【手続補正書】
【提出日】平成22年1月5日(2010.1.5)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
・以下に示すアミノ酸のコンセンサス配列を含むペプチド：
【化１】
2009529509.tif 000001
［各アミノ酸は天然または非天然アミノ酸から選択され、
Ｘ６は、共有結合を形成することができる側鎖官能性を持つアミノ酸またはＡもしくはα
−アミノ−γ−ブロモ酪酸であり；
Ｘ７は、Ｒ、Ｈ、Ｌ、Ｗ、ＹまたはＳであり；
Ｘ８は、Ｍ、Ｆ、Ｉ、ホモセリンメチルエーテルまたはノルイソロイシンであり；
Ｘ９は、ＧまたはＧの保存的置換物であり；
Ｘ１０は、プロリンの非保存的置換物であるか；
または、Ｘ９およびＸ１０が単一のアミノ酸で置換され；
Ｘ１１は、任意のアミノ酸から選択され；
Ｘ１２は、非荷電極性アミノ酸またはＡであり；
Ｘ１３は、Ｗ、１−ｎａｌ、２−ｎａｌ、ＡまたはＦであり；
Ｘ１４は、Ｄ、Ｅ、Ｉ、ＬまたはＶであり；
Ｘ１５は、共有結合を形成することができる側鎖官能性を持つアミノ酸またはＡもしくは
α−アミノ−γ−ブロモ酪酸である］、
および
・ＥＰＯミメティック活性を示し、かつ位置Ｘ１０にプロリンの非保存的置換物を構成す
るアミノ酸を持つか、またはＸ９およびＸ１０が単一のアミノ酸で置換される、上記コン
センサス配列によって定義されるペプチドの機能的に等価なフラグメント、誘導体および
変種、
からなる群より選択される、ＥＰＯ受容体に結合することができるペプチド。
【請求項２】
ＥＰＯ受容体に結合することができ、アゴニスト活性を含む、少なくとも１０アミノ酸
長のペプチドであって、以下の二つの選択肢から選択されるペプチド：
（ａ）以下に示すアミノ酸の配列を含むペプチド：
【化２】
2009529509.tif 000002
［各アミノ酸は天然または非天然アミノ酸から選択され、
Ｘ９は、ＧまたはＧの保存的置換物であり；
Ｘ１０は、プロリンの非保存的置換物であるか、またはＸ９およびＸ１０が単一のアミノ
酸で置換され；
Ｘ１１は、任意のアミノ酸から選択され；
Ｘ１２は、非荷電極性アミノ酸またはＡであり；
Ｘ１３は、ナフチルアラニンである］
（ｂ）以下に示すアミノ酸の配列を含むペプチド、とりわけＥＰＯ受容体に結合すること
ができるもの：
【化３】
2009529509.tif 000003
［各アミノ酸は天然または非天然アミノ酸から選択され、
Ｘ６は、Ｃ、Ａ、Ｅ、α−アミノ−γ−ブロモ酪酸またはホモシステイン（ｈｏｃ）であ
り；
Ｘ７は、Ｒ、Ｈ、Ｌ、ＷもしくはＹまたはＲ、Ｈ、Ｌ、Ｗ、ＹもしくはＳであり；
Ｘ８は、Ｍ、Ｆ、Ｉ、ホモセリンメチルエーテルまたはノルイソロイシンであり；
Ｘ９は、ＧまたはＧの保存的置換物であり；
Ｘ１０は、プロリンの非保存的置換物であるか；
または、Ｘ９およびＸ１０が単一のアミノ酸で置換され；
Ｘ１１は、任意のアミノ酸から選択され；
Ｘ１２は、ＴまたはＡであり；
Ｘ１３は、１−ｎａｌ、２−ｎａｌであり、
Ｘ１４は、Ｄ、Ｅ、Ｉ、ＬまたはＶであり；
Ｘ１５は、Ｃ、Ａ、Ｋ、α−アミノ−γ−ブロモ酪酸またはホモシステイン（ｈｏｃ）で
ある。
ただしＸ６かＸ１５のどちらかはＣまたはｈｏｃであるものとする］
（ｃ）ＥＰＯミメティック活性を示し、かつ位置Ｘ１０にプロリンの非保存的置換物を構
成するアミノ酸を持つか、またはＸ９およびＸ１０が単一のアミノ酸で置換され、位置Ｘ
１３にはナフチルアラニンを持つ、上記コンセンサス配列によって定義されるペプチドの
機能的に等価なフラグメント、誘導体および変種。
【請求項３】
以下に示すアミノ酸のコア配列を含む、請求項２に記載のペプチド：
【化４】
2009529509.tif 000004
［各アミノ酸は天然または非天然アミノ酸から選択され、
Ｘ６は、共有結合を形成することができる側鎖官能性を持つアミノ酸またはＡもしくはα
−アミノ−γ−ブロモ酪酸であり；
Ｘ７は、Ｒ、Ｈ、Ｌ、ＷまたはＹまたはＳであり；
Ｘ８は、Ｍ、Ｆ、Ｉ、Ｙ、Ｈ、ホモセリンメチルエーテルまたはノルイソロイシンであり
；
Ｘ９は、ＧまたはＧの保存的置換物であり；
Ｘ１０は、プロリンの非保存的置換物であるか、またはＸ９およびＸ１０が単一のアミノ
酸で置換され；
Ｘ１１は、任意のアミノ酸から選択され；
Ｘ１２は、非荷電極性アミノ酸またはＡ、好ましくはスレオニン、セリン、アスパラギン
またはグルタミンであり；
Ｘ１３は、ナフチルアラニンであり；
Ｘ１４は、Ｄ、Ｅ、Ｉ、ＬまたはＶであり；
Ｘ１５は、共有結合を形成することができる側鎖官能性を持つアミノ酸またはＡもしくは
α−アミノ−γ−ブロモ酪酸である］。
【請求項４】
以下の追加アミノ酸位置を含む、請求項１〜３のいずれか一項に記載のペプチド：
【化５】
2009529509.tif 000005
［各アミノ酸は天然または非天然アミノ酸から選択され、
Ｘ１６は、任意のアミノ酸、好ましくはＧ、Ｋ、Ｌ、Ｑ、Ｒ、Ｓ、ＨａｒまたはＴから独
立して選択され；
Ｘ１７は、任意のアミノ酸、好ましくはＡ、Ｇ、Ｐ、Ｒ、Ｋ、Ｙ、Ｈａｒから独立して選
択され；
Ｘ１８は、任意のアミノ酸、好ましくはＬまたはＱから独立して選択され；
Ｘ１９は、任意のアミノ酸から独立して選択される］。
【請求項５】
位置Ｘ１０、Ｘ１７および／またはＸ１９の荷電アミノ酸が正または負に荷電していて
、天然アミノ酸、非天然アミノ酸および誘導体化アミノ酸からなる群より選択される、請
求項３または４のいずれか一項に記載のペプチド。
【請求項６】
請求項５に記載のペプチドであって、
（ａ）前記負荷電アミノ酸が、
・天然負荷電アミノ酸、とりわけＤまたはＥ；
・好ましくは、Ａａｄ、２−アミノヘプタン二酸、Ａｓｕなどの伸長された側鎖を示す、
非天然負荷電アミノ酸；
・元々は正荷電アミノ酸であるが、負荷電基が付与されるように適切な化学基で誘導体化
されたもの
からなる群より選択され
（ｂ）前記正荷電アミノ酸が、
・天然正荷電アミノ酸、例えばリジン、アルギニン、ヒスチジンまたはオルニチン；
・位置Ｘ１０および／またはＸ１７において、好ましくは、例えばホモアルギニンに見ら
れるような伸長された側鎖を示す、非天然正荷電アミノ酸；
・元々は負荷電アミノ酸であるが、正荷電基が付与されるように適切な化学基で誘導体化
されたもの
からなる群より選択される
ことを特徴とする、ペプチド。
【請求項７】
ＥＰＯ受容体に結合することができ、アゴニスト活性を含む、少なくとも１０アミノ酸
長のペプチドであって、
・以下に示すアミノ酸のコア配列の少なくとも一つを含むペプチド：
【化７】
2009529509.tif 000006
［各アミノ酸は天然または非天然アミノ酸から選択され、位置Ｘ１０、Ｘ１７またはＸ１
９の少なくとも一つは負荷電アミノ酸であり、
Ｘ９は、ＧまたはＧの保存的置換物であり；
Ｘ１１は、任意のアミノ酸から選択され；
Ｘ１２は、非荷電極性アミノ酸またはＡ、好ましくはスレオニン、セリン、アスパラギン
またはグルタミンであり；
Ｘ１３は、Ｗ、１−ｎａｌ、２−ｎａｌ、ＡまたはＦであり；
Ｘ１４は、Ｄ、Ｅ、Ｉ、ＬまたはＶであり；
Ｘ１５は、共有結合を形成することができる側鎖官能性を持つアミノ酸またはＡもしくは
α−アミノ−γ−ブロモ酪酸であり；
Ｘ１６は、任意のアミノ酸、好ましくはＧ、Ｋ、Ｌ、Ｑ、Ｒ、Ｓ、ＨａｒまたはＴから独
立して選択され；
Ｘ１８は、任意のアミノ酸、好ましくはＬまたはＱから独立して選択される］；
・ＥＰＯミメティック活性を示し、かつ位置Ｘ１０、Ｘ１７またはＸ１９の少なくとも一
つが負荷電アミノ酸である、上記コンセンサス配列によって定義されるペプチドの機能的
に等価なフラグメント、誘導体および変種
からなる群より選択されるペプチド。
【請求項８】
以下の拡大されたコンセンサス配列を含む、請求項７に記載のペプチド：
【化８】
2009529509.tif 000007
［各アミノ酸は天然または非天然アミノ酸から選択され、
Ｘ６は、共有結合を形成することができる側鎖官能性を持つアミノ酸またはＡもしくはα
−アミノ−γ−ブロモ酪酸であり；
Ｘ７は、Ｒ、Ｈ、Ｌ、ＷまたはＹまたはＳであり；
Ｘ８は、Ｍ、Ｆ、Ｉ、Ｙ、Ｈ、ホモセリンメチルエーテルまたはノルイソロイシンであり
；
Ｘ９は、ＧまたはＧの保存的置換物であり；
Ｘ１０が負荷電アミノ酸でない場合、Ｘ１０はプロリン、プロリンの保存的置換物または
プロリンの非保存的置換物であるか、またはＸ９およびＸ１０が単一のアミノ酸で置換さ
れ；
Ｘ１１は、任意のアミノ酸から選択され；
Ｘ１２は、非荷電極性アミノ酸またはＡ、好ましくはスレオニン、セリン、アスパラギン
またはグルタミンであり；
Ｘ１３は、Ｗ、１−ｎａｌ、２−ｎａｌ、ＡまたはＦであり；
Ｘ１４は、Ｄ、Ｅ、Ｉ、ＬまたはＶであり；
Ｘ１５は、共有結合を形成することができる側鎖官能性を持つアミノ酸またはＡもしくは
α−アミノ−γ−ブロモ酪酸であり；
Ｘ１６は、任意のアミノ酸、好ましくはＧ、Ｋ、Ｌ、Ｑ、Ｒ、Ｓ、ＨａｒまたはＴから独
立して選択され；
Ｘ１７が負荷電アミノ酸でない場合、Ｘ１７は任意のアミノ酸、好ましくはＡ、Ｇ、Ｐ、
Ｙまたは正電荷天然、非天然または誘導体化アミノ酸、好ましくはＫ、Ｒ、Ｈ、オルニチ
ンまたはホモアルギニンから選択され；
Ｘ１８は、任意のアミノ酸、好ましくはＬまたはＱから独立して選択され；
Ｘ１９が負荷電アミノ酸でない場合、Ｘ１９は任意のアミノ酸、好ましくはＫ、Ｒ、Ｈ、
オルニチンまたはホモアルギニンなどの正荷電アミノ酸から独立して選択される。
ただしＸ１０、Ｘ１７またはＸ１９の少なくとも一つ、好ましくはＸ１９は、負荷電アミ
ノ酸であるものとする］。
【請求項９】
前記負荷電アミノ酸が、
・天然負荷電アミノ酸、とりわけＤまたはＥ；
・好ましくは、Ａａｄ、２−アミノヘプタン二酸、Ａｓｕなどの伸長された側鎖を示す、
非天然負荷電アミノ酸；
・元々は正荷電アミノ酸であるが、負荷電基が付与されるように適切な化学基で誘導体化
されたもの
からなる群より選択されることを特徴とする、請求項７または８に記載のペプチド。
【請求項１０】
位置Ｘ１０、Ｘ１７および／またはＸ１９の少なくとも一つに正荷電アミノ酸が存在す
る場合、それが、
・天然正荷電アミノ酸、例えばリジン、アルギニン、ヒスチジンおよびオルニチン；
・位置Ｘ１０および／またはＸ１７において、好ましくは、例えばホモアルギニンに見ら
れるような伸長された側鎖を示す、非天然正荷電アミノ酸；
・元々は負荷電アミノ酸であるが、正荷電基が付与されるように適切な化学基で誘導体化
されたもの
からなる群より選択されることを特徴とする、請求項７〜９のいずれか一項に記載の
ペプチド。
【請求項１１】
【化１０】
2009529509.tif 000008
【化１１】
2009529509.tif 000009
からなる群より選択される、請求項７〜１０の少なくとも一つに記載のペプチド。
【請求項１２】
ＥＰＯ受容体に結合することができ、アゴニスト活性を含む、少なくとも１０アミノ酸
長のペプチドであって、以下に示すペプチドの群から選択されるペプチド：
（ａ）以下に示すアミノ酸のコア配列を含むペプチド：
【化１８】
2009529509.tif 000010
【化１９】
2009529509.tif 000011
［各アミノ酸は天然または非天然アミノ酸から選択され、
Ｘ９は、ＧまたはＧの保存的置換物であり；
Ｘ１１は、任意のアミノ酸から選択され；
Ｘ１２は、非荷電極性アミノ酸またはＡ、好ましくはスレオニン、セリン、アスパラギン
またはグルタミンであり；
Ｘ１３は、Ｗ、ナフチルアラニン、ＡまたはＦであり；
Ｘ１４は、Ｄ、Ｅ、Ｉ、ＬまたはＶであり；
Ｘ１５は、共有結合を形成することができる側鎖官能性を持つアミノ酸またはＡもしくは
α−アミノ−γ−ブロモ酪酸である］
ならびに、ＥＰＯミメティック活性を示す、上記コンセンサス配列によって定義されるペ
プチドの機能的に等価なフラグメント、誘導体および変種（位置Ｘ１０、Ｘ１６、Ｘ１７
またはＸ１９の少なくとも一つは、リジンと比較して伸長された側鎖を持つ正荷電非タン
パク質構成アミノ酸を表す）；
（ｂ）以下に示すアミノ酸の配列を含むペプチド、とりわけＥＰＯ受容体に結合すること
ができるもの：
【化２０】
2009529509.tif 000012
［各アミノ酸は天然または非天然アミノ酸から選択され、
Ｘ６は、Ｃ、Ａ、Ｅ、α−アミノ−γ−ブロモ酪酸またはホモシステイン（ｈｏｃ）であ
り；
Ｘ７は、Ｒ、Ｈ、Ｌ、ＷまたはＹまたはＳであり；
Ｘ８は、Ｍ、Ｆ、Ｉ、ホモセリンメチルエーテルまたはノルイソロイシンであり；
Ｘ９は、ＧまたはＧの保存的置換物であり；
Ｘ１０は、Ｈａｒであり、
Ｘ１１は、任意のアミノ酸から選択され；
Ｘ１２は、ＴまたはＡであり；
Ｘ１３は、Ｗ、１−ｎａｌ、２−ｎａｌ、ＡまたはＦであり；
Ｘ１４は、Ｄ、Ｅ、Ｉ、ＬまたはＶであり；
Ｘ１５は、Ｃ、Ａ、Ｋ、α−アミノ−γ−ブロモ酪酸またはホモシステイン（ｈｏｃ）で
ある。
ただしＸ６かＸ１５のどちらかはＣまたはｈｏｃであるものとする］；
（ｃ）以下のアミノ酸配列を含むペプチド
【化２１】
2009529509.tif 000013
［Ｘ６〜Ｘ１５は、変種（ｂ）の上記の意味を持ち、
Ｘ３は、任意のアミノ酸、好ましくはＤ、Ｅ、Ｌ、Ｎ、Ｓ、ＴまたはＶから独立して選択
され；
Ｘ４は、Ｙであり；
Ｘ５は、任意のアミノ酸、好ましくはＡ、Ｈ、Ｋ、Ｌ、Ｍ、Ｓ、ＴまたはＩから独立して
選択され．
Ｘ１６は、任意のアミノ酸、好ましくはＧ、Ｋ、Ｌ、Ｑ、Ｒ、ＳまたはＴから独立して選
択され；
Ｘ１７は、ホモアルギニンであり；
Ｘ１８は、任意のアミノ酸から独立して選択される］。
【請求項１３】
以下に示すアミノ酸のコア配列を含む、請求項１２に記載のペプチド：
【化２２】
2009529509.tif 000014
［各アミノ酸は天然または非天然アミノ酸から選択され、
Ｘ６は、共有結合を形成することができる側鎖官能性を持つアミノ酸またはＡもしくはα
−アミノ−γ−ブロモ酪酸であり；
Ｘ７は、Ｒ、Ｈ、Ｌ、ＷまたはＹまたはＳであり；
Ｘ８は、Ｍ、Ｆ、Ｉ、Ｙ、Ｈ、ホモセリンメチルエーテルまたはノルイソロイシンであり
；
Ｘ９は、ＧまたはＧの保存的置換物であり；
Ｘ１０がリジンと比較して伸長された側鎖を持つ正荷電非タンパク質構成アミノ酸でない
場合、Ｘ１０はプロリン、プロリンの保存的置換物またはプロリンの非保存的置換物であ
るか、またはＸ９およびＸ１０が単一のアミノ酸で置換され；
Ｘ１１は、任意のアミノ酸から選択され；
Ｘ１２は、非荷電極性アミノ酸またはＡ、好ましくはスレオニン、セリン、アスパラギン
またはグルタミンであり；
Ｘ１３は、Ｗ、１−ｎａｌ、２−ｎａｌ、ＡまたはＦであり；
Ｘ１４は、Ｄ、Ｅ、Ｉ、ＬまたはＶであり；
Ｘ１５は、共有結合を形成することができる側鎖官能性を持つアミノ酸またはＡもしくは
α−アミノ−γ−ブロモ酪酸であり；
Ｘ１６がリジンと比較して伸長された側鎖を持つ正荷電非タンパク質構成アミノ酸でない
場合、Ｘ１６は、任意のアミノ酸、好ましくはＧ、Ｋ、Ｌ、Ｑ、Ｒ、ＳまたはＴから独立
して選択され；
Ｘ１７がリジンと比較して伸長された側鎖を持つ正荷電非タンパク質構成アミノ酸でない
場合、Ｘ１７は任意のアミノ酸、好ましくはＡ、Ｇ、Ｐ、Ｙまたは正荷電天然、非天然も
しくは誘導体化アミノ酸、好ましくはＫ、Ｒ、Ｈまたはオルニチンから選択され；
Ｘ１８は、任意のアミノ酸、好ましくはＬまたはＱから独立して選択され；
Ｘ１９がリジンと比較して伸長された側鎖を持つ正荷電非タンパク質構成アミノ酸でない
場合、Ｘ１９は、任意のアミノ酸、好ましくはＫ、Ｒ、Ｈまたはオルニチンなどの正荷電
アミノ酸から独立して選択される。
ただしＸ１０、Ｘ１６、Ｘ１７またはＸ１９の少なくとも一つは、リジンと比較して伸長
された側鎖を持つ正荷電非タンパク質構成アミノ酸であるものとする］。
【請求項１４】
Ｘ１０、Ｘ１６、Ｘ１７またはＸ１９の少なくとも一つが正荷電アミノ酸であり、その
正荷電アミノ酸が、好ましくは、
・天然正荷電アミノ酸、例えばリジン、アルギニン、ヒスチジンおよびオルニチン；
・好ましくはリジンと比較して伸長された側鎖を示す、非天然正荷電アミノ酸；
・元々は負荷電アミノ酸であるが、正荷電基が付与されるように適切な化学基で誘導体化
されたもの；
からなる群より選択される（ただしＸ１０、Ｘ１６、Ｘ１７またはＸ１９の少なくとも一
つはリジンと比較して伸長された側鎖を持つ正荷電非タンパク質構成アミノ酸であるもの
とする）、請求項１３に記載のペプチド。
【請求項１５】
Ｘ１０、Ｘ１７および／またはＸ１９が負荷電アミノ酸であり、そしてここで前記負荷電アミノ酸が、
・天然負荷電アミノ酸、とりわけＤまたはＥ；
・好ましくは、Ａａｄ、２−アミノヘプタン二酸、Ａｓｕなどの伸長された側鎖を示す、
非天然負荷電アミノ酸；
・元々は正荷電アミノ酸であるが、負荷電基が付与されるように適切な化学基で誘導体化
されたもの
からなる群より選択されることを特徴とする、請求項１４に記載のペプチド。
【請求項１６】
ターゲット分子に結合する化合物であって、
（ｉ）少なくとも二つのペプチドユニットであって、各ペプチドユニットがターゲットへ
の結合能を持つ少なくとも二つのドメインを含むもの；
（ｉｉ）少なくとも一つポリマー担体ユニット；
を含み、前記ペプチドユニットが前記ポリマー担体ユニットに取り付けられ、少なくとも
一つのペプチドユニットの少なくとも一つのドメインが請求項１〜１５の少なくとも一つ
に記載のペプチドである化合物。
【請求項１７】
少なくとも一つのペプチドユニットが、請求項１〜１４の少なくとも一つに記載の少な
くとも一つの単量体型ペプチドコンセンサス配列を含むペプチド二量体を含む、請求項１
６に記載の化合物。
【請求項１８】
単量体型ペプチドユニットを二量体化してＥＰＯミメティックペプチド二量体を形成さ
せるための方法であって、単量体型ペプチドユニット間に共有結合を形成させることによ
って二量体が作製され、前記結合が第１単量体型ペプチドユニットのＣ末端アミノ酸と第
２単量体型ペプチドユニットのＮ末端アミノ酸との間に形成される方法。
【請求項１９】
共有結合を形成することができる側鎖官能性を持つアミノ酸をＣ末端またはＮ末端に保
持する単量体型ペプチドユニットが使用され、共有結合が、第１単量体型ペプチドユニッ
トのＣ末端アミノ酸の側鎖と、第２単量体型ペプチドユニットのＮ末端アミノ酸の側鎖と
の間に形成される、請求項１８に記載の方法。