(57)【要約】【課題】効率のよい組換えタンパク質、特に組換え抗体分子、好ましくはミニ抗体のような抗体フラグメントの生産のための、大腸菌の特別な宿主／ベクター系を使用した流加型醗酵法を提供する。【解決手段】高細胞密度醗酵条件下で外来タンパク質を発現させることに適している大腸菌発現ベクターを、少なくとも（i）上流ターミネータシーケンスと下流ターミネータシーケンス、（ii）lacプロモータ／オペレータ  システム、（iii）T7glOシャイン・ダルガノシーケンス、（iv）pelBまたはompAシグナルシーケンス、及び（v)外来遺伝子のシーケンスを用いて構成する。【選択図】図２
2007185197.tif 000002
【特許請求の範囲】
【請求項１】
高細胞密度醗酵条件下で外来タンパク質を発現させることに適しており、
（i）上流ターミネータシーケンスと下流ターミネータシーケンス、
（ii）lacプロモータ／オペレータ  システム、
（iii）T7glOシャイン・ダルガノシーケンス、
（iv）pelBまたはompAシグナルシーケンス、及び
（v）外来遺伝子のシーケンス
を含むことを特徴とする大腸菌発現ベクター。
【請求項２】
さらに自殺システムを有する請求項１記載のベクター。
【請求項３】
前記自殺システムが、hok-sok自殺システムである請求項２に記載のベクター。
【請求項４】
上流ターミネータシーケンスがｔHPであり、下流ターミネータシーケンスがｔLPPである請求項１〜３のいずれかに記載のベクター。
【請求項５】
外来遺伝子にはミニ抗体のＶH鎖とＶL鎖をコードするシーケンスが含まれる請求項１〜４のいずれか１項に記載のベクター。
【請求項６】
以下のpHKK構造：
【化１】
2007185197.tif 000004
を有する発現ベクター。
【請求項７】
請求項６記載の発現ベクターでＲＶ３０８（ＡＴＣＣ  ３１６０８）を形質転換することにより得られる、形質転換大腸菌発現宿主ＲＶ３０８［ｐＨＫＫ］。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
本発明は、特別な大腸菌の宿主／ベクター系を使用して、組換えタンパク質、特に組換え抗体分子、とりわけミニ抗体のような抗体フラグメントを効率よく生産するための流加型発酵プロセスに関する。
【０００２】
本発明による条件下では、大腸菌細胞を最大成長速度で極めて高い細胞密度状態にまで増殖させることができる。生成物の組換え形成の後では、増殖に制限的な影響を与えるのはその生成物そのものだけであり、基質や代謝副産物が増殖を制限するようなことはない。この培養方法と、この目的のために特別に採用した極めて高い安定性を有する新規の発現ベクターとを組み合わせることで、組換えタンパク質の高い時空収率を達成することが可能であり、特に、ここで得られるタンパク質が抗体フラグメントの場合には高い生物学的活性を示す。
【背景技術】
【０００３】
大腸菌細胞を高細胞密度の状態になるまで培養することが、組換えタンパク質を効率的に生産するための必須の前提条件となる。以下に述べる培養法がこの目的の達成のための技術の現状である。すなわち、バッチフェーズで無制限増殖（μ=μmax）させた後、続く流加フェーズで、例えばアセテートのような成長阻止要因として作用する副産物が生成されないような制限的な方法で、炭素源（グルコース又はグリセロール）を量の調節をしながら供給する。これにより、基質に対してのみ制限的（μ＜μmax）であるような方法で、高細胞密度に達するまで増殖を持続することができる（例えば、Riesenbergら，1991，J. Biotechnol., vol. 20, 17-28、 Strandberg ら, 1994, FEMS Microbiol. Rev., vol. 14, 53-56、Korzら，1995, J. Biotechnol. 39, 59-65、EP-B-O 511226)。成長率が低い場合の増殖では、当然の結果として、発酵時間が長くなると同時に時空収率も低下する。このような発酵においては、培養液中の炭素源はすぐに消費されるので、炭素源濃度は実質的にはゼロとなる。組換えタンパク質の生成が開始した後は、その基質制限条件が変化することはない。
【０００４】
炭素源を比較的大きな時間間隔をおいて不連続的に添加した後、基質消費の指標として通常使用しているｐＯ2値が上昇した時に、さらに比較的大量の炭素源を追加添加するような方法を採用した大腸菌流加培養法も知られている（例えば、Eppsteinら、1989， Biotechonol． ７， 1178-1181）。この方法を使用した場合には、比較的長期の基質過剰の状態から基質制限の状態に頻繁に変化するために、代謝不均衡を引き起こす可能性がある。
【０００５】
流加培養法は、その流加フェーズにおいて、最大の成長率（μ＝μmax）で細胞が増殖するように工夫したものである。流加培養法は、比較的大量の炭素源が、基質制限を避けるためにオフラインでの濃度測定結果に従って比較的長い時間間隔で培養物に加えられので、実験的に複雑であり、発酵の全プロセスを通して炭素源の濃度が常に変化してしまうという欠点がある(例えば、Pack ら，1993, Biotechnol., vol. 11, 1271-1277、Hahm ら，1994, Appl. Microbiol. Biotechnol. 42， 100-107)。
【０００６】
また、基質制限を避けるために、炭素源の濃度をオンラインで測定し、その濃度調節を行うタイプの流加バッチ型の培養法が報告されている。しかしながら、その培養法でも、特に高細胞密度状態での培養に関しては、下記のような欠点がある。攪拌タンク型発酵槽を使用した微生物発酵用の加圧滅菌型グルコースセンサーが最近報告されている(M. R. Phelps ら，1995， Biotechnol. Bioeng., vol. 46， 514-524)。このセンサーは大腸菌培養での測定に使用されている。この insitu センサーは、約２分間遅れで、培養液の現在濃度値を示す。グルコースセンサーの信号は、特にｐＨとｐＯ2に依存する。このセンサーは、高細胞密度（Ｘ＞８０ｇ／ｌ）の状態ではまだ試験されていない。高細胞密度状態に達している大腸菌培養に使用した場合、in-situ プローブの増殖において、付加的なエラー値が現れることが経験により判明している。さらに、発酵が進行中の場合には、このセンサー自体を正確に再び較正することは不可能である。そのような in-situセンサーを使用した炭素源の測定を基礎とする代わりに、別の測定プロセスを基礎にした培養法の報告がある。例えば、発酵槽から半連続的に取り出した培養液と、濾過またはミクロ遠心分離により無細胞とした培養液とを、オンライン・フローインジェクション分析（ＦＩＡ）又はオンライン・ＨＰＬＣを使用して炭素源を測定する方法である(Kleman ら，1991， Appl． Environ． Microbiol． 57, 910-917, 918-923、Turner ら,1994, Biotechnol. Bioeng. 44, 819-829)。予想とフィードバック制御アルゴリズムは、Ｘ＝６５ｇ／ｌに増殖するまでグルコース濃度の変動を減少させる(Kleman ら，1991， Appl． Environ． Microbiol． 57, 910-917)。高細胞密度の状態（約８０ｇ／１〜１５０ｇ／ｌ）においては、細胞と栄養溶液を分離することが困難で時間もかかり、その結果、発酵槽中の現在のグルコース値の決定に時間的遅れが発生し、しかも、その遅れは生物量に依存し増大し、そのため、グルコース値を一定に保つことがより困難または不可能となっている。これとは対照的に、細胞分離をしない装置を使用して、一定の短い時間的遅れでグルコース濃度を測定する方法も報告されている(Pfaff ら，1995, pp. 6-11,「バイオテクノロジーにおけるコンピュータ応用に関する第６回国際協議会」Garmish-Partenkirchen， FRG)。このPfaff らの方法によれば、増殖阻止剤で培養液を希釈した後、酵素-電流測定用グルコースセンサーを有するＦＩＡをサンプル部位のすぐ近くで使用する。
【０００７】
好気的な培養の間において、投与形態により基質制限的な増殖を強いられない大腸菌は、通常、代謝副産物であるアセテートを形成増加させる（Riesenberg, 1991, Curr. 0pinion Biotechnol., vol. 2, 380-384)。このアセテートは栄養溶液中で蓄積し、それが比較的大量に存在する場合には、増殖阻止の原因となる(Panら，1987， Biotechnol． Lett.， vol.2， 89-94)。したがって、アセテートの蓄積が特異的遺伝子変換により低減される特別な大腸菌の菌株を用いた場合のみ、高細胞密度になるまでの流加培養を実施することが可能である。一方、これに関連した他の不利益に耐え得る。また、大腸菌Ｋ１２の系統株としてホスホトランスアセチラーゼ陰性突然変異体があるが(Bauer ら，1990， Appl． Environ. Microbiol., vol. 56, 1296-1302、Hahm ら,1994, Appl. Microbiol. Biotechnol., vol.42， 100-107)、これを増殖した場合でも、グルコース／ミネラル塩の培地上ではその増殖も大きく減退してしまう。Phelps らは（上記参照）、大腸菌株ＴＯＰＰ５を、非基質制限培養のための宿主として使用し、その生物量Ｘ＝８５ g/lになるまで培養を行っている。しかしながら、この大腸菌株は、明らかにアセテートを蓄積せず、Ｋ１２株ではない。この大腸菌ＴＯＰＰ５は溶血素(haemolysin)を生成するため病原性株であり、産業分野での組換えＤＮＡ産物の形成のための宿主として使用することは安全上適当でない。また、アセトラクテート・シンターゼ（ＡＬＳ）をコードする遺伝子を含むプラスミドを使用して大腸菌細胞を形質転換させることにより、中間代謝の進行方向の特異的変更によるアセテート蓄積の減少が実現したという報告がある（San ら，1994, Ann. N. Y. Acad. Sci., vol. 721， 257-267)。しかし、この方法には、ＡＬＳをコードしているプラスミドを、「生産」遺伝子を有する第２のプラスミドと組み合わせて使用した時に、高い細胞密度の条件の下ではプラスミドが不安定になるという欠点がある。プラスミドが不安定になると（これは、高細胞密度にまで培養する場合に特に増大する）、組換え産物の生成効率がしばしば低下する。
【０００８】
医学とバイオテクノロジーの分野においては、Ｆａｂ'やＦ（ａｂ'）２のような抗体または抗体フラグメントや、ミニ抗体または単鎖Ｆｖの重要性が増している。本発明で生産しようとしているミニ抗体とは、擬似ヒンジ部により結合されている二価または二重特異性(bispecific)の単鎖Ｆｖ断片のことである。これに関連して、例えばガンの治療では、大量の抗体（約１ｇ／投与）を使えることが重要である。この点において、一価抗体フラグメント又はこれらフラグメントの融合タンパク質、あるいはこれらの多量体の又は多重特異性の変種を、大腸菌を使用することで容易にしかも満足のいく量だけ生産することが可能である。これらのフラグメント又はタンパク質の変種の大きさは小さいもので、高い特異的結合能と関連している（例えば、Plueckthun A., 1992, Immunol. Rev. 130, 151-188; Packら、1995, J. Mol. Biol. 246, 28-34)。しかし、タンパク質や抗体が生物学的かつ機能的に活性であるためには、特に、構造的に正確に折りたたまれていることが必要である。また、細胞当たりの生成抗体フラグメントの収量を考えた場合、細胞密度と関連した問題に注意を払う必要がある。さらに、抗体の一次配列が、インビトロでの収量の決定と、インビボでの折りたたみ構造が決定される時の重要な要素となる（Knappik A. Plueckthun A, 1995, Protein Engin. 8, 81-89）。
【０００９】
したがって、例えばＦａｂフラグメントは不溶性の細胞質または周縁細胞質の細胞塊として発現し、インビトロでは再び折りたたまれた状態となる。低細胞密度の状態で約０．１４ｇ／ｌ(Condra ら，1990， J． Biol． Chem． 265， 2292-2295)、中間細胞密度の状態で約１〜２ｇ／１(Shibui ら，1993， Appl． Microbiol. Biotechnol． 38， 770-775)の不溶性抗体の収量が達成されたことが報告されている。大腸菌から生物学的活性を有する約０．２ｇ／ｌの収量の二価ミニ抗体も得られている(Pack et al.， 1993， Biotechnol． 11， 1993， 1271-1277)。平均的に、これらの得られた収量のうちの約５〜４５％において、再折りたたみが適正になされている。
【００１０】
既知の大腸菌の系においては、外来タンパク質の生成は、一般的には、適切な細胞密度が達成された後に、それそれの発現系に対応した調節プロモータ系により誘導されて開始される。ここで示すことのできるプロモータ系の例としては、（ｉ）AraCリプレッサ存在下での araBAD プロモータ（アラビノースで誘導可能）(例えば、Better ら，1993, Proc. Natl. Acad. Sci. （USA） 90, 457-461)、（ii）phoA プロモータ（リン酸の除去により誘導可能）(例えば、Carter ら，1992, Biotechnol. 10, 163-167)、（iii）lacプロモータ系（IPTGにより誘導可能）(例ば、Pack ら， 1993， loc． Cit. )がある。Lac系では、概して、良好な発現をもたらすが、プロモータが誘導される前に望ましくない基礎発現が起こることや、ＩＰＴＧによる誘導の後に、プラスミドが不安定化するという欠点がある。
【００１１】
本発明の実施例の１つには、外来遺伝子として、マウス又はヒト抗体Ｍａｂ 425のフラグメントをコードする配列を含む特別なベクター（ｐＨＫＫ）が開示されている。Ｍａｂ 425（ＡＴＣＣ ＨＢ ９６２９）は、既知のヒトＡ432癌細胞（ＡＴＣＣ ＣＲＬ １５５５）から分離されたマウスモノクローナル抗体で、これはヒト上皮増殖因子受容体（ＥＧＦＲ、１７０ｋＤの糖タンパク質）のエピトープと結合し、他方において、自然リガンドＥＧＦとの結合を阻止する。Ｍａｂ 425には腫瘍細胞に対する細胞毒性があり、これらの細胞の増殖を阻害する能力があることが示されている(Rodeckら，Cancer Res． 1987， 47: 3692)。ＷＯ ９２／１５６８３には、Ｍａｂ 425のヒト由来のキメラ体、そのＤＮＡ、及びＬ鎖とＨ鎖を有するアミノ酸配列が開示されている。
【特許文献１】欧州特許第511226号明細書
【特許文献２】国際特許公開第９２／１５６８３号パンフレット
【非特許文献１】Riesenbergら，1991， J. Biotechnol., vol.20,17-28
【非特許文献２】Strandberg ら,1994, FEMS Microbiol. Rev., vol. 14, 53-56
【非特許文献３】Korzら，1995, J. Biotechnol. 39, 59-65,
【非特許文献４】Eppsteinら、1989， Biotechonol. ７, 1178-1181
【非特許文献５】Pack ら，1993, Biotechnol., vol. 11, 1271-1277
【非特許文献６】Hahm ら，1994, Appl. Microbiol. Biotechnol. 42, 100-107
【非特許文献７】M.R.Phelps ら，1995， Biotechnol. Bioeng., vol. 46， 514-524
【非特許文献８】Kleman ら， 1991, Appl. Environ. Microbiol. 57, 910-917, 918-923
【非特許文献９】Turner ら, 1994, Biotechnol. Bioeng. 44, 819-829
【非特許文献１０】Kleman ら， 1991， Appl. Environ. Microbiol. 57, 910-917
【非特許文献１１】Pfaff ら， 1995, pp. 6-11, 「バイオテクノロジーにおけるコンピュータ応用に関する第６回国際協議会」Garmish-Partenkirchen，FRG
【非特許文献１２】Riesenberg, 1991, Curr. 0pinion Biotechnol., vol. 2, 380-384
【非特許文献１３】Panら， 1987， Biotechnol． Lett., vol. 2， 89-94
【非特許文献１４】Bauer ら， 1990， Appl. Environ. Microbiol., vol. 56, 1296-1302
【非特許文献１５】Hahm ら, 1994, Appl. Microbiol. Biotechnol., vol. 42， 100-107
【非特許文献１６】San ら， 1994, Ann. N. Y. Acad. Sci., vol. 721， 257-267
【非特許文献１７】Plueckthun A., 1992, Immunol. Rev. 130, 151-188
【非特許文献１８】Packら、1995, J. Mol. Biol. 246, 28-34
【非特許文献１９】Knappik A. Plueckthun A, 1995, Protein Engin. 8, 81-89
【非特許文献２０】Condra ら， 1990，J． Biol． Chem． 265， 2292-2295
【非特許文献２１】Shibui ら， 1993， Appl． Microbiol. Biotechnol． 38， 770-775
【非特許文献２２】Pack et al.， 1993， Biotechnol． 11， 1993， 1271-1277
【非特許文献２３】Better ら， 1993, Proc. Natl. Acad. Sci. （USA） 90, 457-461
【非特許文献２４】Carter ら， 1992, Biotechnol. 10, 163-167
【非特許文献２５】Pack ら， 1993， loc． Cit.
【非特許文献２６】Rodeckら， Cancer Res． 1987， 47: 3692
【発明の開示】
【発明が解決しようとする課題】
【００１２】
本発明の目的は、組換え大腸菌細胞を使用して、外来タンパク質、特に抗体フラグメントを、高細胞密度の条件下（ＨＣＤＣ＝高細胞密度培養）において、高い時空収率で、基質または代謝産物による大きな増殖阻害がなく、さらに重要なプラスミドの消失やプラスミドの不安定化を引き起こすことなく、しかも、有効な生物化学的活性（結合能力および正確な折りたたみ）を高度にタンパク質が示すように生産する方法を提供することである。
【課題を解決するための手段】
【００１３】
本発明にかかる大腸菌発現ベクターは、高細胞密度醗酵条件下で外来タンパク質を発現させることに適しており、
（i）上流ターミネータシーケンスと下流ターミネータシーケンス、
（ii）lacプロモータ／オペレータ  システム、
（iii）T7glOシャイン・ダルガノシーケンス、
（iv）pelBまたはompAシグナルシーケンス、及び
（v）外来遺伝子のシーケンス
を含むことを特徴とする大腸菌発現ベクターである。
【００１４】
上記の大腸菌発現ベクターは、さらに自殺システムを有することができる。この自殺システムとしては、hok-sok自殺システムを用いることができる。更に、上記の大腸菌発現ベクターの上流ターミネータシーケンスはｔHPであり、下流ターミネータシーケンスはｔLPPであってもよい。また、この大腸菌発現ベクターにおいて、外来遺伝子にはミニ抗体のＶH鎖とＶL鎖をコードするシーケンスが含まれていてもよい。この大腸菌発現ベクターの好ましい例として図２に示すpHKK構造を有する発現ベクターを挙げることができる。
【００１５】
本発明にかかる形質転換大腸菌発現宿主ＲＶ３０８［ｐＨＫＫ］は上記の大腸菌発現ベクターＲＶ３０８（ＡＴＣＣ  ３１６０８）を形質転換することにより得られる。
【００１６】
本発明のベクターを用いる方法は、細胞か、バッチ全体を通して最大速度で増殖する（μ=μmax）点で特に優れた多段階バッチプロセスである。この方法を使用することで、最終的に１００〜１５０ｇ／ｌ（生物量乾燥重量）の細胞密度を達成できる。さらに、この方法では、発酵中にアセテートを生成することの少ない大腸菌株を選択使用しているために、アセテートの蓄積が原因で増殖が阻害されることはほとんどない。さらに、他の追加措置を採用すること、すなわちバッチフェーズの後に流加フェーズを挿入することで、炭素源の濃度がある一定の変動のない範囲内に保たれると同時に細胞の無制限増殖が可能となっている。
【００１７】
適当な方法で関連する発現ベクターを準備することにより、調節プロモータ系の方法によるタンパク質合成の開始前に、タンパク質の望ましくない基礎発現を実質的に排除できる。上記で述べたように、発現系には通常プラスミドの消失が起こり得るが（それがときには大きな消失になることがあるが）、本発明ではｌａｃプロモータ系のような強力なプロモータを使用することで、プラスミドは消失することなく観測される。
【発明の効果】
【００１８】
本発明によれば、合計約２５〜３５時間の培養で、平均で３〜５ｇ／ｌのタンパク質収量が達成可能である。抗体フラグメント、特にミニ抗体（その折りたたみ規準により特にクリティカル）の場合には、合成されたミニ抗体の約８０％が生物学的活性を有し、正確な折りたたみがなされている。
【発明を実施するための最良の形態】
【００１９】
したがって、本発明は、外来遺伝子を運ぶプラスミドと誘導プロモータで形質転換した大腸菌細胞を使用して外来タンパク質を生産する方法に関するもので、この方法は、基質または代謝副産物による成長阻害の無い、バッチステージと流加ステージによる高細胞密度発酵の工程、及び発現したタンパク質を培養培地から分離・精製する工程を有し、この流加フェーズにおける基質濃度を、連続した自動または半自動の分析・添加システムにより制御する方法であって、その流加フェーズにおいて、（ｉ）細胞の無制限増殖（μ=μmax）状態を維持しながら培地中の炭素源の濃度を０．１〜２５ｇ／ｌの範囲内で一定に保ち、（ii）細胞密度が１０〜８０ｇ／１の状態でプロモータを誘導することにより外来タンパク質の生成を開始し、（iii）タンパク質合成の誘導を開始した後に、窒素、ホスフェート及び微量の塩を連続的に供給し、（iv）酸素を発酵液体培地に適当な方法で送り込むことにより全流加フェーズを通してｐＯ2が５〜２５％になるように調節する。
【００２０】
本発明によれば、流加フェーズにおいて必要な炭素源濃度の範囲は０．１〜２５ｇ／ｌであり、好ましい範囲は０．５〜１５ｇ／ｌ、特に１．０〜５ｇ／ｌ又は１．０〜３ｇ／ｌである。特に好ましい濃度は１．５ｇ／ｌである。好ましい炭素源は、グルコース、グリセロール又はこれらの２つの混合物である。本発明によれば、炭素源を、自動または半自動の添加・分析システムを使用して連続で（オンラインで）添加する。オンライン・フローインジェクション分析システム（ＦＩＡ）を使用することが望ましい。
【００２１】
バッチフェーズの後に続く流加フェーズにおいて、好ましくは調節プロモータを使用したタンパク質合成が開始した後に、窒素、好ましくはアンモニウム窒素と、ホスフェート、例えばリン酸水素二アンモニウムやリン酸二水素アンモニウムと、微量元素、例えばホウ素、マグネシウム、銅、モリブデン、コバルト、鉄、亜鉛の塩のような培地に溶ける物質を、細胞密度が５０〜８０ｇ／ｌ(生物量の乾燥重量)、好ましくは約７０ｇ／ｌで、総成長率が１００〜１５０ｇ／ｌ、好ましくは１４０ｇ／ｌである状態で供給する。
【００２２】
本発明では、細胞密度が１０〜８０ｇ／ｌ、好ましくは２０〜６０ｇ／ｌ、特に好ましくは４０〜５０ｇ／ｌの状態の時に調節プロモータを活性化させることによりタンパク質合成が開始する。
【００２３】
本発明では、流加フェーズにおいて、酸素分圧は５〜２５％、好ましくは１５〜２５％、特に好ましくは２０％である。
【００２４】
本発明によれば、発酵培地のｐＨを、全バッチの実施中に、６．５〜７．０、好ましくは６．７〜６．９、特に６．８に調整する。
【００２５】
さらに本発明は、外来遺伝子を含み、かつ２つのターミネータシーケンスに隣接している発現カセットを有する発現ベクターを使用する生産方法に関する。これらのターミネータシーケンスのうち、特に、上流に位置しているターミネータシーケンスは、プロモータ系により開始される発現が起こる前に、タンパク質の望まない発現をうまく阻止する。ターミネータｔhp（Nohnoら，1988, J. Bacteriol. 170， 4097-4102）が特に望ましいが、その他の既知のターミネータシーケンスを使用してもかまわない。
【００２６】
本発明はさらに、自殺システムを含む発現ベクターが追加的に使用される生産方法に関する。この自殺システムは、細胞内にプラスミドが存在しない場合には、細胞に対して毒性作用のあるタンパク質を産生する。どのような自殺システムがあるかは文献により知ることができる。本発明に特に適している自殺システムは、hok-sok システムである(例えば、Gerdes K， 1988， Biotechnol. 6， 1402-1405)。このように、組換えタンパク質、特に抗体分子を効率的に生産するためには、宿主／ベクター系の特徴として、高細胞密度の状態で、プラスミドの安定性が高いこと、組換え基礎発現が少ないこと、生成量が多いことが重要である。この関係の中で、ターミネータに隣接している組換え発現カセットとの組み合わせで使用される自殺システムは、ベクターに特異的である。
【００２７】
本発明はさらに、抗体フラグメント、特にミニ抗体をコードする外来遺伝子が使用される生産方法に関する。
【００２８】
また本発明は、下記のような追加の特徴を有する発現ベクターが使用される生産方法に関する。
【００２９】
原理的には、既知となっている大腸菌株の大部分は組換え技術に適しており、工業生産に使用可能である。この大腸菌を高細胞密度になるまで増殖させる場合、アセテート蓄積の少ない菌株を使用することが好ましい。アセテート蓄積が５ｇ／ｌ未満である菌株が特に望ましい。本発明によれば、このような菌株を選択することによって、このアセテート蓄積を少なく保つことができる。すでによく知られた、市場から入手できる大腸菌株ＲＶ３０８（ＡＴＣＣ ３１６０８）及びその変種株の場合に、このアセテート蓄積が少なく、本発明で使用するのに適している。
【００３０】
それゆえ、本発明は発酵中における培地内のアセテート蓄積が５ｇ／ｌ未満である大腸菌株が使用される生産方法に関する。
【００３１】
また本発明は、高細胞密度発酵条件下で、外来タンパク質を発現させるための大腸菌発現ベクターに関する。このベクターは下記の特徴を有する。すなわち、この発現ベクターは、
（ｉ）上流ターミネータシーケンスと下流ターミネータシーケンス、
（ii）lac プロモータ／オペレータ システム、
（iii）T7g10シャイン・ダルガノシーケンス、
（iv）pelB または ompA シグナルシーケンス、及び
（v）外来遺伝子のシーケンス
を有すること。好適な実施例では、自殺システム、特に hok-sok 自殺システムを有する。
【００３２】
本発明によれば、このプロモータを他の適当なシステム、例えば上記のシステムで代替してもかまわない。上記で述べたと同様の効果を有する、その他のシグナルシーケンス、制御シーケンスも本発明に含まれる。
【００３３】
さらに本発明は、Ｍａｂ４２５由来のミニ抗体シーケンスを含む発現ベクターｐＨＫＫ（図２）（構造により規定される）、及び特に実施例として組換え大腸菌宿主ＲＶ３０８［ｐＨＫＫ］に関する。
【００３４】
図面の説明
図１：高細胞密度の条件下でタンパク質を生産するためのバイオリアクタの実験用セットアップを示したものである。このシステムには、測定装置、表示装置、制御装置が取り付けられている。
図２：最適発現ベクターｐＨＫＫとその構成成分を示したものである。このベクターは既知のベクターであるｐＡＳＫ４０、ｐＡＫ１００、ｐＫＧ１０２２由来の構成成分で構成されている。
図３（ａ−ｄ）：大腸菌ＲＶ３０８[ｐＨＫＫ]を使用した組換え大腸菌のＨＣＤ培養を示す。バイオマス、グルコース、アンモニウム窒素、ホスフェート、アセテート、攪拌速度、ｐＯ2、排気ガス中のＯ2、排気ガス中のＣＯ2、プラスミド安定性（β−ラクタマーゼ陽性コロニーでの％として示す）、タンパク質の生成（この場合は、scFv425dhlx）の時間的推移を示す。バッチフェーズと流加フェーズを５つのサブフェーズに分けている。ＩＰＴＧの矢印はタンパク質生産の開始を示している。
【００３５】
本発明による生産方法では、形質転換した大腸菌宿主細胞を使用する。選択されるプラスミドの構造は、発現させようとするタンパク質の種類に依存する。特に好ましいプラスミド構造の特徴は下記に記載した通りである。プラスミドの構築と宿主細胞の形質転換のための技術と方法は知られており、文献にも詳述されている(例えば、Sambrookら，1989, Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor)。その他、本発明の実施例の中でもその特徴が説明されている。原料のプラスミドやプラスミド断片は市販されているし、既によく知られた構築スキームによる標準的な方法で容易に構築することも可能である。
【００３６】
本発明によれば、形質転換した大腸菌細胞の代表的な発酵における先に行うバッチフェーズは２つのサブフェーズに分割される。適当な予備培養物への接種の後、サブフェーズＩは、細胞が順応した後、成長率μがμmaxに上昇することで知られるｌａｇフェーズにより特徴づけられる。サブフェーズIIでは、細胞はμ＝μmaxの成長率で指数関数的に増殖する。ｐＯ2が１００％飽和の状態から５〜１５％以下の状態に低下した後、ｐＯ2値を、ｐＯ2攪拌器の速度を制御することにより、好ましくは１５〜２５％、より好ましくは約２０％に調整する（図３ｃ）。この調整（純粋酸素を含んだ空気を送入して調整する）は、醗酵の開始後約６時間目から１２時間目に実施する必要がある。グルコース濃度(初期段階での濃度は２０〜３５g/lであることが好ましい)はサブフェーズIIの最終段階で低下する(このサブフェーズIIは、流加フェーズの前にあるバッチフェーズの最後の段階でもある)。但し、このグルコース濃度はどのような場合でも０．１g/l以下に低下させてはならない。この値以下に低下するようであれば、適当な量のグルコースを供給する必要がある（サブフェーズIII，図３ａ、流加フェーズの開始）。本発明によれば、このグルコース濃度を０．１〜２５g/l、好ましくは、１〜３g/lで一定に保つようにする。この目的のために、例えば、フィード培地ＦＳ１（表１）を使用する。このグルコース濃度範囲はＫs値を十分に上回っているので、細胞は引き続きμmaxの成長速度で増殖が可能である(Bergter， 1983, "Wachstum von Mikroorganismen (Growth of microorganisms)"， p.41, GustavFischer Verlag, Jena)。本発明によれば、グルコース濃度を自動または半自動装置を使ってモニターしながらその調整を行う。フローインジェクション分析システムをオンラインで操作することが望ましい。手動だけ又は大型の手動システムは好ましくない。流加フェーズは、醗酵開始後およそ１５〜２２時間で始まるが、温度、培地成分、培地濃度、リアクター規模などの個別の要因により差異があり、特に、使用する大腸菌の菌株の性質によっても変動する。流加フェーズが始まってから約４〜８時間で外来タンパク質の合成が開始される。しかし、合成開始の正確な時間は、この時点ですでに到達している培養物の細胞密度により影響され変動する。最終の細胞密度を１００〜１５０g/ｌにする場合であれば、この時点での細胞密度は１０〜８０g/l、好ましくは２０〜６０g/lであることが望ましい。誘導の時点で、細胞密度が、到達目標である最大細胞密度の約１０〜６０％に届いていれば、その時点でタンパク質合成を開始させることが望ましい。
【００３７】
調節プロモータシステムを開始することによりタンパク質合成が行われる。使用するプロモータにより差異があるが、一般的には、基質を添加するか、基質の物理的な量を変化させることによって開始される。Lacプロモータ（プロモータ、オペレータ及びインデューサ）の場合には、ＩＰＴＧ（isopropylthiogalactopyranoside)を添加することにより合成が開始する。細胞のそれ以上の増殖は、蓄積物質によってのみ制限を受けることになる。このため、本発明によれば、全体の増殖と収率に悪影響を与えるような大きな基本発現が誘導の前に起こらないことが重要である。本発明によれば、プラスミドの中の、有効なターミネータシーケンスに隣接している発現カセットに工夫を加え、この発現が起こらないようにしている。
【００３８】
グルコースが供給され始めた時点から、醗酵培地の中の窒素およびホスフェートが無くなっていく（図３ａ、ｂ）。生産が制限されるような状態を避けるために、窒素とホスフェートを同じように連続的に供給する。ｐＨ値に影響が出るので、便宜的にアンモニア塩の形で窒素を供給する(ｐＨは６．５〜７．０、好ましくは６．８)。例えば、ＦＳ２溶液が望ましい（表１）。サブフェーズIVの特徴は、溶解性塩の形で微量物質（例えば、ホウ素、マグネシウム、鉄、コバルト、モリブデン、鉛）が供給されることである。一般的には、この供給は一定の速度で連続的に行う。サブフェーズＶの特徴は、主に生成物の蓄積のために、増殖が減少することである。さらに、アセテート濃度がわずかに上昇する。しかし、培地中におけるアセテートの蓄積とアセテート濃度は驚くほどに低い。この原因として、特別な生産条件を採用していることも挙げられる。醗酵中の最大アセテート蓄積量が５ g/l未満であるような大腸菌株を使用した場合にこの効果がさらに増加する。
【００３９】
タンパク質の種類により変動するが、平均のタンパク質収量は２〜６g/lである。このタンパク質のうちの５０〜９５％が生物学的活性を示すが、それぞれのタンパク質の種類により変動がある。抗体フラグメントの場合、その８０％以上がリフォルディング（再折りたたみ）をする。この数値は、従来法により生産した場合に比べて著しく高い。
【００４０】
抗体フラグメント、特にミニ抗体を効率よく生産するように構築された発現プラスミドを使用する生産方法が望ましい。本発明の方法を使用すれば、この他にも多くのタンパク質、融合タンパク質、酵素を生産することが可能である。そのようなタンパク質の例として、ハイブリッド・ストレプトキナーゼ、グルコース脱水酵素、血液凝固に影響するその他のタンパク質、例えば、ヒルジン(hirudin)、トロンビン(thrombin)、ヘメンチン(hementin)、テロミン(theromin)がある。
【００４１】
【表１】
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【実施例】
【００４２】
実施例１
組換え大腸菌宿主を作製するために、大腸菌K12の原栄養株 RV308(lac74-galISII:OP308strA)(Maurer ら,1980, J. Mol. Biol. 139, 147-161; ATCC 31608)を使用した。別の記載がないかぎり、発現ベクターによる形質転換やその他の DNA操作の手法は標準法に従った。高細胞密度醗酵での対照として、プラスミドを含まない大腸菌RV308細胞を使用した。
【００４３】
ベクターpHKKを下記の方法で作成した（図２）。ｐＫ100（Ｋｒｅｂｂｅｒｔ and Plueckthun 1995)由来の小型MluIフラグメント（強力な転写ターミネータｔHPを含む(Nonoら、上記参照)）を、プラスミドpASK40(Skerra ら，1991，Biotechnol．9，273-278)へ、lac p/oの上流領域内に挿入した。さらに、次のような２つのクローニングステップにより hok-sok DNA を挿入した。pKG1022（Gerdes,1988,上記参照）由来のaphA遺伝子を、XhoI と EcoRI を用いた２回切断(double digestion)により取り除き、ＤＮＡポリメラーゼＩ（クレノウ フラグメント）で満たし、再度つなぎ合わせた。第２の段階で、pKG1022 由来の修飾 BamHI フラグメントを、第１のクローニング生成物の単一BamHI 切断部位にクローン化した。ミニ抗体を単鎖ab フラグメントより得た。このフラグメント内では、多様なドメインがＶH−ＶLの方向でフレキシブルリンカー(gly4ser)3に連結され、その後にはプロリンに富むヒンジ領域と修飾ヘリックス・ターン・ヘリックス・ドメイン(dhlx)が続いている(Pack ら，1993， Biotechnol． 11， 1271-1277)。マウス／ヒト Mab 425 のＤＮＡ配列、プライマー、Ｌ鎖とＨ鎖の増幅とクローニングについては、ＷＯ ９２／１５６８３に詳しく開示されている。scFv425dhlx フラグメントのペリプラズマ(periplasm)への分泌を確実にするために、ＶHドメインをＮ末端で pelB シグナルシーケンスに融着させた。T7g10 リボソーム結合部位（シャイン ダルガノ）を、PCR法を用い、pEG1のXbaIとSfiI切断部位にクローン化した（Strittmatterら，1995)。最後に、完成したscFv425dhlx発現カセットを、XhaIとHindIII切断部位にクローン化した。以上のようにして、図２で示されているような発現ベクターｐＨＫＫを作製した。
【００４４】
実施例２
表１は、エルレンマイヤーフラスコ中の予備培養のための培地成分、撹拌装置を備えたタンクリアクタ中の主培養のための培地成分(Biostat ED10，B.Braun, Biotech International， Melsungen， FRG)、フィード培地であるＦＳ１，ＦＳ２，ＦＳ３の組成を示したものである。主培養培地（８ｌ）は、Riesenberg ら（1991、上記参照）の培地と比較して改変したものを使用した。沈殿を防ぐために、表１で示した順序でそれぞれの成分を追加した。別途、グルコースと硫酸マグネシウムを加圧滅菌した溶液の状態で追加した。リアクターを温度２６℃、圧力０．１５Ｍｐａ、ｐＨ６．８、平均通気速度１０ l/分で運転した。ｐＨの調整には２５％アンモニア水を使用した。醗酵中、センサーで制御しながら、ｐＨの調整のためにアンモニア、消泡剤としてUcolub N115(登録商標：Ｆｒａｇｏｌ Industrieschmierstoffe GmbH, Muehleim/Ruhr, FRG)を添加した。ＦＳ１は下記のような方法で調製した。
【００４５】
すなわち、７５０ｇのグルコースを６００mlのＨ2Ｏに、２２．２ｇのＭｇＳＯ4ｘ７Ｈ2Ｏを５０mlのＨ2Ｏにそれぞれ溶解させ、その溶液を加圧滅菌した後、混合させてＦＳ１とした。ＦＳ２は、加圧滅菌の前に、ｐＨを６．８に調整するために２５％ＮＨ3を６０ml添加しながら、２２７ｇの（ＮＨ4）2ＨＰＯ4と１６９．５ｇの（ＮＨ4）Ｈ2ＰＯ4を水に溶かしてＦＳ２とした。ＦＳ３は、下記の順番でストック溶液を使用して調製した。すなわち、５０ｍｌのクエン酸第２鉄水和物(６g/l)、０．５ｍｌのＨ3ＢＯ3、（３０g/l)、０．５ｍｌのＭｎＣｌ2ｘ ４Ｈ2Ｏ(１０g/l)、０．５ｍｌのＥＤＴＡｘ２Ｈ2Ｏ(８４g/l)、０．５ｍｌのＣｕＣｌ2ｘ２Ｈ2Ｏ(１５g/l)、０.５ｍｌのＮａ2ＭｏＯ4ｘ２Ｈ2Ｏ(２５g/l)、０．５ｍｌのＣｏＣｌ2ｘ２Ｈ2Ｏ(２５g/l)、１０ｍｌのＺｎ（ＣＨ3ＣＯＯ）2ｘ ２Ｈ2Ｏ(４g/l)。
【００４６】
実施例３
事前に２６℃でＬＢ寒天上で増殖させていた数個のコロニーをペトリ皿から取り出して、２０ｍｌの液体ＬＢ培地に接種した。５時間振とう（２００rmp，２６℃）させた後、その１ｍｌを５００ｍｌフラスコ中の予備培養培地１００ｍ１に移し、それをさらにインキュベートさせた。この予備培養物の１０ｍｌを１００ｍｌの新しい予備培養培地に接種した。このようにして９種類の予備培養培地を調製して、それらを醗酵槽中の８リットルの主培養培地に接種して、波長５５０ｎｍでの吸光度（ＯＤ550）が約０．２になるようにした。
【００４７】
実施例４
図１は、付属品や制御装置が装着された１０リットル・バイオリアクタのセットアップを示したものである。高細胞密度醗酵による培養を、デジタル測定制御装置（ＤＣＵ）、マルチ醗酵制御システム（ＭＦＣＳ）、ガス流量制御装置を使用して実施した。炭酸ガスと酸素の放出量を継続的に測定した。接種の後、バイオサンプル・コレクタ・ＭＸ−３(New Brunswick Scientific, Watford, UK)を使用して、無菌サンプルの採取を行い、オフラインのデータ分析を行った（Webb ら，1990，Biotechnol． 8， 926-928)。制御装置を使用して、ガス流入量を１０ ｌ/分、ｐＨを６．８、温度を２６℃、圧力を０．１５ MPaに維持した。２つの制御ループを採用して、ｐＯ2が２０％の好気的増殖状態が保たれるようにした。醗酵の全期間を通して、すべての重要な物理量が表示されるようにして、それらを記録するようにした。
【００４８】
流加フェーズでの培地のグルコース濃度を１．５ g/lに保つようにした。この目的のために、改良型フローインジェクション分析器（FIAstar 5020、光度計と検出制御ユニットが装備されている。Tecator AB、スエーデン）を使用した。この装置の詳細と運転動作に関しては、文献に記載されている(例えば、Pfaff ら，1995, in Munack A. and Schuegerl K(eds): Computer Apllication in Biotechonology，Elsevier Science Ltd.， 0xford， 6-11)。
【００４９】
細胞密度は、波長５５０ｎｍでの光学密度を測定することにより測定した。プラスミド安定性はPackらの方法（1993、上記参照）により測定した。
【００５０】
実施例５
Pack らの方法(1993、上記参照）により、合成されたミニ抗体の定量分析を行った。機能的ミニ抗体の定量分析はＥＬＩＳＡにより行い、ミニ抗体の全量分析は、Laemmli (1970)の方法に従って、１２％ポリアクリルアミドゲルを使用したＳＤＳ−ＰＡＧＥにより実施し、その後、ゲルスキャンニングを行った。ＥＬＩＳＡを行うために、マイクロタイタプレートに、ヒトＥＧＦＲ受容体を塗布する（例えば、WO92/15683)。結合ミニ抗体は、anti-scFv425 ウサギ血清と過酸化物複合ヤギ・抗ウサギＩｇＧ(Jackson Immunoresearch Inc.，USA)で検出を行った。活性ミニ抗体の収量を、精製ミニ抗体から作製した希釈シリーズにより算出した。対照において、anti-scFv425 ウサギ血清は、大腸菌ＲＶ３０８のプラスミドを含まない粗抽出液の他の成分との交差反応を起こさないことが実証されている。さらに、この粗抽出液を、精製した状態の同じ抗体から作製した希釈シリーズに添加した場合でも、ＥＬＩＳＡシグナルには影響を及ぼすことはなかった。ミニ抗体の全量定量を行うために、クーマシーブリリアントブルーで染色したゲルを光度計で測定して、ミニ抗体の濃度は、同じゲル上で分画されている精製ミニ抗体から作製した希釈シリーズを用いて計算した。大腸菌の宿主細胞が使用されているがミニ抗体を産生しない相似混合物を対照として用いた。
【図面の簡単な説明】
【００５１】
【図１】高細胞密度の条件下でタンパク質を生産するためのバイオリアクタの実験用セットアップを示したものである。このシステムには、測定装置、表示装置、制御装置が取り付けられている。
【図２】最適発現ベクターｐＨＫＫとその構成成分を示したものである。このベクターは既知のベクターであるｐＡＳＫ４０、ｐＡＫ１００、ｐＫＧ１０２２由来の構成成分で構成されている。
【図３ａ】大腸菌ＲＶ３０８[ｐＨＫＫ]を使用した組換え大腸菌のＨＣＤ培養におけるアセテートなどの変化を示す図である。
【図３ｂ】大腸菌ＲＶ３０８[ｐＨＫＫ]を使用した組換え大腸菌のＨＣＤ培養におけるホスフェートなどの変化を示す図である。
【図３ｃ】大腸菌ＲＶ３０８[ｐＨＫＫ]を使用した組換え大腸菌のＨＣＤ培養における排ガス中の二酸化炭素濃度などの変化を示す図である。
【図３ｄ】大腸菌ＲＶ３０８[ｐＨＫＫ]を使用した組換え大腸菌のＨＣＤ培養における活性などの変化を示す図である。
【図１】
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【図２】
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【図３ａ】
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【図３ｂ】
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【図３ｃ】
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【図３ｄ】
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