【手続補正書】
【提出日】平成22年8月20日(2010.8.20)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
以下の段階を含む、血液試料中の肺癌のマーカーを検出する方法であって、前記マーカーがNPTX1である方法：
(a) 対象から血液試料を採取する段階；
(b) 血液試料におけるNPTX1レベルを決定する段階；
(c) 段階(b)において決定されたNPTX1レベルを正常対照のNPTX1レベルと比較する段階；および
(d) 正常対照と比較して血液試料におけるNPTX1レベルが高い場合、前記マーカーが、対象が肺癌に罹患している疑いがあることを示す段階。
【請求項２】
肺癌がSCLCまたはNSCLCである、請求項1記載の方法。
【請求項３】
血液試料が全血、血清、および血漿からなる群より選択される、請求項1〜2のいずれかに記載の方法。
【請求項４】
NPTX1レベルが血液試料中のNPTX1タンパク質の検出によって決定される、請求項1〜3のいずれかに記載の方法。
【請求項５】
NPTX1タンパク質が免疫測定法によって検出される、請求項4記載の方法。
【請求項６】
免疫測定法がELISAである、請求項5記載の方法。
【請求項７】
免疫測定法が、検出抗体として抗NPTX1ポリクローナル抗体を用いるサンドイッチ法である、請求項5記載の方法。
【請求項８】
(e) 肺癌のマーカーとして、血液試料におけるCEAレベルおよびproGRPレベルの一方または両方を決定する段階；
(f) 段階(e)において決定されたCEAレベルおよびproGRPレベルの一方または両方のレベルを正常対照レベルと比較する段階；ならびに
(g) 正常対照と比較して血液試料におけるCEAレベルが高い場合、CEAが、対象がNSCLCに罹患している疑いがあることを示し、または、正常対照と比較して血液試料におけるproGRPレベルが高い場合、proGRPが、対象がSCLCに罹患している疑いがあることを示す段階
をさらに含む、請求項1〜7のいずれかに記載の方法。
【請求項９】
(a) 血液試料におけるNPTX1レベルを決定するための免疫測定試薬；および
(b) NPTX1に対する陽性対照試料
を含む、肺癌を検出するためのキット。
【請求項１０】
血清NPTX1を検出するためのELISAキットを含む、請求項9記載のキット。
【請求項１１】
肺癌がSCLCまたはNSCLCである、請求項9記載のキット。
【請求項１２】
陽性対照試料が液体形態である、請求項9〜11のいずれかに記載のキット。
【請求項１３】
癌患者の予後の評価の指標を検出する方法であって、
(a) 患者由来の生体試料におけるNPTX1遺伝子の発現レベルを検出する段階；
(b) 検出した発現レベルを対照レベルと比較する段階；および
(c) (b)の比較を、患者の予後の評価と関連付ける段階
を含む、方法。
【請求項１４】
対照レベルが予後良好の対照レベルであり、対照レベルと比較して増大した発現レベルが予後不良の可能性と関連付けられる、請求項13記載の方法。
【請求項１５】
増大が対照レベルを少なくとも10%上回る、請求項14記載の方法。
【請求項１６】
他の癌関連遺伝子の発現レベルを決定する段階を含む、請求項15記載の方法。
【請求項１７】
発現レベルが、以下からなる群より選択されるいずれか一つの方法によって決定される、請求項16記載の方法：
(a) NPTX1遺伝子のmRNAの検出；
(b) NPTX1タンパク質の検出；および
(c) NPTX1タンパク質の生物学的活性の検出。
【請求項１８】
プローブとNPTX1遺伝子の遺伝子転写物とのハイブリダイゼーションの検出によって発現レベルが決定される、請求項17記載の方法。
【請求項１９】
ハイブリダイゼーション段階がDNAアレイ上で行われる、請求項18記載の方法。
【請求項２０】
NPTX1遺伝子の発現レベルとしてのNPTX1タンパク質に対する抗体の結合の検出によって発現レベルが決定される、請求項13記載の方法。
【請求項２１】
生体試料が痰または血液を含む、請求項13〜20のいずれかに記載の方法。
【請求項２２】
癌が肺癌である、請求項13〜21のいずれかに記載の方法。
【請求項２３】
以下からなる群より選択される試薬を含む、癌患者の予後を評価するためのキット：
(a) NPTX1遺伝子のmRNAを検出するための試薬；
(b) NPTX1タンパク質を検出するための試薬；および
(c) NPTX1タンパク質の生物学的活性を検出するための試薬。
【請求項２４】
試薬がNPTX1タンパク質に対する抗体である、請求項23記載のキット。
【請求項２５】
癌が肺癌である、請求項23〜24のいずれかに記載のキット。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００４９
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００４９】
本明細書記載の方法の利点の一つは、癌の明白な臨床症状の検出前に疾患が同定されることである。本発明のその他の特徴および利点は、以下の詳細な説明から、および添付の特許請求の範囲から明らかとなろう。
[請求項101]
対象由来の生体試料におけるKIF4A遺伝子の発現レベルを検出する段階を含む、対象において肺癌または肺癌を発症する素因を診断するための方法であって、該遺伝子の正常対照レベルと比較して該発現レベルが増大していることにより、該対象が肺癌に罹患しているかまたは肺癌の発症リスクを有することが示される、方法。
[請求項102]
発現レベルが正常対照レベルを少なくとも10%上回る、請求項101記載の方法。
[請求項103]
発現レベルが、以下からなる群より選択される方法のいずれかによって決定される、請求項101記載の方法:
(a) KIF4A遺伝子のmRNAの検出;
(b) KIF4A遺伝子によってコードされるタンパク質の検出;および
(c) KIF4A遺伝子によってコードされるタンパク質の生物学的活性の検出。
[請求項104]
対象由来の生体試料が上皮細胞を含む、請求項101記載の方法。
[請求項105]
対象由来の生体試料が癌細胞を含む、請求項101記載の方法。
[請求項106]
対象由来の生体試料が癌性上皮細胞を含む、請求項101記載の方法。
[請求項107]
癌がSCLCおよびNSCLCである、請求項101記載の方法。
[請求項108]
KIF4A遺伝子の転写産物または翻訳産物に結合する検出試薬を含む、キット。
[請求項109]
(a) 診断されるべき対象から血液試料を採取する段階;
(b) 血液試料におけるNPTX1レベルを決定する段階;
(c) 段階(b)において決定されたNPTX1レベルを正常対照のNPTX1レベルと比較する段階;および
(d) 正常対照と比較して血液試料におけるNPTX1レベルが高いことにより対象が癌に罹患していることが示されると判断する段階
を含む、対象において肺癌を診断するための方法。
[請求項110]
癌がSCLCおよびNSCLCである、請求項109記載の方法。
[請求項111]
血液試料が全血、血清、および血漿からなる群より選択される、請求項109記載の方法。
[請求項112]
NPTX1レベルが血清中のNPTX1タンパク質の検出によって決定される、請求項109記載の方法。
[請求項113]
NPTX1タンパク質が免疫測定法によって検出される、請求項109記載の方法。
[請求項114]
免疫測定法がELISAである、請求項113記載の方法。
[請求項115]
免疫測定法が、検出抗体として抗NPTX1ポリクローナル抗体を用いるサンドイッチ法である、請求項113記載の方法。
[請求項116]
(e) 血液試料におけるCEAレベルおよびproGRPレベルの一方または両方を決定する段階;
(f) 段階(b)において決定されたCEAレベルおよびproGRPレベルの一方または両方のレベルを正常対照レベルと比較する段階;ならびに
(g) 正常対照と比較して血液試料におけるCEAレベルが高いことにより対象がNSCLCに罹患していることが示され、かつ、正常対照と比較して血液試料におけるproGRPレベルが高いことにより対象がSCLCに罹患していることが示されると判断する段階
をさらに含む、請求項109記載の方法。
[請求項117]
(a) 血液試料におけるNPTX1レベルを決定するための免疫測定試薬;および
(b) NPTX1に対する陽性対照試料
を含む、肺癌を検出するためのキット。
[請求項118]
肺癌がSCLCおよびNSCLCである、請求項117記載のキット。
[請求項119]
陽性対照試料がNPTX1に対して陽性である、請求項117記載のキット。
[請求項120]
陽性対照試料が液体形態である、請求項117記載のキット。
[請求項121]
センス鎖およびアンチセンス鎖を含む二本鎖分子であって、センス鎖がSEQ ID NO: 32、33、36、および37からなる群より選択される標的配列に対応するリボヌクレオチド配列を含み、アンチセンス鎖が該センス鎖に相補的なリボヌクレオチド配列を含み、該センス鎖および該アンチセンス鎖が互いにハイブリダイズして該二本鎖分子を形成し、かつ、KIF4A、NPTX1、またはFGFR1OP遺伝子を発現する細胞に導入された場合に該二本鎖分子が該遺伝子の発現を阻害する、二本鎖分子。
[請求項122]
請求項121記載の二本鎖分子をコードする、ベクター。
[請求項123]
二次構造を有する転写物をコードしかつセンス鎖およびアンチセンス鎖を含む、請求項122記載のベクター。
[請求項124]
転写物が、センス鎖およびアンチセンス鎖を連結している一本鎖リボヌクレオチド配列をさらに含む、請求項123記載のベクター。
[請求項125]
センス鎖核酸とアンチセンス鎖核酸の組み合わせを含むポリヌクレオチドを含むベクターであって、該センス鎖核酸がSEQ ID NO: 32、33、36、および37のヌクレオチド配列を含み、かつ該アンチセンス鎖核酸がセンス鎖に相補的な配列からなる、ベクター。
[請求項126]
ポリヌクレオチドが一般式
5'-[A]-[B]-[A']-3'
を有し、
式中、[A]がSEQ ID NO: 32、33、36、および37のヌクレオチド配列であり;[B]が3〜23ヌクレオチドからなるヌクレオチド配列であり;かつ[A']が[A]に相補的なヌクレオチド配列である、請求項125記載のベクター。
[請求項127]
有効成分としての、KIF4A、NPTX1、FGFR1OP、またはWRNIP1の発現を阻害する低分子干渉RNA(siRNA)の薬学上有効量、および薬学的に許容される担体を含む、肺癌を治療または予防するための薬学的組成物。
[請求項128]
siRNAがSEQ ID NO: 32、33、36、37、96、および97からなる群より選択されるヌクレオチド配列を標的配列として含む、請求項127記載の薬学的組成物。
[請求項129]
siRNAが一般式
5'-[A]-[B]-[A']-3'
を有し、
式中、[A]がSEQ ID NO: 32、33、36、37、96、および97のヌクレオチド配列に対応するリボヌクレオチド配列であり;[B]が3〜23ヌクレオチドからなるリボヌクレオチド配列であり;かつ[A']が[A]に相補的なリボヌクレオチド配列である、請求項136記載の組成物。
[請求項130]
肺癌がSCLCおよびNSCLCである、請求項127〜129のいずれか一項記載の組成物。
[請求項131]
癌患者の予後を評価するための方法であって、
(a) 患者由来の生体試料におけるKIF4A、NPTX1、またはFGFR1OP遺伝子の発現レベルを検出する段階;
(b) 検出した発現レベルを対照レベルと比較する段階;および
(c) (b)の比較に基づいて患者の予後を判定する段階
を含む、方法。
[請求項132]
対照レベルが予後良好の対照レベルであり、対照レベルと比較して増大した発現レベルが予後不良と判定される、請求項131記載の方法。
[請求項133]
増大が対照レベルを少なくとも10%上回る、請求項132記載の方法。
[請求項134]
他の癌関連遺伝子の発現レベルを決定する段階を含む、請求項133記載の方法。
[請求項135]
発現レベルが、以下からなる群より選択されるいずれか一つの方法によって決定される、請求項134記載の方法:
(a) KIF4A、NPTX1、またはFGFR1OP遺伝子のmRNAの検出;
(b) KIF4A、NPTX1、またはFGFR1OPタンパク質の検出;および
(c) KIF4A、NPTX1、またはFGFR1OPタンパク質の生物学的活性の検出。
[請求項136]
プローブとKIF4A、NPTX1、またはFGFR1OP遺伝子の遺伝子転写物とのハイブリダイゼーションの検出によって発現レベルが決定される、請求項135記載の方法。
[請求項137]
ハイブリダイゼーション段階がDNAアレイ上で行われる、請求項136記載の方法。
[請求項138]
KIF4A、NPTX1、またはFGFR1OP遺伝子の発現レベルとしてのKIF4A、NPTX1、またはFGFR1OPタンパク質に対する抗体の結合の検出によって発現レベルが決定される、請求項131記載の方法。
[請求項139]
生体試料が痰または血液を含む、請求項131記載の方法。
[請求項140]
癌が肺癌である、請求項131記載の方法。
[請求項141]
以下からなる群より選択される試薬を含む、癌患者の予後を評価するためのキット:
(a) KIF4A、NPTX1、またはFGFR1OP遺伝子のmRNAを検出するための試薬;
(b) KIF4A、NPTX1、またはFGFR1OPタンパク質を検出するための試薬;および
(c) KIF4A、NPTX1、またはFGFR1OPタンパク質の生物学的活性を検出するための試薬。
[請求項142]
試薬がKIF4A、NPTX1、およびFGFR1OPタンパク質に対する抗体である、請求項141記載のキット。
[請求項143]
癌が肺癌である、請求項141記載のキット。
[請求項144]
(1) 標的分子のパートナー分子結合ドメインを含むポリペプチドと、パートナー分子の標的分子結合ドメインを含むポリペプチドとを、試験化合物の存在下で接触させる段階;
(2) ペプチド間の結合を検出する段階;および
(3) 結合を阻害する試験化合物を選択する段階
を含む、結合の阻害物質をスクリーニングする方法であって、
標的分子とそのパートナー分子の組み合わせがKIF4A/ZNF549、KIF4A/ZNF553、MAPJD/MYC、FGFR1OP/WRNIP1、FGFR1OP/ABL1、およびFGFR1OP/WRNIP1/ABL1からなる群より選択される、方法。
[請求項145]
(1) 標的分子のパートナー分子結合ドメインを含むポリペプチドと、パートナー分子の標的分子結合ドメインを含むポリペプチドとを、試験化合物の存在下で接触させる段階;
(2) ペプチド間の結合を検出する段階;および
(3) 結合を阻害する試験化合物を選択する段階
を含む、肺癌を治療または予防するのに有用な化合物をスクリーニングする方法であって、
標的分子とそのパートナー分子の組み合わせがKIF4A/ZNF549、KIF4A/ZNF553、MAPJD/MYC、FGFR1OP/WRNIP1、FGFR1OP/ABL1、およびFGFR1OP/WRNIP1/ABL1からなる群より選択される、方法。
[請求項146]
パートナー分子結合ドメインを含むポリペプチドが、KIF4Aポリペプチド、MAPJDポリペプチド、およびFGFR1OPポリペプチドからなる群より選択されるいずれか一つのペプチドを含む、請求項144または145記載の方法。
[請求項147]
標的分子結合ドメインを含むポリペプチドが、ZNF549ポリペプチド、ZNF553ポリペプチド、MYCポリペプチド、WRNIP1ポリペプチド、およびFGFR1OPポリペプチドからなる群より選択されるいずれか一つのペプチドを含む、請求項144または145記載の方法。
[請求項148]
(a) 標的分子のパートナー分子結合ドメインを含むポリペプチド;
(b) パートナー分子の標的分子結合ドメインを含むポリペプチド;および
(c) ポリペプチド間の相互作用を検出するための試薬
を含む、結合の阻害物質をスクリーニングするためのキットであって、
標的分子とそのパートナー分子の組み合わせがKIF4A/ZNF549、KIF4A/ZNF553、MAPJD/MYC、FGFR1OP/WRNIP1、FGFR1OP/ABL1、およびFGFR1OP/WRNIP1/ABL1からなる群より選択される、キット。
[請求項149]
(a) 標的分子のパートナー分子結合ドメインを含むポリペプチド;
(b) パートナー分子の標的分子結合ドメインを含むポリペプチド;および
(c) ポリペプチド間の相互作用を検出するための試薬
を含む、肺癌の治療または予防に有用な化合物をスクリーニングするためのキットであって、
標的分子とそのパートナー分子の組み合わせがKIF4A/ZNF549、KIF4A/ZNF553、MAPJD/MYC、FGFR1OP/WRNIP1、FGFR1OP/ABL1、およびFGFR1OP/WRNIP1/ABL1からなる群より選択される、キット。
[請求項150]
パートナー分子結合ドメインを含むポリペプチドが、KIF4Aポリペプチド、MAPJDポリペプチド、およびFGFR1OPポリペプチドからなる群より選択されるいずれか一つのペプチドを含む、請求項148または149記載のキット。
[請求項151]
標的分子結合ドメインを含むポリペプチドが、ZNF549ポリペプチド、ZNF553ポリペプチド、MYCポリペプチド、WRNIP1ポリペプチド、およびABL1ポリペプチドからなる群より選択されるいずれか一つのペプチドを含む、請求項148または149記載のキット。
[請求項152]
MAPJD/HAT複合体を介したアセチル化の調節物質をスクリーニングする方法であって、
(1) 試験化合物を、HAT複合体に結合したMAPJDポリペプチドおよび該ポリペプチドによりアセチル化される基質に、基質のアセチル化を可能にする条件下で接触させる段階;
(2) 基質のアセチル化レベルを検出する段階;ならびに
(3) 試験化合物の非存在下で検出された対照アセチル化レベルと比較して、アセチル化されるべき基質のアセチル化レベルを低下させる試験化合物を阻害物質として選択する段階;試験化合物の非存在下で検出された対照アセチル化レベルと比較して、アセチル化されるべき基質のアセチル化レベルを増大させる試験化合物を促進物質として選択する段階
を含む、方法。
[請求項153]
肺癌を治療または予防するのに有用な化合物をスクリーニングする方法であって、
(1) 試験化合物を、HAT複合体に結合したMAPJDポリペプチドおよび該ポリペプチドによりアセチル化される基質に、基質のアセチル化を可能にする条件下で接触させる段階;
(2) 基質のアセチル化レベルを検出する段階;ならびに
(3) 試験化合物の非存在下で検出された対照アセチル化レベルと比較して、アセチル化されるべき基質のアセチル化レベルを低下させる試験化合物を選択する段階
を含む、方法。
[請求項154]
アセチル化されるべき基質がヒストンH4である、請求項152または153記載の方法。
[請求項155]
MAPJDポリペプチドおよびHAT複合体が生細胞中で発現される、請求項152または153記載の方法。
[請求項156]
(a) MAPJDポリペプチドおよびHAT複合体を発現する細胞、ならびに
(b) ヒストンH4のアセチル化レベルを検出するための試薬
を含む、MAPJD/HAT複合体を介したアセチル化の調節物質をスクリーニングするためのキット。
[請求項157]
(a) MAPJDポリペプチドおよびHAT複合体を発現する細胞、ならびに
(b) ヒストンH4のアセチル化レベルを検出するための試薬
を含む、肺癌の治療または予防に有用な化合物をスクリーニングするためのキット。
[請求項158]
MAPJD/HAT複合体およびMAPJD/MYC複合体からなる群より選択される複合体とEボックスモチーフとの間の結合の阻害物質をスクリーニングする方法であって、
(1) 試験化合物を、HAT複合体またはMYCに結合したMAPJDポリペプチドまたはその機能的同等物およびEボックスモチーフを含むポリヌクレオチドに接触させる段階;
(2) ポリペプチドとポリヌクレオチドとの間の結合を検出する段階;ならびに
(3) 結合を阻害する試験化合物を選択する段階
を含む、方法。
[請求項159]
肺癌を治療または予防するのに有用な化合物をスクリーニングする方法であって、
(1) 試験化合物を、HAT複合体またはMYCに結合したMAPJDポリペプチドまたはその機能的同等物およびEボックスモチーフを含むポリヌクレオチドに接触させる段階;
(2) ポリペプチドとポリヌクレオチドとの間の結合を検出する段階;ならびに
(3) 結合を阻害する試験化合物を選択する段階
を含む、方法。
[請求項160]
ポリヌクレオチドが、転写調節領域と該転写調節領域の制御下で発現されるレポーター遺伝子とを含むベクターであり、該転写調節領域がEボックスモチーフを含み、かつ該レポーター遺伝子の発現レベルまたは活性を測定することにより結合が検出される、請求項158または159記載の方法。
[請求項161]
ポリヌクレオチドが、SBNO1、TGFBRAP1、RIOK1、およびRASGEF1Aからなる群より選択される遺伝子の5'隣接領域より選択されるヌクレオチド配列を含む、請求項158または159記載の方法。
[請求項162]
EボックスモチーフとMAPJD/HAT複合体およびMAPJD/MYC複合体からなる群より選択される複合体との間の結合に対する阻害物質をスクリーニングするためのキットであって、
(a) MAPJDポリペプチドまたはその機能的同等物およびHAT複合体またはMYCを発現する細胞であって、該細胞が転写調節領域と該転写調節領域の制御下で発現されるレポーター遺伝子とを含むベクターでトランスフェクションされ、かつ該転写調節領域がEボックスモチーフを含む、細胞、ならびに
(b) レポーター遺伝子の発現レベルまたは活性を検出するための試薬
を含む、キット。
[請求項163]
肺癌の治療または予防に有用な化合物をスクリーニングするためのキットであって、
(a) MAPJDポリペプチドまたはその機能的同等物およびHAT複合体またはMYCを発現する細胞であって、該細胞が転写調節領域と該転写調節領域の制御下で発現されるレポーター遺伝子とを含むベクターでトランスフェクションされ、かつ該転写調節領域がEボックスモチーフを含む、細胞、ならびに
(b) レポーター遺伝子の発現レベルまたは活性を検出するための試薬
を含む、キット。
[請求項164]
ABL1を介したWRNIP1のリン酸化の調節物質をスクリーニングする方法であって、
(a) 試験化合物を、FGFR1OPポリペプチドまたはその機能的同等物、WRNIP1ポリペプチドまたはその機能的同等物、およびABL1ポリペプチドまたはその機能的同等物に、WRNIP1ポリペプチドのリン酸化に適した条件で接触させる段階;
(b) WRNIP1ポリペプチドまたはその機能的同等物のリン酸化レベルを検出する段階;ならびに
(c) 試験化合物の非存在下で検出された対照リン酸化レベルと比較して、リン酸化されていると段階(b)において検出された、リン酸化レベルを増大させる試験化合物を促進物質として選択する段階;試験化合物の非存在下で検出された対照リン酸化レベルと比較して、リン酸化されていると段階(b)において検出された、リン酸化レベルを低下させる試験化合物を阻害物質として選択する段階
を含む、方法。
[請求項165]
肺癌を治療または予防するのに有用な化合物をスクリーニングする方法であって、
(a) 試験化合物を、FGFR1OPポリペプチドまたはその機能的同等物、WRNIP1ポリペプチドまたはその機能的同等物、およびABL1ポリペプチドまたはその機能的同等物に、WRNIP1ポリペプチドのリン酸化に適した条件で接触させる段階;
(b) WRNIP1ポリペプチドまたはその機能的同等物のリン酸化レベルを検出する段階;ならびに
(c) 試験化合物の非存在下で検出された対照リン酸化レベルと比較して、リン酸化されていると段階(b)において検出された、リン酸化レベルを増大させる試験化合物を選択する段階
を含む、方法。
[請求項166]
ABL1を介したWRNIP1リン酸化の調節物質をスクリーニングする方法であって、
(a) 試験化合物を、FGFR1OPポリペプチドまたはその機能的同等物、WRNIP1ポリペプチドまたはその機能的同等物、およびABL1ポリペプチドまたはその機能的同等物を発現する細胞に接触させる段階、
(b) WRNIP1ポリペプチドまたはその機能的同等物のリン酸化レベルを検出する段階、ならびに
(c) 試験化合物の非存在下で検出された対照リン酸化レベルと比較して、リン酸化されていると段階(b)において検出された、リン酸化レベルを増大させる試験化合物を促進物質として選択する段階;試験化合物の非存在下で検出された対照リン酸化レベルと比較して、リン酸化されていると段階(b)において検出された、リン酸化レベルを低下させる試験化合物を阻害物質として選択する段階
を含む、方法。
[請求項167]
肺癌を治療または予防するのに有用な化合物をスクリーニングする方法であって、
(a) 試験化合物を、FGFR1OPポリペプチドまたはその機能的同等物、WRNIP1ポリペプチドまたはその機能的同等物、およびABL1ポリペプチドまたはその機能的同等物を発現する細胞に接触させる段階;
(b) WRNIP1ポリペプチドまたはその機能的同等物のリン酸化レベルを検出する段階;ならびに
(c) 試験化合物の非存在下で検出された対照リン酸化レベルと比較して、リン酸化されていると段階(b)において検出された、リン酸化レベルを増大させる試験化合物を選択する段階
を含む、方法。
[請求項168]
ABL1を介したWRNIP1リン酸化の調節物質をスクリーニングするためのキットであって、
(a) FGFR1OPポリペプチドまたはその機能的同等物、WRNIP1ポリペプチドまたはその機能的同等物、およびABL1ポリペプチドまたはその機能的同等物を発現する細胞、ならびに
(b) WRNIP1ポリペプチドまたはその機能的同等物のリン酸化レベルを検出するための試薬
を含む、キット。
[請求項169]
肺癌の治療または予防に有用な化合物をスクリーニングするためのキットであって、
(a) FGFR1OPポリペプチドまたはその機能的同等物、WRNIP1ポリペプチドまたはその機能的同等物、およびABL1ポリペプチドまたはその機能的同等物を発現する細胞、ならびに
(b) WRNIP1ポリペプチドまたはその機能的同等物のリン酸化レベルを検出するための試薬
を含む、キット。
[請求項170]
以下からなる群より選択される作用物質または化合物を対象に投与する段階を含む、対象において肺癌を治療または予防する方法:
(a) 標的分子とパートナー分子との間の結合を阻害する作用物質であって、標的分子とそのパートナー分子の組み合わせがKIF4A/ZNF549、KIF4A/ZNF553、MAPJD/MYC、FGFR1OP/WRNIP1、およびFGFR1OP/ABL1からなる群より選択される、作用物質、
(b) HAT複合体に結合したMAPJDポリペプチドによるヒストンH4のアセチル化を阻害する作用物質、
(c) HAT複合体またはMYCに結合したMAPJDポリペプチドとEボックスモチーフを含むポリヌクレオチドとの間の結合を阻害する作用物質、ならびに
(d) ABL1ポリペプチドによるWRBIP1ポリペプチドのリン酸化を促進する作用物質。
[請求項171]
有効成分としての、請求項152、158、162、および166のいずれか一項記載の方法によって選択された化合物の薬学上有効量、ならびに薬学的に許容される担体を含む、肺癌を治療または予防するための組成物。
[請求項172]
以下からなる群より選択される作用物質または化合物の使用:
(a) 標的分子とパートナー分子との間の結合を阻害する作用物質であって、標的分子とそのパートナー分子の組み合わせがKIF4A/ZNF549、KIF4A/ZNF553、MAPJD/MYC、FGFR1OP/WRNIP1、およびFGFR1OP/ABL1からなる群より選択される作用物質、
(b) HAT複合体に結合したMAPJDポリペプチドによるヒストンH4のアセチル化を阻害する作用物質、
(c) HAT複合体またはMYCに結合したMAPJDポリペプチドとEボックスモチーフを含むポリヌクレオチドとの間の結合を阻害する作用物質、ならびに
(d) ABL1ポリペプチドによるWRBIP1ポリペプチドのリン酸化を促進する作用物質。
[請求項173]
(a) SEQ ID NO: 59(FGFR1OP)のSEQ ID NO: 98(コドン番号7〜173)、SEQ ID NO: 57(NPTX1)の(コドン番号20〜145)、またはSEQ ID NO: 57(NPTX1)のSEQ ID NO: 100(コドン番号297〜430)からなる群より選択される抗原ペプチドによって動物を免疫する段階;および
(b) 段階(a)の抗原ペプチドに特異的に結合する抗体を選択する段階
を含む方法によって産生される、抗体。