【手続補正書】
【提出日】平成22年9月9日(2010.9.9)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
１型糖尿病の発症に対する小児の感受性を診断する方法であって、
ｉ）診断される小児から採取したサンプルにおける、リン脂質、酸またはそれらの誘導体である、ケトン、またはアルコール、から成る群から選択された少なくとも１つの血清代謝体の収集物を測定し、
ｉｉ）前記血清代謝体の収集物と、健康児からなる対照グループにおける同種の血清代謝体の収集物とを比較し、
ｉｉｉ）前記診断される小児と前記対照グループとの間における収集物の差異を、１型糖尿病の発症に対する小児の感受性を表すためのバイオマーカとして使用することを特徴とする方法。
【請求項２】
請求項１に記載の方法において、前記診断される小児の年齢は、前記対照グループと同じ、またはほぼ同じ年齢であることを特徴とする方法。
【請求項３】
請求項１に記載の方法において、前記血清代謝体は、前記健康児からなる対照グループと比較して前記診断される小児から採取したサンプルの収集物に減少している、酸化ストレスおよび／または炎症から保護するための代謝体であり、１型糖尿病の発症に対する小児の感受性を表すことを特徴とする方法。
【請求項４】
請求項１に記載の方法において、前記血清代謝体は、リン脂質類の合計、１または複数のエステル結合型リン脂質、またはエステル結合型リン脂質類の合計であることを特徴とする方法。
【請求項５】
請求項４に記載の方法において、前記血清代謝体は、新生児から測定することを特徴とする方法。
【請求項６】
請求項５に記載の方法において、前記小児は新生児であって、小児のエステル結合型リン脂質類の合計のレベルが、対照グループの平均レベルの約８０％以下であるか否かにより、１型糖尿病の発症に対する小児の感受性を表すことを特徴とする方法。
【請求項７】
請求項１に記載の方法において、前記血清代謝体は、１または複数のエーテル結合型リン脂質、またはエタノールアミンプラスマローゲンであることを特徴とする方法。
【請求項８】
請求項７に記載の方法において、エーテル結合型ホスファチジルコリンは、ＧＰＣｈｏ（３６：２ｅ）、ＧＰＣｈｏ（３８：ｌｅ）、ＧＰＣｈｏ（３８：５ｅ）、ＧＰＣｈｏ（４０：４ｅ）、ＣＰＣｈｏ（Ｏ−１８：１／１６：０）、ＣＰＣｈｏ（Ｏ−１８：１／１６：１）、ＣＰＣｈｏ（Ｏ−１６：０／２０：４）、ＣＰＣｈｏ（Ｏ−１８：１／２０：４）、ＣＰＣｈｏ（Ｏ−１８：０／１８：２）からなるグループから選出され、その測定は、新生児から６歳児までの年齢の範囲で行われることを特徴とする方法。
【請求項９】
請求項７に記載の方法において、前記エタノールアミンプラスマローゲンは、ＧＰＥｔｎ（Ｏ−１８：１（１Ｚ）／２０：４）であり、かつその測定は、新生児から６歳児までの年齢の範囲で行われることを特徴とする方法。
【請求項１０】
請求項１に記載の方法において、前記血清代謝体は、トリプトファン、リビトール、ペンタン二酸、グリシン、エイコサン酸、１、２、３-プロパントリカルボン酸、ミリストレイン酸、マンニトール、クレアチニン、ブタン二酸、ヘプタン酸、２−ケトグルタル酸メトキシムからなるグループから選出されることを特徴とする方法。
【請求項１１】
請求項１に記載の方法において、前記血清代謝体の測定は、所定の年齢の小児に対して行い、
前記血清代謝体の測定結果は、前記診断される小児と同じ年齢の前記対照グループの測定結果と比較することを特徴とする方法。
【請求項１２】
請求項１１に記載の方法において、所定の前記血清代謝体は、前記診断される小児のために測定され、
前記血清代謝体のレベルは、前記対照グループにおける代謝体のレベルと比較することを特徴とする請求項１４に記載の診断方法。
【請求項１３】
請求項１に記載の方法において、前記１型糖尿病の発症および／または自己免疫の出現に対する遺伝的リスクを測定することを特徴とする方法。
【請求項１４】
請求項１３に記載の方法において、前記１型糖尿病の発症および／または前記自己免疫の出現に対する遺伝的リスクに従って、病気を発症する感受性を検出する代謝体マーカを測定することを特徴とする方法。
【請求項１５】
請求項７に記載の方法において、減少したエーテル結合型ホスホコリンレベルと組み合わせた自己抗体マーカの出現を測定することにより、１型糖尿病を発症する高いリスクを有する個人を識別することを特徴とする方法。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００１９
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００１９】
またさらなる実施例では、バイオマーカは、リン脂質、酸またはそれらの誘導体である、ケトン、またはアルコールとしてよい。限定されない例として、バイオマーカは、トリプトファン、リビトール、ペンタン二酸、グリシン、エイコサン酸、１、２、３−プロパントリカルボン酸、ミリストレイン酸、マンニトール、クレアチニン、ブタン二酸、ヘプタン酸、２−ケトグルタル酸メトキシム等からなるグループとしてよい。これらの化合物のうち、トリプトファン、リビトール、ペンタン二酸、１、２、３−プロパントリカルボン酸、クレアチニンエノール、ブタン二酸、がより好ましいと考えられている。
【手続補正３】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００２３
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００２３】
好ましくは、１型糖尿病の発症に対する遺伝的リスクおよび／または自己抗体の出現に従って、病気を発症する感受性を検出する代謝体マーカを測定するとよい。
【手続補正４】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００３４
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００３４】
１型糖尿病を発症した被験者は、ＨＬＡ遺伝子型、性別、出生地と出生時期に応じて、ＤＩＰＰ試験から選び出された。選出された合計４１人の発症者と５４人の未発症者から、９５０サンプルを選出した（図１ｃ）。実験とデータ解析のために、サンプルは産まれた都市に基づいて２つのバッチにさらに分けた。すなわちトゥルク市（発症者１３人、非発症者２６人）、オウル市（発症者２７人、非発症者２８人）である。
【手続補正５】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００３８
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００３８】
図２は、４つの潜在的な交絡因子として各個人のID、性別、年齢、サンプルの年代を表示する、オウル市のＤＩＰＰバッチのサモンマッピングの結果である。サンプルの年代と性別はいずれも、脂質プロフィールとの類似性に影響を与える主要なファクターではないことは明白であった。しかしながら、年齢のプロフィールの密集（図２ｃ）（すなわち、早期年齢の小児の脂質プロフィール）は、後の段階でのどのプロフィールよりも、互いに相似していた。これは、年齢によって異なるが低年齢であるほど均一になる規定食と、彼らの成長に起因する代謝の顕著な変化と、両方によって生じると考えられる。興味深いことに、各個人の間における差異も検出された（図２ａ）。
【手続補正６】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００８２
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００８２】
データ処理：
ＣｈｒｏｍａＴＯＦソフトウェアはサンプルのデータ処理のために使用した。自作のソフトウェアは、直線とピークが交差し合うサンプルのために使用した。ピークは、合計３６サンプルのプロフィールから検出されたピークの数（最小の１２ピークに設定）に基づき、またデータベース（類似インデックス閾＝８００）への特性の一致に基づき取り出した。