(57)【要約】【課題】パターン変更に容易に対応可能であるとともに，スポット内の化学物質の均一性に優れる有機化合物合成装置および有機化合物合成用基板を提供する。【解決手段】本発明に係る有機化合物合成装置１００は，末端が保護基で保護された繰り返し単位の重合反応により合成された有機化合物と，光反応により保護基を離脱させる物質を生成する光反応物質とを保持する有機化合物合成用基板１１０と；１または２以上の光源１３２を有し，有機化合物合成用基板１１０に保持された光反応物質に向けて光を照射する光照射装置１３０と；を備える。上記有機化合物合成装置１００は，光照射装置１３０が有機化合物合成用基板１１０に対して相対移動することで，１種または２種以上の有機化合物を有機化合物合成用基板１１０に合成する。【選択図】図１
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【特許請求の範囲】
【請求項１】
１または２以上の繰り返し単位からなる有機化合物を光照射により合成する有機化合物合成装置であって：
末端が保護基で保護された前記繰り返し単位と，光反応により前記保護基を離脱させる光生成物質を生成する光反応物質とが供給され，前記繰り返し単位の重合反応が行われる反応容器と；
１または２以上の光源を有し，前記光源から前記反応容器内に向けて光を照射する光照射装置と；
を備えることを特徴とする，有機化合物合成装置。
【請求項２】
前記光照射装置が前記反応容器に対して相対移動することで，１種または２種以上の前記有機化合物を合成することを特徴とする，請求項１に記載の有機化合物合成装置。
【請求項３】
前記光照射装置は，前記反応容器に対して相対移動するときに，前記反応容器内に供給された前記光反応物質のうち一部の前記光反応物質に選択的に光を照射することを特徴とする，請求項２に記載の有機化合物合成装置。
【請求項４】
前記繰り返し単位の重合反応と前記光反応物質の光反応とは，略同一の位置で行われることを特徴とする，請求項１〜３のいずれかに記載の有機化合物合成装置。
【請求項５】
前記繰り返し単位の重合反応と前記光反応物質の光反応とは，離隔した位置で行われることを特徴とする，請求項１〜３のいずれかに記載の有機化合物合成装置。
【請求項６】
前記光照射装置は，アレイ状に配置された２以上の光源を有することを特徴とする，請求項１〜５のいずれかに記載の有機化合物合成装置。
【請求項７】
前記光照射装置は，前記光源のアレイの軸方向と垂直な方向に相対移動することを特徴とする，請求項６に記載の有機化合物合成装置。
【請求項８】
前記光源は，発光ダイオードであることを特徴とする，請求項１〜７のいずれかに記載の有機化合物合成装置。
【請求項９】
前記光照射装置は，前記光源から照射された光を集光する１または２以上の集光レンズをさらに有することを特徴とする，請求項１〜８のいずれかに記載の有機化合物合成装置。
【請求項１０】
前記光反応物質は，光反応によりプロトンを放出するプロトン供給物質であり，
前記保護基は，プロトンと反応することにより前記繰り返し単位から離脱する官能基であることを特徴とする，請求項１〜９のいずれかに記載の有機化合物合成装置。
【請求項１１】
請求項１〜１０のいずれかに記載の有機化合物合成装置を用いて合成された有機化合物が固定される有機化合物合成用基板。
【請求項１２】
前記光反応物質が保持される複数の光反応物質保持部を有し，
前記繰り返し単位の重合反応は，光が照射された前記光反応物質が保持された前記光反応物質保持部で行われることを特徴とする，請求項１１に記載の有機化合物合成用基板。
【請求項１３】
前記繰り返し単位と前記光生成物質とを透過可能な構造を有し，
前記光反応物質の光反応は，前記有機化合物合成用基板の光が照射された側の表面で行われ，
前記繰り返し単位の重合反応は，前記有機化合物合成用基板の光が照射された側と反対側の表面のうち前記光反応物質の光反応が行われた位置で行われることを特徴とする，請求項１１に記載の有機化合物合成用基板。
【請求項１４】
複数の貫通孔を有し，
前記貫通孔は，光が照射される側の開口部が開放され，光が照射される側と反対側の開口部が前記繰り返し単位と前記光生成物質とを透過可能な反応物質透過部材により閉塞され，
前記光反応物質の光反応は，光が照射された側の開口部の近傍で行われ，
前記繰り返し単位の重合反応は，前記光反応物質の光反応が行われた前記貫通孔の光が照射された側と反対側の開口部を閉塞する前記反応物質透過部材の表面で行われることを特徴とする，請求項１１に記載の有機化合物合成用基板。
【請求項１５】
前記光反応物質は，光反応によりプロトンを放出するプロトン供給物質であり，
前記保護基は，プロトンと反応することにより前記繰り返し単位から離脱する官能基であることを特徴とする，請求項１１〜１４のいずれかに記載の有機化合物合成用基板。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
本発明は，有機化合物合成装置および有機化合物合成用基板に関し，特に，所望の塩基配列を有するＤＮＡがアレイ状に配置されたＤＮＡチップの製造に使用される有機化合物合成装置および有機化合物合成用基板に関する。
【背景技術】
【０００２】
近年，生体物質であるＤＮＡ（デオキシリボ核酸）を用いた病気の診断において，ＤＮＡを基板上に配列したチップを用いる方法が，個々の人間の違いに対応したオーダーメイド医療の実現に必須のものとして研究され，実現化されつつある。
【０００３】
このようなＤＮＡチップは，基板上に配列の異なるＤＮＡのセグメントをスポット状に並べたものである。ＤＮＡチップの作製方法としては，あらかじめスポットの種類分だけのＤＮＡを合成しておき，それをインクジェット方式で基板上に並べていく方法と，基板上で核酸をつなげて合成していく方法の２種類が考えられている。
【０００４】
後者の基板上で核酸をつなげて合成していく方法は，４つの塩基に応じた材料だけで，任意の配列のＤＮＡを直接基板上に作製できる点で優れている。このようなＤＮＡチップの作製に当たって，例えばアフィメトリクス社では，フォトリソグラフィの方法で基板上のＤＮＡのパターン形成を行っている。また，例えばアジレント社では，基本的な方法はアフィメトリクス社と同様であるが，インクジェット方式でＤＮＡのパターン化を行っている（例えば，特許文献１〜４を参照）。
【０００５】
上記のようなＤＮＡチップの具体的な作製方法として，一般に，アミダイト法がよく用いられているが，このアミダイト法について以下に簡単に説明する。まず，基板上にリンカーを介して保護基を形成する。この保護基は光または酸に対して反応して離脱し，水素を有したリンカーの端部が現れる。ここに，保護基で修飾した塩基を反応させると，塩基のイソプロピル基を有した部分がリンカーにつながる。さらに，新たな塩基をつなぎたい場所に光を照射または酸を供給すると保護基が離脱し，ここに保護基で修飾した塩基を反応させると，新たな塩基がその部分につながる。このような反応を繰り返すことにより，必要な塩基の配列を形成することができる。
【０００６】
【特許文献１】米国特許第６，３７２，４８３号明細書
【特許文献２】米国特許第６，４２０，１８０号明細書
【特許文献３】米国特許第６，６００，０３１号明細書
【特許文献４】米国特許第６，３７５，９０３号明細書
【発明の開示】
【発明が解決しようとする課題】
【０００７】
ところで，基板上のどの場所にどのような塩基配列のＤＮＡを形成するかは，光を照射する位置または酸をスポッティング（供給）する位置のパターンを決めることで決定することができる。このような光照射等の基板上でのパターンは，現在，半導体集積回路（ＩＣ）を作製する場合に使用されるガラスマスクを用いることが主流となっている。このガラスマスクを用いる方法は，同じパターンのものを大量に生産する場合には適しているが，パターン変更に即座に対応することが困難である。
【０００８】
このようなパターン変更に対応する方法として，例えば，ディスプレイ用に開発されたマイクロマシンミラーや液晶を使用したものなどが考案されている。しかし，このようなマイクロマシンミラーや液晶を使用した場合には，ガラスマスクを用いた方法とは異なり，スポット内でのＤＮＡなどの化学物質の均一性に劣る，という問題があった。さらに，ガラスマスクを用いる方法と同様に，投影系の光学系を用いているために，装置の小型化には限界があった。
【０００９】
また，パターン変更に対応する他の方法として，インクジェット方式によるスポッティングを行う方法がある。しかし，インクジェット方式では，スポッティングの回ごとの位置合わせが精密さを要求されることや乾燥時にムラが生じることなどにより，各ＤＮＡ区画の均一性に劣るという問題があった。
【００１０】
そこで，本発明は，このような問題に鑑みてなされたもので，その目的は，パターン変更に容易に対応可能であるとともに，スポット内の化学物質の均一性に優れる，新規かつ改良された有機化合物合成装置および有機化合物合成用基板を提供することにある。
【課題を解決するための手段】
【００１１】
上記課題を解決するために，本発明のある観点によれば，１または２以上の繰り返し単位からなる有機化合物を光照射により合成する有機化合物合成装置であって，末端が保護基で保護された繰り返し単位と，光反応により保護基を離脱させる光生成物質を生成する光反応物質とが供給され，繰り返し単位の重合反応が行われる反応容器と，１または２以上の光源を有し，この光源から反応容器内に向けて光を照射する光照射装置と，を備える有機化合物合成装置が提供される。
【００１２】
上記有機化合物合成装置は，光照射装置が反応用器に対して相対移動することで，１種または２種以上の有機化合物を合成するように構成してもよい。
【００１３】
また，光照射装置は，反応容器に対して相対移動するときに，反応容器内に供給された光反応物質のうち一部の光反応物質に選択的に光を照射するように構成してもよい。
【００１４】
また，上記有機化合物合成装置において，繰り返し単位の重合反応と光反応物質の光反応とは，略同一の位置で行われるように構成してもよい。
【００１５】
一方，上記有機化合物合成装置において，繰り返し単位の重合反応と光反応物質の光反応とは，離隔した位置で行われるように構成してもよい。繰り返し単位の重合反応と光反応物質の光反応とが略同一の位置で行われる場合には，光照射装置から照射された光が合成される有機化合物に直接照射されて悪影響を与える場合があるが，繰り返し単位の重合反応と光反応物質の光反応とが離隔した位置で行われるように構成することにより，合成される有機化合物に悪影響を与えることなく，重合反応の反応効率を向上させることができる。
【００１６】
また，上記有機化合物合成装置において，光照射装置は，アレイ状に配置された２以上の光源を有していてもよく，さらに，光照射装置は，光源のアレイの軸方向と垂直な方向に相対移動するように構成してもよい。
【００１７】
また，光照射装置の光源としては，例えば，発光ダイオードや半導体レーザなどを使用することができ，特に，発光ダイオードを使用することが好ましい。
【００１８】
さらに，光照射装置は，光源から照射された光を集光する１または２以上の集光レンズをさらに有していてもよい。
【００１９】
また，例えば，上記光反応物質としては，光反応によりプロトンを放出するプロトン供給物質を使用することができ，上記保護基としては，プロトンと反応することにより上記繰り返し単位から離脱する官能基を使用することができる。なお，光反応物質としては，これ以外にも，例えば，酸素ラジカルを放出する物質などを使用してもよい。
【００２０】
上記課題を解決するために，本発明の別の観点によれば，上述した有機化合物合成装置を用いて合成された有機化合物が固定される有機化合物合成用基板が提供される。
【００２１】
また，上記有機化合物合成用基板は，例えば，光反応物質が保持される複数の光反応物質保持部を有していてもよい。この場合，繰り返し単位の重合反応は，光が照射された光反応物質が保持された光反応物質保持部で行われる。
【００２２】
また，上記の例以外にも，上記有機化合物合成用基板は，例えば，繰り返し単位と光生成物質から放出されたプロトンとを透過可能な構造を有していてもよい。この場合，光反応物質の光反応は，有機化合物合成用基板の光が照射された側の表面で行われ，繰り返し単位の重合反応は，有機化合物合成用基板の光が照射された側と反対側の表面のうち光反応物質の光反応が行われた位置で行われる。
【００２３】
さらに，上記例以外にも，例えば，上記有機化合物合成用基板は，該基板を貫通する複数の貫通孔を有していてもよく，この貫通孔は，光が照射される側の開口部が開放され，光が照射される側と反対側の開口部が繰り返し単位と光反応物質から放出された光生成物質とを透過可能な反応物質透過部材により閉塞されていてもよい。この場合，光反応物質の光反応は，光が照射された側の開口部の近傍で行われ，繰り返し単位の重合反応は，光反応物質の光反応が行われた貫通孔の光が照射された側と反対側の開口部を閉塞する反応物質透過部材の表面で行われる。
【００２４】
また，例えば，上記光反応物質としては，光反応によりプロトンを放出するプロトン供給物質を使用することができ，上記保護基としては，プロトンと反応することにより上記繰り返し単位から離脱する官能基を使用することができる。なお，光反応物質としては，これ以外にも，例えば，酸素ラジカルを放出する物質などを使用してもよい。
【発明の効果】
【００２５】
本発明によれば，パターン変更に容易に対応可能であるとともに，スポット内の化学物質の均一性に優れる，有機化合物合成装置および有機化合物合成用基板を提供することができる。
【発明を実施するための最良の形態】
【００２６】
以下に添付図面を参照しながら，本発明の好適な実施の形態について詳細に説明する。なお，本明細書及び図面において，実質的に同一の機能構成を有する構成要素については，同一の符号を付することにより重複説明を省略する。
【００２７】
本発明に係る有機化合物合成装置は，上述したように，１または２以上の繰り返し単位からなる有機化合物を光照射により合成する装置である。この装置により合成される有機化合物としては，例えば，核酸（ＤＮＡ，ＲＮＡなど）またはタンパク質などの生体高分子化合物や，生体以外の通常の高分子化合物（ポリマー，オリゴマー）等がある。ＤＮＡやＲＮＡなどの核酸の場合には，４種類の塩基（Ａ，Ｔ，Ｇ，Ｃ）が繰り返し単位となり，タンパク質の場合には，種々のアミノ酸が繰り返し単位となり，通常の高分子化合物の場合には，モノマーが繰り返し単位となる。
【００２８】
以下，本発明に係る有機化合物合成装置として，アレイ状に配置されたＤＮＡを合成するためのＤＮＡアレイ合成装置を例に挙げて説明する。
【００２９】
（第１の実施形態）
【００３０】
以下に説明する本発明の第１の実施形態に係る有機化合物合成装置は，上述した繰り返し単位の重合反応と光反応物質の光反応とが略同一の位置で行われるものの一例である。
【００３１】
＜ＤＮＡアレイ合成装置１００の構成＞
まず，図１に基づいて，本発明の第１の実施形態に係る有機化合物合成装置の一例としてのＤＮＡアレイ合成装置１００の構成について説明する。なお，図１は，本実施形態に係るＤＮＡアレイ合成装置１００の全体構成を示す断面図である。
【００３２】
図１に示すように，本実施形態に係るＤＮＡアレイ合成装置１００は，本実施形態に係る有機化合物合成用基板の一例としてのＤＮＡアレイ基板１１０と，反応容器１２０と，光照射装置１３０とを備える。
【００３３】
ＤＮＡアレイ基板１１０は，末端が保護基で保護された４種の塩基（Ａ，Ｔ，Ｇ，Ｃ）の重合反応により合成されたＤＮＡと，光反応により保護基を離脱させる物質を生成する光反応物質３０とを保持するための基板である。
【００３４】
本実施形態において，４種の塩基の末端を保護する保護基としては，酸性領域において，言い換えると，プロトンと反応することにより，塩基の末端から離脱する官能基であり，例えば，５´−ジメトキシトリトル（５´−ｄｉｍｅｔｈｏｘｙｔｒｉｔｌ）などを使用することができる。
【００３５】
また，本実施形態に係る光反応物質３０としては，例えば，光反応によりプロトンを放出するプロトン供給物質や酸素ラジカルなどの光生成物質を使用することができる。このようなプロトン供給物質（ＰＧＡ：Ｐｈｏｔｏｇｅｎｅｒａｔｅｄ  Ａｃｉｄ）としては，例えば，ｔｒｉａｒｙｌ−ｓｕｌｆｏｎｉｕｍ−ｈｅｘａｆｌｕｒｏａｎｔｉｍｏｎａｔｅをｐｒｏｐｙｌｅｎｅ  ｃａｒｂｏｎａｔｅに溶解させたものを使用できる。この場合には，３６５ｎｍ程度の波長の光を上記ＰＧＡに照射することにより，プロトンを放出させることができる。この他にも，ＰＧＡとしては，可視光用光酸発生剤（ＰＡＧ：Ｐｈｏｔｏａｃｉｄ  Ｇｅｎｅｒａｔｏｒ）や，光増感剤と光酸発生剤とを組み合わせて使用することができる。
【００３６】
上記可視光用光酸発生剤としては，例えば，ノナフルオロブタンスルホン酸１，３，６−トリオキソ−３．６−ジヒドロ−１Ｈ−１１−チア−アザシクロペンタ［ａ］アントラセン−２−イルエステルや，ノナフルオロブタンスルホン酸８−イソプロピル−１，３，６−トリオキソ−３．６−ジヒドロ−１Ｈ−１１−チア−アザシクロペンタ［ａ］アントラセン−２−イルエステルなどが挙げられる。この場合には，４３６ｎｍ程度の波長の光を上記ＰＧＡに照射することにより，プロトンを放出させることができる。
【００３７】
一方，上記酸発生剤としては，例えば，オニュウム塩，ジアリルヨードニュウム等のヨードニュウム塩，トリアリルスルフォニウム，ジアルキルフェナシルスルフォニウム等のスルフォニウム塩などが挙げられる。また，上記光増感剤としては，例えば，２−イソプロピルチオキサントン，１−クロロ−４−プロポキシチオキサントン等のチオキサントン（Ｔｈｉｏｘａｎｔｈｏｎｅ），ケトクマリン（Ｋｅｔｏｃｏｕｍａｒｉｎ），フェノチアジン誘導体（Ｐｈｅｎｏｔｈｉａｚｉｎｅ），カンファーキノン（Ｃａｍｐｈｏｒｑｕｉｎｏｎｅ），ベンゼン誘導体（Ｂｅｎｚｉｌ），チタノセン化合物（Ｔｉｔａｎｏｃｅｎｅ），ＱＢＳベンゾスルファニル基を有する化合物などが挙げられる。上記光増感剤に対しては，例えば，チオキサントンに対しては３８３ｎｍ程度の波長の光，カンファーキノンに対しては４７８ｎｍ程度の波長の光，ベンゼン誘導体に対しては４８０〜４８６ｎｍ程度の波長の光，チタノセン化合物に対しては４６０ｎｍ程度の波長の光を照射することにより，酸発生剤と組み合わせてプロトンを放出させることができる。
【００３８】
また，ＤＮＡアレイ基板１１０の材質としては，ガラスや種々のプラスチックなどを使用することができる。
【００３９】
ここで，図２を参照しながら，ＤＮＡアレイ基板１１０の構成について説明する。なお，図２は，本実施形態に係るＤＮＡアレイ基板１１０の構成を示す図であり，（ａ）は平面図，（ｂ）は部分断面図である。
【００４０】
図２に示すように，ＤＮＡアレイ基板１１０には，光反応物質３０（以下，「プロトン供給物質３０」と記載することもある）が保持される光反応物質保持部の一例としての凹部１１２が複数形成されている。このような凹部１１２などの光反応物質保持部を設けるのは，光反応物質３０の光反応により生成したプロトンなどの化学反応物質を所定の領域内に局在させる必要があるためである。すなわち，プロトンなどの化学反応物質が所定の領域内に局在していないと，各ＤＮＡが合成される区画のうち，隣り合う区画同士の干渉が生じ，目的とする生成物（本実施形態ではＤＮＡ）以外のものが生成する可能性があるためである。
【００４１】
上記化学反応物質を局在させる方法としては，ＤＮＡアレイ基板１１０の表面修飾など様々な方法が考えられるが，本実施形態においては，ＤＮＡアレイ基板１１０上に複数の凹部１１２を設けている。そして，後述する光照射装置１３０から照射された光の焦点がこの凹部１１２内で結ばれることにより，光反応物質３０の光化学反応が，光が照射された所望の凹部１１２内のみで起こり，プロトンなどの化学反応物質が所望の凹部１１２内で局在する。
【００４２】
反応容器１２０は，末端が保護基で保護された繰り返し単位と光反応物質とを有機化合物合成用基板に供給する反応物質供給部の一実施形態である。すなわち，反応容器１２０は，末端が保護基で保護された４種の塩基のうち所望の塩基とプロトン供給物質３０とを含む反応液を，ＤＮＡアレイ基板１１０に供給する。
【００４３】
この反応容器１２０は，ＤＮＡアレイ基板１１０の一方の面（本実施形態においては，光照射装置１３０の他側の面）を覆うように，上記反応液を保持するための所定の空間（下記反応液保持部１２６を参照）を有して配設され，主に，反応液入口１２２と，反応液出口１２４と，反応液保持部１２６とを備える。反応液保持部１２６では，ＤＮＡの伸張反応（重合反応）を行う間，上記反応液が保持される。反応液は，反応液入口１２２から導入され，反応液保持部１２６を通って，反応液出口１２４から排出される。このように，反応容器１２０内においては，反応液入口１２２→反応液保持部１２６→反応液出口１２４という反応液の流路が形成されている。かかる反応容器１２０の具体的な構造としては，例えば，基板上に溝を掘り込むことにより形成される，いわゆるマイクロ流体構造が代表的なものとして使用される。
【００４４】
光照射装置１３０は，複数の光源１３２を有し，光源１３２からＤＮＡアレイ基板１１０に保持されたプロトン供給物質３０に向けて光を照射する。ここで，本実施形態においては，光源１３２は複数設けられているが，本発明に係る光照射装置としては，１つの光源のみが設けられた構成でもよい。このように，光照射装置１３０の光源１３２から，プロトン供給物質３０に光を照射することにより，ＤＮＡアレイ基板１１０と反応容器１２０とにより構成される化学反応系に対して，空間分布を持った光化学反応を起こさせることができる。
【００４５】
ここで，図３も参照しながら，光照射装置１３０の構成について詳細に説明する。なお，図３は，本実施形態に係る光照射装置１３０の構成を示す斜視図である。
【００４６】
図３に示すように，光照射装置１３０は，光源アレイ基板１３４上にアレイ状に配置された複数の光源１３２と，ロッドレンズ１３６がアレイ状に配列されたロッドレンズアレイ１３８と，を主に備える。
【００４７】
本実施形態に係る複数の光源１３２は，アレイ状に１列に配置されているが，必ずしもアレイ状に配置されている必要はなく，また，光源１３２の配列の数も１列には限られず，ＤＮＡアレイ基板１１０の大きさやＤＮＡアレイ基板１１０上に形成される光照射のパターン等により適宜変更することができる。さらに，光源１３２の個数もＤＮＡアレイ基板１１０の大きさやＤＮＡアレイ基板１１０上に形成される光照射のパターン等により適宜選択することができる。
【００４８】
光源１３２としては，例えば，半導体を用いた光学素子を使用することができるが，このような光学素子としては，例えば，発光ダイオードや半導体レーザなどを使用できる。発光波長の選択に当たっては，ＤＮＡなどの有機化合物を合成するために必要な光エネルギーに応じて，所望の発光波長を選択することが可能であるが，得られる光エネルギーが大きいという点で，波長の短い光を照射する光源を用いることが好ましい。一方，発光ダイオードや半導体レーザは，長波長で発光するものほど作成しやすい。このような観点から，本実施形態では，光源１３２として，例えば，発光波長が４００ｎｍ程度の青色発光ダイオードを使用することができる。
【００４９】
また，光源１３２として発光ダイオードを使用した場合には，発光ダイオードのピッチ（隣り合う発光ダイオード間の間隔）を２０μｍ程度とし，ロッドレンズ１３６の焦点距離を４ｍｍ程度とすることができる。さらに，光源１３２として発光ダイオードを用いることにより，従来使用されていたＵＶランプ等と比べ，１００〜１０００倍程度高い輝度を得ることができるため，光反応物質３０の反応時間を短縮することができる。
【００５０】
なお，発光ダイオードアレイを使用すると，従来のＵＶランプやレーザ等を用いる場合と比べて焦点距離を短くすることができるので，ＤＮＡアレイ基板１１０等の有機化合物合成用基板と光照射装置１３０との距離を短くすることができ，これにより，ＤＮＡアレイ合成装置１００等の有機化合物合成装置全体の大きさを小型化することが可能となる。
【００５１】
ロッドレンズ１３６は，光源１３２から照射された光を集光して所望の焦点位置に調整する，本実施形態に係る集光レンズの一例である。本実施形態においては，上述したように，プロトン供給物質３０の光化学反応（プロトン放出）を凹部１１２内で起こさせるために，光源１３２から照射された光の焦点位置が凹部１１２内となるように，ロッドレンズ１３６により調整される。
【００５２】
本実施形態においては，ロッドレンズ１３６は，千鳥配置となるようにアレイ状に配置されている。そして，アレイ状に配置された複数の光源１３２からの光を集光して，焦点位置を調整する。ただし，光源１３２の場合と同様に，ロッドレンズ１３６は，必ずしもアレイ状に配置される必要はなく，また，ロッドレンズ１３６の配置の仕方も限定されない。さらに，ロッドレンズ１３６の個数も特に限定されない。
【００５３】
なお，本実施形態では，光照射装置１３０がＤＮＡアレイ基板１１０の反応容器１２０と反対側（すなわち，ＤＮＡの合成が行われる側と反対側）に配置され，ＤＮＡアレイ基板１１０に向けて光を照射するように構成されている。これは，反応液保持部１２６中で光の吸収が起こり，照射された光の光量がＤＮＡアレイ基板１１０上で低下し，これにより光反応物質３０の光反応の効率が低下することを防止するためである。ただし，反応液保持部１２６の（ＤＮＡアレイ基板１１０に垂直な方向の）厚みが薄く，ＤＮＡアレイ基板１１０上で光量の低下が抑えられる場合には，ＤＮＡアレイ基板１１０の反応容器１２０と同じ側から光を照射しても問題はない。
【００５４】
また，本実施形態に係るＤＮＡアレイ合成装置１００は，光照射装置１３０をＤＮＡアレイ基板１１０に対して相対移動させる移動機構（図示せず）を有している。この移動機構は，例えば，光照射装置１３０を，光源１３２のアレイの軸方向と垂直な方向に，ＤＮＡアレイ基板１１０と平行に水平移動させるように構成することができる。ただし，光照射装置１３０の相対移動の方向については，上記の場合には限られず，例えば，ＤＮＡアレイ基板１１０の対角線方向でもよく，あるいは，光照射装置１３０がＤＮＡアレイ基板１１０の辺方向に沿って往復しながら相対移動するように構成してもよい。
【００５５】
このように，光照射装置１３０がＤＮＡアレイ基板１１０に対して相対移動しながら光源１３４の光照射を時間的・空間的にオンオフして，光反応物質３０の光化学反応を起こさせたい所望の位置に選択的に光を照射することで，光化学反応が起こる位置（複数の凹部１１２のうち光源１３４により光が照射された位置）の空間パターンをＤＮＡアレイ基板１１０上に形成することができる。また，光照射装置１３０の光源１３２から照射された光は，上述したように，ロッドレンズ１３６により，光化学反応を起こさせたい所望の凹部１１２内に焦点位置が調整されるので，この位置において光化学反応が起こることとなる。
【００５６】
このような方法により光化学反応が起こる位置の空間パターン（光照射のパターン）を形成することにより，光照射の空間パターン（光化学反応が起こる位置の空間パターン）を変更したい場合には，光照射装置１３０を相対移動させる際に，光源１３２からの光照射のオンオフのタイミングを制御するだけで，容易にパターン変更に対応することができる。
【００５７】
さらに，このような空間パターンが形成されたＤＮＡアレイ基板１１０に対して，本実施形態に係る繰り返し単位である４種の塩基のうち，ＤＮＡの伸張を行いたい所望の塩基を供給することにより，光照射が行われた凹部１１２（光反応物質保持部）において，ＤＮＡの伸張（繰り返し単位の重合反応）が行われる。そして，このような操作を繰り返すことにより，所望の塩基配列を有する１種または２種以上のＤＮＡがアレイ状に配置されたＤＮＡアレイを製造することができる。なお，かかるＤＮＡアレイの製造方法の詳細については後述する。
【００５８】
ここで，本実施形態においては，光源１３２およびロッドレンズ１３６がアレイ状に配置された構造を有する光照射装置１３０を用いて，この光照射装置１３０をアレイの軸と垂直な方向にＤＮＡアレイ基板１１０に対して相対移動させることにより，ＤＮＡアレイ基板１１０上に光化学反応が起こる位置の空間パターンを形成している。このようにして上記空間パターンを形成することにより，光照射装置１３０をＤＮＡアレイ基板１１０に対して相対移動させるだけで，所望の位置に正確に光を照射してスポット内のＤＮＡなどの化学物質の均一性を向上できるとともに，高速に空間パターンを形成することができる。
【００５９】
以上，本実施形態に係るＤＮＡアレイ合成装置１００の構成について説明したが，次に，このＤＮＡアレイ合成装置１００を用いたＤＮＡアレイの合成方法について説明する。
【００６０】
＜ＤＮＡアレイ合成装置１００を用いたＤＮＡアレイの合成方法＞
以下，図４に基づいて，本実施形態に係るＤＮＡアレイ合成装置１００を用いたＤＮＡアレイの合成方法について詳細に説明する。なお，図４は，本実施形態に係るＤＮＡアレイの合成方法を示す説明図であり，（ａ）は，ＤＮＡの伸張反応前の状態，（ｂ）は，保護基が離脱した状態，（ｃ）は，ＤＮＡの伸張反応中の状態，（ｄ）は，ＤＮＡの伸張反応後の状態を示す。
【００６１】
まず，図４（ａ）に示すように，ＤＮＡアレイ基板１１０の凹部１１２内にリンカー２２を介して保護基２４を有する第１の塩基２６（この例では，チトシン（Ｔ））を形成し，ここに，反応液供給部（図４（ａ）では図示せず）を用いて，光によりプロトンを放出するプロトン供給物質（図４（ａ）では省略してある）を含む反応液１２を流す。
【００６２】
次に，図４（ｂ）に示すように，ＤＮＡの伸張反応を起こさせたい場所，例えば，図４（ｂ）の左側の凹部１１２に，光照射装置１３０から照射した光を集光すると，この左側の凹部１１２に存在するプロトン供給物質が光反応を起こしてプロトンが供給され，光照射装置１３０から照射された光の焦点位置の近傍に，酸性領域４０が生成する。そして，この酸性領域４０に存在する塩基２６の保護基２４がプロトンと反応することにより，塩基２６から保護基２４が離脱し，他の塩基と反応可能な塩基２６が生成する。
【００６３】
次に，図４（ｃ）に示すように，反応液供給部（図４（ｃ）では図示せず）を用いて，上記反応可能な塩基２６と反応させたい第２の塩基２８（この例では，アデニン（Ａ））を含むアミダイト溶液１４を流すと，保護基２４が離脱した第１の塩基２６に，保護基を有する第２の塩基２８が結合し，ＤＮＡの伸張が起こる。一方，光を照射しなかった区画，例えば，図４（ｃ）の右側の凹部１１２に保持された第１の塩基２６は，保護基２４を有するため，第２の塩基２８が結合することができず，ＤＮＡの伸張は起こらない。
【００６４】
このようにして，図４（ｄ）に示すように，所望のＤＮＡ（この例では，左側の凹部１１２に存在する第１の塩基２６）に対してのみ新たな塩基（この例では，第２の塩基２８）を結合させ，選択的にＤＮＡの伸張反応を起こさせることができる。
【００６５】
さらに，ＤＮＡアレイ基板１１０を含む反応系を洗浄液で洗浄した後，再び，図４（ａ）〜図４（ｄ）に示したサイクルを繰り返すことにより，ＤＮＡアレイ基板１１０上の所望の位置に，所望の配列と長さを有するＤＮＡを形成することができる。この場合に，ＤＮＡアレイ基板１１０上に複数の凹部１１２がアレイ状に配置されていれば，複数種類の所望の配列と長さを有するＤＮＡがアレイ状に配置されたＤＮＡアレイを製造することができる。
【００６６】
しかしながら，上述した第１の実施形態においては，保護基を離脱させるためにプロトンを発生させる位置，すなわち光照射装置により光を照射する位置と，ＤＮＡの伸張反応が行われる位置とが同一の凹部１１２内に存在する。このように，光の照射位置とＤＮＡの伸張反応が起こる位置とが同一である場合には，光照射装置から照射された光が，ＤＮＡアレイ基板上に保持されているＤＮＡに直接照射され，悪影響を与えることとなる。このような悪影響としては，例えば，光照射装置から照射された強い光や，プロトン放出物質の光反応により発生した熱などにより，ＤＮＡが突然変異を起こす可能性があることなどがある。
【００６７】
そこで，以下に述べる第２の実施形態においては，光を照射してプロトンを発生させる位置とＤＮＡの伸張反応が行われる位置とを離隔させることにより，合成されるＤＮＡに悪影響を与えることなく，ＤＮＡ合成反応の反応効率を向上させている。
【００６８】
（第２の実施形態）
【００６９】
以下に説明する本発明の第２の実施形態に係る有機化合物合成装置は，上述した繰り返し単位の重合反応と光反応物質の光反応とが離隔した位置で行われるものの一例である。
【００７０】
＜ＤＮＡアレイ合成装置２００の構成＞
以下，図５に基づいて，本発明の第２の実施形態に係る有機化合物合成装置の一例としてのＤＮＡアレイ合成装置２００の構成について説明する。なお，図５は，本実施形態に係るＤＮＡアレイ合成装置２００の全体構成を示す断面図である。
【００７１】
図５に示すように，本実施形態に係るＤＮＡアレイ合成装置２００は，本実施形態に係る有機化合物合成用基板の一例としてのＤＮＡアレイ基板２１０と，反応容器２２０と，光照射装置２３０とを備える。
【００７２】
ＤＮＡアレイ基板２１０は，末端が保護基で保護された４種の塩基（Ａ，Ｔ，Ｇ，Ｃ）の重合反応により合成されたＤＮＡと，光反応により保護基を離脱させる物質を生成する光反応物質３０とを保持するための基板である。
【００７３】
本実施形態における保護基および光反応物質３０については，上述した第１の実施形態の場合と同様であるので，詳細な説明を省略する。
【００７４】
また，ＤＮＡアレイ基板２１０の材質としては，ガラスや種々のプラスチックなどを使用することができる。
【００７５】
ここで，図６を参照しながら，ＤＮＡアレイ基板２１０の構成について説明する。なお，図６は，本実施形態に係るＤＮＡアレイ基板２１０の構成を示す断面図であり，（ａ）は第１の例，（ｂ）は第２の例，（ｃ）は第３の例を示す。
【００７６】
本実施形態に係るＤＮＡアレイ基板２１０には，少なくとも個々のＤＮＡが保持されるＤＮＡ区画部分またはその周辺部に，ＤＮＡアレイ基板２１０の一方の面（図６では光照射装置２３０側の面）から他方の面（図６では光照射装置２３０の他側の面）へ反応液が流れる流路構造が設けられている。
【００７７】
かかる流路構造の第１の例としては，図６（ａ）に示すように，ＤＮＡアレイ基板２１０を，繰り返し単位である塩基とプロトン供給物質３０から放出されたプロトンとを含む反応液を透過可能な構造を有するような構成が挙げられる。反応液を透過可能な構造としては，例えば，多孔質のガラス基板やプラスチック膜などの多孔質部材２１２を使用することができる。なお，この第１の例においては，上述した第１の実施形態で説明したように，光反応物質３０の光反応により生成したプロトンなどの化学反応物質を所定の領域内に局在させる必要があるため，ＤＮＡアレイ基板２１０の表面を修飾したり，ＤＮＡアレイ基板２１０の表面に凹部を設けたりした方が望ましい。
【００７８】
また，第２の例としては，図６（ｂ）に示すように，ＤＮＡアレイ基板２１０に，この基板を貫通する複数の貫通孔２１０ａを設け，この貫通孔２１０ａの一方の開口部（本実施形態では，光照射装置２３０側の開口部）が開放され，他方の開口部（本実施形態では，光照射装置２３０の他側の開口部）が塩基とプロトン供給物質３０から放出されたプロトンとを含む反応液を透過可能な反応物質透過部材により閉塞されるような構成が挙げられる。上記反応物質透過物質としては，第１の例に挙げた多孔質部材２１２を使用することができる。なお，この第２の例においては，多孔質部材２１２が貫通孔２１０ａの他方の開口部のみに配設されているが，開口部のみならず，少なくとも貫通孔２１０ａの開口部を含んでＤＮＡアレイ基板２１０の表面の一部を覆うように構成してもよい。
【００７９】
また，第３の例は，図６（ｃ）に示すように，ＤＮＡアレイ基板２１０に貫通孔２１０ａを設ける点は第２の例と同様である一方で，貫通孔２１０ａの他方の開口部（本実施形態では，光照射装置２３０の他側の開口部）を閉塞するために，多孔質部材２１２等の反応物質透過部材が，ＤＮＡアレイ基板２１０の表面の一部ではなく，表面全体を覆うように配設されている点で第２の例と異なる。
【００８０】
反応容器２２０は，末端が保護基で保護された繰り返し単位と光反応物質とを有機化合物合成用基板に供給する反応物質供給部の一実施形態である。すなわち，反応容器２２０は，末端が保護基で保護された４種の塩基のうち所望の塩基とプロトン供給物質３０とを含む反応液を，ＤＮＡアレイ基板２１０に供給する。
【００８１】
この反応容器２２０は，ＤＮＡアレイ基板２１０の双方の面を覆うように，上記反応液を保持するための所定の空間（下記入口側反応液保持部２２６Ａおよび出口側反応液保持部２２６Ｂを参照）をＤＮＡアレイ基板２１０の両面側に有して配設される。また，反応容器２２０は，主に，反応液入口２２２と，反応液出口２２４と，入口側反応液保持部２２６Ａと，出口側反応液保持部２２６Ｂとを備える。
【００８２】
反応液入口２２２は，例えば，ＤＮＡアレイ基板２１０に対して光照射装置２３０側に配設され，反応液出口２２４は，例えば，反応液入口２２２とは反対側に，すなわち，ＤＮＡアレイ基板２１０に対して光照射装置２３０の他側に配設される。また，入口側反応液保持部２２６Ａおよび出口側反応液保持部２２６Ｂでは，ＤＮＡの伸張反応（重合反応）を行う間，上記反応液が保持される。反応液は，反応液入口２２２から導入され，入口側反応液保持部２２６Ａを通り，多孔質部材２１２を透過するか，あるいは，ＤＮＡアレイ基板２１０の貫通孔２１０ａを通過した後に，出口側反応液保持部２２６Ｂを通り，反応液出口２２４から排出される。このように，反応容器２２０内においては，反応液入口２２２→入口側反応液保持部２２６Ａ→出口側反応液保持部２２６Ｂ→反応液出口２２４という反応液の流路が形成されている。
【００８３】
光照射装置２３０は，複数の光源２３２と，この光源２３２から照射された光を集光する集光レンズの一例としての複数のロッドレンズ２３６とを有し，光源２３２からロッドレンズ２３６を介してＤＮＡアレイ基板２１０に保持されたプロトン供給物質３０に向けて光を照射する。ここで，本実施形態においては，光源２３２は複数設けられているが，本発明に係る光照射装置としては，１つの光源のみが設けられた構成でもよい。このように，光照射装置２３０の光源２３２から，プロトン供給物質３０に光を照射することにより，ＤＮＡアレイ基板２１０と反応容器２２０とにより構成される化学反応系に対して，空間分布を持った光化学反応を起こさせることができる。
【００８４】
また，図示してはいないが，本実施形態に係る複数の光源２３２は，光源アレイ基板（図示せず）上にアレイ状に１列に配置されており，また，複数のロッドレンズ２３６も，アレイ状に配置された複数の光源２３２のそれぞれに対応する位置に，１つの光源２３２に対して１つのロッドレンズ２３６が配置されるように，アレイ状に１列に配置されてロッドレンズアレイ（図示せず）を構成している。
【００８５】
このように，本実施形態に係る複数の光源２３２および複数のロッドレンズ２３６は，アレイ状に１列に配置されているが，必ずしもアレイ状に配置されている必要はなく，また，光源２３２およびロッドレンズ２３６の配列の数も１列には限られず，ＤＮＡアレイ基板２１０の大きさやＤＮＡアレイ基板２１０上に形成される光照射のパターン等により適宜変更することができる。さらに，光源２３２およびロッドレンズ２３６の個数もＤＮＡアレイ基板２１０の大きさやＤＮＡアレイ基板２１０上に形成される光照射のパターン等により適宜選択することができる。
【００８６】
光源２３２としては，例えば，半導体を用いた光学素子を使用することができるが，このような光学素子としては，例えば，発光ダイオードや半導体レーザなどを使用できる。発光波長の選択に当たっては，ＤＮＡなどの有機化合物を合成するために必要な光エネルギーに応じて，所望の発光波長を選択することが可能であるが，得られる光エネルギーが大きいという点で，波長の短い光を照射する光源を用いることが好ましい。一方，発光ダイオードや半導体レーザは，長波長で発光するものほど作成しやすい。このような観点から，本実施形態では，光源２３２として，例えば，発光波長が４００ｎｍ程度の青色発光ダイオードを使用することができる。
【００８７】
また，光源２３２として発光ダイオードを使用した場合には，発光ダイオードのピッチ（隣り合う発光ダイオード間の間隔）を２０μｍ程度とし，ロッドレンズ２３６の焦点距離を４ｍｍ程度とすることができる。さらに，光源２３２として発光ダイオードを用いることにより，従来使用されていたＵＶランプ等と比べ，１００〜１０００倍程度高い輝度を得ることができるため，光反応物質３０の反応時間を短縮することができる。
【００８８】
なお，発光ダイオードアレイを使用すると，従来のＵＶランプやレーザ等を用いる場合と比べて焦点距離を短くすることができるので，ＤＮＡアレイ基板２１０等の有機化合物合成用基板と光照射装置２３０との距離を短くすることができ，これにより，ＤＮＡアレイ合成装置２００等の有機化合物合成装置全体の大きさを小型化することが可能となる。
【００８９】
また，本実施形態においては，プロトン供給物質３０の光化学反応（プロトン放出）を，図６（ａ）に示した第１の例のＤＮＡアレイ基板を用いた場合には，ＤＮＡアレイ基板を構成する多孔質部材２１２の光照射装置２３０側の表面で起こさせるために，光源２３２から照射された光の焦点位置が多孔質部材２１２の光照射装置２３０側の表面となるように，ロッドレンズ２３６により調整される。また，図６（ｂ），（ｃ）に示した第２および第３の例のＤＮＡアレイ基板を用いた場合には，ＤＮＡアレイ基板２１０に形成された貫通孔２１０ａの光照射装置２３０側の開口部付近で起こさせるために，光源２３２から照射された光の焦点位置が貫通孔２１０ａの光照射装置２３０側の開口部付近となるように，ロッドレンズ２３６により調整される。
【００９０】
このようにロッドレンズ２３６により調整された集光位置（光源２３２から照射された光の焦点位置）において，プロトン供給物質３０の光化学反応によりプロトンが生成される。生成されたプロトンは，プロトン自身の拡散または反応液の流れによって，ＤＮＡアレイ基板２１０の光照射装置２３０の他側の表面に到達する。
【００９１】
一方，ＤＮＡの合成反応は，ＤＮＡアレイ基板２１０の光照射装置２３０の他側の表面で行われる。より具体的には，ＤＮＡの合成反応は，上記第１の例の場合には，ＤＮＡアレイ基板を構成する多孔質部材２１２の光照射装置２３０の他側の表面で行われ，上記第２および第３の例の場合には，貫通孔２１０ａの光照射装置２３０の他側の開口部を閉塞する多孔質部材２１２の表面で行われる。
【００９２】
このように，本実施形態においては，光照射により光反応を起こしてプロトンを発生させる位置とＤＮＡの合成反応が行われる位置とが離隔しているため，上述した第１の実施形態の場合と異なり，合成されるＤＮＡに悪影響を与えることなく，ＤＮＡ合成反応の反応効率を向上させることができる。
【００９３】
なお，上記第２の例（図６（ｂ）参照）および第３の例（図６（ｃ）参照）の場合には，貫通孔２１０ａの他方の開口部が多孔質部材２１２で閉塞された構成を示したが，貫通孔２１０ａの双方の開口部が開放され，多孔質部材２１２を設けられていない構成であってもよい。この場合には，ＤＮＡの合成反応は，貫通孔２１０ａの壁面またはＤＮＡアレイ基板２１０上の貫通孔２１０ａの開口部の周辺で行うことができる。
【００９４】
また，本実施形態に係るＤＮＡアレイ合成装置２００は，光照射装置２３０をＤＮＡアレイ基板２１０に対して相対移動させる移動機構（図示せず）を有している。この移動機構は，例えば，光照射装置２３０を，光源２３２のアレイの軸方向と垂直な方向に，ＤＮＡアレイ基板２１０と平行に水平移動させるように構成することができる。ただし，光照射装置２３０の相対移動の方向については，上記の場合には限られず，例えば，ＤＮＡアレイ基板２１０の対角線方向でもよく，あるいは，光照射装置２３０がＤＮＡアレイ基板２１０の辺方向に沿って往復しながら相対移動するように構成してもよい。
【００９５】
このように，光照射装置２３０がＤＮＡアレイ基板２１０に対して相対移動しながら光源２３４の光照射を時間的・空間的にオンオフして，光反応物質３０の光化学反応を起こさせたい所望の位置に選択的に光を照射することで，光化学反応が起こる位置の空間パターンをＤＮＡアレイ基板２１０上に形成することができる。また，光照射装置２３０の光源２３２から照射された光は，上述したように，ロッドレンズ２３６により，光化学反応を起こさせたい所望の位置に焦点位置が調整されるので，この位置において光化学反応が起こることとなる。
【００９６】
このような方法により光化学反応が起こる位置の空間パターン（光照射のパターン）を形成することにより，光照射の空間パターン（光化学反応が起こる位置の空間パターン）を変更したい場合には，光照射装置２３０を相対移動させる際に，光源２３２からの光照射のオンオフのタイミングを制御するだけで，容易にパターン変更に対応することができる。
【００９７】
さらに，このような空間パターンが形成されたＤＮＡアレイ基板２１０に対して，本実施形態に係る繰り返し単位である４種の塩基のうち，ＤＮＡの伸張を行いたい所望の塩基を供給することにより，光照射が行われた位置に対応する位置において，ＤＮＡの伸張（繰り返し単位の重合反応）が行われる。そして，このような操作を繰り返すことにより，所望の塩基配列を有する１種または２種以上のＤＮＡがアレイ状に配置されたＤＮＡアレイを製造することができる。なお，かかるＤＮＡアレイの製造方法の詳細については後述する。
【００９８】
ここで，本実施形態においては，光源２３２およびロッドレンズ２３６がアレイ状に配置された構造を有する光照射装置２３０を用いて，この光照射装置２３０をアレイの軸と垂直な方向にＤＮＡアレイ基板２１０に対して相対移動させることにより，ＤＮＡアレイ基板２１０上に光化学反応が起こる位置の空間パターンを形成している。このようにして上記空間パターンを形成することにより，光照射装置２３０をＤＮＡアレイ基板２１０に対して相対移動させるだけで，所望の位置に正確に光を照射してスポット内のＤＮＡなどの化学物質の均一性を向上できるとともに，高速に空間パターンを形成することができる。
【００９９】
以上，本実施形態に係るＤＮＡアレイ合成装置２００の構成について説明したが，次に，このＤＮＡアレイ合成装置２００を用いたＤＮＡアレイの合成方法について説明する。
【０１００】
＜ＤＮＡアレイ合成装置２００を用いたＤＮＡアレイの合成方法＞
以下，図７に基づいて，本実施形態に係るＤＮＡアレイ合成装置２００を用いたＤＮＡアレイの合成方法について詳細に説明する。なお，図７は，本実施形態に係るＤＮＡアレイの合成方法を示す説明図であり，（ａ）は，ＤＮＡの伸張反応前の状態，（ｂ）は，光反応により酸性領域が形成された状態，（ｃ）は，酸性領域が移動して保護基が離脱した状態，（ｃ）は，ＤＮＡの伸張反応中の状態，（ｄ）は，ＤＮＡの伸張反応後の状態を示す。
【０１０１】
なお，以下の説明では，説明の便宜のため，ＤＮＡアレイ基板２１０として，図６（ｂ）に示した第２の例に係る基板を用いた場合を例に挙げて説明するが，他の場合についても同様である。
【０１０２】
まず，図７（ａ）に示すように，ＤＮＡアレイ基板２１０の貫通孔２１０ａの一方の開口部を閉塞する多孔質部材２１２にリンカー２２を介して保護基２４を有する第１の塩基２６（この例では，チトシン（Ｔ））を形成する。次いで，ここに，反応液供給部（図７（ａ）では図示せず）を用いて，光によりプロトンを放出するプロトン供給物質（図７（ａ）では省略してある）を含む反応液１２を流す。
【０１０３】
次に，図７（ｂ）に示すように，光化学反応を起こさせたい場所に，例えば，図７（ｂ）の左側の貫通孔２１０ａの開口部付近に，光照射装置２３０から照射した光を集光すると，この左側の貫通孔２１０ａの開口部付近に存在するプロトン供給物質が光反応を起こしてプロトンが供給され，光照射装置２３０から照射された光の焦点位置の近傍に，酸性領域４０が生成する。なお，この段階では，酸性領域４０は，ＤＮＡ合成反応が行われる位置とは離隔されている。
【０１０４】
さらに，図７（ｃ）に示すように，上述した反応容器２２０に形成された反応液の流路における生成されたプロトンの拡散または反応液の流れ等により，酸性領域４０が貫通孔２１０ａ中をＤＮＡ合成反応が行われる位置に向かって行く。入口側反応液保持部２２６Ａと出口側反応液保持部２２６Ｂとの圧力差を利用して，プロトンを貫通孔２１０ａの中をＤＮＡ合成反応が行われる場所に向かって一時的に押し出す構成であっても良い。その結果，酸性領域４０が，ＤＮＡ合成反応が行われる位置，すなわち，左側の貫通孔２１０ａの開口部を閉塞する多孔質部材２１２の周辺領域に達し，この酸性領域４０に存在する塩基２６の保護基２４がプロトンと反応することにより，塩基２６から保護基２４が離脱し，他の塩基と反応可能な塩基２６が生成する。
【０１０５】
次に，図７（ｄ）に示すように，反応液供給部（図７（ｄ）では図示せず）を用いて，上記反応可能な塩基２６と反応させたい第２の塩基２８（この例では，アデニン（Ａ））を含むアミダイト溶液１４を流すと，保護基２４が離脱した第１の塩基２６に，保護基を有する第２の塩基２８が結合し，ＤＮＡの伸張が起こる。一方，光を照射しなかった区画，例えば，図７（ｄ）の右側の貫通孔２１０ａの開口部を覆う多孔質部材２１２に保持された第１の塩基２６は，保護基２４を有するため，第２の塩基２８が結合することができず，ＤＮＡの伸張は起こらない。
【０１０６】
このようにして，図７（ｅ）に示すように，所望のＤＮＡ（この例では，左側の多孔質部材２１２に存在する第１の塩基２６）に対してのみ新たな塩基（この例では，第２の塩基２８）を結合させ，選択的にＤＮＡの伸張反応を起こさせることができる。
【０１０７】
さらに，ＤＮＡアレイ基板２１０を含む反応系を洗浄液で洗浄した後，再び，図７（ａ）〜図７（ｅ）に示したサイクルを繰り返すことにより，ＤＮＡアレイ基板２１０上の所望の位置に，所望の配列と長さを有するＤＮＡを形成することができる。この場合に，ＤＮＡアレイ基板２１０上に複数の貫通孔２１０ａがアレイ状に配置されていれば，複数種類の所望の配列と長さを有するＤＮＡがアレイ状に配置されたＤＮＡアレイを製造することができる。
【０１０８】
なお，以下に，上述した第１の実施形態および第２の実施形態に係るＤＮＡの合成方法について，使用可能な試薬の例を示しながら，さらに具体的に説明する。
【０１０９】
ＤＮＡの合成化学は現在も開発が続いており，様々な方法がある。通常使用されているのは，ｐｈｏｓｐｈｏｒａｍｉｄｅを用いた４−ｓｔｅｐプロセスである。保護基を離脱させる方法としては，一般に，酸ＴＣＡを供給することが行われているが，本実施形態では，保護基を離脱させるために酸ＴＣＡを供給する代わりに，光反応でプロトンを供給するプロトン供給物質を使用する。
【０１１０】
具体的には，まず，５’−ｄｉｍｅｔｈｏｘｙｔｒｉｔｌで保護されている２’−ｄｅｏｘｙｎｕｃｌｅｏｓｉｄｅを，アルキルアミノによるリンカーでガラス系基板の表面に配列したものを用意する。この他には，ポリスチレン基板に，上記の，５’−ｄｉｍｅｔｈｏｘｙｔｒｉｔｌで保護されている２’−ｄｅｏｘｙｎｕｃｌｅｏｓｉｄｅを結合させたものもよく使用される。
【０１１１】
プロトン供給材（ＰＧＡ：Ｐｈｏｔｏｇｅｎｅｒａｔｅｄ  Ａｃｉｄ）としては，上述したように，ｔｒｉａｒｙｌ−ｓｕｌｆｏｎｉｕｍ−ｈｅｘａｆｌｕｒｏａｎｔｉｍｏｎａｔｅをｐｒｏｐｙｌｅｎｅ  ｃａｒｂｏｎａｔｅに溶解させたものを使用できる。この場合，照射波長は３６５ｎｍである。
【０１１２】
次に，ＣＨ３ＣＮ，ＣＨ２Ｃｌ２による洗浄の後，テトラゾール／ＣＨ３ＣＮ溶液中で伸張反応を行う。
【０１１３】
伸張反応を行った後，再びＣＨ３ＣＮで洗浄し，ａｃｅｔｉｃ  ａｎｈｙｄｒｉｄｅ／ｌｕｔｉｄｉｎｅ／ＴＨＦとＮ−ｍｅｔｈｙｌｉｍｉｄａｚｏｌｅ／ＴＨＦとの混合溶液でキャッピングを行う。次いで，洗浄した後，Ｉ２／ＴＨＦ／ｐｙｒｉｄｉｎｅ／Ｈ２Ｏで酸化をする。このように，洗浄，キャッピング，洗浄で１サイクルが終了する。
【０１１４】
以上，添付図面を参照しながら本発明の好適な実施形態について説明したが，本発明はかかる例に限定されないことは言うまでもない。当業者であれば，特許請求の範囲に記載された範疇内において，各種の変更例または修正例に想到し得ることは明らかであり，それらについても当然に本発明の技術的範囲に属するものと了解される。
【０１１５】
例えば，上述した実施形態においては，有機化合物合成装置がＤＮＡアレイ合成装置である場合について説明したが，ＲＮＡの合成はもちろんのこと，タンパク質の合成や一般的な高分子化合物の合成についても，本発明を適用することができる。
【図面の簡単な説明】
【０１１６】
【図１】本発明の第１の実施形態に係るＤＮＡアレイ合成装置の全体構成を示す断面図である。
【図２】同実施形態に係るＤＮＡアレイ基板の構成を示す断面図である。
【図３】同実施形態に係る光照射装置の構成を示す斜視図である。
【図４】同実施形態に係るＤＮＡアレイの合成方法を示す説明図であり，（ａ）は，ＤＮＡの伸張反応前の状態，（ｂ）は，保護基が離脱した状態，（ｃ）は，ＤＮＡの伸張反応中の状態，（ｄ）は，ＤＮＡの伸張反応後の状態を示す。
【図５】本発明の第２の実施形態に係るＤＮＡアレイ合成装置の全体構成を示す断面図である。
【図６】同実施形態に係るＤＮＡアレイ基板の構成を示す断面図であり，（ａ）は第１の例，（ｂ）は第２の例，（ｃ）は第３の例を示す。
【図７】同実施形態に係るＤＮＡアレイの合成方法を示す説明図であり，（ａ）は，ＤＮＡの伸張反応前の状態，（ｂ）は，光反応により酸性領域が形成された状態，（ｃ）は，酸性領域が移動して保護基が離脱した状態，（ｃ）は，ＤＮＡの伸張反応中の状態，（ｄ）は，ＤＮＡの伸張反応後の状態を示す。
【符号の説明】
【０１１７】
１２      プロトン供給物質を含む反応液
１４      アミダイト溶液
２２      リンカー
２４      保護基
２６      第１の塩基（Ｔ）
２８      第２の塩基（Ａ）
３０      光反応物質（プロトン供給物質）
４０      酸性領域
１００      ＤＮＡアレイ合成装置
１１０      ＤＮＡアレイ基板
１１２      凹部
１２０      反応容器
１２２      反応液入口
１２４      反応液出口
１２６      反応液保持部
１３０      光照射装置
１３２      光源
１３４      光源アレイ基板
１３６      ロッドレンズ
１３８      ロッドレンズアレイ
２００      ＤＮＡアレイ合成装置
２１０      ＤＮＡアレイ基板
２１０ａ      貫通孔
２１２      多孔質部材
２２０      反応容器
２２２      反応液入口
２２４      反応液出口
２２６Ａ      入口側反応液保持部
２２６Ｂ      出口側反応液保持部
２３０      光照射装置
２３２      光源
２３６      ロッドレンズ
【図１】
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【図２】
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【図３】
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【図４】
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【図５】
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【図６】
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【図７】
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