(57)【要約】血液脳関門を通過することができる抗体または抗体断片に関する組成物及び方法が提供される。【選択図】図１
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【特許請求の範囲】
【請求項１】
（ａ）配列番号１の重鎖アクセプターフレームワーク、及び所望の抗原に特異的な少なくとも１つの異種可変重鎖ＣＤＲと、
（ｂ）配列番号２の軽鎖アクセプターフレームワーク、及び所望の抗原に特異的な少なくとも１つの異種可変軽鎖ＣＤＲと
を含む、組み換え抗原結合タンパク質。
【請求項２】
所望の抗原に特異的な３つの異種可変重鎖ＣＤＲと３つの異種可変軽鎖ＣＤＲとを含む、請求項１に記載の組み換え抗原結合タンパク質。
【請求項３】
前記抗原が、表１に列挙される抗原から選択される、請求項１に記載の組み換え抗原結合タンパク質。
【請求項４】
前記可変重鎖ＣＤＲ配列が、表１に列挙される抗原に特異的である、請求項１に記載の組み換え抗原結合タンパク質。
【請求項５】
前記可変軽鎖ＣＤＲ配列が、表１に列挙される抗原に特異的である、請求項１に記載の組み換え抗原結合タンパク質。
【請求項６】
８．０〜９．０の等電点を有する、請求項１に記載の組み換え抗原結合タンパク質。
【請求項７】
約８．７の等電点を有する、請求項１に記載の組み換え抗原結合タンパク質。
【請求項８】
血液脳関門を通過することができる、請求項１に記載の組み換え抗原結合タンパク質。
【請求項９】
前記重鎖アクセプターフレームワークが、配列番号１と少なくとも９０％同一である、請求項１に記載の組み換え抗原結合タンパク質。
【請求項１０】
前記軽鎖アクセプターフレームワークが、配列番号２と少なくとも９０％同一である、請求項１に記載の組み換え抗原結合タンパク質。
【請求項１１】
完全な免疫グロブリン、ｓｃＦｖ、Ｆａｂ断片、Ｆ（ａｂ’）２、ジスルフィド架橋によりヒンジ領域で連結されたＦａｂ断片、Ｆａｂ’断片、Ｆｖ、単一ドメイン抗体（Ｄａｂ）、ナノボディまたは二重特異性抗体である、請求項１に記載の組み換え抗原結合タンパク質。
【請求項１２】
請求項１〜１１のいずれか一項に記載の組み換え抗原結合タンパク質をコードする、核酸。
【請求項１３】
請求項１２に記載の核酸を含む、発現ベクター。
【請求項１４】
請求項１３に記載の発現ベクターを含む、宿主細胞。
【請求項１５】
前記宿主細胞が細菌細胞または真核細胞である、請求項１４に記載の宿主細胞。
【請求項１６】
前記真核細胞が哺乳動物細胞である、請求項１５に記載の宿主細胞。
【請求項１７】
組み換え抗原結合タンパク質を治療上有効な量で投与することを含む、血液脳関門を通過する組み換え抗原結合タンパク質を送達する方法であって、
前記組み換え抗原結合タンパク質が、
（ａ）配列番号１の重鎖アクセプターフレームワーク、及び所望の抗原に特異的な少なくとも１つの異種可変重鎖ＣＤＲと、
（ｂ）配列番号２の軽鎖アクセプターフレームワーク、及び所望の抗原に特異的な少なくとも１つの異種可変軽鎖ＣＤＲと
を含む、
前記方法。
【請求項１８】
前記組み換え抗原結合タンパク質が、所望の抗原に特異的な３つの異種可変重鎖ＣＤＲと３つの異種可変軽鎖ＣＤＲとを含む、請求項１７に記載の方法。
【請求項１９】
前記抗原が、表１に列挙される抗原から選択される、請求項１７に記載の方法。
【請求項２０】
前記可変重鎖ＣＤＲ配列が、表１に列挙される抗原に特異的である、請求項１７に記載の方法。
【請求項２１】
前記可変軽鎖ＣＤＲ配列が、表１に列挙される抗原に特異的である、請求項１７に記載の方法。
【請求項２２】
前記組み換え抗原結合タンパク質が８．０〜９．０の等電点を有する、請求項１７に記載の方法。
【請求項２３】
前記組み換え抗原結合タンパク質が約８．７の等電点を有する、請求項１７に記載の方法。
【請求項２４】
前記重鎖アクセプターフレームワークが、配列番号１と少なくとも９０％同一である、請求項１７に記載の方法。
【請求項２５】
前記軽鎖アクセプターフレームワークが、配列番号２と少なくとも９０％同一である、請求項１７に記載の方法。
【請求項２６】
前記抗原結合タンパク質が、完全な免疫グロブリン、ｓｃＦｖ、Ｆａｂ断片、Ｆ（ａｂ’）２、ジスルフィド架橋によりヒンジ領域で連結されたＦａｂ断片、Ｆａｂ’断片、Ｆｖ、単一ドメイン抗体（Ｄａｂ）、ナノボディまたは二重特異性抗体である、請求項１７に記載の方法。
【請求項２７】
がん、感染症、自己免疫疾患または移植拒絶の治療における使用のための請求項１〜１１のいずれか一項に記載の組み換え抗原結合タンパク質。
【請求項２８】
重鎖及び軽鎖を含み、
前記重鎖が配列番号１と少なくとも９０％同一である配列を含み、
前記軽鎖が配列番号２と少なくとも９０％同一である配列を含む、抗体と、
１つ以上の作用物質と
を含む、組成物
を対象に投与することを含む、対象の脳に作用物質を送達する方法。
【請求項２９】
前記作用物質がイメージング剤である、請求項２８に記載の方法。
【請求項３０】
前記作用物質が治療薬である、請求項２８に記載の方法。
【請求項３１】
前記治療薬が化学療法薬である、請求項３０に記載の方法。
【請求項３２】
前記１つ以上の作用物質が前記抗体にコンジュゲートされている、請求項２８〜３１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３３】
前記抗体がプリツムマブである、請求項２８〜３２のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３４】
前記抗体の重鎖が配列番号１を含む、請求項２８〜３２のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３５】
前記抗体の軽鎖が配列番号２を含む、請求項２８〜３２または３４のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３６】
前記抗体が、腫瘍細胞と特異的に結合するが正常細胞には結合しない、請求項２８〜３５のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３７】
重鎖及び軽鎖を含み、
前記重鎖が配列番号１と少なくとも９０％同一である配列を含み、
前記軽鎖が配列番号２と少なくとも９０％同一である配列を含む、抗体と、
１つ以上の作用物質と
を含む、組成物。
【請求項３８】
脳への送達のために製剤化される、請求項３７に記載の組成物。
【請求項３９】
血液脳関門を通過することができる、請求項３７に記載の組成物。
【請求項４０】
前記作用物質がイメージング剤である、請求項３７〜３９のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項４１】
前記作用物質が治療薬である、請求項３７〜３９のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項４２】
前記治療薬が化学療法薬である、請求項４１に記載の組成物。
【請求項４３】
前記１つ以上の作用物質が前記抗体にコンジュゲートされている、請求項３７〜４２のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項４４】
前記抗体がプリツムマブである、請求項３７〜４３のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項４５】
前記抗体の重鎖が配列番号１を含む、請求項３７〜４３のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項４６】
前記抗体の軽鎖が配列番号２を含む、請求項３７〜４３または４５のいずれか一項に記載の組成物。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
関連出願の相互参照
本出願は、２０１５年９月１１日に出願された米国特許仮出願第６２／２１７，６０８号及び２０１５年１０月２８日に出願された米国特許仮出願第６２／２４７，４９０号の優先権を主張するものであり、両出願の全体を参照により本明細書に援用する。
【背景技術】
【０００２】
背景
血液脳関門（ＢＢＢ）は、治療薬の脳への送達にとって大きな障壁となる。ＢＢＢは、ＣＮＳを取り囲む保護的な内皮組織であり、神経系疾患の治療のための治療薬及び診断薬の全身送達に対して大きな障害をもたらす。例えば、脳がんまたは他の固形腫瘍の脳への移転に対する治療は、未だに満たされていない大きなニーズである。良好な治療の欠如は、脳内腫瘍が浸潤性（ｉｎｖａｓｉｖｅ／ｉｎｆｉｌｔｒａｔｉｎｇ）であること及び最も効果的な生物学的薬剤がＢＢＢを通過できないことに起因する。ＢＢＢが漏出性となり、または容易に乗り越えることができれば、新しい有用な薬物を脳組織に送達することができる。ＢＢＢを乗り越え、または迂回するように設計された以前の製品は、制御するのが難しく、それゆえ有用性が制限されていた。
【０００３】
本開示は、ＢＢＢを通過することができる抗体または抗体断片を提供することによって、これらのニーズ及び他のニーズを満たすものである。
【発明の概要】
【０００４】
概要
血液脳関門を通過することができる抗体または抗体断片に関する組成物及び方法が本明細書に記載される。
【０００５】
第１の態様において、本明細書で開示されるのは、（ａ）配列番号１の重鎖アクセプターフレームワーク、及び所望の抗原に特異的な少なくとも１つの異種可変重鎖ＣＤＲと、（ｂ）配列番号２の軽鎖アクセプターフレームワーク、及び所望の抗原に特異的な少なくとも１つの異種可変軽鎖ＣＤＲとを含む、組み換え抗原結合タンパク質である。
【０００６】
いくつかの実施形態において、組み換え抗原結合タンパク質は、所望の抗原に特異的な３つの異種可変重鎖ＣＤＲと３つの異種可変軽鎖ＣＤＲとを含む。いくつかの実施形態において、抗原は、表１に列挙される抗原から選択される。いくつかの実施形態において、可変重鎖ＣＤＲ配列は、表１に列挙される抗原に特異的である。いくつかの実施形態において、可変軽鎖ＣＤＲ配列は、表１に列挙される抗原に特異的である。
【０００７】
いくつかの実施形態において、組み換え抗原結合タンパク質は、８．０〜９．０の等電点を有する。いくつかの実施形態において、組み換え抗原結合タンパク質は、約８．７の等電点を有する。
【０００８】
いくつかの実施形態において、組み換え抗原結合タンパク質は、血液脳関門を通過することができる。
【０００９】
いくつかの実施形態において、重鎖アクセプターフレームワークは、配列番号１と少なくとも９０％同一である。いくつかの実施形態において、軽鎖アクセプターフレームワークは、配列番号２と少なくとも９０％同一である。
【００１０】
いくつかの実施形態において、抗原結合タンパク質は、完全な免疫グロブリン、ｓｃＦｖ、Ｆａｂ断片、Ｆ（ａｂ’）２、ジスルフィド架橋によりヒンジ領域で連結されたＦａｂ断片、Ｆａｂ’断片、Ｆｖ、単一ドメイン抗体（Ｄａｂ）、ナノボディまたは二重特異性抗体である。
【００１１】
別の態様において、本明細書で開示されるのは、上記の態様及び実施形態のいずれかの組み換え抗原結合タンパク質をコードする核酸である。
【００１２】
別の態様において、本明細書で開示されるのは、上記の態様及び実施形態のいずれかの核酸を含む発現ベクターである。別の態様において、本明細書で開示されるのは、上記の態様及び実施形態のいずれかの発現ベクターを含む宿主細胞である。いくつかの実施形態において、宿主細胞は、細菌細胞または真核細胞であり、哺乳動物細胞であってよい。
【００１３】
別の態様において、本明細書で開示されるのは、組み換え抗原結合タンパク質を治療上有効な量で投与することを含む、血液脳関門を通過する組み換え抗原結合タンパク質を送達する方法であり、当該組み換え抗原結合タンパク質は、（ａ）配列番号１の重鎖アクセプターフレームワーク、及び所望の抗原に特異的な少なくとも１つの異種可変重鎖ＣＤＲと、（ｂ）配列番号２の軽鎖アクセプターフレームワーク、及び所望の抗原に特異的な少なくとも１つの異種可変軽鎖ＣＤＲとを含む。
【００１４】
いくつかの実施形態において、組み換え抗原結合タンパク質は、所望の抗原に特異的な３つの異種可変重鎖ＣＤＲと３つの異種可変軽鎖ＣＤＲとを含む。いくつかの実施形態において、抗原は、表１に列挙される抗原から選択される。いくつかの実施形態において、可変重鎖ＣＤＲ配列は、表１に列挙される抗原に特異的である。いくつかの実施形態において、可変軽鎖ＣＤＲ配列は、表１に列挙される抗原に特異的である。
【００１５】
いくつかの実施形態において、組み換え抗原結合タンパク質は、８．０〜９．０の等電点を有する。いくつかの実施形態において、組み換え抗原結合タンパク質は、約８．７の等電点を有する。
【００１６】
いくつかの実施形態において、重鎖アクセプターフレームワークは、配列番号１と少なくとも９０％同一である。いくつかの実施形態において、軽鎖アクセプターフレームワークは、配列番号２と少なくとも９０％同一である。
【００１７】
いくつかの実施形態において、抗原結合タンパク質は、完全な免疫グロブリン、ｓｃＦｖ、Ｆａｂ断片、Ｆ（ａｂ’）２、ジスルフィド架橋によりヒンジ領域で連結されたＦａｂ断片、Ｆａｂ’断片、Ｆｖ、単一ドメイン抗体（Ｄａｂ）、ナノボディまたは二重特異性抗体である。
【００１８】
更なる態様において、本明細書で開示されるのは、がん、感染症、自己免疫疾患または移植拒絶の治療における使用のための、上記の態様及び実施形態の組み換え抗原結合タンパク質の使用である。
【００１９】
対象の脳に作用物質を送達する方法が提供され、この方法は、プリツムマブ（ｐｒｉｔｕｍｕｍａｂ）と１つ以上の作用物質とを含むコンジュゲートを含む組成物を当該対象に投与することを含む。また、組成物およびキットも提供され、キットは、プリツムマブと１つ以上の作用物質とを含むコンジュゲートを含む組成物を含む。
【図面の簡単な説明】
【００２０】
【図１】プリツムマブフレームワークに対して新しい抗原結合特異性を設計するＣＤＲグラフティングを使用して、血液脳関門を通過することができる新規抗原結合タンパク質を作製することを示す模式図である。天然プリツムマブのＣＤＲは、外部ドメインビメンチン（ＥＤＶ）に結合することができる。天然プリツムマブのＣＤＲを異種ＣＤＲに置き換えることで、抗原Ａｇ１、Ａｇ２、Ａｇ３などに対する結合特異性をもたらすことができる。
【図２】プリツムマブが血液脳関門を通過し、脳内の腫瘍組織で検出されることを示す画像である。
【図３】正常脳組織内のプリツムマブ分布を示す画像である。
【図４】脳腫瘍組織内のプリツムマブ分布を示す画像である。
【図５】様々な種類の腫瘍において、プリツムマブが腫瘍細胞と特異的に結合し、正常細胞と結合しないことを示す画像である。
【発明を実施するための形態】
【００２１】
詳細な説明
モノクローナル抗体（ｍＡｂ）は、同一の免疫細胞、すなわち、共通の生殖細胞のクローンによって産生される単一の抗原特異性を有する抗体であり、顕著な特異性、有効性及び安全性をもって、ほぼあらゆる細胞表面または分泌分子を標的にする能力があることから、従来にない薬物開発の機会を提供する。
【００２２】
よく知られているように、標的抗原に結合する抗体の能力は、相補性決定領域（ＣＤＲ）セグメントが担っている。可変ドメイン間の相違は、超可変領域（ＨＶ−１、ＨＶ−２及びＨＶ−３）または（ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３）として知られる３つのループ上に位置する。ＣＤＲは、可変ドメイン内で、保存されたフレームワーク領域によって支持される。本開示は、ヒト天然モノクローナル抗体（プリツムマブ）のフレームワークを、ネズミ抗体、キメラ抗体、ヒト化抗体またはヒトモノクローナル抗体（ｍＡｂ）などの他の抗体に由来する超可変領域をグラフティングするために使用して、血液脳関門を通過することができる新しい抗原結合タンパク質を生成することに関する。
【００２３】
ＣＤＲは、異なる特異性及び親和性を有する抗体間で（１つのグループとして、または個別に）交換される。ＣＤＲのスワッピング（ＣＤＲグラフティングとも呼ばれる）は、ネズミ抗体のヒト化だけでなく、より安定した従来の抗体断片の構築にも利用されている技術である。本明細書で論じるように、プリツムマブのフレームワークは、ヒト起源のものであり、ＢＢＢを通過することができる固有の特徴を提供し、更に、そのＣＤＲは、超可変であり、また安定性よりも結合親和性について選択されることから、ヒトＩｇＧ１（プリツムマブ）のフレームワーク上のＣＤＲのバリエーションは、様々なヒト疾患を治療するのに極めて標的特異的であるが、ＢＢＢを通過することができないために使用できないモノクローナル抗体の臨床的有用性を向上させる革新的なアプローチであることを提案するものである。本明細書で開示されるように、本発明者らは、ＢＢＢを通過する医学的及び治療的に重要なＣＤＲを含有する標的特異性モノクローナル抗体の送達に対するプリツムマブフレームワークの寄与を理解する目的で、一連のＣＤＲスワップ変異体を構築する。
【００２４】
具体的には、本発明者らは、プリツムマブがＢＢＢを容易に通過するヒト抗体であることを明らかにした。異なる特異性及び／またはペイロードを抗体に配置すれば、これらの特異性及び／またはペイロードは脳に容易に送達されるはずである。プリツムマブ重鎖は、ＢＢＢを通過するための担体として機能し、新しい特異性及び／またはペイロードを送達する。したがって、本開示は、ＢＢＢを容易に通過する天然ヒト抗体を利用し、その固有の特徴を用いて追加の薬物を送達するものである。
【００２５】
定義
本発明は、特定の方法、試薬、化合物、組成物または生体系に限定されず、これらは、当然のことながら変わり得ることを理解されたい。また、本明細書で使用される用語は、特定の態様を記載する目的でのみ使用され、限定を意図するものではないことも理解されたい。本明細書及び添付の特許請求の範囲において使用されるとき、単数形「ａ」、「ａｎ」及び「ｔｈｅ」は、文脈により別途明示される場合を除き、複数の指示対象を含む。
【００２６】
本明細書で使用される「約」という用語は、量、時間的な幅などの測定可能な値を指す場合、指定値から±２０％または±１０％、より好ましくは±５％、更により好ましくは±１％、またより好ましくは±０．１％の変動値を包含することを意味する。このような変動値は、本開示の方法の実施に適している。
【００２７】
別途の定義がない限り、本明細書で使用される全ての科学技術用語は、本発明が属する技術分野の当業者によって一般的に理解される意味と同一の意味を有する。本発明の試験実施には、本明細書に記載されるものと類似または同等の任意の方法及び材料を使用することができるが、好ましい材料及び方法については、本明細書に記載される。
【００２８】
「脊椎動物」、「哺乳動物」、「対象」、「哺乳動物対象」または「患者」は、同じ意味で使用され、哺乳類、例えば、ヒト患者及び非ヒト霊長類、更に、ウサギ、ラット及びマウス、ウシ、ウマ、ヤギなどの実験動物ならびに他の動物を指す。動物には、全ての脊椎動物、例えば、哺乳動物及び非哺乳動物、例えば、マウス、ヒツジ、イヌ、ウシ、トリ種、アヒル、ガチョウ、ブタ、ニワトリ、両生類及び爬虫類が含まれる。
【００２９】
「治療すること」または「治療」は、一般に、（ｉ）疾患を防ぐこと、例えば、予防、または（ｉｉ）対象疾患の症状を軽減もしくは排除すること、例えば、治療のいずれかを指す。したがって、治療は、予防的（疾患発症の予防もしくは遅延、またはその臨床的もしくは準臨床的症状の顕在化の予防）であり得るか、疾患の顕在化後における症状の治療的抑制もしくは緩和であり得る。
【００３０】
「予防すること」または「予防」は、本発明の組成物を用いた予防のための投与を指す。
【００３１】
「治療上有効な量」または「有効量」は、疾患の予防または疾患に伴う症状のうちの少なくとも１つの緩和（例えば、鎮静、減少、軽減）に十分な抗体組成物の量を指す。組成物の投与の利点が不利益を上回るのであれば、組成物の投与が疾患の症状を完全に排除することは必須ではない。同様に、「治療する」及び「治療すること」という用語は、疾患に関して本明細書で使用されるとき、対象の疾患が必ず治癒されること、またはその全ての臨床的徴候が排除されることを意味するのではなく、単に対象の病態のいくらかの緩和または改善が組成物の投与によって達成されることを意味することを意図するにすぎない。
【００３２】
抗体及び断片
本明細書で使用されるとき、「抗体」という用語は、特定のエピトープに結合する任意の免疫グロブリンまたはインタクトな分子及びその断片を指す。かかる抗体には、ポリクローナル抗体、モノクローナル抗体、キメラ抗体、ヒト化抗体、一本鎖抗体、Ｆａｂ断片、Ｆａｂ’断片、Ｆ（ａｂ）’断片及び／または完全抗体のＦ（ｖ）部分ならびにこれらのバリアントが含まれるが、これらに限定されない。この用語には、ＩｇＡ、ＩｇＤ、ＩｇＥ、ＩｇＧ、およびＩｇＭ全てのアイソタイプが包含される。
【００３３】
本明細書で使用されるとき、「抗体断片」という用語は、抗体の完全配列のうち、親抗体の抗原結合機能を保持する不完全な部分または単離された部分を特に指す。抗体断片の例には、Ｆａｂ、Ｆａｂ’、Ｆ（ａｂ’）２及びＦｖの各断片、ダイアボディ、直鎖抗体、一本鎖抗体分子、ならびに抗体断片から形成された多重特異性抗体が挙げられる。
【００３４】
インタクト「抗体」は、ジスルフィド結合によって互いに連結された少なくとも２つの重鎖（Ｈ）及び２つの軽鎖（Ｌ）を含む。各重鎖は、重鎖可変領域（本明細書中、ＨＣＶＲまたはＶＨと略す）及び重鎖定常領域からなる。重鎖定常領域は、３つのドメインＣＨ１、ＣＨ２及びＣＨ３からなる。各軽鎖は、軽鎖可変領域（本明細書中、ＬＣＶＲまたはＶＬと略す）及び軽鎖定常領域からなる。軽鎖定常領域は、１つのドメインＣＬからなる。ＶＨ及びＶＬ領域は、フレームワーク領域（ＦＲ）と称される保存性の高い領域に点在する、相補性決定領域（ＣＤＲ）と称される超可変領域に更に細分することができる。各ＶＨ及びＶＬは、３つのＣＤＲ及び４つのＦＲから構成され、アミノ末端からカルボキシル末端に向かって次の順番：ＦＲ１、ＣＤＲ１、ＦＲ２、ＣＤＲ２、ＦＲ３、ＣＤＲ３、ＦＲ４で配置される。重鎖及び軽鎖の可変領域は、抗原と相互作用する結合ドメインを含有する。抗体の定常領域は、免疫系の各種細胞（例えば、エフェクター細胞）及び古典的補体系の第１構成成分（Ｃ１ｑ）などの宿主の組織または因子に対する免疫グロブリンの結合を媒介することができる。抗体という用語には、結合する能力を保持する、インタクト抗体の抗原結合部分が含まれる。結合の例には、（ｉ）ＶＬ、ＶＨ、ＣＬ及びＣＨ１ドメインからなる一価断片である、Ｆａｂ断片；（ｉｉ）ヒンジ領域でジスルフィド架橋により連結された２つのＦａｂ断片を含む二価断片である、Ｆ（ａｂ’）２断片；（ｉｉｉ）ＶＨ及びＣＨ１ドメインからなるＦｄ断片；（ｉｖ）抗体の一本のアームのＶＬ及びＶＨドメインからなるＦｖ断片；（ｖ）ＶＨドメインからなるｄＡｂ断片（Ｗａｒｄ  ｅｔ  ａｌ．，Ｎａｔｕｒｅ，３４１：５４４−５４６（１９８９））；ならびに（ｖｉ）単離された相補性決定領域（ＣＤＲ）が挙げられる。
【００３５】
「抗原結合タンパク質」という用語は、当該抗原結合タンパク質が標的抗原を特異的に認識するように、抗体の抗原結合部位の全部または一部、例えば、重鎖及び／または軽鎖可変ドメインの全部または一部を含有する分子を指す。抗原結合タンパク質の非限定的な例には、完全長免疫グロブリン分子及びｓｃＦｖのみならず、限定するものではないが、（ｉ）ＶＬ、ＶＨ、ＣＬ及びＣＨ１ドメインからなる一価断片である、Ｆａｂ断片；（ｉｉ）ヒンジ領域でジスルフィド架橋により連結された２つのＦａｂ断片を含む二価断片である、Ｆ（ａｂ’）２断片；（ｉｉｉ）ヒンジ領域の部分を含む本質的にＦａｂである、Ｆａｂ’断片（Ｆｕｎｄａｍｅｎｔａｌ  Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ（Ｐａｕｌ  ｅｄ．，３．ｓｕｐ．ｒｄ  ｅｄ．１９９３）参照；（ｉｖ）ＶＨ及びＣＨ１ドメインからなるＦｄ断片；（ｖ）抗体の一本のアームのＶＬ及びＶＨドメインからなるＦｖ断片；（ｖｉ）ＶＨもしくはＶＬドメインからなるＤａｂ断片（Ｗａｒｄ  ｅｔ  ａｌ．，（１９８９）Ｎａｔｕｒｅ  ３４１：５４４−５４６）、ラクダ抗体（Ｈａｍｅｒｓ−Ｃａｓｔｅｒｍａｎ，ｅｔ  ａｌ．，Ｎａｔｕｒｅ  ３６３：４４６−４４８（１９９３）及びＤｕｍｏｕｌｉｎ，ｅｔ  ａｌ．，Ｐｒｏｔｅｉｎ  Ｓｃｉｅｎｃｅ  １１：５００−５１５（２００２）参照）またはサメ抗体（例えば、サメＩｇ−ＮＡＲ  Ｎａｎｏｂｏｄｉｅｓ（商標）などの単一ドメイン抗体；ならびに（ｖｉｉ）１つの可変ドメイン及び２つの定常ドメインを含有する重鎖可変領域である、ナノボディを含む、抗体断片が挙げられる。
【００３６】
「ＣＤＲ」という用語は、抗原結合に主に寄与する抗体の可変ドメイン内の６つの超可変領域のうちの１つを指す。６つのＣＤＲに関して最も一般的に使用されている定義のうちの１つは、Ｋａｂａｔ  Ｅ．Ａ．ｅｔ  ａｌ．，（１９９１）Ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ  ｏｆ  ｐｒｏｔｅｉｎｓ  ｏｆ  ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｉｃａｌ  ｉｎｔｅｒｅｓｔ．ＮＩＨ  Ｐｕｂｌｉｃａｔｉｏｎ  ９１−３２４２）によって提供されたものである。
【００３７】
本明細書で使用される「抗体フレームワーク」という用語は、ＶＬまたはＶＨのいずれかの可変ドメインの一部であって、この可変ドメインの抗原結合ループ（ＣＤＲ）の足場として機能する部分を指す。要するに、ＣＤＲのない可変ドメインである。
【００３８】
本明細書で使用されるとき、「一本鎖抗体」または「一本鎖Ｆｖ（ｓｃＦｖ）」という用語は、Ｆｖ断片のＶＬとＶＨの２つのドメインの抗体融合分子を指す。Ｆｖ断片のＶＬとＶＨの２つのドメインは、別個の遺伝子によってコードされているが、組み換え法を用いて、ＶＬとＶＨの領域が対になって一価分子を形成する単一のタンパク質鎖としての作製を可能にする、合成リンカーによって結合することができる（一本鎖Ｆｖ（ｓｃＦｖ）として知られる；例えば、Ｂｉｒｄ  ｅｔ  ａｌ．，Ｓｃｉｅｎｃｅ，２４２：４２３−４２６（１９８８）；及びＨｕｓｔｏｎ  ｅｔ  ａｌ．，Ｐｒｏｃ  Ｎａｔｌ  Ａｃａｄ  Ｓｃｉ  ＵＳＡ，８５：５８７９−５８８３（１９８８）を参照されたい）。このような一本鎖抗体は、「抗体」断片という用語の参照に含まれ、組み換え技術またはインタクト抗体の酵素的もしくは化学的切断によって調製することができる。
【００３９】
本明細書で使用されるとき、「ヒト配列抗体」という用語は、ヒト生殖系列免疫グロブリン配列に由来する可変領域及び定常領域（存在する場合）を有する抗体を含む。本発明のヒト配列抗体は、ヒト生殖系列免疫グロブリン配列にコードされていないアミノ酸残基（例えば、ｉｎ  ｖｉｔｒｏでのランダム変異導入もしくは部位特異的変異導入によって導入された変異、またはｉｎ  ｖｉｖｏでの体細胞変異によって導入された変異）を含み得る。このような抗体は、例えば、ＰＣＴ出願公開番号ＷＯ０１／１４４２４及びＷＯ００／３７５０４に記載されているような非ヒトトランスジェニック動物において作製することができる。ただし、「ヒト配列抗体」という用語は、本明細書で使用されるとき、マウスなどの別の哺乳動物種の生殖系列に由来するＣＤＲ配列がヒトフレームワーク配列上にグラフティングされた抗体（例えば、ヒト化抗体）を含むことを意図するものではない。
【００４０】
また、組み換え免疫グロブリンを作製することもできる。Ｃａｂｉｌｌｙの米国特許第４，８１６，５６７号（その全体をあらゆる目的のために参照により本明細書に援用する）；及びＱｕｅｅｎ  ｅｔ  ａｌ．，Ｐｒｏｃ  Ｎａｔｌ  Ａｃａｄ  Ｓｃｉ  ＵＳＡ，８６：１００２９−１００３３（１９８９）を参照されたい。
【００４１】
本明細書で使用されるとき、「モノクローナル抗体」という用語は、単一分子組成の抗体分子の調製物を指す。モノクローナル抗体組成物は、特定のエピトープに対して、単一の結合特異性及び親和性を示す。したがって、「ヒトモノクローナル抗体」という用語は、ヒト生殖系列免疫グロブリン配列に由来する可変領域及び定常領域（存在する場合）を有する単一の結合特異性を示す抗体を指す。一態様において、ヒトモノクローナル抗体は、非ヒトトランスジェニック動物（例えば、トランスジェニックマウス）から得られた、ヒトの重鎖導入遺伝子及び軽鎖導入遺伝子を含むゲノムを有する、不死化細胞に融合させたＢ細胞を含む、ハイブリドーマによって産生される。
【００４２】
本明細書で使用されるとき、「抗原」という用語は、抗体の産生を刺激し、免疫応答を引き起こすことができる物質を指し、本開示中、「免疫原」という用語と同じ意味で使用され得る。厳密な意味では、免疫原は、免疫系からの応答を惹起する物質であり、一方、抗原は、特異的抗体に結合する物質として定義される。抗原またはその断片は、特定の抗体と接触する分子（すなわち、エピトープ）であってよい。タンパク質またはタンパク質の断片を使用して宿主動物を免疫化すると、そのタンパク質の多数の領域により、抗原（タンパク質上の所与の領域または三次元構造）に特異的に結合する抗体の産生が誘導され得る（すなわち、免疫応答を惹起する）。
【００４３】
本明細書で使用されるとき、「ヒト化抗体」という用語は、その抗体がヒト抗体により近似し、元の結合能力をなおも保持するように、非抗原結合領域及び／または抗原結合領域内のアミノ酸配列が変更された少なくとも１つの抗体分子を指す。
【００４４】
更に、適切な抗原特異性を有するマウス抗体分子に由来する遺伝子を、適切な生物活性を有するヒト抗体分子に由来する遺伝子とともにスプライシングすることによる、「キメラ抗体」を産生するために開発された技術（Ｍｏｒｒｉｓｏｎ，ｅｔ  ａｌ．，Ｐｒｏｃ  Ｎａｔｌ  Ａｃａｄ  Ｓｃｉ，８１：６８５１−６８５５（１９８４）；その全体を参照により本明細書に援用する）を使用することができる。例えば、マウス抗体分子に由来する遺伝子を、適切な生物活性を有するヒト抗体分子に由来する遺伝子とともにスプライシングすることができる。キメラ抗体は、異なる部分が異なる動物種に由来する分子、例えば、ネズミｍＡｂに由来する可変領域と、ヒト免疫グロブリン定常領域とを有するものである。
【００４５】
更に、ヒト化抗体を作製するための技術が開発されている（例えば、米国特許第５，５８５，０８９号及び米国特許第５，２２５，５３９号参照；その全体を参照により本明細書に援用する）。免疫グロブリンの軽鎖または重鎖可変領域は、相補性決定領域（ＣＤＲ）と呼ばれる３つの超可変領域によって中断された「フレームワーク」領域からなる。簡潔に述べれば、ヒト化抗体は、非ヒト種に由来する１つ以上のＣＤＲと、ヒト免疫グロブリン分子に由来するフレームワーク領域とを有する、非ヒト種由来の抗体分子である。
【００４６】
あるいは、一本鎖抗体の産生について記載される技術を、本開示の免疫原性コンジュゲートに対する一本鎖抗体を産生するように変更してもよい。一本鎖抗体は、Ｆｖ領域の重鎖断片と軽鎖断片とをアミノ酸架橋を介して連結させることによって形成され、これにより一本鎖ポリペプチドが得られる。抗体分子のＦａｂ及びＦ（ａｂ’）２の部分は、実質的にインタクトである抗体分子を周知の方法によってそれぞれパパイン及びペプシンでタンパク質分解反応することによって作製することができる。例えば、米国特許第４，３４２，５６６号を参照されたい。Ｆａｂ’抗体分子部分もまたよく知られており、Ｆ（ａｂ’）２部分から２つの重鎖部分を連結しているジスルフィド結合をメルカプトエタノールなどにより還元し、続いて、得られたタンパク質メルカプタンをヨードアセトアミドなどの試薬によりアルキル化することで作製される。
【００４７】
アミノ酸部分は、ＡＨｏナンバリングスキームに従って指定することができる。ＡＨｏナンバリングシステムは、Ｈｏｎｅｇｇｅｒ，Ａ．ａｎｄ  Ｐｌｕｃｋｔｈｕｎ，Ａ．（２００１）Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．３０９：６５７−６７０）に更に記載されている。あるいは、Ｋａｂａｔら（Ｋａｂａｔ，Ｅ．Ａ．，ｅｔ  ａｌ．（１９９１）Ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ  ｏｆ  Ｐｒｏｔｅｉｎｓ  ｏｆ  Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｉｃａｌ  Ｉｎｔｅｒｅｓｔ，Ｆｉｆｔｈ  Ｅｄｉｔｉｏｎ，Ｕ．Ｓ．Ｄｅｐａｒｔｍｅｎｔ  ｏｆ  Ｈｅａｌｔｈ  ａｎｄ  Ｈｕｍａｎ  Ｓｅｒｖｉｃｅｓ，ＮＩＨ  Ｐｕｂｌｉｃａｔｉｏｎ  Ｎｏ．９１−３２４２）に更に記載されているＫａｂａｔナンバリングシステムを使用することもできる。抗体の重鎖及び軽鎖可変領域内のアミノ酸残基位置を特定するために使用される２つの異なるナンバリングシステムの変換表は、Ａ．Ｈｏｎｅｇｇｅｒ，Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．３０９（２００１）６５７−６７０．に記載されている。
【００４８】
一態様において、本開示は、異種供給源に由来するＣＤＲをグラフティングするためのヒトアクセプターフレームワーク配列を提供する。ヒトプリツムマブフレームワークが特に有用なフレームワークであることが判明した。
【００４９】
したがって、本発明は、ｉ）配列番号１と少なくとも７０％の同一性、好ましくは少なくとも７５％、８０％、８５％、９０％、より好ましくは少なくとも９５％の同一性を有する可変重鎖フレームワーク、及び／または（ｉｉ）配列番号２と少なくとも７０％の同一性、好ましくは少なくとも７５％、８０％、８５％、９０％、より好ましくは少なくとも９５％の同一性を有する可変軽鎖フレームワークを含む、抗原結合タンパク質アクセプターフレームワークを提供する。これらの配列を以下に示す。
2018531625.tif 000003
【００５０】
ＣＤＲをヒトアクセプターフレームワークへグラフティングするための一般的方法は、Ｗｉｎｔｅｒの米国特許第５，２２５，５３９号及びＱｕｅｅｎらのＷＯ９００７８６１Ａ１に開示されており、その全体を参照により本明細書に援用する。
【００５１】
本発明の方法の例示的な実施形態では、ＣＤＲドナー抗体のアミノ酸配列をまず特定し、従来の配列アライメントツール（例えば、Ｎｅｅｄｌｅｍａｎ−Ｗｕｎｓｃｈアルゴリズム及びＢｌｏｓｓｕｍ行列）を使用して配列を整列させる。ギャップの導入及び残基位置の命名は、従来の抗体ナンバリングシステムを使用して行うことができる。例えば、免疫グロブリン可変ドメインにはＡＨｏナンバリングシステムを使用することができる。Ｋａｂａｔナンバリングスキームもまた、抗体の残基ナンバリングに最も広く採用されている標準法であるため、適用することができる。Ｋａｂａｔナンバリングは、例えば、ＳＵＢＩＭプログラムを使用して割り当てが可能である。このプログラムは、Ｋａｂａｔ及び共同研究者によって確立されたシステムに従って、抗体配列の可変領域を解析し、配列に番号を付ける（Ｄｅｒｅｔ  ｅｔ  ａｌ．１９９５）。フレームワーク領域及びＣＤＲ領域の特定は、概して、配列可変性に基づくＫａｂａｔ定義に従って行われ、最も一般的に使用されている。抗体の重鎖及び軽鎖可変領域内のアミノ酸残基位置を特定するために使用される２つの異なるナンバリングシステムの変換表は、Ａ．Ｈｏｎｅｇｇｅｒ，Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．３０９（２００１）６５７−６７０．に記載されている。Ｋａｂａｔナンバリングシステムは、Ｋａｂａｔら（Ｋａｂａｔ，Ｅ．Ａ．，ｅｔ  ａｌ．（１９９１）Ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ  ｏｆ  Ｐｒｏｔｅｉｎｓ  ｏｆ  Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｉｃａｌ  Ｉｎｔｅｒｅｓｔ，Ｆｉｆｔｈ  Ｅｄｉｔｉｏｎ，Ｕ．Ｓ．Ｄｅｐａｒｔｍｅｎｔ  ｏｆ  Ｈｅａｌｔｈ  ａｎｄ  Ｈｕｍａｎ  Ｓｅｒｖｉｃｅｓ，ＮＩＨ  Ｐｕｂｌｉｃａｔｉｏｎ  Ｎｏ．９１−３２４２）に更に記載されている。ＡＨｏナンバリングシステムは、Ｈｏｎｅｇｇｅｒ，Ａ．ａｎｄ  Ｐｌｕｃｋｔｈｕｎ，Ａ．（２００１）Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．３０９：６５７−６７０）に更に記載されている。
【００５２】
例えば、本明細書で開示されるアクセプターフレームワークを使用して、ＣＤＲの起源となった抗体の結合特性を保持するヒト抗体またはヒト化抗体を作製することができる。そのため、好ましい実施形態において、本発明は、ドナー抗原結合タンパク質に由来する重鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３及び／または軽鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３を更に含む、本明細書に開示される抗原結合タンパク質アクセプターフレームワークを包含する。したがって、一実施形態において、本発明は、（ｉ）可変重鎖及び軽鎖ＣＤＲ、（ｉｉ）配列番号１と少なくとも７０％、好ましくは少なくとも７５％、８０％、８５％、９０％、９５％または１００％の同一性を有するヒト可変重鎖フレームワーク、（ｉｉｉ）配列番号２と少なくとも７０％、好ましくは少なくとも７５％、８０％、８５％、９０％、９５％または１００％の同一性を有するヒト可変軽鎖フレームワークを含む、所望の抗原に特異的な抗原結合タンパク質を提供する。
【００５３】
本開示の実施に有用なＣＤＲを含む抗体の例には、以下のものが挙げられる。
【００５４】
（表１）
2018531625.tif 000004
【００５５】
Ｍａｇｄｅｌａｉｎｅ−Ｂｅｕｚｅｌｉｎ  Ｃ，Ｋａａｓ  Ｑ，Ｗｅｈｂｉ  Ｖ，Ｏｈｒｅｓｓｅｒ  Ｍ，Ｊｅｆｆｅｒｉｓ  Ｒ，Ｌｅｆｒａｎｃ  Ｍ−Ｐ，Ｗａｔｉｅｒ  Ｈ．Ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ−ｆｕｎｃｔｉｏｎ  ｒｅｌａｔｉｏｎｓｈｉｐｓ  ｏｆ  ｔｈｅ  ｖａｒｉａｂｌｅ  ｄｏｍａｉｎｓ  ｏｆ  ｍｏｎｏｃｌｏｎａｌ  ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ  ａｐｐｒｏｖｅｄ  ｆｏｒ  ｃａｎｃｅｒ  ｔｒｅａｔｍｅｎｔ．Ｃｒｉｔｉｃａｌ  Ｒｅｖｉｅｗｓ  ｉｎ  Ｏｎｃｏｌｏｇｙ／Ｈｅｍａｔｏｌｏｇｙ．６４：２１０−２２５，２００７をもとに、がん治療のために承認されたいくつかのモノクローナル抗体に由来する可変ドメインのアライメントを以下に示す。セツキシマブ（配列番号３）、リツキシマブ（配列番号４）、アレムツズマブ（配列番号５）、ベバシズマブ（配列番号６）、トラスツズマブ（配列番号７）、ペルツズマブ（配列番号８）、パニツムマブ（配列番号９）。
2018531625.tif 000005
【００５６】
イピリムマブのＣＤＲは、米国特許第２００９／００７４７８７Ａ１号に記載されている。
【００５７】
ベバシズマブ（配列番号１０）及びラニビズマブ（配列番号１１）のＶＨ及びＶ−κドメインのアライメントを以下に示す。
2018531625.tif 000006
【００５８】
別の態様において、本発明は、細胞毒素、薬物（例えば、免疫抑制剤）または放射性毒素などの治療的部分にコンジュゲートされている、本明細書で開示される抗体またはその断片を特徴とする。このようなコンジュゲートは、本明細書中、「免疫コンジュゲート」と呼ばれる。
【００５９】
本発明の抗体コンジュゲートは、所与の生体応答を変更するために使用することができ、薬物部分は、古典的な化学療法剤に限定されると解釈されるものではない。例えば、薬物部分は、所望の生物活性を有するタンパク質またはポリペプチドであってよい。このようなタンパク質には、例えば、アブリン、リシンＡ、シュードモナス外毒素もしくはジフテリア毒素などの酵素活性毒素もしくはその活性断片；腫瘍壊死因子もしくはインターフェロン−γなどのタンパク質；または、例えば、リンフォカイン、インターロイキン−１（「ＩＬ−１」）、インターロイキン−２（「ＩＬ−２」）、インターロイキン−６（「ＩＬ−６」）、顆粒球マクロファージコロニー刺激因子（「ＧＭ−ＣＳＦ」）、顆粒球コロニー刺激因子（「Ｇ−ＣＳＦ」）もしくは他の成長因子などの生体応答調節物質が含まれ得る。
【００６０】
プリツムマブは血液脳関門を通過することができるので、他の作用物質（例えば、イメージング剤または治療薬）を脳または他の腫瘍組織に送達するための送達ビヒクルとして使用することができる。したがって、重鎖及び軽鎖を含む抗体であって、当該重鎖が配列番号１と少なくとも９０％同一である配列を含み、当該軽鎖が配列番号２と少なくとも９０％同一である配列を含む、抗体と、１つ以上の作用物質（例えば、イメージング剤または治療薬）とを含む、組成物が提供される。任意選択により、作用物質は、抗体にコンジュゲートされる。任意選択により、治療薬は、化学療法薬である。任意選択により、コンジュゲートは、１つ以上の作用物質にコンジュゲートされている、本明細書に記載される組み換え抗原結合タンパク質を含む。任意選択により、組成物は、脳への送達のために製剤化される。任意選択により、組成物は、血液脳関門を通過することができる。任意選択により、抗体の重鎖は、配列番号１を含み、軽鎖は、配列番号２を含む。任意選択により、抗体は、プリツムマブである。
【００６１】
このような治療的部分を抗体にコンジュゲートする技術は、よく知られており、例えば、Ａｍｏｎ  ｅｔ  ａｌ．，“Ｍｏｎｏｃｌｏｎａｌ  Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ  Ｆｏｒ  Ｉｍｍｕｎｏｔａｒｇｅｔｉｎｇ  Ｏｆ  Ｄｒｕｇｓ  Ｉｎ  Ｃａｎｃｅｒ  Ｔｈｅｒａｐｙ”，ｉｎ  Ｍｏｎｏｃｌｏｎａｌ  Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ  Ａｎｄ  Ｃａｎｃｅｒ  Ｔｈｅｒａｐｙ，Ｒｅｉｓｆｅｌｄ  ｅｔ  ａｌ．（ｅｄｓ．），ｐｐ．２４３−５６（Ａｌａｎ  Ｒ．Ｌｉｓｓ，Ｉｎｃ．１９８５）；Ｈｅｌｌｓｔｒｏｍ  ｅｔ  ａｌ．，“Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ  Ｆｏｒ  Ｄｒｕｇ  Ｄｅｌｉｖｅｒｙ”，ｉｎ  Ｃｏｎｔｒｏｌｌｅｄ  Ｄｒｕｇ  Ｄｅｌｉｖｅｒｙ（２ｎｄ  Ｅｄ．），Ｒｏｂｉｎｓｏｎ  ｅｔ  ａｌ．（ｅｄｓ．），ｐｐ．６２３−５３（Ｍａｒｃｅｌ  Ｄｅｋｋｅｒ，Ｉｎｃ．１９８７）；Ｔｈｏｒｐｅ，“Ａｎｔｉｂｏｄｙ  Ｃａｒｒｉｅｒｓ  Ｏｆ  Ｃｙｔｏｔｏｘｉｃ  Ａｇｅｎｔｓ  Ｉｎ  Ｃａｎｃｅｒ  Ｔｈｅｒａｐｙ：Ａ  Ｒｅｖｉｅｗ”，ｉｎ  Ｍｏｎｏｃｌｏｎａｌ  Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ  ’８４：Ｂｉｏｌｏｇｉｃａｌ  Ａｎｄ  Ｃｌｉｎｉｃａｌ  Ａｐｐｌｉｃａｔｉｏｎｓ，Ｐｉｎｃｈｅｒａ  ｅｔ  ａｌ．（ｅｄｓ．），ｐｐ．４７５−５０６（１９８５）；“Ａｎａｌｙｓｉｓ，Ｒｅｓｕｌｔｓ，Ａｎｄ  Ｆｕｔｕｒｅ  Ｐｒｏｓｐｅｃｔｉｖｅ  Ｏｆ  Ｔｈｅ  Ｔｈｅｒａｐｅｕｔｉｃ  Ｕｓｅ  Ｏｆ  Ｒａｄｉｏｌａｂｅｌｅｄ  Ａｎｔｉｂｏｄｙ  Ｉｎ  Ｃａｎｃｅｒ  Ｔｈｅｒａｐｙ”，ｉｎ  Ｍｏｎｏｃｌｏｎａｌ  Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ  Ｆｏｒ  Ｃａｎｃｅｒ  Ｄｅｔｅｃｔｉｏｎ  Ａｎｄ  Ｔｈｅｒａｐｙ，Ｂａｌｄｗｉｎ  ｅｔ  ａｌ．（ｅｄｓ．），ｐｐ．３０３−１６（Ａｃａｄｅｍｉｃ  Ｐｒｅｓｓ  １９８５）及びＴｈｏｒｐｅ  ｅｔ  ａｌ．，“Ｔｈｅ  Ｐｒｅｐａｒａｔｉｏｎ  Ａｎｄ  Ｃｙｔｏｔｏｘｉｃ  Ｐｒｏｐｅｒｔｉｅｓ  Ｏｆ  Ａｎｔｉｂｏｄｙ−Ｔｏｘｉｎ  Ｃｏｎｊｕｇａｔｅｓ”，Ｉｍｍｕｎｏｌ．Ｒｅｖ．，６２：１１９−５８（１９８２）を参照されたい。
【００６２】
また、対象の脳に作用物質を送達する方法も提供される。方法は、重鎖及び軽鎖を含む抗体であって、当該重鎖が配列番号１と少なくとも９０％同一である配列を含み、当該軽鎖が配列番号２と少なくとも９０％同一である配列を含む、抗体と、１つ以上の作用物質（例えば、イメージング剤または治療薬）とを含む、組成物を、対象に投与することを含む。任意選択により、治療薬は、化学療法薬である。任意選択により、重鎖は、配列番号１を含み、軽鎖は、配列番号２を含む。任意選択により、抗体は、プリツムマブである。任意選択により、抗体は、腫瘍細胞に特異的と結合するが、正常細胞には結合しない。
【００６３】
提供される組成物及び方法における使用（例えば、提供される抗体へのコンジュゲート）に好適な治療薬には、鎮痛薬、麻酔薬、興奮薬、コルチコステロイド、抗コリン薬、抗コリンエステラーゼ薬、抗痙攣薬、抗腫瘍薬、アロステリック阻害薬、アナボリックステロイド、リウマチ治療薬、精神治療薬、神経遮断薬、抗炎症薬、駆虫薬、抗生物質、抗凝固薬、抗真菌薬、抗ヒスタミン薬、抗ムスカリン薬、抗マイコバクテリア薬、抗原虫薬、抗ウイルス薬、ドパミン作動薬、血液作用薬、免疫作用薬、ムスカリン作動薬、プロテアーゼ阻害薬、ビタミン、成長因子及びホルモンからなる群から選択される治療薬が挙げられるが、これらに限定されない。作用物質及び用量の選択は、当業者であれば、治療が施される所与の疾患に基づいて容易に決定することができる。
【００６４】
本明細書に記載されるように、抗体は、イメージング剤に結合またはコンジュゲートすることができる。イメージング剤及びその使用は知られている。任意選択により、イメージング剤は、「検出可能な部分」であり、分光学、光化学、生化学、免疫化学、化学または他の物理的手段によって検出可能な組成物である。例えば、有用な標識には、３２Ｐ、蛍光色素、電子密度の高い試薬、酵素（例えば、ＥＬＩＳＡにおいて一般に使用されるもの）、ビオチン、ジゴキシゲニンまたはハプテン及びタンパク質または検出を可能にすることができる他の実体（例えば、標的ペプチドと特異的に反応するペプチドまたは抗体に放射性標識を組み込むことによる）が含まれる。抗体を標識にコンジュゲートするには、当該技術分野において知られている任意の方法を利用することができ、例えば、Ｈｅｒｍａｎｓｏｎ，Ｂｉｏｃｏｎｊｕｇａｔｅ  Ｔｅｃｈｎｉｑｕｅｓ  １９９６，Ａｃａｄｅｍｉｃ  Ｐｒｅｓｓ，Ｉｎｃ．，Ｓａｎ  Ｄｉｅｇｏに記載されている方法が使用できる。検出可能な部分は、ガンマ放射体、ベータ放射体及びアルファ放射体、ガンマ放射体、陽電子放射体、Ｘ線放射体ならびに蛍光放射体からなる群から選択することができる。好適な蛍光性化合物には、フルオレセインナトリウム、フルオレセインイソチオシアナート、フィコエリトリン及びテキサスレッド塩化スルホニル、アロフィコシアニン（ＡＰＣ）、Ｃｙ５−ＰＥ、ＣＹ７−ＡＰＣ及びカスケードイエローが含まれる。
【００６５】
任意選択により、検出可能な部分は、組織化学的手法、ＥＬＩＳＡ様アッセイ、共焦点顕微鏡法、蛍光検出法、セルソーティング法、核磁気共鳴法、ラジオイムノシンチグラフィー、Ｘ線撮影法、陽電子放射断層撮影法、コンピュータ断層撮影法、磁気共鳴画像法及び超音波検査法を使用して可視化することができる。
【００６６】
抗体アッセイ
抗体の特異性及び親和性を確認し、これらの抗体が他のタンパク質と交差反応するかどうかを決定するために、目的抗体をアッセイするための多数のスクリーニングアッセイが当該技術分野において知られている。
【００６７】
「特異的結合」または「特異的に結合する」という用語は、抗原とその対応する抗体との間の相互作用を指す。相互作用は、結合分子によって認識されるタンパク質（すなわち、抗原またはエピトープ）の特定の構造の存在に依存する。結合が特異的であるためには、バックグラウンド抗原の抗体結合ではなく、目的のエピトープ（複数可）の抗体結合を伴う必要がある。
【００６８】
抗体が作製されたら、アッセイを行い、その抗体が目的抗原に特異的であることを確認し、他の抗原との何らかの交差反応性を示すかどうかを決定する。このようなアッセイを実施する１つの方法は、米国特許出願公開第２００４／０１２６８２９号に記載の血清スクリーニングアッセイである（その内容を参照により明示的に本明細書に援用する）。しかしながら、品質管理のための他のアッセイ法も当業者の技術範囲内であり、ゆえに、これらも本開示の範囲内である。
【００６９】
本開示の抗体またはその抗原結合断片、バリアントもしくは誘導体は、その抗原に対する結合親和性についても記載または明記され得る。抗原に対する抗体の親和性は、任意の好適な方法を使用して実験的に決定することができる（例えば、Ｂｅｒｚｏｆｓｋｙ  ｅｔ  ａｌ．，“Ａｎｔｉｂｏｄｙ−Ａｎｔｉｇｅｎ  Ｉｎｔｅｒａｃｔｉｏｎｓ，”  Ｉｎ  Ｆｕｎｄａｍｅｎｔａｌ  Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ，Ｐａｕｌ，Ｗ．Ｅ．，Ｅｄ．，Ｒａｖｅｎ  Ｐｒｅｓｓ：Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ，Ｎ．Ｙ．（１９８４）；Ｋｕｂｙ，Ｊａｎｉｓ  Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ，Ｗ．Ｈ．Ｆｒｅｅｍａｎ  ａｎｄ  Ｃｏｍｐａｎｙ：Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ，Ｎ．Ｙ．（１９９２）；及び本明細書に記載される方法を参照されたい）。特定の抗体−抗原相互作用について測定される親和性は、異なる条件（例えば、塩濃度、ｐＨ）下で測定した場合、変動し得る。したがって、親和性及び他の抗原結合パラメータ（例えば、ＫＤ、Ｋａ、Ｋｄ）の測定は、好ましくは、抗体及び抗原の標準液ならびに標準化された緩衝液を用いて行われる。
【００７０】
親和性結合定数（Ｋａｆｆ）は、以下の式を使用して決定することができる。
2018531625.tif 000007
式中、
2018531625.tif 000008
である。
【００７１】
［ｍＡｂ］は、未結合の抗原部位の濃度であり、［ｍＡｇ］は、２つの異なる抗原濃度（すなわち、［ｍＡｇ］ｔ及び［ｍＡｇ’］ｔ）で決定したときの未結合のモノクローナル結合部位の濃度である。（Ｂｅａｔｔｙ  ｅｔ  ａｌ．，Ｊ  Ｉｍｍ  Ｍｅｔｈ，１００：１７３−１７９（１９８７））。
【００７２】
抗体抗原親和性及び反応速度論の検出及び測定には表面プラズモン共鳴（ＳＰＲ）を使用することができる（例えば、Ｈｅａｒｔｙ，Ｓ．，ｅｔ  ａｌ．，Ｍｅｔｈｏｄｓ  Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．，９０７：４１１−４２（２０１２）；Ｍａｌｍｑｖｉｓｔ，Ｍ．，Ｃｕｒｒｅｎｔ  Ｏｐｉｎｉｏｎ  ｉｎ  Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ，５：２８２−２８６（１９９３）；Ｃｈａｔｅｌｌｉｅｒ，Ｊ，ｅｔ  ａｌ．，Ｊ．Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｒｅｃｏｇｎｉｔｉｏｎ，９：３９−５１（１９９６）；Ｍａｒｇｕｌｉｅｓ，Ｄ．Ｈ．，ｅｔ  ａｌ．，Ｃｕｒｒｅｎｔ  Ｏｐｉｎｉｏｎ  ｉｎ  Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ，８：２６２−２７０（１９９６）；Ｆｏｒｂｅｓ，Ｂ．Ｅ．，ｅｔ  ａｌ．，Ｅｕｒ．Ｊ．Ｂｉｏｃｈｅｍ．，２６９：９６１−９６８（２００２）参照）。
【００７３】
抗体に関する「高親和性」という用語は、少なくとも約１×１０７リットル／モル、または少なくとも約１×１０８リットル／モル、または少なくとも約１×１０９リットル／モル、または少なくとも約１×１０１０リットル／モル、または少なくとも約１×１０１１リットル／モル、または少なくとも約１×１０１２リットル／モル、または少なくとも約１×１０１３リットル／モル、または少なくとも約１×１０１４リットル／モルまたはそれ以上の平衡会合定数（Ｋａｆｆ）を指す。「高親和性」結合は、抗体アイソタイプごとに変わり得る。平衡解離定数ＫＤは、抗体親和性を記述するためにも使用される用語であり、Ｋａｆｆの逆数である。
【００７４】
平衡解離定数ＫＤは、抗体親和性を記述するためにも使用される用語であり、Ｋａｆｆの逆数である。ＫＤが使用される場合、抗体に関する「高親和性」という用語は、約１×１０−７モル／リットル未満、または約１×１０−８モル／リットル未満、または約１×１０−９モル／リットル未満、または約１×１０−１０モル／リットル未満、または約１×１０−１１モル／リットル未満、または約１×１０−１２モル／リットル未満、または約１×１０−１３モル／リットル未満、または約１×１０−１４モル／リットルまたはそれ以下の平衡解離定数（ＫＤ）を指す。
【００７５】
本開示による抗体の作製は、生理学的ヒト免疫応答の過程で生じるもの、すなわち、ヒト免疫系によってのみ選択され得る抗体特異性の特徴を有する抗体を提供する。これらの抗体は、適切な製剤化を経て、予防薬または治療薬として使用することができる。
【００７６】
特定の作用物質に関する「中和抗体」、「広範な中和抗体」または「中和モノクローナル抗体」は、本明細書において全て同じ意味で用いられ、当該作用物質が宿主内で機能する能力を中和することができる抗体である。いくつかの実施形態において、本開示に従って作製されたモノクローナル抗体は、その抗体が１０−９Ｍ以下（例えば、１０−１０Ｍ、１０−１１Ｍ、１０−１２Ｍ以下）の濃度で中和することができる場合、中和活性を有する。
【００７７】
本発明の免疫グロブリン分子は、任意の種類（例えば、ＩｇＧ、ＩｇＥ、ＩｇＭ、ＩｇＤ、ＩｇＡ及びＩｇＹ）、クラス（例えば、ＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３、ＩｇＧ４、ＩｇＡ１及びＩｇＡ２）またはサブクラスの免疫グロブリン分子であってよい。いくつかの実施形態において、抗体は、抗原結合抗体断片（例えば、ヒト）であり、Ｆａｂ、Ｆａｂ’及びＦ（ａｂ’）２、Ｆｄ、一本鎖Ｆｖ（ｓｃＦｖ）、一本鎖抗体、ジスルフィド結合Ｆｖ（ｓｄＦｖ）及びＶＬまたはＶＨドメインのいずれかを含む断片が含まれるが、これらに限定されない。抗原結合抗体断片は、一本鎖抗体を含め、可変領域（複数可）を、単独で、または次の全体もしくは一部：ヒンジ領域、ＣＨ１、ＣＨ２及びＣＨ３ドメインとの組み合わせで含み得る。可変領域（複数可）と、ヒンジ領域、ＣＨ１、ＣＨ２及びＣＨ３ドメインとの任意の組み合わせを含む抗原結合断片もまた本開示に含まれる。
【００７８】
組み換え発現
本開示の方法はまた、核酸を利用して、目的抗体を発現することができる宿主細胞を作製することも提供する。
【００７９】
いくつかの実施形態において、所望の抗体をコードするヌクレオチド配列を構築し、その後、異種発現系、例えば、２９３細胞またはＣＨＯ細胞を用いることができる。いくつかの実施形態において、抗体は、目的抗体をコードする核酸（例えば、重鎖及び／または軽鎖の遺伝子）を１つ以上得て、宿主細胞内での目的抗体の発現を可能にするために、その核酸を当該宿主内に挿入することによって、組み換え発現を行うことができる。
【００８０】
組み換えＤＮＡ法を使用した抗体作製は、例えば、米国特許第４，８１６，５６７号に記載されている。抗体の組み換え作製の場合、抗体をコードする核酸を単離し、更なるクローニング（ＤＮＡの増幅）または発現のために複製可能なベクター内に挿入する。モノクローナル抗体をコードするＤＮＡは、従来の手順を使用して（例えば、抗体の重鎖及び軽鎖をコードする遺伝子に特異的に結合することができるオリゴヌクレオチドプローブを使用することによって）、容易に単離及び配列決定される。使用することができるベクターは、一般に、次のもの：シグナル配列、複製起点、１つ以上のマーカー遺伝子、エンハンサーエレメント、プロモーター及び転写終結配列のうちの１つ以上を含むが、これらに限定されない。このような発現系の構成要素の例は、例えば、米国特許第５，７３９，２７７号に開示されている。本明細書のベクターでＤＮＡをクローニングまたは発現させるのに好適な宿主細胞は、原核生物、酵母または高等真核細胞である（例えば、米国特許第５，７３９，２７７号参照）。
【００８１】
医薬組成物
本明細書で開示される主題は、本開示に従って作製された抗体及び抗原結合タンパク質を含む医薬組成物を提供する。いくつかの実施形態において、医薬組成物は、本明細書で開示される方法を使用して作製された抗体または抗原結合タンパク質を１つ以上含むことができる。いくつかの実施形態において、本開示に従って作製された抗体または抗原結合タンパク質のパネルを医薬組成物に含めることができる。いくつかの実施形態において、本開示に従って作製された抗体または抗原結合タンパク質は、１つ以上の追加の作用物質、例えば、抗ウイルスもしくは抗がん薬物または鎮痛薬とともに含めることができる。
【００８２】
いくつかの実施形態において、医薬組成物はまた、抗体または抗原結合タンパク質を投与するための薬学的に許容される担体またはアジュバントも含有し得る。いくつかの実施形態において、担体は、ヒトにおける使用に対して薬学的に許容されるものである。担体またはアジュバントは、それ自体が、組成物の投与を受ける個体に対して有害な抗体の産生を誘発するものであってはならず、有毒であってもならない。好適な担体は、タンパク質、ポリペプチド、リポソーム、多糖、ポリ乳酸、ポリグリコール酸、高分子アミノ酸、アミノ酸共重合体及び不活性ウイルス粒子などのゆっくりと代謝される大きな高分子であり得る。
【００８３】
薬学的に許容される塩は、例えば、塩酸塩、臭化水素酸塩、リン酸塩及び硫酸塩などの鉱酸塩、または酢酸塩、プロピオン酸塩、マロン酸塩及び安息香酸塩などの有機酸塩を使用することができる。
【００８４】
治療用組成物中の薬学的に許容される担体は、水、生理食塩水、グリセロール及びエタノールなどの液体を追加的に含有し得る。更に、湿潤剤または乳化剤またはｐＨ緩衝物質などの補助物質が当該組成物中に存在してもよい。このような担体は、患者による摂取のために、医薬組成物を、錠剤、丸剤、糖衣剤、カプセル剤、液剤、ゲル剤、シロップ剤、スラリー剤及び懸濁剤として製剤化できるようにする。
【００８５】
本明細書で開示される主題の組成物は、組成物の調製及び投与を容易にするための担体を更に含み得る。任意の好適な送達ビヒクルまたは担体を使用することができ、これらには、マイクロカプセル、例えば、マイクロスフェアまたはナノスフェア（Ｍａｎｏｍｅ  ｅｔ  ａｌ．（１９９４）Ｃａｎｃｅｒ  Ｒｅｓ  ５４：５４０８−５４１３；Ｓａｌｔｚｍａｎ＆Ｆｕｎｇ（１９９７）Ａｄｖ  Ｄｒｕｇ  Ｄｅｌｉｖ  Ｒｅｖ  ２６：２０９−２３０）、グリコサミノグリカン（米国特許第６，１０６，８６６号）、脂肪酸（米国特許第５，９９４，３９２号）、脂肪エマルジョン（米国特許第５，６５１，９９１号）、脂質または脂質誘導体（米国特許第５，７８６，３８７号）、コラーゲン（米国特許第５，９２２，３５６号）、多糖またはその誘導体（米国特許第５，６８８，９３１号）、ナノ懸濁液（米国特許第５，８５８，４１０号）、ポリマーミセルまたはコンジュゲート（Ｇｏｌｄｍａｎ  ｅｔ  ａｌ．（１９９７）Ｃａｎｃｅｒ  Ｒｅｓ  ５７：１４４７−１４５１及び米国特許第４，５５１，４８２号、同第５，７１４，１６６号、同第５，５１０，１０３号、同第５，４９０，８４０号及び同第５，８５５，９００号）、及びポリソーム（米国特許第５，９２２，５４５）が含まれるが、これらに限定されない。
【００８６】
抗体配列は、当該技術分野において既知の方法、例えば、限定するものではないが、カルボジイミド結合、エステル化、過ヨウ素酸ナトリウム酸化に続く還元アルキル化、及びグルタルアルデヒド架橋を使用して、活性作用物質または担体に結合させることができる（Ｇｏｌｄｍａｎ  ｅｔ  ａｌ．（１９９７）Ｃａｎｃｅｒ  Ｒｅｓ．５７：１４４７−１４５１；Ｃｈｅｎｇ（１９９６）Ｈｕｍ．Ｇｅｎｅ  Ｔｈｅｒ．７：２７５−２８２；Ｎｅｒｉ  ｅｔ  ａｌ．（１９９７）Ｎａｔ．Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．１５：１２７１−１２７５；Ｎａｂｅｌ（１９９７）Ｖｅｃｔｏｒｓ  ｆｏｒ  Ｇｅｎｅ  Ｔｈｅｒａｐｙ．Ｉｎ  Ｃｕｒｒｅｎｔ  Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ  ｉｎ  Ｈｕｍａｎ  Ｇｅｎｅｔｉｃｓ，Ｊｏｈｎ  Ｗｉｌｅｙ＆Ｓｏｎｓ，Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ；Ｐａｒｋ  ｅｔ  ａｌ．（１９９７）Ａｄｖ．Ｐｈａｒｍａｃｏｌ．４０：３９９−４３５；Ｐａｓｑｕａｌｉｎｉ  ｅｔ  ａｌ．（１９９７）Ｎａｔ．Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．１５：５４２−５４６；Ｂａｕｍｉｎｇｅｒ＆Ｗｉｌｃｈｅｋ（１９８０）Ｍｅｔｈ．Ｅｎｚｙｍｏｌ．７０：１５１−１５９；米国特許第６，０７１，８９０号；及び欧州特許第０４３９０９５号）。
【００８７】
本発明の治療用組成物は、いくつかの実施形態において、薬学的に許容される担体を含む医薬組成物を含む。好適な製剤には、抗酸化剤、緩衝剤、静菌剤、殺菌性抗生物質及び製剤を対象のレシピエントの体液と等張にする溶質を含有し得る、水性及び非水性の無菌注射液；ならびに懸濁化剤及び粘稠化剤を含み得る水性及び非水性の無菌懸濁液が含まれる。製剤は、単位用量または複数回用量の容器（例えば、密封されたアンプル及びバイアル）で提供することができ、使用直前に無菌液体担体（例えば、注射用水）の添加のみを要する凍結またはフリーズドライ（凍結乾燥）状態で保存することができる。いくつかの例示的な成分は、いくつかの実施形態において０．１〜１０ｍｇ／ｍｌの範囲、いくつかの実施形態において約２．０ｍｇ／ｍｌであるＳＤＳ；及び／またはいくつかの実施形態において１０〜１００ｍｇ／ｍｌの範囲、いくつかの実施形態において約３０ｍｇ／ｍｌであるマンニトールもしくは別の糖；及び／またはリン酸緩衝生理食塩水（ＰＢＳ）である。当該製剤の種類を考慮して、当該技術分野において慣用の任意の他の作用物質を使用することができる。いくつかの実施形態において、担体は、薬学的に許容されるものである。いくつかの実施形態において、担体は、ヒトにおける使用に対して薬学的に許容されるものである。
【００８８】
本開示の医薬組成物は、５．５〜８．５、好ましくは６〜８、より好ましくは約７のｐＨを有し得る。ｐＨは、緩衝液の使用により維持することができる。組成物は、滅菌及び／またはパイロジェンフリーであり得る。組成物は、ヒトに対して等張であり得る。本明細書で開示される主題の医薬組成物は、気密容器で供給することができる。
【００８９】
医薬組成物は、本明細書に記載される１つ以上の抗体を有効量で含み得る。いくつかの実施形態において、医薬組成物は、所望の疾患または病態を治療し、改善し、もしくは予防し、または検出可能な治療効果を示すのに十分な量を含み得る。治療効果には、身体的症状の軽減も含まれる。任意の特定の対象に対する正確な有効量は、対象の体格及び健康状態、病態の性質及び程度、ならびに投与のために選択された治療薬または治療薬の組み合わせに依存する。所与の状況に対する有効量は、当業者によって実施される日常的な実験で決定される。
【００９０】
治療レジメン：薬物動態
本発明の医薬組成物は、投与方法に応じて、種々の単位剤形で投与することができる。典型的な抗体医薬組成物の用量は、当業者によく知られている。かかる用量は、典型的に本質は推奨的なものであり、具体的な治療状況または患者の耐性に応じて調整される。これを達成するのに適切な抗体の量を「治療上有効な用量」と定義する。この使用に効果的な投与計画及び量、すなわち、「投薬レジメン」は、疾患または病態のステージ、疾患または病態の重症度、患者の全般的な健康状態、患者の身体的状態、年齢、医薬製剤及び活性作用物質の濃度などを含む、種々の因子に依存する。患者の投薬レジメンを計算する際には、投与方法も考慮される。投薬レジメンは、薬物動態、すなわち、医薬組成物の吸収速度、バイオアベイラビリティ、代謝、クリアランスなどを考慮する必要がある。例えば、最新版のＲｅｍｉｎｇｔｏｎ’ｓ；Ｅｇｌｅｔｏｎ，Ｐｅｐｔｉｄｅｓ  １８：１４３１−１４３９，１９９７；Ｌａｎｇｅｒ，Ｓｃｉｅｎｃｅ  ２４９：１５２７−１５３３，１９９０を参照されたい。
【００９１】
本発明上、抗体を含む治療上有効な量の組成物は、約０．０５〜１５００μｇのタンパク質、好ましくは約１０〜１０００μｇのタンパク質、より好ましくは約３０〜５００μｇ、最も好ましくは約４０〜３００ｐｇ、またはこれらの値の間の任意の整数のタンパク質を含有する。例えば、本発明の抗体は、約０．１μｇ〜約２００ｍｇ、例えば、約０．１μｇ〜約５μｇ、約５μｇ〜約１０μｇ、約１０μｇ〜約２５μｇ、約２５μｇ〜約５０μｇ、約５０μｇ〜約１００μｇ、約１００μｇ〜約５００μｇ、約５００μｇ〜約１ｍｇ、約１ｍｇ〜約２ｍｇの用量で対象に投与することができ、任意選択で、例えば、１週間、２週間、３週間、４週間、２ヶ月、３ヶ月、６ヶ月及び／または１年後に追加投与を行ってもよい。任意の特定の患者に関する具体的な用量レベルは、使用される具体的な化合物の活性、年齢、体重、全般的な健康、性別、食習慣、投与時間、投与経路、排泄速度、薬物の組み合わせ及び治療中の特定の疾患の重症度を含む、種々の因子に依存することが理解される。
【００９２】
投与経路には、経口、局所、皮下（ｓｕｂｃｕｔａｎｅｏｕｓ）、筋肉内、静脈内、皮下（ｓｕｂｃｕｔａｎｅｏｕｓ）、皮内、経皮及び皮下（ｓｕｂｄｅｒｍａｌ）が含まれるが、これらに限定されない。投与経路に応じて、１投与当たりの体積は、好ましくは、約０．００１〜１０ｍｌ、より好ましくは、約０．０１〜５ｍｌ、最も好ましくは約０．１〜３ｍｌである。組成物は、対象の年齢、体重及び状態、使用される具体的な抗体製剤ならびに投与経路に適した計画及び期間にわたって、単回投与治療または反復投与治療で投与することができる。
【００９３】
キット
本発明は、例えば、上記の治療用途に使用することができる、本開示に従って作製された抗体を含むキットを提供する。製造物品は、ラベルの付いた容器を含む。好適な容器には、例えば、ボトル、バイアル及び試験管が含まれる。容器は、ガラスまたはプラスチックなどの種々の材料から形成され得る。容器は、上記のような治療用途に有効な活性作用物質を含む組成物を保持する。組成物中の活性作用物質は、抗体を含み得る。容器のラベルは、当該組成物が特定の治療用途または非治療用途に使用されることを示し、また、上記のようなｉｎ  ｖｉｖｏまたはｉｎ  ｖｉｔｒｏでの使用のいずれかのための指示を示すこともできる。
【００９４】
本発明を実施するための具体的な態様の以下の実施例は、例示のみを目的として提供するものであり、本発明の範囲をいかなる形でも限定するものではない。
【実施例】
【００９５】
実施例１．プリツムマブの血液脳関門の通過
プリツムマブが血液脳関門を通過することを実証するために、ヒト初代膠芽腫幹細胞（ＧＢＭ８細胞；２００Ｋ細胞）をＮＳＧマウス脳内に頭蓋内注射した。３５日後、マウスに５０μｇのプリツムマブ−Ａｌｅｘａ６４７抗体を尾静脈を介して静脈内（ｉ．ｖ．）投与した。３．５時間後、マウス内皮細胞に選択的に結合するフルオレセイン標識Ｇ．ｓｉｍｐｌｉｃｉｆｏｌｉａレクチン２０μｇ（ＧＳＬ  Ｉ−ＢＳＬ  Ｉ；Ｖｅｃｔｏｒ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｉｅｓ，Ｉｎｃ．，Ｂｕｒｌｉｎｇａｍｅ，ＣＡ）をｉ．ｖ．注射した。次いで、マウスを安楽死させ、脳を取り出し、スライスし、様々な領域の画像を共焦点顕微鏡（Ｎｉｋｏｎ  ｅｃｌｉｐｓｅ  Ｔｉ）によって取得した。結果を図２に示す。プリツムマブは、脳腫瘍組織に存在するが、正常組織には存在しない。これらの結果を更に調べるために、プリツムマブの脳内分布について検討した。正常脳領域では、プリツムマブ抗体は、注射４時間後、正常なインタクト血管中に主に存在し、血管周囲の漏出はごくわずかである（図３）。腫瘍領域では、プリツムマブ抗体は、注射４時間後、腫瘍内の蛇行した大きな漏出性腫瘍血管の外側に主に存在する（図４）。
【００９６】
脳及び他の組織内のプリツムマブ分布を更に検討した。概して体重２０〜２５ｇの雄雌のＳＣＩＤマウスをマイクロアイソレーターケージ内でオートクレーブした床敷ならびにオートクレーブした食餌及び水で飼育した。このモデルの制限は、ヒト神経膠腫細胞を無胸腺ｎｕ／ｎｕマウスまたはＳＣＩＤマウスに移植することを伴うことである。
【００９７】
頭蓋内移植のために、ＵＣＳＤ動物実験研究指針に従って無菌外科的手術法を実施した。標的細胞（Ｕ８７細胞株及び患者由来ＧＢＭ８神経膠腫細胞の両方）を濃縮してコンパクト懸濁液にした（１〜２ｕｌ）。ケタミン／キシラジンを用いてマウスに麻酔をかけ、ベタダインで頭部を拭いた。循環水パッドで体温を維持した。５ｕｌのハミルトンシリンジを使用して、腫瘍細胞懸濁液を前頭皮質に１ｕｌ／分で定位的に注射した。注入物質の逆流を防ぐために、シリンジを５分間その場に留置してから引き抜いた。
【００９８】
画像化のために、腫瘍の成長に従って、移植腫瘍（Ｕ８７及び患者由来ＧＢＭ８神経膠腫細胞の両方）のＭＲＩ撮像を毎週実施した。適切なスキャン後、マウスを屠殺した。ＭＲＩプロトコルは以下のとおりとした。撮像中、１．５％イソフルオラン及び９５％酸素の混合物でマウスに麻酔をかけた。ＭＲＩは、市販のスキャナーコンソールと連結している４．７Ｔ水平型システム（Ｂｒｕｋｅｒ  ＢｉｏＳｐｉｎ  Ｃｏｒｐｏｒａｔｉｏｎ（ＭＡ））で均一直交配置バードケージ型ヘッドコイルを使用して実施した。冠状面のＴ２強調画像（Ｔ２ＷＩ）（ＴＲ／ＴＥｅｆｆ＝２，０００／７２ｍｓ）を、２Ｄ高速スピンエコーシーケンス、スライス厚１ｍｍ、平面分解能８０ｕｍ×１３０ｕｍで取得した。マグネビストＧｄ−ＤＴＰＡを０．７ｍｍｏｌ／ｋｇで腹腔内注射し、冠状面のＴ１強調画像（Ｔ１ＷＩ）（ＴＲ／ＴＥｅｆｆ＝４１７／２４．５ｍｓ）を造影剤注射の前に１回、後に２回取得した。造影後の撮像は、注射後１２分に実施した。
【００９９】
脳の強調は、腫瘍微小血管の透過性の尺度を表し、治療薬が腫瘍内でどのように分布し得るか、また造影剤が小さな腫瘍を強調できるかどうかに関係する。コントラスト強調比は、腫瘍組織を反対側の正常脳と比較することによって決定する通常の正規化法を使用した。腫瘍と頸部骨格筋（胸鎖乳突筋）を比較した強調比も算出した。これは、腫瘍浸潤及び浮腫に起因する参照白質の透過性変化から不正確さが生じる可能性があることから、腫瘍対正常脳比の確認を提供するために実施した。
【０１００】
腫瘍と反対側の白質の比（ＴＷＲ）及び腫瘍筋肉強調比（ＴＭＲ）は、造影１２分後のＴ１ＷＩにおける、強調された腫瘍の平均シグナル強度をそれぞれ白質と頸部筋肉の平均シグナル強度で除したものとした。造影前と造影後の画像に関して、最大強調関心領域（ＲＯＩ）を手動で選択した。各動物のＴ１及びＴ２取得を相互参照して、適切なＲＯＩ位置を確保した。
【０１０１】
腫瘍形態については、全てのＧＢＭ８腫瘍（ｎ＝６）が明確な境界を有し、中心壊死は観察されなかった。Ｔ２ＷＩの腫瘍は、周囲の脳実質と比較して相対的に均一な高強度を有し、全てが均一なはっきりと目に見えるコントラスト強調を示した。
【０１０２】
結果を図５及び表２に示す。図５は、種々の腫瘍細胞に特異的に結合するが正常細胞には結合しないプリツムマブを示す、組織スライス画像である。以下の表２は、腫瘍細胞と特異的に結合し、正常細胞とは結合しないプリツムマブを示す。プリツムマブは、そのハイブリドーマから得るか、例えば、Ｇｕｐｔａ，ｅｔ  ａｌ．，ｔｈｅ  Ｊｏｕｒｎａｌ  ｏｆ  Ｂｉｏｐｒｏｃｅｓｓ  Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ  ９８：３１８−３２６（２０１３）（「Ｇｕｐｔａ」）に記載のＣＨＯ細胞で製造した。
【０１０３】
（表２）ハイブリドーマから得たまたはＣＨＯ細胞で製造したプリツムマブの、正常細胞及び腫瘍細胞内分布
2018531625.tif 000009
【０１０４】
実施例２．脳への送達が向上した抗体の生成
材料：
細胞株：大腸菌（Ｅ．ｃｏｌｉ）  ＣＪ２３６（Ｎｅｗ  Ｅｎｇｌａｎｄ  Ｂｉｏｌａｂｓ，Ｂｅｖｅｒｌｙ，ＭＡ）；大腸菌  ＳＳ３２０（Ｌｕｃｉｇｅｎ，Ｍｉｄｄｌｅｔｏｎ，ＷＩ）；大腸菌  Ｏｎｅ  Ｓｈｏｔ（登録商標）ＯｍｎｉＭＡＸ（商標）２  Ｔ１Ｒ（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ，Ｇｒａｎｄ  Ｉｓｌａｎｄ，ＮＹ）；チャイニーズハムスター卵巣（ＣＨＯ）細胞；ＨＥＫ  細胞。
【０１０５】
腫瘍組織及び腫瘍細胞株：腫瘍組織は、その臨床及び診断利用後に全て廃棄され、細胞株は、ＡＴＣＣ（ＵＳＡ）から入手する。腫瘍組織は、脳、乳房、子宮頸部、結腸、肝臓、黒色腫、卵巣及び膵臓の各がんを含む。正常組織対照として子宮平滑筋を使用する。これらの対照を含めることにより、本来のヒト−ヒトハイブリドーマ産生プリツムマブと特にフレームワークに関して同等である組み換え作製ＣＤＲスワッピング抗体の特異性が確定される。
【０１０６】
培地：合成培地の一例は、無血清培地中の脂質添加物である合成低密度リポタンパク質（ｓＬＤＬ）である（Ｈａｙａｖｉ  ａｎｄ  Ｈａｌｂｅｒｔ，２００５）。ｓＬＤＬは、水溶液を含む溶媒中の脂質溶解物を微少溶液操作することによって製造することができ、これにより天然ＬＤＬの物理化学的特徴を有する無毒性製品が生成される。化学的に成分が明らかな（動物性不含）培地中に０．１〜０．５ｍＭクエン酸鉄を含めると、リボソーム形成及びタンパク質折り畳みに関連する遺伝子の上方制御が生じ、ＣＨＯ細胞でのｍＡｂ発現が約１／３増加することが示されている（Ｂａｉ  ｅｔ  ａｌ．，２０１１）。
【０１０７】
抗体／試薬：特定の抗体ならびに他の免疫化学製品及び常用の試薬は、Ｓｉｇｍａ−Ａｌｄｒｉｃｈ及びＰｉｅｒｃｅ  Ｔｈｅｒｍｏ  Ｆｉｓｈｅｒから入手する。
【０１０８】
プリツムマブ：プリツムマブは、特許取得済みＧＰＥｘ技術を使用してＣａｔａｌｅｎｔによって作製されている。
【０１０９】
Ｉｎｔｅｇｒａｔｅｄ  ＤＮＡ  Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ  Ｐｒｏｇｒａｍ「ＰＲＩＭＥ  ＱＵＥＳＴ」を使用したプリツムマブＣＤＲ及びフレームワークのプライマー設計：
2018531625.tif 000010
2018531625.tif 000011
2018531625.tif 000012
【０１１０】
方法：
ＰＣＲプライマー及びフレームワークカセット：拡張パッケージ領域。ＧＰＥｘ（登録商標）プロセスで使用される全ての遺伝子構築物にみられるモロニーマウス白血病ウイルス拡張パッケージング領域の一部を増幅するようにＰＣＲプライマーを設計する。以下に示すプライマーは、８５ｂｐ断片のＥＰＲを増幅する。
【０１１１】
ＥＰＲ  ＰＣＲプライマーは、
2018531625.tif 000013
を含む。
【０１１２】
重鎖。これらのＰＣＲプライマーは、ヒトＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３及びＩｇＧ４定常領域の一部を増幅するように設計する。以下に示すプライマーは、９２ｂｐ断片の定常領域に増幅される。これらのプライマーは、
2018531625.tif 000014
である。
【０１１３】
軽鎖。これらのＰＣＲプライマーは、ヒトκ定常領域の一部を増幅するように設計する。以下に示すプライマーは、８３ｂｐ断片の定常領域に増幅される。
【０１１４】
ＬＣ  ＰＣＲプライマー：
2018531625.tif 000015
【０１１５】
対照。これらのＰＣＲプライマーは、ＣＨＯ  β１，４−ガラクトシルトランスフェラーゼ遺伝子の一部を増幅するように設計する。以下に示すプライマーは、８２ｂｐ断片のＣＨＯ  β１，４−ガラクトシルトランスフェラーゼ−１遺伝子を増幅する。
【０１１６】
対照単一コピー遺伝子ＰＣＲプライマー：
2018531625.tif 000016
【０１１７】
ＤＮｅａｓｙゲノムＤＮＡ精製キット（カタログ番号６９５０４、Ｑｉａｇｅｎ（Ｖａｌｅｎｃｉａ，ＣＡ））を使用して細胞株からＤＮＡを単離する。ＰＣＲ反応は、ＳＹＢＲ（登録商標）Ｇｒｅｅｎ  ＰＣＲ  Ｍａｓｔｅｒ  Ｍｉｘ（カタログ番号４３１１０３４、Ａｐｐｌｉｅｄ  Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍ（Ｆｏｓｔｅｒ  Ｃｉｔｙ，ＣＡ））で以下に記載する条件下で設定する。試料をＢｉｏ−Ｒａｄ社（Ｈｅｒｃｕｌｅｓ，ＣＡ）のｉＱサイクラーで次のサイクルプログラムを使用して走らせる。
【０１１８】
ＰＣＲ成分最終濃度に関するＰＣＲ反応設定
１反応当たりＳＹＢＲ（登録商標）Ｇｒｅｅｎ  ＰＣＲ  Ｍａｓｔｅｒ  Ｍｉｘ  １２．５μＬ
プライマー最終濃度：各プライマーについて１２５ｎＭ
別個の反応は、それぞれ２５μＬの反応物（ヌクレアーゼ不含水中に希釈）に対して２０ｎｇのゲノムＤＮＡを使用して、異なるプライマーセットのそれぞれについて実施する；
ヌクレアーゼ不含水を加えて最終体積２５μＬにする。
各試料（ＥＰＲ及び内部対照）を３つ組で実施する。
【０１１９】
試料は、Ｂｉｏ−Ｒａｄ社のＰＣＲプログラム用のｉＱサイクラーで次のサイクルプログラムを使用して走らせる。
ステップ１：９５℃  ９分（変性及びポリメラーゼ活性化）
ステップ２：９４℃  １５秒（変性）
６０℃  １分（アニーリングと合成のステップの組み合わせ）ステップ２のように４０サイクル
遺伝子コピー指数をコントロールアッセイ（β１，４−ガラクトシルトランスフェラーゼ−１）のＣｔから遺伝子導入アッセイ（ＥＰＲ、ＨＣまたはＬＣ）のＣｔを差し引くことによって算出する。
【０１２０】
発現レトロベクターへの遺伝子クローニング：
目的ＣＤＲをグラフトしたプリツムマブ（Ｐ−ｍＡｂ）重鎖を発現レトロベクターにクローニングする。１回目のＰＣＲ反応において、ＣＰＳ−Ｍ（Ｃａｔａｌｅｎｔ）独自のウシα−ラクトアルブミンシグナルペプチド配列を含むＰ−ｍＡｂ重鎖可変領域ＣＤＳを、プライマー
2018531625.tif 000017
を使用して、合成ＤＮＡ断片プラスミドＧＤＤ２１２０．０００１から増幅する。プライマーＳＰ７５’は、５’末端でＨｉｎｄ  ＩＩＩ部位及びシグナルペプチドの翻訳開始コドン直前にＫｏｚａｋ翻訳開始配列に付加される。プライマーＰ−ｍＡｂＨＣ２は、２つの配列間の重複部分の付加によるＰ−ｍＡｂ重鎖定常領域へのインフレーム融合のための可変領域配列を増幅する。２回目のＰＣＲ反応において、Ｐ−ｍＡｂ重鎖定常領域を、プライマー
2018531625.tif 000018
ならびにＤＮＡ鋳型としてのＧＤＤ２１１０．０００４プラスミドを使用して、可変領域との融合が可能なように増幅する。ＧＤＤ２１１０．０００４プラスミドは、ＣＰＳ−Ｍによって予め構築し、重鎖定常領域配列の反応源とする。プライマーＰ−ｍＡｂＨＣ１は、プライマーＰ−ｍＡｂＨＣ２の逆相補体であるため、２つの配列間の重複部分の付加による可変領域へのインフレーム融合のための増幅された定常領域配列を構築する目的に役立つ。プライマーＩＮＨＣ２は、重鎖定常領域の３’末端をコードし、容易なクローニングのためのＸｈｏ  Ｉ部位を与える。ＰＣＲ反応１及び２の増幅産物を最も外側のプライマーＳＰ７５’及びＩＮＨＣ２を含むＤＮＡ鋳型として使用して、可変領域と定常領域を一緒に結合させ、完全長Ｐ−ｍＡｂ重鎖ＣＤＳを増幅する。得られたＰＣＲ産物をＨｉｎｄ  ＩＩＩ及びＸｈｏ  Ｉ制限エンドヌクレアーゼで消化し、同じ酵素で同様に消化したレトロベクタープラスミドｐＦＣＳｎｅｗＭＣＳ−ＷＰＲＥ−ＳＩＮ（ｎｅｗ  ｏｒｉ）（ＧＤＤ１００８．０１４６）にライゲートする。
【０１２１】
得られたクローンは、組み立てられた重鎖遺伝子及びフランキング領域全体にわたって配列決定し、クローンが所望の完全長Ｐ−ｍＡｂ重鎖ＣＤＳをコードしていることを確認する。
【０１２２】
発現レトロベクターへのＰ−ｍＡｂ軽鎖遺伝子クローニング：１回目のＰＣＲ反応において、ＣＰＳ−Ｍ独自のウシα−ラクトアルブミンシグナルペプチド配列を含むＰ−ｍＡｂ軽鎖可変領域ＣＤＳを、プライマー
2018531625.tif 000019
を使用して、合成ＤＮＡ断片プラスミドＧＤＤ２１２０．０００１から増幅する。プライマーＳＰ７５’は、５’末端でＨｉｎｄ  ＩＩＩ部位及びシグナルペプチドの翻訳開始コドン直前にＫｏｚａｋ翻訳開始配列に付加される。プライマーＰｍａｂＬＣ２は、２つの配列間の重複部分の付加によるＰ−ｍＡｂ軽鎖定常領域へのインフレーム融合のための軽鎖可変領域配列を増幅する。２回目のＰＣＲ反応において、Ｐ−ｍＡｂ軽鎖定常領域を、プライマー
2018531625.tif 000020
ならびにＤＮＡ鋳型としてのＧＤＤ２１０３．０００３プラスミドを使用して、軽鎖可変領域との融合が可能なように増幅する。ＧＤＤ２１０３．０００３プラスミドは、ＣＰＳ−Ｍによって予め構築し、この反応における軽鎖定常領域配列の供給源とする。プライマーＰｍａｂＬＣ１は、プライマーＰｍａｂＬＣ２の逆相補体であるため、可変領域へのインフレーム融合のための増幅された定常領域配列を構築する目的に役立つ。プライマーＩＮＬＣ２は、軽鎖定常領域の３’末端をコードし、容易なクローニングのためのＸｈｏ  Ｉ部位を与えた。
【０１２３】
ＰＣＲ反応１及び２の増幅産物を最も外側のプライマーＳＰ７５’及びＩＮＬＣ２を含むＤＮＡ鋳型として使用して、可変領域及び定常領域を結合させ、完全長Ｐ−ｍＡｂ軽鎖ＣＤＳを増幅する。得られたＰＣＲ産物をＨｉｎｄ  ＩＩＩ及びＸｈｏ  Ｉ制限エンドヌクレアーゼで消化し、同じ酵素で同様に消化したレトロベクタープラスミドｐＦＣＳ−ｎｅｗＭＣＳＷＰＲＥ−ＳＩＮ（ｎｅｗ  ｏｒｉ）（ＧＤＤ１００８．０１４６）にライゲートする。得られたクローンから単離したプラスミドＤＮＡを、組み立てられた軽鎖遺伝子及びフランキング領域全体にわたって配列決定し、クローンが所望の完全長Ｐ−ｍＡｂ軽鎖ＣＤＳをコードしていることを確認した。
【０１２４】
Ｃａｔａｌｅｎｔ  Ｐｈａｒｍａ  Ｓｏｌｕｔｉｏｎｓ−Ｍｉｄｄｌｅｔｏｎの発現レトロベクター構築物ｐＦＣＳ−ｎｅｗＭＣＳ−ＷＰＲＥ−ＳＩＮ（ｎｅｗ  ｏｒｉ）（ＧＤＤ１００８．０１４６）の開発：ｐＦＣＳ−ｎｅｗＭＣＳ−ＳＩＮ（ｎｅｗ  ｏｒｉ）（ＧＤＤ１００８．０１３６）（後述）にＷＰＲＥ転写後調節エレメント（機能については後述）を付加することによって、最新世代のＧＰＥｘ（登録商標）発現プラスミドｐＦＣＳ−ｎｅｗＭＣＳ−ＷＰＲＥ−ＳＩＮ（ｎｅｗ  ｏｒｉ）（ＧＤＤ１００８．０１４６）を作製する。簡潔に述べれば、ｐＣＮＳ−ｎｅｗＭＣＳ−ＷＰＲＥ（ｎｅｗ  ｏｒｉ）（ＧＤＤ１００８．００６８）（後述）をＣｌａＩで消化し、ＷＰＲＥ含有断片を単離及び精製する。このＷＰＲＥ断片を、ＣｌａＩによるｐＦＣＳ−ｎｅｗＭＣＳ−ＳＩＮ（ｎｅｗ  ｏｒｉ）（ＧＤＤ１００８．０１３６）の消化から精製した主要ベクター断片にライゲートする。制限エンドヌクレアーゼＨｉｎｄＩＩＩ及びＮａｅＩを使用して組み換え分子をスクリーニングし、ＷＰＲＥエレメントの正しい配向を確認する。得られたベクターのＣｌａＩ挿入部位の配列を確認する。
【０１２５】
ＧＰＥｘ（登録商標）発現プラスミドｐＦＣＳ−ｎｅｗＭＣＳ−ＳＩＮ（ｎｅｗ  ｏｒｉ）（ＧＤＤ１００８．０１３６）は、自己不活性型（ＳＩＮ）ベクターであり、５’  ＬＴＲ中にある完全長ヒトサイトメガロウイルス（ＣＭＶ）前初期エンハンサー／プロモーターを特徴とする。完全長ヒトＣＭＶプロモーター及び３’ＬＴＲの変異（ＳＩＮ）版は、ウイルス価を増加させ、５’ＬＴＲプロモーター干渉を低減させることによって、発現を改善する。このベクターは、これまで極めて成功している発現ベクターｐＣＳ−ｎｅｗＭＣＳ−ＷＰＲＥ（ｎｅｗ  ｏｒｉ）（ＧＤＤ１００８．００７４）の遺産である。プラスミドｐＦＣＳ−ｎｅｗＭＣＳ−ＳＩＮ（ｎｅｗ  ｏｒｉ）（ＧＤＤ１００８．０１３６）は、プラスミドｐＦＣＮＳ−ｎｅｗＭＣＳ−ＳＩＮ（ｎｅｗ  ｏｒｉ）（ＧＤＤ１００８．０１４０）から３’部分の拡張パッケージング領域（ＥＰＲ）及びＮｅｏ遺伝子（ネオマイシンリン酸転移酵素、選択マーカー）の一部を包含するＥｃｏＲＩ／ＨｉｎｄＩＩＩ断片の除去し、当該ＥＰＲを、その欠損部分を含むｐＣＳｎｅｗＭＣＳ−ＷＰＲＥ（ｎｅｗ  ｏｒｉ）（ＧＤＤ１００８．００７４）の小さなＥｃｏＲＩ／ＨｉｎｄＩＩＩ断片で補うことによって、構築される。プラスミドｐＣＳｎｅｗＭＣＳ−ＷＰＲＥ（ｎｅｗ  ｏｒｉ）（ＧＤＤ１００８．００７４）は、ＧＰＥｘ（登録商標）の前世代発現ベクターであり、その開発の流れを以下に記載する。構築物ｐＦＣＮＳ−ｎｅｗＭＣＳ−ＳＩＮ（ｎｅｗ  ｏｒｉ）（ＧＤＤ１００８．０１４０）は、プラスミドｐＦＣＮＳ−ｎｅｗＭＣＳ−ＷＰＲＥ−ＳＩＮ（ｎｅｗ  ｏｒｉ）ＧＤＤ１００８．０１４１からＣｌａＩ制限断片含有ＷＰＲＥ配列を除去することによって得られる。プラスミドｐＦＣＮＳ−ｎｅｗＭＣＳ−ＷＰＲＥ−ＳＩＮ（ｎｅｗ  ｏｒｉ）（ＧＤＤ１００８．０１４１）は、ネオマイシン選択マーカー遺伝子の上流の５’ＬＴＲ領域に挿入したプラスミドｐＬＮＣ−ＭＣＳ（ＧＤＤ１００８．０００１）のＰＣＲによって増幅させた完全長ヒトＣＭＶプロモーターをクローニングすることによって、ベクターｐＣＮＳ−ｎｅｗＭＣＳ−ＷＰＲＥ（ｎｅｗ  ｏｒｉ）（ＧＤＤ１００８．００６８）から作製される。最後に、構築物ｐＣＮＳ−ｎｅｗＭＣＳＷＰＲＥ（ｎｅｗ  ｏｒｉ）（ＧＤＤ１００８．００６８）は、プラスミドｐＵＣ１９由来の高コピー複製起点をプラスミドｐＣＮＳ−ｎｅｗＭＣＳ−ＷＰＲＥ（ＧＤＤ１００８．００３３）に付加することによって作製される。プラスミドｐＣＮＳ−ｎｅｗＭＣＳ−ＷＰＲＥ（ＧＤＤ１００８．００３３）の起源及び進化については、ＧＰＥｘ（登録商標）の以前の基本発現ベクターｐＣＳｎｅｗＭＣＳ−ＷＰＲＥ（ｎｅｗ  ｏｒｉ）（ＧＤＤ１００８．００７４）の開発に関する記述において以下に詳述する。
【０１２６】
プラスミドｐＣＳ−ｎｅｗＭＣＳ−ＷＰＲＥ（ｎｅｗ  ｏｒｉ）（ＧＤＤ１００８．００７４）は、本来はプラスミドｐＬＮＣＸＩＩ（ＧＤ０００４）に由来する。ｐＬＮＣＸＩＩプラスミドは、ウィスコンシン大学マディソン校Ｐａｕｌ  Ｓｏｎｄｅｌ博士の研究室から受領したプラスミドｐＬＮＣ−ｃｃ４９（ＧＤＤ１００８．００４９）からｃｃ４９遺伝子を除去することによってＣａｔａｌｅｎｔ  Ｐｈａｒｍａ  Ｓｏｌｕｔｉｏｎｓ−Ｍｉｄｄｌｅｔｏｎで再作製されるものである。ｐＬＮＣＸ  ＩＩプラスミドは、Ａ．Ｄ．Ｍｉｌｌｅｒによって作製されたｐＬＮＣＸプラスミド（Ｇｅｎｂａｎｋ  ＡＣＣＥＳＳＩＯＮ  Ｍ２８２４７）にわずかな変更を加えたものである（Ｅｃｏ  ＲＩ部位の除去；国立衛生研究所のＪｅｆｆｅｒｙ  Ｓｃｈｌｏｍ博士の研究室で実施されたＫａｓｈｍｉｒｉ  ｅｔ  ａｌ．Ｈｙｂｒｉｄｏｍａ  １４：４６１−４７３  １９９５）。ｐＬＮＣＸ  ＩＩプラスミドは、オリゴヌクレオチドを変更して、ｈＣＭＶプロモーターの後にマルチクローニングサイトを作製している（プラスミドｐＬＮＣ−ＭＣＳ  ＧＤＤ１００８．０００１）。レトロベクター粒子の産生を向上させるために、ヒトＣＭＶプロモーターを使用してｐＬＮＣ−ＭＣＳの５’  ＬＴＲ  Ｕ５領域を置き換えてプラスミドｐＣＮＣ−ＭＣＳ（ＧＤＤ１００８．００８５）を作製する。このように使用した場合、ＬＴＲの５’末端にあるヒトＣＭＶプロモーターは、レトロベクター粒子に組み込まれず、産生細胞株に挿入されない。
【０１２７】
ウッドチャックＢ型肝炎ウイルスのＰｏｌ遺伝子に由来するセグメントは、当時のＳａｌｋ  ＩｎｓｔｉｔｕｔｅのＴｏｍ  Ｈｏｐｅ博士から入手される（プラスミドｐＢｌｕｅｓｃｒｉｐｔ  ＩＩ  ＳＫ＋  ＷＰＲＥ−Ｂ１１）。この断片（ＷＰＲＥ−ウッドチャック転写後調節エレメント）は、イントロン欠損ｍＲＮＡの核から細胞質への輸送を増大させ、更に、ｍＲＮＡ中にこの配列を含む遺伝子発現を向上させる。プラスミドｐＢｌｕｅｓｃｒｉｐｔ  ＩＩ  ＳＫ＋  ＷＰＲＥ−Ｂ１１配列は、開発者によって変異され、プロモーター機能及びタンパク質ｐＸをコードする推定癌遺伝子の断片の開始コドンが除去される。ＷＰＲＥ断片をマルチクローニングサイトから３’側に挿入し、プラスミドｐＬＮＣ−ＭＣＳ−ＷＰＲＥ（ＧＤＤ１００８．０００５）を作製する。その後、ＷＰＲＥ断片をｐＬＮＣ−ＭＣＳ−ＷＰＲＥからｐＣＮＣ−ＭＣＳに移して、ｐＣＮＣＭＣＳ−ＷＰＲＥ（ＧＤＤ１００８．００３０）を作製した。
【０１２８】
サルサイトメガロウイルス（ｓＣＭＶ）プロモーターは、ＨＴＬＶ  Ｔａｘ遺伝子のための発現プラスミドであるプラスミドＩＥＸの一部として、イリノイ大学のＴｏｍ  Ｈｏｐｅ博士から入手される。サルＣＭＶプロモーターに関する文献及び知的財産背景に関する調査では、サルＣＭＶプロモーターが高い構成活性を有する点でｈＣＭＶプロモーターと同様であり、パブリックドメインで利用可能なことが記されている。ｓＣＭＶプロモーター断片をＩＥＸプラスミドからＰＣＲ増幅し、これを使用してｐＬＮＣ−ＭＣＳ中のｈＣＭＶプロモーターを置き換え、プラスミドｐＳＣＭＶ−ＭＣＳ（ＧＤＤ１００８．００１８）を作製する。その後、ｓＣＭＶプロモーター断片をＰＣＲにより改変して５’末端中のＳａｌ  Ｉ部位を除去し、ｈＣＭＶプロモーターの代わりにｐＣＮＣ−ＭＣＳ−ＷＰＲＥにクローニングして、プラスミドｐＣＮＳ−ＭＣＳ−ＷＰＲＥ（ＧＤＤ１００８．００３１）を作製する。
【０１２９】
オリゴヌクレオチドの第２セットを使用して、マルチクローニングサイトに更なる制限酵素部位を加え、プラスミドｐＣＮＳｎｅｗＭＣＳ−ＷＰＲＥ（ＧＤＤ１００８．００３３）を作製する。産生細胞株においてレトロベクター挿入物からネオマイシンリン酸転移酵素タンパク質が過剰に産生されるおそれを低減するために、ｐＣＮＳ−ｎｅｗＭＣＳ−ＷＰＲＥからＮＥＯ遺伝子を除去して、ｐＣＳ−ｎｅｗＭＣＳ−ＷＰＲＥ（ＧＤＤ１００８．００５４）を作製する。プラスミド調製物の収率を改善するために、ｐＣＳ−ｎｅｗＭＣＳＷＰＲＥ中の大腸菌複製起点をプラスミドｐＵＣ１９由来の複製起点に置き換える。これにより、プラスミドｐＣＳ−ｎｅｗＭＣＳ−ＷＰＲＥ（ｎｅｗ  ｏｒｉ）、ＧＤＤ１００８．００７４が作製される。
【０１３０】
Ｃｏｓ−７発現：ＣＯＳ７細胞をＨｅａｌｔｈ  Ｓｃｉｅｎｃｅ  Ｒｅｓｅａｒｃｈ  Ｒｅｓｏｕｒｃｅｓ  Ｂａｎｋ（Ｏｓａｋａ）から入手した。これは、サッカロミセス属の半数体株である。本項は、所望のタンパク質を短期間で効率的に産生するＣＯＳ細胞の使用について記載する。これらの細胞は、ＳＶ４０起点でのウイルスＤＮＡ複製を開始するのに必要なＳＶ４０ラージ腫瘍性（Ｔ）抗原を高レベルで発現する。ＣＯＳ細胞発現系を短期間での高レベルタンパク質発現に適したものにするには、３つの要因：（１）トランスフェクション４８時間後に、ＣＯＳ細胞中のＳＶ４０起点含有プラスミドが高コピー数を達成すること、（２）良好なＣＯＳ細胞発現／シャトルベクターが利用可能であること、及び（３）ＣＯＳ細胞を効率的にトランスフェクションする簡単な方法が利用可能であることが関与する。細胞表面抗原または細胞質タンパク質をコードするＤＮＡを（適切なベクターで）トランスフェクトした各ＣＯＳ細胞は、トランスフェクションから７２時間後、数千から数十万コピーのタンパク質を発現する。トランスフェクトしたＤＮＡが分泌タンパク質をコードしている場合、トランスフェクションから１週間後に、トランスフェクトしたＣＯＳ細胞の上清から最大１０μｇのタンパク質を回収することができる。ｃＤＮＡライブラリーのスクリーニング、細胞表面タンパク質をコードするｃＤＮＡ、分泌タンパク質及びＤＮＡ結合タンパク質の単離、ならびに安定細胞株の調製前のタンパク質発現ベクターの迅速な試験には、ＣＯＳ細胞一過性発現系も使用されている。
【０１３１】
ＥＬＩＳＡ：プリツムマブ抗体を捕捉試薬として使用するサンドイッチＥＬＩＳＡを構築した。検出抗体には、ビオチン標識された組み換え抗体を使用する。この相同抗体フォーマットは、標的抗原が複数のエピトープを有するという仮定により、可能となる。マイクロタイタープレート（９６ウェルＮｕｎｃ  Ｍａｘｉｓｏｒｐ）を、０．５Ｍ炭酸ナトリウム（ｐＨ９．５）中の濃度１０μｇ／ｍｌの精製した非標識プリツムマブ抗体を用いて、２５℃で終夜コーティングする。次いで、５ｍＭ  ＥＤＴＡ及び１％スクロースを含有するＴｒｉｓ緩衝生理食塩水（ＴＢＳ）中で作製した１％スキムミルクを用いて、プレートを２５℃で４時間ブロッキングする。このようにして調製したプレートは、少なくとも１２ヶ月間、乾燥密閉で保存できる。希釈は全て２０ｍＭ  ＥＤＴＡを添加したＩｍｍｕｎｏＢｏｏｓｔｅｒ緩衝液（Ｂｉｏｗｏｒｌｄ  Ｃｏｎｓｕｌｔｉｎｇ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｉｅｓ，ＬＬＣ）で行う。洗浄緩衝液は、０．０５％Ｔｗｅｅｎ−２０（非イオン性界面活性剤）を含有するＴＢＳである。培養したヒト腫瘍細胞の界面活性剤抽出物を抗原源として使用して標準曲線を得る。単位は、細胞／ウェルとする。同様の方法でヒト脳腫瘍細胞由来の抽出物も作製する。上記したとおり、全ての腫瘍細胞株は、Ａｍｅｒｉｃａｎ  Ｔｙｐｅ  Ｃｕｌｔｕｒｅ  Ｃｏｌｌｅｃｔｉｏｎ（Ｍａｎａｓｓａｓ，ＶＡ）から購入し、１０％ＦＢＳ（加熱不活性化済み）と８ｍＭグルタミンを含有するＲＰＭＩ培地で成長させる。標的抗原に対する抗体の直接結合を測定するために、細胞を無血清培地中で５日間成長させ、馴化培養液を濾過し、１つの大きなロットで４℃で保存する。細胞抽出標準液を希釈して各プレート上でサンドイッチＥＬＩＳＡを実施する。インキュベーションは全て２５℃で実施した。体積は全て１００ｕｌ／ウェルである。プレートを１５分間インキュベートし、洗浄緩衝液で３回洗浄した。次いで、ビオチン標識プリツムマブ抗体を１μｇ／ｍｌでウェルに添加し、１５分間インキュベートし、プレートを３回洗浄する。プレートにペルオキシダーゼ結合ストレプトアビジン（１：５，０００希釈）を１５分間加え、プレートを洗浄緩衝液で３回、ＴＢＳで２回洗浄する。プレートにＴＭＢ基質（ＢｉｏＦＸ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｉｅｓ  Ｉｎｃ．）を添加し、１５分間インキュベーションすることによってシグナルを生じさせ、次いで、０．５Ｍ硫酸の添加により発色反応を停止させる。吸光度４５０ｎｍで測定することによってデータを取得し、ＧｒａｐｈＰａｄ  ＰｒｉｓｍまたはＭｉｃｒｏｓｏｆｔ  Ｅｘｃｅｌソフトウェアプログラムを使用して解析した。
【０１３２】
免疫組織化学（ＩＨＣ）：ＩＨＣ分析には、抗体を精製し、ＨＲＰ（Ａｍｅｒｉｃａｎ  Ｑｕａｌｅｘ提供）に共有結合させ、これを使用して、種々の組織切片、例えば、脳、乳房、子宮頸部、結腸、肝臓、黒色腫、及び膵臓の各組織切片を分析する。ドナーに必要な診断及び臨床評価後に残った腫瘍組織を処理するか、または残ったパラフィンブロックを使用して、プリツムマブまたはそのハイブリッドＣＤＲ型の反応性をＩＨＣで決定する。この目的のために、パラフィンブロックから５ｕｍ切片を切り出し、スライド上に置き、６０℃で終夜、乾燥及び脱パラフィン化する。エピトープを賦活化するために、ｐＨ９のＤａｋｏ  Ｔａｒｇｅｔ  Ｒｅｔｒｉｅｖａｌ  Ｓｏｌｕｔｉｏｎ（Ｄａｋｏ  カタログ番号Ｓ２３６７）を圧力釜とともに使用し、スライドを３０分間熱処理する。次いで、スライドをＤａｋｏ  Ａｕｔｏｓｔａｉｎｅｒで、３％過酸化水素を使用して５分間、一次抗体（ＨＲＰ−プリツムマブまたは対照）を１：２５の希釈で使用して１時間、ポリマーベースのＰｏｗｅｒ  Ｖｉｓｉｏｎ  Ｐｌｕｓ検出溶液（Ｌｅｉｃａ  カタログ番号ＰＶ６１０４）を使用して３０分間、更にＤＡＢを使用して１０分間、染色する。染色したスライドをヘマトキシリンで１分間対比染色し、脱水し、病理検査のためにカバースリップをのせる。
【０１３３】
ＩＥＦ（等電点電気泳動）：ＩＥＦは、３．５〜９．５のｐＨ範囲を使用し、ＬｏｎｚａのＩｓｏＧｅｌ  Ａｇａｒｏｓｅをそのプロトコルに従って使用して実施する。ＩＥＦプレートを最初にクマシーブルーで染色し、次いで、シルバー染色で脱染色する。
【０１３４】
可溶性抗体を用いた免疫蛍光アッセイ（ＦＡＣＳ）解析：
樹立細胞株（黒色腫、肺、乳房）から新たに培養した腫瘍細胞を、本明細書に別途記載するように、ＦＡＣＳ解析に使用する。９５％超の生存率を有する対数増殖期の培養物の細胞をＥＤＴＡ０．０２％（Ｓｉｇｍａ）とともにインキュベーションした後、ゆっくりとこすり落とし、試験管１本当たり３×１０５個の細胞を使用する。可溶性プリツムマブまたは選択したＧＰＥｘクローンの試験抗体を上記方法によって調製する。腫瘍細胞を抗体（ＦＣＳ  ＲＰＭＩ  １６４０で１／１に希釈）とともに、前処理した（１％ＢＳＡ）プラスチックチューブ中、３７℃で１時間インキュベートする。ＦＣＳ  ＲＰＭＩ  １６４０で３回洗浄した後、細胞を、ビオチン標識した抗ヒトＩｇＧ抗体（１：５０）（Ｖｅｃｔｏｒ  Ｌａｂ）とともに４℃で１時間インキュベートする。３回の洗浄ステップ（１％ＢＳＡ  ＰＢＳ及びＰＢＳ）後、フィコエリトリンストレプトアビジン（１：２０）を２０℃で２０分間加える。反復実験では、ＦＩＴＣ標識した抗ヒトＩｇＧ（Ｆａｂ’）２（１：２５）（Ｓｉｇｍａ−Ａｌｄｒｉｃｈ）を使用する。最後に、免疫蛍光標識された細胞を１％ホルマリンＰＢＳで固定する。１００００個の細胞をＦＡＣＳ  Ｃａｌｉｂｕｒ（ＢＤ  Ｂｉｏｓｃｉｅｎｃｅｓ）で計数し、Ｃｅｌｌ  Ｑｕｅｓｔにより解析する。
【０１３５】
ＣＤＲの特定及びＣＤＲ除去／挿入−ポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）：
ＰＣＲ：ネズミモノクローナル抗体（ｍＡｂ）由来のＣＤＲをヒト抗体フレームワーク上にグラフティングするために、２つの新しい組み換えＰＣＲ技術のアプローチを採用した（Ｄａｕｇｈｅｒｔｙ  ＢＬ，ＤｅＭａｒｔｉｎｏ  ＪＡ，Ｌａｗ  ＭＦ，Ｋａｗｋａ  ＤＷ，Ｓｉｎｇｅｒ  ＩＩ，Ｍａｒｋ  ＧＥ（１９９１）Ｐｏｌｙｍｅｒａｓｅ  ｃｈａｉｎ  ｒｅａｃｔｉｏｎ  ｆａｃｉｌｉｔａｔｅｓ  ｔｈｅ  ｃｌｏｎｉｎｇ，ＣＤＲ  ｇｒａｆｔｉｎｇ，ａｎｄ  ｒａｐｉｄ  ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ  ｏｆ  ａ  ｍｕｒｉｎｅ  ｍｏｎｏｃｌｏｎａｌ  ａｎｔｉｂｏｄｙ  ｄｉｒｅｃｔｅｄ  ａｇａｉｎｓｔ  ｔｈｅ  ＣＤ１８  ｃｏｍｐｏｎｅｎｔ  ｏｆ  ｌｅｕｋｏｃｙｔｅ  ｉｎｔｅｇｒｉｎｓ．Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄｓ  Ｒｅｓｅａｒｃｈ，１９：２４７１−２４７６）。一方のアプローチは、クローニングされたヒト可変領域テンプレートの利用可能性に依拠するが、他方の手法は、ヒト可変領域タンパク質の配列データにのみ依存する。組み換えヒト化抗体の一過性発現は、一般に、アデノウイルス主要後期プロモーターによって駆動され、非リンパ系哺乳動物細胞へのトランスフェクション後、４８時間以内に検出することができる。これらのアプローチを使用すると、ネズミｍＡｂのｃＤＮＡクローニングを開始してからわずか６週間以内で、組み換えヒト化抗体の発現が可能になる。
【０１３６】
ＣＤＲの特定及びＣＤＲ除去／挿入：Ｆｉｅｌｄｓらによって詳述されているように、ハイブリドーマ細胞から目的ＣＤＲを特定し、除去及び挿入する（Ｆｉｅｌｄｓ  Ｃ，Ｏ’Ｃｏｎｎｅｌｌ  Ｄ，Ｘｉａｏ  Ｓ，Ｌｅｅ  ＧＵ，Ｂｉｌｌｉａｌｄ  Ｐ，Ｍｕｚａｒｄ  Ｊ：（２０１３）Ｃｒｅａｔｉｏｎ  ｏｆ  ｒｅｃｏｍｂｉｎａｎｔ  ａｎｔｉｇｅｎ−ｂｉｎｄｉｎｇ  ｍｏｌｅｃｕｌｅｓ  ｄｅｒｉｖｅｄ  ｆｒｏｍ  ｈｙｂｒｉｄｏｍａｓ  ｓｅｃｒｅｔｉｎｇ  ｓｐｅｃｉｆｉｃ  ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ．Ｎａｔｕｒｅ  Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ  ８：１１２５−１１４８）。このプロトコルは、機能性可変重鎖（ＶＨ）及び可変軽鎖（ＶＬ）遺伝子の迅速な特定及びクローニングならびに組み換え細菌における発現に最適化した合成ＤＮＡ配列の設計及びクローニングを介した、モノクローナル抗体に由来する組み換え一価抗原結合分子の設計及び開発について記載する。典型的に、モノクローナル抗体は、極めて多くの場合、免疫化マウスのＢリンパ球をネズミ骨髄腫細胞と融合することから生じるマウスハイブリドーマから得られる。ここに記載されるプロトコルは、広範囲の生体分子標的を標的にする複数の抗体をベースにした分子の開発を成功させるために以前から活用されている。本プロトコルは、本分野に特化していないと思われる研究グループにとっても利用しやすく、作業日５０日以内で、機能性ＩｇＧを分泌するハイブリドーマ細胞から機能的な組み換え抗原結合分子を簡単明瞭にリバースエンジニアリングすることを可能にするものである。更に、抗体断片の精製の簡便な手法もこのプロトコルに記載されている。
【０１３７】
プロテインＡ精製方法：
プロテインＡクロマトグラフィーを使用した抗体分子の精製：抗体タンパク質の精製は、通常のｍＡｂ精製に使用される方法と本質的に同じである。使用されるプロトコルを以下に概説する。
１．プロテインＡカラムを指示のとおりに調製する（ＧＥ  Ｈｅａｌｔｈｃａｒｅ）。
２．細胞培養培地（結合緩衝液で１：１に希釈）を、樹脂の上部に重ねることによってカラムに静かに加える。
３．１０倍量の洗浄／結合緩衝液でカラムを洗浄するか、２８０ｎｍでの溶出液の吸光度がバックグラウンドレベルに近づくまで洗浄する。
４．溶出液が直ちに中和されるように、各回収チューブに１００ｍｌの１Ｍ  Ｔｒｉｓ緩衝液（ｐＨ８．０）を添加する。
５．抗体を溶出するために、樹脂の上部に溶出緩衝液をゆっくりと添加し、準備した回収チューブ中に溶出液を回収する（０．９ｍｌ／チューブ）。
６．全容量が回収されるまで、最大８本のチューブまで繰り返す。
７．１０〜２０μｌの溶出画分を３００ｍｌのＣｏｏｍａｓｓｉｅ  Ｐｌｕｓ  Ｐｒｏｔｅｉｎ  Ａｓｓａｙ  Ｒｅａｇｅｎｔ（Ｐｉｅｒｃｅ）（マイクロタイタープレート中）に添加することによって陽性画分を特定する。陽性画分は青色反応を示す。
８．陽性画分を合わせ、試料の１０００倍量のＰＢＳに対して終夜透析する。
９．透析した試料のＯＤ２８０を測定する。
１０．抗体タンパク質濃度をＵＶ２８０ｎｍで決定することができる。
１１．ＳＤＳ−ＰＡＧＥによって試料の純度を確認する。非還元条件下では抗体分子の約２００ｋＤａの単一バンドが観察されるはずであり、還元条件下では、３７．５ｋＤａ（ＬＣ）及び６２．５ｋＤａ（ＨＣ）の２つのバンドが観察されるはずである。
１２．精製したタンパク質を−２０℃で保存する。
【０１３８】
ＳＤＳ  ＰＡＧＥ：
ポリアクリルアミドゲル電気泳動を使用したモノクローナル抗体の分析のために、先に記載されているように、Ｌａｅｍｍｌｉ還元試料緩衝液中、１０℃で５分間、抗体をインキュベーションして、マウスＩｇＧ１の重鎖から誘導された２つの加水分解断片を生成する（Ｄａｖａｇｎｉｎｏ  Ｊ，Ｗｏｎｇ  Ｃ，Ｓｈｅｌｔｏｎ  Ｌ，Ｍａｎｋａｒｉｏｕｓ  Ｓ（１９９５）Ａｃｉｄ  ｈｙｄｒｏｌｙｓｉｓ  ｏｆ  ｍｏｎｏｃｌｏｎａｌ  ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ．Ｊ  Ｉｍｍｕｎｏｌ  Ｍｅｔｈｏｄ．１８５：１７７−１８０）。切断部位は、アミノ末端配列によって特定される。
【０１３９】
ウェスタンブロット：
個々の発現系における抗体の発現レベルは、先に記載されている手順に従ったウェスタンブロットによって評価される（Ｔ．Ｍａｔｓｕｏ，Ａ．Ｙａｍａｍｏｔｏ，Ｔ．Ｙａｍａｍｏｔｏ，Ｋ．Ｏｔｓｕｋｉ，Ｎ．Ｙａｍａｚａｋｉ，Ｍ．Ｋａｔａｏｋａ，Ｈ．Ｔｅｒａｄａ，Ｙ．Ｓｈｉｎｏｈａｒａ，Ｒｅｐｌａｃｅｍｅｎｔ  ｏｆ  Ｃ３０５  ｉｎ  ｈｅａｒｔ／ｍｕｓｃｌｅ−ｔｙｐｅ  ｉｓｏｚｙｍｅ  ｏｆ  ｈｕｍａｎ  ｃａｒｎｉｔｉｎｅ  ｐａｌｍｉｔｏｙｌｔｒａｎｓｆｅｒａｓｅ  Ｉ  ｗｉｔｈ  ａｓｐａｒｔｉｃ  ａｃｉｄ  ａｎｄ  ｏｔｈｅｒ  ａｍｉｎｏ  ａｃｉｄｓ，Ｂｉｏｃｈｅｍ．Ｇｅｎｅｔ．４８（２０１０）１９３−２０１）。特定の抗体を上記のとおりに調製する。
【０１４０】
タンパク質濃度の測定：
ミトコンドリア画分のタンパク質濃度を、ウシ血清アルブミンを標準としたＢＣＡタンパク質アッセイキットの使用により測定した。
【０１４１】
抗体結合親和性：
ＩｇＧ二重特異性抗体の強固な生成は長年の課題であった。既存の方法は、それぞれ個々の抗体の広範なエンジニアリング、共通の軽鎖の発見、または複雑かつ労力のかかる生化学的処理を必要とする。ここで、本発明者らは、計算上の合理的な設計アプローチと実験的構造検証とを組み合わせて、直交するＦａｂ界面を含む抗体の重鎖及び軽鎖を生成する。これらの界面を組み込んだ親モノクローナル抗体は、同時に共発現させると、改善した重鎖−軽鎖対を有する二重特異性ＩｇＧに組み立てられる。このアプローチで生成された二重特異性ＩｇＧは、天然ＩｇＧの薬物動態及び他の望ましい特性を示すが、標的抗原に一価で結合する。したがって、これらのＣＤＲグラフト試薬は、多くの生物工学的用途及び治療用途において有用であり得る。
【０１４２】
ｍＡｂ及びＣＤＲグラフト抗体の親和性測定：
再設計した重鎖−軽鎖を含有するｍＡｂの親和性を表面プラズモン共鳴（Ｂｉａｃｏｒｅ  ３０００、ＧＥ  Ｌｉｆｅｓｃｉｅｎｃｅｓ）を使用して決定する。ＦａｂをＷＴプリツムマブＩｇＧ１及びＣＲＤ２含有ＩｇＧ１から作製する。ヤギ抗ヒトＩｇＧ−Ｆｃ（Ｊａｃｋｓｏｎ  Ｉｍｍｕｎｏｌａｂｓ、カタログ番号１０９−００５−０９８）を１０ｍＭ酢酸塩（ｐＨ５）で４０μｇ／ｍｌに希釈し、標準的な１−エチル−３−（３−ジメチルアミノプロピル）カルボジイミド（ＥＤＣ）／Ｎ−ヒドロキシスクシンイミド（ＮＨＳ）アミンカップリングプロトコルを使用して、ＣＭ５チップ表面に約１０，０００ＲＵまで固定化する。異なる供給源から入手したヒト抗体のＦｃを５μｌ／分で４分間注入することによりセンサーシップ表面上に捕捉させる。流量を３０μｌ／分まで増加させ、各Ｆａｂの２回目の注入（５０、３５、２０、１０、５、２または１ｎＭ）を実施する。ランニング緩衝液（及び希釈緩衝液）は、ＨＢＳ−ＥＰ  １０ｍＭ  Ｈｅｐｅｓ、１５０ｍＭ  ＮａＣｌ、３ｍＭ  ＥＤＴＡ、０．００５％ポリソルベート２０である。チップ表面は、０．１Ｍグリシン（ｐＨ２．０）を２回注入することによって再生する。濃度系列を１：１結合モデルにフィッティングさせ、結合（ｋａ）及び解離の速度定数（ｋｄ）ならびに平衡解離定数（ＫＤ）を決定する。
【０１４３】
軽鎖特異性及びＣＤＲグラフトＩｇＧ組み立ての質量分析測定：
Ａｇｉｌｅｎｔ  １１００  ＨＰＬＣでタンパク質Ｇ（ＰＧ）ＩＤセンサーカートリッジ（Ｌｉｆｅ  Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ）を使用してタンパク質を精製する。精製した試料をＡｇｉｌｅｎｔ  ６２１０飛行時間型液体クロマトグラフィー／質量分析（ＬＣ／ＭＳ）システム分子量分析計で分析する。軽鎖及び重鎖成分の理論上の質量平均分子量をＧＰＭａｗプログラム（ｖ．８．２０）を使用して決定する。軽鎖競合実験では、検出器に当たるイオン化軽鎖の相対数を使用して、設計重鎖またはＷＴ重鎖に結合した設計軽鎖とＷＴ軽鎖の比を定量する。
【０１４４】
Ｆａｂタンパク質結晶化：
パパインを使用するタンパク質分解により完全長ＩｇＧを切断することによってＦａｂタンパク質を生成する。プリツムマブＦａｂ（Ｃλを含む）結晶スクリーニングを１６ｍｇ／ｍｌのタンパク質で実施する。１００ｍＭ酢酸ナトリウム（ｐＨ４．６）／３０％ＰＥＧ  ＭＭＥ  ２Ｋ／２００ｍＭ硫酸アンモニウム中で４日後に結晶（薄い板状の微結晶）が現れるはずである。ＰＥＧ  ＭＭＥ  ２Ｋを含むリザーバー溶液中で結晶を極低温保護する。濃度を１０％増加し、２０％グリセロールを添加する。可変ドメイン内の秩序の改善は、同一条件に１０％ＭＰＤを加え１２．４ｍｇ／ｍｌのタンパク質で結晶を生成することによって達成される。ＣＤＲを含有するプリツムマブＦａｂは、１５ｍｇ／ｍｌのタンパク質の使用により結晶化される。
【０１４５】
構造決定：
Ｘ線回折データをＡｄｖａｎｃｅｄ  Ｐｈｏｔｏｎ  Ｓｏｕｒｃｅ（Ａｒｇｏｎｎｅ  Ｎａｔｉｏｎａｌ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ）のＬＲＬ−ＣＡＴビームラインを使用して標準的な極低温条件下で取得し、これをＭＯＳＦＬＭ、ＳＣＡＬＡ及びＴＲＵＮＣＡＴＥの使用により構造因子振幅に変換する。全ての構造について、ＰＨＡＳＥＲを使用して解析し、ＲＥＦＭＡＣを使用して精密化し、ＸＴＡＬＶＩＥＷ／ＸＦＩＴを使用して可視化及び再構築する。続く設計変異体（ＣＲＤ１及びＣＲＤ２の中間体）の構造について、この親構造を検索モデルとして使用してＰｈａｓｅｒにより解析する。プリツムマブの親Ｆａｂは、プリツムマブの既知の構造及び抗体の可変ドメインを使用して解析する。原子モデルの立体化学上の品質は、自動化品質管理手順を使用してモニターされる。
【０１４６】
ファージディスプレイライブラリー：
Ｋｕｎｋｅｌらの古典的なオリゴヌクレオチド特異的変異導入法に基づいて最適化された手順を使用することにより、非常に大きいファージディスプレイ抗体レパートリー（＞１０１０メンバー）を極めて迅速に構築することができる。重要な点は、この方法が拡張可能であり、また、極めて高効率であるのと同時に最大４つの独立した領域を変異させられることである。まず、ｄｕｔ−／ｕｎｇ−  大腸菌宿主を使用して、変異導入オリゴヌクレオチドがアニーリングされるウラシル含有ｓｓＤＮＡ（ｄＵ−ｓｓＤＮＡ）鋳型を封入したファージを増殖させる。「停止鋳型」は、ＣＤＲ中に終止コドンを含有する。この親停止鋳型は、完全長Ｆａｂプリツムマブ融合タンパク質を発現できないことから、これにより変異抗体のみが提示されることを確保する。したがって、残存した鋳型クローンは、選択中に、ファージプールから除外される。Ｆａｂライブラリー内の多様性は、特定位置に種々の塩基を含有する変異導入オリゴヌクレオチドを使用して縮重コドンセットを生成することによって設計することができる。あるいは、トリヌクレオチドセットから合成したオリゴヌクレオチドを使用することによって、コドン使用頻度の微調整を行うことができる。特定のアミノ酸に対して特定のコドンを選択することによって、ＣＤＲアミノ酸を、天然抗体に通常みられるものまたは抗原認識に特に良好に適するものに偏らせた。ｓｓＤＮＡ鋳型にアニーリングする変異導入オリゴヌクレオチドは、相補ＤＮＡ鎖の合成を開始するように機能し、ウラシルを欠く合成娘鎖を形成する。次いで、リガーゼを合成ＤＮＡ断片に融合させ、共有結合閉環状ヘテロ二本鎖ＤＮＡ（ＣＣＣ−ｄｓＤＮＡ）を形成する。次いで、ヘテロ二本鎖ＤＮＡを、合成鎖が鋳型鎖と比較して優先的に増幅される、ｄｕｔ＋／ｕｎｇ＋  大腸菌  ＳＳ３２０の高コンピテント株にエレクトロポレーションする。
【０１４７】
大腸菌宿主への形質転換により、二本鎖プラスミドとしてファージミド複製が生じる。ヘルパーファージとの重感染の際に、一本鎖ＤＮＡ（ｓｓＤＮＡ）の複製が開始され、ファージミドｓｓＤＮＡは、ファージミドコードタンパク質を含有するファージ粒子中にパッケージされる。これにより、Ｆａｂの表現型とコードファージミド遺伝子型との間の物理的結合が提供される。Ｍ１３ＫＯ７などのヘルパーファージが、いくつかのファージミドコード融合タンパク質を組み込んだファージ粒子の組み立てに必要な全てのタンパク質を供給する。感染細胞から産生されるこれらのファージ粒子は、選択中に宿主大腸菌細胞が抗原に導入されないため、遺伝的バーコードとＦａｂライブラリーの相互作用の読み取りの両方を満たす。
【０１４８】
具体的な態様について記載し、例示してきたが、かかる態様は、単なる例示にすぎず、添付の特許請求の範囲に基づき、限定と解釈されるものではない。
【０１４９】
本明細書で引用される全ての公開物及び特許出願は、それぞれの個々の公開物または特許出願があらゆる目的のために参照により援用されることが具体的かつ個別に示された場合と同様に、その全体をあらゆる目的のために参照により本明細書に援用する。
【０１５０】
上述の組成物及び方法について、理解を明確にするために例示及び実施例によりある程度詳細に記載したが、本発明の教示に照らして、添付の特許請求の趣旨または範囲を逸脱することなく、本発明にいくつかの変更及び改変を施し得ることは、当業者には極めて明白であろう。
【図１】
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【図２】
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【図３】
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【図４】
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【図５】
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【配列表】
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【国際調査報告】
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