(57)【要約】  本明細書には、例えば抗ＬＡＰ抗体を包含するＬＡＰ結合剤と、癌の処置の方法へのそれらの使用とに関する組成物および方法が記載される。ＬＡＰ結合剤は全身および腫瘍内免疫両方に影響し、広範な範囲の癌の型を処置するために有効であることが示された。
2018508483.tif 000002
【特許請求の範囲】
【請求項１】
ＬＡＰに特異的に結合する、単離された抗ＬＡＰ（潜在性関連ペプチド）抗体またはその抗原結合断片であって、以下からなる群から選択される１つ以上の重および軽鎖相補性決定領域（ＣＤＲ）を含む、前記単離された抗ＬＡＰ抗体またはその抗原結合断片：
ａ．配列番号９のアミノ酸配列を有する重鎖ＣＤＲ１；
ｂ．配列番号１０のアミノ酸配列を有する重鎖ＣＤＲ２；
ｃ．配列番号１１のアミノ酸配列を有する重鎖ＣＤＲ３；
ｄ．配列番号１４のアミノ酸配列を有する軽鎖ＣＤＲ１；
ｅ．配列番号１５のアミノ酸配列を有する軽鎖ＣＤＲ２；および
ｆ．配列番号１６のアミノ酸配列を有する軽鎖ＣＤＲ３。
【請求項２】
重鎖相補性決定領域（ＣＤＲ）：
ａ．配列番号９のアミノ酸配列を有する重鎖ＣＤＲ１；
ｂ．配列番号１０のアミノ酸配列を有する重鎖ＣＤＲ；および
ｃ．配列番号１１のアミノ酸配列を有する重鎖ＣＤＲ３
を含む、請求項１に記載の単離された抗ＬＡＰ抗体またはその抗原結合断片。
【請求項３】
軽鎖相補性決定領域（ＣＤＲ）：
ａ．配列番号１４のアミノ酸配列を有する軽鎖ＣＤＲ１；
ｂ．配列番号１５のアミノ酸配列を有する軽鎖ＣＤＲ２；および
ｃ．配列番号１６のアミノ酸配列を有する軽鎖ＣＤＲ３
を含む、請求項１または２に記載の単離された抗ＬＡＰ抗体またはその抗原結合断片。
【請求項４】
相補性決定領域（ＣＤＲ）：
ａ．配列番号９のアミノ酸配列を有する重鎖ＣＤＲ１；
ｂ．配列番号１０のアミノ酸配列を有する重鎖ＣＤＲ２；
ｃ．配列番号１１のアミノ酸配列を有する重鎖ＣＤＲ３；
ｄ．配列番号１４のアミノ酸配列を有する軽鎖ＣＤＲ１；
ｅ．配列番号１５のアミノ酸配列を有する軽鎖ＣＤＲ２；および
ｆ．配列番号１６のアミノ酸配列を有する軽鎖ＣＤＲ３
を含む、請求項１または２に記載の単離された抗ＬＡＰ抗体またはその抗原結合断片。
【請求項５】
配列番号８のアミノ酸配列を有する重鎖を含む、請求項１〜４のいずれか一項に記載の単離された抗ＬＡＰ抗体またはその抗原結合断片。
【請求項６】
配列番号１３の配列を有する軽鎖を含む、請求項１〜５のいずれか一項に記載の単離された抗ＬＡＰ抗体またはその抗原結合断片。
【請求項７】
ＬＡＰに特異的に結合する、単離された抗ＬＡＰ抗体またはその抗原結合断片であって、以下：
ａ．配列番号９のアミノ酸配列を有する重鎖ＣＤＲ１；
ｂ．配列番号１０のアミノ酸配列を有する重鎖ＣＤＲ２；
ｃ．配列番号１１のアミノ酸配列を有する重鎖ＣＤＲ３；
ｄ．配列番号１４のアミノ酸配列を有する軽鎖ＣＤＲ１；
ｅ．配列番号１５のアミノ酸配列を有する軽鎖ＣＤＲ２；および
ｆ．配列番号１６のアミノ酸配列を有する軽鎖ＣＤＲ３
を含む、前記単離された抗ＬＡＰ抗体またはその抗原結合断片。
【請求項８】
ＬＡＰに特異的に結合する、単離された抗ＬＡＰ抗体またはその抗原結合断片であって、以下からなる群から選択される１つ以上の重鎖相補性決定領域（ＣＤＲ）を含む、前記単離された抗ＬＡＰ抗体またはその抗原結合断片：
ａ．配列番号９のアミノ酸配列を有する重鎖ＣＤＲ１；
ｂ．配列番号１０のアミノ酸配列を有する重鎖ＣＤＲ２；および
ｃ．配列番号１１のアミノ酸配列を有する重鎖ＣＤＲ３。
【請求項９】
ＬＡＰに特異的に結合する、単離された抗ＬＡＰ抗体またはその抗原結合断片であって、以下からなる群から選択される１つ以上の軽鎖相補性決定領域（ＣＤＲ）を含む、前記単離された抗ＬＡＰ抗体またはその抗原結合断片：
ａ．配列番号１４のアミノ酸配列を有する軽鎖ＣＤＲ１；
ｂ．配列番号１５のアミノ酸配列を有する軽鎖ＣＤＲ２；および
ｃ．配列番号１６のアミノ酸配列を有する軽鎖ＣＤＲ３。
【請求項１０】
抗体が、キメラ、ＣＤＲグラフト、ヒト化、コンポジットヒトもしくは完全ヒト抗体、または二重抗体、あるいはその抗原結合断片である、請求項１〜９のいずれか一項に記載の単離された抗ＬＡＰ抗体またはその抗原結合断片。
【請求項１１】
抗体断片が、Ｆａｂ断片、Ｆａｂ’断片、Ｆｄ断片、Ｆｄ’断片、Ｆｖ断片、ｄＡｂ断片、Ｆ（ａｂ’）２断片、一本鎖断片、ダイアボディ、またはリニア抗体である、請求項１〜１０のいずれか一項に記載の単離された抗ＬＡＰ抗体またはその抗原結合断片。
【請求項１２】
抗体またはその抗体断片が、ヒトアクセプターフレームワークを含む、請求項１〜１１のいずれか一項に記載の単離された抗ＬＡＰ抗体またはその抗原結合断片。
【請求項１３】
ＬＡＰ結合剤およびＴＧＦ−βシグナル伝達の阻害剤を含む、組成物。
【請求項１４】
ＬＡＰ結合剤が、抗ＬＡＰ抗体またはその抗原結合断片を含む、請求項１３に記載の組成物。
【請求項１５】
抗体が、モノクローナル抗体である、請求項１４に記載の組成物。
【請求項１６】
抗体が、キメラ、ＣＤＲグラフト、ヒト化、または完全ヒトである、請求項１４に記載の組成物。
【請求項１７】
抗ＬＡＰ抗体またはその抗原結合断片が、請求項１〜１２に記載のものから選択される、請求項１４に記載の組成物。
【請求項１８】
ＴＧＦ−βシグナル伝達の阻害剤が、ＴＧＦ−βまたはその受容体に結合する抗体またはその抗原結合断片、二本鎖ＲＮＡまたは二本鎖ＲＮＡをコードする核酸、アプタマー、および小分子からなる群から選択される、請求項１３に記載の組成物。
【請求項１９】
小分子が、４−［４−（１，３−ベンゾジオキソール−５−イル）−５−ピリジン−２−イル−１Ｈ−イミダゾール−２−イル］ベンズアミド（SB431542）、Ｎ−（オキサン−４−イル）−４−［４−（５−ピリジン−２−イル−１Ｈ−ピラゾール−４−イル）ピリジン−２−イル］ベンズアミド（GW788388）、４−［３−（２−ピリジニル）−１Ｈ−ピラゾール−４−イル］−キノリン（LY364947）、および２−（３−（６−メチルピリジン−２−イル）−１Ｈ−ピラゾール−４−イル）−１，５−ナフチリジン（「ＡＬＫ５阻害剤ＩＩ」）からなる群から選択される、請求項１８に記載の組成物。
【請求項２０】
ＬＡＰ結合剤と免疫調節または化学療法剤とを含む、組成物。
【請求項２１】
ＬＡＰ結合剤が、抗体またはその抗原結合断片を含む、請求項２０に記載の組成物。
【請求項２２】
抗体またはその抗原結合断片が、モノクローナル抗体またはその抗原結合断片である、請求項２１に記載の組成物。
【請求項２３】
抗体またはその抗原結合断片が、キメラ、ＣＤＲグラフト、ヒト化、または完全ヒトである、請求項２１に記載の組成物。
【請求項２４】
抗体またはその抗原結合断片が、請求項１〜１２のいずれか一項に記載の抗体組成物を含む、請求項２１に記載の組成物。
【請求項２５】
免疫調節剤が、免疫チェックポイントモジュレーターを含む、請求項２０に記載の組成物。
【請求項２６】
免疫チェックポイントモジュレーターが、ＰＤ−１、ＰＤ−Ｌ１、ＰＤＬ２、ＣＴＬＡ４、ＬＡＧ３、ＴＩＭ３、ＴＩＧＩＴ、および／またはＣＤ１０３からなる群から選択されるポリペプチドの効果を調節する、請求項２５に記載の組成物。
【請求項２７】
免疫調節剤が、腫瘍抗原ワクチンを含む、請求項２０に記載の組成物。
【請求項２８】
腫瘍抗原ワクチンが、樹状細胞腫瘍抗原ワクチンを含む、請求項２７に記載の組成物。
【請求項２９】
ＴＧＦ−βと複合体化したときのＬＡＰに結合し、ＬＡＰ／ＴＧＦ−β複合体からのＴＧＦ−βの放出を阻害する、抗体またはその抗原結合断片。
【請求項３０】
抗体またはその抗原結合断片が、モノクローナル抗体またはその抗原結合断片である、請求項２９に記載の組成物。
【請求項３１】
抗体またはその抗原結合断片が、キメラ、ＣＤＲグラフト、ヒト化、または完全ヒトである、請求項２９に記載の組成物。
【請求項３２】
抗体またはその抗原結合断片が、請求項１〜１２のいずれか一項に記載の抗体組成物を含む、請求項２９に記載の組成物。
【請求項３３】
ＬＡＰのＴＧＦ−βへの結合によって形成されるエピトープに結合する、請求項２９に記載の抗体または抗原結合断片。
【請求項３４】
請求項７に記載の抗体のＣＤＲを含む、請求項２９に記載の抗体または抗原結合断片。
【請求項３５】
請求項１〜３４のいずれか一項に記載の組成物および医薬的に許容される担体を含む、医薬組成物。
【請求項３６】
対象におけるＬＡＰ＋Ｔ制御性細胞の集団の数または活性を減少させる方法であって、方法が、対象にＬＡＰ結合剤を投与し、それによって集団の数または活性が減少することを含む、前記方法。
【請求項３７】
ＬＡＰ結合剤が、抗体またはその抗原結合断片を含む、請求項３６に記載の方法。
【請求項３８】
抗体またはその抗原結合断片が、モノクローナル抗体またはその抗原結合断片である、請求項３７に記載の方法。
【請求項３９】
抗体またはその抗原結合断片が、キメラ、ＣＤＲグラフト、ヒト化、または完全ヒトである、請求項３７に記載の方法。
【請求項４０】
抗体またはその抗原結合断片が、請求項１〜１２のいずれか一項に記載の抗体組成物を含む、請求項３７に記載の方法。
【請求項４１】
ＬＡＰ結合剤が、細胞傷害性薬にコンジュゲーションされる、請求項３６に記載の方法。
【請求項４２】
腫瘍に浸潤した免疫抑制性Ｔ細胞の腫瘍中の数または活性を減少させる方法であって、方法が、腫瘍に浸潤した免疫抑制性Ｔ細胞を含む腫瘍を有する対象にＬＡＰ結合剤を投与し、それによってかかる細胞の数または活性が減少することを含む、前記方法。
【請求項４３】
ＬＡＰ結合剤が、抗体またはその抗原結合断片を含む、請求項４２に記載の方法。
【請求項４４】
抗体またはその抗原結合断片が、モノクローナル抗体またはその抗原結合断片である、請求項４３に記載の方法。
【請求項４５】
抗体またはその抗原結合断片が、キメラ、ＣＤＲグラフト、ヒト化、または完全ヒトである、請求項４３に記載の方法。
【請求項４６】
抗体またはその抗原結合断片が、請求項１〜１２のいずれか一項に記載の抗体組成物を含む、請求項４３に記載の方法。
【請求項４７】
ＬＡＰ結合剤が、細胞傷害性薬にコンジュゲーションされる、請求項４２に記載の方法。
【請求項４８】
ＬＡＰ結合剤の治療有効量の投与を、それが必要な対象に行うことを含む、腫瘍特異的免疫を増大させる方法。
【請求項４９】
ＬＡＰ結合剤が、抗体またはその抗原結合断片を含む、請求項４８に記載の方法。
【請求項５０】
抗体またはその抗原結合断片が、モノクローナル抗体またはその抗原結合断片である、請求項４９に記載の方法。
【請求項５１】
抗体またはその抗原結合断片が、キメラ、ＣＤＲグラフト、ヒト化、または完全ヒトである、請求項４９に記載の方法。
【請求項５２】
抗体またはその抗原結合断片が、請求項１〜１２のいずれか一項に記載の抗体組成物を含む、請求項４９に記載の方法。
【請求項５３】
ＬＡＰ結合剤の治療有効量の投与を、それが必要な対象に行うことを含む、ＬＡＰ発現および／または活性が、癌または腫瘍特異的免疫の抑制に関連する、癌または腫瘍を処置する方法。
【請求項５４】
ＬＡＰ結合剤が、抗体またはその抗原結合断片を含む、請求項５３に記載の方法。
【請求項５５】
抗体またはその抗原結合断片が、モノクローナル抗体またはその抗原結合断片である、請求項５４に記載の方法。
【請求項５６】
抗体またはその抗原結合断片が、キメラ、ＣＤＲグラフト、ヒト化、または完全ヒトである、請求項５４に記載の方法。
【請求項５７】
抗体またはその抗原結合断片が、請求項１〜１２のいずれか一項に記載の抗体組成物を含む、請求項５４に記載の方法。
【請求項５８】
腫瘍中のＣＤ８＋細胞傷害性Ｔ細胞の数を増大させる方法であって、方法が、腫瘍を有する対象にＬＡＰ結合剤を投与することを含む、前記方法。
【請求項５９】
ＬＡＰ結合剤が、抗体またはその抗原結合断片を含む、請求項５８に記載の方法。
【請求項６０】
抗体またはその抗原結合断片が、モノクローナル抗体またはその抗原結合断片である、請求項５９に記載の方法。
【請求項６１】
抗体またはその抗原結合断片が、キメラ、ＣＤＲグラフト、ヒト化、または完全ヒトである、請求項５９に記載の方法。
【請求項６２】
抗体またはその抗原結合断片が、請求項１〜１２のいずれか一項に記載の抗体組成物を含む、請求項５９に記載の方法。
【請求項６３】
ＩＦＮγを発現する末梢ＣＤ４＋Ｔ細胞の増大を、それが必要な対象において行う方法であって、方法が、対象にＬＡＰ結合剤を投与することを含む、前記方法。
【請求項６４】
ＬＡＰ結合剤が、抗体またはその抗原結合断片を含む、請求項６３に記載の方法。
【請求項６５】
抗体またはその抗原結合断片が、モノクローナル抗体またはその抗原結合断片である、請求項６４に記載の方法。
【請求項６６】
抗体またはその抗原結合断片が、キメラ、ＣＤＲグラフト、ヒト化、または完全ヒトである、請求項６４に記載の方法。
【請求項６７】
抗体またはその抗原結合断片が、請求項１〜１２のいずれか一項に記載の抗体組成物を含む、請求項６４に記載の方法。
【請求項６８】
グランザイムＢを発現する末梢ＣＤ８＋Ｔ細胞の増大を、それが必要な対象において行う方法であって、方法が、対象にＬＡＰ結合剤を投与することを含む、前記方法。
【請求項６９】
ＬＡＰ結合剤が、抗体またはその抗原結合断片を含む、請求項６８に記載の方法。
【請求項７０】
抗体またはその抗原結合断片が、モノクローナル抗体またはその抗原結合断片である、請求項６９に記載の方法。
【請求項７１】
抗体またはその抗原結合断片が、キメラ、ＣＤＲグラフト、ヒト化、または完全ヒトである、請求項６９に記載の方法。
【請求項７２】
抗体またはその抗原結合断片が、請求項１〜１２のいずれか一項に記載の抗体組成物を含む、請求項６９に記載の方法。
【請求項７３】
腫瘍中のＦｏｘＰ３＋制御性Ｔ細胞の数を減少させる方法であって、方法が、対象にＬＡＰ結合剤を投与することを含む、前記方法。
【請求項７４】
ＬＡＰ結合剤が、抗体またはその抗原結合断片を含む、請求項７３に記載の方法。
【請求項７５】
抗体またはその抗原結合断片が、モノクローナル抗体またはその抗原結合断片である、請求項７４に記載の方法。
【請求項７６】
抗体またはその抗原結合断片が、キメラ、ＣＤＲグラフト、ヒト化、または完全ヒトである、請求項７４に記載の方法。
【請求項７７】
抗体またはその抗原結合断片が、請求項１〜１２のいずれか一項に記載の抗体組成物を含む、請求項７４に記載の方法。
【請求項７８】
腫瘍中のＣＤ８＋および／またはＣＤ４＋Ｔ細胞による免疫抑制性因子またはマーカーの発現を阻害する方法であって、方法が、腫瘍を有する対象にＬＡＰ結合剤を投与することを含む、前記方法。
【請求項７９】
ＬＡＰ結合剤が、抗体またはその抗原結合断片を含む、請求項７８に記載の方法。
【請求項８０】
抗体またはその抗原結合断片が、モノクローナル抗体またはその抗原結合断片である、請求項７９に記載の方法。
【請求項８１】
抗体またはその抗原結合断片が、キメラ、ＣＤＲグラフト、ヒト化、または完全ヒトである、請求項７９に記載の方法。
【請求項８２】
抗体またはその抗原結合断片が、請求項１〜１２のいずれか一項に記載の抗体組成物を含む、請求項７９に記載の方法。
【請求項８３】
免疫抑制性因子またはマーカーが、ＰＤ−１、ＬＡＧ−３、およびＣＤ１０３の１つ以上を含む、請求項７８に記載の方法。
【請求項８４】
抗腫瘍免疫応答を促進する方法であって、方法が、腫瘍抗原によって腫瘍の処置が必要な対象にワクチン接種すること、および対象にＬＡＰ結合剤を投与することを含む、前記方法。
【請求項８５】
ＬＡＰ結合剤が、抗体またはその抗原結合断片を含む、請求項８４に記載の方法。
【請求項８６】
抗体またはその抗原結合断片が、モノクローナル抗体またはその抗原結合断片である、請求項８５に記載の方法。
【請求項８７】
抗体またはその抗原結合断片が、キメラ、ＣＤＲグラフト、ヒト化、または完全ヒトである、請求項８５に記載の方法。
【請求項８８】
抗体またはその抗原結合断片が、請求項１〜１２のいずれか一項に記載の抗体組成物を含む、請求項８５に記載の方法。
【請求項８９】
免疫チェックポイント阻害剤による処置に不応性である癌を処置する方法であって、方法が、かかる癌を有する対象にＬＡＰ結合剤を投与することを含む、前記方法。
【請求項９０】
ＬＡＰ結合剤が、抗体またはその抗原結合断片を含む、請求項８９に記載の方法。
【請求項９１】
抗体またはその抗原結合断片が、モノクローナル抗体またはその抗原結合断片である、請求項９０に記載の方法。
【請求項９２】
抗体またはその抗原結合断片が、キメラ、ＣＤＲグラフト、ヒト化、または完全ヒトである、請求項９０に記載の方法。
【請求項９３】
抗体またはその抗原結合断片が、請求項１〜１２のいずれか一項に記載の抗体組成物を含む、請求項９０に記載の方法。
【請求項９４】
免疫チェックポイント阻害剤を投与することをさらに含む、請求項８９に記載の方法。
【請求項９５】
癌が、膠芽腫、大腸癌腫、またはメラノーマである、請求項８９に記載の方法。
【請求項９６】
癌が、ＬＡＰ結合剤による処置の前は、ＰＤ−１またはＰＤ−Ｌ１阻害剤に不応性である、請求項８９に記載の方法。
【請求項９７】
癌を処置するための方法であって、方法が、対象からの腫瘍サンプルを解析してＬＡＰ＋Ｔ制御性細胞の存在を決定すること、および、ＬＡＰ＋Ｔ制御性細胞が存在する場合には、対象にＬＡＰ結合剤を投与し、それによって抗腫瘍免疫応答を促進することを含む、前記方法。
【請求項９８】
ＬＡＰ結合剤が、抗体またはその抗原結合断片を含む、請求項９７に記載の方法。
【請求項９９】
抗体またはその抗原結合断片が、モノクローナル抗体またはその抗原結合断片である、請求項９７に記載の方法。
【請求項１００】
抗体またはその抗原結合断片が、キメラ、ＣＤＲグラフト、ヒト化、または完全ヒトである、請求項９７に記載の方法。
【請求項１０１】
抗体またはその抗原結合断片が、請求項１〜１２のいずれか一項に記載の抗体組成物を含む、請求項９７に記載の方法。
【請求項１０２】
癌患者の集団から、その癌がＬＡＰ結合剤による療法に応答する可能性が高い患者を選択する方法であって、方法が、患者からの腫瘍サンプルをＬＡＰ＋Ｔ制御性細胞の存在について解析することを含み、ここでＬＡＰ＋Ｔ制御性細胞が患者の腫瘍中に存在することが見いだされた場合には、患者の腫瘍が、ＬＡＰ結合剤による療法に応答する可能性が高いものとして同定される、前記方法。
【請求項１０３】
ＬＡＰ＋Ｔ制御性細胞が腫瘍中に見いだされたときには、その患者にＬＡＰ結合剤を投与すること、および、ＬＡＰ＋Ｔ制御性細胞が該腫瘍中に見いだされないときには、患者にＬＡＰ結合剤以外の免疫調節剤または抗腫瘍剤を投与することをさらに含む、請求項１０２に記載の方法。
【請求項１０４】
ＬＡＰ結合剤が、抗体またはその抗原結合断片を含む、請求項１０２または１０３に記載の方法。
【請求項１０５】
抗体またはその抗原結合断片が、モノクローナル抗体またはその抗原結合断片である、請求項１０４に記載の方法。
【請求項１０６】
抗体またはその抗原結合断片が、キメラ、ＣＤＲグラフト、ヒト化、または完全ヒトである、請求項１０４に記載の方法。
【請求項１０７】
抗体またはその抗原結合断片が、請求項１〜１２のいずれか一項に記載の抗体組成物を含む、請求項１０４に記載の方法。
【請求項１０８】
患者からの腫瘍サンプルの、ＬＡＰ＋Ｔ制御性細胞の存在についての解析が、存在するＬＡＰ＋Ｔ制御性細胞の量の定量的測定、および、ＬＡＰ＋Ｔ制御性細胞が存在することが見いだされたときには、それらの量を参照と比較することを含み、ここでＬＡＰ＋Ｔ制御性細胞のより高い相対的なレベルを有する腫瘍が、ＬＡＰ結合剤による療法に応答する可能性がより高いものとして同定される、請求項１０２に記載の方法。
【請求項１０９】
免疫調節剤が、免疫チェックポイント阻害剤を含む、請求項１０３に記載の方法。
【請求項１１０】
抗腫瘍剤が、ガンマ放射線または化学療法剤を含む、請求項１０３に記載の方法。
【請求項１１１】
関心の抗原に特異的なメモリーＴ細胞の形成の促進を、それが必要な対象において行う方法であって、方法が、対象にＬＡＰ結合剤と関心の抗原とを投与することを含む、前記方法。
【請求項１１２】
ＣＤ４４＋および／またはＩＬ７Ｒ＋Ｔ細胞が、ＬＡＰ結合剤の投与後に増大する、請求項１１１に記載の方法。
【請求項１１３】
関心の抗原が、腫瘍抗原または感染性病原体によって発現される抗原を含む、請求項１１１に記載の方法。
【請求項１１４】
腫瘍抗原が、樹状細胞ワクチンとして投与される、請求項１１３に記載の方法。
【請求項１１５】
ＬＡＰ結合剤が、抗体またはその抗原結合断片を含む、請求項１１１に記載の方法。
【請求項１１６】
抗体またはその抗原結合断片が、モノクローナル抗体またはその抗原結合断片である、請求項１１５に記載の方法。
【請求項１１７】
抗体またはその抗原結合断片が、キメラ、ヒト化、または完全ヒトである、請求項１１５に記載の方法。
【請求項１１８】
抗体またはその抗原結合断片が、請求項１〜１２のいずれか一項に記載の抗体組成物を含む、請求項１１５に記載の方法。
【請求項１１９】
ＬＡＰ＋Ｔ制御性細胞の望ましくない数または活性を特徴とするかまたはそれが関わる疾患または障害を処置するための、ＬＡＰ結合剤の使用。
【請求項１２０】
腫瘍に浸潤した免疫抑制性Ｔ細胞の腫瘍中の数または活性を減少させるためのＬＡＰ結合剤の使用であって、使用が、腫瘍に浸潤した免疫抑制性Ｔ細胞を含む腫瘍を有する対象にＬＡＰ結合剤を投与し、それによってかかる細胞の数または活性が減少することを含む、前記使用。
【請求項１２１】
腫瘍特異的免疫を増大させるためのＬＡＰ結合剤の使用であって、使用が、ＬＡＰ結合剤の治療有効量の投与を、それが必要な対象に行うことを含む、前記使用。
【請求項１２２】
ＬＡＰ発現および／または活性が、癌または腫瘍特異的免疫の抑制に関連する癌または腫瘍の処置のためのＬＡＰ結合剤の使用であって、使用が、ＬＡＰ結合剤の治療有効量の投与を、それが必要な対象に行うことを含む、前記使用。
【請求項１２３】
腫瘍中のＣＤ８＋細胞傷害性Ｔ細胞の数を増大させることによる、癌または腫瘍の処置のためのＬＡＰ結合剤の使用であって、使用が、腫瘍を有する対象にＬＡＰ結合剤を投与することを含む、前記使用。
【請求項１２４】
ＩＦＮγを発現する末梢ＣＤ４＋Ｔ細胞を増大させることによる、癌または腫瘍の処置を、それが必要な対象において行うためのＬＡＰ結合剤の使用であって、使用が、対象にＬＡＰ結合剤を投与することを含む、前記使用。
【請求項１２５】
グランザイムＢを発現する末梢ＣＤ８＋Ｔ細胞を増大させることによる、癌または腫瘍の処置を、それが必要な対象において行うためのＬＡＰ結合剤の使用であって、使用が、対象にＬＡＰ結合剤を投与することを含む、前記使用。
【請求項１２６】
腫瘍中のＦｏｘＰ３＋制御性Ｔ細胞の数を減少させることによる、癌または腫瘍の処置のためのＬＡＰ結合剤の使用であって、使用が、対象にＬＡＰ結合剤を投与することを含む、前記使用。
【請求項１２７】
腫瘍中のＣＤ８＋および／またはＣＤ４＋Ｔ細胞による免疫抑制性因子の発現を阻害することによる、癌または腫瘍の処置のためのＬＡＰ結合剤の使用であって、使用が、腫瘍を有する対象にＬＡＰ結合剤を投与することを含む、前記使用。
【請求項１２８】
抗腫瘍免疫応答を促進するためのＬＡＰ結合剤の使用であって、使用が、腫瘍抗原によって腫瘍の処置が必要な対象にワクチン接種すること、および、対象にＬＡＰ結合剤を投与することを含む、前記使用。
【請求項１２９】
免疫チェックポイント阻害剤による処置に不応性である癌を処置するためのＬＡＰ結合剤の使用であって、使用が、かかる癌を有する対象にＬＡＰ結合剤を投与することを含む、前記使用。
【請求項１３０】
癌を処置するためのＬＡＰ結合剤の使用であって、使用が、対象からの腫瘍サンプルを解析してＬＡＰ＋Ｔ制御性細胞の存在を決定すること、および、ＬＡＰ＋Ｔ制御性細胞が存在する場合には、対象にＬＡＰ結合剤を投与し、それによって抗腫瘍免疫応答を促進することを含む、前記使用。
【請求項１３１】
対象において、癌または感染の処置のために、関心の抗原に特異的なメモリーＴ細胞の形成を促進する、ＬＡＰ結合剤の使用であって、使用が、対象にＬＡＰ結合剤と関心の抗原とを投与することを含む、前記使用。
【請求項１３２】
ＬＡＰ結合剤が、配列番号１〜３のいずれか１つに示される配列を有するＬＡＰ分子に特異的に結合する、請求項１３〜３２のいずれか一項に記載の組成物、または請求項３６〜１１８のいずれか一項に記載の方法、または請求項１１９〜１３１のいずれか一項に記載の使用。
【請求項１３３】
抗体またはその抗原結合断片が、ＬＡＰリガンド相互作用部位に結合する、請求項１３〜２８のいずれか一項に記載の組成物、または請求項３７、４３、４９、５４、５９、６４、６９、７４、７９、８５、９０、９８、１０４および１１５のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１３４】
ＬＡＰリガンド相互作用部位が、成熟ＴＧＦβと相互作用する部位、インテグリンと相互作用する部位、および／または潜在型ＴＧＦβ結合蛋白質（ＬＴＢＰ）と相互作用する部位である、請求項１３３に記載の組成物または方法。
【請求項１３５】
ＬＡＰ結合剤が、ＴＧＦ−βと複合体化したＬＡＰに結合し、複合体からのＴＧＦ−βの放出を阻害する、請求項１〜２８のいずれか一項に記載の組成物、または請求項３６、４２、４８、５３、５８、６３、６８、７３、７８、８４、８９、９７、１０２および１１１のいずれか一項に記載の方法、または請求項１１９〜１３１のいずれか一項に記載の使用。
【請求項１３６】
モノクローナル抗体が、TW4-9E7、TW4-5A8、TW4-3E5、TW4-4E5、TW4-12B12、TW4-13B12、TW4-1G12、TW4-3G5、TW4-2F8、TW4-6H10、TW4-1G2、TW4-1E1、TW4-16F4、TW4-8F10、TW4-3H6、TW4-2C9、TW7-16B4、TW7-28G11、TW7-7H4、およびTW7-20B9から選択されるハイブリドーマクローンのいずれか１つによって産生される、請求項１５、２２および３０のいずれか一項に記載の組成物、または請求項３８、４４、５０、５５、６０、６５、７０、７５、８０、８６、９１、９９、１０５および１１６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１３７】
ＬＡＰ結合剤が、小分子阻害剤、薬剤、または化合物である、請求項１３、２０および３５のいずれか一項に記載の組成物、または請求項３６、４２、４８、５３、５８、６３、６８、７３、７８、８４、８９、９７、１０２および１１１のいずれか一項に記載の方法、または請求項１１９〜１３１のいずれか一項に記載の使用。
【請求項１３８】
ＬＡＰ結合剤が、ＬＡＰと結合または物理的に相互作用するＲＮＡまたはＤＮＡアプタマーである、請求項１３、２０および３５のいずれか一項に記載の組成物、または請求項３６、４２、４８、５３、５８、６３、６８、７３、７８、８４、８９、９７、１０２および１１１のいずれか一項に記載の方法、または請求項１１９〜１３１のいずれか一項に記載の使用。
【請求項１３９】
対象が、癌を有するか、またはそれと診断されている、請求項３６〜１０１および１１１〜１１８のいずれか一項に記載の方法、または請求項１２０〜１３１のいずれか一項に記載の使用。
【請求項１４０】
対象が、脳腫瘍、メラノーマ、もしくは大腸癌を有するか、またはそれと診断されている、請求項１３９に記載の方法または使用。
【請求項１４１】
脳腫瘍が、膠芽腫である、請求項１４０に記載の方法または使用。
【請求項１４２】
方法が、対象に抗癌療法、化学療法、または免疫調節剤を施すことをさらに含む、請求項３６、４２、４８、５３、５８、６３、６８、７３、７８、８４、８９、９７および１１１のいずれか一項に記載の方法、または請求項１１９〜１３１のいずれか一項に記載の使用。
【請求項１４３】
免疫調節剤が、免疫チェックポイント阻害剤を含む、請求項１４２に記載の方法または使用。
【請求項１４４】
免疫チェックポイント阻害剤が、以下：ＰＤ１、ＰＤＬ１、ＰＤＬ２、ＣＴＬＡ４、ＬＡＧ３、ＴＩＭ３、ＴＩＧＩＴ、および／またはＣＤ１０３の１つ以上に結合する、請求項１４３に記載の方法または使用。
【請求項１４５】
免疫チェックポイント阻害剤が、ペムブロリズマブ、ニボルマブ、MK-3475、MPDL3280A、MEDI0680、MEDI4736、AMP-224、およびMSB0010718Cから選択されるＰＤ１、ＰＤＬ１、および／またはＰＤＬ２阻害剤である、請求項１４３に記載の方法または使用。
【請求項１４６】
方法が、対象に腫瘍抗原または癌抗原を投与することをさらに含む、請求項１４２に記載の方法または使用。
【請求項１４７】
方法が、樹状細胞（ＤＣ）ワクチン接種と同時にまたは組み合わせてＬＡＰ結合剤を投与することを含む、請求項１４６に記載の方法または使用。
【請求項１４８】
ＬＡＰ結合剤が、請求項１〜１１のいずれか一項に記載の単離された抗体もしくはその抗原結合断片、または請求項１２に記載の医薬組成物である、請求項２４に記載の方法。
【請求項１４９】
ＬＡＰ結合剤が、請求項１〜１１のいずれか一項に記載の単離された抗体もしくはその抗原結合断片、または請求項１２に記載の医薬組成物である、請求項１３、２０および３５のいずれか一項に記載の組成物、または請求項３６、４２、４８、５３、５８、６３、６８、７３、７８、８４、８９、９７、１０２および１１１のいずれか一項に記載の方法、または請求項１１９〜１３１のいずれか一項に記載の使用。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
関連出願の相互参照
本出願は２０１５年１月１４日出願のＵ．Ｓ．仮出願Ｎｏ．：６２／１０３，４０１の米国特許法第１１９条（ｅ）の下における優先権を主張し、その内容はその全体として参照によって本明細書に組み込まれる。
【０００２】
技術分野
技術分野は、抗ＬＡＰ抗体および癌を処置するための方法に関する。
【背景技術】
【０００３】
背景
世界保健機関からのデータによれば、全世界の１千万人が２０００年に癌と診断され、６００万がそのために死亡した。その上、統計は癌罹患率が世界中で上昇中であるということを示している。例えば、米国において、見通しは、今日生存しているものの５０パーセントがそれらの一生の何らかの時点において癌の何らかの形態と診断されるであろうということを示している。
【０００４】
癌療法は、放射線、外科手術、細胞傷害性化学療法剤、癌特異的な免疫応答を増大させることを目指した処置、およびかかるアプローチの組み合わせを包含する。癌療法への近年のアプローチは、患者の免疫応答を積極的に御して、種々のアプローチ（腫瘍抗原による免疫化、抑制性／制御性免疫細胞集団の阻害または除去、および疲弊した免疫細胞集団の活性化を包含する）を用いて癌細胞を標的化することにフォーカスしてきた。
【発明の概要】
【０００５】
概要
ＬＡＰまたは潜在性関連ペプチドはＴＧＦ−βのＮ末端蛋白質部分の分離からもたらされる。ＬＡＰは分泌され、細胞外マトリックス中に見出され得る。加えて、ＬＡＰは血小板においてもまた発現され得る。重要なことに、本明細書に記載されるように、ＬＡＰは活性化した制御性Ｔ細胞において見いだされる。本明細書に記載される組成物および方法は、部分的に、抗ＬＡＰ抗体によって処置されたときに腫瘍成長がより低く、マウスがより長く生存するという発見と、本明細書に記載される抗ＬＡＰ抗体が、部分的に、ＴＧＦ−βシグナル伝達を防ぐかもしくは阻害すること（ＬＡＰ／ＴＧＦ−ｂ複合体からのＴＧＦ−βの放出をブロックすることを包含する）ならびに／または活性化したＣＤ４＋およびＣＤ８＋制御性Ｔ細胞集団両方を枯渇させることによって作用するという発見とに基づく。より具体的には、本明細書において示されているように、抗ＬＡＰ抗体処置は次のように全身および腫瘍内免疫両方に影響した。（１）腫瘍は細胞傷害性ＣＤ８＋Ｔ細胞の増大した数によって浸潤され、腫瘍内Ｆｏｘｐ３Ｔｒｅｇは減少した。ＣＤ４＋およびＣＤ８＋腫瘍内Ｔ細胞はＰＤ−１、ＬＡＧ３、およびＣＤ１０３の減少した発現を有した。（２）末梢においては、ＩＦＮ−γおよびグランザイムＢを発現するＣＤ４＋およびＣＤ８＋Ｔ細胞がそれぞれ増大し、その一方でＣＤ１０３＋Ｔ細胞は減少した。最後に、ＣＤ１０３およびＰＤ−Ｌ１を発現する免疫寛容誘導性樹状細胞の低減された数があり、その一方でＭＨＣＩＩは脾臓の骨髄系細胞において上昇した。抗ＬＡＰ抗体はＧＢＭモデル、メラノーマモデル、および結腸癌腫モデルを包含する種々の癌モデルにおいて有効性を示し、類似の腫瘍内および末梢免疫効果が観察され、癌療法のためのこのアプローチの広範な適用性を示した。それゆえに、本明細書において示されているように、抗ＬＡＰ抗体は、自然および獲得免疫両方を活性化することと腫瘍特異的免疫を抑制するメカニズムを克服することとによって、全身および腫瘍内免疫応答に強く影響する。結論として、単独療法としてのまたは従来の抗腫瘍モダリティーと組み合わせての抗ＬＡＰ抗体は、癌の処置のための新規の免疫療法アプローチを表している。
【０００６】
従って、ＬＡＰに特異的に結合する単離された抗ＬＡＰ抗体またはその抗原結合断片が本明細書に記載され、ａ）配列番号９のアミノ酸配列を有する重鎖ＣＤＲ１、ｂ）配列番号１０のアミノ酸配列を有する重鎖ＣＤＲ２、ｃ）配列番号１１のアミノ酸配列を有する重鎖ＣＤＲ３、ｄ）配列番号１４のアミノ酸配列を有する軽鎖ＣＤＲ１、ｅ）配列番号１５のアミノ酸配列を有する軽鎖ＣＤＲ２、およびｆ）配列番号１６のアミノ酸配列を有する軽鎖ＣＤＲ３からなる群から選択される１つ以上の重および軽鎖相補性決定領域（ＣＤＲ）を含む。
【０００７】
１つの態様において、単離された抗ＬＡＰ抗体またはその抗原結合断片は、重鎖相補性決定領域（ＣＤＲ）のａ）配列番号９のアミノ酸配列を有する重鎖ＣＤＲ１とｂ）配列番号１０のアミノ酸配列を有する重鎖ＣＤＲ２とｃ）配列番号１１のアミノ酸配列を有する重鎖ＣＤＲ３とを含む。
【０００８】
別の態様において、単離された抗ＬＡＰ抗体またはその抗原結合断片は、軽鎖相補性決定領域（ＣＤＲ）のａ）配列番号１４のアミノ酸配列を有する軽鎖ＣＤＲ１とｂ）配列番号１５のアミノ酸配列を有する軽鎖ＣＤＲ２とｃ）配列番号１６のアミノ酸配列を有する軽鎖ＣＤＲ３とを含む。
【０００９】
別の態様において、単離された抗ＬＡＰ抗体またはその抗原結合断片は、相補性決定領域（ＣＤＲ）のａ）配列番号９のアミノ酸配列を有する重鎖ＣＤＲ１とｂ）配列番号１０のアミノ酸配列を有する重鎖ＣＤＲ２とｃ）配列番号１１のアミノ酸配列を有する重鎖ＣＤＲ３とｃ）配列番号１４のアミノ酸配列を有する軽鎖ＣＤＲ１とｅ）配列番号１５のアミノ酸配列を有する軽鎖ＣＤＲ２とｆ）配列番号１６のアミノ酸配列を有する軽鎖ＣＤＲ３とを含む。
【００１０】
別の態様において、単離された抗ＬＡＰ抗体またはその抗原結合断片は配列番号８のアミノ酸配列を有する重鎖を含む。
【００１１】
別の態様において、単離された抗ＬＡＰ抗体またはその抗原結合断片は配列番号１３の配列を有する軽鎖を含む。
【００１２】
別の態様において、単離された抗ＬＡＰ抗体またはその抗原結合断片は、ａ）配列番号９のアミノ酸配列を有する重鎖ＣＤＲ１と、ｂ）配列番号１０のアミノ酸配列を有する重鎖ＣＤＲ２と、ｃ）配列番号１１のアミノ酸配列を有する重鎖ＣＤＲ３と、ｄ）配列番号１４のアミノ酸配列を有する軽鎖ＣＤＲ１と、ｅ）配列番号１５のアミノ酸配列を有する軽鎖ＣＤＲ２と、ｆ）配列番号１６のアミノ酸配列を有する軽鎖ＣＤＲ３とを含む。
【００１３】
別の態様において、単離された抗ＬＡＰ抗体または抗原結合断片は、ａ）配列番号９のアミノ酸配列を有する重鎖ＣＤＲ１、ｂ）配列番号１０のアミノ酸配列を有する重鎖ＣＤＲ２、およびｃ）配列番号１１のアミノ酸配列を有する重鎖ＣＤＲ３からなる群から選択される１つ以上の重鎖相補性決定領域（ＣＤＲ）を含む。
【００１４】
別の態様において、単離された抗ＬＡＰ抗体または抗原結合断片は、ａ）配列番号１４のアミノ酸配列を有する軽鎖ＣＤＲ１、ｂ）配列番号１５のアミノ酸配列を有する軽鎖ＣＤＲ２、およびｃ）配列番号１６のアミノ酸配列を有する軽鎖ＣＤＲ３からなる群から選択される１つ以上の軽鎖相補性決定領域（ＣＤＲ）を含む。
【００１５】
本明細書に記載されるいずれかの側面の抗体はモノクローナル抗体であり得る。ある種の態様において、本明細書に記載されるいずれかの側面の抗体はキメラ、ＣＤＲグラフト、ヒト化、コンポジットヒト、もしくは完全ヒト抗体、または二重抗体、あるいはその抗原結合断片である。本明細書に記載されるいずれかの側面の他の態様において、抗体断片はＦａｂ断片、Ｆａｂ’断片、Ｆｄ断片、Ｆｄ’断片、Ｆｖ断片、ｄＡｂ断片、Ｆ（ａｂ’）２断片、一本鎖断片、ダイアボディ、またはリニア抗体である。本明細書に記載されるいずれかの側面の別の態様において、抗体またはその抗原結合断片はヒトアクセプターフレームワークを含む。それらの態様のいずれかが基づくモノクローナル抗体は、例えば、TW4-9E7、TW4-5A8、TW4-4E5、TW4-12B12、TW4-1G12、TW4-3G5、TW4-2F8、TW4-6H10、TW4-1G2、TW4-1E1、TW4-16F4、TW4-8F10、TW4-3H6、TW4-2C9、TW7-16B4、TW7-28G11、TW7-7H4、およびTW7-20B9と呼ばれる群から選択されるハイブリドーマクローンによって産生されるモノクローナル抗体を包含し得る。
【００１６】
ＬＡＰ結合剤とＴＧＦ−βシグナル伝達の阻害剤とを含む組成物もまた記載される。
【００１７】
１つの態様において、ＬＡＰ結合剤は抗ＬＡＰ抗体またはその抗原結合断片を含む。別の態様において、抗体はモノクローナル抗体である。別の態様において、抗体はキメラ、ＣＤＲグラフト、ヒト化、または完全ヒトである。別の態様においては、重および軽鎖相補性決定領域（ＣＤＲ）の１つ以上、２つ以上、３つ以上、４つ以上、５つ以上、または６つ全てを含み、ａ）配列番号９のアミノ酸配列を有する重鎖ＣＤＲ１、ｂ）配列番号１０のアミノ酸配列を有する重鎖ＣＤＲ２、ｃ）配列番号１１のアミノ酸配列を有する重鎖ＣＤＲ３、ｄ）配列番号１４のアミノ酸配列を有する軽鎖ＣＤＲ１、ｅ）配列番号１５のアミノ酸配列を有する軽鎖ＣＤＲ２、およびｆ）配列番号１６のアミノ酸配列を有する軽鎖ＣＤＲ３を包含する抗体。
【００１８】
別の態様において、ＴＧＦ−βシグナル伝達の阻害剤は、ＴＧＦ−βまたはその受容体に結合する抗体またはその抗原結合断片、二本鎖ＲＮＡまたは二本鎖ＲＮＡをコードする核酸、アプタマー、および小分子からなる群から選択される。ＴＧＦ−βおよびＴＧＦ−β受容体に特異的に結合し、それによるシグナル伝達を阻害する抗体は当分野において公知であり、商業的に利用可能な抗体を包含する。ＲＮＡ干渉によってＴＧＦ−βおよび／またはＴＧＦ−β受容体を特異的に標的化する二本鎖ＲＮＡもまた当分野において公知、および商業的に利用可能である。ＴＧＦ−ｂシグナル伝達の小分子阻害剤は当分野において公知であり、例えば４−［４−（１，３−ベンゾジオキソール−５−イル）−５−ピリジン−２−イル−１Ｈ−イミダゾール−２−イル］ベンズアミド（SB431542）、Ｎ−（オキサン−４−イル）−４−［４−（５−ピリジン−２−イル−１Ｈ−ピラゾール−４−イル）ピリジン−２−イル］ベンズアミド（GW788388）、４−［３−（２−ピリジニル）−１Ｈ−ピラゾール−４−イル］−キノリン（LY364947）、および２−（３−（６−メチルピリジン−２−イル）−１Ｈ−ピラゾール−４−イル）−１，５−ナフチリジン（「ＡＬＫ５阻害剤ＩＩ」）を包含する。
【００１９】
ＬＡＰ結合剤と免疫調節または化学療法剤とを含む組成物もまた記載される。
【００２０】
１つの態様において、ＬＡＰ結合剤は抗体またはその抗原結合断片を含む。別の態様において、抗体またはその抗原結合断片はモノクローナル抗体またはその抗原結合断片である。ある種の態様において、抗体またはその抗原結合断片はキメラ、ＣＤＲグラフト、ヒト化、または完全ヒトである。別の態様において、抗体は重および軽鎖相補性決定領域（ＣＤＲ）の１つ以上、２つ以上、３つ以上、４つ以上、５つ以上、または６つ全てを含み、ａ）配列番号９のアミノ酸配列を有する重鎖ＣＤＲ１、ｂ）配列番号１０のアミノ酸配列を有する重鎖ＣＤＲ２、ｃ）配列番号１１のアミノ酸配列を有する重鎖ＣＤＲ３、ｄ）配列番号１４のアミノ酸配列を有する軽鎖ＣＤＲ１、ｅ）配列番号１５のアミノ酸配列を有する軽鎖ＣＤＲ２、およびｆ）配列番号１６のアミノ酸配列を有する軽鎖ＣＤＲ３を包含する。
【００２１】
別の態様において、免疫調節剤は免疫チェックポイントモジュレーターを含む。免疫チェックポイント蛋白質受容体およびそれらのリガンド（本明細書においてはまとまってチェックポイント蛋白質と言われる）は、Ｔ細胞によって媒介される細胞傷害性の抑制を媒介し、多くの場合に、腫瘍によってまたは腫瘍微小環境中の無反応性Ｔ細胞において発現され、腫瘍が免疫の攻撃をかわすことを可能にする。免疫抑制性チェックポイント蛋白質受容体およびそれらのリガンドの活性の阻害剤は、免疫抑制性腫瘍環境を克服して、腫瘍の細胞傷害性Ｔ細胞の攻撃を可能にし得る。免疫チェックポイント蛋白質の例は、ＰＤ−１、ＰＤ−Ｌ１、ＰＤＬ２、ＣＴＬＡ４、ＬＡＧ３、ＴＩＭ３、ＴＩＧＩＴ、およびＣＤ１０３を包含するが、これに限定されない。かかる蛋白質の活性の阻害を包含する調節は免疫チェックポイントモジュレーターによって達成され得、それらは、例えば、とりわけ、チェックポイント蛋白質を標的化する抗体、アプタマー、小分子、およびチェックポイント受容体蛋白質の可溶性バージョンを包含し得る。ＰＤ−１を標的化する阻害剤は認可された薬剤ペムブロリズマブおよびニボルマブを包含し、イピリムマブは認可されたＣＴＬＡ−４阻害剤である。ＰＤ−Ｌ１、ＰＤ−Ｌ２、ＬＡＧ３、ＴＩＭ３、ＴＩＧＩＴ、およびＣＤ１０３に特異的な抗体は公知および／または商業的に利用可能であり、当業者によって産生もまたされ得る。
【００２２】
免疫調節剤は、免疫チェックポイントモジュレーターに加えて、細胞によって媒介される免疫応答を促進する抗原提示を容易化または媒介する薬剤を包含する。かかる免疫モジュレーターは例えば腫瘍抗原ワクチンを包含し得る。腫瘍抗原ワクチンは、対象自身の樹状細胞またはアジュバントありまたはなしに、特定の腫瘍抗原または公知の腫瘍抗原のセットを含む調製物を包含し得る。代替的には、腫瘍抗原ワクチンは患者の腫瘍からの腫瘍細胞抗原の相対的にクルードな調製物を含み得、これは、患者の細胞からインビトロで作製された樹状細胞にエクスビボで暴露されたときには、樹状細胞ワクチンが患者に導入されたときに腫瘍のＴ細胞によって媒介される攻撃を可能にし得る。１つの態様においては、そのため、免疫調節剤が腫瘍抗原ワクチンを含む。別の態様において、腫瘍抗原ワクチンは樹状細胞腫瘍抗原ワクチンを含む。
【００２３】
ＴＧＦ−βと複合体化したときのＬＡＰに結合し、ＬＡＰ／ＴＧＦ−β複合体からのＴＧＦ−βの放出を阻害する抗体またはその抗原結合断片もまた本明細書に記載される。１つの態様において、抗体または抗原結合断片は、ＴＧＦ−βへのＬＡＰの結合によって形成されるエピトープに結合する。別の態様において、抗体または抗原結合断片はモノクローナル抗体またはその抗原結合断片であり、例えば、キメラ、ＣＤＲグラフト、ヒト化、もしくは完全ヒト抗体、またはその抗原（atigen）結合断片を包含し得る。別の態様において、抗体またはその抗原結合断片は重および軽鎖相補性決定領域（ＣＤＲ）の１つ以上、２つ以上、３つ以上、４つ以上、５つ以上、または６つ全てを含み、ａ）配列番号９のアミノ酸配列を有する重鎖ＣＤＲ１、ｂ）配列番号１０のアミノ酸配列を有する重鎖ＣＤＲ２、ｃ）配列番号１１のアミノ酸配列を有する重鎖ＣＤＲ３、ｄ）配列番号１４のアミノ酸配列を有する軽鎖ＣＤＲ１、ｅ）配列番号１５のアミノ酸配列を有する軽鎖ＣＤＲ２、およびｆ）配列番号１６のアミノ酸配列を有する軽鎖ＣＤＲ３を包含する。抗体またはその抗原結合断片は、例えば、ハイブリドーマクローンTW7-28G11によって産生される抗体を包摂する。抗体またはその抗原結合断片は、例えば、本明細書に記載される他の抗ＬＡＰハイブリドーマクローンのいずれかによって産生される抗体をもまた包摂し得る。
【００２４】
本明細書に記載されるＬＡＰ結合剤または例えばヒトＬＡＰを包含するＬＡＰに特異的に結合する抗体と医薬的に許容される担体とを含む医薬組成物もまた本明細書に記載される。本明細書に記載される方法においてそれが必要な個体に投与されるいずれかの組成物について、組成物の量は、その用語が本明細書において定義される「治療有効量」であろう。
【００２５】
対象におけるＬＡＰ＋Ｔ制御性細胞の集団の数または活性を減少させる方法もまた本明細書に記載され、方法は対象にＬＡＰ結合剤を投与することを含み、それによってＬＡＰ＋Ｔ制御性細胞集団の数または活性が減少する。
【００２６】
本明細書において用いられる用語「制御性Ｔ細胞」または「Ｔ制御性細胞」または「Ｔｒｅｇ」は、他のＣＤ４＋およびＣＤ８＋Ｔ細胞を包含する他の免疫細胞の活性化、増殖、および／またはエフェクター機能を阻害または抑制し、自己寛容性を維持することを助けるＣＤ４＋またはＣＤ８＋Ｔ細胞のいずれかの集団を言う。Ｔｒｅｇは、場合によっては古い文献においてはサプレッサーＴ細胞ともまた言われる。ＣＤ４＋ＣＤ２５＋ＦｏｘＰ３＋Ｔｒｅｇは胸腺に由来する制御性Ｔ細胞の集団であり、それらが末梢まで遊走するまでは相対的に均質な集団であり、そこでは、亜集団が通常型のメモリーおよびエフェクターＴ細胞に類似の表現型の特徴を生じ得る。この亜集団の細胞はリンパおよび非リンパ組織まで遊走して、適切な免疫ホメオスタシスを維持し得る。末梢由来またはいわゆる誘導型Ｔｒｅｇは、末梢において通常型のＣＤ４＋ＣＤ２５−ＦｏｘＰ３−Ｔ細胞から発生し得る制御性Ｔ細胞の集団である。ＣＤ４＋Ｔｒｅｇは一般的にＣＤ４＋およびＦｏｘＰ３＋であるが、マーカープロファイルはソースに依存して変わり得る。例えば、胸腺由来のＴｒｅｇはマーカーＨｅｌｉｏｓの高レベルを発現するが、誘導型Ｔｒｅｇはしない。全ての誘導型ＴｒｅｇがＣＤ２５またはＦｏｘＰ３を発現するわけではない。通常型Ｔ細胞とは違って、いくつかのＴｒｅｇ細胞は、Ｔ細胞受容体活性化によって、それらの細胞表面に一過的にＧＡＲＰおよびＬＡＰ／ＴＧＦβ両方を発現する。ＣＤ１０３＋ＣＤ８＋Ｔｒｅｇは、サイトカインＩＬ−１０および／もしくはＴＧＦ−βの産生ならびに／または樹状細胞に及ぼす直接的な阻害作用によって抗原特異的な抑制を媒介する制御性Ｔ細胞の集団である。
【００２７】
制御性Ｔ細胞集団の機能を同定および／またはキャラクタリゼーションするための例示的なアッセイは当分野において公知であり、例えばCollison and Vignali, In Vitro Treg Suppression Assays, METHODS IN MOLECULAR BIOLOGY (CLIFTON, N.J.) ・ JANUARY 2011に記載されており、その内容はそれらの全体として参照によって本明細書に組み込まれる。典型的には、制御性Ｔ細胞の機能は、インビボ、エクスビボ、またはインビトロの増殖の抑制を測定することによって同定される。例えば、インビトロＴｒｅｇ抑制アッセイの例示的な基本的な型は、Ｔｒｅｇ機能が抗原提示細胞（ＡＰＣ）の非存在下において測定されるものである。このアッセイは２つの細胞型の標的ＴｃｏｎｖおよびＴｒｅｇのみを包含し、これらは種々の比で一緒に混合され、典型的には２：１比から始まり、抗ＣＤ３および抗ＣＤ２８を用いて、例えばビーズを用いて刺激される。Ｔｒｅｇ集団の抑制機能は、例えば、チミジン取り込みアッセイを用いてまたはカルボキシフルオレセインスクシンイミジルエステル（ＣＦＳＥ）希釈アッセイなどの蛍光色素に基づくアッセイを用いて、細胞増殖を測定することによって決定される。
【００２８】
本明細書において報告されるように、特に関心のＴｒｅｇの集団はＬＡＰ＋Ｔｒｅｇであり、それらは他の部位のなかでも腫瘍組織に蓄積し得る。本明細書において報告されるように、ＬＡＰ結合剤は、腫瘍に浸潤または腫瘍に関連したＴｒｅｇの数または活性を包含するＬＡＰ＋Ｔｒｅｇの数または活性を減少させ得る。ＬＡＰ＋Ｔｒｅｇによって媒介される免疫抑制の低減は、腫瘍の有効な免疫の攻撃を可能にし得る。１つの態様において、ＬＡＰ結合剤は抗体またはその抗原結合断片であり得る。１つの態様において、抗体はモノクローナル抗体またはその抗原結合断片であり得る。別の態様において、抗体またはその抗原結合断片はキメラ、ＣＤＲグラフト、ヒト化、または完全ヒトであり得る。別の態様において、抗体またはその抗原結合断片は重および軽鎖相補性決定領域（ＣＤＲ）の１つ以上、２つ以上、３つ以上、４つ以上、５つ以上、または６つ全てを含み、ａ）配列番号９のアミノ酸配列を有する重鎖ＣＤＲ１、ｂ）配列番号１０のアミノ酸配列を有する重鎖ＣＤＲ２、ｃ）配列番号１１のアミノ酸配列を有する重鎖ＣＤＲ３、ｄ）配列番号１４のアミノ酸配列を有する軽鎖ＣＤＲ１、ｅ）配列番号１５のアミノ酸配列を有する軽鎖ＣＤＲ２、およびｆ）配列番号１６のアミノ酸配列を有する軽鎖ＣＤＲ３を包含する。抗体またはその抗原結合断片は、例えば、ハイブリドーマクローンTW7-28G11によって産生される抗体を包摂する。抗体またはその抗原結合断片は、例えば、本明細書に記載される他の抗ＬＡＰハイブリドーマクローンのいずれかによって産生される抗体をもまた包摂し得る。未コンジュゲーションの抗体は有効であり得るが、１つの態様において、ＬＡＰ結合剤は細胞傷害性または化学療法剤または薬にコンジュゲーションされ得る。
【００２９】
ＬＡＰ結合剤を投与することによってＬＡＰ＋Ｔｒｅｇが低減されるのみならず、ＦｏｘＰ３＋Ｔｒｅｇもまた低減される。それゆえに、腫瘍中のＦｏｘＰ３＋制御性Ｔ細胞の数を減少させる方法もまた本明細書に記載され、方法は、対象にＬＡＰ結合剤を投与することを含む。本明細書に記載される他の側面のように、１つの態様において、ＬＡＰ結合剤は抗体またはその抗原結合断片であり得る。１つの態様において、抗体はモノクローナル抗体またはその抗原結合断片であり得る。別の態様において、抗体またはその抗原結合断片はキメラ、ＣＤＲグラフト、ヒト化、または完全ヒトであり得る。別の態様において、抗体またはその抗原結合断片は重および軽鎖相補性決定領域（ＣＤＲ）の１つ以上、２つ以上、３つ以上、４つ以上、５つ以上、または６つ全てを含み、ａ）配列番号９のアミノ酸配列を有する重鎖ＣＤＲ１、ｂ）配列番号１０のアミノ酸配列を有する重鎖ＣＤＲ２、ｃ）配列番号１１のアミノ酸配列を有する重鎖ＣＤＲ３、ｄ）配列番号１４のアミノ酸配列を有する軽鎖ＣＤＲ１、ｅ）配列番号１５のアミノ酸配列を有する軽鎖ＣＤＲ２、およびｆ）配列番号１６のアミノ酸配列を有する軽鎖ＣＤＲ３を包含する。抗体またはその抗原結合断片は、例えば、ハイブリドーマクローンTW7-28G11によって産生される抗体を包摂する。抗体またはその抗原結合断片は、例えば、本明細書に記載される他の抗ＬＡＰハイブリドーマクローンのいずれかによって産生される抗体をもまた包摂し得る。未コンジュゲーションの抗体は有効であり得るが、１つの態様において、ＬＡＰ結合剤は細胞傷害性または化学療法剤または薬にコンジュゲーションされ得る。
【００３０】
腫瘍中の腫瘍に浸潤した免疫抑制性Ｔ細胞の数または活性を減少させる方法もまた本明細書に記載され、方法は、腫瘍に浸潤した免疫抑制性Ｔ細胞を含む腫瘍を有する対象にＬＡＰ結合剤を投与することを含み、それによってかかる細胞の数または活性が減少する。１つの態様において、ＬＡＰ結合剤は抗体またはその抗原結合断片であり得る。１つの態様において、抗体はモノクローナル抗体またはその抗原結合断片であり得る。別の態様において、抗体またはその抗原結合断片はキメラ、ＣＤＲグラフト、ヒト化、または完全ヒトであり得る。別の態様において、抗体またはその抗原結合断片は重および軽鎖相補性決定領域（ＣＤＲ）の１つ以上、２つ以上、３つ以上、４つ以上、５つ以上、または６つ全てを含み、ａ）配列番号９のアミノ酸配列を有する重鎖ＣＤＲ１、ｂ）配列番号１０のアミノ酸配列を有する重鎖ＣＤＲ２、ｃ）配列番号１１のアミノ酸配列を有する重鎖ＣＤＲ３、ｄ）配列番号１４のアミノ酸配列を有する軽鎖ＣＤＲ１、ｅ）配列番号１５のアミノ酸配列を有する軽鎖ＣＤＲ２、およびｆ）配列番号１６のアミノ酸配列を有する軽鎖ＣＤＲ３を包含する。抗体またはその抗原結合断片は、例えば、ハイブリドーマクローンTW7-28G11によって産生される抗体を包摂する。抗体またはその抗原結合断片は、例えば、本明細書に記載される他の抗ＬＡＰハイブリドーマクローンのいずれかによって産生される抗体をもまた包摂し得る。未コンジュゲーションの抗体は有効であり得るが、１つの態様において、ＬＡＰ結合剤は細胞傷害性または化学療法剤または薬にコンジュゲーションされ得る。
【００３１】
ＬＡＰ結合剤が、本明細書において、腫瘍組織に関連または浸潤した免疫抑制性Ｔ細胞を包含する免疫抑制性Ｔ細胞集団を低減することが示されているところでは、結果として、本明細書に記載されるＬＡＰ結合剤を用いて腫瘍特異的免疫が増大し得る。それゆえに、これは、それが必要な対象にＬＡＰ結合剤の治療有効量を投与することを含む腫瘍特異的免疫を増大させる方法を提供する。これは、ＬＡＰ発現および／または活性が癌または腫瘍特異的免疫の抑制に関連する癌または腫瘍を処置する方法をもまた提供し、方法は、それが必要な対象にＬＡＰ結合剤の治療有効量を投与することを含む。本明細書に記載されている他のもののように、それらの側面において、投与されるＬＡＰ結合剤は例えば抗体またはその抗原結合断片を包含し得る。１つの態様において、抗体はモノクローナル抗体またはその抗原結合断片であり得る。別の態様において、抗体またはその抗原結合断片はキメラ、ＣＤＲグラフト、ヒト化、または完全ヒトであり得る。別の態様において、抗体またはその抗原結合断片は重および軽鎖相補性決定領域（ＣＤＲ）の１つ以上、２つ以上、３つ以上、４つ以上、５つ以上、または６つ全てを含み、ａ）配列番号９のアミノ酸配列を有する重鎖ＣＤＲ１、ｂ）配列番号１０のアミノ酸配列を有する重鎖ＣＤＲ２、ｃ）配列番号１１のアミノ酸配列を有する重鎖ＣＤＲ３、ｄ）配列番号１４のアミノ酸配列を有する軽鎖ＣＤＲ１、ｅ）配列番号１５のアミノ酸配列を有する軽鎖ＣＤＲ２、およびｆ）配列番号１６のアミノ酸配列を有する軽鎖ＣＤＲ３を包含する。抗体またはその抗原結合断片は、例えば、ハイブリドーマクローンTW7-28G11によって産生される抗体を包摂する。抗体またはその抗原結合断片は、例えば、本明細書に記載される他の抗ＬＡＰハイブリドーマクローンのいずれかによって産生される抗体をもまた包摂し得る。未コンジュゲーションの抗体は有効であり得るが、１つの態様において、ＬＡＰ結合剤は細胞傷害性または化学療法剤または薬にコンジュゲーションされ得る。
【００３２】
本明細書に記載されるように、ＬＡＰ結合剤による処置が腫瘍中のＬＡＰ＋およびＦｏｘＰ３＋Ｔｒｅｇの数を低減するのみならず、腫瘍中のＣＤ８＋細胞傷害性Ｔ細胞の数をもまた増大させるということが発見された。それゆえに、腫瘍中のＣＤ８＋細胞傷害性Ｔ細胞の数を増大させる方法もまた本明細書に記載され、方法は、腫瘍を有する対象にＬＡＰ結合剤を投与することを含む。本明細書に記載されている他のもののように、この側面において、投与されるＬＡＰ結合剤は例えば抗体またはその抗原結合断片を包含し得る。１つの態様において、抗体はモノクローナル抗体またはその抗原結合断片であり得る。別の態様において、抗体またはその抗原結合断片はキメラ、ＣＤＲグラフト、ヒト化、または完全ヒトであり得る。別の態様において、抗体またはその抗原結合断片は重および軽鎖相補性決定領域（ＣＤＲ）の１つ以上、２つ以上、３つ以上、４つ以上、５つ以上、または６つ全てを含み、ａ）配列番号９のアミノ酸配列を有する重鎖ＣＤＲ１、ｂ）配列番号１０のアミノ酸配列を有する重鎖ＣＤＲ２、ｃ）配列番号１１のアミノ酸配列を有する重鎖ＣＤＲ３、ｄ）配列番号１４のアミノ酸配列を有する軽鎖ＣＤＲ１、ｅ）配列番号１５のアミノ酸配列を有する軽鎖ＣＤＲ２、およびｆ）配列番号１６のアミノ酸配列を有する軽鎖ＣＤＲ３を包含する。抗体またはその抗原結合断片は、例えば、ハイブリドーマクローンTW7-28G11によって産生される抗体を包摂する。抗体またはその抗原結合断片は、例えば、本明細書に記載される他の抗ＬＡＰハイブリドーマクローンのいずれかによって産生される抗体をもまた包摂し得る。未コンジュゲーションの抗体は有効であり得るが、１つの態様において、ＬＡＰ結合剤は細胞傷害性または化学療法剤または薬にコンジュゲーションされ得る。
【００３３】
ＣＤ８＋細胞傷害性Ｔ細胞の数および／または活性に及ぼす効果に加えて、ＬＡＰ結合剤による処置が、ＩＦＮγを発現する末梢ＣＤ４＋Ｔ細胞の集団を増大させ得るということもまた発見された。それゆえに、それが必要な対象においてＩＦＮγを発現する末梢ＣＤ４＋Ｔ細胞を増大させる方法もまた本明細書に記載され、方法は、対象にＬＡＰ結合剤を投与することを含む。ＣＤ４＋Ｔ細胞によるＩＦＮγ産生または分泌の測定は当業者に公知であるおよび／または本明細書の他所に記載されている。本明細書に記載されている他のもののように、この側面において、投与されるＬＡＰ結合剤は例えば抗体またはその抗原結合断片を包含し得る。１つの態様において、抗体はモノクローナル抗体またはその抗原結合断片であり得る。別の態様において、抗体またはその抗原結合断片はキメラ、ＣＤＲグラフト、ヒト化、または完全ヒトであり得る。別の態様において、抗体またはその抗原結合断片は重および軽鎖相補性決定領域（ＣＤＲ）の１つ以上、２つ以上、３つ以上、４つ以上、５つ以上、または６つ全てを含み、ａ）配列番号９のアミノ酸配列を有する重鎖ＣＤＲ１、ｂ）配列番号１０のアミノ酸配列を有する重鎖ＣＤＲ２、ｃ）配列番号１１のアミノ酸配列を有する重鎖ＣＤＲ３、ｄ）配列番号１４のアミノ酸配列を有する軽鎖ＣＤＲ１、ｅ）配列番号１５のアミノ酸配列を有する軽鎖ＣＤＲ２、およびｆ）配列番号１６のアミノ酸配列を有する軽鎖ＣＤＲ３を包含する。抗体またはその抗原結合断片は、例えば、ハイブリドーマクローンTW7-28G11によって産生される抗体を包摂する。抗体またはその抗原結合断片は、例えば、本明細書に記載される他の抗ＬＡＰハイブリドーマクローンのいずれかによって産生される抗体をもまた包摂し得る。未コンジュゲーションの抗体は有効であり得るが、１つの態様において、ＬＡＰ結合剤は細胞傷害性または化学療法剤または薬にコンジュゲーションされ得る。
【００３４】
腫瘍中のＣＤ８＋および／またはＣＤ４＋Ｔ細胞による免疫抑制性因子またはマーカーの発現を阻害する方法もまた本明細書に記載され、方法は、腫瘍を有する対象にＬＡＰ結合剤を投与することを含む。腫瘍中のＣＤ８＋およびＣＤ４＋Ｔ細胞によって産生される免疫抑制性因子またはマーカーは、例えばとりわけＰＤ−１、ＬＡＧ３、およびＣＤ１０３を包含し、Ｔ細胞増殖、または例えばＴ細胞受容体刺激または抗原刺激を包含する刺激に対する応答性を阻害する。本明細書に記載されている他のもののように、この側面において、投与されるＬＡＰ結合剤は例えば抗体またはその抗原結合断片を包含し得る。１つの態様において、抗体はモノクローナル抗体またはその抗原結合断片であり得る。別の態様において、抗体またはその抗原結合断片はキメラ、ＣＤＲグラフト、ヒト化、または完全ヒトであり得る。別の態様において、抗体またはその抗原結合断片は重および軽鎖相補性決定領域（ＣＤＲ）の１つ以上、２つ以上、３つ以上、４つ以上、５つ以上、または６つ全てを含み、ａ）配列番号９のアミノ酸配列を有する重鎖ＣＤＲ１、ｂ）配列番号１０のアミノ酸配列を有する重鎖ＣＤＲ２、ｃ）配列番号１１のアミノ酸配列を有する重鎖ＣＤＲ３、ｄ）配列番号１４のアミノ酸配列を有する軽鎖ＣＤＲ１、ｅ）配列番号１５のアミノ酸配列を有する軽鎖ＣＤＲ２、およびｆ）配列番号１６のアミノ酸配列を有する軽鎖ＣＤＲ３を包含する。抗体またはその抗原結合断片は、例えば、ハイブリドーマクローンTW7-28G11によって産生される抗体を包摂する。抗体またはその抗原結合断片は、例えば、本明細書に記載される他の抗ＬＡＰハイブリドーマクローンのいずれかによって産生される抗体をもまた包摂し得る。未コンジュゲーションの抗体は有効であり得るが、１つの態様において、ＬＡＰ結合剤は細胞傷害性または化学療法剤または薬にコンジュゲーションされ得る。
【００３５】
ＬＡＰ結合剤と併せて腫瘍抗原または腫瘍抗原ワクチンを投与することが、抗腫瘍免疫応答を促進するということもまた見いだされた。このアプローチは例えば腫瘍抗原ワクチン治療アプローチを補い得る。それゆえに、抗腫瘍免疫応答を促進する方法もまた本明細書に記載され、方法は、腫瘍抗原によって腫瘍の処置が必要な対象にワクチン接種することと対象にＬＡＰ結合剤を投与することとを含む。腫瘍抗原および腫瘍抗原ワクチンは当分野において公知であり、本明細書の他所に記載されている。本明細書に記載されている他のもののように、この側面において、投与されるＬＡＰ結合剤は例えば抗体またはその抗原結合断片を包含し得る。１つの態様において、抗体はモノクローナル抗体またはその抗原結合断片であり得る。別の態様において、抗体またはその抗原結合断片はキメラ、ＣＤＲグラフト、ヒト化、または完全ヒトであり得る。別の態様において、抗体またはその抗原結合断片は重および軽鎖相補性決定領域（ＣＤＲ）の１つ以上、２つ以上、３つ以上、４つ以上、５つ以上、または６つ全てを含み、ａ）配列番号９のアミノ酸配列を有する重鎖ＣＤＲ１、ｂ）配列番号１０のアミノ酸配列を有する重鎖ＣＤＲ２、ｃ）配列番号１１のアミノ酸配列を有する重鎖ＣＤＲ３、ｄ）配列番号１４のアミノ酸配列を有する軽鎖ＣＤＲ１、ｅ）配列番号１５のアミノ酸配列を有する軽鎖ＣＤＲ２、およびｆ）配列番号１６のアミノ酸配列を有する軽鎖ＣＤＲ３を包含する。抗体またはその抗原結合断片は、例えば、ハイブリドーマクローンTW7-28G11によって産生される抗体を包摂する。抗体またはその抗原結合断片は、例えば、本明細書に記載される他の抗ＬＡＰハイブリドーマクローンのいずれかによって産生される抗体をもまた包摂し得る。未コンジュゲーションの抗体は有効であり得るが、１つの態様において、ＬＡＰ結合剤は細胞傷害性または化学療法剤または薬にコンジュゲーションされ得る。
【００３６】
免疫チェックポイント阻害剤による癌処置は、免疫の攻撃を回避するために腫瘍によって活用される免疫抑制を克服することに有効であり得るが、癌のいくつかの型はチェックポイント阻害剤による処置に不応性であるか、またはそうなり得る。例えば、とりわけ、ある種の膠芽腫、メラノーマ、および大腸癌腫を包含するある種の癌は、ＰＤ−１およびその受容体の阻害剤による処置に不応性である傾向がある。ＬＡＰ結合剤による処置はこれらの癌において抗腫瘍免疫応答を促進するために有効であり得、かかる処置はチェックポイント阻害剤（単数または複数）に対するかかる癌の感受性をもまた回復させるかまたは確立し得るということが企図される。それゆえに、免疫チェックポイント阻害剤による処置に不応性である癌を処置する方法が本明細書に記載され、方法はかかる癌を有する対象にＬＡＰ結合剤を投与することを含む。本明細書に記載されている他のもののように、この側面において、投与されるＬＡＰ結合剤は例えば抗体またはその抗原結合断片を包含し得る。１つの態様において、抗体はモノクローナル抗体またはその抗原結合断片であり得る。別の態様において、抗体またはその抗原結合断片はキメラ、ＣＤＲグラフト、ヒト化、または完全ヒトであり得る。別の態様において、抗体またはその抗原結合断片は重および軽鎖相補性決定領域（ＣＤＲ）の１つ以上、２つ以上、３つ以上、４つ以上、５つ以上、または６つ全てを含み、ａ）配列番号９のアミノ酸配列を有する重鎖ＣＤＲ１、ｂ）配列番号１０のアミノ酸配列を有する重鎖ＣＤＲ２、ｃ）配列番号１１のアミノ酸配列を有する重鎖ＣＤＲ３、ｄ）配列番号１４のアミノ酸配列を有する軽鎖ＣＤＲ１、ｅ）配列番号１５のアミノ酸配列を有する軽鎖ＣＤＲ２、およびｆ）配列番号１６のアミノ酸配列を有する軽鎖ＣＤＲ３を包含する。抗体またはその抗原結合断片は、例えば、ハイブリドーマクローンTW7-28G11によって産生される抗体を包摂する。抗体またはその抗原結合断片は、例えば、本明細書に記載される他の抗ＬＡＰハイブリドーマクローンのいずれかによって産生される抗体をもまた包摂し得る。未コンジュゲーションの抗体は有効であり得るが、１つの態様において、ＬＡＰ結合剤は細胞傷害性または化学療法剤または薬にコンジュゲーションされ得る。１つの態様において、方法は、免疫チェックポイント阻害剤を投与することをさらに含み、これは癌が不応性であったチェックポイント阻害剤を包含し得るが、これに限定されない。１つの態様において、癌は膠芽腫、大腸癌腫、またはメラノーマである。１つの態様において、ＬＡＰ結合剤による処置の前に、癌はＰＤ−１またはＰＤ−Ｌ１阻害剤に不応性である。
【００３７】
ＬＡＰ結合剤による処置が腫瘍免疫抑制を克服することに有効であり得るということが本明細書において示されているところでは、患者が処置のためにおよび／または予想もしくは予測される処置有効性のために選択される方法もまた本明細書に記載され、患者の腫瘍中に存在するＬＡＰ＋Ｔｒｅｇの存在（検出）および／または量（定量的検出）に基づく。結果として、ＬＡＰ＋Ｔｒｅｇが存在するおよび／または参照と相対的に有意な数で存在する場合には、患者は本明細書に記載されるＬＡＰ結合剤による処置に応答する可能性がより高いであろう。それゆえに、ＬＡＰ結合剤による療法に応答する可能性が高い腫瘍を有する患者を同定または選択するための方法もまた本明細書に記載され、方法は、対象からの腫瘍サンプルを解析してＬＡＰ＋Ｔ制御性の存在、およびＬＡＰ＋Ｔ制御性細胞が存在するか、または参照と相対的に有意な数で存在するかどうかを決定することを含む。患者の腫瘍がＬＡＰ＋Ｔｒｅｇを有するか、または例えば参照と相対的に有意な数を有する場合には、患者は、ＬＡＰ結合剤による処置に応答する可能性が高い腫瘍を有するとして同定される。かかる患者については、方法は、対象にＬＡＰ結合剤を投与し、それによって抗腫瘍免疫応答を促進することを含む処置をさらに含み得る。１つの例として、参照は、ＬＡＰ結合剤によって有効に処置されたことが既知の腫瘍中に存在するＬＡＰ＋Ｔｒｅｇ細胞の数であり得る。この態様において、患者の腫瘍中のＬＡＰ＋Ｔｒｅｇ細胞の数が例えばかかる参照の少なくとも２０％以上（すなわち、その用語が本明細書において用いられる参照と相対的に有意な数）である場合には、患者は、患者の腫瘍中の数がそのレベルよりも下であった場合よりも、ＬＡＰ結合剤による処置に応答する可能性が高いであろう。患者の腫瘍がＬＡＰ＋Ｔｒｅｇを有さないことが見いだされるか、または参照と相対的にＬＡＰ＋Ｔｒｅｇの大分より低レベルを有することが見いだされる場合には、ＬＡＰ結合剤による処置が処置を容易化することがなお可能であり得るが、レベルがより高いところよりも可能性が低い。かかる場合に、患者はＬＡＰ結合剤に応答する可能性が低いとして同定され、他の治療アプローチ、例えば患者にＬＡＰ結合剤以外の免疫調節または抗腫瘍剤を投与することが考えられるかまたは実施され得る。かかる治療アプローチの限定しない例は、例えば、免疫チェックポイント阻害剤、化学療法剤、および／またはガンマ放射線を投与することを包含し得る。
【００３８】
本明細書に記載されている他のもののように、この側面において、投与されるＬＡＰ結合剤は例えば抗体またはその抗原結合断片を包含し得る。１つの態様において、抗体はモノクローナル抗体またはその抗原結合断片であり得る。別の態様において、抗体またはその抗原結合断片はキメラ、ＣＤＲグラフト、ヒト化、または完全ヒトであり得る。別の態様において、抗体またはその抗原結合断片は重および軽鎖相補性決定領域（ＣＤＲ）の１つ以上、２つ以上、３つ以上、４つ以上、５つ以上、または６つ全てを含み、ａ）配列番号９のアミノ酸配列を有する重鎖ＣＤＲ１、ｂ）配列番号１０のアミノ酸配列を有する重鎖ＣＤＲ２、ｃ）配列番号１１のアミノ酸配列を有する重鎖ＣＤＲ３、ｄ）配列番号１４のアミノ酸配列を有する軽鎖ＣＤＲ１、ｅ）配列番号１５のアミノ酸配列を有する軽鎖ＣＤＲ２、およびｆ）配列番号１６のアミノ酸配列を有する軽鎖ＣＤＲ３を包含する。抗体またはその抗原結合断片は、例えば、ハイブリドーマクローンTW7-28G11によって産生される抗体を包摂する。抗体またはその抗原結合断片は、例えば、本明細書に記載される他の抗ＬＡＰハイブリドーマクローンのいずれかによって産生される抗体をもまた包摂し得る。未コンジュゲーションの抗体は有効であり得るが、１つの態様において、ＬＡＰ結合剤は細胞傷害性または化学療法剤または薬にコンジュゲーションされ得る。
【００３９】
メモリーＴ細胞のマーカーが、ＬＡＰ結合剤を用いる腫瘍の処置後に上方制御されるということもまた発見された。それゆえに、それが必要な対象において関心の抗原に特異的なメモリーＴ細胞の形成を促進する方法もまた本明細書に記載され、方法は、対象にＬＡＰ結合剤と関心の抗原とを投与することを含む。１つの態様において、ＬＡＰ結合剤による処置は、増大したＣＤ４４＋および／または増大したＩＬ７Ｒ＋Ｔ細胞をもたらす。このアプローチは、腫瘍抗原に対する応答のためのメモリーを促進および維持することのみならず、感染性病原体に対する応答のためのメモリーを促進および維持することにおいてもまた利益を提供し得るということが企図される。関心の抗原は、精製抗原または全腫瘍型抗原調製物などのよりクルードな抗原調製物であり得、それのみで、アジュバントと、または樹状細胞ワクチンの形態で投与され得る。本明細書に記載されている他のもののように、この側面において、投与されるＬＡＰ結合剤は例えば抗体またはその抗原結合断片を包含し得る。１つの態様において、抗体はモノクローナル抗体またはその抗原結合断片であり得る。別の態様において、抗体またはその抗原結合断片はキメラ、ＣＤＲグラフト、ヒト化、または完全ヒトであり得る。別の態様において、抗体またはその抗原結合断片は重および軽鎖相補性決定領域（ＣＤＲ）の１つ以上、２つ以上、３つ以上、４つ以上、５つ以上、または６つ全てを含み、ａ）配列番号９のアミノ酸配列を有する重鎖ＣＤＲ１、ｂ）配列番号１０のアミノ酸配列を有する重鎖ＣＤＲ２、ｃ）配列番号１１のアミノ酸配列を有する重鎖ＣＤＲ３、ｄ）配列番号１４のアミノ酸配列を有する軽鎖ＣＤＲ１、ｅ）配列番号１５のアミノ酸配列を有する軽鎖ＣＤＲ２、およびｆ）配列番号１６のアミノ酸配列を有する軽鎖ＣＤＲ３を包含する。抗体またはその抗原結合断片は、例えば、ハイブリドーマクローンTW7-28G11によって産生される抗体を包摂する。抗体またはその抗原結合断片は、例えば、本明細書に記載される他の抗ＬＡＰハイブリドーマクローンのいずれかによって産生される抗体をもまた包摂し得る。未コンジュゲーションの抗体は有効であり得るが、１つの態様において、ＬＡＰ結合剤は細胞傷害性または化学療法剤または薬にコンジュゲーションされ得る。
【００４０】
本明細書には、
●ＬＡＰ＋Ｔ制御性細胞の望ましくない数または活性を特徴とするかまたはそれが関わる疾患または障害の処置、
●腫瘍中の腫瘍に浸潤した免疫抑制性Ｔ細胞の数または活性を減少させることによる癌の処置であって、使用が、腫瘍に浸潤した免疫抑制性Ｔ細胞を含む腫瘍を有する対象にＬＡＰ結合剤を投与することを含み、それによって、かかる細胞の数または活性が減少すること、
●腫瘍特異的免疫を増大させることによる癌の処置であって、使用が、それが必要な対象にＬＡＰ結合剤の治療有効量を投与することを含むこと、
●ＬＡＰ発現および／または活性が癌または腫瘍特異的免疫の抑制に関連する癌または腫瘍の処置であって、使用が、それが必要な対象にＬＡＰ結合剤の治療有効量を投与することを含むこと、
●腫瘍中のＣＤ８＋細胞傷害性Ｔ細胞の数を増大させることによる、癌または腫瘍の処置であって、使用が、腫瘍を有する対象にＬＡＰ結合剤を投与することを含むこと、
●それが必要な対象において、ＩＦＮγを発現する末梢ＣＤ４＋Ｔ細胞を増大させることによる、癌または腫瘍の処置であって、使用が、対象にＬＡＰ結合剤を投与することを含むこと、
●それが必要な対象において、グランザイムＢを発現する末梢ＣＤ８＋Ｔ細胞を増大させることによる、癌または腫瘍の処置であって、使用が、対象にＬＡＰ結合剤を投与することを含むこと、
●腫瘍中のＦｏｘＰ３＋制御性Ｔ細胞の数を減少させることによる、癌または腫瘍の処置であって、使用が、対象にＬＡＰ結合剤を投与することを含むこと、
●腫瘍中のＣＤ８＋および／またはＣＤ４＋Ｔ細胞による免疫抑制性因子の発現を阻害することによる、癌または腫瘍の処置であって、使用が、腫瘍を有する対象にＬＡＰ結合剤を投与することを含むこと、
●抗腫瘍免疫応答を促進することであって、使用が、腫瘍抗原によって腫瘍の処置が必要な対象にワクチン接種することと対象にＬＡＰ結合剤を投与することとを含むこと、
●免疫チェックポイント阻害剤による処置に不応性である癌を処置することであって、使用が、かかる癌を有する対象にＬＡＰ結合剤を投与することを含むこと、
●癌を処置することであって、使用が、対象からの腫瘍サンプルを解析してＬＡＰ＋Ｔ制御性細胞の存在を決定することと、ＬＡＰ＋Ｔ制御性細胞が存在する場合には、対象にＬＡＰ結合剤を投与し、それによって抗腫瘍免疫応答を促進することとを含むこと、
●対象の癌または感染の処置のために、関心の抗原に特異的なメモリーＴ細胞の形成を促進することであって、使用が、対象にＬＡＰ結合剤と関心の抗原とを投与することを含むこと、
のためのＬＡＰ結合剤の使用もまた記載される。
【００４１】
本明細書に記載される側面のそれぞれにおいて、ＬＡＰ結合剤は、例えば、配列番号１〜３のいずれか１つに示される配列を有するＬＡＰ分子に特異的に結合するものであり得る。
【００４２】
本明細書に記載される側面のそれぞれの１つの態様において、抗体またはその抗原結合断片は、例えば、ＬＡＰリガンド相互作用部位に結合するものであり得る。ＬＡＰリガンド相互作用部位は、例えば、成熟ＴＧＦβと相互作用する部位、インテグリンと相互作用する部位、および／または潜在型ＴＧＦβ結合蛋白質（ＬＴＢＰ）と相互作用する部位であり得る。
【００４３】
本明細書に記載される側面のそれぞれの１つの態様において、ＬＡＰ結合剤はＴＧＦ−βと複合体化したＬＡＰに結合し、複合体からのＴＧＦ−βの放出を阻害する。
【００４４】
本明細書に記載される側面のそれぞれの１つの態様において、モノクローナル抗体は、TW4-9E7、TW4-5A8、TW4-3E5、TW4-4E5、TW4-12B12、TW4-13B12、TW4-1G12、TW4-3G5、TW4-2F8、TW4-6H10、TW4-1G2、TW4-1E1、TW4-16F4、TW4-8F10、TW4-3H6、TW4-2C9、TW7-16B4、TW7-28G11、TW7-7H4、およびTW7-20B9から選択されるハイブリドーマクローンのいずれか１つによって産生されるものである。
【００４５】
本明細書に記載される側面のそれぞれの１つの態様において、ＬＡＰ結合剤は小分子阻害剤、薬剤、または化合物である。
【００４６】
本明細書に記載される側面のそれぞれの１つの態様において、ＬＡＰ結合剤は、ＬＡＰと結合または物理的に相互作用するＲＮＡまたはＤＮＡアプタマーである。
【００４７】
本明細書に記載される方法のそれぞれの１つの態様において、対象は癌を有するか、またはそれと診断されている。
【００４８】
本明細書に記載される方法のそれぞれの１つの態様において、対象は脳腫瘍、メラノーマ、もしくは大腸癌を有するか、またはそれと診断されている。１つの態様において、脳腫瘍は膠芽腫である。
【００４９】
本明細書に記載される治療方法のそれぞれの１つの態様において、方法は、対象に抗癌療法、化学療法、または免疫調節剤を投与することをさらに含む。１つの態様において、免疫調節剤は免疫チェックポイント阻害剤を含む。１つの態様において、免疫チェックポイント阻害剤は次のＰＤ１、ＰＤＬ１、ＰＤＬ２、ＣＴＬＡ４、ＬＡＧ３、ＴＩＭ３、ＴＩＧＩＴ、および／またはＣＤ１０３の１つ以上に結合する。１つの態様において、免疫チェックポイント阻害剤は、ペムブロリズマブ、ニボルマブ、MK-3475、MPDL3280A、MEDI0680、MEDI4736、AMP-224、およびMSB0010718Cから選択されるＰＤ１、ＰＤＬ１、および／またはＰＤＬ２阻害剤である。
【００５０】
本明細書に記載される治療方法のそれぞれの１つの態様において、方法は、対象に化学療法剤を投与することをさらに含む。
【００５１】
本明細書に記載される治療方法のそれぞれの１つの態様において、方法は、対象に腫瘍または癌抗原を投与することをさらに含む。１つの態様において、方法は、樹状細胞（ＤＣ）ワクチン接種と同時にまたは組み合わせでＬＡＰ結合剤を投与することを含む。
【００５２】
本明細書に記載される治療方法のそれぞれの１つの態様において、ＬＡＰ結合剤は、本明細書に記載される単離された抗体もしくはその抗原結合断片、またはかかる抗体もしくはその抗原結合断片を含む医薬組成物である。
【００５３】
定義
本明細書において別様に定義されない限り、本願とのつながりで用いられる科学および技術用語は、本開示が属する分野の業者によって一般に理解される意味を有するものとする。本発明が本明細書に記載される特定の方法論、プロトコール、および試薬などに限定されず、つまり変わり得るということは理解されるべきである。本明細書において用いられる術語は特定の態様を記載する目的のためのみであり、もっぱら請求項によって定義される本発明の範囲を限定することは意図されていない。免疫学および分子生物学における一般の用語の定義はThe Merck Manual of Diagnosis and Therapy, 18th Edition, published by Merck Research Laboratories, 2006 (ISBN 0-911910-18-2)、Robert S. Porter et al. (eds.), The Encyclopedia of Molecular Biology, published by Blackwell Science Ltd., 1994 (ISBN 0-632-02182-9)、およびRobert A. Meyers (ed.), Molecular Biology and Biotechnology: a Comprehensive Desk Reference, published by VCH Publishers, Inc., 1995 (ISBN 1-56081-569-8)、Immunology by Werner Luttmann, published by Elsevier, 2006に見いだされ得る。分子生物学における一般の用語の定義はBenjamin Lewin, Genes IX, published by Jones & Bartlett Publishing, 2007 (ISBN-13: 9780763740634)、Kendrew et al. (eds.), The Encyclopedia of Molecular Biology, published by Blackwell Science Ltd., 1994 (ISBN 0-632-02182-9)、およびRobert A. Meyers (ed.), Maniatis et al., Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, N.Y., USA (1982)、Sambrook et al., Molecular Cloning: A Laboratory Manual (2 ed.), Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, N.Y., USA (1989)、Davis et al., Basic Methods in Molecular Biology, Elsevier Science Publishing, Inc., New York, USA (1986)、またはMethods in Enzymology: Guide to Molecular Cloning Techniques Vol.152, S. L. Berger and A. R. Kimmerl Eds., Academic Press Inc., San Diego, USA (1987)、Current Protocols in Molecular Biology (CPMB) (Fred M. Ausubel, et al. ed., John Wiley and Sons, Inc.)、Current Protocols in Protein Science (CPPS) (John E. Coligan, et. al., ed., John Wiley and Sons, Inc.)、およびCurrent Protocols in Immunology (CPI) (John E. Coligan, et. al., ed. John Wiley and Sons, Inc.)に見いだされ、これらは全てそれらの全体として本明細書に参照によって組み込まれる。
【００５４】
本明細書において用いられる用語「ＬＡＰ結合剤」は、ＬＡＰに特異的に結合し、ＬＡＰおよびそのリガンドまたはＬＡＰと相互作用する分子のいずれかの間の相互作用を有意に調節する分子または薬剤を言い、結果的に、それらの結果的な生物学的または機能的活性をインビトロ、インサイチュ、および／またはインビボで調節する（例えば、小型潜在型複合体または潜在型複合体からのＴＧＦ−β放出、免疫応答のＬＡＰによって媒介される阻害、および抗腫瘍免疫応答のＬＡＰによって媒介される阻害などの、ＬＡＰシグナル伝達によって媒介される下流経路の活性を包含する）。本明細書に記載される種々の側面および態様への使用を企図される例示的なＬＡＰ結合剤は、ＬＡＰおよびＴＧＦ−β、ＬＡＰおよびインテグリン、および／またはＬＡＰおよびＬＴＢの結合および／または相互作用に関わるＬＡＰ上の１つ以上のアミノ酸残基またはエピトープ（ＴＧＦ−βがＬＡＰＰに結合したときに形成されるエピトープを包含する）に特異的に結合し、ならびに／あるいはＬＡＰホモ二量体化および／または結合を調節する抗体あるいはその抗原結合断片と、ＬＡＰおよびＴＧＦβ、ＬＡＰおよびインテグリン、および／またはＬＡＰおよびＬＴＢＰ、および／またはＬＡＰおよびＧＡＲＰの結合および／または相互作用に関わるＬＡＰ上の１つ以上のアミノ酸残基またはエピトープを標的化または特異的に結合し、ならびに／あるいはＬＡＰホモ二量体化および／または結合を調節する小分子薬剤と、ＬＡＰおよびＴＧＦβ、ＬＡＰおよびインテグリン、および／またはＬＡＰおよびＬＴＢＰの結合および／または相互作用に関わるＬＡＰ上の１つ以上のアミノ酸残基またはエピトープに結合し、ならびに／あるいはＬＡＰのホモ二量体化および／または結合を調節するＲＮＡあるいはＤＮＡアプタマーとを包含するが、これに限定されない。本明細書に記載される側面の好ましい態様において、ＬＡＰ結合剤はＬＡＰに特異的に結合し、小型潜在型複合体または潜在型複合体からのＴＧＦ−β放出を阻害またはブロックする。
【００５５】
本明細書において用いられるＬＡＰ結合剤は、ＬＡＰおよびＴＧＦ−β、ＬＡＰおよびインテグリン、および／またはＬＡＰおよびＬＴＢＰの間の相互作用を調節し、ならびに／あるいはＬＡＰホモ二量体化および／またはそれらの結果的な生物学的もしくは機能的活性を、インビトロ、インサイチュ、および／またはインビボで、ＬＡＰ結合剤の非存在下における相互作用および／または活性と相対的に少なくとも５％、少なくとも１０％、少なくとも２０％、少なくとも３０％、少なくとも４０％、少なくとも５０％、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、またはより多く調節する能力を有する。最低でも、本明細書に記載されるＬＡＰ結合剤は、皮下マウスグリオーマモデルなどの癌モデルにおいて腫瘍によって誘導される免疫抑制をブロックし、ＣＤ４＋Ｔ細胞におけるＩＦＮγのより高発現、制御性ＣＤ４＋Ｔ細胞の低減された数および／もしくは活性、腫瘍への細胞傷害性ＣＤ８＋Ｔ細胞の増大した数および／もしくは浸潤、減少した腫瘍サイズ、ならびに／または前記のモデルの増大した生存に至る。
【００５６】
本明細書において交換可能に用いられる「ＬＡＰおよびＴＧＦ−β／インテグリン／潜在型ＴＧＦ−β結合蛋白質／ＬＡＰの間の相互作用を調節すること」または「ＬＡＰおよびＴＧＦ−β／インテグリン／潜在型ＴＧＦ−β結合蛋白質／ＬＡＰの間の相互作用に影響を与えること」は、一般的に、同じ条件下だがＬＡＰ結合剤の存在なしのＬＡＰおよびＴＧＦ−β／インテグリン／潜在型ＴＧＦ−β結合蛋白質／ＬＡＰの間の相互作用と比較して、ＬＡＰおよびＴＧＦ−β／インテグリン／潜在型ＴＧＦ−β結合蛋白質／ＬＡＰの間の相互作用または結合を、少なくとも５％、少なくとも１０％、少なくとも２５％、少なくとも５０％、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、またはより多く調節すること、すなわち増大または減少させることいずれかを意味する。本明細書に記載される側面の好ましい態様において、ＬＡＰ結合剤は、小型潜在型複合体からのＴＧＦ−βの放出が阻害またはブロックされるようにＬＡＰおよびＴＧＦ−βの間の相互作用を調節し、および／または制御性ＣＤ４＋および／またはＣＤ８＋Ｔ細胞の数および／または活性を低減する。
【００５７】
本明細書において用いられる「腫瘍特異的免疫を増大させること」は、癌もしくは腫瘍を対象とする免疫応答を直接的に増大させるかまたは増幅すること、および／または癌もしくは腫瘍に対する免疫応答の抑制を除去することを言い、例えば、癌特異的抗原の認識を増大させること、腫瘍浸潤リンパ球（例えばＣＤ４およびＣＤ８Ｔ細胞）および／または腫瘍浸潤自然免疫細胞（例えば、腫瘍部位へのナチュラルキラー細胞、ナチュラルキラーＴ細胞、マクロファージ、および樹状細胞）の数および／または活性を増大させること、腫瘍／癌部位におけるサイトカインおよび／またはケモカイン産生を増大させるかまたは増幅すること（例えば、ＩＦＮγ、ＣＸＣＬ１０、ＣＸＣＬ９、およびＣＸＣＬ１１、ＩＬ−１７、ＩＬ−１２）、ＬＡＧ３およびＰＤ１などの免疫阻害分子を減少させる／抑制すること、Ｔ制御性細胞（Ｆｏｘｐ３＋ＣＤ４Ｔ細胞およびＣＤ１０３＋ＣＤ８Ｔ細胞などを包含する）などの制御性細胞集団を減少させる／抑制することを包含するが、これに限定されない。この文脈および本明細書の他のものにおいて、「増大させること」は、最低限でも、参照と相対的に統計的に有意な増大、好ましくは少なくとも１０％以上を言う。
【００５８】
本明細書において用いられる言い回し「ＬＡＰ発現および／または活性が癌または腫瘍特異的免疫の抑制に関連する癌または腫瘍」は、ＬＡＰの発現および／または活性が癌または腫瘍特異的免疫の抑制と相関することが決定された癌／腫瘍を言う。換言すると、ＬＡＰの発現および／または活性が、癌特異的抗原の減少した認識、腫瘍部位へのナチュラルキラー細胞、ナチュラルキラーＴ細胞、マクロファージ、および樹状細胞などの腫瘍浸潤リンパ球（例えばＣＤ４およびＣＤ８Ｔ細胞）および／または腫瘍浸潤自然免疫細胞の数および／または活性の欠如または低減、ＩＦＮγ、ＣＸＣＬ１０、ＣＸＣＬ９およびＣＸＣＬ１１、ＩＬ−１７、ＩＬ−１２などの、腫瘍／癌部位における減少したまたは存在しないサイトカインおよび／またはケモカイン産生、ＬＡＧ３およびＰＤ１などの免疫阻害分子の増大した発現、例えばＦｏｘｐ３＋ＣＤ４Ｔ細胞およびＣＤ１０３＋ＣＤ８Ｔ細胞を包含するＴ制御性細胞などの制御性細胞集団の増大した存在と相関する癌または腫瘍である。
【００５９】
本明細書において用いられる抗体またはその抗原結合断片は、モノクローナル、ヒト、ヒト化もしくはキメラ抗体、一本鎖抗体、Ｆａｂ断片、Ｆ（ａｂ’）断片、Ｆａｂ発現ライブラリーによって産生される断片、および／または上のいずれかの抗原結合断片を包含する。抗体は、免疫グロブリン分子および免疫グロブリン分子の免疫活性な部分、すなわち、抗原もしくは標的結合部位を含有する分子または「抗原結合断片」をもまた言う。本明細書に記載される免疫グロブリン分子は、当業者によって理解されるように、免疫グロブリン分子のいずれかの型（例えばＩｇＧ、ＩｇＥ、ＩｇＭ、ＩｇＤ、ＩｇＡ、およびＩｇＹ）、クラス（例えばＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３、ＩｇＧ４、ＩｇＡ１、およびＩｇＡ２）、またはサブクラスであり得る。
【００６０】
用語「抗体断片」または「抗原結合断片」は、限定なしに、（ｉ）ＶＬ、ＣＬ、ＶＨ、およびＣＨ１ドメインを有するＦａｂ断片、（ｉｉ）ＣＨ１ドメインのＣ末端に１つ以上のシステイン残基を有するＦａｂ断片である、Ｆａｂ’断片、（ｉｉｉ）ＶＨおよびＣＨ１ドメインを有するＦｄ断片、（ｉｖ）ＶＨおよびＣＨ１ドメインとＣＨ１ドメインのＣ末端に１つ以上のシステイン残基とを有するＦｄ’断片、（ｖ）抗体の単一のアームのＶＬおよびＶＨドメインを有するＦｖ断片、（ｖｉ）ＶＨドメインまたはＶＬドメインからなるｄＡｂ断片（Ward et al., Nature 341, 544-546 (1989)）、（ｖｉｉ）単離されたＣＤＲ領域、（ｖｉｉｉ）Ｆ（ａｂ’）２断片、ヒンジ領域においてジスルフィドブリッジによってリンクされた２つのＦａｂ’断片を包含する二価断片、（ｉｘ）一本鎖抗体分子（例えば一本鎖Ｆｖ、ｓｃＦｖ）（Bird et al., Science 242:423-426 (1988)およびHuston et al., PNAS (USA) 85:5879-5883 (1988)）、（ｘ）同じポリペプチド鎖中の軽鎖可変ドメイン（ＶＬ）につながれた重鎖可変ドメイン（ＶＨ）を含む２つの抗原結合部位を有する、「ダイアボディ」（例えばＥＰ４０４，０９７、ＷＯ９３／１１１６１、およびHollinger et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 90:6444-6448 (1993)参照）、（ｘｉ）相補的な軽鎖ポリペプチドと一緒になって抗原結合領域のペアを形成するタンデムなＦｄセグメントのペア（ＶＨ−ＣＨ１−ＶＨ−ＣＨ１）を含む、「リニア抗体」（Zapata et al. Protein Eng. 8(10): 1057-1062 (1995)およびＵ．Ｓ．Ｐａｔ．Ｎｏ．５，６４１，８７０）、ならびに抗原結合活性を保持する前述のいずれかの改変バージョン（例えば、ポリアルキレングリコール（例えばポリエチレングリコール、ポリプロピレングリコール、ポリブチレングリコール）または他の好適なポリマーの共有結合的な取り付けによって改変される）を包含する。
【００６１】
本明細書において用いられる「エピトープ」は、連続的なアミノ酸、または蛋白質の三次構造折り畳みによって並列した非連続的なアミノ酸両方から形成され得る。連続的なアミノ酸から形成されるエピトープは、変性溶媒への暴露において典型的には保持され、その一方で、三次構造折り畳みによって形成されるエピトープは、変性溶媒による処置によって典型的には失われる。エピトープは、典型的には、少なくとも３、より通常では少なくとも５、約９、または約８〜１０アミノ酸をユニークな空間的コンフォメーションで包含する。「エピトープ」は、免疫グロブリンＶＨ／ＶＬペアによって従来結合される構造のユニットを包含する。エピトープは抗体に対する最低限の結合部位を定義し、それゆえに抗体の特異性の標的を表す。シングルドメイン抗体のケースでは、エピトープは、単独の可変ドメインによって結合される構造のユニットを表す。用語「抗原性決定基」および「エピトープ」もまた本明細書において交換可能に用いられ得る。
【００６２】
用語「特異性」、「特異的に結合する」または「に特異的」は、特定の抗体またはその抗原結合断片が結合し得る抗原または抗原性決定基の異なる型の数を言う。従って、本明細書において定義される抗体またはその抗原結合断片は、それが、前記のアミノ酸配列またはポリペプチドが別の標的またはポリペプチドに結合する親和性よりも、少なくとも５０倍、例えば少なくとも１００倍、好ましくは少なくとも１０００倍、最大で１０，０００倍以上良好である親和性（例えばＫＤ値として本明細書に記載され、好適に表現される）で第１の抗原に結合するときに、第２の標的または抗原と比較して、第１の標的または抗原「に特異的」であると言われる。好ましくは、抗体またはその抗原結合断片が別の標的または抗原と比較してある標的または抗原に「特異的」であるときには、それは別の標的または抗原ではなく前記の標的または抗原に結合し得る。
【００６３】
本明細書において用いられる「小分子阻害剤」は、小さいペプチドもしくはペプチド様分子、可溶性のペプチド、および合成非ペプチジル有機または無機化合物を包含するが、これに限定されない。小分子阻害剤またはアンタゴニストは約１００から約２０，０００ダルトン（Ｄａ）、約５００から約１５，０００Ｄａ、約１０００から約１０，０００Ｄａのいずれかの分子量を有し得る
【図面の簡単な説明】
【００６４】
図の簡単な説明
【図１】図１Ａ〜１ＥはＧＢＭ中の免疫細胞におけるＬＡＰ発現を示している。単核細胞を、頭蓋内ＧＢＭからパーコール勾配分離に従って単離した。表面ＬＡＰ発現のレベルを骨髄系細胞（図１Ａ）、γδＴ細胞（図１Ｂ）、およびＣＤ４Ｔ細胞（図１Ｃ）において決定した。ＬＡＰおよびＦｏｘＰ３の共発現をＧＢＭ中のＣＤ４Ｔ細胞において調べた（図１Ｄ）。図１Ｅ．ＧＢＭマウスの脾臓におけるγδＴ細胞におけるＬＡＰの発現。＊ｐ＜０．０５
【００６５】
【図２】図２Ａ〜２Ｄは、ＬＡＰ＋γδＴ細胞が免疫抑制性特性を見せるということを示している。炎症性サイトカインの発現を、ナイーブマウスのＬＡＰ−およびＬＡＰ＋γδＴ細胞においてｑＲＴ−ＰＣＲ（図２Ａ）およびフローサイトメトリー（図２Ｂ）によって解析した。ＬＡＰ＋γδＴ細胞はナイーブマウスにおいてＴ細胞増殖を抑制し（図２Ｃ）、ＦｏｘＰ３発現を誘導する（図２Ｄ）。
【００６６】
【図３】図３Ａ〜３Ｂは、グリオーマによるγδＴ細胞におけるＬＡＰ発現の誘導を示している。ＬＡＰ−γδＴ細胞を単独で育てるか、またはＧＬ２６１グリオーマ細胞と共培養した。２および３日後に、ＬＡＰ発現をγδＴ細胞において解析した。両方の時点の代表的な結果（図３Ａ）および３日間のインキュベーションの統計解析（図３Ｂ）を示す。＊ｐ＜０．０５
【００６７】
【図４】図４Ａ〜４Ｂは、抗ＬＡＰ処置が免疫系を炎症促進性応答へと傾斜させるということを示している。ナイーブマウスを抗ＬＡＰまたはＩＣ抗体によって処置した。Ｔ細胞を脾臓および腸間膜リンパ節（ＭＬＮ）から単離し、Ｔ細胞増殖を測定した（図４Ａ）。単離されたＴ細胞を活性化し、細胞がＩＦＮ−γ、ＩＬ１７、およびＩＬ−２を産生するポテンシャルを決定するためのサイトカイン分泌をＥＬＩＳＡによって概算した（図４Ｂ）。
【００６８】
【図５】図５Ａ〜５Ｋは、抗ＬＡＰ処置が皮下グリオーマ成長を排除し、免疫系を活性化するということを示している。ＧＬ２６１グリオーマ細胞をＣ５７ＢＬ／６マウスの側腹に移植し、抗ＬＡＰまたはアイソタイプマッチしたコントロール（ＩＣ）抗体によって処置した。抗ＬＡＰ処置後に、腫瘍は縮小し（図５Ａおよび５Ｂ）、末梢Ｔｈ１応答は増大し（図５Ｃ）、制御性Ｔ細胞は減少し（図５Ｄ〜５Ｆ、５Ｋ）、ＣＴＬ応答は上方制御された（図５Ｇ〜５Ｊ）。＊ｐ＜０．０５、＊＊ｐ＜０．０１、＊＊＊＊ｐ＜０．０００１
【００６９】
【図６】図６は、ＬＡＰ発現が、抗ＬＡＰ処置されたメラノーマ保有マウスのＴ細胞サブセットにおいて低減されているということを示している。
【００７０】
【図７】図７は、ＣＤ４＋Ｔ細胞が、抗ＬＡＰ処置されたメラノーマ保有マウスにおいて炎症促進性表現型を見せるということを示している。
【００７１】
【図８】図８は、ＣＤ８＋Ｔ細胞が抗ＬＡＰ処置されたメラノーマ保有マウスにおいて炎症促進性表現型を見せるということを示している。
【００７２】
【図９】図９は、ＮＫ細胞が、抗ＬＡＰ処置されたメラノーマ保有マウスにおいて炎症促進性表現型を見せるということを示している。
【００７３】
【図１０】図１０は、抗ＬＡＰ処置されたマウスのＬＮから単離された免疫細胞がより良好に増殖するということを示している。ＯＶＡの１００μｇ／ｍｌによるインビトロ刺激の３日間の後の、ＯＶＡ−メラノーマ腫瘍保有マウスの鼠径リンパ節細胞の増殖。
【００７４】
【図１１】図１１は、抗ＬＡＰ処置されたマウスのＬＮから単離された免疫細胞が炎症促進性プロファイルを有するということを示している。ＯＶＡの１００μｇ／ｍｌによるインビトロ刺激の３日間の後の、ＯＶＡ−メラノーマ腫瘍保有マウスの鼠径リンパ節細胞のサイトカイン産生（ＥＬＩＳＡによる）。
【００７５】
【図１２】図１２はＣＤ４＋Ｔ細胞におけるＬＡＰ発現を示している。
【００７６】
【図１３】図１３はＣＤ１６＋ＣＤ１４＋におけるＬＡＰ発現を示している。
【００７７】
【図１４】図１４は、ＣＤ１１ｂ＋ＣＤ１４＋ＣＤ１６−−（古典的単球。Ly6C--hiに似る）におけるＬＡＰ発現を示している。
【００７８】
【図１５】図１５はＣＤ１１ｂ＋ＣＤ１４＋ＣＤ１６−−（古典的単球。Ly6C--hiに似る）におけるＬＡＰ発現を示している。
【００７９】
【図１６】図１６はＬｉｎ−ＣＤ１１ｃ＋（ｍＤＣ）におけるＬＡＰ発現を示している。
【００８０】
【図１７】図１７はＬｉｎ−ＣＤ１１ｃ−ＣＤ１２３＋（ｐＤＣ）のゲーティングを示している。
【００８１】
【図１８】図１８はＬｉｎ−ＣＤ１１ｃ−ＣＤ１２３＋（ｐＤＣ）におけるＬＡＰ発現を示している。
【００８２】
【図１９】図１９は脾臓におけるＣＤ４＋Ｔ細胞におけるＬＡＰ発現を図示している。
【００８３】
【図２０】図２０は、ＩＦＮ−γ発現が抗ＬＡＰ処置後の脾臓のＣＤ４＋Ｔ細胞においてより高いということを示している。
【００８４】
【図２１】図２１は、制御性ＣＤ４＋Ｔ細胞の数が抗ＬＡＰ処置後の脾臓において低減されているということを示している。
【００８５】
【図２２】図２２は、ＣＤ１０３発現が抗ＬＡＰ処置後の脾臓のＣＤ４＋Ｔ細胞において減少しているということを示している。
【００８６】
【図２３】図２３は、抗ＬＡＰ処置後の脾臓のＣＤ８＋Ｔ細胞におけるＬＡＰ発現を示している。
【００８７】
【図２４】図２４は、抗ＬＡＰ処置後の脾臓のＣＤ８＋Ｔ細胞の細胞傷害性表現型の増大を示している。
【００８８】
【図２５】図２５は、ＣＤ８＋Ｔ細胞におけるＩＦＮ−γ発現が抗ＬＡＰ処置後の脾臓においてより高いということを示している。
【００８９】
【図２６】図２６は、ＣＤ１０３発現が抗ＬＡＰ処置後の脾臓のＣＤ８＋Ｔ細胞においてより低いということを示している。
【００９０】
【図２７】図２７は、抗ＬＡＰ処置後の流入領域リンパ節（ＬＮ）におけるＴ細胞サブセットの割合を示している。
【００９１】
【図２８】図２８は、ＣＤ１０３発現が抗ＬＡＰ処置後のＬＮのＣＤ８＋Ｔ細胞においてより低いということを示している。
【００９２】
【図２９】図２９は、ＭＨＣクラスＩＩ発現が抗ＬＡＰ処置後の脾臓のＣＤ１１ｃおよびＣＤ１１ｂ細胞において増大するということを示している。
【００９３】
【図３０】図３０は、脾臓（ナイーブマウス）の骨髄系細胞におけるＬＡＰ発現を示している。
【００９４】
【図３１】図３１は、ＣＤ１０３が主にCD11b-Hi／CD11c-Lo（ナイーブマウス）によって発現されるということを示している。
【００９５】
【図３２】図３２は、抗ＬＡＰ（16B4）処置が、皮下ＧＬ２６１ＧＢＭモデルにおいて脾臓のCD11c-LoおよびCD11c-Hiサブセットの比の変化に至るということを示している。
【００９６】
【図３３】図３３は、皮下ＧＬ２６１ＧＢＭモデルの脾臓において、CD11b-Hi／CD11c-Lo細胞におけるＣＤ１０３発現が抗ＬＡＰによって低減されるということを示している。
【００９７】
【図３４】図３４は、皮下ＧＬ２６１ＧＢＭモデルの脾臓において、CD11b-Hi／CD11c-Lo細胞におけるＣＤ１０３発現が抗ＬＡＰによって低減されるということを示している。
【００９８】
【図３５】図３５は、皮下ＧＬ２６１ＧＢＭモデルの脾臓において、CD11b-Hi／CD11c-Lo細胞におけるＰＤ−Ｌ１発現が抗ＬＡＰによって低減されるということを示している。
【００９９】
【図３６】図３６は、皮下ＧＬ２６１ＧＢＭモデルにおいて、ＧＢＭマウスの脾臓の骨髄系細胞におけるＬＡＰ発現を示している。
【０１００】
【図３７】図３７は、皮下ＧＬ２６１ＧＢＭモデルにおいて、腫瘍中のＣＤ４＋およびＣＤ８＋Ｔ細胞におけるＬＡＰ発現を示している。
【０１０１】
【図３８】図３８は、インビボのＣＤ４＋Ｔ細胞におけるＬＡＰ発現を示している。
【０１０２】
【図３９】図３９は、ＣＤ４＋ＬＡＰ＋Ｔ細胞が抗ＬＡＰ処置後に脾臓において下方制御されているということを示している。
【０１０３】
【図４０】図４０Ａ〜４０Ｂは抗ＬＡＰ抗体がＡＤＣＰおよびＣＤＣを媒介するということを示している。
【０１０４】
【図４１】図４１は、抗ＬＡＰ処置後のＧＢＭにおけるＣＤ８＋Ｔリンパ球の蓄積を示している。
【０１０５】
【図４２】図４２は、抗ＬＡＰ処置後のＧＢＭにおけるＣＤ４＋ＦｏｘＰ３＋Ｔ細胞の減少を示している。
【０１０６】
【図４３】図４３は、抗ＬＡＰ処置後のＧＢＭにおけるＬＡＧ＋ＣＤ４＋Ｔ細胞の減少を示している。
【０１０７】
【図４４】図４４は、抗ＬＡＰ処置後のＧＢＭにおけるＬＡＧ＋ＣＤ８＋Ｔ細胞の減少を示している。
【０１０８】
【図４５】図４５は、抗ＬＡＰ処置後のＧＢＭにおけるＰＤ１＋Ｔ細胞の減少を示している。
【０１０９】
【図４６】図４６は、抗ＬＡＰ処置後のＧＢＭにおけるＰＤ−Ｌ１＋Ｔ細胞の減少を示している。
【０１１０】
【図４７】図４７は、抗ＬＡＰ処置後のＧＢＭにおけるＣＤ１０３＋Ｔ細胞の減少を示している。
【０１１１】
【図４８】図４８は、脾臓のＣＤ４＋Ｔ細胞におけるＣＤ１０３の減少した数を示している。
【０１１２】
【図４９】図４９は、脾臓およびＬＮのＣＤ８＋Ｔ細胞におけるＣＤ１０３の減少した数を示している。
【０１１３】
【図５０】図５０は、B16-OVA保有マウスにおける抗ＬＡＰによる処置が、ＯＶＡ刺激に対するより良好なＴ細胞応答に至るということを示している。
【０１１４】
【図５１】図５１は、全てのヒトおよびマウスＬＡＰアイソフォームの間の配列アラインメントおよび比較を図示している。
【０１１５】
【図５２】図５２は、全てのヒトＬＡＰアイソフォームの間の配列アラインメントおよび比較を図示している。
【０１１６】
【図５３】図５３は、全てのマウスＬＡＰアイソフォームの間の配列アラインメントおよび比較を図示している。
【０１１７】
【図５４】図５４は、全てのヒトおよびマウスプロＴＧＦ−βアイソフォームの間の配列アラインメントおよび比較を図示している。配列番号２５〜３０はそれらの出現の順に開示されている。
【０１１８】
【図５５】図５５Ａ〜５５Ｎは癌モデルにおける抗ＬＡＰ抗体の治療効果を図示している。図５５Ａ、５５Ｂ：メラノーマ、B16、図５５Ｃ〜５５Ｆ：頭蓋内ＧＢＭ、図５５Ｇ、５５Ｈ：皮下膠芽腫、ＧＬ２６１、図５５Ｉ〜５５Ｎ大腸癌腫（ＣＲＣ）（図５５Ｉ〜５５Ｋ：ＡＯＭ／ＤＳＳのＣＲＣ、図５５Ｌ〜５５Ｎ：皮下ＣＲＣ）。マウスをTW7-28G11：図５５Ａ、５５Ｂ、５５Ｇ、５５Ｉ〜５５Ｎおよび16B4：図５５Ｃ〜５５Ｆ、５５Ｈによって処置した。
【０１１９】
【図５６】図５６Ａ〜５６Ｂは、メラノーマ腫瘍モデルを用いて、獲得免疫応答に及ぼす抗ＬＡＰ抗体の効果を図示している。腫瘍内（図５６Ａ）および末梢（図５６Ｂ）免疫応答における効果が示されている。マウスはTW7-28G11によって処置した。
【０１２０】
【図５７】図５７Ａ〜５７Ｊは、脾臓における自然免疫応答に及ぼす抗ＬＡＰ抗体の効果を図示している。図５７Ａ、５７Ｂは、抗ＬＡＰ処置後の脾臓におけるCD11b-int／CD11c-hi細胞の蓄積およびCD11b-hi/CD11c-intの減少を示している。ＣＤ１０３およびＰＤ−Ｌ１の発現が抗ＬＡＰ処置によって減少している（図５７Ｃ）。ＬＡＰは主にCD11b-hi細胞において発現している（図５７Ｄ）。CD11b-hi細胞は、CD11b-intと比較して、免疫抑制性サイトカインＴＧＦ−ｂおよびＩＬ−１０の増大したレベルと炎症促進性サイトカインＩＬ−１２の低減された発現とを発現する（図５７Ｅ）。ＣＤ８＋Ｔ細胞とのCD11b-intの共培養は炎症促進性サイトカインの発現を促進する（図５７Ｆ）。抗原提示マーカーＭＨＣＩＩ（図８７Ｇ）およびＣＤ８６（図５７Ｈ）の発現はCD11b-hiよりもCD11b-intにおいて高い。CD11b-hi細胞はインビトロのＣＤ８＋Ｔ細胞成長を支持する能力がない（図５７Ｉ）。抗ＬＡＰ処置は、ＩＦＮ−ｇを発現するＮＫ細胞の蓄積に至る（図５７Ｊ）。マウスはTW7-16B4によって処置した。
【０１２１】
【図５８】図５８Ａ〜５８Ｄは、抗ＬＡＰ抗体が抑制性ＣＤ４＋Ｔ細胞を枯渇させるということを示している。図５８Ａは、抗ＬＡＰ処置がインビボのＬＡＰ＋ＣＤ４＋Ｔ細胞の数を低減するということを示している。メラノーマ（B16）保有マウスを抗ＬＡＰのTW7-28G11クローンによって処置し、非競合TW7-16B4クローンによってカウントした。マウスをTW7-28G11によって処置した。図５８Ｂは、ＬＡＰ＋ＣＤ４＋Ｔ細胞が抑制マーカーの増大したレベルを発現するということを示している。図５８Ｃは、ＬＡＰ＋ＣＤ４＋Ｔ細胞が抑制能力を備えるということを示している。図５８Ｄは、抗ＬＡＰがＬＡＰ＋ＣＤ４＋Ｔ細胞の抑制能力を縮減するということを示している。
【０１２２】
【図５９】図５９Ａ〜５９Ｅは、抗ＬＡＰ抗体が、脾臓および流入領域リンパ節（ｄＬＮ、図５９Ａ）における抑制性ＣＤ１０３＋ＣＤ８＋Ｔ細胞の数を低減するということを示している。ＣＤ８＋だがＣＤ４＋ではないＴ細胞は抗ＬＡＰの治療効果のために要求される（図５９Ｂ）。抗ＬＡＰ抗体はインビトロのＣＤ１０３＋ＣＤ８＋Ｔ細胞の抑制能力を低減する（図５９Ｃ）。ＣＤ８ＫＯマウスへのＣＤ１０３＋ＣＤ８＋Ｔ細胞の養子移入は抗ＬＡＰの治療効果を失わせ、それゆえにインビボにおけるそれらの抑制効果を示す（図５９Ｄ）。ＣＤ１０３発現はＣＤ８＋Ｔ細胞においてそれらの養子移入の後に（ater）保たれており、ＣＤ１０３＋ＣＤ８＋Ｔは活性化マーカーの低減されたレベルを発現する（図８９Ｅ）。マウスをTW7-28G11によって処置した。
【０１２３】
【図６０】図６０Ａ〜６０Ｃは、樹状細胞（ＤＣ）ワクチン接種と組み合わされた抗ＬＡＰ処置がマウスをＧＢＭから保護するということを示している。マウスにオボアルブミンをローディングしたＤＣを事前接種し、抗ＬＡＰによって処置した。１週間後に、マウスにGL261-OVAグリオーマ細胞を頭蓋内移植し、マウス生存および腫瘍成長をその後に追跡した。図６０Ｄ〜６０Ｆは、抗ＬＡＰ処置後の腫瘍特異的ＣＤ８＋メモリー細胞の増大した蓄積を示している。マウスをTW7-16B4抗ＬＡＰクローンによって処置した。
【０１２４】
【図６１】図６１は、樹状細胞ワクチン接種と組み合わされた抗ＬＡＰ処置がB16メラノーマの処置を改善するということを示している。マウスにオボアルブミンをローディングしたＤＣを事前接種し、TW7-28G11によって処置した。１週間後に、マウスにB16-OVAメラノーマを移植し、腫瘍成長を測定した。ナイーブ（非ワクチン接種マウス）をワクチン接種のコントロールとして用いた。
【０１２５】
【図６２】図６２は、ＴＧＦ−β１／ＬＡＰの高発現および他のＬＡＰ関連ｍＲＮＡが、より良好なＧＢＭ、メラノーマ、およびＣＲＣ患者の生存と相関するということを示している。The Tumor Cancer Genome Atlas（TCGA）データに基づく、癌患者生存と腫瘍中のｍＲＮＡ発現との間の関係性。
【０１２６】
【図６３】図６３は、ＬＡＰ関連遺伝子の低レベルを発現する他の癌患者（ＡＭＬ、膀胱癌腫、胃腺癌）の生存を図示している（TCGA）。
【０１２７】
【図６４】図６４は、ＴＧＦ−β放出のそれらの阻害による抗ＬＡＰ抗体の例示的なスクリーニングを図示している。抗ＬＡＰの異なるクローンを、ヒトＴＧＦ−βを発現するP3U1細胞のそれらの処置と、培養培地中の分泌された活性／遊離ＴＧＦ−βのレベル（非酸性化条件）をＥＬＩＳＡによって測定することとによって試験した。
【０１２８】
【図６５】図６５は、抗ＬＡＰ処置が血小板カウントおよび活性に影響しないということを示している。マウスを抗ＬＡＰのTW7-28G11クローンによって処置し（２５０ｕｇ／マウス）、３日後に解析した（ｎ＝３）。
【０１２９】
【図６６】図６６はマウスおよびヒトプロＴＧＦ−β蛋白質配列の間の類似性を図示している。
【０１３０】
【図６７】図６７は、メモリーＴ細胞のマーカーが抗ＬＡＰ処置後のＧＢＭにおいて上方制御されるということを示している。
【発明を実施するための形態】
【０１３１】
詳細な説明
組成物および方法が提供され、それらは、抗ＬＡＰ抗体によって処置されたときに腫瘍成長がより低く、マウスがより長く生存するという本明細書に記載される発見と、本明細書に記載される抗ＬＡＰ抗体がＴＧＦ−β放出をブロックし、ＣＤ４＋ＬＡＰ＋Ｔ細胞およびＣＤ８＋ＣＤ１０３＋Ｔ細胞を包含する抑制性制御性Ｔ細胞集団を枯渇させるという本明細書に記載される発見とに関する。抗ＬＡＰ抗体を、膠芽腫モデル、メラノーマモデル、および大腸癌モデルを包含する種々の癌モデルにおいて試験し、本明細書に記載されるように類似の腫瘍内および末梢免疫効果が観察された。それゆえに、本明細書において示されているように、部分的に、ＴＧＦ−β放出をブロックすることと抑制性ＣＤ４＋Ｔ細胞を枯渇させることとによって作用する抗ＬＡＰ抗体による処置は、自然および獲得免疫両方を活性化することによって全身および腫瘍内免疫応答に強く影響し、腫瘍特異的免疫を抑制するメカニズムを克服する。
【０１３２】
ＬＡＰおよびＬＡＰ結合剤
ＬＡＰおよびＴＧＦ−βは１つの前駆体ポリペプチドとして翻訳され、これはフーリンによる細胞内切断を経て、ＴＧＦ−βからのＮ末端ＬＡＰ蛋白質部分の分離をもたらす。ＴＧＦ−βは、小型潜在型複合体（ＳＬＣ）を形成することによって直ちにＬＡＰと非共有結合的に再アセンブリされ、これは、ＴＧＦ−βを、ＧＡＲＰ受容体に結合して細胞表面に留まったまたは潜在型ＴＧＦ−β結合蛋白質１（ＬＴＢＰ−１）へのＳＬＣ結合後に細胞外マトリックスに埋め込まれたその不活性形態で保持する。ＴＧＦ−βは、シグナル伝達を開始するためには特異的シグナルによってその潜在型形態から放出されなければならない。このメカニズムは、必要とされるときに活性なサイトカインの直ちの利用可能性および素早い放出を許すと信じられており、なぜＴＧＦ−βが他のサイトカインとは異なって多くの組織において恒常的に発現されているがサイレントであるのかを説明する。
【０１３３】
トランスフォーミング成長因子ベータ（ＴＧＦβ）蛋白質ファミリーは哺乳動物において見いだされる３つの別個のアイソフォームからなる（ＴＧＦβ１、ＴＧＦβ２、およびＴＧＦβ３）。ＴＧＦβ蛋白質は、細胞増殖性、炎症性、および心血管状態を包含する疾患状態に影響する複数の遺伝子応答を活性化および制御する。ＴＧＦβは多機能性サイトカインであり、元は正常線維芽細胞を足場非依存的な成長ができる細胞に形質転換するその能力から名付けられた。ＴＧＦβ分子は主として造血および腫瘍細胞によって産生され、種々の正常および新生物組織起源両方からの細胞の成長および分化を制御、すなわち刺激または阻害し（Sporn et al., Science, 233: 532 (1986)）、種々の間質細胞の形成および増殖を刺激し得る。
【０１３４】
ＴＧＦβは、多くの増殖性および非増殖性の細胞プロセス、例えば細胞増殖および分化、胚発生、細胞外マトリックス形成、骨発生、創傷治癒、造血、ならびに免疫および炎症応答に関わることが公知である。例えばPircher et al, Biochem. Biophys. Res. Commun., 136: 30-37 (1986)、Wakefield et al., Growth Factors, 1: 203-218 (1989)、Roberts and Sporn, pp 419-472 in Handbook of Experimental Pharmacology eds M. B. Sporn & A. B. Roberts (Springer, Heidelberg, 1990)、Massague et al., Annual Rev. Cell Biol., 6: 597-646 (1990)、Singer and Clark, Ne Eng. J. Med., 341: 738-745 (1999)参照。ＴＧＦβは腸粘膜の疾患の処置および予防にもまた用いられる（ＷＯ２００１／２４８１３）。ＴＧＦβは種々の免疫学的細胞型に及ぼす強い免疫抑制効果を有することもまた公知であり、細胞傷害性Ｔリンパ球（ＣＴＬ）阻害（Ranges et al., J. Exp. Med., 166: 991, 1987）、Espevik et al., J. Immunol., 140: 2312, 1988）、低下したＢ細胞リンパ球新生およびカッパ軽鎖発現（Lee et al., J. Exp. Med., 166: 1290, 1987）、造血の負の制御（Sing et al., Blood, 72: 1504, 1988）、腫瘍細胞におけるＨＬＡ−ＤＲ発現の下方制御（Czamiecki et al., J. Immunol., 140: 4217, 1988）、ならびにＢ細胞成長因子に応答した抗原によって活性化されたＢリンパ球の増殖の阻害（Petit-Koskas et al., Eur. J. Immunol., 18: 111, 1988）を包含する。Ｕ．Ｓ．Ｐａｔ．Ｎｏ．７，５２７，７９１もまた参照。
【０１３５】
癌におけるＴＧＦ−βアイソフォーム発現は複雑かつ可変であり、ＴＧＦβアイソフォームの異なる組み合わせは特定の癌において異なる役割を有する。例えばＵ．Ｓ．Ｐａｔ．Ｎｏ．７，９２７，５９３参照。例えば、ＴＧＦ−β１およびＴＧＦ−β３は卵巣癌およびその進行にＴＧＦβ２よりも大きい役割を果たし得るが、ＴＧＦ−β１およびＴＧＦ−β２発現はより高グレードの軟骨肉腫腫瘍においてＴＧＦ−β３よりも高い。ヒト乳癌において、ＴＧＦ−β１およびＴＧＦ−β３は高発現し、ＴＧＦ−β３発現は総合的な生存率と相関するように見え、節転移および陽性のＴＧＦβ３発現を有する患者は不良な予後アウトカムを有する。しかしながら、結腸癌においては、ＴＧＦ−β１およびＴＧＦ−β２はＴＧＦ−β３よりも高発現し、癌がない個体よりも高い循環レベルで存在する。グリオーマにおいては、ＴＧＦ−β２は細胞遊走にとって重要である。
【０１３６】
本明細書において用いられる「潜在性関連ペプチド」または「ＬＡＰ」は、例えばNP_000651.3のアミノ酸３０〜２７８によって記載されるアミノ酸配列
LSTCKTIDMELVKRKRIEAIRGQILSKLRLASPPSQGEVPPGPLPEAVLALYNSTRDRVAGESAEPEPEPEADYYAKEVTRVLMVETHNEIYDKFKQSTHSIYMFFNTSELREAVPEPVLLSRAELRLLRLKLKVEQHVELYQKYSNNSWRYLSNRLLAPSDSPEWLSFDVTGVVRQWLSRGGEIEGFRLSAHCSCDSRDNTLQVDINGFTTGRRGDLATIHGMNRPFLLLMATPLERAQHLQSSRHRR（配列番号１）を有するヒトＴＧＦ−β１前駆体ペプチドのアミノ末端ドメイン、例えばNP_001129071.1のアミノ酸２１〜３０２によって記載されるアミノ酸配列
LSTCSTLDMDQFMRKRIEAIRGQILSKLKLTSPPEDYPEPEEVPPEVISIYNSTRDLLQEKASRRAAACERERSDEEYYAKEVYKIDMPPFFPSENAIPPTFYRPYFRIVRFDVSAMEKNASNLVKAEFRVFRLQNPKARVPEQRIELYQILKSKDLTSPTQRYIDSKVVKTRAEGEWLSFDVTDAVHEWLHHKDRNLGFKISLHCPCCTFVPSNNYIIPNKSEELEARFAGIDGTSTYTSGDQKTIKSTRKKNSGKTPHLLLMLLPSYRLESQQTNRRKKR（配列番号２）を有するヒトＴＧＦ−β２前駆体ペプチドのアミノ末端ドメイン、例えばNP_003230.1のアミノ酸２４〜３００によって記載されるアミノ酸配列
LSTCTTLDFGHIKKKRVEAIRGQILSKLRLTSPPEPTVMTHVPYQVLALYNSTRELLEEMHGEREEGCTQENTESEYYAKEIHKFDMIQGLAEHNELAVCPKGITSKVFRFNVSSVEKNRTNLFRAEFRVLRVPNPSSKRNEQRIELFQILRPDEHIAKQRYIGGKNLPTRGTAEWLSFDVTDTVREWLLRRESNLGLEISIHCPCHTFQPNGDILENIHEVMEIKFKGVDNEDDHGRGDLGRLKKQKDHHNPHLILMMIPPHRLDNPGQGGQRKKR（配列番号３）を有するヒトＴＧＦ−β３前駆体ペプチドのアミノ末端ドメイン、例えばNP_035707.1のアミノ酸３０〜２７８によって記載されるアミノ酸配列
LSTCKTIDMELVKRKRIEAIRGQILSKLRLASPPSQGEVPPGPLPEAVLALYNSTRDRVAGESADPEPEPEADYYAKEVTRVLMVDRNNAIYEKTKDISHSIYMFFNTSDIREAVPEPPLLSRAELRLQRLKSSVEQHVELYQKYSNNSWRYLGNRLLTPTDTPEWLSFDVTGVVRQWLNQGDGIQGFRFSAHCSCDSKDNKLHVEINGISPKRRGDLGTIHDMNRPFLLLMATPLERAQHLHSSRHRR（配列番号４）を有するマウスＴＧＦ−β１前駆体ペプチドのアミノ末端ドメイン、例えばNP_033393.2のアミノ酸２１〜３０２によって記載されるアミノ酸配列
LSTCSTLDMDQFMRKRIEAIRGQILSKLKLTSPPEDYPEPDEVPPEVISIYNSTRDLLQEKASRRAAACERERSDEEYYAKEVYKIDMPSHLPSENAIPPTFYRPYFRIVRFDVSTMEKNASNLVKAEFRVFRLQNPKARVAEQRIELYQILKSKDLTSPTQRYIDSKVVKTRAEGEWLSFDVTDAVQEWLHHKDRNLGFKISLHCPCCTFVPSNNYIIPNKSEELEARFAGIDGTSTYASGDQKTIKSTRKKTSGKTPHLLLMLLPSYRLESQQSSRRKKR（配列番号５）を有するマウスＴＧＦ−β２前駆体ペプチドのアミノ末端ドメイン、例えばNP_033394.2のアミノ酸２４〜２９８によって記載されるアミノ酸配列
LSTCTTLDFGHIKKKRVEAIRGQILSKLRLTSPPEPSVMTHVPYQVLALYNSTRELLEEMHGEREEGCTQETSESEYYAKEIHKFDMIQGLAEHNELAVCPKGITSKVFRFNVSSVEKNGTNLFRAEFRVLRVPNPSSKRTEQRIELFQILRPDEHIAKQRYIGGKNLPTRGTAEWLSFDVTDTVREWLLRRESNLGLEISIHCPCHTFQPNGDILENVHEVMEIKFKGVDNEDDHGRGDLGRLKKQKDHHNPHLILMMIPPHRLDSPGQGSQRKKR（配列番号６）を有するマウスＴＧＦ−β３前駆体ペプチドのアミノ末端ドメインを、そのいずれかの他の天然に存在するアレル、スプライスバリアント、およびプロセシング形態と一緒に言う。用語「ＬＡＰ」は、いくつかの態様においては、ＬＡＰポリペプチドの末端欠失形態または断片を参照するためにもまた用いられる。ＬＡＰのいずれかのかかる形態への参照は、本願においては例えば「ＬＡＰ（２１５〜２１７）」によって同定され得る。ＬＡＰの具体的な残基は例えば「ＬＡＰ（１９４）」、「配列番号１のアミノ酸１９４」、または「配列番号１のＬＡＰのＣｙｓ１９４」と言われ得る。
【０１３７】
いくつかの態様において、ＬＡＰはＬＡＰ分子のホモ二量体として存在し得る。ＬＡＰポリペプチドの配列はいくつもの生物種、例えばヒトおよびマウスＬＡＰについて公知である。それらの相互作用部位と物理的に相互作用するか、結合するか、またはそれへのリガンド結合を立体的に塞ぎ止める薬剤は、ＬＡＰ活性を阻害するために用いられ得る。
【０１３８】
ＬＡＰは、結合パートナー、例えばＴＧＦβとの相互作用に必要な重要な残基を含有する。配列番号１および４の位置１９４および１９６、配列番号２および５の２０６および２０８、ならびに配列番号３および６の２０４および２０６のシステインは２つのＬＡＰの間の分子間ジスルフィド結合に重要である。それらからセリンへの変異は分子を「活性」にする（Sanderson et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 92, 2572-2576 (1995); Brunneret al., Mol. Endocrinol. 6, 1691-1700 (1992)、Brunner et al., J. Biol. Chem, 264, 13660-13664 (1989)。これらはそれらの全体として本明細書に参照によって組み込まれる）。配列番号１および４の位置２１５〜２１７、配列番号２および５の２４１〜２４３、ならびに配列番号３および６の２３８〜２４０のＲＧＤ／ＳＧＤモチーフはインテグリンとの相互作用を容易化する（Munger et al., Mol Biol Cell, 9:2627-2638 (1998、DerynckR, TIBS, 19, 548-553 (1994)。これらはそれらの全体として本明細書に参照によって組み込まれる）。配列番号１〜６の位置４のシステインはＬＴＢＰの第３のシステインリッチリピートとのジスルフィドブリッジに重要である（Saharinen et al. The EMBO Journal, 15, 245-253 (1996)）。ＴＧＦβをコードする核酸はＵ．Ｓ．Ｐａｔ．Ｎｏ．５，８０１，２３１に記載されている。前述の参照は、それらの全体として本明細書に参照によって組み込まれる。
【０１３９】
部分的に、抗ＬＡＰ抗体によって処置されたときに腫瘍成長がより低く、マウスがより長く生存するという発見と、本明細書に記載される抗ＬＡＰ抗体の効果が、部分的に、ＬＡＰを含みＴＧＦ−βをその不活性形態に保持する小型潜在型複合体（ＳＬＣ）からのＴＧＦ−βの放出を阻害し、および／または制御性ＣＤ４＋Ｔ細胞の数を低減するそれらの能力に基づくという発見とに基づく組成物および方法が、本明細書において提供される。本明細書において示されているように、抗ＬＡＰ抗体処置は次のように全身および腫瘍内免疫両方にもまた影響した。腫瘍は細胞傷害性ＣＤ８＋Ｔ細胞の増大した数によって浸潤され、腫瘍内Ｆｏｘｐ３Ｔｒｅｇは減少した。ＣＤ４＋およびＣＤ８＋腫瘍内Ｔ細胞はＰＤ−１、ＬＡＧ３、およびＣＤ１０３の減少した発現を有した。末梢においては、ＩＦＮ−γおよびグランザイムＢを発現するＣＤ４＋およびＣＤ８＋Ｔ細胞がそれぞれ増大し、その一方でＣＤ１０３＋Ｔ細胞は減少した。最後に、ＣＤ１０３およびＰＤ−Ｌ１を発現する免疫寛容誘導性樹状細胞の低減された数があり、その一方でＭＨＣＩＩは脾臓の骨髄系細胞において上昇した。本明細書に記載される抗ＬＡＰ抗体は、自然および獲得免疫両方を活性化することによって全身および腫瘍内免疫応答に強く影響し、腫瘍特異的免疫を抑制するメカニズムを克服する。理論によって束縛または限定されることを望まないが、この活性には、ＳＬＣからのその放出を防ぐことによって活性なＴＧＦ−βを隔離することおよび／または制御性ＣＤ４＋Ｔ細胞の数を低減することが関わり得る。広範囲の腫瘍型に対するそれらの示された活性に鑑みると、本明細書に記載される抗ＬＡＰ抗体は、単独療法としてまたは（例えば抗ＰＤ１抗体、腫瘍免疫抑制を標的化する他の薬剤、および／または他の抗癌療法などの）他の抗腫瘍モダリティーと組み合わされて用いられ得、癌の処置のための新規の免疫療法アプローチを表している。
【０１４０】
従って、いくつかの側面においては、ＬＡＰ発現および／または活性が癌または腫瘍特異的免疫の抑制に関連する癌および腫瘍を処置するための組成物および方法が本明細書において提供され、それが必要な対象にＬＡＰ結合剤の治療有効量を投与することを含む。かかる結合剤は、ＴＧＦβが小型潜在型複合体から放出されないようにＬＡＰおよびＴＧＦβの間の相互作用を調節し、ならびに／またはＬＡＰおよび別のＬＡＰ分子の間の相互作用を阻害／ブロックする、すなわちホモ二量体化を阻害／ブロックするために用いられ得る。特に、本明細書に記載される側面の好ましい態様において、かかるＬＡＰ結合剤は、ＬＡＰと成熟ＴＧＦβとを含む小型潜在型複合体からのＴＧＦβの放出を阻害またはブロックし、それゆえに成熟ＴＧＦβを隔離するために用いられ得る。
【０１４１】
本明細書に記載される方法のいくつかの態様においては、ＬＡＰ結合剤が、配列番号１〜６のいずれか１つに示される配列を有するＬＡＰ分子に結合し得る。本明細書に記載される方法のいくつかの態様においては、ＬＡＰ結合剤が、配列番号１〜３のいずれか１つに示される配列を有するＬＡＰ分子に結合し得る。本明細書に記載される方法のいくつかの態様においては、ＬＡＰ結合剤は、配列番号１〜３のいずれかに示されている配列の間で共有された保存された領域に結合し得る。いくつかの態様において、ＬＡＰ結合剤は、配列番号１〜６のいずれかおよびＴＧＦβなどのＬＡＰ相互作用蛋白質に由来するエピトープに結合し得る。いくつかのかかる態様において、ＬＡＰ結合剤が配列番号１〜６のいずれかおよびＴＧＦβに由来するエピトープに結合するところでは、エピトープへのＬＡＰ結合剤の結合は、小型潜在型複合体からのＴＧＦβの放出を阻害またはブロックする。
【０１４２】
いくつかの態様において、本明細書に記載される組成物および方法への使用のためのＬＡＰ結合剤は、ＬＡＰリガンド相互作用部位、例えば、成熟ＴＧＦβと相互作用する部位、インテグリンと相互作用する部位、および／またはＬＴＢＰと相互作用する部位と結合または物理的に相互作用し得る。かかる部位の限定しない例は、配列番号１および４のＲ１８９、配列番号２および５のＲ１９６、ならびに配列番号３および６のＲ１９２を包含する（例えば McGowan et al. The Journal of Clinical Endocrinology and Metabolism 2003 88:3321-6参照。これはその全体として本明細書に参照によって組み込まれる）。従って、本明細書に記載される組成物および方法のいくつかの態様において、ＬＡＰ結合剤は、配列番号１および４のＲ１８９、配列番号２および５のＲ１９６、ならびに／または配列番号３および６のＲ１９２と結合または物理的に相互作用する。本明細書に記載される組成物および方法のいくつかの態様において、ＬＡＰ結合剤は、配列番号１および４のアミノ酸２１５〜２１７、配列番号２および５のアミノ酸２４１〜２４３、ならびに／または配列番号３および６のアミノ酸２３８〜２４０と結合または物理的に相互作用する。本明細書に記載される方法のいくつかの態様において、ＬＡＰ結合剤は配列番号１〜６のいずれかのＣｙｓ４と結合または物理的に相互作用する。
【０１４３】
本明細書に記載される側面のいくつかの態様において、本明細書に記載される組成物および方法への使用のためのＬＡＰ結合剤は、ＬＡＰホモ二量体化部位、すなわち別のＬＡＰ分子と相互作用する部位と結合または相互作用し得る。従って、本明細書に記載される側面のいくつかの態様において、ＬＡＰ結合剤は、配列番号１および４のＣｙｓ１９４および／もしくはＣｙｓ１９６、配列番号２および５のＣｙｓ２０６および／もしくはＣｙｓ２０８、ならびに／または配列番号３および６のＣｙｓ２０４および／もしくはＣｙｓ２０６と結合または物理的に相互作用する。
【０１４４】
本明細書において用いられる用語「ＬＡＰ結合剤」は、ＬＡＰに特異的に結合し、ＬＡＰおよびそのリガンドまたはＬＡＰと相互作用する分子のいずれかの間の相互作用を有意に調節する分子または薬剤を言い、結果的に、それらの結果的な生物学的または機能的活性をインビトロ、インサイチュ、および／またはインビボで調節する（例えば、小型潜在型複合体または潜在型複合体からのＴＧＦ−β放出、免疫応答のＬＡＰによって媒介される阻害、および抗腫瘍免疫応答のＬＡＰによって媒介される阻害などの、ＬＡＰシグナル伝達によって媒介される下流経路の活性を包含する）。本明細書に記載される種々の側面および態様への使用を企図される例示的なＬＡＰ結合剤は、ＬＡＰおよびＴＧＦ−β、ＬＡＰおよびインテグリン、および／またはＬＡＰおよびＬＴＢＰの結合および／または相互作用に関わるＬＡＰ上の１つ以上のアミノ酸残基またはエピトープに特異的に結合し、ならびに／あるいはＬＡＰホモ二量体化および／または結合を調節する抗体あるいはその抗原結合断片と、ＬＡＰおよびＴＧＦβ、ＬＡＰおよびインテグリン、および／またはＬＡＰおよびＬＴＢＰの結合および／または相互作用に関わるＬＡＰ上の１つ以上のアミノ酸残基またはエピトープを標的化または特異的に結合し、ならびに／あるいはＬＡＰホモ二量体化および／または結合を調節する小分子薬剤と、ＬＡＰおよびＴＧＦβ、ＬＡＰおよびインテグリン、および／またはＬＡＰおよびＬＴＢＰの結合および／または相互作用に関わるＬＡＰ上の１つ以上のアミノ酸残基またはエピトープに結合し、ならびに／あるいはＬＡＰのホモ二量体化および／または結合を調節するＲＮＡあるいはＤＮＡアプタマーとを包含するが、これに限定されない。本明細書に記載される側面の好ましい態様において、ＬＡＰ結合剤はＬＡＰに特異的に結合し、小型潜在型複合体または潜在型複合体からのＴＧＦ−β放出を阻害またはブロックする。
【０１４５】
本明細書において用いられるＬＡＰ結合剤は、ＬＡＰおよびＴＧＦ−β、ＬＡＰおよびインテグリン、および／またはＬＡＰおよびＬＴＢＰの間の相互作用を調節し、ならびに／あるいはＬＡＰホモ二量体化および／またはそれらの結果的な生物学的もしくは機能的活性を、インビトロ、インサイチュ、および／またはインビボで、ＬＡＰ結合剤の非存在下における相互作用および／または活性と相対的に少なくとも５％、少なくとも１０％、少なくとも２０％、少なくとも３０％、少なくとも４０％、少なくとも５０％、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、またはより多く調節する能力を有する。最低でも、本明細書に記載されるＬＡＰ結合剤は、皮下マウスグリオーマモデルなどのマウス癌モデルにおいて腫瘍によって誘導される免疫抑制をブロックする。この活性は、ＣＤ４＋Ｔ細胞におけるＩＦＮγのより高発現、制御性ＣＤ４＋Ｔ細胞の低減された数および／もしくは活性、腫瘍への細胞傷害性ＣＤ８＋Ｔ細胞の増大した数および／もしくは浸潤、減少した腫瘍サイズ、ならびに／またはマウス皮下グリオーマモデルの増大した生存に至る。
【０１４６】
本明細書において交換可能に用いられる「ＬＡＰおよびＴＧＦ−β／インテグリン／潜在型ＴＧＦ−β結合蛋白質／ＬＡＰの間の相互作用を調節すること」または「ＬＡＰおよびＴＧＦ−β／インテグリン／潜在型ＴＧＦ−β結合蛋白質／ＬＡＰの間の相互作用に影響を与えること」は、一般的に、同じ条件下だが本明細書に記載されるＬＡＰ結合剤の存在なしのＬＡＰおよびＴＧＦ−β／インテグリン／潜在型ＴＧＦ−β結合蛋白質／ＬＡＰの間の相互作用と比較して、ＬＡＰおよびＴＧＦ−β／インテグリン／潜在型ＴＧＦ−β結合蛋白質／ＬＡＰの間の相互作用または結合を、少なくとも５％、少なくとも１０％、少なくとも２５％、少なくとも５０％、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、またはより多く調節すること、すなわち増大または減少させることいずれかを意味する。本明細書に記載される側面の好ましい態様において、ＬＡＰ結合剤は、小型潜在型複合体からのＴＧＦ−βの放出が阻害またはブロックされるようにＬＡＰおよびＴＧＦ−βの間の相互作用を調節し、および／または制御性ＣＤ４＋Ｔ細胞の数および／または活性を低減する。
【０１４７】
抗ＬＡＰ抗体などのいくつかのＬＡＰ結合試薬は当分野において公知である。例えば、その全体として本明細書に参照によって組み込まれるAli et al. PLOS ONE 2008:e1914参照。抗ＬＡＰ抗体試薬のさらなる例はＵ．Ｓ．特許Ｎｏ．８，１９８，４１２およびＵ．Ｓ．特許公開Ｎｏ．２００８／０２０６２１９に記載されており、これらはそれらの全体として本明細書に参照によって組み込まれる。
【０１４８】
本明細書に記載される側面のいくつかの態様において、本明細書に記載される組成物および方法への使用のための抗ＬＡＰ抗体またはその抗原結合断片は、ＬＡＰリガンド相互作用部位、例えば成熟ＴＧＦ−βと相互作用する部位、インテグリンと相互作用する部位、および／またはＬＴＢＰと相互作用する部位と結合または物理的に相互作用し得る。本明細書に記載される側面のいくつかの態様において、本明細書に記載される組成物および方法への使用のための抗ＬＡＰ抗体またはその抗原結合断片は、ＬＡＰが潜在型ＴＧＦ−βに結合したときに存在するＬＡＰのエピトープと結合または物理的に相互作用する。本明細書に記載される側面のいくつかの態様において、本明細書に記載される組成物および方法への使用のための抗ＬＡＰ抗体またはその抗原結合断片はマウスおよびヒトＬＡＰ両方に結合する。
【０１４９】
本明細書に記載される側面のいくつかの態様において、抗ＬＡＰ抗体またはその抗原結合断片は、配列番号１および４のＲ１８９、配列番号２および５のＲ１９６、ならびに／または配列番号３および６のＲ１９２と結合または物理的に相互作用する。本明細書に記載される側面のいくつかの態様において、抗ＬＡＰ抗体またはその抗原結合断片は、配列番号１および４のアミノ酸２１５〜２１７、配列番号２および５のアミノ酸２４１〜２４３、ならびに／または配列番号３および６のアミノ酸２３８〜２４０と結合または物理的に相互作用する。本明細書に記載される側面のいくつかの態様において、抗ＬＡＰ抗体またはその抗原結合断片は、配列番号１〜６のいずれかのＣｙｓ４と結合または物理的に相互作用する。
【０１５０】
本明細書に記載される側面のいくつかの態様において、本明細書に記載される組成物および方法への使用のための抗ＬＡＰ抗体またはその抗原結合断片は、ＬＡＰホモ二量体化部位、すなわち別のＬＡＰ分子と相互作用する部位と結合または物理的に相互作用し得る。従って、本明細書に記載される側面のいくつかの態様において、抗ＬＡＰ抗体またはその抗原結合断片は、配列番号１および４のＣｙｓ１９４および／もしくはＣｙｓ１９６、配列番号２および５のＣｙｓ２０６および／もしくはＣｙｓ２０８、ならびに／または配列番号３および６のＣｙｓ２０４および／もしくはＣｙｓ２０６と結合または物理的に相互作用する。
【０１５１】
組成物への使用のためおよび本明細書に記載される方法を実施するために好適な、ＬＡＰに特異的であるかまたは選択的に結合する抗体またはその抗原結合断片は、好ましくはモノクローナルであり、ヒト、ヒト化、ＣＤＲグラフト、またはキメラ抗体を包含し得るがこれに限定されず、一本鎖抗体、Ｆａｂ断片、Ｆ（ａｂ’）断片、Ｆａｂ発現ライブラリーによって産生される断片、および／または上のいずれかの結合断片を含む。抗体は、免疫グロブリン分子および免疫グロブリン分子の免疫活性な部分、すなわち、抗原もしくは標的結合部位を含有する分子または「抗原結合断片」をもまた言う。本明細書に記載される免疫グロブリン分子は、当業者によって理解されるように、免疫グロブリン分子のいずれかの型（例えばＩｇＧ、ＩｇＥ、ＩｇＭ、ＩｇＤ、ＩｇＡ、およびＩｇＹ）、クラス（例えばＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３、ＩｇＧ４、ＩｇＡ１、およびＩｇＡ２）、またはサブクラスであり得る。用語「抗体」は、４つのポリペプチド鎖、２つの重（Ｈ）鎖および２つの軽（Ｌ）鎖からなる免疫グロブリン分子を言うことを意図される。鎖は通常はジスルフィド結合によって互いにリンクされる。それぞれの重鎖は前記の重鎖の可変領域（ここではＨＣＶＲまたはＶＨと省略される）および前記の重鎖の定常領域からなる。重鎖定常領域は３つのドメインＣＨ１、ＣＨ２、およびＣＨ３からなる。それぞれの軽鎖は前記の軽鎖の可変領域（ここではＬＣＶＲまたはＶＬと省略される）および前記の軽鎖の定常領域からなる。軽鎖定常領域はＣＬドメインからなる。ＶＨおよびＶＬ領域は、さらに、フレームワーク領域（ＦＲ）と言われる保存された領域が散在する、相補性決定領域（ＣＤＲ）と言われる超可変領域に分けられ得る。それゆえに、それぞれのＶＨおよびＶＬ領域は３つのＣＤＲおよび４つのＦＲからなり、これらはＮ末端からＣ末端に次の順、ＦＲ１、ＣＤＲ１、ＦＲ２、ＣＤＲ２、ＦＲ３、ＣＤＲ３、ＦＲ４で配置されている。この構造は当業者に周知である。
【０１５２】
本明細書において用いられる用語「ＣＤＲ」は抗体可変配列中の相補性決定領域を言う。重鎖および軽鎖の可変領域のそれぞれの中には３つのＣＤＲがあり、それらは可変領域のそれぞれについてＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３と呼ばれる。本明細書において用いられる用語「ＣＤＲセット」は、抗原に結合できる単一の可変領域中に存在する３つのＣＤＲの群を言う。それらのＣＤＲの厳密な境目は、異なるシステムによって異なって定義されて来た。Kabatによって記載されたシステム（Kabat et al., Sequences of Proteins of Immunological Interest (National Institutes of Health, Bethesda, Md. (1987) and (1991)）は、抗体のいずれかの可変領域に適用可能な明解な残基付番システムを提供するのみならず、３つのＣＤＲを定義する正確な残基の境目をもまた提供する。これらのＣＤＲはKabatのＣＤＲと言われ得る。それぞれの相補性決定領域は、Kabatによって定義される「相補性決定領域」からのアミノ酸残基（すなわち、軽鎖可変ドメイン中の約残基２４〜３４（Ｌ１）、５０〜５６（Ｌ２）、および８９〜９７（Ｌ３）ならびに重鎖可変ドメイン中の３１〜３５（Ｈ１）、５０〜６５（Ｈ２）、および９５〜１０２（Ｈ３）。Kabat et al., Sequences of Proteins of Immunological Interest, 5th Ed. Public Health Service, National Institutes of Health, Bethesda, Md. (1991)）および／または「超可変ループ」からの残基（すなわち、軽鎖可変ドメイン中の約残基２６〜３２（Ｌ１）、５０〜５２（Ｌ２）、および９１〜９６（Ｌ３）ならびに重鎖可変ドメイン中の２６〜３２（Ｈ１）、５３〜５５（Ｈ２）、および９６〜１０１（Ｈ３）。Chothia and Lesk J. Mol. Biol. 196:901-917 (1987)）を含み得る。いくつかの場合には、相補性決定領域は、Kabatに従って定義されるＣＤＲ領域および超可変ループ両方からのアミノ酸を包含し得る。例えば、抗体４Ｄ５のヒト重鎖のＣＤＲＨ１はアミノ酸２６から３５を包含する。Chothiaおよび同僚（Chothia & Lesk, J. Mol. Biol, 196:901-917 (1987) およびChothia et al., Nature 342:877-883 (-1989)）は、KabatのＣＤＲ内のある種の小部分が、アミノ酸配列のレベルでの大きな多様性にもかかわらず、だいたい同一のペプチドバックボーンコンフォメーションを採るということを見いだした。それらの小部分はＬ１、Ｌ２、およびＬ３またはＨ１、Ｈ２、およびＨ３と呼ばれ、「Ｌ」および「Ｈ」はそれぞれ軽鎖および重鎖の領域を指定する。これらの領域はChothiaのＣＤＲと言われ得、それらはKabatのＣＤＲとオーバーラップする境目を有する。KabatのＣＤＲとオーバーラップするＣＤＲを定義する他の境目がPadlan（FASEB J. 9: 133-139 (1995)）およびMacCallum（J Mol Biol 262(5):732-45 (1996)）によって記載されている。なお他のＣＤＲの境目の定義は、上のシステムの１つに厳密に従わずにあり得るが、それでもやはりKabatのＣＤＲとオーバーラップするであろう。ただし、それらは、特定の残基または残基の群またはさらにはＣＤＲ全体が抗原結合に有意に影響を与えないという予測または実験上の知見に照らして短縮または延長され得る。本明細書において用いられる方法はこれらのシステムのいずれかに従って定義されるＣＤＲを利用し得るが、好ましい態様はKabatまたはChothiaによって定義されるＣＤＲを用いる。本明細書において用いられる「抗体可変ドメイン」は、相補性決定領域（ＣＤＲ、すな���ちＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３）およびフレームワーク領域（ＦＲ）のアミノ酸配列を包含する抗体分子の軽および重鎖の部分を言う。ＶＨは重鎖の可変ドメインを言う。ＶＬは軽鎖の可変ドメインを言う。本発明に用いられる方法において、ＣＤＲおよびＦＲに割り当てられるアミノ酸位置はKabatに従って定義され得る（Sequences of Proteins of Immunological Interest (National Institutes of Health, Bethesda, Md., 1987 and 1991)）。抗体または抗原結合断片のアミノ酸付番もまたKabatのものに従う。
【０１５３】
本明細書に記載される用語抗原結合断片または「抗原結合部分」によって包摂される抗体断片の例は、（ｉ）ＶＬ、ＣＬ、ＶＨ、およびＣＨ１ドメインを有するＦａｂ断片、（ｉｉ）ＣＨ１ドメインのＣ末端に１つ以上のシステイン残基を有するＦａｂ断片である、Ｆａｂ’断片、（ｉｉｉ）ＶＨおよびＣＨ１ドメインを有するＦｄ断片、（ｉｖ）ＶＨおよびＣＨ１ドメインとＣＨ１ドメインのＣ末端に１つ以上のシステイン残基とを有するＦｄ’断片、（ｖ）抗体の単一のアームのＶＬおよびＶＨドメインを有するＦｖ断片、（ｖｉ）ＶＨドメインもしくはＶＬドメインから、またはＶＨ、ＣＨ１、ＣＨ２、ＤＨ３、もしくはＶＨ、ＣＨ２、ＣＨ３からなるｄＡｂ断片（Ward et al., Nature 341, 544-546 (1989)）、（ｖｉｉ）単離されたＣＤＲ領域、（ｖｉｉｉ）Ｆ（ａｂ’）２断片、ヒンジ領域においてジスルフィドブリッジによってリンクされた２つのＦａｂ’断片を包含する二価断片、（ｉｘ）一本鎖抗体分子（例えば一本鎖Ｆｖ、ｓｃＦｖ）（Bird et al., Science 242:423-426 (1988)およびHuston et al., PNAS (USA) 85:5879-5883 (1988)）、（ｘ）同じポリペプチド鎖中の軽鎖可変ドメイン（ＶＬ）につながれた重鎖可変ドメイン（ＶＨ）を含む２つの抗原結合部位を有する、「ダイアボディ」（例えばＥＰ４０４，０９７、ＷＯ９３／１１１６１、およびHollinger et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 90:6444-6448 (1993) 参照）、（ｘｉ）相補的な軽鎖ポリペプチドと一緒になって抗原結合領域のペアを形成するタンデムなＦｄセグメントのペア（ＶＨ−ＣＨ１−ＶＨ−ＣＨ１）を含む、「リニア抗体」（Zapata et al. Protein Eng. 8(10): 1057-1062 (1995) およびＵ．Ｓ．Ｐａｔ．Ｎｏ．５，６４１，８７０）、ならびに前述のいずれかの改変バージョン（例えば、ポリアルキレングリコール（例えばポリエチレングリコール、ポリプロピレングリコール、ポリブチレングリコール）または他の好適なポリマーの共有結合的な取り付けによって改変される）を包含する。
【０１５４】
本明細書において用いられる「エピトープ」は、連続的なアミノ酸、または蛋白質の三次構造折り畳みによって並列した非連続的なアミノ酸両方から形成され得る。連続的なアミノ酸から形成されるエピトープは、変性溶媒への暴露において典型的には保持され、その一方で、三次構造折り畳みによって形成されるエピトープは、変性溶媒による処置によって典型的には失われる。エピトープは、２つの異なる蛋白質上に見いだされる非連続的なアミノ酸からもまた形成され得、これは、例えばＬＡＰがＴＧＦ−βに結合したときなどの、それらが互いに結合したときにのみ起こる。従って、本明細書に記載される組成物および方法のいくつかの態様において、抗ＬＡＰ抗体またはその抗原結合断片は、ＬＡＰがＴＧＦ−βに結合したときに見いだされる非連続的なアミノ酸から形成されるエピトープに結合する。エピトープは、典型的には、少なくとも３、より通常では少なくとも５、約９、または約８〜１０アミノ酸をユニークな空間的コンフォメーションで包含する。「エピトープ」は、免疫グロブリンＶＨ／ＶＬペアによって従来結合される構造のユニットを包含する。エピトープは抗体に対する最低限の結合部位を定義し、それゆえに抗体またはその抗原結合断片の特異性の標的を表す。シングルドメイン抗体のケースでは、エピトープは、単独の可変ドメインによって結合される構造のユニットを表す。用語「抗原性決定基」および「エピトープ」もまた本明細書において交換可能に用いられ得る。
【０１５５】
標的または抗原について、標的または抗原上の用語「リガンド相互作用部位」は、リガンド、受容体、もしくは他の結合パートナーへの結合のための部位、触媒部位、切断部位、アロステリック相互作用の部位、標的もしくは抗原の多量体化（例えばホモマー化またはヘテロ二量体化）に関わる部位である標的または抗原上の部位、エピトープ、抗原性決定基、一部、ドメイン、または一続きのアミノ酸残基、あるいは、標的または抗原の生物学的作用またはメカニズムに関わる標的または抗原上のいずれかの他の部位、エピトープ、抗原性決定基、一部、ドメイン、または一続きのアミノ酸残基を意味する。例えば、いくつかの態様において、ＬＡＰ上のリガンド相互作用部位は、ＴＧＦ−βが結合もしくは相互作用するいずれかの部位、またはインテグリンが結合もしくは相互作用するいずれかの部位、またはＬＴＢＰが結合もしくは相互作用するいずれかの部位であり得る。より一般的に、「リガンド相互作用部位」は、ＬＡＰおよびリガンドの間の相互作用または結合（および／または、リガンドへのＬＡＰ結合によって媒介されるいずれかの経路、相互作用、シグナル伝達、生物学的メカニズム、もしくは生物学的効果が関わる）が調節されるように、本明細書に記載されるＬＡＰ結合剤の結合部位が結合し得る標的または抗原上のいずれかの部位、エピトープ、抗原性決定基、一部、ドメイン、または一続きのアミノ酸残基であり得る。例えば、その内容がそれらの全体として参照によって本明細書に組み込まれるMittl et al., Protein Sci. 5: 1261-1271(1996), "The crystal structre of TGFβ3 and comparison to TGFβ2: implications for receptor binding"参照。
【０１５６】
抗体またはその抗原結合断片の文脈において、用語「特異性」または「に特異的」は、特定の抗体またはその抗原結合断片が結合し得る抗原または抗原性決定基の異なる型の数を言う。抗体またはその抗原結合断片もしくは部分の特異性は親和性および／またはアビディティに基づいて決定され得る。親和性は、抗原結合蛋白質との抗原の解離の平衡定数（ＫＤ）によって表され、抗原性決定基および抗原結合蛋白質上の抗原結合部位の間の結合の強さの尺度である。ＫＤの値が小さいほど、抗原性決定基および抗原結合分子の間の結合の強さは強くなる。代替的には、親和性は親和性定数（ＫＡ）としてもまた表現され得、これは１／ＫＤである。当業者には明白であろうように、親和性は、具体的な関心の抗原に依存して自体公知の様式で決定され得る。従って、本明細書において定義される抗体またはその抗原結合断片は、それが、前記のアミノ酸配列またはポリペプチドが別の標的またはポリペプチドに結合する親和性よりも少なくとも５０倍、例えば少なくとも１００倍、好ましくは少なくとも１０００倍、最大で１０，０００倍以上良好である親和性（例えばＫＤ値として上に記載され、好適に表現される）で第１の抗原に結合するときに、第２の標的または抗原と比較して第１の標的または抗原「に特異的」であると言われる。好ましくは、抗体またはその抗原結合断片が別の標的または抗原と比較してある標的または抗原「に特異的」であるときには、それは標的または抗原に結合し得るが、別の標的または抗原には結合しない。
【０１５７】
しかしながら、当業者によって理解されるように、いくつかの態様において、標的上の結合部位が複数の異なるリガンドによって共有または部分的に共有されるところでは、抗体またはその抗原結合断片はＬＡＰなどの標的に特異的に結合し、複数の異なるリガンドの結合を阻害する／防ぐ機能的な効果を有し得る。
【０１５８】
アビディティは、抗原結合分子およびしかるべき抗原の間の結合の強さの尺度である。アビディティは、抗原性決定基および抗原結合分子その抗原結合部位の間の親和性、ならびに抗原結合分子上に存在するしかるべき結合部位の数両方に関係する。典型的には、抗原結合蛋白質は、１０−５から１０−１２モル／リットル以下、好ましくは１０−７から１０−１２モル／リットル以下、より好ましくは１０−８から１０−１２モル／リットルの解離定数（ＫＤ）で（すなわち、１０５から１０１２リットル／モル以上、好ましくは１０７から１０２リットル／モル以上、より好ましくは１０８から１０１２リットル／モルの会合定数（ＫＡ）で）、それらの正しいまたは特異的な抗原に結合するであろう。１０−４モル／リットルよりも大きいいずれかのＫＤ値（または１０４Ｍ−１よりも低いいずれかのＫＡ値）は、一般的には、非特異的結合を示していると考えられる。有意（例えば特異的）と考えられる生物学的相互作用のＫＤは、典型的には１０−１０Ｍ（０．１ｎＭ）から１０−５Ｍ（１００００ｎＭ）の範囲である。相互作用が強いほど、そのＫＤは低くなる。好ましくは、本明細書に記載される抗ＬＡＰ抗体またはその抗原結合断片上の結合部位は、５００ｎＭよりも小さい、好ましくは２００ｎＭよりも小さい、より好ましくは１０ｎＭよりも小さい、例えば５００ｐＭよりも小さい親和性で結合するであろう。抗原または抗原性決定基への抗原結合蛋白質の特異的結合は自体公知のいずれかの好適な様式によって決定され得、例えば、スキャッチャード解析および／または競合的結合アッセイ、例えばラジオイムノアッセイ（ＲＩＡ）、酵素イムノアッセイ（ＥＩＡ）、およびサンドイッチ競合アッセイ、ならびに当分野において自体公知のその異なるバリアント、ならびに本明細書において挙げられる他の技術を包含する。
【０１５９】
本明細書に記載される方法のいくつかの態様において、ＬＡＰ結合剤は抗ＬＡＰモノクローナル抗体である。
【０１６０】
本明細書において用いられる用語「モノクローナル抗体」は、実質的に均質な抗体の集団から得られる抗体を言い、すなわち、少量存在し得る可能な天然に存在する変異を別にすれば、集団を構成する個々の抗体は同一である。モノクローナル抗体は高度に特異的であり、単一の抗原を対象とする。さらにその上に、典型的には異なる決定基（エピトープ）を対象とする異なる抗体を包含するポリクローナル抗体調製物と対照的に、モノクローナル調製物中のそれぞれの抗体は抗原上の同じ単一の決定基を対象とする。用語「モノクローナル抗体」は、それが産生される方法ではなく、いずれかの真核、原核、またはファージクローンを包含する単一のクローンに由来する抗体を言うということが理解されるべきである。本明細書において用いられる用語「モノクローナル抗体」はハイブリドーマテクノロジーによって産生される抗体に限定されず、修飾語「モノクローナル」はいずれかの特定の方法による抗体の産生を要求すると解釈されるべきではない。例えば、本発明によって用いられるべきモノクローナル抗体は、第１にKohler et al., Nature 256:495 (1975)によって記載されたハイブリドーマの方法もしくはその後の改作物によって作られ得るか、または組換えＤＮＡの方法によって作られ得る（例えばＵ．Ｓ．Ｐａｔ．Ｎｏ．４，８１６，５６７参照）。「モノクローナル抗体」は、例えばClackson et al., Nature 352:624-628 (1991)またはMarks et al., J. Mol. Biol. 222:581-597 (1991) に記載されている技術を用いてファージ抗体ライブラリーからもまた単離され得る。
【０１６１】
本明細書に記載される組成物および方法のいくつかの態様において、ＬＡＰ結合剤は、ハイブリドーマクローンTW4-9E7、TW4-5A8、TW4-3E5、TW4-4E5、TW4-12B12、TW4-13B12、TW4-1G12、TW4-3G5、TW4-2F8、TW4-6H10、TW4-1G2、TW4-1E1、TW4-16F4、TW4-8F10、TW4-3H6、TW4-2C9、TW7-16B4、TW7-28G11、TW7-7H4、およびTW7-20B9のいずれか１つによって産生される抗ＬＡＰモノクローナル抗体である。
【０１６２】
本明細書に記載される組成物および方法のいくつかの態様において、ＬＡＰ結合剤は、ハイブリドーマクローンTW4-9E7、TW4-5A8、TW4-4E5、TW4-12B12、TW4-13B12、TW4-1G12、TW4-3E5、TW4-3G5、TW4-2F8、TW4-6H10、TW4-1G2、TW4-1E1、TW4-16F4、TW4-8F10、TW4-3H6、TW4-2C9、TW7-16B4、TW7-28G11、TW7-7H4、およびTW7-20B9のいずれか１つによって産生される抗体の１つ以上の生物学的特徴を有する抗ＬＡＰモノクローナル抗体である。
【０１６３】
本明細書において用いられる、TW7-28G11抗体またはTW7-16B4などの指定の抗体の「生物学的特徴」を有する抗体は、同じ抗原に結合する他の抗体からそれを区別するその抗体の生物学的特徴の１つ以上を備えるものである。例えば、TW7-28G11モノクローナル抗体の生物学的特徴は、所与の集団についてTW7-28G11抗体のＥＤ５０値かまたはその付近のＥＤ５０値（すなわち、集団の５０％において治療有効な用量）を有すること、所与のパラメータまたは表現型についてTW7-28G11抗体のＥＣ５０値かまたはその付近のＥＣ５０値（すなわち、所与のパラメータまたは表現型の最大の半分の阻害を達成する用量）を有することを包含する。いずれかの特定の投薬量の効果は、好適なバイオアッセイによってモニタリングされ得る。例えば、これらの側面のいくつかの態様において、ＬＡＰに特異的に結合し、TW7-28G11抗体の１つ以上の生物学的特徴を有する抗ＬＡＰ抗体によって阻害されるべき所与のパラメータまたは表現型は、ヒトおよびマウスＬＡＰ両方に特異的に結合し、ならびに／または小型潜在型複合体からのＴＧＦ−βの放出を防ぐかもしくは阻害し、ならびに／または制御性Ｔ細胞集団（例えば、ＬＡＰを発現するＣＤ４＋制御性Ｔ細胞および／またはＣＤ１０３＋ＣＤ８Ｔ細胞）を選択的に枯渇させる能力を包含し得るが、これに限定されない。
【０１６４】
本明細書に記載される側面のいくつかの態様において、本明細書に記載される組成物および方法への使用のための抗ＬＡＰ抗体は、ハイブリドーマクローンTW4-9E7、TW4-5A8、TW4-3E5、TW4-4E5、TW4-12B12、TW4-13B12、TW4-1G12、TW4-3G5、TW4-2F8、TW4-6H10、TW4-1G2、TW4-1E1、TW4-16F4、TW4-8F10、TW4-3H6、TW4-2C9、TW7-16B4、TW7-28G11、TW7-7H4、およびTW7-20B9のいずれか１つによって産生されるモノクローナル抗体と同じＬＡＰのあるエピトープまたは複数のエピトープに結合するモノクローナル抗体を包含する。
【０１６５】
いくつかの側面において、抗ＬＡＰモノクローナル抗体は、本明細書に記載されるハイブリドーマTW7-28G11によって産生または発現され、「TW7-28G11抗体」または「TW7-28G11抗ＬＡＰ抗体」と言われるモノクローナル抗ＬＡＰ抗体TW7-28G11、およびその誘導体または抗原結合断片であり、例えば「TW7-28G11可変重鎖」または「TW7-28G11可変軽鎖」を包含する。
【０１６６】
本明細書に記載されるように、TW7-28G11ハイブリドーマは本明細書において「TW7-28G11抗ＬＡＰ抗体」または「TW7-28G11抗体」または「バリアントTW7-28G11抗ＬＡＰモノクローナル抗体」と呼称されるモノクローナル抗体を産生し、これはＬＡＰに高度に特異的であり、ＬＡＰの生物学的活性を強力に阻害し、癌の処置において高い治療効果を提供し得る。本明細書において示されているように、TW7-28G11抗ＬＡＰ抗体はヒトおよびマウスＬＡＰ両方に結合し、小型潜在型複合体からのＴＧＦ−βの放出を防ぐかまたは阻害し、インビボ投与されたときに制御性Ｔ細胞集団（例えば、ＬＡＰを発現するＣＤ４＋制御性Ｔ細胞および／またはＣＤ１０３＋ＣＤ８Ｔ細胞）を選択的に枯渇させる。TW7-28G11抗ＬＡＰ抗体、およびそれから由来または作製されるいずれかの抗原結合断片の生物学的特徴は、治療および診断応用を包含する本明細書に記載される組成物および方法にとってそれを特に有用にする。従って、TW7-28G11抗体の配列解析を本明細書に記載されるように行って、本明細書に記載される組成物および方法への使用のためのTW7-28G11抗体の重および軽鎖可変ドメイン配列ならびに相補性決定領域（ＣＤＲ）配列を同定した。
【０１６７】
本明細書および請求項において、免疫グロブリン重鎖中の残基の付番はKabat et al., Sequences of Proteins of Immunological Interest, 5th Ed. Public Health Service, National Institutes of Health, Bethesda, Md. (1991) のＥＵインデックスのものであり、これはワールドワイドウェブ上でもまた利用可能であり、参照によってその全体として本明細書に明示的に組み込まれる。「KabatのＥＵインデックス」はヒトＩｇＧ１ＥＵ抗体の残基付番を言う。本明細書において用いられる「Kabat配列付番」または「Kabat標識」は、KabatのＥＵインデックスによる可変領域をコードする配列の付番を言う。重鎖可変領域では、超可変領域は、Kabat付番に従って、ＣＤＲ１ではアミノ酸位置３１から３５、ＣＤＲ２ではアミノ酸位置５０から６５、およびＣＤＲ３ではアミノ酸位置９５から１０２の範囲である。軽鎖可変領域では、超可変領域は、Kabat付番に従って、ＣＤＲ１ではアミノ酸位置２４から３４、ＣＤＲ２ではアミノ酸位置５０から５６、およびＣＤＲ３ではアミノ酸位置８９から９７の範囲である。いくつかの態様においては、可変領域のＩＭＧＴ（国際免疫遺伝情報システム）付番もまた用いられ得、これはLefranc, M.-P., "The IMGT unique numbering for Immunoglobulins, T-Cell Receptors and Ig-like Domains", The Immunologist, 7, 132-136 (1999)に記載されているＩＭＧＴの方法による免疫グロブリン可変重または軽鎖の残基の付番であり、参照によってその全体として本明細書に明示的に組み込まれる。本明細書において用いられる「ＩＭＧＴ配列付番」は、ＩＭＧＴによる可変領域をコードする配列の付番を言う。
【０１６８】
TW7-28G11ハイブリドーマから得られた配列の解析によって得られたTW7-28G11抗体の重鎖のＶＨまたは可変ドメインをコードするヌクレオチド配列は、
ATGAAGTTGTGGCTGAACTGGATTTTCCTTGTAACACTTTTAAATGATATCCAGTGTGAGGTGAAGCTGGTGGAGTCTGGAGGAGGCTTGGTACAGCCTGGGGGTTCTCTGAGTCTCTCCTGTGCAGCTTCTGGATTCACCTTCACTGATTACTACATGAGCTGGGTCCGCCAGCCTCCAGGGAAGGCACTTGAGTGGTTGGGTTTTATTAGAAACAAACCTAATGGTTACACAACAGAGTACAGTGCATCTGTGAAGGGTCGGTTCACCATCTCCAGAGATAATTCCCAAAGCATCCTCTATCTTCAAATGAATGTCCTGAGAGCTGAGGACAGTGCCACTTATTACTGTGCAAGATATACGGGGGGGGGTTACTTTGACTACTGGGGCCAAGGCACCACTCTCACAGTCTCCTCA（配列番号７）
である。
【０１６９】
配列番号７に対応するTW7-28G11抗体のＶＨドメインのアミノ酸配列は、
MKLWLNWIFLVTLLNDIQCEVKLVESGGGLVQPGGSLSLSCAASGFTFTDYYMSWVRQPPGKALEWLGFIRNKPNGYTTEYSASVKGRFTISRDNSQSILYLQMNVLRAEDSATYYCARYTGGGYFDYWGQGTTLTVSS（配列番号８）
である。
【０１７０】
Kabatの配列付番に従うTW7-28G11抗体の配列番号８のＶＨドメインの相補性決定領域１またはＣＤＲ１のアミノ酸配列はDYYMS（配列番号９）である。Kabatの配列付番に従うTW7-28G11抗体の配列番号８のＶＨドメインのＣＤＲ２のアミノ酸配列はFIRNKPNGYTTEYSASVKG（配列番号１０）である。Kabatの配列付番に従うTW7-28G11抗体の配列番号８のＶＨドメインのＣＤＲ３のアミノ酸配列はYTGGGYFDY（配列番号１１）である。
【０１７１】
TW7-28G11ハイブリドーマから得られた配列の解析によって得られたTW7-28G11抗体の軽鎖のＶＬまたは可変ドメインをコードするヌクレオチド配列は、
ATGATGTCCTCTGCTCAGTTCCTTGGTCTCCTGTTGCTCTGTTTTCAAGGTACCAGATGTGATATCCAGATGACACAGACTACATCCTCCCTGTCTGCCTCTCTGGGAGACAGACTCACCATCAGTTGCAGGGCAAGTCAGGACATTAGCAATTATTTAAACTGGTATCAGCAGAAACCAGATGGAACTGTTAAACTCCTGATCTACTACACATCAAGATTACACTCAGGAGTCCCATCAAGGTTCAGTGGCAGTGGGTCTGGAACAGATTATTCTCTCACCATTAGCAACCTGGAGCAAGCAGATATTGCCACTTACTTTTGCCAACAGGGTGATACACTTCCGTGGACGTTCGGTGGAGGCACCAAGCTGGAAATCAAA（配列番号１２）
である。
【０１７２】
配列番号１２に対応するTW7-28G11抗体のＶＬドメインのアミノ酸配列は、
MMSSAQFLGLLLLCFQGTRCDIQMTQTTSSLSASLGDRLTISCRASQDISNYLNWYQQKPDGTVKLLIYYTSRLHSGVPSRFSGSGSGTDYSLTISNLEQADIATYFCQQGDTLPWTFGGGTKLEIK（配列番号１３）
である。
【０１７３】
Kabatの配列付番に従うTW7-28G11抗体の配列番号１３のＶＬドメインの相補性決定領域１またはＣＤＲ１のアミノ酸配列はRASQDISNYLN（配列番号１４）である。Kabatの配列付番に従うTW7-28G11抗体の配列番号１３のＶＬドメインのＣＤＲ２のアミノ酸配列はYTSRLHS（配列番号１５）である。Kabatの配列付番に従うTW7-28G11抗体の配列番号１３のＶＬドメインのＣＤＲ３のアミノ酸配列はQQGDTLPWT（配列番号１６）である。
【０１７４】
Kabatの配列付番に従うTW7-28G11抗体の配列番号８のＶＨドメインのフレームワーク１またはＦＲ１領域のアミノ酸配列はEVKLVESGGGLVQPGGSLSLSCAASGFTFT（配列番号１７）である。Kabatの配列付番に従うTW7-28G11抗体の配列番号８のＶＨドメインのフレームワーク２またはＦＲ２領域のアミノ酸配列はWVRQPPGKALEWLG（配列番号１８）である。Kabatの配列付番に従うTW7-28G11抗体の配列番号８のＶＨドメインのフレームワーク３またはＦＲ３領域のアミノ酸配列はRFTISRDNSQSILYLQMNVLRAEDSATYYCAR（配列番号１９）である。Kabatの配列付番に従うTW7-28G11抗体の配列番号８のＶＨドメインのフレームワーク４またはＦＲ４領域のアミノ酸配列はWGQGTTLTVSS（配列番号２０）である。
【０１７５】
Kabatの配列付番に従うTW7-28G11抗体の配列番号１３のＶＬドメインのフレームワーク１またはＦＲ１領域のアミノ酸配列はDIQMTQTTSSLSASLGDRLTISC（配列番号２１）である。Kabatの配列付番に従うTW7-28G11抗体の配列番号１３のＶＬドメインのフレームワーク２またはＦＲ２領域のアミノ酸配列はWYQQKPDGTVKLLIY（配列番号２２）である。Kabatの配列付番に従うTW7-28G11抗体の配列番号１３のＶＬドメインのフレームワーク３またはＦＲ３領域のアミノ酸配列はGVPSRFSGSGSGTDYSLTISNLEQADIATYFC（配列番号２３）である。Kabatの配列付番に従うTW7-28G11抗体の配列番号１３のＶＬドメインのフレームワーク２またはＦＲ２領域のアミノ酸配列はFGGGTKLEIK（配列番号２４）である。
【０１７６】
従って、本明細書において提供される側面のいくつかの態様において、TW7-28G11抗体の重および／または軽鎖可変ドメイン（単数または複数）配列（単数または複数）、すなわち配列番号８および／または配列番号１３、ならびにそれらのそれぞれのＣＤＲ配列の配列番号９〜１１および配列番号１４〜１６は、例えば、本明細書の他所に記載されるように、ＣＤＲグラフト、キメラ、ヒト化、またはコンポジットヒト抗体または抗原結合断片を作製するために用いられ得る。当業者によって理解されるように、TW7-28G11抗体または本明細書に記載される組成物および方法に有用なハイブリドーマTW4-9E7、TW4-5A8、TW4-3E5、TW4-4E5、TW4-12B12、TW4-13B12、TW4-1G12、TW4-3G5、TW4-2F8、TW4-6H10、TW4-1G2、TW4-1E1、TW4-16F4、TW4-8F10、TW4-3H6、TW4-2C9、TW7-16B4、TW7-28G11、TW7-7H4、およびTW7-20B9によって産生される抗体のいずれか１つに由来するいずれかのバリアント、ＣＤＲグラフト、キメラ、ヒト化、もしくはコンポジット抗体または抗原結合断片は、ＬＡＰに免疫特異的に結合する能力を維持し、その結果、バリアント、ＣＤＲグラフト、キメラ、ヒト化、またはコンポジット抗体またはその抗原結合断片は、それが由来する元の抗体と相対的に、ＬＡＰへの少なくとも５０％、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、またはより多くの結合を有するであろう。
【０１７７】
本明細書に記載される側面のいくつかの態様において、ＬＡＰ（例えばヒトＬＡＰ）に特異的に結合する本明細書に記載される抗ＬＡＰ抗体またはその抗原結合断片は軽鎖可変領域（ＶＬ）を含み、配列番号１４のＶＬＣＤＲ１、配列番号１５のＶＬＣＤＲ２、および配列番号１４のＶＬＣＤＲ３、またはハイブリドーマTW4-9E7、TW4-5A8、TW4-3E5、TW4-4E5、TW4-12B12、TW4-13B12、TW4-1G12、TW4-3G5、TW4-2F8、TW4-6H10、TW4-1G2、TW4-1E1、TW4-16F4、TW4-8F10、TW4-3H6、TW4-2C9、TW7-16B4、TW7-28G11、TW7-7H4、およびTW7-20B9によって産生される抗体のいずれか１つのＶＬＣＤＲ１、ＶＬＣＤＲ２、およびＶＬＣＤＲ３を含む。いくつかの態様において、抗ＬＡＰ抗体またはその抗原結合断片はTW7-28G11抗体のＶＬフレームワーク領域を含む。本明細書に記載される側面のいくつかの態様において、抗ＬＡＰ抗体またはその抗原結合断片は、配列番号１３の軽鎖可変領域配列のフレームワーク領域の１つ、２つ、３つ、または４つを含む軽鎖可変領域配列を含む。本明細書に記載される側面のいくつかの態様において、抗ＬＡＰ抗体またはその抗原結合断片は、配列番号１３の軽鎖可変領域配列のフレームワーク領域の１つ、２つ、３つ、または４つと少なくとも７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、または１００％同一である軽鎖可変領域配列のフレームワーク領域の１つ、２つ、３つ、または４つを含む。本明細書に記載される側面のいくつかの態様において、前記のアミノ酸配列に由来する軽鎖可変フレームワーク領域は、最大で１０アミノ酸の置換、欠失、および／または挿入、好ましくは最大で１０アミノ酸の置換の存在を別にすれば、前記のアミノ酸配列からなる。本明細書に記載される側面のいくつかの態様において、前記のアミノ酸配列に由来する軽鎖可変フレームワーク領域は前記のアミノ酸配列からなり、１、２、３、４、５、６、７、８、９、または１０アミノ酸残基が、対応する非ヒト、霊長類、またはヒト軽鎖可変フレームワーク領域中の相当位置に見いだされるアミノ酸に置換される。
【０１７８】
本明細書に記載される側面のいくつかの態様において、ＬＡＰに特異的に結合する本明細書に記載される抗ＬＡＰ抗体またはその抗原結合断片は、それぞれ配列番号１４、１５、および１６のＶＬＣＤＲ１、ＶＬＣＤＲ２、およびＶＬＣＤＲ３を含む。本明細書に記載される側面のいくつかの態様において、抗体または抗原結合断片は、ヒトまたは霊長類抗体のＶＬに由来する１つ、２つ、３つ、または全ての４つのＶＬフレームワーク領域をさらに含む。本明細書に記載される軽鎖ＣＤＲ配列による使用のために選択される抗体の霊長類またはヒト軽鎖フレームワーク領域は、例えば、非ヒト親抗体の軽鎖フレームワーク領域、例えば配列番号２１〜２４と少なくとも７０％の同一性を有し得る。選択される霊長類またはヒト抗体は、TW7-28G11抗体の軽鎖相補性決定領域、すなわち配列番号１４〜１６のものとアミノ酸の同じまたは実質的に同じ数を、その軽鎖相補性決定領域に有し得る。本明細書に記載される側面のいくつかの態様において、霊長類またはヒト軽鎖フレームワーク領域アミノ酸残基は、TW7-28G11抗体の軽鎖フレームワーク領域、すなわち配列番号２０〜２４と少なくとも７５％の同一性、少なくとも８０％の同一性、少なくとも８５％の同一性（またはより多く）を有する天然の霊長類またはヒト抗体軽鎖フレームワーク領域からである。いくつかの態様において、抗ＬＡＰ抗体または抗原結合断片は、ヒト軽鎖可変カッパサブファミリーに由来する１つ、２つ、３つ、または全ての４つのＶＬフレームワーク領域をさらに含む。いくつかの態様において、抗ＬＡＰ抗体または抗原結合断片は、ヒト軽鎖可変ラムダサブファミリーに由来する１つ、２つ、３つ、または全ての４つのＶＬフレームワーク領域をさらに含む。
【０１７９】
本明細書に記載される側面のいくつかの態様において、ＬＡＰに特異的に結合する本明細書に記載される抗ＬＡＰ抗体またはその断片は重鎖可変領域（ＶＨ）を含み，それぞれ配列番号９、１０、および１１のＶＨＣＤＲ１、ＶＨＣＤＲ２、およびＶＨＣＤＲ３、またはハイブリドーマTW4-9E7、TW4-5A8、TW4-3E5、TW4-4E5、TW4-12B12、TW4-13B12、TW4-1G12、TW4-3G5、TW4-2F8、TW4-6H10、TW4-1G2、TW4-1E1、TW4-16F4、TW4-8F10、TW4-3H6、TW4-2C9、TW7-16B4、TW7-28G11、TW7-7H4、およびTW7-20B9によって産生される抗体のいずれか１つのＶＨＣＤＲ１、ＶＨＣＤＲ２、およびＶＨＣＤＲ３を含む。本明細書に記載される側面のいくつかの態様において、抗ＬＡＰ抗体またはその抗原結合断片は、配列番号８の重鎖可変領域配列のフレームワーク領域の１つ、２つ、３つ、または全ての４つを含む。本明細書に記載される側面のいくつかの態様において、抗ＬＡＰ抗体またはその抗原結合断片は、配列番号８の重鎖可変領域配列のフレームワーク領域の１つ、２つ、３つ、または４つと少なくとも７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、または１００％同一である重鎖可変領域配列のフレームワーク領域の１つ、２つ、３つ、または４つを含む。本明細書に記載される側面のいくつかの態様において、前記のアミノ酸配列に由来する重鎖可変フレームワーク領域は、最大で１０アミノ酸の置換、欠失、および／または挿入、好ましくは最大で１０アミノ酸の置換の存在を別にすれば、前記のアミノ酸配列からなる。本明細書に記載される側面のいくつかの態様において、前記のアミノ酸配列に由来する重鎖可変フレームワーク領域は前記のアミノ酸配列からなり、１、２、３、４、５、６、７、８、９、または１０アミノ酸残基が、対応する非ヒト、霊長類、またはヒト重鎖可変フレームワーク領域中の相当位置に見いだされるアミノ酸に置換される。
【０１８０】
本明細書に記載される側面のいくつかの態様において、ＬＡＰに特異的に結合する本明細書に記載される抗ＬＡＰ抗体またはその断片は、それぞれ配列番号９、１０、および１１のＶＨＣＤＲ１、ＶＨＣＤＲ２、およびＶＨＣＤＲ３を含む。本明細書に記載される側面のいくつかの態様において、抗ＬＡＰ抗体または抗原結合断片は、ヒトまたは霊長類抗体のＶＨに由来する１つ、２つ、３つ、または全ての４つのＶＨフレームワーク領域をさらに含む。本明細書に記載される重鎖ＣＤＲ配列による使用のために選択される抗体の霊長類またはヒト重鎖フレームワーク領域は、例えば、非ヒト親抗体の重鎖フレームワーク領域、例えば配列番号１７〜２０と少なくとも７０％の同一性を有し得る。好ましくは、選択される霊長類またはヒト抗体は、TW7-28G11抗体の軽鎖相補性決定領域、すなわち配列番号９〜１１のものとアミノ酸の同じまたは実質的に同じ数をその重鎖相補性決定領域に有し得る。本明細書に記載される側面のいくつかの態様において、霊長類またはヒト重鎖フレームワーク領域アミノ酸残基は、TW7-28G11抗体の重鎖フレームワーク領域、すなわち配列番号１７〜２０と少なくとも７５％の同一性、少なくとも８０％の同一性、少なくとも８５％の同一性（またはより多く）を有する天然の霊長類またはヒト抗体重鎖フレームワーク領域からである。具体的な態様において、抗体または抗原結合断片は、ヒト重鎖可変サブファミリー（例えば、サブファミリー１から７の１つ）に由来する１つ、２つ、３つ、または全ての４つのＶＨフレームワーク領域をさらに含む。
【０１８１】
本明細書に記載される側面のいくつかの態様において、ＬＡＰに特異的に結合する本明細書に記載される抗ＬＡＰ抗体またはその断片は、（ｉ）それぞれ配列番号９、１０、および１１のＶＨＣＤＲ１、ＶＨＣＤＲ２、およびＶＨＣＤＲ３を含む重鎖可変領域（ＶＨ）と、（ｉｉ）それぞれ配列番号１４、１５、および１６のＶＬＣＤＲ１、ＶＬＣＤＲ２、およびＶＬＣＤＲ３を含む軽鎖可変領域（ＶＬ）とを含む。本明細書に記載される側面のいくつかの態様において、本明細書に記載される抗ＬＡＰ抗体またはその抗原結合断片は、配列番号８の重鎖可変領域配列のフレームワーク領域の１つ、２つ、３つ、または４つと少なくとも７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、または１００％同一である重鎖可変領域配列の１つ、２つ、３つ、または４つのフレームワーク領域を含む。本明細書に記載される側面のいくつかの態様において、前記のアミノ酸配列に由来する重鎖可変フレームワーク領域は、最大で１０アミノ酸の置換、欠失、および／または挿入、好ましくは最大で１０アミノ酸の置換の存在を別にすれば、前記のアミノ酸配列からなる。本明細書に記載される側面のいくつかの態様において、前記のアミノ酸配列に由来する重鎖可変フレームワーク領域は前記のアミノ酸配列からなり、１、２、３、４、５、６、７、８、９、または１０アミノ酸残基が、対応する非ヒト、霊長類、またはヒト重鎖可変フレームワーク領域中の相当位置に見いだされるアミノ酸に置換される。本明細書に記載される側面のいくつかの態様において、抗ＬＡＰ抗体またはその抗原結合断片は、配列番号１３の軽鎖可変領域配列のフレームワーク領域の１つ、２つ、３つ、または４つを含む軽鎖可変領域配列を含む。本明細書に記載される側面のいくつかの態様において、抗ＬＡＰ抗体またはその抗原結合断片は、配列番号１３の軽鎖可変領域のフレームワーク領域の１つ、２つ、３つ、または４つと少なくとも７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、または１００％同一である軽鎖可変領域配列の１つ、２つ、３つ、または４つのフレームワーク領域を含む。本明細書に記載される側面のいくつかの態様において、前記のアミノ酸配列に由来する軽鎖可変フレームワーク領域は、最大で１０アミノ酸の置換、欠失、および／または挿入、好ましくは最大で１０アミノ酸の置換の存在を別にすれば、前記のアミノ酸配列からなる。本明細書に記載される側面のいくつかの態様において、前記のアミノ酸配列に由来する軽鎖可変フレームワーク領域は前記のアミノ酸配列からなり、１、２、３、４、５、６、７、８、９、または１０アミノ酸残基が対応する非ヒト、霊長類、またはヒト軽鎖可変フレームワーク領域中の相当位置に見いだされるアミノ酸に置換される。本明細書に記載される軽鎖ＣＤＲ配列による使用のために選択される抗体の霊長類またはヒト軽鎖フレームワーク領域は、例えば、非ヒト親抗体の軽鎖フレームワーク領域、例えば配列番号２１〜２４と少なくとも７０％の同一性を有し得る。選択される霊長類またはヒト抗体は、TW7-28G11抗体の軽鎖相補性決定領域、すなわち配列番号１４〜１６のものとアミノ酸の同じまたは実質的に同じ数をその軽鎖相補性決定領域に有し得る。本明細書に記載される側面のいくつかの態様において、霊長類またはヒト軽鎖フレームワーク領域アミノ酸残基は、TW7-28G11抗体の軽鎖フレームワーク領域、すなわち配列番号２０〜２４と少なくとも７５％の同一性、少なくとも８０％の同一性、少なくとも８５％の同一性（またはより多く）を有する天然の霊長類またはヒト抗体軽鎖フレームワーク領域からである。本明細書に記載される重鎖ＣＤＲ配列による使用のために選択される抗体の霊長類またはヒト重鎖フレームワーク領域は、例えば、非ヒト親抗体の重鎖フレームワーク領域、例えば配列番号１７〜２０と少なくとも７０％の同一性を有し得る。好ましくは、選択される霊長類またはヒト抗体は、TW7-28G11抗体の軽鎖相補性決定領域、すなわち配列番号９〜１１のものとアミノ酸の同じまたは実質的に同じ数をその重鎖相補性決定領域に有し得る。本明細書に記載される側面のいくつかの態様において、霊長類またはヒト重鎖フレームワーク領域アミノ酸残基は、TW7-28G11抗体、すなわち配列番号１７〜２０の重鎖フレームワーク領域と少なくとも７５％の同一性、少なくとも８０％の同一性、少なくとも８５％の同一性（またはより多く）を有する天然の霊長類またはヒト抗体重鎖フレームワーク領域からである。具体的な態様において、抗体または抗原結合断片は、ヒト重鎖可変サブファミリー（例えば、サブファミリー１から７の１つ）に由来する１つ、２つ、３つ、または全ての４つのＶＨフレームワーク領域をさらに含む。
【０１８２】
本明細書に記載される側面のいくつかの態様において、ＬＡＰに特異的に結合する抗ＬＡＰ抗体またはその断片は、それぞれ配列番号１４、１５、１６、９、１０、および１１のＶＬＣＤＲ１、ＶＬＣＤＲ２、ＶＬＣＤＲ３、ＶＨＣＤＲ１、ＶＨＣＤＲ２、およびＶＨＣＤＲ３を含む。ある種の態様において、抗ＬＡＰ抗体または抗原結合断片は、ヒトまたは霊長類抗体のＶＬに由来する１つ、２つ、３つ、または全ての４つのＶＬフレームワーク領域とヒトまたは霊長類抗体のＶＨに由来する１つ、２つ、３つ、または全ての４つのＶＨフレームワーク領域とをさらに含む。本明細書に記載される軽鎖ＣＤＲ配列による使用のために選択される抗体の霊長類またはヒト軽鎖フレームワーク領域は、例えば、非ヒト親抗体の軽鎖フレームワーク領域、例えば配列番号２１〜２４と少なくとも７０％の同一性を有し得る。選択される霊長類またはヒト抗体は、TW7-28G11抗体の軽鎖相補性決定領域、すなわち配列番号１４〜１６のものとアミノ酸の同じまたは実質的に同じ数をその軽鎖相補性決定領域に有し得る。本明細書に記載される側面のいくつかの態様において、霊長類またはヒト軽鎖フレームワーク領域アミノ酸残基は、TW7-28G11抗体の軽鎖フレームワーク領域、すなわち配列番号２０〜２４と少なくとも７５％の同一性、少なくとも８０％の同一性、少なくとも８５％の同一性（またはより多く）を有する天然の霊長類またはヒト抗体軽鎖フレームワーク領域からである。本明細書に記載される重鎖ＣＤＲ配列による使用のために選択される抗体の霊長類またはヒト重鎖フレームワーク領域は、例えば、非ヒト親抗体の重鎖フレームワーク領域、例えば配列番号１７〜２０と少なくとも７０％の同一性を有し得る。好ましくは、選択される霊長類またはヒト抗体は、TW7-28G11抗体の軽鎖相補性決定領域、すなわち配列番号９〜１１のものとアミノ酸の同じまたは実質的に同じ数をその重鎖相補性決定領域に有し得る。本明細書に記載される側面のいくつかの態様において、霊長類またはヒト重鎖フレームワーク領域アミノ酸残基は、TW7-28G11抗体の重鎖フレームワーク領域、すなわち配列番号１７〜２０と少なくとも７５％の同一性、少なくとも８０％の同一性、少なくとも８５％の同一性（またはより多く）を有する天然の霊長類またはヒト抗体重鎖フレームワーク領域からである。具体的な態様において、抗ＬＡＰ抗体または抗原結合断片は、ヒト重鎖可変サブファミリー（例えば、サブファミリー１から７の１つ）に由来する１つ、２つ、３つ、または全ての４つのＶＨフレームワーク領域をさらに含む。
【０１８３】
本明細書に記載される側面のいくつかの態様において、ＬＡＰに特異的に結合する抗体またはその断片は配列番号１３のＶＬドメインのアミノ酸配列を含む。本明細書に記載される側面のいくつかの態様において、ＬＡＰに特異的に結合する抗体またはその断片は、配列番号１３のアミノ酸配列からなるかまたは本質的になるＶＬドメインを含む。
【０１８４】
本明細書に記載される側面のいくつかの態様において、ＬＡＰに特異的に結合する抗ＬＡＰ抗体またはその断片は配列番号８のＶＨドメインのアミノ酸配列を含むＶＨドメインのアミノ酸配列を含む。本明細書に記載される側面のいくつかの態様において、ＬＡＰに特異的に結合する抗ＬＡＰ抗体またはその断片は、配列番号８のアミノ酸配列からなるかまたは本質的になるＶＨドメインを含む。
【０１８５】
本明細書に記載される側面のいくつかの態様において、ＬＡＰに特異的に結合する抗ＬＡＰ抗体またはその断片は、配列番号８のＶＨドメインのアミノ酸配列を含むＶＨドメインと配列番号１３のアミノ酸配列を含むＶＬドメインとを含む。本明細書に記載される側面のいくつかの態様において、ＬＡＰに特異的に結合する抗ＬＡＰ抗体またはその断片は、配列番号８のアミノ酸配列からなるかまたは本質的になるＶＨドメインと配列番号１３のアミノ酸配列からなるかまたは本質的になるＶＬドメインとを含む。
【０１８６】
本明細書に記載される抗体または抗原結合断片は、そのＶＬドメイン単独もしくはそのＶＨドメイン単独によって、またはその３つのＶＬＣＤＲ単独もしくはその３つのＶＨＣＤＲ単独によって記載され得る。例えば、ヒト軽鎖または重鎖ライブラリーからそれぞれ相補軽鎖または重鎖を同定することによるマウス抗ανβ３抗体のヒト化を記載し、元の抗体の親和性と同じく高いかまたはそれよりも高い親和性を有するヒト化抗体バリアントをもたらしている、その全体として参照によって本明細書に組み込まれるRader C et al., (1998) PNAS 95: 8910-8915参照。特異的なＶＬドメイン（またはＶＨドメイン）を用いることとライブラリーから相補的な可変ドメインをスクリーニングすることとによって特異的な抗原に結合する抗体を産生する方法を記載している、その全体として参照によって本明細書に組み込まれるClackson T et al., (1991) Nature 352: 624-628をもまた参照。
【０１８７】
本明細書に記載される側面のいくつかの態様において、本明細書に記載される抗体のＶＨ（例えばＣＤＲ１、ＣＤＲ２、もしくはＣＤＲ３）および／またはＶＬ（例えばＣＤＲ１、ＣＤＲ２、もしくはＣＤＲ３）領域上の１つ以上のＣＤＲの位置は、ＬＡＰ（例えばヒトＬＡＰ）への免疫特異的結合が維持される限りは（例えば実質的に維持され、例えば、それが由来する元の抗体の結合の少なくとも５０％、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％）、１、２、３、４、５、または６つのアミノ酸の位置だけ変わり得る。例えば、いくつかの態様において、本明細書に記載されるいずれかの抗体（例えば、ハイブリドーマTW4-9E7、TW4-5A8、TW4-3E5、TW4-4E5、TW4-12B12、TW4-13B12、TW4-1G12、TW4-3G5、TW4-2F8、TW4-6H10、TW4-1G2、TW4-1E1、TW4-16F4、TW4-8F10、TW4-3H6、TW4-2C9、TW7-16B4、TW7-28G11、TW7-7H4、およびTW7-20B9によって産生される抗体のいずれか１つ）のＣＤＲを定義する位置は、ＬＡＰ（例えばヒトＬＡＰ）への免疫特異的結合が維持される限りは（例えば実質的に維持され、例えば、それが由来する元の抗体の結合の少なくとも５０％、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％）、本明細書に記載される抗体のいずれか１つのＣＤＲ位置と相対的に１、２、３、４、５、または６アミノ酸だけＣＤＲのＮ末端および／またはＣ末端の境目をずらすことによって変わり得る。別の態様において、本明細書に記載される抗体のＶＨ（例えばＣＤＲ１、ＣＤＲ２、もしくはＣＤＲ３）および／またはＶＬ（例えばＣＤＲ１、ＣＤＲ２、もしくはＣＤＲ３）領域の１つ以上のＣＤＲの長さは、ＬＡＰ（例えばヒトＬＡＰ）への免疫特異的結合が維持される限りは（例えば実質的に維持され、例えば、それが由来する元の抗体の結合の少なくとも５０％、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％）、１つ、２つ、３つ、４つ、５つ、またはより多くのアミノ酸だけ変わり（例えば短くまたは長くあり）得る。
【０１８８】
従って、本明細書に記載される側面のいくつかの態様において、本明細書に記載されるＶＬＣＤＲ１、ＶＬＣＤＲ２、ＶＬＣＤＲ３、ＶＨＣＤＲ１、ＶＨＣＤＲ２、および／またはＶＨＣＤＲ３は、ＬＡＰ（例えばヒトＬＡＰ）への免疫特異的結合が維持される限りは（例えば実質的に維持され、例えば、それが由来する元の抗体の結合と相対的に少なくとも５０％、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％）、本明細書に記載されるＣＤＲ（例えば配列番号１４〜１６および９〜１１）の１つ以上よりも１つ、２つ、３つ、４つ、５つ、またはより多くのアミノ酸だけ短くあり得る。本明細書に記載される側面のいくつかの態様において、本明細書に記載されるＶＬＣＤＲ１、ＶＬＣＤＲ２、ＶＬＣＤＲ３、ＶＨＣＤＲ１、ＶＨＣＤＲ２、および／またはＶＨＣＤＲ３は、ＬＡＰ（例えばヒトＬＡＰ）への免疫特異的結合が維持される限りは（例えば実質的に維持され、例えば、それが由来する元の抗体の結合と相対的に少なくとも５０％、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％）、本明細書に記載されるＣＤＲ（例えば配列番号１４〜１６および９〜１１）の１つ以上よりも１つ、２つ、３つ、４つ、５つ、またはより多くのアミノ酸だけ長くあり得る。本明細書に記載される側面のいくつかの態様において、本明細書に記載されるＶＬＣＤＲ１、ＶＬＣＤＲ２、ＶＬＣＤＲ３、ＶＨＣＤＲ１、ＶＨＣＤＲ２、および／またはＶＨＣＤＲ３のアミノ末端は、ＬＡＰ（例えばヒトＬＡＰ）への免疫特異的結合が維持される限りは（例えば実質的に維持され、例えば、それが由来する元の抗体の結合と相対的に少なくとも５０％、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％）、本明細書に記載されるＣＤＲ（例えば配列番号１４〜１６および９〜１１）の１つ以上と比較して１つ、２つ、３つ、４つ、５つ、またはより多くのアミノ酸だけ延長され得る。本明細書に記載される側面のいくつかの態様において、本明細書に記載されるＶＬＣＤＲ１、ＶＬＣＤＲ２、ＶＬＣＤＲ３、ＶＨＣＤＲ１、ＶＨＣＤＲ２、および／またはＶＨＣＤＲ３のカルボキシ末端は、ＬＡＰ（例えばヒトＬＡＰ）への免疫特異的結合が維持される限りは（例えば実質的に維持され、例えば、それが由来する元の抗体の結合と相対的に少なくとも５０％、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％）、本明細書に記載されるＣＤＲ（例えば配列番号１４〜１６および９〜１１）の１つ以上と比較して１つ、２つ、３つ、４つ、５つ、またはより多くのアミノ酸だけ延長され得る。本明細書に記載される側面のいくつかの態様において、本明細書に記載されるＶＬＣＤＲ１、ＶＬＣＤＲ２、ＶＬＣＤＲ３、ＶＨＣＤＲ１、ＶＨＣＤＲ２、および／またはＶＨＣＤＲ３のアミノ末端は、ＬＡＰ（例えばヒトＬＡＰ）への免疫特異的結合が維持される限りは（例えば実質的に維持され、例えば、それが由来する元の抗体の結合と相対的に少なくとも５０％、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％）、本明細書に記載されるＣＤＲ（例えば配列番号１４〜１６および９〜１１）の１つ以上と比較して１つ、２つ、３つ、４つ、５つ、またはより多くのアミノ酸だけ短縮され得る。本明細書に記載される側面のいくつかの態様において、本明細書に記載されるＶＬＣＤＲ１、ＶＬＣＤＲ２、ＶＬＣＤＲ３、ＶＨＣＤＲ１、ＶＨＣＤＲ２、および／またはＶＨＣＤＲ３のカルボキシ末端は、ＬＡＰ（例えばヒトＬＡＰ）への免疫特異的結合が維持される限りは（例えば実質的に維持され、例えば、それが由来する元の抗体の結合と相対的に少なくとも５０％、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％）、本明細書に記載されるＣＤＲ（例えば配列番号１４〜１６および９〜１１）の１つ以上と比較して１つ、２つ、３つ、４つ、５つ、またはより多くのアミノ酸だけ短縮され得る。当分野において公知のいずれかの方法、例えば本明細書において提供される「例」の項に記載される結合アッセイおよび条件が、ＬＡＰ（例えばヒトＬＡＰ）への免疫特異的結合が維持されているかどうかを確かめるために用いられ得る。
【０１８９】
重鎖について、本明細書に記載される側面のいくつかの態様において、本明細書に記載される抗体の重鎖はアルファ（α）、デルタ（Δ）、イプシロン（ε）、ガンマ（γ）、またはミュー（μ）重鎖であり得る。本明細書に記載される側面のいくつかの態様において、本明細書に記載される抗体の重鎖はヒトアルファ（α）、デルタ（Δ）、イプシロン（ε）、ガンマ（γ）、またはミュー（μ）重鎖を含み得る。特定の態様において、本明細書に記載される抗体は、ＶＨドメインのアミノ酸配列が配列番号８を含み、重鎖の定常領域が当分野において公知のいずれかなどのヒトガンマ（γ）重鎖定常領域のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。ヒト定常領域配列の限定しない例は当分野において記載されており、例えばＵ．Ｓ．Ｐａｔ．Ｎｏ．５，６９３，７８０および上記のKabat E A et al., (1991)参照。
【０１９０】
本明細書に記載される側面のいくつかの態様において、抗ＬＡＰ抗体は、配列番号１３および／または配列番号８を含むＶＬドメインおよびＶＨドメインを含み、定常領域は、ＩｇＧ、ＩｇＥ、ＩｇＭ、ＩｇＤ、ＩｇＡ、もしくはＩｇＹ免疫グロブリン分子またはヒトＩｇＧ、ＩｇＥ、ＩｇＭ、ＩｇＤ、ＩｇＡ、もしくはＩｇＹ免疫グロブリン分子の定常領域のアミノ酸配列を含む。本明細書に記載される側面のいくつかの態様において、抗ＬＡＰ抗体は、配列番号１３および／または配列番号８を含むＶＬドメインおよびＶＨドメインを含み、定常領域は、ＩｇＧ、ＩｇＥ、ＩｇＭ、ＩｇＤ、ＩｇＡ、もしくはＩｇＹ免疫グロブリン分子、免疫グロブリン分子のいずれかのクラス（例えば、ＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３、ＩｇＧ４、ＩｇＡ１、およびＩｇＡ２）、またはいずれかのサブクラス（例えばＩｇＧ２ａおよびＩｇＧ２ｂ）の定常領域のアミノ酸配列を含む。ヒト定常領域の限定しない例は当分野において記載されており、例えば上記のKabat E A et al., (1991)参照。
【０１９１】
本明細書に記載される側面のいくつかの態様においては、１つ、２つ、またはより多くの変異（例えばアミノ酸置換）が本明細書に記載される抗ＬＡＰ抗体またはその断片のＦｃ領域（例えば、ＣＨ２ドメイン（ヒトＩｇＧ１の残基２３１〜３４０）および／またはＣＨ３ドメイン（ヒトＩｇＧ１の残基３４１〜４４７）および／またはヒンジ領域。付番はKabatの付番システム（例えばKabatのＥＵインデックス）による）に導入されて、抗体の１つ以上の機能特性、例えば血清中半減期、補体結合、Ｆｃ受容体結合、および／または抗原依存的な細胞傷害性を変える。
【０１９２】
本明細書に記載される側面のいくつかの態様においては、１つ、２つ、またはより多くの変異（例えばアミノ酸置換）がＦｃ領域のヒンジ領域（ＣＨ１ドメイン）に導入され、その結果、例えばＵ．Ｓ．Ｐａｔ．Ｎｏ．５，６７７，４２５に記載されているようにヒンジ領域中のシステイン残基の数が変えられる（例えば、増大または減少する）。ＣＨ１ドメインのヒンジ領域中のシステイン残基の数は、例えば軽および重鎖のアセンブリを容易化または抗体の安定性を変える（例えば、増大または減少させる）ように変えられ得る。
【０１９３】
本明細書に記載される側面のいくつかの態様においては、１つ、２つ、またはより多くの変異（例えばアミノ酸置換）が、本明細書に記載される抗ＬＡＰ抗体またはその断片のＦｃ領域（例えば、ＣＨ２ドメイン（ヒトＩｇＧ１の残基２３１〜３４０）および／またはＣＨ３ドメイン（ヒトＩｇＧ１の残基３４１〜４４７）および／またはヒンジ領域。付番はKabatの付番システムによる（例えばKabatのＥＵインデックス））に導入されて、エフェクター細胞の表面上のＦｃ受容体（例えば活性化したＦｃ受容体）に対する抗体の親和性を増大または減少させる。Ｆｃ受容体に対する抗体の親和性を減少または増大させる抗体またはその断片のＦｃ領域の変異と、かかる変異をＦｃ受容体またはその断片に導入するための技術とは当業者に公知である。Ｆｃ受容体に対する抗体の親和性を変えるためになされ得る抗体のＦｃ受容体の変異の例は、例えばSmith P et al., (2012) PNAS 109: 6181-6186、Ｕ．Ｓ．Ｐａｔ．Ｎｏ．６，７３７，０５６、ならびに国際公開Ｎｏ．ＷＯ０２／０６０９１９、ＷＯ９８／２３２８９、およびＷＯ９７／３４６３１に記載されており、これらは参照によって本明細書に組み込まれる。
【０１９４】
本明細書に記載される側面のいくつかの態様においては、１つ、２つ、またはより多くのアミノ酸変異（すなわち、置換、挿入、または欠失）がＩｇＧ定常ドメインまたはそのＦｃＲｎ結合断片（好ましくはＦｃまたはヒンジ−Ｆｃドメイン断片）に導入されて、インビボの抗体の半減期を変える（例えば減少または増大させる）。インビボの抗体の半減期を変える（例えば減少または増大させる）であろう変異の例については、例えば国際公開Ｎｏ．ＷＯ０２／０６０９１９、ＷＯ９８／２３２８９、およびＷＯ９７／３４６３１、ならびにＵ．Ｓ．Ｐａｔ．Ｎｏ．５，８６９，０４６、６，１２１，０２２、６，２７７，３７５、および６，１６５，７４５参照。
【０１９５】
本明細書に記載される側面のいくつかの態様においては、１つ、２つ、またはより多くのアミノ酸変異（すなわち、置換、挿入、または欠失）がＩｇＧ定常ドメインまたはそのＦｃＲｎ結合断片（好ましくは、Ｆｃもしくはヒンジ−Ｆｃドメイン断片）に導入されて、インビボの抗ＬＡＰ抗体の半減期を減少させる。本明細書に記載される側面のいくつかの態様においては、１つ、２つ、またはより多くのアミノ酸変異（すなわち、置換、挿入、または欠失）がＩｇＧ定常ドメインまたはそのＦｃＲｎ結合断片（好ましくはＦｃもしくはヒンジ−Ｆｃドメイン断片）に導入されて、インビボの抗体の半減期を増大させる。本明細書に記載される側面のいくつかの態様において、抗体は１つ以上のアミノ酸変異（例えば置換）を第２の定常（ＣＨ２）ドメイン（ヒトＩｇＧ１の残基２３１〜３４０）および／または第３の定常（ＣＨ３）ドメイン（ヒトＩｇＧ１の残基３４１〜４４７）に有し得、付番はKabatのＥＵインデックスによる（上記のKabat E A et al., (1991)）。本明細書に記載される側面のいくつかの態様において、本明細書に記載される抗体またはその抗原結合断片のＩｇＧ１の定常領域は、KabatのＥＵインデックスに従って付番される位置２５２のメチオニン（Ｍ）からチロシン（Ｙ）への置換、位置２５４のセリン（Ｓ）からトレオニン（Ｔ）への置換、および位置２５６のトレオニン（Ｔ）からグルタミン酸（Ｅ）への置換を含む。参照によって本明細書に組み込まれるＵ．Ｓ．Ｐａｔ．Ｎｏ．７，６５８，９２１参照。変異体ＩｇＧのこの型は、「ＹＴＥ変異体」と言われ、同じ抗体の野生型バージョンと比較して４倍増大した半減期を表示することが示されている（Dall'Acqua W F et al., (2006) J Biol Chem 281: 23514-24参照）。本明細書に記載される側面のいくつかの態様において、抗体またはその抗原結合断片は、KabatのＥＵインデックスに従って付番される位置２５１〜２５７、２８５〜２９０、３０８〜３１４、３８５〜３８９、および４２８〜４３６のアミノ酸残基に１つ、２つ、３つ、またはより多くのアミノ酸置換を含む、ＩｇＧ定常ドメインを含む。
【０１９６】
本明細書に記載される側面のいくつかの態様においては、１つ、２つ、またはより多くのアミノ酸置換がＩｇＧ定常ドメインＦｃ領域に導入されて、抗ＬＡＰ抗体のエフェクター機能（単数または複数）を変える。例えば、KabatのＥＵインデックスに従って付番されるアミノ酸残基２３４、２３５、２３６、２３７、２９７、３１８、３２０、および３２２から選択される１つ以上のアミノ酸が、異なるアミノ酸残基によって置き換えられ得、その結果、抗体がエフェクターリガンドに対する変わった親和性を有するが、親抗体の抗原結合能力を保持する。それに対する親和性が変えられるエフェクターリガンドは、例えばＦｃ受容体または補体のＣ１コンポーネントであり得る。このアプローチはＵ．Ｓ．Ｐａｔ．Ｎｏ．５，６２４，８２１および５，６４８，２６０にさらに詳細に記載されている。本明細書に記載される側面のいくつかの態様において、定常領域ドメインの欠失または不活性化（点変異または他の手段による）は、循環する抗体のＦｃ受容体結合を低減し、それによって腫瘍局在を増大させ得る。定常ドメインを欠失させるかまたは不活性化し、それによって腫瘍局在を増大させる変異の記載は、例えばＵ．Ｓ．Ｐａｔ．Ｎｏ．５，５８５，０９７および８，５９１，８８６参照。本明細書に記載される側面のいくつかの態様においては、１つ以上のアミノ酸置換が、本明細書に記載される抗体のＦｃ領域に導入されて、Ｆｃ領域上の潜在的なグリコシル化部位を除去し得、これがＦｃ受容体結合を低減し得る（例えばShields R L et al., (2001) J Biol Chem 276: 6591-604参照）。本明細書に記載される側面のいくつかの態様においては、本明細書に記載される抗体の定常領域中の次の変異の１つ以上が作られ得る。KabatのＥＵインデックスに従って付番されるＮ２９７Ａ置換、Ｎ２９７Ｑ置換、Ｌ２３５Ａ置換、およびＬ２３７Ａ置換、Ｌ２３４Ａ置換およびＬ２３５Ａ置換、Ｅ２３３Ｐ置換、Ｌ２３４Ｖ置換、Ｌ２３５Ａ置換、Ｃ２３６欠失、Ｐ２３８Ａ置換、Ｄ２６５Ａ置換、Ａ３２７Ｑ置換、またはＰ３２９Ａ置換。本明細書に記載される側面のいくつかの態様において、本明細書に記載される抗体またはその抗原結合断片はＮ２９７ＱまたはＮ２９７Ａアミノ酸置換を有するＩｇＧ１の定常ドメインを含む。
【０１９７】
本明細書に記載される側面のいくつかの態様においては、本明細書に記載される抗ＬＡＰ抗体の定常領域中のKabatのＥＵインデックスに従って付番されるアミノ酸残基３２９、３３１、および３２２から選択される１つ以上のアミノ酸が、異なるアミノ酸残基によって置き換えられ得、その結果、抗体が変わったＣ１ｑ結合および／または低減されたかもしくは失われた補体依存的な細胞傷害性（ＣＤＣ）を有する。このアプローチはＵ．Ｓ．Ｐａｔ．Ｎｏ．６，１９４，５５１（Idusogie et al）にさらに詳細に記載されている。本明細書に記載される側面のいくつかの態様においては、本明細書に記載される抗体のＣＨ２ドメインのＮ末端領域のアミノ酸位置２３１から２３８の１つ以上のアミノ酸残基が変えられて、それによって抗体が補体に結合する能力を変える。このアプローチは国際公開Ｎｏ．ＷＯ９４／２９３５１にさらに記載されている。本明細書に記載される側面のいくつかの態様においては、本明細書に記載される抗体のＦｃ領域が、次の位置において１つ以上のアミノ酸を変異させること（例えば、アミノ酸置換を導入すること）によって改変されて、抗体が抗体依存的な細胞傷害性（ＡＤＣＣ）を媒介する能力を増大させ、および／またはＦｃγ受容体に対する抗体の親和性を増大させる。KabatのＥＵインデックスに従って付番される２３８、２３９、２４８、２４９、２５２、２５４、２５５、２５６、２５８、２６５、２６７、２６８、２６９、２７０、２７２、２７６、２７８、２８０、２８３、２８５、２８６、２８９、２９０、２９２、２９３、２９４、２９５、２９６、２９８、３０１、３０３、３０５、３０７、３０９、３１２、３１５、３２０、３２２、３２４、３２６、３２７、３２９、３３０、３３１、３３３、３３４、３３５、３３７、３３８、３４０、３６０、３７３、３７６、３７８、３８２、３８８、３８９、３９８、４１４、４１６、４１９、４３０、４３４、４３５、４３７、４３８、または４３９。このアプローチは国際公開Ｎｏ．ＷＯ００／４２０７２にさらに記載されている。
【０１９８】
本明細書に記載される側面のいくつかの態様において、本明細書に記載される抗ＬＡＰ抗体はＩｇＧ４抗体の定常領域を含み、KabatのＥＵインデックスに従って付番される重鎖のアミノ酸残基２２８のセリンがプロリンに置換される。
【０１９９】
低減されたフコース含有量を有する抗体が、例えばＦｃγＲＩＩＩａなどのＦｃ受容体に対する増大した親和性を有することが報告されている。従って、ある種の態様において、本明細書に記載される抗ＬＡＰ抗体またはその抗原結合断片は、低減されたフコース含有量を有するかまたはフコース含有量を有さない。かかる抗体は当業者に公知の技術を用いて産生され得る。例えば、抗体は、フコシル化の能力が不足または欠如した細胞中で発現され得る。具体的な例においては、α１，６−フコシルトランスフェラーゼの両方のアレルのノックアウトを有する細胞株が、低減されたフコース含有量を有する抗体を産生するために用いられ得る。POTELLIGENTR（商標）システム（Lonza）は、低減されたフコース含有量を有する抗体を産生するために用いられ得るかかるシステムの例である。代替的には、低減されたフコース含有量またはフコース含有量なしの抗体または抗原結合断片は、例えば（ｉ）フコシル化を防ぐかまたは低減する条件下において細胞を培養すること、（ｉｉ）フコースの翻訳後除去（例えばフコシダーゼ酵素による）、（ｉｉｉ）例えば非グリコシル化糖蛋白質の組換え発現の後の、所望の炭水化物の翻訳後付加、または（ｉｖ）フコシル化されていない抗体またはその抗原結合断片を選択するための糖蛋白質の精製によって産生され得る。例えば、フコース含有量なしまたは低減されたフコース含有量を有する抗体またはその抗原結合断片を産生するための方法については、Longmore G D & Schachter H (1982) Carbohydr Res 100: 365-92およびImai-Nishiya H et al., (2007) BMC Biotechnol. 7: 84参照。
【０２００】
本明細書に記載される側面のいくつかの態様において、本明細書に記載される抗ＬＡＰ抗体またはその抗原結合断片は、例えば野生型Ｆｃ領域、例えばＩｇＧ１のＦｃを有する抗体と比較して、ＣＤ３２Ｂ（ＦｃγＲＩＩＢまたはＦＣＧＲ２Ｂとしてもまた公知）に対する増大した親和性を有する。本明細書に記載される側面のいくつかの態様において、本明細書に記載される抗ＬＡＰ抗体またはその抗原結合断片は、ＣＤ３２Ａ（ＦｃγＲＩＩＡ）およびＣＤ１６（ＦｃγＲＩＩＩＡ）両方よりも、ＣＤ３２Ｂ（ＦｃγＲＩＩＢ）に対する選択的に増大した親和性を有する。ＣＤ３２Ｂに対する増大した親和性をもたらす配列変更は、例えばMimoto et al., Protein Engineering, Design & Selection 10: 589-598 (2013)、Chu et al., Molecular Immunology 45: 3926-3933 (2008)、およびStrohl, Current Opinion in Biology 20: 685-691 (2009)において提供されており、これらのそれぞれはその全体として参照によって本明細書に組み込まれる。本明細書に記載される側面のいくつかの態様において、ＣＤ３２Ｂに対する増大した親和性を有する抗体または抗原結合断片は、ＥＵインデックスに従って付番されるＧ２３６Ｄ、Ｐ２３８Ｄ、Ｓ２３９Ｄ、Ｓ２６７Ｅ、Ｌ３２８Ｆ、Ｌ３２８Ｅ、位置２３６の後に挿入されたアルギニン、およびその組み合わせからなる群から選択される変異を含む重鎖定常領域、例えばＩｇＧ１定常領域、またはその断片を含む（Kabat et al., Sequences of Proteins of Immunological Interest, U.S. Department of Health and Human Services, Bethesda (1991)）。本明細書に記載される側面のいくつかの態様において、ＣＤ３２Ｂに対する増大した親和性を有する抗体または抗原結合断片は、Ｓ２６７ＥおよびＬ３２８Ｆ置換を含む重鎖定常領域、例えばＩｇＧ１定常領域、またはその断片を含む。本明細書に記載される側面のいくつかの態様において、ＣＤ３２Ｂに対する増大した親和性を有する抗体または抗原結合断片は、Ｐ２３８ＤおよびＬ３２８Ｅ置換を含む重鎖定常領域、例えばＩｇＧ１定常領域、またはその断片を含む。本明細書に記載される側面のいくつかの態様において、ＣＤ３２Ｂに対する増大した親和性を有する抗体または抗原結合断片は、Ｐ２３８Ｄ置換とＥ２３３Ｄ、Ｇ２３７Ｄ、Ｈ２６８Ｄ、Ｐ２７１Ｇ、Ａ３３０Ｒ、およびその組み合わせからなる群から選択される置換とを含む重鎖定常領域、例えばＩｇＧ１定常領域、またはその断片を含む。本明細書に記載される側面のいくつかの態様において、ＣＤ３２Ｂに対する増大した親和性を有する抗体または抗原結合断片は、Ｐ２３８Ｄ、Ｅ２３３Ｄ、Ｇ２３７Ｄ、Ｈ２６８Ｄ、Ｐ２７１Ｇ、およびＡ３３０Ｒ置換を含む重鎖定常領域、例えばＩｇＧ１定常領域、またはその断片を含む。本明細書に記載される側面のいくつかの態様において、ＣＤ３２Ｂに対する増大した親和性を有する抗体または抗原結合断片は、Ｇ２３６ＤおよびＳ２６７Ｅを含む重鎖定常領域、例えばＩｇＧ１定常領域、またはその断片を含む。本明細書に記載される側面のいくつかの態様において、ＣＤ３２Ｂに対する増大した親和性を有する抗体または抗原結合断片は、Ｓ２３９ＤおよびＳ２６７Ｅを含む重鎖定常領域、例えばＩｇＧ１定常領域、またはその断片を含む。本明細書に記載される側面のいくつかの態様において、ＣＤ３２Ｂに���する増大した親和性を有する抗体または抗原結合断片は、Ｓ２６７ＥおよびＬ３２８Ｆを含む重鎖定常領域、例えばＩｇＧ１定常領域、またはその断片を含む。本明細書に記載される側面のいくつかの態様において、ＣＤ３２Ｂに対する増大した親和性を有する抗体または抗原結合断片は、位置２３６の後に挿入されたアルギニンおよびＬ３２８Ｒを含む重鎖定常領域、例えばＩｇＧ１定常領域、またはその断片を含む。
【０２０１】
本明細書に記載される側面のいくつかの態様において、ＬＡＰ（例えばヒトＬＡＰ）に特異的に結合する抗ＬＡＰ抗体またはその抗原結合断片は、配列番号２１〜２４として本明細書に記載されるＶＬフレームワーク領域の１つ、２つ、３つ、または４つと少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、または少なくとも９８％の配列同一性を有するＶＬフレームワーク領域（ＦＲ）を含む。本明細書に記載される側面のいくつかの態様において、ＬＡＰ（例えばヒトＬＡＰ）に特異的に結合する抗ＬＡＰ抗体またはその抗原結合断片は、配列番号１７〜２０として本明細書に記載されるＶＨフレームワーク領域の１つ、２つ、３つ、または４つと少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、または少なくとも９８％の配列同一性を有するＶＨフレームワーク領域（ＦＲ）を含む。本明細書に記載される側面のいくつかの態様において、ＬＡＰ（例えばヒトＬＡＰ）に特異的に結合する抗体またはその抗原結合断片は、（ｉ）配列番号１７〜２０として本明細書に記載されるＶＨフレームワーク領域の１つ、２つ、３つ、または４つと少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、または少なくとも９８％の配列同一性を有するＶＨフレームワーク領域（ＦＲ）と、（ｉｉ）配列番号２１〜２４として本明細書に記載されるＶＬフレームワーク領域の１つ、２つ、３つ、または４つと少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、または少なくとも９８％の配列同一性を有するＶＬフレームワーク領域（ＦＲ）とを含む。
【０２０２】
２つの配列（例えばアミノ酸配列または核酸配列）の間のパーセント同一性の決定は、数理アルゴリズムを用いてもまた達成され得る。２つの配列の比較のために利用される数理アルゴリズムの具体的な限定しない例は、Karlin S & Altschul S F (1993) PNAS 90: 5873-5877のように改変されたKarlin S & Altschul S F (1990) PNAS 87: 2264-2268のアルゴリズムである。かかるアルゴリズムは、Altschul S F et al., (1990) J Mol Biol 215: 403のNBLASTおよびXBLASTプログラムに組み込まれている。BLASTヌクレオチドサーチは、例えばスコア＝１００、ワード長＝１２に設定されたNBLASTヌクレオチドプログラムパラメータによって行われて、本明細書に記載される核酸分子と相同なヌクレオチド配列を得られる。BLAST蛋白質サーチは、例えばスコア５０、ワード長＝３に設定されたXBLASTプログラムパラメータによって行われて、本明細書に記載される蛋白質分子と相同なアミノ酸配列を得られる。比較目的のためにギャップありアラインメントを得るためには、Gapped BLASTが、Altschul S F et al., (1997) Nuc Acids Res 25: 3389-3402に記載されているように利用され得る。代替的には、PSI BLASTが、分子間の遠い関係性を検出する繰り返し(iterated)サーチを行うために用いられ得る（Ｉｄ．）。BLAST、Gapped BLAST、およびPSI Blastプログラムを利用するときには、それぞれのプログラム（例えばXBLASTおよびNBLASTの）デフォルトパラメータが用いられ得る（例えばワールドワイドウェブ上の国立生物工学情報センター（ＮＣＢＩ）、ncbi.nlm.nih.gov参照）。配列の比較のために利用される数理アルゴリズムの別の具体的な限定しない例は、Myers and Miller, 1988, CABIOS 4: 11 17のアルゴリズムである。かかるアルゴリズムはALIGNプログラム（バージョン２．０）に組み込まれており、これはGCG配列アラインメントソフトウェアパッケージの一部である。アミノ酸配列を比較するためにALIGNプログラムを利用するときには、PAM120の重み・残基表、１２というギャップ長ペナルティー、および４というギャップペナルティーが用いられ得る。２つの配列の間のパーセント同一性は、ギャップを許すかまたは許すことなしに、上に記載されているものと類似の技術によって決定され得る。パーセント同一性を計算する上で、典型的には、厳密なマッチのみがカウントされる。
【０２０３】
いくつかの側面においては、ハイブリドーマTW4-9E7、TW4-5A8、TW4-3E5、TW4-4E5、TW4-12B12、TW4-13B12、TW4-1G12、TW4-3G5、TW4-2F8、TW4-6H10、TW4-1G2、TW4-1E1、TW4-16F4、TW4-8F10、TW4-3H6、TW4-2C9、TW7-16B4、TW7-28G11、TW7-7H4、およびTW7-20B9によって産生される抗体のいずれか１つと同じかまたはオーバーラップするＬＡＰ（例えばヒトＬＡＰのエピトープ）のエピトープに結合する、抗ＬＡＰ抗体またはその抗原結合断片が本明細書において提供される。これらの側面のいくつかの態様において、抗ＬＡＰ抗体またはその抗原結合断片は、配列番号８のＶＨドメインおよび配列番号１３のＶＬドメインを有するハイブリドーマTW7-28G11によって産生される抗体と同じかまたはオーバーラップするＬＡＰのエピトープに結合する。当業者に公知のように、抗体のエピトープは、例えばＮＭＲ分光法、Ｘ線回折結晶解析研究、ＥＬＩＳＡアッセイ、質量分析とカップリングした水素／重水素交換（例えば、液体クロマトグラフィーエレクトロスプレー質量分析）、アレイに基づくオリゴペプチドスキャンアッセイ、および／または変異導入マッピング（例えば、部位特異的変異導入マッピング）によって決定され得る。Ｘ線結晶解析のためには、結晶化は当分野における公知の方法のいずれかを用いて達成され得る（例えばGiege R et al., (1994) Acta Crystallogr D Biol Crystallogr 50(Pt 4): 339-350、McPherson A (1990) Eur J Biochem 189: 1-23、Chayen N E (1997) Structure 5: 1269-1274、McPherson A (1976) J Biol Chem 251: 6300-6303）。抗体：抗原結晶は周知のＸ線回折技術を用いて研究され得、コンピュータソフトウェア、例えばX-PLOR（Yale University, 1992, Molecular Simulations, Incによって供給。例えばMeth Enzymol (1985) volumes 114 & 115, eds Wyckoff H W et al.、Ｕ．Ｓ．特許出願Ｎｏ．２００４／００１４１９４参照）およびBUSTER（Bricogne G (1993) Acta Crystallogr D Biol Crystallogr 49(Pt 1): 37-60、Bricogne G (1997) Meth Enzymol 276A: 361-423, ed Carter C W、Roversi P et al., (2000) Acta Crystallogr D Biol Crystallogr 56(Pt 10): 1316-1323）を用いて精密化され得る。変異導入マッピング研究は、当業者に公知のいずれかの方法を用いて達成され得る。例えば、アラニンスキャン変異導入技術を包含する変異導入技術の記載は、上記のChampe M et al., (1995)および上記のCunningham B C & Wells J A (1989)参照。加えて、ＬＡＰ（例えばヒトＬＡＰ）の同じかまたはオーバーラップするエピトープを認識および結合する抗体は、イムノアッセイなどの慣例的な技術を用いて、例えば、１つの抗体が標的抗原への別の抗体の結合をブロックする能力を示すこと、すなわち競合的結合アッセイによって同定され得る。競合結合アッセイは、２つの抗体があるエピトープについて類似の結合特異性を有するかどうかを決定するためにもまた用いられ得る。競合的結合は、試験される免疫グロブリンがＬＡＰなどの共通の抗原への参照抗体の特異的結合を阻害するアッセイにおいて決定され得る。競合的結合アッセイの数々の型、例えば、固相の直接的または間接的ラジオイムノアッセイ（ＲＩＡ）、固相の直接的または間接的酵素イムノアッセイ（ＥＩＡ）、サンドイッチ競合アッセイ（Stahli C et al., (1983) Methods Enzymol 9: 242-253参照）、固相の直接的ビオチン−アビジンＥＩＡ（Kirkland T N et al., (1986) J Immunol 137: 3614-9参照）、固相の直接標識アッセイ、固相の直接標識サンドイッチアッセイ（Harlow E & Lane D, (1988) Antibodies: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Press参照）、Ｉ−１２５標識を用いる固相の直接標識ＲＩＡ（Morel G A et al., (1988) Mol Immunol 25(1): 7-15参照）、固相の直接的ビオチン−アビジンＥＩＡ（Cheung R C et al., (1990) Virology 176: 546-52）、および直接標識ＲＩＡ（Moldenhauer G et al., (1990) Scand J Immunol 32: 77-82）が公知である。典型的には、かかるアッセイには、固体表面に結合された精製抗原（例えばＬＡＰ）、または標識された試験免疫グロブリンおよび標識された参照免疫グロブリンのこれらのいずれかを保有する細胞の使用が関わる。競合的阻害は、試験免疫グロブリンの存在下において固体表面または細胞に結合した標識の量を決定することによって測定され得る。通常は試験免疫グロブリンが過剰に存在する。通常は、競合抗体が過剰に存在するときには、それは共通の抗原への参照抗体の特異的結合を少なくとも５０〜５５％、５５〜６０％、６０〜６５％、６５〜７０％、７０〜７５％、またはより多くだけ阻害するであろう。競合結合アッセイは、標識抗原または標識抗体いずれかを用いる多数の異なるフォーマットで構成され得る。このアッセイの一般のバージョンにおいては、抗原が９６ウェルプレート上に固定化される。それから、未標識の抗体が抗原への標識抗体の結合をブロックする能力が、放射性または酵素標識を用いて測定される。さらなる詳細は、例えばWagener C et al., (1983) J Immunol 130: 2308-2315、Wagener C et al., (1984) J Immunol Methods 68: 269-274、Kuroki M et al., (1990) Cancer Res 50: 4872-4879、Kuroki M et al., (1992) Immunol Invest 21: 523-538、Kuroki M et al., (1992) Hybridoma 11: 391-407、および上記のAntibodies: A Laboratory Manual, Ed Harlow E & Lane D editors, pp. 386-389参照。競合アッセイは、例えば表面プラズモン共鳴（BIACORE）を用いて、例えば、Abdiche Y N et al., (2009) Analytical Biochem 386: 172-180に記載されているものなどの「インタンデムアプローチ」によって行われ得、それによってＬＡＰ抗原はチップ表面、例えばCM5センサーチップに固定化され、それから抗ＬＡＰ抗体がチップ上に流される。抗体が本明細書に記載される抗ＬＡＰ抗体またはその抗原結合断片と競合するかどうかを決定するためには、抗ＬＡＰ抗体は第１に飽和を達成するようにチップ表面に流され、それから潜在的な競合抗体が追加される。それから、競合抗体の結合が非競合コントロールと相対的に決定および定量され得る。
【０２０４】
競合結合アッセイは、２つの抗体が、競合ＥＬＩＳＡアッセイなどの競合結合アッセイにおいて同一のまたは立体的にオーバーラップするエピトープを認識するときに、ある抗体が別の抗体（例えば参照抗体と本質的に同じエピトープまたはオーバーラップするエピトープに結合する抗体）によって例えば用量依存的な様式で競合的にブロックされるかどうかを決定するために用いられ得る。これは多数の異なるフォーマットで、標識抗原または標識抗体いずれかを用いて構成され得る。
【０２０５】
従って、本明細書に記載される側面のいくつかの態様において、抗ＬＡＰ抗体は、本明細書に記載されるハイブリドーマTW4-9E7、TW4-5A8、TW4-3E5、TW4-4E5、TW4-12B12、TW4-13B12、TW4-1G12、TW4-3G5、TW4-2F8、TW4-6H10、TW4-1G2、TW4-1E1、TW4-16F4、TW4-8F10、TW4-3H6、TW4-2C9、TW7-16B4、TW7-28G11、TW7-7H4、およびTW7-20B9によって産生される抗体のいずれか１つ、またはそのキメラもしくはＦａｂ抗体、あるいは本明細書に記載されるハイブリドーマTW4-9E7、TW4-5A8、TW4-3E5、TW4-4E5、TW4-12B12、TW4-13B12、TW4-1G12、TW4-3G5、TW4-2F8、TW4-6H10、TW4-1G2、TW4-1E1、TW4-16F4、TW4-8F10、TW4-3H6、TW4-2C9、TW7-16B4、TW7-28G11、TW7-7H4、およびTW7-20B9によって産生される抗体のいずれか１つの１つ以上のＶＨＣＤＲおよび１つ以上のＶＬＣＤＲを含む抗ＬＡＰ抗体による競合結合アッセイにおいて試験され得る。
【０２０６】
本明細書に記載される方法のいくつかの態様において、ＬＡＰ結合剤は、ＬＡＰに特異的に結合する抗ＬＡＰ抗体またはその抗原結合断片のキメラ抗体誘導体である。
【０２０７】
本明細書において用いられる用語「キメラ抗体」は、それらが所望の生物学的活性を見せる限りは、重および／または軽鎖のある部分が、特定の生物種に由来するかまたは特定の抗体クラスもしくはサブクラスに属する抗体中の対応する配列と同一または相同であり、鎖（単数または複数）の残りが、別の生物種に由来するかまたは別の抗体クラスもしくはサブクラスに属する抗体中の対応する配列と同一または相同である抗体分子、およびかかる抗体の断片を言う（Ｕ．Ｓ．Ｐａｔ．Ｎｏ．４，８１６，５６７およびMorrison et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 81:6851-6855 (1984)）。キメラ抗体分子は、例えば、ヒト定常領域を有する、マウス、ラット、または他の生物種の抗体からの１つ以上のＶＨおよび／またはＶＬ抗原結合ドメインを包含し得る。キメラ抗体を作るための種々のアプローチが記載されており、所望の抗原、例えばＬＡＰを認識する免疫グロブリン可変領域を含有するキメラ抗体を作るために用いられ得る。例えば、Takeda et al., 1985, Nature 314:452、Cabilly et al., Ｕ．Ｓ．Ｐａｔ．Ｎｏ．４，８１６，５６７、Boss et al., Tanaguchi et al., 欧州特許公開ＥＰ１７１４９６、欧州特許公開０１７３４９４、英国特許ＧＢ２１７７０９６Ｂ参照）。
【０２０８】
本明細書に記載される方法のいくつかの態様において、ＬＡＰ結合剤は、ＬＡＰに特異的に結合する抗ＬＡＰ抗体またはその抗原結合断片のＣＤＲグラフト抗体誘導体である。
【０２０９】
用語「ＣＤＲグラフト抗体」は、１つの生物種からの重および軽鎖可変領域配列を含むが、ＶＨおよび／またはＶＬのＣＤＲ領域の１つ以上の配列が別の生物種のＣＤＲ配列によって置き換えられた抗体、例えば、ヒトＣＤＲの１つ以上（例えばＣＤＲ３）がマウスＣＤＲ配列によって置き換えられたヒト重および軽鎖可変領域を有する抗体を言う。本明細書に記載されるＣＤＲグラフト抗体はヒト抗体からの重および軽鎖可変領域配列を含み、ＶＨおよび／またはＶＬのＣＤＲ領域の１つ以上が、配列番号９〜１１および１４〜１６などの本明細書に記載されるマウス抗体のＣＤＲ配列、またはハイブリドーマTW4-9E7、TW4-5A8、TW4-3E5、TW4-4E5、TW4-12B12、TW4-13B12、TW4-1G12、TW4-3G5、TW4-2F8、TW4-6H10、TW4-1G2、TW4-1E1、TW4-16F4、TW4-8F10、TW4-3H6、TW4-2C9、TW7-16B4、TW7-28G11、TW7-7H4、およびTW7-20B9によって産生される抗体のいずれか１つのＣＤＲ配列によって置き換えられる。いずれかのヒト抗体からのフレームワーク配列がＣＤＲグラフトの鋳型として働き得る。しかしながら、かかるフレームワーク上へのストレートな鎖置き換えは、多くの場合には、抗原に対する結合親和性の何らかの損失に至る。ヒト抗体が元の非ヒトまたはマウス抗体に相同であるほど、非ヒトＣＤＲをヒトフレームワークと組み合わせることがＣＤＲ中に親和性を低減し得る歪みを導入する可能性は、可能性が高くなくなる。ゆえに、ＣＤＲから離れて、マウス可変フレームワークを置き換えるために選ばれるヒト可変フレームワークは、例えば、マウス抗体可変領域フレームワークと少なくとも６５％の配列同一性を有する。ＣＤＲから離れて、ヒトおよびマウス可変領域は、例えば、少なくとも７０％の配列同一性、少なくとも７５％の配列同一性、少なくとも８０％の配列同一性、または少なくとも８５％の配列同一性を有する。キメラ抗体を産生するための方法は当分野において公知である（例えば、ＥＰ２３９，４００、ＰＣＴ公開ＷＯ９１／０９９６７、Ｕ．Ｓ．Ｐａｔ．Ｎｏ．５，２２５，５３９、５，５３０，１０１、および５，５８５，０８９参照）。、ベニアリング(veneering)またはリサーフェシング(resurfacing)（ＥＰ５９２，１０６、ＥＰ５１９，５９６、Padlan, Molecular Immunology 28(4/5):489-498 (1991)、Studnicka et al., Protein Engineering 7(6):805-814 (1994)、Roguska et al., PNAS 91: 969-973 (1994)）、および鎖シャッフリング（Ｕ．Ｓ．Ｐａｔ．Ｎｏ．５，５６５，３５２）。これらのそれぞれの内容はそれらの全体として参照によって本明細書に組み込まれる。
【０２１０】
本明細書に記載される方法のいくつかの態様において、ＬＡＰ結合剤は、ＬＡＰに特異的に結合する抗ＬＡＰ抗体またはその抗原結合断片のヒト化抗体誘導体である。
【０２１１】
非ヒト（例えばマウス）抗体のヒト化形態は、非ヒト免疫グロブリンに由来する最小限の配列を含有するキメラ抗体である。大抵は、ヒト化抗体はヒト免疫グロブリン（レシピエント抗体）であり、レシピエントのＣＤＲまたは超可変領域からの残基が、所望の特異性、親和性、および能力を有するマウス、ラット、ウサギ、または非ヒト霊長類などの非ヒト生物種（ドナー抗体）のＣＤＲまたは超可変領域の残基によって置き換えられる。いくつかの場合には、ヒト免疫グロブリンのＦｖフレームワーク領域（ＦＲ）残基は対応する非ヒト残基によって置き換えられる。さらにその上に、ヒト化抗体は、レシピエント抗体またはドナー抗体中に見いだされない残基を含み得る。これらの改変は抗体の性能をさらに精密化するためになされる。一般的に、ヒト化抗体は少なくとも１つ、典型的には２つの可変ドメインの実質的に全てを含み、超可変ループの全てまたは実質的に全てが非ヒト免疫グロブリンのものに対応し、ＦＲ領域の全てまたは実質的に全てはヒト免疫グロブリンコンセンサス配列のものであろう。ヒト化抗体は、免疫グロブリン定常領域（Ｆｃ）、典型的にはヒト免疫グロブリンのものの少なくともある部分をもまた任意に含むであろう。さらなる詳細はJones et al., Nature 321:522-525 (1986)、Riechmann et al., Nature 332:323-329 (1988)、およびPresta, Curr. Op. Struct. Biol. 2:593-596 (1992) 参照。
【０２１２】
ヒト化抗体は、ＩｇＭ、ＩｇＧ、ＩｇＤ、ＩｇＡ、およびＩｇＥを包含する免疫グロブリンのいずれかのクラス、ならびに限定なしにＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３、およびＩｇＧ４を包含するいずれかのサブクラスから選択され得る。
【０２１３】
ヒト化抗体のフレームワークおよびＣＤＲ領域は親の配列に正確に対応する必要はなく、例えば、ドナー抗体ＣＤＲまたはコンセンサスフレームワークは少なくとも１つのアミノ酸残基の置換、挿入、および／または欠失によって変異導入され得、その結果、その部位のＣＤＲまたはフレームワーク残基がドナー抗体またはコンセンサスフレームワークいずれかに厳密に対応しない。しかしながら、好ましい態様において、かかる変異は大掛かりではないであろう。通常は、ヒト化抗体残基の少なくとも８０％、好ましくは少なくとも８５％、より好ましくは少なくとも９０％、最も好ましくは少なくとも９５％が親のＦＲおよびＣＤＲ配列のものに対応するであろう。本明細書において用いられる用語「コンセンサスフレームワーク」は、コンセンサス免疫グロブリン配列中のフレームワーク領域を言う。本明細書において用いられる用語「コンセンサス免疫グロブリン配列」は、関連する免疫グロブリン配列のファミリーにおいて最も頻繁に存在するアミノ酸（またはヌクレオチド）から形成される配列を言う（例えばWinnaker, From Genes to Clones (Veriagsgesellschaft, Weinheim, Germany 1987参照）。免疫グロブリンのファミリーにおいては、コンセンサス配列中のそれぞれの位置は、ファミリーにおいてその位置に最も頻繁に存在するアミノ酸によって占められる。２つのアミノ酸が等しく頻繁に存在するところでは、いずれもコンセンサス配列中に包含され得る。
【０２１４】
本明細書において用いられる「バーニアゾーン」は、FooteおよびWinter（1992, J. Mol. Biol. 224:487-499。これは参照によって本明細書に組み込まれる）によって記載されているように、ＣＤＲ構造を調整し、抗原に対するフィットを微調整し得るフレームワーク残基のサブセットを言う。バーニアゾーン残基はＣＤＲを下支えする層を形成し、ＣＤＲの構造および抗体の親和性に影響を与え得る。
【０２１５】
本明細書に記載されるＣＤＲ配列に用いられ得る公知のヒト免疫グロブリン（Ｉｇ）配列は、例えばワールドワイドウェブ上でwww.ncbi.nlm.nih.gov/entrez-/query.fcgi、www.atcc.org/phage/hdb.html、www.sciquest.com、www.abcam.com/、www.antibodyresource.com/onlinecomp.html、www.public.iastate.eduLabout.pedro/research_tools.html、www.mgen.uniheidelberg.de/SD/IT/IT.html、www.whfreeman.com/immunology/CH-05/kuby05.htm、www.library.thinkquest.org/12429/Immune/Antibody.html、www.hhmi.org/grants/lectures/1996/vlab/、www.path.cam.ac.uk/.about.mrc7/m-ikei-mages.html、www.antibodyresource.com/、mcb.harvard.edu/BioLinks/Immunology.html、www.immunologylink.com/、pathbox.wustl.edu/.about.hcenter/index.-html、www.biotech.ufl.edu/.about.hcl/、www.pebio.com/pa/340913/340913.html-、www.nal.usda.gov/awic/pubs/antibody/、www.m.ehime-u.acjp/.about.yasuhito-/Elisa.html、www.biodesign.com/table.asp、www.icnet.uk/axp/facs/davies/lin-ks.html、www.biotech.ufl.edu/.about.fccl/protocol.html、www.isac-net.org/sites_geo.html、aximtl.imt.uni-marburg.de/.about.rek/AEP-Start.html、baserv.uci.kun.nl/.about.jraats/linksl.html、www.recab.uni-hd.de/immuno.bme.nwu.edu/、www.mrc-cpe.cam.ac.uk/imt-doc/pu-blic/INTRO.html、www.ibt.unam.mx/virN_mice.html、imgt.cnusc.fr:8104/、www.biochem.ucl.ac.uk/.about.martin/abs/index.html、anti-body.bath.ac.uk/、abgen.cvm.tamu.edu/lab/wwwabgen.html、www.unizh.ch/.about.honegger/AHOsem-inar/Slide01.html、www.cryst.bbk.ac.uk/.about.ubcg07s/、www.nimr.mrc.ac.uk/CC/ccaewg/ccaewg.htm、www.path.cam.ac.ukhabout.mrc7/h-umanisation/TAHHP.html、www.ibt.unam.na/vir/structure/stat_aim.html、www.biosci.missouri.edu/smithgp/index.html、www.cryst.bioc.cam.ac.uk/.abo-utimolina/Web-pages/Pept/spottech.html、www.jerini.de/frroducts.htm、www.patents.ibm.com/ibm.html、Kabat et al., Sequences of Proteins of Immunological Interest, U.S. Dept. Health (1983)において開示されており、それぞれ全体として参照によって本明細書に組み込まれる。かかるインポート配列は、当分野において公知のように、免疫原性を低減、または結合、親和性、ｏｎ−ｒａｔｅ、ｏｆｆ−ｒａｔｅ、アビディティ、特異性、半減期、もしくはいずれかの他の好適な特徴を低減、増強、もしくは改変するために用いられ得る。
【０２１６】
ヒトフレームワーク領域中のフレームワーク残基は、ＣＤＲドナー抗体からの対応する残基によって置換されて、抗原結合を変え、好ましくは改善し得る。それらのフレームワーク置換は、当分野において周知の方法によって、例えば抗原結合に重要なフレームワーク残基を同定するためのＣＤＲおよびフレームワーク残基の相互作用のモデリングと、特定の位置における通例ではないフレームワーク残基を同定するための配列比較とによって同定される（例えばQueen et al., Ｕ．Ｓ．Ｐａｔ．Ｎｏ．５，５８５，０８９、Riechmann et al., Nature 332:323 (1988)参照。これらは、それらの全体として参照によって本明細書に組み込まれる）。三次元免疫グロブリンモデルが一般に利用可能であり、当業者には熟知されている。選択された候補免疫グロブリン配列の有望な三次元コンフォメーション構造を例示および表示するコンピュータプログラムが利用可能である。それらの表示の検討は、候補免疫グロブリン配列の機能における残基の可能性が高い役割の解析、すなわち、候補免疫グロブリンがその抗原に結合する能力に影響する残基の解析を可能にする。このようにして、ＦＲ残基は、標的抗原（単数または複数）に対する増大した親和性などの所望の抗体の特徴が達成されるように、コンセンサスおよびインポート配列から選択および組み合わせられ得る。一般的に、ＣＤＲ残基は、抗原結合に影響することに直接的にかつ最も実質的に関わる。抗体は当分野において公知の種々の技術を用いてヒト化され得、Jones et al., Nature 321:522 (1986)、Verhoeyen et al., Science 239: 1534 (1988)、Sims et al., J. Immunol. 151: 2296 (1993)、Chothia and Lesk, J. Mol. Biol. 196:901 (1987)、Carter et al., Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 89:4285 (1992)、Presta et al., J. Immunol. 151 :2623 (1993)、Padlan, Molecular Immunology 28(4/5):489-498 (1991)、Studnicka et al., Protein Engineering 7(6):805-814 (1994)、Roguska. et al., PNAS 91: 969-973 (1994)、ＰＣＴ公開ＷＯ９１／０９９６７、ＰＣＴ／：ＵＳ９８／１６２８０、ＵＳ９６／１８９７８、ＵＳ９１／０９６３０、ＵＳ９１／０５９３９、ＵＳ９４／０１２３４、ＧＢ８９／０１３３４、ＧＢ９１／０１１３４、ＧＢ９２／０１７５５、ＷＯ９０／１４４４３、ＷＯ９０／１４４２４、ＷＯ９０／１４４３０、ＥＰ２２９２４６、ＥＰ５９２，１０６、ＥＰ５１９，５９６、ＥＰ２３９，４００、Ｕ．Ｓ．Ｐａｔ．Ｎｏ．５，５６５，３３２、５，７２３，３２３、５，９７６，８６２、５，８２４，５１４、５，８１７，４８３、５，８１４，４７６、５，７６３，１９２、５，７２３，３２３、５，７６６，８８６、５，７１４，３５２、６，２０４，０２３、６，１８０，３７０、５，６９３，７６２、５，５３０，１０１、５，５８５，０８９、５，２２５，５３９、４，８１６，５６７に記載されているものを包含するが、これに限定されず、それぞれ全体として参照によって本明細書に組み込まれる。
【０２１７】
本明細書において用いられる用語「アクセプター」および「アクセプター抗体」は、フレームワーク領域の１つ以上のアミノ酸配列の少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、または１００％を提供またはコードする抗体または核酸配列を言う。いくつかの態様において、用語「アクセプター」は、定常領域（単数または複数）を提供またはコードする抗体アミノ酸または核酸配列を言う。まだ別の態様において、用語「アクセプター」は、フレームワーク領域および定常領域（単数または複数）の１つ以上を提供またはコードする抗体アミノ酸または核酸配列を言う。具体的な態様において、用語「アクセプター」は、フレームワーク領域の１つ以上のアミノ酸配列の少なくとも８０％、好ましくは、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、または１００％を提供またはコードするヒト抗体アミノ酸または核酸配列を言う。この態様では、アクセプターは、ヒト抗体の１つ以上の具体的な位置に存在しない少なくとも１、少なくとも２、少なくとも３、少なくとも４、少なくとも５、または少なくとも１０アミノ酸残基を含有し得る。アクセプターフレームワーク領域および／またはアクセプター定常領域（単数または複数）は、例えば、生殖系列抗体遺伝子、成熟抗体遺伝子、機能抗体（例えば、当分野において周知の抗体、開発中の抗体、または商業的に利用可能な抗体）に由来し得るかまたはそれから得られる。
【０２１８】
本明細書において用いられる用語「標準」残基は、Chothia et al.によって定義される特定の標準ＣＤＲ構造を定義するＣＤＲまたはフレームワーク中の残基を言う（J. Mol. Biol. 196:901-907 (1987)、Chothia et al., J. Mol. Biol, 227:799 (1992)。両方とも参照によって本明細書に組み込まれる）。Chothia et al.によれば、多くの抗体のＣＤＲの決定的な部分は、アミノ酸配列のレベルでの大きな多様性にもかかわらず、だいたい同一のペプチドバックボーンコンフォメーションを有する。それぞれの標準構造は、主として、ループを形成するアミノ酸残基の連続的なセグメントについてペプチドバックボーンねじれ角度のセットを規定する。
【０２１９】
本明細書において用いられる用語「ドナー」および「ドナー抗体」は、１つ以上のＣＤＲを提供する抗体を言う。本明細書に記載される組成物および方法のいくつかの態様において、ドナー抗体は、それからフレームワーク領域が得られるかまたは由来する抗体とは異なるある生物種からの抗体である。ヒト化抗体の文脈において、用語「ドナー抗体」は１つ以上のＣＤＲを提供する非ヒト抗体を言う。
【０２２０】
本明細書において用いられる用語「鍵」残基は、抗体、特にヒト化抗体の結合特異性および／または親和性により多くの影響を有する可変領域内のある種の残基を言う。鍵残基は、次の、ＣＤＲに隣接する残基、潜在的なグリコシル化部位（これはＮまたはＯ−グリコシル化部位いずれかであり得る）、低頻度残基、抗原と相互作用できる残基、ＣＤＲと相互作用できる残基、標準残基、重鎖可変領域および軽鎖可変領域の間の接触残基、バーニアゾーン内の残基、ならびに可変重鎖ＣＤＲ１のChothiaの定義および第１の重鎖フレームワークのKabatの定義の間のオーバーラップする領域内の残基の１つ以上を包含するが、これに限定されない。
【０２２１】
本明細書に記載される抗ＬＡＰ抗体またはその抗原結合断片のいずれかを含む組成物および方法のいくつかの態様において、抗ＬＡＰ抗体または抗原結合断片は抗体誘導体である。例えば、限定としてではなく、抗体誘導体は、例えばグリコシル化、アセチル化、ＰＥＧ化、リン酸化、アミド化、公知の保護／ブロック基による誘導体化、蛋白質分解的切断、細胞内リガンドまたは他の蛋白質へのリンクなどによって改変された抗体を包含する。数々の化学的改変のいずれかが公知の技術によって実施され得、特異的な化学的切断、アセチル化、ホルミル化などを包含するが、これに限定されない。加えて、誘導体は１つ以上の非古典的アミノ酸を含有し得る。
【０２２２】
本明細書に記載される抗ＬＡＰ抗体およびその抗原結合断片は、当分野において公知のいずれかの好適な方法によって作製され得る。例えばＬＡＰに対するモノクローナルおよびポリクローナル抗体は当分野において公知である。必要な程度に応じて、例えば特定の特徴またはエピトープ特異性を有する抗体を作製するために、当業者は、本明細書において手短に論じられているようにまたは当分野において公知のように新たなモノクローナルまたはポリクローナル抗ＬＡＰ抗体を作製し得る。
【０２２３】
ポリクローナル抗体は当分野において周知の種々の手順によって産生され得る。例えば、ＬＡＰまたはＬＡＰリガンド相互作用部位の１つ以上を含むその断片が、ウサギ、マウス、ラットなどを包含するがこれに限定されない種々のホスト動物に投与されて、蛋白質に特異的なポリクローナル抗体を含有する血清の産生を誘導し得る。ポリクローナル抗体は、好ましくは動物においてしかるべき抗原およびアジュバントの複数の皮下（ｓｃ）または腹腔内（ｉｐ）注射によって増やされる。免疫化される生物種において免疫原性である蛋白質（例えばスカシ貝ヘモシアニン、血清アルブミン、ウシサイログロブリン、または大豆トリプシン阻害剤）に抗原をコンジュゲーションすることが有用であり得、二官能性または誘導体化剤、例えばマレイミドベンゾイルスルホスクシンイミドエステル（システイン残基を介するコンジュゲーション）、Ｎ−ヒドロキシ−スクシンイミド（リジン残基を介する）、グルタルアルデヒド、無水コハク酸、ＳＯＣｌ２、またはＲ１Ｎ＝Ｃ＝ＮＲを用い、ＲおよびＲ１は異なるアルキル基である。種々の他のアジュバントが、ホスト生物種に依存して免疫応答を増大させるために用いられ得、フロイント（完全および不完全）、ミネラルゲル、例えば水酸化アルミニウム、界面活性物質、例えばリゾレシチン、プルロニックポリオール、ポリアニオン、ペプチド、油エマルション、スカシ貝ヘモシアニン、ジニトロフェノール、ならびに可能性として有用なヒトアジュバント、例えばＢＣＧ（カルメット・ゲラン桿菌）およびコリネバクテリウム・パルバムを包含するが、これに限定されない。好適なアジュバントもまた当業者に周知である。
【０２２４】
モノクローナル抗体は当分野において公知の多種多様な技術を用いて調製され得、ハイブリドーマ、組換え、およびファージディスプレイテクノロジー、またはその組み合わせの使用を包含する。本明細書に記載されるモノクローナル抗体を作るための種々の方法が当分野において利用可能である。例えば、モノクローナル抗体は、第１にKohler et al., Nature, 256:495 (1975)によって記載されたハイブリドーマの方法もしくはそのいずれかの後の発展形を用いて、または組換えＤＮＡの方法（Ｕ．Ｓ．Ｐａｔ．Ｎｏ．４，８１６，５６７）によって作られ得る。例えば、モノクローナル抗体は、当分野において公知であり例えばHarlow et al., Antibodies: A Laboratory Manual, (Cold Spring Harbor Laboratory Press, 2nd ed., 1988)、Hammer-ling, et al., in: Monoclonal Antibodies and T-Cell Hybridomas 563-681 (Elsevier, N.Y., 1981)に教示されているものを包含するハイブリドーマ技術を用いて産生され得る（前記の参照はそれらの全体として参照によって組み込まれる）。ハイブリドーマテクノロジーを用いて特異的抗体を産生およびスクリーニングするための方法は当分野において慣例かつ周知である。別の例においては、本明細書に記載される方法および組成物に有用な抗体は、当分野において公知の種々のファージディスプレイ方法、例えばMcCafferty et al., Nature, 348:552-554 (1990)に記載されている技術を用いて作製される抗体ファージライブラリーからの単離を用いてもまた作製され得る。Clackson et al., Nature, 352:624-628 (1991)およびMarks et al., J. Mol. Biol, 222:581-597 (1991)は、ファージライブラリーを用いて、それぞれマウスおよびヒト抗体の単離を記載している。爾後の刊行物は、鎖シャッフリングによる高親和性（ｎＭ範囲）のヒト抗体の産生（Marks et al., Bio/Technology, 10:779-783 (1992)）ならびに非常に大きいファージライブラリーを構築するための戦略としてのコンビナトリアル感染およびインビボ組換え（Waterhouse et al., Nuc. Acids. Res., 21: 2265-2266 (1993)）を記載している。それゆえに、それらの技術は、モノクローナル抗体の単離のための従来のモノクローナル抗体ハイブリドーマ技術の実行可能な代替である。
【０２２５】
本メールに記載される組成物、方法、および使用のいくつかの態様においては、完全ヒト抗体がＬＡＰ結合剤として用いられ、それらはヒト患者の治療処置にとって特に望ましい。
【０２２６】
ヒト抗体は当分野において公知の種々の方法によって作られ得、ヒト免疫グロブリン配列に由来する抗体ライブラリーを用いる、上に記載されているファージディスプレイの方法を包含する。Ｕ．Ｓ．Ｐａｔ．Ｎｏ．４，４４４，８８７および４，７１６，１１１、ならびにＰＣＴ公開ＷＯ９８／４６６４５、ＷＯ９８／５０４３３、ＷＯ９８／２４８９３、ＷＯ９８／１６６５４、ＷＯ９６／３４０９６、ＷＯ９６／３３７３５、およびＷＯ９１／１０７４１もまた参照。これらの内容はそれらの全体として参照によって本明細書に組み込まれる。
【０２２７】
ヒト抗体は、ヒト免疫グロブリン遺伝子を発現し、免疫化によって、内在性の免疫グロブリン産生の非存在下においてヒト抗体の十分なレパートリーを産生できるトランスジェニックマウスを用いてもまた産生され得る。ヒト抗体を産生するためのこのテクノロジーの概論は、Lonberg and Huszar, 1995, Int. Rev. Immunol. 13:65-93参照。ヒト抗体およびヒトモノクローナル抗体を産生するためのこのテクノロジーの詳細な議論とかかる抗体を産生するためのプロトコールとは、例えばＰＣＴ公開ＷＯ９８／２４８９３、ＷＯ９２／０１０４７、ＷＯ９６／３４０９６、ＷＯ９６／３３７３５、欧州特許Ｎｏ．０５９８８７７、Ｕ．Ｓ．Ｐａｔ．Ｎｏ．５，４１３，９２３、５，６２５，１２６、５，６３３，４２５、５，５６９，８２５、５，６６１，０１６、５，５４５，８０６、５，８１４，３１８、５，８８５，７９３、５，９１６，７７１、および５，９３９，５９８参照。これらの内容はそれらの全体として参照によって本明細書に組み込まれる。加えて、Abgenix, Inc.（Freemont, Calif.）およびMedarex（Princeton, N.J.）などの企業は請け負って、上に記載されているものと類似のテクノロジーを用いて、選択された抗原を対象とするヒト抗体を提供し得る。例えば、Jakobovits et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 90:2551 (1993)、Jakobovits et al., Nature, 362:255-258 (1993)、Bruggermann et al., Year in Immuno, 7:33 (1993)、およびDuchosal et al. Nature 355:258 (1992)もまた参照。その内容はそれらの全体として参照によって本明細書に組み込まれる。代替的には、ファージディスプレイテクノロジー（McCafferty et al., Nature 348:552-553 (1990)）が、未免疫化ドナーからの免疫グロブリン可変（Ｖ）ドメイン遺伝子レパートリーからインビトロでヒト抗体および抗体断片を産生するために用いられ得る。ヒト抗体はインビトロの活性化したＢ細胞によってもまた作製され得る（Ｕ．Ｓ．Ｐａｔ．Ｎｏ．５，５６７，６１０および５，２２９，２７５参照。これらの内容はそれらの全体として参照によって本明細書に組み込まれる）。選択されたエピトープを認識する完全ヒト抗体は、「ガイド選択」と言われる技術を用いて作製され得る。このアプローチでは、選択された非ヒトモノクローナル抗体、例えばマウス抗体が、同じエピトープを認識する完全ヒト抗体の選択をガイドするために用いられる（Jespers et al., 1994, Bio/technology 12:899-903）。
【０２２８】
「Ｆｖ」断片は完全な抗原認識および結合部位を含有する抗体断片である。この領域は固く会合した１つの重および１つの軽鎖可変ドメインの二量体からなり、これは、例えばｓｃＦｖにおいて性質上共有結合的であり得る。それぞれの可変ドメインの３つのＣＤＲが相互作用してＶＨ−ＶＬ二量体の表面上の抗原結合部位を定義するのは、この構成においてである。まとまって、６つのＣＤＲまたはそのサブセットは抗体に抗原結合特異性を付与する。しかしながら、通常は結合部位全体よりも低い親和性でではあるが、単一の可変ドメイン（または、抗原に特異的な３つのＣＤＲのみを含むＦｖの半分）でさえも抗原を認識し結合する能力を有する。
【０２２９】
「フレームワーク領域」（以降ではＦＲ）は、ＣＤＲ残基以外の可変ドメイン残基である。それぞれの可変ドメインは、典型的には、ＦＲ１、ＦＲ２、ＦＲ３、およびＦＲ４として同定される４つのＦＲを有する。ＣＤＲがKabatに従って定義される場合には、軽鎖ＦＲ残基は約残基１〜２３（ＬＣＦＲ１）、３５〜４９（ＬＣＦＲ２）、５７〜８８（ＬＣＦＲ３）、および９８〜１０７（ＬＣＦＲ４）に位置し、重鎖ＦＲ残基は重鎖残基中の約残基１〜３０（ＨＣＦＲ１）、３６〜４９（ＨＣＦＲ２）、６６〜９４（ＨＣＦＲ３）、および１０３〜１１３（ＨＣＦＲ４）に位置する。ＣＤＲが超可変ループからのアミノ酸残基を含む場合には、軽鎖ＦＲ残基は軽鎖中の約残基１〜２５（ＬＣＦＲ１）、３３〜４９（ＬＣＦＲ２）、５３〜９０（ＬＣＦＲ３）、および９７〜１０７（ＬＣＦＲ４）に位置し、重鎖ＦＲ残基は重鎖残基中の約残基１〜２５（ＨＣＦＲ１）、３３〜５２（ＨＣＦＲ２）、５６〜９５（ＨＣＦＲ３）、および１０２〜１１３（ＨＣＦＲ４）に位置する。いくつかの場合には、ＣＤＲがKabatによって定義されるＣＤＲおよび超可変ループのもの両方からのアミノ酸を含むときに、ＦＲ残基はそれに従って調整されるであろう。例えば、ＣＤＲＨ１がアミノ酸Ｈ２６〜Ｈ３５を包含するときには、重鎖ＦＲ１残基は位置１〜２５であり、ＦＲ２残基は位置３６〜４９である。それぞれの相補性決定領域は、Kabatによって定義される「相補性決定領域」からのアミノ酸残基（すなわち、軽鎖可変ドメイン中の約残基２４〜３４（Ｌ１）、５０〜５６（Ｌ２）、および８９〜９７（Ｌ３）ならびに重鎖可変ドメイン中の３１〜３５（Ｈ１）、５０〜６５（Ｈ２）、および９５〜１０２（Ｈ３）。Kabat et al., Sequences of Proteins of Immunological Interest, 5th Ed. Public Health Service, National Institutes of Health, Bethesda, Md. (1991)）および／または「超可変ループ」からの残基（すなわち、軽鎖可変ドメイン中の約残基２６〜３２（Ｌ１）、５０〜５２（Ｌ２）、および９１〜９６（Ｌ３）ならびに重鎖可変ドメイン中の２６〜３２（Ｈ１）、５３〜５５（Ｈ２）、および９６〜１０１（Ｈ３）。Chothia and Lesk J. Mol. Biol. 196:901-917 (1987)）を含み得る。いくつかの場合には、相補性決定領域はKabatに従って意義されるＣＤＲ領域および超可変ループ両方からのアミノ酸を包含し得る。
【０２３０】
用語が本明細書において用いられる「ヒト化抗体」は非ヒト生物種からの抗体分子を言い、所望の抗原、すなわちＬＡＰまたはリガンドに結合したＬＡＰに結合する抗体は、非ヒト生物種からの１つ以上のＣＤＲとヒト免疫グロブリン分子からのフレームワークおよび定常領域とを有する。多くの場合に、ヒトフレームワーク領域中のフレームワーク残基は、抗原結合を変える、好ましくは改善するために、ＣＤＲドナー抗体からの対応する残基によって置換されるであろう。これらのフレームワーク置換は、当分野において周知の方法によって、例えば、抗原結合に重要なフレームワーク残基を同定するためのＣＤＲおよびフレームワーク残基の相互作用のモデリングと特定の位置における通例ではないフレームワーク残基を同定するための配列比較とによって同定される（例えばQueen et al., Ｕ．Ｓ．Ｐａｔ．Ｎｏ．５，５８５，０８９、Riechmann et al., 1988, Nature 332:323参照。抗体は、当分野において公知の種々の技術を用いてヒト化され得、例えばＣＤＲグラフト（ＥＰ２３９，４００、ＰＣＴ公開ＷＯ９１／０９９６７、Ｕ．Ｓ．Ｐａｔ．Ｎｏ．５，２２５，５３９、５，５３０，１０１、および５，５８５，０８９）、ベニアリングまたはリサーフェシング（ＥＰ５９２，１０６、ＥＰ５１９，５９６、Padlan, Molecular Immunology, 1991, 28(415):489-498、Studnicka et al., 1994, Protein Engineering 7(6):805-814、Roguska. et al., 1994, PNAS 91: 969-973）、および鎖シャッフリング（Ｕ．Ｓ．Ｐａｔ．Ｎｏ．５，５６５，３３２）を包含し、これらの内容はそれらの全体として参照によって本明細書に組み込まれる。従って、ヒト化抗体は、非ヒトであるソースからそれに導入された１つ以上のアミノ酸残基を有する。それらの非ヒトアミノ酸残基は多くの場合には「インポート」残基と言われ、それらは典型的には「インポート」可変ドメインからとられる。ヒト化は、本質的に、その内容がそれらの全体として参照によって本明細書に組み込まれるWinterおよび同僚の方法に従って、齧歯類ＣＤＲまたはＣＤＲ配列によってヒト抗体の対応する配列を置換することによって行われ得る（Jones et al., Nature, 321:522-525 (1986)、Riechmann et al., Nature, 332:323-327 (1988)、Verhoeyen et al., Science, 239: 1534-1536 (1988)）。従って、かかる「ヒト化」抗体はキメラ抗体であり（Ｕ．Ｓ．Ｐａｔ．Ｎｏ．４，８１６，５６７。その内容はその全体として参照によって本明細書に組み込まれる）、インタクトなヒト可変ドメインよりも実質的に少しが非ヒト生物種からの対応する配列によって置換されている。実際には、ヒト化抗体は、典型的には、いくつかのＣＤＲ残基およびことによってはいくつかのＦＲ残基が齧歯類抗体中の相当部位からの残基によって置換されたヒト抗体である。
【０２３１】
「Ｆａｂ」断片は軽鎖の可変および定常ドメインと重鎖の可変ドメインおよび第１の定常ドメイン（ＣＨ１）とを含有する。Ｆ（ａｂ’）２抗体断片は、一般的にそれらの間のヒンジシステインによってそれらのカルボキシ末端近くで共有結合的にリンクされたＦａｂ断片のペアを含む。抗体断片の他の化学的カップリングもまた当分野において公知である。
【０２３２】
「一本鎖Ｆｖ」または「ｓｃＦｖ」抗体断片は抗体のＶＨおよびＶＬドメインを含み、それらのドメインが単一のポリペプチド鎖中に存在する。一般的に、ＦｖポリペプチドはＶＨおよびＶＬドメインの間にポリペプチドリンカーをさらに含み、これはｓｃＦｖが抗原結合のための所望の構造を形成できるようにする。ｓｃＦｖの総説はPluckthun in The Pharmacology of Monoclonal Antibodies, Vol 113, Rosenburg and Moore eds. Springer-Verlag, New York, pp. 269-315 (1994) 参照。
【０２３３】
用語「ダイアボディ」は、２つの抗原結合部位を有する小さい抗体断片を言い、それらの断片は同じポリペプチド鎖中の軽鎖可変ドメイン（ＶＬ）につながれた重鎖可変ドメイン（ＶＨ）を含む（ＶＨおよびＶＬ）。同じ鎖上の２つのドメインの間のペア形成を許すには短すぎるリンカーを用いることによって、ドメインは別の鎖の相補的なドメインとペア形成することを強いられ、２つの抗原結合部位を作り出す。ダイアボディは例えばＥＰ４０４，０９７、ＷＯ９３／１１１６１、およびHollinger et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 90:6444-6448 (1993) により十分に記載されている。
【０２３４】
表現「リニア抗体」は、Zapata et al., Protein Eng., 8(10): 1057-1062 (1995)に記載されている抗体を言う。手短には、それらの抗体はタンデムなＦｄセグメントのペア（ＶＨ−ＣＨ１−ＶＨ−ＣＨ１）を含み、これらが相補的な軽鎖ポリペプチドと一緒になって抗原結合領域のペアを形成する。リニア抗体は二重特異性または単一特異性であり得る。
【０２３５】
種々の技術が抗体または抗原結合断片の産生のために開発されて来た。本明細書に記載される抗体は従来の技術を用いて断片化され得、断片は完全抗体について上に記載されている同じ様式で有用性についてスクリーニングされ得る。従来、それらの断片はインタクトな抗体の蛋白質分解的消化に由来した（例えばMorimoto et al., Journal of Biochemical and Biophysical Methods 24: 107-117 (1992)およびBrennan et al., Science, 229:81 (1985)参照）。例えば、本明細書に記載される二重特異性および多重特異性抗体のＦａｂおよびＦ（ａｂ’）２断片は、免疫グロブリン分子の蛋白質分解的切断によって、パパイン（Ｆａｂ断片を産生するため）またはペプシン（Ｆ（ａｂ’）２断片を産生するため）などの酵素を用いて産生され得る。Ｆ（ａｂ’）２断片は、可変領域、軽鎖定常領域、および重鎖のＣＨ１ドメインを含有する。しかしながら、これらの断片は今では組換えホスト細胞によって直接的に産生され得る。例えば、抗体断片は、上で論じられている抗体ファージライブラリーから単離され得る。代替的には、Ｆａｂ’−ＳＨ断片が大腸菌から直接的に回収され、化学的にカップリングされて、Ｆ（ａｂ’）２断片を形成し得る（Carter et al., Bio/Technology 10: 163-167 (1992)）。別のアプローチによれば、Ｆ（ａｂ’）２断片は組換えホスト細胞培養物から直接的に単離され得る。抗体断片の産生のための他の技術は当業者には明らかであろう。他の態様において、選ばれる抗体は一本鎖Ｆｖ断片（ｓｃＦｖ）である。ＷＯ９３／１６１８５参照。
【０２３６】
一本鎖Ｆｖおよび抗体を産生するために用いられ得る技術の例は、Ｕ．Ｓ．Ｐａｔ．Ｎｏ．４，９４６，７７８および５，２５８，４９８、Huston et al., 1991, Methods in Enzymology 203:46-88、Shu et al., 1993, PNAS 90:7995-7999、ならびにSkerra et al., 1988, Science 240: 1038-1040に記載されているものを包含する。本明細書に記載されるヒトにおける抗体のインビボ使用とインビトロ増殖または細胞傷害性アッセイとを包含するいくつかの使用のためには、キメラ、ヒト化、またはヒト抗体を用いることが好ましい。
【０２３７】
「親和性成熟した」抗体は、それらの変更（単数または複数）を備えない親抗体と比較して、抗原に対する抗体の親和性の改善をもたらす１つ以上の変更をその１つ以上のＣＤＲ中に有するものである。好ましい親和性成熟した抗体は、標的抗原に対してナノモルまたはさらにはピコモルの親和性を有するであろう。親和性成熟した抗体は当分野において公知の手順によって産生される。Marks et al. Bio/Technology 10:779-783 (1992) はＶＨおよびＶＬドメインシャッフリングによる親和性成熟を記載している。ＣＤＲおよび／またはフレームワーク残基のランダム変異導入はBarbas et al., Proc Nat. Acad. Sci, USA 91: 3809-3813 (1994)、Schier et al., Gene 169: 147-155 (1995)、Yelton et al. J. Immunol. 155: 1994-2004 (1995)、Jackson et al., J. Immunol. 154(7):3310-9 (1995)、およびHawkins et al., J. Mol. Biol. 226:889-896 (1992) によって記載されている。
【０２３８】
本明細書において用いられる「相補的」は、２つの免疫グロブリンドメインが、正しいペアもしくは群を形成する構造のファミリーに属するか、またはかかるファミリーに由来し、この特徴を保持するときを言う。例えば、天然の抗体のＶＨドメインおよびＶＬドメインは相補的であり、２つのＶＨドメインは相補的ではなく、２つのＶＬドメインは相補的ではない。相補的なドメインは、免疫グロブリンスーパーファミリーの他のメンバー、例えばＴ細胞受容体のＶαおよびＶβ（またはγおよびδ）ドメインに見いだされ得る。人工的であるドメイン、例えば、そうなるように操作されない限りエピトープに結合しない蛋白質骨格は、非相補的である。同様に、例えば免疫グロブリンドメインおよびフィブロネクチンドメインに基づく２つのドメインは相補的ではない。
【０２３９】
本明細書に記載される組成物、方法、および使用のいくつかの態様において、ＬＡＰ結合剤は小分子阻害剤、薬剤、または化合物である。
【０２４０】
本明細書に記載される方法のいくつかの態様において、本明細書に記載される方法への使用のためのＬＡＰ小分子結合剤は、ＬＡＰリガンド相互作用部位、例えば成熟ＴＧＦ−βと相互作用する部位、インテグリンと相互作用する部位、および／またはＬＴＢＰと相互作用する部位と結合または物理的に相互作用し得る。
【０２４１】
本明細書に記載される方法のいくつかの態様において、ＬＡＰ小分子結合剤は、配列番号１および４のＲ１８９、配列番号２および５のＲ１９６、ならびに／または配列番号３および６のＲ１９２と結合または物理的に相互作用する。本明細書に記載される方法のいくつかの態様において、ＬＡＰ小分子結合剤は、配列番号１および４のアミノ酸２１５〜２１７、配列番号２および５のアミノ酸２４１〜２４３、ならびに／または配列番号３および６のアミノ酸２３８〜２４０と結合または物理的に相互作用する。本明細書に記載される方法のいくつかの態様において、ＬＡＰ小分子結合剤は、配列番号１〜６のいずれかのＣｙｓ４と結合または物理的に相互作用する。
【０２４２】
本明細書に記載される方法のいくつかの態様において、本明細書に記載される方法への使用のためのＬＡＰ小分子結合剤は、ＬＡＰホモ二量体化部位、すなわち別のＬＡＰ分子と相互作用する部位と結合または物理的に相互作用し得る。従って、本明細書に記載される方法のいくつかの態様において、ＬＡＰ小分子結合剤は、配列番号１および４のＣｙｓ１９４および／もしくはＣｙｓ１９６、配列番号２および５のＣｙｓ２０６および／もしくはＣｙｓ２０８、ならびに／または配列番号３および６のＣｙｓ２０４および／もしくはＣｙｓ２０６と結合または物理的に相互作用する。
【０２４３】
かかる小分子阻害剤は、小さいペプチドまたはペプチド様分子、可溶性のペプチド、および合成非ペプチジル有機または無機化合物を包含するが、これに限定されない。小分子阻害剤またはアンタゴニストは約１００から約２０，０００ダルトン（Ｄａ）、約５００から約１５，０００Ｄａ、約１０００から約１０，０００Ｄａのいずれかの分子量を有し得る。
【０２４４】
本明細書に記載される組成物、方法、および使用のいくつかの態様において、ＬＡＰ結合剤は、ＬＡＰと結合または物理的に相互作用するＲＮＡまたはＤＮＡアプタマーであり、ＬＡＰおよびそのリガンドのいずれかの間の相互作用を調節する。
【０２４５】
本明細書に記載される方法のいくつかの態様において、本明細書に記載される方法への使用のためのＬＡＰＲＮＡまたはＤＮＡアプタマーは、ＬＡＰリガンド相互作用部位、例えば成熟ＴＧＦβと相互作用する部位、インテグリンと相互作用する部位、および／またはＬＴＢＰと相互作用する部位に結合し得る。
【０２４６】
本明細書に記載される方法のいくつかの態様において、ＬＡＰＲＮＡまたはＤＮＡアプタマーは、配列番号１および４のＲ１８９、配列番号２および５のＲ１９６、ならびに／または配列番号３および６のＲ１９２に結合する。本明細書に記載される方法のいくつかの態様において、ＬＡＰＲＮＡまたはＤＮＡアプタマーは、配列番号１および４のアミノ酸２１５〜２１７、配列番号２および５のアミノ酸２４１〜２４３、ならびに／または配列番号３および６のアミノ酸２３８〜２４０と結合または物理的に相互作用する。本明細書に記載される方法のいくつかの態様において、ＲＮＡまたはＤＮＡアプタマーは、配列番号１〜６のいずれかのＣｙｓ４と結合または物理的に相互作用する。
【０２４７】
本明細書に記載される方法のいくつかの態様において、本明細書に記載される方法への使用のためのＬＡＰＲＮＡまたはＤＮＡアプタマーは、ＬＡＰホモ二量体化部位、すなわち別のＬＡＰ分子と相互作用する部位と結合または物理的に相互作用し得る。従って、本明細書に記載される方法のいくつかの態様において、ＬＡＰＲＮＡまたはＤＮＡアプタマーは、配列番号１および４のＣｙｓ１９４および／もしくはＣｙｓ１９６、配列番号２および５のＣｙｓ２０６および／もしくはＣｙｓ２０８、ならびに／または配列番号３および６のＣｙｓ２０４および／もしくはＣｙｓ２０６と結合または物理的に相互作用する。
【０２４８】
本明細書に記載される組成物および方法への使用のためのＬＡＰ結合剤は、当分野において公知の方法、例えば蛋白質−蛋白質結合アッセイ、生化学的スクリーニングアッセイ、および細胞に基づくアッセイを用いて同定またはキャラクタリゼーションされ得、これらは当分野において周知であり、本明細書において例および図面に記載されているものを包含するが、これに限定されない。
【０２４９】
本明細書に記載される方法および使用の臨床使用のためには、ＬＡＰ結合剤を含む組成物の投与は、非経口投与、例えば静脈内、粘膜、例えば経鼻、経眼、または他の投与モードのための医薬組成物または医薬製剤への製剤を包含し得る。いくつかの態様において、本明細書に記載されるＬＡＰ結合剤は、対象の有効な処置をもたらすいずれかの医薬的に許容される担体化合物、材料、または組成物と一緒に投与され得る。それゆえに、本明細書に記載される方法への使用のための医薬製剤は、本明細書に記載されるＬＡＰ結合剤を、１つ以上の医薬的に許容される成分との組み合わせで含有し得る。
【０２５０】
言い回し「医薬的に許容される」は、正当な医療的判断の範囲内において、人間および動物の組織と接触する使用に好適であり、過剰な毒性、痛み、アレルギー性応答、または他の問題もしくは合併症がなく、理にかなった利益／リスク比に釣り合う化合物、材料、組成物、および／または剤形を言う。本明細書において用いられる言い回し「医薬的に許容される担体」は、ＬＡＰ結合剤の安定性、可溶性、または活性を維持することに関わる、医薬的に許容される材料、組成物、または基剤、例えば液体もしくは固体フィラー、希釈剤、賦形剤、溶媒、媒体、封入材料、製造助剤（例えば滑剤、タルクマグネシウム、ステアリン酸カルシウムもしくは亜鉛、またはステアリン酸、または溶媒封入材料を意味する。それぞれの担体は、製剤の他の成分と適合性でありかつ患者にとって危険でないという意味で「許容され」なければならない。医薬的に許容される担体として働き得る材料のいくつかの例は、（１）ラクトース、グルコース、およびスクロースなどの糖、（２）コーンスターチおよび馬鈴薯デンプンなどのデンプン、（３）セルロースおよびその誘導体、例えばカルボキシメチルセルロースナトリウム、メチルセルロース、エチルセルロース、微結晶セルロース、および酢酸セルロース、（４）粉末化トラガカント、（５）麦芽、（６）ゼラチン、（７）ココアバターおよび座薬ワックスなどの賦形剤、（８）油、例えばピーナッツオイル、綿実油、サフラワー油、ごま油、オリーブ油、コーン油、および大豆油、（９）プロピレングリコールなどのグリコール、（１０）グリセリン、ソルビトール、マンニトール、およびポリエチレングリコール（ＰＥＧ）などのポリオール、（１１）オレイン酸エチルおよびラウリン酸エチルなどのエステル、（１２）寒天、（１３）水酸化マグネシウムおよび水酸化アルミニウムなどの緩衝剤、（１４）アルギン酸、（１５）発熱原不含水、（１６）等張生理食塩水、（１７）リンゲル液、（１９）ｐＨ緩衝溶液、（２０）ポリエステル、ポリカーボネート、および／またはポリ酸無水物、（２１）ポリペプチドおよびアミノ酸などの増量剤、（２２）血清アルブミン、ＨＤＬ、およびＬＤＬなどの血清コンポーネント、（２３）エタノールなどのＣ２〜Ｃ１２アルコール、ならびに（２４）医薬製剤に使用される他の非毒性の適合性物質を包含する。離型剤、コーティング剤、保存料、および抗酸化剤もまた製剤中に存在し得る。「賦形剤」、「担体」、「医薬的に許容される担体」または同類などの用語は本明細書において交換可能に用いられる。
【０２５１】
本明細書に記載されるＬＡＰ結合剤は、対象への化合物の投与のために固体、液体、またはゲル形態で特別に製剤され得、次に適したものを包含する。（１）非経口投与、例えば皮下、筋肉内、静脈内、または硬膜外注射により、例えば無菌溶液もしくは懸濁液、または持続放出製剤として、（２）外用、例えば皮膚に適用されるクリーム、軟膏、または制御放出パッチもしくはスプレーとして、（３）膣内または直腸内、例えばペッサリー、クリーム、またはフォームとして、（４）経眼、（５）経皮、（６）経粘膜、あるいは（７９）経鼻。加えて、ＬＡＰ結合剤は患者に移植されるかまたは薬送達システムを用いて注射され得る。例えば、Urquhart, et al., Ann. Rev. Pharmacol. Toxicol. 24: 199-236 (1984)、Lewis, ed. "Controlled Release of Pesticides and Pharmaceuticals" (Plenum Press, New York, 1981)、Ｕ．Ｓ．Ｐａｔ．Ｎｏ．３，７７３，９１９、およびＵ．Ｓ．Ｐａｔ．Ｎｏ．３５３，２７０，９６０参照。
【０２５２】
本明細書に記載される方法において用いられ得るＬＡＰ結合剤を含む組成物の製剤および投与モードのさらなる態様が下に記載される。
【０２５３】
非経口剤形。ＬＡＰ結合剤の非経口剤形は種々の経路によってもまた対象に投与され得、皮下、静脈内（ボーラス注射を包含する）、筋肉内、および動脈内を包含するが、これに限定されない。非経口剤形の投与は典型的にはコンタミナントに対する患者の自然防御をバイパスするので、非経口剤形は好ましくは無菌であるか、または患者への投与に先行して滅菌できる。非経口剤形の例は、注射の準備ができた溶液、注射のために医薬的に許容される基剤中に溶解または懸濁される準備ができた乾燥品、注射の準備ができた懸濁液、制御放出非経口剤形、およびエマルションを包含するが、これに限定されない。
【０２５４】
本開示の非経口剤形を提供するために用いられ得る好適な基剤は当業者に周知である。例は、限定なしに、無菌水、注射のための水（ＵＳＰ）、生理食塩水溶液、グルコース溶液、塩化ナトリウム注射液、リンゲル注射液、ブドウ糖注射液、ブドウ糖および塩化ナトリウム注射液、およびラクテートリンゲル注射液などだがこれに限定されない水系基剤、エチルアルコール、ポリエチレングリコール、およびプロピレングリコールなどだがこれに限定されない水混和性基剤、ならびにコーン油、綿実油、ピーナッツオイル、ごま油、オレイン酸エチル、ミリスチン酸イソプロピル、および安息香酸ベンジルなどだがこれに限定されない非水系基剤を包含する。
【０２５５】
エアロゾル製剤。ＬＡＰ結合剤は、好適なプロペラント（例えば、プロパン、ブタン、またはイソブタンのような炭化水素プロペラント）と一緒に、従来のアジュバントによって加圧エアロゾル容器中にパッケージングされ得る。本明細書に記載されるＬＡＰ結合剤は、ネブライザーまたはアトマイザーなどの非加圧形態でもまた投与され得る。本明細書に記載されるＬＡＰ結合剤は、乾燥粉末の形態で、例えば吸入器の使用によって気道に直接的に投与もまたされ得る。
【０２５６】
好適な粉末組成物は、例示として、ラクトース、または気管支内投与について許容される他の不活性粉末と全く混ざり合った本明細書に記載されるＬＡＰ結合剤の粉末化調製物を包含する。粉末組成物は、エアロゾルディスペンサーから投与されるか、または、易破壊性カプセル中に収容され得、これが、カプセルをパンクさせ、吸入に好適な定流で粉末を吹き出すデバイス中に対象によって挿入され得る。組成物はプロペラント、界面活性剤、および共溶媒を包含し得、好適な絞り弁によって閉じられる従来のエアロゾル容器中に充填され得る。
【０２５７】
気道への送達のためのエアロゾルは当分野において公知であり（例えば、Adjei, A. and Garren, J. Pharm. Res., 1: 565-569 (1990)、Zanen, P. and Lamm, J.-W. J. Int. J. Pharm., 114: 111-115 (1995)、Gonda, I. "Aerosols for delivery of therapeutic and diagnostic agents to the respiratory tract," in Critical Reviews in Therapeutic Drug Carrier Systems, 6:273-313 (1990)、Anderson et al., Am. Rev. Respir. Dis., 140: 1317-1324 (1989) 参照）、ペプチドおよび蛋白質の全身送達のポテンシャルも有する（Patton and Platz, Advanced Drug Delivery Reviews, 8: 179-196 (1992))、Timsina et. al., Int. J. Pharm., 101: 1-13 (1995)、およびTansey, I. P., Spray Technol. Market, 4:26-29 (1994)、French, D. L., Edwards, D. A. and Niven, R. W., Aerosol Sci., 27: 769-783 (1996)、Visser, J., Powder Technology 58: 1-10 (1989))、Rudt, S. and R. H. Muller, J. Controlled Release, 22: 263-272 (1992)、Tabata, Y, and Y. Ikada, Biomed. Mater. Res., 22: 837-858 (1988)、Wall, D. A., Drug Delivery, 2: 10 1-20 1995)、Patton, J. and Platz, R, Adv. Drug Del. Rev., 8: 179-196 (1992)、Bryon, P., Adv. Drug. Del. Rev., 5: 107-132 (1990)、Patton, J. S., et al., Controlled Release, 28: 15 79-85 (1994)、Damms, B. and Bains, W., Nature Biotechnology (1996)、Niven, R. W., et al., Pharm. Res., 12(9); 1343-1349 (1995)、およびKobayashi, S., et al., Pharm. Res., 13(1): 80-83 (1996)。これらの全ての内容はそれらの全体として参照によって本明細書に組み込まれる）。
【０２５８】
水はいくつかの化合物の分解を容易化し得るので、本明細書に記載されるＬＡＰ結合剤の製剤は、開示される化合物を活性成分として含む無水の医薬組成物および剤形をさらに包摂する。例えば、水の追加（例えば５％）は、経時的な製剤の保管期限または安定性などの特徴を決定するために長期保存をシミュレーションする手段として、医薬分野において広く受け入れられている。例えばJens T. Carstensen, Drug Stability: Principles & Practice, 379-80 (2nd ed., Marcel Dekker, NY, N.Y.: 1995) 参照。本開示の無水の医薬組成物および剤形は、無水または低水分含有成分と低水分または低湿気条件とを用いて調製され得る。ラクトースと第１級または第２級アミンを含む少なくとも１つの活性成分とを含む医薬組成物および剤形は、製造、パッケージング、および／または保存の間の水分および／または湿気との実質的な接触が予想される場合には、好ましくは無水である。無水の組成物は、好ましくは、水への暴露を防ぐことが公知の材料を用いてパッケージングされ、その結果、それらは好適なフォーミュラリーキット中に包含され得る。好適なパッケージングの例は、気密封止されたホイル、プラスチック、乾燥剤ありまたはなしのユニットドーズ容器（例えばバイアル）、ブリスターパック、およびストリップパックを包含するが、これに限定されない。
【０２５９】
制御および遅延放出剤形。本明細書に記載される側面のいくつかの態様において、ＬＡＰ結合剤は制御または遅延放出手段によって対象に投与され得る。理想的には、医療処置における最適に設計された制御放出調製物の使用は、最低限の原薬が最低限の時間量で状態を治すかまたはコントロールするために使用されることを特徴とする。制御放出製剤の利点は、１）薬の延長された活性、２）低減された投薬頻度、３）増大した患者コンプライアンス、４）より少ないトータルの薬の使用量、５）局所または全身副作用の低減、６）薬蓄積の最小化、７）血中レベル変動の低減、８）処置の有効性の改善、９）薬の活性の相乗または損失の低減、および１０）疾患または状態のコントロールのスピードの改善を包含する（Kim, Cherng-ju, Controlled Release Dosage Form Design, 2 (Technomic Publishing, Lancaster, Pa.: 2000)）。制御放出製剤は、式（Ｉ）の化合物の作用の開始、作用の持続期間、治療ウィンドウの血漿中レベル、およびピーク血中レベルをコントロールするために用いられ得る。特に、制御または徐放放出剤形または製剤は、式（Ｉ）の化合物の最大限の有効性が達成されながらも、潜在的な有害作用および安全性の問題（これは、薬を過少投与すること（すなわち、最低限の治療レベルを下回ること）および薬の毒性レベルを超過すること両方から起こり得る）を最小化することを保証するために用いられ得る。
【０２６０】
種々の公知の制御または徐放放出剤形、製剤、およびデバイスが、本明細書に記載されるＬＡＰ結合剤による使用に適し得る。例は、それぞれがそれらの全体として参照によって本明細書に組み込まれるＵ．Ｓ．Ｐａｔ．Ｎｏ．：３，８４５，７７０、３，９１６，８９９、３，５３６，８０９、３，５９８，１２３、４，００８，７１９、５６７４，５３３、５，０５９，５９５、５，５９１，７６７、５，１２０，５４８、５，０７３，５４３、５，６３９，４７６、５，３５４，５５６、５，７３３，５６６、および６，３６５，１８５Ｂ１に記載されているものを包含するが、これに限定されない。それらの剤形は、１つ以上の活性成分の低速または制御放出を提供するために用いられ得、例えば、ヒドロキシプロピルメチルセルロース、他のポリマーマトリックス、ゲル、透過膜、浸透圧システム（例えば、OROS（登録商標）（Alza Corporation, Mountain View, Calif. USA））、多層コーティング、マイクロ粒子、リポソーム、もしくはマイクロスフィア、またはその組み合わせを用いて、所望の放出プロファイルをさまざまな割合で提供する。加えて、イオン交換材料が用いられて、開示される化合物の固定化された吸着された塩形態を調製し、それゆえに薬の制御送達を成就し得る。具体的なアニオン交換体の例はDUOLITE（登録商標）A568およびDUOLITE（登録商標）AP143（Rohm&Haas, Spring House, Pa. USA）を包含するが、これに限定されない。
【０２６１】
本明細書に記載される方法のいくつかの態様において、本明細書に記載される方法への使用のためのＬＡＰ結合剤は、持続放出によってまたはパルスで対象に投与される。パルス療法は、経時的な組成物の同じ量の非連続投与の形態ではなく、低減された頻度での組成物の同じ量の投与または低減された用量の投与を含む。持続放出またはパルス投与は、障害が対象において連続的に起こっているとき、例えば対象がウイルス感染の連続的または慢性的症状を有するところで特に好ましい。それぞれのパルス用量は低減され得、対象または患者に処置の過程で投与される本明細書に記載されるＬＡＰ結合剤のトータルの量が最小化される。
【０２６２】
パルスの間のインターバルは、必要に応じて、当業者によって決定され得る。多くの場合に、パルスの間のインターバルは、組成物または組成物の活性コンポーネントが次のパルスの送達に先行してもはや検出可能ではないときに、組成物の別の用量を投与することによって計算され得る。インターバルは組成物のインビボ半減期からもまた計算され得る。インターバルは、インビボ半減期よりも大きく、または組成物半減期の２、３、４、５、さらには１０倍大きく計算され得る。点滴または患者への送達の他の形態によって組成物をパルス投与するための種々の方法および器具は、Ｕ．Ｓ．Ｐａｔ．Ｎｏ．４，７４７，８２５、４，７２３，９５８、４，９４８，５９２、４，９６５，２５１、および５，４０３，５９０に開示されている。
【０２６３】
処置の方法およびＬＡＰ結合剤の使用
本明細書において示されるように、抗ＬＡＰ抗体によって処置されたときに、頭蓋内および皮下ＧＢＭ腫瘍成長はより低く、マウスはより長く生存する。抗ＬＡＰ抗体処置は次のように全身および腫瘍内免疫両方にもまた影響した。（１）腫瘍は、細胞傷害性ＣＤ８＋Ｔ細胞の増大した数によって浸潤され、腫瘍内Ｆｏｘｐ３Ｔｒｅｇは減少した。ＣＤ４＋およびＣＤ８＋腫瘍内Ｔ細胞はＰＤ−１、ＬＡＧ３、およびＣＤ１０３の減少した発現を有した。（２）末梢においては、ＩＦＮ−γおよびグランザイムＢを発現するＣＤ４＋およびＣＤ８＋Ｔ細胞がそれぞれ増大し、その一方でＣＤ１０３＋Ｔ細胞は減少した。最後に、ＣＤ１０３およびＰＤ−Ｌ１を発現する免疫寛容誘導性樹状細胞の低減された数があり、その一方でＭＨＣＩＩは脾臓の骨髄系細胞において上昇していた。抗ＬＡＰ抗体をメラノーマモデルおよび大腸癌モデルにおいてもまた試験し、類似の腫瘍内および末梢免疫効果が観察された。それゆえに、本明細書において示されているように、ＬＡＰの阻害は、自然および獲得免疫両方を活性化することによって全身および腫瘍内免疫応答に強く影響し、腫瘍特異的免疫を抑制するメカニズムを克服する。結論として、単独療法としてのまたは従来の抗腫瘍モダリティーと組み合わされてのＬＡＰ結合剤は、種々の癌（脳腫瘍、メラノーマ、および大腸癌を包含するが、これに限定されない）の処置のための新規の免疫療法アプローチを表す。
【０２６４】
いくつかの側面においては、ＬＡＰ発現および／または活性が癌または腫瘍特異的免疫の抑制に関連する癌および腫瘍を処置するための方法が本明細書において提供され、それが必要な対象にＬＡＰ結合剤の治療有効量を投与することを含む。
【０２６５】
いくつかの側面においては、腫瘍特異的免疫を増大させるための方法が本明細書において提供され、それが必要な対象にＬＡＰ結合剤の治療有効量を投与することを含む。
【０２６６】
これらの側面および本明細書に記載される全てのかかる側面のいくつかの態様において、対象は癌を有するか、またはそれと診断されている。
【０２６７】
本明細書に記載される「癌」または「腫瘍」は、体の臓器およびシステムの正常な機能に干渉する、細胞のコントロールされない成長を言う。癌または腫瘍を有する対象は、対象の体内に存在する客観的に測定可能な癌細胞を有する対象である。この定義には、良性および悪性癌、ならびに休眠腫瘍または微小転移が包含される。それらの元の場所から遊走し、不可欠な臓器に播種する癌は、最後には患部臓器の機能低下によって対象の死亡に至り得る。白血病などの造血系の癌は対象の正常な造血系のコンパートメントを駆逐する能力があり、それによって造血系の不全（貧血、血小板減少症、および好中球減少症の形態）に至り、最終的には死亡を引き起こす。
【０２６８】
「転移」によって、その原発部位から体内の他の箇所への癌の広がりが意味される。癌細胞は原発性腫瘍から抜け出し、リンパおよび血管に入り込み、血流中を循環し、体内の他所の正常組織中の遠隔の病巣において育ち得る（転移する）。転移は局所または遠隔であり得る。転移は一連のプロセスであり、腫瘍細胞が原発性腫瘍から離脱し、血流中を進み、遠隔部位で止まることを条件とする。新たな部位において、細胞は血液供給を確立し、生命を脅かす質量を形成するまでに育ち得る。腫瘍細胞内の刺激性および阻害性分子経路は両方ともこの挙動を制御し、遠隔部位における腫瘍細胞およびホスト細胞の間の相互作用もまた重要である。
【０２６９】
転移は、最も多くの場合に、具体的な症状のモニタリングに加えて、磁気共鳴イメージング（ＭＲＩ）スキャン、コンピュータ断層撮影（ＣＴ）スキャン、血液および血小板カウント、肝臓機能研究、胸部Ｘ線、ならびに骨スキャンの単独のまたは組み合わせた使用によって検出される。
【０２７０】
癌の例は、癌腫、リンパ腫、芽細胞腫、肉腫、および白血病を包含するが、これに限定されない。かかる癌のより特定の例は、基底細胞癌腫、胆道癌、膀胱癌、骨癌、脳およびＣＮＳ癌、乳癌、腹膜の癌、子宮頸癌、胆管癌、絨毛癌、結腸および直腸癌、結合組織癌、消化系の癌、子宮内膜癌、食道癌、眼の癌、頭部および頸部の癌、胃癌（消化器癌を包含する）、膠芽腫、肝臓癌腫、ヘパトーマ、上皮内新生物、腎または腎臓癌、喉頭癌、白血病、肝臓癌、肺癌（例えば小細胞肺癌、非小細胞肺癌、肺の腺癌、および肺の扁平上皮癌腫）、ホジキンおよび非ホジキンリンパ腫を包含するリンパ腫、メラノーマ、ミエローマ、神経芽腫、口腔癌（例えば唇、舌、口腔、および咽頭）、卵巣癌、膵臓癌、前立腺癌、網膜芽細胞腫、横紋筋肉腫、直腸癌、呼吸器系の癌、唾液腺癌腫、肉腫、皮膚癌、扁平上皮癌、胃癌、奇形癌腫、精巣癌、甲状腺癌、子宮または子宮内膜癌、泌尿器系の癌、外陰癌、ならびに他の癌腫および肉腫、ならびにＢ細胞リンパ腫（低グレード／濾胞性非ホジキンリンパ腫（ＮＨＬ）、小リンパ球性（ＳＬ）ＮＨＬ、中グレード／濾胞性ＮＨＬ、中グレードびまん性ＮＨＬ、高グレード免疫芽球性ＮＨＬ、高グレード免疫芽球性ＮＨＬ、高グレード小非切れ込み核細胞ＮＨＬ、かさばり病変ＮＨＬ、マントル細胞リンパ腫、ＡＩＤＳ関連リンパ腫、およびワルデンストレームマクログロブリン血症を包含する）、慢性リンパ性白血病（ＣＬＬ）、急性リンパ芽球性白血病（ＡＬＬ）、有毛細胞白血病、慢性骨髄芽球性白血病、および移植後リンパ増殖性疾患（ＰＴＬＤ）、ならびに母斑症に関連する異常な血管増殖、浮腫（例えば、脳腫瘍に関連するもの）、原始起源の腫瘍、ならびにメイグス症候群を包含するが、これに限定されない。
【０２７１】
これらの方法および本明細書に記載される全てのかかる方法のいくつかの態様において、それが必要な対象は、脳腫瘍を有するか、またはそれと診断されている。いくつかのかかる態様において、脳腫瘍は膠芽腫である。
【０２７２】
これらの方法および本明細書に記載される全てのかかる方法のいくつかの態様において、それが必要な対象は、メラノーマを有するか、またはそれと診断されている。
【０２７３】
これらの方法および本明細書に記載される全てのかかる方法のいくつかの態様において、それが必要な対象は大腸癌を有するか、またはそれと診断されている。
【０２７４】
これらの方法および本明細書に記載される全てのかかる方法のいくつかの態様において、それが必要な対象は、脳腫瘍、メラノーマ、または大腸癌を有するか、またはそれと診断されている。いくつかのかかる態様において、脳腫瘍は膠芽腫である。
【０２７５】
これらの方法および本明細書に記載される全てのかかる方法のいくつかの態様において、方法は、本明細書に記載されるＬＡＰ結合剤（単数または複数）に加えて、対象に抗癌療法または薬剤を投与することをさらに含む。
【０２７６】
用語「抗癌療法」は癌を処置することに有用な療法を言う。抗癌治療薬剤の例は、例えば外科手術、化学療法剤、成長阻害剤、細胞傷害性薬剤、放射線療法および放射線療法に用いられる薬剤、抗血管新生剤、アポトーシス薬剤、抗チューブリン薬剤、および癌を処置するために用いられる他の薬剤、例えば抗ＨＥＲ−２抗体（例えばHERCEPTIN（登録商標））、抗ＣＤ２０抗体、上皮成長因子受容体（ＥＧＦＲ）アンタゴニスト（例えばチロシンキナーゼ阻害剤）、ＨＥＲ１／ＥＧＦＲ阻害剤（例えばエルロチニブ（TARCEVA（登録商標）））、血小板由来成長因子阻害剤（例えばGLEEVEC（商標）（イマチニブメシル酸塩））、ＣＯＸ−２阻害剤（例えばセレコキシブ）、インターフェロン、サイトカイン、次の標的ＰＤ１、ＰＤＬ１、ＰＤＬ２（例えばペムブロリズマブ、ニボルマブ、MK-3475、AMP-224、MPDL3280A、MEDI0680、MSB0010718C、および／またはMEDI4736)、ＣＴＬＡ４（例えばトレメリムマブ（PFIZER）およびイピリムマブ）、ＬＡＧ３（例えばBMS-986016）、ＣＤ１０３、ＴＩＭ−３および／または他のＴＩＭファミリーメンバー、ＣＥＡＣＡＭ−１および／または他のＣＥＡＣＡＭファミリーメンバー、ＥｒｂＢ２、ＥｒｂＢ３、ＥｒｂＢ４、ＰＤＧＦＲ−ベータ、ＢｌｙＳ、ＡＰＲＩＬ、ＢＣＭＡ、またはＶＥＧＦ受容体（単数または複数）、ＴＲＡＩＬ／Ａｐｏ２の１つ以上に結合するアンタゴニスト（例えば中和抗体）、ならびに他の生理活性および有機化学薬剤などを包含するが、これに限定されない。その組み合わせもまた本明細書に記載される方法のために具体的に企図される。
【０２７７】
本明細書に記載される方法のいくつかの態様において、本明細書に記載されるＬＡＰ結合剤と投与されるべき抗癌療法は、ＰＤ１、ＰＤＬ１、および／またはＰＤＬ２阻害剤、例えば抗体を含む。かかるＰＤ１、ＰＤＬ１、およびＰＤＬ２阻害剤の限定しない例は、ペムブロリズマブ（KEYTRUDA, MERCK）、ニボルマブ（BRISTOL-MYERS SQUIBB）、MK-3475、MPDL3280A（GENENTECH）、MEDI0680およびMEDI4736（MEDIMMUNE/ASTRAZENECA）、AMP-224、ならびにMSB0010718Cを包含する。抗ＰＤ１抗体試薬の追加の限定しない例は、ヒトＰＤ１に特異的なモノクローナル抗体、例えばMDX-1106（ONO-4538）、完全ヒトＩｇＧ４抗ＰＤ１ブロック抗体（Journal of Clinical Oncology, 2008 Vol 26, No 15S）、CT-011（CureTech, LTD。以前はCT-AcTibodyまたはBAT）、ヒト化モノクローナルＩｇＧ１抗体（Benson DM et al., Blood. 2010 May 11）からのＰＤ１結合部位配列、またはクローンNAT（Abcam）、クローンEH12.2H7（Biolegend）、クローンJI16（eBioscience）、クローンMIH4（eBioscience）、クローンJI05（eBioscience）、もしくはクローン192106（R&D systems）から得られるものを包含し得る。
【０２７８】
いくつかの態様において、抗癌療法は養子細胞移入などの免疫療法を含む。本明細書において用いられる「養子細胞移入」は、対象または患者自身のＴ細胞を遺伝子操作して、キメラ抗原受容体（ＣＡＲ）と呼ばれる特別な受容体をそれらの表面上に産生することが関わる免疫療法を言う。ＣＡＲは、Ｔ細胞が腫瘍細胞上の特異的な蛋白質（抗原）を認識することを許す蛋白質である。それから、それらの操作されたＣＡＲＴ細胞はそれらが数十億を数えるまで実験室で育てられる。それから、ＣＡＲＴ細胞の増殖させた集団は患者に点滴される。点滴の後に、Ｔ細胞は対象の体内で増加し、それらの操作された受容体からの手引きによって、それらの表面に抗原を宿す癌細胞を認識し、殺す。
【０２７９】
本明細書において用いられる用語「細胞傷害性薬剤」は、細胞の機能を阻害するかもしくは防ぐ、および／または細胞の破壊を引き起こす物質を言う。用語は、放射性同位体（例えば、Ａｔ２１１、Ｉ１３１、Ｉ１２５、Ｙ９０、Ｒｅ１８６、Ｒｅ１８８、Ｓｍ１５３、Ｂｉ２１２、Ｐ３２、およびＬｕの放射性同位体）、化学療法剤、ならびに細菌、真菌、植物、または動物起源の小分子毒素または酵素活性毒素などの毒素を包含することが意図され、その活性断片および／またはバリアントを包含する。
【０２８０】
これらの方法および本明細書に記載される全てのかかる方法のいくつかの態様において、方法は、本明細書に記載されるＬＡＰ結合剤（単数または複数）を投与される対象に、例えばテモゾロミドなどの化学療法剤を投与することをさらに含む。
【０２８１】
化学療法剤の限定しない例は、アルキル化剤、例えばチオテパおよびCYTOXAN（登録商標）シクロホスファミド、テモゾロミド、アルキルスルホナート、例えばブスルファン、インプロスルファン、およびピポスルファン、アジリジン、例えばベンゾドーパ(benzodopa)、カルボコン、メツレドーパ(meturedopa)、およびウレドーパ(uredopa)、エチレンイミンおよびメチルメラミン（アルトレタミン、トリエチレンメラミン、トリエチレンホスホラミド、トリエチレンチオホスホラミド、およびトリメチロールメラミンを包含する）、アセトゲニン（特にブラタシンおよびブラタシノン）、カンプトテシン（合成アナログトポテカンを包含する）、ブリオスタチン、カリスタチン、CC-1065（そのアドゼレシン、カルゼレシン、およびビゼレシン合成アナログを包含する）、クリプトフィシン（特にクリプトフィシン１およびクリプトフィシン８）、ドラスタチン、デュオカルマイシン（合成アナログKW-2189およびCB1-TM1を包含する）、エリュテロビン、パンクラティスタチン(pancratistatin)、サルコジクチイン、スポンジスタチン(spongistatin)、ナイトロジェンマスタード、例えばクロラムブシル、クロルナファジン、クロロホスファミド、エストラムスチン、イホスファミド、メクロレタミン、メクロレタミンオキシド塩酸塩、メルファラン、ノベムビチン、フェンセリン(phenesterine)、プレドニムスチン(prednimustine)、トロホスファミド(trofosfamide)、ウラシルマスタード、ニトロソウレア(nitrosurea)、例えばカルムスチン、クロロゾトシン、フォテムスチン、ロムスチン、ニムスチン、およびラニムスチン（ranimnustine）、抗生物質、例えばエンジイン抗生物質（例えばカリケアミシン、特にカリケアミシンガンマｌ１およびカリケアミシンオメガｌ１（例えばAgnew, Chem. Intl. Ed. Engl., 33: 183-186 (1994)参照）、ダイネミシンＡを包含するダイネミシン、ビスホスホネート、例えばクロドロネート、エスペラミシン、ならびにネオカルジノスタチンクロモフォア、および関連クロモ蛋白質エンジイン抗生物質クロモフォア）、アクラシノマイシン(aclacinomysin)、アクチノマイシン、アントラマイシン、アザセリン、ブレオマイシン、カクチノマイシン、カラビシン、カミノマイシン、カルチノフィリン、クロモマイシニス(chromomycinis)、ダクチノマイシン、ダウノルビシン、デトルビシン(detorubicin)、６−ジアゾ−５−オキソ−Ｌ−ノルロイシン、ADRIAMYCIN（登録商標）ドキソルビシン（モルフォリノ−ドキソルビシン、シアノモルフォリノ−ドキソルビシン、２−ピロリノ−ドキソルビシン、およびデオキシドキソルビシンを包含する）、エピルビシン、エソルビシン、イダルビシン、マルセロマイシン、マイトマイシン、例えばマイトマイシンＣ、ミコフェノール酸、ノガラマイシン、オリボマイシン(olivomycin)、ぺプロマイシン、ポトフィロマイシン(potfiromycin)、ピューロマイシン、ケラマイシン(quelamycin)、ロドルビシン(rodorubicin)、ストレプトニグリン、ストレプトゾシン、ツベルシジン、ウベニメクス、ジノスタチン、ゾルビシン、メトトレキサートおよび５−フルオロウラシル（５−ＦＵ）などの代謝拮抗剤、葉酸アナログ、例えばデノプテリン(denopterin)、メトトレキサート、プテロプテリン(pteropterin)、トリメトレキサート、プリンアナログ、例えばフルダラビン、６−��ルカプトプリン、チアミプリン、チオグアニン、ピリミジンアナログ、例えばアンシタビン、アザシチジン、６−アザウリジン、カルモフール、シタラビン、ジデオキシウリジン、ドキシフルリジン、エノシタビン、フロクスウリジン、アンドロゲン、例えばカルステロン、プロピオン酸ドロモスタノロン、エピチオスタノール、メピチオスタン、テストラクトン、抗副腎薬、例えばアミノグルテチミド、ミトタン、トリロスタン、葉酸補充剤、例えばフォリン酸、アセグラトン、アルドホスファミドグリコシド、アミノレブリン酸、エニルウラシル、アムサクリン、ベストラブシル、ビサントレン、エダトレキサート(edatraxate)、デフォファミン(defofamine)、デメコルシン、ジアジコン(diaziquone)、エルフォルミチン、酢酸エリプチニウム、エポチロン、エトグルシド、硝酸ガリウム、ヒドロキシ尿素、レンチナン、ロニダミン、メイタンシノイド、例えばメイタンシンおよびアンサマイトシン、ミトグアゾン、ミトキサントロン、モピダンモール、ニトラエリン、ペントスタチン、フェナメット、ピラルビシン、ロソキサントロン、ポドフィリン酸、２−エチルヒドラジド、プロカルバジン、PSK（登録商標）多糖複合体（JHS Natural Products, Eugene, Oreg.）、ラゾキサン、リゾキシン、シゾフラン(sizofuran)、スピロゲルマニウム、テヌアゾン酸、トリアジコン、２，２’，２’’−トリクロロトリエチルアミン、トリコテセン（特にＴ−２毒素、ベルラクリン(verracurin)Ａ、ロリジン(roridin)Ａ、およびアンギジン(anguidine)）、ウレタン(urethan)、ビンデシン、ダカルバジン、マンノムスチン、ミトブロニトール、ミトラクトール、ピポブロマン、ガシトシン(gacytosine)、アラビノシド（「Ａｒａ−Ｃ」）、シクロホスファミド、チオテパ、タキソイド、例えばTAXOL（登録商標）パクリタキセル（Bristol-Myers Squibb Oncology, Princeton, N.J.）、ABRAXANE（登録商標）パクリタキセルのクレモフォール不含のアルブミンによって操作されたナノ粒子製剤（American Pharmaceutical Partners, Schaumberg, Ill.）、およびTAXOTERE（登録商標）ドセタキセル（doxetaxel）（Rhone-Poulenc Rorer, Antony, France）、クロラムブシル（chloranbucil）、GEMZAR（登録商標）ゲムシタビン、６−チオグアニン、メルカプトプリン、メトトレキサート、白金アナログ、例えばシスプラチン、オキサリプラチン、およびカルボプラチン、ビンブラスチン、白金、エトポシド（VP-16）、イホスファミド、ミトキサントロン、ビンクリスチン、NAVELBINE、ビノレルビン、ノバントロン、テニポシド、エダトレキサート、ダウノマイシン、アミノプテリン、ゼローダ、イバンドロネート、イリノテカン（カンプトサー、ＣＰＴ−１１）（５−ＦＵおよびロイコボリンとのイリノテカンの処置レジメンを包含する）、トポイソメラーゼ阻害剤RFS2000、ジフルオロメチルオルニチン（ＤＭＦＯ）、レチノイン酸などのレチノイド、カペシタビン、コンブレタスタチン、ロイコボリン（ＬＶ）、オキサリプラチン処置レジメン（FOLFOX）を包含するオキサリプラチン、ラパチニブ（TYKERB.）、細胞増殖を低減するＰＫＣ−アルファ、Ｒａｆ、Ｈ−Ｒａｓ、ＥＧＦＲ（例えばエルロチニブ（TARCEVA（登録商標）））、およびＶＥＧＦ−Ａの阻害剤、ならびに上のいずれかの医薬的に許容される塩、酸、または誘導体を包含し得る。加えて、処置���方法は、さらに放射線、放射線療法(radiotherapy)、または放射線療法(radiation therapy)の使用を包含し得る。
【０２８２】
本明細書において用いられる用語「化学療法」または「化学療法剤」は、異常な細胞成長を特徴とする疾患の処置における治療有用性を有するいずれかの化学薬剤を言う。かかる疾患は、腫瘍、新生物、および癌、ならびに過形成性成長を特徴とする疾患を包含する。本明細書において用いられる化学療法剤は化学的および生物学的薬剤両方を包摂する。それらの薬剤は、癌細胞が継続的な生存のために依存する細胞活性を阻害するように機能する。化学療法剤のカテゴリーは、アルキル化／アルカロイド剤、代謝拮抗剤、ホルモンまたはホルモンアナログ、および色々な抗新生物薬を包含する。これらの薬剤の全てではなくともほとんどは癌細胞にとって直接的に毒性であり、免疫刺激を要求しない。１つの態様において、化学療法剤は固形腫瘍などの新生物を処置することに有用な薬剤である。１つの態様において、化学療法剤は放射性分子である。当業者は有用な化学療法剤を難なく同定し得る（例えば、Slapak and Kufe, Principles of Cancer Therapy, Chapter 86 in Harrison's Principles of Internal Medicine, 14th edition、Perry et al., Chemotherapy, Ch 17 in Abeloff, Clinical Oncology 2, 2000 Churchill Livingstone, Inc、Baltzer L, Berkery R (eds): Oncology Pocket Guide to Chemotherapy, 2nd ed. St. Louis, Mosby-Year Book, 1995、Fischer D S, Knobf M F, Durivage H J (eds): The Cancer Chemotherapy Handbook, 4th ed. St. Louis, Mosby-Year Book, 1993参照）。
【０２８３】
「放射線療法」によって、その能力を限定して正常に機能させるか、または細胞をすっかり破壊するために、細胞に十分なダメージを誘導するための指向的なガンマ線またはベータ線の使用が意味される。処置の照射量および持続期間を決定するための当分野において公知の多くのやり方があるということは理解されるであろう。典型的な処置は１回の投与として与えられ、典型的な照射量は１日あたり１０から２００ユニット（グレイ）の範囲である。
【０２８４】
これらの方法および本明細書に記載される全てのかかる方法のいくつかの態様において、方法は、本明細書に記載されるＬＡＰ結合剤（単数または複数）を投与される対象に腫瘍または癌抗原を投与することをさらに含む。抗原は腫瘍抗原ワクチンとして投与され得る。対象の腫瘍によって発現される公知の腫瘍抗原に加えて、全腫瘍型抗原ワクチン接種もまた企図される。例えばChiang et al., Vaccines 3: 344-372 (2015)参照。
【０２８５】
具体的な癌に関連するいくつもの腫瘍抗原が同定されている。本明細書において用いられる用語「腫瘍抗原」および「癌抗原」は交換可能に用いられて、癌細胞によって差次的に発現され、それによって癌細胞を標的化するために活用され得る抗原を言う。癌抗原は、可能性として、見かけ上腫瘍特異的な免疫応答を刺激し得る抗原である。それらの抗原のいくつかは、必ずしも発現はされないが、正常細胞によってコードされる。それらの抗原は、正常細胞において通常はサイレントである（すなわち発現されない）もの、分化のある種のステージにおいてのみ発現されるもの、ならびに胚および胎児性抗原などの一時的に発現されるものとして、キャラクタリゼーションされ得る。他の癌抗原は、変異体細胞遺伝子、例えば癌遺伝子（例えば活性化型ｒａｓ癌遺伝子）、サプレッサー遺伝子（例えば変異体ｐ５３）、および内部欠失または染色体転座からもたらされる融合蛋白質によってコードされる。なお他の癌抗原が、ＲＮＡおよびＤＮＡ腫瘍ウイルスによって運ばれるものなどのウイルス遺伝子によってコードされ得る。多くの腫瘍抗原が、複数の固形腫瘍の点から定義されている。免疫によって定義されるＭＡＧＥ１、２＆３、ＭＡＲＴ−１／Ｍｅｌａｎ−Ａ、ｇｐ１００、癌胎児性抗原（ＣＥＡ）、ＨＥＲ−２、ムチン（すなわちＭＵＣ−１）、前立腺特異的抗原（ＰＳＡ）、および前立腺酸性ホスファターゼ（ＰＡＰ）である。加えて、Ｂ型肝炎（ＨＢＶ）、エプスタイン−バール（ＥＢＶ）、およびヒトパピローマ（ＨＰＶ）などのウイルス蛋白質は、それぞれ肝細胞癌腫、リンパ腫、および子宮頸癌の発生に重要であることが示されている。しかしながら、腫瘍は、広範囲の異なる免疫回避メカニズムを用いるかまたはそれから利し、その結果、癌患者の免疫系は多くの場合に腫瘍抗原に応答し損なう。精巣の精母細胞または精原細胞、胎盤、および卵巣と通常関連する癌抗原のいくつかの例は、癌−精巣（ＣＴ）抗原ＢＡＧＥ、ＧＡＧＥ、ＭＡＧＥ−１、およびＭＡＧＥ−３、ＮＹ−ＥＳＯ−１、ＳＳＸを包含する。これらの抗原はメラノーマ、リンパ腫、肺、膀胱、結腸、および乳癌腫において見いだされる（例えばButterfield et al., J. Immunotherapy 2008; 31: 294-309、Markowicz et al., J Clin Oncol 27: 15s, 2009 (suppl; abstr 9039)に記載されている）。メラノサイト、上皮組織、前立腺、および結腸に通常見いだされる癌抗原は、分化抗原Ｇｐ１００、Ｍｅｌａｎ−Ａ／Ｍａｒｔ−１、チロシナーゼ、ＰＳＡ、ＣＥＡ、およびマンマグロビン−Ａをもまた包含する。これらの抗原はメラノーマ、前立腺癌、ならびに結腸および乳癌腫に見いだされる。いくつかの癌抗原は、低レベルで普遍的に発現しているが、癌において過剰発現（overespress）される共有の抗原である。過剰発現される癌抗原の例はｐ５３、ＨＥＲ−２／ｎｅｕ、ｌｉｖｉｎ、およびサバイビンを包含し、食道、肝臓、膵臓、結腸、乳、卵巣、膀胱、および前立腺癌腫に見いだされる。他の癌抗原、例えばβ−カテニン−ｍ、β−アクチン／４／ｍ、ミオシン／ｍ、ＨＳＰ７０−２／ｍ、およびＨＬＡ−Ａ２−Ｒ１７０Ｊはユニークであり、これらはメラノーマ、非小細胞肺癌、および腎癌の１つ以上と関連する。なお他の癌抗原は、腎、腸、および大腸組織などの��皮組織に通常見いだされる腫瘍に関連した炭水化物抗原である。これらの癌抗原はＧＭ２、ＧＤ２、ＧＤ３、ＭＵＣ−１、ｓＴｎ、および（abd）ｇｌｏｂｏ−Ｈを包含し、それらはメラノーマ、神経芽腫、大腸、肺、乳、卵巣、および前立腺癌に見いだされ得る。追加の腫瘍抗原、ペプチドエピトープ、およびその記載はＵ．Ｓ．Ｐａｔ．Ｎｏ．７，９０６，６２０、７，９１０，６９２、８，０９７，２４２、７，９３５，５３１、８，０１２，４６８、８，０９７，２５６、８，００３，７７３、Tartour et al., Immunol Lett 2000; 74(1): 1-3に記載されており、その内容はそれらの全体として参照によって本明細書に組み込まれる。いくつかの態様においてはインタクトな癌抗原が用いられ、その一方で、他の態様においては、癌抗原のペプチドエピトープ（蛋白質分解的消化によってまたは組換え的にいずれかで調製される）が用いられる。従って、本明細書に記載される組成物および方法による使用のための腫瘍または癌抗原の限定しない例は、Ｈｅｒ２、前立腺幹細胞抗原（ＰＳＣＡ）、ＰＳＭＡ（前立腺特異的膜抗原）、β−カテニン−ｍ、Ｂ細胞成熟抗原（ＢＣＭＡ）、アルファ−フェトプロテイン（ＡＦＰ）、癌胎児性抗原（ＣＥＡ）、癌抗原−１２５（ＣＡ−１２５）、ＣＡ１９−９、カルレチニン、ＭＵＣ−１、上皮膜蛋白質（ＥＭＡ）、上皮腫瘍抗原（ＥＴＡ）、チロシナーゼ、マンマグロビン−Ａ、メラノーマ関連抗原（ＭＡＧＥ）、ＣＤ３４、ＣＤ４５、ＣＤ９９、ＣＤ１１７、クロモグラニン、サイトケラチン、デスミン、グリア線維性酸性蛋白質（ＧＦＡＰ）、肉眼的嚢胞症液中蛋白質（ＧＣＤＦＰ−１５）、ＥＢＶ、ｇｐ１００、ＨＭＢ−４５抗原、蛋白質メラン−Ａ（Ｔリンパ球によって認識されるメラノーマ抗原。ＭＡＲＴ−１）、ｌｉｖｉｎ、サバイビン、ｍｙｏ−Ｄ１、筋肉特異的アクチン（ＭＳＡ）、ニューロフィラメント、ニューロン特異的エノラーゼ（ＮＳＥ）、胎盤性アルカリホスファターゼ、シナプトフィジン、サイログロブリン、甲状腺転写因子−１、ピルビン酸キナーゼイソ酵素Ｍ２型の二量体形態（腫瘍Ｍ２−ＰＫ）、ＣＤ１９、ＣＤ２２、ＣＤ２７、ＣＤ３０、ＣＤ７０、ＧＤ２（ガングリオシドＧ２）、ＥｐｈＡ２、ＣＳＰＧ４、ＣＤ１３８、ＦＡＰ（線維芽細胞活性化蛋白質）、ＣＤ１７１、カッパ、ラムダ、５Ｔ４、ανβ６インテグリン、Ｂ７−Ｈ３、Ｂ７−Ｈ６、ＣＡＩＸ、ＣＤ１９、ＣＤ２０、ＣＤ２２、ＣＤ３０、ＣＤ３３、ＣＤ４４、ＣＤ４４ｖ６、ＣＤ４４ｖ７／８、ＣＤ７０、ＣＤ１２３、ＥＧＦＲ、ＥＧＰ２、ＥＧＰ４０、ＥｐＣＡＭ、胎児性ＡｃｈＲ、ＦＲα、ＧＡＧＥ、ＧＤ３、ＨＬＡ−Ａ１＋ＭＡＧＥ１、ＭＡＧＥ−３、ＨＬＡ−Ａｌ＋ＮＹ−ＥＳＯ−１、ＩＬ−１１Ｒα、ＩＬ−１３Ｒα２、Ｌｅｗｉｓ−Ｙ、Ｍｕｃｌ６、ＮＣＡＭ、ＮＫＧ２Ｄリガンド、ＮＹ−ＥＳＯ−１、ＰＲＡＭＥ、ＲＯＲ１、ＳＳＸ、サバイビン、ＴＡＧ７２、ＴＥＭ、ＶＥＧＦＲ２、ＥＧＦＲｖＩＩＩ（上皮成長因子バリアントＩＩＩ）、精子蛋白質１７（Ｓｐ１７）、メソテリン、ＰＡＰ（前立腺酸性ホスファターゼ）、ｐｒｏｓｔｅｉｎ、ＴＡＲＰ（Ｔ細胞受容体ガンマ代替リーディングフレーム蛋白質）、Ｔｒｐ−ｐ８、ＳＴＥＡＰ１（前立腺の６回膜貫通上皮抗原１）、ＨＳＰ７０−２／ｍおよびＨＬＡ−Ａ２−Ｒ１７０Ｊ、チロシナーゼ、異常なｒａｓ蛋白質、または異常なｐ５３蛋白質を包含するが、これに限定されない。
【０２８６】
これらの方法および本明細書に記載される全てのかかる方法のいくつかの態様において、方法は、本明細書に記載されるＬＡＰ結合剤（単数または複数）と同時にまたは組み合わせで樹状細胞（ＤＣ）ワクチン接種を投与することをさらに含む。
【０２８７】
本明細書において用いられる「樹状細胞ワクチン接種」または「ＤＣワクチン」は、Ｔ細胞依存的な免疫、例えば癌特異的Ｔ細胞依存的な抗腫瘍免疫を誘導するように設計された免疫療法の形態を言い、これはＤＣを用いて長期的な完全な応答をもたらし得る。本明細書において用いられる「樹状細胞（ＤＣ）免疫療法」または「樹状細胞ワクチン」の例は、自家または異種の改変された樹状細胞およびいずれかの他の抗原提示細胞を包含する。複数の抗原、全癌細胞、単一の抗原、ｍＲＮＡ、ファージディスプレイ、またはいずれかの他の改変によって改変されたかどうかにかかわらず、抗原特異的Ｔ細胞免疫を誘導するためにエクスビボで作製された抗原をローディングした樹状細胞（ＤＣ）、液性免疫を誘導するためにエクスビボで遺伝子をローディングしたＤＣ、腫瘍特異的免疫を誘導するためにエクスビボで作製された抗原をローディングしたＤＣ、例えば寛容性を誘導するためにエクスビボで作製された未成熟ＤＣを包含するが、これに限らない。
【０２８８】
本明細書に記載される値および癌処置方法の点で、「低減する」、「阻害する」、または「減少させる」によって、所与のパラメータまたは症状について好ましくは２０％以上、３０％以上、４０％以上、４５％以上、より好ましくは５０％以上、５５％以上、６０％以上、６５％以上、７０％以上、最も好ましくは７５％以上、８０％以上、８５％以上、９０％以上、または９５％以上の総合的な減少を引き起こす能力が意味される。低減する、阻害する、または減少させるは、例えば、処置される障害の症状、転移または微小転移の存在またはサイズ、原発性腫瘍のサイズ、ある種の細胞集団の数または活性などを言い得る。
【０２８９】
本明細書において用いられる「癌または腫瘍の症状を軽減すること」は、癌に関連するいずれかの状態または症状、例えば処置される癌の症状、転移または微小転移の存在またはサイズ、原発性腫瘍のサイズ、休眠腫瘍の存在またはサイズなどを回復させることである。同等の未処置のコントロール、例えばＬＡＰ結合剤の投与に先行する対象と比較して、かかる低減または予防の度合は、当業者に公知のいずれかの標準的な技術によって測定されて少なくとも５％、１０％、２０％、４０％、５０％、６０％、８０％、９０％、９５％、またはより多くである。癌または腫瘍について処置される患者または対象は、医療従事者がかかる状態を有すると診断したものである。診断はいずれかの好適な手段によってであり得る。
【０２９０】
本明細書に記載されるＬＡＰ結合剤を含む組成物、方法、および使用のいずれかの点で、本明細書において用いられる用語「処置する」、「処置」、「処置すること」、または「回復」は、目標が疾患または障害に関連する状態の進行または重症度を逆転させる、軽減する、回復させる、阻害する、低速化する、または止める治療処置を言う。用語「処置すること」は、疾患または障害の少なくとも１つの有害作用または症状を低減または軽減することを包含する。処置は、一般的には、１つ以上の症状または臨床マーカーが低減される場合に「有効」である。代替的には、処置は、疾患の進行が低減されるかまたは停止した場合に「有効」である。すなわち、「処置」は、症状またはマーカーの改善だけではなく、処置の非存在下において予想されるであろう症状の進行または悪化の終了または少なくとも低速化をもまた包含する。有益なまたは所望の臨床結果は、１つ以上の症状（単数または複数）の軽減、疾患の程度の縮減、疾患の安定化された（すなわち悪化しない）状態、疾患進行の遅延または低速化、疾患状態の回復または待機、および寛解（部分的かトータルかにかかわらず）を、検出可能か検出不可能かにかかわらず包含するが、これに限定されない。用語疾患の「処置」は、疾患の症状または副作用の緩和を提供することをもまた包含する（待機的処置を包含する）。
【０２９１】
本明細書に記載される方法のいずれかの点で用いられる用語「対象」、「患者」、および「個体」は本明細書において交換可能に用いられ、本明細書に記載される阻害剤の動物、例えばヒトのレシピエントを言う。ヒト対象などの具体的な動物に特異的である疾患状態の処置については、用語「対象」はその具体的な動物を言う。用語「非ヒト動物」および「非ヒト哺乳動物」は本明細書において交換可能に用いられ、ラット、マウス、ウサギ、ヒツジ、猫、犬、牛、ブタ、および非ヒト霊長類などの哺乳動物を包含する。用語「対象」はいずれかの脊椎動物をもまた包摂し、哺乳動物、爬虫類、両生類、および魚類を包含するが、これに限定されない。しかしながら、有利には、対象はヒトまたは他の哺乳動物などの哺乳動物、例えば家畜哺乳動物、例えば犬、猫、馬、および同類である。産業哺乳動物、例えば牛、ヒツジ、ブタ、および同類もまた用語対象に包摂される。
【０２９２】
本明細書において用いられる用語「有効量」は、処置される疾患または障害の少なくとも１つ以上の症状を軽減するために必要とされる本明細書に記載されるＬＡＰ結合剤の量を言い、所望の効果を提供する（例えば、ＬＡＰによって媒介される腫瘍免疫抑制を低減または阻害する）ための薬理組成物の十分量に関する。ゆえに、用語「治療有効量」は、本明細書において開示される方法を用いて典型的な対象に投与されたときに特定の効果を提供するために十分である、本明細書に記載される阻害剤または増強剤の量を言う。本明細書において用いられる有効量は、疾患の症状の発生を遅延させる、疾患の症状の過程を変える（例えば、これに限定されないが、疾患の症状の進行を低速化する）、または疾患の症状を逆転させるために十分な量をもまた包含するであろう。それゆえに、厳密な「有効量」を規定することは可能ではない。しかしながら、いずれかの所与のケースでは、適当な「有効量」は、慣例的な実験法のみを用いて当業者によって決定され得る。
【０２９３】
有効量、毒性、および治療有効性は、例えばＬＤ５０（集団の５０％にとって致死的な用量）およびＥＤ５０（集団の５０％において治療有効な用量）を決定するための細胞培養物または実験動物における標準的な薬学的手順によって決定され得る。投薬量は使用される剤形および利用される投与経路に依存して変わり得る。毒性および治療効果の間の用量比は治療指標であり、比ＬＤ５０／ＥＤ５０として表現され得る。大きい治療指標を見せる組成物、方法、および使用が好ましい。治療有効用量は、最初は細胞培養アッセイから概算され得る。用量は、動物モデルにおいて、細胞培養物においてまたは適当な動物モデルにおいて決定されたＩＣ５０（これは、測定される機能または活性の最大の半分の阻害を達成する）を包含する循環血漿濃度範囲を達成するようにもまた定められ得る。血漿中のレベルは例えば高速液体クロマトグラフィーによって測定され得る。いずれかの特定の投薬量の効果は好適なバイオアッセイによってモニタリングされ得る。投薬量は医師によって決定され、必要に応じて、処置の観察される効果に合うように調整され得る。
【０２９４】
本明細書に記載されるＬＡＰ結合剤は、対象に有効な処置をもたらすいずれかの適当な経路によって、それが必要な対象に投与され得る。本明細書において用いられる用語「投与すること」および「導入すること」は交換可能に用いられ、所望の効果（単数または複数）が産生されるように、所望の部位（例えば、腫瘍部位または炎症の部位）へのかかる薬剤の少なくとも部分的な局在をもたらす方法または経路による対象へのＬＡＰ結合剤の移入を言う。
【０２９５】
いくつかの態様において、本明細書に記載されるＬＡＰ結合剤は、薬剤を全身的にまたは所望の表面もしくは標的に送達するいずれかの投与モードによって対象に投与され得、注射、点滴、点眼、および吸入投与を包含し得るが、これに限定されない。ポリペプチド薬剤が腸における不活性化から保護され得る程度に応じて、経口投与形態もまた企図される。「注射」は、限定なしに、静脈内、筋肉内、動脈内、髄腔内、心室内、嚢内、眼窩内、心臓内、皮内、腹腔内、経気管、皮下、表皮下、関節内、被膜下、クモ膜下、脊髄内、脳脊髄内、および胸骨内注射および点滴を包含する。
【０２９６】
本明細書において用いられる言い回し「非経口投与」および「非経口投与される」は、経腸および外用投与以外の、通常は注射による投与モードを言う。本明細書において用いられる言い回し「全身投与」、「全身投与される」、「末梢投与」、および「末梢投与される」は、それが対象の循環系に入り、それゆえに代謝および他の同類のプロセスを受けるような、標的部位、組織、または臓器への直接的以外のＬＡＰ結合剤の投与を言う。
【０２９７】
本発明のいくつかの態様は次の付番したパラグラフのいずれかにおいて定義され得る。
１．  ＬＡＰに特異的に結合する単離された抗ＬＡＰ（潜在性関連ペプチド）抗体またはその抗原結合断片であって、
ａ．配列番号９のアミノ酸配列を有する重鎖ＣＤＲ１、
ｂ．配列番号１０のアミノ酸配列を有する重鎖ＣＤＲ２、
ｃ．配列番号１１のアミノ酸配列を有する重鎖ＣＤＲ３、
ｄ．配列番号１４のアミノ酸配列を有する軽鎖ＣＤＲ１、
ｅ．配列番号１５のアミノ酸配列を有する軽鎖ＣＤＲ２、および
ｆ．配列番号１６のアミノ酸配列を有する軽鎖ＣＤＲ３、
からなる群から選択される１つ以上の重および軽鎖相補性決定領域（ＣＤＲ）を含む。
２．  パラグラフ１の単離された抗ＬＡＰ抗体またはその抗原結合断片であって、重鎖相補性決定領域（ＣＤＲ）の
ａ．配列番号９のアミノ酸配列を有する重鎖ＣＤＲ１と、
ｂ．配列番号１０のアミノ酸配列を有する重鎖ＣＤＲ２と、
ｃ．配列番号１１のアミノ酸配列を有する重鎖ＣＤＲ３と、
を含む。
３．  パラグラフ１〜２のいずれか１つの単離された抗ＬＡＰ抗体またはその抗原結合断片であって、軽鎖相補性決定領域（ＣＤＲ）の
ａ．配列番号１４のアミノ酸配列を有する軽鎖ＣＤＲ１と、
ｂ．配列番号１５のアミノ酸配列を有する軽鎖ＣＤＲ２と、
ｃ．配列番号１６のアミノ酸配列を有する軽鎖ＣＤＲ３と、
を含む。
４．  パラグラフ１〜２のいずれか１つの単離された抗ＬＡＰ抗体またはその抗原結合断片であって、相補性決定領域（ＣＤＲ）の
ａ．配列番号９のアミノ酸配列を有する重鎖ＣＤＲ１と、
ｂ．配列番号１０のアミノ酸配列を有する重鎖ＣＤＲ２と、
ｃ．配列番号１１のアミノ酸配列を有する重鎖ＣＤＲ３と、
ｄ．配列番号１４のアミノ酸配列を有する軽鎖ＣＤＲ１と、
ｅ．配列番号１５のアミノ酸配列を有する軽鎖ＣＤＲ２と、
ｆ．配列番号１６のアミノ酸配列を有する軽鎖ＣＤＲ３と、
を含む。
５．  パラグラフ１〜４のいずれか１つの単離された抗ＬＡＰ抗体またはその抗原結合断片であって、配列番号８のアミノ酸配列を有する重鎖を含む。
６．  パラグラフ１〜５のいずれか１つの単離された抗ＬＡＰ抗体またはその抗原結合断片であって、配列番号１３の配列を有する軽鎖を含む。
７．  ＬＡＰに特異的に結合する単離された抗ＬＡＰ抗体またはその抗原結合断片であって、
ａ．配列番号９のアミノ酸配列を有する重鎖ＣＤＲ１、
ｂ．配列番号１０のアミノ酸配列を有する重鎖ＣＤＲ２、
ｃ．配列番号１１のアミノ酸配列を有する重鎖ＣＤＲ３、
ｄ．配列番号１４のアミノ酸配列を有する軽鎖ＣＤＲ１、
ｅ．配列番号１５のアミノ酸配列を有する軽鎖ＣＤＲ２、および
ｆ．配列番号１６のアミノ酸配列を有する軽鎖ＣＤＲ３、
を含む。
８．  ＬＡＰに特異的に結合する単離された抗ＬＡＰ抗体またはその抗原結合断片であって、
ａ．配列番号９のアミノ酸配列を有する重鎖ＣＤＲ１、
ｂ．配列番号１０のアミノ酸配列を有する重鎖ＣＤＲ２、および
ｃ．配列番号１１のアミノ酸配列を有する重鎖ＣＤＲ３、
からなる群から選択される１つ以上の重鎖相補性決定領域（ＣＤＲ）を含む。
９．  ＬＡＰに特異的に結合する単離された抗ＬＡＰ抗体またはその抗原結合断片であって、
ａ．配列番号１４のアミノ酸配列を有する軽鎖ＣＤＲ１、
ｂ．配列番号１５のアミノ酸配列を有する軽鎖ＣＤＲ２、および
ｃ．配列番号１６のアミノ酸配列を有する軽鎖ＣＤＲ３、
からなる群から選択される１つ以上の軽鎖相補性決定領域（ＣＤＲ）を含む。
１０．  パラグラフ１〜９のいずれか１つの単離された抗ＬＡＰ抗体またはその抗原結合断片であって、抗体がキメラ、ＣＤＲグラフト、ヒト化、コンポジットヒトもしくは完全ヒト抗体、または二重抗体、あるいはその抗原結合断片である。
１１．  パラグラフ１〜１０のいずれか１つの単離された抗ＬＡＰ抗体またはその抗原結合断片であって、抗体断片がＦａｂ断片、Ｆａｂ’断片、Ｆｄ断片、Ｆｄ’断片、Ｆｖ断片、ｄＡｂ断片、Ｆ（ａｂ’）２断片、一本鎖断片、ダイアボディ、またはリニア抗体である。
１２．  パラグラフ１〜１０のいずれか１つの単離された抗ＬＡＰ抗体またはその抗原結合断片であって、抗体またはその抗体断片がヒトアクセプターフレームワークを含む。
１３．  ＬＡＰ結合剤とＴＧＦ−βシグナル伝達の阻害剤とを含む組成物。
１４．  パラグラフ１３の組成物であって、ＬＡＰ結合剤が抗ＬＡＰ抗体またはその抗原結合断片を含む。
１５．  パラグラフ１４の組成物であって、抗体がモノクローナル抗体である。
１６．  パラグラフ１４の組成物であって、抗体がキメラ、ＣＤＲグラフト、ヒト化、または完全ヒトである。
１７．  パラグラフ１４の組成物であって、抗ＬＡＰ抗体またはその抗原結合断片がパラグラフ１〜１２のものから選択される。
１８．  パラグラフ１３の組成物であって、ＴＧＦ−βシグナル伝達の阻害剤が、ＴＧＦ−βまたはその受容体に結合する抗体またはその抗原結合断片、二本鎖ＲＮＡまたは二本鎖ＲＮＡをコードする核酸、アプタマー、および小分子からなる群から選択される。
１９．  パラグラフ１８の組成物であって、小分子が、４−［４−（１，３−ベンゾジオキソール−５−イル）−５−ピリジン−２−イル−１Ｈ−イミダゾール−２−イル］ベンズアミド（SB431542）、Ｎ−（オキサン−４−イル）−４−［４−（５−ピリジン−２−イル−１Ｈ−ピラゾール−４−イル）ピリジン−２−イル］ベンズアミド（GW788388）、４−［３−（２−ピリジニル）−１Ｈ−ピラゾール−４−イル］−キノリン（LY364947）、および２−（３−（６−メチルピリジン−２−イル）−１Ｈ−ピラゾール−４−イル）−１，５−ナフチリジン（「ＡＬＫ５阻害剤ＩＩ」）からなる群から選択される。
２０．  ＬＡＰ結合剤と免疫調節または化学療法剤とを含む組成物。
２１．  パラグラフ２０の組成物であって、ＬＡＰ結合剤が抗体またはその抗原結合断片を含む。
２２．  パラグラフ２１の組成物であって、抗体またはその抗原結合断片がモノクローナル抗体またはその抗原結合断片である。
２３．  パラグラフ２１の組成物であって、抗体またはその抗原結合断片がキメラ、ＣＤＲグラフト、ヒト化、または完全ヒトである。
２４．  パラグラフ２１の組成物であって、抗体またはその抗原結合断片がパラグラフ１〜１２のいずれか１つの抗体組成物を含む。
２５．  パラグラフ２０の組成物であって、免疫調節剤が免疫チェックポイントモジュレーターを含む。
２６．  パラグラフ２５の組成物であって、免疫チェックポイントモジュレーターが、ＰＤ−１、ＰＤ−Ｌ１、ＰＤＬ２、ＣＴＬＡ４、ＬＡＧ３、ＴＩＭ３、ＴＩＧＩＴ、および／またはＣＤ１０３からなる群から選択されるポリペプチドの効果を調節する。
２７．  パラグラフ２０の組成物であって、免疫調節剤が腫瘍抗原ワクチンを含む。
２８．  パラグラフ２７の組成物であって、腫瘍抗原ワクチンが樹状細胞腫瘍抗原ワクチンを含む。
２９．  ＴＧＦ−βと複合体化したときのＬＡＰに結合し、ＬＡＰ／ＴＧＦ−β複合体からのＴＧＦ−βの放出を阻害する、抗体またはその抗原結合断片。
３０．  パラグラフ２９の組成物であって、抗体またはその抗原結合断片がモノクローナル抗体またはその抗原結合断片である。
３１．  パラグラフ２９の組成物であって、抗体またはその抗原結合断片がキメラ、ＣＤＲグラフト、ヒト化、または完全ヒトである。
３２．  パラグラフ２９の組成物であって、抗体またはその抗原結合断片が、パラグラフ１〜１２のいずれか１つの抗体組成物を含む。
３３．  パラグラフ２９の抗体または抗原結合断片であって、ＴＧＦ−βへのＬＡＰの結合によって形成されるエピトープに結合する。
３４．  パラグラフ２９の抗体または抗原結合断片であって、パラグラフ７の抗体のＣＤＲを含む。
３５．  パラグラフ１〜３４のいずれか１つの組成物と医薬的に許容される担体とを含む医薬組成物。
３６．  対象におけるＬＡＰ＋Ｔ制御性細胞の集団の数または活性を減少させる方法であって、方法が、対象にＬＡＰ結合剤を投与することを含み、それによって集団の数または活性が減少する。
３７．  パラグラフ３６の方法であって、ＬＡＰ結合剤が抗体またはその抗原結合断片を含む。
３８．  パラグラフ３７の方法であって、抗体またはその抗原結合断片がモノクローナル抗体またはその抗原結合断片である。
３９．  パラグラフ３７の方法であって、抗体またはその抗原結合断片がキメラ、ＣＤＲグラフト、ヒト化、または完全ヒトである。
４０．  パラグラフ３７の方法であって、抗体またはその抗原結合断片がパラグラフ１〜１２のいずれか１つの抗体組成物を含む。
４１．  パラグラフ３６の方法であって、ＬＡＰ結合剤が細胞傷害性薬にコンジュゲーションされる。
４２．  腫瘍中の腫瘍に浸潤した免疫抑制性Ｔ細胞の数または活性を減少させる方法であって、方法が、腫瘍に浸潤した免疫抑制性Ｔ細胞を含む腫瘍を有する対象にＬＡＰ結合剤を投与することを含み、それによってかかる細胞の数または活性が減少する。
４３．  パラグラフ４２の方法であって、ＬＡＰ結合剤が抗体またはその抗原結合断片を含む。
４４．  パラグラフ４３の方法であって、抗体またはその抗原結合断片がモノクローナル抗体またはその抗原結合断片である。
４５．  パラグラフ４３の方法であって、抗体またはその抗原結合断片がキメラ、ＣＤＲグラフト、ヒト化、または完全ヒトである。
４６．  パラグラフ４３の方法であって、抗体またはその抗原結合断片がパラグラフ１〜１２のいずれか１つの抗体組成物を含む。
４７．  パラグラフ４２の方法であって、ＬＡＰ結合剤が細胞傷害性薬にコンジュゲーションされる。
４８．  腫瘍特異的免疫を増大させる方法であって、それが必要な対象にＬＡＰ結合剤の治療有効量を投与することを含む。
４９．  パラグラフ４８の方法であって、ＬＡＰ結合剤が抗体またはその抗原結合断片を含む。
５０．  パラグラフ４９の方法であって、抗体またはその抗原結合断片がモノクローナル抗体またはその抗原結合断片である。
５１．  パラグラフ４９の方法であって、抗体またはその抗原結合断片がキメラ、ＣＤＲグラフト、ヒト化、または完全ヒトである。
５２．  パラグラフ４９の方法であって、抗体またはその抗原結合断片がパラグラフ１〜１２のいずれか１つの抗体組成物を含む。
５３．  ＬＡＰ発現および／または活性が癌または腫瘍特異的免疫の抑制に関連する癌または腫瘍を処置する方法であって、それが必要な対象にＬＡＰ結合剤の治療有効量を投与することを含む。
５４．  パラグラフ５３の方法であって、ＬＡＰ結合剤が抗体またはその抗原結合断片を含む。
５５．  パラグラフ５４の方法であって、抗体またはその抗原結合断片がモノクローナル抗体またはその抗原結合断片である。
５６．  パラグラフ５４の方法であって、抗体またはその抗原結合断片がキメラ、ＣＤＲグラフト、ヒト化、または完全ヒトである。
５７．  パラグラフ５４の方法であって、抗体またはその抗原結合断片がパラグラフ１〜１２のいずれか１つの抗体組成物を含む。
５８．  腫瘍中のＣＤ８＋細胞傷害性Ｔ細胞の数を増大させる方法であって、方法が、腫瘍を有する対象にＬＡＰ結合剤を投与することを含む。
５９．  パラグラフ５８の方法であって、ＬＡＰ結合剤が抗体またはその抗原結合断片を含む。
６０．  パラグラフ５９の方法であって、抗体またはその抗原結合断片がモノクローナル抗体またはその抗原結合断片である。
６１．  パラグラフ５９の方法であって、抗体またはその抗原結合断片がキメラ、ＣＤＲグラフト、ヒト化、または完全ヒトである。
６２．  パラグラフ５９の方法であって、抗体またはその抗原結合断片がパラグラフ１〜１２のいずれか１つの抗体組成物を含む。
６３．  それが必要な対象において、ＩＦＮγを発現する末梢ＣＤ４＋Ｔ細胞を増大させる方法であって、方法が、対象にＬＡＰ結合剤を投与することを含む。
６４．  パラグラフ６３の方法であって、ＬＡＰ結合剤が抗体またはその抗原結合断片を含む。
６５．  パラグラフ６４の方法であって、抗体またはその抗原結合断片がモノクローナル抗体またはその抗原結合断片である。
６６．  パラグラフ６４の方法であって、抗体またはその抗原結合断片がキメラ、ＣＤＲグラフト、ヒト化、または完全ヒトである。
６７．  パラグラフ６４の方法であって、抗体またはその抗原結合断片がパラグラフ１〜１２のいずれか１つの抗体組成物を含む。
６８．  それが必要な対象において、グランザイムＢを発現する末梢ＣＤ８＋Ｔ細胞を増大させる方法であって、方法が、対象にＬＡＰ結合剤を投与することを含む。
６９．  パラグラフ６８の方法であって、ＬＡＰ結合剤が抗体またはその抗原結合断片を含む。
７０．  パラグラフ６９の方法であって、抗体またはその抗原結合断片がモノクローナル抗体またはその抗原結合断片である。
７１．  パラグラフ６９の方法であって、抗体またはその抗原結合断片がキメラ、ＣＤＲグラフト、ヒト化、または完全ヒトである。
７２．  パラグラフ６９の方法であって、抗体またはその抗原結合断片がパラグラフ１〜１２のいずれか１つの抗体組成物を含む。
７３．  腫瘍中のＦｏｘＰ３＋制御性Ｔ細胞の数を減少させる方法であって、方法が、対象にＬＡＰ結合剤を投与することを含む。
７４．  パラグラフ７３の方法であって、ＬＡＰ結合剤が抗体またはその抗原結合断片を含む。
７５．  パラグラフ７４の方法であって、抗体またはその抗原結合断片がモノクローナル抗体またはその抗原結合断片である。
７６．  パラグラフ７４の方法であって、抗体またはその抗原結合断片がキメラ、ＣＤＲグラフト、ヒト化、または完全ヒトである。
７７．  パラグラフ７４の方法であって、抗体またはその抗原結合断片がパラグラフ１〜１２のいずれか１つの抗体組成物を含む。
７８．  腫瘍中のＣＤ８＋および／またはＣＤ４＋Ｔ細胞による免疫抑制性因子またはマーカーの発現を阻害する方法であって、方法が、腫瘍を有する対象にＬＡＰ結合剤を投与することを含む。
７９．  パラグラフ７８の方法であって、ＬＡＰ結合剤が抗体またはその抗原結合断片を含む。
８０．  パラグラフ７９の方法であって、抗体またはその抗原結合断片がモノクローナル抗体またはその抗原結合断片である。
８１．  パラグラフ７９の方法であって、抗体またはその抗原結合断片がキメラ、ＣＤＲグラフト、ヒト化、または完全ヒトである。
８２．  パラグラフ７９の方法であって、抗体またはその抗原結合断片が、パラグラフ１〜１２のいずれか１つの抗体組成物を含む。
８３．  パラグラフ７８の方法であって、免疫抑制性因子またはマーカーがＰＤ−１、ＬＡＧ−３、およびＣＤ１０３の１つ以上を含む。
８４．  抗腫瘍免疫応答を促進する方法であって、方法が、腫瘍抗原によって腫瘍の処置が必要な対象にワクチン接種することと、対象にＬＡＰ結合剤を投与することとを含む。
８５．  パラグラフ８４の方法であって、ＬＡＰ結合剤が抗体またはその抗原結合断片を含む。
８６．  パラグラフ８５の方法であって、抗体またはその抗原結合断片がモノクローナル抗体またはその抗原結合断片である。
８７．  パラグラフ８５の方法であって、抗体またはその抗原結合断片がキメラ、ＣＤＲグラフト、ヒト化、または完全ヒトである。
８８．  パラグラフ８５の方法であって、抗体またはその抗原結合断片がパラグラフ１〜１２のいずれか１つの抗体組成物を含む。
８９．  免疫チェックポイント阻害剤による処置に不応性である癌を処置する方法であって、方法が、かかる癌を有する対象にＬＡＰ結合剤を投与することを含む。
９０．  パラグラフ８９の方法であって、ＬＡＰ結合剤が抗体またはその抗原結合断片を含む。
９１．  パラグラフ９０の方法であって、抗体またはその抗原結合断片がモノクローナル抗体またはその抗原結合断片である。
９２．  パラグラフ９０の方法であって、抗体またはその抗原結合断片がキメラ、ＣＤＲグラフト、ヒト化、または完全ヒトである。
９３．  パラグラフ９０の方法であって、抗体またはその抗原結合断片がパラグラフ１〜１２のいずれか１つの抗体組成物を含む。
９４．  パラグラフ８９の方法であって、免疫チェックポイント阻害剤を投与することをさらに含む。
９５．  パラグラフ８９の方法であって、癌が膠芽腫、大腸癌腫、またはメラノーマである。
９６．  パラグラフ８９の方法であって、ＬＡＰ結合剤による処置の前に、癌がＰＤ−１またはＰＤ−Ｌ１阻害剤に不応性である。
９７．  癌を処置するための方法であって、方法が、対象からの腫瘍サンプルを解析してＬＡＰ＋Ｔ制御性細胞の存在を決定することと、ＬＡＰ＋Ｔ制御性細胞が存在する場合には、対象にＬＡＰ結合剤を投与し、それによって抗腫瘍免疫応答を促進することとを含む。
９８．  パラグラフ９７の方法であって、ＬＡＰ結合剤が抗体またはその抗原結合断片を含む。
９９．  パラグラフ９７の方法であって、抗体またはその抗原結合断片がモノクローナル抗体またはその抗原結合断片である。
１００．  パラグラフ９７の方法であって、抗体またはその抗原結合断片がキメラ、ＣＤＲグラフト、ヒト化、または完全ヒトである。
１０１．  パラグラフ９７の方法であって、抗体またはその抗原結合断片がパラグラフ１〜１２のいずれか１つの抗体組成物を含む。
１０２．  癌患者の集団から、その癌がＬＡＰ結合剤による療法に応答する可能性が高い患者を選択する方法であって、方法が、患者からの腫瘍サンプルをＬＡＰ＋Ｔ制御性細胞の存在について解析することを含み、ＬＡＰ＋Ｔ制御性細胞が患者の腫瘍中に存在することが見いだされた場合には、患者の腫瘍はＬＡＰ結合剤による療法に応答する可能性が高いとして同定される。
１０３．  パラグラフ１０２の方法であって、ＬＡＰ＋Ｔ制御性細胞が前記の腫瘍中に見いだされたときに、その患者にＬＡＰ結合剤を投与することと、ＬＡＰ＋Ｔ制御性細胞が前記の腫瘍中に見いだされないときに、患者にＬＡＰ結合剤以外の免疫調節または抗腫瘍剤を投与することとをさらに含む。
１０４．  パラグラフ１０２または１０３の方法であって、ＬＡＰ結合剤が抗体またはその抗原結合断片を含む。
１０５．  パラグラフ１０４の方法であって、抗体またはその抗原結合断片がモノクローナル抗体またはその抗原結合断片である。
１０６．  パラグラフ１０４の方法であって、抗体またはその抗原結合断片がキメラ、ＣＤＲグラフト、ヒト化、または完全ヒトである。
１０７．  パラグラフ１０４の方法であって、抗体またはその抗原結合断片がパラグラフ１〜１２のいずれか１つの抗体組成物を含む。
１０８．  パラグラフ１０２の方法であって、ＬＡＰ＋Ｔ制御性細胞の存在についての患者からの腫瘍サンプルの解析が、存在するＬＡＰ＋Ｔ制御性細胞の量の定量的測定と、ＬＡＰ＋Ｔ制御性細胞が存在することが見いだされたときには、それらの量を参照と比較することとを含み、ＬＡＰ＋Ｔ制御性細胞のより高い相対的なレベルを有する腫瘍は、ＬＡＰ結合剤による療法に応答する可能性がより高いとして同定される。
１０９．  パラグラフ１０３の方法であって、免疫調節剤が免疫チェックポイント阻害剤を含む。
１１０．  パラグラフ１０３の方法であって、抗腫瘍剤がガンマ放射線または化学療法剤を含む。
１１１．  それが必要な対象において、関心の抗原に特異的なメモリーＴ細胞の形成を促進する方法であって、方法が、対象にＬＡＰ結合剤と関心の抗原とを投与することを含む。
１１２．  パラグラフ１１１の方法であって、ＬＡＰ結合剤の投与後に、ＣＤ４４＋および／またはＩＬ７Ｒ＋Ｔ細胞が増大する。
１１３．  パラグラフ１１１の方法であって、関心の抗原が、腫瘍抗原または感染性病原体によって発現される抗原を含む。
１１４．  パラグラフ１１３の方法であって、腫瘍抗原が樹状細胞ワクチンとして投与される。
１１５．  パラグラフ１１１の方法であって、ＬＡＰ結合剤が抗体またはその抗原結合断片を含む。
１１６．  パラグラフ１１５の方法であって、抗体またはその抗原結合断片がモノクローナル抗体またはその抗原結合断片である。
１１７．  パラグラフ１１５の方法であって、抗体またはその抗原結合断片がキメラ、ヒト化、または完全ヒトである。
１１８．  パラグラフ１１５の方法であって、抗体またはその抗原結合断片がパラグラフ１〜１２のいずれか１つの抗体組成物を含む。
１１９．  ＬＡＰ＋Ｔ制御性細胞の望ましくない数または活性を特徴とするかまたはそれが関わる疾患または障害を処置するためのＬＡＰ結合剤の使用。
１２０．  腫瘍中の腫瘍に浸潤した免疫抑制性Ｔ細胞の数または活性を減少させるためのＬＡＰ結合剤の使用であって、使用が、腫瘍に浸潤した免疫抑制性Ｔ細胞を含む腫瘍を有する対象にＬＡＰ結合剤を投与することを含み、それによってかかる細胞の数または活性が減少する。
１２１．  腫瘍特異的免疫を増大させるためのＬＡＰ結合剤の使用であって、使用が、それが必要な対象にＬＡＰ結合剤の治療有効量を投与することを含む。
１２２．  ＬＡＰ発現および／または活性が癌または腫瘍特異的免疫の抑制に関連する癌または腫瘍の処置のためのＬＡＰ結合剤の使用であって、使用が、それが必要な対象にＬＡＰ結合剤の治療有効量を投与することを含む。
１２３．  腫瘍中のＣＤ８＋細胞傷害性Ｔ細胞の数を増大させることによる、癌または腫瘍の処置のためのＬＡＰ結合剤の使用であって、使用が、腫瘍を有する対象にＬＡＰ結合剤を投与することを含む。
１２４．  それが必要な対象においてＩＦＮγを発現する末梢ＣＤ４＋Ｔ細胞を増大させることによる、癌または腫瘍の処置のためのＬＡＰ結合剤の使用であって、使用が、対象にＬＡＰ結合剤を投与することを含む。
１２５．  それが必要な対象においてグランザイムＢを発現する末梢ＣＤ８＋Ｔ細胞を増大させることによる、癌または腫瘍の処置のためのＬＡＰ結合剤の使用であって、使用が、対象にＬＡＰ結合剤を投与することを含む。
１２６．  腫瘍中のＦｏｘＰ３＋制御性Ｔ細胞の数を減少させることによる、癌または腫瘍の処置のためのＬＡＰ結合剤の使用であって、使用が、対象にＬＡＰ結合剤を投与することを含む。
１２７．  腫瘍中のＣＤ８＋および／またはＣＤ４＋Ｔ細胞による免疫抑制性因子の発現を阻害することによる、癌または腫瘍の処置のためのＬＡＰ結合剤の使用であって、使用が、腫瘍を有する対象にＬＡＰ結合剤を投与することを含む。
１２８．  抗腫瘍免疫応答を促進するためのＬＡＰ結合剤の使用であって、使用が、腫瘍抗原によって腫瘍の処置が必要な対象にワクチン接種することと、対象にＬＡＰ結合剤を投与することとを含む。
１２９．  免疫チェックポイント阻害剤による処置に不応性である癌を処置するためのＬＡＰ結合剤の使用であって、使用が、かかる癌を有する対象にＬＡＰ結合剤を投与することを含む。
１３０．  癌を処置するためのＬＡＰ結合剤の使用であって、使用が、対象からの腫瘍サンプルを解析してＬＡＰ＋Ｔ制御性細胞の存在を決定することと、ＬＡＰ＋Ｔ制御性細胞が存在する場合には、対象にＬＡＰ結合剤を投与し、それによって抗腫瘍免疫応答を促進することとを含む。
１３１．  対象において、癌または感染の処置のために、関心の抗原に特異的なメモリーＴ細胞の形成を促進する、ＬＡＰ結合剤の使用であって、使用が、対象にＬＡＰ結合剤と関心の抗原とを投与することを含む。
１３２．  パラグラフ１３〜３２のいずれか１つの組成物、またはパラグラフ３６〜１１８のいずれか１つの方法、またはパラグラフ１１９〜１３１のいずれか１つの使用であって、ＬＡＰ結合剤が、配列番号１〜３のいずれか１つに示される配列を有するＬＡＰ分子に特異的に結合する。
１３３．  パラグラフ１３〜２８のいずれか１つの組成物、またはパラグラフ３７、４３、４９、５４、５９、６４、６９、７４、７９、８５、９０、９８、１０４、もしくは１１５のいずれか１つの方法であって、抗体またはその抗原結合断片がＬＡＰリガンド相互作用部位に結合する。
１３４．  パラグラフ１３３の組成物または方法であって、ＬＡＰリガンド相互作用部位が、成熟ＴＧＦβと相互作用する部位、インテグリンと相互作用する部位、および／または潜在型ＴＧＦβ結合蛋白質（ＬＴＢＰ）と相互作用する部位である。
１３５．  パラグラフ１〜２８のいずれか１つの組成物、またはパラグラフ３６、４２、４８、５３、５８、６３、６８、７３、７８、８４、８９、９７、１０２、１１１のいずれか１つの方法、またはパラグラフ１１９〜１３１のいずれか１つの使用であって、ＬＡＰ結合剤が、ＴＧＦ−βと複合体化したＬＡＰに結合し、複合体からのＴＧＦ−βの放出を阻害する。
１３６．  パラグラフ１５、２２、３０のいずれか１つの組成物、またはパラグラフ３８、４４、５０、５５、６０、６５、７０、７５、８０、８６、９１、９９、１０５、もしくは１１６のいずれか１つの方法であって、モノクローナル抗体が、TW4-9E7、TW4-5A8、TW4-3E5、TW4-4E5、TW4-12B12、TW4-13B12、TW4-1G12、TW4-3G5、TW4-2F8、TW4-6H10、TW4-1G2、TW4-1E1、TW4-16F4、TW4-8F10、TW4-3H6、TW4-2C9、TW7-16B4、TW7-28G11、TW7-7H4、およびTW7-20B9から選択されるハイブリドーマクローンのいずれか１つによって産生される。
１３７．  パラグラフ１３、２０、もしくは３５のいずれか１つの組成物、またはパラグラフ３６、４２、４８、５３、５８、６３、６８、７３、７８、８４、８９、９７、１０２、１１１のいずれか１つの方法、またはパラグラフ１１９〜１３１のいずれか１つの使用であって、ＬＡＰ結合剤が小分子阻害剤、薬剤、または化合物である。
１３８．  パラグラフ１３、２０、もしくは３５のいずれか１つの組成物、またはパラグラフ３６、４２、４８、５３、５８、６３、６８、７３、７８、８４、８９、９７、１０２、１１１のいずれか１つの方法、またはパラグラフ１１９〜１３１のいずれか１つの使用であって、ＬＡＰ結合剤が、ＬＡＰと結合または物理的に相互作用するＲＮＡまたはＤＮＡアプタマーである。
１３９．  パラグラフ３６〜１０１、１１１〜１１８のいずれか１つの方法またはパラグラフ１２０〜１３１のいずれか１つの使用であって、対象が癌を有するか、またはそれと診断されている。
１４０．  パラグラフ１３９の方法または使用であって、対象は脳腫瘍、メラノーマ、もしくは大腸癌を有するか、またはそれと診断されている。
１４１．  パラグラフ１４０の方法または使用であって、脳腫瘍が膠芽腫である。
１４２．  パラグラフ３６、４２、４８、５３、５８、６３、６８、７３、７８、８４、８９、９７、１１１のいずれか１つの方法またはパラグラフ１１９〜１３１のいずれか１つの使用であって、方法が、対象に抗癌療法、化学療法、または免疫調節剤を投与することをさらに含む。
１４３．  パラグラフ１４２の方法または使用であって、免疫調節剤が免疫チェックポイント阻害剤を含む。
１４４．  パラグラフ１４３の方法または使用であって、免疫チェックポイント阻害剤が次のＰＤ１、ＰＤＬ１、ＰＤＬ２、ＣＴＬＡ４、ＬＡＧ３、ＴＩＭ３、ＴＩＧＩＴ、および／またはＣＤ１０３の１つ以上に結合する。
１４５．  パラグラフ１４３の方法または使用であって、免疫チェックポイント阻害剤が、ペムブロリズマブ、ニボルマブ、MK-3475、MPDL3280A、MEDI0680、MEDI4736、AMP-224、およびMSB0010718Cから選択されるＰＤ１、ＰＤＬ１、および／またはＰＤＬ２阻害剤である。
１４６．  パラグラフ１４２の方法または使用であって、方法が、対象に腫瘍または癌抗原を投与することをさらに含む。
１４７．  パラグラフ１４６の方法または使用であって、方法が、樹状細胞（ＤＣ）ワクチン接種と同時にまたは組み合わせでＬＡＰ結合剤を投与することを含む。
１４８．  パラグラフ２４の方法であって、ＬＡＰ結合剤が、パラグラフ１〜１１のいずれか１つの単離された抗体もしくはその抗原結合断片またはパラグラフ１２の医薬組成物である。
１４９．  パラグラフ１３、２０、もしくは３５のいずれか１つの組成物、またはパラグラフ３６、４２、４８、５３、５８、６３、６８、７３、７８、８４、８９、９７、１０２、１１１のいずれか１つの方法、またはパラグラフ１１９〜１３１のいずれか１つの使用であって、ＬＡＰ結合剤がパラグラフ１〜１１のいずれか１つの単離された抗体もしくはその抗原結合断片またはパラグラフ１２の医薬組成物である。
【０２９８】
前述の記載および次の例が例示的であるのみであり、本発明の範囲の限定としてとられるべきではないということは理解される。開示される態様の種々の変更および改変が、本発明の趣旨および範囲から逸脱することなしになされ得、それらは当業者には明らかであろう。さらに、同定されている全ての特許、特許出願、および刊行物は、例えば、本発明とのつながりで用いられ得るかかる刊行物に記載されている方法論を記載および開示する目的で、参照によって本明細書に明示的に組み込まれる。それらの刊行物は、もっぱら本願の出願日に先行するそれらの開示のために提供される。この点で、いかなることも、本発明者が先行発明の効力によってまたはいずれかの他の理由でかかる開示に先んずる資格がないという承認として解釈されるべきではない。それらの文書の日付についての全ての記述または内容についての描写は出願人に利用可能な情報に基づいており、それらの文書の日付または内容の正しさについてのいかなる承認にもならない。
【０２９９】
同定される全ての特許および他の刊行物は、例えば、本発明とのつながりで用いられ得るかかる刊行物に記載されている方法論を記載および開示する目的で、参照によって本明細書に明示的に組み込まれる。それらの刊行物は、もっぱら本願の出願日に先行するそれらの開示のために提供される。この点で、いかなることも、本発明者が先行発明の効力によってまたはいずれかの他の理由でかかる開示に先んずる資格がないという承認として解釈されるべきではない。それらの文書の日付についての全ての記述または内容についての描写は出願人に利用可能な情報に基づいており、それらの文書の日付または内容の正しさについてのいかなる承認にもならない。
【０３００】
例
例１
膜に結合したＬＡＰ発現は、頭部および頸部癌患者の腫瘍からのＦＯＸＰ３＋ＣＤ４＋リンパ球において上方制御されていた。ＬＡＰ＋ＣＤ４＋リンパ球は、大腸癌（ＣＲＣ）患者の血液および腫瘍両方において増強されたサプレッサーＴ細胞として見いだされた。血液由来ＬＡＰ＋ＣＤ４＋サブセットは、ナイーブＴ細胞の増殖をＴＧＦ−β依存的な様式で抑制する。大腸癌においては、腫瘍内ＣＤ４＋ＦＯＸＰ３−制御性Ｔ細胞の３０％がＬＡＰおよびＬＡＧ陽性である。それらはＩＬ−１０を分泌し、膜に結合したＴＧＦ−βを産生する。ＩＦＮ−γは血液中ではｖｓ．ＬＡＰ陰性Ｔ細胞でＬＡＰ陽性においてわずかにより高いが、腫瘍浸潤ＬＡＰ陽性Ｔリンパ球（ＬＡＰ＋ＴＩＬ）はＬＡＰ−ＴＩＬと比較してＩＦＮ−γの有意により低い量およびより高いＩＬ−１０を分泌する。興味深いことに、これらのＣＤ４＋ＬＡＰ＋ＴＩＬはＣＤ４＋ＬＡＰ−細胞よりも５０倍抑制性であることが見いだされ、これは部分的にＴＧＦ−βに依存的であった。
【０３０１】
ＴＧＦ−βとは独立して、ＬＡＰは癌の悪性度を促進し得る生物学的機能を有する。可溶性のＬＡＰは、化学誘引物質として働くことによってヒト単球の移動を制御することが示された。それゆえに、脳腫瘍におけるＬＡＰの高レベルは末梢からの単球を誘引し得、それらは腫瘍ミリューにおいて腫瘍関連マクロファージになり、それゆえに免疫抑制に寄与する。加えて、固定化されたＬＡＰはＭＭＰ−９の発現を誘導し、インテグリンシグナル伝達を介して腫瘍細胞の遊走および侵入を促進し得るが、可溶性のＬＡＰは反対の効果を有する。
【０３０２】
抗ＬＡＰの治療効果
ＣＤ４＋ＬＡＰ＋Ｔ細胞の重要な制御上の役割に鑑みて、我々は細胞表面に発現したＬＡＰを認識するモノクローナル抗ＬＡＰ抗体を開発した。我々は、インビボのＣＤ４＋ＬＡＰ＋Ｔ細胞を枯渇させかつＴＧＦ−β放出をブロックするマウスおよびヒト特異的モノクローナル抗ＬＡＰ抗体両方を作製した。本明細書に記載されている我々の結果は、同系モデルにおいて、メラノーマ、ＧＢＭ、およびＣＲＣ腫瘍成長の減少におけるマウス抗体の有効性を示している（図５５Ａ〜５５Ｎ）。具体的には、B16同所腫瘍モデルを抗ＬＡＰによって処置した（28G11クローン、図５５Ａ、５５Ｂ）。加えて、我々は、ＧＢＭ／ＧＬ２６１モデル、同所／頭蓋内および皮下モデル両方において抗ＬＡＰを試験した。頭蓋内モデルを16B4によって処置し（図５５Ｃ〜５５Ｆ）、皮下モデルを16B4（図５５Ｇ）または28G11（図５５Ｈ）いずれかによって処置した。最後に、大腸癌腫（ＣＲＣ）モデルを28G11（図５５Ｉ〜５５Ｎ）または16B4（示していない）によって処置した。ＡＯＭ／ＤＳＳによって誘導された同所（図５５Ｉ〜５５Ｋ）および皮下MC38（図５５Ｌ）およびCT26（図５５Ｍ、５５Ｎ）ＣＲＣモデルを抗ＬＡＰによって処置した。全ての腫瘍モデルにおいて、抗ＬＡＰ処置は治療効果をもたらした。それゆえに、抗ＬＡＰ抗体は、ＬＡＰによって媒介される免疫抑制をメラノーマ、ＧＢＭ、およびＣＲＣのモデルにおいてブロックするために用いられ得る。
【０３０３】
我々は元のＧＬ２６１グリオーマ細胞、B16メラノーマ細胞、およびオボアルブミンを恒常的に発現する細胞（GL261-OVAおよびB16-OVA）に基づく同系癌モデルをもまた取得および試験して、頭蓋内および皮下マウスモデル両方において抗原特異的免疫応答を研究した。
【０３０４】
我々は、免疫抑制性表現型を呈し、ナイーブＴ細胞の増殖を抑制し、ＦｏｘＰ３発現を誘導する新規のＬＡＰ＋γδＴ細胞制御性サブセットを同定し、免疫抑制をさらに支持した（Rezende et al., Nature Comminications）。加えて、我々はこの細胞集団がＧＢＭ保有マウスの脾臓に蓄積することを見いだし（図１Ｅ）、それらの細胞がグリオーマによって誘導される免疫抑制に関わるということを示した。
【０３０５】
ＧＢＭにおいて免疫応答の制御におけるＬＡＰの役割を研究するために、我々は、第１に、ＧＢＭに浸潤する、および末梢の異なる免疫細胞におけるＬＡＰ発現を解析した。我々は、ＧＢＭ浸潤リンパ球および骨髄系細胞がそれらの表面にＬＡＰの高レベルを発現するということを見いだし（図１Ａ〜１Ｄ）、それがＧＢＭの免疫抑制において役割を果たし得るということを示した。
【０３０６】
ＬＡＰ＋免疫細胞のどの集団がＧＢＭによって媒介される免疫抑制に重要であるのかを調査するために、我々はＧＢＭ保有マウスにおける異なるＬＡＰ＋免疫細胞の頻度を比較した。興味深いことに、我々は、γδ＋ＬＡＰ＋Ｔ細胞がＧＢＭ保有マウスの脾臓に強く蓄積するということを見いだした（図１Ｅ）。このサブセットは文献に記載されていないので、我々はその表現型および機能を調査した。我々は、ナイーブマウスから単離されたγδ＋ＬＡＰ−Ｔ細胞と比較したときに、γδ＋ＬＡＰ＋Ｔリンパ球が抑制性表現型を備えているということを見いだした（図２Ａ、２Ｂ）。ｑＲＴ−ＰＣＲおよびフローサイトメトリー両方によるサイトカイン発現プロファイルは、ＩＦＮ−γなどの炎症促進性マーカーは下方制御されるが、免疫抑制性サイトカイン（例えばＴＧＦ−βおよびＩＬ−１０）は上方制御されるということを示している。そのため、我々はγδ＋ＬＡＰ＋Ｔサブセットの機能を試験し、それらの細胞が強い抑制能力を見せ、インビトロアッセイにおいてＦｏｘＰ３発現を誘導する能力があるということを見いだした（図２Ｃ）。
【０３０７】
我々は腫瘍から単離されたγδＴリンパ球におけるＬＡＰの高発現を見いだしたので、我々はグリオーマ細胞がそれらの細胞におけるＬＡＰ発現を誘導し得るかどうかを調べた。図３Ａ〜３Ｂが示しているように、γδ＋ＬＡＰ−Ｔリンパ球をグリオーマＧＬ２６１細胞と共培養することは、インビトロにおいて増大したＬＡＰ発現に至り、グリオーマがγδＴ細胞におけるＬＡＰ発現を誘導することによって免疫抑制を引き起こし得るということを示している。免疫系に及ぼす抑制性のＬＡＰ効果を失わせるために、我々は抗ＬＡＰ抗体を用いてインビボのＬＡＰ活性をブロックした。
【０３０８】
抗ＬＡＰ抗体が免疫系に及ぼす効果を解析するために、我々はナイーブマウスを抗ＬＡＰ抗体によって処置した。我々は、Ｔ細胞増殖および炎症促進性サイトカイン産生が、アイソタイプマッチしたコントロールによって処置されたマウスと比較して抗ＬＡＰ処置された動物においてより高いということを見いだし（図４Ａ〜４Ｂ）、抗ＬＡＰが炎症促進性免疫応答を誘導する能力を有するということを示した（da Cunha, International Immunology, 2014）。
【０３０９】
腫瘍に対する抗ＬＡＰ抗体の治療価値を評価するために、我々は、Ｃ５７ＢＬ／６マウスの側腹へのＧＬ２６１細胞の移植によるマウスグリオーマの皮下モデルを用いた。腫瘍移植後に、マウスを抗ＬＡＰ抗体によって腹腔内（ｉ．ｐ．）処置し、繰り返しの処置を１日おきに与えた。アイソタイプマッチした非特異的抗体（ＩＣ）を負のコントロールとして使用した。腫瘍は移植後の第１０日付近に出現し、最初は両方の処置群において育ち、その後に、それらは、免疫が十分に生じた移植から１４日の後に抗ＬＡＰ処置された群において顕著に縮小した（図５５Ｈ、５Ｂ）。我々が免疫応答を調査したときに、我々は、抗ＬＡＰが、炎症促進性免疫応答と干渉する腫瘍によって誘導される免疫抑制をブロックするということを見いだした（図５Ｃ〜５Ｋ）。抗ＬＡＰ処置は、ＣＤ４＋Ｔ細胞におけるＩＦＮ−γのより高発現とＣＤ４＋Ｔ細胞における低減されたＦｏｘＰ３とに至った（図５Ｃおよび５Ｄに対応）。加えて、処置は、ＣＤ８＋Ｔ細胞の増大した数（図５Ｇ）およびそれらの細胞傷害性表現型（図５Ｈ〜５Ｉ）をもたらした。
【０３１０】
興味深いことに、抗ＬＡＰ処置はCD11b-Hi骨髄系サブセットの減少した頻度をもたらしたが、CD11b-Int細胞は増大した（図５７Ａ、５７Ｂ）。寛容性関連マーカーＰＤ−Ｌ１およびＣＤ１０３のレベルは抗ＬＡＰ処置の後のCD11b-hiにおいて低減される（図５７Ｃ）。ＬＡＰ蛋白質は主にCD11b-hi細胞において発現され、このサブセットの抑制性表現型を加えて示している（図５７Ｄ）。我々はこれらの２つの亜集団の免疫プロファイルを調べた。サブセットをナイーブマウスからソーティングし、抗ＣＤ４０抗体またはリポ多糖（ＬＰＳ）によって刺激し、次に遺伝子発現解析をした。活性化によって、CD11b-Hi集団は、免疫抑制性サイトカインＩＬ−１０およびＴＧＦ−βのより高レベルと炎症促進性サイトカインＩＬ−１２のより低レベルとを発現し、このサブセットが制御上の役割を有し得るということを示し、抗ＬＡＰ処置はこれらの細胞を排除した（図５７Ｅ）。CD11b-hiと共培養されたＣＤ８細胞は、CD11b-intサブセットと比較して、抗腫瘍免疫応答（responce）を支持する炎症促進性サイトカインＩＦＮ−γおよびＴＮＦ−αのより低レベルを発現する（図５７Ｆ）。その上、CD11b-Hiサブセットは抗原提示マーカーの低レベルを発現し（図５７Ｇ、５７Ｈ）、それらの細胞が抗原特異的免疫応答を支持するより低い能力を有するということを示した。最後に、CD11b-hi細胞はインビトロの培養のときにＣＤ８＋Ｔ細胞の成長を支持しない（図５７Ｉ）。それゆえに、我々は、抗ＬＡＰ処置が抑制性特性を有する骨髄系細胞の数を低減するということを見いだし、これはより強い免疫応答および腫瘍排除に好都合である。
【０３１１】
抗ＬＡＰ抗体処置は末梢腫瘍の排除において非常に効率的であったので、我々は実験を行って、頭蓋内ＧＢＭの同所マウスモデルにおいてそのポテンシャルを評価した。定位外科手術を用いる線条体へのＧＬ２６１グリオーマ細胞の移植後に、マウスを、腫瘍移植後の第５日から始めて１日おきに抗ＬＡＰによって処置した。図５５Ｃ〜５５Ｆに示されているように、アグレッシブな腫瘍進行にもかかわらず抗ＬＡＰによって処置されたマウスはより長く生存し、これは脳腫瘍へのＣＤ８＋Ｔ細胞の増大した浸潤と関連した。頭蓋内ＧＢＭの強い悪性の性質を考えると、この結果は脳腫瘍に対する抗ＬＡＰ抗体の治療ポテンシャルを示しており、抗ＬＡＰの治療効果のポテンシャルを示している。
【０３１２】
ヒトＧＢＭにおけるＬＡＰおよびＴＧＦ−βの役割を調査するために、我々はTCGA（The Cancer Genome Atlas）データを解析して、メッセンジャーＲＮＡ（両方の蛋白質に共通）の発現が患者の生存と相関するかどうかを決定した。我々はｍＲＮＡ発現の高レベル（ＴＧＦ−βとマークされている）およびＧＢＭ患者の生存の間に逆相関を見いだし（図６２）、ＬＡＰ／ＴＧＦ−βをコードする遺伝子がＧＢＭの病態生理に関わるということを示した。類似の結果が他の癌の患者についても観察され、悪性度に関連したＬＡＰ発現機構の広範な現象を示した（図６２、６３）。
【０３１３】
癌におけるＬＡＰの免疫抑制性の役割を調査する。
我々は、抗ＬＡＰ抗体TW7-28G11（図５８Ａ）またはTW7-16B4（図３９）いずれかによる処置が、非競合抗ＬＡＰクローンを用いるそれらの細胞の検出によって示されるマウスのＣＤ４＋ＬＡＰ＋Ｔ細胞の低減された蓄積をもたらすということを見いだした（図５８Ａ）。これらの結果は、抗ＬＡＰ処置がインビボのＣＤ４＋ＬＡＰ＋Ｔ細胞の枯渇に至るということを示している。近年の研究は、種々の免疫細胞によって発現されたＬＡＰが免疫抑制を媒介し得るということを示している。フローサイトメトリー解析を用いて，我々は、B16メラノーマから単離されたＬＡＰ＋ＣＤ４＋Ｔ細胞が免疫抑制マーカーＦｏｘＰ３、ＬＡＧ３、ＰＤ１、ＰＤ−Ｌ１、Ｔｉｍ３、ＣＤ１０３のより高レベルを発現するということを見いだし（図５８Ｂ）、これらの細胞について抑制能力を示唆した。癌におけるＬＡＰ＋ＣＤ４＋Ｔ細胞の抑制特性を評価するために、我々はB16腫瘍保有マウスの脾臓（アッセイのためのＬＡＰ＋細胞の十分量を提供する）からＬＡＰ＋ＣＤ４＋細胞をソーティングし、それらをＤＣの存在下においてナイーブＣＤ４＋Ｔ細胞と共培養した。我々は、抑制細胞が追加されなかった条件と比較して、ＬＡＰ＋ＣＤ４＋Ｔ細胞の存在下においてナイーブＴ細胞のほぼ２倍低減された増殖を観察した（図５８Ｃ）。負のコントロールとして我々はＬＡＰ−ＣＤ４＋Ｔ細胞を用い、これはおそらくＦｏｘＰ３＋Ｔ細胞の存在ゆえにＴ細胞増殖をわずかにのみ減少させた。興味深いことに、B16メラノーマを保有するマウスの脾臓または流入領域リンパ節（ｄＬＮ）いずれかから単離されたＣＤ４＋ＬＡＰ＋Ｔ細胞は、抗ＬＡＰ処置後に低減された抑制特性を有した（図５８Ｄ）。マウスをTW7-28G11によって処置し、ＣＤ４＋ＬＡＰ＋Ｔ細胞をTW7-16B4クローンによってソーティングした。
【０３１４】
我々は、抗ＬＡＰ処置が腫瘍保有マウス（皮下ＧＢＭ：図２３、２８、頭蓋内ＧＢＭ：図４７、４９、メラノーマ：図５９Ａ）においてＣＤ８＋ＣＤ１０３＋Ｔ細胞の低減された蓄積に至るということをもまた見いだし、それらの細胞が腫瘍モデルにおいて抑制能力を備え得るということを示唆した。実のところ、ＣＤ８＋Ｔ細胞は抗ＬＡＰの治療効果を媒介するために必要であったが（図５９Ｂ）、メラノーマ保有マウスの脾臓またはｄＬＮから単離されたＣＤ１０３＋ＣＤ８＋Ｔ細胞は抑制能力を示し、それらはインビトロアッセイにおいては抗ＬＡＰ処置によって減少した（図５９Ｃ）。その上、メラノーマを移植されたＣＤ８ＫＯマウスへのそれらの細胞の養子移入は腫瘍成長の悪化を引き起こし（図５９Ｄ）、ＣＤ１０３＋ＣＤ８＋Ｔ細胞がインビボにおいて腫瘍特異的免疫を抑制するということを示した。これらの細胞の表現型解析は、ＣＤ１０３＋ＣＤ８＋Ｔ細胞がＣＤ１０３−細胞よりも低い炎症促進性マーカーを発現するということを示している（図５９Ｅ）。それゆえに、抗ＬＡＰは腫瘍中の新規の制御性ＣＤ８＋Ｔ細胞集団を標的化する能力がある。
【０３１５】
マウスの異なる免疫細胞におけるＬＡＰ発現のレベルを決定するために、頭蓋内ＧＢＭを同系マウスモデル（ＧＬ２６１）において誘導する。末梢および脳両方において、次の免疫サブセット、αβＴリンパ球（ＣＤ４＋およびＣＤ８＋）、γδＴリンパ球、マクロファージ（ＣＤ１１ｂ＋）、および樹状細胞（ＤＣ、ＣＤ１１ｃ＋）におけるＬＡＰ発現のレベルを調べる。
【０３１６】
単核細胞を、パーコール勾配を用いてＧＢＭから単離し、マルチパラメトリックフローサイトメトリー解析のためにそれぞれ抗ＬＡＰ抗体と組み合わせた抗ＣＤ４、ＣＤ８、γδＴＣＲ、ＣＤ１１ｂ、ＣＤ１１ｃ抗体によって染色する。ＧＢＭ保有およびナイーブマウスの脾臓から単離された腫瘍浸潤および末梢免疫細胞におけるＬＡＰ発現のレベルを比較する。
【０３１７】
我々は正常な条件下のヒトＴリンパ球および樹状細胞におけるＬＡＰ発現を以前に示した。ＧＢＭに関連したヒト免疫細胞におけるＬＡＰの発現を解析するために、健康なドナーおよびＧＢＭ対象からの単離された末梢血単核細胞（ＰＢＭＣ）を、生きているＴリンパ球（ＣＤ４＋）、単球（ＣＤ１１ｂ＋）、および樹状細胞（ｍＤＣ、ＣＤ１１ｃ＋Ｌｉｎ−、およびｐＤＣ、ＣＤ１１ｃ−Ｌｉｎ−ＣＤ１２３＋）について、我々の公開した方法に従ってヒト特異的抗ＬＡＰ抗体によって染色する。
【０３１８】
マウスおよびヒトにおいて疾患進行の異なるステージにおいて単離された、頭蓋内ＧＢＭに浸潤するＬＡＰ＋免疫細胞の表現型。
ＬＡＰ＋免疫細胞（αβ＋およびγδ＋Ｔリンパ球；ＣＤ１１ｂ＋およびＣＤ１１ｃ＋骨髄系細胞）の表現型を調べるために、ＬＡＰ＋ｖｓ．ＬＡＰ−免疫細胞の遺伝子プロファイリングを、我々が早くに示したようにNanostringに基づく炎症アレイを使用し、それから具体的な遺伝子の発現をｑＲＴ−ＰＣＲによって検証することによって行う（例えばＴＧＦ−β、ＴＮＦ−α、ＩＬ−１０、およびＩＬ−１２）。炎症関連および制御遺伝子（例えば、Ｔ細胞におけるＩＦＮ−γ、ＧＲＺＢ、ＣＤ１０７ａ、ＩＬ−１０、ＦｏｘＰ３、および骨髄系細胞におけるＰＤ−Ｌ１、ＣＤ３９、ＣＤ１０３）の蛋白質レベルを、休止および刺激条件下においてフローサイトメトリーおよびＥＬＩＳＡによって決定する。骨髄系細胞の抗原提示ポテンシャルを評価するために、ＭＨＣＩ、ＭＨＣＩＩ、ＣＤ８０、ＣＤ８６、およびＣＤ４０のレベルを測定する。これらの研究を異なる疾患ステージにおいて行って、どのようにＬＡＰ発現および細胞表現型が疾患進行にリンクするのかを決定する。
【０３１９】
我々のマウス研究と補完的に、健康なドナーの血液と比較して、グリオーマ患者の血液（ＰＢＭＣ）および腫瘍から単離されたＬＡＰ＋免疫細胞の表現型を調べる。NanostringおよびｑＲＴ−ＰＣＲによる炎症遺伝子の発現（例えばＴＧＦ−β、ＴＮＦ−α、およびＩＬ−１０）を決定する。フローサイトメトリーによる休止および刺激条件下の免疫関連遺伝子（例えば、Ｔ細胞におけるＩＦＮ−γ、ＧＲＺＢ、ＩＬ−１０、ＦｏｘＰ３、および骨髄系細胞におけるＰＤ−Ｌ１、ＣＤ３９、ＣＤ１０３）の蛋白質レベルを調べる。
【０３２０】
腫瘍から単離されたＬＡＰ＋制御性免疫細胞の機能解析
膜に結合したＬＡＰを発現する免疫細胞の機能を研究するために、Ｔ細胞機能に影響するそれらの能力を決定する。Ｔリンパ球および骨髄系細胞を調べる。次のパラメータを試験して、対応するＬＡＰ＋およびＬＡＰ−細胞の抑制能力を解析する。ａ）リンパ球の機能：ＬＡＰ＋ｖｓ．ＬＡＰ−Ｔ細胞の存在下におけるＴ細胞増殖（αβ＋およびγδ＋Ｔリンパ球両方）をエクスビボで調べる。OT-IIマウス（OVA-TCR Tg）を用い、非特異的応答Ｔ細胞活性化（抗ＣＤ３による）および抗原特異的活性化（オボアルブミンによる）を用いるアッセイの２つの型を行う。
【０３２１】
インビボのαβ＋ＬＡＰ＋およびγδ＋ＬＡＰ＋Ｔ細胞の機能的役割を研究するために、ＧＢＭ保有マウスへのそれらの細胞の養子移入を行い、ＧＢＭ進行を、腫瘍成長をモニタリングすることと（ＭＲＩによる）、生存率を評価することと、局所および全身の獲得および自然免疫応答を調べることとによって追跡する。
【０３２２】
ＣＤ１１ｂ＋ＬＡＰ＋細胞の貪食を、マクロファージCytoSelect貪食アッセイ（ザイモサン基質による）を用いて調べる。Ｔ細胞に及ぼす効果を、マクロファージ（ＣＤ１１ｂ＋ＬＡＰ＋）および樹状細胞（ＣＤ１１ｃ＋ＬＡＰ＋）をナイーブＴ細胞と共培養することと、Ｔ細胞増殖アッセイによってそれらの成長をモニタリングすることとによって測定する。これらの実験はＧＢＭにおける骨髄系細胞の抗原提示能力および抑制効果を問う。
【０３２３】
ＧＢＭ患者および健康なドナーのＰＢＭＣから単離されたヒトリンパ球および骨髄系細胞の機能（ＦＡＣＳソーティングによる）を調べ、それらの免疫抑制ポテンシャルをＴ細胞増殖／抑制アッセイを用いて評価する。
【０３２４】
ＬＡＰの免疫抑制性特性に鑑みて、この蛋白質を発現する免疫細胞は他の抑制性マーカーを発現し（図５８Ｂ）、機能アッセイにおいて制御上の役割を示す（図５８Ｃ、５８Ｄ）。今までに記載されているＬＡＰのほとんどの生物学的役割はαβ＋Ｔ細胞機能に帰せられている。本明細書において示されているように、我々は、γδ＋ＬＡＰ＋Ｔ細胞もまた抑制能力を備え（図２Ａ〜２Ｄ）、ＧＢＭ保有マウスにおいて全身的に強く上方制御されている（図１Ｅ）ということを見いだした。我々の実験はそれらの病理的機能をＧＢＭの文脈において評価する。加えて、我々の研究は免疫抑制におけるＬＡＰ＋骨髄系細胞の以前に未調査の役割を探査する。
【０３２５】
ＧＢＭ頭蓋内マウスモデルの処置において抗ＬＡＰ抗体の治療ポテンシャルを評価する。
我々の結果は、抗ＬＡＰ抗体が末梢グリオーマモデルにおいて腫瘍成長を排除するということを示しており、それらが頭蓋内ＧＢＭモデルにおいて生存を増大させ得るということを示している（図５５Ｃ〜５５Ｈ）。我々のラボにおいて開発された抗ＬＡＰ抗体が免疫系に及ぼす効果と、この調節が頭蓋内ＧＢＭモデルにおいて治療効果を有するかどうかとを体系的に評価する。
【０３２６】
腫瘍を保有するマウスの免疫応答に抗ＬＡＰ抗体処置が及ぼす効果。
どのように抗ＬＡＰが免疫系に影響するのかを研究するために、ナイーブおよび頭蓋内腫瘍を保有するＧＢＭマウスをｉ．ｐ．の抗ＬＡＰおよびＩＣ抗体によって１日おきに３週間処置する。脾臓および腫瘍を摘出し、獲得および自然免疫応答を調べる。抗ＬＡＰ抗体が獲得および自然免疫応答両方に及ぼす効果を決定する。
【０３２７】
１）獲得免疫応答。Ｔｈ１／Ｔｈ２および細胞傷害性Ｔリンパ球（ＣＴＬ）応答を、腫瘍および脾臓におけるＴリンパ球サブセット（ＣＤ４＋およびＣＤ８＋）の頻度を解析することによって評価する。両方のサブセットにおけるＩＦＮ−γなどの表面膜結合および細胞内免疫モジュレーター、ＣＤ４＋Ｔ細胞におけるＬＡＰ、ＬＡＧ、ＣＤ１０３、ＰＤ１、Ｔｉｍ３、ＩＬ−１０、ＦｏｘＰ３、ＩＬ−１７、およびＴＧＦ−β、ＣＤ８＋Ｔリンパ球におけるＣＤ１０７、ＧＲＺＢ、およびパーフォリンの発現を、フローサイトメトリーによって調べる。ＧＬ２６１グリオーマ（図２７および４１。16B4によって処置）およびB16メラノーマ（図５６Ａ。28G11によって処置）モデルにおいて、我々は、抗ＬＡＰによって処置されたマウスの腫瘍がＣＤ８＋Ｔ細胞の増大した数によって浸潤されるということを見いだした。メラノーマモデルにおいては、抗ＬＡＰ処置後に、ＣＤ８＋腫瘍浸潤Ｔ細胞はＫｉ６７の発現に基づくより良好な増殖能力を有し、炎症促進性メディエータのより高レベルを発現した（図５６Ａ）。その上、ＣＤ８＋Ｔ細胞／Ｔｒｅｇの比もまた抗ＬＡＰ処置の後により高かった。ＣＤ８＋Ｔ細胞の数およびそれらの炎症促進性表現型もまた末梢においてより高かった（図５６Ｂ）。
【０３２８】
２）自然免疫応答。樹状細胞（ＣＤ１１ｃ＋）およびマクロファージ（ＣＤ１１ｂ＋）を包含する腫瘍浸潤抗原提示細胞を、それらの頻度と抑制マーカー（ＰＤ−Ｌ１、ＣＤ３９、ＣＤ１０３）、抗原提示マーカー（ＭＨＣＩ、ＭＨＣＩＩ）、および補助刺激分子（ＣＤ４０、ＣＤ８０、ＣＤ８６）の発現とをフローサイトメトリーによって調べることによって調査する。図５７Ａ〜５７Ｊ。
【０３２９】
これらの骨髄系細胞サブセットが異なるサイトカイン（ＩＬ−１β、ＩＬ−６、ＩＬ１０、ＩＬ−１２、ＩＬ−２３、およびＴＧＦ−β）を産生する能力を評価した。マクロファージおよびＤＣをソーティングし、抗ＣＤ４０抗体またはリポ多糖（ＬＰＳ）によって刺激し、次に遺伝子発現解析をした。
【０３３０】
ＧＢＭにおける抗ＬＡＰ後の機能的な免疫応答を解析するために、オボアルブミンを発現するＧＬ２６１グリオーマ細胞（GL261-OVA）を頭蓋内注射し、マウスを抗ＬＡＰ抗体によって処置する。ＯＶＡ特異的ＣＤ４＋およびＣＤ８＋Ｔ細胞免疫応答をそれらのマウスにおいて測定する。
【０３３１】
実験ＧＢＭモデルにおける抗ＬＡＰ抗体の治療価値。
ＧＢＭ関連の免疫抑制を標的化する抗体が処置として用いられ得る。我々のラボで作製された抗ＬＡＰ抗体を用いて、ＧＢＭにおけるそれらの治療ポテンシャルを試験する。
【０３３２】
ＧＬ２６１細胞をＣ５７ＢＬ／６マウスに頭蓋内移植し、それから、それらを、腫瘍移植後の第２日から始めて１日おきに抗ＬＡＰ（１００μｇ／マウス）によって処置した。ＧＢＭ成長を磁気共鳴イメージング（ＭＲＩ）および生存率（図８５Ａ〜８５Ｎ）によってモニタリングした。ＧＢＭ侵入および血管新生をヘマトキシリンおよびエオシン（Ｈ＆Ｅ）ならびに免疫組織化学的な抗ＣＤ３１染色によって解析し、３）ＧＢＭにリクルートされたマクロファージの転写および機能プロファイルをNanostringによって行い、インビトロのＴ細胞増殖に及ぼすそれらの効果と４）局所および末梢免疫応答とを、細胞傷害性および制御性Ｔ細胞の頻度ならびにそれらの機能を解析することによって評価する。ＬＡＰは細胞侵入を誘導し得るので、ＧＢＭ侵入が抗ＬＡＰ処置によって低減されるかどうかがインビトロ（ボイデンチャンバー）およびインビボ（組織病理）で解析される。
【０３３３】
本明細書に記載されるように、アグレッシブな頭蓋内ＧＢＭモデルを用いて、我々は抗ＬＡＰによる処置の後にマウスの増強された生存を観察した。本明細書に記載される側面のいくつかの態様において、抗ＬＡＰ抗体のより高い用量と処置を早く始めることとを用いて、ＧＢＭに対する抗ＬＡＰ抗体の治療効果を増強し得る。加えて、ＬＡＰが頭蓋内ＧＢＭにおいて異なる免疫細胞によって産生され、単球を誘引し得るということに鑑みると、抗ＬＡＰ処置はマクロファージによるより低い腫瘍浸潤をもたらし得る。ＧＢＭへの骨髄系細胞の病理的寄与を考えると、抗ＬＡＰ処置は低減された侵入および局所腫瘍免疫抑制に至り得、これはマクロファージによって有意に寄与される特徴である。
【０３３４】
腫瘍関連抗原に対する増強された免疫Ｔ細胞のメモリー。
我々は、頭蓋内ＧＢＭを保有しかつ抗ＬＡＰによって処置されたマウスにおいて、腫瘍浸潤Ｔ細胞がメモリーマーカー（ＩＬ７ＲおよびＣＤ４４、図６７）のより高レベルを発現するということを見いだした。これらの結果に基づいて、我々は、抗ＬＡＰが免疫メモリーを増強し、腫瘍関連抗原を発現するＤＣワクチンによる事前接種から利し得るという仮説を立てた。我々は、オボアルブミンをローディングした樹状細胞をマウスに事前接種することと、抗ＬＡＰ（16B4クローン）によってマウスを処置することと、１週間後に頭蓋内腫瘍（GL261-OVA）を注射することとによって、この仮説を試験した（図６０Ａ）。我々はＭＲＩイメージングおよび生存によって疾患発生を追跡した。抗ＬＡＰによって処置された全てのマウスは腫瘍を生じなかったが、５匹のＩＣ処置されたマウスのうち４匹はＧＢＭを生じ、屠殺されねばならず、それゆえに我々の仮説を支持した（図６０Ｂ、６０Ｃ）。長期免疫を試験するために、残りのマウスを３ヶ月後に皮下GL261-OVAによって再チャレンジした。これらのマウスは腫瘍を生じず、それらがこの腫瘍に対する免疫メモリーを保っているということを示した。抗ＬＡＰ処置されたマウスはＩＬ７Ｒのより高レベルを発現し（図６０Ｄ、６０Ｅ）、四量体シグナルはナイーブマウスまたはＩＣによって処置されたマウスと比較してＣＤ８＋Ｔ細胞においてより高く（図６０Ｆ）、抗ＬＡＰがＣＤ８＋腫瘍抗原特異的Ｔ細胞を増大させるということを示唆した。これらの観察は、抗ＬＡＰの28G11クローンによって処置されたメラノーマモデルにおける類似の観察によって支持された（図６１）。それゆえに、抗ＬＡＰは免疫メモリーを増強し得、可能性として、腫瘍関連抗原による付随的なワクチン接種から利するであろう。
【０３３５】
例２
抗ＬＡＰ抗体コンストラクトの調製
トータルＲＮＡを、TRIZOL（登録商標）試薬（Thermo Fisher Scientific）を用いて、TRIZOL（登録商標）試薬の技術マニュアルに従ってTW7-28G11ハイブリドーマ細胞から単離した。トータルＲＮＡをアガロースゲル電気泳動によって解析した。
【０３３６】
トータルＲＮＡを、アイソタイプ特異的アンチセンスプライマーまたはユニバーサルプライマーを用いて、PRIMESCRIPT（商標）1st Strand cDNA Synthesis Kitの技術マニュアルに従ってｃＤＮＡに逆転写した。TW7-28G11ハイブリドーマ細胞からのＶＨおよびＶＬの抗体断片をGenScriptのＲＡＣＥの標準的な作業手順に従って増幅した。
【０３３７】
増幅された抗体断片を、標準的な分子クローニング手順を用いて標準的なクローニングベクターに別々にクローニングした。
【０３３８】
コロニーＰＣＲスクリーニングを行って、正しいサイズのインサートを有するクローンを同定した。正しいサイズのインサートを有する最低で５つのシングルコロニーを、それぞれの抗体断片についてシーケンシングした。
【０３３９】
正しいＶＨおよびＶＬインサートサイズを有するTW7-28G11ハイブリドーマ細胞からの５つのシングルコロニーをシーケンシングに送った。５つの異なるクローンのＶＨおよびＶＬ遺伝子はだいたい同一であることが見いだされた。本明細書において配列番号７および配列番号１２として掲載されるコンセンサスヌクレオチド配列は、ハイブリドーマTW7-28G11によって産生される抗体の配列であると信じられる。
【０３４０】
TW7-28G11抗体のＶＨＣＤＲ１〜ＣＤＲ３アミノ酸配列は本明細書においては配列番号９〜１１として提供されている。TW7-28G11抗体のＶＬＣＤＲ１〜ＣＤＲ３アミノ酸配列は本明細書においては配列番号１４〜１６として提供される。ヒト化、ＣＤＲグラフト、および／もしくはキメラ抗体、ならびに／またはその抗原結合断片を作製するためにTW7-28G11抗体のＶＨおよび／またはＶＬＣＤＲ配列を用いる好適なフレームワーク配列は、当業者に公知および本明細書の他所に記載の技術を用いて同定および選択され得る。
【０３４１】
トータルＲＮＡを、例えばTRIZOL（登録商標）試薬を用いてTW7-16B4ハイブリドーマ細胞から単離する。トータルＲＮＡは例えばアガロースゲル電気泳動を用いて解析する。
【０３４２】
トータルＲＮＡを、例えばアイソタイプ特異的アンチセンスプライマーまたはユニバーサルプライマーを用いて、PRIMESCRIPT（商標）1st Strand cDNA Synthesis Kitの技術マニュアルに従ってｃＤＮＡに逆転写する。TW7-16B4ハイブリドーマ細胞からのＶＨおよびＶＬの抗体断片を、例えばGenScriptのＲＡＣＥの標準的な作業手順を用いて増幅する。
【０３４３】
増幅された抗体断片を、標準的な分子クローニング手順を用いて標準的なクローニングベクターに別々にクローニングする。
【０３４４】
コロニーＰＣＲスクリーニングを行って、正しいサイズのインサートを有するクローンを同定する。例えば、正しいサイズのインサートを有する少なくとも３つまたは少なくとも５つのシングルコロニーを、それぞれの抗体断片についてシーケンシングする。
【０３４５】
正しいＶＨおよびＶＬインサートサイズを有するTW7-16B4ハイブリドーマ細胞からのシングルコロニーをシーケンシングに送り、コンセンサスヌクレオチド配列を同定し、それからＶＨおよびＶＬならびに対応するＣＤＲ１〜ＣＤＲ３領域のアミノ酸配列が同定される。
【０３４６】
ヒト化、ＣＤＲグラフト、および／もしくはキメラ抗体、ならびに／またはその抗原結合断片を作製するためにTW7-16B4抗体のＶＨおよび／またはＶＬＣＤＲ配列を用いる好適なフレームワーク配列は、当業者に公知および本明細書の他所に記載の技術を用いて同定および選択され得る。
【図１】
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【図２】
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【図３】
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【図４】
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【図５】
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【図６】
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【図７】
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【図８】
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【図９】
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【図１０】
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【図１１】
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【図１２】
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【図１３】
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【図１４】
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【図１５】
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【図１６】
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【図１７】
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【図１８】
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【図１９】
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【図２０】
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【図２１】
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【図２２】
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【図２３】
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【図２４】
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【図２５】
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【図２６】
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【図２７】
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【図２８】
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【図２９】
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【図３０】
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【図３１】
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【図３２】
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【図３３】
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【図３４】
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【図３５】
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【図３６】
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【図３７】
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【図３８】
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【図３９】
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【図４０】
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【図４１】
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【図４２】
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【図４３】
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【図４４】
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【図４５】
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【図４６】
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【図４７】
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【図４８】
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【図４９】
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【図５０】
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【図５１】
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【図５２】
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【図５３】
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【図５４】
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【図５５】
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【図５６】
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【図５７】
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【図５８】
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【図５９】
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【図６０】
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【図６１】
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【図６２】
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【図６３】
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【図６４】
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【図６５】
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【図６６】
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【図６７】
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【手続補正書】
【提出日】平成29年9月14日(2017.9.14)
【手続補正１】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】配列表
【補正方法】追加
【補正の内容】
【配列表】
2018508483000001.app
【国際調査報告】
2018508483.tif 000070
2018508483.tif 000071
2018508483.tif 000072
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