(57)【要約】【課題】  酵母サッカロマイセス・セレビジエのゲノムDNA中に存在するマイクロサテライト多型を特定してゲノムワイドなDNAマーカーを提供する。また、このDNAマーカーを検出するためのPCRプライマーセットを提供する。【解決手段】  本発明者らは、清酒酵母協会7号ゲノムのショットガンシーケンスを実施し、インターネットで公開されている実験室酵母S288Cのゲノム配列と比較することにより、繰り返し数が異なるマイクロサテライト多型が存在する場所をゲノムワイドに特定するに至った。さらに、これらの多型を示す遺伝子座を特異的に検出できるプライマーオリゴヌクレオチドを設計し、PCR増幅産物のフラグメント長の違いにより識別可能なゲノムワイドなDNAマーカーを開発した。【選択図】図1
2007082431.tif 000002
【特許請求の範囲】
【請求項１】
以下の(1)〜(168)のいずれかのポリヌクレオチド、又はこのポリヌクレオチドにおいて1又は数個のヌクレオチドが挿入、欠失、又は置換されたポリヌクレオチド。
(1)  配列番号1で示されるDNA配列において、塩基番号31118〜31123のATATAC配列を欠き、塩基番号31117及び塩基番号31124の2塩基を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(2)  配列番号1で示されるDNA配列において、塩基番号31124〜31147のAT繰り返しの24塩基がAT繰り返しの20塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(3)  配列番号1で示されるDNA配列において、塩基番号77496〜77510のGAA繰り返しの15塩基がGAA繰り返しの30塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(4)  配列番号1で示されるDNA配列において、塩基番号77514〜77540のGAA繰り返しの27塩基がGAA繰り返しの6塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(5)  配列番号1で示されるDNA配列において、塩基番号110697〜110716のAG繰り返しの20塩基がAGAGAGAGAGAGAGAGA配列に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(6)  配列番号1で示されるDNA配列において、塩基番号110717〜110724のA繰り返しの8塩基がA繰り返しの6塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(7)  配列番号1で示されるDNA配列において、塩基番号152108〜152126のT繰り返しの19塩基がT繰り返しの21塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(8)  配列番号1で示されるDNA配列において、塩基番号192268〜192271のGC繰り返しの4塩基がGCの2塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(9)  配列番号1で示されるDNA配列において、塩基番号192278と塩基番号192279との間にCTACTACTA配列が挿入された11塩基の配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(10)  配列番号1で示されるDNA配列において、塩基番号192279〜192281のTTAがTTA繰り返しの18塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(11)  配列番号1で示されるDNA配列において、塩基番号192286〜192315のTAC繰り返しの30塩基がTAC繰り返しの9塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(12)  配列番号2で示されるDNA配列において、塩基番号45954〜45968のT繰り返しの15塩基がT繰り返しの13塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(13)  配列番号2で示されるDNA配列において、塩基番号138278〜138292のT繰り返しの15塩基がT繰り返しの17塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(14)  配列番号2で示されるDNA配列において、塩基番号251595〜251610のT繰り返しの16塩基がT繰り返しの17塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(15)  配列番号2で示されるDNA配列において、塩基番号299556と塩基番号299557との間にGGAAGAGAGCGA配列が挿入された14塩基の配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(16)  配列番号2で示されるDNA配列において、塩基番号452269〜452278のA繰り返しの10塩基がA繰り返しの11塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(17)  配列番号2で示されるDNA配列において、塩基番号452393と塩基番号452394との間にAGAA配列が挿入された6塩基の配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(18)  配列番号2で示されるDNA配列において、塩基番号499605〜499626のGGCAGTCAATGTAAATTTGTGA配列を欠き、塩基番号499604及び塩基番号499627の2塩基を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(19)  配列番号2で示されるDNA配列において、塩基番号628893〜628908のTA繰り返しの16塩基がTA繰り返しの18塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(20)  配列番号2で示されるDNA配列において、塩基番号723659〜723673のA繰り返しの15塩基がA繰り返しの11塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(21)  配列番号3で示されるDNA配列において、塩基番号62744〜62749のCA繰り返しの6塩基がCA繰り返しの4塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(22)  配列番号3で示されるDNA配列において、塩基番号62750〜62769のTA繰り返しの20塩基がTA繰り返しの28塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(23)  配列番号3で示されるDNA配列において、塩基番号164228〜164245のTGC繰り返しの18塩基がTGC繰り返しの15塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(24)  配列番号3で示されるDNA配列において、塩基番号210468〜210482のTTC繰り返しの15塩基がTTC繰り返しの12塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(25)  配列番号3で示されるDNA配列において、塩基番号260022〜260041のTA繰り返しの20塩基がTA繰り返しの22塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(26)  配列番号4で示されるDNA配列において、塩基番号92684〜92709のA繰り返しの26塩基がA繰り返しの23塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(27)  配列番号4で示されるDNA配列において、塩基番号169824〜169833のAT繰り返しの10塩基がAT繰り返しの14塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(28)  配列番号4で示されるDNA配列において、塩基番号169835〜169854のTA繰り返しの20塩基がTA繰り返しの28塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(29)  配列番号4で示されるDNA配列において、塩基番号169893〜169910のA繰り返しの18塩基がA繰り返しの20塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(30)  配列番号4で示されるDNA配列において、塩基番号329788〜329797のTA繰り返しの10塩基がTA繰り返しの30塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(31)  配列番号4で示されるDNA配列において、塩基番号390422〜390436のTAT繰り返しの15塩基がTAT繰り返しの39塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(32)  配列番号4で示されるDNA配列において、塩基番号390457〜390465のTTA繰り返しの9塩基がTTA繰り返しの15塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(33)  配列番号4で示されるDNA配列において、塩基番号390449と塩基番号390450との間にATAGTTTGTT配列が挿入された12塩基を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(34)  配列番号4で示されるDNA配列において、塩基番号538730〜538759のTA繰り返しの30塩基がTA繰り返しの16塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(35)  配列番号4で示されるDNA配列において、塩基番号584615〜584626のCGA繰り返しの12塩基がCGA繰り返しの24塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(36)  配列番号4で示されるDNA配列において、塩基番号694836〜694853のCAG繰り返しの18塩基がCAG繰り返しの21塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(37)  配列番号4で示されるDNA配列において、塩基番号838091と塩基番号838092との間にAAGAAC配列が挿入された8塩基を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(38)  配列番号4で示されるDNA配列において、塩基番号927583〜927619の配列がCGCTACTGGTGCTGGT配列に置換されたこの16塩基を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(39)  配列番号4で示されるDNA配列において、塩基番号1059941と塩基番号1059942との間にGAGAGGAAGAAGAAGAGGAAG配列が挿入された23塩基を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(40)  配列番号4で示されるDNA配列において、塩基番号1059942〜1059956のGAAGAAAAAGAGGAA配列がこの配列の繰り返しの30塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(41)  配列番号4で示されるDNA配列において、塩基番号1279155〜1279168のAC繰り返しの14塩基がAC繰り返しの12塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(42)  配列番号4で示されるDNA配列において、塩基番号1418460〜1418481のAT繰り返しの22塩基がAT繰り返しの18塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(43)  配列番号5で示されるDNA配列において、塩基番号81213〜81236のTTA繰り返しの24塩基がTTA繰り返しの30塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(44)  配列番号5で示されるDNA配列において、塩基番号172598〜172615のAT繰り返しの18塩基がAT繰り返しの22塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(45)  配列番号5で示されるDNA配列において、塩基番号225783〜225804のAT繰り返しの22塩基がAT繰り返しの26塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(46)  配列番号5で示されるDNA配列において、塩基番号311721〜311725のTGGTT配列を欠き、塩基番号311720及び塩基番号311726の2塩基を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(47)  配列番号5で示されるDNA配列において、塩基番号430556〜430570のA繰り返しの15塩基がA繰り返しの16塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(48)  配列番号5で示されるDNA配列において、塩基番号490207〜490242のTGTTCA繰り返しの36塩基がTGTTCA繰り返しの30塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(49)  配列番号5で示されるDNA配列において、塩基番号490243〜490266のTATTCA繰り返しの24塩基がTATTCA繰り返しの18塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(50)  配列番号5で示されるDNA配列において、塩基番号545369〜545379のA繰り返しの11塩基がA繰り返しの10塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(51)  配列番号6で示されるDNA配列において、塩基番号73358〜73384のATT繰り返しの27塩基がATT繰り返しの39塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(52)  配列番号6で示されるDNA配列において、塩基番号107804〜107811のTGTA繰り返しの8塩基がTGTA繰り返しの20塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(53)  配列番号6で示されるDNA配列において、塩基番号107812〜107831のTG繰り返しの20塩基がTG繰り返しの18塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(54)  配列番号6で示されるDNA配列において、塩基番号182876と塩基番号182877との間にCGTGTGTGCGTG配列が挿入された14塩基を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(55)  配列番号6で示されるDNA配列において、塩基番号227466〜227486のT繰り返しの21塩基がT繰り返しの20塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(56)  配列番号7で示されるDNA配列において、塩基番号23643〜23657のACG繰り返しの15塩基がACG繰り返しの42塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(57)  配列番号７で示されるDNA配列において、塩基番号158990と塩基番号158991との間にAGCACAAGCTCAGGCTCAAGCACAAGCTCAGGCTCAAGCACA配列が挿入された42塩基を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(58)  配列番号7で示されるDNA配列において、塩基番号245647〜245685のCAA繰り返しの39塩基がCAA繰り返しの15塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(59)  配列番号7で示されるDNA配列において、塩基番号397841〜397860のA繰り返しの20塩基がA繰り返しの17塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(60)  配列番号7で示されるDNA配列において、塩基番号555986〜556016のA繰り返しの31塩基がA繰り返しの26塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(61)  配列番号7で示されるDNA配列において、塩基番号の640803〜640818のCATT繰り返しの16塩基がCATT繰り返しの12塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(62)  配列番号7で示されるDNA配列において、塩基番号808392〜808417のTA繰り返しの26塩基がTA繰り返しの32塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(63)  配列番号7で示されるDNA配列において、塩基番号910118〜910141のT繰り返しの24塩基がT繰り返しの18塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(64)  配列番号7で示されるDNA配列において、塩基番号988901〜988921のAGC繰り返しの21塩基がAGC繰り返しの18塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(65)  配列番号8で示されるDNA配列において、塩基番号49390と塩基番号49391との間にACCACTACAAGCACCACATCGTCGACTTCT配列が挿入された30塩基を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(66)  配列番号8で示されるDNA配列において、塩基番号169193と塩基番号169194との間にTTG配列が挿入された5塩基を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(67)  配列番号8で示されるDNA配列において、塩基番号169196と塩基番号169197との間にTTG配列が挿入された5塩基を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(68)  配列番号8で示されるDNA配列において、塩基番号169203〜169211のCTG繰り返しの9塩基がCTG繰り返しの21塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(69)  配列番号8で示されるDNA配列において、塩基番号464933〜464946のTA繰り返しの14塩基がTA繰り返しの20塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(70)  配列番号9で示されるDNA配列において、塩基番号56789〜56812のAGC繰り返しの24塩基がAGC繰り返しの27塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(71)  配列番号9で示されるDNA配列において、塩基番号128505〜128525のTCC繰り返しの9塩基がTCC繰り返しの15塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(72)  配列番号9で示されるDNA配列において、塩基番号177461〜177464のCA繰り返しの4塩基がCAの2塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(73)  配列番号9で示されるDNA配列において、塩基番号177465〜177482のTA繰り返しの18塩基がTA繰り返しの12塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(74)  配列番号9で示されるDNA配列において、塩基番号240937〜240943のT繰り返しの7塩基がT繰り返しの6塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(75)  配列番号9で示されるDNA配列において、塩基番号241030〜241050のA繰り返しの21塩基がA繰り返しの20塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(76)  配列番号9で示されるDNA配列において、塩基番号310499〜310509のT繰り返しの11塩基がT繰り返しの12塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(77)  配列番号9で示されるDNA配列において、塩基番号376612〜376635のCGA繰り返しの24塩基がCGA繰り返しの27塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(78)  配列番号9で示されるDNA配列において、塩基番号419477〜419492のTA繰り返しの16塩基がTA繰り返しの22塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(79)  配列番号9で示されるDNA配列において、塩基番号419493〜419498のTG繰り返しの6塩基がTG繰り返しの8塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(80)  配列番号9で示されるDNA配列において、塩基番号419542〜419548のA繰り返しの7塩基がA繰り返しの8塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(81)  配列番号9示されるDNA配列において、塩基番号419562〜419564のTAA繰り返し配列を欠き、塩基番号419561及び塩基番号419565の2塩基を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(82)  配列番号10で示されるDNA配列において、塩基番号76562〜76583のAT繰り返しの22塩基がAT繰り返しの20塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(83)  配列番号10で示されるDNA配列において、塩基番号150066〜150080のTTG繰り返しの15塩基がTTG繰り返しの18塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(84)  配列番号10で示されるDNA配列において、塩基番号265789〜265806のT繰り返しの18塩基がT繰り返しの13塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(85)  配列番号10で示されるDNA配列において、塩基番号316997〜317014のTA繰り返しの18塩基がTA繰り返しの12塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(86)  配列番号10で示されるDNA配列において、塩基番号403983〜404006のCAG繰り返しの24塩基がCAG繰り返しの21塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(87)  配列番号10で示されるDNA配列において、塩基番号470045〜470092のTAA繰り返しの48塩基がTAA繰り返しの78塩基に置換された配列を含む100〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(88)  配列番号10で示されるDNA配列において、塩基番号639907〜639944のCA繰り返しの38塩基がCA繰り返しの18塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(89)  配列番号10で示されるDNA配列において、塩基番号639945〜639956のTA繰り返しの12塩基がTA繰り返しの16塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(90)  配列番号11で示されるDNA配列において、塩基番号26593〜26624のAT繰り返しの32塩基がAT繰り返しの29塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(91)  配列番号11で示されるDNA配列において、塩基番号78805〜78826のTA繰り返しの22塩基がTA繰り返しの38塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(92)  配列番号11で示されるDNA配列において、塩基番号78844〜78853のA繰り返しの10塩基がA繰り返しの9塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(93)  配列番号11で示されるDNA配列において、塩基番号164850〜164883のTA繰り返しの34塩基がTA繰り返しの22塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(94)  配列番号11で示されるDNA配列において、塩基番号165093〜165098のAGA繰り返しの6塩基がAGAの3塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(95)  配列番号11で示されるDNA配列において、塩基番号232190〜232210のTAA繰り返しの21塩基がTAA繰り返しの18塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(96)  配列番号11で示されるDNA配列において、塩基番号232254〜232256のATA配列を欠き、塩基番号232253及び塩基番号232257の2塩基を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(97)  配列番号11で示されるDNA配列において、塩基番号280034〜280039のTGA繰り返しの6塩基がTGA繰り返しの12塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(98)  配列番号11で示されるDNA配列において、塩基番号280114〜280124のA繰り返しの11塩基がA繰り返しの10塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(99)  配列番号11で示されるDNA配列において、塩基番号382199と塩基番号382200との間にGT配列が挿入された4塩基を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(100)  配列番号11で示されるDNA配列において、塩基番号382204と塩基番号382205との間にT配列が挿入された3塩基を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(101)  配列番号11で示されるDNA配列において、塩基番号382213のT配列を欠き、塩基番号382212及び塩基番号382214の2塩基を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(102)  配列番号11で示されるDNA配列において、塩基番号464685〜464688のTA繰り返しの4塩基がTA繰り返しの6塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(103)  配列番号11で示されるDNA配列において、塩基番号464761〜464762のAT配列がAT繰り返しの塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(104)  配列番号11で示されるDNA配列において、塩基番号464816〜464835のTA繰り返しの20塩基がTA繰り返しの16塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(105)  配列番号11で示されるDNA配列において、塩基番号464836〜464851のAATATATATATATATA配列を欠き、塩基番号464835及び464852の2塩基を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(106)  配列番号11で示されるDNA配列において、塩基番号523314と塩基番号523315との間にTTGCTGCTGCTG配列が挿入された14塩基を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(107)  配列番号11で示されるDNA配列において、塩基番号566745〜566768のAGC繰り返しの24塩基がAGC繰り返しの30塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(108)  配列番号11で示されるDNA配列において、塩基番号612730〜612735のAGA繰り返しの6塩基がAGA繰り返しの9塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(109)  配列番号12で示されるDNA配列において、塩基番号35378〜35387のA繰り返しの10塩基がA繰り返しの11塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(110)  配列番号12で示されるDNA配列において、塩基番号35406〜35410のA繰り返しの5塩基がA繰り返しの6塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(111)  配列番号12で示されるDNA配列において、塩基番号35428と塩基番号35429との間にTTATATTAAATTA配列が挿入された15塩基を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(112)  配列番号12で示されるDNA配列において、塩基番号84330と塩基番号84331との間にCGCGGACGCGGAAGGA配列が挿入された18塩基を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(113)  配列番号12で示されるDNA配列において、塩基番号237852〜237875のAAAAAG繰り返しの24塩基がAAAAAGの6塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(114)  配列番号12で示されるDNA配列において、塩基番号511522〜511551のAGC繰り返しの30塩基がAGC繰り返しの27塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(115)  配列番号12で示されるDNA配列において、塩基番号511552〜511557のAACAGC配列を欠き、塩基番号511551及び塩基番号511558の2塩基を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(116)  配列番号12で示されるDNA配列において、塩基番号602125〜602139のTGT繰り返しの15塩基がTGT繰り返しの18塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(117)  配列番号12で示されるDNA配列において、塩基番号881948〜881969のAT繰り返しの22塩基がAT繰り返しの26塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(118)  配列番号12で示されるDNA配列において、塩基番号1002211〜100229のA繰り返しの19塩基がA繰り返しの16塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(119)  配列番号13で示されるDNA配列において、塩基番号44389〜44406のGCA繰り返しの18塩基がGCA繰り返しの15塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(120)  配列番号13で示されるDNA配列において、塩基番号99600〜99617のAT繰り返しの18塩基がAT繰り返しの20塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(121)  配列番号13で示されるDNA配列からなるポリヌクレオチドにおいて、塩基番号159853〜159876のAT繰り返しの24塩基がAT繰り返しの14塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(122)  配列番号13で示されるDNA配列において、塩基番号209865〜209876のTAAGTAATGATG配列を欠き、塩基番号209864及び塩基番号209877の2塩基を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(123)  配列番号13で示されるDNA配列において、塩基番号321328〜321349のTA繰り返しの22塩基がTA繰り返しの12塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(124)  配列番号13で示されるDNA配列において、塩基番号410428〜410442のAAT繰り返しの15塩基がAAT繰り返しの12塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド。
(125)  配列番号13で示されるDNA配列において、塩基番号539498〜539521のCTG繰り返しの24塩基がCTG繰り返しの21塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(126)  配列番号13で示されるDNA配列において、塩基番号625412〜625421のA繰り返しの10塩基がA繰り返しの17塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(127)  配列番号13で示されるDNA配列において、塩基番号625422〜625446のGAAAAAAAGAAAAAAAGAAAAAAAG配列を欠き、塩基番号625421及び塩基番号625447の2塩基を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(128)  配列番号13で示されるDNA配列において、塩基番号703444〜703448のT繰り返しの5塩基がT繰り返しの2塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(129)  配列番号13で示されるDNA配列において、塩基番号703562〜703574のTCTGAAATACGTT配列を欠き、塩基番号703561及び塩基番号703575の2塩基を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(130)  配列番号13で示されるDNA配列において、塩基番号811237〜811263のGTT繰り返しの27塩基がGTT繰り返しの24塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(131)  配列番号13で示されるDNA配列において、塩基番号874559〜874578のT繰り返しの20塩基がT繰り返しの16塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(132)  配列番号14で示されるDNA配列において、塩基番号70025〜70051のGCA繰り返しの27塩基がGCA繰り返しの39塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(133)  配列番号14で示されるDNA配列において、塩基番号70052〜70054のACA配列を欠き、塩基番号70051及び塩基番号70055の2塩基を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(134)  配列番号14で示されるDNA配列において、塩基番号135892と塩基番号135893との間にAAT配列が挿入された5塩基の配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(135)  配列番号14で示されるDNA配列において、塩基番号135906〜135917のTG繰り返しの12塩基がTG繰り返しの10塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(136)  配列番号14で示されるDNA配列において、塩基番号196146〜196149のTC繰り返しの4塩基がTCの2塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(137)  配列番号14で示されるDNA配列において、塩基番号300773〜300782のA繰り返しの10塩基がA繰り返しの11塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(138)  配列番号14で示されるDNA配列において、塩基番号527489〜527803のAT繰り返しの15塩基がAT繰り返しの8塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(139)  配列番号14で示されるDNA配列において、塩基番号606166〜606183のAT繰り返しの18塩基がAT繰り返しの16塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(140)  配列番号14で示されるDNA配列において、塩基番号662255〜662278のCTTGTT繰り返しの24塩基がCTTGTT繰り返しの18塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(141)  配列番号14で示されるDNA配列において、塩基番号721916〜721930のA繰り返しの15塩基がA繰り返しの21塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(142)  配列番号15で示されるDNA配列において、塩基番号53994と塩基番号53995との間にAATGGAAAACCCATCCGAGGTTAA配列が挿入された26塩基の配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(143)  配列番号15で示されるDNA配列において、塩基番号412672〜412674のAAAの3塩基がAAの2塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(144)  配列番号15で示されるDNA配列において、塩基番号412690〜412691のAT配列を欠き、塩基番号412689及び塩基番号412692の2塩基を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(145)  配列番号15で示されるDNA配列において、塩基番号479256〜479259のT繰り返しの4塩基がT繰り返しの5塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(146)  配列番号15で示されるDNA配列において、塩基番号479265と塩基番号479266との間にAT配列が挿入された4塩基の配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(147)  配列番号15で示されるDNA配列において、塩基番号579518〜579541のCAT繰り返しの24塩基がCAT繰り返しの21塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(148)  配列番号15で示されるDNA配列において、塩基番号675325〜675343のT繰り返しの19塩基がT繰り返しの18塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(149)  配列番号15で示されるDNA配列において、塩基番号768688〜768690のAAC配列を欠き、塩基番号768687及び塩基番号768691の2塩基を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(150)  配列番号15で示されるDNA配列において、塩基番号768691〜768702のGAC繰り返しの19塩基がGAC繰り返しの9塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(151)  配列番号15で示されるDNA配列において、塩基番号867908と塩基番号867909との間にC配列が挿入された3塩基の配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(152)  配列番号15で示されるDNA配列において、塩基番号944403〜944411のT繰り返しの9塩基がT繰り返しの10塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(153)  配列番号15で示されるDNA配列において、塩基番号944423〜944425のTTTの3塩基がTTの2塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(154)  配列番号15で示されるDNA配列において、塩基番号944426〜944427のCCの2塩基がCCCの3塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(155)  配列番号15で示されるDNA配列において、塩基番号944454〜944464のT繰り返しの11塩基がT繰り返しの10塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(156)  配列番号15で示されるDNA配列において、塩基番号944468のCの1塩基がCCの2塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(157)  配列番号15で示されるDNA配列において、塩基番号944469〜944492のT繰り返しの24塩基がT繰り返しの21塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(158)  配列番号16で示されるDNA配列において、塩基番号76355〜76372のCT繰り返し18塩基がCT繰り返しの20塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(159)  配列番号16で示されるDNA配列において、塩基番号165850と塩基番号165851との間にCAT配列が挿入された5塩基の配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(160)  配列番号16で示されるDNA配列において、塩基番号212901〜212918のA繰り返しの18塩基がA繰り返しの13塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(161)  配列番号16で示されるDNA配列において、塩基番号298503〜298518のTA繰り返しの16塩基がTA繰り返しの18塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(162)  配列番号16で示されるDNA配列において、塩基番号404721〜404727のA繰り返しの7塩基がA繰り返しの6塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(163)  配列番号16で示されるDNA配列において、塩基番号404731〜404738のT繰り返しの8塩基がT繰り返しの7塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(164)  配列番号16で示されるDNA配列において、塩基番号404757〜404775のT繰り返しの19塩基がT繰り返しの15塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(165)  配列番号16で示されるDNA配列において、塩基番号607995〜608008のT繰り返しの14塩基がT繰り返しの11塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(166)  配列番号16で示されるDNA配列において、塩基番号695612〜695613のTTの2塩基がTTTの3塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(167)  配列番号16で示されるDNA配列において、塩基番号695614〜695628のA繰り返しの15塩基がA繰り返しの11塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(168)  配列番号16で示されるDNA配列において、塩基番号776565〜776574のT繰り返しの10塩基がT繰り返しの8塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
【請求項２】
以下の(I)〜(XVI)のいずれかのポリヌクレオチド。
(I)  請求項1に記載の(1)〜(11)のポリヌクレオチドからなる群より選ばれる少なくとも2種のポリヌクレオチド、又はこれらのポリヌクレオチドにおいて1又は数個のヌクレオチドが挿入、欠失、又は置換されたポリヌクレオチド
(II)  請求項1に記載の(12)〜(20)のポリヌクレオチドからなる群より選ばれる少なくとも2種のポリヌクレオチド、又はこれらのポリヌクレオチドにおいて1又は数個のヌクレオチドが挿入、欠失、又は置換されたポリヌクレオチド
(III)  請求項1に記載の(21)〜(25)のポリヌクレオチドからなる群より選ばれる少なくとも2種のポリヌクレオチド、又はこれらのポリヌクレオチドにおいて1又は数個のヌクレオチドが挿入、欠失、又は置換されたポリヌクレオチド
(IV)  請求項1に記載の(26)〜(42)のポリヌクレオチドからなる群より選ばれる少なくとも2種のポリヌクレオチド、又はこれらのポリヌクレオチドにおいて1又は数個のヌクレオチドが挿入、欠失、又は置換されたポリヌクレオチド
(V)  請求項1に記載の(43)〜(50)のポリヌクレオチドからなる群より選ばれる少なくとも2種のポリヌクレオチド、又はこれらのポリヌクレオチドにおいて1又は数個のヌクレオチドが挿入、欠失、又は置換されたポリヌクレオチド
(VI)  請求項1に記載の(51)〜(55)のポリヌクレオチドからなる群より選ばれる少なくとも2種のポリヌクレオチド、又はこれらのポリヌクレオチドにおいて1又は数個のヌクレオチドが挿入、欠失、又は置換されたポリヌクレオチド
(VII)  請求項1に記載の(56)〜(64)のポリヌクレオチドからなる群より選ばれる少なくとも2種のポリヌクレオチド、又はこれらのポリヌクレオチドにおいて1又は数個のヌクレオチドが挿入、欠失、又は置換されたポリヌクレオチド
(VIII)  請求項1に記載の(65)〜(69)のポリヌクレオチドからなる群より選ばれる少なくとも2種のポリヌクレオチド、又はこれらのポリヌクレオチドにおいて1又は数個のヌクレオチドが挿入、欠失、又は置換されたポリヌクレオチド
(IX)  請求項1に記載の(70)〜(81)のポリヌクレオチドからなる群より選ばれる少なくとも2種のポリヌクレオチド、又はこれらのポリヌクレオチドにおいて1又は数個のヌクレオチドが挿入、欠失、又は置換されたポリヌクレオチド
(X)  請求項1に記載の(82)〜(89)のポリヌクレオチドからなる群より選ばれる少なくとも2種のポリヌクレオチド、又はこれらのポリヌクレオチドにおいて1又は数個のヌクレオチドが挿入、欠失、又は置換されたポリヌクレオチド
(XI)  請求項1に記載の(90)〜(108)のポリヌクレオチドからなる群より選ばれる少なくとも2種のポリヌクレオチド、又はこれらのポリヌクレオチドにおいて1又は数個のヌクレオチドが挿入、欠失、又は置換されたポリヌクレオチド
(XII)  請求項1に記載の(109)〜(118)のポリヌクレオチドからなる群より選ばれる少なくとも2種のポリヌクレオチド、又はこれらのポリヌクレオチドにおいて1又は数個のヌクレオチドが挿入、欠失、又は置換されたポリヌクレオチド
(XIII)  請求項1に記載の(119)〜(131)のポリヌクレオチドからなる群より選ばれる少なくとも2種のポリヌクレオチド、又はこれらのポリヌクレオチドにおいて1又は数個のヌクレオチドが挿入、欠失、又は置換されたポリヌクレオチド
(XIV)  請求項1に記載の(132)〜(141)のポリヌクレオチドからなる群より選ばれる少なくとも2種のポリヌクレオチド、又はこれらのポリヌクレオチドにおいて1又は数個のヌクレオチドが挿入、欠失、又は置換されたポリヌクレオチド
(XV)  請求項1に記載の(142)〜(157)のポリヌクレオチドからなる群より選ばれる少なくとも2種のポリヌクレオチド、又はこれらのポリヌクレオチドにおいて1又は数個のヌクレオチドが挿入、欠失、又は置換されたポリヌクレオチド
(XVI)  請求項1に記載の(158)〜(168)のポリヌクレオチドからなる群より選ばれる少なくとも2種のポリヌクレオチド、又はこれらのポリヌクレオチドにおいて1又は数個のヌクレオチドが挿入、欠失、又は置換されたポリヌクレオチド
【請求項３】
請求項1又は2に記載のポリヌクレオチドからなるDNAマーカー。
【請求項４】
以下の(1')〜(168')のいずれかのポリヌクレオチド、又はこのポリヌクレオチドにおいて1又は数個のヌクレオチドが挿入、欠失、又は置換されたポリヌクレオチドからなるDNAマーカー。
(1')  配列番号1で示されるDNA配列において、塩基番号31118〜31123のATATAC配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(2')  配列番号1で示されるDNA配列において、塩基番号31124〜31147のAT繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(3')  配列番号1で示されるDNA配列において、塩基番号77496〜77510のGAA繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(4')  配列番号1で示されるDNA配列において、塩基番号77514〜77540のGAA繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(5')  配列番号1で示されるDNA配列において、塩基番号110697〜110716のAG繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(6')  配列番号1で示されるDNA配列において、塩基番号110717〜110724のA繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(7')  配列番号1で示されるDNA配列において、塩基番号152108〜152126のT繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(8')  配列番号1で示されるDNA配列において、塩基番号192268〜192271のGC繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(9')  配列番号1で示されるDNA配列において、塩基番号192278〜192279の配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(10')  配列番号1で示されるDNA配列において、塩基番号192279〜192281のTTA繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(11')  配列番号1で示されるDNA配列において、塩基番号192286〜192315のTAC繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(12')  配列番号2で示されるDNA配列において、塩基番号45954〜45968のT繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(13')  配列番号2で示されるDNA配列において、塩基番号138278〜138292のT繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(14')  配列番号2で示されるDNA配列において、塩基番号251595〜251610のT繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(15')  配列番号2で示されるDNA配列において、塩基番号299556〜299557の配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(16')  配列番号2で示されるDNA配列において、塩基番号452269〜452278のA繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(17')  配列番号2で示されるDNA配列において、塩基番号452393〜452394の配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(18')  配列番号2で示されるDNA配列において、塩基番号499605〜499626のGGCAGTCAATGTAAATTTGTGA配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(19')  配列番号2で示されるDNA配列において、塩基番号628893〜628908のTA繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(20')  配列番号2で示されるDNA配列において、塩基番号723659〜723673のA繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(21')  配列番号3で示されるDNA配列において、塩基番号62744〜62749のCA繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(22')  配列番号3で示されるDNA配列において、塩基番号62750〜62769のTA繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(23')  配列番号3で示されるDNA配列において、塩基番号164228〜164245のTGC繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(24')  配列番号3で示されるDNA配列において、塩基番号210468〜210482のTTC繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(25')  配列番号3で示されるDNA配列において、塩基番号260022〜260041のTA繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(26')  配列番号4で示されるDNA配列において、塩基番号92684〜92709のA繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(27')  配列番号4で示されるDNA配列において、塩基番号169824〜169833のAT繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(28')  配列番号4で示されるDNA配列において、塩基番号169835〜169854のTA繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(29')  配列番号4で示されるDNA配列において、塩基番号169893〜169910のA繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(30')  配列番号4で示されるDNA配列において、塩基番号329788〜329797のTA繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(31')  配列番号4で示されるDNA配列において、塩基番号390422〜390436のTAT繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(32')  配列番号4で示されるDNA配列において、塩基番号390457〜390465のTTA繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(33')  配列番号4で示されるDNA配列において、塩基番号390449〜390450の配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(34')  配列番号4で示されるDNA配列において、塩基番号538730〜538759のTA繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(35')  配列番号4で示されるDNA配列において、塩基番号584615〜584626のCGA繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(36')  配列番号4で示されるDNA配列において、塩基番号694836〜694853のCAG繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(37')  配列番号4で示されるDNA配列において、塩基番号838091〜838092の配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(38')  配列番号4で示されるDNA配列において、塩基番号927583〜927619の配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(39')  配列番号4で示されるDNA配列において、塩基番号1059941〜1059942の配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(40')  配列番号4で示されるDNA配列において、塩基番号1059942〜1059956のGAAGAAAAAGAGGAA繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(41')  配列番号4で示されるDNA配列において、塩基番号1279155〜1279168のAC繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(42')  配列番号4で示されるDNA配列において、塩基番号1418460〜1418481のAT繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(43')  配列番号5で示されるDNA配列において、塩基番号81213〜81236のTTA繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(44')  配列番号5で示されるDNA配列において、塩基番号172598〜172615のAT繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(45')  配列番号5で示されるDNA配列において、塩基番号225783〜225804のAT繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(46')  配列番号5で示されるDNA配列において、塩基番号311721〜311725の配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(47')  配列番号5で示されるDNA配列において、塩基番号430556〜430570のA繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(48')  配列番号5で示されるDNA配列において、塩基番号490207〜490242のTGTTCA繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(49')  配列番号5で示されるDNA配列において、塩基番号490243〜490266のTATTCA繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(50')  配列番号5で示されるDNA配列において、塩基番号545369〜545379のA繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(51')  配列番号6で示されるDNA配列において、塩基番号73358〜73384のATT繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(52')  配列番号6で示されるDNA配列において、塩基番号107804〜107811のTGTA繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(53')  配列番号6で示されるDNA配列において、塩基番号107812〜107831のTG繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(54')  配列番号6で示されるDNA配列において、塩基番号182876〜182877の配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(55')  配列番号6で示されるDNA配列において、塩基番号227466〜227486のT繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(56')  配列番号7で示されるDNA配列において、塩基番号23643〜23657のACG繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(57')  配列番号7で示されるDNA配列において、塩基番号158990〜158991の配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(58')  配列番号7で示されるDNA配列において、塩基番号245647〜245685のCAA繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(59')  配列番号7で示されるDNA配列において、塩基番号397841〜397860のA繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(60')  配列番号7で示されるDNA配列において、塩基番号555986〜556016のA繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(61')  配列番号7で示されるDNA配列において、塩基番号の640803〜640818のCATT繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(62')  配列番号7で示されるDNA配列において、塩基番号808392〜808417のTA繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(63')  配列番号7で示されるDNA配列において、塩基番号910118〜910141のT繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(64')  配列番号7で示されるDNA配列において、塩基番号988901〜988921のAGC繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(65')  配列番号8で示されるDNA配列において、塩基番号49390〜49391の配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(66')  配列番号8で示されるDNA配列において、塩基番号169193〜169194の配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(67')  配列番号8で示されるDNA配列において、塩基番号169196〜169197の配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(68')  配列番号8で示されるDNA配列において、塩基番号169203〜169211のCTG繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(69')  配列番号8で示されるDNA配列において、塩基番号464933〜464946のTA繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(70')  配列番号9で示されるDNA配列において、塩基番号56789〜56812のAGC繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(71')  配列番号9で示されるDNA配列において、塩基番号128505〜128525のTCC繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(72')  配列番号9で示されるDNA配列において、塩基番号177461〜177464のCA繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(73')  配列番号9で示されるDNA配列において、塩基番号177465〜177482のTA繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(74')  配列番号9で示されるDNA配列において、塩基番号240937〜240943のT繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(75')  配列番号9で示されるDNA配列において、塩基番号241030〜241050のA繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(76')  配列番号9で示されるDNA配列において、塩基番号310499〜310509のT繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(77')  配列番号9で示されるDNA配列において、塩基番号376612〜376635のCGA繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(78')  配列番号9で示されるDNA配列において、塩基番号419477〜419492のTA繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(79')  配列番号9で示されるDNA配列において、塩基番号419493〜419498のTG繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(80')  配列番号9で示されるDNA配列において、塩基番号419542〜419548のA繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(81')  配列番号9示されるDNA配列において、塩基番号419562〜419564のTAA繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(82')  配列番号10で示されるDNA配列において、塩基番号76562〜76583のAT繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(83')  配列番号10で示されるDNA配列において、塩基番号150066〜150080のTTG繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(84')  配列番号10で示されるDNA配列において、塩基番号265789〜265806のT繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(85')  配列番号10で示されるDNA配列において、塩基番号316997〜317014のTA繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(86')  配列番号10で示されるDNA配列において、塩基番号403983〜404006のCAG繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(87')  配列番号10で示されるDNA配列において、塩基番号470045〜470092のTAA繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(88')  配列番号10で示されるDNA配列において、塩基番号639907〜639944のCA繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(89')  配列番号10で示されるDNA配列において、塩基番号639945〜639956のTA繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(90')  配列番号11で示されるDNA配列において、塩基番号26593〜26624のAT繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(91')  配列番号11で示されるDNA配列において、塩基番号78805〜78826のTA繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(92')  配列番号11で示されるDNA配列において、塩基番号78844〜78853のA繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(93')  配列番号11で示されるDNA配列において、塩基番号164850〜164883のTA繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(94')  配列番号11で示されるDNA配列において、塩基番号165093〜165098のAGA繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(95')  配列番号11で示されるDNA配列において、塩基番号232190〜232210のTAA繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(96')  配列番号11で示されるDNA配列において、塩基番号232254〜232256のATA配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(97')  配列番号11で示されるDNA配列において、塩基番号280034〜280039のTGA繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(98')  配列番号11で示されるDNA配列において、塩基番号280114〜280124のA繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(99')  配列番号11で示されるDNA配列において、塩基番号382199〜382200の配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(100')  配列番号11で示されるDNA配列において、塩基番号382204〜382205の配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(101')  配列番号11で示されるDNA配列において、塩基番号382213のT配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(102')  配列番号11で示されるDNA配列において、塩基番号464685〜464688のTA繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(103')  配列番号11で示されるDNA配列において、塩基番号464761〜464762のAT配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(104')  配列番号11で示されるDNA配列において、塩基番号464816〜464835のTA繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(105')  配列番号11で示されるDNA配列において、塩基番号464836〜464851のAATATATATATATATA配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(106')  配列番号11で示されるDNA配列において、塩基番号523314〜523315の配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(107')  配列番号11で示されるDNA配列において、塩基番号566745〜566768のAGC繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(108')  配列番号11で示されるDNA配列において、塩基番号612730〜612735のAGA繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(109')  配列番号12で示されるDNA配列において、塩基番号35378〜35387のA繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(110')  配列番号12で示されるDNA配列において、塩基番号35406〜35410のA繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(111')  配列番号12で示されるDNA配列において、塩基番号35428〜35429の配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(112')  配列番号12で示されるDNA配列において、塩基番号84330〜84331の配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(113')  配列番号12で示されるDNA配列において、塩基番号237852〜237875のAAAAAG繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(114')  配列番号12で示されるDNA配列において、塩基番号511522〜511551のAGC繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(115')  配列番号12で示されるDNA配列において、塩基番号511552〜511557のAACAGC配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(116')  配列番号12で示されるDNA配列において、塩基番号602125〜602139のTGT繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(117')  配列番号12で示されるDNA配列において、塩基番号881948〜881969のAT繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(118')  配列番号12で示されるDNA配列において、塩基番号1002211〜100229のA繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(119')  配列番号13で示されるDNA配列において、塩基番号44389〜44406のGCA繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(120')  配列番号13で示されるDNA配列において、塩基番号99600〜99617のAT繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(121')  配列番号13で示されるDNA配列において、塩基番号159853〜159876のAT繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(122')  配列番号13で示されるDNA配列において、塩基番号209865〜209876のTAAGTAATGATG配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(123')  配列番号13で示されるDNA配列において、塩基番号321328〜321349のTA繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(124')  配列番号13で示されるDNA配列において、塩基番号410428〜410442のAAT繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(125')  配列番号13で示されるDNA配列において、塩基番号539498〜539521のCTG繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(126')  配列番号13で示されるDNA配列において、塩基番号625412〜625421のA繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(127')  配列番号13で示されるDNA配列において、塩基番号625422〜625446のGAAAAAAAGAAAAAAAGAAAAAAAG配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(128')  配列番号13で示されるDNA配列において、塩基番号703444〜703448のT繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(129')  配列番号13で示されるDNA配列において、塩基番号703562〜703574のTCTGAAATACGTT配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(130')  配列番号13で示されるDNA配列において、塩基番号811237〜811263のGTT繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(131')  配列番号13で示されるDNA配列において、塩基番号874559〜874578のT繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(132')  配列番号14で示されるDNA配列において、塩基番号70025〜70051のGCA繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(133')  配列番号14で示されるDNA配列において、塩基番号70052〜70054のACA配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(134')  配列番号14で示されるDNA配列において、塩基番号135892〜135893の配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(135')  配列番号14で示されるDNA配列において、塩基番号135906〜135917のTG繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(136')  配列番号14で示されるDNA配列において、塩基番号196146〜196149のTC繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(137')  配列番号14で示されるDNA配列において、塩基番号300773〜300782のA繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(138')  配列番号14で示されるDNA配列において、塩基番号527489〜527803のAT繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(139')  配列番号14で示されるDNA配列において、塩基番号606166〜606183のAT繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(140')  配列番号14で示されるDNA配列において、塩基番号662255〜662278のCTTGTT繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(141')  配列番号14で示されるDNA配列において、塩基番号721916〜721930のA繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(142')  配列番号15で示されるDNA配列において、塩基番号53994〜53995の配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からポリヌクレオチド
(143')  配列番号15で示されるDNA配列において、塩基番号412672〜412674のA繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(144')  配列番号15で示されるDNA配列において、塩基番号412690〜412691のAT配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(145')  配列番号15で示されるDNA配列において、塩基番号479256〜479259のT繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(146')  配列番号15で示されるDNA配列において、塩基番号479265〜479266の配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(147')  配列番号15で示されるDNA配列において、塩基番号579518〜579541のCAT繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(148')  配列番号15で示されるDNA配列において、塩基番号675325〜675343のT繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(149')  配列番号15で示されるDNA配列において、塩基番号768688〜768690のAAC配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチドー
(150')  配列番号15で示されるDNA配列において、塩基番号768691〜768702のGAC繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(151')  配列番号15で示されるDNA配列において、塩基番号867908〜867909の配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(152')  配列番号15で示されるDNA配列において、塩基番号944403〜944411のT繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(153')  配列番号15で示されるDNA配列において、塩基番号944423〜944425のT繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(154')  配列番号15で示されるDNA配列において、塩基番号944426〜944427のC繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(155')  配列番号15で示されるDNA配列において、塩基番号944454〜944464のT繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(156')  配列番号15で示されるDNA配列において、塩基番号944468〜944468のC配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(157')  配列番号15で示されるDNA配列において、塩基番号944469〜944492のT繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(158')  配列番号16で示されるDNA配列において、塩基番号76355〜76372のCT繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(159')  配列番号16で示されるDNA配列において、塩基番号165850〜165851の配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(160')  配列番号16で示されるDNA配列において、塩基番号212901〜212918のA繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(161')  配列番号16で示されるDNA配列において、塩基番号298503〜298518のTA繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチドー
(162')  配列番号16で示されるDNA配列において、塩基番号404721〜404727のA繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(163')  配列番号16で示されるDNA配列において、塩基番号404731〜404738のT繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(164')  配列番号16で示されるDNA配列において、塩基番号404757〜404775のT繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(165')  配列番号16で示されるDNA配列において、塩基番号607995〜608008のT繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(166')  配列番号16で示されるDNA配列において、塩基番号695612〜695613のT繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(167')  配列番号16で示されるDNA配列において、塩基番号695614〜695628のA繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(168')  配列番号16で示されるDNA配列において、塩基番号776565〜776574のT繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
【請求項５】
以下の(I')〜(XVI')のいずれかのDNAマーカー。
(I')  請求項4に記載の(1')〜(11')のポリヌクレオチドからなるDNAマーカーの群より選ばれる少なくとも2種のDNAマーカー、又は請求項4に記載の(1')〜(11')のポリヌクレオチドにおいて1又は複数のヌクレオチドが挿入、欠失、又は置換されたポリヌクレオチドからなるDNAマーカーの群より選ばれる少なくとも2種のDNAマーカー
(II')  請求項4に記載の(12)〜(20')のポリヌクレオチドからなるDNAマーカーの群より選ばれる少なくとも2種のDNAマーカー、又は請求項4に記載の(12')〜(20')のポリヌクレオチドにおいて1又は複数のヌクレオチドが挿入、欠失、又は置換されたポリヌクレオチドからなるDNAマーカーの群より選ばれる少なくとも2種のDNAマーカー
(III')  請求項4に記載の(21')〜(25')のポリヌクレオチドからなるDNAマーカーの群より選ばれる少なくとも2種のDNAマーカー、又は請求項4に記載の(21')〜(25')のポリヌクレオチドにおいて1又は複数のヌクレオチドが挿入、欠失、又は置換されたポリヌクレオチドからなるDNAマーカーの群より選ばれる少なくとも2種のDNAマーカー
(IV')  請求項4に記載の(26)〜(42')のポリヌクレオチドからなるDNAマーカーの群より選ばれる少なくとも2種のDNAマーカー、又は請求項4に記載の(26')〜(42')のポリヌクレオチドにおいて1又は複数のヌクレオチドが挿入、欠失、又は置換されたポリヌクレオチドからなるDNAマーカーの群より選ばれる少なくとも2種のDNAマーカー
(V')  請求項4に記載の(43')〜(50')のポリヌクレオチドからなるDNAマーカーの群より選ばれる少なくとも2種のDNAマーカー、又は請求項4に記載の(43')〜(50')のポリヌクレオチドにおいて1又は複数のヌクレオチドが挿入、欠失、又は置換されたポリヌクレオチドからなるDNAマーカーの群より選ばれる少なくとも2種のDNAマーカー
(VI')  請求項4に記載の(51')〜(55')のポリヌクレオチドからなるDNAマーカーの群より選ばれる少なくとも2種のDNAマーカー、又は請求項4に記載の(51')〜(55')のポリヌクレオチドにおいて1又は複数のヌクレオチドが挿入、欠失、又は置換されたポリヌクレオチドからなるDNAマーカーの群より選ばれる少なくとも2種のDNAマーカー
(VII')  請求項4に記載の(56')〜(64')のポリヌクレオチドからなるDNAマーカーの群より選ばれる少なくとも2種のDNAマーカー、又は請求項4に記載の(56')〜(64')のポリヌクレオチドにおいて1又は複数のヌクレオチドが挿入、欠失、又は置換されたポリヌクレオチドからなるDNAマーカーの群より選ばれる少なくとも2種のDNAマーカー
(VIII')  請求項4に記載の(65')〜(69')のポリヌクレオチドからなるDNAマーカーの群より選ばれる少なくとも2種のDNAマーカー、又は請求項4に記載の(65')〜(69')のポリヌクレオチドにおいて1又は複数のヌクレオチドが挿入、欠失、又は置換されたポリヌクレオチドからなるDNAマーカーの群より選ばれる少なくとも2種のDNAマーカー
(IX')  請求項4に記載の(70')〜(81')のポリヌクレオチドからなるDNAマーカーの群より選ばれる少なくとも2種のDNAマーカー、又は請求項4に記載の(70')〜(81')のポリヌクレオチドにおいて1又は複数のヌクレオチドが挿入、欠失、又は置換されたポリヌクレオチドからなるDNAマーカーの群より選ばれる少なくとも2種のDNAマーカー
(X')  請求項4に記載の(82')〜(89')のポリヌクレオチドからなるDNAマーカーの群より選ばれる少なくとも2種のDNAマーカー、又は請求項4に記載の(82')〜(89')のポリヌクレオチドにおいて1又は複数のヌクレオチドが挿入、欠失、又は置換されたポリヌクレオチドからなるDNAマーカーの群より選ばれる少なくとも2種のDNAマーカー
(XI')  請求項4に記載の(90')〜(108')のポリヌクレオチドからなるDNAマーカーの群より選ばれる少なくとも2種のDNAマーカー、又は請求項4に記載の(90')〜(108')のポリヌクレオチドにおいて1又は複数のヌクレオチドが挿入、欠失、又は置換されたポリヌクレオチドからなるDNAマーカーの群より選ばれる少なくとも2種のDNAマーカー
(XII')  請求項4に記載の(109')〜(118')のポリヌクレオチドからなるDNAマーカーの群より選ばれる少なくとも2種のDNAマーカー、又は請求項4に記載の(109')〜(118') のポリヌクレオチドにおいて1又は複数のヌクレオチドが挿入、欠失、又は置換されたポリヌクレオチドからなるDNAマーカーの群より選ばれる少なくとも2種のDNAマーカー
(XIII')  請求項4に記載の(119')〜(131')のポリヌクレオチドからなるDNAマーカーの群より選ばれる少なくとも2種のDNAマーカー、又は請求項4に記載の(119')〜(131')のポリヌクレオチドにおいて1又は複数のヌクレオチドが挿入、欠失、又は置換されたポリヌクレオチドからなるDNAマーカーの群より選ばれる少なくとも2種のDNAマーカー
(XIV')  請求項4に記載の(132')〜(141')のポリヌクレオチドからなるDNAマーカーの群より選ばれる少なくとも2種のDNAマーカー、又は請求項4に記載の(132')〜(141')のポリヌクレオチドにおいて1又は複数のヌクレオチドが挿入、欠失、又は置換されたポリヌクレオチドからなるDNAマーカーの群より選ばれる少なくとも2種のDNAマーカー
(XV')  請求項4に記載の(142')〜(157')のポリヌクレオチドからなるDNAマーカーの群より選ばれる少なくとも2種のDNAマーカー、又は請求項4に記載の(142')〜(157')のポリヌクレオチドにおいて1又は複数のヌクレオチドが挿入、欠失、又は置換されたポリヌクレオチドからなるDNAマーカーの群より選ばれる少なくとも2種のDNAマーカー
(XVI')  請求項4に記載の(158')〜(168')のポリヌクレオチドからなるDNAマーカーの群より選ばれる少なくとも2種のDNAマーカー、又は請求項4に記載の(158')〜(168')のポリヌクレオチドにおいて1又は複数のヌクレオチドが挿入、欠失、又は置換されたポリヌクレオチドからなるDNAマーカーの群より選ばれる少なくとも2種のDNAマーカー
【請求項６】
以下の（200）〜(317)のいずれかのプライマーセット。
(200)  配列番号17に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号18に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(201)  配列番号19に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号20に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(202)  配列番号21に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号22に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(203)  配列番号23に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号24に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(204)  配列番号25に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号26に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(205)  配列番号27に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号28に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(206)  配列番号29に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号30に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(207)  配列番号31に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号32に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(208)  配列番号33に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号34に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(209)  配列番号35に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号36に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(210)  配列番号37に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号38に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(211)  配列番号39に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号40に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(212)  配列番号41に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号42に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(213)  配列番号43に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号44に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(214)  配列番号45に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号46に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(215)  配列番号47に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号48に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(216)  配列番号49に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号50に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(217)  配列番号51に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号52に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(218)  配列番号53に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号54に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(219)  配列番号55に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号56に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(220)  配列番号57に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号58に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(221)  配列番号59に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号60に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(222)  配列番号61に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号62に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(223)  配列番号63に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号64に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(224)  配列番号65に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号66に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(225)  配列番号67に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号68に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(226)  配列番号69に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号70に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(227)  配列番号71に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号72に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(228)  配列番号73に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号74に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(229)  配列番号75に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号76に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(230)  配列番号77に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号78に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(231)  配列番号79に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号80に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(232)  配列番号81に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号82に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(233)  配列番号83に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号84に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(234)  配列番号85に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号86に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(235)  配列番号87に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号88に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(236)  配列番号89に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号90に示される塩基配列をを3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(237)  配列番号91に示される塩基配列をを3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号92に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(238)  配列番号93に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号94に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(239)  配列番号95に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号96に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(240)  配列番号97に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号98に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(241)  配列番号99に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号100に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(242)  配列番号101に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号102に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(243)  配列番号103に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号104に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(244)  配列番号105に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号106に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(245)  配列番号107に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号108に示されるを3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(246)  配列番号109に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号110に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(247)  配列番号111に示される塩基配列をを3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号112に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(248)  配列番号113に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号114に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(249)  配列番号115に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号116に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(250)  配列番号117に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号118に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(251)  配列番号119に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号120に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(252)  配列番号121に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号122に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(253)  配列番号123に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号124に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(254)  配列番号125に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号126に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(255)  配列番号127に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号128に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(256)  配列番号129に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号130に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(257)  配列番号131に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号132に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(258)  配列番号133に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号134に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(259)  配列番号135に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号136に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(260)  配列番号137に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号138に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(261)  配列番号139に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号140に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(262)  配列番号141に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号142に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(263)  配列番号143に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号144に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(264)  配列番号145に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号146に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(265)  配列番号147に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号148に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(266)  配列番号149に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号150に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(267)  配列番号151に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号152に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(268)  配列番号153に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号154に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(269)  配列番号155に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号156に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(270)  配列番号157に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号158に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(271)  配列番号159に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号160に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(272)  配列番号161に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号162に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(273)  配列番号163に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号164に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(274)  配列番号165に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号166に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(275)  配列番号167に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号168に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(276)  配列番号169に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号170に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(277)  配列番号171に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号172に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(278)  配列番号173に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号174に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(279)  配列番号175に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号176に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(280)  配列番号177に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号178に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(281)  配列番号179に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号180に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(282)  配列番号181に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号182に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(283)  配列番号183に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号184に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(284)  配列番号185に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号186に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(285)  配列番号187に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号188に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(286)  配列番号189に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号190に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(287)  配列番号191に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号192に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(288)  配列番号193に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号194に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(289)  配列番号195に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号196に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(290)  配列番号197に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号198に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(291)  配列番号199に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号200に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(292)  配列番号201に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号202に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(293)  配列番号203に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号204に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(294)  配列番号205に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号206に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(295)  配列番号207に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号208に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(296)  配列番号209に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号210に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(297)  配列番号211に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号212に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(298)  配列番号213に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号214に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(299)  配列番号215に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号216に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(300)  配列番号217に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号218に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(301)  配列番号219に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号220に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(302)  配列番号221に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号222に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(203)  配列番号223に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号224に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(304)  配列番号225に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号226に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(305)  配列番号227に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号228に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(306)  配列番号229に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号230に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(307)  配列番号231に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号232に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(308)  配列番号233に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号234に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(309)  配列番号235に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号236に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(310)  配列番号237に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号238に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(311)  配列番号239に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号240に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(312)  配列番号241に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号242に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(313)  配列番号243に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号244に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(314)  配列番号245に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号246に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(315)  配列番号247に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号248に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(316)  配列番号249に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号250に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(317)  配列番号251に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号252に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
【請求項７】
以下の(I'')〜(XVI'')のいずれかのプライマーセット。
(I'')  請求項6に記載の(200)〜(204)のプライマーセットからなる群より選ばれる少なくとも2種のプライマーセット
(II'')  請求項6に記載の(205)〜(212)のプライマーセットからなる群より選ばれる少なくとも2種のプライマーセット
(III'')  請求項6に記載の(213)〜(216)のプライマーセットからなる群より選ばれる少なくとも2種のプライマーセット
(IV'')  請求項6に記載の(217)〜(228)のプライマーセットからなる群より選ばれる少なくとも2種のプライマーセット
(V'')  請求項6に記載の(229)〜(235)のプライマーセットからなる群より選ばれる少なくとも2種のプライマーセット
(VI'')  請求項6に記載の(236)〜(239)のプライマーセットからなる群より選ばれる少なくとも2種のプライマーセット
(VII'')  請求項6に記載の(240)〜(248)のプライマーセットからなる群より選ばれる少なくとも2種のプライマーセット
(VIII'')  請求項6に記載の(249)〜(251)のプライマーセットからなる群より選ばれる少なくとも2種のプライマーセット
(IX'')  請求項6に記載の(252)〜(258)のプライマーセットからなる群より選ばれる少なくとも2種のプライマーセット
(X'')  請求項6に記載の(259)〜(265)のプライマーセットからなる群より選ばれる少なくとも2種のプライマーセット
(XI'')  請求項6に記載の(266)〜(275)のプライマーセットからなる群より選ばれる少なくとも2種のプライマーセット
(XII'')  請求項6に記載の(276)〜(282)のプライマーセットからなる群より選ばれる少なくとも2種のプライマーセット
(XIII'')  請求項6に記載の(283)〜(293)のプライマーセットからなる群より選ばれる少なくとも2種のプライマーセット
(XIV'')  請求項6に記載の(294)〜(301)のプライマーセットからなる群より選ばれる少なくとも2種のプライマーセット
(XV'')  請求項6に記載の(302)〜(309)のプライマーセットからなる群より選ばれる少なくとも2種のプライマーセット
(XVI'')  請求項6に記載の(310)〜(317)のプライマーセットからなる群より選ばれる少なくとも2種のプライマーセット
【請求項８】
被験DNA上のDNAマーカーを含む領域に対してDNA増幅を行い、増幅産物長と表現型とを対比することにより、その表現型を支配する遺伝子の位置を定める連鎖解析方法において、請求項7に記載の組み合わせに含まれる各プライマーセットを用いてDNA増幅を行う方法。
【請求項９】
被験DNA上のDNAマーカーを含む領域に対してDNA増幅を行い、増幅産物長に従い酵母菌株を同定する方法において、請求項6に記載のプライマーセットの1種以上を用いてDNA増幅を行う方法。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
本発明は、酵母サッカロマイセス・セレビジエの染色体DNA上に存在する多型ポリヌクレオチド、このポリヌクレオチドからなるDNAマーカー、このDNAマーカーを検出するためのプライマーセット、このプライマーセットを用いたDNA増幅により連鎖解析を行う方法、及びこのプライマーセットを用いたDNA増幅により酵母菌株を同定する方法に関する。
【背景技術】
【０００２】
有用な遺伝子を同定するための代表的な技術のひとつとして、連鎖解析と呼ばれる遺伝学的手法がある。連鎖解析とは、減数分裂時に同一染色体上の近い位置に存在する遺伝子は、相同組換えにより別々の染色体上に分かれる頻度が少ないため、子孫に同じように受け継がれるという連鎖現象を利用する方法であり、対象遺伝子と複数の既知のDNAマーカーとの連鎖を利用して、その遺伝子の位置を特定することができる。
【０００３】
従来、酵母サッカロマイセス・セレビジエにおいて遺伝子のマッピングは、栄養要求性、温度感受性、薬剤耐性などの変異遺伝子がマーカーとして用いられてきた。しかしこのような表現型マーカーは、調べたい表現型に影響を及ぼすなどの難点があった。例えば、実用酵母の有する高い発酵力の原因遺伝子を特定したい場合、栄養要求性変異遺伝子をマーカーとして幾つも組み合わせると発酵力の低下を招き、形質を評価することが困難になってしまう。
【０００４】
この問題を解決する手段としては、表現型に影響を及ぼさないDNAマーカーの利用があげられる。酵母においては、制限酵素断片長多型やマイクロサテライト多型に基づくDNAマーカーに関する報告がいくつかあるが(非特許文献1〜6)、作製されたDNAマーカー数は10〜20個と少なく、菌株の分類や微生物管理への応用に限定されたものであった。
【０００５】
このような状況から、酵母サッカロマイセス・セレビジエの有用遺伝子の単離、遺伝子型の決定、有用形質の選抜に実用可能なゲノムワイドなDNAマーカーの開発が待ち望まれていた。
【非特許文献１】Lett Appl Microbiol. 2001 Dec;33(6):461-6., Perez MA, Gallego FJ, Martinez I, Hidalgo P., Detection, distribution and selection of microsatellites (SSRs) in the genome of the yeast Saccharomyces cerevisiae as molecular markers.
【非特許文献２】Gene. 1996 Sep 26;174(1):165-74., Richard GF, Dujon B., Distribution and variability of trinucleotide repeats in the genome of the yeast Saccharomyces cerevisiae.
【非特許文献３】Lett Appl Microbiol. 2001 Jul;33(1):71-5., Gonzalez Techera A, Jubany S, Carrau FM, Gaggero C., Differentiation of industrial wine yeast strains using microsatellite markers.
【非特許文献４】Int J Food Microbiol. 2003 Jul 15;84(1):33-9., Capece A, Salzano G, Romano P., Molecular typing techniques as a tool to differentiate non-Saccharomyces wine species.
【非特許文献５】Appl Environ Microbiol. 1996 Jan;62(1):41-6., Baleiras Couto MM, Eijsma B, Hofstra H, Huis in't Veld JH, van der Vossen JM., Evaluation of molecular typing techniques to assign genetic diversity among Saccharomyces cerevisiae strains.
【非特許文献６】Res Microbiol. 1995 Sep;146(7):587-94., Paffetti D, Barberio C, Casalone E, Cavalieri D, Fani R, Fia G, Mori E, Polsinelli M., DNA fingerprinting by random amplified polymorphic DNA and restriction fragment length polymorphism is useful for yeast typing.
【発明の開示】
【発明が解決しようとする課題】
【０００６】
本発明は、酵母サッカロマイセス・セレビジエの新規DNAマーカー、このDNAマーカーになり得るポリヌクレオチド、このDNAマーカーを検出するためのプライマーセット、このプライマーセットを用いた連鎖解析方法、及びこのプライマーセットを用いた酵母菌株の同定方法を提供することを課題とする。
【課題を解決するための手段】
【０００７】
上記課題を解決するために、本発明者らは、清酒酵母きょうかい7号(K-7)ゲノムのショットガンシーケンスを実施し、インターネットで公開されている実験室酵母S288Cのゲノム配列と比較することにより、繰り返し数が異なるマイクロサテライト多型、及びマイクロサテライト近傍の挿入欠失型多型が存在する場所をゲノムワイドに特定するに至った。
【０００８】
さらに、これらの多型を示すDNA配列を含む断片を特異的に増幅することができるプライマーオリゴヌクレオチドを設計し、PCR増幅産物のフラグメント長の違いにより多型を識別可能なゲノムワイドなDNAマーカーを開発した。
【０００９】
本発明においては、168個の多型を見出したが、実際にDNAマーカーとしてプライマーセットを設計した数は118個である。これらは、各染色体上の均一に分布する多型を利用できるように選抜したものであり、これらは連鎖解析に十分な数であるが、目的に応じてプライマーセットを追加設計することも可能である。
【００１０】
すなわち、本発明は、以下のポリヌクレオチド、DNAマーカー、プライマーセット、プライマーセットの組み合わせ、連鎖解析方法、及び酵母菌株の同定方法を提供する。
【００１１】
項1．以下の(1)〜(168)のいずれかのポリヌクレオチド、又はこのポリヌクレオチドにおいて1又は数個のヌクレオチドが挿入、欠失、又は置換されたポリヌクレオチド。
(1)  配列番号1で示されるDNA配列において、塩基番号31118〜31123のATATAC配列を欠き、塩基番号31117及び塩基番号31124の2塩基を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(2)  配列番号1で示されるDNA配列において、塩基番号31124〜31147のAT繰り返しの24塩基がAT繰り返しの20塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(3)  配列番号1で示されるDNA配列において、塩基番号77496〜77510のGAA繰り返しの15塩基がGAA繰り返しの30塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(4)  配列番号1で示されるDNA配列において、塩基番号77514〜77540のGAA繰り返しの27塩基がGAA繰り返しの6塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(5)  配列番号1で示されるDNA配列において、塩基番号110697〜110716のAG繰り返しの20塩基がAGAGAGAGAGAGAGAGA配列に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(6)  配列番号1で示されるDNA配列において、塩基番号110717〜110724のA繰り返しの8塩基がA繰り返しの6塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(7)  配列番号1で示されるDNA配列において、塩基番号152108〜152126のT繰り返しの19塩基がT繰り返しの21塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(8)  配列番号1で示されるDNA配列において、塩基番号192268〜192271のGC繰り返しの4塩基がGCの2塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(9)  配列番号1で示されるDNA配列において、塩基番号192278と塩基番号192279との間にCTACTACTA配列が挿入された11塩基の配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(10)  配列番号1で示されるDNA配列において、塩基番号192279〜192281のTTAがTTA繰り返しの18塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(11)  配列番号1で示されるDNA配列において、塩基番号192286〜192315のTAC繰り返しの30塩基がTAC繰り返しの9塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(12)  配列番号2で示されるDNA配列において、塩基番号45954〜45968のT繰り返しの15塩基がT繰り返しの13塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(13)  配列番号2で示されるDNA配列において、塩基番号138278〜138292のT繰り返しの15塩基がT繰り返しの17塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(14)  配列番号2で示されるDNA配列において、塩基番号251595〜251610のT繰り返しの16塩基がT繰り返しの17塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(15)  配列番号2で示されるDNA配列において、塩基番号299556と塩基番号299557との間にGGAAGAGAGCGA配列が挿入された14塩基の配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(16)  配列番号2で示されるDNA配列において、塩基番号452269〜452278のA繰り返しの10塩基がA繰り返しの11塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(17)  配列番号2で示されるDNA配列において、塩基番号452393と塩基番号452394との間にAGAA配列が挿入された6塩基の配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(18)  配列番号2で示されるDNA配列において、塩基番号499605〜499626のGGCAGTCAATGTAAATTTGTGA配列を欠き、塩基番号499604及び塩基番号499627の2塩基を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(19)  配列番号2で示されるDNA配列において、塩基番号628893〜628908のTA繰り返しの16塩基がTA繰り返しの18塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(20)  配列番号2で示されるDNA配列において、塩基番号723659〜723673のA繰り返しの15塩基がA繰り返しの11塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(21)  配列番号3で示されるDNA配列において、塩基番号62744〜62749のCA繰り返しの6塩基がCA繰り返しの4塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(22)  配列番号3で示されるDNA配列において、塩基番号62750〜62769のTA繰り返しの20塩基がTA繰り返しの28塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(23)  配列番号3で示されるDNA配列において、塩基番号164228〜164245のTGC繰り返しの18塩基がTGC繰り返しの15塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(24)  配列番号3で示されるDNA配列において、塩基番号210468〜210482のTTC繰り返しの15塩基がTTC繰り返しの12塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(25)  配列番号3で示されるDNA配列において、塩基番号260022〜260041のTA繰り返しの20塩基がTA繰り返しの22塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(26)  配列番号4で示されるDNA配列において、塩基番号92684〜92709のA繰り返しの26塩基がA繰り返しの23塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(27)  配列番号4で示されるDNA配列において、塩基番号169824〜169833のAT繰り返しの10塩基がAT繰り返しの14塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(28)  配列番号4で示されるDNA配列において、塩基番号169835〜169854のTA繰り返しの20塩基がTA繰り返しの28塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(29)  配列番号4で示されるDNA配列において、塩基番号169893〜169910のA繰り返しの18塩基がA繰り返しの20塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(30)  配列番号4で示されるDNA配列において、塩基番号329788〜329797のTA繰り返しの10塩基がTA繰り返しの30塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(31)  配列番号4で示されるDNA配列において、塩基番号390422〜390436のTAT繰り返しの15塩基がTAT繰り返しの39塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(32)  配列番号4で示されるDNA配列において、塩基番号390457〜390465のTTA繰り返しの9塩基がTTA繰り返しの15塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(33)  配列番号4で示されるDNA配列において、塩基番号390449と塩基番号390450との間にATAGTTTGTT配列が挿入された12塩基を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(34)  配列番号4で示されるDNA配列において、塩基番号538730〜538759のTA繰り返しの30塩基がTA繰り返しの16塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(35)  配列番号4で示されるDNA配列において、塩基番号584615〜584626のCGA繰り返しの12塩基がCGA繰り返しの24塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(36)  配列番号4で示されるDNA配列において、塩基番号694836〜694853のCAG繰り返しの18塩基がCAG繰り返しの21塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(37)  配列番号4で示されるDNA配列において、塩基番号838091と塩基番号838092との間にAAGAAC配列が挿入された8塩基を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(38)  配列番号4で示されるDNA配列において、塩基番号927583〜927619の配列がCGCTACTGGTGCTGGT配列に置換されたこの16塩基を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(39)  配列番号4で示されるDNA配列において、塩基番号1059941と塩基番号1059942との間にGAGAGGAAGAAGAAGAGGAAG配列が挿入された23塩基を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(40)  配列番号4で示されるDNA配列において、塩基番号1059942〜1059956のGAAGAAAAAGAGGAA配列がこの配列の繰り返しの30塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(41)  配列番号4で示されるDNA配列において、塩基番号1279155〜1279168のAC繰り返しの14塩基がAC繰り返しの12塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(42)  配列番号4で示されるDNA配列において、塩基番号1418460〜1418481のAT繰り返しの22塩基がAT繰り返しの18塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(43)  配列番号5で示されるDNA配列において、塩基番号81213〜81236のTTA繰り返しの24塩基がTTA繰り返しの30塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(44)  配列番号5で示されるDNA配列において、塩基番号172598〜172615のAT繰り返しの18塩基がAT繰り返しの22塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(45)  配列番号5で示されるDNA配列において、塩基番号225783〜225804のAT繰り返しの22塩基がAT繰り返しの26塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(46)  配列番号5で示されるDNA配列において、塩基番号311721〜311725のTGGTT配列を欠き、塩基番号311720及び塩基番号311726の2塩基を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(47)  配列番号5で示されるDNA配列において、塩基番号430556〜430570のA繰り返しの15塩基がA繰り返しの16塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(48)  配列番号5で示されるDNA配列において、塩基番号490207〜490242のTGTTCA繰り返しの36塩基がTGTTCA繰り返しの30塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(49)  配列番号5で示されるDNA配列において、塩基番号490243〜490266のTATTCA繰り返しの24塩基がTATTCA繰り返しの18塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(50)  配列番号5で示されるDNA配列において、塩基番号545369〜545379のA繰り返しの11塩基がA繰り返しの10塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(51)  配列番号6で示されるDNA配列において、塩基番号73358〜73384のATT繰り返しの27塩基がATT繰り返しの39塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(52)  配列番号6で示されるDNA配列において、塩基番号107804〜107811のTGTA繰り返しの8塩基がTGTA繰り返しの20塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(53)  配列番号6で示されるDNA配列において、塩基番号107812〜107831のTG繰り返しの20塩基がTG繰り返しの18塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(54)  配列番号6で示されるDNA配列において、塩基番号182876と塩基番号182877との間にCGTGTGTGCGTG配列が挿入された14塩基を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(55)  配列番号6で示されるDNA配列において、塩基番号227466〜227486のT繰り返しの21塩基がT繰り返しの20塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(56)  配列番号7で示されるDNA配列において、塩基番号23643〜23657のACG繰り返しの15塩基がACG繰り返しの42塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(57)  配列番号７で示されるDNA配列において、塩基番号158990と塩基番号158991との間にAGCACAAGCTCAGGCTCAAGCACAAGCTCAGGCTCAAGCACA配列が挿入された42塩基を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(58)  配列番号7で示されるDNA配列において、塩基番号245647〜245685のCAA繰り返しの39塩基がCAA繰り返しの15塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(59)  配列番号7で示されるDNA配列において、塩基番号397841〜397860のA繰り返しの20塩基がA繰り返しの17塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(60)  配列番号7で示されるDNA配列において、塩基番号555986〜556016のA繰り返しの31塩基がA繰り返しの26塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(61)  配列番号7で示されるDNA配列において、塩基番号の640803〜640818のCATT繰り返しの16塩基がCATT繰り返しの12塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(62)  配列番号7で示されるDNA配列において、塩基番号808392〜808417のTA繰り返しの26塩基がTA繰り返しの32塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(63)  配列番号7で示されるDNA配列において、塩基番号910118〜910141のT繰り返しの24塩基がT繰り返しの18塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(64)  配列番号7で示されるDNA配列において、塩基番号988901〜988921のAGC繰り返しの21塩基がAGC繰り返しの18塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(65)  配列番号8で示されるDNA配列において、塩基番号49390と塩基番号49391との間にACCACTACAAGCACCACATCGTCGACTTCT配列が挿入された30塩基を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(66)  配列番号8で示されるDNA配列において、塩基番号169193と塩基番号169194との間にTTG配列が挿入された5塩基を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(67)  配列番号8で示されるDNA配列において、塩基番号169196と塩基番号169197との間にTTG配列が挿入された5塩基を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(68)  配列番号8で示されるDNA配列において、塩基番号169203〜169211のCTG繰り返しの9塩基がCTG繰り返しの21塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(69)  配列番号8で示されるDNA配列において、塩基番号464933〜464946のTA繰り返しの14塩基がTA繰り返しの20塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(70)  配列番号9で示されるDNA配列において、塩基番号56789〜56812のAGC繰り返しの24塩基がAGC繰り返しの27塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(71)  配列番号9で示されるDNA配列において、塩基番号128505〜128525のTCC繰り返しの9塩基がTCC繰り返しの15塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(72)  配列番号9で示されるDNA配列において、塩基番号177461〜177464のCA繰り返しの4塩基がCAの2塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(73)  配列番号9で示されるDNA配列において、塩基番号177465〜177482のTA繰り返しの18塩基がTA繰り返しの12塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(74)  配列番号9で示されるDNA配列において、塩基番号240937〜240943のT繰り返しの7塩基がT繰り返しの6塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(75)  配列番号9で示されるDNA配列において、塩基番号241030〜241050のA繰り返しの21塩基がA繰り返しの20塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(76)  配列番号9で示されるDNA配列において、塩基番号310499〜310509のT繰り返しの11塩基がT繰り返しの12塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(77)  配列番号9で示されるDNA配列において、塩基番号376612〜376635のCGA繰り返しの24塩基がCGA繰り返しの27塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(78)  配列番号9で示されるDNA配列において、塩基番号419477〜419492のTA繰り返しの16塩基がTA繰り返しの22塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(79)  配列番号9で示されるDNA配列において、塩基番号419493〜419498のTG繰り返しの6塩基がTG繰り返しの8塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(80)  配列番号9で示されるDNA配列において、塩基番号419542〜419548のA繰り返しの7塩基がA繰り返しの8塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(81)  配列番号9示されるDNA配列において、塩基番号419562〜419564のTAA繰り返し配列を欠き、塩基番号419561及び塩基番号419565の2塩基を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(82)  配列番号10で示されるDNA配列において、塩基番号76562〜76583のAT繰り返しの22塩基がAT繰り返しの20塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(83)  配列番号10で示されるDNA配列において、塩基番号150066〜150080のTTG繰り返しの15塩基がTTG繰り返しの18塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(84)  配列番号10で示されるDNA配列において、塩基番号265789〜265806のT繰り返しの18塩基がT繰り返しの13塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(85)  配列番号10で示されるDNA配列において、塩基番号316997〜317014のTA繰り返しの18塩基がTA繰り返しの12塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(86)  配列番号10で示されるDNA配列において、塩基番号403983〜404006のCAG繰り返しの24塩基がCAG繰り返しの21塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(87)  配列番号10で示されるDNA配列において、塩基番号470045〜470092のTAA繰り返しの48塩基がTAA繰り返しの78塩基に置換された配列を含む100〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(88)  配列番号10で示されるDNA配列において、塩基番号639907〜639944のCA繰り返しの38塩基がCA繰り返しの18塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(89)  配列番号10で示されるDNA配列において、塩基番号639945〜639956のTA繰り返しの12塩基がTA繰り返しの16塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(90)  配列番号11で示されるDNA配列において、塩基番号26593〜26624のAT繰り返しの32塩基がAT繰り返しの29塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(91)  配列番号11で示されるDNA配列において、塩基番号78805〜78826のTA繰り返しの22塩基がTA繰り返しの38塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(92)  配列番号11で示されるDNA配列において、塩基番号78844〜78853のA繰り返しの10塩基がA繰り返しの9塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(93)  配列番号11で示されるDNA配列において、塩基番号164850〜164883のTA繰り返しの34塩基がTA繰り返しの22塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(94)  配列番号11で示されるDNA配列において、塩基番号165093〜165098のAGA繰り返しの6塩基がAGAの3塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(95)  配列番号11で示されるDNA配列において、塩基番号232190〜232210のTAA繰り返しの21塩基がTAA繰り返しの18塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(96)  配列番号11で示されるDNA配列において、塩基番号232254〜232256のATA配列を欠き、塩基番号232253及び塩基番号232257の2塩基を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(97)  配列番号11で示されるDNA配列において、塩基番号280034〜280039のTGA繰り返しの6塩基がTGA繰り返しの12塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(98)  配列番号11で示されるDNA配列において、塩基番号280114〜280124のA繰り返しの11塩基がA繰り返しの10塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(99)  配列番号11で示されるDNA配列において、塩基番号382199と塩基番号382200との間にGT配列が挿入された4塩基を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(100)  配列番号11で示されるDNA配列において、塩基番号382204と塩基番号382205との間にT配列が挿入された3塩基を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(101)  配列番号11で示されるDNA配列において、塩基番号382213のT配列を欠き、塩基番号382212及び塩基番号382214の2塩基を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(102)  配列番号11で示されるDNA配列において、塩基番号464685〜464688のTA繰り返しの4塩基がTA繰り返しの6塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(103)  配列番号11で示されるDNA配列において、塩基番号464761〜464762のAT配列がAT繰り返しの塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(104)  配列番号11で示されるDNA配列において、塩基番号464816〜464835のTA繰り返しの20塩基がTA繰り返しの16塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(105)  配列番号11で示されるDNA配列において、塩基番号464836〜464851のAATATATATATATATA配列を欠き、塩基番号464835及び464852の2塩基を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(106)  配列番号11で示されるDNA配列において、塩基番号523314と塩基番号523315との間にTTGCTGCTGCTG配列が挿入された14塩基を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(107)  配列番号11で示されるDNA配列において、塩基番号566745〜566768のAGC繰り返しの24塩基がAGC繰り返しの30塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(108)  配列番号11で示されるDNA配列において、塩基番号612730〜612735のAGA繰り返しの6塩基がAGA繰り返しの9塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(109)  配列番号12で示されるDNA配列において、塩基番号35378〜35387のA繰り返しの10塩基がA繰り返しの11塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(110)  配列番号12で示されるDNA配列において、塩基番号35406〜35410のA繰り返しの5塩基がA繰り返しの6塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(111)  配列番号12で示されるDNA配列において、塩基番号35428と塩基番号35429との間にTTATATTAAATTA配列が挿入された15塩基を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(112)  配列番号12で示されるDNA配列において、塩基番号84330と塩基番号84331との間にCGCGGACGCGGAAGGA配列が挿入された18塩基を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(113)  配列番号12で示されるDNA配列において、塩基番号237852〜237875のAAAAAG繰り返しの24塩基がAAAAAGの6塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(114)  配列番号12で示されるDNA配列において、塩基番号511522〜511551のAGC繰り返しの30塩基がAGC繰り返しの27塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(115)  配列番号12で示されるDNA配列において、塩基番号511552〜511557のAACAGC配列を欠き、塩基番号511551及び塩基番号511558の2塩基を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(116)  配列番号12で示されるDNA配列において、塩基番号602125〜602139のTGT繰り返しの15塩基がTGT繰り返しの18塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(117)  配列番号12で示されるDNA配列において、塩基番号881948〜881969のAT繰り返しの22塩基がAT繰り返しの26塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(118)  配列番号12で示されるDNA配列において、塩基番号1002211〜100229のA繰り返しの19塩基がA繰り返しの16塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(119)  配列番号13で示されるDNA配列において、塩基番号44389〜44406のGCA繰り返しの18塩基がGCA繰り返しの15塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(120)  配列番号13で示されるDNA配列において、塩基番号99600〜99617のAT繰り返しの18塩基がAT繰り返しの20塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(121)  配列番号13で示されるDNA配列からなるポリヌクレオチドにおいて、塩基番号159853〜159876のAT繰り返しの24塩基がAT繰り返しの14塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(122)  配列番号13で示されるDNA配列において、塩基番号209865〜209876のTAAGTAATGATG配列を欠き、塩基番号209864及び塩基番号209877の2塩基を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(123)  配列番号13で示されるDNA配列において、塩基番号321328〜321349のTA繰り返しの22塩基がTA繰り返しの12塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(124)  配列番号13で示されるDNA配列において、塩基番号410428〜410442のAAT繰り返しの15塩基がAAT繰り返しの12塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド。
(125)  配列番号13で示されるDNA配列において、塩基番号539498〜539521のCTG繰り返しの24塩基がCTG繰り返しの21塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(126)  配列番号13で示されるDNA配列において、塩基番号625412〜625421のA繰り返しの10塩基がA繰り返しの17塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(127)  配列番号13で示されるDNA配列において、塩基番号625422〜625446のGAAAAAAAGAAAAAAAGAAAAAAAG配列を欠き、塩基番号625421及び塩基番号625447の2塩基を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(128)  配列番号13で示されるDNA配列において、塩基番号703444〜703448のT繰り返しの5塩基がT繰り返しの2塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(129)  配列番号13で示されるDNA配列において、塩基番号703562〜703574のTCTGAAATACGTT配列を欠き、塩基番号703561及び塩基番号703575の2塩基を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(130)  配列番号13で示されるDNA配列において、塩基番号811237〜811263のGTT繰り返しの27塩基がGTT繰り返しの24塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(131)  配列番号13で示されるDNA配列において、塩基番号874559〜874578のT繰り返しの20塩基がT繰り返しの16塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(132)  配列番号14で示されるDNA配列において、塩基番号70025〜70051のGCA繰り返しの27塩基がGCA繰り返しの39塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(133)  配列番号14で示されるDNA配列において、塩基番号70052〜70054のACA配列を欠き、塩基番号70051及び塩基番号70055の2塩基を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(134)  配列番号14で示されるDNA配列において、塩基番号135892と塩基番号135893との間にAAT配列が挿入された5塩基の配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(135)  配列番号14で示されるDNA配列において、塩基番号135906〜135917のTG繰り返しの12塩基がTG繰り返しの10塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(136)  配列番号14で示されるDNA配列において、塩基番号196146〜196149のTC繰り返しの4塩基がTCの2塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(137)  配列番号14で示されるDNA配列において、塩基番号300773〜300782のA繰り返しの10塩基がA繰り返しの11塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(138)  配列番号14で示されるDNA配列において、塩基番号527489〜527803のAT繰り返しの15塩基がAT繰り返しの8塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(139)  配列番号14で示されるDNA配列において、塩基番号606166〜606183のAT繰り返しの18塩基がAT繰り返しの16塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(140)  配列番号14で示されるDNA配列において、塩基番号662255〜662278のCTTGTT繰り返しの24塩基がCTTGTT繰り返しの18塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(141)  配列番号14で示されるDNA配列において、塩基番号721916〜721930のA繰り返しの15塩基がA繰り返しの21塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(142)  配列番号15で示されるDNA配列において、塩基番号53994と塩基番号53995との間にAATGGAAAACCCATCCGAGGTTAA配列が挿入された26塩基の配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(143)  配列番号15で示されるDNA配列において、塩基番号412672〜412674のAAAの3塩基がAAの2塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(144)  配列番号15で示されるDNA配列において、塩基番号412690〜412691のAT配列を欠き、塩基番号412689及び塩基番号412692の2塩基を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(145)  配列番号15で示されるDNA配列において、塩基番号479256〜479259のT繰り返しの4塩基がT繰り返しの5塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(146)  配列番号15で示されるDNA配列において、塩基番号479265と塩基番号479266との間にAT配列が挿入された4塩基の配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(147)  配列番号15で示されるDNA配列において、塩基番号579518〜579541のCAT繰り返しの24塩基がCAT繰り返しの21塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(148)  配列番号15で示されるDNA配列において、塩基番号675325〜675343のT繰り返しの19塩基がT繰り返しの18塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(149)  配列番号15で示されるDNA配列において、塩基番号768688〜768690のAAC配列を欠き、塩基番号768687及び塩基番号768691の2塩基を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(150)  配列番号15で示されるDNA配列において、塩基番号768691〜768702のGAC繰り返しの19塩基がGAC繰り返しの9塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(151)  配列番号15で示されるDNA配列において、塩基番号867908と塩基番号867909との間にC配列が挿入された3塩基の配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(152)  配列番号15で示されるDNA配列において、塩基番号944403〜944411のT繰り返しの9塩基がT繰り返しの10塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(153)  配列番号15で示されるDNA配列において、塩基番号944423〜944425のTTTの3塩基がTTの2塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(154)  配列番号15で示されるDNA配列において、塩基番号944426〜944427のCCの2塩基がCCCの3塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(155)  配列番号15で示されるDNA配列において、塩基番号944454〜944464のT繰り返しの11塩基がT繰り返しの10塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(156)  配列番号15で示されるDNA配列において、塩基番号944468のCの1塩基がCCの2塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(157)  配列番号15で示されるDNA配列において、塩基番号944469〜944492のT繰り返しの24塩基がT繰り返しの21塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(158)  配列番号16で示されるDNA配列において、塩基番号76355〜76372のCT繰り返し18塩基がCT繰り返しの20塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(159)  配列番号16で示されるDNA配列において、塩基番号165850と塩基番号165851との間にCAT配列が挿入された5塩基の配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(160)  配列番号16で示されるDNA配列において、塩基番号212901〜212918のA繰り返しの18塩基がA繰り返しの13塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(161)  配列番号16で示されるDNA配列において、塩基番号298503〜298518のTA繰り返しの16塩基がTA繰り返しの18塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(162)  配列番号16で示されるDNA配列において、塩基番号404721〜404727のA繰り返しの7塩基がA繰り返しの6塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(163)  配列番号16で示されるDNA配列において、塩基番号404731〜404738のT繰り返しの8塩基がT繰り返しの7塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(164)  配列番号16で示されるDNA配列において、塩基番号404757〜404775のT繰り返しの19塩基がT繰り返しの15塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(165)  配列番号16で示されるDNA配列において、塩基番号607995〜608008のT繰り返しの14塩基がT繰り返しの11塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(166)  配列番号16で示されるDNA配列において、塩基番号695612〜695613のTTの2塩基がTTTの3塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(167)  配列番号16で示されるDNA配列において、塩基番号695614〜695628のA繰り返しの15塩基がA繰り返しの11塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(168)  配列番号16で示されるDNA配列において、塩基番号776565〜776574のT繰り返しの10塩基がT繰り返しの8塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
項2．  以下の(I)〜(XVI)のいずれかのポリヌクレオチド。
(I)  項1に記載の(1)〜(11)のポリヌクレオチドからなる群より選ばれる少なくとも2種のポリヌクレオチド、又はこれらのポリヌクレオチドにおいて1又は数個のヌクレオチドが挿入、欠失、又は置換されたポリヌクレオチド
(II)  項1に記載の(12)〜(20)のポリヌクレオチドからなる群より選ばれる少なくとも2種のポリヌクレオチド、又はこれらのポリヌクレオチドにおいて1又は数個のヌクレオチドが挿入、欠失、又は置換されたポリヌクレオチド
(III)  項1に記載の(21)〜(25)のポリヌクレオチドからなる群より選ばれる少なくとも2種のポリヌクレオチド、又はこれらのポリヌクレオチドにおいて1又は数個のヌクレオチドが挿入、欠失、又は置換されたポリヌクレオチド
(IV)  項1に記載の(26)〜(42)のポリヌクレオチドからなる群より選ばれる少なくとも2種のポリヌクレオチド、又はこれらのポリヌクレオチドにおいて1又は数個のヌクレオチドが挿入、欠失、又は置換されたポリヌクレオチド
(V)  項1に記載の(43)〜(50)のポリヌクレオチドからなる群より選ばれる少なくとも2種のポリヌクレオチド、又はこれらのポリヌクレオチドにおいて1又は数個のヌクレオチドが挿入、欠失、又は置換されたポリヌクレオチド
(VI)  項1に記載の(51)〜(55)のポリヌクレオチドからなる群より選ばれる少なくとも2種のポリヌクレオチド、又はこれらのポリヌクレオチドにおいて1又は数個のヌクレオチドが挿入、欠失、又は置換されたポリヌクレオチド
(VII)  項1に記載の(56)〜(64)のポリヌクレオチドからなる群より選ばれる少なくとも2種のポリヌクレオチド、又はこれらのポリヌクレオチドにおいて1又は数個のヌクレオチドが挿入、欠失、又は置換されたポリヌクレオチド
(VIII)  項1に記載の(65)〜(69)のポリヌクレオチドからなる群より選ばれる少なくとも2種のポリヌクレオチド、又はこれらのポリヌクレオチドにおいて1又は数個のヌクレオチドが挿入、欠失、又は置換されたポリヌクレオチド
(IX)  項1に記載の(70)〜(81)のポリヌクレオチドからなる群より選ばれる少なくとも2種のポリヌクレオチド、又はこれらのポリヌクレオチドにおいて1又は数個のヌクレオチドが挿入、欠失、又は置換されたポリヌクレオチド
(X)  項1に記載の(82)〜(89)のポリヌクレオチドからなる群より選ばれる少なくとも2種のポリヌクレオチド、又はこれらのポリヌクレオチドにおいて1又は数個のヌクレオチドが挿入、欠失、又は置換されたポリヌクレオチド
(XI)  項1に記載の(90)〜(108)のポリヌクレオチドからなる群より選ばれる少なくとも2種のポリヌクレオチド、又はこれらのポリヌクレオチドにおいて1又は数個のヌクレオチドが挿入、欠失、又は置換されたポリヌクレオチド
(XII)  項1に記載の(109)〜(118)のポリヌクレオチドからなる群より選ばれる少なくとも2種のポリヌクレオチド、又はこれらのポリヌクレオチドにおいて1又は数個のヌクレオチドが挿入、欠失、又は置換されたポリヌクレオチド
(XIII)  項1に記載の(119)〜(131)のポリヌクレオチドからなる群より選ばれる少なくとも2種のポリヌクレオチド、又はこれらのポリヌクレオチドにおいて1又は数個のヌクレオチドが挿入、欠失、又は置換されたポリヌクレオチド
(XIV)  項1に記載の(132)〜(141)のポリヌクレオチドからなる群より選ばれる少なくとも2種のポリヌクレオチド、又はこれらのポリヌクレオチドにおいて1又は数個のヌクレオチドが挿入、欠失、又は置換されたポリヌクレオチド
(XV)  項1に記載の(142)〜(157)のポリヌクレオチドからなる群より選ばれる少なくとも2種のポリヌクレオチド、又はこれらのポリヌクレオチドにおいて1又は数個のヌクレオチドが挿入、欠失、又は置換されたポリヌクレオチド
(XVI)  項1に記載の(158)〜(168)のポリヌクレオチドからなる群より選ばれる少なくとも2種のポリヌクレオチド、又はこれらのポリヌクレオチドにおいて1又は数個のヌクレオチドが挿入、欠失、又は置換されたポリヌクレオチド
項3．  項1又は2に記載のポリヌクレオチドからなるDNAマーカー。
【００１２】
項4．  以下の(1')〜(168')のいずれかのポリヌクレオチド、又はこのポリヌクレオチドにおいて1又は数個のヌクレオチドが挿入、欠失、又は置換されたポリヌクレオチドからなるDNAマーカー。
(1')  配列番号1で示されるDNA配列において、塩基番号31118〜31123のATATAC配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(2')  配列番号1で示されるDNA配列において、塩基番号31124〜31147のAT繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(3')  配列番号1で示されるDNA配列において、塩基番号77496〜77510のGAA繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(4')  配列番号1で示されるDNA配列において、塩基番号77514〜77540のGAA繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(5')  配列番号1で示されるDNA配列において、塩基番号110697〜110716のAG繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(6')  配列番号1で示されるDNA配列において、塩基番号110717〜110724のA繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(7')  配列番号1で示されるDNA配列において、塩基番号152108〜152126のT繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(8')  配列番号1で示されるDNA配列において、塩基番号192268〜192271のGC繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(9')  配列番号1で示されるDNA配列において、塩基番号192278〜192279の配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(10')  配列番号1で示されるDNA配列において、塩基番号192279〜192281のTTA繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(11')  配列番号1で示されるDNA配列において、塩基番号192286〜192315のTAC繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(12')  配列番号2で示されるDNA配列において、塩基番号45954〜45968のT繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(13')  配列番号2で示されるDNA配列において、塩基番号138278〜138292のT繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(14')  配列番号2で示されるDNA配列において、塩基番号251595〜251610のT繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(15')  配列番号2で示されるDNA配列において、塩基番号299556〜299557の配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(16')  配列番号2で示されるDNA配列において、塩基番号452269〜452278のA繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(17')  配列番号2で示されるDNA配列において、塩基番号452393〜452394の配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(18')  配列番号2で示されるDNA配列において、塩基番号499605〜499626のGGCAGTCAATGTAAATTTGTGA配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(19')  配列番号2で示されるDNA配列において、塩基番号628893〜628908のTA繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(20')  配列番号2で示されるDNA配列において、塩基番号723659〜723673のA繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(21')  配列番号3で示されるDNA配列において、塩基番号62744〜62749のCA繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(22')  配列番号3で示されるDNA配列において、塩基番号62750〜62769のTA繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(23')  配列番号3で示されるDNA配列において、塩基番号164228〜164245のTGC繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(24')  配列番号3で示されるDNA配列において、塩基番号210468〜210482のTTC繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(25')  配列番号3で示されるDNA配列において、塩基番号260022〜260041のTA繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(26')  配列番号4で示されるDNA配列において、塩基番号92684〜92709のA繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(27')  配列番号4で示されるDNA配列において、塩基番号169824〜169833のAT繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(28')  配列番号4で示されるDNA配列において、塩基番号169835〜169854のTA繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(29')  配列番号4で示されるDNA配列において、塩基番号169893〜169910のA繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(30')  配列番号4で示されるDNA配列において、塩基番号329788〜329797のTA繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(31')  配列番号4で示されるDNA配列において、塩基番号390422〜390436のTAT繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(32')  配列番号4で示されるDNA配列において、塩基番号390457〜390465のTTA繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(33')  配列番号4で示されるDNA配列において、塩基番号390449〜390450の配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(34')  配列番号4で示されるDNA配列において、塩基番号538730〜538759のTA繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(35')  配列番号4で示されるDNA配列において、塩基番号584615〜584626のCGA繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(36')  配列番号4で示されるDNA配列において、塩基番号694836〜694853のCAG繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(37')  配列番号4で示されるDNA配列において、塩基番号838091〜838092の配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(38')  配列番号4で示されるDNA配列において、塩基番号927583〜927619の配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(39')  配列番号4で示されるDNA配列において、塩基番号1059941〜1059942の配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(40')  配列番号4で示されるDNA配列において、塩基番号1059942〜1059956のGAAGAAAAAGAGGAA繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(41')  配列番号4で示されるDNA配列において、塩基番号1279155〜1279168のAC繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(42')  配列番号4で示されるDNA配列において、塩基番号1418460〜1418481のAT繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(43')  配列番号5で示されるDNA配列において、塩基番号81213〜81236のTTA繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(44')  配列番号5で示されるDNA配列において、塩基番号172598〜172615のAT繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(45')  配列番号5で示されるDNA配列において、塩基番号225783〜225804のAT繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(46')  配列番号5で示されるDNA配列において、塩基番号311721〜311725の配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(47')  配列番号5で示されるDNA配列において、塩基番号430556〜430570のA繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(48')  配列番号5で示されるDNA配列において、塩基番号490207〜490242のTGTTCA繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(49')  配列番号5で示されるDNA配列において、塩基番号490243〜490266のTATTCA繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(50')  配列番号5で示されるDNA配列において、塩基番号545369〜545379のA繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(51')  配列番号6で示されるDNA配列において、塩基番号73358〜73384のATT繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(52')  配列番号6で示されるDNA配列において、塩基番号107804〜107811のTGTA繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(53')  配列番号6で示されるDNA配列において、塩基番号107812〜107831のTG繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(54')  配列番号6で示されるDNA配列において、塩基番号182876〜182877の配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(55')  配列番号6で示されるDNA配列において、塩基番号227466〜227486のT繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(56')  配列番号7で示されるDNA配列において、塩基番号23643〜23657のACG繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(57')  配列番号7で示されるDNA配列において、塩基番号158990〜158991の配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(58')  配列番号7で示されるDNA配列において、塩基番号245647〜245685のCAA繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(59')  配列番号7で示されるDNA配列において、塩基番号397841〜397860のA繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(60')  配列番号7で示されるDNA配列において、塩基番号555986〜556016のA繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(61')  配列番号7で示されるDNA配列において、塩基番号の640803〜640818のCATT繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(62')  配列番号7で示されるDNA配列において、塩基番号808392〜808417のTA繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(63')  配列番号7で示されるDNA配列において、塩基番号910118〜910141のT繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(64')  配列番号7で示されるDNA配列において、塩基番号988901〜988921のAGC繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(65')  配列番号8で示されるDNA配列において、塩基番号49390〜49391の配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(66')  配列番号8で示されるDNA配列において、塩基番号169193〜169194の配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(67')  配列番号8で示されるDNA配列において、塩基番号169196〜169197の配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(68')  配列番号8で示されるDNA配列において、塩基番号169203〜169211のCTG繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(69')  配列番号8で示されるDNA配列において、塩基番号464933〜464946のTA繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(70')  配列番号9で示されるDNA配列において、塩基番号56789〜56812のAGC繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(71')  配列番号9で示されるDNA配列において、塩基番号128505〜128525のTCC繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(72')  配列番号9で示されるDNA配列において、塩基番号177461〜177464のCA繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(73')  配列番号9で示されるDNA配列において、塩基番号177465〜177482のTA繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(74')  配列番号9で示されるDNA配列において、塩基番号240937〜240943のT繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(75')  配列番号9で示されるDNA配列において、塩基番号241030〜241050のA繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(76')  配列番号9で示されるDNA配列において、塩基番号310499〜310509のT繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(77')  配列番号9で示されるDNA配列において、塩基番号376612〜376635のCGA繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(78')  配列番号9で示されるDNA配列において、塩基番号419477〜419492のTA繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(79')  配列番号9で示されるDNA配列において、塩基番号419493〜419498のTG繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(80')  配列番号9で示されるDNA配列において、塩基番号419542〜419548のA繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(81')  配列番号9示されるDNA配列において、塩基番号419562〜419564のTAA繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(82')  配列番号10で示されるDNA配列において、塩基番号76562〜76583のAT繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(83')  配列番号10で示されるDNA配列において、塩基番号150066〜150080のTTG繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(84')  配列番号10で示されるDNA配列において、塩基番号265789〜1265806のT繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(85')  配列番号10で示されるDNA配列において、塩基番号316997〜317014のTA繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(86')  配列番号10で示されるDNA配列において、塩基番号403983〜404006のCAG繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(87')  配列番号10で示されるDNA配列において、塩基番号470045〜470092のTAA繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(88')  配列番号10で示されるDNA配列において、塩基番号639907〜639944のCA繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(89')  配列番号10で示されるDNA配列において、塩基番号639945〜639956のTA繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(90')  配列番号11で示されるDNA配列において、塩基番号26593〜26624のAT繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(91')  配列番号11で示されるDNA配列において、塩基番号78805〜78826のTA繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(92')  配列番号11で示されるDNA配列において、塩基番号78844〜78853のA繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(93')  配列番号11で示されるDNA配列において、塩基番号164850〜164883のTA繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(94')  配列番号11で示されるDNA配列において、塩基番号165093〜165098のAGA繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(95')  配列番号11で示されるDNA配列において、塩基番号232190〜232210のTAA繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(96')  配列番号11で示されるDNA配列において、塩基番号232254〜232256のATA配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(97')  配列番号11で示されるDNA配列において、塩基番号280034〜280039のTGA繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(98')  配列番号11で示されるDNA配列において、塩基番号280114〜280124のA繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(99')  配列番号11で示されるDNA配列において、塩基番号382199〜382200の配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(100')  配列番号11で示されるDNA配列において、塩基番号382204〜382205の配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(101')  配列番号11で示されるDNA配列において、塩基番号382213のT配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(102')  配列番号11で示されるDNA配列において、塩基番号464685〜464688のTA繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(103')  配列番号11で示されるDNA配列において、塩基番号464761〜464762のAT配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(104')  配列番号11で示されるDNA配列において、塩基番号464816〜464835のTA繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(105')  配列番号11で示されるDNA配列において、塩基番号464836〜464851のAATATATATATATATA配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(106')  配列番号11で示されるDNA配列において、塩基番号523314〜523315の配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(107')  配列番号11で示されるDNA配列において、塩基番号566745〜566768のAGC繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(108')  配列番号11で示されるDNA配列において、塩基番号612730〜612735のAGA繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(109')  配列番号12で示されるDNA配列において、塩基番号35378〜35387のA繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(110')  配列番号12で示されるDNA配列において、塩基番号35406〜35410のA繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(111')  配列番号12で示されるDNA配列において、塩基番号35428〜35429の配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(112')  配列番号12で示されるDNA配列において、塩基番号84330〜84331の配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(113')  配列番号12で示されるDNA配列において、塩基番号237852〜237875のAAAAAG繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(114')  配列番号12で示されるDNA配列において、塩基番号511522〜511551のAGC繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(115')  配列番号12で示されるDNA配列において、塩基番号511552〜511557のAACAGC配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(116')  配列番号12で示されるDNA配列において、塩基番号602125〜602139のTGT繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(117')  配列番号12で示されるDNA配列において、塩基番号881948〜881969のAT繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(118')  配列番号12で示されるDNA配列において、塩基番号1002211〜100229のA繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(119')  配列番号13で示されるDNA配列において、塩基番号44389〜44406のGCA繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(120')  配列番号13で示されるDNA配列において、塩基番号99600〜99617のAT繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(121')  配列番号13で示されるDNA配列において、塩基番号159853〜159876のAT繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(122')  配列番号13で示されるDNA配列において、塩基番号209865〜209876のTAAGTAATGATG配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(123')  配列番号13で示されるDNA配列において、塩基番号321328〜321349のTA繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(124')  配列番号13で示されるDNA配列において、塩基番号410428〜410442のAAT繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(125')  配列番号13で示されるDNA配列において、塩基番号539498〜539521のCTG繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(126')  配列番号13で示されるDNA配列において、塩基番号625412〜625421のA繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(127')  配列番号13で示されるDNA配列において、塩基番号625422〜625446のGAAAAAAAGAAAAAAAGAAAAAAAG配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(128')  配列番号13で示されるDNA配列において、塩基番号703444〜703448のT繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(129')  配列番号13で示されるDNA配列において、塩基番号703562〜703574のTCTGAAATACGTT配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(130')  配列番号13で示されるDNA配列において、塩基番号811237〜811263のGTT繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(131')  配列番号13で示されるDNA配列において、塩基番号874559〜874578のT繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(132')  配列番号14で示されるDNA配列において、塩基番号70025〜70051のGCA繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(133')  配列番号14で示されるDNA配列において、塩基番号70052〜70054のACA配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(134')  配列番号14で示されるDNA配列において、塩基番号135892〜135893の配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(135')  配列番号14で示されるDNA配列において、塩基番号135906〜135917のTG繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(136')  配列番号14で示されるDNA配列において、塩基番号196146〜196149のTC繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(137')  配列番号14で示されるDNA配列において、塩基番号300773〜300782のA繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(138')  配列番号14で示されるDNA配列において、塩基番号527489〜527803のAT繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(139')  配列番号14で示されるDNA配列において、塩基番号606166〜606183のAT繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(140')  配列番号14で示されるDNA配列において、塩基番号662255〜662278のCTTGTT繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(141')  配列番号14で示されるDNA配列において、塩基番号721916〜721930のA繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(142')  配列番号15で示されるDNA配列において、塩基番号53994〜53995の配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からポリヌクレオチド
(143')  配列番号15で示されるDNA配列において、塩基番号412672〜412674のA繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(144')  配列番号15で示されるDNA配列において、塩基番号412690〜412691のAT配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(145')  配列番号15で示されるDNA配列において、塩基番号479256〜479259のT繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(146')  配列番号15で示されるDNA配列において、塩基番号479265〜479266の配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(147')  配列番号15で示されるDNA配列において、塩基番号579518〜579541のCAT繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(148')  配列番号15で示されるDNA配列において、塩基番号675325〜675343のT繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(149')  配列番号15で示されるDNA配列において、塩基番号768688〜768690のAAC配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチドー
(150')  配列番号15で示されるDNA配列において、塩基番号768691〜768702のGAC繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(151')  配列番号15で示されるDNA配列において、塩基番号867908〜867909の配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(152')  配列番号15で示されるDNA配列において、塩基番号944403〜944411のT繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(153')  配列番号15で示されるDNA配列において、塩基番号944423〜944425のT繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(154')  配列番号15で示されるDNA配列において、塩基番号944426〜944427のC繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(155')  配列番号15で示されるDNA配列において、塩基番号944454〜944464のT繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(156')  配列番号15で示されるDNA配列において、塩基番号944468〜944468のC配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(157')  配列番号15で示されるDNA配列において、塩基番号944469〜944492のT繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(158')  配列番号16で示されるDNA配列において、塩基番号76355〜76372のCT繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(159')  配列番号16で示されるDNA配列において、塩基番号165850〜165851の配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(160')  配列番号16で示されるDNA配列において、塩基番号212901〜212918のA繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(161')  配列番号16で示されるDNA配列において、塩基番号298503〜298518のTA繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチドー
(162')  配列番号16で示されるDNA配列において、塩基番号404721〜404727のA繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(163')  配列番号16で示されるDNA配列において、塩基番号404731〜404738のT繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(164')  配列番号16で示されるDNA配列において、塩基番号404757〜404775のT繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(165')  配列番号16で示されるDNA配列において、塩基番号607995〜608008のT繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(166')  配列番号16で示されるDNA配列において、塩基番号695612〜695613のT繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(167')  配列番号16で示されるDNA配列において、塩基番号695614〜695628のA繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(168')  配列番号16で示されるDNA配列において、塩基番号776565〜776574のT繰り返し配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
項5．  以下の(I')〜(XVI')のいずれかのDNAマーカー。
(I')  項4に記載の(1')〜(11')のポリヌクレオチドからなるDNAマーカーの群より選ばれる少なくとも2種のDNAマーカー、又は項4に記載の(1')〜(11')のポリヌクレオチドにおいて1又は複数のヌクレオチドが挿入、欠失、又は置換されたポリヌクレオチドからなるDNAマーカーの群より選ばれる少なくとも2種のDNAマーカー
(II')  項4に記載の(12)〜(20')のポリヌクレオチドからなるDNAマーカーの群より選ばれる少なくとも2種のDNAマーカー、又は項4に記載の(12')〜(20')のポリヌクレオチドにおいて1又は複数のヌクレオチドが挿入、欠失、又は置換されたポリヌクレオチドからなるDNAマーカーの群より選ばれる少なくとも2種のDNAマーカー
(III')  項4に記載の(21')〜(25')のポリヌクレオチドからなるDNAマーカーの群より選ばれる少なくとも2種のDNAマーカー、又は項4に記載の(21')〜(25')のポリヌクレオチドにおいて1又は複数のヌクレオチドが挿入、欠失、又は置換されたポリヌクレオチドからなるDNAマーカーの群より選ばれる少なくとも2種のDNAマーカー
(IV')  項4に記載の(26)〜(42')のポリヌクレオチドからなるDNAマーカーの群より選ばれる少なくとも2種のDNAマーカー、又は項4に記載の(26')〜(42')のポリヌクレオチドにおいて1又は複数のヌクレオチドが挿入、欠失、又は置換されたポリヌクレオチドからなるDNAマーカーの群より選ばれる少なくとも2種のDNAマーカー
(V')  項4に記載の(43')〜(50')のポリヌクレオチドからなるDNAマーカーの群より選ばれる少なくとも2種のDNAマーカー、又は項4に記載の(43')〜(50')のポリヌクレオチドにおいて1又は複数のヌクレオチドが挿入、欠失、又は置換されたポリヌクレオチドからなるDNAマーカーの群より選ばれる少なくとも2種のDNAマーカー
(VI')  項4に記載の(51')〜(55')のポリヌクレオチドからなるDNAマーカーの群より選ばれる少なくとも2種のDNAマーカー、又は項4に記載の(51')〜(55')のポリヌクレオチドにおいて1又は複数のヌクレオチドが挿入、欠失、又は置換されたポリヌクレオチドからなるDNAマーカーの群より選ばれる少なくとも2種のDNAマーカー
(VII')  項4に記載の(56')〜(64')のポリヌクレオチドからなるDNAマーカーの群より選ばれる少なくとも2種のDNAマーカー、又は項4に記載の(56')〜(64')のポリヌクレオチドにおいて1又は複数のヌクレオチドが挿入、欠失、又は置換されたポリヌクレオチドからなるDNAマーカーの群より選ばれる少なくとも2種のDNAマーカー
(VIII')  項4に記載の(65')〜(69')のポリヌクレオチドからなるDNAマーカーの群より選ばれる少なくとも2種のDNAマーカー、又は項4に記載の(65')〜(69')のポリヌクレオチドにおいて1又は複数のヌクレオチドが挿入、欠失、又は置換されたポリヌクレオチドからなるDNAマーカーの群より選ばれる少なくとも2種のDNAマーカー
(IX')  項4に記載の(70')〜(81')のポリヌクレオチドからなるDNAマーカーの群より選ばれる少なくとも2種のDNAマーカー、又は項4に記載の(70')〜(81')のポリヌクレオチドにおいて1又は複数のヌクレオチドが挿入、欠失、又は置換されたポリヌクレオチドからなるDNAマーカーの群より選ばれる少なくとも2種のDNAマーカー
(X')  項4に記載の(82')〜(89')のポリヌクレオチドからなるDNAマーカーの群より選ばれる少なくとも2種のDNAマーカー、又は項4に記載の(82')〜(89')のポリヌクレオチドにおいて1又は複数のヌクレオチドが挿入、欠失、又は置換されたポリヌクレオチドからなるDNAマーカーの群より選ばれる少なくとも2種のDNAマーカー
(XI')  項4に記載の(90')〜(108')のポリヌクレオチドからなるDNAマーカーの群より選ばれる少なくとも2種のDNAマーカー、又は項4に記載の(90')〜(108')のポリヌクレオチドにおいて1又は複数のヌクレオチドが挿入、欠失、又は置換されたポリヌクレオチドからなるDNAマーカーの群より選ばれる少なくとも2種のDNAマーカー
(XII')  項4に記載の(109')〜(118')のポリヌクレオチドからなるDNAマーカーの群より選ばれる少なくとも2種のDNAマーカー、又は項4に記載の(109')〜(118') のポリヌクレオチドにおいて1又は複数のヌクレオチドが挿入、欠失、又は置換されたポリヌクレオチドからなるDNAマーカーの群より選ばれる少なくとも2種のDNAマーカー
(XIII')  項4に記載の(119')〜(131')のポリヌクレオチドからなるDNAマーカーの群より選ばれる少なくとも2種のDNAマーカー、又は項4に記載の(119')〜(131')のポリヌクレオチドにおいて1又は複数のヌクレオチドが挿入、欠失、又は置換されたポリヌクレオチドからなるDNAマーカーの群より選ばれる少なくとも2種のDNAマーカー
(XIV')  項4に記載の(132')〜(141')のポリヌクレオチドからなるDNAマーカーの群より選ばれる少なくとも2種のDNAマーカー、又は項4に記載の(132')〜(141')のポリヌクレオチドにおいて1又は複数のヌクレオチドが挿入、欠失、又は置換されたポリヌクレオチドからなるDNAマーカーの群より選ばれる少なくとも2種のDNAマーカー
(XV')  項4に記載の(142')〜(157')のポリヌクレオチドからなるDNAマーカーの群より選ばれる少なくとも2種のDNAマーカー、又は項4に記載の(142')〜(157')のポリヌクレオチドにおいて1又は複数のヌクレオチドが挿入、欠失、又は置換されたポリヌクレオチドからなるDNAマーカーの群より選ばれる少なくとも2種のDNAマーカー
(XVI')  項4に記載の(158')〜(168')のポリヌクレオチドからなるDNAマーカーの群より選ばれる少なくとも2種のDNAマーカー、又は項4に記載の(158')〜(168')のポリヌクレオチドにおいて1又は複数のヌクレオチドが挿入、欠失、又は置換されたポリヌクレオチドからなるDNAマーカーの群より選ばれる少なくとも2種のDNAマーカー
項6．  以下の（200）〜(317)のいずれかのプライマーセット。
【００１３】
(200)  配列番号17に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号18に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(201)  配列番号19に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号20に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(202)  配列番号21に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号22に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(203)  配列番号23に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号24に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(204)  配列番号25に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号26に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(205)  配列番号27に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号28に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(206)  配列番号29に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号30に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(207)  配列番号31に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号32に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(208)  配列番号33に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号34に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(209)  配列番号35に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号36に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(210)  配列番号37に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号38に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(211)  配列番号39に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号40に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(212)  配列番号41に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号42に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(213)  配列番号43に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号44に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(214)  配列番号45に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号46に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(215)  配列番号47に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号48に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(216)  配列番号49に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号50に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(217)  配列番号51に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号52に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(218)  配列番号53に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号54に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(219)  配列番号55に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号56に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(220)  配列番号57に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号58に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(221)  配列番号59に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号60に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(222)  配列番号61に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号62に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(223)  配列番号63に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号64に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(224)  配列番号65に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号66に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(225)  配列番号67に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号68に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(226)  配列番号69に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号70に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(227)  配列番号71に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号72に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(228)  配列番号73に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号74に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(229)  配列番号75に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号76に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(230)  配列番号77に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号78に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(231)  配列番号79に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号80に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(232)  配列番号81に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号82に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(233)  配列番号83に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号84に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(234)  配列番号85に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号86に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(235)  配列番号87に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号88に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(236)  配列番号89に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号90に示される塩基配列をを3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(237)  配列番号91に示される塩基配列をを3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号92に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(238)  配列番号93に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号94に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(239)  配列番号95に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号96に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(240)  配列番号97に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号98に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(241)  配列番号99に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号100に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(242)  配列番号101に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号102に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(243)  配列番号103に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号104に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(244)  配列番号105に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号106に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(245)  配列番号107に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号108に示されるを3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(246)  配列番号109に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号110に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(247)  配列番号111に示される塩基配列をを3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号112に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(248)  配列番号113に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号114に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(249)  配列番号115に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号116に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(250)  配列番号117に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号118に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(251)  配列番号119に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号120に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(252)  配列番号121に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号122に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(253)  配列番号123に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号124に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(254)  配列番号125に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号126に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(255)  配列番号127に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号128に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(256)  配列番号129に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号130に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(257)  配列番号131に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号132に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(258)  配列番号133に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号134に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(259)  配列番号135に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号136に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(260)  配列番号137に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号138に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(261)  配列番号139に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号140に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(262)  配列番号141に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号142に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(263)  配列番号143に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号144に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(264)  配列番号145に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号146に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(265)  配列番号147に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号148に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(266)  配列番号149に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号150に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(267)  配列番号151に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号152に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(268)  配列番号153に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号154に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(269)  配列番号155に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号156に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(270)  配列番号157に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号158に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(271)  配列番号159に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号160に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(272)  配列番号161に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号162に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(273)  配列番号163に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号164に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(274)  配列番号165に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号166に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(275)  配列番号167に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号168に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(276)  配列番号169に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号170に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(277)  配列番号171に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号172に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(278)  配列番号173に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号174に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(279)  配列番号175に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号176に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(280)  配列番号177に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号178に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(281)  配列番号179に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号180に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(282)  配列番号181に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号182に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(283)  配列番号183に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号184に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(284)  配列番号185に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号186に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(285)  配列番号187に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号188に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(286)  配列番号189に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号190に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(287)  配列番号191に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号192に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(288)  配列番号193に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号194に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(289)  配列番号195に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号196に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(290)  配列番号197に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号198に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(291)  配列番号199に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号200に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(292)  配列番号201に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号202に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(293)  配列番号203に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号204に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(294)  配列番号205に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号206に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(295)  配列番号207に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号208に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(296)  配列番号209に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号210に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(297)  配列番号211に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号212に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(298)  配列番号213に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号214に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(299)  配列番号215に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号216に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(300)  配列番号217に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号218に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(301)  配列番号219に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号220に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(302)  配列番号221に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号222に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(203)  配列番号223に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号224に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(304)  配列番号225に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号226に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(305)  配列番号227に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号228に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(306)  配列番号229に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号230に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(307)  配列番号231に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号232に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(308)  配列番号233に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号234に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(309)  配列番号235に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号236に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(310)  配列番号237に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号238に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(311)  配列番号239に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号240に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(312)  配列番号241に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号242に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(313)  配列番号243に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号244に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(314)  配列番号245に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号246に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(315)  配列番号247に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号248に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(316)  配列番号249に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号250に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
(317)  配列番号251に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーと、配列番号252に示される塩基配列を3'末端に含む最大40塩基のオリゴヌクレオチドからなるプライマーとのセット
項7．  以下の(I'')〜(XVI'')のいずれかのプライマーセット。
(I'')  項6に記載の(200)〜(204)のプライマーセットからなる群より選ばれる少なくとも2種のプライマーセット
(II'')  項6に記載の(205)〜(212)のプライマーセットからなる群より選ばれる少なくとも2種のプライマーセット
(III'')  項6に記載の(213)〜(216)のプライマーセットからなる群より選ばれる少なくとも2種のプライマーセット
(IV'')  項6に記載の(217)〜(228)のプライマーセットからなる群より選ばれる少なくとも2種のプライマーセット
(V'')  項6に記載の(229)〜(235)のプライマーセットからなる群より選ばれる少なくとも2種のプライマーセット
(VI'')  項6に記載の(236)〜(239)のプライマーセットからなる群より選ばれる少なくとも2種のプライマーセット
(VII'')  項6に記載の(240)〜(248)のプライマーセットからなる群より選ばれる少なくとも2種のプライマーセット
(VIII'')  項6に記載の(249)〜(251)のプライマーセットからなる群より選ばれる少なくとも2種のプライマーセット
(IX'')  項6に記載の(252)〜(258)のプライマーセットからなる群より選ばれる少なくとも2種のプライマーセット
(X'')  項6に記載の(259)〜(265)のプライマーセットからなる群より選ばれる少なくとも2種のプライマーセット
(XI'')  項6に記載の(266)〜(275)のプライマーセットからなる群より選ばれる少なくとも2種のプライマーセット
(XII'')  項6に記載の(276)〜(282)のプライマーセットからなる群より選ばれる少なくとも2種のプライマーセット
(XIII'')  項6に記載の(283)〜(293)のプライマーセットからなる群より選ばれる少なくとも2種のプライマーセット
(XIV'')  項6に記載の(294)〜(301)のプライマーセットからなる群より選ばれる少なくとも2種のプライマーセット
(XV'')  項6に記載の(302)〜(309)のプライマーセットからなる群より選ばれる少なくとも2種のプライマーセット
(XVI'')  項6に記載の(310)〜(317)のプライマーセットからなる群より選ばれる少なくとも2種のプライマーセット
項8．  被験DNA上のDNAマーカーを含む領域に対してDNA増幅を行い、増幅産物長と表現型とを対比することにより、その表現型を支配する遺伝子の位置を定める連鎖解析方法において、項7に記載の組み合わせに含まれる各プライマーセットを用いてDNA増幅を行う方法。
【００１４】
項9．  被験DNA上のDNAマーカーを含む領域に対してDNA増幅を行い、増幅産物長に従い酵母菌株を同定する方法において、項6に記載のプライマーセットの1種以上を用いてDNA増幅を行う方法。
【発明の効果】
【００１５】
本発明により、酵母サッカロマイセス・セレビジェのゲノム全体にわたるマイクロサテライト多型又は挿入欠失型多型を含むポリヌクレオチド、これらの多型を検出するためのPCRプライマーセット、これらのプライマーセットを用いた連鎖解析方法、及び酵母菌株同定方法が提供された。このマイクロサテライト多型又は挿入欠失型多型を含むポリヌクレオチドは、このプライマーセットを用いて核酸増幅を行うための、DNAマーカーとして使用できる。酵母の全ゲノムをあまねくカバーするこのような多数のゲノムワイドなDNAマーカーは本発明により初めて提供されたものである。
【００１６】
また、本発明で提供するマイクロサテライト多型及び挿入欠失型多型以外にも、酵母の全ゲノム中にはこのような多型が存在するが、本発明で提供する多型のセットは、酵母の各染色体上、及び全ゲノム上に均一に分布するため、全ゲノムの遺伝子の連鎖解析に好適に使用できる。このように、本発明により、酵母の有用遺伝子の同定を広範囲に行うことができるようになった。特に、本発明によりサッカロマイセス・セレビジェの多数のDNAマーカーが提供されたことから、遺伝子のマッピングを高精度で行うことができるようになった。
【００１７】
本発明のプライマーセットは、清酒酵母のみならず遺伝学的解析を行える酵母であれば他の酵母サッカロマイセス・セレビジェにおいても利用できる。
【００１８】
また、本発明により、菌株の分類及び管理を、高精度で行うことができるようになった。
【００１９】
さらに、本発明のDNAマーカーは、酵母の有用菌株の育種において、選抜マーカーとして利用できる。例えば、現在、清酒酵母として用いられている酵母は、特定の系統の株に限定されている。本発明のDNAマーカーを用いれば、これまで利用されていなかった別系統の株が持つ高機能性の有用遺伝子を、交配育種により効率的かつ確実に導入することができるようになる。この方法は、組替え技術によらないことを特徴とするため、育種された株は実用酵母としてただちに利用することができる。本発明のDNAマーカーを用いた遺伝子座の決定や菌株の同定に必要な装置は、PCRのためのサーマルサイクラーと電気泳動装置（DNAシーケンサー）だけであり、特殊で高価な装置は不要である。
【発明を実施するための最良の形態】
【００２０】
以下、本発明を詳細に説明する。
第1のDNAマーカー
本発明のポリヌクレオチドは、清酒酵母K-7のマイクロサテライト多型、挿入型多型、欠失型多型、又は置換型多型を含むポリヌクレオチドであり、具体的には、上記の項1における(1)〜(168)のいずれかのポリヌクレオチド（以下、「多型ポリヌクレオチド」ということがある）からなるものである。この多型ポリヌクレオチドは、連鎖解析や菌株の同定などのためのDNAマーカーとして利用できる(本発明の第1のDNAマーカー）。
【００２１】
第1染色体上の多型ポリヌクレオチドは、上記の項1の(1)〜(11)のポリヌクレオチドである。第2染色体上の多型ポリヌクレオチドは、上記の項1の(12)〜(20)のポリヌクレオチドである。第3染色体上の多型ポリヌクレオチドは、上記の項1の(21)〜(25)のポリヌクレオチドである。第4染色体上の多型ポリヌクレオチドは、上記の項1の(26)〜(42)のポリヌクレオチドである。5染色体上の多型ポリヌクレオチドは、上記の項1の(43)〜(50)のポリヌクレオチドである。第6染色体上の多型ポリヌクレオチドは、上記の項1の(51)〜(55)のポリヌクレオチドである。第7染色体上の多型ポリヌクレオチドは、上記の項1の(56)〜(64)のポリヌクレオチドである。第8染色体上の多型ポリヌクレオチドは、上記の項1の(65)〜(69)のポリヌクレオチドである。第9染色体上の多型ポリヌクレオチドは、上記の項1の(70)〜(81)のポリヌクレオチドである。第10染色体上の多型ポリヌクレオチドは、上記の項1の(82)〜(89)のポリヌクレオチドである。第11染色体上の多型ポリヌクレオチドは、上記の項1の(90)〜(108)のポリヌクレオチドである。第12染色体上の多型ポリヌクレオチドは、上記の項1の(109)〜(118)のポリヌクレオチドである。第13染色体上の多型ポリヌクレオチドは、上記の項1の(119)〜(131)のポリヌクレオチドである。第14染色体上の多型ポリヌクレオチドは、上記の項1の(132)〜(141)のポリヌクレオチドである。第15染色体上の多型ポリヌクレオチドは、上記の項1の(142)〜(157)のポリヌクレオチドである。第16染色体上の多型ポリヌクレオチドは、上記の項1の(158)〜(168)のポリヌクレオチドである。
【００２２】
また、上記のポリヌクレオチドは、清酒酵母K-7株のゲノムDNAの塩基配列であるが、実験室酵母S288C株のゲノムDNAの塩基配列と同じである配列、即ち多型以外の配列は、1又は数個のヌクレオチドが挿入、欠失、又は置換されたものであってもよい。「特定ポリヌクレオチドにおいて、数個のヌクレオチドが挿入、欠失、又は置換されたもの」は、特定ポリヌクレオチドとの間で、多型以外の部分の相同性が例えば90％以上、好ましくは95％以上、さらにより好ましくは98％以上、最も好ましくは99％以上のポリヌクレオチドを指す。これは、保存領域のDNAホモロジーが90％より小さくなると、サッカロマイセス・セレビジェとは別の種になり遺伝解析の対象外だからである。また、清酒酵母と実験室酵母との間で互いに異なる部分を除く領域のホモロジーは98〜99％程度と推定されているからである。
【００２３】
このような配列には、酵母サッカロマイセス・セレビジェの他の菌株の対応する配列が含まれる。また、配列番号1〜16は、それぞれ、2005年4月23日に日本DNAデータバンクにアクセション番号NC_001133、NC_001134、NC_001135、NC_001136、NC_001137、NC_001138  NC_001139、NC_001140、NC_001141、NC_001142、NC_001143、NC_001144  NC_001145、NC_001146、NC_001147、NC_001148として登録された実験室酵母S288C株の第1〜第16染色体の塩基配列であるが、アクセション番号NC_001133、NC_001134、NC_001135、NC_001136、NC_001137、NC_001138  NC_001139、NC_001140、NC_001141、NC_001142、NC_001143、NC_001144  NC_001145、NC_001146、NC_001147、NC_001148の塩基配列は、次々に再登録されている（日々変化している）。従って、「(1)〜(168)のポリヌクレオチドにおいて1又は数個のヌクレオチドが挿入、欠失、又は置換されたもの」は、このような変化する配列も含む趣旨である。
【００２４】
連鎖解析を行うには、通常、各染色体について2個以上の多型ポリヌクレオチドをDNAマーカーとして組み合わせて用いればよい。各染色体上のDNAマーカーの組み合わせは特に限定されない。各染色体上のDNAマーカーを好ましくは4個以上組み合わせることにより、より好ましくは各染色体上の全てのDNAマーカーを組み合わせることにより、精度よく連鎖解析を行える。
【００２５】
また、菌株の同定、製造工程での菌株の同一性の管理を行うには、その菌株に特異的な多型であれば、一つの多型ポリヌクレオチドでもDNAマーカーとして有効に利用できる。好ましくは、2個以上のDNAマーカーを用いればよい。通常、4個程度までのDNAマーカーを組み合わせれば、菌株の同一性を管理できる。また、複数の多型ポリヌクレオチドをDNAマーカーとして組み合わせて使用する場合は、同一染色体に限らず、いずれの染色体上に存在するDNAマーカーであっても組み合わせ使用できる。
第2のDNAマーカー
本発明の第2のDNAマーカーは、実験室酵母S288Cのマイクロサテライト多型、挿入型多型、欠失型多型、又は置換型多型を含むポリヌクレオチドからなるものであり、具体的には、上記の項4における(1')〜(168')のいずれかのポリヌクレオチドからなるものである。この多型ポリヌクレオチドも、連鎖解析や菌株の同定などのためのDNAマーカーとして利用できる。
【００２６】
第1染色体上の多型ポリヌクレオチドは、上記の項1の(1')〜(11')のポリヌクレオチドである。第2染色体上の多型ポリヌクレオチドは、上記の項1の(12')〜(20')のポリヌクレオチドである。第3染色体上の多型ポリヌクレオチドは、上記の項1の(21')〜(25')のポリヌクレオチドである。第4染色体上の多型ポリヌクレオチドは、上記の項1の(26')〜(42')のポリヌクレオチドである。5染色体上の多型ポリヌクレオチドは、上記の項1の(43')〜(50')のポリヌクレオチドである。第6染色体上の多型ポリヌクレオチドは、上記の項1の(51')〜(55')のポリヌクレオチドである。第7染色体上の多型ポリヌクレオチドは、上記の項1の(56')〜(64')のポリヌクレオチドである。第8染色体上の多型ポリヌクレオチドは、上記の項1の(65')〜(69')のポリヌクレオチドである。第9染色体上の多型ポリヌクレオチドは、上記の項1の(70')〜(81')のポリヌクレオチドである。第10染色体上の多型ポリヌクレオチドは、上記の項1の(82')〜(89')のポリヌクレオチドである。第11染色体上の多型ポリヌクレオチドは、上記の項1の(90')〜(108')のポリヌクレオチドである。第12染色体上の多型ポリヌクレオチドは、上記の項1の(109')〜(118')のポリヌクレオチドである。第13染色体上の多型ポリヌクレオチドは、上記の項1の(119')〜(131')のポリヌクレオチドである。第14染色体上の多型ポリヌクレオチドは、上記の項1の(132')〜(141')のポリヌクレオチドである。第15染色体上の多型ポリヌクレオチドは、上記の項1の(142')〜(157')のポリヌクレオチドである。第16染色体上の多型ポリヌクレオチドは、上記の項1の(158')〜(168')のポリヌクレオチドである。
【００２７】
また、上記のポリヌクレオチドは、実験室酵母S288C株のゲノムDNAの塩基配列であるが、清酒酵母K-7株のゲノムDNAの塩基配列と同じである配列、即ち多型以外の配列は、1又は数個のヌクレオチドが挿入、欠失、又は置換されたものであってもよい。「数個」の意味、及びその趣旨は、第1のDNAマーカーについて説明した通りである。
プライマーセット
本発明のプライマーセットは、上記の項6の(200)〜(317)のいずれかのプライマーセットである。このプライマーセットは、各染色体上に上記のDNAマーカーが均一に分布するようにDNAマーカー群を選択し、これらのDNAマーカー群を検出できるように設計されたものである。
【００２８】
このセットに含まれる各プライマーは、配列番号17〜252のそれぞれを3'末端に有する。還元すれば、配列番号17〜252のそれぞれの5'末端には任意の配列が付加されていてよい。このような任意の配列が5'末端に存在していてもプライマーとして機能する。またこのような配列を有することにより、増幅産物が不規則に長くなるのが回避される（M. J. Brownstein et.al. BioTechniques 20(6) 1004-1010(1996)
Modulation of non-templated nucleotide addition by taq DNA polymerase:
primer modifications that facilitate genotyping参照）。
【００２９】
また、任意の付加配列の長さは12塩基以下が好ましく、7塩基以下がより好ましい。
【００３０】
目的に応じたプライマーセットの組み合わせ数は、対応するDNAマーカーについて説明した通りである。
【００３１】
第1染色体上のDNAマーカーを検出できるプライマーセットの組み合わせは、項6の(200)〜(204)のプライマーセットからなる群より選ばれる少なくとも2種の組み合わせである。第2染色体上のDNAマーカーを検出できるプライマーセットの組み合わせは、項6の(205)〜(212)のプライマーセットからなる群より選ばれる少なくとも2種の組み合わせである。第3染色体上のDNAマーカーを検出できるプライマーセットの組み合わせは、項6の(213)〜(216)のプライマーセットからなる群より選ばれる少なくとも2種の組み合わせである。第4染色体上のDNAマーカーを検出できるプライマーセットの組み合わせは、項6に記載の(217)〜(228)のプライマーセットからなる群より選ばれる少なくとも2種の組み合わせである。第5染色体上のDNAマーカーを検出できるプライマーセットの組み合わせは、項6に記載の(229)〜(235)のプライマーセットからなる群より選ばれる少なくとも2種の組み合わせである。第6染色体上のDNAマーカーを検出できるプライマーセットの組み合わせは、項6に記載の(236)〜(239)のプライマーセットからなる群より選ばれる少なくとも2種の組み合わせである。第7染色体上のDNAマーカーを検出できるプライマーセットの組み合わせは、項6に記載の(240)〜(248)の組み合わせである。第8染色体上のDNAマーカーを検出できるプライマーセットの組み合わせは、項6に記載の(249)〜(251)のプライマーセットからなる群より選ばれる少なくとも2種の組み合わせである。第9染色体上のDNAマーカーを検出できるプライマーセットの組み合わせは、項6に記載の(252)〜(258)のプライマーセットからなる群より選ばれる少なくとも2種の組み合わせである。第10染色体上のDNAマーカーを検出できるプライマーセットの組み合わせは、項6に記載の(259)〜(265)のプライマーセットからなる群より選ばれる少なくとも2種の組み合わせである。第11染色体上のDNAマーカーを検出できるプライマーセットの組み合わせは、項6に記載の(266)〜(275)のプライマーセットからなる群より選ばれる少なくとも2種の組み合わせである。第12染色体上のDNAマーカーを検出できるプライマーセットの組み合わせは、項6に記載の(276)〜(282)のプライマーセットからなる群より選ばれる少なくとも2種の組み合わせである。第13染色体上のDNAマーカーを検出できるプライマーセットの組み合わせは、項6に記載の(283)〜(293)のプライマーセットからなる群より選ばれる少なくとも2種の組み合わせである。第14染色体上のDNAマーカーを検出できるプライマーセットの組み合わせは、項6に記載の(294)〜(301)のプライマーセットからなる群より選ばれる少なくとも2種の組み合わせである。第15染色体上のDNAマーカーを検出できるプライマーセットの組み合わせは、項6に記載の(302)〜(309)のプライマーセットからなる群より選ばれる少なくとも2種の組み合わせである。第16染色体上のDNAマーカーを検出できるプライマーセットの組み合わせは、項6に記載の(310)〜(317)のプライマーセットからなる群より選ばれる少なくとも2種の組み合わせである。
【００３２】
プライマーセットの各プライマーは、5’末端が6-カルボキシフルオレセイン（6-FAM）、6-カルボキシ-2’, 4, 7', 4, 7-ヘキサクロロフルオレセイン(HEX)などの蛍光色素でラベルされたものであることが好ましい。これにより、複数種類のPCR産物を自動蛍光DNAシーケンサーで直接検出することができる。
連鎖解析方法
連鎖解析は、被験DNA上のDNAマーカーを含む領域に対してDNA増幅を行い、増幅産物長と表現型とを対比することにより、その表現型を支配する遺伝子の位置を決定する方法である。DNA増幅方法は特に限定されないが、代表的にはPCRを挙げることができる。DNA増幅には、本発明のプライマーセットを用いることができる。プライマーセセットの組み合わせ数は、DNAマーカーについて説明した通りである。
酵母菌株の同定方法
本発明の酵母菌株の同定方法は、被験DNA上のDNAマーカーを含む領域に対してDNA増幅を行い、増幅産物長に従い菌株を同定する方法において、本発明のプライマーセットを使用してDNA増幅を行う方法である。この方法では、使用するプライマーセットを用いてDNA増幅を行う場合の増幅産物長を既知の菌株について調べておき、この既知の増幅産物長と被験DNAの増幅産物長とを比較する。プライマーセセットの組み合わせ数は、DNAマーカーについて説明した通りである。
実施例
以下、本発明を実施例を示してより詳細に説明するが、本発明はこれらに限定されない。
【実施例１】
【００３３】
（清酒酵母K-7ゲノムのショットガンシーケンス）
清酒酵母きょうかい7号のゲノムDNA3μｇをDNA断片化装置（ハイドロシェアー、Gene machine社）を用いてランダムに断片化し、アガロース電気泳動によって分画した。アガロースゲルから約2kbのDNAを含む断片を切り出して、DNAを抽出、精製した後、平滑末端処理を行った。HincIIで消化し脱リン酸化をおこなった50ngのプラスミドベクターpUC118と上記のゲノムDNA断片をライゲーションした後、大腸菌DH10B株（ElectroMAX, Invitorogen）をエレクトロポレーション法により、形質転換した。得られた形質転換体の90％以上は平均して約2kbのインサートを含んでいた。形質転換体20,000株を培養して、プラスミドを抽出し、得られたプラスミドDNAを鋳型とし、M13-47プライマー（5’-CGCCAGGGTTTTCCCAGTCACGAC-3’）を用いてダイターミネーター法（DYEnamic ET dye terminator kit, Amersham Bioscience）によってシーケンス反応を行った。塩基配列の読み取りは、キャピラリーシーケンサー（MegaBACE1000、Amersham Bioscience）を用いて行った。得られた塩基配列はFASTA形式のテキストファイルとして保存した。
【実施例２】
【００３４】
（酵母ゲノムシーケンスからのマイクロサテライト配列の抽出）
実験室酵母S288Cゲノムにおける1塩基から4塩基を繰り返し単位とするマイクロサテライトの分布は報告されているが(Genetics. 2000 Mar;154(3):1053-68.,  Young ET, Sloan JS, Van Riper K., Trinucleotide repeats are clustered in regulatory genes in Saccharomyces cerevisiae.)、論文には具体的な場所は一部を除けば掲載されていない。さらに、5塩基以上を繰り返し単位とするマイクロサテライトについては、これまで報告がなされていない。
【００３５】
そこで、繰り返し単位を1塩基から8塩基にまで拡張し、その繰り返し単位を有すマイクロサテライトの場所をゲノム配列から特定するためのプログラムをPerl言語で作成した。このプログラムを用いて公開されているS288Cのゲノム配列からマイクロサテライトの場所を特定した。S288Cのゲノム配列は、Saccharomyces Genome Database（ＳＧＤ：ｈｔｔｐ／／ｇｅｎｏｍｅ−ｗｗｗ．ｓｔａｎｆｏｒｄ．ｅｄｕ／Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ／）より入手した。また、プログラムの実行はActivePerl ver.5.6.0（ActiveState社）を用いて行った。
【００３６】
次いで、S288Cのゲノム配列から特定されたマイクロサテライト部位周辺を対象として、K-7のゲノム配列との比較を行い多型の有無を判定した。具体的には、配列の比較は、マイクロサテライト部位とその前後の1kbから2kbのDNA配列に対して、実施例1で決定したK-7のゲノム配列データベースに対してBlastアルゴリズムによるホモロジー検索を行い、該当するK-7の配列データを抽出した。
【００３７】
抽出された配列データが複数ある場合は、ベクター配列のトリミングを行った後、アセンブルを行いコンセンサスシーケンスすなわちコンティグを作成した。K-7の配列情報とS288Cのゲノム配列とを比較し、多型の有無を判定した。Blast検索、及びコンティグの作成は、市販の配列情報解析ソフトウェアDNASIS Pro（日立ソフト）、DNASIS Pro Contig Manager（日立ソフト）を用いて行った。
【００３８】
その結果、132箇所のマイクロサテライト多型、さらにマイクロサテライト近傍に存在する14箇所の欠失型多型、21箇所の挿入型多型、1箇所の置換型多型を見出した。見出した多型のS288Cゲノム上の位置と性状を以下に示す。これらはいずれもPCR等の核酸増幅方法によりフラグメント長多型として容易に検出可能である。S288Cゲノムの第1〜第16染色体の配列は、それぞれ配列番号1〜16に示される配列である。
(1)  配列番号1で示されるDNA配列において、塩基番号31118〜31123のATATAC配列を欠く。
(2)  配列番号1で示されるDNA配列において、塩基番号31124〜31147のAT繰り返しの24塩基がAT繰り返しの20塩基に置換されている。
(3)  配列番号1で示されるDNA配列において、塩基番号77496〜77510のGAA繰り返しの15塩基がGAA繰り返しの30塩基に置換されている。
(4)  配列番号1で示されるDNA配列において、塩基番号77514〜77540のGAA繰り返しの27塩基がGAA繰り返しの6塩基に置換されている。
(5)  配列番号1で示されるDNA配列において、塩基番号110697〜110716のAG繰り返しの20塩基がAGAGAGAGAGAGAGAGA配列に置換されている。
(6)  配列番号1で示されるDNA配列において、塩基番号110717〜110724のA繰り返しの8塩基がA繰り返しの6塩基に置換されている。
(7)  配列番号1で示されるDNA配列において、塩基番号152108〜152126のT繰り返しの19塩基がT繰り返しの21塩基に置換されている。
(8)  配列番号1で示されるDNA配列において、塩基番号192268〜192271のGC繰り返しの4塩基がGCの2塩基に置換されている。
(9)  配列番号1で示されるDNA配列において、塩基番号192278と塩基番号192279との間にCTACTACTA配列が挿入されている。
(10)  配列番号1で示されるDNA配列において、塩基番号192279〜192281のTTAがTTA繰り返しの18塩基に置換されている。
(11)  配列番号1で示されるDNA配列において、塩基番号192286〜192315のTAC繰り返しの30塩基がTAC繰り返しの9塩基に置換されている。
(12)  配列番号2で示されるDNA配列において、塩基番号45954〜45968のT繰り返しの15塩基がT繰り返しの13塩基に置換されている。
(13)  配列番号2で示されるDNA配列において、塩基番号138278〜138292のT繰り返しの15塩基がT繰り返しの17塩基に置換されている。
(14)  配列番号2で示されるDNA配列において、塩基番号251595〜251610のT繰り返しの16塩基がT繰り返しの17塩基に置換されている。
(15)  配列番号2で示されるDNA配列において、塩基番号299556と塩基番号299557との間にGGAAGAGAGCGA配列が挿入されている。
(16)  配列番号2で示されるDNA配列において、塩基番号452269〜452278のA繰り返しの10塩基がA繰り返しの11塩基に置換されている。
(17)  配列番号2で示されるDNA配列において、塩基番号452393と塩基番号452394との間にAGAA配列が挿入されている。
(18)  配列番号2で示されるDNA配列において、塩基番号499605〜499626のGGCAGTCAATGTAAATTTGTGA配列を欠いている。
(19)  配列番号2で示されるDNA配列において、塩基番号628893〜628908のTA繰り返しの16塩基がTA繰り返しの18塩基に置換されている。
(20)  配列番号2で示されるDNA配列において、塩基番号723659〜723673のA繰り返しの15塩基がA繰り返しの11塩基に置換されている。
(21)  配列番号3で示されるDNA配列において、塩基番号62744〜62749のCA繰り返しの6塩基がCA繰り返しの4塩基に置換されている。
(22)  配列番号3で示されるDNA配列において、塩基番号62750〜62769のTA繰り返しの20塩基がTA繰り返しの28塩基に置換されている。
(23)  配列番号3で示されるDNA配列において、塩基番号164228〜164245のTGC繰り返しの18塩基がTGC繰り返しの15塩基に置換されている。
(24)  配列番号3で示されるDNA配列において、塩基番号210468〜210482のTTC繰り返しの15塩基がTTC繰り返しの12塩基に置換されている。
(25)  配列番号3で示されるDNA配列において、塩基番号260022〜260041のTA繰り返しの20塩基がTA繰り返しの22塩基に置換されている。
(26)  配列番号4で示されるDNA配列において、塩基番号92684〜92709のA繰り返しの26塩基がA繰り返しの23塩基に置換されている。
(27)  配列番号4で示されるDNA配列において、塩基番号169824〜169833のAT繰り返しの10塩基がAT繰り返しの14塩基に置換されている。
(28)  配列番号4で示されるDNA配列において、塩基番号169835〜169854のTA繰り返しの20塩基がAT繰り返しの28塩基に置換されている。
(29)  配列番号4で示されるDNA配列において、塩基番号169893〜169910のA繰り返しの18塩基がA繰り返しの20塩基に置換されている。
(30)  配列番号4で示されるDNA配列において、塩基番号329788〜329797のTA繰り返しの10塩基がTA繰り返しの30塩基に置換されている。
(31)  配列番号4で示されるDNA配列において、塩基番号390422〜390436のTAT繰り返しの15塩基がTAT繰り返しの39塩基に置換されている。
(32)  配列番号4で示されるDNA配列において、塩基番号390457〜390465のTTA繰り返しの9塩基がTTA繰り返しの15塩基に置換されている。
(33)  配列番号4で示されるDNA配列において、塩基番号390449と塩基番号390450との間にATAGTTTGTT配列が挿入されている。
(34)  配列番号4で示されるDNA配列において、塩基番号538730〜538759のTA繰り返しの30塩基がTA繰り返しの16塩基に置換されている。
(35)  配列番号4で示されるDNA配列において、塩基番号584615〜584626のCGA繰り返しの12塩基がCGA繰り返しの24塩基に置換されている。
(36)  配列番号4で示されるDNA配列において、塩基番号694836〜694853のCAG繰り返しの18塩基がCAG繰り返しの21塩基に置換されている。
(37)  配列番号4で示されるDNA配列において、塩基番号838091と塩基番号838092との間にAAGAAC配列が挿入されている。
(38)  配列番号4で示されるDNA配列において、塩基番号927583〜927619の配列がCGCTACTGGTGCTGGT配列に置換されている。
(39)  配列番号4で示されるDNA配列において、塩基番号1059941と塩基番号1059942との間にGAGAGGAAGAAGAAGAGGAAG配列が挿入されている。
(40)  配列番号4で示されるDNA配列において、塩基番号1059942〜1059956のGAAGAAAAAGAGGAA配列がこの配列の繰り返しの30塩基に置換されている。
(41)  配列番号4で示されるDNA配列において、塩基番号1279155〜1279168のAC繰り返しの14塩基がAC繰り返しの12塩基に置換されている。
(42)  配列番号4で示されるDNA配列において、塩基番号1418460〜1418481のAT繰り返しの22塩基がAT繰り返しの18塩基に置換されている。
(43)  配列番号5で示されるDNA配列において、塩基番号81213〜81236のTTA繰り返しの24塩基がTTA繰り返しの30塩基に置換されている。
(44)  配列番号5で示されるDNA配列において、塩基番号172598〜172615のAT繰り返しの18塩基がAT繰り返しの22塩基に置換されている。
(45)  配列番号5で示されるDNA配列において、塩基番号225783〜225804のAT繰り返しの22塩基がAT繰り返しの26塩基に置換されている。
(46)  配列番号5で示されるDNA配列において、塩基番号311721〜311725のTGGTT配列を欠いている。
(47)  配列番号5で示されるDNA配列において、塩基番号430556〜430570のA繰り返しの15塩基がA繰り返しの16塩基に置換されている。
(48)  配列番号5で示されるDNA配列において、塩基番号490207〜490242のTGTTCA繰り返しの36塩基がTGTTCA繰り返しの30塩基に置換されている。
(49)  配列番号5で示されるDNA配列において、塩基番号490243〜490266のTATTCA繰り返しの24塩基がTATTCA繰り返しの18塩基に置換されている。
(50)  配列番号5で示されるDNA配列において、塩基番号545369〜545379のA繰り返しの11塩基がA繰り返しの10塩基に置換されている。
(51)  配列番号6で示されるDNA配列において、塩基番号73358〜73384のATT繰り返しの27塩基がATT繰り返しの39塩基に置換されている。
(52)  配列番号6で示されるDNA配列において、塩基番号107804〜107811のTGTA繰り返しの8塩基がTGTA繰り返しの20塩基に置換されている。
(53)  配列番号6で示されるDNA配列において、塩基番号107812〜107831のTG繰り返しの20塩基がTG繰り返しの18塩基に置換されている。
(54)  配列番号6で示されるDNA配列において、塩基番号182876と塩基番号182877との間にCGTGTGTGCGTG配列が挿入されている。
(55)  配列番号6で示されるDNA配列において、塩基番号227466〜227486のT繰り返しの21塩基がT繰り返しの20塩基に置換されている。
(56)  配列番号7で示されるDNA配列において、塩基番号23643〜23657のACG繰り返しの15塩基がACG繰り返しの42塩基に置換されている。
(57)  配列番号7で示されるDNA配列において、塩基番号158990と塩基番号158991との間にAGCACAAGCTCAGGCTCAAGCACAAGCTCAGGCTCAAGCACA配列が挿入されている。
(58)  配列番号7で示されるDNA配列において、塩基番号245647〜245685のCAA繰り返しの39塩基がCAA繰り返しの15塩基に置換されている。
(59)  配列番号7で示されるDNA配列において、塩基番号397841〜397860のA繰り返しの20塩基がA繰り返しの17塩基に置換されている。
(60)  配列番号7で示されるDNA配列において、塩基番号555986〜556016のA繰り返しの31塩基がA繰り返しの26塩基に置換されている。
(61)  配列番号7で示されるDNA配列において、塩基番号の640803〜640818のCATT繰り返しの16塩基がCATT繰り返しの12塩基に置換されている。
(62)  配列番号7で示されるDNA配列において、塩基番号808392〜808417のTA繰り返しの26塩基がTA繰り返しの32塩基に置換されている。
(63)  配列番号7で示されるDNA配列において、塩基番号910118〜910141のT繰り返しの24塩基がT繰り返しの18塩基に置換されている。
(64)  配列番号7で示されるDNA配列において、塩基番号988901〜988921のAGC繰り返しの21塩基がAGC繰り返しの18塩基に置換されている。
(65)  配列番号8で示されるDNA配列において、塩基番号49390と塩基番号49391との間にACCACTACAAGCACCACATCGTCGACTTCT配列が挿入されている。
(66)  配列番号8で示されるDNA配列において、塩基番号169193と塩基番号169194との間にTTG配列が挿入されている。
(67)  配列番号8で示されるDNA配列において、塩基番号169196と塩基番号169197との間にTTG配列が挿入されている。
(68)  配列番号8で示されるDNA配列において、塩基番号169203〜169211のCTG繰り返しの9塩基がCTG繰り返しの21塩基に置換されている。
(69)  配列番号8で示されるDNA配列において、塩基番号464933〜464946のTA繰り返しの14塩基がTA繰り返しの20塩基に置換されている。
(70)  配列番号9で示されるDNA配列において、塩基番号56789〜56812のAGC繰り返しの24塩基がAGC繰り返しの27塩基に置換されている。
(71)  配列番号9で示されるDNA配列において、塩基番号128505〜128525のTCC繰り返しの9塩基がTCC繰り返しの15塩基に置換されている。
(72)  配列番号9で示されるDNA配列において、塩基番号177461〜177464のCA繰り返しの4塩基がCAの2塩基に置換されている。
(73)  配列番号9で示されるDNA配列において、塩基番号177465〜177482のTA繰り返しの18塩基がTA繰り返しの12塩基に置換されている。
(74)  配列番号9で示されるDNA配列において、塩基番号240937〜240943のT繰り返しの7塩基がT繰り返しの6塩基に置換されている。
(75)  配列番号9で示されるDNA配列において、塩基番号241030〜241050のA繰り返しの21塩基がA繰り返しの20塩基に置換されている。
(76)  配列番号9で示されるDNA配列において、塩基番号310499〜310509のT繰り返しの11塩基がT繰り返しの12塩基に置換されている。
(77)  配列番号9で示されるDNA配列において、塩基番号376612〜376635のCGA繰り返しの24塩基がCGA繰り返しの27塩基に置換されている。
(78)  配列番号9で示されるDNA配列において、塩基番号419477〜419492のTA繰り返しの16塩基がTA繰り返しの22塩基に置換されている。
(79)  配列番号9で示されるDNA配列において、塩基番号419493〜419498のTG繰り返しの6塩基がTG繰り返しの8塩基に置換されている。
(80)  配列番号9で示されるDNA配列において、塩基番号419542〜419548のA繰り返しの7塩基がA繰り返しの8塩基に置換されている。
(81)  配列番号9示されるDNA配列において、塩基番号419562〜419564のTAA繰り返し配列を欠いている。
(82)  配列番号10で示されるDNA配列において、塩基番号76562〜76583のAT繰り返しの22塩基がAT繰り返しの20塩基に置換されている。
(83)  配列番号10で示されるDNA配列において、塩基番号150066〜150080のTTG繰り返しの15塩基がTTG繰り返しの18塩基に置換されている。
(84)  配列番号10で示されるDNA配列において、塩基番号265789〜265806のT繰り返しの18塩基がT繰り返しの13塩基に置換されている。
(85)  配列番号10で示されるDNA配列において、塩基番号316997〜317014のTA繰り返しの18塩基がTA繰り返しの12塩基に置換されている。
(86)  配列番号10で示されるDNA配列において、塩基番号403983〜404006のCAG繰り返しの24塩基がCAG繰り返しの21塩基に置換されている。
(87)  配列番号10で示されるDNA配列において、塩基番号470045〜470092のTAA繰り返しの48塩基がTAA繰り返しの78塩基に置換されている。
(88)  配列番号10で示されるDNA配列において、塩基番号639907〜639944のCA繰り返しの38塩基がCA繰り返しの18塩基に置換されている。
(89)  配列番号10で示されるDNA配列において、塩基番号639945〜639956のTA繰り返しの12塩基がTA繰り返しの16塩基に置換されている。
(90)  配列番号11で示されるDNA配列において、塩基番号26593〜26624のAT繰り返しの32塩基がAT繰り返しの29塩基に置換されている。
(91)  配列番号11で示されるDNA配列において、塩基番号78805〜78826のTA繰り返しの22塩基がTA繰り返しの38塩基に置換されている。
(92)  配列番号11で示されるDNA配列において、塩基番号78844〜78853のA繰り返しの10塩基がA繰り返しの9塩基に置換されている。
(93)  配列番号11で示されるDNA配列において、塩基番号164850〜164883のTA繰り返しの34塩基がTA繰り返しの22塩基に置換されている。
(94)  配列番号11で示されるDNA配列において、塩基番号165093〜165098のAGA繰り返しの6塩基がAGAの3塩基に置換されている。
(95)  配列番号11で示されるDNA配列において、塩基番号232190〜232210のTAA繰り返しの21塩基がTAA繰り返しの18塩基に置換されている。
(96)  配列番号11で示されるDNA配列において、塩基番号232254〜232256のATA配列を欠いている。
(97)  配列番号11で示されるDNA配列において、塩基番号280034〜280039のTGA繰り返しの6塩基がTGA繰り返しの12塩基に置換されている。
(98)  配列番号11で示されるDNA配列において、塩基番号280114〜280124のA繰り返しの11塩基がA繰り返しの10塩基に置換されている。
(99)  配列番号11で示されるDNA配列において、塩基番号382199と塩基番号382200との間にGT配列が挿入されている。
(100)  配列番号11で示されるDNA配列において、塩基番号382204と塩基番号382205との間にT配列が挿入されている。
(101)  配列番号11で示されるDNA配列において、塩基番号382213のT配列を欠いている。
(102)  配列番号11で示されるDNA配列において、塩基番号464685〜464688のTA繰り返しの4塩基がTA繰り返しの6塩基に置換されている。
(103)  配列番号11で示されるDNA配列において、塩基番号464761〜464762のAT配列がAT繰り返しの塩基に置換されている。
(104)  配列番号11で示されるDNA配列において、塩基番号464816〜464835のTA繰り返しの20塩基がTA繰り返しの16塩基に置換されている。
(105)  配列番号11で示されるDNA配列において、塩基番号464836〜464851のAATATATATATATATA配列を欠いている。
(106)  配列番号11で示されるDNA配列において、塩基番号523314と塩基番号523315との間にTTGCTGCTGCTG配列が挿入されている。
(107)  配列番号11で示されるDNA配列において、塩基番号566745〜566768のAGC繰り返しの24塩基がAGC繰り返しの30塩基に置換されている。
(108)  配列番号11で示されるDNA配列において、塩基番号612730〜612735のAGA繰り返しの6塩基がAGA繰り返しの9塩基に置換されている。
(109)  配列番号12で示されるDNA配列において、塩基番号35378〜35387のA繰り返しの10塩基がA繰り返しの11塩基に置換された配列を含む50〜500塩基の連続したDNA配列からなるポリヌクレオチド
(110)  配列番号12で示されるDNA配列において、塩基番号35406〜35410のA繰り返しの5塩基がA繰り返しの6塩基に置換されている。
(111)  配列番号12で示されるDNA配列において、塩基番号35428と塩基番号35429との間にTTATATTAAATTA配列が挿入されている。
(112)  配列番号12で示されるDNA配列において、塩基番号84330と塩基番号84331との間にCGCGGACGCGGAAGGA配列が挿入されている。
(113)  配列番号12で示されるDNA配列において、塩基番号237852〜237875のAAAAAG繰り返しの24塩基がAAAAAGの6塩基に置換されている。
(114)  配列番号12で示されるDNA配列において、塩基番号511522〜511551のAGC繰り返しの30塩基がAGC繰り返しの27塩基に置換されている。
(115)  配列番号12で示されるDNA配列において、塩基番号511552〜511557のAACAGC配列を欠いている。
(116)  配列番号12で示されるDNA配列において、塩基番号602125〜602139のTGT繰り返しの15塩基がTGT繰り返しの18塩基に置換されている。
(117)  配列番号12で示されるDNA配列において、塩基番号881948〜881969のAT繰り返しの22塩基がAT繰り返しの26塩基に置換されている。
(118)  配列番号12で示されるDNA配列において、塩基番号1002211〜100229のA繰り返しの19塩基がA繰り返しの16塩基に置換されている。
(119)  配列番号13で示されるDNA配列において、塩基番号44389〜44406のGCA繰り返しの18塩基がGCA繰り返しの15塩基に置換されている。
(120)  配列番号13で示されるDNA配列において、塩基番号99600〜99617のAT繰り返しの18塩基がAT繰り返しの20塩基に置換されている。
(121)  配列番号13で示されるDNA配列からなるポリヌクレオチドにおいて、塩基番号159853〜159876のAT繰り返しの24塩基がAT繰り返しの14塩基に置換されている。
(122)  配列番号13で示されるDNA配列において、塩基番号209865〜209876のTAAGTAATGATG配列を欠いている。
(123)  配列番号13で示されるDNA配列において、塩基番号321328〜321349のTA繰り返しの22塩基がTA繰り返しの12塩基に置換されている。
(124)  配列番号13で示されるDNA配列において、塩基番号410428〜410442のAAT繰り返しの15塩基がAAT繰り返しの12塩基に置換されている。
(125)  配列番号13で示されるDNA配列において、塩基番号539498〜539521のCTG繰り返しの24塩基がCTG繰り返しの21塩基に置換されている。
(126)  配列番号13で示されるDNA配列において、塩基番号625412〜625421のA繰り返しの10塩基がA繰り返しの17塩基に置換されている。
(127)  配列番号13で示されるDNA配列において、塩基番号625422〜625446のGAAAAAAAGAAAAAAAGAAAAAAAG配列を欠いている。
(128)  配列番号13で示されるDNA配列において、塩基番号703444〜703448のT繰り返しの5塩基がT繰り返しの2塩基に置換されている。
(129)  配列番号13で示されるDNA配列において、塩基番号703562〜703574のTCTGAAATACGTT配列を欠いている。
(130)  配列番号13で示されるDNA配列において、塩基番号811237〜811263のGTT繰り返しの27塩基がGTT繰り返しの24塩基に置換されている。
(131)  配列番号13で示されるDNA配列において、塩基番号874559〜874578のT繰り返しの20塩基がT繰り返しの16塩基に置換されている。
(132)  配列番号14で示されるDNA配列において、塩基番号70025〜70051のGCA繰り返しの27塩基がGCA繰り返しの39塩基に置換されている。
(133)  配列番号14で示されるDNA配列において、塩基番号70052〜70054のACA配列を欠いている。
(134)  配列番号14で示されるDNA配列において、塩基番号135892と塩基番号135893との間にAAT配列が挿入されている。
(135)  配列番号14で示されるDNA配列において、塩基番号135906〜135917のTG繰り返しの12塩基がTG繰り返しの10塩基に置換されている。
(136)  配列番号14で示されるDNA配列において、塩基番号196146〜196149のTC繰り返しの4塩基がTCの2塩基に置換されている。
(137)  配列番号14で示されるDNA配列において、塩基番号300773〜300782のA繰り返しの10塩基がA繰り返しの11塩基に置換されている。
(138)  配列番号14で示されるDNA配列において、塩基番号527489〜527803のAT繰り返しの15塩基がAT繰り返しの8塩基に置換されている。
(139)  配列番号14で示されるDNA配列において、塩基番号606166〜606183のAT繰り返しの18塩基がAT繰り返しの16塩基に置換されている。
(140)  配列番号14で示されるDNA配列において、塩基番号662255〜662278のCTTGTT繰り返しの24塩基がCTTGTT繰り返しの18塩基に置換されている。
(141)  配列番号14で示されるDNA配列において、塩基番号721916〜721930のA繰り返しの15塩基がA繰り返しの21塩基に置換されている。
(142)  配列番号15で示されるDNA配列において、塩基番号53994と塩基番号53995との間にAATGGAAAACCCATCCGAGGTTAA配列が挿入されている。
(143)  配列番号15で示されるDNA配列において、塩基番号412672〜412674のAAAの3塩基がAAの2塩基に置換されている。
(144)  配列番号15で示されるDNA配列において、塩基番号412690〜412691のAT配列を欠いている。
(145)  配列番号15で示されるDNA配列において、塩基番号479256〜479259のT繰り返しの4塩基がT繰り返しの5塩基に置換されている。
(146)  配列番号15で示されるDNA配列において、塩基番号479265と塩基番号479266との間にAT配列が挿入されている。
(147)  配列番号15で示されるDNA配列において、塩基番号579518〜579541のCAT繰り返しの24塩基がCAT繰り返しの21塩基に置換されている。
(148)  配列番号15で示されるDNA配列において、塩基番号675325〜675343のT繰り返しの19塩基がT繰り返しの18塩基に置換されている。
(149)  配列番号15で示されるDNA配列において、塩基番号768688〜768690のAAC配列を欠いている
(150)  配列番号15で示されるDNA配列において、塩基番号768691〜768702のGAC繰り返しの19塩基がGAC繰り返しの9塩基に置換されている。
(151)  配列番号15で示されるDNA配列において、塩基番号867908と塩基番号867909との間にC配列が挿入されている。
(152)  配列番号15で示されるDNA配列において、塩基番号944403〜944411のT繰り返しの9塩基がT繰り返しの10塩基に置換されている。
(153)  配列番号15で示されるDNA配列において、塩基番号944423〜944425のTTTの3塩基がTTの2塩基に置換されている。
(154)  配列番号15で示されるDNA配列において、塩基番号944426〜944427のCCの2塩基がCCCの3塩基に置換されている。
(155)  配列番号15で示されるDNA配列において、塩基番号944454〜944464のT繰り返しの11塩基がT繰り返しの10塩基に置換されている。
(156)  配列番号15で示されるDNA配列において、塩基番号944468のCの1塩基がCCの2塩基に置換されている
(157)  配列番号15で示されるDNA配列において、塩基番号944469〜944492のT繰り返しの24塩基がT繰り返しの21塩基に置換されている。
(158)  配列番号16で示されるDNA配列において、塩基番号76355〜76372のCT繰り返し18塩基がCT繰り返しの20塩基に置換されている。
(159)  配列番号16で示されるDNA配列において、塩基番号165850と塩基番号165851との間にCAT配列が挿入されている。
(160)  配列番号16で示されるDNA配列において、塩基番号212901〜212918のA繰り返しの18塩基がA繰り返しの13塩基に置換されている。
(161)  配列番号16で示されるDNA配列において、塩基番号298503〜298518のTA繰り返しの16塩基がTA繰り返しの18塩基に置換されている。
(162)  配列番号16で示されるDNA配列において、塩基番号404721〜404727のA繰り返しの7塩基がA繰り返しの6塩基に置換されている。
(163)  配列番号16で示されるDNA配列において、塩基番号404731〜404738のT繰り返しの8塩基がT繰り返しの7塩基に置換されている。
(164)  配列番号16で示されるDNA配列において、塩基番号404757〜404775のT繰り返しの19塩基がT繰り返しの15塩基に置換されている。
(165)  配列番号16で示されるDNA配列において、塩基番号607995〜608008のT繰り返しの14塩基がT繰り返しの11塩基に置換されている。
(166)  配列番号16で示されるDNA配列において、塩基番号695612〜695613のTTの2塩基がTTTの3塩基に置換されている。
(167)  配列番号16で示されるDNA配列において、塩基番号695614〜695628のA繰り返しの15塩基がA繰り返しの11塩基に置換されている。
(168)  配列番号16で示されるDNA配列において、塩基番号776565〜776574のT繰り返しの10塩基がT繰り返しの8塩基に置換されている。
【実施例３】
【００３９】
ゲノムワイドなDNAマーカーの開発
実施例2に列記した多型を示すDNA配列を、特異的に増幅するプライマーオリゴヌクレオチドを設計した。特異的に増幅するとは、標的だけを増幅し、他のゲノム領域を増幅しないことをいう。
【００４０】
プライマー配列のデザインにあたってはDNASIS Proを使用し、プライマー相互のプライマーダイマー形成の有無についてはソフトウェアamplify 1.2を使用して確認した。
【００４１】
設計した118セットのプライマーオリゴヌクレオチドの配列を以下の表1〜4に示す。表2〜3は表1の続きである。
【００４２】
【表１】
2007082431.tif 000003
【００４３】
【表２】
2007082431.tif 000004
【００４４】
【表３】
2007082431.tif 000005
【００４５】
【表４】
2007082431.tif 000006
【００４６】
これにより酵母の全ゲノム上に配された118個のゲノムワイドなDNAマーカーが提供された。また、開発したDNAマーカーのS288Cゲノム上の物理配置を図1に示す。マーカー数が多いほど詳細な情報を得ることができ有用性も高くなる。本発明で開発したDNAマーカー間隔の平均は90kbpであり、その遺伝距離はおよそ30cMに相当すると推定され遺伝子マッピングに十分な数である。
【実施例４】
【００４７】
酵母ゲノムDNAの調製とDNAマーカーのタイピング方法
清酒酵母K-7株、実験室酵母S288C株について、それぞれ酵母ゲノムDNA の調整は、QIAGEN社のQIAGEN Genomic-tip Systemを用いて行った。なお、ゲノムDNAの抽出は、この他、例えば「METHODS in YEAST GENETICS」Cold Spring Harbor Laboratory Pressに記載された公知の方法により行うことができる。
【００４８】
調製したゲノムDNAを鋳型として、表1〜4に示したプライマーを用いてPCRを行った。PCR反応溶液の組成は、QIAGEN社のマルチプレックスPCR Kitに添付されたプロトコールに準拠し、反応液トータル容量10μlにプライマー濃度各0.2μM、テンプレートDNAを10〜100ng加え、2XQIAGEN Multiplex PCR Master Mixを5μl加えた。この反応液でサーマルサイクラー（TaKaRa Biochemicals Thermal Cycler Personal）を用いてPCR反応を行った。
【００４９】
PCRの温度条件は、95℃15分の初期活性化を行った後、94℃30秒の変性、60℃90秒のアニーリング、72℃90秒のエクステンションの3ステップを35サイクル、続いて72℃10分の最終エクステンションを行った後、4℃にまで温度を下げPCR反応を終了した。
【００５０】
PCR産物サイズの決定は、まず適当に滅菌水で希釈を行い（予備的にPCR産物の濃度をアガロース電気泳動で確認してから希釈倍率を決定した）、希釈したPCR反応産物1μlを別のチューブにとり、12μlのホルムアミド（アプライドバイオシステム社製 Hi-Di formamidを使用）と0.5μlのサイズマーカー（アプライドバイオシステム社製  GeneScan-500 ROX Size Standardを使用）とを加え、95℃で2分間加熱後、急冷して電気泳動サンプルとした。
【００５１】
電気泳動はDNAシーケンサー(ABI PRISM 310 Gentic Analyzer  アプライドバイオシステム社製) を使用して行い、GeneScanソフトウェアによりサイズを決定した。DNAマーカーによっては単一ピークではなくいわゆるスラッター(吃音)現象を示す場合があるが、そのようなケースでは最も大きいピークのサイズを代表値として採用した。また、アレルコーリングを行うための市販ソフトウェア（例えばアプライドバイオシステム社製  GenotyperあるいはGeneMapper）を利用することもできる。
【００５２】
各酵母の増幅産物長を前掲の表1〜4中に示す。各DNAマーカーのフラグメントサイズは、S288C株とK-7株のゲノムDNAを鋳型とした場合では異なり、S288C株とK-7株とを明瞭に識別できることが示された。
【実施例５】
【００５３】
連鎖解析へのDNAマ−カーの利用
本発明のDNAマーカーが、有用形質の選抜、及び有用遺伝子の単離を行うために有用であることを示すために、1例として、セルレニン耐性変異（特許第2131921号、特許第2632654号）のマッピングを行った。
【００５４】
セルレニン耐性変異は清酒の重要な香気成分の一つであるカプロン酸エチルを高生産する有用形質を付与する変異として広く実用されている。セルレニン耐性清酒酵母C-8株（接合型α）と実験室酵母D458-5A株（接合型a ATCC 90753）との交配株を集団接合法により分離した。分離した二倍体交配株を「METHODS in YEAST  GENETICS」Cold Spring Harbor Laboratory Press）に記載の方法に従い胞子形成培地に塗布し胞子形成させ、マイクロマニュピレーターで一倍体酵母を分離した。
【００５５】
セルレニン耐性変異は一倍体子孫に2：2分離で遺伝した。セルレニン耐性変異を示す一倍体株のみをランダムに17株選抜し、実施例4と同様の方法によりDNAマーカーのフラグメントサイズを調べ、アレルのタイピングを行った。通常、DNAマーカーのアレルはランダムに子孫に遺伝するが、セルレニン耐性変異の原因遺伝子の近傍に存在するDNAマーカーでは連鎖によってアレルの出現頻度に偏りが生じることになる。
【００５６】
第16染色体上に存在する各DNAマーカーのタイピングデータをもとに二項分布式に基づいてアレルの出現頻度の確率を計算しグラフ化した結果を図2に示す。図2のグラフにおいて、横軸は第16番染色体上の位置を示し、縦軸は確率を示す。図2から、第16番染色体左腕に位置する2箇所のDNAマーカーが連鎖を示すことが判明した。この領域にはセルレニン耐性変異の原因遺伝子として既知であるFAS2 遺伝子が存在していることが知られている（Mol Gen Genet. 1994 Jul 8;244(1):90-6., Inokoshi J, Tomoda H, Hashimoto H, Watanabe A, Takeshima H, Omura S.,Cerulenin-resistant mutants of Saccharomyces cerevisiae with an altered fatty acid synthase gene.）。
【００５７】
このことから、本発明で開発したDNAマ−カーを用いて連鎖解析を行うことで遺伝子をマッピングできることが明らかになった。本発明を原因未知の有用形質の解析に利用すれば、未知の有用遺伝子をマッピングすることができる。
【実施例６】
【００５８】
DNAマーカーのフラグメントサイズの違いを利用した酵母菌株の同定
サッカロマイセス・セレビジエに属する清酒酵母C-8株、清酒酵母K-10株、焼酎酵母（鹿児島酵母）、及びワイン酵母162 KIV-1116株から、実施例4と同様にしてゲノムDNAを調製した。これらのゲノムDNAを鋳型とし、表1〜4中の下記の10組のプライマーセットを用いてPCRを行い、実施例4と同様にして、各DNAマーカーのフラグメントサイズを調べた。
・第7染色体：G7T24（配列番号99、100)
G7T246（配列番号103、104)
G7M398(配列番号105、106)
G7Q641(配列番号109、110)
・第8染色体：G8H169（配列番号119、120)
・第10染色体：G10M265（配列番号141、142)
・第12染色体：G12P35(配列番号169, 170)
・第13染色体：G13D321(配列番号191, 192）
G13T539（配列番号195, 196)
・14染色体：G14M196（配列番号209, 210）
各DNAマーカーのフラグメントサイズをGeneScanで解析した結果を図3に示す。図中に▼で示したDNAマーカーは株により特徴的なフラグメントサイズを示す。
【００５９】
このことから、本発明のDNAマーカーを単独であるいは複数個組み合わせてPCRを行うことにより、酵母菌株の同定が可能になることが分かる。本発明のDNAマーカーは、発酵プロセスにおける微生物管理にも活用することができる。
【図面の簡単な説明】
【００６０】
【図１】本発明のDNAマーカーの実験室酵母S288Cゲノム上の位置を示す図である。
【図２】本発明のDNAマーカーのタイピングによりセルレニン耐性変異の原因遺伝子の位置を検出した結果を示すグラフである。
【図３】清酒酵母C-8株、清酒酵母K-10株、焼酎酵母(鹿児島酵母)、及びワイン酵母162 KIV-1116株における本発明のDNAマーカーの解析例を示す図である。
【図１】
2007082431.tif 000007
【図２】
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【図３】
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【配列表】
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