(57)【要約】  本発明は、１７９位にプロリンとは異なるアミノ酸を有するｅｐｓｐシンターゼをコードする内因性アレルを含むベータ・ブルガリス植物を植える又はベータ・ブルガリス種子を播種するステップ、成長中の植物にグリホサート除草剤を適用するステップを含む、ベータ・ブルガリス（Beta vulgaris）成長エリアにおいて抽臺株を防除するための方法に関する。【特許請求の範囲】
【請求項１】
テンサイ成長エリアにおいて抽臺株を防除するための方法であって、
ａ）プロリンとは異なるアミノ酸を１７９位に有するｅｐｓｐシンターゼをコードする内因性アレルを含むテンサイ植物を植える又はテンサイ種子を播種するステップ、
ｂ）成長している植物にグリホサート除草剤を適用するステップ、及び
ｃ）任意に、成長期にステップｂ）を繰り返すステップ
を含む、前記方法。
【請求項２】
ｅｐｓｐシンターゼをコードする内因性アレルが、セリン、トレオニン、アラニン及びロイシンからなる群から選択されるアミノ酸を１７９位に有し、好ましくはアミノ酸が、セリンである、請求項１に記載の方法。
【請求項３】
プロリンとは異なるアミノ酸を１７９位に有するｅｐｓｐシンターゼが、
ｉ）配列番号３の配列、
ｉｉ）セリン及びプロリンとは異なるアミノ酸を１７９位に有するｉ）の配列、又は
ｉｉｉ）好ましくは前記配列の全長にわたって、ｉ）又はｉｉ）の配列に対して少なくとも９０％の同一性を有する配列
から選択されるアミノ酸配列を含む、請求項１又は２に記載の方法。
【請求項４】
プロリンとは異なるアミノ酸を１７９位に有するｅｐｓｐシンターゼをコードする内因性アレルが、
ｉ）配列番号１の配列、
ｉｉ）配列番号２の配列をコードするものを有する配列、
ｉｉｉ）アミノ酸１７９位に対応し、セリン及びプロリンとは異なるアミノ酸をコードするヌクレオチドを有するｉ）又はｉｉ）の配列、
ｉｖ）好ましくは前記配列の全長にわたって、ｉ）、ｉｉ）又はｉｉｉ）の配列に対して少なくとも９０％の同一性を有する配列、又は
ｖ）請求項３に記載のｅｐｓｐシンターゼをコードするヌクレオチド配列、
から選択されるヌクレオチド配列を含む、請求項１から３までのいずれか１項に記載の方法。
【請求項５】
ｅｐｓｐシンターゼをコードする内因性アレルが、さらに１７５位にトレオニンとは異なるアミノ酸を有し、好ましくはアミノ酸がイソロイシンである、請求項１から４までのいずれか１項に記載の方法。
【請求項６】
ステップｂ）において、少なくとも３００ｇ／ｈａのグリホサート酸当量、好ましくは少なくとも６００ｇ／ｈａのグリホサート酸当量、より好ましくは少なくとも１２００ｇ／ｈａのグリホサート酸当量を、成長している植物に適用する、請求項１から５までのいずれか１項に記載の方法。
【請求項７】
さらにテンサイ植物又はテンサイ種子が、トリプトファンとは異なるアミノ酸を５６９位に有するアセトラクテートシンターゼ（ＡＬＳ）をコードする内因性アレルを含み、好ましくはアミノ酸が、アラニン、グリシン、イソロイシン、ロイシン、メチオニン、フェニルアラニン、プロリン、バリン又はアルギニンから選択され、好ましくはアミノ酸がロイシンである、請求項１から５までのいずれか１項に記載の方法。
【請求項８】
アセトラクテートシンターゼをコードする内因性アレルが、さらにプロリンとは異なるアミノ酸を１８８位に有し、好ましくはアミノ酸が、セリン、トレオニン、アルギニン、ロイシン、グルタミン、アラニンからなる群から選択され、より好ましくはアミノ酸がセリンである、請求項７に記載の方法。
【請求項９】
さらに、
ａ）成長期前又は成長期後に、請求項７又は８に記載のアセトラクテートシンターゼをコードする内因性遺伝子を含むテンサイ植物を植えること又はテンサイ種子を播種すること、
ｂ）植物の成長中にＡＬＳ阻害剤を適用すること、及び
ｃ）任意にさらに成長期中にステップｂ）を繰り返すこと
を含む、請求項１から８までのいずれか１項に記載の方法。
【請求項１０】
テンサイ栽培エリアにおいてテンサイを生産するための方法であって、
ａ）請求項１から９までのいずれか１項に記載の方法を実施するステップ、及び
ｂ）テンサイを収穫するステップ
を含む、前記方法。
【請求項１１】
グリホサート耐性テンサイ植物を提供するための方法であって、
ａ）少なくとも０．５％ＥＭＳ又は少なくとも０．３％ＥＮＵでテンサイの細胞又は組織を変異誘発するステップ、
ｂ）変異誘発させた細胞又は組織（Ｍ０）から挿木を生成するステップ、
ｃ）種子（Ｍ１）の集団を生産するために挿木を植え替えるステップ、
ｄ）Ｍ１種子から育てられた植物から種子（Ｍ２）を生産するステップ、
ｅ）Ｍ２種子を播種し、少なくとも６００ｇ／ｈａのグリホサート有効成分を成長中の植物に適用するステップ、
ｆ）任意に、生き残った植物を鉢に植え替え、少なくとも６００ｇ／ｈａのグリホサート有効成分を成長中の植物に適用するステップ、及び
ｇ）除草剤による損傷のない生き残った植物を選択するステップ
を含む、前記方法。
【請求項１２】
請求項１１に記載の方法によって得られるグリホサート耐性のテンサイ植物又は植物部位。
【請求項１３】
プロリンとは異なるアミノ酸を１７９位に有するｅｐｓｐシンターゼをコードする内因性アレルを含むテンサイ植物又は植物部位。
【請求項１４】
糖を生成するための方法であって、
ａ）請求項１２又は１３に記載のビート植物の根ビートを提供すること、
ｂ）前記根ビートから糖を抽出すること
を含む、前記方法。
【請求項１５】
糖の生産、嫌気性消化もしくは発酵の方法における、又は糖、バイオガスもしくはバイオ燃料の生産における、請求項１２又は１３に記載のテンサイ植物又は植物部位の使用。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
本発明は、ベータ・ブルガリス（Beta vulgaris）栽培エリアにおける、雑草ビート（ｗｅｅｄ ｂｅｅｔｓ）、例えば一年生ビート又は抽臺株（ｂｏｌｔｅｒｓ）を防除するための方法に関する。
【０００２】
背景技術
雑草ビートは、本来はテンサイとハマフダンソウとの交配から開発された野生型ビートの人里型であり、栽培したビートと野生型の系統との間に障壁がないため、作物／野生型の交配が生じうる。半年ごとに生育する栽培したテンサイとは対照的に、雑草ビートは本質的に一年生植物であり、最初の年に既に抽臺し、開花する傾向がある。一年生のアレルが顕性であるため、一年生の雑草と二年生のテンサイとの相互交雑は、一年生の雑種をもたらす。抽臺した雑草ビートは、多数の種を植え付けることができる。１つの抽臺株で２万もの種子を生成できる。雑草ビートによって植え付けられたほとんどの種子は発芽して再び抽臺株になった。さらに、抽臺株は、その畑の土壌に種子の貯蔵場を作り、何年も生き残ることができる。
【０００３】
雑草ビートは、多くの国におけるテンサイ作物においてますます問題となっている。例えばイギリスでは、現在、テンサイ畑の約８０％に雑草の種が蔓延している。畑の雑草ビートの密度が増加することにより、根及び糖の収量が徐々に減少した。それぞれ雑草ビート植物／ｍ2について平均１１．７％未満では収量の損失がない雑草ビートの閾値密度の兆候はない。これは、根の作物の抽臺株から生じる報告された損失と同様である、最大１００％の根作物における抽臺した雑草ビートの１％について平均０．６％の糖収量の損失に相当する。
【０００４】
他の作物における防除は、選択的除草剤を使用して達成できるが、テンサイにおいては、多くが一年生である雑草ビートは簡単に防除できず、しばしば作物と競合する。現在、雑草の防除は費用がかかり困難である。雑草管理は、畑の雑草ビートの数及び種子の貯蔵場の種子の数、つまり土壌中の発芽していない種子の数の双方を減らす戦略を含める必要がある。雑草ビートは、テンサイと同種であるため、実生及びロゼットは、抽臺するまで同じように見える。テンサイに対して安全に使用できるあらゆる除草剤は、雑草と同系統のものに効果はない。現在、最も効果的だが非常に時間及び費用がかかる雑草ビートを防除して許容レベルまで減らす方法は、雑草が抽臺するまで待ち、その後手作業で一度に１つずつ駆除することである。
【０００５】
したがって、なかでも雑草ビート又は抽臺株を防除するための改善させた方法を提供する差し迫った必要性がある。本発明は、この問題を解決することを目的とする。
【０００６】
発明の要約
本発明者らは、ベータ・ブルガリス、特にテンサイの栽培範囲における抽臺株（又は雑草ビート）を防除し、それによってこれらの範囲の収量を増加させる方法を開発した。重要な要素の１つは、グリホサート耐性の新たなベータ・ブルガリス植物、特にテンサイの提供である。この除草剤耐性形質は、国際公開第２００４／０７４４９２号（ＷＯ ２００４／０７４４９２ Ａ１）に開示されているテンサイのようなゲノムのトランスジェニック修飾に依存せず、変異誘発物質の使用によって作成されるような内因性ｅｐｓｐシンターゼ遺伝子における単一点変異に依存する。このような変異体ベータ・ブルガリス植物は、遺伝子組み換え生物（ＧＭＯ）とは見なされない。したがって、公有地での受け入れは高く、かかる植物の商業化に関する法的制限は最小限である。
【０００７】
さらに、特定の実施形態において、本発明の方法は、最近市場に参入した他の除草剤耐性テンサイも利用する（国際公開第２０１２／０４９２６８号（ＷＯ ２０１２／０４９２６８ Ａ１））。これらのテンサイ植物は、ＡＬＳ阻害剤と言われる他の除草剤クラスへの耐性を付与する内因性アセトラクテート遺伝子において点変異を保有する。
【０００８】
本発明は、特に、参照により本明細書に明示的に組み込まれる添付の特許請求の範囲によって捕捉される。
【０００９】
一態様において、本発明は、改変させたｅｐｓｐシンターゼをコードする改変させた内因性アレルを含むテンサイ植物を植えること又はテンサイ種子を成長させること、及び成長中の植物にグリホサート除草剤を適用することを含む、テンサイ栽培地域における抽臺株及び他の望ましくない植生を防除するための方法に関する。
【００１０】
より具体的には、前記方法は、ａ）プロリンとは異なるアミノ酸を１７９位に有するｅｐｓｐシンターゼをコードする内因性アレルを含むテンサイ植物を植える又はテンサイ種子を播種するステップ、ｂ）成長中の植物にグリホサート除草剤を適用するステップ、及びｃ）任意に、成長期にステップｂ）を繰り返すステップを含む。
【００１１】
さらなる態様において、本発明は、ａ）前記方法のステップを実施するステップ、及びｂ）テンサイを収穫するステップを含む、テンサイ栽培エリアにおいてテンサイを生産するための方法に関する。
【００１２】
さらなる態様において、本発明は、ａ）少なくとも０．５％ＥＭＳ又は少なくとも０．３％ＥＮＵでテンサイの細胞又は組織を変異誘発するステップ、ｂ）変異誘発させた細胞又は組織（Ｍ０）から挿木（ｓｔｅｃｋ）を生成するステップ、ｃ）種子（Ｍ１）の集団を生産するために挿木を植え替えるステップ、ｄ）Ｍ１種子から育てられた植物から種子（Ｍ２）を生産するステップ、ｅ）Ｍ２種子を播種し、少なくとも６００ｇ／ｈａのグリホサート有効成分を成長中の植物に適用するステップ、ｆ）任意に、生き残った植物を鉢に植え替え、少なくとも６００ｇ／ｈａのグリホサート有効成分を成長中の植物に適用するステップ、及びｇ）除草剤による損傷のない生き残った植物を選択するステップを含む、グリホサート耐性テンサイ植物を提供するための方法に関する。
【００１３】
さらなる態様において、本発明は、プロリンとは異なるアミノ酸を１７９位に有するｅｐｓｐシンターゼをコードする内因性アレルを含むテンサイ植物又は植物部位に関する。
【００１４】
さらなる態様において、本発明は、ａ）前記した本発明によるビート植物のビート根を提供すること、ｂ）前記ビート根から糖を抽出することを含む、糖を生産するための方法に関する。
【００１５】
さらなる態様において、本発明は、糖の生産、嫌気性消化、又は発酵の方法における、前記した本発明によるテンサイ植物の植物部位の使用に関する。
【００１６】
さらなる態様において、本発明は、糖、バイオガス、又はバイオ燃料の生産の方法における、前記した本発明によるテンサイ植物の植物部位の使用に関する。
【００１７】
さらなる態様において、本発明は、テンサイ植物又は植物部位において、プロリンとは異なるアミノ酸を１７９位に有するｅｐｓｐシンターゼをコードする内因性アレルを同定することを含む方法に関する。
【００１８】
発明の詳細な説明
本発明のシステム及び方法を説明する前に、本発明は、記載した特定のシステム及び方法又は組み合わせに限定されないことを理解すべきである。それというのも、かかるシステム及び方法及び組み合わせは、もちろん変化しうるからである。本発明の範囲は添付の特許請求の範囲によってのみ制限されるため、本明細書において使用される用語は制限することを意図するものではないことも理解すべきである。
【００１９】
本明細書において使用されるように、単数形「ａ」、「ａｎ」及び「ｔｈｅ」は、特に本明細書において明らかに示されない限り、単数形及び複数形の双方の指示対象を含む。
【００２０】
本明細書において使用される「含有している（ｃｏｍｐｒｉｓｉｎｇ）」、「含有する（ｃｏｍｐｒｉｓｅｓ）」及び「から構成される（ｃｏｍｐｒｉｓｅｄ ｏｆ）」という用語は、「含んでいる（ｉｎｃｌｕｄｉｎｇ）」、「含む（ｉｎｃｌｕｄｅｓ）」又は「含んでいる（ｃｏｎｔａｉｎｉｎｇ）」、「含む（ｃｏｎｔａｉｎｓ）」と同義であり、かつ包括的又は範囲を設定しないものであり、追加の引用されていない集団要素、要素又は方法ステップを除外するものではない。本明細書で使用される「含有している（ｃｏｍｐｒｉｓｉｎｇ）」、「含有する（ｃｏｍｐｒｉｓｅｓ）」及び「から構成される（ｃｏｍｐｒｉｓｅｄ ｏｆ）」という用語は、「からなっている（ｃｏｎｓｉｓｔｉｎｇ ｏｆ）」、「なる（ｃｏｎｓｉｓｔｓ）」及び「からなる（ｃｏｎｓｉｓｔｓ ｏｆ）」という用語、並びに「実質的にからなっている（ｃｏｎｓｉｓｔｉｎｇ ｅｓｓｅｎｔｉａｌｌｙ ｏｆ）」、「実質的になる（ｃｏｎｓｉｓｔｓ ｅｓｓｅｎｔｉａｌｌｙ）」、「実質的にからなる（ｃｏｎｓｉｓｔｓ ｅｓｓｅｎｔｉａｌｌｙ ｏｆ）」という用語を含むことが理解されよう。
【００２１】
端点による数値範囲の列挙は、それぞれの範囲内に包含される全ての数値及び分数、並びに列挙された端点を含む。
【００２２】
測定可能な値、例えばパラメータ、量、時間継続時間等を示す場合に本明細書において使用される「約」又は「およそ」という用語は、指定された値の＋／−２０％以下、好ましくは＋／−１０％以下、より好ましくは＋／−５％以下、さらにより好ましくは＋／−１％以下の変動を、かかる変動が開示された発明において実施するために適切である限り包含することを意味する。「約」又は「おおよそ」という修飾語が参照する値は、それ自体も具体的に及び好ましくは開示されることを理解されたい。
【００２３】
「１つ以上」又は「少なくとも１つ」という用語、例えば集団要素の群の１つ以上又は少なくとも１つの集団要素は、それ自体は明確であり、さらなる例示によって、この用語は、とりわけ、前記集団要素のいずれか１つ、又は前記集団要素の任意の２つ以上、例えば、前記集団要素の任意の≧３、≧４、≧５、≧６又は≧７等、及び前記集団要素の全てに対する言及を包含する。
【００２４】
本明細書において引用される全ての参考文献は、参照をもってその全体を本明細書に組み込まれたものとする。特に、本明細書において具体的に言及される全ての参考文献の教示は、参照により組み込まれたものとする。
【００２５】
特に定義されない限り、技術用語及び科学用語を含む本発明を開示する際に使用される全ての用語は、本発明が属する当業者によって一般に理解される意味を有する。さらなる指図によって、本発明の教示をよりよく理解するために用語の定義が含まれる。
【００２６】
組換えＤＮＡ技術の一般原則を説明する標準的な参考書は、以下の分子クローニングを含む：A Laboratory Manual, 2nd ed., vol. 1-3, ed. Sambrookら, Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, N.Y., 1989；Current Protocols in Molecular Biology, ed. Ausubelら, Greene Publishing and Wiley-Interscience, New York, 1992 (with periodic updates) (“Ausubelら 1992”)；the series Methods in Enzymology (Academic Press, Inc.)；Innisら, PCR Protocols：A Guide to Methods and Applications, Academic Press：San Diego, 1990；PCR 2：A Practical Approach (M.J. MacPherson, B.D. Hames and G.R. Taylor eds. (1995)；Harlow and Lane, eds. (1988) Antibodies, a Laboratory Manual；及びAnimal Cell Culture (R.I. Freshney, ed. (1987)。微生物学の一般原則は、例えば、Davis, B. D. ら, Microbiology, 3rd edition, Harper & Row, publishers, Philadelphia, Pa. (1980)において示されている。
【００２７】
以下の節において、本発明の異なる態様を、より詳細に定義する。そのように定義されたそれぞれの態様は、反対に明確に示されない限り、他の態様と組み合わせてよい。特に、好ましい又は有利であると示される任意の特徴は、好ましい又は有利であると示される任意の他の特徴又は複数の特徴と組み合わせてよい。
【００２８】
本明細書全体を通して「一実施形態」又は「実施形態」についての言及は、実施形態に関連して記載した特定の特徴、構造又は特性が、本発明の少なくとも１つの実施形態に含まれることを意味する。したがって、本明細書全体を通して種々の箇所での「一実施形態において」又は「実施形態において」という句の出現は、必ずしも全てが同一の実施形態を示すとは限らないが、そうであってよい。さらに、特定の特徴、構造又は特性を、１つ又は複数の実施形態において、本開示から当業者に明らかであるように、任意の適した方法で組み合わせてよい。さらに、本明細書において記載したいくつかの実施形態は、他の実施形態に含まれる他の特徴ではなくいくつかの特徴を含むが、異なる実施形態の特徴の組み合わせは、本発明の範囲内にあり、かつ当業者により理解されるように、異なる実施形態を形成することを意味する。例えば、添付の特許請求の範囲において、請求した実施形態のいずれかは、任意の組み合わせで使用できる。
【００２９】
本発明の範囲から逸脱することなく、他の実施形態を利用してよく、構造的変更又は論理的変更を行ってよいことを理解すべきである。したがって、以下の詳細な説明は、限定的な意味で解釈されるべきではなく、本発明の範囲は、添付の特許請求の範囲によって定義される。
【００３０】
本発明の好ましい主張（特徴）及び実施形態は、本明細書において以下に挙げられる。そのように定義された本発明のそれぞれの主張及び実施形態は、反対に明確に示されない限り、他の主張及び／又は実施形態と組み合わせてよい。特に、好ましい又は有利であると示される任意の特徴は、好ましい又は有利であると示される任意の他の特徴又は複数の特徴もしくは主張と組み合わせてよい。本明細書において、本発明は、特に、以下の番号付けられた態様及び実施形態１〜４８のうちの１つ以上と、他の任意の主張及び／又は実施形態との任意の１つ以上の組み合わせによって捕捉される。
【００３１】
１．  テンサイ栽培エリアにおける抽臺株、雑草ビート又は一年生ビートを防除するための、又はベータ・ブルガリス（Beta vulgaris）栽培エリアにおける、特にテンサイ栽培エリアにおけるテンサイの収量を増加するための方法であって、
ａ）プロリンとは異なるアミノ酸を１７９位に有するｅｐｓｐシンターゼをコードする内因性アレルを含む、ベータ・ブルガリス、特にテンサイ植物を植える又はベータ・ブルガリス、特にテンサイ植物を播種するステップ、
ｂ）成長している植物にグリホサート除草剤を、好ましくは抽臺株、雑草ビート又は一年生ビートの成長を阻害するために十分な投与量で、より好ましくは抽臺株、雑草ビート又は一年生ビートを枯らすために十分な投与量で適用するステップ、及び
ｃ）任意に、成長期にステップｂ）を繰り返すステップ
を含む、前記方法。
【００３２】
２．  ベータ・ブルガリス栽培エリアにおける、特にテンサイ栽培エリアにおける、望ましくない草木、特に雑草ビート、一年生ビート、抽臺株及び／又は種子を防除するためのグリホサート除草剤の使用であって、ベータ・ブルガリス植物、特にテンサイ植物が、プロリンとは異なるアミノ酸を１７９位に有するｅｐｓｐシンターゼをコードする内因性アレルを含む、前記使用。
【００３３】
３．  グリホサート除草剤が、グリホサート又はそれらの誘導体から選択され、好ましくは、前記誘導体が、塩、エステル、アミド、又はアルキルアミドであり、好ましくは、前記塩は、アルカリ金属塩、例えば（モノ−、ジ−、又はトリ−）ナトリム又は（モノ−、ジ−、又はトリ−）カリウム、アンモニウム塩、二アンモニウム塩、例えばジメチルアンモニウム塩、アルキルアミン塩、例えばＣ1〜Ｃ16アルキルアミン塩、例えばジメチルアミン塩、エチルアミン塩、エチレンジアミン塩、ヘキサメチレンジアミン塩、ｎ−プロピルアミン塩及びイソプロピルアミン塩、アルキルアンモニウム塩、例えばＣ1〜Ｃ16アルキルアンモニウム塩、例えばジメチルアンモニウム塩及びイソプロピルアンモニウム塩、例えばモノイソプロピルアンモニウム塩（ＩＰＡ）、アルカノールアミン塩、例えばＣ1〜Ｃ16アルカノールアミン塩、例えば（モノ−、ジ−、又はトリ−）エタノールアミン、例えばモノエタノールアンモニウム塩（ＭＥＡ）、アルキルスルホニウム塩、例えばトリメチルスルホニウム塩（ＴＭＳ）、スルホキソニウム塩、及びそれらの混合物又は組み合わせである、主張１又は２の方法又は使用。
【００３４】
４．  ｅｐｓｐシンターゼをコードする全ての内因性アレルが、プロリンとは異なるアミノ酸を１７９位に有する、主張１から３までのいずれかに記載の方法又は使用。
【００３５】
５．  ｅｐｓｐシンターゼをコードする内因性アレルが、セリン、トレオニン、アラニン及びロイシンからなる群から選択されるアミノ酸を１７９位に有し、好ましくはアミノ酸が、セリンである、主張１から４までのいずれかに記載の方法又は使用。
【００３６】
６．  プロリンとは異なるアミノ酸を１７９位に有するｅｐｓｐシンターゼが、
ｉ）配列番号３の配列、
ｉｉ）セリン及びプロリンとは異なるアミノ酸を１７９位に有するｉ）の配列、又は
ｉｉｉ）好ましくは前記配列の全長にわたって、及び好ましくはＥＰＳＰシンターゼ活性を有する、ｉ）又はｉｉ）の配列に対して少なくとも９０％、好ましくは少なくとも９５％、より好ましくは少なくとも９８％、例えば少なくとも９９％の同一性を有する配列から選択されるアミノ酸配列
を含む、主張１から５までのいずれかに記載の方法又は使用。
【００３７】
７．  プロリンとは異なるアミノ酸を１７９位に有するｅｐｓｐシンターゼをコードする全ての内因性アレルが、
ｉ）配列番号１の配列、
ｉｉ）配列番号２の配列をコードするものを有する配列、
ｉｉｉ）配列番号３のアミノ酸１７９位に対応又は配列番号３のアミノ酸１７９位のコドンに対応し、１７９位でセリン及びプロリンとは異なるアミノ酸をコードするヌクレオチドを有するｉ）又はｉｉ）の配列、
ｉｖ）好ましくは前記配列の全長にわたって、及び好ましくはＥＰＳＰシンターゼ活性を有し、及び／又はｉ）、ｉｉ）又はｉｉｉ）の配列の逆相補配列とストリンジェントな条件下でハイブリダイズする、ｉ）、ｉｉ）又はｉｉｉ）の配列に対して少なくとも９０％、好ましくは少なくとも９５％、より好ましくは少なくとも９８％、例えば少なくとも９９％の同一性を有する配列から選択されるアミノ酸配列、又は
ｖ）主張６に記載のｅｐｓｐシンターゼをコードするヌクレオチド配列
から選択されるヌクレオチド配列を含む、主張１から６までのいずれかに記載の方法又は使用。
【００３８】
８．  ｅｐｓｐシンターゼをコードする内因性アレル又は全ての内因性アレルが、さらにトレオニンとは異なるアミノ酸を１７５位に有し、好ましくはアミノ酸がイソロイシンである、主張１から７までのいずれかに記載の方法又は使用。
【００３９】
９．  さらにトレオニンとは異なるアミノ酸を１７５位に有するｅｐｓｐシンターゼ、
ｉ）配列番号６の配列、又は
ｉｉ）イソロイシン及びトレオニンとは異なるアミノ酸を１７５位に有するｉ）の配列、又は
ｉｉｉ）好ましくは前記配列の全長にわたって、及び好ましくはＥＰＳＰシンターゼ活性を有する、ｉ）又はｉｉ）の配列に対して少なくとも９０％、好ましくは少なくとも９５％、より好ましくは少なくとも９８％、例えば少なくとも９９％の同一性を有する配列から選択されるアミノ酸配列
を含む、主張８に記載の方法又は使用。
【００４０】
１０．  さらにトレオニンとは異なるアミノ酸を１７５位に有するｅｐｓｐシンターゼをコードする全ての内因性アレルが、
ｉ）配列番号４の配列、
ｉｉ）配列番号５の配列をコードするものを有する配列、
ｉｉｉ）配列番号６のアミノ酸１７５位に対応又は配列番号６のアミノ酸１７５位のコドンに対応し、１７５位でイソロイシン及びトレオニンとは異なるアミノ酸をコードするヌクレオチドを有するｉ）又はｉｉ）の配列、
ｉｖ）好ましくは前記配列の全長にわたって、及び好ましくはＥＰＳＰシンターゼ活性を有し、及び／又はｉ）、ｉｉ）又はｉｉｉ）の配列の逆相補配列とストリンジェントな条件下でハイブリダイズする、ｉ）、ｉｉ）又はｉｉｉ）の配列に対して少なくとも９０％、好ましくは少なくとも９５％、より好ましくは少なくとも９８％、例えば少なくとも９９％の同一性を有する配列から選択されるアミノ酸配列、又は
ｖ）主張９に記載のｅｐｓｐシンターゼをコードするヌクレオチド配列、
から選択されるヌクレオチド配列を含む、主張８又は９に記載の方法又は使用。
【００４１】
１１．  （前記方法のステップｂ）において）少なくとも３００ｇ／ｈａの有効成分グリホサート、好ましくは少なくとも６００ｇ／ｈａの有効成分グリホサート、より好ましくは少なくとも１２００ｇ／ｈａの有効成分グリホサートを、成長している植物に適用し、好ましくは前記有効成分が、グリホサート酸当量である、主張１から１０までのいずれかに記載の方法又は使用。
【００４２】
１２．  ステップｂ）を、抽臺株、雑草ビート、又は一年生ビートの花の受粉前に、好ましくは開花前の段階中に又は少なくとも開花時に実施する、主張１から１１までのいずれかに記載の方法。
【００４３】
１３．  さらにベータ・ブルガリス植物又はベータ・ブルガリス種子が、トリプトファンとは異なるアミノ酸を５６９位に有するアセトラクテートシンターゼ（ＡＬＳ）をコードする内因性アレルを含み、好ましくはアミノ酸が、アラニン、グリシン、イソロイシン、ロイシン、メチオニン、フェニルアラニン、プロリン、バリン又はアルギニンから選択され、好ましくはアミノ酸がロイシンである、主張１から１２までのいずれかに記載の方法又は使用。
【００４４】
１４．  アセトラクテートシンターゼをコードする内因性アレルが、さらにプロリンとは異なるアミノ酸を１８８位に有し、好ましくはアミノ酸が、セリン、トレオニン、アルギニン、ロイシン、グルタミン、アラニンからなる群から選択され、より好ましくはアミノ酸がセリンである、主張１３に記載の方法又は使用。
【００４５】
１５．  さらに、
ａ）成長期前又は成長期後に、主張１３又は１４に記載したアセトラクテートシンターゼをコードする内因性遺伝子を含むベータ・ブルガリス植物又はベータ・ブルガリス種子を植えること、
ｂ）植物の成長中にＡＬＳ阻害剤を適用すること、及び
ｃ）任意にさらに成長期中にステップｂ）を繰り返すこと
を含む、主張１３又は１４に記載の方法。
【００４６】
１６．  ベータ・ブルガリス（Beta vulgaris）栽培エリアにおける、特にテンサイ栽培エリアにおける抽臺株、雑草ビート又は一年生ビートを防除するための、又はベータ・ブルガリス栽培エリアにおける、特にテンサイ栽培エリアにおけるテンサイの収量を増加するための方法であって、
ａ）主張１から１２までのいずれかにおいて定義したｅｐｓｐシンターゼをコードする内因性アレル及びトリプトファンとは異なるアミノ酸を５６９位に有するアセトラクテートシンターゼをコードする内因性アレルを含む、ベータ・ブルガリス、特にテンサイ植物を植える又はベータ・ブルガリス、特にテンサイ植物を播種するステップ、
ｂ）成長している植物にグリホサート及び／又はＡＬＳ阻害剤を、好ましくは抽臺株、雑草ビート又は一年生ビートの成長を阻害するために十分な投与量で、より好ましくは抽臺株、雑草ビート又は一年生ビートを枯らすために十分な投与量で適用するステップ、及び
ｃ）任意に、成長期にステップｂ）を繰り返すステップ
を含む、前記方法。
【００４７】
１７．  ベータ・ブルガリス（Beta vulgaris）栽培エリアにおける、特にテンサイ栽培エリアにおける抽臺株、雑草ビート又は一年生ビートを防除するための、又はベータ・ブルガリス栽培エリアにおける、特にテンサイ栽培エリアにおけるテンサイの収量を増加するための方法であって、
ａ）プロリンとは異なるアミノ酸を１７９位に有するｅｐｓｐシンターゼタンパク質をコードする内因性遺伝子及びトリプトファンとは異なるアミノ酸を５６９位に有するアセトラクテートシンターゼをコードする内因性遺伝子を含む、ベータ・ブルガリス、特にテンサイ植物を植える又はベータ・ブルガリス、特にテンサイ植物を播種するステップ、
ｂ）成長している植物にｉ）グリホサート除草剤又はｉｉ）ＡＬＳ阻害除草剤から選択される第一の除草剤を、好ましくは抽臺株、雑草ビート又は一年生ビートの成長を阻害するために十分な投与量で、より好ましくは抽臺株、雑草ビート又は一年生ビートを枯らすために十分な投与量で適用するステップ、
ｃ）成長している植物にｉ）グリホサート除草剤又はｉｉ）ＡＬＳ阻害除草剤から選択される第二の除草剤を、好ましくは抽臺株、雑草ビート又は一年生ビートの成長を阻害するために十分な投与量で、より好ましくは抽臺株、雑草ビート又は一年生ビートを枯らすために十分な投与量で適用するステップ、及び
ｄ）任意に、成長期にステップｂ）及び／又はｃ）を繰り返すステップ
を含む、前記方法。
【００４８】
１８．  ＡＬＳ阻害剤、好ましくは、スルホニルウレア、スルホニルアミノカルボニルトリアゾリノン、トリアゾロピリミジン、スルホンアニリド、イミダゾリノン、ピリミジニルオキシ安息香酸、ピリミジニルチオ安息香酸からなる群から選択されるＡＬＳ阻害剤と組み合わせる、主張１３又は１４に記載の使用。
【００４９】
１９．  それぞれの除草剤の適用を、（ｉ）一緒に又は同時に実施する、又は（ｉｉ）異なる時点で及び／又は複数回に分けて（順次適用）、出芽前の適用と続く出芽後の適用で、又は出芽後の初期の適用と続く出芽後の中期もしくは後期の適用で実施する、主張１８に記載の使用。
【００５０】
２０．  アセトラクテートシンターゼをコードする全ての内因性アレルが、トリプトファンとは異なるアミノ酸を５６９位に有する、主張１３から１９までのいずれかに記載の方法又は使用。
【００５１】
２１．  アセトラクテートシンターゼをコードする内因性アレルが、アラニン、グリシン、イソロイシン、ロイシン、メチオニン、フェニルアラニン、プロリン、バリン又はアルギニンから選択されるアミノ酸を５６９位に有し、好ましくはアミノ酸がロイシンである、主張１３から２０までのいずれかに記載の方法又は使用。
【００５２】
２２．  トリプトファンとは異なるアミノ酸を５６９位に有するアセトラクテートシンターゼが、
ｉ）配列番号９の配列、
ｉｉ）トリプトファン及びロイシンとは異なるアミノ酸を５６９位に有するｉ）の配列、又は
ｉｉｉ）好ましくは前記配列の全長にわたって、好ましくはアセトラクテートシンターゼ活性を有する、配列番号９に対して少なくとも９０％、好ましくは少なくとも９５％、より好ましくは少なくとも９８％、例えば少なくとも９９％の同一性を有する配列
から選択されるアミノ酸配列を含む、主張１３から２１までのいずれかに記載の方法又は使用。
【００５３】
２３．  アセトラクテートシンターゼをコードする内因性アレルが、
ｉ）配列番号７の配列、
ｉｉ）配列番号８の配列をコードするものを有する配列、
ｉｉｉ）配列番号９のアミノ酸５６９位に対応又は配列番号９のアミノ酸５６９位のコドンに対応し、５６９位でトリプトファン及びロイシンとは異なるアミノ酸をコードするヌクレオチドを有するｉ）又はｉｉ）の配列、
ｉｖ）好ましくは前記配列の全長にわたって、及び好ましくはアセトラクテートシンターゼ活性を有し、及び／又はｉ）、ｉｉ）又はｉｉｉ）の配列の逆相補配列とストリンジェントな条件下でハイブリダイズする、ｉ）又はｉｉ）の配列に対して少なくとも９０％、好ましくは少なくとも９５％、より好ましくは少なくとも９８％、例えば少なくとも９９％の同一性を有する配列から選択されるアミノ酸配列、又は
ｖ）主張２２に記載のアセトラクテートシンターゼをコードするヌクレオチド配列、
から選択されるヌクレオチド配列を含む、主張１３から２２までのいずれかに記載の方法又は使用。
【００５４】
２４．  アセトラクテートシンターゼをコードする内因性アレル又は全ての内因性アレルが、さらにプロリンとは異なるアミノ酸を１８８位に有し、好ましくはアミノ酸が、セリン、トレオニン、アルギニン、ロイシン、グルタミン、アラニンからなる群から選択され、より好ましくはアミノ酸がセリンである、主張１３から２３までのいずれかに記載の方法又は使用。
【００５５】
２５．  さらにプロリンとは異なるアミノ酸を１８８位に有するアセトラクテートシンターゼが、
ｉ）配列番号１２の配列、
ｉｉ）セリン及びプロリンとは異なるアミノ酸を１８８位に有するｉ）の配列、又は
ｉｉｉ）好ましくは前記配列の全長にわたって、好ましくはアセトラクテートシンターゼ活性を有する、配列番号１２に対して少なくとも９０％、好ましくは少なくとも９５％、より好ましくは少なくとも９８％、例えば少なくとも９９％の同一性を有する配列
から選択されるアミノ酸配列を含む、主張２４に記載の方法又は使用。
【００５６】
２６．  さらにプロリンとは異なるアミノ酸を１８８位に有するｅｐｓｐシンターゼをコードする全ての内因性アレルが、
ｉ）配列番号１０の配列、
ｉｉ）配列番号１１の配列をコードするものを有する配列、
ｉｉｉ）配列番号１２のアミノ酸１８８位に対応又は配列番号１２のアミノ酸１８８位のコドンに対応し、１８８位でセリン及びプロリンとは異なるアミノ酸をコードするヌクレオチドを有するｉ）又はｉｉ）の配列、
ｉｖ）好ましくは前記配列の全長にわたって、及び好ましくはアセトラクテートシンターゼ活性を有し、及び／又はｉ）、ｉｉ）又はｉｉｉ）の配列の逆相補配列とストリンジェントな条件下でハイブリダイズする、ｉ）、ｉｉ）又はｉｉｉ）の配列に対して少なくとも９０％、好ましくは少なくとも９５％、より好ましくは少なくとも９８％、例えば少なくとも９９％の同一性を有する配列、又は
ｖ）主張２５に記載のアセトラクテートシンターゼをコードするヌクレオチド配列、
から選択されるヌクレオチド配列を含む、主張２４又は２５に記載の方法又は使用。
【００５７】
２７．  （前記方法のステップｂ）において）少なくとも３００ｇ／ｈａの有効成分グリホサートを成長している植物に適用し、好ましくは少なくとも６００ｇ／ｈａの有効成分グリホサート、より好ましくは少なくとも１２００ｇ／ｈａの有効成分グリホサートを適用し、好ましくは前記有効成分が、グリホサート酸当量であり、及び／又はＡＬＳ阻害剤を、３５ｇ／ｈａホラムスルフロンと７ｇ／ｈａイオドスルフロンメチルナトリウムとの混合物と当量である最小投与量で成長している植物に適用する、主張１３から２６までのいずれかに記載の方法又は使用。
【００５８】
２８．  グリホサート除草剤及び／又はＡＬＳ阻害剤を、抽臺株、雑草ビート、又は一年生ビートの花の受粉前に、好ましくは開花前の段階中に又は少なくとも開花時に適用する、主張１３から２７までのいずれかに記載の方法。
【００５９】
２９．  ベータ・ブルガリス（Beta vulgaris）栽培エリアにおける、特にテンサイ栽培エリアにおける抽臺株、雑草ビート又は一年生ビートを防除するための、又はベータ・ブルガリス栽培エリアにおける、特にテンサイ栽培エリアにおけるテンサイの収量を増加させるための方法であって、
Ｉ）成長期において主張１から１２までのいずれかに記載の方法を実施すること、並びに
ＩＩ）他の成長期において、
ａ）主張１３から２６までのいずれかにおいて定義したアセトラクテートシンターゼをコードする内因性遺伝子を含むテンサイ植物を植えるステップ、
ｂ）成長している植物にＡＬＳ阻害剤を提供するステップ、及び
ｃ）任意に他の成長期中にステップｂ）を繰り返すステップ
を実施すること
を含む、前記方法。
【００６０】
３０．  ＩＩ）の他の成長期が、Ｉ）の成長期の前及び／又は後である、主張２９に記載の方法。
【００６１】
３１．  ステップＩＩ）ｂ）において、ＡＬＳ阻害剤を、３５ｇ／ｈａホラムスルフロンと７ｇ／ｈａイオドスルフロンメチルナトリウムとの混合物と当量である最小投与量で成長している植物に適用する、主張２９又は３０に記載の方法。
【００６２】
３２．  ステップＩＩ）ｂ）を、抽臺株、雑草ビート、又は一年生ビートの花の受粉前に、好ましくは開花前の段階中に又は少なくとも開花時に実施する、主張２９から３１までのいずれかに記載の方法。
【００６３】
３３．  ベータ・ブルガリス（Beta vulgaris）栽培エリアにおいて、特にテンサイ栽培エリアにおいて、ベータ・ブルガリスのビート根、特にテンサイを生産するための方法であって、
ａ）主張１から３２までのいずれかに記載の方法を実施すること、及び
ｂ）ベータ・ブルガリスのビート根、特にテンサイを、好ましくは成長期の終わりで収穫すること
を含む、前記方法。
【００６４】
３４．  グリホサート耐性のベータ・ブルガリス（Beta vulgaris）植物、特にテンサイ植物を提供するための方法であって、
ａ）少なくとも０．５％ＥＭＳ又は少なくとも０．３％ＥＮＵでテンサイの細胞又は組織を変異誘発するステップ、
ｂ）変異誘発させた細胞又は組織（Ｍ０）から挿木（ｓｔｅｃｋ）を生成するステップ、
ｃ）種子（Ｍ１）の集団を生産するために挿木を植え替えるステップ、
ｄ）Ｍ１種子から育てられた植物から種子（Ｍ２）を生産するステップ、
ｅ）Ｍ２種子を播種し、少なくとも６００ｇ／ｈａのグリホサート有効成分を成長中の植物に適用し、好ましくは有効成分がグリホサート酸当量であるステップ、
ｆ）任意に、生き残った植物を鉢に植え替え、少なくとも６００ｇ／ｈａのグリホサート有効成分を成長中の植物に適用し、好ましくは有効成分がグリホサート酸当量であるステップ、及び
ｇ）除草剤による損傷のない又は除草剤による損傷が最小である、生き残った植物を選択するステップ
を含む、前記方法。
【００６５】
３５．  さらに、
ｈ）任意に、ｇ）の植物の内因性ｅｐｓｐシンターゼアレルを配列する、又はｇ）の植物上でマーカーｓ１ｔｘｅｐｓｓ０２を使用するステップ、及び
ｉ）プロリンとは異なるアミノ酸を１７９位に有するｅｐｓｐシンターゼをコードする内因性アレルを含むテンサイ植物を選択すること
を含む、主張３４に記載の方法。
【００６６】
３６．  グリホサート耐性のベータ・ブルガリス（Beta vulgaris）植物、特にテンサイ植物、又は主張３４又は３５に記載の方法によって得られる植物部位、又はそれらの子孫又は種子。
【００６７】
３７．  植物が、本質的に生物学的方法によって得られるとは限らない、主張３６に記載のベータ・ブルガリス植物、特にテンサイ植物。
【００６８】
３８．  プロリンとは異なるアミノ酸を１７９位に有するｅｐｓｐシンターゼをコードする内因性アレルを含む、ベータ・ブルガリス植物、特にテンサイ植物、又はそれらの植物部位もしくは種子。
【００６９】
３９．  ｅｐｓｐシンターゼをコードする全ての内因性アレルが、プロリンとは異なるアミノ酸を１７９位に有する、主張３６から３８までのいずれかに記載のベータ・ブルガリス植物、特にテンサイ植物。
【００７０】
４０．  ｅｐｓｐシンターゼをコードする内因性アレルが、主張５から１０までのいずれかにおいて定義したものである、主張３６から３９までのいずれかに記載のベータ・ブルガリス植物、特にテンサイ植物。
【００７１】
４１．  さらに、トリプトファンとは異なるアミノ酸を５６９位に有するアセトラクテートシンターゼをコードする内因性アレルを含む、主張３６から４０までのいずれかに記載のベータ・ブルガリス植物、特にテンサイ植物。
【００７２】
４２．  アセトラクテートシンターゼをコードする全ての内因性アレルが、トリプトファンとは異なるアミノ酸を５６９位に有する、主張４１に記載のベータ・ブルガリス植物、特にテンサイ植物。
【００７３】
４３．  アセトラクテートシンターゼをコードする内因性アレルが、主張１３、１４、又は２１から２６までのいずれかにおいて定義したものである、主張４１又は４２に記載のベータ・ブルガリス植物、特にテンサイ植物。
【００７４】
４４．  植物部位が、根ビート、種子、細胞、又は組織である、主張３６から４３までのいずれかに記載のベータ・ブルガリス植物、例えばテンサイ植物、又は植物部位。
【００７５】
４５．  糖を生成するための方法であって、
ａ）主張３６から４４までのいずれかに記載のビート植物のビート根を提供すること、
ｂ）前記ビート根から糖を抽出すること
を含む、前記方法。
【００７６】
４６．  糖の生産、嫌気性消化、又は発酵の方法における、主張３６から４４までのいずれかに記載のテンサイ植物の植物部位の使用。
【００７７】
４７．  糖、バイオガス、又はバイオ燃料の生産の方法における、主張３６から４４までのいずれかに記載のテンサイ植物の植物部位の使用。
【００７８】
４８．  ベータ・ブルガリス植物、特にテンサイ植物、又はそれらの植物部位において、プロリンとは異なるアミノ酸を１７９位に有する及び／又はトレオニンとは異なるアミノ酸を１７５位に有するｅｐｓｐシンターゼをコードする内因性アレルを同定することを含む方法。
【００７９】
ベータ・ブルガリス種の植物は、特に、亜種であるベータ・ブルガリス亜種ブルガリス（Beta vulgaris subsp. vulgaris）の植物である。例えば、数ある中には、Beta vulgaris subsp. vulgaris var. altissima（狭義でテンサイ）、Beta vulgaris ssp. vulgaris var. vulgaris（チャード）、Beta vulgaris ssp. vulgaris var. conditiva（ビート根／赤カブ）、Beta vulgaris ssp. vulgaris var. crassa/alba（飼料ビート）がある。好ましい実施形態において、ベータ・ブルガリスは、本明細書において、Beta vulgaris subsp. Vulgaris、より好ましくはBeta vulgaris subsp. vulgaris var. altissima（すなわちテンサイ）であると言える。
【００８０】
栽培されるテンサイは、初年度に貯蔵根及び葉ロゼットを形成する二年生植物である。苗条の伸長（抽臺）及び花の形成は、低温の期間の後に開始する一方で、B. vulgaris ssp. maritima（シービート）属の多くの野生のビートは、Ｂ座位での抽臺（ｂｌｏｔｉｎｇ）遺伝子Ｂの存在により、一年生で成長する習性を示す。ＢＯＬＴＩＮＧ遺伝子（Ｂ遺伝子）は、テンサイにおける一年生の習性を決定する役割を果たす。ベータ種における年次性は、単一遺伝子及び優勢な形質と見なされる。顕性Ｂアレルを保有する植物は、抽臺及び続く開花を生じるために春化が必須であるＢアレルを保有する二年生植物とは対照的に、春化に依存しない方法で幼形から生殖段階に切り替えられる。座位Ｂの顕性アレルは、野生ビートにおいて豊富であり、潜性アレルを保有する二年生栽培品種に通常不可欠な寒さを必要とせずに、長い日の下で抽臺を生じる。本明細書において使用される「Ｂ遺伝子」は、ベータ・ブルガリス、例えばテンサイにおける一年生の習性（初期の抽臺）の決定に関与する遺伝子をいう。顕性アレルＢを保有する植物は、春化に依存しない方法で幼形期から生殖期に切り替える、すなわち、事前に低温にさらすことなく、苗条を伸ばして開花させることができる。
【００８１】
ある実施形態において、本明細書において記載される抽臺株、雑草ビート、又は一年生ビートを防除するための方法は、ベータ・ブルガリス栽培エリア、好ましくはBeta vulgaris subsp. vulgaris栽培エリア、特にBeta vulgaris subsp. vulgaris var. altissima栽培エリアにおいて抽臺株、雑草ビート、又は一年生ビートを防除するための方法に関する。ある実施形態において、本明細書において記載される抽臺株、雑草ビート、又は一年生ビートを防除するための方法は、二年生ベータ・ブルガリス栽培エリア、好ましくは二年生Beta vulgaris subsp. vulgaris栽培エリア、特に二年生Beta vulgaris subsp. vulgaris var. altissima栽培エリアにおいて抽臺株、雑草ビート、又は一年生ビートを防除するための方法に関する。
【００８２】
ある実施形態において、本明細書において記載される使用は、ベータ・ブルガリス栽培エリア、好ましくはBeta vulgaris subsp. vulgaris栽培エリア、特にBeta vulgaris subsp. vulgaris var. altissima栽培エリアにおける使用に関する。ある実施形態において、本明細書において記載される使用は、二年生ベータ・ブルガリス栽培エリア、好ましくは二年生Beta vulgaris subsp. vulgaris栽培エリア、特に二年生Beta vulgaris subsp. vulgaris var. altissima栽培エリアにおける使用に関する。
【００８３】
「二年生（biennial）」又は「二年生（biannual）」のベータ・ブルガリスは、生物学的ライフサイクルを完了するために２年を要するベータ・ブルガリス植物をいう。「一年生」ベータ・ブルガリスは、１年で発芽し、開花し、枯死するベータ・ブルガリス植物をいう。「一年生ベータ・ブルガリス」は、ヘテロ接合体又はホモ接合体の状態で、Ｂ座位で顕性アレルＢを含むベータ・ブルガリス植物をいう。「二年生ベータ・ブルガリス」は、ホモ接合体の状態でＢ座位に潜性アレルｂを含むベータ・ブルガリス植物をいう。
【００８４】
「抽臺」は、栄養ロゼット段階から花序又は生殖成長段階への移行、特に苗条形成をいう。抽臺（茎の伸長）は、栄養成長から生殖成長への移行においてはっきりと見える最初のステップである。抽臺は、成長の最初の１年間に、収穫及び加工において不利であるだけでなく、収穫量も減少する（望ましくない）苗条の出現により特徴付けられる。
確かに、ベータ・ブルガリス植物の抽臺及び開花は望ましくなく、それというのも例えばテンサイの場合に、種子又は果物ではなく、むしろ使用される植物の地下の部位、貯蔵根、及び根において貯蔵されるエネルギーが、植物の抽臺及び開花の間に消費されるからである。
【００８５】
本明細書において使用されるように、「抽臺株」という用語は、成長期、特にベータ・ブルガリス植物と同年に、好ましくはビートが収穫される前又は収穫される必要がある前に抽臺するベータ・ブルガリスをいう。特定の実施形態において、抽臺株は、一年生ベータ・ブルガリス植物である。特定の実施形態において、抽臺株は雑草ビートである。特定の実施形態において、抽臺株は、シービート（すなわちBeta vulgaris subsp. maritima）である。特定の実施形態において、抽臺株は、Beta vulgaris subsp. vulgarisではない。特定の実施形態において、抽臺株は、Beta vulgaris subsp. vulgaris var. altissimaではない。特定の実施形態において、抽臺株は、顕性の抽臺遺伝子（Ｂ遺伝子）を含む。本明細書において使用されるように、「雑草ビート」という用語は、ビート栽培エリアにおいて意図して栽培したビート植物とは対照的に、望ましくないビート植物をいう。通常、雑草ビートは野生のビートである。雑草ビートは、好ましくは一年生ビートであり、任意にBeta vulgaris subsp. maritimaである。
【００８６】
本明細書において使用されるように、抽臺又は望ましくない植物又は草木等を防除する記載内容における「防除」は、抽臺株、雑草ビートもしくは一年生ビートもしくは望ましくない植物の成長を阻害又は防止すること、又は雑草ビートもしくは一年生ビートの抽臺を阻害すること、又は雑草ビートもしくは一年生ビートの種子生産を少なくとも阻害することを含む。「防除」は、好ましくは抽臺が生じる前に、又は少なくとも抽臺株、雑草ビートもしくは一年生ビートの種子生産の前に、抽臺株、雑草ビート又は一年生ビート又は望ましくない植物を枯死させることも含んでよい。「防除」は、好ましくは抽臺が生じる前に、又は少なくとも抽臺株、雑草ビートもしくは一年生ビートの種子生産の前に、ビート栽培エリアにおける抽臺株、雑草ビート又は一年生ビート又は望ましくない植物の量を減らすことも含んでよい。特定の実施形態における抽臺株又は望ましくない植物等を防除することは、抽臺株もしくは望ましくない植物等の量の少なくとも５０％の削減、又は抽臺株もしくは望ましくない植物等のバイオマスの少なくとも５０％の削減、例えば好ましくは少なくとも６０％、より好ましくは少なくとも７０％、例えば少なくとも８０％又は少なくとも９０％の削減をいう。
【００８７】
本明細書において使用されるように、「望ましくない植物」又は「望ましくない草木」は、望ましくない場所で成長する全ての植物を意味すると理解されるべきである。これは、例えば、有害な植物（例えば、単子葉植物又は双子葉植物の雑草又は望ましくない作物植物）であってよい。
【００８８】
本明細書において使用されるように、「ベータ・ブルガリス栽培エリア」は、収穫、例えばビート根収穫又は種子収穫を目的として、ベータ・ブルガリス植物を栽培する（すなわち、意図的に植えた又は播種した）農業エリアをいう。
【００８９】
本明細書に記載される本発明による方法及び使用は、特定の態様において、ベータ・ブルガリス植物又は植物部位（すなわち、例えば雑草ビートとは対照的に、栽培したベータ・ブルガリス植物）の収量を増加するためのものであってよい。収量の増加は、例えば、（栽培した）ベータ・ブルガリスの増加量、又は（栽培した）ベータ・ブルガリスのバイオマスの増加量、例えば収穫した又は収穫可能な植物部位、例えばビート根のバイオマスの増加量であってよい。収量の増加は、例えばテンサイの場合に全体的な糖の量又は含有量の増加（例えば、１ヘクタールあたりの糖収量の増加）であってもよい。
【００９０】
本明細書において使用されるように、「成長期」という用語は、一般に、ベータ・ブルガリス植物又は種子を植える又は播種してからベータ・ブルガリス植物、特にビート根を収穫するまでの期間をいう。通常、北半球での成長期は、３月／４月から９月／１０月／１１月である。しかしながら、当業者は、例えば気候又は気象条件又は地質条件又は地理的位置に応じて、成長期がより長く又はより短くなりうることを理解するであろう。さらに、例えば冬ビート又は春ビートの生産において、成長期が移行しうることを理解するであろう。
【００９１】
本明細書において使用されるように、特に明記しない限り、「植物」という用語は、任意の発達段階での植物を意味することを意図した。
【００９２】
本発明のベータ・ブルガリス植物は、正倍数体又は異数体であることが好ましい。正倍数体植物は、好ましくは一倍体、二倍体、四倍体、六倍体、八倍体、十倍体又は十二倍体であってよく、一方で異数体植物は、好ましくは三倍体又は五倍体であってよい。特定の好ましい実施形態において、本発明によるベータ・ブルガリス植物は二倍体である。
【００９３】
本発明による「植物」という用語は、植物全体又はかかる植物全体の部位を含む。植物全体は、好ましくは種子植物又は作物である。「植物の部位」は、例えば苗条の栄養器官／構造物、例えば葉、茎及び塊茎；根、花及び花の器官／構造、例えば苞葉、がく片、花弁、雄しべ、心皮、葯及び胚珠；胚、胚乳及び種皮を含む種子；果物及び成熟した子房；植物組織、例えば維管束組織、基本組織等；並びに細胞、例えば孔辺細胞、卵細胞、花粉、毛状突起等；並びに同様の子孫である。植物の部位は、無傷の植物全体に付着又は分離しうる。植物のかかる部位は、植物の器官、組織、及び細胞、好ましくは種子を含むが、これらに限定されない。「植物細胞」は、植物の構造的及び生理学的単位であり、プロトプラスト及び細胞壁を含む。植物細胞は、単離した単一細胞又は培養細胞の形であるか、又は、より高度に組織化した単位の部位、例えば植物組織、植物器官、又は植物全体であってよい。「植物細胞培養物」は、植物単位、例えばプロトプラスト、細胞培養細胞、植物組織中の細胞、花粉、花粉管、子房、胚嚢、接合子及び発生の種々の段階における胚の培養物を意味する。「植物材料」は、葉、茎、根、花又は花の部位、果物、花粉、卵細胞、接合子、種子、挿し木、細胞又は組織培養物、又は植物の他の部分もしくは産物をいう。カルス又はカルス組織、及び抽出物（例えば主根／根ビートからの抽出物）又は試料も含む。「植物器官」は、植物の明確に視覚的に構造化され、分化した部分、例えば根、茎、葉、花芽、又は胚である。本明細書において使用される「植物組織」は、構造的及び機能的単位に組織化された植物細胞の群を意味する。植物又は培養物における植物の組織が含まれる。この用語は、植物全体、植物器官、植物種子、組織培養物、並びに構造的及び／又は機能的単位に組織化された植物細胞の任意の群を含むが、これらに限定されない。前記した又はこの定義に含まれる任意の特定のタイプの植物組織と組み合わせた、又はそれらの非存在下でのこの用語の使用は、任意の他のタイプの植物組織を排除することを意図しない。特定の好ましい実施形態において、本明細書において言及される植物部位又は植物器官は、根ビート又は種子である。根ビート（又はビート根）という用語は、主根、又は胚軸、又は多肉質の貯蔵器官に変わったビートをいう。
【００９４】
したがって、本発明のベータ・ブルガリス植物は、好ましくは、内因性であるｅｐｓｐシンターゼ遺伝子に関して（及び／又はＡＬＳ遺伝子に関して）非トランスジェニックである。もちろん、本発明は、遺伝子工学、変異誘発、又は従来の方法、例えば交配のいずれかによって、他の外来遺伝子を植物に伝達できることを排除しない。前記遺伝子は、除草剤耐性を付与する遺伝子、好ましくはグリホサート除草剤又はＡＬＳ阻害剤除草剤耐性とは異なる除草剤耐性を付与する遺伝子、収量を改善する遺伝子、生物（真菌、細菌又はウイルス）に対する耐性を改善する遺伝子、非生物的ストレス、例えば干ばつ、霜、熱等に対する耐性を改善する遺伝子、及び／又は含有量もしくは成分の改変に関する遺伝子であってよい。
【００９５】
本明細書での「トランスジェニック」という用語は、非内因性の核酸配列の導入によって遺伝子改変されることを意味する。典型的に、種特異的核酸配列は、核酸配列が細胞内で自然に生じない場所で、形、配置又は量で細胞に導入される。本発明によるベータ・ブルガリス植物は、好ましくは、変異したｅｐｓｐシンターゼに関して（及び／又は変異したＡＬＳに関して）非トランスジェニックである一方で、かかるベータ・ブルガリス植物は、他の形質についてトランスジェニックであってよいことが理解できるであろう。
【００９６】
グリホサートは、芳香族アミノ酸であるフェニルアラニン、チロシン、及びトリプトファンの合成を阻害することが公知である唯一の除草剤であるため、特有な除草剤である。これらの３つのアミノ酸を合成できない植物は生きられない。芳香族アミノ酸を導く生合成経路の影響を受ける酵素は、５−エノールピルビルシキメート−３−ホスフェートシンターゼ（ＥＰＳＰＳ）であり、これは、シキメート−３−ホスフェート（Ｓ３Ｐ）とホスホエノールピルベート（ＰＥＰ）との反応を触媒作用して５−エノールピルビルシキメート−３−ホスフェート（ＥＰＳＰ）を形成する。グリホサートは、ＰＥＰと構造的に類似しており、ＥＰＳＰＳに結合し、拮抗的な方法で酵素の反応を阻害する。グリホサートは、ＥＰＳＰＳに作用する唯一の公知の除草剤である（Schonbrunn E, Eschenburg S, Shuttleworth WA, Schloss JV, Amrhein N, Evans JN, Kabsch W: Interaction of the herbicide glyphosate with its target enzyme 5-enolpyruvylshikimate 3-phosphate synthase in atomic detail. Proc Natl Acad Sci U S A 2001, 98(4):1376-1380.; Pollegioni L, Schonbrunn E, Siehl D: Molecular basis of glyphosate resistance-different approaches through protein engineering. FEBS J 2011, 278(16):2753-2766.）。芳香族アミノ酸の合成の阻害は、多かれ少なかれ成長の即時停止を導き、最終的には適用後数日以内に植物を枯死させる。したがって、グリホサートは、一般に非選択性除草剤であり、接触したあらゆる生きている植物組織を激しく損傷させ、枯死させる。しかしながら、テンサイ、トウモロコシ、大豆、綿花、及びカノーラを含むグリホサート耐性作物に選択的に使用できる。
【００９７】
特定の実施形態において、野生型ベータ・ブルガリスｅｐｓｐシンターゼは、ＮＣＢＩ参照配列ＸＰ＿０１０６９２２２２．１（配列番号２０）で提供されるアミノ酸配列を有する。特定の実施形態において、野生型又は天然のベータ・ブルガリスｅｐｓｐシンターゼは、ＮＣＢＩ参照配列ＸＰ＿０１０６９２２２２．１の配列に対して、少なくとも９０％、好ましくは少なくとも９５％、より好ましくは少なくとも９８％、例えば少なくとも９９％の、好ましくは全長にわたって、配列同一性を有するアミノ酸配列を有し、かつ好ましくはｅｐｓｐシンターゼ活性を有するが、ただし、１７９位でのアミノ酸残基はプロリンであり、任意に１７５位でのアミノ酸残基はトレオニンである。
【００９８】
特定の実施形態において、野生型ベータ・ブルガリスｅｐｓｐシンターゼ遺伝子は、ＮＣＢＩ参照配列ＸＰ＿０１０６９２２２２．１で提供されるアミノ酸配列をコードする配列を有する。特定の実施形態において、野生型又は天然のベータ・ブルガリスｅｐｓｐシンターゼ遺伝子は、ＮＣＢＩ参照配列ＸＰ＿０１０６９２２２２．１の配列に対して、少なくとも９０％、好ましくは少なくとも９５％、より好ましくは少なくとも９８％、例えば少なくとも９９％の、好ましくは全長にわたって、配列同一性を有するアミノ酸配列をコードする配列を有し、かつ好ましくはｅｐｓｐシンターゼ活性を有するが、ただし、１７９位でのアミノ酸残基はプロリンであり、任意に１７５位でのアミノ酸残基はトレオニンである。
【００９９】
好ましくは、本明細書において使用されるように、アミノ酸残基の位置は、ｅｐｓｐシンターゼについて示し、番号付けは、参照配列ＸＰ＿０１０６９２２２２．１のアミノ酸位置に対応する。配列番号３は、Ｐ１７９Ｓ変異を有するＸＰ＿０１０６９２２２２．１の配列に対応する。配列番号６は、Ｐ１７９Ｓ変異及びＴ１７５Ｉ変異を有するＰ＿０１０６９２２２２．１に対応する。本明細書において使用されるように、「ｅｐｓｐシンターゼ活性」という用語は、ｅｐｓｐシンターゼの酵素活性をいう。特定の好ましい実施形態における前記したバリアントｅｐｓｐシンターゼの記載内容における「ｅｐｓｐシンターゼ活性を有する」という用語は、野生型又は天然のｅｐｓｐシンターゼと比較して酵素活性が影響を受けない又は実質的に影響を受けないｅｐｓｐシンターゼをいう。特定の実施形態において、酵素活性は、野生型ｅｐｓｐシンターゼ活性の少なくとも５０％、好ましくは少なくとも６０％、より好ましくは少なくとも７０％、さらにより好ましくは少なくとも８０％、最も好ましくは少なくとも９０％、例えば少なくとも９５％である。酵素活性は、当技術分野において公知の方法によって測定できる。
【０１００】
Ｒｏｕｎｄｕｐ Ｒｅａｄｙ植物は、アグロバクテリウム（Agrobacterium）属ＣＰ４株から得られた、グリホサート非感受性型のＥＰＳＰＳをコードする遺伝子を有する（Funke T, Han H, Healy-Fried ML, Fischer M, Schonbrunn E: Molecular basis for the herbicide resistance of Roundup Ready crops. Proc Natl Acad Sci U S A 2006, 103(35):13010-13015.; Padgette SR, Kolacz KH, Delannay X, Re DB, LaVallee BJ, Tinius CN, Rhodes WK, Otero YI, Barry GF, Eichholtz DAら: Development, Identification, and Characterization of a Glyphosate-Tolerant Soybean Line. Crop Sci 1995, 35(5):1451-1461.）。グリホサート生産施設の廃棄物供給カラムから分離されたアグロバクテリウム属ＣＰ４株は、トランスジェニックのグリホサート抵抗作物の生産に適したグリホサート耐性の速度論的に効率的なＥＰＳＰシンターゼを得た。それ以来、他の分類ＩＩ  ＥＰＳＰシンターゼが、典型的に病原性種、例えば肺炎連鎖球菌（Streptococcus pneumonia）及び黄色ブドウ球菌（Staphylococcus aureus）を含むグラム陽性菌に由来することが報告されている。興味深いことに、活性部位における単一の残基（Ａｌａ−１００、大腸菌（E. coli）タンパク質に基づく番号付け）は、ＣＰ４  ＥＰＳＰシンターゼをグリホサートに対して非感受性する一方で、高度に保存されたグリシン残基は、公知の天然の植物及び細菌酵素においてこの位置で見出される。
【０１０１】
本明細書において使用されるように、「グリホサート除草剤」という用語は、活性グリホサートに変換することができる化合物を含む、グリホサート又はグリホサート誘導体を含む組成物をいう。グリホサートは、Ｎ−ホスホノメチルグリシンとしても公知であり、その酸の形は、以下の構造を有する：
【化１】
2022502083.tif 000002
【０１０２】
酸の形でのグリホサートは、水に比較的不溶性であるため（２５℃で１．１６質量％）、通常、水溶性の塩として配合される。それは通常、一塩基性、二塩基性、又は三塩基性の塩として配合される。グリホサートの種々の塩、グリホサートの塩を調製する方法、グリホサート又はその塩の調製物、並びに雑草及び他の植物を枯死させ、防除するためのグリホサート又はその塩の使用方法は、米国特許第４，５０７，２５０号明細書（U.S. Pat. No. 4,507,250）、米国特許第４，４８１，０２６号明細書（U.S. Pat. No. 4,481,026）、米国特許第４，４０５，５３１号明細書（U.S. Pat. No. 4,405,531）、米国特許第４，３１５，７６５号明細書（U.S. Pat. No. 4,315,765）、米国特許第４，１４０，５１３号明細書（U.S. Pat. No. 4,140,513）、米国特許第３，９７７，８６０号明細書（U.S. Pat. No. 3,977,860）、米国特許第３，８５３，５３０号明細書（U.S. Pat. No. 3,853,530）、及び米国特許第３，７９９，７５８号明細書（U.S. Pat. No. 3, 799, 758）において開示される。
【０１０３】
典型的なグリホサート塩は、例えば、モノ（イソプロピルアンモニウム）（「ＩＰＡ」）、カリウム、ナトリウム、モノエタノールアンモニウム（「ＭＥＡ」）、トリメチルスルホニウム（「ＴＭＳ」）、アンモニウム、ジアンモニウム塩、ｎ−プロピルアミン、エチルアミン、エチレンジアミン、及びヘキサメチレンジアミン塩を含む。グリホサートの最も広く使用される塩はＩＰＡ塩である。有効成分としてグリホサートのＩＰＡ塩を有するＭｏｎｓａｎｔｏ社の市販の除草剤は、Ｒｏｕｎｄｕｐ（登録商標）、Ｒｏｕｎｄｕｐ（登録商標）Ｕｌｔｒａ、Ｒｏｕｎｄｕｐ（登録商標）Ｘｔｒａ、及びＲｏｄｅｏ（登録商標）除草剤である。これらは水溶液濃縮調製物であり、一般に、植物の葉に適用する前に使用者によって水で希釈される。市販の配合したＴＭＳ塩は、例えばＺｅｎｅｃａ（Ｓｙｎｇｅｎｔａ）社のＴｏｕｃｈｄｏｗｎ（登録商標）除草剤において使用され、配合したカリウム塩は、例えばＲｏｕｎｄｕｐ（登録商標）ＰｏｗｅｒＭＡＸにおいて使用され、配合したアンモニウム塩は、例えば、本発明において使用されるようにＲｏｕｎｄｕｐ（登録商標）Ｍａｘ（www.roundup.it/roundup_max.php）において使用される。グリホサート塩は、典型的に除草効果を最大化するために界面活性剤と同時配合される。例えば国際公開第９６／０３２８３９号（WO 96/032839）を参照されたい。
【０１０４】
特定の実施形態において、本明細書において使用されるグリホサート除草剤は、グリホサート又はその誘導体を含み、該誘導体は、塩、エステル、アミド、又はアルキルアミドから選択される。特定の実施形態において、グリホサート塩は、アルカリ金属塩、例えば（モノ−、ジ−、もしくはトリ−）ナトリウム又は（モノ−、ジ−、もしくはトリ−）カリウムである。特定の実施形態において、グリホサート塩は、アンモニウム塩又は二アンモニウム塩、例えばジメチルアンモニウム塩、アルキルアミン塩、例えばＣ1〜Ｃ16アルキルアミン塩、例えばジメチルアミン塩、エチルアミン塩、エチレンジアミン塩、ヘキサメチレンジアミン塩、ｎ−プロピルアミン塩及びイソプロピルアミン塩、アルキルアンモニウム塩、例えばＣ1〜Ｃ16アルキルアンモニウム塩、例えばジメチルアンモニウム塩及びイソプロピルアンモニウム塩、例えばモノイソプロピルアンモニウム塩（ＩＰＡ）、アルカノールアミン塩、例えばＣ1〜Ｃ16アルカノールアミン塩、例えば（モノ−、ジ−、又はトリ−）エタノールアミン、例えばモノエタノールアンモニウム塩（ＭＥＡ）である。特定の実施形態において、グリホサート塩は、アルキルスルホニウム塩、例えばトリメチルスルホニウム塩（ＴＭＳ）、スルホキソニウム塩である。特定の実施形態において、グリホサート除草剤は、グリホサート又はその誘導体のいずれかの、特に前記した塩の混合物又は組み合わせを含む。
【０１０５】
特定の態様において、グリホサート除草剤は、抽臺株、雑草ビート、又は一年生ビートを防除する（例えば、成長を阻害する）ために十分な投与量で、本明細書に記載の本発明による方法及び使用に適用される。特定の実施形態において、かかる投与量は、少なくとも３００ｇ／ｈａ（グリホサート酸当量）、例えば少なくとも６００ｇ／ｈａ、好ましくは少なくとも９００ｇ／ｈａの投与量、より好ましくは少なくとも１０００ｇ／ｈａの投与量、さらにより好ましくは少なくとも１１００ｇ／ｈａの投与量、最も好ましくは少なくとも１２００ｇ／ｈａの投与量又は１２００ｇ／ｈａの投与量である。この投与量は、好ましくは、単一の適用の投与量を示す。１つより多くの適用、例えば２つの適用又は３つの適用が成長期中に必要となる場合があることが理解されるであろう。かかる続く適用の投与量は、最初の適用の投与量と同一又は異なってよい。
【０１０６】
本明細書において使用されるように、「グリホサート酸当量」という用語は、理論的に対応する又は親酸に変換して戻すことができるグリホサート除草剤の調製物の一部、又は誘導体（エステル、塩、アミン等）として配合したグリホサート除草剤からのグリホサート酸の理論的収量をいう。グリホサート酸当量は、グリホサート親酸（その脱プロトン化状態で分子量１６８を有する）と配合したグリホサート生成物（典型的に誘導体、例えば塩）との分子量比から算出できる。例えば、グリホサートイソプロピルアミンは、分子量２２８を有し、１６８／２２８＝０．７３６８のグリホサート親酸（脱プロトン化）の割合である。グリホサートイソプロピルアミンの濃度又は量に０．７３６８の画分を掛けると、グリホサート酸当量の濃度又は量が得られる。したがって、例えば５ｋｇのグリホサートイソプロピルアミンは、３．６８４ｋｇのグリホサート酸当量を有する。
【０１０７】
特定の態様において、本発明は、特に最適な除草活性をもたらすために十分に高い投与量で、グリホサート（及び任意にＡＬＳ阻害剤）に耐性があるベータ・ブルガリス植物に関する。特定の実施形態において、本発明において記載されるベータ・ブルガリス植物は、少なくとも３００ｇ／ｈａ、例えば少なくとも６００ｇ／ｈａの投与量、好ましくは少なくとも９００ｇ／ｈａの投与量、より好ましくは少なくとも１０００ｇ／ｈａの投与量、さらにより好ましくは少なくとも１１００ｇ／ｈａの投与量、最も好ましくは少なくとも１２００ｇ／ｈａの投与量又は１２００ｇ／ｈａの投与量でグリホサート（例えばグリホサート酸当量）に耐性がある。特定の実施形態において、本明細書において記載されるベータ・ブルガリス植物は、ホラムスルフロン３５ｇ／ｈａとヨードスルフロン−メチル−ナトリウムグリホサート７ｇ／ｈａとの混合物に対して同等のＡＬＳ阻害剤投与量に耐性がある。好ましくは、前記投与量は、単一の適用の投与量である。成長期に複数の適用を必要とする場合に、本発明によるベータ・ブルガリス植物は、好ましくは前記複数の適用に耐性があることが理解されるであろう。好ましくは、本発明によるグリホサート（及び任意にＡＬＳ阻害剤）耐性ベータ・ブルガリス植物は、他の重要な農業的特性、例えば成長、収量、品質、病原体耐性、生理学的機能等に関して欠点を有さない。
【０１０８】
グリホサート（またはＡＬＳ阻害剤）耐性は、例えばグリホサートの適用から２週間後に個々の植物で行った評価のように、例えば０（枯死した植物）から９（完全に影響を受けていない植物）までの尺度に基づいた植物の活力及び植物の白化の視覚的損傷評価によって決定されうる。０から３の評価は、感受性の高い植物の特徴である。３から７の評価は、低〜中レベルの耐性を示し、８又は９の評価は、良好なレベルの耐性を示す。特に、評価は次の意味を有する；  ９．影響を受けていない植物は未処理の対照と同じである；  ８．葉面積の５％未満が影響を受け、黄色になる葉の先端の非常に小さな壊死のみ；  ７．丸まり始める葉の先端の非常に小さな壊死；葉面積の５％未満が影響を受け、黄色になる；  ６、５、４．壊死及び葉の丸まりの増加；葉は通常より小さくなる；  ３、２．葉の成長がないか又は非常に限られる；全ての葉が丸まり壊死の影響を受ける；  １．植物の成長ない；植物の５％までが緑色のままである；  ０．枯死した植物。特定の好ましい実施形態において、本発明によるベータ・ブルガリス植物は、少なくとも３、好ましくは少なくとも７、より好ましくは少なくとも８、さらにより好ましくは９の評価を有する。
【０１０９】
特定の実施形態において、本発明によるベータ・ブルガリス植物は、本明細書において他の場所で記載される対応する野生型ベータ・ブルガリス植物又は抽臺株、雑草ビート、一年生ビートよりも、グリホサート（又はグリホサート除草剤）、及び任意にＡＬＳ阻害剤除草剤に対して感受性が低い。特定の実施形態において、本発明によるベータ・ブルガリス植物は、少なくとも１０倍感度が低く、例えば１００倍感度が低く、より好ましくは５００倍、さらにより好ましくは１０００倍、及び最も好ましくは２０００倍未満である。本明細書において使用される場合に感度が低いことは、逆に、「より許容できる」又は「より耐性がある」と見なされてよい。同様に、「より許容できる」又は「より耐性がある」は、逆に、「感度が低い」と見なされてよい。
【０１１０】
特定の実施形態において、本発明によるベータ・ブルガリス植物は、その酵素活性がグリホサートによって影響を受けないか又は実質的に影響を受けないｅｐｓｐシンターゼを有する。特定の実施形態において、本発明によるベータ・ブルガリス植物は、グリホサートの非存在下と比較して、グリホサートの存在下で酵素活性が最大で５０％少なく、好ましくは最大で４０％少なく、より好ましくは最大で３０％少なく、さらにより好ましくは最大で２０％少なく、最も好ましくは最大で１０％少なく、例えば最大で５％少ない。酵素活性は、当技術分野において公知の方法によって測定できる。酵素活性は、好ましくは、関連する適用可能な除草剤投与量での、例えば、少なくとも３００ｇ／ｈａ、例えば少なくとも６００ｇ／ｈａの野外適用に対応する投与量、好ましくは少なくとも９００ｇ／ｈａの投与量、より好ましくは少なくとも１０００ｇ／ｈａの投与量、さらにより好ましくは少なくとも１１００ｇ／ｈａの投与量、最も好ましくは少なくとも１２００ｇ／ｈａの投与量又は１２００ｇ／ｈａの投与量でのグリホサート（又はグリホサート除草剤）の存在下で測定される。
【０１１１】
本明細書において使用されるように、ＡＬＳ（アセト乳酸シンターゼ；ＡＨＡＳ（アセトヒドロキシ酸シンターゼ）としても公知である；ＥＣ２．２．１．６；以前はＥＣ４．１．３．１８））は、アセト乳酸分子及び二酸化炭素への２つのピルビン酸分子の変換に関与している。この反応は、ピロリン酸チアミンを使用して２つのピルビン酸分子を結合する。この反応でもたらされる生成物であるアセトラクテートは、最終的にバリン、ロイシン、及びイソロイシンになる（Singh (1999) "Biosynthesis of valine, leucine and isoleucine", in Plant Amino Acids, Singh, B.K., ed., Marcel Dekker Inc. New York, New York, pp. 227-247）。ＡＬＳの阻害剤は、植物におけるバリン、ロイシン及びイソロイシンの生合成を妨害する。その結果、それぞれのアミノ酸プールが即座に枯渇し、タンパク質生合成が停止し、植物の成長が停止し、最終的には植物が枯死するか、又は少なくとも損傷する。
【０１１２】
特定の実施形態において、野生型ベータ・ブルガリスＡＬＳは、ＮＣＢＩ参照配列ＸＰ＿０１０６９５３６５．１（配列番号２１）で提供されるアミノ酸配列を有する。特定の実施形態において、野生型又は天然のベータ・ブルガリスＡＬＳは、ＮＣＢＩ参照配列ＸＰ＿０１０６９５３６５．１の配列に対して、少なくとも９０％、好ましくは少なくとも９５％、より好ましくは少なくとも９８％、例えば少なくとも９９％の、好ましくは全長にわたって、配列同一性を有するアミノ酸配列を有し、かつ好ましくはＡＬＳ活性を有するが、ただし、５６９位でのアミノ酸残基はトリプトファンであり、任意に１８８位でのアミノ酸残基はプロリンである。
【０１１３】
特定の実施形態において、野生型ベータ・ブルガリスＡＬＳ遺伝子は、ＮＣＢＩ参照配列ＸＰ＿０１０６９５３６５．１で提供されるアミノ酸配列をコードする配列を有する。特定の実施形態において、野生型又は天然のベータ・ブルガリスＡＬＳ遺伝子は、ＮＣＢＩ参照配列ＸＰ＿０１０６９５３６５．１の配列に対して、少なくとも９０％、好ましくは少なくとも９５％、より好ましくは少なくとも９８％、例えば少なくとも９９％の、好ましくは全長にわたって、配列同一性を有するアミノ酸配列をコードする配列を有し、かつ好ましくはｅｐｓｐシンターゼ活性を有するが、ただし、５６９位でのアミノ酸残基はトリプトファンであり、任意に１８８位でのアミノ酸残基はプロリンである。
【０１１４】
好ましくは、本明細書において使用されるように、アミノ酸残基の位置は、ＡＬＳについて示し、番号付けは、参照配列ＸＰ＿０１０６９５３６５．１のアミノ酸位置に対応する。配列番号９は、Ｗ５６９Ｌ変異を有するＸＰ＿０１０６９５３６５．１の配列に対応する。配列番号１２は、Ｗ５６９Ｌ変異及びＰ１８８Ｓ変異を有するＸＰ＿０１０６９５３６５．１に対応する。
【０１１５】
本発明の特定の実施形態において使用できるＡＬＳ阻害剤の分類に属する除草剤化合物は、（ａ）スルホニル尿素系除草剤（Beyer E.Mら(1988), Sulfonylureas in Herbicides: Chemistry, Degradation, and Mode of Action; Marcel Dekker, New York, 1988, 117-189）、（ｂ）スルホニルアミノカルボニルトリアゾリノン除草剤（Pontzen, R., Pflanz.- Nachrichten Bayer, 2002, 55, 37-52）、（ｃ）イミダゾリノン除草剤（Shaner, D.L.,ら, Plant Physiol., 1984, 76, 545-546; Shaner, D.L., and O'Connor, S.L. (Eds.) The Imidazolinone Herbicides, CRC Press, Boca Rato, FL, 1991）、（ｄ）トリアゾロピリミジン除草剤（Kleschick, W.A.ら, Agric. FoodChem, 1992, 40, 1083-1085）、及び（ｅ）ピリミジニル（チオ）ベンゾエート除草剤（Shimizu, T.J., Pestic. Sci.,1997, 22, 245-256; Shimizu, T.ら, Acetolactate Syntehase Inhibitors in Herbicide Classes in Development, Boger, P., Wakabayashi. K., Hirai, K., (Eds.), Springer Verlag, Berlin, 2002, 1-41）を含む。
【０１１６】
特定の実施形態において、ＡＬＳ阻害剤、スルホニルウレア、スルホニルアミノカルボニルトリアゾリノン、トリアゾロピリミジン、スルホンアニリド、イミダゾリノン、ピリミジニルオキシ安息香酸、ピリミジニルチオ安息香酸からなる群から選択される。本発明の特定の態様において使用されてよいさらなるＡＬＳ阻害剤は、例えば国際公開第２０１４／０９０７６０号（WO 2014/090760）、国際公開第２０１２／０４９２６８号（WO 2012/049268）、国際公開第２０１２／０４９２６６号（WO 2012/049266）、欧州特許第２ ６２７ １８３号明細書（EP 2 627 183）、及び国際公開第２０１４／０９１０２１号（WO 2014/091021）において記載されており、それぞれ参照をもって本明細書に組み込まれたものとする。
【０１１７】
特定の実施形態において、ＡＬＳ阻害剤は、国際公開第２０１２０４９２６６号の請求項２から４において挙げられているＡＬＳ阻害剤から選択されて、その全ては参照をもって本明細書に組み込まれたものとする。
【０１１８】
特定の実施形態において、ＡＬＳ阻害剤に対して耐性を付与する適切な変異ＡＬＳは、欧州特許第２ ９３１ ９０２号明細書（EP 2 931 902）及び国際公開第２０１２／０４９２６８号において記載されているものであり、それらは参照をもって本明細書に組み込まれたものとする。特定の実施形態において、非グリホサート除草剤又は非ＡＬＳ阻害剤除草剤は、グリホサート及び／又はＡＬＳ阻害剤除草剤と組み合わせて適用されうる。特定の実施形態において、それぞれの除草剤の適用を、（ｉ）一緒に又は同時に実施する、又は（ｉｉ）異なる時点で及び／又は複数回に分けて（順次適用）、出芽前の適用と続く出芽後の適用で、又は出芽後の初期の適用と続く出芽後の中期もしくは後期の適用で実施する。特定の実施形態において、除草剤は、クロリダゾン、クレトジム、クロジナホップ、クロジナホップ−プロパルギル、クロピラリド、シクロキシジム、デスメディファム、ジメテナミド、ジメテナミド−Ｐ、エトフメセート、フェノキサプロップ、フェノキサプロップ−Ｐ、フェノキサプロップ−エチル、フェノキサプロップ−Ｐ−エチル、フルアジホップ、フルアジホップ−Ｐ、フルアジホップ−ブチル、フルアジホップ−Ｐ−ブチル、グルホシネート、グルホシネート−アンモニウム、グルホシネート−Ｐ、グルホシネート−Ｐ−アンモニウム、グルホシネート−Ｐ−ナトリウム、ハロキシホップ、ハロキシホップ−Ｐ、ハロキシホップ−エトキシエチル、ハロキシホップ−Ｐ−エトキシエチル、ハロキシホップ−メチル、ハロキシホップ−Ｐ−メチル、レナシル、メタミトロン、フェンメディファム、フェンメディファム−エチル、プロパキザホップ、キンメラック、キザロホップ、キザロホップ−エチル、キザロホップ−Ｐ、キザロホップ−Ｐ−エチル、キザロホップ−Ｐ−テフリル、セトキシジムから選択される。
【０１１９】
特定の態様において、本発明は、本発明のベータ・ブルガリス植物の細胞の液胞、及びそこに貯蔵された含有物質に関する。さらに、本発明は、細胞から、好ましくは本発明のベータ・ブルガリス植物の細胞から、及び好ましくは次の作物：テンサイ、チャード、又はビート根のうち１つの細胞からの細胞抽出物に関する。細胞抽出物から植物を再生することはできない。同様に、本発明に含まれるものは、本発明による核酸を含む植物ゲノムである。植物ゲノムから植物を再生することはできない。それにより、細胞抽出物からの糖濃度は、本発明による細胞ではないが、同一の種又は作物に属する細胞と比較して増加しうる。これは、特にグリホサート除草剤を適用する条件下で適用される。糖（サッカロース）の生産又はジュース、好ましくはビート根ジュースの生産のための細胞抽出物の使用も本発明に含まれる。
【０１２０】
本発明の追加の態様は、本発明のベータ・ブルガリス植物の種子を含む種子ストックである。種子ストック及び種子は、技術的に処理されてよい。したがって、本発明は、技術的に処理した種子ストック及び技術的に処理した種子も含む。技術的に処理した種子ストックの種々の実施形態を以下に詳細に説明し、それにより種子ストックという用語は種子も含む：技術的に処理した種子ストックは、研磨した形で存在しうる。これにより、種子の最外層が除去され、種子はより丸みを帯びた形をとる。これは播種に役立ち、最適な均一な形状が播種機による種子ストック粒子の均一な分布を導く。技術的に処理した種子ストックは、ペレット化した種子ストックを含む。それにより、種子ストックは、そこに含まれる種子ストックを保護し、かつより大きな質量をもたらすペレット塊に埋め込まれ、その結果、ペレット化した種子ストックは、風の流れに関してより大きな抵抗能力を示し、したがって、風によって吹き飛ばされにくくなり、同時に、播種中のより正確な位置決めが可能になる。本発明の好ましい実施形態において、販売用に設計したバッチ又はユニットの全てのペレット化種子ストック粒子は、本質的に同一の形状及び同一の質量を有する。直径及び質量における偏差５％がありうる。しかしながら、好ましくは偏差は１％を超えない。主成分の１つとして、ペレット化塊は、例えば鉱物化合物、例えば粘土、ベントナイト、カオリン、腐植土及び／又は泥炭を含んでよい。ポリアシルアミドのような接着剤を添加することが可能である。追加の可能な成分は、米国特許第４，０６７，１４１号明細書（US 4,067,141）に引用されている。さらに、ペレット化塊は、実際の培養にポジティブな影響を与える追加の化学薬品を含んでよい。これらはここでは肥料の中に数えられる物質であってよい。これらは、次の元素：窒素、リン及びカリウム（微量栄養素）の１つ以上の豊富な化合物を含む。したがって、施肥成分は、例えば、硝酸性窒素、アンモニア性窒素、硝酸マグネシウム、硝酸カルシウムアンモニウム、リン酸一アンモニウム、リン酸一カリウム及び硝酸カリウムを含んでよい。さらに、ペレット化塊は、殺菌剤、殺虫剤、及び／又は摂食阻害剤を含んでよい。殺菌剤は、チラム及び／又はヒメキサゾール及び／又は他の殺菌剤であってよい。殺虫剤は、ネオニコチノイド群の物質であってよい。ネオニコチノイド群の物質は、好ましくはイミダクロプリド（ＡＴＣコード：ＱＰ５３ＡＸ１７）及び／又はクロチアニジン（ＣＡＳ番号２１０８８０−９２−５）である。さらに、殺虫剤は、シフルトリン（ＣＡＳ番号６８３５９−３７−５）、ベータシフルトリン又はテフルトリンであってもよい。粉衣（dressing）塊又はペレット化塊に含まれる化合物が植物に取り込まれ、全体浸透効果を示し、それによって植物全体の適した保護を提供することは言及する価値がある。したがって、１つ以上の農薬を含むペレット化種子から得られる植物は、天然に生じる植物とは異なり、生物的ストレス条件下でより優れた性能を示す。本記載内容において、本発明は、本発明によるペレット化塊と種子との混合物も包含する。さらに、本発明は、以下：ａ）本発明のベータ・ブルガリス植物の種子を準備するステップ、���）テンサイ植物種子をペレット化塊に埋め込むステップ、及びｃ）ペレット化塊を乾燥させるステップであって、種子は任意に用意した又は予備発芽させた種子であるか、又は種子は、ステップｂ）中に用意できるステップを含む、本発明によるペレット化種子を生産するための方法も包含する。
【０１２１】
ペレット化種子ストックは、粉衣した種子ストックの特定の実施形態である。本記載内容において、技術的に処理した種子ストックは、粉衣した種子ストックも含む。しかしながら、本発明は、ペレット化種子ストックに限定されず、むしろ、任意の形の粉衣した種子ストックに適用されてよい。したがって、本発明は、ペレット化種子を含むがこれに限定されない、粉衣した種子ストックにも関する。したがって、乾燥粉衣、湿粉衣、及び懸濁粉衣も包含する。それにより、粉衣は、少なくとも１つの染料（着色剤）を含んでよく、その結果、粉衣した種子ストックは、粉衣していない種子ストックと迅速に区別されてよく、さらに、播種後の環境における良好な視認性が保証される。粉衣は、ピリング塊の記載内容において説明されている農薬も含みうる。したがって、本発明は、粉衣が、少なくとも１つの摂食阻害剤、例えば殺虫剤及び／又は少なくとも１つの殺菌剤を含む、かかる粉衣した種子ストックを含む。任意に、いわゆる電気粉衣（電気エネルギーの適用による粉衣）を適用してよい。しかしながら、電子粉衣は、厳密な意味での粉衣ではない。
【０１２２】
技術的に処理した種子ストックの追加の形は、外皮形成した（encrusted）種子ストックである。コーティングとして公知のものは、本記載内容において及びコーティングで処理した種子ストックとしても語られている。ペレット化種子ストックとの違いは、種子グレーンが元の形状を保持していることであり、この方法は特に経済的である。この方法は、例えば、欧州特許出願公開第０３３４ ２５８号明細書（EP 0334 258 A1）に記載されている。技術的に処理した種子ストックの追加の形は、新芽形成させた（sprouted）又は成長促進させた（primed）種子ストックである。新芽形成させた種子ストックは、事前発芽によって前処理されているのに対し、成長促進させた種子ストックは、成長促進（「発芽」）によって前処理されている。発芽前及び成長促進させた種子ストックは、より短い出芽時間の利点を有する。播種後の出芽の時点は、同時に、より強く同調する。これは、栽培中及び特に収穫時の農業技術的処理を向上させ、さらに収量を増加させる。発芽前に、幼根が種子ストックの殻を出るまで種子ストックを発芽させ、その後プロセスを停止させる。成長促進では、幼根が種子ストックの殻を出る前にプロセスを停止させる。発芽前の種子ストックと比較して、成長促進を受けた種子ストックは、再乾燥のストレスに鈍感であり、かかる再乾燥後に、再乾燥が一般的に推奨されていない発芽前の種子ストックと比較してより長い貯蔵寿命を有する。本記載内容において、技術的に前処理した種子ストックには、成長促進した種子ストック及び再乾燥させた種子ストックも含む。発芽前のプロセスは、米国特許第４，９０５，４１１号明細書（US 4,905,411 A）において説明されている。成長促進の種々の実施形態は、欧州特許出願公開第０ ６８６ ３４０号明細書（EP 0 686 340 A1）において説明されている。これに加えて、１つのプロセスで種子ストックを同時に丸剤化及び成長促進することも可能である。この方法は、欧州特許第２ ００２ ７０２号明細書（EP 2 002 702 B1）に記載されている。さらにペレット化した成長促進させた種子ストックが本発明に包含される。
【０１２３】
これに加えて、本発明は、本発明による種子ストック又は本発明による種子、及び前記で定義した粉衣塊を含む混合物も包含する。それにより、粉衣塊は、好ましくは、前記で定義したように、ペレット化塊として具体化される。
【０１２４】
本発明による種子ストックの貯蔵に関して、種子ストックの安定性又は貯蔵寿命に悪影響を及ぼさない貯蔵条件を選択することが好ましい。湿度の変動は、特にここで不都合でありうる。本発明の一部は、同時に撥水性及び通気性によって、袋又は容器に種子ストックを貯蔵するための方法である。かかる袋又は容器は、カートン又はパッキングとして設計されてよい。かかるカートン又はパッキングは、任意に内部防湿層を有しうる。カートン又はパッキングが二重カートンとして設計されている場合に、その安定性は向上する。本発明による種子ストック、又は本発明による技術的に処理した種子ストックを含む容器、袋、カートン又はパッキングは、同様に本発明の一部である。同様に、本発明による種子ストック又は本発明による技術的に処理した種子ストックをかかる袋、容器、パッキング又はカートンに保管することは本発明の一部である。
【０１２５】
本明細書において使用される場合の「配列」という用語は、「配列」という用語を使用する本記載内容に依存して、ヌクレオチド配列、ポリヌクレオチド、核酸配列、核酸、核酸分子、ペプチド、ポリペプチド及びタンパク質をいう。「ヌクレオチド配列」、「ポリヌクレオチド」、「核酸配列」、「核酸」、「核酸分子」という用語は、本明細書において互換的に使用され、任意の長さのポリマー非分岐形で、ヌクレオチド、リボヌクレオチドもしくはデオキシリボヌクレオチドのいずれか又は双方の組み合わせをいう。核酸配列は、ＤＮＡ、ＲＮＡ、ｃＤＮＡ、ゲノムＤＮＡ、ＲＮＡ、合成型、及び混合ポリマー、センス及びアンチセンスストランドの双方を含み、又は非天然又は誘導されたヌクレオチド塩基を含んでよく、当業者によって容易に理解されるであろう。
【０１２６】
「単離された核酸」は、その自然環境又は本来の環境から単離された核酸であると理解される。この用語は、合成的に製造された核酸も含む。
【０１２７】
本明細書において使用される場合に、「ポリペプチド」又は「タンパク質」という用語（両方の用語は本明細書において互換的に使用される）は、アミノ酸残基が共有ペプチド結合によって連結されている、所与の長さのアミノ酸鎖を包含するペプチド、タンパク質、又はポリペプチドを意味する。しかしながら、アミノ酸及び／又はペプチド結合が機能的類似体によって置き換えられているかかるタンパク質／ポリペプチドのペプチド模倣物は、本発明にも含まれ、２０個の遺伝子コード化アミノ酸、例えばセレノシステイン以外にも含まれる。ペプチド、オリゴペプチド及びタンパク質は、ポリペプチドと呼ばれることがある。ポリペプチドという用語も、ポリペプチドの改変、例えば、グリコシル化、アセチル化、リン酸化等をいい、これらを排除するものではない。かかる変更は、基本的なテキスト及びより詳細なモノグラフ、並びに研究文献において詳しく記載されている。
【０１２８】
アミノ酸置換は、アミノ酸が異なる天然に生じるアミノ酸残基で置き換えられているアミノ酸変化を包含する。かかる置換は、野生型タンパク質に含まれるアミノ酸残基が、類似した特性の他の天然に生じるアミノ酸、例えばＧｌｙ⇔Ａｌａ、Ｖａｌ⇔ｌｌｅ⇔Ｌｅｕ、Ａｓｐ⇔Ｇｌｕ、Ｌｙｓ⇔Ａｒｇ、Ａｓｎ⇔Ｇｌｎ又はＰｈｅ⇔Ｔｒｐ⇔Ｔｙｒで置き換えられる、「保存的」として分類されてよい。本発明に包含される置換は、野生型タンパク質に存在するアミノ酸残基が、異なる特性を有するアミノ酸、例えば異なる群からの天然に生じるアミノ酸で置換される（例えば、帯電した又は疎水性アミノ酸をアラニンで置換する）「非保存的」であってもよい。本明細書において使用される「類似のアミノ酸」は、類似のアミノ酸側鎖を有するアミノ酸、すなわち、極性、非極性又は実質的に中性の側鎖を有するアミノ酸をいう。本明細書において使用される「類似でないアミノ酸」は、異なるアミノ酸側鎖を有するアミノ酸をいい、例えば、極性側鎖を有するアミノ酸は、非極性側鎖を有するアミノ酸と類似でない。極性側鎖は、通常、タンパク質の表面に存在する傾向があり、細胞中で見出される水性環境（「親水性」アミノ酸）と相互に作用できる。一方で、「非極性」アミノ酸は、タンパク質の中心内に存在する傾向があり、類似の非極性隣接（「疎水性」アミノ酸）と相互に作用できる。極性側鎖を有するアミノ酸の例は、アルギニン、アスパラギン、アスパラギン酸塩、システイン、グルタミン、グルタミン酸塩、ヒスチジン、リジン、セリン、及びトレオニン（疎水性であるシステインを除いて全て親水性）である。非極性側鎖を有するアミノ酸の例は、アラニン、グリシン、イソロイシン、ロイシン、メチオニン、フェニルアラニン、プロリン、及びトリプトファン（中性であるグリシンを除いて全て疎水性）である。
【０１２９】
本明細書において使用される場合の「遺伝子」という用語は、リボヌクレオチド又はデオキシリボヌクレオチドのいずれかの、任意の長さのヌクレオチドのポリマー形をいう。この用語は、二本鎖及び一本鎖のＤＮＡ及びＲＮＡを含む。公知のタイプの修飾、例えば、メチル化、「キャップ」、類似体での１つ以上の天然に生じるヌクレオチドの置換も含む。好ましくは、遺伝子は、本明細書において定義したポリペプチドをコードするコード配列を含む。「コード配列」は、適切な調節配列の制御下に置いた場合又はその制御下にある場合に、ｍＲＮＡに転写され及び／又はポリペプチドに翻訳されるヌクレオチド配列である。コード配列の境界は、５’末端の翻訳開始コドン及び３’末端の翻訳停止コドンによって決定される。コード配列は、これらに限定されないが、ｍＲＮＡ、ｃＤＮＡ、組換え核酸配列又はゲノムＤＮＡを含んでよく、一方で特定の状況下ではイントロンが存在しうる。
【０１３０】
本明細書において使用される「内因性」という用語は、その天然のゲノム位置に存在する遺伝子又はアレルをいう。「内因性」という用語は、「天然」と互換的に使用できる。しかしながら、これは、野生型アレルとの１つ以上の核酸の差異の存在を排除しない。特定の実施形態において、野生型アレルとの差異は、９ヌクレオチド未満、好ましくは６ヌクレオチド未満、より詳述すれば３ヌクレオチド未満の差異に限定できる。より詳述すれば、野生型配列との差異は、１ヌクレオチドのみであってよい。好ましくは、内因性アレルは、９未満、好ましくは６未満、より詳述すれば３未満、さらにより好ましくは１つのみの野生型タンパク質とのアミノ酸差異を有する改質したタンパク質をコードする。
【０１３１】
本明細書において使用されるように、「ホモ接合体」という用語は、１つ以上の又は全ての座位で同一のアレルを有する個々の細胞又は植物をいう。この用語を特定の座位又は遺伝子に関して使用する場合に、少なくともその座位又は遺伝子が同一のアレルを有することを意味する。本明細書において使用されるように、「ホモ接合性」という用語は、同一のアレルが相同染色体上の対応する座位にある場合に存在する遺伝的状態を意味する。本明細書において使用されるように、「ヘテロ接合体」という用語は、１つ以上の又は全ての座位で異なるアレルを有する個々の細胞又は植物をいう。この用語を特定の座位又は遺伝子に関して使用する場合に、少なくともその座位又は遺伝子が異なるアレルを有することを意味する。本明細書において使用されるように、「ヘテロ接合性」という用語は、異なるアレルが相同染色体上の対応する座位にある場合に存在する遺伝的状態を意味する。
【０１３２】
本明細書において使用されるように、「アレル」は、相同染色体における同一の座位に位置することから遺伝における代替である、遺伝子の異なる形又は任意の種類の識別可能な遺伝子要素に関連する種々の遺伝子単位の代替形をいう。二倍体の細胞又は生物において、所与の遺伝子（又はマーカー）の２つのアレルは、典型的に１対の相同染色体上の対応する座位を占める。
【０１３３】
「マーカー」は、遺伝的又は物理的マップ（上で位置を見出す手段）、あるいはマーカーと形質座位（形質に影響を与える座位）との間の連結である。マーカーが検出する位置は、多型アレルの検出及びそれらの遺伝子マッピングを介して、あるいは物理的にマッピングされた配列のハイブリダイゼーション、配列一致又は増幅によって知られてよい。マーカーは、ＤＮＡマーカー（ＤＮＡ多型を検出する）、タンパク質（コードされたポリペプチドでの変異を検出する）、又は単純に継承された表現型（例えば「ｗａｘｙ」表現型）であってよい。ＤＮＡマーカーは、ゲノムヌクレオチド配列又は発現したヌクレオチド配列から（例えば、スプライシングしたＲＮＡ又はｃＤＮＡから）開発されてよい。ＤＮＡマーカー技術に応じて、マーカーは、座位に隣接する相補的プライマー及び／又は座位で多型アレルにハイブリダイズする相補的プローブからなりうる。マーカー座位という用語は、マーカーが検出する座位（遺伝子、配列、又はヌクレオチド）である。「マーカー」又は「分子マーカー」又は「マーカー座位」は、ゲノム上の特定の座位を特徴づけるために十分に独特である核酸配列又はアミノ酸配列を示すために使用されてもよい。検出可能な多型形質は、それが異なって受け継がれ、目的の表現型形質との連結不均衡を示す限り、マーカーとして使用できる。
【０１３４】
個体群のメンバー間の遺伝子多型を検出するマーカーは、当技術分野で十分に確立されている。マーカーは、検出する多型のタイプ、及び多型を検出するために使用されるマーカー技術によって定義できる。マーカーの種類は、制限酵素断片長多型（ＲＦＬＰ）の検出、アイソザイムマーカーの検出、ランダム増幅多型ＤＮＡ（ＲＡＰＤ）、増幅断片長多型（ＡＦＬＰ）、単純配列反復（ＳＳＲ）の検出、植物ゲノムの増幅させた可変配列の検出、自家持続配列複製の検出、又は一塩基多型（ＳＮＰ）の検出を含むが、これらに限定されない。ＳＮＰは、例えばＤＮＡシーケンシング、ＰＣＲベースの配列特異的増幅法、アレル特異的ハイブリダイゼーション（ＡＳＨ）によるポリヌクレオチド多型の検出、動的アレル特異的ハイブリダイゼーション（ＤＡＳＨ）、分子ビーコン、マイクロアレイハイブリダイゼーション、オリゴヌクレオチドリガーゼアッセイ、フラップエンドヌクレアーゼ、５’エンドヌクレアーゼ、プライマー伸長、一本鎖コンフォメーション多型（ＳＳＣＰ）又は温度勾配ゲル電気泳動（ＴＧＧＥ）によって検出されてよい。ＤＮＡシーケンシング、例えばパイロシーケンシング技術は、ハプロタイプを構成する一連の連結させたＳＮＰアレルを検出できる利点を有する。ハプロタイプは、ＳＮＰよりも有益である（より高いレベルの多型を検出する）傾向がある。
【０１３５】
「マーカーアレル」、あるいは「マーカー座位のアレル」は、個体群におけるマーカー座位で見出される複数の多型ヌクレオチド配列の１つを示しうる。ＳＮＰマーカーに関して、アレルは、その個々の植物におけるそのＳＮＰ座位に存在する特定のヌクレオチド塩基を示す。
【０１３６】
本明細書において使用されるように、「配列同一性」という用語は、任意の所与の核酸配列と標的核酸配列との間の同一性の程度をいう。配列同一性のパーセントは、整列させた核酸配列における一致した位置の数を測定し、一致した位置の数を整列させたヌクレオチドの総数で割り、そして１００を掛けることによって算出される。一致した位置は、整列させた核酸配列の同じ位置に同一のヌクレオチドが存在する位置をいう。配列同一性のパーセントは、任意のアミノ酸配列について決定することもできる。配列同一性のパーセントを測定するために、標的核酸又はアミノ酸配列を、ＢＬＡＳＴＮ及びＢＬＡＳＴＰを含むスタンドアロンバージョンのＢＬＡＳＴＺからのＢＬＡＳＴ２配列（Ｂｌ２ｓｅｑ）プログラムを使用して、同定した核酸又はアミノ酸配列と比較する。このスタンドアロンバージョンのＢＬＡＳＴＺは、Ｆｉｓｈ＆Ｒｉｃｈａｒｄｓｏｎのウェブサイト（ワールドワイドウェブfr.com/blast）又は米国政府の米国国立バイオテクノロジー情報センターのウェブサイト（ワールドワイドウェブncbi.nlm.nih.gov）から入手できる。Ｂｌ２ｓｅｑプログラムの使用方法を説明する手順は、ＢＬＡＳＴＺに付属のｒｅａｄｍｅファイルにある。Ｂｌ２ｓｅｑは、ＢＬＡＳＴＮ又はＬＡＳＴＰのアルゴリズムのいずれかを使用して２つの配列間の比較を実施する。
【０１３７】
ＢＬＡＳＴＮを核酸配列を比較するために使用する一方で、ＢＬＡＳＴＰをアミノ酸配列を比較するために使用する。２つの核酸配列を比較するために、オプションを次のように設定する：− ｉを比較する最初の核酸配列を含むファイルに設定する（例えばC:\seq l .txt）；− ｊを比較する２番目の核酸配列を含むファイルに設定する（例えばC:\seq2.txt）；− ｐをｂｌａｓｔｎに設定する；− ｏを任意のファイル名に設定する（例えばC :\output.txt）；− ｑを−１に設定する；− ｒを２に設定する；他の全てのオプションはデフォルト設定のままにする。次のコマンドは、２つの配列間の比較を含む出力ファイルを生成する：C:\B12seq -i c:\seql .txt -j c:\seq2.txt -p blastn -o c:\output.txt -q - 1 -r 2。標的配列が同定した配列のいずれかの部分と相同性を共有する場合に、設定した出力ファイルは、それらの相同性の領域を整列させた配列として提示される。標的配列が同定した配列のいずれかの部分と相同性を共有しない場合に、設定した出力ファイルは、整列させた配列を提示しない。整列させると、任意の一致した位置で始まり他の任意の一致した位置で終わる、同定した配列からの配列を有するアラインメントで提示した標的配列からの連続ヌクレオチドの数を数えることによって、長さを決定する。一致した位置は、標的配列と同定した配列の双方に同一のヌクレオチドが存在する任意の位置である。ギャップはヌクレオチドではないため、標的配列に存在するギャップは計数されない。同様に、同定した配列からのヌクレオチドではなく、標的配列のヌクレオチドが計数されるため、同定した配列において提示されたギャップは計数されない。特定の長さにわたる同一性のパーセントは、その長さにわたって一致した位置の数を計数し、その数を長さで割り、続いて得られた値に１００を掛けることによって決定される。例えば、（ｉ）５００塩基の核酸標的配列を対象の核酸配列と比較した場合、（ｉｉ）Ｂｌ２ｓｅｑプログラムは、その２００塩基領域の最初と最後の塩基が一致する対象配列の領域で整列した標的配列から２００塩基を提示し、（ｉｉｉ）それらの２００の整列した塩基にわたる一致の数は１８０であり、５００塩基の核酸標的配列は２００の長さ及びその９０％の長さにわたる配列同一性を含む（すなわち、１８０／２００×１００＝９０）。同定した配列と整列する単一の核酸標的配列内の異なる領域は、それぞれ独自の同一性のパーセントを有することができることが理解されよう。同一性のパーセントの値は、最も近い１０分の１に丸められることに注意する。例えば、７８．１１、７８．１２、７８．１３及び７８．１４は７８．１に切り捨てられ、一方で７８．１５、７８．１６、７８．１７、７８．１８及び７８．１９は７８．２に繰り上げられる。長さの値は常に整数になることにも注意する。
【０１３８】
「単離した核酸配列」又は「単離したＤＮＡ」は、それが単離した自然環境にもはや存在しない核酸配列、例えば細菌の宿主細胞における又は植物の核もしくは色素体ゲノムにおける核酸配列をいう。本明細書において「配列」に言及する場合に、かかる配列を有する分子は、例えば核酸分子をいうことが理解される。「宿主細胞」又は「組換え宿主細胞」又は「形質転換細胞」は、少なくとも１つの核酸分子を前記細胞に導入した結果として生じる新たな個々の細胞（又は生物）を示す用語である。宿主細胞は、好ましくは植物細胞又は細菌細胞である。宿主細胞は、染色体外（エピソーム）複製分子として核酸を含むか、又は宿主細胞の核又は色素体ゲノムに組み込まれた核酸を含むか、又は導入された染色体、例えば微小染色体として核酸を含んでよい。
【０１３９】
参照配列に対して「実質的な配列同一性」を有するか、又は参照配列に対して少なくとも８０％の配列同一性、例えば少なくとも８５％、９０％、９５％、９８％又は９９％の核酸配列同一性を有する核酸配列（例えばＤＮＡ又はゲノムＤＮＡ）を参照する場合に、一実施形態において、前記ヌクレオチド配列は、所与のヌクレオチド配列と実質的に同一であると見なされ、ストリンジェントなハイブリダイゼーション条件を使用して同定できる。他の実施形態において、核酸配列は、所与のヌクレオチド配列と比較して１つ以上の変異を含むが、未だストリンジェントなハイブリダイゼーション条件を使用して同定できる。「ストリンジェントなハイブリダイゼーション条件」を使用して、所与のヌクレオチド配列と実質的に同一であるヌクレオチド配列を同定できる。ストリンジェントな条件は、配列に依存し、状況によって異なる。一般に、ストリンジェントな条件は、定義したイオン強度及びｐＨでの特定の配列についての熱融点（Ｔｍ）よりも約５℃低くなるように選択される。Ｔｍは、（定義したイオン強度及びｐＨに基づいて）標的配列の５０％が完全に一致するプローブにハイブリダイズする温度である。通常、塩濃度がｐＨ７で約０．０２モルであり、温度が少なくとも６０℃であるストリンジェントな条件が選択される。塩濃度を下げる及び／又は温度を上げることは、ストリンジェンシーが高まる。ＲＮＡ−ＤＮＡハイブリダイゼーションのストリンジェントな条件（例えば１００ｎｔのプローブを使用したノーザンブロット）は、例えば６３℃で２０分間、０．２×ＳＳＣ中での少なくとも１回の洗浄を含む条件、又は同等の条件である。ＤＮＡ−ＤＮＡハイブリダイゼーションのストリンジェントな条件（例えば１００ｎｔのプローブを使用したサザンブロット）は、例えば少なくとも５０℃、通常約５５℃の温度で２０分間、０．２×ＳＳＣ中での少なくとも１回（通常２回）の洗浄を含む条件、又は同等の条件である。Ｓａｍｂｒｏｏｋら（１９８９）、並びにＳａｍｂｒｏｏｋ及びＲｕｓｓｅｌｌ（２００１）も参照されたい。
【０１４０】
「ハイブリダイズする」又は「ハイブリダイゼーション」という用語は、一本鎖核酸分子が、一本鎖核酸分子自体を相補的核酸鎖に結合させるプロセス、すなわちこの塩基対と適合させるプロセスを意味する。ハイブリダイゼーションの標準的な手順は、例えば、Ｓａｍｂｒｏｏｋら（Molecular Cloning. A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory Press, 3rd edition 2001）において記載されている。好ましくは、これは、核酸鎖の塩基の少なくとも５０％、より好ましくは少なくとも５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％又は８５％、より好ましくは９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％又は９９％が、相補的な核酸鎖と塩基対を形成することを意味すると解される。このような結合の可能性は、ハイブリダイゼーション条件のストリンジェンシーに依存する。「ストリンジェンシー」という用語は、ハイブリダイゼーション条件をいう。塩基対形成がより困難な場合に高いストリンジェンシーであり、塩基対形成が促進される場合に低いストリンジェンシーである。ハイブリダイゼーション条件のストリンジェンシーは、例えば、塩濃度又はイオン強度及び温度に依存する。一般に、ストリンジェンシーは、温度を上げる及び／又は塩分を減らすことによって高められる。「ストリンジェントなハイブリダイゼーション条件」は、ハイブリダイゼーションが主に相同な核酸分子間でのみ生じる条件として定義される。「ハイブリダイゼーション条件」という用語は、一般の条件での核酸の実際の結合だけでなく、一般の条件でのその後の洗浄ステップでも示す。ストリンジェントなハイブリダイゼーション条件は、例えば、主に、少なくとも７０％、好ましくは少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％又は少なくとも９５％の配列同一性を有する核酸分子のみがハイブリダイズする条件である。それほどストリンジェントでないハイブリダイゼーション条件は、３７℃で４×ＳＳＣでのハイブリダイゼーション、続いて室温で１×ＳＳＣでの繰り返し洗浄を含む。ストリンジェントなハイブリダイゼーション条件は、６５℃で４×ＳＳＣでのハイブリダイゼーション、続いて６５℃で０．１×ＳＳＣでの合計約１時間の繰り返し洗浄を含む。
【０１４１】
一態様において、本発明は、グリホサート抵抗又は耐性のベータ尋常性植物を提供するための方法に関する。かかる方法は、変異誘発を含みうる。特定の実施形態において、ｅｐｐｐシンターゼ遺伝子の核酸改変は、ランダム変異誘発により実施される。細胞又は生物は、変異原物質、例えばＵＶ線又は変異原性化学物質（例えば、メタンスルホン酸エチル（ＥＭＳ））に曝露されてよく、そして所望の特性を有する変異体が選択される。変異体は、例えば、ＴＩＬＬＩＮＧ（ゲノムにおいて誘発させた局所病変を標的とする）によって同定できる。前記方法は、変異誘発、例えばメタンスルホン酸エチル（ＥＭＳ）のような化学変異原を使用した変異誘発発と、標的遺伝子における単一塩基変異／点変異を同定する高感度ＤＮＡスクリーニング技術とを組み合わせる。ＴＩＬＬＩＮＧ法は、複数のアレルをＰＣＲによって増幅させ、そして加熱し、ゆっくりと冷却させた場合に形成されるＤＮＡヘテロ二本鎖の形成に依存する。２本のＤＮＡ鎖のミスマッチで「バブル」が形成され、それは一本鎖ヌクレアーゼによって切断される。そしてその生成物は、サイズによって、例えばＨＰＬＣによって分離される。ＭｃＣａｌｌｕｍら “Targeted screening for induced mutations”; Nat Biotechnol. 2000 Apr;18(4):455-7及びＭｃＣａｌｌｕｍら “Targeting induced local lesions IN genomes (TILLING) for plant functional genomics”; Plant Physiol. 2000 Jun;123(2):439-42も参照されたい。特定の実施形態において、変異体ｅｐｓｐシンターゼは、当該技術分野において公知であるように、ＣＲＩＳＰＲ／Ｃａｓ（例えばＣＲＩＳＰＲ／Ｃａｓ９又はＣＲＩＳＰＲＣｐｆ１）、ジンクフィンガーヌクレアーゼ、メガヌクレアーゼ、又はＴＡＬＥＮ遺伝子編集技術を含む遺伝子編集技術のような標的変異誘発によって得られうる。
【０１４２】
一態様において、本発明は、本明細書において記載される本発明によるｅｐｓｐ（又はＡＬＳ）変異を検出又は同定するための方法に関する。本明細書の他の場所において記載されているように、任意の検出手段を適用することができ、例えば、スプライシング、ハイブリダイゼーションベースの方法（例えば（動的）アレル特異的ハイブリダイゼーション、分子ビーコン、ＳＮＰマイクロアレイ）、酵素ベースの方法（例えばＰＣＲ、ＫＡＳＰ（Ｋｏｍｐｅｔｉｔｉｖｅ Ａｌｌｅｌｅ Ｓｐｅｃｉｆｉｃ ＰＣＲ）、ＲＦＬＰ、ＡＬＦＰ、ＲＡＰＤ、フラップエンドヌクレアーゼ、プライマー伸長、５’−ヌクレアーゼ、オリゴヌクレオチドライゲーションアッセイ）、ＤＮＡの物理的特性に基づく増幅後の方法（例えば一塩基多型、温度勾配ゲル電気泳動、変性高性能液体クロマトグラフィー、アンプリコン全体の高解像度融解、ＤＮＡミスマッチ結合タンパク質の使用、ＳＮＰｌｅｘ、サーベイヤーヌクレアーゼアッセイ）等を含む。
【０１４３】
特定の実施形態において、検出を、ＫＡＳＰによって実施する。特定の実施形態において、ＫＡＳＰマーカーは、ｓ１ｔｘｅｐｓｓ０２（配列番号１７〜１９）である。好ましくは、このＫＡＳＰマーカーは、ＢｖＥＰＳＰＳにおけるＰ１７９Ｓアミノ酸変化を生じるベータ・ブルガリスの内因性ｅｐｓｐｓ遺伝子における一塩基点変異を検出するために有用である。
【０１４４】
本明細書において使用される「発酵」は、微生物を使用して有機分子を他の分子に変換するプロセスをいう。例えば、「発酵」は、植物材料、例えば本発明の植物材料から糖又は他の分子を好気的に変換して、アルコール（例えば、エタノール、メタノール、ブタノール）；有機酸（例えば、クエン酸、酢酸、イタコン酸、乳酸、グルコン酸）；ケトン（例：アセトン）、アミノ酸（例えばグルタミン酸）；気体（例えばＨ２及びＣＯ２）、抗生物質（例えばペニシリン及びテトラサイクリン）；酵素；ビタミン（例えばリボフラビン、Ｂ１２、ベータカロチン）；及び／又はホルモンを生成することをいう。発酵は、消費可能なアルコール産業において使用される発酵（例えばビール及びワイン）を含む。発酵は、例えばバイオ燃料の生産のための嫌気的発酵も含む。発酵は、これらに限定されないが細菌、真菌、古細菌、及び原生生物を含む、所望の発酵ステップにおける使用に適した任意の生物によって達せられる。適した発酵生物は、単糖類、二糖類、及び三糖類、特にグルコース及びマルトース、又は他のバイオマス由来分子を、直接的又は間接的に所望の発酵生成物（例えば、エタノール、ブタノール等）に変換できるものを含む。適した発酵生物は、糖でない分子を所望の発酵生成物に変換することができる生物も含む。かかる生物及び発酵方法は、当業者に公知である。
【０１４５】
本明細書において使用される「バイオ燃料」という用語は、バイオマス、すなわち、生きている又は最近まで生きていた生物学的生物、例えば植物又は動物の排泄物に由来する燃料をいう。バイオ燃料は、バイオディーゼル、バイオ水素、バイオガス、バイオマス由来のジメチルフラン（ＤＭＦ）等を含むが、これらに限定されない。特に、「バイオ燃料」という用語は、植物由来のアルコール、例えばエタノール、メタノール、プロパノール、又はブタノールを示すために使用でき、それらは使用前に必要に応じて変性させることができる。「バイオ燃料」という用語は、植物由来燃料を含む燃料混合物、例えばアルコール／ガソリン混合物（すなわち、ガソホール）を示すために使用することもできる。ガソホールは、任意の所望の割合の植物由来アルコール（すなわち、約１０％、１５％、２０％、２５％、３０％、３５％、４０％、４５％、５０％、５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、又は９５％の植物由来アルコール）を含みうる。例えば、有用なバイオ燃料ベースの混合物の１つは、エタノール８５％とガソリン１５％を含むＥ８５である。バイオ燃料は、植物材料の好気性発酵又は嫌気性発酵によって生成される任意のバイオ燃料であってよい。好気性発酵によって得られるバイオ燃料の限定されない例は、バイオエタノールである。嫌気性発酵によって得られるバイオ燃料は、バイオガス及び／又はバイオディーゼルを含むが、これらに限定されない。好気性発酵及び／又は嫌気性発酵の方法は、当業者に公知である。本発明によりさらに含まれるのは、１つ以上のバイオ燃料を製造するための方法又は本発明によって製造されるエタノール、バイオガス、及び／又はバイオディーゼルを含む群から選択されるバイオ燃料である。
【０１４６】
本発明は、他の産業用途、例えば本発明のテンサイ植物における抗体又はバイオプラスチックの生産を含む。さらに、本発明のテンサイ植物又はその一部は、例えば牛の飼料として、さらなる処理なしで使用することもできる。
【０１４７】
「糖」という用語は、発酵性の単糖、二糖、及び三糖、特に単糖及び二糖をいう。したがって、本発明において、糖は、スクロース、フルクトース、グルコース、ガラクトース、マルトース、ラクトース、及びマンノース、好ましくはスクロースを含むが、これらに限定されない。
【０１４８】
本発明の態様及び実施形態は、以下の限定されない例によってさらに裏付けられる。
【０１４９】
実施例
テンサイエリート系統Ｔ８０７（３ＢＴ１７６０、Ｍ０個体群）の種子６ｋｇを、０．５％のＥＭＳ並びにそれぞれ０．３％及び０．５％のＥＮＵで変異誘発し、その後、茎の生産のために掘った。５．８ヘクタールの面積を占める種子生産のために、茎を植え替えた。Ｍ１の個体サイズは、ＥＭＳについて７５０００の種子生産植物、及びＥＮＵ変異種子について１９０００の植物であった。次のＭ２種子量（精製した種子について得た値）を得た：０．５％ＥＭＳについて２４０ｋｇ（識別子Ａ及びＢ）、０．３％ＥＮＵについて５４８ｋｇ（識別子Ｃ及びＤ）、並びに０．５％ＥＮＵについて２５６ｋｇ（識別子Ｅ及びＦ）。
【０１５０】
１７６ｋｇの識別子Ａ及びＢ、並びに７５ｋｇの識別子Ｃ、Ｄ、Ｅ及びＦを、約１５ヘクタールに及ぶ現場で播種した。播種後約１か月で、畑全体に、０．８８ｌ／ｈａのＲＯＵＮＤＵＰ（登録商標）ＭＡＸ（６８０ｇ／ｋｇグリホサート酸当量）を散布した。約６週間後に、グリホサート処理で生き残った植物を畑に集め、鉢に移植し、そして温室でさらに栽培した。生き残った植物を、約２か月後に６００ｇ／ｈａのグリホサート酸当量で処理した。１７２本の植物が、除草剤による損傷の兆候のない非常に健康な段階でその処理を生き延びた。
【０１５１】
観察した除草剤耐性の背後にある原因となる変異を同定するために、シーケンシング分析を実施した。とりわけ、テンサイにおけるｅｐｓｐシンターゼ遺伝子のエキソン２を、全ての１７２本の生きていた植物において、ＰＣＲ増幅させ（プライマーＢｖＥＰＳＰＳ＿Ｅｘ＿２＿ｆｏｒ、５’−ｇｇａａａｔｔｔｃｃａｔｃｃｔａａｃｇａｇ−３’（配列番号１３）、及びＢｖＥＰＳＰＳ＿Ｅｘ＿２＿ｒｅｖ、５’−ｇｃａａｇａｇｇａａａｃａａｇｔｃｔｃｃａ−３’（配列番号１４））、そしてサンガー配列決定した（プライマーＢｖＥＰＳＰＳ＿Ｅｘ２＿Ｓｅｑｆ、５’−ｃａｔｃｃｔａａｃｇａｇａａｔｔａｔｇｃ−３’（配列番号１５）、及びＢｖＥＰＳＰＳ＿Ｅｘ２＿Ｓｅｑｒ、５’−ｇｔｃｔｃｃａｃａｃａａａａｔａａａａｇ−３’（配列番号１６））。識別子６ＭＳ１００８−１０９を有するテンサイ植物は、ＢｖＥＰＳＰＳにおいてＰ１７９Ｓアミノ酸変化を生じるＣからＴへの変異を持っていた。この人工ＳＮＰを、ｉｎ ｓｉｌｉｃｏで開発されたＫＡＳＰマーカーｓ１ｔｘｅｐｓｓ０２（配列番号１７〜１９）を使用したＫＡＳＰマーカーアッセイによって個々に確認した。
【数１】
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【０１５２】
本発明の特定の実施形態によるＰ１７９Ｓアミノ酸変化を生じる変異を有する、変異体ｅｐｐｐシンターゼ遺伝子のゲノムＤＮＡヌクレオチド配列を配列番号１において提供する。本発明の特定の実施形態によるＰ１７９Ｓアミノ酸変化を生じる変異を有する、変異体ｅｐｐｐシンターゼ遺伝子のｃＤＮＡヌクレオチド配列を配列番号２において提供する。本発明の特定の実施形態によるＰ１７９Ｓ変異を有する、変異体ｅｐｐｐシンターゼ遺伝子のタンパク質配列を配列番号３において提供する。本発明の特定の実施形態によるＰ１７９Ｓアミノ酸変化を生じる変異及びＴ１７５Ｉアミノ酸変化を有する、変異体ｅｐｐｐシンターゼ遺伝子のゲノムＤＮＡヌクレオチド配列を配列番号４において提供する。本発明の特定の実施形態によるＰ１７９Ｓアミノ酸変化を生じる変異及びＴ１７５Ｉアミノ酸変化を有する、変異体ｅｐｐｐシンターゼ遺伝子のｃＤＮＡヌクレオチド配列を配列番号５において提供する。本発明の特定の実施形態によるＰ１７９Ｓ変異及びＴ１７５Ｉ変異を有する、変異体ｅｐｐｐシンターゼ遺伝子のタンパク質配列を配列番号６おいて提供する：
【表１−１】
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【表１−２】
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【表１−３】
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【表２】
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【表３】
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【表４−１】
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【表４−２】
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【表４−３】
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【表５】
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【表６】
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【０１５３】
本発明の特定の実施形態によるＷ５６９Ｌアミノ酸変化を生じる変異を有する、変異体ＡＬＳ遺伝子のゲノムＤＮＡヌクレオチド配列を配列番号７において提供する。本発明の特定の実施形態によるＷ５６９Ｌアミノ酸変化を生じる変異を有する、変異体ＡＬＳ遺伝子のｃＤＮＡヌクレオチド配列を配列番号８において提供する。本発明の特定の実施形態によるＷ５６９Ｌ変異を有する、変異体ＡＬＳ遺伝子のタンパク質配列を配列番号９において提供する。本発明の特定の実施形態によるＷ５６９Ｌアミノ酸変化を生じる変異及びＰ１８８Ｓアミノ酸変化を有する、変異体ＡＬＳ遺伝子のゲノムＤＮＡヌクレオチド配列を配列番号１０において提供する。本発明の特定の実施形態によるＷ５６９Ｌアミノ酸変化を生じる変異及びＰ１８８Ｓアミノ酸変化を有する、変異体ＡＬＳ遺伝子のｃＤＮＡヌクレオチド配列を配列番号１１において提供する。本発明の特定の実施形態によるＷ５６９Ｌ変異及びＰ１８８Ｓ変異を有する、変異体ＡＬＳ遺伝子のタンパク質配列を配列番号１２において提供する：
【表７−１】
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【表７−２】
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【表８】
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【表９】
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【表１０−１】
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【表１０−２】
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【表１１】
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【表１２】
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【０１５４】
スクリーニング方法及び選択方法に基づいて、ＢｖＥＰＳＰＳにおけるヘテロ接合Ｐ１７９Ｓ変異が、標準的な野外処理レベルの約５０％である６００ｇ／ｈａのグリホサート酸当量に対する完全な耐性を付与するという非常に強い兆候がある。ヘテロ接合変異体を戻し交配させ、自家受粉させて、種子を収穫する。選択された変異体の特徴付けのためのグリホサート耐性レベルの最初の用量設定を実施する。Ｐ１７９Ｓ変異は、ヘテロ接合及びホモ接合状態でグリホサートに対する耐性を付与する。
【配列表】
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【国際調査報告】
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