(57)【要約】本明細書で提供されるのは、修飾されたカベオリン−１（Ｃａｖ−１）ペプチドを含む組成物である。さらに、肺感染症または急性もしくは慢性の肺損傷、特に肺線維症の処置のために修飾されたＣａｖ−１ペプチドを使用する方法が提供される。【選択図】図１
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【特許請求の範囲】
【請求項１】
アミノ酸配列ＡＳＦＴＴＦＴＶＴ（配列番号３）を含むペプチドであって、配列番号１との同一性を欠く少なくとも１つのＮ末端またはＣ末端付加を含む、前記ペプチド。
【請求項２】
前記ペプチドが、Ｎ末端に付加された少なくとも１つのアミノ酸を含む、請求項１に記載のペプチド。
【請求項３】
前記ペプチドが、前記Ｃ末端に付加された少なくとも１つのアミノ酸を含む、請求項１に記載のペプチド。
【請求項４】
前記ペプチドが、Ｎ末端及びＣ末端に付加された少なくとも１つのアミノ酸を含む、請求項１に記載のペプチド。
【請求項５】
前記ペプチドがＬ−アミノ酸を含む、請求項１〜４のいずれか１項に記載のペプチド。
【請求項６】
前記ペプチドがＤ−アミノ酸を含む、請求項１〜４のいずれか１項に記載のペプチド。
【請求項７】
前記ペプチドがＬ−アミノ酸及びＤ−アミノ酸の両方を含む、請求項１〜４のいずれか１項に記載のペプチド。
【請求項８】
前記ペプチドが重水素化残基を含む、請求項１〜４のいずれか１項に記載のペプチド。
【請求項９】
前記ペプチドが少なくとも１つの非標準アミノ酸を含む、請求項１〜７のいずれか１項に記載のペプチド。
【請求項１０】
前記ペプチドが２つの非標準アミノ酸を含む、請求項９に記載のペプチド。
【請求項１１】
前記非標準アミノ酸がオルニチンである、請求項９に記載のペプチド。
【請求項１２】
前記ペプチドがＮ末端修飾を含む、請求項１〜１１のいずれか１項に記載のペプチド。
【請求項１３】
前記ペプチドがＣ末端修飾を含む、請求項１〜１１のいずれか１項に記載のペプチド。
【請求項１４】
前記ペプチドがＮ末端及びＣ末端修飾を含む、請求項１〜１１のいずれか１項に記載のペプチド。
【請求項１５】
前記Ｎ末端修飾がアシル化である、請求項１２に記載のペプチド。
【請求項１６】
前記Ｃ末端修飾がアミド化である、請求項１３に記載のペプチド。
【請求項１７】
前記ペプチドがアミノ酸配列ＫＡＳＦＴＴＦＴＶＴＫＧＳ  配列番号４）を含む、請求項４に記載のペプチド。
【請求項１８】
前記ペプチドがアミノ酸配列ａａＥＧＫＡＳＦＴＴＦＴＶＴＫＧＳａａ（配列番号６）を含む、請求項７に記載のペプチド。
【請求項１９】
前記ペプチドがアミノ酸配列ＯＡＳＦＴＴＦＴＶＴＯＳ（配列番号９）を含む、請求項１１に記載のペプチド。
【請求項２０】
前記ペプチドがアミノ酸配列ＫＡＳＦＴＴＦＴＶＴＫＧＳ−ＮＨ２（配列番号５）を含む、請求項１６に記載のペプチド。
【請求項２１】
前記ペプチドがアミノ酸配列ａａＥＧＫＡＳＦＴＴＦＴＶＴＫＧＳａａ−ＮＨ２（配列番号７）を含む、請求項１６に記載のペプチド。
【請求項２２】
前記ペプチドがアミノ酸配列Ａｃ−ａａＥＧＫＡＳＦＴＴＦＴＶＴＫＧＳａａ−ＮＨ２（配列番号８）を含む、請求項１４に記載のペプチド。
【請求項２３】
前記ペプチドがアミノ酸配列ＯＡＳＦＴＴＦＴＶＴＯＳ−ＮＨ２（配列番号１０）を含む、請求項１６に記載のペプチド。
【請求項２４】
細胞透過性ペプチド（ＣＰＰ）をさらに含む、請求項１〜２３のいずれか１項に記載のペプチド。
【請求項２５】
ＣＰＰが、ＧＲＫＫＲＲＱＲＲＲＰＰＱ（配列番号２１）、ＲＱＩＫＩＷＦＱＮＲＲＭＫＷＫＫ（配列番号２２）、及びＧＩＧＡＶＬＫＶＬＴＴＧＬＰＡＬＩＳＷＩＫＲＫＲＱＱ（配列番号２３）を含む群から選択されるアミノ酸配列を含む、請求項２５に記載のペプチド。
【請求項２６】
前記ペプチドがカベオリン−１（Ｃａｖ−１）の生物学的活性を維持する、請求項１〜２５のいずれか１項に記載のペプチド。
【請求項２７】
請求項１〜２６のいずれか１項に記載の少なくとも２つのペプチドを含むペプチド多量体。
【請求項２８】
前記少なくとも２つのペプチドの第１のペプチドが、前記少なくとも２つのペプチドの第２のペプチドと本質的に同一である、請求項２７に記載のペプチド多量体。
【請求項２９】
前記少なくとも２つのペプチドの第１のペプチドが、前記少なくとも２つのペプチドの第２のペプチドと同一ではない、請求項２５に記載のペプチド多量体。
【請求項３０】
請求項１〜２９のいずれか１項に記載のペプチドを含む組成物。
【請求項３１】
前記ペプチドが実質的に純粋である、請求項３０に記載の組成物。
【請求項３２】
前記ペプチドが少なくとも９５％純粋である、請求項３０または３１に記載の組成物。
【請求項３３】
前記ペプチドが少なくとも９８％純粋である、請求項３０〜３２のいずれか１項に記載の組成物。
【請求項３４】
請求項１〜２９のいずれか１項に記載のペプチド及び薬学的に許容可能な担体を含む薬学的組成物。
【請求項３５】
前記薬学的組成物が、経口、静脈内、関節内、非経口、経腸、局所、皮下、筋肉内、頬側、舌下、直腸、膣内、陰茎内、眼内、硬膜外、頭蓋内、または吸入投与用に処方される、請求項３４に記載の薬学的組成物。
【請求項３６】
前記薬学的組成物が肺点滴注入用に処方される、請求項３４に記載の薬学的組成物。
【請求項３７】
前記薬学的組成物がネブライザー溶液として処方される、請求項３４に記載の薬学的組成物。
【請求項３８】
請求項１〜２９のいずれか１項に記載のペプチドをコードする核酸配列を含む、ポリヌクレオチド。
【請求項３９】
請求項１〜２９のいずれかに記載の有効量のペプチドを対象に投与することを含む、対象の疾患を処置または予防する方法。
【請求項４０】
前記対象が線維性または炎症性疾患を有する、請求項３９に記載の方法。
【請求項４１】
前記対象が器官線維症を有する、請求項４０に記載の方法。
【請求項４２】
前記対象が腎臓、肝臓、肺または心臓の線維症を有する、請求項４１に記載の方法。
【請求項４３】
前記炎症性疾患が炎症性眼疾患である、請求項３９に記載の方法。
【請求項４４】
対象における肺炎症、急性肺損傷、肺感染症または肺疾患を処置または予防する方法としてさらに定義される、請求項３９に記載の方法。
【請求項４５】
前記対象が肺の炎症を有する、請求項４４に記載の方法。
【請求項４６】
前記対象が慢性閉塞性肺障害（ＣＯＰＤ）を有する、請求項４４に記載の方法。
【請求項４７】
前記対象が化学療法または放射線療法を受けている、請求項３９に記載の方法。
【請求項４８】
前記対象が急性肺損傷を有する、請求項４４に記載の方法。
【請求項４９】
前記対象が肺感染症を有する、請求項４４に記載の方法。
【請求項５０】
前記対象が化学物質誘発性の肺損傷を有する、請求項４４に記載の方法。
【請求項５１】
前記対象が鋳型気管支炎を有する、請求項４４に記載の方法。
【請求項５２】
前記対象が喘息を有する、請求項４４に記載の方法。
【請求項５３】
前記対象が急性呼吸窮迫症候群（ＡＲＤＳ）を有する、請求項４４に記載の方法。
【請求項５４】
前記対象が吸入煙誘発性急性肺損傷（ＩＳＡＬＩ）を有する、請求項４４に記載の方法。
【請求項５５】
前記対象が細気管支炎を有する、請求項４４に記載の方法。
【請求項５６】
前記対象が閉塞性細気管支炎を有する、請求項４４に記載の方法。
【請求項５７】
前記肺疾患が肺の線維性状態である、請求項４４に記載の方法。
【請求項５８】
前記肺疾患が間質性肺疾患である、請求項４４に記載の方法。
【請求項５９】
前記肺疾患が特発性肺線維症（ＩＰＦ）または肺瘢痕である、請求項４４に記載の方法。
【請求項６０】
前記投与が、前記バリアントポリペプチドを含む溶液を噴霧することを含む、請求項４４に記載の方法。
【請求項６１】
前記ペプチドが全身投与される、請求項３９に記載の方法。
【請求項６２】
前記ペプチドが病変組織に局所的に投与される、請求項３９に記載の方法。
【請求項６３】
少なくとも１つの追加の抗線維化治療薬を投与することをさらに含む、請求項３９に記載の方法。
【請求項６４】
前記少なくとも１つの追加の抗線維症薬が、ＮＳＡＩＤ、ステロイド、ＤＭＡＲＤ、免疫抑制剤、生物学的応答モジュレーター、または気管支拡張剤である、請求項６３に記載の方法。
【請求項６５】
前記対象がヒトである、請求項３９に記載の方法。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
本出願は、２０１８年９月１０日に出願された米国仮特許出願第６２／７２８，９９７号の利益を主張し、その全体は、参照により本明細書に組み込まれる。
【０００２】
本発明は、本発明がなされた時点で有効であった共同研究契約の範囲内で行われた活動の結果としてなされた。上記の共同研究契約の当事者は、テキサス大学身体及び肺治療学の理事会（Ｂｏａｒｄ  ｏｆ  Ｒｅｇｅｎｔｓ  ｏｆ  ｔｈｅ  Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ  ｏｆ  Ｔｅｘａｓ  Ｓｙｓｔｅｍ  ａｎｄ  Ｌｕｎｇ  Ｔｈｅｒａｐｅｕｔｉｃｓ）である。
【背景技術】
【０００３】
１．技術分野
本発明は、全般的には、分子生物学及び医薬の分野に関する。より具体的には、それは、呼吸器系への送達などによる、対象への治療用ポリペプチド組成物の送達のための組成物及び方法に関する。
【０００４】
２．関連技術の説明
肺損傷時に、ｐ５３の発現が増大し、プラスミノーゲンアクチベーター阻害剤−１（ＰＡＩ−１）が誘導され、一方では、ウロキナーゼ型プラスミノーゲンアクチベーター（ｕＰＡ）及びその受容体（ｕＰＡＲ）の発現が阻害され、結果として肺上皮細胞（ＬＥＣ）のアポトーシスが起こる。損傷の機構には、ｕＰＡ、ｕＰＡＲ、カベオリン−１（「Ｃａｖ−１」）及びβ１−インテグリンの間の細胞表面シグナル伝達相互作用が含まれる（Ｓｈｅｔｔｙ  ｅｔ  ａｌ．，２００５）。これらの相互作用を調節する組成物は、損なわれたかまたは損傷した肺上皮細胞のアポトーシスを阻害するための方法、ならびに急性肺損傷及びその結果として生じる肺線維症を処置するための方法に使用され得る。したがって、肺損傷を予防または処置するために使用され得るポリペプチド、具体的には、そのようなポリペプチドの治療的送達のための製剤及び方法が必要である。
【発明の概要】
【０００５】
本開示によれば、配列番号２のアミノ酸配列を含むペプチドが提供され、ここで、このペプチドは、少なくとも１つのＮ末端またはＣ末端の付加を含む。Ｎ末端またはＣ末端の付加は、標準アミノ酸であっても、非標準アミノ酸であっても、または化学修飾であってもよい。本開示のペプチドのペプチド多量体が提供される。ペプチドの薬学的組成物も提供される。本開示のペプチドは、肺の損傷、感染症または疾患を治療するために使用され得る。さらなる態様において、実施形態のペプチドは、線維性状態、例えば、臓器線維症、または炎症を処置するために使用され得る。
【０００６】
いくつかの実施形態において、本開示は、アミノ酸配列ＡＳＦＴＴＦＴＶＴ（配列番号３）を含むペプチドを提供し、ここで、このペプチドは、配列番号１との同一性を欠く少なくとも１つのＮまたはＣ末端付加を含む。いくつかの態様において、このペプチドは、Ｎ末端に付加された少なくとも１つのアミノ酸を含む。いくつかの態様において、このペプチドは、Ｃ末端に付加された少なくとも１つのアミノ酸を含む。いくつかの態様において、このペプチドは、Ｎ末端及びＣ末端に付加された少なくとも１つのアミノ酸を含む。いくつかの態様において、このペプチドはカベオリン−１（Ｃａｖ−１）の生物学的活性を維持する。さらなる態様において、実施形態のペプチドは、１つ以上の重水素化残基を含み得る。
【０００７】
いくつかの態様において、このペプチドは、Ｌ−アミノ酸を含む。いくつかの態様において、このペプチドは、Ｄ−アミノ酸を含む。いくつかの態様において、このペプチドは、Ｌ−アミノ酸及びＤ−アミノ酸の両方を含む。
【０００８】
いくつかの態様において、このペプチドは、少なくとも１つの非標準アミノ酸を含む。いくつかの態様において、このペプチドは、２つ以上の非標準アミノ酸を含む。いくつかの態様において、このペプチドは、４つ以上の非標準アミノ酸を含む。いくつかの態様において、この非標準アミノ酸はオルニチンである。いくつかの態様において、この非標準アミノ酸はＤ−アラニンである。
【０００９】
いくつかの態様において、このペプチドは、Ｎ末端またはＣ末端の修飾を含む。いくつかの態様において、このペプチドは、Ｎ末端修飾を含む。いくつかの態様において、このペプチドは、Ｃ末端修飾を含む。いくつかの態様において、このペプチドは、Ｎ末端及びＣ末端修飾を含む。いくつかの態様において、このＮ末端修飾はアシル化である。いくつかの態様において、このＣ末端修飾はアミド化である。
【００１０】
いくつかの態様において、このペプチドは、アミノ酸配列ＫＡＳＦＴＴＦＴＶＴＫＧＳ（配列番号４）を含む。いくつかの態様において、このペプチドは、アミノ酸配列ａａＥＧＫＡＳＦＴＴＦＴＶＴＫＧＳａａ（配列番号６）を含む。他の態様において、このペプチドは、アミノ酸配列ＯＡＳＦＴＴＦＴＶＴＯＳ（配列番号９）を含む。他の態様において、このペプチドは、アミノ酸配列ａａＥＧＫＡＳＦＴＴＦＴＶＴＫＧＳａａ−ＮＨ２（配列番号７）を含む。さらに他の態様において、このペプチドは、アミノ酸配列Ａｃ−ａａＥＧＫＡＳＦＴＴＦＴＶＴＫＧＳａａ−ＮＨ２（配列番号８）を含む。他の態様において、このペプチドは、アミノ酸配列ＯＡＳＦＴＴＦＴＶＴＯＳ−ＮＨ２（配列番号１０）を含む。
【００１１】
いくつかの態様において、このペプチドは、細胞透過性ペプチド（ＣＰＰ）をさらに含む。いくつかの実施形態では、ＣＰＰは、ＧＲＫＫＲＲＱＲＲＲＰＰＱ（配列番号２１）、ＲＱＩＫＩＷＦＱＮＲＲＭＫＷＫＫ（配列番号２２）、及びＧＩＧＡＶＬＫＶＬＴＴＧＬＰＡＬＩＳＷＩＫＲＫＲＱＱ（配列番号２３）を含む群から選択されるアミノ酸配列を含む。
【００１２】
いくつかの実施形態において、本開示は、本明細書に開示されるような少なくとも２つのペプチドを含むペプチド多量体を提供する。いくつかの態様において、少なくとも２つのペプチドの第１のペプチドは、少なくとも２つのペプチドの第２のペプチドと本質的に同一である。他の態様において、少なくとも２つのペプチドの第１のペプチドは、少なくとも２つのペプチドの第２のペプチドと同一ではない。
【００１３】
いくつかの実施形態では、本開示は、本明細書に開示されるペプチドを含む組成物を提供する。いくつかの態様において、このペプチドは実質的に純粋である。いくつかの態様において、このペプチドは、少なくとも９５％純粋、少なくとも９６％純粋、少なくとも９７％純粋、少なくとも９８％純粋、または少なくとも９９％純粋である。
【００１４】
いくつかの実施形態において、本開示は、このペプチド、本明細書に開示されるようなペプチド、及び薬学的に許容される担体を含む薬学的組成物を提供する。いくつかの態様において、この薬学的組成物は、経口、静脈内、関節内、非経口、経腸、局所、皮下、筋肉内、頬側、舌下、直腸、膣内、陰茎内、眼内、硬膜外、頭蓋内、または吸入投与用に処方される。いくつかの態様において、この薬学的組成物は、肺点滴注入のために処方される。いくつかの態様において、この薬学的組成物は、噴霧された溶液として処方される。
【００１５】
いくつかの実施形態において、本開示は、本明細書に記載されるようなペプチドをコードする核酸配列を含むポリヌクレオチドを提供する。
【００１６】
特定の態様では、実施形態のペプチド組成物は、対象の疾患を処置または予防する方法で使用され得る。いくつかの態様において、疾患は、線維性疾患または炎症性疾患である。例えば、線維性疾患とは、臓器線維性疾患であってもよく、腎臓、肝臓、肺または心臓の線維症であってもよい。いくつかの態様において、炎症性疾患とは炎症性眼疾患である。実施形態の組成物は、全身的または局所的に（例えば、病変組織の部位に）投与されてもよい。
【００１７】
いくつかの実施形態では、本開示は、本明細書に記載の有効量のペプチドを対象に投与することを含む、対象における急性肺損傷、肺感染症または肺疾患を処置または予防する方法を提供する。いくつかの態様において、対象は肺の炎症を有する。いくつかの態様において、対象は化学療法または放射線療法を受けている。いくつかの態様において、対象は、急性肺損傷または感染症を患っている。いくつかの態様において、対象は、化学物質によって誘発された肺損傷を有する。いくつかの態様において、対象は、鋳型気管支炎、慢性閉塞性肺疾患、気管支炎、細気管支炎、閉塞性細気管支炎、喘息、急性呼吸窮迫症候群（ＡＲＤＳ）または吸入煙誘発性急性肺損傷（ＩＳＡＬＩ）を有する。いくつかの態様において、肺疾患は、肺の線維性状態である。いくつかの態様において、肺疾患は間質性肺疾患である。いくつかの態様において、肺疾患は、特発性肺線維症（ＩＰＦ）または肺瘢痕である。いくつかの態様において、投与は、ペプチドを含む溶液を噴霧することを含む。いくつかの態様において、この方法は、少なくとも１つの追加の抗線維化治療薬を投与することをさらに含む。いくつかの態様において、少なくとも１つの追加の抗線維症は、ＮＳＡＩＤ、ステロイド、ＤＭＡＲＤ、免疫抑制剤、生物学的応答モジュレーター、または気管支拡張薬である。いくつかの態様において、対象はヒトである。
【００１８】
本明細書に記載の任意の方法または組成物は、本明細書に記載の任意の他の方法または組成物に関して実施され得ると考えられる。本開示の他の目的、特徴及び利点は、以下の詳細な説明から明らかになるであろう。しかしながら、本開示の趣旨及び範囲内の様々な変更及び改変がこの詳細な説明から当業者に明らかになるので、詳細な説明及び特定の実施例は、本開示の特定の実施形態を示してはいるが、例示として示されるにすぎないことを理解されたい。
【００１９】
以下の図面は本明細書の一部をなし、かつ本発明の特定の態様をさらに裏付けるために含まれる。本発明は、これらの図面のうちの１つ以上を本明細書に提示される特定の実施形態の詳細な説明と組み合わせて参照することによって、より深く理解され得る。
【図面の簡単な説明】
【００２０】
【図１】Ｃａｖ−１ペプチドで処理されたＳＭＡ及びチューブリン特発性肺線維症細胞のウエスタンブロット。ＩＰＦ細胞は、以下：１：未処理、２：１０μＭのＬＴＩ−０３、３：９０μＭのＬＴＩ−０３、４：１０μＭのＡＰｉ２３５０、５：１０μＭのＡＰｉ２３５４、６：１０μＭのＡＰｉ２３５５、７：１０μＭのＡＰｉ２３５６、ならびに８：ＤＭＳＯで処理し、ＳＭＡ及びチューブリンの発現をウエスタンブロットによって評価した。
【図２】Ｃａｖ−１ペプチドによる処置は、ＩＰＦ細胞のチューブリンと比較してＳＭＡを増大する。示された処置を受けている細胞におけるチューブリンに対するＳＭＡの比率のグラフ表示。
【発明を実施するための形態】
【００２１】
例示的な実施形態の説明
本開示は、修飾カベオリン−１（Ｃａｖ−１）ペプチド、ならびに疾患の処置及び予防、特に肺線維症のためのその使用を提供することによって、現在の技術に関連する課題を克服する。いくつかの態様において、修飾されたＣａｖ−１ペプチドの医薬製剤が提供される。例えば、いくつかの態様において、このペプチドは、呼吸器系への送達のために処方される。例えば、ペプチドは、水溶液中で処方すること、及びネブライザーを使用して溶液を噴霧することにより、対象の気道に投与するために調製され得る。他の態様では、ペプチドは注射用に処方され得る。治療有効量の修飾Ｃａｖ−１ペプチドを対象に（例えば、気道を介して）投与することにより、肺の損傷及び疾患を処置する方法も本明細書で提供される。
【００２２】
Ｉ．定義
本明細書で使用される場合、特定の成分に関して「本質的に遊離」は、特定の成分のいずれも意図的に組成物に配合されておらず、及び／または汚染物質としてまたは微量でのみ存在することを意味して本明細書で使用される。したがって、組成物の意図しない汚染に起因する特定の成分の総量は、０．０１％をはるかに下回る。最も好ましいのは、特定の成分の量が標準的な分析方法では検出できない組成物である。
【００２３】
本明細書で使用される場合、「ａ」または「ａｎ」とは、１つ以上を意味する場合がある。本明細書で特許請求の範囲で使用される場合、「含む」という単語と併せて使用される場合、「ａ」または「ａｎ」という単語は、１つ以上を意味し得る。
【００２４】
特許請求の範囲における「または」という用語の使用は、代替案のみを指すように明示的に示されない限り、または代替案が相互に排他的である場合を除き、「及び／または」を意味して使用されるが、この開示は、代替案のみ及び「及び／または」を指す定義を支持し、本明細書で使用される場合、「別の」は、少なくとも１秒以上を意味し得る。本明細書で使用される「別の」とは、少なくとも２番目またはそれ以上を意味し得る。
【００２５】
本明細書の全体を通して、用語「約」は、値が、この値を決定するために使用されるデバイス、方法についての誤差の固有の変動、または試験対象間で存在する変動を含むことを示すために使用される。
【００２６】
本明細書で使用される「ペプチド」という用語は、典型的には、ペプチド結合によって結合されたアミノ酸の一本鎖から構成されるアミノ酸の配列を指す。一般に、ペプチドは、他に定義されない限り、少なくとも２つのアミノ酸残基を含み、長さが約５０アミノ酸未満である。
【００２７】
「生物学的に活性な」カベオリン−１（Ｃａｖ−１）ペプチドとは、ｐ５３タンパク質レベルを増大させ、ウロキナーゼプラスミノーゲンアクチベーター（ｕＰＡ）及びｕＰＡ受容体（ｕＰＡＲ）を減少させるか、及び／または線維性肺線維芽細胞などの細胞でのプラスミノーゲンアクチベーター阻害剤−１（ＰＡＩ−１）発現を増大させるペプチドを指す。いくつかの態様において、生物学的に活性なペプチドは、配列番号１の天然のＣａｖ−１ポリペプチドの生物学的または生化学的活性の少なくとも２０％を有する（例えば、インビトロまたはインビボのアッセイによって測定される場合）。いくつかの態様において、生物学的活性ペプチドは、天然のＣａｖ−１ポリペプチドと比較して、生物学的または生化学的活性が増大している。
【００２８】
「同一性」または「相同性」という用語は、配列をアライメントし、及びギャップを導入した（全体の配列について、同一性最大パーセントを得るのに必要な場合）後に、そして配列同一性の部分としていかなる保存的置換も考慮に入れずに、それが比較される対応する配列の残基と同一である候補配列中のアミノ酸残基のパーセンテージを意味すると解釈されるべきである。Ｎ末端またはＣ末端の伸長も挿入も、同一性または相同性を低下させると解釈されるべきではない。アラインメントのための方法及びコンピュータプログラムは、当該技術分野で周知である。配列同一性は、配列分析ソフトウェアを使用して測定され得る。
【００２９】
「ポリペプチド」または「タンパク質」という用語は、その最も広い意味で、２つ以上のサブユニットアミノ酸、アミノ酸類似体、またはペプチド模倣物の化合物を指して使用される。サブユニットはペプチド結合によって連結され得る。別の実施形態では、サブユニットは、他の結合、例えば、エステル、エーテルなどによって連結され得る。本明細書で使用される場合、「アミノ酸」という用語は、グリシン及びＤまたはＬ光学異性体の両方、ならびにアミノ酸類似体及びペプチド模倣物を含む、天然及び／または非天然または合成アミノ酸のいずれかを指す。「ペプチド模倣物（ｐｅｐｔｉｄｏｍｉｍｅｔｉｃ）」または「ペプチド模倣物（ｐｅｐｔｉｄｏ  ｍｉｍｉｃ）」という用語は、本発明によるペプチドが、例えば、尿素結合、カルバメート結合、スルホンアミド結合、ヒドラジン結合、または任意の他の共有結合などの少なくとも１つの非ペプチド結合を含むように修飾されることを意味する。ペプチド鎖が短い場合、３つ以上のアミノ酸のペプチドは一般にオリゴペプチドと呼ばれる。ペプチド鎖が長い場合、そのペプチドは一般にポリペプチドまたはタンパク質と呼ばれる。
【００３０】
「対象」及び「個体」及び「患者」という用語は、本明細書では交換可能に使用され、本明細書に開示されるような薬学的組成物を用いた、予防的処置を含む処置を受ける動物、例えば、ヒトまたは非ヒト動物（例えば、哺乳動物）を指す。本明細書で使用される「対象」という用語は、ヒト及び非ヒト動物を指す。「非ヒト動物」という用語は、全ての脊椎動物、例えば、非ヒト霊長類（特に高等霊長類）、ヒツジ、イヌ、げっ歯類（例えば、マウスまたはラット）、モルモット、ヤギ、ブタ、ネコ、ウサギ、ウシなどの哺乳動物、及びニワトリ、両生類、爬虫類などの非哺乳動物を含む。一実施形態では、対象はヒトである。別の実施形態では、対象は、疾患モデルとしての実験動物または動物代替物である。非ヒト哺乳動物には、非ヒト霊長類（特に高等霊長類）、ヒツジ、イヌ、げっ歯類（例えば、マウスまたはラット）、モルモット、ヤギ、ブタ、ネコ、ウサギ及びウシなどの哺乳動物が挙げられる。いくつかの態様において、非ヒト動物は、イヌまたはネコなどのコンパニオンアニマルである。
【００３１】
対象における疾患もしくは状態を「処置すること」または疾患もしくは状態を有する患者を「処置すること」とは、例えばその疾患の少なくとも１つの症状または状態が低下または安定するように、個体に薬学的処置、例えば、薬物の投与をすることを指す。典型的には、ペプチドが処置として治療的に投与される場合、それは、肺損傷または肺線維症の１つ以上の症状を呈する対象に投与される。
【００３２】
「単離された」とは、そのポリペプチドが、体液、例えば、血液などの任意の自然環境から分離され、そのペプチドに自然に付随する成分から分離されていることを意味する。
【００３３】
単離された「実質的に純粋な」とは、天然には付随する成分から少なくともある程度分離及び精製されたポリペプチドを意味する。典型的には、ポリペプチドは、それが、タンパク質及びそれが自然に関連している天然に存在する有機分子を、少なくとも約６０重量％、または少なくとも約７０重量％、少なくとも約８０重量％、少なくとも約９０重量％、少なくとも約９５重量％、またはさらに少なくとも約９９重量％含まない場合、実質的に純粋である。例えば、実質的に純粋なポリペプチドは、天然の供給源からの抽出によって、通常はそのタンパク質を発現しない細胞における組換え核酸の発現によって、または化学合成によって、得てもよい。
【００３４】
本明細書で使用される「バリアント」という用語は、１つ以上のアミノ酸または核酸の欠失、付加、置換または側鎖修飾によって、ポリペプチドまたは核酸とは異なるが、天然に存在する分子の１つ以上特異的な機能または生物学的活性を保持するポリペプチドまたは核酸を指す。アミノ酸置換としては、アミノ酸が異なる天然または非従来型のアミノ酸残基で置換されている変更が挙げられる。そのような置換は「保存的」として分類され得、その場合、ポリペプチドに含まれるアミノ酸残基は、極性、側鎖官能性またはサイズのいずれかに関して類似の特徴の別の天然に存在するアミノ酸で置き換えられる。そのような保守的な置換は当該技術分野で周知である。本発明に含まれる置換はまた、「非保存的」であってもよく、ここでは、ペプチドに存在するアミノ酸残基が、異なるグループ由来の天然に存在するアミノ酸などの異なる特性を有するアミノ酸で置換されている（例えば、荷電または疎水性アミノ酸をアラニンで置換する）か、あるいは、天然に存在するアミノ酸が非従来型アミノ酸で置換されている。いくつかの実施形態において、アミノ酸置換は保存的である。ポリヌクレオチドまたはポリペプチドに関して使用される場合、バリアントという用語にも含まれ、それぞれ、参照ポリヌクレオチドまたはポリペプチドと比較して（例えば、野生型ポリヌクレオチドまたはポリペプチドと比較して）、一次、二次、または三次構造が異なり得るポリヌクレオチドまたはポリペプチドを指す。
【００３５】
「挿入」または「欠失」という用語は、典型的には、約１から５アミノ酸の範囲にある。許容される変動は、組換えＤＮＡ技術を使用して、配列内のヌクレオチドの挿入、欠失、または置換を体系的に行いながら、ペプチドを合成的に生成することによって実験的に決定され得る。
【００３６】
ペプチドを指す場合の「置換」という用語は、異なる実体、例えば、別のアミノ酸またはアミノ酸部分のアミノ酸の変化を指す。置換は、保存的置換であっても、または非保存的置換であってもよい。
【００３７】
ペプチドなどの分子の「類似体」とは、分子全体またはそのフラグメントのいずれかと機能が類似している分子を指す。「類似体」という用語はまた、対立遺伝子種及び誘導されたバリアントを含むことを意図している。類似体は通常、多くの場合、保存的置換が原因で、１つまたはいくつかの位置で、天然に存在するペプチドとは異なる。類似体とは通常、天然ペプチドと少なくとも８０または９０％の配列同一性を示す。いくつかの類似体には、非天然アミノ酸またはＮまたはＣ末端アミノ酸の修飾も含まれる。非天然アミノ酸の例は、例えば、限定するものではないが、二置換アミノ酸、Ｎ−アルキルアミノ酸、乳酸、４−ヒドロキシプロリン、γ−カルボキシグルタミン酸、ε−Ν，Ν，Ν−トリメチルリジン、ε−Ν−アセチルリジン、Ｏ−ホスホセリン、Ｎ−アセチルセリン、Ｎ−ホルミルメチオニン、３−メチルヒスチジン、５−ヒドロキシリジン、σ−Ν−メチルアルギニンが挙げられる。フラグメント及び類似体は、以下に記載されるように、トランスジェニック動物モデルにおける予防的または処置的有効性についてスクリーニングされ得る。
【００３８】
「共有結合」とは、共有化学結合によって直接的または間接的に（例えば、リンカーを介して）結合されることを意味する。本発明の全ての実施形態のいくつかの態様では、融合ペプチドは共有結合されている。
【００３９】
本明細書で使用される「融合タンパク質」という用語は、２つ以上のタンパク質の組換えタンパク質を指す。融合タンパク質は、例えば、あるタンパク質をコードする核酸配列が別のタンパク質をコードする核酸に結合され、その結果、細胞中で、意図された全てのタンパク質を保有する単一のポリペプチドに翻訳され得る単一のオープンリーディングフレームを構成する。タンパク質の配置の順序は様々であり得る。融合タンパク質には、エピトープタグまたは半減期延長剤を含み得る。エピトープタグとしては、ビオチン、ＦＬＡＧタグ、ｃ−ｍｙｃ、ヘマグルチニン、Ｈｉｓ６、ジゴキシゲニン、ＦＩＴＣ、Ｃｙ３、Ｃｙ５、緑色蛍光タンパク質、Ｖ５エピトープタグ、ＧＳＴ、β−ガラクトシダーゼ、ＡＵ１、ＡＵ５、及びアビジンが挙げられる。半減期延長剤としては、Ｆｃドメイン及び血清アルブミンが挙げられる。
【００４０】
「気道」という用語は、本明細書では、上気道、気道、及び肺を含む気道の任意の部分を指す。上気道には、鼻及び鼻腔、口、ならびに喉が含まれる。気道には、喉頭、気管、気管支、及び細気管支が含まれる。肺には、呼吸細気管支、肺胞管、肺胞嚢、及び肺胞が含まれる。
【００４１】
「吸入煙誘発性急性肺損傷」及び「ＩＳＡＬＩ」という用語は、本明細書では交換可能に使用され、煙吸入によって引き起こされる急性肺損傷（ＡＬＩ）の形態を指す。ＡＬＩは「軽度の急性呼吸窮迫症候群；ＡＲＤＳ」とも呼ばれる。ＡＲＤＳとは、対象の以下の状態のうち１つ以上を見出すことによって定義され得る：１）胸部Ｘ線での両側肺浸潤、２）臨床的に示されるように右心カテーテル検査で測定した場合、肺動脈楔入圧が１８ｍｍＨｇ（２．４ｋＰａ）未満、及び３）ＰａＯ２／ＦｉＯ２＜３００ｍｍＨｇ（４０ｋＰａ）。いくつかの実施形態において、ＩＳＡＬＩの処置は、以下の状態のうちの１つ以上の処置を含む：酸素化の減少、気道閉塞（重度の気道閉塞を含む）、線維性気道キャストまたは破片、及び肺胞フィブリン沈着。
【００４２】
「噴霧化」、「噴霧化」という用語及び他の文法的変形は、本明細書では、液体を小さなエアロゾル液滴に変換するプロセスを指す。いくつかの実施形態では、エアロゾル液滴は、約２〜１０μｍの中央径を有する。いくつかの実施形態では、エアロゾル液滴は、約２〜４μｍの中央径を有する。
【００４３】
ＩＩ．カベオリン−１ペプチド
本開示の実施形態は、カベオリン−１（Ｃａｖ−１）タンパク質のペプチドバリアントを提供する。カベオリン−１（Ｃａｖ−１）足場ドメインまたはポリペプチドは、ＳｒｃキナーゼとのＣａｖ−１相互作用を妨害し、ｕＰＡと抗β１−インテグリン抗体との複合効果を模倣する。天然のヒトＣａｖ−１の長さは、１７８アミノ酸、及び分子量は２２ｋＤａである。Ｃａｖ−１のアミノ酸配列を以下に示す（配列番号１）。
１  ＭＳＧＧＫＹＶＤＳＥ  ＧＨＬＹＴＶＰＩＲＥ  ＱＧＮＩＹＫＰＮＮＫ  ＡＭＡＤＥＬＳＥＫＱ  ＶＹＤＡＨＴＫＥＩＤ  ＬＶＮＲＤＰＫＨＬＮ
６１  ＤＤＶＶＫＩＤＦＥＤ  ＶＩＡＥＰＥＧＴＨＳ  ＦＤＧＩＷＫＡＳＦＴ  ＴＦＴＶＴＫＹＷＦＹ  ＲＬＬＳＡＬＦＧＩＰ  ＭＡＬＩＷＧＩＹＦＡ
１２１        ＩＬＳＦＬＨＩＷＡＶ  ＶＰＣＩＫＳＦＬＩＥ  ＩＱＣＩＳＲＶＹＳＩ  ＹＶＨＴＶＣＤＰＬＦ  ＥＡＶＧＫＩＦＳＮＶ  ＲＩＮＬＱＫＥＩ
【００４４】
いくつかの態様において、このペプチドは、配列番号２、ＦＴＴＦＴＶＴに対して、少なくとも約４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、８５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％または９９％同一のアミノ酸配列を含む足場ドメインペプチドである。このペプチドは、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、または１９残基のポリペプチドを誘導するような、配列番号１の配列に対する１、２、３、４またはそれ以上のアミノの置換、削除、または挿入を含み得る。特定の態様では、ペプチドは、表１に示される例示的なポリペプチドなどの天然のＣａｖ−１ポリペプチドの短縮型である。
【００４５】
【表１】
2022500078.tif 000003
（ａ＝Ｄ−アラニン、Ｏ＝オルニチン）
【００４６】
本開示で提供されるペプチドは、結合または生物学的活性のインビトロまたはインビボアッセイにおいて天然のＣＡＶ−１ポリペプチドの活性を有する、生物学的に活性な誘導体である。特定の態様において、ペプチドは、インビトロまたはインビボでＢＬＭによって誘導されるＬＥＣのアポトーシスを、天然ＣＡＶ−１ポリペプチドの活性の少なくとも約２０％、または少なくとも約３０％、４０％、５０％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、約９５％、９７％、９９％、及びその中で導出可能な任意の範囲、例えば、約７０％〜約８０％、より好ましくは約８１％〜約９０％；またはさらにより好ましくは、約９１％〜約９９％の活性で阻害または防止する。ペプチドは、ネイティブのＣＡＶ−１ポリペプチドよりも１００％またはそれ以上の活性を有し得る。生物学的活性、例えば、抗線維化活性、ｕＰＡ、ｕＰＡＲ及びＰＡＩ−１のｍＲＮＡの発現に影響を与える能力、または肺線維芽細胞の増殖を阻害する能力を試験するためのアッセイは、当技術分野で周知である。
【００４７】
本開示のペプチドは、天然のＣａｖ−１ポリペプチドまたはその修飾バージョンのペプチドである。ペプチドは、当該技術分野で周知の方法を使用して単離または生成された合成、組換え、または化学的に修飾されたペプチドであり得る。Ｎ末端、Ｃ末端、または内部のアミノ酸に修飾を加えてもよい。Ｎ末端修飾は、例えば、これらに限定されないが、アシル化、アセチル化、またはＣ末端アミド化であってもよい。ペプチドは、以下に記載されるように、保存的アミノ酸変化を含んでも、または非保存的アミノ酸変化を含んでもよい。ポリヌクレオチドの変化は、参照配列によってコードされるポリペプチドのアミノ酸置換、付加、欠失、融合及び短縮をもたらし得る。ペプチドはまた、限定するものではないが、Ｌ−アミノ酸、またはオルニチンなどの非標準アミノ酸（通常はヒトのタンパク質には存在しない）の挿入など、修飾されたバリアントの基礎であるペプチド配列に通常は生じない、アミノ酸（及び他の分子）の挿入及び置換を含む、アミノ酸の挿入、欠失または置換を含み得る。保存的置換という用語は、ペプチドを説明する場合、ペプチドの活性を実質的に変化させないペプチドのアミノ酸組成の変化を指す。例えば、保存的置換とは、あるアミノ酸残基で、類似の化学的特性を有する異なるアミノ酸残基を置換することを指す。保存的アミノ酸置換には、ロイシンをイソロイシンもしくはバリンに、アスパラギン酸をグルタメートに、またはスレオニンをセリンに置き換えることが含まれる。
【００４８】
保存的アミノ酸置換は、ロイシンをイソロイシンまたはバリンに、アスパラギン酸をグルタミン酸塩に、またはスレオニンをセリンに置き換えるなど、あるアミノ酸を同様の構造的及び／または化学的特性を有する別のアミノ酸に置き換えることから生じる。したがって、特定のアミノ酸配列の保存的置換とは、ポリペプチド活性に重要ではないアミノ酸の置換、または類似の特性を有する他のアミノ酸（例えば、酸性、塩基性、正または負の荷電、極性または非極性など）でのアミノ酸の置換であって、重要なアミノ酸の置換でさえペプチドの活性を低下させないような置換を指す。機能的に類似したアミノ酸を提供する保存的置換表は、当該技術分野で周知である。例えば、次の６つの群には、それぞれ互いに保存的な置換であるアミノ酸が含まれている：１）アラニン（Ａ）、セリン（Ｓ）、スレオニン（Ｔ）；２）アスパラギン酸（Ｄ）、グルタミン酸（Ｅ）；３）アスパラギン（Ｎ）、グルタミン（Ｑ）；４）アルギニン（Ｒ）、リジン（Ｋ）；５）イソロイシン（Ｉ）、ロイシン（Ｌ）、メチオニン（Ｍ）、バリン（Ｖ）；及び６）フェニルアラニン（Ｆ）、チロシン（Ｙ）、トリプトファン（Ｗ）。（参照によりその全体が組み込まれる、Ｃｒｅｉｇｈｔｏｎ，Ｐｒｏｔｅｉｎｓ，Ｗ．Ｈ．Ｆｒｅｅｍａｎ  ａｎｄ  Ｃｏｍｐａｎｙ（１９８４）も参照のこと）。いくつかの実施形態において、単一のアミノ酸または少数のアミノ酸を変更、追加または削除する個々の置換、欠失または付加は、変更によってペプチドの活性が低下しない場合は、保存的置換と見なすこともできる。挿入または欠失とは、典型的には、約１〜５アミノ酸の範囲である。保存的アミノ酸の選択は、ペプチド内で置換されるアミノ酸の位置、例えば、アミノ酸がペプチドの外側にあり、溶媒にさらされる場合、または内側にあり、溶媒にさらされない場合に基づいて選択されてもよい。
【００４９】
代替の実施形態では、既存のアミノ酸の位置、すなわちその溶媒への曝露（すなわち、アミノ酸が溶媒に曝露されるか、または溶媒にさらされていない内部に局在するアミノ酸と比較してペプチドもしくはポリペプチドの外面に存在する場合）に基づいて、既存のアミノ酸を置換するアミノ酸を選択してもよい。そのような保存的アミノ酸置換の選択は、例えば、Ｄｏｒｄｏ  ｅｔ  ａｌ．，Ｊ．Ｍｏｌ  Ｂｉｏｌ，１９９９，２１７，７２１−７３９及びＴａｙｌｏｒ  ｅｔ  ａｌ．，Ｊ．Ｔｈｅｏｒ．Ｂｉｏｌ．１１９（１９８６）；２０５−２１８ならびにＳ．Ｆｒｅｎｃｈ及びＢ．Ｒｏｂｓｏｎ、Ｊ．Ｍｏｌ．Ｅｖｏｌ．１９（１９８３）１７１に開示されているように、当該技術分野で周知である。したがって、タンパク質またはペプチドの外側のアミノ酸（すなわち、溶媒に曝露されたアミノ酸）に適した保存的アミノ酸置換を選択してもよく、例えば、限定するものではないが、以下の置換を使用してもよい：ＹとＦ、ＴとＳまたはＫ、ＰとＡ、ＥとＤまたはＱ、ＮとＤまたはＧ、ＲとＫ、ＧとＮまたはＡ、ＴとＳまたはＫ、ＤとＮまたはＥ、ＩとＬまたはＶ、ＦとＹ、ＳとＴまたはＡ、ＲとＫ、ＧとＮまたはＡ、ＫとＲ、ＡとＳ、ＫまたはＰとの置換。
【００５０】
代替の実施形態では、タンパク質またはペプチドの内部のアミノ酸に適したものに含まれる保存的アミノ酸置換を選択してもよく、例えば、タンパク質またはペプチドの内部にあるアミノ酸（すなわち、アミノ酸が溶媒にさらされない）の適切な保存的置換を使用してもよく、例えば、限定するものではないが、以下の保存的置換を使用してもよい：ここで、ＹはＦで置換され、ＴはＡまたはＳで、ＩはＬまたはＶで、ＷはＹで、ＭはＬで、ＮはＤで、ＧはＡで、ＴはＡまたはＳで、ＤはＮで、ＩはＬまたはＶで、ＦはＹまたはＬで、ＳはＡまたはＴで、及びＡはＳ、Ｇ、ＴまたはＶで置換される。いくつかの実施形態では、非保存的アミノ酸置換もバリアントの用語に含まれる。
【００５１】
いくつかの態様において、ポリペプチドは、天然のＣａｖ−１ポリペプチドの誘導体である。本明細書で使用される「誘導体」という用語は、例えば、限定するものではないが、アセチル化、ユビキチン化、標識、ペグ化（ポリエチレングリコールによる誘導体化）、脂質化、グリコシル化、アミド化、または他の分子の付加などの技術によって化学的に修飾されたペプチドを指す。分子は、通常は分子の一部ではない追加の化学部分を含む場合、別の分子の「派生物、誘導体（ｄｅｒｉｖａｔｉｖｅ）」でもある。このような部分は、ｐＨを変更するか、または分子の溶解性、吸収、生物学的半減期などを改善し得る。あるいは、この部分は、分子の毒性を減少させ、分子の望ましくない任意の副作用を排除または軽減し得るなどである。そのような効果を媒介し得る部分は、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる、Ｒｅｍｉｎｇｔｏｎ’ｓ  Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ  Ｓｃｉｅｎｃｅｓ，１８ｔｈ  ｅｄｉｔｉｏｎ，Ａ．Ｒ．Ｇｅｎｎａｒｏ，Ｅｄ．，ＭａｃｋＰｕｂｌ．，Ｅａｓｔｏｎ，ＰＡ（１９９０）に開示されている。
【００５２】
「誘導体」または「バリアント」と組み合わせて使用される場合の「機能的」という用語は、その実体または分子の生物学的活性に実質的に類似する生物学的活性（機能的または構造的のいずれか）を有する本発明のポリペプチド（それはその機能的誘導体または機能的バリアントである）を指す。機能的誘導体という用語は、分子のフラグメント、類似体、または化学的誘導体を含むことを意図している。
【００５３】
いくつかの態様において、アミノ酸置換は、１つ以上の位置でポリペプチドにおいてなされてもよく、この置換は同様の親水性を有するアミノ酸に対するものである。タンパク質に相互作用的な生物学的機能を付与する際のアミノ酸ハイドロパシーインデックスの重要性は、当該技術分野で一般的に理解されている（Ｋｙｔｅ  ａｎｄ  Ｄｏｏｌｉｔｔｌｅ，１９８２）。アミノ酸の相対的なハイドロパシー特徴が、得られるタンパク質の二次構造に寄与し、それが次に、タンパク質と他の分子、例えば、酵素、基質、受容体、ＤＮＡ、抗体、抗原などとの相互作用を定義することが認められている。したがって、そのような保存的置換は、ポリペプチドで行ってもよく、それらの活性にわずかな影響しか及ぼさない可能性が高い。米国特許第４，５５４，１０１号に詳述されているように、以下の親水性値が、アミノ酸残基に割り当てられている：アルギニン（＋３．０）；リジン（＋３．０）；アスパラギン酸（＋３．０±１）；グルタミン酸塩（＋３．０±１）；セリン（＋０．３）；アスパラギン（＋０．２）；グルタミン（＋０．２）；グリシン（０）；スレオニン（−０．４）；プロリン（−０．５±１）；アラニン（０．５）；ヒスチジン−０．５）；システイン（−１．０）；メチオニン（−１．３）；バリン（−１．５）；ロイシン（−１．８）；イソロイシン（−１．８）；チロシン（−２．３）；フェニルアラニン（−２．５）；トリプトファン（−３．４）。これらの値はガイドとして使用され得るので、親水性値が±２以内のアミノ酸の置換が好ましく、±１以内のアミノ酸が特に好ましく、±０．５以内のアミノ酸がさらに特に好ましい。したがって、本明細書に記載のポリペプチドのいずれも、類似の親水性値を有する、異なるが相同なアミノ酸を、あるアミノ酸で置換することによって修飾されてもよい。親水性が＋／−１．０または＋／−０．５ポイント以内のアミノ酸は、相同と見なされる。
【００５４】
修飾されたＣａｖ−１ペプチドは、例えば、ジスルフィド結合形成、グリコシル化、アセチル化、リン酸化、タンパク質分解切断（例えば、フューリンまたはメタロプロテアーゼによる切断）などの、同時翻訳及び翻訳後（Ｃ末端ペプチド切断）修飾であって、そのような修飾が、単離されたペプチドの抗炎症特性または血糖制御を改善するそれらの能力に影響を及ぼさない程度までの修飾を含み得る。
【００５５】
いくつかの態様において、修飾されたＣａｖ−１ペプチドは、天然には存在しないアミノ酸を含む。ポリペプチドは、天然に存在するアミノ酸及び天然には存在しないアミノ酸の組み合わせを含んでもよいし、または天然には存在しないアミノ酸のみを含んでもよい。天然に存在しないアミノ酸は、合成非天然アミノ酸、置換アミノ酸、またはペプチド（またはプロテアーゼ認識配列を除く組成物の他の成分）への１つ以上のＤ−アミノ酸を含んでもよく、特定の状況では望ましい。Ｄ−アミノ酸含有ペプチドは、Ｌ−アミノ酸含有形態と比較して、インビトロまたはインビボで安定性の増大を示す。したがって、Ｄ−アミノ酸を組み込んだペプチドの構築は、より高いインビボまたは細胞内安定性が望まれるかまたは必要とされる場合に特に有用であり得る。より具体的には、Ｄ−ペプチドは、内因性ペプチダーゼ及びプロテアーゼに耐性があり、それにより、リンクされた薬物及びコンジュゲートのより良い経口経上皮及び経皮送達、膜−永久複合体のバイオアベイラビリティの改善（さらなる考察については以下を参照）、ならびに長期の血管内及び間質寿命（そのような特性が望ましい場合）を提供する。Ｄ−異性体ペプチドの使用はまた、リンクされた薬物及び他のカーゴ分子の経皮及び経口経上皮送達を強化し得る。さらに、Ｄ−ペプチドは、Ｔヘルパー細胞への主要組織適合遺伝子複合体クラスＩｌ制限提示のために効率的に処理することができないため、生物全体で体液性免疫応答を誘発する可能性が低くなる。したがって、ペプチドコンジュゲートは、例えば、細胞透過性ペプチド配列のＤ異性体形態、切断部位のＬ異性体形態、及び処置用ペプチドのＤ異性体形態を使用して構築され得る。
【００５６】
２０個の「標準的な」Ｌ−アミノ酸に加えて、当該技術分野で明確に定義されているＤ−アミノ酸または非標準の修飾または異常なアミノ酸もまた、本開示における使用が企図される。リン酸化アミノ酸（Ｓｅｒ、Ｔｈｒ、Ｔｙｒ）、グリコシル化アミノ酸（Ｓｅｒ、Ｔｈｒ、Ａｓｎ）、β−アミノ酸、ＧＡＢＡ、ω−アミノ酸は、本開示での使用がさらに企図される。これらとしては、例えば、β−アラニン（β−Ａｌａ）、及び他のω−アミノ酸、例えば、３−アミノプロピオン酸、２，３−ジアミノプロピオン酸（Ｄｐｒ）、４−アミノ酪酸など；α−アミノイソ酪酸（Ａｉｂ）；ε−アミノヘキサン酸（Ａｈａ）；δ−アミノ吉草酸（Ａｖａ）；Ｎ−メチルグリシンまたはサルコシン（ＭｅＧｌｙ）；オルニチン（Ｏｒｎ）；シトルリン（Ｃｉｔ）；ｔ−ブチルアラニン（ｔ−ＢｕＡ）；ｔ−ブチルグリシン（ｔ−ＢｕＧ）；Ｎ−メチルイソロイシン（ＭｅＩｌｅ）；フェニルグリシン（Ｐｈｇ）；ノルロイシン（Ｎｌｅ）；４−クロロフェニルアラニン（Ｐｈｅ（４−Ｃｌ））；２−フルオロフェニルアラニン（Ｐｈｅ（２−Ｆ））；３−フルオロフェニルアラニン（Ｐｈｅ（３−Ｆ））；４−フルオロフェニルアラニン（Ｐｈｅ（４−Ｆ））；ペニシラミン（Ｐｅｎ）；１，２，３，４−テトラヒドロイソキノリン−３−カルボン酸（Ｔｉｃ）；ホモアルギニン（ｈＡｒｇ）；Ｎ−アセチルリジン（ＡｃＬｙｓ）；２，４−ジアミノ酪酸（Ｄｂｕ）；２，４−ジアミノ酪酸（Ｄａｂ）；ｐ−アミノフェニルアラニン（Ｐｈｅ（ｐＮＨ２））；Ｎ−メチルバリン（ＭｅＶａｌ）；ホモシステイン（ｈＣｙｓ）、ホモフェニルアラニン（ｈＰｈｅ）及びホモセリン（ｈＳｅｒ）；ヒドロキシプロリン（Ｈｙｐ）、ホモプロリン（ｈＰｒｏ）、Ｎ−メチル化アミノ酸及びペプトイド（Ｎ−置換グリシン）が挙げられる。
【００５７】
カルボン酸末端修飾としては、カルボン酸：ギ酸、酢酸、プロピオン酸、脂肪酸（ミリスチン酸、パルミチン酸、ステアリン酸）、コハク酸、安息香酸、カルボベンゾキシ（Ｃｂｚ）によるアシル化；アセチル化及びビオチン化が挙げられる。アミノ末端修飾には以下が挙げられる：（ｉ）カルボン酸：ギ酸、酢酸、プロピオン酸、脂肪酸（ミリスチン酸、パルミチン酸、ステアリン酸など）、コハク酸、安息香酸、カルボベンゾキシ（Ｃｂｚ）によるアシル化；（ｉｉ）ビオチン化；（ｉｉｉ）アミド化；（ｉｖ）フルオレセイン（ＦＩＴＣ、ＦＡＭなど）、７−ヒドロキシ−４−メチルクマリン−３−酢酸、７−ヒドロキシクマリン−３−酢酸、７−メトキシクマリン−３−酢酸及び他のクマリン；ローダミン（５−カルボキシローダミン１１０または６Ｇ、５（６）−ＴＡＭＲＡ、ＲＯＸ）；Ｎ−［４−（４−ジメチルアミノ）フェニルアゾ］安息香酸（Ｄａｂｃｙｌ）、２，４−ジニトロベンゼン（Ｄｎｐ）、５−ジメチルアミノナフタレン−１−スルホン酸（Ｄａｎｓｙｌ）及び他の色素などの色素の付着；ならびに（ｖ）ポリエチレングリコール。
【００５８】
ポリペプチドは、そのＮ末端及びＣ末端が、それぞれアシル（略称「Ａｃ」）及びアミド（略称「Ａｍ」）基、例えば、Ｎ末端のアセチル（ＣＨ３ＣＯ−）及びＣ末端のアミド−ＮＨ２）でキャップされてもよい。広範囲のＮ末端キャッピング機能は、好ましくは末端アミノ基に結合して企図され、例えば、ホルミル；
アセチル、プロピオニル、ブチリルなどの１〜１０個の炭素原子を有するアルカノイル；
ヘキサ−３−エノイルなどの１〜１０個の炭素原子を有するアルケノイル；
ヘキサ−５−イノイルなどの１〜１０個の炭素原子を有するアルキノイル；
ベンゾイルまたは１−ナフトイルなどのアロイル；
３−ピロイルまたは４−キノロイルなどのヘテロアロイル；
メタンスルホニルなどのアルキルスルホニル；
ベンゼンスルホニルまたはスルファニリルなどのアリールスルホニル；
ピリジン−４−スルホニルなどのヘテロアリールスルホニル；
４−アミノブチリルなどの１〜１０個の炭素原子を有する置換アルカノイル；
６−ヒドロキシ−ヘキサ−３−エノイルなどの１〜１０個の炭素原子を有する置換アルケノイル；
３−ヒドロキシ−ヘキサ−５−イノイルなどの１〜１０個の炭素原子を有する置換アルキノイル；
４−クロロベンゾイルまたは８−ヒドロキシ−ナフト−２−オイルなどの置換アロイル；
２，４−ジオキソ−１，２，３，４−テトラヒドロ−３−メチル−キナゾリン−６−オイルなどの置換ヘテロアロイル；
２−アミノエタンスルホニルなどの置換アルキルスルホニル；
５−ジメチルアミノ−１−ナフタレンスルホニルなどの置換アリールスルホニル；
１−メトキシ−６−イソキノリンスルホニルなどの置換ヘテロアリールスルホニル；
カルバモイルまたはチオカルバモイル；
Ｒ’がアルキル、アルケニル、アルキニル、アリール、ヘテロアリール、置換アルキル、置換アルケニル、置換アルキニル、置換アリール、または置換ヘテロアリールである置換カルバモイル（Ｒ’−ＮＨ−ＣＯ）または置換チオカルバモイル（Ｒ’−ＮＨ−ＣＳ）；
Ｒ’がアルカノイル、アルケノイル、アルキノイル、アロイル、ヘテロアロイル、置換アルカノイル、置換アルケノイル、置換アルキノイル、置換アロイル、または置換ヘテロアロイルである置換カルバモイル（Ｒ’−ＮＨ−ＣＯ）及び置換チオカルバモイル（Ｒ’−ＮＨ−ＣＳ）（全て上記のように定義）である。
Ｃ末端キャッピング機能は、末端カルボキシルとのアミド結合またはエステル結合のいずれかになる。アミド結合を提供するキャッピング機能は、ＮＲ１Ｒ２として指定され、式中、Ｒ１及びＲ２は、独立して、以下の群から引き出され得る：水素；
好ましくはメチル、エチル、イソプロピルなどの１〜１０個の炭素原子を有するアルキル；
好ましくはプロプ−２−エニルなどの１〜１０個の炭素原子を有するアルケニル；
好ましくはプロプ−２−イニルなどの１〜１０個の炭素原子を有するアルキニル；
ヒドロキシアルキル、アルコキシアルキル、メルカプトアルキル、アルキルチオアルキル、ハロゲノアルキル、シアノアルキル、アミノアルキル、アルキルアミノアルキル、ジアルキルアミノアルキル、アルカノイルアルキル、カルボキシアルキル、カルバモイルアルキルなどの１〜１０個の炭素原子を有する置換アルキル；
ヒドロキシアルケニル、アルコキシアルケニル、メルカプトアルケニル、アルキルチオアルケニル、ハロゲノアルケニル、シアノアルケニル、アミノアルケニル、アルキルアミノアルケニル、ジアルキルアミノアルケニル、アルカノイルアルケニル、カルボキシアルケニル、カルバモイルアルケニルなどの１〜１０個の炭素原子を有する置換アルケニル；
ヒドロキシアルキニル、アルコキシアルキニル、メルカプトアルキニル、アルキルチオアルキニル、ハロゲノアルキニル、シアノアルキニル、アミノアルキニル、アルキルアミノアルキニル、ジアルキルアミノアルキニル、アルカノイルアルキニル、カルボキシアルキニル、カルバモイルアルキニルなどの１〜１０個の炭素原子を有する置換アルキニル；
フェナシルまたは２−ベンゾイルエチルなどの最大１０個の炭素原子を有するアロイルアルキル；
フェニルまたは１−ナフチルなどのアリール；
４−キノリルなどのヘテロアリール；
アセチル、またはブチリルなどの１〜１０個の炭素原子を有するアルカノイル；
ベンゾイルなどのアロイル；
３−キノロイルなどのヘテロアロイル；
ＯＲ’またはＮＲ’Ｒ’’（式中Ｒ’及びＲ’’は独立して水素、アルキル、アリール、ヘテロアリール、アシル、アロイル、スルホニル、スルフィニルである）、またはＳＯ２−Ｒ’’’またはＳＯ−Ｒ’’’（式中、Ｒ’’’は、置換または非置換のアルキル、アリール、ヘテロアリール、アルケニル、またはアルキニルである）。
【００５９】
エステル結合を提供するキャッピング機能は、ＯＲとして示され、ここで、Ｒは、アルコキシ；アリールオキシ；ヘテロアリールオキシ；アラルキルオキシ；ヘテロアラルキルオキシ；置換アルコキシ；置換アリールオキシ；置換ヘテロアリールオキシ；置換アラルキルオキシ；または置換ヘテロアラルキルオキシであってもよい。
【００６０】
Ｎ末端もしくはＣ末端キャッピング機能のいずれか、またはその両方は、キャッピングされた分子が、活性薬物を放出するため、体内で自発的または酵素的変換を受けるプロドラッグ（親薬物分子の薬理学的に不活性な誘導体）として機能し、親薬物分子よりも送達特性が改善されているような構造のものであってもよい（Ｂｕｎｄｇａａｒｄ  Ｈ、Ｅｄ：Ｄｅｓｉｇｎ  ｏｆ  Ｐｒｏｄｒｕｇｓ，Ｅｌｓｅｖｉｅｒ，Ａｍｓｔｅｒｄａｍ，１９８５）。
【００６１】
キャッピング基の賢明な選択は、ペプチドに対する他の活性の追加を可能にする。例えば、Ｎ末端またはＣ末端のキャップに結合したスルフヒドリル基の存在により、誘導体化されたペプチドを他の分子にコンジュゲーションさせることが可能になる。
【００６２】
さらに別の態様では、ペプチドまたはそのフラグメントもしくは誘導体は、「レトロインベルソペプチド」であり得る。「レトロインベルソペプチド」とは、少なくとも１つの位置でペプチド結合の方向が反転しているペプチド、すなわち、アミノ酸の側鎖に関してアミノ末端及びカルボキシ末端が反転しているペプチドを指す。したがって、レトロインベルソ類似体は、ネイティブペプチド配列のように側鎖のトポロジーをほぼ維持しながら、ペプチド結合の逆転末端及び方向の逆転を有した。レトロインベルソペプチドは、Ｌ−アミノ酸もしくはＤ−アミノ酸、またはＬ−アミノ酸及びＤ−アミノ酸の混合物を含んでもよく、最大で全てのアミノ酸がＤ−異性体である。部分的なレトロインベルソペプチド類似体は、配列の一部のみが逆にされ、エナンチオマーアミノ酸残基で置き換えられているポリペプチドである。このような類似体の逆反転部分はアミノ末端とカルボキシル末端が逆になっているので、逆反転部分に隣接するアミノ酸残基は、それぞれ側鎖類似のα−置換ジェミナル−ジアミノメタン及びマロン酸塩に置き換えられる。細胞透過性ペプチドのレトロインベルソ形態は、天然形態と同じように膜を横切って移動する際に効率的に機能することが見出された。レトロインベルソペプチド類似体の合成は、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる、Ｂｏｎｅｌｌｉ，Ｆ．ｅｔ  ａｌ．，Ｉｎｔ  Ｊ  Ｐｅｐｔ  Ｐｒｏｔｅｉｎ  Ｒｅｓ．２４（６）：５５３−６（１９８４）；Ｖｅｒｄｉｎｉ，Ａ  ａｎｄ  Ｖｉｓｃｏｍｉ，Ｇ．Ｃ，Ｊ．Ｃｈｅｍ．Ｓｏｃ．Ｐｅｒｋｉｎ  Ｔｒａｎｓ．１  ：６９７−７０１（１９８５）；及び米国特許第６，２６１，５６９号に記載される。部分的なレトロインベルソペプチド類似体の固相合成のためのプロセスが記載されており（欧州特許第９７９９４−Ｂ号）、これも参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。
【００６３】
ポリヌクレオチドまたはポリヌクレオチド領域（またはポリペプチドまたはポリペプチド領域）は、別の配列に対して特定のパーセンテージ（例えば、８０％、８５％、９０％、または９５％）の「配列同一性」または「相同性」を有し、このことは、アラインメントしたとき、２つの配列を比較して塩基（またはアミノ酸）の割合が同じになることを意味する。このアラインメント及びパーセント相同性または配列同一性は、当該技術分野で公知であるソフトウェアプログラム、例えば、Ｃｕｒｒｅｎｔ  Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ  Ｉｎ  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｂｉｏｌｏｇｙ（Ｆ．Ｍ．Ａｕｓｕｂｅｌ  ｅｔ  ａｌ．，ｅｄｓ．，１９８７）Ｓｕｐｐｌｅｍｅｎｔ  ３０，ｓｅｃｔｉｏｎ  ７．７．１８、表７．７．１に記載されるプログラムを用いて決定され得る。好ましくは、デフォルトのパラメーターがアラインメントのために使用される。好ましいアライメントプログラムは、デフォルトのパラメーターを使用するＢＬＡＳＴである。特に、好ましいプログラムは、以下のデフォルトパラメーターを使用するＢＬＡＳＴＮ及びＢＬＡＳＴＰである：Ｇｅｎｅｔｉｃ  ｃｏｄｅ＝標準；フィルター＝なし；ストランド＝両方；カットオフ＝６０；期待値＝１０；マトリックス＝ＢＬＯＳＵＭ６２；説明＝５０シーケンス；並べ替＝ハイスコア；データベース＝非冗長、ＧｅｎＢａｎｋ＋ＥＭＢＬ＋ＤＤＢＪ＋ＰＤＢ＋ＧｅｎＢａｎｋＣＤＳ翻訳＋ＳｗｉｓｓＰｒｏｔｅｉｎ＋ＳＰｕｐｄａｔｅ＋ＰＩＲ。
【００６４】
Ａ．      多量体ポリペプチド
本開示の実施形態はまた、修飾されたＣａｖ−１バリアントポリペプチドの繰り返し単位から構築されたより長いポリペプチドも含む。ポリペプチド多量体は、ポリペプチドの異なる組み合わせを含んでもよい。そのような多量体ポリペプチドは、本明細書で考察されるように、化学合成によって、または組換えＤＮＡ技術によって作製され得る。化学合成によって生成される場合、オリゴマーは好ましくはコアポリペプチド配列の２〜５回の繰り返しを有し、多量体中のアミノ酸の総数は、約１６０残基を超えてはならず、好ましくは１００残基以下であるべきである（またはそれらの同等物（リンカーまたはスペーサーを含む場合））。
【００６５】
Ｂ．      ペプチド模倣物
修飾されたＣａｖ−１ペプチドは、天然のＣａｖ−１ポリペプチドの生物学的効果を模倣するペプチド模倣化合物であり得る。ペプチド模倣剤は、天然のＣａｖ−１ポリペプチドの結合活性及び生物学的活性を有するように、天然のＣａｖ−１ポリペプチドの結合要素の立体空間特性を再現する非天然ペプチドであっても、または非ペプチド剤であってもよい。天然のＣａｖ−１ポリペプチドまたはポリペプチド多量体と同様に、ペプチド模倣物は、結合面（天然のＣａｖ−１が結合する任意のリガンドと相互作用する）及び非結合面を有する。
【００６６】
いくつかの態様において、本開示はまた、部分的なペプチド特徴を保持する化合物も含む。例えば、本発明のペプチド内の任意のタンパク質分解的に不安定な結合は、分子の残りがそのペプチド性を保持している間、等量式（Ｎ−メチル化；Ｄ−アミノ酸）または還元ペプチド結合などの非ペプチド要素によって選択的に置き換えられてもよい。
【００６７】
アゴニスト、基質または阻害剤のいずれかのペプチド模倣化合物は、オピオイドペプチド、ＶＩＰ、トロンビン、ＨＩＶプロテアーゼなどの多くの生物活性ペプチド／ポリペプチドについて記載されている。ペプチド模倣化合物を設計及び調製するための方法は、当該技術分野で公知である（Ｈｒｕｂｙ，ＶＪ，Ｂｉｏｐｏｌｙｍｅｒｓ  ３３：１０７３−１０８２（１９９３）；Ｗｉｌｅｙ，ＲＡ  ｅｔ  ａｌ．，Ｍｅｄ．Ｒｅｓ．Ｒｅｖ．１３：３２７−３８４（１９９３）；Ｍｏｏｒｅ  ｅｔ  ａｌ．，Ａｄｖ．ｉｎ  Ｐｈａｒｍａｃｏｌ  ３３：９１−１４１（１９９５）；Ｇｉａｎｎｉｓ  ｅｔ  ａｌ．，Ａｄｖ．ｉｎ  Ｄｒｕｇ  Ｒｅｓ．２９：１−７８（１９９７）。二次構造を模倣する特定の模倣物は、Ｊｏｈｎｓｏｎ  ｅｔ  ａｌ．，Ｉｎ：Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ  ａｎｄ  Ｐｈａｒｍａｃｙ，Ｐｅｚｚｕｔｏ  ｅｔ  ａｌ．，Ｃｈａｐｍａｎ  ａｎｄ  Ｈａｌｌ（Ｅｄｓ．），ＮＹ，１９９３に記載されている。これらの方法は、少なくともネイティブＣａｖ−１ポリペプチドの結合能力及び特異性を保有し、好ましくはまた生物学的活性も保有するペプチド模倣薬を作るために使用される。当業者に利用可能なペプチド化学及び一般的な有機化学の知識は、本開示に照らして、そのような化合物の合成及び合成のために、十分である。
【００６８】
例えば、そのようなペプチド模倣物は、遊離であるか、またはリガンド（例えば、可溶性ｕＰＡＲまたはそのフラグメント）と複合体で結合した、本発明のポリペプチドの三次元構造の検査によって同定され得る。あるいは、そのリガンドに結合した本発明のポリペプチドの構造は、核磁気共鳴分光法の技術によって得てもよい。ペプチドとそのリガンドまたは受容体との相互作用の立体化学についてのより深い知識によって、そのようなペプチド模倣剤の合理的な設計が可能になるであろう。リガンドの非存在下での本発明のペプチドまたはポリペプチドの構造はまた、模倣分子の設計のための足場を提供し得る。
【００６９】
Ｃ．      ＰＥＧ化
修飾されたＣａｖ−１ペプチドは、ポリエチレングリコールなどの異種ポリペプチドセグメントまたはポリマーとコンジュゲートされ得る。ポリペプチドを、酵素の流体力学的半径を増大させ、それによって血清持続性を増大させるために、ＰＥＧに連結してもよい。ポリペプチドは、外部受容体に特異的かつ安定的に結合する能力を有するリガンドなどの任意の標的化剤にコンジュゲートしてもよい（米国特許公開２００９／０３０４６６６号）。
【００７０】
特定の態様における、開示されたポリペプチドのＰＥＧ化に関連する実施形態の方法及び組成物。ＰＥＧ化とは、ポリ（エチレングリコール）ポリマー鎖が別の分子（通常は薬物または治療用タンパク質）に共有結合するプロセスである。ＰＥＧ化は、ＰＥＧの反応性誘導体を標的高分子とインキュベートすることによって慣用的に達成される。薬物または処置用タンパク質へのＰＥＧの共有結合は、宿主の免疫系から薬剤を「マスク」し得る（免疫原性及び抗原性の低下）か、または薬剤の流体力学的サイズ（溶液中のサイズ）を増大し得、腎クリアランスを減少させることによって循環時間を延長する。ＰＥＧ化は、疎水性の薬物及びタンパク質を水溶性にもし得る。
【００７１】
ＰＥＧ化の最初のステップは、一方または両方の末端でのＰＥＧポリマーの適切な官能化である。同じ反応性部分によって各末端で活性化されるＰＥＧは、「ホモ二官能性」として公知であるが、存在する官能基が異なるならば、ＰＥＧ誘導体は「ヘテロ二官能性」または「ヘテロ官能性」と呼ばれる。ＰＥＧポリマーの化学的に活性な誘導体または活性化された誘導体は、ＰＥＧを所望の分子に結合するように調製される。
【００７２】
ＰＥＧ誘導体のための適切な官能基の選択は、ＰＥＧに結合される分子上の利用可能な反応性基のタイプに基づく。タンパク質の場合、典型的な反応性アミノ酸としては、リジン、システイン、ヒスチジン、アルギニン、アスパラギン酸、グルタミン酸、セリン、スレオニン、及びチロシンが挙げられる。Ｎ末端アミノ基及びＣ末端カルボン酸も使用してもよい。
【００７３】
第１世代のＰＥＧ誘導体を形成するために使用される技術は、一般に、ＰＥＧポリマーを、ヒドロキシル基と反応する基、典型的には無水物、酸塩化物、クロロホルメート、及びカーボネートと反応させることである。第２世代のＰＥＧ化化学では、アルデヒド、エステル、アミドなどのより効率的な官能基がコンジュゲーションに利用可能になる。
【００７４】
ＰＥＧ化の適用がますます高度かつ洗練されてきたので、コンジュゲーションのためのヘテロ二官能性ＰＥＧの必要性が増大している。これらのヘテロ二官能性ＰＥＧは、親水性、柔軟性、及び生体適合性のスペーサーが必要な２つの実体をリンクするのに非常に有用である。ヘテロ二官能性ＰＥＧの好ましい末端基は、マレイミド、ビニルスルホン、ピリジルジスルフィド、アミン、カルボン酸、及びＮＨＳエステルである。
【００７５】
最も一般的な修飾剤、またはリンカーは、メトキシＰＥＧ（ｍＰＥＧ）分子に基づく。それらの活性は、アルコール末端にタンパク質修飾基を追加することに依存する。場合によっては、ポリエチレングリコール（ＰＥＧジオール）が前駆体分子として使用される。ヘテロまたはホモ二量体のＰＥＧ結合分子を作成するために、続いて、ジオールを両端で修飾する。
【００７６】
タンパク質は、一般に、非プロトン化チオール（システイン残基）またはアミノ基などの求核部位でＰＥＧ化される。システイニル特異的修飾試薬の例としては、ＰＥＧマレイミド、ＰＥＧヨード酢酸、ＰＥＧチオール、及びＰＥＧビニルスルホンが挙げられる。４つ全てが穏やかな条件、及び中性からわずかにアルカリ性のｐＨ下で強力にシステイン特異的であるが、それぞれにいくつかの欠点がある。マレイミドで形成されたチオエーテルは、アルカリ性条件下ではやや不安定になり得、そのため、このリンカーを使用した処方オプションにはいくつかの限界がある場合がある。ヨードＰＥＧで形成されたカルバモチオエート結合はより安定しているが、遊離ヨウ素はいくつかの条件下でチロシン残基を修飾し得る。ＰＥＧチオールは、タンパク質チオールとジスルフィド結合を形成するが、この結合はアルカリ性条件下でも不安定になる可能性もある。ＰＥＧ−ビニルスルホンの反応性は、マレイミド及びヨードＰＥＧと比較して比較的遅い。ただし、形成されたチオエーテル結合は非常に安定している。反応速度が遅いこともまた、ＰＥＧ−ビニルスルホン反応の制御を容易にし得る。
【００７７】
天然のシステイン残基での部位特異的ＰＥＧ化はめったに実行されない。なぜなら、これらの残基は通常、ジスルフィド結合の形であるか、生物活性に必要であるためである。他方では、部位特異的突然変異誘発は、チオール特異的リンカーのためのシステインＰＥＧ化部位を組み込むために使用してもよい。システイン変異は、ＰＥＧ化試薬にアクセス可能であり、ＰＥＧ化後も生物学的に活性であるように設計する必要がある。
【００７８】
アミン特異的修飾剤としては、ＰＥＧ  ＮＨＳエステル、ＰＥＧトレシレート、ＰＥＧアルデヒド、ＰＥＧイソチオシアネート、及びその他いくつかが挙げられる。全てが穏やかな条件下で反応し、アミノ基に非常に特異的である。ＰＥＧＮＨＳエステルは、おそらくより反応性の高い薬剤の１つである。ただし、その高い反応性により、ＰＥＧ化反応を大規模に制御することが困難になる場合がある。ＰＥＧアルデヒドはアミノ基とイミンを形成し、次にシアノ水素化ホウ素ナトリウムで２級アミンに還元される。水素化ホウ素ナトリウムとは異なり、シアノ水素化ホウ素ナトリウムはジスルフィド結合を還元しない。ただし、この化学物質は毒性が高く、特に揮発性になる低ｐＨでは慎重に取り扱う必要がある。
【００７９】
ほとんどのタンパク質上の複数のリジン残基に起因して、部位特異的ＰＥＧ化は挑戦となり得る。幸いなことに、これらの試薬はプロトン化されていないアミノ基と反応するので、より低いｐＨで反応を行うことにより、ＰＥＧ化をより低いｐＫアミノ基に向けることが可能である。一般に、アルファ−アミノ基のｐＫは、リジン残基のイプシロン−アミノ基よりも１〜２ｐＨ単位低い。分子をｐＨ７以下でＰＥＧ化することにより、Ｎ末端の高い選択性は高頻度に達成され得る。ただし、これは、タンパク質のＮ末端部分が生物活性に必要でない場合にのみ実行可能である。それでも、ＰＥＧ化による薬物動態の利点は、多くの場合、インビトロの生物活性の大幅な低下を上回り、ＰＥＧ化化学に関係なく、かなり大きいインビボ生物活性を備えた生成物になる。
【００８０】
ＰＥＧ化手順を開発する際に考慮すべきいくつかのパラメーターがある。幸いなことに、通常、４つまたは５つ以下の重要なパラメーターがある。ＰＥＧ化条件を最適化するための「実験のデザイン」アプローチは非常に有用であり得る。チオール特異的ＰＥＧ化反応の場合、考慮すべきパラメーターとしては、タンパク質濃度、ＰＥＧ対タンパク質比（モルベースで）、温度、ｐＨ、反応時間、及び場合によっては酸素の排除が挙げられる。（酸素はタンパク質による分子間ジスルフィド形成に寄与する可能性があり、ＰＥＧ化生成物の収率が低下する。）アミン特異的修飾については、特にＮ末端アミノ基を標的とする場合、ｐＨがさらに重要になる可能性があることを除いて、同じ要因を考慮する必要がある（酸素は除く）。
【００８１】
アミン特異的及びチオール特異的修飾の両方について、反応条件はタンパク質の安定性に影響を及ぼし得る。これにより、温度、タンパク質濃度、及びｐＨが制限される場合がある。さらに、ＰＥＧ化反応を開始する前に、ＰＥＧリンカーの反応性を知る必要がある。例えば、ＰＥＧ化剤の活性が７０％しかない場合、使用するＰＥＧの量により、タンパク質とＰＥＧの反応化学量論で活性ＰＥＧ分子のみがカウントされることを保証する必要がある。
【００８２】
Ｄ．      融合タンパク質
本発明の特定の実施形態は、修飾されたＣａｖ−１ペプチドの融合タンパク質に関する。これらの分子は、Ｎ末端またはＣ末端で異種ドメインに連結された実施形態のポリペプチドを有し得る。例えば、融合はまた、他の種由来のリーダー配列を使用して、異種宿主におけるタンパク質の組換え発現を可能にし得る。融合タンパク質は、半減期延長剤を含んでもよい。別の有用な融合としては、融合タンパク質の精製を容易にするために、血清アルブミン親和性タグもしくは６つのヒスチジン残基などのタンパク質親和性タグ、または抗体エピトープなどの免疫学的に活性なドメイン、好ましくは切断可能なドメインの添加が含まれる。非限定的なアフィニティータグとしては、ポリヒスチジン、キチン結合タンパク質（ＣＢＰ）、マルトース結合タンパク質（ＭＢＰ）、及びグルタチオン−Ｓ−トランスフェラーゼ（ＧＳＴ）が挙げられる。
【００８３】
特定の実施形態において、実施形態のペプチドを、インビボ半減期を延長するペプチド、例えば、ＸＴＥＮ（登録商標）ポリペプチド（Ｓｃｈｅｌｌｅｎｂｅｒｇｅｒ  ｅｔ  ａｌ．，２００９）、ＩｇＧ  Ｆｃドメイン、アルブミン、またはアルブミン結合ペプチドに連結してもよい。
【００８４】
融合タンパク質を生成する方法は、当業者に周知である。そのようなタンパク質は、例えば、完全な融合タンパク質のデノボ合成によって、または異種ドメインをコードするＤＮＡ配列の付着、それに続くインタクトな融合タンパク質の発現によって産生され得る。
【００８５】
親タンパク質の機能的活性を回復する融合タンパク質の産生は、タンデムに接続されたポリペプチド間でスプライシングされるペプチドリンカーをコードする架橋ＤＮＡセグメントと遺伝子を接続することによって促進され得る。このリンカーは、得られた融合タンパク質の適切な折り畳みを可能にするのに十分な長さであろう。
【００８６】
１．      リンカー
特定の実施形態において、実施形態のポリペプチドは、二機能性架橋試薬を使用して化学的にコンジュゲートされてもよいし、またはペプチドリンカーとタンパク質レベルで融合されてもよい。
【００８７】
二官能性架橋試薬は、親和性マトリックスの調製、多様な構造の修飾及び安定化、リガンド及び受容体結合部位の同定、及び構造研究を含む、様々な目的のために広く使用されてきた。適切なペプチドリンカーを使用して、Ｇｌｙ−Ｓｅｒリンカーなどの実施形態のポリペプチドを連結してもよい。
【００８８】
２つの同一の官能基を有するホモ二官能性試薬は、同一及び異なる高分子または高分子のサブユニット間の架橋を誘導し、ポリペプチドリガンドをそれらの特異的結合部位に連結するのに非常に効率的であることが証明された。ヘテロ二官能性試薬には、２つの異なる官能基が含まれている。２つの異なる官能基の異なる反応性を利用することにより、架橋を選択的及び連続的に制御してもよい。二官能性架橋試薬は、それらの官能基、例えば、アミノ−、スルフヒドリル−、グアニジン−、インドール−、カルボキシル−特異的基の特異性に従って分類され得る。これらのうち、遊離アミノ基に向けられた試薬は、それらの商業的入手可能性、合成の容易さ、及びそれらが適用され得る穏やかな反応条件という理由で特に人気になっている。
【００８９】
ヘテロ二官能性架橋試薬の大部分は、第一級アミン反応性基及びチオール反応性基を含む。別の例では、ヘテロ二官能性架橋試薬及び架橋試薬を使用する方法が記載されている（米国特許第５，８８９，１５５号、その全体が参照により本明細書に具体的に組み込まれる）。架橋試薬は、求核性ヒドラジド残基と求電子性マレイミド残基とを結合し、一例では、アルデヒドの遊離チオールへのカップリングを可能にする。架橋試薬は、様々な官能基を架橋するように修飾してもよい。
【００９０】
さらに、当業者に公知である任意の他の連結／カップリング剤及び／または機構を使用して、例えば、抗体−抗原相互作用、アビジンビオチン結合、アミド結合、エステル結合、チオエステル結合、エーテル結合、チオエーテル結合、ホスホエステル結合、ホスホルアミド結合、無水物結合、ジスルフィド結合、イオン性及び疎水性相互作用、二重特異性抗体及び抗体フラグメント、またはそれらの組み合わせなどの実施形態のポリペプチドを組み合わせてもよい。
【００９１】
血液中で適度な安定性を有する架橋剤を使用することが好ましい。標的化剤及び処置剤／予防剤をコンジュゲートするために首尾よく使用され得る多くのタイプのジスルフィド結合含有リンカーが公知である。立体障害のあるジスルフィド結合を含むリンカーは、インビボでの安定性を高めることが証明される場合がある。したがって、これらのリンカーは、連結剤の１つのグループである。
【００９２】
妨害された架橋剤に加えて、妨害されていないリンカーもまた、本明細書に従って使用されてもよい。保護されたジスルフィドを含むかまたは生成するとは考えられていない他の有用な架橋剤としては、ＳＡＴＡ、ＳＰＤＰ、及び２−イミノチオランが挙げられる（Ｗａｗｒｚｙｎｃｚａｋ  ａｎｄ  Ｔｈｏｒｐｅ，１９８７）。そのような架橋剤の使用は、当該技術分野でよく理解されている。別の実施形態は、柔軟なリンカーの使用を含む。
【００９３】
一旦、化学的にコンジュゲートされると、ペプチドを一般には精製して、コンジュゲートを非コンジュゲート剤及び他の汚染物質から分離する。それらを臨床的に有用にするのに十分な程度の純度のコンジュゲートを提供する際に使用するために、多数の精製技術が利用可能である。
【００９４】
ゲル濾過、ゲル浸透、または高速液体クロマトグラフィーなどのサイズ分離に基づく精製方法が、一般的に最も有用である。青−セファロース分離などの他のクロマトグラフィー技術も使用されてもよい。封入体から融合タンパク質を精製する従来の方法は、ナトリウムＮ−ラウロイル−サルコシン（ＳＬＳ）などの弱い界面活性剤を使用するなど、有用であり得る。
【００９５】
２．細胞透過性及び膜移行ペプチド
さらに、特定の態様において、修飾されたＣａｖ−１ペプチドは、細胞結合ドメインまたは細胞透過性ペプチド（ＣＰＰ）をさらに含んでもよい。本明細書で使用される場合、「細胞透過性ペプチド」及び「膜移行ドメイン」という用語は交換可能に使用され、ポリペプチドが細胞膜（例えば、真核細胞の場合は原形質膜）を通過することを可能にするポリペプチド配列のセグメントを指す。ＣＰＰセグメントの例としては、限定するものではないが、ＨＩＶ  Ｔａｔに由来するセグメント（例えば、ＧＲＫＫＲＲＱＲＲＲＰＰＱ（配列番号２１））、ヘルペスウイルスＶＰ２２、ショウジョウバエ（Ｄｒｏｓｏｐｈｉｌａ）アンテナペディア（Ａｎｔｅｎｎａｐｅｄｉａ）ホメオボックス遺伝子産物、プロテグリンＩ、ペネトラチン（ＲＱＩＫＩＷＦＱＮＲＲＭＫＷＫＫ（配列番号２２））またはメリチン（ＧＩＧＡＶＬＫＶＬＴＴＧＬＰＡＬＩＳＷＩＫＲＫＲＱＱ（配列番号２３））が挙げられる。特定の態様において、ＣＰＰは、Ｔ１（ＴＫＩＥＳＬＫＥＨＧ（配列番号２４））、Ｔ２（ＴＱＩＥＮＬＫＥＫＧ（配列番号２５））、２６（ＡＡＬＥＡＬＡＥＡＬＥＡＬＡＥＡＬＥＡＬＡＥＡＡＡＡ（配列番号２６））またはＩＮＦ７（ＧＬＦＥＡＩＥＧＦＩＥＮＧＷＥＧＭＩＥＧＷＹＧＣＧ（配列番号：２７））ＣＰＰ配列を含む。
【００９６】
ＩＩＩ．使用方法
本発明の一態様は、本明細書に記載のポリペプチド及びそれらの変異体、バリアント、類似体または誘導体の使用に関する。具体的には、これらの方法は、本明細書に記載のポリペプチドのいずれか１つ、またはそれらの薬学的に許容される修飾を薬学的に許容される担体中で対象に投与すること、肺の疾患、損傷または感染を処置または予防する処置に使用するための組成物（例えば、肺の線維性状態）に関し、該組成物は、薬学的に許容される担体中に実施形態のポリペプチドを含む。
【００９７】
Ａ．      薬学的組成物
修飾されたＣａｖ−１ペプチドは、細胞アポトーシスを阻害するために、そして肺組織への損傷の処置及び予防のために、全身的または局所的に投与され得ることが企図される。それらは、静脈内、髄腔内、及び／または腹腔内に投与してもよい。特定の態様において、ポリペプチドは、吸入用の噴霧製剤または乾燥粉末製剤の投与など、気道に局所的に送達される。それらは、単独で投与されても、または抗線維化合物と組み合わせて投与されてもよい。
【００９８】
修飾されたＣａｖ−１ペプチドは、肺線維症の少なくとも１つの追加の治療薬と組み合わせて投与されてもよいし、同時に投与されてもよいし、または連続して投与されてもよい。追加の治療薬は、ＮＳＡＩＤ、ステロイド、ＤＭＡＲＤ、免疫抑制剤、生物学的反応モジュレーター、気管支拡張薬、または抗線維化剤、例えば、ピルフェネドン（抗線維化作用機序が完全には理解されていないが、ＴＧＦ−ベータ、ニンテダニブ、広範なチロシンキナーゼ遮断薬もしくは任意の他の抗線維化剤の遮断を伴う可能性がある）であってもよい。適切なＮＳＡＩＤＳは、非選択的ＣＯＸ阻害剤であるアセチルサリチル酸、メサラジン、イブプロフェン、ナプロキセン、フルビプロフェン、フェノプロフェン、フェンブフェン、ケトプロフェン、インドプロフェン、ピルプロフェン、カルプロフェン、オキサプロジン、プラノプロフェン、ミロプロフェン、チオキサプロフェン、スプロフェン、アルミノプロフェン、チアプロフェン酸、フルプロフェン、インドメタシン、スリンダク、トルメチン、ゾメピラック、ナブメトン、ジクロフェナク、フェンクロフェナク、アルクロフェナク、ブロムフェナク、イブフェナク、アセクロフェナク、アセメタシン、フェンチアザク、クリダナク、エトドラク、オキシピナク、
メフェナム酸、メクロフェナム酸、フルフェナム酸、ニフルミン酸、トルフェナム酸、ジフルニサル、フルフェニサル、ピロキシカム、テノキシカム、ロノキシカム及びニメスリド及びそれらの薬学的に許容される塩、選択的ＣＯＸ  ２阻害剤であるメロキシカム、セレコキシブ及びロフェコキシブ、ならびにそれらの薬学的に許容される塩から選択される。適切なステロイドは、プレドニゾン、プレドニゾロン、メチルプレドニゾロン、デキサメタゾン、ブデノシド、フルオコルトロン及びトリアムシノロンである。適切なＤＭＡＲＤは、スルファサラジン、オルサラジン、クロロキン、金誘導体（オーラノフィン）、Ｄ−ペニシラミン、及び細胞増殖抑制剤、例えば、メトトレキサート及びシクロホスファミドである。適切な免疫抑制剤は、シクロスポリンＡ及びその誘導体、ミコフェノラートモフェチル、ＦＫ  ５０６、ＯＫＴ−３、ＡＴＧ、１５−デスオキシスペルグアリン、ミゾリビン、ミソプロストール、ラパマイシン、レフルノミド及びアザチオプリンである。適切な生物学的応答修飾因子は、インターフェロンβ、抗ＴＮＦ−α（エタネルセプト）、ＩＬ−１０、抗ＣＤ３または抗ＣＤ２５である。適切な気管支拡張薬は、臭化イプラトロピウム、臭化オキシトロピウム、臭化チオトロピウム、塩酸エピネフリン、サルブタモール、硫酸テルブタモール、臭化フェノテロール、サルメテロール及びホルモテロールである。そのような組み合わせにおいて、各有効成分は、その通常の投与量範囲に従って、またはその通常の投与量範囲よりも低い用量のいずれかに従って、投与され得る。ＮＳＡＩＤ、ステロイド、ＤＭＡＲＤ、免疫抑制剤、及び生物学的反応修飾薬を組み合わせた投与量は、通常推奨される最低用量の適切には１／５０から、通常推奨される投与量の１／１まで、好ましくは１／２０〜１／２、より好ましくは１／１０〜１／５である。併用薬の通常推奨される用量は、例えば、ＲｏｔｅＬｉｓｔｅ（登録商標）２００２，Ｅｄｉｔｉｏ  Ｃａｎｔｏｒ  Ｖｅｒｌａｇ  Ａｕｌｅｎｄｏｒｆ，Ｇｅｒｍａｎｙ、またはＰｈｙｓｉｃｉａｎ’ｓ  Ｄｅｓｋ  Ｒｅｆｅｒｅｎｃｅに開示されている用量であると理解されるべきである。
【００９９】
臨床用途が企図される場合、意図される用途に適切な形態のタンパク質、抗体、及び薬物を含む薬学的組成物を調製することが必要な場合がある。一般に、薬学的組成物は、実施形態の有効量の１つ以上のポリペプチド、または医薬的に許容される担体に溶解もしくは分散された追加の薬剤を含み得る。「医薬的または薬理学的に許容される」という句は、必要に応じて、例えば、ヒトなどの動物に投与されたときに、有害、アレルギー、または他の有害な反応を生じない、分子実体及び組成物を指す。本明細書に開示される方法によって単離された実施形態の少なくとも１つのポリペプチド、または追加の有効成分を含む薬学的組成物の調製は、参照により本明細書に組み込まれる、Ｒｅｍｉｎｇｔｏｎ’ｓ  Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ  Ｓｃｉｅｎｃｅｓ，１８ｔｈ  Ｅｄ．，１９９０によって例示されるように、本開示に照らして当業者に公知である。さらに、動物（例えば、ヒト）の投与については、調製物は、ＦＤＡ  Ｏｆｆｉｃｅ  ｏｆ  Ｂｉｏｌｏｇｉｃａｌ  Ｓｔａｎｄａｒｄｓによって要求される無菌、発熱原性、一般的安全性、及び純度標準に適合するべきであることが理解されよう。
【０１００】
本明細書で使用される場合、「薬学的に許容される担体」には、ありとあらゆる溶媒、分散媒体、コーティング、界面活性剤、抗酸化剤、防腐剤（例えば、抗菌剤、抗真菌剤）、等張剤、吸収遅延剤、塩、防腐剤、薬物、薬物安定剤、ゲル、結合剤、賦形剤、崩壊剤、潤滑剤、甘味剤、香味剤、色素などの材料及びそれらの組み合わせが、当業者に公知のとおり挙げられる（例えば、参照により本明細書に組み込まれる、Ｒｅｍｉｎｇｔｏｎ’ｓ  Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ  Ｓｃｉｅｎｃｅｓ，１８ｔｈ  Ｅｄ．，１９９０を参照のこと）。いかなる従来の担体も活性成分と不適合でない限り、薬学的組成物に使用することが企図される。
【０１０１】
本発明の特定の実施形態は、それが固体、液体、またはエアロゾルの形態で投与されるかどうか、及び注射などの投与経路のために無菌である必要があるかどうかに応じて、異なるタイプの担体を含み得る。組成物は、静脈内、髄腔内、皮内、経皮、髄腔内、動脈内、腹腔内、鼻腔内、膣内、直腸内、筋肉内、皮下、粘膜、経口、局所、局所的に、吸入（例えば、噴霧または乾燥粉末製剤の吸入）、注射による、注入による、持続注入による、水浴標的細胞を直接局所灌流することにより、カテーテルを介して、洗浄を介して、脂質組成物（例えば、リポソーム）中で、または他の方法もしくは上記の任意の組み合わせによって、当業者に公知であるように投与してもよい（例えば、参照により本明細書に組み込まれる、Ｒｅｍｉｎｇｔｏｎ’ｓ  Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ  Ｓｃｉｅｎｃｅｓ，１８ｔｈ  Ｅｄ．，１９９０を参照のこと）。
【０１０２】
修飾されたポリペプチドは、遊離塩基、中性、または塩の形態の組成物に処方され得る。薬学的に許容される塩としては、酸付加塩、例えば、タンパク性組成物の遊離アミノ基で形成される塩、または例えば塩酸もしくはリン酸などの無機酸、または酢酸、シュウ酸、酒石酸、もしくはマンデル酸などの有機酸で形成される塩が挙げられる。遊離カルボキシル基で形成された塩はまた、例えば、ナトリウム、カリウム、アンモニウム、カルシウム、もしくは水酸化第二鉄などの無機塩基から；または、イソプロピルアミン、トリメチルアミン、ヒスチジン、もしくはプロカインなどの有機塩基から誘導され得る。溶液は、配合されたら、剤形と適合した様式により、治療上有効な量で、投与される。製剤は、注射液などの非経口投与用に処方されたもの、または肺に送達するためのエアロゾル、または薬物放出カプセルなどの消化剤投与用に処方されたものなど、様々な剤形で容易に投与される。
【０１０３】
さらに、本発明の特定の態様によれば、投与に適した組成物は、不活性希釈剤の有無にかかわらず、薬学的に許容される担体で提供され得る。担体は同化可能でなければならず、液体、半固体、すなわちペースト、または固体担体を含む。なんらかの従来の媒体、薬剤、希釈剤、または担体がレシピエントに対して、またはそこに含まれる組成物の処置効果に有害である場合を除いて、方法の実施に使用するための投与可能な組成物におけるその使用は適切である。担体または希釈剤の例としては、脂肪、油、水、食塩水、脂質、リポソーム、樹脂、結合剤、充填剤など、またはそれらの組み合わせが挙げられる。組成物はまた、１つ以上の成分の酸化を遅らせるための様々な抗酸化剤を含み得る。さらに、微生物の作用の防止は、パラベン（例えば、メチルパラベン、プロピルパラベン）、クロロブタノール、フェノール、ソルビン酸、チメロサールまたはそれらの組み合わせを含むがこれらに限定されない、様々な抗菌剤及び抗真菌剤などの防腐剤によってもたらされ得る。
【０１０４】
本発明の特定の態様によれば、組成物は、任意の便利でかつ実用的な方法で、すなわち、溶液、懸濁液、乳化、混合、カプセル化、吸収などによって、担体と組み合わされる。そのような手順は、当業者にとって慣用的である。
【０１０５】
本発明の特定の実施形態では、この組成物は、半固体または固体の担体と完全に組み合わされるかまたは混合される。混合は、粉砕などの任意の便利な方法で実行され得る。処置活性の喪失、すなわち胃の変性から組成物を保護するために、安定剤を混合プロセスに加えてもよい。組成物に使用するための安定剤の例としては、緩衝液、グリシン及びリジンなどのアミノ酸、炭水化物または凍結保護剤、例えば、デキストロース、マンノース、ガラクトース、フルクトース、ラクトース、スクロース、マルトース、ソルビトール、マンニトールなどが挙げられる。
【０１０６】
いくつかの態様において、医薬製剤は、１つ以上の界面活性剤を含む。開示された方法に従って使用される界面活性剤としては、イオン性及び非イオン性界面活性剤が挙げられる。代表的な非イオン性界面活性剤としては、ポリソルベート、例えば、ＴＷＥＥＮ（登録商標）−２０及びＴＷＥＥＮ（登録商標）−８０界面活性剤（ニュージャージー州ブリッジウォーターのＩＣＩ  Ａｍｅｒｉｃａｓ  Ｉｎｃ．）；ポロキサマー（例えば、ポロキサマー１８８）；ＴＲＩＴＯＮ（登録商標）界面活性剤（ミズーリ州セントルイスのＳｉｇｍａ）；ドデシル硫酸ナトリウム（ＳＤＳ）；ラウリル硫酸ナトリウム；オクチルグリコシドナトリウム；ラウリル−、ミリスチル−、リノレイル−、またはステアリル−スルホベタイン；ラウリル−、ミリスチル−、リノレイル−またはステアリル−サルコシン；リノレイル−、ミリスチル−、またはセチル−ベタイン；ラウロアミドプロピル−、コカミドプロピル−、リノールアミドプロピル−、ミリスタミドプロピル−、パルニドプロピル−、または（例えば、ラウロアミドプロピル）；ミリスタミドプロピル−、パルミドプロピル−、またはイソステアラミドプロピル−ジメチルアミン；ナトリウムメチルココイル−、または二ナトリウムメチルオレイル−タウレート；ＭＯＮＡＱＵＡＴ（商標）界面活性剤（ニュージャージー州パターソンのＭｏｎａ  Ｉｎｄｕｓｔｒｉｅｓ  Ｉｎｃ．）；ポリエチルグリコール；ポリプロピレングリコール；エチレンとプロピレングリコールのブロック共重合体、例えば、ＰＬＵＲＯＮＩＣ（登録商標）界面活性剤（ニュージャージー州マウントオリーブのＢＡＳＦ）；オリゴ（エチレンオキシド）アルキルエーテル；アルキル（チオ）グルコシド、アルキルマルトシド；及びリン脂質が挙げられる。例えば、界面活性剤は、約０．０１％〜約０．５％（配合物の他の固体成分の総重量に対する界面活性剤の重量；「ｗ／ｗ」）、約０．０３％〜約０．５％（ｗ／ｗ）、約０．０５％〜約０．５％（ｗ／ｗ）、または約０．１％〜約０．５％（ｗ／ｗ）の量で配合物中に存在し得る。しかしながら、さらなる態様において、実施形態の医薬製剤は、本質的に非イオン性界面活性剤を含まないか、または本質的に全ての界面活性剤を含まない。
【０１０７】
本発明の治療方法に関して、本明細書に開示される１つ以上のペプチドまたはその変異体、バリアント、類似体または誘導体の投与は、特定の投与様式、投与量、または投与の頻度に限定されることを意図するものではない；本発明は、筋肉内、静脈内、腹腔内、小胞内、関節内、病変内、皮下、または炎症関連障害を処置するのに十分な用量を提供するのに十分な任意の他の経路を含む、全ての投与様式を企図する。治療薬は、単回投与で患者に投与されても、または複数回投与で患者に投与されてもよい。複数の用量が投与される場合、用量は、例えば、１時間、３時間、６時間、８時間、１日、２日、１週間、２週間、または１ヶ月間によって互いに分離され得る。例えば、治療薬は、例えば、２、３、４、５、６、７、８、１０、１５、２０、またはそれ以上の週の間投与されてもよい。任意の特定の対象について、特定の投与計画は、個々の必要性、及び組成物を投与するか、または投与を監督する人の専門的判断に従って、時間とともに調整されるべきであることを理解されたい。例えば、より低い用量で十分な処置活性が得られない場合、治療薬の投与量を増やしてもよい。
【０１０８】
主治医が最終的に適切な量及び投与計画を決定する一方で、本明細書に開示される１つ以上のポリペプチドまたはその変異体、バリアント、類似体もしくは誘導体の治療有効量は、０．０００１、０．０１、０．０１  ０．１、１、５、１０、２５、５０、１００、５００、または１，０００ｍｇ／ｋｇまたはｇ／ｋｇの用量で提供され得る。有効用量は、インビトロまたは動物モデルの試験バイオアッセイまたは系から誘導された用量反応曲線から外挿され得る。
【０１０９】
特定の患者または対象の投与量は、従来の考慮事項を使用して（例えば、適切な従来の薬理学的プロトコルによって）当業者によって決定され得る。医師は、例えば、最初は比較的低用量を処方し、その後、適切な応答が得られるまで用量を増やしてもよい。患者に投与される用量は、用途に応じて、経時的に患者に有益な治療反応をもたらすのに十分であるか、または、例えば、症状もしくは他の適切な活動を低減するのに十分である。用量は、特定の製剤の有効性、ならびに本明細書に開示される１つ以上のポリペプチドまたはその変異体、バリアント、類似体もしくは誘導体の活性、安定性または血清半減期、及び患者の状態、ならびに処置される患者の体重または表面積によって決定される。
【０１１０】
いくつかの態様において、対象は、単回投与を与えられ、対象、好ましくは哺乳動物、より好ましくは肺線維症に罹患しているかまたは肺線維症に罹りやすいヒトを処置するために１日１回与えられるのは、約０．２ｍｇ／ｋｇ〜２５０ｍｇ／ｋｇ、例えば、約１０ｍｇ／ｋｇ〜約５０ｍｇ／ｋｇの間で、例えば、点滴注入（吸入による）による。そのような用量は、約３日から１週間以上のどこにでも毎日投与され得る。当該技術分野でよく理解されているように、用量を下方に調整する必要があるかもしれないが、慢性投与も可能である。しかしながら、個々の処置レジームにおける変数の数が多く、これらの好ましい値からのかなりの逸脱が予想されるので、前述の範囲は示唆的である。
【０１１１】
例えば、以下に記載される実験のいくつかで使用された浸透圧ポンプなどのポンプシステムによる連続投与の場合、約１〜２週間の時間経過の総投与量は、好ましくは１ｍｇ／ｋｇ〜１ｇ／ｋｇ、好ましくは２０〜３００ｍｇ／ｋｇ、より好ましくは５０〜２００ｍｇ／ｋｇの範囲である。そのような連続投与レジメンの後、活性化合物の総濃度は、好ましくは約０．５〜約５０μＭ、好ましくは約１〜約１０μＭの範囲である。
【０１１２】
インビトロでアポトーシスを阻害または阻害することを防止するための活性化合物の有効濃度は、約０．５ｎＭ〜約１００ｎＭの範囲、より好ましくは約２ｎＭ〜約２０ｎＭである。有効用量及び最適用量範囲は、本明細書に記載の方法を使用してインビトロで決定され得る。
【０１１３】
Ｂ．エアロゾル分散及び噴霧デバイス
製剤は、ジェットネブライザー、超音波ネブライザー、定量吸入器（ＭＤＩ）、及びジェットまたはノズルを強制的に通過させることによる液体のエアロゾル化のためのデバイスを含むがこれらに限定されない任意の適切なデバイス（例えば、カリフォルニア州、ヘーワードのＡｒａｄｉｇｍによるＡＥＲＸ（登録商標）ドラッグデリバリーデバイス）を使用してエアロゾル化され得る。さらに、化合物は、乾燥粉末吸入器デバイスを使用して送達するための乾燥粉末として処方されてもよい。本明細書以下でさらに説明するように、製剤を対象に送達するために、肺送達デバイスはまた、任意選択でマスク、マウスピース、ミスト吸入装置、及び／またはユーザが正しく吸入するように誘導し、呼吸の適切なタイミングで自動的に薬剤を送達するプラットフォームと組み合わせて、人工呼吸器を含んでもよい。本発明の方法に従って使用され得る代表的なエアロゾル化デバイスとしては、限定するものではないが、米国特許第６，３５７，６７１号；同第６，３５４，５１６号；同第６，２４１，１５９号；同第６，０４４，８４１号；同第６，０４１，７７６号；同第６，０１６，９７４号；同第５，８２３，１７９号；同第５，７９７，３８９号；同第５，６６０，１６６号；同第５，３５５，８７２号；同第５，２８４，１３３号；及び同第５，２７７，１７５号、ならびに米国特許出願公開第２００２００２０４１２号及び２００２００２０４０９号に記載されるデバイスが挙げられる。
【０１１４】
ジェットネブライザーを使用して、コンプレッサーまたは病院のエアラインからの圧縮ガスは、ジェットとして知られる狭い狭窄部を通過する。これにより低圧の領域が作成され、リザーバーからの薬液がフィードチューブから吸い上げられ、空気の流れによって液滴に断片化される。最小の液滴のみがネブライザーを直接離れ、大部分はバッフル及び壁に影響を与え、リザーバーに戻される。その結果、ジェット噴霧を実行するのに必要な時間は、他の要因の中でもとりわけ、噴霧される組成物の容積に応じて変化し、そのような時間は、当業者によって容易に調整され得る。
【０１１５】
定量吸入器（ＭＤＩ）を使用して、ネブライザーを使用して通常送達されるよりもより濃縮された形態で本発明の組成物を送達してもよい。最適な効果を得るために、ＭＤＩ送達システムには、吸入によるエアロゾル送達の協調作動、毎秒約０．５〜０．７５リットルのゆっくりとした吸入、吸気吸入能力に達する深呼吸、及び少なくとも４秒間の息止めを含む、適切な投与技術が必要である。ＭＤＩを使用した肺送達は、処置が比較的短い処置時間及び低コストの恩恵を受ける場合に便利でかつ適切である。場合により、製剤は、噴霧中に約２５℃〜約９０℃に加熱されて、効果的な液滴形成及びその後の送達を促進し得る。例えば、米国特許第５，２９９，５６６を参照のこと。
【０１１６】
実施形態のエアロゾル組成物は、肺内への効率的な送達に適したサイズである組成物の液滴を含む。場合によっては、界面活性剤製剤は、肺気管支、さらに好ましくは細気管支、さらにより好ましくは肺胞管、さらにより好ましくは肺胞に送達される。エアロゾル液滴は、典型的には、直径が約１５μｍ未満、直径が約１０μｍ未満、直径が約５μｍ未満、または直径が約２μｍ未満である。ヒト対象の肺胞気管支への効率的な送達のために、エアロゾル組成物は、好ましくは、約１μｍ〜約５μｍの直径を有する液滴を含んでもよい。
【０１１７】
液滴サイズは、当該技術分野で公知の技術、例えば、カスケード、衝突、レーザー回折、及び光学的パターン化を使用して評価され得る。ＭｃＬｅａｎ  ｅｔ  ａｌ．（２０００）Ａｎａｌ  Ｃｈｅｍ  ７２：４７９６−８０４，Ｆｕｌｔｓ  ｅｔ  ａｌ．（１９９１）Ｊ  Ｐｈａｒｍ  Ｐｈａｒｍａｃｏｌ  ４３：７２６−８，及びＶｅｃｅｌｌｉｏ  Ｎｏｎｅ  ｅｔ  ａｌ．（２００１）Ｊ  Ａｅｒｏｓｏｌ  Ｍｅｄ  １４：１０７−１４を参照のこと。
【０１１８】
エアロゾル化後のタンパク質の安定性は、サイズ排除クロマトグラフィー；電気泳動技術；ＵＶ分光法及び円二色性分光法などの分光技術、及びタンパク質活性（インビトロまたはインビボで測定）を含む当該技術分野で公知の技術を使用して評価され得る。タンパク質の安定性のインビトロアッセイを実行するために、エアロゾル組成物を収集し、蒸留するか、フィルターに吸収させてもよい。インビボアッセイを実施するために、または対象への組成物の肺投与のために、エアロゾル化のためのデバイスは、対象による吸入に適合されている。例えば、タンパク質の安定性は、タンパク質凝集のレベルを決定することによって評価され得る。好ましくは、本発明のエアロゾル組成物は、タンパク質凝集体を実質的に含まない。可溶性凝集物の存在は、ＤＬＳ（ＤｙｎａＰｒｏ−８０１ＴＣ、バージニア州シャーロッツビルのＰｒｏｔｅｉｎＳｏｌｕｔｉｏｎｓ  Ｉｎｃ．）を使用して、及び／またはＵＶ分光光度法によって定性的に決定され得る。
【０１１９】
「振動メッシュネブライザー」という用語は、本明細書では、複数の開口を有する振動メッシュまたはプレート（開口プレート）を使用して微粒子の低速エアロゾルを生成するという一般原理に基づいて動作する任意のネブライザーを指す。一部のネブライザーは、１０００〜７０００個の穴を備えたメッシュ／メンブレンを含む場合があり、このメッシュ／メンブレンは液体リザーバーの上部で振動する（例えば、米国特許公開２００９０１３４２３５及びＷａｌｄｒｅｐ  ａｎｄ  Ｄｈａｎｄ  ２００８を参照、それぞれ参照により本明細書に組み込まれる）。いくつかの実施形態では、振動メッシュネブライザーは、ＡＥＲＯＮＥＢ（登録商標）プロフェッショナルネブライザー、オムロンＭＩＣＲＯＡＩＲ（登録商標）、Ｐａｒｉ  ＥＦＬＯＷ（登録商標）、またはＥＺ  Ｂｒｅａｔｈｅ  Ａｔｏｍｉｚｅｒである。いくつかの態様において、振動メッシュネブライザーは、約５０〜２５０ｋＨｚ、７５〜２００ｋＨｚ、１００〜１５０ｋＨｚ、または約１２０ｋＨｚの間の振動周波数を有する。これらのデバイスは、エアロゾルを肺に送達する効率が高く、これらのデバイスに残っている液体の量は最小限であり、これは、プラスミノーゲン活性化因子のような高価でかつ強力な化合物にとって有利である。
【０１２０】
特定の態様では、実施形態の噴霧組成物は、振動メッシュ噴霧器を使用して生成される。例えば、この組成物は、アクティブ振動メッシュネブライザー（例えば、Ａｅｒｏｎｅｂ（登録商標）Ｐｒｏｆｅｓｓｉｏｎａｌ  Ｎｅｂｕｌｉｚｅｒ  Ｓｙｓｔｅｍ）を用いて生成され得る。そのようなシステム及びそこでの動作の説明は、例えば、米国特許第６，９２１，０２０号；同第６，９２６，２０８号；同第６，９６８，８４０号；同第６，９７８，９４１号；同第７，０４０，５４９号；同第７，０８３，１１２号；同第７，１０４，４６３号；及び同第７，３６０，５３６号（これらのそれぞれは、その全体が参照により本明細書に組み込まれる）に見出され得る。さらに別の態様では、実施形態の組成物は、Ｏｍｒｏｎ  ＭｉｃｒｏＡｉｒ（オムロンマイクロエア）（登録商標）またはＥＺ  Ｂｒｅａｔｈｅ  Ａｔｏｍｉｚｅｒなどの受動振動メッシュネブライザーを使用して生成され得る。
【０１２１】
ＩＶ．処置のための肺の状態
本発明の修飾ペプチドは、様々な肺の状態を処置するために使用され得る。処置のための肺の状態は、急性である場合もまたは慢性の場合もある。急性の肺の状態は、急性肺損傷、感染症、または化学物質誘発性である場合がある。慢性肺状態は、損傷、感染症、または疾患の結果である場合がある。
【０１２２】
Ａ．肺損傷
いくつかの態様において、対象は、急性肺損傷（ＡＬＩ）または感染症または化学物質誘発性肺損傷を有する。特定の態様において、対象は、急性呼吸窮迫症候群（ＡＲＤＳ）、吸入煙誘発性急性肺損傷（ＩＳＡＬＩ）、気管支拡張症、吸入毒素誘発性気道疾患（例えば、塩素または他の誘発性気道疾患）、マスタードガスへの曝露、粒子状物質（例えば、シリカダスト）への曝露、閉塞性細気管支炎、肺炎を組織化する閉塞性細気管支炎、薬物誘発性肺疾患、及び肺線維症の加速（例えば、ＡＲＤＳを含む急性肺損傷後に発生）を有する。急性肺損傷（ＡＬＩ）は、アメリカ軍関係者の間で深刻な医学的問題である。戦闘中のＡＬＩは、極めて広範な病因から生じ得る。
【０１２３】
吸入傷害によるＡＬＩは、吸入抗凝固薬、ステロイド、ベータアゴニスト、高頻度換気、及び体外式膜型人工肺で処置されており、結果は変動し、一般的には最適ではない。呼吸マスクを備えたバリア以外に効果的な予防策はない。ＡＲＤＳの管理は大幅に進歩したが、大部分は引き続き支援的であり、内因性の治癒メカニズムが効果を発揮するのを注意深く待つものであり；院内死亡率は４０％を超えたままである（Ｍａｔｔｈａｙ  ｅｔ  ａｌ．，２０１２）。ＡＬＩの生存者は、生活の質が低下した慢性呼吸器疾患に苦しむ場合が多い。慢性呼吸不全及び肺線維症などの回復を加速するか、及び／または後の合併症を防ぎ得る任意の手順が非常に望ましい。早期診断、さらに重要なことに、ＡＬＩの予防と治療を改善することが切実に必要とされている。全身性疾患に起因する直接吸入肺損傷またはＡＲＤＳによるＡＬＩの病態生理学は、極めて複雑かつ不均一であり、膜透過性の増大、炎症性サイトカインの流入、酸化的細胞損傷、コンパートメント液シフト、イオンチャネルの障害などのような全身性及び局所性の心肺因子を含む（Ｍａｔｔｈａｙ  ｅｔ  ａｌ．，２０１２）。明らかに、ＡＬＩなどの肺障害を処置及び予防するには、新しい処置法が必要である。
【０１２４】
いくつかの実施形態において、対象において、急性肺損傷、肺感染症または肺疾患を処置または予防する方法が提供され、これは、対象に、少なくとも１つのアミノ酸置換、ＦＴＴＦＴＶＴのアミノ酸配列（配列番号２）に対する挿入または欠失を含む有効量のバリアントポリペプチド（このバリアントポリペプチドはカベオリン−１（Ｃａｖ−１）の生物学的活性を維持する）を投与することを含む。いくつかの態様において、実施形態の医薬製剤を投与する方法は、バリアントポリペプチドを含む溶液を噴霧することを含む。特定の態様では、対象は、ヒトである。
【０１２５】
Ｂ．肺疾患
肺疾患としては、嚢胞性線維症、慢性閉塞性肺疾患（ＣＯＰＤ）、喘息、閉塞性細気管支炎、鋳型細気管支炎、及び肺感染症、コラーゲン血管肺疾患（例えば、ループス、強皮症または混合結合組織疾患から）、間質性肺疾患（例えば、特発性肺線維症またはサルコイドーシス）、ならびに線維症につながる急性及び慢性の肺損傷が挙げられる（Ｍｕｒｒａｙ  ｅｔ  ａｌ．，１９９７；Ｒａｂｅ  ｅｔ  ａｌ．，２００７；Ｔｓｕｓｈｉｍａ  ｅｔ  ａｌ．，２００９）。これらの疾患は、世界で３番目に多い死因となっている。
【０１２６】
嚢胞性線維症は、主に消化器系及び呼吸器系に影響を与える外分泌腺及び外分泌汗腺の遺伝性疾患である。この病気は通常、慢性呼吸器感染症、膵臓機能不全、異常に粘稠な粘液性分泌物、及び早死を特徴とする。嚢胞性線維症（ＣＦ）は、進行性の気流閉塞を特徴とする。ＣＦ個体のサブセットはまた、吸入コリン作動薬に対する気道過敏性（Ｗｅｉｎｂｅｒｇｅｒ，２００２及びＭｉｔｃｈｅｌｌ  ｅｔ  ａｌ．，１９７８）及び気管支拡張薬に応答した気流制限の可逆性（ｖａｎ  Ｈａｒｅｎ  ｅｔ  ａｌ．，１９９１及びｖａｎ  Ｈａｒｅｎ  ｅｔ  ａｌ．，１９９２）も発症する。気管支過敏性及び気道閉塞の存在によって、ＣＦと、喘息または慢性閉塞性肺疾患（ＣＯＰＤ）など、気道平滑筋機能障害が疾患プロセスに寄与すると考えられている他の気道狭窄疾患との間で共通の病因の可能性が示唆される。
【０１２７】
肺感染症は、細菌感染症であってもよい。感染性細菌は、Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ  ａｅｒｕｇｉｎｏｓａ、Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ａｎｔｈｒａｃｉｓ、Ｌｉｓｔｅｒｉａ  ｍｏｎｏｃｙｔｏｇｅｎｅｓ、Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ  ａｕｒｅｕｓ、Ｓａｌｍｅｎｅｌｌｏｓｉｓ、Ｙｅｒｓｉｎａ  ｐｅｓｔｉｓ、Ｍｙｃｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｌｅｐｒａｅ、Ｍ．ａｆｒｉｃａｎｕｍ、Ｍ．ａｓｉａｔｉｃｕｍ、Ｍ．ａｖｉｕｉｎ−ｉｎｔｒａｃｅｌｌｕｌａｉｒｅ、Ｍ．ｃｈｅｌｏｎｅｉ  ａｂｓｃｅｓｓｕｓ、Ｍ．ｆａｌｌａｘ、Ｍ．ｆｏｒｔｕｉｔｕｍ、Ｍ．ｋａｎｓａｓｉｉ、Ｍ．ｌｅｐｒａｅ、Ｍ．ｍａｌｍｏｅｎｓｅ、Ｍ．ｓｈｉｍｏｉｄｅｉ、Ｍ．ｓｉｍｉａｅ、Ｍ．ｓｚｕｌｇａｉ、Ｍ．ｘｅｎｏｐｉ、Ｍ．ｔｕｂｅｒｃｕｌｏｓｉｓ、Ｂｒｕｃｅｌｌａ  ｍｅｌｉｔｅｎｓｉｓ、Ｂｒｕｃｅｌｌａ  ｓｕｉｓ、Ｂｒｕｃｅｌｌａ  ａｂｏｒｔｕｓ、Ｂｒｕｃｅｌｌａ  ｃａｎｉｓ、Ｌｅｇｉｏｎｅｌｌａ  ｐｎｅｕｍｏｎｏｐｈｉｌｉａ、Ｆｒａｎｃｉｓｅｌｌａ  ｔｕｌａｒｅｎｓｉｓ、Ｐｎｅｕｒｎｏｃｙｓｔｉｓ  ｃａｒｉｎｉｉ、ｍｙｃｏｐｌａｓｍａ、またはＢｕｒｋｈｏｌｄｅｒｉａ  ｃｅｐａｃｉａであってもよい。細菌感染は肺炎を生じ得る。
【０１２８】
慢性閉塞性肺疾患（ＣＯＰＤ）とは、２つの主要な気流閉塞障害である、慢性気管支炎及び肺気腫を分類するために使用される用語である。約１６００万人のアメリカ人がＣＯＰＤを患っており、その８０〜９０％は生涯を通じて喫煙者であった。ＣＯＰＤは、米国の主要な死因であり、２００３年には１２２，２８３人の死亡例を占める。ＣＯＰＤに関する米国での費用は、２００３年の直接医療費で約２０９億ドルであった。慢性気管支炎は、気管支気道の炎症である。気管支気道は気管と肺とを接続する。炎症を起こすと、気管支が粘液を分泌し、慢性の咳を引き起こす。
【０１２９】
肺気腫では、肺のエラスチン骨格への損傷の結果として、肺胞嚢が過剰に膨張している。気腫性肺の炎症細胞はエラスターゼ酵素を放出し、これが肺マトリックス内のエラスチン繊維を分解または損傷する。肺気腫には、喫煙、環境汚染物質への曝露、アルファ１アンチトリプシン欠乏症及び老化など、多くの原因がある。
【０１３０】
細気管支炎は、ウイルス性下気道感染症によって最も一般的に引き起こされ、主に急性炎症、浮腫、小さな気道を覆う上皮細胞の壊死、及び粘液産生の増大を特徴とする（Ｒａｌｓｔｏｎ  ｅｔ  ａｌ．，２０１４）。兆候及び症状は通常、鼻炎及び咳から始まり、頻呼吸、喘鳴、ラ音、副筋の使用、及び／または鼻のフレアに進行し得る。
【０１３１】
閉塞性細気管支炎は、肺の小気道の異常なリモデリングの結果としての進行性の気流低下である（Ｍｅｙｅｒ  ｅｔ  ａｌ．，２０１４）。閉塞性細気管支炎症候群は、肺移植の主要な合併症であり、これを使用して他の既知の原因によって引き起こされない強制呼気量及び力の持続的な低下をもたらす、同種移植片機能不全の遅延を説明する場合が多い（Ｍｅｙｅｒ  ｅｔ  ａｌ．，２０１４）。
【０１３２】
「喘息」という用語は、急性喘息、慢性喘息、間欠性喘息、軽度持続性喘息、中等度持続性喘息、重度持続性喘息、慢性持続性喘息、軽度から中等度の喘息、軽度から中等度の持続性喘息、軽度から中等度の慢性持続性喘息、アレルギー性（外因性）喘息、非アレルギー性（内因性）喘息、夜間喘息、気管支喘息、運動誘発性喘息、職業性喘息、季節性喘息、無症候性喘息、胃食道喘息、特発性喘息及び咳喘息（ｃｏｕｇｈ  ｖａｒｉａｎｔ  ａｓｔｈｍａ）を指し得る。喘息の間、気道は持続的に炎症を起こし、時にはけいれんを起こす場合がある。
【実施例】
【０１３３】
Ｖ．実施例
以下の実施例は、本発明の好ましい実施形態を裏付けるために含まれる。以下に続く実施例において開示された技術は、本発明の実行において良好に機能するように本発明者によって発見された技術を表し、したがって、その好適な実行のモードを構成すると考えられ得ることが、当業者に理解されるべきである。しかしながら、当業者は、本開示に照らして、本発明の趣旨及び範囲から逸脱することなく、多くの変更が開示される特定の実施形態においてなされるが、それでも同様なまたは類似する結果を得ることができることを理解するべきである。
実施例１−Ｃａｖ−１ペプチド溶解性
【０１３４】
どのペプチドが液体製剤に最も溶解し得るかを決定するために、５０ｍｇの各Ｃａｖ−１ペプチドを５ｍＬのＴｒｉｓ緩衝生理食塩水、ｐＨ７．５１に溶解した。試料が完全に溶解するのを助けるために、各試料をボルテックスした。６００  ｎｍでの吸光度は、不溶性ペプチドの場合はペプチドの溶解直後、または可溶性ペプチドの場合は１０分後に測定した。吸光度は、それぞれ、溶解後１５分、５分、または１５分に２回目に測定された試料ＡＰｉ２３４８、ＡＰｉ２３５２、ＡＰｉ２３５３を除いて、不溶性ペプチドに関して１０分後に再度測定した。試料ＡＰｉ２３４５は、溶解が不完全であったため、溶解後２０分後にのみ測定した（表２）。ｐＨはまた２４時間後にも試験した。
【０１３５】
試料ＡＰｉ２３５０、ＡＰｉ２３５４、ＡＰｉ２３５５、及びＡＰｉ２３５６は、他の試験されたペプチドと比較して、ｐＨ７．５１での溶解度が増大していた（表２）。２４時間後、全ての試料でｐＨは約ｐＨ７．５で安定したままであった。
【０１３６】
【表２】
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【０１３７】
実施例２−Ｃａｖ−１ペプチドは平滑筋アクチン産生を増大させる
Ｃａｖ−１ペプチドを、ＤＭＳＯに溶解して、１０ｍＭのストック溶液を作製した。次に、各ペプチドの１０ｍＭストック溶液を、ＨＢＳＳで希釈して、９００μＭのワーキングストック溶液を作成した。ＤＭＳＯに再懸濁したポリペプチド及びワーキングストックを−２０℃で保存した。培地の場合、Ｃａｖ−１ペプチドの最終濃度が１０μＭになるようにワーキングストックをＤＭＥＭ培養培地に添加した。
【０１３８】
特発性肺線維症（ＩＰＦ）細胞株２０５１を購入し、第４継代からのＩＰＦ細胞を、ＤＭＥＭ、１０％ＦＢＳ、及び１％Ｐ／Ｓを含む１００ｍｍプレートに播種した。ＩＰＦ細胞を４ｍＬのＤＭＥＭ＋１％Ｐ／Ｓで洗浄し、血清を一晩飢餓状態にした。次に、細胞を、４４μＬのＨＢＳＳ（陰性対照）、１０μＭのＬＴＩ−０３（配列番号２）、９０μＭのＬＴＩ−０３（陽性対照）、１０μＭのＡＰｉ２３５０、１０μＭのＡＰｉ２３５４、１０μＭのＡＰｉ２３５５、１０ｕＭのＡＰｉ２３５６または２０ｕＬのＤＭＳＯ（陰性対照）のいずれかで２日間処理した。
【０１３９】
２日間の処理後、細胞を冷無菌ＨＢＳＳで１回洗浄した。ＨＢＳＳを除去し、プロテアーゼ阻害剤カクテルを含む１５０ｕＬの溶解緩衝液を細胞に添加した。細胞を溶解緩衝液とともに１０分間インキュベートした。細胞溶解物をプレートからこすり取り、収集した。次に、細胞溶解物を２回超音波処理した。超音波処理後、溶解物を１３，０００ＲＰＭで２０分間遠心分離した。次に、溶解物を液体窒素で急速冷凍し、解凍し、ボルテックスし、１３，０００ＲＰＭで３０分間再度遠心分離した。次に、上澄みを収集し、ペレットを廃棄した。次に、細胞溶解物の濃度をＢＣＡアッセイによって決定した。
【０１４０】
処置の効果の存在を評価するために、ウエスタンブロットを実施した。簡単に説明すると、１２ｕｇの各溶解物を１０％ポリアクリルアミドゲルで泳動した。次に、ゲルを膜に移し、洗浄した。平滑筋アクチン（ＳＭＡ）及びチューブリンに対する一次抗体のウエスタンブロットの結果は、図１に見られ得る。写真のレーンの各溶解物の処理は次のとおりである：１：未処理、２：１０μＭのＬＴＩ−０３、３：９０μＭのＬＴＩ−０３、４：１０μＭのＡＰｉ２３５０、５：１０μＭのＡＰｉ２３５４、６：１０μＭのＡＰｉ  ２３５５、７：１０μＭのＡＰｉ２３５６、及び８：ＤＭＳＯ。
【０１４１】
ウエスタンブロットを写真撮影し、ＩｍａｇｅＪで分析して、平滑筋アクチンとチューブリンの比率を決定した（図２）。予想どおり、ＬＴＩ−０３はチューブリンと比較してＳＭＡ産生の増大を誘発した。Ｃａｖ−１ペプチドＡＰｉ２３５０、ＡＰｉ２３５４、ＡＰｉ２３５５、及びＡＰｉ２３５６による処置は全て、チューブリンと比較してＳＭＡの発現も増大させた（図２）。
実施例３−Ｃａｖ−１ペプチドは、線維性肺生検のＡＥＣ２細胞を保存する
【０１４２】
ＡＥＣ２細胞生存率に対するＣａｖ−１ペプチドＡＰｉ２３５５（配列番号８）の効果を評価するために、非特異的間質性肺炎精密切断肺スライス（ＰＣＬＳ）の調製のために外科的生検を得た。非特異的間質性肺炎（ＮＳＩＰ）の１個体及び末期ＩＰＦの別の個体を処理した。生細胞の酸性コンパートメントを染色し、肺ＡＥＣ２細胞の層状体に選択的に蓄積するＬｙｓｏｔｒａｃｋｅｒ染色を実施した（Ｖａｎ  ｄｅｒ  Ｖｅｌｄｅｎ  ｅｔ  ａｌ．，２０１３）。Ｃａｖ−１ペプチドをＤＭＥＭ／５％ＦＢＳに懸濁し、ＰＣＬＳスライス（ｎ＝５複製／処理グループ）を１０、１００、または５００μＭのＬＴＩ−０３またはＡＰｉ２３５５（Ｖａｒ  ５５）で処理した。Ｌｙｓｏｔｒａｃｋｅｒ染色（Ｇｒｅｅｎ  ＤＮＤ−２６、Ｐｒｏｍｅｇａ）は、１回の処理の４８時間後にＮＳＩＰ  ＰＣＬＳで実行した。ＡＥＣ２細胞生存率の強い用量依存的増大を観察した。さらに、リゾトラッカー染色（Ｒｅｄ  ＤＮＤ−９９，Ｐｒｏｍｅｇａ）は、ＬＴＩ−０３またはＡＰｉ２３５５による毎日の処置後１、２、３、５、及び７日目の末期ＩＰＦで実施した。ＬＴＩ−０３で７日間連続して処置した末期ＩＰＦ生検で、ＡＥＣ２細胞生存率の用量依存的な増大を観察した。ＡＰｉ２３５５（Ｖａｒ  ５５）の治療効果は３日目まで観察した。
【０１４３】
＊  ＊  ＊
本明細書に開示され主張される方法の全ては、本開示に照らして、過度の実験なしに実行かつ達成される。本発明の組成物及び方法が、好ましい実施形態に関して記述されてきたが、その変形が、本発明の概念、趣旨、または範囲から逸脱することなく、本明細書に記載される方法に対して、及びステップにおいてまたは方法のステップの順序において適用されてもよいことが、当業者には明らかであろう。より具体的には、同一または類似の結果が達成される限り、化学的及び生理学的の両方に関連する特定の作用物質が、本明細書に記載される作用物質に置き換えられてもよいことが明らかであろう。当業者に明確な全てのこうした類似の置換及び改変は、添付の特許請求の範囲により定義される本発明の趣旨、範囲、及び概念の範囲内であると見なされる。
【０１４４】
Ｖ．      引用文献
以下の参考文献は、これらが例示的な手法または他の細部の補足を本明細書に記載されるものに提供する程度まで、具体的に参照により本明細書に組み込まれる。
Ｂｏｎｅｌｌｉ，Ｆ．ｅｔ  ａｌ．，Ｉｎｔ  Ｊ  Ｐｅｐｔ  Ｐｒｏｔｅｉｎ  Ｒｅｓ．２４（６）：５５３−６（１９８４）．
Ｂｕｎｄｇａａｒｄ  Ｈ，Ｅｄ：Ｄｅｓｉｇｎ  ｏｆ  Ｐｒｏｄｒｕｇｓ，Ｅｌｓｅｖｉｅｒ，Ａｍｓｔｅｒｄａｍ，１９８５
Ｃｕｒｒｅｎｔ  Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ  Ｉｎ  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｂｉｏｌｏｇｙ（Ｆ．Ｍ．Ａｕｓｕｂｅｌ  ｅｔ  ａｌ．，ｅｄｓ．，１９８７）
Ｄｏｒｄｏ  ｅｔ  ａｌ，Ｊ．Ｍｏｌ  Ｂｉｏｌ，１９９９，２１７，７２１−７３９
Ｆｕｌｔｓ  ｅｔ  ａｌ．（１９９１）Ｊ  Ｐｈａｒｍ  Ｐｈａｒｍａｃｏｌ  ４３：７２６−８
Ｇｉａｎｎｉｓ  ｅｔ  ａｌ．，Ａｄｖ．ｉｎ  Ｄｒｕｇ  Ｒｅｓ．２９：１−７８（１９９７）．
Ｈｒｕｂｙ，ＶＪ，Ｂｉｏｐｏｌｙｍｅｒｓ  ３３：１０７３−１０８２（１９９３）
Ｊｏｈｎｓｏｎ  ｅｔ  ａｌ．，Ｉｎ：Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ  ａｎｄ  Ｐｈａｒｍａｃｙ，ｉｎ  Ｐｅｚｚｕｔｏ  ｅｔ  ａｌ．，Ｃｈａｐｍａｎ  ａｎｄ  Ｈａｌｌ（Ｅｄｓ．），ＮＹ，１９９３
Ｋｙｔｅ及びＤｏｏｌｉｔｔｌｅ，Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．，１５７（１）：１０５−３２，１９８２．
ＭｃＬｅａｎ  ｅｔ  ａｌ．（２０００）Ａｎａｌ  Ｃｈｅｍ  ７２：４７９６−８０４．
Ｍｅｙｅｒ  ｅｔ  ａｌ．，Ｅｕｒｏｐｅａｎ  Ｒｅｓｐｉｒａｔｏｒｙ  Ｊｏｕｒｎａｌ，４４：１４７９−１５０３，２０１４．
Ｍｏｏｒｅ  ｅｔ  ａｌ．，Ａｄｖ．ｉｎ  Ｐｈａｒｍａｃｏｌ  ３３：９１−１４１（１９９５）
Ｒａｌｓｔｏｎ  ｅｔ  ａｌ．，Ｐｅｄｉａｔｒｉｃｓ，１３４（５）：ｅ１４７４−ｅ１５０２，２０１４．
Ｒｅｍｉｎｇｔｏｎ’ｓ  Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ  Ｓｃｉｅｎｃｅｓ，１８ｔｈ  ｅｄｉｔｉｏｎ，Ａ．Ｒ．Ｇｅｎｎａｒｏ，Ｅｄ．，ＭａｃｋＰｕｂｌ．，Ｅａｓｔｏｎ，ＰＡ（１９９０）．
Ｓ．Ｆｒｅｎｃｈ及びＢ．Ｒｏｂｓｏｎ，Ｊ．Ｍｏｌ．Ｅｖｏｌ．１９（１９８３）１７１
Ｔａｙｌｏｒ  ｅｔ  ａｌ，Ｊ．Ｔｈｅｏｒ．Ｂｉｏｌ．１１９（１９８６）；２０５−２１８
米国特許第４，５５４，１０１号
米国特許第５，２７７，１７５号
米国特許第５，２８４，１３３号
米国特許第５，３５５，８７２号
米国特許第５，６６０，１６６号
米国特許第５，７９７，３８９号
米国特許第５，８２３，１７９号
米国特許第５，８８９，１５５号
米国特許第６，０１６，９７４号
米国特許第６，０４１，７７６号
米国特許第６，０４４，８４１号
米国特許第６，２４１，１５９号
米国特許第６，２６１，５６９号
米国特許第６，２６１，５６９号
米国特許第６，３５４，５１６号
米国特許第６，３５７，６７１号
米国特許第６，９２１，０２０号
米国特許第６，９２６，２０８号
米国特許第６，９６８，８４０号
米国特許第６，９７８，９４１号
米国特許第７，０４０，５４９号
米国特許第７，０８３，１１２号
米国特許第７，１０４，４６３号
米国特許第７，３６０，５３６号
米国特許出願公開第２００２／００２０４０９号
米国特許出願公開第２００２／００２０４１２号
米国特許出願公開第２００９／０１３４２３５号
米国特許出願公開第２００９／０３０４６６６号
Ｖｅｃｅｌｌｉｏ  Ｎｏｎｅ  ｅｔ  ａｌ．（２００１）Ｊ  Ａｅｒｏｓｏｌ  Ｍｅｄ  １４：１０７−１
Ｖｅｒｄｉｎｉ，Ａ及びＶｉｓｃｏｍｉ，Ｇ．Ｃ，Ｊ．Ｃｈｅｍ．Ｓｏｃ．Ｐｅｒｋｉｎ  Ｔｒａｎｓ．１  ：６９７−７０１，１９８５．
Ｗａｌｄｒｅｐ及びＤｈａｎｄ，Ｃｕｒｒ．Ｄｒｕｇ  Ｄｅｌｉｖ．，５（２）：１１４−９，２００８．
Ｗａｗｒｚｙｎｃｚａｋ及びＴｈｏｒｐｅ，Ｃａｎｃｅｒ  Ｔｒｅａｔ  Ｒｅｓ．，３７：２３９−５１，１９８８．
Ｗｉｌｅｙ，ＲＡ  ｅｔ  ａｌ．，Ｍｅｄ．Ｒｅｓ．Ｒｅｖ．１３：３２７−３８４，１９９３．
【図１】
2022500078.tif 000005
【図２】
2022500078.tif 000006
【配列表】
2022500078000001.app
【国際調査報告】
2022500078.tif 000007
2022500078.tif 000008
2022500078.tif 000009