｍａｂ）、テリモマブアリトクス（Ｔｅｌｉｍｏｍａｂ  ａｒｉｔｏｘ）、テナツモマブ（Ｔｅｎａｔｕｍｏｍａｂ）、テネリキシマブ（Ｔｅｎｅｌｉｘｉｍａｂ）、テプリズマブ（Ｔｅｐｌｉｚｕｍａｂ）、テプロツムマブ（Ｔｅｐｒｏｔｕｍｕｍａｂ）、ＴＧＮ１４１２、チシリムマブ（Ｔｉｃｉｌｉｍｕｍａｂ）（＝トレメリムマブ（ｔｒｅｍｅｌｉｍｕｍａｂ））、チルドラキズマブ（Ｔｉｌｄｒａｋｉｚｕｍａｂ）、チガツズマブ（Ｔｉｇａｔｕｚｕｍａｂ）、ＴＮＸ−６５０、トシリズマブ（Ｔｏｃｉｌｉｚｕｍａｂ）（＝アツリズマブ（ａｔｌｉｚｕｍａｂ））、トラリズマブ（Ｔｏｒａｌｉｚｕｍａｂ）、トシツモマブ（Ｔｏｓｉｔｕｍｏｍａｂ）、トラロキヌマブ（Ｔｒａｌｏｋｉｎｕｍａｂ）、トラスツズマブ（Ｔｒａｓｔｕｚｕｍａｂ）、ＴＲＢＳ０７、トレガリズマブ（Ｔｒｅｇａｌｉｚｕｍａｂ）、トレメリムマブ（Ｔｒｅｍｅｌｉｍｕｍａｂ）、ツコツズマブセルモロイキン（Ｔｕｃｏｔｕｚｕｍａｂ  ｃｅｌｍｏｌｅｕｋｉｎ）、ツビルマブ（Ｔｕｖｉｒｕｍａｂ）、ウブリツキシマブ（Ｕｂｌｉｔｕｘｉｍａｂ）、ウレルマブ（Ｕｒｅｌｕｍａｂ）、ウルトキサズマブ（Ｕｒｔｏｘａｚｕｍａｂ）、ウステキヌマブ（Ｕｓｔｅｋｉｎｕｍａｂ）、バパリキシマブ（Ｖａｐａｌｉｘｉｍａｂ）、バテリズマブ（Ｖａｔｅｌｉｚｕｍａｂ）、ベドリズマブ（Ｖｅｄｏｌｉｚｕｍａｂ）、ベルツズマブ（Ｖｅｌｔｕｚｕｍａｂ）、ベパリモマブ（Ｖｅｐａｌｉｍｏｍａｂ）、ベセンクマブ（Ｖｅｓｅｎｃｕｍａｂ）、ビシリズマブ（Ｖｉｓｉｌｉｚｕｍａｂ）、ボロシキシマブ（Ｖｏｌｏｃｉｘｉｍａｂ）、ボルセツズマブマフォドチン（Ｖｏｒｓｅｔｕｚｕｍａｂ  ｍａｆｏｄｏｔｉｎ）、ボツムマブ（Ｖｏｔｕｍｕｍａｂ）、ザルツムマブ（Ｚａｌｕｔｕｍｕｍａｂ）、ザノリムマブ（Ｚａｎｏｌｉｍｕｍａｂ）、ザツキシマブ（Ｚａｔｕｘｉｍａｂ）、ジラリムマブ（Ｚｉｒａｌｉｍｕｍａｂ）、又はゾリモマブアリトクス（Ｚｏｌｉｍｏｍａｂ  ａｒｉｔｏｘ）であり得る。
【００９６】
利益が向上する治療は、典型的には臓器移植である。臓器は、腎臓、肝臓、心臓、膵臓、肺、又は小腸から選択され得る。治療される被験体は、好ましくは、感作されるか又は高感作され得る。「感作された」とは、被験体がヒト主要組織適合性（ＭＨＣ）抗原（ヒト白血球抗原（ＨＬＡ）とも呼ばれる）に対する抗体を有するようになったことを意味する。抗ＨＬＡ抗体は、同種感作Ｂ細胞に由来し、通常、輸血、以前の移植又は妊娠により、以前に感作された患者に存在する（Ｊｏｒｄａｎ  ｅｔ  ａｌ．，２００３）。
【００９７】
移植レシピエントの候補が感作されているか否かは、任意の好適な方法によって決定され得る。レシピエントが感作されているか否かを判定するために、例えば、パネル反応性抗体（ＰＲＡ）試験が用いられ得る。ＰＲＡスコア＞３０％は、典型的には、患者が「高い免疫学的（ｉｍｍｕｌｏｇｉｃ）リスク」又は「感作性」であることを意味すると解される。或いは、移植ドナー候補の血液の試料が、意図されたレシピエントのそれと混合される、交差適合試験が行なわれ得る。交差適合陽性は、レシピエントがドナー試料に反応する抗体を有することを意味し、レシピエントが感作され、移植が行われるべきでないことを示す。交差適合試験は、典型的には、移植直前の最終検査として行われる。
【００９８】
ドナー候補のＭＨＣ抗原に対する、力価の高い抗体（即ち、ドナー特異的抗体（ＤＳＡ））の存在は、急性抗体媒介性拒絶反応のリスクのため、まさに移植の禁忌である。要するに、ドナーＭＨＣ抗原への感作は、好適なドナーの同定を妨げる。交差適合試験陽性は、移植に対する明白な障害である。腎臓移植を待っている患者のおおよそ３分の１が感作されており、１５％が高感作性であるため、このことが、移植を待っている患者の集積につながる。米国においては、２００１〜２００２年における腎移植待ちリストの平均時間は、パネル反応性抗体（ＰＲＡ）スコアが０〜９％の患者については１３２９日、ＰＲＡが１０〜７９％の患者については１９２０日であり、ＰＲＡが８０％以上の患者については３６４９日であった（臓器調達移植ネットワーク（ＯＰＴＮ）データベース、２０１１）。
【００９９】
ＤＳＡの障害を克服するための、承認された１つの戦略は、ＤＳＡのレベルを、移植が検討され得るレベルに低下させるために、血漿交換又は免疫吸着を、多くの場合静脈内ガンマグロブリン（ＩＶＩｇ）又はリツキシマブ（例）と併用して適用することである（Ｊｏｒｄａｎ  ｅｔ  ａｌ．，  ２００４；Ｍｏｎｔｇｏｍｅｒｙ  ｅｔ  ａｌ．，２０００；Ｖｏ  ｅｔ  ａｌ．，２００８ａ；Ｖｏ  ｅｔ  ａｌ．，２００８ｂ）。しかしながら、血漿交換、免疫吸着及びＩＶＩｇ処置は、長期間にわたる反復治療を含むので、非効率的で、厳密な計画を必要とするという欠点がある。死亡したドナーからの臓器が利用可能になるときは、長引いた冷虚血時間が、腎臓移植における遅延移植機能及び同種移植片喪失の最も重要な危険因子の１つであるので、数時間以内に移植する必要がある（Ｏｊｏ  ｅｔ  ａｌ．，１９９７）。
【０１００】
対照的に、本発明の方法は、移植レシピエント候補において、ＤＳＡの、迅速、一時的且つ安全な除去を可能にする。移植の直前に本発明のポリペプチドを投与することにより、高感作患者を効果的に脱感作することができ、それにより移植が可能となり、急性抗体媒介性拒絶反応が回避される。移植前の、ポリペプチドの単回投与により、ドナー特異的ＩｇＧ抗体を有する数千人の患者の移植が可能になる。
【０１０１】
この実施形態の文脈において、本方法は、代替的に、被験体における臓器不全を治療するための方法であって、（ａ）被験体に、本発明のポリペプチドを投与すること、及び（ｂ）続いて、被験体に置換臓器を移植することを含み：
−  投与される前記ポリペプチドの量は、被験体の血漿中に存在する実質的に全てのＩｇＧ分子を切断するのに十分である；及び
−  工程（ａ）及び（ｂ）は、少なくとも２時間、また多くとも２１日の時間間隔で隔てられる、方法と記述され得る。
【０１０２】
言い換えれば、この実施形態は、被験体における移植臓器の拒絶反応、特に急性抗体媒介性移植拒絶反応の拒絶反応、を予防するための方法であって、臓器移植の少なくとも２時間前、また多くとも２１日前に、被験体に本発明のポリペプチドを投与することを含み、投与される前記ポリペプチドの量が、被験体の血漿中に存在する実質的に全てのＩｇＧ分子を切断するのに十分である、方法として記述され得る。本発明は、臓器不全を治療する、又は移植拒絶反応、特に急性抗体媒介性移植拒絶反応、を予防する方法等における、本発明のポリペプチドの使用も提供する。本発明は、かかる方法による、臓器不全の治療のため、又は移植拒絶反応の予防のための医薬の製造における、本発明のポリペプチドの使用も提供する。この実施形態においては、本発明の方法は、移植時又は移植の直前に実施される工程であって、患者中のＴ細胞及び／又はＢ細胞の誘導抑制を含む、工程を更に含み得る。前記誘導抑制は、典型的には、Ｔ細胞を死滅させるか又は抑圧する、有効量の薬剤を投与すること、及び／又はＢ細胞を死滅させるか又は抑圧する、有効量の薬剤を投与することを含み得る。Ｔ細胞を死滅させるか又は抑圧する薬剤としては、ムロモナブ、バシリキシマブ、ダクリズマブ、抗胸腺細胞グロブリン（ＡＴＧ）抗体及びリンパ球免疫グロブリン、抗胸腺細胞グロブリン製剤（ＡＴＧＡＭ）が挙げられる。リツキシマブは、Ｂ細胞を死滅又は抑圧することが知られている。
【実施例】
【０１０３】
実施例
特に表示しない限り、用いた方法は、標準的な生化学及び分子生物学の技術である。好適な方法論の教科書の例としては、Ｓａｍｂｒｏｏｋ  ｅｔ  ａｌ．，Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｃｌｏｎｉｎｇ，Ａ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｍａｎｕａｌ（１９８９）及びＡｕｓｕｂｅｌ  ｅｔ  ａｌ．，Ｃｕｒｒｅｎｔ  Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ  ｉｎ  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｂｉｏｌｏｇｙ（１９９５），Ｊｏｈｎ  Ｗｉｌｅｙ  ａｎｄ  Ｓｏｎｓ，Ｉｎｃ．が挙げられる。
【０１０４】
実施例１−ポリペプチドの設計、製造及び精製
成熟したＩｄｅＳ分子を解析し、突然変異に好適な領域を同定した。いくつかの場合においては、インシリコ評価を用いて、突然変異で起こり得る結果を評価した。各ポリペプチドの配列を決定し、各ポリペプチドをコードするｃＤＮＡを、導入された突然変異の数に応じて、出発配列の部位特異的突然変異又は合成のいずれかによって、ＧｅｎｅＣｕｓｔ，Ｌｕｘｅｍｂｏｕｒｇで生成した。ｃＤＮＡを配列決定し、短いグリシンリンカー（３×Ｇｌｙ）によってＣ末端に連結したＣ末端６×Ｈｉｓタグとインフレームで、ｐＥＴ９ａ発現ベクター（Ｎｏｖａｇｅｎｅ）に移した。細菌の発現を向上させるために、Ｎ末端メチオニンを付加した。Ｅ．コリＢＬ２１（ＤＥ３）（Ｓｔｒａｔａｇｅｎｅ）を、プラスミドで形質転換（熱ショック）して、３０μｇ／ｍｌのカナマイシンを含有するＬＢアガロースプレート上に播種した。単一のコロニーを拾い、一晩の培養（３ｍｌのＬＢ培地）を３７℃、２５０ｒｐｍで開始した。翌日、グリセロールストックを調製し、３０μｇ／ｍｌのカナマイシン及び消泡剤を添加した１０ｍｌのＴＢ培地に終夜培養液を植菌し、ＯＤ０．６〜０．８（３７℃、３００ｒｐｍ）まで増殖させた。この時点で、ＩＰＴＧ（１ｍＭ）を加え、１時間培養を継続した後、遠心分離により細菌を回収した。ペレットをＰＢＳ中で洗浄し、−２０℃で凍結させた。細菌溶解のための凍結融解プロトコルを用い（各１ｍｌ  ＰＢＳにおいて３回の凍結／融解サイクル）、タンパク質を、Ｎｉ−ＮＴＡを予め充填したスピンカラム（Ｐｉｅｒｃｅ）を用いて精製した。精製後、溶出したタンパク質を、緩衝液交換（ＭＷＣＯ  ９Ｋ  Ｍｉｌｌｉｐｏｒｅ  ｃｆｇ装置中に３倍容量のＰＢＳ）前に、１０ｍＭ  ＤＴＴで活性化した。ドデシル硫酸ナトリウムポリアクリルアミドゲル電気泳動（ＳＤＳ−ＰＡＧＥ）無染色１２％Ｍｉｎｉ−ＰＲＯＴＥＡＮ（登録商標）ＴＧＸ（商標）プレキャストゲル（Ｂｉｏｒａｄ）ＳＤＳ−ＰＡＧＥを用いて、各タンパク質の純度及び安定性を評価した。
【０１０５】
以下の表には、試験した各ポリペプチドについて行った変更を、Ｎ末端メチオニン及びｈｉｓタグを含まない、成熟ＩｄｅＺ又はＩｄｅＳ／Ｚと比較してまとめている。従って、本明細書に記載される実験において用いられる各ポリペプチドの配列は、典型的には、該表に示される通りの配列番号の配列と、追加のＮ末端メチオニン及び短いグリシンリンカーによってＣ末端に連結したｈｉｓタグを含む。
【０１０６】
【表８】
2018510622.tif 000015
【０１０７】
【表９】
2018510622.tif 000016
【０１０８】
コントロールとして、改造型ＩｄｅＳ、ＩｄｅＺ及びＩｄｅＳ／Ｚを、上記と同じ方法論を用いて製造した。これら改造型を、本明細書において、それぞれｐＣＡＲＴ１２４、ｐＣＡＲＴ１４４及びｐＣＡＲＴ１４５と言う。
【０１０９】
ｐＣＡＲＴ１２４は、配列番号２の配列と、追加のＮ末端メチオニン及び短いグリシンリンカーによってＣ末端に連結したｈｉｓタグを含む。
ｐＣＡＲＴ１２４の配列を以下に示す：
【０１１０】
【化２】
2018510622.tif 000017
【０１１１】
ｐＣＡＲＴ１４４は、配列番号４の配列と、追加のＮ末端メチオニン及び短いグリシンリンカーによってＣ末端に連結したｈｉｓタグを含む。
ｐＣＡＲＴ１４４の配列を以下に示す：
【０１１２】
【化３】
2018510622.tif 000018
【０１１３】
ｐＣＡＲＴ１４５は、配列番号５の配列と、追加のＮ末端メチオニン及び短いグリシンリンカーによってＣ末端に連結したｈｉｓタグを含む。
ｐＣＡＲＴ１４５の配列を以下に示す：
【０１１４】
【化４】
2018510622.tif 000019
【０１１５】
更なるコントロールとして用いるために、タグを欠いているＩｄｅＳも、自動化された多段階クロマトグラフィー精製を用いて、製造管理及び品質管理に関する基準（ＧＭＰ  ｓｔａｎｄａｒｄ）と無関係に製造した。このポリペプチドを、本明細書においてＢＸ１００１８６５と言う。
【０１１６】
試験したポリペプチド並びにｐＣＡＲＴ１２４、ｐＣＡＲＴ１４４及びｐＣＡＲＴ１４５のそれぞれを製造するために用いたｃＤＮＡ配列を以下に示す。各ｃＤＮＡ配列は、３’末端にＮ末端メチオニン（ＡＴＧ）のコドン、及び５’末端の停止コドン（ＴＡＡ）の前の、グリシンリンカー及びヒスチジンタグのコドンを含む。
【０１１７】
【化５−１】
2018510622.tif 000020
【０１１８】
【化５−２】
2018510622.tif 000021
【０１１９】
【化５−３】
2018510622.tif 000022
【０１２０】
【化５−４】
2018510622.tif 000023
【０１２１】
【化５−５】
2018510622.tif 000024
【０１２２】
【化５−６】
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【０１２３】
【化５−７】
2018510622.tif 000026
【０１２４】
実施例２−効力の評価（ＩｇＧ切断の有効性）
ＥＬＩＳＡ
ＥＬＩＳＡベースの効力アッセイを用いて、酵素活性を測定した。ＥＬＩＳＡの原理は、マルチタイタープレートのウェルを抗体標的（ＢＳＡ）でコーティングし、次いで種々の濃度の（試験又はコントロールの）ＩｇＧシステインプロテアーゼポリペプチドを、ウェル中の抗ＢＳＡ抗体とインキュベーションした後、検出抗体を用いて、ウェルに結合した抗ＢＳＡ抗体の量を検出することである。ある特定の、ウェル中のＩｇＧシステインプロテアーゼポリペプチドの濃度が高いほど、ウェルに結合する無傷の抗ＢＳＡポリペプチドはより少なく、もたらされるシグナルはより弱い。同様に、同じ濃度で存在する場合、より強力なＩｇＧシステインプロテアーゼポリペプチドは、より効力が弱いＩｇＧシステインプロテアーゼポリペプチドよりも、弱いシグナルをもたらす。
【０１２５】
基準ＩｄｅＳ、ＢＸ１００１８６５を、１：２の段階希釈で、３２０ｎＭから０．１６ｎＭまでの滴定シリーズとして調製し、アッセイ用の標準較正曲線を描くことを可能にした。複数の既知濃度についてのアッセイで得られた、試験した各ポリペプチドの結果を較正曲線の直線部分と比較して、同じ効力を達成する基準ＩｄｅＳの濃度を決定した。各ポリペプチドの既知の濃度を、曲線から決定した、基準ＩｄｅＳの等価濃度で割ることにより、基準ＩｄｅＳ  ＢＸ１００１８６５と比較した効力の倍数変化であるスコアがもたらされる。例えば、５ｎＭ試験ポリペプチドが較正曲線上の１０ｎＭ基準ＩｄｅＳに等しい結果を出す場合、試験ポリペプチドは、基準ＩｄｅＳ  ＢＸ１００１８６５の２倍超の効力を有する。基準ＩｄｅＳ  ＢＸ１００１８６５に対する効力の倍数変化の平均スコアを、試験した各ポリペプチドについて、種々の濃度で得られた全スコア（それらが較正曲線の直線部分内にあることを条件とする）から算出した。次いで、プレート間の比較を可能にするために、この平均スコアを、各プレートに含めたｐＣＡＲＴ１２４の基準ＩｄｅＳについて得た平均スコアと比較した。ｐＣＡＲＴ１２４についての平均スコアを、試験ポリペプチドについての平均スコアで割って「ｐＣＡＲＴ１２４比」を編み出した。これは事実上、各ポリペプチドについての効力の、ＩｄｅＳに対する倍数変化である。このｐＣＡＲＴ１２４比は、次いで、棒グラフに視覚化し得る。
【０１２６】
実験プロトコルの簡単な要旨：マルチタイタープレートのウェルを、ＢＳＡ（１０μｇ／ｍｌ）で一晩コーティングし、次いでＰＢＳ−Ｔで洗浄し、ＰＢＳ中２％魚皮ゼラチンで１時間ブロッキングした。ＩｄｅＳ  ＢＸ１００１８６５ポリペプチドは、０．１％ゼラチンを含むＰＢＳ中、１：２の段階希釈で、３２０ｎＭから０．１６ｎＭまでの滴定シリーズとして調製した。次いで、試験ポリペプチド及びｐＣＡＲＴ１２４コントロールを、０．１％ゼラチンを含むＰＢＳ中、それぞれ１５、７．５、３．７５及び１．９ｎＭで調製した。５０μｌのポリペプチド試料を、５０μｌのウサギ抗ＢＳＡ（ＡＣＲＩＳ、＃Ｒ１０４８Ｐ、１０ｎＭ）を基質として含む各ウェルに加えた。プレートを室温で１時間インキュベーションし、次いでＰＢＳ−Ｔで洗浄した。特異的なビオチン化抗ウサギＦｃヤギ抗体（３０，０００×希釈）を検出抗体として加え、３０分間インキュベーションした。プレートを洗浄し、４００００倍に希釈したストレプトアビジン（ＳＡ）−セイヨウワサビペルオキシダーゼ（ＨＲＰ；Ｐｉｅｒｃｅ）を加え、３０分間インキュベーションした。プレートを洗浄し、ＨＲＰ用の発色基質としてＴＭＢ  Ｏｎｅ  Ｃｏｍｐｏｎｅｎｔを用いて、７分間発色させ、０．５Ｍ  Ｈ２ＳＯ４で停止させた。λ＝４５０ｎｍで吸光度（ＯＤ）を測定した。各試験ポリペプチドについて、及びｐＣＡＲＴ１２４について、ＢＸ１００１８６５と比較した効力の倍数変化についての平均スコアを決定した。次いで、各試験ポリペプチドについての「ｐＣＡＲＴ１２４比」を、上記の通り算出した。
【０１２７】
ｐＣＡＲＴ１９１、１９２、１９３、１９４、１９７、１９８、２００及び２０１についての「ｐＣＡＲＴ１２４比」の結果を、ｐＣＡＲＴ１２４についての結果と共に、図１に示す。本明細書に示される本発明の例示的なポリペプチドは全て、ＩｄｅＳコントロール（ｐＣＡＲＴ１２４）と比べて、少なくとも同等の効力を達成する。ｐＣＡＲＴ１９４、１９７、２００及び２０１は全て、はるかに高い効力、ｐＣＡＲＴ１９７及びｐＣＡＲＴ２０１についての、コントロールよりも８．０倍も高い向上でさえ、達成する。
【０１２８】
興味深いことに、ｐＣＡＲＴ２００及び２０１は、両方、Ｎ末端に対する改変を含む。また、ｐＣＡＲＴ１９４及び１９７は、それぞれＮ１３８Ｒ／Ｋ改変を有する。配列番号３の１３９位に対応する位置での、正電荷アミノ酸への変化は、Ｎ１３８Ｒ／Ｋ置換と同様の結果を生じると予想される。１３８位及び１３９位は、配列番号３の１３４位から１４４位にわたるベータヘアピン構造のループ中に位置する。本明細書で得られた結果に基づくと、１３８位及び１３９位のいずれか又は両方における、正電荷アミノ酸への変化が、ＩｇＧシステインプロテアーゼ活性を増加させると予想される。
【０１２９】
ｐＣＡＲＴ２０２、２０３及び２０４についての結果を図２に示す。特にｐＣＡＲＴ２０３は、ＩｄｅＳより約３．５倍強力である。ｐＣＡＲＴ２０２は、ＩｄｅＳより１〜１．５倍強力である。ｐＣＡＲＴ２０４は、ｐＣＡＲＴ１４４に匹敵する効力を有する。
【０１３０】
ＩｇＧ切断パターンの可視化
種々の基質中の、各ポリペプチドの滴定シリーズによって生成された切断産物を、ＳＤＳ−ＰＡＧＥで可視化することにより、種々のｐＣＡＲＴポリペプチドの有効性を更に評価した。純粋ＩｇＧ基質中での有効性を試験するために、アダリムマブ（Ｈｕｍｉｒａ）をＩｇＧ１用に用い、デノスマブ（ＸＧＥＶＡ）をＩｇＧ２用に用いた。より複雑な生理学的環境中での有効性を試験するために、ポリペプチドをＩＶＩｇ（Ｏｃｔａｇａｍ）中（ｉｎ  ｉｎ）でもいくつか滴定した。これにより、中和作用を有する抗ＩｄｅＳ抗体がポリペプチド活性に与える影響を評価できる。各ポリペプチドの切断パターンを、同一基質中のＩｄｅＳ（ＢＸ１００１８６５及びｐＣＡＲＴ１２４）の切断パターンと比較する。プロトコルは以下の通りである：
【０１３１】
純粋ＩｇＧの試験のために、各試験ポリペプチド又はコントロールを、支持タンパク質として０．０５％ＢＳＡを含むＰＢＳ中、１：３の段階滴定シリーズで、６．７μｇ／ｍｌから０．０４ｎｇ／ｍｌまで希釈した。各濃度の２５μｌをマルチタイタープレートに移し、切断反応を、Ｈｕｍｉｒａ又はＸＧＥＶＡ（２ｍｇ／ｍｌ）のいずれか２５μｌを加えることによって開始した。従って、各出発濃度のポリペプチドは、ウェル中で１：２に希釈され、３．３μｇ／ｍｌ〜０．０２ｎｇ／ｍｌの滴定シリーズがもたらされる。
【０１３２】
ＩＶＩｇ試験のために、各試験ポリペプチド又はコントロールを、支持タンパク質として０．０５％ＢＳＡを含むＰＢＳ中、１：２の段階滴定シリーズで、３０μｇ／ｍｌから０．０１５ｎｇ／ｍｌまで希釈した。各濃度の２５μｌをマルチタイタープレートに移し、２５μｌの１０ｍｇ／ｍｌ  ＩＶＩｇを加えることによって切断反応を開始させた。従って、各出発濃度のポリペプチドは、ウェル中で１：２に希釈され、１５μｇ／ｍｌ〜０．００７５ｎｇ／ｍｌの滴定シリーズがもたらされる。
【０１３３】
プレートを、３７℃で１．５時間インキュベーションした。試料を、２×ＳＤＳローディング緩衝液で１：４に混合し、９２℃で５分間加熱した。１０μｌをポリアクリルアミドゲル（１５ウェル４−２０％Ｍｉｎｉ−ＰＲＯＴＥＡＮ（登録商標）ＴＧＸ（商標）プレキャストゲル（Ｂｉｏｒａｄ））にロードし、これを、標準的なプロトコルに従って読み取った。
【０１３４】
図３は、ｐＣＡＲＴ２０２、２０３及び２０４について、ＩｇＧ１基質を用いて生成された切断パターンを、ＩｄｅＳコントロール（ｐＣＡＲＴ１２４及びＢＸ１００１８６５）及びＩｄｅＺ（ｐＣＡＲＴ１４４）の両方と比較して示す。酵素濃度は、１：３の段階希釈系列で３．３３μｇ／ｍｌ（レーン１）から０．０２ｎｇ／ｍｌ（レーン１２）まで低下させる（ｄｏｗｎ  ｔｏ）。無傷のアダリムマブ（酵素なし）を、レーン１３に示す。右側の矢印は、ＩｇＧ由来の種々の切断産物を示す。矢印１：無傷ＩｇＧ；矢印２：ｓｃＩｇＧ（１回切断ＩｇＧ−第１のＩｇＧ重鎖の切断の結果）；矢印３：Ｆ（ａｂ’）２断片（第２のＩｇＧ重鎖の切断の結果）。縦線を付記し、無傷ＩｇＧがｓｃＩｇＧになる第１のＩｇＧ重鎖切断（レーン６と７との間）、及びｓｃＩｇＧがＦ（ａｂ’）２断片になる第２のＩｇＧ重鎖切断（レーン２と３との間）での比較を容易にした。
【０１３５】
酵素ＩｄｅＺ（ｐＣＡＲＴ１４４）は、第１及び第２のＩｇＧ重鎖の両方の切断の有効性がより低い。ＩｄｅＳ（ＢＸ１００１８６５及びｐＣＡＲＴ１２４）は、両方の重鎖の切断において、ｐＣＡＲＴ１４４よりも約３倍有効（即ち、１滴定段階）である。ＩｄｅＳ（ＢＸ１００１８６５及びｐＣＡＲＴ１２４）についての、１．５ｎｇ／ｍｌ（レーン８）での切断は、４．６ｎｇ／ｍｌ（レーン７）でのｐＣＡＲＴ１４４（ＩｄｅＺ）切断と同等である。ＢＸ１００１８６５及びｐＣＡＲＴ１２４は、４．６ｎｇ／ｍｌ（レーン７）で濃いｓｃＩＧｇバンド（矢印２）を示すが、ｐＣＡＲＴ１４４は、この濃度（レーン７）でのｓｃＩｇＧバンド（矢印２）が極めて薄い。
【０１３６】
重要なことに、ｐＣＡＲＴ２０２及びｐＣＡＲＴ２０３は、両方、ＩｄｅＺ（ｐＣＡＲＴ１４４）と比較して、ＩｇＧの切断における効力の増大を示し（レーン７及びレーン３）、より濃いｓｃＩｇＧバンド（矢印２）及びより濃いＦ（ａｂ’）２バンド（矢印３）を生じる。酵素ｐＣＡＲＴ２０４に関して、有効性の増大は見られない。第２の重鎖の切断におけるｐＣＡＲＴ２０２の有効性は、ＩｄｅＳ（ＢＸ１００１８６５及びｐＣＡＲＴ１２４）とほぼ同じであることが示される（レーン３を比較）。ｐＣＡＲＴ２０２はＩｄｅＳより有効性が低いが、第１のＩｇＧ重鎖の切断に関しては、ｐＣＡＲＴ１４４より有効である（レーン７を比較）。酵素ｐＣＡＲＴ２０３は、主に第２の重鎖の切断において、ＩｄｅＳよりも更に高い有効性を有し、０．３７μｇ／ｍｌ（レーン３）において、ＢＸ１００１８６５及びｐＣＡＲＴ１２４と比較して（矢印３及び２）、より濃いＦ（ａｂ’）２バンド（矢印３）及びより薄いｓｃＩｇＧバンド（矢印２）をもたらす。
【０１３７】
従って、図３は、全体で、ｐＣＡＲＴ２０２及びｐＣＡＲＴ２０３の両方に見られる、以下の改変、Ｒ７０Ｔ、Ｙ７１ｄｅｌ、Ｎ７２Ｑ、Ｎ７３Ｇを伴うＩｄｅＺ配列の改変が、ｐＣＡＲＴ１４４（ＩｄｅＺ）と比較して、第２のＩｇＧ重鎖の切断の有効性を増大させることを示す。更に、Ｌ６４＿Ｔ６５ｄｅｌ改変を導入することにより、第１の重鎖の切断の有効性も増大する（ｐＣＡＲＴ２０３について見られる）。
【０１３８】
図４は、ｐＣＡＲＴ２０２、２０３及び２０４について、ＩＶＩｇ基質を用いて生成された切断パターンを、ＩｄｅＳコントロール（ｐＣＡＲＴ１２４及びＢＸ１００１８６５）並びにＩｄｅＺ（ｐＣＡＲＴ１４４）の両方と比較して示す。酵素濃度は、１：２の段階希釈系列で３０μｇ／ｍｌ（レーン１）から０．０１５ｎｇ／ｍｌ（レーン１２）まで低下させる。無傷のＩＶＩｇ（酵素なし）を、レーン１３に示す（このレーンが存在しないｐＣＡＲＴ２０３についての画像を除く）。右側の矢印は、ＩｇＧ由来の種々の切断産物を示す。矢印１：無傷ＩｇＧ；矢印２：ｓｃＩｇＧ（１回切断ＩｇＧ−第１のＩｇＧ重鎖切断の結果）；矢印３：Ｆ（ａｂ’）２断片（第２のＩｇＧ重鎖切断の結果）。縦線を付記し、無傷ＩｇＧがｓｃＩｇＧになる第１のＩｇＧ重鎖切断（レーン６と７との間）、及びｓｃＩｇＧがＦ（ａｂ’）２断片になる第２のＩｇＧ重鎖切断（レーン２と３との間）での比較を容易にした。
【０１３９】
酵素ｐＣＡＲＴ１４４（ＩｄｅＺ）は、ＩｄｅＳ（ＢＸ１００１８６５及びｐＣＡＲＴ１２４）と比較して、第１のＩｇＧ重鎖（レーン６）でより有効な切断を示し、より濃いｓｃＩｇＧバンド（矢印２）及びより薄い無傷ＩｇＧバンド（矢印１）を生じる。これは、おそらく中和作用を有する抗ＩｄｅＳ抗体による、ｐＣＡＲＴ１４４（ＩｄｅＺ）への結合のレベルが、それらの、ＩｄｅＳの認識と比較して、より低いためである。ｐＣＡＲＴ２０２、ｐＣＡＲＴ２０３及びｐＣＡＲＴ２０４に見られる通り、第１の重鎖切断における有効性の増大は、すべてのＩｄｅＺ由来酵素に当てはまる（レーン６）。ｐＣＡＲＴ２０２、ｐＣＡＲＴ２０３及びｐＣＡＲＴ２０４に関して、０．９４ｎｇ／ｍｌ（レーン６）の濃度では、ｓｃＩｇＧの濃いバンドを生じ（矢印２）、ほとんどのＩｇＧが１回切断されたが、同濃度のＩｄｅＳで生じるのは、５０％未満のｓｃＩｇＧである（レーン６）。
【０１４０】
しかしながら、ｐＣＡＲＴ１４４（ＩｄｅＺ）は、ＩｄｅＳ（ＢＸ１００１８６５及びｐＣＡＲＴ１２４）と比較して第２の重鎖の切断がより不十分である。このことは、レーン５（１．９ｎｇ／ｍｌの酵素）、またレーン４及び３において、切断が継続して、隣の滴定段階（レーン４、３．７５μｇ／ｍｌ）で既にＦ（ａｂ’）２バンド（矢印３）へ、ＩｄｅＳと比較して、より濃いｓｃＩｇＧバンド（矢印２）をもたらす。注目すべきことに、ｐＣＡＲＴ２０３は、第２の切断部位において、ＩｄｅＳ（ＢＸ１００１８６５及びｐＣＡＲＴ１２４）に匹敵する能力（レーン２、３及び４）を、及び第１の切断部位において、ＩｄｅＳ及びＩｄｅＺ（ｐＣＡＲＴ１４４）の両方よりも高い切断の有効性（レーン７）を示す。
【０１４１】
酵素ｐＣＡＲＴ２０３は、０．５ｎｇ／ｍｌ（レーン７）でＩｇＧ切断を実証し、約０．９ｎｇ／ｍｌ（レーン６）で大部分のｓｃＩｇＧ（矢印２）を生成した。これは、０．９ｎｇ／ｍｌ（レーン６）で切断を開始し、１．９ｎｇ／ｍｌで支配的なｓｃＩｇＧバンドを有する（レーン５）ＩｄｅＳと比較して、２倍の有効性増大に相当する。図４は、全体で、改変Ｌ６４＿Ｔ６５ｄｅｌ、Ｒ７０Ｔ、Ｙ７１ｄｅｌ、Ｎ７２Ｑ及びＮ７３ＧでＩｄｅＺを改変すると、中和作用を有するＡＤＡの存在下でさえ、ヒトＩｇＧ切断の有効性が増大することを示す。このことは、ＩｄｅＳと比較してｐＣＡＲＴ２０３に明確に見られる。
【０１４２】
図５は、ｐＣＡＲＴ２０５、２０６、２０７、２０８及び２１０についての、ＩｇＧ１基質を用いて生成された切断パターンを、ＩｄｅＳコントロール（ｐＣＡＲＴ１２４及びＢＸ１００１８６５）及びＩｄｅＺ（ｐＣＡＲＴ１４４）の両方と比較して示す。酵素濃度は、１：３の段階希釈系列で３．３３μｇ／ｍｌ（レーン１）から０．０２ｎｇ／ｍｌ（レーン１２）まで低下させる。右側の矢印は、ＩｇＧ由来の種々の切断産物を示す。矢印１：無傷ＩｇＧ；矢印２：ｓｃＩｇＧ（１回切断ＩｇＧ−第１のＩｇＧ重鎖切断の結果）；矢印３：Ｆ（ａｂ’）２断片（第２のＩｇＧ重鎖切断の結果）。縦線を付記し、無傷ＩｇＧがｓｃＩｇＧになる第１のＩｇＧ重鎖切断（レーン６と７との間）、及びｓｃＩｇＧがＦ（ａｂ’）２断片になる第２のＩｇＧ重鎖切断（レーン２と３との間）での比較を容易にした。
【０１４３】
酵素ｐＣＡＲＴ２０５は、ｐＣＡＲＴ１４４（ＩｄｅＺ）と比較して、両方のＩｇＧ重鎖の切断（レーン６及び３）において能力の増大を示し、ｐＣＡＲＴ１４４（ＩｄｅＺ）（レーン６及び３）と比較して、より濃いｓｃＩｇＧバンド（矢印２、レーン６）及び無傷ＩｇＧの、非常に薄いバンド（矢印１、レーン６）並びにより濃いＦ（ａｂ’）２バンド（矢印３、レーン３）をもたらす。しかしながら、この実験において、中和作用を有するＡＤＡ非存在下では（図４に示すものとは対照的に）、ＩｄｅＳ（ｐＣＡＲＴ１２４）の、純粋ＩｇＧ１に対する切断活性は、ｐＣＡＲＴ２０５よりも高い。
【０１４４】
ポリペプチドｐＣＡＲＴ２０７及びｐＣＡＲＴ２１０は、両方、ＩｄｅＳ（ｐＣＡＲＴ１２４）及びＩｄｅＺ（ｐＣＡＲＴ１４４）の両方と比較して、ＩｇＧ切断の有効性の増大を示す（第１の切断についてレーン７及び第２の切断についてレーン３）。最も強力な酵素であるｐＣＡＲＴ２０７は、ＩｄｅＳ（ｐＣＡＲＴ１２４）と比較して、両方のＩｇＧ重鎖の切断において、おおよそ３倍の有効性増大を示す。ｐＣＡＲＴ１２４については、１４ｎｇ／ｍｌ（レーン６）において、ｓｃＩｇＧ（矢印２）への完全な変換が達成されるが、ｐＣＡＲＴ２０７については、単一のｓｃＩｇＧバンド（矢印２）が、４．６ｎｇ／ｍｌ（レーン７）で既にみられる。第２の重鎖の切断においては、ｐＣＡＲＴ１２４と比較して、ｐＣＡＲＴ２０７についての有効性において、より大幅な増大が見られる。ｐＣＡＲＴ２０７については、４１ｎｇ／ｍｌ（レーン４）において、ｐＣＡＲＴ１２４が０．３７μｇ／ｍｌ（レーン３）で示すより濃いＦ（ａｂ’）２のバンド（矢印３）が見られる。
【０１４５】
ｐＣＡＲＴ２０７及びｐＣＡＲＴ２１０は、ＩｄｅＺ配列に対して、以下：Ｌ６４＿Ｔ６５ｄｅｌ、Ｒ７０Ｔ、Ｙ７１ｄｅｌ、Ｎ７２Ｑ、Ｎ７３Ｇ、Ｎ１３８Ｒの改変を共有する。従って、図５は、全体で、これらの変化がヒトＩｇＧ１の切断の有効性を増大させることを示す。
【０１４６】
図６は、ｐＣＡＲＴ２０３、２０５、２０６、２０７、２０８及び２１０について、ＩｇＧ２基質を用いて生成した切断パターンを、ＩｄｅＳコントロール（ｐＣＡＲＴ１２４及びＢＸ１００１８６５）及びＩｄｅＺ（ｐＣＡＲＴ１４４）の両方と比較して示す。酵素濃度は、１：３の段階希釈系列で３．３３μｇ／ｍｌ（レーン１）から０．０２ｎｇ／ｍｌ（レーン１２）まで低下させる。右側の矢印は、ＩｇＧ由来の種々の切断産物を示す。矢印１：無傷ＩｇＧ；矢印２：ｓｃＩｇＧ（１回切断ＩｇＧ−第１のＩｇＧ重鎖切断の結果）；矢印３：Ｆ（ａｂ’）２断片（第２のＩｇＧ重鎖切断の結果）。縦線を付記し、無傷ＩｇＧがｓｃＩｇＧになる、第１のＩｇＧ重鎖の切断（レーン６と７との間）、及びｓｃＩｇＧがＦ（ａｂ’）２断片になる、第２のＩｇＧ重鎖の切断（レーン２と３との間）での比較を容易にした。
【０１４７】
酵素ｐＣＡＲＴ２０３及びｐＣＡＲＴ２０７の両方が、ｐＣＡＲＴ１４４（ＩｄｅＺ）と比較して、切断の有効性においておおよそ３倍の増大を示す。ｐＣＡＲＴ１４４は、０．１２μｇ／ｍｌ（レーン４）の濃度で、より低い、４１ｎｇ／ｍｌ（レーン５）の濃度におけるｐＣＡＲＴ２０３及びｐＣＡＲＴ２０７の支配的なｓｃＩｇＧバンド（矢印２）と比較して、濃い、単一のｓｃＩｇＧバンド（矢印２）を示す。ｐＣＡＲＴ２０３及びｐＣＡＲＴ２０７は、第１及び第２のＩｇＧ重鎖の両方の切断の有効性において、ＩｄｅＳ（ＢＸ１００１８６５及びｐＣＡＲＴ１２４）に匹敵する（レーン６及びレーン２）。しかしながら、この実験において、中和作用を有するＡＤＡの非存在下では（図４に示したものとは対照的に）、純粋ＩｇＧ２の両方の重鎖に対する、ＩｄｅＳ（ｐＣＡＲＴ１２４）の切断活性は、ｐＣＡＲＴ２０６、ｐＣＡＲＴ２０８及びｐＣＡＲＴ２１０のそれぞれよりも高い。これは、ｐＣＡＲＴ２０６及びｐＣＡＲＴ２０８について、酵素の、３．３μｇ／ｍｌの最高濃度（レーン１）においてさえ存在する単一の濃いｓｃＩｇＧバンド（矢印２）から理解できる。ＩｄｅＳ／Ｚハイブリッド（ｐＣＡＲＴ１４５）に由来するｐＣＡＲＴ２０５は、純粋ヒトＩｇＧ２の切断（第１の切断部位についてはレーン５、第２の切断部位についてはレーン２）において、ＩｄｅＺ（ｐＣＡＲＴ１４４）とほぼ同じ有効性を有し、その結果、両方とも、０．１２μｇ／ｍｌ（レーン４）で単一のｓｃＩｇＧバンド（矢印２）及び最高濃度３．３μｇ／ｍｌ（レーン１）で支配的なＦ（ａｂ’）２バンドを生じる。
【０１４８】
図６は、全体で、ＩｄｅＺの最良の改変、即ち、ＩｇＧ２の切断において最も大幅な有効性の増大をもたらす改変が、ｐＣＡＲＴ２０３及びｐＣＡＲＴ２０７に見られるものであったことを示す。これらの酵素は、Ｌ６４＿Ｔ６５ｄｅｌ、Ｒ７０Ｔ、Ｙ７１ｄｅｌ、Ｎ７２Ｑ、Ｎ７３Ｇの改変を共有し、ｐＣＡＲＴ２０７は、更にＮ１３８Ｒ改変を有する。
【０１４９】
図７は、ｐＣＡＲＴ２０７、２０８及び２１０について、ＩＶＩｇ基質を用いて生成した切断パターンを、ＩｄｅＳコントロール（ＢＸ１００１８６５）と比較して示す。酵素濃度は、１：２の段階希釈系列で３０μｇ／ｍｌ（レーン１）から０．０１５ｎｇ／ｍｌ（レーン１２）まで低下させる。無傷のＩＶＩｇ（酵素なし）をレーン１３に示す。右側の矢印は、ＩｇＧ由来の種々の切断産物を示す。矢印１：無傷ＩｇＧ；矢印２：ｓｃＩｇＧ（１回切断ＩｇＧ−第１のＩｇＧ重鎖切断の結果）；矢印３：Ｆ（ａｂ’）２断片（第２のＩｇＧ重鎖切断の結果）。縦線を付記し、無傷ＩｇＧがｓｃＩｇＧ（レーン６と７との間）になる、第１のＩｇＧ重鎖の切断、及びｓｃＩｇＧがＦ（ａｂ’）２断片になる、第２のＩｇＧ重鎖の切断（レーン２と３との間）での比較を容易にした。
【０１５０】
ｐＣＡＲＴ２０７、ｐＣＡＲＴ２０８及びｐＣＡＲＴ２１０はすべて、ＩｄｅＳ（ＢＸ１００１８６５）と比較して、第１のＩｇＧ重鎖の切断において、有効性の増大を示す（レーン６）。ＩｄｅＳ（ＢＸ１００１８６５）は、１．９ｎｇ／ｍｌ（レーン５）の濃度で、大部分のｓｃＩｇＧ（矢印２）を生成した。同様の結果が、ｐＣＡＲＴ２０７及びｐＣＡＲＴ２１０の両方について、０．９ｎｇ／ｍｌ（レーン６）で得られ、ｐＣＡＲＴ２０８については、ほんの０．５ｎｇ／ｍｌ（レーン７）で得られる。ｐＣＡＲＴ２０８の場合、これは、第１の重鎖の切断有効性における、おおよそ４倍の増大である。ｐＣＡＲＴ２０８は、第２の重鎖の切断において、１．９ｎｇ／ｍｌ（レーン５）で、支配的なＦ（ａｂ’）２バンドを生じ、切断有効性の向上を示すのに対し、ＩｄｅＳ（ＢＸ１００１８６５）は、同濃度で、ｓｃＩｇＧ（矢印２）を生成するのみであった。
【０１５１】
図７は、全体で、ｐＣＡＲＴ２０７、ｐＣＡＲＴ２０８及びｐＣＡＲＴ２１０が、ＩｄｅＳと比較して、抗ＩｄｅＳ中和抗体（ＡＤＡ）の存在下で、ヒトＩｇＧの切断の有効性を増大させることを示す。ｐＣＡＲＴ２０６について同様の結果が得られた（データ示さず）。ｐＣＡＲＴ２０６、２０７、２０８及び２１０はすべて、ＩｄｅＺ配列に対して、以下の、Ｌ６４＿Ｔ６５ｄｅｌ、Ｒ７０Ｔ、Ｙ７１ｄｅｌ、Ｎ７２Ｑ及びＮ７３Ｇの改変を共有する。更に、ｐＣＡＲＴ２０７、２０８及び２１０は、Ｎ１３８Ｒの改変も共有する。従って、図７により、これらの種々の改変が、中和作用を有するＡＤＡの存在下で、ヒトＩｇＧ切断の有効性を増大させることも確認される。
【０１５２】
実施例３−免疫原性の評価
競合的抗ＩｄｅＳ抗体アッセイ
このアッセイは、抗ＩｄｅＳ抗体への結合についての、試験ポリペプチドとＩｄｅＳとの間の競合に基づいている。試験酵素とＩＶＩｇとのプレインキュベーションにより、試験したｐＣＡＲＴ酵素に対する抗ＩｄｅＳ抗体の結合が可能になる。その後、ＩｄｅＳでコーティングしたプレートに、ＩＶＩｇ−酵素混合物を加え、試験ポリペプチドに結合していないすべての抗ＩｄｅＳ抗体を、プレート上のＩｄｅＳに、代わりに結合させる。結合のためのインキュベーションは、すべて、ＩｇＧ切断を阻害するために、２ｍＭヨード酢酸（ＩＨＡｃ）の存在下で、及び高塩濃度で行い、高親和性結合のみが生じるようにした。洗浄後、検出剤として、特異的なビオチン化抗ヒトＦ（ａｂ’）２ヤギＦ（ａｂ’）２断片を使用する。ＩＶＩｇ中の抗ＩｄｅＳ抗体による試験ポリペプチドの認識が乏しいと、ＩＶＩｇ中の抗ＩｄｅＳ抗体のプレートへの高結合をもたらし、強いシグナルをもたらす。ＩＶＩｇ中の抗ＩｄｅＳ抗体による試験ポリペプチドの良好な認識は、反対の結果をもたらす。詳細なプロトコルは以下の通りである。
【０１５３】
マルチタイタープレート上に、基準ＩｄｅＳ（ＢＸ１００１８６５）を一晩コーティングし（５μｇ／ｍｌ）、次いでＰＢＳ−Ｔで洗浄し、２ｍＭ  ＩＨＡｃ及び１Ｍ  ＮａＣｌを添加したＰＢＳ中２％ＢＳＡで１時間ブロッキングした。０．１％ＢＳＡ、２ｍＭ  ＩＨＡｃ及び１Ｍ  ＮａＣｌを添加したＰＢＳ中の試験ポリペプチド及び２０μｇ／ｍｌ  ＩＶＩｇを段階的に希釈して、混合用プレートを調製した。混合用プレートを、シェーカー上で、室温で１時間インキュベーションした。インキュベーション後、ブロッキング溶液を、ＩｄｅＳでコーティングしたプレートから捨て、混合用プレートからの各混合物５０μｌを、コーティングしたプレートのウェルに移した。シェーカー上で、室温で１時間インキュベーションした後、プレートをＰＢＳ−Ｔで洗浄し、検出剤の、特異的なビオチン化抗ヒトＦ（ａｂ’）２ヤギＦ（ａｂ’）２断片（２００００倍希釈）を加えた。３０分間インキュベーションした後、プレートを洗浄し、４００００倍に希釈したＳＡ−ＨＲＰ（Ｐｉｅｒｃｅ）を加え、３０分間インキュベーションした。プレートを洗浄し、ＨＲＰの発色基質としてＴＭＢ  Ｏｎｅ  Ｃｏｍｐｏｎｅｎｔを用いて、７分間発色させ、０．５Ｍ  Ｈ２ＳＯ４で停止させた。吸光度（ＯＤ）を、λ＝４５０ｎｍで測定した。棒グラフにおいて視覚化するために、結果を逆数にし（１／ＯＤ値）、ｐＣＡＲＴ１２４と比較した比（１／（試験ポリペプチド／ｐＣＡＲＴ１２４））として提示した。
【０１５４】
ｐＣＡＲＴ１９１、１９２、１９３、１９４、１９７、１９８、２００及び２０１についての結果を図８に示す。ｐＣＡＲＴ２０２、２０３及び２０４についての結果を図９に示す。試験したポリペプチドは全て、ＩｄｅＳと比較して、抗ＩｄｅＳ抗体の相当な認識低下を示す。最も小幅な低下を示すポリペプチド（ｐＣＡＲＴ１９３）は、ＩｄｅＳよりおおよそ６０％低いレベルで認識された。試験した残りのポリペプチドは、ＩｄｅＳよりも、７０％、又は８０％も低かった。
【０１５５】
抗ＩｄｅＳ力価アッセイ
このアッセイは、ＩＶＩｇの希釈力価を比較することに基づいている。マイクロタイタープレート上に、種々の試験ポリペプチド並びにコントロールＩｄｅＳ（ＢＸ１００１８８６５及びｐＣＡＲＴ１２４）をコーティングした。試験ポリペプチド又はコントロールへの、抗ＩｄｅＳ抗体の結合を、滴定量のＩＶＩｇを（４０〜０．６２５μｇ／ｍｌの１：２段階希釈系列、即ち１：２５０〜１：１６０００の希釈血清に相当する力価で）プレートに加えることにより評価した。希釈緩衝液は、高親和性結合のみが生じるように、高塩濃度であって、高親和性結合のみが生じるように、高塩中に、ＩｇＧ切断を阻害するための２ｍＭ  ＩＨＡｃを含む。カットオフＯＤ値は、各実験におけるブランクのおおよそ３倍に設定した。試験した各ポリペプチドについて、カットオフを超え、最低ＯＤ値（抗ＩｄｅＳ抗体の最低結合）をもたらした、ＩＶＩｇの希釈力価の結果を確認した。即ち；抗ＩｄｅＳ抗体（ＡＤＡ）による認識が弱いポリペプチドには、より希釈されていないＩＶＩｇが必要であり、ＡＤＡにより強く認識される酵素には、より希釈されたＩＶＩｇが必要である。簡潔に述べると、プロトコルは以下の通りであった：
【０１５６】
マルチタイタープレート上に、基準ＩｄｅＳ及び各試験酵素を一晩コーティングし（２μｇ／ｍｌ）、ＰＢＳ−Ｔで洗浄し、２ｍＭのＩＨＡｃを添加したＰＢＳ中２％ＢＳＡで１時間ブロッキングした。ブロッキング溶液を捨て、５０μｌのＩＶＩｇ（希釈緩衝液：ＰＢＳ  １Ｍ  ＮａＣｌ＋０．１％ＢＳＡ＋２ｍＭ  ＩＨＡｃ）の段階的希釈物を加え、シェーカー上で、室温で１時間インキュベーションした。プレートを、ＰＢＳ−Ｔで洗浄し、検出剤の、特異的なビオチン化抗ヒトＦ（ａｂ’）２ヤギＦ（ａｂ’）２断片（２００００倍希釈）を加え、３０分間インキュベーションした。プレートを洗浄し、４００００倍に希釈したＳＡ−ＨＲＰ（Ｐｉｅｒｃｅ）を加え、３０分間インキュベーションした。プレートを洗浄し、ＨＲＰの発色基質としてＴＭＢ  Ｏｎｅ  Ｃｏｍｐｏｎｅｎｔを用いて、７分間発色させ、０．５Ｍ  Ｈ２ＳＯ４で停止させた。吸光度（ＯＤ）を、λ＝４５０ｎｍで測定した。
【０１５７】
ｐＣＡＲＴ２０２、２０３及び２０４についての結果を図１０に示す。試験した３つのポリペプチドは、すべて、抗ＩｄｅＳ抗体による認識に関して、ＩｄｅＳよりも３倍低い希釈度を記録した。
【０１５８】
ｐＣＡＲＴ２０５、２０６、２０７、２０８及び２１０についての結果を図１１に示す。ｐＣＡＲＴ２０６以外の全ては、抗ＩｄｅＳ抗体による認識に関して、ＩｄｅＳよりも３倍低い希釈度を記録した。ｐＣＡＲＴ２０６は、２倍低い希釈度を記録した。試験したポリペプチドは、全体としては、ＩｄｅＳよりも、明らかに免疫原性が低い。
【０１５９】
まとめ
試験したポリペプチドは、一般に、ヒトＩｇＧを切断するのに、ＩｄｅＺよりも有効であり、及び／又は、ヒトＩｇＧを切断するのに、ＩｄｅＳと少なくとも同等に有効であり、典型的には、免疫原性も、ＩｄｅＳより低い。
【０１６０】
実施例４−効力の評価
効力ＥＬＩＳＡ
ヒトＩｇＧ１及びＩｇＧ２の切断能力を扱うために、２つのＥＬＩＳＡベースの効力アッセイを用意した。一方のアッセイはＩｇＧ１の切断を、そして他方はＩｇＧ２の切断を測定する。試験した種々のＩｇＧシステインプロテアーゼポリペプチドについて、ＥＣ５０（半最大有効濃度）値を算出した。アッセイの原理は、Ｆａｂ領域に対し特異性を有する、ヒトＩｇＧ抗体に対するＦ（ａｂ）２断片で、マルチタイタープレートのウェルをコーティングすることであった。次いで、ウェル中で、ヒトＩｇＧ１抗体（Ｈｕｍｉｒａ）又はヒトＩｇＧ２抗体（ＸＧＥＶＡ）と共に、滴定濃度のＩｇＧシステインプロテアーゼポリペプチド（試験又はコントロール）をインキュベーションした。ウェルに結合した無傷又は一回切断のヒトＩｇＧ（Ｈｕｍｉｒａ又はＸＧＥＶＡ）の量を、抗体のＦｃ部分に対する特異性を有する、ヒトＩｇＧに対する検出抗体を用いて測定した。ある特定の、ウェル中のＩｇＧシステインプロテアーゼポリペプチドの濃度が高いほど、ウェルに結合する無傷ヒトＩｇＧ抗体が少なく、より弱いシグナルがもたらされる。同様に、より強力なＩｇＧシステインプロテアーゼポリペプチドは、同じ濃度で存在する場合、より効力が弱いＩｇＧシステインプロテアーゼポリペプチドよりも弱いシグナルをもたらす。ＩｇＧ１（ｈｕｍｉｒａ）及びＩｇＧ２（ＸＧＥＶＡ）アッセイの両方において、ＩｄｅＳコントロール（ｐＣＡＲＴ１２４）及び全ての試験したＩｇＧシステインプロテアーゼポリペプチドについて、滴定用量応答曲線を作成した。ＩｇＧ分子の第２の重鎖切断において、その最大効果の５０％が観察されるポリペプチドの濃度、即ちＩｇＧ分子の半数が一回切断され、半数が完全に切断されている濃度を表すＥＣ５０値も、試験した各変異体について算出した。ＥＣ５０値がより低いと、より有効なＩｇＧシステインプロテアーゼを表す。ＩｇＧのＦｃ部分が依然として存在し、Ｆｃ特異的検出抗体によって検出し得るので、ＩｇＧからｓｃＩｇＧへの、第１のＩｇＧ重鎖の切断は、このアッセイにおいては明確でない（図１８）。
【０１６１】
実験プロトコルの簡単な要約：特異的な抗ヒトＦａｂヤギＦ（ａｂ）２断片（０．５μｇ／ｍｌ）（Ｊａｃｋｓｏｎ＃１０９−００６−０９７）を用いて、マルチタイタープレートのウェルを、一晩（＋２〜８℃）コーティングし、次いで、０．０５％Ｔｗｅｅｎ２０添加ＰＢＳ（ＰＢＳ−Ｔ）で洗浄し、ＰＢＳ−Ｔ中０．４５％フィッシュゼラチン（ブロック緩衝液）中で、室温で４５〜１２０分間ブロッキングした。コントロールのＩｄｅＳ（ｐＣＡＲＴ１２４）及び試験するＩｇＧシステインプロテアーゼポリペプチドを、開始濃度８０μｇ／ｍｌで、ブロック緩衝液中、１：４段階希釈で滴定シリーズとして調製した。等量（２５μｌ）の、０．５μｇ／ｍｌの濃度のヒトＩｇＧ１（Ｈｕｍｉｒａ）及び滴定量ＩｇＧシステインプロテアーゼポリペプチドをウェルに加え、３７℃の、制御された温度環境下で震盪しながら２時間インキュベーションし、次いでＰＢＳ−Ｔで洗浄した。特異的なビオチン化抗ヒトＩｇＧ  Ｆｃマウス抗体（ｍ−ａ−ｈＩｇＧ  Ｂｉｏ  ＩＩ、Ｌｏｔ：Ｃ００１３−ＺＣ４３Ｃ、Ｓｏｕｔｈｅｒｎ  Ｂｉｏｔｅｃｈ）（６００ｎｇ／ｍｌ）をＳｔｒｅｐ−ｓｕｌｆｏ（２００ｎｇ／ｍｌ）と混合し、マルチタイタープレートに加えた。プレートをアルミニウムテープで密封し、振盪しながら、＋２５℃で１時間インキュベーションした。次いで、プレートをＰＢＳ−Ｔ中で洗浄し、１５０μｌの２倍希釈Ｒｅａｄ  ｂｕｆｆｅｒ  Ｔ（ＭＳＤ  ｒｅａｄ  ｂｕｆｆｅｒ  Ｔ  Ｃａｔ．ｎｏ．Ｒ９２ＴＣ−２）を各ウェルに加えた。プレートを直ちにプレートリーダー、ＭＳＤ（Ｍｅｓｏ  Ｓｃａｌｅ  Ｄｉｓｃｏｖｅｒｙ）ＱｕｉｃｋＰｌｅｘ  ＳＱ  １２０  Ｍｏｄｅｌ  １３００で読み取った。
【０１６２】
ゲルで可視化された有効性アッセイ：ＩｇＧ１（Ｈｕｍｉｒａ）、ＩｇＧ２（ＸＧＥＶＡ）の切断並びにヒトＩｇＧのプールのＩＶＩｇ（Ｏｃｔａｇａｍ）の切断について、実施例２に記載の通りに行ったアッセイ。
【０１６３】
結果
効力ＥＬＩＳＡ
効力アッセイにおいて、試験したＩｇＧシステインプロテアーゼについて得られた用量−応答曲線を図１２（ＩｇＧ１切断）及び図１３（ＩｇＧ２切断）に示す。本明細書で試験した、本発明の例示的なポリペプチドのｐＣＡＲＴ２０７、２１７、２１９は、ＩｄｅＳコントロールのｐＣＡＲＴ１２４（表１）と比較して、両方のＩｇＧ１の重鎖（図１２）を切断する効力を向上（ＥＣ５０値を減少）させ、ｐＣＡＲＴ２１９については１．４、ｐＣＡＲＴ２１７については３．２、ｐＣＡＲＴ２０７については４．０の、倍数的な効力向上であった。ｐＣＡＲＴ２２６は、ＩｄｅＳ（ｐＣＡＲＴ１２４）より幾分弱い効力を示し、ＥＣ５０において倍数差が０．６（表１）である。ＩｇＧ２の切断（図１３）に関しては、試験したポリペプチドはすべて、第２のＩｇＧ重鎖の切断において、原型ＩｄｅＳ（ｐＣＡＲＴ１２４）と比較して、より弱い効力を示し、ＥＣ５０値はより高く（表１）、倍数差は１未満である。しかしながら、試験したポリペプチドは全て、本発明のＩｇＧシステインプロテアーゼポリペプチドが由来する配列であるｐＣＡＲＴ１４４（配列番号２７）よりも強力である（データ示さず）。
【０１６４】
ゲルで可視化した有効性アッセイ
ゲルで可視化した、ＩｇＧ１（図１４Ａ）及びＩｇＧ２（図１４Ｂ）の切断は、第１及び第２の重鎖切断を明確に示す（図中の縦線は、ＢＸ１００１８６５及びｐＣＡＲＴ１２４の切断による第１及び第２のＩｇＧ重鎖切断を示す）。図中の＊は、おおよそのＥＣ５０値、即ち、ＩｇＧの５０％が１回切断（ｓｃＩｇＧ）され、５０％が完全に切断（Ｆ（ａｂ’）２）される濃度を示す。ゲルからのデータを表２（ＩｇＧ１切断）及び表３（ＩｇＧ２切断）にまとめる。ＩｇＧ１（Ｈｕｍｉｒａ）の第１の重鎖の切断は、ＩｄｅＳ（ｐＣＡＲＴ１２４及びＢＸ１００１８６５）、ｐＣＡＲＴ２０７及び２１７についてはほぼ同じ１．５ｎｇ／ｍｌであるが、ｐＣＡＲＴ２１９及び２２６については、支配的なｓｃＩｇＧバンドを得るために、幾分高い濃度、約４．６、が必要である（表２）。しかしながら、ＩｇＧ１の第２の重鎖切断に関しては、ｐＣＡＲＴ２０７、２１７及び２１９はすべて、ＩｄｅＳ（ｐＣＡＲＴ１２４及びＢＸ１００１８６４）より高い有効性（表２）（ＩｄｅＳについては約３７０ｎｇ／ｍｌ、そしてｐＣＡＲＴ２０７、２１７及び２１９については約１２０ｎｇ／ｍｌであり、切断において約３倍（１滴定段階）より有効である）を示す。ＩｇＧ２（ＸＧＥＶＡ）の切断（図１４Ｂ）においては、ＩｄｅＳと比較して、ｐＣＡＲＴ２０７、２１７、２１９はいずれも、第１及び第２の重鎖の両方の切断において、１滴定段階（１：３）低い有効性を示し、ｐＣＡＲＴ２２６は、有効性が約２滴定段階（１：６）低い（表３）。ｐＣＡＲＴ２２９は、ＩｇＧ１（Ｈｕｍｉｒａ）の第１（４．６ｎｇ／ｍｌ）及び第２（３７０ｎｇ／ｍｌ）の、ＩｇＧ両重鎖の切断において、ＩｄｅＳ（ＢＸ１００１８６５及びｐＣＡＲＴ１２４）とほぼ同様の有効性を示す（図１５Ａ及び表４）が、ｐＣＡＲＴ２２９によるＩｇＧ２（ＸＧＥＶＡ）の切断は、第１及び第２の、ＩｇＧ両重鎖の切断におけるＩｄｅＳよりも、約１滴定段階（１：３）有効性が低い（図１５Ｂ及び表４）。
【０１６５】
ＩｇＧシステインプロテアーゼポリペプチドｐＣＡＲＴ２０７、２１７、２１９及び２２６も、ＩｄｅＳ（ＢＸ１００１８６５）をコントロールとして用いて、ヒトＩｇＧプール、ＩＶＩｇ（Ｏｃｔａｇａｍ）中で滴定した（図１６）。それらの全てが、ＩＶＩｇの第１ＩｇＧ重鎖の切断において、ＩｄｅＳと比較してより高い有効性を示した。ｐＣＡＲＴ２０７、２１７、２１９及び２２６は、第１の切断を成し遂げるために、すべて０．７５μｇ／ｍｌを必要としたが、ＩｄｅＳ（ＢＸ１００１８６５）がｓｃＩｇＧを生成するために必要としたのは１．５μｇ／ｍｌだった（図１６及び表５）。第２の切断においては、ｐＣＡＲＴ２０７及び２１７は、両方、ＩｄｅＳ（ＢＸ１００１８６５）よりも効率的であり、３μｇ／ｍｌの濃度で支配的なＦ（ａｂ’）２断片を生成するが、ＩｄｅＳは約６μｇ／ｍｌを必要とする（図１６及び表５）。ｐＣＡＲＴ２１９及び２２６は、両方、ＩｇＧプールＩＶＩｇの第２の切断においては、ＩｄｅＳと比較して、有効性がより低い。図１６における、３０μｇ／ｍｌからの１：２希釈物（図１７）を用いたより広い滴定スペクトルにおいて、試験したポリペプチドと比較して、ｐＣＡＲＴ２２９によるＩＶＩｇの切断を解析した。ＩｄｅＳ（ＢＸ１００１８６５及びｐＣＡＲＴ１２４）並びにｐＣＡＲＴ２２９については（図１７）、ｓｃＩｇＧ生成のための濃度が１．９μｇ／ｍｌで、Ｆ（ａｂ’）２断片を得るためには７．５μｇ／ｍｌであり、同等の有効性が見られる（表６）。
【０１６６】
実施例４の図の要旨
図１２。種々のＩｇＧシステインプロテアーゼポリペプチドによるＩｇＧ１（Ｈｕｍｉｒａ）切断についての滴定曲線。
【０１６７】
図１３。種々のＩｇＧシステインプロテアーゼポリペプチドによるＩｇＧ２（ＸＧＥＶＡ）切断についての滴定曲線。
【０１６８】
図１４。ＢＸ１００１８６５及びｐＣＡＲＴ１２４（原型ＩｄｅＳ）を、同じ切断実験におけるコントロールとして伴う、ｐＣＡＲＴ２０７、２１７、２１９及び２２６の滴定量（３３００ｎｇ／ｍｌから１：３希釈）を用いたＳＤＳ−ＰＡＧＥにより解析したＩｇＧ切断。Ａ：ｈｕｍｉｒａ（ＩｇＧ１）の切断及びＢ：ＸＧＥＶＡ（ＩｇＧ２）の切断。縦線は、第１及び第２のＩｇＧ重鎖切断（切断産物の量が未切断産物よりも支配的である）をもたらすのに必要なＩｄｅＳ（ＢＸ１００１８６５及びｐＣＡＲＴ１２４）濃度を示す。図中の＊は、この実験におけるおおよそのＥＣ５０値を示す。
【０１６９】
図１５。ＢＸ１００１８６５及びｐＣＡＲＴ１２４（原型ＩｄｅＳ）を、同じ切断実験におけるコントロールとして伴う、ｐＣＡＲＴ２２９の滴定量（３３００ｎｇ／ｍｌから１：３希釈）を用いたＳＤＳ−ＰＡＧＥにより解析したＩｇＧ切断。Ａ：ｈｕｍｉｒａ（ＩｇＧ１）の切断及びＢ：ＸＧＥＶＡ（ＩｇＧ２）の切断。縦線は、第１及び第２のＩｇＧ重鎖切断（切断産物の量が未切断産物よりも支配的である）をもたらすのに必要なＩｄｅＳ（ＢＸ１００１８６５及びｐＣＡＲＴ１２４）濃度を示す。
【０１７０】
図１６。試験したＩｇＧシステインプロテアーゼポリペプチドの滴定（６μｇ／ｍｌから１：２希釈）量及び同じ切断実験におけるコントロールとしてＩｄｅＳ（ＢＸ１００１８６５）を用いたＳＤＳ−ＰＡＧＥにより解析したＩＶＩｇ切断。
【０１７１】
図１７。ＢＸ１００１８６５及びｐＣＡＲＴ１２４（原型ＩｄｅＳ）を、同じ切断実験のコントロールとして伴う、ｐＣＡＲＴ２２９の滴定量（３０μｇ／ｍｌからの１：２希釈）を用いたＳＤＳ−ＰＡＧＥにより解析したＩＶＩｇ切断。
【０１７２】
図１８。本発明のポリペプチドによる免疫グロブリン切断の模式図。ＩｇＧの酵素的切断は２段階で行われる。第１に、無傷ＩｇＧの１つの重鎖が切断され、１回切断されたＩｇＧ（ｓｃＩｇＧ）が生成される。第２に、次の重鎖が切断され、Ｆｃ部分が遊離する。ｓｃＩｇＧ分子においては、Ｆｃ部分は依然としてＦａｂ部分に結合しており、効力ＥＬＩＳＡにおける検出抗体は、ＩｇＧ分子のＦｃ部分を認識しているので、該アッセイでは、完全なＩｇＧとｓｃＩｇＧは区別されない。
【０１７３】
考察及び結論
Ｈｕｍｉｒａ効力ＥＬＩＳＡにおけるｐＣＡＲＴ２０７、２１７、２１９のより低いＥＣ５０値は、ｐＣＡＲＴ１２４（原型ＩｄｅＳ）と比較して、ＩｇＧ１の第２の切断（ｓｃＩｇＧからＦ（ａｂ’）２へ）の効力向上を示す。Ｈｕｍｉｒａ効力ＥＬＩＳＡ及びＳＤＳ−ＰＡＧＥによって解析されたＨｕｍｉｒａ有効性アッセイの両方で、ｐＣＡＲＴ２２６の、ＩｇＧ１の切断における、幾分低い活性が示される。
【０１７４】
ＸＧＥＶＡ効力ＥＬＩＳＡにおいては、試験したポリペプチドｐＣＡＲＴ２０７、２１７、２１９及び２２６のすべてが、ＩｄｅＳ（ｐＣＡＲＴ１２４）と比較して、ＩｇＧ２の両方のＩｇＧ重鎖の切断において効力が低いことが実証される。しかしながら、代わりに、切断をゲルで視覚化すると、ｐＣＡＲＴ２０７は、第１のＩｇＧ重鎖切断において、ＩｄｅＳ（ＢＸ１００１８６５及びｐＣＡＲＴ１２４）とほぼ同じ活性を有するのに対し、第２の切断では、ＩｄｅＳと比較して、約３倍効果（１滴定段階）が弱いことが明らかである。同様のパターンが、ｐＣＡＲＴ２２９について見られ、ＩｇＧ１の切断においては、有効性はＩｄｅＳの活性に匹敵する高さであるが、ＩｇＧ２の切断、主として第２のＩｇＧ重鎖の切断については有効性がより低い。ＩｇＧ切断をゲルで解析することにより、（ＩｇＧからｓｃＩｇＧへの）第１の重鎖の切断が顕在化する。この切断は、Ｆｃ特異的検出抗体を用いた効力ＥＬＩＳＡにおいては可視化できない。病原性ＩｇＧ分子を不能化することが主な焦点である臨床状況において重要な、Ｆｃにより媒介されるＩｇＧの作用は、大抵、１回切断分子において、既に無くなっている（データ示さず）。
【０１７５】
ＩＶＩｇは、おおよそ６５〜７０％のＩｇＧ１、３５〜３０％のＩｇＧ２及び約１％を占めるＩｇＧ３／ＩｇＧ４を含有するヒトＩｇＧのプールである。ヒトＩＶＩｇはまた、ＩｇＧドナーの、以前のＳ．ピオゲネスへの暴露に由来する抗ＩｄｅＳ抗体を自然に含有し、これらの抗体のいくつかは中和作用がある（即ち、これらＩｄｅＳ特異的抗体の、ＩｄｅＳに対する結合は、ＩｄｅＳのＩｇＧプロテアーゼ活性を低下させるか、完全に無くする）。従って、種々のＩｇＧシステインプロテアーゼポリペプチドによるＩＶＩｇ切断の結果は、４つのヒトＩｇＧサブクラス全ての、それらのヒト血清中のおよその正常な比率における、また、中和作用を有する抗ＩｄｅＳ抗体の存在下における、総体的な切断を示す。
【０１７６】
概して、ＩｇＧ２切断においては、試験したＩｇＧシステインプロテアーゼポリペプチドは全て、ＩｇＧ１と比較して有効性がより低い。ｐＣＡＲＴ２０７、２１７及び２１９は、ＩｇＧ１を切断することにおいてはＩｄｅＳよりも効率的であるが、専らＩｇＧ２の第２の重鎖を切断することにおいては、効率はより低い。図１６における、ｐＣＡＲＴ２０７、２１７、２１９及び２２６の最高用量（６μｇ／ｍｌ）で、及び図１７において、ｐＣＡＲＴ２２９についてみられる、ｓｃＩｇＧバンドは、ＩｇＧプールであるＩＶＩｇ中のＩｇＧ２分子を表す可能性が極めて高い（図１４Ａを１４Ｂと、１５Ａを１５Ｂと比較）。
【０１７７】
【表１０】
2018510622.tif 000027
【０１７８】
【表１１】
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【０１７９】
【表１２】
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【０１８０】
【表１３】
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【０１８１】
【表１４】
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【０１８２】
【表１５】
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【０１８３】
実施例５−ＡＤＡ  ＥＬＩＳＡ（ＡＤＡ−ＩｄｅＳ結合部位に対する競合ＥＬＩＳＡ）。
ＥＬＩＳＡ，Ｍｅｓｏ  Ｓｃａｌｅ  Ｄｉｓｃｏｖｅｒｙ（ＭＳＤ）ベースのアッセイを用いて、ＩｄｅＳに対する抗薬物抗体（ＡＤＡ）結合部位を、本発明の「ＡＤＡ」改変ポリペプチド（ｐＣＡＲＴ２０７、２１７、２１９及び２２６）について評価した。ＥＬＩＳＡの原理は、原型のｈｉｓタグ付きＩｄｅＳ（ｐＣＡＲＴ１２４）で、マルチタイタープレートのウェルをコーティングすることであった。ほとんどのヒトは、以前のＳ．ピオゲネスの感染に起因して、血清中に、ＩｄｅＳに対する抗体を有する。本明細書では、２つの異なるヒト臨床血清プールを、ＡＤＡ検出についての基準として用いた。第１のプールは、ヒト血清プール１１９１８０７と呼ばれる、１００個体の血清プールからの正常なヒト血清であり、第２のプールは、第ＩＩ相プール−２と呼ばれる、第ＩＩ相研究１３−ＨＭｅｄＩｄｅＳ−０２における患者由来の血清プールである。これらの患者には、ＩｄｅＳが、０．２４〜０．５ｍｇ／ｋｇ体重の用量範囲で、１回投与され、それにより血清中の抗ＩｄｅＳ  ＡＤＡレベルをおおよそ５０倍に誘導した。
【０１８４】
この競合的ＡＤＡ  ＥＬＩＳＡの要点は、ＩｄｅＳ（ｐＣＡＲＴ１２４）が、マイクロタイタープレートの底部にコーティングされていることである。ヒト血清プールを、ＡＤＡ認識部位に関して試験するポリペプチド（ｐｏｌｙｐｅｔｉｄｅ）か、又はポジティブコントロールＩｄｅＳ（ｐＣＡＲＴ１２４）と、試験したポリペプチドが１００倍過剰の、１：１００のモル比で、共にプレインキュベーションする。原型ＩｄｅＳへの、おおよそ８０％の結合をもたらすための、プレインキュベーション用に用いた２つの異なる血清プールの濃度を、標準曲線から推定する。試験したポリペプチドにおいて、ＡＤＡ結合部位が無効化した場合、これらのポリペプチドは、ウェルの底部において、ＡＤＡの結合で、原型ＩｄｅＳに対して競合することができない、即ち、弱いシグナルにより、原型ＩｄｅＳ（ｐＣＡＲＴ１２４）に対する、高いＡＤＡ類似性が実証され、強いシグナルにより、原型ＩｄｅＳに対する、低いＡＤＡ類似性が実証される。
【０１８５】
標準曲線の直線部分において、おおよそ８０％の結合を達成する両基準の濃度は、約２００ｎｇＡＤＡ（ＩｄｅＳ）／ｍｌであった。競合的プレインキュベーションにおいては、両基準は別々にこの濃度で用い、ＩｇＧシステインプロテアーゼポリペプチドの濃度は、ＡＤＡ濃度の１００倍の比率（１５０ｋＤａの抗体とおおよそ３５ｋＤａのＩｄｅＺとの間のモル重量差、４．２倍を加味し、２００ｎｇ／ｍｌの１００倍を４．２で割り、試験したポリペプチドおおよそ５μｇ／ｍｌを得る）で用いた。２００ｎｇ／ｍｌのＡＤＡを含有する基準血清及びＩｄｅＳ（ｐＣＡＲＴ１２４）又は試験したポリペプチドを、室温（ＲＴ）で１時間、共にプレインキュベーションする。最大ＡＤＡ結合についてのコントロールとして、同濃度の基準を、ＩｄｅＳ（ｐＣＡＲＴ１２４）や他のすべてのＩｇＧシステインプロテアーゼなしでプレインキュベーションし、最大結合の８０％の値として用いた。標準曲線の最低値を、競合の算出範囲に関しての下限値として用いた。ＩｄｅＳ（ｐＣＡＲＴ１２４）又は試験したポリペプチドとプレインキュベーションした基準についての平均スコアを、８０％基準結合値で引き、下限値で引いた８０％基準結合値で割り、競合値％を得た。％競合が最低のＩｇＧシステインプロテアーゼポリペプチドは、原型ＩｄｅＳ（ｐＣＡＲＴ１２４）と比較して、ほとんどのＡＤＡ結合エピトープが無効化したことを意味する。
【０１８６】
実験プロトコルの簡単な要約：マルチタイタープレートのウェルを、一晩、ｐＣＡＲＴ１２４（１μｇ／ｍｌ）でコーティングし、ＰＢＳ−Ｔで３回洗浄し、ＰＢＳ中０．４５％の魚皮ゼラチン及び２ｍＭのシステインプロテアーゼ阻害剤、ヨード酢酸（ＩＨＡｃ）で１時間ブロッキングした。
【０１８７】
両基準を、ＰＢＳ中０．４５％魚皮ゼラチン、２ｍＭ  ＩＨＡｃで、１：３の段階希釈で、５０００ｎｇＡＤＡ（ＩｄｅＳ）／ｍｌ〜２．５ｎｇＡＤＡ（ＩｄｅＳ）／ｍｌの滴定シリーズとして調製し、標準曲線の直線部分並びに最大部分及び最小部分の、両方での測定により、アッセイの標準較正曲線の作成を可能にした。プレートのブロッキングと同時に、該基準及びＩｄｅＳ（ｐＣＡＲＴ１２４）又は試験したポリペプチド、即ち、２００ｎｇ／ｍｌ  ＡＤＡ（基準）及び５μｇ／ｍｌ  ＩｄｅＳコントロール（ｐＣＡＲＴ１２４）又は試験するＩｇＧシステインプロテアーゼポリペプチドを用いた、競合工程における試料を、室温で１時間、共にプレインキュベーションした。
ｐＣＡＲＴ１２４でコーティングしたプレートを３回洗浄し、次いで、５０μｌのプレインキュベーションした試料又は５０μｌの基準を、マルチタイタープレートの各ウェルに加えた。
【０１８８】
プレートを室温で２時間インキュベーションし、次いでＰＢＳ−Ｔで洗浄した。ブロッキング緩衝液中に、検出抗体として、特異的な抗ヒトＦ（ａｂ）ヤギＦ（ａｂ）２断片−ｂｉｏ（Ｊａｃｋｓｏｎ＃１０９−０６６−０９７，０．６５ｍｇ／ｍｌ）（１０００倍希釈）、及びＳｔｒｅｐｔａｖｉｄｉｎ−Ｓｕｌｆｏ（ＭＳＤ  Ｃａｔ．Ｎｏ：Ｒ３２ＡＤ−１又はＲ３２ＡＤ−５）（２０００倍希釈）を加え、暗中、室温で１時間インキュベーションした。プレートを３回洗浄し、４倍希釈のＲｅａｄ  ｂｕｆｆｅｒ  Ｔ（ＭＳＤ  Ｒｅａｄ  ｂｕｆｆｅｒ  Ｔ（４×））を加え、プレートを、プレートリーダー、ＭＳＤ（Ｍｅｓｏ  Ｓｃａｌｅ  Ｄｉｓｃｏｖｅｒｙ）ＱｕｉｃｋＰｌｅｘ  ＳＱ１２０  Ｍｏｄｅｌ  １３００で直接解析した。
【０１８９】
結果及び考察
ｐＣＡＲＴ２０７、２１７、２１９及び２２６についての、ＩｄｅＳ−ＡＤＡ結合部位の遮断パーセンテージ（％）を図１９及び図２０に示す。原型ＩｄｅＳのｐＣＡＲＴ１２４を１００％類似のポジティブコントロールとして使用する。
試験したすべてのＩｇＧシステインプロテアーゼポリペプチド、ｐＣＡＲＴ２０７、２１７、２１９及び２２６は、原型ＩｄｅＳ（ｐＣＡＲＴ１２４）と比較して、ヒト血清中のＡＤＡ結合部位をほとんど塞閉しない。ＩｄｅＳにより１回治療された患者（２相プール−２）は、より多くのＩｄｅＳ特異的ＡＤＡを有するようになり、健康なボランティア由来の血清プール（ヒト血清プール１１９１８０７）（図１９）と比較して、ｐＣＡＲＴ２０７、２１７及び２１９の認識が極めて低かった（図２０）。
【０１９０】
実施例６−オクタガム（ヒトＩＶＩｇ）マウスモデルにおけるインビボ有効性の評価
本研究においては、ＢＡＬＢ／ｃマウスに、ヒトＩＶＩｇ（Ｏｃｔａｇａｍ）を腹腔内（ｉ．ｐ．）注射した。ヒトＩＶＩｇの濃度は、ヒトＩｇＧ血漿濃度（１０ｍｇ／ｍｌ）と関連性を持たせるように、９００ｍｇ／ｋｇの用量で投与した。
【０１９１】
０日目に、ヒトＩＶＩｇをｉ．ｐ．注射した。ヒトＩＶＩｇの注射の２４時間後（１日目）、ＰＢＳ、ＩｄｅＳコントロール（ＢＸ１００１８６５及びｐＣＡＲＴ１２４）又は試験するＩｇＧプロテアーゼのｐＣＡＲＴ２０７、ｐＣＡＲＴ２１７、ｐＣＡＲＴ２１９及びｐＣＡＲＴ２２６を、１ｍｇ／ｋｇの用量で静脈内（ｉ．ｖ．）投与した。２時間後、血清試料を採取し、マウスを屠殺した。
【０１９２】
有効性ＥＬＩＳＡ
アッセイの原理は、Ｆａｂ領域に対する特異性を有する、ヒトＩｇＧ抗体に対するＦ（ａｂ’）２断片で、マルチタイタープレートのウェルをコーティングすることであった。次いで、ＩＶＩｇ並びにＩｄｅＳコントロール（ＢＸ１００１８６５及びｐＣＡＲＴ１２４）又は試験したＩｇＧシステインプロテアーゼポリペプチドで処置したマウス由来の血清を加えた。抗体のＦｃ部分に対する特異性を有する、ヒトＩｇＧ（ＩＶＩｇ）に対する検出抗体を用いて、ウェルに結合した無傷又は１回切断のヒトＩｇＧ（ＩＶＩｇ）の量を測定した。無傷ヒトＩｇＧ抗体（ＩＶＩｇ）の検出濃度が低いほど、ＩｇＧシステインプロテアーゼポリペプチドがより有効であると予想される。
【０１９３】
実験室プロトコルの簡単な要約：特異的な抗ヒトＦａｂヤギＦ（ａｂ）２断片（０．５μｇ／ｍｌ）（Ｊａｃｋｓｏｎ＃１０９−００６−０９７）を用いて、マルチタイタープレートのウェルを一晩コーティングし（＋２〜８℃）、次いで０．０５％Ｔｗｅｅｎ２０添加ＰＢＳ（ＰＢＳ−Ｔ）で洗浄し、ＰＢＳ−Ｔ（ブロック緩衝液）中２％ＢＳＡで、室温で４５〜１２０分間ブロッキングした。ヒト血清タンパク質検量物質（ＤＡＫＯ＃Ｘ０９０８）を基準として用い、０．５〜３００ｎｇ／ｍｌの範囲で加えた。ＩＶＩｇ及び種々のＩｇＧシステインプロテアーゼポリペプチドで処置したマウスから採取した血清試料を解凍し、ブロック緩衝液で１０００００倍に希釈した後、アッセイマルチタイタープレートに加えた。プレートを、震盪しながら、室温で２時間インキュベーションし、次いでＰＢＳ−Ｔで洗浄した。特異的なビオチン化抗ヒトＩｇＧ  Ｆｃマウス（６００ｎｇ／ｍｌ）（Ｊａｃｋｓｏｎ＃１０９−０６６−０９８）抗体を、Ｓｔｒｅｐ−ｓｕｌｆｏ（２００ｎｇ／ｍｌ）（ＭＳＤ＃Ｒ３２ＡＤ−１）と混合し、マルチタイタープレートに加えた。プレートをアルミニウムテープで密封し、震盪しながら、室温で１時間インキュベーションした。次いで、プレートをＰＢＳ−Ｔで洗浄し、１５０μｌの２倍希釈Ｒｅａｄ  ｂｕｆｆｅｒ  Ｔ（ＭＳＤ＃Ｒ９２ＴＣ−２）を各ウェルに加えた。該プレートを、直ちにプレートリーダー、ＭＳＤ（Ｍｅｓｏ  Ｓｃａｌｅ  Ｄｉｓｃｏｖｅｒｙ）ＱｕｉｃｋＰｌｅｘ  ＳＱ  １２０  Ｍｏｄｅｌ  １３００で直接解析した。
【０１９４】
ゲルで可視化された有効性
マウスにおけるインビボでのヒトＩｇＧ切断を可視化するために、１０μｌの血清を９０μｌのＰＢＳで１：１０希釈した。その後、１０μｌの希釈血清を３０μｌの４×ＳＤＳ−ＰＡＧＥローディング緩衝液と混合した。５μｌの自製（ｉｎ−ｈｏｕｓｅ）ＩｇＧマーカーを用いて、種々のＩｇＧ断片（ＩｇＧ、ｓｃＩｇＧ及びＦ（ａｂ’）２）を示した。試料を、９２℃で３分間加熱し（Ｔｈｅｒｍｏ  ｍｉｘｅｒ  ｃｏｍｐａｃｔ，ｅｐｐｅｎｄｏｒｆ）、短時間遠心してから、１０μｌを４〜２０％Ｍｉｎｉ−Ｐｒｏｔｅａｎ（登録商標）ＴＧＸ、Ｓｔａｉｎ−ｆｒｅｅ（商標）ゲル（Ｃａｔ．＃４５６−８０９６、Ｂｉｏｒａｄ）にロードした。ゲルを、２００Ｖで４０分間泳動（ｒｕｎ）した。
【０１９５】
結果と結論
有効性ＥＬＩＳＡにより、血清中のヒトＩｇＧレベルを研究し、ＳＤＳ−ＰＡＧＥによるＩｇＧ分解を解析することにより、ＩｄｅＳ（ＢＸ１００１８６５及びｐＣＡＲＴ１２４）及びｐＣＡＲＴ２０７、２１７、２１９及び２２６によるヒトＩＶＩｇ（Ｏｃｔａｇａｍ）のインビボ切断を比較した。
【０１９６】
ＩＶＩｇマウスにおける、ＩｄｅＳ（ＢＸ１００１８６５及びｐＣＡＲＴ１２４）及び種々のＩｇＧシステインプロテアーゼｐＣＡＲＴ２０７、ｐＣＡＲＴ２１７、ｐＣＡＲＴ２１９及びｐＣＡＲＴ２２６による治療は、このマウスモデルにおいて、明らかに、インビボでのヒトＩｇＧの切断を実証した（表７及び図２１）。
【０１９７】
ＩｄｅＳコントロール（ＢＸ１００１８６５）、ｐＣＡＲＴ２０７及びｐＣＡＲＴ２１７について、完全な切断が示され、ゲルに、目に見えるｓｃＩｇＧバンド及び顕著なＦ（ａｂ’）２バンドはなかった（図２２）。ｐＣＡＲＴ２１９及びｐＣＡＲＴ２２６は、ｓｃＩｇＧ分子が、マウス血清中に、２時間後にまだ存在し、このマウスモデルにおいて、示された有効性がより低かった（図２２Ｃ）。しかしながら、ゲルには、無傷ＩＶＩｇは検出できなかった。このことは、図２１において、ｐＣＡＲＴ２１９及びｐＣＡＲＴ２２６に対する検出抗体（より高いバー）による、より高濃度のＩｇＧ−Ｆｃは、無傷ＩｇＧではなく、ｓｃＩｇＧに由来することを示す。ｐＣＡＲＴ２０７群におけるマウス番号２とｐＣＡＲＴ２１９群におけるマウス番号４は、ＩＶＩｇ注射を受けなかった（図２２Ｂ及びＣ）。従って、これらの動物からは、ゲルでＩｇＧ切断断片が見られなかった。タンパク質のバンドパターンは、ＢＡＬＢ／ｃマウス血清中のバックグラウンドタンパク質を表す。これは、本発明のポリペプチドが、インビボモデルにおいて、ＩｇＧを切断することを示す。
【０１９８】
【表１６】
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【図１】
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【図２】
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【図３】
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【図４】
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【図５】
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【図６】
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【図７】
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【図８】
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【図９】
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【図１０】
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【図１１】
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【図１２】
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【図１３】
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【図１４】
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【図１５】
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【図１６】
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【図１７】
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【図１８】
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【図１９】
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【図２０】
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【図２１】
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【図２２】
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【配列表】
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【国際調査報告】
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