【手続補正書】
【提出日】平成22年10月14日(2010.10.14)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
生物試料を最適に染色する方法であって、
複数の染色された実体、および／または、複数の外面が染色された実体を含む染色された試料を調製するため、試料に染色剤を接触させること
前記染色された実体から少なくとも一部の前記染色剤が除去された、部分脱色試料を調製するため、前記試料に脱色剤を接触させること、
前記試料への前記染色剤の接触の前後に、および、前記試料への前記脱色剤の接触の後に、前記試料の少なくとも１つの画像を記録すること、
前記試料への前記染色剤の接触の前後に、および、前記試料への前記脱色剤の接触の後に記録された前記試料の前記画像の比較に少なくとも部分的に基づいて、少なくとも１つの差分画像を生成すること、および
前記少なくとも１つの差分画像に少なくとも部分的に基づいて、前記染色剤および／または前記脱色剤の前記接触を補正すること
を含むことを特徴とする方法。
【請求項２】
前記記録することは、前記試料の第１の画像を記録すること、および、前記染色された試料の第２の画像を記録することを含み、前記生成することは、存在する場合に、少なくとも１つの前記染色された実体の表面上における位置を決定するために、前記第２の画像を前記第１の画像と比較することによって、第１の差分画像を生成することを含むことを特徴とする請求項１に記載の方法。
【請求項３】
前記記録することは、前記部分脱色試料の第３の画像を記録することを含み、前記生成することは、存在する場合に、少なくとも１つの前記外面が染色された実体の表面上における位置を決定するために、前記第３の画像を前記第２の画像と比較することによって、第２の差分画像を生成することを含むことを特徴とする請求項２に記載の方法。
【請求項４】
前記補正することは、存在する場合に、前記染色された実体を実質的に脱色することなく、存在する場合に、前記外面が染色された実体を実質的に脱色するために、前記部分脱色試料に前記脱色剤を接触させることができる暴露時間を決定するため、前記少なくとも１つの差分画像を解析することを含むことを特徴とする請求項１に記載の方法。
【請求項５】
存在する場合に、前記外面が染色された実体が実質的に脱色されており、存在する場合に、前記染色された実体が実質的に脱色されていない、実質的に脱色された試料を調製するために、前記決定された暴露時間の間、前記部分脱色試料に前記脱色剤を接触させることをさらに含むことを特徴とする請求項４に記載の方法。
【請求項６】
前記実質的に脱色された試料の第４の画像を記録すること、
前記第４の画像を前記第２の画像と比較することにより、存在する場合に、少なくとも１つの前記外面が染色された実体の表面上における位置を示す第３の差分画像を生成すること、および
前記第４の画像を前記第１の画像と比較することにより、存在する場合に、少なくとも１つの前記染色された実体の表面上における位置を示す第４の差分画像を生成すること
をさらに含むことを特徴とする請求項５に記載の方法。
【請求項７】
存在する場合に、前記外面が染色された実体、および、存在する場合に、前記染色された実体のうちの少なくとも１つの形態を解析することをさらに含むことを特徴とする請求項６に記載の方法。
【請求項８】
前記染色剤はグラム染色剤を含み、存在する場合に、前記外面が染色された実体は複数のグラム陰性菌を含み、存在する場合に、前記染色された実体は複数のグラム陽性菌を含むことを特徴とする請求項１に記載の方法。
【請求項９】
前記補正ステップに従って、前記染色剤および／または前記脱色剤を再び接触させること、および、
前記再接触ステップによって識別可能となった前記試料中の少なくとも１つの関心のあるターゲットを区別するため、前記試料の最終画像を生成すること
をさらに含むことを特徴とする請求項１に記載の方法。
【請求項１０】
生物試料の染色手順を実行するシステムであって、
染色剤の供給源および脱色剤の供給源と流体連通したチャネルを画定し、前記試料と使用可能に係合するように構成された表面を含むフローチャンバと、
前記フローチャンバ、前記染色剤の前記供給源および前記脱色剤の前記供給源と流体連通した流体システムであって、
複数の染色された実体および／または複数の外面が染色された実体を含む染色された試料を調製するため、前記試料に前記染色剤を接触させるように構成され、
前記染色された試料から少なくとも一部の前記染色剤が除去された部分脱色試料を調製するため、前記染色された試料に前記脱色剤を接触させるように構成された流体システムと、
前記フローチャンバに隣接して配置された画像化システムであって、前記染色剤および前記脱色剤の前記接触の前、最中および／または後に、前記試料の少なくとも１つの画像を記録するように構成され、前記試料への前記染色剤の接触の前後に、および、前記試料への前記脱色剤の接触の後に記録された前記試料の画像の比較に少なくとも部分的に基づいて、少なくとも１つの差分画像を生成するように構成された画像化システムと、
前記画像化システムおよび前記流体システムと通信するコントローラ装置であって、前記染色剤および／または前記脱色剤の前記接触を、前記少なくとも１つの差分画像に少なくとも部分的に基づいて制御するように構成されたコントローラ装置と
を備えることを特徴とするシステム。
【請求項１１】
前記フローチャンバは、前記試料と使用可能に係合する前記表面を画定したスライドを受け取るように適合されており、前記フローチャンバは、スライド開口を画定したフローチャネルハウジングを備え、前記スライド開口は、前記スライドが前記スライド開口の中に配置されたときに、前記試料が、前記スライドと前記フローチャネルハウジングの間に実質的に配置されるように前記スライドを受け取るように構成されており、前記フローチャネルハウジングは、前記スライドと前記フローチャネルハウジングの間に前記試料が配置されている間に、前記画像化システムが前記試料の少なくとも１つの画像を記録することができるように、実質的に透光性の材料を含むことを特徴とする請求項１０に記載のシステム。
【請求項１２】
前記画像化システムは、
前記スライドと前記フローチャネルハウジングの間に前記試料が配置されている間に、前記試料の前記少なくとも１つの画像を記録するように構成されたカメラ装置と、
前記カメラ装置と動作可能に係合したアクチュエータ装置であり、前記フローチャンバに対する前記カメラ装置の位置を調整するように構成されたアクチュエータ装置と
を備えることを特徴とする請求項１１に記載のシステム。
【請求項１３】
前記画像化システムは、存在する場合に、前記染色された実体を実質的に脱色することなく、存在する場合に、前記外面が染色された実体を実質的に脱色するために、前記部分脱色試料に前記脱色剤を接触させることができる暴露時間を決定するようにさらに構成されていることを特徴とする請求項１０に記載のシステム。
【請求項１４】
前記流体システムはさらに、存在する場合に、前記外面が染色された実体が実質的に脱色されており、存在する場合に、前記染色された実体が実質的に脱色されていない実質的に脱色された試料を調製するため、前記フローチャンバと協働して、決定された前記暴露時間の間、前記部分脱色試料に前記脱色剤を接触させるように適合されていることを特徴とする請求項１３に記載のシステム。
【請求項１５】
前記画像化システムは、画像処理コンピュータであって、前記少なくとも１つの差分画像を解析し、前記少なくとも１つの差分画像を、
画像減算、
画像加算、
画像比計算、および、
これらの組合せ
を含むグループから選択されたプロセスを使用して生成するように構成された画像処理コンピュータを含むことを特徴とする請求項１０に記載のシステム。
【請求項１６】
前記染色剤はグラム染色剤を含み、存在する場合に、前記外面が染色された実体は複数のグラム陰性菌を含み、存在する場合に、前記染色された実体は複数のグラム陽性菌を含むことを特徴とする請求項１０に記載のシステム。