(57)【要約】  疾患幹細胞および特に癌幹細胞に関連する状態の処置のための組成物および方法が開示される。ある態様において、疾患幹細胞において１つ以上の破壊的経路を誘導するために、幹細胞分化剤および／または催奇形性医薬化合物で患者を処置する。最も典型的には、破壊的経路には、アポトーシス経路、壊死経路およびオートファジー経路が含まれる。【特許請求の範囲】
【請求項１】
病変組織を処置する方法であって、
少なくとも１つの幹細胞特性および少なくとも１つの分化細胞特性を有する疾患幹細胞が試料中に存在することを、前記病変組織から採取した前記試料から判定すること；および
前記病変組織中に残存する疾患幹細胞において破壊的経路を活性化するために、有効量の催奇形性医薬化合物および／または幹細胞分化剤を前記病変組織に投与すること
を含む、方法。
【請求項２】
前記病変組織が腫瘍性組織を含む、請求項１に記載の方法。
【請求項３】
前記病変組織が癌組織を含む、請求項１に記載の方法。
【請求項４】
前記癌組織が、乳癌組織、結腸癌組織、前立腺癌組織、神経膠芽腫組織、卵巣癌組織、頭頸部癌組織、メラノーマ組織、基底細胞癌、扁平上皮癌、胃癌組織、膵臓癌組織または肺癌組織である、請求項３に記載の方法。
【請求項５】
前記判定する工程が、トランスクリプトミクス分析、プロテオミクス分析、質量分析および免疫組織化学分析のうち少なくとも１つを含む、請求項１に記載の方法。
【請求項６】
前記少なくとも１つの幹細胞特性が、ＣＤ１９、ＣＤ２４、ＣＤ３４、ＣＤ４４、ＣＤ９０（Ｔｈｙ１）、ＣＤ１１７、ＣＤ１３３、ＣＤ２００（ＯＸ−２）、ＥｐＣＡＭ（上皮細胞接着分子）およびＡＢＣＢ５（ＡＴＰ結合カセットＢ５）からなる群から選択される、請求項１に記載の方法。
【請求項７】
前記少なくとも１つの分化細胞特性が、Ｆｏｘ３、ＭＡＰ２、ベータＩＩＩチューブリン、ＢＲＣＡ１、サイトケラチン５、ポドカリキシン、サイトケラチン８、サイトケラチン１４、サイトケラチン１８、ＭＵＣ−１、ＣＡ１２５、サイトケラチン１８、ＨＳＰ２７、サイトケラチン１５、ＣＤ１３８、コルヌリン（ｃｏｒｎｕｌｉｎ）、カテプシンＥ、デスモコリン−２、カベオリン−１、ｆｏｘａ１およびＲｅｘ−１からなる群から選択される、請求項１に記載の方法。
【請求項８】
前記催奇形性医薬化合物が、ＡＣＥ（アンジオテンシン変換酵素）阻害剤、アンドロゲン、イソトレチノイン、テトラサイクリン、ドキシサイクリン、ストレプトマイシン、フェニトイン、バルプロ酸、メトトレキサート、アミノプテリン、チオウラシル、カルビマゾール、ＤＥＳ、サリドマイド、レナリドマイド、ポマリドマイドおよびアプレミラストからなる群から選択される、請求項１に記載の方法。
【請求項９】
前記幹細胞分化剤が、ＡＩＣＡＲ（Ｎ１−（β−Ｄ−リボフラノシル）−５−アミノイミダゾール−４−カルボキサミド）、５−アザシチジン、ＣＣＧ１４２３（Ｎ−［２−［（４−クロロフェニル）アミノ］−１−メチル−２−オキソエトキシ］−３，５−ビス（トリフルオロメチル）ベンズアミド）、ＣＷ００８（４−フルオロ−Ｎ−［５−フルオロ−６−（５−メトキシピラゾロ［１，５−ａ］ピリジン−３−イル）−１Ｈ−ピラゾロ［３，４−ｂ］ピリジン−３−イル］ベンズアミド）、シクロパミン、ＤＡＰＴ（Ｎ−［（３，５−ジフルオロフェニル）アセチル］−Ｌ−アラニル−２−フェニル］グリシン−１，１−ジメチルエチルエステル）、デキサメタゾン、フォルスコリン、レチノイン酸およびＳＩＳ３（１，２，３，４−テトラヒドロ−６，７−ジメトキシ−２−［（２Ｅ）−３−（１−フェニル−１Ｈ−ピロロ［２，３−ｂ］ピリジン−３−イル）−１−オキソ−２−プロペニル］−イソキノリン塩酸塩）からなる群から選択される、請求項１に記載の方法。
【請求項１０】
前記催奇形性医薬化合物および／または幹細胞分化剤がインビボで前記病変組織に投与される、請求項１に記載の方法。
【請求項１１】
前記催奇形性医薬化合物および／または幹細胞分化剤が処方薬であり、前記催奇形性医薬化合物および／または幹細胞分化剤が前記病変組織に、処方投与量の５０％未満の量で投与される、請求項１０に記載の方法。
【請求項１２】
前記催奇形性医薬化合物および／または幹細胞分化剤が処方薬であり、前記催奇形性医薬化合物および／または幹細胞分化剤が前記病変組織に、処方投与量の２５％未満の量で投与される、請求項１０に記載の方法。
【請求項１３】
前記催奇形性医薬化合物および／または幹細胞分化剤が処方薬であり、前記催奇形性医薬化合物および／または幹細胞分化剤が前記病変組織に、処方投与量の１０％未満の量で投与される、請求項１０に記載の方法。
【請求項１４】
前記催奇形性医薬化合物および／または幹細胞分化剤が処方薬であり、前記催奇形性医薬化合物および／または幹細胞分化剤が処方投与量を下回る量でメトロノーム投与される、請求項１０に記載の方法。
【請求項１５】
前記破壊的経路が、アポトーシス経路またはオートファジー経路である、請求項１に記載の方法。
【請求項１６】
前記破壊的経路が、Ｆａｓ受容体、ＴＮＦＲ１（腫瘍壊死因子受容体−１）、Ａｐｏ２受容体、Ａｐｏ３受容体、カスパーゼ、ＺＩＰキナーゼ、Ｂｃｌ２、ＢＡＸ、ｐ５３およびＳＭＡＣ（セカンドミトコンドリア由来カスパーゼ活性化剤（Ｓｅｃｏｎｄ  Ｍｉｔｏｃｈｏｎｄｒｉａ−Ｄｅｒｉｖｅｄ  Ａｃｔｉｖａｔｏｒ  ｏｆ  Ｃａｓｐａｓｅ））のうち少なくとも１つによって活性化される、請求項１に記載の方法。
【請求項１７】
患者における癌幹細胞数を減少させる方法であって、
前記患者の癌組織から採取された試料から、少なくとも１つの幹細胞特性および少なくとも１つの分化細胞特性を有する癌幹細胞が前記試料中に存在することを判定すること；および
前記患者に残存する癌幹細胞において破壊的経路を活性化することによって癌幹細胞の数を減少させるために、有効量の催奇形性医薬化合物および／または幹細胞分化剤を前記患者に投与すること
を含む、方法。
【請求項１８】
前記癌組織が、乳癌組織、結腸癌組織、前立腺癌組織、神経膠芽腫組織、卵巣癌組織、頭頸部癌組織、メラノーマ組織、基底細胞癌、扁平上皮癌、胃癌組織、膵臓癌組織または肺癌組織である、特許請求１７に記載の方法。
【請求項１９】
前記判定する工程が、トランスクリプトミクス分析、プロテオミクス分析、質量分析および免疫組織化学分析のうち少なくとも１つを含む、特許請求１７に記載の方法。
【請求項２０】
前記少なくとも１つの幹細胞特性が、ＣＤ１９、ＣＤ２４、ＣＤ３４、ＣＤ４４、ＣＤ９０（Ｔｈｙ１）、ＣＤ１１７、ＣＤ１３３、ＣＤ２００（ＯＸ−２）、ＥｐＣＡＭ（上皮細胞接着分子）およびＡＢＣＢ５（ＡＴＰ結合カセットＢ５）からなる群から選択される、特許請求１７に記載の方法。
【請求項２１】
前記少なくとも１つの分化細胞特性が、Ｆｏｘ３、ＭＡＰ２、ベータＩＩＩチューブリン、ＢＲＣＡ１、サイトケラチン５、ポドカリキシン、サイトケラチン８、サイトケラチン１４、サイトケラチン１８、ＭＵＣ−１、ＣＡ１２５、サイトケラチン１８、ＨＳＰ２７、サイトケラチン１５、ＣＤ１３８、コルヌリン、カテプシンＥ、デスモコリン−２、カベオリン−１、ｆｏｘａ１およびＲｅｘ−１からなる群から選択される、特許請求１７に記載の方法。
【請求項２２】
前記催奇形性医薬化合物が、ＡＣＥ（アンジオテンシン変換酵素）阻害剤、アンドロゲン、イソトレチノイン、テトラサイクリン、ドキシサイクリン、ストレプトマイシン、フェニトイン、バルプロ酸、メトトレキサート、アミノプテリン、チオウラシル、カルビマゾール、ＤＥＳ、サリドマイド、レナリドマイド、ポマリドマイドおよびアプレミラストからなる群から選択される、特許請求１７に記載の方法。
【請求項２３】
前記幹細胞分化剤が、ＡＩＣＡＲ（Ｎ１−（β−Ｄ−リボフラノシル）−５−アミノイミダゾール−４−カルボキサミド）、５−アザシチジン、ＣＣＧ１４２３（Ｎ−［２−［（４−クロロフェニル）アミノ］−１−メチル−２−オキソエトキシ］−３，５−ビス（トリフルオロメチル）ベンズアミド）、ＣＷ００８（４−フルオロ−Ｎ−［５−フルオロ−６−（５−メトキシピラゾロ［１，５−ａ］ピリジン−３−イル）−１Ｈ−ピラゾロ［３，４−ｂ］ピリジン−３−イル］ベンズアミド）、シクロパミン、ＤＡＰＴ（Ｎ−［（３，５−ジフルオロフェニル）アセチル］−Ｌ−アラニル−２−フェニル］グリシン−１，１−ジメチルエチルエステル）、デキサメタゾン、フォルスコリン、レチノイン酸およびＳＩＳ３（１，２，３，４−テトラヒドロ−６，７−ジメトキシ−２−［（２Ｅ）−３−（１−フェニル−１Ｈ−ピロロ［２，３−ｂ］ピリジン−３−イル）−１−オキソ−２−プロペニル］−イソキノリン塩酸塩）からなる群から選択される、特許請求１７に記載の方法。
【請求項２４】
前記催奇形性医薬化合物および／または幹細胞分化剤が処方薬であり、前記催奇形性医薬化合物および／または幹細胞分化剤が前記患者に、処方投与量の２５％未満の量で投与される、特許請求１７に記載の方法。
【請求項２５】
前記催奇形性医薬化合物および／または幹細胞分化剤が処方薬であり、前記催奇形性医薬化合物および／または幹細胞分化剤が前記病変組織に、処方投与量の１０％未満の量で投与される、特許請求１７に記載の方法。
【請求項２６】
前記催奇形性医薬化合物および／または幹細胞分化剤が処方薬であり、前記催奇形性医薬化合物および／または幹細胞分化剤が処方投与量を下回る量でメトロノーム投与される、特許請求１７に記載の方法。
【請求項２７】
前記破壊的経路が、アポトーシス経路またはオートファジー経路である、特許請求１７に記載の方法。
【請求項２８】
前記破壊的経路が、Ｆａｓ受容体、ＴＮＦＲ１（腫瘍壊死因子受容体−１）、Ａｐｏ２受容体、Ａｐｏ３受容体、カスパーゼ、ＺＩＰキナーゼ、Ｂｃｌ２、ＢＡＸ、ｐ５３およびＳＭＡＣ（セカンドミトコンドリア由来カスパーゼ活性化剤（Ｓｅｃｏｎｄ  Ｍｉｔｏｃｈｏｎｄｒｉａ−Ｄｅｒｉｖｅｄ  Ａｃｔｉｖａｔｏｒ  ｏｆ  Ｃａｓｐａｓｅ））のうち少なくとも１つによって活性化される、特許請求１７に記載の方法。
【請求項２９】
少なくとも１つの幹細胞特性および少なくとも１つの分化細胞特性を有する疾患幹細胞において破壊的経路を活性化するための催奇形性医薬化合物および／または幹細胞分化剤の使用。
【請求項３０】
前記幹細胞特性が、ＣＤ１９、ＣＤ２４、ＣＤ３４、ＣＤ４４、ＣＤ９０（Ｔｈｙ１）、ＣＤ１１７、ＣＤ１３３、ＣＤ２００（ＯＸ−２）、ＥｐＣＡＭ（上皮細胞接着分子）およびＡＢＣＢ５（ＡＴＰ結合カセットＢ５）からなる群から選択され、前記疾患幹細胞が、乳癌組織、結腸癌組織、前立腺癌組織、神経膠芽腫組織、卵巣癌組織、頭頸部癌組織、メラノーマ組織、基底細胞癌、扁平上皮癌、胃癌組織、膵臓癌組織または肺癌組織由来である、請求項２９に記載の使用。
【請求項３１】
前記催奇形性医薬化合物が、ＡＣＥ（アンジオテンシン変換酵素）阻害剤、アンドロゲン、イソトレチノイン、テトラサイクリン、ドキシサイクリン、ストレプトマイシン、フェニトイン、バルプロ酸、メトトレキサート、アミノプテリン、チオウラシル、カルビマゾール、ＤＥＳ、サリドマイド、レナリドマイド、ポマリドマイドおよびアプレミラストからなる群から選択される、請求項２９に記載の使用。
【請求項３２】
前記幹細胞分化剤が、ＡＩＣＡＲ（Ｎ１−（β−Ｄ−リボフラノシル）−５−アミノイミダゾール−４−カルボキサミド）、５−アザシチジン、ＣＣＧ１４２３（Ｎ−［２−［（４−クロロフェニル）アミノ］−１−メチル−２−オキソエトキシ］−３，５−ビス（トリフルオロメチル）ベンズアミド）、ＣＷ００８（４−フルオロ−Ｎ−［５−フルオロ−６−（５−メトキシピラゾロ［１，５−ａ］ピリジン−３−イル）−１Ｈ−ピラゾロ［３，４−ｂ］ピリジン−３−イル］ベンズアミド）、シクロパミン、ＤＡＰＴ（Ｎ−［（３，５−ジフルオロフェニル）アセチル］−Ｌ−アラニル−２−フェニル］グリシン−１，１−ジメチルエチルエステル）、デキサメタゾン、フォルスコリン、レチノイン酸およびＳＩＳ３（１，２，３，４−テトラヒドロ−６，７−ジメトキシ−２−［（２Ｅ）−３−（１−フェニル−１Ｈ−ピロロ［２，３−ｂ］ピリジン−３−イル）−１−オキソ−２−プロペニル］−イソキノリン塩酸塩）からなる群から選択される、請求項２９に記載の使用。
【発明の詳細な説明】
【関連出願の相互参照】
【０００１】
本願は、２０１５年４月３０日提出の、同時係属の米国仮出願第６２／１５５４５９号明細書に対する優先権を主張する。
【技術分野】
【０００２】
本発明の分野は、分化または細胞周期の変化を誘導する医薬化合物、および特に癌幹細胞に関連する腫瘍性疾患の処置のための催奇形剤および分化剤の使用である。
【背景技術】
【０００３】
背景の説明には、本発明の主題を理解する上で有用であり得る情報が含まれる。本明細書中で提供される情報の何れも、先行技術であるか、もしくは現在主張されている発明主題に関連していること、または具体的にもしくは暗示的に参照される何らかの刊行物が先行技術であることを認めるものではない。
【０００４】
新しい癌治療薬または処置の研究および開発には、毎年数十億ドルが費やされている。典型的には、このようなＲ＆Ｄは、新しい化学物質の同定、このような物質の実行可能性の判定、毒性に対する試験、動物試験、処方物の作製、生産規模拡大、規制当局の承認を求めることなどを含む多岐にわたる開発活動を包含する。実際には、金銭の支出を超えて、企業は市場で使用される新しい化合物を開発するのに１０年以上を容易に費やし得る。複雑なＲ＆Ｄ経路に沿ったあらゆる時点で、新規化合物が結果的に行き詰まり得る。薬品開発に伴う高いリスクおよびコストを考慮しても、市場で実現可能な化合物が発見されれば、投資利益率はかなり高くなり得る。しかし、結果的に行き詰まると、投資損失は非常に高くなり得る。
【０００５】
多くの場合、新薬の開発は、薬物が１つ以上の規制要件を満たさないために、中止されるかまたは単純に中断される。例えば、催奇形性があることが分かった新しい化合物の場合を考える。このような薬物は先天性欠損を引き起こし得るため、中断される。実際に、化合物が催奇形性であるかを判定することに対して、米国特許出願公開第２０１５／０１３３３４０号明細書または国際公開第２０１４／０７１１３７号パンフレットから見られ得るように、多大な努力が払われている。本明細書中で特定される全ての特許出願および刊行物は、それぞれの個々の特許出願または刊行物が具体的かつ個別に参照により組み入れられることが示されるのと同程度まで参照により組み込まれる。組み込まれる参考文献における用語の定義または使用が矛盾しているか、または本明細書中で提供されるその用語の定義に反する場合、本明細書中で提供されるその用語の定義が適用され、参考文献におけるその用語の定義は適用されない。
【０００６】
同様に、ある種の分化剤は、既に存在する悪性細胞に対する良好な処置法であるものとして報告されている。例えば、全トランスレチノイン酸は、前骨髄球細胞を下流の成熟度に押し込み、癌集団の成長を低下させるかまたは排除するために、急性前骨髄球性白血病の多くの症例において有効であることが示された（Ｏｎｃｏｇｅｎｅ  ２００１；２０，７１４０−７１４５）。しかし、このような処置は、特異的な分化系列が決定された細胞に限定されており、したがって、他のタイプの悪性腫瘍については企図されない。
【０００７】
分化剤に続き、サリドマイドは２００ｍｇ／ｄの低用量で投与した場合、アンドロゲン非依存性前立腺癌における血管新生阻害剤として報告されたが（Ｃｌｉｎ  Ｃａｎｃｅｒ，Ｒｅｓ．２００１）、一方で非小細胞肺癌ではサリドマイドについて決定的な結果は報告されなかった（Ｃｏｎｔｅｍｐ  Ｏｎｃｏｌ（Ｐｏｚｎ）．２０１４；１８（１）：３９−４７）。さらに別の報告では、サリドマイド＋放射線が食道癌患者のＶＥＧＦレベルを低下させることが示されており（Ｗｏｒｌｄ  Ｊ  Ｇａｓｔｒｏｅｎｔｅｒｏｌ  ２０１４  Ｍａｙ  ７；２０（１７）：５０９８−１０３）、これにより著者らは、このような悪性腫瘍においてサリドマイドを使用すると処置成績が向上し得ると推測した。さらに、多発性骨髄腫（Ｓｃｉｅｎｃｅ  ２０１４  Ｊａｎｕａｒｙ  １７；３４３（６１６８）：２５６−２５７；ＰＬｏＳ  Ｏｎｅ，２０１３  Ｍａｙ  １４；８（５）：ｅ６４３５４）の処置においてはサリドマイドについての機序として免疫調節効果も提案された。しかし、これらの限定的な機構的洞察にもかかわらず、観察されたこれらの効果は、効果的な癌処置につながらなかった。
【０００８】
したがって、細胞処理のための様々な組成物および方法が当技術分野で公知であるにもかかわらず、それらの全てまたは殆ど全てには１つ以上の欠点がある。したがって、悪性疾患および特に癌幹細胞による悪性疾患の原因に対する薬学的介入の改善が依然として必要とされている。
【発明の概要】
【０００９】
本発明の主題は、分化剤および／または催奇形性医薬化合物が癌の処置、および特に癌幹細胞に由来する癌の処置および予防に対して使用される、化合物、組成物および方法を対象とする。最も典型的には、このようにして処置された細胞は、癌幹細胞において破壊的経路を活性化する。
【００１０】
本発明の主題の１つの態様において、発明者らは、病変組織を処置する方法であって、少なくとも１つの幹細胞特性および少なくとも１つの分化細胞特性を有する疾患幹細胞が試料中に存在することを、前記病変組織から採取した前記試料から判定する工程を含む方法を企図する。企図される方法はまた、前記病変組織に残存する疾患幹細胞において破壊的経路（例えばアポトーシス経路またはオートファジー経路）を活性化するために、有効量の催奇形性医薬化合物および／または幹細胞分化剤を前記病変組織に投与する、さらなる工程も含む。最も典型的には、このような活性化は、Ｆａｓ受容体、ＴＮＦＲ１（腫瘍壊死因子受容体−１）、Ａｐｏ２受容体、Ａｐｏ３受容体、カスパーゼ、ＺＩＰキナーゼ、Ｂｃｌ２、ＢＡＸ、ｐ５３および／またはＳＭＡＣ（セカンドミトコンドリア由来カスパーゼ活性化剤（Ｓｅｃｏｎｄ  Ｍｉｔｏｃｈｏｎｄｒｉａ−Ｄｅｒｉｖｅｄ  Ａｃｔｉｖａｔｏｒ  ｏｆ  Ｃａｓｐａｓｅ））の活性化を介して進行し得る。
【００１１】
典型的には、前記病変組織は腫瘍性組織、最も典型的には癌組織（例えば乳癌組織、結腸癌組織、前立腺癌組織、神経膠芽腫組織、卵巣癌組織、頭頸部癌組織、メラノーマ組織、基底細胞癌、扁平上皮癌、胃癌組織、膵臓癌組織または肺癌組織）を含む。本発明の主題を限定するものではないが、前記判定する工程は、前記病変組織の少なくとも一部のトランスクリプトミクス分析、プロテオミクス分析、質量分析および／または免疫組織化学分析を含むことが一般的に好ましい。特定の組織に依存して、前記幹細胞の特性は、ＣＤ１９、ＣＤ２４、ＣＤ３４、ＣＤ４４、ＣＤ９０（Ｔｈｙ１）、ＣＤ１１７、ＣＤ１３３、ＣＤ２００（ＯＸ−２）、ＥｐＣＡＭ（上皮細胞接着分子）および／またはＡＢＣＢ５（ＡＴＰ結合カセットＢ５）であり得、一方で前記分化細胞特性は、Ｆｏｘ３、ＭＡＰ２、ベータＩＩＩチューブリン、ＢＲＣＡ１、サイトケラチン５、ポドカリキシン、サイトケラチン８、サイトケラチン１４、サイトケラチン１８、ＭＵＣ−１、ＣＡ１２５、サイトケラチン１８、ＨＳＰ２７、サイトケラチン１５、ＣＤ１３８、コルヌリン（ｃｏｒｎｕｌｉｎ）、カテプシンＥ、デスモコリン−２、カベオリン−１、ｆｏｘａ１および／またはＲｅｘ−１を含み得る。
【００１２】
適切な他の選択肢の中でも、企図される催奇形性医薬化合物としては、ＡＣＥ（アンジオテンシン変換酵素）、アンドロゲン、イソトレチノイン、テトラサイクリン、ドキシサイクリン、ストレプトマイシン、フェニトイン、バルプロ酸、メトトレキサート、アミノプテリン、チオウラシル、カルビマゾール、ＤＥＳ、サリドマイド、レナリドマイド、ポマリドマイドおよびアプレミラストが挙げられる。企図される幹細胞分化剤としては、ＡＩＣＡＲ（Ｎ１−（β−Ｄ−リボフラノシル）−５−アミノイミダゾール−４−カルボキサミド）、５−アザシチジン、ＣＣＧ１４２３（Ｎ−［２−［（４−クロロフェニル）アミノ］−１−メチル−２−オキソエトキシ］−３，５−ビス（トリフルオロメチル）ベンズアミド）、ＣＷ００８（４−フルオロ−Ｎ−［５−フルオロ−６−（５−メトキシピラゾロ［１，５−ａ］ピリジン−３−イル）−１Ｈ−ピラゾロ［３，４−ｂ］ピリジン−３−イル］ベンズアミド）、シクロパミン、ＤＡＰＴ（Ｎ−［（３，５−ジフルオロフェニル）アセチル］−Ｌ−アラニル−２−フェニル］グリシン−１，１−ジメチルエチルエステル）、デキサメタゾン、フォルスコリン、レチノイン酸およびＳＩＳ３（１，２，３，４−テトラヒドロ−６，７−ジメトキシ−２−［（２Ｅ）−３−（１−フェニル−１Ｈ−ピロロ［２，３−ｂ］ピリジン−３−イル）−１−オキソ−２−プロペニル］−イソキノリン塩酸塩）が挙げられる。
【００１３】
さらに、前記催奇形性医薬化合物および／または幹細胞分化剤がインビボで前記病変組織に投与されることが一般的に好ましい。例えば、前記催奇形性医薬化合物および／または幹細胞分化剤が処方薬である場合、前記病変組織に対して、推奨される処方投与量の５０％未満、または２５％未満、またはさらに１０％未満の（しかし、０．１％を上回る）量で投与され得る。さらに、またはあるいは、前記催奇形性医薬化合物および／または幹細胞分化剤は、典型的には処方投与量を下回る量でメトロノーム投与され得る。
【００１４】
したがって、異なる視点から見て、発明者らは、患者における癌幹細胞数を減少させる方法も企図する。特に企図される方法は、患者の癌組織から採取された試料から、少なくとも１つの幹細胞特性および少なくとも１つの分化細胞特性を有する癌幹細胞が前記試料中に存在することを判定する工程；および前記患者に残存する癌幹細胞において破壊的経路を活性化することによって癌幹細胞数を減少させるために、有効量の催奇形性医薬化合物および／または幹細胞分化剤を前記患者に投与する別の工程を含む。
【００１５】
上記のように、企図される癌組織には、乳癌組織、結腸癌組織、前立腺癌組織、神経膠芽腫組織、卵巣癌組織、頭頸部癌組織、メラノーマ組織、基底細胞癌、扁平上皮癌、胃癌組織、膵臓癌組織および肺癌組織が含まれ、一方で、前記判定する工程は、トランスクリプトミクス分析、プロテオミクス分析、質量分析および免疫組織化学分析のうち少なくとも１つを含み得る。前記幹細胞特性、分化細胞特性、催奇形性医薬化合物および幹細胞分化剤および投与に関して、上記で提供されるものと同じ配慮が適用される。
【００１６】
結果として、発明者らはまた、少なくとも１つの幹細胞の特性および少なくとも１つの分化細胞の特性を有する疾患幹細胞において破壊的経路を活性化するための、催奇形性医薬化合物および／または幹細胞分化剤の使用も企図する。前記のように、企図される幹細胞特性としては、ＣＤ１９、ＣＤ２４、ＣＤ３４、ＣＤ４４、ＣＤ９０（Ｔｈｙ１）、ＣＤ１１７、ＣＤ１３３、ＣＤ２００（ＯＸ−２）、ＥｐＣＡＭ（上皮細胞接着分子）およびＡＢＣＢ５（ＡＴＰ結合カセットＢ５）が挙げられ、前記疾患幹細胞が、乳癌組織、結腸癌組織、前立腺癌組織、神経膠芽腫組織、卵巣癌組織、頭頸部癌組織、メラノーマ組織、基底細胞癌、扁平上皮癌、胃癌組織、膵臓癌組織または肺癌組織由来であることがさらに企図される。
【００１７】
同様に、前記催奇形性医薬化合物は、ＡＣＥ（アンジオテンシン変換酵素）、アンドロゲン、イソトレチノイン、テトラサイクリン、ドキシサイクリン、ストレプトマイシン、フェニトイン、バルプロ酸、メトトレキサート、アミノプテリン、チオウラシル、カルビマゾール、ＤＥＳ、サリドマイド、レナリドマイド、ポマリドマイドおよび／またはアプレミラストであり得、一方で前記幹細胞分化剤は、ＡＩＣＡＲ（Ｎ１−（β−Ｄ−リボフラノシル）−５−アミノイミダゾール−４−カルボキサミド）、５−アザシチジン、ＣＣＧ１４２３（Ｎ−［２−［（４−クロロフェニル）アミノ］−１−メチル−２−オキソエトキシ］−３，５−ビス（トリフルオロメチル）ベンズアミド）、ＣＷ００８（４−フルオロ−Ｎ−［５−フルオロ−６−（５−メトキシピラゾロ［１，５−ａ］ピリジン−３−イル）−１Ｈ−ピラゾロ［３，４−ｂ］ピリジン−３−イル］ベンズアミド）、シクロパミン、ＤＡＰＴ（Ｎ−［（３，５−ジフルオロフェニル）アセチル］−Ｌ−アラニル−２−フェニル］グリシン−１，１−ジメチルエチルエステル）、デキサメタゾン、フォルスコリン、レチノイン酸および／またはＳＩＳ３（１，２，３，４−テトラヒドロ−６，７−ジメトキシ−２−［（２Ｅ）−３−（１−フェニル−１Ｈ−ピロロ［２，３−ｂ］ピリジン−３−イル）−１−オキソ−２−プロペニル］−イソキノリン塩酸塩）であり得るような使用であることが企図される。
【００１８】
本発明の主題の様々な目的、特徴、態様および長所が以下の好ましい実施形態の詳細な説明からより明らかになろう。
【発明の詳細な説明】
【００１９】
現在のところ、癌などの疾患は増殖問題としてのみ扱われている。現在の処置は、増殖の中止または停止に焦点を当てている。しかし、このような処置の後でさえも、患者が寛解しているように見える状況でさえ、患者において癌が再発し得る。したがって、このような問題に取り組むために、癌に対する異なる展望が必要とされる。
【００２０】
癌の処置に重大な影響を与えるためには、おそらく異なる処置を介して、癌細胞の個々のタイプ（例えば、癌幹細胞、癌前駆細胞、癌転移細胞など）のそれぞれを攻撃しなければならないと考えられる。過去には、上記で言及されるように、これらの様々なタイプの癌細胞は単一のタイプの増殖問題として扱われてきた。例えば、化学療法は、総じて癌を処置するために使用されるが、増殖した癌細胞および残念ながら健康な細胞も単純に死滅させ得る。しかし、上記の癌モデルにおいて、化学療法によって必ずしも患者から癌幹細胞が排除されるとは限らない。このように、癌は、おそらく分化した形態で再発し得る。簡潔に述べると、各タイプの癌細胞は異なる治療戦略を必要とし得る。
【００２１】
癌幹細胞に関して、癌幹細胞が化学療法または他の従来的な経路を介して処置することができない状況において、癌幹細胞は、１つ以上のシグナル伝達経路によって支配されるそれらの細胞代謝を介して攻撃し得る。
【００２２】
発明者は、疾患／癌幹細胞が破壊的経路を活性化するように、疾患幹細胞および特に癌幹細胞を催奇形性医薬化合物および／または幹細胞分化剤で処置し得、次いでこれが、破壊的経路の活性化、特にアポトーシス経路またはオートファジー経路の活性化につながることを発見した。したがって、この観察に基づき、発明者は、疾患／癌幹細胞の存在が当技術分野で周知のオミクスまたは免疫組織化学的方法を用いて最初に判定される病変（典型的には腫瘍性または癌性）組織を処置する方法を企図する。疾患／癌幹細胞が存在すると判定された場合、病変組織中に残存する疾患幹細胞または癌幹細胞において破壊的経路を活性化するために、有効量の催奇形性医薬化合物および／または幹細胞分化剤を病変組織に投与する。
【００２３】
最も典型的には、企図される癌幹細胞は、ある種の幹細胞特性を示し、最も一般的には、幹細胞および既知の癌幹細胞に対する１つ以上の表面マーカーを有する。例えば、癌幹細胞は、ＣＤ１９、ＣＤ２４、ＣＤ３４、ＣＤ４４、ＣＤ９０（Ｔｈｙ１）、ＣＤ１１７、ＣＤ１３３、ＣＤ２００（ＯＸ−２）、ＥｐＣＡＭ（上皮細胞接着分子）および／またはＡＢＣＢ５（ＡＴＰ結合カセットＢ５）を提示し得る。言うまでもなく、このようなマーカーは、特定の癌幹細胞において選択的に発現され得、異なる癌は、そのそれぞれの表面マーカーを有する異なる癌幹細胞を有するであろうことに留意すべきである。例えば、癌幹細胞が存在する、企図される癌組織としては、乳癌組織、結腸癌組織、前立腺癌組織、神経膠芽腫組織、卵巣癌組織、頭頸部癌組織、基底細胞癌組織、扁平上皮癌組織、メラノーマ組織、胃癌組織、膵臓癌組織および肺癌組織が挙げられる。この文脈において、癌幹細胞は必ずしも癌塊中にある必要はないが、遠位および／または休眠形態で存在し得ることが理解されるべきである。このようなものとして、また特に癌幹細胞が無活動状態である場合、従来的な化学療法剤は細胞分裂が有効であることを必要とするため、これらの薬剤の大部分が有効ではない。
【００２４】
疾患／癌幹細胞は、腫瘍の試料または生検から得られると一般的に企図される一方で、循環腫瘍細胞（ＣＴＣ）が１つ以上の癌幹細胞を含み得る場合、ＣＴＣが血液試料中でも同定され得ることが認識されるべきである。例えば、ＣＴＣは、米国特許第８，５６９，００９号明細書に記載されているものに基づくものであると思われるビー・バルキング技術（ｂｅ−ｂｕｌｋｉｎｇ  ｔｅｃｈｎｉｑｕｅｓ）を通じて血液試料から濃縮され得る。
【００２５】
癌幹細胞の分析は、癌幹細胞が少なくとも１つの分化細胞特性を有することの確認も含む。例えば、癌が神経癌である場合、企図される特性は、Ｆｏｘ３、ＭＡＰ２および／またはベータＩＩＩチューブリンを含み得るか、または癌が乳癌である場合、特性は、ＢＲＣＡ１、サイトケラチン５またはポドカリキシンを含み得る。同様に、癌が前立腺癌である場合、その特性はサイトケラチン８、１４および／または１８であり得、癌が卵巣癌である場合、その特性はＭＵＣ−１、ＣＡ１２５またはサイトケラチン１８であり得る。メラノーマの特性にはＨＳＰ２７が含まれ、一方で基底細胞癌の特性にはサイトケラチン１５が含まれ、扁平上皮癌の特性にはＣＤ１３８および／またはコルヌリンが含まれる。さらなる例において、カテプシンＥまたはデスモコリン−２は、胃癌の特性となり得、一方で肺癌に対する特性には、カベオリン−１、ｆｏｘａ１およびＲｅｘ−１が含まれる。
【００２６】
幹細胞特性および分化細胞特性の存在の確認のために、全ての様式が適切であるとみなされることが企図される。最も典型的には、特性を発現させる必要があるため、企図される分析方法は、特に、マーカーの存在または非存在を直接的または間接的に確認する方法を含む。したがって、他の適切な方法の中で、組織切片（固定または新鮮）上の標識化抗体を用いる免疫組織化学的試験が適切であるとみなされる。あるいは、定性的および定量的質量分析法またはプロテオミクス法（例えば、ゲル電気泳動または質量分析免疫アッセイを用いる）もまた企図される。さらに、マーカー発現を示す間接的な確認方法としては、トランスクリプトーム分析、特に定性的および定量的トランスクリプトーム分析（例えば、ｑＰＣＲ、マイクロアレイまたは全トランスクリプトームショットガンシークエンシングを使用）が挙げられる。
【００２７】
したがって、疾患／癌幹細胞の同定に関しては、同定または検出の全ての様式が本明細書中での使用に適しているとみなされ、検出または同定の最も適切な様式は、典型的には、少なくともある程度、疾患／癌幹細胞に対して使用される所望のマーカーに依存することに留意すべきである。しかし、殆どの企図された方法において、試料は病変または癌組織から得られ、疾患／癌幹細胞の存在は、上記のような方法に従って判定される。疾患／癌組織が疾患／癌幹細胞を含むことが確認されたら、次に、組織を１つ以上の催奇形性医薬化合物および／または幹細胞分化剤に曝露し得る。言うまでもなく、このような曝露はインビトロまたはインビボで行い得ることを認識すべきである。その結果、催奇形性医薬化合物および／または幹細胞分化剤の投与様式は大きく変動し得る。
【００２８】
例えば、病変／癌組織を催奇形性医薬化合物および／または幹細胞分化剤とインビトロで接触させる場合、接触は、細胞または組織培養において、典型的には催奇形性医薬化合物および／または幹細胞分化剤を適切な濃度で培養または温置培地と組み合わせることによって、行われ得る。容易に認識されるように、以下でより詳細にさらに記載されるような、破壊的経路が疾患／癌幹細胞において活性化されたことを確立する１つ以上の試験手順を用いて、適切な濃度を確認し得る。一方、催奇形性医薬化合物および／または幹細胞分化剤がインビボで投与される場合、接触は、特に経口または非経口投与（例えば静脈内注射、筋肉内注射、吸入など）を介して、患者に医薬化合物を投与する全ての既知の様式を用いて行われ得る。都合よく、多数の催奇形性医薬化合物および幹細胞分化剤が当技術分野で公知であるので、インビボでの投与は、このような化合物および薬剤（通常、処方情報に記載）に対して述べられるものと同じ経路、投与量およびスケジュールに従い得る。
【００２９】
発明者は、このような化合物および／または薬剤の使用が、いくつかの状況（例えば妊娠中）において、特に長期間および比較的高投与量で問題となり得るが、このような化合物および薬剤の低用量投与は、他の場合では観察される有害作用を惹起することなく（または低頻度になる）、癌幹細胞に対して同じ効果を有利に達成し得ることを今回認識した。したがって、発明者は、催奇形性医薬化合物および／または幹細胞分化剤が処方投与量の５０％未満、より好ましくは処方投与量の２５％未満、最も好ましくは処方投与量の１０％未満の量で病変組織に投与されることを企図する。さらに、疾患／癌幹細胞における破壊的経路を活性化する所望の効果を持続させるために、催奇形性医薬化合物および／または幹細胞分化剤を（処方情報と比較して）少ない投与量にてメトロノーム方式で投与することが企図される。例えば、本化合物または薬物は、処方情報で示される投与量の２０％で、４日ごとに２ヶ月の期間にわたって経口投与され得る。したがって、メトロノーム投与は、処方情報中の指示される投与量の１〜１０％、または１０〜２５％、または２５〜５０％の投与量レベルで少なくとも２週間、より好ましくは少なくとも４週間、最も好ましくは少なくとも８週間にわたって、有利に拡大する。このようなメトロノーム低用量投与は、非疾患／癌幹細胞に有害作用を顕著に引き起こすことなく、疾患／癌幹細胞において破壊的経路の活性化を維持すると考えられる。
【００３０】
適切な催奇形性医薬化合物に関して、催奇形性活性を有する全ての医薬剤は本明細書中での使用に適切であるとみなされ、このような薬剤に対して催奇形性活性が知られているか、または当技術分野で周知のプロトコールに従って確認し得るかの何れかであることに留意すべきである（例えば、米国特許出願公開第２０１５／０１３３３４０Ａ１号明細書または国際公開第２０１４／０７１１３７Ａ１号パンフレット）。例えば、適切な催奇形剤としては、様々なＡＣＥ（アンジオテンシン変換酵素）阻害剤、例えばベナゼプリル、カプトプリル、エナラプリル、フォシノプリルナトリウム、リシノプリル、リシノプリル、ヒドロクロロチアジド、キナプリルおよびラミプリル、ある種のアンドロゲン（および特にテストステロン誘導体）、ジエチルスチルベストロール、イソトレチノイン、ある種の抗生物質（例えばテトラサイクリン、ドキシサイクリン、ストレプトマイシン）、ある種の抗けいれん薬、例えばフェニトイン、バルプロ酸、トリメタジオン、パラメタジオンおよびカルバマゼピン、およびメトトレキサート、アミノプテリン、チオウラシル、カルビマゾール、サリドマイド、レナリドマイド、ポマリドマイドおよびアプレミラストが挙げられる。
【００３１】
同様に、当技術分野で知られている幹細胞分化剤が数多く存在し、特に企図される薬剤としては、内胚葉形成、外胚葉形成、中胚葉形成を誘発するものおよびニューロン分化、骨芽細胞形成または脂肪細胞形成、心筋分化などを促進するものが挙げられる。したがって、本明細書での使用に適した代表的な幹細胞分化剤としては、ＡＩＣＡＲ（Ｎ１−（β−Ｄ−リボフラノシル）−５−アミノイミダゾール−４−カルボキサミド）、５−アザシチジン、ＣＣＧ１４２３（Ｎ−［２−［（４−クロロフェニル）アミノ］−１−メチル−２−オキソエトキシ］−３，５−ビス（トリフルオロメチル）ベンズアミド）、ＣＷ００８（４−フルオロ−Ｎ−［５−フルオロ−６−（５−メトキシピラゾロ［１，５−ａ］ピリジン−３−イル）−１Ｈ−ピラゾロ［３，４−ｂ］ピリジン−３−イル］ベンズアミド）、シクロパミン、ＤＡＰＴ（Ｎ−［（３，５−ジフルオロフェニル）アセチル］−Ｌ−アラニル−２−フェニル］グリシン−１，１−ジメチルエチルエステル）、デキサメタゾン、フォルスコリン、レチノイン酸およびＳＩＳ３（１，２，３，４−テトラヒドロ−６，７−ジメトキシ−２−［（２Ｅ）−３−（１−フェニル−１Ｈ−ピロロ［２，３−ｂ］ピリジン−３−イル）−１−オキソ−２−プロペニル］−イソキノリン塩酸塩）が挙げられる。３種類の胚葉細胞タイプの何れか１つに幹細胞の分化を誘導することが知られているさらなる適切な化合物および組成物としては、「Ｒｅｖｉｅｗｓ  ｉｎ  Ｓｔｅｍ  ａｎｄ  Ｐｒｏｇｅｎｉｔｏｒ  Ｃｅｌｌｓ」（Ｔｈｅ  Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ  Ｗｏｒｌｄ  Ｊｏｕｒｎａｌ（２００２）２，１１４７−１１６６）に記載されているものが挙げられる。適切な薬剤としては、幹細胞タイプの段階を通過することなく、少なくとも分化系列が決定された細胞を別の系列またはタイプにトランス分化させるものも挙げられる（例えば、Ｍｏｌ  Ｈｕｍ  Ｒｅｐｒｏｄ  Ｖｏｌｕｍｅ  １６，Ｉｓｓｕｅ  １１；Ｐｐ．８５６−８６８；またはＭｏｌ  Ｈｕｍ  Ｒｅｐｒｏｄ  ２０１０  Ｎｏｖ；１６（１１）：８５６−６８）。
【００３２】
特定の催奇形性医薬化合物および／または幹細胞分化剤に依存して、特定の作用機序が少なくともある程度まで変動し得ることが認識されるべきである。しかし、本明細書中で企図される化合物および薬剤が、アポトーシス経路および／またはオートファジー経路を惹起または活性化することが一般的に企図される。別の観点から見ると、催奇形性医薬化合物および／または幹細胞分化剤は、Ｗｎｔ／β−カテニンシグナル伝達、Ｈｉｐｐｏシグナル伝達、Ｎｏｔｃｈシグナル伝達、Ｈｅｄｇｅｈｏｇシグナル伝達、ＴＧＦ−βシグナル伝達および／またはＧタンパク質シグナル伝達において存在する１つ以上の構成要素を妨害し得る。したがって、破壊的経路は、Ｆａｓ受容体またはそのリガンド、ＴＮＦＲ１（腫瘍壊死因子受容体−１）またはそのリガンド、Ａｐｏ２受容体またはそのリガンド、Ａｐｏ３受容体またはそのリガンド、カスパーゼ、ＳＭＡＣ（セカンドミトコンドリア由来カスパーゼ活性化剤（Ｓｅｃｏｎｄ  Ｍｉｔｏｃｈｏｎｄｒｉａ−Ｄｅｒｉｖｅｄ  Ａｃｔｉｖａｔｏｒ  ｏｆ  Ｃａｓｐａｓｅ））、ＺＩＰキナーゼ、Ｂｃｌ２、ＢＡＸおよび／またはｐ５３により活性化され得ることが認識されるべきである。
【００３３】
したがって、特定の化合物または薬剤にかかわらず、疾患／癌幹細胞は、低濃度であっても、最終的に疾患／癌幹細胞の破壊につながる破壊的経路の活性化に向けて疾患／癌幹細胞を処理する事象を受けることが認識されるべきである。さらに、疾患／癌幹細胞がアポトーシスまたはオートファジーを受ける場合、多くのタンパク質およびタンパク質断片が放出され、続いてこれは、免疫系にとって、瀕死の疾患／癌幹細胞に対する反応を認識し標的とするための誘発事象となり得る。注目すべきことに、疾患／癌幹細胞の全てまたは殆ど全てが突然変異のためにネオエピトープを発現するので、このようなネオエピトープは、免疫系が治療的に有効な反応を開始し得る抗原となり得る。
【００３４】
さらに、破壊的経路の活性化を増大または相乗的に増強するために、癌または患者に第２の薬物を提供し得ることが企図される。最も好ましくは、第２の薬物は、特に、このような薬物が上記のような低用量メトロノーム計画で（同時）投与される場合、全ての既知の化学療法薬を含む。
【００３５】
したがって、企図される組成物および方法は、患者における癌幹細胞の数を減少させるためにも有用であり得る。そのためには、最初に、癌組織から試料を採取し、その癌組織が癌幹細胞を含有することが一般的に企図される。前述のように、適切な癌幹細胞は、少なくとも１つの幹細胞特性および少なくとも１つの分化細胞特性を有する。癌幹細胞の存在を確認したら、患者に残存する癌幹細胞において破壊的経路を活性化することによって癌幹細胞数を減少させるために、有効量の催奇形性医薬化合物および／または幹細胞分化剤を患者に投与する。したがって、異なる観点から見ると、発明者らはまた、疾患幹細胞（この疾患幹細胞は、少なくとも１つの幹細胞の特性および少なくとも１つの分化細胞特性を有する）において破壊的経路を活性化するための、催奇形性医薬化合物および／または幹細胞分化剤の使用も企図する。癌幹細胞、その特性、催奇形性医薬化合物および／または幹細胞分化剤および投与に関して、上記で提供されるものと同じ配慮が適用される。
【００３６】
体細胞は、少なくとも、ヘイフリック限界まで、標準的な有糸分裂を通じて増殖することがまたさらに認識されるべきである。一方、幹細胞は、必ずしも体細胞と同じ過程に従うとは限らず；例えば幹細胞は自己再生し得る。むしろ、幹細胞は、対称細胞分裂、非対称細胞分裂（例えば、内因性、外因性など）、または完全に分化している体細胞にとって利用不可能な他の経路などの経路を通じて自己再生し得る。より具体的な例として、全能性接合細胞を考慮する。接合子の成長において、細胞は細胞開裂を介して分裂する。８細胞期の前に、各細胞は実質的に未分化のままであり、個々に、各細胞が幹細胞とみなされ得る別個の生物になり得る。幹細胞と体細胞との間の重要な相違の１つは、幹細胞のテロメアの再生を可能にする高いテロメラーゼ活性に基づいて、幹細胞が不死であると考えられ得、テロメア惹起アポトーシスを防止することである。
【００３７】
癌幹細胞は、標準的な幹細胞と同様の自己再生経路に従うと考えられる。その結果、癌幹細胞は、同様の幹細胞再生経路を通じて自己再生し得、増殖し分化した癌細胞を標的とする化学療法または他の癌の処置は、癌幹細胞を顕著に標的とすることが不可能である。出願人らは、薬物、分子または他の医薬化合物で癌幹細胞の特殊な細胞分裂または自己再生経路を標的とすることにより、化学療法などの従来的な処置が不首尾であった患者を処置するためのさらなる経路が提供されることを認識した。したがって、本発明の主題はまた、自己再生または細胞分裂の特殊な癌幹細胞経路を特異的に攻撃する、催奇形性医薬化合物、幹細胞分化剤または他の化合物の開発または使用を含むとも考えられる。
【００３８】
本発明の主題のさらに別の態様は、ＮＫ細胞の癌細胞寛容を破壊するか、またはおそらく、ＮＫ細胞がアポトーシス経路を惹起することが可能なようにＮＫ細胞に対して癌幹細胞を見えるようにする医薬化合物の使用を含む。このような実施形態において、ＮＫ細胞の細胞傷害性は、標的細胞（例えば、癌前駆細胞、癌腫瘍細胞、癌幹細胞など）に対して再活性化されると考えられ得る。ＮＫ細胞は、サイトカインまたはサイトカインとして作用する化合物を通じて活性化されるその細胞傷害性を有し得る。
【００３９】
いくつかの実施形態において、１つ以上の化合物または分子の組み合わせは、標的癌細胞に近接している場合に、ＮＫ細胞の細胞傷害性を向上させるように作用し得る。例となる化合物またはその類似体としては、例を挙げると、ＣＯＸ−２阻害剤、メトホルミン、顆粒球マクロファージコロニー刺激因子（ＧＭ−ＣＳＦ）および顆粒球コロニー刺激因子（ＧＣＳＦ）が挙げられる。このような化合物は、単独または組み合わせて、標的癌細胞に対して、サイトカインがＮＫ細胞をどのように活性化するかに影響を及ぼし得る。
【００４０】
さらに、いくつかの実施形態において、ＧＣＳＦまたはインターフェロンなどの化合物は、癌幹細胞を誘導して、癌前駆細胞になるようにすると考えられる。次いで、癌前駆細胞を正常に分裂させ得る。したがって、化学療法によって通常は影響を受けない癌幹細胞は、分化型になるがゆえに、化学療法に対して感受性になるようにされ得る。この戦略を以前に論じられた戦略と組み合わせることによって、癌、特に癌幹細胞に関連する癌のために患者を処置し得る複数の経路がもたらされる。
【００４１】
本明細書中の発明概念から逸脱することなく、既に記載されるもの以外の多くのさらなる変更が可能であることは、当業者にとって明らかであるはずである。したがって、本発明の主題は、添付の特許請求の範囲の精神を除いて制限されるものではない。さらに、明細書および特許請求の範囲の両方を解釈する上で、全ての用語は、文脈と一致する最も広い可能な様式で解釈されるべきである。特に、「含む（ｃｏｍｐｒｉｓｅｓ）」および「含むこと（ｃｏｍｐｒｉｓｉｎｇ）」という用語は、要素、構成要素または工程を包括的様式に言及するものとして解釈されるべきであり、言及される要素、構成要素または工程は、明らかに言及されていない他の要素、構成要素もしくは工程とともに、存在し得るか、または利用され得るか、または組み合わせられ得ることが示される。明細書または特許請求の範囲が、Ａ、Ｂ、Ｃ．．．およびＮからなる群から選択されるあるもののうち少なくとも１つを指す場合、その文章は、Ａ＋ＮまたはＢ＋Ｎなどではなく、群からのただ１つの要素を必要とすると解釈されるべきである。
【手続補正書】
【提出日】平成28年12月18日(2016.12.18)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
病変組織を処置する方法であって、
少なくとも１つの幹細胞特性および少なくとも１つの分化細胞特性を有する疾患幹細胞が試料中に存在することを、前記病変組織から採取した前記試料から判定すること；および
前記病変組織中に残存する疾患幹細胞において破壊的経路を活性化するために、有効量の催奇形性医薬化合物および／または幹細胞分化剤を前記病変組織に投与すること
を含む、方法。
【請求項２】
前記病変組織が腫瘍性組織を含む、請求項１に記載の方法。
【請求項３】
前記病変組織が癌組織を含む、請求項１に記載の方法。
【請求項４】
前記癌組織が、乳癌組織、結腸癌組織、前立腺癌組織、神経膠芽腫組織、卵巣癌組織、頭頸部癌組織、メラノーマ組織、基底細胞癌、扁平上皮癌、胃癌組織、膵臓癌組織または肺癌組織である、請求項３に記載の方法。
【請求項５】
前記判定する工程が、トランスクリプトミクス分析、プロテオミクス分析、質量分析および免疫組織化学分析のうち少なくとも１つを含む、請求項１に記載の方法。
【請求項６】
前記少なくとも１つの幹細胞特性が、ＣＤ１９、ＣＤ２４、ＣＤ３４、ＣＤ４４、ＣＤ９０（Ｔｈｙ１）、ＣＤ１１７、ＣＤ１３３、ＣＤ２００（ＯＸ−２）、ＥｐＣＡＭ（上皮細胞接着分子）およびＡＢＣＢ５（ＡＴＰ結合カセットＢ５）からなる群から選択される、請求項１に記載の方法。
【請求項７】
前記少なくとも１つの分化細胞特性が、Ｆｏｘ３、ＭＡＰ２、ベータＩＩＩチューブリン、ＢＲＣＡ１、サイトケラチン５、ポドカリキシン、サイトケラチン８、サイトケラチン１４、サイトケラチン１８、ＭＵＣ−１、ＣＡ１２５、サイトケラチン１８、ＨＳＰ２７、サイトケラチン１５、ＣＤ１３８、コルヌリン（ｃｏｒｎｕｌｉｎ）、カテプシンＥ、デスモコリン−２、カベオリン−１、ｆｏｘａ１およびＲｅｘ−１からなる群から選択される、請求項１に記載の方法。
【請求項８】
前記催奇形性医薬化合物が、ＡＣＥ（アンジオテンシン変換酵素）阻害剤、アンドロゲン、イソトレチノイン、テトラサイクリン、ドキシサイクリン、ストレプトマイシン、フェニトイン、バルプロ酸、メトトレキサート、アミノプテリン、チオウラシル、カルビマゾール、ＤＥＳ、サリドマイド、レナリドマイド、ポマリドマイドおよびアプレミラストからなる群から選択される、請求項１に記載の方法。
【請求項９】
前記幹細胞分化剤が、ＡＩＣＡＲ（Ｎ１−（β−Ｄ−リボフラノシル）−５−アミノイミダゾール−４−カルボキサミド）、５−アザシチジン、ＣＣＧ１４２３（Ｎ−［２−［（４−クロロフェニル）アミノ］−１−メチル−２−オキソエトキシ］−３，５−ビス（トリフルオロメチル）ベンズアミド）、ＣＷ００８（４−フルオロ−Ｎ−［５−フルオロ−６−（５−メトキシピラゾロ［１，５−ａ］ピリジン−３−イル）−１Ｈ−ピラゾロ［３，４−ｂ］ピリジン−３−イル］ベンズアミド）、シクロパミン、ＤＡＰＴ（Ｎ−［（３，５−ジフルオロフェニル）アセチル］−Ｌ−アラニル−２−フェニル］グリシン−１，１−ジメチルエチルエステル）、デキサメタゾン、フォルスコリン、レチノイン酸およびＳＩＳ３（１，２，３，４−テトラヒドロ−６，７−ジメトキシ−２−［（２Ｅ）−３−（１−フェニル−１Ｈ−ピロロ［２，３−ｂ］ピリジン−３−イル）−１−オキソ−２−プロペニル］−イソキノリン塩酸塩）からなる群から選択される、請求項１に記載の方法。
【請求項１０】
前記催奇形性医薬化合物および／または幹細胞分化剤がインビボで前記病変組織に投与される、請求項１に記載の方法。
【請求項１１】
前記催奇形性医薬化合物および／または幹細胞分化剤が処方薬であり、前記催奇形性医薬化合物および／または幹細胞分化剤が前記病変組織に、処方投与量の５０％未満の量で投与される、請求項１０に記載の方法。
【請求項１２】
前記催奇形性医薬化合物および／または幹細胞分化剤が処方薬であり、前記催奇形性医薬化合物および／または幹細胞分化剤が前記病変組織に、処方投与量の２５％未満の量で投与される、請求項１０に記載の方法。
【請求項１３】
前記催奇形性医薬化合物および／または幹細胞分化剤が処方薬であり、前記催奇形性医薬化合物および／または幹細胞分化剤が前記病変組織に、処方投与量の１０％未満の量で投与される、請求項１０に記載の方法。
【請求項１４】
前記催奇形性医薬化合物および／または幹細胞分化剤が処方薬であり、前記催奇形性医薬化合物および／または幹細胞分化剤が処方投与量を下回る量でメトロノーム投与される、請求項１０に記載の方法。
【請求項１５】
前記破壊的経路が、アポトーシス経路またはオートファジー経路である、請求項１に記載の方法。
【請求項１６】
前記破壊的経路が、Ｆａｓ受容体、ＴＮＦＲ１（腫瘍壊死因子受容体−１）、Ａｐｏ２受容体、Ａｐｏ３受容体、カスパーゼ、ＺＩＰキナーゼ、Ｂｃｌ２、ＢＡＸ、ｐ５３およびＳＭＡＣ（セカンドミトコンドリア由来カスパーゼ活性化剤（Ｓｅｃｏｎｄ  Ｍｉｔｏｃｈｏｎｄｒｉａ−Ｄｅｒｉｖｅｄ  Ａｃｔｉｖａｔｏｒ  ｏｆ  Ｃａｓｐａｓｅ））のうち少なくとも１つによって活性化される、請求項１に記載の方法。
【請求項１７】
患者における癌幹細胞数を減少させる方法であって、
前記患者の癌組織から採取された試料から、少なくとも１つの幹細胞特性および少なくとも１つの分化細胞特性を有する癌幹細胞が前記試料中に存在することを判定すること；および
前記患者に残存する癌幹細胞において破壊的経路を活性化することによって癌幹細胞の数を減少させるために、有効量の催奇形性医薬化合物および／または幹細胞分化剤を前記患者に投与すること
を含む、方法。
【請求項１８】
前記癌組織が、乳癌組織、結腸癌組織、前立腺癌組織、神経膠芽腫組織、卵巣癌組織、頭頸部癌組織、メラノーマ組織、基底細胞癌、扁平上皮癌、胃癌組織、膵臓癌組織または肺癌組織である、特許請求１７に記載の方法。
【請求項１９】
前記判定する工程が、トランスクリプトミクス分析、プロテオミクス分析、質量分析および免疫組織化学分析のうち少なくとも１つを含む、特許請求１７に記載の方法。
【請求項２０】
前記少なくとも１つの幹細胞特性が、ＣＤ１９、ＣＤ２４、ＣＤ３４、ＣＤ４４、ＣＤ９０（Ｔｈｙ１）、ＣＤ１１７、ＣＤ１３３、ＣＤ２００（ＯＸ−２）、ＥｐＣＡＭ（上皮細胞接着分子）およびＡＢＣＢ５（ＡＴＰ結合カセットＢ５）からなる群から選択される、特許請求１７に記載の方法。
【請求項２１】
前記少なくとも１つの分化細胞特性が、Ｆｏｘ３、ＭＡＰ２、ベータＩＩＩチューブリン、ＢＲＣＡ１、サイトケラチン５、ポドカリキシン、サイトケラチン８、サイトケラチン１４、サイトケラチン１８、ＭＵＣ−１、ＣＡ１２５、サイトケラチン１８、ＨＳＰ２７、サイトケラチン１５、ＣＤ１３８、コルヌリン、カテプシンＥ、デスモコリン−２、カベオリン−１、ｆｏｘａ１およびＲｅｘ−１からなる群から選択される、特許請求１７に記載の方法。
【請求項２２】
前記催奇形性医薬化合物が、ＡＣＥ（アンジオテンシン変換酵素）阻害剤、アンドロゲン、イソトレチノイン、テトラサイクリン、ドキシサイクリン、ストレプトマイシン、フェニトイン、バルプロ酸、メトトレキサート、アミノプテリン、チオウラシル、カルビマゾール、ＤＥＳ、サリドマイド、レナリドマイド、ポマリドマイドおよびアプレミラストからなる群から選択される、特許請求１７に記載の方法。
【請求項２３】
前記幹細胞分化剤が、ＡＩＣＡＲ（Ｎ１−（β−Ｄ−リボフラノシル）−５−アミノイミダゾール−４−カルボキサミド）、５−アザシチジン、ＣＣＧ１４２３（Ｎ−［２−［（４−クロロフェニル）アミノ］−１−メチル−２−オキソエトキシ］−３，５−ビス（トリフルオロメチル）ベンズアミド）、ＣＷ００８（４−フルオロ−Ｎ−［５−フルオロ−６−（５−メトキシピラゾロ［１，５−ａ］ピリジン−３−イル）−１Ｈ−ピラゾロ［３，４−ｂ］ピリジン−３−イル］ベンズアミド）、シクロパミン、ＤＡＰＴ（Ｎ−［（３，５−ジフルオロフェニル）アセチル］−Ｌ−アラニル−２−フェニル］グリシン−１，１−ジメチルエチルエステル）、デキサメタゾン、フォルスコリン、レチノイン酸およびＳＩＳ３（１，２，３，４−テトラヒドロ−６，７−ジメトキシ−２−［（２Ｅ）−３−（１−フェニル−１Ｈ−ピロロ［２，３−ｂ］ピリジン−３−イル）−１−オキソ−２−プロペニル］−イソキノリン塩酸塩）からなる群から選択される、特許請求１７に記載の方法。
【請求項２４】
前記催奇形性医薬化合物および／または幹細胞分化剤が処方薬であり、前記催奇形性医薬化合物および／または幹細胞分化剤が前記患者に、処方投与量の２５％未満の量で投与される、特許請求１７に記載の方法。
【請求項２５】
前記催奇形性医薬化合物および／または幹細胞分化剤が処方薬であり、前記催奇形性医薬化合物および／または幹細胞分化剤が前記病変組織に、処方投与量の１０％未満の量で投与される、特許請求１７に記載の方法。
【請求項２６】
前記催奇形性医薬化合物および／または幹細胞分化剤が処方薬であり、前記催奇形性医薬化合物および／または幹細胞分化剤が処方投与量を下回る量でメトロノーム投与される、特許請求１７に記載の方法。
【請求項２７】
前記破壊的経路が、アポトーシス経路またはオートファジー経路である、特許請求１７に記載の方法。
【請求項２８】
前記破壊的経路が、Ｆａｓ受容体、ＴＮＦＲ１（腫瘍壊死因子受容体−１）、Ａｐｏ２受容体、Ａｐｏ３受容体、カスパーゼ、ＺＩＰキナーゼ、Ｂｃｌ２、ＢＡＸ、ｐ５３およびＳＭＡＣ（セカンドミトコンドリア由来カスパーゼ活性化剤（Ｓｅｃｏｎｄ  Ｍｉｔｏｃｈｏｎｄｒｉａ−Ｄｅｒｉｖｅｄ  Ａｃｔｉｖａｔｏｒ  ｏｆ  Ｃａｓｐａｓｅ））のうち少なくとも１つによって活性化される、特許請求１７に記載の方法。
【請求項２９】
少なくとも１つの幹細胞特性および少なくとも１つの分化細胞特性を有する疾患幹細胞において破壊的経路を活性化するための催奇形性医薬化合物および／または幹細胞分化剤の使用であって、前記催奇形性医薬化合物が、ＡＣＥ（アンジオテンシン変換酵素）阻害剤、アンドロゲン、イソトレチノイン、テトラサイクリン、ドキシサイクリン、ストレプトマイシン、フェニトイン、バルプロ酸、チオウラシル、カルビマゾール、サリドマイド、レナリドマイド、ポマリドマイドおよびアプレミラストからなる群から選択される催奇形剤を含む、使用。
【請求項３０】
前記幹細胞特性が、ＣＤ１９、ＣＤ２４、ＣＤ３４、ＣＤ４４、ＣＤ９０（Ｔｈｙ１）、ＣＤ１１７、ＣＤ１３３、ＣＤ２００（ＯＸ−２）、ＥｐＣＡＭ（上皮細胞接着分子）およびＡＢＣＢ５（ＡＴＰ結合カセットＢ５）からなる群から選択され、前記疾患幹細胞が、乳癌組織、結腸癌組織、前立腺癌組織、神経膠芽腫組織、卵巣癌組織、頭頸部癌組織、メラノーマ組織、基底細胞癌、扁平上皮癌、胃癌組織、膵臓癌組織または肺癌組織由来である、請求項２９に記載の使用。
【請求項３１】
前記催奇形性医薬化合物が、ＡＣＥ（アンジオテンシン変換酵素）阻害剤［［１つまたは複数］］、アンドロゲン、イソトレチノイン、テトラサイクリン、ドキシサイクリン、ストレプトマイシン、フェニトイン、バルプロ酸、チオウラシル、カルビマゾール、サリドマイド、レナリドマイド、ポマリドマイドおよびアプレミラストからなる群から選択される、請求項２９に記載の使用。
【請求項３２】
前記幹細胞分化剤が、ＡＩＣＡＲ（Ｎ１−（β−Ｄ−リボフラノシル）−５−アミノイミダゾール−４−カルボキサミド）、５−アザシチジン、ＣＣＧ１４２３（Ｎ−［２−［（４−クロロフェニル）アミノ］−１−メチル−２−オキソエトキシ］−３，５−ビス（トリフルオロメチル）ベンズアミド）、ＣＷ００８（４−フルオロ−Ｎ−［５−フルオロ−６−（５−メトキシピラゾロ［１，５−ａ］ピリジン−３−イル）−１Ｈ−ピラゾロ［３，４−ｂ］ピリジン−３−イル］ベンズアミド）、シクロパミン、ＤＡＰＴ（Ｎ−［（３，５−ジフルオロフェニル）アセチル］−Ｌ−アラニル−２−フェニル］グリシン−１，１−ジメチルエチルエステル）、デキサメタゾン、フォルスコリン、レチノイン酸およびＳＩＳ３（１，２，３，４−テトラヒドロ−６，７−ジメトキシ−２−［（２Ｅ）−３−（１−フェニル−１Ｈ−ピロロ［２，３−ｂ］ピリジン−３−イル）−１−オキソ−２−プロペニル］−イソキノリン塩酸塩）からなる群から選択される、請求項２９に記載の使用。
【請求項３３】
ＡＩＣＡＲ（Ｎ１−（β−Ｄ−リボフラノシル）−５−アミノイミダゾール−４−カルボキサミド）、５−アザシチジン、ＣＣＧ１４２３（Ｎ−［２−［（４−クロロフェニル）アミノ］−１−メチル−２−オキソエトキシ］−３，５−ビス（トリフルオロメチル）ベンズアミド）、ＣＷ００８（４−フルオロ−Ｎ−［５−フルオロ−６−（５−メトキシピラゾロ［１，５−ａ］ピリジン−３−イル）−１Ｈ−ピラゾロ［３，４−ｂ］ピリジン−３−イル］ベンズアミド）、シクロパミン、ＤＡＰＴ（Ｎ−［（３，５−ジフルオロフェニル）アセチル］−Ｌ−アラニル−２−フェニル］グリシン−１，１−ジメチルエチルエステル）、デキサメタゾン、フォルスコリン、レチノイン酸およびＳＩＳ３（１，２，３，４−テトラヒドロ−６，７−ジメトキシ−２−［（２Ｅ）−３−（１−フェニル−１Ｈ−ピロロ［２，３−ｂ］ピリジン−３−イル）−１−オキソ−２−プロペニル］−イソキノリン塩酸塩）からなる群から選択される前記幹細胞分化剤の使用を含む、請求項２９に記載の使用。
【請求項３４】
前記幹細胞特性が、ＣＤ１９、ＣＤ１１７、ＣＤ１３３、ＣＤ２００（ＯＸ−２）、ＥｐＣＡＭ（上皮細胞接着分子）およびＡＢＣＢ５（ＡＴＰ結合カセットＢ５）からなる群から選択され、前記疾患幹細胞が、乳癌組織、結腸癌組織、前立腺癌組織、神経膠芽腫組織、卵巣癌組織、頭頸部癌組織、メラノーマ組織、基底細胞癌、扁平上皮癌、胃癌組織、膵臓癌組織または肺癌組織由来である、請求項２９に記載の使用。
【請求項３５】
少なくとも１つの幹細胞特性および少なくとも１つの分化細胞特性を有する疾患幹細胞において破壊的経路を活性化するための催奇形性医薬化合物および／または幹細胞分化剤の使用であって、前記催奇形性医薬化合物が、ＡＣＥ（アンジオテンシン変換酵素）阻害剤、アンドロゲン、イソトレチノイン、テトラサイクリン、ドキシサイクリン、ストレプトマイシン、フェニトイン、バルプロ酸、メトトレキサート、アミノプテリン、チオウラシル、カルビマゾール、ＤＥＳ、サリドマイド、レナリドマイド、ポマリドマイドおよびアプレミラストからなる群から選択される、使用。
【国際調査報告】
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