(57)【要約】【課題】ユーザーの経済的負担が小さい試料採取支援装置を実現する。【解決手段】試料採取支援装置は、試料の二次元電気泳動が行われたゲルプレート（２００）上のスポット分布像を読み取る読取手段（２０）と、読み取られたスポット分布像を解析してスポット位置を特定する特定手段（１０）と、特定されたスポット位置を示すマークの分布像をゲルプレート上のスポット分布像と等倍で印刷して、試料採取用のテンプレート（３００）を作成するテンプレート作成手段（１０，３０）とを具備する。【選択図】      図１
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【特許請求の範囲】
【請求項１】
試料の二次元電気泳動が行われたゲルプレート上のスポット分布像を読み取る読取手段と、
読み取られたスポット分布像を解析してスポット位置を特定する特定手段と、
特定されたスポット位置を示すマークの分布像をゲルプレート上のスポット分布像と等倍で印刷して、試料採取用のテンプレートを作成するテンプレート作成手段と、
を具備することを特徴とする試料採取支援装置。
【請求項２】
前記読取手段は、ゲルプレート上のリファレンスマーカーを同時に読み取り、
前記特定手段は、読み取られたリファレンスマーカーの位置を特定し、
前記テンプレート作成手段は、特定されたリファレンスマーカーの位置を示すマークを一緒に印刷する、
ことを特徴とする請求項１に記載の試料採取支援装置。
【請求項３】
前記リファレンスマーカーの個数は複数個である、
ことを特徴とする請求項２に記載の試料採取支援装置。
【請求項４】
前記リファレンスマーカーは、包絡線が多角形を描くように配置された４個以上のマーカーである、
ことを特徴とする請求項３に記載の試料採取支援装置。
【請求項５】
前記テンプレート作成手段は、テンプレートの向きを示す記号を一緒に印刷する、
ことを特徴とする請求項１ないし請求項４のうちのいずれか１つに記載の試料採取支援装置。
【請求項６】
前記テンプレート作成手段は、前記マークの分布像を前記スポット分布像と等倍で印刷するためのキャリブレーション機能を有する、
ことを特徴とする請求項１ないし請求項５のうちのいずれか１つに記載の試料採取支援装置。
【請求項７】
前記テンプレート作成手段は、オーバーヘッドプロジェクター用のシートに印刷を行う、
ことを特徴とする請求項１ないし請求項６のうちのいずれか１つに記載の試料採取支援装置。
【請求項８】
前記テンプレート作成手段は、レーザープリンターで印刷を行う、
ことを特徴とする請求項１ないし請求項７のうちのいずれか１つに記載の試料採取支援装置。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
本発明は試料採取支援装置に関し、特に、二次元電気泳動を行ったゲルプレートからの試料採取を支援する装置に関する。
【背景技術】
【０００２】
プロテオミクスの分野では、二次元電気泳動によって、タンパク質等の試料をゲルプレート上に分布するスポットに分離し、各スポット位置において試料を採取し、質量分析法等により同定を行う。スポット位置における試料採取にはゲル切出装置が用いられる。ゲル切出装置は、ゲルプレートに沿って二次元的に移動可能な切出具を備え、ゲルプレートについての画像解析によって判明したスポットの位置情報に基づいて、自動的にゲルの切り出しを行うようになっている（例えば、特許文献１参照）。
【特許文献１】特開２００５−１７２６２１号公報（第３頁、図１−３）
【発明の開示】
【発明が解決しようとする課題】
【０００３】
上記のような自動切出装置は、便利ではあるが一般に高価であり、中小のユーザーにとっては経済的負担が大きい。
そこで、本発明の課題は、ユーザーの経済的負担が小さい試料採取支援装置を実現することである。
【課題を解決するための手段】
【０００４】
上記の課題を解決するための本発明は、試料の二次元電気泳動が行われたゲルプレート上のスポット分布像を読み取る読取手段と、読み取られたスポット分布像を解析してスポット位置を特定する特定手段と、特定されたスポット位置を示すマークの分布像をゲルプレート上のスポット分布像と等倍で印刷して、試料採取用のテンプレートを作成するテンプレート作成手段と、を具備することを特徴とする試料採取支援装置である。
【０００５】
前記読取手段は、ゲルプレート上のリファレンスマーカーを同時に読み取り、前記特定手段は、読み取られたリファレンスマーカーの位置を特定し、前記テンプレート作成手段は、特定されたリファレンスマーカーの位置を示すマークを一緒に印刷することが、ゲルプレートとテンプレートの位置合わせが容易な点で好ましい。
【０００６】
前記リファレンスマーカーの個数は複数個であることが、位置合わせを正確に行う点で好ましい。
前記リファレンスマーカーは、包絡線が多角形を描くように配置された４個以上のマーカーであることが、正確な位置合わせを容易に行う点で好ましい。
【０００７】
前記テンプレート作成手段は、テンプレートの向きを示す記号を一緒に印刷することが、テンプレートの取扱が容易な点で好ましい。
前記テンプレート作成手段は、前記マークの分布像を前記スポット分布像と等倍で印刷するためのキャリブレーション機能を有することが、等倍印刷の精度を維持する点で好ましい。
【０００８】
前記テンプレート作成手段は、オーバーヘッドプロジェクター用のシートに印刷を行うことが、耐水性のテンプレートを得る点で好ましい。
前記テンプレート作成手段は、レーザープリンターで印刷を行うことが、耐水性のテンプレートを得る点で好ましい。
【発明の効果】
【０００９】
本発明によれば、試料採取支援装置が、試料の二次元電気泳動が行われたゲルプレート上のスポット分布像を読み取る読取手段と、読み取られたスポット分布像を解析してスポット位置を特定する特定手段と、特定されたスポット位置を示すマークの分布像をゲルプレート上のスポット分布像と等倍で印刷して、試料採取用のテンプレートを作成するテンプレート作成手段とを具備するので、ユーザーの経済的負担が小さい試料採取支援装置を実現することができる。
【発明を実施するための最良の形態】
【００１０】
以下、図面を参照して発明を実施するための最良の形態を詳細に説明する。なお、本発明は、発明を実施するための最良の形態に限定されるものではない。図１に試料採取支援装置のブロック図を示す。本装置は発明を実施するための最良の形態の一例である。本装置の構成によって、試料採取支援装置に関する発明を実施するための最良の形態の一例が示される。
【００１１】
図１に示すように、本装置は、データ処理部１０を有する。データ処理部１０は表示部１２および操作部１４を備えており、ユーザーによるインタラクティブな操作が可能になっている。データ処理部１０、表示部１２および操作部１４からなる部分は、例えば、パーソナルコンピュータやワークステーション等によって実現される。
【００１２】
データ処理部１０には読取部２０が接続されている。読取部２０にはゲルプレート２００が読取対象として供給される。ゲルプレート２００には、二次元電気泳動によりスポット分布が形成済みである。
【００１３】
読取部２０は、ゲルプレート２００上のスポット分布像を読み取る。読取部２０としては例えばイメージスキャナ等が用いられ、読取は、特定波長の光の下でのスポット像の蛍光等を利用して行われる。読取部２０は、本発明における読取手段の一例である。
【００１４】
読み取られたスポット分布像はデータ処理部１０に入力される。データ処理部１０入力画像について画像解析を行う。画像解析により、スポット分布像における個々のスポットが同定され、ゲルプレート２００上のスポット位置が特定される。データ処理部１０は、本発明における特定手段の一例である。
【００１５】
データ処理部１０は、特定したスポットの位置情報を印刷部３０に出力する。印刷部３０は、位置情報に基づいてテンプレート３００を印刷する。テンプレート３００はゲルプレート２００と等倍で印刷される。データ処理部１０と印刷部３０からなる部分は、本発明におけるテンプレート作成手段の一例である。
【００１６】
テンプレート３００は、スポット位置を示すマークを有するシートである。テンプレート３００は、ユーザーがマークを頼りにゲルプレート２００から試料を切り出すのに用いられる。
【００１７】
テンプレート３００用のシートとしては、例えば、オーバーヘッドプロジェクター用のシートが用いられる。オーバーヘッドプロジェクター用のシートは、耐水性と寸法安定性を備えているので試料切り出し用のテンプレートとして好適である。なお、オーバーヘッドプロジェクター用のシートに限らず、耐水性と寸法安定性を備えた適宜の材料からなるシートを用いてよい。
【００１８】
印刷部３０は、例えばレーザープリンター等によって実現される。レーザープリンターは耐水性の印刷痕を形成するので、テンプレート用のプリンターとして好適である。なお、レーザープリンターに限らず、耐水性の印刷痕が形成可能な適宜のプリンターを用いてよい。
【００１９】
図２に、ゲルプレート２００を平面図で示す。ゲルプレート２００は透明なベースプレート上にゲル層が形成されたものである。ゲル層も透明である。ゲル層の透明性はスポット分布が形成されて変わらない。ベースプレートのゲル層とは反対側の面に、リファレンスマーカー２０２が複数個付与される。リファレンスマーカー２０２は、読取部２０によって読取可能なマーカーであり、かつ、肉眼で目視可能なものである。
【００２０】
ここでは、リファレンスマーカー２０２が６個付与された例を示す。６個のマーカーは、読取部２０の読取範囲内の周辺部に、包絡線が概ね四辺形を形成するように分散配置される。なお、６個のマーカーの配置は、四辺形に限らず、包絡線が五角形や六角形等の多角形を形成する配置であってよい。また、マーカーの個数も６個に限らずそれ以下または以上の適宜の複数であってよい。
【００２１】
図３に、表示部１２に表示される画面の一例を示す。この画面には、画像解析によって特定された各スポットの位置がスポットマーク３０２によってそれぞれ示される。なお、煩雑を避けるために、スポットマークへの符号付けは１個所にとどめる。以下同様である。画面には、また、リファレンスマーカーの位置がリファレンスマーク２１２で示される。いずれのマークも中抜きの円である。なお、スポットマーク３０２とリファレンスマーク２１２は表示色を異ならせて、識別を容易にしてある。
【００２２】
画面の左側にユーザーインターフェースがある。ユーザーインターフェースは、上の２つのボックス「１  ｐｉｘｅｌ」がスポット分布像の読取分解能を表し、次の２つのボックス「Ｃｏｒｒｅｃｔｉｏｎ」がテンプレート印刷の倍率補正を表し、次の３つのチェックボックス「Ａｄｄ  Ｎｕｍｂｅｒ，  Ｄａｔａ  Ｓｈｉｆｔ，  Ｄｉｒｅｃｔｉｏｎ  Ｃｈｅｃｋ」がそれぞれ、マークへの番号付け、印刷範囲シフトおよび方向記号付加のためのチェックボックスを表し、次のボタン「Ｐｒｉｎｔ」が印刷ボタンを表し、最後のボタン「Ｅｘｉｔ」がルーチンからの退出ボタンを表す。
【００２３】
図４に、表示部１２の画面の他の例を示す。この画面も、データ処理部１０による画像解析結果の表示するものであり、各スポットおよびリファレンスマーカーの位置を二次元座標のリストによって示す。
【００２４】
図５に、テンプレート３００を平面図で示す。テンプレート３００は、所定のシートにスポットマーク３０２およびリファレンスマーク２１２を印刷したものとなっている。なお、スポットマーク３０２とリファレンスマーク２１２は印刷色を異ならせて、識別を容易にしてある。スポットマーク３０２およびリファレンスマーク２１２と一緒に、方向を示す記号「Ｒ」も適宜の位置に印刷される。記号「Ｒ」が正立となる方向が、テンプレート３００の正しい方向である。テンプレート３００の印刷は、図３に示した画面において印刷ボタン「Ｐｒｉｎｔ」をクリックすることによって行われる。
【００２５】
テンプレート３００の印刷はゲルプレート２００と等倍で行われている。このため、図６に示すように、ゲルプレート２００をテンプレート３００の上に重ねたとき、ゲルプレート２００上のリファレンスマーカー２０２を、テンプレート３００上のリファレンスマーク２１２に、対応するもの同士で完全に重なるようにすることができる。
【００２６】
このように重ね合わせたとき、テンプレート３００上のスポットマーク３０２は、ゲルプレート２００上の透明なスポット分布像におけるスポットの位置を表す。したがって、ユーザーは、スポットマーク３０２を頼りにして、ゲルプレート２００上の透明なスポット分布像におけるスポットの位置を知ることができる。
【００２７】
なお、テンプレート３００の寸法がゲルプレート２００の寸法と厳密に同一であるときは、両プレートの四辺が完全に一致するように重ね合わせることができるので、リファレンスマークは省略可能である。
【００２８】
図７に、試料採取の要領を模式的に示す。図７に示すように、ゲルプレート２００とテンプレート３００は、上記のように重ね合わせた状態でホルダー７０２によって一体化され、水を張ったトレイ７０４の中に設置される。この状態で、ユーザーはペン型の切出具８００を用いて、スポットマーク３０２を頼りに、ゲルプレート２００に垂直な方向から試料を採取する。
【００２９】
このように、試料採取は、テンプレート３００のスポットマーク３０２を頼りに、ユーザーが手作業で行うので、高価な自動切出装置等は不要となる。したがって、ユーザーの経済的負担が小さい。
【００３０】
テンプレート３００の印刷は、厳密に等倍で行う必要がある。それを可能にするために、本装置はキャリブレーションが可能になっている。キャリブレーションには、図２に示したものと同様な、リファレンスマーカー付きのキャリブレーションシートが使用される。
【００３１】
すなわち、読取部２０でキャリブレーションシートを読み取り、データ処理部１０で読取画像からリファレンスマーカーの位置を特定し、その位置データに基づいて、印刷部３０でキャリブレーションシートの複製を印刷する。
【００３２】
キャリブレーションシートとその複製を重ね合わせて、キャリブレーションシートのリファレンスマーカーと複製のリファレンスマークとのずれ具合から、倍率の誤差を求め、誤差が０となるように印刷の倍率を調整する。倍率の調整は、例えば、図３に示した画面において、テンプレート印刷の倍率補正「Ｃｏｒｒｅｃｔｉｏｎ」ボックスを使用して行われる。
【００３３】
このようにして、印刷部３０ばかりでなく読取部２０をも含めた総合的なキャリブレーションが行える。一度キャリブレーションを行った後は、システムに変更がない限り同一キャリブレーション状態で動作を続けてよい。あるいは、定期的または随時にキャリブレーションを行うことにより、倍率の精度維持を確実にすることができる。
【図面の簡単な説明】
【００３４】
【図１】本発明を実施するための最良の形態の一例の試料採取支援装置のブロック図である。
【図２】ゲルプレートの一例を示す図である。
【図３】表示画面の一例示す図である。
【図４】表示画面の一例示す図である。
【図５】テンプレートの一例を示す図である。
【図６】ゲルプレートとテンプレートの重ね合わせを示す図である。
【図７】試料採取状態を示す図である。
【符号の説明】
【００３５】
１０ ： データ処理部
１２ ： 表示部
１４ ： 操作部
２０ ： 読取部
３０ ： 印刷部
２００ ： ゲルプレート
２０２ ： リファレンスマーカー
２１２ ： リファレンスマーク
３００ ： テンプレート
３０２ ： スポットマーク
７０２ ： ホルダー
７０４ ： トレイ
８００ ： 切出具
【図１】
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【図２】
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【図３】
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【図４】
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【図５】
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【図６】
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【図７】
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