(57)【要約】被験体においてｐ５３非活性化変異が欠如していると決定された液性がんを処置する方法が提供される。また、被験体においてｐ５３非活性化変異が欠如していると決定された液性がんの処置に使用するためのペプチド模倣大環状分子が提供される。本発明は、例えばｐ５３非活性化変異が欠如していると決定された液性腫瘍を処置することを必要とするヒト被験体において該液性腫瘍を処置する方法であって、該ヒト被験体に、治療有効量のペプチド模倣大環状分子または薬学的に許容されるその塩を含む医薬組成物を投与するステップを含み、該ペプチド模倣大環状分子が、ＭＤＭ２タンパク質および／またはＭＤＭＸタンパク質に結合する、方法を提供する。【特許請求の範囲】
【請求項１】
ｐ５３非活性化変異が欠如していると決定された液性腫瘍を処置することを必要とするヒト被験体において該液性腫瘍を処置する方法であって、該ヒト被験体に、治療有効量のペプチド模倣大環状分子または薬学的に許容されるその塩を含む医薬組成物を投与するステップを含み、該ペプチド模倣大環状分子が、ＭＤＭ２タンパク質および／またはＭＤＭＸタンパク質に結合する、方法。
【請求項２】
ｐ５３非活性化変異が欠如している液性腫瘍を処置することを必要とするヒト被験体において該液性腫瘍を処置する方法であって、該ヒト被験体に、治療有効量のペプチド模倣大環状分子または薬学的に許容されるその塩を含む医薬組成物を投与するステップを含み、該ペプチド模倣大環状分子が、ＭＤＭ２タンパク質および／またはＭＤＭＸタンパク質に結合する、方法。
【請求項３】
ｐ５３遺伝子にｐ５３非活性化変異を有している液性腫瘍を処置することを必要とするヒト被験体において該液性腫瘍を処置する方法であって、該ヒト被験体に、治療有効量のペプチド模倣大環状分子または薬学的に許容されるその塩を含む医薬組成物を投与するステップを含み、該ペプチド模倣大環状分子が、ＭＤＭ２タンパク質および／またはＭＤＭＸタンパク質に結合する、方法。
【請求項４】
液性腫瘍を処置することを必要とするヒト被験体において液性腫瘍を処置する方法であって、該ヒト被験体に、治療有効量のペプチド模倣大環状分子または薬学的に許容されるその塩を含む医薬組成物を投与するステップを含み、該ペプチド模倣大環状分子が、ＭＤＭ２タンパク質および／またはＭＤＭＸタンパク質に結合し、該液性腫瘍が、ｐ５３タンパク質の発現に対して陰性ではない（例えば、野生型ｐ５３タンパク質または部分的機能性を有する変異型ｐ５３タンパク質を発現する液性腫瘍）、方法。
【請求項５】
液性腫瘍を処置することを必要とするヒト被験体において液性腫瘍を処置する方法であって、該ヒト被験体に、治療有効量のペプチド模倣大環状分子または薬学的に許容されるその塩を含む医薬組成物を投与するステップを含み、該ペプチド模倣大環状分子が、ＭＤＭ２タンパク質および／またはＭＤＭＸタンパク質に結合し、該液性腫瘍が、機能獲得型変異を有するｐ５３タンパク質（例えば、超アポトーシス性ｐ５３）を発現する、方法。
【請求項６】
液性腫瘍を処置することを必要とするヒト被験体において液性腫瘍を処置する方法であって、該ヒト被験体に、治療有効量のペプチド模倣大環状分子または薬学的に許容されるその塩を含む医薬組成物を投与するステップを含み、該ペプチド模倣大環状分子が、ＭＤＭ２タンパク質および／またはＭＤＭＸタンパク質に結合し、該液性腫瘍が、部分的な機能喪失を引き起こす変異を有するｐ５３タンパク質を発現する、方法。
【請求項７】
液性腫瘍を処置することを必要とするヒト被験体において液性腫瘍を処置する方法であって、該ヒト被験体に、治療有効量のペプチド模倣大環状分子または薬学的に許容されるその塩を含む医薬組成物を投与するステップを含み、該ペプチド模倣大環状分子が、ＭＤＭ２タンパク質および／またはＭＤＭＸタンパク質に結合し、該液性腫瘍の細胞が、ｐ５３遺伝子の単一ゲノムコピーだけからｐ５３を発現する、方法。
【請求項８】
液性腫瘍を処置することを必要とするヒト被験体において液性腫瘍を処置する方法であって、該ヒト被験体に、治療有効量のペプチド模倣大環状分子または薬学的に許容されるその塩を含む医薬組成物を投与するステップを含み、該ペプチド模倣大環状分子が、ＭＤＭ２タンパク質および／またはＭＤＭＸタンパク質に結合し、該液性腫瘍が、１つまたは複数のサイレント変異を有するｐ５３タンパク質を発現する、方法。
【請求項９】
液性腫瘍を処置することを必要とするヒト被験体において液性腫瘍を処置する方法であって、該ヒト被験体に、治療有効量のペプチド模倣大環状分子または薬学的に許容されるその塩を含む医薬組成物を投与するステップを含み、該ペプチド模倣大環状分子が、ＭＤＭ２タンパク質および／またはＭＤＭＸタンパク質に結合し、該液性腫瘍の細胞が、ｐ５３発現に対して陰性である、方法。
【請求項１０】
前記液性腫瘍の細胞が、前記ｐ５３遺伝子の１つのコピーにおいて前記ｐ５３非活性化変異を有する、請求項３に記載の方法。
【請求項１１】
前記液性腫瘍の細胞が、ｐ５３遺伝子の第２のコピーにおいて第２のｐ５３非活性化変異を有する、請求項１０に記載の方法。
【請求項１２】
前記ｐ５３遺伝子の１つのコピーにおける前記ｐ５３非活性化変異が、ｐ５３遺伝子の前記第２のコピーにおける前記第２のｐ５３非活性化変異と同じである、請求項１１に記載の方法。
【請求項１３】
前記ｐ５３遺伝子の１つのコピーにおける前記ｐ５３非活性化変異が、ｐ５３遺伝子の前記第２のコピーにおける前記第２のｐ５３非活性化変異とは異なる、請求項１１に記載の方法。
【請求項１４】
前記ｐ５３遺伝子における前記ｐ５３非活性化変異が、該ｐ５３遺伝子からのｐ５３タンパク質の発現の欠如をもたらすか、または部分的な機能喪失を有する部分的なｐ５３タンパク質の発現をもたらす、請求項３および１０から１３のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１５】
ｐ５３遺伝子の前記第２のコピーにおける前記第２のｐ５３非活性化変異が、該ｐ５３遺伝子からのｐ５３タンパク質の発現の欠如をもたらすか、または部分的な機能喪失を有する部分的なｐ５３タンパク質の発現をもたらす、請求項３および１０から１３のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１６】
前記液性腫瘍の前記細胞が、ｐ５３遺伝子のコピーにおいて少なくとも１つの変異を有し、該変異が、該ｐ５３遺伝子の該コピーから発現したｐ５３タンパク質の活性を、非変異型ｐ５３遺伝子のコピーから発現した野生型ｐ５３と比較して、排除または低減する、請求項３から１５のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１７】
液性腫瘍を処置することを必要とするヒト被験体において液性腫瘍を処置する方法であって、該ヒト被験体に、治療有効量のペプチド模倣大環状分子または薬学的に許容されるその塩を含む医薬組成物を投与するステップを含み、該ペプチド模倣大環状分子が、ＭＤＭ２タンパク質および／またはＭＤＭＸタンパク質に結合する、方法。
【請求項１８】
前記ペプチド模倣大環状分子が、ｐ５３とＭＤＭ２およびＭＤＭＸとの間の相互作用を妨害する、請求項１から１７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１９】
前記医薬組成物を投与する前の前記液性腫瘍における前記ｐ５３非活性化変異の欠如を決定するステップを含む、請求項１から１８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２０】
前記ｐ５３非活性化変異の欠如を決定する前記ステップが、前記液性腫瘍における野生型ｐ５３の存在を確認するステップを含む、請求項１９に記載の方法。
【請求項２１】
前記液性腫瘍におけるｐ５３機能獲得型変異の存在を決定するステップを含む、請求項１から１８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２２】
前記液性腫瘍におけるｐ５３の非活性化変異の存在を決定するステップを含む、請求項２から１８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２３】
前記液性腫瘍におけるｐ５３のコピー喪失変異の存在を決定するステップを含む、請求項２から１８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２４】
前記液性腫瘍におけるＰ５３の部分的な機能喪失変異の存在を決定するステップを含む、請求項２から１８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２５】
前記医薬組成物を投与する前の前記液性腫瘍における前記ｐ５３非活性化変異の欠如を確認するステップをさらに含む、請求項１から２４のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２６】
前記ｐ５３非活性化変異の欠如を確認する前記ステップが、前記液性腫瘍における野生型ｐ５３の存在を確認するステップを含む、請求項２５に記載の方法。
【請求項２７】
前記液性腫瘍におけるｐ５３機能獲得型変異の存在を確認するステップを含む、請求項１から１８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２８】
前記液性腫瘍におけるｐ５３の非活性化変異の存在を確認するステップを含む、請求項２から１８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２９】
前記液性腫瘍におけるｐ５３のコピー喪失変異の存在を確認するステップを含む、請求項２から１８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３０】
前記液性腫瘍におけるＰ５３の部分的な機能喪失変異の存在を確認するステップを含む、請求項２から１８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３１】
前記決定するステップまたは前記確認するステップが、前記医薬組成物の投与前、１〜１５カ月以内に実施される、請求項１９から３０のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３２】
前記決定するステップまたは前記確認するステップが、前記医薬組成物の投与前、１〜１２カ月以内に実施される、請求項１９から３０のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３３】
前記決定するステップまたは前記確認するステップが、前記医薬組成物の投与前、１〜３カ月以内に実施される、請求項１９から３０のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３４】
前記決定するステップまたは前記確認するステップが、前記医薬組成物の投与前、１カ月以内に実施される、請求項１９から３０のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３５】
前記決定するステップまたは前記確認するステップが、前記医薬組成物の投与前、２１日以内に実施される、請求項１９から３０のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３６】
前記決定するステップまたは前記確認するステップが、前記医薬組成物の投与の最大約１年前に実施される、請求項１９から３０のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３７】
前記決定するステップまたは前記確認するステップが、前記医薬組成物の投与の最大約２年前に実施される、請求項１９から３０のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３８】
前記決定するステップまたは前記確認するステップが、前記医薬組成物の投与の最大約３年前に実施される、請求項１９から３０のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３９】
前記処置が、前記ヒト被験体において、ｐ５３経路を再活性化し、液性がん細胞の増殖を低減し、ｐ５３タンパク質を増大し、ｐ２１を増大し、かつ／またはアポトーシスを増大する、前記請求項のいずれか一項に記載の方法。
【請求項４０】
前記医薬組成物が、週２回または３回投与される、請求項１から３９のいずれか一項に記載の方法。
【請求項４１】
前記医薬組成物が、週２回投与される、請求項１から３９のいずれか一項に記載の方法。
【請求項４２】
前記医薬組成物が、２週間または３週間ごとに１回投与される、請求項１から３９のいずれか一項に記載の方法。
【請求項４３】
前記医薬組成物が、１週間または２週間ごとに１回投与される、請求項１から３９のいずれか一項に記載の方法。
【請求項４４】
前記医薬組成物が、２１日サイクルの１日目、４日目、８日目、および１１日目に投与される、請求項１から３９のいずれか一項に記載の方法。
【請求項４５】
前記医薬組成物が、２８日サイクルの１日目、８日目、および１５日目に投与される、請求項１から３９のいずれか一項に記載の方法。
【請求項４６】
前記治療有効量が、前記ヒト被験体の体重１キログラム当たり約０．５〜約３０ｍｇである、請求項１から４５のいずれか一項に記載の方法。
【請求項４７】
前記治療有効量が、前記ヒト被験体の体重１キログラム当たり約０．５〜約２０ｍｇである、請求項１から４５のいずれか一項に記載の方法。
【請求項４８】
前記治療有効量が、前記ヒト被験体の体重１キログラム当たり約０．５〜約１０ｍｇである、請求項１から４５のいずれか一項に記載の方法。
【請求項４９】
前記治療有効量が、前記ヒト被験体の体重１キログラム当たり約０．０４ｍｇ、約０．０８ｍｇ、約０．１６ｍｇ、約０．３２ｍｇ、約０．６４ｍｇ、約１．２５ｍｇ、約１．２８ｍｇ、約１．９２ｍｇ、約２．５ｍｇ、約３．５６ｍｇ、約３．７５ｍｇ、約５．０ｍｇ、約７．１２ｍｇ、約７．５ｍｇ、約１０ｍｇ、約１４．２４ｍｇ、約１５ｍｇ、約２０ｍｇ、または約３０ｍｇである、請求項１から４５のいずれか一項に記載の方法。
【請求項５０】
前記治療有効量が、前記ヒト被験体の体重１キログラム当たり約１．９２ｍｇ、約３．７５ｍｇ、約７．５ｍｇ、約１５．０ｍｇ、または約３０．０ｍｇであり、前記医薬組成物が、週２回投与される、請求項１から４５のいずれか一項に記載の方法。
【請求項５１】
前記治療有効量が、前記ヒト被験体の体重１キログラム当たり約１．２８ｍｇ、約２．５６ｍｇ、約５．０ｍｇ、約１０ｍｇ、または約２０ｍｇであり、前記医薬組成物が、週２回投与される、請求項１から４５のいずれか一項に記載の方法。
【請求項５２】
前記治療有効量が、前記ヒト被験体の体重１キログラム当たり約１．９２ｍｇ、約３．７５ｍｇ、約７．５ｍｇ、約１５．０ｍｇ、または約３０．０ｍｇであり、前記医薬組成物が、週１回投与される、請求項１から４５のいずれか一項に記載の方法。
【請求項５３】
前記治療有効量が、前記ヒト被験体の体重１キログラム当たり約１．２８ｍｇ、約２．５６ｍｇ、約５．０ｍｇ、約１０ｍｇ、または約２０ｍｇであり、前記医薬組成物が、週１回投与される、請求項１から４５のいずれか一項に記載の方法。
【請求項５４】
前記治療有効量が、前記ヒト被験体の体重１キログラム当たり約１．９２ｍｇ、約３．７５ｍｇ、約７．５ｍｇ、約１５．０ｍｇ、または約３０．０ｍｇであり、前記医薬組成物が、１日１回、７日間で３回、５回または７回投与される、請求項１から４５のいずれか一項に記載の方法。
【請求項５５】
前記医薬組成物が、１日１回、７日間で７回、静脈内投与される、請求項５４に記載の方法。
【請求項５６】
前記治療有効量が、前記ヒト被験体の体重１キログラム当たり約１．２８ｍｇ、約２．５６ｍｇ、約５．０ｍｇ、約１０ｍｇ、または約２０ｍｇであり、前記医薬組成物が、１日１回、７日間で３回、５回または７回投与される、請求項１から４５のいずれか一項に記載の方法。
【請求項５７】
前記医薬組成物が、１日１回、７日間で７回、静脈内投与される、請求項５６に記載の方法。
【請求項５８】
前記医薬組成物が、０．２５時間、０．５時間、１時間、２時間、３時間、４時間、５時間、６時間、７時間、８時間、９時間、１０時間、１１時間、または１２時間かけて投与される、請求項１から５７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項５９】
前記医薬組成物が、０．２５〜２．０時間かけて投与される、請求項１から５７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項６０】
前記医薬組成物が、１時間かけて徐々に投与される、請求項１から５７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項６１】
前記医薬組成物が、２時間かけて徐々に投与される、請求項１から５７のいずれか一項に前記請求項のいずれか一項に記載の方法。
【請求項６２】
前記処置が、処置開始後１カ月以内に、液性がん細胞の数を約９５％、９０％、８５％、８０％、７５％、７０％、６５％、６０％、５５％、５０％、４５％、４０％、３５％、３０％、２５％、２０％、１５％、１０％、または５％低減する、請求項１から６１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項６３】
前記処置が、処置開始後１カ月以内に、液性がん細胞の数を少なくとも６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、または９５％低減する、請求項１から６１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項６４】
前記処置が、処置開始後１年以内に、液性がん細胞の数を約９５％、９０％、８５％、８０％、７５％、７０％、６５％、６０％、５５％、５０％、４５％、４０％、３５％、３０％、２５％、２０％、１５％、１０％、または５％低減する、請求項１から６１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項６５】
前記処置が、処置開始後１年以内に、液性がん細胞の数を少なくとも６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、または９５％低減する、請求項１から６１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項６６】
前記処置が、処置開始後６カ月以内に、液性がん細胞の数を約９５％、９０％、８５％、８０％、７５％、７０％、６５％、６０％、５５％、５０％、４５％、４０％、３５％、３０％、２５％、２０％、１５％、１０％、または５％低減する、請求項１から６１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項６７】
前記処置が、処置開始後６カ月以内に、液性がん細胞の数を少なくとも６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、または９５％低減する、請求項１から６１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項６８】
前記処置が、処置開始後３カ月以内に、液性がん細胞の数を約９５％、９０％、８５％、８０％、７５％、７０％、６５％、６０％、５５％、５０％、４５％、４０％、３５％、３０％、２５％、２０％、１５％、１０％、または５％低減する、請求項１から６１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項６９】
前記処置が、処置開始後３カ月以内に、液性がん細胞の数を少なくとも６０％、少なくとも６５％、少なくとも７０％、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、または少なくとも９５％低減する、請求項１から６１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項７０】
前記液性がんが、安定疾患である、請求項６２から６９のいずれか一項に記載の方法。
【請求項７１】
前記処置が、前記ヒト被験体が前記医薬組成物で処置されなかった場合の該ヒト被験体の予測生存期間と比較して、該ヒト被験体の生存期間を延長する、請求項１から７０のいずれか一項に記載の方法。
【請求項７２】
前記ヒト被験体の生存期間の前記延長が、少なくとも３０日である、請求項７１に記載の方法。
【請求項７３】
前記ヒト被験体の生存期間の前記延長が、少なくとも３カ月である、請求項７１に記載の方法。
【請求項７４】
前記ヒト被験体の生存期間の前記延長が、少なくとも６カ月である、請求項７１に記載の方法。
【請求項７５】
前記ヒト被験体の生存期間の前記延長が、少なくとも１年である、請求項７１に記載の方法。
【請求項７６】
前記医薬組成物のｉｎ  ｖｉｖｏ循環半減期が、約１時間、約２時間、約３時間、約４時間、約５時間、約６時間、約７時間、約８時間、約９時間、約１０時間または約１２時間である、請求項１から７５のいずれか一項に記載の方法。
【請求項７７】
前記医薬組成物のｉｎ  ｖｉｖｏ循環半減期が、約４時間である、請求項１から７５のいずれか一項に記載の方法。
【請求項７８】
前記医薬組成物のｉｎ  ｖｉｖｏ循環半減期が、約６時間である、請求項１から７５のいずれか一項に記載の方法。
【請求項７９】
前記医薬組成物の生体組織半減期が、約１時間、約２時間、約３時間、約４時間、約５時間、約６時間、約７時間、約８時間、約９時間、約１０時間または約１２時間である、請求項１から７８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項８０】
前記医薬組成物の生体組織半減期が、約１０時間である、請求項１から７８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項８１】
前記ヒト被験体が、前記液性がんの１つまたは複数の他の処置に対して難治性および／または不耐性である、前記請求項のいずれか一項に記載の方法。
【請求項８２】
前記ヒト被験体が、前記液性がんの少なくとも１つの過去の処置および／または治療が不成功に終わっている、前記請求項のいずれか一項に記載の方法。
【請求項８３】
前記液性がんが、野生型ｐ５３タンパク質を発現する、前記請求項のいずれか一項に記載の方法。
【請求項８４】
前記液性がんが、液性リンパ腫、白血病、および骨髄腫からなる群から選択される、前記請求項のいずれか一項に記載の方法。
【請求項８５】
前記液性がんが、液性リンパ腫である、前記請求項のいずれか一項に記載の方法。
【請求項８６】
前記液性がんが、白血病である、前記請求項のいずれか一項に記載の方法。
【請求項８７】
前記液性がんが、骨髄腫である、前記請求項のいずれか一項に記載の方法。
【請求項８８】
前記液性がんが、ＨＰＶ陽性がんではない、請求項８４から８７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項８９】
前記液性がんが、ＨＰＶ陽性子宮頸がん、ＨＰＶ陽性肛門がんまたはＨＰＶ陽性頭頸部がん、例えば口腔咽頭がんではない、請求項８４に記載の方法。
【請求項９０】
前記医薬組成物が、静脈内投与される、前記請求項のいずれか一項に記載の方法。
【請求項９１】
前記医薬組成物に加えて、治療有効量の少なくとも１つの追加の治療剤および／または治療手技を前記ヒト被験体に施すステップをさらに含む、前記請求項のいずれか一項に記載の方法。
【請求項９２】
前記ヒト被験体が、前記処置に対して完全奏効を示す、前記請求項のいずれか一項に記載の方法。
【請求項９３】
前記ヒト被験体が、前記処置に対して部分奏効を示す、前記請求項のいずれか一項に記載の方法。
【請求項９４】
前記液性がんが、進行性疾患である、前記請求項のいずれか一項に記載の方法。
【請求項９５】
前記液性がんが、安定疾患である、前記請求項のいずれか一項に記載の方法。
【請求項９６】
投与された前記医薬組成物の臨床活性を決定するステップをさらに含む、前記請求項のいずれか一項に記載の方法。
【請求項９７】
前記臨床活性が、コンピューター断層撮影法（ＣＴ）、磁気共鳴画像法（ＭＲＩ）、および骨スキャンからなる群から選択される画像化法によって決定される、請求項９６に記載の方法。
【請求項９８】
１つまたは複数の特定の時点において前記ヒト被験体から生体試料を得、分析手順を用いて該生体試料を分析するステップをさらに含む、前記請求項のいずれか一項に記載の方法。
【請求項９９】
前記分析手順が、血液化学分析、染色体転座分析、針生検、組織生検、蛍光インサイツハイブリダイゼーション、臨床検査バイオマーカー分析、免疫組織化学的染色法、フローサイトメトリー、またはそれらの組合せである、請求項９８に記載の方法。
【請求項１００】
前記分析手順の結果を作表および／または作図するステップをさらに含む、請求項９８に記載の方法。
【請求項１０１】
前記１つまたは複数の特定の時点が、前記医薬組成物を前記ヒト被験体に投与する前の時点を含む、請求項９８に記載の方法。
【請求項１０２】
前記１つまたは複数の特定の時点が、前記医薬組成物を前記ヒト被験体に投与した後の時点を含む、請求項９８に記載の方法。
【請求項１０３】
前記１つまたは複数の特定の時点が、前記医薬組成物を前記ヒト被験体に投与する前の時点および投与した後の時点を含む、請求項９８に記載の方法。
【請求項１０４】
前記医薬組成物を前記ヒト被験体に投与する前および投与した後に収集された前記生体試料を比較するステップをさらに含む、請求項１０３に記載の方法。
【請求項１０５】
前記１つまたは複数の特定の時点が、前記医薬組成物を前記ヒト被験体に投与する前および投与した後の複数の時点を含む、請求項９８に記載の方法。
【請求項１０６】
前記複数の時点で収集された前記生体試料を比較するステップをさらに含む、請求項１０５に記載の方法。
【請求項１０７】
前記生体試料が、バイオマーカー評価のために使用される、請求項９８に記載の方法。
【請求項１０８】
前記生体試料が、薬物動態評価のために使用される、請求項９８に記載の方法。
【請求項１０９】
前記薬物動態評価が、前記特定の時点における前記生体試料中の前記ペプチド模倣大環状分子および／またはその代謝産物のレベルを研究することを含む、請求項１０８に記載の方法。
【請求項１１０】
前記生体試料が、血液試料または骨髄試料である、請求項１０９に記載の方法。
【請求項１１１】
前記生体試料が、薬力学的評価のために使用される、請求項９８に記載の方法。
【請求項１１２】
前記薬力学的評価が、前記特定の時点における前記生体試料中のｐ５３、ＭＤＭ２、ＭＤＭＸ、ｐ２１および／またはカスパーゼのレベルを研究することを含む、請求項１１１に記載の方法。
【請求項１１３】
前記生体試料が、液性がん細胞被検物である、請求項１１２に記載の方法。
【請求項１１４】
前記生体試料が、免疫原性アッセイのために使用される、請求項９８に記載の方法。
【請求項１１５】
前記医薬組成物を前記ヒト被験体に投与する前の、該ヒト被験体における少なくとも１つの循環腫瘍細胞（ＣＴＣ）または単核血球（ＭＮＢＣ）を選択および／または同定するステップをさらに含む、前記請求項のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１１６】
１つまたは複数の特定の時点における循環腫瘍細胞（ＣＴＣ）または単核血球（ＭＮＢＣ）の数を測定するステップをさらに含み、循環腫瘍細胞（ＣＴＣ）または単核血球（ＭＮＢＣ）の数が、該特定の時点における前記少なくとも１つの循環腫瘍細胞（ＣＴＣ）または単核血球（ＭＮＢＣ）の総数である、請求項１１５に記載の方法。
【請求項１１７】
ベースライン直径和を測定するステップをさらに含み、該ベースライン直径和が、前記医薬組成物を前記ヒト被験体に投与する前の、前記少なくとも１つの循環腫瘍細胞（ＣＴＣ）または単核血球（ＭＮＢＣ）の該直径の和である、請求項１１６に記載の方法。
【請求項１１８】
前記処置が、前記少なくとも１つの循環腫瘍細胞（ＣＴＣ）または単核血球（ＭＮＢＣ）を消失させる、請求項１１５に記載の方法。
【請求項１１９】
前記処置の後、ＣＴＣおよび／またはＭＮＢＣの数が低減する、前記請求項のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１２０】
前記１つまたは複数の特定の時点が、前記処置後の時点を含む、請求項１１７に記載の方法。
【請求項１２１】
前記処置後の前記時点におけるＣＴＣおよび／またはＭＮＢＣの数が、ＣＴＣおよび／またはＭＮＢＣのベースライン数より少なくとも３０％少ない、請求項１２０に記載の方法。
【請求項１２２】
前記処置が、ＣＴＣおよび／またはＭＮＢＣのベースライン数を参照として、前記１つまたは複数の特定の時点におけるＣＴＣおよび／またはＭＮＢＣの数を十分に増大せず、かつ十分に低減しない、請求項１１７に記載の方法。
【請求項１２３】
前記ペプチド模倣大環状分子が、チトクロムＰ４５０アイソフォームの阻害剤ではない、前記請求項のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１２４】
前記処置が、用量制限血小板減少症を本質的にもたらさない、前記請求項のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１２５】
前記処置が、正常な造血器官および／または組織において、有害効果を本質的に引き起こさない、前記請求項のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１２６】
前記処置が、前記ヒト被験体において、おそらく、ほぼ確実に、または確実に前記医薬組成物の投与に関係し得る有害事象を本質的に引き起こさない、前記請求項のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１２７】
前記処置が、前記ヒト被験体において、おそらく、ほぼ確実に、または確実に前記医薬組成物の投与に関係し得る重篤な有害事象を本質的に引き起こさない、前記請求項のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１２８】
前記液性がんにおけるｐ５３非活性化変異の欠如が、前記ｐ５３タンパク質をコードする核酸のＤＮＡ配列決定によって決定される、前記請求項のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１２９】
前記液性がんにおけるｐ５３非活性化変異の欠如が、ＲＮＡアレイベースの試験によって決定される、前記請求項のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１３０】
前記液性がんにおけるｐ５３非活性化変異の欠如が、ＲＮＡ分析によって決定される、前記請求項のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１３１】
前記液性がんにおけるｐ５３非活性化変異の欠如が、ポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）によって決定される、前記請求項のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１３２】
前記ｐ５３非活性化変異が、前記タンパク質のＤＮＡ結合ドメインにおける変異を含む、前記請求項のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１３３】
前記ｐ５３非活性化変異が、ミスセンス変異を含む、前記請求項のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１３４】
前記ｐ５３非活性化変異が、優性非活性化変異である、前記請求項のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１３５】
前記ｐ５３非活性化変異が、Ｖ１７３Ｌ、Ｒ１７５Ｈ、Ｇ２４５Ｃ、Ｒ２４８Ｗ、Ｒ２４９ＳおよびＲ２７３Ｈからなる群から選択される１つまたは複数の変異を含む、前記請求項のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１３６】
前記ｐ５３非活性化変異が、表１に示される変異の１つまたは複数を含む、前記請求項のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１３７】
ｐ５３非活性化変異が欠如していると決定されたヒト被験体における液性がんを処置する方法であって、該ヒト被験体に、該ヒト被験体の体重１キログラム当たり０．５〜２０ｍｇのペプチド模倣大環状分子または薬学的に許容されるその塩を、２８日サイクルの１日目、８日目および１５日目に投与するステップを含む、方法。
【請求項１３８】
前記ヒト被験体の体重１キログラム当たり０．５〜１０ｍｇの前記ペプチド模倣大環状分子または薬学的に許容されるその塩が、該ヒト被験体に投与される、請求項１３７に記載の方法。
【請求項１３９】
８日目および／または１５日目に投与される前記ペプチド模倣大環状分子の量が、１日目に投与される前記ペプチド模倣大環状分子の量を超える、請求項１３７に記載の方法。
【請求項１４０】
８日目および／または１５日目に投与される前記ペプチド模倣大環状分子の量が、１日目に投与される前記ペプチド模倣大環状分子の量に等しい、請求項１３７に記載の方法。
【請求項１４１】
１日目および／または８日目に投与される前記ペプチド模倣大環状分子の量が、１５日目に投与される前記ペプチド模倣大環状分子の量を超える、請求項１３７に記載の方法。
【請求項１４２】
１日目、８日目および１５日目に、等量の前記ペプチド模倣大環状分子が投与される、請求項１３７に記載の方法。
【請求項１４３】
前記２８日サイクルが、２回または３回反復される、請求項１３７から１４２のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１４４】
ｐ５３非活性化変異が欠如していると決定されたヒト被験体における液性がんを処置する方法であって、該ヒト被験体に、該ヒト被験体の体重１キログラム当たり０．２５〜１０ｍｇのペプチド模倣大環状分子または薬学的に許容されるその塩を、２１日サイクルの１日目、４日目、８日目および１１日目に投与するステップを含む、方法。
【請求項１４５】
前記ヒト被験体の体重１キログラム当たり０．２５〜５ｍｇの前記ペプチド模倣大環状分子または薬学的に許容されるその塩が、前記ヒト被験体に投与される、請求項１４４に記載の方法。
【請求項１４６】
４日目、８日目および／または１１日目に投与される前記ペプチド模倣大環状分子の量が、１日目に投与される前記ペプチド模倣大環状分子の量を超える、請求項１４４に記載の方法。
【請求項１４７】
４日目、８日目および／または１１日目に投与される前記ペプチド模倣大環状分子の量が、１日目に投与される前記ペプチド模倣大環状分子の量に等しい、請求項１４４に記載の方法。
【請求項１４８】
１日目、４日目、および／または８日目に投与される前記ペプチド模倣大環状分子の量が、１１日目に投与される前記ペプチド模倣大環状分子の量を超える、請求項１４４に記載の方法。
【請求項１４９】
１日目、４日目、８日目および１５１日目に、等量の前記ペプチド模倣大環状分子が投与される、請求項１４４に記載の方法。
【請求項１５０】
前記２１日サイクルが、２回または３回反復される、請求項１４４から１４９のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１５１】
前記ペプチド模倣大環状分子が、表３、表３ａ、表３ｂ、および表３ｃのいずれかのアミノ酸配列と少なくとも約６０％、少なくとも約７０％、少なくとも約８０％、少なくとも約９０％、または少なくとも約９５％同一であるアミノ酸配列を含み、式
【化６３】
2018516844.tif 000133
（式中、
各Ａ、Ｃ、およびＤは、独立に、アミノ酸であり、
各Ｂは、独立に、アミノ酸、
【化６４】
2018516844.tif 000134
、［−ＮＨ−Ｌ３−ＣＯ−］、［−ＮＨ−Ｌ３−ＳＯ２−］、または［−ＮＨ−Ｌ３−］であり、
各Ｅは、独立に、Ａｌａ（アラニン）、Ｄ−Ａｌａ（Ｄ−アラニン）、Ａｉｂ（α−アミノイソ酪酸）、Ｓａｒ（Ｎ−メチルグリシン）、およびＳｅｒ（セリン）からなる群から選択されるアミノ酸であり、
各Ｒ１およびＲ２は、独立に、−Ｈ、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロアルキルもしくはヘテロシクロアルキルであるか（非置換であるか、またはハロ−で置換されている）、または前記ＤもしくはＥアミノ酸の１つのアルファ位に結合している大環状分子を形成するリンカーＬ’を形成し、
各Ｒ３は、独立に、水素、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、ヘテロアルキル、シクロアルキル、ヘテロシクロアルキル、シクロアルキルアルキル、シクロアリール、またはヘテロシクロアリールであり（Ｒ５により任意選択で置換されている）、
各ＬおよびＬ’は、独立に、式−Ｌ１−Ｌ２−の大環状分子を形成するリンカーであり、
各Ｌ３は、独立に、アルキレン、アルケニレン、アルキニレン、ヘテロアルキレン、シクロアルキレン、ヘテロシクロアルキレン、シクロアリーレン、ヘテロシクロアリーレン、または［−Ｒ４−Ｋ−Ｒ４−］ｎであり、それぞれＲ５により任意選択で置換されており、
各Ｒ４は、独立に、アルキレン、アルケニレン、アルキニレン、ヘテロアルキレン、シクロアルキレン、ヘテロシクロアルキレン、アリーレン、またはヘテロアリーレンであり、
各Ｋは、独立に、Ｏ、Ｓ、ＳＯ、ＳＯ２、ＣＯ、ＣＯ２、またはＣＯＮＲ３であり、
各Ｒ５は、独立に、ハロゲン、アルキル、−ＯＲ６、−Ｎ（Ｒ６）２、−ＳＲ６、−ＳＯＲ６、−ＳＯ２Ｒ６、−ＣＯ２Ｒ６、蛍光部分、放射性同位体または治療剤であり、
各Ｒ６は、独立に、−Ｈ、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロシクロアルキル、蛍光部分、放射性同位体または治療剤であり、
各Ｒ７は、独立に、−Ｈ、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキル、ヘテロアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロシクロアルキル、シクロアリールもしくはヘテロシクロアリールであるか（Ｒ５により任意選択で置換されている）、またはＤ残基を有する環式構造の一部であり、
各Ｒ８は、独立に、−Ｈ、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキル、ヘテロアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロシクロアルキル、シクロアリールもしくはヘテロシクロアリールであるか（Ｒ５により任意選択で置換されている）、またはＥ残基を有する環式構造の一部であり、
各ｖは、独立に、整数であり、
各ｗは、独立に、３〜１０００の整数であり、
ｕは、１〜１０の整数であり、
各ｘ、ｙおよびｚは、独立に、０〜１０の整数であり、
各ｎは、独立に、１〜５の整数である）
を有する、前記請求項のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１５２】
前記ペプチド模倣大環状分子が、式
【化６５】
2018516844.tif 000135
（式中、
Ｘａａ３、Ｘａａ５、Ｘａａ６、Ｘａａ７、Ｘａａ８、Ｘａａ９、およびＸａａ１０のそれぞれは、個々にアミノ酸であり、Ｘａａ３、Ｘａａ５、Ｘａａ６、Ｘａａ７、Ｘａａ８、Ｘａａ９、およびＸａａ１０の少なくとも３つは、配列Ｐｈｅ３−Ｘ４−Ｈｉｓ５−Ｔｙｒ６−Ｔｒｐ７−Ａｌａ８−Ｇｌｎ９−Ｌｅｕ１０−Ｘ１１−Ｓｅｒ１２またはＰｈｅ３−Ｘ４−Ｇｌｕ５−Ｔｙｒ６−Ｔｒｐ７−Ａｌａ８−Ｇｌｎ９−Ｌｅｕ１０／Ｃｂａ１０−Ｘ１１−Ａｌａ１２の対応する位置のアミノ酸と同じアミノ酸であり、各Ｘ４およびＸ１１は、独立に、アミノ酸であり、
各Ｄは、独立に、アミノ酸であり、
各Ｅは、独立に、Ａｌａ（アラニン）、Ｄ−Ａｌａ（Ｄ−アラニン）、Ａｉｂ（α−アミノイソ酪酸）、Ｓａｒ（Ｎ−メチルグリシン）、およびＳｅｒ（セリン）からなる群から選択されるアミノ酸であり、
各Ｒ１およびＲ２は、独立に、−Ｈ、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロアルキルもしくはヘテロシクロアルキルであるか（非置換であるか、またはハロ−で置換されている）、または前記ＤもしくはＥアミノ酸の１つのアルファ位に結合している大環状分子を形成するリンカーＬ’を形成し、
各ＬまたはＬ’は、独立に、大環状分子を形成するリンカーであり、
各Ｒ５は、独立に、ハロゲン、アルキル、−ＯＲ６、−Ｎ（Ｒ６）２、−ＳＲ６、−ＳＯＲ６、−ＳＯ２Ｒ６、−ＣＯ２Ｒ６、蛍光部分、放射性同位体または治療剤であり、
各Ｒ６は、独立に、−Ｈ、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロシクロアルキル、蛍光部分、放射性同位体または治療剤であり、
各Ｒ７は、独立に、−Ｈ、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキル、ヘテロアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロシクロアルキル、シクロアリールもしくはヘテロシクロアリールであるか（Ｒ５により任意選択で置換されている）、またはＤ残基を有する環式構造の一部であり、
各Ｒ８は、独立に、−Ｈ、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキル、ヘテロアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロシクロアルキル、シクロアリールもしくはヘテロシクロアリールであるか（Ｒ５により任意選択で置換されている）、またはＥ残基を有する環式構造の一部であり、
ｖは、１〜１０００の整数であり、
ｗは、０〜１０００の整数である）
を有する、前記請求項のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１５３】
前記大環状分子を形成するリンカーの少なくとも１つが、式−Ｌ１−Ｌ２−
（式中、
Ｌ１およびＬ２は、独立に、アルキレン、アルケニレン、アルキニレン、ヘテロアルキレン、シクロアルキレン、ヘテロシクロアルキレン、シクロアリーレン、ヘテロシクロアリーレン、または［−Ｒ４−Ｋ−Ｒ４−］ｎであり、それぞれＲ５により任意選択で置換されており、
各Ｒ４は、独立に、アルキレン、アルケニレン、アルキニレン、ヘテロアルキレン、シクロアルキレン、ヘテロシクロアルキレン、アリーレン、またはヘテロアリーレンであり、
各Ｋは、独立に、Ｏ、Ｓ、ＳＯ、ＳＯ２、ＣＯ、ＣＯ２、またはＣＯＮＲ３であり、
各Ｒ３は、独立に、水素、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、ヘテロアルキル、シクロアルキル、ヘテロシクロアルキル、シクロアルキルアルキル、シクロアリール、またはヘテロシクロアリールであり（Ｒ５により任意選択で置換されている）、
ｎは、１〜５の整数である）
を有する、請求項１５１または１５２に記載の方法。
【請求項１５４】
ｗが、３〜１０００、例えば３〜５００、３〜２００、３〜１００、３〜５０、３〜３０、３〜２０、または３〜１０の整数である、請求項１５１に記載の方法。
【請求項１５５】
Ｘａａ５が、Ｇｌｕまたはそのアミノ酸類似体である、請求項１５１に記載の方法。
【請求項１５６】
各Ｅが、独立に、Ａｌａ（アラニン）、Ｓｅｒ（セリン）またはそれらの類似体である、請求項１５１から１５５のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１５７】
［Ｄ］ｖが、−Ｌｅｕ１−Ｔｈｒ２である、請求項１５１から１５６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１５８】
ｗが、３〜１０である、請求項１５１から１５７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１５９】
ｗが、３〜６である、請求項１５１から１５７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１６０】
ｗが、６〜１０である、請求項１５１から１５７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１６１】
ｗが、６である、請求項１５１から１５７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１６２】
ｖが、１〜１０である、請求項１５１から１６１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１６３】
ｖが、２〜１０である、請求項１５１から１６１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１６４】
ｖが、２〜５である、請求項１５１から１６１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１６５】
ｖが、２である、請求項１５１から１６１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１６６】
Ｌ１およびＬ２が、独立に、アルキレン、アルケニレン、アルキニレン、ヘテロアルキレン、シクロアルキレン、ヘテロシクロアルキレン、シクロアリーレン、またはヘテロシクロアリーレンであり、それぞれＲ５により任意選択で置換されている、請求項１５１または１５３に記載の方法。
【請求項１６７】
Ｌ１およびＬ２が、独立に、アルキレンまたはアルケニレンである、請求項１５１または１５３に記載の方法。
【請求項１６８】
Ｌが、アルキレン、アルケニレン、またはアルキニレンである、請求項１５１または１５２に記載の方法。
【請求項１６９】
Ｌが、アルキレンである、請求項１５１または１５２に記載の方法。
【請求項１７０】
Ｌが、Ｃ３〜Ｃ１６アルキレンである、請求項１５１または１５２に記載の方法。
【請求項１７１】
Ｌが、Ｃ１０〜Ｃ１４アルキレンである、請求項１５１または１５２に記載の方法。
【請求項１７２】
Ｒ１およびＲ２が、独立に、−Ｈ、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロアルキル、またはヘテロシクロアルキルである（非置換であるか、またはハロ−で置換されている）、請求項１５１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１７３】
Ｒ１およびＲ２が、Ｈである、請求項１５１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１７４】
Ｒ１およびＲ２が、独立に、アルキルである、請求項１５１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１７５】
Ｒ１およびＲ２が、メチルである、請求項１５１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１７６】
ｘ＋ｙ＋ｚ＝６である、請求項１５１に記載の方法。
【請求項１７７】
ｕが、１である、請求項１５１に記載の方法。
【請求項１７８】
前記ペプチド模倣大環状分子が、アミノ酸類似体である少なくとも１つのアミノ酸を含む、請求項１５１から１７７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１７９】
前記ペプチド模倣大環状分子が、式
【化６６】
2018516844.tif 000136
または薬学的に許容されるその塩を有する、請求項１５１に記載の方法。
【請求項１８０】
前記ペプチド模倣大環状分子が、式
【化６７】
2018516844.tif 000137
または薬学的に許容されるその塩を有する、請求項１５１に記載の方法。
【請求項１８１】
前記ペプチド模倣大環状分子が、式
【化６８】
2018516844.tif 000138
または薬学的に許容されるその塩を有する、請求項１５１に記載の方法。
【請求項１８２】
前記ペプチド模倣大環状分子が、式
【化６９】
2018516844.tif 000139
または薬学的に許容されるその塩を有する、請求項１５１に記載の方法。
【請求項１８３】
前記ペプチド模倣大環状分子が、式
【化７０】
2018516844.tif 000140
または薬学的に許容されるその塩を有する、請求項１５１に記載の方法。
【請求項１８４】
前記ペプチド模倣大環状分子が、式
【化７１】
2018516844.tif 000141
または薬学的に許容されるその塩を有する、請求項１５１に記載の方法。
【請求項１８５】
前記ペプチド模倣大環状分子が、式
【化７２】
2018516844.tif 000142
または薬学的に許容されるその塩を有する、請求項１５１に記載の方法。
【請求項１８６】
前記ペプチド模倣大環状分子が、式
【化７３】
2018516844.tif 000143
または薬学的に許容されるその塩を有する、請求項１５１に記載の方法。
【請求項１８７】
前記ペプチド模倣大環状分子が、式
【化７４】
2018516844.tif 000144
または薬学的に許容されるその塩を有する、請求項１５１に記載の方法。
【請求項１８８】
前記ペプチド模倣大環状分子が、式
【化７５】
2018516844.tif 000145
または薬学的に許容されるその塩を有する、請求項１５１に記載の方法。
【請求項１８９】
前記ペプチド模倣大環状分子が、式
【化７６】
2018516844.tif 000146
または薬学的に許容されるその塩を有する、請求項１５１に記載の方法。
【請求項１９０】
前記ペプチド模倣大環状分子が、式
【化７７】
2018516844.tif 000147
または薬学的に許容されるその塩を有する、請求項１５１に記載の方法。
【請求項１９１】
前記ペプチド模倣大環状分子が、式
【化７８】
2018516844.tif 000148
または薬学的に許容されるその塩を有する、請求項１５１に記載の方法。
【請求項１９２】
前記ペプチド模倣大環状分子が、式
【化７９】
2018516844.tif 000149
または薬学的に許容されるその塩を有する、請求項１５１に記載の方法。
【請求項１９３】
前記ペプチド模倣大環状分子が、式
【化８０】
2018516844.tif 000150
または薬学的に許容されるその塩を有する、請求項１５１に記載の方法。
【請求項１９４】
前記ペプチド模倣大環状分子が、式
【化８１】
2018516844.tif 000151
または薬学的に許容されるその塩を有する、請求項１５１に記載の方法。
【請求項１９５】
前記ペプチド模倣大環状分子が、式
【化８２】
2018516844.tif 000152
または薬学的に許容されるその塩を有する、請求項１５１に記載の方法。
【請求項１９６】
前記ペプチド模倣大環状分子が、式
【化８３】
2018516844.tif 000153
または薬学的に許容されるその塩を有する、請求項１５１に記載の方法。
【請求項１９７】
前記ペプチド模倣大環状分子が、式
【化８４】
2018516844.tif 000154
または薬学的に許容されるその塩を有する、請求項１５１に記載の方法。
【請求項１９８】
前記ペプチド模倣大環状分子が、式
【化８５】
2018516844.tif 000155
または薬学的に許容されるその塩を有する、請求項１５１に記載の方法。
【請求項１９９】
前記ペプチド模倣大環状分子が、式
【化８６】
2018516844.tif 000156
または薬学的に許容されるその塩を有する、請求項１５１に記載の方法。
【請求項２００】
前記ペプチド模倣大環状分子が、式
【化８７】
2018516844.tif 000157
または薬学的に許容されるその塩を有する、請求項１５１に記載の方法。
【請求項２０１】
前記ペプチド模倣大環状分子が、式
【化８８】
2018516844.tif 000158
または薬学的に許容されるその塩を有する、請求項１５１に記載の方法。
【請求項２０２】
前記ペプチド模倣大環状分子が、式
【化８９】
2018516844.tif 000159
または薬学的に許容されるその塩を有する、請求項１５１に記載の方法。
【請求項２０３】
前記ペプチド模倣大環状分子が、式
【化９０】
2018516844.tif 000160
または薬学的に許容されるその塩を有する、請求項１５１に記載の方法。
【請求項２０４】
前記ペプチド模倣大環状分子が、式
【化９１】
2018516844.tif 000161
または薬学的に許容されるその塩を有する、請求項１５１に記載の方法。
【請求項２０５】
前記ペプチド模倣大環状分子が、式
【化９２】
2018516844.tif 000162
または薬学的に許容されるその塩を有する、請求項１５１に記載の方法。
【請求項２０６】
前記ペプチド模倣大環状分子が、式
【化９３】
2018516844.tif 000163
または薬学的に許容されるその塩を有する、請求項１５１に記載の方法。
【請求項２０７】
前記ペプチド模倣大環状分子が、式
【化９４】
2018516844.tif 000164
または薬学的に許容されるその塩を有する、請求項１５１に記載の方法。
【請求項２０８】
前記ペプチド模倣大環状分子が、式
【化９５】
2018516844.tif 000165
または薬学的に許容されるその塩を有する、請求項１５１に記載の方法。
【請求項２０９】
ｐ５３非活性化変異が欠如しているヒト被験体において、１つまたは複数の液性がんバイオマーカーを同定する方法であって、該ヒト被験体に、治療有効量のペプチド模倣大環状分子を投与するステップを含む、方法。
【請求項２１０】
前記バイオマーカーが、ｐ５３ステータス、ＭＤＭ２発現レベルまたはＭＤＭＸ発現レベルである、請求項２０９に記載の方法。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
相互参照
本願は、２０１５年３月２０日に出願された米国仮特許出願第６２／１３６，３５７号、および２０１５年９月２４日に出願された米国仮特許出願第６２／２３２，２７５号の利益を主張し、これらそれぞれの全体が、本明細書中に参照によって組み込まれる。
【背景技術】
【０００２】
ヒト転写因子タンパク質ｐ５３は、ＤＮＡ損傷および細胞ストレスに応答して、細胞周期の停止およびアポトーシスを誘導し、それによって悪性形質転換から細胞を保護するのに非常に重要な役割を果たしている。Ｅ３ユビキチンリガーゼＭＤＭ２（ＨＤＭ２またはヒト二重微小染色体２としても公知）は、ｐ５３トランス活性化活性を中和する直接結合の相互作用を介してｐ５３機能を負に制御し、核からｐ５３タンパク質を輸出し、ユビキチン化−プロテアソーム経路を介してｐ５３を分解の標的とする。欠失、変異、またはＭＤＭ２過剰発現のいずれかによるｐ５３活性の喪失は、ヒトのがんにおいて最も一般的な欠損である。野生型ｐ５３を発現する腫瘍は、活性ｐ５３の濃度を安定化または増大する薬理学的薬剤に対して脆弱である。この文脈において、ＭＤＭ２活性の阻害は、ｐ５３活性を修復し、ｉｎ  ｖｉｔｒｏおよびｉｎ  ｖｉｖｏでがん細胞をアポトーシスに再感受性にするのに妥当な手法として浮上した。最近になって、ＭＤＭＸ（ＭＤＭ４、ＨＤＭ４またはヒト二重微小染色体４としても公知）は、ｐ５３の類似の負の制御因子として同定されており、その研究では、ＭＤＭ２およびＭＤＭＸのｐ５３結合界面間の有意な構造的相同性が明らかになっている。またＭＤＭＸは、ヒトの腫瘍において過剰発現することが観察されている。ｐ５３−ＭＤＭ２およびｐ５３−ＭＤＭＸのタンパク質−タンパク質相互作用は、ｐ５３の同じ１５残基のアルファヘリカルトランス活性化ドメインによって媒介され、そのドメインは、ＭＤＭ２およびＭＤＭＸの表面上の疎水性間隙に挿入される。ＷＴ  ｐ５３のこのドメインにおける３つの残基（Ｆ１９、Ｗ２３、およびＬ２６）は、ＭＤＭ２およびＭＤＭＸとの結合に必須である。
【発明の概要】
【課題を解決するための手段】
【０００３】
本明細書では、ｐ５３、ＭＤＭ２および／またはＭＤＭＸに結合し、その活性をモジュレートすることができる化合物が提供される。また本明細書では、ｐ５３の活性をモジュレートするｐ５３ベースのペプチド模倣大環状分子を含む医薬製剤が提供される。また本明細書では、ｐ５３タンパク質、ＭＤＭ２タンパク質および／またはＭＤＭＸタンパク質の間の相互作用を阻害するｐ５３ベースのペプチド模倣大環状分子を含む医薬製剤が提供される。さらに本明細書では、それらに限定されるものではないが、液性がんおよび他の過剰増殖性疾患を含む疾患を処置する方法が提供される。
【０００４】
本明細書では、ｐ５３非活性化変異が欠如していると決定された液性腫瘍を処置することを必要とするヒト被験体において該液性腫瘍を処置する方法であって、該ヒト被験体に、治療有効量のペプチド模倣大環状分子または薬学的に許容されるその塩を含む医薬組成物を投与するステップを含み、該ペプチド模倣大環状分子が、ＭＤＭ２タンパク質および／またはＭＤＭＸタンパク質に結合する方法が記載される。
【０００５】
さらに本明細書では、ｐ５３非活性化変異が欠如している液性腫瘍を処置することを必要とするヒト被験体において該液性腫瘍を処置する方法であって、該ヒト被験体に、治療有効量のペプチド模倣大環状分子または薬学的に許容されるその塩を含む医薬組成物を投与するステップを含み、該ペプチド模倣大環状分子が、ＭＤＭ２タンパク質および／またはＭＤＭＸタンパク質に結合する方法が開示される。
【０００６】
さらに本明細書では、ｐ５３遺伝子にｐ５３非活性化変異を有している液性腫瘍を処置することを必要とするヒト被験体において該液性腫瘍を処置する方法であって、該ヒト被験体に、治療有効量のペプチド模倣大環状分子または薬学的に許容されるその塩を含む医薬組成物を投与するステップを含み、該ペプチド模倣大環状分子が、ＭＤＭ２タンパク質および／またはＭＤＭＸタンパク質に結合する方法が開示される。
【０００７】
さらに本明細書では、液性腫瘍を処置することを必要とするヒト被験体において液性腫瘍を処置する方法であって、該ヒト被験体に、治療有効量のペプチド模倣大環状分子または薬学的に許容されるその塩を含む医薬組成物を投与するステップを含み、該ペプチド模倣大環状分子が、ＭＤＭ２タンパク質および／またはＭＤＭＸタンパク質に結合し、該液性腫瘍が、ｐ５３タンパク質の発現に対して陰性ではない（例えば、野生型ｐ５３タンパク質または部分的機能性を有する変異型ｐ５３タンパク質を発現する液性腫瘍）方法が開示される。
【０００８】
さらに本明細書では、液性腫瘍を処置することを必要とするヒト被験体において液性腫瘍を処置する方法であって、該ヒト被験体に、治療有効量のペプチド模倣大環状分子または薬学的に許容されるその塩を含む医薬組成物を投与するステップを含み、該ペプチド模倣大環状分子が、ＭＤＭ２タンパク質および／またはＭＤＭＸタンパク質に結合し、該液性腫瘍が、機能獲得型変異を有するｐ５３タンパク質（例えば、超アポトーシス性ｐ５３）を発現する方法が開示される。
【０００９】
さらに本明細書では、液性腫瘍を処置することを必要とするヒト被験体において液性腫瘍を処置する方法であって、該ヒト被験体に、治療有効量のペプチド模倣大環状分子または治療上等価な量の薬学的に許容されるその塩を含む医薬組成物を投与するステップを含み、該ペプチド模倣大環状分子が、ＭＤＭ２タンパク質および／またはＭＤＭＸタンパク質に結合し、該液性腫瘍が、部分的な機能喪失を引き起こす変異を有するｐ５３タンパク質を発現する方法が開示される。
【００１０】
さらに本明細書では、液性腫瘍を処置することを必要とするヒト被験体において液性腫瘍を処置する方法であって、該ヒト被験体に、治療有効量のペプチド模倣大環状分子または薬学的に許容されるその塩を含む医薬組成物を投与するステップを含み、該ペプチド模倣大環状分子が、ＭＤＭ２タンパク質および／またはＭＤＭＸタンパク質に結合し、該液性腫瘍中の細胞が、ｐ５３遺伝子の単一ゲノムコピーだけからｐ５３を発現する（例えば、該細胞がコピー喪失変異を有し、例えばハプロ不全である場合）方法が開示される。
【００１１】
さらに本明細書では、液性腫瘍を処置することを必要とするヒト被験体において液性腫瘍を処置する方法であって、該ヒト被験体に、治療有効量のペプチド模倣大環状分子または薬学的に許容されるその塩を含む医薬組成物を投与するステップを含み、該ペプチド模倣大環状分子が、ＭＤＭ２タンパク質および／またはＭＤＭＸタンパク質に結合し、該液性腫瘍が、１つまたは複数のサイレント変異を有するｐ５３タンパク質を発現する方法が開示される。
【００１２】
さらに本明細書では、液性腫瘍を処置することを必要とするヒト被験体において液性腫瘍を処置する方法であって、該ヒト被験体に、治療有効量のペプチド模倣大環状分子または治療上等価な量の薬学的に許容されるその塩を含む医薬組成物を投与するステップを含み、該ペプチド模倣大環状分子が、ＭＤＭ２タンパク質および／またはＭＤＭＸタンパク質に結合し、該液性腫瘍中の細胞が、ｐ５３発現に対して陰性である方法が開示される。
【００１３】
一部の実施形態では、液性腫瘍中の細胞は、ｐ５３遺伝子の１つのコピーにおいてｐ５３非活性化変異を有する。別の実施形態では、液性腫瘍中の細胞は、ｐ５３遺伝子の第２のコピーにおいて第２のｐ５３非活性化変異を有する。別の実施形態では、ｐ５３遺伝子の１つのコピーにおけるｐ５３非活性化変異は、ｐ５３遺伝子の第２のコピーにおける第２のｐ５３非活性化変異と同じである。別の実施形態では、ｐ５３遺伝子の１つのコピーにおけるｐ５３非活性化変異は、ｐ５３遺伝子の第２のコピーにおける第２のｐ５３非活性化変異とは異なる。別の実施形態では、ｐ５３遺伝子におけるｐ５３非活性化変異は、ｐ５３遺伝子からのｐ５３タンパク質の発現の欠如をもたらすか、または部分的な機能喪失を有する部分的なｐ５３タンパク質（partial  a  p53  protein）の発現をもたらす。別の実施形態では、ｐ５３遺伝子の第２のコピーにおける第２のｐ５３非活性化変異は、ｐ５３遺伝子からのｐ５３タンパク質の発現の欠如をもたらすか、または部分的な機能喪失を有する部分的なｐ５３タンパク質の発現をもたらす。
【００１４】
一部の実施形態では、液性腫瘍の細胞は、ｐ５３遺伝子のコピー（a  copy  of  a  p53  gene）において少なくとも１つの変異を有し、その変異は、該ｐ５３遺伝子のそのコピーから発現したｐ５３タンパク質の活性を、非変異型ｐ５３遺伝子のコピーから発現した野生型ｐ５３と比較して、排除または低減する。別の実施形態では、ｐ５３遺伝子のコピーにおける少なくとも１つの変異は、非同義変異である。別の実施形態では、ｐ５３遺伝子のコピーにおける少なくとも１つの変異は、同義変異である。別の実施形態では、ｐ５３遺伝子のコピーにおける少なくとも１つの変異は、同義変異であり、その同義変異は、該ｐ５３遺伝子のそのコピーから発現したｐ５３タンパク質のアミノ酸配列を変化させない。別の実施形態では、ｐ５３遺伝子のコピーにおける少なくとも１つの変異は、同義変異であり、その同義変異は、ｍＲＮＡとのマイクロＲＮＡの結合を増大または低減する。別の実施形態では、ｐ５３遺伝子のコピーにおける少なくとも１つの変異は、同義変異であり、その同義変異は、ｍＲＮＡの半減期を変える（例えば増大または低減する）。
【００１５】
さらに本明細書では、液性腫瘍を処置することを必要とするヒト被験体において液性腫瘍を処置する方法であって、該ヒト被験体に、治療有効量のペプチド模倣大環状分子または治療上等価な量の薬学的に許容されるその塩を含む医薬組成物を投与するステップを含み、該ペプチド模倣大環状分子が、ＭＤＭ２タンパク質および／またはＭＤＭＸタンパク質に結合する方法が開示される。
【００１６】
一部の実施形態では、ペプチド模倣大環状分子は、ｐ５３とＭＤＭ２およびＭＤＭＸとの間の相互作用を妨害する。
【００１７】
一部の実施形態では、該方法は、医薬組成物を投与する前の液性腫瘍におけるｐ５３非活性化変異の欠如を決定するステップを含む。別の実施形態では、ｐ５３非活性化変異の欠如を決定するステップは、液性腫瘍における野生型ｐ５３の存在を確認するステップを含む。別の実施形態では、該方法は、液性腫瘍におけるｐ５３機能獲得型変異の存在を決定するステップを含む。別の実施形態では、該方法は、液性腫瘍におけるｐ５３の非活性化変異の存在を決定するステップを含む。別の実施形態では、該方法は、液性腫瘍におけるｐ５３のコピー喪失変異の存在を決定するステップを含む。別の実施形態では、該方法は、液性腫瘍におけるＰ５３の部分的な機能喪失変異の存在を決定するステップを含む。別の実施形態では、該方法は、医薬組成物を投与する前の液性腫瘍におけるｐ５３非活性化変異の欠如を確認するステップを含む。別の実施形態では、ｐ５３非活性化変異の欠如を確認するステップは、液性腫瘍における野生型ｐ５３の存在を確認するステップを含む。別の実施形態では、該方法は、液性腫瘍におけるｐ５３機能獲得型変異の存在を確認するステップを含む。別の実施形態では、該方法は、液性腫瘍におけるｐ５３の非活性化変異の存在を確認するステップを含む。別の実施形態では、該方法は、液性腫瘍におけるｐ５３のコピー喪失変異の存在を確認するステップを含む。別の実施形態では、該方法は、液性腫瘍におけるＰ５３の部分的な機能喪失変異の存在を確認するステップを含む。
【００１８】
一部の実施形態では、決定するステップまたは確認するステップは、医薬組成物の投与前、１〜１５カ月以内に実施される。別の実施形態では、決定するステップまたは確認するステップは、医薬組成物の投与前、１〜１２カ月以内に実施される。別の実施形態では、決定するステップまたは確認するステップは、医薬組成物の投与前、１〜３カ月以内に実施される。別の実施形態では、決定するステップまたは確認するステップは、医薬組成物の投与前、１カ月以内に実施される。別の実施形態では、決定するステップまたは確認するステップは、医薬組成物の投与前、２１日以内に実施される。別の実施形態では、決定するステップまたは確認するステップは、医薬組成物の投与の最大約１年前に実施される。別の実施形態では、決定するステップまたは確認するステップは、医薬組成物の投与の最大約２年前に実施される。別の実施形態では、決定するステップまたは確認するステップは、医薬組成物の投与の最大約３年前に実施される。
【００１９】
一部の実施形態では、処置は、ヒト被験体において、ｐ５３経路を再活性化し、液性がん細胞の増殖を低減し、ｐ５３タンパク質を増大し、ｐ２１を増大し、かつ／またはアポトーシスを増大する。
【００２０】
一部の実施形態では、医薬組成物は、週２回または３回投与される。別の実施形態では、医薬組成物は、週２回投与される。別の実施形態では、医薬組成物は、２週間または３週間ごとに１回投与される。別の実施形態では、医薬組成物は、１週間または２週間ごとに１回投与される。別の実施形態では、医薬組成物は、２１日サイクルの１日目、４日目、８日目、および１１日目に投与される。別の実施形態では、医薬組成物は、２８日サイクルの１日目、８日目、および１５日目に投与される。
【００２１】
一部の実施形態では、投与される化合物の量は、ヒト被験体の体重１キログラム当たり約０．５〜３０ｍｇである。別の実施形態では、投与される化合物の量は、ヒト被験体の体重１キログラム当たり約０．５〜２０ｍｇである。別の実施形態では、投与される化合物の量は、ヒト被験体の体重１キログラム当たり約０．５〜１０ｍｇである。別の実施形態では、投与される化合物の量は、ヒト被験体の体重１キログラム当たり約０．０４ｍｇ、約０．０８ｍｇ、約０．１６ｍｇ、約０．３２ｍｇ、約０．６４ｍｇ、約１．２５ｍｇ、約１．２８ｍｇ、約１．９２ｍｇ、約２．５ｍｇ、約３．５６ｍｇ、約３．７５ｍｇ、約５．０ｍｇ、約７．１２ｍｇ、約７．５ｍｇ、約１０ｍｇ、約１４．２４ｍｇ、約１５ｍｇ、約２０ｍｇ、または約３０ｍｇである。別の実施形態では、投与される化合物の量は、ヒト被験体の体重１キログラム当たり約１．９２ｍｇ、約３．７５ｍｇ、約７．５ｍｇ、約１５．０ｍｇ、または約３０．０ｍｇであり、該化合物は、週２回投与される。別の実施形態では、投与される化合物の量は、ヒト被験体の体重１キログラム当たり約１．２８ｍｇ、約２．５６ｍｇ、約５．０ｍｇ、約１０ｍｇ、または約２０ｍｇであり、該化合物は、週２回投与される。別の実施形態では、投与される化合物の量は、ヒト被験体の体重１キログラム当たり約１．９２ｍｇ、約３．７５ｍｇ、約７．５ｍｇ、約１５．０ｍｇ、または約３０．０ｍｇであり、該化合物は、週１回投与される。別の実施形態では、投与される化合物の量は、ヒト被験体の体重１キログラム当たり約１．２８ｍｇ、約２．５６ｍｇ、約５．０ｍｇ、約１０ｍｇ、または約２０ｍｇであり、該化合物は、週１回投与される。別の実施形態では、投与される化合物の量は、ヒト被験体の体重１キログラム当たり約約１．９２ｍｇ、約３．７５ｍｇ、約７．５ｍｇ、約１５．０ｍｇ、または約３０．０ｍｇｍｇであり、該化合物は、１日１回、７日間で３回、５回または７回投与される。別の実施形態では、化合物は、１日１回、７日間で７回、静脈内投与される。別の実施形態では、投与される化合物の量は、ヒト被験体の体重１キログラム当たり約１．２８ｍｇ、約２．５６ｍｇ、約５．０ｍｇ、約１０ｍｇ、または約２０ｍｇであり、該化合物は、１日１回、７日間で３回、５回または７回投与される。別の実施形態では、化合物は、１日１回、７日間で７回、静脈内投与される。
【００２２】
一部の実施形態では、化合物は、０．２５時間、０．５時間、１時間、２時間、３時間、４時間、５時間、６時間、７時間、８時間、９時間、１０時間、１１時間、または１２時間かけて投与される。別の実施形態では、化合物は、０．２５〜２時間かけて投与される。別の実施形態では、化合物は、１時間かけて徐々に投与される。別の実施形態では、化合物は、２時間かけて徐々に投与される。
【００２３】
一部の実施形態では、処置は、処置開始後１カ月以内に、液性がん細胞の数を約９５％、約９０％、約８５％、約８０％、約７５％、約７０％、約６５％、約６０％、約５５％、約５０％、約４５％、約４０％、約３５％、約３０％、約２５％、約２０％、約１５％、約１０％、または約５％低減する。別の実施形態では、処置は、処置開始後１カ月以内に、液性がん細胞の数を少なくとも約６０％、少なくとも約６５％、少なくとも約７０％、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、または少なくとも約９５％低減する。別の実施形態では、処置は、処置開始後１年以内に、液性がん細胞の数を約９５％、約９０％、約８５％、約８０％、約７５％、約７０％、約６５％、約６０％、約５５％、約５０％、約４５％、約４０％、約３５％、約３０％、約２５％、約２０％、約１５％、約１０％、または約５％低減する。別の実施形態では、処置は、処置開始後１年以内に、液性がん細胞の数を少なくとも約６０％、少なくとも約６５％、少なくとも約７０％、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、または少なくとも約９５％低減する。別の実施形態では、処置は、処置開始後６カ月以内に、液性がん細胞の数を約９５％、約９０％、約８５％、約８０％、約７５％、約７０％、約６５％、約６０％、約５５％、約５０％、約４５％、約４０％、約３５％、約３０％、約２５％、約２０％、約１５％、約１０％、または約５％低減する。別の実施形態では、処置は、処置開始後６カ月以内に、液性がん細胞の数を少なくとも約６０％、少なくとも約６５％、少なくとも約７０％、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、または少なくとも約９５％低減する。別の実施形態では、処置は、処置開始後３カ月以内に、液性がん細胞の数を約９５％、約９０％、約８５％、約８０％、約７５％、約７０％、約６５％、約６０％、約５５％、約５０％、約４５％、約４０％、約３５％、約３０％、約２５％、約２０％、約１５％、約１０％、または約５％低減する。別の実施形態では、処置は、処置開始後３カ月以内に、液性がん細胞の数を少なくとも約６０％、少なくとも約６５％、少なくとも約７０％、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、または少なくとも約９５％低減する。
【００２４】
一部の実施形態では、液性がんは、安定疾患である。
【００２５】
一部の実施形態では、処置は、ヒト被験体が化合物で処置されなかった場合のヒト被験体の予測生存期間と比較して、ヒト被験体の生存期間を延長する。別の実施形態では、ヒト被験体の生存期間の延長は、少なくとも３０日である。別の実施形態では、ヒト被験体の生存期間の延長は、少なくとも３カ月である。別の実施形態では、ヒト被験体の生存期間の延長は、少なくとも６カ月である。別の実施形態では、ヒト被験体の生存期間の延長は、少なくとも１年である。
【００２６】
一部の実施形態では、化合物のｉｎ  ｖｉｖｏ循環半減期は、約１時間、２時間、３時間、４時間、５時間、６時間、７時間、８時間、９時間、１０時間または１２時間である。別の実施形態では、化合物のｉｎ  ｖｉｖｏ循環半減期は、約４時間である。別の実施形態では、化合物のｉｎ  ｖｉｖｏ循環半減期は、約６時間である。
【００２７】
一部の実施形態では、化合物の生体組織半減期は、約１時間、２時間、３時間、４時間、５時間、６時間、７時間、８時間、９時間、１０時間または１２時間である。別の実施形態では、化合物の生体組織半減期は、約１０時間である。
【００２８】
一部の実施形態では、ヒト被験体は、液性がんの１つまたは複数の他の処置に対して難治性および／または不耐性である。別の実施形態では、ヒト被験体は、液性がんの少なくとも１つの過去の処置および／または治療が不成功に終わっている。
【００２９】
一部の実施形態では、液性がんは、野生型ｐ５３タンパク質を発現する。
【００３０】
一部の実施形態では、液性がんは、液性リンパ腫、白血病、および骨髄腫からなる群から選択される。別の実施形態では、液性がんは、液性リンパ腫である。別の実施形態では、液性がんは、白血病である。別の実施形態では、液性がんは、急性白血病である。別の実施形態では、急性白血病は、急性骨髄性白血病（ＡＭＬ）である。別の実施形態では、急性白血病は、急性リンパ性白血病（ＡＬＬ）である。別の実施形態では、液性がんは、骨髄腫である。別の実施形態では、液性がんは、ＨＰＶ陽性がんではない。別の実施形態では、液性がんは、ＨＰＶ陽性子宮頸がん、ＨＰＶ陽性肛門がんまたはＨＰＶ陽性頭頸部がん、例えば口腔咽頭がんではない。
【００３１】
一部の実施形態では、化合物は、静脈内投与される。
【００３２】
一部の実施形態では、該方法は、化合物に加えて、治療有効量の少なくとも１つの追加の治療剤および／または治療手技をヒト被験体に施すステップをさらに含む。
【００３３】
一部の実施形態では、ヒト被験体は、処置に対して完全奏効を示す。別の実施形態では、ヒト被験体は、処置に対して部分奏効を示す。
【００３４】
一部の実施形態では、液性がんは、進行性疾患である。別の実施形態では、液性がんは、安定疾患である。
【００３５】
一部の実施形態では、該方法は、投与された化合物の臨床活性を決定するステップをさらに含む。別の実施形態では、臨床活性は、コンピューター断層撮影法（ＣＴ）、磁気共鳴画像法（ＭＲＩ）、骨スキャン、および陽電子放出断層撮影（ＰＥＴ）スキャンからなる群から選択される画像化法によって決定される。別の実施形態では、ＰＥＴスキャンは、１つまたは複数のトレーサーを使用する。別の実施形態では、１つまたは複数のトレーサーは、１８Ｆ−フルオロデオキシグルコース（ＦＤＧ）、６４Ｃｕジアセチル−ビス（Ｎ４−メチルチオセミカルバゾン）（ＡＴＳＭ）、１８Ｆ−フッ化物、３’−デオキシ−３’−［１８Ｆ］フルオロチミジン（ＦＬＴ）、１８Ｆ−フルオロミソニダゾール（ＦＭＩＳＯ）、ガリウム、テクネチウム−９９ｍ、またはタリウムを含む。
【００３６】
別の実施形態では、該方法は、１つまたは複数の特定の時点においてヒト被験体から生体試料を得、分析手順を用いてその生体試料を分析するステップをさらに含む。別の実施形態では、分析手順は、血液化学分析、染色体転座分析、針生検、組織生検、蛍光インサイツハイブリダイゼーション、臨床検査バイオマーカー分析（laboratory  biomarker  analysis）、免疫組織化学的染色法、フローサイトメトリー、またはそれらの組合せを含む群から選択される。別の実施形態では、該方法は、分析手順の結果を作表および／または作図するステップを含む。別の実施形態では、１つまたは複数の特定の時点は、化合物をヒト被験体に投与する前の時点を含む。別の実施形態では、１つまたは複数の特定の時点は、化合物をヒト被験体に投与した後の時点を含む。別の実施形態では、１つまたは複数の特定の時点は、化合物をヒト被験体に投与する前の時点および投与した後の時点を含む。別の実施形態では、該方法は、化合物をヒト被験体に投与する前および投与した後に収集された生体試料を比較するステップをさらに含む。別の実施形態では、１つまたは複数の特定の時点は、化合物をヒト被験体に投与する前および投与した後の複数の時点を含む。別の実施形態では、該方法は、複数の時点で収集された生体試料を比較するステップをさらに含む。別の実施形態では、生体試料は、バイオマーカー評価のために使用される。別の実施形態では、生体試料は、薬物動態評価のために使用される。別の実施形態では、薬物動態評価は、特定の時点における生体試料中のペプチド模倣大環状分子および／またはその代謝産物のレベルを研究することを含む。別の実施形態では、生体試料は、血液試料または骨髄試料である。別の実施形態では、生体試料は、薬力学的評価のために使用される。別の実施形態では、薬力学的評価は、特定の時点における生体試料中のｐ５３、ＭＤＭ２、ＭＤＭＸ、ｐ２１および／またはカスパーゼのレベルを研究することを含む。別の実施形態では、生体試料は、液性がん細胞被検物である。別の実施形態では、生体試料は、免疫原性アッセイのために使用される。
【００３７】
一部の実施形態では、該方法は、化合物をヒト被験体に投与する前の、ヒト被験体における少なくとも１つの循環腫瘍細胞（ＣＴＣ）または単核血球（ＭＮＢＣ）を選択および／または同定するステップをさらに含む。別の実施形態では、該方法は、１つまたは複数の特定の時点における循環腫瘍細胞（ＣＴＣ）または単核血球（ＭＮＢＣ）の数を測定するステップをさらに含み、循環腫瘍細胞（ＣＴＣ）または単核血球（ＭＮＢＣ）の数は、特定の時点における少なくとも１つの循環腫瘍細胞（ＣＴＣ）または単核血球（ＭＮＢＣ）の総数である。別の実施形態では、該方法は、ベースライン直径和（baseline  sum  diameter）を測定するステップをさらに含み、ベースライン直径和は、化合物をヒト被験体に投与する前の、少なくとも１つの循環腫瘍細胞（ＣＴＣ）または単核血球（ＭＮＢＣ）の直径の和である。別の実施形態では、処置は、少なくとも１つの（the  least  one）循環腫瘍細胞（ＣＴＣ）または単核血球（ＭＮＢＣ）を消失させる。別の実施形態では、処置（the  treatment）、ＣＴＣおよび／またはＭＮＢＣの数が低減する。別の実施形態では、１つまたは複数の特定の時点は、処置後の時点を含む。別の実施形態では、処置後の時点におけるＣＴＣおよび／またはＭＮＢＣの数は、ＣＴＣおよび／またはＭＮＢＣのベースライン数より少なくとも３０％少ない。別の実施形態では、処置は、ＣＴＣおよび／またはＭＮＢＣのベースライン数を参照として、１つまたは複数の特定の時点におけるＣＴＣおよび／またはＭＮＢＣの数を十分に増大せず、かつ十分に低減しない。
【００３８】
一部の実施形態では、ペプチド模倣大環状分子は、チトクロムＰ４５０アイソフォームの阻害剤ではない。
【００３９】
一部の実施形態では、処置は、用量制限血小板減少症を本質的にもたらさない。別の実施形態では、処置は、正常な造血器官および／または組織において、有害効果を本質的に引き起こさない。別の実施形態では、処置は、ヒト被験体において、おそらく、ほぼ確実に、または確実に化合物の投与に関係する有害事象を本質的にもたらさない。別の実施形態では、処置は、ヒト被験体において、ほぼ確実に（probably）、ほぼ確実に、または確実に化合物の投与に関係する重篤な有害事象を本質的にもたらさない。
【００４０】
一部の実施形態では、液性がんにおけるｐ５３非活性化変異の欠如は、ｐ５３タンパク質をコードする核酸のＤＮＡ配列決定によって決定される。別の実施形態では、液性がんにおけるｐ５３非活性化変異の欠如は、ＲＮＡアレイベースの試験によって決定される。別の実施形態では、液性がんにおけるｐ５３非活性化変異の欠如は、ＲＮＡ分析によって決定される。別の実施形態では、液性がんにおけるｐ５３非活性化変異の欠如は、ポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）によって決定される。別の実施形態では、ｐ５３非活性化変異は、タンパク質のＤＮＡ結合ドメインにおける変異を含む。別の実施形態では、ｐ５３非活性化変異は、ミスセンス変異を含む。別の実施形態では、ｐ５３非活性化変異は、優性非活性化変異である。別の実施形態では、ｐ５３非活性化変異は、Ｖ１７３Ｌ、Ｒ１７５Ｈ、Ｇ２４５Ｃ、Ｒ２４８Ｗ、Ｒ２４９ＳおよびＲ２７３Ｈからなる群から選択される１つまたは複数の変異を含む。別の実施形態では、ｐ５３非活性化変異は、表１に示される変異の１つまたは複数を含む。
【００４１】
また本明細書では、ｐ５３非活性化変異が欠如していると決定されたヒト被験体における液性がんを処置する方法であって、該ヒト被験体に、該ヒト被験体の体重１キログラム当たり０．５〜２０ｍｇのペプチド模倣大環状分子または薬学的に許容されるその塩を、２８日サイクルの１日目、８日目および１５日目に投与するステップを含む方法が開示される。
【００４２】
一部の実施形態では、ヒト被験体の体重１キログラム当たりのペプチド模倣大環状分子または薬学的に許容されるその塩は、ヒト被験体に投与される。
【００４３】
一部の実施形態では、８日目および／または１５日目に投与される（entered）ペプチド模倣大環状分子の量は、１日目に投与されるペプチド模倣大環状分子の量を超える。別の実施形態では、８日目および／または１５日目に投与されるペプチド模倣大環状分子の量は、１日目に投与されるペプチド模倣大環状分子の量に等しい。別の実施形態では、１日目および／または８日目に投与されるペプチド模倣大環状分子の量は、１５日目に投与されるペプチド模倣大環状分子の量を超える。別の実施形態では、１日目、８日目および１５日目に、等量のペプチド模倣大環状分子が投与される。
【００４４】
一部の実施形態では、２８日サイクルは、２回または３回反復される。
【００４５】
また本明細書では、ｐ５３非活性化変異が欠如していると決定されたヒト被験体における液性がんを処置する方法であって、該ヒト被験体に、該ヒト被験体の体重１キログラム当たり０．２５〜１０ｍｇのペプチド模倣大環状分子または薬学的に許容されるその塩を、２１日サイクルの１日目、４日目、８日目および１１日目に投与するステップを含む方法が開示される。
【００４６】
一部の実施形態では、ヒト被験体の体重１キログラム当たり０．２５〜５ｍｇのペプチド模倣大環状分子または薬学的に許容されるその塩は、ヒト被験体に投与される。
【００４７】
一部の実施形態では、４日目、８日目および／または１１日目に投与されるペプチド模倣大環状分子の量は、１日目に投与されるペプチド模倣大環状分子の量を超える。別の実施形態では、４日目、８日目および／または１１日目に投与されるペプチド模倣大環状分子の量は、１日目に投与されるペプチド模倣大環状分子の量に等しい。別の実施形態では、１日目、４日目および／または８日目に投与されるペプチド模倣大環状分子の量は、１１日目に投与されるペプチド模倣大環状分子の量を超える。別の実施形態では、１日目、４日目、８日目および１５１日目に、等量のペプチド模倣大環状分子が投与される。
【００４８】
一部の実施形態では、２１日サイクルは、２回または３回反復される。
【００４９】
一部の実施形態では、ペプチド模倣大環状分子は、表３、表３ａ、表３ｂ、および表３ｃのいずれかのアミノ酸配列と少なくとも約６０％、少なくとも約７０％、少なくとも約８０％、少なくとも約９０％、または少なくとも約９５％同一であるアミノ酸配列を含み、式
【化１】
2018516844.tif 000002
（式中、
各Ａ、ＣおよびＤは、独立に、アミノ酸であり、
各Ｂは、独立に、アミノ酸、
【化２】
2018516844.tif 000003
、［−ＮＨ−Ｌ３−ＣＯ−］、［−ＮＨ−Ｌ３−ＳＯ２−］、または［−ＮＨ−Ｌ３−］であり、
各Ｅは、独立に、Ａｌａ（アラニン）、Ｄ−Ａｌａ（Ｄ−アラニン）、Ａｉｂ（α−アミノイソ酪酸）、Ｓａｒ（Ｎ−メチルグリシン）、およびＳｅｒ（セリン）からなる群から選択されるアミノ酸であり、
各Ｒ１およびＲ２は、独立に、−Ｈ、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロアルキルもしくはヘテロシクロアルキルであるか（非置換であるか、またはハロで置換されている）、または前記ＤもしくはＥアミノ酸の１つのアルファ位に結合している大環状分子を形成するリンカーＬ’を形成し、
各Ｒ３は、独立に、水素、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、ヘテロアルキル、シクロアルキル、ヘテロシクロアルキル、シクロアルキルアルキル、シクロアリール、またはヘテロシクロアリールであり（Ｒ５により任意選択で置換されている）、
各ＬおよびＬ’は、独立に、式−Ｌ１−Ｌ２−の大環状分子を形成するリンカーであり、
各Ｌ３は、独立に、アルキレン、アルケニレン、アルキニレン、ヘテロアルキレン、シクロアルキレン、ヘテロシクロアルキレン、シクロアリーレン、ヘテロシクロアリーレン、または［−Ｒ４−Ｋ−Ｒ４−］ｎであり、それぞれＲ５により任意選択で置換されており、
各Ｒ４は、独立に、アルキレン、アルケニレン、アルキニレン、ヘテロアルキレン、シクロアルキレン、ヘテロシクロアルキレン、アリーレン、またはヘテロアリーレンであり、
各Ｋは、独立に、Ｏ、Ｓ、ＳＯ、ＳＯ２、ＣＯ、ＣＯ２、またはＣＯＮＲ３であり、
各Ｒ５は、独立に、ハロゲン、アルキル、−ＯＲ６、−Ｎ（Ｒ６）２、−ＳＲ６、−ＳＯＲ６、−ＳＯ２Ｒ６、−ＣＯ２Ｒ６、蛍光部分、放射性同位体または治療剤であり、各Ｒ６は、独立に、−Ｈ、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロシクロアルキル、蛍光部分、放射性同位体または治療剤であり、
各Ｒ７は、独立に、−Ｈ、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキル、ヘテロアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロシクロアルキル、シクロアリールもしくはヘテロシクロアリールであるか（Ｒ５により任意選択で置換されている）、またはＤ残基を有する環式構造の一部であり、
各Ｒ８は、独立に、−Ｈ、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキル、ヘテロアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロシクロアルキル、シクロアリールもしくはヘテロシクロアリールであるか（Ｒ５により任意選択で置換されている）、またはＥ残基を有する環式構造の一部であり、
各ｖは、独立に、０〜１０００の整数であり、
各ｗは、独立に、０〜１０００、例えば０〜５００、０〜２００、０〜１００、０〜５０、０〜３０、０〜２０、０〜１０、０〜５、１〜１０００、１〜５００、１〜２００、１〜１００、１〜５０、１〜３０、１〜２０、１〜１０、１〜５、３〜１０００、３〜５００、３〜２００、３〜１００、３〜５０、３〜３０、３〜２０、３〜１０、０、１、２、３、４、５、６、７、８、９、または１０の整数であり、
ｕは、１〜１０の整数であり、
各ｘ、ｙおよびｚは、独立に、０〜１０の整数であり、
各ｎは、独立に、１〜５の整数である）
を有する。
【００５０】
一部の実施形態では、ペプチド模倣大環状分子は、式
【化３】
2018516844.tif 000004
（式中、
Ｘａａ３、Ｘａａ５、Ｘａａ６、Ｘａａ７、Ｘａａ８、Ｘａａ９、およびＸａａ１０のそれぞれは、個々にアミノ酸であり、Ｘａａ３、Ｘａａ５、Ｘａａ６、Ｘａａ７、Ｘａａ８、Ｘａａ９、およびＸａａ１０の少なくとも３つは、配列Ｐｈｅ３−Ｘ４−Ｈｉｓ５−Ｔｙｒ６−Ｔｒｐ７−Ａｌａ８−Ｇｌｎ９−Ｌｅｕ１０−Ｘ１１−Ｓｅｒ１２またはＰｈｅ３−Ｘ４−Ｇｌｕ５−Ｔｙｒ６−Ｔｒｐ７−Ａｌａ８−Ｇｌｎ９−Ｌｅｕ１０／Ｃｂａ１０−Ｘ１１−Ａｌａ１２の対応する位置のアミノ酸と同じアミノ酸であり、各Ｘ４およびＸ１１は、独立に、アミノ酸であり、
各Ｄは、独立に、アミノ酸であり、
各Ｅは、独立に、Ａｌａ（アラニン）、Ｄ−Ａｌａ（Ｄ−アラニン）、Ａｉｂ（α−アミノイソ酪酸）、Ｓａｒ（Ｎ−メチルグリシン）、およびＳｅｒ（セリン）からなる群から選択されるアミノ酸であり、
各Ｒ１およびＲ２は、独立に、−Ｈ、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロアルキルもしくはヘテロシクロアルキルであるか（非置換であるか、またはハロ−で置換されている）、またはＤもしくはＥアミノ酸の１つのアルファ位に結合している大環状分子を形成するリンカーＬ’を形成し、
各ＬまたはＬ’は、独立に、大環状分子を形成するリンカーであり、
各Ｒ５は、独立に、ハロゲン、アルキル、−ＯＲ６、−Ｎ（Ｒ６）２、−ＳＲ６、−ＳＯＲ６、−ＳＯ２Ｒ６、−ＣＯ２Ｒ６、蛍光部分、放射性同位体または治療剤であり、
各Ｒ６は、独立に、−Ｈ、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロシクロアルキル、蛍光部分、放射性同位体または治療剤であり、
各Ｒ７は、独立に、−Ｈ、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキル、ヘテロアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロシクロアルキル、シクロアリールもしくはヘテロシクロアリールであるか（Ｒ５により任意選択で置換されている）、またはＤ残基を有する環式構造の一部であり、
各Ｒ８は、独立に、−Ｈ、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキル、ヘテロアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロシクロアルキル、シクロアリールもしくはヘテロシクロアリールであるか（Ｒ５により任意選択で置換されている）、またはＥ残基を有する環式構造の一部であり、
ｖは、１〜１０００の整数であり、
ｗは、０〜１０００の整数である）
を有する。
【００５１】
一部の実施形態では、大環状分子を形成するリンカーの少なくとも１つは、式−Ｌ１−Ｌ２−
（式中、
Ｌ１およびＬ２は、独立に、アルキレン、アルケニレン、アルキニレン、ヘテロアルキレン、シクロアルキレン、ヘテロシクロアルキレン、シクロアリーレン、ヘテロシクロアリーレン、または［−Ｒ４−Ｋ−Ｒ４−］ｎであり、それぞれＲ５により任意選択で置換されており、各Ｒ４は、独立に、アルキレン、アルケニレン、アルキニレン、ヘテロアルキレン、シクロアルキレン、ヘテロシクロアルキレン、アリーレン、またはヘテロアリーレンであり、各Ｋは、独立に、Ｏ、Ｓ、ＳＯ、ＳＯ２、ＣＯ、ＣＯ２、またはＣＯＮＲ３であり、各Ｒ３は、独立に、水素、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、ヘテロアルキル、シクロアルキル、ヘテロシクロアルキル、シクロアルキルアルキル、シクロアリール、またはヘテロシクロアリールであり（Ｒ５により任意選択で置換されている）、ｎは、１〜５の整数である）
を有する。
【００５２】
一部の実施形態では、ｗは、０〜１０００、例えば０〜５００、０〜２００、０〜１００、０〜５０、０〜３０、０〜２０、０〜１０、０〜５、１〜１０００、１〜５００、１〜２００、１〜１００、１〜５０、１〜３０、１〜２０、１〜１０、１〜５、３〜１０００、３〜５００、３〜２００、３〜１００、３〜５０、３〜３０、３〜２０、３〜１０、０、１、２、３、４、５、６、７、８、９、または１０の整数である。
【００５３】
一部の実施形態では、Ｘａａ５は、Ｇｌｕまたはそのアミノ酸類似体である。別の実施形態では、各Ｅは、独立に、Ａｌａ（アラニン）、Ｓｅｒ（セリン）またはそれらの類似体である。別の実施形態では、［Ｄ］ｖは、−Ｌｅｕ１−Ｔｈｒ２である。
【００５４】
一部の実施形態では、ｗは、３〜１０である。別の実施形態では、ｗは、３〜６である。別の実施形態では、ｗは、６〜１０である。別の実施形態では、ｗは、６である。
【００５５】
一部の実施形態では、ｖは、１〜１０である。別の実施形態では、ｖは、２〜１０である。別の実施形態では、ｖは、２〜５である。別の実施形態では、ｖは、２である。
【００５６】
一部の実施形態では、Ｌ１およびＬ２は、独立に、アルキレン、アルケニレン、アルキニレン、ヘテロアルキレン、シクロアルキレン、ヘテロシクロアルキレン、シクロアリーレン、またはヘテロシクロアリーレンであり、それぞれＲ５により任意選択で置換されている。別の実施形態では、Ｌ１およびＬ２は、独立に、アルキレンまたはアルケニレンである。別の実施形態では、Ｌは、アルキレン、アルケニレン、またはアルキニレンである。別の実施形態では、Ｌは、アルキレンである。別の実施形態では、Ｌは、Ｃ３〜Ｃ１６アルキレンである。別の実施形態では、Ｌは、Ｃ１０〜Ｃ１４アルキレンである。
【００５７】
一部の実施形態では、Ｒ１およびＲ２は、独立に、−Ｈ、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロアルキル、またはヘテロシクロアルキルである（非置換であるか、またはハロ−で置換されている）。別の実施形態では、Ｒ１およびＲ２は、Ｈである。別の実施形態では、Ｒ１およびＲ２は、独立に、アルキルである。別の実施形態では、Ｒ１およびＲ２は、メチルである。
【００５８】
一部の実施形態では、ｘ＋ｙ＋ｚ＝６である。
【００５９】
一部の実施形態では、ｕは、１である。
【００６０】
一部の実施形態では、ペプチド模倣大環状分子は、アミノ酸類似体である少なくとも１つのアミノ酸を含む。
【００６１】
一部の実施形態では、ペプチド模倣大環状分子は、式
【化４】
2018516844.tif 000005
または薬学的に許容されるその塩を有する。
【００６２】
一部の実施形態では、ペプチド模倣大環状分子は、式
【化５】
2018516844.tif 000006
または薬学的に許容されるその塩を有する。
【００６３】
一部の実施形態では、ペプチド模倣大環状分子は、式
【化６】
2018516844.tif 000007
または薬学的に許容されるその塩を有する。
【００６４】
一部の実施形態では、ペプチド模倣大環状分子は、式
【化７】
2018516844.tif 000008
または薬学的に許容されるその塩を有する。
【００６５】
一部の実施形態では、ペプチド模倣大環状分子は、式
【化８】
2018516844.tif 000009
または薬学的に許容されるその塩を有する。
【００６６】
一部の実施形態では、ペプチド模倣大環状分子は、式
【化９】
2018516844.tif 000010
または薬学的に許容されるその塩を有する。
【００６７】
一部の実施形態では、ペプチド模倣大環状分子は、式
【化１０】
2018516844.tif 000011
または薬学的に許容されるその塩を有する。
【００６８】
一部の実施形態では、ペプチド模倣大環状分子は、式
【化１１】
2018516844.tif 000012
または薬学的に許容されるその塩を有する。
【００６９】
一部の実施形態では、ペプチド模倣大環状分子は、式
【化１２】
2018516844.tif 000013
または薬学的に許容されるその塩を有する。
【００７０】
一部の実施形態では、ペプチド模倣大環状分子は、式
【化１３】
2018516844.tif 000014
または薬学的に許容されるその塩を有する。
【００７１】
一部の実施形態では、ペプチド模倣大環状分子は、式
【化１４】
2018516844.tif 000015
または薬学的に許容されるその塩を有する。
【００７２】
一部の実施形態では、ペプチド模倣大環状分子は、式
【化１５】
2018516844.tif 000016
または薬学的に許容されるその塩を有する。
【００７３】
一部の実施形態では、ペプチド模倣大環状分子は、式
【化１６】
2018516844.tif 000017
または薬学的に許容されるその塩を有する。
【００７４】
一部の実施形態では、ペプチド模倣大環状分子は、式
【化１７】
2018516844.tif 000018
または薬学的に許容されるその塩を有する。
【００７５】
一部の実施形態では、ペプチド模倣大環状分子は、式
【化１８】
2018516844.tif 000019
または薬学的に許容されるその塩を有する。
【００７６】
一部の実施形態では、ペプチド模倣大環状分子は、式
【化１９】
2018516844.tif 000020
または薬学的に許容されるその塩を有する。
【００７７】
一部の実施形態では、ペプチド模倣大環状分子は、式
【化２０】
2018516844.tif 000021
または薬学的に許容されるその塩を有する。
【００７８】
一部の実施形態では、ペプチド模倣大環状分子は、式
【化２１】
2018516844.tif 000022
または薬学的に許容されるその塩を有する。
【００７９】
一部の実施形態では、ペプチド模倣大環状分子は、式
【化２２】
2018516844.tif 000023
または薬学的に許容されるその塩を有する。
【００８０】
一部の実施形態では、ペプチド模倣大環状分子は、式
【化２３】
2018516844.tif 000024
または薬学的に許容されるその塩を有する。
【００８１】
一部の実施形態では、ペプチド模倣大環状分子は、式
【化２４】
2018516844.tif 000025
または薬学的に許容されるその塩を有する。
【００８２】
一部の実施形態では、ペプチド模倣大環状分子は、式
【化２５】
2018516844.tif 000026
または薬学的に許容されるその塩を有する。
【００８３】
一部の実施形態では、ペプチド模倣大環状分子は、式
【化２６】
2018516844.tif 000027
または薬学的に許容されるその塩を有する。
【００８４】
一部の実施形態では、ペプチド模倣大環状分子は、式
【化２７】
2018516844.tif 000028
または薬学的に許容されるその塩を有する。
【００８５】
一部の実施形態では、ペプチド模倣大環状分子は、式
【化２８】
2018516844.tif 000029
または薬学的に許容されるその塩を有する。
【００８６】
一部の実施形態では、ペプチド模倣大環状分子は、式
【化２９】
2018516844.tif 000030
または薬学的に許容されるその塩を有する。
【００８７】
一部の実施形態では、ペプチド模倣大環状分子は、式
【化３０】
2018516844.tif 000031
または薬学的に許容されるその塩を有する。
【００８８】
一部の実施形態では、ペプチド模倣大環状分子は、式
【化３１】
2018516844.tif 000032
または薬学的に許容されるその塩を有する。
【００８９】
一部の実施形態では、ペプチド模倣大環状分子は、式
【化３２】
2018516844.tif 000033
または薬学的に許容されるその塩を有する。
【００９０】
一部の実施形態では、ペプチド模倣大環状分子は、式
【化３３】
2018516844.tif 000034
または薬学的に許容されるその塩を有する。
【００９１】
また本明細書では、ｐ５３非活性化変異が欠如しているヒト被験体における、１つまたは複数の液性がんバイオマーカーを同定する方法であって、該ヒト被験体に、治療有効量のペプチド模倣大環状分子を投与するステップを含む方法が開示される。
【００９２】
一部の実施形態では、バイオマーカーは、ｐ５３ステータス、ＭＤＭ２発現レベルまたはＭＤＭＸ発現レベルである。
【００９３】
参考文献の援用
本明細書で言及されているあらゆる刊行物、特許文書、および特許出願文書は、各個々の刊行物、特許文書、または特許出願文書が、あたかも具体的に個々に参照によって組み込まれることが示されているかのように、参照によって本明細書に組み込まれる。
【００９４】
本発明の新規な特徴を、添付の特許請求の範囲において詳細に示す。本発明の特徴および利点は、本発明の原理が利用される例示的な実施形態を記載する以下の詳細な説明および以下の添付の図を参照することによってより良好に理解されよう。
【図面の簡単な説明】
【００９５】
【図１】図１は、ヒト野生型Ｐ５３コードおよびタンパク質配列を示す。
【００９６】
【図２】図２は、ペプチド１がｐ５３野生型造血細胞株においてロバストなアポトーシス応答をもたらしたことを示す。
【００９７】
【図３】図３は、ペプチド１がｐ５３野生型造血細胞株において機構上の（on-mechanism）ｐ２１薬力学応答をもたらしたことを示す。
【００９８】
【図４】図４は、ペプチド１が代表的造血細胞株パネルにおいてｐ５３野生型がん細胞を選択的に死滅させたことを示す。
【００９９】
【図５】図５は、ＡＭＬ異種移植片モデルにおいてペプチド１の投薬後の動物の生存期間を示す。
【０１００】
【図６】図６は、４週のサルＧＬＰ毒性研究におけるペプチド１の用量依存性血小板応答を示す。
【発明を実施するための形態】
【０１０１】
本開示の好ましい実施形態を、本明細書で示し記載するが、当業者には、このような実施形態が単に例示的に提示されることが明らかである。ここで当業者には、本開示から逸脱することなく、数々の変更、変化、および置換が想到される。本開示の実施には、本明細書に記載の本開示の実施形態に対して様々な代替形態を用い得ることを理解されたい。下記の特許請求の範囲は、本開示の範囲を定義し、これらの特許請求の範囲に含まれる方法および構造、ならびにそれらの均等物は、特許請求の範囲によって保護されるものとする。
【０１０２】
定義
本明細書で使用される用語「大環状分子」は、共有結合により結合している少なくとも９個の原子によって形成された環またはサイクルを含む化学的構造を有する分子を指す。
【０１０３】
本明細書で使用される用語「ペプチド模倣大環状分子」または「架橋ポリペプチド」は、複数のペプチド結合および少なくとも１つの大環状分子を形成するリンカーによって連結した複数のアミノ酸残基を含み、それによって、第１の天然に存在するまたは天然に存在しないアミノ酸残基（または類似体）と、同じ分子内の第２の天然に存在するまたは天然に存在しないアミノ酸残基（または類似体）の間に大環状分子を形成する化合物を指す。ペプチド模倣大環状分子は、大環状分子を形成するリンカーが、第１のアミノ酸残基（または類似体）のα炭素を、第２のアミノ酸残基（または類似体）のα炭素に結合している実施形態を含む。ペプチド模倣大環状分子は、任意選択で、１つまたは複数のアミノ酸残基および／またはアミノ酸類似体残基の間に１つまたは複数の非ペプチド結合を含み、任意選択で、大環状分子を形成する任意のものに加えて、１つまたは複数の天然に存在しないアミノ酸残基またはアミノ酸類似体残基を含む。「対応する未架橋ポリペプチド」は、ペプチド模倣大環状分子の文脈で言及される場合、大環状分子と同じ長さであり、大環状分子に対応する野生型配列の等価な天然アミノ酸を含むポリペプチドに関すると理解される。
【０１０４】
本明細書で使用される場合、用語「検査学的ＴＬＳ」は、血清尿酸、カリウムもしくはリンのレベルの２５％上昇、またはカルシウムレベルの２５％低下を指す。
【０１０５】
本明細書で使用される場合、用語「ヘリックスの安定性」は、円二色性またはＮＭＲによって測定して、ペプチド模倣大環状分子によりαヘリックス構造が維持されることを指す。例えば、一部の実施形態では、ペプチド模倣大環状分子は、円二色性によって決定して、対応する未架橋大環状分子と比較して、αらせん度の少なくとも１．２５倍、１．５倍、１．７５倍または２倍の増大を呈する。
【０１０６】
用語「アミノ酸」は、アミノ基とカルボキシル基の両方を含有する分子を指す。適切なアミノ酸には、それらに限定されるものではないが、天然に存在するアミノ酸、および有機合成または他の代謝経路によって調製された天然に存在しないアミノ酸のＤ−異性体とＬ−異性体の両方が含まれる。本明細書で使用されるアミノ酸という用語には、α−アミノ酸、天然アミノ酸、非天然アミノ酸、およびアミノ酸類似体が含まれるが、それらに限定されない。
【０１０７】
用語「α−アミノ酸」は、α−炭素と指定される炭素に結合したアミノ基とカルボキシル基の両方を含有する分子を指す。
【０１０８】
用語「β−アミノ酸」は、β立体配置にアミノ基とカルボキシル基の両方を含有する分子を指す。
【０１０９】
用語「天然に存在するアミノ酸」は、天然に合成されたペプチドに一般に見出され、一文字略語Ａ、Ｒ、Ｎ、Ｃ、Ｄ、Ｑ、Ｅ、Ｇ、Ｈ、Ｉ、Ｌ、Ｋ、Ｍ、Ｆ、Ｐ、Ｓ、Ｔ、Ｗ、ＹおよびＶによって公知の２０種のアミノ酸のいずれか１つを指す。
【０１１０】
以下の表によって、天然アミノ酸の特性の概要を示す。
【表Ａ】
2018516844.tif 000035
【０１１１】
「疎水性アミノ酸」には、小さい疎水性アミノ酸および大きい疎水性アミノ酸が含まれる。「小さい疎水性アミノ酸」は、グリシン、アラニン、プロリン、およびそれらの類似体である。「大きい疎水性アミノ酸」は、バリン、ロイシン、イソロイシン、フェニルアラニン、メチオニン、トリプトファン、およびそれらの類似体である。「極性アミノ酸」は、セリン、スレオニン、アスパラギン、グルタミン、システイン、チロシン、およびそれらの類似体である。「荷電アミノ酸」は、リシン、アルギニン、ヒスチジン、アスパラギン酸、グルタミン酸、およびそれらの類似体である。
【０１１２】
用語「アミノ酸類似体」は、構造的にアミノ酸に類似しており、ペプチド模倣大環状分子の形成においてアミノ酸を置換することができる分子を指す。アミノ酸類似体には、β−アミノ酸、およびアミノ基またはカルボキシ基が同様に反応基によって置換されている（例えば第一級アミンが第二級もしくは第三級アミンで置換されている、またはカルボキシ基がエステルで置換されている）アミノ酸が含まれるが、それらに限定されない。
【０１１３】
用語「非天然アミノ酸」は、天然に合成されたペプチドに一般に見出され、一文字略語Ａ、Ｒ、Ｎ、Ｃ、Ｄ、Ｑ、Ｅ、Ｇ、Ｈ、Ｉ、Ｌ、Ｋ、Ｍ、Ｆ、Ｐ、Ｓ、Ｔ、Ｗ、ＹおよびＶによって公知の２０種のアミノ酸の１つではないアミノ酸を指す。非天然アミノ酸またはアミノ酸類似体には、以下による構造が含まれるが、それらに限定されない。
【化３４】
2018516844.tif 000036
【化３５】
2018516844.tif 000037
【化３６】
2018516844.tif 000038
【化３７】
2018516844.tif 000039
【０１１４】
アミノ酸類似体には、β−アミノ酸類似体が含まれる。β−アミノ酸類似体の例として、環式β−アミノ酸類似体；β−アラニン；（Ｒ）−β−フェニルアラニン；（Ｒ）−１，２，３，４−テトラヒドロ−イソキノリン−３−酢酸；（Ｒ）−３−アミノ−４−（１−ナフチル）−酪酸；（Ｒ）−３−アミノ−４−（２，４−ジクロロフェニル）酪酸；（Ｒ）−３−アミノ−４−（２−クロロフェニル）−酪酸；（Ｒ）−３−アミノ−４−（２−シアノフェニル）−酪酸；（Ｒ）−３−アミノ−４−（２−フルオロフェニル）−酪酸；（Ｒ）−３−アミノ−４−（２−フリル）−酪酸；（Ｒ）−３−アミノ−４−（２−メチルフェニル）−酪酸；（Ｒ）−３−アミノ−４−（２−ナフチル）−酪酸；（Ｒ）−３−アミノ−４−（２−チエニル）−酪酸；（Ｒ）−３−アミノ−４−（２−トリフルオロメチルフェニル）−酪酸；（Ｒ）−３−アミノ−４−（３，４−ジクロロフェニル）酪酸；（Ｒ）−３−アミノ−４−（３，４−ジフルオロフェニル）酪酸；（Ｒ）−３−アミノ−４−（３−ベンゾチエニル）−酪酸；（Ｒ）−３−アミノ−４−（３−クロロフェニル）−酪酸；（Ｒ）−３−アミノ−４−（３−シアノフェニル）−酪酸；（Ｒ）−３−アミノ−４−（３−フルオロフェニル）−酪酸；（Ｒ）−３−アミノ−４−（３−メチルフェニル）−酪酸；（Ｒ）−３−アミノ−４−（３−ピリジル）−酪酸；（Ｒ）−３−アミノ−４−（３−チエニル）−酪酸；（Ｒ）−３−アミノ−４−（３−トリフルオロメチルフェニル）−酪酸；（Ｒ）−３−アミノ−４−（４−ブロモフェニル）−酪酸；（Ｒ）−３−アミノ−４−（４−クロロフェニル）−酪酸；（Ｒ）−３−アミノ−４−（４−シアノフェニル）−酪酸；（Ｒ）−３−アミノ−４−（４−フルオロフェニル）−酪酸；（Ｒ）−３−アミノ−４−（４−ヨードフェニル）−酪酸；（Ｒ）−３−アミノ−４−（４−メチルフェニル）−酪酸；（Ｒ）−３−アミノ−４−（４−ニトロフェニル）−酪酸；（Ｒ）−３−アミノ−４−（４−ピリジル）−酪酸；（Ｒ）−３−アミノ−４−（４−トリフルオロメチルフェニル）−酪酸；（Ｒ）−３−アミノ−４−ペンタフルオロ−フェニル酪酸；（Ｒ）−３−アミノ−５−ヘキセン酸；（Ｒ）−３−アミノ−５−ヘキシン酸；（Ｒ）−３−アミノ−５−フェニルペンタン酸；（Ｒ）−３−アミノ−６−フェニル−５−ヘキセン酸；（Ｓ）−１，２，３，４−テトラヒドロ−イソキノリン−３−酢酸；（Ｓ）−３−アミノ−４−（１−ナフチル）−酪酸；（Ｓ）−３−アミノ−４−（２，４−ジクロロフェニル）酪酸；（Ｓ）−３−アミノ−４−（２−クロロフェニル）−酪酸；（Ｓ）−３−アミノ−４−（２−シアノフェニル）−酪酸；（Ｓ）−３−アミノ−４−（２−フルオロフェニル）−酪酸；（Ｓ）−３−アミノ−４−（２−フリル）−酪酸；（Ｓ）−３−アミノ−４−（２−メチルフェニル）−酪酸；（Ｓ）−３−アミノ−４−（２−ナフチル）−酪酸；（Ｓ）−３−アミノ−４−（２−チエニル）−酪酸；（Ｓ）−３−アミノ−４−（２−トリフルオロメチルフェニル）−酪酸；（Ｓ）−３−アミノ−４−（３，４−ジクロロフェニル）酪酸；（Ｓ）−３−アミノ−４−（３，４−ジフルオロフェニル）酪酸；（Ｓ）−３−��ミノ−４−（３−ベンゾチエニル）−酪酸；（Ｓ）−３−アミノ−４−（３−クロロフェニル）−酪酸；（Ｓ）−３−アミノ−４−（３−シアノフェニル）−酪酸；（Ｓ）−３−アミノ−４−（３−フルオロフェニル）−酪酸；（Ｓ）−３−アミノ−４−（３−メチルフェニル）−酪酸；（Ｓ）−３−アミノ−４−（３−ピリジル）−酪酸；（Ｓ）−３−アミノ−４−（３−チエニル）−酪酸；（Ｓ）−３−アミノ−４−（３−トリフルオロメチルフェニル）−酪酸；（Ｓ）−３−アミノ−４−（４−ブロモフェニル）−酪酸；（Ｓ）−３−アミノ−４−（４−クロロフェニル）−酪酸；（Ｓ）−３−アミノ−４−（４−シアノフェニル）−酪酸；（Ｓ）−３−アミノ−４−（４−フルオロフェニル）−酪酸；（Ｓ）−３−アミノ−４−（４−ヨードフェニル）−酪酸；（Ｓ）−３−アミノ−４−（４−メチルフェニル）−酪酸；（Ｓ）−３−アミノ−４−（４−ニトロフェニル）−酪酸；（Ｓ）−３−アミノ−４−（４−ピリジル）−酪酸；（Ｓ）−３−アミノ−４−（４−トリフルオロメチルフェニル）−酪酸；（Ｓ）−３−アミノ−４−ペンタフルオロ−フェニル酪酸；（Ｓ）−３−アミノ−５−ヘキセン酸；（Ｓ）−３−アミノ−５−ヘキシン酸；（Ｓ）−３−アミノ−５−フェニルペンタン酸；（Ｓ）−３−アミノ−６−フェニル−５−ヘキセン酸；１，２，５，６−テトラヒドロピリジン−３−カルボン酸；１，２，５，６−テトラヒドロピリジン−４−カルボン酸；３−アミノ−３−（２−クロロフェニル）−プロピオン酸；３−アミノ−３−（２−チエニル）−プロピオン酸；３−アミノ−３−（３−ブロモフェニル）−プロピオン酸；３−アミノ−３−（４−クロロフェニル）−プロピオン酸；３−アミノ−３−（４−メトキシフェニル）−プロピオン酸；３−アミノ−４，４，４−トリフルオロ−酪酸；３−アミノアジピン酸；Ｄ−β−フェニルアラニン；β−ロイシン；Ｌ−β−ホモアラニン；Ｌ−β−ホモアスパラギン酸γ−ベンジルエステル；Ｌ−β−ホモグルタミン酸δ−ベンジルエステル；Ｌ−β−ホモイソロイシン；Ｌ−β−ホモロイシン；Ｌ−β−ホモメチオニン；Ｌ−β−ホモフェニルアラニン；Ｌ−β−ホモプロリン；Ｌ−β−ホモトリプトファン；Ｌ−β−ホモバリン；Ｌ−Ｎω−ベンジルオキシカルボニル−β−ホモリシン；Ｎω−Ｌ−β−ホモアルギニン；Ｏ−ベンジル−Ｌ−β−ホモヒドロキシプロリン；Ｏ−ベンジル−Ｌ−β−ホモセリン；Ｏ−ベンジル−Ｌ−β−ホモトレオニン；Ｏ−ベンジル−Ｌ−β−ホモチロシン；γ−トリチル−Ｌ−β−ホモアスパラギン；（Ｒ）−β−フェニルアラニン；Ｌ−β−ホモアスパラギン酸γ−ｔ−ブチルエステル；Ｌ−β−ホモグルタミン酸δ−ｔ−ブチルエステル；Ｌ−Ｎω−β−ホモリシン；Ｎδ−トリチル−Ｌ−β−ホモグルタミン；Ｎω−２，２，４，６，７−ペンタメチル−ジヒドロベンゾフラン−５−スルホニル−Ｌ−β−ホモアルギニン；Ｏ−ｔ−ブチル−Ｌ−β−ホモヒドロキシ−プロリン；Ｏ−ｔ−ブチル−Ｌ−β−ホモセリン；Ｏ−ｔ−ブチル−Ｌ−β−ホモトレオニン；Ｏ−ｔ−ブチル−Ｌ−β−ホモチロシン；２−アミノシクロペンタンカルボン酸；および２−アミノシクロヘキサンカルボン酸が挙げられるが、それらに限定されない。
【０１１５】
アミノ酸類似体には、アラニン、バリン、グリシンまたはロイシンの類似体が含まれる。アラニン、バリン、グリシン、およびロイシンのアミノ酸類似体の例として、α−メトキシグリシン；α−アリル−Ｌ−アラニン；α−アミノイソ酪酸；α−メチル−ロイシン；β−（１−ナフチル）−Ｄ−アラニン；β−（１−ナフチル）−Ｌ−アラニン；β−（２−ナフチル）−Ｄ−アラニン；β−（２−ナフチル）−Ｌ−アラニン；β−（２−ピリジル）−Ｄ−アラニン；β−（２−ピリジル）−Ｌ−アラニン；β−（２−チエニル）−Ｄ−アラニン；β−（２−チエニル）−Ｌ−アラニン；β−（３−ベンゾチエニル）−Ｄ−アラニン；β−（３−ベンゾチエニル）−Ｌ−アラニン；β−（３−ピリジル）−Ｄ−アラニン；β−（３−ピリジル）−Ｌ−アラニン；β−（４−ピリジル）−Ｄ−アラニン；β−（４−ピリジル）−Ｌ−アラニン；β−クロロ−Ｌ−アラニン；β−シアノ−Ｌ−アラニン；β−シクロヘキシル−Ｄ−アラニン；β−シクロヘキシル−Ｌ−アラニン；β−シクロペンテン−１−イル−アラニン；β−シクロペンチル−アラニン；β−シクロプロピル−Ｌ−Ａｌａ−ＯＨ・ジシクロヘキシルアンモニウム塩；β−ｔ−ブチル−Ｄ−アラニン；β−ｔ−ブチル−Ｌ−アラニン；γ−アミノ酪酸；Ｌ−α，β−ジアミノプロピオン酸；２，４−ジニトロ−フェニルグリシン；２，５−ジヒドロ−Ｄ−フェニルグリシン；２−アミノ−４，４，４−トリフルオロ酪酸；２−フルオロ−フェニルグリシン；３−アミノ−４，４，４−トリフルオロ−酪酸；３−フルオロ−バリン；４，４，４−トリフルオロ−バリン；４，５−デヒドロ−Ｌ−ｌｅｕ−ＯＨ・ジシクロヘキシルアンモニウム塩；４−フルオロ−Ｄ−フェニルグリシン；４−フルオロ−Ｌ−フェニルグリシン；４−ヒドロキシ−Ｄ−フェニルグリシン；５，５，５−トリフルオロ−ロイシン；６−アミノヘキサン酸；シクロペンチル−Ｄ−Ｇｌｙ−ＯＨ・ジシクロヘキシルアンモニウム塩；シクロペンチル−Ｇｌｙ−ＯＨ・ジシクロヘキシルアンモニウム塩；Ｄ−α，β−ジアミノプロピオン酸；Ｄ−α−アミノ酪酸；Ｄ−α−ｔ−ブチルグリシン；Ｄ−（２−チエニル）グリシン；Ｄ−（３−チエニル）グリシン；Ｄ−２−アミノカプロン酸；Ｄ−２−インダニルグリシン；Ｄ−アリルグリシン・ジシクロヘキシルアンモニウム塩；Ｄ−シクロヘキシルグリシン；Ｄ−ノルバリン；Ｄ−フェニルグリシン；β−アミノ酪酸；β−アミノイソ酪酸；（２−ブロモフェニル）グリシン；（２−メトキシフェニル）グリシン；（２−メチルフェニル）グリシン；（２−チアゾイル）グリシン；（２−チエニル）グリシン；２−アミノ−３−（ジメチルアミノ）−プロピオン酸；Ｌ−α，β−ジアミノプロピオン酸；Ｌ−α−アミノ酪酸；Ｌ−α−ｔ−ブチルグリシン；Ｌ−（３−チエニル）グリシン；Ｌ−２−アミノ−３−（ジメチルアミノ）−プロピオン酸；Ｌ−２−アミノカプロン酸ジシクロヘキシル−アンモニウム塩；Ｌ−２−インダニルグリシン；Ｌ−アリルグリシン・ジシクロヘキシルアンモニウム塩；Ｌ−シクロヘキシルグリシン；Ｌ−フェニルグリシン；Ｌ−プロパルギルグリシン；Ｌ−ノルバリン；Ｎ−α−アミノメチル−Ｌ−アラニン；Ｄ−α，γ−ジアミノ酪酸；Ｌ−α，γ−ジアミノ酪酸；β−シクロプロピル−Ｌ−アラニン；（Ｎ−β−（２，４−ジニトロフェニル））−Ｌ−α，β−ジアミノプロピオン酸；（Ｎ−β−１−（４，４−ジメチル−２，６−ジオキソシクロヘキサ−１−イリデン）エチル）−Ｄ−α，β−ジアミノプロピオン酸；（Ｎ−β−１−（４，４−ジメチル−２，６−ジオキソシクロヘキサ−１−イリデン）エチル）−Ｌ−α，β−ジアミノプロピオン酸；（Ｎ−β−４−メチルトリチル）−Ｌ−α，β−ジアミノプロピオン酸；（Ｎ−β−アリルオキシカルボニル）−Ｌ−α，β−ジアミノプロピオン酸；（Ｎ−γ−１−（４，４−ジメチル−２，６−ジオキソシクロヘキサ−１−イリデン）エチル）−Ｄ−α，γ−ジアミノ酪酸；（Ｎ−γ−１−（４，４−ジメチル−２，６−ジオキソシクロヘキサ−１−イリデン）エチル）−Ｌ−α，γ−ジアミノ酪酸；（Ｎ−γ−４−メチルトリチル）−Ｄ−α，γ−ジアミノ酪酸；（Ｎ−γ−４−メチルトリチル）−Ｌ−α，γ−ジアミノ酪酸；（Ｎ−γ−アリルオキシカルボニル）−Ｌ−α，γ−ジアミノ酪酸；Ｄ−α，γ−ジアミノ酪酸；４，５−デヒドロ−Ｌ−ロイシン；シクロペンチル−Ｄ−Ｇｌｙ−ＯＨ；シクロペンチル−Ｇｌｙ−ＯＨ；Ｄ−アリルグリシン；Ｄ−ホモシクロヘキシルアラニン；Ｌ−１−ピレニルアラニン；Ｌ−２−アミノカプロン酸；Ｌ−アリルグリシン；Ｌ−ホモシクロヘキシルアラニン；およびＮ−（２−ヒドロキシ−４−メトキシ−Ｂｚｌ）−Ｇｌｙ−ＯＨが挙げられるが、それらに限定されない。
【０１１６】
アミノ酸類似体には、アルギニンまたはリシンの類似体が含まれる。アルギニンおよびリシンのアミノ酸類似体の例として、シトルリン；Ｌ−２−アミノ−３−グアニジノプロピオン酸；Ｌ−２−アミノ−３−ウレイドプロピオン酸；Ｌ−シトルリン；Ｌｙｓ（Ｍｅ）２−ＯＨ；Ｌｙｓ（Ｎ３）−ＯＨ；Ｎδ−ベンジルオキシカルボニル−Ｌ−オルニチン；Ｎω−ニトロ−Ｄ−アルギニン；Ｎω−ニトロ−Ｌ−アルギニン；α−メチル−オルニチン；２，６−ジアミノヘプタン二酸；Ｌ−オルニチン；（Ｎδ−１−（４，４−ジメチル−２，６−ジオキソ−シクロヘキサ−１−イリデン）エチル）−Ｄ−オルニチン；（Ｎδ−１−（４，４−ジメチル−２，６−ジオキソ−シクロヘキサ−１−イリデン）エチル）−Ｌ−オルニチン；（Ｎδ−４−メチルトリチル）−Ｄ−オルニチン；（Ｎδ−４−メチルトリチル）−Ｌ−オルニチン；Ｄ−オルニチン；Ｌ−オルニチン；Ａｒｇ（Ｍｅ）（Ｐｂｆ）−ＯＨ；Ａｒｇ（Ｍｅ）２−ＯＨ（非対称）；Ａｒｇ（Ｍｅ）２−ＯＨ（対称）；Ｌｙｓ（ｉｖＤｄｅ）−ＯＨ；Ｌｙｓ（Ｍｅ）２−ＯＨ・ＨＣｌ；Ｌｙｓ（Ｍｅ３）−ＯＨクロリド；Ｎω−ニトロ−Ｄ−アルギニン；およびＮω−ニトロ−Ｌ−アルギニンが挙げられるが、それらに限定されない。
【０１１７】
アミノ酸類似体には、アスパラギン酸またはグルタミン酸の類似体が含まれる。アスパラギン酸およびグルタミン酸のアミノ酸類似体の例として、α−メチル−Ｄ−アスパラギン酸；α−メチル−グルタミン酸；α−メチル−Ｌ−アスパラギン酸；γ−メチレン−グルタミン酸；（Ｎ−γ−エチル）−Ｌ−グルタミン；［Ｎ−α−（４−アミノベンゾイル）］−Ｌ−グルタミン酸；２，６−ジアミノピメリン酸；Ｌ−α−アミノスベリン酸；Ｄ−２−アミノアジピン酸；Ｄ−α−アミノスベリン酸；α−アミノピメリン酸；イミノ二酢酸；Ｌ−２−アミノアジピン酸；トレオ−β−メチル−アスパラギン酸；γ−カルボキシ−Ｄ−グルタミン酸γ，γ−ジ−ｔ−ブチルエステル；γ−カルボキシ−Ｌ−グルタミン酸γ，γ−ジ−ｔ−ブチルエステル；Ｇｌｕ（ＯＡｌｌ）−ＯＨ；Ｌ−Ａｓｕ（ＯｔＢｕ）−ＯＨ；およびピログルタミン酸が挙げられるが、それらに限定されない。
【０１１８】
アミノ酸類似体には、システインおよびメチオニンの類似体が含まれる。システインおよびメチオニンのアミノ酸類似体の例として、Ｃｙｓ（ファルネシル）−ＯＨ、Ｃｙｓ（ファルネシル）−ＯＭｅ、α−メチル−メチオニン、Ｃｙｓ（２−ヒドロキシエチル）−ＯＨ、Ｃｙｓ（３−アミノプロピル）−ＯＨ、２−アミノ−４−（エチルチオ）酪酸、ブチオニン、ブチオニンスルホキシミン、エチオニン、メチオニンメチルスルホニウムクロリド、セレノメチオニン、システイン酸、［２−（４−ピリジル）エチル］−ＤＬ−ペニシラミン、［２−（４−ピリジル）エチル］−Ｌ−システイン、４−メトキシベンジル−Ｄ−ペニシラミン、４−メトキシベンジル−Ｌ−ペニシラミン、４−メチルベンジル−Ｄ−ペニシラミン、４−メチルベンジル−Ｌ−ペニシラミン、ベンジル−Ｄ−システイン、ベンジル−Ｌ−システイン、ベンジル−ＤＬ−ホモシステイン、カルバモイル−Ｌ−システイン、カルボキシエチル−Ｌ−システイン、カルボキシメチル−Ｌ−システイン、ジフェニルメチル−Ｌ−システイン、エチル−Ｌ−システイン、メチル−Ｌ−システイン、ｔ−ブチル−Ｄ−システイン、トリチル−Ｌ−ホモシステイン、トリチル−Ｄ−ペニシラミン、シスタチオニン、ホモシスチン、Ｌ−ホモシスチン、（２−アミノエチル）−Ｌ−システイン、セレノ−Ｌ−シスチン、シスタチオニン、Ｃｙｓ（ＳｔＢｕ）−ＯＨ、およびアセトアミドメチル−Ｄ−ペニシラミンが挙げられるが、それらに限定されない。
【０１１９】
アミノ酸類似体には、フェニルアラニンおよびチロシンの類似体が含まれる。フェニルアラニンおよびチロシンのアミノ酸類似体の例として、β−メチル−フェニルアラニン、β−ヒドロキシフェニルアラニン、α−メチル−３−メトキシ−ＤＬ−フェニルアラニン、α−メチル−Ｄ−フェニルアラニン、α−メチル−Ｌ−フェニルアラニン、１，２，３，４−テトラヒドロイソキノリン−３−カルボン酸、２，４−ジクロロ−フェニルアラニン、２−（トリフルオロメチル）−Ｄ−フェニルアラニン、２−（トリフルオロメチル）−Ｌ−フェニルアラニン、２−ブロモ−Ｄ−フェニルアラニン、２−ブロモ−Ｌ−フェニルアラニン、２−クロロ−Ｄ−フェニルアラニン、２−クロロ−Ｌ−フェニルアラニン、２−シアノ−Ｄ−フェニルアラニン、２−シアノ−Ｌ−フェニルアラニン、２−フルオロ−Ｄ−フェニルアラニン、２−フルオロ−Ｌ−フェニルアラニン、２−メチル−Ｄ−フェニルアラニン、２−メチル−Ｌ−フェニルアラニン、２−ニトロ−Ｄ−フェニルアラニン、２−ニトロ−Ｌ−フェニルアラニン、２；４；５−トリヒドロキシ−フェニルアラニン、３，４，５−トリフルオロ−Ｄ−フェニルアラニン、３，４，５−トリフルオロ−Ｌ−フェニルアラニン、３，４−ジクロロ−Ｄ−フェニルアラニン、３，４−ジクロロ−Ｌ−フェニルアラニン、３，４−ジフルオロ−Ｄ−フェニルアラニン、３，４−ジフルオロ−Ｌ−フェニルアラニン、３，４−ジヒドロキシ−Ｌ−フェニルアラニン、３，４−ジメトキシ−Ｌ−フェニルアラニン、３，５，３’−トリヨード−Ｌ−チロニン、３，５−ジヨード−Ｄ−チロシン、３，５−ジヨード−Ｌ−チロシン、３，５−ジヨード−Ｌ−チロニン、３−（トリフルオロメチル）−Ｄ−フェニルアラニン、３−（トリフルオロメチル）−Ｌ−フェニルアラニン、３−アミノ−Ｌ−チロシン、３−ブロモ−Ｄ−フェニルアラニン、３−ブロモ−Ｌ−フェニルアラニン、３−クロロ−Ｄ−フェニルアラニン、３−クロロ−Ｌ−フェニルアラニン、３−クロロ−Ｌ−チロシン、３−シアノ−Ｄ−フェニルアラニン、３−シアノ−Ｌ−フェニルアラニン、３−フルオロ−Ｄ−フェニルアラニン、３−フルオロ−Ｌ−フェニルアラニン、３−フルオロ−チロシン、３−ヨード−Ｄ−フェニルアラニン、３−ヨード−Ｌ−フェニルアラニン、３−ヨード−Ｌ−チロシン、３−メトキシ−Ｌ−チロシン、３−メチル−Ｄ−フェニルアラニン、３−メチル−Ｌ−フェニルアラニン、３−ニトロ−Ｄ−フェニルアラニン、３−ニトロ−Ｌ−フェニルアラニン、３−ニトロ−Ｌ−チロシン、４−（トリフルオロメチル）−Ｄ−フェニルアラニン、４−（トリフルオロメチル）−Ｌ−フェニルアラニン、４−アミノ−Ｄ−フェニルアラニン、４−アミノ−Ｌ−フェニルアラニン、４−ベンゾイル−Ｄ−フェニルアラニン、４−ベンゾイル−Ｌ−フェニルアラニン、４−ビス（２−クロロエチル）アミノ−Ｌ−フェニルアラニン、４−ブロモ−Ｄ−フェニルアラニン、４−ブロモ−Ｌ−フェニルアラニン、４−クロロ−Ｄ−フェニルアラニン、４−クロロ−Ｌ−フェニルアラニン、４−シアノ−Ｄ−フェニルアラニン、４−シアノ−Ｌ−フェニルアラニン、４−フルオロ−Ｄ−フェニルアラニン、４−フルオロ��Ｌ−フェニルアラニン、４−ヨード−Ｄ−フェニルアラニン、４−ヨード−Ｌ−フェニルアラニン、ホモフェニルアラニン、チロキシン、３，３−ジフェニルアラニン、チロニン、エチル−チロシン、およびメチル−チロシンが挙げられる。
【０１２０】
アミノ酸類似体には、プロリンの類似体が含まれる。プロリンのアミノ酸類似体の例として、３，４−デヒドロ−プロリン、４−フルオロ−プロリン、シス−４−ヒドロキシ−プロリン、チアゾリジン−２−カルボン酸、およびトランス−４−フルオロ−プロリンが挙げられるが、それらに限定されない。
【０１２１】
アミノ酸類似体には、セリンおよびスレオニンの類似体が含まれる。セリンおよびスレオニンのアミノ酸類似体の例として、３−アミノ−２−ヒドロキシ−５−メチルヘキサン酸、２−アミノ−３−ヒドロキシ−４−メチルペンタン酸、２−アミノ−３−エトキシブタン酸、２−アミノ−３−メトキシブタン酸、４−アミノ−３−ヒドロキシ−６−メチルヘプタン酸、２−アミノ−３−ベンジルオキシプロピオン酸、２−アミノ−３−ベンジルオキシプロピオン酸、２−アミノ−３−エトキシプロピオン酸、４−アミノ−３−ヒドロキシブタン酸、およびα−メチルセリンが挙げられるが、それらに限定されない。
【０１２２】
アミノ酸類似体には、トリプトファンの類似体が含まれる。トリプトファンのアミノ酸類似体の例として、α−メチル−トリプトファン；β−（３−ベンゾチエニル）−Ｄ−アラニン；β−（３−ベンゾチエニル）−Ｌ−アラニン；１−メチル−トリプトファン；４−メチル−トリプトファン；５−ベンジルオキシ−トリプトファン；５−ブロモ−トリプトファン；５−クロロ−トリプトファン；５−フルオロ−トリプトファン；５−ヒドロキシ−トリプトファン；５−ヒドロキシ−Ｌ−トリプトファン；５−メトキシ−トリプトファン；５−メトキシ−Ｌ−トリプトファン；５−メチル−トリプトファン；６−ブロモ−トリプトファン；６−クロロ−Ｄ−トリプトファン；６−クロロ−トリプトファン；６−フルオロ−トリプトファン；６−メチル−トリプトファン；７−ベンジルオキシ−トリプトファン；７−ブロモ−トリプトファン；７−メチル−−トリプトファン；Ｄ−１，２，３，４−テトラヒドロ−ノルハルマン−３−カルボン酸；６−メトキシ−１，２，３，４−テトラヒドロノルハルマン−１−カルボン酸；７−アザトリプトファン；Ｌ−１，２，３，４−テトラヒドロ−ノルハルマン−３−カルボン酸；５−メトキシ−２−メチル−トリプトファン；および６−クロロ−Ｌ−トリプトファンが挙げられるが、それらに限定されない。
【０１２３】
一部の実施形態では、アミノ酸類似体は、ラセミである。一部の実施形態では、アミノ酸類似体のＤ異性体が使用される。一部の実施形態では、アミノ酸類似体のＬ異性体が使用される。他の実施形態では、アミノ酸類似体は、ＲまたはＳ立体配置中にあるキラル中心を含む。さらに他の実施形態では、β−アミノ酸類似体のアミノ基（複数可）は、保護基、例えばｔｅｒｔ−ブチルオキシカルボニル（ＢＯＣ基）、９−フルオレニルメチルオキシカルボニル（ＦＭＯＣ）、トシル等で置換されている。さらなる他の実施形態では、β−アミノ酸類似体のカルボン酸官能基は、例えばそのエステル誘導体として保護される。一部の実施形態では、アミノ酸類似体の塩が使用される。
【０１２４】
「非必須」アミノ酸残基は、その必須の生物学的または生化学的な活性（例えば、受容体結合または活性化）を消失することなく、または実質的に変えることなく、ポリペプチドの野生型配列から変わり得る残基である。「必須」アミノ酸残基は、ポリペプチドの野生型配列から変わると、ポリペプチドの必須の生物学的または生化学的な活性を消失するか、または実質的に消失する残基である。
【０１２５】
「保存アミノ酸の置換」は、アミノ酸残基が、類似の側鎖を有するアミノ酸残基で置き換えられているものである。類似の側鎖を有するアミノ酸残基のファミリーは、当技術分野で定義されている。これらのファミリーには、塩基性側鎖を有するアミノ酸（例えば、Ｋ、Ｒ、Ｈ）、酸性側鎖を有するアミノ酸（例えば、Ｄ、Ｅ）、無電荷極性側鎖を有するアミノ酸（例えば、Ｇ、Ｎ、Ｑ、Ｓ、Ｔ、Ｙ、Ｃ）、非極性側鎖を有するアミノ酸（例えば、Ａ、Ｖ、Ｌ、Ｉ、Ｐ、Ｆ、Ｍ、Ｗ）、ベータ−分岐側鎖を有するアミノ酸（例えば、Ｔ、Ｖ、Ｉ）および芳香族側鎖を有するアミノ酸（例えば、Ｙ、Ｆ、Ｗ、Ｈ）が含まれる。したがって、例えばポリペプチドにおいて予測される非必須アミノ酸残基は、同じ側鎖ファミリーの別のアミノ酸残基で置き換えられる。許容される置換の他の例は、等比体積的考察に基づく置換であるか（例えばメチオニンについてはノルロイシン）、または他の特性に基づく置換である（例えばフェニルアラニンについては２−チエニルアラニン、またはトリプトファンについては６−Ｃｌ−トリプトファン）。
【０１２６】
用語「キャッピング基」は、主題であるペプチド模倣大環状分子のポリペプチド鎖のカルボキシ末端またはアミノ末端のいずれかに存在する化学的部分を指す。カルボキシ末端のキャッピング基には、非修飾カルボン酸（すなわち−ＣＯＯＨ）または置換基を有するカルボン酸が含まれる。例えば、カルボキシ末端は、アミノ基で置換されると、Ｃ末端にカルボキサミドをもたらすことができる。様々な置換基には、第一級アミンおよびペグ化第二級アミンを含めた第二級アミンが含まれるが、それらに限定されない。Ｃ末端の代表的な第二級アミンキャッピング基には、
【化３８】
2018516844.tif 000040
が含まれる。
【０１２７】
アミノ末端のキャッピング基には、非修飾アミン（すなわち−ＮＨ２）または置換基を有するアミンが含まれる。例えば、アミノ末端は、アシル基で置換されると、Ｎ末端にカルボキサミドをもたらすことができる。様々な置換基には、Ｃ１〜Ｃ６カルボニル、Ｃ７〜Ｃ３０カルボニル、およびペグ化カルバメートを含めた置換アシル基が含まれるが、それらに限定されない。Ｎ末端の代表的なキャッピング基には、４−ＦＢｚｌ（４−フルオロ−ベンジル）および以下：
【化３９】
2018516844.tif 000041
【化４０】
2018516844.tif 000042
が含まれるが、それらに限定されない。
【０１２８】
大環状分子または大環状分子を形成するリンカーと共に本明細書で使用される用語「員」は、大環状分子を形成するか、または形成することができる原子を指し、置換基または側鎖原子を除外する。水素またはフルオロ置換基またはメチル側鎖は、大環状分子の形成には関与しないので、シクロデカン、１，２−ジフルオロ−デカンおよび１，３−ジメチルシクロデカンは、すべて類似性によって１０員の大環状分子とみなされる。
【０１２９】
記号
【化４１】
2018516844.tif 000043
は、分子構造の一部として使用される場合、単結合、またはトランスもしくはシス二重結合を指す。
【０１３０】
用語「アミノ酸側鎖」は、アミノ酸のα−炭素（または別の骨格原子）に結合している部分を指す。例えば、アラニンのアミノ酸側鎖は、メチルであり、フェニルアラニンのアミノ酸側鎖は、フェニルメチルであり、システインのアミノ酸側鎖は、チオメチルであり、アスパラギン酸のアミノ酸側鎖は、カルボキシメチルであり、チロシンのアミノ酸側鎖は、４−ヒドロキシフェニルメチルである等である。また、他の天然に存在しないアミノ酸の側鎖、例えば天然に存在するもの（例えばアミノ酸代謝産物）または合成により作製されたもの（例えばα，α二置換アミノ酸）が含まれる。
【０１３１】
用語「α，α二置換アミノ」酸は、２つの天然または非天然アミノ酸側鎖に結合している炭素（α−炭素）に結合したアミノ基とカルボキシル基の両方を含有する分子または部分を指す。
【０１３２】
用語「ポリペプチド」は、共有結合（例えば、アミド結合）によって連結した２つまたはそれを超える数の天然に存在するまたは天然に存在しないアミノ酸を包含する。本明細書に記載のポリペプチドには、全長タンパク質（例えば完全にプロセシングされたタンパク質）ならびにより短いアミノ酸配列（例えば、天然に存在するタンパク質の断片または合成ポリペプチドの断片）が含まれる。
【０１３３】
用語「第１のＣ末端アミノ酸」は、Ｃ末端に最も近接しているアミノ酸を指す。用語「第２のＣ末端アミノ酸」は、第１のＣ末端アミノ酸のＮ末端に結合しているアミノ酸を指す。
【０１３４】
本明細書で使用される用語「大環状化試薬」または「大環状分子形成試薬」は、２つの反応基間の反応を媒介することによってペプチド模倣大環状分子を調製するために使用され得る任意の試薬を指す。反応基は、例えばアジドおよびアルキンであってよく、その場合、大環状化試薬には、それらに限定されるものではないが、Ｃｕ試薬、例えば反応性Ｃｕ（Ｉ）種をもたらす試薬、例えばＣｕＢｒ、ＣｕＩまたはＣｕＯＴｆ、ならびに還元剤、例えばアスコルビン酸またはアスコルビン酸ナトリウムを添加することによって活性なＣｕ（Ｉ）試薬にｉｎ  ｓｉｔｕで変換することができるＣｕ（ＩＩ）塩、例えばＣｕ（ＣＯ２ＣＨ３）２、ＣｕＳＯ４、およびＣｕＣｌ２が含まれる。大環状化試薬には、さらに、例えば当技術分野で公知のＲｕ試薬、例えばＣｐ＊ＲｕＣｌ（ＰＰｈ３）２、［Ｃｐ＊ＲｕＣｌ］４または反応性Ｒｕ（ＩＩ）種をもたらすことができる他のＲｕ試薬が含まれ得る。他の場合には、反応基は、末端オレフィンである。このような実施形態では、大環状化試薬または大環状分子形成試薬は、それらに限定されるものではないが、安定化された後期遷移金属カルベン錯体触媒、例えばＶＩＩＩ群の遷移金属カルベン触媒を含めたメタセシス触媒である。例えば、このような触媒は、＋２酸化状態、電子計数１６を有し、五配位されているＲｕおよびＯｓ金属中心である。他の例では、触媒は、ＷまたはＭｏ中心を有する。様々な触媒が、Grubbsら、「Ring  Closing  Metathesis  and  Related  Processes  in  Organic  Synthesis」Acc.  Chem.  Res.  １９９５年、２８巻、４４６〜４５２頁、米国特許第５，８１１，５１５号；米国特許第７，９３２，３９７号；米国特許出願第２０１１／００６５９１５号；米国特許出願第２０１１／０２４５４７７号；Yuら、「Synthesis  of  Macrocyclic  Natural  Products  by  Catalyst-Controlled  Stereoselective  Ring-Closing  Metathesis」、Nature  ２０１１年、４７９巻、８８頁；およびPeryshkovら、「Z-Selective  Olefin  Metathesis  Reactions  Promoted  by  Tungsten  Oxo  Alkylidene  Complexes」、J.  Am.  Chem.  Soc.  ２０１１年、１３３巻、２０７５４頁に開示されている。さらに他の場合には、反応基は、チオール基である。このような実施形態では、大環状化試薬は、例えば２つのチオール反応基、例えばハロゲン基で官能化されているリンカーである。いくつかの例では、大環状化試薬には、パラジウム試薬、例えばＰｄ（ＰＰｈ３）４、Ｐｄ（ＰＰｈ３）２Ｃｌ２、Ｐｄ（ｄｐｐｅ）Ｃｌ、Ｐｄ（ｄｐｐｐ）Ｃｌ２、およびＰｄ（ｄｐｐｆ）Ｃｌ２が含まれる。
【０１３５】
用語「ハロ」または「ハロゲン」は、フッ素、塩素、臭素もしくはヨウ素、またはそれらのラジカルを指す。
【０１３６】
用語「アルキル」は、指示数の炭素原子を含有する直鎖または分岐鎖である炭化水素鎖を指す。例えば、Ｃ１〜Ｃ１０は、その基が１〜１０個（両端を含む）の炭素原子を有することを示す。「アルキル」は、任意の数が指定されない場合、１〜２０個（両端を含む）の炭素原子を有する鎖（直鎖または分岐鎖）である。
【０１３７】
用語「アルキレン」は、二価のアルキル（すなわち−Ｒ−）を指す。
【０１３８】
用語「アルケニル」は、１つまたは複数の炭素−炭素二重結合を有する直鎖または分岐鎖である炭化水素鎖を指す。アルケニル部分は、指示数の炭素原子を含有する。例えば、Ｃ２〜Ｃ１０は、その基が２〜１０個（両端を含む）の炭素原子を有することを示す。用語「低級アルケニル」は、Ｃ２〜Ｃ６アルケニル鎖を指す。「アルケニル」は、任意の数が指定されない場合、２〜２０個（両端を含む）の炭素原子を有する鎖（直鎖または分岐鎖）である。
【０１３９】
用語「アルキニル」は、１つまたは複数の炭素−炭素三重結合を有する直鎖または分岐鎖である炭化水素鎖を指す。アルキニル部分は、指示数の炭素原子を含有する。例えば、Ｃ２〜Ｃ１０は、その基が２〜１０個（両端を含む）の炭素原子を有することを示す。用語「低級アルキニル」は、Ｃ２〜Ｃ６アルキニル鎖を指す。「アルキニル」は、任意の数が指定されない場合、２〜２０個（両端を含む）の炭素原子を有する鎖（直鎖または分岐鎖）である。
【０１４０】
用語「アリール」は、６個の炭素の単環式または１０個の炭素の二環式芳香族環系を指し、ここで各環の０、１、２、３、または４個の原子は、置換基によって置換されている。アリール基の例として、フェニル、ナフチル等が挙げられる。用語「アリールアルコキシ」は、アリールで置換されているアルコキシを指す。
【０１４１】
「アリールアルキル」は、アリール基の水素原子の１つが、上で定義のＣ１〜Ｃ５アルキル基で置き換えられている、上で定義のアリール基を指す。アリールアルキル基の代表例として、２−メチルフェニル、３−メチルフェニル、４−メチルフェニル、２−エチルフェニル、３−エチルフェニル、４−エチルフェニル、２−プロピルフェニル、３−プロピルフェニル、４−プロピルフェニル、２−ブチルフェニル、３−ブチルフェニル、４−ブチルフェニル、２−ペンチルフェニル、３−ペンチルフェニル、４−ペンチルフェニル、２−イソプロピルフェニル、３−イソプロピルフェニル、４−イソプロピルフェニル、２−イソブチルフェニル、３−イソブチルフェニル、４−イソブチルフェニル、２−ｓｅｃ−ブチルフェニル、３−ｓｅｃ−ブチルフェニル、４−ｓｅｃ−ブチルフェニル、２−ｔ−ブチルフェニル、３−ｔ−ブチルフェニルおよび４−ｔ−ブチルフェニルが挙げられるが、それらに限定されない。
【０１４２】
「アリールアミド」は、アリール基の水素原子の１つが、１つまたは複数の−Ｃ（Ｏ）ＮＨ２基で置き換えられている、上で定義のアリール基を指す。アリールアミド基の代表例として、２−Ｃ（Ｏ）ＮＨ２−フェニル、３−Ｃ（Ｏ）ＮＨ２−フェニル、４−Ｃ（Ｏ）ＮＨ２−フェニル、２−Ｃ（Ｏ）ＮＨ２−ピリジル、３−Ｃ（Ｏ）ＮＨ２−ピリジル、および４−Ｃ（Ｏ）ＮＨ２−ピリジルが挙げられる。
【０１４３】
「アルキル複素環」は、Ｃ１〜Ｃ５アルキル基の水素原子の１つが、複素環で置き換えられている、上で定義のＣ１〜Ｃ５アルキル基を指す。アルキル複素環基の代表例として、−ＣＨ２ＣＨ２−モルホリン、−ＣＨ２ＣＨ２−ピペリジン、−ＣＨ２ＣＨ２ＣＨ２−モルホリン、および−ＣＨ２ＣＨ２ＣＨ２−イミダゾールが挙げられるが、それらに限定されない。
【０１４４】
「アルキルアミド」は、Ｃ１〜Ｃ５アルキル基の水素原子の１つが、−Ｃ（Ｏ）ＮＨ２基で置き換えられている、上で定義のＣ１〜Ｃ５アルキル基を指す。アルキルアミド基の代表例として、−ＣＨ２−Ｃ（Ｏ）ＮＨ２、−ＣＨ２ＣＨ２−Ｃ（Ｏ）ＮＨ２、−ＣＨ２ＣＨ２ＣＨ２Ｃ（Ｏ）ＮＨ２、−ＣＨ２ＣＨ２ＣＨ２ＣＨ２Ｃ（Ｏ）ＮＨ２、−ＣＨ２ＣＨ２ＣＨ２ＣＨ２ＣＨ２Ｃ（Ｏ）ＮＨ２、−ＣＨ２ＣＨ（Ｃ（Ｏ）ＮＨ２）ＣＨ３、−ＣＨ２ＣＨ（Ｃ（Ｏ）ＮＨ２）ＣＨ２ＣＨ３、−ＣＨ（Ｃ（Ｏ）ＮＨ２）ＣＨ２ＣＨ３、−Ｃ（ＣＨ３）２ＣＨ２Ｃ（Ｏ）ＮＨ２、−ＣＨ２−ＣＨ２−ＮＨ−Ｃ（Ｏ）−ＣＨ３、−ＣＨ２−ＣＨ２−ＮＨ−Ｃ（Ｏ）−ＣＨ３−ＣＨ３、および−ＣＨ２−ＣＨ２−ＮＨ−Ｃ（Ｏ）−ＣＨ＝ＣＨ２が挙げられるが、それらに限定されない。
【０１４５】
「アルカノール」は、Ｃ１〜Ｃ５アルキル基の水素原子の１つが、ヒドロキシル基で置き換えられている、上で定義のＣ１〜Ｃ５アルキル基を指す。アルカノール基の代表例として、−ＣＨ２ＯＨ、−ＣＨ２ＣＨ２ＯＨ、−ＣＨ２ＣＨ２ＣＨ２ＯＨ、−ＣＨ２ＣＨ２ＣＨ２ＣＨ２ＯＨ、−ＣＨ２ＣＨ２ＣＨ２ＣＨ２ＣＨ２ＯＨ、−ＣＨ２ＣＨ（ＯＨ）ＣＨ３、−ＣＨ２ＣＨ（ＯＨ）ＣＨ２ＣＨ３、−ＣＨ（ＯＨ）ＣＨ３および−Ｃ（ＣＨ３）２ＣＨ２ＯＨが挙げられるが、それらに限定されない。
【０１４６】
「アルキルカルボキシ」は、Ｃ１〜Ｃ５アルキル基の水素原子の１つが、−−ＣＯＯＨ基で置き換えられている、上で定義のＣ１〜Ｃ５アルキル基を指す。アルキルカルボキシ基の代表例として、−ＣＨ２ＣＯＯＨ、−ＣＨ２ＣＨ２ＣＯＯＨ、−ＣＨ２ＣＨ２ＣＨ２ＣＯＯＨ、−ＣＨ２ＣＨ２ＣＨ２ＣＨ２ＣＯＯＨ、−ＣＨ２ＣＨ（ＣＯＯＨ）ＣＨ３、−ＣＨ２ＣＨ２ＣＨ２ＣＨ２ＣＨ２ＣＯＯＨ、−ＣＨ２ＣＨ（ＣＯＯＨ）ＣＨ２ＣＨ３、−ＣＨ（ＣＯＯＨ）ＣＨ２ＣＨ３および−Ｃ（ＣＨ３）２ＣＨ２ＣＯＯＨが挙げられるが、それらに限定されない。
【０１４７】
本明細書で用いられる用語「シクロアルキル」は、３〜１２個の炭素、好ましくは３〜８個の炭素、より好ましくは３〜６個の炭素を有する飽和および部分的に不飽和の環式炭化水素基を含み、ここでシクロアルキル基は、任意選択でさらに置換されている。いくつかのシクロアルキル基には、シクロプロピル、シクロブチル、シクロペンチル、シクロペンテニル、シクロヘキシル、シクロヘキセニル、シクロヘプチル、およびシクロオクチルが含まれるが、それらに限定されない。
【０１４８】
用語「ヘテロアリール」は、単環式の場合は１〜３個のヘテロ原子を有し、二環式の場合は１〜６個のヘテロ原子を有し、または三環式の場合は１〜９個のヘテロ原子を有する、芳香族の５〜８員の単環式、８〜１２員の二環式、または１１〜１４員の三環式環系を指し、前記ヘテロ原子は、Ｏ、Ｎ、またはＳから選択され（例えば、炭素原子およびそれぞれ単環式、二環式または三環式の場合には、Ｏ、ＮまたはＳの１〜３個、１〜６個または１〜９個のヘテロ原子）、各環の０、１、２、３、または４個の原子は、置換基によって置換されている。ヘテロアリール基の例として、ピリジル、フリルまたはフラニル、イミダゾリル、ベンズイミダゾリル、ピリミジニル、チオフェニルまたはチエニル、キノリニル、インドリル、チアゾリル等が挙げられる。
【０１４９】
用語「ヘテロアリールアルキル」または用語「ヘテロアラルキル」は、ヘテロアリールで置換されているアルキルを指す。用語「ヘテロアリールアルコキシ」は、ヘテロアリールで置換されているアルコキシを指す。
【０１５０】
用語「ヘテロアリールアルキル」または用語「ヘテロアラルキル」は、ヘテロアリールで置換されているアルキルを指す。用語「ヘテロアリールアルコキシ」は、ヘテロアリールで置換されているアルコキシを指す。
【０１５１】
用語「ヘテロシクリル」は、単環式の場合は１〜３個のヘテロ原子を有し、二環式の場合は１〜６個のヘテロ原子を有し、または三環式の場合は１〜９個のヘテロ原子を有する、非芳香族の５〜８員の単環式、８〜１２員の二環式、または１１〜１４員の三環式環系を指し、前記ヘテロ原子は、Ｏ、Ｎ、またはＳから選択され（例えば、炭素原子およびそれぞれ単環式、二環式または三環式の場合には、Ｏ、ＮまたはＳの１〜３個、１〜６個または１〜９個のヘテロ原子）、各環の０、１、２または３個の原子は、置換基によって置換されている。ヘテロシクリル基の例として、ピペラジニル、ピロリジニル、ジオキサニル、モルホリニル、テトラヒドロフラニル等が挙げられる。
【０１５２】
用語「置換基」は、任意の分子、化合物または部分上の第２の原子または基、例えば水素原子を置き換える基を指す。適切な置換基には、ハロ、ヒドロキシ、メルカプト、オキソ、ニトロ、ハロアルキル、アルキル、アルカリール、アリール、アラルキル、アルコキシ、チオアルコキシ、アリールオキシ、アミノ、アルコキシカルボニル、アミド、カルボキシ、アルカンスルホニル、アルキルカルボニル、およびシアノ基が含まれるが、それらに限定されない。
【０１５３】
一部の実施形態では、本明細書に開示の化合物は、１つまたは複数の不斉中心を含有し、したがってラセミ体およびラセミ混合物、単一エナンチオマー、個々のジアステレオマーおよびジアステレオマー混合物として生じる。別段明確に提示されない限り、これらの化合物のこのようなすべての異性体形態が含まれる。また一部の実施形態では、本明細書に開示の化合物は、複数の互変異性体の形態で表され、このような場合、化合物には、本明細書に記載の化合物のすべての互変異性体の形態が含まれる（例えば、環系のアルキル化が、複数部位においてアルキル化をもたらす場合、本開示は、このようなすべての反応生成物を含む）。別段明確に提示されない限り、このような化合物のこのようなすべての異性体形態が含まれる。別段明確に提示されない限り、本明細書に記載の化合物のすべての結晶形が含まれる。
【０１５４】
本明細書で使用される用語「増加」および「低減」は、それぞれ、少なくとも５％の統計的に有意な（すなわちｐ＜０．１）増加または低減を引き起こすことを意味する。
【０１５５】
本明細書で使用される、変数に関する数値範囲の記載は、その変数が、その範囲内の値のいずれかと等しいことを伝えるものである。したがって、本質的に別々の変数に関して、その変数は、範囲の終点を含めた数値範囲内の任意の整数値に等しい。同様に、本質的に連続している変数に関して、その変数は、範囲の終点を含めた数値範囲内の任意の真の値に等しい。一例として、限定されるものではないが、０と２の間の値を有すると記載される変数は、その変数が本質的に別々である場合には、０、１または２の値をとり、変数が本質的に連続している場合には、０．０、０．１、０．０１、０．００１の値もしくは≧０および≦２の任意の他の真の値をとる。
【０１５６】
別段具体的に示されない限り、本明細書で使用される「または」という用語は、「および／または」の包括的な意味で使用され、「いずれか／または」の排他的意味では使用されない。
【０１５７】
用語「平均で」は、データ点ごとに少なくとも３つの独立な反復を実施することから得られた平均値を表す。
【０１５８】
用語「生物活性」は、大環状分子の構造的および機能的特性を包含する。生物活性は、例えば構造的安定性、アルファ−ヘリシティ、標的に対する親和性、タンパク分解による分解に対する抵抗性、細胞透過性、細胞内安定性、ｉｎ  ｖｉｖｏ安定性、またはそれらの任意の組合せである。
【０１５９】
用語「結合親和性」は、例えばペプチド模倣大環状分子と標的の間の結合相互作用の強度を指す。結合親和性は、例えば平衡解離定数（「ＫＤ」）として表すことができ、この定数は、濃度の尺度である単位（例えばＭ、ｍＭ、μＭ、ｎＭ等）で表される。数的には、結合親和性およびＫＤ値は反比例し、したがって、より低い結合親和性は、より高いＫＤ値に相当し、より高い結合親和性は、より低いＫＤ値に相当する。高い結合親和性が望ましい場合、「改善された」結合親和性は、より高い結合親和性を指し、したがってより低いＫＤ値を指す。
【０１６０】
用語「ｉｎ  ｖｉｔｒｏ有効性」は、ペプチド模倣大環状分子などの試験化合物が、ｉｎ  ｖｉｔｒｏ試験系またはアッセイにおいて有益な結果をもたらす程度を指す。ｉｎ  ｖｉｔｒｏ有効性は、例えば、試験系において最大効果の５０％をもたらす試験化合物の濃度を表す「ＩＣ５０」または「ＥＣ５０」値として測定され得る。
【０１６１】
用語「ｉｎ  ｖｉｔｒｏ有効性の比」または「ｉｎ  ｖｉｔｒｏ有効率」は、第１のアッセイ（分子）対第２のアッセイ（分母）から得られたＩＣ５０またはＥＣ５０値の比を指す。結果的に、アッセイ１対アッセイ２の改善されたｉｎ  ｖｉｔｒｏ有効率は、ＩＣ５０（アッセイ１）／ＩＣ５０（アッセイ２）または、あるいはＥＣ５０（アッセイ１）／ＥＣ５０（アッセイ２）として表される比に関するより低い値を指す。またこの概念は、アッセイ１対アッセイ２において「改善された選択性」と特徴付けることができ、標的１に関するＩＣ５０もしくはＥＣ５０値の低下、または標的２に関するＩＣ５０もしくはＥＣ５０値の増大のいずれかに起因し得る。
【０１６２】
用語「液性がん」は、本明細書で使用される場合、体液、例えば血液、リンパおよび骨髄中に存在するがん細胞を指す。液性がんには、白血病、骨髄腫、骨髄異形成症候群（ＭＤＳ）、および液性リンパ腫が含まれる。例えば、液性がんは、急性骨髄性白血病（ＡＭＬ）であり得る。液性リンパ腫には、嚢胞または液体領域を含有するリンパ腫が含まれる。液性がんは、本明細書で使用される場合、固形腫瘍、例えば肉腫および癌、または嚢胞もしくは液体領域を含有しない固形リンパ腫が含まれない。
【０１６３】
用語「有害事象」（ＡＥ）は、本明細書で使用される場合、被験薬の投与と時間的に関連しているか否かに関わらず、および被験薬と関係するとみなされるか否かに関わらず、臨床研究の任意の相で生じる身体的徴候、症状、および／または臨床検査値の変化によって示される、解剖学的、生理学的、または代謝的機能の任意の有害な、病理学的な、または意図されない変化を含む。この定義には、既存の病状もしくは事象の増悪、介在性疾病、過敏反応、薬物相互作用、または臨床的に有意な臨床検査所見が含まれる。ＡＥには、以下は含まれない。（ｉ）医学的または外科的手技、例えば抜歯、輸血、外科手術（その手技に至る病状は、ＡＥとして記録されるべきである）、（ｉｉ）研究の開始時に存在していたまたは検出された、悪化しない既存の状態または手技、（ｉｉｉ）待機的外科手術または有害な医学的事象が生じていない他の状況のための入院、（ｉｖ）治験責任医師に従って臨床的に有意でない場合を除き、介入が必要となる、または研究薬物投与の遅延、中断もしくは変更をもたらす異常臨床検査値、（ｖ）徴候／症状が伴わない、過量の研究薬物または併用医薬（徴候／症状が生じる場合、最終的な診断は、ＡＥとして記録されるべきである）、（ｖｉ）妊娠中に合併症が生じて入院に至らない限り、妊娠それ自体（この場合、入院に至る病状は、ＡＥとして記録されるべきである）、および（ｖｉｉ）この研究において有効性パラメーターとして捕捉され、したがってＡＥとしては記録されない、調査中の疾患の重大な悪化。
【０１６４】
重篤な有害事象（ＳＡＥ）という用語は、本明細書で使用される場合は、以下の結果のいずれかをもたらす有害事象を指す。（ｉ）死亡、（ｉｉ）生命を危うくする有害な経験（すなわち事象が生じた場合、その事象による差し迫った死亡の危険性。この事象には、より重篤な形態で生じ、死亡を引き起こしたかもしれない有害事象は含まれない）、（ｉｉｉ）持続的なまたは重大な障害／無能力（disability/incapacitation）、（ｉｖ）入院または現在の入院の延長、および（ｖ）先天性異常／出生時欠損。死亡をもたらさず、生命を危うくせず、または入院を必要とし得ない重要な医学的事象は、医学的判断に基づいて、それらが患者を危険に曝すおそれがあるか、またはこの定義において列挙された結果の１つを防止するために医学的もしくは外科的介入を必要とし得る場合、重篤であるとみなされ得る。基礎疾患に起因する入院は、研究薬物との因果関係が疑われる理由がない限り、ＳＡＥとして記録されない。
【０１６５】
ＡＥまたは疑わしい有害反応は、ペプチド模倣大環状分子の治験薬概要書（Investigator’s  Brochure）に列挙されていないか、または観測された特異性もしくは重症度に列挙されていないか、またはプロトコルなどに記載の危険性情報と一致しない場合、「予期されない」とみなされる（予期されない有害事象（ＵＡＥ）と呼ばれる。例えば、この定義によれば、治験薬概要書に、肝酵素の上昇または肝炎だけが言及されている場合、肝臓壊死は予期されないものとなり得る（重症度がより高いことによる）。同様に、治験薬概要書に、脳血管事故だけが列挙されている場合、脳血栓塞栓症および脳血管炎は予期されないものとなり得る（特異性がより高いことによる）。またこの定義で使用される「予期されない」は、治験薬概要書において、あるクラスの薬物により生じるものとして、またはペプチド模倣大環状分子の薬理学的特性から予期されるものとして言及されているが、ペプチド模倣大環状分子により生じるものとして具体的に言及されていないＡＥまたは疑わしい有害反応を指す。
【０１６６】
「用量制限毒性」（ＤＬＴ）は、本明細書で使用される場合、おそらく、ほぼ確実に、または確実に研究薬物に関係するとみなされる、任意の非血液学的グレード≧３のＡＥと定義されるが、以下は除外される。（１）疲労、悪心、嘔吐、下痢または粘膜炎（完全非経口栄養（ＴＰＮ）または入院を要するすべてのグレード４および任意のグレード３のＡＥは、ＤＬＴとみなされる）、（２）電解質不均衡（２４時間以内に矯正に応答しないグレード≧３のＡＥだけは、ＤＬＴとみなされる）、（３）輸注反応（入院を引き起こしたグレード３の反応またはグレード４だけは、ＤＬＴとみなされる）、（４）任意のグレードの脱毛症、（５）研究薬物に明らかに無関係であると決定され得る（例えば、疾患の進行だけに関係する）任意の事象。またＤＬＴは、ｉ）ＡＮＣが、活動性白血病または脊髄形成異常症がない状態で治療を開始して４２日以内に、＞０．５Ｇｉ／Ｌまで回復しない場合、およびｉｉ）血小板数が、活動性白血病または脊髄形成異常症がない状態で、治療を開始して４２日以内に＞２０，０００まで回復しないか、または赤血球もしくは血小板の輸血を必要とする臨床的に有意な出血と関連している場合を含む。さらに、特異的な血液学的ＤＬＴは、
（ｉ）血小板減少症−任意の期間のグレード４、≧７日のグレード３、または臨床的に有意な出血と関連しているグレード３、
（ｉｉ）好中球減少症−≧３日のグレード４、または任意のグレード≧３の発熱性好中球減少症
と定義付けられる。
【０１６７】
先の判定基準を使用して、治験の全期間にわたる用量の低減、中断または中止に関する決定を個々の患者に対して行うことができるが、サイクル１中に生じたＤＬＴは、用量漸増を決定するための安全性および忍容性評価を知らせるために使用される。ＤＬＴを評価可能な集団は、処置の最初のサイクル中、ＤＬＴを経験する第１相用量漸増のあらゆる患者を含む。
【０１６８】
「最大耐用量」（ＭＴＤ）は、本明細書で使用される場合、６人の患者のうち≦１人が、ＤＬＴと評する処置関連毒性を経験する用量と定義され、２番めに多い用量は、６人までの患者のうち≧２人がＤＬＴを経験する用量である。ＭＴＤは、コホートに登録したすべての患者が、サイクル１を完了したか、処置を中止したか、または用量を低減したときまで、確立することはできない。既に確立されている用量レベルの忍容性は、ＤＬＴが後のサイクルで観測される場合に、再評価されることになる。
【０１６９】
用語「被験体」または「患者」は、哺乳動物および非哺乳動物を包含する。哺乳動物の例として、ヒト；非ヒト霊長類、例えばチンパンジー、ならびに他の類人猿およびサル種；家畜動物、例えばウシ、ウマ、ヒツジ、ヤギ、ブタ；飼育動物、例えばウサギ、イヌ、およびネコ；げっ歯類、例えばラット、マウスおよびモルモット等を含む実験動物が挙げられるが、それらに限定されない。非哺乳動物の例として、鳥、魚等が挙げられるが、それらに限定されない。本明細書で提供される方法および組成物の一実施形態では、哺乳動物はヒトである。
【０１７０】
本発明の１つまたは複数の特定の実施形態の詳細を、添付の図および以下の説明に記載する。本発明の他の特徴、目的および利点は、説明および図、ならびに特許請求の範囲から明らかである。
【０１７１】
概要
一態様では、本開示は、被験体においてｐ５３非活性化変異が欠如していると決定された液性がんを処置する方法が提供される。該方法は、被験体に、治療有効量のペプチド模倣大環状分子または薬学的に許容されるその塩を投与するステップを含み、該ペプチド模倣大環状分子は、ＭＤＭ２タンパク質および／またはＭＤＭＸタンパク質に結合する。一部の実施形態では、ペプチド模倣大環状分子は、ｐ５３とＭＤＭ２およびＭＤＭＸとの間の相互作用を妨害する。
【０１７２】
別の態様では、本開示は、野生型ｐ５３を発現する被験体における液性がんを処置する方法を提供する。該方法は、被験体に、治療有効量のペプチド模倣大環状分子または薬学的に許容されるその塩を投与するステップを含み、該ペプチド模倣大環状分子は、ＭＤＭ２タンパク質および／またはＭＤＭＸタンパク質に結合する。一部の実施形態では、ペプチド模倣大環状分子は、ｐ５３とＭＤＭ２およびＭＤＭＸとの間の相互作用を妨害する。
【０１７３】
一部の実施形態では、本明細書で提供される方法に従って処置される被験体は、ｐ５３非活性化変異が欠如している、かつ／または野生型ｐ５３を発現する液性がんを有しているか、または有していると診断されたヒトである。一部の実施形態では、本明細書で提供される方法に従って液性がんを処置される被験体は、ｐ５３非活性化変異が欠如している、かつ／または野生型ｐ５３を発現する液性がんの素因があるか、または罹患しやすいヒトである。一部の実施形態では、本明細書で提供される方法に従って液性がんを処置される被験体は、ｐ５３非活性化変異が欠如している、かつ／または野生型ｐ５３を発現する液性がんを発症する危険性があるヒトである。いくつかの例において、ｐ５３非活性化変異は、ｐ５３タンパク質のＤＮＡ結合ドメインの変異であり得る。いくつかの例では、ｐ５３非活性化変異は、ミスセンス変異であり得る。様々な例において、液性がんは、残基Ｒ１７５、Ｇ２４５、Ｒ２４８、Ｒ２４９、Ｒ２７３、およびＲ２８２の１つまたは複数における変異から選択される１つまたは複数のｐ５３非活性化変異が欠如していると決定され得る。液性がんにおけるｐ５３非活性化変異の欠如および／または野生型ｐ５３の存在は、当技術分野で公知の任意の適切な方法によって、例えば配列決定、アレイベースの試験、ＲＮＡ分析およびＰＣＲのような増幅方法によって決定され得る。
【０１７４】
ある特定の実施形態では、ヒト被験体は、当技術分野で公知の液性がんの１つまたは複数の他の標準処置に対して難治性および／または不耐性である。一部の実施形態では、ヒト被験体は、液性がんの少なくとも１つの過去の処置および／または治療が不成功に終わっている。
【０１７５】
一部の実施形態では、本明細書で提供される液性がんを処置する方法は、液性がんと関連する液性がん細胞を、阻害、低減、減少、抑止、または安定化する。一部の実施形態では、本明細書で提供される液性がんを処置する方法は、液性がんまたはその１つもしくは複数の症状と関連する液性がん細胞の血流、代謝、または浮腫を、阻害、低減、減少、抑止、または安定化する。一部の実施形態では、本明細書で提供される液性がんを処置する方法は、液性がん細胞の（od）数、または液性がん細胞の代謝、および／または液性がんと関連する１つもしくは複数の症状の退行を引き起こす。一部の実施形態では、本明細書で提供される液性がんを処置する方法は、ＣＴＣおよび／またはＭＮＢＣの数を維持し、したがってＣＴＣおよび／またはＭＮＢＣの数は、当業者に利用可能な従来の方法、例えば超音波、ＣＴスキャン、ＭＲＩ、ダイナミック造影ＭＲＩ、またはＰＥＴスキャンによって測定して増大しないか、または標準治療の投与後のＣＴＣおよび／もしくはＭＮＢＣの数の増大ほど増大しない。特定の実施形態では、本明細書で提供される液性がんを処置する方法は、液性がん細胞の数を低減する。一部の実施形態では、本明細書で提供される液性がんを処置する方法は、ＣＴＣおよび／またはＭＮＢＣの形成を低減する。ある特定の実施形態では、本明細書で提供される液性がんを処置する方法は、液性がんと関連する原発性、局所性および／または転移性液性がん細胞を、根絶、除去、または調節する。一部の実施形態では、本明細書で提供される液性がんを処置する方法は、液性がんと関連する転移の数またはサイズを低減する。一部の実施形態では、本明細書で提供される液性がんを処置する方法は、処置に対して完全奏効をもたらす。一部の実施形態では、本明細書で提供される液性がんを処置する方法は、処置に対して部分奏効をもたらす。一部の実施形態では、本明細書に開示の方法によって処置される液性がんは、安定疾患である。一部の実施形態では、本明細書に開示の方法によって処置される液性がんは、進行性疾患である。
【０１７６】
本明細書で提供される方法によって処置され得る液性がん（liquid  cancer  cancers）には、白血病、骨髄腫、および液性リンパ腫が含まれるが、それらに限定されない。特定の実施形態では、記載の方法に従って処置され得る液性がんには、液性リンパ腫、白血病（lekemias）、および骨髄腫が含まれるが、それらに限定されない。記載の方法に従って処置され得る例示的な液性リンパ腫および白血病として、急性骨髄性白血病（ＡＭＬ）、骨髄異形成症候群（ＭＤＳ）、慢性リンパ球性白血病／小リンパ球性リンパ腫、Ｂ細胞前リンパ球性白血病、リンパ形質細胞性リンパ腫（例えば、ワルデンストレームマクログロブリン血症）、脾性辺縁帯リンパ腫、形質細胞骨髄腫、形質細胞腫、単クローン性免疫グロブリン沈着症、重鎖病、ｍａｌｔリンパ腫とも呼ばれる節外性辺縁帯Ｂ細胞リンパ腫、節性辺縁帯Ｂ細胞リンパ腫（ｎｍｚｌ）、濾胞性リンパ腫、マントル細胞リンパ腫、びまん性大細胞型Ｂ細胞リンパ腫、縦隔（胸腺）大細胞型Ｂ細胞リンパ腫、血管内大細胞型Ｂ細胞リンパ腫、原発性滲出性リンパ腫、バーキットリンパ腫／白血病、Ｔ細胞前リンパ球性白血病、Ｔ細胞大型顆粒リンパ球性白血病、侵攻性ＮＫ細胞白血病、成人Ｔ細胞白血病／リンパ腫、節外性ＮＫ／Ｔ細胞リンパ腫、鼻型、腸症型Ｔ細胞リンパ腫、肝脾Ｔ細胞リンパ腫、芽球性ＮＫ細胞リンパ腫、菌状息肉症／セザリー症候群、原発性皮膚ＣＤ３０陽性Ｔ細胞リンパ増殖性障害、原発性皮膚未分化大細胞リンパ腫、リンパ腫様丘疹症、血管免疫芽球性Ｔ細胞リンパ腫、末梢Ｔ細胞リンパ腫、分類不能未分化大細胞型リンパ腫（unspecified,  anaplastic  large  cell  lymphoma）、古典的ホジキンリンパ腫（結節硬化型、混合細胞型、リンパ球豊富型、リンパ球減少型または非減少型）、および結節性リンパ球優位型ホジキンリンパ腫が挙げられるが、それらに限定されない。
【０１７７】
一態様では、骨髄異形成症候群（ＭＤＳ）は、特徴的な形態学的骨髄変化、異常な血球数、一般的な細胞遺伝学的異常、および反復変異によって特徴付けられるクローン性造血幹細胞障害の異種群である。ＭＤＳは、主に高齢者において生じ得る。ＭＤＳの処置は、危険性分類に基づいて、国際予後スコアリングシステム（ＩＰＳＳ）または最も一般的な分類システムである改訂版ＩＰＳＳ（ＩＰＳＳ−Ｒ）を用いて行うことができる。低危険度のＭＤＳ患者は、支持療法または造血成長因子を受けることができる。５ｑが欠失している患者のサブセットは、レナリドミドで処置することができる。高危険度の患者は、低メチル化（hypomethylating）剤（例えば、アザシチジン、デシタビン）、集中化学療法、および／または同種幹細胞移植で処置することができる。ある場合には、ＭＤＳ患者は、ＡＭＬに変換し得る。一部のＭＤＳ患者は、進行性骨髄不全を発症するおそれがあり、かつ／または好中球減少症（例えば、感染症）もしくは血小板減少症（例えば、出血）と関係する合併症により死亡するおそれがある。ＭＤＳの初期管理は、危険性分類に基づいて行うことができる。より新しいＩＰＳＳ−Ｒは、患者を、非常に良好、良好、中程度の危険度、高危険度、および非常に高い危険度の群の５つに分類することができる。非常に良好な患者、良好な患者、および選択された中程度の危険度の患者は、「低危険度」に分類することができ、一方、高危険度、非常に高い危険度、およびある特定の中程度の危険度の患者は、「高危険度」群に分類することができる。アザシチジン（５’−アザシチジン）およびデシタビン（５’−アザ−２’−デオキシシチジン）は、共にシトシン類似体であり、ＤＮＡ−メチルトランスフェラーゼ（ＤＮＭＴ）を阻害することができ、低メチル化剤として作用することができる。
【０１７８】
別の態様では、急性骨髄性白血病（ＡＭＬ）は、造血不全が伴う骨髄性細胞の増殖および蓄積によって特徴付けられる。ＡＭＬは、化学物質への曝露、過去の化学療法および放射線、または他の環境毒素によって引き起こされ得る。
【０１７９】
液性がんの例として、例えば骨髄性、リンパ性もしくは赤血球性系統、またはそれらの前駆体細胞から生じた、造血性起源の過形成／新生物細胞を伴うがんが挙げられる。例示的な障害として、急性白血病、例えば赤芽球性白血病および急性巨核芽球性白血病が挙げられる。追加の例示的な骨髄性障害として、急性前骨髄性白血病（ＡＰＭＬ）、急性骨髄性白血病（ＡＭＬ）および慢性骨髄性白血病（ＣＭＬ）（Vaickus,  L.（１９９１年）Crit  Rev.  in  Oncol./Hemotol.  １１巻：２６７〜９７頁に総説されている）が挙げられるが、それらに限定されない。リンパ性悪性腫瘍には、Ｂ−系統ＡＬＬおよびＴ−系統ＡＬＬを含む急性リンパ芽球性白血病（acute  lymphoblastic  leukemia）（ＡＬＬ）、慢性リンパ球性白血病（ＣＬＬ）、前リンパ球性白血病（ＰＬＬ）、多発性骨髄腫（mylenoma）、有毛細胞白血病（ＨＬＬ）およびワルデンストレームマクログロブリン血症（ＷＭ）が含まれるが、それらに限定されない。悪性液性リンパ腫の追加の形態には、非ホジキンリンパ腫およびそのバリアント、末梢Ｔ細胞リンパ腫、成人Ｔ細胞白血病／リンパ腫（ＡＴＬ）、皮膚Ｔ細胞リンパ腫（ＣＴＣＬ）、大顆粒性リンパ球性白血病（ＬＧＦ）、ホジキン病およびリード−シュテルンベルク病が含まれるが、それらに限定されない。例えば、液性がんには、急性リンパ球性白血病（ＡＬＬ）、Ｔ細胞急性リンパ球性白血病（Ｔ−ＡＬＬ）、未分化大細胞型リンパ腫（ＡＬＣＬ）、慢性骨髄性白血病（ＣＭＬ）、急性骨髄性白血病（ＡＭＬ）、慢性リンパ球性白血病（ＣＬＬ）、Ｂ細胞慢性リンパ球性白血病（Ｂ−ＣＬＬ）、びまん性大細胞型Ｂ細胞リンパ腫（ＤＬＢＣＬ）、過好酸球増加症／慢性好酸球増加症、およびバーキットリンパ腫が含まれるが、それらに限定されない。
【０１８０】
いくつかの実施形態では、がんは、急性リンパ芽球性白血病、急性骨髄性白血病、ＡＩＤＳ関連がん、ＡＩＤＳ関連リンパ腫、慢性リンパ球性白血病、慢性骨髄性白血病、慢性骨髄増殖性障害、皮膚Ｔ細胞リンパ腫、ホジキンリンパ腫、多発性骨髄腫、多発性骨髄腫／形質細胞新生物、非ホジキンリンパ腫、原発性中枢神経系（ＣＮＳ）リンパ腫、またはＴ細胞リンパ腫を含む。様々な実施形態では、液性がんは、Ｂ細胞慢性リンパ球性白血病、Ｂ細胞リンパ腫−ＤＬＢＣＬ、Ｂ細胞リンパ腫−ＤＬＢＣＬ−胚中心様、Ｂ細胞リンパ腫−ＤＬＢＣＬ−活性化Ｂ細胞様、またはバーキットリンパ腫であり得る。
【０１８１】
ペプチド模倣大環状分子は、任意の架橋されたペプチド、すなわち第１のアミノ酸残基（または類似体）と第２のアミノ酸残基の間に大環状分子を形成する少なくとも１つの大環状分子を形成するリンカーを含む任意のペプチドであり得る。例えば、ペプチド模倣大環状分子は、ＭＤＭ２タンパク質および／またはＭＤＭＸタンパク質に結合することができるペプチド模倣大環状分子であり得る。一部の実施形態では、ペプチド模倣大環状分子は、式Ｉのペプチド模倣大環状分子であり得る
【化４２】
2018516844.tif 000044
（式中、
Ｘａａ３、Ｘａａ５、Ｘａａ６、Ｘａａ７、Ｘａａ８、Ｘａａ９、およびＸａａ１０のそれぞれは、個々にアミノ酸であり、Ｘａａ３、Ｘａａ５、Ｘａａ６、Ｘａａ７、Ｘａａ８、Ｘａａ９、およびＸａａ１０の少なくとも３つは、配列Ｐｈｅ３−Ｘ４−Ｈｉｓ５−Ｔｙｒ６−Ｔｒｐ７−Ａｌａ８−Ｇｌｎ９−Ｌｅｕ１０−Ｘ１１−Ｓｅｒ１２またはＰｈｅ３−Ｘ４−Ｇｌｕ５−Ｔｙｒ６−Ｔｒｐ７−Ａｌａ８−Ｇｌｎ９−Ｌｅｕ１０／Ｃｂａ１０−Ｘ１１−Ａｌａ１２の対応する位置のアミノ酸と同じアミノ酸であり、各Ｘは、アミノ酸であり、
各ＤおよびＥは、独立に、アミノ酸であり、
Ｒ１およびＲ２は、独立に、−Ｈ、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロアルキルもしくはヘテロシクロアルキルであるか（非置換であるか、またはハロ−で置換されている）、またはＲ１およびＲ２の少なくとも１つは、前記ＤもしくはＥアミノ酸の１つのアルファ位に結合している大環状分子を形成するリンカーＬ’を形成し、
各ＬまたはＬ’は、独立に、大環状分子を形成するリンカーであり、
各Ｒ５は、独立に、ハロゲン、アルキル、−ＯＲ６、−Ｎ（Ｒ６）２、−ＳＲ６、−ＳＯＲ６、−ＳＯ２Ｒ６、−ＣＯ２Ｒ６、蛍光部分、放射性同位体または治療剤であり、
各Ｒ６は、独立に、−Ｈ、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロシクロアルキル、蛍光部分、放射性同位体または治療剤であり、
Ｒ７は、−Ｈ、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキル、ヘテロアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロシクロアルキル、シクロアリールもしくはヘテロシクロアリールであるか（Ｒ５により任意選択で置換されている）、またはＤ残基を有する環式構造の一部であり、
Ｒ８は、−Ｈ、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキル、ヘテロアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロシクロアルキル、シクロアリールもしくはヘテロシクロアリールであるか（Ｒ５により任意選択で置換されている）、またはＥ残基を有する環式構造の一部であり、
ｖは、１〜１０００、例えば１〜５００、１〜２００、１〜１００、１〜５０、１〜３０、１〜２０、または１〜１０の整数であり、
ｗは、０〜１０００の整数である）。
【０１８２】
ペプチド模倣大環状分子の投与は、任意の適切な手段によって達成され得る。例えば、ペプチド模倣大環状分子は、非経口投与することができる。例えば、投与は、静脈内、動脈内、骨内注入、筋肉内、脳内、脳室内、髄腔内、または皮下であり得る。一部の実施形態では、投与は、静脈内で実施される。
【０１８３】
一部の実施形態では、本明細書に開示の方法は、さらにまたは任意選択で、ｐ５３非活性化変異が欠如していると決定された液性がんを有するか、または野生型（ＷＴ）ｐ５３タンパク質を発現する液性がんを有する被験体における、本開示のペプチド模倣大環状分子の安全性および／または忍容性を評価するステップを含む。
【０１８４】
また本明細書では、ｐ５３非活性化変異が欠如していると決定された液性がんを有するか、または野生型（ＷＴ）ｐ５３タンパク質を発現する液性がんを有する被験体における、本明細書に開示のペプチド模倣大環状分子の用量制限毒性（ＤＬＴ）および最大耐用量（ＭＴＤまたはＯＢＤ）または最適な生物学的用量（ＯＢＤ）を決定する方法が提供される。
【０１８５】
一部の実施形態では、本明細書に開示の方法は、さらにまたは任意選択で、ペプチド模倣大環状分子を被験体に単回投与および／または複数回投与した後の血中のペプチド模倣大環状分子および／またはその代謝産物の薬物動態（ＰＫ）分析を含む。
【０１８６】
一部の実施形態では、本明細書に開示の方法は、さらにまたは任意選択で、液性がん試料（骨髄吸引物を含む）における薬力学的（ＰＤ）バイオマーカー（例えば、ｐ２１、カスパーゼ、ＭＤＭ２）および血液試料における薬力学的（ＰＤ）バイオマーカー（例えば、マクロファージ阻害性サイトカイン−１［ＭＩＣ−１］）に対するペプチド模倣大環状分子の効果を研究し、これらのバイオマーカーと臨床的奏効の間で生じる可能性がある相関を評価するステップを含む。
【０１８７】
一部の実施形態では、本明細書に開示の方法は、さらにまたは任意選択で、潜在的な患者のバイオマーカー（例えば、ｐ５３ステータス、ＭＤＭ２およびＭＤＭＸ発現レベル）、これらのバイオマーカーに対するペプチド模倣大環状分子による処置の効果、およびこれらのバイオマーカーとペプチド模倣大環状分子の臨床的奏効との間で生じる可能性がある相関を評価するステップを含む。
【０１８８】
また本明細書では、ｐ５３非活性化変異が欠如している、かつ／またはＷＴ  ｐ５３を発現する特異的な液性がん型を有する被験体におけるペプチド模倣大環状分子の臨床活性を用量拡大相で評価するための方法が提供される。
化合物および組成物
ペプチド模倣大環状分子
【０１８９】
一部の実施形態では、ペプチド模倣大環状分子は、式（Ｉ）
【化４３】
2018516844.tif 000045
（式中、
各Ａ、Ｃ、およびＤは、独立に、アミノ酸であり、
各Ｂは、独立に、アミノ酸、
【化４４】
2018516844.tif 000046
、［−ＮＨ−Ｌ３−ＣＯ−］、［−ＮＨ−Ｌ３−ＳＯ２−］、または［−ＮＨ−Ｌ３−］であり、
各Ｅは、独立に、Ａｌａ（アラニン）、Ｄ−Ａｌａ（Ｄ−アラニン）、Ａｉｂ（α−アミノイソ酪酸）、Ｓａｒ（Ｎ−メチルグリシン）、およびＳｅｒ（セリン）からなる群から選択されるアミノ酸であり、
各Ｒ３は、独立に、水素、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、ヘテロアルキル、シクロアルキル、ヘテロシクロアルキル、シクロアルキルアルキル、シクロアリール、またはヘテロシクロアリールであり（Ｒ５により任意選択で置換されている）、
各Ｒ１およびＲ２は、独立に、−Ｈ、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロアルキルもしくはヘテロシクロアルキルであるか（非置換であるか、またはハロ−で置換されている）、または前記ＤもしくはＥアミノ酸の１つのアルファ位に結合している大環状分子を形成するリンカーＬ’を形成し、
各ＬおよびＬ’は、独立に、大環状分子を形成するリンカーであり、
各Ｌ３は、独立に、アルキレン、アルケニレン、アルキニレン、ヘテロアルキレン、シクロアルキレン、ヘテロシクロアルキレン、シクロアリーレン、ヘテロシクロアリーレン、または［−Ｒ４−Ｋ−Ｒ４−］ｎであり、それぞれＲ５により任意選択で置換されており、
各Ｒ４は、独立に、アルキレン、アルケニレン、アルキニレン、ヘテロアルキレン、シクロアルキレン、ヘテロシクロアルキレン、アリーレン、またはヘテロアリーレンであり、
各Ｋは、独立に、Ｏ、Ｓ、ＳＯ、ＳＯ２、ＣＯ、ＣＯ２、またはＣＯＮＲ３であり、
各Ｒ５は、独立に、ハロゲン、アルキル、−ＯＲ６、−Ｎ（Ｒ６）２、−ＳＲ６、−ＳＯＲ６、−ＳＯ２Ｒ６、−ＣＯ２Ｒ６、蛍光部分、放射性同位体または治療剤であり、
各Ｒ６は、独立に、−Ｈ、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロシクロアルキル、蛍光部分、放射性同位体または治療剤であり、
各Ｒ７は、独立に、−Ｈ、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキル、ヘテロアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロシクロアルキル、シクロアリールもしくはヘテロシクロアリールであるか（Ｒ５により任意選択で置換されている）、またはＤ残基を有する環式構造の一部であり、
各Ｒ８は、独立に、−Ｈ、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキル、ヘテロアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロシクロアルキル、シクロアリールもしくはヘテロシクロアリールであるか（Ｒ５により任意選択で置換されている）、またはＥ残基を有する環式構造の一部であり、
各ｖは、独立に、０〜１０００、例えば０〜５００、０〜２００、０〜１００、０〜５０、０〜３０、０〜２０、０〜１０、０〜５、１〜１０００、１〜５００、１〜２００、１〜１００、１〜５０、１〜３０、１〜２０、１〜１０、１〜５、３〜１０００、３〜５００、３〜２００、３〜１００、３〜５０、３〜３０、３〜２０、３〜１０、０、１、２、３、４、５、６、７、８、９、または１０の整数であり、
各ｗは、独立に、０〜１０００、例えば０〜５００、０〜２００、０〜１００、０〜５０、０〜３０、０〜２０、０〜１０、０〜５、１〜１０００、１〜５００、１〜２００、１〜１００、１〜５０、１〜３０、１〜２０、１〜１０、１〜５、３〜１０００、３〜５００、３〜２００、３〜１００、３〜５０、３〜３０、３〜２０、３〜１０、０、１、２、３、４、５、６、７、８、９、または１０の整数であり、
ｕは、１〜１０の整数であり、
各ｘ、ｙおよびｚは、独立に、０〜１０の整数であり、
各ｎは、独立に、１〜５の整数である）
を有する。
【０１９０】
一部の実施形態では、各ｖおよびｗは、独立に、１〜３０の整数である。一部の実施形態では、ｗまたはｖは、３〜１０００、例えば３〜５００、３〜２００、３〜１００、３〜５０、３〜３０、３〜２０、または３〜１０の整数である。一部の実施形態では、ｘ＋ｙ＋ｚの合計は、３または６である。一部の実施形態では、ｘ＋ｙ＋ｚの合計は、３である。他の実施形態では、ｘ＋ｙ＋ｚの合計は、６である。
【０１９１】
また、一部の実施形態では、式
【化４５】
2018516844.tif 000047
（式中、
Ｘａａ３、Ｘａａ５、Ｘａａ６、Ｘａａ７、Ｘａａ８、Ｘａａ９、およびＸａａ１０のそれぞれは、個々にアミノ酸であり、Ｘａａ３、Ｘａａ５、Ｘａａ６、Ｘａａ７、Ｘａａ８、Ｘａａ９、およびＸａａ１０の少なくとも３つは、配列Ｐｈｅ３−Ｘ４−Ｈｉｓ５−Ｔｙｒ６−Ｔｒｐ７−Ａｌａ８−Ｇｌｎ９−Ｌｅｕ１０−Ｘ１１−Ｓｅｒ１２の対応する位置のアミノ酸と同じアミノ酸であり、各Ｘは、アミノ酸であり、
各ＤおよびＥは、独立に、アミノ酸であり、
各Ｒ１およびＲ２は、独立に、−Ｈ、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロアルキルもしくはヘテロシクロアルキルであるか（非置換であるか、またはハロ−で置換されている）、またはＲ１およびＲ２の少なくとも１つは、前記ＤもしくはＥアミノ酸またはＸａａ３の１つのアルファ位に結合している大環状分子を形成するリンカーＬ’を形成し、
各ＬまたはＬ’は、独立に、大環状分子を形成するリンカーであり、
各Ｒ５は、独立に、ハロゲン、アルキル、−ＯＲ６、−Ｎ（Ｒ６）２、−ＳＲ６、−ＳＯＲ６、−ＳＯ２Ｒ６、−ＣＯ２Ｒ６、蛍光部分、放射性同位体または治療剤であり、
各Ｒ６は、独立に、−Ｈ、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロシクロアルキル、蛍光部分、放射性同位体または治療剤であり、
各Ｒ７は、独立に、−Ｈ、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキル、ヘテロアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロシクロアルキル、シクロアリールもしくはヘテロシクロアリールであるか（Ｒ５により任意選択で置換されている）、またはＤ残基を有する環式構造の一部であり、
各Ｒ８は、独立に、−Ｈ、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキル、ヘテロアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロシクロアルキル、シクロアリールもしくはヘテロシクロアリールであるか（Ｒ５により任意選択で置換されている）、またはＥ残基を有する環式構造の一部であり、
ｖは、０〜１０００、例えば０〜５００、０〜２００、０〜１００、０〜５０、０〜３０、０〜２０、０〜１０、０〜５、１〜１０００、１〜５００、１〜２００、１〜１００、１〜５０、１〜３０、１〜２０、１〜１０、１〜５、３〜１０００、３〜５００、３〜２００、３〜１００、３〜５０、３〜３０、３〜２０、３〜１０、０、１、２、３、４、５、６、７、８、９、または１０の整数であり、
ｗは、０〜１０００、例えば０〜５００、０〜２００、０〜１００、０〜５０、０〜３０、０〜２０、０〜１０、０〜５、１〜１０００、１〜５００、１〜２００、１〜１００、１〜５０、１〜３０、１〜２０、１〜１０、１〜５、３〜１０００、３〜５００、３〜２００、３〜１００、３〜５０、３〜３０、３〜２０、３〜１０、０、１、２、３、４、５、６、７、８、９、または１０の整数である）
のペプチド模倣大環状分子が提供される。
【０１９２】
一部の実施形態では、各ｖおよびｗは、独立に、１〜３０の整数である。一部の実施形態では、ｗまたはｖは、３〜１０００、例えば３〜５００、３〜２００、３〜１００、３〜５０、３〜３０、３〜２０、または３〜１０の整数である。一部の実施形態では、ｘ＋ｙ＋ｚの合計は、３または６である。一部の実施形態では、ｘ＋ｙ＋ｚの合計は、３である。他の実施形態では、ｘ＋ｙ＋ｚの合計は、６である。
【０１９３】
本明細書に記載の式のいずれかの一部の実施形態では、Ｘａａ３、Ｘａａ５、Ｘａａ６、Ｘａａ７、Ｘａａ８、Ｘａａ９、およびＸａａ１０の少なくとも３つは、配列Ｐｈｅ３−Ｘ４−Ｈｉｓ５−Ｔｙｒ６−Ｔｒｐ７−Ａｌａ８−Ｇｌｎ９−Ｌｅｕ１０−Ｘ１１−Ｓｅｒ１２の対応する位置のアミノ酸と同じアミノ酸である。他の実施形態では、Ｘａａ３、Ｘａａ５、Ｘａａ６、Ｘａａ７、Ｘａａ８、Ｘａａ９、およびＸａａ１０の少なくとも４つは、配列Ｐｈｅ３−Ｘ４−Ｈｉｓ５−Ｔｙｒ６−Ｔｒｐ７−Ａｌａ８−Ｇｌｎ９−Ｌｅｕ１０−Ｘ１１−Ｓｅｒ１２の対応する位置のアミノ酸と同じアミノ酸である。他の実施形態では、Ｘａａ３、Ｘａａ５、Ｘａａ６、Ｘａａ７、Ｘａａ８、Ｘａａ９、およびＸａａ１０の少なくとも５つは、配列Ｐｈｅ３−Ｘ４−Ｈｉｓ５−Ｔｙｒ６−Ｔｒｐ７−Ａｌａ８−Ｇｌｎ９−Ｌｅｕ１０−Ｘ１１−Ｓｅｒ１２の対応する位置のアミノ酸と同じアミノ酸である。他の実施形態では、Ｘａａ３、Ｘａａ５、Ｘａａ６、Ｘａａ７、Ｘａａ８、Ｘａａ９、およびＸａａ１０の少なくとも６つは、配列Ｐｈｅ３−Ｘ４−Ｈｉｓ５−Ｔｙｒ６−Ｔｒｐ７−Ａｌａ８−Ｇｌｎ９−Ｌｅｕ１０−Ｘ１１−Ｓｅｒ１２の対応する位置のアミノ酸と同じアミノ酸である。他の実施形態では、Ｘａａ３、Ｘａａ５、Ｘａａ６、Ｘａａ７、Ｘａａ８、Ｘａａ９、およびＸａａ１０の少なくとも７つは、配列Ｐｈｅ３−Ｘ４−Ｈｉｓ５−Ｔｙｒ６−Ｔｒｐ７−Ａｌａ８−Ｇｌｎ９−Ｌｅｕ１０−Ｘ１１−Ｓｅｒ１２の対応する位置のアミノ酸と同じアミノ酸である。
【０１９４】
一部の実施形態では、ペプチド模倣大環状分子は、式
【化４６】
2018516844.tif 000048
（式中、
Ｘａａ３、Ｘａａ５、Ｘａａ６、Ｘａａ７、Ｘａａ８、Ｘａａ９、およびＸａａ１０のそれぞれは、個々にアミノ酸であり、Ｘａａ３、Ｘａａ５、Ｘａａ６、Ｘａａ７、Ｘａａ８、Ｘａａ９、およびＸａａ１０の少なくとも３つは、配列Ｐｈｅ３−Ｘ４−Ｇｌｕ５−Ｔｙｒ６−Ｔｒｐ７−Ａｌａ８−Ｇｌｎ９−Ｌｅｕ１０／Ｃｂａ１０−Ｘ１１−Ａｌａ１２の対応する位置のアミノ酸と同じアミノ酸であり、各Ｘは、アミノ酸であり、各Ｄは、独立に、アミノ酸であり、
各Ｅは、独立に、アミノ酸、例えばＡｌａ（アラニン）、Ｄ−Ａｌａ（Ｄ−アラニン）、Ａｉｂ（α−アミノイソ酪酸）、Ｓａｒ（Ｎ−メチルグリシン）、およびＳｅｒ（セリン）から選択されるアミノ酸であり、
各Ｒ１およびＲ２は、独立に、−Ｈ、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロアルキルもしくはヘテロシクロアルキルであるか（非置換であるか、またはハロ−で置換されている）、またはＲ１およびＲ２の少なくとも１つは、前記ＤまたはＥアミノの１つのアルファ位に結合している大環状分子を形成するリンカーＬ’を形成し、
各ＬまたはＬ’は、独立に、大環状分子を形成するリンカーであり、
各Ｒ５は、独立に、ハロゲン、アルキル、−ＯＲ６、−Ｎ（Ｒ６）２、−ＳＲ６、−ＳＯＲ６、−ＳＯ２Ｒ６、−ＣＯ２Ｒ６、蛍光部分、放射性同位体または治療剤であり、
各Ｒ６は、独立に、−Ｈ、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロシクロアルキル、蛍光部分、放射性同位体または治療剤であり、
各Ｒ７は、独立に、−Ｈ、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキル、ヘテロアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロシクロアルキル、シクロアリールもしくはヘテロシクロアリールであるか（Ｒ５により任意選択で置換されている）、またはＤ残基を有する環式構造の一部であり、
各Ｒ８は、独立に、−Ｈ、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキル、ヘテロアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロシクロアルキル、シクロアリールもしくはヘテロシクロアリールであるか（Ｒ５により任意選択で置換されている）、またはＥ残基を有する環式構造の一部であり、
ｖは、０〜１０００、例えば０〜５００、０〜２００、０〜１００、０〜５０、０〜３０、０〜２０、０〜１０、０〜５、１〜１０００、１〜５００、１〜２００、１〜１００、１〜５０、１〜３０、１〜２０、１〜１０、１〜５、３〜１０００、３〜５００、３〜２００、３〜１００、３〜５０、３〜３０、３〜２０、３〜１０、０、１、２、３、４、５、６、７、８、９、または１０の整数であり、
ｗは、０〜１０００、例えば０〜５００、０〜２００、０〜１００、０〜５０、０〜３０、０〜２０、０〜１０、０〜５、１〜１０００、１〜５００、１〜２００、１〜１００、１〜５０、１〜３０、１〜２０、１〜１０、１〜５、３〜１０００、３〜５００、３〜２００、３〜１００、３〜５０、３〜３０、３〜２０、３〜１０、０、１、２、３、４、５、６、７、８、９、または１０の整数である）
を有する。
【０１９５】
上の式の一部の実施形態では、Ｘａａ３、Ｘａａ５、Ｘａａ６、Ｘａａ７、Ｘａａ８、Ｘａａ９、およびＸａａ１０の少なくとも３つは、配列Ｐｈｅ３−Ｘ４−Ｇｌｕ５−Ｔｙｒ６−Ｔｒｐ７−Ａｌａ８−Ｇｌｎ９−Ｌｅｕ１０／Ｃｂａ１０−Ｘ１１−Ａｌａ１２の対応する位置のアミノ酸と同じアミノ酸である。上の式の他の実施形態では、Ｘａａ３、Ｘａａ５、Ｘａａ６、Ｘａａ７、Ｘａａ８、Ｘａａ９、およびＸａａ１０の少なくとも４つは、配列Ｐｈｅ３−Ｘ４−Ｇｌｕ５−Ｔｙｒ６−Ｔｒｐ７−Ａｌａ８−Ｇｌｎ９−Ｌｅｕ１０／Ｃｂａ１０−Ｘ１１−Ａｌａ１２の対応する位置のアミノ酸と同じアミノ酸である。上の式の他の実施形態では、Ｘａａ３、Ｘａａ５、Ｘａａ６、Ｘａａ７、Ｘａａ８、Ｘａａ９、およびＸａａ１０の少なくとも５つは、配列Ｐｈｅ３−Ｘ４−Ｇｌｕ５−Ｔｙｒ６−Ｔｒｐ７−Ａｌａ８−Ｇｌｎ９−Ｌｅｕ１０／Ｃｂａ１０−Ｘ１１−Ａｌａ１２の対応する位置のアミノ酸と同じアミノ酸である。上の式の他の実施形態では、Ｘａａ３、Ｘａａ５、Ｘａａ６、Ｘａａ７、Ｘａａ８、Ｘａａ９、およびＸａａ１０の少なくとも６つは、配列Ｐｈｅ３−Ｘ４−Ｇｌｕ５−Ｔｙｒ６−Ｔｒｐ７−Ａｌａ８−Ｇｌｎ９−Ｌｅｕ１０／Ｃｂａ１０−Ｘ１１−Ａｌａ１２の対応する位置のアミノ酸と同じアミノ酸である。上の式の他の実施形態では、Ｘａａ３、Ｘａａ５、Ｘａａ６、Ｘａａ７、Ｘａａ８、Ｘａａ９、およびＸａａ１０の少なくとも７つは、配列Ｐｈｅ３−Ｘ４−Ｇｌｕ５−Ｔｙｒ６−Ｔｒｐ７−Ａｌａ８−Ｇｌｎ９−Ｌｅｕ１０／Ｃｂａ１０−Ｘ１１−Ａｌａ１２の対応する位置のアミノ酸と同じアミノ酸である。
【０１９６】
一部の実施形態では、ｗは、３〜１０、例えば３〜６、３〜８、６〜８、または６〜１０の整数である。一部の実施形態では、ｗは、３である。他の実施形態では、ｗは、６である。一部の実施形態では、ｖは、１〜１０、例えば２〜５の整数である。一部の実施形態では、ｖは、２である。
【０１９７】
本明細書に記載の式のいずれかの一実施形態では、大環状分子を形成するリンカー（Ｌ）は、式−Ｌ１−Ｌ２−
（式中、
Ｌ１およびＬ２は、独立に、アルキレン、アルケニレン、アルキニレン、ヘテロアルキレン、シクロアルキレン、ヘテロシクロアルキレン、シクロアリーレン、ヘテロシクロアリーレン、または［−Ｒ４−Ｋ−Ｒ４−］ｎであり、それぞれＲ５により任意選択で置換されており、
各Ｒ４は、独立に、アルキレン、アルケニレン、アルキニレン、ヘテロアルキレン、シクロアルキレン、ヘテロシクロアルキレン、アリーレン、またはヘテロアリーレンであり、
各Ｋは、独立に、Ｏ、Ｓ、ＳＯ、ＳＯ２、ＣＯ、ＣＯ２、またはＣＯＮＲ３であり、
各Ｒ３は、独立に、水素、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、ヘテロアルキル、シクロアルキル、ヘテロシクロアルキル、シクロアルキルアルキル、シクロアリール、またはヘテロシクロアリールであり（Ｒ５により任意選択で置換されている）、
ｎは、１〜５の整数である）
を有する。
【０１９８】
本明細書に記載の式の一部の実施形態では、Ｌ（またはＬ’）は、式
【化４７】
2018516844.tif 000049
の大環状分子を形成するリンカーである。
【０１９９】
このような大環状分子を形成するリンカーＬの例示的な実施形態は、以下に示される。
【化４８】
2018516844.tif 000050
【化４９】
2018516844.tif 000051
【０２００】
本明細書に記載の式のいずれかの一実施形態では、Ｌ１およびＬ２は、単独でまたは組合せのいずれかで、トリアゾールまたはチオエーテルを形成する。
【０２０１】
本明細書に記載の式のいずれかの一実施形態では、Ｌ１およびＬ２は、単独でもまたは組合せでも、トリアゾールまたはチオエーテルを形成しない。
【０２０２】
一例では、Ｒ１およびＲ２の少なくとも１つは、非置換であるか、またはハロ−で置換されているアルキルである。別の例では、Ｒ１およびＲ２の両方は、独立に、非置換であるか、またはハロ−で置換されているアルキルである。一部の実施形態では、Ｒ１およびＲ２の少なくとも１つは、メチルである。他の実施形態では、Ｒ１およびＲ２は、メチルである。
【０２０３】
一部の実施形態では、ｘ＋ｙ＋ｚは、少なくとも３である。他の実施形態では、ｘ＋ｙ＋ｚは、１、２、３、４、５、６、７、８、９または１０である。一部の実施形態では、ｘ＋ｙ＋ｚの合計は、３または６である。一部の実施形態では、ｘ＋ｙ＋ｚの合計は、３である。他の実施形態では、ｘ＋ｙ＋ｚの合計は、６である。大環状分子または大環状分子前駆体におけるＡ、Ｂ、Ｃ、ＤまたはＥは、出現するごとに独立に選択される。例えば、式［Ａ］ｘ（ｘが３である場合）によって表される配列は、アミノ酸が同一でない、例えばＧｌｎ−Ａｓｐ−Ａｌａである実施形態、ならびにアミノ酸が同一である、例えばＧｌｎ−Ｇｌｎ−Ｇｌｎである実施形態を包含する。このことは、示されている範囲内のｘ、ｙ、またはｚのいずれの値にも適用される。同様に、ｕが１を超える場合、各化合物は、同じかまたは異なっているペプチド模倣大環状分子を包含することができる。例えば、化合物は、異なるリンカー長さまたは化学的組成を含むペプチド模倣大環状分子を含むことができる。
【０２０４】
一部の実施形態では、ペプチド模倣大環状分子は、α−ヘリックスである二次構造を含み、Ｒ８は−Ｈであり、ヘリックス内に水素結合を生じる。一部の実施形態では、Ａ、Ｂ、Ｃ、ＤまたはＥの少なくとも１つは、α，α−二置換アミノ酸である。一例では、Ｂは、α，α−二置換アミノ酸である。例えば、Ａ、Ｂ、Ｃ、ＤまたはＥの少なくとも１つは、２−アミノイソ酪酸である。他の実施形態では、Ａ、Ｂ、Ｃ、ＤまたはＥの少なくとも１つは、
【化５０】
2018516844.tif 000052
である。
【０２０５】
他の実施形態では、第１のＣαから第２のＣαまでを測定した、大環状分子を形成するリンカーＬの長さは、必ずしも限定されないが第１のＣαと第２のＣαの間にあるものを含むペプチド模倣大環状分子の残基によって形成されたα−ヘリックスなどの、所望の二次ペプチド構造を安定化するように選択される。
【０２０６】
一実施形態では、式（Ｉ）のペプチド模倣大環状分子は、
【化５１】
2018516844.tif 000053
であり、式中、各Ｒ１およびＲ２は、独立に、独立に、−Ｈ、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロアルキル、またはヘテロシクロアルキルである（非置換であるか、またはハロ−で置換されている）。
【０２０７】
関係する実施形態では、式（Ｉ）のペプチド模倣大環状分子は、
【化５２】
2018516844.tif 000054
であり、式中、各Ｒ１’およびＲ２’は、独立に、アミノ酸である。
【０２０８】
他の実施形態では、式（Ｉ）のペプチド模倣大環状分子は、以下に示す式
【化５３】
2018516844.tif 000055
【化５４】
2018516844.tif 000056
（式中、「ＡＡ」は、任意の天然または非天然アミノ酸側鎖を表し、
【化５５】
2018516844.tif 000057
は、上で定義の［Ｄ］ｖ、［Ｅ］ｗであり、ｎは、０〜２０、５０、１００、２００、３００、４００または５００の整数である）
のいずれかの化合物である。一部の実施形態では、ｎは、０である。他の実施形態では、ｎは、５０未満である。
【０２０９】
大環状分子を形成するリンカーＬの例示的な実施形態は、以下に示される。
【化５６】
2018516844.tif 000058
【０２１０】
他の実施形態では、式Ｉの化合物のＤおよび／またはＥは、細胞の取込みを容易にするためにさらに修飾される。一部の実施形態では、ペプチド模倣大環状分子を脂質化またはＰＥＧ化すると、細胞の取込みが容易になり、バイオアベイラビリティが増大し、血液循環が増大し、薬物動態が変わり、免疫原性が低下し、かつ／または必要な投与頻度が低下する。
【０２１１】
他の実施形態では、式Ｉの化合物の［Ｄ］および［Ｅ］の少なくとも１つは、追加の大環状分子を形成するリンカーを含む部分を表し、したがってペプチド模倣大環状分子は、大環状分子を形成する少なくとも２つのリンカーを含む。特定の一実施形態では、ペプチド模倣大環状分子は、大環状分子を形成する２つのリンカーを含む。一実施形態では、ｕは、２である。
【０２１２】
一部の実施形態では、本明細書に記載の大環状分子を形成するリンカーのいずれかは、表３、表３ａ、表３ｂ、または表３ｃに示されている配列のいずれか、および本明細書に示されているＲ−置換基のいずれかとの任意の組合せで使用することができる。
【０２１３】
一部の実施形態では、ペプチド模倣大環状分子は、少なくとも１つのα−ヘリックスモチーフを含む。例えば、式Ｉの化合物のＡ、Ｂおよび／またはＣは、１つまたは複数のα−ヘリックスを含む。一般的に、α−ヘリックスは、１ターン当たり３〜４個のアミノ酸残基を含む。一部の実施形態では、ペプチド模倣大環状分子のα−ヘリックスは、１〜５ターンを含み、したがって３〜２０個のアミノ酸残基を含む。特定の実施形態では、α−ヘリックスは、１ターン、２ターン、３ターン、４ターン、または５ターンを含む。一部の実施形態では、大環状分子を形成するリンカーは、ペプチド模倣大環状分子内に含まれるα−ヘリックスモチーフを安定化する。したがって、一部の実施形態では、第１のＣαから第２のＣαまでの大環状分子を形成するリンカーＬの長さは、α−ヘリックスの安定性を増大するように選択される。一部の実施形態では、大環状分子を形成するリンカーは、１ターン〜５ターンのα−ヘリックスをスパンする。一部の実施形態では、大環状分子を形成するリンカーは、およそ１ターン、２ターン、３ターン、４ターン、または５ターンのα−ヘリックスをスパンする。一部の実施形態では、大環状分子を形成するリンカーの長さは、α−ヘリックス１ターン当たりおよそ５Å〜９Åであり、またはα−ヘリックス１ターン当たりおよそ６Å〜８Åである。大環状分子を形成するリンカーが、α−ヘリックスのおよそ１ターンをスパンする場合、長さは、およそ５個の炭素−炭素結合〜１３個の炭素−炭素結合、およそ７個の炭素−炭素結合〜１１個の炭素−炭素結合、またはおよそ９個の炭素−炭素結合に等しい。大環状分子を形成するリンカーが、α−ヘリックスのおよそ２ターンをスパンする場合、長さは、およそ８個の炭素−炭素結合〜１６個の炭素−炭素結合、およそ１０個の炭素−炭素結合〜１４個の炭素−炭素結合、またはおよそ１２個の炭素−炭素結合に等しい。大環状分子を形成するリンカーが、α−ヘリックスのおよそ３ターンをスパンする場合、長さは、およそ１４個の炭素−炭素結合〜２２個の炭素−炭素結合、およそ１６個の炭素−炭素結合〜２０個の炭素−炭素結合、またはおよそ１８個の炭素−炭素結合に等しい。大環状分子を形成するリンカーが、α−ヘリックスのおよそ４ターンをスパンする場合、長さは、およそ２０個の炭素−炭素結合〜２８個の炭素−炭素結合、およそ２２個の炭素−炭素結合〜２６個の炭素−炭素結合、またはおよそ２４個の炭素−炭素結合に等しい。大環状分子を形成するリンカーが、α−ヘリックスのおよそ５ターンをスパンする場合、長さは、およそ２６個の炭素−炭素結合〜３４個の炭素−炭素結合、およそ２８個の炭素−炭素結合〜３２個の炭素−炭素結合、またはおよそ３０個の炭素−炭素結合に等しい。大環状分子を形成するリンカーが、α−ヘリックスのおよそ１ターンをスパンする場合、連結は、およそ４個の原子〜１２個の原子、およそ６個の原子〜１０個の原子、またはおよそ８個の原子を含有する。大環状分子を形成するリンカーが、α−ヘリックスのおよそ２ターンをスパンする場合、連結は、およそ７個の原子〜１５個の原子、およそ９個の原子〜１３個の原子、またはおよそ１１個の原子を含有する。大環状分子を形成す��リンカーが、α−ヘリックスのおよそ３ターンをスパンする場合、連結は、およそ１３個の原子〜２１個の原子、およそ１５個の原子〜１９個の原子、またはおよそ１７個の原子を含有する。大環状分子を形成するリンカーが、α−ヘリックスのおよそ４ターンをスパンする場合、連結は、およそ１９個の原子〜２７個の原子、およそ２１個の原子〜２５個の原子、またはおよそ２３個の原子を含有する。大環状分子を形成するリンカーが、α−ヘリックスのおよそ５ターンをスパンする場合、連結は、およそ２５個の原子〜３３個の原子、およそ２７個の原子〜３１個の原子、またはおよそ２９個の原子を含有する。大環状分子を形成するリンカーが、α−ヘリックスのおよそ１ターンをスパンする場合、得られる大環状分子は、およそ１７員〜２５員、およそ１９員〜２３員、またはおよそ２１員を含有する環を形成する。大環状分子を形成するリンカーが、α−ヘリックスのおよそ２ターンをスパンする場合、得られる大環状分子は、およそ２９員〜３７員、およそ３１員〜３５員、またはおよそ３３員を含有する環を形成する。大環状分子を形成するリンカーが、α−ヘリックスのおよそ３ターンをスパンする場合、得られる大環状分子は、およそ４４員〜５２員、およそ４６員〜５０員、またはおよそ４８員を含有する環を形成する。大環状分子を形成するリンカーが、α−ヘリックスのおよそ４ターンをスパンする場合、得られる大環状分子は、およそ５９員〜６７員、およそ６１員〜６５員、またはおよそ６３員を含有する環を形成する。大環状分子を形成するリンカーが、α−ヘリックスのおよそ５ターンをスパンする場合、得られる大環状分子は、およそ７４員〜８２員、およそ７６員〜８０員、またはおよそ７８員を含有する環を形成する。
【０２１４】
他の実施形態では、式（ＩＶ）または（ＩＶａ）
【化５７】
2018516844.tif 000059
（式中、
各Ａ、Ｃ、Ｄ、およびＥは、独立に、天然または非天然アミノ酸であり、末端ＤおよびＥは、独立に、任意選択でキャッピング基を含み、
Ｂは、天然または非天然アミノ酸、アミノ酸類似体、
【化５８】
2018516844.tif 000060
［−ＮＨ−Ｌ３−ＣＯ−］、［−ＮＨ−Ｌ３−ＳＯ２−］、または［−ＮＨ−Ｌ３−］であり、
Ｒ１およびＲ２は、独立に、−Ｈ、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロアルキルもしくはヘテロシクロアルキルであるか（非置換であるか、またはハロ−で置換されている）、またはＲ１およびＲ２の少なくとも１つは、前記ＤまたはＥアミノ酸の１つのアルファ位に結合している大環状分子を形成するリンカーＬ’を形成し、
Ｒ３は、水素、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、ヘテロアルキル、シクロアルキル、ヘテロシクロアルキル、シクロアルキルアルキル、シクロアリール、またはヘテロシクロアリールであり（Ｒ５により任意選択で置換されている）、
Ｌは、式−Ｌ１−Ｌ２−の大環状分子を形成するリンカーであり、
Ｌ１、Ｌ２およびＬ３は、独立に、アルキレン、アルケニレン、アルキニレン、ヘテロアルキレン、シクロアルキレン、ヘテロシクロアルキレン、シクロアリーレン、ヘテロシクロアリーレン、または［−Ｒ４−Ｋ−Ｒ４−］ｎであり、それぞれＲ５により任意選択で置換されており、
各Ｒ４は、アルキレン、アルケニレン、アルキニレン、ヘテロアルキレン、シクロアルキレン、ヘテロシクロアルキレン、アリーレン、またはヘテロアリーレンであり、
各Ｋは、Ｏ、Ｓ、ＳＯ、ＳＯ２、ＣＯ、ＣＯ２、またはＣＯＮＲ３であり、
各Ｒ５は、独立に、ハロゲン、アルキル、−ＯＲ６、−Ｎ（Ｒ６）２、−ＳＲ６、−ＳＯＲ６、−ＳＯ２Ｒ６、−ＣＯ２Ｒ６、蛍光部分、放射性同位体または治療剤であり、
各Ｒ６は、独立に、−Ｈ、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロシクロアルキル、蛍光部分、放射性同位体または治療剤であり、
Ｒ７は、−Ｈ、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキル、ヘテロアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロシクロアルキル、シクロアリール、またはヘテロシクロアリールであり（Ｒ５により任意選択で置換されている）、
ｖおよびｗは、独立に、１〜１０００の整数であり、
ｕは、１〜１０の整数であり、
ｘ、ｙおよびｚは、独立に、０〜１０の整数であり、
ｎは、１〜５の整数である）
のペプチド模倣大環状分子が提供される。
【０２１５】
一例では、Ｌ１およびＬ２は、単独でもまたは組合せでも、トリアゾールまたはチオエーテルを形成しない。
【０２１６】
一例では、Ｒ１およびＲ２の少なくとも１つは、非置換であるか、またはハロ−で置換されているアルキルである。別の例では、Ｒ１およびＲ２の両方は、独立に、非置換であるか、またはハロ−で置換されているアルキルである。一部の実施形態では、Ｒ１およびＲ２の少なくとも１つは、メチルである。他の実施形態では、Ｒ１およびＲ２は、メチルである。
【０２１７】
一部の実施形態では、ｘ＋ｙ＋ｚは、少なくとも１である。他の実施形態では、ｘ＋ｙ＋ｚは、少なくとも２である。他の実施形態では、ｘ＋ｙ＋ｚは、１、２、３、４、５、６、７、８、９または１０である。大環状分子または大環状分子前駆体におけるＡ、Ｂ、Ｃ、ＤまたはＥは、出現するごとに独立に選択される。例えば、式［Ａ］ｘ（ｘが３である場合）によって表される配列は、アミノ酸が同一でない、例えばＧｌｎ−Ａｓｐ−Ａｌａである実施形態、ならびにアミノ酸が同一である、例えばＧｌｎ−Ｇｌｎ−Ｇｌｎである実施形態を包含する。このことは、示されている範囲内のｘ、ｙ、またはｚのいずれの値にも適用される。
【０２１８】
一部の実施形態では、ペプチド模倣大環状分子は、α−ヘリックスである二次構造を含み、Ｒ８は−Ｈであり、ヘリックス内に水素結合を生じる。一部の実施形態では、Ａ、Ｂ、Ｃ、ＤまたはＥの少なくとも１つは、α，α−二置換アミノ酸である。一例では、Ｂは、α，α−二置換アミノ酸である。例えば、Ａ、Ｂ、Ｃ、ＤまたはＥの少なくとも１つは、２−アミノイソ酪酸である。他の実施形態では、Ａ、Ｂ、Ｃ、ＤまたはＥの少なくとも１つは、
【化５９】
2018516844.tif 000061
である。
【０２１９】
他の実施形態では、第１のＣαから第２のＣαまでを測定した、大環状分子を形成するリンカーＬの長さは、必ずしも限定されないが第１のＣαと第２のＣαの間にあるものを含むペプチド模倣大環状分子の残基によって形成されたα−ヘリックスなどの、所望の二次ペプチド構造を安定化するように選択される。
【０２２０】
大環状分子を形成するリンカー−Ｌ１−Ｌ２−の例示的な実施形態は、以下に示される。
【化６０】
2018516844.tif 000062
【０２２１】
別段指定されない限り、任意の化合物（ペプチド模倣大環状分子、大環状分子前駆体、および他の組成物を含む）はまた、１つまたは複数の同位体的に富化された原子の存在だけが異なっている化合物を包含することを意味する。例えば、重水素もしくはトリチウムによって水素が置き換えられているか、または１３Ｃ−もしくは１４Ｃが富化された炭素によって炭素が置き換えられていることを除いて、記載の構造を有する化合物は、本開示の範囲に含まれる。
【０２２２】
一部の実施形態では、本明細書に開示の化合物は、このような化合物を構成する原子の１つまたは複数において、非天然の割合の原子の同位体を含有することができる。例えば、化合物は、例えばトリチウム（３Ｈ）、ヨウ素−１２５（１２５Ｉ）または炭素−１４（１４Ｃ）などの放射性同位体で放射標識することができる。他の実施形態では、１つまたは複数の炭素原子は、ケイ素原子で置き換えられる。放射性であろうと放射性でなかろうと、本明細書に開示の化合物のあらゆる同位体変形形態が、本明細書において企図される。
【０２２３】
ヒト血中のペプチド模倣大環状分子の循環半減期は、約１〜２４時間であり得る。例えば、ヒト血中のペプチド模倣大環状分子の循環半減期は、約２〜２４時間、４〜２４時間、６〜２４時間、８〜２４時間、１０〜２４時間、１２〜２４時間、１４〜２４時間、１６〜２４時間、１８〜２４時間、２０〜２４時間、２２〜２４時間、１〜２０時間、４〜２０時間、６〜２０時間、８〜２０時間、１０〜２０時間、１２〜２０時間、１４〜２０時間、１６〜２０時間、１８〜２０時間、１〜１６時間、４〜１６時間、６〜１６時間、８〜１６時間、１０〜１６時間、１２〜１６時間、１４〜１６時間、１〜１２時間、４〜１２時間、６〜１２時間、８〜１２時間、１０〜１２時間、１〜８時間、４〜８時間、６〜８時間、または１〜４時間であり得る。いくつかの例では、ヒト血中のペプチド模倣大環状分子の循環半減期は、約１〜１２時間、例えば約１時間、２時間、３時間、４時間、５時間、６時間、７時間、８時間、９時間、１０時間、１１時間、または１２時間であり得る。いくつかの例では、ヒト血中のペプチド模倣大環状分子の循環半減期は、約２時間である。いくつかの例では、ヒト血中のペプチド模倣大環状分子の循環半減期は、約４時間である。いくつかの例では、ヒト血中のペプチド模倣大環状分子の循環半減期は、約６時間である。いくつかの例では、ヒト血中のペプチド模倣大環状分子の循環半減期は、約８時間である。いくつかの例では、ヒト血中のペプチド模倣大環状分子の循環半減期は、約１０時間である。
【０２２４】
生体組織中のペプチド模倣大環状分子の半減期は、約１〜２４時間であり得る。例えば、ヒト血中のペプチド模倣大環状分子の循環半減期は、約１〜２４時間、５〜２４時間、１０〜２４時間、１５〜２４時間、２０〜２４時間、１〜２２時間、５〜２２時間、１０〜２２時間、１５〜２２時間、２０〜２２時間、１〜２０時間、５〜２０時間、１５〜２０時間、１〜１８時間、５〜１８時間、１０〜１８時間、１５〜１８時間、１〜１６時間、５〜１６時間、１０〜１６時間、１５〜１６時間、１〜１４時間、５〜１４時間、１０〜１４時間、１〜１２時間、５〜１２時間、１０〜１２時間、１〜１０時間、５〜１０時間、１〜８時間、５〜８時間、１〜６時間、５〜６時間、または１〜４時間であり得る。いくつかの例では、ヒト血中のペプチド模倣大環状分子の循環半減期は、約５〜２０時間、例えば約５時間、６時間、７時間、８時間、９時間、１０時間、１１時間、１２時間、１３時間、１４時間、１５時間、１６時間、１７時間、１８時間、１９時間または２０時間であり得る。いくつかの例では、ヒト血中のペプチド模倣大環状分子の循環半減期は、約２時間である。いくつかの例では、ヒト血中のペプチド模倣大環状分子の循環半減期は、約４時間である。いくつかの例では、ヒト血中のペプチド模倣大環状分子の循環半減期は、約６時間である。いくつかの例では、ヒト血中のペプチド模倣大環状分子の循環半減期は、約８時間である。いくつかの例では、ヒト血中のペプチド模倣大環状分子の循環半減期は、約１０時間である。
【０２２５】
ヒト血中のペプチド模倣大環状分子の循環半減期は、生体組織におけるペプチド模倣大環状分子の半減期を超えるか、それに等しいか、またはそれ未満であり得る。いくつかの例では、ヒト血中のペプチド模倣大環状分子の循環半減期は、生体組織におけるペプチド模倣大環状分子の半減期を超え得る。いくつかの例では、ヒト血中のペプチド模倣大環状分子の循環半減期は、生体組織におけるペプチド模倣大環状分子の半減期と等しい場合がある。いくつかの例では、生体組織中のペプチド模倣大環状分子の半減期は、ヒト血中のペプチド模倣大環状分子の循環半減期を超える。これによって、ペプチド模倣大環状分子をより低い用量および／またはより低い頻度で投与することが容易になり得る。一部の実施形態では、生体組織中のペプチド模倣大環状分子の半減期は、ヒト血中のペプチド模倣大環状分子の循環半減期よりも少なくとも１時間、少なくとも２時間、少なくとも３時間、少なくとも４時間、少なくとも５時間、少なくとも６時間、少なくとも７時間、少なくとも８時間、少なくとも９時間、少なくとも１０時間、少なくとも１１時間、または少なくとも１２時間長い。いくつかの例では、ヒト血中のペプチド模倣大環状分子の循環半減期は、約４時間であり、生体組織の半減期は、約１０時間である。いくつかの例では、ヒト血中のペプチド模倣大環状分子の循環半減期は、約６時間であり、生体組織中の半減期は、約１０時間である。
ペプチド模倣大環状分子の調製
【０２２６】
ペプチド模倣大環状分子は、当技術分野で公知の様々な方法のいずれかによって調製することができる。例えば、表３、表３ａ、表３ｂ、または表３ｃの「＄」または「＄ｒ８」によって示される残基のいずれかは、同じ分子の第２の残基と共にクロスリンカーを形成することができる残基またはこのような残基の前駆体で置換され得る。
【０２２７】
ペプチド模倣大環状分子を形成する様々な方法が、当技術分野で公知である。例えば、式Ｉのペプチド模倣大環状分子の調製は、Schafmeisterら、J.  Am.  Chem.  Soc.  １２２巻：５８９１〜５８９２頁（２０００年）；SchafmeisterおよびVerdine、J.  Am.  Chem.  Soc.  １２２巻：５８９１頁（２００５年）；Walenskyら、Science  ３０５巻：１４６６〜１４７０頁（２００４年）；米国特許第７，１９２，７１３号およびＰＣＴ出願ＷＯ２００８／１２１７６７号に記載されている。引用参考文献に開示されているα，α−二置換アミノ酸およびアミノ酸前駆体は、ペプチド模倣大環状分子の前駆体ポリペプチドの合成に用いることができる。例えば、「Ｓ５−オレフィンアミノ酸」は、（Ｓ）−α−（２’−ペンテニル）アラニンであり、「Ｒ８オレフィンアミノ酸」は、（Ｒ）−α−（２’−オクテニル）アラニンである。このようなアミノ酸を前駆体ポリペプチドに組み込んだ後、末端オレフィンをメタセシス触媒と反応させて、ペプチド模倣大環状分子を形成させる。様々な実施形態では、以下のアミノ酸：
【化６１】
2018516844.tif 000063
は、ペプチド模倣大環状分子の合成に用いることができる。
【０２２８】
他の実施形態では、ペプチド模倣大環状分子は、式ＩＶまたはＩＶａのものである。このような大環状分子を調製する方法は、例えば米国特許第７，２０２，３３２号に記載されている。
【０２２９】
適切であると想定されるペプチド模倣大環状分子を形成する追加の方法には、Mustapa,  M.  Firouz  Mohdら、J.  Org.  Chem（２００３年）、６８巻、８１９３〜８１９８頁；Yang,  Binら、Bioorg  Med.  Chem.  Lett.（２００４年）、１４巻、１４０３〜１４０６頁；米国特許第５，３６４，８５１号；米国特許第５，４４６，１２８号；米国特許第５，８２４，４８３号；米国特許第６，７１３，２８０号；および米国特許第７，２０２，３３２号に開示の方法が含まれる。このような実施形態では、アルファ位に追加の置換基Ｒ−を含有するアミノ酸前駆体が使用される。このようなアミノ酸は、大環状分子前駆体の所望の位置に組み込まれ、それによって、該アミノ酸は、クロスリンカーが置換される位置、または、あるいは大環状分子前駆体の配列の他所に存在し得る。次に、示されている方法に従って、前駆体を環化する。
アッセイ
【０２３０】
ペプチド模倣大環状分子の特性は、例えば下記の方法を使用することによってアッセイされる。一部の実施形態では、ペプチド模倣大環状分子は、本明細書に記載の置換基を有していない対応するポリペプチドと比較して、改善された生物学的特性を有する。
α−ヘリシティを決定するためのアッセイ
【０２３１】
溶液中、α−ヘリカルドメインを有するポリペプチドの二次構造は、ランダムコイル構造とα−ヘリカル構造の間の動的平衡に達し、これはしばしば「ヘリシティパーセント（percent  helicity）」と表される。したがって、例えばアルファ−ヘリカルドメインは、溶液中、α−ヘリカル含量が通常２５％未満の、主にランダムコイルである。他方では、最適化リンカーを有するペプチド模倣大環状分子は、例えば対応する未架橋のポリペプチドのアルファ−ヘリシティの少なくとも２倍のアルファ−ヘリシティを有する。一部の実施形態では、大環状分子は、５０％超のアルファ−ヘリシティを有する。ペプチド模倣大環状分子のヘリシティをアッセイするために、化合物を、水溶液に溶解させる（例えばｐＨ７の５０ｍＭリン酸カリウム溶液、または蒸留水で、濃度２５〜５０μＭまで）。円二色性（ＣＤ）スペクトルを、分光偏光計（例えば、Ｊａｓｃｏ  Ｊ−７１０）で、標準測定パラメーター（例えば、温度、２０℃；波長、１９０〜２６０ｎｍ；ステップ分解能、０．５ｎｍ；速度、２０ｎｍ／秒；積算回数（accumulation）、１０；レスポンス、１秒；バンド幅、１ｎｍ；路長、０．１ｃｍ）を使用して得る。各ペプチドのα−ヘリカル含量は、平均残基楕円率（例えば［Φ］２２２ｏｂｓ）を、モデルヘリカルデカペプチドについて記録された値で割ることによって算出される（Yangら（１９８６年）、Methods  Enzymol.  １３０巻：２０８頁））。
融解温度（Ｔｍ）を決定するためのアッセイ
【０２３２】
α−ヘリックスなどの二次構造を含むペプチド模倣大環状分子は、例えば、対応する未架橋ポリペプチドよりも高い融解温度を呈する。典型的に、ペプチド模倣大環状分子は、＞６０℃のＴｍを呈し、これは、水溶液中で高度に安定な構造を表している。融解温度に対する大環状分子の形成の効果をアッセイするために、ペプチド模倣大環状分子または非修飾ペプチドを、蒸留水に溶解させ（例えば最終濃度５０μＭ）、Ｔｍを、分光偏光計（例えば、Ｊａｓｃｏ  Ｊ−７１０）で、標準パラメーター（例えば、波長２２２ｎｍ；ステップ分解能、０．５ｎｍ；速度、２０ｎｍ／秒；積算回数、１０；レスポンス、１秒；バンド幅、１ｎｍ；温度上昇速度：１℃／分；路長、０．１ｃｍ）を使用して、ある温度範囲（例えば４〜９５℃）にわたって楕円率の変化を測定することによって決定する。
プロテアーゼ抵抗性アッセイ
【０２３３】
ペプチド骨格のアミド結合は、プロテアーゼによる加水分解を受けやすく、それによってペプチド化合物がｉｎ  ｖｉｖｏで急速に分解されやすくなる。しかし、ペプチドがヘリックスを形成すると、典型的にアミド骨格が隠され、したがってアミド骨格がタンパク分解的切断から保護され得る。ペプチド模倣大環状分子を、ｉｎ  ｖｉｔｒｏでトリプシンによるタンパク質分解に供して、対応する未架橋ポリペプチドと比較して分解速度の任意の変化について評価することができる。例えば、ペプチド模倣大環状分子および対応する未架橋ポリペプチドを、トリプシンアガロースと共にインキュベートし、遠心分離によって様々な時点で反応をクエンチし、その後ＨＰＬＣ注入処理して、２８０ｎｍの紫外吸収によって残留基質を定量する。簡潔には、ペプチド模倣大環状分子およびペプチド模倣前駆体（５ｍｃｇ）を、トリプシンアガロース（Ｐｉｅｒｃｅ）（Ｓ／Ｅ約１２５）と共に０分間、１０分間、２０分間、９０分間、および１８０分間インキュベートする。反応を、高速の卓上遠心分離によってクエンチし、分離された上清中の残留した基質を、２８０ｎｍにおけるＨＰＬＣベースのピーク検出によって定量する。タンパク分解的反応は、一次反応速度を呈し、速度定数ｋは、ｌｎ［Ｓ］対時間のプロットから決定される（ｋ＝−１Ｘ勾配）。
ｅｘ  ｖｉｖｏ安定性アッセイ
【０２３４】
最適化リンカーを有するペプチド模倣大環状分子は、例えば、対応する未架橋ポリペプチドのｅｘ  ｖｉｖｏ半減期の少なくとも２倍のｅｘ  ｖｉｖｏ半減期を有し、１２時間またはそれを超えるｅｘ  ｖｉｖｏ半減期を有する。ｅｘ  ｖｉｖｏ血清安定性研究のために、様々なアッセイを使用することができる。例えば、ペプチド模倣大環状分子および対応する未架橋ポリペプチド（２ｍｃｇ）を、新鮮なマウス、ラットおよび／またはヒトの血清（２ｍＬ）と共に３７℃で０時間、１時間、２時間、４時間、８時間、および２４時間インキュベートする。無傷化合物のレベルを決定するために、以下の手順を使用することができる。試料を、血清１００μｌを２ｍｌ遠心管に移した後、５０％ギ酸１０μＬおよびアセトニトリル５００μＬを添加し、４±２℃において１４，０００ＲＰＭで１０分間遠心分離することによって抽出する。次に、上清を新しい２ｍｌ管に移し、Ｔｕｒｂｏｖａｐで、Ｎ２＜１０ｐｓｉの下で３７℃において蒸発させる。試料を、５０：５０アセトニトリル：水１００μＬで再構成し、ＬＣ−ＭＳ／ＭＳ分析に付す。
ｉｎ  ｖｉｔｒｏ結合アッセイ
【０２３５】
アクセプタータンパク質へのペプチド模倣大環状分子およびペプチド模倣前駆体の結合および親和性を評価するために、例えば蛍光偏光アッセイ（ＦＰＡ）が使用される。ＦＰＡ技術により、偏光および蛍光トレーサーを使用して分子の配向および可動性を測定する。見かけの高い分子量を有する分子に結合している蛍光トレーサー（例えば、ＦＩＴＣ）（例えば、大きいタンパク質に結合したＦＩＴＣ標識ペプチド）は、偏光で励起されると、より小さい分子に結合している蛍光トレーサー（例えば、溶液中で遊離状態であるＦＩＴＣ標識ペプチド）と比較して回転速度が低いことに起因して、より高レベルの偏光蛍光を放射する。
【０２３６】
例えば、フルオレセイン化ペプチド模倣大環状分子（２５ｎＭ）を、結合バッファー（１４０ｍＭのＮａＣｌ、５０ｍＭのＴｒｉｓ−ＨＣＬ、ｐＨ７．４）中、アクセプタータンパク質（２５〜１０００ｎＭ）と共に室温で３０分間インキュベートする。結合活性を、例えば発光分光光度計（例えばＰｅｒｋｉｎ−Ｅｌｍｅｒ  ＬＳ５０Ｂ）で蛍光偏光によって測定する。Ｋｄ値は、非線形回帰分析によって、例えばＧｒａｐｈｐａｄ  Ｐｒｉｓｍソフトウェア（ＧｒａｐｈＰａｄ  Ｓｏｆｔｗａｒｅ，Ｉｎｃ．、カリフォルニア州サンディエゴ）を使用して決定することができる。ペプチド模倣大環状分子は、一部の実施形態では、対応する未架橋ポリペプチドに類似の、またはそれよりも低いＫｄを示す。
ペプチド−タンパク質相互作用のアンタゴニストを特徴付けるためのｉｎ  ｖｉｔｒｏディスプレイスメントアッセイ
【０２３７】
ペプチドとアクセプタータンパク質の間の相互作用を拮抗する化合物の結合および親和性を評価するために、例えばペプチド模倣前駆体配列から得られた、フルオレセイン化ペプチド模倣大環状分子を利用する蛍光偏光アッセイ（ＦＰＡ）が使用される。ＦＰＡ技術により、偏光および蛍光トレーサーを使用して分子の配向および可動性を測定する。見かけの高い分子量を有する分子に結合している蛍光トレーサー（例えば、ＦＩＴＣ）（例えば、大きいタンパク質に結合したＦＩＴＣ標識ペプチド）は、偏光で励起されると、より小さい分子に結合している蛍光トレーサー（例えば、溶液中で遊離状態であるＦＩＴＣ標識ペプチド）と比較して回転速度が低いことに起因して、より高レベルの偏光蛍光を放射する。フルオレセイン化ペプチド模倣大環状分子とアクセプタータンパク質との間の相互作用を拮抗する化合物は、競合的結合ＦＰＡ実験で検出される。
【０２３８】
例えば、推定上のアンタゴニスト化合物（１ｎＭ〜１ｍＭ）およびフルオレセイン化ペプチド模倣大環状分子（２５ｎＭ）を、結合バッファー（１４０ｍＭのＮａＣｌ、５０ｍＭのＴｒｉｓ−ＨＣＬ、ｐＨ７．４）中、アクセプタータンパク質（５０ｎＭ）と共に室温で３０分間インキュベートする。アンタゴニスト結合活性を、例えば発光分光光度計（例えばＰｅｒｋｉｎ−Ｅｌｍｅｒ  ＬＳ５０Ｂ）で蛍光偏光によって測定する。Ｋｄ値は、非線形回帰分析によって、例えばＧｒａｐｈｐａｄ  Ｐｒｉｓｍソフトウェア（ＧｒａｐｈＰａｄ  Ｓｏｆｔｗａｒｅ，Ｉｎｃ．、カリフォルニア州サンディエゴ）を使用して決定することができる。
【０２３９】
このアッセイでは、小さい有機分子、ペプチド、オリゴヌクレオチドまたはタンパク質などの任意のクラスの分子を、推定上のアンタゴニストとして調査することができる。
親和性選択−質量分析によるタンパク質−リガンド結合のためのアッセイ
【０２４０】
タンパク質に対する試験化合物の結合および親和性を評価するために、例えば親和性選択質量分析アッセイを使用する。タンパク質−リガンド結合実験は、システム全体の対照実験について概説されている以下の代表的手順に従って、１μＭのペプチド模倣大環状分子と５μＭのｈＭＤＭ２を使用して実施する。ペプチド模倣大環状分子の４０μＭ原液のＤＭＳＯアリコート１μＬを、ＰＢＳ１９μＬ（リン酸緩衝食塩水：１５０ｍＭのＮａＣｌを含有する５０ｍＭ、ｐＨ７．５のリン酸緩衝液）に溶解させる。得られた溶液を、反復ピペット操作によって混合し、１００００ｇで１０分間遠心分離することによって清澄化する。得られた上清のアリコート４μＬに、ＰＢＳ中１０μＭのｈＭＤＭ２  ４μＬを添加する。したがって、実験試料各８．０μＬは、ＰＢＳ中５．０μＭ濃度のタンパク質４０ｐｍｏｌ（１．５μｇ）と、１μＭペプチド模倣大環状分子および２．５％ＤＭＳＯを含有している。こうして濃度点ごとに調製した二つ組の試料を、室温で６０分間インキュベートし、次に４℃に冷やした後、５．０μＬ注入のサイズ排除クロマトグラフィー−ＬＣ−ＭＳ分析を行う。標的タンパク質、タンパク質−リガンド複合体、および非結合化合物を含有する試料を、ＳＥＣカラム上に注入し、そこで迅速なＳＥＣステップによって複合体を非結合構成成分から分離する。ＳＥＣカラム溶離液を、ＵＶ検出器を使用してモニタして、ＳＥＣカラムのボイドボリュームに溶出する初期溶出タンパク質画分が、カラム上に保持されている非結合構成成分から十分に分離されることが確認される。タンパク質およびタンパク質−リガンド複合体を含有するピークは、一次ＵＶ検出器から溶出した後、試料ループに入り、そこでＳＥＣ段階のフローストリームから切り離され、弁機序を介してＬＣ−ＭＳに直接移される。ペプチド模倣大環状分子の（Ｍ＋３Ｈ）３＋イオンを、ＥＳＩ−ＭＳによって、予測されるｍ／ｚにおいて観測し、タンパク質−リガンド複合体の検出を確実にする。
タンパク質−リガンドＫｄ滴定実験のためのアッセイ
【０２４１】
タンパク質に対する試験化合物の結合および親和性を評価するために、例えば、タンパク質−リガンドのＫｄ滴定実験を実施する。タンパク質−リガンドのＫｄ滴定実験を、以下の通り実施する。滴定剤ペプチド模倣大環状分子の連続希釈原液（５、２．５、．．．、０．０９８ｍＭ）のＤＭＳＯアリコート２μＬを調製し、次にＰＢＳ３８μＬに溶解させる。得られた溶液を、反復ピペット操作によって混合し、１００００ｇで１０分間遠心分離することによって清澄化する。得られた上清のアリコート４．０μＬに、ＰＢＳ中１０μＭのｈＭＤＭ２  ４．０μＬを添加する。したがって、実験試料各８．０μＬは、ＰＢＳ中５．０μＭ濃度のタンパク質４０ｐｍｏｌ（１．５μｇ）、様々な濃度（１２５、６２．５、．．．、０．２４μＭ）の滴定剤ペプチドおよび２．５％ＤＭＳＯを含有している。こうして濃度点ごとに調製した二つ組の試料を、室温で３０分間インキュベートし、次に４℃に冷やした後、２．０μＬ注入のＳＥＣ−ＬＣ−ＭＳ分析を行う。（Ｍ＋Ｈ）１＋、（Ｍ＋２Ｈ）２＋、（Ｍ＋３Ｈ）３＋、および／または（Ｍ＋Ｎａ）１＋イオンは、「A  General  Technique  to  Rank  Protein-Ligand  Binding  Affinities  and  Determine  Allosteric  vs.  Direct  Binding  Site  Competition  in  Compound  Mixtures.」Annis,  D.  A.；Nazef,  N.；Chuang,  C.  C.；Scott,  M.  P.；Nash,  H.  M.  J.  Am.  Chem.  Soc.  ２００４年、１２６巻、１５４９５〜１５５０３頁；また「ALIS:  An  Affinity  Selection-Mass  Spectrometry  System  for  the  Discovery  and  Characterization  of  Protein-Ligand  Interactions」D.  A.  Annis、C.-C.  Chuang、およびN.  Nazef.  In  Mass  Spectrometry  in  Medicinal  Chemistry.  Wanner  K、Hoefner  G編:  Wiley-VCH；２００７年：１２１〜１８４頁。Mannhold  R、Kubinyi  H、Folkers  G(シリーズ編者):  Methods  and  Principles  in  Medicinal  Chemistryに記載の通り、ＥＳＩ−ＭＳによって観測し、抽出されたイオンクロマトグラムを定量し、次に結合親和性Ｋｄを得るための等式にフィットさせる。
親和性選択−質量分析による競合結合実験のためのアッセイ
【０２４２】
タンパク質に競合的に結合する試験化合物の能力を決定するために、例えば親和性選択質量分析アッセイを実施する。構成成分１つ当たり４０μＭのリガンド混合物を、３種の化合物のそれぞれの４００μＭ原液のアリコート２μＬをＤＭＳＯ１４μＬと混ぜ合わせることによって調製する。次に、構成成分の混合物１つ当たりこの４０μＭのアリコート１μＬを、滴定剤ペプチド模倣大環状分子の連続希釈原液（１０、５、２．５、．．．、０．０７８ｍＭ）のＤＭＳＯアリコート１μＬと混ぜ合わせる。これらの試料２μＬを、ＰＢＳ３８μＬに溶解させる。得られた溶液を、反復ピペット操作によって混合し、１００００ｇで１０分間遠心分離することによって清澄化する。得られた上清のアリコート４．０μＬに、ＰＢＳ中１０μＭのｈＭＤＭ２タンパク質４．０μＬを添加する。したがって、実験試料各８．０μＬは、ＰＢＳ中５．０μＭ濃度のタンパク質４０ｐｍｏｌ（１．５μｇ）と、０．５μＭのリガンド、２．５％ＤＭＳＯ、および様々な濃度（１２５、６２．５、．．．、０．９８μＭ）の滴定剤ペプチド模倣大環状分子を含有している。こうして濃度点ごとに調製した二つ組の試料を、室温で６０分間インキュベートし、次に４℃に冷やした後、２．０μＬ注入のＳＥＣ−ＬＣ−ＭＳ分析を行う。これらおよび他の方法のさらなる詳細は、「A  General  Technique  to  Rank  Protein-Ligand  Binding  Affinities  and  Determine  Allosteric  vs.  Direct  Binding  Site  Competition  in  Compound  Mixtures.」Annis,  D.  A.；Nazef,  N.；Chuang,  C.  C.；Scott,  M.  P.；Nash,  H.  M.  J.  Am.  Chem.  Soc.  ２００４年、１２６巻、１５４９５〜１５５０３頁；また「ALIS:  An  Affinity  Selection-Mass  Spectrometry  System  for  the  Discovery  and  Characterization  of  Protein-Ligand  Interactions」D.  A.  Annis、C.-C.  Chuang、およびN.  Nazef.  In  Mass  Spectrometry  in  Medicinal  Chemistry.  Wanner  K、Hoefner  G編:  Wiley-VCH；２００７年：１２１〜１８４頁。Mannhold  R、Kubinyi  H、Folkers  G(シリーズ編者):  Methods  and  Principles  in  Medicinal  Chemistryに提示されている。
無傷細胞における結合アッセイ
【０２４３】
無傷細胞における、ペプチドまたはペプチド模倣大環状分子とそれらの天然アクセプターの結合を、免疫沈降実験によって測定することが可能である。例えば、無傷細胞は、血清がない状態でフルオレセイン化（ＦＩＴＣ標識された）化合物と共に４時間インキュベートした後、血清代替物と共に、４〜１８時間、さらにインキュベートする。次に、細胞をペレット化し、溶解緩衝液（５０ｍＭのＴｒｉｓ［ｐＨ７．６］、１５０ｍＭのＮａＣｌ、１％ＣＨＡＰＳおよびプロテアーゼ阻害剤カクテル）中で４℃において１０分間インキュベートする。抽出物を、１４，０００ｒｐｍで１５分間遠心分離し、上清を収集し、ヤギ抗−ＦＩＴＣ抗体１０μｌと共に２時間インキュベートし、４℃で回転させた後、タンパク質Ａ／Ｇセファロース（５０％ビーズスラリー５０μｌ）と共に４℃でさらに２時間インキュベートする。急速遠心分離した後、ペレットを、漸増塩濃度（例えば、１５０ｍＭ、３００ｍＭ、５００ｍＭ）を含有する溶解緩衝液で洗浄する。次に、ビーズを１５０ｍＭのＮａＣｌで再平衡化した後、ＳＤＳを含有する試料緩衝液を添加し、煮沸させる。遠心分離した後、上清を、任意選択で４％〜１２％勾配のＢｉｓ−Ｔｒｉｓゲルを使用して電気泳動させた後、イモビロン−Ｐ膜に移す。ブロッキングした後、ブロットを、任意選択でＦＩＴＣを検出する抗体と共にインキュベートし、また、ペプチド模倣大環状分子に結合するタンパク質を検出する１種または複数種の抗体と共にインキュベートする。
細胞透過性アッセイ
【０２４４】
ペプチド模倣大環状分子は、例えば、対応する未架橋大環状分子と比較して、細胞透過性がより高い。最適化リンカーを有するペプチド模倣大環状分子は、例えば、対応する未架橋大環状分子の少なくとも２倍の細胞透過性を有し、適用したペプチド模倣大環状分子のしばしば２０％またはそれ超が、４時間後に細胞を透過したことが観察される。ペプチド模倣大環状分子および対応する未架橋大環状分子の細胞透過性を測定するために、無傷細胞を、蛍光標識された（例えばフルオレセイン化）ペプチド模倣大環状分子または対応する未架橋大環状分子（１０μＭ）と共に、無血清培地中で３７℃において４時間インキュベートし、培地で２回洗浄し、トリプシン（０．２５％）と共に３７℃で１０分間インキュベートする。細胞を再び洗浄し、ＰＢＳに再懸濁させる。細胞の蛍光を、例えば、ＦＡＣＳＣａｌｉｂｕｒフローサイトメーターまたはＣｅｌｌｏｍｉｃｓ’  ＫｉｎｅｔｉｃＳｃａｎ（登録商標）ＨＣＳ  Ｒｅａｄｅｒのいずれかを使用することによって分析する。
細胞の有効性アッセイ
【０２４５】
ある特定のペプチド模倣大環状分子の有効性を、例えば細胞ベースの殺滅アッセイにおいて、様々な腫瘍形成細胞株および非腫瘍形成細胞株、ならびにヒトまたはマウス細胞集団から得られた初代細胞を使用して決定する。細胞生存率を、例えば、ペプチド模倣大環状分子（０．５〜５０μＭ）と共に２４〜９６時間かけてインキュベートしてモニタして、ＥＣ５０＜１０μＭで死滅させる細胞を同定する。細胞生存率を測定するいくつかの標準アッセイは、市販されており、任意選択でペプチド模倣大環状分子の有効性を評価するために使用される。さらに、アネキシンＶおよびカスパーゼ活性化を測定するアッセイは、任意選択でペプチド模倣大環状分子が、アポトーシス機構を活性化することによって細胞を死滅させるかどうかを評価するために使用される。例えば、Ｃｅｌｌ  Ｔｉｔｅｒ−ｇｌｏアッセイを使用し、それによって、細胞生存率を細胞内ＡＴＰ濃度の関数として決定する。
ｉｎ  ｖｉｖｏ安定性アッセイ
【０２４６】
ペプチド模倣大環状分子のｉｎ  ｖｉｖｏ安定性を調査するために、化合物を、例えば０．１〜５０ｍｇ／ｋｇの濃度でＩＶ、ＩＰ、ＰＯまたは吸入経路によってマウスおよび／またはラットに投与し、注射の０分後、５分後、１５分後、３０分後、１時間後、４時間後、８時間後および２４時間後に血液被検物を得る。次に、新鮮な血清２５μＬ中の無傷化合物のレベルを、上の通りＬＣ−ＭＳ／ＭＳによって測定する。
動物モデルにおけるｉｎ  ｖｉｖｏ有効性
【０２４７】
ペプチド模倣大環状分子のｉｎ  ｖｉｖｏでの抗腫瘍形成活性を決定するために、化合物を、例えば単独で（ＩＰ、ＩＶ、ＰＯ、吸入、または経鼻経路によって）、または最適以下の用量の関連化学療法（例えば、シクロホスファミド、ドキソルビシン、エトポシド）と組み合わせて投与する。一例では、ルシフェラーゼを安定に発現する５×１０６個のＲＳ４；１１細胞（急性リンパ芽球性白血病の患者の骨髄から樹立された）を、ＮＯＤ−ＳＣＩＤマウスを全身照射に付した３時間後に尾静脈注射する。この白血病の形態は、処置せずにおくと、このモデルでは３週間で致死的なものになる。該白血病は、例えばマウスにＤ−ルシフェリン（６０ｍｇ／ｋｇ）を注射し、麻酔下の動物を画像化することによって（例えば、Ｘｅｎｏｇｅｎ  Ｉｎ  Ｖｉｖｏ  Ｉｍａｇｉｎｇ  Ｓｙｓｔｅｍ、Ｃａｌｉｐｅｒ  Ｌｉｆｅ  Ｓｃｉｅｎｃｅｓ、マサチューセッツ州ホプキントン）、容易にモニタされる。全身バイオルミネセンスは、Ｌｉｖｉｎｇ  Ｉｍａｇｅ  Ｓｏｆｔｗａｒｅ（Ｃａｌｉｐｅｒ  Ｌｉｆｅ  Ｓｃｉｅｎｃｅｓ、マサチューセッツ州ホプキントン）により、光量子束（photonic  flux）（光子／秒）の積分によって定量される。ペプチド模倣大環状分子は、単独で、または最適以下の用量の関連化学療法剤と組み合わせて、例えば白血病マウス（バイオルミネセンス範囲１４〜１６で、注射／実験１日目の１０日後）に、尾静脈またはＩＰ経路によって、０．１ｍｇ／ｋｇ〜５０ｍｇ／ｋｇの範囲の用量で７〜２１日間投与される。任意選択で、マウスを、実験中２日ごとに画像化し、実験期間中、生存を毎日モニタする。死亡したマウスは、任意選択で実験の終了時に剖検する。別の動物モデルは、安定にルシフェラーゼを発現する、ヒト濾胞性リンパ腫から得られた細胞株であるＤｏＨＨ２の、ＮＯＤ−ＳＣＩＤマウスへの移植である。これらのｉｎ  ｖｉｖｏ試験により、任意選択で薬物動態学的、薬力学的および毒性学的な予備データを作成する。
臨床試験
【０２４８】
ヒトを処置するためのペプチド模倣大環状分子の適合性を決定するために、臨床試験を実施する。例えば、液性がんを有すると診断され、処置が必要な患者を選択し、処置群と１つまたは複数の対照群に分離することができ、ここで処置群にはペプチド模倣大環状分子を投与し、対照群にはプラセボまたは公知の抗がん薬物を投与する。したがって、ペプチド模倣大環状分子の処置の安全性および有効性は、生存および生活の質などの因子に関して患者群を比較することによって評価することができる。この例では、ペプチド模倣大環状分子で処置した患者群は、プラセボで処置した患者対照群と比較して、改善された生存期間の延長を示し得る。
製剤および投与
投与方法
【０２４９】
本開示の有効量のペプチド模倣大環状分子は、許容される投与方法のいずれかによって単回または複数回用量のいずれかで投与され得る。一部の実施形態では、本開示のペプチド模倣大環状分子は、例えば皮下、筋肉内、髄腔内、静脈内または硬膜外注射によって非経口投与される。例えば、ペプチド模倣大環状分子は、静脈内、動脈内、皮下または注入によって投与される。いくつかの例では、ペプチド模倣大環状分子は、静脈内投与される。いくつかの例では、ペプチド模倣大環状分子は、動脈内投与される。
【０２５０】
選択された投与経路に関わらず、本開示のペプチド模倣大環状分子、および／または本開示の医薬組成物は、薬学的に許容される剤形に製剤化される。本開示によるペプチド模倣大環状分子は、他の医薬品と類似して、ヒトまたは動物の医療において使用するのに好都合な任意の方式で投与するために製剤化され得る。
【０２５１】
一態様では、本開示は、１種または複数種の薬学的に許容されるキャリア（添加物）および／または賦形剤と一緒に製剤化された、治療上有効な量の上記のペプチド模倣大環状分子の１つまたは複数を含む医薬製剤を提供する。一実施形態では、本明細書に記載のペプチド模倣大環状分子の１つまたは複数は、非経口投与のために非経口投与のために製剤化され、本明細書に開示の１つまたは複数のペプチド模倣大環状分子は、水性もしくは非水性溶液、分散液、懸濁液もしくは乳濁液として、または使用直前に注入可能な滅菌溶液もしくは分散液に再構成することができる滅菌粉末として製剤化され得る。このような製剤は、糖、アルコール、抗酸化剤、バッファ、静菌剤、製剤を所期のレシピエントの血液と等張にする溶質、または懸濁化剤もしくは増粘剤を含むことができる。また、これらの組成物は、防腐剤、湿潤剤、乳化剤および分散化剤などのアジュバントを含有することができる。対象化合物に対する微生物の作用の防止は、様々な抗菌剤および抗真菌剤、例えばパラベン、クロロブタノール、フェノール  ソルビン酸等を含むことによって確保することができる。糖、塩化ナトリウムなどの等張剤等を組成物に含むことも望ましい。さらに、注射可能な医薬形態の吸収の延長は、吸収を遅延させる剤、例えばモノステアリン酸アルミニウムおよびゼラチンを含むことによってもたらすことができる。所望に応じて、製剤は、例えば等張食塩水またはブドウ糖溶液を用いて、使用前に希釈することができる。いくつかの例では、ペプチド模倣大環状分子は、水溶液として製剤化され、静脈内投与される。
投与量および投与頻度
【０２５２】
投与量は、様々な技術を使用して決定され得る。選択される投与量レベルは、用いられる特定のペプチド模倣大環状分子の活性、投与経路、投与時間、用いられる特定のペプチド模倣大環状分子の排泄または代謝速度、処置期間、用いられる特定のペプチド模倣大環状分子と組み合わせて使用される他の薬物、化合物および／または材料、処置を受ける患者の年齢、性別、体重、状態、全体的な健康状態および過去の既往歴、ならびに医療分野で周知の同様の因子を含めた様々な因子に応じて決まり得る。また投与量の値は、軽減される予定の状態の重症度と共に変わり得る。任意の特定の被験体のために、個々の必要性、および組成物を投与または投与を監督するヒトの専門的判断に従って、特異的な投与レジメンを経時的に調整することができる。
【０２５３】
医師または獣医師は、有効量の必要な化合物を処方することができる。例えば、医師または獣医師は、所望の治療効果を達成するために必要なレベルよりも低いレベルで化合物を用いて、本開示の化合物の投与を開始し、所望の効果が達成されるまで投与量を徐々に増大することができる。
【０２５４】
一部の実施形態では、本開示のペプチド模倣大環状分子の適切な日用量は、治療効果をもたらすのに有効な最少用量であるペプチド模倣大環状分子の量であり得る。このような有効用量は、一般に、上記の因子に依存する。所与の患者において最も有効な処置をもたらす任意の特定のペプチド模倣大環状分子の正確な投与時間および量は、特定のペプチド模倣大環状分子の活性、薬物動態およびバイオアベイラビリティ、患者の身体状態（年齢、性別、疾患のタイプおよびステージ、全体的な身体状態、所与の投与量に対する応答性、ならびに薬物療法のタイプを含む）、投与経路等に依存する。
【０２５５】
投与量は、患者の体重１ｋｇ当たりのペプチド模倣大環状分子の量に基づくことができる。あるいは、本開示の投与量は、ペプチド模倣大環状分子の血漿濃度を参照することによって決定され得る。例えば、最大血漿濃度（Ｃｍａｘ）および時間０から無限までの血漿濃度−時間曲線下面積（ＡＵＣ）を使用することができる。
【０２５６】
一部の実施形態では、被験体は、ヒト被験体であり、投与される化合物の量は、ヒト被験体の体重１キログラム当たり０．０１〜１００ｍｇである。例えば、様々な例では、投与される化合物の量は、ヒト被験体の体重１キログラム当たり約０．０１〜５０ｍｇ、約０．０１〜２０ｍｇ、約０．０１〜１０ｍｇ、約０．１〜１００ｍｇ、約０．１〜５０ｍｇ、約０．１〜２０ｍｇ、約０．１〜１０ｍｇ、約０．５〜１００ｍｇ、約０．５〜５０ｍｇ、約０．５〜２０ｍｇ、約０．５〜１０ｍｇ、約１〜１００ｍｇ、約１〜５０ｍｇ、約１〜２０ｍｇ、約１〜１０ｍｇである。一実施形態では、ヒト被験体の体重１キログラム当たり約０．５ｍｇ〜１０ｍｇのペプチド模倣大環状分子が投与される。いくつかの例では、投与される化合物の量は、ヒト被験体の体重１キログラム当たり約０．１６ｍｇ、約０．３２ｍｇ、約０．６４ｍｇ、約１．２８ｍｇ、約３．５６ｍｇ、約７．１２ｍｇ、約１４．２４ｍｇ、または約２０ｍｇである。いくつかの例では、投与される化合物の量は、ヒト被験体の体重１キログラム当たり約０．１６ｍｇ、約０．３２ｍｇ、約０．６４ｍｇ、約１．２８ｍｇ、約３．５６ｍｇ、約７．１２ｍｇ、または約１４．２４ｍｇである。いくつかの例では、投与される化合物の量は、ヒト被験体の体重１キログラム当たり約０．１６ｍｇである。いくつかの例では、投与される化合物の量は、ヒト被験体の体重１キログラム当たり約０．３２ｍｇである。いくつかの例では、投与される化合物の量は、ヒト被験体の体重１キログラム当たり約０．６４ｍｇである。いくつかの例では、投与される化合物の量は、ヒト被験体の体重１キログラム当たり約１．２８ｍｇである。いくつかの例では、投与される化合物の量は、ヒト被験体の体重１キログラム当たり約３．５６ｍｇである。いくつかの例では、投与される化合物の量は、ヒト被験体の体重１キログラム当たり約７．１２ｍｇである。いくつかの例では、投与される化合物の量は、ヒト被験体の体重１キログラム当たり約１４．２４ｍｇである。
【０２５７】
一部の実施形態では、ヒト被験体の体重１キログラム当たり約０．５〜約２０ｍｇまたは約０．５〜約１０ｍｇの化合物が、週２回投与される。例えば、ヒト被験体の体重１キログラム当たり約０．５〜約１ｍｇ、約０．５〜約５ｍｇ、約０．５〜約１０ｍｇ、約０．５〜約１５ｍｇ、約１〜約５ｍｇ、約１〜約１０ｍｇ、約１〜約１５ｍｇ、約１〜約２０ｍｇ、約５〜約１０ｍｇ、約１〜約１５ｍｇ、約５〜約２０ｍｇ、約１０〜約１５ｍｇ、約１０〜約２０ｍｇ、または約１５〜約２０ｍｇの化合物が、週約２回投与される。いくつかの例では、ヒト被験体の体重１キログラム当たり約１ｍｇ、約１．２５ｍｇ、約１．５ｍｇ、約１．７５ｍｇ、約２ｍｇ、約２．２５ｍｇ、約２．５ｍｇ、約２．７５ｍｇ、約３ｍｇ、約３．２５ｍｇ、約３．５ｍｇ、約３．７５ｍｇ、約４ｍｇ、約４．２５ｍｇ、約４．５ｍｇ、約４．７５ｍｇ、約５ｍｇ、約５．２５ｍｇ、約５．５ｍｇ、約５．７５ｍｇ、約６ｍｇ、約６．２５ｍｇ、約６．５ｍｇ、約６．７５ｍｇ、約７ｍｇ、約７．２５ｍｇ、約７．５ｍｇ、約７．７５ｍｇ、約８ｍｇ、約８．２５ｍｇ、約８．５ｍｇ、約８．７５ｍｇ、約９ｍｇ、約９．２５ｍｇ、約９．５ｍｇ、約９．７５ｍｇ、約１０ｍｇ、約１０．２５ｍｇ、約１０．５ｍｇ、約１０．７５ｍｇ、約１１ｍｇ、約１１．２５ｍｇ、約１１．５ｍｇ、約１１．７５ｍｇ、約１２ｍｇ、約１２．２５ｍｇ、約１２．５ｍｇ、約１２．７５ｍｇ、約１３ｍｇ、約１３．２５ｍｇ、約１３．５ｍｇ、約１３．７５ｍｇ、約１４ｍｇ、約１４．２５ｍｇ、約１４．５ｍｇ、約１４．７５ｍｇ、約１５ｍｇ、約１５．２５ｍｇ、約１５．５ｍｇ、約１５．７５ｍｇ、約１６ｍｇ、約１６．５ｍｇ、約１７ｍｇ、約１７．５ｍｇ、約１８ｍｇ、約１８．５ｍｇ、約１９ｍｇ、約１９．５ｍｇ、または約２０ｍｇの化合物が、週２回投与される。いくつかの例では、投与される化合物の量は、ヒト被験体の体重１キログラム当たり約１．２５ｍｇ、約２．５ｍｇ、約５ｍｇ、約１０ｍｇ、または約２０ｍｇであり、該化合物は、週２回投与される。いくつかの例では、投与される化合物の量は、ヒト被験体の体重１キログラム当たり約１．２５ｍｇ、約２．５ｍｇ、約５ｍｇまたは約１０ｍｇであり、該化合物は、週２回投与される。
【０２５８】
一部の実施形態では、ヒト被験体の体重１キログラム当たり約０．５〜約２０ｍｇまたは約０．５〜約１０ｍｇの化合物が、週１回投与される。例えば、ヒト被験体の体重１キログラム当たり約０．５〜約１ｍｇ、約０．５〜約５ｍｇ、約０．５〜約１０ｍｇ、約０．５〜約１５ｍｇ、約１〜約５ｍｇ、約１〜約１０ｍｇ、約１〜約１５ｍｇ、約１〜約２０ｍｇ、約５〜約１０ｍｇ、約１〜約１５ｍｇ、約５〜約２０ｍｇ、約１０〜約１５ｍｇ、約１０〜約２０ｍｇ、または約１５〜約２０ｍｇの化合物が、週１回投与される。いくつかの例では、ヒト被験体の体重１キログラム当たり約１ｍｇ、約１．２５ｍｇ、約１．５ｍｇ、約１．７５ｍｇ、約２ｍｇ、約２．２５ｍｇ、約２．５ｍｇ、約２．７５ｍｇ、約３ｍｇ、約３．２５ｍｇ、約３．５ｍｇ、約３．７５ｍｇ、約４ｍｇ、約４．２５ｍｇ、約４．５ｍｇ、約４．７５ｍｇ、約５ｍｇ、約５．２５ｍｇ、約５．５ｍｇ、約５．７５ｍｇ、約６ｍｇ、約６．２５ｍｇ、約６．５ｍｇ、約６．７５ｍｇ、約７ｍｇ、約７．２５ｍｇ、約７．５ｍｇ、約７．７５ｍｇ、約８ｍｇ、約８．２５ｍｇ、約８．５ｍｇ、約８．７５ｍｇ、約９ｍｇ、約９．２５ｍｇ、約９．５ｍｇ、約９．７５ｍｇ、約１０ｍｇ、約１０．２５ｍｇ、約１０．５ｍｇ、約１０．７５ｍｇ、約１１ｍｇ、約１１．２５ｍｇ、約１１．５ｍｇ、約１１．７５ｍｇ、約１２ｍｇ、約１２．２５ｍｇ、約１２．５ｍｇ、約１２．７５ｍｇ、約１３ｍｇ、約１３．２５ｍｇ、約１３．５ｍｇ、約１３．７５ｍｇ、約１４ｍｇ、約１４．２５ｍｇ、約１４．５ｍｇ、約１４．７５ｍｇ、約１５ｍｇ、約１５．２５ｍｇ、約１５．５ｍｇ、約１５．７５ｍｇ、約１６ｍｇ、約１６．５ｍｇ、約１７ｍｇ、約１７．５ｍｇ、約１８ｍｇ、約１８．５ｍｇ、約１９ｍｇ、約１９．５ｍｇ、または約２０ｍｇの化合物が、週１回投与される。いくつかの例では、投与される化合物の量は、ヒト被験体の体重１キログラム当たり約１．２５ｍｇ、約２．５ｍｇ、約５ｍｇ、約１０ｍｇ、または約２０ｍｇであり、該化合物は、週１回投与される。いくつかの例では、投与される化合物の量は、ヒト被験体の体重１キログラム当たり約１．２５ｍｇ、約２．５ｍｇ、約５ｍｇまたは約１０ｍｇであり、該化合物は、週１回投与される。
【０２５９】
一部の実施形態では、ヒト被験体の体重１キログラム当たり約０．５〜約２０ｍｇまたは約０．５〜約１０ｍｇの化合物が、週に３回、４回、５回、６回、または７回投与される。例えば、ヒト被験体の体重１キログラム当たり約０．５〜約１ｍｇ、約０．５〜約５ｍｇ、約０．５〜約１０ｍｇ、約０．５〜約１５ｍｇ、約１〜約５ｍｇ、約１〜約１０ｍｇ、約１〜約１５ｍｇ、約１〜約２０ｍｇ、約５〜約１０ｍｇ、約１〜約１５ｍｇ、約５〜約２０ｍｇ、約１０〜約１５ｍｇ、約１０〜約２０ｍｇ、または約１５〜約２０ｍｇの化合物が、週に３回、４回、５回、６回、または７回投与される。いくつかの例では、ヒト被験体の体重１キログラム当たり約１ｍｇ、約１．２５ｍｇ、約１．５ｍｇ、約１．７５ｍｇ、約２ｍｇ、約２．２５ｍｇ、約２．５ｍｇ、約２．７５ｍｇ、約３ｍｇ、約３．２５ｍｇ、約３．５ｍｇ、約３．７５ｍｇ、約４ｍｇ、約４．２５ｍｇ、約４．５ｍｇ、約４．７５ｍｇ、約５ｍｇ、約５．２５ｍｇ、約５．５ｍｇ、約５．７５ｍｇ、約６ｍｇ、約６．２５ｍｇ、約６．５ｍｇ、約６．７５ｍｇ、約７ｍｇ、約７．２５ｍｇ、約７．５ｍｇ、約７．７５ｍｇ、約８ｍｇ、約８．２５ｍｇ、約８．５ｍｇ、約８．７５ｍｇ、約９ｍｇ、約９．２５ｍｇ、約９．５ｍｇ、約９．７５ｍｇ、約１０ｍｇ、約１０．２５ｍｇ、約１０．５ｍｇ、約１０．７５ｍｇ、約１１ｍｇ、約１１．２５ｍｇ、約１１．５ｍｇ、約１１．７５ｍｇ、約１２ｍｇ、約１２．２５ｍｇ、約１２．５ｍｇ、約１２．７５ｍｇ、約１３ｍｇ、約１３．２５ｍｇ、約１３．５ｍｇ、約１３．７５ｍｇ、約１４ｍｇ、約１４．２５ｍｇ、約１４．５ｍｇ、約１４．７５ｍｇ、約１５ｍｇ、約１５．２５ｍｇ、約１５．５ｍｇ、約１５．７５ｍｇ、約１６ｍｇ、約１６．５ｍｇ、約１７ｍｇ、約１７．５ｍｇ、約１８ｍｇ、約１８．５ｍｇ、約１９ｍｇ、約１９．５ｍｇ、または約２０ｍｇの化合物が、週に３回、４回、５回、６回、または７回投与される。いくつかの例では、投与される化合物の量は、ヒト被験体の体重１キログラム当たり約１．２５ｍｇ、約２．５ｍｇ、約５ｍｇ、約１０ｍｇ、または約２０ｍｇであり、該化合物は、週に３回、４回、５回、６回、または７回投与される。いくつかの例では、投与される化合物の量は、ヒト被験体の体重１キログラム当たり約１．２５ｍｇ、約２．５ｍｇ、約５ｍｇまたは約１０ｍｇであり、該化合物は、週に３回、４回、５回、６回、または７回投与される。
【０２６０】
一部の実施形態では、ヒト被験体の体重１キログラム当たり約０．５〜約２０ｍｇまたは約０．５〜約１０ｍｇの化合物が、２週、３週、または４週ごとに１回投与される。例えば、ヒト被験体の体重１キログラム当たり約０．５〜約１ｍｇ、約０．５〜約５ｍｇ、約０．５〜約１０ｍｇ、約０．５〜約１５ｍｇ、約１〜約５ｍｇ、約１〜約１０ｍｇ、約１〜約１５ｍｇ、約１〜約２０ｍｇ、約５〜約１０ｍｇ、約１〜約１５ｍｇ、約５〜約２０ｍｇ、約１０〜約１５ｍｇ、約１０〜約２０ｍｇ、または約１５〜約２０ｍｇの化合物が、２週または３週ごとに３，４，５，６または７回、１回投与される。いくつかの例では、ヒト被験体の体重１キログラム当たり約１ｍｇ、約１．２５ｍｇ、約１．５ｍｇ、約１．７５ｍｇ、約２ｍｇ、約２．２５ｍｇ、約２．５ｍｇ、約２．７５ｍｇ、約３ｍｇ、約３．２５ｍｇ、約３．５ｍｇ、約３．７５ｍｇ、約４ｍｇ、約４．２５ｍｇ、約４．５ｍｇ、約４．７５ｍｇ、約５ｍｇ、約５．２５ｍｇ、約５．５ｍｇ、約５．７５ｍｇ、約６ｍｇ、約６．２５ｍｇ、約６．５ｍｇ、約６．７５ｍｇ、約７ｍｇ、約７．２５ｍｇ、約７．５ｍｇ、約７．７５ｍｇ、約８ｍｇ、約８．２５ｍｇ、約８．５ｍｇ、約８．７５ｍｇ、約９ｍｇ、約９．２５ｍｇ、約９．５ｍｇ、約９．７５ｍｇ、約１０ｍｇ、約１０．２５ｍｇ、約１０．５ｍｇ、約１０．７５ｍｇ、約１１ｍｇ、約１１．２５ｍｇ、約１１．５ｍｇ、約１１．７５ｍｇ、約１２ｍｇ、約１２．２５ｍｇ、約１２．５ｍｇ、約１２．７５ｍｇ、約１３ｍｇ、約１３．２５ｍｇ、約１３．５ｍｇ、約１３．７５ｍｇ、約１４ｍｇ、約１４．２５ｍｇ、約１４．５ｍｇ、約１４．７５ｍｇ、約１５ｍｇ、約１５．２５ｍｇ、約１５．５ｍｇ、約１５．７５ｍｇ、約１６ｍｇ、約１６．５ｍｇ、約１７ｍｇ、約１７．５ｍｇ、約１８ｍｇ、約１８．５ｍｇ、約１９ｍｇ、約１９．５ｍｇ、または約２０ｍｇの化合物が、２週または３週ごとに１回投与される。いくつかの例では、投与される化合物の量は、ヒト被験体の体重１キログラム当たり約１．２５ｍｇ、約２．５ｍｇ、約５ｍｇ、約１０ｍｇ、または約２０ｍｇであり、該化合物は、２週ごとに１回投与される。いくつかの例では、投与される化合物の量は、ヒト被験体の体重１キログラム当たり約１．２５ｍｇ、約２．５ｍｇ、約５ｍｇまたは約１０ｍｇであり、該化合物は、２週ごとに１回投与される。いくつかの例では、投与される化合物の量は、ヒト被験体の体重１キログラム当たり約１．２５ｍｇ、約２．５ｍｇ、約５ｍｇ、約１０ｍｇ、または約２０ｍｇであり、該化合物は、３週ごとに１回投与される。いくつかの例では、投与される化合物の量は、ヒト被験体の体重１キログラム当たり約１．２５ｍｇ、約２．５ｍｇ、約５ｍｇまたは約１０ｍｇであり、該化合物は、３週ごとに１回投与される。
【０２６１】
一部の実施形態では、化合物は、ある一定期間かけて徐々に投与される。所望の量の化合物は、例えば約０．１時間〜２４時間かけて徐々に投与され得る。ある場合には、所望の量の化合物は、０．１時間、０．５時間、１時間、１．５時間、２時間、２．５時間、３時間、３．５時間、４時間、４．５時間、５時間、６時間、７時間、８時間、９時間、１０時間、１１時間、１２時間、１３時間、１４時間、１５時間、１６時間、１７時間、１８時間、１９時間、２０時間、２１時間、２２時間、２３時間、または２４時間かけて徐々に投与される。いくつかの例では、所望の量の化合物は、０．２５〜１２時間かけて、例えば０．２５〜１時間、０．２５〜２時間、０．２５〜３時間、０．２５〜４時間、０．２５〜６時間、０．２５〜８時間、０．２５〜１０時間かけて徐々に投与される。いくつかの例では、所望の量の化合物は、０．２５〜２時間かけて徐々に投与される。いくつかの例では、所望の量の化合物は、０．２５〜１時間かけて徐々に投与される。いくつかの例では、所望の量の化合物は、０．２５時間、０．３時間、０．４時間、０．５時間、０．６時間、０．７時間、０．８時間、０．９時間、１．０時間、１．１時間、１．２時間、１．３時間、１．４時間、１．５時間、１．６時間、１．７時間、１．８時間、１．９時間、または２．０時間かけて徐々に投与される。いくつかの例では、所望の量の化合物は、１時間かけて徐々に投与される。いくつかの例では、所望の量の化合物は、２時間かけて徐々に投与される。
【０２６２】
化合物の投与は、必要な限り継続することができる。一部の実施形態では、本開示の１つまたは複数の化合物は、１日超、１週超、１カ月超、２カ月超、３カ月超、４カ月超、５カ月超、６カ月超、７カ月超、８カ月超、９カ月超、１０カ月超、１１カ月超、１２カ月超、１３カ月超、１４カ月超、１５カ月超、１６カ月超、１７カ月超、１８カ月超、１９カ月超、２０カ月超、２１カ月超、２２カ月超、２３カ月超、または２４カ月超投与される。一部の実施形態では、本開示の１つまたは複数の化合物は、１週未満、１カ月未満、２カ月未満、３カ月未満、４カ月未満、５カ月未満、６カ月未満、７カ月未満、８カ月未満、９カ月未満、１０カ月未満、１１カ月未満、１２カ月未満、１３カ月未満、１４カ月未満、１５カ月未満、１６カ月未満、１７カ月未満、１８カ月未満、１９カ月未満、２０カ月未満、２１カ月未満、２２カ月未満、２３カ月未満、または２４カ月未満投与される。
【０２６３】
一部の実施形態では、化合物は、２８日サイクルの１日目、８日目、１５日目および２８日目に投与される。一部の実施形態では、化合物は、２８日サイクルの１日目、８日目、１５日目および２８日目に投与され、投与は、２つのサイクルの間継続される。一部の実施形態では、化合物は、２８日サイクルの１日目、８日目、１５日目および２８日目に投与され、投与は、３つのサイクルの間継続される。一部の実施形態では、化合物は、２８日サイクルの１日目、８日目、１５日目および２８日目に投与され、投与は、４、５、６、７、８、９、１０、またはそれを超えるサイクルの間継続される。
【０２６４】
一部の実施形態では、化合物は、２１日サイクルの１日目、８日目、１１日目および２１日目に投与される。一部の実施形態では、化合物は、２１日サイクルの１日目、８日目、１１日目および２１日目に投与され、投与は、２つのサイクルの間継続される。一部の実施形態では、化合物は、２１日サイクルの１日目、８日目、１１日目および２１日目に投与され、投与は、３つのサイクルの間継続される。一部の実施形態では、化合物は、２１日サイクルの１日目、８日目、１１日目および２１日目に投与され、投与は、４、５、６、７、８、９、１０、またはそれを超えるサイクルの間継続される。
【０２６５】
一部の実施形態では、本開示の１つまたは複数の化合物は、長期にわたって継続的に投与される。一部の実施形態では、本開示の１つまたは複数の化合物の投与は、疾患の進行、許容されない毒性、または患者もしくは医師による投与中断の決定が記載されるまで継続される。
方法および使用
【０２６６】
一態様では、本開示は、被験体における液性がんを処置する方法であって、該被験体に、治療有効量のペプチド模倣大環状分子または薬学的に許容されるその塩を投与するステップを含み、該ペプチド模倣大環状分子が、ＭＤＭ２タンパク質および／またはＭＤＭＸタンパク質に結合する方法を提供する。一部の実施形態では、ペプチド模倣大環状分子は、ｐ５３とＭＤＭ２およびＭＤＭＸとの間の相互作用を妨害し得る。一部の実施形態では、本明細書に開示の方法による処置は、ヒト被験体において、ｐ５３経路を再活性化し、液性がん細胞の増殖を低減し、ｐ５３タンパク質を増大し、ｐ２１を増大し、かつ／またはアポトーシスを増大し得る。
【０２６７】
一態様では、本開示は、被験体においてｐ５３非活性化変異が欠如していると決定された液性がんを処置する方法であって、該被験体に、治療有効量のペプチド模倣大環状分子または薬学的に許容されるその塩を投与するステップを含み、該ペプチド模倣大環状分子が、ＭＤＭ２タンパク質および／またはＭＤＭＸタンパク質に結合する方法を提供する。一部の実施形態では、ペプチド模倣大環状分子は、ｐ５３とＭＤＭ２およびＭＤＭＸとの間の相互作用を妨害し得る。該方法は、ペプチド模倣大環状分子を投与する前の被験体におけるｐ５３非活性化変異の欠如を確認するステップをさらに含み得る。一部の実施形態では、本明細書に開示の方法による処置は、ヒト被験体において、ｐ５３経路を再活性化し、液性がん細胞の増殖を低減し、ｐ５３タンパク質を増大し、ｐ２１を増大し、かつ／またはアポトーシスを増大し得る。
【０２６８】
一態様では、本開示は、野生型ｐ５３を発現する被験体における液性がんを処置する方法であって、該被験体に、治療有効量のペプチド模倣大環状分子または薬学的に許容されるその塩を投与するステップを含み、該ペプチド模倣大環状分子が、ＭＤＭ２タンパク質および／またはＭＤＭＸタンパク質に結合する方法を提供する。一部の実施形態では、ペプチド模倣大環状分子は、ｐ５３とＭＤＭ２およびＭＤＭＸとの間の相互作用を妨害し得る。該方法は、ペプチド模倣大環状分子を投与する前の被験体における野生型ｐ５３ステータスを確認するステップをさらに含み得る。一部の実施形態では、本明細書に開示の方法による処置は、ヒト被験体において、ｐ５３経路を再活性化し、液性がん細胞の増殖を低減し、ｐ５３タンパク質を増大し、ｐ２１を増大し、かつ／またはアポトーシスを増大し得る。
【０２６９】
一部の実施形態では、本明細書で提供される液性がんを処置する方法は、液性がんと関連する液性がん細胞、例えばＣＴＣまたはＭＮＢＣを、阻害、低減、減少、抑止、または安定化する。他の実施形態では、本明細書で提供される液性がんを処置する方法は、液性がんと関連する症状またはその２つもしくはそれ超の症状を、阻害、低減、減少、抑止、または安定化する。いくつかの例では、本明細書で提供される液性がんを処置する方法は、液性がん細胞の数および／または液性がんと関連する１つもしくは複数の症状の退行を引き起こす。他の例では、本明細書で提供される液性がんを処置する方法は、液性がん細胞の数を維持し、したがって液性がん細胞の数は、例えば当業者に利用可能な従来の方法、例えば超音波、ＣＴスキャン、ＭＲＩ、ダイナミック造影ＭＲＩ、またはＰＥＴスキャンによって測定して増大しないか、または標準治療の投与後のいくつかの液性がん細胞の増大ほど増大しない。いくつかの例では、本明細書で提供される液性がんを処置する方法は、液性がん細胞の数を低減する。いくつかの例では、本明細書で提供される液性がんを処置する方法は、液性がん細胞の形成を低減する。いくつかの例では、本明細書で提供される液性がんを処置する方法は、液性がんと関連する原発性、局所性および／または転移性液性がん細胞を、根絶、除去、または調節する。いくつかの例では、本明細書で提供される液性がんを処置する方法は、液性がんと関連する転移の数またはサイズを低減する。いくつかの例では、本明細書で提供される液性がんを処置する方法は、例えばＣＴスキャン、ＭＲＩ、ＤＣＥ−ＭＲＩ、またはＰＥＴスキャンによって評価して、ペプチド模倣大環状分子の投与前の被験体における液性がん細胞の数と比較して、被験体における液性がん細胞の数を、約５〜約１０％、約５〜約２０％、約１０〜約２０％、約１５〜約２０％、約１０〜約３０％、約２０〜約３０％、約２０〜約４０％、約３０〜約４０％、約１０〜約５０％、約２０〜約５０％、約３０〜約５０％、約４０〜約５０％、約１０〜約６０％、約２０〜約６０％、約３０〜約６０％、約４０〜約６０％、約５０〜約６０％、約１０〜約７０％、約２０〜約７０％、約３０〜約７０％、約４０〜約７０％、約５０〜約７０％、約６０〜約７０％、約１０〜約８０％、約２０〜約８０％、約３０〜約８０％、約４０〜約８０％、約５０〜約８０％、約６０〜約８０％、約７０〜約８０％、約１０〜約９０％、約２０〜約９０％、約３０〜約９０％、約４０〜約９０％、約５０〜約９０％、約６０〜約９０％、約７０〜約９０％、約８０〜約９０％、約１０〜約１００％、約２０％〜約１００％、約３０〜約１００％、約４０〜約１００％、約５０〜約１００％、約６０〜約１００％、約７０〜約１００％、約８０〜約１００％、約９０〜約１００％、約９５〜約１００％の範囲、またはその間の任意の範囲の量、低減する。ある特定の実施形態では、本明細書の方法は、例えばＣＴスキャン、ＭＲＩ、ＤＣＥ−ＭＲＩ、またはＰＥＴスキャンによって評価して、ペプチド模倣大環状分子の投与前の液性がん細胞の数と比較して、被験体における液性がん細胞の数を、少なくとも約５％、少なくとも約１０％、少なくとも約１５％、少なくとも約２０％、少なくとも約２５％、少なくとも約３０％、少なくとも約３５％、少なくとも約４０％、少なくとも約４５％、少なくとも約５０％、少なくとも約５５％、少なくとも約６０％、少なくとも約６５％、少なくとも約７０％、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９９％、または約１００％、低減する。
【０２７０】
一部の実施形態では、本明細書で提供される方法は、例えばＭＲＩ、ＤＣＥ−ＭＲＩ、またはＰＥＴスキャンによって評価して、ペプチド模倣大環状分子の投与前の液性がん細胞灌流と比較して、被験体における液性がん細胞灌流を、約５〜約１０％、約５〜約２０％、約１０〜約２０％、約１５〜約２０％、約１０〜約３０％、約２０〜約３０％、約２０〜約４０％、約３０〜約４０％、約１０〜約５０％、約２０〜約５０％、約３０〜約５０％、約４０〜約５０％、約１０〜約６０％、約２０〜約６０％、約３０〜約６０％、約４０〜約６０％、約５０〜約６０％、約１０〜約７０％、約２０〜約７０％、約３０〜約７０％、約４０〜約７０％、約５０〜約７０％、約６０〜約７０％、約１０〜約８０％、約２０〜約８０％、約３０〜約８０％、約４０〜約８０％、約５０〜約８０％、約６０〜約８０％、約７０〜約８０％、約１０〜約９０％、約２０〜約９０％、約３０〜約９０％、約４０〜約９０％、約５０〜約９０％、約６０〜約９０％、約７０〜約９０％、約８０〜約９０％、約１０〜約１００％、約２０％〜約１００％、約３０〜約１００％、約４０〜約１００％、約５０〜約１００％、約６０〜約１００％、約７０〜約１００％、約８０〜約１００％、約９０〜約１００％、約９５〜約１００％の範囲、またはその間の任意の範囲の量、低減する。ある特定の実施形態では、本明細書で提供される方法は、例えばＭＲＩ、ＤＣＥ−ＭＲＩ、またはＰＥＴスキャンによって評価して、ペプチド模倣大環状分子の投与前の液性がん細胞灌流と比較して、被験体における液性がん細胞灌流を、少なくとも約５％、約１０％、約１５％、約２０％、約２５％、約３０％、約３５％、約４０％、約４５％、約５０％、約５５％、約６０％、約６５％、約７０％、約７５％、約８０％、約８５％、約９０％、約９５％、約９９％、または約１００％、低減する。
【０２７１】
一部の実施形態では、本明細書で提供される方法は、例えばＭＲＩ、ＤＣＥ−ＭＲＩ、またはＰＥＴスキャンによって評価して、ペプチド模倣大環状分子の投与前の液性がん細胞代謝と比較して、被験体における液性がん細胞代謝を、約５〜約１０％、約５〜約２０％、約１０〜約２０％、約１５〜約２０％、約１０〜約３０％、約２０〜約３０％、約２０〜約４０％、約３０〜約４０％、約１０〜約５０％、約２０〜約５０％、約３０〜約５０％、約４０〜約５０％、約１０〜約６０％、約２０〜約６０％、約３０〜約６０％、約４０〜約６０％、約５０〜約６０％、約１０〜約７０％、約２０〜約７０％、約３０〜約７０％、約４０〜約７０％、約５０〜約７０％、約６０〜約７０％、約１０〜約８０％、約２０〜約８０％、約３０〜約８０％、約４０〜約８０％、約５０〜約８０％、約６０〜約８０％、約７０〜約８０％、約１０〜約９０％、約２０〜約９０％、約３０〜約９０％、約４０〜約９０％、約５０〜約９０％、約６０〜約９０％、約７０〜約９０％、約８０〜約９０％、約１０〜約１００％、約２０％〜約１００％、約３０〜約１００％、約４０〜約１００％、約５０〜約１００％、約６０〜約１００％、約７０〜約１００％、約８０〜約１００％、約９０〜約１００％、約９５〜約１００％の範囲、またはその間の任意の範囲、阻害または低減する。ある特定の実施形態では、本明細書で提供される方法は、例えばＰＥＴスキャンによって評価して、被験体における液性がん細胞代謝を阻害または低減する。特定の実施形態では、本明細書で提供される方法は、ペプチド模倣大環状分子の投与前の液性がん細胞代謝と比較して、被験体における液性がん細胞代謝を、少なくとも約５％、少なくとも約１０％、少なくとも約１５％、少なくとも約２０％、少なくとも約２５％、少なくとも約３０％、少なくとも約３５％、少なくとも約４０％、少なくとも約４５％、少なくとも約５０％、少なくとも約５５％、少なくとも約６０％、少なくとも約６５％、少なくとも約７０％、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、または約１００％、阻害または低減する。
【０２７２】
他の態様では、本開示は、ｐ５３非活性化変異が欠如していると決定された液性がんおよび／または野生型ｐ５３を発現する液性がんを有する被験体の生存期間を延長する方法であって、該被験体に、治療有効量のペプチド模倣大環状分子または薬学的に許容されるその塩を投与するステップを含み、該ペプチド模倣大環状分子が、ＭＤＭ２タンパク質および／またはＭＤＭＸタンパク質に結合する方法を提供する。いくつかの例では、被験体の生存期間は、該被験体が本明細書で提供される方法に従って処置されなかった場合の該被験体の予測生存期間よりも、少なくとも３０日長い。いくつかの例では、被験体の生存期間は、被験体が本明細書で提供される方法に従って処置されなかった場合の該被験体の予測生存期間よりも、１カ月〜約５年長い。例えば、被験体の生存期間は、該被験体が本明細書に開示の方法（the  methods  disclosed  herein  disclosure）に従って処置されなかった場合の該被験体の予測生存期間よりも、少なくとも３カ月、少なくとも６カ月、少なくとも９カ月、少なくとも１２カ月、少なくとも１５カ月、少なくとも１８カ月、少なくとも２１カ月、または少なくとも２４カ月長い。
【０２７３】
一態様では、本開示は、液性がんに罹患している被験体におけるバイオマーカーの存在、非存在または量を評価する方法（a  method  to  assessed）を提供する。いくつかの例では、バイオマーカーには、患者のバイオマーカー、例えば被験体におけるｐ５３ステータス、ならびに被験体におけるＭＤＭ２およびＭＤＭＸ発現レベルが含まれる。
【０２７４】
本開示の方法はまた、任意選択で、被験体における本明細書に開示のペプチド模倣大環状分子の安全性および／または忍容性を研究かつ／または評価するステップを含み得る。
【０２７５】
また本明細書では、ｐ５３非活性化変異が欠如している、かつ／または野生型ｐ５３を発現する液性がんを有する被験体において、ｐ５３経路を再活性化する方法であって、該被験体に、治療有効量のペプチド模倣大環状分子または薬学的に許容されるその塩を投与するステップを含み、該ペプチド模倣大環状分子が、ＭＤＭ２タンパク質および／またはＭＤＭＸタンパク質に結合する方法が提供される。
【０２７６】
また本明細書では、ｐ５３非活性化変異が欠如している、かつ／または野生型ｐ５３を発現する液性がんを有するヒト被験体において、液性がん細胞の増殖を低減する方法であって、該被験体に、治療有効量のペプチド模倣大環状分子または薬学的に許容されるその塩を投与するステップを含み、該ペプチド模倣大環状分子が、ＭＤＭ２タンパク質および／またはＭＤＭＸタンパク質に結合する方法が提供される。
【０２７７】
また本明細書では、ｐ５３非活性化変異が欠如している、かつ／または野生型ｐ５３を発現する液性がんを有する被験体において、ｐ５３タンパク質を増大する方法（a  method  to  increased）であって、該被験体に、治療有効量のペプチド模倣大環状分子または薬学的に許容されるその塩を投与するステップを含み、該ペプチド模倣大環状分子が、ＭＤＭ２タンパク質および／またはＭＤＭＸタンパク質に結合する方法が提供される。
【０２７８】
また本明細書では、ｐ５３非活性化変異が欠如している、かつ／または野生型ｐ５３を発現する液性がんを有する被験体において、ｐ２１を増大する方法であって、該被験体に、治療有効量のペプチド模倣大環状分子または薬学的に許容されるその塩を投与するステップを含み、該ペプチド模倣大環状分子が、ＭＤＭ２タンパク質および／またはＭＤＭＸタンパク質に結合する方法が提供される。
【０２７９】
また本明細書では、ｐ５３非活性化変異が欠如している、かつ／または野生型ｐ５３を発現する液性がんを有する被験体において、アポトーシスを増大する方法であって、該被験体に、治療有効量のペプチド模倣大環状分子または薬学的に許容されるその塩を投与するステップを含み、該ペプチド模倣大環状分子が、ＭＤＭ２タンパク質および／またはＭＤＭＸタンパク質に結合する方法が提供される。
【０２８０】
一部の実施形態では、本開示はまた、ｐ５３非活性化変異が欠如している、かつ／または野生型ｐ５３を発現する液性がん（例えば、液性リンパ腫）を有している被験体における、本明細書に開示のペプチド模倣大環状分子の用量制限毒性（ＤＬＴ）および／または最大耐用量（ＭＴＤまたはＯＢＤ）または最適な生物学的用量（ＯＢＤ）を決定する方法を提供する。
【０２８１】
本開示の方法は、任意選択で、本明細書に開示のペプチド模倣大環状分子の薬物動態分析を含み得る。したがって、該方法は、１つまたは複数の特定の時点において被験体から１つまたは複数の生体試料を収集し、ペプチド模倣大環状分子および／またはその（it）代謝産物のレベルについて該１つまたは複数の生体試料を分析するステップをさらに含み得る。生体試料は、被験体の血液試料、例えばヒト被験体の血液試料であり得る。１つまたは複数の特定の時点は、ペプチド模倣大環状分子を被験体に投与する前、投与した後、および／または投与している最中の時点が含まれ得る。一部の実施形態では、１つまたは複数の生体試料は、ペプチド模倣大環状分子を被験体にそれぞれ投与する前および投与した後に収集された生体試料を含む。一部の実施形態では、薬物動態分析のための生体試料は、最初にペプチド模倣大環状分子を被験体に投与する前、およびペプチド模倣大環状分子を被験体にそれぞれ投与した後の１つまたは複数の時点で収集される。ペプチド模倣大環状分子を被験体に投与する前に収集される生体試料は、ペプチド模倣大環状分子を被験体に投与し始める前、０〜２４時間以内に収集され得る。例えば、生体試料は、ペプチド模倣大環状分子を被験体に投与する前、２４時間以内、２３時間以内、２２時間以内、２１時間以内、２０時間以内、１９時間以内、１８時間以内、１７時間以内、１６時間以内、１５時間以内、１４時間以内、１３時間以内、１２時間以内、１１時間以内、１０時間以内、９時間以内、８時間以内、７時間以内、６時間以内、５時間以内、４時間以内、３時間以内、２時間以内、１時間以内、３０分間以内、１５分間以内、または直前に収集され得る。ペプチド模倣大環状分子を被験体に投与した後に収集される１つまたは複数の生体試料は、ペプチド模倣大環状分子を被験体に投与してから、例えば０分後、５分後、１０分後、２０分後、３０分後、４５分後、６０分後、１．２５時間後、１．５時間後、１．７５時間後、２．０時間後、２．２５時間後、２．５時間後、２．７５時間後、３．０時間後、３．２５時間後、３．５時間後、３．７５時間後、４．０時間後、４．２５時間後、４．５時間後、４．７５時間後、５．０時間後、５．２５時間後、５．５時間後、５．７５時間後、６．０時間後、６．２５時間後、６．５時間後、６．７５時間後、７．０時間後、７．２５時間後、７．５時間後、７．７５時間後、８．０時間後、８．２５時間後、８．５時間後、８．７５時間後、９．０時間後、９．２５時間後、９．５時間後、９．７５時間後、１０．０時間後、１０．２５時間後、１０．５時間後、１０．７５時間後、１１．０時間後、１１．２５時間後、１１．５時間後、１１．７５時間後、１２．０時間後、２０時間後、２４時間後、２８時間後、３２時間後、３６時間後、４０時間後、４４時間後、４８時間後、５２時間後、５６時間後、６０時間後、６４時間後、６８時間後、７２時間後、または０〜７２時間後に収集され得る。一部の実施形態では、ペプチド模倣大環状分子は、２８日サイクルの１日目、８日目、１５日目に投与され、生体試料は、１日目の投与前、１日目の投与後（複数の生体試料を、例えば投与の約０分後、約３０分後、約１時間���、約２時間後、約４時間後、約８時間後、約２４時間後、および４８時間後に収集することができる）、８日目の投与前、８日目の投与後（複数の生体試料を、例えば投与の約０分後、約３０分後、約１時間後、約２時間後、および約４時間後に収集することができる）、１５日目の投与前、および１５日目の投与後（複数の生体試料を、例えば投与の約０分後、約３０分後、約１時間後、約２時間後、約４時間後、約８時間後、および約２４時間後に収集することができる）に収集される。一部の実施形態では、ペプチド模倣大環状分子は、２１日サイクルの１日目、８日目、１１日目に投与され、生体試料は、１日目の投与前、１日目の投与後（複数の生体試料を、例えば投与の約０分後、約３０分後、約１時間後、約２時間後、約４時間後、約８時間後、約２４時間後、および４８時間後に収集することができる）、８日目の投与前、８日目の投与後（複数の生体試料を、例えば投与の約０分後、約３０分後、約１時間後、約２時間後、および約４時間後に収集することができる）、１１日目の投与前、および１１日目の投与後（複数の生体試料を、例えば投与の約０分後、約３０分後、約１時間後、約２時間後、約４時間後、約８時間後、および約２４時間後に収集することができる）に収集される。
【０２８２】
本開示の方法は、任意選択で、本明細書に開示のペプチド模倣大環状分子の薬力学的分析を含み得る。したがって、該方法は、薬力学的分析のために、１つまたは複数の特定の時点において被験体から１つまたは複数の生体試料を収集するステップを含み得る。薬力学的分析は、生体試料のＭＩＣ−１、ｐ５３、ＭＤＭ２、ＭＤＭＸ、ｐ２１および／または症例を含むバイオマーカーのレベルの分析を含み得る。生体試料中のバイオマーカーの検出は、例えば、直接測定、免疫組織化学検査、免疫ブロット、免疫蛍光法（immunoflourescense）、免疫吸着（immunoabsorbence）、免疫沈降、タンパク質アレイ、蛍光（flourescence）インサイツハイブリダイゼーション、ＦＡＣＳ分析、ハイブリダイゼーション、インサイツハイブリダイゼーション、ノーザンブロット、サザンブロット、ウエスタンブロット、ＥＬＩＳＡ、放射イムノアッセイ、遺伝子アレイ／チップ、ＰＣＲ、ＲＴ−ＰＣＲ、または細胞遺伝学的分析によって実施され得る。薬力学的分析のための生体試料は、被験体由来の血液試料または液性がん細胞被検物であってよく、例えば薬力学的分析のための生体試料は、ヒト被験体由来の血液試料または液性がん細胞被検物であってよい。ペプチド模倣大環状分子の薬力学的分析のための生体試料は、該ペプチド模倣大環状分子を被験体に投与する前、投与している最中、または投与した後の任意の時間に収集され得る。一部の実施形態では、薬物動態分析のための血液試料は、最初にペプチド模倣大環状分子を被験体に投与する前、およびペプチド模倣大環状分子を被験体にそれぞれ投与した後の１つまたは複数の時点に収集される。ペプチド模倣大環状分子を被験体に投与する前に収集される血液試料は、ペプチド模倣大環状分子を被験体に投与し始める前、０〜２４時間以内に収集され得る。例えば、生体試料は、ペプチド模倣大環状分子を被験体に投与する前、２４時間以内、２３時間以内、２２時間以内、２１時間以内、２０時間以内、１９時間以内、１８時間以内、１７時間以内、１６時間以内、１５時間以内、１４時間以内、１３時間以内、１２時間以内、１１時間以内、１０時間以内、９時間以内、８時間以内、７時間以内、６時間以内、５時間以内、４時間以内、３時間以内、２時間以内、１時間以内、３０分以内、１５分以内、または直前に収集され得る。ペプチド模倣大環状分子を被験体に投与した後に収集される薬力学的分析のための１つまたは複数の血液試料は、ペプチド模倣大環状分子を被験体に投与してから０〜約７２時間後、例えば約１２時間後、約２４時間後、約３６時間後または約４８時間後に収集され得る。一部の実施形態では、ペプチド模倣大環状分子は、２８日サイクルの１日目、８日目、１５日目に投与され、薬力学的分析のための血液試料は、１日目の投与前、１日目の投与後（複数の試料を、例えば投与の約２４時間後および４８時間後に収集することができる）、８日目の投与前、８日目の投与後（複数の試料を、例えば、投与の約１時間で（with  about  1  h  administration）収集することができる）、１５日目の投与前、および１５日目の投与後（複数の試料を、例えば、投与後約１時間および約４８時間で収集することができる）、ならびに２２日目に収集される。薬力学的分析の��体試料は、ペプチド模倣大環状分子を被験体に投与する前、投与した後、または投与している最中の任意の時間に収集され得る。例えば、ペプチド模倣大環状分子は、２８日サイクルの１日目、８日目、１５日目に投与することができ、薬力学的分析のための液性がん細胞試料は、１日目の投与前、および１４日目〜１８日目、例えば１６日目に（of  day  16）収集される。一部の実施形態では、ペプチド模倣大環状分子は、２１日サイクルの１日目、８日目、１１日目に投与され、薬力学的分析のための血液試料は、１日目の投与前、１日目の投与後（複数の試料を、例えば投与してから約２４時間後および４８時間後に収集することができる）、８日目の投与前、８日目の投与後（複数の試料を、例えば、投与の約１時間で収集することができる）、１１日目の投与前、および１１日目の投与後（複数の試料を、例えば、投与後約１時間および約４８時間で収集することができる）、ならびに２２日目に収集される。薬力学的分析のための生体試料は、ペプチド模倣大環状分子を被験体に投与する前、投与した後、または投与している最中の任意の時間に収集され得る。例えば、ペプチド模倣大環状分子は、２１日サイクルの１日目、８日目、１１日目に投与することができ、薬力学的分析のための液性がん細胞試料は、１日目の投与前、および１０日目〜１４日目、例えば１２日目に収集される。
【０２８３】
本開示の方法は、任意選択で、本明細書に開示のペプチド模倣大環状分子の臨床活性分析を含み得る。したがって、該方法は、１つまたは複数の特定の時点において被験体から収集された１つまたは複数の生体試料を分析するステップを含み得る。任意の適切な分析手順を、生体試料の分析のために使用することができる。例えば、X線写真、超音波、ＣＴスキャン、ＰＥＴスキャン、ＭＲＩスキャン、胸部Ｘ線、腹腔鏡検査、全血算（ＣＢＣ）検査、骨スキャンおよび便潜血検査のような画像化技術を使用することができる。使用され得るさらなる分析手順には、血液化学分析、染色体転座分析、針生検、組織生検、蛍光インサイツハイブリダイゼーション、臨床検査バイオマーカー分析、免疫組織化学的染色法、フローサイトメトリー、またはそれらの組合せが含まれる。該方法は、分析手順の結果を作表および／または作図するステップをさらに含み得る。
【０２８４】
例えば、薬力学は、液性がん細胞組織におけるｐ２１、カスパーゼおよびＭＤＭ２、ならびに利用可能な場合にはペプチド模倣大環状分子で処置する前および処置した後の血中のＣＴＣおよびＭＩＣ−１のレベルを含むｐ５３活性化のいくつかのバイオマーカーの検査室ベースの評価によって評価され得る。
【０２８５】
過去の遺伝的試験およびバイオマーカー試験、ならびにペプチド模倣大環状分子の安全性および有効性に関連するバイオマーカーに関する血液および液性がん細胞試料（t  liquid  cancer  cell  sample）の追加の試験から利用可能な結果は、患者の結果との可能な相関について調査され得る。
【０２８６】
例えば、臨床活性または奏効は、標準画像化評価、例えばコンピューター断層撮影法（ＣＴ）、磁気共鳴画像法（ＭＲＩ）、および骨スキャンによって評価され得る。さらに、［１８Ｆ］−フルオロデオキシグルコースおよび［１８Ｆ］−フルオロチミジン陽電子放出断層撮影（それぞれＦＤＧ−ＰＥＴおよびＦＬＴ−ＰＥＴ）、または患者の特定の疾患タイプに臨床的に適しているとみなされる他の技術が使用され得る。ＣＴ−画像化は、例えばサイクル２の終了時、およびその後ＤＲ−Ａのために２サイクルごと（例えばサイクル４および６）、ならびにサイクル３の最終注入後、およびその後ＤＲ−Ｂにおいて３サイクルごと（例えばサイクル６および９）に実施され得る。抗液性がん細胞活性は、液性リンパ腫を有する患者のためのＩＷＧ（２０１４年）（付録Ｈ）判定基準を使用して評価され得る。さらに、ＦＤＧ集積型の液性リンパ腫を有する患者では、ＩＷＧ  ２０１４に概説されている通り、ベースラインおよびベースライン後にＦＤＧ−ＰＥＴ画像化が実施され得る。ＦＬＴ−ＰＥＴ画像化は、一般にＦＬＴトレーサーの十分な取込みを示す液性がん細胞を有する患者、例えば液性リンパ腫を有する患者では、ベースラインで実施され得る。例えば、ベースラインにおいて≧５の標準取込み値（ＳＵＶ）を示す、ＤＲ−Ａに割り当てられた患者では、サイクル１における被験薬の最終注入の１日後、すなわち１６日目に、反復ＦＬＴ画像を得てよい。例えば、ベースラインにおいて≧５の標準取込み値（ＳＵＶ）を示すＤＲ−Ｂ患者では、サイクル１における被験薬の最終注入の１日後、すなわち１２日目に、反復ＦＬＴ画像を得てよい。
生体試料
【０２８７】
本願で使用される場合、「生体試料」は、正常なまたは疾患状態にある被験体の身体由来の任意の体液または他の材料、例えば血液、血清、血漿、リンパ、尿、唾液、涙、脳脊髄液、乳、羊水、胆汁、腹水、膿等を意味する。また、用語「生体試料」の意味には、器官または組織抽出物、ならびに被験体由来の任意の細胞または組織調製物をインキュベートした培養液（culture  fluid）が含まれる。また、生体試料には、液性がん細胞試料または被検物が含まれる。液性がん細胞試料は、液性がん細胞組織試料であり得る。一部の実施形態では、液性がん細胞組織試料は、外科的に切除された組織から得ることができる。また、組織試料および細胞試料は、侵襲的な外科手術を用いずに、例えば細針を用いて胸壁もしくは腹壁を穿刺し、または乳房、甲状腺もしくは他の部位の塊から穿刺し、細胞材料を取り出すことによって（細針吸引生検）得ることができる。一部の実施形態では、生体試料は、骨髄吸引試料である。
【０２８８】
得られた生体試料は、試料の性質、使用されるアッセイ、および実務者の利便性に応じて、新鮮な、凍結した、または固定した（例えば、パラフィン包埋した）形態で使用され得る。新鮮な、凍結した、および固定した材料は、様々なＲＮＡおよびタンパク質アッセイに適しているが、一般に、活性のｅｘ  ｖｉｖｏ測定には、新鮮な組織が好ましい場合がある。
【０２８９】
固定組織試料を用いることもできる。生検によって得られた組織は、通常、例えばホルマリン、ホルムアルデヒドもしくはグルタルアルデヒド（gluteraldehyde）によって、またはアルコール浸漬によってしばしば固定される。固定生体試料は、しばしば脱水され、パラフィンまたは他の固体支持体に包埋される。参考文献として、Plenatら、２００１年、Ann.  Pathol.  ２１巻：２９〜４７頁を参照されたい。本発明の方法では、非包埋固定組織および包埋固定組織が使用され得る。固定組織を包埋するための固体支持体は、有機溶媒を用いて除去して、その後、保存組織の再水和を可能にすることができる。
【０２９０】
ある場合には、アッセイは、細胞または組織の培養ステップを含む。例えば、生検由来の細胞は、酵素（例えば、コラゲナーゼおよびヒアルロニダーゼ）およびまたは細胞を解離させるための物理的妨害（例えば２５ゲージ針を繰り返し通過させる）を使用して脱凝集させ、遠心分離によって収集し、培養、即時分析またはさらなる処理のために所望の緩衝液または培養培地に再懸濁させることができる。
被験体／患者集団
【０２９１】
一部の実施形態では、本明細書で提供される方法に従って液性がんを処置される被験体は、液性がんを有するか、または有すると診断されたヒトである。他の実施形態では、本明細書で提供される方法に従って液性がんを処置される被験体は、液性がんの素因があるか、または罹患しやすいヒトである。一部の実施形態では、本明細書で提供される方法に従って液性がんを処置される被験体は、液性がんを発症する危険性があるヒトである。
【０２９２】
一部の実施形態では、本明細書で提供される方法に従って液性がんを処置される被験体は、ｐ５３非活性化変異が欠如している、かつ／または野生型ｐ５３を発現すると決定された液性がんを有しているか、または有していると診断されたヒトである。他の実施形態では、本明細書で提供される方法に従って液性がんを処置される被験体は、ｐ５３非活性化変異が欠如している、かつ／または野生型ｐ５３を発現すると決定された液性がんの素因があるか、または罹患しやすいヒトである。一部の実施形態では、本明細書で提供される方法に従って液性がんを処置される被験体は、ｐ５３非活性化変異が欠如している、かつ／または野生型ｐ５３を発現すると決定された液性がんを発症する危険性があるヒトである。ｐ５３非活性化変異は、本明細書で使用される場合、ｐ５３のｉｎ  ｖｉｔｒｏアポトーシス活性の喪失（または低減）をもたらす任意の変異である。ｐ５３非活性化変異の非限定的な例は、表１に含まれている。したがって、一部の実施形態では、本明細書で提供される組成物（composition）と調和する液性がんを有する被験体は、ｐ５３非活性化変異、例えば表１に示されている非活性化変異が欠如していると決定された液性がんを有するか、または有すると診断されたヒトである。
【０２９３】
一部の実施形態では、本明細書で提供される方法に従って液性がんを処置される被験体は、優性ｐ５３非活性化変異が欠如していると決定された液性がんを有するか、または有すると診断されたヒトである。優性ｐ５３非活性化変異または優性ネガティブ変異は、本明細書で使用される場合、変異型ｐ５３が、野生型ｐ５３遺伝子の活性を阻害または妨害する変異である。
【表１−１】
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【表１−２】
2018516844.tif 000065
表１は、図１に示した野生型ヒトＴＰ５３腫瘍タンパク質ｐ５３の配列を指す。アミノ酸変化は、置換されるアミノ酸、その後に野生型ｐ５３配列における置換されるアミノ酸の位置、その後に置換のために使用されるアミノ酸として記録される。例えば、Ｌ３４４Ｐは、野生型配列の３４４位におけるロイシン残基（Ｌ）が、プロリン残基（Ｐ）によって置き換えられることを示す。
【０２９４】
一部の実施形態では、本明細書で提供される方法に従って液性がんを処置される被験体は、難治性患者である。ある特定の一実施形態では、難治性患者は、標準治療（例えば、外科手術、放射線、抗アンドロゲン治療および／または薬物治療、例えば化学療法）に対して難治性の患者である。ある特定の実施形態では、液性がんを有する患者は、液性がんが、著しく根絶されなかった、かつ／または１つもしくは複数の症状が、著しく軽減されなかった場合、治療に対して難治性である。患者が難治性かどうかの決定は、液性がんの処置の有効性をアッセイするために、当技術分野で公知の任意の方法によって、ｉｎ  ｖｉｖｏまたはｉｎ  ｖｉｔｒｏのいずれかで行うことができる。様々な実施形態では、液性がんを有する患者は、液性がんと関連するＣＴＣまたはＭＮＢＣの数が、低減しないか、または増大した場合、難治性である。様々な実施形態では、液性がんを有する患者は、１つまたは複数の液性がん細胞が、転移し、かつ／または別の器官に拡大する場合、難治性である。
【０２９５】
一部の実施形態では、本明細書で提供される方法に従って液性がんが処置される被験体は、本開示のペプチド模倣大環状分子による処置以外の治療に対して難治性であることが証明されたが、もはやこれらの治療を受けていないヒトである。ある特定の実施形態では、本明細書で提供される方法に従って液性がんを処置される被験体は、１つまたは複数の従来の抗がん治療、例えば外科手術、薬物治療、例えば化学療法、抗アンドロゲン治療または放射線を既に受けているヒトである。これらの患者には、難治性患者、従来の治療を受けるには若すぎる患者、および既存の治療による処置を受けたにも関わらず液性がん細胞を再発した患者が含まれる。
【０２９６】
一部の実施形態では、被験体は、液性がんの少なくとも１つの過去の処置および／または治療が不成功に終わっているヒトである。
野生型ｐ５３および／またはｐ５３変異の検出方法
【０２９７】
被験体由来の液性がん細胞試料は、ｐ５３非活性化変異の欠如および／または野生型ｐ５３の発現を決定するためにアッセイすることができる。
【０２９８】
組織におけるｐ５３野生型遺伝子および／またはｐ５３非活性化変異の欠如を検出するために、周囲の正常組織から組織を離して分離することが助けとなり得る。例えば、組織は、パラフィン切片またはクリオスタット切片から単離することができる。がん細胞はまた、正常細胞からフローサイトメトリーによって分離することができる。液性がん細胞組織が、正常細胞によって高度に汚染されている場合、変異の検出はより困難となり得る。
【０２９９】
点変異の検出は、液性がん細胞組織中に存在する１つのｐ５３対立遺伝子（または複数の対立遺伝子）の分子クローニング、およびその対立遺伝子（複数可）の配列決定によって達成され得る。あるいは、ポリメラーゼ連鎖反応を使用して、液性がん細胞組織由来のゲノムＤＮＡ調製物からｐ５３遺伝子配列を直接的に増幅することができる。次に、増幅した配列のＤＮＡ配列を決定することができる。例えば、Saikiら、Science、２３９巻、４８７頁、１９８８年、米国特許第４，６８３，２０２号、および米国特許第４，６８３，１９５号参照。
【０３００】
また、ｐ５３遺伝子の特異的欠失を検出することができる。例えば、ｐ５３遺伝子または周囲のマーカー遺伝子のための制限断片長多型（ＲＦＬＰ）プローブを使用して、ｐ５３対立遺伝子の喪失を記録することができる。
【０３０１】
また、野生型ｐ５３遺伝子の喪失は、ｐ５３遺伝子の野生型発現産物の喪失に基づいて検出することができる。このような発現産物には、ｍＲＮＡならびにｐ５３タンパク質産物自体の両方が含まれる。点変異は、ｍＲＮＡを直接的に配列決定することによって、またはｍＲＮＡから作製されたｃＤＮＡの分子クローニングを介して検出することができる。クローン化ｃＤＮＡの配列は、ＤＮＡ配列決定技術を使用して決定され得る。また、ｃＤＮＡは、ポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）を介して配列決定され得る。
【０３０２】
あるいは、ミスマッチ検出を使用して、ｐ５３遺伝子またはそのｍＲＮＡ産物における点変異を検出することができる。該方法は、ヒト野生型ｐ５３遺伝子に相補的な標識リボプローブの使用を含み得る。リボプローブおよび液性がん細胞組織から単離されたｍＲＮＡまたはＤＮＡのいずれかを、一緒にアニーリングし（ハイブリダイズし）、その後、二本鎖ＲＮＡ構造において一部のミスマッチを検出することができる酵素ＲＮａｓｅ  Ａを用いて消化する。ミスマッチは、ＲＮａｓｅ  Ａによって検出される場合、ミスマッチ部位を切断する。したがって、アニーリングされたＲＮＡ調製物が、電気泳動ゲルマトリックスで分離される場合、ミスマッチがＲＮａｓｅ  Ａによって検出され、切断されると、ＲＮＡ産物は、リボプローブの全長二本鎖ＲＮＡおよびｐ５３のｍＲＮＡまたはＤＮＡよりも小さいことが分かる。リボプローブは、ｐ５３のｍＲＮＡまたは遺伝子の全長である必要はないが、いずれかのセグメントであり得る。リボプローブが、ｐ５３のｍＲＮＡまたは遺伝子のセグメントだけを含む場合、いくつかのこれらのプローブを使用して、全長ｍＲＮＡ配列をミスマッチについてスクリーニングすることが望ましい。
【０３０３】
同様に、ＤＮＡプローブを使用して、酵素的または化学的切断を介してミスマッチを検出することができる。例えば、Cottonら、Proc.  Natl.  Acad.  Sci.  USA、８５巻、４３９７頁、１９８８年；およびShenkら、Proc.  Natl.  Acad.  Sci.  USA、７２巻、９８９頁、１９７５年参照。あるいは、ミスマッチは、マッチ二本鎖に対するミスマッチ二本鎖の電気泳動移動度の変化によって検出することができる。例えば、Cariello、Human  Genetics、４２巻、７２６頁、１９８８年参照。リボプローブまたはＤＮＡプローブのいずれかを用いて、変異を含有し得る細胞ｍＲＮＡまたはＤＮＡを、ハイブリダイゼーションの前にＰＣＲを使用して増幅することができる（以下参照）。
【０３０４】
また、ポリメラーゼ連鎖反応を使用することによって増幅された液性がん細胞組織由来のｐ５３遺伝子のＤＮＡ配列は、対立遺伝子に特異的なプローブを使用してスクリーニングすることができる。これらのプローブは、それぞれ、公知の変異を有するｐ５３遺伝子配列領域を含有する核酸オリゴマーである。例えば、あるオリゴマーは、ｐ５３遺伝子配列の一部に対応する約３０ヌクレオチド長であり得る。ｐ５３遺伝子の１７５番目のコドンをコードする位置において、オリゴマーは、野生型コドンであるバリンではなく、アラニンをコードする。一組のこのような対立遺伝子に特異的なプローブを使用することによって、ＰＣＲ増幅産物をスクリーニングして、ｐ５３遺伝子において既に同定された変異の存在を同定することができる。対立遺伝子に特異的なプローブと増幅ｐ５３配列のハイブリダイゼーションは、例えばナイロンフィルタ上で実施され得る。特定のプローブとのハイブリダイゼーションによって、対立遺伝子に特異的なプローブの場合のように、液性がん細胞組織において同じ変異の存在が示される。
【０３０５】
液性がん細胞におけるｐ５３遺伝子の構造変化の同定は、多様な一連の高分解能ハイスループットマイクロアレイプラットフォームを適用することによって容易になり得る。本質的に、クローン化核酸（例えば、ｃＤＮＡ、ＢＡＣ、コスミド）由来のＰＣＲ産物を担持するもの、およびオリゴヌクレオチドを使用するものの、２つのタイプのアレイがある。該方法は、ゲノムワイドのＤＮＡコピー数の異常および発現レベルを調査して、同じ試料中で過剰発現および過少発現する遺伝子を有する液性がん細胞における喪失、獲得および増幅の間の相関を得るための方法を提供することができる。液性がん細胞におけるｍＲＮＡレベルを推定する遺伝子発現アレイは、両方の遺伝子発現レベル、代替スプライシング事象およびｍＲＮＡプロセシング変化を同定し得る、エクソンに特異的なアレイを生じた。またオリゴヌクレオチドアレイは、連鎖および関連研究のためにゲノム全般にわたって一塩基多型（ＳＮＰ）を調べるために使用されており、これらは、コピー数の異常およびヘテロ接合事象の喪失を定量するために適合されている。ＤＮＡシークエンシングアレイは、染色体領域および全ゲノムを並べ直すことができる。
【０３０６】
ＳＮＰベースのアレイまたは他の遺伝子アレイまたはチップも、野生型ｐ５３の対立遺伝子の存在および変異の構造を決定することが企図されている。ＤＮＡにおける単一部位の変化である一塩基多型（ＳＮＰ）は、ゲノムにおいて最も頻繁に生じるタイプの変化である。例えば、ヒトゲノムでは推定５００万〜１０００万のＳＮＰが存在する。ＳＮＰは、集団内で進化全体を通して高度に保存されているので、ＳＮＰのマップは、研究のための優れた遺伝子型マーカーとして働く。ＳＮＰアレイは、全ゲノムを研究するための有用な手段である。
【０３０７】
さらに、ＳＮＰアレイを使用して、ヘテロ接合性消失（ＬＯＨ）を研究することができる。ＬＯＨは、対立遺伝子の完全な喪失から、または一方の対立遺伝子の他方の対立遺伝子に対するコピー数の増大から生じ得る、対立遺伝子不均衡の形態である。他のチップベースの方法（例えば、比較ゲノムハイブリダイゼーションは、ゲノムの獲得または欠失だけを検出することができる）に対して、ＳＮＰアレイには、片親性ダイソミー（ＵＰＤ）に起因してコピー数中性ＬＯＨを検出できるというさらなる利点がある。ＵＰＤでは、一方の親からの１つの対立遺伝子または全染色体が欠損して、他方の親の対立遺伝子の繰り返し（reduplication）をもたらす（片親性＝一方の親由来、ダイソミー＝重複）。疾患の状況において、この発生は、野生型対立遺伝子（例えば、母親由来）が欠損し、その代わりにヘテロ接合性対立遺伝子（例えば、父親由来）の２つのコピーが存在する場合に、病的であり得る。ＬＯＨは、ほとんどのヒトのがんの顕著な特徴なので、このＳＮＰアレイの使用には、がん診断において大いなる潜在性がある。ＳＮＰアレイ技術は、液性がんだけでなく（例えば、胃がん、肝臓がん等）、血液系悪性腫瘍（ＡＬＬ、ＭＤＳ、ＣＭＬ等）が、ゲノム欠失またはＵＰＤおよびゲノム獲得に起因して高い率のＬＯＨを有することを示した。本開示では、ＬＯＨを検出するために高密度ＳＮＰアレイを使用することにより、対立遺伝子不均衡のパターンを同定して、野生型ｐ５３対立遺伝子の存在を決定することができる（Lipsら（et  ah）、２００５年；Laiら、２００７年）。
【０３０８】
現在のｐ５３遺伝子配列および一塩基多型アレイの例として、ｐ５３  Ｇｅｎｅ  Ｃｈｉｐ（Ａｆｆｙｍｅｔｒｉｘ、カリフォルニア州、サンタクララ）、Ｒｏｃｈｅ  ｐ５３  Ａｍｐｌｉ−Ｃｈｉｐ（Ｒｏｃｈｅ  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｓｙｓｔｅｍｓ、カリフォルニア州、プレザントン）、ＧｅｎｅＣｈｉｐ  Ｍａｐｐｉｎｇアレイ（Ａｆｆｙｍｅｔｒｉｘ、カリフォルニア州、サンタクララ）、ＳＮＰ  Ａｒｒａｙ  ６．０（Ａｆｆｙｍｅｔｒｉｘ、カリフォルニア州、サンタクララ）、ＢｅａｄＡｒｒａｙｓ（Ｉｌｌｕｍｉｎａ、カリフォルニア州、サンディエゴ）等が挙げられる。
【０３０９】
また、野生型ｐ５３遺伝子の変異は、該ｐ５３遺伝子の野生型発現産物の変異に基づいて検出することができる。このような発現産物には、ｍＲＮＡならびにｐ５３タンパク質産物自体の両方が含まれる。点変異は、ｍＲＮＡを直接的に配列決定することによって、またはｍＲＮＡから作製されたｃＤＮＡの分子クローニングを介して検出することができる。クローン化ｃＤＮＡの配列は、ＤＮＡ配列決定技術を使用して決定され得る。また、ｃＤＮＡは、ポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）を介して配列決定され得る。ｐ５３機能に関与するエピトープのそれぞれがモノクローナル抗体によって表されるモノクローナル抗体のパネルを使用することができる。そのパネルのモノクローナル抗体の結合の喪失または攪乱は、ｐ５３タンパク質の、したがってｐ５３遺伝子自体の変異による変化（mutational  alteration）を示し得る。また、変異体ｐ５３遺伝子または遺伝子産物は、身体試料、例えば血清、糞便、または他の体液、例えば尿および喀痰において検出され得る。組織中の変異体ｐ５３遺伝子または遺伝子産物の検出について上記で論じたものと同じ技術を、他の身体試料に適用することができる。
【０３１０】
また、野生型ｐ５３遺伝子の喪失は、野生型ｐ５３タンパク質機能の喪失についてスクリーニングすることによって検出され得る。該ｐ５３タンパク質が疑いの余地なく有する機能のすべては、まだ解明されていないが、少なくとも２つの特異的な機能が公知である。タンパク質ｐ５３は、ＳＶ４０ラージＴ抗原ならびにアデノウイルスＥ１Ｂ抗原に結合する。該ｐ５３タンパク質がこれらの抗原のいずれかまたは両方に結合する能力の喪失は、該タンパク質の変異による変化を示すが、その変化は、その遺伝子自体の変異による変化を反映している。あるいは、ｐ５３機能に関与するエピトープのそれぞれがモノクローナル抗体によって表されるモノクローナル抗体のパネルを使用することができる。そのパネルのモノクローナル抗体の結合の喪失または攪乱は、該ｐ５３タンパク質の、したがってｐ５３遺伝子自体の変異による変化を示し得る。変化したｐ５３タンパク質を検出するための任意の手段を使用して、野生型ｐ５３遺伝子の喪失を検出することができる。
【０３１１】
また、変異体ｐ５３遺伝子または遺伝子産物は、身体試料、例えば血清、糞便、または他の体液、例えば尿および喀痰において検出され得る。組織中の変異体ｐ５３遺伝子または遺伝子産物の検出について上記で論じたものと同じ技術を、他の身体試料に適用することができる。
【０３１２】
液性がんを有する被験体におけるｐ５３非活性化変異の欠如および／または野生型ｐ５３の発現の決定は、ペプチド模倣大環状分子を投与する前、投与している最中または投与した後の任意の時間に実施され得る（can  be  performedd）。一部の実施形態では、ｐ５３非活性化変異の欠如および／または野生型ｐ５３の発現の決定は、最初にペプチド模倣大環状分子を被験体に投与する前、例えば、最初にペプチド模倣大環状分子を被験体に投与する約５年〜約１カ月前、約４年〜約１カ月前、約３年〜１カ月前、約２年〜約１カ月前、約１年〜約１カ月前、約５年〜約１週前、約４年〜約１週前、約３年〜約１カ月前、約２年〜約１週前、約１年〜約１週前、約５年〜約１日前、約４年〜約１日前、約３年〜約１日前、約２年〜約１日前、約１年〜約１日前、約１５カ月〜約１カ月前、約１５カ月〜約１週前、約１５カ月〜約１日前、約１２カ月〜約１カ月前、約１２カ月〜約１週前、約１２カ月〜約１日前、約６カ月〜約１カ月（1  about  month）前、約６カ月〜約１週前、約６カ月〜約１日前、約３カ月〜約１カ月前、約３カ月〜約１週前、または約３カ月〜約１日前に実施される。いくつかの例では、ｐ５３非活性化変異の欠如および／または野生型ｐ５３の発現の確認は、最初にペプチド模倣大環状分子を被験体に投与する最長６年前、５年前、４年前、３年前、２４カ月前、２３カ月前、２２カ月前、２１カ月前、２０カ月前、１９カ月前、１８カ月前、１７カ月前、１６カ月前、１５カ月前、１４カ月前、１３カ月前、１２カ月前、１１カ月前、１０カ月前、９カ月前、８カ月前、７カ月前、６カ月前、５カ月前、４カ月前、３カ月前、２カ月前、１カ月前、４週（２８日）前、３週（２１日）前、２週（１４日）前、１週（７日）前、６日前、５日前、４日前、３日前、２日前または１日前までに実施される。いくつかの例では、ｐ５３非活性化変異の欠如の確認は、最初にペプチド模倣大環状分子を被験体に投与する前、１カ月以内に実施される。いくつかの例では、ｐ５３非活性化変異の欠如の確認は、最初にペプチド模倣大環状分子を被験体に投与する前、２１日以内に実施される。
液性がん
【０３１３】
本発明の方法によって処置され得る液性がんには、液性リンパ腫、白血病、および骨髄腫が含まれるが、それらに限定されない。記載の方法に従って処置され得る液性リンパ腫および白血病の例として、慢性リンパ球性白血病／小リンパ球性リンパ腫、Ｂ細胞前リンパ球性白血病、リンパ形質細胞性リンパ腫（例えば、ワルデンストレームマクログロブリン血症）、脾性辺縁帯リンパ腫、形質細胞骨髄腫、形質細胞腫、単クローン性免疫グロブリン沈着症、重鎖病、ｍａｌｔリンパ腫とも呼ばれる節外性辺縁帯Ｂ細胞リンパ腫、節性辺縁帯Ｂ細胞リンパ腫（ｎｍｚｌ）、濾胞性リンパ腫、マントル細胞リンパ腫、びまん性大細胞型Ｂ細胞リンパ腫、縦隔（胸腺）大細胞型Ｂ細胞リンパ腫、血管内大細胞型Ｂ細胞リンパ腫、原発性滲出性リンパ腫、バーキットリンパ腫／白血病、Ｔ細胞前リンパ球性白血病、Ｔ細胞大型顆粒リンパ球性白血病、侵攻性ＮＫ細胞白血病、成人Ｔ細胞白血病／リンパ腫、節外性ＮＫ／Ｔ細胞リンパ腫、鼻型、腸症型Ｔ細胞リンパ腫、肝脾Ｔ細胞リンパ腫、芽球性ＮＫ細胞リンパ腫、菌状息肉症／セザリー症候群、原発性皮膚ＣＤ３０陽性Ｔ細胞リンパ増殖性障害、原発性皮膚未分化大細胞リンパ腫、リンパ腫様丘疹症、血管免疫芽球性Ｔ細胞リンパ腫、末梢Ｔ細胞リンパ腫、分類不能未分化大細胞型リンパ腫、古典的ホジキンリンパ腫（結節硬化型、混合細胞型、リンパ球豊富型、リンパ球減少型または非減少型）、および結節性リンパ球優位型ホジキンリンパ腫が挙げられるが、それらに限定されない。
【０３１４】
本開示の方法によって処置され得る液性がんの例として、例えば骨髄性、リンパ性もしくは赤血球性系統、またはそれらの前駆体細胞から生じた、造血性起源の過形成／新生物細胞を伴うがんが挙げられる。障害の例として、急性白血病、例えば赤芽球性白血病および急性巨核芽球性白血病が挙げられる。追加の例示的な骨髄性障害として、急性前骨髄性白血病（ＡＰＭＬ）、急性骨髄性白血病（ＡＭＬ）および慢性骨髄性白血病（ＣＭＬ）（Vaickus,  L.（１９９１年）Crit  Rev.  in  Oncol./Hemotol.  １１巻：２６７〜９７頁に総説されている）が挙げられるが、それらに限定されない。リンパ性悪性腫瘍には、Ｂ−系統ＡＬＬおよびＴ−系統ＡＬＬを含む急性リンパ芽球性白血病（ＡＬＬ）、慢性リンパ球性白血病（ＣＬＬ）、前リンパ球性白血病（ＰＬＬ）、多発性骨髄腫、有毛細胞白血病（ＨＬＬ）およびワルデンストレームマクログロブリン血症（ＷＭ）が含まれるが、それらに限定されない。悪性リンパ腫の追加の形態には、非ホジキンリンパ腫およびそのバリアント、末梢Ｔ細胞リンパ腫、成人Ｔ細胞白血病／リンパ腫（ＡＴＬ）、皮膚Ｔ細胞リンパ腫（ＣＴＣＬ）、大顆粒性リンパ球性白血病（ＬＧＦ）、ホジキン病およびリード−シュテルンベルク病が含まれるが、それらに限定されない。例えば、液性がんには、急性リンパ球性白血病（ＡＬＬ）、Ｔ細胞急性リンパ球性白血病（Ｔ−ＡＬＬ）、未分化大細胞型リンパ腫（ＡＬＣＬ）、慢性骨髄性白血病（ＣＭＬ）、急性骨髄性白血病（ＡＭＬ）、慢性リンパ球性白血病（ＣＬＬ）、Ｂ細胞慢性リンパ球性白血病（Ｂ−ＣＬＬ）、びまん性大細胞型Ｂ細胞リンパ腫（ＤＬＢＣＬ）、過好酸球増加症／慢性好酸球増加症、およびバーキットリンパ腫が含まれるが、それらに限定されない。
【０３１５】
一部の実施形態では、本開示の方法によって処置される液性がんは、急性リンパ芽球性白血病、急性骨髄性白血病、ＡＩＤＳ関連がん、ＡＩＤＳ関連リンパ腫、慢性リンパ球性白血病、慢性骨髄性白血病、慢性骨髄増殖性障害、皮膚Ｔ細胞リンパ腫、ホジキンリンパ腫、多発性骨髄腫、多発性骨髄腫／形質細胞新生物、非ホジキンリンパ腫、原発性中枢神経系（ＣＮＳ）リンパ腫、またはＴ細胞リンパ腫である。様々な実施形態では、液性がんは、Ｂ細胞慢性リンパ球性白血病、Ｂ細胞リンパ腫−ＤＬＢＣＬ、Ｂ細胞リンパ腫−ＤＬＢＣＬ−胚中心様、Ｂ細胞リンパ腫−ＤＬＢＣＬ−活性化Ｂ細胞様、またはバーキットリンパ腫であり得る。
【０３１６】
一部の実施形態では、本明細書に開示の方法によって処置される液性がんには、ＨＰＶ（ヒトパピローマウイルス）と関連することが公知のがんは含まれない。
【０３１７】
本明細書に開示の方法によるがん処置の有効性および／または奏効は、任意の適切な方法によって決定され得る。奏効は、完全奏効であり、処置に対する客観的奏効、臨床的奏効、または病理学的奏効であり得る。例えば、奏効は、その全体が参照によって本明細書に組み込まれる液性リンパ腫患者のための改訂版国際ワーキンググループ奏効基準（revised  international  working  group  response  criteria）（ＩＷＧ  ２０１４年）に記載されているか、またはそれによる液性がんの処置に対する奏効を評価するための技術に基づいて決定され得る。奏効は、生存期間（またはこのような持続時間の見込み）または無増悪の間隔であり得る。このような事象のタイミングまたは持続時間は、およそ診断時から、または処置のおよそ開始時から、または処置のおよそ終了時から（ペプチド模倣大環状分子の最終投与など）決定され得る。あるいは、奏効は、液性がん細胞の数、単位体積当たりの液性がん細胞の数、もしくは液性がん細胞代謝の低減に基づくか、または全体的な液性がん細胞負荷に基づくか、または特に病状において上昇した場合の血清マーカーレベルに基づき得る。
【０３１８】
個々の患者における奏効は、完全奏効、部分奏効、安定疾患、および進行性疾患として特徴付けることができる。一部の実施形態では、奏効は、完全奏効（ＣＲ）である。完全奏効は、すべての循環腫瘍細胞（ＣＴＣ）または単核血球（ＭＮＢＣ）の消失と定義付けることができ、すなわち任意の病理学的リンパ節（標的であろうと、または非標的であろうと）において、短軸が＜１０ｍｍまで低減しなければならない。いくつかの例（例えば、ＡＭＬ）では、完全奏効は、以下のとおり定義付けることができる：骨髄芽球＜５％、アウエルロッドを有する芽球が存在しないこと、髄外性疾患がないこと、絶対好中球数＞１．０×１０９／Ｌ（１０００／μＬ）；血小板数＞１００×１０９／Ｌ（１０００００／μＬ）、および赤血球輸血に依存しないこと。ある特定の実施形態では、奏効は、不完全回復を伴うＣＲ（ＣＲｉ）である。不完全回復を伴うＣＲは、いくつかの例（例えば、ＡＭＬ）では、残存する好中球減少症（＜１．０×１０９／Ｌ［１０００／μＬ］）または血小板減少症（＜１００×１０９／Ｌ［１０００００／μＬ］）を除くすべてのＣＲ判定基準を含むと定義付けることができる。ある特定の実施形態では、奏効は、形態的白血病がない状態である。形態的白血病がない状態は、いくつかの例（例えば、ＡＭＬ）では、骨髄芽球＜５％、アウエルロッドを有する芽球が存在しないこと、髄外性疾患がないこと、および血液学的回復を必要としないことを含むと定義付けることができる。ある特定の実施形態では、奏効は、部分奏効（ＰＲ）である。部分奏効は、ベースライン直径和を参照として、循環腫瘍細胞（ＣＴＣ）または単核血球（ＭＮＢＣ）の直径の和が少なくとも３０％低減することを意味すると定義付けることができる。いくつかの例（例えば、ＡＭＬ）では、部分奏効は、ＣＲのすべての血液学的判定基準、骨髄芽球百分率が５％〜２５％に低減すること、および前処置骨髄芽球百分率が少なくとも５０％低減することを含むと定義付けることができる。ある特定の実施形態では、奏効は、形態的白血病がない状態である。形態的白血病がない状態は、いくつかの例（例えば、ＡＭＬ）では、骨髄芽球＜５％、アウエルロッドを有する芽球が存在しないこと、髄外性疾患がないこと、および血液学的回復を必要としないことを含むと定義付けることができる。ある特定の実施形態では、奏効は、再発である。再発は、いくつかの例（例えば、ＡＭＬ）では、骨髄芽球＜５％、アウエルロッドを有する芽球が存在しないこと、髄外性疾患がないこと、および血液学的回復を必要としないことを含むと定義付けることができる。一部の実施形態では、奏効は、進行性疾患（ＰＤ）である。進行性疾患は、研究中の最小数（the  smallest  number）を参照として（これは、最小値である場合のベースライン数を含む）、循環腫瘍細胞（ＣＴＣ）または単核血球（ＭＮＢＣ）の数の少なくとも２０％増大、および少なくとも１個、少なくとも２個、少なくとも３個、少なくとも４個、少なくとも５個、少なくとも６個、少なくとも７個、少なくとも８個、少なくとも９個、少なくとも１０個、少なくとも１１個、少なくとも１２個、少なくとも１３個、少なくとも１４個、少なくとも１５個、少なくとも１６個、��なくとも１７個、少なくとも１８個、少なくとも１９個、少なくとも２０個、少なくとも３０個、少なくとも４０個、少なくとも５０個、または少なくとも１００個またはそれを超える循環腫瘍細胞（ＣＴＣ）または単核血球（ＭＮＢＣ）の絶対的増加と定義付けることができる。１つまたは複数の新しい病変の出現も、進行とみなされ得る。一部の実施形態では、上記疾患は、安定疾患（ＳＤ）であり得る。安定疾患は、研究中のＣＴＣおよび／またはＭＮＢＣの最小数を参照としてＰＲの条件を満たすほど液性がん細胞の数が十分に減少せず、かつＰＤの条件を満たすほど十分に増加しないことによって特徴付けることができる。ある特定の実施形態では、奏効は、病理学的な完全奏効である。例えば、外科手術または生検時に除去された組織の試験後に病理学者によって決定される病理学的な完全奏効は、一般に、外科手術被検物における侵襲性および／または非侵襲性液性がん細胞の組織学的証拠が存在しないことを指す。
組合せ処置
【０３１９】
また本明細書では、本明細書に開示のペプチド模倣大環状分子を、１種または複数種の追加の治療と組み合わせて、ｐ５３非活性化変異が欠如している、かつ／または野生型ｐ５３を発現すると決定された液性がんを有する被験体に投与することを含む、液性がんの処置のための併用治療が提供される。本明細書の特定の実施形態では、有効量のペプチド模倣大環状分子を、有効量の別の治療と組み合わせて、ｐ５３非活性化変異が欠如していると決定された液性がん、かつ／または野生型ｐ５３を発現する液性がんを有する被験体に投与することを含む、液性がんの処置のための併用治療が提供される。
【０３２０】
本明細書で使用される場合、用語「組み合わせて」は、ペプチド模倣大環状分子の投与の文脈では、液性がんの処置に使用するための１種または複数種の追加の治療（例えば、薬剤、外科手術、または放射線）の投与前、投与と同時、または投与後に、ペプチド模倣大環状分子を投与することを指す。用語「組み合わせて」の使用は、ペプチド模倣大環状分子および１種または複数種の追加の治療が、被験体に投与される順序を制限しない。特定の実施形態では、ペプチド模倣大環状分子の投与と、１種または複数種の追加の治療の投与の間の時間間隔は、約１〜約５分、約１〜約３０分、約３０分〜約６０分、約１時間、約１〜約２時間、約２〜約６時間、約２〜約１２時間、約１２〜約２４時間、約１〜約２日、約２日、約３日、約４日、約５日、約６日、約７日、約１週、約２週、約３週、約４週、約５週、約６週、約７週、約８週、約９週、約１０週、約１５週、約２０週、約２６週、約５２週、約１１〜約１５週、約１５〜約２０週、約２０〜約３０週、約３０〜約４０週、約４０〜約５０週、約１カ月、約２カ月、約３カ月、約４カ月、約５カ月、約６カ月、約７カ月、約８カ月、約９カ月、約１０カ月、約１１カ月、約１２カ月、約１年、約２年、またはその間の任意の期間であり得る。ある特定の実施形態では、ペプチド模倣大環状分子および１種または複数種の追加の治療は、１日未満、１週未満、２週未満、３週未満、４週未満、１カ月未満、２カ月未満、３カ月未満、６カ月未満、１年未満、２年未満、または５年未満、隔てて投与される。
【０３２１】
一部の実施形態では、本明細書で提供される併用治療は、ペプチド模倣大環状分子を週１〜２回、毎週１回、２週ごとに１回、３週ごとに１回、４週ごとに１回、５週ごとに１回、６週ごとに１回、７週ごとに１回、または８週ごとに１回投与し、１種または複数種の追加の治療を、週１回、２週ごとに１回、３週ごとに１回、４週ごとに１回、１カ月ごとに１回、２カ月（例えば、およそ８週）ごとに１回、３カ月（例えば、およそ１２週）ごとに１回、または４カ月（例えば、およそ１６週）ごとに１回投与することを含む。ある特定の実施形態では、ペプチド模倣大環状分子および１種または複数種の追加の治療は、被験体に周期的に投与される。周期的治療は、ある期間にわたってペプチド模倣大環状分子化合物を投与した後、ある期間にわたって１種または複数種の追加の治療を投与し、この逐次的な投与を反復することを含む。また、ある特定の実施形態では、周期的治療は、ペプチド模倣大環状分子または追加の治療が、ある期間にわたって（例えば、２日、３日、４日、５日、６日、７日、１週、２週、３週、４週、５週、１０週、２０週、１カ月、２カ月、３カ月、４カ月、５カ月、６カ月、７カ月、８カ月、９カ月、１０カ月、１１カ月、１２カ月、２年、または３年）投与されない、休薬期間を含み得る。一実施形態では、投与されるサイクルの数は、１〜１２サイクル、２〜１０サイクル、または２〜８サイクルである。
【０３２２】
一部の実施形態では、本明細書で提供される液性がんを処置する方法は、ペプチド模倣大環状分子を追加の治療と組み合わせて投与する前、ある一定期間、ペプチド模倣大環状分子を単剤として投与することを含む。ある特定の実施形態では、本明細書で提供されるがんを処置する方法は、ペプチド模倣大環状分子を追加の治療と組み合わせて投与する前、ある一定期間、追加の治療だけを投与することを含む。
【０３２３】
一部の実施形態では、本明細書に提示の方法によるペプチド模倣大環状分子および１種または複数種の追加の治療の投与は、ペプチド模倣大環状分子だけ、または前記１種もしくは複数種の追加の治療だけの投与と比較して、相加効果を有する。一部の実施形態では、本明細書に提示の方法によるペプチド模倣大環状分子および１種または複数種の追加の治療の投与は、ペプチド模倣大環状分子だけ、または前記１種もしくは複数種の追加の治療だけの投与と比較して、相乗効果を有する。
【０３２４】
本明細書で使用される場合、用語「相乗的」は、ペプチド模倣大環状分子を１種または複数種の追加の治療（例えば、薬剤）と組み合わせて投与する効果を指し、その組合せは、任意の２種またはそれを超える単一の治療（例えば、薬剤）の相加効果よりも有効である。特定の一実施形態では、併用治療の相乗効果によって、より低い投与量（例えば、最適以下の用量）のペプチド模倣大環状分子もしくは追加の治療を使用することができ、かつ／またはペプチド模倣大環状分子もしくは追加の治療の被験体への投与頻度を低減することができる。ある特定の実施形態では、より低い投与量のペプチド模倣大環状分子もしくはより低い投与量の追加の治療を利用できること、および／またはペプチド模倣大環状分子もしくは前記追加の治療の投与頻度を低減できることにより、液性がんの処置におけるペプチド模倣大環状分子の有効性または前記追加の治療の有効性を低減せずに、被験体にそれぞれペプチド模倣大環状分子または前記追加の治療を投与することに関連する毒性がそれぞれ低減される。一部の実施形態では、相乗効果によって、がんの処置におけるペプチド模倣大環状分子および前記追加の治療のそれぞれの有効性が改善される。一部の実施形態では、ペプチド模倣大環状分子および１種または複数種の追加の治療の組合せの相乗効果は、任意の単一治療の使用と関連する有害な、または望ましくない副作用を回避または低減する。
【０３２５】
ペプチド模倣大環状分子および１種または複数種の追加の治療の組合せは、同じ医薬組成物で被験体に投与することができる。あるいは、ペプチド模倣大環状分子および１種または複数種の追加の治療は、別々の医薬組成物で被験体に同時に投与することができる。ペプチド模倣大環状分子および１種または複数種の追加の治療は、別々の医薬組成物で被験体に逐次的に投与することができる。また、ペプチド模倣大環状分子化合物および１種または複数種の追加の治療は、同じまたは異なる投与経路によって被験体に投与することができる。
【０３２６】
本明細書で提供される併用治療は、それを必要とする被験体に、ペプチド模倣大環状分子を、がんを処置するための従来のまたは公知の治療と組み合わせて投与することを含む。がんまたはそれと関連する状態のための他の治療は、１つまたは複数の症状を調節または軽減することを目的とする。したがって、一部の実施形態では、本明細書で提供される併用治療は、それを必要とする被験体に、疼痛軽減剤、あるいはそれと関連する１つもしくは複数の症状またはそれと関連する状態を軽減または調節する目的の他の治療を投与することを含む。
【０３２７】
ペプチド模倣大環状分子と組み合わせて使用することができる抗がん剤の非限定的な具体例として、ホルモン剤（例えば、アロマターゼ阻害剤、選択的エストロゲン受容体モジュレーター（ＳＥＲＭ）、およびエストロゲン受容体アンタゴニスト）、化学療法剤（例えば、微小管分解遮断薬、代謝拮抗剤、トポイソメラーゼ阻害剤、およびＤＮＡクロスリンカーまたは損傷剤）、抗抗原剤（例えば、ＶＥＧＦアンタゴニスト、受容体アンタゴニスト、インテグリンアンタゴニスト、血管標的化剤（ＶＴＡ）／血管破壊剤（ＶＤＡ））、放射線治療、および従来の外科手術が挙げられる。
【０３２８】
ペプチド模倣大環状分子と組み合わせて使用することができるホルモン剤の非限定的な例として、アロマターゼ阻害剤、ＳＥＲＭ、およびエストロゲン受容体アンタゴニストが挙げられる。アロマターゼ阻害剤であるホルモン剤は、ステロイド系または非ステロイド系であり得る。非ステロイド系ホルモン剤の非限定的な例として、レトロゾール、アナストロゾール、アミノグルテチミド、ファドロゾール、およびボロゾールが挙げられる。ステロイド系ホルモン剤の非限定的な例として、アロマシン（エキセメスタン）、フォルメスタン、およびテストラクトンが挙げられる。ＳＥＲＭであるホルモン剤の非限定的な例として、タモキシフェン（Ｎｏｌｖａｄｅｘ（登録商標）として商標が付され／販売されている）、アフィモキシフェン、アルゾキシフェン、バゼドキシフェン、クロミフェン、フェマレレ（femarelle）、ラソフォキシフェン、オルメロキシフェン、ラロキシフェン、およびトレミフェンが挙げられる。エストロゲン受容体アンタゴニストであるホルモン剤の非限定的な例として、フルベストラントが挙げられる。他のホルモン剤として、アビラテロンおよびロナプリサンが挙げられるが、それらに限定されない。
【０３２９】
ペプチド模倣大環状分子と組み合わせて使用することができる化学療法剤の非限定的な例として、微小管分解遮断薬、代謝拮抗剤、トポイソメラーゼ阻害剤、およびＤＮＡクロスリンカーまたは損傷剤が挙げられる。微小管分解遮断薬である化学療法剤には、タキサン（例えば、パクリタキセル（ＴＡＸＯＬ（登録商標）として商標が付され／販売されている）、ドセタキセル、アブラキサン、ラロタキセル、オルタタキセル、およびテセタキセル）；エポチロン（例えば、イクサベピロン）；およびビンカアルカロイド（例えば、ビノレルビン、ビンブラスチン、ビンデシン、およびビンクリスチン（ＯＮＣＯＶＩＮ（登録商標）として商標が付され／販売されている））が含まれるが、それらに限定されない。
【０３３０】
代謝拮抗剤である化学療法剤には、葉酸代謝拮抗剤（anitmetabolite）（例えば、メトトレキセート、アミノプテリン、ペメトレキセド、ラルチトレキセド）；プリン代謝拮抗剤（例えば、クラドリビン、クロファラビン、フルダラビン、メルカプトプリン、ペントスタチン、チオグアニン）；ピリミジン代謝拮抗剤（例えば、５−フルオロウラシル、カペシタビン（capcitabine）、ゲムシタビン（ＧＥＭＺＡＲ（登録商標））、シタラビン、デシタビン、フロクスウリジン、テガフール）；およびデオキシリボヌクレオチド代謝拮抗剤（例えば、ヒドロキシ尿素）が含まれるが、それらに限定されない。
【０３３１】
トポイソメラーゼ阻害剤である化学療法剤には、クラスＩ（カンプトテカ）トポイソメラーゼ阻害剤（例えば、トポテカン（ＨＹＣＡＭＴＩＮ（登録商標）として商標が付され／販売されている）  イリノテカン、ルビテカン、およびベロテカン）；クラスＩＩ（ポドフィルム）トポイソメラーゼ阻害剤（例えば、エトポシドまたはＶＰ−１６、およびテニポシド）；アントラサイクリン（例えば、ドキソルビシン、エピルビシン、ドキシル、アクラルビシン、アムルビシン、ダウノルビシン、イダルビシン、ピラルビシン、バルルビシン、およびゾルビシン）；およびアントラセンジオン（例えば、ミトキサントロン、およびピクサントロン）が含まれるが、それらに限定されない。
【０３３２】
ＤＮＡクロスリンカー（またはＤＮＡ損傷剤）である化学療法剤には、アルキル化剤（例えば、シクロホスファミド、メクロレタミン、イホスファミド（ＩＦＥＸ（登録商標）として商標が付され／販売されている）、トロホスファミド、クロラムブシル、メルファラン、プレドニムスチン、ベンダムスチン、ウラムスチン、エストラムスチン、カルムスチン（ＢｉＣＮＵ（登録商標）として商標が付され／販売されている）、ロムスチン、セムスチン、フォテムスチン、ニムスチン、ラニムスチン、ストレプトゾシン、ブスルファン、マンノスルファン、トレオスルファン、カルボコン、Ｎ，Ｎ’Ｎ’−トリエチレンチオホスホラミド、トリアジコン、トリエチレンメラミン）；アルキル化様薬剤（例えば、カルボプラチン（ＰＡＲＡＰＬＡＴＩＮ（登録商標）として商標が付され／販売されている）、シスプラチン、オキサリプラチン、ネダプラチン、トリプラチン四硝酸塩、サトラプラチン、ピコプラチン）；非古典的ＤＮＡクロスリンカー（例えば、プロカルバジン、ダカルバジン、テモゾロミド（ＴＥＭＯＤＡＲ（登録商標）として商標が付され／販売されている）、アルトレタミン、ミトブロニトール）；および挿入剤（例えば、アクチノマイシン、ブレオマイシン、マイトマイシン、およびプリカマイシン）が含まれるが、それらに限定されない。
【０３３３】
ペプチド模倣大環状分子と組み合わせて被験体に投与することができる他の治療の非限定的な例として、（１）スタチン、例えばロバスタチン（lovostatin）（例えば、ＭＥＶＡＣＯＲ（登録商標）として商標が付され／販売されている）；（２）ｍＴＯＲ阻害剤、例えばラパマイシンとしても公知のシロリムス（例えば、ＲＡＰＡＭＵＮＥ（登録商標）として商標が付され／販売されている）、テムシロリムス（例えば、ＴＯＲＩＳＥＬ（登録商標）として商標が付され／販売されている）、エベロリムス（evorolimus）（例えば、ＡＦＩＮＩＴＯＲ（登録商標）として商標が付され／販売されている）、およびデフォロリムス；（３）ファルネシルトランスフェラーゼ阻害剤、例えばチピファルニブ；（４）抗線維化剤、例えばピルフェニドン；（５）ペグ化インターフェロン、例えばＰＥＧ−インターフェロンアルファ−２ｂ；（６）ＣＮＳ刺激剤、例えばメチルフェニデート（ＲＩＴＡＬＩＮ（登録商標）として商標が付され／販売されている）；（７）ＨＥＲ−２アンタゴニスト、例えば抗ＨＥＲ−２抗体（例えば、トラスツズマブ）およびキナーゼ阻害剤（例えば、ラパチニブ）；（８）ＩＧＦ−１アンタゴニスト、例えば抗ＩＧＦ−１抗体（例えば、ＡＶＥ１６４２およびＩＭＣ−Ａ１１）またはＩＧＦ−１キナーゼ阻害剤；（９）ＥＧＦＲ／ＨＥＲ−１アンタゴニスト、例えば抗ＥＧＦＲ抗体（例えば、セツキシマブ、パニツムマブ（panitumamab））またはＥＧＦＲキナーゼ阻害剤（例えば、エルロチニブ、ゲフィチニブ）；（１０）ＳＲＣアンタゴニスト、例えばボスチニブ；（１１）サイクリン依存性キナーゼ（ＣＤＫ）阻害剤、例えばセリシクリブ；（１２）ヤヌスキナーゼ２阻害剤、例えばレスタウルチニブ；（１３）プロテアソーム阻害剤、例えばボルテゾミブ；（１４）ホスホジエステラーゼ阻害剤、例えばアナグレリド；（１５）イノシン一リン酸デヒドロゲナーゼ阻害剤、例えばチアゾフリン；（１６）リポキシゲナーゼ阻害剤、例えばマソプロコール；（１７）エンドセリンアンタゴニスト；（１８）レチノイド受容体アンタゴニスト、例えばトレチノインまたはアリトレチノイン；（１９）免疫モジュレーター、例えばレナリドミド、ポマリドミド、またはサリドマイド；（２０）キナーゼ（例えば、チロシンキナーゼ）阻害剤、例えばイマチニブ、ダサチニブ、エルロチニブ、ニロチニブ、ゲフィチニブ、ソラフェニブ、スニチニブ、ラパチニブ、またはＴＧ１００８０１；（２１）非ステロイド系抗炎症剤、例えばセレコキシブ（ＣＥＬＥＢＲＥＸ（登録商標）として商標が付され／販売されている）；（２２）ヒト顆粒球コロニー刺激因子（Ｇ−ＣＳＦ）、例えばフィルグラスチム（ＮＥＵＰＯＧＥＮ（登録商標）として商標が付され／販売されている）；（２３）フォリン酸またはロイコボリンカルシウム；（２４）インテグリンアンタゴニスト、例えばインテグリンα５β１−アンタゴニスト（例えば、ＪＳＭ６４２７）；（２５）核内因子カッパベータ（ＮＦ−κβ）アンタゴニスト、例えばＯＴ−５５１（抗酸化剤でもある）、（２６）ヘッジホッグ阻害剤、例えばＣＵＲ６１４１４、シクロパミン、ＧＤＣ−０４４９、および抗ヘッジホッグ抗体；（２７）ヒストンデアセチラーゼ（ＨＤＡＣ）阻害剤、例えばＳＡＨＡ（ボリノスタットとしても公知（ＺＯＬＩＮＺＡとして商標が付され／販売されている））、ＰＣＩ−２４７８１、ＳＢ９３９、ＣＨＲ−３９９６、ＣＲＡ−０２４７８１、ＩＴＦ２３５７、ＪＮＪ−２６４８１５８５、またはＰＣＩ−２４７８１；（２８）レチノイド、例えばイソトレチノイン（例えば、ＡＣＣＵＴＡＮＥ（登録商標）として商標が付され／販売されている）；（２９）肝細胞成長因子／分散因子（ＨＧＦ／ＳＦ）アンタゴニスト、例えばＨＧＦ／ＳＦモノクローナル抗体（例えば、ＡＭＧ  １０２）；（３０）合成化学物質、例えばアンチネオプラストン；（３１）抗糖尿病薬、例えばロシグリタゾン（rosaiglitazone）（例えば、ＡＶＡＮＤＩＡ（登録商標）として商標が付され／販売されている）；（３２）抗マラリア薬および殺アメーバ薬、例えばクロロキン（例えば、ＡＲＡＬＥＮ（登録商標）として商標が付され／販売されている）；（３３）合成ブラジキニン、例えばＲＭＰ−７；（３４）血小板由来成長因子受容体阻害剤、例えばＳＵ−１０１；（３５）Ｆｌｋ−１／ＫＤＲ／ＶＥＧＦＲ２、ＦＧＦＲ１およびＰＤＧＦＲベータの受容体チロシンキナーゼ阻害剤、例えばＳＵ５４１６およびＳＵ６６６８；（３６）抗炎症剤、例えばスルファサラジン（例えば、ＡＺＵＬＦＩＤＩＮＥ（登録商標）として商標が付され／販売されている）；ならびに（３７）ＴＧＦ−ベータアンチセンス治療が挙げられる。
【０３３４】
一部の実施形態では、本明細書に開示のペプチド模倣大環状分子は、臨床的に関連し得る濃度で、１種または複数種の輸送体酵素（例えば、ＯＡＴＰ１Ｂ１、ＯＡＴＰ１Ｂ３、ＢＳＥＰ）を阻害することができる。したがって、本明細書に開示のペプチド模倣大環状分子は、主に肝胆道輸送体によって除去される医薬と相互作用し得る。特に、メトトレキセートおよびスタチン（例えば、アトルバスタチン、フルバスタチン  ロバスタチン、ピタバスタチン  プラバスタチン、ロスバスタチンおよびシンバスタチン）は、本明細書に開示のペプチド模倣大環状分子を投与して４８時間以内、３６時間以内、２４時間以内、または１２時間以内（例えば、２４時間以内）に投与することができない。本明細書に開示のペプチド模倣大環状分子との共投与によって影響を受け得る医薬の例を、以下に列挙する。様々な実施形態では、表１から選択される医薬の１つまたは複数は、本明細書に開示のペプチド模倣大環状分子を投与して４８時間以内、３６時間以内、２４時間以内、または１２時間以内（例えば、２４時間以内）に投与されない。
【０３３５】
【表２】
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生体試料
【０３３６】
本願で使用される場合、「生体試料」は、正常なまたは疾患状態にある被験体の身体から得られた任意の体液または他の材料、例えば血液、血清、血漿、リンパ、尿、唾液、涙、脳脊髄液、乳、羊水、胆汁、腹水、膿等を意味する。また、用語「生体試料」の意味には、器官または組織抽出物、ならびに被験体から得られた任意の細胞または組織調製物をインキュベートした培養液が含まれる。生体試料は、遺伝子材料をそれから得ることができる任意の試料であり得る。また、生体試料には、固形または液性がん細胞試料または被検物が含まれ得る。がん細胞試料は、がん細胞組織試料であり得る。一部の実施形態では、がん細胞組織試料は、外科的に切除された組織から得ることができる。生体試料の例示的な供給源として、細針吸引、コア針生検、真空補助下生検、切開生検、切除生検、パンチ生検、薄片生検または皮膚生検が挙げられる。ある場合には、生体試料は、細針吸引試料を含む。一部の実施形態では、生体試料は、例えば切除生検、切開生検、または他の生検を含めた組織試料を含む。生体試料は、２つまたはそれを超える供給源、例えば細針吸引物および組織試料の混合物を含み得る。また、組織試料および細胞試料は、侵襲的な外科手術を用いずに、例えば細針を用いて胸壁もしくは腹壁を穿刺し、または乳房、甲状腺もしくは他の部位の塊から細胞材料を取り出すことによって（細針吸引生検）得ることができる。一部の実施形態では、生体試料は、骨髄吸引試料である。生体試料は、本明細書で提供される生検方法、スワブ、擦過、静脈切開、または任意の他の適切な方法によって得ることができる。
野生型ｐ５３および／またはｐ５３変異の検出方法
【０３３７】
一部の実施形態では、ｐ５３非活性化変異が欠如している被験体は、本発明の化合物を用いるがん処置の候補である。ｐ５３非活性化変異および／または野生型ｐ５３の発現を決定するために、患者群から得られたがん細胞は、本発明の化合物を用いる処置の前にアッセイされるべきである。
【０３３８】
ｐ５３経路の活性は、例えば、ＡＫＴ１、ＡＫＴ２、ＡＫＴ３、ＡＬＫ、ＢＲＡＦ、ＣＤＫ４、ＣＤＫＮ２Ａ、ＤＤＲ２、ＥＧＦＲ、ＥＲＢＢ２（ＨＥＲ２）、ＦＧＦＲ１、ＦＧＦＲ３、ＧＮＡ１１、ＧＮＱ、ＧＮＡＳ、ＫＤＲ、ＫＩＴ、ＫＲＡＳ、ＭＡＰ２Ｋ１（ＭＥＫ１）、ＭＥＴ、ＨＲＡＳ、ＮＯＴＣＨ１、ＮＲＡＳ、ＮＴＲＫ２、ＰＩＫ３ＣＡ、ＮＦ１、ＰＴＥＮ、ＲＡＣ１、ＲＢ１、ＮＴＲＫ３、ＳＴＫ１１、ＰＩＫ３Ｒ１、ＴＳＣ１、ＴＳＣ２、ＲＥＴ、ＴＰ５３、およびＶＨＬを含めた、ｐ５３経路に関与する遺伝子の変異状況によって決定され得る。例えば、キナーゼ：ＡＢＬ１、ＪＡＫ１、ＪＡＡＫ２、ＪＡＫ３；受容体チロシンキナーゼ：ＦＬＴ３およびＫＩＴ；受容体：ＣＳＦ３Ｒ、ＩＬ７Ｒ、ＭＰＬ、およびＮＯＴＣＨ１；転写因子：ＢＣＯＲ、ＣＥＢＰＡ、ＣＲＥＢＢＰ、ＥＴＶ６、ＧＡＴＡ１、ＧＡＴＡ２、ＭＬＬ、ＫＺＦ１、ＰＡＸ５、ＲＵＮＸ１、ＳＴＡＴ３、ＷＴ１、およびＴＰ５３；エピジェネティック因子：ＡＳＸＬ１、ＤＮＭＴ３Ａ、ＥＺＨ２、ＫＤＭ６Ａ（ＵＴＸ）、ＳＵＺ１２、ＴＥＴ２、ＰＴＰＮ１１、ＳＦ３Ｂ１、ＳＲＳＦ２、Ｕ２ＡＦ３５、ＺＲＳＲ２；ＲＡＳタンパク質：ＨＲＡＳ、ＫＲＡＳ、およびＮＲＡＳ；アダプターＣＢＬおよびＣＢＬ−Ｂ；ＦＢＸＷ７、ＩＤＨ１、ＩＤＨ２、およびＮＰＭ１を含めた、ｐ５３の活性をモジュレートする遺伝子を評価することもできる。
【０３３９】
がん細胞試料は、例えば固形腫瘍または液性腫瘍から、原発性もしくは転移性腫瘍切除（例えば、肺切除術、肺葉切除術（lobetomy）、楔状切除術、および開頭術）  原発性もしくは転移性疾患の生検（例えば、経気管支または針コア）、胸水または腹水（例えば、ＦＦＰＥ細胞ペレット）、骨髄吸引物、骨髄クロット、および骨髄生検、または腫瘍が多量に存在する領域（固形腫瘍）のマクロ解剖（macro-dissection）により、得ることができる。
【０３４０】
組織におけるｐ５３野生型遺伝子および／またはｐ５３非活性化変異の欠如を検出するために、がん組織を、周囲の正常組織から単離することできる。例えば、組織は、パラフィン切片またはクリオスタット切片から単離することができる。がん細胞はまた、正常細胞からフローサイトメトリーによって分離することができる。がん細胞組織が、正常細胞によって高度に汚染されている場合、変異の検出はより困難となり得る。
【０３４１】
野生型ｐ５３および／またはｐ５３変異を分析するための様々な方法およびアッセイが、本発明において使用するのに適している。アッセイの非限定的な例として、ポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）、制限断片長多型（ＲＦＬＰ）、マイクロアレイ、サザンブロット、ノーザンブロット、ウエスタンブロット、イースタンブロット、Ｈ＆Ｅ染色、腫瘍の顕微鏡的評価、次世代ＤＮＡ配列決定（ＮＧＳ）（例えば、ＤＮＡの抽出、精製、定量および増幅、ライブラリー調製）  免疫組織化学検査、および蛍光インサイツハイブリダイゼーション（ＦＩＳＨ）が挙げられる。
【０３４２】
マイクロアレイによって、研究者は、表面、例えばガラスもしくはケイ素、またはポリマー性ビーズもしくは樹脂でできているＤＮＡチップに結合している複数のＤＮＡ配列を調査することができる。ＤＮＡ配列は、蛍光プローブまたは発光プローブとハイブリダイズされる。マイクロアレイは、試料配列をプローブとハイブリダイズした後、洗浄し、その後プローブを検出することに基づいて、試料中のオリゴヌクレオチド配列の存在を示すことができる。蛍光または発光シグナルの定量によって、試料中の公知のオリゴヌクレオチド配列の存在が示される。
【０３４３】
ＰＣＲは、ＤＮＡオリゴマーを急速に増幅させ、試料中のオリゴヌクレオチド配列を同定するために使用することができる。ＰＣＲ実験は、オリゴヌクレオチド試料を、標的配列に相補的なプライマー、１種または複数種のＤＮＡポリメラーゼ酵素、ｄＡＴＰ、ｄＧＴＰ、ｄＴＴＰおよびｄＣＴＰを含めたデオキシヌクレオチド（deoxnucleotide）三リン酸（ｄＮＴＰ）基本要素、ならびに適切なバッファ、塩および添加物を含有するＰＣＲ混合物と接触させることを含む。試料が、一対のプライマーに相補的なオリゴヌクレオチド配列を含有する場合、実験によって試料配列を増幅し、それらを収集し、同定することができる。
【０３４４】
一部の実施形態では、アッセイは、がん試料から得られた生体分子を増幅させることを含む。生体分子は、ＤＮＡまたはＲＮＡなどの核酸分子であり得る。一部の実施形態では、アッセイは、核酸分子を環状化し、その後、環状化された核酸分子を消化することを含む。
【０３４５】
一部の実施形態では、アッセイは、生物、または生物から収集された生化学試料、例えば核酸試料を、オリゴヌクレオチドのライブラリー、例えばＰＣＲプライマーと接触させることを含む。ライブラリーは、任意の数のオリゴヌクレオチド分子を含有し得る。オリゴヌクレオチド分子は、個々のＤＮＡモチーフもしくはＲＮＡモチーフ、または本明細書に記載のモチーフの任意の組合せに結合し得る。モチーフは、任意の距離を隔てて存在することができ、その距離は、公知または未知であり得る。一部の実施形態では、同じライブラリーの２つまたはそれを超えるオリゴヌクレオチドが、親核酸配列において公知の距離を隔てて存在するモチーフに結合する。親配列とのプライマーの結合は、親配列に対するプライマーの相補性に基づいて起こり得る。結合は、例えばアニーリング下またはストリンジェントな条件下で起こり得る。
【０３４６】
一部の実施形態では、アッセイの結果を使用して、将来使用するための新しいオリゴヌクレオチド配列を設計する。一部の実施形態では、アッセイの結果を使用して、将来使用するための新しいオリゴヌクレオチドライブラリーを設計する。一部の実施形態では、アッセイの結果を使用して、既存のオリゴヌクレオチドライブラリーを将来使用するために改訂、改良または更新する。例えば、アッセイによって、以前に未記載の核酸配列が、標的材料の存在と関連することを明らかにすることができる。この情報を使用して、核酸分子およびライブラリーを設計または再設計することができる。
【０３４７】
一部の実施形態では、ライブラリーにおける１つまたは複数の核酸分子は、バーコードタグを含む。一部の実施形態では、ライブラリーにおける核酸分子の１つまたは複数は、増幅試料の核酸配列を環状化し、切断するのに適したＩ型またはＩＩ型制限部位を含む。このようなプライマーを使用して、ＰＣＲ産物を環状化し、そのＰＣＲ産物を切断して、試料生物に生来の核酸配列とは異なって組織化された配列を有する核酸配列産物をもたらすことができる。
【０３４８】
ＰＣＲ実験の後、増幅した配列の存在を検証することができる。増幅した配列を見出すための方法の非限定的な例として、ＤＮＡ配列決定、全トランスクリプトームショットガン配列決定（ＷＴＳＳまたはＲＮＡ−ｓｅｑ）、質量分析（ＭＳ）、マイクロアレイ、パイロシーケンシング、カラム精製分析、ポリアクリルアミドゲル電気泳動法、およびインデックスタグ付きプライマーから作成されたＰＣＲ産物のインデックスタグ配列決定が挙げられる。
【０３４９】
一部の実施形態では、試料生物中の２つ以上の核酸配列が増幅される。ＰＣＲ産物混合物中の異なる核酸配列を分離する方法の非限定的な例として、カラム精製、高速液体クロマトグラフィー（ＨＰＬＣ）、ＨＰＬＣ／ＭＳ、ポリアクリルアミドゲル電気泳動法、サイズ排除クロマトグラフィーが挙げられる。
【０３５０】
増幅した核酸分子は、配列決定によって同定され得る。核酸配列決定は、自動計測手段で行うことができる。配列決定実験は、数十、数百、または数千の配列を、並行して同時に行うことができる。配列決定技術の非限定的な例を、以下に記載する。
【０３５１】
パイロシーケンシングでは、ＤＮＡは、油溶液中、プライマーでコーティングしたビーズに結合した単一ＤＮＡ鋳型を含有する水滴内で増幅される。ヌクレオチドを付加して、配列を成長させ、各塩基の付加は、可視光によって証明される。
【０３５２】
イオン半導体配列決定は、合成中に遊離した水素イオンと関連する電気シグナルとして、核酸残基の付加を検出する。鋳型を含有する反応ウェルを、４種類のヌクレオチド基本要素で一度に１つ満たす。電気シグナルのタイミングにより、どの基本要素が付加されたかを同定し、鋳型中の対応する残基を同定する。
【０３５３】
ＤＮＡナノボールは、ローリングサークル複製を使用して、ＤＮＡをナノボールへと増幅させる。ナノボールのライゲーションによる非鎖状配列決定（unchained  sequencing）によって、ＤＮＡ配列が明らかになる。
【０３５４】
可逆的色素による手法では、核酸分子は、スライド上でプライマーにアニーリングされ、増幅される。天然核酸塩基にそれぞれ相補的な４種類の蛍光色素残基が付加され、核酸配列における次の塩基に相補的な残基が付加され、組み込まれなかった色素は、スライドからすすがれる。４種類の可逆的なターミネーター塩基（ＲＴ塩基）が付加され、組み込まれなかったヌクレオチドは洗い流される。蛍光は、色素残基の付加を示し、したがって鋳型配列における相補的塩基を同定する。色素残基は、化学的に除去され、このサイクルが反復される。
【０３５５】
点変異の検出は、がん細胞組織中に存在するｐ５３対立遺伝子（複数可）の分子クローニング、およびその対立遺伝子（複数可）の配列決定によって達成され得る。あるいは、ポリメラーゼ連鎖反応を使用して、がん細胞組織由来のゲノムＤＮＡ調製物からｐ５３遺伝子配列を直接的に増幅することができる。次に、増幅した配列のＤＮＡ配列を決定することができる。例えば、Saikiら、Science、第２３９巻、４８７頁、１９８８年、米国特許第４，６８３，２０２号、および米国特許第４，６８３，１９５号参照。また、ｐ５３遺伝子の特異的欠失を検出することができる。例えば、ｐ５３遺伝子または周囲のマーカー遺伝子のための制限断片長多型（ＲＦＬＰ）プローブを使用して、ｐ５３対立遺伝子の喪失を記録することができる。
【０３５６】
また、野生型ｐ５３遺伝子の喪失は、該ｐ５３遺伝子の野生型発現産物の喪失に基づいて検出することができる。このような発現産物には、ｍＲＮＡならびにｐ５３タンパク質産物自体の両方が含まれる。点変異は、ｍＲＮＡを直接的に配列決定することによって、またはｍＲＮＡから作製されたｃＤＮＡの分子クローニングを介して検出することができる。クローン化ｃＤＮＡの配列は、ＤＮＡ配列決定技術を使用して決定され得る。また、ｃＤＮＡは、ポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）を介して配列決定され得る。
【０３５７】
あるいは、ミスマッチ検出を使用して、ｐ５３遺伝子またはｍＲＮＡ産物における点変異を検出することができる。該方法は、ヒト野生型ｐ５３遺伝子に相補的な標識リボプローブの使用を含み得る。リボプローブおよびがん細胞組織から単離されたｍＲＮＡまたはＤＮＡのいずれかを、一緒にアニーリングし（ハイブリダイズし）、その後、二本鎖ＲＮＡ構造において一部のミスマッチを検出することができる酵素ＲＮａｓｅ  Ａを用いて消化する。ミスマッチがＲＮａｓｅ  Ａによって検出される場合、その酵素が、ミスマッチ部位で切断する。したがって、アニーリングされたＲＮＡ調製物が、電気泳動ゲルマトリックスで分離される場合、ミスマッチがＲＮａｓｅ  Ａによって検出され、切断されると、ＲＮＡ産物は、リボプローブについての全長二本鎖ＲＮＡおよびｐ５３のｍＲＮＡまたはＤＮＡよりも小さいことが分かる。リボプローブは、ｐ５３のｍＲＮＡまたは遺伝子の全長である必要はないが、いずれかのセグメントであり得る。リボプローブが、ｐ５３のｍＲＮＡまたは遺伝子のセグメントだけを含む場合、いくつかのこれらのプローブを使用して、全長ｍＲＮＡ配列をミスマッチについてスクリーニングすることが望ましい。
【０３５８】
同様に、ＤＮＡプローブを使用して、酵素的または化学的切断を介してミスマッチを検出することができる。例えば、Cottonら、Proc.  Natl.  Acad.  Sci.  USA、８５巻、４３９７頁、１９８８年；およびShenkら、Proc.  Natl.  Acad.  Sci.  USA、７２巻、９８９頁、１９７５年参照。あるいは、ミスマッチは、マッチ二本鎖に対するミスマッチ二本鎖の電気泳動移動度の変化によって検出することができる。例えば、Cariello、Human  Genetics、４２巻、７２６頁、１９８８年参照。リボプローブまたはＤＮＡプローブのいずれかを用いて、変異を含有する可能性がある細胞ｍＲＮＡまたはＤＮＡを、ハイブリダイゼーションの前にＰＣＲを使用して増幅することができる（以下参照）。
【０３５９】
また、ポリメラーゼ連鎖反応を使用することによって増幅されたがん細胞組織由来のｐ５３遺伝子のＤＮＡ配列は、対立遺伝子に特異的なプローブを使用してスクリーニングすることができる。これらのプローブは、そのそれぞれが、公知の変異を有するｐ５３遺伝子配列領域を含有する核酸オリゴマーである。例えば、あるオリゴマーは、ｐ５３遺伝子配列の一部分に対応する約３０ヌクレオチド長であり得る。ｐ５３遺伝子の１７５番目のコドンをコードする位置において、オリゴマーは、野生型コドンであるバリンではなく、アラニンをコードする。一連のこのような対立遺伝子に特異的なプローブを使用することによって、ＰＣＲ増幅産物をスクリーニングして、ｐ５３遺伝子において既に同定された変異の存在を同定することができる。対立遺伝子に特異的なプローブと増幅ｐ５３配列とのハイブリダイゼーションは、例えばナイロンフィルタ上で実施され得る。特定のプローブとのハイブリダイゼーションによって、がん細胞組織において、対立遺伝子に特異的なプローブの場合のように、同じ変異の存在が示される。
【０３６０】
がん細胞におけるｐ５３遺伝子の構造変化の同定は、多様な一連の高分解能ハイスループットマイクロアレイプラットフォームを適用することによって容易になり得る。本質的に、２つのタイプのアレイは、クローン化核酸（例えば、ｃＤＮＡ、ＢＡＣ、コスミド）由来のＰＣＲ産物を担持するもの、およびオリゴヌクレオチドを使用するものを含む。該方法は、ゲノムワイドのＤＮＡコピー数の異常および発現レベルを調査して、同じ試料中で過剰発現および過少発現する遺伝子を有するがん細胞における喪失、獲得および増幅の間の相関を得るための方法を提供することができる。がん細胞におけるｍＲＮＡレベルを推定する遺伝子発現アレイは、両方の遺伝子発現レベル、代替スプライシング事象およびｍＲＮＡプロセシング変化を同定し得る、エクソンに特異的なアレイを生じた。
【０３６１】
オリゴヌクレオチドアレイを使用して、連鎖および関連研究のためにゲノム全般にわたって一塩基多型（ＳＮＰ）を調べることができ、これらは、コピー数の異常およびヘテロ接合事象の喪失を定量するために適合されている。ＤＮＡシークエンシングアレイは、染色体領域、エクソーム、および全ゲノムを並べ直すことができる。
【０３６２】
ＳＮＰベースのアレイまたは他の遺伝子アレイまたはチップによって、野生型ｐ５３の対立遺伝子の存在および変異の構造を決定することができる。ＤＮＡにおける単一部位の変化である一塩基多型（ＳＮＰ）は、ゲノムにおいて最も頻繁に生じるタイプの変化である。例えば、ヒトゲノムでは推定５００万〜１０００万のＳＮＰが存在する。ＳＮＰは、同義または非同義置換であり得る。同義ＳＮＰ置換は、遺伝暗号の縮重に起因してタンパク質におけるアミノ酸の変化を生じさせないが、他の方式で機能に影響を及ぼし得る。例えば、膜輸送タンパク質をコードする遺伝子における外見的にサイレントな変異は、翻訳を減速させ、ペプチド鎖をミスフォールドさせ、機能的でない変異体膜輸送タンパク質を産生し得る。非同義ＳＮＰ置換は、ミスセンス置換またはナンセンス置換であり得る。ミスセンス置換は、単一塩基の変化がタンパク質のアミノ酸配列の変化をもたらす場合に生じ、その機能不全は、疾患を生じる。ナンセンス置換は、点変異が、早計の終止コドン、または転写ｍＲＮＡにおいてナンセンスコドンをもたらす場合に生じ、それによって切断型の、通常は非機能性タンパク質産物が生じる。ＳＮＰは、集団内で進化全体を通して高度に保存されているので、ＳＮＰのマップは、研究のための優れた遺伝子型マーカーとして働く。ＳＮＰアレイは、全ゲノムを研究するための有用な手段である。
【０３６３】
さらに、ＳＮＰアレイを使用して、ヘテロ接合性消失（ＬＯＨ）を研究することができる。ＬＯＨは、対立遺伝子の完全な喪失から、または一方の対立遺伝子の他方の対立遺伝子に対するコピー数の増大から生じ得る、対立遺伝子不均衡の形態である。他のチップベースの方法（例えば、比較ゲノムハイブリダイゼーションは、ゲノムの獲得または欠失だけを検出することができる）に対して、ＳＮＰアレイには、片親性ダイソミー（ＵＰＤ）に起因してコピー数中性ＬＯＨを検出できるというさらなる利点がある。ＵＰＤでは、一方の親からの１つの対立遺伝子または全染色体が欠損して、他方の親の対立遺伝子の繰り返しをもたらす（片親性＝一方の親由来、ダイソミー＝重複）。疾患の状況において、この発生は、野生型対立遺伝子（例えば、母親由来）が欠損し、その代わりにヘテロ接合性対立遺伝子（例えば、父親由来）の２つのコピーが存在する場合に、病的であり得る。ＬＯＨは、ほとんどのヒトのがんの顕著な特徴なので、このＳＮＰアレイの使用には、がん診断において大いなる潜在性がある。ＳＮＰアレイ技術は、がん（例えば、胃がん、肝臓がん等）および血液系悪性腫瘍（ＡＬＬ、ＭＤＳ、ＣＭＬ等）が、ゲノム欠失またはＵＰＤおよびゲノム獲得に起因して高い率のＬＯＨを有することを示した。本開示では、ＬＯＨを検出するために高密度ＳＮＰアレイを使用することにより、対立遺伝子不均衡のパターンを同定して、野生型ｐ５３対立遺伝子の存在を決定することができる（Lipsら、２００５年；Laiら、２００７年）。
【０３６４】
ｐ５３遺伝子配列および一塩基多型アレイの例として、ｐ５３  Ｇｅｎｅ  Ｃｈｉｐ（Ａｆｆｙｍｅｔｒｉｘ、カリフォルニア州、サンタクララ）、Ｒｏｃｈｅ  ｐ５３  Ａｍｐｌｉ−Ｃｈｉｐ（Ｒｏｃｈｅ  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｓｙｓｔｅｍｓ、カリフォルニア州、プレザントン）、ＧｅｎｅＣｈｉｐ  Ｍａｐｐｉｎｇアレイ（Ａｆｆｙｍｅｔｒｉｘ、カリフォルニア州、サンタクララ）、ＳＮＰ  Ａｒｒａｙ  ６．０（Ａｆｆｙｍｅｔｒｉｘ、カリフォルニア州、サンタクララ）、ＢｅａｄＡｒｒａｙｓ（Ｉｌｌｕｍｉｎａ、カリフォルニア州、サンディエゴ）等が挙げられる。
【０３６５】
また、野生型ｐ５３遺伝子の変異は、該ｐ５３遺伝子の野生型発現産物の変異に基づいて検出することができる。このような発現産物には、ｍＲＮＡならびにｐ５３タンパク質産物自体の両方が含まれる。点変異は、ｍＲＮＡを直接的に配列決定することによって、またはｍＲＮＡから作製されたｃＤＮＡの分子クローニングを介して検出することができる。クローン化ｃＤＮＡの配列は、ＤＮＡ配列決定技術を使用して決定され得る。また、ｃＤＮＡは、ポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）を介して配列決定され得る。ｐ５３機能に関与するエピトープのそれぞれがモノクローナル抗体によって表されるモノクローナル抗体のパネルを使用することができる。そのパネルのモノクローナル抗体の結合の喪失または攪乱は、ｐ５３タンパク質の、したがってｐ５３遺伝子自体の変異による変化を示し得る。また、変異体ｐ５３遺伝子または遺伝子産物は、例えば、血清、糞便、尿および喀痰を含む身体試料において検出され得る。組織中の変異体ｐ５３遺伝子または遺伝子産物の検出について上記で論じたものと同じ技術を、他の身体試料に適用することができる。
【０３６６】
また、野生型ｐ５３遺伝子の喪失は、野生型ｐ５３タンパク質機能の喪失についてスクリーニングすることによって検出され得る。該ｐ５３タンパク質が疑いの余地なく有する機能のすべては、まだ解明されていないが、少なくとも２つの特異的な機能が公知である。タンパク質ｐ５３は、ＳＶ４０ラージＴ抗原ならびにアデノウイルスＥ１Ｂ抗原に結合する。該ｐ５３タンパク質がこれらの抗原のいずれかまたは両方に結合する能力の喪失は、該タンパク質の変異による変化を示すが、その変化は、その遺伝子自体の変異による変化を反映している。あるいは、ｐ５３機能に関与するエピトープのそれぞれがモノクローナル抗体によって表されるモノクローナル抗体のパネルを使用することができる。そのパネルのモノクローナル抗体の結合の喪失または攪乱は、該ｐ５３タンパク質の、したがってｐ５３遺伝子自体の変異による変化を示し得る。変化したｐ５３タンパク質を検出するための任意の方法を使用して、野生型ｐ５３遺伝子の喪失を検出することができる。
【実施例】
【０３６７】
（実施例１）
ペプチド模倣大環状分子
ペプチド模倣大環状分子を、既に記載されており、以下に記載されている通りに合成し、精製し、分析した（Schafmeisterら、J.  Am.  Chem.  Soc.  １２２巻：５８９１〜５８９２頁（２０００年）；SchafmeisterおよびVerdine、J.  Am.  Chem.  Soc.  １２２巻：５８９１頁（２００５年）；Walenskyら、Science  ３０５巻：１４６６〜１４７０頁（２００４年）；および米国特許第７，１９２，７１３号）。ペプチド模倣大環状分子は、２つまたはそれを超える天然に存在するアミノ酸を対応する合成アミノ酸で置き換えることによって設計した。置換は、ｉおよびｉ＋４位置、ならびにｉおよびｉ＋７位置で行った。ペプチド合成を、手動または自動化ペプチド合成機（Ａｐｐｌｉｅｄ  Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ、モデル４３３Ａ）のいずれかで、固相条件、ｒｉｎｋ  ａｍｉｄｅ  ＡＭ樹脂（Ｎｏｖａｂｉｏｃｈｅｍ）、およびＦｍｏｃ主鎖保護基化学を使用して実施した。天然Ｆｍｏｃ−保護アミノ酸（Ｎｏｖａｂｉｏｃｈｅｍ）のカップリングのために、１０当量のアミノ酸および１：１：２モル比のカップリング試薬ＨＢＴＵ／ＨＯＢｔ（Ｎｏｖａｂｉｏｃｈｅｍ）／ＤＩＥＡを用いた。非天然アミノ酸（４当量）を、１：１：２モル比のＨＡＴＵ（Ａｐｐｌｉｅｄ  Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ）／ＨＯＢｔ／ＤＩＥＡとカップリングさせた。合成ペプチドのＮ−末端を、アセチル化し、Ｃ−末端をアミド化した。
【０３６８】
架橋化合物の精製は、高速液体クロマトグラフィー（ＨＰＬＣ）（Ｖａｒｉａｎ  ＰｒｏＳｔａｒ）によって、逆相Ｃ１８カラム（Ｖａｒｉａｎ）上で達成して、純粋な化合物を得た。純粋な生成物の化学組成を、ＬＣ／ＭＳ質量分析（Ａｇｉｌｅｎｔ  １１００  ＨＰＬＣ系と連結させたＭｉｃｒｏｍａｓｓＬＣＴ）およびアミノ酸分析（Ａｐｐｌｉｅｄ  Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ、モデル４２０Ａ）によって確認した。
【０３６９】
以下のプロトコル（protocol）を、ＳＰ６６２、ＳＰ６６３およびＳＰ６６４を含むジアルキン架橋ペプチド模倣大環状分子の合成において使用した。完全に保護された樹脂結合ペプチドを、ＰＥＧ−ＰＳ樹脂（負荷０．４５ｍｍｏｌ／ｇ）上で０．２ｍｍｏｌのスケールで合成した。一時的Ｆｍｏｃ基の脱保護を、ＤＭＦ中２０％（ｖ／ｖ）ピペリジンで樹脂結合ペプチドを３×１０分間処理することによって達成した。ＮＭＰ（３×）、ジクロロメタン（３×）およびＮＭＰ（３×）で洗浄した後、連続的な各アミノ酸のカップリングを、予め活性化させた適切なＦｍｏｃ−アミノ酸誘導体と共に１×６０分間インキュベーションして達成した。すべての保護アミノ酸（０．４ｍｍｏｌ）を、ＮＭＰ中に溶解させ、ＨＣＴＵ（０．４ｍｍｏｌ）およびＤＩＥＡ（０．８ｍｍｏｌ）で活性化させた後、カップリング溶液を脱保護した樹脂結合ペプチドに移した。カップリングが完了した後、樹脂を、次の脱保護／カップリングサイクルに備えて洗浄した。アミノ末端のアセチル化を、ＮＭＰ中、無水酢酸／ＤＩＥＡの存在下で実施した。各カップリングの完了を検証するために、完全に構築された樹脂結合ペプチドのアリコートから得た、切断し脱保護した試料のＬＣ−ＭＳ分析を達成した。典型的な例では、テトラヒドロフラン（４ｍｌ）およびトリエチルアミン（２ｍｌ）を、４０ｍｌのガラスバイアルに入れたペプチド樹脂（０．２ｍｍｏｌ）に添加し、１０分間振とうした。次に、Ｐｄ（ＰＰｈ３）２Ｃｌ２（０．０１４ｇ、０．０２ｍｍｏｌ）およびヨウ化銅（０．００８ｇ、０．０４ｍｍｏｌ）を添加し、得られた反応混合物を、大気に開放した状態で機械的に１６時間振とうした。ジイン環化樹脂結合ペプチドを脱保護し、ＴＦＡ／Ｈ２Ｏ／ＴＩＳ（９５／５／５  ｖ／ｖ）で室温において２．５時間処理することによって、固体支持体から切断した。樹脂を濾過した後、ＴＦＡ溶液を冷ジエチルエーテル中で沈殿させ、それを遠心分離して、所望の生成物を固体として得た。粗製生成物を、分取ＨＰＬＣによって精製した。
【０３７０】
以下のプロトコルを、ＳＰ６６５を含む単一のアルキン架橋ペプチド模倣大環状分子の合成に使用した。完全に保護された樹脂結合ペプチドを、Ｒｉｎｋ  ａｍｉｄｅ  ＭＢＨＡ樹脂（負荷０．６２ｍｍｏｌ／ｇ）上で０．１ｍｍｏｌのスケールで合成した。一時的なＦｍｏｃ基の脱保護を、ＮＭＰ中２５％（ｖ／ｖ）ピペリジンで樹脂結合ペプチドを２×２０分間処理することによって達成した。ＮＭＰおよびジクロロメタンで十分に洗い流した後、連続的な各アミノ酸のカップリングを、予め活性化させた適切なＦｍｏｃ−アミノ酸誘導体と共に１×６０分間インキュベーションして達成した。すべての保護アミノ酸（１ｍｍｏｌ）を、ＮＭＰ中に溶解させ、ＨＣＴＵ（１ｍｍｏｌ）およびＤＩＥＡ（１ｍｍｏｌ）で活性化させた後、カップリング溶液を脱保護した樹脂結合ペプチドに移した。カップリングが完了した後、樹脂を、次の脱保護／カップリングサイクルに備えて十分に洗い流した。アミノ末端のアセチル化を、ＮＭＰ／ＮＭＭ中、無水酢酸／ＤＩＥＡの存在下で実施した。各カップリングの完了を検証するために、完全に構築された樹脂結合ペプチドのアリコートから得た、切断し脱保護した試料のＬＣ−ＭＳ分析を達成した。典型的な例では、ペプチド樹脂（０．１ｍｍｏｌ）を、ＤＣＭで洗浄した。樹脂を、マイクロ波バイアルに入れた。容器を排気し、窒素でパージした。ヘキサカルボニルモリブデン（０．０１当量、Ｓｉｇｍａ  Ａｌｄｒｉｃｈ  １９９９５９）を添加した。無水クロロベンゼンを、反応容器に添加した。次に、２−フルオロフェノール（１当量、Ｓｉｇｍａ  Ａｌｄｒｉｃｈ  Ｆ１２８０４）を添加した。次に、反応物をマイクロ波バイアルに入れ、１３０℃で１０分間保持した。反応は、完了するためにその後の時間進める必要がある場合がある。アルキンメタセシス化された（metathesized）樹脂結合ペプチドを脱保護し、ＴＦＡ／Ｈ２Ｏ／ＴＩＳ（９４／３／３  ｖ／ｖ）で室温において３時間処理することによって、固体支持体から切断した。樹脂を濾過した後、ＴＦＡ溶液を冷ジエチルエーテル中で沈殿させ、遠心分離して、所望の生成物を固体として得た。粗製生成物を、分取ＨＰＬＣによって精製した。
【０３７１】
表３は、調製したペプチド模倣大環状分子の一覧を示す。
【表３−１】
2018516844.tif 000067
【表３−２】
2018516844.tif 000068
【表３−３】
2018516844.tif 000069
【表３−４】
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【表３−５】
2018516844.tif 000071
【表３−６】
2018516844.tif 000072
【表３−７】
2018516844.tif 000073
【表３−８】
2018516844.tif 000074
【表３−９】
2018516844.tif 000075
【表３−１０】
2018516844.tif 000076
【表３−１１】
2018516844.tif 000077
【表３−１２】
2018516844.tif 000078
【表３−１３】
2018516844.tif 000079
【０３７２】
表３ａは、ペプチド模倣大環状分子の選択を示す。
【表３ａ】
2018516844.tif 000080
【０３７３】
表３ｂは、ペプチド模倣大環状分子のさらなる選択を示す。
【表３ｂ−１】
2018516844.tif 000081
【表３ｂ−２】
2018516844.tif 000082
【０３７４】
上および他所に示されている配列には、以下の略語が使用される。「Ｎｌｅ」はノルロイシンを表し、「Ａｉｂ」は２−アミノイソ酪酸を表し、「Ａｃ」はアセチルを表し、「Ｐｒ」はプロピオニルを表す。「＄」と表されるアミノ酸は、１つの二重結合を含む全炭素クロスリンカーによって結合しているアルファ−Ｍｅ  Ｓ５−ペンテニル−アラニンオレフィンアミノ酸である。「＄ｒ５」と表されるアミノ酸は、１つの二重結合を含む全炭素によって結合しているアルファ−Ｍｅ  Ｒ５−ペンテニル−アラニンオレフィンアミノ酸である。「＄ｓ８」と表されるアミノ酸は、１つの二重結合を含む全炭素クロスリンカーによって結合しているアルファ−Ｍｅ  Ｓ８−オクテニル−アラニンオレフィンアミノ酸である。「＄ｒ８」と表されるアミノ酸は、１つの二重結合を含む全炭素クロスリンカーによって結合しているアルファ−Ｍｅ  Ｒ８−オクテニル−アラニンオレフィンアミノ酸である。「Ａｈｘ」は、アミノシクロヘキシルリンカーを表す。クロスリンカーは、各アミノ酸のアルファ炭素の間に８個または１１個の炭素原子を含む、直鎖全炭素クロスリンカーである。「＄／」と表されるアミノ酸は、いかなるクロスリンカーによっても結合していないアルファ−Ｍｅ  Ｓ５−ペンテニル−アラニンオレフィンアミノ酸である。「＄／ｒ５」と表されるアミノ酸は、いかなるクロスリンカーによっても結合していないアルファ−Ｍｅ  Ｒ５−ペンテニル−アラニンオレフィンアミノ酸である。「＄／ｓ８」と表されるアミノ酸は、いかなるクロスリンカーによっても結合していないアルファ−Ｍｅ  Ｓ８−オクテニル−アラニンオレフィンアミノ酸である。「＄／ｒ８」と表されるアミノ酸は、いかなるクロスリンカーによっても結合していないアルファ−Ｍｅ  Ｒ８−オクテニル−アラニンオレフィンアミノ酸である。「Ａｍｗ」と表されるアミノ酸は、アルファ−Ｍｅトリプトファンアミノ酸である。「Ａｍｌ」と表されるアミノ酸は、アルファ−Ｍｅロイシンアミノ酸である。「Ａｍｆ」と表されるアミノ酸は、アルファ−Ｍｅフェニルアラニンアミノ酸である。「２ｆｆ」と表されるアミノ酸は、２−フルオロ−フェニルアラニンアミノ酸である。「３ｆｆ」と表されるアミノ酸は、３−フルオロ−フェニルアラニンアミノ酸である。「Ｓｔ」と表されるアミノ酸は、それぞれが示されている通り別のアミノ酸に架橋されている２つのペンテニル−アラニンオレフィン側鎖を含むアミノ酸である。「Ｓｔ／／」と表されるアミノ酸は、架橋されていない２つのペンテニル−アラニンオレフィン側鎖を含むアミノ酸である。「％Ｓｔ」と表されるアミノ酸は、それぞれが示されている通り完全に飽和した炭化水素架橋を介して別のアミノ酸に架橋されている２つのペンテニル−アラニンオレフィン側鎖を含むアミノ酸である。「Ｂａ」と表されるアミノ酸は、ベータ−アラニンである。架橋アミノ酸の命名（例えば「＄ｅｒ８」または「＄ｚｒ８」）における小文字「ｅ」または「ｚ」は、二重結合の立体配置を表す（それぞれＥまたはＺ）。他の文脈では、「ａ」または「ｆ」などの小文字は、Ｄアミノ酸（例えば、それぞれＤ−アラニンまたはＤ−フェニルアラニン）を表す。「ＮｍＷ」と指定されるアミノ酸は、��−メチルトリプトファンを表す。「ＮｍＹ」と指定されるアミノ酸は、Ｎ−メチルチロシンを表す。「ＮｍＡ」と指定されるアミノ酸は、Ｎ−メチルアラニンを表す。「Ｋｂｉｏ」は、リシン残基の側鎖アミノ基に結合しているビオチン基を表す。「Ｓａｒ」と指定されるアミノ酸は、サルコシンを表す。「Ｃｈａ」と指定されるアミノ酸は、シクロヘキシルアラニンを表す。「Ｃｐｇ」と指定されるアミノ酸は、シクロペンチルグリシンを表す。「Ｃｈｇ」と指定されるアミノ酸は、シクロヘキシルグリシンを表す。「Ｃｂａ」と指定されるアミノ酸は、シクロブチルアラニンを表す。「Ｆ４Ｉ」と指定されるアミノ酸は、４−ヨードフェニルアラニンを表す。「７Ｌ」は、Ｎ１５同位体ロイシンを表す。「Ｆ３Ｃｌ」と指定されるアミノ酸は、３−クロロフェニルアラニンを表す。「Ｆ４ｃｏｏｈ」と指定されるアミノ酸は、４−カルボキシフェニルアラニンを表す。「Ｆ３４Ｆ２」と指定されるアミノ酸は、３，４−ジフルオロフェニルアラニンを表す。「６ｃｌＷ」と指定されるアミノ酸は、６−クロロトリプトファンを表す。「＄ｒｄａ６」と指定されるアミノ酸は、第２のアルキニルアミノ酸とのジアルキン結合を介して架橋されたアルファ−Ｍｅ  Ｒ６−ヘキシニル−アラニンアルキニルアミノ酸を表す。「＄ｄａ５」と指定されるアミノ酸は、アルファ−Ｍｅ  Ｓ５−ペンチニル−アラニンアルキニルアミノ酸を表し、ここでアルキンは、第２のアルキニルアミノ酸とのジアルキン結合の半分を形成する。「＄ｒａ９」と指定されるアミノ酸は、第２のアルキニルアミノ酸とのアルキンメタセシス反応を介して架橋されたアルファ−Ｍｅ  Ｒ９−ノニニル−アラニンアルキニルアミノ酸を表す。「＄ａ６」と指定されるアミノ酸は、第２のアルキニルアミノ酸とのアルキンメタセシス反応を介して架橋されたアルファ−Ｍｅ  Ｓ６−ヘキシニル−アラニンアルキニルアミノ酸を表す。名称「ｉｓｏ１」または「ｉｓｏ２」は、ペプチド模倣大環状分子が、単一異性体であることを示す。
【０３７５】
「Ｃｉｔ」と指定されるアミノ酸は、シトルリンを表す。「Ｃｏｕ４」、「Ｃｏｕ６」、「Ｃｏｕ７」および「Ｃｏｕ８」と指定されるアミノ酸は、それぞれ以下の構造を表す：
【化６２】
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【０３７６】
一部の実施形態では、ペプチド模倣大環状分子は、例えば、架橋の構造内の二重結合の立体配置（Ｅ対Ｚ）に起因して、２つ以上の異性体で得られる。一部の実施形態では、このような異性体は、従来のクロマトグラフィーによる方法によって分離することができ、または分離できない場合がある。一部の実施形態では、一方の異性体は、他方の異性体と比較して改善された生物学的な特性を有する。一実施形態では、ペプチド模倣大環状分子のＥの架橋オレフィン異性体は、そのＺの対応物と比較して、より良好な溶解度、より良好な標的親和性、より良好なｉｎ  ｖｉｖｏもしくはｉｎ  ｖｉｔｒｏ有効性、より高いヘリシティ、または改善された細胞透過性を有する。別の実施形態では、ペプチド模倣大環状分子のＺの架橋オレフィン異性体は、そのＥの対応物と比較して、より良好な溶解度、より良好な標的親和性、より良好なｉｎ  ｖｉｖｏもしくはｉｎ  ｖｉｔｒｏ有効性、より高いヘリシティ、または改善された細胞透過性を有する。
【０３７７】
表３ｃは、例示的なペプチド模倣大環状分子を示す：
【表３ｃ−１】
2018516844.tif 000084
【表３ｃ−２】
2018516844.tif 000085
【表３ｃ−３】
2018516844.tif 000086
【表３ｃ−４】
2018516844.tif 000087
【表３ｃ−５】
2018516844.tif 000088
【表３ｃ−６】
2018516844.tif 000089
【表３ｃ−７】
2018516844.tif 000090
【０３７８】
一部の実施形態では、ペプチド模倣大環状分子は、表４ａに示されているペプチド模倣大環状分子の１つまたは複数を除外する：
【表４ａ−１】
2018516844.tif 000091
【表４ａ−２】
2018516844.tif 000092
表４ａでは、Ｘは、Ｓまたは任意のアミノ酸を表す。示されているペプチドは、アセチルなどのＮ末端キャッピング基を含むことができ、またはそのキャッピング基とペプチド配列開始部の間に、ベータ−アラニンなどの追加のリンカーを含むことができる。
【０３７９】
一部の実施形態では、ペプチド模倣大環状分子は、表４ａに示されているペプチド模倣大環状分子構造を含まない。
【０３８０】
他の実施形態では、ペプチド模倣大環状分子は、表４ｂに示されている１つまたは複数のペプチド模倣大環状分子を除外する。
【表４ｂ−１】
2018516844.tif 000093
【表４ｂ−２】
2018516844.tif 000094
【表４ｂ−３】
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【表４ｂ−４】
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【表４ｂ−５】
2018516844.tif 000097
【表４ｂ−６】
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【表４ｂ−７】
2018516844.tif 000099
【表４ｂ−８】
2018516844.tif 000100
【表４ｂ−９】
2018516844.tif 000101
【表４ｂ−１０】
2018516844.tif 000102
【表４ｂ−１１】
2018516844.tif 000103
【表４ｂ−１２】
2018516844.tif 000104
【表４ｂ−１３】
2018516844.tif 000105
【表４ｂ−１４】
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【表４ｂ−１５】
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【表４ｂ−１６】
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【０３８１】
一部の実施形態では、本明細書に開示のペプチド模倣大環状分子は、表４ｂに示されているペプチド模倣大環状分子構造を含まない。
【０３８２】
表４ｃは、Ｄ−アミノ酸を含む非架橋ポリペプチドの例を示す。
【表４ｃ】
2018516844.tif 000109
（実施例２）
安全性および／または忍容性研究
研究目的
【０３８３】
この研究は、（ｉ）２１日サイクルまたは２８日サイクルの連続した３週間で毎週１回ＩＶ注入によって投与された、この開示のペプチドであるペプチド１の安全性および／または忍容性を評価するために、ならびに（ｉｉ）ＷＴｐ５３タンパク質を発現する進行型液性がんの患者におけるペプチド１のＤＬＴおよびＭＴＤまたはＯＢＤを決定するために設計されている。ペプチド１は、２０個未満のアミノ酸長のアミノ酸配列を有するアルファヘリカル炭化水素架橋ポリペプチド大環状分子であり、これは、野生型ヒトＰ５３タンパク質のトランス活性化ドメインから得られ、野生型ヒトＰ５３タンパク質のトランス活性化ドメインの場合のように、互いに対して同じ位置にフェニルアラニン、トリプトファンおよびロイシンアミノ酸を含有している。ペプチド１は、アミノ酸配列のｉ位置のアミノ酸からｉ＋７位置のアミノ酸にわたる単一架橋を有しており、ｉ＋７位置とカルボキシル末端との間に３個を超えるアミノ酸を有している。ペプチド１は、ヒトＭＤＭ２およびＭＤＭ４に結合し、エレクトロスプレーイオン化法−質量分析によって測定して、９５０〜９７５ｍ／ｅの観測質量を有する。
調査計画
研究設計
【０３８４】
この研究は、ＷＴ  ｐ５３タンパク質（以下のｐ５３ステータス決定を参照）を発現する進行型液性がん（例えば、白血病、骨髄腫および液性リンパ腫）の患者において、２８日サイクルまたは２１日サイクルの２つの異なる投薬レジメンを使用して、ＩＶ注入によって投与されたペプチド１の安全性、忍容性、ＰＫ、ＰＤ、および抗液性がん細胞効果を評価するために設計された用量−漸増２アーム研究を含む。例えば、ペプチド１は、再発性／難治性急性骨髄性白血病（ＡＭＬ）および／または急性リンパ性白血病（ＡＬＬ）の患者に使用することができる。患者は、２８日サイクル中の連続した３週間に毎週１回または２１日サイクル中の連続した２週間に毎週２回のいずれかでペプチド１を受ける。液性リンパ腫の多くの患者は、末梢血液中に循環腫瘍細胞（ＣＴＣ）を呈し、これは、フローサイトメトリーを使用して検出および分析することができる。したがって、これらの細胞における研究薬物特異的標的結合（target  engagement）の検出が可能である。
【０３８５】
研究は、用量漸増相（ＤＥＰ）および拡大相（ＥＸＰ）からなる。ＤＥＰは、ペプチド−１のＭＴＤまたはＯＢＤを確立するための「３＋３」用量漸増設計である。ＥＸＰでは、用量レベルの臨床安全性プロファイルおよび潜在的有効性をさらに調査するためのＭＴＤまたはＯＢＤで特定の液性がんの患者の最大２つまでの別個の群を登録する。ＥＸＰのための患者の選択は、ＤＥＰの結果、ならびに追加の非臨床薬理研究からのデータに基づいて確定される。後者は、液性がん型にわたっておよび液性がん型内でのペプチド−１に対する細胞株感受性の比較を容易にする、複数の液性がん細胞株（例えば、白血病、液性リンパ腫、骨髄腫）の調査を含む。
【０３８６】
この研究の用量漸増相および用量拡大相における患者の処置は、疾患進行、許容できない毒性、または治療を中止するという患者もしくは医師による決定が記載されるまで継続する。
【０３８７】
登録前のｐ５３ステータス決定および腫瘍サンプリング要件：
【０３８８】
中央検査室試験は、次世代配列決定（ＮＧＳ）を使用して、ｐ５３ステータスのための研究に登録されたすべての患者由来の保存組織試料または新鮮な生検試料の両方を試験する。
【０３８９】
段階１の第１の３用量レベルについて：
患者は、ｐ５３ステータスに無関係で登録され得る。それでもなお、患者はまた、中央検査室でｐ５３ステータスについて試験される。この目的のため、保存された組織（例えば、試料は３年より古くてはいけない）が使用され得るか、または代替として、生検が患者に著しいリスクをもたらさないならば新鮮な生検材料を考慮に入れ得る。
【０３９０】
段階１の用量レベル４で開始（およびＤＥＰの段階２に登録された患者について）：
【０３９１】
ＷＴ  ｐ５３タンパク質を発現する液性がん細胞を有する患者のみが登録される。この鍵となる包含判定基準は、ＷＴ  ｐ５３タンパク質が薬理学的に活性であることを必要とする、ペプチド１の提案されている作用機序に基づいている。包含判定基準はまた、ペプチド１が、ＷＴ  ｐ５３タンパク質を発現する液性がん細胞において活性を明らかに示すがｐ５３の変異を有する細胞では示さないｉｎ  ｖｉｔｒｏ液性がん細胞成長アッセイの結果によっても支持される。患者は、以下のシナリオの１つを介してｐ５３要件を満たし得る：
・患者は、地方の検査室で行われた以前のｐ５３遺伝子試験結果に基づいて適格であり得る。これらの患者は、また、中央検査室でＮＧＳを使用して、ｐ５３ステータスについて試験される。この目的のため、保存組織が使用され得るか（試料は、３年より古くてはいけない）、または代替として、生検が患者に著しいリスクをもたらさないならば新鮮な生検材料が考慮されるべきである。保存組織を有さない患者および生検が著しいリスクをもたらす患者は登録されない。
・患者は、中央検査室でｐ５３について試験された保存組織に基づいて適格であり得るか（試料は、３年より古くてはいけない）、または代替として、生検が患者に著しいリスクをもたらさないならば新鮮な生検材料が考慮され得る。保存組織を有さない患者および生検が著しいリスクをもたらす患者は登録されない。
【０３９２】
ＥＸＰに登録される患者について：
・ｐ５３  ＷＴを発現する液性がん細胞を有する患者のみが登録され、すべての患者は、登録より前に中央検査室でＮＧＳを使用してｐ５３ステータスについて試験されなければならない。保存組織が使用され得るか（試料は、１年より古くてはいけない）、または代替として、生検が患者に著しいリスクをもたらさないならば新鮮な生検材料が考慮され得る。保存組織を有さない患者および生検が著しいリスクをもたらす患者は登録されない。
【０３９３】
ＷＴ  ｐ５３タンパク質を発現する液性がん細胞を有する患者のみが登録される。ｐ５３ステータスの決定は、スクリーニング期間中に得られた液性がん細胞試料で実施される。アッセイは、必要とされる能力を有する研究現場によって実施することができ；そうでなければ、それは中央検査室で実施することができる。保存の組織試料からの結果は、利用可能ならば、ＤＥＰにおける患者適格性を決定するために使用することができる。この研究に登録された患者の合計数は、ＭＴＤまたはＯＢＤが確立される前の、用量レベルの数および各コホートにおける患者の数に依存する。安全でないという理由で中止する患者の交代要員を除外して、およそ４５人の患者がＤＥＰに登録され、最大２つの患者群（合計６０）の各々で合計最大およそ６０人の追加の患者がＥＸＰコホートに登録される。合計最大１００人の患者の登録が、この研究のために計画される。ＵＳでおよそ６つの臨床現場が計画される。予想される発生相は、およそ１５カ月である。予想されるフォローアップ相は、およそ２３カ月の合計研究持続期間の間、最後の患者が登録された後およそ８カ月である。
【０３９４】
ＷＴ  ｐ５３ステータスのドキュメンテーションを含むすべての包含判定基準および除外判定基準を満たす患者は、ペプチド１を受ける３人から６人の患者のコホートに登録される。ペプチド１は、２８日サイクルの１日目、８日目および１５日目に１時間（±５分）かける用量レジメンＡで、または２１日サイクルの１日目、４日目、８日目、１１日目に用量レベル３で開始して同様に１時間（±５分）かける用量レジメンＢで、ＩＶ注入によって投与される。
【０３９５】
処置は、疾患進行、許容できない毒性、または患者もしくは医師によるコンセントの撤回まで継続する。ＭＴＤまたはＯＢＤが確立された後、追加の患者が、この用量レベルおよび特に患者または液性がん細胞型でのさらなる経験を獲得するために、最大２つの別々の拡大コホート（１つの拡大コホート当たりおよそ３０人の患者）に登録され得る。患者または液性がん細胞型の選択は、部分的に、この研究の用量漸増部分（dose  escalation  portion）で行われる観察に基づいて決定される。
【０３９６】
安全性は、ＡＥの発生率、重症度、持続期間、因果律、重篤度およびタイプ、ならびに、患者の理学的検査、バイタルサインおよび臨床検査の結果における変化に基づいて評価される。治験責任医師は、ＮＣＩ  ＣＴＣＡＥバージョン４．０を使用して、ＡＥの重症度を評価する。
【０３９７】
この研究の第１の目的が安全性およびＰＫに基づいているので、統計分析は、本質的に記述的であり、完全奏効（ＣＲ）または部分奏効（ＰＲ）を達成する患者またはＩＷＧ（２０１４）判定基準に基づく安定疾患（ＳＤ）を維持する患者を含めて、すべての研究された用量およびすべての観測された応答を明らかにする。ペプチド１の少なくとも１用量を受ける患者は、安全性集団を構成し、すべての安全性分析に含まれる。ペプチド１の少なくとも１つのサイクルを完了し、処置後の客観的疾患評価を受ける患者は、有効性評価可能な患者集団を構成する。
患者集団
包含判定基準
【０３９８】
すべてのＡＭＬ患者は、ＷＨＯ判定基準に従った再発性または難治性急性骨髄性白血病を有することが必要とされる。急性前骨髄球性白血病の患者は除外される。すべてのＭＤＳ患者は、以下を有することが必要とされる：（ｉ）研究エントリーの前８週以内にＭＤＳの診断が確立；（ｉｉ）低メチル化剤（アザシチジンまたはデシタビン）に非応答性または不耐性；（ｉｉｉ）ＩＰＳＳ−Ｒ中程度／高い／非常に高いリスクのＭＤＳ患者（スクリーニングでＩＰＳＳ−Ｒ判定基準を適用）；または、ＩＰＳＳ−Ｒステータスが決定され得ないならば（例えば、細胞遺伝学検査（cytogenetics）がドライタップにより利用不可能であるならば）、ＦＡＢ分類：ＲＡＥＢ−１（５％から９％のＢＭ芽球）、ＲＡＥＢ−２（１０％から１９％のＢＭ芽球）、ＣＭＭＬ（１０％から２０％ＢＭの芽球）およびＷＢＣ＜１３，０００／μＬ、ＲＡＥＢ−ｔ（２０％から３０％のＢＭ芽球）；（ｉｖ）ＭＤＳ患者は、また以下の少なくとも１つを満たさなければならない：ａ．アザシチジン処置またはデシタビン処置の開始後の任意の時に進行（２００６  ＩＷＧ判定基準に従う）；ｂ．アザシチジンまたはデシタビンの少なくとも６つの４週サイクル後に完全奏効もしくは部分奏効または血液学的改善（２００６  ＩＷＧに従う）を達成することの失敗；ｃ．アザシチジンまたはデシタビンの少なくとも４つの４週サイクル後に観察された初期の完全奏効もしくは部分奏効または血液学的改善（２００６  ＩＷＧ判定基準に従う）後に再発；ｄ．処置中止に至る薬物関連の≧グレード３の肝臓または腎臓毒性によって定義されている、アザシチジンまたはデシタビンに対する不耐性。
【０３９９】
すべての患者は、以下の包含判定基準を満たすことが必要とされる：（ｉ）インフォームドコンセントの時に、１８歳およびそれ超の年齢の男性または女性の患者全てを含む（ｉｉ）組織学的にまたは細胞学的に液性がんが確認された。標準的な治癒尺度は存在しないか、またはもはや有効でない；（ｉｉｉ）再発性または処置難治性液性新生物のＷＴ  ｐ５３ステータスは、ＤＥＰの段階１において用量レベル４およびそれ超に登録する患者にとって、ならびにＤＥＰの段階２においてまたはＥＸＰにおいて登録されたすべての患者にとって、必須である；（ｉｖ）液性リンパ腫患者において改訂版国際ワーキンググループ奏効判定基準（ＩＷＧ（２０１４））によって測定可能である少なくとも１つの標的病変；（ｖ）ＥＣＯＧパフォーマンスステータス０〜１；（ｖｉ）≧３カ月の予測平均余命；（ｖｉｉ）ペプチド１の第１の用量より前７日以内に測定された適切な血液学的機能（以下のように定義されている：ＡＮＣ≧１．５×１０９／Ｌ、ヘモグロビン≧９．０ｇ／ｄ、および血小板数≧１００×１０９／Ｌ）；（ｖｉｉｉ）ペプチド１の第１の用量より前７日以内に測定された適切な肝機能（以下のように定義されている：肝臓への疾患関与の非存在下：ビリルビン≦１．５倍  施設ＵＬＮ：ＡＳＴおよびＡＬＴ≦２．５倍  ＵＬＮ；肝臓への疾患関与の存在下：ビリルビン≦２倍  ＵＬＮ：ＡＳＴおよびＡＬＴ≦５倍  ＵＬＮ）、（ｉｘ）ペプチド１の第１の用量より前７日以内に測定された適切な腎機能、（以下のように定義されている：＋２またはそれ超のタンパク尿のエビデンスがない尿検査、血清クレアチニン≦１．５倍  施設ＵＬＮまたは算出クレアチニンクリアランス≧５０ｍＬ／分（Ｃｏｃｋｃｒｏｆｔ−Ｇａｕｌｔ式））；（ｘ）ペプチド１の第１の用量より前７日以内に測定された許容される凝固プロファイル（以下のように定義されている：ＰＴまたはＩＮＲ≦１．５倍  ＵＬＮ；ａＰＴＴ≦１．５倍  ＵＬＮ）；（Ｘｉ）先の治療から、脱毛症を除外する重大な毒性が、グレード１またはベースラインへ回復している、以前の化学療法または生物学的治療、放射線治療または外科手術（胸部内、腹腔内または骨盤内）から少なくとも４週。ペプチド１の第１の用量より≦２週前の、骨病変のための緩和的放射線治療は、急性毒性が解消されている（resolved）ならば許容される；（ｘｉｉ）子宮摘出を受けていないか、または連続した≧２４カ月の間自然閉経後でない（即ち、先行する連続した２４カ月の任意の時に月経があった）性的に成熟した女性と定義されている、出産可能な女性について、ペプチド１の第１の用量より前１４日以内に血清妊娠試験が陰性；（ｘｉｉｉ）出産能のあるすべての患者（女性および男性）は、ペプチド１の第１の用量の２週前およびペプチド１の最終用量後３０日間に始まる産児制限（即ち、ラテックスコンドーム、避妊ペッサリー（diaphragm）、子宮頚部キャップ、ＩＵＤ、産児制限ピルなど）の有効な方法を使用することに同意する；（ｘｉｖ）書面でのインフォームドコンセント文書を理解する能力および署名する意志；および前立腺がんの患者は、アンドロゲン枯渇療法がペプチド１の第１の用量より６カ月前に中止されていないならば、アンドロゲン枯渇��法を継続しなければならない。急性骨髄性白血病（ＡＭＬ）または急性リンパ性白血病（ＡＬＬ）にペプチド１を使用するという研究において、Ｂ細胞急性リンパ性白血病（Ｂ−ＡＬＬ）およびＴ細胞急性リンパ球性白血病（Ｔ−ＡＬＬ）など、ＡＭＬまたはＡＬＬの病理学的確認を有する患者が含まれる。こうした研究において、標準的化学療法に対して再発性、難治性、または不耐性である患者が含まれる。
除外判定基準
【０４００】
スクリーニングまたは−１日目で以下の判定基準のいずれかを満たす患者は除外される：（ｉ）ＭＤＭ２またはＭＤＭＸ活性に影響する治験薬を用いる以前の処置；任意の研究薬物構成成分に対する既知の過敏症；（ｉｉｉ）既知および未処置の脳転移。処置され、≧３０日間臨床的に安定であると実証された脳転移を有する患者は、本研究の用量漸増部分に登録され得る；（ｉｖ）凝血異常の病歴、血小板障害、または非薬物誘発血小板減少症の病歴；（ｖ）ペプチド１の第１の用量より前６カ月以内の肺塞栓症、または未処置ＤＶＴの病歴；（ｖｉ）アスピリン用量≦８１ｍｇ／日を除外する、抗凝固薬もしくは抗血小板医薬、ＤＶＴ予防のための低用量ＳＣヘパリンもしくはＳＣ低分子量ヘパリン、またはＩＶカテーテル開存性を維持するためのヘパリンフラッシュの、必要とされる同時使用；（ｖｉｉ）既知の心血管リスクの既存の病歴または既知の心血管リスクを有する患者（例えば：心筋梗塞を含む急性冠動脈症候群の病歴、不安定アンギナ、冠状動脈バイパスグラフト、血管形成術、またはペプチド１の第１の用量より前６カ月以内のステント留置；収縮期ＢＰ≧１６０ｍｍＨｇおよび／または拡張期ＢＰ≧１００ｍｍＨｇと定義されている制御されない高血圧；既存の心不全（ニューヨーク心臓協会クラスＩＩＩ−ＩＶ）；抗凝固薬での心房細動；臨床的に重大な制御されない不整脈、または処置を必要とする不整脈、例外は心房細動および発作性上室性頻拍；重症の弁膜症；男性について≧４５０ｍｓｅｃおよび女性について≧４７０ｍｓｅｃの、スクリーニングＥＣＧ上の補正ＱＴｃ間隔）；（ｖｉｉｉ）ペプチド１の第１の用量より前６カ月以内での臨床的に重大な胃腸出血；（ｉｘ）臨床的に重大なサードスペース体液蓄積（例えば、利尿剤の使用にもかかわらず穿刺（tapping）を必要とする腹水、または穿刺を必要とするもしくは息切れと関係する胸水）；（ｘ）妊娠中または授乳中の女性；（ｘｉ）患者安全性またはこの研究に参加するためのインフォームドコンセントの提供を妨害し得る重篤および／または不安定な既存の医学的、精神的または他の状態（臨床検査異常を含む）のエビデンス；（ｘｉｉ）活動性の制御されない感染、ＨＩＶ／ＡＩＤＳの病歴、または肝細胞癌の非存在下のＢ型肝炎もしくはＣ型肝炎の病歴。肝炎血清学的検査陽性を有するが活動性ウイルス性肝炎を示していない原発性肝臓がんの患者は、彼らがすべての他の包含判定基準を満たし、他の除外判定基準を満たさないならば、登録が考慮され得る；（ｘｉｉｉ）ＤＥＰの段階１において用量レベル４およびそれ超で開始する（ＤＥＰの段階２においてまたはＥＸＰにおいて登録するすべての患者についても同様）：既知のヒトパピローマウイルス（ＨＰＶ）が関係するがん、例えばＨＰＶ陽性子宮頸がん、ＨＰＶ陽性中咽頭がんまたはＨＰＶ陽性肛門がん；（ｘｉｖ）≧２年間寛解していなかった別の原発性悪性腫瘍の既知の病歴。非メラノーマ皮膚がんおよび子宮頸上皮内癌または扁平上皮内病変（例えば、ＣＩＮまたはＰＩＮ）は認められない；（ｘｖ）研究プロトコルおよびフォローアップスケジュールを有するコンプライアンスを潜在的に妨害し得る任意の心理学的、社会学的または地理的状態；（ｘｖｉ）ペ��チド１注入の２４時間以内の肝胆輸送体（例えば、ＯＡＴＰメンバーＯＡＴＰ１Ｂ１およびＯＡＴＰ１Ｂ３）によって主にクリアされる任意の併用医薬の必要とされる使用；（ｘｖｉｉ）ペプチド１の第１の用量より前４週以内または５つの循環半減期以内の任意の治験薬の使用。急性骨髄性白血病（ＡＭＬ）または急性リンパ性白血病（ＡＬＬ）のためにペプチド１を使用するという研究において、急性の未分化型または二表現型白血病の患者は除外される。５０，０００／ｕＬを超える白血病芽球カウントを有する患者は除外される。染色体１７の欠失、またはｄｅｌ（１７ｐ）の患者は除外される。
研究治療からの患者の除去／交代
【０４０１】
患者は、以下を含む様々な理由で研究治療から除去され得る：（ｉ）疾患進行；（ｉｉ）許容できない有害事象（複数可）；（ｉｉｉ）さらなる参加を防止する介在性疾病；（ｉｖ）２週の投薬遅延にもかかわらない、または２つの用量低減後の、臨床的に重大な毒性；（ｖ）研究を通して処置を継続することへの患者拒否および／または研究参加のためのコンセント撤回；（ｖｉ）研究要件を順守することができないまたは嫌がる患者；（ｖｉｉ）妊娠、または適切な産児制限を使用することの失敗；（ｖｉｉｉ）治験責任医師の判断において、この研究でのさらなる処置に患者を受け入れられなくする、患者の状態の一般または特定の変化。
【０４０２】
スクリーニングを完了し、ペプチド１の用量を受けない任意の患者は、交代される。安全性以外の理由で第１のサイクルの完了より前に本研究を中止する、本研究の用量漸増部分の患者においては交代される。任意の理由で処置の第１のサイクルの完了より前に研究参加を中止する、研究の用量拡大部分の患者においては交代され得る。
処置計画
研究薬物投与
【０４０３】
研究薬物は、治験薬ペプチド１である。この治験薬は、臨床現場に分配される。患者は、スクリーニングの開始に続いて２１日以内にペプチド１で処置を始める。ペプチド１薬物は、単回使用のガラスバイアル中に供給された凍結液体生成物である。注射用のペプチド模倣大環状分子は、≦−１５℃で冷凍貯蔵される。ペプチド１は、Ｄ５Ｗを含有するＩＶ注入バッグに導入され；これは、ペプチド１投薬溶液として公知であり、患者への投与のために現場の薬局によって提供される。ペプチド１投薬溶液は、患者識別番号で標識される。治験スタッフは、この情報および所期の患者に対するそれの関連性を確認する。ペプチド１は、ＤＲ−Ａについては２８日サイクルの１日目、８日目および１５日目に、またはＤＲ−Ｂについては２１日処置サイクルの１日目、４日目、８日目、１１日目に、１時間（±５分）かけてＤ５Ｗ中ＩＶ注入によって投与される。先に定義されている用量は、各サイクルの開始での体重に基づき各患者について算出される。
【０４０４】
ペプチド１は、サイクル１において用量レジメンＡおよびＢのための計画スケジュール外で投与されることはなく、即ち、用量日数（dose  days）についての計画ウインドウはない。非投薬日のフォローアップ来院は、ＤＲ−Ａでは２２日目および２９日目においてならびにＤＲ−Ｂでは１８日目および２１日目において、±１日のウインドウを有する。逸脱はｅＣＲＦ上に記録される。本研究の用量漸増相および用量拡大相における患者の処置は、疾患進行、許容できない毒性、または治療を中止するという患者もしくは医師による決定が記載されるまで継続する。
【０４０５】
注入関連反応の場合に、ペプチド１注入は一時的に中止される。薬理作用物質および他の治療的介入は、施設ガイドラインによって投与することができる。ペプチド１注入を再開する決定は、患者の慎重な評価後になされる。
開始用量、用量漸増および用量低減
【０４０６】
用量レベル（ＤＬ）３で開始して、患者は、以下の２つの処置アームの１つに順次割り当てられる：用量レジメン（ＤＲ）Ａは、１週当たり１回、ペプチド１の試験投与を継続し、または用量レジメン（ＤＲ）Ｂは、１週当たり２回、ペプチド１の試験投与を継続する。用量レベル３について、ＤＲ−Ａは第１に登録され、ＤＲ−Ｂは第２に登録される。非臨床の毒性学的評価からの結果に基づく、ＤＥＰにおける開始用量（ＤＬ−１）は、０．１６ｍｇ／ｋｇである。第１の２用量レベルの間、患者は、２８日サイクルの１日目、８日目および１５日目にペプチド１を受ける。ＤＬ３で開始して、ＤＲ−Ａの患者は、週１回、２８日サイクルの１日目、８日目および１５日目に処置されることを継続し、一方、ＤＲ−Ｂの患者は、週２回、２１日サイクルの１日目および４日目、８日目および１１日目に処置される。
研究の用量漸増部分のための用量レベル
【０４０７】
本研究の用量漸増部分において、ペプチド１の増加する用量レベルは、３〜６人の患者コホートで評価される。ペプチド１は、ＷＴ  ｐ５３タンパク質を発現する進行型液性リンパ腫の患者において、２８日サイクルまたは２１日サイクルの２つの異なる投薬レジメンを使用して、ＩＶ注入によって投与される。患者は、２８日サイクルについては連続した３週間に毎週１回、または２１日サイクルについては連続した２週間に毎週２回のいずれかで、ペプチド１を受ける。液性リンパ腫の多くの患者は、末梢血液中に循環腫瘍細胞（ＣＴＣ）を呈し、これは、フローサイトメトリーを使用して検出および分析することができる。この分析は、これらの細胞における研究薬物特異的標的結合の検出を可能にする。アロメトリックスケーリングに基づいて、０．１６ｍｇ／ｋｇ（５０μｇ・ｈｒ／ｍＬ）でのヒトにおける見積もられたＡＵＣは、ＳＴＤ１０でラットＡＵＣのおよそ９％、およびサルＨＮＳＴＤでＡＵＣのおよそ６％である。
【０４０８】
いずれかのＤＲにおける患者の≧３３％におけるＤＬＴの非存在下で、３人から６人の患者の後続コホートは、ＭＴＤまたはＯＢＤが各用量レジメンについて確立されるまで、漸増された用量を受ける。
【０４０９】
２段階用量漸増デザインが用いられる。初期段階１漸増相の間（表５）、１００％用量増分は、コホートにおける３人の患者の≧１人が少なくともおそらく研究薬物に関連する任意のグレード≧２ＡＥを経験するまで利用される。後続の用量漸増は、ＭＴＤまたはＯＢＤが確立されるまで、３患者コホートおよび改変Ｆｉｂｏｎａｃｃｉ数列（即ち、段階２漸増相；表６）を使用して継続する。
【表５−１】
2018516844.tif 000110
【表５−２】
2018516844.tif 000111
【表６】
2018516844.tif 000112
【０４１０】
漸増スキームは、治験責任医師、治験依頼者のメディカルモニターおよび安全性担当医師（safety  physician）代表が、より保存的進行（more  conservative  progression）に同意する任意の時点で、段階２漸増スケジュールに切り換えることができる。
【０４１１】
ＤＬＴ（複数可）の観察は、治験過程の全体にわたって用量低減、中断または中止に関して個々の患者が決定するのに使用されるが、サイクル１中に生じるＤＬＴは、用量漸増決定のために安全性および忍容性の評価を通知するのに使用される。
【０４１２】
ＤＬＴが第１のコホートにおいて観察されるならば、用量は用量レベル１にデエスカレーションする。ＤＬＴが用量レベル１で観察されるならば、用量は用量レベル２にデエスカレーションする。ＤＬＴが用量レベル２で観察されるならば、他の用量レベルが考えられ、治験責任医師、治験依頼者のメディカルモニターおよび安全性担当医師代表の間での考察後に実現され得る。
【０４１３】
各用量レジメン内：
【０４１４】
ＤＬＴがコホートにおいて観察されないならば、後続の患者群は、その用量レジメンの次の計画用量レベルで登録される。
【０４１５】
ＤＬＴが任意の用量レベルで３人の患者の２人以上に観察されるならば、さらなる用量漸増は、そのＤＲにおいて生じず、現在の用量はＭＡＤと定義される。
【０４１６】
ＤＬＴが任意の用量レベルで３人の患者の１人に観察されるならば、最大３人の追加の患者が、その同じ用量レベルで同じＤＲに登録される。ＤＬＴが拡大コホートにおいて２人以上の患者に観察されるならば、さらなる用量漸増は生じず、現在の用量はＭＡＤと定義される。
【０４１７】
ＭＡＤが定義された後、以前に投与された、より低い用量が６人の患者の合計に拡大されるか、または中間（ＭＡＤと次のより低い用量レベルとの間）が最大６人の患者において調査されるかのいずれかである。１つの処置アームからのコホートにおいて６人の患者の少なくとも５人でＤＬＴなく忍容性が示された最も高い用量は、その処置アームについてＭＴＤまたはＯＢＤと定義される。
【０４１８】
最大２つのＥＸＰコホートに関する用量レジメンおよび用量レベルの選択は、サイクル１におけるＭＴＤ決定、ならびにＤＥＰにおける後続の処置サイクル中のペプチド１の累積の安全性、有効性およびＰＫ／ＰＤのプロファイルに基づく。
【０４１９】
用量レベルは、各コホート内のサイクル間で増加され、患者は、ただ１つの用量レベルを割り当てられる（即ち、患者内用量漸増はなし）。
研究の拡大部分に関する用量レベル
【０４２０】
ＭＴＤまたはＯＢＤが定義された後、およそ３０人の追加の患者が、この用量レベルでさらなる経験を獲得するための、および特定の患者または液性がん細胞型におけるペプチド１の効果を調査するための研究の最大２つの拡大コホートに登録され得る。２つの疾患型が評価のために選択され得る最大２つの拡大コホートがあってよい。拡大コホートにおいて患者に投与されるペプチド１の用量および投薬スケジュールは、本研究の用量漸増部分における両方の用量レジメンからの患者からの利用可能な安全性および他の情報の評価から得られる。
患者内用量漸増
【０４２１】
患者内用量漸増は許可されない。
毒性に関する用量およびスケジュール調整
【０４２２】
サイクル中に生じる毒性は、処置を継続するためには下に概説されている通りに回復しなければならない。ヘモグロビン≧８．５ｇ／ｄＬ；ＡＮＣ≧１．０  １０９／Ｌ；血小板カウント≧７５×１０９／Ｌ；肝臓機能試験が以前のサイクルより前のグレードに戻る（ＰＴ／ＩＮＲを含む）；他の毒性は、グレード＞１がセクション４に列挙されている判定基準に記載されている通り治験に含めることが許容された場合、グレード１以下またはベースラインレベルに戻らなければならない。
【０４２３】
ペプチド１に関連すると考えられているグレード４  ＡＥが観察される事象において、ペプチド１は永久に中止されなければならない。例外としては、３日未満続くグレード４好中球減少症、および最適な処置で２日以内に解消する嘔吐、下痢または電解質異常が挙げられる。これらの例外について、処置を最大２週間遅延させて、毒性の解消を可能にすることができ（即ち、グレード１以下またはベースラインに戻す）、その後、低減用量での再処置が続く。２つの用量低減が許可される。第３の用量低減は、臨床的利益のエビデンスおよびメディカルモニターによる承認を必要とする。
【０４２４】
ペプチド１に関連すると考えられるグレード３  ＡＥが観察される事象において（例外は、最適な処置で２日以内に解消するグレード３吐き気、嘔吐、下痢または臨床的に重大でない電解質異常）、処置を最大２週間遅延させて、毒性の解消を可能にすることができ、その後、低減用量での再処置が続く。２つの用量低減は許可される。第３の用量低減は、臨床的利益のエビデンスおよびメディカルモニターによる承認を必要とする。
【０４２５】
関連のグレード３  ＡＥおよびグレード４  ＡＥ（許可されている通り）に続く再処置に関する用量修飾は、以下の通りである。ＤＥＰのため、患者は先の用量レベル（表１および／または表２による）で再処置される。ＥＸＰのため、用量は２５％間隔で低減される（例えば、第ＩＩ相の用量が５ｍｇ／ｋｇであるならば、用量は３．７５ｍｇ／ｋｇおよび２．８ｍｇ／ｋｇに順次に低減される）。２つの用量低減は許可される。第３の用量低減は、臨床的利益のエビデンスおよびメディカルモニターによる承認を必要とする。
【０４２６】
臨床的に重大なＡＥが、処置サイクル中に患者において観察されるならば、さらなる投薬は、毒性が許容されるレベルに解消するまで遅延される。処置は最大２週遅延されて、ＡＥの解消を可能にすることができ、先のレベルへの用量低減は、治験依頼者のメディカルモニターおよび安全性担当医師代表と相談して治験責任医師の裁量で行うことができる。患者が複数のＡＥを経験するならば、投薬遅延または用量低減の決定は、最も重症のＡＥに基づくことができる。１つの用量低減後に再発性の臨床的に重大なＡＥを経験する任意の患者は、１つの追加の用量低減を受けることができる。２週の遅延または最大可能数の用量低減の後、臨床的に重大な毒性の経験を継続する患者においては、本研究を中止する。
【０４２７】
用量低減が考えられる有害事象は、基礎疾患もしくは他の病状または併用処置に排他的に関連すると治験責任医師によって評価される事象を含まない。ペプチド１に関連すると考えられるＡＥを経験する患者は、患者が臨床的利益を受けているおよび／または治験責任医師が継続参加は患者の利益に最もかなっていると思うならば、研究を継続することができる。こうした場合に、治験責任医師の裁量で、ならびに治験依頼者のメディカルモニターおよび安全性担当医師代表との同意で、患者のための用量は、先のより低いレベルに低減され得る。
【０４２８】
患者のための最大２つの用量低減は許可される。第３の用量低減は、臨床的利益のエビデンスおよびメディカルモニターによる承認を必要とし、この後、患者においては研究を中止する。
【０４２９】
ＤＬＴを経験する患者は、疾患進行または許容できない毒性まで、治験責任医師の裁量で、および治験依頼者のメディカルモニターおよび安全性担当医師代表との同意で、先のより低いレベルで処置を継続することができる。一旦用量が患者のために低減されると、それは再漸増され得ない。
【０４３０】
毒性グレード化はＮＣＩ  ＣＴＣＡＥ  ｖ４．０に基づく。
統計的方法
【０４３１】
研究の目的はＤＬＴおよびＭＴＤまたはＯＢＤを決定することなので、ＤＥＰおよびＥＸＰに関する安全性および有効性の統計分析は、主として、本質的に記述的である。これらの目的は、決定論的アルゴリズムの結果によって達成され：連続変数は、記述統計学を使用して要約される［ｎ、平均、標準偏差、中央値、最小および最大］。カテゴリー変数は、各分類内で患者の数および百分率（ｎ、％）を示して要約される。結果は、すべての患者および液性リンパ腫患者について評価される。ＤＲ−ＡおよびＤＲ−Ｂからの結果は、すべての用量レベルおよび患者群について比較される。
（実施例３）
研究手順
研究事象のスケジュール
【０４３２】
スクリーニングで始まり、サイクル１［２８日サイクルの１日目、８日目および１５日目］を通して継続して行われる研究活動（評価、試験、検査、疾患評価、組織被検物の提出、および研究薬物投与を含む）のスケジュールは、表７に概説されている。サイクル２［サイクル１の２９日目＝サイクル２の１日目］で始めて行われる研究は、表８に概説されている。
【表７−１】
2018516844.tif 000113
【表７−２】
2018516844.tif 000114
【表７−３】
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【表７−４】
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【表８−１】
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【表８−２】
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【表９−１】
2018516844.tif 000119
【表９−２】
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【表１０−１】
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【表１０−２】
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【表１０−３】
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【表１１】
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【表１２】
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（実施例４）
薬物動態学的分析
【０４３３】
ペプチド１およびそれの代謝物のレベルは、以下に記載されている特定の時点で採取された血液試料において測定される。薬物動態学的データは、個々の患者によっておよび各用量レジメンについての用量レベルによって集団的に作表および要約されている。グラフ表示は、結果の解釈において有用な場合に提供されている。
【０４３４】
ＰＫ評価のための血液試料は、以下の時点で採取される：
【表１３−１】
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【表１３−２】
2018516844.tif 000127
【０４３５】
ＳＯＩは、ペプチド１の注入の開始を表し；ＥＯＩは、ペプチド１の注入の終了を表す。
（実施例５）
薬物動態研究
【０４３６】
薬物動態研究は、ラットおよびサルにおいて２種の異なる投薬製剤の評価を含む、マウス、ラットおよびサルにおけるペプチド１の単回ＩＶ投与に続く曝露動態を特徴付ける。有効性モデルおよび用量範囲設定（dose  range-finding）（ＤＲＦ）研究のための、適格性が確認された液体クロマトグラフィー−タンデム質量分析（ＬＣ−ＭＳ−ＭＳ）方法ならびにＧＬＰ安全性研究のための検証された方法を使用して、吸収を、マウスでの有効性モデルにおけるＭＥＤで、ならびにラットおよびサルでの毒性学研究における耐用量および非耐用量で、特徴付けた。曝露は、概して用量と比例して増加したが、明らかなプラトーは、４週のサル毒性学研究の最も高い用量で観察された。性別ベースの差異は、いずれの種においても観察されず、蓄積は複数回投薬した後に観察されなかった。
【０４３７】
ペプチド１のｉｎ  ｖｉｔｒｏタンパク質結合を、マウス、ラットおよびサルの血漿、ならびに正常被験体（subject）および低アルブミン血症患者からのヒト血漿試料における濃度の範囲にわたって評価した。タンパク質結合は、２μＭの単一濃度でのペプチド１のインキュベーション後にマウス、ラット、イヌ、サルおよびヒトの血漿中で９２％から９８％の範囲にわたり、最大２５０μＭにてマウスおよびラットの血漿中で９８％を超えた。ヒトおよびサルの血漿において、３〜４％の遊離ペプチド１画分を、最大１５ｍｇ／ｋｇの臨床用量からの予想Ｃｍａｘ値に対応する最大１５０μＭのペプチド１濃度で測定し、濃度＞２００μＭで１２〜１４％に上昇した。低アルブミン血症患者からの血漿において、同様の上昇が、最大１０ｍｇ／ｋｇの臨床用量からの予想Ｃｍａｘ値に対応するペプチド１の＞１００μＭ濃度で見られた。濃度依存性血漿タンパク質結合は、４週のサルＧＬＰ毒性研究において高用量群（２０ｍｇ／ｋｇ）で観察された曝露におけるプラトーと一致しており、非常に高い臨床用量で、特に低アルブミン血症の患者では、用量比例よりも少ない曝露（less-than-dose-proportional  exposure）を示唆している。
【０４３８】
ｉｎ  ｖｉｔｒｏ研究は、ヒトを含む種にわたって同様の代謝物プロファイルを実証し、毒性学研究のための適当な種としてラットおよびサルに対する裏付けを提供した。タンパク質分解は、ペプチド１の主要な生体内転換経路である。主な代謝物は、環状ペプチド部分を無傷で有する３−アミノ酸トランケーションであり、同じ代謝物プロファイルが、マウス、ラット、サルおよびヒトの凍結保存肝実質細胞を用いるｉｎ  ｖｉｔｒｏ安定性研究において記述された。単一用量ラット研究において、肝胆道の代謝および排除は、ペプチド１の主なクリアランス経路を表し、主な代謝物は、胆汁中で観察される主要な排泄産物であった。主な代謝物は、またラットおよびサルの両方の４週のＧＬＰ毒性学研究において血漿中で観察され、これらの研究における適切な曝露は、ペプチド１の全体的な安全性プロファイルに対するそれの影響の特徴付けを提供した。サルにおいて、主な代謝物血漿曝露は主な代謝物ＡＵＣの１０％であり、ラットにおいて、主な代謝物曝露はペプチド１  ＡＵＣの６％であった。主な代謝物の蓄積は、ラットまたはサルにおける週２回の反復投薬で、観察されなかった。
【０４３９】
ペプチド１によるチトクロムＰ４５０（ＣＹＰ）酵素の阻害または誘導は、臨床関連の濃度で無視できるようであるが、相互作用は、肝胆輸送体によって主にクリアされる薬物とのペプチド１の高い曝露で可能である。
（実施例６）
薬力学的分析
【０４４０】
ｐ５３、ＭＤＭ２、ＭＤＭＸ、ｐ２１およびカスパーゼのレベルは、処置を始める前およびサイクル１またはサイクル２の終了時に採取された液性がん細胞被検物で測定される。ＭＩＣ−１は、血液試料において測定される。ＰＤ評価のための血液および組織の採取のための特定の時点は、以下に記載されている。薬力学的データは、個々の患者によって、および用量レベルによって集団的に作表および要約される。グラフ表示は、結果の解釈において有用な場合に提供される。
【０４４１】
以前の遺伝子およびバイオマーカーの試験、ならびにペプチド−１の安全性および有効性に関連するバイオマーカーについての血液および液性がん細胞の試料の追加の試験から利用可能な結果は、患者転帰との可能な相関関係について調査することができる。
【０４４２】
ＰＤ評価のための血液試料は、以下の時点で採取する：
【表１４】
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（実施例７）
ペプチド模倣大環状分子の臨床活性の評価
【０４４３】
臨床活性を評価するために、ＩＷＧ（２０１４）判定基準または他の適切な判定基準に基づく奏効率および奏効の持続期間は、ＣＲ、ＰＲまたはＳＤを呈するすべての患者のケースバイケースの記載と共に提供される。抗液性がん細胞活性の他のエビデンスまたは他の臨床的利益の記述的分析は、有効性または臨床的抗液性がん細胞活性の臨床評価、Ｘ線評価または他の適切な評価に基づいて提供される。臨床活性の分析は、以下の２つの患者集団で行われる：（１）治療の少なくとも１つのサイクルを受け、少なくとも１つのベースライン後の疾患評価を有する患者のサブセット（有効性評価可能集団）ならびに（２）有効性評価可能集団を含む患者、ならびに目的の疾患進行を呈するまたはサイクル１の終了前にＤＬＴおよび／または許容できない毒性を経験する患者のより大きい群。
【０４４４】
関連の疾患徴候を有する患者に関する画像化スキャン、理学的検査および／または臨床検査ベースのアッセイ（例えば、前立腺特異的抗原）は、ベースライン時に（例えば、サイクル１の２８日以内または２１日以内の１日目）得られ、例えば、ベースラインＰＥＴ−ＦＤＧおよびおそらくＦＬＴ−ＰＥＴスキャン（複数可）、ならびに以下に概説されている目的の抗液性がん細胞活性について、を含める。同じ型の画像化、理学的検査、または臨床検査ベースのアッセイ手順は、患者に関する各評価に使用される。ＩＷＧ（２０１４）判定基準は、液性がん奏効および奏効の持続期間を評価するのに使用される。スケジュール化されたスキャン（および／または他の臨床検査ベースのアッセイ）は、次の処置サイクルの開始より前に解釈される。ＣＲまたはＰＲについての判定基準が満たされれば、スキャンは、奏効を確認するための４週以内より早くは反復されない。奏効する患者（ＣＲ、ＰＲまたはＳＤ）は、ＤＲ−Ａにおいてサイクル２およびその後１つおきのサイクル（例えば、サイクル４および６）後、ならびにＤＲ−Ｂにおけるサイクル３およびその後３つごとのサイクル（例えば、サイクル６および９）での最終注入後の疾患評価と共に、疾患進行、インフォームドコンセントの撤回、または許容できない毒性まで研究を継続する。
【０４４５】
主要機関の外の地域のまたは他の設備で実施されたそれらの手順を含めて、画像化手順からのフィルムまたは他の記録は、患者に関して、対応する主要な研究機関で放射線学スタッフが読み取り、概説する。
【０４４６】
［１８Ｆ］−フルオロデオキシグルコースポジトロン放出断層撮影（ＦＤＧ−ＰＥＴ）画像化は、液性リンパ腫の患者についてＩＷＧ（２０１４）判定基準を使用して（using  using）、ベースライン時に実施される。ベースライン後のＦＤＧ−ＰＥＴ画像化は、患者において、抗液性がん細胞活性を決定する補助として安定な疾患の第１の発生でのみ実施される。ＰＥＴ／ＣＴスキャンは、造影剤増強ＣＴスキャンの代用となり得るが、ただし、ＰＥＴ−ＣＴの一部として実施されるＣＴがＩＶおよび経口造影剤を用いる診断ＣＴと同様の診断品質であることを前提とする。
【０４４７】
ＦＬＴ−ＰＥＴ画像化は、ＦＬＴトレーサーの充分な取込みを共通して示す液性がん細胞を有する患者、例えば、液性リンパ腫および他の液性がんの患者についてベースライン時に実施される。
・ベースライン時に、≧５の標準的な取込み値（ＳＵＶ）を実証するＤＲ−Ａに割り当てた患者は、サイクル１における研究医薬の彼らの最終注入の１日後、即ち、１６日目に、反復ＦＬＴ画像を有する。
・ベースライン時に、≧５の標準的な取込み値（ＳＵＶ）を実証するＤＲ−Ｂの患者は、サイクル１における研究医薬の彼らの最終注入の１日後、即ち、１２日目に、反復ＦＬＴ画像を有する。
（実施例８）
サイクル１の１日目より前の分子スクリーニング
【０４４８】
分子スクリーニングは、ペプチド１の第１の投与（サイクル１の１日目）より前に、以下を包含する。
・分子スクリーニングのための署名済みインフォームドコンセントの収集
・ｐ５３試験のための、保存された液性がん細胞試料または新鮮な液性がん細胞生検（生検が重大な臨床的なリスクをもたらさないならば）の収集
・ｐ５３  ＷＴであると確認されたならば、登録患者からの組織試料の残りが、ＰＤバイオマーカーについて試験するために使用される
・ペプチド１の第１の用量の投与前のｐ５３  ＷＴステータスの確認は、以下において登録に必須である：
・用量レベル４およびそれ超で開始する患者に関するＤＥＰの段階１
・すべての患者に関するＤＥＰおよびＥＸＰの段階２（必要ならば）
【０４４９】
ＤＥＰの段階１において用量レベル４およびそれ超で（ＤＥＰの段階２に登録されているすべての患者と同様に）、不明なｐ５３ステータスを有する患者における分子スクリーニングは、臨床スクリーニングの開始より前に行われる。ｐ５３ステータスがＷＴであるとわかれば、これらの患者は、臨床スクリーニングに進むことができ、中央検査室によるｐ５３  ＷＴの確認前に、登録され、ペプチド１を受けることができる。
【０４５０】
ＥＸＰにおいて、患者は、登録（enrolment）に進むより前に、中央検査室で分子スクリーニングを完了していなければならない。これらの患者は、中央検査室によるｐ５３  ＷＴの確認後にのみ、登録され、ペプチド１を受けることができる。
（実施例９）
腫瘍崩壊症候群（ＴＬＳ）の管理
【０４５１】
液性リンパ腫の患者、殊に、大きい液性がん細胞負荷、投薬前に上昇した乳酸脱水素酵素および白血球カウント、腎機能不全、または脱水を有する患者に、腫瘍崩壊症候群（ＴＬＳ）の潜在性がある。ＴＬＳは、処置に誘発された急激ながん細胞崩解によって引き起こされ得る。それは通常、処置を開始した後すぐに観察される。ＴＬＳの危険性がある患者は、局所的臨床プロトコル（local  clinical  protocol）に従った標準治療の一部として液性がん細胞溶解予防処置を受けることができる。
【０４５２】
検査学的ＴＬＳは、血清尿酸、カリウムもしくはリンのレベルにおける２５％の増加またはカルシウムレベルにおける２５％の減少と定義されている。そのため、患者は、これら臨床検査パラメーターについて、サイクル１中のＤＲ−ＡおよびＤＲ−Ｂにおける１日目に、ペプチド１の注入の２４時間（２日目）後にモニタリングされる。ＴＬＳの徴候および症状は、解消されるまでモニタリングされる。
（実施例１０）
多重化された細胞毒性アッセイ
【０４５３】
この研究の目的は、細胞毒性がＰＤ媒介されているかどうかを決定するために、野生型ｐ５３または変異型ｐ５３のいずれかを有すると特徴付けされた複数の液性がん細胞細胞株におけるペプチド１誘導細胞毒性、ｐ２１上方調節およびカスパーゼ−３活性化を同時に評価することであった。
【０４５４】
ｐ５３変異体／野生型ステータスについて特徴付けされた血液液性がん細胞由来の細胞株を、３８４ウェルプレートに播種し、５％ＣＯ２の加湿大気中にて３７℃でインキュベートした。ペプチド１を連続希釈し、０．１％ＤＭＳＯの最終アッセイ濃度において、３０μＭまでの１０種類の濃度にわたってアッセイした。時間ゼロ未処理細胞プレートは、また、７２時間のアッセイ期間において倍加数を決定するために生成させたときに、処理を細胞播種の２４時間後に加えた。１ウェル当たり約１００個の細胞を、デュプリケートウェルにおいて実施された各試験条件を用いて評価した。７２時間のインキュベーション期間後、細胞を固定し、蛍光標識抗体および核色素を用いて染色した。同じウェルにおいて、核を自動蛍光顕微鏡法によって毒性（色素取込み）について評価し；アポトーシスを抗活性カスパーゼ−３抗体の上昇によってアッセイし；細胞周期停止を抗ｐ２１モノクローナル抗体ＥＡ１０の上昇によってアッセイした。この研究において評価された３２種の血液細胞株の特徴を、表１５に列挙する。
【表１５】
2018516844.tif 000129
【０４５５】
細胞増殖を、相対細胞カウントによって測定し、これを対照に対するパーセントとして表した。早期段階から後期段階のアポトーシスに由来する活性化カスパーゼ−３マーカー標識細胞、およびアウトプットは、各ウェルにおいて相対細胞カウントに対して正規化されたビヒクルバックグラウンドに対するアポトーシス細胞の増加倍率（fold  increase）（Ｅｍａｘ）として示され；≧５倍の誘導は、アポトーシスの有意な誘導を示す。例えば、ペプチド１は、ｐ５３野生型造血細胞株においてロバストなアポトーシス応答を誘導することができた（図２を参照）。
【０４５６】
合計ｐ２１レベルはｐ５３の相対的活性を示し、アウトプットは、各ウェルにおいて相対細胞カウントに対して正規化されたビヒクルバックグラウンドに対してｐ２１濃度の誘導倍率（hold  induction）（Ｅｍａｘ）として示され；１細胞当たりの合計ｐ２１タンパク質の≧２倍の増加または減少は有意と考えられる。例えば、ペプチド１は、ｐ５３野生型造血細胞株において、ｐ２１の有意な誘導、および得られた機構上のｐ２１薬力学応答を示すことができた（図３を参照）。
【０４５７】
各細胞株について、ＥＣ５０は、細胞の５０％を死滅させた概算濃度である。応答を特徴付ける追加のパラメーターとしては、ＩＣ５０（５０％最大可能応答でのペプチド１濃度）、ＧＩ５０（５０％まで成長を低減するのに必要とされる濃度）、および活性面積（生存曲線にわたる積分面積）が挙げられる。例えば、野生型ｐ５３タンパク質を有する細胞株の増殖および生存はペプチド１に感受性であり、ＩＣ５０値は０．２μＭから３．３μＭの範囲にわたった。すべての細胞株が、試験したペプチド１濃度で細胞毒性を呈したわけではなかった。細胞毒性を呈したものは、最も頻繁に、カスパーゼ−３およびｐ２１の両方の有意な誘導を特徴とした。ＢＶ−１７３白血病細胞を用いる結果（表１６）は、これらの細胞株による典型的な応答を代表する。
【表１６】
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【０４５８】
変異体ｐ５３を有する液性がん細胞株における細胞毒性は、観察されたとき、最も頻繁に、有意なカスパーゼ−３誘導なしのｐ２１の有意な誘導を特徴とした。ＨＥＬ−９２−１−７白血病細胞（表１７）での結果は、これらの細胞株による典型的応答を代表する。
【表１７】
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【０４５９】
すべての血液学的液性がん細胞株について１μＭのＥＣ５０カットオフを使用して、アポトーシスの誘導は、細胞のｐ５３ステータスとの非常に良好な一致を有することが見出された（表１８）。そのため、ｐ５３ステータスは、ペプチド１など、化合物の細胞毒性を試験するための感受性バイオマーカーであり得る。
【表１８】
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ペプチド１は、野生型ｐ５３タンパク質を含有する液性がん細胞株（例えば造血がん細胞）におけるｐ５３媒介アポトーシス細胞死を選択的に誘導した。図４に示されている通り、すべての１１のｐ５３  ＷＴ（６つのリンパ腫および５つの白血病）血液がん細胞株は、すべての株が０．６μＭ未満のＥＣ５０を呈した通り、ペプチド１介入に高感受性であった。まとめると、これらの一連のエビデンスは、ｐ５３  ＷＴステータスを保持する複数の組織学的起源にわたる液体腫瘍細胞株に対するペプチド１の有効性を示唆した。変異ｐ５３を含有する液性がん細胞株において、細胞毒性は、アポトーシスの上昇なしの細胞周期停止と関連した。これらの所見は、活性野生型ｐ５３を有する液性がん細胞に向かうペプチド１の薬力学的選択性を実証している。
（実施例１１）
腫瘍成長阻害に対するペプチド１の効果
【０４６０】
別の研究において、ＭＶ４；１１ヒト白血病異種移植片モデルをマウスにおいて使用することで、腫瘍成長を阻害し、高悪性度液体腫瘍であるＡＭＬにおける全生存を改善するペプチド１の能力を評価した。この研究において、２５ｍｇ／ｋｇ用量のペプチド１を、２週間に６用量（six  bi-weekly  doses）を投与し、対照群であるシクロホスファミドのみで処置されたマウスの結果と比較した。マウスを、白血病の進行による病的状態のエンドポイントについて個々にモニタリングした。対照を受けたすべての１０匹のマウスは、２１日目から２８日目の間に研究を終了し（exited）、これは、活性についての感受性アッセイを提示した。図５に示されている通り、ペプチド１を用いる処置は、非処置マウスについての２２日と比較すると４０日の全生存中央値であり、ペプチド１を受けるマウスについて８１％増加をもたらした。ペプチド１は、ＷＴ  ｐ５３を有する液体腫瘍においておよびＡＭＬにおいて効果を有することができる。
（実施例１２）
ペプチド１の安全性（safty）および毒性学
【０４６１】
ラットおよびサルにおける４週の複数用量ＧＬＰ研究には、ペプチド１の毎週２回ＩＶ投薬を利用した。該研究で、投薬期間中および回復期間中の両方での用量関連および曝露関連の評価を提供した。結果を利用して、最大耐用量（ＭＴＤ）を定義し、ラットの１０％に対する重度毒性用量（ＳＴＤ１０）およびサルにおける最も高い非重度毒性用量（ＨＮＳＴＤ）を概算した。不耐性のすべての肉眼的徴候および顕微鏡的徴候（例えば、臓器重量の低減、多組織出血の散在的所見、および肝臓壊死）、ならびに血清化学パラメーターの変化は、両種における赤血球（ＲＢＣ）、血小板および／もしくは白血球（ＷＢＣ）欠乏、または拒食症および脱水に続発するものと考えられた。回復評価で、骨髄細胞生存およびすべての関連する血液毒性および二次毒性の可逆性と一致する、再生変化および代償性変化を明らかにした。
【０４６２】
両動物種における用量制限毒性（ＤＬＴ）は、骨髄における造血細胞、特に巨核球系統の細胞の抑制に関連するようであり、投薬の休止での回復を実証する末梢血液血小板の有意な減少をもたらす。例えば、回復での血小板の用量依存減少は、ペプチド１の異なる投薬量を使用する代表的な４週のサルＧＬＰ毒性研究において示された（図６を参照）。
【０４６３】
ラットにおけるＳＴＤ１０を、回復中の血液学サンプリングのためのサテライト群における１匹の動物の死亡（mortality）に基づいて１０ｍｇ／ｋｇと決定した。サルにおけるＨＮＳＴＤを、この最も低い用量レベルで著しい血小板減少症の完全欠如に基づいて、５ｍｇ／ｋｇと決定した。しかしながら、中用量レベルおよび高用量レベルでサルのほとんどすべては、ペプチド１投与に良好な忍容性を示し；これらの用量レベルの各々でただ１頭の動物は、有意な血小板減少症（＜１００，０００×１０６／ｍｌ）を発症した。
【０４６４】
ラットは、最大耐用量での曝露に基づいて、ペプチド１の骨髄および血液学的効果に対してサルよりも感受性であった。ラットＳＴＤ１０での曝露（１０ｍｇ／ｋｇでＡＵＣ０−∞＝５６２μｇ・ｈｒ／ｍＬ）は、サルにおけるＨＮＳＴＤのそれ（５ｍｇ／ｋｇでＡＵＣ０−∞＝８１３μｇ・ｈｒ／ｍＬ）より低かった。これらのｉｎ  ｖｉｖｏ結果は、発光アウトプット（ＨＡＬＯ）を介してｉｎ  ｖｉｔｒｏ血液毒性（hemotoxicity）アッセイから得られたものと相関した。これらの調査において、ペプチド１は一般に、サルまたはヒトからのものよりも大きい度合いで、ラットからの骨髄前駆体細胞の誘導増殖を阻害した。ＩＣ５０値は、サル細胞またはヒト細胞についてよりもラット細胞についてのほうが約２倍から８倍高く、最も大きい差異は、血小板前駆体である巨核球コロニー形成細胞について認められた。これらの結果は、ラットのほうが、最大耐用量での用量および曝露に基づいて、ペプチド１の骨髄および血液学的効果に対してサルよりも感受性であることを示すｉｎ  ｖｉｖｏ所見と相関した。これらの結果は、また、ヒトにおける突出する潜在的な骨髄および血液学的毒性レベルの点から、サルＰＫ−ＰＤデータがラットデータよりもより臨床的に関連し得ることを示唆した。
【０４６５】
ペプチド１は、細菌変異原性（Ａｍｅｓ）アッセイ、染色体異常（ヒト末梢血液リンパ球）アッセイおよびｉｎ  ｖｉｖｏ微小核（ラット骨髄）アッセイを含めて、遺伝毒性学研究において陰性であった。安全性薬理学研究を実施して、ｉｎ  ｖｉｔｒｏのｈＥＲＧカリウムチャネルに対するおよびカニクイザルにおける心臓機能に対するペプチド１の効果を評価した。
【０４６６】
上記の研究は、ペプチド１が、げっ歯類およびサルにおける前臨床ＧＬＰ安全性研究で好ましいプロファイルを示すことを実証した。遺伝毒性、胃腸毒性、心毒性および免疫原性は観察されなかった。組織病理学は、軽度から中程度の骨髄抑制と一致する骨髄低細胞性を示した。
（実施例１３）
ペプチド１の薬物動態
【０４６７】
ラットにおいて、ペプチド１は一般に、ＣｍａｘおよびＡＵＣにおいて線形の用量比例増加を示した。４週のラットＧＬＰ毒性研究において、ペプチド１のＣｍａｘは４９．９μｇ／ｍＬから１８６μｇ／ｍＬの範囲にわたり、ＡＵＣ０−∞は９０．５μｇ・ｈｒ／ｍＬから５６２μｇ・ｈｒ／ｍＬの範囲にわたり、クリアランスは１９．２ｍＬ／ｈｒ／ｋｇから２８．３ｍＬ／ｈｒ／ｋｇの範囲にわたった。
【０４６８】
非ヒト霊長類において、ペプチド１は一般に、用量に比例して増加した曝露を示したが、曝露における明らかなプラトーは、４週のサルＧＬＰ毒性研究において高用量群（２０ｍｇ／ｋｇ）で観察された。該研究において、Ａｉｌｅｒｏｎペプチド１のＣｍａｘは１３３μｇ／ｍＬから５６２μｇ／ｍＬの範囲にわたり、ｔ１／２は３．７時間から６．０時間の範囲にわたり、ＡＵＣ０−∞は８１３μｇ・ｈｒ／ｍＬから１，６００μｇ・ｈｒ／ｍＬの範囲にわたり、クリアランスは６．５ｍＬ／ｈｒ／ｋｇから１３．８ｍＬ／ｈｒ／ｋｇの範囲にわたった。
【０４６９】
ＰＫパラメーターにおいて有意な性別ベースの差異は、ラットまたはサルのいずれにおいても観察されず、蓄積は、ＧＬＰ毒性研究における毎週２回のスケジュールで反復用量に続いて観察されなかった。
【０４７０】
ｉｎ  ｖｉｔｒｏ研究は、ペプチド１が、試験された任意のチトクロムＰ４５０（ＣＹＰ）アイソフォームの阻害剤でないことを明らかにした。ＣＹＰ誘発についてのｉｎ  ｖｉｔｒｏアッセイも、ペプチド１を用いる任意の有意な処置関連効果を示さなかった。これらの所見に基づき、ＣＹＰ媒介機序を介してクリアされる併用医薬についての臨床関連の薬物間相互作用の潜在性は低いはずである。
【図１】
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【図２】
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【図３】
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【図４】
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【図５】
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【図６】
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【手続補正書】
【提出日】平成29年12月25日(2017.12.25)
【手続補正１】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】配列表
【補正方法】追加
【補正の内容】
【配列表】
2018516844000001.app
【国際調査報告】
2018516844.tif 000172
2018516844.tif 000173
2018516844.tif 000174