【手続補正書】
【提出日】平成22年1月20日(2010.1.20)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
ｍＡｂ  ＩＧ３．ＢＤ４標的領域、ｍＡｂ  ２Ｈ２．ＢＥ１１標的領域、ｍＡｂ  １３Ｃ７．ＢＣ１およびｍＡｂ  １３Ｇ１１．ＢＦ３標的領域よりなる群から選ばれる標的領域に結合する、第１可変領域および第２可変領域を含んでなる単離された抗原結合タンパク質。
【請求項２】
該標的領域が、ｍＡｂ  ２Ｈ２．ＢＥ１１標的領域であり、第１可変領域が、
配列番号２０のアミノ酸２６から３５またはアミノ酸２６から３５とは１つのアミノ酸が異なる配列を含む第１  Ｖｈ  ＣＤＲ、
配列番号２０のアミノ酸５０から６５またはアミノ酸５０から６５とは１つのアミノ酸が異なる配列を含む第２  Ｖｈ  ＣＤＲ、および
配列番号２０のアミノ酸９８から１０７またはアミノ酸９８から１０７とは１つのアミノ酸が異なる配列を含む第３  Ｖｈ  ＣＤＲ
を含むＶｈ領域である、請求項１記載の結合タンパク質。
【請求項３】
第２可変領域が、
配列番号２１のアミノ酸２４から３３またはアミノ酸２４から３３とは１つのアミノ酸が異なる配列を含む第１  Ｖｌ  ＣＤＲ、
配列番号２１のアミノ酸４９から５５またはアミノ酸４９から５５とは１つのアミノ酸が異なる配列を含む第２  Ｖｌ  ＣＤＲ、および
配列番号２１のアミノ酸８８から９６またはアミノ酸８８から９６とは１つのアミノ酸が異なる配列を含む第３  Ｖｌ  ＣＤＲ
を含むＶｌ領域である、請求項２記載の結合タンパク質。
【請求項４】
該結合タンパク質が抗体である、請求項３記載の結合タンパク質。
【請求項５】
該抗体がモノクローナル抗体である、請求項４記載の結合タンパク質。
【請求項６】
該Ｖｈ領域が、配列番号２０、ヒト化された配列番号２０または脱免疫化（ｄｅ−ｉｍｍｕｎｉｚｅｄ）された配列番号２０のいずれかであり、該Ｖｌ領域が、配列番号２１、ヒト化された配列番号２１または脱免疫化（ｄｅ−ｉｍｍｕｎｉｚｅｄ）された配列番号２１のいずれかである、請求項４記載の結合タンパク質。
【請求項７】
該結合タンパク質が、（ａ）該Ｖｈ領域、ならびにヒトヒンジ、ＣＨ１、ＣＨ２およびＣＨ３領域（ＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３またはＩｇＧ４サブタイプからのもの）を含む重鎖と、（ｂ）該Ｖｌ領域、およびヒトカッパＣＬまたはヒトラムダＣＬのいずれかを含む軽鎖とを含む抗体である、請求項６記載の結合タンパク質。
【請求項８】
該Ｖｈ領域が、配列番号２０のアミノ酸２６から３５よりなる第１  Ｖｈ  ＣＤＲ、配列番号２０のアミノ酸５０から６５よりなる第２  Ｖｈ  ＣＤＲ、および配列番号２０のアミノ酸９８から１０７よりなる第３  Ｖｈ  ＣＤＲを含み、
該Ｖｌ領域が、配列番号２１のアミノ酸２４から３３よりなる第１  Ｖｌ  ＣＤＲ、配列番号２１のアミノ酸４９から５５よりなる第２  Ｖｌ  ＣＤＲ、および配列番号２１のアミノ酸８８から９６よりなる第３  Ｖｌ  ＣＤＲを含む、請求項３記載の結合タンパク質。
【請求項９】
該結合タンパク質が抗体である、請求項８記載の結合タンパク質。
【請求項１０】
該抗体がモノクローナル抗体である、請求項９記載の結合タンパク質。
【請求項１１】
該Ｖｈ領域が、配列番号２０、ヒト化された配列番号２０または脱免疫化（ｄｅ−ｉｍｍｕｎｉｚｅｄ）された配列番号２０のいずれかであり、該Ｖｌ領域が、配列番号２１、ヒト化された配列番号２１または脱免疫化（ｄｅ−ｉｍｍｕｎｉｚｅｄ）された配列番号２１のいずれかである、請求項９記載の結合タンパク質。
【請求項１２】
該結合タンパク質が、（ａ）該Ｖｈ領域、ならびにヒトヒンジ、ＣＨ１、ＣＨ２およびＣＨ３領域（ＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３またはＩｇＧ４サブタイプからのもの）を含む重鎖と、（ｂ）該Ｖｌ領域、およびヒトカッパＣＬまたはヒトラムダＣＬのいずれかを含む軽鎖とを含む抗体である、請求項８記載の結合タンパク質。
【請求項１３】
該重鎖が配列番号２２のアミノ酸配列より実質的になり、該軽鎖が配列番号２３のアミノ酸配列より実質的になる、請求項１２記載の結合タンパク質。
【請求項１４】
ｍＡｂ  ＩＧ３．ＢＤ４標的領域、ｍＡｂ  ２Ｈ２．ＢＥ１１標的領域、ｍＡｂ  １３Ｃ７．ＢＣ１およびｍＡｂ  １３Ｇ１１．ＢＦ３標的領域よりなる群から選ばれる標的領域に結合する抗体可変領域をコードするヌクレオチド配列を含む組換え遺伝子を含んでなる核酸。
【請求項１５】
該標的領域が、ｍＡｂ  ２Ｈ２．ＢＥ１１標的領域であり、該可変領域が、
配列番号２０のアミノ酸２６から３５またはアミノ酸２６から３５とは１つのアミノ酸が異なる配列を含む第１  Ｖｈ  ＣＤＲ、
配列番号２０のアミノ酸５０から６５またはアミノ酸５０から６５とは１つのアミノ酸が異なる配列を含む第２  Ｖｈ  ＣＤＲ、および
配列番号２０のアミノ酸９８から１０７またはアミノ酸９８から１０７とは１つのアミノ酸が異なる配列を含む第３  Ｖｈ  ＣＤＲ
を含むＶｈ領域である、請求項１４記載の核酸。
【請求項１６】
該Ｖｈ領域が、配列番号２０のアミノ酸２６から３５よりなる第１  Ｖｈ  ＣＤＲ、配列番号２０のアミノ酸５０から６５よりなる第２  Ｖｈ  ＣＤＲ、および配列番号２０のアミノ酸９８から１０７よりなる第３  Ｖｈ  ＣＤＲを含む、請求項１５記載の核酸。
【請求項１７】
該可変領域が、配列番号２０、ヒト化された配列番号２０または脱免疫化（ｄｅ−ｉｍｍｕｎｉｚｅｄ）された配列番号２０のいずれかである、請求項１４記載の核酸。
【請求項１８】
該組換え遺伝子が、可変領域、ヒトヒンジ、ならびにＣＨ１、ＣＨ２およびＣＨ３領域（ＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３またはＩｇＧ４サブタイプからのもの）を含む抗体重鎖をコードする、請求項１７記載の核酸。
【請求項１９】
該可変領域が、
配列番号２１のアミノ酸２４から３３またはアミノ酸２４から３３とは１つのアミノ酸が異なる配列を含む第１  Ｖｌ  ＣＤＲ、
配列番号２１のアミノ酸４９から５５またはアミノ酸４９から５５とは１つのアミノ酸が異なる配列を含む第２  Ｖｌ  ＣＤＲ、および
配列番号２１のアミノ酸８８から９６またはアミノ酸８８から９６とは１つのアミノ酸が異なる配列を含む第３  Ｖｌ  ＣＤＲ
を含むＶｌ領域である、請求項１４記載の核酸。
【請求項２０】
該第１  Ｖｌ領域が、配列番号２１のアミノ酸２４から３３よりなる第１  Ｖｌ  ＣＤＲ、配列番号２１のアミノ酸４９から５５よりなる第２  Ｖｌ  ＣＤＲ、および配列番号２１のアミノ酸８８から９６よりなる第３  Ｖｌ  ＣＤＲを含む、請求項１９記載の核酸。
【請求項２１】
該可変領域が、配列番号２１、ヒト化された配列番号２１または脱免疫化（ｄｅ−ｉｍｍｕｎｉｚｅｄ）された配列番号２１のいずれかである、請求項１４記載の核酸。
【請求項２２】
該組換え遺伝子が、該可変領域およびヒトカッパまたはラムダＣＬを含む抗体軽鎖をコードする、請求項１７記載の核酸。
【請求項２３】
請求項１４〜２２のいずれか１項記載の１以上の核酸を含んでなる組換え細胞。
【請求項２４】
該細胞が請求項１８記載の核酸および請求項２２記載の核酸の両方を含む、請求項２３記載の組換え細胞。
【請求項２５】
抗体可変領域を含むタンパク質の製造方法であって、
（ａ）該タンパク質が発現される条件下、請求項２３記載の組換え細胞を増殖させ、
（ｂ）該タンパク質を精製する段階を含んでなる製造方法。
【請求項２６】
抗体可変領域を含むタンパク質の製造方法であって、
（ａ）該タンパク質が発現される条件下、請求項２４記載の組換え細胞を増殖させ、
（ｂ）該タンパク質を精製する段階を含んでなる製造方法。
【請求項２７】
請求項１〜１３のいずれか１項記載の結合タンパク質と医薬上許容される担体とを含んでなる医薬組成物。
【請求項２８】
溶液中または細胞上のＯＦＲ０６５７ｎ抗原の存在の検出方法であって、（ａ）請求項１〜１３のいずれか１項記載の結合タンパク質を該溶液または該細胞に加え、（ｂ）該溶液中に存在する該抗原への又は該細胞への該結合タンパク質の結合能を測定する段階を含んでなる検出方法。
【請求項２９】
請求項１〜１３のいずれか１項記載の結合タンパク質の有効量を患者に投与する段階を含んでなる、患者におけるスタヒロコッカス・アウレウス（Ｓ．ａｕｒｅｕｓ）感染に対する治療方法。
【請求項３０】
該抗原結合タンパク質を手術または異物インプラントと共に投与する、請求項２９記載の方法。
【請求項３１】
ｍＡｂ  １Ｇ３．Ｂ３、ｍＡｂ  ２Ｈ２．Ｂ８、ｍＡｂ  １３Ｃ７．Ｄ１２またはｍＡｂ  １３Ｇ１１．Ｃ１１のいずれかであるタンパク質、またはＯＲＦ０６５７ｎへの結合に関してｍＡｂ  ＩＧ３．Ｂ３、ｍＡｂ  ２Ｈ２．Ｂ８、ｍＡｂ  １３Ｃ７．Ｄ１２またはｍＡｂ  １３Ｇ１１．Ｃ１１のいずれかと競合するタンパク質を産生する細胞系。
【請求項３２】
該系がＡＴＣＣ番号ＰＴＡ−７１２４、ＡＴＣＣ番号ＰＴＡ−７１２５、ＡＴＣＣ番号ＰＴＡ−７１２６またはＡＴＣＣ番号ＰＴＡ−７１２７のいずれかである、請求項３１記載の細胞系。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００５３
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００５３】
ｍＡｂ  ２Ｈ２．ＢＥ１１可変領域のアミノ酸配列を配列番号２０（Ｖｈ）および配列番号２１（Ｖｌ）に示す。Ｖｈ内の相補性決定領域（ＣＤＲ）はアミノ酸２６から３５，５０から６５および９８から１０７において特定された。Ｖｌ内のＣＤＲは配列番号２１のアミノ酸２４から３３、４９から５５および８８から９６において特定された。
【手続補正３】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００５４
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００５４】
Ｖｈ領域に関する他の実施形態においては、該結合タンパク質はｍＡｂ  ２Ｈ２．ＢＥ１１標的領域に結合し、そして、配列番号２０のアミノ酸２６から３５またはアミノ酸２６から３５とは１つのアミノ酸が異なる配列を含む又はそれよりなる又はそれより実質的になる第１  Ｖｈ  ＣＤＲ；配列番号２０のアミノ酸５０から６５またはアミノ酸５０から６５とは１つのアミノ酸が異なる配列を含む又はそれよりなる又はそれより実質的になる第２  Ｖｈ  ＣＤＲ；および配列番号２０のアミノ酸９８から１０７またはアミノ酸９８から１０７とは１つのアミノ酸が異なる配列を含む又はそれよりなる又はそれより実質的になる第３  Ｖｈ  ＣＤＲを含む又はそれよりなる又はそれより実質的になる。
【手続補正４】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００７６
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００７６】
Ｖｈコード領域に関する１つの実施形態においては、該ヌクレオチド配列は、配列番号２０のアミノ酸２６から３５またはアミノ酸２６から３５とは１つのアミノ酸が異なる配列を含む又はそれよりなる又はそれより実質的になる第１  Ｖｈ  ＣＤＲ；配列番号２０のアミノ酸５０から６５またはアミノ酸５０から６５とは１つのアミノ酸が異なる配列を含む又はそれよりなる又はそれより実質的になる第２  Ｖｈ  ＣＤＲ；および配列番号２０のアミノ酸９８から１０７またはアミノ酸９８から１０７とは１つのアミノ酸が異なる配列を含む又はそれよりなる又はそれより実質的になる第３  Ｖｈ  ＣＤＲを含む又はそれよりなる又はそれより実質的になる可変領域をコードする。