(57)【要約】  本開示は、ＰＤ−Ｌ１のＰＤ−１との結合を遮断し、従って、ＰＤ−１発現Ｔ細胞に対するＰＤ−Ｌ１の阻害機能を遮断し得る、タンパク質プログラム細胞死１リガンド（ＰＤ−Ｌ１）に対するモノクローナル抗体を提供する。開示される抗体は、ヒト免疫機能を調節することによって、複数の癌の処置のための極めて強力な薬剤を提供する。【選択図】図１
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【特許請求の範囲】
【請求項１】
配列番号１、３、５、１３、１５、１７、２５、２７、２９、３７、３９および４１からなる群から選択される重鎖ＣＤＲ配列を含む、単離された抗体または抗原結合断片。
【請求項２】
７、９、１１、１９、２１、２３、３１、３３および３５からなる群から選択される軽鎖ＣＤＲ配列をさらに含む、請求項１に記載の抗体またはその抗原結合断片。
【請求項３】
ａ）配列番号１、配列番号３および／または配列番号５を含む重鎖可変領域、
ｂ）配列番号１３、配列番号１５および／または配列番号１７を含む重鎖可変領域、
ｃ）配列番号２５、配列番号２７および／または配列番号２９を含む重鎖可変領域、ならびに
ｄ）配列番号３７、配列番号３９および／または配列番号４１を含む重鎖可変領域
からなる群から選択される重鎖可変領域を含む、先行する請求項のいずれかに記載の抗体またはその抗原結合断片。
【請求項４】
ａ）配列番号７、配列番号９および／または配列番号１１を含む軽鎖可変領域、
ｂ）配列番号１９、配列番号２１および／または配列番号２３を含む軽鎖可変領域、ならびに
ｃ）配列番号３１、配列番号３３および／または配列番号３５を含む軽鎖可変領域
からなる群から選択される軽鎖可変領域を含む、先行する請求項のいずれかに記載の抗体またはその抗原結合断片。
【請求項５】
ａ）配列番号１、配列番号３および／もしくは配列番号５を含む重鎖可変領域ならびに配列番号７、配列番号９および／もしくは配列番号１１を含む軽鎖可変領域、
ｂ）配列番号１３、配列番号１５および／もしくは配列番号１７を含む重鎖可変領域ならびに配列番号１９、配列番号２１および／もしくは配列番号２３を含む軽鎖可変領域、
ｃ）配列番号２５、配列番号２７および／もしくは配列番号２９を含む重鎖可変領域ならびに配列番号３１、配列番号３３および／もしくは配列番号３５を含む軽鎖可変領域、または
ｄ）配列番号３７、配列番号３９および／または配列番号４１を含む重鎖可変領域ならびに配列番号１９、配列番号２１および／もしくは配列番号２３を含む軽鎖可変領域
を含む、先行する請求項のいずれかに記載の抗体またはその抗原結合断片。
【請求項６】
配列番号４３、配列番号４７、配列番号５１および配列番号５５からなる群から選択される重鎖可変領域を含む、先行する請求項のいずれかに記載の抗体またはその抗原結合断片。
【請求項７】
配列番号４５、配列番号４９および配列番号５３からなる群から選択される軽鎖可変領域を含む、先行する請求項のいずれかに記載の抗体またはその抗原結合断片。
【請求項８】
ａ）配列番号４３を含む重鎖可変領域および配列番号４５を含む軽鎖可変領域、
ｂ）配列番号４７を含む重鎖可変領域および配列番号４９を含む軽鎖可変領域、
ｃ）配列番号５１を含む重鎖可変領域および配列番号５３を含む軽鎖可変領域、または
ｄ）配列番号５５を含む重鎖可変領域および配列番号４９を含む軽鎖可変領域
を含む、先行する請求項のいずれかに記載の抗体またはその抗原結合断片。
【請求項９】
プラズモン共鳴結合アッセイによって測定されるものとして、１０-8Ｍ以下のＫｄ値でヒトＰＤ−Ｌ１と特異的に結合可能である、先行する請求項のいずれかに記載の抗体またはその抗原結合断片。
【請求項１０】
１０ｎＭ以下または１ｎＭ以下のＥＣ５０でサルＰＤ−Ｌ１と結合し、および／またはマウスＰＤ−Ｌ１と結合しない、先行する請求項のいずれかに記載の抗体またはその抗原結合断片。
【請求項１１】
１００ｎＭ以下のＩＣ５０で、ヒトまたはサルＰＤ−Ｌ１の、その受容体との結合を阻害可能である、先行する請求項のいずれかに記載の抗体またはその抗原結合断片。
【請求項１２】
ＰＤ−Ｌ２と実質的に結合しない、先行する請求項のいずれかに記載の抗体またはその抗原結合断片。
【請求項１３】
ＡＤＣＣまたはＣＤＣまたはその両方を媒介しない、先行する請求項のいずれかに記載の抗体またはその抗原結合断片。
【請求項１４】
完全ヒトモノクローナル抗体である、先行する請求項のいずれかに記載の抗体またはその抗原結合断片。
【請求項１５】
完全ヒトモノクローナル抗体が、トランスジェニックラットによって生成される、請求項１４に記載の抗体またはその抗原結合断片。
【請求項１６】
先行する請求項のいずれかに記載の抗体またはその抗原結合断片と同一のエピトープについて競合する、抗体またはその抗原結合断片。
【請求項１７】
ヒトＰＤ−Ｌ１のその受容体との結合を遮断可能であり、それによって、以下の活性：
ａ）ＣＤ４+Ｔ細胞におけるＩＬ−２の生成を誘導すること、
ｂ）ＣＤ４+Ｔ細胞におけるＩＦＮγの生成を誘導すること、
ｃ）ＣＤ４+Ｔ細胞の増殖を誘導すること、および
ｄ）Ｔｒｅｇの抑制機能を逆転させること
のうち少なくとも１つを提供する、先行する請求項のいずれかに記載の抗体またはその抗原結合断片。
【請求項１８】
ラクダ化単一ドメイン抗体、ダイアボディー、ｓｃＦｖ、ｓｃＦｖ二量体、ＢｓＦｖ、ｄｓＦｖ、（ｄｓＦｖ）２、ｄｓＦｖ−ｄｓＦｖ’、Ｆｖ断片、Ｆａｂ、Ｆａｂ’、Ｆ（ａｂ’）２、ｄｓダイアボディー、ナノボディー、ドメイン抗体または二価ドメイン抗体である、先行する請求項のいずれかに記載の抗体またはその抗原結合断片。
【請求項１９】
免疫グロブリン定常領域をさらに含む、先行する請求項のいずれかに記載の抗体またはその抗原結合断片。
【請求項２０】
コンジュゲートをさらに含む、先行する請求項のいずれかに記載の抗体またはその抗原結合断片。
【請求項２１】
請求項１から１９に記載の抗体またはその抗原結合断片をコードする単離されたポリヌクレオチド。
【請求項２２】
請求項２１に記載の単離されたポリヌクレオチドを含むベクター。
【請求項２３】
請求項２２に記載のベクターを含む宿主細胞。
【請求項２４】
請求項１から１９のいずれかに記載の抗体またはその抗原結合断片を発現させる方法であって、請求項２３に記載の宿主細胞を、請求項２１に記載のポリヌクレオチドが発現される条件下で培養することを含む、方法。
【請求項２５】
請求項１から２０のいずれかに記載の抗体またはその抗原結合断片を含むキット。
【請求項２６】
生体サンプルにおいてヒトまたはサルＰＤ−Ｌ１の存在またはレベルを検出する方法であって、生体サンプルを、請求項１から２０のいずれかに記載の抗体またはその抗原結合断片に対して曝露すること、およびサンプルにおいてヒトまたはサルＰＤ−Ｌ１の存在またはレベルを調べることを含む、方法。
【請求項２７】
ＰＤ−Ｌ１アンタゴニストに対して応答する可能性が高い障害または状態を有する個体を同定する方法であって、請求項１から２０のいずれかに記載の抗体またはその抗原結合断片を用いて、個体から得られた試験生体サンプルにおいてＰＤ−Ｌ１の存在またはレベルを調べることを含み、試験生体サンプルにおけるＰＤ−Ｌ１の存在または上方制御されたレベルが、応答性の見込みを示す、方法。
【請求項２８】
個体に、治療上有効な量の、請求項１から２０のいずれかに記載の抗体またはその抗原結合断片を投与することをさらに含む、請求項２７に記載の方法。
【請求項２９】
ＰＤ−Ｌ１アンタゴニストで処置された対象における、治療的応答または疾患の進行をモニタリングする方法であって、請求項１から２０のいずれかに記載の抗ＰＤ−Ｌ１抗体またはその抗原結合断片を用いて、個体から得られた試験生体サンプルにおいてＰＤ−Ｌ１の存在またはレベルを調べることを含む方法。
【請求項３０】
請求項１から２０のいずれかに記載の抗体またはその抗原結合断片および１種または複数の医薬上許容される担体を含む医薬組成物。
【請求項３１】
免疫応答の上方制御から恩恵を受けるであろう対象における状態を処置する方法であって、対象に、治療上有効な量の、請求項１から２０のいずれかに記載の抗体またはその抗原結合断片を投与することを含む、方法。
【請求項３２】
対象が、ＰＤ−Ｌ１の上方制御された発現を有する、請求項３１に記載の方法。
【請求項３３】
免疫応答の上方制御から恩恵を受けるであろう状態を処置するための医薬の製造における、請求項１から２０のいずれかに記載の抗体またはその抗原結合断片の使用。
【請求項３４】
状態が、癌または慢性ウイルス感染である、請求項３３に記載の使用。
【請求項３５】
エピトープが、ＰＤ−Ｌ１の以下のアミノ酸残基：Ｅ５８、Ｅ６０、Ｄ６１、Ｋ６２、Ｎ６３およびＲ１１３のうち少なくとも１個を含む、請求項１６に記載の抗体またはその抗原結合断片。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
本開示内容は、概して、新規抗ＰＤ−Ｌ１抗体に関する。
【背景技術】
【０００２】
前臨床および臨床結果からのますます増大する証拠によって、免疫チェックポイントを標的化することが、癌を有する患者を処置するための最も有望なアプローチとなってきていることが示されてきた。プログラム細胞死１、免疫チェックポイントタンパク質の１種は、それによって腫瘍細胞が免疫監視を逃れた主要な免疫抵抗機序を提供する、Ｔ細胞の活性の制限において主要な役割を果たす。活性化されたＴ細胞で発現されたＰＤ−１および腫瘍細胞で発現されたＰＤ−Ｌ１の相互作用は、免疫応答を負に調節し、抗腫瘍免疫を減衰させる。腫瘍でのＰＤ−Ｌ１の発現は、食道、膵臓およびその他の種類の癌における生存の低減と相関しており、これは、この経路を腫瘍免疫療法の新規有望標的として強調する。Ｂｒｉｓｔｏｌ−Ｍｙｅｒｓ  Ｓｑｕｉｂｂ（ＢＭＳ）、Ｍｅｒｃｋ、ＲｏｃｈｅおよびＧｌａｘｏＳｍｉｔｈＫｌｉｎｅ（ＧＳＫ）などの製薬会社によって、ＰＤ−１経路を標的化する複数の薬剤が開発されてきた。臨床治験から得られたデータは、種々の種類の腫瘍を有する患者において耐久性のある臨床活性および安全性プロファイルの後押しの初期証拠を実証した。ニボルマブ、ＢＭＳによって開発されたＰＤ−１薬物が、次世代分野の主役に据えられている。現在、６つの後期研究において、７２人の肺癌患者のうち１８％、９８人の黒色腫患者のうち３分の１近く、および腎臓癌を有する３３人の患者のうち２７％を含む、研究された５つの癌のグループのうち３つにおいて処置が腫瘍収縮を誘発した。Ｍｅｒｃｋによって開発されたランブロリズマブは、ＰＤ−１に対して作用する完全ヒトモノクローナルＩｇＧ４抗体であり、これは、皮膚癌についての印象的なＩＢデータが現れた後にＦＤＡの新規ブレイクスルー指定をつかみとった。第ＩＢ相研究から得られた結果は、８５人の癌患者のうち５１％において他覚的な抗腫瘍反応を、患者の９％において完全な反応を示した。Ｒｏｃｈｅの実験的ＭＰＤＬ３２８０Ａは、種々の腫瘍の大きさを有する１４０人の進行癌患者のうち２９人（２１％）において腫瘍を収縮させる能力を実証した。
【０００３】
しかし、既存の両方は、すべて満足のいくものではない場合があり、従って、新規抗ＰＤ−Ｌ１抗体が依然として必要である。
【発明の概要】
【０００４】
本開示は、新規モノクローナル抗ＰＤ−Ｌ１抗体（特に、完全ヒト抗体）、それをコードするポリヌクレオチドおよびそれを使用する方法を提供する。
【０００５】
一態様では、本開示は、プラズモン共鳴結合アッセイによって測定されるものとして、１０-9Ｍ以下（例えば、≦９×１０-10Ｍ、≦８×１０-10Ｍ、≦７×１０-10Ｍ、≦６×１０-10Ｍ、≦５×１０-10Ｍ、≦４×１０-10Ｍ、≦３×１０-10Ｍ、≦２×１０-10Ｍまたは≦１０-10Ｍ以下）のＫｄ値でヒトＰＤ−Ｌ１と特異的に結合可能である、単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合断片を提供する。
【０００６】
特定の実施形態では、抗体またはその抗原結合断片は、１０ｎＭ以下（例えば、１ｎＭ、０．９ｎＭ、０．８ｎＭ、０．７ｎＭ、０．６ｎＭ、０．５ｎＭ、０．４ｎＭ、０．３ｎＭ、０．２ｎＭ、０．１ｎＭ、０．０９ｎＭ、０．０８ｎＭ、０．０７ｎＭ、０．０６ｎＭ、０．０５ｎＭ、０．０４ｎＭ、０．０３ｎＭ、０．０２ｎＭまたは０．０１ｎＭ以下のＥＣ５０でサルＰＤ−Ｌ１と結合する。特定の実施形態では、抗体およびその抗原結合断片は、マウスＰＤ−Ｌ１と結合しないが、ヒトＰＤ−Ｌ１のものと同様の結合親和性でサルＰＤ−Ｌ１と結合する。特定の実施形態では、抗体またはその抗原結合断片は、１００ｎＭ以下（例えば、５０ｎＭ、４０ｎＭ、３０ｎＭ、２０ｎＭ、１０ｎＭ、９ｎＭ、８ｎＭ、７ｎＭ、６ｎＭ、５ｎＭ、４ｎＭ、３ｎＭ、２ｎＭ、１ｎＭ、０．９ｎＭ、０．８ｎＭ、０．７ｎＭ、０．６ｎＭ、０．５ｎＭ、０．４ｎＭ、０．３ｎＭ、０．２ｎＭまたは０．１ｎＭ以下）のＩＣ５０で、ヒトまたはサルＰＤ−Ｌ１の、その受容体（例えば、ＰＤ−１）との結合を強力に阻害する。特定の実施形態では、ＥＣ５０またはＩＣ５０は、蛍光活性化セルソーティング（ＦＡＣＳ）解析によって測定される。
【０００７】
特定の実施形態では、抗体またはその抗原結合断片は、エフェクター機能を実質的に低減している。特定の実施形態では、抗体またはその抗原結合断片は、ＡＤＣＣまたはＣＤＣまたはその両方を媒介しない。
【０００８】
特定の実施形態では、本明細書において提供される抗体またはその抗原結合断片は、配列番号１、３、５、１３、１５、１７、２５、２７、２９、３７、３９および４１からなる群から選択される重鎖ＣＤＲ配列を含む。
【０００９】
一態様では、本明細書において提供される抗体またはその抗原結合断片は、配列番号７、９、１１、１９、２１、２３、３１、３３および３５からなる群から選択される軽鎖ＣＤＲ配列を含む。
【００１０】
特定の実施形態では、本明細書において提供される抗体またはその抗原結合断片は、配列番号１、３、５、７、９および１１からなる群から選択される、または配列番号１３、１５、１７、１９、２１および２３からなる群から選択される、または配列番号２５、２７、２９、３１、３３および３５からなる群から選択される、または配列番号３７、３９、４１、１９、２１および２３からなる群から選択される少なくとも１つ、２つ、３つ、４つ、５つまたは６つのＣＤＲを含む。
【００１１】
特定の実施形態では、本明細書において提供される抗体またはその抗原結合断片は、
ａ）配列番号１、配列番号３および／または配列番号５を含む重鎖可変領域、
ｂ）配列番号１３、配列番号１５および／または配列番号１７を含む重鎖可変領域、
ｃ）配列番号２５、配列番号２７および／または配列番号２９を含む重鎖可変領域、ならびに
ｄ）配列番号３７、配列番号３９および／または配列番号４１を含む重鎖可変領域
からなる群から選択される重鎖可変領域を含む。
【００１２】
特定の実施形態では、本明細書において提供される抗体またはその抗原結合断片は、
ａ）配列番号７、配列番号９および／または配列番号１１を含む軽鎖可変領域、
ｂ）配列番号１９、配列番号２１および／または配列番号２３を含む軽鎖可変領域、ならびに
ｃ）配列番号３１、配列番号３３および／または配列番号３５を含む軽鎖可変領域
からなる群から選択される軽鎖可変領域を含む。
【００１３】
特定の実施形態では、本明細書において提供される抗体またはその抗原結合断片は、
ａ）配列番号１、配列番号３および／または配列番号５を含む重鎖可変領域ならびに配列番号７、配列番号９および／または配列番号１１を含む軽鎖可変領域、
ｂ）配列番号１３、配列番号１５および／もしくは配列番号１７を含む重鎖可変領域ならびに配列番号１９、配列番号２１および／もしくは配列番号２３を含む軽鎖可変領域、
ｃ）配列番号２５、配列番号２７および／もしくは配列番号２９を含む重鎖可変領域ならびに配列番号３１、配列番号３３および／もしくは配列番号３５を含む軽鎖可変領域、または
ｄ）配列番号３７、配列番号３９および／または配列番号４１を含む重鎖可変領域ならびに配列番号１９、配列番号２１および／もしくは配列番号２３を含む軽鎖可変領域
を含む。
【００１４】
特定の実施形態では、本明細書において提供される抗体またはその抗原結合断片は、配列番号４３、配列番号４７、配列番号５１および配列番号５５からなる群から選択される重鎖可変領域を含む。
【００１５】
特定の実施形態では、本明細書において提供される抗体またはその抗原結合断片は、配列番号４５、配列番号４９および配列番号５３からなる群から選択される軽鎖可変領域を含む。
【００１６】
特定の実施形態では、本明細書において提供される抗体またはその抗原結合断片は、
ａ）配列番号４３を含む重鎖可変領域および配列番号４５を含む軽鎖可変領域、
ｂ）配列番号４７を含む重鎖可変領域および配列番号４９を含む軽鎖可変領域、
ｃ）配列番号５１を含む重鎖可変領域および配列番号５３を含む軽鎖可変領域、または
ｄ）配列番号５５を含む重鎖可変領域および配列番号４９を含む軽鎖可変領域
を含む。
【００１７】
特定の実施形態では、本明細書において提供される抗体は、例えば、１．４．１、１．１４．４、１．２０．１５および１．４６．１１を含む。
【００１８】
特定の実施形態では、本明細書において提供される抗体またはその抗原結合断片は、抗体１．４．１、１．１４．４、１．２０．１５および１．４６．１１と同一エピトープについて競合する。特定の実施形態では、本明細書において提供される抗体またはその抗原結合断片は、ＰＤ−Ｌ１の以下のアミノ酸残基：Ｅ５８、Ｅ６０、Ｄ６１、Ｋ６２、Ｎ６３およびＲ１１３のうち少なくとも１個を含むエピトープと結合する。
【００１９】
特定の実施形態では、抗体またはその抗原結合断片は、ヒトＰＤ−Ｌ１の、その受容体との結合を遮断可能であり、それによって、以下の活性のうち少なくとも１種を提供する：
ａ）ＣＤ４＋Ｔ細胞におけるＩＬ−２の生成を誘導すること、
ｂ）ＣＤ４＋Ｔ細胞におけるＩＦＮγの生成を誘導すること、
ｃ）ＣＤ４＋Ｔ細胞の増殖を誘導すること、および
ｄ）Ｔｒｅｇの抑制機能を逆転させること。
【００２０】
特定の実施形態では、本明細書において提供される抗体は、モノクローナル抗体、完全ヒト抗体、ヒト化抗体、キメラ抗体、組換え抗体、二重特異性抗体、標識された抗体、二価抗体または抗イディオタイプ抗体である。
【００２１】
特定の実施形態では、本明細書において提供されるその抗原結合断片は、ラクダ化された〔camelized〕〕単一ドメイン抗体、ダイアボディー、ｓｃＦｖ、ｓｃＦｖ二量体、ＢｓＦｖ、ｄｓＦｖ、（ｄｓＦｖ）２、ｄｓＦｖ−ｄｓＦｖ’、Ｆｖ断片、Ｆａｂ、Ｆａｂ’、Ｆ（ａｂ’）２、ｄｓダイアボディー、ナノボディー、ドメイン抗体または二価ドメイン抗体である。
【００２２】
特定の実施形態では、本明細書において提供される抗体またはその抗原結合断片は、免疫グロブリン定常領域をさらに含む。
【００２３】
特定の実施形態では、本明細書において提供される抗体またはその抗原結合断片は、コンジュゲートをさらに含む。
【００２４】
特定の実施形態では、コンジュゲートは、検出可能な標識、薬物動態修飾部分または精製部分であり得る。
【００２５】
別の態様では、本開示は、本明細書において提供される抗体またはその抗原結合断片をコードする単離されたポリヌクレオチドを提供する。特定の実施形態では、本明細書において提供される抗体または抗原結合断片のアミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドが提供される。特定のその他の実施形態では、これらのポリヌクレオチドを含むベクターが提供され、特定のその他の実施形態では、これらのベクターを含む宿主細胞が提供される。特定の実施形態では、ポリヌクレオチドによってコードされる本明細書において提供される抗体または抗原結合断片が、ベクターから発現される条件下で、これらの宿主細胞を培養することによって、本明細書において提供される抗体または抗原結合断片のうち１種以上を発現させるための方法が提供される。特定の実施形態では、本明細書において提供されるポリヌクレオチドは、ベクター中でＳＶ４０プロモーターなどのプロモーターと作動可能に結合される。特定の実施形態では、本明細書において提供されるベクターを含む宿主細胞は、チャイニーズハムスター卵巣細胞または２９３Ｆ細胞である。
【００２６】
別の態様では、本開示内容は、抗体またはその抗原結合断片を含むキットを提供する。
【００２７】
別の態様では、１．４．１、１．１４．４、１．２０．１５および１．４６．１１などの本明細書において提供されるＰＤ−Ｌ１抗体は、動物において良好な耐容性および高いｉｎ  ｖｉｖｏ抗腫瘍活性を有する。特定の実施形態では、本明細書において提供されるＰＤ−Ｌ１抗体が投与された腫瘍細胞を有する動物は、同様のベースライン腫瘍量を有するがビヒクルのみが投与された対照動物と比較して、少なくとも２０％、少なくとも３０％、少なくとも４０％、少なくとも５０％、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％または少なくとも９５％までの腫瘍量の低減を有する。
【００２８】
別の態様では、本開示内容は、生体サンプルにおいてＰＤ−Ｌ１（例えば、ヒトまたはサル）の存在またはレベルを検出する方法であって、生体サンプルを、本明細書において提供される抗体またはその抗原結合断片に対して曝露することおよびサンプルにおいてＰＤ−Ｌ１の存在またはレベルを調べることを含む方法を提供する。
【００２９】
別の態様では、本開示内容は、ＰＤ−Ｌ１アンタゴニストに対して応答する可能性が高い障害または状態を有する個体を同定する方法であって、本明細書において提供される抗体またはその抗原結合断片を用いて、個体から得られた試験生体サンプルにおいてＰＤ−Ｌ１（例えば、ヒトまたはサル）の存在またはレベルを調べることを含み、試験生体サンプルにおけるＰＤ−Ｌ１の存在または上方制御されたレベルが、応答性の見込みを示す方法を提供する。特定の実施形態では、方法は、ＰＤ−Ｌ１アンタゴニストに対して応答する可能性が高い障害または状態を有すると同定されている個体に、有効量の、本明細書において提供される抗体またはその抗原結合断片を投与することをさらに含む。
【００３０】
本開示は、ＰＤ−Ｌ１アンタゴニストで処置された対象における、治療的応答または疾患の進行をモニタリングする方法であって、本明細書において提供される抗ＰＤ−Ｌ１抗体またはその抗原結合断片を用いて、個体から得られた試験生体サンプルにおいてＰＤ−Ｌ１（例えば、ヒトまたはサル）の存在またはレベルを調べることを含む方法をさらに提供する。
【００３１】
別の態様では、本開示は、本明細書において提供される抗体またはその抗原結合断片および１種または複数の医薬上許容される担体を含む医薬組成物を提供する。これらの実施形態のうち特定のものでは、医薬担体は、例えば、希釈剤、抗酸化剤、アジュバント、賦形剤または非毒性補助物質であり得る。
【００３２】
別の態様では、本開示は、免疫応答の上方制御から恩恵を受けるであろう対象における状態を処置する方法であって、対象に、有効量の、本明細書において提供される抗体またはその抗原結合断片を投与することを含む方法を提供する。特定の実施形態では、対象は、ＰＤ−Ｌ１の上方制御された発現を有する。
【００３３】
免疫応答の上方制御から恩恵を受けるであろう状態を処置するための医薬の製造における、本明細書において提供される抗体またはその抗原結合断片の使用。特定の実施形態では、状態は、癌または慢性ウイルス感染である。
【図面の簡単な説明】
【００３４】
【図１】図１は、ＦＡＣＳ解析によって測定されるような、完全ヒトＰＤ−Ｌ１抗体の、ＣＨＯ細胞を発現するＰＤ−１との結合を示す図である。
【図２】図２は、ＦＡＣＳ解析によって測定されるような、完全ヒトＰＤ−Ｌ１抗体が、ＰＤ−１の、ＰＤ−Ｌ１がトランスフェクトされたＣＨＯ細胞との結合を遮断したことを示す。
【図３】図３は、ＦＡＣＳ解析によって測定されるような、完全ヒトＰＤ−Ｌ１抗体が、ＰＤ−Ｌ１と特異的に結合したが、ＰＤ−Ｌ２とは結合しなかったことを示す。
【図４】図４は、完全ヒトＰＤ−Ｌ１抗体が、ヒトおよびカニクイザルＰＤ−Ｌ１と結合したことを示す。
【図５】図５は、表面プラズモン共鳴によって決定されるような、２．２６Ｅ−１０〜４．７８Ｅ−１０ｍｏｌ／Ｌの範囲の、ＰＤ−Ｌ１抗体の、ヒトＰＤ−Ｌ１に対する結合親和性の完全動態学を示す図である。
【図６】図６は、特異的Ｔ細胞応答におけるＩＦＮγ生成に対する完全ヒト抗ＰＤ−Ｌ１抗体の効果を示す図である。
【図７】図７は、完全ヒト抗ＰＤ−Ｌ１抗体が、特異的Ｔ細胞増殖を増強したことを示す図である。
【図８】図８は、完全ヒトＰＤ−Ｌ１抗体が、混合リンパ球反応（ＭＬＲ）におけるＩＦＮγ生成を増強したことを示す。
【図９】図９は、ＭＬＲにおけるＩＬ−２生成に対する完全ヒト抗ＰＤ−Ｌ１抗体の効果を示す図である。
【図１０】図１０は、抗ＰＤ−Ｌ１抗体が、ＭＬＲにおいてＴ細胞増殖を促進したことを示す図である。
【図１１】図１１は、抗ＰＤ−Ｌ１抗体が、Ｔｒｅｇの抑制機能を逆転させたことを示す図である。
【図１２】図１２は、抗ＰＤ−Ｌ１抗体が、活性化されたＴ細胞に対するＡＤＣＣを欠いたことを示す図である。
【図１３】図１３は、抗ＰＤ−Ｌ１抗体が、活性化されたＴ細胞に対するＣＤＣを欠いていたことを示す図である。
【図１４】図１４Ａおよび１４Ｂは、抗ＰＤ−Ｌ１抗体の、ヒト／マウスＰＤ−１との交差反応性を示す図である。２μｇ／ｍｌの、１．１４．４抗体を、９６ウェルプレートで一晩コーティングし、（図１４Ａ）ｈＰＤ−Ｌ１−Ｈｉｓタンパク質および（図１４Ｂ）ｍＰＤ−Ｌ１−Ｈｉｓタンパク質とともにインキュベートし、検出のためにＨＲＰ抗Ｈｉｓ抗体を添加した。
【図１５】図１５は、ｈＰＤ−Ｌ１構造上にマッピングされたホットスポット残基を示す図である。抗体１．１４．４の結合部位。データは、表３から得た。像上の色は、エピトープ間の相違を区別するのに役立つ。
【図１６】図１６は、ｈＰＤ−Ｌ１抗体１．１４．４の良好なｉｎ  ｖｉｖｏ耐容性を示す図である。抗体１．１４．４の３種の用量（３ｍｇ／ｋｇ、１０ｍｇ／ｋｇおよび３０ｍｇ／ｋｇ）を、ヒト化Ｂ−ｈＰＤ−１マウスに複数回腹膜内注射によって投与した。実験の間に、体重の有意な変化は観察されなかった。
【図１７】図１７は、ｈＰＤ−Ｌ１抗体１．１４．４の腫瘍細胞成長に対する有意なｉｎ  ｖｉｖｏ阻害を示す図である。抗体投与の１９日後、抗体１．１４．４の３種の用量（３ｍｇ／ｋｇ、１０ｍｇ／ｋｇおよび３０ｍｇ／ｋｇ）すべてが、＞４０％の腫瘍成長阻害（ＴＧＩ）によって示される有意な抗腫瘍効果を示した。
【発明を実施するための形態】
【００３５】
本開示の以下の説明は、単に、本開示の種々の実施形態を例示するよう意図される。そのようなものとして、論じられる特定の改変は、本開示の範囲に対する制限と解釈されてはならない。本開示の範囲から逸脱することなく、種々の等価物、変法および改変が行われ得ることは当業者には明らかであろう、また、このような同等な実施形態は、本明細書に含まれるべきであるということは理解される。刊行物、特許および特許出願を含む本明細書において引用されたすべての参考文献は、参照によりその全文で本明細書に組み込まれる。
【００３６】
―定義―
用語「抗体」は、本明細書において、特異的抗原と結合する任意の免疫グロブリン、モノクローナル抗体、ポリクローナル抗体、多重特異性抗体または二重特異性（二価）抗体を含む。天然の無傷の抗体は、２つの重鎖および２つの軽鎖を含む。各重鎖は、可変領域ならびに第１、第２および第３の定常領域からなり、各軽鎖は、可変領域および定常領域からなる。哺乳動物重鎖は、α、δ、ε、γおよびμとして分類され、哺乳動物軽鎖は、λまたはκとして分類される。抗体は、「Ｙ」型を有し、Ｙのステムは、ジスルフィド結合を介して一緒に結合している２つの重鎖の第２および第３の定常領域からなる。Ｙの各アームは、単一軽鎖の可変および定常領域と結合している単一重鎖の可変領域および第１の定常領域を含む。軽鎖および重鎖の可変領域は、抗原結合に関与している。両鎖中の可変領域は、一般に、相補性決定領域（ＣＤＲ）（ＬＣＤＲ１、ＬＣＤＲ２およびＬＣＤＲ３を含む軽（Ｌ）鎖ＣＤＲ、ＨＣＤＲ１、ＨＣＤＲ２、ＨＣＤＲ３を含む重（Ｈ）鎖ＣＤＲ）と呼ばれる３つの高度可変ループを含有する。本明細書において開示される抗体および抗原結合断片のＣＤＲ境界は、Ｋａｂａｔ、ＣｈｏｔｈｉａまたはＡｌ−Ｌａｚｉｋａｎｉの慣習（Ａｌ−Ｌａｚｉｋａｎｉ，Ｂ．、Ｃｈｏｔｈｉａ，Ｃ．、Ｌｅｓｋ，Ａ．Ｍ．、Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．、第２７３巻（４号）、９２７頁（１９９７）；Ｃｈｏｔｈｉａ，Ｃ．ら、Ｊ  Ｍｏｌ  Ｂｉｏｌ．１２月５日；第１８６巻（３号）：６５１〜６３頁（１９８５年）；Ｃｈｏｔｈｉａ，Ｃ．およびＬｅｓｋ，Ａ．Ｍ．、Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．、第１９６巻、９０１頁（１９８７年）；Ｃｈｏｔｈｉａ，Ｃ．ら、Ｎａｔｕｒｅ．１２月２１〜２８日；第３４２巻（６２５２号）：８７７〜８３頁（１９８９年）；Ｋａｂａｔ  Ｅ．Ａ．ら、Ｎａｔｉｏｎａｌ  Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅｓ  ｏｆ  Ｈｅａｌｔｈ、Ｂｅｔｈｅｓｄａ、Ｍｄ．（１９９１年））によって定義または同定され得る。３つのＣＤＲは、ＣＤＲよりもより高度に保存され、超可変ループを支持するスキャフォールドを形成するフレームワーク領域（ＦＲ）として知られる、両端に位置するストレッチの間に挿入されている。重鎖および軽鎖の定常領域は、抗原結合に関与しないが、種々のエフェクター機能を示す。抗体は、その重鎖の定常領域のアミノ酸配列に基づいてクラスに割り当てられる。抗体の５種の主要なクラスまたはアイソタイプとして、ＩｇＡ、ＩｇＤ、ＩｇＥ、ＩｇＧおよびＩｇＭがあり、これらは、α、δ、ε、γおよびμ重鎖それぞれの存在を特徴とする。主要な抗体クラスのうちいくつかは、ＩｇＧ１（γ１重鎖）、ＩｇＧ２（γ２重鎖）、ＩｇＧ３（γ３重鎖）、ＩｇＧ４（γ４重鎖）、ＩｇＡ１（α１重鎖）またはＩｇＡ２（α２重鎖）などのサブクラスに分割される。
【００３７】
用語「抗原結合断片」とは、本明細書において、１つまたは複数のＣＤＲを含む、抗体の一部から形成される抗体断片、または抗原と結合するが無傷の天然抗体構造を含まない任意のその他の抗体断片を指す。抗原結合断片の例として、制限するものではないが、ダイアボディー、Ｆａｂ、Ｆａｂ’、Ｆ（ａｂ’）2、Ｆｖ断片、ジスルフィド安定化Ｆｖ断片（ｄｓＦｖ）、（ｄｓＦｖ）2、二重特異性ｄｓＦｖ（ｄｓＦｖ−ｄｓＦｖ’）、ジスルフィド安定化ダイアボディー（ｄｓダイアボディー）、一本鎖抗体分子（ｓｃＦｖ）、ｓｃＦｖ二量体（二価ダイアボディー）、多重特異性抗体、ラクダ化単一ドメイン抗体、ナノボディー、ドメイン抗体および二価ドメイン抗体が挙げられる。抗原結合断片は、親抗体が結合する同一抗原と結合可能である。特定の実施形態では、抗原結合断片は、１種または複数の異なるヒト抗体に由来するフレームワーク領域にグラフトされた特定のヒト抗体に由来する１つまたは複数のＣＤＲを含み得る。
【００３８】
抗体に関して「Ｆａｂ」とは、ジスルフィド結合によって単一重鎖の可変領域および第１の定常領域と結合している単一軽鎖（可変および定常領域の両方）からなる抗体の部分を指す。
【００３９】
「Ｆａｂ’」とは、ヒンジ領域の部分を含むＦａｂ断片を指す。
【００４０】
「Ｆ（ａｂ’）2」とは、Ｆａｂ’の二量体を指す。
【００４１】
抗体に関して「Ｆｃ」とは、ジスルフィド結合を介して第２の重鎖の第２および第３の定常領域と結合している、第１の重鎖の第２および第３の定常領域からなる抗体の部分を指す。抗体のＦｃ部分は、ＡＤＣＣおよびＣＤＣなどの種々のエフェクター機能に関与するが、抗原結合における機能に関与しない。
【００４２】
抗体に関して「Ｆｖ」とは、完全抗原結合部位を有するための抗体の最小断片を指す。Ｆｖ断片は、単一重鎖の可変領域と結合している単一軽鎖の可変領域からなる。
【００４３】
「一本鎖Ｆｖ抗体」または「ｓｃＦｖ」とは、互いに直接またはペプチドリンカー配列を介して接続している軽鎖可変領域および重鎖可変領域からなる遺伝子操作された抗体を指す（Ｈｕｓｔｏｎ  ＪＳら  Ｐｒｏｃ  Ｎａｔｌ  Ａｃａｄ  Ｓｃｉ  ＵＳＡ、第８５巻：５８７９頁（１９８８年））。
【００４４】
「一本鎖Ｆｖ−Ｆｃ抗体」または「ｓｃＦｖ−Ｆｃ」とは、抗体のＦｃ領域と接続しているｓｃＦｖからなる遺伝子操作された抗体を指す。
【００４５】
「ラクダ化単一ドメイン抗体」、「重鎖抗体」または「ＨＣＡｂ」とは、２つのＶHドメインを含有し、軽鎖を含有しない抗体を指す（Ｒｉｅｃｈｍａｎｎ  Ｌ．およびＭｕｙｌｄｅｒｍａｎｓ  Ｓ．、Ｊ  Ｉｍｍｕｎｏｌ  Ｍｅｔｈｏｄｓ．１２月１０日；第２３１巻（１−２号）：２５〜３８頁（１９９９年）；Ｍｕｙｌｄｅｒｍａｎｓ  Ｓ．、Ｊ  Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．  Ｊｕｎ；第７４巻（４号）：２７７〜３０２頁（２００１年）；ＷＯ９４／０４６７８；ＷＯ９４／２５５９１；米国特許第６，００５，０７９号）。重鎖抗体は、元々、ラクダ科〔Camelidae〕（ラクダ、ヒトコブラクダおよびラマ）に由来していた。ラクダ化抗体は、軽鎖を欠くが、信頼のおける抗原結合レパートリーを有する（Ｈａｍｅｒｓ−Ｃａｓｔｅｒｍａｎ  Ｃ．ら、Ｎａｔｕｒｅ．６月３日；第３６３巻（６４２８号）：４４６〜８頁（１９９３年）；Ｎｇｕｙｅｎ  ＶＫ．ら「Ｈｅａｖｙ−ｃｈａｉｎ  ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ  ｉｎ  Ｃａｍｅｌｉｄａｅ；  ａ  ｃａｓｅ  ｏｆ  ｅｖｏｌｕｔｉｏｎａｒｙ  ｉｎｎｏｖａｔｉｏｎ」、Ｉｍｍｕｎｏｇｅｎｅｔｉｃｓ．４月；第５４巻（１号）：３９〜４７頁（２００２年）；Ｎｇｕｙｅｎ  ＶＫ．らＩｍｍｕｎｏｌｏｇｙ．５月；第１０９巻（１号）：９３〜１０１頁（２００３年））。重鎖抗体の可変ドメイン（ＶＨＨドメイン）は、適応免疫応答によって生じた最小の既知抗原結合単位に相当する（Ｋｏｃｈ−Ｎｏｌｔｅ  Ｆ．ら、ＦＡＳＥＢ  Ｊ．１１月；第２１巻（１３号）：３４９０〜８頁．  Ｅｐｕｂ  ２００７年６月１５日（２００７年））。
【００４６】
「ナノボディー」とは、重鎖抗体に由来するＶＨＨドメインおよび２つの定常ドメイン、ＣＨ２およびＣＨ３からなる抗体断片を指す。
【００４７】
「ダイアボディー」は、２つの抗原結合部位を有する小さい抗体断片を含み、この断片は、同一ポリペプチド鎖中でＶLドメインと接続しているＶHドメイン（ＶH−ＶLまたはＶH−ＶL）を含む（例えば、Ｈｏｌｌｉｇｅｒ  Ｐ．ら、Ｐｒｏｃ  Ｎａｔｌ  Ａｃａｄ  Ｓｃｉ  Ｕ  Ｓ  Ａ．７月１５日；第９０巻（１４号）：６４４４〜８頁（１９９３年）；ＥＰ４０４０９７；ＷＯ９３／１１１６１を参照のこと）。同一鎖上の２つのドメイン間で対合を可能にするには短すぎるリンカーを使用することによって、ドメインが、別の鎖の相補的ドメインと対を形成するようにされ、それによって、２つの抗原結合部位を作製する。抗原結合部位は、異なる抗原（またはエピトープ）の同一のものを標的とし得る。
【００４８】
「ドメイン抗体」とは、重鎖の可変領域または軽鎖の可変領域のみを含有する抗体断片を指す。特定の例では、２つまたはそれ以上のＶHドメインは、ペプチドリンカーと共有結合によって結合されて、二価または多価ドメイン抗体を作製する。二価ドメイン抗体の２つのＶHドメインは、同一または異なる抗原を標的とし得る。
【００４９】
特定の実施形態では、「（ｄｓＦｖ）2」は、３つのペプチド鎖：ペプチドリンカーによって連結され、２つのＶL部分とジスルフィド橋によって結合されている２つのＶH部分を含む。
【００５０】
特定の実施形態では、「二重特異性ｄｓダイアボディー」は、ＶH1およびＶL1の間のジスルフィド橋を介してＶL1−ＶH2（同様にペプチドリンカーによって連結された）と結合しているＶH1−ＶL2（ペプチドリンカーによって連結された）を含む。
【００５１】
特定の実施形態では、「二重特異性ｄｓＦｖ」またはｄｓＦｖ−ｄｓＦｖ’」は、３つのペプチド鎖：重鎖がペプチドリンカー（例えば、長い可動性リンカー）によって連結され、ジスルフィド橋を介してそれぞれ、ＶL1およびＶL2部分と結合しており、各ジスルフィド対形成された重鎖および軽鎖が異なる抗原特異性を有する、ＶH1−ＶH2部分を含む。
【００５２】
特定の実施形態では、「ｓｃＦｖ二量体」は、別のＶH−ＶL部分と二量体化されたＶH−ＶL（ペプチドリンカーによって連結された）を含み、その結果、一方の部分のＶHのものが、もう一方の部分のＶLと協調し、同一抗原（またはエピトープ）または異なる抗原（またはエピトープ）を標的化し得る２つの結合部位を形成する、二価ダイアボディーまたは二価ＳｃＦｖ（ＢｓＦｖ）である。その他の実施形態では、「ｓｃＦｖ二量体」は、ＶL1−ＶH2（同様にペプチドリンカーによって連結された）と会合しているＶH1−ＶL2（ペプチドリンカーによって連結された）を含み、その結果、ＶH1およびＶL1が協調し、ＶH2およびＶL2が協調し、各協調対が異なる抗原特異性を有する二重特異性ダイアボディーである。
【００５３】
抗体または抗原結合断片に関して用語「完全ヒト」とは、本明細書において、抗体または抗原結合断片が、ヒトもしくはヒト免疫細胞によって生成された、またはヒト抗体レパートリーもしくはその他のヒト抗体をコードする配列を利用するトランスジェニック非ヒト動物などの非ヒト供給源に由来する抗体のものに対応するアミノ酸配列（単数または複数）を有する、またはからなることを意味する。特定の実施形態では、完全ヒト抗体は、非ヒト抗体に由来するアミノ酸残基（特に、抗原結合残基）を含まない。
【００５４】
抗体または抗原結合断片に関して用語「ヒト化」とは、本明細書において、抗体または抗原結合断片が、非ヒト動物に由来するＣＤＲ、ヒトに由来するＦＲ領域、適用可能な場合には、ヒトに由来する定常領域を含むことを意味する。ヒト化抗体または抗原結合断片は、特定の実施形態では、ヒトにおいて低減された免疫原性を有するので、ヒト治療薬として有用である。いくつかの実施形態では、非ヒト動物は、哺乳動物、例えば、マウス、ラット、ウサギ、ヤギ、ヒツジ、モルモットまたはハムスターである。いくつかの実施形態では、ヒト化抗体または抗原結合断片は、非ヒトであるＣＤＲ配列を除く実質的にすべてのヒト配列から構成される。いくつかの実施形態では、ヒトに由来するＦＲ領域は、それが由来するヒト抗体と同一のアミノ酸配列を含み得る、またはいくつかのアミノ酸変更、例えば、例えば、１０、９、８、７、６、５、４、３、２または１つ以下のアミノ酸の変更を含み得る。いくつかの実施形態では、このようなアミノ酸の変更は、重鎖ＦＲ領域中にのみ、軽鎖ＦＲ領域中にのみまたは両方の鎖中に存在し得る。いくつかの好ましい実施形態では、ヒト化抗体は、ヒトＦＲ１−３およびヒトＪＨおよびＪκを含む。
【００５５】
用語「キメラ」とは、本明細書において、ある種に由来する重鎖および／または軽鎖の一部ならびに別の種に由来する重鎖および／または軽鎖の残りを有する抗体または抗原結合断片を意味する。例示的例では、キメラ抗体は、ヒトに由来する定常領域およびマウスなどに由来する非ヒト種に由来する可変領域を含み得る。
【００５６】
「ＰＤ−Ｌ１」とは、本明細書において、プログラム細胞死リガンド１（ＰＤ−Ｌ１、例えば、Ｆｒｅｅｍａｎら（２０００）  Ｊ．Ｅｘｐ．Ｍｅｄ．第１９２巻：１０２７頁を参照のこと）を指す。ヒトＰＤ−Ｌ１の代表的なアミノ酸配列は、ＮＣＢＩ受託番号ＮＰ＿０５４８６２．１のもとで開示されており、ヒトＰＤ−Ｌ１をコードする代表的な核酸配列は、ＮＣＢＩ受託番号：ＮＭ＿０１４１４３．３のもとで示されている。ＰＤ−Ｌ１は、胎盤、脾臓、リンパ節、胸腺、心臓、胎児肝臓において発現され、また、多数の腫瘍または癌細胞で見られる。ＰＤ−Ｌ１は、活性化されたＴ細胞、Ｂ細胞および骨髄細胞で発現されるその受容体ＰＤ−１またはＢ７−１と結合する。ＰＤ−Ｌ１およびその受容体との結合は、シグナル伝達を誘導して、サイトカイン産生およびＴ細胞増殖ＴＣＲ媒介性活性化を抑制する。したがって、ＰＤ−Ｌ１は、妊娠、自己免疫疾患、組織同種移植などの特定の事象の際に免疫系の抑制において主要な役割を果たし、腫瘍または癌細胞が免疫学的チェックポイントを回避し、免疫応答を逃れることを可能にすると考えられる。
【００５７】
「抗ＰＤ−Ｌ１抗体」とは、本明細書において、ＰＤ−Ｌ１（例えば、ヒトまたはサルＰＤ−Ｌ１）と、診断的および／または治療的使用のために提供するのに十分である親和性で特異的に結合可能である抗体を指す。
【００５８】
用語「特異的結合」または「特異的に結合する」とは、本明細書において、例えば、抗体および抗原の間などの２つの分子間の非ランダム結合反応を指す。特定の実施形態では、本明細書において提供される抗体または抗原結合断片は、ヒトおよび／またはサルＰＤ−Ｌ１と、≦１０-6Ｍ（例えば、≦５×１０-7Ｍ、≦２×１０-7Ｍ、≦１０-7Ｍ、≦５×１０-8Ｍ、≦２×１０-8Ｍ、≦１０-8Ｍ、≦５×１０-9Ｍ、≦２×１０-9Ｍ、≦１０-9Ｍ、約１０-10Ｍ、１０-10Ｍ〜１０-9Ｍ、１０-10Ｍ〜１０-8.5Ｍまたは１０-10Ｍ〜１０-8Ｍ）の結合親和性（ＫD）で特異的に結合する。ＫDとは、本明細書において、結合速度に対する解離速度の割合（ｋoff／ｋon）を指し、表面プラズモン共鳴法を使用して、例えば、Ｂｉａｃｏｒｅなどの機器を使用して決定され得る。
【００５９】
「結合を遮断する」または「同一エピトープについて競合する」能力とは、本明細書において、抗体または抗原結合断片の、２つの分子（例えば、ヒトＰＤ−Ｌ１および抗ＰＤ−Ｌ１抗体）の間の結合相互作用を、任意の検出可能な程度に阻害する能力を指す。特定の実施形態では、２つの分子間の結合を遮断する抗体または抗原結合断片は、２つの分子間の結合相互作用を少なくとも５０％阻害する。特定の実施形態では、この阻害は、６０％超、７０％超、８０％超または９０％超であり得る。
【００６０】
用語「エピトープ」は、本明細書において、抗体が結合する、抗原上の原子またはアミノ酸の特定の群を指す。２種の抗体は、抗原について競合結合を示す場合には、抗原内の同一エピトープと結合し得る。例えば、もしも、本明細書において開示されるような抗体または抗原結合断片が１．４．１、１．１４．４、１．２０．１５および１．４６．１１などの例示的抗体のヒトＰＤ−Ｌ１との結合を遮断するならば、そのとき、抗体または抗原結合断片は、例示的抗体と同一のエピトープと結合すると考えられ得る。
【００６１】
エピトープ内の特定のアミノ酸残基は、例えば、アラニンスキャニング変異誘発によって変異され得、タンパク質結合を低減する、または防ぐ変異が同定される。「アラニンスキャニング変異誘発」は、エピトープの、それと結合する別の化合物またはタンパク質との相互作用に影響を及ぼすタンパク質の特定の残基または領域を同定するために実施され得る方法である。タンパク質内の標的残基の残基または基が、中性または負に帯電したアミノ酸（最も好ましくは、アラニンもしくはポリアラニンまたは保存的アミノ酸置換）によって置換される。タンパク質の結合を閾値よりも低減する、またはその他の変異よりも最大程度にタンパク質の結合を低減する、それをコードするアミノ酸残基またはコドンの任意の変異は、タンパク質によって結合されるエピトープ内である可能性が高い。本開示の特定の実施形態では、ＰＤ−Ｌ１抗体にとって重大であるエピトープは、Ｅ５８、Ｅ６０、Ｄ６１、Ｋ６２、Ｎ６３およびＲ１１３のアミノ酸残基のうち少なくとも１つを含む。
【００６２】
「１．４．１」とは、本明細書において、配列番号４３の重鎖可変領域、配列番号４５の軽鎖可変領域およびＩｇＧ４アイソタイプのヒト定常領域を有する完全ヒトモノクローナル抗体を指す。
【００６３】
「１．１４．４」とは、本明細書において、配列番号４７の重鎖可変領域、配列番号４９の軽鎖可変領域およびＩｇＧ４アイソタイプのヒト定常領域を有する完全ヒトモノクローナル抗体を指す。
【００６４】
「１．２０．１５」とは、本明細書において、配列番号５１の重鎖可変領域、配列番号５３の軽鎖可変領域およびＩｇＧ４アイソタイプのヒト定常領域を有する完全ヒトモノクローナル抗体を指す。
【００６５】
「１．４６．１１」とは、本明細書において、配列番号５５の重鎖可変領域、配列番号４９の軽鎖可変領域およびＩｇＧ４アイソタイプのヒト定常領域を有する完全ヒトモノクローナル抗体を指す。
【００６６】
「保存的置換」とは、アミノ酸配列に関して、アミノ酸残基を、同様の生理化学的特性を有する側鎖を有する異なるアミノ酸残基と置換することを指す。例えば、保存的置換は、疎水性側鎖を有するアミノ酸残基（例えば、Ｍｅｔ、Ａｌａ、Ｖａｌ、ＬｅｕおよびＩｌｅ）の間で、中性親水性側鎖を有する残基（例えば、Ｃｙｓ、Ｓｅｒ、Ｔｈｒ、ＡｓｎおよびＧｌｎ）の間で、酸性側鎖を有する残基（例えば、Ａｓｐ、Ｇｌｕ）の間で、塩基性側鎖を有するアミノ酸（例えば、Ｈｉｓ、ＬｙｓおよびＡｒｇ）の間で、または芳香族側鎖を有する残基（例えば、Ｔｒｐ、ＴｙｒおよびＰｈｅ）の間で行われ得る。当技術分野で公知であるように、保存的置換は、通常、タンパク質のコンホメーション構造において重大な変化を引き起こさず、従って、タンパク質の生物活性を保持し得る。
【００６７】
アミノ酸配列（または核酸配列）に関して「配列同一性パーセント（％）」は、最大数の同一アミノ酸（または核酸）を達成するように、配列をアラインし、必要に応じて、ギャップを導入した後の、参照配列中のアミノ酸（または核酸）残基と同一である、候補配列中のアミノ酸（または核酸）残基のパーセンテージとして定義される。アミノ酸残基の保存的置換は、同一残基と考えられる場合も考えられない場合もある。アミノ酸（または核酸）配列同一性パーセントを決定するためのアラインメントは、例えば、ＢＬＡＳＴＮ、ＢＬＡＳＴｐ（Ｕ．Ｓ．  Ｎａｔｉｏｎａｌ  Ｃｅｎｔｅｒ  ｆｏｒ  Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ  Ｉｎｆｏｒｍａｔｉｏｎ（ＮＣＢＩ）のウェブサイトで入手可能、Ａｌｔｓｃｈｕｌ  Ｓ．Ｆ．ら、Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．、第２１５巻：４０３〜４１０頁（１９９０年）；Ｓｔｅｐｈｅｎ  Ｆ．ら、Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄｓ  Ｒｅｓ．、第２５巻：３３８９〜３４０２頁（１９９７年）も参照のこと）、ＣｌｕｓｔａｌＷ２（Ｅｕｒｏｐｅａｎ  Ｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓ  Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅのウェブサイトで入手可能、Ｈｉｇｇｉｎｓ  Ｄ．Ｇ．ら、Ｍｅｔｈｏｄｓ  ｉｎ  Ｅｎｚｙｍｏｌｏｇｙ、第２６６巻：３８３〜４０２頁（１９９６年）；Ｌａｒｋｉｎ  Ｍ．Ａ．ら、Ｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓ（Ｏｘｆｏｒｄ、Ｅｎｇｌａｎｄ）、第２３巻（２１号）：２９４７〜８頁（２００７年）も参照のこと）およびＡＬＩＧＮまたはＭｅｇａｌｉｇｎ（ＤＮＡＳＴＡＲ）ソフトウェアなどの公的に入手可能なツールを使用して達成され得る。当業者は、ツールによって提供されるデフォルトパラメータを使用してもよく、またはアラインメントにとって必要に応じて、例えば、適したアルゴリズムを選択することなどによって、パラメータをカスタマイズしてもよい。
【００６８】
「Ｔ細胞」は、本明細書において、ＣＤ４+Ｔ細胞、ＣＤ８+Ｔ細胞、Ｔヘルパー１型Ｔ細胞、Ｔヘルパー２型Ｔ細胞、Ｔヘルパー１７型Ｔ細胞および阻害性Ｔ細胞を含む。
【００６９】
「エフェクター機能」とは、本明細書において、抗体のＦｃ領域の、Ｃ１複合体およびＦｃ受容体などのそのエフェクターとの結合に起因する生物学的活性を指す。例示的エフェクター機能は、抗体およびＣ１複合体上のＣ１ｑの相互作用によって誘導される補体依存性細胞毒性（ＣＤＣ）、抗体のＦｃ領域の、エフェクター細胞上のＦｃ受容体との結合によって誘導される抗体依存性細胞媒介性細胞毒性（ＡＤＣＣ）、および食作用を含む。
【００７０】
「癌」または「癌性状態」とは、本明細書において、新生物性または悪性細胞成長、増殖または転移によって媒介される任意の医学的状態を指し、固形癌および白血病などの非固形癌の両方を含む。「腫瘍」とは、本明細書において、新生物性および／または悪性細胞の固体塊を指す。
【００７１】
状態を「処置すること」または「処置」とは、本明細書において、状態を予防することまたは軽減すること、状態の発症または発生の速度を減速すること、状態の発生のリスクを低減すること、状態と関連する症状の発生を予防することまたは遅延すること、状態と関連する症状を低減することまたは終了させること、状態の完全なまたは部分的な退縮をもたらすこと、状態を治癒させることまたはそれらのいくつかの組合せを含む。癌に関して、「処置すること」または「処置」は、新生物性または悪性細胞成長、増殖または転移を阻害または減速すること、新生物性または悪性細胞成長、増殖または転移の発生を予防することまたは遅延することまたはそれらのいくつかの組合せを指し得る。腫瘍に関して、「処置すること」または「処置」は、腫瘍のすべてまたは一部を根絶すること、腫瘍成長および転移を阻害することまたは減速すること、腫瘍の発生を予防することまたは遅延することまたはそれらのいくつかの組合せを含む。
【００７２】
「単離された」物質は、天然状態から人の手によって変更されている。「単離された」組成物または物質が天然に生じる場合には、元の環境から変化されている、または取り出されている、または両方である。例えば、生存する動物中に天然に存在するポリヌクレオチドまたはポリペプチドは、「単離されて」いないが、同一ポリヌクレオチドまたはポリペプチドは、実質的に純粋な状態で存在するようにその天然状態の共存する材料から十分に分離されている場合には「単離されている」。特定の実施形態では、抗体および抗原結合断片は、電気泳動法（ＳＤＳ−ＰＡＧＥ、等電点電気泳動、キャピラリー電気泳動など）またはクロマトグラフィー法（イオン交換クロマトグラフィーまたは逆相ＨＰＬＣなど）によって決定されるような、少なくとも９０％、９３％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％の純度を有する。
【００７３】
用語「ベクター」とは、本明細書において、タンパク質をコードするポリヌクレオチドが、そのタンパク質の発現を引き起こすように作動可能に挿入され得る媒体を指す。ベクターは、宿主細胞内に運ぶ遺伝要素の発現を引き起こすように、宿主細胞を形質転換、形質導入またはトランスフェクトするために使用され得る。ベクターの例として、プラスミド、ファージミド、コスミド、酵母人工染色体（ＹＡＣ）、細菌人工染色体（ＢＡＣ）またはＰ１由来人工染色体（ＰＡＣ）などの人工染色体、λファージまたはＭ１３ファージなどのバクテリオファージおよび動物ウイルスが挙げられる。ベクターとして使用される動物ウイルスのカテゴリーとして、レトロウイルス（レンチウイルスを含む）、アデノウイルス、アデノ随伴ウイルス、ヘルペスウイルス（例えば、単純ヘルペスウイルス）、ポックスウイルス、バキュロウイルス、パピローマウイルスおよびパポーバウイルス（例えば、ＳＶ４０）が挙げられる。ベクターは、プロモーター配列、転写開始配列、エンハンサー配列、選択可能要素およびリポーター遺伝子を含む、発現を制御するための種々の要素を含有し得る。さらに、ベクターは、複製起点を含有し得る。ベクターはまた、限定されるものではないが、ウイルス粒子、リポソームまたはタンパク質コーティングを含む、細胞へのその侵入を補助するための材料を含み得る。
【００７４】
語句「宿主細胞」とは、本明細書において、外因性ポリヌクレオチドおよび／またはベクターが導入されている細胞を指す。
【００７５】
「ＰＤ−Ｌ１と関連する、またはそれと関係する疾患」とは、本明細書において、ＰＤ−Ｌ１（例えば、ヒトＰＤ−Ｌ１）の発現または活性の増大または減少によって引き起こされる、それによって増悪される、またはそうでなければそれと関連付けられる任意の状態を指す。
【００７６】
用語「治療上有効な量」または「有効投与量」とは、本明細書において、ヒトＰＤ−Ｌ１と関連する疾患または状態を処置するのに有効な薬物の投与量または濃度を指す。例えば、癌を処置するための本明細書において開示される抗体または抗原結合断片の使用に関して、治療上有効な量は、腫瘍のすべてまたは一部を根絶、腫瘍成長を阻害または減速、癌性状態を媒介する細胞の成長または増殖を阻害、腫瘍細胞転移を阻害、腫瘍または癌性状態と関連する任意の症状またはマーカーを回復、腫瘍または癌性状態の発生を予防または遅延可能な抗体または抗原結合断片の投与量または濃度またはそのいくつかの組合せである。
【００７７】
用語「医薬上許容される」は、指定された担体、ビヒクル、希釈剤、賦形剤（単数または複数）および／または塩が、一般に、製剤を含むその他の成分と化学的におよび／または物理的に適合しており、そのレシピエントと生理学的に適合していることを示す。
【００７８】
―抗ＰＤ−Ｌ１抗体―
一態様では、本開示は、抗ＰＤ−Ｌ１抗体およびその抗原結合断片を提供する。ＣＤ２７９とも呼ばれるＰＤ−１は、活性化されたＴ細胞によって発現される重要な免疫チェックポイント受容体としても知られており、免疫抑制を媒介する。ＰＤ−１リガンド１（ＰＤ−Ｌ１）は、種々の腫瘍細胞、間質細胞または両方で発現される４０ｋＤａの膜貫通タンパク質であり、ＰＤ−１と結合する。ＰＤ−１およびＰＤ−Ｌ１間の相互作用の阻害は、Ｔ細胞反応を増強し、したがって、抗癌活性を媒介し得る。
【００７９】
特定の実施形態では、本開示は、例示的完全ヒトモノクローナル抗体１．４．１、１．１４．４、１．２０．１５および１．４６．１１を提供し、そのＣＤＲ配列は、以下の表１に示されており、重鎖または軽鎖可変領域配列も以下に示されている。
【００８０】
【表１−１】
2018527949.tif 000003
【表１−２】
2018527949.tif 000004
【００８１】
１．４．１−ＶＨ（３０５１１）：重鎖ＣＤＲ１〜３：それぞれ、配列番号１、３、５は、アミノ酸配列であり、配列番号２、４、６は、核酸配列である：を有する（アミノ酸について配列番号４３および核酸について配列番号４４）：
Ｖセグメント：ＩＧＨＶ４−３９＊０１
Ｄセグメント：ＩＧＨＤ１−２６＊０１
Ｊセグメント：ＩＧＨＪ４＊０２
【化１】
2018527949.tif 000005
【００８２】
１．４．１−ＶＬ（３００２７）：軽鎖ＣＤＲ１〜３：それぞれ、配列番号７、９、１１は、アミノ酸配列であり、配列番号８、１０、１２は、核酸配列である：を有する（アミノ酸について配列番号４５および核酸について配列番号４６）：
Ｖセグメント：ＩＧＬＶ３−１＊０１
Ｊセグメント：ＩＧＬＪ２＊０１
【化２】
2018527949.tif 000006
【００８３】
１．１４．４−ＶＨ（２９８１２）：重鎖ＣＤＲ１〜３：それぞれ、配列番号１３、１５、１７は、アミノ酸配列であり、配列番号１４、１６、１８は、核酸配列である：を有する（アミノ酸について配列番号４７および核酸について配列番号４８）：
Ｖセグメント：ＩＧＨＶ３−２３＊０１
Ｄセグメント：ＩＧＨＤ５−５＊０１
Ｊセグメント：ＩＧＨＪ４＊０２
【化３】
2018527949.tif 000007
【００８４】
１．１４．４−ＶＬおよび１．４６．１１−ＶＬ（２９８４１）：軽鎖ＣＤＲ１〜３：それぞれ、配列番号１９、２１、２３は、アミノ酸配列であり、配列番号２０、２２、２４は、核酸配列である：を有する（アミノ酸について配列番号４９および核酸について配列番号５０）：
Ｖセグメント：ＩＧＬＶ３−２１＊０２
Ｊセグメント：ＩＧＬＪ２＊０１
【化４】
2018527949.tif 000008
【００８５】
１．２０．１５−ＶＨ（３０７１２）：重鎖ＣＤＲ１〜３：それぞれ、配列番号２５、２７、２９は、アミノ酸配列であり、配列番号２６、２８、３０は、核酸配列である：を有する（アミノ酸について配列番号５１および核酸について配列番号５２）：
Ｖセグメント：ＩＧＨＶ４−３９＊０１
Ｄセグメント：決定されていない
Ｊセグメント：ＩＧＨＪ４＊０２
【化５】
2018527949.tif 000009
【００８６】
１．２０．１５−ＶＬ（２９９０７）：軽鎖ＣＤＲ１〜３：それぞれ、配列番号３１、３３、３５は、アミノ酸配列であり、配列番号３２、３４、３６は、核酸配列である：を有する（アミノ酸について配列番号５３および核酸について配列番号５４）：
Ｖセグメント：ＩＧＬＶ３−１＊０１
Ｊセグメント：ＩＧＬＪ２＊０１
【化６】
2018527949.tif 000010
【００８７】
１．４６．１１−ＶＨ（３０６２６）：重鎖ＣＤＲ１〜３：それぞれ、配列番号３７、３９、４１は、アミノ酸配列であり、配列番号３８、４０、４２は、核酸配列である：を有する（アミノ酸について配列番号５５および核酸について配列番号５６）：
Ｖセグメント：ＩＧＨＶ３−２３＊０１
Ｄセグメント：ＩＧＨＤ５−５＊０１
Ｊセグメント：ＩＧＨＪ４＊０２
【化７】
2018527949.tif 000011
【００８８】
１．４６．１１−ＶＬ（２９８４１）：軽鎖ＣＤＲ１〜３：それぞれ、配列番号１９、２１、２３は、アミノ酸配列であり、配列番号２０、２２、２４は、核酸配列である：を有する（アミノ酸について配列番号４９および核酸について配列番号５０）：
Ｖセグメント：ＩＧＬＶ３−２１＊０２
Ｊセグメント：ＩＧＬＪ２＊０１
【化８】
2018527949.tif 000012
【００８９】
いくつかの実施形態では、抗ＰＤ−Ｌ１抗体およびその抗原結合断片は、配列番号１、３、５、１３、１５、１７、２５、２７、２９、３７、３９および４１からなる群から選択される重鎖ＣＤＲ配列を含む。いくつかの実施形態では、抗ＰＤ−Ｌ１抗体およびその抗原結合断片は、配列番号７、９、１１、１９、２１、２３、３１、３３および３５からなる群から選択される軽鎖ＣＤＲ配列を含む。
【００９０】
いくつかの実施形態では、抗ＰＤ−Ｌ１抗体およびその抗原結合断片は、配列番号１、配列番号３および／または配列番号５を含む重鎖可変領域、配列番号１３、配列番号１５、および／または配列番号１７を含む重鎖可変領域、配列番号２５、配列番号２７および／または配列番号２９を含む重鎖可変領域、ならびに配列番号３７、配列番号３９および／または配列番号４１を含む重鎖可変領域からなる群から選択される重鎖可変領域を含む。
【００９１】
いくつかの実施形態では、抗ＰＤ−Ｌ１抗体およびその抗原結合断片は、配列番号７、配列番号９および／または配列番号１１を含む軽鎖可変領域、配列番号１９、配列番号２１および／または配列番号２３を含む軽鎖可変領域、ならびに配列番号３１、配列番号３３および／または配列番号３５を含む軽鎖可変領域からなる群から選択される軽鎖可変領域を含む。
【００９２】
いくつかの実施形態では、ａ）配列番号１、配列番号３および／もしくは配列番号５を含む重鎖可変領域ならびに配列番号７、配列番号９および／もしくは配列番号１１を含む軽鎖可変領域、ｂ）配列番号１３、配列番号１５および／もしくは配列番号１７を含む重鎖可変領域ならびに配列番号１９、配列番号２１および／もしくは配列番号２３を含む軽鎖可変領域、ｃ）配列番号２５、配列番号２７および／もしくは配列番号２９を含む重鎖可変領域ならびに配列番号３１、配列番号３３および／もしくは配列番号３５を含む軽鎖可変領域、またはｄ）配列番号３７、配列番号３９および／または配列番号４１を含む重鎖可変領域ならびに配列番号１９、配列番号２１および／もしくは配列番号２３を含む軽鎖可変領域を含む抗ＰＤ−Ｌ１抗体およびその抗原結合断片。
【００９３】
当業者ならば、表１に提供されるＣＤＲ配列は、ヒトＰＤ−Ｌ１との結合親和性の改善などの生物活性の改善を提供するように、アミノ酸の１つまたは複数の置換を含有するように修飾され得るということを理解するであろう。例えば、抗体変異体（ＦａｂまたはｓｃＦｖ変異体など）のライブラリーが作製され、ファージディスプレイ技術を用いて発現され、次いで、ヒトＰＤ−Ｌ１との結合親和性についてスクリーニングされ得る。別の例については、抗体の、ヒトＰＤ−Ｌ１との結合をコンピュータ上でシミュレートし、結合面を形成する抗体上のアミノ酸残基を同定するためにコンピュータソフトウェアが使用され得る。このような残基は、結合親和性の低下を防ぐために置換において避けられるか、またはより強力な結合を提供するために置換のために標的とされるかのいずれかであり得る。特定の実施形態では、ＣＤＲ配列中の置換（単数または複数）のうち少なくとも１つ（またはすべて）は、保存的置換である。
【００９４】
特定の実施形態では、抗体およびその抗原結合断片は、表１に列挙されるもの（単数または複数）に対して、少なくとも８０％（例えば、少なくとも８５％、８８％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％）の配列同一性を有する、１つまたは複数のＣＤＲ配列を含み、その一方で、対応するＣＤＲ配列が、表１に列挙されるもの（単数または複数）に対して１００％の配列同一性にある場合を除いて、ヒトＰＤ−Ｌ１に対して、実質的に同一の配列を有するその親抗体と同様またはさらにより高いレベルの結合親和性を保持する。
【００９５】
特定の実施形態では、抗ＰＤ−Ｌ１抗体およびその抗原結合断片は、完全ヒトである。完全ヒト抗体は、ヒト化抗体を用いる場合にしばしば観察されるような、ヒトにおける免疫原性および／または結合親和性の低減の問題を有さない。
【００９６】
いくつかの実施形態では、完全ヒト抗ＰＤ−Ｌ１抗体およびその抗原結合断片は、配列番号４３、配列番号４７、配列番号５１、配列番号５５および少なくとも８０％（例えば、少なくとも８５％、８８％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％）の配列同一性を有するその相同配列からなる群から選択される重鎖可変領域、ならびに／または配列番号４５、配列番号４９、配列番号５３および少なくとも８０％（例えば、少なくとも８５％、８８％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％）の配列同一性を有するその相同配列からなる群から選択される軽鎖可変領域を含む。これらの完全ヒト抗体は、ヒトＰＤ−Ｌ１に対する結合親和性を、好ましくは、例示的抗体１．４．１、１．１４．４、１．２０．１５および１．４６．１１のうち１種と同様のレベルで保持する。
【００９７】
いくつかの実施形態では、完全ヒト抗ＰＤ−Ｌ１抗体およびその抗原結合断片は、ａ）配列番号４３を含む重鎖可変領域および配列番号４５を含む軽鎖可変領域、ｂ）  配列番号４７を含む重鎖可変領域および配列番号４９を含む軽鎖可変領域、ｃ）配列番号５１を含む重鎖可変領域および配列番号５３を含む軽鎖可変領域、またはｄ）配列番号５５を含む重鎖可変領域および配列番号４９を含む軽鎖可変領域を含む。
【００９８】
また、同一エピトープについて、本明細書において提供される抗ＰＤ−Ｌ１抗体およびその抗原結合断片と競合する、抗体および抗原結合断片も本明細書において考慮される。特定の実施形態では、抗体は、１．４．１、１．１４．４、１．２０．１５および１．４６．１１の、ヒトまたはサルＰＤ−Ｌ１との結合を、例えば、１０-6Ｍ未満、１０-7Ｍ未満、１０-7.5Ｍ未満、１０-8Ｍ未満、１０-8.5Ｍ未満、１０-9Ｍ未満または１０-10Ｍ未満のＩＣ50値（すなわち、５０％阻害濃度）で遮断する。ＩＣ50値は、ＥＬＩＳＡアッセイ、放射性リガンド競合結合アッセイおよびＦＡＣＳ解析などの競合アッセイに基づいて決定される。
【００９９】
いくつかの実施形態では、本明細書において提供される抗ＰＤ−Ｌ１抗体およびその抗原結合断片は、プラズモン共鳴結合アッセイによって測定されるものとして、≦１０-6Ｍ（例えば、≦５×１０-7Ｍ、≦２×１０-7Ｍ、≦１０-7Ｍ、≦５×１０-8Ｍ、≦２×１０-8Ｍ、≦１０-8Ｍ、≦５×１０-9Ｍ、≦２×１０-9Ｍ、≦１０-9Ｍ、約１０-10Ｍ、１０-10Ｍ〜１０-8.5Ｍまたは１０-10Ｍ〜１０-8Ｍ）の結合親和性（Ｋｄ）でヒトＰＤ−Ｌ１と特異的に結合可能である。結合親和性は、抗原および抗原結合分子間の結合が平衡に達する場合に、結合速度に対する解離速度の割合（ｋoff／ｋon）として算出されるＫｄ値によって表され得る。抗原結合親和性（例えば、ＫD）は、例えば、Ｂｉａｃｏｒｅなどの機器を使用するプラズモン共鳴結合アッセイを含む当技術分野で公知の適した方法を使用して適宜決定され得る（例えば、Ｍｕｒｐｈｙ，Ｍ．ら、Ｃｕｒｒｅｎｔ  ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ  ｉｎ  ｐｒｏｔｅｉｎ  ｓｃｉｅｎｃｅ、第１９章、１９．１４単元、２００６年を参照のこと）。
【０１００】
特定の実施形態では、本明細書において提供される抗体およびその断片は、ヒトＰＤ−Ｌ１と、０．１ｎＭ〜１００ｎＭ（例えば、０．１ｎＭ〜５０ｎＭ、０．１ｎＭ〜３０ｎＭ、０．１ｎＭ〜２０ｎＭ、０．１ｎＭ〜１０ｎＭまたは０．１ｎＭ〜１ｎＭのＥＣ50（すなわち、５０％結合濃度）で結合する。抗体のヒトＰＤ−Ｌ１との結合は、当技術分野で公知の方法、例えば、ＥＬＩＳＡなどのサンドイッチアッセイ、ウエスタンブロット、ＦＡＣＳまたはその他の結合アッセイによって測定され得る。例示的例では、試験抗体（すなわち、第１の抗体）は、固定化されたヒトＰＤ−Ｌ１またはヒトＰＤ−Ｌ１を発現する細胞と結合することが可能にされ、結合していない抗体を洗浄除去した後に、結合している第１の抗体と結合でき、その検出を可能にする標識された二次抗体が導入される。検出は、固定化されたＰＤ−Ｌ１が使用される場合にはマイクロプレートリーダーを用いて、またはヒトＰＤ−Ｌ１を発現する細胞が使用される場合にはＦＡＣＳ解析を使用することによって実施され得る。特定の実施形態では、本明細書において提供される抗体およびその断片は、ヒトＰＤ−Ｌ１と、ＦＡＣＳ解析によって測定されるような１ｎＭ〜１０ｎＭの、または１ｎＭ〜５ｎＭのＥＣ50（すなわち、５０％有効濃度）で結合する。
【０１０１】
特定の実施形態では、本明細書において提供される抗体およびその断片は、ヒトＰＤ−Ｌ１の、その受容体との結合を、競合アッセイにおいて測定されるような０．２ｎＭ〜１００ｎＭ（例えば、０．２ｎＭ〜５０ｎＭ、０．２ｎＭ〜３０ｎＭ、０．２ｎＭ〜２０ｎＭ、０．２ｎＭ〜１０ｎＭまたは１ｎＭ〜１０ｎＭ）のＩＣ50で阻害する。
【０１０２】
特定の実施形態では、本明細書において提供される抗体およびその断片は、ヒトＰＤ−Ｌ１のその受容体との結合を遮断し、それによって、例えば、活性化されたＴ細胞（ＣＤ４＋Ｔ細胞およびＣＤ８＋Ｔ細胞など）からのサイトカイン産生を誘導すること、活性化されたＴ細胞（ＣＤ４＋Ｔ細胞およびＣＤ８＋Ｔ細胞など）の増殖を誘導すること、およびＴｒｅｇの抑制機能を逆転させることを含む生物活性を提供する。例示的サイトカインとして、ＩＬ−２およびＩＦＮγが挙げられる。用語「ＩＬ−２」とは、インターロイキン２、白血球〔white blood cell〕（例えば、白血球細胞〔leukocyte〕）の活性を調節する免疫系におけるサイトカインシグナル伝達分子の１種を指す。用語「インターフェロンγ（ＩＦＮγ）」は、ナチュラルキラー（ＮＫ）、ＮＫＴ細胞、ＣＤ４+およびＣＤ８+Ｔ細胞によって産生されるサイトカインであり、マクロファージの重要なアクチベーターおよび主要組織適合複合体（ＭＨＣ）分子発現のインデューサーである。サイトカイン産生は、当技術分野で公知の方法を使用して、例えば、ＥＬＩＳＡによって調べられ得る。［3Ｈ］チミジン組込みアッセイを含む方法はまた、Ｔ細胞の増殖を検出するために使用され得る。
【０１０３】
抗ＰＤ−Ｌ１抗体およびその抗原結合断片は、ヒトＰＤ−Ｌ１に対して特異的である。特定の実施形態では、抗体およびその抗原結合断片は、ＰＤ−Ｌ２（例えば、ヒトＰＤ−Ｌ２）と結合しない。例えば、ＰＤ−Ｌ２との結合親和性は、ヒトＰＤ−Ｌ１とのものの１５％、１０％、９％、８％、７％、６％、５％、４％、３％、２％または１％未満である。
【０１０４】
特定の実施形態では、抗体およびその抗原結合断片は、サルＰＤ−Ｌ１と、ＥＬＩＳＡによって測定されるような１００ｎＭ以下、例えば、１０ｎＭ、９ｎＭ、８ｎＭ、７ｎＭ、６ｎＭ、５ｎＭ、４ｎＭ、３ｎＭ、２ｎＭ、１ｎＭ、０．９ｎＭ、０．８ｎＭ、０．７ｎＭ、０．６ｎＭ、０．５ｎＭ、０．４ｎＭ、０．３ｎＭ、０．２ｎＭ、０．１ｎＭ、０．０９ｎＭ、０．０８ｎＭ、０．０７ｎＭ、０．０６ｎＭ、０．０５ｎＭ、０．０４ｎＭ、０．０３ｎＭ、０．０２ｎＭもしくは０．０１ｎＭ以下のＥＣ５０で結合する。特定の実施形態では、抗体およびその抗原結合断片は、サルＰＤ−Ｌ１と、約１ｎＭ〜１０ｎＭのＥＣ５０で結合する。
【０１０５】
特定の実施形態では、抗体およびその抗原結合断片は、マウスＰＤ−Ｌ１と結合しないが、サルＰＤ−Ｌ１と、ヒトＰＤ−Ｌ１のものと同様の結合親和性で結合する。例えば、例示的抗体１．４．１、１．１４．４、１．２０．１５および１．４６．１１の、マウスＰＤ−Ｌ１との結合は、ＥＬＩＳＡまたはＦＡＣＳ解析などの従来の結合アッセイでは検出可能でないが、これらの抗体のサルＰＤ−Ｌ１との結合は、ＥＬＩＳＡまたはＦＡＣＳによって測定されるような、ヒトＰＤ−Ｌ１のものと同様の親和性またはＥＣ５０値である。
【０１０６】
いくつかの実施形態では、抗ＰＤ−Ｌ１抗体およびその抗原結合断片は、エフェクター機能が低減している、または枯渇している。いくつかの実施形態では、抗ＰＤ−Ｌ１抗体およびその抗原結合断片は、エフェクター機能が低減している、または枯渇しているＩｇＧ４アイソタイプの定常領域を有する。ＡＤＣＣおよびＣＤＣなどのエフェクター機能は、ＰＤ−Ｌ１を発現する細胞に対する細胞毒性につながり得る。正常細胞を含む多数の細胞は、ＰＤ−Ｌ１を発現し得る。それらの正常細胞に対する可能性のある不要な毒性を避けるために、本明細書において提供される抗体および抗原結合断片の特定の実施形態は、エフェクター機能が低減している、さらには枯渇している場合がある。種々のアッセイ、例えば、Ｆｃ受容体結合アッセイ、Ｃ１ｑ結合アッセイおよび細胞溶解アッセイが、ＡＤＣＣまたはＣＤＣ活性を評価すると知られており、当業者によって容易に選択され得る。理論に捉われようとは思わないが、ＡＤＣＣまたはＣＤＣなどのエフェクター機能が低減している、または枯渇している抗体は、ＰＤ−Ｌ１発現細胞、例えば、それらの正常細胞に対して細胞毒性を引き起こさない、または最小の細胞毒性しか引き起こさず、したがって、不要な副作用からそれらを救うが、その一方で、ＰＤ−Ｌ１を発現する腫瘍細胞は抗ＰＤ−Ｌ１抗体によって結合され、したがって、免疫チェックポイントから逃れることはできず、ゆえに、免疫系によって認識され、排除され得ると考えられる。
【０１０７】
特定の実施形態では、本明細書において提供される抗ＰＤ−Ｌ１抗体およびその抗原結合断片は、副作用が低減されている。例えば、本明細書において提供される抗体およびその抗原結合断片は、完全ヒトＩｇＧ配列を有し得、したがって免疫原性がヒト化抗体よりも低減されている。別の例については、本明細書において提供される抗体およびその抗原結合断片は、ＡＤＣＣおよびＣＤＣを排除するためにＩｇＧ４形式であり得る。
【０１０８】
特定の実施形態では、本明細書において提供される抗ＰＤ−Ｌ１抗体およびその抗原結合断片は、腫瘍細胞、精製腫瘍抗原および免疫刺激性サイトカインをコードする遺伝子を用いてトランスフェクトされた細胞、腫瘍ワクチンなどの免疫原と組み合わせて使用され得るという点で有利である。さらに、抗ＰＤ−Ｌ１抗体およびその抗原結合断片は、標準化学および放射線療法、標的ベースの小分子療法を含み、その他の免疫チェックポイントモジュレーター療法が現れる併用療法に含まれ得る。特定の実施形態では、抗体およびその抗原結合断片は、抗体−薬物コンジュゲート、二重特異性または多価抗体の基礎として使用され得る。
【０１０９】
本明細書において提供される抗ＰＤ−Ｌ１抗体またはその抗原結合断片は、モノクローナル抗体、ポリクローナル抗体、完全ヒト抗体、ヒト化抗体、キメラ抗体、組換え抗体、二重特異性抗体、標識された抗体、二価抗体または抗イディオタイプ抗体であり得る。組換え抗体は、動物においてではなく組換え法を使用してｉｎ  ｖｉｔｒｏで調製される抗体である。二重特異性または二価抗体は、２種の異なるモノクローナル抗体の断片を有し、２種の異なる抗原を結合し得る人工抗体である。「二価」である抗体またはその抗原結合断片は、２つの抗原結合部位を含む。２つの抗原結合部位は、同一抗原と結合する場合も、またはそれらは、異なる抗原と各々結合する場合もあり、その場合には、抗体または抗原結合断片は、「二重特異性」と特性決定される。
【０１１０】
いくつかの実施形態では、本明細書において提供される抗ＰＤ−Ｌ１抗体またはその抗原結合断片は、完全ヒト抗体である。特定の実施形態では、完全ヒト抗体は、組換え法を使用して調製される。例えば、マウスなどのトランスジェニック動物は、ヒト免疫グロブリン遺伝子の導入遺伝子または導入染色体〔transchromosome〕を運び、従って、ヒトＰＤ−Ｌ１などの適当な抗原を用いた免疫処置後に完全ヒト抗体を産生可能であるように作製され得る。完全ヒト抗体は、このようなトランスジェニック動物から単離され得る、あるいは、トランスジェニック動物の脾臓細胞を、不死細胞株と融合して、完全ヒト抗体を分泌するハイブリドーマ細胞を作製することによるハイブリドーマ技術によって作製され得る。例示的トランスジェニック動物として、制限するものではないが、ラット免疫グロブリン遺伝子のその内因性発現が不活性化されており、同時に、機能的組換えヒト免疫グロブリン遺伝子座を含有するように遺伝子操作されているＯｍｎｉＲａｔ；マウス免疫グロブリン遺伝子のその内因性発現が不活性化されており、同時に、Ｊ−遺伝子座欠失およびＣ−κ変異を有する組換えヒト免疫グロブリン遺伝子座を含有するように遺伝子操作されているＯｍｎｉＭｏｕｓｅ；ラット免疫グロブリン遺伝子のその内因性発現が不活性化されており、同時に、単一の共通の再編成されたＶｋＪｋ軽鎖および機能的重鎖を有する組換えヒト免疫グロブリン遺伝子座を含有するように遺伝子操作されているトランスジェニックラットであるＯｍｎｉＦｌｉｃが挙げられる。詳細な情報は、Ｏｓｂｏｒｎ  Ｍ．ら、Ｊｏｕｒｎａｌ  ｏｆ  Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ、２０１３年、第１９０巻：１４８１〜９０頁；Ｍａ  Ｂ．ら、Ｊｏｕｒｎａｌ  ｏｆ  Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｉｃａｌ  Ｍｅｔｈｏｄｓ  第４００〜４０１巻（２０１３年）７８〜８６頁；Ｇｅｕｒｔｓ  Ａ．ら、Ｓｃｉｅｎｃｅ、２００９年、第３２５巻：４３３頁；米国特許第８，９０７，１５７号；ＥＰ特許第２１５２８８０Ｂ１号；ＥＰ特許第２３３６３２９Ｂ１号でさらに見い出すことができ、そのすべては、参照によりその全文が本明細書に組み込まれる。その他の適したトランスジェニック動物、例えば、ＨｕＭａｂマウス（詳細については、Ｌｏｎｂｅｒｇ、Ｎ．らＮａｔｕｒｅ第３６８巻（６４７４号）：８５６  ８５９頁（１９９４年）を参照のこと）、Ｘｅｎｏマウス（ＭｅｎｄｅｚらＮａｔ  Ｇｅｎｅｔ．、１９９７年、第１５巻：１４６〜１５６頁）、ＴｒａｎｓＣｈｒｏｍｏマウス（ＩｓｈｉｄａらＣｌｏｎｉｎｇ  Ｓｔｅｍ  Ｃｅｌｌｓ、２００２年、第４巻：９１〜１０２頁）およびＶｅｌｏｃＩｍｍｕｎｅマウス（ＭｕｒｐｈｙらＰｒｏｃ  Ｎａｔｌ  Ａｃａｄ  Ｓｃｉ  ＵＳＡ、２０１４年、第１１１巻：５１５３〜５１５８頁）、Ｋｙｍｏｕｓｅ（ＬｅｅらＮａｔ  Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ、２０１４年、第３２巻：３５６〜３６３頁）およびトランスジェニックウサギ（ＦｌｉｓｉｋｏｗｓｋａらＰＬｏＳ  Ｏｎｅ、２０１１年、第６巻：ｅ２１０４５）も使用され得る。
【０１１１】
いくつかの実施形態では、抗ＰＤ−Ｌ１抗体およびその抗原結合断片は、ラクダ化単一ドメイン抗体、ダイアボディー、ｓｃＦｖ、ｓｃＦｖ二量体、ＢｓＦｖ、ｄｓＦｖ、（ｄｓＦｖ）２、ｄｓＦｖ−ｄｓＦｖ’、Ｆｖ断片、Ｆａｂ、Ｆａｂ’、Ｆ（ａｂ’）２、ｄｓダイアボディー、ナノボディー、ドメイン抗体または二価ドメイン抗体である。
【０１１２】
いくつかの実施形態では、抗ＰＤ−Ｌ１抗体およびその抗原結合断片は、免疫グロブリン定常領域をさらに含む。いくつかの実施形態では、免疫グロブリン定常領域は、重鎖および／または軽鎖定常領域を含む。重鎖定常領域は、ＣＨ１、ＣＨ１−ＣＨ２またはＣＨ１−ＣＨ３領域を含む。いくつかの実施形態では、定常領域は、所望の特性を付与するように１つまたは複数の修飾をさらに含み得る。例えば、定常領域は、１種もしくは複数のエフェクター機能を低減もしくは枯渇させるように、ＦｃＲｎ受容体結合を改善するように、または１つまたは複数のシステイン残基を導入するように修飾され得る。
【０１１３】
いくつかの実施形態では、抗ＰＤ−Ｌ１抗体およびその抗原結合断片は、コンジュゲートをさらに含む。種々のコンジュゲートは、本明細書において提供される抗体または抗原結合断片と連結され得るということは考慮される（例えば、「Ｃｏｎｊｕｇａｔｅ  Ｖａｃｃｉｎｅｓ」、Ｃｏｎｔｒｉｂｕｔｉｏｎｓ  ｔｏ  Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌｏｇｙ  ａｎｄ  Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ、Ｊ．  Ｍ．  ＣｒｕｓｅおよびＲ．  Ｅ．  Ｌｅｗｉｓ、Ｊｒ．（編）、Ｃａｒｇｅｒ  Ｐｒｅｓｓ、Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ、（１９８９年）を参照のこと）。これらのコンジュゲートは、その他の方法の中でも、共有結合、親和性結合、インターカレーション、配位結合、複合体形成、会合、ブレンドまたは付加によって抗体または抗原結合断片と連結され得る。特定の実施形態では、本明細書において開示される抗体および抗原結合断片は、エピトープ結合部分の外側に、１つまたは複数のコンジュゲートとの結合に利用され得る特異的部位を含有するように遺伝子操作され得る。例えば、このような部位は、コンジュゲートとの共有結合を促進するために、例えば、システインまたはヒスチジン残基などの１つまたは複数の反応性アミノ酸残基を含み得る。特定の実施形態では、抗体は、コンジュゲートと間接的に、または別のコンジュゲートを介して連結され得る。例えば、抗体または抗原結合断片は、ビオチンとコンジュゲートされ、次いで、アビジンとコンジュゲートされている第２のコンジュゲートと間接的にコンジュゲートされ得る。コンジュゲートは、検出可能な標識、薬物動態修飾部分、精製部分または細胞傷害性部分であり得る。検出可能な標識の例として、蛍光標識（例えば、フルオレセイン、ローダミン、ダンシル、フィコエリトリンまたはテキサスレッド）、酵素基質標識（例えば、西洋ワサビペルオキシダーゼ、アルカリホスファターゼ、ルシフェラーゼ、グルコアミラーゼ、リゾチーム、糖類オキシダーゼまたはβ−Ｄ−ガラクトシダーゼ）、放射性同位元素（例えば、123Ｉ、124Ｉ、125Ｉ、131Ｉ、35Ｓ、3Ｈ、111Ｉｎ、112Ｉｎ、14Ｃ、64Ｃｕ、67Ｃｕ、86Ｙ、88Ｙ、90Ｙ、177Ｌｕ、211Ａｔ、186Ｒｅ、188Ｒｅ、153Ｓｍ、212Ｂｉおよび32Ｐ、その他のランタニド、発光標識）、発色団部分、ジゴキシゲニン、ビオチン／アビジン、ＤＮＡ分子または検出用金を挙げることができる。特定の実施形態では、コンジュゲートは、抗体の半減期を増大するのに役立つＰＥＧなどの薬物動態修飾部分であり得る。その他の適したポリマーとして、カルボキシメチルセルロース、デキストラン、ポリビニルアルコール、ポリビニルピロリドンなど、エチレングリコール／プロピレングリコールのコポリマーなどが挙げられる。特定の実施形態では、コンジュゲートは、磁性ビーズなどの精製部分であり得る。「細胞傷害性部分」は、細胞にとって有害である、または細胞に損傷を与え得る、または死滅させ得る任意の薬剤であり得る。細胞傷害性部分の例として、制限するものではないが、タキソール、サイトカラシンＢ、グラミシジンＤ、臭化エチジウム、エメチン、マイトマイシン、エトポシド、テノポシド、ビンクリスチン、ビンブラスチン、コルヒチン、ドキソルビシン、ダウノルビシン、ジヒドロキシアントラセンジオン、ミトキサントロン���ミトラマイシン、アクチノマイシンＤ、１−デヒドロテストステロン、グルココルチコイド、プロカイン、テトラカイン、リドカイン、プロプラノロール、ピューロマイシンおよびその類似体、代謝拮抗物質（例えば、メトトレキサート、６−メルカプトプリン、６−チオグアニン、シタラビン、５−フルオロウラシルデカルバジン）、アルキル化剤（例えば、メクロレタミン、チオエパクロラムブシル、メルファラン、カルムスチン（ＢＳＮＵ）およびロムスチン（ＣＣＮＵ）、シクロホスファミド、ブスルファン、ジブロモマンニトール、ストレプトゾトシン、マイトマイシンＣおよびシスジクロロジアミン白金（ＩＩ）（ＤＤＰ）シスプラチン）、アントラサイクリン（例えば、ダウノルビシン（以前は、ダウノマイシン）およびドキソルビシン）、抗生物質（例えば、ダクチノマイシン（以前は、アクチノマイシン）、ブレオマイシン、ミトラマイシンおよびアントラマイシン（ＡＭＣ））および抗有糸分裂剤（例えば、ビンクリスチンおよびビンブラスチン）が挙げられる。
【０１１４】
―ポリヌクレオチドおよび組換え法―
本開示は、抗ＰＤ−Ｌ１抗体およびその抗原結合断片をコードする単離されたポリヌクレオチドを提供する。特定の実施形態では、単離されたポリヌクレオチドは、表１に提供されるＣＤＲ配列をコードする、表１に示されるような１種または複数のヌクレオチド配列を含む。
【０１１５】
いくつかの実施形態では、単離されたポリヌクレオチドは、重鎖可変領域をコードし、配列番号４４、配列番号４８、配列番号５２、配列番号５６および少なくとも８０％（例えば、少なくとも８５％、８８％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％）の配列同一性を有するその相同配列からなる群から選択される配列を含む。いくつかの実施形態では、単離されたポリヌクレオチドは、軽鎖可変領域をコードし、配列番号４６、配列番号５０、配列番号５４および少なくとも８０％（例えば、少なくとも８５％、８８％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％）の配列同一性を有するその相同配列からなる群から選択される配列を含む。特定の実施形態では、同一性パーセンテージは、遺伝暗号縮重に起因し、コードされるタンパク質配列は、変更されないままである。
【０１１６】
抗ＰＤ−Ｌ１抗体およびその抗原結合断片（例えば、表１中の配列を含む）をコードする単離されたポリヌクレオチドは、当技術分野で公知の組換え技術を使用してさらなるクローニング（ＤＮＡの増幅）のために、または発現のためにベクター中に挿入され得る。別の実施形態では、抗体は、当技術分野で公知の相同組換えによって生成され得る。モノクローナル抗体をコードするＤＮＡは、従来の手順を使用して（例えば、抗体の重鎖および軽鎖をコードする遺伝子と特異的に結合可能であるオリゴヌクレオチドプローブを使用することによって）容易に単離され、配列決定される。多数のベクターが入手可能である。ベクター成分は、一般に、限定されるものではないが、以下のうち１種または複数を含む：シグナル配列、複製起点、１種または複数のマーカー遺伝子、エンハンサーエレメント、プロモーター（例えば、ＳＶ４０、ＣＭＶ、ＥＦ−１α）および転写終結配列。
【０１１７】
いくつかの実施形態では、ベクター系として、哺乳動物、細菌、酵母系などが挙げられ、限定されるものではないが、ｐＡＬＴＥＲ、ｐＢＡＤ、ｐｃＤＮＡ、ｐＣａｌ、ｐＬ、ｐＥＴ、ｐＧＥＭＥＸ、ｐＧＥＸ、ｐＣＩ、ｐＣＭＶ、ｐＥＧＦＰ、ｐＥＧＦＴ、ｐＳＶ２、ｐＦＵＳＥ、ｐＶＩＴＲＯ，ｐＶＩＶＯ、ｐＭＡＬ、ｐＭＯＮＯ、ｐＳＥＬＥＣＴ、ｐＵＮＯ、ｐＤＵＯ、Ｐｓｇ５Ｌ、ｐＢＡＢＥ、ｐＷＰＸＬ、ｐＢＩ、ｐ１５ＴＶ−Ｌ、ｐＰｒｏ１８、ｐＴＤ、ｐＲＳ４２０、ｐＬｅｘＡ、ｐＡＣＴ２．２など、ならびにその他の実験室および市販のベクターなどのプラスミドを含む。適したベクターとして、プラスミドまたはウイルスベクター（例えば、複製欠損レトロウイルス、アデノウイルスおよびアデノ随伴ウイルス）を挙げることができる。
【０１１８】
抗体または抗原結合断片をコードするポリヌクレオチド配列を含むベクターは、クローニングまたは遺伝子発現のために宿主細胞に導入され得る。クローニングに適した、本明細書におけるベクター中でＤＮＡを発現する宿主細胞は、上記の原核生物、酵母または高等真核生物細胞である。この目的に適した原核生物として、グラム陰性またはグラム陽性生物などの真正細菌、例えば、エシェリキア属〔Escherichia〕、例えば、大腸菌〔E.coli〕、エンテロバクター属〔Enterobacter〕、エルウィニア属〔Erwinia〕、クレブシエラ属〔Klebsiella〕、プロテウス属〔Proteus〕、サルモネラ属〔Salmonella〕、例えば、サルモネラ・チフィリウム〔Salmonella typhimurium〕、セラチア属〔Serratia〕、例えば、セラチア・マルセッセンス〔Serratia marcescans〕および赤痢菌属〔Shigella〕ならびにＢ．スブチリス〔subtilis〕およびＢ．リケニフォルミス〔licheniformis〕などのバチルス属〔Bacilli〕、Ｐ．エルジノーサ〔aeruginosa〕などのシュードモナス属〔Pseudomonas〕およびストレプトマイセス属〔Streptomyces〕などの腸内細菌科〔Enterobacteriaceae〕が挙げられる。
【０１１９】
原核生物に加えて、糸状菌または酵母などの真核細胞微生物は、抗ＰＤ−Ｌ１抗体をコードするベクターの適したクローニングまたは発現宿主である。サッカロミセス・セレビシエ〔Saccharomyces cerevisiae〕または一般的なパン酵母は、下等真核細胞宿主微生物の中で最もよく使用されている。しかし、シゾサッカロミセス・ポンベ〔Schizosaccharomyces pombe〕；例えば、Ｋ．ラクチス〔lactis〕、Ｋ．フラギリス〔fragilis〕(ＡＴＣＣ１２，４２４)、Ｋ．ブルガリクス〔bulgaricus〕（ＡＴＣＣ１６，０４５）、Ｋ．ウィッカーアミー〔wickeramii〕（ＡＴＣＣ２４，１７８）、Ｋ．ワルチー〔waltii〕（ＡＴＣＣ５６，５００）、Ｋ．ドロソフィラルム〔drosophilarum〕（ＡＴＣＣ３６，９０６）、Ｋ．サーモトレランス〔thermotolerans〕およびＫ．マーキシアヌス〔marxianus〕などのクリベロミセス属〔Kluyveromyces〕宿主；ヤロウイア属〔yarrowia〕（ＥＰ４０２，２２６）；ピキア・パストリス〔Pichia pastoris〕（ＥＰ１８３，０７０）；カンジダ属〔Candida〕；トリコデルマ・リーゼイ〔Trichoderma reesia〕（ＥＰ２４４，２３４）；アカパンカビ〔Neurospora crassa〕；シュワニオミセス・オクシデンタリス〔Schwanniomyces occidentalis〕などのシュワニオミセス属〔Schwanniomyces〕；および例えば、アカパンカビ属〔Neurospora〕、アオカビ属〔Penicillium〕、トリポクラジウム属〔Tolypocladium〕ならびにA.ニデュランス〔A.nidulans〕およびクロコウジカビ〔A.niger〕などのアスペルギルス属〔Aspergillus〕宿主などの糸状菌などの、いくつかのその他の属、種および株が一般に入手可能であり、本明細書において有用である。
【０１２０】
本明細書において提供されるグリコシル化抗体または抗原断片の発現に適した宿主細胞は、多細胞生物に由来する。脊椎動物細胞における例として、植物および昆虫細胞が挙げられる。多数のバキュロウイルス株および変異体ならびにヨトウガ〔Spodoptera frugiperda〕（イモムシ）、ネッタイシマカ〔Aedes aegypti〕（蚊）、ヒトスジシマカ〔Aedes albopictus〕（蚊）、キイロショウジョウバエ〔Drosophila melanogaster〕（ショウジョウバエ〔fruiffly〕）およびカイコ〔Bombyx mori〕などの宿主に由来する対応する許容昆虫宿主細胞が同定されている。トランスフェクションのための種々のウイルス株、例えば、オートグラファ・カリフォルニカ〔Autographa californica〕ＮＰＶのＬ−１変異体およびカイコ〔Bombyx mori〕ＮＰＶのＢｍ−５株が公的に入手可能であり、このようなウイルスは、本明細書において、本発明に従って、特に、ヨトウガ〔Spodoptera frugiperda〕細胞のトランスフェクションのためにウイルスとして使用され得る。ワタ、トウモロコシ、ジャガイモ、ダイズ、ペチュニア、トマトおよびタバコの植物細胞培養物も宿主として使用され得る。
【０１２１】
しかし、関心は、脊椎動物細胞において最大であり、培養（組織培養）での脊椎動物細胞の増殖は、日常的な手順となった。有用な哺乳動物宿主細胞株の例として、ＳＶ４０によって形質転換されたサル腎臓ＣＶ１株（ＣＯＳ−７、ＡＴＣＣ  ＣＲＬ１６５１）；ヒト胚性腎臓株（２９３または懸濁培養における成長のためにサブクローニングされた２９３細胞、Ｇｒａｈａｍら、Ｊ．  Ｇｅｎ  Ｖｉｒｏｌ．第３６巻：５９頁（１９７７））；ベビーハムスター腎臓細胞（ＢＨＫ、ＡＴＣＣ  ＣＣＬ１０）；チャイニーズハムスター卵巣細胞／−ＤＨＦＲ（ＣＨＯ、Ｕｒｌａｕｂら、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ  第７７巻：４２１６頁（１９８０年））；マウスセルトリ細胞（ＴＭ４、Ｍａｔｈｅｒ、Ｂｉｏｌ．  Ｒｅｐｒｏｄ．第２３巻：２４３〜２５１頁（１９８０年））；サル腎臓細胞（ＣＶ１  ＡＴＣＣ  ＣＣＬ７０）；アフリカミドリザル腎臓細胞（ＶＥＲＯ−７６、ＡＴＣＣ  ＣＲＬ−１５８７）；ヒト子宮頸癌細胞（ＨＥＬＡ、ＡＴＣＣ  ＣＣＬ  ２）；イヌ腎臓細胞（ＭＤＣＫ、ＡＴＣＣ  ＣＣＬ  ３４）；バッファローラット肝臓細胞（ＢＲＬ  ３Ａ、ＡＴＣＣ  ＣＲＬ１４４２）；ヒト肺細胞（Ｗ１３８、ＡＴＣＣ  ＣＣＬ７５）；ヒト肝臓細胞（Ｈｅｐ  Ｇ２、ＨＢ  ８０６５）；マウス乳房腫瘍（ＭＭＴ  ０６０５６２、ＡＴＣＣ  ＣＣＬ５１）；ＴＲＩ細胞（Ｍａｔｈｅｒら、Ａｎｎａｌｓ  Ｎ．Ｙ．  Ａｃａｄ．  Ｓｃｉ．第３８３巻：４４〜６８頁（１９８２年））；ＭＲＣ５細胞；ＦＳ４細胞；およびヒト肝細胞腫株（Ｈｅｐ  Ｇ２）がある。いくつかの好ましい実施形態では、宿主細胞は、２９３Ｆ細胞である。
【０１２２】
宿主細胞は、抗ＰＤ−Ｌ１抗体生成のために上記の発現またはクローニングベクターを用いて形質転換され、プロモーターを誘導し、形質転換体を選択するか、または所望の配列をコードする遺伝子を増幅するために必要に応じて修飾された従来の栄養培地で培養される。
【０１２３】
本明細書において提供される抗体または抗原結合断片を生成するために使用される宿主細胞は、種々の培地で培養され得る。ＨａｍのＦ１０（Ｓｉｇｍａ）、最小必須培地（ＭＥＭ）、（Ｓｉｇｍａ）、ＲＰＭＩ−１６４０（Ｓｉｇｍａ）および「ダルベッコ改変イーグル培地」（ＤＭＥＭ）、Ｓｉｇｍａ）などの市販の培地は、宿主細胞を培養するのに適している。さらに、Ｈａｍら、Ｍｅｔｈ．Ｅｎｚ．第５８巻：４４頁（１９７９年）、Ｂａｒｎｅｓら．、Ａｎａｌ．Ｂｉｏｃｈｅｍ．第１０２巻：２５５頁（１９８０年）、米国特許第４，７６７，７０４号；同４，６５７，８６６号；同４，９２７，７６２号；同４，５６０，６５５号；または同５，１２２，４６９号；ＷＯ９０／０３４３０；ＷＯ８７／００１９５；または再発行米国特許第３０，９８５号に記載される培地のいずれも、宿主細胞のための培養培地として使用され得る。これらの培地のいずれも、必要に応じて、ホルモンおよび／またはその他の増殖因子（インスリン、トランスフェリンまたは上皮成長因子など）、塩（塩化ナトリウム、カルシウム、マグネシウムおよびリン酸など）、バッファー（ＨＥＰＥＳなど）、ヌクレオチド（アデノシンおよびチミジンなど）、抗生物質（ＧＥＮＴＡＭＹＣＩＮ（商標）薬など）、微量元素（マイクロモーラー範囲の最終濃度で通常存在する無機化合物として定義される）およびグルコースまたは同等のエネルギー供給源を用いて補給され得る。任意のその他の必要な栄養補助剤もまた、当業者に公知であろう適当な濃度で含まれ得る。温度、ｐＨなどといった培養状態は、発現のために選択された宿主細胞とともにこれまでに使用されたものであり、当業者には明らかとなろう。
【０１２４】
組換え技術を使用する場合には、抗体は、細胞膜周辺腔において細胞内で生成され得る、または培地中に直接分泌され得る。抗体が細胞内で生成される場合には、第１のステップとして、微粒子状細片、宿主細胞または溶解した断片のいずれかが例えば、遠心分離または限外濾過によって除去される。Ｃａｒｔｅｒら、Ｂｉｏ／Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ第１０巻：１６３〜１６７頁（１９９２年）には、大腸菌（Ｅ．ｃｏｌｉ）の細胞膜周辺腔に分泌される抗体を単離するための手順が記載されている。手短には、細胞ペーストが、酢酸ナトリウム（ｐＨ３．５）、ＥＤＴＡおよびフェニルメチルスルホニルフルオリド（ＰＭＳＦ）の存在下で約３０分かけて解凍される。細胞細片は、遠心分離によって除去され得る。抗体が培地中に分泌される場合には、このような発現系から得られた上清は、一般に、市販のタンパク質濃縮フィルター、例えば、ＡｍｉｃｏｎまたはＭｉｌｌｉｐｏｒｅ  Ｐｅｌｌｉｃｏｎ限外濾過ユニットを使用してまず濃縮される。タンパク質分解を阻害するために、ＰＭＳＦなどのプロテアーゼ阻害剤が前記のステップのいずれにも含まれ得、外来性の混入物質の成長を防ぐために、抗生物質が含まれ得る。
【０１２５】
細胞から調製される抗体は、例えば、ヒドロキシルアパタイトクロマトグラフィー、ゲル電気泳動、透析、ＤＥＡＥ−セルロースイオン交換クロマトグラフィー、硫酸アンモニウム沈殿、塩析およびアフィニティークロマトグラフィーを使用して精製され得、アフィニティークロマトグラフィーが好ましい精製技術である。親和性リガンドとしてのプロテインＡの適合性は、抗体中に存在する任意の免疫グロブリンＦｃドメインの種およびアイソタイプに応じて変わる。プロテインＡは、ヒトγ１、γ２またはγ４重鎖をベースとする抗体を精製するために使用され得る（Ｌｉｎｄｍａｒｋら、Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．Ｍｅｔｈ．第６２巻：１〜１３頁（１９８３年））。プロテインＧは、すべてのマウスアイソタイプに対して、およびヒトγ３に対して推奨される（Ｇｕｓｓら、ＥＭＢＯ  Ｊ．第５巻：１５６７  １５７５（１９８６年））。親和性リガンドが付着されるマトリックスは、最も多くはアガロースであるが、その他のマトリックスが利用可能である。コントロールドポアガラスまたはポリ（スチレンジビニル）ベンゼンなどの機械的に安定なマトリックスは、アガロースを用いて達成され得るものよりも迅速な流速およびより短い処理時間を可能にする。抗体がＣＨ３ドメインを含む場合には、精製にはＢａｋｅｒｂｏｎｄ  ＡＢＸ．ＴＭ．樹脂（Ｊ．Ｔ．  Ｂａｋｅｒ、Ｐｈｉｌｌｉｐｓｂｕｒｇ、Ｎ．Ｊ．）が有用である。イオン交換カラムでの分画、エタノール沈殿、逆相ＨＰＬＣ、シリカでのクロマトグラフィー、ヘパリンＳＥＰＨＡＲＯＳＥ（商標）でのクロマトグラフィー  陰イオンまたは陽イオン交換樹脂（ポリアスパラギン酸カラムなど）でのクロマトグラフィー、等電点電気泳動、ＳＤＳ−ＰＡＧＥおよび硫酸アンモニウム沈殿などのタンパク質精製のためのその他の技術も、回収されるべき抗体に応じて利用可能である。
【０１２６】
任意の予備的精製ステップ（単数または複数）後に、対象の抗体および混入物質を含む混合物は、約２．５〜４．５の間のｐＨの溶出バッファーを使用する、好ましくは、低塩濃度（例えば、約０〜０．２５Ｍの塩）で実施される低ｐＨ疎水性相互作用クロマトグラフィーに付され得る。
【０１２７】
―キット―
本開示は、抗ＰＤ−Ｌ１抗体またはその抗原結合断片を含むキットを提供する。いくつかの実施形態では、キットは、生体サンプルにおいてＰＤ−Ｌ１の存在またはレベルを検出するために有用である。生体サンプルは、細胞または組織を含み得る。
【０１２８】
いくつかの実施形態では、キットは、検出可能な標識とコンジュゲートしている抗ＰＤ−Ｌ１抗体またはその抗原結合断片を含む。特定のその他の実施形態では、キットは、未標識抗ＰＤ−Ｌ１抗体または抗原結合断片を含み、未標識抗ＰＤ−Ｌ１抗体と結合可能である二次標識抗体をさらに含む。キットは、使用の説明のおよびキット中の成分の各々を分離するパッケージをさらに含み得る。
【０１２９】
特定の実施形態では、抗ＰＤ−Ｌ１抗体またはその抗原結合断片は、ＥＬＩＳＡなどのサンドイッチアッセイにおいて、またはイムノグラフィー〔immunographic〕アッセイにおいて有用な基質またはデバイスと関連している。有用な基質またはデバイスは例えば、マイクロタイタープレートおよび試験ストリップであり得る。
【０１３０】
―医薬組成物および治療方法―
本開示は、抗ＰＤ−Ｌ１抗体またはその抗原結合断片および１種または複数の医薬上許容される担体を含む医薬組成物をさらに提供する。
【０１３１】
本明細書において開示される医薬組成物において使用するための医薬上許容される担体として、例えば、医薬上許容される液体、ゲルまたは固体担体、水性ビヒクル、非水性ビヒクル、抗菌剤、等張化剤、バッファー、抗酸化剤、麻酔剤、懸濁剤／分配剤〔dispending agents〕、封鎖剤またはキレート化剤、希釈剤、アジュバント、賦形剤または非毒性補助物質、当技術分野で公知のその他の成分またはそれらの種々の組合せを挙げることができる。
【０１３２】
適した成分として、例えば、抗酸化剤、増量剤、結合剤、崩壊剤、バッファー、保存料、滑沢剤、香味料、増粘剤、着色剤、乳化剤または糖およびシクロデキストリンなどの安定化剤を挙げることができる。適した抗酸化剤として、例えば、メチオニン、アスコルビン酸、ＥＤＴＡ、チオ硫酸ナトリウム、白金、カタラーゼ、クエン酸、システイン、チオグリセロール、チオグリコール酸、チオソルビトール、ブチル化ヒドロキシアニソール〔butylated hydroxanisol〕、ブチル化ヒドロキシトルエンおよび／または没食子酸プロピルを挙げることができる。本明細書において開示されるように、本明細書において提供されるような抗体または抗原結合断片およびコンジュゲートを含む組成物中に、メチオニンなどの１種または複数の抗酸化剤を含めることによって、抗体または抗原結合断片の酸化が減少される。酸化の低減は、結合親和性の喪失を防ぐまたは低減し、それによって、抗体安定性を改善し、有効期間を最大化する。したがって、特定の実施形態では、本明細書において開示されるような１種または複数の抗体または抗原結合断片およびメチオニンなどの１種または複数の抗酸化剤を含む組成物が提供される。抗体または抗原結合断片を、メチオニンなどの１種または複数の抗酸化剤と混合することによって、酸化を防ぐための、有効期間を延長するための、および／または本明細書において提供されるような抗体もしくは抗原結合断片の有効性を改善するための方法がさらに提供される。
【０１３３】
さらに例示するために、医薬上許容される担体として、例えば、塩化ナトリウム注射、リンゲル注射、等張性デキストロース注射、滅菌水注射またはデキストロースおよび乳酸リンゲル注射などの水性ビヒクル、植物起源の硬化油、綿実油、トウモロコシオイル、ゴマ油またはピーナッツオイルなどの非水性ビヒクル、静菌性または静真菌性濃度の抗菌剤、塩化ナトリウムまたはデキストロースなどの等張性剤、リン酸またはクエン酸バッファーなどのバッファー、重硫酸ナトリウムなどの抗酸化剤、塩酸プロカインなどの局所麻酔、ナトリウムカルボキシメチルセルロース、ヒドロキシプロピルメチルセルロースまたはポリビニルピロリドンなどの懸濁剤および分散剤、ポリソルベート８０（ＴＷＥＥＮ−８０）などの乳化剤、ＥＤＴＡ（エチレンジアミン四酢酸）またはＥＧＴＡ（エチレングリコール四酢酸）などの封鎖剤またはキレート化剤、エチルアルコール、ポリエチレングリコール、プロピレングリコール、水酸化ナトリウム、塩酸、クエン酸または乳酸を挙げることができる。担体として利用される抗菌剤は、複数回用量容器中の医薬組成物に添加され得、これとして、フェノールまたはクレゾール、水銀剤、ベンジルアルコール、クロロブタノール、メチルおよびプロピルｐ−ヒドロキシ安息香酸エステル、チメロサール、塩化ベンズアルコニウムおよび塩化ベンゼトニウムが挙げられる。適した賦形剤として、例えば、水、生理食塩水、デキストロース、グリセロールまたはエタノールを挙げることができる。適した非毒性補助物質として、例えば、湿潤剤または乳化剤、ｐＨ緩衝剤、安定化剤、溶解促進剤、または酢酸ナトリウム、モノラウリン酸ソルビタン、オレイン酸トリエタノールアミンもしくはシクロデキストリンなどの薬剤を挙げることができる。
【０１３４】
医薬組成物は、液体溶液、懸濁液、エマルジョン、丸剤、カプセル剤、錠剤、持続放出製剤または散剤であり得る。経口製剤はとして、医薬等級のマンニトール、ラクトース、デンプン、ステアリン酸マグネシウム、ポリビニルピロリドン、サッカリンナトリウム、セルロース、炭酸マグネシウムなどといった標準担体を挙げることができる。
【０１３５】
実施形態では、医薬組成物は、注射用組成物に製剤化される。注射用医薬組成物は、例えば、液体溶液、懸濁液、エマルジョンまたは液体溶液、懸濁液またはエマルジョンを作製するのに適した固体形態などの任意の従来の形態で調製され得る。注射のための調製物として、注射用に準備された滅菌および／または非発熱性溶液、皮下錠剤を含む、使用直前に溶媒と組み合わされるべく準備された凍結乾燥散剤などの滅菌乾燥可溶性製剤、注射用に準備された滅菌懸濁液、使用直前にビヒクルと組み合わされるべく準備された滅菌乾燥不溶性製剤、ならびに滅菌および／または非発熱性エマルジョンを挙げることができる。
【０１３６】
特定の実施形態では、単位用量非経口調製物は、アンプル、バイアルまたはニードルを備えたシリンジ中にパッケージングされる。非経口投与用のすべての調製物は、当技術分野で公知であり、実施されるように滅菌および非発熱性でなくてはならない。
【０１３７】
特定の実施形態では、滅菌、凍結乾燥散剤は、適した溶媒中に本明細書において開示されるような抗体または抗原結合断片を溶解することによって調製される。溶媒は、散剤または散剤から調製された再構成された溶液の安定性またはその他の薬理学的成分を改善する賦形剤を含有し得る。使用され得る賦形剤として、それだけには限らないが、水、デキストロース、ソルビトール〔sorbital〕、フルクトース、コーンシロップ、キシリトール、グリセリン、グルコース、スクロースまたはその他の適した薬剤が挙げられる。溶媒は、クエン酸、リン酸ナトリウムまたはリン酸カリウムなどのバッファーまたは、一実施形態ではおよそ中性のｐＨの、当業者に公知のその他のこのようなバッファーを含有し得る。当業者に公知の溶液のその後の滅菌濾過と、それに続く標準状態下での凍結乾燥によって、望ましい製剤が提供される。一実施形態では、得られた溶液は、凍結乾燥のためにバイアル中に配分される。各バイアルは、抗ＰＤ−Ｌ１抗体またはその抗原結合断片またはその組成物の単一投与量または複数回投与量を含有し得る。バイアルに用量または用量のセットに必要なものを上回る少量（例えば、約１０％）を過剰充填することは、正確なサンプル引き出しおよび正確な投薬を促進するために許容される。凍結乾燥散剤は、約４℃〜室温などの適当な状態下で保存され得る。
【０１３８】
注射水を用いる凍結乾燥散剤の再構成は、非経口投与において使用するための製剤を提供する。一実施形態では、再構成のために滅菌および／または非発熱性水またはその他の液体の適した担体が、凍結乾燥散剤に付加される。正確な量は、与えられている選択された療法に応じて変わり、経験的に決定され得る。
【０１３９】
本明細書において提供されるような抗体または抗原結合断片の治療上有効な量を、それを必要とする対象に投与し、それによって、ＰＤ−Ｌ１と関係する関連する状態または障害を処置または予防することを含む治療方法もまた提供される。別の態様では、本明細書において提供されるような抗体または抗原結合断片の治療上有効な量を、それを必要とする対象に投与することを含む、免疫応答の上方制御から恩恵を受ける対象における状態を処置するための方法が提供される。
【０１４０】
本明細書において提供されるような抗体または抗原結合断片の治療上有効な量は、例えば、体重、年齢および過去の病歴、現在の薬物適用、対象の健康の状態および交差反応の可能性、アレルギー、感受性および有害な副作用、ならびに投与経路および腫瘍発達の程度などの当技術分野で公知の種々の因子に応じて変わる。投与量は、これらおよびその他の状況または必要条件によって示されるように、当業者（例えば、医師または獣医師）によって比例的に低減または増大され得る。
【０１４１】
特定の実施形態では、本明細書において提供されるような抗体または抗原結合断片は、約０．０１ｍｇ／ｋｇ〜約１００ｍｇ／ｋｇ（例えば、約０．０１ｍｇ／ｋｇ、約０．５ｍｇ／ｋｇ、約１ｍｇ／ｋｇ、約２ｍｇ／ｋｇ、約５ｍｇ／ｋｇ、約１０ｍｇ／ｋｇ、約１５ｍｇ／ｋｇ、約２０ｍｇ／ｋｇ、約２５ｍｇ／ｋｇ、約３０ｍｇ／ｋｇ、約３５ｍｇ／ｋｇ、約４０ｍｇ／ｋｇ、約４５ｍｇ／ｋｇ、約５０ｍｇ／ｋｇ、約５５ｍｇ／ｋｇ、約６０ｍｇ／ｋｇ、約６５ｍｇ／ｋｇ、約７０ｍｇ／ｋｇ、約７５ｍｇ／ｋｇ、約８０ｍｇ／ｋｇ、約８５ｍｇ／ｋｇ、約９０ｍｇ／ｋｇ、約９５ｍｇ／ｋｇまたは約１００ｍｇ／ｋｇ）の治療上有効な投与量で投与され得る。これらの実施形態のうち特定のものでは、抗体または抗原結合断片は、約５０ｍｇ／ｋｇ以下の投与量で投与され、これらの実施形態のうち特定のものでは、投与量は、１０ｍｇ／ｋｇ以下、５ｍｇ／ｋｇ以下、１ｍｇ／ｋｇ以下、０．５ｍｇ／ｋｇ以下または０．１ｍｇ／ｋｇ以下である。特定の実施形態では、投薬量は、治療過程にわたって変化し得る。例えば、特定の実施形態では、初期投薬量は、その後の投薬量よりも高い場合がある。特定の実施形態では、投薬量は、対象の反応に応じて治療過程にわたって変わり得る。
【０１４２】
投与計画は、最適な望ましい応答（例えば、治療的応答）を提供するように調整され得る。例えば、単回用量が投与され得、または数回の分割用量が経時的に投与され得る。
【０１４３】
本明細書において開示される抗体および抗原結合断片は、例えば、非経口（例えば、皮下、腹腔内、静脈内注入を含む静脈内、筋肉内または皮内注射）または非経口ではない（例えば、経口、鼻腔内、眼球内、舌下、直腸内または局所）経路などの当技術分野で公知の任意の経路によって投与され得る。
【０１４４】
ＰＤ−Ｌ１と関連する状態および障害は、免疫関係疾患または障害であり得る。特定の実施形態では、ＰＤ−Ｌ１関連状態および障害として、腫瘍および癌、例えば、非小細胞肺癌、小細胞肺癌、腎細胞癌、結腸直腸癌、卵巣癌、乳癌、膵臓癌、胃癌腫、膀胱癌、食道癌、中皮腫、黒色腫、頭頸部癌、甲状腺癌、肉腫、前立腺癌、神経膠芽腫、子宮頸癌、胸腺癌腫、白血病、リンパ腫、骨髄腫、菌状息肉腫〔mycoses fungoids〕、メルケル細胞癌および古典的なホジキンリンパ腫（ＣＨＬ）などのその他の血液悪性腫瘍、原発性縦隔大細胞型Ｂ細胞リンパ腫、Ｔ細胞／組織球豊富型Ｂ細胞リンパ腫、ＥＢＶ陽性および陰性ＰＴＬＤならびにＥＢＶ関連びまん性大細胞型Ｂ細胞リンパ腫（ＤＬＢＣＬ）、形質芽球性リンパ腫、節外性ＮＫ／Ｔ細胞リンパ腫、上咽頭癌腫およびＨＨＶ８関連原発性滲出リンパ腫、ホジキンリンパ腫、原発性ＣＮＳリンパ腫などの中枢神経系（ＣＮＳ）の新生物、脊髄軸腫瘍、脳幹神経膠腫が挙げられる。特定の実施形態では、腫瘍および癌は、転移性、特に、ＰＤ−Ｌ１を発現する転移性腫瘍である。特定の実施形態では、ＰＤ−Ｌ１関連状態および障害として、全身性エリテマトーデス（ＳＬＥ）、乾癬、全身性強皮症、自己免疫糖尿病などといった自己免疫疾患が挙げられる。特定の実施形態では、ＰＤ−Ｌ１関連状態および障害として、慢性ウイルス感染、例えば、Ｂ型肝炎、Ｃ型肝炎、ヘルペスウイルス、エプスタイン−バーウイルス、ＨＩＶ、サイトメガロウイルス、１型単純ヘルペスウイルス、２型単純ヘルペスウイルス、ヒトパピローマウイルス、アデノウイルス、カポジウエスト〔Kaposi West〕肉腫関連ヘルペスウイルス伝染病、シンリングウイルス〔thin ring virus〕（トルクテノウイルス）、ＪＣウイルスまたはＢＫウイルスのウイルス感染などの感染性疾患が挙げられる。
【０１４５】
―使用方法―
本開示は、抗ＰＤ−Ｌ１抗体またはその抗原結合断片を使用する方法をさらに提供する。
【０１４６】
いくつかの実施形態では、本開示は、抗ＰＤ−Ｌ１抗体またはその抗原結合断片の治療上有効な量を投与することを含む、個体においてＰＤ−Ｌ１と関係する関連する状態または障害を処理する方法を提供する。特定の実施形態では、個体はＰＤ−Ｌ１アンタゴニストに対して応答する可能性が高い障害または状態を有すると同定されている。
【０１４７】
対象の生体サンプル上のＰＤ−Ｌ１の存在またはレベルは、生体サンプルが由来する個体が、ＰＤ−Ｌ１アンタゴニストに対して応答できる可能性が高いか否かを示し得る。個体から得られた試験生体サンプル中のＰＤ−Ｌ１の存在またはレベルを調べるために種々の方法が使用され得る。例えば、試験生体サンプルは、発現されたＰＤ−Ｌ１タンパク質と結合し、それを検出する抗ＰＤ−Ｌ１抗体またはその抗原結合断片に対して曝露され得る。あるいは、ＰＤ−Ｌ１はまた、ｑＰＣＲ、逆転写酵素ＰＣＲ、マイクロアレイ、ＳＡＧＥ、ＦＩＳＨなどといった方法を使用して核酸発現レベルで検出され得る。いくつかの実施形態では、試験サンプルは、癌細胞または組織または腫瘍浸潤免疫細胞に由来する。特定の実施形態では、試験生体サンプル中のＰＤ−Ｌ１の存在または上方制御されたレベルは、応答性の見込みを示す。用語「上方制御された」とは、本明細書において、本明細書において提供される抗体または抗原結合断片を使用して検出されるような試験サンプル中のＰＤ−Ｌ１のタンパク質レベルの、同一抗体を使用して検出されるような参照サンプル中のＰＤ−Ｌ１タンパク質レベルと比較した１０％、１５％、２０％、２５％、３０％、３５％、４０％、４５％、５０％、５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％以上またはそれを超える全体的な増大を指す。参照サンプルは、健常もしくは非疾患の個体、または試験サンプルが得られている同一個体から得られた健常もしくは非疾患のサンプルから得られた対照サンプルであり得る。例えば、参照サンプルは、試験サンプル（例えば、腫瘍）に隣接する、またはその近隣の非疾患サンプルであり得る。
【０１４８】
本明細書において開示される抗体または抗原結合断片は、単独で、または１種もしくは複数のさらなる治療手段または薬剤と組み合わせて投与され得る。例えば、本明細書において開示される抗体または抗原結合断片は、化学療法、放射線療法、癌の治療のための手術（例えば、腫瘍摘出）、１種または複数の制吐剤または化学療法に起因する合併症のその他の処置、または癌もしくはＰＤ−Ｌ１によって媒介される任意の医学的障害の処置において使用するための任意のその他の治療薬と組み合わせて投与され得る。これらの実施形態のうち特定のものでは、１種または複数のさらなる治療薬と組み合わせて投与される本明細書において開示されるような抗体または抗原結合断片は、１種または複数のさらなる治療薬と同時に投与され得、これらの実施形態のうち特定のものでは、抗体または抗原結合断片およびさらなる治療薬（単数または複数）は、同一医薬組成物の一部として投与され得る。しかし、別の治療薬と「組み合わせて」投与される抗体または抗原結合断片は、薬剤と同時に、または薬剤と同一組成物中で投与されなくてもよい。別の薬剤に先立って、またはその後に投与される抗体または抗原結合断片は、抗体または抗原結合断片および第２の薬剤が、異なる経路によって投与される場合でさえ、その語句が本明細書において使用される場合、その薬剤と「組み合わせて」投与されると考えられる。可能であれば、本明細書において開示される抗体または抗原結合断片と組み合わせて投与されるさらなる治療薬は、さらなる治療薬の英文添付文書に列挙されるスケジュールに従って、またはＰｈｙｓｉｃｉａｎｓ’  Ｄｅｓｋ  Ｒｅｆｅｒｅｎｃｅ  ２００３年（Ｐｈｙｓｉｃｉａｎｓ’  Ｄｅｓｋ  Ｒｅｆｅｒｅｎｃｅ、第５７版；  Ｍｅｄｉｃａｌ  Ｅｃｏｎｏｍｉｃｓ  Ｃｏｍｐａｎｙ；  ＩＳＢＮ：  １５６３６３４４５７；  第５７版（２００２年１１月））もしくは当技術分野で周知のプロトコールに従って投与される。
【０１４９】
特定の実施形態では、治療薬は、癌に対する免疫応答を誘導またはブーストし得る。例えば、腫瘍ワクチンは、特定の腫瘍または癌に対する免疫応答を誘導するために使用され得る。サイトカイン療法はまた、免疫系に対する腫瘍抗原提示を増強するために使用され得る。サイトカイン療法の例として、制限するものではないが、インターフェロン−α、−βおよび−γなどのインターフェロン、マクロファージ−ＣＳＦ、顆粒球マクロファージＣＳＦおよび顆粒球ＣＳＦなどのコロニー刺激因子、ＩＬ−１、ＩＬ−１α、ＩＬ−２、ＩＬ−３、ＩＬ−４、ＩＬ−５、ＩＬ−６、ＩＬ−７、ＩＬ−８、ＩＬ−９、ＩＬ−１０、ＩＬ−１１およびＩＬ−１２のようなインターロイキン、ＴＮＦ−αおよびＴＮＦ−βなどの腫瘍壊死因子が挙げられる。免疫抑制標的を不活性化する薬剤、例えば、ＴＧＦ−β阻害剤、ＩＬ−１０阻害剤およびＦａｓリガンド阻害剤もまた使用され得る。薬剤の別の群として、腫瘍または癌細胞に対する免疫応答性を活性化するもの、例えば、Ｔ細胞活性化を増強するもの（例えば、ＣＴＬＡ−４、ＩＣＯＳおよびＯＸ−４０などのＴ細胞共刺激分子のアゴニスト）ならびに樹状細胞機能および抗原提示を増強するものが挙げられる。
【０１５０】
本開示は、ＰＤ−Ｌ１アンタゴニストを用いて処置された対象における、治療的応答または疾患進行をモニタリングする方法であって、抗ＰＤ−Ｌ１抗体またはその抗原結合断片を用いて個体から得た試験生体サンプル中のＰＤ−Ｌ１の存在またはレベルを調べることを含む方法をさらに提供する。特定の実施形態では、方法は、試験生体サンプル中のＰＤ−Ｌ１レベルを、同一個体からこれまでに得られた比較可能なサンプル中のＰＤ−Ｌ１レベルと比較することをさらに含み、試験生体サンプル中のＰＤ−Ｌ１レベルの低減または増大の減速もしくは増大の停止は、正の治療的応答または制御された疾患進行を示す。比較可能なサンプルは、試験サンプルと同一の種類のサンプルであり得るが、処置の前に、または処置の早期段階の間に同一個体から得られている。
【０１５１】
以下の実施例は、特許請求された本発明をより良好に例示するために提供され、本発明の範囲を制限すると解釈されてはならない。以下に記載されるすべての特定の組成物、材料および方法は、全体で、または一部で本発明の範囲内に入る。これらの特定の組成物、材料および方法は、本発明を制限するものではなく、単に、本発明の範囲内に入る特定の実施形態を例示するものである。当業者は、発明の能力を行使することなく、本発明の範囲から逸脱することなく、同等の組成物、材料および方法を開発し得る。本発明の範囲内にとどまりながら本明細書に記載される手順において多数の変法を行うことができるということは理解されよう。このような変法が本発明の範囲内に含まれることは本発明者らの意図である。
【実施例】
【０１５２】
［実施例１］抗体ハイブリドーマ作製
１．１  免疫処置：雌のＯＭＴラット（Ｏｐｅｎ  Ｍｏｎｏｃｌｏｎａｌ  Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ、Ｉｎｃ．、米国、パロアルトから入手、８〜１０週齢）を、足蹠注射による、１０μｇのＴｉｔｅｒＭａｘ中のヒトＰＤ−Ｌ１  ＥＣＤタンパク質を用いて抗原刺激し、次いで、融合の準備が整うまで、３日毎に足蹠注射によるリン酸アルミニウムゲルアジュバント中のＰＤ−Ｌ１  ＥＣＤタンパク質を用いてブーストした。抗ＰＤ−Ｌ１抗体血清力価を２週間毎にＥＬＩＳＡまたはＦＡＣＳによって調べた。
【０１５３】
１．２  細胞融合：融合の３日前に、腹膜内注射によって、１０μｇのＰＢＳ中のヒトＰＤ−Ｌ１  ＥＣＤタンパク質を用いて動物に最後の追加免疫を施した。融合の当日に、リンパ節を採取し、調製して、単細胞懸濁液を得た。得られたリンパ球を、骨髄腫細胞（Ｐ３）と適切な割合で混合した。細胞混合物を洗浄し、ＥＣＦ溶液に２．０×１０6個細胞／ｍＬで再懸濁した。融合はＢＴＸ  ２０００電気機器を使用することによって実施した。
【０１５４】
１．３  ハイブリドーマ上清の一次および二次スクリーニング：３７℃で７〜１４日間培養した後、Ｍｉｒｒｏｒｂａｌｌ解析を使用することによってハイブリドーマ上清の一部を調べた。手短には、ハイブリドーマ上清を、１ＸＰＢＳで５倍希釈した。ＰＤ−Ｌ１を発現するＣＨＯ−Ｋ１細胞を、二次蛍光色素標識された抗体およびＤｒａＱ５と混合した。３８４ウェルプレートの各ウェル中に、２０μＬの細胞混合物および２０μＬの希釈したハイブリドーマ上清サンプルを添加し、Ｍｉｒｒｏｒｂａｌｌ（登録商標）高感受性マイクロプレート血球計算器での解析の準備が整うまで、暗所、室温で少なくとも２時間インキュベートした。ＰＤ−Ｌ１を発現するＣＨＯ−Ｋ１細胞を使用するＦＡＣＳによって正のヒットを確認した。ハイブリドーマ上清サンプルを用いて細胞を染色し、続いて、ＦＩＴＣがコンジュゲートしているヤギ抗マウスＩｇＧ  Ｆｃを用いる二次抗体染色をした。対応する親細胞株を陰性対照として使用した。ＢＤ  Ｂｉｏｓｃｉｅｎｃｅｓ  ＦＡＣＳＣａｎｔｏ  ＩＩおよびＦｌｏｗＪｏバージョンソフトウェアを使用することによって染色された細胞を解析した。
【０１５５】
１．４  サブクローン：ＰＤ−Ｌ１を発現する細胞との正の結合が確認されたハイブリドーマ細胞株をサブクローニングのために使用した。手短には、各ハイブリドーマ細胞株について、細胞をカウントし、希釈して、クローニング培地中、２００μＬあたり５または１個の細胞を得た。２００μＬ／ウェルを９６ウェルプレート中にプレーティングする。以下の解析の準備が整うまでプレートを３７℃、５％  ＣＯ2でインキュベートした。
【０１５６】
１．５  アイソタイプ試験：ＥＬＩＳＡプレートを、５０μＬ／ウェルのヤギ抗ラットＩｇＧ１、ＩｇＧ２ａ、ＩｇＧ２ｂ、ＩｇＧ３、ＩｇＡおよびＩｇＭ抗体を、それぞれ、１μｇ／ｍＬで用いてコーティングした。ブロッキング後、各ウェルに５０μＬのハイブリドーマ上清サンプルを添加し、室温で２時間インキュベートした。ヤギ抗ラットκ軽鎖ＨＲＰを、検出抗体として使用した。ＴＭＢ基質を１０分間使用して呈色反応を発色させ、２Ｍ  ＨＣｌによって停止した。次いで、プレートを、ＥＬＩＳＡマイクロプレートリーダーで４５０ｎｍで読み取った。
【０１５７】
１．６  細胞ベースの結合アッセイ：完全ヒト抗体の標的との結合活性を調べるために、ヒトＰＤ−Ｌ１を発現するＣＨＯ−Ｋ１細胞または成熟樹状細胞（ｍＤＣ）を、完全ヒト抗体を用いて染色し、続いて、ＦＩＴＣがコンジュゲートしているヤギ抗ヒトＩｇＧ  Ｆｃを用いる二次抗体染色をした。対応する親細胞株を陰性対照として使用した。ＢＤ  Ｂｉｏｓｃｉｅｎｃｅｓ  ＦＡＣＳＣａｎｔｏ  ＩＩおよびＦｌｏｗＪｏバージョンソフトウェアを使用することによって染色された細胞を解析した。
【０１５８】
全長ヒトＰＤ−Ｌ１を用いてトランスフェクトされたＣＨＯ細胞を、ラットハイブリドーマから得たヒトＰＤ−Ｌ１に対する抗体を用いて染色し、ＦＩＴＣがコンジュゲートしているヤギ抗ラットＩｇＧ  Ｆｃを用いる二次抗体染色を続け、ＦＡＣＳによって解析した。図１に示されるように、抗体１．４．１、１．１４．４、１．２０．１５および１．４６．１１は、ＣＨＯ細胞上に発現されたＰＤ−Ｌ１と、約１ｎＭのＥＣ５０値で特異的に結合した。
【０１５９】
［実施例２］Ｆｃ部分の変更および精製
次いで、２９３Ｆ細胞培養上清中の抗体を、プロテインＡアフィニティークロマトグラフィーを使用することによって精製した。
【０１６０】
［実施例３］完全ヒト抗体特性決定
３．１  ＦＡＣＳによる競合アッセイ：完全ヒト抗体が、ＰＤ−Ｌ１のＰＤ−１との結合を遮断できるか否かを調べるために、ヒトＰＤ−Ｌ１を発現するＣＨＯ−Ｋ１細胞を、種々の濃度の完全ヒト抗体とともに４℃で１時間インキュベートした。結合していない抗体を洗浄除去し、次いで、細胞に、マウスＦｃタグが付けられたヒトＰＤ−１を添加した。ＦＩＴＣがコンジュゲートしているヤギ抗マウスＩｇＧを使用することによって、ヒトＰＤ−１のＰＤ−Ｌ１を発現する細胞との結合を検出し、続いて、ＢＤ  Ｂｉｏｓｃｉｅｎｃｅｓ  ＦＡＣＳＣａｎｔｏ  ＩＩおよびＦｌｏｗＪｏバージョンソフトウェアを使用する解析をした。
【０１６１】
ヒトＰＤ−Ｌ１を発現するＣＨＯ細胞を、種々の濃度の完全ヒト抗体（１．４．１、１．１４．４、１．２０．１５および１．４６．１１）とともにインキュベートした。次いで、細胞に、マウスＦｃタグが付けられたヒトＰＤ−１を添加した。ＦＩＴＣがコンジュゲートしているヤギ抗マウスＩｇＧを使用することによって、ヒトＰＤ−１のＰＤ−Ｌ１を発現する細胞との結合を検出し、続いて、ＦＡＣＳ解析をした。図２に示されるように、すべての試験された完全ヒトＰＤ−Ｌ１抗体が、トランスフェクトされたＣＨＯ細胞上に発現されたＰＤ−Ｌ１とのＰＤ−１結合を遮断し、１．１４．４、１．２０．１５および１．４６．１１は、約１０ｎＭのＩＣ５０値を示した。
【０１６２】
３．２  表面プラズモン共鳴（ＳＰＲ）による親和性試験：ＰｒｏｔｅＯｎ  ＸＰＲ３６（Ｂｉｏ−Ｒａｄ）を使用するＳＰＲアッセイによって、ＰＤ−Ｌ１に対する親和性および結合動態学について抗体を特性決定した。プロテインＡタンパク質（Ｓｉｇｍａ）を、アミンカップリングによってＧＬＭセンサーチップ（Ｂｉｏ−Ｒａｄ）に固定化した。精製された抗体をセンサーチップ上に流し、プロテインＡによって捕獲させた。チップを９０°回転し、ベースラインが安定となるまでランニングバッファー（１ＸＰＢＳ／０．０１％  Ｔｗｅｅｎ２０、Ｂｉｏ−Ｒａｄ）で洗浄した。２４０秒の結合相と、それに続く６００秒の解離の間、流速１００μＬ／分で、抗体フローセルに対して５種の濃度のヒトＰＤ−Ｌ１およびランニングバッファーを流した。各実施後に、ｐＨ１．７のＨ3ＰＯ4を用いてチップを再生した。結合および解離曲線を、ＰｒｏｔｅＯｎソフトウェアを使用して１：１  Ｌａｎｇｍｉｕｒ結合モデルにフィッティングした。
【０１６３】
図５に示されるように、組換えヒトＰＤ−Ｌ１に対する完全ヒトＰＤ−Ｌ１抗体の親和性は、表面プラズモン共鳴によって測定されるものとして、４．７８Ｅ−１０〜２．２６Ｅ−１０ｍｏｌ／Ｌであった。
【０１６４】
３．３  ＦＡＣＳによる親和性試験：ヒトＰＤ−Ｌ１を発現するＣＨＯ−Ｋ１細胞を使用するＦＡＣＳ解析によって、細胞表面ＰＤ−Ｌ１に対する抗体結合親和性を実施した。試験された抗体は、洗浄バッファー（１ＸＰＢＳ／１％ＢＳＡ）で段階希釈された２種のうちの１種であり、細胞とともに４℃で１時間インキュベートした。二次抗体ヤギ抗ヒトＩｇＧ  Ｆｃ  ＦＩＴＣ（Ｊａｃｋｓｏｎ  Ｉｍｍｕｎｏｒｅｓｅａｒｃｈ  Ｌａｂ）を添加し、暗所、４℃で１時間インキュベートした。次いで、細胞を１回洗浄し、１ＸＰＢＳ／１％ＢＳＡに再懸濁し、フローサイトメトリー（ＢＤ）によって解析した。定量的ビーズＱｕａｎｔｕｍＴＭ  ＭＥＳＦキット（Ｂａｎｇｓ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｉｅｓ、Ｉｎｃ．）に基づいて、蛍光強度が結合している分子／細胞に変換される。Ｇｒａｐｈｐａｄ  Ｐｒｉｓｍ５を使用してＫＤを算出した。
【０１６５】
３．４  ｉｎ  ｖｉｔｒｏ機能アッセイ：サイトカイン生成および細胞増殖を含むＴ細胞応答性の調節における完全ヒト抗体の能力を評価するために、以下の３種のアッセイを実施した。
【０１６６】
３．４．１  同種異系ＭＬＲ：ヒト単球濃縮キットを製造業者の使用説明書に従って使用して、健常ドナーから単球を単離した。細胞を５〜７日間培養して、樹状細胞（ＤＣ）に分化させた。使用の１８〜２４時間前に、細胞培養物に１μｇ／ｍｌのＬＰＳを添加して、ＤＣの成熟を誘導した。
【０１６７】
ヒトＣＤ４+Ｔ細胞濃縮キットを製造業者のプロトコールに従って使用して、ＣＤ４+Ｔ細胞を単離し、次いで、完全ヒト抗体または対照Ａｂの存在下または不在下で成熟または未熟同種異系ＤＣを用いて刺激した。培養上清中のＩＬ−２およびＩＦＮγのレベルを、ＥＬＩＳＡによって、それぞれ３日目および５日目に測定した。［3Ｈ］チミジン組込みによってＣＤ４+Ｔ細胞の増殖を評価した。
【０１６８】
図９に示されるように、すべての試験された完全ヒトＰＤ−Ｌ１抗体（１．４．１、１．１４．４、１．２０．１５および１．４６．１１）が、ＩＬ−２分泌を用量的に増大した。図８に示されるように、すべての試験された完全ヒトＰＤ−Ｌ１抗体（１．４．１、１．１４．４、１．２０．１５および１．４６．１１）は、ＩＦＮγ分泌を用量的に増大した。図１０に示されるように、すべての試験された完全ヒトＰＤ−Ｌ１抗体（１．４．１、１．１４．４、１．２０．１５および１．４６．１１）は、濃度依存性Ｔ細胞増殖を増強した。
【０１６９】
３．４．２  自己Ａｇ特異的免疫応答：同一ドナーからＰＢＭＣおよび単球を単離した。ＣＭＶ  ｐｐ６５ペプチドおよび低用量のＩＬ２（２０Ｕ／ｍｌ）の存在下でＰＢＭＣを培養した。その間に、単球を、先に記載されたように培養することによってＤＣを作製した。５日後、ＤＣにｐｐ６５ペプチドをパルスし、次いで、完全ヒト抗体または対照Ａｂの存在下または不在下でＣＤ４+Ｔ細胞に添加した。それぞれ、３日目および５日目にＥＬＩＳＡによって培養上清中のＩＬ−２およびＩＦＮγのレベルを測定した。［3Ｈ］チミジン組込みによってＣＭＶｐｐ６５特異的ＣＤ４+Ｔ細胞の増殖を評価した。
【０１７０】
図６に示されるように、特異的Ｔ細胞応答におけるＩＦＮγ生成は、完全ヒトＰＤ−Ｌ１抗体（１．４．１、１．１４．４、１．２０．１５および１．４６．１１）によって増強された。図７は、完全ヒトＰＤ−Ｌ１抗体が、ＣＭＶ  ｐｐ６５ペプチドが付加された自己ＤＣで刺激された、濃度依存性ＣＭＶ+−ＣＤ４+Ｔ細胞増殖を増強したことを示す。
【０１７１】
３．４．３  Ｔｒｅｇ抑制アッセイ：制御性Ｔ細胞（Ｔｒｅｇ）は、重要な免疫モジュレーターであり、自己寛容の維持において重要な役割を果たす。ＣＤ４+ＣＤ２５+  Ｔｒｅｇは、複数の癌を有する患者においてＴｒｅｇ数の増大が見られたので腫瘍と関連しており、より悪い予後と関連している。本発明者らは、Ｔｒｅｇの阻害機能に対する抗ヒトＰＤ−Ｌ１完全ヒト抗体の効果を直接評価するために、完全ヒト抗体または対照Ａｂの存在下または不在下でＴｒｅｇの機能を比較した。手短には、ＭＡＣＳによって、ＣＤ４+ＣＤ２５+  ＴｒｅｇおよびＣＤ４+ＣＤ２５Ｔ細胞を分離した。ＣＤ４+ＣＤ２５+  ＴｒｅｇおよびＣＤ４+ＣＤ２５Ｔ細胞（Ｔｒｅｇ：Ｔｅｆｆ  １：１比）を、種々の濃度の完全ヒト抗体または対照Ａｂの存在下または不在下で同種異系のｍＤＣと同時培養した。抗体なしまたはアイソタイプ抗体のいずれかを陰性対照として使用した。サイトカイン生成およびＴ細胞増殖を、これまでに記載したように測定した。
【０１７２】
図１１に示されるように、ＰＤ−Ｌ１抗体１．２０．１５は、Ｔｒｅｇの抑制機能を抑制し、応答するＴ細胞増殖およびＩＦＮγ分泌を回復させた。
【０１７３】
３．５  抗体依存性細胞媒介性細胞傷害性（ＡＤＣＣ）および補体依存性細胞傷害性（ＣＤＣ）アッセイ：ヒトＰＤ−Ｌ１は、種々の細胞種で、健常および腫瘍細胞の両方で発現されるので、健常ＰＤ−Ｌ１+細胞に対する望まれない毒性を最小化するために、選択された抗ＰＤ−Ｌ１完全ヒト抗体を、ＡＤＣＣおよびＣＤＣ機能を有さないと確認した。
【０１７４】
３．５．１  ＡＤＣＣ：標的細胞（ｍＤＣ）および種々の濃度の完全ヒト抗体を、９６ウェルプレート中で３０分間プレインキュベートし、次いで、ＩＬ−２によって活性化されたＰＢＭＣ（エフェクター）を５０：１のエフェクター／標的比で添加した。プレートを５％  ＣＯ2インキュベーター中で３７℃で６時間インキュベートした。細胞傷害性検出キット（Ｒｏｃｈｅ）によって標的細胞溶解を調べた。Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｄｅｖｉｃｅｓ  ＳｐｅｃｔｒａＭａｘ  Ｍ５ｅプレートリーダーによって光学濃度を測定した。対照ｈＡｂ（ＩｇＧ１）および対照ｈＡｂ（ＩｇＧ４）を、それぞれ、陽性および陰性対照として使用した。
【０１７５】
ナチュラルキラー（ＮＫ）細胞の供給源として、ＩＬ−２によって活性化されたＰＢＭＣを、および標的細胞として高レベルの細胞表面ＰＤ−Ｌ１を発現するｍＤＣを使用したとき、完全ヒトＰＤ−Ｌ１抗体（１．４．１、１．１４．４、１．２０．１５および１．４６．１１）は、ＡＤＣＣを媒介しなかった（図１２）。
【０１７６】
３．５．２  ＣＤＣ：９６ウェルプレート中で、標的細胞（ｍＤＣ）、希釈されたヒト血清補体（Ｑｕｉｄｅｌ−Ａ１１２）および種々の濃度の完全ヒト抗体を混合した。プレートを、５％  ＣＯ2インキュベーター中で３７℃で４時間インキュベートした。ＣｅｌｌＴｉｔｅｒ  ｇｌｏ（Ｐｒｏｍｅｇａ−Ｇ７５７３）によって標的細胞溶解を調べた。リツキサン（Ｒｏｃｈｅ）およびヒトＢリンパ腫細胞株Ｒａｊｉ（ＣＤ２０陽性）を陽性対照として使用した。図１３に示されるように、完全ヒトＰＤ−Ｌ１抗体は、ＣＤＣを媒介しなかった。
【０１７７】
３．６  ＦＡＣＳによる結合試験：完全ヒト抗体が、ベンチマーク抗体と同一のエピトープビン中にあるか否かを調べるために、ヒトＰＤ−Ｌ１を発現するＣＨＯ−Ｋ１細胞を、種々の濃度の完全ヒト抗体とともに４℃で１時間インキュベートした。結合していない抗体を洗浄除去し、次いで、細胞にビオチンタグが付けられた対照Ａｂを添加した。ＰＥがコンジュゲートしているストレプトアビジンを使用することによって、ビオチンタグが付けられた対照Ａｂの、ＰＤ−Ｌ１発現細胞との結合を検出し、続いて、ＢＤ  Ｂｉｏｓｃｉｅｎｃｅｓ  ＦＡＣＳＣａｎｔｏ  ＩＩおよびＦｌｏｗＪｏバージョンソフトウェアを使用する解析をした。
【０１７８】
結合試験の結果は、完全ヒトＰＤ−Ｌ１抗体（すなわち、１．４．１、１．１４．４、１．２０．１５および１．４６．１１）によって結合されるヒトＰＤ−Ｌ１上のエピトープは、既存のＰＤ−Ｌ１抗体（すなわち、ベンチマーク抗体）とは異なることを示した。
【０１７９】
３．７  種間結合アッセイ：ＡｂのカニクイザルおよびマウスＰＤ−Ｌ１に対する交差反応性を、ＥＬＩＳＡによって測定した。ヒト、サルおよびマウスＰＤ−Ｌ１を、それぞれＥＬＩＳＡプレート上にコーティングした。ブロッキング後、プレート中に完全ヒト抗体を添加し、室温で少なくとも２時間インキュベートした。ヤギ抗ヒトＩｇＧ  Ｆｃ−ＨＲＰを使用することによって、抗体の、コーティングされた抗原との結合を検出した。ＴＭＢ基質を使用して呈色反応を発色させ、２Ｍ  ＨＣｌによって停止した。ＥＬＩＳＡプレートを、Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｄｅｖｉｃｅ  Ｍ５ｅマイクロプレートリーダーを使用して４５０ｎｍで解析した。
【０１８０】
図４に示されるように、ＥＬＩＳＡ実験の結果は、試験された完全ヒトＰＤ−Ｌ１は、カニクイザルＰＤ−Ｌ１と用量依存的に結合したことを実証した。しかし、試験された抗体（１．４．１、１．１４．４、１．２０．１５および１．４６．１１）の中にマウスＰＤ−Ｌ１と結合するものはなかった。
【０１８１】
３．８  ＦＡＣＳによるファミリー間結合アッセイ：完全ヒト抗体のファミリー間結合活性を調べるために、ＰＤ−Ｌ２を発現する細胞株を完全ヒト抗体を用いて染色し、続いて、ＦＩＴＣがコンジュゲートしているヤギ抗ヒトＩｇＧ  Ｆｃを用いる二次抗体染色をした。ＰＤ−Ｌ１を発現する細胞を、陽性対照として使用した。対応する親細胞株を陰性対照として使用した。ＢＤ  Ｂｉｏｓｃｉｅｎｃｅｓ  ＦＡＣＳＣａｎｔｏ  ＩＩおよびＦｌｏｗＪｏバージョンソフトウェアを使用することによって染色された細胞を解析した。
【０１８２】
ＰＤ−Ｌ１またはＰＤ−Ｌ２を用いてトランスフェクトされたＣＨＯ細胞を、完全ヒトＰＤ−Ｌ１抗体を用いて染色し、ＦＡＣＳによって解析した。図３に示されるように、完全ヒトＰＤ−Ｌ１抗体は、ＰＤ−Ｌ１と特異的に結合したが、ＰＤ−１リガンドファミリーのＰＤ−Ｌ２とは結合しなかった。
【０１８３】
［実施例４］完全ヒト抗体のエピトープマッピング
本明細書において提供される本発明の抗体１．１４．４のエピトープを調べるために、１．１４．４を使用してｈＰＤ−１でアラニンスキャニング実験および抗体結合に対する効果評価を実施した。
【０１８４】
ｈＰＤ−Ｌ１でのアラニンスキャニング実験を実施し、抗体結合に対するその効果を評価した。ｈＰＤ−Ｌ１上のアラニン残基を、グリシンコドンに変異させ、すべてのその他の残基をアラニンコドンに変異させた。ｈＰＤ−Ｌ１細胞外ドメイン（ＥＣＤ）の各残基について、２つの連続ＰＣＲステップを使用して点アミノ酸置換を行った。ヒトＰＤ−Ｌ１のＥＣＤおよびＣ末端ＨｉｓタグをコードするｐｃＤＮＡ３．３−ｈＰＤ−Ｌ１＿ＥＣＤ．Ｈｉｓプラスミドを鋳型として使用し、変異原性プライマーのセットを、ＱｕｉｋＣｈａｎｇｅ  ｌｉｇｈｔｎｉｎｇ多重部位特異的変異誘発キット（Ａｇｉｌｅｎｔ  ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ、カリフォルニア州、パロアルト）を使用する第１のステップＰＣＲに使用した。Ｄｐｎ  Ｉエンドヌクレアーゼを使用して、変異体鎖合成反応後に親鋳型を消化した。第２ステップＰＣＲでは、ＣＭＶプロモーター、ＰＤ−Ｌ１の細胞外ドメイン（ＥＣＤ）、Ｈｉｓタグおよび単純ヘルペスウイルスチミジンキナーゼ（ＴＫ）ポリアデニル化から構成される直線ＤＮＡ発現カセットを増幅し、ＨＥＫ２９３Ｆ細胞（Ｌｉｆｅ  Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ、Ｇａｉｔｈｅｒｓｂｕｒｇ、ＭＤ）において一時的に発現させた。
【０１８５】
ＥＬＩＳＡ結合アッセイのプレート中にモノクローナル抗体１．１４．４をコーティングした。定量化されたＰＤ−Ｌ１変異体またはヒト／マウスＰＤ−Ｌ１＿ＥＣＤ．Ｈｉｓタンパク質（Ｓｉｎｏ  Ｂｉｏｌｏｇｉｃａｌ、Ｃｈｉｎａ）を含有する上清と相互作用させた後、ＨＲＰがコンジュゲートしている抗Ｈｉｓ抗体（１：５０００；Ｒｏｃｋｌａｎｄ  Ｉｍｍｕｎｏｃｈｅｍｉｃａｌｓ、ペンシルバニア州、ポッツタウン）を検出抗体として添加した。対照変異体の平均に従って吸光度を正規化した。結合変化倍数に対するさらなるカットオフ（＜０．５５）を設定した後、最終決定エピトープ残基を同定した。
【０１８６】
抗体１．１４．４の、ヒトおよびマウスＰＤ−Ｌ１の両方に対する結合活性を実施した（図１４）。本発明らのリード１．１４．４は、ヒトＰＤ−Ｌ１（図１４Ａ）と結合するとわかったが、マウスＰＤ−Ｌ１とは結合しなかった（図１４Ｂ）。
【０１８７】
抗体結合に対する１３１ＰＤ−Ｌ１点変異の効果を表２に示す。ｈＰＤ−Ｌ１結晶構造（ＰＤＢコード３ＢＩＫおよび４ＺＱＫ）上のすべてのこれらの残基の位置を調べることによって、いくつかのアミノ酸（例えば、Ｇｌｙ１５９、Ｔｙｒ１６０、Ｐｒｏ１６１）は、任意の抗体と直接接触する可能性が低いことが示された。観察された結合の低減は、おそらくは、アラニン置換後のｈＰＤ−Ｌ１構造の不安定性または崩壊にさえ起因していた。結合変化倍数にさらなるカットオフ（＜０．５５）を設定した後に、最終決定エピトープ残基を表３に列挙した。それらは、１．１４．４に対する６つの位置である。
【０１８８】
したがって、表３中のすべてのデータを、ｈＰＤ−Ｌ１の結晶構造上にマッピングして、良好な可視化および比較を行った（図１５）。
【０１８９】
【表２−１】
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【表２−２】
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【表２−３】
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【０１９０】
【表３】
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【０１９１】
図１５に示されるように、ｈＰＤ−Ｌ１結合に預かるホットスポット残基は、Ｃ鎖、ＣＣ’ループおよびＦ鎖中にすべて集まっていた（図１５）。ｈＰＤ−１／ｈＰＤ−Ｌ１複合体結晶構造（ＰＤＢコード４ＺＱＫ、４Å）上の残基の位置を調べることによって、これらの残基はＡ、Ｃ、ＦおよびＧ鎖上に主に位置していることが明らかになった。１．１４．４のエピトープは、ｈＰＤ−１およびｈＰＤ−Ｌ１相互作用部位と直接重複しているＣ鎖上の残基によって主に寄与され、これは、ｈＰＤ−Ｌ１結合およびｈＰＤ−１遮断の観点で機序を示す。
【０１９２】
［実施例５］腫瘍成長に対する完全ヒト抗体ｈＰＤ−Ｌ１のｉｎ  ｖｉｖｏ阻害
腫瘍成長に対するｈＰＤ−Ｌ１抗体の阻害を評価するために、５×１０5個細胞／０．１ｍＬのＭＣ３８−Ｂ７Ｈ１腫瘍細胞を、４２匹の雄Ｂ−ｈＰＤ−１ヒト化マウスの前側右肋骨の皮下に播種した。腫瘍の大きさが、約１００ｍｍ3に達した時点で、マウスを群にし（５群、群あたり７匹）、以下のとおりに薬剤を投与した：群１：ビヒクル、群２：対照抗体ＢＭＫ６（ＷＯ２０１１０６６３８９Ａ１における詳細な記載を参照のこと）、群３：１．１４．４、３ｍｇ／ｋｇ、群４：１．１４．４、１０ｍｇ／ｋｇおよび群５：１．１４．４、３０ｍｇ／ｋｇ。すべての群に、２日に１回、６回の連続投与を用い、腹膜内注射によって投与した。動物を、投与の終了後さらに２週間連続的に観察した。腫瘍量および体重を、週に２回測定し、マウス体重の変化および投与期間の間の関係ならびに腫瘍量の変化および投与期間の間の関係を記録した。実験の最後に、治療群対ビヒクル群における腫瘍量の割合（Ｔ／Ｃ）および腫瘍成長阻害（ＴＧＩ）を算出し、統計的に解析した。Ｇｒａｐｈｐａｄ  Ｐｒｉｓｍ  ５を用いてＴ検定を実施し、腫瘍量を統計的に解析した。Ｐ＜０．０５は、有意差を有すると考えた。
【０１９３】
腫瘍容量を、ノギスを使用して、長い直径および短い直径について週に２回測定し、容量を算出するための式は、腫瘍量＝０．５×長い直径×短い直径2である。腫瘍成長速度を、測定結果：Ｔ／Ｃ（％）＝治療群の腫瘍量／陰性対照群の腫瘍量×１００％に基づいて算出した。腫瘍成長阻害ＴＧＩ（％）＝［１−（Ｔｉ−Ｔ０）／（Ｖｉ−Ｖ０）］×１００（式中、Ｔｉは、ｉ日目の治療群の平均腫瘍量であり、Ｔ０は、０日目の治療群の平均腫瘍量であり、Ｖｉは、ｉ日目の対照群の平均腫瘍量であり、Ｖ０は、０日目の対照群の平均腫瘍量である）。
【０１９４】
【表４】
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【０１９５】
実験の間、各群中の動物の体重は有意な低減を示さず（表４および図１６）、試験薬剤が良好な耐容性を有することを示す。投与の１９日後（すなわち、腫瘍細胞播種の２５日後）、ビヒクル群における腫瘍量は、２３５９ｍｍ3に達し、ビヒクル群と比較し、高、中および低用量の抗体１．１４．４の群における腫瘍量は、有意な低減を示した（平均腫瘍量は、それぞれ９４９ｍｍ3、１４１６ｍｍ3および１１１５ｍｍ3であった）。３種の用量すべての抗体が、それぞれＴＧＩ６２．８％、４２．０％および５５．４％までを示す有意な抗腫瘍効果を示した（表４および図１７）。対照抗体ＢＭＫ６はまた、有意な抗腫瘍効果を示した（平均腫瘍量は、１２４１ｍｍ3であり、ＴＧＩは４９．７％である）。したがって、結果は、抗体１．１４．４は、有意な抗腫瘍効果を示し、高、中および低用量のすべての群について阻害は、４０％を上回っていることを示した。
【０１９６】
本開示は、特定の実施形態（その一部は好ましい実施形態である）に関して特に示され、記載されているが、本明細書において開示されるような本開示の趣旨および範囲から逸脱することなく、形態および詳細の種々の変法が行われ得るということは当業者によって理解されなくてはならない。
【図１】
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【図２】
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【図３】
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【図４】
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【図５】
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【図６】
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【図７】
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【図８】
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【図９】
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【図１０】
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【図１１】
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【図１２】
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【図１３】
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【図１４】
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【図１５】
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【図１６】
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【図１７】
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【配列表】
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【国際調査報告】
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