【手続補正書】
【提出日】平成22年2月15日(2010.2.15)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
インビトロでヒト細胞に感染可能なチクングンヤウイルス(CHIKV)の分離されかつ精製された野生株。
【請求項２】
分離株05.115、05.61、05.209、06.21、06.27及び06.49からなる群より選択される請求項1に記載の株。
【請求項３】
そのゲノムが、図4に示す配列(配列番号1)、図5に示す配列(配列番号2)、図6に示す配列(配列番号3)、図7に示す配列(配列番号4)、図8に示す配列(配列番号5)、又は図9に示す配列(配列番号6)を含む請求項1又は2に記載の株。
【請求項４】
構造タンパク質E1及び／又は構造タンパク質E2に少なくとも1つの変異を含む、チクングンヤウイルス(CHIKV)の分離されかつ精製された株。
【請求項５】
少なくとも1つの変異が、タンパク質E1及び／又はE2の外部ドメイン内に位置する請求項4に記載の株。
【請求項６】
E2タンパク質内の少なくとも1つの変異が、配列番号23の382位、399位、404位、485位、489位、506位、536位、624位、637位、669位、700位又は711位のアミノ酸に相同な位置での変異である請求項4又は5に記載の株。
【請求項７】
変異が、G382K、I399M、G404E、N485T、A489T、L506M、I536T、S624N、T637M、A669T、S700T及びV711Aからなる群より選択される請求項6に記載の株。
【請求項８】
E1タンパク質内の少なくとも1つの変異が、配列番号23の1035位、1078位、1093位又は1131位のアミノ酸に相同な位置での変異である請求項4又は5に記載の株。
【請求項９】
変異が、A1035V、M1078V、D1093E及びV1131Aからなる群より選択される請求項8に記載の株。
【請求項１０】
図4、5、6、7、8又は9に示す配列(配列番号1、2、3、4、5又は6)の全体又は一部分を含む分離されかつ精製されたポリヌクレオチド。
【請求項１１】
糖タンパク質E2の外部ドメインをコードする請求項10で定義されるポリヌクレオチドのフラグメント。
【請求項１２】
図10、11、12又は13に示すヌクレオチド配列(配列番号7、8、9又は10)を含む請求項11に記載のフラグメント。
【請求項１３】
糖タンパク質E2の可溶形をコードする請求項10で定義されるポリヌクレオチドのフラグメント。
【請求項１４】
図14、15、16又は17に示すヌクレオチド配列(配列番号11、12、13又は14)からなる請求項13に記載のフラグメント。
【請求項１５】
糖タンパク質E1の外部ドメインをコードする請求項10で定義されるポリヌクレオチドのフラグメント。
【請求項１６】
請求項11〜15のいずれか1項で定義されるフラグメントを含むベクター。
【請求項１７】
フランス、75724 パリ  セデックス15、リュ  デュ  ドクトール  28のCNCM (国立培養微生物コレクション)に、2006年3月15日に、アクセッション番号I-3587、I-3588、I-3589及びI-3590の下で寄託された群から選択される請求項12で定義されるフラグメントを含むプラスミド。
【請求項１８】
配列が、組換えE2タンパク質の効率的な産生のために最適化されている請求項14で定義されるフラグメントを含み、フランス、75724 パリ  セデックス15、リュ  デュ  ドクトール  28のCNCM (国立培養微生物コレクション)に、2007年3月14日に、アクセッション番号I-3733の下で寄託されたプラスミド。
【請求項１９】
請求項16で定義されるベクターを含む宿主細胞。
【請求項２０】
請求項17又は18で定義されるプラスミドを含む宿主細胞。
【請求項２１】
請求項10で定義されるポリヌクレオチド、又は請求項11〜15のいずれか1項で定義されるフラグメントによりコードされる精製されたポリペプチド。
【請求項２２】
図38〜49で定義される配列(配列番号24〜34及び78)の全体又は一部分を含む精製されたポリペプチド。
【請求項２３】
図18、19、20又は21で定義される配列(配列番号15、16、17又は18)の全体又は一部分を含む精製されたポリペプチド。
【請求項２４】
図22、23、24又は25で定義される配列(配列番号19、20、21又は22)の全体又は一部分を含む精製されたポリペプチド。
【請求項２５】
請求項21〜24のいずれか1項で定義されるポリペプチドに特異的に結合するモノクローナル若しくはポリクローナル抗体又はそのフラグメント。
【請求項２６】
- 請求項1〜9のいずれか1項で定義される株；
- 請求項10で定義されるポリヌクレオチド；
- 請求項11〜15のいずれか1項で定義されるフラグメント；
- 請求項16〜18のいずれか1項で定義されるベクター；
- 請求項17又は18で定義されるプラスミド；
- 請求項19又は20で定義される宿主細胞；
- 請求項21〜24のいずれか1項で定義されるポリペプチド；並びに
- 請求項25で定義される抗体
からなる群より選択される成分の、アルボウイルス症に関連するCHIKVの検出のための使用。
【請求項２７】
- 請求項1〜9のいずれか1項で定義される株；
- 請求項10で定義されるポリヌクレオチド；
- 請求項11〜15のいずれか1項で定義されるフラグメント；
- 請求項16〜18のいずれか1項で定義されるベクター；
- 請求項17又は18で定義されるプラスミド；
- 請求項19又は20で定義される宿主細胞；
- 請求項21〜24のいずれか1項で定義されるポリペプチド；並びに
- 請求項25で定義される抗体
からなる群より選択される成分の、アルボウイルス症を予防及び／又は治療する組成物を製造するための使用。
【請求項２８】
- 請求項1〜9のいずれか1項で定義される株；
- 請求項10で定義されるポリヌクレオチド；
- 請求項11〜15のいずれか1項で定義されるフラグメント；
- 請求項16〜18のいずれか1項で定義されるベクター；
- 請求項17又は18で定義されるプラスミド；
- 請求項19又は20で定義される宿主細胞；
- 請求項21〜24のいずれか1項で定義されるポリペプチド；並びに
- 請求項25で定義される抗体
からなる群より選択される少なくとも1つの成分を含む、アルボウイルス症を治療及び／又は予防するための組成物。
【請求項２９】
必要とする対象においてアルボウイルス症を治療及び／又は予防するための医薬品を製造するための、請求項28で定義される組成物の使用。
【請求項３０】
- 請求項1〜9のいずれか1項で定義される株；
- 請求項10で定義されるポリヌクレオチド；
- 請求項11〜15のいずれか1項で定義されるフラグメント；
- 請求項16〜18のいずれか1項で定義されるベクター；
- 請求項17又は18で定義されるプラスミド；
- 請求項19又は20で定義される宿主細胞；
- 請求項21〜24のいずれか1項で定義されるポリペプチド；並びに
- 請求項25で定義される抗体
からなる群より選択される少なくとも1つの成分を含む、アルボウイルス症に関連するCHIKVの検出のためのキット。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００２８
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００２８】
本発明は、本発明のポリヌクレオチド又は本発明のポリヌクレオチドのフラグメントを含むベクターにも関する。本明細書において用いる場合、用語「ベクター」は、1又は複数の種類の細胞の形質導入／トランスフェクションのために設計されたポリヌクレオチド構築物のことをいう。ベクターは、例えば、挿入ヌクレオチドの分離、増殖及び複製のために設計された「クローニングベクター」、宿主細胞内のヌクレオチド配列の発現のために設計された「発現ベクター」、又は組換えウイルス若しくはウイルス様粒子の産生をもたらすように設計された「ウイルスベクター」、又は1より多い型のベクターの属性を含む「シャトルベクター」であり得る。好ましいベクターは、フランス、75724 パリ  セデックス15、リュ  デュ  ドクトール  28(28 rue du Docteur Roux, 75724 PARIS Cedex 15, France)のCNCM (国立培養微生物コレクション(Collection Nationale de Cultures de Microorganismes))に、2006年3月15日に、アクセッション番号I-3587、I-3588、I-3589及びI-3590の下で寄託されたものである。本発明により意図される別の好ましいベクターは、TRIP-CHIK.sE2と呼ばれるプラスミドであり、これは、フランス、75724 パリ  セデックス15、リュ  デュ  ドクトール  28のCNCM (国立培養微生物コレクション)に、2007年3月14日に、アクセッション番号I-3733の下で寄託されている。このようなベクターは、本発明の糖タンパク質E2の可溶形をコードするフラグメントを含む。この好ましいベクターは、哺乳動物細胞への組換えE2タンパク質の効率的な産生のために最適化されている。本明細書で用いる場合、用語「最適化された」は、ベクターが、所望のコードされたタンパク質を適切に発現するために、シグナルペプチド配列のような調節配列を組み込んでいることを意味する。
【手続補正３】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００２９
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００２９】
関連する態様において、本発明は、上記で定義されるベクターを含む宿主細胞を提供する。用語「宿主細胞」は、天然では互いに連結されていない核酸セグメントの新しい組み合わせを有する細胞のことである。核酸セグメントの新しい組み合わせは、当業者に利用可能な広い範囲の核酸操作法を用いて、生物に導入できる。宿主細胞は、単一の真核細胞、又は単一の原核細胞、又は哺乳動物細胞であり得る。宿主細胞は、ゲノム外(extragenomic)のベクターを有し得る。ゲノム外核酸ベクターは、細胞のゲノムには挿入されない。宿主細胞は、ゲノム内であるベクター又はその一部分をさらに有し得る。ゲノム内との用語は、宿主細胞のゲノムに組み込まれる核酸構築物と定義される。本発明の好ましい宿主細胞は、E. coli、例えばフランス、75724 パリ  セデックス15、リュ  デュ  ドクトール  28のCNCM (国立培養微生物コレクション)に、2006年3月15日に、アクセッション番号I-3587、I-3588、I-3589及びI-3590の下で、並びに2007年3月14日に、アクセッション番号I-3733の下で寄託された本発明のベクターを含むものである。