【事件の表示】
　上記当事者間の特許第３１４０７７６号発明「無細胞ワクチン」の特許無効審判事件について、次のとおり審決する。
【結　論】
　特許第３１４０７７６号の請求項１〜９に係る発明についての特許を無効とする。
　審判費用は、被請求人の負担とする。
【理　由】
１．手続きの経緯
　本件特許第３１４０７７６号に係る発明は、平成３年（１９９１年）９月２７日に国際特許出願（パリ条約による優先権主張：１９９０年９月２７日、英国）され、平成１２年１２月１５日に特許権の設定の登録がされたものである。
    　
２．本件特許発明
　本件特許発明は、その特許請求の範囲の請求項１〜９に記載された、次のとおりのものである。
【特許請求の範囲】
【請求項１】ボルデテラペルツシス（Bordetella pertussis）の69kDa抗原とボルデテラペルツシスのトキソイド化されたリンパ球促進因子との相乗的組合せ物を含むワクチン。
【請求項２】69kDa抗原が、組換えDNA技術を使用して得られた請求項１に記載のワクチン。
【請求項３】リンパ球促進因子が、ホルムアルデヒド、グルタルアルデヒド、過酸化水素またはそれらの組合せから選択される不活性剤を使用してトキソイド化された請求項１または２に記載のワクチン。
【請求項４】69kDa抗原とトキソイド化されたリンパ球促進因子の重量比が、約1:1である請求項１〜３のいずかに記載のワクチン。
【請求項５】さらに、非経口投与に適した薬学的に許容され得る液体賦形剤を含む請求項１〜４のいずれかに記載のワクチン。
【請求項６】抗原タンパク質の濃度が、0.03〜2mg/mlである請求項５に記載のワクチン。
【請求項７】さらに、佐剤を含む請求項１〜６のいずれかに記載のワクチン。
【請求項８】さらに、ボルデテラペルツシスのその他の抗原またはジフテリア若しくは破傷風の抗原を含む請求項１〜７のいずれかに記載のワクチン。
【請求項９】ボルデテラペルツシスの69kDa抗原とボルデテラペルツシスのトキソイド化されたリンパ球促進因子とを、その相乗的組合せを与えるような量で混合することを含む請求項１に記載のワクチンの製造方法。
　　    　
３．当事者の主張の概要
（１）請求人の主張
　請求人は、本件特許の請求項１−９の発明は特許法第２９条の２の規定により、請求項１−５、７−８の発明は特許法第２９条第１項第２号に該当するため、請求項１−３、５、８−９の発明は特許法第２９条第１項第３号の規定に該当するため、請求項１−９の発明は特許法第２９条第２項の規定により、それぞれ特許を受けることができないものであり、また、請求項１−９に係る本件特許明細書の記載は特許法第３６条第４項及び特許法第３６条第５項第１号および第２号の規定に違反するものであるので、本件特許は、特許法第１２３条第１項第２号及び第１２３条第１項第４号に該当し無効とすべきであると主張し、証拠方法として甲第１〜１０号証を提出している。
　　
（２）被請求人の主張
　被請求人には、審判請求書の副本を送達し、期間を指定して答弁書を提出する機会を与えたが、指定期間を過ぎても何ら応答しない。
　　
４．甲号証の記載
〈1〉甲第１号証：特開平４−３６８３３７号公報［特願平３−１７５８１９号（平成３年６月２１日出願、パリ条約による優先権主張１９９０年６月２１日、イタリア）の公開公報］
（〈1〉−１）「【請求項１】無毒の百日咳菌トキシン二重変異体、繊維状赤血球凝集素（ＦＨＡ）、６９キロダルトンタンパク質（６９ｋｄ）及び薬剤学的に許容可能なベクター類からなり適宜ジフテリア及び／または破傷風アナトキシンと関連させた無細胞抗百日咳菌ワクチン類。
【請求項２】前記繊維状赤血球凝集素（ＦＨＡ）及び前記６９キロダルトンタンパク質（６９ｋｄ）が、百日咳菌トキシン遺伝子を欠失している（Ｂ．ペルツシス（Ｂ．ｐｅｒｔｕｓｓｉｓ）△Ｔｏｘ）かまたは無毒のＰＴを産生するように改質されているボルデテラ・ペルツシス（Ｂｏｒｄｅｔｅｌｌａ  ｐｅｒｔｕｓｓｉｓ）から得られる請求項１記載の無細胞抗百日咳菌ワクチン類。
【請求項１５】０．０３５％から０．７％（重量％／容量）ホルムアルデヒドによる処理によって安定化されている請求項１３及び１４記載の変異体類。」
（〈1〉−２）「先行技術において、１種以上の抗原タンパク質類からなる無細胞ワクチン類が提案されており、その中でもホルムアルデヒド・・・、グルタールアルデヒド・・・、テトラニトロメタン・・・、トリニトロベンゼンスルホン酸・・・、過酸化水素・・・のような範囲の化学的試薬によって百日咳菌トキシンは無毒化される。」（３頁左欄１−２２行）
（〈1〉−３）「結論として、本発明にしたがってＢ．ペルツシス（Ｂ．ｐｅｒｔｕｓｓｉｓ）の変異株によって得られたＰＴ変異体、ＦＨＡ及び６９ｋｄタンパク質は、それらの高い免疫原性及び毒性の欠如のゆえに、所望の特性を示す無細胞抗百日咳菌一価または三価（ＤＰＴ）のワクチンを開発するために選択された抗原類を示すことになる。」（５頁左欄１５−２１行）
（〈1〉−４）「抗百日咳菌ワクチン類として適切な免疫原性製剤は、本発明にしたがって、ヒトにおいて免疫原性材料の賦形薬として一般に使用されるものの中から選択された薬剤学的に許容される担体に対して前記抗原類を添加することによって調製できる。前記担体類の例は、生理食塩水である。抗原性産物は、担体中における溶液または懸濁物として存在することができる。」（４頁右欄３０−３６行）
（〈1〉−５）「前記製剤類は、さらに、免疫反応を刺激ししたがってワクチンの有効性を改良するためのアジュバンドからなることができる。本発明の目的のための適当なアジュバンド類として、例えば、リン酸アルミニウム（ＡｌＰＯ４　）、水酸化アルミニウム｛Ａｌ（ＯＨ）３　｝、インタロイキン−１または２またはそれらのペプチド断片類である。」（４頁右欄３６−４２行）
（〈1〉−６）「前記６９ｋｄタンパク質は、Ｂ．ペルツシス（Ｂ．ｐｅｒｔｕｓｓｉｓ）Ｗ２８−９Ｋ／１２８ＧまたはＢ．ペルツシス（Ｂ．ｐｅｒｔｕｓｓｉｓ）Ｗ２８−ΔＴｏｘの細胞抽出物を精製することによって得られる。」（８頁左欄３８−４１行）
「Ｓ１配列内部に２つのアミノ酸置換Ａｒｇ９−＞Ｌｙｓ及びＧｌｕ−＞Ｇｌｙを含有するＰＴ−９Ｋ／１２９Ｇ二重変異体が、形質転換Ｂ．ペルツシス（Ｂ．ｐｅｒｔｕｓｓｉｓ）株Ｗ２８−９Ｋ／１２９Ｇの培養物から得られる。」（５頁左欄２５−２９行）
「本発明による好適な抗原類は、アミノ酸残基類Ａｒｇ９及びＧｌｕ１２９が欠失しそれぞれアミノ酸残基類Ｌｙｓ及びＧｌｙによって置換されたことを特徴とする百日咳菌トキシン変異体（ＰＴ−９Ｋ／１２９Ｇ）、ＦＨＡ及び６９ｋｄである。・・・、上述の抗原類を産生可能なボルデテラ（Ｂｏｒｄｅｔｅｌｌａ）株は、（ａ）・・・、（ｂ）段階（ａ）において得られた株において百日咳菌トキシンをコードする染色体遺伝子を異なるタンパク質をコードする遺伝子と相同組換えによって置換すること、（ｃ）段階（ｂ）において得られたＰＴ遺伝子（ΔＴｏｘ）を欠失したボルデテラ（Ｂｏｒｄｅｔｅｌｌａ）株類を選択すること、（ｄ）・・・、（ｅ）ボルデテラ（Ｂｏｒｄｅｔｅｌｌａ）において複製不可の適切に修飾されたプラスミド中に前記変異遺伝子を挿入すること、（ｆ）段階（ｃ）において選択されたボルデテラ（Ｂｏｒｄｅｔｅｌｌａ）（ΔＴｏｘ）株類中に前記プラスミドを結合によって導入すること、及び最後に（ｇ）前記変異百日咳菌トキシンの遺伝子との相同組換えによって形質転換されたボルデテラ（Ｂｏｒｄｅｔｅｌｌａ）株類を単離すること、からなる工程によって得られる。」（４頁左欄３２行−右欄７行）
（〈1〉−７）「体重（約）１６ｇの１６匹の３−４週齢雄性ＣＤ１マウス群（チャールズリバー（Ｃｈａｒｌｅｓ　Ｒｉｖｅｒ）、カルコ（Ｃａｌｃｏ） イタリア）に対してＷＨＯ規則にしたがって、アジュバンド上に吸着されたワクチンの剤形に応じて異なる量のＰＴ−９Ｋ／１２９Ｇ、ＦＨＡおよび６９ｋｄからなる滅菌生理食塩水溶液０．５ｍｌをｉ．ｐ．注射する。」（１１頁右欄３７−４４行）
（〈1〉−８）「本発明によれば、二重変異体ＰＴ−９Ｋ／１２９ＧまたはＰＴ−１３Ｌ／１２９ＧまたはＰＴ−２６Ｉ／２９Ｇ及びＦＨＡは無細胞培地から精製され、一方、６９ｋｄは細胞部分から精製される。」（４頁右欄８〜１１行）
（〈1〉−９）実施例８には、二重変異体ＰＴ−９Ｋ／１２９Ｇ及び６９ｋｄを種々の重量比で含むワクチンが開示されている。特に、ワクチンロットI (DPT8/PFK/AF) は、二重変異体ＰＴ−９Ｋ／１２９Ｇ及び６９ｋｄを１：１の重量比で含むことが開示されている。表９には、二重変異体ＰＴ−９Ｋ／１２９Ｇ、６９ｋｄ、ＦＨＡを含むワクチンの他、当該ワクチンを用いた生存率の結果について開示がある。（１０頁右欄３行〜１２頁表９）
　　
〈2〉甲第２号証：特開平４−２３０３２８号公報［特願平３−１９２７７５（平成３年７月８日出願、パリ条約による優先権主張１９９０年７月１１日、米国）の公開公報
（〈2〉−１）「百日咳菌により惹起される疾病を防止するのに有効なワクチンであって、百日咳抗原糸状赤血球凝集素（ＦＨＡ）、無毒化されたリンパ球増多症因子（ＬＰＦ）及び６９キロダルトン外層膜タンパク質を含んで成り、一緒にして前記ワクチンを形成する前に、前記抗原を個々に精製することを特徴とするワクチン。」
（〈2〉−２）「本発明の好ましい態様では、最終ワクチンは、５７：２９：１４（又は正確であるために４：２：１）のＦＨＡ：ＬＰＦ：６９Ｋ比率を有する。」（５頁左欄３０〜３３行）
（〈2〉−３）「個々の百日咳成分は、文献で知られておりそして下記に例示される精製方法を使用して生の百日咳菌から精製されるか、又は、個々の成分を発現する組換えＤＮＡ技術の使用の如き他の方法により精製される。抗原は、下記の属、ボルデテラ（Ｂｏｒｄｅｔｅｌｌａ）、大腸菌（Ｅ．Ｃｏｌｉ）、・・・などのような適当な宿主生物中で発現される。」（３頁左欄４９行−右欄８行）
（〈2〉−４）「ＬＰＦ成分は、文献・・・に記載の如くして化学的無毒化方法を使用して無毒化される。或いは、ＬＰＦは、毒素の望ましくない生物学的活性・・・をなくする部位特異的突然変異の導入により遺伝学的手段により無毒化することができる。」（３頁右欄９−１３行）
「実施例１に記載のいずれかの方法により生成されたＬＰＦを、次いで無毒化して、最終ワクチンの副反応を引き起こすことがある所望されない活性を除去する。ホルムアルデヒド、過酸化水素、テトラニトロメタン又はグルタルアルデヒドによる処理のような種々の慣用の化学的無毒化方法を使用することができる。」（４頁左欄４８行−右欄３行）
（〈2〉−５）「所望により、ワクチンは、アルミニウムゲル・・・の如き製薬学的に許容しうる補助薬も含むことができる。・・・補助薬として有用なアルミニウムゲルの例には、リン酸アルミニウム及び水酸化アルミニウムのような沈殿アルミニウム塩が包含される。・・・ワクチンが注射可能な形態にあることが望まれる場合には、免疫学的に許容し得る希釈剤又は担体を慣用の方法で含ませて液体溶液又は懸濁液を製造することができる。」（３頁右欄４２行−４頁左欄５行）
（〈2〉−６）「非百日咳ワクチン成分と一緒に請求項１に記載の百日咳ワクチンを含んで成る多価ワクチン。」（請求項２）
「他の非百日咳ワクチン成分を、慣用の方法により加えて多価ワクチンを製造することができる。・・・このような他のワクチンの成分の例には、ジフテリアトキソイド、破傷風トキソイド、・・・が包含される。」（３頁右欄３０−４１行）
（〈2〉−７）「慣用の分離方法を使用して、百日咳菌培養物の培養上澄液からＬＰＦを単離する。」（４頁左欄１８−１９行）
　「６９Ｋ外層膜タンパク質を、下記の方法を使用してバクテリア細胞から回収する。」（５頁左欄３−４行）
　「本発明の最終ワクチン製品を製造するために、実施例１−４にしたがって、製造した精製され、無菌化された百日咳成分を、先ず最初に塩化ナトリウムとリン酸ナトリウムを含む水性媒体中で一緒にする。」（５頁左欄２１−２４行）
（〈2〉−８）武田ワクチンについて、【００１５】に次の記載がある。
「武田ワクチンは、８５：７：７：１のＦＨＡ：ＬＰＦ：６９Ｋ；凝集原（agglutinogen）比率を有する。この出願全体にわたり、比率は所定の用量のワクチン中に含まれる抗原のマイクログラムの比率に基づく。」（３頁左欄１４−１７行）
　
〈3〉甲第３号証：国際公開第92/05798号パンフレット（特許第３１４０７７６号における国際公開公報）
　　
〈4〉甲第４号証：Pediatrics, p939-984 (1988)
（〈4〉-1）「日本で製造されているコンポーネントワクチンには、およそ当量のＬＰＦとＦＨＡとを含有するＢタイプと、ほとんどＦＨＡで少量のＬＰＦと幾らかの凝集原を含有するＴタイプの２タイプがある。」（９７２頁左欄「日本における非細胞性ワクチンの開発」の項、５−９行）
（〈4〉-2）「第１世代の非細胞ワクチンとしては、ＦＨＡ、ＬＰＦ、僅かな量のその他のタンパク質を含有し、且つエンドトキシンの量が低減された、現在日本で使用されているようなワクチンである。第２世代のワクチンは第１世代のワクチンとよく似ているが、ロットごとのばらつきが少ないより均一化されたもので、抗原の割合が固定化されていて、またエンドトキシンを有さないというものである。第３世代のワクチンでは、他の精製された防御的な抗原性コンポーネントを加えてもよい（凝集原２及び３、及び外膜タンパク質、ならびに可能性のある他のタンパク質が候補となる）。」（９７５頁右欄「将来的なワクチン開発」の項、２−１３行）
     　
〈5〉甲第５号証：American Journal of Diseases of Children, Vol.144, p899-904 (August 1990) 
（〈5〉-1）「ジフテリアトキソイド及び破傷風トキソイドと組み合わせてアルミニウム塩に吸着させた、リンパ球増多促進因子、繊維状ヘマグルチニン、凝集原、及び69-kd 外膜タンパク質を含有する非細胞百日咳ワクチンの臨床効果を家族内感染試験で評価した。予めワクチンを接種した６２名の小児における家族内感染７〜３０日後の百日咳の発生率を、同様に曝露(expose)したワクチンを接種していない６２名の小児における発生率と比較した。４３名の免疫感作していない小児において典型的な百日咳が診断され、1 名のワクチンを接種した小児が５週間の疾病を経験し、これはおそらく百日咳であった（有効性, 98%; 95%信頼区間, 84% から99% ）。各群の数名の小児は呼吸器疾患を発症し、これは軽症の変則的な百日咳を示していたかもしれない。これらの百日咳の可能性を含めると、ワクチンの有効性は81% であった（95% 信頼区間, 64% から90% ）。ジフテリアトキソイド及び破傷風トキソイドと組み合わせたこの４成分百日咳ワクチンでの事前の免疫は百日咳の予防に非常に有効であると結論される。」（８９９頁左欄−中欄上の要約）
（〈5〉-2）「本研究は、武田薬品工業株式会社（大阪、日本）により製造された単一のＴタイプ製剤（吸着）の臨床効果を決定するために計画された。このワクチンは、最近同定された69-kd 外膜タンパク質（このタンパク質に対する抗体が天然の百日咳及び全細胞百日咳免疫感作の後に見出される）も含有する。」（８９９頁右欄下から４行−９００頁左欄５行）
　
〈6〉甲第６号証：「沈降精製百日せきジフテリア破傷風混合ワクチン」についての医薬品添付文書
　
〈7〉甲第７号証：The Lancet, Vol.335, p1324-1329 (June 2, 1990)
（〈7〉-1）　「しかしながら、ic  チャレンジで判定したように、PT単独では全細胞ワクチンより有効性が低い。１以上の他の抗原（例えば、69K タンパク質）を添加したときにのみ、非細胞ワクチンの効力は全細胞ワクチンの効力に接近する。これらの観察に基づいて、種々の非細胞ワクチンが提案され（表III）、それらのうちの幾つかの安全性及び有効性が小児で試験された。」（１３２７頁右欄６−１２行）
（〈7〉-2）　「表III   提案された百日咳に対する非細胞ワクチン」には、トキソイド化ＰＴ（ＬＰＦ）よ６９Ｋ（６９ｋＤａ抗原）を含むワクチンが記載されている。
　
〈8〉甲第８号証：The Journal of Experimental Medicine, Vol.171, pp.63-73 (January 1990)
（〈8〉-1）「非細胞百日咳ワクチン中の69-kD OMPの検出　抗69-kD OMP mAb BPE3 (5)を使用するイムノブロット分析により、武田非細胞百日咳ワクチンの製剤中に69-kD OMP が存在することが明らかとなった（図3A）。銀染色ゲルのデンシトメトリ分析により、この製剤中の総タンパク質のうち重量比で５％の69-kD OMPを含有することが明らかとなった。」（６７頁下から２行−６９頁３行）
（〈8〉-2）「我々はここで、武田により製造されたＴタイプ非細胞ワクチン中にかなりの量の69-kD OMP が検出可能であることを示す。Ｔタイプワクチンは、ボルデテラペルツシス抽出物のショ糖勾配精製製剤であり、百日咳トキシン、繊維状ヘマグルチニン、及びフィムブリエを含有することが証明されている。精製されたFHA は簡単に分解され、通常アクリルアミドゲル上で69-kD 付近のバンドを含む数本のバンドとして移動するため、Ｔタイプ非細胞ワクチン中の69-kD OMP の存在はこれまで検出されずにいた。我々はこれらの抗原に特異的なmAbsを使用して、このワクチン中にFHA のみならず69-kD OMP も存在することをイムノブロット法によって証明した。」（７１頁６−１４行）
（〈8〉-3）　「我々の結果は、ボルデテラペルツシスの69kD OMPが、動物における防御抗原であり、また、ヒトに対し免疫原性であり、さらに、日本において広く用いられている非細胞百日咳ワクチン製剤中に存在することを示している。これらの知見は、69kD OMPが、抗原性が定義された非細胞百日咳ワクチンの新たな処方に含まれる候補として真剣に考慮されるべきであることを示している。」（７２頁１１−１５行）
 　
〈9〉甲第９号証：The Journal of Infectious Diseases, Vol.159, No.2, p211-218 (February 1989)
（〈9〉-1）「我々は、百日咳感染後あるいはワクチン接種後に、イムノブロッティング技術によってFHA、PT及びOMPに対する血清抗体が容易に検出されることを見出した。これらの結果は、ELISAを用いた他の実験の結果、すなわち、全細胞百日咳ワクチンを接種した患者における、FHA、PT及びOMPに対する抗体の検出[29]、及び百日咳菌患者における超音波で破砕された百日咳菌、FHA、PTおよび69KDタンパク質に対する抗体の検出と一致している。」（２１６頁左欄下３−右欄６行）
（〈9〉-2）「FHA及びPTを構成成分とする非細胞性ワクチンはマウスで、百日咳呼吸器感染に対して防御作用があることが示されてきたが、それらの小児における効力は現在利用されている全細胞百日咳ワクチンを用いた場合に比べ優れたものではない。このことはFHA及びPT以外の抗原に対する応答もまた感染後あるいはワクチン接種後の免疫性に貢献していることを示唆している。我々の研究は、全細胞ワクチンを用いた免疫化、及び程度は劣るが百日咳菌感染がFHA及びPT以外の百日咳菌コンポーネント、とくに、69KDタンパク質及び幾つかのOMPに応答する抗体を誘導することを示している。これらの抗体応答はワクチン接種あるいは感染後の免疫性に際立った貢献を示すかもしれない。」（２１７頁左欄４−１７行）
　
〈10〉甲第１０号証：百日咳菌に関する第６回国際シンポジウム (開催日１９９０年９月２６−２８日) の抄録集及びプログラムにおけるポスター番号７６（発表日１９９０年９月２６日）の抄録文
　
５．対比・判断
（Ｉ）特許法第２９条の２
（Ｉ−〈1〉）甲第１号証との対比
［Ｉ−〈1〉−１］：請求項１について
　ｉ）甲第１号証の請求項１には、「無毒の百日咳菌トキシン二重変異体、繊維状赤血球凝集素（ＦＨＡ）、６９キロダルトンタンパク質（６９ｋｄ）及び薬剤学的に許容可能なベクター類からなり適宜ジフテリア及び／または破傷風アナトキシンと関連させた無細胞抗百日咳菌ワクチン類」が開示されている。（「百日咳菌」は、ボルデテラペルツシス（Bordetella pertussis）と同義である。）
　甲第１号証における「無毒の百日咳菌トキシン二重変異体」とは２箇所のアミノ酸置換によりトキソイド化された百日咳菌トキシンのことであり、「百日咳菌トキシン」（ＰＴ）は「リンパ球促進因子」（ＬＰＦ）と同義語であるから、甲第１号証における「無毒の百日咳菌トキシン二重変異体」は本件特許の請求項１の発明における『トキソイド化されたリンパ球促進因子』である。
　また、甲第１号証における「６９キロダルトンタンパク質（６９ｋｄ）」は、甲第１号証の請求項２より、ボルデテラ・ペルツシスに由来するものであることが明らかであるから、請求項１の発明における『ボルデテラペルツシス（Bordetella pertussis）の６９ｋＤａ抗原』に一致する。
　そして、本件特許明細書の『６９ｋＤａ抗原対トキソイド化されたＬＰＦの比は、例えば１：１０〜１０：１のような広い範囲内で変化することができるが、約１：１が好ましく、とにかくワクチン効能に相乗的効果をもたらすような比である。この比は重量比である。』（特許公報３頁左欄６〜１０行）との記載からみて、６９ｋＤａ抗原とトキソイド化ＬＰＦを１０：１〜１：１０の重量比で組合わせたものが請求項１の発明における『相乗的組合せ物』に該当することは明らかであるところ、甲第１号証にも、両成分を１０：１〜１：１０の重量比の範囲内で含むものが開示されている（〈1〉−９）。
　してみれば、両発明は、『ボルデテラペルツシス（Ｂｏｒｄｅｔｅｌｌａ　ｐｅｒｔｕｓｓｉｓ）の６９ｋＤａ抗原とボルデテラペルツシスのトキソイド化されたリンパ球促進因子との相乗的組合せ物を含むワクチン』である点で一致するから、請求項１の発明は甲第１号証に記載された発明である。
　
［Ｉ−〈1〉−２］：請求項２〜９について
請求項２について
　甲第１号証のワクチンにおける６９ｋＤタンパク質は、Ｂ．ペルツシス（Ｂ．Ｐｅｒｔｕｓｓｉｓ）Ｗ２８−９Ｋ／１２９ＧまたはＢ．ペルツシス（Ｂ．ｐｅｒｔｕｓｓｉｓ）Ｗ２８−ΔＴｏｘの細胞抽出物より精製されたものであり（（〈1〉−６）、６９ｋＤタンパク質を産生可能な上記の細胞も、組換えＤＮＡ技術により作製されたものである（〈1〉―６）。
　
請求項３について
　甲第１号証には、百日咳菌トキシンの無毒化として、ホルムアルデヒド、グルタールアルデヒド、テトラニトロメタン、トリニトロベンゼンスルホン酸、過酸化水素などの化学的試薬による処理が記載され（〈1〉−２）、【請求項１５】には特にホルムアルデヒドによる処理が記載されている（〈1〉―１）。
　
請求項４について　
　甲第１号証のワクチンロットＩ（ＤＰＴ８／ＰＦＫ／ＡＦ）は、二重変異体ＰＴ−９Ｋ／１２９Ｇ及び６９ｋｄを１：１の重量比で含むものである〈1〉−９）。
　
請求項５について　
　甲第１号証における薬剤学的に許容される担体である生理食塩水（〈1〉−４、〈1〉−７）は、「非経口投与に適した薬剤学的に許容される液体賦形剤」に相当する。
　　
請求項６について　
　甲第１号証におけるワクチン容量は０．５ｍｌであり（〈1〉−７）、実施例８の「Ｂ」３価のワクチンの処方」で開示されるワクチンロットＩ（ＤＰＴ８／ＰＦＫ／ＡＦ）では抗原タンパク質の含量が１５μｇ、表９のワクチンロットＣ（一番上のもの）では抗原タンパク質の含量が２７．５μｇ（いずれもＰＴ−９Ｋ／１２９Ｇ、ＦＨＡ及び６９ｋｄの合計）であるから、それぞれ、抗原タンパク質濃度が０．０３ｍｇ／ｍｌ、０．０５５ｍｇ／ｍｌとなるので、請求項６の濃度範囲に含まれる。
　　
請求項７について
　「さらに、佐剤（アジュバント）を含む」ことは、甲第１号証に記載されている（〈1〉−５）。
　 　
請求項８について
　「さらに、ボルデテラペルツシスのその他の抗原またはジフテリア若しくは破傷風の抗原を含む」ことは、甲第１号証に記載された事項である（〈1〉−１、〈1〉−３、〈1〉−９）。
　　
請求項９について
　甲第１号証においては、ＰＴ−９Ｋ／１２９Ｇと６９ｋｄとは別個に精製されている（〈1〉−６）〈1〉−８）ことから、両抗原を含む甲第１号証のワクチンを製造するためには、これら各々の抗原を混合することは当然のことである。
　　
　したがって、請求項２〜９の発明は甲第１号証に記載された発明と同一である。
　　
（Ｉ−〈2〉）甲第２号証に記載された発明との対比
［Ｉ−〈2〉−１］：請求項１について
　請求項１の発明と、甲第２号証の特許請求の範囲１に記載された発明（〈2〉−１）を対比すると、後者における「無毒化されたリンパ球増多因子（ＬＰＦ）」は前者における『トキソイド化されたリンパ球促進因子』に、また後者における「６９キロダルトン外層膜タンパク質」は前者における『69kDa 抗原』に相当することは明らかであり、甲第２号証のものが百日咳菌即ちＢｏｒｄｅｔｅｌｌａ　ｐｅｒｔｕｓｓｉｓ由来のものであることも明らかである。
　そして、甲第２号証には、相乗的組合せ物に該当する６９ｋＤａ抗原とトキソイド化ＬＰＦを１０：１〜１：１０の重量比の範囲内で含むワクチンが開示されている。（〈2〉−２、〈2〉−８）
　してみれば、両発明は、『ボルデテラペルツシス（Ｂｏｒｄｅｔｅｌｌａ　ｐｅｒｔｕｓｓｉｓ）の６９ｋＤａ抗原とボルデテラペルツシスのトキソイド化されたリンパ球促進因子との相乗的組合せ物を含むワクチン』である点で一致する。
　したがって、請求項１の発明は甲第２号証と同一である。
　　
［Ｉ−〈2〉−２］：請求項２、３、５、７〜９について
請求項２について
　甲第２号証のワクチンにおける69kDタンパク質は、組換えＤＮＡ技術の使用により精製され、ボルデテラ（Ｂｏｒｄｅｔｅｌｌａ）、大腸菌（Ｅ．Ｃｏｌｉ）などの適当な宿主細胞中で発現されたものである（〈2〉−３）。
　　
請求項３について
　甲第２号証には、請求項３の発明と同じ「ホルムアルデヒド、過酸化水素、グルタルアルデヒド」などによる処理のような慣用の化学的無毒化方法を使用できる旨が記載されている（〈2〉−４）。
　　
請求項５について
『さらに、非経口投与に適した薬学的に許容され得る液体賦形剤を含む』に相当するものとして、甲第２号証に液体賦形剤を含む旨の記載がある（〈2〉−５）。
　　
請求項７について
甲第２号証には、請求項７の発明と同じく佐剤を含む旨の記載がある（〈2〉−５）。
　　
請求項８について
　甲第２号証には、ボルデテラペルツシスのその他の抗原として百日咳菌抗原糸状赤血球凝集素（ＦＨＡ）を含有すること、並びに、ジフテリア若しくは破傷風の抗原としてジフテリアトキソイド、破傷風トキソイドを包含する多価ワクチンの記載があり（〈2〉−１、〈2〉−６）、これは請求項８と同一のものである。
　　
請求項９について
　甲第２号証には各成分を別個に得、これを混合してワクチンを得るという、請求項９の発明と同一の発明が開示されている（〈2〉−１、〈2〉−７）。
　　
（Ｉ−〈3〉）：特許法２９条の２の規定違反についての結論
　以上のとおり、請求項１−９の発明は、いずれも、甲第１号証に記載された発明と同一である。また、請求項１−３、５、７−９の発明は、いずれも、甲第２号証に記載された発明と同一である。
　　
（ＩＩ）特許法第２９条第１項第３号
（ＩＩ−〈1〉）甲第７号証との対比 
［ＩＩ−〈1〉−１］：請求項１について
　ｉ）甲第７号証の表ＩＩＩには、抗百日咳菌ワクチンとして、ボルデテラペルツシスのＰＴ（ホルムアルデヒドによるトキソイド化）と６９ｋとの組合せ、ＰＴ（ホルムアルデヒドによるトキソイド化）とＦＨＡと６９ｋとの組合せ、ＰＴ（ＰＴ遺伝子の遺伝子操作によるトキソイド化）とＦＨＡと６９ｋとの組合せが記載されている。
　ここに、甲第７号証における「ＰＴ（ホルムアルデヒドによるトキソイド化、ＰＴ遺伝子の遺伝子操作によるトキソイド化）」が、請求項１の発明にいうトキソイド化されたリンパ球促進因子であることは当業者に広く知られていることである。
　甲第７号証には、「しかしながら、ic  チャレンジで判定したように、PT単独では全細胞ワクチンより有効性が低い。１以上の他の抗原（例えば、69K タンパク質）を添加したときにのみ、非細胞ワクチンの効力は全細胞ワクチンの効力に接近する。これらの観察に基づいて、種々の非細胞ワクチンが提案され（表III）、それらのうちの幾つかの安全性及び有効性が小児で試験された。」（１３２７頁右欄６−１２行）と記載され、ＬＰＦと６９ｋＤａ抗原等の他の抗原との組合せにより、その効力が全細胞ワクチンの効力とほぼ同等になること、そのような知見に基づき、６９ｋＤａ抗原とトキソイド化ＬＰＦを含むワクチン（表ＩＩＩ参照）が実際に開発されたことが記載されており、全細胞ワクチンと同等の効力を示すものであるから、効果の点でも、請求項１の発明と異なるものではない。
　したがって、甲第７号証には、請求項１の発明の構成成分を含むワクチンが記載されており、請求項１の発明は甲第７号証に記載された発明である。
　　
［ＩＩＩ−〈1〉−２］：請求項３、５，８及び９について
請求項３について
　甲第７号証の表ＩＩＩには、ＰＴ（リンパ球促進因子）のトキソイド化として、請求項３の発明と同じホルムアルデヒド、グルタルアルデヒド、過酸化水素による処理が記載されている。
　　
請求項５について
　甲第７号証の表ＩＩＩには、請求項５の発明の要件である、ワクチンが非経口投与に適した薬学的に許容され得る液体賦形剤を含むことについての直接的記載はないが、この種のワクチンは通常非経口投与であるから、当該ワクチンが被経口投与に適した薬学的に許容され得る液体賦形剤を含むことは当然のことである。
　
請求項８について
　甲第７号証の表ＩＩＩには、請求項８の発明の要件である、ボルデテラペルツシスのその他の抗原としてＦＨＡをさらに含むワクチンが記載されている。
　
請求項９について
　甲第７号証の表ＩＩＩに示される選択的なトキソイド化（即ち、ＬＰＦ（ＰＴ）のみのトキソイド化）を実現するためには、ワクチンの製造に際し、ＬＰＦをトキソイド化した後、６９ｋＤａと混合するのは当然である。
　
（ＩＩ−〈2〉）：特許法第２９条第１項第３号についての結論
　以上のとおり、請求項１、３、５、８及び９の発明は、特許出願前に頒布された刊行物に記載された発明であるから、特許法第２９条第１項第３号に該当する。
　
（ＩＩＩ）特許法第２９条第２項
（ＩＩＩ−〈1〉）甲第４、５，８及び９号証に記載された発明との対比 
［ＩＩＩ−〈1〉−１］：請求項１について
　甲第８号証には、武田により製造されたＴタイプ非細胞ワクチンは、ボルデテラペルツシス抽出物のショ糖勾配精製製剤であり、百日咳トキシン［ＰＴ：リンパ球促進因子（ＬＰＦ）と同義］、繊維状ヘマグルチニン及びフィムブリエを含有しており、重量比で５％の69-kD OMPを含有することが記載されており、毒性の強いＬ百日咳トキシンＰＦをトキソイド化することは、当該技術分野における周知の事項であるから、百日咳トキシン及び６９ｋＤａ抗原を含むワクチンにおいて、毒性を低減させるために百日咳トキシンＬＰＦをトキソイド化したものとすることは、当業者が容易になし得ることである。
　また、甲第４号証には、ＬＰＦ、ＦＨＡ、及び少量のその他のタンパク質を含有する第１世代の非細胞ワクチンに対し、第３世代のワクチンでは、他の精製された抗原性コンポーネントを加えてもよいとして、その候補として、外膜タンパク質が指摘されている（〈4〉-2）。そして、甲第９号証には、百日咳菌感染による免疫形成に際し、ＦＨＡ及びＰＴ（百日咳トキシン：リンパ球促進因子と同義）以外の百日咳菌コンポーネント、特に、６９ｋＤタンパク質及び幾つかのＯＭＰに応答する抗体を誘導するとの研究成果を踏まえて、これらの抗体が免疫形成に際立った貢献をするかもしれないとの推定がされている（〈9〉-2）から、ＬＰＦ、ＦＨＡ及び少量のその他のタンパク質を含有する第１世代の非細胞ワクチンに、さらに加える抗原性コンポーネントとして、外膜タンパク質である上記６９ｋＤａタンパク質を選ぶことは、当業者が容易に想到し得ることである。
　以上のとおり、請求項１の発明は、出願前に頒布された刊行物である甲第８号証に記載された発明に基づいて、また甲第４号証及び甲第９号証に記載された発明に基づいて、当業者が容易に発明をすることができたものである。
　
［ＩＩＩ−〈1〉−２］：請求項２〜９について
請求項２について
　６９ｋＤａ抗原のＤＮＡ配列が決定されていたことは明らかであるので、69kDa 抗原の入手に際し、当該ＤＮＡ配列に基づき組換えＤＮＡ技術を使用することは当業者であれば容易に想到し得るものである。
　
請求項３について
　トキソイド化として、ホルムアルデヒド、グルタルアルデヒド、過酸化水素等による処理が可能であることは当該技術分野において周知の事項であるから、ＬＰＦに対し当該処理を行なうことは、当業者が容易に想到し得るところである。
　　
請求項４について
　請求項４の発明は、『６９ｋＤａ抗原とトキソイド化されたリンパ球促進因子の重量比が、約１：１である請求項１〜３のいずれかに記載のワクチン』であるところ、両抗原の重量比は、当業者が任意に設定し得るものである。
　
請求項５について
　請求項５の発明は、『さらに、非経口投与に適した薬学的に許容され得る液体賦形剤を含む請求項１〜４のいずれかに記載のワクチン』であるところ、非経口投与に適した薬学的に許容され得る液体賦形剤をワクチンに含ませることは周知の事項である。
　　
請求項６について
　請求項６の発明は、『抗原タンパク質の濃度が、０．０３〜２ｍｇ／ｍｌである請求項５に記載のワクチン』であるところ、当業者であれば抗原タンパク質の濃度を任意に適切に設定し得るものであり、また、該特定の濃度を選択したことによって、格別に顕著な効果を奏するべき根拠もない。
　　
請求項７−８について
　請求項７の発明における『さらに、佐剤を含むワクチン』である点、請求項８の発明における『さらに、ボルデテラペルツシスのその他の抗原またはジフテリア若しくは破傷風の抗原を含むワクチン』である点は、甲第５号証における「ジフテリアトキソイド及び破傷風トキソイドと組み合わせてアルミニウム塩に吸着させた、リンパ球増多促進因子、繊維状ヘマグルチニン、凝集原、及び69-kd 外膜タンパク質を含有する非細胞百日咳ワクチンの臨床効果を家族内感染試験で評価した。・・・」（〈5〉-1）との記載、及び上記アルミニウム塩が佐剤の一つであることから、当業者であれば容易に想到し得るものである。
　　
請求項９について
　請求項９の発明は、『ボルデテラペルツシスの６９ｋＤａ抗原とボルデテラペルツシスのトキソイド化されたリンパ球促進因子とを、その相乗的組合せを与えるような量で混合することを含む請求項１に記載のワクチンの製造方法』であるところ、[ＩＶ−〈1〉−１] に述べた通り、請求項１の発明のワクチンは当業者が容易に想到し得るものである。したがって、そのようなワクチンの製造に際して、ボルデテラペルツシスの６９ｋＤａ抗原とボルデテラペルツシスのトキソイド化ＬＰＦとを適切な量で混合することは当業者にとって容易に想到することができる。
　　
（ＩＩＩ−〈2〉）：特許法第２９条第２項の規定違反についての結論
　以上のとおり、請求項１−９の発明は、いずれも、本件特許出願前に頒布された甲第４，５，８，９号証刊行物に記載された発明に基づいて当業者が容易に発明をすることができたものであるから、特許法第２９条第２項の規定に違反する。
　　
６．むすび　
　以上のとおりであるので、本件請求項１−９に係る発明の特許は、特許法第１２３条第１項第２号に該当し、無効にすべきものである。
　審判に関する費用については、特許法第１６９条第２項の規定で準用する民事訴訟法第６１条の規定を適用して、被請求人が負担すべきものとする。
　　
　よって、結論のとおり審決する。