(57)【要約】      （修正有）【課題】２次元ゲル電気泳動を用いた複合タンパク質サンプルの分離のための電気泳動用組立品または使い捨てデバイスと該デバイス処理の自動操作ステップの提供。【解決手段】１次元目ゲルストリップ７のための区画と２次元目ゲルのための区画１６とを備える、フィルムもしくは箔またはガラス板等の担体５を備え、前記２つの区画は直接的に互いに連絡している組立品またはデバイス。該組立品またはデバイスは、前記担体５から可変的な距離にある硬コンポーネント３と薄く柔軟な軟コンポーネント層１１とからなるツーコンポーネント本体をさらに備え、該本体は、少なくとも１つの弁９、１０の外部からの作動のための、少なくとも１つのスリットまたは開口部をさらに備え、該弁は、少なくとも１つの該スリットに対応した、該軟コンポーネント部材である。【選択図】図１
2007178433.tif 000002
【特許請求の範囲】
【請求項１】
２次元ゲル電気泳動を用いた複合タンパク質サンプルの分離のための電気泳動用組立品または使い捨てデバイスであって、
１次元目ゲルストリップ（７）のための区画と２次元目ゲルのための区画（１６）とを有する、フィルムもしくは箔またはガラス板等の担体（５）であって、前記２つの区画は直接的に互いに連絡している担体と、
前記担体（５）から可変的な距離にある硬コンポーネント（３）と薄く柔軟な軟コンポーネント層（１１）とからなるツーコンポーネント本体であって、少なくとも１つの弁の、外部からの作動のための少なくとも１つのスリットまたは開口部をさらに含み、該弁が、該スリットを介した該軟コンポーネントの外部からの作動に際して、該スリットに対応して、該担体に対する方向について可逆的に張り出すことにより現れるものである本体と
を含んでなる、上記組立品または使い捨てデバイス。
【請求項２】
前記使い捨て本体が少なくとも部分的にＵＶ透過性であることを特徴とする、請求項１に記載の組立品または使い捨てデバイス。
【請求項３】
前記使い捨て本体の内側面に位置する前記軟コンポーネント層（１１）が、前記硬コンポーネント（３）中の少なくとも１つのスリットを介した外部からの作動に際して、該スリットに対応して、ゲル担体（５）に向かって押し込むことが可能であることを特徴とする、請求項１もしくは２に記載の組立品または使い捨てデバイス。
【請求項４】
前記硬コンポーネント（３）が、前記１次元目ゲルストリップ（７）の区画の両側で弁（９、１０）として機能し、かつ／または適切な位置で２次元目ゲルのための弁として機能する、前記軟コンポーネント層の外部からの作動のための、少なくとも２つのスリットもしくは開口部を含んでなることを特徴とする、請求項１〜３のいずれか１項に記載の組立品または使い捨てデバイス。
【請求項５】
前記使い捨て本体とゲル担体との間の距離の変化を、該使い捨て本体と担体との間にサンドイッチ状に配置され、好ましくは２次元目ゲル区画の外辺に沿い、かつ該使い捨てデバイスの一部分である、少なくとも１つの弾性で圧縮可能／膨張可能な密封材またはガスケットにより実現することを特徴とする、請求項１〜４のいずれか１項に記載の組立品または使い捨てデバイス。
【請求項６】
前記硬コンポーネント（３）が、サンプルのロード、平衡化溶液の流入、ゲル溶液の注入のための穴もしくは連結部品、または排出口をさらに含んでなることを特徴とする、請求項１〜５のいずれか１項に記載の組立品または使い捨てデバイス。
【請求項７】
前記硬コンポーネント（３）が、好ましくはＰＭＭＡ、ＰＣ、ＰＥ、ＰＥＴ、ＰＰまたはＣＯＣ（シクロオレフィンコポリマー）の中から選択されることを特徴とする、請求項１〜６のいずれか１項に記載の組立品または使い捨てデバイス。
【請求項８】
前記軟コンポーネント（１１）が、好ましくは、前記硬コンポーネントの材料と適合しうるものであることによりツーコンポーネント射出成形が可能であり、かつ２次元目ゲルが張りつかない、例えばＰＴＳ−Ｔｈｅｒｍｏｆｌｅｘ（登録商標）またはＳａｎｔｏｐｒｅｎｅ（登録商標）のような熱可塑性エラストマーの中から選択されることを特徴とする、請求項１〜７のいずれか１項に記載の組立品または使い捨てデバイス。
【請求項９】
使い捨て本体（１）が、１次元目および／もしくは２次元目のための電極、および／または外部からの電極の差し込みのための構造をさらに含むことを特徴とする、請求項１〜８のいずれか１項に記載の組立品または使い捨てデバイス。
【請求項１０】
前記使い捨て本体が、２次元目ゲルとランニングバッファーとの間の境界にスリットをさらに含んでなることを特徴とする、請求項１〜９のいずれか１項に記載の組立品または使い捨てデバイス。
【請求項１１】
２次元目ゲルとランニングバッファーとの境界にある前記スリットが、追加のメンブレン（２１、２２）により密封されていることを特徴とする、請求項１０に記載の組立品または使い捨てデバイス。
【請求項１２】
前記追加のメンブレン（２１、２２）が、厚さ、孔サイズおよび材料（例えばＰＥＴ、ＰＥ、ＰＰまたはＰＥＳ）の適切な組み合わせを有することにより、注入の間は液体ゲル溶液のためのバリアとして働くが、重合したゲルとＳＤＳ含有バッファーとの間の液体連絡および正常な電気的接触を可能とする機能を発揮することを特徴とする、請求項１１に記載の組立品または使い捨てデバイス。
【請求項１３】
前記メンブレンが、例えばＵｌｔｒａｎ（登録商標）５ＫＤのようなＰＥＳ（ポリエーテルスルホン）であることを特徴とする、請求項１１もしくは１２に記載の組立品または使い捨てデバイス。
【請求項１４】
２次元目ゲルとランニングバッファーとの境界にある前記スリットが、ブレード機能により、ゲル重合の後においてのみ作られることを特徴とする、請求項１０に記載の組立品または使い捨てデバイス。
【請求項１５】
前記使い捨てデバイスの外寸が、ロボット操作を容易にするために、好ましくはＡＮＳＩ ＳＢＳ（米国規格協会、生物分子スクリーニング学会：１２７．７６±０．２５ｍｍ×８５．４８±０．２５ｍｍ）規格に従い設計されていることを特徴とする、請求項１〜１４のいずれか１項に記載の組立品または使い捨てデバイス。
【請求項１６】
少なくとも１つの大型の外部バッファー貯留部を含んでなり、それにより、請求項９または１０に記載の穴、スリットもしくは開口部に対応して、前記使い捨てデバイスと一体となっているかまたはその外部に取り付けられた、より小型のバッファー貯留部に２次元目の分離のためのランニングバッファーを新規に供給することができ、かつ／またはそこから再循環させることができる、請求項９〜１５のいずれか１項に記載の組立品。
【請求項１７】
前記使い捨てデバイスが、例えばセラミック、金属もしくは他の熱伝導性アロイ等の、それを介した真空吸引が可能な多孔性材料から作られた冷却ブロック上の外側担体面と幾何的にフィットし、かつ好ましくはそれに安定に固定されていることを特徴とする、請求項１〜１６のいずれか１項に記載の組立品。
【請求項１８】
請求項１〜１７のいずれか１項に記載の組立品または使い捨てデバイス内での２次元ゲル電気泳動を用いた複合タンパク質サンプルの分離方法であって、再水和溶液中でサンプルを１次元目ゲルストリップにロードするが、該ゲルストリップは、ストリップの両側で閉じられた弁とともに担体上に配置され、担体と使い捨て本体との間の距離は概ね再水和したストリップの厚さに対応していること、ならびに、再水和および１次元目の分離の後に、担体と使い捨て本体との間の距離が増大し、それと同時に、ストリップの周囲環境を閉鎖されたまま維持するためにストリップの両側で弁がさらに押し込まれて、それによりストリップの上部に空間または導水路が作られることで、平衡化溶液が流れることができるようになることを特徴とする、上記方法。
【請求項１９】
２次元目分離ゲルのためのゲル溶液を、ストリップの一方の側にある少なくとも１つの弁が開放され、かつ前記担体と使い捨て本体との距離が増大した状態で導入し、それにより同時に該ストリップとカップリングさせ、次にＵＶ開始重合を行うことを特徴とする、請求項１８に記載の方法。
【請求項２０】
２次元目ゲルのゲル溶液の注入を、前記使い捨てデバイスをいくぶんか直立した状態にすることにより行うことを特徴とする、請求項１８または１９に記載の方法。
【請求項２１】
分離したサンプルの分析を続けて行うために、好ましくはゲル接着性を有する箔またはフィルムである前記担体を、接着したゲルと一緒に前記使い捨て本体から剥ぎ取ることを特徴とする、請求項１８〜２０のいずれか１項に記載の方法。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
本発明は、２次元ゲル電気泳動を用いた複合タンパク質サンプルの分離のための電気泳動用組立品または使い捨てデバイス、および２次元ゲル電気泳動を用いた複合タンパク質サンプルの分離方法に関する。
【０００２】
本発明は、改良型使い捨てデバイスおよびその使用方法に関し、２次元ゲル電気泳動に基づくプロテオミクス解析における複合タンパク質サンプルの分離のために、一般に受け入れられかつ手動で実行するステップを統合する、都合が良く有効な手段を提供し、従って、新規な方法が紹介されている先の欧州特許出願公開第１ ７１２ ９０３号の範囲を補足しかつ拡張するものである。
【背景技術】
【０００３】
背景
２次元スラブゲル電気泳動は今もって、プロテオミクスに最も利用されるアプローチであり、代替手段であるクロマトグラフ法が一般的になりつつあるものの、長年にわたる改良の後に依然として存在する他の限界への対応がなされた場合には、また数年間利用されるだろう。特に、２次元スラブゲル電気泳動は時間がかかり労力を要する方法であり、熟練者を必要とし、結果の質は主にその熟練者の手腕に左右される。多くの手作業を含むため、再現性を達成するのは極めて困難であるが、その一方ゲルはほとんどの場合比較のために作製される。これらのゲルは適切な設定および電力供給によって制御され、新規なバッファーシステムがゲルの安定性および性能を向上させているので、実施条件は非常に再現性の高いものとし得るが、制御下で維持すべき他の多数のパラメータの変動から、精度および一貫性に関して問題が生じ得る。これらの問題の一部としては、例えば、サンプル量、その損失、およびストリップの均一性の点に関して、サンプルのロードおよび再水和、損傷および汚染の危険を伴うストリップの扱い、ストリップとゲルとの不正確で遅いカップリング、均一性の点についてゲル注入および重合、特に勾配について注入速度および反応速度、空気感受性、泳動開始までの完成時間、結果的に電場の不連続性も引き起こす泡を閉じ込めるリスク、泳動中の温度の上昇、ｐＨおよび粘度の変化、バッファー量の損失、が挙げられる。
【０００４】
文献中に幾つかの総説を見出すことができるため、全てのプロセスを詳細に説明することは本発明の範囲外である。しかしながら、理解の助けとするために以下に短い概要を記載する。
【０００５】
通常、１次元目の分離は、等電点電気泳動(ＩＥＦ)からなり、ここでタンパク質は、ストリップの形状を帯び、そのように呼ばれる、長くて幅の狭い支持されたゲル内のｐＨ勾配（典型的には固定化されている(ＩＰＧ)）中でその等電点により分離される。ストリップは市販されており、通常は半乾燥状態で供給され、分析前にサンプル溶液で再水和しなければならない。この操作には数時間から典型的には一晩かかり、通常は、サンプル溶液中に存在する尿素の乾燥および結晶化を防ぐためにミネラルオイルの下で行われる。ＩＥＦもまた同じ理由からミネラルオイル下で、両側で２つの電極と接触しているストリップを有する同一のトレイまたは異なるトレイの中で行われ、該電極間には高電圧がかけられる。ＩＥＦ後は、ストリップを平衡化しなければならず、すなわちストリップ内でフォーカスしたタンパク質をまずアルキル化し、後に２次元目のゲルにトランスファーしてサイズに応じて分離するために、ドデシル硫酸ナトリウム(ＳＤＳ)と複合体化させなければならない。
【０００６】
還元／アルキル化は種々の試薬で行うことが可能であり、等電点の変化を生じ得るが、実験者はこのステップを再水和前のサンプル調製の間に行うという選択肢を有する［１］。しかしながら、ＳＤＳ平衡化はＩＥＦ後にしか行うことができず、この操作によりストリップはＳＤＳを含有する平衡化溶液中で数分間、文字通り洗浄される。その後これを予め重合させたＳＤＳポリアクリルアミドゲルの上端に接して載せ、熱したアガロース溶液をストリップの上に注ぐことによりカップリングさせる。この操作は通常互いに固定された２枚のガラス板の間で行われ、その後バッファーを含有するカセット中に置かれ、ゲルを横切って電圧がかけられる。２次元目での分解能を上げるために、ゲルを、多孔率勾配を有して形成してもよい。これが完了した後、ゲルを取り出し、固定し、染色してバックグラウンドの染色色素を除き、そして最終的に次のステップ、すなわち、スポット回収（picking）、消化および質量分析へと進む。
【０００７】
理想的には、実際により優れた再現性を伴う自動化が主な強みである、機器によるクロマトグラフ法と同様に、サンプルをロードした後にはさらなる手作業の介入を必要としないことが望ましい。このゲルに基づく方法に関わるステップの自動化および統合化は、他の人々が既に向き合ってきた課題である。
【０００８】
統合型で、完全自動化型であり、手動方法（サンプル調製およびストリップ注入も含む）を順に模倣するシステムが、ＵＳ ６５５４９９１ Ｂ１に記載されている。その後にロボット型装置が続いているが、操作の複雑さと必要とされる資本から、実際的かつ広範な使用、特に比較的小さな研究室での使用には程遠い。ＵＳ ２００３／０１２７３３１には、２つのプレートにより形成される垂直の型の底部に置かれたストリップを、ＩＥＦの後に移動させる必要がないシステムが開示されている。ストリップを平衡化溶液を用いて処理し（見たところ一方の側からのみ）、次にストリップと直接接するか、またはアガロース層の上部に型内へとゲル溶液を注ぐことにより、２次元目のゲルとカップリングすることができるものと解される。しかしながら、ＳＤＳがストリップ中を一方の側のみから拡散しなければならないため、平衡化の効率および／またはそれにかかる時間に関して疑念が残り、また１次元目で得た分解能を保つことができるのかどうかについても疑問である。重合法については何の言及もなされていないので、古典的な方法に伴う長い時間が、分解能の損失に関する懸念をさらに増大させる。また、ストリップを形成する方法およびサンプルを添加する方法はあまり再現性がなく、型の底部の密閉用つまみを最後に取り除かなければならないことは実際的ではない。ＥＰ ０３６６８９７では、初めにストリップを、非伝導性相変化材料を用いることにより、予め重合させたゲルから分離し、ＩＥＦ後に該材料を温度の上昇により融解させて取り除き、他のゲル媒体に置き換えることが提案されている。しかしながら、平衡化ステップ、ならびにタンパク質およびゲルへの温度の影響に関する懸念についてはいかなる言及もなされておらず、この場合、型の上部の開閉に関する問題が残る。ストリップとゲルの間の他の遮断方法が、ＷＯ ０２／０８４２７３ Ａ１で提案されている。そのうちの第一の実施形態では、スライド式の固体隔壁の使用について、この動作によって形成済ゲルが破壊されるかもしれないため、確かに最も有利なものではないと報告している。より興味深い解決策では、柔軟で伸展可能な材料からなる空気圧支援弁を用いており、この弁はストリップを好ましくはプレキャストゲルから分離する。この弁により占められる空間は、後でカップリング用のアガロースにより充填される。第三の実施形態では、ストリップの両側の部分壁（semi-walls）をガスケットとして用い、ゲル支持体としても用いられる箔をこのガスケットに対して押し付けることができるため、向かい合う側の堅い表面に対する位置を変えることによるストリップチャンバーの開閉が可能となる。この場合、好ましくは１次元目の終わりにストリップチャンバーを開けた後、ゲル溶液を導入し、重合させるか、または、箔を移動させなければならないため想像し難いが、ゲルをプレキャストすることができる。ストリップをゲル溶液に１ステップで浸す可能性が特許請求の範囲に記載されているが、この場合も先と同様にアガロースを用いることが好ましい。平衡化溶液は、装置の固定された部分を通ってストリップに到達することができる。この原理に基づく自動化システムは、いずれ近い将来、Ｎｅｘｔｇｅｎ Ｓｃｉｅ���ｃｅｓにより市販されるはずである。しかしながら、このシステムには依然として弱点が残っており、第一の弱点は、実施形態に関係なく、サンプルのデッドボリューム（dead volume）に代表される。実際、１次元目の後に平衡化溶液を流すために十分に再水和化したストリップの上部に余分な空間が必要であり、従ってストリップを再水和化する際にこの同じ空隙を満たすための余分のサンプルを必要とする。また、ＩＥＦの間ストリップの上部に余分な液体が残っていることは、タンパク質のフォーカス化の阻害および水平方向の衝突（horizontal striking）をもたらす可能性があり、この液体が取り除かれた場合は、ストリップの乾燥をもたらし得る。さらに、対象とする古典的な重合法の他にはゲル溶液の重合法について請求の範囲に記載されておらず、言及すらされていないため、ＩＥＦ後にゲルを注入する際、ゲル重合のための長い待ち時間による分解能の損失およびアクリルアミドモノマーのストリップへの浸透による悪影響が予測される。このことが、全ての場合においてアガロースの使用が好ましい理由に違いない。しかしながら、アガロースは、融解前に沸騰させる必要性などの新たな煩わしい事柄や、アガロースがゲル化し始めたら、全てのチューブや部品からこれを取り除く面倒をもたらす。また、ゲルの均一な厚さを保証するのに重要な、平らで変形していない箔の形状を保持することの効率に関する懸念も残る。
【特許文献１】ＥＰ １ ７１２ ９０３
【特許文献２】ＵＳ ６５５４９９１ Ｂ１
【特許文献３】ＵＳ ２００３／０１２７３３１
【特許文献４】ＥＰ ０３６６８９７
【特許文献５】ＷＯ ０２／０８４２７３ Ａ１
【非特許文献１】Herbertら, "Electrophoresis", Vol.22, pp.2046-2057 (2001)
【発明の開示】
【発明が解決しようとする課題】
【０００９】
本発明の目的の１つは、サンプルがデバイスに一旦ロードされていれば、最小限の手動操作の介入のみを必要とし、または好ましくは全く必要としない、２次元ゲル電気泳動に基づくサンプル分離のための電気泳動用組立品または使い捨てデバイスを提案することである。
【００１０】
本発明のさらなる目的は、該デバイスの処理の自動操作ステップを提案することである。
【課題を解決するための手段】
【００１１】
２次元電気泳動を用いたサンプルの分離のための電気泳動用組立品または使い捨てデバイスが提案され、該組立品または使い捨てデバイスは、１次元目ゲルストリップ（７）のための区画と２次元目ゲルのための区画（１６）とを有する、フィルムもしくは箔またはガラス板等の担体（５）であって、前記２つの区画は直接的に互いに連絡している担体と；前記担体（５）から可変的な距離にある硬コンポーネント（３）と薄く柔軟な軟コンポーネント層（１１）とからなるツーコンポーネント本体であって、少なくとも１つの弁の、外部からの作動のための少なくとも１つのスリットまたは開口部をさらに含み、該弁が、該スリットを介した該軟コンポーネントの外部からの作動に際して、該スリットに対応して、該担体に対する方向について可逆的に張り出すことにより現れるものである本体とを含んでなる。
【００１２】
本発明により、上記の古典的な方法に従い、ゲル電気泳動用の使い捨てデバイス中の弁を依然として用いても、従来技術に対してさらなる改良を行うことが可能であることが示される。
【発明を実施するための最良の形態】
【００１３】
発明の説明
以下の記載、そして後に続く模式図を参照して、従来技術との差異および主張し得る利点を明らかにしつつ、本発明のシステムおよび方法についての例の簡単な説明を行う。
【００１４】
システム
２次元電気泳動システムは、例えば、ソフトウェア制御機器による一連の自動操作ステップに供される使い捨てのコア部分を備え、該使い捨てコア部分の各要素もまた、方法、使い捨て形式およびその機能と組み合わせて本発明の一部となる。機器という用語から、使い捨て本体を使用するための、例えば、バッファー貯留部、冷却ブロック、電極、チューブ、ＵＶランプ等を備える装置が理解される。少なくとも１つの弁を含むこの電気泳動用デバイスの本体は、例えばツーコンポーネント成形技術の適用により射出成形されるが、このことは２つの部品の間の組み立てが不要であり、従って製造コストが減少することを意味する。このように、上記デバイスは使い捨てであることが意図され、これを以下使い捨て本体と呼ぶ。本体の材料は、好ましくはＰＭＭＡ、ＰＣ、ＰＥ、ＰＥＴ、ＰＰまたはＣＯＣから選択され、この方法の間、機器に組み込まれた１つまたは複数のランプから適切な波長の光を直接その材料を通して当てることによりゲル溶液をＵＶ開始高速重合させるという具体的な意図により、ＵＶ透過性であることに留意する。弁のための軟コンポーネントの材料は、好ましくは予め選択された本体の材料と適合可能なＴＰＥ(熱可塑性エラストマー)、例えばＰＴＳ−Ｔｈｅｒｍｏｆｌｅｘ（登録商標）(Plastic Technology Service Ltd, Salisburg SP5 4BZ, UK)またはＳａｎｔｏｐｒｅｎｅ（登録商標）(Advanced Elastomer Systems, LP, Akron, Ohio, USA)から選択される。これもまたＵＶ透過性であってよく、例えば、使い捨て本体の内側に直接取り付けられる都合のよい平面的な薄板形に成形される。ストリップが下に置かれる領域の直隣で使い捨て本体に２つのスリットを残すことによって、弾性の軟コンポーネントを機器が行う外部からの剛性の作動部により押し込むことが可能となり、従って、ストリップ／ゲル担体（例えばゲル結合箔またはガラス板）に押し付けることによって、ストリップを閉鎖されたタイトな環境中に閉じ込める。同様に、必要であれば、または単に結果として生じる任意の開放端部を閉じるために、ゲルチャンバーを区画に分けるために他の位置にもスリットを設計することができる。
【００１５】
別の軟コンポーネントは、ゲル区画の境界線に沿ったガスケットロッドまたはリングとして、かつ本体の内側と担体箔との間のサンドイッチ状の配置で使い捨て本体中に組み込まれる。この軟コンポーネントは、同時に、同じ方法を用いて、そしてまた結果的には上記と同じ材料を用いて成形することが可能であり、外部から圧力をかけると２つの向かい合った面の間の距離を変化させることができるという別の重要な機能を果たす。この距離は、例えば、好ましくは再水和およびＩＥＦの間は約０．７ｍｍに相当し、平衡化、ゲル注入、重合および２次元目の分離の間は約１．０ｍｍに相当する。
【００１６】
重合の間はゲルと連結する担体箔は、例えば使い捨て本体をも覆い、方法終了後に使用者が剥がすことができる。
【００１７】
さらに、使い捨て本体の外寸は、ロボット操作を容易とするため、好ましくはＡＮＳＩ ＳＢＳ(米国規格協会、生物分子スクリーニング学会：１２７．７６±０．２５ｍｍ×８５．４８±０．２５ｍｍ)規格に従って設計される。
【００１８】
１つの選択肢はまた、１次元目の分離のために、例えばグラファイトからなる安価な使い捨て電極を組み込むことである。使い捨て本体中の穴を通ってストリップの端部と接触することとなる代替的な電極ロッド、例えば白金からなるロッドを機器の一部とすることが可能であり、これは使い捨てではない。好ましくは、適切な時点で使い捨て本体のバッファー貯留部に挿入される、２次元目用の電極を機器に組み込む。別の選択肢は、酸化還元反応および電極の消耗がそれほど重要ではない場合には、例えばカソード（陰極）において該使い捨て本体に組み込まれた少なくとも１つの安価な電極を有することである。
【００１９】
別の実施形態において、ガスケットおよび外圧を利用する簡単な手段により必要とされる場合、使い捨てデバイスをさらに簡素かつコンパクトにするため、２次元目のためのバッファー貯留部を、使い捨て本体に固定された機器の一部とすることもできる。小さな貯留部および少ないバッファー量に伴うバッファー容量の低下を防ぐために、バッファーを上流のより大きな貯留部から新たに循環させることができる。回路全体を印加電圧下で保持することは、幾つかの方法により回避することができ、例えば、バッファーを交換するために、回路を周期的に開放するか、または大きな貯留部と小さな貯留部との間の連絡の導水路を制限し、結果的に絶縁物としての液体通路の途中の気泡も抜く、「ストップアンドゴー（stop and go）」不連続アプローチを用いて回避することができる。あるいは、バッファー容量の制限は、陰極バッファーを陽極バッファーと再循環させることにより克服することが可能であり、逆の場合もまた可能である。この手段によって、泳動中にさらなるバッファーを必要とすることなく、バッファー貯留部を小型のままにしておくことができる。
【００２０】
いずれも再現性のために必須な、ゲルの均一性および効率的な冷却を保証するのに特に重要な、担体箔の平坦さおよび均一性を維持するために、使い捨て本体が幾何的にフィットする機器の冷却ブロックを、それを介して真空吸引することが可能な多孔性セラミック、金属または他の熱伝導性アロイで作ることができる。このことは同時に、使い捨て本体を安定的に機器に固定することによって、ゲル導入の間に冷却ブロックの機械的回転により使い捨て本体が９０°も回転することさえ可能にする、有利な方法を表す。
【００２１】
この使い捨て本体はＩＥＦストリップを備えていない汎用的なものであってもよく、従って操作者が所望のｐＨ範囲を有する所望のストリップを挿入することができ、かつストリップを内蔵した使い捨て本体全体を冷蔵温度で輸送および保存する必要性を回避することができる。ガイド機能を備えることにより、例えば弁が閉じていること等による誤配置は生じ得ないようにすることができ、また電極もストリップを定位置に保つ役割を果たし得る。しかしながら、特に上記提案のとおり使い捨て本体がさらに簡素かつコンパクトに作られる場合、ストリップをあらかじめ使い捨て本体に組み込み、注文者が様々なストリップと様々な使い捨て本体のセットを注文することができるようにすることが可能である。別の可能性は、ストリップをあらかじめ箔上に取り付け、この箔を使い捨て本体とは別個に輸送することである。この場合使用者は、後で、例えば位置決め穴を用いて２つの部品を合わせて組み立てなければならない。他の選択肢の１つは、カバー箔中の開口部を通してストリップを入れ、その後テープ状の機構を用いて開口部を閉じることである。
【００２２】
弁を用いた実施形態に適用することができる別の構成要素は、ゲル／バッファー境界でのメンブレンまたはブレードの使用である。特許を受けようとする対象は、疎水性で最終的には支えがなされる、材料、厚さおよび孔サイズの適切な組み合わせを有する、例えばＰＥＴ、ＰＥ、ＰＰまたはＰＥＳから作られるメンブレンの使用であって、該メンブレンは垂直での注入の間でも液体ゲル溶液用のバリアとして働く機能を有するが、重合したゲルとＳＤＳ含有バッファーとの間の液体接触および正常な電気的接触は可能とするものである。有効な例は、Schleicher & Schuell, Einbeck, DE,(Watman)製の、Ｕｌｔｒａｎ（登録商標）ＰＥＳ(ポリエーテルスルホン)５ＫＤメンブレンであり、これは通常は濾過および生物学的用途に用いられる。ゲルがＳＤＳを含有しているか否かに依存して、同程度に、またはそれより多少して効果的に、他のものを用いることも可能である。使い捨て本体をできる限り簡素にしておくために、ゲル／バッファー境界のスリットが、ゲル重合の後にのみ作り出されることも想像することができ、このとき該スリットは、成形された使い捨て本体の薄い一体的な内張りに沿った縦方向の切り込みの形で、または機器に組み込まれたブレードを用いて、硬コンポーネント部分中のスリットを介して軟コンポーネント材料に切り込みを入れることにより作られる。ストリップを閉じ込めるために何らかの弁を使用する場合、おそらくより簡単な解決策は、使い捨て本体と共に射出成形される軟コンポーネントを用いて、外部からの作動に際して、ストリップチャンバーを閉じる場合と同様の方法で、注入および重合の間ゲルチャンバーの開放端部を閉じることである。別の簡単な解決策は、スリットにテープを渡し、バッファーとの接触を設けなければならなくなったときに、このテープを取り除くことができるようにすることである。最も簡単な解決策は、ストリップ側の外部弁を閉じたままにして、底側にストリップを置いてゲルを注入することである。
【００２３】
以下の記載および後に続く模式図を参照して、従来技術との差異および主張し得る利点を明らかにしつつ、本発明のシステムおよび処理の例の簡単な説明を行う。
【００２４】
自動的に行われる処理ステップは以下のとおりであり、これについて添付図面を参照して説明する：
ステップ１
閉じられた使い捨て本体１の中にストリップが既に組み込まれている場合を除いて、使い捨て本体１の中に第１のゲルストリップ７を挿入するか、またはストリップ７を担持する箔５を取り付ける。考えられる代替法は、両側に配置された２つの弁９および１０が閉じられた状態でＩＥＦストリップ７を現場導入することである。この弁は、挿し込み部１２および１４（使い捨て本体１を用いるために設けられた機器（図示せず）の一部である）によって作動することが可能である。
【００２５】
ステップ２
ストリップ７の両側の２つの弁９および１０が閉じられた状態で、箔５と、使い捨て本体３の内側を覆う軟コンポーネント弁材料１１との間の距離を、例えば０．７ｍｍとして、作り出されたストリップチャンバーが満たされるまで再水和溶液中のサンプルをロードする。
【００２６】
ステップ３
冷却ブロック（図示せず）の温度を、例えば３０℃〜３５℃に設定し、少なくとも、例えば１時間、再水和を待つ。
【００２７】
ステップ４
２つの電極（図示せず）の間に傾斜（ramping）高電圧をかけることによりＩＥＦを実施するが、ここで電極はこの時点で処理用機器に組み込まれているか挿入されており、該処理用機器は例えば２０℃に設定された温度も制御する。
【００２８】
ステップ５
使い捨てデバイスから、機器により付加される圧を解放することによって、箔５と内側面１１との間の図１ａに示される距離ａを、例えば０．７ｍｍから距離ｂ、例えば図１ｂに示される１．０ｍｍにまで増大させ、他方、ストリップ７のチャンバーを閉じられた状態に保つために、外部挿入部１２および１４を用いて軟コンポーネント弁９および１０をさらに押し込む。図１ａの距離ａから図１ｂの距離ｂへの増大は、例えば弾性の軟コンポーネント材料で作られる内蔵ガスケット１７が膨張して元の形に戻ることにより達成される。図１ａに示される配置において、使い捨て本体３は、外部から圧力をかけることによって箔５に向かって押し下げられるが、この圧力は図１ｂの配置においては取り除かれている。
【００２９】
ステップ６
アルキル化／ＳＤＳ平衡化溶液を、ストリップ７の上部に作られ、最後には空になる、例えば０．３ｍｍの深さの導水路２３の中へ流し込む。
【００３０】
ステップ７
使い捨て本体１全体を９０°回転させ、例えば、図２ａおよび図２ｂに示されるように直立した状態にする。この動作は、使い捨て本体が上記に提案される幾何的フィッティングおよび多孔性材料を介した真空吸引により安定に固定されている冷却ブロック（図示せず）の回転により実現することができる。
【００３１】
図２ａは、ストリップ７の一方の側の弁１０が閉じられた状態のままで弁９が開いている、直立した状態での図１ｂに示される使い捨て本体の設計を示す。
【００３２】
ステップ８
ゲル／バッファー境界のスリット１３および１５がまだ作られていない場合を除き、またはこれらのスリットが軟コンポーネント層１１もしくは図３に示される付加的なメンブレン２１および２２のいずれかにより閉じられている場合、ストリップ７を底側にした図２ａの実施形態の弁１０を、ゲル溶液が注入され重合するまで閉じたままにしておかなければならない。ゲルストリップ７を頂側にした図２ｂの別の実施形態では、使い捨て本体１の向かい側に追加の外部弁２７が配置される（箔５とカバープレート３との間に、例えば１ｍｍの間隔をあけるが、これは図１ｂの距離ｂを意味する）。
【００３３】
ステップ９
２次元目での分離のゲルを形成するために、例えば使い捨て本体３中の穴（図示せず）を通じてゲル溶液を注入し、それによりストリップ７とのカップリングを同時に達成し、高速ＵＶ開始反応による重合を、例えば５分未満で完了させるが、これはＵＶ透過性の使い捨て本体３および層１１により可能となる。必要に応じて、勾配ゲルを注入することもできる。
【００３４】
ステップ１０
図２ａの配置における弁１０、または図２ｂの配置における挿入部２６により稼動させられる弁２７を開き、これによってランニングバッファーが２次元目の分離用のゲルと接触できるようにする。あるいは代替ステップとして、スリットがまだ存在しない場合には、例えば図４に示されるブレード機能３２によりスリット１３および／または１５を作る。別の代替ステップは、スリット１３および１５が図３に示される追加のメンブレン２１および２２により閉じられている場合には、すぐに次のステップに進むことである。
【００３５】
ステップ１１
最終的には、開放系のバッファー貯留部を用いる場合には装置を回転させて水平の状態に戻すが、そうでなければ戻し回転は必ずしも必要ではない。貯留部が機器の一部分である場合、すなわち使い捨て本体に組み込まれていない場合、ここで図５に示され、符号４１および４２で指し示すように、貯留部を接続することができる。
【００３６】
ステップ１２
ランニングバッファーを導入し、最終的にランニングバッファーを循環させて、２つの貯留部の間に電圧をかけることによって、制御された温度（例えば２０℃）で２次元目の泳動を開始する（電極は使い捨て本体または機器のいずれかに組み込まれている）。
【００３７】
ステップ１３
２次元目の泳動が完了した後、使い捨て本体１を機器から取り外し、これを開けてゲルが接着されている箔５を剥がすことによってゲルを取り除く。
【００３８】
添付の図面を参照する上記のプロセスは当然に、本発明を説明するための好適な一例であり、本発明を限定するものでは全くない。弁用の軟コンポーネント、箔、圧縮性部品等を含む使い捨て本体を製造するために用いられる材料の種類は、適宜変更することができる。第２のゲルのＵＶまたは光開始重合が可能となるように、使い捨て本体のためのＵＶ透過性または光透過性材料の使用が好ましいが、これは本発明の制限要因となるべきではない。さらに２つ、３つまたはこれ以上の弁を用いることが可能である。本発明の１つの重要な特徴は、当然、使い捨て本体の内側面と、第１のゲルストリップが取り付けられている箔との間の距離が可変的であることであり、このことは、１次元目の分離の後、例えば配置された弾性ガスケットによって、距離を広げることができることを意味する。
【００３９】
ストリップの周囲の弁と、カバー用箔と使い捨て本体の内側面との間の可変的な距離（例えば、それぞれ１次元目の間および２次元目の間で、０．７ｍｍおよび１．０ｍｍ）との組み合わせは、弁について許容される位置の数を２つから３つへと増加させ、従来技術と比べて重要な利点を提供する。まず第１に、弁によって作られるストリップチャンバーの容積が再水和したストリップの体積に対応するため、ストリップを再水和するために余分のサンプルは必要とされないか、または最小限でよい。このようにして、ストリップの上部に余分な液体がない最適条件下でＩＥＦを行うこともできる。ＩＥＦの後にのみ、平衡化溶液を流すためにストリップの上部に空間が作られ、それにより最適な平衡化条件ももたらされる。最終的に、適切なカップリングを達成し、電場の均一性、２Ｄ分解能および再現性の点で良好な２次元分析を行うためにはストリップの上に小さな空間を有するより厚いゲルが必要とされるため、この続くステップにおいても、最適条件がまた提供される。
【００４０】
従来技術と異なり、２次元ゲル電気泳動の分野にＵＶ開始高速重合が導入され、波長域がその吸収スペクトルを含む光源に曝されるまでアクリルアミドゲル溶液中で安定な開始剤が選択される。ゲルを１次元目の分離の後で急速に重合させることができ、予め注入する必要がないため、弁はストリップをタイトな環境中に閉じ込めるためにのみ用いられ、ゲルとストリップとの間のバリアとしては用いられない。従って、化学的性質、保存期間および保存条件、ならびにＩＥＦ前または後での重合のための待ち時間はもはや問題ではない。先行するの欧州特許出願公開第１ ７１２ ９０３号に開示されているように、重合が速く進行するため、例えばアガロースのようなカップリングゲルの使用もまた排除することができる。ゲル溶液は型を完全に満たし、ストリップに接触し、ストリップを覆いかつ閉じ込めることが可能となるが、これは、それぞれラジカル重合の開始剤および触媒として過硫酸アンモニウム（ＡＰＳ）およびＮ，Ｎ，Ｎ’，Ｎ’−テトラメチルエチレンジアミン（ＴＥＭＥＤ）を使用する従来の方法を用いては可能とならない。当然、これらの試薬は添加および混合しなければならないが、そうすると注入の間に既にこれらがすぐに重合を開始し、このため事前調製の問題を生じ、そして反応はゆっくりと進んで通常は完了するまで１時間より長くかかるため、１次元目の間に得られた分解能の損失およびアクリルアミドモノマーのストリップ中への拡散（タンパク質との架橋の可能性を生じる）が他の重大な問題となる。
【００４１】
同様の理由により、勾配ゲルを注入する場合にも、高速ＵＶ重合は特に都合がよいものとなる。
【図面の簡単な説明】
【００４２】
【図１】図１ａおよび１ｂは、閉じられた弁および２つの可変的な厚さを有し、第１の厚さは再水和化およびＩＥＦの間のものであり、第２の厚さは平衡化の間のものであるツーコンポーネント使い捨て本体のコア部分を、模式的に、原寸大とは異なる縮尺で示す。
【図２】図２ａおよび２ｂは、２次元目でのゲル注入の間の、ツーコンポーネント使い捨て本体のコア部分についての２つの考えられる実施形態を、模式的に、原寸大とは異なる縮尺で示す。
【図３】適当なメンブレンまたはテープにより密封された、ゲル／バッファー境界のスリットを示す。
【図４】ゲル注入およびゲル重合の後にのみ、機器に組み込まれたブレード機能を用いてゲル／バッファー境界においてスリットを作るための考えられる方法を示す。
【図５】２次元目のためのバッファー貯留部が、使い捨て本体中に組み込まれるのではなく、必要な場合に機器に取り付けられ、小型の貯留部および少ないバッファー容量に伴うバッファー量の損失を防ぐために、バッファーが上流の大型の貯留部から新たに循環する、１つの考えられる実施形態を模式的に示す。
【図１】
2007178433.tif 000003
【図２】
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【図３】
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【図４】
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【図５】
2007178433.tif 000007
【手続補正書】
【提出日】平成19年1月30日(2007.1.30)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
２次元ゲル電気泳動を用いた複合タンパク質サンプルの分離のための電気泳動用組立品または使い捨てデバイスであって、
１次元目ゲルストリップ（７）のための区画と２次元目ゲルのための区画（１６）とを有する担体（５）であって、前記２つの区画は直接的に互いに連絡している担体と、
前記担体（５）から可変的な距離にある硬コンポーネント（３）と薄く柔軟な軟コンポーネント層（１１）とからなるツーコンポーネント本体であって、少なくとも１つの弁の、外部からの作動のための少なくとも１つのスリットまたは開口部をさらに含み、該弁が、該スリットを介した該軟コンポーネントの外部からの作動に際して、該スリットに対応して、該担体に対する方向について可逆的に張り出すことにより現れるものである本体と
を含んでなる、上記組立品または使い捨てデバイス。
【請求項２】
前記使い捨て本体が少なくとも部分的にＵＶ透過性であることを特徴とする、請求項１に記載の組立品または使い捨てデバイス。
【請求項３】
前記使い捨て本体の内側面に位置する前記軟コンポーネント層（１１）が、前記硬コンポーネント（３）中の少なくとも１つのスリットを介した外部からの作動に際して、該スリットに対応して、ゲル担体（５）に向かって押し込むことが可能であることを特徴とする、請求項１もしくは２に記載の組立品または使い捨てデバイス。
【請求項４】
前記硬コンポーネント（３）が、前記１次元目ゲルストリップ（７）の区画の両側で弁（９、１０）として機能し、かつ／または適切な位置で２次元目ゲルのための弁として機能する、前記軟コンポーネント層の外部からの作動のための、少なくとも２つのスリットもしくは開口部を含んでなることを特徴とする、請求項１〜３のいずれか１項に記載の組立品または使い捨てデバイス。
【請求項５】
前記使い捨て本体とゲル担体との間の距離の変化を、該使い捨て本体と担体との間にサンドイッチ状に配置され、２次元目ゲル区画の外辺に沿い、かつ該使い捨てデバイスの一部分である、少なくとも１つの弾性で圧縮可能／膨張可能な密封材またはガスケットにより実現することを特徴とする、請求項１〜４のいずれか１項に記載の組立品または使い捨てデバイス。
【請求項６】
使い捨て本体（１）が、１次元目および／もしくは２次元目の分離のための電極、および／または外部からの電極の差し込みのための構造をさらに含むことを特徴とする、請求項１〜５のいずれか１項に記載の組立品または使い捨てデバイス。
【請求項７】
前記使い捨て本体が、２次元目ゲルとランニングバッファーとの間の境界に、スリットをさらに含んでなることを特徴とする、請求項１〜６のいずれか１項に記載の組立品または使い捨てデバイス。
【請求項８】
２次元目ゲルとランニングバッファーとの境界にある前記スリットが、ブレード機能により、ゲル重合の後においてのみ作られることを特徴とする、請求項７に記載の組立品または使い捨てデバイス。
【請求項９】
少なくとも１つの大型の外部バッファー貯留部を含んでなり、それにより、請求項７または８に記載のスリットに対応して、前記使い捨てデバイスと一体となっているかまたはその外部に取り付けられた、より小型のバッファー貯留部に２次元目の分離のためのランニングバッファーを新規に供給することができ、かつ／またはそこから再循環させることができる、請求項７もしくは８に記載の組立品または使い捨てデバイス。
【請求項１０】
請求項１〜９のいずれか１項に記載の組立品または使い捨てデバイス内での２次元ゲル電気泳動を用いた複合タンパク質サンプルの分離方法であって、再水和溶液中でサンプルを１次元目ゲルストリップにロードするが、該ゲルストリップは、ストリップの両側で閉じられた弁とともに担体上に配置され、担体と使い捨て本体との間の距離は概ね再水和したストリップの厚さに対応していること、ならびに、再水和および１次元目の分離の後に、担体と使い捨て本体との間の距離が増大し、それと同時に、ストリップの周囲環境を閉鎖されたまま維持するためにストリップの両側で弁がさらに押し込まれて、それによりストリップの上部に空間または導水路が作られることで、平衡化溶液が流れることができるようになることを特徴とする、上記方法。
【外国語明細書】
2007178433000001.pdf