【手続補正書】
【提出日】平成22年8月6日(2010.8.6)
【手続補正１】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００１１
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００１１】
(発明の簡単な要旨)
本発明の１つの態様により、複数の検出試薬を含む診断パネルが提供され、各検出試薬は１つの器官特異的蛋白質に対して特異的であり；該複数の検出試薬によって検出された器官特異的蛋白質は本明細書における表で提供される器官特異的蛋白質組のいずれか１つから選択され；および該複数の検出試薬は、該器官特異的蛋白質が由来する器官に影響する病気に罹った対象からの血液試料中の複数の検出試薬によって検出された少なくとも１つの器官特異的蛋白質のレベルが所定の正常範囲未満、またはそれを超えるように選択される。
本発明は、例えば以下の項目を提供する。
（項目１）
複数の検出試薬を含む診断パネルであって、各検出試薬は１つの器官特異的蛋白質に対して特異的であり；該複数の検出試薬によって検出される器官特異的蛋白質は表１ないし３２、３６ないし４５および４７ないし７９で提供される器官特異的蛋白質組のいずれか１つから選択され；および該複数の検出試薬は、該器官特異的蛋白質が由来する器官に影響する病気に罹った対象からの血液試料中の該複数の検出試薬によって検出された少なくとも１つの器官特異的蛋白質のレベルが所定の通常の範囲を超えるか、または未満であるように選択される、診断パネル。
（項目２）
前記複数の検出試薬が、器官特異的蛋白質が由来する器官に影響する病気に罹った対象からの血液試料中の該複数の検出試薬によって検出される少なくとも２つの器官特異的蛋白質のレベルが所定の正常な範囲を超えるか、または未満であるように選択される、請求項１記載の診断パネル。
（項目３）
前記複数の検出試薬が、器官特異的蛋白質が由来する器官に影響する病気に罹った対象からの血液試料中の該複数の検出試薬によって検出される少なくとも３つの器官特異的蛋白質のレベルが所定の正常な範囲を超えるか、または未満であるように選択される、請求項１記載の診断パネル。
（項目４）
前記複数の検出試薬が、器官特異的蛋白質が由来する器官に影響する病気に罹った対象からの血液試料中の該複数の検出試薬によって検出される少なくとも４つの器官特異的蛋白質のレベルが所定の正常な範囲を超えるか、または未満であるように選択される、請求項１記載の診断パネル。
（項目５）
前記複数の検出試薬が２〜１００の検出試薬である、請求項１記載の診断パネル。
（項目６）
前記複数の検出試薬によって検出される器官特異的蛋白質が、表１ないし３２、３６ないし４５および４７ないし７９で提供される器官特異的蛋白質組のいずれか１つから、および分泌されるものとして同定された蛋白質内から選択される、請求項１記載の診断パネル。
（項目７）
前記複数の検出試薬によって検出される器官特異的蛋白質が、表１ないし３２、３６ないし４５および４７ないし７９で提供される器官特異的蛋白質組のいずれか１つから、および膜貫通するものとして同定された蛋白質内から選択される、請求項１記載の診断パネル。
（項目８）
前記複数の検出試薬によって検出される該器官特異的蛋白質が、表１ないし３２、３６ないし４５および４７ないし７９で提供される器官特異的蛋白質組のいずれか１つから、および０．８以上の特異性を持つ蛋白質内から選択される、請求項１記載の診断パネル。
（項目９）
前記病気が副腎に影響を与え、かつ前記複数の検出試薬によって検出される器官特異的蛋白質が表１から検出される、請求項１記載の診断パネル。
（項目１０）
前記病気が膀胱に影響を与え、かつ前記複数の検出試薬によって検出される器官特異的蛋白質が表２から検出される、請求項１記載の診断パネル。
（項目１１）
前記病気が骨髄に影響を与え、かつ前記複数の検出試薬によって検出される器官特異的蛋白質が表３から検出される、請求項１記載の診断パネル。
（項目１２）
前記病気が脳扁桃に影響を与え、かつ前記複数の検出試薬によって検出される器官特異的蛋白質が表４から検出される、請求項１記載の診断パネル。
（項目１３）
前記病気が結腸に影響を与え、かつ前記複数の検出試薬によって検出される器官特異的蛋白質が表１１から検出される、請求項１記載の診断パネル。
（項目１４）
前記病気が心臓に影響を与え、かつ前記複数の検出試薬によって検出される器官特異的蛋白質が表１２から検出される、請求項１記載の診断パネル。
（項目１５）
前記病気が腎臓に影響を与え、かつ前記複数の検出試薬によって検出される器官特異的蛋白質が表１３から検出される、請求項１記載の診断パネル。
（項目１６）
前記病気が肺に影響を与え、かつ前記複数の検出試薬によって検出される器官特異的蛋白質が表１４から検出される、請求項１記載の診断パネル。
（項目１７）
前記病気が乳腺に影響を与え、かつ前記複数の検出試薬によって検出される器官特異的蛋白質が表１５から検出される、請求項１記載の診断パネル。
（項目１８）
前記病気が末梢血液に影響を与え、かつ前記複数の検出試薬によって検出される器官特異的蛋白質が表１６から検出される、請求項１記載の診断パネル。
（項目１９）
前記病気が膵臓に影響を与え、かつ前記複数の検出試薬によって検出される器官特異的蛋白質が表１７から検出される、請求項１記載の診断パネル。
（項目２０）
前記病気が末梢血液に影響を与え、かつ前記複数の検出試薬によって検出される器官特異的蛋白質が表１８から検出される、請求項１記載の診断パネル。
（項目２１）
前記病気が下垂体に影響を与え、かつ前記複数の検出試薬によって検出される器官特異的蛋白質が表１９から検出される、請求項１記載の診断パネル。
（項目２２）
前記病気が前立腺に影響を与え、かつ前記複数の検出試薬によって検出される器官特異的蛋白質が表２１から検出される、請求項１記載の診断パネル。
（項目２３）
前記病気が網膜に影響を与え、かつ前記複数の検出試薬によって検出される器官特異的蛋白質が表２２から検出される、請求項１記載の診断パネル。
（項目２４）
前記病気が唾液腺に影響を与え、かつ前記複数の検出試薬によって検出される器官特異的蛋白質が表２３から検出される、請求項１記載の診断パネル。
（項目２５）
前記病気が小腸に影響を与え、かつ前記複数の検出試薬によって検出される器官特異的蛋白質が表２４から検出される、請求項１記載の診断パネル。
（項目２６）
前記病気が脊髄に影響を与え、かつ前記複数の検出試薬によって検出される器官特異的蛋白質が表２５から検出される、請求項１記載の診断パネル。
（項目２７）
前記病気が脾臓に影響を与え、かつ前記複数の検出試薬によって検出される器官特異的蛋白質が表２６から検出される、請求項１記載の診断パネル。
（項目２８）
前記病気が胃に影響を与え、かつ前記複数の検出試薬によって検出される器官特異的蛋白質が表２７から検出される、請求項１記載の診断パネル。
（項目２９）
前記病気が精巣に影響を与え、かつ前記複数の検出試薬によって検出される器官特異的蛋白質が表２８から検出される、請求項１記載の診断パネル。
（項目３０）
前記病気が胸腺に影響を与え、かつ前記複数の検出試薬によって検出される器官特異的蛋白質が表２９から検出される、請求項１記載の診断パネル。
（項目３１）
前記病気が甲状腺に影響を与え、かつ前記複数の検出試薬によって検出される器官特異的蛋白質が表３０から検出される、請求項１記載の診断パネル。
（項目３２）
前記病気が子宮に影響を与え、かつ前記複数の検出試薬によって検出される器官特異的蛋白質が表３２から検出される、請求項１記載の診断パネル。
（項目３３）
前記病気がクッシング症候群である、請求項４記載の診断パネル。
（項目３４）
複数の検出試薬を含む診断パネルであって、各検出試薬は１つの器官特異的蛋白質に特異的であり；該複数の検出試薬によって検出される器官特異的蛋白質は表１ないし３２、３６ないし４５および４７ないし７９で提供される器官特異的蛋白質組の２以上から選択され；および該複数の検出試薬は、該器官特異的蛋白質が由来する器官に影響する病気に罹った対象からの血液試料中の該複数の検出試薬によって検出される少なくとも１つの器官特異的蛋白質のレベルが所定の正常な範囲を超えるか、または未満であるように選択される、診断パネル。
（項目３５）
前記複数の検出試薬が、器官特異的蛋白質が由来する器官に影響する病気に罹った対象からの血液試料中の該複数の検出試薬によって検出される少なくとも２つの器官特異的蛋白質のレベルが所定の正常な範囲を超えるか、または未満であるように選択される、請求項３４記載の診断パネル。
（項目３６）
前記複数の検出試薬が、器官特異的蛋白質が由来する器官に影響する病気に罹った対象からの血液試料中の該複数の検出試薬によって検出される少なくとも３つの器官特異的蛋白質のレベルが所定の正常な範囲を超えるか、または未満であるように選択される、請求項３４記載の診断パネル。
（項目３７）
前記複数の検出試薬が、器官特異的蛋白質が由来する器官に影響する病気に罹った対象からの血液試料中の該複数の検出試薬によって検出される少なくとも４つの器官特異的蛋白質のレベルが所定の正常な範囲を超えるか、または未満であるように選択される、請求項３４記載の診断パネル。
（項目３８）
前記複数の検出試薬が２〜１００つの検出試薬である、請求項３４記載の診断パネル。
（項目３９）
前記複数の検出試薬によって検出される器官特異的蛋白質が表１ないし３２、３６ないし４５および４７ないし７９で提供される器官特異的蛋白質組の２以上から、および分泌されるものとして同定された蛋白質内から選択される、請求項３４記載の診断パネル。
（項目４０）
前記複数の検出試薬によって検出される器官特異的蛋白質が表１ないし３２、３６ないし４５および４７ないし７９で提供される器官特異的蛋白質組の２以上から、および膜貫通されるものとして同定された蛋白質内から選択される、請求項３４記載の診断パネル。
（項目４１）
前記複数の検出試薬によって検出される器官特異的蛋白質が表１ないし３２、３６ないし４５および４７ないし７９で提供される器官特異的蛋白質組の２以上から、および０．８以上の特異性を持つ蛋白質から選択される、請求項３４記載の診断パネル。
（項目４２）
前記病気が膀胱病であって、前記複数の検出試薬によって検出される器官特異的蛋白質が表１３および２のいずれか１つ、または双方から選択される、請求項３４記載の診断パネル。
（項目４３）
前記病気が神経病であって、前記複数の検出試薬によって検出される器官特異的蛋白質が表３、４、５、６、７、８および９のいずれか１以上から選択される、請求項３４記載の診断パネル。
（項目４４）
前記結腸病が結腸癌であって、前記複数の検出試薬によって検出される器官特異的蛋白質が表１１から選択される、請求項１３記載の診断パネル。
（項目４５）
前記心臓病が弁心臓病；肺性心、心筋障害、心筋炎、心臓周辺病；アテローム性動脈硬化症、急性心筋梗塞、虚血性心臓病のような血管病よりなる群から選択され、該複数の検出試薬によって検出される該器官特異的蛋白質が表１２から選択される、請求項１４記載の診断パネル。
（項目４６）
前記病気が子宮に影響を与え、前記複数の検出試薬によって検出される器官特異的蛋白質が表３２から選択される、請求項１記載の診断パネル。
（項目４７）
前記検出試薬が抗体またはその抗原結合断片を含む、請求項１または請求項３４記載の診断パネル。
（項目４８）
前記検出試薬がＤＮＡまたはＲＮＡアプタマーを含む、請求項１または請求項３４記載の診断パネル。
（項目４９）
前記検出試薬が同位体標識ペプチドを含む、請求項１または請求項３４記載の診断パネル。
（項目５０）
対象の生物学的状態を規定する方法であって、該方法は、
ａ．該対象からの血液試料中の、表１ないし３２、３６ないし４５および４７ないし７９で提供される器官特異的蛋白質組のいずれか１つから選択される少なくとも２つの器官特異的蛋白質のレベルを測定し；
ｂ．（ａ）において決定されたレベルを、該少なくとも２つの器官特異的蛋白質の所定の正常レベルと比較することを含み、
所定の正常レベルを超えるか、または未満の２つのうち少なくとも１つの器官特異的蛋白質のレベルが該対象の生物学的状態を規定する、方法。
（項目５１）
前記少なくとも２つの器官特異的蛋白質のレベルがイムノアッセイを用いて測定される、請求項５０記載の方法。
（項目５２）
前記イムノアッセイがＥＬＩＳＡを含む、請求項５１記載の方法。
（項目５３）
前記少なくとも２つの器官特異的蛋白質のレベルが質量分析を用いて測定される、請求項５０記載の方法。
（項目５４）
前記少なくとも２つの器官特異的蛋白質のレベルがアプタマー捕獲アッセイを用いて測定される、請求項５０記載の方法。
（項目５５）
対象の生物学的状態を規定する方法であって、該方法は、
ａ．該対象からの血液試料中の、表１ないし３２、３６ないし４５および４７ないし７９で提供される器官特異的蛋白質組のいずれか２以上から選択される少なくとも２つの器官特異的蛋白質のレベルを測定し；
ｂ．（ａ）において決定されたレベルを該少なくとも２つの器官特異的蛋白質の所定の正常レベルと比較することを含み、
該所定の正常レベルを超える、または未満の２つのうち少なくとも１つの器官特異的蛋白質のレベルが該対象の生物学的状態を規定する、方法。
（項目５６）
前記少なくとも２つの器官特異的蛋白質のレベルがイムノアッセイを用いて測定される、請求項５５記載の方法。
（項目５７）
前記イムノアッセイがＥＬＩＳＡを含む、請求項５６記載の方法。
（項目５８）
前記少なくとも２つの器官特異的蛋白質のレベルが質量分析を用いて測定される、請求項５５記載の方法。
（項目５９）
前記少なくとも２つの器官特異的蛋白質のレベルがアプタマー捕獲アッセイを用いて測定される、請求項５５記載の方法。
（項目６０）
病気関連器官特異的血液フィンガープリントを規定する方法であって、該方法は、
ａ．少なくとも２つの器官特異的蛋白質が選択される器官に影響を与える病気を有すると決定された対象からの血液試料中の表１ないし３２、３６ないし４５および４７ないし７９で提供される器官特異的蛋白質組のいずれか１つから選択される少なくとも２つの器官特異的蛋白質のレベルを測定し；
ｂ．（ａ）において決定された該少なくとも２つの器官特異的蛋白質のレベルを該少なくとも２つの器官特異的蛋白質の所定の正常レベルと比較することを含み、
該対応する所定の正常レベル未満であるか、またはそれを超える病気を有すると決定された対象からの血液試料中の少なくとも２つのうち少なくとも１つの器官特異的蛋白質のレベルは病気関連器官特異的血液フィンガープリントを規定する、方法。
（項目６１）
工程（ａ）が、表１ないし３２、３６ないし４５および４７ないし７９で提供される器官特異的蛋白質組のいずれか１つから選択される少なくとも３つの器官特異的蛋白質のレベルを測定することを含み、対応する所定の正常レベル未満の、またはそれを超える病気を有すると決定された対象からの血液試料中の少なくとも３つのうち少なくとも２つの器官特異的蛋白質のレベルが病気関連器官特異的血液フィンガープリントを規定する、請求項６０記載の方法。
（項目６２）
工程（ａ）が、表１ないし３２、３６ないし４５および４７ないし７９で提供される器官特異的蛋白質組のいずれか１つから選択される４以上の器官特異的蛋白質のレベルを測定することを含み、対応する所定の正常レベル未満の、またはそれを超える病気を有すると決定された対象からの血液試料中の４以上のうち少なくとも３つの器官特異的蛋白質のレベルが病気関連器官特異的血液フィンガープリントを規定する、請求項６０記載の方法。
（項目６３）
工程（ａ）が、表１ないし３２、３６ないし４５および４７ないし７９で提供される器官特異的蛋白質組のいずれか１つから選択される４以上の器官特異的蛋白質のレベルを測定することを含み、対応する所定の正常レベル未満の、またはそれを超える病気を有すると決定された対象からの血液試料中の４以上のうち少なくとも４つの器官特異的蛋白質のレベルが病気関連器官特異的血液フィンガープリントを規定する、請求項６０記載の方法。
（項目６４）
工程（ａ）が、表１ないし３２、３６ないし４５および４７ないし７９で提供される器官特異的蛋白質組のいずれか１つから選択される５以上の器官特異的蛋白質のレベルを測定することを含み、対応する所定の正常レベル未満の、またはそれを超える病気を有すると決定された対象からの血液試料中の５以上のうち少なくとも５つの器官特異的蛋白質のレベルが病気関連器官特異的血液フィンガープリントを規定する、請求項６０記載の方法。
（項目６５）
前記少なくとも２つの器官特異的蛋白質のレベルが、抗体、または各蛋白質に対して特異的なその抗原結合断片を用いて測定される、請求項６０記載の方法。
（項目６６）
前記抗体またはその抗原結合断片がモノクローナル抗体である、請求項６５記載の方法。
（項目６７）
該少なくとも２つの器官特異的蛋白質のレベルが質量分析を用いて測定される、請求項６０記載の方法。
（項目６８）
前記少なくとも２つの器官特異的蛋白質のレベルがアプタマー捕獲アッセイを用いて測定される、請求項６０記載の方法。
（項目６９）
前記病気が前立腺癌であって、前記少なくとも２つの器官特異的蛋白質が表２１から選択される、請求項６０記載の方法。
（項目７０）
前記病気が乳癌であって、前記少なくとも２つの器官特異的蛋白質が表１５から選択される、請求項６０記載の方法。
（項目７１）
前記病気が腎臓癌であって、前記少なくとも２つの器官特異的蛋白質が表１５から選択される、請求項６０記載の方法。
（項目７２）
前記病気が膀胱癌であって、前記少なくとも２つの器官特異的蛋白質が表２から選択される、請求項６０記載の方法。
（項目７３）
病気関連器官特異的血液フィンガープリントを規定する方法であって、該方法は、
ａ．注目する病気を有すると決定された対象からの血液試料中の表１ないし３２、３６ないし４５および４７ないし７９で提供される器官特異的蛋白質組の２以上から選択される少なくとも２つの器官特異的蛋白質のレベルを測定し；
ｂ．（ａ）において決定された少なくとも２つの器官特異的蛋白質のレベルを該少なくとも２つの器官特異的蛋白質の所定の正常レベルと比較することを含み、
対応する所定の正常レベル未満であるか、またはそれを超える、病気を有すると決定された対象からの血液試料中の少なくとも２つのうち少なくとも１つの器官特異的蛋白質のレベルが病気関連器官特異的血液フィンガープリントを規定する、方法。
（項目７４）
工程（ａ）が、表１ないし３２、３６ないし４５および４７ないし７９で提供される器官特異的蛋白質組の２以上から選択される少なくとも３つの器官特異的蛋白質のレベルを測定することを含み、対応する所定の正常レベル未満、またはそれを超える、病気を有すると決定された対象からの血液試料中の少なくとも３つのうち少なくとも２つの器官特異的蛋白質のレベルが病気関連器官特異的血液フィンガープリントを規定する、請求項７３記載の方法。
（項目７５）
工程（ａ）が、表１ないし３２、３６ないし４５および４７ないし７９で提供される器官特異的蛋白質組の２以上から選択される４以上の器官特異的蛋白質のレベルを測定することを含み、対応する所定の正常レベル未満、またはそれを超える、病気を有すると決定された対象からの血液試料中の４以上のうち少なくとも３つの器官特異的蛋白質のレベルが病気関連器官特異的血液フィンガープリントを規定する、請求項７３記載の方法。
（項目７６）
工程（ａ）が、表１ないし３２、３６ないし４５および４７ないし７９で提供される器官特異的蛋白質組の２以上から選択される４以上の器官特異的蛋白質のレベルを測定することを含み、対応する所定の正常レベル未満、またはそれを超える、病気を有すると決定された対象からの血液試料中の４以上のうち少なくとも４つの器官特異的蛋白質のレベルが病気関連器官特異的血液フィンガープリントを規定する、請求項７３記載の方法。
（項目７７）
工程（ａ）が、表１ないし３２、３６ないし４５および４７ないし７９で提供される器官特異的蛋白質組の２以上から選択される５以上の器官特異的蛋白質のレベルを測定することを含み、対応する所定の正常レベル未満、またはそれを超える、病気を有すると決定された対象からの血液試料中の５以上のうち少なくとも５つの器官特異的蛋白質のレベルが病気関連器官特異的血液フィンガープリントを規定する、請求項７３記載の方法。
（項目７８）
対象において正常な生物学的状態の乱れを検出する方法であって、該方法は、
ａ）該対象からの血液試料を複数の検出試薬と接触させ、各検出試薬は１つの器官特異的蛋白質に対して特異的であり；該複数の検出試薬によって検出される器官特異的蛋白質は表１ないし３２、３６ないし４５および４７ないし７９で提供される器官特異的蛋白質組のいずれか１つから選択され；
ｂ）各検出試薬によって血液試料中で検出された器官特異的蛋白質の量を測定し；
ｃ）各検出試薬によって血液試料中で検出された器官特異的蛋白質の量をそれぞれの各器官特異的蛋白質についての所定の正常な量と比較することを含み；
１以上の該器官特異的蛋白質における統計学的に有意な変化したレベルは正常な生物学的状態における乱れを示す、方法。
（項目７９）
対象において正常な生物学的状態の乱れを検出する方法であって、該方法は、
ａ）対象からの血液試料を複数の検出試薬と接触させ、各検出試薬は１つの器官特異的蛋白質に対して特異的であり；該複数の検出試薬によって検出された器官特異的蛋白質は表１ないし３２、３６ないし４５および４７ないし７９で提供される器官特異的蛋白質組の２以上から選択され；
ｂ）各検出試薬によって血液試料中で検出された器官特異的蛋白質の量を測定し；
ｃ）各検出試薬によって血液試料中において検出された器官特異的蛋白質の量をそれぞれの各器官特異的蛋白質についての所定の正常な量と比較することを含み；
１以上の該器官特異的蛋白質における統計学的に有意な変化したレベルは正常な生物学的状態における乱れを示す、方法。
（項目８０）
対象における前立腺の病気を検出する方法であって、
ａ）該対象からの血液試料を複数の検出試薬と接触させ、各検出試薬は１つの前立腺特異的蛋白質に対して特異的であり；前立腺特異的蛋白質は表２１で提供される器官特異的蛋白質組から選択され；
ｂ）各検出試薬によって血液試料中で検出された器官特異的蛋白質の量を測定し；
ｃ）各検出試薬によって血液試料中において検出された器官特異的蛋白質の量をそれぞれの各器官特異的蛋白質についての所定の正常な対照量と比較することを含み；
１以上の該器官特異的蛋白質における統計学的に有意な変化したレベルは正常な生物学的状態における乱れを示す、方法。
（項目８１）
前記前立腺特異的蛋白質が、分泌されたものとして指定され、かつ０．９以上の特異性を持つ表２１中の蛋白質から選択される、請求項８０記載の方法。
（項目８２）
前記前立腺の病気が前立腺癌、前立腺炎、および良性前立腺過形成よりなる群から選択される、請求項８０記載の方法。
（項目８３）
前記複数の検出試薬が少なくとも２つの検出試薬を含む、請求項８０記載の方法。
（項目８４）
前記複数の検出試薬が少なくとも３つの検出試薬を含む、請求項８０記載の方法。
（項目８５）
前記複数の検出試薬が少なくとも４つの検出試薬を含む、請求項８０記載の方法。
（項目８６）
前記複数の検出試薬が少なくとも５つの検出試薬を含む、請求項８０記載の方法。
（項目８７）
前記複数の検出試薬が少なくとも６つの検出試薬を含む、請求項８０記載の方法。
（項目８８）
（ａ）複数の器官特異的蛋白質のレベルを対象から得られた血液試料中で測定し、該複数の器官特異的蛋白質は表１ないし３２、３６ないし４５および４７ないし７９で提供される器官特異的蛋白質組のいずれか１つから選択され；
（ｂ）療法を受けた後の対象から得られた血液試料を用いて工程（ａ）を反復し；
（ｃ）工程（ｂ）で検出された該複数の器官特異的蛋白質のレベルを工程（ａ）で検出された量と比較し、該比較から、患者における療法に対する応答をモニターする；
工程を含む、対象において療法に対する応答をモニターする方法。
（項目８９）
（ａ）複数の器官特異的蛋白質のレベルを対象から得られた血液試料中で測定し、該複数の器官特異的蛋白質は表１ないし３２、３６ないし４５および４７ないし７９で提供される器官特異的蛋白質組の２以上から選択され；
（ｂ）療法を受けた後の対象から得られた血液試料を用いて工程（ａ）を反復し；
（ｃ）工程（ｂ）で検出された該複数の器官特異的蛋白質のレベルを工程（ａ）で検出された量と比較し、該比較から、患者における療法に対する応答をモニターする；
工程を含む、対象において療法に対する応答をモニターする方法。
（項目９０）
表１ないし３２、３６ないし４５および４７ないし７９に記載された配列のいずれか１以上の配列を特異的に認識する器官特異的プローブを提供し、該プローブはそれに付着した標識を有し、該標識は検出可能なマーカーを含み、該プローブを動物に投与し、該プローブの位置を検出することを含む、器官、組織、または、器官もしくは組織に由来する細胞を画像化する方法。
（項目９１）
表１ないし３２、３６ないし４５および４７ないし７９に記載された配列のいずれか１以上の配列を特異的に認識する器官特異的プローブを含むイメージングプローブであって、該プローブはそれに付着した標識を有し、該標識は検出可能なマーカーを含むイメージングプローブ。
（項目９２）
表１ないし３２、３６ないし４５および４７ないし７９に記載された配列のいずれか１以上の配列を特異的に認識する器官特異的プローブを提供することを含み、該プローブはそれに付着した治療剤を有し、該治療剤は放射性同位体または細胞傷害剤を含む、器官、組織、または細胞を標的化する方法。
（項目９３）
表１ないし３２、３６ないし４５および４７ないし７９に記載された配列のいずれか１以上の配列を特異的に認識する器官特異的プローブを含み、該プローブは該プローブに付着した治療剤を有し、該治療剤は放射性同位体または細胞傷害剤を含む、標的化剤。
（項目９４）
該複数の検出試薬によって検出された該器官特異的蛋白質が表４７ないし７９で提供される器官特異的蛋白質組のいずれか１つから、およびＭＰＳＳデータおよびＳＢＳデータによって同定された蛋白質内から選択される、請求項１記載の診断パネル。
（項目９５）
該複数の検出試薬によって検出された該器官特異的蛋白質が表４７ないし７９で提供される器官特異的蛋白質組の２以上から、およびＭＰＳＳデータおよびＳＢＳデータによって同定された蛋白質内から選択される、請求項３４記載の診断パネル。
【手続補正２】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
複数の検出試薬を含む診断パネルであって、各検出試薬は１つの器官特異的蛋白質に対して特異的であり；該複数の検出試薬によって検出される器官特異的蛋白質は表１ないし３２、３６ないし４５および４７ないし７９で提供される器官特異的蛋白質組のいずれか１つから選択され；および該複数の検出試薬は、該器官特異的蛋白質が由来する器官に影響する病気に罹った対象からの血液試料中の該複数の検出試薬によって検出された少なくとも１つの器官特異的蛋白質のレベルが所定の通常の範囲を超えるか、または未満であるように選択される、診断パネル。
【請求項２】
前記複数の検出試薬が、器官特異的蛋白質が由来する器官に影響する病気に罹った対象からの血液試料中の該複数の検出試薬によって検出される少なくとも２つの器官特異的蛋白質のレベルが所定の正常な範囲を超えるか、または未満であるように選択される、請求項１記載の診断パネル。
【請求項３】
前記複数の検出試薬が、器官特異的蛋白質が由来する器官に影響する病気に罹った対象からの血液試料中の該複数の検出試薬によって検出される少なくとも３つの器官特異的蛋白質のレベルが所定の正常な範囲を超えるか、または未満であるように選択される、請求項１記載の診断パネル。
【請求項４】
前記複数の検出試薬が、器官特異的蛋白質が由来する器官に影響する病気に罹った対象からの血液試料中の該複数の検出試薬によって検出される少なくとも４つの器官特異的蛋白質のレベルが所定の正常な範囲を超えるか、または未満であるように選択される、請求項１記載の診断パネル。
【請求項５】
前記複数の検出試薬が２〜１００の検出試薬である、請求項１記載の診断パネル。
【請求項６】
前記複数の検出試薬によって検出される器官特異的蛋白質が、表１ないし３２、３６ないし４５および４７ないし７９で提供される器官特異的蛋白質組のいずれか１つから、および分泌されるものとして同定された蛋白質内から選択される、請求項１記載の診断パネル。
【請求項７】
前記複数の検出試薬によって検出される器官特異的蛋白質が、表１ないし３２、３６ないし４５および４７ないし７９で提供される器官特異的蛋白質組のいずれか１つから、および膜貫通するものとして同定された蛋白質内から選択される、請求項１記載の診断パネル。
【請求項８】
前記複数の検出試薬によって検出される該器官特異的蛋白質が、表１ないし３２、３６ないし４５および４７ないし７９で提供される器官特異的蛋白質組のいずれか１つから、および０．８以上の特異性を持つ蛋白質内から選択される、請求項１記載の診断パネル。
【請求項９】
前記病気が副腎に影響を与え、かつ前記複数の検出試薬によって検出される器官特異的蛋白質が表１から検出され、該病気が膀胱に影響を与え、かつ該複数の検出試薬によって検出される器官特異的蛋白質が表２から検出され、該病気が骨髄に影響を与え、かつ該複数の検出試薬によって検出される器官特異的蛋白質が表３から検出され、該病気が脳扁桃に影響を与え、かつ該複数の検出試薬によって検出される器官特異的蛋白質が表４から検出され、該病気が結腸に影響を与え、かつ該複数の検出試薬によって検出される器官特異的蛋白質が表１１から検出され、該病気が心臓に影響を与え、かつ該複数の検出試薬によって検出される器官特異的蛋白質が表１２から検出され、該病気が腎臓に影響を与え、かつ該複数の検出試薬によって検出される器官特異的蛋白質が表１３から検出され、該病気が肺に影響を与え、かつ該複数の検出試薬によって検出される器官特異的蛋白質が表１４から検出され、該病気が乳腺に影響を与え、かつ該複数の検出試薬によって検出される器官特異的蛋白質が表１５から検出され、該病気が末梢血液に影響を与え、かつ該複数の検出試薬によって検出される器官特異的蛋白質が表１６から検出され、該病気が膵臓に影響を与え、かつ該複数の検出試薬によって検出される器官特異的蛋白質が表１７から検出され、該病気が末梢血液に影響を与え、かつ該複数の検出試薬によって検出される器官特異的蛋白質が表１８から検出され、該病気が下垂体に影響を与え、かつ該複数の検出試薬によって検出される器官特異的蛋白質が表１９から検出され、該病気が前立腺に影響を与え、かつ該複数の検出試薬によって検出される器官特異的蛋白質が表２１から検出され、該病気が網膜に影響を与え、かつ該複数の検出試薬によって検出される器官特異的蛋白質が表２２から検出され、該病気が唾液腺に影響を与え、かつ該複数の検出試薬によって検出される器官特異的蛋白質が表２３から検出され、該病気が小腸に影響を与え、かつ該複数の検出試薬によって検出される器官特異的蛋白質が表２４から検出され、該病気が脊髄に影響を与え、かつ該複数の検出試薬によって検出される器官特異的蛋白質が表２５から検出され、該病気が脾臓に影響を与え、かつ該複数の検出試薬によって検出される器官特異的蛋白質が表２６から検出され、該病気が胃に影響を与え、かつ該複数の検出試薬によって検出される器官特異的蛋白質が表２７から検出され、該病気が精巣に影響を与え、かつ該複数の検出試薬によって検出される器官特異的蛋白質が表２８から検出され、該病気が胸腺に影響を与え、かつ該複数の検出試薬によって検出される器官特異的蛋白質が表２９から検出され、該病気が甲状腺に影響を与え、かつ該複数の検出試薬によって検出される器官特異的蛋白質が表３０から検出され、該病気が子宮に影響を与え、かつ該複数の検出試薬によって検出される器官特異的蛋白質が表３２から検出される、請求項１記載の診断パネル。
【請求項１０】
前記病気がクッシング症候群である、請求項４記載の診断パネル。
【請求項１１】
複数の検出試薬を含む診断パネルであって、各検出試薬は１つの器官特異的蛋白質に特異的であり；該複数の検出試薬によって検出される器官特異的蛋白質は表１ないし３２、３６ないし４５および４７ないし７９で提供される器官特異的蛋白質組の２以上から選択され；および該複数の検出試薬は、該器官特異的蛋白質が由来する器官に影響する病気に罹った対象からの血液試料中の該複数の検出試薬によって検出される少なくとも１つの器官特異的蛋白質のレベルが所定の正常な範囲を超えるか、または未満であるように選択される、診断パネル。
【請求項１２】
前記結腸病が結腸癌であって、前記複数の検出試薬によって検出される器官特異的蛋白質が表１１から選択される、請求項９記載の診断パネル。
【請求項１３】
前記心臓病が弁心臓病；肺性心、心筋障害、心筋炎、心臓周辺病；アテローム性動脈硬化症、急性心筋梗塞、虚血性心臓病のような血管病よりなる群から選択され、前記複数の検出試薬によって検出される器官特異的蛋白質が表１２から選択される、請求項９記載の診断パネル。
【請求項１４】
前記病気が子宮に影響を与え、前記複数の検出試薬によって検出される器官特異的蛋白質が表３２から選択される、請求項１記載の診断パネル。
【請求項１５】
前記検出試薬が抗体またはその抗原結合断片を含む、請求項１記載の診断パネル。
【請求項１６】
前記検出試薬がＤＮＡまたはＲＮＡアプタマーを含む、請求項１記載の診断パネル。
【請求項１７】
前記検出試薬が同位体標識ペプチドを含む、請求項１記載の診断パネル。
【請求項１８】
病気関連器官特異的血液フィンガープリントを規定する方法であって、該方法は、
ａ．少なくとも２つの器官特異的蛋白質が選択される器官に影響を与える病気を有すると決定された対象からの血液試料中の表１ないし３２、３６ないし４５および４７ないし７９で提供される器官特異的蛋白質組のいずれか１つから選択される少なくとも２つの器官特異的蛋白質のレベルを測定し；
ｂ．（ａ）において決定された該少なくとも２つの器官特異的蛋白質のレベルを該少なくとも２つの器官特異的蛋白質の所定の正常レベルと比較することを含み、
該対応する所定の正常レベル未満であるか、またはそれを超える病気を有すると決定された対象からの血液試料中の少なくとも２つのうち少なくとも１つの器官特異的蛋白質のレベルは病気関連器官特異的血液フィンガープリントを規定する、方法。
【請求項１９】
病気関連器官特異的血液フィンガープリントを規定する方法であって、該方法は、
ａ．注目する病気を有すると決定された対象からの血液試料中の表１ないし３２、３６ないし４５および４７ないし７９で提供される器官特異的蛋白質組の２以上から選択される少なくとも２つの器官特異的蛋白質のレベルを測定し；
ｂ．（ａ）において決定された少なくとも２つの器官特異的蛋白質のレベルを該少なくとも２つの器官特異的蛋白質の所定の正常レベルと比較することを含み、
対応する所定の正常レベル未満であるか、またはそれを超える、病気を有すると決定された対象からの血液試料中の少なくとも２つのうち少なくとも１つの器官特異的蛋白質のレベルが病気関連器官特異的血液フィンガープリントを規定する、方法。
【請求項２０】
表１ないし３２、３６ないし４５および４７ないし７９に記載された配列のいずれか１以上の配列を特異的に認識する器官特異的プローブを含むイメージングプローブであって、該プローブはそれに付着した標識を有し、該標識は検出可能なマーカーを含むイメージングプローブ。
【請求項２１】
表１ないし３２、３６ないし４５および４７ないし７９に記載された配列のいずれか１以上の配列を特異的に認識する器官特異的プローブを含み、該プローブは該プローブに付着した治療剤を有し、該治療剤は放射性同位体または細胞傷害剤を含む、標的化剤。
【請求項２２】
該複数の検出試薬によって検出された該器官特異的蛋白質が表４７ないし７９で提供される器官特異的蛋白質組のいずれか１つから、およびＭＰＳＳデータおよびＳＢＳデータによって同定された蛋白質内から選択される、請求項１記載の診断パネル。