【手続補正書】
【提出日】平成21年12月1日(2009.12.1)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
Ｔ細胞急性リンパ性白血病（Ｔ−ＡＬＬ）または急性骨髄性白血病サブタイプＭ０／１（ＡＭＬ−Ｍ０／１）の予防および／または治療のための候補化合物を識別する方法であって、
前記試験化合物の存在下で、ＤＯＴ１Ｌポリペプチドを、ヒストンＨ３を含むヒストンまたはヌクレオソーム基質と接触させるステップと、
ヒストンＨ３リジン７９（Ｈ３−Ｋ７９）メチル化をもたらすのに十分な条件下で、基質のＨ３−Ｋ７９メチル化を検出するステップと、
を含み、
前記試験化合物の非存在下でのＨ３−Ｋ７９メチル化のレベルと比較した、前記試験化合物存在下での、Ｈ３−Ｋ７９メチル化の減少が、前記試験化合物がＴ−ＡＬＬまたはＡＭＬサブタイプＭ０／１の予防および／または治療のための候補化合物であることを示す方法。
【請求項２】
Ｔ細胞急性リンパ性白血病（Ｔ−ＡＬＬ）または急性骨髄性白血病サブタイプＭ０／１（ＡＭＬ−Ｍ０／１）の予防および／または治療のための候補化合物を識別する方法であって、
ＤＯＴ１ＬポリペプチドがＡＦ１０に結合するのに十分な条件下で、ＤＯＴ１ＬポリペプチドをＡＦ１０と接触させるステップと、
前記ＤＯＴ１ＬポリペプチドとＡＦ１０の間の相互作用を検出するステップと
を含み、
前記試験化合物の非存在下での結合のレベルと比較した、前記試験化合物存在下での、ＤＯＴ１ＬポリペプチドとＡＦ１０との間の相互作用の減少は、前記試験化合物がＴ−ＡＬＬまたはＡＭＬサブタイプＭ０／１の予防および／または治療のための候補化合物であることを示す方法。
【請求項３】
対象が白血病を有するかどうかもしくは白血病を発症する危険があるかどうかを診断し、かつ／または前記疾患の経過に関する予後を決定するインビトロの方法であって、
ヌクレオソームを含む、前記対象から取得された生物学的試料中のＨｏｘＡ５遺伝子と関連するヒストンＨ３リジン７９（Ｈ３−Ｋ７９）メチル化を検出するステップと
を含み、
非白血病生物学的試料中のＨｏｘＡ５関連Ｈ３−Ｋ７９メチル化のレベルと比較した、生物学的試料中のＨｏｘＡ５関連Ｈ３−Ｋ７９メチル化の増加が、前記対象が白血病を有することもしくは白血病を発症する危険があることの診断指標となり、かつ／または前記対象における疾患の経過の予後指標となる、方法。
【請求項４】
前記生物学的試料が細胞試料または組織試料である、請求項３に記載の方法。
【請求項５】
前記生物学的試料がＢ細胞試料または骨髄試料である、請求項３に記載の方法。
【請求項６】
前記生物学的試料がヌクレオソーム調製物である、請求項３に記載の方法。
【請求項７】
前記ＨｏｘＡ５遺伝子と関連するヒストンＨ３リジン４メチル化を検出することをさらに含む、請求項３〜６のいずれかに記載の方法。
【請求項８】
前記ＨｏｘＡ５プロモーターのＨ３−Ｋ７９メチル化が決定される、請求項３〜６のいずれかに記載の方法。
【請求項９】
対象が白血病を有するかどうかもしくは白血病を発症する危険があるかどうかを診断し、かつ／または前記疾患の経過に関する予後を決定するインビトロの方法であって、対象から取得された生物学的試料中のＨｏｘＡ５プロモーター活性を決定するステップを含む方法。
【請求項１０】
白血病の予防および／または治療のための候補化合物を識別する方法であって、
ＤＯＴ１ＬポリペプチドがＣＡＬＭ−ＡＦ１０融合タンパク質に結合するのに十分な条件下で、試験化合物の存在下で、ＤＯＴ１ＬポリペプチドをＣＡＬＭ−ＡＦ１０融合タンパク質と接触させるステップと、
ＤＯＴ１ＬポリペプチドとＣＡＬＭ−ＡＦ１０融合タンパク質の間の相互作用を検出するステップと
を含み、
前記試験化合物の非存在下での相互作用のレベルと比較した、前記試験化合物存在下での、ＤＯＴ１ＬポリペプチドとＣＡＬＭ−ＡＦ１０融合タンパク質の間の相互作用の減少が、前記試験化合物が白血病の予防および／または治療のための候補化合物であることを示す、方法。
【請求項１１】
ＤＯＴ１ＬポリペプチドのＣＡＬＭ−ＡＦ１０融合タンパク質との相互作用が、
（ｉ）ＤＯＴ１ＬポリペプチドとＣＡＬＭ−ＡＦ１０の間の結合を決定すること、
（ｉｉ）ＣＡＬＭ−ＡＦ１０の核局在化を決定すること、
（ｉｉｉ）ＨｏｘＡ５のヒストンＨ３リジン７９（Ｈ３−Ｋ７９）メチル化を決定することであって、任意選択的に前記ＨｏｘＡ５プロモーターの前記Ｈ３−Ｋ７９メチル化が決定されること、または
（ｉｖ）ＨｏｘＡ５プロモーター活性を決定すること
によって評価される、請求項１０に記載の方法。
【請求項１２】
白血病の予防および／または治療のための候補化合物を識別する方法であって、
試験化合物がＣＡＬＭ−ＡＦ１０融合タンパク質に結合するのに十分な条件下で、ＣＡＬＭ−ＡＦ１０融合タンパク質を前記試験化合物と接触させるステップと、
前記試験化合物とＣＡＬＭ−ＡＦ１０融合タンパク質の間の結合を検出するステップと
を含み、
ＣＡＬＭ−ＡＦ１０融合タンパク質への前記試験化合物の結合が、前記試験化合物が白血病の予防および／または治療のための候補化合物であることを示す方法。
【請求項１３】
白血病の予防および／または治療のための候補化合物を識別する方法であって、
（ｉ）ＣＡＬＭポリペプチドもしくはＣＡＬＭ−ＡＦ１０融合タンパク質がＨｏｘＡ５プロモーターに結合するのに十分な条件下、または（ｉｉ）ＤＯＴ１ＬポリペプチドとＣＡＬＭ−ＡＦ１０融合タンパク質が複合体を形成し、前記複合体がＨｏｘＡ５プロモーターに結合するのに十分な条件下で、試験化合物の存在下で、ＨｏｘＡ５プロモーター領域を含む核酸を（ｉ）ＣＡＬＭポリペプチドもしくはＣＡＬＭ−ＡＦ１０融合タンパク質、または（ｉｉ）ＤＯＴ１ＬポリペプチドおよびＣＡＬＭ−ＡＦ１０融合タンパク質と接触させるステップと、
（ｉ）前記ＣＡＬＭポリペプチドもしくはＣＡＬＭ−ＡＦ１０融合タンパク質の前記ＨｏｘＡ５プロモーターとの相互作用、または（ｉｉ）前記ＤＯＴ１Ｌ／ＣＡＬＭ−ＡＦ１０複合体の前記ＨｏｘＡ５プロモーターとの相互作用を検出するステップと
を含み、
前記試験化合物の非存在下での相互作用のレベルと比較した、前記試験化合物存在下での、（ｉ）ＣＡＬＭポリペプチドもしくはＣＡＬＭ−ＡＦ１０融合タンパク質とＨｏｘＡ５プロモーターとの相互作用、または（ｉｉ）前記ＤＯＴ１Ｌ／ＣＡＬＭ−ＡＦ１０複合体の前記ＨｏｘＡ５プロモーターとの相互作用の減少が、前記試験化合物が白血病の予防および／または治療のための候補化合物であることを示す方法。
【請求項１４】
白血病の予防および／または治療のための候補化合物を識別する方法であって、
試験化合物がＨｏｘＡ５プロモーター領域および／またはＨｏｘＡ５遺伝子の他の任意の部分に結合するのに十分な条件下で、前記ＨｏｘＡ５プロモーター領域および／またはＨｏｘＡ５遺伝子の他の任意の部分を含む核酸を前記試験化合物と接触させるステップと、
前記試験化合物と前記ＨｏｘＡ５プロモーターおよび／またはＨｏｘＡ５遺伝子の他の任意の部分の間の結合を検出するステップと
を含み、
前記試験化合物と前記ＨｏｘＡ５プロモーターおよび／またはＨｏｘＡ５遺伝子の他の任意の部分の間の結合が、前記試験化合物が白血病の予防および／または治療のための候補化合物であることを示す方法。
【請求項１５】
白血病の予防および／または治療のための候補化合物を識別する方法であって、
ＨｏｘＡ５プロモーター活性にとって十分な条件下で、ＨｏｘＡ５プロモーター領域を含む核酸を試験化合物と接触させるステップと、
ＨｏｘＡ５プロモーター活性を検出するステップと
を含み、
前記試験化合物の非存在下での前記ＨｏｘＡ５プロモーター活性のレベルと比較した、前記試験化合物存在下での前記ＨｏｘＡ５プロモーター活性の減少が、前記試験化合物が白血病の予防および／または治療のための候補化合物であることを示す方法。
【請求項１６】
前記核酸が前記ＨｏｘＡ５遺伝子のエクソン１をさらに含む、請求項１３〜１５のいずれかに記載の方法。
【請求項１７】
前記核酸が前記ＨｏｘＡ５遺伝子のエクソン１とエクソン２の間のイントロンをさらに含む、請求項１３〜１６のいずれかに記載の方法。
【請求項１８】
前記核酸が前記ＨｏｘＡ５遺伝子のエクソン２をさらに含む、請求項１３〜１７のいずれかに記載の方法。
【請求項１９】
前記ＤＯＴ１Ｌ／ＣＡＬＭ−ＡＦ１０複合体の前記ＨｏｘＡ５プロモーターとの相互作用が、前記ＨｏｘＡ５プロモーターへの前記ＤＯＴ１Ｌ／ＣＡＬＭ−ＡＦ１０複合体の結合を決定することによって評価される、請求項１３に記載の方法。
【請求項２０】
ＤＯＴ１Ｌ／ＣＡＬＭ−ＡＦ１０複合体の前記ＨｏｘＡ５プロモーターとの相互作用が、前記ＨｏｘＡ５プロモーターのヒストンＨ３リジン７９（Ｈ３−Ｋ７９）メチル化を決定することによって評価される、請求項１３に記載の方法。
【請求項２１】
前記ＤＯＴ１Ｌ／ＣＡＬＭ−ＡＦ１０複合体の前記ＨｏｘＡ５プロモーターとの相互作用が、前記ＨｏｘＡ５プロモーター活性を決定することによって評価される、請求項１３に記載の方法。
【請求項２２】
前記ＨｏｘＡ５プロモーターがレポーター分子をコードするヌクレオチド配列と作動可能に関連し、ＨｏｘＡ５プロモーター活性が前記レポーター分子を検出することによって決定される、請求項１１、１３、および１５のいずれかに記載の方法。
【請求項２３】
前記レポーター分子がポリペプチドである、請求項２２に記載の方法。
【請求項２４】
前記ポリペプチドが酵素である、請求項２３に記載の方法。
【請求項２５】
無細胞アッセイとして行われる、請求項１０〜１５のいずれかに記載の方法。
【請求項２６】
細胞に基づくアッセイとして行われる、請求項１０〜１５のいずれかに記載の方法。
【請求項２７】
前記ＤＯＴ１Ｌポリペプチドおよび／またはＣＡＬＭ−ＡＦ１０融合タンパク質が核酸から発現される、請求項１０〜１３のいずれかに記載の方法。
【請求項２８】
前記白血病がＴ細胞急性リンパ性白血病（Ｔ−ＡＬＬ）または急性骨髄性白血病サブタイプＭ０／１（ＡＭＬ−Ｍ０／１）である、請求項３〜１５のいずれかに記載の方法。