【手続補正書】
【提出日】平成21年12月10日(2009.12.10)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
敗血症を発症するリスクがある試験対象から採取した生体試料を使用して敗血症の発症を予測する方法であって：
試験対象のバイオマーカープロフィールの複数の特徴が第1の値セットを満たすかどうかを評価することを含み、該第1の値セットを満たすことは、該試験対象が敗血症を発症する可能性が高いことを予測し、かつ該複数の特徴は、表1、4、5、6、7、8及び／又は9に収載されたバイオマーカーの複数の測定可能な態様であり、該複数のバイオマーカーが補体成分C3及び補体成分C4を含むときに、該複数のバイオマーカーは、3つ以上のバイオマーカーを含む、前記方法。
【請求項２】
試験対象のバイオマーカープロフィールの複数の特徴が第2の値セットを満たすかどうかを評価することを更に含み：
該第2の値セットを満たすことは、前記試験対象が敗血症を発症する可能性が高くないことを予測する、請求項1記載の方法。
【請求項３】
前記複数のバイオマーカーが、C反応性タンパク質、アポリポタンパク質AII及び抗トロンビンIIIを含む、請求項1又は2記載の方法。
【請求項４】
前記複数のバイオマーカーのそれぞれのバイオマーカーが、表1に収載されたバイオマーカーである、請求項1又は2記載の方法。
【請求項５】
前記複数のバイオマーカーのそれぞれのバイオマーカーが、表5に収載されたバイオマーカーである、請求項1又は2記載の方法。
【請求項６】
前記複数のバイオマーカーのそれぞれのバイオマーカーがタンパク質である、請求項1又は2記載の方法。
【請求項７】
前記複数の特徴の特徴が、前記複数のバイオマーカーのバイオマーカーの測定可能な態様であり、かつ前記特徴のための特徴値が単一時に前記試験対象から採取した生体試料を使用して決定される、請求項1又は2記載の方法。
【請求項８】
前記特徴が、前記試料中の前記バイオマーカーの存在量である、請求項7記載の方法。
【請求項９】
前記方法が、評価する工程の前に、前記バイオマーカープロフィールを構築することを更に含む、請求項1又は2記載の方法。
【請求項１０】
前記構築する工程が、第1のデータ分析アルゴリズムを、集団のメンバーから得られた表1、4、5、6、7、8及び／又は9に収載されたバイオマーカーに対応する特徴に対して適用することを含む、請求項9記載の方法。
【請求項１１】
前記集団が、その後に敗血症を発症する対象（敗血症対象）及びその後に敗血症を発症しない対象（SIRS対象）を含む、請求項10記載の方法。
【請求項１２】
前記集団のメンバーから得られる表1、4、5、6、7、8及び／又は9に収載されたバイオマーカーに対応する特徴が、前記集団の対象が敗血症を得るときよりも前に一度に得られる、請求項10又は11記載の方法。
【請求項１３】
前記第1のデータ分析アルゴリズムが、決定木、マイクロアレイの予測解析、多重付加回帰樹木、ニューラルネットワーク、クラスタリングアルゴリズム、主成分分析法、最近傍分析法、線形判別分析法、二次判別分析法、サポートベクトルマシン、進化的方法、投射追跡又は加重投票である、請求項10〜12のいずれか1項記載の方法。
【請求項１４】
前記試験対象が、8〜12時間以内に敗血症を発症する可能性を有する、請求項1又は2記載の方法。
【請求項１５】
前記試験対象が、12〜24時間以内に敗血症を発症する可能性を有する、請求項1又は2記載の方法。
【請求項１６】
前記試験対象が、24〜36時間以内に敗血症を発症する可能性を有する、請求項1又は2記載の方法。
【請求項１７】
前記試験対象が、36〜48時間以内に敗血症を発症する可能性を有する、請求項1又は2記載の方法。
【請求項１８】
前記試験対象が、48〜72時間以内に敗血症を発症する可能性を有する、請求項1又は2記載の方法。
【請求項１９】
前記方法が、前記試験対象の前記バイオマーカープロフィールにおける前記複数の特徴が、前記第1の値セットを満たすかどうかを使用者、メモリ、記憶装置又はソフトウエアプログラムに伝達することを更に含む、請求項1又は2記載の方法。
【請求項２０】
試験対象から採取した生体試料を使用して敗血症を診断する方法であって：
試験対象のバイオマーカープロフィールの複数の特徴が第1の値セットを満たすかどうかを評価する工程を含み、該第1の値セットを満たすことは、該試験対象が敗血症を発症する可能性が高いことを予測し、該複数の特徴は、複数のバイオマーカーに対応し、該複数のバイオマーカーは、表1、4、5、6、7、8及び9のいずれか1つに収載された少なくとも2つのバイオマーカーを含み、該複数のバイオマーカーが補体成分C3及び補体成分C4を含むときに、該複数のバイオマーカーは、3つ以上のバイオマーカーを含む、前記方法。
【請求項２１】
前記方法が、評価する工程の前に、前記バイオマーカープロフィールを構築することを更に含む、請求項20記載の方法。
【請求項２２】
前記構築する工程が、前記複数の特徴に対応する表1、4、5、6、7、8又は9のバイオマーカーの同一性を決定することを含む、請求項21記載の方法。
【請求項２３】
前記決定する工程が、データ分析アルゴリズムを、集団のメンバーから得られる表1、4、5、6、7、8、又は9に収載されたバイオマーカーに対応する特徴に対して適用することを含む、請求項22記載の方法。
【請求項２４】
前記集団が、後に敗血症を発症する対象（敗血症対象）及び敗血症を発症しない対象（SIRS対象）を含む、請求項23記載の方法。
【請求項２５】
前記複数のバイオマーカーが表1のものである、請求項20記載の方法。
【請求項２６】
前記複数のバイオマーカーが表5のものである、請求項20記載の方法。
【請求項２７】
前記複数のバイオマーカーがC反応性タンパク質、アポリポタンパク質AII及び抗トロンビンIIIを含む、請求項20記載の方法。
【請求項２８】
複数のプローブスポットを含むマイクロアレイであって、前記複数のプローブスポットにおけるプローブスポットの少なくとも20パーセントは、表1、4、5、6、7、8、又は9に収載された複数のバイオマーカーに対応する、前記マイクロアレイ。
【請求項２９】
試験対象における敗血症の発症を予測するためのキットであって、表1、4、5、6、7、8及び／又は9に収載された複数のバイオマーカーに特異的に結合する複数の抗体を含む、前記キット。
【請求項３０】
試験対象における敗血症の発症を予測するためのキットであって、C反応性タンパク質に特異的に結合する第1の抗体、アポリポタンパク質AIIに特異的に結合する第2の抗体、及び抗トロンビンIII前駆体に特異的に結合する第3の抗体を含む、前記キット。
【請求項３１】
試験対象における敗血症の発症を予測するためのキットであって、表5に収載された複数のバイオマーカーに特異的に結合する複数の抗体を含む、前記キット。
【請求項３２】
コンピュータシステムと組み合わせて使用するためのコンピュータプログラム製品であって、該コンピュータプログラム製品は、コンピュータ読み取り可能な記憶媒体及びその中に埋め込まれたコンピュータプログラムメカニズムを含み、該コンピュータプログラムメカニズムは：
敗血症を発症するリスクのある試験対象のバイオマーカープロフィールにおける複数の特徴が第1の値セットを満たすかどうかを評価するための命令を含み、該第1の値セットを満たすことは、該試験対象が敗血症を発症する可能性が高いことを予測し、かつ該複数の特徴は、複数のバイオマーカーの測定可能な態様であり、該複数のバイオマーカーは、表1、4、5、6、7、8及び／又は9に収載された少なくとも2つのバイオマーカーを含み、該複数のバイオマーカーが補体成分C3及び補体成分C4を含むときに、該複数のバイオマーカーは、3つ以上のバイオマーカーを含む、前記コンピュータプログラム製品。
【請求項３３】
前記コンピュータプログラム製品が：
試験対象のバイオマーカープロフィールにおける複数の特徴が第2の値セットを満たすかどうかを評価するための命令を更に含み、該第2の値セットを満たすことは、該試験対象が敗血症を発症する可能性が高くないことを予測する、請求項32記載のコンピュータプログラム製品。
【請求項３４】
前記バイオマーカープロフィールが、表1に収載された2〜90個のバイオマーカーからなる、請求項32又は33記載のコンピュータプログラム製品。
【請求項３５】
前記バイオマーカープロフィールが、表5に収載された2〜90個のバイオマーカーからなる、請求項32又は33記載のコンピュータプログラム製品。
【請求項３６】
中央処理装置；
前記中央処理装置に連結されたメモリ；を含むコンピュータであって：
前記メモリは、敗血症を発症するリスクのある試験対象のバイオマーカープロフィールにおける複数の特徴が第1の値セットを満たすかどうかを評価するための命令を記憶し、該第1の値セットを満たすことは、該試験対象が敗血症を発症する可能性が高いことを予測し、かつ複数の特徴は、複数のバイオマーカーの測定可能な態様であり、該複数のバイオマーカーは、表1、4、5、6、7、8及び／又は9に収載された少なくとも2つのバイオマーカーを含み、該複数のバイオマーカーが補体成分C3及び補体成分C4を含むときに、該複数のバイオマーカーは、3つ以上のバイオマーカーを含む、前記コンピュータ。
【請求項３７】
対象が敗血症を発症する可能性が高いかどうかを決定するためのコンピュータシステムであって：
中央処理装置；及び、
前記中央処理装置に連結されたメモリであって：
試験対象のバイオマーカープロフィールを得るための命令であって、前記バイオマーカープロフィールは、複数の特徴を含み、かつ該複数の特徴は、複数のバイオマーカーの測定可能な態様であり、該複数のバイオマーカーは、表1、4、5、6、7、8及び9のいずれか１つに収載された少なくとも2つのバイオマーカーを含み、該複数のバイオマーカーが補体成分C3及び補体成分C4を含むときに、該複数のバイオマーカーは、3つ以上のバイオマーカーを含む、前記命令；
前記バイオマーカープロフィールをリモートコンピュータに伝達するための命令であって、該リモートコンピュータは、該試験対象のバイオマーカープロフィールにおける複数の特徴が第1の値セットを満たすかどうかを評価するための命令を含み、該第1の値セットを満たすと、試験対象が敗血症を発症する可能性が高いことを予測する、前記命令；及び、
前記リモートコンピュータから前記試験対象のバイオマーカープロフィールにおける複数の特徴が前記第1の値セットを満たすかどうかに関しての決定を受けるための命令；並びに、
前記試験対象のバイオマーカープロフィールにおける複数の特徴が前記第1の値セットを満たすかどうかを、使用者、メモリ、記憶装置又はソフトウエアプログラムに報告するための命令；を記憶する、前記メモリ、
を含む、前記コンピュータシステム。
【請求項３８】
前記リモートコンピュータが、
試験対象のバイオマーカープロフィールにおける複数の特徴が第2の値セットを満たすかどうかを評価するための命令であって、該第2の値セットを満たすことは、前記試験対象が敗血症を発症する可能性が高くないことを予測する、前記命令を更に含み、かつ前記メモリは：
前記リモートコンピュータから、前記試験対象のバイオマーカープロフィールにおける複数の特徴が前記第2のセットを満たすかどうかに関しての決定を受けるための命令；及び、
前記試験対象のバイオマーカープロフィールにおける複数の特徴が前記第2の値セットを満たすかどうかを、使用者、メモリ、記憶装置又はソフトウエアプログラムに報告するための命令；をさらに含む、
請求項37記載のコンピュータシステム。
【請求項３９】
前記複数のバイオマーカーが、表1に収載された少なくとも3つのバイオマーカーを含む、請求項37記載のコンピュータシステム。
【請求項４０】
前記複数のバイオマーカーが、表5に収載された少なくとも3つのバイオマーカーを含む、請求項37記載のコンピュータシステム。
【請求項４１】
前記複数のバイオマーカーが、C反応性タンパク質、アポリポタンパク質AII及び抗トロンビンIIIを含む、請求項37記載のコンピュータシステム。
【請求項４２】
対象が敗血症を発症する可能性が高いかどうかを決定するためのグラフィカルユーザインタフェースであって、該グラフィカルユーザインタフェースは、リモートコンピュータから受けた搬送波に埋め込まれたデジタル信号にコードされた結果を示すための表示フィールドを含み、該複数の特徴は、複数のバイオマーカーの測定可能な態様であり、該複数のバイオマーカーは、表1、4、5、6、7、8及び9のいずれか1つに収載された少なくとも2つのバイオマーカーを含み、該複数のバイオマーカーが補体成分C3及び補体成分C4を含むときに、該複数のバイオマーカーは、3つ以上のバイオマーカーを含み、かつ
前記結果は、試験対象のバイオマーカープロフィールにおける複数の特徴が第1の値セットを満たすときに、第1の値を有し；及び、
前記結果は、試験対象のバイオマーカープロフィールにおける複数の特徴が第2の値セットを満たすときに、第2の値を有する、
前記グラフィカルユーザインタフェース。
【請求項４３】
前記複数のバイオマーカーが、表1に収載された少なくとも3つのバイオマーカーを含む、請求項42記載のグラフィカルユーザインタフェース。
【請求項４４】
前記複数のバイオマーカーが、表5に収載された少なくとも3つのバイオマーカーを含む、請求項42記載のグラフィカルユーザインタフェース。
【請求項４５】
前記複数のバイオマーカーが、C反応性タンパク質、アポリポタンパク質AII及び抗トロンビン-IIIを含む、請求項42記載のグラフィカルユーザインタフェース。
【請求項４６】
対象が敗血症を発症する可能性が高いかどうかを決定するためのコンピュータシステムであって： 
中央処理装置；及び、
前記中央処理装置に連結されたメモリであって：
試験対象のバイオマーカープロフィールを得るための命令であって、前記バイオマーカープロフィールは、複数の特徴を含み、かつ該複数の特徴は、複数のバイオマーカーの測定可能な態様であり、該複数のバイオマーカーは、表1、4、5、6、7、8、及び9のいずれか1つに収載された少なくとも2つのバイオマーカーを含み、該複数のバイオマーカーが補体成分C3及び補体成分C4を含むときに、該複数のバイオマーカーは、3つ以上のバイオマーカーを含む、前記命令；及び、
前記試験対象のバイオマーカープロフィールにおける複数の特徴が第1の値セットを満たすかどうかを評価するための命令であって、前記第1の値セットを満たすことは、前記試験対象が敗血症を発症する可能性が高いことを予測する、前記命令；並びに、
前記試験対象のバイオマーカープロフィールにおける複数の特徴が、前記第1の値セットを満たすかどうかを、使用者、メモリ、記憶装置又はソフトウエアプログラムに報告するための命令；
を記憶している、前記メモリ、
を含む、前記コンピュータシステム。
【請求項４７】
前記複数のバイオマーカーが、表1に収載された少なくとも2つのバイオマーカーを含む、請求項46記載のコンピュータシステム。
【請求項４８】
前記複数のバイオマーカーが、表5に収載された少なくとも2つのバイオマーカーを含む、請求項46記載のコンピュータシステム。
【請求項４９】
前記複数のバイオマーカーが、C反応性タンパク質、アポリポタンパク質AII及び抗トロンビン-IIIを含む、請求項46記載のコンピュータシステム。