【事件の表示】
　特願２００６−５３６８８３「ウイルス感染に対する抵抗性に関連する遺伝子である、ＯＡＳ１における変異の検出」拒絶査定不服審判事件〔平成１７年　５月　６日国際公開、ＷＯ２００５／０４０４２８、平成１９年１０月２５日国内公表、特表２００７−５２９１９９〕について、次のとおり審決する。
【結　論】
　本件審判の請求は、成り立たない。
【理　由】
第１　手続の経緯・本願発明
　本願は、平成１６年１０月２２日（パリ条約による優先権主張２００３年１０月２３日　米国、２００４年２月６日　米国、２００４年３月１９日　米国、２００４年４月８日　米国、２００４年６月９日　米国、２００４年６月２８日　米国、２００４年８月２６日　米国）を国際出願日とする出願であって、平成２５年５月７日に拒絶査定不服審判請求がなされ、平成２６年１１月１４日付けで当審拒絶理由通知がなされ、平成２７年３月１７日に意見書および手続補正書が提出されたものである。本願の請求項１〜１３に係る発明は、平成２７年３月１７日付け手続補正書により補正された特許請求の範囲の請求項１〜１３に記載された事項により特定されるとおりのものであり、そのうち本願の請求項１に係る発明（以下、「本願発明」という。）は、請求項１に記載される以下のとおりのものである。
　
　「配列番号４８のアミノ酸配列からなる単離されたポリペプチド。」
　
第２　当審拒絶理由の概要 
　当審の拒絶理由通知において、本願の優先権について、以下のとおり述べた。
　「本願の優先権主張の基礎となる７件の米国特許出願のうち、米国特許出願６０／５７８３２３号より前の出願の当初明細書等には、「配列番号４８のアミノ酸配列」について全く記載されていない。また、「配列番号４８のアミノ酸配列」のポリペプチドがオリゴアデニレートシンターゼ１活性を有すること（図８）が示されたのは、国際出願の明細書等である。 
　したがって、これらの事項が特定された請求項１〜１４に係る発明の新規性・進歩性の判断基準日は、「配列番号４８のアミノ酸配列」については、米国特許出願６０／５７８３２３号の出願日である２００４年６月９日、「配列番号４８のアミノ酸配列」のポリペプチドがオリゴアデニレートシンターゼ１活性を有することについては、本願の現実の出願日である２００４年１０月２２日となる。」
　 
　そして、当審の通知した拒絶理由の１つは、本願発明は、引用例１〜５，７に記載された発明に基づいて当業者が容易に発明をすることができたものである、というものである。 
　
（引用例）
１．CMLS, Cell. Mol. Life Sci.，２０００年，Vol.57，p.1593-1612  
２．Molecular Cell, ２００３年，Vol.19, p.1173-1185 
３．国際公開２００４／０００９９８号 
４．国際公開第０２／０９０５５２号  
５．THE JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY ,１９９１年，
　　 Vol.266,No.23, p.15293-15299 
７．国際公開０３／０９２６１８号 
 　 
第３　優先権、および引用文献の記載事項 
　上記のとおり、本願発明の新規性・進歩性の判断基準日は、「配列番号４８のアミノ酸配列」については、２００４年６月９日、「配列番号４８のアミノ酸配列」のポリペプチドがオリゴアデニレートシンターゼ１活性を有することについては、２００４年１０月２２日となる。そして該基準日前に頒布された刊行物である引用文献１〜５，７には、それぞれ以下の事項が記載されている。なお、下線は当審が付した。
　
１．引用例１（CMLS, Cell. Mol. Life Sci.，２０００年，Vol.57，p.1593-1612 ）
（１−１）「
　図４．ヒトＯＡＳ１、ＯＡＳ２、ＯＡＳ３およびＯＡＳＬ遺伝子のエクソンA-Eの７つのグループによってコードされるアミノ酸配列のアライメント。アミノ酸配列はすべて、ＯＡＳ遺伝子のPACクローンRP1-71H24のDNA配列の翻訳により誘導される。ＯＡＳ３の長いエクソンA2のN末端の58アミノ酸は、Aグループのエクソンの下に示される。配列の上の数は、表２ので突然変異に関する。黒塗りのボックスは、一致する残基の位置を示し、灰色のボックスは、類似する残基の位置を示す。」（第１５９８頁）
　
（１−２）「
　図１０．ヒトＯＡＳ１とヒト以外のＯＡＳ１のアミノ酸配列のアライメント。ブタ（Sus）、鶏（Gallus）と海洋性海綿動物（Geodia）のタンパク質のアミノ酸配列がヒトＯＡＳ１遺伝子のエキソンA-Eにしたがって配列された。黒塗りのボックスは、一致する残基の位置を示し、灰色のボックスは、類似する残基の位置を示す。」（第１６０８頁）
　
（１−３）
「免疫ブロット法により、ヒトの細胞にはインターフェロン誘導ＯＡＳとして３種のもの、小さい型（p42/p46 ＯＡＳ）、中くらいの型（p69/p71 ＯＡＳ）、そして大きい型（p100 ＯＡＳ）、が認識される（図２、表１）［11,12］。」（第１５９３頁右欄３〜６行）
　
（１−４）
「
　表１．ＯＡＳタンパク質ファミリーの名称」（第１５９６頁）
　表１のＯＡＳ１の行には、小さい型として、p42（別名としてp40、E16）、p46（別名としてE18）などの名称が記載されている。
　
（１−５）
「
　・・・・
　図３．ヒトＯＡＳ１およびＯＡＳ２の２つの遺伝子のエクソン/イントロン構造。エクソンは色のついたバーで標識され、そして、末端エキソンの非翻訳領域は陰影線で標識される。ＯＡＳ１遺伝子において、エクソン6の翻訳領域はp42スプライスバリアントのそれに一致し、エクソン7のそれはp46に、そしてエキソン8の翻訳領域はESTクローンのそれと一致する。・・・・」（第１５９７頁）
　
（１−６）
「
　図５．ヒトＯＡＳファミリーのメンバーのＣ末端エキソンの翻訳アミノ酸配列」
　図５のＯＡＳ１の項には、p40、p46などが記載されている。
　
２．引用例２（Molecular Cell, ２００３年，Vol.19, p.1173-1185 ）
（２−１）「
　図２．構造に導かれる配列アライメント 
ブタＯＡＳ１、ヒトＯＡＳ１、ヒトＯＡＳ２とＯＡＳ３のC-末端の触媒的繰り返しは、ウシと酵母のPAPの対応する部分に合わせる。βストランド（矢印）とαヘリックス（長方形）は、ブタＯＡＳ１に示される。重要な残基は、以下のとおりに標識される：＊，触媒的なアスパラギン酸；赤い四角，活性部位における突然変異のターゲットとされた残基；青の逆三角形，RNA活性化部位における突然変異のターゲットとされた残基；黒い三角形，制御突然変異R245E/K246E．」（第１１７７頁）
　
３．引用例３（国際公開２００４／０００９９８号；2003年12月31日発行）
（３−１）「
ＯＡＳ１のＮ末端の３４６のアミノ酸は１つの機能単位を意味し
　
４．引用例４（国際公開第０２／０９０５５２号 ）
（４−１）「ヒトの細胞には2'-5'-オリゴアデニレート合成酵素の様々な型が存在し、小さい型、中くらいの型、そして大きい型のタンパク質と呼ばれ、スプライシングの結果、異なる変異体に存在する順番で、前の２つのタンパク質となることが可能である（Reboulliat and Hovanessian,1999,Journal of Interferon and Cytokine Reseach,19;295-600）。
小さいタンパク質、すなわちp40（SEQ ID No.3）とp46は、一つの触媒単位を含み、ＯＡＳ１と称される
　
（４−２）配列番号３として、３６４アミノ酸残基の配列が記載されている。（ただし、配列は摘記せず。）
　
５．引用例５（THE JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY ,１９９１年，Vol.266,No.23, p.15293-15299 ）
（５−１）「２’-５’-オリゴアデニレート合成酵素は、二重鎖RNAを必須のコファクターとして必要とする、インターフェロン−誘導性の酵素のマルチメンバーファミリーを構成する。我々は２つの新しいネズミの合成酵素のcDNA クローンを分離した。
これらの２つのクローン、９-２と３-９は、４１４と３６３のアミノ酸残基のタンパク質をコードし、アミノ末端の３４６の残余がほとんど同一であった。それらはまた、ヒトの合成酵素のＥ１６とＥ１８の対応する領域に非常に類似していた。
　
（５−２）「
　図５．９−２の変異体タンパク質のdsRNAへの結合。Ａ，カルボキシル末端を削除したセットが示される。大部分は、示されたサイト（カッコ内の数はヌクレオチド数を示す。）におけるcDNA クローンの制限消化によって生産された。“実験手順”の下で解説されるように、特にそれらの合成のために造られたcDNAクローンから、N-320、N-304とN-344（Lys-333 + Arg-333）が作り出された。・・・」（第１５２９７頁左欄）
　
（５−３）
「
　図６．変異体9-2タンパク質の酵素活性。A-Dは、４つの異なる実験の結果である。A、N-344、N-278およびコントロールサンプルの酵素活性、B、クローンN-344、N-320およびN-304のインビトロの翻訳物の電気泳動的分析。C、N-344、N-320およびN-304の等しい量のインビトロ翻訳物の酵素活性分析。D、N-344とN-344（Lys-333 + Arg-333）タンパク質の酵素活性。」（第１５２９７頁右欄）
　
６．引用例７（国際公開０３／０９２６１８号）
（６−１）「活性化がdsRNAに依存する、2-5 ASのp40およびp46の変異体は、第5と追加的な第6のエクソンの間の差別的なスプライシングによって同じ遺伝子から誘導され、Ｃ末端端部を除いて、最初の３４６残基が同じである。」（第３８頁７〜１０行）
　
第４　当審の判断
１．引用発明 
　引用例１の（１−３）〜（１−６）の記載より、ヒトＯＡＳには大、中、小の型のＯＡＳがあり、そのうち小さい型のＯＡＳがＯＡＳ１であること、ヒトＯＡＳ１には、エキソンA-E部分の配列は共通するものの、Ｃ末端部分の長さや配列が異なる変異体が存在することが理解される。
　そして、引用例１には、ヒトＯＡＳ１の変異体であるp42、p46が記載され、図４（１−１）のＯＡＳ１の行には、エキソンA-E部分の共通配列に相当する配列が記載されていると認められ、変異体p42、p46の全長ポリペプチドは、図４に示されるエキソンA-Eに基づく３４６アミノ酸残基の配列を有し、さらにＣ末端側に、図５（１−６）のp40（別名p42）、p46の行に示されるさらなる配列が存在するものであると認められる。なお、引用例７には、OSA1の２つの変異体p40（別名p42）とp46は、最初の３４６アミノ酸残基が同じであることが記載されており（６−１）、上記認定に沿うものである。
。
　
　以上から、引用例１には、「図４に示されるＯＡＳ１のエキソンA-Eに基づく３４６アミノ酸残基の配列を含むポリペプチド。」の発明（以下「引用発明」という。）が記載されていると認められる。 
 　 
 ２．対比 
 　本願発明と引用発明を対比する。本願発明の「配列番号４８のアミノ酸配列」と引用発明の「図４に示されるＯＡＳ１のエキソンA-Eに基づく３４６アミノ酸残基の配列」とは同じ配列である。
　したがって、両者は、「配列番号４８のアミノ酸配列」を有するポリペプチドである点で一致し、本願発明では、「配列番号４８のアミノ酸配列からなる、単離された」ものと特定されているのに対して、引用発明は、「配列番号４８のアミノ酸配列」を含むが、さらなる配列も含む点で相違する。 
 　 
 ３．相違点についての判断 
　上記１．で述べたとおり、図４に示されるＯＡＳ１のエキソンA-Eに基づく３４６アミノ酸残基の配列は、ＯＡＳ１の変異体の間で共通する配列であるから、その活性に大きく関係する部分であると考えられるところ、引用例１の図４（１−１）のアライメントの記載から、この領域は、ヒトＯＡＳの他のファミリーとの間でも配列がよく保存されていることが理解される。また、引用例１の図１０（１−２）のヒトＯＡＳ１の配列も本願発明の配列番号４８と一致するものであるが、図１０の記載から、この領域は、ヒト以外の動物のＯＡＳ１との間でも配列がよく保存されていることが理解される。
　さらに、引用例２の（２−１）のヒトＯＡＳ１の配列も、本願発明の配列番号４８と一致するものであり、アライメント中の標識された部分が触媒活性に重要な残基であることが記載されている。
　引用例３には、ＯＡＳ１のＮ末端の３４６アミノ酸残基が一つの機能的ユニットであることが記載されている（３−１）。
　引用例４には、p40が一つの触媒単位を含むヒトＯＡＳ１タンパク質として記載されており（４−１）、（４−２）、引用例４に示される配列番号３の配列（摘記せず）から、p40はＯＡＳ１のエキソンA-Eに基づく３４６アミノ酸残基に加え、さらに１８アミノ酸残基を有する変異体であることが理解される。つまり、引用例４には、ＯＡＳ１のエキソンA-E領域のポリペプチドよりわずか１８アミノ酸残基長いp40が、ＯＡＳとしての活性を有する変異体として記載されていると認められる。なお、引用例１にも、p40（別名p42）はＯＡＳ１として記載されており、引用例１の図５（１−６）の記載から、ＯＡＳ１のエキソンA-Eに基づく３４６アミノ酸残基に続けて、さらにエキソン6に基づく１８アミノ酸残基を有する変異体であることが分かる。
　引用例５には、ネズミＯＡＳの全長４１４のクローン９-２と、全長３６３のクローン３-９とは、３４６アミノ酸残基が共通すること、クローン９-２のカルボキシル末端を削除して３４４アミノ酸残基に短縮したＮ−３４４、すなわち、ＯＡＳの共通する３４６の配列よりもさらに短いポリペプチドが、ＯＡＳ活性を示したことが記載されている（５−１）〜（５−３）。そして、引用例５には、２つのクローン９-２と３-９は、「ヒトの合成酵素のＥ１６とＥ１８の対応する領域に非常に類似していた。」こと、すなわち、ネズミの２つのＯＡＳクローンは、ヒトＯＡＳのp42、p46と類似することが記載されており（（１−４）から、E16、E18の別名は、p42、p46である。）、さらに（１−２）の記載から、ＯＡＳの配列は、異なる動物種間でよく保存されていることも理解されるから、引用例５の短縮ポリペプチドに活性があったことは、ヒトＯＡＳ１のp42、p46を短縮した場合においても同様であることが予測される。
　したがって、引用例１〜５、７の記載に接した当業者であれば、引用発明における「図４に示されるＯＡＳ１のエキソンA-Eに基づく３４６アミノ酸残基の配列」は、ＯＡＳ活性に関与する部分であることを理解し、この部分のみに短縮したポリペプチドもＯＡＳ活性を有することを予測するといえる。
　そして、活性を有するポリペプチドを単離しようとすることは、当業者の自明の課題であるから、引用例１〜５、７に記載された発明に基づいて、引用発明のポリペプチドを「図４に示されるＯＡＳ１のエキソンA-Eに基づく３４６アミノ酸残基の配列」の部分、すなわち配列番号４８に相当する部分のみに短縮し、これを単離することは、当業者が容易になし得ることである。そして、本願発明において、単離されたポリペプチドにＯＡＳ活性があったことは、引用例１〜５、７の記載から、当業者が予測し得ることである。 
　
４．請求人の主張について
　請求人は、平成２７年３月１７日付け意見書において、「配列番号４８のポリペプチドを発現する個体群は、Ｃ型肝炎ウイルスの感染に対して抵抗性を有するという特徴を有するポリペプチドである」、「全長ＯＡＳ１が有さないＨＣＶ感染に対する抵抗性を、短縮型の配列番号４８のポリペプチドが有するという点で、当業者にとっても、極めて予想することができないどころか、驚くべきことであると言えます。」などと、ＨＣＶ感染に対する抵抗性を本願発明の顕著な効果として主張し、その根拠として本願明細書の段落【００６６】、【００６９】、【００９４】、【０１９９】の記載を挙げている。
　そこで、本願明細書の記載をみると、請求人が挙げた段落【００６６】、【００６９】、【００９４】、【０１９９】を始め、本願明細書のいずれにも、配列番号４８のポリペプチドとＨＣＶ感染に対する抵抗性との関係などについて記載されていない。
　なお、本願明細書の段落【００９５】には、
「ゲノムの変異は、オリゴアデニレートシンセターゼ遺伝子（ＯＡＳ１）において、単独かまたは組み合わせで同定され、ＨＣＶ感染に対する抵抗性に有意（ｐ＜０．０５）に関連した。これらの変異を構成する塩基置換および塩基欠失は、図１に示される。ＯＡＳ１遺伝子の改変体形態（「ＯＡＳ１Ｒ」）は、１つ以上の本発明の変異の存在によって形成される（
配列番号１〜配列番号７および配列番号５７〜配列番号６４として同定される
　したがって、請求人の主張する本願発明の効果は、本願明細書に記載されておらず、参酌することができない。
　
　また、請求人が参考資料として提出した宣誓書の項目８．には、「ＨＣＶに耐性のある個人は、変異ｐ４２型をコードする、１又は２コピーのＯＡＳ１遺伝子を有することを確認した。」と記載され、請求人はこのことに基づいて、配列番号４８はＨＣＶ抵抗性を示す機能を有することを主張していると認められるが、本願明細書には、変異ｐ４２型がＨＣＶ耐性の個人から同定されたことなどについて記載されていない。
　したがって、請求人の宣誓書に基づく主張も、本願明細書に記載された事項に基づかず、参酌することができない。
　　
５．まとめ
　よって、本願発明は、引用例１〜５、７に記載された発明に基づいて当業者が容易に発明をすることができたものであるから、特許法第２９条第２項の規定により特許を受けることができない。 
 　 
 第５　結論 
 　以上のとおり、本願の請求項１に係る発明は、特許法第２９条第２項の規定により特許を受けることができないので、他の請求項に係る発明について論及するまでもなく、本願は拒絶すべきものである。 
 　よって、結論のとおり審決する。