【手続補正書】
【提出日】平成22年4月16日(2010.4.16)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
蛍光に基づいたハイブリダイゼーションアッセイを実施する上で適した試料調製および
分析システムであって、
生体試料を受容可能な試料収集チャンバーと、
前記試料収集チャンバーと液体流通可能な溶解（溶菌）チャンバーと、
前記溶解チャンバーと液体流通し、多孔質高分子モノリスを有する直線状のマイクロ流体アレイと、
前記溶解チャンバーと前記直線状のマイクロ流体アレイとの間にあり、双方と液体流通可能な任意に選択される導管と、
前記溶解チャンバー、前記直線状のマイクロ流体アレイ、前記任意に選択される導管、またはこれらの任意の組み合わせと液体流通可能な試料調製モジュールであって、前記溶解チャンバー、前記直線状のマイクロ流体アレイ、前記任意に選択される導管、またはこれらの任意の組み合わせの温度を制御できるものである、前記試料調製モジュールと、
前記直線状のマイクロ流体アレイと光学的に通信可能な光学的励起および検出システムと
を有する試料調製および分析システム。
【請求項２】
請求項１記載の試料調製および分析システムにおいて、前記試料収集チャンバー、前記溶解チャンバー、および前記任意に選択される導管は、カードタイプの装置に一体化されるものである。
【請求項３】
請求項１記載の試料調製および分析システムにおいて、前記直線状のマイクロ流体アレイは、さらに、核酸プローブを有し、当該核酸プローブは１若しくはそれ以上の触手プローブを有するものである。
【請求項４】
請求項１記載の試料調製および分析システムにおいて、前記直線状のマイクロ流体アレイは、さらに、複数の生物有機体に対し特異的な複数の触手プローブを有するものである。
【請求項５】
１若しくはそれ以上の標的生物有機体を識別する方法であって、
熱溶解チャンバー内の１若しくはそれ以上の生物有機体から１若しくはそれ以上の細胞または胞子を溶解して溶解物を生じさせる工程であって、当該溶解により、前記１若しくはそれ以上の生物有機体から核酸を生じさせるものである、前記生じさせる工程と、
前記溶解物から前記核酸をフィルタリングする工程と、
前記核酸を直線状のマイクロ流体のマイクロアレイに輸送する工程であって、当該直線状のマイクロ流体のマイクロアレイは多孔質高分子モノリスに結合し、空間配置された複数のプローブを有し、当該プローブは前記標的生物有機体各々からの核酸の少なくとも一部をハイブリダイズすることが可能なものである、前記輸送する工程と、
前記標的生物有機体のうちの少なくとも１つにおける少なくとも１つの核酸を前記プローブのうち少なくとも１つにハイブリダイズさせる工程と、
前記標的生物有機体のうちの少なくとも１つにおける少なくとも１つの核酸にハイブリダイズした前記プローブを励起する工程と、
前記直線状のマイクロ流体のマイクロアレイ上の前記励起されたプローブのうち少なくとも１つの空間位置を検出する工程と、
前記直線状のマイクロ流体のマイクロアレイ上における前記励起されたプローブの空間位置と、前記細胞または前記胞子の少なくとも１つの識別結果とを相関させる工程と
を有する方法。
【請求項６】
請求項５記載の方法において、前記プローブは協働するプローブを有するものである。
【請求項７】
ハイブリダイゼーションアッセイを実施する上で適した試料調製および分析カードであって、
生体試料を受容可能な溶解チャンバーと、
前記溶解チャンバーと液体流通可能な直線状のマイクロ流体アレイであって、多孔質媒体に結合した１若しくはそれ以上の触手プローブを有するものである、前記直線状のマイクロ流体アレイと、
前記溶解チャンバーと前記直線状のマイクロ流体アレイとの間にあり、双方と液体流通可能な任意に選択される導管と
を有する試料調製および分析カード。
【請求項８】
請求項７記載の試料調製および分析カードにおいて、前記直線状のマイクロ流体アレイは、着脱自在なカートリッジ内に設けられているものである。
【請求項９】
蛍光に基づいたハイブリダイゼーションアッセイを実施する上で適した試料調製および
分析システムであって、
生体試料を受容可能な試料収集チャンバーと、
前記試料収集チャンバーと液体流通可能な溶解（溶菌）チャンバーと、
前記溶解チャンバーと液体流通し、１若しくはそれ以上の協働するプローブを有する直線状のマイクロ流体アレイと、
前記溶解チャンバーと前記直線状のマイクロ流体アレイとの間にあり、双方と液体流通可能な任意に選択される導管と、
前記溶解チャンバー、前記直線状のマイクロ流体アレイ、前記任意に選択される導管、またはこれらの任意の組み合わせと液体流通可能な試料調製モジュールであって、前記溶解チャンバー、前記直線状のマイクロ流体アレイ、前記任意に選択される導管、またはこれらの任意の組み合わせの温度を制御できるものである、前記試料調製モジュールと、
前記直線状のマイクロ流体アレイと光学的に通信可能な光学的励起および検出システムと
を有する試料調製および分析システム。
【請求項１０】
請求項９記載の試料調製および分析システムにおいて、前記試料収集チャンバー、前記溶解チャンバー、および前記任意に選択される導管は、カードタイプの装置に一体化されるものである。
【請求項１１】
請求項９記載の試料調製および分析システムにおいて、前記直線状のマイクロ流体アレイは、さらに、複数の生物有機体に対し特異的な複数の協働するプローブを有するものである。
【請求項１２】
請求項９記載の試料調製および分析システムにおいて、前記光学的励起および検出システムは、励起光子源により前記直線状のマイクロアレイを走査（スキャン）して当該直線状のマイクロアレイ上の個々の検出プローブを空間分解できるスキャナを有するものである。
【請求項１３】
請求項９記載の試料調製および分析システムにおいて、前記スキャナは、直線状のマイクロアレイ面積１平方ミクロンあたり約０．０５色素分子〜約１色素分子を分解（分離）
できるものである。
【請求項１４】
請求項１３記載の試料調製および分析システムにおいて、前記直線状のマイクロ流体アレイは、さらに、複数の生物有機体に対し特異的な複数の協働するプローブを有するものである。
【請求項１５】
請求項９記載の試料調製および分析システムにおいて、前記協働するプローブの少なくとも１つは触手プローブを有するものである。
【請求項１６】
試料調製および個別の（ｄｉｓｃｒｅｔｅ）モノリシックマイクロアレイが一体化されたシステムであって、
生体試料を受容可能な試料収集チャンバーと、
前記試料収集チャンバーと液体流通可能な溶解（溶菌）チャンバーと、
前記溶解チャンバーと液体流通し、多孔質高分子モノリスを有する直線状のマイクロ流体アレイと、
前記溶解チャンバーと前記直線状のマイクロ流体アレイとの間にあり、双方と液体流通可能な任意に選択される導管と、
前記溶解チャンバー、前記直線状のマイクロ流体アレイ、前記任意に選択される導管、またはこれらの任意の組み合わせと液体流通可能な試料調製モジュールであって、前記溶解チャンバー、前記直線状のマイクロ流体アレイ、前記任意に選択される導管、またはこれらの任意の組み合わせの温度を制御できるものである、前記試料調製モジュールと、
前記直線状のマイクロ流体アレイと光学的に通信可能な光学的励起および検出システムと
を有する試料調製および個別のモノリシックマイクロアレイが一体化されたシステム。
【請求項１７】
請求項１６記載の試料調製および個別のモノリシックマイクロアレイが一体化されたシステムにおいて、前記直線状のマイクロ流体アレイは、さらに、１若しくはそれ以上の協働するプローブを有するものである。
【請求項１８】
請求項１７記載の試料調製および個別のモノリシックマイクロアレイが一体化されたシステムにおいて、前記直線状のマイクロ流体アレイは、さらに、複数の生物有機体に対し特異的な複数の協働するプローブを有するものである。
【請求項１９】
試料調製およびマイクロアレイが一体化されたシステムにおいて１若しくはそれ以上の標的生物有機体を識別する方法であって、
温度制御され、選択的に気圧より高い圧力で加圧された溶解チャンバー内の１若しくはそれ以上の生物有機体から１若しくはそれ以上の細胞または胞子を溶解して溶解物を生じさせる工程であって、当該溶解により、前記１若しくはそれ以上の生物有機体から核酸を生じさせるものである、前記生じさせる工程と、
前記溶解物から前記核酸をフィルタリングする工程と、
冷却中に、溶液中の前記核酸を直線状のマイクロ流体のマイクロアレイに輸送する工程であって、当該直線状のマイクロ流体のマイクロアレイは多孔質高分子モノリスに結合し、空間配置された複数の協働するプローブを有し、当該協働するプローブは前記標的生物有機体各々からの核酸の少なくとも一部をハイブリダイズすることが可能なものである、前記輸送する工程と、
前記標的生物有機体のうちの少なくとも１つにおける少なくとも１つの核酸を前記協働するプローブのうち少なくとも１つにハイブリダイズさせる工程と、
前記標的生物有機体のうちの少なくとも１つにおける少なくとも１つの核酸にハイブリダイズした前記協働するプローブを励起する工程と、
前記直線状のマイクロ流体のマイクロアレイ上の前記励起されたプローブのうち少なくとも１つの空間位置を検出する工程と、
前記直線状のマイクロ流体のマイクロアレイ上における前記励起されたプローブの空間位置と、前記細胞または前記胞子の少なくとも１つの識別結果とを相関させる工程と
を有する方法。
【請求項２０】
請求項１９記載の方法において、前記協働するプローブの少なくとも１つは触手プローブを有するものである。
【請求項２１】
ハイブリダイゼーションアッセイを実施する上で適した試料調製および分析カードであって、
生体試料を受容可能な溶解チャンバーと、
前記溶解チャンバーと液体流通可能な直線状のマイクロ流体アレイであって、多孔質高分子モノリスに結合した１若しくはそれ以上の協働するプローブを有するものである、前記直線状のマイクロ流体アレイと、
前記溶解チャンバーと前記直線状のマイクロ流体アレイとの間にあり、双方と液体流通可能な任意に選択される導管であって、冷却中に、前記生物試料の少なくとも一部を前記多孔質高分子モノリスに輸送するものである、前記導管と
を有する試料調製および分析カード。
【請求項２２】
請求項２１記載の試料調製および分析カードにおいて、前記協働するプローブの少なくとも１つは触手プローブを有するものである。