(57)【要約】少なくとも１つのムチン調節性微生物と、少なくとも１つのブチレート産生微生物とを含む組成物の投与は、前糖尿病または２型糖尿病を有する対象に対する治療効果を提供することができる。治療効果は、ヘモグロビンＡ１Ｃレベルの低下、食事負荷試験後のグルコース曲線下面積の低下、または空腹時グルコースレベルの低下を含んでもよい。一部の態様では、ヘモグロビンＡ１Ｃ（ｈＡ１Ｃ）レベルが上昇した対象を処置する方法であって、対象に、少なくとも１つの単離および精製されたブチレート産生微生物（ｍｉｃｒｏｂｅ）と、少なくとも１つの単離および精製されたムチン調節性微生物とを含む組成物を投与することを含み、それによって、対象中のｈＡ１Ｃレベルを、総ヘモグロビンの少なくとも０．２％低下させる、方法が本明細書で開示される。
2022502373.tif 000002
【特許請求の範囲】
【請求項１】
ヘモグロビンＡ１Ｃ（ｈＡ１Ｃ）レベルが上昇した対象を処置する方法であって、前記対象に、少なくとも１つの単離および精製されたブチレート産生微生物と、少なくとも１つの単離および精製されたムチン調節性微生物とを含む組成物を投与することを含み、それによって、前記対象中のｈＡ１Ｃレベルを、総ヘモグロビンの少なくとも０．２％低下させる、方法。
【請求項２】
前記組成物の投与が、食事負荷試験後の前記対象のグルコース曲線下面積（ＡＵＣ）を、対照と比較して少なくとも１０％低下させる、請求項１に記載の方法。
【請求項３】
前記対照が、前記投与前の前記対象について測定される対照ＡＵＣである、請求項２に記載の方法。
【請求項４】
前記対照が、前記組成物を投与されていない第２の対象に由来する対照ＡＵＣである、請求項２に記載の方法。
【請求項５】
前記対象が、２型糖尿病または前糖尿病を有するか、または有することが疑われる、請求項１から４のいずれか一項に記載の方法。
【請求項６】
前記少なくとも１つの単離および精製されたブチレート産生微生物が、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉ、およびＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍのうちのいずれか１つまたは複数に由来するｒＲＮＡ配列に対する少なくとも約８５％の配列同一性を有する１つまたは複数のｒＲＮＡ配列を含む、請求項１から５のいずれか一項に記載の方法。
【請求項７】
前記少なくとも１つの単離および精製されたブチレート産生微生物が、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉ、およびＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍのうちのいずれか１つまたは複数に由来するｒＲＮＡ配列に対する少なくとも約９０％の配列同一性を有する１つまたは複数のｒＲＮＡ配列を含む、請求項１から５のいずれか一項に記載の方法。
【請求項８】
前記少なくとも１つの単離および精製されたブチレート産生微生物が、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉ、およびＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍのうちのいずれか１つまたは複数に由来するｒＲＮＡ配列に対する少なくとも約９７％の配列同一性を有する１つまたは複数のｒＲＮＡ配列を含む、請求項１から５のいずれか一項に記載の方法。
【請求項９】
前記少なくとも１つの単離および精製されたブチレート産生微生物が、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉ、およびＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍからなる群から選択される１つまたは複数の微生物を含む、請求項１から８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１０】
前記少なくとも１つの単離および精製されたムチン調節性微生物が、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａのｒＲＮＡ配列に対する少なくとも約８５％の配列同一性を含むｒＲＮＡ配列を含む、請求項１から９のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１１】
前記少なくとも１つの単離および精製されたムチン調節性微生物が、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａのｒＲＮＡ配列に対する少なくとも約９０％の配列同一性を含むｒＲＮＡ配列を含む、請求項１から９のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１２】
前記少なくとも１つの単離および精製されたムチン調節性微生物が、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａのｒＲＮＡ配列に対する少なくとも約９７％の配列同一性を含むｒＲＮＡ配列を含む、請求項１から９のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１３】
前記少なくとも１つの単離および精製されたムチン調節性微生物が、配列番号１〜６のいずれか１つに対する少なくとも約９７％の配列同一性を含むｒＲＮＡ配列を含む、請求項１から９のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１４】
前記少なくとも１つの単離および精製されたムチン調節性微生物が、配列番号１〜６のいずれか１つに対する少なくとも約９９％の配列同一性を含むｒＲＮＡ配列を含む、請求項１から９のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１５】
前記少なくとも１つの単離および精製されたムチン調節性微生物が、配列番号１〜６のいずれか１つであるｒＲＮＡ配列を含む、請求項１から９のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１６】
前記少なくとも１つの単離および精製されたムチン調節性微生物が、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａを含む、請求項１から１５のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１７】
前記対象が２型糖尿病を有する、請求項５から１６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１８】
前記対象が前糖尿病を有する、請求項５から１６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１９】
前記２型糖尿病が初期段階である、請求項５から１７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２０】
前記２型糖尿病が中期段階である、請求項５から１７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２１】
前記２型糖尿病が後期段階である、請求項５から１７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２２】
前記組成物がメトホルミンをさらに含む、請求項１から２１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２３】
前記組成物が治療剤と同時投与される、請求項１から２２のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２４】
前記治療剤がメトホルミンである、請求項２３に記載の方法。
【請求項２５】
前記治療剤がスルホニルウレアである、請求項２３に記載の方法。
【請求項２６】
前記治療剤がインスリンである、請求項２３に記載の方法。
【請求項２７】
前記組成物が治療剤を含む、請求項１から２２のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２８】
前記治療剤がメトホルミンである、請求項２７に記載の方法。
【請求項２９】
前記治療剤がスルホニルウレアである、請求項２７に記載の方法。
【請求項３０】
前記治療剤がインスリンである、請求項２７に記載の方法。
【請求項３１】
前記ｈＡ１Ｃレベルが、前記対象において、総ヘモグロビンの少なくとも０．２％低下する、請求項１から３０のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３２】
前記ｈＡ１Ｃレベルが、前記対象において、総ヘモグロビンの少なくとも０．３％低下する、請求項１から３０のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３３】
前記ｈＡ１Ｃレベルが、前記対象において、総ヘモグロビンの少なくとも０．４％低下する、請求項１から３０のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３４】
前記ｈＡ１Ｃレベルが、前記対象において、総ヘモグロビンの少なくとも０．５％低下する、請求項１から３０のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３５】
前記ｈＡ１Ｃレベルが、前記対象において、総ヘモグロビンの少なくとも０．６％低下する、請求項１から３０のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３６】
前記ｈＡ１Ｃレベルが、前記組成物を投与されていない第２の対象と比較して、前記対象において、総ヘモグロビンの少なくとも０．２％低下する、請求項１から３５のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３７】
前記ｈＡ１Ｃレベルが、前記組成物を投与されていない第２の対象と比較して、前記対象において、総ヘモグロビンの少なくとも０．３％低下する、請求項１から３５のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３８】
前記ｈＡ１Ｃレベルが、前記組成物を投与されていない第２の対象と比較して、前記対象において、総ヘモグロビンの少なくとも０．４％低下する、請求項１から３５のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３９】
前記ｈＡ１Ｃレベルが、前記組成物を投与されていない第２の対象と比較して、前記対象において、総ヘモグロビンの少なくとも０．５％低下する、請求項１から３５のいずれか一項に記載の方法。
【請求項４０】
前記ｈＡ１Ｃレベルが、前記組成物を投与されていない第２の対象と比較して、前記対象において、総ヘモグロビンの少なくとも０．６％低下する、請求項１から３５のいずれか一項に記載の方法。
【請求項４１】
前記グルコースＡＵＣが少なくとも１０％低下する、請求項２から４０のいずれか一項に記載の方法。
【請求項４２】
前記グルコースＡＵＣが少なくとも１５％低下する、請求項２から４０のいずれか一項に記載の方法。
【請求項４３】
前記グルコースＡＵＣが少なくとも２０％低下する、請求項２から４０のいずれか一項に記載の方法。
【請求項４４】
前記グルコースＡＵＣが少なくとも３０％低下する、請求項２から４０のいずれか一項に記載の方法。
【請求項４５】
空腹時グルコースが、前記対象において、少なくとも５％低下する、請求項１から４４のいずれか一項に記載の方法。
【請求項４６】
空腹時グルコースが、前記対象において、少なくとも１０％低下する、請求項１から４４のいずれか一項に記載の方法。
【請求項４７】
空腹時グルコースが、前記対象において、少なくとも２０％低下する、請求項１から４４のいずれか一項に記載の方法。
【請求項４８】
空腹時グルコースが、前記対象において、少なくとも２５％低下する、請求項１から４４のいずれか一項に記載の方法。
【請求項４９】
前記対象がヒトである、請求項１から４８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項５０】
前記対象が併存疾患を有する、請求項１から４９のいずれか一項に記載の方法。
【請求項５１】
前記組成物が、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉのｒＲＮＡ配列に対する少なくとも約８５％の配列同一性を含むｒＲＮＡ配列を有する１つまたは複数の微生物を含む、請求項１から５０のいずれか一項に記載の方法。
【請求項５２】
前記組成物が、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍのｒＲＮＡ配列に対する少なくとも約８５％の配列同一性を含むｒＲＮＡ配列を有する１つまたは複数の微生物を含む、請求項１から５１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項５３】
前記組成物が、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓのｒＲＮＡ配列に対する少なくとも約８５％の配列同一性を含むｒＲＮＡ配列を有する１つまたは複数の微生物を含む、請求項１から５２のいずれか一項に記載の方法。
【請求項５４】
前記組成物が、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉのｒＲＮＡ配列に対する少なくとも約８５％の配列同一性を含むｒＲＮＡ配列を有する１つまたは複数の微生物を含む、請求項１から５３のいずれか一項に記載の方法。
【請求項５５】
前記組成物が、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａのｒＲＮＡ配列に対する少なくとも約８５％の配列同一性を含むｒＲＮＡ配列を有する１つまたは複数の微生物を含む、請求項１から５４のいずれか一項に記載の方法。
【請求項５６】
前記組成物が、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉのｒＲＮＡ配列に対する少なくとも約９０％の配列同一性を含むｒＲＮＡ配列を有する１つまたは複数の微生物を含む、請求項１から５５のいずれか一項に記載の方法。
【請求項５７】
前記組成物が、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍのｒＲＮＡ配列に対する少なくとも約９０％の配列同一性を含むｒＲＮＡ配列を有する１つまたは複数の微生物を含む、請求項１から５６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項５８】
前記組成物が、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓのｒＲＮＡ配列に対する少なくとも約９０％の配列同一性を含むｒＲＮＡ配列を有する１つまたは複数の微生物を含む、請求項１から５７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項５９】
前記組成物が、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉのｒＲＮＡ配列に対する少なくとも約９０％の配列同一性を含むｒＲＮＡ配列を有する１つまたは複数の微生物を含む、請求項１から５８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項６０】
前記組成物が、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａのｒＲＮＡ配列に対する少なくとも約９０％の配列同一性を含むｒＲＮＡ配列を有する１つまたは複数の微生物を含む、請求項１から５９のいずれか一項に記載の方法。
【請求項６１】
前記組成物が、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉのｒＲＮＡ配列に対する少なくとも約９７％の配列同一性を含むｒＲＮＡ配列を有する１つまたは複数の微生物を含む、請求項１から６０のいずれか一項に記載の方法。
【請求項６２】
前記組成物が、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍのｒＲＮＡ配列に対する少なくとも約９７％の配列同一性を含むｒＲＮＡ配列を有する１つまたは複数の微生物を含む、請求項１から６１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項６３】
前記組成物が、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓのｒＲＮＡ配列に対する少なくとも約９７％の配列同一性を含むｒＲＮＡ配列を有する１つまたは複数の微生物を含む、請求項１から６２のいずれか一項に記載の方法。
【請求項６４】
前記組成物が、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉのｒＲＮＡ配列に対する少なくとも約９７％の配列同一性を含むｒＲＮＡ配列を有する１つまたは複数の微生物を含む、請求項１から６３のいずれか一項に記載の方法。
【請求項６５】
前記組成物が、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａのｒＲＮＡ配列に対する少なくとも約９７％の配列同一性を含むｒＲＮＡ配列を有する１つまたは複数の微生物を含む、請求項１から６４のいずれか一項に記載の方法。
【請求項６６】
前記組成物がＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉを含む、請求項１から６５のいずれか一項に記載の方法。
【請求項６７】
前記組成物がＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍを含む、請求項１から６６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項６８】
前記組成物がＢｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓを含む、請求項１から６７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項６９】
前記組成物がＡｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａを含む、請求項１から６８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項７０】
前記組成物がＥｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉを含む、請求項１から６９のいずれか一項に記載の方法。
【請求項７１】
前記組成物がＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍ、およびＢｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓを含む、請求項１から７０のいずれか一項に記載の方法。
【請求項７２】
前記組成物がＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓ、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａ、およびＥｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉを含む、請求項１から７１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項７３】
前記組成物がＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓ、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａ、およびＥｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉを含む、請求項１から７２のいずれか一項に記載の方法。
【請求項７４】
前記組成物がＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓ、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａ、およびＥｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉを含む、請求項１から７３のいずれか一項に記載の方法。
【請求項７５】
前記組成物がＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉ、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａ、およびＥｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉを含む、請求項１から７４のいずれか一項に記載の方法。
【請求項７６】
前記組成物がＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉおよびＢｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓを含む、請求項１から７５のいずれか一項に記載の方法。
【請求項７７】
前記組成物がＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓ、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａ、およびＥｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉを含む、請求項１から７６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項７８】
前記組成物がＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓ、およびＡｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａを含む、請求項１から７７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項７９】
前記組成物がＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓ、およびＡｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａを含む、請求項１から７８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項８０】
前記組成物がＥｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉおよびＡｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａを含む、請求項１から７９のいずれか一項に記載の方法。
【請求項８１】
前記組成物がＢｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉ、およびＡｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａを含む、請求項１から８０のいずれか一項に記載の方法。
【請求項８２】
前記組成物が少なくとも２つの微生物を含む、請求項１から８１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項８３】
前記組成物が少なくとも３つの微生物を含む、請求項１から８１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項８４】
前記組成物が少なくとも４つの微生物を含む、請求項１から８１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項８５】
前記組成物が少なくとも５つの微生物を含む、請求項１から８１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項８６】
前記組成物が、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓ、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａ、およびＥｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉからなる群から選択される少なくとも２つの微生物を含む、請求項１から８１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項８７】
前記組成物が、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓ、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａ、およびＥｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉからなる群から選択される少なくとも３つの微生物を含む、請求項１から８１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項８８】
前記組成物が、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓ、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａ、およびＥｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉからなる群から選択される少なくとも４つの微生物を含む、請求項１から８１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項８９】
前記組成物が単位剤形中にある、請求項１から８８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項９０】
前記組成物が食品または飲料である、請求項１から８９のいずれか一項に記載の方法。
【請求項９１】
前記組成物が栄養補助食品である、請求項１から８９のいずれか一項に記載の方法。
【請求項９２】
前記栄養補助食品がフードバーの形態にある、請求項９１に記載の方法。
【請求項９３】
前記栄養補助食品が粉末の形態にある、請求項９１に記載の方法。
【請求項９４】
前記栄養補助食品が液体の形態にある、請求項９１に記載の方法。
【請求項９５】
前記組成物が医薬組成物である、請求項１から９０のいずれか一項に記載の方法。
【請求項９６】
前記組成物がピルまたはカプセルの形態にある、請求項１から９１または９５のいずれか一項に記載の方法。
【請求項９７】
前記ピルまたはカプセルが、前記ピルまたはカプセルの内容物を、前記対象の回腸、前記対象の結腸、またはそれらの組合せに放出するように設計された腸溶コーティングを含む、請求項９６に記載の方法。
【請求項９８】
それぞれのピルまたはカプセルが、少なくとも１ｘ１０６ＣＦＵの総微生物を含む、請求項９６または９７に記載の方法。
【請求項９９】
それぞれのピルまたはカプセルが、少なくとも１ｘ１０６ＣＦＵの前記少なくとも１つの単離および精製されたムチン調節性微生物を含む、請求項９６から９８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１００】
それぞれのピルまたはカプセルが、少なくとも１ｘ１０６ＣＦＵの前記少なくとも１つの単離および精製されたブチレート産生微生物を含む、請求項９６から９９のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１０１】
それぞれのピルまたはカプセルが、少なくとも１ｘ１０６ＣＦＵのＡｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａ、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａに由来するｒＲＮＡに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列を含む微生物、または配列番号１〜６のいずれか１つに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列を含む微生物を含む、請求項９６から１００のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１０２】
それぞれのピルまたはカプセルが、少なくとも１ｘ１０６ＣＦＵのＥｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉまたはＥｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉに由来するｒＲＮＡに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列を含む微生物を含む、請求項９６から１０１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１０３】
それぞれのピルまたはカプセルが、少なくとも１ｘ１０６ＣＦＵのＢｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓまたはＢｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓに由来するｒＲＮＡに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列を含む微生物を含む、請求項９６から１０２のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１０４】
それぞれのピルまたはカプセルが、少なくとも１ｘ１０６ＣＦＵのＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉまたはＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉに由来するｒＲＮＡに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列を含む微生物を含む、請求項９６から１０３のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１０５】
それぞれのピルまたはカプセルが、少なくとも１ｘ１０６ＣＦＵのＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍまたはＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍに由来するｒＲＮＡに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列を含む微生物を含む、請求項９６から１０４のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１０６】
それぞれのピルまたはカプセルが、約１ｘ１０６ＣＦＵ〜１ｘ１０１２ＣＦＵの総微生物を含む、請求項９６から１０５のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１０７】
それぞれのピルまたはカプセルが、約１ｘ１０６ＣＦＵ〜１ｘ１０１２ＣＦＵの前記少なくとも１つの単離および精製されたムチン調節性微生物を含む、請求項９６から１０６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１０８】
それぞれのピルまたはカプセルが、約１ｘ１０６ＣＦＵ〜１ｘ１０１２ＣＦＵの前記少なくとも１つの単離および精製されたブチレート産生微生物を含む、請求項９６から１０７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１０９】
それぞれのピルまたはカプセルが、約１ｘ１０６ＣＦＵ〜１ｘ１０１２ＣＦＵのＡｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａ、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａに由来するｒＲＮＡに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列を含む微生物、または配列番号１〜６のいずれか１つに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列を含む微生物を含む、請求項９６から１０８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１１０】
それぞれのピルまたはカプセルが、約１ｘ１０６ＣＦＵ〜１ｘ１０１２ＣＦＵのＥｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉまたはＥｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉに由来するｒＲＮＡに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列を含む微生物を含む、請求項９６から１０９のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１１１】
それぞれのピルまたはカプセルが、約１ｘ１０６ＣＦＵ〜１ｘ１０１２ＣＦＵのＢｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓまたはＢｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓに由来するｒＲＮＡに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列を含む微生物を含む、請求項９６から１１０のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１１２】
それぞれのピルまたはカプセルが、約１ｘ１０６ＣＦＵ〜１ｘ１０１２ＣＦＵのＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉまたはＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉに由来するｒＲＮＡに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列を含む微生物を含む、請求項９６から１１１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１１３】
それぞれのピルまたはカプセルが、約１ｘ１０６ＣＦＵ〜１ｘ１０１２ＣＦＵのＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍまたはＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍに由来するｒＲＮＡに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列を含む微生物を含む、請求項９６から１１２のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１１４】
１用量の前記組成物が、少なくとも１つの、１つのピルまたはカプセルを含む、請求項１から１１３のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１１５】
１用量の前記組成物が、少なくとも２つの前記ピルまたはカプセルを含む、請求項１から１１３のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１１６】
１用量の前記組成物が、１〜６つの前記ピルまたはカプセルを含む、請求項１から１１３のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１１７】
前記組成物が少なくとも毎週、前記対象に投与される、請求項１から１１６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１１８】
前記組成物が少なくとも毎日、前記対象に投与される、請求項１から１１６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１１９】
前記組成物が少なくとも１日２回、前記対象に投与される、請求項１から１１６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１２０】
前記組成物の各用量が、少なくとも１ｘ１０６ＣＦＵの総微生物を含む、請求項１から１１９のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１２１】
前記組成物の各用量が、少なくとも１ｘ１０６ＣＦＵの前記少なくとも１つの単離および精製されたムチン調節性微生物を含む、請求項１から１２０のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１２２】
前記組成物の各用量が、少なくとも１ｘ１０６ＣＦＵの前記少なくとも１つの単離および精製されたブチレート産生微生物を含む、請求項１から１２１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１２３】
前記組成物の各用量が、少なくとも１ｘ１０６ＣＦＵのＡｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａ、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａに由来するｒＲＮＡに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列を含む微生物、または配列番号１〜６のいずれか１つに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列を含む微生物を含む、請求項１から１２２のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１２４】
前記組成物の各用量が、少なくとも１ｘ１０６ＣＦＵのＥｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉまたはＥｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉに由来するｒＲＮＡに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列を含む微生物を含む、請求項１から１２３のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１２５】
前記組成物の各用量が、少なくとも１ｘ１０６ＣＦＵのＢｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓまたはＢｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓに由来するｒＲＮＡに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列を含む微生物を含む、請求項１から１２４のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１２６】
前記組成物の各用量が、少なくとも１ｘ１０６ＣＦＵのＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉまたはＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉに由来するｒＲＮＡに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列を含む微生物を含む、請求項１から１２５のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１２７】
前記組成物の各用量が、少なくとも１ｘ１０６ＣＦＵのＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍまたはＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍに由来するｒＲＮＡに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列を含む微生物を含む、請求項１から１２６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１２８】
前記組成物の各用量が、約１ｘ１０６ＣＦＵ〜１ｘ１０１２ＣＦＵの総微生物を含む、請求項１から１２７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１２９】
前記組成物の各用量が、約１ｘ１０６ＣＦＵ〜１ｘ１０１２ＣＦＵの前記少なくとも１つの単離および精製されたムチン調節性微生物を含む、請求項１から１２８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１３０】
前記組成物の各用量が、約１ｘ１０６ＣＦＵ〜１ｘ１０１２ＣＦＵの前記少なくとも１つの単離および精製されたブチレート産生微生物を含む、請求項１から１２９のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１３１】
前記組成物の各用量が、約１ｘ１０６ＣＦＵ〜１ｘ１０１２ＣＦＵのＡｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａ、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａに由来するｒＲＮＡに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列を含む微生物、または配列番号１〜６のいずれか１つに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列を含む微生物を含む、請求項１から１３０のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１３２】
前記組成物の各用量が、約１ｘ１０６ＣＦＵ〜１ｘ１０１２ＣＦＵのＥｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉまたはＥｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉに由来するｒＲＮＡに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列を含む微生物を含む、請求項１から１３１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１３３】
前記組成物の各用量が、約１ｘ１０６ＣＦＵ〜１ｘ１０１２ＣＦＵのＢｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓまたはＢｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓに由来するｒＲＮＡに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列を含む微生物を含む、請求項１から１３２のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１３４】
前記組成物の各用量が、約１ｘ１０６ＣＦＵ〜１ｘ１０１２ＣＦＵのＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉまたはＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉに由来するｒＲＮＡに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列を含む微生物を含む、請求項１から１３３のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１３５】
前記組成物の各用量が、約１ｘ１０６ＣＦＵ〜１ｘ１０１２ＣＦＵのＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍまたはＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍに由来するｒＲＮＡに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列を含む微生物を含む、請求項１から１３４のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１３６】
前記投与前に、前記対象が、少なくとも約１２５ｍｇ／ｄＬの空腹時血中グルコースレベルを示す、請求項１から１３５のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１３７】
前記投与前に、前記対象が、少なくとも約２００ｍｇ／ｄＬのブドウ糖負荷試験後の血中グルコースレベルを示す、請求項１から１３６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１３８】
前記投与前に、前記対象が、食事後約１．５〜２．５時間で少なくとも約２００ｍｇ／ｄＬの食事後グルコースレベルを示す、請求項１から１３７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１３９】
前記投与前に、前記対象が、総ヘモグロビンの少なくとも６．４％のｈＡ１Ｃレベルを示す、請求項１から１３８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１４０】
前記投与前に、前記対象が、少なくとも約１００ｍｇ／ｄＬの空腹時血中グルコースレベルを示す、請求項１から１３９のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１４１】
前記投与前に、前記対象が、少なくとも約１４０ｍｇ／ｄＬのブドウ糖負荷試験後の血中グルコースレベルを示す、請求項１から１４０のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１４２】
前記投与前に、前記対象が、食事後約１．５〜２．５時間で少なくとも約１４０ｍｇ／ｄＬの食事後グルコースレベルを示す、請求項１から１４１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１４３】
前記投与前に、前記対象が、総ヘモグロビンの少なくとも５．７％のｈＡ１Ｃレベルを示す、請求項１から１３８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１４４】
前記投与前に、前記対象が、約１００ｍｇ／ｄＬ未満の空腹時血中グルコースレベルを示す、請求項１から１３８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１４５】
前記投与前に、前記対象が、約１４０ｍｇ／ｄＬ未満のブドウ糖負荷試験後の血中グルコースレベルを示す、請求項１から１３８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１４６】
前記投与前に、前記対象が、食事後約１．５〜２．５時間で約１４０ｍｇ／ｄＬ未満の食事後グルコースレベルを示す、請求項１から１３８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１４７】
前記投与前に、前記対象が、総ヘモグロビンの５．７％未満のｈＡ１Ｃレベルを示す、請求項１から１３８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１４８】
前記対象においてインスリン感受性が増大する、請求項１から１４７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１４９】
前記対象において血中グルコースレベルが安定化される、請求項１から１４８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１５０】
前記対象において代謝症候群が処置される、請求項１から１４９のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１５１】
前記対象においてインスリン耐性が処置される、請求項１から１５０のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１５２】
対象における前糖尿病を処置する方法であって、前記対象に、少なくとも１つの単離および精製されたブチレート産生微生物と、少なくとも１つの単離および精製されたムチン調節性微生物とを含む組成物を投与することを含み、それによって、前記対象における前糖尿病を処置する、方法。
【請求項１５３】
前記組成物の投与が、前記対象中のヘモグロビンＡ１Ｃ（ｈＡ１Ｃ）レベルを、総ヘモグロビンの少なくとも０．１％低下させる、請求項１５２に記載の方法。
【請求項１５４】
前記組成物の投与が、食事負荷試験後の前記対象のグルコース曲線下面積（ＡＵＣ）を、対照と比較して少なくとも１０％低下させる、請求項１５２または１５３に記載の方法。
【請求項１５５】
前記対照が、前記投与前の前記対象について測定される対照ＡＵＣである、請求項１５４に記載の方法。
【請求項１５６】
前記対照が、前記組成物を投与されていない第２の対象に由来する対照ＡＵＣである、請求項１５４に記載の方法。
【請求項１５７】
前記投与前に、前記対象が、約１００ｍｇ／ｄＬ〜１２５ｍｇ／ｄＬの空腹時血中グルコースレベルを示す、請求項１５２から１５６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１５８】
前記投与前に、前記対象が、約１４０ｍｇ／ｄＬ〜１９９ｍｇ／ｄＬのブドウ糖負荷試験後の血中グルコースレベルを示す、請求項１５２から１５７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１５９】
前記投与前に、前記対象が、総ヘモグロビンの約５．７〜６．４％のｈＡ１Ｃレベルを示す、請求項１５２から１５８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１６０】
前記投与前に、前記対象が、食事後約１．５〜２．５時間で約１４０ｍｇ／ｄＬ〜１９９ｍｇ／ｄＬの食事後グルコースレベルを示す、請求項１５２から１５９のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１６１】
前記対象が、少なくとも１ヶ月間にわたって前糖尿病であった、請求項１５２から１６０のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１６２】
前記少なくとも１つの単離および精製されたブチレート産生微生物が、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉ、およびＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍのうちのいずれか１つまたは複数に由来するｒＲＮＡ配列に対する少なくとも約８５％の配列同一性を有する１つまたは複数のｒＲＮＡ配列を含む、請求項１５２から１６１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１６３】
前記少なくとも１つの単離および精製されたブチレート産生微生物が、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉ、およびＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍのうちのいずれか１つまたは複数に由来するｒＲＮＡ配列に対する少なくとも約９０％の配列同一性を有する１つまたは複数のｒＲＮＡ配列を含む、請求項１５２から１６１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１６４】
前記少なくとも１つの単離および精製されたブチレート産生微生物が、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉ、およびＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍのうちのいずれか１つまたは複数に由来するｒＲＮＡ配列に対する少なくとも約９７％の配列同一性を有する１つまたは複数のｒＲＮＡ配列を含む、請求項１５２から１６１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１６５】
前記少なくとも１つの単離および精製されたブチレート産生微生物が、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉ、およびＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍからなる群から選択される１つまたは複数の微生物を含む、請求項１５２から１６１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１６６】
前記少なくとも１つの単離および精製されたムチン調節性微生物が、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａのｒＲＮＡ配列に対する少なくとも約８５％の配列同一性を含むｒＲＮＡ配列を含む、請求項１５２から１６５のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１６７】
前記少なくとも１つの単離および精製されたムチン調節性微生物が、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａのｒＲＮＡ配列に対する少なくとも約９０％の配列同一性を含むｒＲＮＡ配列を含む、請求項１５２から１６５のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１６８】
前記少なくとも１つの単離および精製されたムチン調節性微生物が、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａのｒＲＮＡ配列に対する少なくとも約９７％の配列同一性を含むｒＲＮＡ配列を含む、請求項１５２から１６５のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１６９】
前記少なくとも１つの単離および精製されたムチン調節性微生物が、配列番号１〜６のいずれか１つに対する少なくとも約９７％の配列同一性を含むｒＲＮＡ配列を含む、請求項１５２から１６５のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１７０】
前記少なくとも１つの単離および精製されたムチン調節性微生物が、配列番号１〜６のいずれか１つに対する少なくとも約９９％の配列同一性を含むｒＲＮＡ配列を含む、請求項１５２から１６５のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１７１】
前記少なくとも１つの単離および精製されたムチン調節性微生物が、配列番号１〜６のいずれか１つであるｒＲＮＡ配列を含む、請求項１５２から１６５のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１７２】
前記少なくとも１つの単離および精製されたムチン調節性微生物が、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａを含む、請求項１５２から１７１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１７３】
前記組成物がメトホルミンをさらに含む、請求項１５２から１７２のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１７４】
前記組成物が治療剤と同時投与される、請求項１５２から１７２のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１７５】
前記治療剤がメトホルミンである、請求項１７４に記載の方法。
【請求項１７６】
前記治療剤がスルホニルウレアである、請求項１７４に記載の方法。
【請求項１７７】
前記治療剤がインスリンである、請求項１７４に記載の方法。
【請求項１７８】
前記組成物が治療剤を含む、請求項１５２から１７２のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１７９】
前記治療剤がメトホルミンである、請求項１７８に記載の方法。
【請求項１８０】
前記治療剤がスルホニルウレアである、請求項１７８に記載の方法。
【請求項１８１】
前記治療剤がインスリンである、請求項１７８に記載の方法。
【請求項１８２】
前記ｈＡ１Ｃレベルが、前記対象において、総ヘモグロビンの少なくとも０．２％低下する、請求項１５３から１８１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１８３】
前記ｈＡ１Ｃレベルが、前記対象において、総ヘモグロビンの少なくとも０．３％低下する、請求項１５３から１８１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１８４】
前記ｈＡ１Ｃレベルが、前記対象において、総ヘモグロビンの少なくとも０．４％低下する、請求項１５３から１８１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１８５】
前記ｈＡ１Ｃレベルが、前記対象において、総ヘモグロビンの少なくとも０．５％低下する、請求項１５３から１８１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１８６】
前記ｈＡ１Ｃレベルが、前記対象において、総ヘモグロビンの少なくとも０．６％低下する、請求項１５３から１８１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１８７】
前記ｈＡ１Ｃレベルが、前記組成物を投与されていない第２の対象と比較して、前記対象において、総ヘモグロビンの少なくとも０．２％低下する、請求項１５３から１８１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１８８】
前記ｈＡ１Ｃレベルが、前記組成物を投与されていない第２の対象と比較して、前記対象において、総ヘモグロビンの少なくとも０．３％低下する、請求項１５３から１８１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１８９】
前記ｈＡ１Ｃレベルが、前記組成物を投与されていない第２の対象と比較して、前記対象において、総ヘモグロビンの少なくとも０．４％低下する、請求項１５３から１８１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１９０】
前記ｈＡ１Ｃレベルが、前記組成物を投与されていない第２の対象と比較して、前記対象において、総ヘモグロビンの少なくとも０．５％低下する、請求項１５３から１８１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１９１】
前記ｈＡ１Ｃレベルが、前記組成物を投与されていない第２の対象と比較して、前記対象において、総ヘモグロビンの少なくとも０．６％低下する、請求項１５３から１８１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１９２】
前記グルコースＡＵＣが少なくとも１０％低下する、請求項１６４から１９１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１９３】
前記グルコースＡＵＣが少なくとも１５％低下する、請求項１６４から１９１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１９４】
前記グルコースＡＵＣが少なくとも２０％低下する、請求項１６４から１９１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１９５】
前記グルコースＡＵＣが少なくとも３０％低下する、請求項１６４から１９１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１９６】
空腹時グルコースが、前記対象において、少なくとも５％低下する、請求項１５２から１９１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１９７】
空腹時グルコースが、前記対象において、少なくとも１０％低下する、請求項１５２から１９６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１９８】
空腹時グルコースが、前記対象において、少なくとも２０％低下する、請求項１５２から１９６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１９９】
空腹時グルコースが、前記対象において、少なくとも２５％低下する、請求項１５２から１９６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２００】
前記対象がヒトである、請求項１５２から１９９のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２０１】
前記対象が併存疾患を有する、請求項１５２から２００のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２０２】
前記組成物が、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉのｒＲＮＡ配列に対する少なくとも約８５％の配列同一性を含むｒＲＮＡ配列を有する１つまたは複数の微生物を含む、請求項１５２から２０１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２０３】
前記組成物が、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍのｒＲＮＡ配列に対する少なくとも約８５％の配列同一性を含むｒＲＮＡ配列を有する１つまたは複数の微生物を含む、請求項１５２から２０２のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２０４】
前記組成物が、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓのｒＲＮＡ配列に対する少なくとも約８５％の配列同一性を含むｒＲＮＡ配列を有する１つまたは複数の微生物を含む、請求項１５２から２０３のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２０５】
前記組成物が、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉのｒＲＮＡ配列に対する少なくとも約８５％の配列同一性を含むｒＲＮＡ配列を有する１つまたは複数の微生物を含む、請求項１５２から２０４のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２０６】
前記組成物が、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａのｒＲＮＡ配列に対する少なくとも約８５％の配列同一性を含むｒＲＮＡ配列を有する１つまたは複数の微生物を含む、請求項１５２から２０５のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２０７】
前記組成物が、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉのｒＲＮＡ配列に対する少なくとも約９０％の配列同一性を含むｒＲＮＡ配列を有する１つまたは複数の微生物を含む、請求項１５２から２０６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２０８】
前記組成物が、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍのｒＲＮＡ配列に対する少なくとも約９０％の配列同一性を含むｒＲＮＡ配列を有する１つまたは複数の微生物を含む、請求項１５２から２０７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２０９】
前記組成物が、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓのｒＲＮＡ配列に対する少なくとも約９０％の配列同一性を含むｒＲＮＡ配列を有する１つまたは複数の微生物を含む、請求項１５２から２０８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２１０】
前記組成物が、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉのｒＲＮＡ配列に対する少なくとも約９０％の配列同一性を含むｒＲＮＡ配列を有する１つまたは複数の微生物を含む、請求項１５２から２０９のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２１１】
前記組成物が、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａのｒＲＮＡ配列に対する少なくとも約９０％の配列同一性を含むｒＲＮＡ配列を有する１つまたは複数の微生物を含む、請求項１５２から２１０のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２１２】
前記組成物が、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉのｒＲＮＡ配列に対する少なくとも約９７％の配列同一性を含むｒＲＮＡ配列を有する１つまたは複数の微生物を含む、請求項１５２から２１１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２１３】
前記組成物が、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍのｒＲＮＡ配列に対する少なくとも約９７％の配列同一性を含むｒＲＮＡ配列を有する１つまたは複数の微生物を含む、請求項１５２から２１２のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２１４】
前記組成物が、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓのｒＲＮＡ配列に対する少なくとも約９７％の配列同一性を含むｒＲＮＡ配列を有する１つまたは複数の微生物を含む、請求項１５２から２１３のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２１５】
前記組成物が、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉのｒＲＮＡ配列に対する少なくとも約９７％の配列同一性を含むｒＲＮＡ配列を有する１つまたは複数の微生物を含む、請求項１５２から２１４のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２１６】
前記組成物が、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａのｒＲＮＡ配列に対する少なくとも約９７％の配列同一性を含むｒＲＮＡ配列を有する１つまたは複数の微生物を含む、請求項１５２から２１５のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２１７】
前記組成物がＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉを含む、請求項１５２から２１６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２１８】
前記組成物がＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍを含む、請求項１５２から２１７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２１９】
前記組成物がＢｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓを含む、請求項１５２から２１８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２２０】
前記組成物がＡｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａを含む、請求項１５２から２１９のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２２１】
前記組成物がＥｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉを含む、請求項１５２から２２０のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２２２】
前記組成物がＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍ、およびＢｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓを含む、請求項１５２から２２１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２２３】
前記組成物がＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓ、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａ、およびＥｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉを含む、請求項１５２から２２１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２２４】
前記組成物がＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓ、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａ、およびＥｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉを含む、請求項１５２から２２１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２２５】
前記組成物がＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓ、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａ、およびＥｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉを含む、請求項１５２から２２１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２２６】
前記組成物がＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉ、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａ、およびＥｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉを含む、請求項１５２から２２１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２２７】
前記組成物がＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉおよびＢｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓを含む、請求項１５２から２２１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２２８】
前記組成物がＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓ、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａ、およびＥｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉを含む、請求項１５２から２２１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２２９】
前記組成物がＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓ、およびＡｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａを含む、請求項１５２から２２１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２３０】
前記組成物がＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓ、およびＡｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａを含む、請求項１５２から２２１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２３１】
前記組成物がＥｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉおよびＡｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａを含む、請求項１５２から２２１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２３２】
前記組成物がＢｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉ、およびＡｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａを含む、請求項１５２から２２１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２３３】
前記組成物が少なくとも２つの微生物を含む、請求項１５２から２２１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２３４】
前記組成物が少なくとも３つの微生物を含む、請求項１５２から２２１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２３５】
前記組成物が少なくとも４つの微生物を含む、請求項１５２から２２１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２３６】
前記組成物が少なくとも５つの微生物を含む、請求項１５２から２２１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２３７】
前記組成物が、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓ、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａ、およびＥｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉからなる群から選択される少なくとも２つの微生物を含む、請求項１５２から２２１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２３８】
前記組成物が、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓ、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａ、およびＥｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉからなる群から選択される少なくとも３つの微生物を含む、請求項１５２から２２１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２３９】
前記組成物が、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓ、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａ、およびＥｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉからなる群から選択される少なくとも４つの微生物を含む、請求項１５２から２２１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２４０】
前記組成物が単位剤形中にある、請求項１５２から２３９のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２４１】
前記組成物が食品または飲料である、請求項１５２から２４０のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２４２】
前記組成物が栄養補助食品である、請求項１５２から２４１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２４３】
前記栄養補助食品がフードバーの形態にある、請求項２４２に記載の方法。
【請求項２４４】
前記栄養補助食品が粉末の形態にある、請求項２４２に記載の方法。
【請求項２４５】
前記栄養補助食品が液体の形態にある、請求項２４２に記載の方法。
【請求項２４６】
前記組成物が医薬組成物である、請求項１５２から２４５のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２４７】
前記組成物がピルまたはカプセルの形態にある、請求項１５２から２４６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２４８】
前記ピルまたはカプセルが、前記ピルまたはカプセルの内容物を、前記対象の回腸、前記対象の結腸、またはその組合せに放出するように設計された腸溶コーティングを含む、請求項２４７に記載の方法。
【請求項２４９】
それぞれのピルまたはカプセルが、少なくとも１ｘ１０６ＣＦＵの総微生物を含む、請求項２４７または２４８に記載の方法。
【請求項２５０】
それぞれのピルまたはカプセルが、少なくとも１ｘ１０６ＣＦＵの前記少なくとも１つの単離および精製されたムチン調節性微生物を含む、請求項２４７から２４９のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２５１】
それぞれのピルまたはカプセルが、少なくとも１ｘ１０６ＣＦＵの前記少なくとも１つの単離および精製されたブチレート産生微生物を含む、請求項２４７から２５０のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２５２】
それぞれのピルまたはカプセルが、少なくとも１ｘ１０６ＣＦＵのＡｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａ、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａに由来するｒＲＮＡに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列を含む微生物、または配列番号１〜６のいずれか１つに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列を含む微生物を含む、請求項２４７から２５１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２５３】
それぞれのピルまたはカプセルが、少なくとも１ｘ１０６ＣＦＵのＥｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉまたはＥｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉに由来するｒＲＮＡに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列を含む微生物を含む、請求項２４７から２５２のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２５４】
それぞれのピルまたはカプセルが、少なくとも１ｘ１０６ＣＦＵのＢｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓまたはＢｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓに由来するｒＲＮＡに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列を含む微生物を含む、請求項２４７から２５３のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２５５】
それぞれのピルまたはカプセルが、少なくとも１ｘ１０６ＣＦＵのＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉまたはＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉに由来するｒＲＮＡに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列を含む微生物を含む、請求項２４７から２５４のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２５６】
それぞれのピルまたはカプセルが、少なくとも１ｘ１０６ＣＦＵのＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍまたはＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍに由来するｒＲＮＡに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列を含む微生物を含む、請求項２４７から２５５のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２５７】
それぞれのピルまたはカプセルが、約１ｘ１０６ＣＦＵ〜１ｘ１０１２ＣＦＵの総微生物を含む、請求項２４７から２５６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２５８】
それぞれのピルまたはカプセルが、約１ｘ１０６ＣＦＵ〜１ｘ１０１２ＣＦＵの前記少なくとも１つの単離および精製されたムチン調節性微生物を含む、請求項２４７から２５７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２５９】
それぞれのピルまたはカプセルが、約１ｘ１０６ＣＦＵ〜１ｘ１０１２ＣＦＵの前記少なくとも１つの単離および精製されたブチレート産生微生物を含む、請求項２４７から２５８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２６０】
それぞれのピルまたはカプセルが、約１ｘ１０６ＣＦＵ〜１ｘ１０１２ＣＦＵのＡｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａ、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａに由来するｒＲＮＡに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列を含む微生物、または配列番号１〜６のいずれか１つに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列を含む微生物を含む、請求項２４７から２５９のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２６１】
それぞれのピルまたはカプセルが、約１ｘ１０６ＣＦＵ〜１ｘ１０１２ＣＦＵのＥｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉまたはＥｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉに由来するｒＲＮＡに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列を含む微生物を含む、請求項２４７から２６０のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２６２】
それぞれのピルまたはカプセルが、約１ｘ１０６ＣＦＵ〜１ｘ１０１２ＣＦＵのＢｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓまたはＢｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓに由来するｒＲＮＡに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列を含む微生物を含む、請求項２４７から２６１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２６３】
それぞれのピルまたはカプセルが、約１ｘ１０６ＣＦＵ〜１ｘ１０１２ＣＦＵのＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉまたはＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉに由来するｒＲＮＡに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列を含む微生物を含む、請求項２４７から２６２のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２６４】
それぞれのピルまたはカプセルが、約１ｘ１０６ＣＦＵ〜１ｘ１０１２ＣＦＵのＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍまたはＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍに由来するｒＲＮＡに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列を含む微生物を含む、請求項２４７から２６３のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２６５】
１用量の前記組成物が、少なくとも１つの、１つのピルまたはカプセルを含む、請求項１５２から２６４のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２６６】
１用量の前記組成物が、少なくとも２つの前記ピルまたはカプセルを含む、請求項１５２から２６４のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２６７】
１用量の前記組成物が、１〜６つの前記ピルまたはカプセルを含む、請求項１５２から２６４のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２６８】
前記組成物が少なくとも毎週、前記対象に投与される、請求項１５２から２６７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２６９】
前記組成物が少なくとも毎日、前記対象に投与される、請求項１５２から２６７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２７０】
前記組成物が少なくとも１日２回、前記対象に投与される、請求項１５２から２６７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２７１】
前記組成物の各用量が、少なくとも１ｘ１０６ＣＦＵの総微生物を含む、請求項１５２から２７０のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２７２】
前記組成物の各用量が、少なくとも１ｘ１０６ＣＦＵの前記少なくとも１つの単離および精製されたムチン調節性微生物を含む、請求項１５２から２７１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２７３】
前記組成物の各用量が、少なくとも１ｘ１０６ＣＦＵの前記少なくとも１つの単離および精製されたブチレート産生微生物を含む、請求項１５２から２７２のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２７４】
前記組成物の各用量が、少なくとも１ｘ１０６ＣＦＵのＡｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａ、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａに由来するｒＲＮＡに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列を含む微生物、または配列番号１〜６のいずれか１つに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列を含む微生物を含む、請求項１５２から２７３のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２７５】
前記組成物の各用量が、少なくとも１ｘ１０６ＣＦＵのＥｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉまたはＥｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉに由来するｒＲＮＡに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列を含む微生物を含む、請求項１５２から２７４のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２７６】
前記組成物の各用量が、少なくとも１ｘ１０６ＣＦＵのＢｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓまたはＢｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓに由来するｒＲＮＡに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列を含む微生物を含む、請求項１５２から２７５のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２７７】
前記組成物の各用量が、少なくとも１ｘ１０６ＣＦＵのＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉまたはＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉに由来するｒＲＮＡに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列を含む微生物を含む、請求項１５２から２７６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２７８】
前記組成物の各用量が、少なくとも１ｘ１０６ＣＦＵのＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍまたはＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍに由来するｒＲＮＡに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列を含む微生物を含む、請求項１５２から２７７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２７９】
前記組成物の各用量が、約１ｘ１０６ＣＦＵ〜１ｘ１０１２ＣＦＵの総微生物を含む、請求項１５２から２７８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２８０】
前記組成物の各用量が、約１ｘ１０６ＣＦＵ〜１ｘ１０１２ＣＦＵの前記少なくとも１つの単離および精製されたムチン調節性微生物を含む、請求項１５２から２７９のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２８１】
前記組成物の各用量が、約１ｘ１０６ＣＦＵ〜１ｘ１０１２ＣＦＵの前記少なくとも１つの単離および精製されたブチレート産生微生物を含む、請求項１５２から２８０のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２８２】
前記組成物の各用量が、約１ｘ１０６ＣＦＵ〜１ｘ１０１２ＣＦＵのＡｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａ、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａに由来するｒＲＮＡに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列を含む微生物、または配列番号１〜６のいずれか１つに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列を含む微生物を含む、請求項１５２から２８１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２８３】
前記組成物の各用量が、約１ｘ１０６ＣＦＵ〜１ｘ１０１２ＣＦＵのＥｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉまたはＥｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉに由来するｒＲＮＡに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列を含む微生物を含む、請求項１５２から２８２のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２８４】
前記組成物の各用量が、約１ｘ１０６ＣＦＵ〜１ｘ１０１２ＣＦＵのＢｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓまたはＢｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓに由来するｒＲＮＡに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列を含む微生物を含む、請求項１５２から２８３のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２８５】
前記組成物の各用量が、約１ｘ１０６ＣＦＵ〜１ｘ１０１２ＣＦＵのＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉまたはＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉに由来するｒＲＮＡに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列を含む微生物を含む、請求項１５２から２８４のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２８６】
前記組成物の各用量が、約１ｘ１０６ＣＦＵ〜１ｘ１０１２ＣＦＵのＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍまたはＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍに由来するｒＲＮＡに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列を含む微生物を含む、請求項１５２から２８５のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２８７】
前記対象においてインスリン感受性が増大する、請求項１５２から２８６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２８８】
前記対象において血中グルコースレベルが安定化される、請求項１５２から２８７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２８９】
前記対象において代謝症候群が処置される、請求項１５２から２８８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２９０】
前記対象においてインスリン耐性が処置される、請求項１５２から２８９のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２９１】
ヘモグロビンＡ１Ｃ（ｈＡ１Ｃ）レベルが上昇した対象を処置する方法であって、前記対象に、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓ、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａ、およびＥｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉを含む組成物を経口投与することを含み、それによって、前記対象中のｈＡ１Ｃレベルを、総ヘモグロビンの少なくとも０．２％低下させ、前記組成物が、前記対象の回腸、前記対象の結腸、またはその組合せにピルまたはカプセルの内容物を放出するように設計された腸溶コーティングを含む前記ピルまたはカプセルの形態にあり、前記対象がヒトである、方法。
【請求項２９２】
対象における前糖尿病を処置する方法であって、前記対象に、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓ、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａ、およびＥｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉを含む組成物を経口投与することを含み、それによって、前記対象における前糖尿病を処置し、前記組成物が、前記対象の回腸、前記対象の結腸、またはその組合せにピルまたはカプセルの内容物を放出するように設計された腸溶コーティングを含む前記ピルまたはカプセルの形態にあり、前記対象がヒトである、方法。
【請求項２９３】
ヘモグロビンＡ１Ｃ（ｈＡ１Ｃ）レベルが上昇した対象を処置する方法であって、前記対象に、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓ、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａ、およびＥｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉを含む組成物を経口投与することを含み、それによって、前記対象中のｈＡ１Ｃレベルを、総ヘモグロビンの少なくとも０．２％低下させ、前記組成物が、栄養補助食品であり、前記対象がヒトである、方法。
【請求項２９４】
前記栄養補助食品がフードバーの形態にある、請求項２９３に記載の方法。
【請求項２９５】
前記栄養補助食品が粉末の形態にある、請求項２９３に記載の方法。
【請求項２９６】
前記栄養補助食品が液体の形態にある、請求項２９３に記載の方法。
【請求項２９７】
対象における前糖尿病を処置する方法であって、前記対象に、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓ、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａ、およびＥｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉを含む組成物を経口投与することを含み、それによって、前記対象中の前糖尿病を処置し、前記組成物が栄養補助食品であり、前記対象がヒトである、方法。
【請求項２９８】
前記栄養補助食品がフードバーの形態にある、請求項２９７に記載の方法。
【請求項２９９】
前記栄養補助食品が粉末の形態にある、請求項２９７に記載の方法。
【請求項３００】
前記栄養補助食品が液体の形態にある、請求項２９７に記載の方法。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
相互参照
本出願は、２０１８年９月２４日に出願された米国仮特許出願第６２／７３５，７４７号、および２０１９年２月６日に出願された米国仮特許出願第６２／８０１，９８３号の利益を主張し、それぞれ、その全体が参照により本明細書に組み込まれる。
【背景技術】
【０００２】
２型糖尿病は、身体が産生するインスリンを、それが有効に使用することができず、かくして、その血糖を調整することができない場合に起こる慢性疾患である。高血糖症、または高血糖は、未制御の２型糖尿病の一般的な効果であり、経時的に、多くの身体系、特に、神経および血管に対する重大な損傷をもたらし得る。糖尿病を有する多くの患者は、現在利用可能な療法を使用する血糖管理を達成することができない。
生物学的寄託
【０００３】
本出願は、生物学的材料の寄託に関する参照を含有する。以下の生物学的材料は、Ｍａｎａｓｓａｓ、ＶＡのＡｍｅｒｉｃａｎ  Ｔｙｐｅ  Ｃｕｌｔｕｒｅ  Ｃｏｌｌｅｃｔｉｏｎ（ＡＴＣＣ）に寄託されており、寄託物の以下の名称、受託番号および日付：Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉ；ＷＢ−ＳＴＲ−０００５（ＰＴＡ−１２３６３４、２０１６年１２月１４日寄託）；Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍ；ＷＢ−ＳＴＲ−０００６（ＰＴＡ−１２３６３５、２０１６年１２月１４日寄託）を有する。
【発明の概要】
【課題を解決するための手段】
【０００４】
一部の態様では、ヘモグロビンＡ１Ｃ（ｈＡ１Ｃ）レベルが上昇した対象を処置する方法であって、対象に、少なくとも１つの単離および精製されたブチレート産生微生物（ｍｉｃｒｏｂｅ）と、少なくとも１つの単離および精製されたムチン調節性微生物とを含む組成物を投与することを含み、それによって、対象中のｈＡ１Ｃレベルを、総ヘモグロビンの少なくとも０．２％低下させる、方法が本明細書で開示される。
【０００５】
一部の実施形態では、組成物の投与は、食事負荷試験後の対象のグルコース曲線下面積（ＡＵＣ）を、対照と比較して少なくとも１０％低下させる。一部の実施形態では、対照は、投与前の対象について測定された対照ＡＵＣである。一部の実施形態では、対照は、組成物を投与されていない第２の対象に由来する対照ＡＵＣである。一部の実施形態では、対象は、２型糖尿病または前糖尿病を有するか、または有することが疑われる。一部の実施形態では、少なくとも１つの単離および精製されたブチレート産生微生物は、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉ、およびＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍのうちのいずれか１つまたは複数に由来するｒＲＮＡ配列に対する少なくとも約８５％の配列同一性を有する１つまたは複数のｒＲＮＡ配列を含む。一部の実施形態では、少なくとも１つの単離および精製されたブチレート産生微生物は、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉ、およびＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍのうちのいずれか１つまたは複数に由来するｒＲＮＡ配列に対する少なくとも約９０％の配列同一性を有する１つまたは複数のｒＲＮＡ配列を含む。一部の実施形態では、少なくとも１つの単離および精製されたブチレート産生微生物は、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉ、およびＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍのうちのいずれか１つまたは複数に由来するｒＲＮＡ配列に対する少なくとも約９７％の配列同一性を有する１つまたは複数のｒＲＮＡ配列を含む。一部の実施形態では、少なくとも１つの単離および精製されたブチレート産生微生物は、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉ、およびＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍからなる群から選択される１つまたは複数の微生物を含む。一部の実施形態では、少なくとも１つの単離および精製されたムチン調節性微生物は、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａのｒＲＮＡ配列に対する少なくとも約８５％の配列同一性を含むｒＲＮＡ配列を含む。一部の実施形態では、少なくとも１つの単離および精製されたムチン調節性微生物は、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａのｒＲＮＡ配列に対する少なくとも約９０％の配列同一性を含むｒＲＮＡ配列を含む。一部の実施形態では、少なくとも１つの単離および精製されたムチン調節性微生物は、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａのｒＲＮＡ配列に対する少なくとも約９７％の配列同一性を含むｒＲＮＡ配列を含む。一部の実施形態では、少なくとも１つの単離および精製されたムチン調節性微生物は、配列番号１〜６のいずれか１つに対する少なくとも約９７％の配列同一性を含むｒＲＮＡ配列を含む。一部の実施形態では、少なくとも１つの単離および精製されたムチン調節性微生物は、配列番号１〜６のいずれか１つに対する少なくとも約９９％の配列同一性を含むｒＲＮＡ配列を含む。一部の実施形態では、少なくとも１つの単離および精製されたムチン調節性微生物は、配列番号１〜６のいずれか１つであるｒＲＮＡ配列を含む。一部の実施形態では、少なくとも１つの単離および精製されたムチン調節性微生物は、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａを含む。一部の実施形態では、対象は、２型糖尿病を有する。一部の実施形態では、対象は、前糖尿病を有する。一部の実施形態では、２型糖尿病は、初期段階である。一部の実施形態では、２型糖尿病は、中期段階である。一部の実施形態では、２型糖尿病は、後期段階である。一部の実施形態では、組成物は、メトホルミンをさらに含む。一部の実施形態では、組成物は、治療剤と同時投与される。一部の実施形態では、治療剤は、メトホルミンである。一部の実施形態では、治療剤は、スルホニルウレアである。一部の実施形態では、治療剤は、インスリンである。一部の実施形態では、組成物は、治療剤を含む。一部の実施形態では、治療剤は、メトホルミンである。一部の実施形態では、治療剤は、スルホニルウレアである。一部の実施形態では、治療剤は、インスリンである。一部の実施形態では、ｈＡ１Ｃレベルは、対象において、総ヘモグロビンの少なくとも０．２％低下する。一部の実施形態では、ｈＡ１Ｃレベルは、対象において、総ヘモグロビンの少なくとも０．３％低下する。一部の実施形態では、ｈＡ１Ｃレベルは、対象において、総ヘモグロビンの少なくとも０．４％低下する。一部の実施形態では、ｈＡ１Ｃレベルは、対象において、総ヘモグロビンの少なくとも０．５％低下する。一部の実施形態では、ｈＡ１Ｃレベルは、対象において、総ヘモグロビンの少なくとも０．６％低下する。一部の実施形態では、ｈＡ１Ｃレベルは、対象において、組成物を投与されていない第２の対象と比較して、総ヘモグロビンの少なくとも０．２％低下する。一部の実施形態では、ｈＡ１Ｃレベルは、対象において、組成物を投与されていない第２の対象と比較して、総ヘモグロビンの少なくとも０．３％低下する。一部の実施形態では、ｈＡ１Ｃレベルは、対象において、組成物を投与されていない第２の対象と比較して、総ヘモグロビンの少なくとも０．４％低下する。一部の実施形態では、ｈＡ１Ｃレベルは、対象において、組成物を投与されていない第２の対象と比較して、総ヘモグロビンの少なくとも０．５％低下する。一部の実施形態では、ｈＡ１Ｃレベルは、対象において、組成物を投与されていない第２の対象と比較して、総ヘモグロビンの少なくとも０．６％低下する。一部の実施形態では、グルコースのＡＵＣは、少なくとも１０％低下する。一部の実施形態では、グルコースのＡＵＣは、少なくとも１５％低下する。一部の実施形態では、グルコースのＡＵＣは、少なくとも２０％低下する。一部の実施形態では、グルコースのＡＵＣは、少なくとも３０％低下する。一部の実施形態では、空腹時グルコースは、対象において、少なくとも５％低下する。一部の実施形態では、空腹時グルコースは、対象において、少なくとも１０％低下する。一部の実施形態では、空腹時グルコースは、対象において、少なくとも２０％低下する。一部の実施形態では、空腹時グルコースは、対象において、少なくとも２５％低下する。一部の実施形態では、対象は、ヒトである。一部の実施形態では、対象は���併存疾患を有する。一部の実施形態では、組成物は、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉのｒＲＮＡ配列に対する少なくとも約８５％の配列同一性を含むｒＲＮＡ配列を有する１つまたは複数の微生物を含む。一部の実施形態では、組成物は、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍのｒＲＮＡ配列に対する少なくとも約８５％の配列同一性を含むｒＲＮＡ配列を有する１つまたは複数の微生物を含む。一部の実施形態では、組成物は、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓのｒＲＮＡ配列に対する少なくとも約８５％の配列同一性を含むｒＲＮＡ配列を有する１つまたは複数の微生物を含む。一部の実施形態では、組成物は、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉのｒＲＮＡ配列に対する少なくとも約８５％の配列同一性を含むｒＲＮＡ配列を有する１つまたは複数の微生物を含む。一部の実施形態では、組成物は、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａのｒＲＮＡ配列に対する少なくとも約８５％の配列同一性を含むｒＲＮＡ配列を有する１つまたは複数の微生物を含む。一部の実施形態では、組成物は、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉのｒＲＮＡ配列に対する少なくとも約９０％の配列同一性を含むｒＲＮＡ配列を有する１つまたは複数の微生物を含む。一部の実施形態では、組成物は、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍのｒＲＮＡ配列に対する少なくとも約９０％の配列同一性を含むｒＲＮＡ配列を有する１つまたは複数の微生物を含む。一部の実施形態では、組成物は、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓのｒＲＮＡ配列に対する少なくとも約９０％の配列同一性を含むｒＲＮＡ配列を有する１つまたは複数の微生物を含む。一部の実施形態では、組成物は、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉのｒＲＮＡ配列に対する少なくとも約９０％の配列同一性を含むｒＲＮＡ配列を有する１つまたは複数の微生物を含む。一部の実施形態では、組成物は、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａのｒＲＮＡ配列に対する少なくとも約９０％の配列同一性を含むｒＲＮＡ配列を有する１つまたは複数の微生物を含む。一部の実施形態では、組成物は、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉのｒＲＮＡ配列に対する少なくとも約９７％の配列同一性を含むｒＲＮＡ配列を有する１つまたは複数の微生物を含む。一部の実施形態では、組成物は、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍのｒＲＮＡ配列に対する少なくとも約９７％の配列同一性を含むｒＲＮＡ配列を有する１つまたは複数の微生物を含む。一部の実施形態では、組成物は、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓのｒＲＮＡ配列に対する少なくとも約９７％の配列同一性を含むｒＲＮＡ配列を有する１つまたは複数の微生物を含む。一部の実施形態では、組成物は、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉのｒＲＮＡ配列に対する少なくとも約９７％の配列同一性を含むｒＲＮＡ配列を有する１つまたは複数の微生物を含む。一部の実施形態では、組成物は、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａのｒＲＮＡ配列に対する少なくとも約９７％の配列同一性を含むｒＲＮＡ配列を有する１つまたは複数の微生���を含む。一部の実施形態では、組成物は、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉを含む。一部の実施形態では、組成物は、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍを含む。一部の実施形態では、組成物は、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓを含む。一部の実施形態では、組成物は、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａを含む。一部の実施形態では、組成物は、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉを含む。一部の実施形態では、組成物は、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍ、およびＢｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓを含む。一部の実施形態では、組成物は、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓ、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａ、およびＥｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉを含む。一部の実施形態では、組成物は、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓ、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａ、およびＥｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉを含む。一部の実施形態では、組成物は、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓ、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａ、およびＥｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉを含む。一部の実施形態では、組成物は、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉ、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａ、およびＥｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉを含む。一部の実施形態では、組成物は、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉおよびＢｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓを含む。一部の実施形態では、組成物は、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓ、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａ、およびＥｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉを含む。一部の実施形態では、組成物は、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙ
ｒｉｃｕｍ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓ、およびＡｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａを含む。一部の実施形態では、組成物は、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓ、およびＡｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａを含む。一部の実施形態では、組成物は、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉおよびＡｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａを含む。一部の実施形態では、組成物は、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉ、およびＡｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａを含む。一部の実施形態では、組成物は、少なくとも２つの微生物を含む。一部の実施形態では、組成物は、少なくとも３つの微生物を含む。一部の実施形態では、組成物は、少なくとも４つの微生物を含む。一部の実施形態では、組成物は、少なくとも５つの微生物を含む。一部の実施形態では、組成物は、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓ、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａ、およびＥｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉからなる群から選択される少なくとも２つの微生物を含む。一部の実施形態では、組成物は、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓ、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａ、およびＥｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉからなる群から選択される少なくとも３つの微生物を含む。一部の実施形態では、組成物は、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓ、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａ、およびＥｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉからなる群から選択される少なくとも４つの微生物を含む。一部の実施形態では、組成物は、単位剤形中にある。一部の実施形態では、組成物は、食品または飲料である。一部の実施形態では、組成物は、栄養補助食品である。一部の実施形態では、栄養補助食品は、フードバーの形態にある。一部の実施形態では、栄養補助食品は、粉末の形態にある。一部の実施形態では、栄養補助食品は、液体の形態にある。一部の実施形態では、組成物は、医薬組成物である。一部の実施形態では、組成物は、ピルまたはカプセルの形態にある。一部の実施形態では、ピルまたはカプセルは、ピルまたはカプセルの内容物を、対象の回腸、対象の結腸、またはその組合せに放出するように設計された腸溶コーティングを含む。一部の実施形態では、それぞれのピルまたはカプセルは、少なくとも１ｘ１０６ＣＦＵの総微生物を含む。一部の実施形態では、それぞれのピルまたはカプセルは、少なくとも１ｘ１０６ＣＦＵの少なくとも１つの単離および精製されたムチン調節性微生物を含む。一部の実施形態では、それぞれのピルまたはカプセルは、少なくとも１ｘ１０６ＣＦＵの少なくとも１つの単離および精製され���ブチレート産生微生物を含む。一部の実施形態では、それぞれのピルまたはカプセルは、少なくとも１ｘ１０６ＣＦＵのＡｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａ、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａに由来するｒＲＮＡに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列を含む微生物、または配列番号１〜６のいずれか１つに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列を含む微生物を含む。一部の実施形態では、それぞれのピルまたはカプセルは、少なくとも１ｘ１０６ＣＦＵのＥｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉまたはＥｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉに由来するｒＲＮＡに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列を含む微生物を含む。一部の実施形態では、それぞれのピルまたはカプセルは、少なくとも１ｘ１０６ＣＦＵのＢｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓまたはＢｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓに由来するｒＲＮＡに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列を含む微生物を含む。一部の実施形態では、それぞれのピルまたはカプセルは、少なくとも１ｘ１０６ＣＦＵのＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉまたはＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉに由来するｒＲＮＡに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列を含む微生物を含む。一部の実施形態では、それぞれのピルまたはカプセルは、少なくとも１ｘ１０６ＣＦＵのＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍまたはＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍに由来するｒＲＮＡに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列を含む微生物を含む。一部の実施形態では、それぞれのピルまたはカプセルは、約１ｘ１０６ＣＦＵ〜１ｘ１０１２ＣＦＵの総微生物を含む。一部の実施形態では、それぞれのピルまたはカプセルは、約１ｘ１０６ＣＦＵ〜１ｘ１０１２ＣＦＵの少なくとも１つの単離および精製されたムチン調節性微生物を含む。一部の実施形態では、それぞれのピルまたはカプセルは、約１ｘ１０６ＣＦＵ〜１ｘ１０１２ＣＦＵの少なくとも１つの単離および精製されたブチレート産生微生物を含む。一部の実施形態では、それぞれのピルまたはカプセルは、約１ｘ１０６ＣＦＵ〜１ｘ１０１２ＣＦＵのＡｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａ、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａに由来するｒＲＮＡに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列を含む微生物、または配列番号１〜６のいずれか１つに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列を含む微生物を含む。一部の実施形態では、それぞれのピルまたはカプセルは、約１ｘ１０６ＣＦＵ〜１ｘ１０１２ＣＦＵのＥｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉまたはＥｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉに由来するｒＲＮＡに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列を含む微生物を含む。一部の実施形態では、それぞれのピルまたはカプセルは、約１ｘ１０６ＣＦＵ〜１ｘ１０１２ＣＦＵのＢｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓまたはＢｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａ��ｔｉｓに由来するｒＲＮＡに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列を含む微生物を含む。一部の実施形態では、それぞれのピルまたはカプセルは、約１ｘ１０６ＣＦＵ〜１ｘ１０１２ＣＦＵのＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉまたはＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉに由来するｒＲＮＡに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列を含む微生物を含む。一部の実施形態では、それぞれのピルまたはカプセルは、約１ｘ１０６ＣＦＵ〜１ｘ１０１２ＣＦＵのＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍまたはＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍに由来するｒＲＮＡに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列を含む微生物を含む。一部の実施形態では、１用量の組成物は、少なくとも１つの１つのピルまたはカプセルを含む。一部の実施形態では、１用量の組成物は、少なくとも２つのピルまたはカプセルを含む。一部の実施形態では、１用量の組成物は、１〜６つのピルまたはカプセルを含む。一部の実施形態では、組成物は、少なくとも毎週、対象に投与される。一部の実施形態では、組成物は、少なくとも毎日、対象に投与される。一部の実施形態では、組成物は、少なくとも１日２回、対象に投与される。一部の実施形態では、組成物の各用量は、少なくとも１ｘ１０６ＣＦＵの総微生物を含む。一部の実施形態では、組成物の各用量は、少なくとも１ｘ１０６ＣＦＵの少なくとも１つの単離および精製されたムチン調節性微生物を含む。一部の実施形態では、組成物の各用量は、少なくとも１ｘ１０６ＣＦＵの少なくとも１つの単離および精製されたブチレート産生微生物を含む。一部の実施形態では、組成物の各用量は、少なくとも１ｘ１０６ＣＦＵのＡｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａ、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａに由来するｒＲＮＡに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列を含む微生物、または配列番号１〜６のいずれか１つに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列を含む微生物を含む。一部の実施形態では、組成物の各用量は、少なくとも１ｘ１０６ＣＦＵのＥｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉまたはＥｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉに由来するｒＲＮＡに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列を含む微生物を含む。一部の実施形態では、組成物の各用量は、少なくとも１ｘ１０６ＣＦＵのＢｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓまたはＢｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓに由来するｒＲＮＡに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列を含む微生物を含む。一部の実施形態では、組成物の各用量は、少なくとも１ｘ１０６ＣＦＵのＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉまたはＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉに由来するｒＲＮＡに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列を含む微生物を含む。一部の実施形態では、組成物の各用量は、少なくとも１ｘ１０６ＣＦＵのＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍまたはＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍに由来���るｒＲＮＡに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列を含む微生物を含む。一部の実施形態では、組成物の各用量は、約１ｘ１０６ＣＦＵ〜１ｘ１０１２ＣＦＵの総微生物を含む。一部の実施形態では、組成物の各用量は、約１ｘ１０６ＣＦＵ〜１ｘ１０１２ＣＦＵの少なくとも１つの単離および精製されたムチン調節性微生物を含む。一部の実施形態では、組成物の各用量は、約１ｘ１０６ＣＦＵ〜１ｘ１０１２ＣＦＵの少なくとも１つの単離および精製されたブチレート産生微生物を含む。一部の実施形態では、組成物の各用量は、約１ｘ１０６ＣＦＵ〜１ｘ１０１２ＣＦＵのＡｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａ、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａに由来するｒＲＮＡに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列を含む微生物、または配列番号１〜６のいずれか１つに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列を含む微生物を含む。一部の実施形態では、組成物の各用量は、約１ｘ１０６ＣＦＵ〜１ｘ１０１２ＣＦＵのＥｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉまたはＥｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉに由来するｒＲＮＡに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列を含む微生物を含む。一部の実施形態では、組成物の各用量は、約１ｘ１０６ＣＦＵ〜１ｘ１０１２ＣＦＵのＢｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓまたはＢｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓに由来するｒＲＮＡに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列を含む微生物を含む。一部の実施形態では、組成物の各用量は、約１ｘ１０６ＣＦＵ〜１ｘ１０１２ＣＦＵのＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉまたはＣｌｏｓｔ
ｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉに由来するｒＲＮＡに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列を含む微生物を含む。一部の実施形態では、組成物の各用量は、約１ｘ１０６ＣＦＵ〜１ｘ１０１２ＣＦＵのＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍまたはＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍに由来するｒＲＮＡに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列を含む微生物を含む。一部の実施形態では、投与前に、対象は、少なくとも約１２５ｍｇ／ｄＬの空腹時血中グルコースレベルを示す。一部の実施形態では、投与前に、対象は、少なくとも約２００ｍｇ／ｄＬのブドウ糖負荷試験後の血中グルコースレベルを示す。一部の実施形態では、投与前に、対象は、食事後約１．５〜２．５時間で、少なくとも約２００ｍｇ／ｄＬの食後グルコースレベルを示す。一部の実施形態では、投与前に、対象は、総ヘモグロビンの少なくとも６．４％のｈＡ１Ｃレベルを示す。一部の実施形態では、投与前に、対象は、少なくとも約１００ｍｇ／ｄＬの空腹時血中グルコースレベルを示す。一部の実施形態では、投与前に、対象は、少なくとも約１４０ｍｇ／ｄＬのブドウ糖負荷試験後の血中グルコースレベルを示す。一部の実施形態では、投与前に、対象は、食事後約１．５〜２．５時間で、少なくとも約１４０ｍｇ／ｄＬの食後グルコースレベルを示す。一部の実施形態では、投与前に、対象は、総ヘモグロビンの少なくとも５．７％のｈＡ１Ｃレベルを示す。一部の実施形態では、投与前に、対象は、約１００ｍｇ／ｄＬ未満の空腹時血中グルコースレベルを示す。一部の実施形態では、投与前に、対象は、約１４０ｍｇ／ｄＬ未満のブドウ糖負荷試験後の血中グルコースレベルを示す。一部の実施形態では、投与前に、対象は、食事後約１．５〜２．５時間で、約１４０ｍｇ／ｄＬ未満の食後グルコースレベルを示す。一部の実施形態では、投与前に、対象は、総ヘモグロビンの５．７％未満のｈＡ１Ｃレベルを示す。一部の実施形態では、インスリン感受性は、対象において増大している。一部の実施形態では、血中グルコースレベルは、対象において安定化されている。一部の実施形態では、代謝症候群が対象において処置される。一部の実施形態では、インスリン耐性が対象において処置される。
【０００６】
一部の態様では、対象における前糖尿病を処置する方法であって、対象に、少なくとも１つの単離および精製されたブチレート産生微生物と、少なくとも１つの単離および精製されたムチン調節性微生物とを含む組成物を投与することを含み、それによって、対象における前糖尿病を処置する、方法が本明細書で開示される。
【０００７】
一部の実施形態では、組成物は、対象において、ヘモグロビンＡ１Ｃ（ｈＡ１Ｃ）レベルを、総ヘモグロビンの少なくとも０．１％低下させる。一部の実施形態では、組成物の投与は、食事負荷試験後の対象のグルコース曲線下面積（ＡＵＣ）を、対照と比較して少なくとも１０％低下させる。一部の実施形態では、対照は、投与前の対象について測定された対照ＡＵＣである。一部の実施形態では、対照は、組成物を投与されていない第２の対象に由来する対照ＡＵＣである。一部の実施形態では、投与前に、対象は、約１００ｍｇ／ｄＬ〜１２５ｍｇ／ｄＬの空腹時血中グルコースレベルを示す。一部の実施形態では、投与前に、対象は、約１４０ｍｇ／ｄＬ〜１９９ｍｇ／ｄＬのブドウ糖負荷試験後の血中グルコースレベルを示す。一部の実施形態では、投与前に、対象は、総ヘモグロビンの約５．７〜６．４％のｈＡ１Ｃレベルを示す。一部の実施形態では、投与前に、対象は、食事後約１．５〜２．５時間で、約１４０ｍｇ／ｄＬ〜１９９ｍｇ／ｄＬの食後グルコースレベルを示す。一部の実施形態では、対象は、少なくとも１ヶ月にわたって前糖尿病であった。一部の実施形態では、少なくとも１つの単離および精製されたブチレート産生微生物は、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉ、およびＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍのうちのいずれか１つまたは複数に由来するｒＲＮＡ配列に対する少なくとも約８５％の配列同一性を有する１つまたは複数のｒＲＮＡ配列を含む。一部の実施形態では、少なくとも１つの単離および精製されたブチレート産生微生物は、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉ、およびＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍのうちのいずれか１つまたは複数に由来するｒＲＮＡ配列に対する少なくとも約９０％の配列同一性を有する１つまたは複数のｒＲＮＡ配列を含む。一部の実施形態では、少なくとも１つの単離および精製されたブチレート産生微生物は、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉ、およびＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍのうちのいずれか１つまたは複数に由来するｒＲＮＡ配列に対する少なくとも約９７％の配列同一性を有する１つまたは複数のｒＲＮＡ配列を含む。一部の実施形態では、少なくとも１つの単離および精製されたブチレート産生微生物は、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉ、およびＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍからなる群から選択される１つまたは複数の微生物を含む。一部の実施形態では、少なくとも１つの単離および精製されたムチン調節性微生物は、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａのｒＲＮＡ配列に対する少なくとも約８５％の配列同一性を含むｒＲＮＡ配列を含む。一部の実施形態では、少なくとも１つの単離および精製されたムチン調節性微生物は、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａのｒＲＮＡ配列に対する少なくとも約９０％の配列同一性を含むｒＲＮＡ配列を含む。一部の実施形態では、少なくとも１つの単離および精��されたムチン調節性微生物は、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａのｒＲＮＡ配列に対する少なくとも約９７％の配列同一性を含むｒＲＮＡ配列を含む。一部の実施形態では、少なくとも１つの単離および精製されたムチン調節性微生物は、配列番号１〜６のいずれか１つに対する少なくとも約９７％の配列同一性を含むｒＲＮＡ配列を含む。一部の実施形態では、少なくとも１つの単離および精製されたムチン調節性微生物は、配列番号１〜６のいずれか１つに対する少なくとも約９９％の配列同一性を含むｒＲＮＡ配列を含む。一部の実施形態では、少なくとも１つの単離および精製されたムチン調節性微生物は、配列番号１〜６のいずれか１つであるｒＲＮＡ配列を含む。一部の実施形態では、少なくとも１つの単離および精製されたムチン調節性微生物は、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａを含む。一部の実施形態では、組成物は、メトホルミンをさらに含む。一部の実施形態では、組成物は、治療剤と同時投与される。一部の実施形態では、治療剤は、メトホルミンである。一部の実施形態では、治療剤は、スルホニルウレアである。一部の実施形態では、治療剤は、インスリンである。一部の実施形態では、組成物は、治療剤を含む。一部の実施形態では、治療剤は、メトホルミンである。一部の実施形態では、治療剤は、スルホニルウレアである。一部の実施形態では、治療剤は、インスリンである。一部の実施形態では、ｈＡ１Ｃレベルは、対象において、総ヘモグロビンの少なくとも０．２％低下する。一部の実施形態では、ｈＡ１Ｃレベルは、対象において、総ヘモグロビンの少なくとも０．３％低下する。一部の実施形態では、ｈＡ１Ｃレベルは、対象において、総ヘモグロビンの少なくとも０．４％低下する。一部の実施形態では、ｈＡ１Ｃレベルは、対象において、総ヘモグロビンの少なくとも０．５％低下する。一部の実施形態では、ｈＡ１Ｃレベルは、対象において、総ヘモグロビンの少なくとも０．６％低下する。一部の実施形態では、ｈＡ１Ｃレベルは、対象において、組成物を投与されていない第２の対象と比較して、総ヘモグロビンの少なくとも０．２％低下する。一部の実施形態では、ｈＡ１Ｃレベルは、対象において、組成物を投与されていない第２の対象と比較して、総ヘモグロビンの少なくとも０．３％低下する。一部の実施形態では、ｈＡ１Ｃレベルは、対象において、組成物を投与されていない第２の対象と比較して、総ヘモグロビンの少なくとも０．４％低下する。一部の実施形態では、ｈＡ１Ｃレベルは、対象において、組成物を投与されていない第２の対象と比較して、総ヘモグロビンの少なくとも０．５％低下する。一部の実施形態では、ｈＡ１Ｃレベルは、対象において、組成物を投与されていない第２の対象と比較して、総ヘモグロビンの少なくとも０．６％低下する。一部の実施形態では、グルコースのＡＵＣは、少なくとも１０％低下する。一部の実施形態では、グルコースのＡＵＣは、少なくとも１５％低下する。一部の実施形態では、グルコースのＡＵＣは、少なくとも２０％低下する。一部の実施形態では、グルコースのＡＵＣは、少なくとも３０％低下する。一部の実施形態では、空腹時グルコースは、対象において、���なくとも５％低下する。一部の実施形態では、空腹時グルコースは、対象において、少なくとも１０％低下する。一部の実施形態では、空腹時グルコースは、対象において、少なくとも２０％低下する。一部の実施形態では、空腹時グルコースは、対象において、少なくとも２５％低下する。一部の実施形態では、対象は、ヒトである。一部の実施形態では、対象は、併存疾患を有する。一部の実施形態では、組成物は、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉのｒＲＮＡ配列に対する少なくとも約８５％の配列同一性を含むｒＲＮＡ配列を有する１つまたは複数の微生物を含む。一部の実施形態では、組成物は、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍのｒＲＮＡ配列に対する少なくとも約８５％の配列同一性を含むｒＲＮＡ配列を有する１つまたは複数の微生物を含む。一部の実施形態では、組成物は、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓのｒＲＮＡ配列に対する少なくとも約８５％の配列同一性を含むｒＲＮＡ配列を有する１つまたは複数の微生物を含む。一部の実施形態では、組成物は、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉのｒＲＮＡ配列に対する少なくとも約８５％の配列同一性を含むｒＲＮＡ配列を有する１つまたは複数の微生物を含む。一部の実施形態では、組成物は、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａのｒＲＮＡ配列に対する少なくとも約８５％の配列同一性を含むｒＲＮＡ配列を有する１つまたは複数の微生物を含む。一部の実施形態では、組成物は、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉのｒＲＮＡ配列に対する少なくとも約９０％の配列同一性を含むｒＲＮＡ配列を有する１つまたは複数の微生物を含む。一部の実施形態では、組成物は、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍのｒＲＮＡ配列に対する少なくとも約９０％の配列同一性を含むｒＲＮＡ配列を有する１つまたは複数の微生物を含む。一部の実施形態では、組成物は、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓのｒＲＮＡ配列に対する少なくとも約９０％の配列同一性を含むｒＲＮＡ配列を有する１つまたは複数の微生物を含む。一部の実施形態では、組成物は、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉのｒＲＮＡ配列に対する少なくとも約９０％の配列同一性を含むｒＲＮＡ配列を有する１つまたは複数の微生物を含む。一部の実施形態では、組成物は、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａのｒＲＮＡ配列に対する少なくとも約９０％の配列同一性を含むｒＲＮＡ配列を有する１つまたは複数の微生物を含む。一部の実施形態では、組成物は、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉのｒＲＮＡ配列に対する少なくとも約９７％の配列同一性を含むｒＲＮＡ配列を有する１つまたは複数の微生物を含む。一部の実施形態では、組成物は、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍのｒＲＮＡ配列に対する少なくとも約９７％の配列同一性を含むｒＲＮＡ配列を有する１つまたは複数の微生物を含む。一部の実施形態では、組成物は、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓのｒＲＮＡ配列に対する少なくとも約９７％の配列同一性を含むｒＲＮＡ配列を有する１つまたは複数の微生物を含む。一部の実施形態で��、組成物は、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉのｒＲＮＡ配列に対する少なくとも約９７％の配列同一性を含むｒＲＮＡ配列を有する１つまたは複数の微生物を含む。一部の実施形態では、組成物は、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａのｒＲＮＡ配列に対する少なくとも約９７％の配列同一性を含むｒＲＮＡ配列を有する１つまたは複数の微生物を含む。一部の実施形態では、組成物は、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉを含む。一部の実施形態では、組成物は、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍを含む。一部の実施形態では、組成物は、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓを含む。一部の実施形態では、組成物は、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａを含む。一部の実施形態では、組成物は、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉを含む。一部の実施形態では、組成物は、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍ、およびＢｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓを含む。一部の実施形態では、組成物は、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓ、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａ、およびＥｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉを含む。一部の実施形態では、組成物は、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓ、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａ、およびＥｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉを含む。一部の実施形態では、組成物は、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓ、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａ、およびＥｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉを含む。一部の実施形態では、組成物は、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉ、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａ、およびＥｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉを含む。一部の実施形態では、組成物は、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉおよびＢｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓを含む。一部の実施形態では、組成物は、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  
ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓ、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａ、およびＥｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉを含む。一部の実施形態では、組成物は、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓ、およびＡｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａを含む。一部の実施形態では、組成物は、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓ、およびＡｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａを含む。一部の実施形態では、組成物は、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉおよびＡｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａを含む。一部の実施形態では、組成物は、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉ、およびＡｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａを含む。一部の実施形態では、組成物は、少なくとも２つの微生物を含む。一部の実施形態では、組成物は、少なくとも３つの微生物を含む。一部の実施形態では、組成物は、少なくとも４つの微生物を含む。一部の実施形態では、組成物は、少なくとも５つの微生物を含む。一部の実施形態では、組成物は、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓ、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａ、およびＥｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉからなる群から選択される少なくとも２つの微生物を含む。一部の実施形態では、組成物は、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓ、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａ、およびＥｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉからなる群から選択される少なくとも３つの微生物を含む。一部の実施形態では、組成物は、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓ、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａ、およびＥｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉからなる群から選択される少なくとも４つの微生物を含む。一部の実施形態では、組成物は、単位剤形中にある。一部の実施形態では、組成物は、食品または飲料である。一部の実施形態では、組成物は、栄養補助食品である。一部の実施形態では、栄養補助食品は、フードバーの形態にある。一部の実施形態では、栄養補助食品は、粉末の形態にある。一部の実施形態では、栄養補助食品は、液体の形態にある。一部の実施形態では、組成物は、医薬組成物である。一部の実施形態では、組成物は、ピルまたはカプセルの形態にある。一部の実施形態では、ピルまたはカプセルは、ピルまたはカプセルの内容物を、対象の回腸、対象の結腸、またはその組合せに放出するように設計された腸溶コーティングを含む。一部の実施形態では、それぞ���のピルまたはカプセルは、少なくとも１ｘ１０６ＣＦＵの総微生物を含む。一部の実施形態では、それぞれのピルまたはカプセルは、少なくとも１ｘ１０６ＣＦＵの少なくとも１つの単離および精製されたムチン調節性微生物を含む。一部の実施形態では、それぞれのピルまたはカプセルは、少なくとも１ｘ１０６ＣＦＵの少なくとも１つの単離および精製されたブチレート産生微生物を含む。一部の実施形態では、それぞれのピルまたはカプセルは、少なくとも１ｘ１０６ＣＦＵのＡｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａ、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａに由来するｒＲＮＡに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列を含む微生物、または配列番号１〜６のいずれか１つに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列を含む微生物を含む。一部の実施形態では、それぞれのピルまたはカプセルは、少なくとも１ｘ１０６ＣＦＵのＥｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉまたはＥｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉに由来するｒＲＮＡに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列を含む微生物を含む。一部の実施形態では、それぞれのピルまたはカプセルは、少なくとも１ｘ１０６ＣＦＵのＢｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓまたはＢｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓに由来するｒＲＮＡに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列を含む微生物を含む。一部の実施形態では、それぞれのピルまたはカプセルは、少なくとも１ｘ１０６ＣＦＵのＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉまたはＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉに由来するｒＲＮＡに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列を含む微生物を含む。一部の実施形態では、それぞれのピルまたはカプセルは、少なくとも１ｘ１０６ＣＦＵのＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍまたはＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍに由来するｒＲＮＡに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列を含む微生物を含む。一部の実施形態では、それぞれのピルまたはカプセルは、約１ｘ１０６ＣＦＵ〜１ｘ１０１２ＣＦＵの総微生物を含む。一部の実施形態では、それぞれのピルまたはカプセルは、約１ｘ１０６ＣＦＵ〜１ｘ１０１２ＣＦＵの少なくとも１つの単離および精製されたムチン調節性微生物を含む。一部の実施形態では、それぞれのピルまたはカプセルは、約１ｘ１０６ＣＦＵ〜１ｘ１０１２ＣＦＵの少なくとも１つの単離および精製されたブチレート産生微生物を含む。一部の実施形態では、それぞれのピルまたはカプセルは、約１ｘ１０６ＣＦＵ〜１ｘ１０１２ＣＦＵのＡｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａ、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａに由来するｒＲＮＡに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列を含む微生物、または配列番号１〜６のいずれか１つに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列を含む微生物を含む。一部の実施形態では、それぞれのピルまたはカプセルは、少なくとも１ｘ１０６ＣＦＵ〜１ｘ１０１２ＣＦＵのＥｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ��ａｌｌｉｉまたはＥｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉに由来するｒＲＮＡに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列を含む微生物を含む。一部の実施形態では、それぞれのピルまたはカプセルは、約１ｘ１０６ＣＦＵ〜１ｘ１０１２ＣＦＵのＢｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓまたはＢｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓに由来するｒＲＮＡに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列を含む微生物を含む。一部の実施形態では、それぞれのピルまたはカプセルは、約１ｘ１０６ＣＦＵ〜１ｘ１０１２ＣＦＵのＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉまたはＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉに由来するｒＲＮＡに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列を含む微生物を含む。一部の実施形態では、それぞれのピルまたはカプセルは、約１ｘ１０６ＣＦＵ〜１ｘ１０１２ＣＦＵのＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍまたはＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍに由来するｒＲＮＡに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列を含む微生物を含む。一部の実施形態では、１用量の組成物は、少なくとも１つの１つのピルまたはカプセルを含む。一部の実施形態では、１用量の組成物は、少なくとも２つのピルまたはカプセルを含む。一部の実施形態では、１用量の組成物は、１〜６つのピルまたはカプセルを含む。一部の実施形態では、組成物は、少なくとも毎週、対象に投与される。一部の実施形態では、組成物は、少なくとも毎日、対象に投与される。一部の実施形態では、組成物は、少なくとも１日２回、対象に投与される。一部の実施形態では、組成物の各用量は、少なくとも１ｘ１０６ＣＦＵの総微生物を含む。一部の実施形態では、組成物の各用量は、少なくとも１ｘ１０６ＣＦＵの少なくとも１つの単離および精製されたムチン調節性微生物を含む。一部の実施形態では、組成物の各用量は、少なくとも１ｘ１０６ＣＦＵの少なくとも１つの単離および精製されたブチレート産生微生物を含む。一部の実施形態では、組成物の各用量は、少なくとも１ｘ１０６ＣＦＵのＡｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａ、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａに由来するｒＲＮＡに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列を含む微生物、または配列番号１〜６のいずれか１つに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列を含む微生物を含む。一部の実施形態では、組成物の各用量は、少なくとも１ｘ１０６ＣＦＵのＥｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉまたはＥｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉに由来するｒＲＮＡに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列を含む微生物を含む。一部の実施形態では、組成物の各用量は、少なくとも１ｘ１０６ＣＦＵのＢｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓまたはＢｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓに由来するｒＲＮＡに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列を含む微生物を含む。一部の実施形態では、組成物の各用量は、少なくとも１ｘ１０６ＣＦＵのＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ���ｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉまたはＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉに由来するｒＲＮＡに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列を含む微生物を含む。一部の実施形態では、組成物の各用量は、少なくとも１ｘ１０６ＣＦＵのＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍまたはＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍに由来するｒＲＮＡに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列を含む微生物を含む。一部の実施形態では、組成物の各用量は、約１ｘ１０６ＣＦＵ〜１ｘ１０１２ＣＦＵの総微生物を含む。一部の実施形態では、組成物の各用量は、約１ｘ１０６ＣＦＵ〜１ｘ１０１２ＣＦＵの少なくとも１つの単離および精製されたムチン調節性微生物を含む。一部の実施形態では、組成物の各用量は、約１ｘ１０６ＣＦＵ〜１ｘ１０１２ＣＦＵの少なくとも１つの単離および精製されたブチレート産生微生物を含む。一部の実施形態では、組成物の各用量は、約１ｘ１０６ＣＦＵ〜１ｘ１０１２ＣＦＵのＡｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａ、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａに由来するｒＲＮＡに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列を含む微生物、または配列番号１〜６のいずれか１つに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列を含む微生物を含む。一部の実施形態では、組成物の各用量は、約１ｘ１０６ＣＦＵ〜１ｘ１０１２ＣＦＵのＥｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉまたはＥｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉに由来するｒＲＮＡに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列を含む微生物を含む。一部の実施形態では、組成物の各用量は、約１ｘ１０６ＣＦＵ〜１ｘ１０１２ＣＦＵのＢｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒ
ｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓまたはＢｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓに由来するｒＲＮＡに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列を含む微生物を含む。一部の実施形態では、組成物の各用量は、約１ｘ１０６ＣＦＵ〜１ｘ１０１２ＣＦＵのＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉまたはＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉに由来するｒＲＮＡに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列を含む微生物を含む。一部の実施形態では、組成物の各用量は、約１ｘ１０６ＣＦＵ〜１ｘ１０１２ＣＦＵのＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍまたはＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍに由来するｒＲＮＡに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列を含む微生物を含む。一部の実施形態では、インスリン感受性は、対象において増大している。一部の実施形態では、血中グルコースレベルは、対象において安定化されている。一部の実施形態では、代謝症候群が対象において処置される。一部の実施形態では、インスリン耐性が対象において処置される。
【０００８】
一部の態様では、ヘモグロビンＡ１Ｃ（ｈＡ１Ｃ）レベルが上昇した対象を処置する方法であって、対象に、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓ、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａ、およびＥｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉを含む組成物を経口投与することを含み、それによって、対象中のｈＡ１Ｃレベルを、総ヘモグロビンの少なくとも０．２％低下させ、組成物が、対象の回腸、対象の結腸、またはその組合せにピルまたはカプセルの内容物を放出するように設計された腸溶コーティングを含むピルまたはカプセルの形態にあり、対象がヒトである、方法が本明細書で開示される。
【０００９】
一部の態様では、対象における前糖尿病を処置する方法であって、対象に、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓ、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａ、およびＥｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉを含む組成物を経口投与することを含み、それによって、対象における前糖尿病を処置し、組成物が、対象の回腸、対象の結腸、またはその組合せにピルまたはカプセルの内容物を放出するように設計された腸溶コーティングを含むピルまたはカプセルの形態にあり、対象がヒトである、方法が本明細書で開示される。
【００１０】
一部の態様では、ヘモグロビンＡ１Ｃ（ｈＡ１Ｃ）レベルが上昇した対象を処置する方法であって、対象に、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓ、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａ、およびＥｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉを含む組成物を経口投与することを含み、それによって、対象中のｈＡ１Ｃレベルを、総ヘモグロビンの少なくとも０．２％低下させ、組成物が、栄養補助食品であり、対象がヒトである、方法が本明細書で開示される。
【００１１】
一部の実施形態では、栄養補助食品はフードバーの形態にある。一部の実施形態では、栄養補助食品は粉末の形態にある。一部の実施形態では、栄養補助食品は液体の形態にある。
【００１２】
一部の態様では、対象における前糖尿病を処置する方法であって、対象に、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓ、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａ、およびＥｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉを含む組成物を経口投与することを含み、それによって、対象中の前糖尿病を処置し、組成物が栄養補助食品であり、対象がヒトである、方法が本明細書で開示される。
【００１３】
一部の実施形態では、栄養補助食品は、フードバーの形態にある。一部の実施形態では、栄養補助食品は、粉末の形態にある。一部の実施形態では、栄養補助食品は、液体の形態にある。
【００１４】
本開示のさらなる態様および利点は、本開示の例示的な実施形態のみが示され、記載される以下の詳細な説明から、当業者には容易に明らかとなるであろう。気付かれるように、本開示は、他の異なる実施形態を可能にし、そのいくつかの詳細は、全て本開示から逸脱することなく、様々な自明の点で改変を可能にする。したがって、図面および説明は、事実上例示的なものであり、制限的なものではないと見なされるべきである。
参照による組込み
【００１５】
本明細書に記載の全ての刊行物、特許、および特許出願は、あたかもそれぞれ個々の刊行物、特許、または特許出願が具体的かつ個別的に参照により組み込まれると示されたのと同程度まで参照により本明細書に組み込まれる。参照により組み込まれた刊行物および特許または特許出願が本明細書に含まれる開示と相反する程度まで、本明細書は、任意のそのような相反する材料に取って代わる、および／または優先することが意図される。
【００１６】
本発明の新規特徴は、添付の特許請求の範囲に詳細に記載される。本発明の特徴および利点のより良い理解は、本発明の原理を利用する、例示的実施形態を記載する以下の詳細な説明、および添付の図面（本明細書では「図面」および「図」ともいう）を参照することによって得られるであろう。
【図面の簡単な説明】
【００１７】
【図１】図１は、本明細書に記載の処置期間にわたってプラセボ処置および微生物組成物を受けている対象における、長期グルコース制御の尺度であり得る、ヘモグロビンＡ１Ｃ（「ｈＡ１Ｃ」）のレベルの相対変化を示す。
【００１８】
【図２】図２は、本明細書に記載の処置期間にわたってプラセボ処置および微生物組成物を受けている対象における、食事負荷試験（「ＭＴＴ」）後のグルコース曲線下面積（「ＡＵＣ」）の相対変化を示す。
【００１９】
【図３】図３Ａ〜図３Ｄは、スルホニルウレアを含む、または含まない本明細書に記載の微生物組成物を投与された対象群についての、処置期間にわたる、全患者（図３Ａ）およびスルホニルウレアを投与されていない患者（図３Ｂ）に関する食事負荷試験後のグルコース曲線下面積の、プラセボ群と比較した相対変化、ならびに全患者（図３Ｃ）およびスルホニルウレアを投与されていない患者（図３Ｄ）に関するヘモグロビンＡ１Ｃの、プラセボ群と比較した相対変化を示す。
【００２０】
【図４】図４は、プラセボ対照、二重盲検、無作為化クロスオーバー試験の期を示す。対象を、２群に無作為に分配した。３日のベースライン期間の後、一方の群は２週間の処置期を開始し、他方の群は２週間のプラセボ期を開始した。プラセボ期の間に、対象は１日２回、コロイド性二酸化ケイ素プラセボを投与された。処置期の間に、対象は１日２回、プレバイオティック、ムチン調節性微生物、ならびに少なくとも１つのブチレート産生微生物とを含有する単離および精製された微生物の組成物を投与された。２週間の処置またはプラセボ期の後、両群は、プラセボまたは処置組成物を投与しない３日間の「ウォッシュアウト」期を経た。ウォッシュアウト期の後、プラセボ／処置期を「クロスオーバー」させた：以前に処置期を受けた群は、プラセボ期を開始し、以前にプラセボ期を受けた群は、処置期を開始した。それぞれのプラセボ／処置期の開始および終了時に、対象は食事負荷試験（ＭＴＴ）を受けた。
【００２１】
【図５】図５は、持続グルコースモニタリング（ＣＧＭ）によって収集されたデータの例を提供する。
【００２２】
【図６】図６は、持続グルコースモニタリング（ＣＧＭ）中に食品、飲料、および活動を記録している対象の例を提供する。
【００２３】
【図７】図７は、持続グルコースモニタリング（ＣＧＭ）中に食事負荷試験（ＭＴＴ）を記録している対象に由来するデータの例を提供する。
【００２４】
【図８】図８は、処置期の開始時（すなわち、単離および精製された微生物の組成物を受ける前）に食事負荷試験（ＭＴＴ）を受けている６人の対象に関するグルコース濃度曲線を提供する。
【００２５】
【図９】図９は、処置期の開始からのグルコース濃度曲線に重ね合わせた、処置期の終了時（すなわち、単離および精製された微生物の組成物を受けた後）に食事負荷試験（ＭＴＴ）を受けている５人の対象に関するグルコース濃度曲線を提供する。
【００２６】
【図１０】図１０は、式ΔΔＡＵＣ＝ΔＡＵＣＴＲＥＡＴＭＥＮＴ−ΔＡＵＣＰＬＡＣＥＢＯを使用して算出された、各対象に関するプラセボ期と処置期との間のＡＵＣの差異を示す。負のΔΔＡＵＣ値は、処置がプラセボと比較して血中グルコース制御の改善をもたらしたことを示す。
【００２７】
【図１１Ａ】図１１Ａは、対象における短鎖脂肪酸（ＳＣＦＡ）代謝を変更するための戦略を示す。結腸中の微生物は、例えば、Ｇタンパク質共役受容体（ＧＰＣＲ）シグナル伝達を変更すること、ＧＬＰ−１分泌を変更すること、インスリン感受性を増大させること、食欲を低下させること、またはその組合せによって、食物繊維を、有益な下流の効果を有し得るブチレートに変換させることができる。本開示の組成物および方法を使用して、対象中の微生物叢（ｍｉｃｒｏｂｉｏｍｅ）を変更して、ブチレート産生を促進することができる。例えば、対象中の微生物叢を、プレバイオティックをブチレート中間体（例えば、アセテートなどの、ブチレート産生のための基質として働き得る中間体）に変換することができる増大したレベルの１つまたは複数の一次発酵微生物を含む、およびブチレート中間体をブチレートに変換することができる増大したレベルの１つまたは複数の二次発酵微生物を含むように改変することができる。
【００２８】
【図１１Ｂ】図１１Ｂは、本開示の微生物によって産生される短鎖脂肪酸であるアセテートおよびブチレートのレベルを示す。微生物Ａ〜Ｄは、ブチレート中間体（例えば、ブチレート産生微生物によるブチレート産生のための基質として働く）であってよい、アセテートを主に産生した。微生物Ｅ、Ｆ、およびＧは、主にブチレートを産生した。
【００２９】
【図１２】図１２は、マウス食餌誘導性肥満モデルにおける経口ブドウ糖負荷試験（ＯＧＴＴ）に由来する例示的データセットを描写する。本開示の組成物を投与されたマウスは、ＯＧＴＴ中に対照マウスよりも有意に低い血中グルコースレベルを示した。
【００３０】
【図１３】図１３は、糞便試料中の微生物の存在量を示す。ヒト対象から、彼らが本開示の単離および精製された微生物を含むピルの摂取を開始する前に、彼らがピルを摂取している間（７日目−低用量；および１４日目−高用量）、および彼らがピルの摂取を中止する１４日間のウォッシュアウト期間の後に、糞便試料を収集した。
【００３１】
【図１４】図１４は、本開示の組成物および方法をどのように使用して、対象中の微生物叢を変更して健康利益を惹起するかの例を提供する。本開示の組成物は、対象においてブチレートを産生させるための微生物の組合せを含んでもよい。例えば、組合せは、エネルギー源またはプレバイオティック（例えば、繊維）と共に提供した場合に、ブチレート中間体（例えば、ラクテート、アセテート、ムチン由来糖）を産生することができる、１つまたは複数の一次発酵微生物および／またはムチン調節性微生物を含んでもよい。本開示の組成物は、ブチレート中間体をブチレートに変換することができる、１つまたは複数の二次発酵微生物および／またはブチレート産生微生物を含んでもよい。
【発明を実施するための形態】
【００３２】
本発明の様々な実施形態を本明細書に示し、説明してきたが、そのような実施形態は、ほんの一例として提供されることが当業者には明らかであろう。当業者であれば、本発明から逸脱することなく、いくつかの変形形態、変化および置換を想到するであろう。本明細書に記載の本発明の実施形態に対する様々な代替手段を使用することができることが理解されるべきである。
【００３３】
対象に、１つまたは複数のブチレート産生微生物および１つまたは複数のムチン調節性微生物を含む組成物を投与することを含む、２型糖尿病または前糖尿病を処置するための方法が本明細書に開示される。そのような組成物は、対象中のヘモグロビンＡ１Ｃレベルを低下させることができる。本明細書に開示される一部の組成物は、食事負荷試験（ＭＴＴ）後の対象に関するグルコース曲線下面積（ＡＵＣ）を低下させることができる。一部の実施形態では、本明細書に開示される組成物は、対象における空腹時グルコースレベルを低下させることができる。
【００３４】
様々な障害を処置し、福祉を改善するための微生物叢の変更は、興味深く、探究すべき領域である。前糖尿病および２型糖尿病は、人口の大部分が罹患し得る障害の例である。前糖尿病および２型糖尿病は、有意な健康問題と関連し得る。一部の場合、前糖尿病および２型糖尿病は、良好に制御されないか、または良好に制御することができない。かくして、２型糖尿病を管理する、制御する、処置する、または治癒させるために微生物叢を変更させることは興味深いものであってよい。
【００３５】
糖尿病を処置する現行の方法としては、チアゾリジンジオン、グリプチン、ＧＬＰ−１アゴニスト、ＳＬＧＴ２阻害剤、ジペプチジルペプチダーゼ４阻害剤、インスリン療法、メトホルミン、スルホニルウレアの使用、食事、および運動が挙げられる。しかしながら、これらの方法は、コンプライアンス不良、低血糖症、心血管疾患リスクの増大、膵炎、ケトアシドーシス、下肢切断、下痢、貧血、悪心、萎縮、アレルギー、アテローム性動脈硬化症、および骨折リスクの増大を含む、ある特定の望ましくない副作用と関連してきた。本明細書に開示される組成物およびそれを使用するための方法は、そのような望ましくない副作用なしに、少なくとも一部の手段によって同等の治療結果をもたらすことができる。さらに、本明細書に開示される組成物は、同時投与した場合、ある特定の治療剤、例えば、メトホルミンの治療効果をさらにモジュレートするか、または増強することができる。
【００３６】
前糖尿病および／または２型糖尿病を防止する、管理する、制御する、処置する、または治癒させるためのプロバイオティック組成物およびプロバイオティック組成物を使用する方法が本明細書に開示される。一部の場合、組成物は、治療的であってよい。一部のプロバイオティック組成物は、一時的に微生物叢を変更することができる。一部のプロバイオティック組成物は、微生物叢を永続的に、または長期間にわたって変更することができる（例えば、組成物中で投与される微生物は、組成物がもはや投与されない後であっても、対象の腸内微生物叢中で生存し、増殖し続けることができる）。一部の場合、微生物叢の変更は、前糖尿病を有する対象および／または２型糖尿病を有する対象のための治療効果を提供することができる。一部の場合、治療効果は、インスリン分泌の増加を含んでもよい。一部の場合、治療効果は、インスリン耐性の低下を含んでもよい。治療効果は、例えば、空腹時グルコースレベルの低下、ヘモグロビンＡ１Ｃレベルの低下、食後グルコースレベルの低下、または食事負荷試験（ＭＴＴ）後のグルコース曲線下面積（ＡＵＣ）の減少を示す検査によって示すことができる。患者が現在インスリン療法にある場合、治療効果は、インスリンの必要性の低下または除去を含んでもよい。
【００３７】
用語「微生物（ｍｉｃｒｏｂｅ）」および「微生物（ｍｉｃｒｏｏｒｇａｎｉｓｍ）」は、本明細書では互換的に使用することができ、細菌、古細菌、真核生物（例えば、原生動物、真菌、酵母）、および細菌ウイルス（すなわち、ファージ）を含むウイルスを指してもよい。
【００３８】
用語「微生物叢（ｍｉｃｒｏｂｉｏｍｅ）」、「微生物相（ｍｉｃｒｏｂｉｏｔａ）」、および「微生物生息環境（ｍｉｃｒｏｂｉａｌ  ｈａｂｉｔａｔ）」は、本明細書では互換的に使用され、対象の身体の上または中で生きる微生物の生態学的共同体を指してもよい。微生物叢は、片利共生、共生、および／または病原性微生物から構成されていてもよい。微生物叢は、対象の多くの、またはほとんどの部分の上または中に存在してもよい。微生物叢の生息環境の一部の非限定例としては、体表面、体腔、体液、腸、結腸、皮膚表面および毛穴、膣腔、臍部、結膜領域、腸領域、胃、鼻腔および鼻孔、消化管、尿生殖路、唾液、粘液、および糞便が挙げられる。
【００３９】
本明細書で使用される場合、用語「プレバイオティック」は、宿主における微生物の増殖および／または活動に影響し得る（例えば、組成物中の特異的変化および／または微生物叢中での活動を可能にし得る）化学物質および／または成分を指す一般的用語であってもよい。プレバイオティクスは、宿主に対して健康利益を提供することができる。プレバイオティクスは、例えば、結腸中で選択的に発酵され得る。プレバイオティクスの一部の非限定例としては、複合炭水化物、複合糖質、難消化性デキストリン、難消化性デンプン、アミノ酸、ペプチド、栄養化合物、ビオチン、ポリデキストロース、オリゴ糖、多糖、フルクトオリゴ糖（ＦＯＳ）、フルクタン、可溶性繊維、不溶性繊維、繊維、デンプン、ガラクトオリゴ糖（ＧＯＳ）、イヌリン、リグニン、オオバコ、キチン、キトサン、ゴム（例えば、グアーガム）、高アミローストウモロコシデンプン（ＨＡＳ）、セルロース、β−グルカン、ヘミセルロース、ラクツロース、マンノオリゴ糖、マンナンオリゴ糖（ＭＯＳ）、オリゴフルクトース強化イヌリン、オリゴフルクトース、オリゴデキストロース、タガトース、ｔｒａｎｓ−ガラクトオリゴ糖、ペクチン、難消化性デンプン、キシロオリゴ糖（ＸＯＳ）、ローカストビーンガム、Ｐ−グルカン、およびメチルセルロースが挙げられる。プレバイオティクスは、食品（例えば、アカシアゴム、グアー種子、玄米、米ぬか、玄麦、チコリー根、キクイモ、タンポポ若葉、ニンニク、ニラネギ、タマネギ、アスパラガス、ふすま、オート麦のふすま、ベークドビーンズ、全粒小麦粉、バナナ）、および母乳中に見出すことができる。プレバイオティクスを、他の形態（例えば、カプセルまたは栄養補助食品の一部として）で投与することもできる。プレバイオティクスを、微生物を含む組成物（例えば、プロバイオティクス）の一部として投与することができる。プレバイオティクスを、プロバイオティクスと同時投与するか、またはプロバイオティクスと別々に投与することができる。
【００４０】
本明細書で使用される場合、用語「プロバイオティック」は、適切に投与した場合、宿主または対象に対して健康利益を提供することができる、１つまたは複数の微生物を意味してもよい。微生物の一部の非限定例は、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａ、Ａｎａｅｒｏｓｔｉｐｅｓ  ｃａｃｃａｅ、Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ  ｓｔｅｒｃｏｒｉｓ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ａｄｏｌｅｓｃｅｎｔｉｓ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｂｉｆｉｄｕｍ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｌｏｎｇｕｍ、Ｂｕｔｙｒｉｖｉｂｒｉｏ  ｆｉｂｒｉｓｏｌｖｅｎｓ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ａｃｅｔｏｂｕｔｙｌｉｃｕｍ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ａｍｉｎｏｐｈｉｌｕｍ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｃｏｌｉｎｕｍ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｃｏｃｃｏｉｄｅｓ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｉｎｄｏｌｉｓ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｎｅｘｉｌｅ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｏｒｂｉｓｃｉｎｄｅｎｓ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｐｒｏｐｉｏｎｉｃｕｍ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｘｙｌａｎｏｌｙｔｉｃｕｍ、Ｃｏｌｌｉｎｓｅｌｌａ  ａｅｒｏｆａｃｉｅｎｓ、Ｅｎｔｅｒｏｃｏｃｃｕｓ  ｆａｅｃｉｕｍ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｒｅｃｔａｌｅ、Ｆａｅｃａｌｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｐｒａｕｓｎｉｔｚｉｉ、Ｆｉｂｒｏｂａｃｔｅｒ  ｓｕｃｃｉｎｏｇｅｎｅｓ、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ａｃｉｄｏｐｈｉｌｕｓ、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｂｒｅｖｉｓ、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｂｕｌｇａｒｉｃｕｓ、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃａｓｅｉ、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃａｕｃａｓｉｃｕｓ、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｆｅｒｍｅｎｔｕｍ、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｈｅｌｖｅｔｉｃｕｓ、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｌａｃｔｉｓ、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｐｌａｎｔａｒｕｍ、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｒｅｕｔｅｒｉ、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｒｈａｍｎｏｓｕｓ、Ｏｓｃｉｌｌｏｓｐｉｒａ  ｇｕｉｌｌｉｅｒｍｏｎｄｉｉ、Ｒｏｓｅｂｕｒｉａ  ｃｅｃｉｃｏｌａ、Ｒｏｓｅｂｕｒｉａ  ｉｎｕｌｉｎｉｖｏｒａｎｓ、Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ  ｆａｅｃｉｓ、Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ  ｆｌａｖｅｆａｃｉｅｎｓ、Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ  ｇｎａｖｕｓ、Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ  ｏｂｅｕｍ、Ｓｔｅｎｏｔｒｏｐｈｏｍｏｎａｓ  ｎｉｔｒｉｔｉｒｅｄｕｃｅｎｓ、Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ  ｃｒｅｍｏｒｉｓ、Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ  ｆａｅｃｉｕｍ、Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ  ｉｎｆａｎｔｉｓ、Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ  ｍｕｔａｎｓ、Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ  ｔｈｅｒｍｏｐｈｉｌｕｓ、Ａｎａｅｒｏｆｕｓｔｉｓ  ｓｔｅｒｃｏｒｉｈｏｍｉｎｉｓ、Ａｎａｅｒｏｓｔｉｐｅｓ  ｈａｄｒｕｓ、Ａｎａｅｒｏｔｒｕｎｃｕｓ  ｃｏｌｉｈｏｍｉｎｉｓ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｓｐｏｒｏｇｅｎｅｓ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｔｅｔａｎｉ、Ｃｏｐｒｏｃｏｃｃｕｓ、Ｃｏｐｒｏｃｏｃｃｕｓ  ｅｕｔａｃｔｕｓ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｃｙｌｉｎｄｒｏｉｄｅｓ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｄｏｌｉｃｈｕｍ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｖｅｎｔｒｉｏｓｕｍ、Ｒｏｓｅｂｕｒｉａ  ｆａｅｃｃｉｓ、Ｒｏｓｅｂｕｒｉａ  ｈｏｍｉｎｉｓ、Ｒｏｓｅｂｕｒｉａ  ｉｎｔｅｓｔｉｎａｌｉｓ、Ｌａｃａｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｂｉｆｉｄｕｓ、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｊｏｈｎｓｏｎｉｉ、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｉ、Ａｃｉｄａｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ  ｆｅｒｍｅｎｔａｎｓ、Ａｃｉｄａｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ  ｉｎｔｅｓｔｉｎｅ、Ｂｌａｕｔｉａ  ｈｙｄｒｏｇｅｎｏｔｒｏｐｈｉｃａ、Ｃｉｔｒｏｂａｃｔｅｒ  ａｍａｌｏｎａｔｉｃｕｓ、Ｃｉｔｒｏｂａｃｔｅｒ  ｆｒｅｕｎｄｉｉ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ａｍｉｎｏｂｕｔｙｒｉｃｕｍ  Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂａｒｔｌｅｔｔｉｉ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｃｏｃｈｌｅａｒｉｕｍ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｋｌｕｙｖｅｒｉ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｌｉｍｏｓｕｍ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｍａｌｅｎｏｍｉｎａｔｕｍ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｐａｓｔｅｕｒｉａｎｕｍ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｐｅｐｔｉｄｉｖｏｒａｎｓ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｓａｃｃｈａｒｏｂｕｔｙｌｉｃｕｍ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｓｐｏｒｏｓｐｈａｅｒｏｉｄｅｓ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｓｔｉｃｋｌａｎｄｉｉ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｓｕｂｔｅｒｍｉｎａｌｅ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｓｙｍｂｉｏｓｕｍ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｔｅｔａｎｏｍｏｒｐｈｕｍ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｏｘｉｄｏｒｅｄｕｃｅｎｓ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｐｙｒｕｖａｔｉｖｏｒａｎｓ、Ｍｅｔｈａｎｏｂｒｅｖｉｂａｃｔｅｒ  ｓｍｉｔｈｉｉ、Ｍｏｒｇａｎｅｌｌａ  ｍｏｒｇａｎｉｉ、Ｐｅｐｔｏｎｉｐｈｉｌｕｓ  ａｓａｃｃｈａｒｏｌｙｔｉｃｕｓ、Ｐｅｐｔｏｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ、およびその任意の組合せからなる群から選択される１つまたは複数の単離および精製された微生物であってもよい。
【００４１】
対象（例えば、腸管）への微生物またはプロバイオティック組成物（例えば、プロバイオティクス）の投与は、多くの治療利益を提供することができる。例えば、腸内微生物相は、健康な消化（ＧＩ）管を維持することによって疾患に対して保護することができる。微生物組成物の投与は、例えば、障害を処置する、および／または病原体を鎮圧するための、天然の非侵襲的な方法と考えることができる。プロバイオティクスを、単独で、食品と共に、食品中で、医薬品と同時に、またはその任意の組合せで、経口投与することができる。
組成物
【００４２】
本明細書に記載される「プロバイオティック組成物」（本明細書では「微生物組成物」または「組成物」とも称される）は、微生物を含んでもよい。組成物中の微生物は、１つまたは複数のブチレート産生微生物と、１つまたは複数のムチン調節性微生物とを含んでもよい。
【００４３】
本開示のプロバイオティック組成物は、２つの微生物を含んでもよい。本開示のプロバイオティック組成物は、３つの微生物を含んでもよい。本開示のプロバイオティック組成物は、４つの微生物を含んでもよい。一部のプロバイオティック組成物は、３〜５つの微生物を含んでもよい。一部のプロバイオティック組成物は、５つを超える微生物を含んでもよい。一部の実施形態では、本開示のプロバイオティック組成物は、５つの微生物を含む。
【００４４】
本明細書に記載の組成物は、少なくとも１つの単離および精製されたブチレート産生微生物と、少なくとも１つの単離および精製されたムチン調節性微生物とを含んでもよい。一部の場合、本開示の組成物は、特定の微生物種の実質的に均一な集団を生産するための、単離および精製された微生物から培養される少なくとも１つの微生物集団を含む。考察を容易にするために、そのような集団は一般に、単離および精製された微生物または単離および精製された微生物の集団であると本明細書で称することもできる。また、本明細書で使用される場合、組成物は、集団が本明細書に記載のように予め単離および精製されたそのような集団の混合物を含んでもよい。
【００４５】
一例では、本開示の組成物は、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａ、Ａｎａｅｒｏｓｔｉｐｅｓ  ｃａｃｃａｅ、Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ  ｓｔｅｒｃｏｒｉｓ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ａｄｏｌｅｓｃｅｎｔｉｓ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｂｉｆｉｄｕｍ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｌｏｎｇｕｍ、Ｂｕｔｙｒｉｖｉｂｒｉｏ  ｆｉｂｒｉｓｏｌｖｅｎｓ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ａｃｅｔｏｂｕｔｙｌｉｃｕｍ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ａｍｉｎｏｐｈｉｌｕｍ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｃｏｌｉｎｕｍ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｃｏｃｃｏｉｄｅｓ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｉｎｄｏｌｉｓ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｎｅｘｉｌｅ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｏｒｂｉｓｃｉｎｄｅｎｓ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｐｒｏｐｉｏｎｉｃｕｍ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｘｙｌａｎｏｌｙｔｉｃｕｍ、Ｃｏｌｌｉｎｓｅｌｌａ  ａｅｒｏｆａｃｉｅｎｓ、Ｅｎｔｅｒｏｃｏｃｃｕｓ  ｆａｅｃｉｕｍ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｒｅｃｔａｌｅ、Ｆａｅｃａｌｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｐｒａｕｓｎｉｔｚｉｉ、Ｆｉｂｒｏｂａｃｔｅｒ  ｓｕｃｃｉｎｏｇｅｎｅｓ、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ａｃｉｄｏｐｈｉｌｕｓ、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｂｒｅｖｉｓ、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｂｕｌｇａｒｉｃｕｓ、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃａｓｅｉ、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃａｕｃａｓｉｃｕｓ、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｆｅｒｍｅｎｔｕｍ、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｈｅｌｖｅｔｉｃｕｓ、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｌａｃｔｉｓ、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｐｌａｎｔａｒｕｍ、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｒｅｕｔｅｒｉ、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｒｈａｍｎｏｓｕｓ、Ｏｓｃｉｌｌｏｓｐｉｒａ  ｇｕｉｌｌｉｅｒｍｏｎｄｉｉ、Ｒｏｓｅｂｕｒｉａ  ｃｅｃｉｃｏｌａ、Ｒｏｓｅｂｕｒｉａ  ｉｎｕｌｉｎｉｖｏｒａｎｓ、Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ  ｆａｅｃｉｓ、Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ  ｆｌａｖｅｆａｃｉｅｎｓ、Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ  ｇｎａｖｕｓ、Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ  ｏｂｅｕｍ、Ｓｔｅｎｏｔｒｏｐｈｏｍｏｎａｓ  ｎｉｔｒｉｔｉｒｅｄｕｃｅｎｓ、Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ  ｃｒｅｍｏｒｉｓ、Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ  ｆａｅｃｉｕｍ、Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ  ｉｎｆａｎｔｉｓ、Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ  ｍｕｔａｎｓ、Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ  ｔｈｅｒｍｏｐｈｉｌｕｓ、Ａｎａｅｒｏｆｕｓｔｉｓ  ｓｔｅｒｃｏｒｉｈｏｍｉｎｉｓ、Ａｎａｅｒｏｓｔｉｐｅｓ  ｈａｄｒｕｓ、Ａｎａｅｒｏｔｒｕｎｃｕｓ  ｃｏｌｉｈｏｍｉｎｉｓ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｓｐｏｒｏｇｅｎｅｓ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｔｅｔａｎｉ、Ｃｏｐｒｏｃｏｃｃｕｓ、Ｃｏｐｒｏｃｏｃｃｕｓ  ｅｕｔａｃｔｕｓ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｃｙｌｉｎｄｒｏｉｄｅｓ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｄｏｌｉｃｈｕｍ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｖｅｎｔｒｉｏｓｕｍ、Ｒｏｓｅ���ｕｒｉａ  ｆａｅｃｃｉｓ、Ｒｏｓｅｂｕｒｉａ  ｈｏｍｉｎｉｓ、Ｒｏｓｅｂｕｒｉａ  ｉｎｔｅｓｔｉｎａｌｉｓ、Ｌａｃａｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｂｉｆｉｄｕｓ、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｊｏｈｎｓｏｎｉｉ、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｉ、Ａｃｉｄａｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ  ｆｅｒｍｅｎｔａｎｓ、Ａｃｉｄａｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ  ｉｎｔｅｓｔｉｎｅ、Ｂｌａｕｔｉａ  ｈｙｄｒｏｇｅｎｏｔｒｏｐｈｉｃａ、Ｃｉｔｒｏｂａｃｔｅｒ  ａｍａｌｏｎａｔｉｃｕｓ、Ｃｉｔｒｏｂａｃｔｅｒ  ｆｒｅｕｎｄｉｉ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ａｍｉｎｏｂｕｔｙｒｉｃｕｍ  Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂａｒｔｌｅｔｔｉｉ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｃｏｃｈｌｅａｒｉｕｍ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｋｌｕｙｖｅｒｉ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｌｉｍｏｓｕｍ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｍａｌｅｎｏｍｉｎａｔｕｍ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｐａｓｔｅｕｒｉａｎｕｍ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｐｅｐｔｉｄｉｖｏｒａｎｓ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｓａｃｃｈａｒｏｂｕｔｙｌｉｃｕｍ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｓｐｏｒｏｓｐｈａｅｒｏｉｄｅｓ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｓｔｉｃｋｌａｎｄｉｉ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｓｕｂｔｅｒｍｉｎａｌｅ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｓｙｍｂｉｏｓｕｍ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｔｅｔａｎｏｍｏｒｐｈｕｍ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｏｘｉｄｏｒｅｄｕｃｅｎｓ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｐｙｒｕｖａｔｉｖｏｒａｎｓ、Ｍｅｔｈａｎｏｂｒｅｖｉｂａｃｔｅｒ  ｓｍｉｔｈｉｉ、Ｍｏｒｇａｎｅｌｌａ  ｍｏｒｇａｎｉｉ、Ｐｅｐｔｏｎｉｐｈｉｌｕｓ  ａｓａｃｃｈａｒｏｌｙｔｉｃｕｓ、およびＰｅｐｔｏｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓからなる群から選択される１つまたは複数の単離および精製された微生物を含んでもよい。
【００４６】
一部の実施形態では、本開示の組成物および方法を使用して、対象中の微生物叢を変更して、ブチレート産生を促進することができる。ブチレート産生は、本明細書に開示される障害（例えば、前糖尿病および２型糖尿病）の処置にとって有用であり得る。ブチレートは、対象において有益な代謝およびエピジェネティック効果を示すことができる。ブチレートは、例えば、Ｇタンパク質共役受容体（ＧＰＣＲ）シグナル伝達を変更すること、ＧＬＰ−１分泌を変更すること、インスリン感受性を増大させること、食欲を低下させること、満腹感を増大させること、肝臓中での脂質生成を減少させること、筋肉中での脂肪酸化を増加させること、腸内糖新生を増加させること、炎症を減少させること、腸の完全性もしくはバリア機能を改善すること、ＬＰＳ誘発性炎症を減少させること、ヒストンデアセチラーゼを阻害すること、またはその組合せによって、有益な下流の効果を示すことができる。
【００４７】
本開示の組成物および方法を使用して、対象中の微生物叢を変更して、図１４に例示されるような健康利益を惹起することができる。
【００４８】
例えば、対象中の微生物叢を、ムチンまたはプレバイオティックをブチレート中間体（例えば、アセテートなどの、ブチレート産生のための基質として働き得る中間体）に変換することができる増大したレベルの１つまたは複数の一次発酵微生物および／またはムチン調節性微生物を含む、ならびにブチレート中間体をブチレートに変換することができる増大したレベルの１つまたは複数の二次発酵微生物および／またはブチレート産生微生物を含むように改変することができる。一次発酵微生物は、ムチン調節性微生物を含んでもよい。
【００４９】
ムチン調節性微生物は、粘液溶解活性を有する微生物、例えば、ムチン分解性微生物であってもよい。ムチン調節性またはムチン分解性微生物は、主要エネルギー源としてムチンを含む培養培地中で増殖することができる。ムチン分解性微生物（「ムチン分解菌」とも称される）は、ムチン（例えば、宿主対象のムチン）を分解して、ブチレート産生微生物によってエネルギー源として利用され得るブチレート中間体（例えば、糖）を産生することができる。さらに、ムチン分解菌は、ブチレート産生菌によるブチレート産生のための基質（例えば、アセテートなどの短鎖脂肪酸ブチレート中間体）として使用することができる短鎖脂肪酸を産生することができる。ムチン調節性微生物は、一次発酵菌であってもよい。ムチン調節性微生物は、対象に対して健康利益を提供するための下流のブチレート産生に寄与することができる。ムチン調節性微生物は、例えば、ムチンを分解して、ブチレート産生微生物にとっての好ましい環境を提供することによって、および／またはブチレート産生微生物の増殖を支援する代謝基質（例えば、ブチレート中間体）を提供することによって、対象中でのブチレート産生微生物の増殖および／または維持に寄与することができる。ムチン調節性微生物の例としては、例えば、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａが挙げられる。表１は、６つの例示的なＡｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａ株の１６Ｓ  ｒＲＮＡコンセンサス配列を提供する。
表１：例示的なムチン分解性微生物
【表１−１】
2022502373.tif 000003
【表１−２】
2022502373.tif 000004
【表１−３】
2022502373.tif 000005
【表１−４】
2022502373.tif 000006
【表１−５】
2022502373.tif 000007
【表１−６】
2022502373.tif 000008
【００５０】
本開示の組成物は、ブチレート産生微生物を含んでもよい。ブチレート産生微生物は、ブチレートを産生することができる微生物であってもよい。ブチレート産生微生物の非限定例としては、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉ、およびＦａｅｃａｌｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｐｒａｕｓｎｉｔｚｉｉが挙げられる。
【００５１】
本開示の組成物は、図１４に示されるように、対象においてブチレートを産生させるための微生物の組合せを含んでもよい。例えば、組合せは、第１の微生物と第２の微生物とを含んでもよい。第１の微生物は、エネルギー源またはプレバイオティック（例えば、繊維）と共に提供した場合、ブチレート中間体（例えば、ラクテート、アセテート、ムチン由来糖）を産生することができる。第２の微生物は、第１の微生物によって産生されたブチレート中間体を、ブチレートに変換することができる（例えば、ブチレート産生微生物）。一部の実施形態では、第１の微生物は一次発酵菌であってよく、第２の微生物は二次発酵菌であってよい。ブチレート産生のための中間体分子を産生することができる微生物の非限定例としては、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ａｄｏｌｅｓｃｅｎｔｉｓ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓおよびＢｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｌｏｎｇｕｍが挙げられる。ブチレートを産生するための中間体分子を使用することができる微生物の非限定例としては、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｉｎｄｏｌｉｓ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉ、およびＦａｅｃａｌｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｐｒａｕｓｎｉｔｚｉｉが挙げられる。組成物は、ブチレート中間体分子の産生のための少なくとも１つの微生物と、ブチレート中間体のブチレートへの変換のための少なくとも１つの微生物とを含んでもよい。組成物は、ブチレート中間体を産生する第１の微生物のための基質をさらに含んでもよい。例えば、組成物は、本明細書に開示されるプレバイオティック、および／またはムチンを含んでもよい。一部の実施形態では、本開示の組成物は、イヌリンを含む。
【００５２】
対象においてブチレートを産生させるための１つの微生物または微生物の組合せは、ブチレートを産生するための１つまたは複数の代謝経路に由来する酵素の組合せを含んでもよい。対象においてブチレートを産生させるための１つの微生物または微生物の組合せは、特定のブチレート代謝経路を介してブチレートを産生することができる。特定の代謝経路によるブチレートの産生は、産生されるブチレートの量を変更することができる。特定の代謝経路によるブチレートの産生は、ブチレート中間体の存在量または相対割合を変更することができ、一部の実施形態では、対象における健康利益にさらに寄与することができる（例えば、前糖尿病または２型糖尿病の処置）。
【００５３】
ブチレート産生代謝経路の例としては、限定されるものではないが、アセチル−ＣｏＡブチレート産生経路、グルタル酸ブチレート産生経路、４−アミノブチレートブチレート産生経路、およびリシンブチレート産生経路が挙げられる。
【００５４】
アセチル−ＣｏＡブチレート産生経路の存在量は、２型糖尿病を有するヒト患者由来糞便試料中で減少し、この経路をブーストする組成物または方法は、前糖尿病、２型糖尿病、および関連する状態を防止する、処置する、低減させる、またはその進行を遅延させるのに有用であり得ることを示している。一部の実施形態では、対象におけるアセチル−ＣｏＡブチレート産生経路の存在量の増加は、対象におけるより高レベルのブチレートの産生を可能にし得る。アセチル−ＣｏＡブチレート産生経路の存在量の増加は、選択されたブチレート中間体の存在量または相対割合を変更することができ、対象における健康利益にさらに寄与することができる（例えば、前糖尿病または２型糖尿病の処置）。
【００５５】
アセチル−ＣｏＡブチレート産生経路における酵素としては、ｔｈｌ（アセチル−ＣｏＡアセチルトランスフェラーゼ／チオラーゼ）、ｂｈｂｄ（β−ヒドロキシブチリル−ＣｏＡデヒドロゲナーゼ）、ｃｒｏ（クロトナーゼ）、ｂｕｔ（ブチリル−ＣｏＡ：アセテートＣｏＡトランスフェラーゼ）、ｂｕｋ（ブチレートキナーゼ）、およびｂｃｄ−ｅｆｔＡＢ（電子伝達タンパク質α、βサブユニットを含むブチリル−ＣｏＡデヒドロゲナーゼ）が挙げられる。
【００５６】
グルタル酸ブチレート産生経路における酵素としては、ｇｃｔＡＢ（グルタコン酸−ＣｏＡトランスフェラーゼα、βサブユニット）、ｈｃＣｏＡｄＡＢＣ（２−ヒドロキシグルタリル−ＣｏＡデヒドラターゼα、β、およびγサブユニット）、ｇｃｄＡＢ（グルタコニル−ＣｏＡデカルボキシラーゼα、βサブユニット）、およびｂｃｄ−ｅｆｔＡＢ（電子伝達タンパク質α、βサブユニットを含むブチリル−ＣｏＡデヒドロゲナーゼ）が挙げられる。
【００５７】
４−アミノブチレートブチレート産生経路における酵素としては、ａｂｆＨ（４−ヒドロキシブチレートデヒドロゲナーゼ）、４ｈｂｔ（ブチリル−ＣｏＡ：４−ヒドロキシブチレートＣｏＡトランスフェラーゼ）、ａｂｆＤ（４−ヒドロキシブチリル−ＣｏＡデヒドラターゼ）、ａｂｆＤ（ビニルアセチル−ＣｏＡ３，２−イソメラーゼ）、およびｂｃｄ−ｅｆｔＡＢ（電子伝達タンパク質α、βサブユニットを含むブチリル−ＣｏＡデヒドロゲナーゼ）が挙げられる。
【００５８】
リシンブチレート産生経路における酵素としては、ｋａｍＡ（リシン−２，３−アミノムターゼ）、ｋａｍＤＥ（β−リシン−５，６−アミノムターゼα、βサブユニット）、ｋｄｄ（３，５−ジアミノヘキサン酸デヒドロゲナーゼ）、ｋｃｅ（３−ケト−５−アミノヘキサン酸切断酵素）、ｋａｌ（３−アミノブチリル−ＣｏＡアンモニア−リアーゼ）、ａｔｏＡＤ（ブチリル−ＣｏＡ：アセトアセテートＣｏＡトランスフェラーゼα、βサブユニット）、およびｂｃｄ−ｅｆｔＡＢ（電子伝達タンパク質α、βサブユニットを含むブチリル−ＣｏＡデヒドロゲナーゼ）が挙げられる。
【００５９】
組成物は、ブチレートキナーゼ酵素（例えば、ＥＣ２．７．２．７；ＭｅｔａＣｙｃ  Ｒｅａｃｔｉｏｎ  ＩＤ  Ｒ１１−ＲＸＮ）をコードする微生物を含んでもよい。ブチレートキナーゼは、トランスフェラーゼのファミリー、例えば、アクセプターとしてカルボキシ基を用いてリン含有基を移動させるもの（例えば、ホスホトランスフェラーゼ）に属する酵素である。この酵素クラスの系統名は、ＡＴＰ：ブタン酸１−ホスホトランスフェラーゼであってもよい。ブチレートキナーゼは、ブチレート代謝に参画することができる。ブチレートキナーゼは、以下の反応：
【化１】
2022502373.tif 000009
を触媒することができる。
【００６０】
本開示の組成物は、ブチレート−コエンザイムＡを含む微生物を含んでもよい。ブチレート−コエンザイムＡ、また、ブチリル−コエンザイムＡは、酪酸のコエンザイムＡにより活性化された形態であってよい。それは、ブチリル−ＣｏＡデヒドロゲナーゼによって作用し、アセトン−ブタノール−エタノール発酵における中間化合物であってよい。ブチレート−コエンザイムＡは、ブチレート代謝に関与してもよい。
【００６１】
本開示の組成物は、ブチレート−コエンザイムＡトランスフェラーゼ酵素をコードする微生物を含んでもよい。ブチレート−アセトアセテートＣｏＡトランスフェラーゼとしても知られる、ブチレート−コエンザイムＡトランスフェラーゼは、トランスフェラーゼのファミリー、例えば、ＣｏＡトランスフェラーゼに属してもよい。この酵素クラスの系統名は、ブタノイル−ＣｏＡ：アセトアセテートＣｏＡトランスフェラーゼであってもよい。一般的に使用される他の名称としては、ブチリルコエンザイムＡ−アセトアセテートコエンザイムＡトランスフェラーゼ（例えば、ＥＣ２．８．３．９；ＭｅｔａＣｙｃ  Ｒｅａｃｔｉｏｎ  ＩＤ２．８．３．９−ＲＸＮ）、およびブチリル−ＣｏＡ−アセトアセテートＣｏＡトランスフェラーゼが挙げられる。ブチレート−コエンザイムＡトランスフェラーゼは、以下の化学反応：
【化２】
2022502373.tif 000010
を触媒することができる。
【００６２】
本開示の組成物は、アセテートコエンザイムＡトランスフェラーゼ（例えば、ＥＣ２．８．３．１／２．８．３．８；ＭｅｔａＣｙｃ  Ｒｅａｃｔｉｏｎ  ＩＤ  ＢＵＴＹＲＡＴＥ−ＫＩＮＡＳＥ−ＲＸＮ）をコードする微生物を含んでもよい。
【００６３】
本開示の組成物は、ブチリル−コエンザイムＡデヒドロゲナーゼをコードする微生物を含んでもよい。ブチリル−ＣｏＡデヒドロゲナーゼは、オキシドリダクターゼのファミリー、例えば、他のアクセプターを用いてドナーのＣＨ−ＣＨ基に対して作用するものに属してもよい。この酵素クラスの系統名は、ブタノイル−ＣｏＡ：アクセプター２，３−オキシドリダクターゼであってもよい。一般的に使用される他の名称としては、ブチリルデヒドロゲナーゼ、不飽和アシル−ＣｏＡリダクターゼ、エチレンリダクターゼ、エノイル−コエンザイムＡリダクターゼ、不飽和アシルコエンザイムＡリダクターゼ、ブチリルコエンザイムＡデヒドロゲナーゼ、短鎖アシルＣｏＡデヒドロゲナーゼ、短鎖アシル−コエンザイムＡデヒドロゲナーゼ、３−ヒドロキシアシルＣｏＡリダクターゼ、およびブタノイル−ＣｏＡ：（アクセプター）２，３−オキシドリダクターゼが挙げられる。ブチリル−ＣｏＡデヒドロゲナーゼが参画することができる代謝経路の非限定例としては、脂肪酸代謝；バリン、ロイシンおよびイソロイシン分解；ならびにブタノエート代謝が挙げられる。ブチリル−ＣｏＡデヒドロゲナーゼは、１つのコファクター、ＦＡＤを用いることができる。ブチリル−ＣｏＡデヒドロゲナーゼは、以下の反応：
【化３】
2022502373.tif 000011
を触媒することができる。
【００６４】
本開示の組成物は、ベータ−ヒドロキシブチリル−ＣｏＡデヒドロゲナーゼをコードする微生物を含んでもよい。ベータ−ヒドロキシブチリル−ＣｏＡデヒドロゲナーゼまたは３−ヒドロキシブチリル−ＣｏＡデヒドロゲナーゼは、オキシドリダクターゼのファミリー、例えば、アクセプターとしてＮＡＤ＋またはＮＡＤＰ＋を用いてドナーのＣＨ−ＯＨ基に対して作用するものに属してもよい。この酵素クラスの系統名は、（Ｓ）−３−ヒドロキシブタノイル−ＣｏＡ：ＮＡＤＰ＋オキシドリダクターゼであってもよい。一般的に使用される他の名称としては、ベータ−ヒドロキシブチリルコエンザイムＡデヒドロゲナーゼ、Ｌ（＋）−３−ヒドロキシブチリル−ＣｏＡデヒドロゲナーゼ、ＢＨＢＤ、デヒドロゲナーゼ、Ｌ−３−ヒドロキシブチリルコエンザイムＡ（ニコチンアミドアデニン、ジヌクレオチドリン酸）、Ｌ−（＋）−３−ヒドロキシブチリル−ＣｏＡデヒドロゲナーゼ、および３−ヒドロキシブチリル−ＣｏＡデヒドロゲナーゼが挙げられる。ベータ−ヒドロキシブチリル−ＣｏＡデヒドロゲナーゼ酵素は、コライゲーションにより安息香酸分解に参画することができる。ベータ−ヒドロキシブチリル−ＣｏＡデヒドロゲナーゼ酵素は、ブタノエート代謝に参画することができる。ベータ−ヒドロキシブチリル−ＣｏＡデヒドロゲナーゼは、以下の反応：
【化４】
2022502373.tif 000012
を触媒することができる。
【００６５】
本開示の組成物は、クロトナーゼをコードする微生物を含んでもよい。クロトナーゼは、例えば、デハロゲナーゼ、ヒドラターゼ、イソメラーゼ活性を有する酵素を含んでもよい。クロトナーゼは、チオエステルの炭素間結合形成、切断、および加水分解に関与し得る。クロトナーゼスーパーファミリーの酵素としては、例えば、２−ｔｒａｎｓ−エノイル−ＣｏＡの３−ヒドロキシアシル−ＣｏＡへの加水（ｈｙｄｒａｔａｔｉｏｎ）を触媒することができるエノイル−ＣｏＡヒドラターゼ；不飽和脂肪酸酸化の中間体の３−二重結合を、２−ｔｒａｎｓ位置にシフトさせることができる、３−２ｔｒａｎｓ−エノイル−ＣｏＡイソメラーゼまたはドデセノイル−ＣｏＡイソメラーゼ（例えば、ＥＣ５．３．３．８）；ブチレート／ブタノール産生経路に関与し得る、３−ヒドロキシブチリル−ＣｏＡデヒドラターゼ（例えば、クロトナーゼ；ＥＣ４．２．１．５５）；４−クロロ安息香酸−ＣｏＡの４−ヒドロキシ安息香酸−ＣｏＡへの変換を触媒することができる４−クロロベンゾイル−ＣｏＡデハロゲナーゼ（例えば、ＥＣ３．８．１．６）；３−ｔｒａｎｓ，５−ｃｉｓ−ジエノイル−ＣｏＡの２−ｔｒａｎｓ，４−ｔｒａｎｓ−ジエノイル−ＣｏＡへの異性化を触媒することができるジエノイル−ＣｏＡイソメラーゼ；メナキノン（例えば、ビタミンＫ２）の生合成に関与し得る、ナフトエートシンターゼ（例えば、ＭｅｎＢ、またはＤＨＮＡシンテターゼ；ＥＣ４．１．３．３６）；Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉ中でのクロトノベタインのＬ−カルニチンへの可逆的変換を触媒することができるカルニチンラセマーゼ（例えば、ｃａｉＤ遺伝子）；メチルマロニルＣｏＡデカルボキシラーゼ（例えば、ＭＭＣＤ；ＥＣ４．１．１．４１）；カルバペネム生合成に関与し得るカルボキシメチルプロリンシンターゼ（例えば、ＣａｒＢ）；二環式ベータ−ジケトンの光学的に活性なケト酸への非対称化を触媒することができる６−オキソカンファーヒドロラーゼ；脂肪酸ベータ酸化サイクルにおける最後の３つの反応を触媒することができる多酵素複合体である脂肪酸酸化複合体のアルファサブユニット；およびエノイル−ＣｏＡヒドラターゼの二官能性ＲＮＡ結合ホモログであってよいＡＵＨタンパク質が挙げられる。
【００６６】
本開示の組成物は、チオラーゼをコードする微生物を含んでもよい。アセチル−コエンザイムＡアセチルトランスフェラーゼ（ＡＣＡＴ）としても知られるチオラーゼは、例えば、メバロン酸経路において、２ユニットのアセチル−ＣｏＡをアセトアセチルＣｏＡに変換することができる。チオラーゼは、例えば、分解性チオラーゼ（例えば、ＥＣ２．３．１．１６）および生合成チオラーゼ（例えば、ＥＣ２．３．１．９）を含んでもよい。チオラーゼＩとも呼ばれる３−ケトアシル−ＣｏＡチオラーゼは、脂肪酸ベータ酸化などの分解経路に関与し得る。チオラーゼＩＩとも呼ばれるアセトアセチル−ＣｏＡチオラーゼは、アセトアセチル−ＣｏＡのチオリシスに特異的であってよく、ポリベータヒドロキシ酪酸合成またはステロイドバイオジェネシスなどの生合成経路に関与し得る。チオラーゼは、以下の反応：
【化５】
2022502373.tif 000013
を触媒することができる。
【００６７】
１つの非限定例では、組成物は、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ａｄｏｌｅｓｃｅｎｔｉｓおよびＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｉｎｄｏｌｉｓを含んでもよい。別の実証例では、組成物は、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍ、およびＥｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉを含んでもよい。別の非限定例では、組成物は、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｌｏｎｇｕｍ、およびＦａｅｃａｌｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｐｒａｕｓｎｉｔｚｉｉを含んでもよい。別の非限定例では、組成物は、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉ、およびＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍを含んでもよい。別の非限定例では、組成物は、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍ、およびＡｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａを含んでもよい。別の非限定例では、組成物は、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍ、およびＡｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａを含んでもよい。別の非限定例では、組成物は、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍ、およびＡｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａを含んでもよい。別の非限定例では、組成物は、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａおよびＥｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉを含んでもよい。
【００６８】
組成物は、以下の微生物：Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓ、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａ、またはＥｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉから選択されるｒＲＮＡ配列に対して少なくとも約８５％、８７％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％、または１００％の配列同一性を含むｒＲＮＡ（例えば、１６Ｓ  ｒＲＮＡおよび／または２３Ｓ  ｒＲＮＡ）配列を有する、治療有効量の少なくとも１つの単離および精製された微生物を含んでもよい。
【００６９】
組成物の第１の例（Ａ）は、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍ、およびＢｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓを含んでもよい。組成物の第２の例（Ｂ）は、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓ、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａ、およびＥｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉを含んでもよい。組成物の第３の例（Ｃ）は、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓ、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａ、およびＥｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉを含んでもよい。第４の例（Ｄ）は、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓ、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａ、およびＥｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉを含んでもよい。組成物の第５の例（Ｅ）は、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉ、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａ、およびＥｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉを含んでもよい。組成物の第６の例（Ｆ）は、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉおよびＢｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓを含んでもよい。組成物の第７の例（Ｇ）は、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓ、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａ、およびＥｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉを含んでもよい。組成物の第８の例（Ｈ）は、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓ、およびＡｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａを含んでもよい。組成物の第９の例（Ｉ）は、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉａ  ｉｎｆａｎｔｉｓ、およびＡｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａを含んでもよい。組成物の第１０の例（Ｊ）は、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓ、およびＡｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａを含んでもよい。
【００７０】
他の例では、組成物は、一部の場合、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｌｏｎｇｕｍ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｉｎｄｏｌｉｓ、Ａｃｉｄａｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ  ｆｅｒｍｅｎｔａｎｓ、Ａｃｉｄａｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ  ｉｎｔｅｓｔｉｎｅ、Ｂｌａｕｔｉａ  ｈｙｄｒｏｇｅｎｏｔｒｏｐｈｉｃａ、Ｃｉｔｒｏｂａｃｔｅｒ  ａｍａｌｏｎａｔｉｃｕｓ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｒｅｃｔａｌｅ、またはＦａｅｃａｌｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｐｒａｕｓｎｉｔｚｉｉであってもよい、少なくとも１つのさらなる微生物種と共に、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａを含んでもよい。一部の実施形態では、本開示の組成物は、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａおよびＥｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉを含む。
【００７１】
他の例では、組成物は、一部の場合、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｌｏｎｇｕｍ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｉｎｄｏｌｉｓ、Ａｃｉｄａｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ  ｆｅｒｍｅｎｔａｎｓ、Ａｃｉｄａｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ  ｉｎｔｅｓｔｉｎｅ、Ｂｌａｕｔｉａ  ｈｙｄｒｏｇｅｎｏｔｒｏｐｈｉｃａ、Ｃｉｔｒｏｂａｃｔｅｒ  ａｍａｌｏｎａｔｉｃｕｓ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｒｅｃｔａｌｅ、またはＦａｅｃａｌｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｐｒａｕｓｎｉｔｚｉｉから独立に選択することができる少なくとも２つのさらなる微生物種と共に、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａを含んでもよい。一部の実施形態では、本開示の組成物は、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉ、およびＢｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓを含む。
【００７２】
他の例では、組成物は、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｌｏｎｇｕｍ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｉｎｄｏｌｉｓ、Ａｃｉｄａｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ  ｆｅｒｍｅｎｔａｎｓ、Ａｃｉｄａｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ  ｉｎｔｅｓｔｉｎｅ、Ｂｌａｕｔｉａ  ｈｙｄｒｏｇｅｎｏｔｒｏｐｈｉｃａ、Ｃｉｔｒｏｂａｃｔｅｒ  ａｍａｌｏｎａｔｉｃｕｓ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｒｅｃｔａｌｅ、またはＦａｅｃａｌｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｐｒａｕｓｎｉｔｚｉｉから独立に選択することができる少なくとも３つのさらなる微生物種と共に、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａを含んでもよい。一部の実施形態では、本開示の組成物は、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓ、およびＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉを含む。一部の実施形態では、本開示の組成物は、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓ、およびＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍを含む。
【００７３】
他の例では、組成物は、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｌｏｎｇｕｍ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｉｎｄｏｌｉｓ、Ａｃｉｄａｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ  ｆｅｒｍｅｎｔａｎｓ、Ａｃｉｄａｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ  ｉｎｔｅｓｔｉｎｅ、Ｂｌａｕｔｉａ  ｈｙｄｒｏｇｅｎｏｔｒｏｐｈｉｃａ、Ｃｉｔｒｏｂａｃｔｅｒ  ａｍａｌｏｎａｔｉｃｕｓ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｒｅｃｔａｌｅ、またはＦａｅｃａｌｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｐｒａｕｓｎｉｔｚｉｉから独立に選択することができる少なくとも４つのさらなる微生物種と共に、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａを含んでもよい。一部の実施形態では、本開示の組成物は、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉ、およびＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍを含む。
【００７４】
他の例では、組成物は、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｌｏｎｇｕｍ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｉｎｄｏｌｉｓ、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  Ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａ、Ａｃｉｄａｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ  ｆｅｒｍｅｎｔａｎｓ、Ａｃｉｄａｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ  ｉｎｔｅｓｔｉｎｅ、Ｂｌａｕｔｉａ  ｈｙｄｒｏｇｅｎｏｔｒｏｐｈｉｃａ、Ｃｉｔｒｏｂａｃｔｅｒ  ａｍａｌｏｎａｔｉｃｕｓ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｒｅｃｔａｌｅ、またはＦａｅｃａｌｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｐｒａｕｓｎｉｔｚｉｉから独立に選択することができる少なくとも２つのさらなる微生物種と共に、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉを含んでもよい。
【００７５】
他の例では、組成物は、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｌｏｎｇｕｍ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｉｎｄｏｌｉｓ、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  Ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａ、Ａｃｉｄａｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ  ｆｅｒｍｅｎｔａｎｓ、Ａｃｉｄａｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ  ｉｎｔｅｓｔｉｎｅ、Ｂｌａｕｔｉａ  ｈｙｄｒｏｇｅｎｏｔｒｏｐｈｉｃａ、Ｃｉｔｒｏｂａｃｔｅｒ  ａｍａｌｏｎａｔｉｃｕｓ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｒｅｃｔａｌｅ、またはＦａｅｃａｌｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｐｒａｕｓｎｉｔｚｉｉから独立に選択することができる少なくとも３つのさらなる微生物種と共に、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉを含んでもよい。
【００７６】
他の例では、組成物は、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｌｏｎｇｕｍ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｉｎｄｏｌｉｓ、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  Ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａ、Ａｃｉｄａｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ  ｆｅｒｍｅｎｔａｎｓ、Ａｃｉｄａｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ  ｉｎｔｅｓｔｉｎｅ、Ｂｌａｕｔｉａ  ｈｙｄｒｏｇｅｎｏｔｒｏｐｈｉｃａ、Ｃｉｔｒｏｂａｃｔｅｒ  ａｍａｌｏｎａｔｉｃｕｓ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｒｅｃｔａｌｅ、またはＦａｅｃａｌｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｐｒａｕｓｎｉｔｚｉｉから独立に選択することができる少なくとも４つのさらなる微生物種と共に、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉを含んでもよい。
【００７７】
他の例では、組成物は、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｌｏｎｇｕｍ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｉｎｄｏｌｉｓ、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  Ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａ、Ａｃｉｄａｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ  ｆｅｒｍｅｎｔａｎｓ、Ａｃｉｄａｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ  ｉｎｔｅｓｔｉｎｅ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉ、Ｃｉｔｒｏｂａｃｔｅｒ  ａｍａｌｏｎａｔｉｃｕｓ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｒｅｃｔａｌｅ、またはＦａｅｃａｌｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｐｒａｕｓｎｉｔｚｉｉから独立に選択することができる少なくとも２つのさらなる微生物種と共に、Ｂｌａｕｔｉａ  ｈｙｄｒｏｇｅｎｏｔｒｏｐｈｉｃａを含んでもよい。
【００７８】
他の例では、組成物は、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｌｏｎｇｕｍ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｉｎｄｏｌｉｓ、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  Ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａ、Ａｃｉｄａｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ  ｆｅｒｍｅｎｔａｎｓ、Ａｃｉｄａｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ  ｉｎｔｅｓｔｉｎｅ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉ、Ｃｉｔｒｏｂａｃｔｅｒ  ａｍａｌｏｎａｔｉｃｕｓ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｒｅｃｔａｌｅ、またはＦａｅｃａｌｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｐｒａｕｓｎｉｔｚｉｉから独立に選択することができる少なくとも３つのさらなる微生物種と共に、Ｂｌａｕｔｉａ  ｈｙｄｒｏｇｅｎｏｔｒｏｐｈｉｃａを含んでもよい。
【００７９】
他の例では、組成物は、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｌｏｎｇｕｍ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｉｎｄｏｌｉｓ、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  Ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａ、Ａｃｉｄａｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ  ｆｅｒｍｅｎｔａｎｓ、Ａｃｉｄａｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ  ｉｎｔｅｓｔｉｎｅ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉ、Ｃｉｔｒｏｂａｃｔｅｒ  ａｍａｌｏｎａｔｉｃｕｓ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｒｅｃｔａｌｅ、またはＦａｅｃａｌｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｐｒａｕｓｎｉｔｚｉｉから独立に選択することができる少なくとも４つのさらなる微生物種と共に、Ｂｌａｕｔｉａ  ｈｙｄｒｏｇｅｎｏｔｒｏｐｈｉｃａを含んでもよい。
【００８０】
他の例では、組成物は、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｌｏｎｇｕｍ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｉｎｄｏｌｉｓ、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  Ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａ、Ｂｌａｕｔｉａ  ｈｙｄｒｏｇｅｎｏｔｒｏｐｈｉｃａ、Ａｃｉｄａｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ  ｉｎｔｅｓｔｉｎｅ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉ、Ｃｉｔｒｏｂａｃｔｅｒ  ａｍａｌｏｎａｔｉｃｕｓ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｒｅｃｔａｌｅ、またはＦａｅｃａｌｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｐｒａｕｓｎｉｔｚｉｉから独立に選択することができる少なくとも２つのさらなる微生物種と共に、Ａｃｉｄａｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ  ｆｅｒｍｅｎｔａｎｓを含んでもよい。
【００８１】
他の例では、組成物は、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｌｏｎｇｕｍ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｉｎｄｏｌｉｓ、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  Ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａ、Ｂｌａｕｔｉａ  ｈｙｄｒｏｇｅｎｏｔｒｏｐｈｉｃａ、Ａｃｉｄａｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ  ｉｎｔｅｓｔｉｎｅ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉ、Ｃｉｔｒｏｂａｃｔｅｒ  ａｍａｌｏｎａｔｉｃｕｓ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｒｅｃｔａｌｅ、またはＦａｅｃａｌｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｐｒａｕｓｎｉｔｚｉｉから独立に選択することができる少なくとも３つのさらなる微生物種と共に、Ａｃｉｄａｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ  ｆｅｒｍｅｎｔａｎｓを含んでもよい。
【００８２】
他の例では、組成物は、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｌｏｎｇｕｍ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｉｎｄｏｌｉｓ、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  Ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａ、Ｂｌａｕｔｉａ  ｈｙｄｒｏｇｅｎｏｔｒｏｐｈｉｃａ、Ａｃｉｄａｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ  ｉｎｔｅｓｔｉｎｅ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉ、Ｃｉｔｒｏｂａｃｔｅｒ  ａｍａｌｏｎａｔｉｃｕｓ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｒｅｃｔａｌｅ、またはＦａｅｃａｌｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｐｒａｕｓｎｉｔｚｉｉから独立に選択することができる少なくとも４つのさらなる微生物種と共に、Ａｃｉｄａｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ  ｆｅｒｍｅｎｔａｎｓを含んでもよい。
【００８３】
他の例では、組成物は、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉ、Ａｃｉｄａｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ  ｆｅｒｍｅｎｔａｎｓ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｌｏｎｇｕｍ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｉｎｄｏｌｉｓ、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  Ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａ、Ｂｌａｕｔｉａ  ｈｙｄｒｏｇｅｎｏｔｒｏｐｈｉｃａ、Ａｃｉｄａｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ  ｉｎｔｅｓｔｉｎｅ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉ、Ｃｉｔｒｏｂａｃｔｅｒ  ａｍａｌｏｎａｔｉｃｕｓ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｒｅｃｔａｌｅ、またはＦａｅｃａｌｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｐｒａｕｓｎｉｔｚｉｉから独立に選択することができる少なくとも２つのさらなる微生物種と共に、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍを含んでもよい。
【００８４】
他の例では、組成物は、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉ、Ａｃｉｄａｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ  ｆｅｒｍｅｎｔａｎｓ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｌｏｎｇｕｍ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｉｎｄｏｌｉｓ、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  Ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａ、Ｂｌａｕｔｉａ  ｈｙｄｒｏｇｅｎｏｔｒｏｐｈｉｃａ、Ａｃｉｄａｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ  ｉｎｔｅｓｔｉｎｅ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉ、Ｃｉｔｒｏｂａｃｔｅｒ  ａｍａｌｏｎａｔｉｃｕｓ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｒｅｃｔａｌｅ、またはＦａｅｃａｌｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｐｒａｕｓｎｉｔｚｉｉから独立に選択することができる少なくとも３つのさらなる微生物種と共に、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍを含んでもよい。
【００８５】
他の例では、組成物は、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉ、Ａｃｉｄａｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ  ｆｅｒｍｅｎｔａｎｓ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｌｏｎｇｕｍ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｉｎｄｏｌｉｓ、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  Ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａ、Ｂｌａｕｔｉａ  ｈｙｄｒｏｇｅｎｏｔｒｏｐｈｉｃａ、Ａｃｉｄａｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ  ｉｎｔｅｓｔｉｎｅ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉ、Ｃｉｔｒｏｂａｃｔｅｒ  ａｍａｌｏｎａｔｉｃｕｓ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｒｅｃｔａｌｅ、またはＦａｅｃａｌｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｐｒａｕｓｎｉｔｚｉｉから独立に選択することができる少なくとも４つのさらなる微生物種と共に、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍを含んでもよい。
【００８６】
他の例では、組成物は、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉ、Ａｃｉｄａｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ  ｆｅｒｍｅｎｔａｎｓ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｌｏｎｇｕｍ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｉｎｄｏｌｉｓ、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  Ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａ、Ｂｌａｕｔｉａ  ｈｙｄｒｏｇｅｎｏｔｒｏｐｈｉｃａ、Ａｃｉｄａｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ  ｉｎｔｅｓｔｉｎｅ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉ、Ｃｉｔｒｏｂａｃｔｅｒ  ａｍａｌｏｎａｔｉｃｕｓ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｒｅｃｔａｌｅ、またはＦａｅｃａｌｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｐｒａｕｓｎｉｔｚｉｉから独立に選択することができる少なくとも２つのさらなる微生物種と共に、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓを含んでもよい。
【００８７】
他の例では、組成物は、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉ、Ａｃｉｄａｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ  ｆｅｒｍｅｎｔａｎｓ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｌｏｎｇｕｍ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｉｎｄｏｌｉｓ、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  Ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａ、Ｂｌａｕｔｉａ  ｈｙｄｒｏｇｅｎｏｔｒｏｐｈｉｃａ、Ａｃｉｄａｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ  ｉｎｔｅｓｔｉｎｅ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉ、Ｃｉｔｒｏｂａｃｔｅｒ  ａｍａｌｏｎａｔｉｃｕｓ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｒｅｃｔａｌｅ、またはＦａｅｃａｌｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｐｒａｕｓｎｉｔｚｉｉから独立に選択することができる少なくとも３つのさらなる微生物種と共に、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓを含んでもよい。
【００８８】
他の例では、組成物は、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉ、Ａｃｉｄａｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ  ｆｅｒｍｅｎｔａｎｓ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｌｏｎｇｕｍ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｉｎｄｏｌｉｓ、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  Ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａ、Ｂｌａｕｔｉａ  ｈｙｄｒｏｇｅｎｏｔｒｏｐｈｉｃａ、Ａｃｉｄａｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ  ｉｎｔｅｓｔｉｎｅ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉ、Ｃｉｔｒｏｂａｃｔｅｒ  ａｍａｌｏｎａｔｉｃｕｓ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｒｅｃｔａｌｅ、またはＦａｅｃａｌｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｐｒａｕｓｎｉｔｚｉｉから独立に選択することができる少なくとも４つのさらなる微生物種と共に、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓを含んでもよい。
【００８９】
組成物は、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉのｒＲＮＡ配列に対する少なくとも約８５％の配列同一性を含むｒＲＮＡ配列を有する１つまたは複数の微生物を含んでもよい。さらなる組成物は、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａのｒＲＮＡ配列に対する少なくとも約８５％の配列同一性を含むｒＲＮＡ配列を有する１つまたは複数の微生物を含んでもよい。組成物は、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉのｒＲＮＡ配列に対する少なくとも約９０％の配列同一性を含むｒＲＮＡ配列を有する１つまたは複数の微生物を含んでもよい。組成物は、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍのｒＲＮＡ配列に対する少なくとも約９０％の配列同一性を含むｒＲＮＡ配列を有する１つまたは複数の微生物を含んでもよい。一部の組成物は、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓのｒＲＮＡ配列に対する少なくとも約９０％の配列同一性を含むｒＲＮＡ配列を有する１つまたは複数の微生物を含んでもよい。組成物は、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉのｒＲＮＡ配列に対する少なくとも約９０％の配列同一性を含むｒＲＮＡ配列を有する１つまたは複数の微生物を含んでもよい。組成物は、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａのｒＲＮＡ配列に対する少なくとも約９０％の配列同一性を含むｒＲＮＡ配列を有する１つまたは複数の微生物を含んでもよい。組成物は、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉのｒＲＮＡ配列に対する少なくとも約９５％の配列同一性を含むｒＲＮＡ配列を有する１つまたは複数の微生物を含んでもよい。組成物は、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍのｒＲＮＡ配列に対する少なくとも約９５％の配列同一性を含むｒＲＮＡ配列を有する１つまたは複数の微生物を含んでもよい。組成物は、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓのｒＲＮＡ配列に対する少なくとも約９５％の配列同一性を含むｒＲＮＡ配列を有する１つまたは複数の微生物を含んでもよい。組成物は、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉのｒＲＮＡ配列に対する少なくとも約９５％の配列同一性を含むｒＲＮＡ配列を有する１つまたは複数の微生物を含んでもよい。組成物は、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａのｒＲＮＡ配列に対する少なくとも約９５％の配列同一性を含むｒＲＮＡ配列を有する１つまたは複数の微生物を含んでもよい。組成物は、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉのｒＲＮＡ配列に対する少なくとも約９７％の配列同一性を含むｒＲＮＡ配列を有する１つまたは複数の微生物を含んでもよい。組成物は、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍのｒＲＮＡ配列に対する少なくとも約９７％の配列同一性を含むｒＲＮＡ配列を有する１つまたは複数の微生物を含んでもよい。組成物は、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓのｒＲＮＡ配列に対する少なくとも約９７％の配列同一性を含むｒＲＮＡ配列を有する１つまたは複数の微生物を含んでもよい。組成物は、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉのｒＲＮＡ配列に対する少なくとも約９７％の配列同一性を含むｒＲＮＡ配列を有する１つまたは複数の微生物を含んでもよい。組成物は、Ａｋ���ｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａのｒＲＮＡ配列に対する少なくとも約９７％の配列同一性を含むｒＲＮＡ配列を有する１つまたは複数の微生物を含んでもよい。組成物は、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉのｒＲＮＡ配列に対する少なくとも約９８％の配列同一性を含むｒＲＮＡ配列を有する１つまたは複数の微生物を含んでもよい。組成物は、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍのｒＲＮＡ配列に対する少なくとも約９８％の配列同一性を含むｒＲＮＡ配列を有する１つまたは複数の微生物を含んでもよい。組成物は、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓのｒＲＮＡ配列に対する少なくとも約９８％の配列同一性を含むｒＲＮＡ配列を有する１つまたは複数の微生物を含んでもよい。組成物は、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉのｒＲＮＡ配列に対する少なくとも約９８％の配列同一性を含むｒＲＮＡ配列を有する１つまたは複数の微生物を含んでもよい。組成物は、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａのｒＲＮＡ配列に対する少なくとも約９８％の配列同一性を含むｒＲＮＡ配列を有する１つまたは複数の微生物を含んでもよい。組成物は、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉのｒＲＮＡ配列に対する少なくとも約９９％の配列同一性を含むｒＲＮＡ配列を有する１つまたは複数の微生物を含んでもよい。組成物は、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍのｒＲＮＡ配列に対する少なくとも約９９％の配列同一性を含むｒＲＮＡ配列を有する１つまたは複数の微生物を含んでもよい。組成物は、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓのｒＲＮＡ配列に対する少なくとも約９９％の配列同一性を含むｒＲＮＡ配列を有する１つまたは複数の微生物を含んでもよい。組成物は、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉのｒＲＮＡ配列に対する少なくとも約９９％の配列同一性を含むｒＲＮＡ配列を有する１つまたは複数の微生物を含んでもよい。組成物は、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａのｒＲＮＡ配列に対する少なくとも約９９％の配列同一性を含むｒＲＮＡ配列を有する１つまたは複数の微生物を含んでもよい。組成物は、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉのｒＲＮＡ配列に対する少なくとも約９５％の配列同一性を含むｒＲＮＡ配列を有する１つまたは複数の微生物を含んでもよい。組成物は、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍのｒＲＮＡ配列に対する少なくとも約９５％の配列同一性を含むｒＲＮＡ配列を有する１つまたは複数の微生物を含んでもよい。組成物は、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓのｒＲＮＡ配列に対する少なくとも約９５％の配列同一性を含むｒＲＮＡ配列を有する１つまたは複数の微生物を含んでもよい。組成物は、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉのｒＲＮＡ配列に対する少なくとも約９５％の配列同一性を含むｒＲＮＡ配列を有する１つまたは複数の微生物を含んでもよい。組成物は、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａのｒＲＮＡ配列に対する少なくとも約９５％の配列同一性を含むｒＲＮＡ配列を有する１つまたは複数の微生物を含んでもよい。
【００９０】
本明細書に記載の微生物組成物を、対象を処置するための組成物の有効量または治療有効量を含む組成物中で使用することができる。本開示の組成物は、本明細書に記載の任意の微生物と、担体、安定化剤、希釈剤、分散剤、懸濁剤、増粘剤、および賦形剤などの他の成分との組合せであってもよい。組成物は、対象への微生物の投与を容易にすることができる。投与しようとする治療組成物の適切な量、処置の回数、および単位用量は、対象および／または対象の疾患状態に応じて変化してもよい。組成物を、治療剤または化粧品として投与することができる。
【００９１】
本開示の組成物は、実質的に乾燥粉末形態で製剤化された、単離および精製された微生物を含んでもよい。単離および精製された微生物は、微生物培養物の凍結乾燥物に由来するものであってもよい。凍結乾燥組成物を、投与前に塩水もしくは他の溶液と混合することができるか、またはそれを、乾燥形態として、例えば、カプセルもしくは錠剤中で投与するか、または例えば、以下により詳細に説明されるように、別の摂取可能な形態に組み込むことができる。
【００９２】
組成物は、生きた微生物を含んでもよい。例えば、微生物組成物は、それらが標的生息環境（例えば、腸）に送達されたら複製することができる微生物を含む。一部の場合、組成物は、胞子を含まない。
【００９３】
本開示の組成物は、単位剤形中にあってもよい。単位用量は、カプセルであってもよい。単位用量は、ピルであってもよい。単位用量は、フードバーであってもよい。単位用量は、粉末（例えば、粉末重量または粉末の分割された小袋）であってもよい。単位用量は、液体（例えば、密閉されたカートン、ボトル、カン、またはバイアル中の液体）であってもよい。
【００９４】
一部の態様では、組成物は、対象に投与される用量あたり、少なくとも約１ｘ１０７コロニー形成単位（ＣＦＵ）から、用量あたり約１ｘ１０１４ＣＦＵまでのレベルの任意の個々の微生物種の、生きた微生物を提供するであろう。一部の場合、組成物は、用量あたり約１ｘ１０７ＣＦＵ、用量あたり約１ｘ１０８ＣＦＵ、用量あたり約１ｘ１０９ＣＦＵ、用量あたり約１ｘ１０１０ＣＦＵ、用量あたり約１ｘ１０１１ＣＦＵ、用量あたり約１ｘ１０１２ＣＦＵ、用量あたり約１ｘ１０１３ＣＦＵ、または用量あたり約１ｘ１０１４ＣＦＵを含むであろう。用量は、粉末１グラムあたり約１ｘ１０７ＣＦＵ、粉末１グラムあたり約１ｘ１０８ＣＦＵ、粉末１グラムあたり約１ｘ１０９ＣＦＵ、粉末１グラムあたり約１ｘ１０１０ＣＦＵ、粉末１グラムあたり約１ｘ１０１１ＣＦＵ、粉末１グラムあたり約１ｘ１０１２ＣＦＵ、粉末１グラムあたり約１ｘ１０１３ＣＦＵ、または粉末１グラムあたり約１ｘ１０１４ＣＦＵを含んでもよい。用量は、液体懸濁液１ｍＬあたり約１ｘ１０７ＣＦＵ、液体懸濁液１ｍＬあたり約１ｘ１０８ＣＦＵ、液体懸濁液１ｍＬあたり約１ｘ１０９ＣＦＵ、液体懸濁液１ｍＬあたり約１ｘ１０１０ＣＦＵ、液体懸濁液１ｍＬあたり約１ｘ１０１１ＣＦＵ、液体懸濁液１ｍＬあたり約１ｘ１０１２ＣＦＵ、液体懸濁液１ｍＬあたり約１ｘ１０１３ＣＦＵ、または液体懸濁液１ｍＬあたり約１ｘ１０１４ＣＦＵを含んでもよい。
【００９５】
本開示の組成物の用量または単位用量は、例えば、少なくとも約１ｘ１０＾３、１ｘ１０＾４、１ｘ１０＾５、２ｘ１０＾５、３ｘ１０＾５、４ｘ１０＾５、５ｘ１０＾５、６ｘ１０＾５、７ｘ１０＾５、８ｘ１０＾５、９ｘ１０＾５、１ｘ１０＾６、２ｘ１０＾６、３ｘ１０＾６、４ｘ１０＾６、５ｘ１０＾６、６ｘ１０＾６、７ｘ１０＾６、８ｘ１０＾６、９ｘ１０＾６、１ｘ１０＾７、２ｘ１０＾７、３ｘ１０＾７、４ｘ１０＾７、５ｘ１０＾７、６ｘ１０＾７、７ｘ１０＾７、８ｘ１０＾７、９ｘ１０＾７、１ｘ１０＾８、２ｘ１０＾８、３ｘ１０＾８、４ｘ１０＾８、５ｘ１０＾８、６ｘ１０＾８、７ｘ１０＾８、８ｘ１０＾８、９ｘ１０＾８、１ｘ１０＾９、２ｘ１０＾９、３ｘ１０＾９、４ｘ１０＾９、５ｘ１０＾９、６ｘ１０＾９、７ｘ１０＾９、８ｘ１０＾９、９ｘ１０＾９、１ｘ１０＾１０、２ｘ１０＾１０、３ｘ１０＾１０、４ｘ１０＾１０、５ｘ１０＾１０、６ｘ１０＾１０、７ｘ１０＾１０、８ｘ１０＾１０、９ｘ１０＾１０、１ｘ１０＾１１、２ｘ１０＾１１、３ｘ１０＾１１、４ｘ１０＾１１、５ｘ１０＾１１、６ｘ１０＾１１、７ｘ１０＾１１、８ｘ１０＾１１、９ｘ１０＾１１、１ｘ１０＾１２、２ｘ１０＾１２、３ｘ１０＾１２、４ｘ１０＾１２、５ｘ１０＾１２、６ｘ１０＾１２、７ｘ１０＾１２、８ｘ１０＾１２、９ｘ１０＾１２、１ｘ１０＾１３、２ｘ１０＾１３、３ｘ１０＾１３、４ｘ１０＾１３、５ｘ１０＾１３、６ｘ１０＾１３、７ｘ１０＾１３、８ｘ１０＾１３、９ｘ１０＾１３、１ｘ１０＾１４、２ｘ１０＾１４、３ｘ１０＾１４、４ｘ１０＾１４、５ｘ１０＾１４、６ｘ１０＾１４、７ｘ１０＾１４、８ｘ１０＾１４、９ｘ１０＾１４、１ｘ１０＾１５、２ｘ１０＾１５、３ｘ１０＾１５、４ｘ１０＾１５、５ｘ１０＾１５、６ｘ１０＾１５、７ｘ１０＾１５、８ｘ１０＾１５、９ｘ１０＾１５、１ｘ１０＾１６、または１ｘ１０＾１７ＣＦＵの本明細書に開示される微生物を含んでもよい。
【００９６】
一部の場合、本開示の組成物の用量または単位用量は、最大で約１ｘ１０＾６、２ｘ１０＾６、３ｘ１０＾６、４ｘ１０＾６、５ｘ１０＾６、６ｘ１０＾６、７ｘ１０＾６、８ｘ１０＾６、９ｘ１０＾６、１ｘ１０＾７、２ｘ１０＾７、３ｘ１０＾７、４ｘ１０＾７、５ｘ１０＾７、６ｘ１０＾７、７ｘ１０＾７、８ｘ１０＾７、９ｘ１０＾７、１ｘ１０＾８、２ｘ１０＾８、３ｘ１０＾８、４ｘ１０＾８、５ｘ１０＾８、６ｘ１０＾８、７ｘ１０＾８、８ｘ１０＾８、９ｘ１０＾８、１ｘ１０＾９、２ｘ１０＾９、３ｘ１０＾９、４ｘ１０＾９、５ｘ１０＾９、６ｘ１０＾９、７ｘ１０＾９、８ｘ１０＾９、９ｘ１０＾９、１ｘ１０＾１０、２ｘ１０＾１０、３ｘ１０＾１０、４ｘ１０＾１０、５ｘ１０＾１０、６ｘ１０＾１０、７ｘ１０＾１０、８ｘ１０＾１０、９ｘ１０＾１０、１ｘ１０＾１１、２ｘ１０＾１１、３ｘ１０＾１１、４ｘ１０＾１１、５ｘ１０＾１１、６ｘ１０＾１１、７ｘ１０＾１１、８ｘ１０＾１１、９ｘ１０＾１１、１ｘ１０＾１２、２ｘ１０＾１２、３ｘ１０＾１２、４ｘ１０＾１２、５ｘ１０＾１２、６ｘ１０＾１２、７ｘ１０＾１２、８ｘ１０＾１２、９ｘ１０＾１２、１ｘ１０＾１３、２ｘ１０＾１３、３ｘ１０＾１３、４ｘ１０＾１３、５ｘ１０＾１３、６ｘ１０＾１３、７ｘ１０＾１３、８ｘ１０＾１３、９ｘ１０＾１３、１ｘ１０＾１４、２ｘ１０＾１４、３ｘ１０＾１４、４ｘ１０＾１４、５ｘ１０＾１４、６ｘ１０＾１４、７ｘ１０＾１４、８ｘ１０＾１４、９ｘ１０＾１４、１ｘ１０＾１５、２ｘ１０＾１５、３ｘ１０＾１５、４ｘ１０＾１５、５ｘ１０＾１５、６ｘ１０＾１５、７ｘ１０＾１５、８ｘ１０＾１５、９ｘ１０＾１５、１ｘ１０＾１６、または１ｘ１０＾１７ＣＦＵの本明細書に開示される微生物を含む。
【００９７】
一部の実施形態では、本開示の組成物の用量または単位用量は、例えば、約１ｘ１０＾３、１ｘ１０＾４、１ｘ１０＾５、２ｘ１０＾５、３ｘ１０＾５、４ｘ１０＾５、５ｘ１０＾５、６ｘ１０＾５、７ｘ１０＾５、８ｘ１０＾５、９ｘ１０＾５、１ｘ１０＾６、２ｘ１０＾６、３ｘ１０＾６、４ｘ１０＾６、５ｘ１０＾６、６ｘ１０＾６、７ｘ１０＾６、８ｘ１０＾６、９ｘ１０＾６、１ｘ１０＾７、２ｘ１０＾７、３ｘ１０＾７、４ｘ１０＾７、５ｘ１０＾７、６ｘ１０＾７、７ｘ１０＾７、８ｘ１０＾７、９ｘ１０＾７、１ｘ１０＾８、２ｘ１０＾８、３ｘ１０＾８、４ｘ１０＾８、５ｘ１０＾８、６ｘ１０＾８、７ｘ１０＾８、８ｘ１０＾８、９ｘ１０＾８、１ｘ１０＾９、２ｘ１０＾９、３ｘ１０＾９、４ｘ１０＾９、５ｘ１０＾９、６ｘ１０＾９、７ｘ１０＾９、８ｘ１０＾９、９ｘ１０＾９、１ｘ１０＾１０、２ｘ１０＾１０、３ｘ１０＾１０、４ｘ１０＾１０、５ｘ１０＾１０、６ｘ１０＾１０、７ｘ１０＾１０、８ｘ１０＾１０、９ｘ１０＾１０、１ｘ１０＾１１、２ｘ１０＾１１、３ｘ１０＾１１、４ｘ１０＾１１、５ｘ１０＾１１、６ｘ１０＾１１、７ｘ１０＾１１、８ｘ１０＾１１、９ｘ１０＾１１、１ｘ１０＾１２、２ｘ１０＾１２、３ｘ１０＾１２、４ｘ１０＾１２、５ｘ１０＾１２、６ｘ１０＾１２、７ｘ１０＾１２、８ｘ１０＾１２、９ｘ１０＾１２、１ｘ１０＾１３、２ｘ１０＾１３、３ｘ１０＾１３、４ｘ１０＾１３、５ｘ１０＾１３、６ｘ１０＾１３、７ｘ１０＾１３、８ｘ１０＾１３、９ｘ１０＾１３、１ｘ１０＾１４、２ｘ１０＾１４、３ｘ１０＾１４、４ｘ１０＾１４、５ｘ１０＾１４、６ｘ１０＾１４、７ｘ１０＾１４、８ｘ１０＾１４、９ｘ１０＾１４、１ｘ１０＾１５、２ｘ１０＾１５、３ｘ１０＾１５、４ｘ１０＾１５、５ｘ１０＾１５、６ｘ１０＾１５、７ｘ１０＾１５、８ｘ１０＾１５、９ｘ１０＾１５、１ｘ１０＾１６、または１ｘ１０＾１７ＣＦＵの本明細書に開示される微生物を含んでもよい。
【００９８】
本開示の組成物の用量または単位用量は、例えば、少なくとも約１ｘ１０＾３、１ｘ１０＾４、１ｘ１０＾５、２ｘ１０＾５、３ｘ１０＾５、４ｘ１０＾５、５ｘ１０＾５、６ｘ１０＾５、７ｘ１０＾５、８ｘ１０＾５、９ｘ１０＾５、１ｘ１０＾６、２ｘ１０＾６、３ｘ１０＾６、４ｘ１０＾６、５ｘ１０＾６、６ｘ１０＾６、７ｘ１０＾６、８ｘ１０＾６、９ｘ１０＾６、１ｘ１０＾７、２ｘ１０＾７、３ｘ１０＾７、４ｘ１０＾７、５ｘ１０＾７、６ｘ１０＾７、７ｘ１０＾７、８ｘ１０＾７、９ｘ１０＾７、１ｘ１０＾８、２ｘ１０＾８、３ｘ１０＾８、４ｘ１０＾８、５ｘ１０＾８、６ｘ１０＾８、７ｘ１０＾８、８ｘ１０＾８、９ｘ１０＾８、１ｘ１０＾９、２ｘ１０＾９、３ｘ１０＾９、４ｘ１０＾９、５ｘ１０＾９、６ｘ１０＾９、７ｘ１０＾９、８ｘ１０＾９、９ｘ１０＾９、１ｘ１０＾１０、２ｘ１０＾１０、３ｘ１０＾１０、４ｘ１０＾１０、５ｘ１０＾１０、６ｘ１０＾１０、７ｘ１０＾１０、８ｘ１０＾１０、９ｘ１０＾１０、１ｘ１０＾１１、２ｘ１０＾１１、３ｘ１０＾１１、４ｘ１０＾１１、５ｘ１０＾１１、６ｘ１０＾１１、７ｘ１０＾１１、８ｘ１０＾１１、９ｘ１０＾１１、１ｘ１０＾１２、２ｘ１０＾１２、３ｘ１０＾１２、４ｘ１０＾１２、５ｘ１０＾１２、６ｘ１０＾１２、７ｘ１０＾１２、８ｘ１０＾１２、９ｘ１０＾１２、１ｘ１０＾１３、２ｘ１０＾１３、３ｘ１０＾１３、４ｘ１０＾１３、５ｘ１０＾１３、６ｘ１０＾１３、７ｘ１０＾１３、８ｘ１０＾１３、９ｘ１０＾１３、１ｘ１０＾１４、２ｘ１０＾１４、３ｘ１０＾１４、４ｘ１０＾１４、５ｘ１０＾１４、６ｘ１０＾１４、７ｘ１０＾１４、８ｘ１０＾１４、９ｘ１０＾１４、１ｘ１０＾１５、２ｘ１０＾１５、３ｘ１０＾１５、４ｘ１０＾１５、５ｘ１０＾１５、６ｘ１０＾１５、７ｘ１０＾１５、８ｘ１０＾１５、９ｘ１０＾１５、１ｘ１０＾１６、または１ｘ１０＾１７ＣＦＵのＡｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａ、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａに由来するｒＲＮＡに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列（例えば、１６Ｓ  ｒＲＮＡもしくは２３Ｓ  ｒＲＮＡ）を含む微生物、または配列番号１〜６のいずれか１つに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列を含む微生物を含んでもよい。
【００９９】
一部の場合、本開示の組成物の用量または単位用量は、最大で約１ｘ１０＾６、２ｘ１０＾６、３ｘ１０＾６、４ｘ１０＾６、５ｘ１０＾６、６ｘ１０＾６、７ｘ１０＾６、８ｘ１０＾６、９ｘ１０＾６、１ｘ１０＾７、２ｘ１０＾７、３ｘ１０＾７、４ｘ１０＾７、５ｘ１０＾７、６ｘ１０＾７、７ｘ１０＾７、８ｘ１０＾７、９ｘ１０＾７、１ｘ１０＾８、２ｘ１０＾８、３ｘ１０＾８、４ｘ１０＾８、５ｘ１０＾８、６ｘ１０＾８、７ｘ１０＾８、８ｘ１０＾８、９ｘ１０＾８、１ｘ１０＾９、２ｘ１０＾９、３ｘ１０＾９、４ｘ１０＾９、５ｘ１０＾９、６ｘ１０＾９、７ｘ１０＾９、８ｘ１０＾９、９ｘ１０＾９、１ｘ１０＾１０、２ｘ１０＾１０、３ｘ１０＾１０、４ｘ１０＾１０、５ｘ１０＾１０、６ｘ１０＾１０、７ｘ１０＾１０、８ｘ１０＾１０、９ｘ１０＾１０、１ｘ１０＾１１、２ｘ１０＾１１、３ｘ１０＾１１、４ｘ１０＾１１、５ｘ１０＾１１、６ｘ１０＾１１、７ｘ１０＾１１、８ｘ１０＾１１、９ｘ１０＾１１、１ｘ１０＾１２、２ｘ１０＾１２、３ｘ１０＾１２、４ｘ１０＾１２、５ｘ１０＾１２、６ｘ１０＾１２、７ｘ１０＾１２、８ｘ１０＾１２、９ｘ１０＾１２、１ｘ１０＾１３、２ｘ１０＾１３、３ｘ１０＾１３、４ｘ１０＾１３、５ｘ１０＾１３、６ｘ１０＾１３、７ｘ１０＾１３、８ｘ１０＾１３、９ｘ１０＾１３、１ｘ１０＾１４、２ｘ１０＾１４、３ｘ１０＾１４、４ｘ１０＾１４、５ｘ１０＾１４、６ｘ１０＾１４、７ｘ１０＾１４、８ｘ１０＾１４、９ｘ１０＾１４、１ｘ１０＾１５、２ｘ１０＾１５、３ｘ１０＾１５、４ｘ１０＾１５、５ｘ１０＾１５、６ｘ１０＾１５、７ｘ１０＾１５、８ｘ１０＾１５、９ｘ１０＾１５、１ｘ１０＾１６、または１ｘ１０＾１７ＣＦＵのＡｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａ、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａに由来するｒＲＮＡに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列（例えば、１６Ｓ  ｒＲＮＡもしくは２３Ｓ  ｒＲＮＡ）を含む微生物、または配列番号１〜６のいずれか１つに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列を含む微生物を含む。
【０１００】
一部の実施形態では、本開示の組成物の用量または単位用量は、例えば、約１ｘ１０＾３、１ｘ１０＾４、１ｘ１０＾５、２ｘ１０＾５、３ｘ１０＾５、４ｘ１０＾５、５ｘ１０＾５、６ｘ１０＾５、７ｘ１０＾５、８ｘ１０＾５、９ｘ１０＾５、１ｘ１０＾６、２ｘ１０＾６、３ｘ１０＾６、４ｘ１０＾６、５ｘ１０＾６、６ｘ１０＾６、７ｘ１０＾６、８ｘ１０＾６、９ｘ１０＾６、１ｘ１０＾７、２ｘ１０＾７、３ｘ１０＾７、４ｘ１０＾７、５ｘ１０＾７、６ｘ１０＾７、７ｘ１０＾７、８ｘ１０＾７、９ｘ１０＾７、１ｘ１０＾８、２ｘ１０＾８、３ｘ１０＾８、４ｘ１０＾８、５ｘ１０＾８、６ｘ１０＾８、７ｘ１０＾８、８ｘ１０＾８、９ｘ１０＾８、１ｘ１０＾９、２ｘ１０＾９、３ｘ１０＾９、４ｘ１０＾９、５ｘ１０＾９、６ｘ１０＾９、７ｘ１０＾９、８ｘ１０＾９、９ｘ１０＾９、１ｘ１０＾１０、２ｘ１０＾１０、３ｘ１０＾１０、４ｘ１０＾１０、５ｘ１０＾１０、６ｘ１０＾１０、７ｘ１０＾１０、８ｘ１０＾１０、９ｘ１０＾１０、１ｘ１０＾１１、２ｘ１０＾１１、３ｘ１０＾１１、４ｘ１０＾１１、５ｘ１０＾１１、６ｘ１０＾１１、７ｘ１０＾１１、８ｘ１０＾１１、９ｘ１０＾１１、１ｘ１０＾１２、２ｘ１０＾１２、３ｘ１０＾１２、４ｘ１０＾１２、５ｘ１０＾１２、６ｘ１０＾１２、７ｘ１０＾１２、８ｘ１０＾１２、９ｘ１０＾１２、１ｘ１０＾１３、２ｘ１０＾１３、３ｘ１０＾１３、４ｘ１０＾１３、５ｘ１０＾１３、６ｘ１０＾１３、７ｘ１０＾１３、８ｘ１０＾１３、９ｘ１０＾１３、１ｘ１０＾１４、２ｘ１０＾１４、３ｘ１０＾１４、４ｘ１０＾１４、５ｘ１０＾１４、６ｘ１０＾１４、７ｘ１０＾１４、８ｘ１０＾１４、９ｘ１０＾１４、１ｘ１０＾１５、２ｘ１０＾１５、３ｘ１０＾１５、４ｘ１０＾１５、５ｘ１０＾１５、６ｘ１０＾１５、７ｘ１０＾１５、８ｘ１０＾１５、９ｘ１０＾１５、１ｘ１０＾１６、または１ｘ１０＾１７ＣＦＵのＡｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａ、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａに由来するｒＲＮＡに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列（例えば、１６Ｓ  ｒＲＮＡもしくは２３Ｓ  ｒＲＮＡ）を含む微生物、または配列番号１〜６のいずれか１つに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列を含む微生物を含んでもよい。一部の実施形態では、本開示の組成物の用量または単位用量は、例えば、約１．９ｘ１０＾８ＣＦＵのＡｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａ、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａに由来するｒＲＮＡに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列（例えば、１６Ｓ  ｒＲＮＡもしくは２３Ｓ  ｒＲＮＡ）を含む微生物、または配列番号１〜６のいずれか１つに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列を含む微生物を含んでもよい。一部の実施形態では、本開示の組成物の用量または単位用量は、例えば、約３．９ｘ１０＾８ＣＦＵのＡｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａ、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａに由来するｒＲＮＡに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列（例えば、１６Ｓ  ｒＲＮＡもしくは２��Ｓ  ｒＲＮＡ）を含む微生物、または配列番号１〜６のいずれか１つに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列を含む微生物を含んでもよい。一部の実施形態では、本開示の組成物の用量または単位用量は、例えば、約１．２ｘ１０＾９ＣＦＵのＡｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａ、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａに由来するｒＲＮＡに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列（例えば、１６Ｓ  ｒＲＮＡもしくは２３Ｓ  ｒＲＮＡ）を含む微生物、または配列番号１〜６のいずれか１つに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列を含む微生物を含んでもよい。
【０１０１】
本開示の組成物の用量または単位用量は、例えば、少なくとも約１ｘ１０＾３、１ｘ１０＾４、１ｘ１０＾５、２ｘ１０＾５、３ｘ１０＾５、４ｘ１０＾５、５ｘ１０＾５、６ｘ１０＾５、７ｘ１０＾５、８ｘ１０＾５、９ｘ１０＾５、１ｘ１０＾６、２ｘ１０＾６、３ｘ１０＾６、４ｘ１０＾６、５ｘ１０＾６、６ｘ１０＾６、７ｘ１０＾６、８ｘ１０＾６、９ｘ１０＾６、１ｘ１０＾７、２ｘ１０＾７、３ｘ１０＾７、４ｘ１０＾７、５ｘ１０＾７、６ｘ１０＾７、７ｘ１０＾７、８ｘ１０＾７、９ｘ１０＾７、１ｘ１０＾８、２ｘ１０＾８、３ｘ１０＾８、４ｘ１０＾８、５ｘ１０＾８、６ｘ１０＾８、７ｘ１０＾８、８ｘ１０＾８、９ｘ１０＾８、１ｘ１０＾９、２ｘ１０＾９、３ｘ１０＾９、４ｘ１０＾９、５ｘ１０＾９、６ｘ１０＾９、７ｘ１０＾９、８ｘ１０＾９、９ｘ１０＾９、１ｘ１０＾１０、２ｘ１０＾１０、３ｘ１０＾１０、４ｘ１０＾１０、５ｘ１０＾１０、６ｘ１０＾１０、７ｘ１０＾１０、８ｘ１０＾１０、９ｘ１０＾１０、１ｘ１０＾１１、２ｘ１０＾１１、３ｘ１０＾１１、４ｘ１０＾１１、５ｘ１０＾１１、６ｘ１０＾１１、７ｘ１０＾１１、８ｘ１０＾１１、９ｘ１０＾１１、１ｘ１０＾１２、２ｘ１０＾１２、３ｘ１０＾１２、４ｘ１０＾１２、５ｘ１０＾１２、６ｘ１０＾１２、７ｘ１０＾１２、８ｘ１０＾１２、９ｘ１０＾１２、１ｘ１０＾１３、２ｘ１０＾１３、３ｘ１０＾１３、４ｘ１０＾１３、５ｘ１０＾１３、６ｘ１０＾１３、７ｘ１０＾１３、８ｘ１０＾１３、９ｘ１０＾１３、１ｘ１０＾１４、２ｘ１０＾１４、３ｘ１０＾１４、４ｘ１０＾１４、５ｘ１０＾１４、６ｘ１０＾１４、７ｘ１０＾１４、８ｘ１０＾１４、９ｘ１０＾１４、１ｘ１０＾１５、２ｘ１０＾１５、３ｘ１０＾１５、４ｘ１０＾１５、５ｘ１０＾１５、６ｘ１０＾１５、７ｘ１０＾１５、８ｘ１０＾１５、９ｘ１０＾１５、１ｘ１０＾１６、または１ｘ１０＾１７ＣＦＵのＥｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉまたはＥｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉに由来するｒＲＮＡに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列（例えば、１６Ｓ  ｒＲＮＡまたは２３Ｓ  ｒＲＮＡ）を含む微生物を含んでもよい。
【０１０２】
一部の場合、本開示の組成物の用量または単位用量は、最大で約１ｘ１０＾６、２ｘ１０＾６、３ｘ１０＾６、４ｘ１０＾６、５ｘ１０＾６、６ｘ１０＾６、７ｘ１０＾６、８ｘ１０＾６、９ｘ１０＾６、１ｘ１０＾７、２ｘ１０＾７、３ｘ１０＾７、４ｘ１０＾７、５ｘ１０＾７、６ｘ１０＾７、７ｘ１０＾７、８ｘ１０＾７、９ｘ１０＾７、１ｘ１０＾８、２ｘ１０＾８、３ｘ１０＾８、４ｘ１０＾８、５ｘ１０＾８、６ｘ１０＾８、７ｘ１０＾８、８ｘ１０＾８、９ｘ１０＾８、１ｘ１０＾９、２ｘ１０＾９、３ｘ１０＾９、４ｘ１０＾９、５ｘ１０＾９、６ｘ１０＾９、７ｘ１０＾９、８ｘ１０＾９、９ｘ１０＾９、１ｘ１０＾１０、２ｘ１０＾１０、３ｘ１０＾１０、４ｘ１０＾１０、５ｘ１０＾１０、６ｘ１０＾１０、７ｘ１０＾１０、８ｘ１０＾１０、９ｘ１０＾１０、１ｘ１０＾１１、２ｘ１０＾１１、３ｘ１０＾１１、４ｘ１０＾１１、５ｘ１０＾１１、６ｘ１０＾１１、７ｘ１０＾１１、８ｘ１０＾１１、９ｘ１０＾１１、１ｘ１０＾１２、２ｘ１０＾１２、３ｘ１０＾１２、４ｘ１０＾１２、５ｘ１０＾１２、６ｘ１０＾１２、７ｘ１０＾１２、８ｘ１０＾１２、９ｘ１０＾１２、１ｘ１０＾１３、２ｘ１０＾１３、３ｘ１０＾１３、４ｘ１０＾１３、５ｘ１０＾１３、６ｘ１０＾１３、７ｘ１０＾１３、８ｘ１０＾１３、９ｘ１０＾１３、１ｘ１０＾１４、２ｘ１０＾１４、３ｘ１０＾１４、４ｘ１０＾１４、５ｘ１０＾１４、６ｘ１０＾１４、７ｘ１０＾１４、８ｘ１０＾１４、９ｘ１０＾１４、１ｘ１０＾１５、２ｘ１０＾１５、３ｘ１０＾１５、４ｘ１０＾１５、５ｘ１０＾１５、６ｘ１０＾１５、７ｘ１０＾１５、８ｘ１０＾１５、９ｘ１０＾１５、１ｘ１０＾１６、または１ｘ１０＾１７ＣＦＵのＥｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉまたはＥｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉに由来するｒＲＮＡに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列（例えば、１６Ｓ  ｒＲＮＡまたは２３Ｓ  ｒＲＮＡ）を含む微生物を含む。
【０１０３】
一部の実施形態では、本開示の組成物の用量または単位用量は、例えば、約１ｘ１０＾３、１ｘ１０＾４、１ｘ１０＾５、２ｘ１０＾５、３ｘ１０＾５、４ｘ１０＾５、５ｘ１０＾５、６ｘ１０＾５、７ｘ１０＾５、８ｘ１０＾５、９ｘ１０＾５、１ｘ１０＾６、２ｘ１０＾６、３ｘ１０＾６、４ｘ１０＾６、５ｘ１０＾６、６ｘ１０＾６、７ｘ１０＾６、８ｘ１０＾６、９ｘ１０＾６、１ｘ１０＾７、２ｘ１０＾７、３ｘ１０＾７、４ｘ１０＾７、５ｘ１０＾７、６ｘ１０＾７、７ｘ１０＾７、８ｘ１０＾７、９ｘ１０＾７、１ｘ１０＾８、２ｘ１０＾８、３ｘ１０＾８、４ｘ１０＾８、５ｘ１０＾８、６ｘ１０＾８、７ｘ１０＾８、８ｘ１０＾８、９ｘ１０＾８、１ｘ１０＾９、２ｘ１０＾９、３ｘ１０＾９、４ｘ１０＾９、５ｘ１０＾９、６ｘ１０＾９、７ｘ１０＾９、８ｘ１０＾９、９ｘ１０＾９、１ｘ１０＾１０、２ｘ１０＾１０、３ｘ１０＾１０、４ｘ１０＾１０、５ｘ１０＾１０、６ｘ１０＾１０、７ｘ１０＾１０、８ｘ１０＾１０、９ｘ１０＾１０、１ｘ１０＾１１、２ｘ１０＾１１、３ｘ１０＾１１、４ｘ１０＾１１、５ｘ１０＾１１、６ｘ１０＾１１、７ｘ１０＾１１、８ｘ１０＾１１、９ｘ１０＾１１、１ｘ１０＾１２、２ｘ１０＾１２、３ｘ１０＾１２、４ｘ１０＾１２、５ｘ１０＾１２、６ｘ１０＾１２、７ｘ１０＾１２、８ｘ１０＾１２、９ｘ１０＾１２、１ｘ１０＾１３、２ｘ１０＾１３、３ｘ１０＾１３、４ｘ１０＾１３、５ｘ１０＾１３、６ｘ１０＾１３、７ｘ１０＾１３、８ｘ１０＾１３、９ｘ１０＾１３、１ｘ１０＾１４、２ｘ１０＾１４、３ｘ１０＾１４、４ｘ１０＾１４、５ｘ１０＾１４、６ｘ１０＾１４、７ｘ１０＾１４、８ｘ１０＾１４、９ｘ１０＾１４、１ｘ１０＾１５、２ｘ１０＾１５、３ｘ１０＾１５、４ｘ１０＾１５、５ｘ１０＾１５、６ｘ１０＾１５、７ｘ１０＾１５、８ｘ１０＾１５、９ｘ１０＾１５、１ｘ１０＾１６、または１ｘ１０＾１７ＣＦＵのＥｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉまたはＥｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉに由来するｒＲＮＡに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列（例えば、１６Ｓ  ｒＲＮＡまたは２３Ｓ  ｒＲＮＡ）を含む微生物を含んでもよい。一部の実施形態では、本開示の組成物の用量または単位用量は、例えば、約１．５ｘ１０＾８ＣＦＵのＥｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉまたはＥｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉに由来するｒＲＮＡに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列（例えば、１６Ｓ  ｒＲＮＡまたは２３Ｓ  ｒＲＮＡ）を含む微生物を含んでもよい。一部の実施形態では、本開示の組成物の用量または単位用量は、例えば、約３ｘ１０＾８ＣＦＵのＥｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉまたはＥｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉに由来するｒＲＮＡに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列（例えば、１６Ｓ  ｒＲＮＡまたは２３Ｓ  ｒＲＮＡ）を含む微生物を含んでもよい。一部の実施形態では、本開示の組成物の用量または単位用量は、例えば、約９ｘ１０＾９ＣＦＵのＥｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉまたはＥｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉに由来するｒＲＮＡに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有す��ｒＲＮＡ配列（例えば、１６Ｓ  ｒＲＮＡまたは２３Ｓ  ｒＲＮＡ）を含む微生物を含んでもよい。
【０１０４】
本開示の組成物の用量または単位用量は、例えば、少なくとも約１ｘ１０＾３、１ｘ１０＾４、１ｘ１０＾５、２ｘ１０＾５、３ｘ１０＾５、４ｘ１０＾５、５ｘ１０＾５、６ｘ１０＾５、７ｘ１０＾５、８ｘ１０＾５、９ｘ１０＾５、１ｘ１０＾６、２ｘ１０＾６、３ｘ１０＾６、４ｘ１０＾６、５ｘ１０＾６、６ｘ１０＾６、７ｘ１０＾６、８ｘ１０＾６、９ｘ１０＾６、１ｘ１０＾７、２ｘ１０＾７、３ｘ１０＾７、４ｘ１０＾７、５ｘ１０＾７、６ｘ１０＾７、７ｘ１０＾７、８ｘ１０＾７、９ｘ１０＾７、１ｘ１０＾８、２ｘ１０＾８、３ｘ１０＾８、４ｘ１０＾８、５ｘ１０＾８、６ｘ１０＾８、７ｘ１０＾８、８ｘ１０＾８、９ｘ１０＾８、１ｘ１０＾９、２ｘ１０＾９、３ｘ１０＾９、４ｘ１０＾９、５ｘ１０＾９、６ｘ１０＾９、７ｘ１０＾９、８ｘ１０＾９、９ｘ１０＾９、１ｘ１０＾１０、２ｘ１０＾１０、３ｘ１０＾１０、４ｘ１０＾１０、５ｘ１０＾１０、６ｘ１０＾１０、７ｘ１０＾１０、８ｘ１０＾１０、９ｘ１０＾１０、１ｘ１０＾１１、２ｘ１０＾１１、３ｘ１０＾１１、４ｘ１０＾１１、５ｘ１０＾１１、６ｘ１０＾１１、７ｘ１０＾１１、８ｘ１０＾１１、９ｘ１０＾１１、１ｘ１０＾１２、２ｘ１０＾１２、３ｘ１０＾１２、４ｘ１０＾１２、５ｘ１０＾１２、６ｘ１０＾１２、７ｘ１０＾１２、８ｘ１０＾１２、９ｘ１０＾１２、１ｘ１０＾１３、２ｘ１０＾１３、３ｘ１０＾１３、４ｘ１０＾１３、５ｘ１０＾１３、６ｘ１０＾１３、７ｘ１０＾１３、８ｘ１０＾１３、９ｘ１０＾１３、１ｘ１０＾１４、２ｘ１０＾１４、３ｘ１０＾１４、４ｘ１０＾１４、５ｘ１０＾１４、６ｘ１０＾１４、７ｘ１０＾１４、８ｘ１０＾１４、９ｘ１０＾１４、１ｘ１０＾１５、２ｘ１０＾１５、３ｘ１０＾１５、４ｘ１０＾１５、５ｘ１０＾１５、６ｘ１０＾１５、７ｘ１０＾１５、８ｘ１０＾１５、９ｘ１０＾１５、１ｘ１０＾１６、または１ｘ１０＾１７ＣＦＵのＢｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓまたはＢｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓに由来するｒＲＮＡに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列（例えば、１６Ｓ  ｒＲＮＡまたは２３Ｓ  ｒＲＮＡ）を含む微生物を含んでもよい。
【０１０５】
一部の場合、本開示の組成物の用量または単位用量は、最大で約１ｘ１０＾６、２ｘ１０＾６、３ｘ１０＾６、４ｘ１０＾６、５ｘ１０＾６、６ｘ１０＾６、７ｘ１０＾６、８ｘ１０＾６、９ｘ１０＾６、１ｘ１０＾７、２ｘ１０＾７、３ｘ１０＾７、４ｘ１０＾７、５ｘ１０＾７、６ｘ１０＾７、７ｘ１０＾７、８ｘ１０＾７、９ｘ１０＾７、１ｘ１０＾８、２ｘ１０＾８、３ｘ１０＾８、４ｘ１０＾８、５ｘ１０＾８、６ｘ１０＾８、７ｘ１０＾８、８ｘ１０＾８、９ｘ１０＾８、１ｘ１０＾９、２ｘ１０＾９、３ｘ１０＾９、４ｘ１０＾９、５ｘ１０＾９、６ｘ１０＾９、７ｘ１０＾９、８ｘ１０＾９、９ｘ１０＾９、１ｘ１０＾１０、２ｘ１０＾１０、３ｘ１０＾１０、４ｘ１０＾１０、５ｘ１０＾１０、６ｘ１０＾１０、７ｘ１０＾１０、８ｘ１０＾１０、９ｘ１０＾１０、１ｘ１０＾１１、２ｘ１０＾１１、３ｘ１０＾１１、４ｘ１０＾１１、５ｘ１０＾１１、６ｘ１０＾１１、７ｘ１０＾１１、８ｘ１０＾１１、９ｘ１０＾１１、１ｘ１０＾１２、２ｘ１０＾１２、３ｘ１０＾１２、４ｘ１０＾１２、５ｘ１０＾１２、６ｘ１０＾１２、７ｘ１０＾１２、８ｘ１０＾１２、９ｘ１０＾１２、１ｘ１０＾１３、２ｘ１０＾１３、３ｘ１０＾１３、４ｘ１０＾１３、５ｘ１０＾１３、６ｘ１０＾１３、７ｘ１０＾１３、８ｘ１０＾１３、９ｘ１０＾１３、１ｘ１０＾１４、２ｘ１０＾１４、３ｘ１０＾１４、４ｘ１０＾１４、５ｘ１０＾１４、６ｘ１０＾１４、７ｘ１０＾１４、８ｘ１０＾１４、９ｘ１０＾１４、１ｘ１０＾１５、２ｘ１０＾１５、３ｘ１０＾１５、４ｘ１０＾１５、５ｘ１０＾１５、６ｘ１０＾１５、７ｘ１０＾１５、８ｘ１０＾１５、９ｘ１０＾１５、１ｘ１０＾１６、または１ｘ１０＾１７ＣＦＵのＢｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓまたはＢｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓに由来するｒＲＮＡに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列（例えば、１６Ｓ  ｒＲＮＡまたは２３Ｓ  ｒＲＮＡ）を含む微生物を含む。
【０１０６】
一部の実施形態では、本開示の組成物の用量または単位用量は、例えば、約１ｘ１０＾３、１ｘ１０＾４、１ｘ１０＾５、２ｘ１０＾５、３ｘ１０＾５、４ｘ１０＾５、５ｘ１０＾５、６ｘ１０＾５、７ｘ１０＾５、８ｘ１０＾５、９ｘ１０＾５、１ｘ１０＾６、２ｘ１０＾６、３ｘ１０＾６、４ｘ１０＾６、５ｘ１０＾６、６ｘ１０＾６、７ｘ１０＾６、８ｘ１０＾６、９ｘ１０＾６、１ｘ１０＾７、２ｘ１０＾７、３ｘ１０＾７、４ｘ１０＾７、５ｘ１０＾７、６ｘ１０＾７、７ｘ１０＾７、８ｘ１０＾７、９ｘ１０＾７、１ｘ１０＾８、２ｘ１０＾８、３ｘ１０＾８、４ｘ１０＾８、５ｘ１０＾８、６ｘ１０＾８、７ｘ１０＾８、８ｘ１０＾８、９ｘ１０＾８、１ｘ１０＾９、２ｘ１０＾９、３ｘ１０＾９、４ｘ１０＾９、５ｘ１０＾９、６ｘ１０＾９、７ｘ１０＾９、８ｘ１０＾９、９ｘ１０＾９、１ｘ１０＾１０、２ｘ１０＾１０、３ｘ１０＾１０、４ｘ１０＾１０、５ｘ１０＾１０、６ｘ１０＾１０、７ｘ１０＾１０、８ｘ１０＾１０、９ｘ１０＾１０、１ｘ１０＾１１、２ｘ１０＾１１、３ｘ１０＾１１、４ｘ１０＾１１、５ｘ１０＾１１、６ｘ１０＾１１、７ｘ１０＾１１、８ｘ１０＾１１、９ｘ１０＾１１、１ｘ１０＾１２、２ｘ１０＾１２、３ｘ１０＾１２、４ｘ１０＾１２、５ｘ１０＾１２、６ｘ１０＾１２、７ｘ１０＾１２、８ｘ１０＾１２、９ｘ１０＾１２、１ｘ１０＾１３、２ｘ１０＾１３、３ｘ１０＾１３、４ｘ１０＾１３、５ｘ１０＾１３、６ｘ１０＾１３、７ｘ１０＾１３、８ｘ１０＾１３、９ｘ１０＾１３、１ｘ１０＾１４、２ｘ１０＾１４、３ｘ１０＾１４、４ｘ１０＾１４、５ｘ１０＾１４、６ｘ１０＾１４、７ｘ１０＾１４、８ｘ１０＾１４、９ｘ１０＾１４、１ｘ１０＾１５、２ｘ１０＾１５、３ｘ１０＾１５、４ｘ１０＾１５、５ｘ１０＾１５、６ｘ１０＾１５、７ｘ１０＾１５、８ｘ１０＾１５、９ｘ１０＾１５、１ｘ１０＾１６、または１ｘ１０＾１７ＣＦＵのＢｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓまたはＢｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓに由来するｒＲＮＡに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列（例えば、１６Ｓ  ｒＲＮＡまたは２３Ｓ  ｒＲＮＡ）を含む微生物を含んでもよい。一部の実施形態では、本開示の組成物の用量または単位用量は、例えば、約３．３ｘ１０＾７ＣＦＵのＢｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓまたはＢｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓに由来するｒＲＮＡに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列（例えば、１６Ｓ  ｒＲＮＡまたは２３Ｓ  ｒＲＮＡ）を含む微生物を含んでもよい。一部の実施形態では、本開示の組成物の用量または単位用量は、例えば、約６．７ｘ１０＾７ＣＦＵのＢｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓまたはＢｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓに由来するｒＲＮＡに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列（例えば、１６Ｓ  ｒＲＮＡまたは２３Ｓ  ｒＲＮＡ）を含む微生物を含んでもよい。一部の実施形態では、本開示の組成物の用量または単位用量は、例えば、約２ｘ１０＾８ＣＦＵのＢｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓまたはＢｉｆｉｄ���ｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓに由来するｒＲＮＡに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列（例えば、１６Ｓ  ｒＲＮＡまたは２３Ｓ  ｒＲＮＡ）を含む微生物を含んでもよい。
【０１０７】
本開示の組成物の用量または単位用量は、例えば、少なくとも約１ｘ１０＾３、１ｘ１０＾４、１ｘ１０＾５、２ｘ１０＾５、３ｘ１０＾５、４ｘ１０＾５、５ｘ１０＾５、６ｘ１０＾５、７ｘ１０＾５、８ｘ１０＾５、９ｘ１０＾５、１ｘ１０＾６、２ｘ１０＾６、３ｘ１０＾６、４ｘ１０＾６、５ｘ１０＾６、６ｘ１０＾６、７ｘ１０＾６、８ｘ１０＾６、９ｘ１０＾６、１ｘ１０＾７、２ｘ１０＾７、３ｘ１０＾７、４ｘ１０＾７、５ｘ１０＾７、６ｘ１０＾７、７ｘ１０＾７、８ｘ１０＾７、９ｘ１０＾７、１ｘ１０＾８、２ｘ１０＾８、３ｘ１０＾８、４ｘ１０＾８、５ｘ１０＾８、６ｘ１０＾８、７ｘ１０＾８、８ｘ１０＾８、９ｘ１０＾８、１ｘ１０＾９、２ｘ１０＾９、３ｘ１０＾９、４ｘ１０＾９、５ｘ１０＾９、６ｘ１０＾９、７ｘ１０＾９、８ｘ１０＾９、９ｘ１０＾９、１ｘ１０＾１０、２ｘ１０＾１０、３ｘ１０＾１０、４ｘ１０＾１０、５ｘ１０＾１０、６ｘ１０＾１０、７ｘ１０＾１０、８ｘ１０＾１０、９ｘ１０＾１０、１ｘ１０＾１１、２ｘ１０＾１１、３ｘ１０＾１１、４ｘ１０＾１１、５ｘ１０＾１１、６ｘ１０＾１１、７ｘ１０＾１１、８ｘ１０＾１１、９ｘ１０＾１１、１ｘ１０＾１２、２ｘ１０＾１２、３ｘ１０＾１２、４ｘ１０＾１２、５ｘ１０＾１２、６ｘ１０＾１２、７ｘ１０＾１２、８ｘ１０＾１２、９ｘ１０＾１２、１ｘ１０＾１３、２ｘ１０＾１３、３ｘ１０＾１３、４ｘ１０＾１３、５ｘ１０＾１３、６ｘ１０＾１３、７ｘ１０＾１３、８ｘ１０＾１３、９ｘ１０＾１３、１ｘ１０＾１４、２ｘ１０＾１４、３ｘ１０＾１４、４ｘ１０＾１４、５ｘ１０＾１４、６ｘ１０＾１４、７ｘ１０＾１４、８ｘ１０＾１４、９ｘ１０＾１４、１ｘ１０＾１５、２ｘ１０＾１５、３ｘ１０＾１５、４ｘ１０＾１５、５ｘ１０＾１５、６ｘ１０＾１５、７ｘ１０＾１５、８ｘ１０＾１５、９ｘ１０＾１５、１ｘ１０＾１６、または１ｘ１０＾１７ＣＦＵのＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉまたはＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉに由来するｒＲＮＡに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列（例えば、１６Ｓ  ｒＲＮＡまたは２３Ｓ  ｒＲＮＡ）を含む微生物を含んでもよい。
【０１０８】
一部の場合、本開示の組成物の用量または単位用量は、最大で約１ｘ１０＾６、２ｘ１０＾６、３ｘ１０＾６、４ｘ１０＾６、５ｘ１０＾６、６ｘ１０＾６、７ｘ１０＾６、８ｘ１０＾６、９ｘ１０＾６、１ｘ１０＾７、２ｘ１０＾７、３ｘ１０＾７、４ｘ１０＾７、５ｘ１０＾７、６ｘ１０＾７、７ｘ１０＾７、８ｘ１０＾７、９ｘ１０＾７、１ｘ１０＾８、２ｘ１０＾８、３ｘ１０＾８、４ｘ１０＾８、５ｘ１０＾８、６ｘ１０＾８、７ｘ１０＾８、８ｘ１０＾８、９ｘ１０＾８、１ｘ１０＾９、２ｘ１０＾９、３ｘ１０＾９、４ｘ１０＾９、５ｘ１０＾９、６ｘ１０＾９、７ｘ１０＾９、８ｘ１０＾９、９ｘ１０＾９、１ｘ１０＾１０、２ｘ１０＾１０、３ｘ１０＾１０、４ｘ１０＾１０、５ｘ１０＾１０、６ｘ１０＾１０、７ｘ１０＾１０、８ｘ１０＾１０、９ｘ１０＾１０、１ｘ１０＾１１、２ｘ１０＾１１、３ｘ１０＾１１、４ｘ１０＾１１、５ｘ１０＾１１、６ｘ１０＾１１、７ｘ１０＾１１、８ｘ１０＾１１、９ｘ１０＾１１、１ｘ１０＾１２、２ｘ１０＾１２、３ｘ１０＾１２、４ｘ１０＾１２、５ｘ１０＾１２、６ｘ１０＾１２、７ｘ１０＾１２、８ｘ１０＾１２、９ｘ１０＾１２、１ｘ１０＾１３、２ｘ１０＾１３、３ｘ１０＾１３、４ｘ１０＾１３、５ｘ１０＾１３、６ｘ１０＾１３、７ｘ１０＾１３、８ｘ１０＾１３、９ｘ１０＾１３、１ｘ１０＾１４、２ｘ１０＾１４、３ｘ１０＾１４、４ｘ１０＾１４、５ｘ１０＾１４、６ｘ１０＾１４、７ｘ１０＾１４、８ｘ１０＾１４、９ｘ１０＾１４、１ｘ１０＾１５、２ｘ１０＾１５、３ｘ１０＾１５、４ｘ１０＾１５、５ｘ１０＾１５、６ｘ１０＾１５、７ｘ１０＾１５、８ｘ１０＾１５、９ｘ１０＾１５、１ｘ１０＾１６、または１ｘ１０＾１７ＣＦＵのＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉまたはＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉに由来するｒＲＮＡに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列（例えば、１６Ｓ  ｒＲＮＡまたは２３Ｓ  ｒＲＮＡ）を含む微生物を含む。
【０１０９】
一部の実施形態では、本開示の組成物の用量または単位用量は、例えば、約１ｘ１０＾３、１ｘ１０＾４、１ｘ１０＾５、２ｘ１０＾５、３ｘ１０＾５、４ｘ１０＾５、５ｘ１０＾５、６ｘ１０＾５、７ｘ１０＾５、８ｘ１０＾５、９ｘ１０＾５、１ｘ１０＾６、２ｘ１０＾６、３ｘ１０＾６、４ｘ１０＾６、５ｘ１０＾６、６ｘ１０＾６、７ｘ１０＾６、８ｘ１０＾６、９ｘ１０＾６、１ｘ１０＾７、２ｘ１０＾７、３ｘ１０＾７、４ｘ１０＾７、５ｘ１０＾７、６ｘ１０＾７、７ｘ１０＾７、８ｘ１０＾７、９ｘ１０＾７、１ｘ１０＾８、２ｘ１０＾８、３ｘ１０＾８、４ｘ１０＾８、５ｘ１０＾８、６ｘ１０＾８、７ｘ１０＾８、８ｘ１０＾８、９ｘ１０＾８、１ｘ１０＾９、２ｘ１０＾９、３ｘ１０＾９、４ｘ１０＾９、５ｘ１０＾９、６ｘ１０＾９、７ｘ１０＾９、８ｘ１０＾９、９ｘ１０＾９、１ｘ１０＾１０、２ｘ１０＾１０、３ｘ１０＾１０、４ｘ１０＾１０、５ｘ１０＾１０、６ｘ１０＾１０、７ｘ１０＾１０、８ｘ１０＾１０、９ｘ１０＾１０、１ｘ１０＾１１、２ｘ１０＾１１、３ｘ１０＾１１、４ｘ１０＾１１、５ｘ１０＾１１、６ｘ１０＾１１、７ｘ１０＾１１、８ｘ１０＾１１、９ｘ１０＾１１、１ｘ１０＾１２、２ｘ１０＾１２、３ｘ１０＾１２、４ｘ１０＾１２、５ｘ１０＾１２、６ｘ１０＾１２、７ｘ１０＾１２、８ｘ１０＾１２、９ｘ１０＾１２、１ｘ１０＾１３、２ｘ１０＾１３、３ｘ１０＾１３、４ｘ１０＾１３、５ｘ１０＾１３、６ｘ１０＾１３、７ｘ１０＾１３、８ｘ１０＾１３、９ｘ１０＾１３、１ｘ１０＾１４、２ｘ１０＾１４、３ｘ１０＾１４、４ｘ１０＾１４、５ｘ１０＾１４、６ｘ１０＾１４、７ｘ１０＾１４、８ｘ１０＾１４、９ｘ１０＾１４、１ｘ１０＾１５、２ｘ１０＾１５、３ｘ１０＾１５、４ｘ１０＾１５、５ｘ１０＾１５、６ｘ１０＾１５、７ｘ１０＾１５、８ｘ１０＾１５、９ｘ１０＾１５、１ｘ１０＾１６、または１ｘ１０＾１７ＣＦＵのＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉまたはＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉに由来するｒＲＮＡに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列（例えば、１６Ｓ  ｒＲＮＡまたは２３Ｓ  ｒＲＮＡ）を含む微生物を含んでもよい。一部の実施形態では、本開示の組成物の用量または単位用量は、例えば、約１．９ｘ１０＾８ＣＦＵのＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉまたはＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉに由来するｒＲＮＡに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列（例えば、１６Ｓ  ｒＲＮＡまたは２３Ｓ  ｒＲＮＡ）を含む微生物を含んでもよい。一部の実施形態では、本開示の組成物の用量または単位用量は、例えば、約３．８ｘ１０＾８ＣＦＵのＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉまたはＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉに由来するｒＲＮＡに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列（例えば、１６Ｓ  ｒＲＮＡまたは２３Ｓ  ｒＲＮＡ）を含む微生物を含んでもよい。一部の実施形態では、本開示の組成物の用量または単位用量は、例えば、約１．２ｘ１０＾９ＣＦＵのＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉまたはＣｌｏ���ｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉに由来するｒＲＮＡに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列（例えば、１６Ｓ  ｒＲＮＡまたは２３Ｓ  ｒＲＮＡ）を含む微生物を含んでもよい。
【０１１０】
本開示の組成物の用量または単位用量は、例えば、少なくとも約１ｘ１０＾３、１ｘ１０＾４、１ｘ１０＾５、２ｘ１０＾５、３ｘ１０＾５、４ｘ１０＾５、５ｘ１０＾５、６ｘ１０＾５、７ｘ１０＾５、８ｘ１０＾５、９ｘ１０＾５、１ｘ１０＾６、２ｘ１０＾６、３ｘ１０＾６、４ｘ１０＾６、５ｘ１０＾６、６ｘ１０＾６、７ｘ１０＾６、８ｘ１０＾６、９ｘ１０＾６、１ｘ１０＾７、２ｘ１０＾７、３ｘ１０＾７、４ｘ１０＾７、５ｘ１０＾７、６ｘ１０＾７、７ｘ１０＾７、８ｘ１０＾７、９ｘ１０＾７、１ｘ１０＾８、２ｘ１０＾８、３ｘ１０＾８、４ｘ１０＾８、５ｘ１０＾８、６ｘ１０＾８、７ｘ１０＾８、８ｘ１０＾８、９ｘ１０＾８、１ｘ１０＾９、２ｘ１０＾９、３ｘ１０＾９、４ｘ１０＾９、５ｘ１０＾９、６ｘ１０＾９、７ｘ１０＾９、８ｘ１０＾９、９ｘ１０＾９、１ｘ１０＾１０、２ｘ１０＾１０、３ｘ１０＾１０、４ｘ１０＾１０、５ｘ１０＾１０、６ｘ１０＾１０、７ｘ１０＾１０、８ｘ１０＾１０、９ｘ１０＾１０、１ｘ１０＾１１、２ｘ１０＾１１、３ｘ１０＾１１、４ｘ１０＾１１、５ｘ１０＾１１、６ｘ１０＾１１、７ｘ１０＾１１、８ｘ１０＾１１、９ｘ１０＾１１、１ｘ１０＾１２、２ｘ１０＾１２、３ｘ１０＾１２、４ｘ１０＾１２、５ｘ１０＾１２、６ｘ１０＾１２、７ｘ１０＾１２、８ｘ１０＾１２、９ｘ１０＾１２、１ｘ１０＾１３、２ｘ１０＾１３、３ｘ１０＾１３、４ｘ１０＾１３、５ｘ１０＾１３、６ｘ１０＾１３、７ｘ１０＾１３、８ｘ１０＾１３、９ｘ１０＾１３、１ｘ１０＾１４、２ｘ１０＾１４、３ｘ１０＾１４、４ｘ１０＾１４、５ｘ１０＾１４、６ｘ１０＾１４、７ｘ１０＾１４、８ｘ１０＾１４、９ｘ１０＾１４、１ｘ１０＾１５、２ｘ１０＾１５、３ｘ１０＾１５、４ｘ１０＾１５、５ｘ１０＾１５、６ｘ１０＾１５、７ｘ１０＾１５、８ｘ１０＾１５、９ｘ１０＾１５、１ｘ１０＾１６、または１ｘ１０＾１７ＣＦＵのＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍまたはＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍに由来するｒＲＮＡに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列（例えば、１６Ｓ  ｒＲＮＡまたは２３Ｓ  ｒＲＮＡ）を含む微生物を含んでもよい。
【０１１１】
一部の場合、本開示の組成物の用量または単位用量は、最大で約１ｘ１０＾６、２ｘ１０＾６、３ｘ１０＾６、４ｘ１０＾６、５ｘ１０＾６、６ｘ１０＾６、７ｘ１０＾６、８ｘ１０＾６、９ｘ１０＾６、１ｘ１０＾７、２ｘ１０＾７、３ｘ１０＾７、４ｘ１０＾７、５ｘ１０＾７、６ｘ１０＾７、７ｘ１０＾７、８ｘ１０＾７、９ｘ１０＾７、１ｘ１０＾８、２ｘ１０＾８、３ｘ１０＾８、４ｘ１０＾８、５ｘ１０＾８、６ｘ１０＾８、７ｘ１０＾８、８ｘ１０＾８、９ｘ１０＾８、１ｘ１０＾９、２ｘ１０＾９、３ｘ１０＾９、４ｘ１０＾９、５ｘ１０＾９、６ｘ１０＾９、７ｘ１０＾９、８ｘ１０＾９、９ｘ１０＾９、１ｘ１０＾１０、２ｘ１０＾１０、３ｘ１０＾１０、４ｘ１０＾１０、５ｘ１０＾１０、６ｘ１０＾１０、７ｘ１０＾１０、８ｘ１０＾１０、９ｘ１０＾１０、１ｘ１０＾１１、２ｘ１０＾１１、３ｘ１０＾１１、４ｘ１０＾１１、５ｘ１０＾１１、６ｘ１０＾１１、７ｘ１０＾１１、８ｘ１０＾１１、９ｘ１０＾１１、１ｘ１０＾１２、２ｘ１０＾１２、３ｘ１０＾１２、４ｘ１０＾１２、５ｘ１０＾１２、６ｘ１０＾１２、７ｘ１０＾１２、８ｘ１０＾１２、９ｘ１０＾１２、１ｘ１０＾１３、２ｘ１０＾１３、３ｘ１０＾１３、４ｘ１０＾１３、５ｘ１０＾１３、６ｘ１０＾１３、７ｘ１０＾１３、８ｘ１０＾１３、９ｘ１０＾１３、１ｘ１０＾１４、２ｘ１０＾１４、３ｘ１０＾１４、４ｘ１０＾１４、５ｘ１０＾１４、６ｘ１０＾１４、７ｘ１０＾１４、８ｘ１０＾１４、９ｘ１０＾１４、１ｘ１０＾１５、２ｘ１０＾１５、３ｘ１０＾１５、４ｘ１０＾１５、５ｘ１０＾１５、６ｘ１０＾１５、７ｘ１０＾１５、８ｘ１０＾１５、９ｘ１０＾１５、１ｘ１０＾１６、または１ｘ１０＾１７ＣＦＵのＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍまたはＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍに由来するｒＲＮＡに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列（例えば、１６Ｓ  ｒＲＮＡまたは２３Ｓ  ｒＲＮＡ）を含む微生物を含む。
【０１１２】
一部の実施形態では、本開示の組成物の用量または単位用量は、例えば、約１ｘ１０＾３、１ｘ１０＾４、１ｘ１０＾５、２ｘ１０＾５、３ｘ１０＾５、４ｘ１０＾５、５ｘ１０＾５、６ｘ１０＾５、７ｘ１０＾５、８ｘ１０＾５、９ｘ１０＾５、１ｘ１０＾６、２ｘ１０＾６、３ｘ１０＾６、４ｘ１０＾６、５ｘ１０＾６、６ｘ１０＾６、７ｘ１０＾６、８ｘ１０＾６、９ｘ１０＾６、１ｘ１０＾７、２ｘ１０＾７、３ｘ１０＾７、４ｘ１０＾７、５ｘ１０＾７、６ｘ１０＾７、７ｘ１０＾７、８ｘ１０＾７、９ｘ１０＾７、１ｘ１０＾８、２ｘ１０＾８、３ｘ１０＾８、４ｘ１０＾８、５ｘ１０＾８、６ｘ１０＾８、７ｘ１０＾８、８ｘ１０＾８、９ｘ１０＾８、１ｘ１０＾９、２ｘ１０＾９、３ｘ１０＾９、４ｘ１０＾９、５ｘ１０＾９、６ｘ１０＾９、７ｘ１０＾９、８ｘ１０＾９、９ｘ１０＾９、１ｘ１０＾１０、２ｘ１０＾１０、３ｘ１０＾１０、４ｘ１０＾１０、５ｘ１０＾１０、６ｘ１０＾１０、７ｘ１０＾１０、８ｘ１０＾１０、９ｘ１０＾１０、１ｘ１０＾１１、２ｘ１０＾１１、３ｘ１０＾１１、４ｘ１０＾１１、５ｘ１０＾１１、６ｘ１０＾１１、７ｘ１０＾１１、８ｘ１０＾１１、９ｘ１０＾１１、１ｘ１０＾１２、２ｘ１０＾１２、３ｘ１０＾１２、４ｘ１０＾１２、５ｘ１０＾１２、６ｘ１０＾１２、７ｘ１０＾１２、８ｘ１０＾１２、９ｘ１０＾１２、１ｘ１０＾１３、２ｘ１０＾１３、３ｘ１０＾１３、４ｘ１０＾１３、５ｘ１０＾１３、６ｘ１０＾１３、７ｘ１０＾１３、８ｘ１０＾１３、９ｘ１０＾１３、１ｘ１０＾１４、２ｘ１０＾１４、３ｘ１０＾１４、４ｘ１０＾１４、５ｘ１０＾１４、６ｘ１０＾１４、７ｘ１０＾１４、８ｘ１０＾１４、９ｘ１０＾１４、１ｘ１０＾１５、２ｘ１０＾１５、３ｘ１０＾１５、４ｘ１０＾１５、５ｘ１０＾１５、６ｘ１０＾１５、７ｘ１０＾１５、８ｘ１０＾１５、９ｘ１０＾１５、１ｘ１０＾１６、または１ｘ１０＾１７ＣＦＵのＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍまたはＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍに由来するｒＲＮＡに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列（例えば、１６Ｓ  ｒＲＮＡまたは２３Ｓ  ｒＲＮＡ）を含む微生物を含んでもよい。一部の実施形態では、本開示の組成物の用量または単位用量は、例えば、約５．６ｘ１０＾７ＣＦＵのＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍまたはＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍに由来するｒＲＮＡに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列（例えば、１６Ｓ  ｒＲＮＡまたは２３Ｓ  ｒＲＮＡ）を含む微生物を含んでもよい。一部の実施形態では、本開示の組成物の用量または単位用量は、例えば、約１．１ｘ１０＾８ＣＦＵのＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍまたはＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍに由来するｒＲＮＡに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列（例えば、１６Ｓ  ｒＲＮＡまたは２３Ｓ  ｒＲＮＡ）を含む微生物を含んでもよい。一部の実施形態では、本開示の組成物の用量または単位用量は、例えば、約３．３ｘ１０＾８ＣＦＵのＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍまたはＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍに由来��るｒＲＮＡに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列（例えば、１６Ｓ  ｒＲＮＡまたは２３Ｓ  ｒＲＮＡ）を含む微生物を含んでもよい。
【０１１３】
本開示の組成物の用量または単位用量は、例えば、少なくとも約１ｘ１０＾３、１ｘ１０＾４、１ｘ１０＾５、２ｘ１０＾５、３ｘ１０＾５、４ｘ１０＾５、５ｘ１０＾５、６ｘ１０＾５、７ｘ１０＾５、８ｘ１０＾５、９ｘ１０＾５、１ｘ１０＾６、２ｘ１０＾６、３ｘ１０＾６、４ｘ１０＾６、５ｘ１０＾６、６ｘ１０＾６、７ｘ１０＾６、８ｘ１０＾６、９ｘ１０＾６、１ｘ１０＾７、２ｘ１０＾７、３ｘ１０＾７、４ｘ１０＾７、５ｘ１０＾７、６ｘ１０＾７、７ｘ１０＾７、８ｘ１０＾７、９ｘ１０＾７、１ｘ１０＾８、２ｘ１０＾８、３ｘ１０＾８、４ｘ１０＾８、５ｘ１０＾８、６ｘ１０＾８、７ｘ１０＾８、８ｘ１０＾８、９ｘ１０＾８、１ｘ１０＾９、２ｘ１０＾９、３ｘ１０＾９、４ｘ１０＾９、５ｘ１０＾９、６ｘ１０＾９、７ｘ１０＾９、８ｘ１０＾９、９ｘ１０＾９、１ｘ１０＾１０、２ｘ１０＾１０、３ｘ１０＾１０、４ｘ１０＾１０、５ｘ１０＾１０、６ｘ１０＾１０、７ｘ１０＾１０、８ｘ１０＾１０、９ｘ１０＾１０、１ｘ１０＾１１、２ｘ１０＾１１、３ｘ１０＾１１、４ｘ１０＾１１、５ｘ１０＾１１、６ｘ１０＾１１、７ｘ１０＾１１、８ｘ１０＾１１、９ｘ１０＾１１、１ｘ１０＾１２、２ｘ１０＾１２、３ｘ１０＾１２、４ｘ１０＾１２、５ｘ１０＾１２、６ｘ１０＾１２、７ｘ１０＾１２、８ｘ１０＾１２、９ｘ１０＾１２、１ｘ１０＾１３、２ｘ１０＾１３、３ｘ１０＾１３、４ｘ１０＾１３、５ｘ１０＾１３、６ｘ１０＾１３、７ｘ１０＾１３、８ｘ１０＾１３、９ｘ１０＾１３、１ｘ１０＾１４、２ｘ１０＾１４、３ｘ１０＾１４、４ｘ１０＾１４、５ｘ１０＾１４、６ｘ１０＾１４、７ｘ１０＾１４、８ｘ１０＾１４、９ｘ１０＾１４、１ｘ１０＾１５、２ｘ１０＾１５、３ｘ１０＾１５、４ｘ１０＾１５、５ｘ１０＾１５、６ｘ１０＾１５、７ｘ１０＾１５、８ｘ１０＾１５、９ｘ１０＾１５、１ｘ１０＾１６、または１ｘ１０＾１７ＣＦＵの総組合せ微生物を含んでもよい。
【０１１４】
一部の場合、本開示の組成物の用量または単位用量は、最大で約１ｘ１０＾６、２ｘ１０＾６、３ｘ１０＾６、４ｘ１０＾６、５ｘ１０＾６、６ｘ１０＾６、７ｘ１０＾６、８ｘ１０＾６、９ｘ１０＾６、１ｘ１０＾７、２ｘ１０＾７、３ｘ１０＾７、４ｘ１０＾７、５ｘ１０＾７、６ｘ１０＾７、７ｘ１０＾７、８ｘ１０＾７、９ｘ１０＾７、１ｘ１０＾８、２ｘ１０＾８、３ｘ１０＾８、４ｘ１０＾８、５ｘ１０＾８、６ｘ１０＾８、７ｘ１０＾８、８ｘ１０＾８、９ｘ１０＾８、１ｘ１０＾９、２ｘ１０＾９、３ｘ１０＾９、４ｘ１０＾９、５ｘ１０＾９、６ｘ１０＾９、７ｘ１０＾９、８ｘ１０＾９、９ｘ１０＾９、１ｘ１０＾１０、２ｘ１０＾１０、３ｘ１０＾１０、４ｘ１０＾１０、５ｘ１０＾１０、６ｘ１０＾１０、７ｘ１０＾１０、８ｘ１０＾１０、９ｘ１０＾１０、１ｘ１０＾１１、２ｘ１０＾１１、３ｘ１０＾１１、４ｘ１０＾１１、５ｘ１０＾１１、６ｘ１０＾１１、７ｘ１０＾１１、８ｘ１０＾１１、９ｘ１０＾１１、１ｘ１０＾１２、２ｘ１０＾１２、３ｘ１０＾１２、４ｘ１０＾１２、５ｘ１０＾１２、６ｘ１０＾１２、７ｘ１０＾１２、８ｘ１０＾１２、９ｘ１０＾１２、１ｘ１０＾１３、２ｘ１０＾１３、３ｘ１０＾１３、４ｘ１０＾１３、５ｘ１０＾１３、６ｘ１０＾１３、７ｘ１０＾１３、８ｘ１０＾１３、９ｘ１０＾１３、１ｘ１０＾１４、２ｘ１０＾１４、３ｘ１０＾１４、４ｘ１０＾１４、５ｘ１０＾１４、６ｘ１０＾１４、７ｘ１０＾１４、８ｘ１０＾１４、９ｘ１０＾１４、１ｘ１０＾１５、２ｘ１０＾１５、３ｘ１０＾１５、４ｘ１０＾１５、５ｘ１０＾１５、６ｘ１０＾１５、７ｘ１０＾１５、８ｘ１０＾１５、９ｘ１０＾１５、１ｘ１０＾１６、または１ｘ１０＾１７ＣＦＵの総組合せ微生物を含む。
【０１１５】
一部の実施形態では、本開示の組成物の用量または単位用量は、例えば、約１ｘ１０＾３、１ｘ１０＾４、１ｘ１０＾５、２ｘ１０＾５、３ｘ１０＾５、４ｘ１０＾５、５ｘ１０＾５、６ｘ１０＾５、７ｘ１０＾５、８ｘ１０＾５、９ｘ１０＾５、１ｘ１０＾６、２ｘ１０＾６、３ｘ１０＾６、４ｘ１０＾６、５ｘ１０＾６、６ｘ１０＾６、７ｘ１０＾６、８ｘ１０＾６、９ｘ１０＾６、１ｘ１０＾７、２ｘ１０＾７、３ｘ１０＾７、４ｘ１０＾７、５ｘ１０＾７、６ｘ１０＾７、７ｘ１０＾７、８ｘ１０＾７、９ｘ１０＾７、１ｘ１０＾８、２ｘ１０＾８、３ｘ１０＾８、４ｘ１０＾８、５ｘ１０＾８、６ｘ１０＾８、７ｘ１０＾８、８ｘ１０＾８、９ｘ１０＾８、１ｘ１０＾９、２ｘ１０＾９、３ｘ１０＾９、４ｘ１０＾９、５ｘ１０＾９、６ｘ１０＾９、７ｘ１０＾９、８ｘ１０＾９、９ｘ１０＾９、１ｘ１０＾１０、２ｘ１０＾１０、３ｘ１０＾１０、４ｘ１０＾１０、５ｘ１０＾１０、６ｘ１０＾１０、７ｘ１０＾１０、８ｘ１０＾１０、９ｘ１０＾１０、１ｘ１０＾１１、２ｘ１０＾１１、３ｘ１０＾１１、４ｘ１０＾１１、５ｘ１０＾１１、６ｘ１０＾１１、７ｘ１０＾１１、８ｘ１０＾１１、９ｘ１０＾１１、１ｘ１０＾１２、２ｘ１０＾１２、３ｘ１０＾１２、４ｘ１０＾１２、５ｘ１０＾１２、６ｘ１０＾１２、７ｘ１０＾１２、８ｘ１０＾１２、９ｘ１０＾１２、１ｘ１０＾１３、２ｘ１０＾１３、３ｘ１０＾１３、４ｘ１０＾１３、５ｘ１０＾１３、６ｘ１０＾１３、７ｘ１０＾１３、８ｘ１０＾１３、９ｘ１０＾１３、１ｘ１０＾１４、２ｘ１０＾１４、３ｘ１０＾１４、４ｘ１０＾１４、５ｘ１０＾１４、６ｘ１０＾１４、７ｘ１０＾１４、８ｘ１０＾１４、９ｘ１０＾１４、１ｘ１０＾１５、２ｘ１０＾１５、３ｘ１０＾１５、４ｘ１０＾１５、５ｘ１０＾１５、６ｘ１０＾１５、７ｘ１０＾１５、８ｘ１０＾１５、９ｘ１０＾１５、１ｘ１０＾１６、または１ｘ１０＾１７ＣＦＵの総組合せ微生物を含んでもよい。一部の実施形態では、本開示の組成物の用量または単位用量は、例えば、約６．２ｘ１０＾８ＣＦＵの総組合せ微生物を含んでもよい。一部の実施形態では、本開示の組成物の用量または単位用量は、例えば、約１．３ｘ１０＾９ＣＦＵの総組合せ微生物を含んでもよい。一部の実施形態では、本開示の組成物の用量または単位用量は、例えば、約３．７ｘ１０＾９ＣＦＵの総組合せ微生物を含んでもよい。
【０１１６】
本開示の組成物の用量または単位用量は、例えば、少なくとも約１ｘ１０＾３、１ｘ１０＾４、１ｘ１０＾５、２ｘ１０＾５、３ｘ１０＾５、４ｘ１０＾５、５ｘ１０＾５、６ｘ１０＾５、７ｘ１０＾５、８ｘ１０＾５、９ｘ１０＾５、１ｘ１０＾６、２ｘ１０＾６、３ｘ１０＾６、４ｘ１０＾６、５ｘ１０＾６、６ｘ１０＾６、７ｘ１０＾６、８ｘ１０＾６、９ｘ１０＾６、１ｘ１０＾７、２ｘ１０＾７、３ｘ１０＾７、４ｘ１０＾７、５ｘ１０＾７、６ｘ１０＾７、７ｘ１０＾７、８ｘ１０＾７、９ｘ１０＾７、１ｘ１０＾８、２ｘ１０＾８、３ｘ１０＾８、４ｘ１０＾８、５ｘ１０＾８、６ｘ１０＾８、７ｘ１０＾８、８ｘ１０＾８、９ｘ１０＾８、１ｘ１０＾９、２ｘ１０＾９、３ｘ１０＾９、４ｘ１０＾９、５ｘ１０＾９、６ｘ１０＾９、７ｘ１０＾９、８ｘ１０＾９、９ｘ１０＾９、１ｘ１０＾１０、２ｘ１０＾１０、３ｘ１０＾１０、４ｘ１０＾１０、５ｘ１０＾１０、６ｘ１０＾１０、７ｘ１０＾１０、８ｘ１０＾１０、９ｘ１０＾１０、１ｘ１０＾１１、２ｘ１０＾１１、３ｘ１０＾１１、４ｘ１０＾１１、５ｘ１０＾１１、６ｘ１０＾１１、７ｘ１０＾１１、８ｘ１０＾１１、９ｘ１０＾１１、１ｘ１０＾１２、２ｘ１０＾１２、３ｘ１０＾１２、４ｘ１０＾１２、５ｘ１０＾１２、６ｘ１０＾１２、７ｘ１０＾１２、８ｘ１０＾１２、９ｘ１０＾１２、１ｘ１０＾１３、２ｘ１０＾１３、３ｘ１０＾１３、４ｘ１０＾１３、５ｘ１０＾１３、６ｘ１０＾１３、７ｘ１０＾１３、８ｘ１０＾１３、９ｘ１０＾１３、１ｘ１０＾１４、２ｘ１０＾１４、３ｘ１０＾１４、４ｘ１０＾１４、５ｘ１０＾１４、６ｘ１０＾１４、７ｘ１０＾１４、８ｘ１０＾１４、９ｘ１０＾１４、１ｘ１０＾１５、２ｘ１０＾１５、３ｘ１０＾１５、４ｘ１０＾１５、５ｘ１０＾１５、６ｘ１０＾１５、７ｘ１０＾１５、８ｘ１０＾１５、９ｘ１０＾１５、１ｘ１０＾１６、または１ｘ１０＾１７ＣＦＵのムチン調節性および／または一次発酵微生物を含んでもよい。
【０１１７】
一部の場合、本開示の組成物の用量または単位用量は、最大で約１ｘ１０＾６、２ｘ１０＾６、３ｘ１０＾６、４ｘ１０＾６、５ｘ１０＾６、６ｘ１０＾６、７ｘ１０＾６、８ｘ１０＾６、９ｘ１０＾６、１ｘ１０＾７、２ｘ１０＾７、３ｘ１０＾７、４ｘ１０＾７、５ｘ１０＾７、６ｘ１０＾７、７ｘ１０＾７、８ｘ１０＾７、９ｘ１０＾７、１ｘ１０＾８、２ｘ１０＾８、３ｘ１０＾８、４ｘ１０＾８、５ｘ１０＾８、６ｘ１０＾８、７ｘ１０＾８、８ｘ１０＾８、９ｘ１０＾８、１ｘ１０＾９、２ｘ１０＾９、３ｘ１０＾９、４ｘ１０＾９、５ｘ１０＾９、６ｘ１０＾９、７ｘ１０＾９、８ｘ１０＾９、９ｘ１０＾９、１ｘ１０＾１０、２ｘ１０＾１０、３ｘ１０＾１０、４ｘ１０＾１０、５ｘ１０＾１０、６ｘ１０＾１０、７ｘ１０＾１０、８ｘ１０＾１０、９ｘ１０＾１０、１ｘ１０＾１１、２ｘ１０＾１１、３ｘ１０＾１１、４ｘ１０＾１１、５ｘ１０＾１１、６ｘ１０＾１１、７ｘ１０＾１１、８ｘ１０＾１１、９ｘ１０＾１１、１ｘ１０＾１２、２ｘ１０＾１２、３ｘ１０＾１２、４ｘ１０＾１２、５ｘ１０＾１２、６ｘ１０＾１２、７ｘ１０＾１２、８ｘ１０＾１２、９ｘ１０＾１２、１ｘ１０＾１３、２ｘ１０＾１３、３ｘ１０＾１３、４ｘ１０＾１３、５ｘ１０＾１３、６ｘ１０＾１３、７ｘ１０＾１３、８ｘ１０＾１３、９ｘ１０＾１３、１ｘ１０＾１４、２ｘ１０＾１４、３ｘ１０＾１４、４ｘ１０＾１４、５ｘ１０＾１４、６ｘ１０＾１４、７ｘ１０＾１４、８ｘ１０＾１４、９ｘ１０＾１４、１ｘ１０＾１５、２ｘ１０＾１５、３ｘ１０＾１５、４ｘ１０＾１５、５ｘ１０＾１５、６ｘ１０＾１５、７ｘ１０＾１５、８ｘ１０＾１５、９ｘ１０＾１５、１ｘ１０＾１６、または１ｘ１０＾１７ＣＦＵのムチン調節性および／または一次発酵微生物を含む。
【０１１８】
一部の実施形態では、本開示の組成物の用量または単位用量は、例えば、約１ｘ１０＾３、１ｘ１０＾４、１ｘ１０＾５、２ｘ１０＾５、３ｘ１０＾５、４ｘ１０＾５、５ｘ１０＾５、６ｘ１０＾５、７ｘ１０＾５、８ｘ１０＾５、９ｘ１０＾５、１ｘ１０＾６、２ｘ１０＾６、３ｘ１０＾６、４ｘ１０＾６、５ｘ１０＾６、６ｘ１０＾６、７ｘ１０＾６、８ｘ１０＾６、９ｘ１０＾６、１ｘ１０＾７、２ｘ１０＾７、３ｘ１０＾７、４ｘ１０＾７、５ｘ１０＾７、６ｘ１０＾７、７ｘ１０＾７、８ｘ１０＾７、９ｘ１０＾７、１ｘ１０＾８、２ｘ１０＾８、３ｘ１０＾８、４ｘ１０＾８、５ｘ１０＾８、６ｘ１０＾８、７ｘ１０＾８、８ｘ１０＾８、９ｘ１０＾８、１ｘ１０＾９、２ｘ１０＾９、３ｘ１０＾９、４ｘ１０＾９、５ｘ１０＾９、６ｘ１０＾９、７ｘ１０＾９、８ｘ１０＾９、９ｘ１０＾９、１ｘ１０＾１０、２ｘ１０＾１０、３ｘ１０＾１０、４ｘ１０＾１０、５ｘ１０＾１０、６ｘ１０＾１０、７ｘ１０＾１０、８ｘ１０＾１０、９ｘ１０＾１０、１ｘ１０＾１１、２ｘ１０＾１１、３ｘ１０＾１１、４ｘ１０＾１１、５ｘ１０＾１１、６ｘ１０＾１１、７ｘ１０＾１１、８ｘ１０＾１１、９ｘ１０＾１１、１ｘ１０＾１２、２ｘ１０＾１２、３ｘ１０＾１２、４ｘ１０＾１２、５ｘ１０＾１２、６ｘ１０＾１２、７ｘ１０＾１２、８ｘ１０＾１２、９ｘ１０＾１２、１ｘ１０＾１３、２ｘ１０＾１３、３ｘ１０＾１３、４ｘ１０＾１３、５ｘ１０＾１３、６ｘ１０＾１３、７ｘ１０＾１３、８ｘ１０＾１３、９ｘ１０＾１３、１ｘ１０＾１４、２ｘ１０＾１４、３ｘ１０＾１４、４ｘ１０＾１４、５ｘ１０＾１４、６ｘ１０＾１４、７ｘ１０＾１４、８ｘ１０＾１４、９ｘ１０＾１４、１ｘ１０＾１５、２ｘ１０＾１５、３ｘ１０＾１５、４ｘ１０＾１５、５ｘ１０＾１５、６ｘ１０＾１５、７ｘ１０＾１５、８ｘ１０＾１５、９ｘ１０＾１５、１ｘ１０＾１６、または１ｘ１０＾１７ＣＦＵのムチン調節性および／または一次発酵微生物を含んでもよい。
【０１１９】
本開示の組成物の用量または単位用量は、例えば、少なくとも約１ｘ１０＾３、１ｘ１０＾４、１ｘ１０＾５、２ｘ１０＾５、３ｘ１０＾５、４ｘ１０＾５、５ｘ１０＾５、６ｘ１０＾５、７ｘ１０＾５、８ｘ１０＾５、９ｘ１０＾５、１ｘ１０＾６、２ｘ１０＾６、３ｘ１０＾６、４ｘ１０＾６、５ｘ１０＾６、６ｘ１０＾６、７ｘ１０＾６、８ｘ１０＾６、９ｘ１０＾６、１ｘ１０＾７、２ｘ１０＾７、３ｘ１０＾７、４ｘ１０＾７、５ｘ１０＾７、６ｘ１０＾７、７ｘ１０＾７、８ｘ１０＾７、９ｘ１０＾７、１ｘ１０＾８、２ｘ１０＾８、３ｘ１０＾８、４ｘ１０＾８、５ｘ１０＾８、６ｘ１０＾８、７ｘ１０＾８、８ｘ１０＾８、９ｘ１０＾８、１ｘ１０＾９、２ｘ１０＾９、３ｘ１０＾９、４ｘ１０＾９、５ｘ１０＾９、６ｘ１０＾９、７ｘ１０＾９、８ｘ１０＾９、９ｘ１０＾９、１ｘ１０＾１０、２ｘ１０＾１０、３ｘ１０＾１０、４ｘ１０＾１０、５ｘ１０＾１０、６ｘ１０＾１０、７ｘ１０＾１０、８ｘ１０＾１０、９ｘ１０＾１０、１ｘ１０＾１１、２ｘ１０＾１１、３ｘ１０＾１１、４ｘ１０＾１１、５ｘ１０＾１１、６ｘ１０＾１１、７ｘ１０＾１１、８ｘ１０＾１１、９ｘ１０＾１１、１ｘ１０＾１２、２ｘ１０＾１２、３ｘ１０＾１２、４ｘ１０＾１２、５ｘ１０＾１２、６ｘ１０＾１２、７ｘ１０＾１２、８ｘ１０＾１２、９ｘ１０＾１２、１ｘ１０＾１３、２ｘ１０＾１３、３ｘ１０＾１３、４ｘ１０＾１３、５ｘ１０＾１３、６ｘ１０＾１３、７ｘ１０＾１３、８ｘ１０＾１３、９ｘ１０＾１３、１ｘ１０＾１４、２ｘ１０＾１４、３ｘ１０＾１４、４ｘ１０＾１４、５ｘ１０＾１４、６ｘ１０＾１４、７ｘ１０＾１４、８ｘ１０＾１４、９ｘ１０＾１４、１ｘ１０＾１５、２ｘ１０＾１５、３ｘ１０＾１５、４ｘ１０＾１５、５ｘ１０＾１５、６ｘ１０＾１５、７ｘ１０＾１５、８ｘ１０＾１５、９ｘ１０＾１５、１ｘ１０＾１６、または１ｘ１０＾１７ＣＦＵのブチレート産生および／または二次発酵微生物を含んでもよい。
【０１２０】
一部の場合、本開示の組成物の用量または単位用量は、最大で約１ｘ１０＾６、２ｘ１０＾６、３ｘ１０＾６、４ｘ１０＾６、５ｘ１０＾６、６ｘ１０＾６、７ｘ１０＾６、８ｘ１０＾６、９ｘ１０＾６、１ｘ１０＾７、２ｘ１０＾７、３ｘ１０＾７、４ｘ１０＾７、５ｘ１０＾７、６ｘ１０＾７、７ｘ１０＾７、８ｘ１０＾７、９ｘ１０＾７、１ｘ１０＾８、２ｘ１０＾８、３ｘ１０＾８、４ｘ１０＾８、５ｘ１０＾８、６ｘ１０＾８、７ｘ１０＾８、８ｘ１０＾８、９ｘ１０＾８、１ｘ１０＾９、２ｘ１０＾９、３ｘ１０＾９、４ｘ１０＾９、５ｘ１０＾９、６ｘ１０＾９、７ｘ１０＾９、８ｘ１０＾９、９ｘ１０＾９、１ｘ１０＾１０、２ｘ１０＾１０、３ｘ１０＾１０、４ｘ１０＾１０、５ｘ１０＾１０、６ｘ１０＾１０、７ｘ１０＾１０、８ｘ１０＾１０、９ｘ１０＾１０、１ｘ１０＾１１、２ｘ１０＾１１、３ｘ１０＾１１、４ｘ１０＾１１、５ｘ１０＾１１、６ｘ１０＾１１、７ｘ１０＾１１、８ｘ１０＾１１、９ｘ１０＾１１、１ｘ１０＾１２、２ｘ１０＾１２、３ｘ１０＾１２、４ｘ１０＾１２、５ｘ１０＾１２、６ｘ１０＾１２、７ｘ１０＾１２、８ｘ１０＾１２、９ｘ１０＾１２、１ｘ１０＾１３、２ｘ１０＾１３、３ｘ１０＾１３、４ｘ１０＾１３、５ｘ１０＾１３、６ｘ１０＾１３、７ｘ１０＾１３、８ｘ１０＾１３、９ｘ１０＾１３、１ｘ１０＾１４、２ｘ１０＾１４、３ｘ１０＾１４、４ｘ１０＾１４、５ｘ１０＾１４、６ｘ１０＾１４、７ｘ１０＾１４、８ｘ１０＾１４、９ｘ１０＾１４、１ｘ１０＾１５、２ｘ１０＾１５、３ｘ１０＾１５、４ｘ１０＾１５、５ｘ１０＾１５、６ｘ１０＾１５、７ｘ１０＾１５、８ｘ１０＾１５、９ｘ１０＾１５、１ｘ１０＾１６、または１ｘ１０＾１７ＣＦＵのブチレート産生および／または二次発酵微生物を含む。
【０１２１】
一部の実施形態では、本開示の組成物の用量または単位用量は、例えば、約１ｘ１０＾３、１ｘ１０＾４、１ｘ１０＾５、２ｘ１０＾５、３ｘ１０＾５、４ｘ１０＾５、５ｘ１０＾５、６ｘ１０＾５、７ｘ１０＾５、８ｘ１０＾５、９ｘ１０＾５、１ｘ１０＾６、２ｘ１０＾６、３ｘ１０＾６、４ｘ１０＾６、５ｘ１０＾６、６ｘ１０＾６、７ｘ１０＾６、８ｘ１０＾６、９ｘ１０＾６、１ｘ１０＾７、２ｘ１０＾７、３ｘ１０＾７、４ｘ１０＾７、５ｘ１０＾７、６ｘ１０＾７、７ｘ１０＾７、８ｘ１０＾７、９ｘ１０＾７、１ｘ１０＾８、２ｘ１０＾８、３ｘ１０＾８、４ｘ１０＾８、５ｘ１０＾８、６ｘ１０＾８、７ｘ１０＾８、８ｘ１０＾８、９ｘ１０＾８、１ｘ１０＾９、２ｘ１０＾９、３ｘ１０＾９、４ｘ１０＾９、５ｘ１０＾９、６ｘ１０＾９、７ｘ１０＾９、８ｘ１０＾９、９ｘ１０＾９、１ｘ１０＾１０、２ｘ１０＾１０、３ｘ１０＾１０、４ｘ１０＾１０、５ｘ１０＾１０、６ｘ１０＾１０、７ｘ１０＾１０、８ｘ１０＾１０、９ｘ１０＾１０、１ｘ１０＾１１、２ｘ１０＾１１、３ｘ１０＾１１、４ｘ１０＾１１、５ｘ１０＾１１、６ｘ１０＾１１、７ｘ１０＾１１、８ｘ１０＾１１、９ｘ１０＾１１、１ｘ１０＾１２、２ｘ１０＾１２、３ｘ１０＾１２、４ｘ１０＾１２、５ｘ１０＾１２、６ｘ１０＾１２、７ｘ１０＾１２、８ｘ１０＾１２、９ｘ１０＾１２、１ｘ１０＾１３、２ｘ１０＾１３、３ｘ１０＾１３、４ｘ１０＾１３、５ｘ１０＾１３、６ｘ１０＾１３、７ｘ１０＾１３、８ｘ１０＾１３、９ｘ１０＾１３、１ｘ１０＾１４、２ｘ１０＾１４、３ｘ１０＾１４、４ｘ１０＾１４、５ｘ１０＾１４、６ｘ１０＾１４、７ｘ１０＾１４、８ｘ１０＾１４、９ｘ１０＾１４、１ｘ１０＾１５、２ｘ１０＾１５、３ｘ１０＾１５、４ｘ１０＾１５、５ｘ１０＾１５、６ｘ１０＾１５、７ｘ１０＾１５、８ｘ１０＾１５、９ｘ１０＾１５、１ｘ１０＾１６、または１ｘ１０＾１７ＣＦＵのブチレート産生および／または二次発酵微生物を含んでもよい。
【０１２２】
一部の場合、本開示の組成物が２つまたはそれより多い異なる微生物を含む場合、一方の微生物は、組成物または単位用量中に総ＣＦＵの少なくとも１％、２％、３％、４％、５％、６％、７％、８％、９％、１０％、１１％、１２％、１３％、１４％、１５％、１６％、１７％、１８％、１９％、２０％、２１％、２２％、２３％、２４％、２５％、２６％、２７％、２８％、２９％、３０％、３１％、３２％、３３％、３４％、３５％、３６％、３７％、３８％、３９％、４０％、４１％、４２％、４３％、４４％、４５％、４６％、４７％、４８％、４９％、５０％、５１％、５２％、５３％、５４％、５５％、５６％、５７％、５８％、５９％、６０％、６１％、６２％、６３％、６４％、６５％、６６％、６７％、６８％、６９％、７０％、７１％、７２％、７３％、７４％、７５％、７６％、７７％、７８％、７９％、８０％、８１％、８２％、８３％、８４％、８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％を含んでもよい。
【０１２３】
一部の場合、本開示の組成物が２つまたはそれより多い異なる微生物を含む場合、一方の微生物は、組成物または単位用量中に総ＣＦＵの最大で１％、２％、３％、４％、５％、６％、７％、８％、９％、１０％、１１％、１２％、１３％、１４％、１５％、１６％、１７％、１８％、１９％、２０％、２１％、２２％、２３％、２４％、２５％、２６％、２７％、２８％、２９％、３０％、３１％、３２％、３３％、３４％、３５％、３６％、３７％、３８％、３９％、４０％、４１％、４２％、４３％、４４％、４５％、４６％、４７％、４８％、４９％、５０％、５１％、５２％、５３％、５４％、５５％、５６％、５７％、５８％、５９％、６０％、６１％、６２％、６３％、６４％、６５％、６６％、６７％、６８％、６９％、７０％、７１％、７２％、７３％、７４％、７５％、７６％、７７％、７８％、７９％、８０％、８１％、８２％、８３％、８４％、８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％を含んでもよい。
【０１２４】
一部の実施形態では、本開示の組成物が２つまたはそれより多い異なる微生物を含む場合、一方の微生物は、組成物または単位用量中に総ＣＦＵの約１％、２％、３％、４％、５％、６％、７％、８％、９％、１０％、１１％、１２％、１３％、１４％、１５％、１６％、１７％、１８％、１９％、２０％、２１％、２２％、２３％、２４％、２５％、２６％、２７％、２８％、２９％、３０％、３１％、３２％、３３％、３４％、３５％、３６％、３７％、３８％、３９％、４０％、４１％、４２％、４３％、４４％、４５％、４６％、４７％、４８％、４９％、５０％、５１％、５２％、５３％、５４％、５５％、５６％、５７％、５８％、５９％、６０％、６１％、６２％、６３％、６４％、６５％、６６％、６７％、６８％、６９％、７０％、７１％、７２％、７３％、７４％、７５％、７６％、７７％、７８％、７９％、８０％、８１％、８２％、８３％、８４％、８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％を含んでもよい。
【０１２５】
一部の実施形態では、本開示の組成物が２つまたはそれより多い異なる微生物を含む場合、一方の微生物は、組成物または単位用量中に総ＣＦＵの約０％〜約５％、約１％〜約５％、約５％〜約１０％、約１０％〜約１５％、約１５％〜約２０％、約２０％〜約２５％、約２５％〜約３０％、約３０％〜約３５％、約３５％〜約４０％、約４０％〜約４５％、約４５％〜約５０％、約５０％〜約５５％、約５５％〜約６０％、約６０％〜約６５％、約６５％〜約７０％、約７０％〜約７５％、約７５％〜約８０％、約８０％〜約８５％、約８５％〜約９０％、約９０％〜約９５％、約９５％〜約９９％、約０％〜約１０％、約１％〜約１０％、約１０％〜約２０％、約２０％〜約３０％、約３０％〜約４０％、約４０％〜約５０％、約５０％〜約６０％、約６０％〜約７０％、約７０％〜約８０％、約８０％〜約９０％約９０％〜約９９％、約０％〜約２０％、約２０％〜約４０％、約４０％〜約６０％、約６０％〜約８０％、約８０％〜約９９％、約０％〜約４０％約１％〜約４０％、約４０％〜約８０％、約１０％〜約５０％、約５０％〜約９０％、約３０％〜約７０％、約５０％〜約９０％、約０％〜約３０％、約１％〜約３０％、約１０％〜約４０％、約２０％〜約５０％、約３０％〜約８０％、約４０％〜約７０％、約５０％〜約８０％、または約６０％〜約９０％を含んでもよい。
【０１２６】
一部の場合、本開示の組成物が２つまたはそれより多い異なる微生物を含む場合、組成物または単位用量中の総ＣＦＵの少なくとも１％、２％、３％、４％、５％、６％、７％、８％、９％、１０％、１１％、１２％、１３％、１４％、１５％、１６％、１７％、１８％、１９％、２０％、２１％、２２％、２３％、２４％、２５％、２６％、２７％、２８％、２９％、３０％、３１％、３２％、３３％、３４％、３５％、３６％、３７％、３８％、３９％、４０％、４１％、４２％、４３％、４４％、４５％、４６％、４７％、４８％、４９％、５０％、５１％、５２％、５３％、５４％、５５％、５６％、５７％、５８％、５９％、６０％、６１％、６２％、６３％、６４％、６５％、６６％、６７％、６８％、６９％、７０％、７１％、７２％、７３％、７４％、７５％、７６％、７７％、７８％、７９％、８０％、８１％、８２％、８３％、８４％、８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％は、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａ、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａに由来するｒＲＮＡに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列（例えば、１６Ｓ  ｒＲＮＡもしくは２３Ｓ  ｒＲＮＡ）を含む微生物、または配列番号１〜６のいずれか１つに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列を含む微生物であってもよい。
【０１２７】
一部の場合、本開示の組成物が２つまたはそれより多い異なる微生物を含む場合、組成物または単位用量中の総ＣＦＵの最大で１％、２％、３％、４％、５％、６％、７％、８％、９％、１０％、１１％、１２％、１３％、１４％、１５％、１６％、１７％、１８％、１９％、２０％、２１％、２２％、２３％、２４％、２５％、２６％、２７％、２８％、２９％、３０％、３１％、３２％、３３％、３４％、３５％、３６％、３７％、３８％、３９％、４０％、４１％、４２％、４３％、４４％、４５％、４６％、４７％、４８％、４９％、５０％、５１％、５２％、５３％、５４％、５５％、５６％、５７％、５８％、５９％、６０％、６１％、６２％、６３％、６４％、６５％、６６％、６７％、６８％、６９％、７０％、７１％、７２％、７３％、７４％、７５％、７６％、７７％、７８％、７９％、８０％、８１％、８２％、８３％、８４％、８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％は、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａ、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａに由来するｒＲＮＡに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列（例えば、１６Ｓ  ｒＲＮＡもしくは２３Ｓ  ｒＲＮＡ）を含む微生物、または配列番号１〜６のいずれか１つに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列を含む微生物であってもよい。
【０１２８】
一部の実施形態では、本開示の組成物が２つまたはそれより多い異なる微生物を含む場合、組成物または単位用量中の総ＣＦＵの約１％、２％、３％、４％、５％、６％、７％、８％、９％、１０％、１１％、１２％、１３％、１４％、１５％、１６％、１７％、１８％、１９％、２０％、２１％、２２％、２３％、２４％、２５％、２６％、２７％、２８％、２９％、３０％、３１％、３２％、３３％、３４％、３５％、３６％、３７％、３８％、３９％、４０％、４１％、４２％、４３％、４４％、４５％、４６％、４７％、４８％、４９％、５０％、５１％、５２％、５３％、５４％、５５％、５６％、５７％、５８％、５９％、６０％、６１％、６２％、６３％、６４％、６５％、６６％、６７％、６８％、６９％、７０％、７１％、７２％、７３％、７４％、７５％、７６％、７７％、７８％、７９％、８０％、８１％、８２％、８３％、８４％、８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％は、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａ、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａに由来するｒＲＮＡに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列（例えば、１６Ｓ  ｒＲＮＡもしくは２３Ｓ  ｒＲＮＡ）を含む微生物、または配列番号１〜６のいずれか１つに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列を含む微生物であってもよい。
【０１２９】
一部の実施形態では、本開示の組成物が２つまたはそれより多い異なる微生物を含む場合、組成物または単位用量中の総ＣＦＵの約０％〜約５％、約１％〜約５％、約５％〜約１０％、約１０％〜約１５％、約１５％〜約２０％、約２０％〜約２５％、約２５％〜約３０％、約３０％〜約３５％、約３５％〜約４０％、約４０％〜約４５％、約４５％〜約５０％、約５０％〜約５５％、約５５％〜約６０％、約６０％〜約６５％、約６５％〜約７０％、約７０％〜約７５％、約７５％〜約８０％、約８０％〜約８５％、約８５％〜約９０％、約９０％〜約９５％、約９５％〜約９９％、約０％〜約１０％、約１％〜約１０％、約１０％〜約２０％、約２０％〜約３０％、約３０％〜約４０％、約４０％〜約５０％、約５０％〜約６０％、約６０％〜約７０％、約７０％〜約８０％、約８０％〜約９０％約９０％〜約９９％、約０％〜約２０％、約２０％〜約４０％、約４０％〜約６０％、約６０％〜約８０％、約８０％〜約９９％、約０％〜約４０％約１％〜約４０％、約４０％〜約８０％、約１０％〜約５０％、約５０％〜約９０％、約３０％〜約７０％、約５０％〜約９０％、約０％〜約３０％、約１％〜約３０％、約１０％〜約４０％、約２０％〜約５０％、約３０％〜約８０％、約４０％〜約７０％、約５０％〜約８０％、または約６０％〜約９０％は、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａ、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａに由来するｒＲＮＡに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列（例えば、１６Ｓ  ｒＲＮＡもしくは２３Ｓ  ｒＲＮＡ）を含む微生物、または配列番号１〜６のいずれか１つに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列を含む微生物であってもよい。
【０１３０】
一部の場合、本開示の組成物が２つまたはそれより多い異なる微生物を含む場合、組成物または単位用量中の総ＣＦＵの少なくとも１％、２％、３％、４％、５％、６％、７％、８％、９％、１０％、１１％、１２％、１３％、１４％、１５％、１６％、１７％、１８％、１９％、２０％、２１％、２２％、２３％、２４％、２５％、２６％、２７％、２８％、２９％、３０％、３１％、３２％、３３％、３４％、３５％、３６％、３７％、３８％、３９％、４０％、４１％、４２％、４３％、４４％、４５％、４６％、４７％、４８％、４９％、５０％、５１％、５２％、５３％、５４％、５５％、５６％、５７％、５８％、５９％、６０％、６１％、６２％、６３％、６４％、６５％、６６％、６７％、６８％、６９％、７０％、７１％、７２％、７３％、７４％、７５％、７６％、７７％、７８％、７９％、８０％、８１％、８２％、８３％、８４％、８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％は、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉまたはＥｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉに由来するｒＲＮＡに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列（例えば、１６Ｓ  ｒＲＮＡまたは２３Ｓ  ｒＲＮＡ）を含む微生物であってもよい。
【０１３１】
一部の場合、本開示の組成物が２つまたはそれより多い異なる微生物を含む場合、組成物または単位用量中の総ＣＦＵの最大で１％、２％、３％、４％、５％、６％、７％、８％、９％、１０％、１１％、１２％、１３％、１４％、１５％、１６％、１７％、１８％、１９％、２０％、２１％、２２％、２３％、２４％、２５％、２６％、２７％、２８％、２９％、３０％、３１％、３２％、３３％、３４％、３５％、３６％、３７％、３８％、３９％、４０％、４１％、４２％、４３％、４４％、４５％、４６％、４７％、４８％、４９％、５０％、５１％、５２％、５３％、５４％、５５％、５６％、５７％、５８％、５９％、６０％、６１％、６２％、６３％、６４％、６５％、６６％、６７％、６８％、６９％、７０％、７１％、７２％、７３％、７４％、７５％、７６％、７７％、７８％、７９％、８０％、８１％、８２％、８３％、８４％、８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％は、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉまたはＥｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉに由来するｒＲＮＡに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列（例えば、１６Ｓ  ｒＲＮＡまたは２３Ｓ  ｒＲＮＡ）を含む微生物であってもよい。
【０１３２】
一部の実施形態では、本開示の組成物が２つまたはそれより多い異なる微生物を含む場合、組成物または単位用量中の総ＣＦＵの約１％、２％、３％、４％、５％、６％、７％、８％、９％、１０％、１１％、１２％、１３％、１４％、１５％、１６％、１７％、１８％、１９％、２０％、２１％、２２％、２３％、２４％、２５％、２６％、２７％、２８％、２９％、３０％、３１％、３２％、３３％、３４％、３５％、３６％、３７％、３８％、３９％、４０％、４１％、４２％、４３％、４４％、４５％、４６％、４７％、４８％、４９％、５０％、５１％、５２％、５３％、５４％、５５％、５６％、５７％、５８％、５９％、６０％、６１％、６２％、６３％、６４％、６５％、６６％、６７％、６８％、６９％、７０％、７１％、７２％、７３％、７４％、７５％、７６％、７７％、７８％、７９％、８０％、８１％、８２％、８３％、８４％、８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％は、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉまたはＥｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉに由来するｒＲＮＡに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列（例えば、１６Ｓ  ｒＲＮＡまたは２３Ｓ  ｒＲＮＡ）を含む微生物であってもよい。
【０１３３】
一部の実施形態では、本開示の組成物が２つまたはそれより多い異なる微生物を含む場合、組成物または単位用量中の総ＣＦＵの約０％〜約５％、約１％〜約５％、約５％〜約１０％、約１０％〜約１５％、約１５％〜約２０％、約２０％〜約２５％、約２５％〜約３０％、約３０％〜約３５％、約３５％〜約４０％、約４０％〜約４５％、約４５％〜約５０％、約５０％〜約５５％、約５５％〜約６０％、約６０％〜約６５％、約６５％〜約７０％、約７０％〜約７５％、約７５％〜約８０％、約８０％〜約８５％、約８５％〜約９０％、約９０％〜約９５％、約９５％〜約９９％、約０％〜約１０％、約１％〜約１０％、約１０％〜約２０％、約２０％〜約３０％、約３０％〜約４０％、約４０％〜約５０％、約５０％〜約６０％、約６０％〜約７０％、約７０％〜約８０％、約８０％〜約９０％約９０％〜約９９％、約０％〜約２０％、約２０％〜約４０％、約４０％〜約６０％、約６０％〜約８０％、約８０％〜約９９％、約０％〜約４０％約１％〜約４０％、約４０％〜約８０％、約１０％〜約５０％、約５０％〜約９０％、約３０％〜約７０％、約５０％〜約９０％、約０％〜約３０％、約１％〜約３０％、約１０％〜約４０％、約２０％〜約５０％、約３０％〜約８０％、約４０％〜約７０％、約５０％〜約８０％、または約６０％〜約９０％は、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉまたはＥｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉに由来するｒＲＮＡに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列（例えば、１６Ｓ  ｒＲＮＡまたは２３Ｓ  ｒＲＮＡ）を含む微生物であってもよい。
【０１３４】
一部の場合、本開示の組成物が２つまたはそれより多い異なる微生物を含む場合、組成物または単位用量中の総ＣＦＵの少なくとも１％、２％、３％、４％、５％、６％、７％、８％、９％、１０％、１１％、１２％、１３％、１４％、１５％、１６％、１７％、１８％、１９％、２０％、２１％、２２％、２３％、２４％、２５％、２６％、２７％、２８％、２９％、３０％、３１％、３２％、３３％、３４％、３５％、３６％、３７％、３８％、３９％、４０％、４１％、４２％、４３％、４４％、４５％、４６％、４７％、４８％、４９％、５０％、５１％、５２％、５３％、５４％、５５％、５６％、５７％、５８％、５９％、６０％、６１％、６２％、６３％、６４％、６５％、６６％、６７％、６８％、６９％、７０％、７１％、７２％、７３％、７４％、７５％、７６％、７７％、７８％、７９％、８０％、８１％、８２％、８３％、８４％、８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％，９５％は、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓまたはＢｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓに由来するｒＲＮＡに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列（例えば、１６Ｓ  ｒＲＮＡまたは２３Ｓ  ｒＲＮＡ）を含む微生物であってもよい。
【０１３５】
一部の場合、本開示の組成物が２つまたはそれより多い異なる微生物を含む場合、組成物または単位用量中の総ＣＦＵの最大で１％、２％、３％、４％、５％、６％、７％、８％、９％、１０％、１１％、１２％、１３％、１４％、１５％、１６％、１７％、１８％、１９％、２０％、２１％、２２％、２３％、２４％、２５％、２６％、２７％、２８％、２９％、３０％、３１％、３２％、３３％、３４％、３５％、３６％、３７％、３８％、３９％、４０％、４１％、４２％、４３％、４４％、４５％、４６％、４７％、４８％、４９％、５０％、５１％、５２％、５３％、５４％、５５％、５６％、５７％、５８％、５９％、６０％、６１％、６２％、６３％、６４％、６５％、６６％、６７％、６８％、６９％、７０％、７１％、７２％、７３％、７４％、７５％、７６％、７７％、７８％、７９％、８０％、８１％、８２％、８３％、８４％、８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％は、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓまたはＢｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓに由来するｒＲＮＡに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列（例えば、１６Ｓ  ｒＲＮＡまたは２３Ｓ  ｒＲＮＡ）を含む微生物であってもよい。
【０１３６】
一部の実施形態では、本開示の組成物が２つまたはそれより多い異なる微生物を含む場合、組成物または単位用量中の総ＣＦＵの約１％、２％、３％、４％、５％、６％、７％、８％、９％、１０％、１１％、１２％、１３％、１４％、１５％、１６％、１７％、１８％、１９％、２０％、２１％、２２％、２３％、２４％、２５％、２６％、２７％、２８％、２９％、３０％、３１％、３２％、３３％、３４％、３５％、３６％、３７％、３８％、３９％、４０％、４１％、４２％、４３％、４４％、４５％、４６％、４７％、４８％、４９％、５０％、５１％、５２％、５３％、５４％、５５％、５６％、５７％、５８％、５９％、６０％、６１％、６２％、６３％、６４％、６５％、６６％、６７％、６８％、６９％、７０％、７１％、７２％、７３％、７４％、７５％、７６％、７７％、７８％、７９％、８０％、８１％、８２％、８３％、８４％、８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％は、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓまたはＢｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓに由来するｒＲＮＡに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列（例えば、１６Ｓ  ｒＲＮＡまたは２３Ｓ  ｒＲＮＡ）を含む微生物であってもよい。
【０１３７】
一部の実施形態では、本開示の組成物が２つまたはそれより多い異なる微生物を含む場合、組成物または単位用量中の総ＣＦＵの約０％〜約５％、約１％〜約５％、約５％〜約１０％、約１０％〜約１５％、約１５％〜約２０％、約２０％〜約２５％、約２５％〜約３０％、約３０％〜約３５％、約３５％〜約４０％、約４０％〜約４５％、約４５％〜約５０％、約５０％〜約５５％、約５５％〜約６０％、約６０％〜約６５％、約６５％〜約７０％、約７０％〜約７５％、約７５％〜約８０％、約８０％〜約８５％、約８５％〜約９０％、約９０％〜約９５％、約９５％〜約９９％、約０％〜約１０％、約１％〜約１０％、約１０％〜約２０％、約２０％〜約３０％、約３０％〜約４０％、約４０％〜約５０％、約５０％〜約６０％、約６０％〜約７０％、約７０％〜約８０％、約８０％〜約９０％約９０％〜約９９％、約０％〜約２０％、約２０％〜約４０％、約４０％〜約６０％、約６０％〜約８０％、約８０％〜約９９％、約０％〜約４０％約１％〜約４０％、約４０％〜約８０％、約１０％〜約５０％、約５０％〜約９０％、約３０％〜約７０％、約５０％〜約９０％、約０％〜約３０％、約１％〜約３０％、約１０％〜約４０％、約２０％〜約５０％、約３０％〜約８０％、約４０％〜約７０％、約５０％〜約８０％、または約６０％〜約９０％は、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓまたはＢｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓに由来するｒＲＮＡに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列（例えば、１６Ｓ  ｒＲＮＡまたは２３Ｓ  ｒＲＮＡ）を含む微生物であってもよい。
【０１３８】
一部の場合、本開示の組成物が２つまたはそれより多い異なる微生物を含む場合、組成物または単位用量中の総ＣＦＵの少なくとも１％、２％、３％、４％、５％、６％、７％、８％、９％、１０％、１１％、１２％、１３％、１４％、１５％、１６％、１７％、１８％、１９％、２０％、２１％、２２％、２３％、２４％、２５％、２６％、２７％、２８％、２９％、３０％、３１％、３２％、３３％、３４％、３５％、３６％、３７％、３８％、３９％、４０％、４１％、４２％、４３％、４４％、４５％、４６％、４７％、４８％、４９％、５０％、５１％、５２％、５３％、５４％、５５％、５６％、５７％、５８％、５９％、６０％、６１％、６２％、６３％、６４％、６５％、６６％、６７％、６８％、６９％、７０％、７１％、７２％、７３％、７４％、７５％、７６％、７７％、７８％、７９％、８０％、８１％、８２％、８３％、８４％、８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％は、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉまたはＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉに由来するｒＲＮＡに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列（例えば、１６Ｓ  ｒＲＮＡまたは２３Ｓ  ｒＲＮＡ）を含む微生物であってもよい。
【０１３９】
一部の場合、本開示の組成物が２つまたはそれより多い異なる微生物を含む場合、組成物または単位用量中の総ＣＦＵの最大で１％、２％、３％、４％、５％、６％、７％、８％、９％、１０％、１１％、１２％、１３％、１４％、１５％、１６％、１７％、１８％、１９％、２０％、２１％、２２％、２３％、２４％、２５％、２６％、２７％、２８％、２９％、３０％、３１％、３２％、３３％、３４％、３５％、３６％、３７％、３８％、３９％、４０％、４１％、４２％、４３％、４４％、４５％、４６％、４７％、４８％、４９％、５０％、５１％、５２％、５３％、５４％、５５％、５６％、５７％、５８％、５９％、６０％、６１％、６２％、６３％、６４％、６５％、６６％、６７％、６８％、６９％、７０％、７１％、７２％、７３％、７４％、７５％、７６％、７７％、７８％、７９％、８０％、８１％、８２％、８３％、８４％、８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％は、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉまたはＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉに由来するｒＲＮＡに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列（例えば、１６Ｓ  ｒＲＮＡまたは２３Ｓ  ｒＲＮＡ）を含む微生物であってもよい。
【０１４０】
一部の実施形態では、本開示の組成物が２つまたはそれより多い異なる微生物を含む場合、組成物または単位用量中の総ＣＦＵの約１％、２％、３％、４％、５％、６％、７％、８％、９％、１０％、１１％、１２％、１３％、１４％、１５％、１６％、１７％、１８％、１９％、２０％、２１％、２２％、２３％、２４％、２５％、２６％、２７％、２８％、２９％、３０％、３１％、３２％、３３％、３４％、３５％、３６％、３７％、３８％、３９％、４０％、４１％、４２％、４３％、４４％、４５％、４６％、４７％、４８％、４９％、５０％、５１％、５２％、５３％、５４％、５５％、５６％、５７％、５８％、５９％、６０％、６１％、６２％、６３％、６４％、６５％、６６％、６７％、６８％、６９％、７０％、７１％、７２％、７３％、７４％、７５％、７６％、７７％、７８％、７９％、８０％、８１％、８２％、８３％、８４％、８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％は、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉまたはＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉに由来するｒＲＮＡに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列（例えば、１６Ｓ  ｒＲＮＡまたは２３Ｓ  ｒＲＮＡ）を含む微生物であってもよい。
【０１４１】
一部の実施形態では、本開示の組成物が２つまたはそれより多い異なる微生物を含む場合、組成物または単位用量中の総ＣＦＵの約０％〜約５％、約１％〜約５％、約５％〜約１０％、約１０％〜約１５％、約１５％〜約２０％、約２０％〜約２５％、約２５％〜約３０％、約３０％〜約３５％、約３５％〜約４０％、約４０％〜約４５％、約４５％〜約５０％、約５０％〜約５５％、約５５％〜約６０％、約６０％〜約６５％、約６５％〜約７０％、約７０％〜約７５％、約７５％〜約８０％、約８０％〜約８５％、約８５％〜約９０％、約９０％〜約９５％、約９５％〜約９９％、約０％〜約１０％、約１％〜約１０％、約１０％〜約２０％、約２０％〜約３０％、約３０％〜約４０％、約４０％〜約５０％、約５０％〜約６０％、約６０％〜約７０％、約７０％〜約８０％、約８０％〜約９０％約９０％〜約９９％、約０％〜約２０％、約２０％〜約４０％、約４０％〜約６０％、約６０％〜約８０％、約８０％〜約９９％、約０％〜約４０％約１％〜約４０％、約４０％〜約８０％、約１０％〜約５０％、約５０％〜約９０％、約３０％〜約７０％、約５０％〜約９０％、約０％〜約３０％、約１％〜約３０％、約１０％〜約４０％、約２０％〜約５０％、約３０％〜約８０％、約４０％〜約７０％、約５０％〜約８０％、または約６０％〜約９０％は、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉまたはＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉに由来するｒＲＮＡに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列（例えば、１６Ｓ  ｒＲＮＡまたは２３Ｓ  ｒＲＮＡ）を含む微生物であってもよい。
【０１４２】
一部の場合、本開示の組成物が２つまたはそれより多い異なる微生物を含む場合、組成物または単位用量中の総ＣＦＵの少なくとも１％、２％、３％、４％、５％、６％、７％、８％、９％、１０％、１１％、１２％、１３％、１４％、１５％、１６％、１７％、１８％、１９％、２０％、２１％、２２％、２３％、２４％、２５％、２６％、２７％、２８％、２９％、３０％、３１％、３２％、３３％、３４％、３５％、３６％、３７％、３８％、３９％、４０％、４１％、４２％、４３％、４４％、４５％、４６％、４７％、４８％、４９％、５０％、５１％、５２％、５３％、５４％、５５％、５６％、５７％、５８％、５９％、６０％、６１％、６２％、６３％、６４％、６５％、６６％、６７％、６８％、６９％、７０％、７１％、７２％、７３％、７４％、７５％、７６％、７７％、７８％、７９％、８０％、８１％、８２％、８３％、８４％、８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％は、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍまたはＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍに由来するｒＲＮＡに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列（例えば、１６Ｓ  ｒＲＮＡまたは２３Ｓ  ｒＲＮＡ）を含む微生物であってもよい。
【０１４３】
一部の例では、本開示の組成物が２つまたはそれより多い異なる微生物を含む場合、組成物または単位用量中の総ＣＦＵの最大で１％、２％、３％、４％、５％、６％、７％、８％、９％、１０％、１１％、１２％、１３％、１４％、１５％、１６％、１７％、１８％、１９％、２０％、２１％、２２％、２３％、２４％、２５％、２６％、２７％、２８％、２９％、３０％、３１％、３２％、３３％、３４％、３５％、３６％、３７％、３８％、３９％、４０％、４１％、４２％、４３％、４４％、４５％、４６％、４７％、４８％、４９％、５０％、５１％、５２％、５３％、５４％、５５％、５６％、５７％、５８％、５９％、６０％、６１％、６２％、６３％、６４％、６５％、６６％、６７％、６８％、６９％、７０％、７１％、７２％、７３％、７４％、７５％、７６％、７７％、７８％、７９％、８０％、８１％、８２％、８３％、８４％、８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％は、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍまたはＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍに由来するｒＲＮＡに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列（例えば、１６Ｓ  ｒＲＮＡまたは２３Ｓ  ｒＲＮＡ）を含む微生物であってもよい。
【０１４４】
一部の実施形態では、本開示の組成物が２つまたはそれより多い異なる微生物を含む場合、組成物または単位用量中の総ＣＦＵの約１％、２％、３％、４％、５％、６％、７％、８％、９％、１０％、１１％、１２％、１３％、１４％、１５％、１６％、１７％、１８％、１９％、２０％、２１％、２２％、２３％、２４％、２５％、２６％、２７％、２８％、２９％、３０％、３１％、３２％、３３％、３４％、３５％、３６％、３７％、３８％、３９％、４０％、４１％、４２％、４３％、４４％、４５％、４６％、４７％、４８％、４９％、５０％、５１％、５２％、５３％、５４％、５５％、５６％、５７％、５８％、５９％、６０％、６１％、６２％、６３％、６４％、６５％、６６％、６７％、６８％、６９％、７０％、７１％、７２％、７３％、７４％、７５％、７６％、７７％、７８％、７９％、８０％、８１％、８２％、８３％、８４％、８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％は、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍまたはＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍに由来するｒＲＮＡに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列（例えば、１６Ｓ  ｒＲＮＡまたは２３Ｓ  ｒＲＮＡ）を含む微生物であってもよい。
【０１４５】
一部の実施形態では、本開示の組成物が２つまたはそれより多い異なる微生物を含む場合、組成物または単位用量中の総ＣＦＵの約０％〜約５％、約１％〜約５％、約５％〜約１０％、約１０％〜約１５％、約１５％〜約２０％、約２０％〜約２５％、約２５％〜約３０％、約３０％〜約３５％、約３５％〜約４０％、約４０％〜約４５％、約４５％〜約５０％、約５０％〜約５５％、約５５％〜約６０％、約６０％〜約６５％、約６５％〜約７０％、約７０％〜約７５％、約７５％〜約８０％、約８０％〜約８５％、約８５％〜約９０％、約９０％〜約９５％、約９５％〜約９９％、約０％〜約１０％、約１％〜約１０％、約１０％〜約２０％、約２０％〜約３０％、約３０％〜約４０％、約４０％〜約５０％、約５０％〜約６０％、約６０％〜約７０％、約７０％〜約８０％、約８０％〜約９０％約９０％〜約９９％、約０％〜約２０％、約２０％〜約４０％、約４０％〜約６０％、約６０％〜約８０％、約８０％〜約９９％、約０％〜約４０％約１％〜約４０％、約４０％〜約８０％、約１０％〜約５０％、約５０％〜約９０％、約３０％〜約７０％、約５０％〜約９０％、約０％〜約３０％、約１％〜約３０％、約１０％〜約４０％、約２０％〜約５０％、約３０％〜約８０％、約４０％〜約７０％、約５０％〜約８０％、または約６０％〜約９０％は、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍまたはＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍに由来するｒＲＮＡに対する少なくとも約９７％の配列同一性を有するｒＲＮＡ配列（例えば、１６Ｓ  ｒＲＮＡまたは２３Ｓ  ｒＲＮＡ）を含む微生物であってもよい。
【０１４６】
一部の場合、本開示の組成物が少なくとも１つのムチン調節性微生物および／または少なくとも１つの一次発酵菌を含む場合、組成物または単位用量中の総ＣＦＵの少なくとも１％、２％、３％、４％、５％、６％、７％、８％、９％、１０％、１１％、１２％、１３％、１４％、１５％、１６％、１７％、１８％、１９％、２０％、２１％、２２％、２３％、２４％、２５％、２６％、２７％、２８％、２９％、３０％、３１％、３２％、３３％、３４％、３５％、３６％、３７％、３８％、３９％、４０％、４１％、４２％、４３％、４４％、４５％、４６％、４７％、４８％、４９％、５０％、５１％、５２％、５３％、５４％、５５％、５６％、５７％、５８％、５９％、６０％、６１％、６２％、６３％、６４％、６５％、６６％、６７％、６８％、６９％、７０％、７１％、７２％、７３％、７４％、７５％、７６％、７７％、７８％、７９％、８０％、８１％、８２％、８３％、８４％、８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％は、少なくとも１つのムチン調節性微生物および／または少なくとも１つの一次発酵菌であってもよい。
【０１４７】
一部の例では、本開示の組成物が少なくとも１つのムチン調節性微生物および／または少なくとも１つの一次発酵菌を含む場合、組成物または単位用量中の総ＣＦＵの最大で１％、２％、３％、４％、５％、６％、７％、８％、９％、１０％、１１％、１２％、１３％、１４％、１５％、１６％、１７％、１８％、１９％、２０％、２１％、２２％、２３％、２４％、２５％、２６％、２７％、２８％、２９％、３０％、３１％、３２％、３３％、３４％、３５％、３６％、３７％、３８％、３９％、４０％、４１％、４２％、４３％、４４％、４５％、４６％、４７％、４８％、４９％、５０％、５１％、５２％、５３％、５４％、５５％、５６％、５７％、５８％、５９％、６０％、６１％、６２％、６３％、６４％、６５％、６６％、６７％、６８％、６９％、７０％、７１％、７２％、７３％、７４％、７５％、７６％、７７％、７８％、７９％、８０％、８１％、８２％、８３％、８４％、８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％は、少なくとも１つのムチン調節性微生物および／または少なくとも１つの一次発酵菌であってもよい。
【０１４８】
一部の実施形態では、本開示の組成物が少なくとも１つのムチン調節性微生物および／または少なくとも１つの一次発酵菌を含む場合、組成物または単位用量中の総ＣＦＵの約１％、２％、３％、４％、５％、６％、７％、８％、９％、１０％、１１％、１２％、１３％、１４％、１５％、１６％、１７％、１８％、１９％、２０％、２１％、２２％、２３％、２４％、２５％、２６％、２７％、２８％、２９％、３０％、３１％、３２％、３３％、３４％、３５％、３６％、３７％、３８％、３９％、４０％、４１％、４２％、４３％、４４％、４５％、４６％、４７％、４８％、４９％、５０％、５１％、５２％、５３％、５４％、５５％、５６％、５７％、５８％、５９％、６０％、６１％、６２％、６３％、６４％、６５％、６６％、６７％、６８％、６９％、７０％、７１％、７２％、７３％、７４％、７５％、７６％、７７％、７８％、７９％、８０％、８１％、８２％、８３％、８４％、８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％は、少なくとも１つのムチン調節性微生物および／または少なくとも１つの一次発酵菌であってもよい。
【０１４９】
一部の実施形態では、本開示の組成物が少なくとも１つのムチン調節性微生物および／または少なくとも１つの一次発酵菌を含む場合、組成物または単位用量中の総ＣＦＵの約０％〜約５％、約１％〜約５％、約５％〜約１０％、約１０％〜約１５％、約１５％〜約２０％、約２０％〜約２５％、約２５％〜約３０％、約３０％〜約３５％、約３５％〜約４０％、約４０％〜約４５％、約４５％〜約５０％、約５０％〜約５５％、約５５％〜約６０％、約６０％〜約６５％、約６５％〜約７０％、約７０％〜約７５％、約７５％〜約８０％、約８０％〜約８５％、約８５％〜約９０％、約９０％〜約９５％、約９５％〜約９９％、約０％〜約１０％、約１％〜約１０％、約１０％〜約２０％、約２０％〜約３０％、約３０％〜約４０％、約４０％〜約５０％、約５０％〜約６０％、約６０％〜約７０％、約７０％〜約８０％、約８０％〜約９０％約９０％〜約９９％、約０％〜約２０％、約２０％〜約４０％、約４０％〜約６０％、約６０％〜約８０％、約８０％〜約９９％、約０％〜約４０％約１％〜約４０％、約４０％〜約８０％、約１０％〜約５０％、約５０％〜約９０％、約３０％〜約７０％、約５０％〜約９０％、約０％〜約３０％、約１％〜約３０％、約１０％〜約４０％、約２０％〜約５０％、約３０％〜約８０％、約４０％〜約７０％、約５０％〜約８０％、または約６０％〜約９０％は、少なくとも１つのムチン調節性微生物および／または少なくとも１つの一次発酵菌であってもよい。
【０１５０】
一部の場合、本開示の組成物が少なくとも１つのブチレート産生微生物および／または少なくとも１つの二次発酵菌を含む場合、組成物または単位用量中の総ＣＦＵの少なくとも１％、２％、３％、４％、５％、６％、７％、８％、９％、１０％、１１％、１２％、１３％、１４％、１５％、１６％、１７％、１８％、１９％、２０％、２１％、２２％、２３％、２４％、２５％、２６％、２７％、２８％、２９％、３０％、３１％、３２％、３３％、３４％、３５％、３６％、３７％、３８％、３９％、４０％、４１％、４２％、４３％、４４％、４５％、４６％、４７％、４８％、４９％、５０％、５１％、５２％、５３％、５４％、５５％、５６％、５７％、５８％、５９％、６０％、６１％、６２％、６３％、６４％、６５％、６６％、６７％、６８％、６９％、７０％、７１％、７２％、７３％、７４％、７５％、７６％、７７％、７８％、７９％、８０％、８１％、８２％、８３％、８４％、８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％は、少なくとも１つのブチレート産生微生物および／または少なくとも１つの二次発酵菌であってもよい。
【０１５１】
一部の例では、本開示の組成物が少なくとも１つのブチレート産生微生物および／または少なくとも１つの二次発酵菌を含む場合、組成物または単位用量中の総ＣＦＵの最大で１％、２％、３％、４％、５％、６％、７％、８％、９％、１０％、１１％、１２％、１３％、１４％、１５％、１６％、１７％、１８％、１９％、２０％、２１％、２２％、２３％、２４％、２５％、２６％、２７％、２８％、２９％、３０％、３１％、３２％、３３％、３４％、３５％、３６％、３７％、３８％、３９％、４０％、４１％、４２％、４３％、４４％、４５％、４６％、４７％、４８％、４９％、５０％、５１％、５２％、５３％、５４％、５５％、５６％、５７％、５８％、５９％、６０％、６１％、６２％、６３％、６４％、６５％、６６％、６７％、６８％、６９％、７０％、７１％、７２％、７３％、７４％、７５％、７６％、７７％、７８％、７９％、８０％、８１％、８２％、８３％、８４％、８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％は、少なくとも１つのブチレート産生微生物および／または少なくとも１つの二次発酵菌であってもよい。
【０１５２】
一部の実施形態では、本開示の組成物が少なくとも１つのブチレート産生微生物および／または少なくとも１つの二次発酵菌を含む場合、組成物または単位用量中の総ＣＦＵの約１％、２％、３％、４％、５％、６％、７％、８％、９％、１０％、１１％、１２％、１３％、１４％、１５％、１６％、１７％、１８％、１９％、２０％、２１％、２２％、２３％、２４％、２５％、２６％、２７％、２８％、２９％、３０％、３１％、３２％、３３％、３４％、３５％、３６％、３７％、３８％、３９％、４０％、４１％、４２％、４３％、４４％、４５％、４６％、４７％、４８％、４９％、５０％、５１％、５２％、５３％、５４％、５５％、５６％、５７％、５８％、５９％、６０％、６１％、６２％、６３％、６４％、６５％、６６％、６７％、６８％、６９％、７０％、７１％、７２％、７３％、７４％、７５％、７６％、７７％、７８％、７９％、８０％、８１％、８２％、８３％、８４％、８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％は、少なくとも１つのブチレート産生微生物および／または少なくとも１つの二次発酵菌であってもよい。
【０１５３】
一部の実施形態では、本開示の組成物が少なくとも１つのブチレート産生微生物および／または少なくとも１つの二次発酵菌を含む場合、組成物または単位用量中の総ＣＦＵの約０％〜約５％、約１％〜約５％、約５％〜約１０％、約１０％〜約１５％、約１５％〜約２０％、約２０％〜約２５％、約２５％〜約３０％、約３０％〜約３５％、約３５％〜約４０％、約４０％〜約４５％、約４５％〜約５０％、約５０％〜約５５％、約５５％〜約６０％、約６０％〜約６５％、約６５％〜約７０％、約７０％〜約７５％、約７５％〜約８０％、約８０％〜約８５％、約８５％〜約９０％、約９０％〜約９５％、約９５％〜約９９％、約０％〜約１０％、約１％〜約１０％、約１０％〜約２０％、約２０％〜約３０％、約３０％〜約４０％、約４０％〜約５０％、約５０％〜約６０％、約６０％〜約７０％、約７０％〜約８０％、約８０％〜約９０％約９０％〜約９９％、約０％〜約２０％、約２０％〜約４０％、約４０％〜約６０％、約６０％〜約８０％、約８０％〜約９９％、約０％〜約４０％約１％〜約４０％、約４０％〜約８０％、約１０％〜約５０％、約５０％〜約９０％、約３０％〜約７０％、約５０％〜約９０％、約０％〜約３０％、約１％〜約３０％、約１０％〜約４０％、約２０％〜約５０％、約３０％〜約８０％、約４０％〜約７０％、約５０％〜約８０％、または約６０％〜約９０％は、少なくとも１つのブチレート産生微生物および／または少なくとも１つの二次発酵菌であってもよい。
【０１５４】
単位用量は、本開示の１つまたは複数のプレバイオティクス（例えば、イヌリン、チコリイヌリン、チコリイヌリンおよびオリゴフルクトース、複合炭水化物、複合糖質、難消化性デキストリン、難消化性デンプン、アミノ酸、ペプチド、栄養化合物、ビオチン、ポリデキストロース、オリゴ糖、多糖、フルクトオリゴ糖（ＦＯＳ）、フルクタン、可溶性繊維、不溶性繊維、繊維、デンプン、ガラクトオリゴ糖（ＧＯＳ）、リグニン、オオバコ、キチン、キトサン、ゴム（例えば、グアーガム）、高アミローストウモロコシデンプン（ＨＡＳ）、セルロース、β−グルカン、ヘミセルロース、ラクツロース、マンノオリゴ糖、マンナンオリゴ糖（ＭＯＳ）、オリゴフルクトース強化イヌリン、オリゴフルクトース、オリゴデキストロース、タガトース、ｔｒａｎｓ−ガラクトオリゴ糖、ペクチン、難消化性デンプン、キシロオリゴ糖（ＸＯＳ）、ローカストビーンガム、Ｐ−グルカン、またはメチルセルロース）を含んでもよい。
【０１５５】
用量または単位用量は、少なくとも約０．００１ｍｇ、０．０１ｍｇ、０．０２ｍｇ、０．０３ｍｇ、０．０４ｍｇ、０．０５ｍｇ、０．０６ｍｇ、０．０７ｍｇ、０．０８ｍｇ、０．０９ｍｇ、０．１ｍｇ、０．２ｍｇ、０．３ｍｇ、０．４ｍｇ、０．５ｍｇ、０．６ｍｇ、０．７ｍｇ、０．８ｍｇ、０．９ｍｇ、１ｍｇ、１．５ｍｇ、２ｍｇ、３ｍｇ、４ｍｇ、５ｍｇ、６ｍｇ、７ｍｇ、８ｍｇ、９ｍｇ、１０ｍｇ、１１ｍｇ、１２ｍｇ、１３ｍｇ、１４ｍｇ、１５ｍｇ、１６ｍｇ、１７ｍｇ、１８ｍｇ、１９ｍｇ、２０ｍｇ、２５ｍｇ、３０ｍｇ、３５ｍｇ、４０ｍｇ、４１ｍｇ、４２ｍｇ、４３ｍｇ、４４ｍｇ、４５ｍｇ、４６ｍｇ、４７ｍｇ、４８ｍｇ、４９ｍｇ、５０ｍｇ、６０ｍｇ、７０ｍｇ、８０ｍｇ、８５ｍｇ、９０ｍｇ、９１ｍｇ、９２ｍｇ、９３ｍｇ、９４ｍｇ、９５ｍｇ、９６ｍｇ、９７ｍｇ、９８ｍｇ、９９ｍｇ、１００ｍｇ、１５０ｍｇ、２００ｍｇ、２５０ｍｇ、２６０ｍｇ、２６５ｍｇ、２７０ｍｇ、２７５ｍｇ、２８０ｍｇ、２８５ｍｇ、２９０ｍｇ、２９５ｍｇ、３００ｍｇ、４００ｍｇ、５００ｍｇ、６００ｍｇ、７００ｍｇ、８００ｍｇ、９００ｍｇ、１ｇ、１．５ｇ、２ｇ、３ｇ、４ｇ、５ｇ、６ｇ、７ｇ、８ｇ、９ｇ、１０ｇ、１１ｇ、１２ｇ、１３ｇ、１４ｇ、１５ｇ、１６ｇ、１７ｇ、１８ｇ、１９ｇ、２０ｇ、２５ｇ、３０ｇ、３５ｇ、４０ｇ、４５ｇ、５０ｇ、６０ｇ、７０ｇ、８０ｇ、９０ｇ、１００ｇの本開示のプレバイオティック（例えば、イヌリン）を含んでもよい。
【０１５６】
一部の場合、用量または単位用量は、最大で約０．００１ｍｇ、０．０１ｍｇ、０．０２ｍｇ、０．０３ｍｇ、０．０４ｍｇ、０．０５ｍｇ、０．０６ｍｇ、０．０７ｍｇ、０．０８ｍｇ、０．０９ｍｇ、０．１ｍｇ、０．２ｍｇ、０．３ｍｇ、０．４ｍｇ、０．５ｍｇ、０．６ｍｇ、０．７ｍｇ、０．８ｍｇ、０．９ｍｇ、１ｍｇ、１．５ｍｇ、２ｍｇ、３ｍｇ、４ｍｇ、５ｍｇ、６ｍｇ、７ｍｇ、８ｍｇ、９ｍｇ、１０ｍｇ、１１ｍｇ、１２ｍｇ、１３ｍｇ、１４ｍｇ、１５ｍｇ、１６ｍｇ、１７ｍｇ、１８ｍｇ、１９ｍｇ、２０ｍｇ、２５ｍｇ、３０ｍｇ、３５ｍｇ、４０ｍｇ、４１ｍｇ、４２ｍｇ、４３ｍｇ、４４ｍｇ、４５ｍｇ、４６ｍｇ、４７ｍｇ、４８ｍｇ、４９ｍｇ、５０ｍｇ、６０ｍｇ、７０ｍｇ、８０ｍｇ、８５ｍｇ、９０ｍｇ、９１ｍｇ、９２ｍｇ、９３ｍｇ、９４ｍｇ、９５ｍｇ、９６ｍｇ、９７ｍｇ、９８ｍｇ、９９ｍｇ、１００ｍｇ、１５０ｍｇ、２００ｍｇ、２５０ｍｇ、２６０ｍｇ、２６５ｍｇ、２７０ｍｇ、２７５ｍｇ、２８０ｍｇ、２８５ｍｇ、２９０ｍｇ、２９５ｍｇ、３００ｍｇ、３１０ｍｇ、３２０ｍｇ、３３０ｍｇ、３４０ｍｇ、３５０ｍｇ、３６０ｍｇ、３７０ｍｇ、３８０ｍｇ、３９０ｍｇ、４００ｍｇ、４５０ｍｇ、５００ｍｇ、６００ｍｇ、７００ｍｇ、８００ｍｇ、９００ｍｇ、１ｇ、１．５ｇ、２ｇ、３ｇ、４ｇ、５ｇ、６ｇ、７ｇ、８ｇ、９ｇ、１０ｇ、１１ｇ、１２ｇ、１３ｇ、１４ｇ、１５ｇ、１６ｇ、１７ｇ、１８ｇ、１９ｇ、２０ｇ、２５ｇ、３０ｇ、３５ｇ、４０ｇ、４５ｇ、５０ｇ、６０ｇ、７０ｇ、８０ｇ、９０ｇ、１００ｇの本開示のプレバイオティック（例えば、イヌリン）を含んでもよい。
【０１５７】
一部の実施形態では、用量または単位用量は、約０．００１ｍｇ、０．０１ｍｇ、０．０２ｍｇ、０．０３ｍｇ、０．０４ｍｇ、０．０５ｍｇ、０．０６ｍｇ、０．０７ｍｇ、０．０８ｍｇ、０．０９ｍｇ、０．１ｍｇ、０．２ｍｇ、０．３ｍｇ、０．４ｍｇ、０．５ｍｇ、０．６ｍｇ、０．７ｍｇ、０．８ｍｇ、０．９ｍｇ、１ｍｇ、１．５ｍｇ、２ｍｇ、３ｍｇ、４ｍｇ、５ｍｇ、６ｍｇ、７ｍｇ、８ｍｇ、９ｍｇ、１０ｍｇ、１１ｍｇ、１２ｍｇ、１３ｍｇ、１４ｍｇ、１５ｍｇ、１６ｍｇ、１７ｍｇ、１８ｍｇ、１９ｍｇ、２０ｍｇ、２５ｍｇ、３０ｍｇ、３５ｍｇ、４０ｍｇ、４１ｍｇ、４２ｍｇ、４３ｍｇ、４４ｍｇ、４５ｍｇ、４６ｍｇ、４７ｍｇ、４８ｍｇ、４９ｍｇ、５０ｍｇ、６０ｍｇ、７０ｍｇ、８０ｍｇ、８５ｍｇ、９０ｍｇ、９１ｍｇ、９２ｍｇ、９３ｍｇ、９４ｍｇ、９５ｍｇ、９６ｍｇ、９７ｍｇ、９８ｍｇ、９９ｍｇ、１００ｍｇ、１５０ｍｇ、２００ｍｇ、２５０ｍｇ、２６０ｍｇ、２６５ｍｇ、２７０ｍｇ、２７５ｍｇ、２７６ｍｇ、２８０ｍｇ、２８５ｍｇ、２９０ｍｇ、２９５ｍｇ、３００ｍｇ、４００ｍｇ、５００ｍｇ、６００ｍｇ、７００ｍｇ、８００ｍｇ、９００ｍｇ、１ｇ、１．５ｇ、２ｇ、３ｇ、４ｇ、５ｇ、６ｇ、７ｇ、８ｇ、９ｇ、１０ｇ、１１ｇ、１２ｇ、１３ｇ、１４ｇ、１５ｇ、１６ｇ、１７ｇ、１８ｇ、１９ｇ、２０ｇ、２５ｇ、３０ｇ、３５ｇ、４０ｇ、４５ｇ、５０ｇ、６０ｇ、７０ｇ、８０ｇ、９０ｇ、１００ｇの本開示のプレバイオティック（例えば、イヌリン）を含んでもよい。一部の実施形態では、用量または単位用量は、約４６ｍｇのイヌリンを含んでもよい。一部の実施形態では、用量または単位用量は、約９２ｍｇのイヌリンを含んでもよい。一部の実施形態では、用量または単位用量は、約２７６ｍｇのイヌリンを含んでもよい。
【０１５８】
一部の場合、用量または単位用量は、約０．０１ｍｇ〜約１００ｇ、０．０１ｍｇ〜約１０ｇ、０．０１ｍｇ〜約１ｇ、０．０１ｍｇ〜約５００ｍｇ、０．０１ｍｇ〜約３００ｍｇ、０．０１ｍｇ〜約２００ｍｇ、０．０１ｍｇ〜約１００ｍｇ、０．０１ｍｇ〜約９０ｍｇ、０．０１ｍｇ〜約８０ｍｇ、０．０１ｍｇ〜約７０ｍｇ、０．０１ｍｇ〜約６０ｍｇ、０．０１ｍｇ〜約５０ｍｇ、０．０１ｍｇ〜約４０ｍｇ、０．０１ｍｇ〜約３０ｍｇ、０．０１ｍｇ〜約２０ｍｇ、０．０１ｍｇ〜約１０ｍｇ、１ｍｇ〜約５００ｍｇ、１ｍｇ〜約３００ｍｇ、１ｍｇ〜約２００ｍｇ、１ｍｇ〜約１００ｍｇ、１ｍｇ〜約９０ｍｇ、１ｍｇ〜約８０ｍｇ、１ｍｇ〜約７０ｍｇ、１ｍｇ〜約６０ｍｇ、１ｍｇ〜約５０ｍｇ、１ｍｇ〜約４０ｍｇ、１ｍｇ〜約３０ｍｇ、１ｍｇ〜約２０ｍｇ、１ｍｇ〜約１０ｍｇ、約１００ｍｇ〜約８００ｍｇ、約５０ｍｇ〜約１００ｍｇ、約１００ｍｇ〜約２００ｍｇ、約２００ｍｇ〜約３００ｍｇ、約３００ｍｇ〜約４００ｍｇ、約４００ｍｇ〜約５００ｍｇ、約５００ｍｇ〜約６００ｍｇ、約６００ｍｇ〜約７００ｍｇ、約７００ｍｇ〜約８００ｍｇ、約８００ｍｇ〜約９００ｍｇ、約９００ｍｇ〜約１ｇ、約１ｇ〜約２ｇ、約２ｇ〜約１０ｇ、約１０ｇ〜約１００ｇ、約１０ｍｇ〜約１００ｍｇ、約５０ｍｇ〜約５０ｇ、約１００ｍｇ〜約３０ｇ、約２００ｍｇ〜約２０ｇ、約３００ｍｇ〜約１５ｇ、約５００ｍｇ〜約１０ｇ、約１ｇ〜約２５ｇ、約１ｇ〜約２０ｇ、約１ｇ〜約１５ｇ、約１０ｍｇ〜約１００ｍｇ、約２０ｍｇ〜約９０ｍｇ、約３０ｍｇ〜約６０ｍｇ、約４０ｍｇ〜約５０ｍｇ、約４５ｍｇ〜約４７ｍｇ、約６０ｍｇ〜約１２０ｍｇ、約７０ｍｇ〜約１１０ｍｇ、約８０ｍｇ〜約１００ｍｇ、約８５ｍｇ〜約９５ｍｇ、約９０ｍｇ〜約１００ｍｇ、約９１ｍｇ〜約９３ｍｇ、約２５０ｍｇ〜約３００ｍｇ、約２６０ｍｇ〜約２９０ｍｇ、約２７０ｍｇ〜約２８０ｍｇ、または約２７５ｍｇ〜約２７７ｍｇの本開示のプレバイオティックを含んでもよい。
【０１５９】
一部の場合、用量または単位用量は、約０．０１ｍｇ〜約１００ｇ、０．０１ｍｇ〜約１０ｇ、０．０１ｍｇ〜約１ｇ、０．０１ｍｇ〜約５００ｍｇ、０．０１ｍｇ〜約３００ｍｇ、０．０１ｍｇ〜約２００ｍｇ、０．０１ｍｇ〜約１００ｍｇ、０．０１ｍｇ〜約９０ｍｇ、０．０１ｍｇ〜約８０ｍｇ、０．０１ｍｇ〜約７０ｍｇ、０．０１ｍｇ〜約６０ｍｇ、０．０１ｍｇ〜約５０ｍｇ、０．０１ｍｇ〜約４０ｍｇ、０．０１ｍｇ〜約３０ｍｇ、０．０１ｍｇ〜約２０ｍｇ、０．０１ｍｇ〜約１０ｍｇ、１ｍｇ〜約５００ｍｇ、１ｍｇ〜約３００ｍｇ、１ｍｇ〜約２００ｍｇ、１ｍｇ〜約１００ｍｇ、１ｍｇ〜約９０ｍｇ、１ｍｇ〜約８０ｍｇ、１ｍｇ〜約７０ｍｇ、１ｍｇ〜約６０ｍｇ、１ｍｇ〜約５０ｍｇ、１ｍｇ〜約４０ｍｇ、１ｍｇ〜約３０ｍｇ、１ｍｇ〜約２０ｍｇ、１ｍｇ〜約１０ｍｇ、約１００ｍｇ〜約８００ｍｇ、約５０ｍｇ〜約１００ｍｇ、約１００ｍｇ〜約２００ｍｇ、約２００ｍｇ〜約３００ｍｇ、約３００ｍｇ〜約４００ｍｇ、約４００ｍｇ〜約５００ｍｇ、約５００ｍｇ〜約６００ｍｇ、約６００ｍｇ〜約７００ｍｇ、約７００ｍｇ〜約８００ｍｇ、約８００ｍｇ〜約９００ｍｇ、約９００ｍｇ〜約１ｇ、約１ｇ〜約２ｇ、約２ｇ〜約１０ｇ、約１０ｇ〜約１００ｇ、約１０ｍｇ〜約１００ｍｇ、約５０ｍｇ〜約５０ｇ、約１００ｍｇ〜約３０ｇ、約２００ｍｇ〜約２０ｇ、約３００ｍｇ〜約１５ｇ、約５００ｍｇ〜約１０ｇ、約１ｇ〜約２５ｇ、約１ｇ〜約２０ｇ、約１ｇ〜約１５ｇ、約１０ｍｇ〜約１００ｍｇ、約２０ｍｇ〜約９０ｍｇ、約３０ｍｇ〜約６０ｍｇ、約４０ｍｇ〜約５０ｍｇ、約４５ｍｇ〜約４７ｍｇ、約６０ｍｇ〜約１２０ｍｇ、約７０ｍｇ〜約１１０ｍｇ、約８０ｍｇ〜約１００ｍｇ、約８５ｍｇ〜約９５ｍｇ、約９０ｍｇ〜約１００ｍｇ、約９１ｍｇ〜約９３ｍｇ、約２５０ｍｇ〜約３００ｍｇ、約２６０ｍｇ〜約２９０ｍｇ、約２７０ｍｇ〜約２８０ｍｇ、または約２７５ｍｇ〜約２７７ｍｇのイヌリンを含んでもよい。
【０１６０】
対象に投与される用量は、同時に投与される１または複数の単位用量（例えば、錠剤またはカプセル）を含んでもよい。一部の場合、用量は、実質的に同時に投与される１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０個またはそれより多いカプセルまたは錠剤を含んでもよい。ある特定の場合、用量は、実質的に同時に投与される約１〜約６個のカプセルまたは錠剤を含むであろう。一部の場合、用量は、錠剤またはカプセル１個あたり約１ｘ１０７ＣＦＵ、錠剤またはカプセル１個あたり約１ｘ１０８ＣＦＵ、錠剤またはカプセル１個あたり約１ｘ１０９ＣＦＵ、錠剤またはカプセル１個あたり約１ｘ１０１０ＣＦＵ、錠剤またはカプセル１個あたり約１ｘ１０１１ＣＦＵ、錠剤またはカプセル１個あたり約１ｘ１０１２ＣＦＵ、錠剤またはカプセル１個あたり約１ｘ１０１３ＣＦＵ、または錠剤またはカプセル１個あたり約１ｘ１０１４ＣＦＵを含んでもよい。
【０１６１】
用量を、１日５回、１日４回、１日３回、１日２回、または１日１回投与してもよい。用量を、１日置きに投与してもよい。用量を、週１回、週２回、週３回、週４回、週５回、週６回、週７回、またはそれより多く投与してもよい。用量を、月１回、月２回、月３回、月４回、またはそれより多く投与してもよい。用量を、１回または複数回の食事時間に投与してもよい。用量を、食事の直後に、食事の約０．５時間後に、食事の約１時間後に、食事の約２時間後に、食事の約３時間後に、食事の約４時間後に、または食事の約５時間後に投与してもよい。用量を、食事の直前に、食事の約０．５時間前に、食事の約１時間前に、食事の約２時間前に、食事の約３時間前に、食事の約４時間前に、または食事の約５時間前に投与してもよい。用量を、食事後約０．５時間以内に、食事後約１時間以内に、食事後約２時間以内に、食事後約３時間以内に、食事後約４時間以内に、または食事後約５時間以内に投与してもよい。用量を、食事前の約０．５時間以内に、食事前の約１時間以内に、食事前の約２時間以内に、食事前の約３時間以内に、食事前の約４時間以内に、または食事前の約５時間以内に投与してもよい。
【０１６２】
組成物を、１日、２日、３日、４日、５日、６日、または７日の経過にわたって投与することができる。組成物を、約２週間、約３週間、約４週間、約５週間、約６週間、約７週間、約８週間、約９週間、約１０週間、約１１週間、または約１２週間の経過にわたって投与することができる。組成物を、約３ヶ月、約４ヶ月、約５ヶ月、約６ヶ月、約７ヶ月、約８ヶ月、約９ヶ月、約１０ヶ月、約１１ヶ月、または約１２ヶ月の経過にわたって投与することができる。一部の場合、組成物を、継続的に投与することができる。継続は、少なくとも１年、少なくとも１．５年、少なくとも２年、少なくとも３年、少なくとも４年、少なくとも５年、少なくとも６年、少なくとも７年、少なくとも８年、少なくとも９年、少なくとも１０年の、またはそれより長い期間であってもよい。
【０１６３】
組成物は、少なくとも約１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、または１２ヶ月の、またはそれより長い保存可能期間を有してもよい。一部の場合、組成物は、少なくとも約１、１．５、２、２．５、３、３．５、もしくは４年の、またはそれより長い保存可能期間を有してもよい。一部の場合、組成物は、１年〜４年、１年〜３．５年、１年〜３年、１年〜年、１年〜２．５年、１年〜２年、１．５年〜４年、１．５年〜３．５年、１．５年〜３年、１．５年〜３年、１．５年〜２．５年、１．５年〜２年、２年〜４年、２年〜３．５年、２年〜３年、２年〜２．５年、２．５年〜４年、２．５年〜３．５年、２．５年〜３年、３年〜４年、３年〜３．５年、または３．５年〜４年の保存可能期間を有してもよい。一部の場合、本明細書に記載の保存可能期間は、冷蔵温度で保存される組成物に適用できる。一部の場合、本明細書に記載の保存可能期間は、室温で保存される組成物に適用できる。偏性嫌気性微生物を含む組成物を、保存可能期間を増大させるために、酸素への曝露を低減するか、または排除するように製剤化することができる。
【０１６４】
本明細書に開示される組成物を、食品もしくは飲料製品、化粧品、または栄養補給剤として製剤化することができる。微生物組成物を、栄養補助食品として製剤化することができる。微生物組成物を、ビタミン補助食品と共に組み込むことができる。微生物組成物を、プロバイオティックグミなどのチュアブル形態で製剤化することができる。微生物組成物を、食品および／または飲料の形態に組み込むことができる。微生物組成物を組み込むことができる食品および飲料の非限定例としては、例えば、バー、シェイク、ジュース、乳児用調製粉乳、飲料、冷凍食品、発酵食品、ならびにヨーグルト、ヨーグルト飲料、チーズ、乳酸菌飲料、およびケフィアなどの培養乳製品が挙げられる。本明細書に開示される組成物は、マトリックス中に包含された微生物を含んでもよい。一部の実施形態では、本開示の組成物は、アーモンドバター中に包含された微生物を含む食品形態である。
【０１６５】
組成物を、対象の消化管の好適な部分への放出のために製剤化することができる。消化管領域の非限定例としては、十二指腸、十二指腸、空腸、回腸を含む小腸領域、ならびに盲腸、結腸（例えば、上行結腸、横行結腸、下行結腸、および／またはＳ状結腸）、直腸、および肛門管を含む大腸領域が挙げられる。組成物を、消化管の回腸および／または結腸領域への送達のために製剤化することができる。
【０１６６】
組成物を、任意の好適な送達方法による送達のために製剤化することができる。送達経路の非限定例としては、局所、経口、非経口、直腸、粘膜、経膣、および腸／消化管が挙げられる。投与経路の組合せを使用してもよい。
【０１６７】
組成物を、経口的に、例えば、カプセル、ピル、または錠剤として投与することができる。本開示のカプセル、ピル、または錠剤は、サイズ０のカプセル、ピル、または錠剤であってもよい。本開示のカプセル、錠剤、またはピルは、酸耐性であってもよい。本開示のカプセル、錠剤、またはピルは、水、ヒドロキシプロピルメチルセルロース、ヒドロキシプロピルメチルセルロースフタレート、およびプロピレングリコールのうちの１つまたは複数を含んでもよい。本開示のカプセル、錠剤、またはピルは、水、ヒドロキシプロピルメチルセルロース、ヒドロキシプロピルメチルセルロースフタレート、およびプロピレングリコールを含んでもよい。本開示のカプセル、錠剤、またはピルは、ヒドロキシプロピルメチルセルロース、ヒドロキシプロピルメチルセルロースフタレート、およびプロピレングリコールからなる、またはから本質的になるケーシングを含んでもよい。本開示のカプセル、錠剤、またはピルは、９９ｍｇの平均空重量、±６ｍｇの耐容量、および表２に開示される仕様を有するゼラチンカプセルであってもよい。本開示のカプセル、錠剤、またはピルは、１０５ｍｇの平均空重量、±６ｍｇの耐容量、および表２に開示される仕様を有する植物性カプセルであってもよい。
表２：例示的なカプセルの仕様
【表２−１】
2022502373.tif 000014
【表２−２】
2022502373.tif 000015
【０１６８】
組成物を、経口的に、例えば、消化管において組成物を放出するように設計された、カプセル、ピル、粉末、錠剤、ゲル、または液体によって投与することができる。
【０１６９】
１つの非限定例では、微生物組成物を、例えば、ピルまたはカプセル中での経口投与のために製剤化することができる。組成物は、例えば、対象の胃での内容物の放出を防止するために、腸溶コーティングを含んでもよい。組成物を、望ましい、または好ましい消化管領域（例えば、十二指腸、空腸、回腸、盲腸、結腸上部、結腸中央部、結腸下部、上行結腸、横行結腸、下行結腸、Ｓ状結腸、直腸、肛門管、またはその組合せ）であってもよい、対象の消化管領域中での組成物の内容物の実質的な放出のために設計することができる。
【０１７０】
腸溶コーティングは、組成物、例えば、ピルまたはカプセルなどの経口組成物の内容物を、胃の酸性から保護することができる。腸溶コーティングは、回腸および／または結腸上部領域への送達を提供することができる。微生物組成物を、組成物の内容物が対象の腸領域または好ましい腸領域、例えば、回腸および／または結腸領域以外の身体部分で放出されないように製剤化することができる。腸溶コーティングの非限定例としては、ｐＨ感受性ポリマー（例えば、Ｅｕｄｒａｇｉｔ  ＦＳ３０Ｄ）、メチルアクリレート−メタクリル酸コポリマー、セルロースアセテートスクシネート、ヒドロキシプロピルメチルセルロースフタレート、ヒドロキシプロピルメチルセルロースアセテートスクシネート（例えば、ヒプロメロースアセテートスクシネート）、ポリビニルアセテートフタレート（ＰＶＡＰ）、メチルメタクリレート−メタクリル酸コポリマー、シェラック、セルロースアセテートトリメリテート、アルギン酸ナトリウム、ゼイン、他のポリマー、脂肪酸、ワックス、シェラック、プラスチック、および植物繊維が挙げられる。腸溶コーティングは、ｐＨ感受性ポリマーによって形成させることができる。腸溶コーティングは、Ｅｕｄｒａｇｉｔ  ＦＳ３０Ｄによって形成させることができる。
【０１７１】
腸溶コーティングを、任意の好適なｐＨで溶解するように設計することができる。腸溶コーティングを、ｐＨ約６．５〜ｐＨ約７．０よりも高いｐＨで溶解するように設計することができる。腸溶コーティングを、ｐＨ約６．５よりも高いｐＨで溶解するように設計することができる。腸溶コーティングを、ｐＨ約７．０よりも高いｐＨで溶解するように設計することができる。腸溶コーティングを、約５、５．１、５．２、５．３、５．４、５．５、５．６、５．７、５．８、５．９、６、６．１、６．２、６．３、６．４、６．５、６．６、６．７、６．８、６．９、７、７．１、７．２、７．３、７．４、または７．５ｐＨ単位よりも高いｐＨで溶解するように設計することができる。腸溶コーティングを、腸、例えば、回腸および／または結腸領域において溶解するように設計することができる。腸溶コーティングを、胃で溶解しないように設計することができる。
【０１７２】
プロバイオティック送達のための製剤の例は、カプセル、錠剤、またはビーズを含んでもよい。微生物の生存率を増大させるために、さらなるパラメーターを組成物に組み込むことができる。
【０１７３】
本明細書で考察される、１つまたは複数の単離および精製された微生物を含む組成物を、対象の小腸、大腸、回腸、またはその組合せへの送達のために封入してもよい。封入される混合物は、対象の小腸または大腸の前に単離および精製された微生物の集団を実質的に放出しなくてもよい。
【０１７４】
硬化バス中での溶媒蒸発および冷却または架橋は、空気に懸濁された液滴を固化させることができる。乳化は、連続相液体中での活性物質の懸濁液または溶液の乳化を含んでもよい別の方法である。この後、内部ゲル化、重合、層静電沈着による層、内部相分離、および液滴形成によるマトリックス／シェル生産を行うことができる。封入プロセスにおける固体シェルおよびマトリックス形成のための一般的な方法は、機械的および温度的、物理化学的、または化学的なものであってもよい。機械的および温度的方法としては、冷却、凍結、パンコーティング、または流動床コーティングが挙げられる。流動床コーティングは、トップスプレー、ボトムスプレー、接線スプレー、またはウルスタープロセスを含んでもよい。物理化学的方法は、溶媒除去、層沈着による層、自己集合、単純および複雑な液滴形成、イオンチャネル型ゲル化、または内部相分離を含んでもよい。溶媒除去は、蒸発または乾燥および液体抽出を含む。化学的方法は、懸濁重合、界面重縮合、または固体−ゲル化学を含んでもよい。懸濁重合は、１段階（直接）懸濁重合または２段階懸濁重合（液滴膨張）法を含んでもよい。リポソームを、封入のために使用することもできる。
【０１７５】
ヒドロゲルを使用して微生物を封入することができる。微生物は、１つまたは複数の株を含んでもよい。ヒドロゲルは、親水性ポリマーネットワーク中に捕捉されている親水性活性剤（例えば、本開示の１つまたは複数の微生物）を含んでもよい。化学的または物理的ゲル化は、ゲルネットワークを形成することができる。化学的ゲル化は、フリーラジカルプロセスの重合または縮合を含んでもよい。物理的ゲル化は、加熱設定ゲルを用いた加熱、冷却設定ゲルを用いた冷却、またはイオンチャネル型ゲル化による多価対抗イオンの付加を利用することができる。液滴形成は、第１に、ポリマーに富む液相、ポリマーが少ない液相、および活性成分を含む液相または固相を含有する３相系への、活性成分のエマルジョンまたは懸濁液中での静電相分離を含んでもよい。第２に、液滴形成は、分散した液滴または粒子上への液滴相の沈着、次いで、被膜の硬化を含んでもよい。
【０１７６】
溶媒蒸発法では、有機溶媒は、高融点の油を溶解することができ、混合物は水相と共に室温で乳化される。次に、固体粒子を、有機溶媒蒸発によって生産することができる。結果として、固体脂質粒子は、初期の油滴よりも小さい。他方、温度制御された乳化中に、固体脂質微粒子は一般に、初期の油滴と同じサイズであり得る。溶媒蒸発または冷却の前に水エマルジョン中の油中水（Ｗ／Ｏ／Ｗ）を形成させることによって、親水性試料を封入することができる。
【０１７７】
本開示は、健康状態、例えば、微生物叢と関連する健康状態を処置するための方法および組成物を提供する。例えば、治療有効量の微生物に基づく組成物を、疾患開始との相関関係を示す好適な身体部位に投与することによって、処置を達成することができる。組成物を、対象の腸に送達することができる。投与される組成物を、対象の腸における放出のために製剤化することができる。
【０１７８】
本明細書に開示される組成物を、代謝障害を処置するための方法において使用することができる。代謝障害の非限定例としては、前糖尿病、糖尿病、Ｉ型糖尿病、ＩＩ型糖尿病、妊娠糖尿病、若年性糖尿病、代謝症候群、炎症性腸疾患（ＩＢＤ）、過敏性腸症候群（ＩＢＳ）、肥満、過体重状態、肝虚血−再かん流傷害などの虚血−再かん流傷害、脂肪肝疾患、非アルコール性脂肪肝疾患（ＮＡＦＬＤ）、アルコール性脂肪性肝炎（ＡＳＨ）、非アルコール性脂肪性肝炎（ＮＡＳＨ）、非肥満対象におけるＮＡＦＬＤ（例えば、肥満または過体重問題によって引き起こされない、またはそれと関連しないＮＡＦＬＤ）、非肥満対象におけるＮＡＳＨ（例えば、肥満または過体重問題によって引き起こされない、またはそれと関連しないＮＡＳＨ）、クローン病、大腸炎、潰瘍性大腸炎、偽膜性大腸炎、腎機能不全、腎臓病理、糸球体疾患、乳糖不耐症、インスリン非感受性、インスリン欠乏、インスリン耐性、耐糖能異常、下痢、アレルギー性下痢、デキストラン硫酸ナトリウム誘導性大腸炎、セリアック病、および胃不全麻痺が挙げられる。一部の場合、障害は、Ｉ型糖尿病であってもよい。一部の場合、障害は、２型糖尿病であってもよい。一部の場合、障害は、前糖尿病であってもよい。
【０１７９】
本明細書に開示される組成物を、１つまたは複数の代謝障害を管理する、軽減する、または処置するための方法において使用することができる。一部の場合、処置される１つまたは複数の代謝障害は、２型糖尿病を含んでもよい。一部の場合、処置される１つまたは複数の代謝障害は、前糖尿病または肥満を含んでもよい。
【０１８０】
２型糖尿病を処置または管理するための方法は、２型糖尿病を有する対象に、少なくとも１つのブチレート産生微生物と、少なくとも１つのムチン調節性微生物とを含むプロバイオティック組成物を投与し、ヘモグロビンＡ１Ｃレベルの低下をもたらすことを含んでもよい。２型糖尿病を処置する、または管理するための別の方法は、２型糖尿病を有する対象に、少なくとも１つのブチレート産生微生物と、少なくとも１つのムチン調節性微生物とを含むプロバイオティック組成物を投与し、一部の食事、多くの食事、または全部の食事の後の食事後グルコースレベルの低下をもたらすことを含んでもよい。２型糖尿病を処置または管理するための別の方法は、２型糖尿病を有する対象に、少なくとも１つのブチレート産生微生物と、少なくとも１つのムチン調節性微生物とを含むプロバイオティック組成物を投与し、食事負荷試験後のグルコースＡＵＣの低下をもたらすことを含んでもよい。２型糖尿病を処置または管理するための別の方法は、２型糖尿病を有する対象に、少なくとも１つのブチレート産生微生物と、少なくとも１つのムチン調節性微生物とを含むプロバイオティック組成物を投与し、空腹時グルコースレベルの低下をもたらすことを含んでもよい。ヘモグロビンＡ１Ｃレベルの低下をもたらす一部の方法では、食事負荷試験後のグルコースＡＵＣを低下させることもできる。ヘモグロビンＡ１Ｃレベルの低下をもたらす一部の方法では、空腹時血中グルコースを低下させることもできる。一部の方法では、ヘモグロビンＡ１Ｃレベル、食事負荷試験後のグルコースＡＵＣ、および空腹時グルコースレベルを低下させることができる。２型糖尿病を処置または管理するための別の方法は、２型糖尿病を有する対象に、少なくとも１つのブチレート産生微生物と、少なくとも１つのムチン調節性微生物とを含むプロバイオティック組成物を投与し、空腹時グルコースレベルの低下をもたらすことを含んでもよい。
【０１８１】
前糖尿病を処置または管理するための方法は、前糖尿病を有する対象に、少なくとも１つのブチレート産生微生物と、少なくとも１つのムチン調節性微生物とを含むプロバイオティック組成物を投与し、ヘモグロビンＡ１Ｃレベルの低下をもたらすことを含んでもよい。前糖尿病を処置する、または管理するための別の方法は、前糖尿病を有する対象に、少なくとも１つのブチレート産生微生物と、少なくとも１つのムチン調節性微生物とを含むプロバイオティック組成物を投与し、一部の食事、多くの食事、または全部の食事の後の食事後グルコースレベルの低下をもたらすことを含んでもよい。前糖尿病を処置または管理するための別の方法は、前糖尿病を有する対象に、少なくとも１つのブチレート産生微生物と、少なくとも１つのムチン調節性微生物とを含むプロバイオティック組成物を投与し、食事負荷試験後のグルコースＡＵＣの低下をもたらすことを含んでもよい。前糖尿病を処置または管理するための別の方法は、前糖尿病を有する対象に、少なくとも１つのブチレート産生微生物と、少なくとも１つのムチン調節性微生物とを含むプロバイオティック組成物を投与し、空腹時グルコースレベルの低下をもたらすことを含んでもよい。ヘモグロビンＡ１Ｃレベルの低下をもたらす一部の方法では、食事負荷試験後のグルコースＡＵＣを低下させることもできる。ヘモグロビンＡ１Ｃレベルの低下をもたらす一部の方法では、空腹時血中グルコースを低下させることもできる。一部の方法では、ヘモグロビンＡ１Ｃレベル、食事負荷試験後のグルコースＡＵＣ、および空腹時グルコースレベルを低下させることができる。前糖尿病を処置または管理するための別の方法は、前糖尿病を有する対象に、少なくとも１つのブチレート産生微生物と、少なくとも１つのムチン調節性微生物とを含むプロバイオティック組成物を投与し、空腹時グルコースレベルの低下をもたらすことを含んでもよい。
対象
【０１８２】
プロバイオティック組成物を受ける対象は、２型糖尿病の診断を有してもよい。一部の場合、２型糖尿病の診断を有する対象は、１２５ｍｇ／ｄＬを超える空腹時血中グルコースレベルを有してもよい。２型糖尿病の診断を有する対象は、１９９ｍｇ／ｄＬを超えるブドウ糖負荷試験後の血中グルコースレベルを有してもよい。２型糖尿病の診断を有する対象は、６．４％よりも高いｈＡ１Ｃレベルを有してもよい。一部の場合、プロバイオティック組成物を受ける対象は、前糖尿病の診断を有してもよい。一部の場合、前糖尿病の診断を有する対象は、１００ｍｇ／ｄＬ〜１２５ｍｇ／ｄＬの空腹時血中グルコースレベルを有してもよい。一部の場合、前糖尿病の診断を有する対象は、１４０ｍｇ／ｄＬ〜１９９ｍｇ／ｄＬのブドウ糖負荷試験後の血中グルコースレベルを有してもよい。前糖尿病の診断を有する対象は、５．７〜６．４のｈＡ１Ｃレベルを有してもよい。２型糖尿病の診断を有する対象は、初期段階、中期段階、または後期段階の糖尿病を有してもよい。
【０１８３】
一部の対象は、増大したヘモグロビンＡ１Ｃレベル、増大した食事負荷試験後のグルコースＡＵＣ、または増大した空腹時グルコースレベルを有してもよいか、または有したことがあってもよい。対象は、インスリン、メトホルミン、スルホニルウレア、または他の薬剤を含んでもよい、他の治療剤を使用して現在処置されているか、または以前に処置されていてもよい。対象は、本明細書に開示される組成物と、別の治療剤、例えば、インスリン、メトホルミン、グルカゴン様ペプチド１アゴニスト（ＧＬＰ−１）、グリプチン、ナトリウム−グルコース共輸送体−２阻害剤（ＳＧＬＴ２）、メグリチニド、アルファ−グルコシダーゼ阻害剤、および／またはスルホニルウレアとの組合せを受けてもよい。
【０１８４】
一部の対象は、良好に制御されていてもよい２型糖尿病を有してもよい。一部の場合、良好に制御された糖尿病を有する対象は、その試料の少なくとも３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、９０％、９５％、または９９％から測定された場合、５．７％未満のヘモグロビンＡ１Ｃレベルを有してもよい。一部の場合、良好に制御された糖尿病を有する対象は、その試料の少なくとも３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、９０％、９５％、または９９％から測定された場合、１２５ｍｇ／ｄＬ未満の空腹時グルコースレベルを有してもよい。一部の場合、良好に制御された糖尿病を有する対象は、その試料の少なくとも３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、９０％、９５％、または９９％から測定された場合、１００ｍｇ／ｄＬ未満の空腹時グルコースレベルを有してもよい。一部の場合、良好に制御された糖尿病を有する対象は、１１０、１２０、１３０、１４０、または１５０ｍｇ／ｄＬ未満の食後グルコースレベルを有してもよい。
【０１８５】
一部の対象は、制限された、制御された、またはそうでなければ特別食に現在あるか、または以前にあったことがあってもよい。一部の対象は、過去に食事介入を有したことがあってもよい。一部の対象は、食事介入を有したことがなくてもよい。
【０１８６】
組成物を、経口的または経鼻胃的に対象に投与してもよい。組成物は、固体、粉末、液体であってもよいか、または送達のために封入してもよい。
【０１８７】
対象は、任意量の時間にわたって２型糖尿病を有したことがあってもよい。対象は、少なくとも１ヶ月、２ヶ月、３ヶ月、４ヶ月、５ヶ月、６ヶ月、７ヶ月、８ヶ月、９ヶ月、１０ヶ月、１１ヶ月、１年、２年、３年、４年、５年、１０年、１５年、２０年、２５年、３０年にわたって、またはそれより長く糖尿病であってもよい。一部の実施形態では、対象は、最大で１ヶ月、２ヶ月、３ヶ月、４ヶ月、５ヶ月、６ヶ月、７ヶ月、８ヶ月、９ヶ月、１０ヶ月、１１ヶ月、１年、２年、３年、４年、５年、１０年、１５年、２０年、２５年、３０年にわたって、またはそれより短く糖尿病であってもよい。対象は、任意量の時間にわたって前糖尿病を有したことがあってもよい。対象は、少なくとも１ヶ月、２ヶ月、３ヶ月、４ヶ月、５ヶ月、６ヶ月、７ヶ月、８ヶ月、９ヶ月、１０ヶ月、１１ヶ月、１年、２年、３年、４年、５年、１０年、１５年、２０年、２５年、３０年にわたって、またはそれより長く前糖尿病であってもよい。一部の実施形態では、対象は、最大で１ヶ月、２ヶ月、３ヶ月、４ヶ月、５ヶ月、６ヶ月、７ヶ月、８ヶ月、９ヶ月、１０ヶ月、１１ヶ月、１年、２年、３年、４年、５年、１０年、１５年、２０年、２５年、３０年にわたって、またはそれより短く前糖尿病であってもよい。
【０１８８】
対象は、さらなる併存疾患を有してもよい。さらなる併存疾患は、早期陣痛、慢性疲労症候群、座瘡などの皮膚状態、アレルギー、自閉症、喘息、抑鬱症、高血圧、過敏性腸症候群、代謝症候群、肥満、乳糖不耐症、口腔カンジダ症、潰瘍性大腸炎、薬物代謝、膣症、アトピー性皮膚炎、乾癬、多発性硬化症、パーキンソン病などの神経障害、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  Ｄｉｆｆｉｃｉｌｅ感染、炎症性腸疾患、クローン病、心臓病、糖尿病性足潰瘍、菌血症、乳児疝痛、がん、嚢胞性線維症、多発性硬化症、尿路感染症、放射線腸疾患、薬物代謝、虫歯、口臭、代謝障害、消化管障害、インスリン非感受性、代謝症候群、非アルコール性脂肪肝疾患（ＮＡＦＬＤ）、非アルコール性脂肪性肝炎（ＮＡＳＨ）、心血管疾患、高血圧、コレステロールと関連する障害、トリグリセリドと関連する障害、肥満、過体重状態、炎症、乳児用調製粉乳供給、虫垂炎、アトピー疾患、加齢、空腹、妊娠、妊娠中の肥満、デキストラン硫酸ナトリウム誘導性大腸炎、下痢、アレルギー性下痢、およびアテローム性動脈硬化症を含んでもよい。
【０１８９】
一部の実施形態では、対象は、健康な対象であってもよい。例えば、本開示の組成物または方法を使用して、前糖尿病または２型糖尿病を発症する健康な対象のリスクを防止する、遅延させる、または減少させることができる。一部の実施形態では、本開示の組成物を、５．７未満のｈＡ１Ｃレベルを有する対象に投与することができる。本開示の組成物を、１４，５００ｍｇ・ｍｉｎ／ｄＬ〜２２，０００ｍｇ・ｍｉｎ／ｄＬのＭＴＴ後のグルコースＡＵＣを有する対象に投与することができる。本開示の組成物を、１４０ｍｇ／ｄＬ未満のブドウ糖負荷試験後の血中グルコースレベルを有する対象に投与することができる。本開示の組成物を、１００ｍｇ／ｄＬ未満の空腹時グルコースレベルを有する対象に投与することができる。本開示の組成物を、１４０ｍｇ／ｄＬ未満の食後グルコースレベルを有する対象に投与することができる。本開示の組成物を、前糖尿病または２型糖尿病の兆候も症状も示さない対象に投与することができる。本開示の組成物を、前糖尿病または２型糖尿病のための臨床検査を受けていない対象に投与することができる。
処置計画
【０１９０】
プロバイオティック組成物を、処置計画の一部として対象に投与することができる。処置計画は、さらなる療法、特別食、運動レジメン、肥満手術、もしくは他の処置またはライフスタイルの変化を含んでもよい。処置計画がさらなる療法を含む場合、以下に記載されるように、これらのものを、組成物と共に製剤化する、組成物と同時投与する、または組成物とは別々に、もしくは組成物とは異なる時間に投与することができる。
【０１９１】
処置計画は、プロバイオティック組成物を毎日投与することを含んでもよい。毎日の投与は、組成物を１日１、２、３、４、５回、またはそれより多く投与することを含んでもよい。処置計画は、プロバイオティック組成物を、合計で１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、２０、２５、３０、３５、４０、４５、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１１０、１２０、１３０、１４０、１５０、１７５、２００、２５０、３００、３５０、３６５、４００、５００、６００、７００、８００、９００、１０００回、またはそれより多く投与することを含んでもよい。処置計画は、プロバイオティック組成物を、１、２、３、４、５、６、７日、またはそれより多い日数毎に投与することを含んでもよい。処置計画は、プロバイオティック組成物を、毎週、隔週、毎月、隔月、年４回、年２回、または毎年投与することを含んでもよい。一部の処置計画は、規則的にスケジュールされた投薬を必要としてもよい。一部の処置計画は、不規則にスケジュールされた投薬を可能にするか、または必要としてもよい。一部の処置計画は、追加のプロバイオティック組成物をいつ投与するべきかを決定するための試験を必要としてもよい。例として、糞便試料をモニタリングし、対象の微生物叢中の投与されるプロバイオティックの量が特定のレベルより下に低下する場合に、組成物を対象に投与することができる。
【０１９２】
一部の組成物を、少なくとも１週間、２週間、３週間、４週間、５週間、６週間、７週間、８週間、９週間、１０週間、１１週間、１２週間、１３週間、１４週間、１５週間、または１６週間を超えて投与することができる。一部の組成物を、最大で１週間、２週間、３週間、４週間、５週間、６週間、７週間、８週間、９週間、１０週間、１１週間、１２週間、１３週間、１４週間、１５週間、１６週間、１７週間、１８週間、１９週間、２０週間、２６週間、１年、２年、３年、４年、または５年にわたって投与することができる。一部の組成物を、約１週間、２週間、３週間、４週間、５週間、６週間、７週間、８週間、９週間、１０週間、１１週間、１２週間、１３週間、１４週間、１５週間、１６週間、１７週間、１８週間、１９週間、２０週間、２６週間、１年、２年、３年、４年、または５年にわたって投与することができる。
【０１９３】
プロバイオティック組成物を、抗生物質などの抗微生物剤を用いる処置の前、間、または後に投与することができる。プロバイオティック組成物を、抗生物質を用いる処置の前および／または後に少なくとも約１時間、２時間、５時間、１２時間、１日、２日、３日、４日、５日、６日、１週間、８日、９日、１０日、１１日、１２日、１３日、２週間、２．５週間、３週間、４週間、５週間、６週間、７週間、８週間、９週間、１０週間、１１週間、１２週間、１３週間、１４週間、１５週間、１６週間、６ヶ月間、または１年間投与することができる。プロバイオティック組成物を、抗生物質を用いる処置の前および／または後に最大で１時間、２時間、５時間、１２時間、１日、２日、３日、４日、５日、６日、１週間、８日、９日、１０日、１１日、１２日、１３日、２週間、２．５週間、３週間、４週間、５週間、６週間、７週間、８週間、９週間、１０週間、１１週間、１２週間、１３週間、１４週間、１５週間、１６週間、６ヶ月間、または１年間投与することができる。
【０１９４】
一部の場合、プロバイオティック組成物を、本明細書に開示されるように食品消費の前、間、または後に投与することができる。
メトホルミン
【０１９５】
一部の場合、組成物を、メトホルミンと共に投与することができる。一部の場合、本開示の組成物を、メトホルミンとの併用療法として提供することができる。メトホルミンを、組成物と同時に投与するか、または組成物を投与する１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、もしくは１２時間前もしくは後に投与することができる。
【０１９６】
メトホルミンを、組成物中に製剤化するか、または別々に投与することができる。一部の場合、患者は、彼らがプロバイオティック組成物の投与を開始する時、既にメトホルミンレジメン上にあってもよい。一部の場合、患者は、彼らが組成物の投与を開始するのと同時にメトホルミン療法を開始してもよい。一部の場合、患者は、彼らが組成物の投与を開始した後にメトホルミン療法を開始してもよい。
【０１９７】
メトホルミンを、約５００ｍｇ、約５５０ｍｇ、約６００ｍｇ、約６５０ｍｇ、約７００ｍｇ、約７５０ｍｇ、約８００ｍｇ、約８５０ｍｇ、約９００ｍｇ、約９５０ｍｇ、または約１０００ｍｇの用量で投与することができる。メトホルミンを、１日に少なくとも１回または２回投与することができる。一部の場合、メトホルミン用量は、１日に少なくとも５００ｍｇであってもよい。一部の場合、メトホルミン用量は、１日に２５００ｍｇ以下であってもよい。一部の場合、メトホルミン用量は、１日に５００ｍｇ〜２５００ｍｇであってもよい。
【０１９８】
一部の場合、投与されるメトホルミンは、投与される組成物の治療効果を増大させることができる。代謝障害に罹患している対象における治療効果の増大または増強を、組成物単独の投与から生じるものよりも大きい、ヘモグロビンＡ１Ｃレベルの低下によって示すことができる。一部の場合、代謝障害に罹患している対象における治療効果の増大または増強を、組成物単独の投与から生じるものよりも大きい、ＭＴＴ後のグルコースＡＵＣの低下によって示すことができる。一部の場合、代謝障害に罹患している対象における治療効果の増大または増強を、組成物単独の投与から生じるものよりも大きい、空腹時グルコースレベルの低下によって示すことができる。
【０１９９】
一部の場合、投与される組成物は、投与されるメトホルミンの治療効果を増大させることができる。代謝障害に罹患している対象における治療効果の増大または増強を、メトホルミン単独の投与から生じるものよりも大きい、ヘモグロビンＡ１Ｃレベルの低下によって示すことができる。一部の場合、代謝障害に罹患している対象における治療効果の増大または増強を、メトホルミン単独の投与から生じるものよりも大きい、ＭＴＴ後のグルコースＡＵＣの低下によって示すことができる。一部の場合、代謝障害に罹患している対象における治療効果の増大または増強を、メトホルミン単独の投与から生じるものよりも大きい、空腹時グルコースレベルの低下によって示すことができる。
【０２００】
一部の場合、本開示の組成物と同時投与されるか、または本開示の組成物の一部として投与される場合、メトホルミンが単独で投与された場合の治療量以下である用量でメトホルミンを投与することができる。一部の場合、メトホルミンの治療量以下の用量は、ヘモグロビンＡ１Ｃレベルを低下させない、またはヘモグロビンＡ１Ｃレベルを少なくとも閾値レベルまで低下させないメトホルミンの用量であってよい。一部の場合、メトホルミンの治療量以下の用量は、ＭＴＴ後のグルコースＡＵＣを低下させない、またはＭＴＴ後のグルコースＡＵＣを少なくとも閾値レベルまで低下させないメトホルミンの用量であってもよい。一部の場合、メトホルミンの治療量以下の用量は、空腹時グルコースレベルを低下させない、または空腹時グルコースレベルを少なくとも閾値レベルまで低下させないメトホルミンの用量であってよい。一部の場合、メトホルミンのそのような治療量以下の用量は、組成物の治療効果を増強することができる。一部の場合、組成物は、メトホルミンの用量、治療量以下の用量またはその他の効果を増強することができる。
スルホニルウレア
【０２０１】
一部の場合、組成物を、スルホニルウレアの非存在下で投与することができる。特に、一部の対象については、スルホニルウレアとの同時投与の非存在下で本明細書に記載の組成物を投与することが望ましい場合がある。したがって、本明細書に記載の組成物を、本明細書に記載の組成物を受けるのと同時にスルホニルウレアを投与されていない対象に投与することができる。処置のためのそのような対象を、スルホニルウレアで現在処置されていない対象と同定するか、または本明細書に記載の組成物の投与を開始する前にスルホニルウレアの摂取を停止するよう指示することができる。
【０２０２】
一部の場合、組成物を、低用量のスルホニルウレアと共に投与することができる。低用量を、本開示の微生物組成物の投与と同時に、その前に、またはその後に投与することができる。低用量は、スルホニルウレアが単独で投与される場合に治療効果を提供することができない用量であり得る、治療量以下の用量であってもよい。一部の場合、スルホニルウレアを、約０．２５、０．５、１、１．２５、１．５、１．７５、２、２．２５、または２．５ｍｇ未満の減少した用量で投与することができる。
【０２０３】
一部の場合、スルホニルウレアの適切な用量または処置レジメンを、実験的に決定することができる。例えば、対象を、それぞれ、治療有効用量の本明細書に記載の組成物と、ある用量のスルホニルウレアとを与えられる、群に分割することができる。対象の例としては、ヒト、マウス、またはラットが挙げられる。一部の場合、それぞれの群は、異なる用量のスルホニルウレアを受けてもよい。一部の場合、１つまたは複数の群は治療量以下の用量のスルホニルウレアを受けてもよい。
【０２０４】
他の場合、スルホニルウレアの投与および本明細書に記載の組成物の投与を、患者へのその投与が少なくとも１日、少なくとも２日、少なくとも３日、少なくとも４日、少なくとも１週間、またはそれより長く隔てられるように、ずらすことができる。
インスリン療法との組合せ
【０２０５】
本明細書における一部のプロバイオティック組成物を、インスリン療法を受けている対象に、または過去にインスリン療法を受けていた対象に投与することができる。一部の場合、プロバイオティック組成物を、インスリンと同時に対象に投与することができる。一部の場合、投与されるインスリンは、投与されるプロバイオティック組成物の治療効果を改善することができる。一部の場合、インスリン療法を、必要に応じて使用することができる。一部の場合、インスリンを、少なくとも１つの単離および精製されたブチレート産生微生物と、少なくとも１つの単離および精製されたムチン調節性微生物とを含む組成物と一緒に、またはそれとほぼ同時に摂取してもよい。一部の場合、インスリンを投与する前に、少なくとも０．５、１、２、３、または４時間が経過してもよい。一部の場合、投与されるプロバイオティック組成物は、インスリンに対する対象のニーズを低下させるか、または除去することができる。
他の療法との組合せ
【０２０６】
一部の場合、本明細書に記載のプロバイオティック組成物を、別の療法または複数の療法と共に投与することができる。他の療法の例としては、メグリチニド、チアゾリジンジオン、ＤＰＰ−４阻害剤、ＧＬＰ−１受容体アゴニスト、またはＳＧＬＴ２阻害剤が挙げられる。１つまたは複数の他の療法は、少なくとも１つの単離および精製されたブチレート産生微生物と、少なくとも１つの単離および精製されたムチン調節性微生物とを含む、投与される組成物の治療効果を増大させるか、または増強することができる。代謝障害に罹患している対象における治療効果の増大または増強を、組成物単独の投与から生じるものよりも大きい、ヘモグロビンＡ１Ｃレベルの低下によって示すことができる。一部の場合、ヘモグロビンＡ１Ｃを、糖化された、またはグリコシル化されたヘモグロビンのパーセンテージとして報告することができる。一部の場合、組成物が別の療法と共に投与される場合、ヘモグロビンＡ１Ｃを、さらに１％、２％、３％、４％、５％、６％、７％、８％、９％、１０％、１１％、１２％、１３％、１４％、または１５％低下させることができる。一部の場合、組成物が別の療法と共に投与される場合、ヘモグロビンＡ１Ｃを、総ヘモグロビンのさらに０．０５％、０．０６％、０．０７％、０．０８％、０．０９％、０．１％、０．２％、０．３％、０．４％、０．５５％、０．６％、０．７％、０．８％、０．９％、または１％低下させることができる。一部の場合、代謝障害に罹患している対象における治療効果の増大または増強を、組成物単独の投与から生じるものよりも大きい、ＭＴＴ後のグルコースＡＵＣの低下によって示すことができる。一部の場合、組成物が別の療法と共に投与される場合、ＭＴＴ後のグルコースＡＵＣを、さらに１％、２％、３％、４％、５％、１０％、１５％、２０％、２５％、３０％、３５％、４０％、４５％、または５０％低下させることができる。一部の場合、代謝障害に罹患している対象における治療効果の増大または増強を、組成物単独の投与から生じるものよりも大きい、空腹時グルコースレベルの低下によって示すことができる。一部の場合、組成物が別の療法と共に投与される場合、空腹時グルコースレベルを、さらに１％、２％、３％、４％、５％、１０％、１５％、２０％、２５％、３０％、３５％、４０％、４５％、または５０％低下させることができる。
【０２０７】
２型糖尿病を有する一部の対象は、状態を制御する努力において肥満手術を受けてもよい。一部の場合、プロバイオティック組成物を、肥満手術の前または後に対象に投与することができる。理論によって制限されないが、肥満手術は、投与されるプロバイオティック組成物の治療効果を改善することができる。
特別食または食事レジメンとの組合せ
【０２０８】
一部の場合、本明細書に記載のプロバイオティック組成物を、特別食または食事レジメンと一緒に投与することができる。例えば、対象は、果物、野菜、全粒のうちの１つまたは複数に富む食事を消費してもよい。別の例では、対象は、動物性食品、精製炭水化物、または甘味料のうちの１つまたは複数が制限された食事を消費してもよい。一部の特別食または食事レジメンは、高血糖インデックス食を制限してもよい。一部の特別食または食事レジメンは、大量の低血糖インデックス食を含んでもよい。
【０２０９】
一部の特別食は、低血糖インデックス食、菜食、ビーガン食、半菜食、低カロリー食、低炭水化物食、低脂肪食、グルテンフリー食、無糖食、低糖食、低グルコース食、ケトン食、流動食、低ＦＯＤＭＡＰ（発酵性オリゴ糖、二糖、単糖およびポリオール）食、特定の炭水化物食、１つもしくは複数のアレルゲンを含まない食事、または別の型の食事を含んでもよい。一部の食事は、２型糖尿病を自ら制御するか、または制御するのに役立ち得る。一部の場合、特別食は、投与されるプロバイオティック組成物の治療効果を改善することができる。一部の食事は、本明細書に記載のプロバイオティック組成物と組み合わせた場合、２型糖尿病を制御するか、または制御するのに役立ち得る。
運動レジメンとの組合せ
【０２１０】
２型糖尿病を有する一部の対象は、運動レジメンを開始する、継続する、または変化させてもよい。本明細書におけるプロバイオティック組成物を、これらの対象に、または任意の運動レジメンにある、もしくは運動レジメンにない対象に投与することができる。一部の場合、運動レジメンは、投与されるプロバイオティック組成物の治療効果を改善することができる。
転帰
【０２１１】
本明細書に記載のプロバイオティック組成物の投与は、１つまたは複数の転帰をもたらすことができる。これらの転帰を、プロバイオティック組成物を、単独で、別の治療剤と共に、特別食と組み合わせて、肥満手術と組み合わせて、または運動レジメンと組み合わせて投与する場合に達成することができる。転帰は、プロバイオティック組成物が、単独で、別の治療剤と共に、特別食と組み合わせて、肥満手術と組み合わせて、もしくは運動レジメンと組み合わせて、または上記の組合せと組み合わせて投与されるかどうかとは無関係であってもよい。例えば、転帰を、プロバイオティック組成物が、肥満手術を受けた対象において特別食および運動と組み合わせて投与される場合に達成することができる。一部の場合、転帰は、プロバイオティック組成物を、単独で、別の治療剤と共に、特別食と組み合わせて、肥満手術と組み合わせて、または運動レジメンと組み合わせて投与することに依存してもよい。
【０２１２】
転帰は、全ての対象について、または対象のサブセットについて変化させてもよい。対象の一部のサブセットは、対象の他のサブセットとは異なる転帰を有してもよい。そのため、対象の一部のサブセットは、全ての対象の転帰の平均とは異なる転帰を有してもよく、対象の一部のサブセットは、対象に関する典型的な転帰とは異なる転帰を有してもよい。
【０２１３】
転帰、例えば、変化または変化率が本明細書に記載される場合、それらは、個体、対象のサブセット、全ての対象、平均転帰、中央転帰、モード転帰、または転帰の予想範囲に関するものであってよい。転帰、例えば、本開示の組成物を投与する前のパラメーターと組成物を投与した後のパラメーターとを比較することによって算出される対象に関するパラメーターの変化を、対象あたりベースで決定することができる。転帰を、対照と比較して決定することができる。対照は、本開示の組成物を投与する前の対象において測定されたパラメーターであってもよい。対照は、本開示の組成物を投与されていない対象において測定されたパラメーターであってもよい。対照は、プラセボを投与された対象において測定されたパラメーターであってもよい。対照は、別の組成物または別の治療剤を投与された対象において測定されたパラメーターであってもよい。
【０２１４】
転帰は、治療効果の測定または検出に関する情報を提供することができる。一部の場合、転帰は、治療効果であってもよい。一部の場合、治療効果は、組成物の投与後のヘモグロビンＡ１Ｃレベルの低下であってもよい。一部の場合、治療効果は、組成物の投与後のＭＴＴ後のグルコースＡＵＣの低下であってもよい。一部の場合、治療効果は、組成物の投与後の空腹時グルコースレベルの低下であってもよい。
【０２１５】
一部の場合、食事関連グルコースＡＵＣの低下を、自由に生活している状況で証明することができる。例えば、食事関連グルコースＡＵＣのそのような低下を、持続グルコースモニタリングまたは頻回グルコースモニタリングによって観察することができる。
ｈＡ１Ｃの低下
【０２１６】
ｈＡ１Ｃを、一定量の血液から測定することができる。一部の場合、ｈＡ１Ｃの測定値は、２型糖尿病または前糖尿病の指標であってよい。一部の場合、ヘモグロビンＡ１Ｃを、グリコシル化されているヘモグロビンのパーセンテージとして報告または測定することができる。グリコシル化されたヘモグロビンのパーセンテージは、過去約３ヶ月にわたる平均血中グルコースレベルを示してもよい。例えば、低いｈＡ１Ｃレベルは、対象における前糖尿病または糖尿病の非存在または制御を示してもよい。
【０２１７】
ｈＡ１Ｃレベルの変化は、介入の開始（例えば、本開示の組成物の摂取の開始後）の約２週間、３週間、４週間、５週間、６週間、７週間、８週間、９週間、１０週間、１１週間、１２週間、１３週間、１４週間、１５週間、１６週間、１７週間、１８週間、１９週間、２０週間、２２週間、２４週間、または２６週間以内に起こってもよい。ｈＡ１Ｃレベルの変化は、介入の開始（例えば、本開示の組成物の摂取の開始後）の約２週間、３週間、４週間、５週間、６週間、７週間、８週間、９週間、１０週間、１１週間、１２週間、１３週間、１４週間、１５週間、１６週間、１７週間、１８週間、１９週間、２０週間、２２週間、２４週間、または２６週間後に起こってもよい。
【０２１８】
ｈＡ１Ｃレベルは、時間と共に、対象間で、または同じ対象中で変化してもよい。一部の場合、ｈＡ１Ｃレベルは、対象が前糖尿病または糖尿病を有するかどうかを示してもよい。例えば、５．７％より低いｈＡ１Ｃレベルは、非糖尿病対象または糖尿病もしくは前糖尿病が療法もしくは食事レジメンもしくは運動レジメンもしくはその組合せの上で良好に制御されている対象を示してもよい。一部の対象では、５．７％〜６．４％のｈＡ１Ｃレベルは、前糖尿病を示してもよい。一部の場合、６．５％の、または６．５％を超えるｈＡ１Ｃレベルは、２型糖尿病を含む糖尿病を示してもよい。
【０２１９】
一部の対象では、ｈＡ１Ｃを複数回測定してもよい。平均値、中央値、モード、最高値、最低値、最近レベル、レベルの変化、またはその組合せを考慮してもよい。
【０２２０】
ｈＡ１Ｃを、少なくとも０．６、０．７、０．８、０．９、１．０、１．５、２．０、２．５、３．０、３．５、４．０、４．５、もしく５μＬの、またはそれより多い血液である一定量の血液中で測定することができる。ｈＡ１Ｃレベルを測定するために使用される血液量は、少なくとも１μＬ、５μＬ、１０μＬ、１５μＬ、２０μＬ、３０μＬ、４０μＬ、５０μＬ、１００μＬ、２００μＬ、３００μＬ、４００μＬ、５００μＬ、６００μＬ、７００μＬ、８００μＬ、９００μＬ、１ｍＬ、２ｍＬ、３ｍＬ、４ｍＬ、５ｍＬ、６ｍＬ、７ｍＬ、８ｍＬ、９ｍＬ、もしくは１０ｍＬの、またはそれより多い血液であってもよい。
【０２２１】
一部の場合、本明細書に開示される組成物の投与は、ｈＡ１Ｃを、処置前のｈＡ１Ｃレベルの少なくとも１％、２％、３％、４％、５％、６％、７％、８％、９％、１０％、１１％、１２％、１３％、１４％、１５％、１６％、１７％、１８％、１９％、２０％、２１％、２２％、２３％、２４％、２５％、３０％、３５％、４０％、４５％、または５０％低下させることができる。一部の場合、本明細書に開示される組成物の投与は、ｈＡ１Ｃを、１％〜５０％、１％〜４０％、１％〜３０％、１％〜２０％、１％〜１０％、５％〜５０％、５％〜４０％、５％〜３０％、５％〜２０％、５％〜１０％、１０％〜５０％、１０％〜４０％、１０％〜３０％、２０％〜５０％、２０％〜４０％、２０％〜３０％、３０％〜５０％、３０％〜４０％、または４０％〜５０％低下させることができる。一部の場合、最終ｈＡ１Ｃは、総ヘモグロビンの約３％、約４％、約５％、約６％、または約７％であってもよい。実証例として、糖尿病を示してもよい、総ヘモグロビンの７％のｈＡ１Ｃレベルを有する対象における１０％のｈＡ１Ｃの低下は、前糖尿病を示してもよい、総ヘモグロビンの６．３％の最終ｈＡ１Ｃレベルをもたらしてもよい。
【０２２２】
一部の場合、本明細書に開示される組成物の投与は、ｈＡ１Ｃレベルを、総ヘモグロビンの少なくとも０．０５、０．１、０．２、０．３、０．４、０．５、０．６、０．７、０．８、０．９、１．０、１．１、１．２、１．３、１．５、１．６、１．７、１．８、１．９、２、２．１、２．２、２．３、２．４、２．５、２．６、２．７、２．８、２．９、もしくは３．０％、またはそれより多く低下させることができる。一部の場合、本明細書に開示されるプロバイオティック組成物の投与は、ｈＡ１Ｃレベルを、総ヘモグロビンの約０．０５％〜約３％、約０．０５％〜約２．５％、約０．０５％〜約２％、約０．０５％〜約１．５％、約０．０５％〜約１．２％、約０．０５％〜約１．１％、約０．０５％〜約１％、約０．０５％〜約０．９％、約０．０５％〜約０．８％、約０．０５％〜約０．７％、約０．０５％〜約０．６％、約０．０５％〜約０．５％、約０．０５％〜約０．４％、約０．０５％〜約０．３％、約０．０５％〜約０．２％、約０．０５％〜約１％、約０．１％〜約２．５％、約０．１％〜約２％、約０．１％〜約１．５％、約０．１％〜約１．２％、約０．１％〜約１．１％、約０．１％〜約１％、約０．１％〜約０．９％、約０．１％〜約０．８％、約０．１％〜約０．７％、約０．１％〜約０．６％、約０．１％〜約０．５％、約０．１％〜約０．４％、約０．１％〜約０．３％、約０．１％〜約０．２％、約０．２％〜約２．５％、約０．２％〜約２％、約０．２％〜約１．５％、約０．２％〜約１．２％、約０．２％〜約１．１％、約０．２％〜約１％、約０．２％〜約０．９％、約０．２％〜約０．８％、約０．２％〜約０．７％、約０．２％〜約０．６％、約０．２％〜約０．５％、約０．２％〜約０．４％、約０．２％〜約０．３％、約０．３％〜約２．５％、約０．３％〜約２％、約０．３％〜約１．５％、約０．３％〜約１．２％、約０．３％〜約１．１％、約０．３％〜約１％、約０．３％〜約０．９％、約０．３％〜約０．８％、約０．３％〜約０．７％、約０．３％〜約０．６％、約０．３％〜約０．５％、約０．３％〜約０．４％、約０．４％〜約２．５％、約０．４％〜約２％、約０．４％〜約１．５％、約０．４％〜約１．２％、約０．４％〜約１．１％、約０．４％〜約１％、約０．４％〜約０．９％、約０．４％〜約０．８％、約０．４％〜約０．７％、約０．４％〜約０．６％、約０．４％〜約０．５％、約０．５％〜約２．５％、約０．５％〜約２％、約０．５％〜約１．５％、約０．５％〜約１．２％、約０．５％〜約１．１％、約０．５％〜約１％、約０．５％〜約０．９％、約０．５％〜約０．８％、約０．５％〜約０．７％、約０．５％〜約０．６％、約０．５％〜約０．５％、約０．５％〜約０．４％、約０．６％〜約１．１％、約０．６％〜約１％、約０．６％〜約０．９％、約０．６％〜約０．８％、または約０．６％〜約０．７％低下させることができる。一部の場合、本明細書に開示されるプロバイオティック組成物は、ｈＡ１Ｃレベルを、総ヘモグロビンの約０．４％〜約０．７％低下させることができる。一部の場合、本明細書に開示されるプロバイオティック組成物の投与は、ｈＡ１Ｃレベルを、総ヘモグロビンの約０．５５〜約０．６５％低下させることができる。変化率は、投与前レベルに対するか、またはプラセボを投与される、および／もしくは同じ組成物を投与されない対照対象に対するものであってよい。
【０２２３】
一部の場合、組成物を、時間経過、例えば、数日または数週間にわたって投与することができ、ｈＡ１Ｃレベルは、処置の長さの間の様々な時点でｈＡ１Ｃレベルを測定することによって決定された場合、その投与の経過にわたって低下を受けてもよい。例えば、一部の場合、組成物を、少なくとも１２週間にわたって投与してもよい。一部の場合、６ヶ月後、ｈＡ１Ｃを、総ヘモグロビンの、平均で少なくとも０．１％、平均で少なくとも０．２％、平均で少なくとも０．３％、平均で少なくとも０．４％、平均で少なくとも０．５％、または平均で少なくとも０．６％低下させることができる。一部の場合、１２週間後、ｈＡ１Ｃを、総ヘモグロビンの、平均で少なくとも０．１％、平均で少なくとも０．２％、平均で少なくとも０．３％、平均で少なくとも０．４％、平均で少なくとも０．５％、または平均で少なくとも０．６％低下させることができる。一部の場合、１０週間後、ｈＡ１Ｃを、出発ｈＡ１Ｃレベルと比較して、または対照対象と比較して、少なくとも５％、１０％、または１５％低下させることができる。一部の場合、８週間後、ｈＡ１Ｃを、総ヘモグロビンの、平均で少なくとも０．１％、平均で少なくとも０．２％、平均で少なくとも０．３％、平均で少なくとも０．４％、平均で少なくとも０．５％、または平均で少なくとも０．６％低下させることができる。一部の場合、６週間後、ｈＡ１Ｃを、総ヘモグロビンの、平均で少なくとも０．０５％、平均で少なくとも０．１％、平均で少なくとも０．２％、平均で少なくとも０．３％、平均で少なくとも０．４％、平均で少なくとも０．５％、または平均で少なくとも０．６％低下させることができる。一部の場合、４週間後、ｈＡ１Ｃを、総ヘモグロビンの、平均で少なくとも０．０５％、平均で少なくとも０．１％、平均で少なくとも０．２％、平均で少なくとも０．３％、平均で少なくとも０．４％、平均で少なくとも０．５％、または平均で少なくとも０．６％低下させることができる。一部の場合、規定の期間にわたるｈＡ１Ｃの低下は、より短い規定の期間にわたるｈＡ１Ｃの低下を超えなくてもよい。
【０２２４】
一部の場合、本明細書に開示される組成物の投与は、前糖尿病または２型糖尿病を有する対象の少なくとも５％、１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、９０％、９５％、または９９％においてｈＡ１Ｃレベルを低下させることができる。
【０２２５】
一部の場合、ｈＡ１Ｃレベルを、糖尿病レベルから正常レベルまで低下させることができる。一部の場合、ｈＡ１Ｃレベルを、糖尿病レベルから前糖尿病レベルまで低下させることができる。一部の場合、ｈＡ１Ｃレベルを、前糖尿病レベルから正常レベルまで低下させることができる。一部の場合、ｈＡ１Ｃレベルを、より高い糖尿病レベルからより低い糖尿病レベルまで低下させることができる。一部の場合、ｈＡ１Ｃレベルを、より高い前糖尿病レベルからより低い前糖尿病レベルまで低下させることができる。
ＭＴＴ後のグルコースＡＵＣの低下
【０２２６】
ここで、「ＭＴＴ」は、食事負荷試験を指してもよい。ＭＴＴは、標準食であってよい食事を投与した後、時間で隔てられた血液試料中のグルコースを測定することを含んでもよい。標準食であってよい食事は、Ｅｎｓｕｒｅ（登録商標）などの液体栄養シェイク、または他の同様の標準化された高栄養食品などの、標準栄養食品を含んでもよい。一部の場合、グルコースを、持続グルコースモニターを使用して測定することができる。一部の場合、対象は、ＭＴＴの前に食べなくても、飲まなくてもよい。一部の場合、血液試料は、カテーテル、注射筒、または他の方法によって採取してもよい。血液試料を、約１０、１５、２０、２５、３０、４５、もしくは６０分毎に、または他の任意の間隔で採取してもよい。血液試料を、約１、１．５、２、２．５、３、３．５、４、４．５、もしくは５時間の経過にわたって、または対象にとって別の適切な期間にわたって採取してもよい。一部の場合、血液試料を、血中グルコースレベルが空腹時血中グルコースのものとなるまで採取してもよい。
【０２２７】
ＭＴＴ後のグルコースＡＵＣレベルの変化は、介入の開始（例えば、本開示の組成物の摂取の開始後）の約１日、１週間、２週間、３週間、４週間、５週間、６週間、７週間、８週間、９週間、１０週間、１１週間、１２週間、１３週間、１４週間、１５週間、１６週間、１７週間、１８週間、１９週間、２０週間、２２週間、２４週間、または２６週間以内に起こってもよい。
【０２２８】
ＭＴＴ後のグルコースＡＵＣレベルの変化は、介入の開始（例えば、本開示の組成物の摂取の開始後）の約２週間、３週間、４週間、５週間、６週間、７週間、８週間、９週間、１０週間、１１週間、１２週間、１３週間、１４週間、１５週間、１６週間、１７週間、１８週間、１９週間、２０週間、２２週間、２４週間、または２６週間後に起こってもよい。
【０２２９】
ＭＴＴ後のグルコースＡＵＣは、時間と共に、対象間で、または同じ対象中で変化してもよい。一部の対象では、ＭＴＴ後の健康なグルコースＡＵＣは、１４，５００ｍｇ・ｍｉｎ／ｄＬ〜２２，０００ｍｇ・ｍｉｎ／ｄＬであってもよい。
【０２３０】
ＭＴＴ後のグルコースＡＵＣを、無作為な食事、糖に富む食事、糖が少ない食事、大量の食事、少量の食事、平均的な食事、標準食、処方食、または栄養補給食品もしくは完全食の後に測定することができる。
【０２３１】
ＭＴＴ後のグルコースＡＵＣを、一部の対象では、複数回測定することができる。平均値、中央値、モード、最高値、最低値、もしくは最近レベル、またはその組合せを考慮してもよい。
【０２３２】
ＭＴＴ後のグルコースＡＵＣを、連続的に取得された血液試料から測定することができる。ＭＴＴ後のグルコースＡＵＣを、２、３、４、５、６、７、８、９、１０の、またはそれより多い時点を使用して測定することができる。それぞれの時点について、グルコースレベルを測定するために使用される血液量は、少なくとも０．５、０．６、０．７、０．８、０．９、１．０、１．５、２．０、２．５、３．０、３．５、４．０、４．５、または５μＬの、またはそれより多い血液であってもよい。それぞれの時点について、グルコースレベルを測定するために使用される血液量は、少なくとも１μＬ、５μＬ、１０μＬ、１５μＬ、２０μＬ、３０μＬ、４０μＬ、５０μＬ、１００μＬ、２００μＬ、３００μＬ、４００μＬ、５００μＬ、６００μＬ、７００μＬ、８００μＬ、９００μＬ、１ｍＬ、２ｍＬ、３ｍＬ、４ｍＬ、５ｍＬ、６ｍＬ、７ｍＬ、８ｍＬ、９ｍＬ、もしくは１０ｍＬの、またはそれより多い血液であってもよい。
【０２３３】
一部の場合、ＭＴＴ後のグルコースＡＵＣを、血液試料を引き出すことなく、例えば、持続グルコースモニタリングデバイスを使用して測定することができる。
【０２３４】
一部の場合、本明細書に開示される組成物の投与は、ＭＴＴ後のグルコースＡＵＣを、組成物を投与する前に測定されたＭＴＴ後のグルコースＡＵＣと比較して、または組成物を投与されていない対照対象と比較して少なくとも１％、２％、３％、４％、５％、６％、７％、８％、９％、１０％、１１％、１２％、１３％、１４％、１５％、１６％、１７％、１８％、１９％、２０％、２１％、２２％、２３％、２４％、２５％、３０％、３５％、４０％、４５％、５０％、５５％、６０％、６５％、７０％、または７５％低下させることができる。一部の場合、本明細書のプロバイオティック組成物の投与は、ＭＴＴ後のグルコースＡＵＣを、１２％〜１８％低下させることができる。一部の場合、プロバイオティック組成物は、ＭＴＴ後のグルコースＡＵＣを、１０％〜２０％低下させることができる。一部の場合、プロバイオティック組成物は、ＭＴＴ後のグルコースＡＵＣを、５％〜２５％低下させることができる。一部の場合、プロバイオティック組成物は、ＭＴＴ後のグルコースＡＵＣを、５％〜３０％低下させることができる。一部の場合、本明細書に開示される組成物の投与は、ＭＴＴ後のグルコースＡＵＣを、１％〜５０％、１％〜４０％、１％〜３０％、１％〜２０％、１％〜１０％、５％〜５０％、５％〜４０％、５％〜３０％、５％〜２０％、５％〜１０％、１０％〜５０％、１０％〜４０％、１０％〜３０％、２０％〜５０％、２０％〜４０％、２０％〜３０％、３０％〜５０％、３０％〜４０％、または４０％〜５０％低下させることができる。
【０２３５】
一部の場合、本明細書のプロバイオティック組成物の投与は、前糖尿病または２型糖尿病を有する対象の少なくとも５％、１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、９０％、９５％、または９９％においてＭＴＴ後のグルコースＡＵＣを低下させることができる。
【０２３６】
一部の場合、ＭＴＴ後のグルコースＡＵＣレベルは、少なくとも約４．５、５、５．５、６、６．５、または７パーセンテージ点低下する。変化は、投与前レベルに対するか、またはプラセボを投与される、および／もしくは同じ組成物を投与されない対照対象に対するものであってよい。
【０２３７】
一部の場合、組成物を、時間経過、例えば、数日または数週間にわたって投与することができ、グルコースレベルは、処置の長さの間の様々な時点でグルコースレベルを測定することによって決定された場合、その投与の経過にわたって低下を受けてもよい。
【０２３８】
例えば、一部の場合、組成物を、少なくとも１２週間にわたって投与してもよい。一部の場合、６ヶ月後、グルコースＡＵＣを、投与前レベルと比較して、またはプラセボを投与される、および／もしくは同じ組成物を投与されない対照対象と比較して、平均で少なくとも５％、１０％、１５％、２０％、２５％、３０％、３５％、４０％、５０％、または６０％低下させることができる。一部の場合、１２週間後、グルコースＡＵＣを、投与前レベルと比較して、またはプラセボを投与される、および／もしくは同じ組成物を投与されない対照対象と比較して、平均で少なくとも５％、１０％、１５％、２０％、２５％、３０％、３５％、４０％、５０％、または６０％低下させることができる。一部の場合、１０週間後、ＭＴＴ後のグルコースＡＵＣを、投与前レベルと比較して、またはプラセボを投与される、および／もしくは同じ組成物を投与されない対照対象と比較して、平均で少なくとも５％、１０％、１５％、２０％、２５％、３０％、３５％、４０％、５０％、または６０％低下させることができる。一部の場合、８週間後、ＭＴＴ後のグルコースＡＵＣを、投与前レベルと比較して、またはプラセボを投与される、および／もしくは同じ組成物を投与されない対照対象と比較して、平均で少なくとも５％、１０％、１５％、２０％、２５％、３０％、３５％、４０％、５０％、または６０％低下させることができる。一部の場合、６週間後、ＭＴＴ後のグルコースＡＵＣを、投与前レベルと比較して、またはプラセボを投与される、および／もしくは同じ組成物を投与されない対照対象と比較して、平均で少なくとも５％、１０％、１５％、２０％、２５％、３０％、３５％、４０％、５０％、または６０％低下させることができる。一部の場合、４週間後、ＭＴＴ後のグルコースＡＵＣを、投与前レベルと比較して、またはプラセボを投与される、および／もしくは同じ組成物を投与されない対照対象と比較して、平均で少なくとも５％、１０％、１５％、２０％、２５％、３０％、３５％、４０％、５０％、または６０％低下させることができる。
【０２３９】
一部の場合、ＭＴＴ後のグルコースＡＵＣを、糖尿病レベルから正常レベルまで低下させることができる。一部の場合、ＭＴＴ後のグルコースＡＵＣを、糖尿病レベルから前糖尿病レベルまで低下させることができる。一部の場合、ＭＴＴ後のグルコースＡＵＣを、前糖尿病レベルから正常レベルまで低下させることができる。一部の場合、ＭＴＴ後のグルコースＡＵＣを、より高い糖尿病レベルからより低い糖尿病レベルまで低下させることができる。一部の場合、ＭＴＴ後のグルコースＡＵＣを、より高い前糖尿病レベルからより低い前糖尿病レベルまで低下させることができる。
【０２４０】
一部の場合、規定の期間にわたるＭＴＴ後のＡＵＣの低下は、より短い規定の期間にわたるＭＴＴ後のＡＵＣの低下を超えなくてもよい。
空腹時グルコースレベルの低下
【０２４１】
空腹時グルコースレベルは、時間と共に、対象間で、または同じ対象中で変化してもよい。一部の対象では、健康な空腹時グルコースレベルは、１００ｍｇ／ｄＬ未満であってよい。一部の対象では、前糖尿病を示す空腹時グルコースレベルは、１００〜１２５ｍｇ／ｄＬであってよい。一部の対象では、糖尿病を示す空腹時グルコースレベルは、１２５ｍｇ／ｄＬまたはそれより上であってよい。
【０２４２】
空腹時グルコースレベルの変化は、介入の開始（例えば、本開示の組成物の摂取の開始後）の約１日、１週間、２週間、３週間、４週間、５週間、６週間、７週間、８週間、９週間、１０週間、１１週間、１２週間、１３週間、１４週間、１５週間、１６週間、１７週間、１８週間、１９週間、２０週間、２２週間、２４週間、または２６週間以内に起こってもよい。
【０２４３】
空腹時グルコースレベルの変化は、介入の開始（例えば、本開示の組成物の摂取の開始後）の約２週間、３週間、４週間、５週間、６週間、７週間、８週間、９週間、１０週間、１１週間、１２週間、１３週間、１４週間、１５週間、１６週間、１７週間、１８週間、１９週間、２０週間、２２週間、２４週間、または２６週間後に起こってもよい。
【０２４４】
空腹時グルコースレベルは、食品が消費された後の有意な期間に血液試料中で測定されるグルコースの量であってよい。空腹時グルコースを、一晩の絶食後、または睡眠からの覚醒後に測定してもよい。空腹時グルコースを、食品が消費された約３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、もしくは１３時間後に、またはそれより長い時間の後に測定してもよい。空腹時グルコースを、食品が消費された少なくとも３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、または１３時間後に測定してもよい。
【０２４５】
一部の対象では、空腹時グルコースを複数回測定してもよい。平均値、中央値、モード、最高値、最低値、もしくは最近レベルを考慮してもよい。
【０２４６】
空腹時グルコースを、少なくとも０．４、０．５、０．６、０．７、０．８、０．９、１．０、１．５、２．０、２．５、３．０、３．５、４．０、４．５、もしく５μＬの、またはそれより多い血液である一定量の血液中で測定することができる。グルコースレベルを測定するために使用される血液量は、少なくとも１μＬ、５μＬ、１０μＬ、１５μＬ、２０μＬ、３０μＬ、４０μＬ、５０μＬ、１００μＬ、２００μＬ、３００μＬ、４００μＬ、５００μＬ、６００μＬ、７００μＬ、８００μＬ、９００μＬ、１ｍＬ、２ｍＬ、３ｍＬ、４ｍＬ、５ｍＬ、６ｍＬ、７ｍＬ、８ｍＬ、９ｍＬ、もしくは１０ｍＬの、またはそれより多い血液であってもよい。
【０２４７】
一部の場合、空腹時グルコースを、血液試料を引き出すことなく、例えば、持続グルコースモニタリングデバイスを使用して測定することができる。
【０２４８】
一部の対象では、空腹時グルコースレベルを複数回測定してもよい。平均値、中央値、モード、最高値、最低値、最近レベル、またはその組合せを考慮してもよい。
【０２４９】
一部の場合、本明細書に開示される組成物の投与は、空腹時グルコースレベルを、投与前レベルと比較して、またはプラセボを投与される、および／もしくは同じ組成物を投与されない対照対象と比較して、少なくとも１％、２％、３％、４％、５％、６％、７％、８％、９％、１０％、１１％、１２％、１３％、１４％、１５％、１６％、１７％、１８％、１９％、２０％、２１％、２２％、２３％、２４％、２５％、３０％、３５％、４０％、４５％、５０％、５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、または８０％低下させることができる。一部の場合、本明細書に開示される組成物の投与は、空腹時グルコースレベルを、１％〜５０％、１％〜４０％、１％〜３０％、１％〜２０％、１％〜１０％、５％〜５０％、５％〜４０％、５％〜３０％、５％〜２０％、５％〜１０％、１０％〜５０％、１０％〜４０％、１０％〜３０％、２０％〜５０％、２０％〜４０％、２０％〜３０％、３０％〜５０％、３０％〜４０％、または４０％〜５０％低下させることができる。一部の場合、本明細書に開示される組成物の投与は、空腹時グルコースレベルを、１％〜８０％、１％〜７０％、１％〜６０％、１０％〜８０％、１０％〜７０％、１０％〜６０％、２０％〜８０％、２０％〜７０％、２０％〜６０％、３０％〜８０％、３０％〜７０％、３０％〜６０％、４０％〜８０％、４０％〜７０％、４０％〜６０％、５０％〜８０％、５０％〜７０％、５０％〜６０％、６０％〜８０％、６０％〜７０％、または７０％〜８０％低下させることができる。一部の場合、本明細書に開示される組成物の投与は、空腹時グルコースレベルを、少なくとも１、５、１０、１５、２０、２５、３０、３５、４０、４５、５０ｍｇ／ｄＬ、またはそれより多く低下させることができる。
【０２５０】
一部の場合、本開示の組成物の投与は、空腹時グルコースレベルを、投与前レベルと比較して、またはプラセボを投与される、および／もしくは同じ組成物を投与されない対照対象と比較して、少なくとも３ｍｇ／ｄＬ、５ｍｇ／ｄＬ、１０ｍｇ／ｄＬ、１５ｍｇ／ｄＬ、２０ｍｇ／ｄＬ、２５ｍｇ／ｄＬ、３０ｍｇ／ｄＬ、３５ｍｇ／ｄＬ、４０ｍｇ／ｄＬ、４５ｍｇ／ｄＬ、５０ｍｇ／ｄＬ、６０ｍｇ／ｄＬ、７０ｍｇ／ｄＬ、８０ｍｇ／ｄＬ、９０ｍｇ／ｄＬ、もしくは１００ｍｇ／ｄＬ、１５０ｍｇ／ｄＬ、２００ｍｇ／ｄＬ、またはそれより多く低下させることができる。一部の場合、空腹時グルコースを、投与前レベルと比較して、またはプラセボを投与される、および／もしくは同じ組成物を投与されない対照対象と比較して、最大で２０ｍｇ／ｄＬ、３０ｍｇ／ｄＬ、４０ｍｇ／ｄＬ、５０ｍｇ／ｄＬ、６０ｍｇ／ｄＬ、７０ｍｇ／ｄＬ、８０ｍｇ／ｄＬ、９０ｍｇ／ｄＬ、１００ｍｇ／ｄＬ、１５０ｍｇ／ｄＬ、もしくは２００ｍｇ／ｄＬ、２５０ｍｇ／ｄＬ、３００ｍｇ／ｄＬ、３５０ｍｇ／ｄＬ、３７０ｍｇ／ｄＬ、または４００ｍｇ／ｄＬ低下させることができる。変化は、投与前レベルに対するか、または健康な対象に対するものであってよい。
【０２５１】
一部の場合、組成物を、時間経過、例えば、数日または数週間にわたって投与することができ、空腹時グルコースレベルは、処置の長さの間の様々な時点でグルコースレベルを測定することによって決定された場合、その投与の経過にわたって低下を受けてもよい。例えば、一部の場合、組成物を、少なくとも１２週間にわたって投与してもよい。一部の場合、６ヶ月後、空腹時グルコースを、投与前レベルと比較して、またはプラセボを投与される、および／もしくは同じ組成物を投与されない対照対象と比較して、少なくとも５％、１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、または８０％低下させることができる。一部の場合、１２週間後、空腹時グルコースを、投与前レベルと比較して、またはプラセボを投与される、および／もしくは同じ組成物を投与されない対照対象と比較して、少なくとも５％、１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、または８０％低下させることができる。一部の場合、１０週間後、空腹時グルコースを、投与前レベルと比較して、またはプラセボを投与される、および／もしくは同じ組成物を投与されない対照対象と比較して、平均で少なくとも５％、１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、または８０％低下させることができる。一部の場合、８週間後、空腹時グルコースを、投与前レベルと比較して、またはプラセボを投与される、および／もしくは同じ組成物を投与されない対照対象と比較して、平均で少なくとも５％、１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、または８０％低下させることができる。一部の場合、６週間後、空腹時グルコースを、投与前レベルと比較して、またはプラセボを投与される、および／もしくは同じ組成物を投与されない対照対象と比較して、平均で少なくとも５％、１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、または８０％低下させることができる。一部の場合、４週間後、空腹時グルコースを、投与前レベルと比較して、またはプラセボを投与される、および／もしくは同じ組成物を投与されない対照対象と比較して、平均で少なくとも５％、１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、または８０％低下させることができる。
【０２５２】
一部の場合、本明細書のプロバイオティック組成物の投与は、前糖尿病または２型糖尿病を有する対象の少なくとも５％、１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、９０％、９５％、または９９％において空腹時グルコースを低下させることができる。
【０２５３】
一部の場合、空腹時グルコースレベルを、糖尿病レベルから正常レベルまで低下させることができる。一部の場合、空腹時グルコースレベルを、糖尿病レベルから前糖尿病レベルまで低下させることができる。一部の場合、空腹時グルコースレベルを、前糖尿病レベルから正常レベルまで低下させることができる。一部の場合、空腹時グルコースレベルを、より高い糖尿病レベルからより低い糖尿病レベルまで低下させることができる。一部の場合、空腹時グルコースレベルを、より高い前糖尿病レベルからより低い前糖尿病レベルまで低下させることができる。
【０２５４】
一部の場合、規定の期間にわたる空腹時グルコースレベルの低下は、より短い規定の期間にわたる空腹時グルコースレベルの低下を超えなくてもよい。
食後グルコースレベルの低下
【０２５５】
食後グルコースレベルは、時間と共に、対象間で、または同じ対象中で変化してもよい。一部の場合、食後グルコースを、食事の約２時間後に測定してもよい。一部の場合、食後グルコースを、食事の約１．５〜２．５時間後に測定してもよい。一部の対象では、健康な食後グルコースレベルは、１４０ｍｇ／ｄＬ未満であってよい。一部の対象では、前糖尿病を示す食後グルコースレベルは、１４０〜１９９ｍｇ／ｄＬであってよい。一部の対象では、糖尿病を示す食後グルコースレベルは、２００ｍｇ／ｄＬまたはそれより上であってよい。
【０２５６】
食後グルコースレベルの変化は、介入の開始（例えば、本開示の組成物の摂取の開始後）の約１日、１週間、２週間、３週間、４週間、５週間、６週間、７週間、８週間、９週間、１０週間、１１週間、１２週間、１３週間、１４週間、１５週間、１６週間、１７週間、１８週間、１９週間、２０週間、２２週間、２４週間、または２６週間以内に起こってもよい。
【０２５７】
食後グルコースレベルの変化は、介入の開始（例えば、本開示の組成物の摂取の開始後）の約２週間、３週間、４週間、５週間、６週間、７週間、８週間、９週間、１０週間、１１週間、１２週間、１３週間、１４週間、１５週間、１６週間、１７週間、１８週間、１９週間、２０週間、２２週間、２４週間、または２６週間後に起こってもよい。
【０２５８】
食後グルコースレベルは、食品が消費された後の設定された期間に採取された血液試料中で測定されるグルコースの量であってよい。食後グルコースを、一晩の絶食後、または睡眠からの覚醒後、食品が消費された後に測定してもよい。食後グルコースを、食品が消費された約０、１、２または３時間後に測定してもよい。
【０２５９】
一部の対象では、食後グルコースを複数回測定してもよい。平均値、中央値、モード、最高値、最低値、最近レベル、またはその組合せを考慮してもよい。
【０２６０】
食後グルコースを、少なくとも１．０、１．５、２．０、２．５、３．０、３．５、４．０、４．５、もしく５μＬの、またはそれより多い血液である一定量の血液中で測定することができる。グルコースレベルを測定するために使用される血液量は、少なくとも１μＬ、５μＬ、１０μＬ、１５μＬ、２０μＬ、３０μＬ、４０μＬ、５０μＬ、１００μＬ、２００μＬ、３００μＬ、４００μＬ、５００μＬ、６００μＬ、７００μＬ、８００μＬ、９００μＬ、１ｍＬ、２ｍＬ、３ｍＬ、４ｍＬ、５ｍＬ、６ｍＬ、７ｍＬ、８ｍＬ、９ｍＬ、もしくは１０ｍＬの、またはそれより多い血液であってもよい。
【０２６１】
一部の場合、食後グルコースを、血液試料を引き出すことなく、例えば、持続グルコースモニタリングデバイスを使用して測定することができる。
【０２６２】
一部の場合、本明細書に開示される組成物の投与は、食後グルコースレベルを、投与前レベルと比較して、またはプラセボを投与される、および／もしくは同じ組成物を投与されない対照対象と比較して、少なくとも１％、２％、３％、４％、５％、６％、７％、８％、９％、１０％、１１％、１２％、１３％、１４％、１５％、１６％、１７％、１８％、１９％、２０％、２１％、２２％、２３％、２４％、２５％、３０％、３５％、４０％、４５％、５０％、６０％、７０％、または８０％低下させることができる。一部の場合、本明細書に開示される組成物の投与は、食後グルコースレベルを、投与前レベルと比較して、またはプラセボを投与される、および／もしくは同じ組成物を投与されない対照対象と比較して、１％〜５０％、１％〜４０％、１％〜３０％、１％〜２０％、１％〜１０％、５％〜５０％、５％〜４０％、５％〜３０％、５％〜２０％、５％〜１０％、１０％〜５０％、１０％〜４０％、１０％〜３０％、２０％〜５０％、２０％〜４０％、２０％〜３０％、３０％〜５０％、３０％〜４０％、または４０％〜５０％低下させることができる。一部の場合、本明細書に開示される組成物の投与は、食後グルコースレベルを、投与前レベルと比較して、またはプラセボを投与される、および／もしくは同じ組成物を投与されない対照対象と比較して、１％〜８０％、１％〜７０％、１％〜６０％、１０％〜８０％、１０％〜７０％、１０％〜６０％、２０％〜８０％、２０％〜７０％、２０％〜６０％、３０％〜８０％、３０％〜７０％、３０％〜６０％、４０％〜８０％、４０％〜７０％、４０％〜６０％、５０％〜８０％、５０％〜７０％、５０％〜６０％、６０％〜８０％、６０％〜７０％、または７０％〜８０％低下させることができる。一部の場合、本明細書の組成物の投与は、食後グルコースレベルを、投与前レベルと比較して、またはプラセボを投与される、および／もしくは同じ組成物を投与されない対照対象と比較して、少なくとも１、５、１０、１５、２０、２５、３０、２５、４０、４５、５０、５５、６０、６５、７０、７５、８０、８５、９０、９５、もしくは１００ｍｇ／ｄＬ、またはそれより多く低下させることができる。
【０２６３】
一部の場合、食後グルコースレベルは、少なくとも３ｍｇ／ｄＬ、１０ｍｇ／ｄＬ、２０ｍｇ／ｄＬ、３０ｍｇ／ｄＬ、４０ｍｇ／ｄＬ、５０ｍｇ／ｄＬ、６０ｍｇ／ｄＬ、７０ｍｇ／ｄＬ、８０ｍｇ／ｄＬ、９０ｍｇ／ｄＬ、または１００ｍｇ／ｄＬ低下する。一部の場合、食後グルコースレベルを、３７０ｍｇ／ｄＬも低下させることができる。
【０２６４】
一部の場合、組成物を、時間経過、例えば、数日または数週間にわたって投与することができ、食後グルコースレベルは、処置の長さの間の様々な時点で食後グルコースレベルを測定することによって決定された場合、その投与の経過にわたって低下を受けてもよい。例えば、一部の場合、組成物を、少なくとも１２週間にわたって投与してもよい。一部の場合、６ヶ月後、食後グルコースを、投与前レベルと比較して、またはプラセボを投与される、および／もしくは同じ組成物を投与されない対照対象と比較して、少なくとも２％低下させることができる。一部の場合、１２週間後、食後グルコースを、投与前レベルと比較して、またはプラセボを投与される、および／もしくは同じ組成物を投与されない対照対象と比較して、少なくとも２％低下させることができる。一部の場合、１０週間後、食後グルコースを、投与前レベルと比較して、またはプラセボを投与される、および／もしくは同じ組成物を投与されない対照対象と比較して、平均で少なくとも２％低下させることができる。一部の場合、８週間後、食後グルコースを、投与前レベルと比較して、またはプラセボを投与される、および／もしくは同じ組成物を投与されない対照対象と比較して、平均で少なくとも２％低下させることができる。一部の場合、６週間後、食後グルコースを、投与前レベルと比較して、またはプラセボを投与される、および／もしくは同じ組成物を投与されない対照対象と比較して、平均で少なくとも２％低下させることができる。一部の場合、４週間後、食後グルコースを、投与前レベルと比較して、またはプラセボを投与される、および／もしくは同じ組成物を投与されない対照対象と比較して、平均で少なくとも２％低下させることができる。
【０２６５】
一部の場合、本明細書のプロバイオティック組成物の投与は、前糖尿病または２型糖尿病を有する対象の少なくとも５％、１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、９０％、９５％、または９９％において食後グルコースを低下させることができる。
【０２６６】
一部の場合、食後グルコースレベルを、糖尿病レベルから正常レベルまで低下させることができる。一部の場合、食後グルコースレベルを、糖尿病レベルから前糖尿病レベルまで低下させることができる。一部の場合、食後グルコースレベルを、前糖尿病レベルから正常レベルまで低下させることができる。一部の場合、食後グルコースレベルを、より高い糖尿病レベルからより低い糖尿病レベルまで低下させることができる。一部の場合、食後グルコースレベルを、より高い前糖尿病レベルからより低い前糖尿病レベルまで低下させることができる。
【０２６７】
一部の場合、規定の期間にわたる空腹時グルコースレベルの低下は、より短い規定の期間にわたる空腹時グルコースレベルの低下を超えなくてもよい。
【実施例】
【０２６８】
（実施例１）
転帰に対する組成物の効果
釣り合いのとれた、平行群、二重盲検、プラセボ対照試験を行った。初期段階の２型糖尿病を有する６０人の対象を採用し、３群：プラセボ群、製剤１群（ブチレート産生微生物を含有する）、および製剤２群（少なくとも１つのブチレート産生微生物と、少なくとも１つのムチン調節性微生物とを含有する）に分割した。プラセボ群の対象は、微生物を用いないプラセボ処置を受けた。製剤１群の対象は、ブチレート産生微生物を含む、３つの微生物を含むプロバイオティック組成物を受けた。製剤２群の対象は、ムチン調節性微生物と、ブチレート産生微生物とを含む、５つの微生物を含むプロバイオティック組成物を受けた。プラセボ、製剤１、および製剤２を、水、ヒドロキシプロピルメチルセルロース、ヒドロキシプロピルメチルセルロースフタレート、およびプロピレングリコールを含む、酸耐性の植物に基づくカプセル中で投与した。
【０２６９】
製剤１は、以下の微生物：Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍ、およびＢｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓを含んでいた。製剤２は、以下の微生物：Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓ、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａ、およびＥｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉを含んでいた。製剤２群の対象には、表３に示される量の微生物を投与した。
表３：製剤２の仕様
【表３】
2022502373.tif 000016
【０２７０】
対象に、１２週間の経過にわたって、１日２回、組成物を投与した。試験の開始時（０日目）および１２週間の終わりに、空腹時血中グルコース、ｈＡ１Ｃ、および食事負荷試験後のグルコース曲線下面積（ＡＵＣ）を測定した。
【０２７１】
製剤１または製剤２を投与した対象は、有意な、または許容されない有害効果を示さなかった。
【０２７２】
試験の開始時（０日目）および１２週間後に、ｈＡ１Ｃを、３群全てに由来する対象に由来する血液試料中で測定した。０日目と１２週目との間のｈＡ１Ｃの変化を、それぞれの対象について算出し、データをプラセボ群と比較した。結果を、図１に示す。製剤１群は、プラセボ群と比較して、ｈＡ１Ｃレベルの低下を示した。製剤２群は、プラセボ群と比較して、平均で０．６のｈＡ１Ｃの有意な（ｐ＝０．０５）低下を示した。製剤２群はまた、０日目から１２週目までｈＡ１Ｃの低下を示した。かくして、ブチレート産生微生物と、ムチン調節性微生物との両方を含む製剤２は、プラセボ群と比較した場合、１２週間にわたって対象のｈＡ１Ｃレベルを低下させた。
【０２７３】
試験の開始時（０日目）および１２週間の終わりに、食事負荷試験を実施し、血中グルコースを３時間にわたって連続的に測定し、グルコースの曲線下面積対時間を、３群全てに由来する対象について算出した。簡単に述べると、対象に食事を投与し、血中グルコース濃度を、食事後０、３０、６０、９０、１２０、および１８０分で３時間にわたって測定した（食事負荷試験、またはＭＴＴ）。グルコースの曲線下面積（ＡＵＣ）対時間を、それぞれの対象について算出した。０日目と１２週目との間のＡＵＣの変化を、それぞれの対象について算出し、データをプラセボ群と比較した。結果を、図２に示す。製剤１群は、プラセボ群と比較して、ＭＴＴ後のグルコースＡＵＣのわずかな低下を示した。製剤２群は、プラセボ群と比較して、平均で１５．１％の、ＭＴＴ後のグルコースＡＵＣの有意な（ｐ＝０．０５）低下を示した。製剤２群はまた、０日目から１２週目までＡＵＣの低下を示した。かくして、ブチレート産生微生物とムチン調節性微生物とを含む５つの微生物のプロバイオティック組成物は、プラセボと比較した場合、１２週間にわたって対象のＭＴＴ後のＡＵＣレベルを低下させた。
【０２７４】
１２週間後、３つ全部の群に由来する対象に由来する血液試料から、空腹時グルコースレベルを測定した。プラセボ群と、製剤１群または製剤２群との間で空腹時血中グルコースレベルの有意差は認められなかった。
（実施例２）
メトホルミンと同時投与した組成物の効果
【０２７５】
対象に、実施例１に記載のように１２週間の経過にわたってプラセボ、製剤１、または製剤２を投与した。対象に、同じ１２週間にわたってメトホルミンも投与した。試験の開始時（０日目）および１２週間の終わりに、空腹時血中グルコース、ｈＡ１Ｃ、および食事負荷試験後のグルコース曲線下面積（ＡＵＣ）を、実施例１に記載のように測定した。製剤１または製剤２を投与した対象は、有意な、または許容されない有害効果を示さなかった。
【０２７６】
製剤２とメトホルミンとを受ける対象は、プラセボとメトホルミンとを受ける対象と比較してｈＡ１Ｃの減少を示した。製剤２＋メトホルミン群もまた、０日目から１２週目までｈＡ１Ｃの低下を示した。
【０２７７】
製剤２とメトホルミンとを受ける対象は、プラセボ＋メトホルミンを受ける群と比較して、ＭＴＴ後のグルコースＡＵＣの低下を示した。製剤２＋メトホルミン群もまた、０日目から１２週目までＡＵＣの低下を示した。
【０２７８】
プラセボ群と、製剤１群または製剤２群との間で空腹時血中グルコースレベルの有意差は認められなかった。
【０２７９】
かくして、ブチレート産生微生物と、ムチン調節性微生物との両方を含む製剤２は、プラセボ＋メトホルミンを受ける対象と比較した場合、１２週間にわたってメトホルミンを受ける対象において、ｈＡ１ＣレベルおよびＭＴＴ後のＡＵＣレベルを低下させた。
（実施例３）
市販薬との比較
【０２８０】
ムチン調節性微生物と、１つまたは複数のブチレート産生微生物とを含有する製剤２は、初期段階のＩＩ型糖尿病に罹患する対象に投与した場合、安全性の問題なしに、または低血糖を誘導することなく、他の市販薬と比較して同等の治療効果を提供した。表４は、製剤２と、糖尿病の処置のために市販された薬物との比較を提供する。
表４．製剤２と、糖尿病の処置のために市販された薬物との比較
【表４】
2022502373.tif 000017
（実施例４）
スルホニルウレアと同時投与した組成物の効果
【０２８１】
初期段階の２型糖尿病を有する対象を採用し、３群：プラセボ群、製剤１群（ブチレート産生微生物を含有する）、および製剤２群（少なくとも１つのブチレート産生微生物と、少なくとも１つのムチン調節性微生物とを含有する）に分割した。プラセボ群の対象は、微生物を用いないプラセボ処置を受けた。製剤１群の対象は、ブチレート産生微生物を含む、３つの微生物を含むプロバイオティック組成物を受けた。製剤２群の対象は、ムチン調節性微生物と、ブチレート産生微生物とを含む、５つの微生物を含むプロバイオティック組成物を受けた。製剤１は、以下の微生物：Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍ、およびＢｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓを含んでいた。製剤２は、以下の微生物：Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓ、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａ、およびＥｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉを含んでいた。
【０２８２】
対象に、１２週間の経過にわたって１日２回、プラセボまたは組成物（製剤１もしくは製剤２のいずれか）を投与した。各群の対象のサブセットは、同じ１２週間にわたってスルホニルウレアの予め確立されたレジメンを継続した。試験の開始時（０日目）および１２週間の終わりに、ｈＡ１Ｃを測定した。さらに、試験の開始時および１２週間の終わりに、食事負荷試験を投与し、３時間にわたって連続的に血中グルコースを測定し、グルコースの曲線下面積対時間を算出した。
【０２８３】
製剤１または製剤２を投与した対象は、有意な、または許容されない有害効果を示さなかった。
【０２８４】
試験の開始時および１２週間後、グルコース曲線下面積を、３つ全ての群に由来する対象について決定した。簡単に述べると、対象に食事を投与し、血中グルコース濃度を、食事後０、３０、６０、９０、１２０、および１８０分で３時間にわたって測定した（食事負荷試験、またはＭＴＴ）。グルコースの曲線下面積（ＡＵＣ）対時間を、それぞれの対象について算出した。０日目と１２週目との間のＡＵＣの変化を、それぞれの対象について算出した。全ての対象を考慮した場合（スルホニルウレア投与とは関係なく）、製剤１群は、プラセボ群と比較してＭＴＴ後のグルコースＡＵＣのわずかな低下を示し、製剤２群は、プラセボ群と比較して、平均で１５．１％の、ＭＴＴ後のグルコースＡＵＣの有意な（ｐ＝０．０５）低下を示した（図３Ａ）。スルホニルウレアを受ける患者を分析から除外した場合、ＭＴＴ後のＡＵＣの変化は、図３Ｂに描写されるように、大きさにおいて−２４．４％まで増大した。これらの結果は、一部の場合、本開示の組成物および方法が、スルホニルウレアを受ける対象と比較して、スルホニルウレアを受けない対象において、グルコースＡＵＣを低下させるための増大した有効性を示し得ることを示唆する。
【０２８５】
試験の開始時および１２週間後に、ヘモグロビンＡ１Ｃ（ｈＡ１Ｃ）を、３群全てに由来する対象に由来する血液試料中で測定した。全ての対象を考慮した場合（スルホニルウレア投与とは関係なく）、製剤１群は、プラセボ群と比較して、ｈＡ１Ｃレベルの低下を示した。製剤２群は、プラセボ群と比較して、平均で０．６のｈＡ１Ｃの有意な（ｐ＝０．０５）低下を示した（図３Ｃ）。スルホニルウレアを受ける患者を分析から除外した場合、ヘモグロビンＡ１Ｃの変化は、図３Ｄに描写されるように、大きさにおいて−０．７４まで増大した。これらの結果は、一部の場合、本開示の組成物および方法が、スルホニルウレアを受ける対象と比較して、スルホニルウレアを受けない対象において、ｈＡ１Ｃを低下させるための増大した有効性を示し得ることを示唆する。
【０２８６】
かくして、一部の場合、低用量または無用量のスルホニルウレアは、投与される組成物に関する治療転帰を促進することができる。
（実施例５）
血中グルコース制御に対する組成物の効果
【０２８７】
６人の対象を、プラセボ対照、二重盲検、無作為化クロスオーバー試験に登録した。３人の対象を前糖尿病と指定し、他の３人の対象を健康と指定した。対象を、３人の対象の２群に無作為に分配した。試験中に、それぞれの群は、図４に示されるような一連の期を経験した。３日のベースライン期間の後、一方の群は２週間の処置期を開始し、他方の群は２週間のプラセボ期を開始した。プラセボ期の間に、対象は１日２回、コロイド性二酸化ケイ素プラセボを投与された。処置期の間に、対象は、１日２回、プレバイオティック、ムチン調節性微生物、および少なくとも１つのブチレート産生微生物とを含有する単離および精製された微生物の組成物を投与された。対象は、朝に３個のピルおよび夕方に３個のピルを摂取した。単離および精製された微生物の組成物は、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓ、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａ、およびＥｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉを含有していた。２週間の処置またはプラセボ期の後、両群は、プラセボまたは処置組成物を投与しない３日間の「ウォッシュアウト」期を経た。ウォッシュアウト期の後、プラセボ／処置を「クロスオーバー」させた：以前に処置期を受けた群は、プラセボ期を開始し、以前にプラセボ期を受けた群は、処置期を開始した。
【０２８８】
試験を通して、持続グルコースモニタリング（ＣＧＭ）を使用してそれぞれの対象におけるグルコースレベルを測定するために、グルコースモニターを使用した。ＣＧＭから得られたデータの例を、図５に提供する。対象は、携帯電話のアプリケーションを使用して、彼らの食品、飲料、および活動を記録した。食品、飲料、および活動を記録する対象の例を、図６に示す。
【０２８９】
それぞれの処置およびプラセボ期の開始および終了時に、対象は、ＣＧＭを使用する空腹時食事負荷試験（ＭＴＴ）を受けて間質液グルコース（血中グルコースの代用）を測定した。一晩の絶食の後、標準食を消費し、参加者に、ＭＴＴ測定値と干渉しないように、食事後さらに１時間にわたって絶食するよう求めた。図７は、ＭＴＴを記録する対象に由来するデータの例を提供する。対象は、携帯電話のアプリケーションに標準食の写真を撮影することによってＭＴＴの開始を記録した。影付きの領域は、ＭＴＴの前の一晩の絶食を表す。囲み領域は、ＭＴＴに由来するグルコースの急上昇を表す。
【０２９０】
図８は、ベースライン時（処置期の前、すなわち、単離および精製された微生物の組成物またはプラセボを受ける前）にＭＴＴを受ける６人の対象に関するグルコース濃度曲線を提供する。対象１、２および４は、前糖尿病としてのその試験前の指定と一致して、標準食を消費した後に血中グルコースの有意な急上昇を示した。対象３および５は、健康としてのその試験前の指定と一致して、血中グルコースの小さい上昇を示した。対象６は、妥当なグルコース応答を示さず、盲検解除の前にさらなる分析から除外された。
【０２９１】
図９は、処置期の開始からのグルコース濃度曲線に重ね合わせた、処置期の終了時（すなわち、単離および精製された微生物の組成物またはプラセボを受けた後）にＭＴＴを受けている残り５人の対象に関するグルコース濃度曲線を提供する。グルコース濃度曲線下面積は、処置期の後、対象１、２および４についてはより低いが、これは、単離および精製された微生物を含む組成物が前糖尿病の対象においてＡＵＣを低下させることができることを示している。
【０２９２】
グルコース濃度曲線下面積（ＡＵＣ）を、ＣＧＭデータを使用してそれぞれの対象について算出した。それぞれの対象について、プラセボ／処置期の開始時のＡＵＣを、プラセボ／処置期の終了時のＡＵＣと比較し、期の開始と終了との間のＡＵＣの変化を、以下の式を使用して算出した：
【０２９３】
ΔＡＵＣ＝ＡＵＣＥＮＤ−ＡＵＣＢＥＧＩＮＮＩＮＧ。
【０２９４】
ＡＵＣが期の開始時よりも期の終了時により低いため、負のΔＡＵＣ値は、血中グルコース濃度の制御の改善を示す。
【０２９５】
治験のクロスオーバー設計は、それぞれの対象についてのプラセボ期と処置期との間のΔＡＵＣの比較を可能にした。期の間のΔＡＵＣの差異を、以下の式を使用して算出した：
【０２９６】
ΔΔＡＵＣ＝ΔＡＵＣＴＲＥＡＴＭＥＮＴ−ΔＡＵＣＰＬＡＣＥＢＯ。
【０２９７】
負のΔΔＡＵＣ値は、処置がプラセボと比較して血中グルコース制御の改善をもたらしたことを示す。
【０２９８】
それぞれの期に関するΔＡＵＣ値およびそれぞれの対象に関するΔΔＡＵＣ値を、表５に提供する。
表５：それぞれの期に関するΔＡＵＣ値および本開示の組成物を投与されたそれぞれの対象に関するΔΔＡＵＣ値
【表５】
2022502373.tif 000018
【０２９９】
対象３および５ではなく、対象１、２、および４について、ＡＵＣは処置期の開始時と処置期の終了時との間で低下したが、これは、単離および精製された微生物を含む組成物が、前糖尿病を有する対象において血中グルコースの制御を改善することができることを示している。対象１、２、および４においては、ΔΔＡＵＣも低下したが、これは、単離および精製された微生物を含む組成物が、プラセボと比較して血中グルコースの制御を改善する優れた能力を示すことを示している。
【０３００】
図１０は、対象１〜５に関するΔΔ−ＡＵＣを示す。
（実施例６）
短鎖脂肪酸の生産
【０３０１】
図１１Ａは、対象における短鎖脂肪酸（ＳＣＦＡ）代謝を変更するための戦略を示す。結腸中の微生物は、例えば、Ｇタンパク質共役受容体（ＧＰＣＲ）シグナル伝達を変更すること、ＧＬＰ−１分泌を変更すること、インスリン感受性を増大させること、食欲を低下させること、またはその組合せによって、食物繊維を、有益な下流の効果を有し得るブチレートに変換させることができる。本開示の組成物および方法を使用して、対象中の微生物叢を変更して、ブチレート産生を促進することができる。例えば、対象中の微生物叢を、プレバイオティックをブチレート中間体（例えば、アセテートなどの、ブチレート産生のための基質として働き得る中間体）に変換することができる増大したレベルの１つまたは複数の一次発酵微生物を含む、およびブチレート中間体をブチレートに変換することができる増大したレベルの１つまたは複数の二次発酵微生物を含むように改変することができる。
【０３０２】
図１１Ｂは、本開示の微生物によって産生される短鎖脂肪酸レベルを示す。微生物Ａ〜Ｄは、ブチレート中間体（例えば、ブチレート産生微生物によるブチレート産生のための基質として働く）であってよい、アセテートを主に産生した。微生物Ｅ、Ｆ、およびＧは、主にブチレートを産生した。ブチレート中間体を産生する第１の微生物（例えば、微生物Ａ〜Ｄのいずれか）と、その中間体をブチレートに変換する第２の微生物（例えば、微生物Ｅ〜Ｇのいずれか）との組合せを、状態を処置するために利用することができる。１つの非限定例では、株Ａは、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ａｄｏｌｅｓｃｅｎｔｉｓ（ＢＡＤＯ）であってもよい。１つの非限定例では、株Ｂは、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓ（ＢＩＮＦ）であってもよい。１つの非限定例では、株Ｃは、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｌｏｎｇｕｍ（ＢＬＯＮ）であってもよい。１つの非限定例では、株Ｄは、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｉｎｄｏｌｉｓ（ＣＩＮＤ）であってもよい。１つの非限定例では、株Ｅは、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉ（ＣＢＥＩ）であってもよい。１つの非限定例では、株Ｆは、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍ（ＣＢＵＴ）であってもよい。１つの非限定例では、株Ｇは、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉ（ＥＨＡＬ）であってもよい。
（実施例７）
動物モデルにおける安全性試験
【０３０３】
２８日の安全性試験を、Ｓｐｒａｇｕｅ  Ｄａｗｌｅｙラットにおいて行った。ラットに、２８日間にわたってプラセボまたは本開示の組成物を経口投与した。凍結乾燥された微生物（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓ、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａ、およびＥｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉを含む）のバイアルを、嫌気的条件下でパッケージングされた希釈剤中で再構成させた。液体を注射筒に引き出し、適切な量をそれぞれの動物に経口投与した。それぞれのスケジュールされた時点で臨床観察を規定通りに実施した。組成物またはプラセボのそれぞれの投与の前に、体重を記録した。動物を、２８日目または３５日目（７日間のウォッシュアウト期間の後）に犠牲にし、剖検を行った。全ての動物から、血液（できるだけ多く）を収集した。血液のアリコートを適切に処理し、臨床化学および鑑別を伴う完全血球算定（ＣＢＣ）について分析した。動物の臨床観察、血漿化学、血液学パネル、および剖検評価に由来するデータにより、齧歯類に対する、投与された組成物に由来する有害効果はないことが確認された。プラセボを受けるラットと、組成物を受けるラットとの間で、健康指標の差異は観察されなかった。
（実施例８）
動物モデルにおける有効性試験
【０３０４】
前臨床試験を、食餌誘導性肥満マウスモデルにおいて行った。４５匹の５週齢のＣ５７ＢＬ／６マウスに、３２週間にわたって６０％の高脂肪食（Ｒｅｓｅａｒｃｈ  Ｄｉｅｔ、＃Ｄｌ２４９２）を自由に接近させて与え、肥満を誘導した。食餌させて３２週間後、マウスに、経口強制摂取により、１日１回、本開示の組成物を投与した（「処置」）。組成物は、ムチン調節性微生物と、ブチレート産生微生物とを含んでいた。組成物は、一次発酵菌と、二次発酵菌とを含んでいた。１つの非限定例では、組成物は、プレバイオティック（例えば、イヌリン）と、株Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｌｏｎｇｕｍ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ａｄｏｌｅｓｃｅｎｔｉｓ、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉ、およびＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｉｎｄｏｌｉｓの単離および精製された微生物とを含んでいた。図１２は、処置を開始した１４日後に実施した経口ブドウ糖負荷試験（ＯＧＴＴ）に由来する例示的なデータセットを描写する。組成物を投与されたマウスは、ＯＧＴＴ中に対照マウスよりも有意に低い血中グルコースレベルを示した。
（実施例９）
ｑＰＣＲによるヒト糞便中での微生物の検出
【０３０５】
本開示の微生物を含むピルを、医薬品適正製造基準（ｃＧＭＰ）の規則を順守して製造した。凍結乾燥された微生物の実質的に乾燥した集団を含むコーティングされたカプセルを使用した。腸への送達を可能にするために胃酸の中での生存時間を最大化するようにカプセルを設計した。対象への投薬および消費の時点を除いて、カプセルを冷蔵保存した。
【０３０６】
ヒト対象に、表６に記載の用量で低用量または高用量の微生物を含むピルを経口投与した。対象は、１４日間にわたって朝食および夕食の開始前の３０分以内にカプセルを消費した。低用量を、０〜６日目に投与し、７〜１４日目については用量を５倍に増加させた。次いで、対象は、試験食品が投与されない１４日間のウォッシュアウト期間に入った。
表６：投与量
【表６】
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【０３０７】
対象から、彼らがピルの摂取を開始する前に、彼らがピルを摂取している間（７日目−低用量；および１４日目−高用量）、および彼らがピルの摂取を中止する１４日間のウォッシュアウト期間の後に、糞便試料を収集した。
【０３０８】
試料を核酸抽出および定量的リアルタイムＰＣＲ（ｑＰＣＲ）にかけて、本開示の微生物を検出した。糞便試料中の微生物の存在量は、対象がピルの摂取を開始した後に増加した（図１３）。より高用量のピルを摂取する対象においては、より高レベルの微生物が検出された。ウォッシュアウト期間の後、糞便試料中で検出される微生物のレベルは、多くの対象については減少したが、１人の対象においては持続し、これは、その対象における微生物の生着の可能性を示している。
（実施例１０）
血糖および２型糖尿病を管理するための組成物の例
【０３０９】
本開示の組成物を使用して、血糖および２型糖尿病を管理する。
【０３１０】
組成物は、２型糖尿病の食事管理のためのものである。
【０３１１】
組成物は、医学的プロバイオティクスの組成物である。
【０３１２】
組成物は、健康なＡ１Ｃおよび血中グルコースレベルを管理する。
【０３１３】
組成物は、カプセル形態で（例えば、６０個のカプセルのパッケージとして）提供される。
【０３１４】
組成物は、ビーガンである。組成物は、遺伝子改変されていない（非ＧＭＯ）。
【０３１５】
組成物は、傷みやすく、冷蔵で保持しなければならない。
【０３１６】
組成物は、開封の２ヶ月以内に使用される場合に最良である。
【０３１７】
組成物は、医学的監視の下でのみ使用される。
【０３１８】
組成物は、朝に１個のピルおよび夕方に１個のピルのように、食品と共に毎日摂取される。
【０３１９】
プロバイオティクスおよびプレバイオティクスの組成物の正確な株は、繊維を代謝し、血糖を調節する身体の自然の能力を回復させる。
【０３２０】
組成物は、米国の複数の場所にわたる無作為化、二重盲検、プラセボ対照臨床試験において、２型糖尿病を有する人々におけるＨｂＡ１Ｃおよび血糖急上昇の統計的に有意な低下をもたらす。
【０３２１】
組成物は、成分として：プロバイオティックブレンド（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｅｉｊｅｒｉｎｃｋｉｉ  ＷＢ−ＳＴＲ−０００５、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍ  ＷＢ−ＳＴＲ−０００６、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓ  １００、Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａ  ＷＢ−ＳＴＲ−０００１、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉ  ＷＢ−ＳＴＲ−０００８）、チコリイヌリンおよびオリゴフルクトース、フルーツおよび野菜ジュース（着色）、ステアリン酸マグネシウム、カプセル（水、ヒドロキシプロピルメチルセルロースフタレート、ヒドロキシプロピルメチルセルロース）を含む。
【０３２２】
本発明の好ましい実施形態を本明細書に示し、説明してきたが、そのような実施形態は、ほんの一例として提供されることが当業者には明らかであろう。本発明は、本明細書内で提供される特定の例によって限定されないことが意図される。本発明を、上記明細書を参照して説明してきたが、本明細書における実施形態の説明および実証は、限定的な意味で解釈されることを意味しない。当業者であればここで、本発明から逸脱することなく、いくつかの変形形態、変化および置換を想到するであろう。さらに、本発明の全ての態様は、様々な状態および変数に依存する、本明細書に記載される特定の描写、構成または相対的な割合に限定されないことが理解されるべきである。本明細書に記載の本発明の実施形態に対する様々な代替手段を、本発明の実施において使用することができることが理解されるべきである。したがって、本発明は、任意のそのような代替手段、改変、変形形態または等価物も包含することが企図される。以下の特許請求の範囲は、本発明の範囲を定義し、これらの特許請求の範囲にある方法および構造ならびにそれらの等価物がそれによって包含されることが意図される。
【図１】
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【図２】
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【図３】
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【図４】
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【図５】
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【図６】
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【図７】
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【図８】
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【図９】
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【図１０】
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【図１１Ａ】
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【図１１Ｂ】
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【図１２】
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【図１３】
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【図１４】
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【配列表】
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【国際調査報告】
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