【手続補正書】
【提出日】平成22年8月11日(2010.8.11)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
個体からの試料が過敏性腸症候群（ＩＢＳ）と関連するか否かを分類する分類方法であって、
前記分類方法は、
（ａ）前記試料における、サイトカイン、増殖因子、抗好中球抗体、抗サッカロマイセス・セレビジエ抗体（ＡＳＣＡ）、抗菌性抗体、ラクトフェリン、抗組織トランスグルタミナーゼ（抗ｔＴＧ）抗体、リポカリン、マトリクス・メタロプロテアーゼ（ＭＭＰ）、組織メタロプロテアーゼインヒビター（ＴＩＭＰ）、α−グロブリン、アクチン切断タンパク質、Ｓ１００タンパク質、フィブリノペプチド、カルシトニン遺伝子関連ペプチド（ＣＧＲＰ）、タチキニン、グレリン、ニューロテンシン、コルチコトロピン放出ホルモン、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される少なくとも１つの診断マーカーの存在又はレベルを検出することによって診断マーカープロファイルを決定する工程；及び
（ｂ）前記診断マーカープロファイルに基づくアルゴリズムを用いて、前記試料をＩＢＳ試料又は非ＩＢＳ試料として分類する工程、
を備えることを特徴とする分類方法。
【請求項２】
前記サイトカインは、ＩＬ−８、ＩＬ−１β、ＴＮＦ関連アポトーシス弱誘導因子（ＴＷＥＡＫ）、レプチン、オステオプロテジェリン（ＯＰＧ）、ＭＩＰ−３β、ＧＲＯα、ＣＸＣＬ４／ＰＦ−４、ＣＸＣＬ７／ＮＡＰ−２、及びそれらの組み合わせからなる群から選択されることを特徴とする請求項１に記載の分類方法。
【請求項３】
前記増殖因子は、上皮細胞増殖因子（ＥＧＦ）、血管内皮増殖因子（ＶＥＧＦ）、色素上皮由来因子（ＰＥＤＦ）、脳由来神経栄養因子（ＢＤＮＦ）、アンフィレグリン（ＳＤＧＦ）、及びそれらの組み合わせからなる群から選択されることを特徴とする請求項１又は２に記載の分類方法。
【請求項４】
前記抗好中球抗体は、抗好中球細胞質抗体（ＡＮＣＡ）、核周囲抗好中球細胞質抗体（ｐＡＮＣＡ）、及びそれらの組み合わせからなる群から選択されることを特徴とする請求項１〜３の何れか１項に記載の分類方法。
【請求項５】
前記ＡＳＣＡは、ＡＳＣＡ−ＩｇＡ、ＡＳＣＡ−ＩｇＧ、及びそれらの組み合わせからなる群から選択されることを特徴とする請求項１〜４の何れか１項に記載の分類方法。
【請求項６】
前記抗菌性抗体は、抗外膜タンパク質Ｃ（抗ＯｍｐＣ）抗体、抗フラジェリン抗体、抗Ｉ２抗体、及びそれらの組み合わせからなる群から選択されることを特徴とする請求項１〜５の何れか１項に記載の分類方法。
【請求項７】
前記リポカリンは、好中球ゼラチナーゼ関連リポカリン（ＮＧＡＬ）、ＮＧＡＬ／ＭＭＰ−９複合体、及びそれらの組み合わせからなる群から選択されることを特徴とする請求項１〜６の何れか１項に記載の分類方法。
【請求項８】
前記ＭＭＰは、ＭＭＰ−９であることを特徴とする請求項１〜７の何れか１項に記載の分類方法。
【請求項９】
前記ＴＩＭＰは、ＴＩＭＰ−１であることを特徴とする請求項１〜８の何れか１項に記載の分類方法。
【請求項１０】
前記α−グロブリンは、α２−マクログロブリン、ハプトグロビン、オロソムコイド、及びそれらの組み合わせからなる群から選択されることを特徴とする請求項１〜９の何れか１項に記載の分類方法。
【請求項１１】
前記アクチン切断タンパク質は、ゲルソリンであることを特徴とする請求項１〜１０の何れか１項に記載の分類方法。
【請求項１２】
前記Ｓ１００タンパク質は、カルグラニュリン（ｃａｌｇｒａｎｕｌｉｎ）であることを特徴とする請求項１〜１１の何れか１項に記載の分類方法。
【請求項１３】
前記フィブリノペプチドは、フィブリノペプチドＡ（ＦＩＢＡ）であることを特徴とする請求項１〜１２の何れか１項に記載の分類方法。
【請求項１４】
前記診断マーカープロファイルは、少なくとも２、３、４、５、又は６つの診断マーカーの存在又はレベルを検出することによって決定されることを特徴とする請求項１〜１３の何れか１項に記載の分類方法。
【請求項１５】
前記少なくとも１つの診断マーカーの存在又はレベルは、ハイブリダイゼーション法、増幅法、免疫測定法、又は免疫組織化学的測定法を用いて検出されることを特徴とする請求項１〜１４の何れか１項に記載の分類方法。
【請求項１６】
前記分類方法は、
症状プロファイルと組み合わせて、前記診断マーカープロファイルを決定する工程；及び、
前記診断マーカープロファイル及び前記症状プロファイルに基づくアルゴリズムを用いて、前記試料をＩＢＳ試料又は非ＩＢＳ試料として分類する工程、
を備え、
前記症状プロファイルは、前記個体における少なくとも１つの症状の存在又は重症度を同定することによって決定される、
ことを特徴とする請求項１〜１５の何れか１項に記載の分類方法。
【請求項１７】
前記少なくとも１つの症状は、胸痛、胸部の不快感、胸やけ、普通量の食事後の不快な膨満感、普通量の食事を食べることができないこと、腹痛、腹部の不快感、便秘、下痢、膨満感、腹部の膨張、痛み又は不快感を有することに伴う消極的な考え又は感情、及びそれらの組み合わせからなる群から選択されることを特徴とする請求項１６に記載の分類方法。
【請求項１８】
前記少なくとも１つの症状の存在又は重症度は、質問票を用いて同定されることを特徴とする請求項１６又は１７に記載の分類方法。
【請求項１９】
前記質問票は、前記少なくとも１つの症状の存在又は重症度について前記個体に問う一連の質問、痛み又は不快感を有することに伴う消極的な考え又は感情の存在又は重症度について前記個体に問う一連の質問、及びそれらの組み合わせからなる群から選択されることを特徴とする請求項１８に記載の分類方法。
【請求項２０】
前記少なくとも１つの症状の存在又は重症度は、前記個体に、前記個体が現在何らかの症状を経験しているか否かを問うことによって同定されることを特徴とする請求項１６又は１７に記載の分類方法。
【請求項２１】
前記症状プロファイルは、少なくとも２、３、４、５、又は６つの症状の存在又は重症度を同定することによって決定されることを特徴とする請求項１６〜２０の何れか１項に記載の分類方法。
【請求項２２】
前記試料は、血清、血漿、全血、及び便からなる群から選択されることを特徴とする請求項１〜２１の何れか１項に記載の分類方法。
【請求項２３】
前記アルゴリズムは、統計的アルゴリズムを含むことを特徴とする請求項１〜２２の何れか１項に記載の分類方法。
【請求項２４】
前記統計的アルゴリズムは、学習統計的分類子システムを含むことを特徴とする請求項２３に記載の分類方法。
【請求項２５】
前記学習統計的分類子システムは、ランダムフォレスト、分類・回帰木、ブーストされた木、ニューラルネットワーク、サポートベクターマシン、一般的なカイ二乗による相互作用の自動検出モデル、インターアクティブ木、多適応的回帰スプライン、機械学習分類子、及びそれらの組み合わせからなる群から選択されることを特徴とする請求項２４に記載の分類方法。
【請求項２６】
前記統計的アルゴリズムは、単一の学習統計的分類子システムを含むことを特徴とする請求項２３〜２５の何れか１項に記載の分類方法。
【請求項２７】
前記統計的アルゴリズムは、少なくとも２つの学習統計的分類子システムの組み合わせを含むことを特徴とする請求項２３〜２５の何れか１項に記載の分類方法。
【請求項２８】
前記分類方法は、さらに前記非ＩＢＳ試料を健常者、炎症性腸疾患（ＩＢＤ）、又は非ＩＢＤ試料として分類する工程を備えることを特徴とする請求項１〜２７の何れか１項に記載の分類方法。
【請求項２９】
前記分類方法は、さらに前記分類からの結果を臨床医へ送付する工程を備えることを特徴とする請求項１〜２８の何れか１項に記載の分類方法。
【請求項３０】
前記分類方法は、さらに前記個体がＩＢＳを有する確率の形式で診断を提供する工程を備えることを特徴とする請求項１〜２９の何れか１項に記載の分類方法。
【請求項３１】
前記分類方法は、さらに前記ＩＢＳ試料をＩＢＳ便秘型（ＩＢＳ−Ｃ）、ＩＢＳ下痢型（ＩＢＳ−Ｄ）、ＩＢＳ混合型（ＩＢＳ−Ｍ）、ＩＢＳ交替型（ＩＢＳ−Ａ）、又は感染後型ＩＢＳ（ＩＢＳ−ＰＩ）試料として分類する工程を備えることを特徴とする請求項１〜３０の何れか１項に記載の分類方法。
【請求項３２】
前記方法は、さらに腸炎を除外する工程を備えることを特徴とする請求項１〜３１の何れか１項に記載の方法。
【請求項３３】
個体における過敏性腸症候群（ＩＢＳ）の進行又は後退をモニタリングするモニタリング方法であって、
前記モニタリング方法は、
（ａ）前記試料における、サイトカイン、増殖因子、抗好中球抗体、抗サッカロマイセス・セレビジエ抗体（ＡＳＣＡ）、抗菌性抗体、ラクトフェリン、抗組織トランスグルタミナーゼ（抗ｔＴＧ）抗体、リポカリン、マトリクス・メタロプロテアーゼ（ＭＭＰ）、組織メタロプロテアーゼインヒビター（ＴＩＭＰ）、α−グロブリン、アクチン切断タンパク質、Ｓ１００タンパク質、フィブリノペプチド、カルシトニン遺伝子関連ペプチド（ＣＧＲＰ）、タチキニン、グレリン、ニューロテンシン、コルチコトロピン放出ホルモン、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される少なくとも１つの診断マーカーの存在又はレベルを検出することによって診断マーカープロファイルを決定する工程；及び
（ｂ）前記診断マーカープロファイルに基づくアルゴリズムを用いて前記個体におけるＩＢＳの存在又は重症度を決定する工程、
を備えることを特徴とするモニタリング方法。
【請求項３４】
前記モニタリング方法は、
症状プロファイルと組み合わせて、前記診断マーカープロファイルを決定する工程；及び
前記診断マーカープロファイル及び前記症状プロファイルに基づくアルゴリズムを用いて、前記個体におけるＩＢＳの存在又は重症度を決定する工程、
を備え、
前記症状プロファイルは、前記個体における少なくとも１つの症状の存在又は重症度を同定することによって決定される、
ことを特徴とする請求項３３に記載のモニタリング方法。
【請求項３５】
前記アルゴリズムは、統計的アルゴリズムを含むことを特徴とする請求項３３又は３４に記載のモニタリング方法。
【請求項３６】
過敏性腸症候群（ＩＢＳ）を治療するために有用な薬を投与されている個体における薬の効果をモニタリングするモニタリング方法であって、
前記モニタリング方法は、
（ａ）前記試料における、サイトカイン、増殖因子、抗好中球抗体、抗サッカロマイセス・セレビジエ抗体（ＡＳＣＡ）、抗菌性抗体、ラクトフェリン、抗組織トランスグルタミナーゼ（抗ｔＴＧ）抗体、リポカリン、マトリクス・メタロプロテアーゼ（ＭＭＰ）、組織メタロプロテアーゼインヒビター（ＴＩＭＰ）、α−グロブリン、アクチン切断タンパク質、Ｓ１００タンパク質、フィブリノペプチド、カルシトニン遺伝子関連ペプチド（ＣＧＲＰ）、タチキニン、グレリン、ニューロテンシン、コルチコトロピン放出ホルモン、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される少なくとも１つの診断マーカーの存在又はレベルを検出することによって診断マーカープロファイルを決定する工程；及び
（ｂ）前記診断マーカープロファイルに基づくアルゴリズムを用いて前記薬の有効性を決定する工程、
を備えることを特徴とするモニタリング方法。
【請求項３７】
前記モニタリング方法は、
症状プロファイルと組み合わせて前記診断マーカープロファイルを決定する工程；及び
前記診断マーカープロファイル及び前記症状プロファイルに基づくアルゴリズムを用いて前記薬の有効性を決定する工程、
を備え、
前記症状プロファイルは、前記個体における少なくとも１つの症状の存在又は重症度を同定することによって決定される、
ことを特徴とする請求項３６に記載のモニタリング方法。
【請求項３８】
前記アルゴリズムは、統計的アルゴリズムを含むことを特徴とする請求項３６又は３７に記載の分類方法。
【請求項３９】
個体からの試料が過敏性腸症候群（ＩＢＳ）に関連するか否かを分類するために、１つ又は複数のプロセッサを制御するためのコードを含むコンピューター読み取り可能な記憶媒体であって、
前記コードは、診断マーカープロファイルに基づき、前記試料をＩＢＳ試料又は非ＩＢＳ試料として分類する統計的に導出される決定を生み出すために、前記診断マーカープロファイルを含むデータセットに統計処理を適用する命令を含み、
前記診断マーカープロファイルは、前記試料におけるサイトカイン、増殖因子、抗好中球抗体、抗サッカロマイセス・セレビジエ抗体（ＡＳＣＡ）、抗菌性抗体、ラクトフェリン、抗組織トランスグルタミナーゼ（抗ｔＴＧ）抗体、リポカリン、マトリクス・メタロプロテアーゼ（ＭＭＰ）、組織メタロプロテアーゼインヒビター（ＴＩＭＰ）、α−グロブリン、アクチン切断タンパク質、Ｓ１００タンパク質、フィブリノペプチド、カルシトニン遺伝子関連ペプチド（ＣＧＲＰ）、タチキニン、グレリン、ニューロテンシン、コルチコトロピン放出ホルモン、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される少なくとも１つの診断マーカーの存在又はレベルを示す、
ことを特徴とするコンピューター読み取り可能な記憶媒体。
【請求項４０】
個体からの試料が過敏性腸症候群（ＩＢＳ）に関連するか否かを分類する分類システムであって、
前記分類システムは、
（ａ）診断マーカープロファイルを含むデータセットを生成するよう構成されたデータ収集モジュール；
（ｂ）前記診断マーカープロファイルに基づき、前記試料をＩＢＳ試料又は非ＩＢＳ試料として分類する、統計的に導出される決定を生み出すために、前記データセットに統計処理を適用することによって、該データセットを処理するよう構成されたデータ処理モジュール；及び
（ｃ）前記統計的に導出される決定を表示するよう構成された表示モジュール、
を備え、
前記診断マーカープロファイルは、前記試料における、サイトカイン、増殖因子、抗好中球抗体、抗サッカロマイセス・セレビジエ抗体（ＡＳＣＡ）、抗菌性抗体、ラクトフェリン、抗組織トランスグルタミナーゼ（抗ｔＴＧ）抗体、リポカリン、マトリクス・メタロプロテアーゼ（ＭＭＰ）、組織メタロプロテアーゼインヒビター（ＴＩＭＰ）、α−グロブリン、アクチン切断タンパク質、Ｓ１００タンパク質、フィブリノペプチド、カルシトニン遺伝子関連ペプチド（ＣＧＲＰ）、タチキニン、グレリン、ニューロテンシン、コルチコトロピン放出ホルモン、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される少なくとも１つの診断マーカーの存在又はレベルを示す、
ことを特徴とする分類システム。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０００７
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０００７】
ＩＢＳの原因は、十分に特徴づけられていないが、医学界は、患者病歴に基づくＩＢＳ診断を目的として、ローマＩＩ基準として知られる、一定の定義と基準を創り出した。ローマＩＩ基準は、１年の期間における３ヶ月の継続的又は反復的な腹痛あるいはその不調がみられ、これら腹痛又は不調は、排便によって改善され、及び／又は排便頻度もしくは軟度の変化と同様に２つ又はそれ以上の次の状態を伴うことを要する：排便頻度の変化、便形状の変化、便排泄の変化、粘液の排泄、又は膨満及び腹部の膨張。これらの症状を引き起こしうる形態上もしくは生化学的な異常がまったくないこともまた必要な条件である。その結果、ローマＩＩ基準は、実質的な患者病歴がある場合のみ使用可能であり、他方でその症状を説明できる、異常な腸構造又は代謝異常がない場合にのみ信頼性がある。同様に、最近、医学界によって策定されたローマＩＩＩ基準は、ある特定の組み合わせの症状が認められ、かつ詳細な患者病歴及び身体検査の提示がある場合にのみ用いることができる。
【手続補正３】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００１２
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００１２】
ある実施形態において、診断マーカープロファイルは、サイトカイン、増殖因子、抗好中球抗体、抗サッカロマイセス・セレビジエ抗体（ＡＳＣＡ）、抗菌性抗体、ラクトフェリン（ｌａｃｔｏｆｅｒｒｉｎ）、抗組織（型）トランスグルタミナーゼ抗体（抗ｔＴＧ抗体）、リポカリン（ｌｉｐｏｃａｌｉｎ）、マトリクス・メタロプロテアーゼ（ＭＭＰ）、組織（型）メタロプロテアーゼインヒビター（ＴＩＭＰ）、α−グロブリン、アクチン切断タンパク質、Ｓ１００タンパク質、フィブリノペプチド、カルシトニン遺伝子関連ペプチド（ＣＧＲＰ）、タチキニン（ｔａｃｈｙｋｉｎｉｎ）、グレリン（ｇｈｒｅｌｉｎ）、ニューロテンシン（ｎｅｕｒｏｔｅｎｓｉｎ）、コルチコトロピン放出ホルモン、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される少なくとも１つの診断マーカーの存在又はレベル（値）を検出することによって決定される。
【手続補正４】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００１６
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００１６】
症状プロファイルは、一般的に、胸痛、胸部の不快感、胸やけ、普通量の食事後の不快な膨満感、普通量の食事を食べることができないこと、腹痛、腹部の不快感、便秘、下痢、膨満感、腹部の膨張、痛み又は不快感があることに伴う消極的な考え又は感情、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される少なくとも１つの症状の存在及び重症度を同定することによって決定される。
【手続補正５】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００３１
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００３１】
関連する態様において、本発明は、個体からの試料がＩＢＳと関連があるか否かを分類するために、１つ又はそれ以上のプロセッサを制御するためのコードを記録したコンピューター読取り可能な記憶媒体を提供し、そのコードは以下の命令を含む：
（ａ）  試料における少なくとも１つの診断マーカーの存在又はレベルを示す診断マーカープロファイルに基づき、試料をＩＢＤ試料又は非ＩＢＤ試料として分類する統計的に導出される決定を生み出すために、第１の統計処理を、上記診断マーカープロファイルを含むデータセットに適用する命令；及び
その試料が非ＩＢＤ試料として分類された場合は、
（ｂ）  当該非ＩＢＤ試料をＩＢＳ試料又は非ＩＢＳ試料として分類する、第２の統計的に導出される決定を生み出すために、第２の統計処理を同一又は異なるデータセットに適用する命令。
【手続補正６】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００３３
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００３３】
他の実施形態において、第１にＩＢＤを排除し、その後ＩＢＳを判定するためのコンピューター読み取り可能記憶媒体は、診断マーカープロファイル及び症状プロファイルに基づき試料をＩＢＤ試料又は非ＩＢＤ試料として分類する、統計的に導出される決定を生み出すため、個体における少なくとも１つの症状の存在又は重症度を示す症状プロファイルと選択的に組み合わせた診断マーカープロファイルからなるデータセットに、第１の統計処理を適用する命令；及び、その試料が非ＩＢＤ試料として分類された場合は、当該試料をＩＢＳ試料又は非ＩＢＳ試料として分類する、第２の統計的に導出される決定を生み出すため、第２の統計処理を同一又は異なるデータセットに適用する命令、を含む。
【手続補正７】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００４６
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００４６】
「過敏性腸症候群（ｉｒｒｉｔａｂｌｅ  ｂｏｗｅｌ  ｓｙｎｄｒｏｍｅ）」又は「ＩＢＳ」という用語は、これに限定されないが、一般的には、明確な構造上の異常がなく、腹痛、腹部の不快感、排便パターンの変化、便通の消失又は頻回な便通、下痢、及び便秘を含む１つ又はそれ以上の症状によって特徴づけられる機能的排便障害群を包含する。症状の顕著さにより、少なくとも３つのＩＢＳ型がある：（１）下痢優勢型（ＩＢＳ−Ｄ）；（２）便秘優勢型（ＩＢＳ−Ｃ）、及び（３）交互に変化する排泄パターンを持つＩＢＳ（ＩＢＳ−Ａ）。ＩＢＳはまた、症状の混合型としても発症し得る（ＩＢＳ−Ｍ）。感染後ＩＢＳなどの、様々な臨床上のＩＢＳサブタイプも存在する（ＩＢＳ−ＰＩ）。
【手続補正８】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００６７
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００６７】
症状プロファイルは、胸痛、胸部の不快感、胸やけ、普通量の食事後の不快な膨満感、普通量の食事を食べることができないこと、腹痛、腹部の不快感、便秘、下痢、膨満感、腹部の膨張、痛み又は不快感があることに伴う消極的な考え又は感情、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される少なくとも１つの症状の存在とその重症度によって一般的に決定される。
【手続補正９】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０１２１
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０１２１】
（ＩＶ．ＩＢＳ様症状を示す疾病と障害）
様々な構造的又は代謝的疾病及び障害は、ＩＢＳと類似する兆候又は症状を引き起こし得る。これに限定されない例として、例えば、炎症性腸疾患（ＩＢＤ）、セリアック病（ＣＤ）、急性炎症、憩室炎、回腸嚢肛門吻合、顕微鏡的大腸炎、慢性感染性下痢症、乳糖分解酵素欠損症、癌（例えば、直腸結腸癌）、小腸又は結腸の機能的閉塞、腸管感染症、虚血、消化不良、吸収不良、子宮内膜症、及び、その他未同定の腸管の炎症性疾患といった疾病又は障害を持つ患者は、ＩＢＳと同様に、軽度から中等度の痛み、及び便の硬さ及び／又は便通の頻度における変化を伴う腹部の不快感を示しうる。さらなるＩＢＳ様症状は、慢性下痢症又は慢性便秘症又は便秘と下痢を交互に繰り返す症状、体重減少、腹部の膨張又は膨満、及び排便中の粘液を含む。
【手続補正１０】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０１４８
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０１４８】
（Ｅ．組織メタロプロテアーゼインヒビター）
試料中の少なくとも１つの組織メタロプロテアーゼインヒビター（ＴＩＭＰ）の存在又はレベルの決定はまた、本発明において有用である。本明細書において、「組織（型）メタロプロテアーゼインヒビター（ｔｉｓｓｕｅ  ｉｎｈｉｂｉｔｏｒ  ｏｆ  ｍｅｔａｌｌｏｐｒｏｔｅａｓｅ）」又は「ＴＩＭＰ」という用語はＭＭＰ群を阻害すことができるタンパク質を含む。
【手続補正１１】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０２９４
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０２９４】
ある実施形態においては、本質問票は、その個人に、１つ又はそれ以上のＩＢＳ関連症状の存在又は重症度に関する回答を提供することを求める一連の質問を含む第１セクションからなる。本質問票は一般的に、胸痛、胸部の不快感、胸やけ、普通量の食事後の不快な膨満感、普通量の食事を食べることができないこと、腹痛、腹部の不快感、便秘、下痢、膨満感、及び／又は腹部の膨張などのＩＢＳ関連症状の存在、重症度、頻度、及び／又は持続期間を同定するように方向付けられた質問を包含する。
【手続補正１２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０３３１
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０３３１】
以上、本発明は、明確な理解の目的のために、説明及び実施例により詳細に開示されているが、当業者は、添付する特許請求の範囲の範囲内において変更及び修正を加えることが許容されることを理解するだろう。加えて、本明細書にて提供される各引用文献は、各引用文献が参照により個別に援用されたのと同程度に全体として参照により援用される。
以下に本発明とその実施態様をまとめて記載する。
１．個体からの試料が過敏性腸症候群（ＩＢＳ）と関連するか否かを分類する分類方法であって、
前記分類方法は、
（ａ）前記個体における、サイトカイン、増殖因子、抗好中球抗体、抗サッカロマイセス・セレビジエ抗体（ＡＳＣＡ）、抗菌性抗体、ラクトフェリン、抗組織トランスグルタミナーゼ（抗ｔＴＧ）抗体、リポカリン、マトリクス・メタロプロテアーゼ（ＭＭＰ）、組織メタロプロテアーゼインヒビター（ＴＩＭＰ）、α−グロブリン、アクチン切断タンパク質、Ｓ１００タンパク質、フィブリノペプチド、カルシトニン遺伝子関連ペプチド（ＣＧＲＰ）、タチキニン、グレリン、ニューロテンシン、コルチコトロピン放出ホルモン、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される少なくとも１つの診断マーカーの存在又はレベルを検出することによって診断マーカープロファイルを決定する工程；及び
（ｂ）前記診断マーカープロファイルに基づくアルゴリズムを用いて、前記試料をＩＢＳ試料又は非ＩＢＳ試料として分類する工程、
を備えることを特徴とする分類方法。
２．前記サイトカインは、ＩＬ−８、ＩＬ−１β、ＴＮＦ関連アポトーシス弱誘導因子（ＴＷＥＡＫ）、レプチン、オステオプロテジェリン（ＯＰＧ）、ＭＩＰ−３β、ＧＲＯα、ＣＸＣＬ４／ＰＦ−４、ＣＸＣＬ７／ＮＡＰ−２、及びそれらの組み合わせからなる群から選択されることを特徴とする上記１に記載の分類方法。
３．前記増殖因子は、上皮細胞増殖因子（ＥＧＦ）、血管内皮増殖因子（ＶＥＧＦ）、色素上皮由来因子（ＰＥＤＦ）、脳由来神経栄養因子（ＢＤＮＦ）、アンフィレグリン（ＳＤＧＦ）、及びそれらの組み合わせからなる群から選択されることを特徴とする上記１に記載の分類方法。
４．前記抗好中球抗体は、抗好中球細胞質抗体（ＡＮＣＡ）、核周囲抗好中球細胞質抗体（ｐＡＮＣＡ）、及びそれらの組み合わせからなる群から選択されることを特徴とする上記１に記載の分類方法。
５．前記ＡＳＣＡは、ＡＳＣＡ−ＩｇＡ、ＡＳＣＡ−ＩｇＧ、及びそれらの組み合わせからなる群から選択されることを特徴とする上記１に記載の分類方法。
６．前記抗菌性抗体は、抗外膜タンパク質Ｃ（抗ＯｍｐＣ）抗体、抗フラジェリン抗体、抗Ｉ２抗体、及びそれらの組み合わせからなる群から選択されることを特徴とする上記１に記載の分類方法。
７．前記リポカリンは、好中球ゼラチナーゼ関連リポカリン（ＮＧＡＬ）、ＮＧＡＬ／ＭＭＰ−９複合体、及びそれらの組み合わせからなる群から選択されることを特徴とする上記１に記載の分類方法。
８．前記ＭＭＰは、ＭＭＰ−９であることを特徴とする上記１に記載の分類方法。
９．前記ＴＩＭＰは、ＴＩＭＰ−１であることを特徴とする上記１に記載の分類方法。
１０．前記α−グロブリンは、α２−マクログロブリン、ハプトグロビン、オロソムコイド、及びそれらの組み合わせからなる群から選択されることを特徴とする上記１に記載の分類方法。
１１．前記アクチン切断タンパク質は、ゲルソリンであることを特徴とする上記１に記載の分類方法。
１２．前記Ｓ１００タンパク質は、カルグラニュリンであることを特徴とする上記１に記載の分類方法。
１３．前記フィブリノペプチドは、フィブリノペプチドＡ（ＦＩＢＡ）であることを特徴とする上記１に記載の分類方法。
１４．前記診断マーカープロファイルは、少なくとも２、３、４、５、又は６つの診断マーカーの存在又はレベルを検出することによって決定されることを特徴とする上記１に記載の分類方法。
１５．前記少なくとも１つの診断マーカーの存在又はレベルは、ハイブリダイゼーション法、増幅法、免疫測定法、又は免疫組織化学的測定法を用いて検出されることを特徴とする上記１に記載の分類方法。
１６．前記分類方法は、
症状プロファイルと組み合わせて、前記診断マーカープロファイルを決定する工程；及び、
前記診断マーカープロファイル及び前記症状プロファイルに基づくアルゴリズムを用いて、前記試料をＩＢＳ試料又は非ＩＢＳ試料として分類する工程、
を備え、
前記症状プロファイルは、前記個体における少なくとも１つの症状の存在又は重症度を同定することによって決定される、
ことを特徴とする上記１に記載の分類方法。
１７．前記少なくとも１つの症状は、胸痛、胸部の不快感、胸やけ、普通量の食事後の不快な膨満感、普通量の食事を食べることができないこと、腹痛、腹部の不快感、便秘、下痢、膨満感、腹部の膨張、痛み又は不快感を有することに伴う消極的な考え又は感情、及びそれらの組み合わせからなる群から選択されることを特徴とする上記１６に記載の分類方法。
１８．前記少なくとも１つの症状の存在又は重症度は、質問票を用いて同定されることを特徴とする上記１６に記載の分類方法。
１９．前記質問票は、前記少なくとも１つの症状の存在又は重症度について前記個体に問う一連の質問、痛み又は不快感を有することに伴う消極的な考え又は感情の存在又は重症度について前記個体に問う一連の質問、及びそれらの組み合わせからなる群から選択されることを特徴とする上記１８に記載の分類方法。
２０．前記少なくとも１つの症状の存在又は重症度は、前記個体に、前記個体が現在何らかの症状を経験しているか否かを問うことによって同定されることを特徴とする上記１６に記載の分類方法。
２１．前記症状プロファイルは、少なくとも２、３、４、５、又は６つの症状の存在又は重症度を同定することによって決定されることを特徴とする上記１６に記載の分類方法。
２２．前記試料は、血清、血漿、全血、及び便からなる群から選択されることを特徴とする上記１に記載の分類方法。
２３．前記アルゴリズムは、統計的アルゴリズムを含むことを特徴とする上記１に記載の分類方法。
２４．前記統計的アルゴリズムは、学習統計的分類子システムを含むことを特徴とする上記２３に記載の分類方法。
２５．前記学習統計的分類子システムは、ランダムフォレスト、分類・回帰木、ブーストされた木、ニューラルネットワーク、サポートベクターマシン、一般的なカイ二乗による相互作用の自動検出モデル、インターアクティブ木、多適応的回帰スプライン、機械学習分類子、及びそれらの組み合わせからなる群から選択されることを特徴とする上記２４に記載の分類方法。
２６．前記統計的アルゴリズムは、単一の学習統計的分類子システムを含むことを特徴とする上記２３に記載の分類方法。
２７．前記統計的アルゴリズムは、少なくとも２つの学習統計的分類子システムの組み合わせを含むことを特徴とする上記２３に記載の分類方法。
２８．前記分類方法は、さらに前記非ＩＢＳ試料を健常者、炎症性腸疾患（ＩＢＤ）、又は非ＩＢＤ試料として分類する工程を備えることを特徴とする上記１に記載の分類方法。
２９．前記分類方法は、さらに前記分類からの結果を臨床医へ送付する工程を備えることを特徴とする上記１に記載の分類方法。
３０．前記分類方法は、さらに前記個体がＩＢＳを有する確率の形式で診断を提供する工程を備えることを特徴とする上記１に記載の分類方法。
３１．前記分類方法は、さらに前記ＩＢＳ試料をＩＢＳ便秘型（ＩＢＳ−Ｃ）、ＩＢＳ下痢型（ＩＢＳ−Ｄ）、ＩＢＳ混合型（ＩＢＳ−Ｍ）、ＩＢＳ交替型（ＩＢＳ−Ａ）、又は感染後型ＩＢＳ（ＩＢＳ−ＰＩ）試料として分類する工程を備えることを特徴とする上記１に記載の分類方法。
３２．前記方法は、さらに腸炎を除外する工程を備えることを特徴とする上記１に記載の方法。
３３．個体における過敏性腸症候群（ＩＢＳ）の進行又は後退をモニタリングするモニタリング方法であって、
前記モニタリング方法は、
（ａ）前記試料における、サイトカイン、増殖因子、抗好中球抗体、抗サッカロマイセス・セレビジエ抗体（ＡＳＣＡ）、抗菌性抗体、ラクトフェリン、抗組織トランスグルタミナーゼ（抗ｔＴＧ）抗体、リポカリン、マトリクス・メタロプロテアーゼ（ＭＭＰ）、組織メタロプロテアーゼインヒビター（ＴＩＭＰ）、α−グロブリン、アクチン切断タンパク質、Ｓ１００タンパク質、フィブリノペプチド、カルシトニン遺伝子関連ペプチド（ＣＧＲＰ）、タチキニン、グレリン、ニューロテンシン、コルチコトロピン放出ホルモン、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される少なくとも１つの診断マーカーの存在又はレベルを検出することによって診断マーカープロファイルを決定する工程；及び
（ｂ）前記診断マーカープロファイルに基づくアルゴリズムを用いて前記個体におけるＩＢＳの存在又は重症度を決定する工程、
を備えることを特徴とするモニタリング方法。
３４．前記モニタリング方法は、
症状プロファイルと組み合わせて、前記診断マーカープロファイルを決定する工程；及び
前記診断マーカープロファイル及び前記症状プロファイルに基づくアルゴリズムを用いて、前記個体におけるＩＢＳの存在又は重症度を決定する工程、
を備え、
前記症状プロファイルは、前記個体における少なくとも１つの症状の存在又は重症度を同定することによって決定される、
ことを特徴とする上記３３に記載のモニタリング方法。
３５．前記アルゴリズムは、統計的アルゴリズムを含むことを特徴とする上記３３に記載のモニタリング方法。
３６．前記統計的アルゴリズムは、単一の学習統計的分類子システム又は少なくとも２つの学習統計的分類子システムの組み合わせを含むことを特徴とする上記３５に記載のモニタリング方法。
３７．前記モニタリング方法は、さらに工程（ｂ）において決定したＩＢＳの存在又は重症度を、より早期の前記個体におけるＩＢＳの存在又は重症度と比較する工程を備えることを特徴とする上記３３に記載のモニタリング方法。
３８．過敏性腸症候群（ＩＢＳ）を治療するために有用な薬を投与されている個体における薬の効果をモニタリングするモニタリング方法であって、
前記モニタリング方法は、
（ａ）前記試料における、サイトカイン、増殖因子、抗好中球抗体、抗サッカロマイセス・セレビジエ抗体（ＡＳＣＡ）、抗菌性抗体、ラクトフェリン、抗組織トランスグルタミナーゼ（抗ｔＴＧ）抗体、リポカリン、マトリクス・メタロプロテアーゼ（ＭＭＰ）、組織メタロプロテアーゼインヒビター（ＴＩＭＰ）、α−グロブリン、アクチン切断タンパク質、Ｓ１００タンパク質、フィブリノペプチド、カルシトニン遺伝子関連ペプチド（ＣＧＲＰ）、タチキニン、グレリン、ニューロテンシン、コルチコトロピン放出ホルモン、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される少なくとも１つの診断マーカーの存在又はレベルを検出することによって診断マーカープロファイルを決定する工程；及び
（ｂ）前記診断マーカープロファイルに基づくアルゴリズムを用いて前記薬の有効性を決定する工程、
を備えることを特徴とするモニタリング方法。
３９．前記モニタリング方法は、
症状プロファイルと組み合わせて前記診断マーカープロファイルを決定する工程；及び
前記診断マーカープロファイル及び前記症状プロファイルに基づくアルゴリズムを用いて前記薬の有効性を決定する工程、
を備え、
前記症状プロファイルは、前記個体における少なくとも１つの症状の存在又は重症度を同定することによって決定される、
ことを特徴とする上記３８に記載のモニタリング方法。
４０．前記アルゴリズムは、統計的アルゴリズムを含むことを特徴とする上記３８に記載のモニタリング方法。
４１．前記統計的アルゴリズムは、単一の学習統計的分類子システム又は少なくとも２つの学習統計的分類子システムを含むことを特徴とする上記４０に記載のモニタリング方法。
４２．前記モニタリング方法は、さらに工程（ｂ）で決定した前記薬の有効性を、治療の早期での前記個体における前記薬の有効性と比較する工程を備えることを特徴とする上記３８に記載のモニタリング方法。
４３．前記薬は、セロトニン作動薬、抗うつ剤、塩素チャネル活性化因子、グアニル酸シクラーゼ作動薬、抗生物質、オピオイド、ニューロキニン拮抗薬、抗痙攣又は抗コリン作動薬、ベラドンナアルカロイド、バルビツール酸、それらの遊離塩基、それらの薬学的に許容される塩、それらの誘導体、それらのアナログ、及びそれらの組み合わせからなる群から選択されることを特徴とする上記３８に記載のモニタリング方法。
４４．個体からの試料が過敏性腸症候群（ＩＢＳ）に関連するか否かを分類するために、１つ又はそれ以上のプロセッサを制御するためのコードを含むコンピューター読み取り可能な記憶媒体であって、
前記コードは、診断マーカープロファイルに基づき、前記試料をＩＢＳ試料又は非ＩＢＳ試料として分類する統計的に導出される決定を生み出すために、前記診断マーカープロファイルを含むデータセットに統計処理を適用する命令を含み、
前記診断マーカープロファイルは、サイトカイン、増殖因子、抗好中球抗体、抗サッカロマイセス・セレビジエ抗体（ＡＳＣＡ）、抗菌性抗体、ラクトフェリン、抗組織トランスグルタミナーゼ（抗ｔＴＧ）抗体、リポカリン、マトリクス・メタロプロテアーゼ（ＭＭＰ）、組織メタロプロテアーゼインヒビター（ＴＩＭＰ）、α−グロブリン、アクチン切断タンパク質、Ｓ１００タンパク質、フィブリノペプチド、カルシトニン遺伝子関連ペプチド（ＣＧＲＰ）、タチキニン、グレリン、ニューロテンシン、コルチコトロピン放出ホルモン、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される少なくとも１つの診断マーカーの存在又はレベルを示す、
ことを特徴とするコンピューター読み取り可能な記憶媒体。
４５．前記コンピューター読み取り可能な記憶媒体は、前記診断マーカープロファイル及び症状プロファイルに基づき、前記試料をＩＢＳ試料又は非ＩＢＳ試料として分類する統計的に導出される決定を生み出すために、前記個体における少なくとも１つの症状の存在又は重症度を示す症状プロファイルと組み合わせて、前記診断マーカープロファイルからなるデータセットに統計処理を適用する命令を有することを特徴とする上記４４に記載のコンピューター読み取り可能な記憶媒体。
４６．前記統計処理は、単一の学習統計的分類子システムを含むことを特徴とする上記４４に記載のコンピューター読み取り可能な記憶媒体。
４７．前記統計処理は、少なくとも２つの学習統計的分類子システムの組み合わせを含むことを特徴とする上記４４に記載のコンピューター読み取り可能な記憶媒体。
４８．個体からの試料が過敏性腸症候群（ＩＢＳ）に関連するか否かを分類する分類システムであって、
前記分類システムは、
（ａ）診断マーカープロファイルからなるデータセットを生成するよう構成されたデータ収集モジュール；
（ｂ）前記診断マーカープロファイルに基づき、前記試料をＩＢＳ試料又は非ＩＢＳ試料として分類する、統計的に導出される決定を生み出すために、当該データセットに統計処理を適用することによって、当該データセットを処理するよう構成されたデータ処理モジュール；及び
（ｃ）統計的に導出される当該決定を表示するよう構成された表示モジュール、
を備え、
前記診断マーカープロファイルは、前記試料における、サイトカイン、増殖因子、抗好中球抗体、抗サッカロマイセス・セレビジエ抗体（ＡＳＣＡ）、抗菌性抗体、ラクトフェリン、抗組織トランスグルタミナーゼ（抗ｔＴＧ）抗体、リポカリン、マトリクス・メタロプロテアーゼ（ＭＭＰ）、組織メタロプロテアーゼインヒビター（ＴＩＭＰ）、α−グロブリン、アクチン切断タンパク質、Ｓ１００タンパク質、フィブリノペプチド、カルシトニン遺伝子関連ペプチド（ＣＧＲＰ）、タチキニン、グレリン、ニューロテンシン、コルチコトロピン放出ホルモン、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される少なくとも１つの診断マーカーの存在又はレベルを示す、
ことを特徴とする分類システム。
４９．前記分類システムは、
前記個体における少なくとも１つの症状の存在又は重症度を示す症状プロファイルと組み合わせて、前記診断マーカープロファイルからなるデータセットを生成するよう構成されたデータ収集モジュール；
前記診断マーカープロファイル及び前記症状プロファイルに基づき、前記試料をＩＢＳ試料又は非ＩＢＳ試料として分類する、統計的に導出される決定を生み出すために、当該データセットに統計処理を適用することによって、当該データセットを処理するよう構成されたデータ処理モジュール；及び
統計的に導出される当該決定を表示するよう構成された表示モジュール、
を備えることを特徴とする上記４８に記載の分類システム。
５０．前記統計処理は、単一の学習統計的分類子システムを含むことを特徴とする上記４８に記載の分類システム。
５１．前記統計処理は、少なくとも２つの学習統計的分類子システムを含むことを特徴とする上記４８に記載の分類システム。
５２．個体からの試料がＩＢＳと関連するか否かを分類する分類方法であって、
前記分類方法は、
（ａ）診断マーカープロファイルを決定する工程；
（ｂ）前記診断プロファイルに基づくアルゴリズムを用いて前記試料をＩＢＤ試料又は非ＩＢＤ試料として分類する工程；及び
（ｃ）前記診断プロファイルに基づく第２の統計的アルゴリズムを用いて前記非ＩＢＤ試料をＩＢＳ試料又は非ＩＢＳ試料として分類する工程、
を備え、
前記診断マーカープロファイルは、前記試料における、サイトカイン、増殖因子、抗好中球抗体、抗サッカロマイセス・セレビジエ抗体（ＡＳＣＡ）、抗菌性抗体、ラクトフェリン、抗組織トランスグルタミナーゼ（抗ｔＴＧ）抗体、リポカリン、マトリクス・メタロプロテアーゼ（ＭＭＰ）、組織メタロプロテアーゼインヒビター（ＴＩＭＰ）、α−グロブリン、アクチン切断タンパク質、Ｓ１００タンパク質、フィブリノペプチド、カルシトニン遺伝子関連ペプチド（ＣＧＲＰ）、タチキニン、グレリン、ニューロテンシン、コルチコトロピン放出ホルモン、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される少なくとも１つの診断マーカーの存在又はレベルを示す、
ことを特徴とする分類方法。
５３．前記サイトカインは、ＩＬ−８、ＩＬ−１β、ＴＮＦ関連アポトーシス弱誘導因子（ＴＷＥＡＫ）、レプチン、オステオプロテジェリン（ＯＰＧ）、ＭＩＰ−３β、ＧＲＯα、ＣＸＣＬ４／ＰＦ−４、ＣＸＣＬ７／ＮＡＰ−２、及びそれらの組み合わせからなる群から選択されることを特徴とする上記５２に記載の分類方法。
５４．前記増殖因子は、上皮細胞増殖因子（ＥＧＦ）、血管内皮増殖因子（ＶＥＧＦ）、色素上皮由来因子（ＰＥＤＦ）、脳由来神経栄養因子（ＢＤＮＦ）、アンフィレグリン（ＳＤＧＦ）、及びそれらの組み合わせからなる群から選択されることを特徴とする上記５２に記載の分類方法。
５５．前記抗好中球抗体は、抗好中球細胞質抗体（ＡＮＣＡ）、核周辺抗好中球細胞質抗体（ｐＡＮＣＡ）、及びそれらの組み合わせからなる群から選択されることを特徴とする上記５２に記載の分類方法。
５６．前記ＡＳＣＡは、ＡＳＣＡ−ＩｇＡ、ＡＳＣＡ−ＩｇＧ、及びそれらの組み合わせからなる群から選択されることを特徴とする上記５２に記載の分類方法。
５７．前記抗菌性抗体は、抗外膜タンパク質Ｃ（抗ＯｍｐＣ）抗体、抗フラジェリン抗体、抗Ｉ２抗体、及びそれらの組み合わせからなる群から選択されることを特徴とする上記５２に記載の分類方法。
５８．前記リポカリンは、好中球ゼラチナーゼ関連リポカリン（ＮＧＡＬ）、ＮＧＡＬ／ＭＭＰ−９複合体、及びそれらの組み合わせからなる群から選択されることを特徴とする上記５２に記載の分類方法。
５９．前記ＭＭＰは、ＭＭＰ−９であることを特徴とする上記５２に記載の分類方法。
６０．前記ＴＩＭＰは、ＴＩＭＰ−１であることを特徴とする上記５２に記載の分類方法。
６１．前記α−グロブリンは、α２−マクログロブリン、ハプトグロビン、オロソムコイド、及びそれらの組み合わせからなる群から選択されることを特徴とする上記５２に記載の分類方法。
６２．前記アクチン切断タンパク質は、ゲルソリンであることを特徴とする上記５２に記載の分類方法。
６３．前記Ｓ１００タンパク質は、カルグラニュリンであることを特徴とする上記５２に記載の分類方法。
６４．前記フィブリノペプチドは、フィブリノペプチドＡ（ＦＩＢＡ）であることを特徴とする上記５２に記載の分類方法。
６５．前記診断マーカープロファイルは、少なくとも２、３、４、５、又は６つの診断マーカーの存在又はレベルを検出することによって決定されることを特徴とする上記５２に記載の分類方法。
６６．前記少なくとも１つの診断マーカーの存在又はレベルは、ハイブリダイゼーション法、増幅法、免疫測定法、又は免疫組織化学的測定法を用いて検出されることを特徴とする上記５２に記載の分類方法。
６７．前記分類方法は、
症状プロファイルと組み合わせて、前記診断マーカープロファイルを決定する工程；及び
前記診断マーカープロファイル及び前記症状プロファイルに基づくアルゴリズムを用いて、前記試料を分類する工程、
を備え、
前記症状プロファイルは、前記個体における少なくとも１つの症状の存在又は重症度を同定することによって決定される、
ことを特徴とする上記５２に記載の分類方法。
６８．前記少なくとも１つの症状は、胸痛、胸部の不快感、胸やけ、普通量の食事後の不快な満腹感、普通量の食事を食べることができないこと、腹痛、腹部の不快感、便秘、下痢、膨満感、腹部の膨張、痛み又は不快感に伴う消極的な考え又は感情、及びそれらの組み合わせからなる群から選択されることを特徴とする上記６７に記載の分類方法。
６９．前記少なくとも１つの症状の存在又は重症度は、質問票を用いて同定されることを特徴とする上記６７に記載の分類方法。
７０．前記質問票は、前記少なくとも１つの症状の存在又は重症度について前記個体に問う一連の質問、痛み又は不快感を有することに伴う消極的な考え又は感情の存在又は重症度について前記個体に問う一連の質問、及びそれらの組み合わせからなる群から選択されることを特徴とする上記６９に記載の分類方法。
７１．前記少なくとも１つの症状の存在又は重症度は、前記個体に、前記個体が現在何らかの症状を経験しているか否かを問うことによって同定されることを特徴とする上記６７に記載の分類方法。
７２．前記症状プロファイルは、少なくとも２、３、４、５、又は６つの症状の存在又は重症度を同定することによって決定されることを特徴とする上記６７に記載の分類方法。
７３．前記試料は、血清、血漿、全血、及び便からなる群から選択されることを特徴とする上記５２に記載の分類方法。
７４．個体からの試料がＩＢＳと関連するか否かを分類するために１つ又はそれ以上のプロセッサを制御するためのコードを含むコンピューター読み取り可能な記憶媒体であって、
前記コードは、
（ａ）診断マーカープロファイルからなるデータセットに第１の統計処理を適用し；及び
前記試料が非ＩＢＤ試料として分類される場合は、
（ｂ）前記診断プロファイルに基づき、当該非ＩＢＤ試料をＩＢＳ試料又は非ＩＢＳ試料として分類する、統計的に導出される第２の決定を生み出すために、当該データセットに第２の統計処理を適用する、
ための命令を含み、
前記診断マーカープロファイルは、前記試料における、サイトカイン、増殖因子、抗好中球抗体、抗サッカロマイセス・セレビジエ抗体（ＡＳＣＡ）、抗菌性抗体、ラクトフェリン、抗組織トランスグルタミナーゼ（抗ｔＴＧ）抗体、リポカリン、マトリクス・メタロプロテアーゼ（ＭＭＰ）、組織メタロプロテアーゼインヒビター（ＴＩＭＰ）、α−グロブリン、アクチン切断タンパク質、Ｓ１００タンパク質、フィブリノペプチド、カルシトニン遺伝子関連ペプチド（ＣＧＲＰ）、タチキニン、グレリン、ニューロテンシン、コルチコトロピン放出ホルモン、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される少なくとも１つの診断マーカーの存在又はレベルを示す、
ことを特徴とするコンピューター読み取り可能な記憶媒体。
７５．前記統計処理は、単一の学習統計的分類子システムを含むことを特徴とする上記７４に記載のコンピューター読み取り可能な記憶媒体。
７６．前記統計処理は、少なくとも２つの学習統計的分類子システムの組み合わせを含むことを特徴とする上記７４に記載のコンピューター読み取り可能な記憶媒体。
７７．前記サイトカインは、ＩＬ−８、ＩＬ−１β、ＴＮＦ関連アポトーシス弱誘導因子（ＴＷＥＡＫ）、レプチン、オステオプロテジェリン（ＯＰＧ）、ＭＩＰ−３β、ＧＲＯα、ＣＸＣＬ４／ＰＦ−４、ＣＸＣＬ７／ＮＡＰ−２、及びそれらの組み合わせからなる群から選択されることを特徴とする上記７４に記載のコンピューター読み取り可能な記憶媒体。
７８．前記増殖因子は、上皮細胞増殖因子（ＥＧＦ）、血管内皮増殖因子（ＶＥＧＦ）、色素上皮由来因子（ＰＥＤＦ）、脳由来神経栄養因子（ＢＤＮＦ）、アンフィレグリン（ＳＤＧＦ）、及びそれらの組み合わせからなる群から選択されることを特徴とする上記７４に記載のコンピューター読み取り可能な記憶媒体。
７９．前記抗好中球抗体は、抗好中球細胞質抗体（ＡＮＣＡ）、核周辺抗好中球細胞質抗体（ｐＡＮＣＡ）、及びそれらの組み合わせからなる群から選択されることを特徴とする上記７４に記載のコンピューター読み取り可能な記憶媒体。
８０．前記ＡＳＣＡは、ＡＳＣＡ−ＩｇＡ、ＡＳＣＡ−ＩｇＧ、及びそれらの組み合わせからなる群から選択されることを特徴とする上記７４に記載のコンピューター読み取り可能な記憶媒体。
８１．前記抗菌性抗体は、抗外膜タンパク質Ｃ（抗ＯｍｐＣ）抗体、抗フラジェリン抗体、抗Ｉ２抗体、及びそれらの組み合わせからなる群から選択されることを特徴とする上記７４に記載のコンピューター読み取り可能な記憶媒体。
８２．前記リポカリンは、好中球ゼラチナーゼ関連リポカリン（ＮＧＡＬ）、ＮＧＡＬ／ＭＭＰ−９複合体、及びそれらの組み合わせからなる群から選択されることを特徴とする上記７４に記載のコンピューター読み取り可能な記憶媒体。
８３．前記ＭＭＰは、ＭＭＰ−９であることを特徴とする上記７４に記載のコンピューター読み取り可能な記憶媒体。
８４．前記ＴＩＭＰは、ＴＩＭＰ−１であることを特徴とする上記７４に記載のコンピューター読み取り可能な記憶媒体。
８５．前記α−グロブリンは、α２−マクログロブリン、ハプトグロビン、オロソムコイド、及びそれらの組み合わせからなる群から選択されることを特徴とする上記７４に記載のコンピューター読み取り可能な記憶媒体。
８６．前記アクチン切断タンパク質は、ゲルソリンであることを特徴とする上記７４に記載のコンピューター読み取り可能な記憶媒体。
８７．前記Ｓ１００タンパク質は、カルグラニュリンであることを特徴とする上記７４に記載のコンピューター読み取り可能な記憶媒体。
８８．前記フィブリノペプチドは、フィブリノペプチドＡ（ＦＩＢＡ）であることを特徴とする上記７４に記載のコンピューター読み取り可能な記憶媒体。
８９．前記診断マーカープロファイルは、少なくとも２、３、４、５、又は６つの診断マーカーの存在又はレベルを検出することによって決定されることを特徴とする上記７４に記載のコンピューター読み取り可能な記憶媒体。
９０．前記少なくとも１つの診断マーカーの存在又はレベルは、ハイブリダイゼーション法、増幅法、免疫測定法、又は免疫組織化学的測定法を用いて検出されることを特徴とする上記７４に記載のコンピューター読み取り可能な記憶媒体。
９１．前記コンピューター読み取り可能な記憶媒体は、
症状プロファイルと組み合わせて、前記診断マーカープロファイルを決定する構造；及び
前記診断マーカープロファイル及び前記症状プロファイルに基づくアルゴリズムを用いて前記試料を分類する構造、
を有し、
前記症状プロファイルは、前記個体における少なくとも１つの症状の存在又は重症度を同定することによって決定される、
ことを特徴とする上記７４に記載のコンピューター読み取り可能な記憶媒体。
９２．前記少なくとも１つの症状は、胸痛、胸部の不快感、胸やけ、普通量の食事後の不快な満腹感、普通量の食事を食べることができないこと、腹痛、腹部の不快感、便秘、下痢、膨満感、腹部の膨張、痛み又は不快感を有することに伴う消極的な考え又は感情、及びそれらの組み合わせからなる群から選択されることを特徴とする上記９１に記載のコンピューター読み取り可能な記憶媒体。
９３．前記少なくとも１つの症状の存在又は重症度は、質問票を用いて同定されることを特徴とする上記９１に記載のコンピューター読み取り可能な記憶媒体。
９４．前記質問票は、前記少なくとも１つの症状の存在又は重症度について前記個体に問う一連の質問、痛み又は不快感を有することに伴う消極的な考え又は感情の存在又は重症度について前記個体に問う一連の質問、及びそれらの組み合わせからなる群から選択されることを特徴とする上記９１に記載のコンピューター読み取り可能な記憶媒体。
９５．前記少なくとも１つの症状の存在又は重症度は、前記個体に、前記個体が最近何らかの症状を経験しているかについて問うことによって同定されることを特徴とする上記９１に記載のコンピューター読み取り可能な記憶媒体。
９６．前記症状プロファイルは、少なくとも２、３、４、５、又は６つの症状の存在又は重症度を同定することによって決定されることを特徴とする上記９１に記載のコンピューター読み取り可能な記憶媒体。
９７．前記方法は、診断マーカープロファイル及び症状プロファイルを決定する構造を備えることを特徴とする上記９１に記載のコンピューター読み取り可能な記憶媒体。
９８．前記試料は、血清、血漿、全血、及び便からなる群から選択されることを特徴とする上記９１に記載のコンピューター読み取り可能な記憶媒体。
９９．個体からの試料がＩＢＳと関連するか否かを分類するためのシステムであって、
前記分類システムは、
（ａ）診断マーカープロファイルからなるデータセットを生成するよう構成されたデータ収集モジュール；
（ｂ）前記診断マーカープロファイルに基づき、前記試料をＩＢＤ試料又は非ＩＢＤ試料として分類する、第１の統計的に導出される決定を生み出すために、当該データセットに第１の統計処理を適用することによって、当該データセットを処理し；
前記試料が非ＩＢＤ試料として分類される場合には、前記診断マーカープロファイルに基づき、前記非ＩＢＤ試料をＩＢＳ試料又は非ＩＢＳ試料として分類する、第２の統計的に導出される決定を生み出すために、当該データセットに第２の統計処理を適用するよう構成されたデータ処理モジュール；及び
（ｃ）当該第１の、及び／又は第２の統計的に導出される決定を表示するよう構成された表示モジュール、
を備え、
前記診断マーカープロファイルは、前記試料における、サイトカイン、増殖因子、抗好中球抗体、抗サッカロマイセス・セレビジエ抗体（ＡＳＣＡ）、抗菌性抗体、ラクトフェリン、抗組織トランスグルタミナーゼ（抗ｔＴＧ）抗体、リポカリン、マトリクス・メタロプロテアーゼ（ＭＭＰ）、組織メタロプロテアーゼインヒビター（ＴＩＭＰ）、α−グロブリン、アクチン切断タンパク質、Ｓ１００タンパク質、フィブリノペプチド、カルシトニン遺伝子関連ペプチド（ＣＧＲＰ）、タチキニン、グレリン、ニューロテンシン、コルチコトロピン放出ホルモン、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される少なくとも１つの診断マーカーの存在又はレベルを示す、
ことを特徴とする分類システム。
１００．前記統計処理は、単一の学習統計的分類子システムを含むことを特徴とする上記９９に記載の分類システム。
１０１．前記統計処理は、少なくとも２つの学習統計的分類子システムの組み合わせを含むことを特徴とする上記９９に記載の分類システム。
１０２．前記サイトカインは、ＩＬ−８、ＩＬ−１β、ＴＮＦ関連アポトーシス弱誘導因子（ＴＷＥＡＫ）、レプチン、オステオプロテジェリン（ＯＰＧ）、ＭＩＰ−３β、ＧＲＯα、ＣＸＣＬ４／ＰＦ−４、ＣＸＣＬ７／ＮＡＰ−２、及びそれらの組み合わせからなる群から選択されることを特徴とする上記９９に記載の分類システム。
１０３．前記増殖因子は、上皮細胞増殖因子（ＥＧＦ）、血管内皮増殖因子（ＶＥＧＦ）、色素上皮由来因子（ＰＥＤＦ）、脳由来神経栄養因子（ＢＤＮＦ）、アンフィレグリン（ＳＤＧＦ）、及びそれらの組み合わせからなる群から選択されることを特徴とする上記９９に記載の分類システム。
１０４．前記抗好中球抗体は、抗好中球細胞質抗体（ＡＮＣＡ）、核周辺抗好中球細胞質抗体（ｐＡＮＣＡ）、及びそれらの組み合わせからなる群から選択されることを特徴とする上記９９に記載の分類システム。
１０５．前記ＡＳＣＡは、ＡＳＣＡ−ＩｇＡ、ＡＳＣＡ−ＩｇＧ、及びそれらの組み合わせからなる群から選択されることを特徴とする上記９９に記載の分類システム。
１０６．前記抗菌性抗体は、抗外膜タンパク質Ｃ（抗ＯｍｐＣ）抗体、抗フラジェリン抗体、抗Ｉ２抗体、及びそれらの組み合わせからなる群から選択されることを特徴とする上記９９に記載の分類システム。
１０７．前記リポカリンは、好中球ゼラチナーゼ関連リポカリン（ＮＧＡＬ）、ＮＧＡＬ／ＭＭＰ−９複合体、及びそれらの組み合わせからなる群から選択されることを特徴とする上記９９に記載の分類システム。
１０８．前記ＭＭＰは、ＭＭＰ−９であることを特徴とする上記９９に記載の分類システム。
１０９．前記ＴＩＭＰは、ＴＩＭＰ−１であることを特徴とする上記９９に記載の分類システム。
１１０．前記α−グロブリンは、α２−マクログロブリン、ハプトグロビン、オロソムコイド、及びそれらの組み合わせからなる群から選択されることを特徴とする上記９９に記載の分類システム。
１１１．前記アクチン切断タンパク質は、ゲルソリンであることを特徴とする上記９９に記載の分類システム。
１１２．前記Ｓ１００タンパク質は、カルグラニュリンであることを特徴とする上記９９に記載の分類システム。
１１３．前記フィブリノペプチドは、フィブリノペプチドＡ（ＦＩＢＡ）であることを特徴とする上記９９に記載の分類システム。
１１４．前記診断マーカープロファイルは、少なくとも２、３、４、５、又は６つの診断マーカーの存在又はレベルを検出することによって決定されることを特徴とする上記９９に記載の分類システム。
１１５．前記少なくとも１つの診断マーカーの存在又はレベルは、ハイブリダイゼーション法、増幅法、免疫測定法、又は免疫組織化学的測定法を用いて検出されることを特徴とする上記９９に記載の分類システム。
１１６．前記コンピューター読み取り可能な記憶媒体は、
症状プロファイルと組み合わせて、前記診断マーカープロファイルを決定する構造；及び
前記診断マーカープロファイル及び前記症状プロファイルに基づくアルゴリズムを用いて前記試料を分類する構造、
を有し、
前記症状プロファイルは、前記個体における少なくとも１つの症状の存在又は重症度を同定することによって決定される、
ことを特徴とする上記９９に記載の分類システム。
１１７．前記少なくとも１つの症状は、胸痛、胸部の不快感、胸やけ、普通量の食事後の不快な満腹感、普通量の食事を食べることができないこと、腹痛、腹部の不快感、便秘、下痢、膨満感、腹部の膨張、痛み又は不快感を有することに伴う消極的な考え又は感情、及びそれらの組み合わせからなる群から選択されることを特徴とする上記１１６に記載の分類システム。
１１８．前記少なくとも１つの症状の存在又は重症度は、質問票を用いて同定されることを特徴とする上記１１６に記載の分類システム。
１１９．前記質問票は、前記少なくとも１つの症状の存在又は重症度について前記個体に問う一連の質問、痛み又は不快感を有することに伴う消極的な考え又は感情の存在又は重症度について前記個体に問う一連の質問、及びそれらの組み合わせからなる群から選択されることを特徴とする上記１１６に記載の分類システム。
１２０．前記少なくとも１つの症状の存在又は重症度は、前記個体に、前記個体が現在何らかの症状を経験しているかを問うことによって同定されることを特徴とする上記１１６に記載の分類システム。
１２１．前記症状プロファイルは、少なくとも２、３、４、５、又は６つの症状の存在又は重症度を同定することによって決定されることを特徴とする上記１１６に記載の分類システム。
１２２．前記方法は、診断マーカープロファイル及び症状プロファイルを決定する構造を備えることを特徴とする上記１１６に記載の分類システム。
１２３．前記試料は、血清、血漿、全血、及び便からなる群から選択されることを特徴とする上記１１６に記載の分類システム。