【手続補正書】
【提出日】平成22年7月29日(2010.7.29)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
ポリヌクレオチドによりコード化された蛋白質を、標的を含有する試料と組み合わせて、ポリヌクレオチドによりコード化された蛋白質−標的の複合体を形成するステップ、
前記ポリヌクレオチドによりコード化された蛋白質−標的の複合体を、相補的な基板に結合された基板のポリヌクレオチドとハイブリッド形成させるステップ、及び、
前記ハイブリッド形成されたポリヌクレオチドによりコード化された蛋白質−標的の複合体を検出するステップ、
を含む、標的検出方法。
【請求項２】
基板のポリヌクレオチドに相補的なポリヌクレオチドによりコード化された蛋白質を、基板に結合された前記基板のポリヌクレオチド及び標的を含有する試料と組み合わせて、ハイブリッド形成されたポリヌクレオチドによりコード化された蛋白質−標的の複合体を形成するステップ、及び、
前記ハイブリッド形成されたポリヌクレオチドによりコード化された蛋白質−標的の複合体を検出するステップ、
を含む、標的検出方法。
【請求項３】
基板のポリヌクレオチドに相補的な直交性のポリヌクレオチドによりコード化された蛋白質を、基板に結合された基板のポリヌクレオチドとハイブリッド形成させるステップ、
前記ハイブリッド形成された直交性のポリヌクレオチドによりコード化された蛋白質を、標的を含有する試料と組み合わせて、ハイブリッド形成された直交性のポリヌクレオチドによりコード化された蛋白質−標的の複合体を形成するステップ、及び、
前記ハイブリッド形成された直交性のポリヌクレオチドによりコード化された蛋白質−標的の複合体を検出するステップ、
を含む、標的検出方法。
【請求項４】
ポリヌクレオチドによりコード化された抗体を、標的を含有する試料と組み合わせて、ポリヌクレオチドによりコード化された抗体−標的の複合体を形成するステップ、
ラベルされた抗体を、前記ポリヌクレオチドによりコード化された抗体−標的の複合体と組み合わせて、ラベルされた抗体−ポリヌクレオチドによりコード化された抗体−標的の複合体を形成するステップ、
前記ラベルされた抗体−ポリヌクレオチドによりコード化された抗体−標的の複合体を、相補的な基板に結合された基板のポリヌクレオチドとハイブリッド形成させるステップ、及び、
前記ハイブリッド形成されたラベルされた抗体−ポリヌクレオチドによりコード化された抗体−標的の複合体を検出するステップ、
を含む、標的検出方法。
【請求項５】
ポリヌクレオチドによりコード化された抗体を、標的を含有する試料及びラベルされた抗体と組み合わせて、ラベルされた抗体−ポリヌクレオチドによりコード化された抗体−標的の複合体を形成するステップ、
前記ラベルされた抗体−ポリヌクレオチドによりコード化された抗体−標的の複合体を、相補的な基板に結合された基板のポリヌクレオチドとハイブリッド形成させるステップ、及び、
前記ハイブリッド形成されたラベルされた抗体−ポリヌクレオチドによりコード化された抗体−標的の複合体を検出するステップ、
を含む、標的検出方法。
【請求項６】
ラベルされたポリヌクレオチドによりコード化された抗体を、細胞を含有する試料と組み合わせて、ポリヌクレオチドによりコード化された抗体−細胞の複合体を形成するステップであって、各ラベルされたポリヌクレオチドによりコード化された抗体が１又は複数のラベルされたポリヌクレオチド鎖を含む、ステップ、
前記ラベルされたポリヌクレオチドによりコード化された抗体−細胞の複合体を、相補的な基板に結合された基板のポリヌクレオチドとハイブリッド形成させるステップ、及び、
前記ハイブリッド形成されたラベルされたポリヌクレオチドによりコード化された抗体−細胞の複合体を検出するステップ、
を含む、細胞選別方法。
【請求項７】
（ａ）標的のポリヌクレオチドにも第一の群の基板のポリヌクレオチドにも相補的なラベルされたポリヌクレオチドと、（ｂ）第二の群の基板のポリヌクレオチドに相補的なポリヌクレオチドによりコード化された抗体と、（ｃ）基板に結合された前記第一及び第二の群の基板のポリヌクレオチドと、（ｄ）標的を含有する試料とを組み合わせて、（ｉ）ラベルされたポリヌクレオチド−標的のポリヌクレオチドの複合体とハイブリッド形成された基板のポリヌクレオチドと、（ｉｉ）ポリヌクレオチドによりコード化された抗体−標的の複合体とハイブリッド形成された基板のポリヌクレオチドとを形成するステップ、並びに、
前記ラベルされたポリヌクレオチド−標的のポリヌクレオチドの複合体、及び、前記ポリヌクレオチドによりコード化された抗体−標的の複合体を検出するステップ、
を含む、標的検出方法。
【請求項８】
１又は複数のマイクロ流体チャネルに通して、標的を含有する試料及びラベルされた抗体と共にポリヌクレオチドによりコード化された抗体を流し、ラベルされた抗体−ポリヌクレオチドによりコード化された抗体−標的の複合体を形成するステップ、
前記ラベルされた抗体−ポリヌクレオチドによりコード化された抗体−標的の複合体を、該ラベルされた抗体−ポリヌクレオチドによりコード化された抗体−標的の複合体とハイブリッド形成する基板のポリヌクレオチドと結合された基板を含むマイクロ流体アレイ上に流すステップ、及び、
前記ハイブリッド形成されたラベルされた抗体−ポリヌクレオチドによりコード化された抗体−標的の複合体を検出するステップ、
を含む、マイクロ流体イムノアッセイ。
【請求項９】
ポリヌクレオチドによりコード化された抗体を、１又は複数のマイクロ流体チャネルに通して、及び、前記ポリヌクレオチドによりコード化された抗体とハイブリッド形成する結合された基板のポリヌクレオチドで飽和されたポリリジン基板を含むマイクロ流体アレイ上に流して、ハイブリッド形成されたポリヌクレオチドによりコード化された抗体を形成するステップ、
１又は複数の標的を含有する試料を、前記１又は複数のマイクロ流体チャネルに通して、及び、前記マイクロ流体アレイ上に流して、ハイブリッド形成されたポリヌクレオチドによりコード化された抗体−標的の複合体を形成するステップ、
ラベルされた抗体を、前記１又は複数のマイクロ流体チャネルに通して、及び、前記マイクロ流体アレイ上に流して、ハイブリッド形成されたラベルされた抗体−ポリヌクレオチドによりコード化された抗体−標的の複合体を形成するステップ、並びに、
前記ハイブリッド形成されたラベルされた抗体−ポリヌクレオチドによりコード化された抗体−標的の複合体を検出するステップ、
を含む、マイクロ流体イムノアッセイ。
【請求項１０】
前記ポリヌクレオチドによりコード化された蛋白質が、直交性のポリヌクレオチドによりコード化された蛋白質をさらに含む、請求項１又は２に記載の方法。
【請求項１１】
前記ポリヌクレオチドによりコード化された抗体が、直交性のポリヌクレオチドによりコード化された抗体をさらに含む、請求項４乃至７のうちいずれか一項に記載の方法。
【請求項１２】
前記直交性のポリヌクレオチドによりコード化された抗体が、ＳＥＱ  ＩＤ番号：７から１８までの群から選択されるポリヌクレオチド配列をさらに含む、請求項１１に記載の方法。
【請求項１３】
前記ポリヌクレオチドによりコード化された蛋白質−標的の複合体を形成するステップが、抗体−抗原、受容体−リガンド、及び、酵素−基質の相互作用からなる群から選択される蛋白質−標的の相互作用を形成するステップをさらに含む、請求項１乃至３のうちいずれか一項に記載の方法。
【請求項１４】
ポリヌクレオチドによりコード化された抗体が、モノクローナル抗体、ポリクローナル抗体、又は、抗体の断片をさらに含む、請求項４乃至７のうちいずれか一項に記載の方法。
【請求項１５】
前記抗体の断片が、Ｆａｂ、Ｆｖ、Ｆａｂ’、及び、Ｆ（ａｂ’）２からなる群から選択される、請求項１４に記載の方法。
【請求項１６】
前記標的が、分析物、バイオマーカー、生体分子、細胞、糖、アミノ酸、ペプチド、蛋白質、オリゴヌクレオチド、ポリヌクレオチド、ＤＮＡ、ＲＮＡ、ポリペプチド、有機分子、ハプテン、エピトープ、生物細胞、生物細胞の一部、ビタミン、ホルモン、脂質、代謝物、ケモカイン、及び、小分子からなる群から選択される１又は複数の標的をさらに含む、請求項１乃至７のうちいずれか一項に記載の方法。
【請求項１７】
前記ハイブリダイゼーションステップが、２０個の相補的な塩基のハイブリダイゼーションをさらに含む、請求項１乃至６のうちいずれか一項に記載の方法。
【請求項１８】
前記ラベルが、放射性同位体、蛍光体、小分子の染料、蛋白質発色団、量子ドット、化学発光染料、発色団、酵素、酵素の基質、酵素の補助因子、酵素の阻害物、染料、金属イオン、ナノ粒子、金属ゾル、及び、リガンドからなる群から選択される、請求項１乃至７のうちいずれか一項に記載の方法。
【請求項１９】
前記ラベルが蛍光体である、請求項１８に記載の方法。
【請求項２０】
前記ラベルが金ナノ粒子である、請求項１８に記載の方法。
【請求項２１】
各ラベルされたポリヌクレオチドによりコード化された抗体が、３つのラベルされたポリヌクレオチド鎖を含む、請求項６に記載の方法。
【請求項２２】
各ポリヌクレオチド鎖が、蛍光体でラベルされる、請求項２１に記載の方法。
【請求項２３】
前記ラベルが蛍光体であり、前記検出するステップが蛍光を測定するステップをさらに含む、請求項８又は９に記載のイムノアッセイ。
【請求項２４】
前記ラベルが金ナノ粒子であり、前記検出するステップが光散乱を測定するステップをさらに含む、請求項８又は９に記載のイムノアッセイ。
【請求項２５】
前記測定するステップが、デジタル式のカウントをさらに含む、請求項２４に記載のイムノアッセイ。
【請求項２６】
前記基板のポリヌクレオチドが一本鎖ＤＮＡを含む、請求項１乃至７のうちいずれか一項に記載の方法。
【請求項２７】
前記ポリヌクレオチドによりコード化された蛋白質が一本鎖ＤＮＡを含む、請求項１乃至３のうちいずれか一項に記載の方法。
【請求項２８】
前記ポリヌクレオチドによりコード化された抗体が一本鎖ＤＮＡを含む、請求項４乃至７のうちいずれか一項に記載の方法。
【請求項２９】
請求項１に記載の方法であって、
第一及び第二の群のポリヌクレオチドによりコード化された蛋白質を前記試料と組み合わせて、第一の群及び第二の群のポリヌクレオチドによりコード化された蛋白質−標的の複合体を形成するステップであり、前記第一の群が第一の標的に特異的に結合し、前記第二の群が第二の標的に特異的に結合する、ステップ、
前記第一の群及び第二の群のポリヌクレオチドによりコード化された蛋白質−標的の複合体を第一及び第二の群の基板に結合された基板のポリヌクレオチドとハイブリッド形成させるステップであり、前記第一の群の基板のポリヌクレオチドが、前記第一の群のポリヌクレオチドによりコード化された蛋白質−標的の複合体に相補的であり、前記第二の群の基板のポリヌクレオチドが、前記第二の群のポリヌクレオチドによりコード化された蛋白質−標的の複合体に相補的である、ステップ、並びに、
前記第一の群及び第二の群のハイブリッド形成されたポリヌクレオチドによりコード化された蛋白質−標的の複合体を検出するステップ、
をさらに含む方法。
【請求項３０】
結合された基板のポリヌクレオチドで飽和されたポリリジン基板、及び
前記基板のポリヌクレオチドとハイブリッド形成された直交性のポリヌクレオチドによりコード化された抗体、
を含む、高密度蛋白質マイクロアレイ。
【請求項３１】
前記直交性のポリヌクレオチドによりコード化された蛋白質が、５’Ａ１０配列をさらに含む、請求項３０に記載のマイクロアレイ。
【請求項３２】
前記基板のポリヌクレオチドが、少なくとも７５塩基長である、請求項３１に記載のマイクロアレイ。
【請求項３３】
請求項１乃至９のうちいずれか一項に記載の方法を行うための、請求項３２に記載のマイクロアレイの使用。
【請求項３４】
前記基板のポリヌクレオチドが、静電気的相互作用によって前記基板に結合される、請求項３３に記載のマイクロアレイの使用。
【請求項３５】
請求項２９に記載の方法であって、前記第一及び前記第二の群のポリヌクレオチドによりコード化された蛋白質が互いに直交であり、前記第一の群の基板のポリヌクレオチドが、前記第二の群のポリヌクレオチドによりコード化された蛋白質−標的の複合体に直交であり、前記第二の群の基板のポリヌクレオチドが、前記第一の群のポリヌクレオチドによりコード化された蛋白質−標的の複合体に直交である、方法。