【手続補正書】
【提出日】平成21年12月4日(2009.12.4)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
ｉ）ＥＸ2Ｘ3Ｘ4ＡＸ6Ｘ7ＥＩＸ10  Ｘ11ＬＰＮＬＮＸ17Ｘ18ＱＸ20  Ｘ21ＡＦＩＸ25ＳＬＸ28Ｄ
［配列中、相互に独立して、
Ｘ2はＭ、Ｆ、Ｖ、Ｌ、Ｉ、およびＳから選択され；
Ｘ3はＷ、Ｄ、Ｅ、およびＬから選択され；
Ｘ4はＩ、Ｖ、Ｇ、Ｓ、Ｍ、Ｌ、Ａ、Ｔ、Ｎ、Ｄ、およびＷから選択され；
Ｘ6はＷ、Ｖ、Ｌ、Ｉ、Ｍ、およびＳから選択され；
Ｘ7はＤ、Ｅ、Ｎ、およびＫから選択され；
Ｘ10はＲ、Ｇ、Ｈ、およびＫから選択され；
Ｘ11はＤ、Ｎ、Ｅ、Ｙ、およびＳから選択され；
Ｘ17はＧ、Ｗ、およびＡから選択され；
Ｘ18はＷ、Ｇ、およびＡから選択され；
Ｘ20はＭ、Ｌ、Ｆ、Ａ、およびＥから選択され；
Ｘ21はＴ、Ｄ、Ｎ、Ａ、およびＱから選択され；
Ｘ25はＡ、Ｓ、Ｎ、Ｇ、およびＬから選択され；そして
Ｘ28はＬ、Ｗ、Ｖ、Ｆ、およびＡから選択される］
ならびに
ii）ｉ）において規定される配列と少なくとも８５％の同一性を有するアミノ酸配列、から選択されるアミノ酸配列からなる上皮成長因子受容体結合モチーフ、ＥＢＭを含み、最大１０μＭの相互作用のＫD値でＥＧＦＲに結合する、上皮成長因子受容体（ＥＧＦＲ）結合ポリペプチド。
【請求項２】
Ｘ2がＭである、請求項１に記載のＥＧＦＲ結合ポリペプチド。
【請求項３】
Ｘ3がＷである、請求項１または２に記載のＥＧＦＲ結合ポリペプチド。
【請求項４】
Ｘ4がＩ、Ｖ、Ｇ、およびＳから選択される、請求項１〜３のいずれかに記載のＥＧＦＲ結合ポリペプチド。
【請求項５】
Ｘ6がＶおよびＷから選択される、請求項１〜４のいずれかに記載のＥＧＦＲ結合ポリペプチド。
【請求項６】
Ｘ10がＲおよびＧから選択される、請求項１〜５のいずれかに記載のＥＧＦＲ結合ポリペプチド。
【請求項７】
Ｘ11がＤ、Ｎ、およびＥから選択される、請求項１〜６のいずれかに記載のＥＧＦＲ結合ポリペプチド。
【請求項８】
Ｘ17がＷおよびＧから選択される、請求項１〜７のいずれかに記載のＥＧＦＲ結合ポリペプチド。
【請求項９】
Ｘ18がＷおよびＧから選択される、請求項１〜８のいずれかに記載のＥＧＦＲ結合ポリペプチド。
【請求項１０】
Ｘ18がＷである、請求項９に記載のＥＧＦＲ結合ポリペプチド。
【請求項１１】
Ｘ20がＭである、請求項１〜１０のいずれかに記載のＥＧＦＲ結合ポリペプチド。
【請求項１２】
Ｘ21がＴおよびＤから選択される、請求項１〜１１のいずれかに記載のＥＧＦＲ結合ポリペプチド。
【請求項１３】
Ｘ21がＴである、請求項１２に記載のＥＧＦＲ結合ポリペプチド。
【請求項１４】
Ｘ25がＡ、Ｓ、およびＮから選択される、請求項１〜１３のいずれかに記載のＥＧＦＲ結合ポリペプチド。
【請求項１５】
Ｘ28がＬおよびＷから選択される、請求項１〜１４のいずれかに記載のＥＧＦＲ結合ポリペプチド。
【請求項１６】
Ｘ18がＷであり、Ｘ21がＴである、請求項１〜１５のいずれかに記載のＥＧＦＲ結合ポリペプチド。
【請求項１７】
Ｘ18がＷであり、Ｘ20がＭである、請求項１〜１６のいずれかに記載のＥＧＦＲ結合ポリペプチド。
【請求項１８】
アミノ酸配列ｉ）が以下の９つの条件Ｉ〜ＩＸ：
Ｉ）        Ｘ2がＭである；
ＩＩ）      Ｘ3がＷである；
ＩＩＩ）    Ｘ6がＷである；
ＩＶ）      Ｘ10がＲである；
Ｖ）        Ｘ17がＧである；
ＶＩ）      Ｘ18がＷである；
ＶＩＩ）    Ｘ20がＭである；
ＶＩＩＩ）  Ｘ21がＴである；
ＩＸ）      Ｘ28がＬである、
の少なくとも６つを満たす、請求項１〜１７のいずれかに記載のＥＧＦＲ結合ポリペプチド。
【請求項１９】
アミノ酸配列ｉ）が９つの条件Ｉ〜ＩＸの少なくとも７つを満たす、請求項１８に記載
のＥＧＦＲ結合ポリペプチド。
【請求項２０】
アミノ酸配列ｉ）が９つの条件Ｉ〜ＩＸの少なくとも８つを満たす、請求項１９に記載のＥＧＦＲ結合ポリペプチド。
【請求項２１】
アミノ酸配列ｉ）が
ＥＭＷＸ4ＡＷＸ7ＥＩＲ  Ｘ11ＬＰＮＬＮＧＷＱＭ  ＴＡＦＩＸ25ＳＬＬＤ
である、請求項２０に記載のＥＧＦＲ結合ポリペプチド。
【請求項２２】
アミノ酸配列ｉ）が以下の５つの条件Ｖ〜ＶＩＩＩおよびＸ：
Ｖ）        Ｘ17がＧである；
ＶＩ）      Ｘ18がＷである；
ＶＩＩ）    Ｘ20がＭである；
ＶＩＩＩ）  Ｘ21がＴである；
Ｘ）        Ｘ25がＡである、
の少なくとも３つを満たす、請求項１〜１７のいずれか一項に記載のＥＧＦＲ結合ポリペプチド。
【請求項２３】
アミノ酸配列ｉ）が５つの条件Ｖ〜ＶＩＩＩおよびＸの少なくとも４つを満たす、請求項２２に記載のＥＧＦＲ結合ポリペプチド。
【請求項２４】
アミノ酸配列ｉ）が
ＥＸ2Ｘ3Ｘ4ＡＸ6Ｘ7ＥＩＸ10  Ｘ11ＬＰＮＬＮＧＷＱＭ  ＴＡＦＩＡＳＬＸ28Ｄ
である、請求項２３に記載のＥＧＦＲ結合ポリペプチド。
【請求項２５】
アミノ酸配列ｉ）が
ＥＸ2Ｘ3Ｘ4ＡＸ6Ｘ7ＥＩＧ  Ｘ11ＬＰＮＬＮＷＧＱＸ20  Ｘ21ＡＦＩＸ25ＳＬＷＤ
である、請求項１〜１７のいずれか一項に記載のＥＧＦＲ結合ポリペプチド。
【請求項２６】
アミノ酸配列ｉ）が
ＥＸ2Ｘ3ＩＡＶＸ7ＥＩＧ  ＥＬＰＮＬＮＷＧＱＸ20  ＤＡＦＩＮＳＬＷＤ
である、請求項２５に記載のＥＧＦＲ結合ポリペプチド。
【請求項２７】
アミノ酸配列ｉ）が配列番号１〜１６３から選択される、請求項１〜２６のいずれかに記載のＥＧＦＲ結合ポリペプチド。
【請求項２８】
アミノ酸配列ｉ）が配列番号３３、配列番号４８、配列番号５７、配列番号８７、配列番号８８、および配列番号１４７から選択される、請求項２７に記載のＥＧＦＲ結合ポリペプチド。
【請求項２９】
ＥＧＦＲ結合モチーフが３ヘリックスバンドルタンパク質ドメインの一部を形成する、請求項１〜２８のいずれかに記載のＥＧＦＲ結合ポリペプチド。
【請求項３０】
ＥＧＦＲ結合モチーフが、主として、３ヘリックスバンドルタンパク質ドメイン内の二つのアルファヘリックスおよびそれらを結ぶループの一部を形成する、請求項２９に記載のＥＧＦＲ結合ポリペプチド。
【請求項３１】
３ヘリックスバンドルタンパク質ドメインが、細菌受容体タンパク質のドメインから選択される、請求項３０に記載のＥＧＦＲ結合ポリペプチド。
【請求項３２】
３ヘリックスバンドルタンパク質ドメインが、黄色ブドウ球菌由来のプロテインＡのドメインまたはその誘導体のドメインから選択される、請求項３１に記載のＥＧＦＲ結合ポリペプチド。
【請求項３３】
ＡＤＮＮＦＮＫ−［ＥＢＭ］−ＤＰＳＱＳＡＮＬＬＳＥＡＫＫＬＮＥＳＱＡＰＫ；
ＡＤＮＫＦＮＫ−［ＥＢＭ］−ＤＰＳＱＳＡＮＬＬＡＥＡＫＫＬＮＤＡＱＡＰＫ；
ＡＤＮＫＦＮＫ−［ＥＢＭ］−ＤＰＳＶＳＫＥＩＬＡＥＡＫＫＬＮＤＡＱＡＰＫ；
ＡＤＡＱＱＮＮＦＮＫ−［ＥＢＭ］−ＤＰＳＱＳＴＮＶＬＧＥＡＫＫＬＮＥＳＱＡＰＫ；
ＡＱＨＤＥ−［ＥＢＭ］−ＤＰＳＱＳＡＮＶＬＧＥＡＱＫＬＮＤＳＱＡＰＫ；および
ＶＤＮＫＦＮＫ−［ＥＢＭ］−ＤＰＳＱＳＡＮＬＬＡＥＡＫＫＬＮＤＡＱＡＰＫ；
から選択されるアミノ酸配列を含み、［ＥＢＭ］は請求項１〜２８のいずれか一項に規定されるＥＧＦＲ結合モチーフである、請求項３２に記載のＥＧＦＲ結合ポリペプチド。
【請求項３４】
アミノ酸配列が、以下：
iii）配列番号１６４〜３２６から選択される；
iv） 配列番号１６４〜３２６から選択される配列に対して８５％またはそれ以上の同一性を有するアミノ酸配列である、
から選択される定義の一つを満たす配列を含む、ＥＧＦＲ結合ポリペプチド。
【請求項３５】
アミノ酸配列が、以下：
ｖ）配列番号１９６、配列番号２１１、配列番号２２０、配列番号２５０、配列番号２５１、および配列番号３１０から選択される
vi）配列番号１９６、配列番号２１１、配列番号２２０、配列番号２５０、配列番号２５１、および配列番号３１０から選択される配列に対して８５％またはそれ以上の同一性を有するアミノ酸配列である、
から選択される定義の一つを満たす配列を含む、請求項３４に記載のＥＧＦＲ結合ポリペプチド。
【請求項３６】
Ｃ末端および／またはＮ末端アミノ酸が伸長された、請求項１〜３５のいずれかに記載のＥＧＦＲ結合ポリペプチド。
【請求項３７】
アミノ酸伸長または各アミノ酸伸長が、ポリペプチドの生成、精製、インビボもしくはインビトロでの安定性、結合、または検出を向上させる、請求項３６に記載のＥＧＦＲ結合ポリペプチド。
【請求項３８】
伸長部分が、連鎖球菌プロテインＧのアルブミン結合ドメインまたはその誘導体のドメインを含み、治療用途におけるＥＧＦＲ結合ポリペプチドの半減期を向上させる、請求項３７に記載のＥＧＦＲ結合ポリペプチド。
【請求項３９】
最大１×１０-6Ｍの相互作用のＫD値でＥＧＦＲに結合する、請求項１〜３８のいずれかに記載のＥＧＦＲ結合ポリペプチド。
【請求項４０】
最大１×１０-7Ｍの相互作用のＫD値でＥＧＦＲに結合する、請求項３９に記載のＥＧＦＲ結合ポリペプチド。
【請求項４１】
ＥＧＦＲの細胞外ドメインに結合する、請求項１〜４０のいずれかに記載のＥＧＦＲ結合ポリペプチド。
【請求項４２】
配列番号３２９に対応するＥＧＦＲの細胞外ドメインの一部に結合する、請求項４１に
記載のＥＧＦＲ結合ポリペプチド。
【請求項４３】
請求項１〜４２のいずれかに記載のＥＧＦＲ結合ポリペプチドのフラグメントを含む、ＥＧＦＲ結合ポリペプチド。
【請求項４４】
フラグメントが請求項１〜４２のいずれか一項に記載のポリペプチドのＮ末端短縮を含む、請求項４３に記載のＥＧＦＲ結合ポリペプチド。
【請求項４５】
Ｎ末端短縮が４アミノ酸以下である、請求項４４に記載のＥＧＦＲ結合ポリペプチド。
【請求項４６】
請求項１〜４５のいずれかに記載のポリペプチドをコードするポリヌクレオチド。
【請求項４７】
請求項４６に記載のポリヌクレオチドを発現させることを含む、請求項１〜４５のいずれか一項に記載のポリペプチドの製造方法。
【請求項４８】
請求項１〜４５のいずれか一項に記載のＥＧＦＲ結合ポリペプチドおよび検出剤の組み合わせ。
【請求項４９】
検出剤が、放射線イメージングにおいて使用するための放射性物質である、請求項４８に記載の組み合わせ。
【請求項５０】
放射性物質が放射性核種である、請求項４９に記載の組み合わせ。
【請求項５１】
検出剤が酵素である、請求項４８に記載の組み合わせ。
【請求項５２】
請求項１〜４５のいずれか一項に記載のＥＧＦＲ結合ポリペプチドおよび治療剤の組み合わせ。
【請求項５３】
ＥＧＦＲ結合ポリペプチドおよび検出剤または治療剤が共有結合により一緒に結合されている、請求項４８〜５２のいずれか一項に記載の組み合わせ。
【請求項５４】
ＥＧＦＲ結合ポリペプチドおよび検出剤または治療剤が融合タンパク質として発現される、請求項４８〜５３のいずれか一項に記載の組み合わせ。
【請求項５５】
請求項４８〜５４のいずれか一項に記載の組み合わせを放射線イメージング剤として使用する、放射線イメージング方法。
【請求項５６】
ＥＧＦＲを含む疑いのあるサンプルを準備し、請求項１〜４５のいずれかに記載のＥＧＦＲ結合ポリペプチドまたは請求項４８〜５４のいずれかに記載の組み合わせとサンプルを接触させ、サンプル中のＥＧＦＲの存在を示すポリペプチドまたは組み合わせへの結合を検出することを含む、ＥＧＦＲの検出方法。
【請求項５７】
請求項１〜４５のいずれかに記載のＥＧＦＲ結合ポリペプチドまたは請求項４８〜５４のいずれかに記載の組み合わせとサンプルを接触させることを含み、それによってＥＧＦＲがポリペプチドに結合し、これをサンプルから除去することができる、サンプルからのＥＧＦＲの分離または捕捉方法。
【請求項５８】
被検体由来のサンプルを、請求項１〜４５のいずれかに記載のＥＧＦＲ結合ポリペプチドまたは請求項４８〜５４のいずれかに記載の組み合わせと接触させ、ポリペプチドまたは組み合わせへの結合を検出することを含む、哺乳動物被検体におけるＥＧＦＲの存在を
決定するためのインビトロ診断方法。
【請求項５９】
被検体がヒトである、請求項５８に記載の方法。
【請求項６０】
医薬として使用するための、請求項１〜４５のいずれかに記載のＥＧＦＲ結合ポリペプチド。
【請求項６１】
医薬として使用するための、請求項４８〜５４のいずれかに記載の組み合わせ。
【請求項６２】
診断剤として使用するための、請求項１〜４５のいずれかに記載のＥＧＦＲ結合ポリペプチド。
【請求項６３】
診断剤として使用するための、請求項４８〜５４のいずれかに記載の組み合わせ。
【請求項６４】
癌のインビボ診断のための診断剤の製造のための、請求項１〜４５のいずれかに記載のＥＧＦＲ結合ポリペプチドまたは請求項４８〜５４のいずれかに記載の組み合わせの使用。
【請求項６５】
癌の処置のための医薬の製造のための、請求項１〜４７のいずれかに記載のＥＧＦＲ結合ポリペプチドまたは請求項４８〜５４のいずれかに記載の組み合わせの使用。