(57)【要約】細胞外マトリックスタンパク質（ＥＣＭ）は、細胞外マトリックス形成、細胞接着、細胞シグナル伝達、骨鉱化、炎症性応答、胚形成の調節、組織分化および／または成熟（例えば、肺の発達における気道の分枝）、組織分解、および細胞極性の樹立の調節において役割を果たすと考えられる本発明は、新規なヒトＥＣＭポリペプチドおよびこのようなポリペプチドをコードする遺伝子のコード領域を含む単離された核酸に関する。ベクター、宿主細胞、抗体、ならびにヒトＥＣＭタンパク質を産生するための組換え方法がまた、提供される。本発明はさらに、これらの新規なヒトＥＣＭタンパク質に関する障害を、診断および処置するために有用な診断方法および治療方法に関する。【特許請求の範囲】
【請求項１】
単離された核酸分子であって、以下：
（ａ）配列番号Ｘとして示されるポリヌクレオチド、またはＡＴＣＣ寄託番号Ｚに含まれるｃＤＮＡによってコードされるポリヌクレオチド；
（ｂ）配列番号Ｙの生物学的に活性なポリペプチドフラグメント、またはＡＴＣＣ寄託番号Ｚに含まれるｃＤＮＡ配列によってコードされる生物学的に活性なポリペプチドフラグメントをコードする、ポリヌクレオチド；
（ｃ）配列番号Ｙのポリペプチドエピトープ、またはＡＴＣＣ寄託番号Ｚに含まれるｃＤＮＡ配列によってコードされるポリペプチドエピトープをコードする、ポリヌクレオチド；
（ｄ）（ａ）〜（ｃ）において特定されるポリヌクレオチドのいずれか１つにストリンジェント条件下でハイブリダイズし得るポリヌクレオチドであって、ここで、該ポリヌクレオチドは、Ａ残基のみかまたはＴ残基のみのヌクレオチド配列を有する核酸分子に、ストリンジェントな条件下でハイブリダイズしない、ポリヌクレオチド、
からなる群より選択されるポリヌクレオチドを含む、単離された核酸分子。
【請求項２】
前記ポリヌクレオチドが、可溶性ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む、請求項１に記載の単離された核酸分子。
【請求項３】
前記ポリヌクレオチドが、配列番号Ｙとして同定される配列、またはＡＴＣＣ寄託番号Ｚに含まれるｃＤＮＡ配列によってコードされるポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む、請求項１に記載の単離された核酸分子。
【請求項４】
前記ポリヌクレオチドが、配列番号Ｘの全体のヌクレオチド配列、またはＡＴＣＣ寄託番号Ｚに含まれるｃＤＮＡを含む、請求項１に記載の単離された核酸分子。
【請求項５】
前記ポリヌクレオチドがＤＮＡである、請求項２に記載の単離された核酸分子。
【請求項６】
前記ポリヌクレオチドがＲＮＡである、請求項３に記載の単離された核酸分子。
【請求項７】
請求項１に記載の単離された核酸分子を含む、ベクター。
【請求項８】
請求項７に記載のベクターを含む、宿主細胞。
【請求項９】
遺伝子発現を制御する異種調節エレメントに作動可能に連結されている請求項１に記載の核酸分子を含む、組換え宿主細胞。
【請求項１０】
請求項９に記載の宿主細胞からコードされたポリペプチドを発現する工程、および該ポリペプチドを回収する工程を包含する、ポリペプチドの産生方法。
【請求項１１】
単離されたポリペプチドであって、以下：
（ａ）配列番号Ｙとして示されるポリペプチド、またはｃＤＮＡによってコードされるポリペプチド；
（ｂ）配列番号Ｙのポリペプチドフラグメント、またはｃＤＮＡによってコードされるポリペプチド；
（ｃ）配列番号Ｙのポリペプチドエピトープ、またはｃＤＮＡによってコードされるポリペプチド；および
（ｄ）配列番号Ｙの改変体、
からなる群より選択される配列に少なくとも９５％同一のアミノ酸配列を含む、単離されたポリペプチド。
【請求項１２】
配列番号Ｙを有するポリペプチドを含む、請求項１１に記載の単離されたポリペプチド。
【請求項１３】
請求項１１に記載の単離されたポリペプチドに特異的に結合する、単離された抗体。
【請求項１４】
請求項１１に記載の単離されたポリペプチドを発現する、組換え宿主細胞。
【請求項１５】
単離されたポリペプチドを作製する方法であって、以下の工程：
（ａ）該ポリペプチドが発現されるような条件下で、請求項１４に記載の組換え宿主細胞を培養する工程；および
（ｂ）該ポリペプチドを回収する工程、
を包含する、方法。
【請求項１６】
請求項１５に記載の方法によって産生される、ポリペプチド。
【請求項１７】
医学的状態を予防、処置、または緩和する方法であって、治療有効量の請求項１に記載のポリヌクレオチドを、哺乳動物被験体に投与する工程を包含する、方法。
【請求項１８】
被験体において、病理学的状態、または病理学的状態に対する感受性を診断する方法であって、以下の工程：
（ａ）請求項１に記載のポリヌクレオチドにおける変異の存在または非存在を決定する工程；および
（ｂ）該変異の存在または非存在に基づいて、病理学的状態、または病理学的状態に対する感受性を診断する工程、
を包含する、方法。
【請求項１９】
被験体において、病理学的状態、または病理学的状態に対する感受性を診断する方法であって、以下の工程：
（ａ）生物学的サンプルにおける請求項１１に記載のポリペプチドの発現の存在または量を決定する工程；および
（ｂ）該ポリペプチドの発現の存在または量に基づいて、病理学的状態、または病理学的状態に対する感受性を診断する工程、
を包含する、方法。
【請求項２０】
請求項１１に記載のポリペプチドに対する結合パートナーを同定するための方法であって、以下の工程：
（ａ）請求項１１に記載のポリペプチドを結合パートナーと接触させる工程；および
（ｂ）該結合パートナーが該ポリペプチドの活性をもたらすか否かを決定する工程、
を包含する、方法。
【請求項２１】
請求項１１に記載のポリペプチドの活性を改変する分子についてスクリーニングする方法であって、以下の工程：
（ａ）該ポリペプチドを、アゴニスト活性またはアンタゴニスト活性を有すると疑われる化合物と接触させる工程；および
（ｂ）該ポリペプチドの活性についてアッセイする工程、
を包含する、方法。
【請求項２２】
医学的状態を予防、処置、または緩和する方法であって、治療有効量の請求項１１に記載のポリペプチドを、哺乳動物被験体に投与する工程を包含する、方法。
【発明の詳細な説明】
【０００１】
（発明の分野）
本発明は、新規の細胞外マトリックス（「ＥＣＭ」）タンパク質に関する。より詳細定には、新規ＥＣＭポリペプチドをコードする単離された核酸分子が提供される。新規ＥＣＭポリペプチドおよびこれらのポリペプチドに結合する抗体が提供される。ヒトＥＣＭポリヌクレオチドおよび／またはポリペプチドを産生するためのベクター、宿主細胞ならびに組換え法および合成法もまた提供される。本発明はさらに、これらの新規ＥＣＭポリペプチドに関する障害を診断、処置、予防、および／または予測するために有用な診断法および治療法に関する。本発明はさらに、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドのアゴニストおよびアンタゴニストを同定するためのスクリーニング法に関する。本発明はさらに、本発明のポリペプチドの産生および機能を阻害するための方法および／または組成物に関する。
【０００２】
（発明の背景）
組織中で組織化された細胞は、通常、分泌された細胞外高分子（総称的に、細胞外マトリックスとして公知）の複雑なネットワークに接触している。この細胞外高分子（細胞外マトリックス）は、繊維性コラーゲンタンパク質、ヒアルロン酸、ヘパラン硫酸プロテオグリカン（ＨＳＧＰ）、ならびに他のポリサッカライド（多糖類）およびプロテオグリカンの異なる組み合わせから構成される。この細胞外マトリックスは、環境内の自己分泌、パラ分泌、およびジャクスタクリンの特性を通じて、構造的支持、組織同一性、および組織化された格子（この中で細胞は移動し、そして互いに相互作用する）を提供する（ＭｃＧｏｗａｎ、Ｓ．Ｅ．，ＦＡＳＥＢ　Ｊ．，６：２８９５〜２９０４（１９９２））。
【０００３】
細胞外マトリックスタンパク質は、細胞外マトリックス形成、細胞接着、細胞シグナル伝達、骨鉱化、炎症性応答、胚形成の調節、組織分化および／または成熟（例えば、肺の発達における気道の分枝）、組織分解、および細胞極性の樹立の調節において役割を果たすと考えられる（ＭｃＧｏｗａｎ、Ｓ．Ｅ．（１９９２）；Ｆｒａｎｃｏｍａｎｏ，Ｃ．Ａ．ら、Ｃｕｒｒ．Ｏｐｉｎ．Ｇｅｎｅｔ．Ｄｅｖ．６：３０１〜３０８（１９９６）；Ｒｏｍａｎ，Ｊ．，Ｉｍｍｕｎｏｌ．Ｒｅｓ．，１５：１６３〜１７８（１９９６）；Ｂｈａｌｅｒａｏ，Ｊら．，Ｊ　Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．，２７０：１６３８５〜３９４（１９９５））。
【０００４】
実証されたように、細胞外マトリックスタンパク質およびその相互作用は、身体中の器官、組織、および支持構造の発達および維持において重要な役割を果たす。細胞外マトリックスタンパク質に関与する機能不全は、広範な種々の障害（例えば、癌転移、および関節炎を含む炎症性障害など）を生じ得る。
【０００５】
細胞外マトリックスの維持、機能、および分解に関与すると考えられるタンパク質ファミリーの例としては、シンデカン（ｓｙｎｄｅｃａｎ）、ヘパラナーゼ、インテグリン、オステオポンチン（ｏｓｔｅｏｐｏｎｔｉｎ）、リンク（ｌｉｎｋ）、カドヘリン、ラミニン型ＥＧＦ、レクチン、フィブロネクチン、ノッチ、およびマトリキシンが挙げられる。これらのタンパク質（マトリックスタンパク質）およびこれらの機能不全に関連する疾患のいくつかの記載は以下のとおりである。
【０００６】
（インテグリン）
インテグリンは、細胞外マトリックスに対する細胞の接着に関与するレセプターとして働く（そして、細胞間相互作用のメディエーターとして機能する）細胞表面糖タンパク質のファミリーである。インテグリンおよび異種二量体（αサブユニットおよびβサブユニットを含む）は、代表的に、細胞外ドメイン、膜貫通ドメインおよび小さい細胞質テールから構成される（Ａｐｌｉｎ，Ａ．Ｅ．ら、Ｐｈａｒｍ．Ｒｅｖ．，５０：１９７〜２６３（１９９８））。形成する特定のインテグリン異種二量体は、それが結合するリガンドに依存する。これらのレセプターに対する代表的なリガンドは、コラーゲン、ラミニン、フィブロネクチン、またはビトロネクチンのような大きい細胞外マトリックスタンパク質である。
【０００７】
インテグリンは、細胞マトリックス接着接合部に位置し、ここでインテグリンは、細胞外マトリックスを、限局性接触を通じてアクチン細胞骨格に、または半接着斑（ヘミデソモソーム）を通じて中間繊維性細胞骨格に、のいずれかに接触させ得る。限局性接触または半接着斑でのインテグリンの細胞外ドメインは、細胞外マトリックスのタンパク質成分に結合すると考えられるが、その細胞内ドメインは、接着タンパク質の複合体を介して対応する細胞骨格に間接的に結合する。
【０００８】
これらのレセプターの細胞外部分に対する、低分子、短いペプチド、または抗体のようなアンタゴニストは、インテグリンが役割を果たし得ると考えられる多数の疾患（例えば、凝固障害、炎症および／または癌）の効果を排除、および／または予防するのに有用であると考えられる。これらの役割とは別に、インテグリンはまた、シグナル伝達において機能すると考えられる。
【０００９】
明確に、新規なインテグリンタンパク質、および／またはその対応するサブユニットの同定、および／または特徴づけは、可能性としては、広範な種々の疾患および／または障害（例えば、水疱形成障害、異常な創傷治癒、骨粗しょう症、アテローム性動脈硬化症、関節炎、凝固障害、炎症、および癌）において適用を有する。
【００１０】
従って、新規なインテグリンタンパク質を同定および開発する明確な必要性が存在する。構造的に関連するが、このようなタンパク質は、種々の細胞および組織型において多用でかつ多面的な機能を保有し得る。本発明の精製されたインテグリンタンパク質は、細胞遊走、細胞外マトリックスモデリング、および創傷治癒、ならびにそれらの調節に関与するさらなる分子の同定、特徴づけ、および精製に検索ツールとして有用である。さらに、新しいインテグリンコード遺伝子の同定により、核酸レベルおよびタンパク質レベルで誘導体、アゴニスト、およびアンタゴニストの範囲の開発が可能になる。これらが次に、広範な範囲の状態（例えば、異常な創傷治癒、水疱形成障害、骨粗しょう症、アテローム性動脈硬化症、関節炎、凝固障害、炎症および癌）の処置および診断において適用を有する。
【００１１】
（カドヘリン）
カドヘリンは、カルシウム依存性の同型の細胞間接着分子のファミリーである。立体配置的に、カドヘリンファミリーのメンバーは、この分子の細胞外部分に５つの並列の外部カドヘリン反復、単一の膜貫通ドメイン、および約１５０アミノ酸を含む細胞質テールを含むと考えられる（Ａｐｌｉｎ、Ａ．Ｅ．ら、Ｐｈａｒｍ　Ｒｅｖ．５０：１９７〜２６３（１９９８））。
【００１２】
カドヘリンは、細胞間接着および相互作用において主な役割を果たすと考えられる。カドヘリンは、接着接合部またはベルトと名づけられた、細胞間接着の特定の部位に局在化され、ここでカドヘリンは、細胞内接着タンパク質（αカテニン、βカテニンおよびγカテニン、ビンキュリン、およびαアクチニンを含む）との相互作用を通じてアクチン含有細胞骨格との結合を確立し得る。あるいは、カドヘリンのサブファミリーは、デスモグレインおよびデスモコリンによって示され、デスモソーム（接着斑）に局在し、ここで、これらは、プラコグロビン（ｐｌａｋｏｇｌｏｂｉｎ）のような接着タンパク質を通じて中間線維への細胞内結合を形成する。カドヘリン媒介細胞間接着は、逆平行の「ジッパー」型の組織化を含み、ここで１つの細胞表面におけるカドヘリン分子のＮ末端は、反対側の細胞表面上の等価な二量体と相互作用する一連の固定二量体（ｒｉｇｉｄ　ｄｉｍｅｒ）を形成する、と考えられる（Ａｐｌｉｎ，Ａ．Ｅ．ら、Ｐｈａｒｍ．Ｒｅｖ．５０：１９７〜２６３（１９９８））。
【００１３】
カドヘリンの発現または機能の損失は、重篤な病態生理学的な障害を生じ得る。例えば、Ｅカドヘリンの損失および変異は、上皮腫瘍の悪性の侵襲性の表現型の進行に関与すると考えられる。
【００１４】
明確に、新規なカドヘリンタンパク質の同定および／または特徴づけは、可能性として、広範な種々の疾患および／または障害（例えば、骨粗しょう症、アテローム性動脈硬化症、関節炎、凝固障害、炎症、および癌）、において適用を有する。
【００１５】
従って、新規なカドヘリンタンパク質を同定および開発する明確な必要性が存在する。構造的に関連するが、このようなタンパク質は、種々の細胞および組織型において多用でかつ多面的な機能を保有し得る。本発明の精製されたカドヘリンタンパク質は、細胞遊走、細胞外マトリックスモデリング、および創傷治癒、ならびにそれらの調節に関与するさらなる分子の同定、特徴づけ、および精製のための検索ツールとして有用である。さらに、新しいカドヘリンコード遺伝子の同定により、核酸レベルおよびタンパク質レベルで誘導体、アゴニスト、およびアンタゴニストの範囲の開発が可能になる。これらが次に、広範な範囲の状態（例えば、異常な創傷治癒、骨粗しょう症、アテローム性動脈硬化症、関節炎、凝固障害、炎症および癌）の処置および診断において適用を有する。
【００１６】
（ヘパラナーゼ）
ヘパラン硫酸プロテオグリカン（ＨＳＧＰ）は、細胞外マトリックスにわたって分布しており、ここでそれらは、細胞外マトリックス成分、細胞接着、および移動運動の自己アセンブリおよび不安定性において役割を果たすと考えられる（Ｖｌｏｄａｖｓｋｙ，Ｉら、Ｎａｔ．Ｍｅｄ．，５：７９３〜８０２（１９９９））。ＨＳＧＰは、内皮下基底膜における毛細血管に見出され、ここで血管内皮に対して支持の役割を、そして毛細血管壁の構造に対して安定性を提供する。従って、ヘパラン硫酸の切断は、血液由来細胞の遊離に必須である。ヘパラナーゼとして公知のヘパラン硫酸分解エンドグリコシダーゼは、ヒトにおいて同定されている（Ｖｌｏｄａｖｓｋｙ，Ｉ．ら（１９９９））。
【００１７】
ヒトヘパラナーゼタンパク質は、転移性細胞株ならびに、乳房、結腸、および肝臓の癌腫の標品において優先的に発現された。従って、ヘパラナーゼは、おそらく、例えば、ヘパラン硫酸の分解を通じて、転移性癌腫を促進するのに役割を果たすと考えられる。従って、ヘパラナーゼ様タンパク質に対する抗体は、特に、癌細胞の移動を防止することによって転移性癌腫が、身体の局所領域および遠位領域に伝播することを防止および／または処置するのに有用であり得る。
【００１８】
明確に、新規なヘパラナーゼタンパク質の同定および／または特徴づけは、可能性として、広範な種々の疾患および／または障害（例えば、転移性の癌）において適用を有する。
【００１９】
従って、新規なヘパラナーゼタンパク質を同定および開発する明確な必要性が存在する。構造的に関連するが、このようなタンパク質は、種々の細胞および組織型において多用でかつ多面的な機能を保有し得る。本発明の精製されたヘパラナーゼタンパク質は、転移性癌に関与するさらなる分子の同定、特徴づけ、および精製のための検索ツールとして有用である。さらに、新しいヘパラナーゼコード遺伝子の同定により、核酸レベルおよびタンパク質レベルで誘導体、アゴニスト、および特にアンタゴニストの範囲の開発が可能になる。これらが次に、広範な範囲の状態（例えば、転移性癌）の処置および診断において適用を有する。
【００２０】
（発明の要旨）
本発明は、配列表に開示されたおよび／または表１に記載されかつＡｍｅｒｉｃａｎ　Ｔｙｐｅ　Ｃｕｌｔｕｒｅ　Ｃｏｌｌｅｃｔｉｏｎ（ＡＴＣＣ）に寄託されたヒトｃＤＮＡプラスミドに含まれるポリヌクレオチド配列を含むか、あるいはこれらからなる単離された核酸分子を含む。これらの核酸分子のフラグメント、改変体および誘導体はまた、本発明によって含まれる。本発明はまた、ＥＣＭポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含むかあるいはこれらからなる単離された核酸分子を含む。本発明はさらに、これらのポリヌクレオチドによってコードされるＥＣＭポリペプチドを含む。配列表に開示されたおよび／または表１に記載されかつＡＴＣＣに寄託されたヒトｃＤＮＡプラスミドによってコードされるＥＣＭポリペプチドを含むか、あるいはこれらからなるアミノ酸配列をさらに提供する。これらのポリペプチドに結合する抗体もまた、本発明によって含まれる。これらのアミノ酸配列のポリペプチドフラグメント、改変体および誘導体はまた、これらのポリペプチドをコードするポリヌクレオチドおよびこれらのポリペプチドに結合する抗体と同様に、本発明によって含まれる。
【００２１】
（詳細な説明）
（表）
表１は、本願に関するＡＴＣＣ寄託物、ＡＴＣＣ寄託日、およびＡＴＣＣで作製された寄託物のＡＴＣＣ受託番号を要約する。表１はさらに、ｃＤＮＡクローン識別因子、このｃＤＮＡクローン識別因子に含まれるベクターの型、ヌクレオチド配列識別因子番号、開示された配列に含まれるヌクレオチド、開示された配列の開始コドンの５’ヌクレオチドの位置、アミノ酸配列識別因子の番号、および開示された配列によってコードされるＯＲＦの最終アミノ酸を含む、以下に記載の各々の「遺伝子番号」に関する情報を要約する。
【００２２】
表２は、公開ＥＳＴを示し、これらの公開ＥＳＴ配列のいずれか１つ以上の少なくとも１、２、３、４、５、１０以上は本発明の特定の実施形態から必要に応じて抽出される。
【００２３】
表３は、表１に開示されるクローンに対応するポリヌクレオチドの発現プロフィールを要約する。第１列は、独特のクローン識別因子を提供し、ｃＤＮＡクローンについての「クローンＩＤ番号：Ｖ」は、表１に開示された各々のコンティグ（ｃｏｎｔｉｇ）配列に関する。列（ｃｏｌｕｍｎ）２の「ライブラリーコード」は、本発明のポリヌクレオチドを発現する組織および／または細胞株のライブラリーの発現プロフィールを示す。２列目の各ライブラリーコードは、表４に提供されるライブラリーコードおよびライブラリーの記載に対応する組織／細胞の供給源識別因子コードを示す。これらのポリヌクレオチドの発現は、試験された他の組織および／または細胞のライブラリーでは観察されなかった。当業者は、対応する本発明のポリヌクレオチドの優位な発現パターンを示す組織を同定するためにか、または優位なおよび／または特異的な組織発現を示すポリヌクレオチドを同定するためにこの情報を通常使用し得た。
【００２４】
表４第１列は、表３第２列に開示されるライブラリーコードを提供する。２列目は、対応するライブラリーが由来する組織または細胞の供給源の記載を提供する。疾患組織に対応するライブラリーコードは、用語「疾患」を有する列３に示される。列３における用語「疾患」の使用は、制限的なものではない。ライブラリーの組織供給源は、特異的（例えば、新生物）であるか、または疾患関連性（例えば、疾患器官の正常な部分由来の組織サンプル）であり得る。さらに、「疾患」の表示を欠くライブラリーは、なお疾患状態または障害に直接的または間接的に関与する供給源に由来し得、従って、その疾患状態または障害におけるさらなる有用性を有し得る。
【００２５】
（定義）
以下の定義は、本明細書全体を通して使用される特定の用語の理解を容易にするために提供される。
【００２６】
本発明において、「単離された（単離した）」とは、その本来の環境（例えば、それが天然に存在する場合は天然の環境）から取り出された物質をいい、したがって、その天然の状態から「人間の手によって」変更されている。例えば、単離されたポリヌクレオチドは、ベクターまたは組成物の一部であり得るか、あるいは細胞中に含まれ得、そしてなお「単離されている」状態であり得る。なぜなら、そのベクター、組成物、または特定の細胞は、そのポリヌクレオチドの本来の環境ではないからである。用語「単離された」は、ゲノムライブラリーまたはｃＤＮＡライブラリー、細胞全体の総ＲＮＡ調製物またはｍＲＮＡ調製物、ゲノムＤＮＡ調製物（電気泳動により分離され、そしてブロットへトランスファーされたものを含む）、剪断された細胞全体のゲノムＤＮＡ調製物をも、本発明のポリヌクレオチド／配列の識別する特徴がないことが当該分野で示されている他の組成物をもいわない。
【００２７】
本明細書中で使用される場合、「ポリヌクレオチド」とは、（表１の第５列に記載にされる）配列番号Ｘ（ＳＥＱ　ＩＤ　ＮＯ：Ｘ）に含まれる核酸配列を有する分子、または（表１の第２列に記載され、そしてＡＴＣＣ寄託番号Ｚ中のＡＴＣＣに寄託されたプラスミドのプール内に含まれる）ｃＤＮＡプラスミドＶをいう。例えば、このポリヌクレオチドは、５’および３’非翻訳配列、天然または人工のシグナル配列を伴うかまたは伴わないコード領域、タンパク質コード領域、ならびにこの核酸配列のフラグメント、エピトープ、ドメイン、および改変体を含む、全長ｃＤＮＡ配列のヌクレオチド配列を含み得る。さらに、本明細書で使用される場合、「ポリペプチド」とは、広く定義される本発明のポリヌクレオチド（ｃＤＮＡに対応する配列のポリＡテールの翻訳から生じるポリフェニルアラニンペプチド配列もポリリジンペプチド配列も明らかに除く）によってコードされるアミノ酸配列を有する分子をいう。
【００２８】
本発明では、配列番号Ｘの配列を含む代表的プラスミドが、Ａｍｅｒｉｃａｎ　Ｔｙｐｅ　Ｃｕｌｔｕｒｅ　Ｃｏｌｌｅｃｔｉｏｎ（「ＡＴＣＣ」）に寄託され、そしてまたは表１に記載されている。表１に示すように、各プラスミドは、ｃＤＮＡクローンＩＤ（識別番号）およびＡＴＣＣ受託番号（ＡＴＣＣ受託番号Ｚ）によって同定される。単一の寄託物としてプールし寄託したプラスミドは、同じＡＴＣＣ受託番号を有する。ＡＴＣＣは、１０８０１　Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ　Ｂｏｕｌｅｖａｒｄ，Ｍａｎａｓｓａｓ，Ｖｉｒｇｉｎｉａ　２０１１０−２２０９，ＵＳＡに位置する。ＡＴＣＣ寄託は、特許手続上の微生物の寄託の国際的承認に関するブダペスト条約の条項に拠って行われた。
【００２９】
本発明の「ポリヌクレオチド」はまた、ストリンジェントなハイブリダイゼーション条件下で、配列番号Ｘに含まれる配列、またはその相補体（例えば、本明細書中に記載されるポリヌクレオチドフラグメントのうちのいずれか１つ、２つ、３つ、４つ以上の相補体）、および／またはｃＤＮＡプラスミドＶに含まれる配列（例えば、本明細書中に記載されるポリヌクレオチドフラグメントのうちのいずれか１つ、２つ、３つ、４つ以上の相補体）にハイブリダイズし得るポリヌクレオチドを含む。「ストリンジェントなハイブリダイゼーション条件」とは、５０％ホルムアミド、５×ＳＳＣ（７５０ｍＭ　ＮａＣｌ、７５ｍＭクエン酸三ナトリウム）、５０ｍＭリン酸ナトリウム（ｐＨ７．６）、５×デンハルト溶液、１０％デキストラン硫酸、および２０μｇ／ｍｌ変性剪断サケ精子ＤＮＡを含む溶液中での４２℃での一晩のインキュベーション、続いて０．１×ＳＳＣ中で約６５℃にてフィルターを洗浄することをいう。
【００３０】
本発明の「ポリヌクレオチド」には、より低いストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件で本発明のポリヌクレオチドにハイブリダイズする核酸分子もまた含まれる。ハイブリダイゼーションのストリンジェンシーおよびシグナル検出の変更は、主として、ホルムアミド濃度（より低い百分率のホルムアミドが、低下したストリンジェンシーを生じる）；塩条件、または温度の操作を通じて達成される。例えば、より低いストリンジェンシー条件は、６×ＳＳＰＥ（２０×ＳＳＰＥ＝３Ｍ　ＮａＣｌ；０．２Ｍ　ＮａＨ２ＰＯ４；０．０２Ｍ　ＥＤＴＡ、ｐＨ７．４）、０．５％　ＳＤＳ、３０％ホルムアミド、１００μｇ／ｍｌサケ精子ブロッキングＤＮＡを含む溶液中、３７℃で一晩のインキュベーション；次いで１×ＳＳＰＥ、０．１％　ＳＤＳを用いた５０℃での洗浄を含む。さらに、さらにより低いストリンジェンシーを達成するために、ストリンジェントなハイブリダイゼーション後に行われる洗浄は、より高い塩濃度（例えば、５×ＳＳＣ）で行われ得る。
【００３１】
上記の条件におけるバリエーションが、ハイブリダイゼーション実験においてバックグラウンドを抑制するために使用される代替的なブロッキング試薬の含有および／または置換によって達成され得ることに留意のこと。代表的なブロッキング試薬としては、デンハルト試薬、ＢＬＯＴＴＯ、ヘパリン、変性サケ精子ＤＮＡ、および市販の特許処方物が挙げられる。特異的ブロッキング試薬の含有は、適合性の問題に起因して、上記のハイブリダイゼーション条件の改変を必要とし得る。
【００３２】
もちろん、ポリＡ＋配列（例えば、配列表に示されるｃＤＮＡの任意の３’末端ポリＡ＋領域（ｔｒａｃｔ））に、またはＴ（もしくはＵ）残基の相補的ストレッチにのみハイブリダイズするポリヌクレオチドは、「ポリヌクレオチド」の定義に包含されない。なぜなら、このようなポリヌクレオチドは、ポリ（Ａ）ストレッチまたはその相補体を含む任意の核酸分子（例えば、プライマーとしてオリゴｄＴを用いて生成される、事実上任意の二本鎖ｃＤＮＡクローン）にハイブリダイズするからである。
【００３３】
本発明のポリヌクレオチドは、任意のポリリボヌクレオチドまたはポリデオキシリボヌクレオチドから構成され得、これは、非改変ＲＮＡもしくは非改変ＤＮＡまたは改変ＲＮＡもしくは改変ＤＮＡであり得る。例えば、ポリヌクレオチドは、一本鎖および二本鎖のＤＮＡ、一本鎖領域と二本鎖領域との混合物であるＤＮＡ、一本鎖および二本鎖のＲＮＡ、ならびに一本鎖領域と二本鎖領域との混合物であるＲＮＡ、一本鎖、またはより代表的には二本鎖もしくは一本鎖領域と二本鎖領域との混合物であり得るＤＮＡおよびＲＮＡを含むハイブリッド分子から構成され得る。さらに、このポリヌクレオチドは、ＲＮＡもしくはＤＮＡまたはＲＮＡおよびＤＮＡの両方を含む、三本鎖領域から構成され得る。ポリヌクレオチドはまた、安定性のために、または他の理由のために改変された、１つ以上の改変された塩基またはＤＮＡ骨格もしくはＲＮＡ骨格を含み得る。「改変された」塩基としては、例えば、トリチル化された塩基およびイノシンのような普通でない塩基が挙げられる。種々の改変が、ＤＮＡおよびＲＮＡに対して行われ得；したがって、「ポリヌクレオチド」は、化学的、酵素的、または代謝的に改変された形態を含む。
【００３４】
特定の実施形態において、本発明のポリヌクレオチドは、少なくとも１５、少なくとも３０、少なくとも５０、少なくとも１００、少なくとも１２５、少なくとも５００または少なくとも１０００個連続するヌクレオチドであるが、長さが３００ｋｂ、２００ｋｂ、１００ｋｂ、５０ｋｂ、１５ｋｂ、１０ｋｂ、７．５ｋｂ、５ｋｂ、２．５ｋｂ、２．０ｋｂまたは１ｋｂ以下である。さらなる実施形態において、本発明のポリヌクレオチドは、本明細書において開示されるようなコード配列の一部を含むが、任意のイントロンの全てまたは一部を含まない。別の実施形態において、コード配列を含むポリヌクレオチドは、ゲノム隣接遺伝子（すなわち、ゲノム中の目的の遺伝子に対してゲノムにおいて５’側または３’側）のコード配列を含まない。他の実施形態では、本発明のポリヌクレオチドは、１０００、５００、２５０、１００、５０、２５、２０、１５、１０、５、４、３、２、または１より多いゲノム隣接遺伝子のコード配列を含まない。
【００３５】
「配列番号Ｘ（ＳＥＱ　ＩＤ　ＮＯ：Ｘ）」とは、表１の第５列に記載されるポリヌクレオチド配列をいい、一方、「配列番号Ｙ」とは、表１の第１０列に記載されるポリペプチド配列をいう。配列番号Ｘは、表１の第６列において特定される整数によって同定される。ポリペプチド配列の配列番号Ｙは、ポリヌクレオチド配列番号Ｘによってコードされる、翻訳されるオープンリーディングフレーム（ＯＲＦ）である。ポリヌクレオチド配列は配列表に示され、すぐ後にすべてのポリペプチド配列が続く。従って、ポリヌクレオチド配列の配列番号２に対応するポリペプチド配列は、配列表に示される最初のポリペプチド配列である。以下、第２のポリペプチド配列は、配列番号３に示されるようなポリヌクレオチド配列に対応する、などとなる。
【００３６】
本発明のポリペプチドは、ペプチド結合または改変されたペプチド結合、すなわち、ペプチドアイソスター（ｉｓｏｓｔｅｒｅ）によって互いに連結したアミノ酸から構成され得、そして遺伝子がコードする２０個のアミノ酸以外のアミノ酸を含み得る。このポリペプチドは、翻訳後プロセシングのような天然のプロセスによって、または当該技術分野で周知の化学改変技術によってのいずれかで、改変され得る。このような改変は、基本書、およびより詳細な研究論文、ならびに多くの研究文献に十分記載される。改変は、ペプチド骨格、アミノ酸側鎖、およびアミノ末端またはカルボキシル末端を含む、ポリペプチドのどこにでも生じ得る。同じ型の改変が、所定のポリペプチド中のいくつかの部位で同じまたは種々の程度で存在し得ることが理解される。また、所定のポリペプチドは多くの型の改変を含み得る。ポリペプチドは、例えば、ユビキチン化の結果として分枝状であり得、そしてポリペプチドは、分枝を含むかまたは含まない、環状であり得る。環状、分枝状および分枝した環状のポリペプチドは、天然の翻訳後プロセスから生じ得るか、または合成方法によって作製され得る。改変としては、アセチル化、アシル化、ＡＤＰ−リボシル化、アミド化、フラビンの共有結合、ヘム部分の共有結合、ヌクレオチドまたはヌクレオチド誘導体の共有結合、脂質または脂質誘導体の共有結合、ホスファチジルイノシトール（ｐｈｏｓｐｈｏｔｉｄｙｌｉｎｏｓｉｔｏｌ）の共有結合、架橋、環化、ジスルフィド結合形成、脱メチル化、共有結合架橋の形成、システインの形成、ピログルタメートの形成、ホルミル化、γ−カルボキシル化、グリコシル化、ＧＰＩアンカー形成、水酸化、ヨウ素化、メチル化、ミリストイル化、酸化、ペグ化（ｐｅｇｙｌａｔｉｏｎ）、タンパク質分解プロセシング、リン酸化、プレニル化、ラセミ化、セレノイル化、硫酸化、アルギニル化のような、タンパク質へのアミノ酸のトランスファーＲＮＡ媒介付加、およびユビキチン化が挙げられる。（例えば、ＰＲＯＴＥＩＮＳ−ＳＴＲＵＣＴＵＲＥ　ＡＮＤ　ＭＯＬＥＣＵＬＡＲ　ＰＲＯＰＥＲＴＩＥＳ，第２版，Ｔ．Ｅ．Ｃｒｅｉｇｈｔｏｎ，Ｗ．Ｈ．Ｆｒｅｅｍａｎ　ａｎｄ　Ｃｏｍｐａｎｙ，Ｎｅｗ　Ｙｏｒｋ（１９９３）；ＰＯＳＴＴＲＡＮＳＬＡＴＩＯＮＡＬ　ＣＯＶＡＬＥＮＴ　ＭＯＤＩＦＩＣＡＴＩＯＮ　ＯＦ　ＰＲＯＴＥＩＮＳ，Ｂ．Ｃ．Ｊｏｈｎｓｏｎ編，Ａｃａｄｅｍｉｃ　Ｐｒｅｓｓ，Ｎｅｗ　Ｙｏｒｋ，１−１２頁（１９８３）；Ｓｅｉｆｔｅｒら，Ｍｅｔｈ　Ｅｎｚｙｍｏｌ　１８２：６２６−６４６（１９９０）；Ｒａｔｔａｎら，Ａｎｎ　ＮＹ　Ａｃａｄ　Ｓｃｉ　６６３：４８−６２（１９９２）を参照のこと）。
【００３７】
本発明のポリペプチドは、任意の適切な様式で調製され得る。このようなポリペプチドには、天然に存在する単離されたポリペプチド、組換え的に産生されたポリペプチド、合成的に産生されたポリペプチド、またはこれらの方法の組み合わせによって産生されたポリペプチドが含まれる。このようなポリペプチドを調製するための手段は、当該分野で十分に理解されている。
【００３８】
そのポリペプチドは、分泌タンパク質の形態（成熟型を含む）であり得るか、またはより大きなタンパク質（例えば、融合タンパク質（以下を参照のこと））の一部であり得る。さらなるアミノ酸配列を含むことは、しばしば有利である。このアミノ酸配列としては、分泌配列またはリーダー配列、プロ配列、精製を補助する配列（例えば、複数のヒスチジン残基）、または組換え産生の間の安定性のためのさらなる配列が挙げられる。
【００３９】
本発明のポリペプチドは、好ましくは、単離された形態で提供され、そして好ましくは実質的に精製される。ポリペプチドの組換え的に産生されたバージョン（分泌ポリペプチドを含む）は、本明細書中に記載されるかまたはさもなくば当該分野で公知の技術を使用して（例えば、ＳｍｉｔｈおよびＪｏｈｎｓｏｎ、Ｇｅｎｅ　６７：３１−４０（１９８８）において記載される１段階方法によって）、実質的に精製され得る。本発明のポリペプチドはまた、本明細書中に記載されるかまたはさもなくば当該分野で公知の技術（例えば、当該分野において周知である方法において本発明のポリペプチドに対して惹起された本発明の抗体）を使用して、天然の、合成の、または組換えの供給源から精製され得る。
【００４０】
「機能的活性」を示すポリペプチドとは、本発明の全長（完全）タンパク質に関連する１以上の既知の機能的活性を示し得るポリペプチドを意味する。このような機能的活性としては、生物学的活性、抗原性［抗ポリペプチド抗体に結合（または結合についてポリペプチドと競合）する能力］、免疫原性（本発明の特定のポリペプチドに結合する抗体を生成する能力）、本発明のポリペプチドとマルチマーを形成する能力、およびポリペプチドについてのレセプターまたはリガンドに結合する能力が挙げられるがこれらに限定されない。
【００４１】
「機能的活性を有するポリペプチド」とは、特定のアッセイ（例えば、生物学的アッセイ）において測定した場合に、用量依存性ありまたはなしで、本発明のポリペプチドの活性と類似の活性であるが、その活性と必ずしも同一でない活性を示すポリペプチド（成熟型を含む）をいう。用量依存性が存在する場合、用量依存性は、そのポリペプチドの用量依存性と同一である必要はなく、むしろ本発明のポリペプチドと比較した場合の所定の活性における用量依存性と実質的に類似である（すなわち、候補ポリペプチドは、本発明のポリペプチドと比較してより高い活性、または約１／２５以上、好ましくは１／１０以上、そして最も好ましくは、約１／３以上の活性を示す）。
【００４２】
そのポリペプチド、ならびにそのフラグメント、改変体、誘導体、およびアナログの機能的活性は、種々の方法によってアッセイされ得る。
【００４３】
例えば、全長ポリペプチドに対する抗体の結合について本発明の全長ポリペプチドと結合または競合する能力についてアッセイする１つの実施形態において、当該分野で公知の種々のイムノアッセイが使用され得、これらのアッセイ系としては、ラジオイムノアッセイ、ＥＬＩＳＡ（酵素結合免疫吸着アッセイ）、「サンドウィッチ」イムノアッセイ、イムノラジオメトリックアッセイ、ゲル拡散沈降反応、免疫拡散アッセイ、インサイチュイムノアッセイ（例えば、コロイド状金、酵素標識または放射性同位元素標識を使用する）、ウェスタンブロット、沈降反応、凝集アッセイ（例えば、ゲル凝集アッセイ、血球凝集アッセイ）、補体結合アッセイ、免疫蛍光アッセイ、プロテインＡアッセイ、および免疫電気泳動アッセイなどのような技術を使用する競合的および非競合的アッセイ系が挙げられるがこれらに限定されない。１つの実施形態において、抗体結合は、一次抗体上の標識を検出することにより検出される。別の実施形態において、一次抗体は、一次抗体に対する二次抗体または試薬の結合を検出することによって検出される。さらなる実施形態において、二次抗体が標識される。イムノアッセイにおける結合を検出するための多くの手段が当該分野において公知であり、そして本発明の範囲内にある。
【００４４】
別の実施形態では、リガンドが同定される場合、または本発明のポリペプチドフラグメント、改変体、または誘導体が多量体化する能力が評価される場合、結合が、例えば、還元および非還元ゲルクロマトグラフィー、タンパク質アフィニティークロマトグラフィー、ならびにアフィニティーブロッティングのような当該分野で周知の手段によって、アッセイされ得る。一般には、Ｐｈｉｚｉｃｋｙ、Ｅ．ら、Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌ．Ｒｅｖ．５９：９４−１２３（１９９５）を参照のこと。別の実施形態では、その基質への本発明のポリヌクレオチドの生理学的相関（シグナル伝達）がアッセイされ得る。
【００４５】
さらに、本明細書中に記載のアッセイ（例えば、実施例を参照のこと）および当該分野で公知の他のアッセイは、本発明のポリペプチドおよびそれらのフラグメント、改変体、誘導体、およびアナログが、ポリペプチドに関連した生物学的活性（インビトロまたはインビボのいずれかで）を惹起する能力を測定するために、慣用的に適用され得る。他の方法は当業者に公知であり、そして、本発明の範囲内である。
【００４６】
（本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチド）
（遺伝子番号１によってコードされるタンパク質の特徴）
本願の目的のために、この遺伝子およびその対応する翻訳産物は、ヘパラナーゼ様遺伝子およびヘパラナーゼ様タンパク質として公知である。ヘパラナーゼ様遺伝子に対応する翻訳産物は、哺乳動物のヘパラナーゼと配列相同性を共有する（Ｇｅｎｂａｎｋ登録番号ＡＡＤ４１３４２を参照のこと）。このタンパク質は、新脈管形成の調節において、組織修復において、脂質代謝において、癌転移において、ヘパラン硫酸分解において、そして細胞外マトリックス分解において、役割を果たすと考えられる。これらの２つのタンパク質のい間の相同性に基づいて、これらのタンパク質は、少なくともいくつかの生物学的活性を共有すると考えられる。
【００４７】
従って、ヘパラナーゼ様遺伝子に対応する翻訳産物に対する抗体または低分子のようなアンタゴニストは、これらの活性を防止および／または排除するのに有用である。さらなる非排他的実施形態において、本発明のポリペプチドは、ヘパラナーゼ様タンパク質の成熟形態の以下のアミノ酸配列を含むか、あるいはそれらのアミノ酸配列から構成される：
ＧＤＲＲＰＬＰＶＤＲＡＡＧＬＫＥＫＴＬＩＬＬＤＶＳＴＫＮＰＶＲＴＶＮＥＮＦＬＳＬＱＬＤＰＳＩＩＨＤＧＷＬＤＦＬＳＳＫＲＬＶＴＬＡＲＧＬＳＰＡＦＬＲＦＧＧＫＲＴＤＦＬＱＦＱＮＬＲＮＰＡＫＳＲＧＧＰＧＰＤＹＹＬＫＮＹＥＤＥＰＮＮＹＲＴＭＨＧＲＡＶＮＧＳＱＬＧＫＤＹＩＱＬＫＳＬＬＱＰＩＲＩＹＳＲＡＳＬＹＧＰＮＩＧＲＰＲＫＮＶＩＡＬＬＤＧＦＭＫＶＡＧＳＴＶＤＡＶＴＷＱＨＣＹＩＤＧＲＶＶＫＶＭＤＦＬＫＴＲＬＬＤＴＬＳＤＱＩＲＫＩＱＫＶＶＮＴＹＴＰＧＫＫＩＷＬＥＧＶＶＴＴＳＡＧＧＴＮＮＬＳＤＳＹＡＡＧＦＬＷＬＮＴＬＧＭＬＡＮＱＧＩＤＶＶＩＲＨＳＦＦＤＨＧＹＮＨＬＶＤＱＮＦＮＰＬＰＤＹＷＬＳＬＬＹＫＲＬＩＧＰＫＶＬＡＶＨＶＡＧＬＱＲＫＰＲＰＧＲＶＩＲＤＫＬＲＩＹＡＨＣＴＮＨＨＮＨＮＹＶＲＧＳＩＴＬＦＩＩＮＬＨＲＳＲＫＫＩＫＬＡＧＴＬＲＤＫＬＶＨＱＹＬＬＱＰＹＧＱＥＧＬＫＳＫＳＶＱＬＮＧＱＰＬＶＭＶＤＤＧＴＬＰＥＬＫＰＲＰＬＲＡＧＲＴＬＶＩＰＰＶＴＭＧＦＦＶＶＫＮＶＮＡＬＡＣＲＹＲ（配列番号１２）。これらのポリペプチドをコードするポリヌクレオチドがまた、これらのポリペプチドの１つ以上に結合する抗体がそうであるように、本発明によって包含される。さらに、これらのポリペプチドのフラグメントおよび改変体（例えば、本明細書に記載のフラグメント、これらのポリペプチドに少なくとも、８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％または９９％同一であるポリペプチド、およびこれらのポリペプチドをコードするポリヌクレオチドにストリンジェントな条件下でハイブリダイズするポリヌクレオチドによりコードされるポリペプチド、またはその相補体など）がまた、本発明により包含される。本発明のこれらのフラグメントおよび改変体に結合する抗体がまた、本発明により包含される。これらのフラグメントおよび改変体をコードするポリヌクレオチドがまた、本発明により包含される。
【００４８】
本出願の目的について、ヘパラナーゼ様遺伝子のスプライシング改変体が発見されており、ヘパラナーゼ様Ｓ．Ｖ．と呼ばれる。本発明の別の実施形態は、以下のアミノ酸配列のヘパラナーゼ様Ｓ．Ｖ．を含むか、あるいはそれらから構成される：
ＭＲＶＬＣＡＦＰＥＡＭＰＳＳＮＳＲＰＰＡＣＬＡＰＧＡＬＹＬＡＬＬＬＨＬＳＬＳＳＱＡＧＤＲＲＰＬＰＶＤＲＡＡＧＬＫＥＫＴＬＩＬＬＤＶＳＴＫＮＰＶＲＴＶＮＥＮＦＬＳＬＱＬＤＰＳＩＩＨＤＧＷＬＤＦＬＳＳＫＲＬＶＴＬＡＲＧＬＳＰＡＦＬＲＦＧＧＫＲＴＤＦＬＱＦＱＮＬＲＮＰＡＫＳＲＧＧＰＧＰＤＹＹＬＫＮＹＥＤＤＩＶＲＳＤＶＡＬＤＫＱＫＧＣＫＩＡＱＨＰＤＶＭＬＥＬＱＲＥＫＡＡＱＭＨＬＶＬＬＫＥＱＦＳＮＴＹＳＮＬＩＬＴＡＲＳＬＤＫＬＹＮＦＡＤＣＳＧＬＨＬＩＦＡＬＮＡＬＲＲＮＰＮＮＳＷＮＳＳＳＡＬＳＬＬＫＹＳＡＳＫＫＹＮＩＳＷＥＬＧＮＥＰＮＮＹＲＴＭＨＧＲＡＶＮＧＳＱＬＧＫＤＹＩＱＬＫＳＬＬＱＰＩＲＩＹＳＲＡＳＬＹＧＰＮＩＧＲＰＲＫＮＶＩＡＬＬＤＧＦＭＫＶＡＧＳＴＶＤＡＶＴＷＱＨＣＹＩＤＧＲＶＶＫＶＭＤＦＬＫＴＲＬＬＤＴＬＳＤＱＩＲＫＩＱＫＶＶＮＴＹＴＰＧＫＫＩＷＬＥＧＶＶＴＴＳＡＧＧＴＮＮＬＳＤＳＹＡＡＧＦＬＷＬＮＴＬＧＭＬＡＮＱＧＩＤＶＶＩＲＨＳＦＦＤＨＧＹＮＨＬＶＤＱＮＦＮＰＬＰＤＹＷＬＳＬＬＹＫＲＬＩＧＰＫＶＬＡＶＨＶＡＧＬＱＲＫＰＲＰＧＲＶＩＲＤＫＬＲＩＹＡＨＣＴＮＨＨＮＨＮＹＶＲＧＳＩＴＬＦＩＩＮＬＨＲＳＲＫＫＩＫＬＡＧＴＬＲＤＫＬＶＨＱＹＬＬＱＰＹＧＱＥＧＬＫＳＫＳＶＱＬＮＧＱＰＬＶＭＶＤＤＧＴＬＰＥＬＫＰＲＰＬＲＡＧＲＴＬＶＩＰＰＶＴＭＧＦＦＶＶＫＮＶＮＡＬＡＣＲＹＲ（配列番号１３）。これらのポリペプチドをコードするポリヌクレオチドがまた、配列番号１５として提供される。本発明の好ましい実施形態は、以下のアミノ酸配列として配列番号１４によってコードされ、そして配列番号１３に含まれるスプライシング改変体の領域を含むか、あるいはこれからなる：ＤＩＶＲＳＤＶＡＬＤＫＱＫＧＣＫＩＡＱＨＰＤＶＭＬＥＬＱＲＥＫＡＡＱＭＨＬＶＬＬＫＥＱＦＳＮＴＹＳＮＬＩＬＴＡＲＳＬＤＫＬＹＮＦＡＤＣＳＧＬＨＬＩＦＡＬＮＡＬＲＲＮＰＮＮＳＷＮＳＳＳＡＬＳＬＬＫＹＳＡＳＫＫＹＮＩＳＷＥＬＧＮ（配列番号１４）。これらのポリペプチドをコードするポリヌクレオチドはまた、本発明によって包含され、そして配列番号１６として提供される。さらに好ましいのは、配列番号１６のポリヌクレオチド配列に対して、ストリンジェントな条件下でハイブリダイズする、配列番号１４のポリペプチドをコードするポリヌクレオチドである。
【００４９】
本発明の好ましいポリペプチドは、配列番号７において残基：Ｍｅｔ−１１〜Ａｒｇ−１７、Ｇｌｎ−４０〜Ｌｅｕ−４７、Ｇｌｙ−１１６〜Ａｓｐ−１２１、Ｌｅｕ−１２８〜Ａｓｐ−１４１、Ａｓｎ−１４６〜Ａｒｇ−１５５、Ａｓｎ−１９３〜Ｌｙｓ−１９９、Ｌｅｕ−２４５〜Ｌｙｓ−２５１、Ｐｈｅ−３１１〜Ｔｙｒ−３１６、Ｇｌｎ−３２２〜Ａｓｐ−３２９、Ｇｌｎ−３５３〜Ｇｌｙ−３５９、Ｃｙｓ−３７２〜Ａｒｇ−３８２、Ａｒｇ−３９４〜Ｉｌｅ−３９９、Ｐｒｏ−４１７〜Ｌｙｓ−４２４、および／またはＧｌｕ−４４５〜Ｇｌｙ−４５４として示されるヘパラナーゼ様タンパク質の細胞外部分のうち１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３または１４全てを含むか、あるいはこれらから構成される。これらのポリペプチドをコードするポリヌクレオチドがまた、これらのポリペプチドの１つ以上に結合する抗体がそうであるように、本発明によって包含される。さらに、これらのポリペプチドのフラグメントおよび改変体（例えば、本明細書に記載のフラグメント、これらのポリペプチドに少なくとも、８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％または９９％同一であるポリペプチド、およびこれらのポリペプチドをコードするポリペプチド、またはその相補体など）がまた、本発明により包含される。これらのフラグメントおよび改変体をコードするポリヌクレオチドがまた、本発明により包含される。
【００５０】
好ましいのは、機能的活性を示すヘパラナーゼ様タンパク質（配列番号７および／または１３）のフラグメントを含むか、あるいはこのようなフラグメントからなるポリペプチドである。機能的活性とは、全長（完全）ヘパラナーゼ様タンパク質と関連する１つ以上の既知の機能的活性を示し得るポリペプチドフラグメントを意味する。このような機能的活性としては、生物学的活性（例えば、ヘパラン分解、癌転移）、抗原性（抗ヘパラナーゼ様抗体に結合する［または結合に関してヘパラナーゼ様ポリペプチドと競合する）能力］、および免疫原性（ヘパラナーゼ様ポリペプチドに結合する抗体を生成する能力）が挙げられるがこれらに限定されない。
【００５１】
本発明は、さらに、本明細書中に記載されるポリヌクレオチド配列のフラグメントに関する。例えば、寄託されたｃＤＮＡのポリヌクレオチド配列または配列番号２に示されるヌクレオチド配列のフラグメントとは、少なくとも約１５ヌクレオチド長、そしてより好ましくは少なくとも約２０ヌクレオチド長、少なくとも約２５ヌクレオチド長、なおより好ましくは少なくとも約３０ヌクレオチド長、少なくとも約３５ヌクレオチド長、そしてなおより好ましくは少なくとも約４０ヌクレオチド長、少なくとも約４５ヌクレオチド長、少なくとも約５０ヌクレオチド長、少なくとも約６０ヌクレオチド長、少なくとも約７０ヌクレオチド長、少なくとも約８０ヌクレオチド長、少なくとも約９０ヌクレオチド長、少なくとも約１００ヌクレオチド長、少なくとも約１２５ヌクレオチド長、少なくとも約１５０ヌクレオチド長、少なくとも約１７５ヌクレオチド長の、ポリヌクレオチドフラグメントを意図し、これらは、本明細書中で議論されるような診断プローブおよびプライマーとして、有用である。もちろん、２００−１５００ヌクレオチド長のより大きなフラグメントもまた、本発明によれば有用である。なぜなら、寄託されたｃＤＮＡまたは配列番号２に示されるヌクレオチド配列の、全てでなければ大部分に対応するフラグメントであるからである。例えば、少なくとも２０ヌクレオチド長のフラグメントとは、寄託されたｃＤＮＡのヌクレオチド配列、または配列番号２に示されるヌクレオチド配列由来の２０以上の連続する塩基を含むフラグメントを意図する。この文脈において「約（おおよそ）」は、いずれかの末端かまたは両方の末端で、特に記載された大きさ、およびそれより数個（５、４、３、２、または１）のヌクレオチドだけ大きいかまたは小さな大きさを含む。本発明のポリヌクレオチドフラグメントの代表的な例としては、例えば、配列番号２またはその相補鎖、または寄託されたクローンに含まれるｃＤＮＡのおおよそ以下のヌクレオチド数の配列を含むか、あるいはそれからなるフラグメントが挙げられる：約１〜約５０、約５１〜約１００、約１０１〜約１５０、約１５１〜約２００、約２０１〜約２５０、約２５１〜約３００、約３０１〜約３５０、約３５１〜約４００、約４０１〜約４５０、約４５１〜約５００、および約５０１〜約５５０、および約５５１〜約６００、約６０１〜約６５０、約６５１〜約７００、約７０１〜約７５０、約７５１〜約８００、および約８０１〜約８６０。この文脈において、「約（おおよそ）」は、いずれかの末端もしくは両方の末端において、特に記載された範囲、およびこれより数個（５、４、３、２、または１）のヌクレオチドだけ大きいか、または小さな範囲を含む。さらなる実施形態において、本発明のポリヌクレオチドは、対応するタンパク質の機能的属性をコードする。
【００５２】
本発明の好ましいポリペプチドフラグメントは、アミノ末端もしくはカルボキシ末端またはその両方から、連続した一連の残基を欠失した分泌タンパク質を含むか、あるいはこのようなタンパク質から構成される。詳細には、ポリペプチドのＮ末端欠失は、一般式ｍ−４８０で記載され得、ここでｍは、２〜４７５の整数であり、ｍは、配列番号７に同定されるアミノ酸残基の位置に対応する。より詳細には、本発明は、配列番号７の以下の群：Ｒ−２〜Ｒ−４８０；Ｖ−３〜Ｒ−４８０；Ｌ−４〜Ｒ−４８０；Ｃ−５〜Ｒ−４８０；Ａ−６〜Ｒ−４８０；Ｆ−７〜Ｒ−４８０；Ｐ−８〜Ｒ−４８０；Ｅ−９〜Ｒ−４８０；Ａ−１０〜Ｒ−４８０；Ｍ−１１〜Ｒ−４８０；Ｐ−１２〜Ｒ−４８０；Ｓ−１３〜Ｒ−４８０；Ｓ−１４〜Ｒ−４８０；Ｎ−１５〜Ｒ−４８０；Ｓ−１６〜Ｒ−４８０；Ｒ−１７〜Ｒ−４８０；Ｐ−１８〜Ｒ−４８０；Ｐ−１９〜Ｒ−４８０；Ａ−２０〜Ｒ−４８０；Ｃ−２１〜Ｒ−４８０；Ｌ−２２〜Ｒ−４８０；Ａ−２３〜Ｒ−４８０；Ｐ−２４〜Ｒ−４８０；Ｇ−２５〜Ｒ−４８０；Ａ−２６〜Ｒ−４８０；Ｌ−２７〜Ｒ−４８０；Ｙ−２８〜Ｒ−４８０；Ｌ−２９〜Ｒ−４８０；Ａ−３０〜Ｒ−４８０；Ｌ−３１〜Ｒ−４８０；Ｌ−３２〜Ｒ−４８０；Ｌ−３３〜Ｒ−４８０；Ｈ−３４〜Ｒ−４８０；Ｌ−３５〜Ｒ−４８０；Ｓ−３６〜Ｒ−４８０；Ｌ−３７〜Ｒ−４８０；Ｓ−３８〜Ｒ−４８０；Ｓ−３９〜Ｒ−４８０；Ｑ−４０〜Ｒ−４８０；Ａ−４１〜Ｒ−４８０；Ｇ−４２〜Ｒ−４８０；Ｄ−４３〜Ｒ−４８０；Ｒ−４４〜Ｒ−４８０；Ｒ−４５〜Ｒ−４８０；Ｐ−４６〜Ｒ−４８０；Ｌ−４７〜Ｒ−４８０；Ｐ−４８〜Ｒ−４８０；Ｖ−４９〜Ｒ−４８０；Ｄ−５０〜Ｒ−４８０；Ｒ−５１〜Ｒ−４８０；Ａ−５２〜Ｒ−４８０；Ａ−５３〜Ｒ−４８０；Ｇ−５４〜Ｒ−４８０；Ｌ−５５〜Ｒ−４８０；Ｋ−５６〜Ｒ−４８０；Ｅ−５７〜Ｒ−４８０；Ｋ−５８〜Ｒ−４８０；Ｔ−５９〜Ｒ−４８０；Ｌ−６０〜Ｒ−４８０；Ｉ−６１〜Ｒ−４８０；Ｌ−６２〜Ｒ−４８０；Ｌ−６３〜Ｒ−４８０；Ｄ−６４〜Ｒ−４８０；Ｖ−６５〜Ｒ−４８０；Ｓ−６６〜Ｒ−４８０；Ｔ−６７〜Ｒ−４８０；Ｋ−６８〜Ｒ−４８０；Ｎ−６９〜Ｒ−４８０；Ｐ−７０〜Ｒ−４８０；Ｖ−７１〜Ｒ−４８０；Ｒ−７２〜Ｒ−４８０；Ｔ−７３〜Ｒ−４８０；Ｖ−７４〜Ｒ−４８０；Ｎ−７５〜Ｒ−４８０；Ｅ−７６〜Ｒ−４８０；Ｎ−７７〜Ｒ−４８０；Ｆ−７８〜Ｒ−４８０；Ｌ−７９〜Ｒ−４８０；Ｓ−８０〜Ｒ−４８０；Ｌ−８１〜Ｒ−４８０；Ｑ−８２〜Ｒ−４８０；Ｌ−８３〜Ｒ−４８０；Ｄ−８４〜Ｒ−４８０；Ｐ−８５〜Ｒ−４８０；Ｓ−８６〜Ｒ−４８０；Ｉ−８７〜Ｒ−４８０；Ｉ−８８〜Ｒ−４８０；Ｈ−８９〜Ｒ−４８０；Ｄ−９０〜Ｒ−４８０；Ｇ−９１〜Ｒ−４８０；Ｗ−９２〜Ｒ−４８０；Ｌ−９３〜Ｒ−４８０；Ｄ−９４〜Ｒ−４８０；Ｆ−９５〜Ｒ−４８０；Ｌ−９６〜Ｒ−４８０；Ｓ−９７〜Ｒ−４８０；Ｓ−９８〜Ｒ−４８０；Ｋ−９９〜Ｒ−４８０；Ｒ−１００〜Ｒ−４８０；Ｌ−１０１〜Ｒ−４８０；Ｖ−１０２〜Ｒ−４８０；Ｔ−１０３〜Ｒ−４８０；Ｌ−１０４〜Ｒ−４８０；Ａ−１０５〜Ｒ−４８０；Ｒ−１０６〜Ｒ−４８０；Ｇ−１０７〜Ｒ−４８０；Ｌ−１０８〜Ｒ−４８０；Ｓ−１０９〜Ｒ−４８０；Ｐ−１１０〜Ｒ−４８０；Ａ−１１１〜Ｒ−４８０；Ｆ−１１２〜Ｒ−４８０；Ｌ−１１３〜Ｒ−４８０；Ｒ−１１４〜Ｒ−４８０；Ｆ−１１５〜Ｒ−４８０；Ｇ−１１６〜Ｒ−４８０；Ｇ−１１７〜Ｒ−４８０；Ｋ−１１８〜Ｒ−４８０；Ｒ−１１９〜Ｒ−４８０；Ｔ−１２０〜Ｒ−４８０；Ｄ−１２１〜Ｒ−４８０；Ｆ−１２２〜Ｒ−４８０；Ｌ−１２３〜Ｒ−４８０；Ｑ−１２４〜Ｒ−４８０；Ｆ−１２５〜Ｒ−４８０；Ｑ−１２６〜Ｒ−４８０；Ｎ−１２７〜Ｒ−４８０；Ｌ−１２８〜Ｒ−４８０；Ｒ−１２９〜Ｒ−４８０；Ｎ−１３０〜Ｒ−４８０；Ｐ−１３１〜Ｒ−４８０；Ａ−１３２〜Ｒ−４８０；Ｋ−１３３〜Ｒ−４８０；Ｓ−１３４〜Ｒ−４８０；Ｒ−１３５〜Ｒ−４８０；Ｇ−１３６〜Ｒ−４８０；Ｇ−１３７〜Ｒ−４８０；Ｐ−１３８〜Ｒ−４８０；Ｇ−１３９〜Ｒ−４８０；Ｐ−１４０〜Ｒ−４８０；Ｄ−１４１〜Ｒ−４８０；Ｙ−１４２〜Ｒ−４８０；Ｙ−１４３〜Ｒ−４８０；Ｌ−１４４〜Ｒ−４８０；Ｋ−１４５〜Ｒ−４８０；Ｎ−１４６〜Ｒ−４８０；Ｙ−１４７〜Ｒ−４８０；Ｅ−１４８〜Ｒ−４８０；Ｄ−１４９〜Ｒ−４８０；Ｅ−１５０〜Ｒ−４８０；Ｐ−１５１〜Ｒ−４８０；Ｎ−１５２〜Ｒ−４８０；Ｎ−１５３〜Ｒ−４８０；Ｙ−１５４〜Ｒ−４８０；Ｒ−１５５〜Ｒ−４８０；Ｔ−１５６〜Ｒ−４８０；Ｍ−１５７〜Ｒ−４８０；Ｈ−１５８〜Ｒ−４８０；Ｇ−１５９〜Ｒ−４８０；Ｒ−１６０〜Ｒ−４８０；Ａ−１６１〜Ｒ−４８０；Ｖ−１６２〜Ｒ−４８０；Ｎ−１６３〜Ｒ−４８０；Ｇ−１６４〜Ｒ−４８０；Ｓ−１６５〜Ｒ−４８０；Ｑ−１６６〜Ｒ−４８０；Ｌ−１６７〜Ｒ−４８０；Ｇ−１６８〜Ｒ−４８０；Ｋ−１６９〜Ｒ−４８０；Ｄ−１７０〜Ｒ−４８０；Ｙ−１７１〜Ｒ−４８０；Ｉ−１７２〜Ｒ−４８０；Ｑ−１７３〜Ｒ−４８０；Ｌ−１７４〜Ｒ−４８０；Ｋ−１７５〜Ｒ−４８０；Ｓ−１７６〜Ｒ−４８０；Ｌ−１７７〜Ｒ−４８０；Ｌ−１７８〜Ｒ−４８０；Ｑ−１７９〜Ｒ−４８０；Ｐ−１８０〜Ｒ−４８０；Ｉ−１８１〜Ｒ−４８０；Ｒ−１８２〜Ｒ−４８０；Ｉ−１８３〜Ｒ−４８０；Ｙ−１８４〜Ｒ−４８０；Ｓ−１８５〜Ｒ−４８０；Ｒ−１８６〜Ｒ−４８０；Ａ−１８７〜Ｒ−４８０；Ｓ−１８８〜Ｒ−４８０；Ｌ−１８９〜Ｒ−４８０；Ｙ−１９０〜Ｒ−４８０；Ｇ−１９１〜Ｒ−４８０；Ｐ−１９２〜Ｒ−４８０；Ｎ−１９３〜Ｒ−４８０；Ｉ−１９４〜Ｒ−４８０；Ｇ−１９５〜Ｒ−４８０；Ｒ−１９６〜Ｒ−４８０；Ｐ−１９７〜Ｒ−４８０；Ｒ−１９８〜Ｒ−４８０；Ｋ−１９９〜Ｒ−４８０；Ｎ−２００〜Ｒ−４８０；Ｖ−２０１〜Ｒ−４８０；Ｉ−２０２〜Ｒ−４８０；Ａ−２０３〜Ｒ−４８０；Ｌ−２０４〜Ｒ−４８０；Ｌ−２０５〜Ｒ−４８０；Ｄ−２０６〜Ｒ−４８０；Ｇ−２０７〜Ｒ−４８０；Ｆ−２０８〜Ｒ−４８０；Ｍ−２０９〜Ｒ−４８０；Ｋ−２１０〜Ｒ−４８０；Ｖ−２１１〜Ｒ−４８０；Ａ−２１２〜Ｒ−４８０；Ｇ−２１３〜Ｒ−４８０；Ｓ−２１４〜Ｒ−４８０；Ｔ−２１５〜Ｒ−４８０；Ｖ−２１６〜Ｒ−４８０；Ｄ−２１７〜Ｒ−４８０；Ａ−２１８〜Ｒ−４８０；Ｖ−２１９〜Ｒ−４８０；Ｔ−２２０〜Ｒ−４８０；Ｗ−２２１〜Ｒ−４８０；Ｑ−２２２〜Ｒ−４８０；Ｈ−２２３〜Ｒ−４８０；Ｃ−２２４〜Ｒ−４８０；Ｙ−２２５〜Ｒ−４８０；Ｉ−２２６〜Ｒ−４８０；Ｄ−２２７〜Ｒ−４８０；Ｇ−２２８〜Ｒ−４８０；Ｒ−２２９〜Ｒ−４８０；Ｖ−２３０〜Ｒ−４８０；Ｖ−２３１〜Ｒ−４８０；Ｋ−２３２〜Ｒ−４８０；Ｖ−２３３〜Ｒ−４８０；Ｍ−２３４〜Ｒ−４８０；Ｄ−２３５〜Ｒ−４８０；Ｆ−２３６〜Ｒ−４８０；Ｌ−２３７〜Ｒ−４８０；Ｋ−２３８〜Ｒ−４８０；Ｔ−２３９〜Ｒ−４８０；Ｒ−２４０〜Ｒ−４８０；Ｌ−２４１〜Ｒ−４８０；Ｌ−２４２〜Ｒ−４８０；Ｄ−２４３〜Ｒ−４８０；Ｔ−２４４〜Ｒ−４８０；Ｌ−２４５〜Ｒ−４８０；Ｓ−２４６〜Ｒ−４８０；Ｄ−２４７〜Ｒ−４８０；Ｑ−２４８〜Ｒ−４８０；Ｉ−２４９〜Ｒ−４８０；Ｒ−２５０〜Ｒ−４８０；Ｋ−２５１〜Ｒ−４８０；Ｉ−２５２〜Ｒ−４８０；Ｑ−２５３〜Ｒ−４８０；Ｋ−２５４〜Ｒ−４８０；Ｖ−２５５〜Ｒ−４８０；Ｖ−２５６〜Ｒ−４８０；Ｎ−２５７〜Ｒ−４８０；Ｔ−２５８〜Ｒ−４８０；Ｙ−２５９〜Ｒ−４８０；Ｔ−２６０〜Ｒ−４８０；Ｐ−２６１〜Ｒ−４８０；Ｇ−２６２〜Ｒ−４８０；Ｋ−２６３〜Ｒ−４８０；Ｋ−２６４〜Ｒ−４８０；Ｉ−２６５〜Ｒ−４８０；Ｗ−２６６〜Ｒ−４８０；Ｌ−２６７〜Ｒ−４８０；Ｅ−２６８〜Ｒ−４８０；Ｇ−２６９〜Ｒ−４８０；Ｖ−２７０〜Ｒ−４８０；Ｖ−２７１〜Ｒ−４８０；Ｔ−２７２〜Ｒ−４８０；Ｔ−２７３〜Ｒ−４８０；Ｓ−２７４〜Ｒ−４８０；Ａ−２７５〜Ｒ−４８０；Ｇ−２７６〜Ｒ−４８０；Ｇ−２７７〜Ｒ−４８０；Ｔ−２７８〜Ｒ−４８０；Ｎ−２７９〜Ｒ−４８０；Ｎ−２８０〜Ｒ−４８０；Ｌ−２８１〜Ｒ−４８０；Ｓ−２８２〜Ｒ−４８０；Ｄ−２８３〜Ｒ−４８０；Ｓ−２８４〜Ｒ−４８０；Ｙ−２８５〜Ｒ−４８０；Ａ−２８６〜Ｒ−４８０；Ａ−２８７〜Ｒ−４８０；Ｇ−２８８〜Ｒ−４８０；Ｆ−２８９〜Ｒ−４８０；Ｌ−２９０〜Ｒ−４８０；Ｗ−２９１〜Ｒ−４８０；Ｌ−２９２〜Ｒ−４８０；Ｎ−２９３〜Ｒ−４８０；Ｔ−２９４〜Ｒ−４８０；Ｌ−２９５〜Ｒ−４８０；Ｇ−２９６〜Ｒ−４８０；Ｍ−２９７〜Ｒ−４８０；Ｌ−２９８〜Ｒ−４８０；Ａ−２９９〜Ｒ−４８０；Ｎ−３００〜Ｒ−４８０；Ｑ−３０１〜Ｒ−４８０；Ｇ−３０２〜Ｒ−４８０；Ｉ−３０３〜Ｒ−４８０；Ｄ−３０４〜Ｒ−４８０；Ｖ−３０５〜Ｒ−４８０；Ｖ−３０６〜Ｒ−４８０；Ｉ−３０７〜Ｒ−４８０；Ｒ−３０８〜Ｒ−４８０；Ｈ−３０９〜Ｒ−４８０；Ｓ−３１０〜Ｒ−４８０；Ｆ−３１１〜Ｒ−４８０；Ｆ−３１２〜Ｒ−４８０；Ｄ−３１３〜Ｒ−４８０；Ｈ−３１４〜Ｒ−４８０；Ｇ−３１５〜Ｒ−４８０；Ｙ−３１６〜Ｒ−４８０；Ｎ−３１７〜Ｒ−４８０；Ｈ−３１８〜Ｒ−４８０；Ｌ−３１９〜Ｒ−４８０；Ｖ−３２０〜Ｒ−４８０；Ｄ−３２１〜Ｒ−４８０；Ｑ−３２２〜Ｒ−４８０；Ｎ−３２３〜Ｒ−４８０；Ｆ−３２４〜Ｒ−４８０；Ｎ−３２５〜Ｒ−４８０；Ｐ−３２６〜Ｒ−４８０；Ｌ−３２７〜Ｒ−４８０；Ｐ−３２８〜Ｒ−４８０；Ｄ−３２９〜Ｒ−４８０；Ｙ−３３０〜Ｒ−４８０；Ｗ−３３１〜Ｒ−４８０；Ｌ−３３２〜Ｒ−４８０；Ｓ−３３３〜Ｒ−４８０；Ｌ−３３４〜Ｒ−４８０；Ｌ−３３５〜Ｒ−４８０；Ｙ−３３６〜Ｒ−４８０；Ｋ−３３７〜Ｒ−４８０；Ｒ−３３８〜Ｒ−４８０；Ｌ−３３９〜Ｒ−４８０；Ｉ−３４０〜Ｒ−４８０；Ｇ−３４１〜Ｒ−４８０；Ｐ−３４２〜Ｒ−４８０；Ｋ−３４３〜Ｒ−４８０；Ｖ−３４４〜Ｒ−４８０；Ｌ−３４５〜Ｒ−４８０；Ａ−３４６〜Ｒ−４８０；Ｖ−３４７〜Ｒ−４８０；Ｈ−３４８〜Ｒ−４８０；Ｖ−３４９〜Ｒ−４８０；Ａ−３５０〜Ｒ−４８０；Ｇ−３５１〜Ｒ−４８０；Ｌ−３５２〜Ｒ−４８０；Ｑ−３５３〜Ｒ−４８０；Ｒ−３５４〜Ｒ−４８０；Ｋ−３５５〜Ｒ−４８０；Ｐ−３５６〜Ｒ−４８０；Ｒ−３５７〜Ｒ−４８０；Ｐ−３５８〜Ｒ−４８０；Ｇ−３５９〜Ｒ−４８０；Ｒ−３６０〜Ｒ−４８０；Ｖ−３６１〜Ｒ−４８０；Ｉ−３６２〜Ｒ−４８０；Ｒ−３６３〜Ｒ−４８０；Ｄ−３６４〜Ｒ−４８０；Ｋ−３６５〜Ｒ−４８０；Ｌ−３６６〜Ｒ−４８０；Ｒ−３６７〜Ｒ−４８０；Ｉ−３６８〜Ｒ−４８０；Ｙ−３６９〜Ｒ−４８０；Ａ−３７０〜Ｒ−４８０；Ｈ−３７１〜Ｒ−４８０；Ｃ−３７２〜Ｒ−４８０；Ｔ−３７３〜Ｒ−４８０；Ｎ−３７４〜Ｒ−４８０；Ｈ−３７５〜Ｒ−４８０；Ｈ−３７６〜Ｒ−４８０；Ｎ−３７７〜Ｒ−４８０；Ｈ−３７８〜Ｒ−４８０；Ｎ−３７９〜Ｒ−４８０；Ｙ−３８０〜Ｒ−４８０；Ｖ−３８１〜Ｒ−４８０；Ｒ−３８２〜Ｒ−４８０；Ｇ−３８３〜Ｒ−４８０；Ｓ−３８４〜Ｒ−４８０；Ｉ−３８５〜Ｒ−４８０；Ｔ−３８６〜Ｒ−４８０；Ｌ−３８７〜Ｒ−４８０；Ｆ−３８８〜Ｒ−４８０；Ｉ−３８９〜Ｒ−４８０；Ｉ−３９０〜Ｒ−４８０；Ｎ−３９１〜Ｒ−４８０；Ｌ−３９２〜Ｒ−４８０；Ｈ−３９３〜Ｒ−４８０；Ｒ−３９４〜Ｒ−４８０；Ｓ−３９５〜Ｒ−４８０；Ｒ−３９６〜Ｒ−４８０；Ｋ−３９７〜Ｒ−４８０；Ｋ−３９８〜Ｒ−４８０；Ｉ−３９９〜Ｒ−４８０；Ｋ−４００〜Ｒ−４８０；Ｌ−４０１〜Ｒ−４８０；Ａ−４０２〜Ｒ−４８０；Ｇ−４０３〜Ｒ−４８０；Ｔ−４０４〜Ｒ−４８０；Ｌ−４０５〜Ｒ−４８０；Ｒ−４０６〜Ｒ−４８０；Ｄ−４０７〜Ｒ−４８０；Ｋ−４０８〜Ｒ−４８０；Ｌ−４０９〜Ｒ−４８０；Ｖ−４１０〜Ｒ−４８０；Ｈ−４１１〜Ｒ−４８０；Ｑ−４１２〜Ｒ−４８０；Ｙ−４１３〜Ｒ−４８０；Ｌ−４１４〜Ｒ−４８０；Ｌ−４１５〜Ｒ−４８０；Ｑ−４１６〜Ｒ−４８０；Ｐ−４１７〜Ｒ−４８０；Ｙ−４１８〜Ｒ−４８０；Ｇ−４１９〜Ｒ−４８０；Ｑ−４２０〜Ｒ−４８０；Ｅ−４２１〜Ｒ−４８０；Ｇ−４２２〜Ｒ−４８０；Ｌ−４２３〜Ｒ−４８０；Ｋ−４２４〜Ｒ−４８０；Ｓ−４２５〜Ｒ−４８０；Ｋ−４２６〜Ｒ−４８０；Ｓ−４２７〜Ｒ−４８０；Ｖ−４２８〜Ｒ−４８０；Ｑ−４２９〜Ｒ−４８０；Ｌ−４３０〜Ｒ−４８０；Ｎ−４３１〜Ｒ−４８０；Ｇ−４３２〜Ｒ−４８０；Ｑ−４３３〜Ｒ−４８０；Ｐ−４３４〜Ｒ−４８０；Ｌ−４３５〜Ｒ−４８０；Ｖ−４３６〜Ｒ−４８０；Ｍ−４３７〜Ｒ−４８０；Ｖ−４３８〜Ｒ−４８０；Ｄ−４３９〜Ｒ−４８０；Ｄ−４４０〜Ｒ−４８０；Ｇ−４４１〜Ｒ−４８０；Ｔ−４４２〜Ｒ−４８０；Ｌ−４４３〜Ｒ−４８０；Ｐ−４４４〜Ｒ−４８０；Ｅ−４４５〜Ｒ−４８０；Ｌ−４４６〜Ｒ−４８０；Ｋ−４４７〜Ｒ−４８０；Ｐ−４４８〜Ｒ−４８０；Ｒ−４４９〜Ｒ−４８０；Ｐ−４５０〜Ｒ−４８０；Ｌ−４５１〜Ｒ−４８０；Ｒ−４５２〜Ｒ−４８０；Ａ−４５３〜Ｒ−４８０；Ｇ−４５４〜Ｒ−４８０；Ｒ−４５５〜Ｒ−４８０；Ｔ−４５６〜Ｒ−４８０；Ｌ−４５７〜Ｒ−４８０；Ｖ−４５８〜Ｒ−４８０；Ｉ−４５９〜Ｒ−４８０；Ｐ−４６０〜Ｒ−４８０；Ｐ−４６１〜Ｒ−４８０；Ｖ−４６２〜Ｒ−４８０；Ｔ−４６３〜Ｒ−４８０；Ｍ−４６４〜Ｒ−４８０；Ｇ−４６５〜Ｒ−４８０；Ｆ−４６６〜Ｒ−４８０；Ｆ−４６７〜Ｒ−４８０；Ｖ−４６８〜Ｒ−４８０；Ｖ−４６９〜Ｒ−４８０；Ｋ−４７０〜Ｒ−４８０；Ｎ−４７１〜Ｒ−４８０；Ｖ−４７２〜Ｒ−４８０；Ｎ−４７３〜Ｒ−４８０；Ａ−４７４〜Ｒ−４８０；および／またはＬ−４７５〜Ｒ−４８０から選択されるアミノ酸配列を含むか、あるいはこのようなアミノ酸配列から構成されるポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを提供する。これらのポリペプチドをコードするポリヌクレオチドもまた、本発明によって包含され、これらのポリペプチドの１つ以上を結合する抗体もまた包含される。さらに、これらのポリペプチドのフラグメントおよび改変体（例えば、本明細書中で記載されるようなフラグメント、これらのポリペプチドに少なくとも８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、または９９％同一なポリペプチド、およびストリンジェントな条件下でこれらのポリペプチドをコードするポリヌクレオチド、またはその相補体にハイブリダイズするヌクレオチドによってコードされるポリペプチド）は、本発明によって包含される。本発明のこれらのフラグメントおよび改変体を結合する抗体はまた、本発明によって含まれる。これらのフラグメントおよび改変体をコードするポリヌクレオチドはまた、本発明によって含まれる。
【００５３】
さらに、本発明は、配列番号７の以下の群：Ｍ−１〜Ｙ−４７９；Ｍ−１〜Ｒ−４７８；Ｍ−１〜Ｃ−４７７；Ｍ−１〜Ａ−４７６；Ｍ−１〜Ｌ−４７５；Ｍ−１〜Ａ−４７４；Ｍ−１〜Ｎ−４７３；Ｍ−１〜Ｖ−４７２；Ｍ−１〜Ｎ−４７１；Ｍ−１〜Ｋ−４７０；Ｍ−１〜Ｖ−４６９；Ｍ−１〜Ｖ−４６８；Ｍ−１〜Ｆ−４６７；Ｍ−１〜Ｆ−４６６；Ｍ−１〜Ｇ−４６５；Ｍ−１〜Ｍ−４６４；Ｍ−１〜Ｔ−４６３；Ｍ−１〜Ｖ−４６２；Ｍ−１〜Ｐ−４６１；Ｍ−１〜Ｐ−４６０；Ｍ−１〜Ｉ−４５９；Ｍ−１〜Ｖ−４５８；Ｍ−１〜Ｌ−４５７；Ｍ−１〜Ｔ−４５６；Ｍ−１〜Ｒ−４５５；Ｍ−１〜Ｇ−４５４；Ｍ−１〜Ａ−４５３；Ｍ−１〜Ｒ−４５２；Ｍ−１〜Ｌ−４５１；Ｍ−１〜Ｐ−４５０；Ｍ−１〜Ｒ−４４９；Ｍ−１〜Ｐ−４４８；Ｍ−１〜Ｋ−４４７；Ｍ−１〜Ｌ−４４６；Ｍ−１〜Ｅ−４４５；Ｍ−１〜Ｐ−４４４；Ｍ−１〜Ｌ−４４３；Ｍ−１〜Ｔ−４４２；Ｍ−１〜Ｇ−４４１；Ｍ−１〜Ｄ−４４０；Ｍ−１〜Ｄ−４３９；Ｍ−１〜Ｖ−４３８；Ｍ−１〜Ｍ−４３７；Ｍ−１〜Ｖ−４３６；Ｍ−１〜Ｌ−４３５；Ｍ−１〜Ｐ−４３４；Ｍ−１〜Ｑ−４３３；Ｍ−１〜Ｇ−４３２；Ｍ−１〜Ｎ−４３１；Ｍ−１〜Ｌ−４３０；Ｍ−１〜Ｑ−４２９；Ｍ−１〜Ｖ−４２８；Ｍ−１〜Ｓ−４２７；Ｍ−１〜Ｋ−４２６；Ｍ−１〜Ｓ−４２５；Ｍ−１〜Ｋ−４２４；Ｍ−１〜Ｌ−４２３；Ｍ−１〜Ｇ−４２２；Ｍ−１〜Ｅ−４２１；Ｍ−１〜Ｑ−４２０；Ｍ−１〜Ｇ−４１９；Ｍ−１〜Ｙ−４１８；Ｍ−１〜Ｐ−４１７；Ｍ−１〜Ｑ−４１６；Ｍ−１〜Ｌ−４１５；Ｍ−１〜Ｌ−４１４；Ｍ−１〜Ｙ−４１３；Ｍ−１〜Ｑ−４１２；Ｍ−１〜Ｈ−４１１；Ｍ−１〜Ｖ−４１０；Ｍ−１〜Ｌ−４０９；Ｍ−１〜Ｋ−４０８；Ｍ−１〜Ｄ−４０７；Ｍ−１〜Ｒ−４０６；Ｍ−１〜Ｌ−４０５；Ｍ−１〜Ｔ−４０４；Ｍ−１〜Ｇ−４０３；Ｍ−１〜Ａ−４０２；Ｍ−１〜Ｌ−４０１；Ｍ−１〜Ｋ−４００；Ｍ−１〜Ｉ−３９９；Ｍ−１〜Ｋ−３９８；Ｍ−１〜Ｋ−３９７；Ｍ−１〜Ｒ−３９６；Ｍ−１〜Ｓ−３９５；Ｍ−１〜Ｒ−３９４；Ｍ−１〜Ｈ−３９３；Ｍ−１〜Ｌ−３９２；Ｍ−１〜Ｎ−３９１；Ｍ−１〜Ｉ−３９０；Ｍ−１〜Ｉ−３８９；Ｍ−１〜Ｆ−３８８；Ｍ−１〜Ｌ−３８７；Ｍ−１〜Ｔ−３８６；Ｍ−１〜Ｉ−３８５；Ｍ−１〜Ｓ−３８４；Ｍ−１〜Ｇ−３８３；Ｍ−１〜Ｒ−３８２；Ｍ−１〜Ｖ−３８１；Ｍ−１〜Ｙ−３８０；Ｍ−１〜Ｎ−３７９；Ｍ−１〜Ｈ−３７８；Ｍ−１〜Ｎ−３７７；Ｍ−１〜Ｈ−３７６；Ｍ−１〜Ｈ−３７５；Ｍ−１〜Ｎ−３７４；Ｍ−１〜Ｔ−３７３；Ｍ−１〜Ｃ−３７２；Ｍ−１〜Ｈ−３７１；Ｍ−１〜Ａ−３７０；Ｍ−１〜Ｙ−３６９；Ｍ−１〜Ｉ−３６８；Ｍ−１〜Ｒ−３６７；Ｍ−１〜Ｌ−３６６；Ｍ−１〜Ｋ−３６５；Ｍ−１〜Ｄ−３６４；Ｍ−１〜Ｒ−３６３；Ｍ−１〜Ｉ−３６２；Ｍ−１〜Ｖ−３６１；Ｍ−１〜Ｒ−３６０；Ｍ−１〜Ｇ−３５９；Ｍ−１〜Ｐ−３５８；Ｍ−１〜Ｒ−３５７；Ｍ−１〜Ｐ−３５６；Ｍ−１〜Ｋ−３５５；Ｍ−１〜Ｒ−３５４；Ｍ−１〜Ｑ−３５３；Ｍ−１〜Ｌ−３５２；Ｍ−１〜Ｇ−３５１；Ｍ−１〜Ａ−３５０；Ｍ−１〜Ｖ−３４９；Ｍ−１〜Ｈ−３４８；Ｍ−１〜Ｖ−３４７；Ｍ−１〜Ａ−３４６；Ｍ−１〜Ｌ−３４５；Ｍ−１〜Ｖ−３４４；Ｍ−１〜Ｋ−３４３；Ｍ−１〜Ｐ−３４２；Ｍ−１〜Ｇ−３４１；Ｍ−１〜Ｉ−３４０；Ｍ−１〜Ｌ−３３９；Ｍ−１〜Ｒ−３３８；Ｍ−１〜Ｋ−３３７；Ｍ−１〜Ｙ−３３６；Ｍ−１〜Ｌ−３３５；Ｍ−１〜Ｌ−３３４；Ｍ−１〜Ｓ−３３３；Ｍ−１〜Ｌ−３３２；Ｍ−１〜Ｗ−３３１；Ｍ−１〜Ｙ−３３０；Ｍ−１〜Ｄ−３２９；Ｍ−１〜Ｐ−３２８；Ｍ−１〜Ｌ−３２７；Ｍ−１〜Ｐ−３２６；Ｍ−１〜Ｎ−３２５；Ｍ−１〜Ｆ−３２４；Ｍ−１〜Ｎ−３２３；Ｍ−１〜Ｑ−３２２；Ｍ−１〜Ｄ−３２１；Ｍ−１〜Ｖ−３２０；Ｍ−１〜Ｌ−３１９；Ｍ−１〜Ｈ−３１８；Ｍ−１〜Ｎ−３１７；Ｍ−１〜Ｙ−３１６；Ｍ−１〜Ｇ−３１５；Ｍ−１〜Ｈ−３１４；Ｍ−１〜Ｄ−３１３；Ｍ−１〜Ｆ−３１２；Ｍ−１〜Ｆ−３１１；Ｍ−１〜Ｓ−３１０；Ｍ−１〜Ｈ−３０９；Ｍ−１〜Ｒ−３０８；Ｍ−１〜Ｉ−３０７；Ｍ−１〜Ｖ−３０６；Ｍ−１〜Ｖ−３０５；Ｍ−１〜Ｄ−３０４；Ｍ−１〜Ｉ−３０３；Ｍ−１〜Ｇ−３０２；Ｍ−１〜Ｑ−３０１；Ｍ−１〜Ｎ−３００；Ｍ−１〜Ａ−２９９；Ｍ−１〜Ｌ−２９８；Ｍ−１〜Ｍ−２９７；Ｍ−１〜Ｇ−２９６；Ｍ−１〜Ｌ−２９５；Ｍ−１〜Ｔ−２９４；Ｍ−１〜Ｎ−２９３；Ｍ−１〜Ｌ−２９２；Ｍ−１〜Ｗ−２９１；Ｍ−１〜Ｌ−２９０；Ｍ−１〜Ｆ−２８９；Ｍ−１〜Ｇ−２８８；Ｍ−１〜Ａ−２８７；Ｍ−１〜Ａ−２８６；Ｍ−１〜Ｙ−２８５；Ｍ−１〜Ｓ−２８４；Ｍ−１〜Ｄ−２８３；Ｍ−１〜Ｓ−２８２；Ｍ−１〜Ｌ−２８１；Ｍ−１〜Ｎ−２８０；Ｍ−１〜Ｎ−２７９；Ｍ−１〜Ｔ−２７８；Ｍ−１〜Ｇ−２７７；Ｍ−１〜Ｇ−２７６；Ｍ−１〜Ａ−２７５；Ｍ−１〜Ｓ−２７４；Ｍ−１〜Ｔ−２７３；Ｍ−１〜Ｔ−２７２；Ｍ−１〜Ｖ−２７１；Ｍ−１〜Ｖ−２７０；Ｍ−１〜Ｇ−２６９；Ｍ−１〜Ｅ−２６８；Ｍ−１〜Ｌ−２６７；Ｍ−１〜Ｗ−２６６；Ｍ−１〜Ｉ−２６５；Ｍ−１〜Ｋ−２６４；Ｍ−１〜Ｋ−２６３；Ｍ−１〜Ｇ−２６２；Ｍ−１〜Ｐ−２６１；Ｍ−１〜Ｔ−２６０；Ｍ−１〜Ｙ−２５９；Ｍ−１〜Ｔ−２５８；Ｍ−１〜Ｎ−２５７；Ｍ−１〜Ｖ−２５６；Ｍ−１〜Ｖ−２５５；Ｍ−１〜Ｋ−２５４；Ｍ−１〜Ｑ−２５３；Ｍ−１〜Ｉ−２５２；Ｍ−１〜Ｋ−２５１；Ｍ−１〜Ｒ−２５０；Ｍ−１〜Ｉ−２４９；Ｍ−１〜Ｑ−２４８；Ｍ−１〜Ｄ−２４７；Ｍ−１〜Ｓ−２４６；Ｍ−１〜Ｌ−２４５；Ｍ−１〜Ｔ−２４４；Ｍ−１〜Ｄ−２４３；Ｍ−１〜Ｌ−２４２；Ｍ−１〜Ｌ−２４１；Ｍ−１〜Ｒ−２４０；Ｍ−１〜Ｔ−２３９；Ｍ−１〜Ｋ−２３８；Ｍ−１〜Ｌ−２３７；Ｍ−１〜Ｆ−２３６；Ｍ−１〜Ｄ−２３５；Ｍ−１〜Ｍ−２３４；Ｍ−１〜Ｖ−２３３；Ｍ−１〜Ｋ−２３２；Ｍ−１〜Ｖ−２３１；Ｍ−１〜Ｖ−２３０；Ｍ−１〜Ｒ−２２９；Ｍ−１〜Ｇ−２２８；Ｍ−１〜Ｄ−２２７；Ｍ−１〜Ｉ−２２６；Ｍ−１〜Ｙ−２２５；Ｍ−１〜Ｃ−２２４；Ｍ−１〜Ｈ−２２３；Ｍ−１〜Ｑ−２２２；Ｍ−１〜Ｗ−２２１；Ｍ−１〜Ｔ−２２０；Ｍ−１〜Ｖ−２１９；Ｍ−１〜Ａ−２１８；Ｍ−１〜Ｄ−２１７；Ｍ−１〜Ｖ−２１６；Ｍ−１〜Ｔ−２１５；Ｍ−１〜Ｓ−２１４；Ｍ−１〜Ｇ−２１３；Ｍ−１〜Ａ−２１２；Ｍ−１〜Ｖ−２１１；Ｍ−１〜Ｋ−２１０；Ｍ−１〜Ｍ−２０９；Ｍ−１〜Ｆ−２０８；Ｍ−１〜Ｇ−２０７；Ｍ−１〜Ｄ−２０６；Ｍ−１〜Ｌ−２０５；Ｍ−１〜Ｌ−２０４；Ｍ−１〜Ａ−２０３；Ｍ−１〜Ｉ−２０２；Ｍ−１〜Ｖ−２０１；Ｍ−１〜Ｎ−２００；Ｍ−１〜Ｋ−１９９；Ｍ−１〜Ｒ−１９８；Ｍ−１〜Ｐ−１９７；Ｍ−１〜Ｒ−１９６；Ｍ−１〜Ｇ−１９５；Ｍ−１〜Ｉ−１９４；Ｍ−１〜Ｎ−１９３；Ｍ−１〜Ｐ−１９２；Ｍ−１〜Ｇ−１９１；Ｍ−１〜Ｙ−１９０；Ｍ−１〜Ｌ−１８９；Ｍ−１〜Ｓ−１８８；Ｍ−１〜Ａ−１８７；Ｍ−１〜Ｒ−１８６；Ｍ−１〜Ｓ−１８５；Ｍ−１〜Ｙ−１８４；Ｍ−１〜Ｉ−１８３；Ｍ−１〜Ｒ−１８２；Ｍ−１〜Ｉ−１８１；Ｍ−１〜Ｐ−１８０；Ｍ−１〜Ｑ−１７９；Ｍ−１〜Ｌ−１７８；Ｍ−１〜Ｌ−１７７；Ｍ−１〜Ｓ−１７６；Ｍ−１〜Ｋ−１７５；Ｍ−１〜Ｌ−１７４；Ｍ−１〜Ｑ−１７３；Ｍ−１〜Ｉ−１７２；Ｍ−１〜Ｙ−１７１；Ｍ−１〜Ｄ−１７０；Ｍ−１〜Ｋ−１６９；Ｍ−１〜Ｇ−１６８；Ｍ−１〜Ｌ−１６７；Ｍ−１〜Ｑ−１６６；Ｍ−１〜Ｓ−１６５；Ｍ−１〜Ｇ−１６４；Ｍ−１〜Ｎ−１６３；Ｍ−１〜Ｖ−１６２；Ｍ−１〜Ａ−１６１；Ｍ−１〜Ｒ−１６０；Ｍ−１〜Ｇ−１５９；Ｍ−１〜Ｈ−１５８；Ｍ−１〜Ｍ−１５７；Ｍ−１〜Ｔ−１５６；Ｍ−１〜Ｒ−１５５；Ｍ−１〜Ｙ−１５４；Ｍ−１〜Ｎ−１５３；Ｍ−１〜Ｎ−１５２；Ｍ−１〜Ｐ−１５１；Ｍ−１〜Ｅ−１５０；Ｍ−１〜Ｄ−１４９；Ｍ−１〜Ｅ−１４８；Ｍ−１〜Ｙ−１４７；Ｍ−１〜Ｎ−１４６；Ｍ−１〜Ｋ−１４５；Ｍ−１〜Ｌ−１４４；Ｍ−１〜Ｙ−１４３；Ｍ−１〜Ｙ−１４２；Ｍ−１〜Ｄ−１４１；Ｍ−１〜Ｐ−１４０；Ｍ−１〜Ｇ−１３９；Ｍ−１〜Ｐ−１３８；Ｍ−１〜Ｇ−１３７；Ｍ−１〜Ｇ−１３６；Ｍ−１〜Ｒ−１３５；Ｍ−１〜Ｓ−１３４；Ｍ−１〜Ｋ−１３３；Ｍ−１〜Ａ−１３２；Ｍ−１〜Ｐ−１３１；Ｍ−１〜Ｎ−１３０；Ｍ−１〜Ｒ−１２９；Ｍ−１〜Ｌ−１２８；Ｍ−１〜Ｎ−１２７；Ｍ−１〜Ｑ−１２６；Ｍ−１〜Ｆ−１２５；Ｍ−１〜Ｑ−１２４；Ｍ−１〜Ｌ−１２３；Ｍ−１〜Ｆ−１２２；Ｍ−１〜Ｄ−１２１；Ｍ−１〜Ｔ−１２０；Ｍ−１〜Ｒ−１１９；Ｍ−１〜Ｋ−１１８；Ｍ−１〜Ｇ−１１７；Ｍ−１〜Ｇ−１１６；Ｍ−１〜Ｆ−１１５；Ｍ−１〜Ｒ−１１４；Ｍ−１〜Ｌ−１１３；Ｍ−１〜Ｆ−１１２；Ｍ−１〜Ａ−１１１；Ｍ−１〜Ｐ−１１０；Ｍ−１〜Ｓ−１０９；Ｍ−１〜Ｌ−１０８；Ｍ−１〜Ｇ−１０７；Ｍ−１〜Ｒ−１０６；Ｍ−１〜Ａ−１０５；Ｍ−１〜Ｌ−１０４；Ｍ−１〜Ｔ−１０３；Ｍ−１〜Ｖ−１０２；Ｍ−１〜Ｌ−１０１；Ｍ−１〜Ｒ−１００；Ｍ−１〜Ｋ−９９；Ｍ−１〜Ｓ−９８；Ｍ−１〜Ｓ−９７；Ｍ−１〜Ｌ−９６；Ｍ−１〜Ｆ−９５；Ｍ−１〜Ｄ−９４；Ｍ−１〜Ｌ−９３；Ｍ−１〜Ｗ−９２；Ｍ−１〜Ｇ−９１；Ｍ−１〜Ｄ−９０；Ｍ−１〜Ｈ−８９；Ｍ−１〜Ｉ−８８；Ｍ−１〜Ｉ−８７；Ｍ−１〜Ｓ−８６；Ｍ−１〜Ｐ−８５；Ｍ−１〜Ｄ−８４；Ｍ−１〜Ｌ−８３；Ｍ−１〜Ｑ−８２；Ｍ−１〜Ｌ−８１；Ｍ−１〜Ｓ−８０；Ｍ−１〜Ｌ−７９；Ｍ−１〜Ｆ−７８；Ｍ−１〜Ｎ−７７；Ｍ−１〜Ｅ−７６；Ｍ−１〜Ｎ−７５；Ｍ−１〜Ｖ−７４；Ｍ−１〜Ｔ−７３；Ｍ−１〜Ｒ−７２；Ｍ−１〜Ｖ−７１；Ｍ−１〜Ｐ−７０；Ｍ−１〜Ｎ−６９；Ｍ−１〜Ｋ−６８；Ｍ−１〜Ｔ−６７；Ｍ−１〜Ｓ−６６；Ｍ−１〜Ｖ−６５；Ｍ−１〜Ｄ−６４；Ｍ−１〜Ｌ−６３；Ｍ−１〜Ｌ−６２；Ｍ−１〜Ｉ−６１；Ｍ−１〜Ｌ−６０；Ｍ−１〜Ｔ−５９；Ｍ−１〜Ｋ−５８；Ｍ−１〜Ｅ−５７；Ｍ−１〜Ｋ−５６；Ｍ−１〜Ｌ−５５；Ｍ−１〜Ｇ−５４；Ｍ−１〜Ａ−５３；Ｍ−１〜Ａ−５２；Ｍ−１〜Ｒ−５１；Ｍ−１〜Ｄ−５０；Ｍ−１〜Ｖ−４９；Ｍ−１〜Ｐ−４８；Ｍ−１〜Ｌ−４７；Ｍ−１〜Ｐ−４６；Ｍ−１〜Ｒ−４５；Ｍ−１〜Ｒ−４４；Ｍ−１〜Ｄ−４３；Ｍ−１〜Ｇ−４２；Ｍ−１〜Ａ−４１；Ｍ−１〜Ｑ−４０；Ｍ−１〜Ｓ−３９；Ｍ−１〜Ｓ−３８；Ｍ−１〜Ｌ−３７；Ｍ−１〜Ｓ−３６；Ｍ−１〜Ｌ−３５；Ｍ−１〜Ｈ−３４；Ｍ−１〜Ｌ−３３；Ｍ−１〜Ｌ−３２；Ｍ−１〜Ｌ−３１；Ｍ−１〜Ａ−３０；Ｍ−１〜Ｌ−２９；Ｍ−１〜Ｙ−２８；Ｍ−１〜Ｌ−２７；Ｍ−１〜Ａ−２６；Ｍ−１〜Ｇ−２５；Ｍ−１〜Ｐ−２４；Ｍ−１〜Ａ−２３；Ｍ−１〜Ｌ−２２；Ｍ−１〜Ｃ−２１；Ｍ−１〜Ａ−２０；Ｍ−１〜Ｐ−１９；Ｍ−１〜Ｐ−１８；Ｍ−１〜Ｒ−１７；Ｍ−１〜Ｓ−１６；Ｍ−１〜Ｎ−１５；Ｍ−１〜Ｓ−１４；Ｍ−１〜Ｓ−１３；Ｍ−１〜Ｐ−１２；Ｍ−１〜Ｍ−１１；Ｍ−１〜Ａ−１０；Ｍ−１〜Ｅ−９；Ｍ−１〜Ｐ−８；および／またはＭ−１〜Ｆ−７のＣ末端欠失から選択されるアミノ酸配列を含むか、あるいはこの配列からなるポリペプチドをコードする、ポリヌクレオチドを提供する。これらのポリペプチドをコードするポリヌクレオチドもまた、本発明によって包含され、これらのポリペプチドの１つ以上を結合する抗体もまた包含される。さらに、これらのポリペプチドのフラグメントおよび改変体（例えば、本明細書中で記載されるようなフラグメント、これらのポリペプチドに少なくとも８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、または９９％同一なポリペプチド、およびストリンジェントな条件下でこれらのポリペプチドをコードするポリヌクレオチド、またはその相補体にハイブリダイズするヌクレオチドによってコードされるポリペプチド）は、本発明によって包含される。本発明のこれらのフラグメントおよび改変体を結合する抗体はまた、本発明によって含まれる。これらのフラグメントおよび改変体をコードするポリヌクレオチドはまた、本発明によって含まれる。
【００５４】
また、上記のように、タンパク質のＣ末端からの１つ以上のアミノ酸の欠失が、このタンパク質の１つ以上の生物学的機能（例えば、ヘパラン硫酸分解）の改変または損失を生じるとしても、他の機能的活性（例えば、生物学的活性、抗体を産生する能力、抗体を結合する能力）は、なお保持され得る。例えば、抗原性を誘導するおよび／またはポリペプチドの完全な形態または成熟形態を認識する抗体に結合する、短縮型タンパク質の能力は、完全なポリペプチド、または成熟ポリペプチドの大部分より少ない残基が、Ｃ末端から除去される場合には、一般的に保持される。完全なポリペプチドのＣ末端残基を欠く特定のポリペプチドが、このような免疫原性活性を保持するか否かは、本明細書中に記載される慣用的な方法、およびそうでなければ当該分野において公知の他の方法によって容易に決定され得る。Ｃ末端アミノ酸残基が多数欠失したポリペプチドは、いくつかの生物学的活性または免疫原性活性を保持し得るようである。実際に、６つと同じくらい少ないアミノ酸残基からなるペプチドは、しばしば免疫応答を惹起し得る。従って、本発明は、一般式１−ｎによって記載されるポリペプチド（配列番号７）のアミノ酸配列のカルボキシ末端から１つ以上の残基が欠失したポリペプチドを、さらに提供し、ここでｎは、６〜４７４の整数であり、ここでｎは、配列番号７において同定されるアミノ酸残基の位置に対応する。さらに、上記のＮ末端またはＣ末端の欠失のいずれかを組み合わせて、Ｎ末端およびＣ末端欠失型ポリペプチドを産生し得る。
【００５５】
本発明はまた、アミノ末端およびカルボキシ末端の両方からの１つ以上のアミノ酸欠失を含むかあるいはこれからなるポリペプチドを提供し、このポリペプチドは、一般的に、配列番号７の、残基ｍ−ｎを有すると記載され得、ここでｎおよびｍは、上記のような整数である。これらのポリペプチドをコードするポリヌクレオチドもまた、本発明に含まれる。本発明はまた、本明細書中においてｍ−ｎと記載されるポリペプチド配列と、少なくとも８０％、８５％、９０％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％または９９％同一のポリペプチドを含む、タンパク質に関する。好ましい実施形態において、本願は、本明細書中に言及される特定のＮ末端欠失およびＣ末端欠失のアミノ酸配列を有するポリペプチドと、少なくとも８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％または９９％同一のポリペプチドを含むタンパク質に関する。
【００５６】
ＡＴＣＣ受託番号ＰＴＡ１７３５に含まれるｃＤＮＡクローンによってコードされる完全アミノ酸配列の部分からなるポリペプチドをコードするポリヌクレオチド配列もまた包含され、ここで、この部分は、ＡＴＣＣ受託番号ＰＴＡ１７３５に含まれるｃＤＮＡクローンによってコードされる完全アミノ酸配列のアミノ末端から１〜約４７４アミノ酸の任意の整数のアミノ酸残基、またはＡＴＣＣ受託番号ＰＴＡ１７３５に含まれるｃＤＮＡクローンによってコードされる完全アミノ酸配列のカルボキシ末端、もしくは上記アミノ末端およびカルボキシ末端の欠失の任意の組合せからの、７〜約４８０アミノ酸の任意の整数のアミノ酸を除外する。これらのポリヌクレオチドによってコードされるポリペプチドもまた、本発明によって包含される。本明細書中に記載されるかまたは他に当該分野において公知であるように、本発明のポリヌクレオチドは、染色体の同定、染色体のマッピング、および連鎖分析におけるプローブまたはプライマーとして働くことが挙げられるがこれらに限定されない用途を有する。これらのポリペプチドをコードするポリヌクレオチドもまた、本発明によって包含され、これらのポリペプチドの１つ以上を結合する抗体もまた包含される。さらに、これらのポリペプチドのフラグメントおよび改変体（例えば、本明細書中で記載されるようなフラグメント、これらのポリペプチドに少なくとも８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、または９９％同一なポリペプチド、およびストリンジェントな条件下でこれらのポリペプチドをコードするポリヌクレオチド、またはその相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドによってコードされるポリペプチド）は、本発明によって包含される。本発明のこれらのフラグメントおよび改変体を結合する抗体はまた、本発明によって含まれる。
【００５７】
この遺伝子は、女性の膀胱組織において発現されることが、発見された。
【００５８】
本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチド（抗体を含む）は、生物学的サンプル中に存在する組織または細胞型の示差的同定のため、ならびに異常なヘパラナーゼ（ｈｅｐａｒａｎａｓｅ）活性が関与する疾患および／または障害（例えば、癌の転移、新脈管形成、炎症、および心臓血管疾患とともに見出され得る）を含むがそれらに限定されない疾患および状態の診断のための試薬として有用である。同様に、ポリペプチドおよびこれらのポリペプチドに対する抗体は、組織または細胞型の示差的同定のための免疫学的プローブの提供に有用である。
【００５９】
ヘパラナーゼ様タンパク質の活性に対するアンタゴニストとして働く、このタンパク質の成熟部分に対する抗体の使用もまた、特に考慮される。このような拮抗性抗体は、本明細書中に開示されるような生物学的活性（例えば、癌の転移、新脈管形成）の予防および／または阻害のために、有用である。上記組織または細胞、特に、細胞外マトリックスの多数の障害に対して、標準の遺伝子発現レベル（すなわち、その障害を有さない個体由来の健常組織または体液中の発現レベル）に対して有意により高いか、またはより低いレベルのこの遺伝子の発現が、このような障害を有する個体から採取された特定の組織もしくは細胞型（例えば、癌性組織および創傷組織）または体液（例えば、リンパ、血清、血漿、尿、滑液および髄液）、または別の組織もしくは細胞サンプルの中で、慣用的に検出され得る。
【００６０】
女性の膀胱組織における組織分布、および哺乳動物ヘパラナーゼに対する相同性は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチド、翻訳産物、および抗体が、異常なヘパラナーゼ活性が関与する疾患および／または障害の診断、検出および／または処置のために有用であることを示す。特に、ヘパラナーゼ様遺伝子の翻訳産物は、例えば、癌の転移、炎症応答の促進、および新脈管形成に関与し得る。
【００６１】
タンパク質ならびにこのタンパク質に対する抗体は、上記に列挙された組織の腫瘍マーカーおよび／または免疫療法標的としての有用性を示し得る。さらに、このタンパク質はまた、その栄養補給剤としての使用に加えて、生物学的活性を決定するために、抗体を惹起するために、組織マーカーとして、同族のリガンドまたはレセプターを単離するために、それらの相互作用を調節する薬剤を同定するために使用され得る。
【００６２】
（遺伝子番号２によってコードされるタンパク質の特徴）
この遺伝子に対応する翻訳産物は、多数の糖タンパク質ＩＩＩａ分子（例えば、Ｇｅｎｂａｎｋ登録番号ＡＡＡ６０１２２を参照のこと）およびインテグリンβサブユニット前駆体分子（例えば、Ｇｅｎｂａｎｋ登録番号ＡＡＡ５９１８３を参照のこと）と配列相同性を共有する。これらの分子は、細胞と細胞、および細胞とマトリックスの接着において、接着タンパク質のための細胞表面レセプターとして機能すると考えられる、α／βヘテロ二量体の大ファミリーのメンバーである。これらのタンパク質間の相同性に基づいて、これらのタンパク質が、少なくともいくつかの生物学的活性を共有することが予測される。
【００６３】
本発明の好ましいポリペプチドは、以下の残基として配列番号８に示される免疫原性エピトープの、１個、２個、３個、４個、５個、６個、７個、８個、９個、１０個、１１個、１２個、１３個、１４個、１５個、１６個、１７個、１８個、１９個、２０個、または２１個全てを含むか、あるいはこのエピトープからなる：Ｍｅｔ−１〜Ａｒｇ−８、Ａｒｇ−９３〜Ｇｌｎ−１０５、Ａｒｇ−１１９〜Ｐｈｅ−１２６、Ｐｒｏ−２０２〜Ｌｙｓ−２０７、Ｇｌｎ−２２５〜Ｇｌｙ−２４８、Ｌｙｓ−２６１〜Ａｌａ−２６８、Ｐｒｏ−２９４〜Ｃｙｓ−２９９、Ｖａｌ−３０１〜Ｔｙｒ−３０７、Ｃｙｓ−４３２〜Ｌｙｓ−４３８、Ｇｌｎ−４６６〜Ｇｌｙ−４７９、Ｔｈｒ−４９５〜Ｔｙｒ−５０８、Ｐｒｏ−５１９〜Ａｓｎ−５３０、Ｓｅｒ−５５３〜Ｇｌｙ−５５９、Ｇｌｙ−５６４〜Ｃｙｓ−５７５、Ｃｙｓ−５９３〜Ｇｌｙ−６０５、Ｃｙｓ−６３４〜Ａｓｐ−６３９、Ｓｅｒ−６４８〜Ｃｙｓ−６５６、Ｐｒｏ−７１１〜Ａｓｎ−７１８、Ｐｈｅ−７５６〜Ａｌａ−７６８、Ｐｒｏ−７７１〜Ｉｌｅ−７７７、およびＬｙｓ−７８８〜Ｇｌｙ−７９５。これらのポリペプチドをコードするポリヌクレオチドもまた、本発明によって包含され、これらのポリペプチドの１つ以上を結合する抗体もまた包含される。さらに、これらのポリペプチドのフラグメントおよび改変体（例えば、本明細書中で記載されるようなフラグメント、これらのポリペプチドに少なくとも８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、または９９％同一なポリペプチド、およびストリンジェントな条件下でこれらのポリペプチドをコードするポリヌクレオチド、またはその相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドによってコードされるポリペプチド）は、本発明によって包含される。本発明のこれらのフラグメントおよび改変体を結合する抗体はまた、本発明によって含まれる。これらのフラグメントおよび改変体をコードするポリヌクレオチドはまた、本発明によって含まれる。
【００６４】
この遺伝子は、喉頭および舌の癌性組織において強く特異的に発現され、そして正常な子宮組織において発現され、そしてより少ない程度で、一般に、消化器系組織において発現される。
【００６５】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチド（抗体を含む）は、生物学的サンプル中に存在する子宮および消化器系の組織または細胞型の示差的同定のため、ならびに子宮および消化器系の疾患および／または障害（その癌を含む）を含むがそれらに限定されない疾患および状態の診断のための試薬として有用である。同様に、ポリペプチドおよびこれらのポリペプチドに対する抗体は、組織または細胞型の示差的同定のための免疫学的プローブの提供に有用である。上記組織または細胞、特に消化器系の多数の障害に関して、標準の遺伝子発現レベル（すなわち、その障害を有さない個体由来の健常組織または体液中の発現レベル）に対して有意により高いか、またはより低いレベルのこの遺伝子の発現が、このような障害を有する個体から採取された特定の組織もしくは細胞型（例えば、消化器組織、癌性組織および創傷組織）または体液（例えば、リンパ、血清、血漿、尿、滑液および髄液）、または別の組織もしくはサンプルの中で、慣用的に検出され得る。
【００６６】
咽頭および舌の癌性組織、ならびに一般に消化系組織における強い組織分布、ならびにインテグリンβサブユニット前駆体分子に対する相同性は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチド、翻訳産物、および抗体が、消化器系の疾患および／または障害、特に、喉頭および舌の癌の診断、検出および／または処置のために有用であることを示す。
【００６７】
この遺伝子の翻訳産物は、非限定的な仮説として、隣接する組織または細胞外マトリックスへの接着を介して、あるいは新脈管形成を増強することによって、転移の増強に関与し得る。従って、この遺伝子に対応する翻訳産物に対する拮抗性抗体が好ましい。これらの抗体は、この遺伝子に対応する翻訳産物によって媒介されると考えられる活性（例えば、癌の転移および新脈管形成のような）を排除、低減および／または予防するために、有用である。
【００６８】
さらに、正常子宮組織における組織分布およびインテグリンタンパク質に対する相同性は、この遺伝子に対応する翻訳産物が、妊娠に関連する疾患および／または障害（例えば、不妊症）を処置するために有用であることを示唆する。このタンパク質は、着床のための子宮内膜の調製において役割を果たし得、そして局所的にかまたは経口的にかのいずれかで、投与され得る。
【００６９】
あるいは、この遺伝子は、遺伝子置換処置において、子宮の細胞にトランスフェクトされ得、そしてタンパク質産物が産生され得る。同様に、これらの処置は、着床の尤度、胎盤形成、および健全な胚種の発生を増加させる目的で、人工授精の間に実施され得る。両方の場合において、この遺伝子またはその遺伝子産物は、子宮内膜および胎盤の健全な発達を促進するために、妊娠の後期段階において投与され得る。さらに、この遺伝子に対応する翻訳産物、およびこれらの翻訳産物に対する抗体は、上に列挙した組織に対する腫瘍マーカーおよび／または免疫療法標的として、有用性を示し得る。
【００７０】
（遺伝子番号３によってコードされるタンパク質の特徴）
この遺伝子に対応する翻訳産物は、マウスセマホリン（ｓｅｍａｐｈｏｒｉｎ）Ｃタンパク質（Ｇｅｎｂａｎｋ登録番号ＣＡＡ５９９８４を参照のこと）と配列相同性を共有し、このタンパク質は、増殖円錐体（ｇｒｏｗｔｈ　ｃｏｎｅｓ）のガイダンスにおいて、調節的役割を果たすと考えられる。この遺伝子は、インテグリンβと相同性を共有し、従って、この遺伝子に対応する翻訳産物は、インテグリンβと少なくともいくらかの生物学的活性を共有すると予測される。
【００７１】
本発明の好ましいポリペプチドは、以下の残基として配列番号９に示される免疫原性エピトープの、１個、２個、３個、４個、または５個全てを含むか、あるいはこのエピトープからなる：Ａｓｐ−１５９〜Ｇｌｙ−１６５、Ａｌａ−１８８〜Ｔｒｐ−１９３、Ａｒｇ−２１７〜Ｍｅｔ−２２２、Ｈｉｓ−２６２〜Ｇｌｙ−２７４、およびＧｌｕ−２８０〜Ｌｅｕ−２８６。これらのポリペプチドをコードするポリヌクレオチドもまた、本発明によって包含され、これらのポリペプチドの１つ以上を結合する抗体もまた包含される。さらに、これらのポリペプチドのフラグメントおよび改変体（例えば、本明細書中で記載されるようなフラグメント、これらのポリペプチドに少なくとも８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、または９９％同一なポリペプチド、およびこれらのポリペプチドをコードするポリヌクレオチドまたはその相補体によってコードされるポリペプチド）は、本発明によって包含される。本発明のこれらのフラグメントおよび改変体を結合する抗体はまた、本発明によって含まれる。これらのフラグメントおよび改変体をコードするポリヌクレオチドはまた、本発明によって含まれる。
【００７２】
この遺伝子は、主として、胎児の腎臓組織およびＴ細胞において発現され、そしてより少ない程度において、膵臓線癌および結腸腫瘍において発現される。
【００７３】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチド（抗体を含む）は、生物学的サンプル中に存在する腎臓組織または細胞型の示差的同定のため、ならびに腎臓系の疾患および／または障害を含むがそれらに限定されない疾患および状態の診断のための試薬として有用である。同様に、ポリペプチドおよびこれらのポリペプチドに対する抗体は、組織または細胞型の示差的同定のための免疫学的プローブの提供に有用である。上記組織または細胞、特に腎臓系の多数の障害に関して、標準の遺伝子発現レベル（すなわち、その障害を有さない個体由来の健常組織または体液中の発現レベル）に対して有意により高いか、またはより低いレベルのこの遺伝子の発現が、このような障害を有する個体から採取された特定の組織もしくは細胞型（例えば、腎臓組織、癌性組織および創傷組織）または体液（例えば、リンパ、血清、血漿、尿、滑液および髄液）、または別の組織もしくはサンプルの中で、慣用的に検出され得る。
【００７４】
胎児腎臓組織および活性化Ｔ細胞における組織分布、ならびにインテグリンβおよびセマホリンＣに対する相同性は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチド、翻訳産物、および抗体が、腎臓および／または免疫系の疾患および／または障害の診断、検出および／または処置のために有用であることを示す。
【００７５】
この遺伝子に対応する翻訳産物は、細胞と細胞または細胞とマトリックスの接着に関与し得る。これらの翻訳産物は、増強された癌細胞の転移、新脈管形成、または発達において、役割を果たし得る。従って、この遺伝子に対応する翻訳産物に対する拮抗性抗体が好ましい。これらの抗体は、この遺伝子に対応する翻訳産物によって媒介されると考えられる活性（例えば、癌の転移および新脈管形成のような）を排除、低減および／または予防するために、有用である。
【００７６】
セマホリンＣ（これは、増殖円錐体ガイダンスをネガティブに調節する）に対するこの遺伝子の翻訳産物の相同性、および胎児組織における組織分布は、この遺伝子に対応する翻訳産物が、特に胎児腎臓組織のような胎児組織において、増殖円錐体ガイダンスのネガティブ調節に役割を果たし得ることを示す。従って、この遺伝子に対応する翻訳産物に対する抗体は、増殖円錐体発達の促進、およびその増殖において、有用であり得る。
【００７７】
より一般的には、胎児腎臓組織における組織分布は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチド、ポリペプチド、および抗体が、腎臓疾患（ウィルムス腫疾患に加えて、腎不全、腎炎、尿細管性アシドーシス、タンパク尿、膿尿、水腫、腎盂腎炎、水腎症、ネフローゼ症候群、圧挫症候群、糸球体腎炎、血尿、腎仙痛および腎結石、ならびに先天性腎異常（例えば、馬蹄腎、多発性嚢胞腎、およびファンコーニ症候群）が挙げられる）の処置および／または検出において有用であることを示唆する。
【００７８】
さらに、癌性組織および胎児組織における組織分布は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチド、ポリペプチド、および抗体が、癌および他の増殖性障害の診断および処置のために有用であることを示す。胚組織および他の細胞供給源（増殖性細胞によって特徴付けられる）における発現は、このタンパク質が、細胞分化の調節において役割を果たし得、そして癌および他の増殖性障害の診断および処置において、有用性を示し得ることを示唆する。同様に、胚の発達もまた、パターン形成において細胞分化および／またはアポトーシスが関与する決定を包含する。従って、このタンパク質はまた、アポトーシスまたは組織分化に関与し得、そして再度、癌治療において有用であり得る。
【００７９】
あるいは、この遺伝子に対応する翻訳産物は、恐らく増殖因子の異常なアップレギュレーションを介して、過剰増殖に関与し得るか、あるいは恐らく隣接する組織もしくは細胞外マトリックスへの接着を介して、または新脈管形成を増強することによって、転移の増強に関与し得る。従って、これらの翻訳産物に対する拮抗性抗体が好ましい。これらの抗体は、この遺伝子の翻訳産物によって媒介されると考えられる活性（例えば、過剰増殖、癌の転移、および新脈管形成のような）を排除、低減、および／または予防するために、有用である。さらに、この遺伝子に対応する翻訳産物、およびこれらの翻訳産物に対する抗体は、腫瘍マーカーおよび／または上に列挙した器官に対する免疫標的として、用途を示し得る。
【００８０】
（遺伝子番号４によってコードされるタンパク質の特徴）
この遺伝子に対応する翻訳産物は、多数の基底膜硫酸ヘパリンプロテオグリカン（Ｍｕｓ筋由来のペルレカン（ｐｅｒｌｅｃａｎ）を含む）（Ｇｅｎｂａｎｋ登録番号ＡＡＡ３９９１１を参照のこと）と配列相同性を共有する。種々の細胞型の基底膜において発現される、このタンパク質は基底膜（特に、ラミニン）の構築および構成において役割を果たし、そして分子および細胞の、基底膜を横切る移動を調節するための選択的ふるいとして働くと考えられる。ペルレカンもまた、多くの生理学的に重要なリガンド（例えば、増殖因子）の安定化およびタンパク質分解において、役割を果たすと考えられ、従って、増殖因子活性を調節し、そして細胞接着を調節する。これらのタンパク質間の相同性に基づいて、これらのタンパク質は、少なくともいくらかの生物学的活性を共有すると予測される。
【００８１】
この遺伝子に対応する翻訳産物はまた、野鶏属ｇａｌｌｕｓ（Ｇｅｎｂａｎｋ登録番号ＡＡＡ４８５８６を参照のこと）由来のアルギン関連タンパク質と、配列相同性を共有する。このタンパク質は、形質転換増殖因子のメンバーまたはＰＤＧＦファミリーのメンバーを結合する能力を有し得、従って、これらの増殖因子を、マトリックス結合濃縮によって局在化させると考えられる。このことは、これらの分子の影響の領域を特定および限定することによって、シナプス構築物の形成およびその長期間にわたる維持に寄与する。これらのタンパク質間の相同性に基づいて、これらのタンパク質は、少なくともいくらかの生物学的活性を共有すると予測される。
【００８２】
開示されたｃＤＮＡをコードする遺伝子は、第５染色体に存在すると考えられる。従って、本発明に関するポリヌクレオチドは、第５染色体の連鎖分析におけるマーカーとして有用である。
【００８３】
本発明の好ましいポリペプチドは、配列番号１０に以下の残基として示される免疫原性エピトープの、１個、２個、３個、４個、５個、６個、７個、８個、または９個全てを含むか、あるいはこれらのエピトープからなる：Ａｒｇ−８〜Ａｓｐ−１３、Ｐｒｏ−１０６〜Ｇｌｙ−１１６、Ｇｌｙ−１６３〜Ａｓｐ−１７５、Ｔｙｒ−２０３〜Ｉｌｅ−２１１、Ｇｌｙ−２３９〜Ｓｅｒ−２４７、Ｓｅｒ−２７７〜Ａｒｇ−２８２、Ａｒｇ−２９０〜Ｇｌｙ−２９５、Ｔｙｒ−３０２〜Ｓｅｒ−３０９、およびＴｈｒ−３３４〜Ｍｅｔ−３３９。これらのポリペプチドをコードするポリヌクレオチドもまた、本発明によって包含され、これらのポリペプチドの１つ以上を結合する抗体もまた包含される。さらに、これらのポリペプチドのフラグメントおよび改変体（例えば、本明細書中で記載されるようなフラグメント、これらのポリペプチドに少なくとも８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、または９９％同一なポリペプチド、およびストリンジェントな条件下でこれらのポリペプチドをコードするポリヌクレオチド、またはその相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドによってコードされるポリペプチド）は、本発明によって包含される。本発明のこれらのフラグメントおよび改変体を結合する抗体はまた、本発明によって含まれる。これらのフラグメントおよび改変体をコードするポリヌクレオチドはまた、本発明によって含まれる。
【００８４】
この遺伝子は、筋肉腫および精巣組織において発現され、そしてより少ない程度に、肺癌組織および胎児肝臓／脾臓組織において発現される。
【００８５】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチド（抗体を含む）は、生物学的サンプル中に存在する組織または細胞型の示差的同定のため、ならびに筋骨格系および雄性生殖系の疾患および／または障害を含むがそれらに限定されない疾患および状態の診断のための試薬として有用である。同様に、ポリペプチドおよびこれらのポリペプチドに対する抗体は、組織または細胞型の示差的同定のための免疫学的プローブの提供に有用である。上記組織または細胞、特に筋骨格系および雄性生殖系の多数の障害に関して、標準の遺伝子発現レベル（すなわち、その障害を有さない個体由来の健常組織または体液中での発現レベル）に対して有意により高いか、またはより低いレベルのこの遺伝子の発現が、このような障害を有する個体から採取された特定の組織もしくは細胞型（例えば、筋骨格組織、生殖組織、癌性組織および創傷組織）または体液（例えば、リンパ、血清、血漿、尿、滑液および髄液）、または別の組織もしくはサンプルの中で、慣用的に検出され得る。
【００８６】
筋肉腫および精巣組織における組織分布、ならびにパーレカンおよびアグリン関連タンパク質に対する相同性は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチド、翻訳産物、および抗体が、筋骨格系および生殖系の疾患および／または障害の診断、検出および／または処置に有用であることを示す。
【００８７】
この遺伝子に対応する翻訳産物は、筋骨格系の疾患および／または障害、特に、例えば、神経損傷、変性、代謝または炎症性のニューロパシー、末梢ニューロパシー、または環境の毒素もしくは薬物によって引き起こされる神経に対する損傷に起因する筋肉組織の萎縮を処置するのに有用である。これは、筋肉萎縮が、運動ニューロン障害、代謝ストレスまたは栄養不全、免疫系の慢性障害、筋ジストロフィー症候群、先天性ミオパシーまたは後天性ミオパシーに起因する場合、特に、有用である。
【００８８】
より一般的に、精巣組織における組織分布は、この遺伝子に対応する翻訳産物が、適切な精巣機能（例えば、内分泌機能、精子成熟）に関係する状態、ならびに癌の処置および／または診断に有用であることを示す。従って、この遺伝子に対応する翻訳産物は、雄性不妊および／またはインポテンス（不能症）の処置において有用である。この翻訳産物はまた、男性の避妊薬として有用な因子（アンタゴニスト）のような結合因子を同定するために設計されたアッセイにおいて有用である。同様に、この遺伝子の翻訳産物は、精巣癌の処置および／または診断において有用であると考えられる。精巣はまた、身体の他の組織において、特に低レベルで発現され得る転写物の活性な遺伝子発現部位である。従って、これらの翻訳産物は、他の特定の組織または器官において発現され得、ここで、これは、他のプロセス（例えば、いくつかの可能性のある標的指標を挙げると、造血、炎症、骨形成、および腎機能）において、関連した機能的な役割を果たし得る。
【００８９】
さらに、癌組織および胎児組織における組織分布は、この遺伝子に対応する翻訳産物が、癌および他の増殖障害の診断および処置に有用であることを示す。細胞を増殖することによって特徴付けられる胚性組織および他の細胞供給源における発現は、この遺伝子の翻訳産物が細胞分裂の調節において役割を果たし得ることを示唆し、そして癌および他の増殖性障害の診断および処置において有用性を示し得る。同様に、胚発生はまた、パターン形成における細胞分化および／またはアポトーシスに関与する決定を含む。従って、この遺伝子の翻訳産物はまた、アポトーシスまたは組織分化に関与し得、そして癌の治療においてもさらに有用であり得る。
【００９０】
あるいは、この遺伝子に対応する翻訳産物は、非限定的な仮説として、増殖因子の異常なアップレギュレーションによる過剰増殖に関与し得るか、あるいは非限定的な仮説として、隣接組織もしくは細胞外マトリクスへの接着によるかまたは新脈管形成を増強することによって、転移を増加することに関与し得る。従って、この遺伝子の翻訳産物に指向するアンタゴニスト抗体が好ましい。これらの抗体は、この遺伝子の翻訳産物によって媒介されると考えられる活性（例えば、過剰増殖、癌転移、および新脈管形成）を除去、減少および／または予防するのに有用である。さらに、この遺伝子に対応する翻訳産物、ならびにこれらの翻訳産物に指向される抗体は、上に列挙された組織に対する腫瘍マーカーおよび／または免疫療法の標的としての有用性を示し得る。
【００９１】
（遺伝子番号５によってコードされるタンパク質の特徴）
この遺伝子に対応する翻訳産物は、多くのカドヘリンタンパク質（例えば、Ｘｅｎｏｐｕｓ　ｌａｅｖｉｓ由来のカドヘリン前駆体（Ｇｅｎｂａｎｋ受託ＡＡＣ２８０７３を参照のこと））と配列相同性を共有する。カドヘリンは、カルシウム結合膜貫通糖タンパク質であり、これは、細胞−細胞の会合の重要なメディエーターである。この遺伝子の翻訳産物は、カドヘリンファミリーのタンパク質のメンバーであると考えられ、従って、この遺伝子に対応する翻訳産物は、このファミリーのタンパク質のメンバーに対して共通の活性（例えば、細胞−細胞会合を媒介すること）の少なくともいくらかを共有する。
【００９２】
本発明の好ましいポリペプチドは、配列番号１１において残基：Ｐｒｏ−２０〜Ａｒｇ−２６、Ｇｌｎ−３１〜Ｔｈｒ−３６、Ｌｅｕ−７６〜Ａｌａ−８２、Ａｓｐ−１１０〜Ａｓｎ−１１６、Ｇｌｎ−１３５〜Ｇｌｙ−１４０、Ａｒｇ−１４９〜Ａｒｇ−１５４、およびＰｒｏ−２０３〜Ｈｉｓ−２１１として示される免疫原性エピトープの１、２、３、４、５、６、または７全てを含むか、またはこれらからなる。これらのポリペプチドをコードするポリヌクレオチドもまた、
本発明によって含まれ、これらはこれらのポリペプチドの１つ以上に結合する抗体である。さらに、これらのポリペプチドのフラグメントおよび改変体（例えば、本明細書中に記載のフラグメント、これらのポリペプチドおよびストリンジェントな条件下でこれらのポリペプチドをコードするポリヌクレオチドにハイブリダイズする、ポリヌクレオチドによってコードされるポリペプチドに対して少なくとも８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、または９９％同一であるポリペプチド、またはその相補体）は、本発明によって包含される。本発明のこれらのフラグメントおよび改変体に結合する抗体もまた本発明によって包含される。これらのフラグメントおよび改変体をコードするポリヌクレオチドはまた、本発明によって包含される。
【００９３】
この遺伝子は、ケラチノサイト、治癒中の鼡径部創傷組織、乳房組織、およびプロゲステロンで処理されたヒト子宮内膜間質細胞において発現される。
【００９４】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチド（抗体を含む）は、生物学的サンプル中に存在する組織または細胞型の示差的同定のため、ならびに異常な創傷治癒および組織再増殖に関連する疾患および／または障害を含むがそれらに限定されない疾患および状態の診断のための試薬として有用である。同様に、ポリペプチドおよびこれらのポリペプチドに対する抗体は、組織または細胞型の示差的同定のための免疫学的プローブの提供に有用である。上記組織または細胞、特に上皮および内皮の細胞および組織の多数の障害に関して、標準の遺伝子発現レベル（すなわち、その障害を有さない個体由来の健常組織または体液中の発現レベル）に対して有意により高いか、またはより低いレベルのこの遺伝子の発現が、このような障害を有する個体から採取された特定の組織もしくは細胞型（例えば、ケラチノサイト、子宮内膜組織、癌性組織および創傷組織）または体液（例えば、リンパ、血清、血漿、尿、滑液および髄液）、または別の組織もしくは細胞サンプルの中で、慣用的に検出され得る。
【００９５】
ケラチノサイト、治癒中の鼡径部創傷組織、および乳房組織における組織分布、ならびにカドヘリンファミリーのタンパク質に対する相同性は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチド、ポリペプチド、および抗体が、創傷治癒および組織リモデリング（特に、細胞−細胞相互作用に関係するもの）を含む疾患および／または障害の診断、検出、および／または処置に有用である。さらに、これらの翻訳産物は、上皮細胞増殖および／または内皮細胞増殖の促進に有用である。
【００９６】
この遺伝子に対応する翻訳産物は、組織の適切な発生において重大な役割を果たし得、そしてさらに、組織モデリングをもたらす細胞間の相互作用において重要な役割を果たし得る。あるいは、この遺伝子の翻訳産物に指向されるアンタゴニスト（例えば、抗体）は、本発明のカドヘリンポリペプチドの活性を妨げるそして／または排除する際に有用である。このような適用は、特定の細胞型（例えば、癌細胞）の増殖を阻害するのに有用であり得る。
【００９７】
さらに、プロゲステロン処置したヒト子宮内膜細胞および乳房組織における組織分布、ならびにカドヘリンファミリーに対する相同性は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチド、ポリペプチド、および抗体が、雌性生殖疾患または雌性生殖障害を処置／診断する際に有用であることを示唆する。さらに、これらの翻訳産物は、子宮内膜症、再発性の妊娠死産（ｐｒｅｇｎａｎｃｙ　ｌｏｓｓ）、および不妊を処置する際に有用である。不妊の処置において、この翻訳産物は、着床のための子宮内膜の調製において有用であり得、そして局所的または経口的のいずれかで投与され得る。あるいは、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドは、対応する翻訳産物の産生のために、子宮内膜の細胞に、遺伝子置換処置においてトランスフェクトされ得る。同様に、これらの処置は、着床および健常な胚の発生の可能性を増加する目的で、人工受精の間に行われ得る。両者の場合において、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよび翻訳産物は、妊娠の後期の段階で投与され、子宮内膜の健常な発生を促進し得る。さらに、この遺伝子に対応する翻訳産物、ならびにこれらの翻訳産物に指向される抗体は、上に列挙された組織に対する腫瘍マーカーおよび／または免疫療法の標的としての有用性を示し得る。
【００９８】
【表１】
2004504011.tif 000002
表１は、上記の各「遺伝子番号（Ｇｅｎｅ　Ｎｏ．：）」に対応する情報を要約する。「ヌクレオチド配列番号Ｘ（ＮＴ　ＳＥＱ　ＩＤ　ＮＯ：Ｘ）」として同定されるヌクレオチド配列は、表１において同定される「ｃＤＮＡクローン番号Ｖ（ｃＤＮＡ　ｃｌｏｎｅ　ＩＤ　ＮＯ：Ｖ）」から、およびいくつかの場合において、さらなる関連のＤＮＡクローンから得られる、部分的に相同な（「重複する」）配列から構築された。重複する配列は、高い重複性の単一の連続した配列に構築され（通常、各ヌクレオチド位置で３〜５個の重複する配列）、配列番号Ｘとして同定される最終的な配列を得た。
【００９９】
ｃＤＮＡクローン番号Ｖは、その日付に寄託され、そして「ＡＴＣＣ受託番号Ｚおよび日付」において列挙される対応する受託番号が与えられた。寄託物のいくつかは、同じ遺伝子に対応する複数の異なるクローンを含む。「ベクター」は、ｃＤＮＡクローン番号に含まれるベクターの型をいう。
【０１００】
「総ヌクレオチド配列」は、「遺伝子番号」によって同定されるコンティグにおけるヌクレオチドの総数をいう。寄託されたプラスミドは、これらの配列の全てを含み、この配列は、配列番号Ｘの「クローン配列の５’ヌクレオチド」および「クローン配列の３’ヌクレオチド」として示されるヌクレオチドの位置によって反映される。推定メチオニン開始コドン（存在する場合）の配列番号Ｘのヌクレオチドの位置は、「開始コドンの５’ヌクレオチド」として同定される。同様に、推定シグナル配列（存在する場合）の配列番号Ｘのヌクレオチドの位置は、「シグナルペプチドの第一のアミノ酸の５’ヌクレオチド」として同定される。
【０１０１】
翻訳されたアミノ酸配列は、ポリヌクレオチド配列の第１翻訳コドンで始まり、「アミノ酸配列番号Ｙ」として同定されるが、他のリーディングフレームもまた、公知の分子生物学技術を使用して容易に翻訳され得る。これらの代替的オープンリーディングフレームによって産生されるポリペプチドは、本発明によって具体的に意図される。
【０１０２】
配列番号Ｘ（ここで、Ｘは、配列表に開示されたポリヌクレオチド配列のいずれかであり得る）および翻訳される配列番号Ｙ（ここで、Ｙは、配列表に開示されたポリペプチド配列のいずれかであり得る）は、十分に正確であり、そしてそうでなければ、当該分野において周知でありかつ以下でさらに記載される種々の使用に適切である。例えば、配列番号Ｘは、配列番号Ｘに含まれる核酸配列または寄託されたプラスミドに含まれるｃＤＮＡを検出する核酸ハイブリダイゼーションプローブを設計することを含む使用を有するが、これらに限定されない。これらのプローブはまた、生物学的サンプル中の核酸分子にハイブリダイズし、それによって本発明の種々の法医学の方法、および診断の方法を可能にする。同様に、配列番号Ｙから同定されるポリペプチドは、表１において同定されたｃＤＮＡクローンによりコードされる分泌タンパク質に特異的に結合する抗体を産生することを含むが、これらに限定されない使用を有する。
【０１０３】
それにもかかわらず、配列決定反応によって生じるＤＮＡ配列は、配列決定のエラーを含み得る。エラーは、誤って同定されたヌクレオチドとして、または生じたＤＮＡ配列におけるヌクレオチドの挿入または欠失として存在する。誤って挿入されたか、または欠失されたヌクレオチドは、推定アミノ酸配列のリーディングフレームにおいてフレームシフトを引き起こす。これらの場合において、生じたＤＮＡ配列は、実際のＤＮＡ配列と９９．９％（例えば、１０００塩基を超えるオープンリーディングフレームにおける１塩基の挿入または欠失）を超えて同一であり得るにもかかわらず、推定アミノ酸配列は、実際のアミノ酸配列とは異なる。
【０１０４】
従って、ヌクレオチド配列またはアミノ酸配列における正確さを必要とするこれらの適用のために、本発明は、配列番号Ｘとして同定された作製されたヌクレオチド配列、および配列番号Ｙとして同定された推定の翻訳されたアミノ酸配列のみではなく、表１において記載されるような、ＡＴＣＣに寄託された本発明のヒトｃＤＮＡを含むプラスミドＤＮＡのサンプルもまた提供する。各々の寄託されたプラスミドのヌクレオチド配列は、公知の方法に従って寄託されたプラスミドの配列決定により容易に決定され得る。
【０１０５】
次いで、推定アミノ酸配列は、このような寄託物から確認され得る。さらに、特定のプラスミドによりコードされるタンパク質のアミノ酸配列はまた、ペプチド配列決定により、または寄託されたヒトｃＤＮＡを含む適切な宿主細胞中でタンパク質を発現し、このタンパク質を収集し、そしてその配列を決定することにより、直接的に決定され得る。
【０１０６】
また、ｃＤＮＡプラスミドを含むベクターの名前を表１に示す。各ベクターは、当該分野において、慣用的に使用される。以下のさらなる情報は、利便性のために提供される。
【０１０７】
ベクターＬａｍｂｄａ　Ｚａｐ（米国特許第５，１２８，２５６号および同第５，２８６，６３６号）、Ｕｎｉ−Ｚａｐ　ＸＲ（米国特許第５，１２８，２５６号および同第５，２８６，６３６号）、Ｚａｐ　Ｅｘｐｒｅｓｓ（米国特許第５，１２８，２５６号および同第５，２８６，６３６号）、ｐＢｌｕｅｓｃｒｉｐｔ（ｐＢＳ）（Ｓｈｏｒｔ，Ｊ．Ｍ．ら、Ｎｕｃｌｅｉｃ　Ａｃｉｄｓ　Ｒｅｓ．１６：７５８３−７６００（１９８８）；Ａｌｔｉｎｇ−Ｍｅｅｓ，Ｍ．Ａ．およびＳｈｏｒｔ，Ｊ．Ｍ．、Ｎｕｃｌｅｉｃ　Ａｃｉｄｓ　Ｒｅｓ．　１７：９４９４（１９８９））ならびにｐＢＫ（Ａｌｔｉｎｇ−Ｍｅｅｓ，Ｍ．Ａ．ら、Ｓｔｒａｔｅｇｉｅｓ　５：５８−６１（１９９２））は、Ｓｔｒａｔａｇｅｎｅ　Ｃｌｏｎｉｎｇ　Ｓｙｓｔｅｍｓ，Ｉｎｃ．、１１０１１　Ｎ．Ｔｏｒｒｅｙ　Ｐｉｎｅｓ　Ｒｏａｄ、Ｌａ　Ｊｏｌｌａ，ＣＡ，９２０３７から市販されている。ｐＢＳは、アンピシリン耐性遺伝子を含み、そしてｐＢＫはネオマイシン耐性遺伝子を含む。ファージミドｐＢＳは、λＺａｐベクターおよびＵｎｉ−Ｚａｐ　ＸＲベクターから切り出され得、そしてファージミドｐＢＫは、Ｚａｐ発現ベクターから切り出され得る。両方のファージミドは、Ｅ．ｃｏｌｉ株ＸＬ−１　Ｂｌｕｅ（これもまた、Ｓｔｒａｔａｇｅｎｅから入手可能である）に形質転換され得る。
【０１０８】
ベクターｐＳｐｏｒｔ１、ｐＣＭＶＳｐｏｒｔ　１．０、ｐＣＭＶＳｐｏｒｔ　２．０およびｐＣＭＶＳｐｏｒｔ３．０は、Ｌｉｆｅ　Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ、Ｉｎｃ．、Ｐ．Ｏ．Ｂｏｘ　６００９、Ｇａｉｔｈｅｒｓｂｕｒｇ，ＭＤ　２０８９７から得られた。全てのＳｐｏｒｔベクターはアンピシリン耐性遺伝子を含み、そしてＥ．ｃｏｌｉ株ＤＨ１０Ｂ（これもまた、Ｌｉｆｅ　Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓから入手可能である）に形質転換され得る。例えば、Ｇｒｕｂｅｒ，Ｃ．Ｅ．ら、Ｆｏｃｕｓ　１５：５９（１９９３）を参照のこと。ベクターｌａｆｍｉｄ　ＢＡ（Ｂｅｎｔｏ　Ｓｏａｒｅｓ、Ｃｏｌｕｍｂｉａ　Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ、Ｎｅｗ　Ｙｏｒｋ、ＮＹ）は、アンピシリン耐性遺伝子を含み、そしてＥ．ｃｏｌｉ株ＸＬ−１　Ｂｌｕｅに形質転換され得る。ベクターｐＣＲ（登録商標）２．１（これはＩｎｖｉｔｒｏｇｅｎ、１６００　Ｆａｒａｄａｙ　Ａｖｅｎｕｅ、Ｃａｒｌｓｂａｄ、ＣＡ　９２００８から入手可能である）は、アンピシリン耐性遺伝子を含み、そしてＥ．ｃｏｌｉ株ＤＨ１０Ｂ（Ｌｉｆｅ　Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓから入手可能である）に形質転換され得る。例えば、Ｃｌａｒｋ，Ｊ．Ｍ．、Ｎｕｃ．Ａｃｉｄｓ　Ｒｅｓ．１６：９６７７−９６８６（１９８８）およびＭｅａｄ，Ｄ．ら、Ｂｉｏ／Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ　９：（１９９１）を参照のこと。
【０１０９】
本発明はまた、配列番号Ｘ、配列番号Ｙ、および／または寄託されたプラスミド（ｃＤＮＡプラスミドＶ）に対応する遺伝子に関する。対応する遺伝子は、本明細書中に開示される配列情報を使用して、公知の方法に従って単離され得る。このような方法は、開示された配列からプローブまたはプライマーを調製する工程、およびゲノム物質の適切な供給源から対応する遺伝子を同定または増幅する工程を包含するが、これらに限定されない。
【０１１０】
本発明においてまた提供されるものは、対立遺伝子改変体、オルソログ（ｏｒｔｈｏｌｏｇ）、および／または種相同体である。当該分野において公知である手順は、本明細書中で開示された配列またはＡＴＣＣに寄託されたクローンからの情報を用いて、配列番号Ｘ、配列番号Ｙ、および／またはｃＤＮＡプラスミドＶに対応する遺伝子の全長遺伝子、対立遺伝子改変体、スプライス改変体、全長コード部分、オルソログ、および／または種相同体を得るために使用され得る。例えば、対立遺伝子改変体および／または種相同体は、本明細書中に提供される配列から適切なプローブまたはプライマーを作製し、そして対立遺伝子改変体および／または所望の相同体について適切な核酸供給源をスクリーニングすることにより単離および同定され得る。
【０１１１】
本発明は、配列番号Ｘの核酸配列および／またはｃＤＮＡプラスミドＶを含むか、あるいはこれらからなるポリヌクレオチドを提供する。本発明はまた、配列番号Ｙのポリペプチド配列、配列番号Ｘによりコードされるポリペプチド、および／またはｃＤＮＡプラスミドＶ中のｃＤＮＡによりコードされるポリペプチドを含むか、あるいはこれらからなるポリペプチドを提供する。配列番号Ｙのポリペプチド配列、配列番号Ｘによりコードされるポリペプチド、および／またはｃＤＮＡプラスミドＶ中のｃＤＮＡによりコードされるポリペプチドを含むか、あるいはこれらからなるポリペプチドをコードするポリヌクレオチドはまた、本発明により包含される。本発明はさらに、配列番号Ｘの核酸配列の相補体、および／またはｃＤＮＡプラスミドＶ中のｃＤＮＡのコード鎖の相補体を含むか、あるいはこれらからなるポリヌクレオチドを包含する。
【０１１２】
多くのポリヌクレオチド配列（例えば、ＥＳＴ配列）は、公に利用可能であり、そして配列データベースを通してアクセス可能であり、そして本発明の着想の前に公に利用可能であったかもしれない。好ましくは、このような関連するポリヌクレオチドは、本発明の範囲から特に除外される。全ての関連配列を列挙することは、本出願の開示では非常に煩わしい。従って、好ましくは、配列番号Ｘから、一般式ａ−ｂにより記載されるヌクレオチド配列（ここで、ａは配列番号Ｘの１と配列番号Ｘの最終ヌクレオチド−１５との間の任意の整数であり、ｂは１５〜配列番号Ｘの最終ヌクレオチドの整数であり、ここでａおよびｂの両方は配列番号Ｘに示されるヌクレオチド残基の位置に対応し、そしてここでｂはａ＋１４以上である）を含む１つ以上のポリヌクレオチドが除外される。
【０１１３】
（全長遺伝子の回収のためのＲＡＣＥプロトコル）
部分的ｃＤＮＡクローンは、Ｆｒｏｈｍａｎ，Ｍ．Ａら、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔ’ｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ，８５：８９９８−９００２（１９８８）に記載されたｃＤＮＡ末端の高速増幅（ＲＡＣＥ）手順を利用することにより全長を作製し得る。５’末端または３’末端のいずれかが欠失しているｃＤＮＡクローンは、翻訳の開始コドンまたは終止コドンのそれぞれに伸長する欠失塩基対を含むように再構築され得る。いくつかの場合において、ｃＤＮＡは、そのために翻訳の開始を欠失している。以下に、この本来の５’ＲＡＣＥ手順の改変を簡単に記載する。ポリＡ＋または全ＲＮＡを、Ｓｕｐｅｒｓｃｒｉｐｔ　ＩＩ（Ｇｉｂｃｏ／ＢＲＬ）およびｃＤＮＡ配列に特異的なアンチセンスプライマーまたは相補的プライマーを用いて逆転写する。そのプライマーを、Ｍｉｃｒｏｃｏｎ　Ｃｏｎｃｅｎｔｒａｔｏｒ（Ａｍｉｃｏｎ）を用いて反応から除去する。次いで、第１鎖ｃＤＮＡを、ｄＡＴＰおよび末端デオキシヌクレオチドトランスフェラーゼ（Ｇｉｂｃｏ／ＢＲＬ）を用いて、テイルに付加した。このように、ＰＣＲ増幅のために必要なアンカー配列を産生する。第２鎖をＰＣＲ緩衝液中のｄＡ−テイル、ＴａｑＤＮＡポリメラーゼ（Ｐｅｒｋｉｎ−Ｅｌｍｅｒ　Ｃｅｔｕｓ）、５’末端で３つの隣接制限部位（ＸｈｏＩ、ＳａｌＩおよびＣｌａＩ）を含むオリゴｄＴプライマーならびにこれらの制限部位を正しく含むプライマーから合成する。この２本鎖ｃＤＮＡを同じプライマーならびにネスト（ｎｅｓｔｅｄ）されたｃＤＮＡ特異的アンチセンスプライマーを用いて４０サイクルの間、ＰＣＲ増幅する。このＰＣＲ産物を、エチジウムブロマイドアガロースゲル上でサイズ分離し、そして欠失しているタンパク質コードＤＮＡの推定サイズのｃＤＮＡ産物を含むゲルの領域を取り出す。ｃＤＮＡをＭａｇｉｃ　ＰＣＲ　Ｐｒｅｐ　ｋｉｔ（Ｐｒｏｍｅｇａ）を用いてアガロースゲルから精製し、ＸｈｏＩまたはＳａｌＩを用いて制限消化し、そしてプラスミド（例えば、ｐＢｌｕｅｓｃｒｉｐｔ　ＳＫＩＩ（Ｓｔｒａｔａｇｅｎｅ））にＸｈｏＩ部位およびＥｃｏＲＶ部位で連結する。このＤＮＡを細菌に形質転換し、そしてこのプラスミドクローンを配列決定して、正確なタンパク質コード挿入物を同定する。正確な５’末端を、推定的に同定された相同体を有するこの配列と部分的ｃＤＮＡクローンを有する重複を比較することにより確認する。当該分野において公知の同様の方法および／または市販のキットを使用して、増幅し、そして３’末端を回収する。
【０１１４】
いくつかの、品質制御キットが購入のために市販されている。上記のそれらと同様の試薬および方法は、全長遺伝子を回収をするための５’　ＲＡＣＥおよび３’ＲＡＣＥの両方について、Ｇｉｂｃｏ／ＢＲＬからキットの形態で供給される。第２のキットは、Ｃｌｏｎｔｅｃｈから入手可能である。このキットは、Ｄｕｍａｓら、Ｎｕｃｌｅｉｃ　Ａｃｉｄｓ　Ｒｅｓ．，１９：５２２７−３２（１９９１）により開発された、関連技術（ＳＬＩＣ（一本鎖ｃＤＮＡへの、一本鎖の連結））の改変である。手順における主な違いは、ＲＮＡを、逆転写後にアルカリ加水分解し、そしてＲＮＡリガーゼを使用して、第１鎖ｃＤＮＡに、制限部位を含むアンカープライマーを連結することである。これは、過去に配列決定をするのが困難なポリＴの伸長を生じるｄＡテーリング反応の必要性を除去する。
【０１１５】
ＲＮＡからの５’ｃＤＮＡまたは３’ｃＤＮＡを産生する代替法は、ｃＤＮＡライブラリー二本鎖ＤＮＡを使用することである。非対称性ＰＣＲ増幅アンチセンスｃＤＮＡ鎖を、アンチセンスｃＤＮＡ特異的プライマーおよびプラスミドアンカープライマーを用いて合成する。これらのプライマーを除去し、そして対称ＰＣＲ反応を、ネストしたｃＤＮＡ特異的アンチセンスプライマーおよびプラスミドアンカープライマーを用いて実施する。
【０１１６】
（５’末端配列または３’末端配列を産生し、全長遺伝子を得るための、ＲＮＡリガーゼのプロトコル）
一旦、目的の遺伝子が同定されると、本来のｃＤＮＡプラスミド中には存在しないかもしれない遺伝子の５’部分または３’部分の同定のためのいくつかの方法が利用可能になる。これらの方法は、以下を含むがこれらに限定されない：フィルタープローブ探索、特異的プローブを使用するクローン富化、ならびに５’ＲＡＣＥおよび３’ＲＡＣＥと類似および同一のプロトコル。全長遺伝子は、ライブラリー中に存在し得、そして探索によって同定され得るが、一方、５’末端または３’末端を生成するために有用な方法は、欠けている情報を生成するために、本来のｃＤＮＡからの既存の配列情報を、使用することである。５’ＲＡＣＥに類似する方法は、所望の全長遺伝子の欠けている５’末端を生成するために利用可能である（この方法は、Ｆｒｏｍｏｎｔ−Ｒａｃｉｎｅら、Ｎｕｃｌｅｉｃ　Ａｃｉｄｓ　Ｒｅｓ．，２１（７）：１６８３−１６８４（１９９３）によって発表された）。簡潔には、特定のＲＮＡオリゴヌクレオチドを、全長遺伝子ＲＮＡ転写物をおそらく含むＲＮＡの集団の５’末端に連結し、そして連結されたＲＮＡオリゴヌクレオチドに特異的なプライマーおよび目的の遺伝子の既知の配列に特異的なプライマーを含むプライマーセットを使用して、所望の全長遺伝子の５’部分をＰＣＲ増幅する。次いで、この増幅した産物を配列決定し得、そしてこれを使用して全長遺伝子を生成し得る。この方法は、所望の供給源から単離された総ＲＮＡを用いて開始し、この手順では必須ではないが、ポリＡ　ＲＮＡを使用し得る。次いで、ＲＮＡ調製物を、必要ならばホスファターゼで処理して、後のＲＮＡリガーゼ工程を妨害し得る分解または損傷ＲＮＡの５’リン酸基を排除し得る。次いで、ホスファターゼを不活化し（使用した場合）、そしてＲＮＡをメッセンジャーＲＮＡの５’末端に存在するキャップ構造を除去するために、タバコ酸性ピロホスファターゼを用いて処理する。この反応は、次いでＴ４　ＲＮＡリガーゼを用いてＲＮＡオリゴヌクレオチドに連結され得る、キャップ切断ＲＮＡの５’末端に５’リン酸基を残す。次いで、この改変されたＲＮＡ調製物を、遺伝子特異的なオリゴヌクレオチドを用いる、第一鎖ｃＤＮＡ合成のためのテンプレートとして使用し得る。次いで、第一鎖合成反応物を、連結されたＲＮＡオリゴヌクレオチドに特異的なプライマーおよび目的のＥＣＭ遺伝子の公知の配列に特異的なプライマーを用いる、所望の５’末端のＰＣＲ増幅のためのテンプレートとして使用し得る。次いで、得られた生成物を配列決定し、そして分析して５’末端配列が関連するＥＣＭ遺伝子に属することを確認する。
【０１１７】
（ポリヌクレオチドフラグメントおよびポリペプチドフラグメント）
本発明はまた、本発明のポリヌクレオチド（核酸）の、ポリヌクレオチドフラグメントに関する。本発明において、「ポリヌクレオチドフラグメント」とは、以下である核酸配列を有するポリヌクレオチドをいう：ｃＤＮＡプラスミドＶに含まれるｃＤＮＡの一部か、もしくはｃＤＮＡプラスミドＶに含まれるｃＤＮＡによりコードされるポリペプチドをコードするｃＤＮＡの一部；配列番号Ｘもしくはその相補鎖におけるポリヌクレオチド配列の一部；配列番号Ｙのポリペプチドの一部をコードするポリヌクレオチド配列；あるいは配列番号Ｘによりコードされるポリペプチドの一部をコードするポリヌクレオチド配列。本発明のヌクレオチドフラグメントは、好ましくは、少なくとも約１５ｎｔ、そしてより好ましくは少なくとも約２０ｎｔ、さらにより好ましくは少なくとも約３０ｎｔ、そしてなおより好ましくは少なくとも約４０ｎｔ、少なくとも約５０ｎｔ、少なくとも約７５ｎｔ、少なくとも約１００ｎｔ、少なくとも約１２５ｎｔ、または少なくとも約１５０ｎｔの長さである。例えば、「少なくとも約２０ｎｔの長さ」のフラグメントは、例えば、ｃＤＮＡプラスミドＶのｃＤＮＡ配列に含まれる配列または配列番号Ｘもしくはその相補鎖に示されるヌクレオチド配列由来の２０以上の連続する塩基を含むことが意図される。この文脈において「約（おおよそ）」は、特に記載された値、あるいはそれより数個（５、４、３、２、または１）のヌクレオチドだけ大きいかまたは小さな値を含む。これらのヌクレオチドフラグメントは、本明細書中で議論されるように、診断プローブおよびプライマーとしての使用を含むが、それらに限定されない使用を有する。もちろん、より大きなフラグメント（例えば、少なくとも１５０、１７５、２００、２５０、５００、６００、１０００または２０００のヌクレオチドの長さ）もまた、本発明に含まれる。
【０１１８】
さらに、本発明のポリヌクレオチドフラグメントの代表例としては、例えば、配列番号Ｘ、またはその相補鎖の以下のおおよそのヌクレオチド数の配列を含むか、あるいはそれらからなるフラグメントが挙げられる：１〜５０、５１〜１００、１０１〜１５０、１５１〜２００、２０１〜２５０、２５１〜３００、３０１〜３５０、３５１〜４００、４０１〜４５０、４５１〜５００、５０１〜５５０、５５１〜６００、６０１〜６５０、６５１〜７００、７０１〜７５０、７５１〜８００、８０１〜８５０、８５１〜９００、９０１〜９５０、９５１〜１０００、１００１〜１０５０、１０５１〜１１００、１１０１〜１１５０、１１５１〜１２００、１２０１〜１２５０、１２５１〜１３００、１３０１〜１３５０、１３５１〜１４００、１４０１〜１４５０、１４５１〜１５００、１５０１〜１５５０、１５５１〜１６００、１６０１〜１６５０、１６５１〜１７００、１７０１〜１７５０、１７５１〜１８００、１８０１〜１８５０、１８５１〜１９００、１９０１〜１９５０、１９５１〜２０００、２００１〜２０５０、２０５１〜２１００、２１０１〜２１５０、２１５１〜２２００、２２０１〜２２５０、２２５１〜２３００、２３０１〜２３５０、２３５１〜２４００、２４０１〜２４５０、２４５１〜２５００、２５０１〜２５５０、２５５１〜２６００、および／または２６００〜２６４３。この文脈において、「おおよそ（約）」は、特に記載された範囲、またはいずれかの末端もしくは両方の末端において、これより数個（５、４、３、２、または１）のヌクレオチドだけ大きいか、または小さな範囲を含む。好ましくは、これらのフラグメントは、その配列が一部であるポリヌクレオチドによりコードされるポリペプチドの、機能的活性（例えば、生物学的活性）を有するポリペプチドをコードする。より好ましくは、これらのフラグメントは、本明細書中で議論されるようにプローブまたはプライマーとして使用され得る。ストリンジェントなハイブリダイゼーション条件下またはより低いストリンジェンシー条件下でこれらのフラグメントの１つ以上にハイブリダイズするポリヌクレオチドもまた本発明に含まれ、これらのポリヌクレオチドまたはフラグメントによりコードされるポリペプチドも同様に含まれる。
【０１１９】
さらに、本発明のポリヌクレオチドフラグメントの代表例としては、例えば、ｃＤＮＡプラスミドＶに含まれるｃＤＮＡヌクレオチド配列、またはその相補鎖の以下のおおよそのヌクレオチド数の配列を含むか、あるいはそれらからなるフラグメントが挙げられる：１〜５０、５１〜１００、１０１〜１５０、１５１〜２００、２０１〜２５０、２５１〜３００、３０１〜３５０、３５１〜４００、４０１〜４５０、４５１〜５００、５０１〜５５０、５５１〜６００、６０１〜６５０、６５１〜７００、７０１〜７５０、７５１〜８００、８０１〜８５０、８５１〜９００、９０１〜９５０、９５１〜１０００、１００１〜１０５０、１０５１〜１１００、１１０１〜１１５０、１１５１〜１２００、１２０１〜１２５０、１２５１〜１３００、１３０１〜１３５０、１３５１〜１４００、１４０１〜１４５０、１４５１〜１５００、１５０１〜１５５０、１５５１〜１６００、１６０１〜１６５０、１６５１〜１７００、１７０１〜１７５０、１７５１〜１８００、１８０１〜１８５０、１８５１〜１９００、１９０１〜１９５０、１９５１〜２０００、２００１〜２０５０、２０５１〜２１００、２１０１〜２１５０、２１５１〜２２００、２２０１〜２２５０、２２５１〜２３００、２３０１〜２３５０、２３５１〜２４００、２４０１〜２４５０、２４５１〜２５００、２５０１〜２５５０、２５５１〜２６００、および／または２６００〜２６４３。この文脈において、「おおよそ（約）」は、特に記載された範囲、あるいはいずれかの末端もしくは両方の末端において、これより数個（５、４、３、２、または１）のヌクレオチドだけ大きいか、または小さな範囲を含む。好ましくは、これらのフラグメントは、ｃＤＮＡプラスミドＶに含まれるｃＤＮＡヌクレオチド配列によってコードされるポリペプチドの機能的活性（例えば、生物学的活性）を有するポリペプチドをコードする。より好ましくは、これらのフラグメントは、本明細書中で議論されるように、プローブまたはプライマーとして使用され得る。ストリンジェントなハイブリダイゼーション条件下またはより低いストリンジェンシー条件下で１つ以上のこれらのフラグメントにハイブリダイズするポリヌクレオチドもまた本発明に含まれ、これらのポリヌクレオチドまたはフラグメントによりコードされるポリペプチドも同様に本発明に含まれる。
【０１２０】
本発明において、「ポリペプチドフラグメント」とは、配列番号Ｙに含まれるアミノ酸配列の一部、配列番号Ｘのポリヌクレオチド配列によってコードされるアミノ酸配列の一部、および／またはｃＤＮＡプラスミドＶ中のｃＤＮＡによってコードされるアミノ酸配列の一部であるアミノ酸配列をいう。タンパク質（ポリペプチド）フラグメントは、「自立構造（ｆｒｅｅ−ｓｔａｎｄｉｎｇ）」であり得るか、あるいはより大きなポリペプチド（このフラグメントが、部分または領域（最も好ましくは単一の連続した領域として）を形成する）内に含まれ得る。本発明のポリペプチドフラグメントの代表例としては、例えば、配列番号Ｙのコード領域の、以下のおおよそのアミノ酸数のアミノ酸配列を含むか、あるいはそれらからなるフラグメントが挙げられる：１〜２０、２１〜４０、４１〜６０、６１〜８０、８１〜１００、１０１〜１２０、１２１〜１４０、１４１〜１６０、１６１〜１８０、１８１〜２００、２０１〜２２０、２２１〜２４０、２４１〜２６０、２６１〜２８０、２８１〜３００、３０１〜３２０、３２１〜３４０、３４１〜３６０、３６１〜３８０、３８１〜４００、４０１〜４２０、４２１〜４４０、４４１〜４６０、４６１〜４８０、４８１〜５００、５０１〜５２０、５２１〜５４０、５４１〜５６０、５６１〜５８０、５８１〜６００、６０１〜６２０、６２１〜６４０、６４１〜６６０、６６１〜６８０、６８１〜７００、７０１〜７２０、７２１〜７４０、７４１〜７６０、７６１〜７８０、および／または７８１〜７９８。さらに、本発明のポリペプチドフラグメントは、少なくとも約１０、１５、２０、２５、３０、３５、４０、４５、５０、５５、６０、６５、７０、７５、８０、８５、９０、１００、１１０、１２０、１３０、１４０、または１５０のアミノ酸の長さであり得る。この文脈において、「約（おおよそ）」とは、特に記載された範囲または値、あるいはいずれかの末端もしくは両方の末端において、これより数個（５、４、３、２、または１）のアミノ酸だけ大きいかまたは小さな、範囲または値を含む。これらのポリペプチドフラグメントをコードするポリヌクレオチドもまた、本発明に含まれる。
【０１２１】
タンパク質のＮ末端からの１つ以上のアミノ酸の欠失が、タンパク質の１つ以上の生物学的機能の損失の改変を生じるとしても、他の機能的活性（例えば、生物学的活性、多量体化する能力、リガンドに結合する能力）は、なお保持され得る。例えば、ポリペプチドの完全な形態または成熟形態を認識する抗体を誘導するおよび／または抗体に結合する、短縮型ムテインの能力は、完全なポリペプチド、または成熟ポリペプチドの大部分より少ない残基が、Ｎ末端から除去される場合には、一般的に保持される。完全なポリペプチドのＮ末端残基を欠く特定のポリペプチドが、このような免疫原性活性を保持するか否かは、本明細書中に記載される慣用的な方法、およびそうでなければ当該分野において公知の別の方法によって容易に決定され得る。多数の欠失したＮ末端アミノ酸残基を有するムテインは、いくつかの生物学的活性または免疫原性活性を保持し得るようである。実際に、６つと同じくらい少ないアミノ酸残基からなるペプチドは、しばしば免疫応答を惹起し得る。
【０１２２】
従って、本発明のポリペプチドフラグメントとしては、分泌タンパク質および成熟形態が挙げられる。さらに好ましいポリペプチドフラグメントとしては、アミノ末端もしくはカルボキシ末端またはその両方から、連続した一連の欠失した残基を有する分泌タンパク質、もしくは成熟形態が挙げられる。例えば、任意の数のアミノ酸（１〜６０の範囲）は、分泌ポリペプチドもしくは成熟形態のいずれかのアミノ末端から欠失され得る。同様に、任意の数のアミノ酸（１〜３０の範囲）が、分泌タンパク質もしくは成熟形態のカルボキシ末端から欠失され得る。さらに、上記のアミノ末端およびカルボキシ末端の欠失の任意の組み合わせが好ましい。同様に、これらのポリペプチドフラグメントをコードするポリヌクレオチドもまた好ましい。
【０１２３】
本発明は、本明細書中で開示されるポリペプチド（例えば、配列番号Ｙのポリペプチド、配列番号Ｘに含まれるポリヌクレオチド配列によりコードされるポリペプチド、および／またはｃＤＮＡプラスミドＶに含まれるｃＤＮＡによりコードされるポリペプチド）のアミノ酸配列のアミノ末端から、１つ以上の欠失した残基を有するポリペプチドを、さらに提供する。特に、Ｎ末端の欠失は、一般式ｍ−ｑによって記載され得、ここでｑは、本発明のポリペプチド（例えば、配列番号Ｙに開示されるポリペプチド）におけるアミノ酸残基の総数を表す全整数であり、そしてｍは、２〜ｑ−６の範囲の任意の整数として定義される。これらのポリペプチドをコードするポリヌクレオチド（フラグメントおよび／または改変体を含む）もまた、本発明に含まれる。
【０１２４】
また、上記のように、タンパク質のＣ末端からの１つ以上のアミノ酸の欠失が、このタンパク質の１つ以上の生物学的機能の損失の改変を生じるとしても、他の機能的活性（例えば、生物学的活性、多量体化する能力、リガンドに結合する能力）は、なお保持され得る。例えば、ポリペプチドの完全な形態または成熟形態を認識する抗体を誘導するおよび／またはこの抗体に結合する、短縮型ムテインの能力は、完全なポリペプチド、または成熟ポリペプチドの大部分より少ない残基が、Ｃ末端から除去される場合には、一般的に保持される。完全なポリペプチドのＣ末端残基を欠く特定のポリペプチドが、このような免疫原性活性を保持するか否かは、本明細書中に記載される慣用的な方法、およびそうでなければ当該分野において公知の他の方法によって容易に決定され得る。多数の欠失したＣ末端アミノ酸残基を有するムテインは、いくつかの生物学的活性または免疫原性活性を保持し得るようである。実際に、６つと同じくらい少ないアミノ酸残基からなるペプチドは、しばしば免疫応答を惹起し得る。
【０１２５】
従って、本発明は、本明細書中で開示されるポリペプチド（例えば、配列番号Ｙのポリペプチド、配列番号Ｘに含まれるポリヌクレオチド配列によりコードされるポリペプチド、および／またはｃＤＮＡプラスミドＶに含まれるｃＤＮＡによりコードされるポリペプチド）のアミノ酸配列のカルボキシ末端からの１つ以上の残基を有するポリペプチドを、さらに提供する。特に、Ｃ末端の欠失は、一般式１−ｎによって記載され得、ここでｎは、６〜ｑ−１の範囲の任意の全整数であり、そしてここでｎは、本発明のポリペプチドにおけるアミノ酸残基の位置に対応する。これらのポリペプチドをコードするポリヌクレオチド（フラグメントおよび／または改変体を含む）もまた、本発明により含まれる。
【０１２６】
さらに、上記のＮ末端またはＣ末端の欠失のいずれかを組み合わせて、Ｎ末端およびＣ末端欠失のポリペプチドを作製し得る。本発明はまた、アミノ末端およびカルボキシ末端の両方から１つ以上の欠失したアミノ酸を有するポリペプチドを提供する。このポリペプチドは、一般的に、配列番号Ｘ（例えば、好ましくは配列番号Ｙとして開示されるポリペプチドを含むが、これに限定されない）および／またはｃＤＮＡプラスミドＶ中のｃＤＮＡ、ならびに／あるいはそれらの相補鎖によってコードされるポリペプチドの、残基ｍ−ｎを有するとして記載され得、ここでｎおよびｍは、上記のような整数である。これらのポリペプチドをコードするポリヌクレオチド（フラグメントおよび／または改変体を含む）もまた、本発明に含まれる。
【０１２７】
配列番号Ｙのポリペプチドに含まれる任意のポリペプチド配列、配列番号Ｘとして示されるポリヌクレオチド配列によってコードされる、任意のポリペプチド配列、またはｃＤＮＡプラスミドＶ中のｃＤＮＡによってコードされる任意のポリペプチド配列は、そのポリペプチドの特定の好ましい領域を決定するために、分析され得る。例えば、配列番号ＸまたはｃＤＮＡプラスミドＶ中のｃＤＮＡのポリヌクレオチド配列によってコードされるポリペプチドのアミノ酸配列は、ＤＮＡＳＴＡＲコンピュータアルゴリズム（ＤＮＡＳＴＡＲ，Ｉｎｃ．，１２２８　Ｓ．Ｐａｒｋ　Ｓｔ．，Ｍａｄｉｓｏｎ，ＷＩ　５３７１５　ＵＳＡ；ｈｔｔｐ：／／ｗｗｗ．ｄｎａｓｔａｒ．ｃｏｍ／）のデフォルトパラメーターを使用して、分析され得る。
【０１２８】
ＤＮＡＳＴＡＲコンピュータアルゴリズムを使用して慣用的に得られ得るポリペプチドの領域としては、以下が挙げられるが、それらに限定されない：Ｇａｒｎｉｅｒ−Ｒｏｂｓｏｎのα−領域、β−領域、ターン領域、およびコイル領域、Ｃｈｏｕ−Ｆａｓｍａｎのα−領域、β−領域、およびターン領域、Ｋｙｔｅ−Ｄｏｏｌｉｔｔｌｅの親水性領域および疎水性領域、Ｅｉｓｅｎｂｅｒｇのα−両親媒性領域およびβ−両親媒性領域、Ｋａｒｐｌｕｓ−Ｓｃｈｕｌｚの可撓性領域、Ｅｍｉｎｉの表面形成領域ならびに高い抗原性指標のＪａｍｅｓｏｎ−Ｗｏｌｆの領域。この点で、本発明のとりわけ非常に好ましいポリヌクレオチドの中に、いくつかの構造的特徴（例えば、上記の特徴のいくつか（例えば、１、２、３または４））と組み合わされる領域を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチドがある。
【０１２９】
さらに、Ｋｙｔｅ−Ｄｏｏｌｉｔｔｌｅ親水性領域および疎水性領域、Ｅｍｉｎｉ表面形成領域、ならびに高い抗原性指標のＪａｍｅｓｏｎ−Ｗｏｌｆ領域（すなわち、Ｊａｍｅｓｏｎ−Ｗｏｌｆプログラムのデフォルトパラメターを使用して同定されるような、１．５より大きいか、または１．５に等しい抗原性指標を有する、４つ以上の連続するアミノ酸を含む）を慣用的に使用して、抗原性に対する高い程度の潜在性を表すポリペプチドの領域を決定し得る。高い抗原性の領域は、免疫応答の開始プロセスにおいて、抗原認識が生じ得る環境中のポリペプチドの表面上に曝されるようであるポリペプチドの領域を表す値を選択することによって、ＤＮＡＳＴＡＲ分析によるデータから決定される。
【０１３０】
本発明の好ましいポリペプチドフラグメントは、そのアミノ酸配列がフラグメントであるポリペプチド配列の、機能的活性（例えば、生物学的活性）を示すアミノ酸配列を含むか、またはあるいは、これらからなるフラグメントである。「機能的活性」を示すポリペプチドとは、全長タンパク質と関連した１つ以上の公知の機能的活性（例えば、前述のような、生物学的活性、抗原性、免疫原性、および／または多量体化など）を示し得るポリペプチドを意味する。
【０１３１】
他の好ましいポリペプチドフラグメントは、生物学的に活性なフラグメントである。生物学的に活性なフラグメントとは、本発明のポリペプチドの活性に対して、同一である必要はないが、類似する活性を示すフラグメントである。このフラグメントの生物学的活性は、改善された所望の活性、または低下した望ましくない活性を含み得る。
【０１３２】
好ましい実施形態において、本発明のポリペプチドは、配列番号Ｙのポリペプチドの１、２、３、４、５以上の抗原性フラグメントか、またはその部分を含むか、またはあるいはそれらからなる。これらのポリペプチドをコードするポリヌクレオチド（フラグメントおよび／または改変体を含む）もまた、本発明に含まれる。
【０１３３】
本発明は、以下のポリペプチドを含むか、またはあるいは以下からなるポリペプチドを含む：配列番号Ｙに示されるポリペプチド配列のエピトープ、またはｃＤＮＡプラスミドＶ中のｃＤＮＡによりコードされるポリペプチド配列のエピトープ、あるいは前述で定義されるように、ストリンジェントなハイブリダイゼーション条件下またはより低いストリンジェンシーハイブリダイゼーション条件下で、配列番号Ｘのエピトープコード配列またはｃＤＮＡプラスミドＶに含まれるエピトープコード配列の相補鎖にハイブリダイズするポリヌクレオチドによってコードされるポリペプチド配列のエピトープ。本発明はさらに、本発明のポリペプチド配列のエピトープをコードするポリヌクレオチド配列（例えば、配列番号Ｘに開示される配列など）、本発明のエピトープをコードするポリヌクレオチド配列の相補鎖のポリヌクレオチド配列、および前記で定義されるように、ストリンジェントなハイブリダイゼーション条件下またはより低いストリンジェンシー条ハイブリダイゼーション件下で、この相補鎖にハイブリダイズするポリヌクレオチド配列を含む。
【０１３４】
用語「エピトープ」とは、本明細書中で使用される場合、動物において、好ましくは哺乳動物において、そして最も好ましくはヒトにおいて抗原性活性または免疫原性活性を有するポリペプチドの部分をいう。好ましい実施形態において、本発明は、エピトープを含むポリペプチド、およびこのポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む。「免疫原性エピトープ」とは、本明細書中で使用される場合、当該分野で公知の任意の方法によって決定されるような（例えば、下記に記載される抗体を産生するための方法による）、動物における抗体応答を誘発するタンパク質の一部として定義される（例えば、Ｇｅｙｓｅｎら、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ　８１：３９９８−４００２（１９８３）を参照のこと）。用語「抗原性エピトープ」とは、本明細書中で使用される場合、当該分野で周知の任意の方法（例えば、本明細書中に記載される免疫アッセイによる）によって決定されるような、抗体がその抗原に免疫特異的に結合し得るタンパク質の一部として定義される。免疫特異的結合は、非特異的結合は除外するが、他の抗原との交差反応を除外する必要はない。抗原性エピトープは、免疫原性である必要はない。
【０１３５】
エピトープとして機能するフラグメントは、任意の従来の方法によって産生され得る。（例えば、Ｈｏｕｇｈｔｅｎ，Ｒ．Ａ．，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ　８２：５１３１−５１３５（１９８５）を参照のこと。これはさらに、米国特許第４，６３１，２１１号に記載される）。
【０１３６】
本発明においては、抗原性エピトープは、好ましくは、少なくとも４、少なくとも５、少なくとも６、少なくとも７アミノ酸配列を含み、より好ましくは、少なくとも８、少なくとも９、少なくとも１０、少なくとも１１、少なくとも１２、少なくとも１３、少なくとも１４、少なくとも１５、少なくとも２０、少なくとも２５、少なくとも３０、少なくとも４０、少なくとも５０アミノ酸配列を含み、そして最も好ましくは約１５アミノ酸と約３０アミノ酸との間の配列を含む。免疫原性エピトープまたは抗原性エピトープを含有する好ましいポリペプチドは、少なくとも１０、１５、２０、２５、３０、３５、４０、４５、５０、５５、６０、６５、７０、７５、８０、８５、９０、９５または１００アミノ酸残基の長さである。さらなる非排他的に好ましい抗原性エピトープは、本明細書中で開示される抗原性エピトープおよびその一部を含む。抗原性エピトープは、有用である（例えば、エピトープに特異的に結合する抗体（モノクローナル抗体を含む）を惹起するため）。好ましい抗原性エピトープは、本明細書中で開示される抗原性エピトープ、および２、３、４、５以上のこれらの抗原性エピトープの任意の組合わせを含む。抗原性エピトープは、イムノアッセイにおいて、標的分子として使用され得る。（例えば、Ｗｉｌｓｏｎら、Ｃｅｌｌ　３７：７６７−７７８（１９８４）；Ｓｕｔｃｌｉｆｆｅら、Ｓｃｉｅｎｃｅ　２１９：６６０−６６６（１９８３）を参照のこと）。
【０１３７】
同様に、免疫原性エピトープを使用して、例えば、当該分野で周知の方法に従う抗体を誘導し得る。（例えば、Ｓｕｔｃｌｉｆｆｅら、前出；Ｗｉｌｓｏｎら，前出；Ｃｈｏｗら、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ　８２：９１０−９１４；およびＢｉｔｔｌｅら、Ｊ．Ｇｅｎ．Ｖｉｒｏｌ．６６：２３４７−２３５４（１９８５）を参照のこと）。好ましい免疫原性エピトープは、本明細書で開示される免疫原性および２、３、４、５以上のこれらの免疫原性エピトープの任意の組合せを含む。１つ以上の免疫原性エピトープを含むポリペプチドは、キャリアタンパク質（例えば、アルブミン）とともに動物系（例えば、ウサギまたはマウス）に対する抗体応答を誘発するために提示され得るか、またはこのポリペプチドが十分に長い場合（少なくとも約２５アミノ酸）、そのポリペプチドはキャリアなしで提示され得る。しかし、８〜１０個程度の少なさのアミノ酸を含む免疫原性エピトープは、少なくとも変性ポリペプチド中の直鎖状エピトープに結合し得る抗体を惹起するには十分であることが示されている（例えば、ウェスタンブロッティングにおいて）。
【０１３８】
本発明のエピトープ保有ポリペプチドは、当該分野で周知の方法に従って抗体を誘導するために使用され得る。これらの周知の方法としては、インビボ免疫、インビトロ免疫、およびファージディスプレイ法が挙げられるが、それらに限定されない。例えば、Ｓｕｔｃｌｉｆｆｅら、前出；Ｗｉｌｓｏｎら、前出、およびＢｉｔｔｌｅら、Ｊ．Ｇｅｎ．Ｖｉｒｏｌ．、６６：２３４７−２３５４（１９８５）を参照のこと。インビボ免疫を使用する場合、動物を遊離ペプチドを用いて免疫し得る；しかし、抗ペプチド抗体力価は、高分子キャリア（例えば、キーホールリンペットヘモシアニン（ＫＬＨ）または破傷風トキソイド）にペプチドを結合させることによりブーストされ得る。例えば、システイン残基を含むペプチドは、マレイミドベンゾイル−Ｎ−ヒドロキシスクシンイミドエステル（ＭＢＳ）のようなリンカーを用いてキャリアに結合され得る。その一方、他のペプチドは、より一般的な結合剤（例えば、グルタルアルデヒド）を用いてキャリアに結合され得る。ウサギ、ラット、およびマウスのような動物は、遊離のペプチドまたはキャリア結合ペプチドのいずれかを用いて、例えば、約１００μｇのペプチドまたはキャリアタンパク質およびフロイントアジュバントまたは免疫応答を刺激することが公知である他のアジュバントを含むエマルジョンを腹腔内注射および／または皮内注射することにより免疫される。いくつかのブースター注射が、抗ペプチド抗体の有用な力価を提供するために、例えば、約２週間の間隔で、必要とされ得る。この力価は、例えば、固体表面に吸着した遊離のペプチドを用いるＥＬＩＳＡアッセイにより検出され得る。免疫した動物由来の血清中の抗ペプチド抗体の力価は、抗ペプチド抗体の選択（例えば、当該分野で周知の方法に従う固体支持体上のペプチドへの吸着および選択された抗体の溶出による）により上昇し得る。
【０１３９】
当業者に理解されるように、そして上記で考察されるように、本発明のポリペプチドおよびその免疫原性エピトープフラグメントおよび／または抗原性エピトープフラグメントは、他のポリペプチド配列に融合され得る。例えば、本発明のポリペプチドは、免疫グロブリン（ＩｇＡ、ＩｇＥ、ＩｇＧ、ＩｇＭ）の定常ドメインまたはそれらの部分（ＣＨ１、ＣＨ２、ＣＨ３、またはそれらの任意の組み合わせ、およびこれらの部分）と融合し得、これがキメラポリペプチドを生じる。このような融合タンパク質は、精製を容易にし得、そしてインビボにおける半減期を増加し得る。このことは、ヒトＣＤ４ポリペプチドの最初の２つのドメインおよび哺乳動物の免疫グロブリンの重鎖または軽鎖の定常領域の種々のドメインからなるキメラタンパク質について示された。例えば、ＥＰ　３９４，８２７；Ｔｒａｕｎｅｃｋｅｒら、Ｎａｔｕｒｅ，３３１：８４−８６（１９８８）を参照のこと。上皮の関門を横切っての免疫系への抗原の増強された送達は、ＦｃＲｎ結合パートナー（例えば、ＩｇＧフラグメントまたはＦｃフラグメント（例えば、ＰＣＴ公開　ＷＯ９６／２２０２４およびＷＯ　９９／０４８１３を参照のこと）に結合体化した抗原（例えば、インスリン）について実証されている。ジスルフィド架橋二量体構造を有するＩｇＧ融合タンパク質はまた、そのＩｇＧ部分ジスルフィド結合に起因して、単量体ポリペプチドまたはそれらのフラグメント単独よりも、他の分子の結合および中和において効果的であることが見出された。例えば、Ｆｏｕｎｔｏｕｌａｋｉｓら、Ｊ．Ｂｉｏｃｈｅｍ．、２７０：３９５８−３９６４（１９９５）を参照のこと。
【０１４０】
同様に、ＥＰ−Ａ−Ｏ　４６４　５３３（カナダ国対応出願２０４５８６９）は、別のヒトタンパク質またはその一部とともに免疫グロブリン分子の定常領域の種々の部分を含む、融合タンパク質を開示する。多くの場合、融合タンパク質中のＦｃ部分は、治療および診断において有利であり、従って、例えば改善された薬物動態学的特性を生じ得る（ＥＰ−Ａ　０２３２　２６２）。あるいは、融合タンパク質が発現、検出、および精製された後に、Ｆｃ部分が欠失され得ることが望ましい。例えば、融合タンパク質が、免疫の抗原として使用される場合、そのＦｃ部分は、治療および診断を妨げ得る。薬物探索において、例えばｈＩＬ−５のようなヒトタンパク質が、ｈＩＬ−５のアンタゴニストを同定するための高処理能力スクリーニングアッセイの目的のためにＦｃ部分と融合されている。（Ｄ．Ｂｅｎｎｅｔｔら、Ｊ．Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ　Ｒｅｃｏｇｎｉｔｉｏｎ　８：５２−５８（１９９５）；Ｋ．Ｊｏｈａｎｓｏｎら、Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．２７０：９４５９−９４７１（１９９５）を参照のこと）。
【０１４１】
さらに、本発明のポリペプチドは、融合されたポリペプチドの精製を容易にするペプチドのような、マーカー配列と融合され得る。好ましい実施形態において、このマーカーアミノ酸配列は、とりわけ、ｐＱＥベクター（ＱＩＡＧＥＮ，Ｉｎｃ．，９２５９　Ｅｔｏｎ　Ａｖｅｎｕｅ，Ｃｈａｔｓｗｏｒｔｈ，ＣＡ，９１３１１）において提供されるタグのようなヘキサ−ヒスチジンペプチドであり、それらの多くは市販されている。例えば、Ｇｅｎｔｚら、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ　８６：８２１−８２４（１９８９）に記載されるように、ヘキサ−ヒスチジンは、融合タンパク質の簡便な精製を提供する。精製に有用な他のペプチドタグである「ＨＡ」タグは、インフルエンザ赤血球凝集素タンパク質由来のエピトープに対応する（Ｗｉｌｓｏｎら、Ｃｅｌｌ　３７：７６７（１９８４））。
【０１４２】
従って、これら上記の融合物のいずれかは、本発明のポリヌクレオチドまたはポリペプチドを用いて操作され得る。
【０１４３】
上記のエピトープをコードする核酸はまた、エピトープタグ（例えば、血球凝集素（「ＨＡ」）タグまたはフラッグタグ（ｆｌａｇ　ｔａｇ））として目的の遺伝子と組換えられ、発現されたポリペプチドの検出および精製を補助し得る。例えば、Ｊａｎｋｎｅｃｈｔらによって記載された系は、ヒト細胞株において発現される非変性融合タンパク質の迅速な精製を可能にする（Ｊａｎｋｎｅｃｈｔら、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ　８８：８９７２−８９７（１９９１））。この系において、目的の遺伝子は、遺伝子のオープンリーディングフレームが、６つのヒスチジン残基からなるアミノ末端タグと翻訳で融合されるように、ワクシニア組換えプラスミド中にサブクローンされる。このタグは、融合タンパク質についての基質結合ドメインとして働く。組換えワクシニアウイルスに感染した細胞由来の抽出物は、Ｎｉ２＋ニトリロ三酢酸アガロースカラムに充填され、そしてヒスチジンタグ化したタンパク質が、イミダゾール含有緩衝液を用いて選択的に溶出され得る。
【０１４４】
本発明のさらなる融合タンパク質は、遺伝子シャッフリング、モチーフシャッフリング、エキソンシャッフリング、および／またはコドンシャッフリング（総称して「ＤＮＡシャッフリング」といわれる）の技術を通じて生成され得る。ＤＮＡシャッフリングを使用して、本発明のポリペプチドの活性を調節し得、このような方法を用いて、変化した活性を有するポリペプチド、ならびにそのポリペプチドのアゴニストおよびアンタゴニストを生成し得る。一般には、米国特許第５，６０５，７９３号；同第５，８１１，２３８号；同第５，８３０，７２１号；同第５，８３４，２５２号；および同第５，８３７，４５８号、ならびにＰａｔｔｅｎら、Ｃｕｒｒ．Ｏｐｉｎｉｏｎ　Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．８：７２４−３３（１９９７）；Ｈａｒａｙａｍａ、Ｔｒｅｎｄｓ　Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．１６（２）：７６−８２（１９９８）；Ｈａｎｓｓｏｎら、Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．２８７：２６５−７６（１９９９）；ならびにＬｏｒｅｎｚｏおよびＢｌａｓｃｏ，Ｂｉｏｔｅｃｈｎｉｑｕｅｓ　２４（２）：３０８−１３（１９９８）（これらの特許および刊行物の各々は、本明細書によってその全体が参考として援用される）を参照のこと。１つの実施形態において、配列番号Ｘに対応するポリヌクレオチドおよびこれらのポリヌクレオチドによってコードされるポリペプチドの改変は、ＤＮＡシャッフリングにより達成され得る。ＤＮＡシャッフリングは、相同組換えまたは部位特異的組換えにより、２つ以上のＤＮＡセグメントをアセンブリして、ポリヌクレオチド配列における変化を産生することを含む。別の実施形態において、本発明のポリヌクオチドまたはコードされるポリペプチドは、組換え前に、エラープローンＰＣＲ、ランダムヌクレオチド挿入または他の方法による、ランダムな変異誘発に供されることによって改変され得る。別の実施形態において、本発明のポリペプチドをコードするポリヌクレオチドの１つ以上の成分、モチーフ、セクション（ｓｅｃｔｉｏｎ）、部分、ドメイン、フラグメントなどは、１つ以上の異種分子の１つ以上の成分、モチーフ、セクション、部分、ドメイン、フラグメントなどと組み換えられ得る。
【０１４５】
（ポリヌクレオチド改変体およびポリペプチド改変体）
本発明はまた、ＥＣＭ改変体を含む。本発明は、配列番号Ｘに開示されるポリヌクレオチド配列の改変体またはそれらに対する相補鎖の改変体、および／またはｃＤＮＡプラスミドＶ中に含まれるｃＤＮＡ配列の改変体に関する。
【０１４６】
本発明はまた、配列番号Ｙに開示されるポリペプチド配列の改変体、配列番号Ｘのポリヌクレオチドによってコードされるポリペプチド配列の改変体および／またはｃＤＮＡプラスミドＶ中のｃＤＮＡによってコードされるポリペプチド配列の改変体を含む。
【０１４７】
「改変体」とは、本発明のポリヌクレオチドまたはポリペプチドとは異なるがそれらの特性は保持している、ポリヌクレオチドまたはポリペプチドをいう。一般的に、改変体は全体的に非常に類似しており、そして、多くの領域において、本発明のポリヌクレオチドまたはポリペプチドと同一である。
【０１４８】
従って、本発明の１つの局面は、以下からなる群より選択されるヌクレオチド配列を有するポリヌクレオチドを含む単離された核酸分子か、あるいはその代わりに以下からなる群より選択されるヌクレオチド配列を有するポリヌクレオチドからなる単離された核酸分子を提供する：（ａ）配列番号Ｘに記載されるヌクレオチド配列、またはクローン番号ＶのｃＤＮＡ配列に含まれるヌクレオチド配列；（ｂ）配列番号Ｘのヌクレオチド配列、または配列番号Ｙの完全アミノ酸配列をコードするクローン番号ＶのｃＤＮＡ、またはクローンＩＤ番号ＶのｃＤＮＡによりコードされる完全アミノ酸配列；（ｃ）配列番号Ｘのヌクレオチド配列または成熟ＥＣＭポリペプチドをコードするクローンＩＤ番号Ｖ中のｃＤＮＡ；（ｄ）配列番号Ｘのヌクレオチド配列またはクローンＩＤ番号ＶのｃＤＮＡ配列（これは、ＥＣＭポリペプチドの生物学的に活性なフラグメントをコードする）；（ｅ）配列番号Ｘのヌクレオチド配列またはクローンＩＤ番号ＶのｃＤＮＡ配列（ＥＣＭポリペプチドの抗原性フラグメントをコードする）；（ｆ）配列番号Ｙの完全アミノ酸配列またはクローンＩＤ番号ＶのｃＤＮＡによってコードされた完全アミノ酸配列を含むＥＣＭポリペプチドをコードするヌクレオチド配列；（ｇ）配列番号Ｙのアミノ酸配列またはクローンＩＤ番号ＶのｃＤＮＡによってコードされたアミノ酸配列の成熟ＥＣＭポリペプチドをコードするヌクレオチド配列；（ｈ）配列番号Ｙの完全アミノ酸配列またはクローンＩＤ番号ＶのｃＤＮＡによってコードされた完全アミノ酸配列を有するＥＣＭポリペプチドの生物学的に活性なフラグメントをコードするヌクレオチド配列；（ｉ）配列番号Ｙの完全アミノ酸配列またはクローンＩＤ番号ＶのｃＤＮＡによってコードされた完全アミノ酸配列を有するＥＣＭポリペプチドの抗原性フラグメントをコードするヌクレオチド配列；ならびに（ｊ）上記の（ａ）、（ｂ）、（ｃ）、（ｄ）、（ｅ）、（ｆ）、（ｇ）、（ｈ）、または（ｉ）における任意のヌクレオチド配列に相補的なヌクレオチド配列。
【０１４９】
本発明はまた、例えば上記の（ａ）、（ｂ）、（ｃ）、（ｄ）、（ｅ）、（ｆ）、（ｇ）、（ｈ）、（ｉ）または（ｊ）中の任意のヌクレオチド配列に少なくとも８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％または１００％同一であるヌクレオチド配列、クローンＩＤ番号Ｖ中に含まれるｃＤＮＡの配列をコードするヌクレオチド、またはその相補鎖、配列番号Ｙのポリペプチドをコードするヌクレオチド配列、配列番号Ｘのヌクレオチド配列によりコードされるポリペプチド配列をコードするヌクレオチド配列、配列番号Ｘのポリヌクレオチド配列の相補体によりコードされるポリペプチド配列、クローンＩＤ番号Ｖに含まれるｃＤＮＡによってコードされるポリペプチドをコードするヌクレオチド配列、表１の１０列に規定されるポリペプチド配列をコードする配列番号Ｘのヌクレオチド配列またはその相補鎖、表１の１０列に規定されるポリペプチドをコードするヌクレオチド配列またはその相補鎖、および／またはこれらの任意の核酸分子のポリヌクレオチドフラグメント（例えば、本明細書に記載のフラグメント）を含むか、あるいはこれらからなる、核酸分子に関する。これらの核酸分子に、ストリンジェントなハイブリダイゼーション条件下または低いストリンジェンシー条件下でハイブリダイズするポリヌクレオチドもまた、これらのポリヌクレオチドおよび核酸分子によってコードされるポリペプチドがそうであるように、本発明によって包含される。
【０１５０】
好ましい実施形態において、本発明は、これらのポリヌクレオチドによりコードされるポリペプチドがそうであるように、上記の（ａ）、（ｂ）、（ｃ）、（ｄ）、（ｅ）、（ｆ）、（ｇ）、（ｈ）または（ｉ）中のポリヌクレオチドに、ストリンジェントな条件下でハイブリダイズするか、あるいは低ストリンジェンシー条件下でハイブリダイズするポリヌクレオチドを含むか、あるいはこのようなポリヌクレオチドからなる核酸分子を包含する。別の好ましい実施形態において、これらの核酸分子の相補体に、ストリンジェントなハイブリダイゼーション条件下または低いストリンジェンシー条件下でハイブリダイズするポリヌクレオチドもまた、これらのポリヌクレオチドおよび核酸分子によってコードされるポリペプチドがそうであるように、本発明によって包含される。
【０１５１】
別の実施形態において、本発明は、以下からなる群より選択されるアミノ酸配列を有するポリペプチドを含むかまたはそれからなる、単離されたタンパク質を提供する：（ａ）配列番号Ｙの完全アミノ酸配列またはクローンＩＤ番号ＶのｃＤＮＡによってコードされる完全アミノ酸配列；（ｂ）配列番号Ｙのアミノ酸配列を有するＥＣＭポリペプチドの成熟形態のアミノ酸配列またはクローンＩＤ番号Ｖによってコードされるアミノ酸配列；（ｃ）配列番号Ｙの完全アミノ酸配列またはクローンＩＤ番号Ｖによってコードされる完全アミノ酸配列を有するＥＣＭポリペプチドの生物学的に活性なフラグメントのアミノ酸配列；ならびに（ｄ）配列番号Ｙの完全アミノ酸配列またはクローンＩＤ番号Ｖによりコードされる完全アミノ酸配列を有するＥＣＭポリペプチドの抗原性フラグメントのアミノ酸配列。
【０１５２】
本発明はまた、例えば、上記（ａ）、（ｂ）、（ｃ）、または（ｄ）におけるアミノ酸配列、配列番号Ｙに示されるアミノ酸配列、クローンＩＤ番号Ｖに含まれるｃＤＮＡによってコードされるアミノ酸配列、表１の１０列目に規定されるアミノ酸配列、配列番号Ｘのヌクレオチド配列によりコードされるアミノ酸配列、および配列番号Ｘのポリヌクレオチド配列の相補体によってコードされるアミノ酸配列のいずれかに少なくとも８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％同一であるアミノ酸配列を含むかまたはそれからなる、タンパク質に関する。これらのポリペプチドによってのフラグメント（例えば、本明細書に記載のフラグメント）もまた提供される。これらのアミノ酸配列をコードする核酸分子の相補体に、ストリンジェントなハイブリダイゼーション条件下またはより低いストリンジェンシー条件下でハイブリダイズするポリヌクレオチドによってコードされるさらなるタンパク質もまた、本発明により包含され、同様に、これらのタンパク質をコードするポリヌクレオチドも、本発明により包含される。
【０１５３】
本発明の参照ヌクレオチド配列に、例えば、少なくとも９５％「同一」であるヌクレオチド配列を有する核酸とは、その核酸のヌクレオチド配列が、そのヌクレオチド配列がポリペプチドをコードする参照ヌクレオチド配列の各１００ヌクレオチドあたり５つまでの点変異を含み得ることを除いて、参照配列に対して同一であることを意図する。換言すれば、参照ヌクレオチド配列に対して少なくとも９５％同一のヌクレオチド配列を有する核酸を得るために、参照配列のヌクレオチドの５％までが、欠失され得るか、または別のヌクレオチドで置換され得るか、あるいは参照配列中の総ヌクレオチドの５％までの数のヌクレオチドが参照配列中に挿入され得る。問い合わせ（ｑｕｅｒｙ）配列は、表１に示される配列全体、ＯＲＦ（オープンリーディングフレーム）、または本明細書中で記載されるように特定される任意のフラグメントであり得る。
【０１５４】
実際問題として、任意の特定の核酸分子またはポリペプチドが、本発明のヌクレオチド配列に対して少なくとも８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、または９９％同一であるか否かは、公知のコンピュータープログラムを使用して従来的に決定され得る。問い合わせ配列（本発明の配列）と対象配列との間の最も良好な全体的な適合性（全体的な配列整列とも呼ばれる）を決定するための好ましい方法は、Ｂｒｕｔｌａｇら（Ｃｏｍｐ．Ａｐｐ．　Ｂｉｏｓｃｉ．６：２３７−２４５（１９９０））のアルゴリズムに基づくＦＡＳＴＤＢコンピュータープログラムを使用して決定され得る。配列整列において、問い合わせ配列および対象配列は、両方ともにＤＮＡ配列である。ＲＮＡ配列は、ＵからＴに変換することによって比較され得る。この全体的な配列整列の結果は、同一性パーセント（％）で示される。同一性パーセントを算定するためにＤＮＡ配列のＦＡＳＴＤＢ整列において使用される好ましいパラメーターは：Ｍａｔｒｉｘ＝Ｕｎｉｔａｒｙ、ｋ−ｔｕｐｌｅ＝４、Ｍｉｓｍａｔｃｈ　Ｐｅｎａｌｔｙ＝１、Ｊｏｉｎｉｎｇ　Ｐｅｎａｌｔｙ＝３０、Ｒａｎｄｏｍｉｚａｔｉｏｎ　Ｇｒｏｕｐ　Ｌｅｎｇｔｈ＝０、Ｃｕｔｏｆｆ　Ｓｃｏｒｅ＝１、Ｇａｐ　Ｐｅｎａｌｔｙ＝５、Ｇａｐ　Ｓｉｚｅ　Ｐｅｎａｌｔｙ　０．０５、Ｗｉｎｄｏｗ　Ｓｉｚｅ＝５００または対象ヌクレオチド配列の長さ（どちらかより短い方）である。
【０１５５】
対象配列が、５’または３’欠失のために（内部欠失のためではなく）問い合わせ配列より短い場合、手動の補正が結果に対してなされなければならない。これは、同一性パーセントを計算する場合に、ＦＡＳＴＤＢプログラムが対象配列の５’および３’の短縮を考慮しないからである。５’末端または３’末端で短縮されている対象配列について、問い合わせ配列に対して、同一性パーセントは、問い合わせ配列の総塩基のパーセントとして一致／整列されない対象配列の５’および３’である問い合わせ配列の塩基の数を計算することによって補正される。ヌクレオチドが一致／整列されるか否かは、ＦＡＳＴＤＢ配列整列の結果によって決定される。次いで、このパーセントは、特定のパラメーターを用いて上記のＦＡＳＴＤＢプログラムによって算定された同一性パーセントから差し引かれ、最終的な同一性パーセントのスコアに到達する。この補正されたスコアが、本発明の目的に使用されるものである。ＦＡＳＴＤＢ整列によって示されるように、問い合わせ配列と一致／整列されない、対象配列の５’および３’の塩基の外側の塩基のみが、同一性パーセントのスコアを手動で調整する目的で算定される。
【０１５６】
例えば、９０塩基の対象配列が、同一性パーセントを決定するために１００塩基の問い合わせ配列に整列される。欠失が、対象配列の５’末端で生じ、従って、ＦＡＳＴＤＢ整列は、５’末端の最初の１０塩基で一致／整列を示さない。１０個の不対合塩基は、配列の１０％（一致していない５’および３’の末端の塩基の数／問い合わせ配列の塩基の総数）を表し、そのため１０％が、ＦＡＳＴＤＢプログラムによって算定される同一性パーセントのスコアから差し引かれる。残りの９０塩基が完全に一致する場合は、最終的な同一性パーセントは９０％である。別の例では、９０塩基の対象配列が、１００塩基の問い合わせ配列と比較される。この場合、欠失は、内部欠失であり、その結果、対象配列の５’または３’に問い合わせと一致／整列しない塩基が存在しない。この場合、ＦＡＳＴＤＢによって算定される同一性パーセントは手動で補正されない。再び、問い合わせ配列と一致／整列しない対象配列の５’または３’の塩基のみが手動で補正される。他の手動の補正は、本発明の目的のためにはなされない。
【０１５７】
本発明の問い合わせアミノ酸配列に、例えば、少なくとも９５％「同一」であるアミノ酸配列を有するポリペプチドにより、対象ポリペプチドのアミノ酸配列は、その対象ポリペプチド配列が問い合わせアミノ酸配列の各１００個のアミノ酸あたり５つまでのアミノ酸の変更を含み得ることを除いて、問い合わせ配列に同一であることが意図される。換言すれば、問い合わせアミノ酸配列に少なくとも９５％同一であるアミノ酸配列を有するポリペプチドを得るために、対象配列におけるアミノ酸残基の５％までが、挿入、欠失、（インデル（挿入−欠失）（ｉｎｄｅｌｓ））または別のアミノ酸で置換され得る。参照配列のこれらの改変は、参照アミノ酸配列のアミノ末端もしくはカルボキシ末端位置で生じ得るか、またはそれらの末端位置の間のどこにでも生じ得、参照配列中の残基間で個々にかまたは参照配列内の１個以上連続する群の状態かのいずれかで、散在する。
【０１５８】
実際問題として、任意の特定のポリペプチドが、例えば、表１に示されるアミノ酸配列またはそのフラグメント、配列番号Ｘにおけるヌクレオチド配列によりコードされるアミノ酸配列またはそのフラグメント、あるいはｃＤＮＡプラスミドＶにおけるｃＤＮＡによりコードされるアミノ酸配列またはそのフラグメントに対して、少なくとも８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、または９９％同一であるか否かは、公知のコンピュータープログラムを使用して従来のように決定され得る。問い合わせ配列（本発明の配列）と対象配列との間での最良の全体的な一致（全体的配列整列とも呼ばれる）を決定するための好ましい方法は、Ｂｒｕｔｌａｇら（Ｃｏｍｐ．Ａｐｐ．Ｂｉｏｓｃｉ．６：２３７−２４５（１９９０））のアルゴリズムに基づくＦＡＳＴＤＢコンピュータープログラムを使用して決定され得る。配列整列において、問い合わせ配列および対象配列は、両方ともヌクレオチド配列であるかまたは両方ともアミノ酸配列であるかのいずれかである。上記の全体的配列整列の結果は、同一性パーセントで示される。ＦＡＳＴＤＢアミノ酸整列に用いられる好ましいパラメーターは：Ｍａｔｒｉｘ＝ＰＡＭ　０、ｋ−ｔｕｐｌｅ＝２、Ｍｉｓｍａｔｃｈ　Ｐｅｎａｌｔｙ＝１、Ｊｏｉｎｉｎｇ　Ｐｅｎａｌｔｙ＝２０、Ｒａｎｄｏｍｉｚａｔｉｏｎ　Ｇｒｏｕｐ　Ｌｅｎｇｔｈ＝０、Ｃｕｔｏｆｆ　Ｓｃｏｒｅ＝１、Ｗｉｎｄｏｗ　Ｓｉｚｅ＝配列の長さ、Ｇａｐ　Ｐｅｎａｌｔｙ＝５、Ｇａｐ　Ｓｉｚｅ　Ｐｅｎａｌｔｙ＝０．０５、Ｗｉｎｄｏｗ　Ｓｉｚｅ＝５００または対象アミノ酸配列の長さ（どちらかより短い方）である。
【０１５９】
対象配列が、Ｎ末端またはＣ末端欠失により（内部の欠失のためではなく）問い合わせ配列よりも短い場合、手動の補正が結果に対してなされなければならない。これは、ＦＡＳＴＤＢプログラムが、全体的な同一性パーセントを算定する場合に、対象配列のＮ末端短縮およびＣ末端短縮を考慮しないからである。Ｎ末端およびＣ末端で短縮されている対象配列について、問い合わせ配列に対して、同一性パーセントは、問い合わせ配列の総塩基のパーセントとして、対応する対象残基と一致／整列しない、対象配列のＮ末端およびＣ末端である問い合わせ配列の残基の数を計算することによって補正される。残基が一致／整列されているか否かは、ＦＡＳＴＤＢ配列整列の結果によって決定される。次いで、このパーセントは、上記のＦＡＳＴＤＢプログラムによって特定のパラメーターを使用して計算された同一性パーセントから差し引かれ、最終的な同一性パーセントのスコアに到達する。この最終的な同一性パーセントのスコアが、本発明の目的で使用されるものである。問い合わせ配列と一致／整列していない対象配列のＮ末端側およびＣ末端側の残基のみが、同一性パーセントのスコアを手動で調整する目的のために考慮される。すなわち、対象配列の最も遠いＮ末端およびＣ末端残基の外側の問い合わせ残基位置のみである。
【０１６０】
例えば、９０アミノ酸残基の対象配列が、同一性パーセントを決定するために１００残基の問い合わせ配列と整列される。欠失が対象配列のＮ末端で生じ、そしてそれゆえＦＡＳＴＤＢ整列は、Ｎ末端での最初の１０残基の一致／整列を示さない。この１０個の不対合残基は、配列の１０％（一致していないＮ末端およびＣ末端の残基の数／問い合わせ配列中の残基の総数）を表し、その結果ＦＡＳＴＤＢプログラムによって計算される同一性パーセントのスコアから１０％が差し引かれる。残りの９０残基が完全に一致した場合、最終的な同一性パーセントは９０％である。別の例において、９０残基の対象配列が、１００残基の問い合わせ配列と比較される。この場合、欠失は、内部欠失であり、そのため問い合わせ配列と一致／整列しない対象配列のＮ末端またはＣ末端の残基は存在しない。この場合、ＦＡＳＴＤＢによって算定される同一性パーセントは、手動で補正されない。再び、ＦＡＳＴＤＢ整列において示される、問い合わせ配列と一致／整列しない対象配列のＮ末端およびＣ末端の外側の残基位置のみが手動で補正される。他の手動の補正は、本発明の目的のためにはなされない。
【０１６１】
改変体は、コード領域、非コード領域、またはその両方における変化を含み得る。特に好ましいものは、サイレントな置換、付加、または欠失を生成するがコードされるポリペプチドの特性または活性を変化させない変化を含む、ポリヌクレオチド改変体である。遺伝コードの縮重に起因するサイレントな置換によって生成されるヌクレオチド改変体が、好ましい。さらに、５０アミノ酸未満、４０アミノ酸未満、３０アミノ酸未満、２０アミノ酸未満、１０アミノ酸未満、あるいは５〜５０アミノ酸、５〜２５アミノ酸、５〜１０アミノ酸、１〜５アミノ酸、または１〜２アミノ酸が、任意の組合せで置換、欠失、または付加されている改変体もまた、好ましい。ポリヌクレオチド改変体は、種々の理由（例えば、特定の宿主についてのコドン発現を至適化する（ヒトｍＲＮＡにおけるコドンを、Ｅ．ｃｏｌｉのような細菌宿主によって好ましいコドンに変化させる））のために、生成され得る。
【０１６２】
天然に存在する改変体は、「対立遺伝子改変体」と呼ばれ、そして生物の染色体上の所定の遺伝子座を占有する遺伝子のいくつかの代替の形態のうちの１つをいう。（Ｇｅｎｅｓ　ＩＩ、Ｌｅｗｉｎ，Ｂ．，編　Ｊｏｈｎ　Ｗｉｌｅｙ　＆　Ｓｏｎｓ，Ｎｅｗ　Ｙｏｒｋ（１９８５））。これらの対立遺伝子改変体は、ポリヌクレオチドレベルおよび／またはポリペプチドレベルのいずれかで変化し得、そして本発明に含まれる。あるいは、天然に存在しない改変体は、変異誘発技術によってまたは直接的な合成によって生成され得る。
【０１６３】
タンパク質工学および組換えＤＮＡ技術の公知の方法を使用して、改変体は、本発明のポリペプチドの特性を改善または変化させるために作製され得る。例えば、本明細書中に考察されるように、１つ以上のアミノ酸が、生物学的機能の実質的な欠損を伴わずに、本発明のポリペプチドのＮ末端またはＣ末端から欠失され得る。Ｒｏｎら、Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．２６８：２９８４−２９８８（１９９３）の著者らは、３個、８個、または２７個のアミノ末端アミノ酸残基を欠失させた後でさえもヘパリン結合活性を有する改変体ＫＧＦタンパク質を報告した。同様に、インターフェロンγは、このタンパク質のカルボキシ末端から８〜１０個のアミノ酸残基を欠失させた後、１０倍までのより高い活性を示した（Ｄｏｂｅｌｉら、Ｊ．Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ　７：１９９−２１６（１９８８））。
【０１６４】
さらに、豊富な証拠は、改変体が、天然に存在するタンパク質の生物学的活性に類似する活性をしばしば保持することを実証する。例えば、Ｇａｙｌｅおよび共同研究者ら（Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ　２６８：２２１０５−２２１１１（１９９３））は、ヒトサイトカインＩＬ−１ａの広範囲にわたる変異分析を行った。彼らは、ランダムな変異誘発を使用して、分子の全長にわたって改変体当たり平均２．５アミノ酸の変化になる、３，５００個を超える個々のＩＬ−１ａ改変体を作製した。複数の変異が、全ての潜在的なアミノ酸の位置で試験された。この研究者らは、「分子の大部分は、［結合活性または生物学的活性］のいずれに対してもほとんど影響を伴わないで変化され得る」ことを見出した。（要約を参照のこと）。実際、試験された３，５００個を超えるヌクレオチド配列のうち、わずか２３個の独特なアミノ酸配列が、野生型と活性が有意に異なるタンパク質を生成した。
【０１６５】
さらに、本明細書において記載されるように、ポリペプチドのＮ末端またはＣ末端からの１つ以上のアミノ酸の欠失が、１つ以上の生物学的機能の改変または欠失を生じたとしても、他の生物学的活性はなお保持され得る。例えば、分泌される形態を認識する抗体を誘導および／または結合する、欠失改変体の能力は、分泌される形態の大多数より少ない残基が、Ｎ末端またはＣ末端から除去される場合に保持されるようである。タンパク質のＮ末端またはＣ末端残基を欠損する特定のポリぺプチドが、このような免疫原性活性を保持するか否かは、本明細書中に記載される慣用的な方法、およびそうでなければ当該分野において公知の慣用的な方法によって容易に決定され得る。
【０１６６】
従って、本発明はさらに、本発明のポリペプチド（それらが改変体である）の機能的な活性（例えば、生物学的活性）を示すポリペプチド改変体を含む。このような改変体としては、活性に対する影響をほとんど有さないように、当該分野において公知の一般的な法則に従って選択される、欠失、挿入、逆位、反復、および置換が挙げられる。
【０１６７】
本出願は、本明細書中に開示される核酸配列に対して少なくとも８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７、９８％、９９％または１００％同一の核酸分子に関し（例えば、Ｎおよび／Ｃ末端欠失のアミノ酸配列を有するポリペプチドをコードする）、それらが機能的活性を有するポリペプチドをコードするかどうかに関わらない。これは、特定の核酸分子が機能的活性を有するポリペプチドをコードしないためであり、当業者は、例えば、ハイブリダイゼーションプローブまたはポリメラーゼ鎖反応（ＰＣＲ）プライマーとして核酸分子をどのようにして使用するかを知る。機能的活性を有するポリペプチドをコードしない本発明の核酸分子の使用は、特に、（１）ｃＤＮＡライブラリー内で遺伝子または対立遺伝子またはそれらのスプライス変異体を単離する工程；（２）Ｖｅｒｍａら、Ｈｕｍａｎ　Ｃｈｒｏｍｏｓｏｍｅｓ：Ａ　Ｍａｎｕａｌ　ｏｆ　Ｂａｓｉｃ　Ｔｅｃｈｎｉｑｕｅｓ、Ｐｅｒｇａｍｏｎ　Ｐｒｅｓｓ、Ｎｅｗ　Ｙｏｒｋ（１９８８）に記載されるような、遺伝子の正確な染色体位置を提供するための、中期染色体拡散へのインサイチュハイブリダイゼーション（例えば、「ＦＩＳＨ」）；および（３）特定の組織内でｍＲＮＡ発現を検出するためのＮｏｒｔｈｅｒｎ　Ｂｌｏｔ分析。
【０１６８】
しかし、本明細書中に開示される核酸配列に対して少なくとも８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％または１００％同一の配列を有する核酸分子が好ましく、これは、実際に本発明のポリペプチドの機能的活性を有するポリペプチドをコードする。
【０１６９】
当然のことながら、遺伝子コードの縮重に起因して、例えば、ｃＤＮＡプラスミドＶ中のｃＤＮＡの核酸配列、表１（配列番号Ｘ）に示される核酸配列またはそのフラグメントに対して少なくとも８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％同一の配列を有する多数の核酸分子が、「機能活性を有する」ポリペプチドをコードするということを、当業者は、直ちに理解する。実際に、これらのヌクレオチド配列のいずれかの縮重改変体すべてが、同じポリぺプチドをコードするので、多くの場合、このことは、上記の比較アッセイを実行しなくても、当業者に明らかである。縮重改変体でないような核酸分子について、合理的な数がまた、機能活性を有するポリペプチドをコードすることが、当該分野でさらに理解される。なぜならば、当業者が、さらに以下に記載されるように、タンパク質を有意に機能させるかまたは機能しそうにないアミノ酸置換（例えば、１つの脂肪族アミノ酸を第２の脂肪族アミノ酸と置換すること）を完全に知っているからである。
【０１７０】
例えば、表現型的にサイレントなアミノ酸置換の作製方法に関する手引きは、Ｂｏｗｉｅ，Ｊ．Ｕ．ら、「Ｄｅｃｉｐｈｅｒｉｎｇ　ｔｈｅ　Ｍｅｓｓａｇｅ　ｉｎ　Ｐｒｏｔｅｉｎ　Ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ：Ｔｏｌｅｒａｎｃｅ　ｔｏ　Ａｍｉｎｏ　Ａｃｉｄ　Ｓｕｂｓｔｉｔｕｔｉｏｎｓ」，Ｓｃｉｅｎｃｅ　２４７：１３０６−１３１０（１９９０）に提供され、ここにおいてこの著者らは、アミノ酸配列の変化に対する寛容性を研究するための２つの主な戦略を示す。
【０１７１】
第１のストラテジーは、進化の過程の間の自然の選択によるアミノ酸置換の寛容を利用する。異なる種におけるアミノ酸配列を比較して、保存されるアミノ酸が同定され得る。これらの保存されるアミノ酸は、タンパク質の機能について重要であるようである。対照的に、置換が自然の選択によって寛容されたアミノ酸の位置は、これらの位置がタンパク質の機能に重要ではないことを示す。従って、アミノ酸置換を寛容する位置は改変され得るが、タンパク質の生物学的活性をなおも維持する。
【０１７２】
第２のストラテジーは、タンパク質機能に重要な領域を同定するために、クローン化された遺伝子の特定の位置でアミノ酸変化を導入するための遺伝子工学を使用する。例えば、部位指向性変異誘発またはアラニンスキャニング変異誘発（分子中の各残基で１つのアラニン変異の導入）が、使用され得る。（ＣｕｎｎｉｎｇｈａｍおよびＷｅｌｌｓ，Ｓｃｉｅｎｃｅ　２４４：１０８１−１０８５（１９８９））。次いで、得られた変異分子は生物学的活性について試験され得る。
【０１７３】
著者らが言及するように、これらの２つのストラテジーは、タンパク質がアミノ酸置換に驚くほど寛容であることを明らかにした。著者らはさらに、どのアミノ酸変化が、タンパク質中の特定のアミノ酸位置で許容されるようであるかを示す。例えば、（タンパク質の三次構造内に）ほとんど埋もれているアミノ酸残基は、非極性側鎖を必要とするが、表面側鎖の特徴は、一般にほとんど保存されない。さらに、寛容される保存的なアミノ酸置換は、脂肪族または疎水性アミノ酸のＡｌａ、Ｖａｌ、Ｌｅｕ、およびＩｌｅの置換；ヒドロキシル残基のＳｅｒおよびＴｈｒの置換；酸性残基のＡｓｐおよびＧｌｕの置換；アミド残基のＡｓｎおよびＧｌｎの置換、塩基性残基のＬｙｓ、Ａｒｇ、およびＨｉｓの置換；芳香族残基のＰｈｅ、Ｔｙｒ、およびＴｒｐの置換、ならびに小さなサイズのアミノ酸のＡｌａ、Ｓｅｒ、Ｔｈｒ、Ｍｅｔ、およびＧｌｙの置換を含む。保存的なアミノ酸置換に加えて、本発明の改変体は、（ｉ）１つ以上の非保存的なアミノ酸残基との置換、ここでは置換されるアミノ酸残基は、遺伝コードによってコードされるアミノ酸残基であってもよく、もしくはそうでなくてもよい、または（ｉｉ）置換基を有する１つ以上のアミノ酸残基での置換、または（ｉｉｉ）別の化合物（例えば、ポリぺプチドの安定性および／もしくは可溶性を増加するための化合物（例えば、ポリエチレングリコール））との成熟ポリペプチドの融合、または（ｉｖ）さらなるアミノ酸（例えば、ＩｇＧ　Ｆｃ融合領域ペプチド、またはリーダーもしくは分泌配列、または精製を容易にする配列のような）とのポリぺプチドの融合、または（ｖ）アルブミン（組み換えアルブミンを含むがこれに限定されない（例えば、その全体が参考として本明細書に援用される、１９９９年３月２日発行、米国特許番号第５，８７６，９６９号、欧州特許番号第０４１３　６２２号、および１９９８年６月１６日発行、米国特許番号第５，７６６，８８３号）を参照のこと）のような別の化合物とのこのポリペプチドの融合を含む。このような改変体ポリペプチドは、本明細書中の教示から、当業者の範囲内であると考えられる。
【０１７４】
例えば、他の荷電されたアミノ酸または中性のアミノ酸での荷電されたアミノ酸のアミノ酸置換を含むポリぺプチド改変体は、改善された特性（例えば、より少ない凝集性）を有するタンパク質を生成し得る。薬学的処方物の凝集は、凝集体の免疫原性活性に起因して、活性の減少およびクリアランスの増加の両方をもたらす。（Ｐｉｎｃｋａｒｄら、Ｃｌｉｎ．Ｅｘｐ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．２：３３１−３４０（１９６７）；Ｒｏｂｂｉｎｓら、Ｄｉａｂｅｔｅｓ　３６：８３８−８４５（１９８７）；Ｃｌｅｌａｎｄら、Ｃｒｉｔ．Ｒｅｖ．Ｔｈｅｒａｐｅｕｔｉｃ　Ｄｒｕｇ　Ｃａｒｒｉｅｒ　Ｓｙｓｔｅｍｓ　１０：３０７−３７７（１９９３））。
【０１７５】
本発明のさらなる実施形態は、少なくとも１つのアミノ酸置換を含むが、５０アミノ酸置換を超えず、さらにより好ましくは、４０アミノ酸置換を超えず、なおより好ましくは、３０アミノ酸置換を超えず、そしてなおさらにより好ましくは、２０アミノ酸置換を超えないアミノ酸配列を有するポリペプチドのアミノ酸配列を含むポリペプチドに関する。もちろん、ポリペプチドが、配列番号Ｙのポリペプチドのアミノ酸配列、配列番号Ｘによってコードされるアミノ酸配列、および／またはｃＤＮＡプラスミドＶ中のｃＤＮＡによってコードされるアミノ酸配列を含むアミノ酸配列を有することが非常に好ましく、好ましさの増大する順番に、これは、少なくとも１つのアミノ酸置換を含むが、１０、９、８、７、６、５、４、３、２、または１アミノ酸置換を超えない。特定の実施形態において、配列番号Ｙのアミノ酸配列またはそのフラグメント（例えば、本明細書に記載の成熟形態および／または他のフラグメント）、配列番号Ｘによってコードされるアミノ酸配列またはそのフラグメント、ならびに／あるいはｃＤＮＡプラスミドＶまたはそのフラグメントによってコードされるアミノ酸配列における付加、置換、および／または欠失の数は、１〜５、５〜１０、５〜２５、５〜５０、１０〜５０、または５０〜１５０であり、保存的アミノ酸置換が好ましい。本明細書中で議論されるように、本発明の任意のポリペプチドは、融合タンパク質を産生するために使用され得る。例えば、本発明のポリペプチドは、第２のタンパク質と融合される場合、抗原性タグとして使用され得る。本発明のポリペプチドに対して惹起される抗体は、ポリペプチドに結合することによって、第２のタンパク質を間接的に検出するために使用され得る。さらに、分泌されるタンパク質は、細胞位置を輸送シグナルに基づいて標的化するので、分泌されることが示される本発明のポリペプチドは、他のタンパク質に一旦融合されると標的化分子として使用され得る。
【０１７６】
本発明のポリペプチドと融合され得るドメインの例は、異種シグナル配列のみならず、また他の異種機能性領域をも含む。融合は、必ずしも直接的である必要はないが、リンカー配列を介して起こり得る。
【０１７７】
特定の好ましい実施形態において、本発明のタンパク質は、ポリペプチドがＮおよび／またはＣ末端欠失変異体である融合タンパク質を含む。好ましい実施形態において、本出願は、特定のＮおよびＣ末端欠失変異体のアミノ酸配列を有するポリペプチドをコードする核酸配列に対して少なくとも８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％または９９％同一の核酸分子に関する。これらのポリペプチド（フラグメントおよび／または改変体を含む）をコードするポリヌクレオチドはまた、本発明によって包含される。
【０１７８】
さらに、融合タンパク質はまた、本発明のポリペプチドの特徴を改良するために操作され得る。例えば、さらなるアミノ酸、特に荷電アミノ酸の領域が、宿主細胞からの精製または続く取り扱いおよび貯蔵の間の安定性および持続性を改良するためにポリペプチドのＮ末端へ付加され得る。また、ペプチド部分は精製を容易にするためにポリペプチドへ付加され得る。このような領域は、ポリペプチドの最終調製の前に除去され得る。ポリペプチドの取り扱いを容易にするためのペプチド部分の付加は、当該分野でよく知られる慣用の技術である。
【０１７９】
当業者に理解されるように、上記の本発明のポリペプチドおよびそのエピトープ保有フラグメントは、異種ポリペプチド配列と連結させられ得る。例えば、本発明のポリペプチドは、異種ポリペプチド配列と融合され得、例えば、本発明のポリペプチドは、免疫グロブリン（ＩｇＡ、ＩｇＥ、ＩｇＧ、ＩｇＭ）の定常ドメインまたはそれらの部分（ＣＨ１、ＣＨ２、ＣＨ３、またはそれらの任意の組み合わせ（それらの全体領域および部分の両方を含む）と融合され得、キメラポリペプチドを生じる。これらの融合タンパク質は、精製を容易にし、そしてインビボでの半減期の増大を示す。１つの報告例は、ヒトＣＤ４−ポリペプチドの最初の２つのドメインおよび哺乳動物の免疫グロブリンの重鎖または軽鎖の定常領域の種々のドメインからなるキメラタンパク質を記載する。（ＥＰ　Ａ３９４，８２７；Ｔｒａｕｎｅｃｋｅｒら、Ｎａｔｕｒｅ，３３１：８４〜８６（１９８８））。（ＩｇＧ部分に起因する）ジスルフィド結合二量体構造を有する融合タンパク質はまた、単量体タンパク質またはタンパク質のフラグメント単独よりも、他の分子の結合および中和においてより効果的である（Ｆｏｕｎｔｏｕｌａｋｉｓら，Ｊ．Ｂｉｏｃｈｅｍ．，２７０：３９５８−３９６４（１９９５））。
【０１８０】
（ベクター、宿主細胞、およびタンパク質産生）
本発明はまた、本発明のポリヌクレオチドを含むベクター、宿主細胞、および組換え技術によるポリペプチドの産生に関連する。例えば、ベクターは、ファージベクター、プラスミドベクター、ウイルスベクター、またはレトロウイルスベクターであり得る。レトロウイルスベクターは、複製コンピテント、または複製欠損であり得る。後者の場合、一般的にウイルス増殖は、補完性（ｃｏｍｐｌｅｍｅｎｔｉｎｇ）宿主細胞にのみ生じる。
【０１８１】
本発明のポリヌクレオチドは、宿主における増殖のために選択マーカーを含むベクターに連結され得る。一般に、プラスミドベクターは、リン酸カルシウム沈澱物のような沈澱物、または荷電脂質との複合体において導入される。ベクターがウイルスである場合、このベクターは、適切なパッケージング細胞株を使用してインビトロでパッケージングされ、次いで宿主細胞に形質導入され得る。
【０１８２】
ポリヌクレオチド挿入物は、適切なプロモーター（いくつか挙げれば、例えば、ファージλＰＬプロモーター、Ｅ．ｃｏｌｉ　ｌａｃプロモーター、ｔｒｐプロモーター、ｐｈｏＡプロモーターおよびｔａｃプロモーター、ＳＶ４０初期プロモーターおよびＳＶ４０後期プロモーター、ならびにレトロウイルスＬＴＲのプロモーター）に作動可能に連結されるべきである。他の適切なプロモーターは当業者に公知である。発現構築物はさらに、転写開始、転写終結のための部位、および転写領域において、翻訳のためのリボソーム結合部位を含む。この構築物によって発現される転写物のコード部分は、好ましくは、始めに翻訳開始コドン、および翻訳されるべきポリペプチドの末端に適切に位置される終結コドン（ＵＡＡ、ＵＧＡまたはＵＡＧ）を含む。
【０１８３】
示されるように、発現ベクターは、好ましくは少なくとも１つの選択マーカーを含む。このようなマーカーは、真核細胞培養のためのジヒドロ葉酸レダクターゼ、Ｇ４１８、またはネオマイシン耐性遺伝子、ならびにＥ．ｃｏｌｉおよび他の細菌において培養するためのテトラサイクリン、カナマイシンまたはアンピシリン耐性遺伝子を含む。適切な宿主の代表的な例は、細菌細胞（例えば、Ｅ．ｃｏｌｉ、ＳｔｒｅｐｔｏｍｙｃｅｓおよびＳａｌｍｏｎｅｌｌａ　ｔｙｐｈｉｍｕｒｉｕｍ細胞）；真菌細胞（例えば、酵母細胞（例えば、Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ　ｃｅｒｅｖｉｓｉａｅまたはＰｉｃｈｉａ　ｐａｓｔｏｒｉｓ（ＡＴＣＣ受託番号２０１１７８）））；昆虫細胞（例えば、Ｄｒｏｓｏｐｈｉｌｉａ　Ｓ２およびＳｐｏｄｏｐｔｅｒａ　Ｓｆ９細胞）；動物細胞（例えば、ＣＨＯ細胞、ＣＯＳ細胞、２９３細胞、およびＢｏｗｅｓメラノーマ細胞）；ならびに植物細胞を含むが、これらに限定されない。上記の宿主細胞のための適切な培養培地および条件は、当該分野で公知である。
【０１８４】
細菌における使用のために好ましいベクターの中には、ｐＱＥ７０、ｐＱＥ６０およびｐＱＥ−９（ＱＩＡＧＥＮ，Ｉｎｃ．から入手可能）；ｐＢｌｕｅｓｃｒｉｐｔベクター、Ｐｈａｇｅｓｃｒｉｐｔベクター、ｐＮＨ８Ａ、ｐＮＨ１６ａ、ｐＮＨ１８Ａ、ｐＮＨ４６Ａ（Ｓｔｒａｔａｇｅｎｅ　Ｃｌｏｎｉｎｇ　Ｓｙｓｔｅｍｓ，Ｉｎｃ．から入手可能）；およびｐｔｒｃ９９ａ、ｐＫＫ２２３−３、ｐＫＫ２３３−３、ｐＤＲ５４０、ｐＲＩＴ５（Ｐｈａｒｍａｃｉａ　Ｂｉｏｔｅｃｈ，Ｉｎｃ．から入手可能）を含む。好ましい真核生物ベクターの中には、ｐＷＬＮＥＯ、ｐＳＶ２ＣＡＴ、ｐＯＧ４４、ｐＸＴ１およびｐＳＧ（Ｓｔｒａｔａｇｅｎｅから入手可能）；ならびにｐＳＶＫ３、ｐＢＰＶ、ｐＭＳＧおよびｐＳＶＬ（Ｐｈａｒｍａｃｉａから入手可能）がある。酵母系における使用のために好ましい発現ベクターとしては、ｐＹＥＳ２、ｐＹＤ１、ｐＴＥＦ１／Ｚｅｏ、ｐＹＥＳ２／ＧＳ、ｐＰＩＣＺ、ｐＧＡＰＺ、ｐＧＡＰＺａｌｐｈ、ｐＰＩＣ９、ｐＰＩＣ３．５、ｐＨＩＬ−Ｄ２、ｐＨＩＬ−Ｓ１、ｐＰＩＣ３．５Ｋ、ｐＰＩＣ９Ｋ、およびＰＡＯ８１５（全てが、Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ，Ｃａｒｌｂａｄ，ＣＡから入手可能）が挙げられるがこれらに限定されない。他の適切なベクターは、当業者に容易に明らかである。
【０１８５】
宿主細胞への構築物の導入は、リン酸カルシウムトランスフェクション、ＤＥＡＥ−デキストラン媒介トランスフェクション、カチオン性脂質媒介トランスフェクション、エレクトロポレーション、形質導入、感染、または他の方法によってもたらされ得る。このような方法は、Ｄａｖｉｓら、Ｂａｓｉｃ　Ｍｅｔｈｏｄｓ　Ｉｎ　Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ　Ｂｉｏｌｏｇｙ　（１９８６）のような多くの標準的実験マニュアルに記載される。本発明のポリペプチドが、実際、組換えベクターを欠損する宿主細胞によって発現され得ることが特に意図される。
【０１８６】
本発明のポリペプチドは、硫酸アンモニウム沈澱またはエタノール沈澱、酸抽出、陰イオンまたは陽イオン交換クロマトグラフィー、ホスホセルロースクロマトグラフィー、疎水性相互作用クロマトグラフィー、アフィニティークロマトグラフィー、ヒドロキシルアパタイトクロマトグラフィーおよびレクチンクロマトグラフィーを含む周知の方法によって組換え細胞培養物から回収され得、そして精製され得る。最も好ましくは、高速液体クロマトグラフィー（「ＨＰＬＣ」）が精製のために使用される。
【０１８７】
本発明のポリペプチドはまた、以下から回収され得る：直接単離されるかまたは培養されるかにかかわらず、体液、組織および細胞を含む天然の供給源から精製された産物；化学的合成手順の産物；ならびに、例えば、細菌細胞、酵母細胞、高等植物細胞、昆虫細胞、および哺乳動物細胞を含む、原核生物宿主または真核生物宿主から組換え技術によって産生された産物。組換え産生手順に使用される宿主に依存して、本発明のポリペプチドは、グリコシル化されてもまたはグリコシル化されていなくてもよい。さらに、本発明のポリペプチドはまた、宿主媒介プロセスの結果として、いくつかの場合において、最初の改変されたメチオニン残基を含み得る。従って、一般に、翻訳開始コドンによってコードされるＮ末端メチオニンが、すべての真核生物細胞における翻訳後の任意のタンパク質から高い効率で除去されることは当該分野において周知である。ほとんどのタンパク質においてＮ末端メチオニンもまた、ほとんどの原核生物において効果的に除去されるが、いくつかのタンパク質について、この原核生物除去プロセスは、Ｎ末端メチオニンが共有結合するアミノ酸の性質に依存しており、非効率的である。
【０１８８】
１つの実施形態において、酵母Ｐｉｃｈｉａ　ｐａｓｔｏｒｉｓは、真核細胞系において、本発明のポリペプチドを発現させるために使用される。Ｐｉｃｈｉａ　ｐａｓｔｏｒｉｓは、メタノールをその唯一の炭素供給源として代謝し得るメチル栄養性（ｍｅｔｈｙｌｏｔｒｏｐｈｉｃ）酵母である。メタノール代謝経路における主要な工程は、Ｏ２を使用してのホルムアルデヒドへのメタノールの酸化である。この反応は、酵素アルコールオキシダーゼによって触媒される。その唯一の炭素供給源としてメタノールを代謝するために、Ｐｉｃｈｉａ　ｐａｓｔｏｒｉｓは、Ｏ２に対するアルコールオキシダーゼの比較的低い親和性に部分的に起因して、高レベルのアルコールオキシダーゼを生成するべきである。結果的に、主要な炭素供給源としてメタノールに依存する増殖培地において、２つのアルコールオキシダーゼ遺伝子（ＡＯＸ１）のうちの１つのプロモーター領域は、非常に活性である。メタノールの存在下で、ＡＯＸ１遺伝子から産生されるアルコールオキシダーゼは、Ｐｉｃｈｉａ　ｐａｓｔｏｒｉｓにおける総可溶性タンパク質のうちのおよそ３０％までを含む。Ｅｌｌｉｓ，Ｓ．Ｂ．ら、Ｍｏｌ．Ｃｅｌｌ．Ｂｉｏｌ．５：１１１１〜２１（１９８５）；Ｋｏｕｔｚ，Ｐ．Ｊ．ら、Ｙｅａｓｔ　５：１６７〜７７（１９８９）；Ｔｓｃｈｏｐｐ，Ｊ．Ｆ．ら、Ｎｕｃｌ．Ａｃｉｄｓ　Ｒｅｓ．１５：３８５９〜７６（１９８７）を参照のこと。従って、ＡＯＸ１調節配列の全てまたは一部の転写調節下の異種コード配列（例えば、本発明のポリヌクレオチドなど）は、メタノールの存在下で増殖したＰｉｃｈｉａ酵母において、指数関数的に高レベルで発現される。
【０１８９】
１つの例において、プラスミドベクターｐＰＩＣ９Ｋは、「Ｐｉｃｈｉａ　Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ：Ｍｅｔｈｏｄｓ　ｉｎ　Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ　Ｂｉｏｌｏｇｙ」，Ｄ．Ｒ．ＨｉｇｇｉｎｓおよびＪ．Ｃｒｅｇｇ編（Ｔｈｅ　Ｈｕｍａｎａ　Ｐｒｅｓｓ，Ｔｏｔｏｗａ，ＮＪ，１９９８）において本質的に記載されるように、Ｐｉｃｈｅａ酵母系において、本明細書中に示されるように本発明のポリペプチドをコードするＤＮＡを発現させるために使用される。この発現ベクターは、マルチクローニング部位の上流に位置するＰｉｃｈｉａ　ｐａｓｔｏｒｉｓアルカリホスファターゼ（ＰＨＯ）分泌シグナルペプチド（すなわち、リーダー）に連結された強力なＡＯＸ１プロモーターの効力によって、本発明のポリペプチドの発現および分泌を可能にする。
【０１９０】
多くの他の酵母ベクター（例えば、ｐＹＥＳ２、ｐＹＤ１、ｐＴＥＦ１／Ｚｅｏ、ｐＹＥＳ２／ＧＳ、ｐＰＩＣＺ、ｐＧＡＰＺ、ｐＧＡＰＺα、ｐＰＩＣ９、ｐＰＩＣ３．５、ｐＨＩＬ−Ｄ２、ｐＨＩＬ−Ｓ１、ｐＰＩＣ３．５Ｋ、およびＰＡＯ８１５）は、当業者が容易に理解するように、提案された発現構築物が必要とされる場合インフレームのＡＵＧを含む転写、翻訳、分泌（所望される場合）などの適切に配置されたシグナルを提供する限り、ｐＰＩＣ９Ｋの代わりに使用され得る。
【０１９１】
別の実施形態において、異種コード配列（例えば、本発明のポリヌクレオチドなど）の高レベルの発現は、本発明の異種ポリヌクレオチドを発現ベクター（例えば、ｐＧＡＰＺまたはｐＧＡＰＺαなど）中にクローニングし、そしてメタノールの非存在下で酵母培養物を増殖させることによって達成され得る。
【０１９２】
本明細書において議論されるベクター構築物を含む宿主細胞を含むことに加えて、本発明はまた、脊椎動物起源（特に、哺乳動物起源）の一次（ｐｒｉｍａｒｙ）宿主細胞、二次（ｓｅｃｏｎｄａｒｙ）宿主細胞、および不死化宿主細胞を含む。これらの宿主細胞は、内因性の遺伝物質（例えば、コード配列）を欠失または置換するように操作されており、そして／または本発明のポリヌクレオチドと作動可能に連結された遺伝物質（例えば、異種ポリヌクレオチド配列）を含むように操作され、そして内因性のポリヌクレオチドを活性化、変更、および／または増幅する。例えば、当該分野で公知の技術は、相同組換えを介して、異種制御領域（例えば、プロモーターおよび／またはエンハンサー）ならびに内因性ポリヌクレオチド配列を作動可能に連結するために使用され得る（例えば、１９９７年６月２４日に発行された米国特許番号第５，６４１，６７０号；１９９６年９月２６日に公開された国際公開第ＷＯ　９６／２９４１１号；１９９４年８月４日に公開された国際公開第ＷＯ　９４／１２６５０号；Ｋｏｌｌｅｒら，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ　８６：８９３２−８９３５（１９８９）；およびＺｉｊｌｓｔｒａら，Ｎａｔｕｒｅ　３４２：４３５−４３８（１９８９）を参照のこと。これらの開示の各々は、それら全体において参考として援用される）。
【０１９３】
さらに、本発明のポリペプチドは、当該分野で公知の技術を用いて化学合成され得る（例えば、Ｃｒｅｉｇｈｔｏｎ，１９８３，Ｐｒｏｔｅｉｎｓ：Ｓｔｒｕｃｔｕｒｅｓ　ａｎｄ　Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ　Ｐｒｉｎｃｉｐｌｅｓ，Ｗ．Ｈ．Ｆｒｅｅｍａｎ　＆　Ｃｏ．，Ｎ．Ｙ．およびＨｕｎｋａｐｉｌｌｅｒら，Ｎａｔｕｒｅ，３１０：１０５−１１１（１９８４）を参照のこと）。例えば、ポリペプチドのフラグメントに対応するポリペプチドは、ペプチド合成機の使用により合成され得る。さらに、所望の場合、非古典的アミノ酸または化学的アミノ酸アナログが、置換または付加としてこのポリペプチド配列に導入され得る。非古典的アミノ酸としては、以下が挙げられるがこれらに限定されない：通常のアミノ酸のＤ異性体、２，４−ジアミノ酪酸、ａ−アミノイソ酪酸、４−アミノ酪酸、Ａｂｕ、２−アミノ酪酸、ｇ−Ａｂｕ、ｅ−Ａｈｘ、６−アミノヘキサン酸、Ａｉｂ、２−アミノイソ酪酸、３−アミノプロピオン酸、オルニチン、ノルロイシン、ノルバリン、ヒドロキシプロリン、サルコシン、シトルリン、ホモシトルリン、システイン酸、ｔ−ブチルグリシン、ｔ−ブチルアラニン、フェニルグリシン、シクロヘキシルアラニン、ｂ−アラニン、フルオロアミノ酸、デザイナーアミノ酸（例えば、ｂ−メチルアミノ酸）、Ｃａ−メチルアミノ酸、Ｎａ−メチルアミノ酸、および一般のアミノ酸アナログ。さらに、アミノ酸はＤ（右旋性）またはＬ（左旋性）であり得る。
【０１９４】
本発明は、翻訳の間または翻訳後に、例えば、グリコシル化、アセチル化、リン酸化、アミド化、公知の保護基／ブロッキング基による誘導体化、タンパク質分解切断、抗体分子または他の細胞性リガンドへの結合などによって示差的に改変される本発明のポリペプチドを含む。任意の多数の化学的改変は、以下を含むがこれらに限定されない公知の技術によって実施され得る：臭化シアン、トリプシン、キモトリプシン、パパイン、Ｖ８プロテアーゼ、ＮａＢＨ４による特異的化学的切断；アセチル化、ホルミル化、酸化、還元；ツニカマイシンの存在下での代謝合成；など。
【０１９５】
本発明によって含まれるさらなる翻訳後修飾としては、例えば、以下などが挙げられる：Ｎ結合型もしくはＯ結合型の炭水化物鎖（Ｎ末端またはＣ末端のプロセシング）、アミノ酸骨格への化学部分の結合、Ｎ結合型もしくはＯ結合型の炭水化物鎖の化学修飾、および原核生物宿主細胞発現の結果としてのＮ末端メチオニン残基の付加もしくは欠失。このポリペプチドはまた、検出可能な標識（例えば、酵素標識、蛍光標識、同位体標識または親和性標識）を用いて改変して、このタンパク質の検出および単離が可能にされ得る。
【０１９６】
本発明によってまた、さらなる利点（例えば、このポリペプチドの溶解度、安定性および循環時間の増加、または免疫原性の減少）を提供し得る、本発明のポリペプチドの化学修飾誘導体が提供される（米国特許番号第４，１７９，３３７号を参照のこと）。誘導体化のための化学部分は、水溶性ポリマー（例えば、ポリエチレングリコール、エチレングリコール／プロピレングリコールコポリマー、カルボキシメチルセルロース、デキストラン、ポリビニルアルコールなど）から選択され得る。このポリペプチドは、この分子内のランダムな位置で、またはこの分子内の所定の位置で改変され得、そして１、２、３またはそれ以上の結合した化学部分を含み得る。
【０１９７】
このポリマーは、任意の分子量のポリマーであり得、そして分枝状であっても非分枝状であってもよい。ポリエチレングリコールに関しては、好ましい分子量は、取り扱いおよび製造の容易さのために、約１ｋＤａと約１００ｋＤａとの間（用語「約」は、ポリエチレングリコールの調製において、いくつかの分子は示した分子量よりも重く、いくつかは示した分子量よりも軽いことを示す）である。所望の治療的プロフィール（例えば、所望される徐放性の持続時間、ある場合には生物学的活性に対する効果、取り扱いの容易さ、抗原性の程度または抗原性がないこと、および治療タンパク質またはアナログに対するポリエチレングリコールの他の公知の効果）に依存して、他のサイズが用いられ得る。
【０１９８】
ポリエチレングリコール分子（または他の化学的部分）は、このタンパク質の機能的ドメインまたは抗原性ドメインに対する効果を考慮してタンパク質に結合されるべきである。当業者に利用可能な多数の結合方法が存在する（例えば、本明細書中に参考として援用される、ＥＰ　０　４０１　３８４（Ｇ−ＣＳＦにＰＥＧを結合する）、Ｍａｌｉｋら，Ｅｘｐ．Ｈｅｍａｔｏｌ．２０：１０２８−１０３５（１９９２）（塩化トレシルを用いたＧＭ−ＣＳＦのペグ化（ｐｅｇｙｌａｔｉｏｎ）を報告する）もまた参照のこと）。例えば、ポリエチレングリコールは、反応性基（例えば、遊離のアミノ基またはカルボキシル基）によってアミノ酸残基を介して共有結合され得る。反応性基は、活性化ポリエチレングリコール分子が結合し得る基である。遊離のアミノ基を有するアミノ酸残基としては、リジン残基およびＮ末端アミノ酸残基が挙げられ得る；遊離のカルボキシル基を有するアミノ酸残基としては、アスパラギン酸残基、グルタミン酸残基およびＣ末端アミノ酸残基が挙げられ得る。スルフヒドリル残基もまた、ポリエチレングリコール分子を結合するための反応性基として用いられ得る。治療目的のために好ましいのは、アミノ基での結合、例えば、Ｎ末端またはリジン基での結合である。
【０１９９】
Ｎ末端で化学修飾されたタンパク質を具体的に所望し得る。ポリエチレングリコールを本発明の組成の例示として用いて、種々のポリエチレングリコール分子から（分子量、分枝などによって）、反応混合物中でのポリエチレングリコール分子のタンパク質（ポリペプチド）分子に対する比、行われるべきペグ化反応の型、および選択されたＮ末端ペグ化タンパク質の獲得方法を選択し得る。Ｎ末端ペグ化調製物の獲得方法（すなわち、必要な場合、この部分を他のモノペグ化部分から分離すること）は、ペグ化タンパク質分子の集団からの、Ｎ末端ペグ化物質の精製により行われ得る。Ｎ末端修飾で化学修飾された選択的タンパク質は、特定のタンパク質における誘導体化に利用可能な異なる型の第１級アミノ基（リジン対Ｎ末端）の示差的反応性を利用する還元的アルキル化によって達成され得る。適切な反応条件下では、カルボニル基含有ポリマーを用いた、Ｎ末端でのタンパク質の実質的に選択的な誘導体化が達成される。
【０２００】
本発明のポリペプチドは、単量体または多量体（すなわち、二量体、三量体、四量体およびより高度の多量体）であり得る。従って、本発明は、単量体および多量体の本発明のポリペプチド、それらの調製物ならびにそれらを含む組成物（好ましくは治療薬）に関する。特定の実施形態では、本発明のポリペプチドは、単量体、二量体、三量体または四量体である。さらなる実施形態では、本発明の多量体は、少なくとも二量体、少なくとも三量体、または少なくとも四量体である。
【０２０１】
本発明によって含まれる多量体は、ホモマーまたはヘテロマーであり得る。本明細書中で用いられる場合、用語ホモマーは、配列番号Ｙのアミノ酸配列に対応するかまたは配列番号Ｘによってコードされるアミノ酸配列または配列番号Ｘの相補体、および／またはｃＤＮＡプラスミドＶによってコードされるアミノ酸配列（本明細書中に記載されるこれらに対応する、フラグメント、改変体、スプライス改変体および融合タンパク質を含む）のみを含む多量体をいう。これらのホモマーは、同一または異なるアミノ酸配列を有するポリペプチドを含み得る。特定の実施形態では、本発明のホモマーは、同一のアミノ酸配列を有するポリペプチドのみを含む多量体である。別の特定の実施形態では、本発明のホモマーは、異なるアミノ酸配列を有するポリペプチドを含む多量体である。特定の実施形態では、本発明の多量体は、ホモ二量体（例えば、同一または異なるアミノ酸配列を有するポリペプチドを含む）あるいはホモ三量体（例えば、同一および／または異なるアミノ酸配列を有するポリペプチドを含む）である。さらなる実施形態では、本発明のホモマー性多量体は、少なくともホモ二量体、少なくともホモ三量体または少なくともホモ四量体である。
【０２０２】
本明細書中で用いられる場合、用語ヘテロマーとは、本発明のポリペプチドに加えて、１つ以上の異種ポリペプチド（すなわち、異なるタンパク質のポリペプチド）を含む多量体をいう。特定の実施形態では、本発明の多量体は、ヘテロ二量体、ヘテロ三量体またはヘテロ四量体である。さらなる実施形態では、本発明のヘテロマー性多量体は、少なくともヘテロ二量体、少なくともヘテロ三量体または少なくともヘテロ四量体である。
【０２０３】
本発明の多量体は、疎水性、親水性、イオン性および／もしくは共有結合性の結合の結果であり得、ならびに／または例えば、リポソーム形成によって間接的に連結され得る。従って、１つの実施形態では、本発明の多量体（例えば、ホモ二量体またはホモ三量体など）は、本発明のポリペプチドが溶液中で互いに接触する場合に形成される。別の実施形態では、本発明のへテロ多量体（例えば、ヘテロ三量体またはヘテロ四量体など）は、本発明のポリペプチドが、溶液中で本発明のポリペプチドに対する抗体（本発明の融合タンパク質中の異種ポリペプチド配列に対する抗体を含む）と接触する場合に、形成される。他の実施形態では、本発明の多量体は、本発明のポリペプチドとの、および／または本発明のポリペプチド間での共有結合によって形成される。このような共有結合は、ポリペプチド配列（例えば、配列番号Ｙに列挙されるか、または配列番号Ｘおよび／もしくはｃＤＮＡプラスミドＶによってコードされるポリペプチド中に含まれる、ポリペプチド配列）中に含まれる１以上のアミノ酸残基を含み得る。１例では、この共有結合は、ネイティブ（すなわち、天然に存在する）ポリペプチドにおいて相互作用するポリペプチド配列内に存在するシステイン残基間での架橋である。別の例では、この共有結合は、化学的操作または組換え操作の結果である。あるいは、このような共有結合は、融合タンパク質中の異種ポリペプチド配列において含まれる、１以上のアミノ酸残基を含み得る。１例では、共有結合は、本発明の融合タンパク質に含まれる異種配列間にある（例えば、米国特許番号第５，４７８，９２５号を参照のこと）。特定の例では、この共有結合は、（本明細書中に記載されるような）本発明のＦｃ融合タンパク質に含まれる異種配列間にある。別の特定の例では、本発明の融合タンパク質の共有結合は、共有結合した多量体を形成し得る別のタンパク質（例えば、オステオプロテゲリン（ｏｓｔｅｏｐｒｏｔｅｇｅｒｉｎ）（例えば、国際公開第ＷＯ　９８／４９３０５号（この内容はその全体が本明細書中で参考として援用される）を参照のこと）など）由来の異種ポリペプチド配列間にある。別の実施形態では、２以上の本発明のポリペプチドは、ペプチドリンカーを介して連結される。例としては、米国特許番号第５，０７３，６２７号（本明細書中に参考として援用される）に記載されるペプチドリンカーが挙げられる。ペプチドリンカーによって隔てられた本発明の複数のポリペプチドを含むタンパク質は、従来の組換えＤＮＡ技術を用いて生成され得る。
【０２０４】
本発明の多量体ポリペプチドを調製する別の方法は、ロイシンジッパーまたはイソロイシンジッパーのポリペプチド配列に融合した本発明のポリペプチドの使用を含む。ロイシンジッパードメインおよびイソロイシンジッパードメインは、それらが発見されたタンパク質の多量体化を促進するポリペプチドである。ロイシンジッパーは、本来、いくつかのＤＮＡ結合タンパク質（Ｌａｎｄｓｃｈｕｌｚら、Ｓｃｉｅｎｃｅ　２４０：１７５９（１９８８））において同定され、そしてそれ以来、種々の異なるタンパク質から見出されている。公知のロイシンジッパーは、共通して、二量体化または三量体化する天然に存在するペプチド、およびそれらの誘導体である。本発明の可溶性多量体タンパク質を産生するために適切なロイシンジッパードメインの例は、ＰＣＴ出願ＷＯ９４／１０３０８（本明細書中で参考として援用される）に記載されるロイシンジッパードメインである。溶液中で二量体化または三量体化するポリペプチド配列と融合した、本発明のポリペプチドを含む組換え融合タンパク質は、適切な宿主細胞において発現され、そして得られる可溶性多量体融合タンパク質は、当該分野で公知の技術を使用して、培養上清から回収される。
【０２０５】
本発明の三量体ポリペプチドは、増大した生物学的活性の利点を提供し得る。好ましいロイシンジッパー部分およびイソロイシン部分は、優先的に三量体を形成するものである。１つの例は、Ｈｏｐｐｅら（ＦＥＢＳ　Ｌｅｔｔｅｒｓ　３４４：１９１，（１９９４））および米国特許出願第０８／４４６，９２２号（本明細書中で参考として援用される）に記載されるような、肺サーファクタントタンパク質Ｄ（ＳＰＤ）から誘導されるロイシンジッパーである。天然に存在する三量体タンパク質から誘導される他のペプチドは、本発明の三量体ポリペプチドの調製において使用され得る。
【０２０６】
別の例において、本発明のタンパク質は、Ｆｌａｇ（登録商標）ポリペプチド配列を含む本発明の融合タンパク質に含まれるＦｌａｇ（登録商標）ポリペプチド配列間の相互作用によって結合される。さらなる実施形態において、本発明の結合タンパク質は、本発明のＦｌａｇ（登録商標）融合タンパク質に含まれる異種ポリペプチド配列と抗Ｆｌａｇ（登録商標）抗体との間の相互作用によって結合される。
【０２０７】
本発明の多量体は、当該分野で公知の化学技術を用いて生成され得る。例えば、本発明の多量体中に含まれることが所望されるポリペプチドは、当該分野で公知のリンカー分子およびリンカー分子長最適化技術を用いて化学的に架橋され得る（例えば、米国特許番号第５，４７８，９２５号を参照のこと、これは、本明細書中でその全体が参考として援用される）。さらに、本発明の多量体は、多量体中に含まれることが所望されるポリペプチドの配列中に位置するシステイン残基間に１つ以上の分子間架橋を形成するために、当該分野で公知の技術を用いて生成され得る（例えば、米国特許番号第５，４７８，９２５号を参照のこと、これは、本明細書中でその全体が参考として援用される）。さらに、本発明のポリペプチドは、そのポリペプチドのＣ末端またはＮ末端へのシステインまたはビオチンの付加によって慣用的に改変され得、そして当該分野で公知の技術が、１つ以上のこれらの改変したポリペプチドを含む多量体を生成するために適用され得る（例えば、米国特許番号第５，４７８，９２５号を参照のこと、これは、本明細書中でその全体が参考として援用される）。さらに、当該分野で公知の技術は、本発明の多量体に含まれることが所望されるポリペプチド成分を含むリポソームを生成するために適用され得る（例えば、米国特許番号第５，４７８，９２５号を参照のこと、これは、本明細書中でその全体が参考として援用される）。
【０２０８】
あるいは、本発明の多量体は、当該分野で公知の遺伝子工学技術を用いて生成され得る。１つの実施形態において、本発明の多量体中に含まれるポリペプチドは、本明細書中に記載されるかまたはさもなくば当該分野で公知の融合タンパク質技術を用いて組換え産生される（例えば、米国特許番号第５，４７８，９２５号を参照のこと、これは、本明細書中でその全体が参考として援用される）。特定の実施形態において、本発明のホモ二量体をコードするポリヌクレオチドは、本発明のポリペプチドをコードするポリヌクレオチド配列を、リンカーポリペプチドをコードする配列に連結し、次いで、もともとのＣ末端からＮ末端へ逆方向にポリペプチドの翻訳産物をコードする合成ポリヌクレオチド（リーダー配列を欠く）に、さらに連結することによって生成される（例えば、米国特許番号第５，４７８，９２５号を参照のこと、これは、本明細書中でその全体が参考として援用される）。別の実施形態において、本明細書中に記載されるかまたはさもなくば当該分野で公知の組換え技術が適用されて、膜貫通ドメイン（あるいは疎水性ペプチドまたはシグナルペプチド）を含む本発明の組換えポリペプチドを生成し、そしてこれは、膜再構成技術によってリポソームに取り込まれ得る（例えば、米国特許番号第５，４７８，９２５号を参照のこと、これは、本明細書中でその全体が参考として援用される）。
【０２０９】
（抗体）
本発明のさらなるポリペプチドは、本発明の配列番号Ｙのポリペプチド、ポリペプチドフラグメント、もしくは改変体、および／または本発明のエピトープに免疫特異的に結合する（特異的抗体−抗原結合をアッセイするための当該分野で周知のイムノアッセイにより決定されるような）抗体およびＴ−細胞抗原レセプター（ＴＣＲ）に関する。本発明の抗体としては、ポリクローナル抗体、モノクローナル抗体、多重特異的抗体、ヒト抗体、ヒト化抗体、またはキメラ抗体、単鎖抗体、Ｆａｂフラグメント、Ｆ（ａｂ’）フラグメント、Ｆａｂ発現ライブラリーによって産生されたフラグメント、抗イディオタイプ（抗Ｉｄ）抗体（例えば、本発明の抗体に対する抗Ｉｄ抗体が挙げられる）、および任意の上記抗体のエピトープ結合フラグメントが挙げられるが、これらに限定されない。本明細書中で使用される場合、用語「抗体」とは、免疫グロブリン分子および免疫グロブリン分子の免疫学的に活性な部分（すなわち、抗原に免疫特異的に結合する抗原結合部位を含む分子）をいう。本発明の免疫グロブリン分子は、免疫グロブリン分子の任意の型（例えば、ＩｇＧ、ＩｇＥ、ＩｇＭ、ＩｇＤ、ＩｇＡ、およびＩｇＹ）、クラス（例えば、ＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３、ＩｇＧ４、ＩｇＡ１およびＩｇＡ２）またはサブクラスの分子であり得る。
【０２１０】
最も好ましくは、抗体は、本発明のヒト抗原結合抗体フラグメントであり、そしてＦａｂ、Ｆａｂ’およびＦ（ａｂ’）２、Ｆｄ、単鎖Ｆｖ（ｓｃＦｖ）、単鎖抗体、ジスルフィド連結Ｆｖ（ｓｄＦｖ）およびＶＬドメインまたはＶＨドメインのいずれかを含むフラグメントが挙げられるが、これらに限定されない。単鎖抗体を含む抗原結合抗体フラグメントは、可変領域を、単独であるいは以下：ヒンジ領域、ＣＨ１ドメイン、ＣＨ２ドメインおよびＣＨ３ドメインの全体または部分との組み合わせで含み得る。ヒンジ領域、ＣＨ１ドメイン、ＣＨ２ドメインおよびＣＨ３ドメインと可変領域の任意の組み合わせをもまた含む抗原結合フラグメントもまた、本発明に含まれる。本発明の抗体は、鳥類および哺乳動物を含む任意の動物起源由来であり得る。好ましくは、この抗体は、ヒト、ネズミ（例えば、マウスおよびラット）、ロバ、ウサギ（ｓｈｉｐ　ｒａｂｂｉｔ）、ヤギ、モルモット、ラクダ、ウマ、またはニワトリである。本明細書中で使用される場合、「ヒト」抗体は、ヒト免疫グロブリンのアミノ酸配列を有する抗体を含み、そしてヒト免疫グロブリンライブラリーから、または１つ以上のヒト免疫グロブリンについてトランスジェニックでかつ内因性免疫グロブリンを発現しない動物（以下および、例えば、Ｋｕｃｈｅｒｌａｐａｔｉらによる米国特許番号第５，９３９，５９８号に記載されるような）から単離された抗体を含む。
【０２１１】
本発明の抗体は、一重特異的、二重特異的、三重特異的またはより多価の多重特異的であり得る。多重特異的な抗体は、本発明のポリペプチドの異なるエピトープに対して特異的であり得るか、または本発明のポリペプチドおよび異種エピトープ（例えば、異種ポリペプチドまたは固体支持体物質）の両方に特異的であり得る。例えば、ＰＣＴ公開ＷＯ　９３／１７７１５；ＷＯ９２／０８８０２；ＷＯ　９１／００３６０；ＷＯ　９２／０５７９３；Ｔｕｔｔら、Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１４７：６０−６９（１９９１）；米国特許第４，４７４，８９３号；同第４，７１４，６８１号；同第４，９２５，６４８号；同第５，５７３，９２０号；同第５，６０１，８１９号；Ｋｏｓｔｅｌｎｙら、Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１４８：１５４７−１５５３（１９９２）を参照のこと。
【０２１２】
本発明の抗体は、この抗体により認識されるかまたは特異的に結合される本発明のポリペプチドのエピトープまたは部分によって、記載され得るかまたは特定化され得る。このエピトープまたはポリペプチド部分は、本明細書中に記載されるように、例えば、Ｎ末端およびＣ末端位置により、または連続するアミノ酸残基のサイズにより、特定化され得る。本発明の任意のエピトープまたはポリペプチドを特異的に結合する抗体はまた排除され得る。従って、本発明は、本発明のポリペプチドを特異的に結合し、そしてこのポリペプチドの排除を可能にする抗体を含む。
【０２１３】
本発明の抗体はまた、その交差反応性によって記載され得るか、または特定化され得る。本発明のポリペプチドの任意の他のアナログ、オルソログ（ｏｒｔｈｏｌｏｇ）またはホモログを結合しない抗体が、含まれる。本発明のポリペプチドに対して少なくとも９５％、少なくとも９０％、少なくとも８５％、少なくとも８０％、少なくとも７５％、少なくとも７０％、少なくとも６５％、少なくとも６０％、少なくとも５５％および少なくとも５０％の同一性（当該分野で公知の方法および本明細書において記載された方法を用いて計算される場合）を有するポリペプチドを結合する抗体もまた、本発明に含まれる。特定の実施形態において、本発明の抗体は、ヒトタンパク質のマウスホモログ、ラットホモログおよび／またはウサギホモログならびにそれらの対応するエピトープと交差反応する。本発明のポリペプチドに対して９５％未満、９０％未満、８５％未満、８０％未満、７５％未満、７０％未満、６５％未満、６０％未満、５５％未満および５０％未満の同一性（当該分野で公知の方法および本明細書において記載された方法を用いて計算される場合）を有するポリペプチドに結合しない抗体もまた、本発明に含まれる。特定の実施形態において、上記の交差反応性は、任意の単一特異的な抗原性ポリペプチドもしくは免疫原性ポリペプチド、または２、３、４、５もしくはそれより多くの本明細書中に開示される特異的な抗原性ポリペプチドおよび／または免疫原性ポリペプチドの組み合わせに関する。さらに本発明には、（本明細書中に記載されるような）ストリンジェントなハイブリダイゼーション条件下で本発明のポリヌクレオチドにハイブリダイズするポリヌクレオチドによりコードされるポリペプチドを結合する抗体が含まれる。本発明の抗体はまた、本発明のポリペプチドに対するその結合親和性によって記載または特定され得る。好ましい結合親和性としては、５×１０−２Ｍ、１０−２Ｍ、５×１０−３Ｍ、１０−３Ｍ、５×１０−４Ｍ、１０−４Ｍ、５×１０−５Ｍ、１０−５Ｍ、５×１０−６Ｍ、１０−６Ｍ、５×１０−７Ｍ、１０−７Ｍ、５×１０−８Ｍ、１０−８Ｍ、５×１０−９Ｍ、１０−９Ｍ、５×１０−１０Ｍ、１０−１０Ｍ、５×１０−１１Ｍ、１０−１１Ｍ、５×１０−１２Ｍ、１０−１２Ｍ、５×１０−１３Ｍ、１０−１３Ｍ、５×１０−１４Ｍ、１０−１４Ｍ、５×１０−１５Ｍ、または１０−１５Ｍ未満の解離定数すなわちＫｄを有する結合親和性が挙げられる。
【０２１４】
本発明はまた、競合的な結合を決定するための当該分野で公知の任意の方法（例えば、本明細書中に記載されるイムノアッセイ）によって決定されるような、本発明のエピトープに対する抗体の結合を競合的に阻害する抗体を提供する。好ましい実施形態において、この抗体は、少なくとも９５％、少なくとも９０％、少なくとも８５％、少なくとも８０％、少なくとも７５％、少なくとも７０％、少なくとも６０％、または少なくとも５０％、エピトープに対する結合を競合的に阻害する。
【０２１５】
本発明の抗体は、本発明のポリペプチドのアゴニストまたはアンタゴニストとして作用し得る。例えば、本発明は、レセプター／リガンドと本発明のポリペプチドとの相互作用を部分的または完全にのいずれかで破壊する抗体を含む。好ましくは、本発明の抗体は、本明細書中に開示される抗原性のエピトープまたはその部分に結合する。本発明は、レセプター特異的抗体およびリガンド特異的抗体の両方を特徴とする。本発明はまた、リガンド結合を妨げないがレセプターの活性化を妨げるレセプター特異的抗体を特徴とする。レセプターの活性化（すなわち、シグナル伝達）は、本明細書中に記載される技術、またはさもなくば当該分野で公知の技術によって決定され得る。例えば、レセプターの活性化は、（例えば、上記されたような）免疫沈降、続いてウエスタンブロット分析によって、レセプターのリン酸化（例えば、チロシンまたはセリン／スレオニン）あるいはその基質を検出することによって決定され得る。特定の実施形態において、抗体の非存在下の活性の少なくとも９５％、少なくとも９０％、少なくとも８５％、少なくとも８０％、少なくとも７５％、少なくとも７０％、少なくとも６０％、または少なくとも５０％でリガンド活性またはレセプター活性を阻害する抗体を提供する。
【０２１６】
本発明はまた、リガンド結合およびレセプター活性化の両方を妨げるレセプター特異的抗体、ならびにレセプター−リガンド複合体を認識し、そして、好ましくは、結合していないレセプターまたは結合していないリガンドを特異的に認識しない抗体を特徴とする。同様に、本発明には、リガンドに結合し、そしてリガンドのレセプターへの結合を妨げる中和抗体、ならびにリガンドに結合し、それによってレセプター活性化を妨げるが、リガンドがレセプターに結合することは妨げない抗体が含まれる。さらに本発明に含まれるのは、レセプターを活性化する抗体である。これらの抗体は、レセプターアゴニストとして作用し得、すなわち、リガンド媒介のレセプター活性化の生物学的活性のすべてまたはサブセット（ｓｕｂｓｅｔ）のいずれかを増強または活性化し得る（例えば、レセプターの二量体化を誘導することによる）。この抗体は、本明細書中に開示される本発明のペプチドの特定の生物学的活性を含む生物学的活性に対するアゴニスト、アンタゴニストまたはインバース（ｉｎｖｅｒｓｅ）アゴニストとして特定化され得る。上記の抗体アゴニストは、当該分野で公知の方法を用いて作製され得る。例えば、ＰＣＴ公開ＷＯ９６／４０２８１；米国特許第５，８１１，０９７号；Ｄｅｎｇら、Ｂｌｏｏｄ　９２（６）：１９８１−１９８８（１９９８）；Ｃｈｅｎら、Ｃａｎｃｅｒ　Ｒｅｓ．５８（１６）：３６６８−３６７８（１９９８）；Ｈａｒｒｏｐら、Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１６１（４）：１７８６−１７９４（１９９８）；Ｚｈｕら、Ｃａｎｃｅｒ　Ｒｅｓ：５８（１５）：３２０９−３２１４（１９９８）；Ｙｏｏｎら、Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１６０（７）：３１７０−３１７９（１９９８）；Ｐｒａｔら、Ｊ．Ｃｅｌｌ．Ｓｃｉ．１１１（Ｐｔ２）：２３７−２４７（１９９８）；Ｐｉｔａｒｄら、Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．Ｍｅｔｈｏｄｓ　２０５（２）：１７７−１９０（１９９７）；Ｌｉａｕｔａｒｄら、Ｃｙｔｏｋｉｎｅ　９（４）：２３３−２４１（１９９７）；Ｃａｒｌｓｏｎら、Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．２７２（１７）：１１２９５−１１３０１（１９９７）；Ｔａｒｙｍａｎら、Ｎｅｕｒｏｎ　１４（４）：７５５−７６２（１９９５）；Ｍｕｌｌｅｒら、Ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ　６（９）：１１５３−１１６７（１９９８）；Ｂａｒｔｕｎｅｋら、Ｃｙｔｏｋｉｎｅ　８（１）：１４−２０（１９９６）（上記の文献はすべて、その全体が本明細書において参考として援用される）を参照のこと。
【０２１７】
本発明の抗体は、例えば、インビトロおよびインビボの両方における診断方法および治療方法を含む本発明のポリペプチドを精製、検出および標的化するのために使用され得るが、これに限定されない。例えば、この抗体は、生物学的サンプルにおいて本発明のポリペプチドのレベルを定性的および定量的に測定するためのイムノアッセイにおいて用途を有する。例えば、Ｈａｒｌｏｗら，Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ：Ａ　Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ　Ｍａｎｕａｌ，（Ｃｏｌｄ　Ｓｐｒｉｎｇ　Ｈａｒｂｏｒ　Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ　Ｐｒｅｓｓ，第２版，１９８８）（その全体が参考として本明細書中に援用される）を参照のこと。
【０２１８】
以下により詳細が議論されるように、本発明の抗体は、単独で、または他の組成物との組み合わせのいずれかで用いられ得る。この抗体は、さらに、Ｎ末端もしくはＣ末端で異種ポリペプチドに組換え的に融合され得るか、またはポリペプチドもしくは他の組成物に化学的に結合（共有結合および非共有結合を含む）され得る。例えば、本発明の抗体は、検出アッセイにおける標識として有用な分子およびエフェクター分子（例えば、異種ポリペプチド、薬物、放射性核種または毒素）に、組換え的に融合または結合され得る。例えば、ＰＣＴ公開ＷＯ９２／０８４９５；ＷＯ９１／１４４３８；ＷＯ８９／１２６２４；米国特許第５，３１４，９９５号；およびＥＰ３９６，３８７号を参照のこと。
【０２１９】
本発明の抗体は、改変された（すなわち、共有結合性付着（ｃｏｖａｌｅｎｔ　ａｔｔａｃｈｍｅｎｔ）が、抗体が抗イディオタイプ応答を産生するのを妨げないような、抗体に対する任意の型の分子の共有結合性付着による）誘導体を含む。例えば、制限されないが、抗体誘導体には、例えば、グリコシル化、アセチル化、ぺグ化（ｐｅｇｙｌａｔｉｏｎ）、リン酸化（ｐｈｏｓｐｈｙｌａｔｉｏｎ）、アミド化、既知の保護基／ブロック基（ｂｌｏｃｋｉｎｇ　ｇｒｏｕｐ）による誘導体化、タンパク質分解性切断、細胞性リガンドまたは他のタンパク質への連結などによって改変された抗体が挙げられる。多数の任意の化学的改変が、特異的化学切断、アセチル化、ホルミル化、ツニカマイシンの代謝的合成などを含むが、これらに制限されない公知の技術によって実行され得る。さらに、誘導体は、１つ以上の非古典的アミノ酸を含み得る。
【０２２０】
本発明の抗体は、当該分野で公知の任意の適切な方法によって産生され得る。目的の抗原に対するポリクローナル抗体は、当該分野で周知の種々の手順によって産生され得る。例えば、本発明のポリペプチドが種々の宿主動物（ウサギ、マウス、ラットなどを含むがこれらに限定されない）に投与されて、抗原に対して特異的なポリクローナル抗体を含む血清の産生を誘導し得る。種々のアジュバントが、宿主種に依存して、免疫学的応答を増加させるために使用され得、そしてフロイント（完全および不完全）、水酸化アルミニウムのような鉱物ゲル（ｍｉｎｅｒａｌ　ｇｅｌ）、リゾレシチンのような界面活性物質、プルロニック（ｐｌｕｒｏｎｉｃ）ポリオール、ポリアニオン、ペプチド、油エマルジョン、キーホールリンペットヘモシアニン、ジニトロフェノール、ならびにＢＣＧ（カルメット−ゲラン杆菌）およびｃｏｒｙｎｅｂａｃｔｅｒｉｕｍ　ｐａｒｖｕｍのような潜在的に有用なヒトアジュバントを含むが、これらに限定されない。このようなアジュバントはまた、当該分野で周知である。
【０２２１】
モノクローナル抗体は、ハイブリドーマ、組換え、およびファージディスプレイ技術、またはそれらの組み合わせの使用を含む、当該分野で公知の広範な種々の技術を用いて調製され得る。例えば、モノクローナル抗体は、当該分野で公知の以下に挙げられるハイブリドーマ技術を使用して産生され得、例えば、Ｈａｒｌｏｗら、Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ：Ａ　Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ　Ｍａｎｕａｌ，（Ｃｏｌｄ　Ｓｐｒｉｎｇ　Ｈａｒｂｏｒ　Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ　Ｐｒｅｓｓ，第２版、１９８８）；Ｈａｍｍｅｒｌｉｎｇら、Ｍｏｎｏｃｌｏｎａｌ　Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ　ａｎｄ　Ｔ−Ｃｅｌｌ　Ｈｙｂｒｉｄｏｍａｓ　５６３−６８１（Ｅｌｓｅｖｉｅｒ，Ｎ．Ｙ．１９８１）（上記の参考文献は、その全体が参考として援用される）に教示される。本明細書中で使用される場合、用語「モノクローナル抗体」とは、ハイブリドーマ技術を通して生成された抗体に限定されない。用語「モノクローナル抗体」とは、任意の真核生物クローン、原核生物クローン、またはファージクローンを含む単一のクローンに由来する抗体をいい、そしてその生成される方法に由来する抗体ではない。
【０２２２】
ハイブリドーマ技術を用いて特異的抗体を産生およびスクリーニングする方法は、当該分野で慣用的かつ周知であり、そして実施例に詳細に議論される。非限定的な実施例において、マウスは、本発明のポリペプチドまたはそのようなペプチドを発現する細胞を用いて免疫され得る。一旦免疫応答が検出される（例えば、抗原に特異的な抗体がマウスの血清中に検出される）と、マウスの脾臓を収集しそして脾細胞を単離する。次に、その脾細胞を周知の技術によって任意の適切な骨髄腫細胞（例えば、ＡＴＣＣから入手可能な細胞株ＳＰ２０由来の細胞）に融合させる。ハイブリドーマを限界希釈によって選択およびクローン化する。次に、ハイブリドーマクローンを、本発明のポリペプチドに結合し得る抗体を分泌する細胞について、当該分野で公知の方法によってアッセイする。一般的に高いレベルの抗体を含む腹水（ａｓｃｉｔｅｓ　ｆｌｕｉｄ）が、陽性ハイブリドーマクローンを用いてマウスを免疫することによって、産生され得る。
【０２２３】
従って、本発明は、モノクローナル抗体および本発明の抗体を分泌するハイブリドーマ細胞を培養する工程を包含する方法によって産生される抗体を、生成する方法を提供し、ここで、好ましくは、このハイブリドーマは、骨髄腫細胞と本発明の抗原で免疫したマウスから単離された脾細胞とを融合させ、次いで本発明のポリペプチドと結合し得る抗体を分泌するハイブリドーマクローンについて、融合物から生じるハイブリドーマをスクリーニングすることによって生成される。
【０２２４】
特定のエピトープを認識する抗体フラグメントは、公知の技術により産生し得る。例えば、本発明のＦａｂフラグメントおよびＦ（ａｂ’）２フラグメントは、パパイン（Ｆａｂフラグメントを産生するため）またはペプシン（Ｆ（ａｂ’）２フラグメントを産生するため）のような酵素を使用して、免疫グロブリン分子のタンパク質分解性切断によって産生され得る。Ｆ（ａｂ’）２フラグメントは、可変領域、軽鎖定常領域および重鎖のＣＨ１ドメインを含む。例えば、本発明の抗体はまた、当該分野で公知の種々のファージディスプレイ方法を用いて産生され得る。ファージディスプレイ方法において、機能的な抗体ドメインは、それらをコードするポリヌクレオチド配列を保有するファージ粒子の表面上に提示される。特定の実施形態において、このようなファージを、レパートリー抗体ライブラリーまたはコンビナトリアル抗体ライブラリー（例えば、ヒトまたはマウス）から発現される抗原結合ドメインを提示するために利用し得る。目的の抗原と結合する抗原結合ドメインを発現するファージを、抗原を用いて、（例えば、標識化抗原、あるいは固体表面または固体ビーズへ結合または捕捉された抗原を使用して）選択または同定し得る。これらの方法において使用されるファージは、代表的に、ファージ遺伝子ＩＩＩタンパク質またはファージ遺伝子ＶＩＩＩタンパク質のいずれかに組換え的に融合されたＦａｂ、Ｆｖまたはジスルフィド安定化されたＦｖの抗体ドメインを有するファージから発現されたｆｄおよびＭ１３結合ドメインを含む糸状ファージである。本発明の抗体を作製するために用いられ得るファージディスプレイ方法の例としては、以下に開示される方法が挙げられる：Ｂｒｉｎｋｍａｎら、Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．Ｍｅｔｈｏｄｓ　１８２：４１〜５０（１９９５）；Ａｍｅｓら、Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．Ｍｅｔｈｏｄｓ　１８４：１７７〜１８６（１９９５）；Ｋｅｔｔｌｅｂｏｒｏｕｇｈら、Ｅｕｒ．Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．２４：９５２〜９５８（１９９４）；Ｐｅｒｓｉｃら、Ｇｅｎｅ　１８７　９〜１８（１９９７）；Ｂｕｒｔｏｎら、Ａｄｖａｎｃｅｓ　ｉｎ　Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ　５７：１９１〜２８０（１９９４）；ＰＣＴ出願番号ＰＣＴ／ＧＢ９１／０１１３４；ＰＣＴ公開　ＷＯ９０／０２８０９；ＷＯ９１／１０７３７；ＷＯ９２／０１０４７；ＷＯ９２／１８６１９；ＷＯ９３／１１２３６；ＷＯ９５／１５９８２；ＷＯ９５／２０４０１；ならびに米国特許第５，６９８，４２６号；同第５，２２３，４０９号；同第５，４０３，４８４号；同第５，５８０，７１７号；同第５，４２７，９０８号；同第５，７５０，７５３号；同第５，８２１，０４７号；同第５，５７１，６９８号；同第５，４２７，９０８号；同第５，５１６，６３７号；同第５，７８０，２２５号；同第５，６５８，７２７号；同第５，７３３，７４３号および同第５，９６９，１０８号（これらのそれぞれは、その全体が参考として援用される）。
【０２２５】
上記参考文献に記載されているように、ファージ選択後、ファージ由来の抗体をコードする領域は、ヒト抗体を含む抗体の全体、または任意の他の所望の抗原結合フラグメントを作製するために単離および使用され得、そして例えば、以下に詳細に記載されるように、哺乳動物細胞、昆虫細胞、植物細胞、酵母および細菌を含む任意の所望の宿主において発現され得る。例えば、Ｆａｂ、Ｆａｂ’およびＦ（ａｂ’）２フラグメントを組換え的に産生するための技術はまた、当該分野で公知の方法を用いて使用され得る。この方法は、例えば、以下に開示される方法である：ＰＣＴ公開ＷＯ９２／２２３２４；Ｍｕｌｌｉｎａｘら、ＢｉｏＴｅｃｈｎｉｑｕｅｓ　１２（６）：８６４−８６９（１９９２）；およびＳａｗａｉら、ＡＪＲＩ　３４：２６−３４（１９９５）；およびＢｅｔｔｅｒら、Ｓｃｉｅｎｃｅ　２４０：１０４１−１０４３（１９９８）（上記の参考文献は、その全体が参考として援用される）。
【０２２６】
単鎖のＦｖｓおよび抗体を産生するために用いられ得る技術の例としては、米国特許第４，９４６，７７８号および同第５，２５８，４９８号；Ｈｕｓｔｏｎら、Ｍｅｔｈｏｄｓ　ｉｎ　Ｅｎｚｙｍｏｌｏｇｙ　２０３：４６−８８（１９９１）；Ｓｈｕら、ＰＮＡＳ　９０：７９９５−７９９９（１９９３）；およびＳｋｅｒｒａら、Ｓｃｉｅｎｃｅ　２４０：１０３８−１０４０（１９８８）に記載される技術が挙げられる。ヒトにおける抗体のインビボ使用およびインビトロ検出アッセイを含むいくつかの用途のために、キメラ抗体、ヒト化抗体またはヒト抗体の使用が好ましくあり得る。キメラ抗体は、この抗体の異なる部分が異なる動物種に由来する分子（例えば、マウスモノクローナル抗体由来の可変領域およびヒト免疫グロブリン定常領域を有する抗体）である。キメラ抗体を産生するための方法は、当該分野において公知である。例えば、Ｍｏｒｒｉｓｏｎ，Ｓｃｉｅｎｃｅ　２２９：１２０２（１９８５）；Ｏｉら、ＢｉｏＴｅｃｈｎｉｑｕｅｓ　４：２１４（１９８６）；Ｇｉｌｌｉｅｓら、（１９８９）Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．Ｍｅｔｈｏｄｓ　１２５：１９１−２０２；および米国特許第５，８０７，７１５号；同第４，８１６，５６７号；および同第４，８１６，３９７号を参照のこと（これらは、本明細書中でその全体が参照として援用される）。ヒト化抗体は、非ヒト種由来の１以上の相補性決定領域（ＣＤＲ）およびヒト免疫グロブリン分子由来のフレームワーク領域を有する、所望の抗原に結合する非ヒト種抗体由来の抗体分子である。しばしば、ヒトフレームワーク領域におけるフレームワーク残基は、ＣＤＲドナー抗体由来の対応する残基と置換され、抗原結合を改変（好ましくは、改善）する。これらのフレームワーク置換は、当該分野で周知の方法により同定され、例えば、抗原結合に重要なフレームワーク残基を同定するためのＣＤＲとフレームワーク残基との相互作用のモデリング、ならびに特定の位置における異常なフレームワーク残基を同定するための配列比較による。（例えば、Ｑｕｅｅｎら、米国特許第５，５８５，０８９号；Ｒｉｅｃｈｍａｎｎら、Ｎａｔｕｒｅ　３３２：３２３（１９８８）（これらは本明細書中でその全体が参考として援用される）を参照のこと）。抗体は、例えば、以下を含む当該分野で公知の種々の技術を用いてヒト化され得る：ＣＤＲ−グラフティング（ｇｒａｆｔｉｎｇ）（欧州特許第２３９，４００号；ＰＣＴ公開　ＷＯ９１／０９９６７；米国特許第５，２２５，５３９号；同第５，５３０，１０１号および同第５，５８５，０８９号）、ベニヤリング（ｖｅｎｅｅｒｉｎｇ）またはリサーフェイシング（ｒｅｓｕｒｆａｃｉｎｇ）（欧州特許第５９２，１０６号；欧州特許第５１９，５９６号；Ｐａｄｌａｎ、Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ　Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ　２８（４／５）：４８９−４９８（１９９１）；Ｓｔｕｄｎｉｃｋａら、Ｐｒｏｔｅｉｎ　Ｅｎｇｉｎｅｅｒｉｎｇ　７（６）：８０５−８１４（１９９４）；Ｒｏｇｕｓｋａら、ＰＮＡＳ　９１：９６９−９７３（１９９４））、およびチェーンシャッフリング（ｃｈａｉｎ　ｓｈｕｆｆｌｉｎｇ）（米国特許第５，５６５，３３２号）。
【０２２７】
完全なヒト抗体が、ヒト患者の治療的処置に対して特に望ましい。ヒト抗体は、当該分野で公知の種々の方法によって作製され得、これらの方法としては、ヒト免疫グロブリン配列由来の抗体ライブラリーを用いる上記のファージディスプレイ方法が挙げられる。米国特許第４，４４４，８８７号および同第４，７１６，１１１号；ならびにＰＣＴ公開ＷＯ９８／４６６４５、ＷＯ９８／５０４３３、ＷＯ９８／２４８９３、ＷＯ９８／１６６５４、ＷＯ９６／３４０９６、ＷＯ９６／３３７３５、およびＷＯ９１／１０７４１（これらの各々は、その全体が参考として本明細書中に援用される）もまた参照のこと。
【０２２８】
ヒト抗体はまた、機能的内因性免疫グロブリンの発現は出来ないが、ヒト免疫グロブリン遺伝子を発現し得るトランスジェニックマウスを用いて産生され得る。例えば、ヒト重鎖免疫グロブリン遺伝子およびヒト軽鎖免疫グロブリン遺伝子の複合体は、無作為にまたは相同組換えによってマウス胚性幹細胞に導入され得る。あるいは、ヒト可変領域、定常領域および多様性領域（ｄｉｖｅｒｓｉｔｙ　ｒｅｇｉｏｎ）は、ヒト重鎖遺伝子およびヒト軽鎖遺伝子に加えて、マウスの胚性幹細胞に導入され得る。マウス重鎖免疫グロブリン遺伝子およびマウス軽鎖免疫グロブリン遺伝子は、相同組換えによるヒト免疫グロブリン座の導入と別々にまたは同時に非機能的にされ得る。特に、ＪＨ領域のホモ接合性の欠失は、内因性抗体の産生を妨げる。この改変された胚性幹細胞を増殖させ、そして胚盤胞に微量注入して、キメラマウスを産生する。次に、このキメラマウスを、ヒト抗体を発現するホモ接合性の子孫を産生するために繁殖させる。トランスジェニックマウスを、選択された抗原（例えば、本発明のポリペプチドの全体または一部）を用いて通常の様式で免疫する。その抗原に対するモノクローナル抗体は、従来のハイブリドーマ技術を用いた免疫したトランスジェニックマウスから得られ得る。ヒト免疫グロブリン導入遺伝子は、Ｂ細胞分化の間のトランスジェニックマウスの再編成によってかくまわれ（ｈａｒｂｏｒｅｄ）、そしてその後、クラススイッチングおよび体細胞変異を受ける。従って、そのような技術の使用によって、治療的に有用なＩｇＧ抗体、ＩｇＡ抗体、ＩｇＭ抗体およびＩｇＥ抗体の産生が可能である。ヒト抗体を産生するためのこの技術の概要については、ＬｏｎｂｅｒｇおよびＨｕｓｚａｒ、Ｉｎｔ．Ｒｅｖ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１３：６５−９３（１９９５）を参照のこと。ヒト抗体およびヒトモノクローナル抗体を産生するためのこの技術のならびにそのような抗体を産生するためのプロトコールの詳細な議論については、例えば、ＰＣＴ公開ＷＯ９８／２４８９３；ＷＯ９２／０１０４７；ＷＯ９６／３４０９６；ＷＯ９６／３３７３５；欧州特許第０　５９８　８７７；米国特許第５，４１３，９２３号；同第５，６２５，１２６号；同第５，６３３，４２５号；同第５，５６９，８２５号；同第５，６６１，０１６号；同第５，５４５，８０６号；同第５，８１４，３１８号；同第５，８８５，７９３号；同第５，９１６，７７１号；および同第５，９３９，５９８号を参照のこと（これらは、その全体が本明細書中に参考として援用される）。さらに、Ａｂｇｅｎｉｘ，Ｉｎｃ．（Ｆｒｅｅｍｏｎｔ，ＣＡ）およびＧｅｎｐｈａｒｍ（Ｓａｎ　Ｊｏｓｅ，ＣＡ）のような企業は、上記の技術に類似した技術を用いて選択された抗原に対するヒト抗体を提供することに従事し得る。
【０２２９】
選択されたエピトープを完全に認識するヒト抗体を、「ガイドされた（ｇｕｉｄｅｄ）選択」といわれる技術を用いて産生し得る。このアプローチにおいて、選択された非ヒトモノクローナル抗体（例えば、マウス抗体）は、同じエピトープを完全に認識するヒト抗体の選択を導くために使用される（Ｊｅｓｐｅｒｓら、Ｂｉｏ／ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ　１２：８９９−９０３（１９８８））。
【０２３０】
さらに、本発明のポリペプチドに対する抗体は、当業者に周知の技術を用いて、本発明のポリペプチドを「模倣する」抗イディオタイプ抗体を生成するために順々に利用され得る。（例えば、ＧｒｅｅｎｓｐａｎおよびＢｏｎａ、ＦＡＳＥＢ　Ｊ．７（５）：４３７−４４４（１９８９）；ならびにＮｉｓｓｉｎｏｆｆ、Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１４７（８）：２４２９−２４３８（１９９１）を参照のこと）。例えば、結合し、そしてポリペプチドのマルチマー化（ｍｕｌｔｉｍｅｒｉｚａｔｉｏｎ）および／または本発明のポリペプチドのリガンドに対する結合を競合的に阻害する抗体を用いて、このポリペプチドのマルチマー化および／または結合ドメインを「模倣し」、そして結果として、ポリペプチドおよび／またはそのリガンドに結合し、そして中和する抗イディオタイプを生成し得る。このような中和抗イディオタイプまたはこのような抗イディオタイプのＦａｂフラグメントは、治療レジメンにおいて使用されて、ポリペプチドリガンドを中和し得る。例えば、このような抗イディオタイプ抗体を使用して、本発明のポリペプチドを結合し得るか、そして／またはそのリガンド／レセプターを結合し得、それによって、その生物学的活性をブロックし得る。
【０２３１】
（抗体をコードするポリヌクレオチド）
本発明はさらに、本発明の抗体およびそのフラグメントをコードするヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチドを提供する。本発明はまた、ストリンジェントな条件下またはより低いストリンジェンシーハイブリダイゼーション条件下で（例えば、上記のような）、抗体（好ましくは、本発明のポリペプチドに特異的に結合する抗体）をコードするポリヌクレオチド、好ましくは、配列番号Ｙのアミノ酸配列を有するポリヌクレオチドに結合する抗体をコードするポリヌクレオチド、に対してハイブリダイズするポリヌクレオチドを含む。
【０２３２】
当該分野で公知の任意の方法によって、これらのポリヌクレオチドが得られ得、そしてこれらポリヌクレオチドのヌクレオチド配列が、決定され得る。例えば、抗体のヌクレオチド配列が公知である場合、この抗体をコードするポリヌクレオチドは、化学的に合成されたオリゴヌクレオチドからアセンブルされ得（例えば、Ｋｕｔｍｅｉｅｒら、ＢｉｏＴｅｃｈｎｉｑｕｅｓ　１７：２４２（１９９４）に記載されるように）、これは、手短に言えば、抗体をコードする配列の部分を含むオーバーラップするオリゴヌクレオチドの合成、それらのオリゴヌクレオチドのアニーリングおよび連結、ならびに次いでＰＣＲによるこの連結されたオリゴヌクレオチドの増幅を含む。
【０２３３】
あるいは、抗体をコードするポリヌクレオチドは、適切な供給源からの核酸から作製され得る。特定の抗体をコードする核酸を含むクローンは入手不可能だが、その抗体分子の配列が既知である場合、免疫グロブリンをコードする核酸は、化学的に合成され得るか、あるいは適切な供給源（例えば、抗体ｃＤＮＡライブラリー、または抗体を発現する任意の組織もしくは細胞（例えば、本発明の抗体の発現のために選択されたハイブリドーマ細胞）から生成されたｃＤＮＡライブラリー、またはそれから単離された核酸（好ましくはポリＡ＋ＲＮＡ））を、例えば、抗体をコードするｃＤＮＡライブラリーからのｃＤＮＡクローンを同定するために、その配列の３’末端および５’末端にハイブリダイズ可能な合成プライマーを使用するＰＣＲ増幅によって、またはその特定の遺伝子配列に特異的なオリゴヌクレオチドプローブを使用するクローニングによって得られ得る。ＰＣＲによって作製された増幅された核酸は、次いで、当該分野で周知の任意の方法を用いて、複製可能なクローニングベクターにクローニングされ得る。
【０２３４】
一旦、抗体のヌクレオチド配列および対応するアミノ酸配列が決定されると、抗体のヌクレオチド配列は、ヌクレオチド配列の操作について当該分野で周知の方法（例えば、組換えＤＮＡ技術、部位指向性変異誘発、ＰＣＲなど（例えば、Ｓａｍｂｒｏｏｋら、１９９０，Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ　Ｃｌｏｎｉｎｇ，Ａ　Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ　Ｍａｎｕａｌ，第２版、Ｃｏｌｄ　Ｓｐｒｉｎｇ　Ｈａｒｂｏｒ　Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ，Ｃｏｌｄ　Ｓｐｒｉｎｇ　Ｈａｒｂｏｒ，ＮＹおよびＡｕｓｕｂｅｌら編、１９９８，Ｃｕｒｒｅｎｔ　Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ　ｉｎ　Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ　Ｂｉｏｌｏｇｙ，Ｊｏｈｎ　Ｗｉｌｅｙ＆Ｓｏｎｓ，ＮＹに記載の技術を参照のこと。これらは両方がその全体において本明細書に参考として援用される。））を用いて操作され、例えば、アミノ酸の置換、欠失、および／または挿入を生成するように異なるアミノ酸配列を有する抗体を作製し得る。
【０２３５】
特定の実施形態では、重鎖および／または軽鎖の可変ドメインのアミノ酸配列は、相補性決定領域（ＣＤＲ）の配列を同定するために、当該分野で周知の方法、例えば、他の重鎖および軽鎖の可変領域の既知のアミノ酸配列と比較して、配列超可変性領域を決定する方法、によって、調べられ得る。慣用的組換えＤＮＡ技術を使用して、一つ以上のＣＤＲが、フレームワーク領域内、例えば、上記のように、非ヒト抗体をヒト化させるためにヒトフレームワーク領域内に挿入され得る。このフレームワーク領域は、天然に存在、または共通するフレームワーク領域であり得、そして好ましくはヒトフレームワーク領域であり得る（ヒトフレームワーク領域の一覧については、例えばＣｈｏｔｈｉａら、Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．　２７８：４５７−４７９（１９９８）を参照のこと）。好ましくは、フレームワーク領域およびＣＤＲの組合せによって生成するポリヌクレオチドは、本発明のポリペプチドに特異的に結合する抗体をコードする。好ましくは、上で考察したように、一つ以上のアミノ酸の置換は、フレームワーク領域内で起こり、そして好ましくは、このアミノ酸置換は、その抗原への抗体の結合を改善する。さらに、このような方法は、アミノ酸置換させるため、または鎖内ジスルフィド結合に参加している一つ以上の可変領域システイン残基を欠失させて、一つ以上の鎖内ジスルフィド結合が欠けた抗体分子を生成させるために、使用され得る。ポリヌクレオチドに対する他の改変は、本発明および当該分野の技術によって達成される。
【０２３６】
さらに、適切な抗原特異性のマウス抗体分子からの遺伝子を、適切な生物学的活性のヒト抗体分子からの遺伝子とともに、スプライシングすることによる、「キメラ抗体」の産生のために開発された技術（Ｍｏｒｒｉｓｏｎら、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．８１：８５１−８５５（１９８４）；Ｎｅｕｂｅｒｇｅｒら、Ｎａｔｕｒｅ　３１２：６０４−６０８（１９８４）；Ｔａｋｅｄａら、Ｎａｔｕｒｅ　３１４：４５２−４５４（１９８５））が、使用され得る。上記のように、キメラ抗体は、異なる部分が異なる動物の種に由来する分子（例えばマウスｍＡｂに由来する可変領域およびヒト免疫グロブリン定常領域を有する分子）であり、例えばヒト化抗体である。
【０２３７】
あるいは、一本鎖抗体の産生について記載された技術（米国特許第４，９４６，７７８号；Ｂｉｒｄ，Ｓｃｉｅｎｃｅ　２４２：４２３−４２（１９９８）；Ｈｕｓｔｏｎら、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ　８５：５８７９−５８８３（１９９８）；およびＷａｒｄら、Ｎａｔｕｒｅ　３３４：５４４−５４（１９８９））は、一本鎖抗体を産生するために適合され得る。一本鎖抗体は、アミノ酸架橋を介して、Ｆｖ領域の重鎖および軽鎖フラグメントを連結し、一本鎖ポリペプチドを生じることによって形成される。Ｅ．ｃｏｌｉにおける機能的Ｆｖフラグメントのアセンブリのための技術もまた使用され得る（Ｓｋｅｒｒａら、Ｓｃｉｅｎｃｅ　２４２：１０３８−１０４１（１９８８））。
【０２３８】
（抗体産生の方法）
本発明の抗体は、抗体の合成について当該技術分野で公知の任意の方法によって、特に化学合成によって、または好ましくは組換え発現技術によって、産生され得る。
【０２３９】
本発明の抗体、またはそのフラグメント、誘導体もしくはアナログ（例えば、本発明の抗体の重鎖もしくは軽鎖、または本発明の一本鎖抗体）の組換え発現は、抗体をコードするポリヌクレオチドを含む発現ベクターの構築を必要とする。本発明の、抗体分子または抗体の重鎖もしくは軽鎖、またはそれらの部分（好ましくは重鎖もしくは軽鎖の可変ドメインを含む）をコードするポリヌクレオチドが一旦得られれば、抗体分子の産生のためのベクターは、当該分野で周知の技術を使用する組換えＤＮＡ技術によって産生され得る。従って、抗体をコードするヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチドの発現によってタンパク質を調製するための方法は、本明細書中に記載される。当業者に周知の方法は、抗体コード配列ならびに適切な転写および翻訳制御シグナルを含む発現ベクターを構築するために使用され得る。これらの方法は、例えば，インビトロ組換えＤＮＡ技術、合成技術、およびインビボ遺伝子組換えを含む。従って、本発明は、プロモーターに作動可能に連結された、本発明の抗体分子をコードするヌクレオチド配列、またはその重鎖もしくは軽鎖、または重鎖もしくは軽鎖の可変ドメイン、を含む複製可能ベクターを提供する。このようなベクターは、抗体分子の定常領域をコードするヌクレオチド配列を含み得（例えば、ＰＣＴ国際公開第ＷＯ　８６／０５８０７号；ＰＣＴ国際公開第ＷＯ　８９／０１０３６；および米国特許第５，１２２，４６４号を参照のこと）、そして、この抗体の可変領域は、重鎖または軽鎖の全体の発現のためにこのようなベクター内にクローニングされ得る。
【０２４０】
発現ベクターは、従来の技術によって宿主細胞に移入され、次いでトランスフェクトされた細胞は、従来の技術によって本発明の抗体を産生するために培養される。従って、本発明は、異種のプロモーターに作動可能に連結された、本発明の抗体、またはその重鎖もしくは軽鎖、または本発明の一本鎖抗体をコードするポリヌクレオチドを含む宿主細胞を含む。二本鎖抗体の発現のための好ましい実施形態では、重鎖および軽鎖の両方をコードするベクターは、下記に詳細に記載したように、免疫グロブリン分子全体の発現のための宿主細胞において同時発現され得る。
【０２４１】
種々の宿主発現ベクター系は、本発明の抗体分子を発現させるために利用され得る。このような宿主発現系は、目的のコード配列が産生され、かつ続いて精製され得るビヒクルを表わすが、また、適切なヌクレオチドコード配列で形質転換またはトランスフェクトされる場合に、インサイチュで本発明の抗体分子を発現し得る細胞を表わす。これらには、以下が挙げられるが、これらに限定されない：抗体をコードする配列を含む組換えバクテリオファージＤＮＡ発現ベクター、プラスミドＤＮＡ発現ベクターまたはコスミドＤＮＡ発現ベクターを用いて形質転換された細菌（例えば、Ｅ．ｃｏｌｉ、Ｂ．ｓｕｂｔｉｌｉｓ）のような微生物；抗体をコードする配列を含む組換え酵母発現ベクターで形質転換された酵母（例えば、Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ、Ｐｉｃｈｉａ）；抗体をコードする配列を含む組換えウイルス発現ベクター（例えば、バキュロウイルス）に感染した昆虫細胞系；組換えウイルス発現ベクター（例えば、カリフラワーモザイクウイルス、ＣａＭＶ；タバコモザイクウイルス、ＴＭＶ）に感染した植物細胞系または抗体をコードする配列を含む組換えプラスミド発現ベクター（例えば、Ｔｉプラスミド）で形質転換された植物細胞系；あるいは哺乳動物細胞のゲノムに由来するプロモーター（例えば、メタロチオネインプロモーター）または哺乳動物のウイルスに由来するプロモーター（例えば、アデノウイルス後期プロモーター；ワクシニアウイルス７．５Ｋプロモーター）を含む組換え発現構築物を保有する哺乳動物細胞系（例えば、ＣＯＳ、ＣＨＯ、ＢＨＫ、２９３、３Ｔ３細胞）。好ましくは、Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ　ｃｏｌｉのような細菌細胞、そしてより好ましくは、特に、組換え抗体分子全体の発現のために真核生物細胞が、組換え抗体分子の発現のために使用される。例えば、ヒトサイトメガロウイルス由来の主要最初期遺伝子プロモーターエレメントのようなベクターと組み合わされた、チャイニーズハムスターの卵巣細胞（ＣＨＯ）のような哺乳動物細胞が、抗体のための効果的な発現系である（Ｆｏｅｃｋｉｎｇら、Ｇｅｎｅ　４５：１０１（１９８６）；Ｃｏｃｋｅｔｔら、Ｂｉｏ／Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ　８：２（１９９０））。
【０２４２】
細菌系において、多くの発現ベクターが、抗体分子の発現を意図する使用に依存して有利に選択され得る。例えば、多量のこのようなタンパク質が産生される場合、抗体分子の薬学的組成物の生成のために、容易に精製される融合タンパク質産物の高レベルの発現を指向するベクターが所望され得る。このようなベクターには、以下が挙げられるが、これらに限定されない：抗体をコードする配列がｌａｃＺをコードする領域と共にベクターにインフレーム（ｉｎ　ｆｒａｍｅ）で個別に連結され得、その結果、融合タンパク質が産生されるＥ．ｃｏｌｉ発現ベクターｐＵＲ２７８（Ｒｕｔｈｅｒら、ＥＭＢＯ　Ｊ．２：１７９１（１９８３））；ｐＩＮベクター（Ｉｎｏｕｙｅ＆Ｉｎｏｕｙｅ、Ｎｕｃｌｅｉｃ　Ａｃｉｄｓ　Ｒｅｓ．１３：３１０１−３１０９（１９８５）；Ｖａｎ　Ｈｅｅｋｅ＆Ｓｃｈｕｓｔｅｒ、Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．２４：５５０３−５５０９（１９８９））など。ｐＧＥＸベクターもまた、グルタチオンＳ−トランスフェラーゼ（ＧＳＴ）との融合タンパク質として、外来性ポリペプチドを発現させるために使用され得る。一般に、このような融合タンパク質は可溶性であり、そして溶解した細胞から、マトリックスであるグルタチオン−アガロースビーズへの吸着および結合、それに続く遊離グルタチオン存在化での溶出によって容易に精製され得る。このｐＧＥＸベクターは、トロンビンまたはＸａ因子プロテアーゼ切断部位を含むように設計され、その結果、このクローニングされた標的遺伝子産物は、ＧＳＴ部分から放出され得る。
【０２４３】
昆虫系においては、Ａｕｔｏｇｒａｐｈａ　ｃａｌｉｆｏｒｎｉｃａ核多角体病ウィルス（ＡｃＮＰＶ）は、異種遺伝子を発現するためのベクターとして使用される。このウィルスは、Ｓｐｏｄｏｐｔｅｒａ　ｆｒｕｇｉｐｅｒｄａ細胞において増殖する。抗体をコードする配列は、このウィルスの非必須の領域（例えばポリヘドリン遺伝子）に個々にクローニングされ得、そしてＡｃＮＰＶプロモーター（例えばポリヘドリンプロモーター）の制御下に配置され得る。
【０２４４】
哺乳動物宿主細胞においては、多数のウィルスに基づく発現系が利用され得る。アデノウィルスが発現ベクターとして使用される場合においては、目的の抗体をコードする配列は、アデノウィルスの転写／翻訳制御複合体、例えば後期プロモーターおよび３つの部分に分かれるリーダー配列、に連結され得る。次いで、このキメラ遺伝子は、インビトロまたはインビボでの組換えによって、アデノウィルスゲノムに挿入され得る。ウィルスのゲノムの非必須領域（例えば、Ｅ１またはＥ３領域）における挿入は、生存可能で、感染した宿主において抗体分子を発現する能力のある組換えウィルスを生じる（例えば、Ｌｏｇａｎ＆Ｓｈｅｎｋ、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ　８１：３５５−３５９（１９８４）を参照のこと）。特異的開始シグナルはまた、挿入された抗体をコードする配列の効率的な翻訳のために必要とされ得る。これらのシグナルは、ＡＴＧ開始コドンおよび隣接する配列を含む。さらに、この開始コドンは、挿入部分全体の翻訳を確実にするために、所望されるコード配列のリーディングフレームと相が同じでなければならない。これらの外因性翻訳制御シグナルおよび開始コドンは、種々の起源、天然および合成の両方であり得る。発現の効率は、適切な転写エンハンサーエレメント、転写ターミネーター、などの含有によって高められ得る（Ｂｉｔｔｎｅｒら、Ｍｅｔｈｏｄｓ　ｉｎ　Ｅｎｚｙｍｏｌ．１５３：５１−５４４（１９８７）を参照のこと）。
【０２４５】
さらに、宿主細胞株は、選択され得、これは挿入配列の発現を調節し、または、所望される特異的な様式で遺伝子産物を改変し、そしてプロセシングする。タンパク質産物のこのような改変（例えばグリコシル化）およびプロセシング（例えば切断）は、タンパク質の機能のために重要であり得る。異なる宿主細胞は、タンパク質および遺伝子産物の、翻訳後プロセシングおよび改変のための、特徴的で特異的な機構を有する。適切な細胞株または宿主系は、発現された外来タンパク質の正確な改変およびプロセシングを確実にするように選択され得る。この目的のために、遺伝子産物の、１次転写産物、グリコシル化、およびリン酸化の正確なプロセシングのための細胞機構を有する、真核生物宿主細胞が、使用され得る。このような哺乳動物宿主細胞は、ＣＨＯ、ＶＥＲＹ、ＢＨＫ、Ｈｅｌａ、ＣＯＳ、ＭＤＣＫ、２９３、３Ｔ３、ＷＩ３８、そして特に、例えば、ＢＴ４８３、Ｈｓ５７８Ｔ、ＨＴＢ２、ＢＴ２０およびＴ４７Ｄのような乳癌細胞株、ならびに、例えば、ＣＲＬ７０３０およびＨｓ５７８Ｂｓｔのような正常な乳腺細胞株を含むが、これらに限定されない。
【０２４６】
組換えタンパク質の長期間の高収率産生、安定発現が好ましい。例えば、安定に抗体分子を発現する細胞株が操作され得る。ウィルスの複製起点を含む発現ベクターを使用するよりも、宿主細胞は、適切な発現制御エレメント（例えば、プロモーター、エンハンサー、配列、転写ターミネーター、ポリアデニル化部位、など）によって制御されるＤＮＡ、および選択マーカーで形質転換され得る。外来ＤＮＡの導入に続いて、操作された細胞は、１〜２日間富化培地で増殖させられ得、次いで、選択培地に切り替えられる。組換えプラスミドにおける選択マーカーは、選択に対する耐性を与え、そして細胞が、プラスミドをその染色体内に安定に組み込み、そして増殖して、細胞増殖巣を形成し、これを今度はクローニングし得、細胞株に拡大することを可能にする。この方法は、抗体分子を発現する細胞株を操作するために、有利に使用され得る。このような操作された細胞株は、直接的または間接的に抗体分子と相互作用する化合物のスクリーニングおよび評価において、特に有用であり得る。
【０２４７】
多数の選択系が使用され得、この選択系は、単純ヘルペスウィルスチミジンキナーゼ（Ｗｉｇｌｅｒら、Ｃｅｌｌ　１１：２２３（１９７７））、ヒポキサンチン−グアニンホスホリボシルトランスフェラーゼ（Ｓｚｙｂａｌｓｋａ＆Ｓｚｙｂａｌｓｋｉ、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ　４８：２０２（１９９２））、およびアデニンホスホリボシルトランスフェラーゼ（Ｌｏｗｙら、Ｃｅｌｌ　２２：８１７（１９８０））の遺伝子を含むが限定されず、これらの遺伝子は、ｔｋ−、ｈｇｐｒｔ−またはａｐｒｔ−細胞においてそれぞれ使用され得る。また、代謝拮抗物質耐性は、以下の遺伝子の選択の根拠として使用され得る：ｄｈｆｒ、これはメトトレキサートに対する耐性を与える（Ｗｉｇｌｅｒら、Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ　７７：３５７（１９８０）；Ｏ’Ｈａｒｅら、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ　７８：１５２７（１９８１））；ｇｐｔ、これはミコフェノール酸に対する耐性を与える（Ｍｕｌｌｉｇａｎ＆Ｂｅｒｇ、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ　７８：２０７２（１９８１））；ｎｅｏ、これはアミノグリコシドＧ−４１８に対する耐性を与える（Ｃｌｉｎｉｃａｌ　Ｐｈａｒｍａｃｙ　１２：４８８−５０５；Ｗｕ　ａｎｄ　Ｗｕ、Ｂｉｏｔｈｅｒａｐｙ　３：８７−９５（１９９１）；Ｔｏｌｓｔｏｓｈｅｖ、Ａｎｎ．Ｒｅｖ．Ｐｈａｒｍａｃｏｌ．Ｔｏｘｉｃｏｌ．　３２：５７３−５９６（１９９３）；Ｍｕｌｌｉｇａｎ、Ｓｃｉｅｎｃｅ　２６０：９２６−９３２（１９９３）；およびＭｏｒｇａｎ　ａｎｄ　Ａｎｄｅｒｓｏｎ、Ａｎｎ．Ｒｅｖ．Ｂｉｏｃｈｅｍ．６２：１９１−２１７（１９９３）；Ｍａｙ、１９９３年、ＴＩＢ　ＴＥＣＨ　１１（５）：１５５−２１５）；ならびにｈｙｇｒｏ、これはハイグロマイシンに対する耐性を与える（Ｓａｎｔｅｒｒｅら、Ｇｅｎｅ　３０：１４７（１９８４））。組換えＤＮＡ技術の分野で周知の方法は、所望の組換えクローンを選択するために、慣用的に適用され得、そしてこのような方法は、以下に記載されている：例えば、Ａｕｓｕｂｅｌら（編）、Ｃｕｒｒｅｎｔ　Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ　ｉｎ　Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ　Ｂｉｏｌｏｇｙ、Ｊｏｈｎ　Ｗｉｌｅｙ＆Ｓｏｎｓ、ＮＹ（１９９３）；Ｋｒｉｅｇｌｅｒ、Ｇｅｎｅ　Ｔｒａｎｓｆｅｒ　ａｎｄ　Ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ、Ａ　Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ　Ｍａｎｕａｌ、Ｓｔｏｃｋｔｏｎ　Ｐｒｅｓｓ、ＮＹ（１９９０）；ならびに１２章および１３章、Ｄｒａｃｏｐｏｌｉら（編）、Ｃｕｒｒｅｎｔ　Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ　ｉｎ　Ｈｕｍａｎ　Ｇｅｎｅｔｉｃｓ、Ｊｏｈｎ　Ｗｉｌｅｙ＆Ｓｏｎｓ、ＮＹ（１９９４）；Ｃｏｌｂｅｒｒｅ−Ｇａｒａｐｉｎら、Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．　１５０：１（１９８１）（これらはその全体が本明細書中に参考として援用される）。
【０２４８】
抗体分子の発現レベルは、ベクター増幅によって増大され得る（総説として、ＢｅｂｂｉｎｇｔｏｎおよびＨｅｎｔｓｃｈｅｌ、Ｔｈｅ　ｕｓｅ　ｏｆ　ｖｅｃｔｏｒｓ　ｂａｓｅｄ　ｏｎ　ｇｅｎｅ　ａｍｐｌｉｆｉｃａｔｉｏｎ　ｆｏｒ　ｔｈｅ　ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ　ｏｆ　ｃｌｏｎｅｄ　ｇｅｎｅｓ　ｉｎ　ｍａｍｍａｌｉａｎ　ｃｅｌｌｓ　ｉｎ　ＤＮＡ　ｃｌｏｎｉｎｇ、Ｖｏｌ．３．（Ａｃａｄｅｍｉｃ　Ｐｒｅｓｓ、Ｎｅｗ　Ｙｏｒｋ、１９８７）を参照のこと）。抗体を発現するベクター系におけるマーカーが、増幅可能であると、宿主細胞の培養物に存在するインヒビターのレベルにおける増加は、マーカー遺伝子のコピーの数を増加する。増幅領域は抗体遺伝子と結合しているので、抗体の産生もまた増加する（Ｃｒｏｕｓｅら、Ｍｏｌ．Ｃｅｌｌ．Ｂｉｏｌ．３：２５７（１９８３））。
【０２４９】
宿主細胞は、本発明の二つの発現ベクター（重鎖由来のポリペプチドをコードする第一のベクターおよび軽鎖由来のポリペプチドをコードする第二のベクター）で、同時トランスフェクトされ得る。この二つのベクターは、重鎖および軽鎖のポリペプチドの等しい発現を可能にする、同一の選択マーカーを含み得る。あるいは、単一のベクターが使用され得、これは重鎖および軽鎖両方のポリペプチドをコードし、そして発現することができる。このような状況において、過剰の毒性の遊離重鎖を避けるために、重鎖の前に軽鎖が配置されるべきである（Ｐｒｏｕｄｆｏｏｔ、Ｎａｔｕｒｅ　３２２：５２（１９８６）；Ｋｏｈｌｅｒ、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ　７７：２１９７（１９８０））。重鎖および軽鎖のためのコード配列はｃＤＮＡまたはゲノムＤＮＡを含み得る。
【０２５０】
一旦本発明の抗体分子が、動物によって産生されるか、化学的に合成されるか、または組換えにより発現されると、当該分野で公知の、免疫グロブリン分子の精製のための任意の方法、例えば、クロマトグラフィー（例えば、イオン交換、アフィニティー（特に、プロテインＡの後に特異的抗原に対するアフィニティーによる）、およびサイズカラムクロマトグラフィー）、遠心分離、溶解度差、またはタンパク質精製のための任意の他の標準的な技術によって、精製され得る。さらに、本発明の抗体またはそのフラグメントは、本明細書中に記載されるかまたはそうでなければ当該分野において公知の、異種ポリペプチド配列に融合され得、精製を容易にする。
【０２５１】
本発明は、本発明のポリペプチド（もしくはその部分、好ましくはこのポリペプチドの少なくとも１０、２０、３０、４０、５０、６０、７０、８０、９０、もしくは１００個のアミノ酸）に、組換えにより融合されるかまたは化学的に結合されて（共有結合および非共有結合の両方を含む）、融合タンパク質を生成する抗体、を含む。この融合は、直接的である必要はないが、リンカー配列を介して起こり得る。この抗体は、本発明のポリペプチド（またはその部分、好ましくはこのポリペプチドの少なくとも１０、２０、３０、４０、５０、６０、７０、８０、９０、もしくは１００個のアミノ酸）以外の抗原に特異的であり得る。例えば、インビトロまたはインビボのいずれにおいても、本発明のポリペプチドを特定の細胞表面のレセプターに特異的な抗体に融合または結合させることによって、特定の細胞型に対して、本発明のポリペプチドを標的にするために、抗体が使用され得る。本発明のポリぺプチドに融合または結合される抗体はまた、インビトロ免疫アッセイおよび当該分野で公知の方法を使用する精製方法において使用され得る。例えば、Ｈａｒｂｏｒら、上記、およびＰＣＴ公開ＷＯ９３／２１２３２；ＥＰ４３９，０９５；Ｎａｒａｍｕｒａら、Ｉｍｍｕｎｏｌ．Ｌｅｔｔ．３９：９１−９９（１９９４）；米国特許第５，４７４，９８１号；Ｇｉｌｌｉｅｓら、ＰＮＡＳ　８９：１４２８−１４３２（１９９２）；Ｆｅｌｌら、Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１４６：２４４６−２４５２（１９９１）を参照のこと。これらは、その全体が参考として援用される。
【０２５２】
本発明はさらに、抗体の可変領域以外のドメインに融合または結合された、本発明のポリぺプチドを含む組成物を含む。例えば、本発明のポリぺプチドは、抗体のＦｃ領域、またはその部分に融合または結合され得る。本発明のポリぺプチドに融合されたこの抗体の部分は、定常領域、ヒンジ領域、ＣＨ１ドメイン、ＣＨ２ドメイン、およびＣＨ３ドメイン、またはそのドメイン全体もしくは部分の任意の組合せを含み得る。これらのポリぺプチドはまた、上記の抗体の部分に融合または結合され得、多量体を形成する。例えば、本発明のポリぺプチドに融合されたＦｃ部分は、このＦｃ部分の間のジスルフィド結合を通して二量体を形成し得る。より高度の多量体形態は、ポリぺプチドをＩｇＡおよびＩｇＭの部分に融合させることによって作製され得る。本発明のポリぺプチドを抗体部分に融合または結合させるための方法は、当該分野において公知である。例えば、米国特許第５，３３６，６０３号；同第５，６２２，９２９号；同第５，３５９，０４６号；同第５，３４９，０５３号；同第５，４４７，８５１号；同第５，１１２，９４６号；ＥＰ　３０７，４３４；ＥＰ　３６７，１６６；ＰＣＴ公開ＷＯ９６／０４３８８；ＷＯ９１／０６５７０；Ａｓｈｋｅｎａｚｉら、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ　８８：１０５３５−１０５３９（１９９１）；Ｚｈｅｎｇら、Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１５４：５５９０−５６００（１９９５）；およびＶｉｌら、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ　８９：１１３３７−１１３４１（１９９２）（前記の参考文献はその全体が参考として援用される）を参照のこと。
【０２５３】
上記で考察されたように、ポリぺプチド、ポリぺプチドフラグメント、または配列番号Ｙの改変体、に対応するポリぺプチドは、このポリぺプチドのインビボ半減期を増大させるため、または当該分野で公知の方法を使用する免疫学的アッセイにおいて使用するために、上記の抗体部分に融合または結合体化され得る。さらに、配列番号Ｙに対応するポリぺプチドを、上記の抗体部分に融合または結合体化させて、精製を容易にし得る。１つの報告された例は、ヒトＣＤ４ポリペプチドの最初の２つのドメイン、および哺乳動物の免疫グロブリンの重鎖または軽鎖の定常領域の種々のドメインからなるキメラタンパク質を記載している（ＥＰ　３９４，８２７；Ｔｒａｕｎｅｃｋｅｒら、Ｎａｔｕｒｅ　３３１：８４−８６（１９８８））。ジスルフィド連結二量体構造（ＩｇＧに起因する）を有する抗体に融合または結合体化される本発明のポリぺプチドもまた、単量体分泌タンパク質またはタンパク質フラグメント単独よりも、他の分子に結合しそして中和するのにさらに効率的であり得る（Ｆｏｕｎｔｏｕｌａｋｉｓら、Ｊ．Ｂｉｏｃｈｅｍ．２７０：３９５８−３９６４（１９９５））。多くの場合、融合タンパク質のＦｃ部分は、治療および診断において有益であり、従って、例えば、改良された薬物動態学的な特性を生じ得る（ＥＰ　Ａ　２３２，２６２）。あるいは、融合タンパク質が発現され、検出され、そして精製された後に、Ｆｃ部分を欠失させることが望ましい。例えば、融合タンパク質が免疫のための抗原として使用される場合、Ｆｃ部分は、治療および診断を妨害し得る。例えば、薬物の発見において、ｈＩＬ−５のようなヒトタンパク質は、ｈＩＬ−５のアンタゴニストを同定するための高スループットスクリーニングアッセイの目的のためにＦｃ部分と融合されてきた（Ｂｅｎｎｅｔｔら、Ｊ．Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ　Ｒｅｃｏｇｎｉｔｉｏｎ　８：５２−５８（１９９５）；Ｊｏｈａｎｓｏｎら、Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．２７０：９４５９−９４７１（１９９５）を参照のこと）。
【０２５４】
さらに、本発明の抗体またはそのフラグメントは、精製を容易にするペプチドのような、マーカー配列に融合され得る。好ましい実施形態において、マーカーアミノ酸配列は、とりわけヘキサ−ヒスチジンペプチド（例えば、ｐＱＥベクター（ＱＩＡＧＥＮ，Ｉｎｃ．，９２５９　Ｅｔｏｎ　Ａｖｅｎｕｅ，Ｃｈａｔｓｗｏｒｔｈ，ＣＡ，９１３１１）において提供されるタグ）であり、これらの多くのマーカーアミノ酸配列が市販されている。例えば、Ｇｅｎｔｚら、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ　８６：８２１−８２４（１９８９）に記載されるように、ヘキサ−ヒスチジンは、融合タンパク質の都合の良い精製を提供する。精製のために有用な別のペプチドタグは、インフルエンザ赤血球凝集素タンパク質由来のエピトープに対応する「ＨＡ」タグ（Ｗｉｌｓｏｎら、Ｃｅｌｌ　３７：７６７（１９８４））、および「ｆｌａｇ」タグを含むが、これに限定されない。
【０２５５】
本発明は、診断剤または治療剤に結合体化される、抗体またはそのフラグメントをさらに含む。抗体は、例えば、臨床上の試験手順（例えば、所定の処置レジメン（ｒｅｇｉｍｅｎ）の効力を決定するため）の一部として、腫瘍の発生または進行をモニターするために、診断的に使用され得る。検出は、抗体を検出可能な物質と連結させることによって容易にされ得る。検出可能な物質の例としては、種々の酵素、補欠分子団、蛍光物質、発光物質、生物発光物質、放射性物質、種々の陽電子放射断層撮影に使用される陽電子放射金属、および非放射性常磁性金属イオン、が挙げられる。この検出可能な物質は、当該分野で公知の技術を使用して、抗体（またはそのフラグメント）に対して直接的、または媒介物（例えば、当該分野で公知のリンカーなど）を介して間接的、のいずれかで、連結または結合体化され得る。例えば、本発明に従う診断薬としての使用のための抗体に結合体化され得る金属イオンに関しては、米国特許第４，７４１，９００号を参照のこと。適切な酵素の例としては、西洋ワサビペルオキシダーゼ、アルカリホスファターゼ、β−ガラクトシダーゼ、またはアセチルコリンエステラーゼが挙げられ；適切な補欠分子団複合体の例としては、ストレプトアビジン／ビオチンおよびアビジン／ビオチンが挙げられ；適切な蛍光物質の例としては、ウンベリフェロン、フルオレセイン、フルオレセインイソチオシアネート、ローダミン、ジクロロトリアジニルアミンフルオレセイン、ダンシルクロリドまたはフィコエリトリンが挙げられ；発光物質の例としては、ルミノールが挙げられ；生物発光物質の例としては、ルシフェラーゼ、ルシフェリンおよびエクオリンが挙げられ；ならびに、適切な放射性物質の例としては、１２５Ｉ、１３１Ｉ、１１１Ｉｎまたは９９Ｔｃが挙げられる。
【０２５６】
さらに、抗体またはそのフラグメントは、治療用部分（例えば細胞毒（例えば細胞増殖抑制性もしくは細胞殺傷性の薬剤））、治療剤または放射性金属イオン（例えば、α−エミッタ−（例えば２１３Ｂｉ）など）に結合体化され得る。細胞毒または細胞毒性薬剤は、細胞に対して有害な任意の薬剤を含む。例としては、パクリタキセル（ｐａｃｌｉｔａｘｏｌ）、サイトカラシンＢ、グラミシジンＤ、臭化エチジウム、エメチン、マイトマイシン、エトポシド、テニポシド（ｔｅｎｏｐｏｓｉｄｅ）、ビンクリスチン、ビンブラスチン、コルヒチン（ｃｏｌｃｈｉｃｉｎ）、ドキソルビシン、ダウノルビシン、ジヒドロキシアントラシンジオン（ｄｉｈｙｄｒｏｘｙ　ａｎｔｈｒａｃｉｎ　ｄｉｏｎｅ）、ミトキサントロン、ミトラマイシン、アクチノマイシンＤ、１−デヒドロテストステロン、グルココルチコイド、プロカイン、テトラカイン、リドカイン、プロプラノロール、およびピューロマイシン、ならびにそのアナログまたはホモログ、が挙げられる。治療剤は、代謝拮抗物質（例えば、メトトレキサート、６−メルカプトプリン、６−チオグアニン、シタラビン、５−フルオロウラシルデカルバジン（５−ｆｌｕｏｒｏｕｒａｃｉｌ　ｄｅｃａｒｂａｚｉｎｅ）、アルキル化剤（例えば、メクロレタミン、チオテパ（ｔｈｉｏｅｐａ）、クロラムブシル、メルファラン、カルムスチン（ＢＳＮＵ）およびロムスチン（ＣＣＮＵ）、シクロホスファミド（ｃｙｃｌｏｔｈｏｓｐｈａｍｉｄｅ）、ブスルファン、ジブロモマンニトール、ストレプトゾトシン、マイトマイシンＣ、ならびにｃｉｓ−ジクロロジアミン白金（ＩＩ）（ＤＤＰ）シスプラチン）、アントラサイクリン（例えば、ダウノルビシン（以前はダウノマイシン）およびドキソルビシン）、抗生物質（例えば、ダクチノマイシン（以前はアクチノマイシン）、ブレオマイシン、ミトラマイシン、およびアントラマイシン（ａｎｔｈｒａｍｙｃｉｎ）（ＡＭＣ））、ならびに抗有糸分裂剤（例えばビンクリスチンおよびビンブラスチン）、を含むが、それらに限定されない。
【０２５７】
本発明の結合体は、所定の生物学的応答を改変するために使用され得、治療剤または薬物部分は、古典的な化学的治療剤に限定されると解釈されない。例えば、薬物部分は、所望の生物学的活性を有するタンパク質またはポリぺプチドであり得る。このようなタンパク質としては、例えば、毒素（例えばアブリン、リシンＡ、シュードモナス外毒素、またはジフテリア毒素）；タンパク質（例えば、腫瘍壊死因子、ａ−インターフェロン、β−インターフェロン、神経発育因子、血小板由来増殖因子、組織プラスミノゲンアクチベーター、アポトーシス薬（例えば、ＴＮＦ−α、ＴＮＦ−β、ＡＩＭ　Ｉ（国際公開第ＷＯ９７／３３８９９号を参照のこと）、ＡＩＭ　ＩＩ（国際公開第ＷＯ９７／３４９１１号を参照のこと）、Ｆａｓリガンド（Ｔａｋａｈａｓｈｉら、Ｉｎｔ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．６：１５６７−１５７４（１９９４））、ＶＥＧＩ（国際公開第ＷＯ９９／２３１０５号を参照のこと））、血栓症薬もしくは抗脈管形成薬（例えば、アンジオスタチンもしくはエンドスタチン）；または生物学的応答改変剤（例えばリンホカイン、インターロイキン−１（「ＩＬ−１」）、インターロイキン−２（「ＩＬ−２」）、インターロイキン−６（「ＩＬ−６」）、顆粒球マクロファージコロニー刺激因子（「ＧＭ−ＣＳＦ」）、顆粒球コロニー刺激因子（「Ｇ−ＣＳＦ」）、または他の増殖因子など）、が挙げられ得る。
【０２５８】
抗体はまた、固体支持体に付着させられ得、この固体支持体は、標的抗原の免疫アッセイまたは精製に特に有用である。このような固体支持体としては、ガラス、セルロース、ポリアクリルアミド、ナイロン、ポリスチレン、ポリ塩化ビニルまたはポリプロピレン、が挙げられるがそれらに限定されない。
【０２５９】
このような治療部分を抗体に結合する技術は周知であり、例えば、Ａｒｎｏｎら、「Ｍｏｎｏｃｌｏｎａｌ　Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ　Ｆｏｒ　Ｉｍｍｕｎｏｔａｒｇｅｔｉｎｇ　Ｏｆ　Ｄｒｕｇｓ　Ｉｎ　Ｃａｎｃｅｒ　Ｔｈｅｒａｐｙ」Ｍｏｎｏｃｌｏｎａｌ　Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ　Ａｎｄ　Ｃａｎｃｅｒ　Ｔｈｅｒａｐｙ、Ｒｅｉｓｆｅｌｄら（編）、２４３−５６頁（Ａｌａｎ　Ｒ．Ｌｉｓｓ，Ｉｎｃ．１９８５）；Ｈｅｌｌｓｔｒｏｍら、「Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ　Ｆｏｒ　Ｄｒｕｇ　Ｄｅｌｉｖｅｒｙ」Ｃｏｎｔｒｏｌｌｅｄ　Ｄｒｕｇ　Ｄｅｌｉｖｅｒｙ（第２版）、Ｒｏｂｉｎｓｏｎら（編）、６２３−５３頁（Ｍａｒｃｅｌ　Ｄｅｋｋｅｒ，Ｉｎｃ．１９８７）；Ｔｈｏｒｐｅ、「Ａｎｔｉｂｏｄｙ　Ｃａｒｒｉｅｒｓ　Ｏｆ　Ｃｙｔｏｔｏｘｉｃ　Ａｇｅｎｔｓ　Ｉｎ　Ｃａｎｃｅｒ　Ｔｈｅｒａｐｙ：Ａ　Ｒｅｖｉｅｗ」Ｍｏｎｏｃｌｏｎａｌ　Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ’８４：Ｂｉｏｌｏｇｉｃａｌ　Ａｎｄ　Ｃｌｉｎｉｃａｌ　Ａｐｐｌｉｃａｔｉｏｎｓ、Ｐｉｎｃｈｅｒａら（編）、４７５−５０６頁（１９８５）；「Ａｎａｌｙｓｉｓ，Ｒｅｓｕｌｔｓ，Ａｎｄ　Ｆｕｔｕｒｅ　Ｐｒｏｓｐｅｃｔｉｖｅ　Ｏｆ　Ｔｈｅ　Ｔｈｅｒａｐｅｕｔｉｃ　Ｕｓｅ　Ｏｆ　Ｒａｄｉｏｌａｂｅｌｅｄ　Ａｎｔｉｂｏｄｙ　Ｉｎ　Ｃａｎｃｅｒ　Ｔｈｅｒａｐｙ」Ｍｏｎｏｃｌｏｎａｌ　Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ　Ｆｏｒ　Ｃａｎｃｅｒ　Ｄｅｔｅｃｔｉｏｎ　Ａｎｄ　Ｔｈｅｒａｐｙ、Ｂａｌｄｗｉｎら（編）、３０３−１６頁（Ａｃａｄｅｍｉｃ　Ｐｒｅｓｓ　１９８５）、およびＴｈｏｒｐｅら、「Ｔｈｅ　Ｐｒｅｐａｒａｔｉｏｎ　Ａｎｄ　Ｃｙｔｏｔｏｘｉｃ　Ｐｒｏｐｅｒｔｉｅｓ　Ｏｆ　Ａｎｔｉｂｏｄｙ−Ｔｏｘｉｎ　Ｃｏｎｊｕｇａｔｅｓ」、Ｉｍｍｕｎｏｌ．Ｒｅｖ．６２：１１９−５８（１９８２）を参照のこと。
【０２６０】
あるいは、抗体は２次抗体に結合され、米国特許第４，６７６，９８０号（これは、その全体が本明細書に参考として援用される）におけるＳｅｇａｌによる記載のような抗体の異種結合体（ｈｅｔｅｒｏｃｏｎｊｕｇａｔｅ）を形成し得る。
【０２６１】
単独、あるいは細胞毒性因子および／またはサイトカインと組み合わせて投与される、抗体に結合する治療部分を有するかまたは有さない抗体が、治療薬として使用され得る。
【０２６２】
（免疫表現型分類（ｉｍｍｕｎｏｐｈｅｎｏｔｙｐｉｎｇ））
本発明の抗体は、細胞株および生物学的サンプルの免疫表現型分類のために利用され得る。本発明の遺伝子の翻訳生成物は、細胞特異的マーカーとして、あるいはより詳細には、特定の細胞型の分化および／または成熟の種々の段階で示差的に発現される細胞マーカーとして有用であり得る。特異的エピトープ、またはエピトープの組み合わせに対して指向されるモノクロナール抗体は、マーカーを発現する細胞集団のスクリーニングを可能とする。種々の技術が、マーカーを発現する細胞集団をスクリーニングするために、モノクロナール抗体を用いて利用され得、そしてその技術には、抗体でコーティングされた磁気ビーズを用いる磁気分離、固体マトリクス（すなわち、プレート）に付着した抗体を用いる「パンニング」、ならびにフローサイトメトリー（例えば、米国特許第５，９８５，６６０号；およびＭｏｒｒｉｓｏｎら、Ｃｅｌｌ，９６：７３７−４９（１９９９）を参照のこと）が挙げられる。
【０２６３】
これらの技術は、血液学的悪性腫瘍（すなわち、急性白血病患者における微小残存病変（ｍｉｎｉｍａｌ　ｒｅｓｉｄｕａｌ　ｄｉｓｅａｓｅ）（ＭＲＤ））および移植片対宿主病（ＧＶＨＤ）を予防するための移植術における「非自己」細胞と共に見出され得るような、細胞の特定集団のスクリーニングを可能にする。あるいは、これらの技術は、ヒト臍帯血において見出され得るような増殖および／または分化を受け得る、造血幹細胞および前駆細胞のスクリーニングを可能にする。
【０２６４】
（抗体結合アッセイ）
本発明の抗体は、免疫特異的結合について、当該分野で公知の任意の方法によってアッセイされ得る。使用され得る免疫アッセイは、競合的および非競合的アッセイ系を含むがこれに限定されない。このアッセイ系は以下のような技術を使用する、少し例を挙げると、ウェスタンブロット、放射性免疫アッセイ、ＥＬＩＳＡ（酵素結合免疫吸着アッセイ）、「サンドイッチ」免疫アッセイ、免疫沈降アッセイ、沈降素反応、ゲル拡散沈降素反応、免疫拡散アッセイ、凝集アッセイ、補体結合アッセイ、免疫放射分析アッセイ、蛍光免疫アッセイ、プロテインＡ免疫アッセイ。このようなアッセイは、当該分野で、慣習的および周知である（例えば、Ａｕｓｕｂｅｌら（編）、１９９４、Ｃｕｒｒｅｎｔ　Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ　ｉｎ　Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ　Ｂｉｏｌｏｇｙ、第１巻、Ｊｏｈｎ　Ｗｉｌｅｙ＆Ｓｏｎｓ　Ｉｎｃ．，Ｎｅｗ　Ｙｏｒｋを参照のこと。これはその全体が本明細書中で参考として援用される）。典型的な免疫アッセイは、以下に簡単に記載される（しかし限定として意図されない）。
【０２６５】
免疫沈降プロトコルは、一般に、ＲＩＰＡ緩衝液（１％ＮＰ−４０またはＴｒｉｔｏｎ　Ｘ−１００、１％デオキシコール酸ナトリウム、０．１％ＳＤＳ、０．１５Ｍ　ＮａＣｌ、０．０１Ｍリン酸ナトリウム（ｐＨ７．２）、１％Ｔｒａｓｙｌｏｌ）のような、タンパク質ホスファターゼおよび／またはプロテアーゼインヒビター（例えば、ＥＤＴＡ、ＰＭＳＦ、アプロチニン、バナジウム酸ナトリウム）を補充した溶解緩衝液中で、細胞の集団を溶解する工程、目的の抗体を細胞溶解物に添加する工程、４℃である時間（例えば１〜４時間）インキュベートする工程、プロテインＡおよび／またはプロテインＧのセファロースビーズを細胞溶解物に添加する工程、約１時間以上、４℃でインキュベートする工程、ビーズを溶解緩衝液で洗浄する工程およびビーズをＳＤＳ／サンプル緩衝液中に再懸濁する工程、を包含する。目的の抗体が特定の抗原を免疫沈降する能力は、例えば、ウェスタンブロット分析によって評価され得る。当業者は、抗原に対する抗体の結合を増加し、そしてバックグラウンドを減少する（例えば、セファロースビーズとともに細胞溶解物を予め洗浄する）ように改変され得るパラメータに関して、よく知っている。免役沈降プロトコルに関するさらなる考察については、Ａｕｓｕｂｅｌら（編）、１９９４、Ｃｕｒｒｅｎｔ　Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ　ｉｎ　Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ　Ｂｉｏｌｏｇｙ、Ｖｏｌ．１、Ｊｏｈｎ　Ｗｉｌｅｙ＆Ｓｏｎｓ，Ｉｎｃ．，Ｎｅｗ　Ｙｏｒｋ（１０．１６．１）を参照のこと。
【０２６６】
ウェスタンブロット分析は一般的に、タンパク質サンプルを調製する工程、タンパク質サンプルのポリアクリルアミドゲルでの電気泳動（例えば抗原の分子量によって８％〜２０％のＳＤＳ−ＰＡＧＥ）、タンパク質サンプルをポリアクリルアミドゲルからメンブレン（例えばニトロセルロース、ＰＶＤＦまたはナイロン）へ移す工程、ブロッキング溶液（例えば、３％のＢＳＡまたは無脂肪ミルクを含むＰＢＳ）中でメンブレンをブロッキングする工程、メンブレンを洗浄緩衝液（例えば、ＰＢＳ−Ｔｗｅｅｎ２０）中で洗浄する工程、ブロッキング緩衝液で希釈された１次抗体（目的の抗体）を用いてメンブレンをブロッキングする工程、洗浄緩衝液中でメンブレンを洗浄する工程、ブロッキング緩衝液で希釈された、酵素基質（例えば西洋ワサビペルオキシダーゼもしくはアルカリホスファターゼ）または放射性分子（例えば３２Ｐまたは１２５Ｉ）に結合した２次抗体（これは１次抗体（例えば抗ヒト抗体）を認識する）でメンブレンをブロッキングする工程、洗浄緩衝液中でメンブレンを洗浄する工程、および抗原の存在を検出する工程、を包含する。当業者は、検出されるシグナルを増加し、そしてバックグランドノイズを減少するように改変され得るパラメータをよく知っている。ウェスタンブロットプロトコルに関するさらなる考察については、例えば、Ａｕｓｕｂｅｌら（編）、１９９４、Ｃｕｒｒｅｎｔ　Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ　ｉｎ　Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ　Ｂｉｏｌｏｇｙ、Ｖｏｌ．１、Ｊｏｈｎ　Ｗｉｌｅｙ＆Ｓｏｎｓ，Ｉｎｃ．、Ｎｅｗ　Ｙｏｒｋ（１０．８．１）を参照のこと。
【０２６７】
ＥＬＩＳＡは、抗原を調製する工程、９６ウェルマイクロタイタープレートのウェルをその抗原でコーティングする工程、酵素基質（例えば、西洋ワサビペルオキシダーゼまたはアルカリホスフォターゼ）のような検出可能な化合物に結合した目的の抗体をそのウェルに添加し、そして一定時間インキュベートする工程、および抗原の存在を検出する工程を含む。ＥＬＩＳＡにおいて、目的の抗体は、検出可能な化合物に結合している必要はない；その代わり、検出可能な化合物に結合した第二の抗体（目的の抗体を認識する）がウェルに添加され得る。さらに、ウェルを抗原でコーティングする代わりに、抗体がウェルにコーティングされ得る。この場合、検出可能な化合物に結合した第二の抗体が、コーティングされたウェルへの目的の抗原の添加に続いて、添加され得る。当業者は、検出されるシグナルを増加させるように改変され得るパラメータ、および当該分野において公知のＥＬＩＳＡの他のバリエーションに関して、認め得る。ＥＬＩＳＡに関するさらなる考察については、例えば、Ａｕｓｕｂｅｌら編，１９９４，Ｃｕｒｒｅｎｔ　Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ　ｉｎ　Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ　Ｂｉｏｌｏｇｙ，第１巻、Ｊｏｈｎ　Ｗｉｌｅｙ　＆　Ｓｏｎｓ，Ｉｎｃ．，Ｎｅｗ　Ｙｏｒｋ，１１．２．１を参照のこと。
【０２６８】
抗体の抗原に対する結合親和性および抗体−抗原相互作用のオフレート（ｏｆｆ−ｒａｔｅ）が、競合結合アッセイにより決定され得る。競合結合アッセイの一つの例は、ラジオイムノアッセイであり、ラジオイムノアッセイは、標識した抗原（例えば、３Ｈまたは１２５Ｉ）と、漸増量の非標識抗原の存在下での目的の抗体とのインキュベーション、および標識した抗原に結合した抗体の検出を含む。目的の抗体の、特定の抗原に対する親和性、および結合オフレートは、スキャッチャードプロット分析によるデータから決定され得る。第二の抗体との競合はまた、ラジオイムノアッセイを用いて決定され得る。この場合、抗原は、漸増量の非標識第二抗体の存在下で、標識した化合物（例えば、３Ｈまたは１２５Ｉ）に結合した目的の抗体とともにインキュベートされる。
【０２６９】
（治療用途）
本発明はさらに、抗体を基礎とした治療に関し、この治療は、本発明の抗体を、１つ以上の開示された疾患、障害、または状態を処置するために、動物、好ましくは哺乳動物、そして最も好ましくはヒトの患者に投与する工程を含む。本発明の治療化合物としては、本発明の抗体（本明細書中に記載するような、それらのフラグメント、アナログおよび誘導体を含む）ならびに本発明の抗体をコードする核酸（本明細書中に記載するような、それらのフラグメント、アナログおよび誘導体ならびに抗イディオタイプ抗体を含む）が挙げられるがこれらに限定されない。本発明の抗体は、本発明のポリペプチドの異常な発現および／または活性に関連した疾患、障害または状態（本明細書中に記載する任意の１つ以上の疾患、障害、または状態を含むがこれらに限定されない）を処置、阻害または予防するために使用され得る。本発明のポリペプチドの異常な発現および／または活性に関連した疾患、障害または状態の処置および／または予防は、それらの疾患、障害または状態に関連した症状を緩和する工程を含むがこれに限定されない。本発明の抗体は、当該分野で公知であるか、または本明細書中に記載されるように、薬学的に受容可能な組成物中に提供され得る。
【０２７０】
本発明の抗体が治療的に使用され得る方法の１つの要約は、身体内で局所的にまたは全身的に、あるいは（例えば、補体（ＣＤＣ）により、またはエフェクター細胞（ＡＤＣＣ）により媒介されるような）抗体の直接的細胞傷害性により、本発明のポリヌクレオチドまたはポリペプチドを結合させることを含む。これらのアプローチのいくつかは、より詳細に以下に記載される。本明細書中で提供される教示を与えられれば、当業者は、過度の実験なしに、診断上の目的、モニタリングの目的あるいは治療上の目的のために、本発明の抗体を使用する方法がわかる。
【０２７１】
本発明の抗体は、例えば、抗体と相互作用するエフェクター細胞の数または活性を増加させるために役立つ、他のモノクローナル抗体またはキメラ抗体、あるいはリンホカインまたは造血増殖因子（例えば、ＩＬ−２、ＩＬ−３およびＩＬ−７など）と組み合わせて有利に利用され得る。
【０２７２】
本発明の抗体は、単独で、または他の型の処置（例えば、放射線療法、化学療法、ホルモン治療、免疫治療および抗腫瘍剤）との組み合わせで投与され得る。一般的に、（抗体の場合には）患者の種と同じ種である種起源または種反応性の生成物の投与が好ましい。従って、好ましい実施形態においては、ヒトの抗体、フラグメント誘導体、アナログ、または核酸が、治療または予防のために、ヒトの患者に投与される。
【０２７３】
本発明のポリヌクレオチドまたはポリペプチド（それらのフラグメントを含む）に関するイムノアッセイ、およびそれらに関連した障害の治療の両方のために、本発明のポリペプチドまたはポリヌクレオチドに対する、高親和性および／または強力な、インビボでの阻害抗体および／または中和抗体、それらのフラグメント、またはその領域を使用することが好ましい。このような抗体、フラグメント、または領域は、好ましくは、本発明のポリヌクレオチドまたはポリペプチド（それらのフラグメントを含む）に対して親和性を有する。好ましい結合親和性としては、５×１０−２Ｍ、１０−２Ｍ、５×１０−３Ｍ、１０−３Ｍ、５×１０−４Ｍ、１０−４Ｍ、５×１０−５Ｍ、１０−５Ｍ、５×１０−６Ｍ、１０−６Ｍ、５×１０−７Ｍ、１０−７Ｍ、５×１０−８Ｍ、１０−８Ｍ、５×１０−９Ｍ、１０−９Ｍ、５×１０−１０Ｍ、１０−１０Ｍ、５×１０−１１Ｍ、１０−１１Ｍ、５×１０−１２Ｍ、１０−１２Ｍ、５×１０−１３Ｍ、１０−１３Ｍ、５×１０−１４Ｍ、１０−１４Ｍ、５×１０−１５Ｍ、および１０−１５Ｍより小さい解離定数すなわちＫｄを有する結合親和性が挙げられる。
【０２７４】
（遺伝子治療）
特定の実施形態において、抗体またはその機能的誘導体をコードする配列を含む核酸は、本発明のポリペプチドの異常な発現および／または活性に関連した疾患または障害を処置、阻害または予防するために、遺伝子治療の目的で投与される。遺伝子治療とは、発現したか、または発現可能な核酸の、被験体への投与により行われる治療をいう。本発明のこの実施形態において、核酸は、それらのコードされたタンパク質を産生し、そのタンパク質は治療効果を媒介する。
【０２７５】
当該分野で利用可能な遺伝子治療のための任意の方法は、本発明に従って使用され得る。例示的な方法が以下に記載される。
【０２７６】
遺伝子治療の方法の一般的な概説については、Ｇｏｌｄｓｐｉｅｌら，Ｃｌｉｎｉｃａｌ　Ｐｈａｒｍａｃｙ　１２：４８８−５０５（１９９３）；ＷｕおよびＷｕ，Ｂｉｏｔｈｅｒａｐｙ　３：８７−９５（１９９１）；Ｔｏｌｓｔｏｓｈｅｖ，Ａｎｎ．Ｒｅｖ．Ｐｈａｒｍａｃｏｌ．Ｔｏｘｉｃｏｌ．３２：５７３−５９６（１９９３）；Ｍｕｌｌｉｇａｎ，Ｓｃｉｅｎｃｅ　２６０：９２６−９３２（１９９３）；ならびにＭｏｒｇａｎおよびＡｎｄｅｒｓｏｎ，Ａｎｎ．Ｒｅｖ．Ｂｉｏｃｈｅｍ．６２：１９１−２１７（１９９３）；Ｍａｙ，ＴＩＢＴＥＣＨ　１１（５）：１５５−２１５（１９９３）を参照のこと。使用され得る、組換えＤＮＡ技術分野において一般的に公知である方法は、Ａｕｓｕｂｅｌら（編），Ｃｕｒｒｅｎｔ　Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ　ｉｎ　Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ　Ｂｉｏｌｏｇｙ，Ｊｏｈｎ　Ｗｉｌｅｙ　＆　Ｓｏｎｓ，ＮＹ（１９９３）；およびＫｒｉｅｇｌｅｒ，Ｇｅｎｅ　Ｔｒａｎｓｆｅｒ　ａｎｄ　Ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ，Ａ　Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ　Ｍａｎｕａｌ，Ｓｔｏｃｋｔｏｎ　Ｐｒｅｓｓ，ＮＹ（１９９０）に記載される。
【０２７７】
好ましい局面において、化合物は抗体をコードする核酸配列を含有し、上記核酸配列は、適切な宿主において、抗体、またはそのフラグメントもしくはキメラタンパク質、あるいはその重鎖もしくは軽鎖を発現する発現ベクターの一部である。特に、このような核酸配列は、抗体コード領域に作動可能に連結したプロモーターを有し、上記プロモーターは誘導性であるかまたは構成性であり、そして必要に応じて組織特異的である。別の特定の実施形態においては、抗体をコードする配列および任意の他の所望の配列がゲノム中の所望の部位での相同組換えを促進する領域に隣接した核酸分子が使用され、それにより抗体をコードする核酸の染色体内の発現を提供する（ＫｏｌｌｅｒおよびＳｍｉｔｈｉｅｓ，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ　８６：８９３２−８９３５（１９８９）；Ｚｉｊｌｓｔｒａら，Ｎａｔｕｒｅ　３４２：４３５−４３８（１９８９））。特定の実施形態において、発現した抗体分子は単鎖抗体であるか；あるいはこの核酸配列は、この抗体の重鎖および軽鎖の両方をコードする配列またはそのフラグメントを含む。
【０２７８】
核酸の患者への送達は、直接的（この場合、患者は核酸または核酸保有ベクターに直接的に曝される）か、または間接的（この場合、細胞は最初にインビトロで核酸で形質転換され、次いで患者に移植される）のいずれかであり得る。これらの２つのアプローチは、インビボ遺伝子治療として、またはエキソビボ遺伝子治療としてそれぞれ公知である。
【０２７９】
特定の実施形態において、核酸配列はインビボで直接的に投与され、そこで核酸配列は発現されて、コードされた産物を産生する。これは、当該分野で公知の多数の方法などのいずれかにより（例えば、それらを適切な核酸発現ベクターの一部として構築し、そしてそれを細胞内になるように投与することにより（例えば、欠損性または弱毒化したレトロウイルスまたは他のウイルスベクター（米国特許第４，９８０，２８６号を参照のこと）を用いた感染により）、あるいは、裸のＤＮＡの直接注射により、あるいは、微粒子ボンバードメント（例えば、遺伝子銃；Ｂｉｏｌｉｓｔｉｃ、Ｄｕｐｏｎｔ）の使用により、あるいは脂質もしくは細胞表面のレセプターでコーティングするか、または薬剤をトランスフェクトすることにより、リポソーム、微粒子、もしくはマイクロカプセル中へのカプセル化により、あるいは、それらを核に進入することが公知であるペプチドと結合させて投与することにより、レセプター媒介のエンドサイトーシスを受けるリガンドとそれを結合させて投与することにより（例えば、ＷｕおよびＷｕ，Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．２６２：４４２９−４４３２（１９８７）を参照のこと）（レセプターを特異的に発現する細胞型を標的にするために用いられ得る）達成され得る。別の実施形態において、核酸−リガンド複合体が形成され得、ここで、このリガンドはエンドソームを破壊するフソジェニック（ｆｕｓｏｇｅｎｉｃ）ウイルス性ペプチドを含み、核酸がリソソーム分解を回避するようにする。さらに別の実施形態において、核酸は、特異的なレセプターを標的とすることにより、細胞特異的な取り込みおよび発現についてインビボで標的とされ得る（例えば、ＰＣＴ公開第ＷＯ９２／０６１８０号；同第ＷＯ９２／２２６３５号；同第ＷＯ９２／２０３１６号；同第ＷＯ９３／１４１８８号、同第ＷＯ９３／２０２２１号を参照のこと）。あるいは、核酸は、細胞内に導入され得、そして相同組換えにより、発現のために宿主細胞ＤＮＡ中に組み込まれ得る（ＫｏｌｌｅｒおよびＳｍｉｔｈｉｅｓ，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ　８６：８９３２−８９３５（１９８９）；Ｚｉｊｌｓｔｒａら，Ｎａｔｕｒｅ　３４２：４３５−４３８（１９８９））。
【０２８０】
特定の実施形態において、本発明の抗体をコードする核酸配列を含むウイルスベクターが使用される。例えば、レトロウイルスベクターが用いられ得る（Ｍｉｌｌｅｒら，Ｍｅｔｈ．Ｅｎｚｙｍｏｌ．２１７：５８１−５９９（１９９３）を参照のこと）。これらのレトロウイルスベクターは、ウイルス性ゲノムの正確なパッケージングおよび宿主細胞ＤＮＡへの正確な組込みのために必要な構成要素を含む。遺伝子治療において使用される抗体をコードする核酸配列は、一つ以上のベクター中にクローン化され、これは、患者内への遺伝子の送達を容易にする。レトロウイルスベクターに関するさらなる詳細は、Ｂｏｅｓｅｎら，Ｂｉｏｔｈｅｒａｐｙ　６：２９１−３０２（１９９４）（これは、幹細胞を化学療法に対してより耐性にするために、ｍｄｒ１遺伝子を造血性幹細胞に送達するための、レトロウイルスベクターの使用を記載する）に見出され得る。遺伝子治療におけるレトロウイルスベクターの使用を説明する他の参考文献は、以下である。：Ｃｌｏｗｅｓら，Ｊ．Ｃｌｉｎ．Ｉｎｖｅｓｔ．９３：６４４−６５１（１９９４）；Ｋｉｅｍら，Ｂｌｏｏｄ　８３：１４６７−１４７３（１９９４）；ＳａｌｍｏｎｓおよびＧｕｎｚｂｅｒｇ，Ｈｕｍａｎ　Ｇｅｎｅ　Ｔｈｅｒａｐｙ　４：１２９−１４１（１９９３）；ならびにＧｒｏｓｓｍａｎおよびＷｉｌｓｏｎ，Ｃｕｒｒ．Ｏｐｉｎ．ｉｎ　Ｇｅｎｅｔｉｃｓ　ａｎｄ　Ｄｅｖｅｌ．３：１１０−１１４（１９９３）。
【０２８１】
アデノウイルスは、遺伝子治療において使用され得る他のウイルスベクターである。アデノウイルスは、特に、気道上皮へ遺伝子を送達するための魅力的なビヒクルである。アデノウイルスは、自然に気道上皮に感染し、そこで軽い疾患を起こす。アデノウイルスに基づく送達系の他の標的は、肝臓、中枢神経系、内皮細胞、および筋肉である。アデノウイルスは、非分裂細胞に感染し得るという利点を有する。ＫｏｚａｒｓｋｙおよびＷｉｌｓｏｎ，Ｃｕｒｒｅｎｔ　Ｏｐｉｎｉｏｎ　ｉｎ　Ｇｅｎｅｔｉｃｓ　ａｎｄ　Ｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔ　３：４９９−５０３（１９９３）は、アデノウイルスに基づく遺伝子治療の概説を示す。Ｂｏｕｔら，Ｈｕｍａｎ　Ｇｅｎｅ　Ｔｈｅｒａｐｙ　５：３−１０（１９９４）は、アカゲザルの気道上皮に遺伝子を移入するためのアデノウイルスベクターの使用を実証した。遺伝子治療におけるアデノウイルスの使用の他の例は、Ｒｏｓｅｎｆｅｌｄら，Ｓｃｉｅｎｃｅ　２５２：４３１−４３４（１９９１）；Ｒｏｓｅｎｆｅｌｄら，Ｃｅｌｌ　６８：１４３−１５５（１９９２）；Ｍａｓｔｒａｎｇｅｌｉら，Ｊ．Ｃｌｉｎ．Ｉｎｖｅｓｔ．９１：２２５−２３４（１９９３）；ＰＣＴ公開第ＷＯ９４／１２６４９号；およびＷａｎｇら，Ｇｅｎｅ　Ｔｈｅｒａｐｙ　２：７７５−７８３（１９９５）に見出され得る。好ましい実施形態において、アデノウイルスベクターが使用される。
【０２８２】
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）はまた、遺伝子治療における使用について提案されてきた（Ｗａｌｓｈら，Ｐｒｏｃ．Ｓｏｃ．Ｅｘｐ．Ｂｉｏｌ．Ｍｅｄ．２０４：２８９−３００（１９９３）；米国特許第５，４３６，１４６号）。
【０２８３】
遺伝子治療への別のアプローチは、エレクトロポレーション、リポフェクション、リン酸カルシウム媒介トランスフェクション、またはウイルス感染のような方法により、組織培養中の細胞へ遺伝子を移入する工程を含む。通常、移入の方法は、選択マーカーの細胞への移入を含む。次いで、細胞は、移入された遺伝子を取り込みそして発現している細胞を単離するために選沢下に置かれる。それらの細胞は次いで、患者に送達される。
【０２８４】
この実施形態においては、得られた組換え細胞のインビボ投与の前に、核酸が細胞に導入される。このような導入は、当該分野において公知の任意の方法により実施され得、それらの方法としては以下が挙げられるがこれらに限定されない：トランスフェクション、エレクトロポレーション、マイクロインジェクション、核酸配列を含むウイルスベクターまたはバクテリオファージベクターでの感染、細胞融合、染色体媒介の遺伝子移入、マイクロセル（ｍｉｃｒｏｃｅｌｌ）媒介の遺伝子移入、スフェロプラスト融合など。外来遺伝子の細胞への導入については、当該分野において多数の技術が公知であり（例えば、ＬｏｅｆｆｌｅｒおよびＢｅｈｒ，Ｍｅｔｈ．Ｅｎｚｙｍｏｌ．２１７：５９９−６１８（１９９３）；Ｃｏｈｅｎら，Ｍｅｔｈ．Ｅｎｚｙｍｏｌ．２１７：６１８−６４４（１９９３）；Ｃｌｉｎｅ，Ｐｈａｒｍａｃ．Ｔｈｅｒ．２９：６９−９２ｍ（１９８５）を参照のこと）、そしてレシピエント細胞の必要な発生的および生理学的機能が破壊されない場合、本発明に従って使用され得る。この技術は、核酸の細胞への安定した移入を提供するはずであり、その結果、核酸は、細胞により発現可能であり、そして好ましくは、遺伝性であり、そしてその細胞の子孫により発現可能である。
【０２８５】
得られた組換え細胞は、当該分野において公知の様々な方法により、患者へ送達され得る。組換え血球（例えば、造血幹細胞または造血前駆細胞）は、好ましくは、静脈内に投与される。使用が考えられる細胞の量は、所望の効果、患者の状態などに依存し、そして当業者により決定され得る。
【０２８６】
遺伝子治療の目的のために核酸が導入され得る細胞は、任意の所望の入手可能な細胞型を包含し、そして以下を含むがそれらに限定されない：上皮細胞、内皮細胞、ケラチノサイト、線維芽細胞、筋肉細胞、肝細胞；Ｔリンパ球、Ｂリンパ球、単球、マクロファージ、好中球、好酸球、巨核球、顆粒球のような血球；種々の幹細胞または前駆細胞、特に、造血幹細胞または造血前駆細胞（例えば、骨髄、臍帯血、末梢血、胎児の肝臓などから得られるような細胞）。
【０２８７】
好ましい実施形態において、遺伝子治療に使用される細胞は、患者に対して自己である。
【０２８８】
遺伝子治療において組換え細胞が使用される実施形態において、抗体をコードする核酸配列は、細胞またはそれらの子孫により核酸配列が発現可能であるように細胞に導入され、次いで組換え細胞は、治療的効果のためにインビボで投与される。特定の実施形態において、幹細胞または前駆細胞が用いられる。インビトロで単離され得、そしてインビトロで保存され得る任意の幹細胞および／または前駆細胞は、本発明のこの実施形態に従って潜在的に使用され得る（例えば、ＰＣＴ公開第ＷＯ９４／０８５９８号：ＳｔｅｍｐｌｅおよびＡｎｄｅｒｓｏｎ，Ｃｅｌｌ　７１：９７３−９８５（１９９２）；Ｒｈｅｉｎｗａｌｄ，Ｍｅｔｈ．Ｃｅｌｌ　Ｂｉｏ．２１Ａ：２２９（１９８０）；ならびにＰｉｔｔｅｌｋｏｗおよびＳｃｏｔｔ，Ｍａｙｏ　Ｃｌｉｎｉｃ　Ｐｒｏｃ．６１：７７１（１９８６）を参照のこと）。
【０２８９】
特定の実施形態において、遺伝子治療の目的で導入される核酸は、コード領域に作動可能に連結された誘導性プロモーターを含有し、その結果、核酸の発現は、適切な転写誘導因子の存在または非存在を制御することにより制御可能である。
【０２９０】
本発明の化合物または薬学的組成物は、好ましくは、ヒトでの使用の前にインビトロで、次いでインビボで、所望の治療活性または予防活性について試験される。例えば、化合物または薬学的組成物の治療有用性または予防有用性を実証するためのインビトロアッセイとしては、細胞株または患者組織サンプルに対する化合物の効果が挙げられる。細胞株および／または組織サンプルに対する化合物または組成物の効果は、当業者に公知である技術（ロゼット形成アッセイおよび細胞溶解アッセイが挙げられるがこれらに限定されない）を利用して決定され得る。本発明に従って、特定の化合物の投与が示されるかどうかを決定するために用いられ得るインビトロアッセイとしては、インビトロ細胞培養アッセイが挙げられ、このアッセイでは、患者組織サンプルが培養において増殖され、そして化合物に曝されるか、そうでなければ化合物が投与され、そして、組織サンプルに対するそのような化合物の効果が観察される。
【０２９１】
（治療的／予防的な投与および組成物）
本発明は、被験体への有効量の本発明の化合物または薬学的組成物、好ましくは本発明のポリペプチドまたは抗体の投与による処置、阻害および予防の方法を提供する。好ましい局面において、化合物は実質的に精製される（例えば、その効果を制限するかまたは望ましくない副作用を生じる物質は実質的にない）。被験体は好ましくは、ウシ、ブタ、ウマ、ニワトリ、ネコ、イヌなどの動物が挙げられるがそれらに限定されない動物であり、そして好ましくは哺乳動物であり、そして最も好ましくはヒトである。
【０２９２】
化合物が核酸または免疫グロブリンを含む場合に使用され得る処方物および投与方法は、上記に記載され；さらなる適切な処方物および投与経路は、本明細書中で以下に記載されたものの中から選択され得る。
【０２９３】
種々の送達系が公知であり、そして本発明の化合物を投与するために用いられ得る（例えば、リポソーム、微粒子、マイクロカプセル中でのカプセル化、この化合物の発現が可能な組み換え細胞、レセプター媒介エンドサイトーシス（例えば、ＷｕおよびＷｕ，Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．２６２：４４２９−４４３２（１９８７）を参照のこと）、レトロウイルスまたは他のベクターの一部としての核酸の構築など）。導入方法としては、皮内、筋内、腹腔内、静脈内、皮下、鼻腔内、硬膜外、および経口経路が挙げられるがそれらに限定されない。化合物または組成物は、任意の好都合な経路により（例えば、注入またはボーラス注射により、上皮または粘膜皮膚内層（例えば、口腔粘膜、直腸粘膜および腸粘膜など）を通しての吸収により）投与され得、そして他の生物学的に活性な薬剤と一緒に投与され得る。投与は、全身的または局所的であり得る。さらに、本発明の薬学的化合物または組成物を、任意の適切な経路（脳室内注射および鞘内注射を包含する；脳室内注射は、例えば、Ｏｍｍａｙａリザーバのようなリザーバに取り付けられた脳室内カテーテルにより容易にされ得る）により中枢神経系に導入することが望まれ得る。例えば、吸入器または噴霧器の使用、およびエアゾール化剤を用いた処方により、肺投与もまた使用され得る。
【０２９４】
特定の実施形態において、本発明の薬学的化合物または組成物を、処置の必要な領域に局所的に投与することが望まれ得る；これは、制限する目的ではないが、例えば、手術中の局部注入、局所適用（例えば、手術後の創傷包帯との組み合わせて）により、注射により、カテーテルにより、坐剤により、またはインプラント（このインプラントは、シアラスティック（ｓｉａｌａｓｔｉｃ）膜のような膜または繊維を含む、多孔性、非多孔性、またはゼラチン様材料である）により達成され得る。好ましくは、抗体を含む本発明のタンパク質を投与する場合、タンパク質が吸収されない材料を使用するために注意が払われなければならない。
【０２９５】
別の実施形態において、化合物または組成物は、小胞、特に、リポソーム中へ送達され得る（Ｌａｎｇｅｒ，Ｓｃｉｅｎｃｅ　２４９：１５２７−１５３３（１９９０）；Ｔｒｅａｔら，Ｌｉｐｏｓｏｍｅｓ　ｉｎ　ｔｈｅ　Ｔｈｅｒａｐｙ　ｏｆ　Ｉｎｆｅｃｔｉｏｕｓ　Ｄｉｓｅａｓｅ　ａｎｄ　Ｃａｎｃｅｒ，Ｌｏｐｅｚ−ＢｅｒｅｓｔｅｉｎおよびＦｉｄｌｅｒ（編），Ｌｉｓｓ，Ｎｅｗ　Ｙｏｒｋ，３５３〜３６５頁（１９８９）；Ｌｏｐｅｚ−Ｂｅｒｅｓｔｅｉｎ，同書３１７〜３２７頁を参照のこと；広く同書を参照のこと）。
【０２９６】
さらに別の実施形態において、化合物または組成物は制御された放出システム中で送達され得る。１つの実施形態において、ポンプが用いられ得る（Ｌａｎｇｅｒ，（前出）；Ｓｅｆｔｏｎ，ＣＲＣ　Ｃｒｉｔ．Ｒｅｆ．Ｂｉｏｍｅｄ．Ｅｎｇ．１４：２０１（１９８７）；Ｂｕｃｈｗａｌｄら，Ｓｕｒｇｅｒｙ　８８：５０７（１９８０）；Ｓａｕｄｅｋら，Ｎ．Ｅｎｇｌ．Ｊ．Ｍｅｄ．３２１：５７４（１９８９）を参照のこと）。別の実施形態において、高分子材料が用いられ得る（Ｍｅｄｉｃａｌ　Ａｐｐｌｉｃａｔｉｏｎｓ　ｏｆ　Ｃｏｎｔｒｏｌｌｅｄ　Ｒｅｌｅａｓｅ，ＬａｎｇｅｒおよびＷｉｓｅ（編），ＣＲＣ　Ｐｒｅｓ．，Ｂｏｃａ　Ｒａｔｏｎ，Ｆｌｏｒｉｄａ（１９７４）；Ｃｏｎｔｒｏｌｌｅｄ　Ｄｒｕｇ　Ｂｉｏａｖａｉｌａｂｉｌｉｔｙ，Ｄｒｕｇ　Ｐｒｏｄｕｃｔ　Ｄｅｓｉｇｎ　ａｎｄ　Ｐｅｒｆｏｒｍａｎｃｅ，ＳｍｏｌｅｎおよびＢａｌｌ（編），Ｗｉｌｅｙ，Ｎｅｗ　Ｙｏｒｋ（１９８４）；ＲａｎｇｅｒおよびＰｅｐｐａｓ，Ｊ．，Ｍａｃｒｏｍｏｌ．Ｓｃｉ．Ｒｅｖ．Ｍａｃｒｏｍｏｌ．Ｃｈｅｍ．２３：６１（１９８３）を参照のこと；Ｌｅｖｙら，Ｓｃｉｅｎｃｅ　２２８：１９０（１９８５）；Ｄｕｒｉｎｇら，Ａｎｎ．Ｎｅｕｒｏｌ．２５：３５１（１９８９）；Ｈｏｗａｒｄら，Ｊ．Ｎｅｕｒｏｓｕｒｇ．７１：１０５（１９８９）もまた参照のこと）。さらに別の実施形態において、制御された放出システムは、治療標的、即ち、脳の近くに置かれ得、従って、全身用量の一部のみを必要とする（例えば、Ｇｏｏｄｓｏｎ，Ｍｅｄｉｃａｌ　Ａｐｐｌｉｃａｔｉｏｎｓ　ｏｆ　Ｃｏｎｔｒｏｌｌｅｄ　Ｒｅｌｅａｓｅ，（前出），第２巻，１１５〜１３８頁（１９８４）を参照のこと）。
【０２９７】
他の制御された放出システムは、Ｌａｎｇｅｒにより総説において議論される（Ｓｃｉｅｎｃｅ　２４９：１５２７−１５３３（１９９０））。
【０２９８】
本発明の化合物がタンパク質をコードする核酸である、具体的な実施形態において、その核酸は、それを適切な核酸発現ベクターの一部として構築し、そしてそれが細胞内になるように投与することにより（例えば、レトロウイルスベクターの使用により（米国特許第４，９８０，２８６号を参照のこと）、または直接注射により、または微粒子ボンバードメント（例えば、遺伝子銃；Ｂｉｏｌｉｓｔｉｃ，Ｄｕｐｏｎｔ）の使用により、または脂質もしくは細胞表面レセプターもしくはトランスフェクト剤でコーティングすることにより、または核に入ることが公知であるホメオボックス様ペプチドと結合させて投与すること（例えば、Ｊｏｌｉｏｔら，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ　８８：１８６４−１８６８（１９９１）を参照のこと）などにより、そのコードされたタンパク質の発現を促進するようにインビボで投与され得る。あるいは、核酸は、細胞内に導入され得、そして、発現のために相同組換えにより宿主細胞ＤＮＡ内に組み込まれ得る。
【０２９９】
本発明はまた、薬学的組成物を提供する。このような組成物は、治療有効量の化合物、および薬学的に受容可能なキャリアを含む。具体的な実施形態において、用語「薬学的に受容可能な」とは、動物における、そしてさらに特にヒトにおける使用のために、連邦規制当局もしくは米国政府により認められたか、または米国薬局方もしくは他の一般に認められた薬局方に列挙されたことを意味する。用語「キャリア」とは、治療剤とともに投与される、希釈剤、アジュバンド、賦形剤、またはビヒクルをいう。このような薬学的なキャリアは、水および油（石油起源、動物起源、植物起源、または合成起源の油（例えば、ピーナッツ油、大豆油、鉱油、ゴマ油など）を含む）のような滅菌した液体であり得る。水は、薬学的組成物が静脈内に投与される場合に、好ましいキャリアである。生理食塩水溶液、ならびにデキストロースおよびグリセロールの水溶液はまた、特に注射可能な溶液のために、液体キャリアとして使用され得る。適切な薬学的賦形剤としては、デンプン、グルコース、ラクトース、スクロース、ゼラチン、麦芽、コメ、フラワー、チョーク、シリカゲル、ステアリン酸ナトリウム、モノステアリン酸グリセロール、タルク、塩化ナトリウム、脱脂粉乳、グリセロール、プロピレン、グリコール、水、エタノールなどが挙げられる。組成物はまた、所望されるならば、少量の湿潤剤もしくは乳化剤、またはｐＨ緩衝剤を含み得る。これらの組成物は、液剤、懸濁剤、乳剤、錠剤、丸剤、カプセル剤、散剤、持続放出処方物などの形態を取り得る。この組成物は、従来の結合剤およびトリグリセリドのようなキャリアとともに、坐剤として処方され得る。経口処方物は、薬学的等級のマンニトール、ラクトース、デンプン、ステアリン酸マグネシウム、サッカリンナトリウム、セルロース、炭酸マグネシウムなどのような標準キャリアを含み得る。適切な薬学的キャリアの例は、Ｅ．Ｗ．Ｍａｒｔｉｎによる「Ｒｅｍｉｎｇｔｏｎ’ｓ　Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ　Ｓｃｉｅｎｃｅｓ」に記載される。このような組成物は、治療有効量の化合物を、好ましくは精製された形態で、適切な量のキャリアとともに含んで、患者への適切な投与のための形態を提供する。処方物は、投与形態に適するべきである。
【０３００】
好ましい実施形態において、組成物は、慣用手順に従って、ヒトへの静脈内投与のために採用された薬学的組成物として、処方される。代表的には、静脈内投与のための組成物は、滅菌等張水性緩衝液の溶液である。必要な場合、組成物はまた、可溶化剤および注射の部位での痛みを緩和するリグノカインのような局部麻酔を含み得る。一般的には、成分は、別々にかまたは単一投薬形態で一緒に混合してのどちらかで、例えば、一定量の活性薬剤を示すアンプルまたは小袋（ｓａｃｈｅｔｔｅ）のような密封された容器中の乾燥した凍結乾燥粉末または水を含まない濃縮物として供給される。組成物が注入により投与されるべき場合には、組成物は、滅菌した薬学的等級の水または生理食塩水を含む注入ボトルに分配され得る。組成物が注射により投与される場合、成分が投与の前に混合され得るように、注射用滅菌水または生理食塩水のアンプルが提供され得る。
【０３０１】
本発明の化合物は、中性のまたは塩の形態として処方され得る。薬学的に受容可能な塩としては、塩酸、リン酸、酢酸、シュウ酸、酒石酸などに由来するもののようなアニオンとともに形成される塩、およびナトリウム、カリウム、アンモニウム、カルシウム、水酸化第２鉄、イソプロピルアミン、トリエチルアミン、２−エチルアミノエタノール、ヒスチジン、プロカインなどに由来するもののようなカチオンとともに形成される塩が挙げられる。
【０３０２】
この処置（本発明のポリペプチドの異常な発現および／または活性と関連する疾患または障害の抑制および予防）において効果的である本発明の化合物の量は、標準的な臨床技術により決定され得る。さらに、インビトロアッセイは、必要に応じて、使用して最適な投薬量の範囲を同定するのを助け得る。処方において使用されるべき正確な用量はまた、投与の経路、および疾患または障害の重篤さに依存し、そして開業医の判断および各患者の状況に従って決定されるべきである。有効用量は、インビトロまたは動物モデル試験系から得られた用量反応曲線から外插され得る。
【０３０３】
抗体に関して、患者に投与される投薬量は、代表的に、患者の体重１ｋｇあたり０．１ｍｇ〜１００ｍｇである。好ましくは、患者に投与される投薬量は、患者の体重１ｋｇあたり０．１ｍｇと２０ｍｇとの間であり、より好ましくは、患者の体重１ｋｇあたり１ｍｇ〜１０ｍｇである。一般に、ヒト抗体は、外来ポリペプチドへの免疫応答に起因して、他種由来の抗体よりもヒト体内で長い半減期を有する。従って、ヒト抗体の低い投薬量および頻度の低い投与は、しばしば可能である。さらに、本発明の抗体の投与の投薬量および頻度は、改変（例えば、脂溶化（ｌｉｐｉｄａｔｉｏｎ）のような）による抗体の取り込みおよび組織浸透（例えば、脳への）を増強することにより減少され得る。
【０３０４】
本発明はまた、本発明の薬学的組成物の一つ以上の成分で満たされている一つ以上の容器を備える薬学的パックまたはキットを提供する。薬学的製品または生物学的製品の製造、使用または販売を規制している政府機関により規定される形式における通告は、このような容器に、必要に応じて伴ない得る。この通告は、ヒトの投与のための製造、使用または販売のこの機関による認可を反映する。
【０３０５】
（診断および画像化）
目的のポリペプチドに特異的に結合する標識化抗体、ならびにその誘導体およびそのアナログは、診断目的のために使用されて、本発明のポリペプチドの異常な発現および／または活性に関連する疾患、障害および／または状態を検出、診断またはモニターし得る。本発明は、目的のポリペプチドの異常な発現の検出を提供し、これは、（ａ）目的のポリペプチドに特異的な１つ以上の抗体を使用して、個体の細胞または体液中の目的のポリペプチドの発現をアッセイする工程、および（ｂ）この遺伝子発現レベルと標準的な遺伝子発現のレベルを比較する工程、を包含し、これによって、その標準的な発現レベルと比較されるアッセイされたポリペプチド遺伝子発現レベルの増加または減少が、異常な発現を示す。
【０３０６】
本発明は、障害を診断するための診断アッセイを提供し、このアッセイは、（ａ）目的のポリペプチドに特異的な１つ以上の抗体を使用して、個体の細胞または体液中の目的のポリペプチドの発現をアッセイする工程、および（ｂ）この遺伝子発現レベルと標準的な遺伝子発現のレベルを比較する工程、を包含し、これによって、その標準的な発現レベルと比較されるアッセイされたポリペプチド遺伝子発現レベルの増加または減少が、特定の障害を示す。癌に関して、個体由来の生検組織における比較的高い量の転写物の存在は、疾患の発生についての素因を示し得るか、または実際の臨床症状の出現前に疾患を検出するための手段を提供し得る。この型のより決定的な診断は、保健専門家に予防手段を使用させること、またはより早期の積極的な処置を可能にし得、これにより、癌の発生またはさらなる進行を予防する。
【０３０７】
本発明の抗体を使用して、当業者に公知の古典的な免疫組織学的方法を使用して生物学的サンプル中のタンパク質レベルをアッセイに使用し得る（例えば、Ｊａｌｋａｎｅｎら、Ｊ．Ｃｅｌｌ．Ｂｉｏｌ．１０１：９７６−９８５（１９８５）；Ｊａｌｋａｎｅｎら、Ｊ．Ｃｅｌｌ．Ｂｉｏｌ．１０５：３０８７−３０９６（１９８７）を参照のこと）。タンパク質遺伝子発現を検出するために有用な、抗体に基づく他の方法としては、イムノアッセイ（例えば、酵素結合免疫吸着アッセイ（ＥＬＩＳＡ）および放射免疫アッセイ（ＲＩＡ））が挙げられる。適切な抗体アッセイ標識は、当該分野において公知であり、そして酵素標識（例えば、グルコースオキシダーゼ）；放射性同位体（例えば、ヨウ素（１２５Ｉ、１２１Ｉ）、炭素（１４Ｃ）、硫黄（３５Ｓ）、トリチウム（３Ｈ）、インジウム（１１２Ｉｎ）、およびテクネチウム（９９Ｔｃ））；発光標識（例えば、ルミノール）；ならびに蛍光標識（例えば、フルオレセインおよびローダミン）、ならびにビオチンが挙げられる。
【０３０８】
本発明の１つの局面は、動物、好ましくは哺乳動物、そして最も好ましくはヒトにおける、目的のポリペプチドの異常な発現と関連する疾患または障害の検出および診断である。１つの実施形態において、診断は、ａ）目的のポリペプチドに特異的に結合する有効量の標識化分子を被験体に（例えば、非経口的に、皮下に、または腹腔内に）投与する工程；ｂ）このポリペプチドが発現する被験体内の部位でこの標識化分子が優先的に濃縮することを可能にするために（および結合していない標識化分子がバックグラウンドレベルまで除去されるために）投与後、時間間隔を待つ工程；ｃ）バックグラウンドレベルを決定する工程；およびｄ）この被験体中の標識化分子を検出する工程、を包含し、その結果、このバックグラウンドレベルを越える標識化分子の検出は、この被験体が目的のポリペプチドの異常な発現と関連する特定の疾患または障害を有することを示す。バックグラウンドレベルは、特定の系について以前に決定された標準的な値と、検出された標識化分子の量を比較する工程を包含する種々の方法により決定され得る。
【０３０９】
被験体の大きさおよび使用される画像化システムが、診断の画像を作製するために必要である画像化部分の量を決定するということは、当該分野において理解される。放射性同位体部分の場合、ヒト被験体に対して、注入される放射能の量は、通常、約５〜２０ミリキュリーの範囲の９９ｍＴｃである。次いで、標識化抗体または標識化抗体フラグメントは、特定のタンパク質を含む細胞の位置で優先的に蓄積する。インビボでの腫瘍の画像化は、Ｓ．Ｗ．Ｂｕｒｃｈｉｅｌら、「Ｉｍｍｕｎｏｐｈａｒｍａｃｏｋｉｎｅｔｉｃｓ　ｏｆ　Ｒａｄｉｏｌａｂｅｌｅｄ　Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ　ａｎｄ　Ｔｈｅｉｒ　Ｆｒａｇｍｅｎｔｓ」（Ｔｕｍｏｒ　Ｉｍａｇｉｎｇ、第１３章：Ｔｈｅ　Ｒａｄｉｏｃｈｅｍｉｃａｌ　Ｄｅｔｅｃｔｉｏｎ　ｏｆ　Ｃａｎｃｅｒ，Ｓ．Ｗ．ＢｕｒｃｈｉｅｌおよびＢ．Ａ．Ｒｈｏｄｅｓ編、Ｍａｓｓｏｎ　Ｐｕｂｌｉｓｈｉｎｇ　Ｉｎｃ．（１９８２）において、記載される。
【０３１０】
使用される標識の型および投与の様式を含む、いくつかの変動に依存して、標識化分子が被験体中の部位に優先的に濃縮することを可能にするため、および結合していない標識化分子がバックグラウンドレベルまで清澄されるための投与後の時間間隔は、６〜４８時間または６〜２４時間または６〜１２時間である。別の実施形態において、投与後の時間間隔は、５〜２０日間または５〜１０日間である。
【０３１１】
１つの実施形態において、疾患または障害をモニターすることは、疾患または障害（ｄｉｓｅａｓｅ）を診断するための方法を繰り返すことによって実施される（例えば、最初の診断から１ヶ月後、最初の診断から６ヶ月後、最初の診断から１年後、など）。
【０３１２】
標識化分子の存在は、インビボスキャニングについての当該分野で公知の方法を使用して患者中で検出され得る。これらの方法は、使用される標識の型に依存する。当業者は、特定の標識を決定するための適切な方法を決定することができる。本発明の診断方法において使用され得る方法およびデバイスとしては、コンピュータ連動断層撮影（ＣＴ）、体全体のスキャン（例えば、陽子（ｐｏｓｉｔｉｏｎ）放射断層撮影法（ＰＥＴ））、磁気共鳴画像法（ＭＲＩ）、および超音波診断法が挙げられるが、これらに限定されない。
【０３１３】
特定の実施形態において、分子を放射性同位体で標識し、そして放射応答性外科的機器（ｒａｄｉａｔｉｏｎ　ｒｅｓｐｏｎｓｉｖｅ　ｓｕｒｇｉｃａｌ　ｉｎｓｔｒｕｍｅｎｔ）（Ｔｈｕｒｓｔｏｎら、米国特許第５，４４１，０５０号）を使用して患者中で検出する。別の実施形態において、分子を蛍光化合物で標識し、そして蛍光応答性スキャニング機器を使用して患者中で検出する。別の実施形態において、分子を陽電子射出金属で標識し、そして陽電子射出断層撮影法を使用して患者中で検出する。さらに別の実施形態において、分子を常磁性標識で標識し、そして磁気共鳴画像法（ＭＲＩ）を使用して患者中で検出する。
（キット）
本発明は、上記の方法において使用され得るキットを提供する。１つの実施形態において、キットは、１つ以上の容器中に、本発明の抗体、好ましくは精製した抗体を備える。特定の実施形態において、本発明のキットは、エピトープを含む実質的に単離されたポリペプチドを備える。このエピトープは、キット中に含まれる抗体と特異的に免疫反応する。好ましくは、本発明のキットは、目的のポリペプチドと反応しないコントロール抗体をさらに備える。別の特定の実施形態において、本発明のキットは、目的のポリペプチドへの抗体の結合を検出するための手段を備える（例えば、この抗体は、検出可能な基質（例えば、蛍光化合物、酵素基質、放射性化合物もしくは発光化合物）に結合体化され得るか、または一次抗体を認識する二次抗体が、検出可能な基質と結合体化され得る）。
【０３１４】
本発明の別の特定の実施形態において、キットは、増殖性および／または癌性のポリヌクレオチドおよびポリペプチドに対して特異的な抗体を含む血清のスクリーニングに使用するための診断キットである。このようなキットは、目的のポリペプチドと反応しないコントロール抗体を備え得る。このようなキットは、エピトープを含む実質的に単離されたポリペプチド抗原を備え得る。このエピトープは、少なくとも１つの抗ポリペプチド抗原抗体と特異的に免疫反応する。さらに、このようなキットは、抗原に対する上記の抗体の結合を検出するための手段を備える（例えば、抗体は、蛍光化合物（例えば、フローサイトメトリーにより検出され得るフルオレセインまはたローダミン）と結合体化され得る）。特定の実施形態において、キットは、組換え的に産生されたポリペプチド抗原または化学的に合成されたポリペプチド抗原を備え得る。キットのポリペプチド抗原はまた、固体支持体に付着され得る。
【０３１５】
より特定の実施形態において、上記のキットの検出手段は、上記のポリペプチド抗原が付着する固体支持体を備える。このようなキットはまた、非付着性のレポーター標識化抗ヒト抗体を備え得る。この実施形態において、ポリペプチド抗原への抗体の結合は、上記のレポーター標識化抗体の結合によって検出され得る。
【０３１６】
さらなる実施形態において、本発明は、本発明のポリペプチドの抗原を含む血清のスクリーニングにおいて使用するための、診断キットを含む。この診断キットは、ポリペプチド抗原またはポリヌクレオチド抗原と特異的に免疫反応する実質的に単離された抗体、およびこの抗体へのこのポリヌクレオチド抗原またはポリペプチド抗原の結合を検出するための手段を備える。１つの実施形態において、抗体は、固体支持体に付着される。特定の実施形態において、抗体は、モノクロナール抗体であり得る。キットのこの検出手段は、第２の標識化モノクロナール抗体を備え得る。あるいは、またはさらに、この検出手段は、標識化競合抗原を備え得る。
【０３１７】
１つの診断構成において、試験血清を、本発明の方法により得られる表面結合抗原を有する固相試薬と反応させる。特定の抗原抗体を用いたこの試薬への結合、および洗浄することによる結合していない血清成分の除去の後、この試薬をレポーター標識化抗ヒト抗体と反応させて、固体支持体上の結合した抗抗原抗体の量に比例して、この試薬にレポーターを結合させる。この試薬を再び洗浄して、結合していない標識化抗体を除去し、そしてこの試薬と会合するレポーターの量を決定する。代表的に、レポーターは、酵素であり、この酵素は、適切な蛍光性基質、発光性基質または比色用基質（Ｓｉｇｍａ，Ｓｔ．Ｌｏｕｉｓ，ＭＯ）の存在下で固相をインキュベートすることにより検出される。
【０３１８】
上記のアッセイにおける固体表面試薬は、タンパク質材料を固体支持体材料（例えば、高分子ビーズ、計深棒、９６ウェルプレートまたは濾過材料）に付着させるための公知の技術により調製される。これらの付着方法としては、一般的に、支持体へのタンパク質の非特異的な吸着または固体支持体上の化学的に反応性の基（例えば、活性化カルボキシル基、ヒドロキシル基、またはアルデヒド基）とのタンパク質への共有結合（ｃｏｖａｌｅｎｔ　ａｔｔａｃｈｍｅｎｔ）（代表的には、遊離アミン基を介する）が挙げられる。あるいは、ストレプトアビジンでコートされたプレートが、ビオチン化された抗原と共に使用され得る。
【０３１９】
従って、本発明は、この診断方法を行うためのアッセイ系またはキットを提供する。このキットは、一般的に、表面結合された組換え抗原を有する支持体、および表面結合された抗抗原抗体を検出するための、レポーター標識化抗ヒト抗体を備える。
【０３２０】
（ポリヌクレオチドの使用）
本明細書中で同定された各々のポリヌクレオチドは、試薬として多数の方法において使用され得る。以下の説明は例示的であるとみなされるべきであり、そして公知の技術を利用する。
【０３２１】
本発明のポリヌクレオチドは、染色体同定のために有用である。実際の配列データ（反復多型性）に基づく染色体マーキング試薬は現在ほとんど利用可能ではないでの、新しい染色体マーカーを同定する必要性が存在するままである。各々の配列は、個々のヒト染色体上の特定の位置に特に標的化され、そしてこの位置にハイブリダイズされ得る。従って、本発明の各々のポリヌクレオチドは、当該分野で公知の技術を用いて染色体マーカーとして慣用的に使用され得る。
【０３２２】
簡単に言うと、配列は、配列番号Ｘで示される配列からＰＣＲプライマー（好ましくは、少なくとも１５ｂｐ（例えば、１５〜２５ｂｐ））を調製することによって染色体にマッピングされ得る。プライマーが、ゲノムＤＮＡ中の１つより多くの予測されたエキソンにまたがらないように、プライマーは、コンピューター分析を使用して必要に応じて選択され得る。次いで、これらのプライマーは、個々のヒト染色体を含む体細胞ハイブリッドのＰＣＲスクリーニングのために使用される。配列番号Ｘに対応するヒト遺伝子を含むハイブリッドのみが、増幅されたフラグメントを産生する。
【０３２３】
同様に、体細胞ハイブリッドは、特定の染色体に対してポリヌクレオチドをＰＣＲマッピングする迅速な方法を提供する。単一のサーマルサイクラーを使用して１日あたり３つ以上のクローンが割り当てられ得る。さらに、ポリヌクレオチドの下位位置決定（ｓｕｂｌｏｃａｌｉｚａｔｉｏｎ）は、特定の染色体フラグメントのパネルを用いて達成され得る。使用され得る他の遺伝子マッピング戦略は、インサイチュハイブリダイゼーション、標識されたフロー分類化（ｌａｂｅｌｅｄ　ｆｌｏｗ　ｓｏｒｔｅｄ）染色体を用いたプレスクリーニング、染色体特異的ｃＤＮＡライブラリーを構築するためのハイブリダイゼーションによる前選択、およびコンピューターマッピング技術（例えば、その全体が本明細書中に参考として援用される、Ｓｈｕｌｅｒ，Ｔｒｅｎｄｓ　Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ　１６：４５６−４５９（１９９８）を参照のこと）を含む。
【０３２４】
ポリヌクレオチドの正確な染色体位置はまた、中期染色体スプレッド（ｓｐｒｅａｄ）の蛍光インサイチュハイブリダイゼーション（ＦＩＳＨ）を使用して獲得され得る。この技術は５００または６００塩基ほどの短さのポリヌクレオチドを使用する；しかし２，０００〜４，０００ｂｐのポリヌクレオチドが好ましい。この技術の総説に関しては、Ｖｅｒｍａら、「Ｈｕｍａｎ　Ｃｈｒｏｍｏｓｏｍｅｓ：ａ　Ｍａｎｕａｌ　ｏｆ　Ｂａｓｉｃ　Ｔｅｃｈｎｉｑｕｅｓ」，Ｐｅｒｇａｍｏｎ　Ｐｒｅｓｓ，Ｎｅｗ　Ｙｏｒｋ（１９８８）を参照のこと。
【０３２５】
染色体マッピングについては、ポリヌクレオチドは、個々に（単一染色体またはその染色体上の単一部位をマークするために）またはパネルで（複数部位および／または複数染色体をマークするために）使用され得る。
【０３２６】
従って、本発明はまた、染色体の位置決定のための方法も提供し、この方法は、（ａ）表１におけるポリヌクレオチド配列および配列番号ＸからＰＣＲプライマーを調製する工程、ならびに（ｂ）個々の染色体を含む体細胞ハイブリッドをスクリーニングする工程を包含する。
【０３２７】
本発明のポリヌクレオチドは、同様に、放射線ハイブリッドマッピング、ＨＡＰＰＹマッピング、および長範囲制限マッピングに有用である。これらの技術および当該分野で公知の他の技術の概説について、例えば、Ｄｅａｒ「Ｇｅｎｏｍｅ　Ｍａｐｐｉｎｇ：Ａ　Ｐｒａｃｔｉｃａｌ　Ａｐｐｒｏａｃｈ」ＩＲＬ　Ｐｒｅｓｓ　ａｔ　Ｏｘｆｏｒｄ　Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ　Ｐｒｅｓｓ、Ｌｏｎｄｏｎ（１９９７）；Ａｙｄｉｎ、Ｊ．Ｍｏｌ．Ｍｅｄ．７７：６９１〜６９４（１９９９）；Ｈａｃｉａら、Ｍｏｌ．Ｐｓｙｃｈｉａｔｒｙ　３：４８３〜４９２（１９９８）；Ｈｅｒｒｉｃｋら、Ｃｈｒｏｍｏｓｏｍｅ　Ｒｅｓ．７：４０９〜４２３（１９９９）；Ｈａｍｉｌｔｏｎら、Ｍｅｔｈｏｄｓ　Ｃｅｌｌ　Ｂｉｏｌ．６２：２６５〜２８０（２０００）；および／またはＯｔｔ、Ｊ．Ｈｅｒｅｄ．９０：６８〜７０（１９９９）（これらの各々は、その全体が参考として本明細書中に援用される）を参照のこと。
【０３２８】
一旦、ポリヌクレオチドが正確な染色体位置にマップされると、ポリヌクレオチドの物理的位置は、連鎖分析において使用され得る。連鎖分析は、染色体位置と特定の疾患の提示との間の同時遺伝（ｃｏｉｎｈｅｒｉｔａｎｃｅ）を確立する。（疾患マッピングデータは、例えば、Ｖ．ＭｃＫｕｓｉｃｋ，Ｍｅｎｄｅｌｉａｎ　Ｉｎｈｅｒｉｔａｎｃｅ　ｉｎ　Ｍａｎ（Ｊｏｈｎｓ　Ｈｏｐｋｉｎｓ　Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ　Ｗｅｌｃｈ　Ｍｅｄｉｃａｌ　Ｌｉｂｒａｒｙを通してオンラインで利用可能である）において見い出される）。１メガベースマッピング解像度および２０ｋｂあたり１遺伝子と仮定すると、疾患と関連する染色体領域に正確に位置決定されるｃＤＮＡは、５０〜５００の潜在的な原因遺伝子のうちの１つであり得る。
【０３２９】
従って、一旦、同時遺伝が確立されると、罹患個体と非罹患個体との間での本発明のポリヌクレオチドおよび対応する遺伝子における差異が試験され得る。まず、染色体中の可視的構造変化（例えば、欠失または転座）は染色体スプレッドにおいて、またはＰＣＲによって試験される。構造的変化が存在しない場合、点変異の存在が確認される。何人かのまたは全ての罹患個体で観察されたが、正常な個体では観察されなかった変異は、この変異がこの疾患を引き起こし得ることを示す。しかし、いくつかの正常な個体由来のポリペプチドおよび対応する遺伝子の完全な配列決定は、変異を多型性と区別するために要求される。新しい多型性が同定される場合、この多型ポリペプチドはさらなる連鎖分析のために使用され得る。
【０３３０】
さらに、非罹患個体と比較した、罹患個体の遺伝子の増加または減少した発現が、本発明のポリヌクレオチドを使用して評価され得る。任意のこれらの変化（変化した発現、染色体再配置、または変異）は、診断マーカーまたは予後マーカーとして使用され得る。
【０３３１】
従って、本発明はまた、障害の診断の間に有用な診断方法を提供し、この方法は、個体由来の細胞または体液中の本発明のポリヌクレオチドの発現レベルを測定する工程、および測定された遺伝子発現レベルを標準レベルのポリヌクレオチド発現レベルと比較する工程を包含し、これによって、標準と比較して、遺伝子発現レベルの増加または減少が、障害の指標になる。
【０３３２】
なお別の実施形態では、本発明は、サンプルを、試験被験体に由来する増殖性および／または癌性のポリヌクレオチドの存在について分析するためのキットを含む。一般的実施形態において、このキットは、本発明のポリヌクレオチドと特異的にハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む少なくとも１つのポリヌクレオチドプローブ、および適切な容器を備える。この特定の実施形態では、このキットは、本発明のポリヌクレオチドの内部領域を規定する２つのポリヌクレオチドプローブを備え、ここで各プローブは、この領域に対して内部に３１’マー末端を含む１つの鎖を有する。さらなる実施形態では、このプローブは、ポリメラーゼ連鎖反応増幅のためのプライマーとして有用であり得る。
【０３３３】
例えば、腫瘍の診断を含む、関連障害の診断が既に従来方法に従って行われている場合、本発明は、予後インジケーターとして有用であり、それによって増強または抑制された本発明のポリヌクレオチドの発現を示す患者は、標準レベルにより近いレベルでこの遺伝子を発現する患者と比較して悪い臨床結果を経験する。
【０３３４】
「本発明のポリヌクレオチドの発現レベルを測定する（こと）」によって、本発明のポリペプチドのレベルまたは本発明のポリペプチドをコードするｍＲＮＡのレベルを、第１の生物学的サンプルにおいて直接的（例えば、絶対のタンパク質レベルまたはｍＲＮＡレベルを決定または評価することによって）または相対的（例えば、第２の生物学的サンプル中のポリペプチドレベルまたはｍＲＮＡレベルに対して比較することによって）のいずれかで定性的または定量的に測定または評価することが意図される。好ましくは、第１の生物学的サンプル中のポリペプチドレベルまたはｍＲＮＡレベルが測定または評価され、そして標準のポリペプチドレベルまたはｍＲＮＡレベルに対して比較され、この標準は、関連障害を有さない個体から得られる第２の生物学的サンプルから得られるかまたは関連障害を有さない個体の集団由来のレベルを平均することによって決定される。当該分野で認識されるように、一旦標準的なポリペプチドレベルまたはｍＲＮＡレベルが公知になれば、これを、比較のための標準として反復して用い得る。
【０３３５】
「生物学的サンプル」によって、本発明のポリペプチドまたは対応するｍＲＮＡを含む、個体、体液、細胞株、組織培養物または他の供給源から得られる任意の生物学的サンプルが意図される。示されるように、生物学的サンプルは、本発明のポリペプチドを含む体液（例えば、精液、リンパ、血清、血漿、尿、滑液および髄液）、本発明のポリペプチドを発現することが見出された組織供給源を含む。哺乳動物から組織生検および体液を得るための方法は、当該分野で周知である。生物学的サンプルがｍＲＮＡを含む場合、組織生検が好ましい供給源である。
【０３３６】
上記で提供された方法は好ましくは、本発明のポリヌクレオチドおよび／またはポリペプチドが固体支持体に結合される、診断方法および／またはキットに適用され得る。１つの例示的な方法では、この支持体は、米国特許第５，８３７，８３２号、同第５，８７４，２１９号および同第５，８５６，１７４号に記載される、「遺伝子チップ」または「生物学的チップ」であり得る。さらに、本発明のポリヌクレオチドが結合されたこのような遺伝子チップを用いて、本発明の単離されたポリヌクレオチド配列と、試験被験体から単離されたポリヌクレオチドとの間の多型性を同定し得る。このような多型の知識（すなわち、その多型の位置、およびその多型の存在）は、多くの障害（例えば、神経障害、免疫系障害、筋肉障害、生殖障害、胃腸障害、肺障害、心血管障害、腎障害、増殖性障害、ならびに／または癌性疾患および癌性状態）について、疾患遺伝子座を同定する際に有益である。このような方法は、米国特許第５，８５８，６５９号および同第５，８５６，１０４号に記載される。上記に参照した米国特許は、その全体が本明細書中に参考として援用される。
【０３３７】
本発明は、化学的に合成されるか、または、ペプチド核酸（ＰＮＡ）として再現されるか、または当該分野で公知の他の方法に従って、本発明のポリヌクレオチドを包含する。ＰＮＡの使用は、本発明のポリヌクレオチドが固体支持体、または、遺伝子チップ上に組み込まれる場合、好ましい形態として役立つ。本発明の目的のために、ペプチド核酸（ＰＮＡ）は、ポリアミド型のＤＮＡアナログであり、そしてアデニン、グアニン、チミンおよびシトシンについてのモノマー単位が市販されている（Ｐｅｒｃｅｐｔｉｖｅ　Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ）。ＤＮＡの特定の成分（例えば、リン、酸化リンまたはデオキシリボース誘導体）は、ＰＮＡ中に存在しない。Ｐ．Ｅ．Ｎｉｅｌｓｅｎ，Ｍ．Ｅｇｈｏｌｍ，Ｒ．Ｈ．ＢｅｒｇおよびＯ．Ｂｕｃｈａｒｄｔ，Ｓｃｉｅｎｃｅ　２５４，１４９７（１９９１）；ならびにＭ．Ｅｇｈｏｌｍ，Ｏ．Ｂｕｃｈａｒｄｔ，Ｌ．Ｃｈｒｉｓｔｅｎｓｅｎ，Ｃ．Ｂｅｈｒｅｎｓ，Ｓ．Ｍ．Ｆｒｅｉｅｒ，Ｄ．Ａ．Ｄｒｉｖｅｒ，Ｒ．Ｈ．Ｂｅｒｇ、Ｓ．Ｋ．Ｋｉｍ，Ｂ．ＮｏｒｄｅｎおよびＰ．Ｅ．Ｎｉｅｌｓｅｎ，Ｎａｔｕｒｅ　３６５，６６６（１９９３）によって開示されるように、ＰＮＡは、相補的なＤＮＡ鎖に対して特異的かつ緊密に結合し、そしてヌクレアーゼによって分解されない。実際、ＰＮＡは、ＤＮＡ自体が結合するよりも強力にＤＮＡに結合する。これはおそらく、２つの鎖の間に静電斥力が存在せず、そしてまたポリアミド骨格がより可撓性が高いことによる。これによって、ＰＮＡ／ＤＮＡ二重鎖は、ＤＮＡ／ＤＮＡ二重鎖よりも広範囲のストリンジェンシー条件下で結合し、多重鎖ハイブリダイゼーションを行うのをより容易にする。強力な結合に起因して、ＤＮＡを用いてよりも小さいプローブが用いられ得る。さらに、おそらく、単一の塩基ミスマッチが、ＰＮＡ／ＤＮＡハイブリダイゼーションを用いて決定され得る。なぜなら、ＰＮＡ／ＤＮＡの１５マーにおける単一のミスマッチは、ＤＮＡ／ＤＮＡの１５マー二重鎖については融点（Ｔ．ｓｕｂ．ｍ）を４℃〜１６℃で低下させるのに対して、融点（Ｔ．ｓｕｂ．ｍ）を８〜２０℃低下させるからである。また、ＰＮＡ中に電荷基が存在しないことは、ハイブリダイゼーションが、低いイオン強度で行われ得、そして分析の間の塩によって可能な妨害を減少させることを意味する。
【０３３８】
本発明は、哺乳動物における癌の検出を含むがこれらに限定されない用途を有する。特に、本発明は、以下を含むがこれらに限定されない、病理学的細胞増殖新形成の診断の間に有用である：急性骨髄性白血病（急性単球性白血病、急性骨髄芽球性白血病、急性前骨髄球性白血病、急性骨髄単球性白血病、急性赤白血病、急性巨核球性白血病、および急性未分化白血病などを含む）；および慢性骨髄性白血病（慢性骨髄単球性白血病、慢性顆粒球性白血病などを含む）。好ましい哺乳動物としては、有尾猿（ｍｏｎｋｅｙ）、無尾猿（ａｐｅ）、ネコ、イヌ、ウシ、ブタ、ウマ、ウサギおよびヒトが挙げられる。特に好ましいのは、ヒトである。
【０３３９】
病理学的細胞増殖障害はしばしば、癌原遺伝子の不適切な活性化に関連する（Ｇｅｌｍａｎｎ，Ｅ．Ｐ．ら，「Ｔｈｅ　Ｅｔｉｏｌｏｇｙ　ｏｆ　Ａｃｕｔｅ　Ｌｅｕｋｅｍｉａ：Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ　Ｇｅｎｅｔｉｃｓ　ａｎｄ　Ｖｉｒａｌ　Ｏｎｃｏｌｏｇｙ」，Ｎｅｏｐｌａｓｔｉｃ　Ｄｉｓｅａｓｅｓ　ｏｆ　ｔｈｅ　Ｂｌｏｏｄ，第１巻，Ｗｉｅｒｎｉｋ、Ｐ．Ｈ．ら編，１６１−１８２（１９８５））。新形成は現在、ウイルス配列の染色体への挿入、より活性に転写される領域への遺伝子の染色体転座、または何らかの他の機構による、正常な細胞遺伝子産物の定性的変化から、または遺伝子発現の定量的改変から生じると考えられている（Ｇｅｌｍａｎｎら、前出）。特定の遺伝子の変異または変更された発現が、他の組織および他の細胞型の中でも、いくつかの白血病の病因に関与するようである（Ｇｅｌｍａｎｎら、前出）。実際、いくつかの動物新形成に関与する癌遺伝子のヒト対応物は、ヒトの白血病および癌のいくつかの症例において増幅または転座されている（Ｇｅｌｍａｎｎら、前出）。
【０３４０】
例えば、ｃ−ｍｙｃ発現は、非リンパ球性白血病細胞株ＨＬ−６０において高度に増幅される。ＨＬ−６０細胞が増幅を止めるように化学的に誘導される場合、ｃ−ｍｙｃのレベルは、ダウンレギュレートされることが見出される（国際公開番号ＷＯ９１／１５５８０）。しかし、ｃ−ｍｙｃまたはｃ−ｍｙｂの５’末端に相補的であるＤＮＡ構築物へのＨＬ−６０細胞の曝露が、ｃ−ｍｙｃタンパク質またはｃ−ｍｙｂタンパク質の発現をダウンレギュレートする対応するｍＲＮＡの翻訳をブロックし、処理した細胞の細胞増殖および分化の停止を引き起こすことが示されている（国際公開番号ＷＯ９１／１５５８０；Ｗｉｃｋｓｔｒｏｍら、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．８５：１０２８（１９８８）；Ａｎｆｏｓｓｉら、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．８６：３３７９（１９８９））。しかし、当業者は、増殖表現型を示すことが公知である種々の起源の多数の細胞および細胞型を考慮すれば、本発明の有用性が造血性の細胞および組織の増殖性障害の処置に限定されないことを認識する。
【０３４１】
前記に加えて、本発明のポリヌクレオチドは、三重らせん形成を通して、またはアンチセンスＤＮＡもしくはＲＮＡを通して遺伝子発現を制御するために使用され得る。アンチセンス技術は、例えば、Ｏｋａｎｏ，Ｊ．Ｎｅｕｒｏｃｈｅｍ．５６：５６０（１９９１），「Ｏｌｉｇｏｄｅｏｘｙｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅｓ　ａｓ　Ａｎｔｉｓｅｎｓｅ　Ｉｎｈｉｂｉｔｏｒｓ　ｏｆ　Ｇｅｎｅ　Ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ」，ＣＲＣ　Ｐｒｅｓｓ，Ｂｏｃａ　Ｒａｔｏｎ，ＦＬ（１９８８）において考察される。三重らせん形成は例えば、Ｌｅｅら、Ｎｕｃｌｅｉｃ　Ａｃｉｄｓ　Ｒｅｓｅａｒｃｈ　６：３０７３（１９７９）；Ｃｏｏｎｅｙら、Ｓｃｉｅｎｃｅ　２４１：４５６（１９８８）；およびＤｅｒｖａｎら、Ｓｃｉｅｎｃｅ　２５１：１３６０（１９９１）において考察される。両方の方法は、相補的ＤＮＡまたは相補的ＲＮＡへのポリヌクレオチドの結合に依存する。これらの技術に関して、好ましいポリヌクレオチドは通常、２０〜４０塩基長のオリゴヌクレオチドであり、そして転写に関与する遺伝子領域（三重らせん−Ｌｅｅら，Ｎｕｃｌ．Ａｃｉｄｓ　Ｒｅｓ．６：３０７３（１９７９）；Ｃｏｏｎｅｙら、Ｓｃｉｅｎｃｅ　２４１：４５６（１９８８）；およびＤｅｒｖａｎら、Ｓｃｉｅｎｃｅ　２５１：１３６０（１９９１）を参照のこと）またはｍＲＮＡ自体（アンチセンス−Ｏｋａｎｏ，Ｊ．Ｎｅｕｒｏｃｈｅｍ．５６：５６０（１９９１）；Ｏｌｉｇｏｄｅｏｘｙ−ｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅｓ　ａｓ　Ａｎｔｉｓｅｎｓｅ　Ｉｎｈｉｂｉｔｏｒｓ　ｏｆ　Ｇｅｎｅ　Ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ，ＣＲＣ　Ｐｒｅｓｓ，Ｂｏｃａ　Ｒａｔｏｎ，ＦＬ（１９８８））のいずれかに相補的である。三重らせん形成は、最適にはＤＮＡからのＲＮＡ転写の遮断を生じるが、アンチセンスＲＮＡハイブリダイゼーションは、ポリペプチドへのｍＲＮＡ分子の翻訳をブロックする。上記に記載のオリゴヌクレオチドはまた、アンチセンスＲＮＡまたはＤＮＡが、インビボで発現されて本発明の抗原のポリペプチド産生を阻害し得るように細胞に送達され得る。両方の技術は、モデル系において効果的であり、そして本明細書に開示される情報は、疾患を処置するための試みにおいて、特に、増殖性疾患および／または状態の処置のために、アンチセンスまたは三重らせんポリヌクレオチドを設計するために使用され得る。
【０３４２】
本発明のポリヌクレオチドはまた、遺伝子治療において有用である。遺伝子治療の１つの目標は、遺伝欠損を修正する試みにおいて、欠損遺伝子を有する生物へ正常遺伝子を挿入することである。本発明に開示されるポリヌクレオチドは、高度に正確な様式でこのような遺伝欠損を標的化する手段を提供する。別の目標は、宿主ゲノム中には存在しなかった新しい遺伝子を挿入し、それによって宿主細胞中に新しい形質を生成することである。
【０３４３】
ポリヌクレオチドはまた、微小な生物学的サンプルから個体を同定するために有用である。例えば、米国軍は、その職員を同定するために制限フラグメント長多型（ＲＦＬＰ）の使用を考慮している。この技術において、個体のゲノムＤＮＡは、１つ以上の制限酵素で消化され、そして職員を同定するため固有なバンドを得るためにサザンブロット上でプローブ化される。この方法は、「認識票（Ｄｏｇ　ｔａｇ）」（これは、失われたり、交換されたり、または盗まれたりすることにより、ポジティブな同定を困難にし得る）の現在の限界を受けない。本発明のポリヌクレオチドは、ＲＦＬＰのためのさらなるＤＮＡマーカーとして使用され得る。
【０３４４】
本発明のポリヌクレオチドはまた、個体のゲノムの選択された部分の実際の塩基ごとのＤＮＡ配列を決定することによって、ＲＦＬＰに対する代替物として使用され得る。これらの配列は、このような選択されたＤＮＡを増幅しそして単離するためのＰＣＲプライマーを調製するために使用され得、次いで、この選択されたＤＮＡは、配列決定され得る。各個体が固有のセットのＤＮＡ配列を有するので、この技術を使用して、個体が同定され得る。一旦、固有のＩＤデータベースが個体について確立されると、その個体が生存していようとまたは死亡していようと、その個体のポジティブ同定が、極めて小さな組織サンプルからなされ得る。
【０３４５】
法医学生物学もまた、本明細書に開示されるようなＤＮＡに基づく同定技術を使用して利益を得る。組織（例えば、髪または皮膚）、または体液（例えば、血液、唾液、精液、滑液、羊水、乳汁、リンパ、肺痰（ｐｕｌｍｏｎａｒｙ　ｓｐｕｔｕｍ）またはサーファクタント、尿、糞便物質など）のような非常に小さな生物学的サンプルから得られたＤＮＡ配列は、ＰＣＲを使用して増幅され得る。ある先行技術において、ＤＱａクラスＩＩ　ＨＬＡ遺伝子のような多型性遺伝子座から増幅された遺伝子配列は、個体を同定するための法医学生物学において使用される。（Ｅｒｌｉｃｈ，Ｈ．，ＰＣＲ　Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ，Ｆｒｅｅｍａｎ　ａｎｄ　Ｃｏ．（１９９２））。一旦、これらの特異的多型性遺伝子座が増幅されると、これらは１つ以上の制限酵素で消化される。これは、ＤＱａクラスＩＩ　ＨＬＡ遺伝子に対応するＤＮＡでプローブされたサザンブロット上でバンドの同定セットを生じる。同様に、本発明のポリヌクレオチドは、法医学的目的のための多型性マーカーとして使用され得る。
【０３４６】
また、特定の組織の供給源を同定し得る試薬についての必要性が存在する。例えば、未知の起源の組織が提供される場合、法医学においてこのような必要性が生じる。適切な試薬は、例えば、本発明の配列から調製される、ＤＮＡプローブまたはプライマーを含み得る。このような試薬のパネルは、種および／または器官型によって組織を同定し得る。同様の様式で、これらの試薬は、夾雑物について組織培養物をスクリーニングするために使用され得る。
【０３４７】
本発明のポリヌクレオチドはまた、生物学的サンプル中に存在する組織または細胞型の示差的同定のためのハイブリダイゼーションプローブとして有用である。同様に、本発明のポリペプチドおよびポリペプチドに対する抗体は、組織（例えば、免疫組織化学アッセイ）または細胞型（例えば、免疫細胞化学アッセイ）の示差的同定のための免疫学的プローブを提供するのに有用である。さらに、「標準」遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有しない個体由来の健康組織の発現レベル）と比較して、上記の組織または細胞の多くの障害に対して、本発明のポリヌクレオチド／ポリペプチドの有意に高いかまたは低いレベルの遺伝子発現が、このような障害を有する個体から採取された特定の組織（例えば、本発明のポリペプチドおよび／またはポリヌクレオチドを発現する組織および／または癌性組織および／または創傷組織）または体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液または髄液）において検出され得る。
【０３４８】
従って、本発明は、以下の工程を含む障害の診断方法を提供する：（ａ）個体の細胞または体液中の遺伝子発現レベルをアッセイする工程；（ｂ）標準的な遺伝子発現レベルと、この遺伝子発現レベルを比較し、それにより、標準の発現レベルと比較して、アッセイされた遺伝子発現レベルの増加または減少が障害を示す、工程。
【０３４９】
少なくとも、本発明のポリヌクレオドは、サザンブロットのゲル上の分子量マーカーとして、特定の細胞型における特異的ｍＲＮＡの存在についての診断プローブとして、新規のポリヌクレオドを発見するプロセスにおける「減算した（ｓｕｂｔｒａｃｔ−ｏｕｔ）」公知の配列に対するプローブとして、「遺伝子チップ」または他の支持体に付着するためのオリゴマーを選択および作製するために、ＤＮＡ免疫技術を用いて抗ＤＮＡ抗体を惹起するために、および免疫応答を惹起する抗原として使用され得る。
【０３５０】
（ポリペプチドの使用）
本明細書中で同定される各々のポリペプチドは、多くの方法において使用され得る。以下の記述は、例示として考慮されるべきであり、そして公知の技術を利用する。
【０３５１】
本発明のポリペプチドおよびポリペプチドに対して指向される抗体は、組織（例えば、ＡＢＣ免疫ペルオキシダーゼのような免疫組織化学アッセイ（Ｈｓｕら、Ｊ．Ｈｉｓｔｏｃｈｅｍ．Ｃｙｔｏｃｈｅｍ．２９：５７７−５８０（１９８１）））または細胞型（例えば、免疫細胞化学アッセイ）の差次的同定のための免疫学的プローブを提供するために有用である。
【０３５２】
抗体を使用して、当業者に公知の古典的な免疫組織学的な方法を用いて、生物学的サンプル中の本発明のポリヌクレオチドによりコードされるポリペプチドのレベルをアッセイし得る（例えば、Ｊａｌｋａｎｅｎら、Ｊ．Ｃｅｌｌ．Ｂｉｏｌ．１０１：９７６−９８５（１９８５）；Ｊａｌｋａｎｅｎら、Ｊ．Ｃｅｌｌ．Ｂｉｏｌ．１０５：３０８７−３０９６（１９８７）を参照のこと）。タンパク質の遺伝子発現を検出するのに有用な、他の抗体に基づく方法には、イムノアッセイ（例えば、酵素結合イムノソルベント検定（ＥＬＩＳＡ）およびラジオイムノアッセイ（ＲＩＡ））が含まれる。適切な抗体アッセイの標識は、当該分野で公知であり、そして酵素標識（例えば、グルコースオキシダーゼ）；放射性同位体（例えば、ヨウ素（１３１Ｉ、１２５Ｉ、１２３Ｉ、１２１Ｉ）、炭素（１４Ｃ）、硫黄（３５Ｓ）、トリチウム（３Ｈ）、インジウム（１１５ｍＩｎ、１１３ｍＩｎ、１１２Ｉｎ、１１１Ｉｎ）、およびテクネチウム（９９Ｔｃ、９９ｍＴｃ）、タリウム（２０１Ｔｉ）、ガリウム（６８Ｇａ、６７Ｇａ）、パラジウム（１０３Ｐｄ）、モリブデン（９９Ｍｏ）、キセノン（１３３Ｘｅ）、フッ素（１８Ｆ）、１５３Ｓｍ、１７７Ｌｕ、１５９Ｇｄ、１４９Ｐｍ、１４０Ｌａ、１７５Ｙｂ、１６６Ｈｏ、９０Ｙ、４７Ｓｃ、１８６Ｒｅ、１８８Ｒｅ、１４２Ｐｒ、１０５Ｒｈ、９７Ｒｕ）；発光標識（例えば、ルミノール）；ならびに蛍光標識（例えば、フルオレセインおよびローダミン）ならびにビオチンが挙げられる。
【０３５３】
生物学的サンプル中の本発明のポリペプチドのレベルをアッセイすることに加えて、タンパク質はまた、画像化によりインビボで検出され得る。タンパク質のインビボ画像化のための抗体の標識またはマーカーは、Ｘ線撮影法、ＮＭＲ、またはＥＳＲにより検出可能なものを含む。Ｘ線撮影法のために適切な標識は、放射性同位体（例えば、バリウムまたはセシウム）を含み、これは検出可能な放射線を放射するが、被験体に対して明らかに有害ではない。ＮＭＲおよびＥＳＲのための適切なマーカーは、検出可能な特徴的なスピンを有するマーカー（例えば、重水素）を含み、これは、関連するハイブリドーマのための栄養分を標識することにより抗体中に取り込まれ得る。
【０３５４】
放射性同位体（例えば、１３１Ｉ、１１２Ｉｎ、９９ｍＴｃ、（１３１Ｉ、１２５Ｉ、１２３Ｉ、１２１Ｉ）、炭素（１４Ｃ）、硫黄（３５Ｓ）、トリチウム（３Ｈ）、インジウム（１１５ｍＩｎ、１１３ｍＩｎ、１１２Ｉｎ、１１１Ｉｎ）、およびテクネチウム（９９Ｔｃ、９９ｍＴｃ）、タリウム（２０１Ｔｉ）、ガリウム（６８Ｇａ、６７Ｇａ）、パラジウム（１０３Ｐｄ）、モリブデン（９９Ｍｏ）、キセノン（１３３Ｘｅ）、フッ素（１８Ｆ）、１５３Ｓｍ、１７７Ｌｕ、１５９Ｇｄ、１４９Ｐｍ、１４０Ｌａ、１７５Ｙｂ、１６６Ｈｏ、９０Ｙ、４７Ｓｃ、１８６Ｒｅ、１８８Ｒｅ、１４２Ｐｒ、１０５Ｒｈ、９７Ｒｕ）、放射線不透過性物質、または核磁気共鳴により検出可能な材料のような適切な検出可能な画像化部分で標識された、タンパク質特異的抗体または抗体フラグメントは、免疫系の障害について検査される哺乳動物に（例えば、非経口的、皮下、または腹腔内に）導入される。被験体のサイズおよび用いられる画像化システムは、診断画像を生成するために必要な画像化部分の量を決定することが当該分野で理解される。放射性同位体部分の場合には、ヒト被験体について、注射される放射能の量は、通常、９９ｍＴｃの約５〜２０ミリキュリーの範囲である。次いで、標識された抗体または抗体フラグメントは、本発明のポリヌクレオチドによりコードされるポリペプチドを発現する細胞の位置に優先的に蓄積される。インビボ腫瘍画像化は、Ｓ．Ｗ．Ｂｕｒｃｈｉｅｌら、「Ｉｍｍｕｎｏｐｈａｒｍａｃｏｋｉｎｅｔｉｃｓ　ｏｆ　Ｒａｄｉｏｌａｂｅｌｅｄ　Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ　ａｎｄ　Ｔｈｅｉｒ　Ｆｒａｇｍｅｎｔｓ」（Ｔｕｍｏｒ　Ｉｍａｇｉｎｇの第１３章：Ｔｈｅ　Ｒａｄｉｏｃｈｅｍｉｃａｌ　Ｄｅｔｅｃｔｉｏｎ　ｏｆ　Ｃａｎｃｅｒ、Ｓ．Ｗ．ＢｕｒｃｈｉｅｌおよびＢ．Ａ．Ｒｈｏｄｅｓ編、Ｍａｓｓｏｎ　Ｐｕｂｌｉｓｈｉｎｇ　Ｉｎｃ．（１９８２））に記載される。
【０３５５】
１つの実施形態において、本発明は、異種ポリペプチドまたは核酸と会合する本発明のポリペプチド（例えば、本発明のポリヌクレオチドによりコードされるポリペプチドおよび／または抗体）を投与することによる、本発明の組成物の細胞への特異的な送達のための方法を提供する。１つの例において、本発明は、治療タンパク質を標的化細胞中へ送達するための方法を提供する。別の例において、本発明は、一本鎖核酸（例えば、アンチセンスまたはリボザイム）または二本鎖核酸（例えば、細胞のゲノムに組み込み得るか、またはエピソームにて複製し得、そして転写され得るＤＮＡ）を、標的化細胞に送達するための方法を提供する。
【０３５６】
別の実施形態において、本発明は、毒素または細胞傷害性プロドラッグに関連する本発明のポリペプチドを投与することによる細胞の特異的な破壊（例えば、腫瘍細胞の破壊）のための方法を提供する。
【０３５７】
「毒素」とは、内因性の細胞傷害性エフェクタ系、放射性同位体、ホロ毒素（ｈｏｌｏｔｏｘｉｎ）、改変型毒素、毒素の触媒サブユニット、または規定の条件下で細胞死を引き起こす細胞中もしくは細胞表面には通常存在しない任意の分子もしくは酵素を、結合および活性化する、１つ以上の化合物を意味する。本発明の方法に従って使用され得る毒素としては、以下が挙げられるが、これらに限定されない：当該分野で公知の放射性同位体、固有のまたは誘導された内因性の細胞傷害性エフェクタ系に結合する化合物（例えば、抗体（またはその補体固定含有部分））、チミジンキナーゼ、エンドヌクレアーゼ、ＲＮＡｓｅ、α毒素、リシン、アブリン、Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ外毒素Ａ、ジフテリア毒素、サポリン、モモルジン（ｍｏｍｏｒｄｉｎ）、ゲロニン（ｇｅｌｏｎｉｎ）、ヤマゴボウ抗ウイルスタンパク質、αサルシン（ｓａｒｃｉｎ）およびコレラ毒素。「毒素」はまた、細胞分裂停止剤もしくは細胞破壊剤、治療薬または放射活性金属イオン（例えば、α−放射体（例えば、２１３Ｂｉ））もしくは他の放射性同位体（例えば、１０３Ｐｄ、１３３Ｘｅ、１３１Ｉ、６８Ｇｅ、５７Ｃｏ、６５Ｚｎ、８５Ｓｒ、３２Ｐ、３５Ｓ、９０Ｙ、１５３Ｓｍ、１５３Ｇｄ、１６９Ｙｂ、５１Ｃｒ、５４Ｍｎ、７５Ｓｅ、１１３Ｓｎ、９０イットリウム、１１７スズ、１８６レニウム、１６６ホルミウム、および１８８レニウムなど）；発光標識（例えば、ルミノール）；および蛍光標識（例えば、フルオレセインおよびローダミン）、ならびにビオチンを含む。
【０３５８】
当該分野において公知の技術は、本発明のポリペプチド（抗体を含む）を標識化するために適用され得る。このような技術としては、二官能性結合剤の使用（例えば、米国特許第５，７５６，０６５号；同第５，７１４，６３１号；同第５，６９６，２３９号；同第５，６５２，３６１号；同第５，５０５，９３１号；同第５，４８９，４２５号；同第５，４３５，９９０号；同第５，４２８，１３９号；同第５，３４２，６０４号；同第５，２７４，１１９号；同第４，９９４，５６０号；および同第５，８０８，００３号を参照のこと；これら各々の内容は、本明細書中に参考としてその全体を援用する）が挙げられるが、これに限定されない。
【０３５９】
従って、本発明は、障害の診断方法を提供し、これは以下の工程を含む：（ａ）個体の細胞または体液における本発明のポリペプチドの発現レベルをアッセイする工程；および（ｂ）アッセイされたポリペプチドの発現レベルを標準のポリペプチドの発現レベルと比較し、それによって標準の発現レベルと比較してアッセイされたポリペプチドの発現レベルにおける増加または減少が障害を示す工程。癌に関しては、個体由来の生検された組織中の相対的に高い量の転写物の存在は、疾患の発症の素因を示し得るか、または実際の臨床的な症状が明らかとなる前に疾患を検出するための手段を提供し得る。より決定的なこのタイプの診断は、保健専門家がより早く予防策または積極的な処置を使用し、それによって癌の発症またはさらなる進行を防ぐことを可能にし得る。
【０３６０】
さらに、本発明のポリペプチドを用いて疾患または状態（例えば、神経障害、免疫系障害、筋肉障害、生殖障害、胃腸障害、肺障害、心血管障害、腎臓障害、増殖障害ならびに／または癌性疾患および状態など）を処置または予防し得る。例えば、患者は、ポリペプチドの非存在またはポリペプチドの減少したレベルを元に戻すこと（例えば、インスリン）、異なるポリペプチドの不在または異なるポリペプチドの減少したレベルを補充すること（例えば、ヘモグロビンＢに対するヘモグロビンＳ、ＳＯＤ、カタラーゼ、ＤＮＡ修復タンパク質）、ポリペプチドの活性を阻害すること（例えば、癌遺伝子または腫瘍抑制因子）、ポリペプチドの活性を活性化すること（例えば、レセプターに結合することによって）、遊離リガンドについて膜結合レセプターと競合させることによって膜結合レセプターの活性を減少させること（例えば、炎症を低減させる際に用いられる可溶性ＴＮＦレセプター）、または所望の応答をもたらすこと（例えば、血管の成長の阻害、増殖性細胞または増殖性組織に対する免疫応答の増強）の試みにおいて、本発明のポリペプチドが投与され得る。
【０３６１】
同様に、本発明のポリペプチドに対して指向される抗体もまた用いられ、疾患（上記、および本明細書中のいずれかに記載されるような）を処置し得る。例えば、本発明のポリペプチドに対して指向される抗体の投与には、ポリペプチドを結合して、そして／またはポリペプチドを中和し、そして／またはポリペプチドの過剰産生を低減し得る。同様に、抗体の投与は、例えば、膜に結合したポリペプチド（レセプター）へ結合することにより、ポリペプチドを活性化し得る。
【０３６２】
少なくとも、本発明のポリペプチドは、当業者に周知の方法を使用して、ＳＤＳ−ＰＡＧＥゲル上または分子ふるいゲルろ過カラム上の分子量マーカーとして使用され得る。ポリペプチドはまた、抗体を惹起するために使用され得、これは、次いで、宿主細胞の形質転換を評価する方法として組換え細胞由来のタンパク質発現を測定するために使用され得る。さらに、本発明のポリペプチドは、以下の生物学的活性を試験するために使用され得る。
【０３６３】
（診断アッセイ）
本発明の化合物は、哺乳動物（好ましくはヒト）における種々の障害の診断、処置、予防および／または予後のために有用である。このような障害としては、神経障害（例えば、以下の「神経活性および神経学的疾患」に記載される通り）、免疫系の障害（例えば、以下の「免疫活性」に記載される通り）、筋肉障害（例えば、以下の「神経活性および神経学的疾患」に記載される通り）、生殖障害（例えば、以下の「抗新脈管形成活性」に記載される通り）、肺障害（例えば、以下の「免疫活性」に記載される通り）、心臓血管障害（例えば、以下の「心臓血管障害」に記載される通り）、感染性疾患（例えば、以下の「感染性疾患」に記載される通り）、増殖性障害（例えば、以下の「過剰増殖性障害」、「抗新脈管形成活性」および「細胞レベルでの疾患」に記載される通り）、ならびに／または、癌性の疾患および状態（例えば、以下の「過剰増殖性障害」、「抗新脈管形成活性」および「細胞レベルでの疾患」に記載される通り）が挙げられるが、これらに限定されない。
【０３６４】
ＥＣＭタンパク質は、細胞接着、分子の細胞間輸送、および細胞間シグナル伝達に関連する生物学的活性に関与すると考えられる。従って、本発明の組成物（本発明のポリヌクレオチド、ポリペプチドおよび抗体、ならびにそれらのフラグメントおよび改変体を含む）は、異常なＥＣＭ活性に関連する疾患および／または障害の診断、予後、予防および／または処置において用いられ得る。
【０３６５】
好ましい実施形態では、本発明の組成物（本発明のポリヌクレオチド、ポリペプチドおよび抗体、ならびにそれらのフラグメントおよび改変体を含む）は、炎症および心臓血管障害（例えば、アテローム性動脈硬化症／関節硬化症（ａｒｔｈｅｒｏｓｃｌｅｒｏｓｉｓ）、狭窄、心ブロック、筋収縮機能不全、および／または本明細書中で「免疫活性」および「心臓血管障害」との表題の節に記載された通り）、筋骨格障害（例えば、骨粗鬆症、関節炎）、凝固障害、異常な創傷治癒、水疱形成障害ならびに過剰増殖性障害（例えば、癌、癌転移物、および／または本明細書中で「過剰増殖性障害」、「抗新脈管形成活性」および「細胞レベルでの疾患」との表題の節に記載された通り）に関連する疾患および／または障害の診断、予後、予防および／または処置において用いられ得る。
【０３６６】
別の実施形態において、本発明のポリペプチド、またはそのポリペプチドに対応するポリヌクレオチド、抗体、アゴニスト、もしくはアンタゴニストは、本発明のポリペプチドが発現される組織（「本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチド」において開示される組織ならびに／または表３の第２欄（組織分布）に開示される１、２、３、４、５もしくはそれより多くの組織を含む）に関連する障害を診断、予後、予防、および／または処置するために使用され得る。
【０３６７】
多数の障害について、「標準」のＥＣＭ遺伝子発現レベル、すなわち、この障害を有さない個体由来の組織または体液中のＥＣＭ発現レベルと比較して実質的に変更された（増大または減少した）レベルのＥＣＭ遺伝子発現が、このような障害を有する個体から得た組織、細胞または体液（例えば、血清、血漿、尿、精液、滑液または髄液）中で検出され得る。従って、本発明は、障害の診断中に有用な診断方法を提供し、この方法は、個体由来の組織、細胞または体液中でのＥＣＭポリペプチドをコードする遺伝子の発現レベルを測定する工程、および測定した遺伝子発現レベルを標準のＥＣＭ遺伝子発現レベルと比較する工程を包含し、それにより、標準と比較した遺伝子発現レベルの増加または減少が、ＥＣＭ障害の指標である。これらの診断アッセイは、例えば、血液サンプル、生検組織、または剖検組織などについて、インビボまたはインビトロで実施され得る。
【０３６８】
本発明はまた、予後指標として有用であり、これによりＥＣＭ遺伝子発現の上昇または低下を示す患者は、標準レベルにより近いレベルでこの遺伝子を発現する患者と比較して悪い臨床結果を経験する。
【０３６９】
「ＥＣＭポリペプチドをコードする遺伝子の発現レベルをアッセイする」とは、第一の生物学的サンプル中のＥＣＭポリペプチドのレベルまたはＥＣＭポリペプチドをコードするｍＲＮＡのレベルを、直接的（例えば、絶対的なタンパク質レベルまたはｍＲＮＡレベルの決定または評価によって）または相対的（例えば、第二の生物学的サンプル中のＥＣＭのポリペプチドレベルまたはｍＲＮＡレベルに対する比較によって）のいずれかで、定性的または定量的に測定または評価することを意図する。好ましくは、第一の生物学的サンプル中のＥＣＭポリペプチド発現レベルまたはｍＲＮＡレベルは測定または評価され、そしてＥＣＭの標準のポリペプチドレベルまたはｍＲＮＡレベルに対して比較され、この標準は、この障害を有さない個体から得た第二の生物学的サンプルから得られるか、またはこの障害を有さない個体集団からのレベルを平均して決定される。当該分野で理解されるように、一旦、ＥＣＭの標準のポリペプチドレベルまたはｍＲＮＡレベルが判明すると、これは、比較のための標準として繰り返し使用され得る。
【０３７０】
「生物学的サンプル」とは、ＥＣＭのポリペプチド（その一部を含む）またはｍＲＮＡを含有する、個体、細胞株、組織培養物、またはその他の供給源から得られた、任意の生物学的サンプルを意図する。示されるように、生物学的サンプルとしては、ＥＣＭポリペプチドの全長またはそのフラグメントを発現することが見出された体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、および髄液）および組織供給源が挙げられる。哺乳動物から組織生検および体液を得る方法は、当該分野で周知である。生物学的サンプルが、ｍＲＮＡを含む場合、組織生検が好ましい供給源である。
【０３７１】
全細胞ＲＮＡは、ＣｈｏｍｃｚｙｎｓｋｉおよびＳａｃｃｈｉ（Ａｎａｌ．Ｂｉｏｃｈｅｍ．１６２：１５６−１５９（１９８７））により記載される一段階グアニジニウム−チオシアネート−フェノール−クロロホルム法のような任意の適切な技術を用いて生物学的サンプルから単離され得る。次いで、ＥＣＭポリペプチドをコードするｍＲＮＡのレベルが、任意の適切な方法を用いてアッセイされる。これらは、ノーザンブロット分析、Ｓ１ヌクレアーゼマッピング、ポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）、ポリメラーゼ連鎖反応と組み合わせた逆転写（ＲＴ−ＰＣＲ）、およびリガーゼ連鎖反応と組み合わせた逆転写（ＲＴ−ＬＣＲ）を包含する。
【０３７２】
本発明はまた、ポリペプチドの正常なレベルおよび異常なレベルの決定を含む、生物学的サンプル（例えば、細胞および組織）中のＥＣＭポリペプチドのレベルを検出するための定量アッセイおよび診断アッセイのような診断アッセイに関する。従って、例えば、正常なコントロール組織サンプルと比較した、ＥＣＭポリペプチドの過剰発現を検出するための本発明に従う診断アッセイは、腫瘍の存在を検出するために使用され得る。宿主由来のサンプルにおいて、本発明のＥＣＭポリペプチドのようなポリペプチドのレベルを決定するために使用され得るアッセイ技術は、当業者に周知である。このようなアッセイ方法としては、ラジオイムノアッセイ、競合結合アッセイ、ウエスタンブロット分析、およびＥＬＩＳＡアッセイが挙げられる。生物学的サンプルにおけるＥＣＭポリペプチドレベルのアッセイは、任意の当該分野で公知の方法を用いて行われ得る。
【０３７３】
生物学的サンプル中のＥＣＭポリペプチドレベルをアッセイすることは、抗体に基づく技術を用いて行われ得る。例えば、組織におけるＥＣＭポリペプチド発現は、古典的な免疫組織学的方法（Ｊａｌｋａｎｅｎら、Ｊ．Ｃｅｌｌ．Ｂｉｏｌ．１０１：９７６−９８５（１９８５）；Ｊａｌｋａｎｅｎ、Ｍ．ら、Ｊ．Ｃｅｌｌ．Ｂｉｏｌ．１０５：３０８７−３０９６（１９８７））を用いて研究され得る。ＥＣＭポリペプチド遺伝子発現を検出するために有用な他の抗体に基づく方法は、イムノアッセイ（例えば、酵素結合イムノソルベント検定法（ＥＬＩＳＡ）およびラジオイムノアッセイ（ＲＩＡ））を包含する。適切な抗体アッセイ標識は、当該分野で公知であり、そして酵素標識（例えば、グルコースオキシダーゼ）および放射性同位元素（例えば、ヨウ素（１２５Ｉ、１２１Ｉ）、炭素（１４Ｃ）、硫黄（３５Ｓ）、トリチウム（３Ｈ）、インジウム（１１２Ｉｎ）、およびテクネチウム（９９ｍＴｃ）および蛍光標識（例えば、フルオレセインおよびローダミン）、ならびにビオチンを包含する。
【０３７４】
分析されるべき組織または細胞型としては、一般的には、ＥＣＭ遺伝子を発現することが公知であるか、またはそのことが疑われる組織または細胞型（例えば、癌など）が挙げられる。本明細書中で使用されるタンパク質単離方法は、例えば、ＨａｒｌｏｗおよびＬａｎｅ（Ｈａｒｌｏｗ，Ｅ．およびＬａｎｅ，Ｄ．，１９８８、「Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ：Ａ　Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ　Ｍａｎｕａｌ」、Ｃｏｌｄ　Ｓｐｒｉｎｇ　Ｈａｒｂｏｒ　Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ　Ｐｒｅｓｓ，Ｃｏｌｄ　Ｓｐｒｉｎｇ　Ｈａｒｂｏｒ，Ｎｅｗ　Ｙｏｒｋ（これは、その全体が本明細書中で参考として援用される））に記載される方法であり得る。単離された細胞は、細胞培養物または患者由来であり得る。培養物から採取された細胞の分析は、細胞ベースの遺伝子治療技術の一部として、あるいはＥＣＭ遺伝子の発現に対する化合物の効果を試験するために使用され得る細胞の評価において必須の工程であり得る。
【０３７５】
例えば、抗体または抗体のフラグメント（例えば、本明細書中に記載されるもの）を使用して、ＥＣＭ遺伝子産物またはその保存された改変体もしくはペプチドフラグメントの存在を定量的にまたは定性的に検出し得る。これは、例えば、光学顕微鏡検出、フローサイトメトリー検出、または蛍光定量検出と組み合わせた、蛍光標識抗体を使用する免疫蛍光技術によって達成され得る。
【０３７６】
好ましい実施形態において、ＥＣＭポリペプチドの推定エピトープドメインのいずれか１つもしくは全てに対する抗体または抗体フラグメントは、ＥＣＭ遺伝子産物、またはその保存された改変体もしくはペプチドフラグメントの存在を定量的にまたは定性的に検出するために用いられ得る。これは、例えば、光学顕微鏡検出、フローサイトメトリー検出、または蛍光定量検出と組み合わせた、蛍光標識抗体を使用する免疫蛍光技術によって達成され得る。
【０３７７】
さらに好ましい実施形態において、ＥＣＭポリペプチドのコンホメーションエピトープに対する抗体または抗体フラグメントは、ＥＣＭ遺伝子産物、またはその保存された改変体もしくはペプチドフラグメントの存在を定量的にまたは定性的に検出するために用いられ得る。これは、例えば、光学顕微鏡検出、フローサイトメトリー検出、または蛍光定量検出と組み合わせた、蛍光標識した抗体を使用する免疫蛍光技術によって達成され得る。
【０３７８】
本発明の抗体（またはそのフラグメント）、および／または本発明のＥＣＭポリペプチドは、ＥＣＭ遺伝子産物またはその保存された改変体もしくはそのペプチドフラグメントのインサイチュ検出のために、免疫蛍光、免疫電子顕微鏡または非免疫学的アッセイとしてさらに組織学的に使用され得る。インサイチュ検出は、患者から組織学的標本を取り出すこと、および本発明の標識した抗体またはＥＣＭポリペプチドをそれに適用することによって達成され得る。抗体（またはそのフラグメント）またはＥＣＭポリペプチドは、好ましくは、生物学的サンプル上に標識抗体（またはフラグメント）を重層することによって適用される。このような手順の使用を通して、ＥＣＭ遺伝子産物、または保存された改変体もしくはペプチドフラグメント、あるいはＥＣＭポリペプチド結合の存在だけでなく、調べた組織におけるその分布も決定することが可能である。本発明を使用して、当業者は、広範な種々の組織学的方法のいずれも（例えば、染色手順）が、このようなインサイチュ検出を達成するために改変され得ることを容易に理解する。
【０３７９】
ＥＣＭ遺伝子産物またはその保存された改変体もしくはペプチドフラグメントについてのイムノアッセイおよび非イムノアッセイは、代表的に、ＥＣＭ遺伝子産物またはその保存された改変体もしくはペプチドフラグメントを結合し得る検出可能に標識された抗体の存在下で、サンプル（例えば、生物学的液体、組織抽出物、新鮮に収集された細胞、または細胞培養においてインキュベートされた細胞の溶解物）をインキュベートする工程、ならびに当該分野で周知の多数の技術のいずれかによって結合した抗体を検出する工程を包含する。
【０３８０】
生物学的サンプルは、固相支持体またはキャリア（例えば、ニトロセルロース）あるいは細胞、細胞粒子もしくは可溶性タンパク質を固定し得る他の固体支持体と接触させられてそこに固定され得る。次いで、この支持体を、適切な緩衝液で洗浄し得、続いて、検出可能に標識された抗ＥＣＭポリペプチド抗体または検出可能なＥＣＭポリペプチドで処理し得る。この固相支持体を、次いで、緩衝液で２回洗浄して、未結合の抗体またはポリペプチドを除去し得る。必要に応じて、この抗体は、その後標識される。次いで、固体支持体上の結合した標識の量は、従来の手段によって検出され得る。
【０３８１】
「固相支持体またはキャリア」とは、抗原または抗体を結合し得る任意の支持体を意図する。周知の支持体またはキャリアとしては、ガラス、ポリスチレン、ポリプロピレン、ポリエチレン、デキストラン、ナイロン、アミラーゼ、天然のおよび改変したセルロース、ポリアクリルアミド、斑糲岩、および磁鉄鉱が挙げられる。キャリアの性質は、本発明の目的のためにある程度可溶性であるかまたは不溶性のいずれかであり得る。支持体材料は、結合した分子が、抗原または抗体に結合し得る限り、実質的に任意の可能な構造的形状を有し得る。従って、支持体の形状は、ビーズにおいてのように球状、あるいは試験管の内表面またはロッドの外表面においてのように円筒形であり得る。あるいは、表面は、平面（例えば、シート、試験ストリップなど）であり得る。好ましい支持体は、ポリスチレンビーズを含む。当業者には、抗体または抗原を結合するための多くの他の適切なキャリアが公知であるか、または当業者は慣用的な実験の使用によって適切なキャリアを確認することができる。
【０３８２】
抗ＥＣＭポリペプチド抗体またはＥＣＭ抗原ポリペプチドの所定のロットの結合活性は、周知の方法に従って決定され得る。当業者は、慣用的な実験を使用することによって各々の決定のための有効かつ最適のアッセイ条件を決定し得る。
【０３８３】
個体から得られた生物学的サンプルにおいてＥＣＭのポリペプチドレベルまたはポリヌクレオチドレベルをアッセイすることに加えて、ＥＣＭのポリペプチドまたはポリヌクレオチドは、画像化によってインビボでも検出され得る。例えば、本発明の１つの実施形態において、ＥＣＭのポリペプチドおよび／または抗ＥＣＭ抗原抗体は、罹病細胞（例えば、新生物）を画像化するために使用される。別の実施形態において、本発明のＥＣＭのポリヌクレオチド（例えば、特定のＥＣＭ　ｍＲＮＡ転写物の、全体または一部分に相補的なポリヌクレオチド）ならびに／あるいは抗ＥＣＭ抗体（例えば、本発明のＥＣＭポリペプチドのエピトープのいずれか１つまたはそれらの組み合わせに対する抗体、本発明のＥＣＭポリペプチドのコンホメーションエピトープに対する抗体、または哺乳動物細胞の細胞表面上で発現された全長ポリペプチドに対する抗体）は、罹病細胞または新生物細胞を画像化するために使用される。
【０３８４】
ＥＣＭポリペプチドをインビボで画像化するための抗体標識またはマーカーとしては、Ｘ線撮影、ＮＭＲ、ＭＲＩ、ＣＡＴスキャンもしくはＥＳＲにより検出可能なものが挙げられる。Ｘ線撮影のために、適切な標識としては、検出可能な放射線を放射するが被験体に対して明らかには有害でない、放射線同位元素（例えば、バリウムまたはセシウム）が挙げられる。ＮＭＲおよびＥＳＲのための適切なマーカーとしては、検出可能な特徴的なスピンを有するマーカー（例えば、重水素）が挙げられ、これらは、関連のハイブリドーマのための栄養素の標識化により抗体に取り込まれ得る。インビボ画像化がヒトにおける診断のためにＥＣＭポリペプチドの増強されたレベルを検出するために使用される場合、ヒト抗体または「ヒト化」キメラモノクローナル抗体を使用することが好適であり得る。そのような抗体は、本明細書中に記載されるかさもなくば当該分野で公知の技術を用いて産生され得る。例えば、キメラ抗体を産生するための方法は、当該分野で公知である。総説については、Ｍｏｒｒｉｓｏｎ，Ｓｃｉｅｎｃｅ　２２９：１２０２（１９８５）；Ｏｉら、ＢｉｏＴｅｃｈｎｉｑｕｅｓ　４：２１４（１９８６）；Ｃａｂｉｌｌｙら、米国特許第４，８１６，５６７号；Ｔａｎｉｇｕｃｈｉら、ＥＰ　１７１４９６；Ｍｏｒｒｉｓｏｎら、ＥＰ　１７３４９４；Ｎｅｕｂｅｒｇｅｒら、ＷＯ　８６０１５３３；Ｒｏｂｉｎｓｏｎら、ＷＯ　８７０２６７１；Ｂｏｕｌｉａｎｎｅら、Ｎａｔｕｒｅ　３１２：６４３（１９８４）；Ｎｅｕｂｅｒｇｅｒら、Ｎａｔｕｒｅ　３１４：２６８（１９８５）を参照のこと。
【０３８５】
さらに、存在が検出され得る任意のＥＣＭポリペプチドが、投与され得る。例えば、放射性不透過性（ｒａｄｉｏ−ｏｐａｑｕｅ）化合物または他の適切な化合物で標識されたＥＣＭポリペプチドは、投与され、標識抗体に関して上記に記載されるようにインビボで可視化され得る。さらにこのようなＥＣＭポリペプチドは、インビトロ診断手順のために利用され得る。
【０３８６】
適切な検出可能な画像化部分（例えば、放射性同位元素（例えば、１３１Ｉ、１１２Ｉｎ、９９ｍＴｃ）、放射線不透過性物質、または核磁気共鳴により検出可能な材料）で標識されたＥＣＭポリペプチド特異的抗体または抗体フラグメントが、障害について試験される哺乳動物に（例えば、非経口で、皮下で、もしくは腹腔内で）導入される。使用される被験体の大きさおよび画像化システムが、診断画像を生じるのに必要とされる画像化部分の量を決定することは、当該分野で理解される。放射線同位元素部分の場合、ヒト被験体については、注入される放射能の量は、通常、約５〜２０ミリキュリーの９９ｍＴｃの範囲である。標識された抗体または抗体フラグメントは、次いで、ＥＣＭタンパク質を含む細胞の位置に優先的に蓄積する。インビボ腫瘍画像化は、Ｓ．Ｗ．Ｂｕｒｃｈｉｅｌら、「Ｉｍｍｕｎｏｐｈａｒｍａｃｏｋｉｎｅｔｉｃｓ　ｏｆ　Ｒａｄｉｏｌａｂｅｌｅｄ　Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ　ａｎｄ　Ｔｈｅｉｒ　Ｆｒａｇｍｅｎｔｓ」に記載される（Ｔｕｍｏｒ　Ｉｍａｇｉｎｇ：Ｔｈｅ　Ｒａｄｉｏｃｈｅｍｉｃａｌ　Ｄｅｔｅｃｔｉｏｎ　ｏｆ　Ｃａｎｃｅｒ、Ｓ．Ｗ．ＢｕｒｃｈｉｅｌおよびＢ．Ａ．Ｒｈｏｄｅｓ編、Ｍａｓｓｏｎ　Ｐｕｂｌｉｓｈｉｎｇ　Ｉｎｃ．（１９８２）の１３章）。
【０３８７】
抗体に関して、抗ＥＣＭポリペプチド抗体が検出可能に標識され得る方法の１つは、これらをレポーター酵素へ連結し、そしてこの連結された産物を酵素免疫アッセイ（ＥＩＡ）に用いることによる（Ｖｏｌｌｅｒ，Ａ．、「Ｔｈｅ　Ｅｎｚｙｍｅ　Ｌｉｎｋｅｄ　Ｉｍｍｕｎｏｓｏｒｂｅｎｔ　Ａｓｓａｙ（ＥＬＩＳＡ）」、１９７８、Ｄｉａｇｎｏｓｔｉｃ　Ｈｏｒｉｚｏｎｓ　２：１−７、Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌｏｇｉｃａｌ　Ａｓｓｏｃｉａｔｅｓ　Ｑｕａｒｔｅｒｌｙ　Ｐｕｂｌｉｃａｔｉｏｎ、Ｗａｌｋｅｒｓｖｉｌｌｅ、ＭＤ）；Ｖｏｌｌｅｒら、Ｊ．Ｃｌｉｎ．Ｐａｔｈｏｌ．３１：５０７−５２０（１９７８）；Ｂｕｔｌｅｒ，Ｊ．Ｅ．、Ｍｅｔｈ．Ｅｎｚｙｍｏｌ．７３：４８２−５２３（１９８１）；Ｍａｇｇｉｏ，Ｅ．（編）１９８０、Ｅｎｚｙｍｅ　Ｉｍｍｕｎｏａｓｓａｙ、ＣＲＣ　Ｐｒｅｓｓ、Ｂｏｃａ　Ｒａｔｏｎ、ＦＬ；Ｉｓｈｉｋａｗａ，Ｅ．ら（編）１９８１、Ｅｎｚｙｍｅ　Ｉｍｍｕｎｏａｓｓａｙ、Ｋｇａｋｕ　Ｓｈｏｉｎ、Ｔｏｋｙｏ）。抗体に結合したレポーター酵素は、適切な基質（好ましくは色素形成基質）と、例えば、分光光度手段、蛍光定量手段または可視手段によって検出され得る化学部分を生成するような様式で反応する。抗体を検出可能に標識するために使用され得るレポーター酵素としては、リンゴ酸デヒドロゲナーゼ、ブドウ球菌ヌクレアーゼ、δ−５−ステロイドイソメラーゼ、酵母アルコールデヒドロゲナーゼ、α−グリセロリン酸デヒドロゲナーゼ、トリオースリン酸イソメラーゼ、西洋ワサビペルオキシダーゼ、アルカリホスファターゼ、アスパラギナーゼ、グルコースオキシダーゼ、β−ガラクトシダーゼ、リボヌクレアーゼ、ウレアーゼ、カタラーゼ、グルコース−６−リン酸デヒドロゲナーゼ、グルコアミラーゼおよびアセチルコリンエステラーゼが挙げられるが、これらに限定されない。さらに、この検出は、このレポーター酵素に対する色素形成基質を用いる比色方法によって達成され得る。検出はまた、同様に調製された標準物質と比較して、基質の酵素反応の程度を視覚的に比較することによって達成され得る。
【０３８８】
検出はまた、種々の他のイムノアッセイのいずれかを用いて達成され得る。例えば、抗体または抗体フラグメントを放射性標識することによって、ラジオイムノアッセイ（ＲＩＡ）の使用を介してＥＣＭポリペプチドを検出することが可能である（例えば、Ｗｅｉｎｔｒａｕｂ，Ｂ．，Ｐｒｉｎｃｉｐｌｅｓ　ｏｆ　Ｒａｄｉｏｉｍｍｕｎｏａｓｓａｙｓ，Ｓｅｖｅｎｔｈ　Ｔｒａｉｎｉｎｇ　Ｃｏｕｒｓｅ　ｏｎ　Ｒａｄｉｏｌｉｇａｎｄ　Ａｓｓａｙ　Ｔｅｃｈｎｉｑｕｅｓ，Ｔｈｅ　Ｅｎｄｏｃｒｉｎｅ　Ｓｏｃｉｅｔｙ，１９８６年３月を参照のこと（これは、本明細書中に参考として援用される））。放射性同位元素は、γカウンター、シンチレーションカウンター、またはオードラジオグラフィーを含むが、これらに限定されない手段によって検出され得る。
【０３８９】
抗体を蛍光化合物で標識することもまた可能である。蛍光標識された抗体が適切な波長の光に曝露される場合、次いでその存在は、蛍光に起因して検出され得る。最も一般的に使用される蛍光標識化合物のなかでも、フルオレセインイソチオシアネート、ローダミン、フィコエリトリン、フィコシアニン、アロフィコシアニン、ｏ−フタルアルデヒド（ｏｐｈｔｈａｌｄｅｈｙｄｅ）およびフルオレサミンがある。
【０３９０】
抗体はまた、１５２Ｅｕまたはランタニド系列の他の金属のような蛍光発光金属を用いて検出可能に標識され得る。これらの金属は、ジエチレントリアミン五酢酸（ＤＴＰＡ）またはエチレンジアミン四酢酸（ＥＤＴＡ）のような金属キレート群を用いて抗体に結合され得る。
【０３９１】
抗体はまた、化学発光化合物に結合することによって検出可能に標識され得る。次いで、化学発光タグ化抗体の存在は、化学反応の過程の間に生じる発光の存在を検出することによって決定される。特に有用な化学発光標識化合物の例は、ルミノール、イソルミノール、セロマティックアクリジニウムエステル（ｔｈｅｒｏｍａｔｉｃ　ａｃｒｉｄｉｎｉｕｍ　ｅｓｔｅｒ）、イミダゾール、アクリジニウム塩およびオキサレートエステルである。
【０３９２】
同様に、生物発光化合物を使用して、本発明の抗体を標識し得る。生物発光は、触媒タンパク質が化学発光反応の効率を上昇させる、生物系において見出される化学発光の型である。生物発光タンパク質の存在は、発光の存在を検出することによって決定される。標識目的のための重要な生物発光化合物は、ルシフェリン、ルシフェラーゼおよびエクオリンである。
【０３９３】
（疾患を検出するための方法）
概して、疾患は、患者から得られた生物学的サンプル（例えば、血液、血清、尿、および／または腫瘍生検）中の１つ以上の本発明のＥＣＭタンパク質および／またはこのようなタンパク質をコードするポリヌクレオチドの存在に基づき、患者において検出され得る。言い換えれば、このようなタンパク質は、疾患または障害（癌および／または本明細書の他の箇所に記載のものを含む）の存在または非存在を示すマーカーとして用いられ得る。さらに、このようなタンパク質は、他の疾患および癌の検出に有用であり得る。本明細書に提供される結合剤は、概して生物学的サンプル中でこの薬剤に結合する抗原のレベルの検出を可能にする。ポリヌクレオチドプライマーおよびプローブは、ＥＣＭポリペプチドをコードするｍＲＮＡ（これはまた、癌を含む疾患または障害の存在または非存在の指標である）のレベルを検出するために用いられ得る。一般に、ＥＣＭポリペプチドは、罹病組織で正常組織よりも少なくとも３倍高いレベルで存在するはずである。
【０３９４】
サンプル中でポリペプチドマーカーを検出するために結合剤を用いるための当業者に公知の種々のアッセイ形式が存在する。例えば、ＨａｒｌｏｗおよびＬａｎｅ（前出）を参照のこと。概して、患者における疾患の存在または非存在は、以下（ａ）患者から得た生物学的サンプルを結合剤と接触させる工程；（ｂ）この結合剤に結合するポリペプチドのレベルをサンプル中で検出する工程；および（ｃ）ポリペプチドのレベルを事前に決定したカットオフ値と比較する工程、により決定され得る。
【０３９５】
好ましい実施形態において、このアッセイは、本発明のＥＣＭポリペプチドに結合し、そしてそれをサンプルの残りの部分から取り出すための、固体支持体上に固定された結合剤の使用を含む。次いでこの結合されたポリペプチドは、レポーター基を含んで結合剤／ポリペプチド複合体に特異的に結合する検出試薬を用いて検出され得る。このような検出試薬は、例えば、このポリペプチドに特異的に結合する結合剤、またはこの結合剤に特異的に結合する抗体もしくは他の薬剤（例えば、抗免疫グロブリン、プロテインＧ、プロテインＡまたはレクチン）を含み得る。あるいは、競合アッセイが利用され得、ここでは、ポリペプチドがレポーター基で標識されており、そして結合剤とサンプルとのインキュベーションの後に、固定された結合剤へと結合される。サンプルの成分が結合剤に対する標識ポリペプチドの結合を阻害する程度は、サンプルと固定された結合剤との反応性の指標である。このようなアッセイでの使用に適切なポリペプチドとしては、上記のように、ＥＣＭポリペプチドおよびその一部分、または抗体（ここに結合剤が結合する）が挙げられる。
【０３９６】
固体支持体は、本発明のＥＣＭポリペプチドが結合し得る、当業者に公知の任意の物質であり得る。例えば、固体支持体は、マイクロタイタープレートにおける試験ウェル、またはニトロセルロースメンブレンまたは他の適切なメンブレンであり得る。あるいは、この支持体は、ビースまたはディスク（例えば、ガラスファイバーガラス）、ラテックスまたはプラスチック材料（例えばポリスチレンまたはポリ塩化ビニル）であり得る。この支持体はまた、例えば、米国特許第５，３５９，６８１号に開示されるもののような、磁気粒子または光ファイバーセンサーであり得る。結合剤は、当業者に公知の種々の技術を用いて、固体支持体に固定され得る。これは、特許および科学文献に十分に記載されている。本発明の文脈では、用語「固定（ｉｍｍｏｂｉｌｉｚａｔｉｏｎ）」とは、非共有結合的会合（例えば、吸着）および共有結合（支持体上の薬剤と官能基との間の直接連結であり得るか、または架橋剤による連結であり得る）の両方をいう。マイクロタイタープレート中のウェルへの、またはメンブレンへの吸着による固定が好ましい。このような場合、吸着は、適切な緩衝液中での、結合剤と固体支持体との、適切な時間にわたる接触によって達成され得る。接触時間は温度で変化するが、代表的には、約１時間と約１日との間である。一般に、プラスチックのマイクロタイタープレート（例えば、ポリスチレンまたはポリ塩化ビニル）のウェルと、約１０ｎｇ〜約１０μｇ、そして好ましくは約１００ｎｇ〜約１μｇの範囲にわたる量の結合剤との接触は、適切な量の結合剤を固定するのに十分である。
【０３９７】
固体支持体に対する結合剤の共有結合は、一般にこの支持体と二官能性試薬（支持体および結合剤上の官能基（例えば、ヒドロキシル基またはアミノ基）の両方と反応する）とを最初に反応させることによって達成され得る。例えば、この結合剤は、ベンゾキノンを用いて、または支持体上のアルデヒド基と結合パートナー上のアミンおよび活性水素との縮合により、適切なポリマーコーティングを有する支持体に共有結合され得る（例えば、Ｐｉｅｒｃｅ　Ｉｍｍｕｎｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ　Ｃａｔａｌｏｇ　ａｎｄ　Ｈａｎｄｂｏｏｋ、１９９１　Ａ１２〜Ａ１３を参照のこと）。
【０３９８】
（遺伝子治療方法）
本発明の別の局面は、障害、疾患および状態を処置または予防するための遺伝子治療方法である。この遺伝子治療方法は、本発明のポリペプチドの発現を達成するための、核酸（ＤＮＡ、ＲＮＡおよびアンチセンスＤＮＡまたはＲＮＡ）配列の動物への導入に関する。この方法は、標的組織によるこのポリペプチドの発現のために必要なプロモーターおよび他の任意の遺伝エレメントと、作動可能に連結した本発明のポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを必要とする。このような遺伝子治療および送達技術は当該分野において公知である（例えば、本明細書中に参考として援用される、ＷＯ９０／１１０９２を参照のこと）。
【０３９９】
従って、例えば、患者由来の細胞は、エキソビボで本発明のポリヌクレオチドと作動可能に連結したプロモーターを含むポリヌクレオチド（ＤＮＡまたはＲＮＡ）を用いて操作され得、次いで、操作された細胞は、本発明のポリペプチドを用いて処置されるべき患者に提供される。このような方法は、当該分野において周知である。例えば、Ｂｅｌｌｄｅｇｒｕｎ，Ａ．ら、Ｊ．Ｎａｔｌ．Ｃａｎｃｅｒ　Ｉｎｓｔ．８５：２０７−２１６（１９９３）；Ｆｅｒｒａｎｔｉｎｉ，Ｍ．ら、Ｃａｎｃｅｒ　Ｒｅｓｅａｒｃｈ　５３：１１０７−１１１２（１９９３）；Ｆｅｒｒａｎｔｉｎｉ，Ｍ．ら、Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ　１５３：４６０４−４６１５（１９９４）；Ｋａｉｄｏ，Ｔ．ら、Ｉｎｔ．Ｊ．Ｃａｎｃｅｒ　６０：２２１−２２９（１９９５）；Ｏｇｕｒａ，Ｈ．ら、Ｃａｎｃｅｒ　Ｒｅｓｅａｒｃｈ　５０：５１０２−５１０６（１９９０）；Ｓａｎｔｏｄｏｎａｔｏ，Ｌ．ら、Ｈｕｍａｎ　Ｇｅｎｅ　Ｔｈｅｒａｐｙ　７：１−１０（１９９６）；Ｓａｎｔｏｄｏｎａｔｏ，Ｌ．ら、Ｇｅｎｅ　Ｔｈｅｒａｐｙ　４：１２４６−１２５５（１９９７）；およびＺｈａｎｇ，Ｊ．−Ｆ．ら、Ｃａｎｃｅｒ　Ｇｅｎｅ　Ｔｈｅｒａｐｙ　３：３１−３８（１９９６）を参照のこと。これらは、本明細書中に参考として援用される。１つの実施形態においては、操作される細胞は、動脈細胞である。この動脈細胞は、動脈、動脈の周囲の組織への直接的な注射を介して、またはカテーテル注入を介して患者に再導入され得る。
【０４００】
以下により詳細に考察されるように、このポリヌクレオチド構築物は、注射可能な物質を動物の細胞に送達する任意の方法（例えば、組織（心臓、筋肉、皮膚、肺、肝臓など）の間質空間への注射）により送達され得る。このポリヌクレオチド構築物は、薬学的に受容可能な液体または水性のキャリア中で送達され得る。
【０４０１】
１つの実施形態においては、本発明のポリヌクレオチドは、裸のポリヌクレオチドとして送達される。用語「裸の」ポリヌクレオチド、ＤＮＡまたはＲＮＡとは、細胞への侵入を補助し、促進し、または容易にするために作用するいかなる送達ビヒクル（ウイルス配列、ウイルス粒子、リポソーム処方物、リポフェクチンまたは沈殿剤などを含む）も含まない配列をいう。しかし、本発明のポリヌクレオチドはまた、当業者に周知の方法により調製され得るリポソーム処方物中およびリポフェクチン処方物中などで送達され得る。このような方法は、例えば、米国特許第５，５９３，９７２号、同第５，５８９，４６６号および同第５，５８０，８５９号（これらは、本明細書中に参考として援用される）に記載される。
【０４０２】
遺伝子治療方法において使用されるポリヌクレオチドベクター構築物は、好ましくは、宿主ゲノム中に組み込まれないかまたは複製を可能にする配列を含まない構築物である。適切なベクターとしては、Ｓｔｒａｔａｇｅｎｅから入手可能なｐＷＬＮＥＯ、ｐＳＶ２ＣＡＴ、ｐＯＧ４４、ｐＸＴ１およびｐＳＧ；Ｐｈａｒｍａｃｉａから入手可能なｐＳＶＫ３、ｐＢＰＶ、ｐＭＳＧおよびｐＳＶＬ；ならびにＩｎｖｉｔｒｏｇｅｎから入手可能なｐＥＦ１／Ｖ５、ｐｃＤＮＡ３．１、およびｐＲｃ／ＣＭＶ２が挙げられる。他の適切なベクターは、当業者に容易に明らかである。
【０４０３】
当業者に公知の任意の強力なプロモーターは、ポリヌクレオチド配列の発現を駆動するために用いられ得る。適切なプロモーターとしては、アデノウイルスプロモーター（例えば、アデノウイルス主要後期プロモーター）；または異種プロモーター（例えば、サイトメガロウイルス（ＣＭＶ）プロモーター）；ＲＳウイルス（ＲＳＶ）プロモーター；誘導性プロモーター（例えば、ＭＭＴプロモーター、メタロチオネインプロモーター）；熱ショックプロモーター；アルブミンプロモーター；ＡｐｏＡＩプロモーター；ヒトグロビンプロモーター；ウイルスチミジンキナーゼプロモーター（例えば、単純ヘルペスチミジンキナーゼプロモーター）；レトロウイルスＬＴＲ；ｂ−アクチンプロモーター；およびヒト成長ホルモンプロモーターが挙げられる。このプロモーターはまた、本発明のポリヌクレオチドについてネイティブなプロモーターであり得る。
【０４０４】
他の遺伝子治療技術とは異なり、裸の核酸配列を標的細胞に導入する１つの主要な利点は、その細胞におけるポリヌクレオチド合成の一過性の性質である。研究によって、非複製ＤＮＡ配列が細胞に導入されて、６ヶ月までの期間の間、所望のポリペプチドの産生を提供し得ることが示された。
【０４０５】
ポリヌクレオチド構築物は、動物内の組織（筋肉、皮膚、脳、肺、肝臓、脾臓、骨髄、胸腺、心臓、リンパ、血液、骨、軟骨、膵臓、腎臓、胆嚢、胃、腸、精巣、卵巣、子宮、直腸、神経系、眼、腺、および結合組織を包含する）の間隙空間に送達され得る。これらの組織の間隙空間は、細胞間液、器官組織の細網線維間のムコ多糖マトリクス、血管または室の壁における弾性線維、線維性組織のコラーゲン線維、あるいは筋肉細胞を囲む結合組織内の同じマトリクスまたは骨の裂孔中の結合組織内の同じマトリクスを包含する。これは、同様に、循環の血漿およびリンパチャンネルのリンパ液により占められた空間である。筋肉組織の間隙空間への送達は、以下で議論される理由のために好ましい。ポリヌクレオチド構築物は、これらの細胞を含む組織への注射によって、好都合に送達され得る。ポリヌクレオチド構築物は好ましくは、分化した持続性の非分裂細胞に送達され、そしてその細胞において発現されるが、送達および発現は、非分化細胞または完全には分化していない細胞（例えば、血液の幹細胞または皮膚線維芽細胞）において達成され得る。インビボでの筋肉細胞は、ポリヌクレオチドを取り込み、そして発現する能力において、特に適格である。
【０４０６】
裸の核酸配列注射のために、ＤＮＡまたはＲＮＡの有効投薬量は、約０．０５ｍｇ／ｋｇ体重から約５０ｍｇ／ｋｇ体重の範囲にある。好ましくは、この投薬量は、約０．００５ｍｇ／ｋｇから約２０ｍｇ／ｋｇであり、そしてより好ましくは約０．０５ｍｇ／ｋｇから約５ｍｇ／ｋｇである。もちろん、当業者が認識するように、この投薬量は、注射の組織部位に応じて変化する。核酸配列の適切かつ有効な投薬量は、当業者によって容易に決定され得、そして処置される状態および投与経路に依存し得る。
【０４０７】
好ましい投与経路は、組織の間隙空間への非経口注射経路による。しかし、他の非経口経路もまた用いられ得、これには、例えば、特に、肺または気管支の組織、咽喉または鼻の粘膜への送達のためのエアゾール処方物の吸入が挙げられる。さらに、裸のＤＮＡ構築物が、血管形成術の間にこの手順において用いられるカテーテルによって動脈に送達され得る。
【０４０８】
裸のポリヌクレオチドは、送達部位での直接の針注射、静脈内注射、局所投与、カテーテル注入、およびいわゆる「遺伝子銃」を含むがこれらに限定されない、当該分野で公知の任意の方法によって送達される。これらの送達方法は、当該分野で公知である。
【０４０９】
この構築物はまた、ウイルス配列、ウイルス粒子、リポソーム処方物、リポフェクチン、沈殿剤などのような送達ビヒクルを用いて送達され得る。このような送達方法は、当該分野で公知である。
【０４１０】
特定の実施形態において、ポリヌクレオチド構築物は、リポソーム調製物中で複合体化している。本発明にて使用するためのリポソーム調製物は、カチオン性（正に荷電した）、アニオン性（負に荷電した）および中性の調製物を包含する。しかしながら、カチオン性リポソームとポリアニオン性核酸との間で強固な電荷複合体を形成し得るので、カチオン性リポソームが特に好ましい。カチオン性リポソームは、機能的形態において、プラスミドＤＮＡ（本明細書中で参考として援用される、Ｆｅｌｇｎｅｒら、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ（１９８７）８４：７４１３〜７４１６）；ｍＲＮＡ（本明細書中で参考として援用される、Ｍａｌｏｎｅら、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ（１９８９）８６：６０７７〜６０８１）；および精製された転写因子（本明細書中で参考として援用される、Ｄｅｂｓら、Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．（１９９０）２６５：１０１８９〜１０１９２）の細胞内送達を媒介することが示されている。
【０４１１】
カチオン性リポソームは容易に入手可能である。例えば、Ｎ［１−２，３−ジオレイルオキシ）プロピル］−Ｎ，Ｎ，Ｎ−トリエチルアンモニウム（ＤＯＴＭＡ）リポソームは特に有用であり、そして商標ＬｉｐｏｆｅｃｔｉｎのもとにＧＩＢＣＯ　ＢＲＬ，Ｇｒａｎｄ　Ｉｓｌａｎｄ，Ｎ．Ｙ．より入手可能である（本明細書中で参考として援用される、Ｆｅｌｇｎｅｒら、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ（１９８７）８４：７４１３〜７４１６をもまた参照のこと）。他の市販のリポソームとしては、トランスフェクテース（ｔｒａｎｓｆｅｃｔａｃｅ）（ＤＤＡＢ／ＤＯＰＥ）およびＤＯＴＡＰ／ＤＯＰＥ（Ｂｏｅｈｒｉｎｇｅｒ）が挙げられる。
【０４１２】
当該分野で周知の技術を使用して、他のカチオン性リポソームを、容易に入手可能な物質から調製し得る。ＤＯＴＡＰ（１，２−ビス（オレオイルオキシ）−３−（トリメチルアンモニオ）プロパン）リポソームの合成の記述に関して、例えばＰＣＴ公開番号ＷＯ９０／１１０９２（本明細書中で参考として援用される）を参照のこと。ＤＯＴＭＡリポソームの調製は文献にて説明されており、例えば、本明細書中で参考として援用される、Ｐ．Ｆｅｌｇｎｅｒら、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ　８４：７４１３〜７４１７を参照のこと。類似した方法を使用して、他のカチオン性脂質物質からリポソームを調製し得る。
【０４１３】
同様に、アニオン性リポソームおよび中性リポソームは、例えば、Ａｖａｎｔｉ　Ｐｏｌａｒ　Ｌｉｐｉｄｓ（Ｂｉｒｍｉｎｇｈａｍ，Ａｌａ．）から容易に入手可能であり、または容易に入手可能な物質を使用して簡単に調製され得る。そのような物質としてはとりわけ、ホスファチジルコリン、コレステロール、ホスファチジルエタノールアミン、ジオレオイルホスファチジルコリン（ＤＯＰＣ）、ジオレオイルホスファチジルグリセロール（ＤＯＰＧ）、ジオレオイルホスファチジルエタノールアミン（ＤＯＰＥ）が挙げられる。これらの物質はまた、ＤＯＴＭＡ出発物資およびＤＯＴＡＰ出発物質と適切な割合において混合され得る。これらの物質を使用してリポソームを生成する方法は、当該分野で周知である。
【０４１４】
例えば、商業的に、ジオレオイルホスファチジルコリン（ＤＯＰＣ）、ジオレオイルホスファチジルグリセロール（ＤＯＰＧ）、およびジオレオイルホスファチジルエタノールアミン（ＤＯＰＥ）を種々の組み合わせにおいて使用し、コレステロールを添加してもしなくても、従来のリポソームを生成し得る。従って、例えば、超音波処理バイアル中への窒素ガス流下で、各５０ｍｇのＤＯＰＧおよびＤＯＰＣを乾燥することにより、ＤＯＰＧ／ＤＯＰＣ小胞を調製し得る。このサンプルを一晩真空ポンプ下に置き、そして次の日、脱イオン水で水和する。次いで、逆位カップ（浴タイプ）プローブを装備したＨｅａｔ　Ｓｙｓｔｅｍｓ　モデル３５０超音波処理器を、浴を１５ＥＣで循環させながら、最大設定にて使用して、このサンプルを栓をしたバイアル中にて２時間超音波処理する。あるいは、負に荷電した小胞を、超音波処理なしで調製して多重膜小胞を生成し得るか、または核孔膜（ｎｕｃｌｅｏｐｏｒｅ　ｍｅｍｂｒａｎｅ）を通して押し出すことにより別々の大きさの単膜小胞を生成し得る。他の方法は、当業者に公知でありそして利用可能である。
【０４１５】
このリポソームとしては、多重膜小胞（ＭＬＶ）、小さな単膜小胞（ＳＵＶ）または大きな単膜小胞（ＬＵＶ）が挙げられ得、ＳＵＶが好ましい。当該分野で周知の方法を使用して、種々のリポソーム−核酸複合体が調製される。例えば、本明細書中で参考として援用される、Ｓｔｒａｕｂｉｎｇｅｒら、Ｍｅｔｈｏｄｓ　ｏｆ　Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ（１９８３）、１０１：５１２〜５２７を参照のこと。例えば、核酸を含有するＭＬＶは、ガラスチューブの壁面にリン脂質の薄膜を堆積させ、そしてその後、カプセル化されるべき物質の溶液で水和することによって調製され得る。ＳＵＶはＭＬＶの長期超音波処理により調製され、単膜リポソームの均質集団を生成する。封入されるべき物質を、予め形成されたＭＬＶの懸濁液に添加し、次いで、超音波処理する。カチオン性脂質を含むリポソームを使用する場合、乾燥した脂質膜を、滅菌水または１０ｍＭ　Ｔｒｉｓ／ＮａＣｌのような等張性緩衝溶液のような適切な溶液中に再懸濁し、超音波処理し、次いで、予め形成されたリポソームをＤＮＡと直接混合する。正に荷電したリポソームのカチオン性ＤＮＡへの結合に起因して、リポソームおよびＤＮＡは非常に安定な複合体を形成する。ＳＵＶは、小さな核酸フラグメントについての用途を見出す。ＬＵＶは、当該分野で周知の多くの方法により調製される。一般に使用される方法としては、Ｃａ２＋−ＥＤＴＡキレート化（Ｐａｐａｈａｄｊｏｐｏｕｌｏｓら、Ｂｉｏｃｈｉｍ．Ｂｉｏｐｈｙｓ．Ａｃｔａ（１９７５）３９４：４８３；Ｗｉｌｓｏｎら、Ｃｅｌｌ（１９７９）１７：７７）；エーテル注入（Ｄｅａｍｅｒ，Ｄ．およびＢａｎｇｈａｍ，Ａ．、Ｂｉｏｃｈｉｍ．Ｂｉｏｐｈｙｓ．Ａｃｔａ（１９７６）４４３：６２９；Ｏｓｔｒｏら、Ｂｉｏｃｈｅｍ．Ｂｉｏｐｈｙｓ．Ｒｅｓ．Ｃｏｍｍｕｎ．（１９７７）７６：８３６；Ｆｒａｌｅｙら、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ（１９７９）７６：３３４８）；界面活性剤透析（Ｅｎｏｃｈ，Ｈ．およびＳｔｒｉｔｔｍａｔｔｅｒ，Ｐ．、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ（１９７９）７６：１４５）；および逆相エバポレーション（ＲＥＶ）（Ｆｒａｌｅｙら、Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．（１９８０）２５５：１０４３１；Ｓｚｏｋａ、Ｆ．およびＰａｐａｈａｄｊｏｐｏｕｌｏｓ，Ｄ．、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ（１９７８）７５：１４５；Ｓｃｈａｅｆｅｒ−Ｒｉｄｄｅｒら、Ｓｃｉｅｎｃｅ（１９８２）２１５：１６６）が挙げられ、これらの文献は本明細書中で参考として援用される。
【０４１６】
一般に、ＤＮＡのリポソームに対する割合は約１０：１から約１：１０までである。好ましくは、その割合（ｒａｔｉｏｎ）は約５：１から約１：５までである。より好ましくは、その割合は約３：１から約１：３までである。さらにより好ましくは、その割合は約１：１である。
【０４１７】
米国特許第５，６７６，９５４号（本明細書中で参考として援用される）はカチオン性リポソームキャリアと複合体化された遺伝物質のマウスへの注入について報告する。米国特許第４，８９７，３５５号、同第４，９４６，７８７号、同第５，０４９，３８６号、同第５，４５９，１２７号、同第５，５８９，４６６号、同第５，６９３，６２２号、同第５，５８０，８５９号、同第５，７０３，０５５号および国際公開第ＷＯ９４／９４６９号（これらは本明細書中で参考として援用される）は、ＤＮＡを細胞および哺乳動物にトランスフェクトする際に使用するためのカチオン性脂質を提供する。米国特許第５，５８９，４６６号、同第５，６９３，６２２号、同第５，５８０，８５９号、同第５，７０３，０５５号および国際公開第ＷＯ９４／９４６９号（これらは本明細書中で参考として援用される）は、ＤＮＡ−カチオン性脂質複合体を哺乳動物に送達する方法を提供する。
【０４１８】
特定の実施形態において、本発明のポリペプチドをコードする配列を含むＲＮＡを含むレトロウイルス粒子を使用して、エキソビボまたはインビボで細胞を操作する。レトロウイルスプラスミドベクターが由来し得るレトロウイルスとしては、モロニーマウス白血病ウイルス、脾臓壊死ウイルス、ラウス肉腫ウイルス、ハーベイ肉腫ウイルス、ニワトリ白血病ウイルス、テナガザル白血病ウイルス、ヒト免疫不全ウイルス、骨髄増殖性肉腫ウイルス、および乳癌ウイルスが挙げられるが、これらに限定されない。
【０４１９】
このレトロウイルスプラスミドベクターを使用して、パッケージング細胞株を形質導入し、プロデューサー細胞株を形成する。トランスフェクトされ得るパッケージング細胞株の例としては、その全体が本明細書中で参考として援用される、Ｍｉｌｌｅｒ、Ｈｕｍａｎ　Ｇｅｎｅ　Ｔｈｅａｐｙ、１：５〜１４（１９９０）にて記載されるようなＰＥ５０１、ＰＡ３１７、Ｒ−２、Ｒ−ＡＭ、ＰＡ１２、Ｔ１９−１４Ｘ、ＶＴ−１９−１７−Ｈ２、ＲＣＲＥ、ＲＣＲＩＰ、ＧＰ＋Ｅ−８６、ＧＰ＋ｅｎｖＡｍ１２およびＤＡＮ細胞株が挙げられるが、これらに限定されない。このベクターは、当該分野で公知の任意の手段により、パッケージング細胞を形質導入し得る。そのような手段としては、エレクトロポレーション、リポソームの使用、およびＣａＰＯ４沈殿が挙げられるが、それらに限定されない。１つの代替法において、このレトロウイルスプラスミドベクターをリポソームにカプセル化し得るか、または脂質に結合し得て、次いで宿主に投与し得る。
【０４２０】
このプロデューサー細胞株は、本発明のポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む感染性レトロウイルスベクター粒子を産生する。次いで、そのようなレトロウイルスベクター粒子を使用して、インビトロまたはインビボのどちらかで、真核生物細胞を形質導入し得る。この形質導入された真核生物細胞は、本発明のポリペプチドを発現する。
【０４２１】
特定の他の実施形態において、アデノウイルスベクター中に含まれるポリヌクレオチドを用いて、エキソビボまたはインビボで細胞を操作する。アデノウイルスは、それが本発明のポリペプチドをコードし、そして発現し、それと同時に通常の溶菌性ウイルス生活環にて複製するその能力に関して不活性化されるように操作され得る。アデノウイルス発現は、そのウイルスＤＮＡの宿主細胞染色体への組み込み無しに達成され、その結果、挿入性変異誘発についての心配が軽減される。さらに、アデノウイルスは、何年もの間、腸の生ワクチンとして優れた安全側面を伴って使用されている（Ｓｃｈｗａｒｔｚ，Ａ．Ｒ．ら（１９７４）、Ａｍ．Ｒｅｖ．Ｒｅｓｐｉｒ．Ｄｉｓ．、１０９：２３３−２３８）。最終的に、アデノウイルス媒介性遺伝子移入が、コトンラットの肺へのα−１−アンチトリプシンおよびＣＦＴＲの移入を含む多くの例において実証されている（Ｒｏｓｅｎｆｅｌｄ，Ｍ．Ａ．ら（１９９１）、Ｓｃｉｅｎｃｅ、２５２：４３１〜４３４；Ｒｏｓｅｎｆｅｌｄら（１９９２）、Ｃｅｌｌ、６８：１４３〜１５５）。さらに、ヒト癌における原因物質としてアデノウイルスを確立しようとする広範な研究は、一様に否定的であった（Ｇｒｅｅｎ，Ｍ．ら（１９７９）　Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ，７６：６６０６）。
【０４２２】
本発明において有用である適切なアデノウイルスベクターが、例えば、ＫｏｚａｒｓｋｙおよびＷｉｌｓｏｎ，Ｃｕｒｒ．Ｏｐｉｎ．Ｇｅｎｅｔ．Ｄｅｖｅｌ．　３：４９９〜５０３（１９９３）；Ｒｏｓｅｎｆｅｌｄら、Ｃｅｌｌ　６８：１４３〜１５５（１９９２）；Ｅｎｇｅｌｈａｒｄｔら、Ｈｕｍａｎ　Ｇｅｎｅｔ．Ｔｈｅｒ．　４：７５９〜７６９（１９９３）；Ｙａｎｇら、Ｎａｔｕｒｅ　Ｇｅｎｅｔ．　７：３６２〜３６９（１９９４）；Ｗｉｌｓｏｎら、Ｎａｔｕｒｅ　３６５：６９１〜６９２（１９９３）；および米国特許第５，６５２，２２４号に記載されており、これらの文献および特許は本明細書中で参考として援用される。例えば、アデノウイルスベクターＡｄ２が有用であり、そしてヒト２９３細胞にて増殖され得る。これらの細胞は、アデノウイルスのＥ１領域を含み、そして構成的にＥｌａおよびＥｌｂを発現し、このことは、このベクターから欠失している遺伝子の産物を提供することによって欠損アデノウイルスを補完する。Ａｄ２に加えて、他の多様なアデノウイルス（例えば、Ａｄ３、Ａｄ５、およびＡｄ７）もまた、本発明において有用である。
【０４２３】
好ましくは、本発明において使用されるアデノウイルスは、複製欠損性である。複製欠損アデノウイルスは、感染性粒子を形成するために、ヘルパーウイルスおよび／またはパッケージング細胞株の助けを必要とする。得られたウイルスは、細胞に感染する能力があり、そしてプロモーターに作動可能に連結された目的のポリヌクレオチドを発現し得るが、ほとんどの細胞にて複製し得ない。複製欠損アデノウイルスは、次の遺伝子のすべてまたは一部のうちの１つ以上にて欠失され得る：Ｅ１ａ、Ｅ１ｂ、Ｅ３、Ｅ４、Ｅ２ａまたはＬ１〜Ｌ５。
【０４２４】
特定の他の実施形態において、アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）を使用して、エキソビボまたはインビボでこの細胞を操作する。ＡＡＶは、感染性粒子を生成するためにヘルパーウイルスを必要とする、天然に存在する欠損ウイルスである（Ｍｕｚｙｃｚｋａ，Ｎ．，Ｃｕｒｒ．Ｔｏｐｉｃｓ　ｉｎ　Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１５８：９７（１９９２））。ＡＡＶはまた、非分裂細胞の中にそのＤＮＡを組み込み得る数少ないウイルスの中の１つである。３００塩基対程度の小さいＡＡＶを含むベクターがパッケージされ得、そして組み込み得るが、外来性ＤＮＡのためのスペースは約４．５ｋｂに限られる。そのようなＡＡＶの生成および使用の方法は当該分野で公知である。例えば、米国特許第５，１３９，９４１号、同第５，１７３，４１４号、同第５，３５４，６７８号、同第５，４３６，１４６号、同第５，４７４，９３５号、同第５，４７８，７４５号および同第５，５８９，３７７号を参照のこと。
【０４２５】
例えば、本発明において使用するために適切なＡＡＶベクターは、ＤＮＡ複製、キャプシド形成、および宿主細胞組み込みに必要な配列すべてを含む。Ｓａｍｂｒｏｏｋら、Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ　Ｃｌｏｎｉｎｇ：Ａ　Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ　Ｍａｎｕａｌ、Ｃｏｌｄ　Ｓｐｒｉｎｇ　Ｈａｒｂｏｒ　Ｐｒｅｓｓ（１９８９）において見い出される方法のような、標準的クローニング方法を使用して、ポリヌクレオチド構築物を、このＡＡＶベクターに挿入する。次いで、リポフェクション、エレクトロポレーション、リン酸カルシウム沈殿などを含む、任意の標準的技術を使用して、この組換えＡＡＶベクターを、ヘルパーウイルスに感染しているパッケージング細胞にトランスフェクトする。適切なヘルパーウイルスとしては、アデノウイルス、サイトメガロウイルス、ワクシニアウイルス、またはヘルペスウイルスが挙げられる。一旦パッケージング細胞がトランスフェクトおよび感染されると、それらはそのポリヌクレオチド構築物を含む感染性ＡＡＶウイルス粒子を生成する。次いで、エキソビボまたはインビボのいずれかで、これらのウイルス粒子を使用して真核生物細胞を形質導入する。この形質導入細胞は、そのゲノムに組み込まれたポリヌクレオチド構築物を含み、そして本発明のポリペプチドを発現する。
【０４２６】
遺伝子治療の別の方法は、相同組換え（例えば、米国特許第５，６４１，６７０号、１９９７年６月２４日発行；国際公開第ＷＯ９６／２９４１１号、１９９６年９月２６日公開；国際公開第ＷＯ９４／１２６５０号、１９９４年８月４日公開；Ｋｏｌｌｅｒら、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ　８６：８９３２〜８９３５（１９８９）；およびＺｉｊｌｓｔｒａら、Ｎａｔｕｒｅ　３４２：４３５〜４３８（１９８９）を参照のこと）を介して、異種制御領域および内在性ポリヌクレオチド配列（例えば、本発明のポリペプチドをコードしている配列）を作動可能に連結する工程を含む。この方法は、標的細胞中に存在しているが、通常はその細胞中で発現しないかまたは所望するよりも低いレベルで発現する、遺伝子の活性化を含む。
【０４２７】
当該分野で既知の標準的技術を使用して、ポリヌクレオチド構築物を作製する。この構築物は、プロモーターを、そのプロモーターに隣接した標的化配列とともに含む。適切なプロモーターが、本明細書中に記載されている。標的化配列は、プロモーター−標的化配列と内在性配列との相同組換えを可能にするに十分にその内在性配列に対して相補的である。標的化配列は、所望される内在性ポリヌクレオチド配列の５’末端の十分近くに存在し、それゆえ、相同組換えに際して、そのプロモーターは、その内在性配列に作動可能に連結される。
【０４２８】
このプロモーターおよび標的化配列は、ＰＣＲを使用して増幅され得る。好ましくは、この増幅されたプロモーターは、５’末端および３’末端に別の制限酵素部位を含む。好ましくは、第１の標的化配列の３’末端は、増幅されたプロモーターの５’末端と同じ制限酵素部位を含み、そして第２の標的化配列の５’末端は、増幅されたプロモーターの３’末端と同じ制限部位を含む。増幅されたプロモーターおよび標的化配列を消化し、そしてともに連結する。
【０４２９】
裸のポリヌクレオチドとしてか、もしくは上記により詳細に記載されるようなリポソーム、ウイルス配列、ウイルス粒子、ウイルス全体、リポフェクション、沈殿剤などのようなトランスフェクション促進剤と一緒にかのいずれかで、このプロモーター−標的化配列構築物を細胞に送達する。直接針注射、静脈内注射、局所投与、カテーテル注入、粒子加速器などを含む任意の方法により、Ｐプロモーター−標的化配列を送達し得る。この方法を、下記により詳細に記載する。
【０４３０】
プロモーター−標的化配列構築物は、細胞により取り込まれる。この構築物と内在性配列との間に相同組換えが起こり、その結果、内在性配列は、このプロモーターの制御下に配置される。次いで、このプロモーターは、内在性配列の発現を駆動する。
【０４３１】
好ましくは、本発明のポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、そのタンパク質の分泌を促進する分泌シグナル配列を含む。代表的に、このシグナル配列は、コード領域の５’末端に向かってかまたは５’末端で発現される、そのポリヌクレオチドのコード領域に位置する。このシグナル配列は、目的のポリヌクレオチドに対して同種であってもよいしまたは異種であってもよく、そしてトランスフェクトされる細胞に対して同種であってもよいしまたは異種であってもよい。さらに、当該分野で公知の方法を使用して、このシグナル配列は化学合成され得る。
【０４３２】
その投与形態によって、治療効果を提供するのに十分な量にて１つ以上の分子が発現される限り、上記のポリヌクレオチド構築物のうちのいずれかの任意の投与形態が使用され得る。これは、直接針注射、全身性注射、カテーテル注入、バイオリスティック（ｂｉｏｌｉｓｔｉｃ）注射器、粒子加速器（すなわち、「遺伝子銃」）、ゲルフォームスポンジデポー（ｄｅｐｏｔ）、他の市販デポー（ｄｅｐｏｔ）物質、浸透圧ポンプ（例えば、Ａｌｚａミニポンプ）、経口用または坐剤用の固形（錠剤または丸剤）薬学的処方物、および手術中のデカンティング（ｄｅｃａｎｔｉｎｇ）または局所適用を含む。例えば、ラット肝臓およびラット脾臓へのリン酸カルシウム沈澱した裸のプラスミドの直接注射、または門脈へのタンパク質被覆プラスミドの直接注射は、ラット肝臓における外来遺伝子の遺伝子発現をもたらした（Ｋａｎｅｄａら、Ｓｃｉｅｎｃｅ、２４３：３７５（１９８９））。
【０４３３】
局所投与の好ましい方法は、直接注射によるものである。好ましくは、送達ビヒクルと複合体を形成した本発明の組換え分子は、動脈領域内部に直接注射により投与されるか、または動脈領域内部に局所投与される。動脈領域内部での組成物の局所投与とは、その組成物を動脈内に数センチメートル、好ましくは数ミリメートルで注射することを言う。
【０４３４】
局所投与の別の方法は、本発明のポリヌクレオチド構築物を外科的創傷中または外科的創傷の周囲に接触させることである。例えば、患者は手術を経験し得、そしてこのポリヌクレオチド構築物がその創傷の内側の組織の表面上にコーティングされ得るか、またはこの構築物が、その創傷の内側の組織の領域に注入され得る。
【０４３５】
全身投与に有用な治療組成物は、本発明の標的化された送達ビヒクルと複合体を形成した本発明の組換え分子を含む。全身投与で使用するために適切な送達ビヒクルは、特定部位に対してそのビヒクルを標的化するリガンドを含むリポソームを含む。
【０４３６】
全身投与の好ましい方法としては、静脈内注射、エアロゾル、経口および経皮（局所的）送達が挙げられる。当該分野で標準的な方法を使用して、静脈内注射が実行され得る。当該分野で標準的な方法を使用して、エアロゾル送達もまた実行され得る（例えば、本明細書中で参考として援用される、Ｓｔｒｉｂｌｉｎｇら、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ　１８９：１１２７７〜１１２８１（１９９２）を参照のこと）。動物の腸内の消化酵素による分解に耐える能力をもつキャリアに対して本発明のポリヌクレオチド構築物を複合体形成することにより、経口送達は実行され得る。そのようなキャリアの例としては、当該分野で公知であるもののような、プラスチックカプセルまたは錠剤が挙げられる。皮膚内へ通過可能な親油性試薬（例えば、ＤＭＳＯ）と本発明のポリヌクレオチド構築物を混合することによって、局所的送達は実行され得る。
【０４３７】
送達される物質の有効量を決定することは、例えば、その物質の化学構造および生物学的活性、動物の年齢および体重、処置を必要とする正確な状態およびその重症度、ならびに投与経路を含む、多数の因子に依存し得る。処置の頻度は、１用量あたりの投与されるポリヌクレオチド構築物の量ならびに被験体の健康および病歴のような、多くの因子に依存する。正確な量、投薬回数および投薬のタイミングは、主治医または主治獣医により決定される。
【０４３８】
本発明の治療的組成物は、任意の動物に、好ましくは哺乳動物および鳥類に投与され得る。好ましい哺乳動物としては、ヒト、イヌ、ネコ、マウス、ラット、ウサギ、ヒツジ、ウシ、ウマおよびブタが挙げられ、特にヒトが好ましい。
【０４３９】
（生物学的活性）
本発明のポリヌクレオチドもしくはポリペプチド、またはアゴニストもしくはアンタゴニストをアッセイに使用し、１つ以上の生物学的活性について試験し得る。本発明のこれらのポリヌクレオチドもしくはポリペプチドまたはアゴニストもしくはアンタゴニストが特定のアッセイにおいて活性を示す場合、これらの分子はその生物学的活性に関連した疾患に関与し得るようである。従って、このポリヌクレオチドおよびポリペプチド、ならびにアゴニストもしくはアンタゴニストを使用し、その関連した疾患を処置し得る。
【０４４０】
ＥＣＭタンパク質は、細胞接着、分子の細胞間輸送、および細胞間シグナル伝達に関連する生物学的活性に関与すると考えられている。従って、本発明の組成物（本発明のポリヌクレオチド、ポリペプチドおよび抗体、ならびにそのフラグメントおよび改変体を含む）は、異常なＥＣＭ活性に関連する疾患および／または障害の診断、予後（予測）、予防、および／または処置において有用であり得る。
【０４４１】
好ましい実施形態において、本発明の組成物（本発明のポリヌクレオチド、ポリペプチドおよび抗体、ならびにそのフラグメントおよび改変体を含む）は、炎症性障害および心血管障害（例えば、アテローム性動脈硬化症、狭窄、心ブロック、筋収縮性機能不全、および／または本明細書中で「免疫活性」および「心血管障害」の表題の節に記載されるような障害）、筋骨格障害（例えば、骨粗しょう症、関節炎）、凝固障害、異常な創傷治癒、水疱形成障害、ならびに過増殖性障害（例えば、癌、癌転移、および／または本明細書中の「過増殖性障害」、「抗新脈管形成活性」および「細胞レベルでの疾患」の表題の節に記載されるような障害）に関する疾患および／または障害の診断、予後（予測）、予防、および／または処置において有用であり得る。
【０４４２】
特定の実施形態において、本発明のポリペプチド、またはこのポリペプチドに対応するポリヌクレオチド、抗体、アゴニスト、もしくはアンタゴニストは、「本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチド」において開示される組織、および／または表３の第２列（組織分布）において開示される１、２、３、４、５またはそれより多くの組織を含む、本発明のポリペプチドが発現している組織に関連する疾患および／または障害を診断および／または予測するために使用され得る。
【０４４３】
従って、本発明のポリヌクレオチド、翻訳産物および抗体は、以下を含むがこれらに限定されない活性に関する疾患および／または障害の診断、検出および／または処置において有用である：異常な創傷治癒、水疱形成障害、骨粗しょう症、アテローム動脈硬化症、関節炎、凝固障害、炎症、および癌。
【０４４４】
より一般的には、この遺伝子に対応するポリヌクレオチド、翻訳産物および抗体は、以下の系に関連する疾患および／または障害の診断、検出および／または処置に有用であり得る。
【０４４５】
（免疫活性）
本発明のポリヌクレオチド、ポリペプチド、抗体および／またはアゴニストもしくはアンタゴニストは、例えば、免疫細胞の増殖、分化、もしくは動員（走化性）を活性化または阻害することにより、免疫系の疾患、障害および／または状態の処置、予防および／または診断において有用であり得る。免疫細胞は、造血と呼ばれるプロセスを介して発達し、多能性幹細胞から骨髄性細胞（血小板、赤血球、好中球およびマクロファージ）およびリンパ系細胞（Ｂリンパ球およびＴリンパ球）を生成する。これら免疫の疾患、障害および／または状態の病因は、遺伝的、体細胞的（ｓｏｍａｔｉｃ）（例えば、癌またはいくつかの自己免疫性の疾患）、後天的（例えば、化学療法もしくは毒素による）または感染的であり得る。さらに、本発明のポリヌクレオチド、ポリペプチド、抗体および／またはアゴニストもしくはアンタゴニストは、特定の免疫系の疾患または障害のマーカーまたは検出物質（ｄｅｔｅｃｔｏｒ）として使用され得る。
【０４４６】
別の実施形態において，本発明のポリペプチドまたはポリヌクレオチド、抗体、アゴニスト、またはそのポリペプチドに対応するアンタゴニストを用いて、免疫系の疾患および障害を処置して、そして／または組織（本発明のポリペプチドが発現される組織であって、「本発明のポリヌクレオチドまたはポリペプチド」と表題される節において開示される組織を含む）に関連する細胞によって引き起こされる免疫応答を阻害または増強し得る。
【０４４７】
本発明のポリヌクレオチド、ポリペプチド、抗体および／またはアゴニストあるいはアンタゴニストは、免疫不全（先天性および後天性免疫不全を含む）の処置、防止および／または診断に有用であり得る。免疫グロブリンレベルＢ細胞機能および／またはＢ細胞数が減少されるＢ細胞免疫不全の例としては以下が挙げられる：Ｘ連鎖無ガンマグロブリン血症（Ｂｒｕｔｏｎ’ｓ病）、Ｘ連鎖乳児無ガンマグロブリン血症、過剰ＩｇＭを伴うＸ連鎖免疫欠損、過剰ＩｇＭを伴う非Ｘ連鎖免疫欠損、Ｘ連鎖リンパ球増殖症候群（ＸＬＰ）、先天性および後天性無ガンマグロブリン血症を含む無ガンマグロブリン血症、成人発症無ガンマグロブリン血症、後期発症無ガンマグロブリン血症、異常ガンマグロブリン血症、低ガンマグロブリン血症、非特異的低ガンマグロブリン血症、退縮無ガンマグロブリン血症（Ｓｗｉｓｓ型）、選択的ＩｇＭ免疫欠損、選択的ＩｇＡ欠損、選択的ＩｇＧサブクラス欠損、ＩｇＧサブクラス欠損（ＩｇＡ欠損を伴うかまたは伴わない）、上昇したＩｇＭを伴うＩｇ欠損、上昇したＩｇＭを伴うＩｇＧ欠損およびＩｇＡ欠損、正常なＩｇまたは上昇したＩｇを伴う抗体欠損、Ｉｇ重鎖欠失、κ鎖欠損、Ｂ細胞リンパ球増殖性障害（ＢＬＰＤ）、分類不能性免疫不全症（ＣＶＩＤ）、分類不能型免疫不全（ＣＶＩ）（後天性）および一過性乳児低ガンマグロブリン血症。
【０４４８】
特定の実施形態において、毛細血管拡張性運動失調または毛細血管拡張性運動失調と関連する状態は、本発明のポリペプチドもしくはポリヌクレオチドおよび／またはそのアゴニストを投与することで緩和されるか処置される。
【０４４９】
Ｔ細胞および／もしくはＢ細胞機能、ならびに／または数が減少される先天性免疫不全の例としては、以下が挙げられるがこれらに限定されない：ディジョージ奇形、重症複合型免疫不全（ＳＣＩＤ）（Ｘ連鎖ＳＣＩＤ、常染色体ＳＣＩＤ、およびアデノシンデアミナーゼ不全症、プリンヌクレオシドホスホリラーゼ欠損（ＰＮＰ）、ＭＨＣクラスＩＩ欠失（不全リンパ球症候群）、ヴィスコット−オールドリッチ症候群および毛細血管拡張性運動失調を含むが、これに限定されない）、胸腺発育不全、第３および第４咽頭嚢症候群、２２ｑ１１．２欠損、慢性粘膜皮膚カンジダ症、ナチュラルキラー細胞欠損（ＮＫ）、特発性ＣＤ４＋　Ｔリンパ球減少、顕著なＴ細胞欠損を伴う免疫欠損（不特定）、および細胞媒介免疫の不特定の免疫欠損が挙げられるがこれらに限定されない。
【０４５０】
特定の実施形態において、ディジョージ奇形またはディジョージ奇形に関連する状態は、例えば、本発明のポリペプチドもしくはポリヌクレオチド、またはそのアンタゴニストもしくはアゴニストを投与することによって、緩和されるか処置される。
【０４５１】
本発明のポリペプチドもしくはポリヌクレオチド、および／またはそれらのアゴニストを投与することによって寛解または処置され得る他の免疫不全症としては、慢性肉芽腫症、チェディアック−東症候群、ミエロペルオキシダーゼ欠損、白血球グルコース−６−ホスフェートデヒドロゲナーゼ欠損、Ｘ連鎖リンパ球増多症症候群（ＸＬＰ）、白血球接着不全、補体成分欠損（Ｃ１、Ｃ２、Ｃ３、Ｃ４、Ｃ５、Ｃ６、Ｃ７、Ｃ８および／またはＣ９欠損を含む）、網様発育不全、胸腺リンパ形成不全−発育不全、胸腺腫を伴う免疫欠損、重篤な先天性白血球減少症、免疫欠損を伴う形成異常、新生児好中球減少症、短肢（ｓｈｏｒｔ　ｌｉｍｂｅｄ）小人症およびＩｇを伴うネゼロフ症候群複合免疫欠損を含むがこれに限定されない。
【０４５２】
好ましい実施形態において、免疫欠損および／または上記に列挙される免疫欠損に関連する状態は、本発明のポリヌクレオチド、ポリペプチド、抗体および／またはアゴニストもしくはそのアンタゴニストを用いて処置、予防および／または診断される。
【０４５３】
好ましい実施形態において、本発明のポリヌクレオチド、ポリペプチド、抗体および／またはアゴニストもしくはアンタゴニストを薬剤として用いて、免疫欠損個体間の免疫応答性をブーストし得る。特定の実施形態において、本発明のポリヌクレオチド、ポリペプチド、抗体および／またはアゴニストもしくはアンタゴニストを薬剤として用いて、Ｂ細胞および／またはＴ細胞の免疫欠損個体間の免疫応答性をブーストし得る。
【０４５４】
本発明のポリヌクレオチド、ポリペプチド、抗体および／またはアゴニストあるいはアンタゴニストは、自己免疫障害の処置、防止および／または診断に有用であり得る。多数の自己免疫疾患は、免疫細胞による外来物質として、それ自体の不適用な認識から生じる。この不適用な認識から、宿主細胞の破壊を導く免疫応答が生じる。従って、免疫応答（特にＴ細胞の増殖、分化または走化）を阻害し得る本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドの投与は、自己免疫疾患を処置する際の効果的治療法であり得る。
【０４５５】
本発明のポリヌクレオチド、ポリペプチド、抗体および／またはアゴニストあるいはアンタゴニストによって処置、防止および／または診断され得る、自己免疫疾患および自己免疫障害には、以下の１つ以上が挙げられるがこれに限定されない：全身性エリテマトーデス、慢性関節リウマチ、強直性脊椎炎、多発性硬化症、自己免疫甲状腺炎、橋本甲状腺炎、自己免疫溶血性貧血、溶血性貧血、血小板減少、自己免疫血小板減少紫斑病、自己免疫性新生児血小板減少、特発性血小板減少性紫斑病、紫斑病（例えば、ヘノッホ−シェーンライン（Ｈｅｎｌｏｃｈ−Ｓｃｏｅｎｌｅｉｎ）紫斑病）、自己免疫性血球減少症、グッドパスチャー症候群、尋常性天疱瘡、重症筋無力症、グレーヴズ病（甲状腺機能亢進）、およびインシュリン依存性糖尿病（ｍｅｌｌｉｔｉｓ）。
【０４５６】
本発明の組成物で処置、予防および／または診断され得る自己免疫成分を有し得るさらなる障害には、以下が挙げられるがこれに限定されない：ＩＩ型コラーゲン誘導関節炎、抗リン脂質症候群、皮膚炎、アレルギー性脳脊髄炎、心筋炎、再発性多発性軟骨炎、リウマチ性心疾患、神経炎、ブドウ膜炎眼炎、多発性内分泌腺症、ライター病、Ｓｔｉｆｆ−Ｍａｎ症候群、自己免疫肺炎症、自閉症、ギヤン−バレー症候群、インスリン依存性糖尿病および自己免疫炎症性眼。
【０４５７】
本発明の組成物で処置、予防および／または診断され得る自己免疫成分を有し得るさらなる障害には、以下が挙げられるがこれに限定されない：坑コラーゲン抗体を伴う強皮症（例えば、核小体および他の核小体抗体によってしばしば特徴付けられる）、混合結合組織病（例えば、可溶性核抗原（例えば、リボ核タンパク質）に対する抗体によってしばしば特徴付けられる）、多発性筋炎（例えば、非ヒストンＡＮＡによってしばしば特徴付けられる）、悪性貧血（例えば、抗壁細胞、ミクロソーム、および内因子抗体によってしばしば特徴付けられる）、特発性アジソン病（例えば、体液および細胞媒介性副腎細胞傷害性によってしばしば特徴付けられる）、不妊症（例えば、抗精子抗体によってしばしば特徴付けられる）、糸球体腎炎（例えば、糸球体基底膜抗体または免疫複合体によってしばしば特徴付けられる）、水疱性類天疱瘡（例えば、基底膜中のＩｇＧおよび補体によってしばしば特徴付けられる）、シェーグレン症候群（例えば、多重組織抗体、および／または特定の非ヒストンＡＮＡ（ＳＳ−Ｂ）によってしばしば特徴付けられる）、糖尿病（例えば、細胞媒介性および体液性島細胞抗体によってしばしば特徴付けられる）、ならびにアドレナリン作動性薬剤抵抗性（喘息または嚢胞性線維症を伴うアドレナリン作動性薬剤抵抗性を含む）（例えば、βアドレナリンレセプター抗体によってしばしば特徴付けられる）。
【０４５８】
本発明の組成物で処置、予防および／または診断され得る自己免疫成分を有し得るさらなる障害には、以下が挙げられるがこれに限定されない：慢性活性肝炎（例えば、平滑筋抗体によってしばしば特徴付けられる）、原発性胆汁性肝硬変（例えば、ミトコンドリア抗体によってしばしば特徴付けられる）、他の内分泌腺不全（例えば、いくつかの場合は、特定の組織抗体によってしばしば特徴付けられる）、白斑（例えば、メラノサイト抗体によってしばしば特徴付けられる）、脈管炎（例えば、脈管壁におけるＩｇおよび補体ならびに／または低血清補体によってしばしば特徴付けられる）、ＭＩ後（例えば、心筋抗体によってしばしば特徴付けられる）、心臓切開症候群（例えば、心筋抗体によってしばしば特徴付けられる）、じんま疹（例えば、ＩｇＥに対するＩｇＧ抗体およびＩｇＭ抗体によってしばしば特徴付けられる）、アトピー性皮膚炎（例えば、ＩｇＥに対するＩｇＧ抗体およびＩｇＭ抗体によってしばしば特徴付けられる）、喘息（例えば、ＩｇＥに対するＩｇＧ抗体およびＩｇＭ抗体によってしばしば特徴付けられる）、ならびに多くの他の炎症性障害、肉芽種性障害、変性障害、および萎縮性障害。
【０４５９】
好ましい実施形態においては、自己免疫性疾患および障害ならびに／または上記に列挙された疾患および障害に関連する状態は、例えば、本発明のアンタゴニスト、またはアゴニスト、ポリペプチドもしくはポリヌクレオチド、または抗体を用いて、処置、予防、および／または診断される。特定の好ましい実施形態においては、本発明のポリヌクレオチド、ポリペプチド、抗体、および／またはアゴニストもしくはアンタゴニストを用いて、慢性関節リウマチは処置、予防および／または診断される。別の特定の好ましい実施形態において、本発明のポリヌクレオチド、ポリペプチド、抗体、および／またはアゴニストもしくはアンタゴニストを用いて、特発性血小板減少性紫斑病は処置、予防および／または診断される。別の特定の好ましい実施形態において、本発明のポリヌクレオチド、ポリペプチド、抗体、および／またはアゴニストもしくはアンタゴニストを用いて、ＩｇＡ腎症は処置、予防および／または診断される。
【０４６０】
好ましい実施形態において、自己免疫疾患および自己免疫障害ならびに／または上に列挙される疾患および障害に関連する状態が、本発明のポリヌクレオチド、ポリペプチド、抗体および／またはアゴニストもしくはそれらのアンタゴニストによって処置、予防および／または診断され得る。
【０４６１】
好ましい実施形態において、本発明のポリペプチド、抗体、ポリヌクレオチドおよび／またはアンタゴニストは、免疫抑制性薬剤として使用され得る。
【０４６２】
本発明のポリヌクレオチド、ポリペプチド、抗体および／またはアゴニストもしくはアンタゴニストは、造血系の疾患、障害および／または状態の処置、予防および／または診断において有用であり得る。本発明のポリヌクレオチド、ポリペプチド、抗体および／またはアゴニストもしくはアンタゴニストを使用して、造血細胞（それらの疾患、障害および／または特定の（または多数の）型の造血細胞を処置または予防するための多能性幹細胞を含み、これは白血球減少、好中球減少、貧血、血小板減少を含むが、これに限定されない）の分化または増殖を増加させ得る。あるいは、本発明のポリヌクレオチド、ポリペプチド、抗体および／またはアゴニストもしくはアンタゴニストは、造血系（それらの疾患、障害および／または特定の（または多数の）型の造血細胞を処置または予防するための多能性幹細胞を含み、これは組織球増殖を含むが、これに限定されない）の分化および増殖を増加するため使用され得る。
【０４６３】
アレルギー反応および状態（例えば、喘息（特にアレルギー性喘息）または他の呼吸障害）はまた、本発明のポリペプチド、抗体、ポリヌクレオチド、および／またはそれらのアゴニストもしくはアンタゴニストを用いて、処置、予防および／または診断され得る。さらに、これらの分子は、アナフィラキシー、抗原性分子に対する過敏性、または血液型不適合を処置、予防および／または診断するために用いられ得る。
【０４６４】
さらに、本発明のポリペプチドまたはポリヌクレオチド、および／またはそのアゴニストは、ＩｇＥ媒介アレルギー応答を処置または予防するために使用され得る。このようなアレルギー反応としては、ぜん息、鼻炎および湿疹が挙げられるが、これらに限定されない。特定の実施形態において、本発明のポリヌクレオチド、ポリペプチド、抗体、および／またはアゴニストもしくはアンタゴニストを使用して、インビボまたはインビトロにおいてＩｇＥ濃度を調節しうる。
【０４６５】
さらに、本発明のポリヌクレオチド、ポリペプチド、抗体、および／またはアゴニストもしくはアンタゴニストは、炎症状態の診断、予後、予防、および／または処置に用途を有する。例えば、このポリペプチドもしくはポリヌクレオチド、またはアゴニストもしくはアンタゴニストは、炎症応答に関与する細胞の活性、増殖および分化を阻害し得るので、これらの分子を使用して、慢性および急性の両方の状態の炎症状態を処置、予防および／または診断し得る。このような炎症状態には、例えば以下が挙げられるがそれらに限定されない：感染に関連する炎症（例えば、敗血症性ショック、敗血症、または全身炎症応答症候群）、虚血再灌流傷害に関連する炎症、内毒素致死に関連する炎症、補体媒介性超急性拒絶に関連する炎症、サイトカインまたはケモカインが誘導する肺傷害に関連する炎症、炎症性腸疾患に関連する炎症、クローン病に関連する炎症、サイトカイン（例えば、ＴＮＦまたはＩＬ−１）の過剰生成から生じる炎症、呼吸障害に関連する炎症（例えば、ぜん息およびアレルギー）；胃腸障害（例えば、炎症性腸障害）；癌（例えば、胃癌、卵巣癌、肺癌、膀胱癌、肝臓癌、および乳癌など）；ＣＮＳ障害（例えば、多発性硬化症、血液脳関門透過性、虚血性脳損傷、および／または脳梗塞、外傷性脳損傷、神経変性性障害（例えば、パーキンソン病およびアルツハイマー病など）、ＡＩＤＳ関連痴呆、およびプリオン病）；心血管障害（例えば、アテローム性動脈硬化症、心筋炎、心血管疾患、および心肺バイパス合併症など）；ならびに炎症によって特徴付けられる多くのさらなる疾患、状態、および障害（例えば、肝炎、慢性関節リウマチ、痛風、外傷、敗血性ショック、膵炎、サルコイドーシス、皮膚炎、腎虚血再還流障害、グレーヴス病、全身性エリテマトーデス、真性糖尿病、および同種異系移植拒絶など）。
【０４６６】
炎症は、基本的な防御機構なので、炎症は実質的に任意の身体の組織で影響し得る。従って、本発明のポリヌクレオチド、ポリペプチド、および抗体、ならびにそれらのアゴニストまたはアンタゴニストは、以下を含むがそれらに限定されない組織特異的な炎症疾患に用途を有する：副腎炎、肺胞炎、胆管胆嚢炎、虫垂炎、亀頭炎、眼瞼炎、気管支炎、滑液包炎、心臓炎、蜂巣炎、子宮頸管炎、胆嚢炎、声帯炎、ｃｏｃｈｉｌｉｔｉｓ、大腸炎、結膜炎、膀胱炎、皮膚炎、憩室炎、脳炎、心内膜炎、食道炎、耳管炎、結合組織炎、毛包炎、胃炎、胃腸炎、歯肉炎、舌炎、肝脾炎、角膜炎、迷路炎、喉頭炎、リンパ管炎、乳腺炎、媒介耳炎（ｍｅｄｉａ　ｏｔｉｔｉｓ）、髄膜炎、子宮筋層炎、粘膜炎、心筋炎、筋炎（ｍｙｏｓｉｔｉｔｉｓ）、鼓膜炎、腎炎、神経炎、精巣炎、骨軟骨炎、耳炎、心膜炎、腱鞘炎、腹膜炎、咽頭炎、静脈炎、ポリオ、前立腺炎、歯髄炎、網膜炎、鼻炎、卵管炎、強膜炎、強膜脈絡膜炎、陰嚢炎、静脈洞炎、脊椎炎（ｓｐｏｎｙｌｉｔｉｓ）、脂肪組織炎、口内炎、滑膜炎、耳管炎、腱炎、扁桃炎、尿道炎、および腟炎。
【０４６７】
特定の実施形態において、本発明のポリペプチド、抗体、またはポリヌクレオチドおよび／またそれらのアゴニストもしくはアンタゴニストは、器官移植拒絶または対宿主性移植片病（ＧＶＨＤ）を処置、診断および／または予防に有用である。器官拒絶は、免疫応答を介して宿主免疫細胞による移植組織の破壊によって起こる。同様に、免疫応答はＧＶＨＤにもまた関与しているが、この場合、外来性の移植免疫細胞が宿主組織を破壊する。免疫応答、特にＴ細胞の活性、増殖、分化または走化性を阻害する、本発明のポリペプチド、抗体、またはポリヌクレオチド、および／またそれらのアゴニストもしくはアンタゴニストは、器官拒絶またはＧＶＨＤの防止において効果的な治療であり得る。特定の実施形態において、免疫応答、特にＴ細胞の活性、増殖、分化または走化性を阻害する、本発明のポリペプチド、抗体、またはポリヌクレオチドおよび／またそれらのアゴニストもしくはアンタゴニストは、実験的アレルギーおよび超急性異種移植拒絶において効果的な治療であり得る。
【０４６８】
他の実施形態において、本発明のポリペプチド、抗体、またはポリヌクレオチドおよび／またそれらのアゴニストもしくはアンタゴニストは、免疫複合体病（血清病、ｐｏｓｔ　ｓｔｅｐｔｏｃｏｃｃａｌ　糸球体腎炎および結節性多発性動脈炎、免疫複合体誘導脈管炎を含むがそれらに限定されない）処置、診断および／または予防に有用である。
【０４６９】
本発明のポリペプチド、抗体、ポリヌクレオチド、および／またはアゴニストもしくはアンタゴニストを使用して、感染因子を処置、検出、および／または予防し得る。例えば、免疫応答を上昇させることによって、特にＢ細胞および／またはＴ細胞の増殖活性および／または分化を増加させることによって、感染性疾患が処置、検出および／または予防され得る。免疫応答は、既存の免疫応答を上昇させるか、または新たな免疫応答を開始させるかのいずれかにより上昇され得る。あるいは、本発明のポリヌクレオチド、ポリペプチド、抗体および／またはアゴニストもしくはアンタゴニストはまた、必ずしも免疫応答を誘発することなく、感染因子（感染因子を列挙する応用の節で引用される）を直接阻害し得る。
【０４７０】
別の実施形態において、本発明のポリペプチド、抗体、ポリヌクレオチド、および／またはアゴニストもしくはアンタゴニストは、特定の抗原に対する免疫応答を上昇するワクチンアジュバントとして使用される。特定の実施形態において、本発明のポリペプチド、抗体、ポリヌクレオチド、および／またはアゴニストもしくはアンタゴニストは、腫瘍特異的免疫応答を増強するアジュバントとして使用される。
【０４７１】
別の特定の実施形態において、本発明のポリペプチド、抗体、ポリヌクレオチド、および／またはアゴニストもしくはアンタゴニストは、抗ウイルス免疫応答を増強するアジュバントとして使用される。アジュバントとして本発明の組成物を用いて増強され得る抗ウイルス免疫応答としては、本明細書において記載されるかさもなければ当該分野で公知のウイルスおよびウイルス関連疾患または症状が挙げられる。特定の実施形態において、本発明の組成物は、以下：ＡＩＤＳ、髄膜炎、デング、ＥＢＶ、および肝炎（例えば、Ｂ型肝炎）からなる群より選択される、ウイルス、疾患または症状に対する免疫応答を増強するためのアジュバントとして用いられる。別の特定の実施形態において、本発明の組成物は、以下：ＨＩＶ／ＡＩＤＳ、ＲＳウイルス、デング、ロタウイルス、日本脳炎、インフルエンザＡおよびＢ、パラインフルエンザ、麻疹、サイトメガロウイルス、狂犬病、Ｊｕｎｉｎウイルス、チクングニヤウイルス、リフトバレー熱、単純疱疹、および黄熱病からなる群より選択されるウイルス、疾患または症状に対する免疫応答を増強するアジュバントとして用いられる。
【０４７２】
別の特定の実施形態において、本発明のポリペプチド、抗体、ポリヌクレオチド、および／またはアゴニストもしくはアンタゴニストは、抗細菌免疫応答または抗真菌免疫応答を増大し得るアジュバントとして使用される。アジュバントとして本発明の組成物を使用して増大され得る抗細菌免疫応答または抗真菌免疫応答としては、細菌または真菌、および本明細書中に記載されるか、またはさもなくば当該分野で公知の疾患または症状に関連する細菌または真菌が挙げられる。特定の実施形態において、本発明の組成物は、細菌または真菌、疾患、または症状（これは、破傷風、ジフテリア、ボツリスム、およびＢ型髄膜炎からなる群から選択される）に対する免疫応答を増大するためのアジュバントとして使用される。
【０４７３】
別の特定の実施形態において、本発明の組成物は、細菌または真菌、疾患、または症状（これは、Ｖｉｂｒｉｏ　ｃｈｏｌｅｒａｅ、Ｍｙｃｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ　ｌｅｐｒａｅ、Ｓａｌｍｏｎｅｌｌａ　ｔｙｐｈｉ、Ｓａｌｍｏｎｅｌｌａ　ｐａｒａｔｙｐｈｉ、Ｍｅｉｓｓｅｒｉａ　ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ、Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ　ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ、Ｇｒｏｕｐ　Ｂ　ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ、Ｓｈｉｇｅｌｌａ　ｓｐｐ．、Ｅｎｔｅｒｏｔｏｘｉｇｅｎｉｃ　Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ　ｃｏｌｉ、Ｅｎｔｅｒｏｈｅｍｏｒｒｈａｇｉｃ　Ｅ．ｃｏｌｉ、およびＢｏｒｒｅｌｉａ　ｂｕｒｇｄｏｒｆｅｒｉからなる群から選択される）に対する免疫応答を増大するためのアジュバントとして使用される。
【０４７４】
別の特定の実施形態において、本発明のポリペプチド、抗体、ポリヌクレオチド、および／またはアゴニストもしくはアンタゴニストは、抗寄生生物免疫応答を増大するためのアジュバントとして使用される。アジュバントとして本発明の組成物を使用して増大され得る抗寄生生物免疫応答としては、寄生生物、および本明細書中に記載されるかまたはさもなくば当該分野で公知の疾患または症状に関連する寄生生物が挙げられる。特定の実施形態において、本発明の組成物は、寄生生物に対する免疫応答を増大するためのアジュバントとして使用される。別の特定の実施形態において、本発明の組成物は、Ｐｌａｓｍｏｄｉｕｍ（マラリア）またはＬｅｉｓｈｍａｎｉａに対する免疫応答を増大するためのアジュバントとして使用される。
【０４７５】
別の特定の実施形態において、本発明のポリペプチド、抗体、ポリヌクレオチド、および／またはアゴニストもしくはアンタゴニストは、例えば、単核食細胞の補充および活性化を妨げることによって、珪肺症、サルコイドーシス、特発性肺線維症を含む、感染性疾患を処置するために使用され得る。
【０４７６】
別の特定の実施形態において、本発明のポリペプチド、抗体、ポリヌクレオチド、および／またはアゴニストもしくはアンタゴニストはまた、本発明のポリペプチドに対する免疫介在応答を阻害する、または増大する抗体の産生のための抗体として使用される。
【０４７７】
１つの実施形態において、本発明のポリペプチド、抗体、ポリヌクレオチド、および／またはアゴニストもしくはアンタゴニストは、免疫系をブーストし、１つ以上の抗体（例えば、ＩｇＧ、ＩｇＡ、ＩｇＭ、およびＩｇＥ）の量の増大を生じ、高い親和性の抗体産生および免疫グロブリンクラス転換（例えば、ＩｇＧ、ＩｇＡ、ＩｇＭおよびＩｇＥ）を誘導し、および／または免疫応答を増大するために動物（例えば、マウス、ラット、ウサギ、ハムスター、モルモット、ブタ、ミニブタ、ニワトリ、ラクダ、ヤギ、ウマ、ウシ、ヒツジ、イヌ、ネコ、非ヒト霊長類、およびヒト、最も好ましくはヒト）に投与される。
【０４７８】
別の特定の実施形態において、本発明のポリペプチド、抗体、ポリヌクレオチド、および／またはアゴニストもしくはアンタゴニストは、病原体に対するＢ細胞応答性の刺激物質として使用される。
【０４７９】
別の特定の実施形態において、本発明のポリペプチド、抗体、ポリヌクレオチド、および／またはアゴニストもしくはアンタゴニストは、Ｔ細胞のアクチベーターとして使用される。
【０４８０】
別の特定の実施形態において、本発明のポリペプチド、抗体、ポリヌクレオチド、および／またはアゴニストもしくはアンタゴニストは、免疫抑制性治療を受ける前の、個体の免疫状態を増大させる薬剤として使用される。
【０４８１】
別の特定の実施形態において、本発明のポリペプチド、抗体、ポリヌクレオチド、および／またはアゴニストもしくはアンタゴニストは、より高い親和性抗体を誘導するための薬剤として使用される。
【０４８２】
別の特定の実施形態において、本発明のポリペプチド、抗体、ポリヌクレオチド、および／またはアゴニストもしくはアンタゴニストは、血清免疫グロブリン濃度を増加するための薬剤として使用される。
【０４８３】
別の特定の実施形態において、本発明のポリペプチド、抗体、ポリヌクレオチド、および／またはアゴニストもしくはアンタゴニストは、免疫無防備状態の個体の回復を促進するための薬剤として使用される。
【０４８４】
別の特定の実施形態において、本発明のポリペプチド、抗体、ポリヌクレオチド、および／またはアゴニストもしくはアンタゴニストは、高齢の集団の間の免疫応答性をブーストするための薬剤として使用される。
【０４８５】
別の特定の実施形態において、本発明のポリペプチド、抗体、ポリヌクレオチド、および／またはアゴニストもしくはアンタゴニストは、骨髄移植および／または他の移植（例えば、同種異系または異種の器官移植）の前、間、または後の免疫系エンハンサーとして使用される。移植に関して、本発明の組成物は、移植の前、同時、および／または後に投与され得る。特定の実施形態において、本発明の組成物は、移植の後、Ｔ細胞集団の回復の開始前に投与される。別の特定の実施形態において、本発明の組成物は、移植の後、Ｔ細胞集団の回復の開始後であるが、Ｂ細胞集団の完全な回復の前に最初に投与される。
【０４８６】
別の特定の実施形態において、本発明のポリペプチド、抗体、ポリヌクレオチド、および／またはアゴニストもしくはアンタゴニストは、Ｂ細胞機能の後天的欠損を有する個体間で免疫応答性をブーストするための薬剤として使用される。ポリペプチド、抗体、ポリヌクレオチドおよび／またはそれらのアゴニストもしくはアンタゴニストを投与することによって寛解または処置され得る、Ｂ細胞機能の後天的欠損を生じる状態としては、ＨＩＶ感染、ＡＩＤＳ、骨髄移植、およびＢ細胞慢性リンパ球性白血病（ＣＬＬ）が挙げられるが、これらに限定されない。
【０４８７】
別の特定の実施形態において、本発明のポリペプチド、抗体、ポリヌクレオチド、および／またはアゴニストもしくはアンタゴニストは、一時的な免疫不全を有する個体間で免疫応答性をブーストするための薬剤として使用される。ポリペプチド、抗体、ポリヌクレオチドおよび／またはそれらのアゴニストもしくはアンタゴニストを投与することによって寛解または処置され得る、一時的な免疫不全を生じる状態としては、ウイルス感染（例えば、インフルエンザ）からの回復、栄養失調に関連する状態、感染性単核細胞症からの回復、またはストレスに関連する状態、麻疹からの回復、輸血からの回復、および手術からの回復が挙げられるが、これらに限定されない。
【０４８８】
別の特定の実施形態において、本発明のポリペプチド、抗体、ポリヌクレオチド、および／またはアゴニストもしくはアンタゴニストは、単球、樹状細胞および／またはＢ細胞による抗原提示のレギュレーターとして使用される。１つの実施形態において、本発明のポリヌクレオチド、ポリペプチド、抗体、および／またはアゴニストもしくはアンタゴニストは、インビトロまたはインビボで抗原提示を増強するかまたは抗原提示をアンタゴナイズする。さらに、関連する実施形態において、この抗原提示の増強またはアンタゴナイズは、抗腫瘍処置としてかまたは免疫系を調節するために有用であり得る。
【０４８９】
別の特定の実施形態において、本発明のポリペプチド、抗体、ポリヌクレオチド、および／またはアゴニストもしくはアンタゴニストは、個体の免疫系を、ＴＨ１細胞性応答とは反対に、体液性応答（すなわち、ＴＨ２）の発生に指向するための薬剤として使用される。
【０４９０】
別の特定の実施形態において、本発明のポリペプチド、抗体、ポリヌクレオチド、および／またはアゴニストもしくはアンタゴニストは、腫瘍増殖を誘導し、従って、腫瘍を抗腫瘍性薬剤に対してより感受性にするための手段として使用される。例えば、多発性骨髄腫は、緩慢な細胞分裂（ｄｉｖｉｄｉｎｇ）の疾患であり、従って、実質的に全ての抗腫瘍性レジメンに対して不応性である。これらの細胞は、より迅速に増殖させた場合、これらの感受性プロフィールは、おそらく変化するであろう。
【０４９１】
別の特定の実施形態において、本発明のポリペプチド、抗体、ポリヌクレオチド、および／またはアゴニストもしくはアンタゴニストは、ＡＩＤＳ、慢性リンパ球障害および／または分類不能型免疫不全のような病理におけるＢ細胞の産生の刺激因子として使用される。
【０４９２】
別の特定の実施形態において、本発明のポリペプチド、抗体、ポリヌクレオチド、および／またはアゴニストもしくはアンタゴニストは、手術、外傷または遺伝的欠陥後のリンパ組織の生成および／または再生のための治療として使用される。別の特定の実施形態において、本発明のポリペプチド、抗体、ポリヌクレオチド、および／またはアゴニストもしくはアンタゴニストは、移植前の骨髄サンプルの前処理として使用される。
【０４９３】
別の特定の実施形態において、本発明のポリペプチド、抗体、ポリヌクレオチド、および／またはアゴニストもしくはアンタゴニストは、ＳＣＩＤ患者の間で観察されるような免疫不全症／免疫欠損を生じる遺伝性の障害のための遺伝子ベースの治療として使用される。
【０４９４】
別の特定の実施形態において、本発明のポリペプチド、抗体、ポリヌクレオチド、および／またはアゴニストもしくはアンタゴニストは、単球に影響を及ぼす寄生生物疾患（リーシュマニア属（Ｌｅｓｈｍａｎｉａ））に対して防御するために単球／マクロファージを活性化する手段として使用される。
【０４９５】
別の特定の実施形態において、本発明のポリペプチド、抗体、ポリヌクレオチド、および／またはアゴニストもしくはアンタゴニストは、本発明のポリペプチドによって誘発される分泌サイトカインを調節する手段として使用される。
【０４９６】
上述の全ての適用は、それら自体で獣医学的医療に適用され得る。
【０４９７】
別の特定の実施形態において、本発明のポリペプチド、抗体、ポリヌクレオチド、および／またはアゴニストもしくはアンタゴニストは、外来因子または自己に対する種々の局面の免疫応答をブロックする手段として使用される。種々の局面の免疫応答をブロックすることが望ましくあり得る疾患または状態の例としては、狼瘡および関節炎のような自己免疫障害、ならびに皮膚アレルギー、炎症、腸疾患、損傷に対する免疫応答性および病原体に関する疾患／障害が挙げられる。
【０４９８】
別の特定の実施形態において、本発明のポリペプチド、抗体、ポリヌクレオチド、および／またはアゴニストもしくはアンタゴニストは、自己免疫疾患（例えば、特発性血小板減少性紫斑病、全身性エリテマトーデスおよび多発性硬化症）に関連するＢ細胞増殖およびＩｇ分泌を妨げるための治療として使用される。
【０４９９】
別の特定の実施形態において、本発明のポリペプチド、抗体、ポリヌクレオチド、および／またはアゴニストもしくはアンタゴニストは、内皮細胞におけるＢ細胞および／またはＴ細胞の遊走のインヒビターとして使用される。この活性は、組織構造または同族の応答を破壊し、そして例えば、免疫応答の破壊および敗血症のブロックにおいて有用である。
【０５００】
別の特定の実施形態において、本発明のポリペプチド、抗体、ポリヌクレオチド、および／またはアゴニストもしくはアンタゴニストは、未定量有意性の単一クローン性高ガンマグロブリン血症（ｍｏｎｏｃｌｏｎａｌｇａｍｍｏｐａｔｈｙ　ｏｆ　ｕｎｄｅｔｅｒｍｉｎｅｄ　ｓｉｇｎｉｆｉｃａｎｃｅ）（ＭＧＵＳ）、ヴァルデンストレーム疾患、関連する特発性単一クローン性高ガンマグロブリン血症、およびプラスマ細胞腫のような疾患における、慢性の高ガンマグロブリン血症事象のための治療として使用される。
【０５０１】
別の特定の実施形態において、本発明のポリペプチド、抗体、ポリヌクレオチド、および／またはアゴニストもしくはアンタゴニストは、例えば、特定の自己免疫疾患および慢性炎症疾患および感染性疾患における、マクロファージおよびその前駆体、ならびに好中球、好塩基球、Ｂリンパ球およびいくつかのＴ細胞サブセット（例えば、活性化Ｔ細胞およびＣＤ８細胞傷害性Ｔ細胞ならびにナチュラルキラー細胞）の、ポリペプチド走化性および活性化を阻害するために使用され得る。自己免疫疾患の例は、本明細書中に記載され、その自己免疫疾患の例としては、多発性硬化症およびインスリン依存性糖尿病が挙げられる。
【０５０２】
本発明のポリペプチド、抗体、ポリヌクレオチド、および／またはアゴニストもしくはアンタゴニストはまた、例えば、好酸球の産生および遊走を妨げることによって、特発性好酸球増多症候群を処置するために使用され得る。
【０５０３】
別の特定の実施形態において、本発明のポリペプチド、抗体、ポリヌクレオチド、および／またはアゴニストもしくはアンタゴニストは、相補体媒介細胞溶解を増大する、または阻害するために使用される。
【０５０４】
別の特定の実施形態において、本発明のポリペプチド、抗体、ポリヌクレオチド、および／またはアゴニストもしくはアンタゴニストは、抗体依存性細胞性細胞障害性を増大する、または阻害するために使用される。
【０５０５】
別の特定の実施形態において、本発明のポリペプチド、抗体、ポリヌクレオチド、および／またはアゴニストもしくはアンタゴニストはまた、例えば、動脈壁における単球浸潤を妨げることによって、アテローム性動脈硬化症を処置するために使用され得る。
【０５０６】
別の特定の実施形態において、本発明のポリペプチド、抗体、ポリヌクレオチド、および／またはアゴニストもしくはアンタゴニストは、成人呼吸促進症候群（ＡＲＤＳ）を処置するために使用され得る。
【０５０７】
別の特定の実施形態において、本発明のポリペプチド、抗体、ポリヌクレオチド、および／またはアゴニストもしくはアンタゴニストは、創傷および組織の修復の刺激、新脈管形成の刺激、血管またはリンパの疾患または障害の修復の刺激において有用であり得る。さらに、本発明のアゴニストおよびアンタゴニストは、粘膜表面の再生を刺激するために使用され得る。
【０５０８】
特定の実施形態において、ポリヌクレオチドもしくはポリペプチド、および／またはそれらのアゴニストは、原発性または後天性の免疫不全、欠損性の血清免疫グロブリン産生、再発性の感染および／または免疫系機能不全によって特徴付けられる障害を処置または予防するために使用される。さらに、ポリヌクレオチドもしくはポリペプチド、および／またはそれらのアゴニストは、関節、骨、皮膚および／または耳下腺の感染、血液由来の感染（例えば、敗血症、髄膜炎、敗血症性関節炎および／または骨髄炎）、自己免疫疾患（例えば、本明細書中に開示されるような自己免疫疾患）、炎症性障害、および悪性疾患、ならびに／あるいはこれらの感染、疾患、障害および／または悪性疾患に関連する任意の疾患または障害または状態（ＣＶＩＤ、他の原発性免疫不全、ＨＩＶ疾患、ＣＬＬ、再発性気管支炎、静脈洞炎、中耳炎、結膜炎、肺炎、肝炎、髄膜炎、帯状ヘルペス（例えば、重篤な帯状ヘルペス）および／またはニューモシスティスを含むが、これらに限定されない）を処置または予防するために使用され得る。本発明のポリヌクレオチドまたはポリペプチド、および／またはアゴニストによって予防、診断、または処置され得る他の疾患および傷害として、ＨＩＶ感染、ＨＴＬＶ−ＢＬＶ感染、リンパ球減少、食細胞殺細菌機能不全、血小板減少、およびヘモグロビン尿症が挙げられるが、それらに限定されない。
【０５０９】
別の実施形態において、本発明のポリヌクレオチド、ポリペプチド、抗体、および／またはアゴニストもしくはアンタゴニストは、分類不能型免疫不全「ＣＶＩＤ」；「後天性無ガンマグロブリン血症」および「後天性低ガンマグロブリン血症」としても公知である）またはこの疾患のサブセットを有する個体を、処置および／または診断するために使用される。
【０５１０】
特定の実施形態において、本発明のポリヌクレオチド、ポリペプチド、抗体、および／またはアゴニストもしくはアンタゴニストは、自己免疫細胞あるいは、組織関連癌または新生物を含む癌または新生物の処置、診断、および／または予防に使用され得る。本発明のポリヌクレオチド、ポリペプチド、抗体、および／またはアゴニストもしくはアンタゴニストによって、予防、診断または処置され得る癌または新生物の例は、本明細書中に記載され、そして以下が挙げられる：急性骨髄性白血病、慢性骨髄性白血病、ホジキン病、非ホジキンリンパ腫、急性リンパ性白血病（ＡＬＬ）、慢性リンパ性白血病、プラスマ細胞腫、多発性骨髄腫、バーキットリンパ腫、ＥＢＶ変換性（ＥＢＶ−ｔｒａｎｓｆｏｒｍｅｄ）疾患。好ましい実施例において、本明細書において記載されるように毒素または放射性同位元素に結合した、本発明のポリヌクレオチド、ポリペプチド、抗体、および／またはアゴニストもしくはアンタゴニストを用いて、癌および新生物を処置、診断、および／または予防し得る。さらなる好ましい実施形態において、本明細書において記載されるように毒素または放射性同位元素に結合した、本発明のポリヌクレオチド、ポリペプチド、抗体、および／またはアゴニストもしくはアンタゴニストを用いて、急性骨髄性白血病を処置、診断および／または予防し得る。
【０５１１】
別の特定の実施形態において、本発明のポリペプチド、抗体、ポリヌクレオチド、および／またはアゴニストもしくはアンタゴニストは、ラージＢ細胞リンパ腫の細胞増殖を減少するための治療として使用される。
【０５１２】
別の特定の実施形態において、本発明のポリペプチド、抗体、ポリヌクレオチド、および／またはアゴニストもしくはアンタゴニストは、慢性骨髄性白血病に関連するＢ細胞およびＩｇの関与を減少する手段として使用される。
【０５１３】
特定の実施形態において、本発明の組成物は、Ｂ細胞免疫不全個体（例えば、部分的または完全な脾臓摘出術をうけた個体など）の間で免疫応答性をブーストするための因子として使用される。
【０５１４】
例えば、本発明のアンタゴニストとしては、結合抗体および／または阻害抗体、アンチセンス核酸、リボザイムあるいは可溶性形態の本発明のポリペプチド（例えば、Ｆｃ融合タンパク質；例えば、実施例９を参照のこと）が挙げられる。例えば、本発明のアゴニストとしては、結合抗体または刺激抗体、および可溶性形態のポリペプチド（例えば、Ｆｃ融合タンパク質；例えば、実施例９を参照のこと）が挙げられる。本発明のポリペプチド、抗体、ポリヌクレオチド、および／またはアゴニストもしくはアンタゴニストは、本明細書中に記載されるように、例えば薬学的に受容可能なキャリアとともに組成物において使用され得る。
【０５１５】
別の実施形態において、本発明のポリペプチド、抗体、ポリヌクレオチド、および／またはアゴニストもしくはアンタゴニストは、機能的な内因性抗体分子を産生できないか、さもなければ易感染性の内因性免疫系を有するが、別の動物由来の再構成されたか、または部分的に再構成された免疫系によってヒト免疫グロブリン分子を産生し得る、動物（上記に列挙した動物を含むがこれに限定されず、またトランスジェニック動物も含む）へ投与される（例えば、ＰＣＴ公開番号、ＷＯ９８／２４８９３、ＷＯ９６／３４０９６、ＷＯ９６／３３７３５、およびＷＯ９１／１０７４１を参照のこと）。さらに、このような動物への本発明のポリペプチド、抗体、ポリヌクレオチドおよび／またはアゴニスト、もしくはアンタゴニストの投与は、本発明のポリペプチド、抗体、ポリヌクレオチドおよび／またはアゴニスト、もしくはアンタゴニストに対するモノクローナル抗体の産生に有用である。
【０５１６】
さらに本発明のポリヌクレオチド、ポリペプチド、および／またはアゴニストもしくはアンタゴニストは、アポトーシスに影響し得、したがって細胞生存の増大またはアポトーシスの阻害に関する多くの疾患を処置する際に有用である。例えば、本発明のポリヌクレオチド、ポリペプチド、および／またはアンタゴニストを用いて処置または検出し得る細胞生存の増大またはアポトーシスの阻害に関する疾患としては、以下が挙げられる：癌（例えば、濾胞性リンパ腫、ｐ５３変異を伴う癌、およびホルモン依存性腫瘍（以下を含むが、これらに限定されない：結腸癌、心臓性腫瘍（ｃａｒｄｉａｃ　ｔｕｍｏｒｓ）、膵臓癌、黒色腫、網膜芽腫、神経膠芽腫、肺癌、腸癌、精巣癌、胃癌、神経芽腫、粘液腫、筋腫、リンパ腫、内皮腫、骨芽細胞腫、骨巨細胞腫、骨肉腫、軟骨肉腫、腺腫、乳癌、前立腺癌、カポージ肉腫、および卵巣癌））；自己免疫障害（例えば、多発性硬化症、シェーグレン症候群、橋本甲状腺炎、胆汁性肝硬変、ベーチェット病（Ｂｅｈｃｅｔ’ｓ　ｄｉｓｅａｓｅ）、クローン病、多発性筋炎、全身性エリテマトーデス、ならびに免疫性糸球体腎炎（ｉｍｍｕｎｅ−ｒｅｌａｔｅｄ　ｇｌｏｍｅｒｕｌｏｎｅｐｈｒｉｔｉｓ）および慢性関節リウマチ）ならびにウイルス感染（例えば、ヘルペスウイルス、ポックスウイルスおよびアデノウイルス）炎症、対宿主性移植片病、急性移植片拒絶、ならびに慢性移植片拒絶。
【０５１７】
好ましい実施形態において、本発明のポリヌクレオチド、ポリペプチド、および／またはアンタゴニストを用いて、癌（特に上に列挙したもの）の増殖、進行、および／または転移を阻害する。
【０５１８】
本発明のポリヌクレオチド、ポリペプチド、および／またはアンタゴニストによって、処置または検出され得る、細胞の生存を増大させることに関するさらなる疾患または状態としては、以下の進行および／または転移が挙げられるが、これらに限定されない：悪性腫瘍および関連する障害（例えば、白血病（急性白血病（例えば、急性リンパ性白血病、急性骨髄性白血病（骨髄芽球性白血病、前骨髄性白血病（ｐｒｏｍｙｅｌｏｃｙｔｉｃ）、骨髄単球性白血病、単球性白血病および赤白血病を含む））、ならびに慢性白血病（例えば、慢性骨髄性白血病（顆粒球性白血病）および慢性リンパ性白血病）を含む）、真性赤血球増加、リンパ腫（例えば、ホジキン病および非ホジキン病）、多発性骨髄腫、ヴァルデンストレームマクログロブリン血症、Ｈ鎖病、および固形腫瘍（これらは、以下が挙げられるが、これらに限定されない：肉腫および癌（例えば、線維肉腫、粘液肉腫、脂肪肉腫、軟骨肉腫、骨原性肉腫、脊索腫、血管肉腫、内皮性肉腫（ｅｎｄｏｔｈｅｌｉｏｓａｒｃｏｍａ）、リンパ管肉腫、リンパ管内皮腫、骨膜腫、中皮腫、ユーイング腫、平滑筋肉腫、横紋筋肉腫、結腸癌、膵臓、乳癌、卵巣癌、前立腺癌、扁平上皮癌、基底細胞癌、腺癌、汗腺癌、皮脂腺癌、乳頭状癌、乳頭状腺癌、嚢胞腺癌、髄様癌、気管支原生癌、腎細胞癌、ヘパトーム、胆管癌、絨毛癌、セミノーマ、胎生期癌、ウィルムス腫、頚部癌、精巣癌、肺癌、小細胞肺癌、膀胱癌、上皮癌、神経膠腫、星状細胞腫、髄芽腫、頭蓋咽頭腫、脳室上衣細胞腫、松果体腫、血管芽細胞腫（ｅｍａｎｇｉｏｂｌａｓｔｏｍａ）、聴神経鞘腫（ａｃｏｕｓｔｉｃ　ｎｅｕｒｏｍａ）、乏突起神経膠腫、髄膜腫（ｍｅｎａｎｇｉｏｍａ）、黒色腫、神経芽腫、ならびに網膜芽腫））。
【０５１９】
本発明のポリヌクレオチド、ポリペプチド、および／またはアンタゴニストによって、処置または検出され得る、アポトーシスを増大させることに関する疾患は、以下を含む：ＡＩＤＳ；神経変性障害（例えば、アルツハイマー病、パーキンソン病、筋萎縮性側索硬化症、色素性網膜炎、小脳変性、および脳腫瘍または原発性関連疾患（ｐｒｉｏｒ　ａｓｓｏｃｉａｔｅｄ　ｄｉｓｅａｓｅ））；自己免疫障害（例えば、多発性硬化症、シェーグレン症候群、橋本甲状腺炎、胆汁性肝硬変、ベーチェット病（Ｂｅｈｃｅｔ’ｓ　ｄｉｓｅａｓｅ）、クローン病、多発性筋炎、全身性エリテマトーデス、および免疫関連糸球体腎炎（ｉｍｍｕｎｅ−ｒｅｌａｔｅｄ　ｇｌｏｍｅｒｕｌｏｎｅｐｈｒｉｔｉｓ）および慢性関節リウマチ）、脊髄形成異常症候群（例えば、再生不良性貧血）、対宿主性移植片病、虚血性障害（例えば、心筋梗塞、発作、および再灌流障害に起因するもの）、肝障害（例えば、肝炎に関連する肝障害、虚血／再灌流障害、胆汁うっ滞（ｃｈｏｌｅｓｔｏｓｉｓ）（胆管障害）、および肝癌）；毒素誘導性肝疾患（例えば、アルコールに起因するもの）、敗血症性ショック、悪液質ならびに食欲不振。
【０５２０】
本発明のポリヌクレオチド、ポリペプチド、および／またはアンタゴニストによって、処置および／または検出され得る、過剰増殖性の疾患および／または障害としては、以下が挙げられるが、これらに限定されない：肝、腹部、骨、胸、消化器系、膵臓、腹膜、内分泌腺（副腎、上皮小体、下垂体、精巣、卵巣、胸腺、甲状腺）、眼、頭、および首、神経系（中枢神経および末梢神経）、リンパ系、骨盤、皮膚、柔組織、脾臓、胸郭および泌尿性器路に位置する新生物。
【０５２１】
同様に、他の過剰増殖障害もまた、本発明のポリヌクレオチド、ポリペプチド、および／またはアンタゴニストによって、処置または検出され得る。このような過剰増殖障害の例としては、以下が挙げられるが、これらに限定されない：高ガンマグロブリン血症、リンパ球増殖障害、パラプロテイン血症、紫斑病、サルコイドーシス、セザリー症候群、ヴァルデンストレームマクログロブリン血症、ゴシェ病、組織球増殖症、および新形成に加えて、上に列挙した器官系に位置する他の任意の過剰増殖障害。
【０５２２】
（過剰増殖性障害）
本発明のポリヌクレオチド、もしくはポリペプチド、またはアゴニストもしくはアンタゴニストは、過剰増殖性障害（新生物を含む）を処置または検出するために使用され得る。本発明のポリヌクレオチド、もしくはポリペプチド、またはアゴニストもしくはアンタゴニストは、直接的相互作用または間接的相互作用を通して、障害の増殖を阻害し得る。あるいは、本発明のポリヌクレオチド、もしくはポリペプチド、またはアゴニストもしくはアンタゴニストは、過剰増殖性障害を阻害し得る他の細胞を増殖し得る。
【０５２３】
例えば、免疫応答を増加させることによって、特に、過剰増殖性障害の抗原性の質を増加させることかまたはＴ細胞を増殖、分化、もしくは動員することによって、過剰増殖性障害は処置され得る。この免疫応答は、既存の免疫応答を増強することか、または新たな免疫応答を開始することのいずれかによって増加され得る。あるいは、免疫応答を減少させることはまた、過剰増殖性障害を処置する方法であり得る（例えば、化学療法剤）。
【０５２４】
本発明のポリヌクレオチド、もしくはポリペプチド、またはアゴニストもしくはアンタゴニストによって処置または検出され得る過剰増殖性障害の例としては、以下が挙げられるが、これらに限定されない：結腸、腹部、骨、乳房、消化器系、肝臓、膵臓、腹膜、内分泌腺（腎上体、上皮小体、下垂体、精巣、卵巣、胸腺、甲状腺）、眼、頭頸部、神経（中枢および末梢）、リンパ系、骨盤、皮膚、軟組織、脾臓、胸郭、および泌尿性器管に位置づけられる新生物。
【０５２５】
同様に、他の過剰増殖性障害もまた、本発明のポリヌクレオチド、もしくはポリペプチド、またはアゴニストもしくはアンタゴニストによって処置または検出され得る。このような過剰増殖性障害の例としては、以下が挙げられるが、これらに限定されない：高ガンマグロブリン血症、リンパ増殖性（ｌｙｍｐｈｏｐｒｏｌｉｆｅｒａｔｉｖｅ）障害、パラプロテイン血症、紫斑、サルコイドーシス肉腫、セザリー症候群、ヴァルデンストレームマクログロブリン血症、ゴシェ病、組織球増殖症、および新形成に加えて、上に列挙した器官系に位置する他の任意の過剰増殖障害。
【０５２６】
一つの好ましい実施形態は、本発明および／またはそのタンパク質融合物またはそのフラグメントを使用する遺伝子治療によって、異常な細胞分裂を阻害するために本発明のポリヌクレオチドを利用する。
【０５２７】
従って、本発明は、異常に増殖する細胞中に、本発明のポリヌクレオチドを挿入することによって細胞増殖性障害を処置するための方法を提供し、ここでこのポリヌクレオチドは、その発現を抑制する。
【０５２８】
本発明の別の実施形態は、個体において細胞増殖性障害を処置する方法を提供し、この方法は、異常な増殖する細胞（単数または複数）に本発明の１つ以上の活性遺伝子コピーを投与する工程を包含する。好ましい実施形態において、本発明のポリヌクレオチドは、そのポリヌクレオチドをコードするＤＮＡ配列を発現する際に有効な、組換え発現ベクターを含むＤＮＡ構築物である。本発明の別の好ましい実施形態において、本発明のポリヌクレオチドをコードするＤＮＡ構築物は、レトロウイルス（またはより好ましくは、アデノウイルスベクター）を利用して処置されるべき細胞中に、挿入される（Ｇ．Ｊ．Ｎａｂｅｌら、ＰＮＡＳ　１９９９　９６：３２４〜３２６（本明細書により参考として援用される）を参照のこと）。最も好ましい実施形態において、このウイルスベクターは欠損性であり、そして、非増殖細胞を形質転換せず、増殖する細胞のみ形質転換する。さらに、好ましい実施形態において、単独でか、他のポリヌクレオチドと組み合わせてか、または他のポリヌクレオチドと融合されてのいずれかで、増殖する細胞中に挿入される本発明のポリヌクレオチドは、その後、外部刺激（すなわち、磁気、特定の低分子、化学物質または薬物の投与など）を介して調節され得、この外部刺激は、コードされるタンパク質産物の発現を誘導するように、このポリヌクレオチドの上流のプロモーターに対して作用する。このように、本発明の有益な治療効果は、この外部刺激に基づいて明らかに調節され（すなわち、本発明の発現を増加、減少または阻害し）得る。
【０５２９】
本発明のポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、他の脈管形成タンパク質をコードする他のポリヌクレオチドと一緒に投与され得る。脈管形成タンパク質の例としては、酸性および塩基性の線維芽細胞増殖因子、ＶＥＧＦ−１、ＶＥＧＦ−２、ＶＥＧＦ−３、上皮増殖因子αおよびβ、血小板由来内皮細胞増殖因子、血小板由来増殖因子、腫瘍壊死因子α、肝細胞増殖因子、インスリン様増殖因子、コロニー刺激因子、マクロファージコロニー刺激因子、顆粒球／マクロファージコロニー刺激因子、および一酸化窒素シンターゼが挙げられるが、これらに限定されない。
【０５３０】
本発明のポリヌクレオチドは、腫瘍性遺伝子または抗原の発現を抑制するにおいて有用であり得る。「腫瘍性遺伝子の発現を抑制する」とは、この遺伝子の転写の抑制、この遺伝子転写物（プレメッセージＲＮＡ）の破壊、スプライシングの阻害、メッセンジャーＲＮＡの破壊、タンパク質の翻訳後改変の妨害、タンパク質の崩壊、またはタンパク質の正常な機能の阻害を意図する。
【０５３１】
異常に増殖している細胞への局所投与のために、本発明のポリヌクレオチドは、当業者に公知の任意の方法によって投与され得る。この方法には、トランスフェクション、エレクトロポレーション、細胞の微量注入、もしくはリポソームのようなビヒクル中、リポフェクチン、または裸のポリヌクレオチドとして、あるいは、本明細書全体を通して記載される任意の他の方法が挙げられるが、これらに限定されない。本発明のポリヌクレオチドは、当業者に公知のレトロウイルスベクター（Ｇｉｌｂｏａ，Ｊ．Ｖｉｒｏｌｏｇｙ　４４：８４５（１９８２）；Ｈｏｃｋｅ，Ｎａｔｕｒｅ　３２０：２７５（１９８６）；Ｗｉｌｓｏｎら，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．Ｕ．Ｓ．Ａ．８５：３０１４）、ワクシニアウイルス系（Ｃｈａｋｒａｂａｒｔｙら，Ｍｏｌ．Ｃｅｌｌ　Ｂｉｏｌ．５：３４０３（１９８５）、または他の効率的なＤＮＡ送達系（Ｙａｔｅｓら，Ｎａｔｕｒｅ　３１３：８１２（１９８５））のような公知の遺伝子送達系（しかし、これらに限定されない）によって送達され得る。これらの参考文献は例示のみであり、そして本明細書中で参考として援用される。異常に増殖している細胞を特異的に送達またはトランスフェクトし、そして非分裂の細胞を残すために、当業者に公知のレトロウイルス、またはアデノウイルス（当該分野において記載され、そして本明細書中の他の箇所において記載されるような）送達系を利用することが好ましい。宿主ＤＮＡ複製は、レトロウイルスＤＮＡを組み込むために必要とされ、そしてレトロウイルスは、その生活環に必要とされるレトロウイルス遺伝子を欠損するので、自律複製し得ない。本発明のポリヌクレオチドのためにこのようなレトロウイルス送達系を利用することは、この遺伝子および構築物を異常に増殖している細胞へと標的化し、そして分裂していない正常細胞を残す。
【０５３２】
本発明のポリヌクレオチドは、疾患部位に直接的に注射針をガイドするために使用される画像化デバイスを使用することによって、内部の器官、体腔などにおける細胞増殖性障害／疾患の部位に直接的に送達され得る。本発明のポリヌクレオチドはまた、外科的介入の時点で、疾患部位に投与され得る。
【０５３３】
「細胞増殖性疾患」とは、良性であろうと悪性であろうと、細胞、細胞群、または組織の単一または複数の局所的異常増殖によって特徴付けられる、器官、腔、または身体部分のいずれか１つまたはいずれかの組み合わせに罹患する、ヒトまたは動物の任意の疾患または障害を意味する。
【０５３４】
本発明のポリヌクレオチドの任意の量が、それらが処理された細胞の増殖に対して生物学的に阻害する効果を有する限り、投与され得る。さらに、同一部位に同時に、本発明の１より多くのポリヌクレオチドを投与することが可能である。「生物学的に阻害する」とは、部分的または全体的な増殖阻害、ならびに細胞の増殖または成長の速度減少を意味する。生物学的に阻害性の用量は、組織培養物中の標的悪性疾患または異常に増殖している細胞増殖、動物および細胞培養物中の腫瘍増殖に対する本発明のポリヌクレオチドの効果を評価することによって、または当業者に公知の任意の他の方法によって、決定され得る。
【０５３５】
本発明はさらに、記載された１以上の障害を処置するために、哺乳動物（好ましくは、ヒト）患者に、抗ポリペプチド抗体および抗ポリヌクレオチド抗体を投与することを包含する、抗体に基づく治療に関する。抗ポリペプチド抗体、および抗ポリヌクレオチド抗体であるポリクローナル抗体およびモノクローナル抗体を産生する方法は、本明細書中の他の箇所で詳細に記載されている。このような抗体は、当業者に公知または本明細書中に記載のような薬学的に受容可能な組成物において提供され得る。
【０５３６】
本発明の抗体が治療的に使用され得る様式をまとめると、身体内に局所的または全身的に本発明のポリヌクレオチドまたはポリペプチドを結合させることか、または抗体の直接的な細胞傷害性によるか（例えば、補体（ＣＤＣ）によるか、またはエフェクター細胞（ＡＤＣＣ）によって媒介されるような）が挙げられる。これらのアプローチのいくつかは、以下により詳細に記載される。本明細書中に提供される教示を携えて、当業者は、過度な実験を伴わずに、診断目的、モニタリング目的、または治療目的のために本発明の抗体を使用する方法を知る。
【０５３７】
特に、本発明の抗体、フラグメント、および誘導体は、本明細書中に記載のような細胞の増殖および／または分化障害を有するかまたは発生させている被験体を処置するために有用である。このような処置は、単回用量または複数回用量の抗体、またはそれらのフラグメント、誘導体、もしくは結合体を投与する工程を包含する。
【０５３８】
本発明の抗体は、他のモノクローナル抗体もしくはキメラ抗体と組み合わせて、またはリンホカインもしくは造血性増殖因子（例えば、抗体と相互作用するエフェクター細胞の数または活性を増加させるように作用する）と組み合わせて、有利なように利用され得る。
【０５３９】
本発明のポリヌクレオチドまたはポリペプチド（それらのフラグメントを含む）に関連した障害に関するイムノアッセイおよびその障害の治療の両方のために、本発明のポリペプチドもしくはポリヌクレオチド、それらのフラグメントもしくは領域に対して高親和性であり、および／またはインビボで強力に阻害および／または中和する抗体を使用することが好ましい。このような抗体、フラグメント、または領域は、好ましくは、ポリヌクレオチドまたはポリペプチド（それらのフラグメントを含む）に対して親和性を有する。好ましい結合親和性としては、５×１０−６Ｍ，１０−６Ｍ，５×１０−７Ｍ，１０−７Ｍ，５×１０−８Ｍ，１０−８Ｍ，５×１０−９Ｍ，１０−９Ｍ，５×１０−１０Ｍ，１０−１０Ｍ，５×１０−１１Ｍ，１０−１１Ｍ，５×１０−１２Ｍ，１０−１２Ｍ，５×１０−１３Ｍ，１０−１３Ｍ，５×１０−１４Ｍ，１０−１４Ｍ，５×１０−１５Ｍ，および１０−１５Ｍ未満の解離定数またはＫｄを有するものが挙げられる。
【０５４０】
さらに、本発明のポリペプチドは、単独でか、タンパク質融合物としてか、または本明細書中の他の箇所に記載されるように直接的または間接的に他のポリペプチドと組み合わせるかのいずれかで、増殖性の細胞または組織の新脈管形成を阻害するにおいて有用である。最も好ましい実施形態では、この抗新脈管形成作用は、例えば、造血性腫瘍特異的細胞（例えば、腫瘍関連マクロファージ）の阻害を通して、間接的に達成され得る（Ｊｏｓｅｐｈ　ＩＢら，Ｊ　Ｎａｔｌ　Ｃａｎｃｅｒ　Ｉｎｓｔ，９０（２１）：１６４８〜５３（１９９８）（本明細書中で参考として援用される）を参照のこと）。本発明のポリペプチドまたはポリヌクレオチドに対して指向した抗体はまた、直接的または間接的に、新脈管形成の阻害を引き起こし得る（Ｗｉｔｔｅ　Ｌら，Ｃａｎｃｅｒ　Ｍｅｔａｓｔａｓｉｓ　Ｒｅｖ．１７（２）：１５５〜６１（１９９８）（本明細書中で参考として援用される）を参照のこと）。
【０５４１】
本発明のポリペプチド（タンパク質融合物を含む）またはそのフラグメントは、アポトーシスの誘導を通して増殖性の細胞または組織を阻害するにおいて有用であり得る。このポリペプチドは、例えば、死ドメイン（ｄｅａｔｈ−ｄｏｍａｉｎ）レセプター（例えば、腫瘍壊死因子（ＴＮＦ）レセプター−１、ＣＤ９５（Ｆａｓ／ＡＰＯ−１）、ＴＮＦレセプター関連アポトーシス媒介性タンパク質（ＴＲＡＭＰ）およびＴＮＦ関連アポトーシス誘導リガンド（ＴＲＡＩＬ）レセプター−１および−２（Ｓｃｈｕｌｚｅ−Ｏｓｔｈｏｆｆ　Ｋら，Ｅｕｒ　Ｊ　Ｂｉｏｃｈｅｍ　２５４（３）：４３９−５９（１９９８）（本明細書中で参考として援用される）を参照のこと））の活性化において、増殖性の細胞および組織のアポトーシスを誘導するように、直接的または間接的のいずれかで作用し得る。さらに、本発明の別の好ましい実施形態では、このポリペプチドは、アポトーシスを活性化する他のタンパク質の活性化におけるような他の機構を通してか、あるいは単独または低分子薬物もしくはアジュバント（例えば、アポプトニン（ａｐｏｐｔｏｎｉｎ）、ガレクチン（ｇａｌｅｃｔｉｎ）、チオレドキシン、抗炎症性タンパク質（例えば、Ｍｕｔａｔ　Ｒｅｓ　４００（１〜２）：４４７〜５５（１９９８），Ｍｅｄ　Ｈｙｐｏｔｈｅｓｅｓ．５０（５）：４２３〜３３（１９９８），Ｃｈｅｍ　Ｂｉｏｌ　Ｉｎｔｅｒａｃｔ．Ａｐｒ　２４；１１１〜１１２：２３〜３４（１９９８），Ｊ　Ｍｏｌ　Ｍｅｄ．７６（６）：４０２〜１２（１９９８），Ｉｎｔ　Ｊ　Ｔｉｓｓｕｅ　Ｒｅａｃｔ；２０（１）：３〜１５（１９９８）（これらはすべて、本明細書中で参考として援用される）を参照のこと））と組み合わせてかのいずれかで、このタンパク質の発現を刺激することを通して、アポトーシスを誘導し得る。
【０５４２】
本発明のポリペプチド（それに対するタンパク質融合物を含む）、またはそのフラグメントは、増殖性細胞または組織の転移を阻害する際に有用である。阻害は、本明細書中他の箇所に記載されるように、ポリペプチドまたは上記ポリペプチドに対する抗体を投与する工程の直接的結果として、または間接的に（例えば、転移を阻害することが公知のタンパク質（例えば、α４インテグリン）の発現を活性化する）生じ得る（例えば、本明細書中に参考として援用される、Ｃｕｒｒ　Ｔｏｐ　Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌ　Ｉｍｍｕｎｏｌ　１９９８；２３１：１２５〜４１を参照のこと）。本発明のこのような治療的影響は、単独で、または低分子薬物もしくはアジュバントと組み合わせてかのいずれかで達成され得る。
【０５４３】
別の実施形態において、本発明は、本発明のポリペプチド（例えば、ポリペプチドまたは異種ポリペプチドに関連するポリペプチド抗体、異種核酸、毒素、またはプロドラッグを含む組成物）を含む組成物を、本発明のポリペプチドを発現する、標的とされた細胞に送達する方法を提供する。本発明のポリペプチドまたはポリペプチド抗体は、異種ポリペプチド、異種核酸、毒素、またはプロドラッグと、疎水性、親水性、イオン性および／または共有結合的な相互作用を通じて結合され得る。
【０５４４】
本発明のポリペプチド、それに対するタンパク質融合物、またはそのフラグメントは、増殖性抗原および免疫原に対して、直接的（例えば、本発明のポリペプチドが「ワクチン接種」された場合、上記の増殖性の抗原および免疫原に対して応答するように免疫応答を生じる）または間接的（例えば、免疫応答を増強することが公知のタンパク質（例えば、ケモカイン）の発現を活性化することにおいて）のいずれかで、増殖している細胞または組織の免疫原性および／または抗原性を増強する際に有用である。
【０５４５】
（心臓血管障害）
本発明のポリヌクレオチドもしくはポリペプチド、またはアゴニストもしくはアンタゴニストを使用して、四肢虚血のような末梢動脈疾患を含む心臓血管障害を処置し得る。
【０５４６】
心臓血管障害としては、動動脈瘻（ａｒｔｅｒｉｏ−ａｒｔｅｒｉａｌ　ｆｉｓｔｕｌａ）、動静脈瘻、大脳動静脈先天異常、先天性心欠陥（ｃｏｎｇｅｎｉｔａｌ　ｈｅａｒｔ　ｄｅｆｅｃｔｓ）、肺動脈弁閉鎖症、およびシミター症候群のような心臓血管異常が挙げられる。先天性心欠陥としては、大動脈縮窄、三房心、冠状脈管奇形（ｃｏｒｏｎａｒｙ　ｖｅｓｓｅｌ　ａｎｏｍａｌｉｅｓ）、交差心、右胸心、開存性動脈管（ｐａｔｅｎｔ　ｄｕｃｔｕｓ　ａｒｔｅｒｉｏｓｕｓ）、エブスタイン奇形、アイゼンメンガー複合体、左心室発育不全症候群、左胸心、ファロー四徴症、大血管転位症、両大血管右室起始症、三尖弁閉鎖症、動脈管遺残、および心中隔欠損症（ｈｅａｒｔ　ｓｅｐｔａｌ　ｄｅｆｅｃｔｓ）（例えば、大動脈肺動脈中隔欠損症（ａｏｒｔｏｐｕｌｍｏｎａｒｙ　ｓｅｐｔａｌ　ｄｅｆｅｃｔ）、心内膜床欠損症、リュタンバッシェ症候群、ファロー三徴症、心室心中隔欠損症（ｖｅｎｔｒｉｃｕｌａｒ　ｈｅａｒｔ　ｓｅｐｔａｌ　ｄｅｆｅｃｔｓ））が挙げられる。
【０５４７】
心臓血管障害としてはまた、不整脈、カルチノイド心臓病、高心拍出量（ｈｉｇｈ　ｃａｒｄｉａｃ　ｏｕｔｐｕｔ）、低心拍出量（ｌｏｗ　ｃａｒｄｉａｃ　ｏｕｔｐｕｔ）、心タンポナーデ、心内膜炎（細菌性を含む）、心臓動脈瘤、心停止、うっ血性心不全、うっ血性心筋症、発作性呼吸困難、心臓水腫、心肥大、うっ血性心筋症、左心室肥大、右心室肥大、梗塞後心破裂（ｐｏｓｔ−ｉｎｆａｒｃｔｉｏｎ　ｈｅａｒｔ　ｒｕｐｔｕｒｅ）、心室中隔破裂、心臓弁疾患、心筋疾患、心筋虚血、心内膜液浸出、心外膜炎（梗塞性および結核性を含む）、気心膜症、心膜切開後症候群、右心疾患、リウマチ性心疾患、心室機能不全、充血、心臓血管妊娠合併症（ｃａｒｄｉｏｖａｓｃｕｌａｒ　ｐｒｅｇｎａｎｃｙ　ｃｏｍｐｌｉｃａｔｉｏｎｓ）、シミター症候群、心血管梅毒、および心血管結核（ｃａｒｄｉｏｖａｓｃｕｌａｒ　ｔｕｂｅｒｃｕｌｏｓｉｓ）のような心臓病が挙げられる。
【０５４８】
不整脈としては、洞性不整脈、心房性細動、心房粗動、徐脈、期外収縮、アダムズ−ストークス症候群、脚ブロック、洞房ブロック、長ＱＴ症候群（ｌｏｎｇ　ＱＴ　ｓｙｎｄｒｏｍｅ）、副収縮、ローン−ギャノング−レヴァイン症候群、マヘーム型早期興奮症候群（Ｍａｈａｉｍ−ｔｙｐｅ　ｐｒｅ−ｅｘｃｉｔａｔｉｏｎ　ｓｙｎｄｒｏｍｅ）、ウルフ−パーキンソン−ホワイト症候群、洞不全症候群、頻拍、および心室性細動が挙げられる。頻拍としては、発作性頻拍、上室性頻拍、心室固有調律促進、房室結節性再入頻拍（ａｔｒｉｏｖｅｎｔｒｉｃｕｌａｒ　ｎｏｄａｌ　ｒｅｅｎｔｒｙ　ｔａｃｈｙｃａｒｄｉａ）、異所心房性頻拍、異所接合部頻拍、洞房結節性再入頻拍（ｓｉｎｏａｔｒｉａｌ　ｎｏｄａｌ　ｒｅｅｎｔｒｙ　ｔａｃｈｙｃａｒｄｉａ）、洞性頻拍、トルサード・ド・ポワント、および心室性頻拍が挙げられる。
【０５４９】
心臓弁疾患としては、大動脈弁機能不全症、大動脈弁狭窄症、心雑音（ｈｅａｒ　ｍｕｒｍｕｒｓ）、大動脈弁逸脱症、僧帽弁逸脱症、三尖弁逸脱症、僧帽弁機能不全、僧帽弁狭窄症、肺動脈弁閉鎖症、肺動脈弁機能不全、肺動脈弁狭窄症、三尖閉鎖症、三尖弁機能不全、および三尖弁狭窄症が挙げられる。
【０５５０】
心筋疾患としては、アルコール性心筋症、うっ血性心筋症、肥大型心筋症、弁下部性大動脈狭搾症、弁下部性肺動脈狭搾症、拘束型心筋症、シャーガス心筋症、心内膜線維弾性症、心内膜心筋線維症、キーンズ症候群、心筋再灌流障害、および心筋炎が挙げられる。
【０５５１】
心筋性虚血としては、狭心症、冠動脈瘤、冠動脈硬化、冠動脈血栓症、冠動脈血管痙攣、心筋梗塞、および心筋気絶（ｍｙｏｃａｒｄｉａｌ　ｓｔｕｎｎｉｎｇ）のような冠動脈疾患が挙げられる。
【０５５２】
心臓血管疾患としてはまた、動脈瘤、血管形成異常、血管腫症、細菌性血管腫症状、ヒッペル−リンダラ疾患（Ｈｉｐｐｅｌ−Ｌｉｎｄａｕ　Ｄｉｓｅａｓｅ）、クリペル−トルノネー−ウェーバー症候群、スタージ−ウェーバー症候群、血管運動神経性水腫、大動脈疾患、高安動脈炎、大動脈炎、ルリーシュ症候群、動脈閉塞疾患、動脈炎、動脈内膜炎（ｅｎａｒｔｅｒｉｔｉｓ）、結節性多発性動脈炎、脳血管障害、糖尿病性血管障害、糖尿病性網膜症、塞栓症、血栓症、先端紅痛症、痔、肝静脈閉塞障害、高血圧、低血圧、虚血、末梢血管障害、静脈炎、肺静脈閉塞疾患、レーノー病、ＣＲＥＳＴ症候群、網膜静脈閉塞、シミター症候群、上大静脈症候群、毛細血管拡張症、毛細血管拡張性運動失調（ａｔａｃｉａ　ｔｅｌａｎｇｉｅｃｔａｓｉａ）、遺伝性出血性毛細管拡張症、精索静脈瘤、拡張蛇行静脈、静脈瘤性潰瘍、脈管炎、および静脈機能不全のような血管疾患が挙げられる。
【０５５３】
動脈瘤としては、解離性動脈瘤、偽動脈瘤、感染した動脈瘤、破裂した動脈瘤、大動脈性動脈瘤、大脳性動脈瘤、冠動脈瘤、心動脈瘤、および腸骨性動脈瘤が挙げられる。
【０５５４】
動脈閉塞疾患としては、動脈硬化症、間欠性跛行、頸動脈狭窄症、線維筋性形成異常、腸間膜性血管閉塞、モヤモヤ病、腎動脈閉塞、網膜動脈閉塞、および閉塞性血栓性血管炎が挙げられる。
【０５５５】
脳血管障害としては、頸動脈疾患、脳のアミロイドアンギオパチー、大脳動脈瘤、大脳無酸素症、大脳動脈硬化、大脳動静脈先天異常、大脳動脈疾患、大脳の塞栓症および血栓症、頸動脈血栓症、洞血栓症、ヴァレンベルク症候群、大脳出血、硬膜上血腫、硬膜下血腫、クモ膜下出血（ｓｕｂａｒａｘｈｎｏｉｄ　ｈｅｍｏｒｒｈａｇｅ）、大脳梗塞、大脳虚血（一過性を含む）、鎖骨下動脈盗血症候群、室周白軟化症（ｐｅｒｉｖｅｎｔｒｉｃｕｌａｒ　ｌｅｕｋｏｍａｌａｃｉａ）、血管性頭痛、群発性頭痛、片頭痛、および椎骨基部（ｖｅｒｔｅｂｒｏｂａｓｉｌａｒ）機能不全が挙げられる。
【０５５６】
塞栓症としては、空気塞栓症、羊水塞栓症、コレステロール塞栓症、爪先チアノーゼ症候群、脂肪塞栓症、肺動脈塞栓症、および血栓塞栓症が挙げられる。血栓症としては、冠状動脈血栓症、肝静脈血栓症、網膜静脈閉塞、頸動脈血栓症、洞血栓症、ヴァレンベルク症候群、および血栓性静脈炎が挙げられる。
【０５５７】
虚血としては、大脳虚血、虚血性大腸炎、仕切り症候群（ｃｏｍｐａｒｔｍｅｎｔ　ｓｙｎｄｒｏｍｅ）、前仕切り症候群（ａｎｔｅｒｉｏｒ　ｃｏｍｐａｒｔｍｅｎｔ　ｓｙｎｄｒｏｍｅ）、心筋虚血、再灌流傷害、および末梢四肢虚血が挙げられる。脈管炎としては、大動脈炎、動脈炎、ベーチェット（Ｂｅｈｃｅｔ）症候群、チャーグ−ストラウス症候群、粘膜皮膚リンパ節症候群、閉塞性血栓性血管炎、過敏性血管炎、シェーンライン−ヘーノホ紫斑病（Ｓｃｈｏｅｎｌｅｉｎ−Ｈｅｎｏｃｈ　ｐｕｒｐｕｒａ）、アレルギー性皮膚血管炎およびヴェーゲナー肉芽腫症が挙げられる。
【０５５８】
本発明のポリヌクレオチドもしくはポリペプチド、またはアゴニストもしくはアンタゴニストは、危険な四肢虚血および冠状動脈疾患の処置に対して特に有効である。
【０５５９】
ポリペプチドは、当該分野で公知である任意の方法を使用して投与され得、これらの方法としては、送達部位における直接的針注射、静脈内注射、局所投与、カテーテル注入、微粒子銃（ｂｉｏｌｉｓｔｉｃ）注射、粒子加速器、ゲルフォームスポンジデポー、他の市販デポー物質、浸透圧ポンプ、経口または坐剤の固形薬学的処方物、手術中のデカンティングまたは局所適用、エアロゾル送達が挙げられるが、これらに限定されない。そのような方法は当該分野で公知である。ポリペプチドは、下記でより詳細に記載される、治療剤（Ｔｈｅｒａｐｅｕｔｉｃ）の一部として投与され得る。ポリヌクレオチドを送達する方法は本明細書中でより詳細に記載される。
【０５６０】
（抗新脈管形成活性）
新脈管形成の内因性の、刺激因子とインヒビターとの間の天然に存在する平衡は、阻害影響が優勢である平衡である。Ｒａｓｔｉｎｅｊａｄら、Ｃｅｌｌ　５６：３４５〜３５５（１９８９）。新生血管形成が正常な生理学的条件下において生じるまれな場合（例えば、創傷治癒、器官再生、胚発生、および雌性生殖プロセス）において、新脈管形成は、厳密に調節され、そして空間的および時間的に定められる。病的な新脈管形成の条件（例えば、固形腫瘍増殖を特徴付ける）の下において、これらの調節の制御はできない。調節されていない新脈管形成は病的になり、そして多くの新生物性疾患および非新生物性疾患の進行を維持する。多くの重篤な疾患は、固形腫瘍の増殖および転移、関節炎、いくつかの型の眼の障害および乾癬を含む、異常な新生血管形成により支配される。例えば、Ｍｏｓｅｓら、Ｂｉｏｔｅｃｈ．９：６３０〜６３４（１９９１）；Ｆｏｌｋｍａｎら、Ｎ．Ｅｎｇｌ．Ｊ．Ｍｅｄ．、３３３：１７５７〜１７６３（１９９５）；Ａｕｅｒｂａｃｈら、Ｊ．Ｍｉｃｒｏｖａｓｃ．Ｒｅｓ．２９：４０１〜４１１（１９８５）；Ｆｏｌｋｍａｎ、Ａｄｖａｎｃｅｓ　ｉｎ　Ｃａｎｃｅｒ　Ｒｅｓｅａｒｃｈ、ＫｌｅｉｎおよびＷｅｉｎｈｏｕｓｅ編、Ａｃａｄｅｍｉｃ　Ｐｒｅｓｓ、Ｎｅｗ　Ｙｏｒｋ、１７５〜２０３頁（１９８５）；Ｐａｔｚ、Ａｍ．Ｊ．Ｏｐｔｈａｌｍｏｌ．９４：７１５〜７４３（１９８２）；およびＦｏｌｋｍａｎら、Ｓｃｉｅｎｃｅ　２２１：７１９〜７２５（１９８３）による概説を参照のこと。多くの病的状態において、新脈管形成のプロセスは、その疾患状態に寄与する。例えば、固形腫瘍の増殖が新脈管形成に依存することを示唆する有意なデータが蓄積されている。ＦｏｌｋｍａｎおよびＫｌａｇｓｂｒｕｎ、Ｓｃｉｅｎｃｅ　２３５：４４２〜４４７（１９８７）。
【０５６１】
本発明は、本発明のポリヌクレオチドおよび／またはポリペプチド、ならびに本発明のアゴニストまたはアンタゴニストの投与による新生血管形成に関連する疾患または障害の処置を提供する。本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチド、またはアゴニストもしくはアンタゴニストを用いて処置し得る悪性状態および転移性状態には、本明細書に記載の悪性疾患、固形腫瘍、および癌、ならびに当該分野で公知の他のもの（このような障害の総説については、Ｆｉｓｈｍａｎら、Ｍｅｄｉｃｉｎｅ、第２版、Ｊ．Ｂ．Ｌｉｐｐｉｎｃｏｔｔ　Ｃｏ．，Ｐｈｉｌａｄｅｌｐｈｉａ（１９８５）を参照のこと）が挙げられるが、これらに限定されない。従って、本発明は、新脈管形成関連疾患および／または障害の処置の方法を提供し、この方法は、治療有効量の、本発明のポリヌクレオチド、ポリペプチド、アンタゴニストおよび／またはアゴニストを、その処置の必要な個体に投与する工程を包含する。例えば、ポリヌクレオチド、ポリペプチド、アンタゴニストおよび／またはアゴニストは、癌または腫瘍を治療的に処置するために、種々のさらなる方法で利用され得る。ポリヌクレオチド、ポリペプチド、アンタゴニストおよび／またはアゴニストで処置され得る癌としては、前立腺癌、肺癌、乳癌、卵巣癌、胃癌、膵臓癌、喉頭癌、食道癌、精巣癌、肝臓癌、耳下腺癌、胆管癌、結腸癌、直腸癌、頸部癌、子宮癌、子宮内膜癌、腎臓癌、膀胱癌、甲状腺癌を含む固形腫瘍；原発性腫瘍および転移；黒色腫；膠芽腫；カポージ肉腫；平滑筋肉腫；非小細胞肺癌；結腸直腸癌；進行性（ａｄｖａｎｃｅｄ）悪性疾患；および血液から生じる腫瘍（例えば、白血病）が挙げられるが、これらに限定されない。例えば、ポリヌクレオチド、ポリペプチド、アンタゴニストおよび／またはアゴニストは、皮膚癌、頭頸部腫瘍、乳房腫瘍およびカポージ肉腫のような癌を処置するために、局所送達され得る。
【０５６２】
なお他の局面において、ポリヌクレオチド、ポリペプチド、アンタゴニストおよび／またはアゴニストは、例えば膀胱内投与によって膀胱癌の浅在形態を処置するために利用され得る。ポリヌクレオチド、ポリペプチド、アンタゴニストおよび／またはアゴニストは、腫瘍に直接的に、または注射もしくはカテーテルを介して腫瘍部位付近に送達され得る。当然のことながら、当業者が理解するように、適切な投与様式は、処置されるべき癌によって変化する。他の送達様式は本明細書中において議論される。
【０５６３】
ポリヌクレオチド、ポリペプチド、アンタゴニストおよび／またはアゴニストは、癌に加えて、他の障害（新脈管形成を含む）を処置する際に有用であり得る。これらの障害としては、以下が挙げられるが、これらに限定されない：良性腫瘍（例えば、血管腫、聴神経腫、神経線維腫、トラコーマ、および化膿性肉芽腫）；動脈硬化プラーク；眼の脈管形成疾患（例えば、糖尿病性網膜症、未熟網膜症、黄斑変性、角膜移植拒絶、血管新生緑内障、水晶体後線維増殖、ルベオーシス、網膜芽細胞腫、ブドウ膜炎（ｕｖｉｅｔｉｓ）および眼の翼状片（Ｐｔｅｒｙｇｉａ）（異常な血管増殖））；慢性関節リウマチ；乾癬；遅延型創傷治癒；子宮内膜症；脈管形成；顆粒化；過形成性瘢痕（ケロイド）；偽関節骨折；強皮症；トラコーマ；血管接着；心筋の新脈管形成；冠状側副枝（ｃｏｒｏｎａｒｙ　ｃｏｌｌａｔｅｒａｌｓ）；大脳側副枝；動静脈奇形；虚血性四肢新脈管形成；オースラー−ウェーバー（Ｏｓｌｅｒ−Ｗｅｂｂｅｒ）症候群；プラーク新生血管形成；毛細血管拡張症；血友病性関節；血管線維腫；線維筋性形成異常；創傷顆粒化；クローン病；およびアテローム性動脈硬化症。
【０５６４】
例えば、本発明の１つの局面において、本発明のポリヌクレオチド、ポリペプチド、アンタゴニストおよび／またはアゴニストを過形成性瘢痕またはケロイドに投与する工程を包含する、過形成性瘢痕およびケロイドを処置するための方法が提供される。
【０５６５】
本発明の１つの実施形態において、ポリヌクレオチド、ポリペプチド、アンタゴニストおよび／またはアゴニストは、過形成性瘢痕またはケロイドに、これらの病変の進行を妨げるために直接注射される。この治療は、過形成性瘢痕およびケロイド（例えば、やけど）の発生を生じることが知られている状態の予防処置において特に価値があり、そして好ましくは、増殖期が進行する時間（最初の傷害の約１４日後）を有した後であるが、過形成性瘢痕またはケロイドの発生の前に開始される。上述のように、本発明はまた、眼の新生血管形成疾患（例えば、角膜新生血管形成、血管新生緑内障、増殖性糖尿病網膜症、水晶体後線維増殖および黄斑変性を含む）を処置するための方法を提供する。
【０５６６】
さらに、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチド（アゴニストおよび／またはアンタゴニストを含む）を用いて処置され得る新生血管形成に関連する眼の障害としては、以下が挙げられるが、これらに限定されない：血管新生緑内障、糖尿病網膜症、網膜芽細胞腫、水晶体後線維増殖症、ブドウ膜炎、未熟網膜症、黄斑変性、角膜移植新生血管形成、ならびに他の眼の炎症性疾患、眼の腫瘍、および脈絡膜または虹彩の新生血管形成に関連する疾患。例えば、Ｗａｌｔｍａｎら、Ａｍ．Ｊ．Ｏｐｈｔｈａｌ．８５：７０４〜７１０（１９７８）およびＧａｒｔｎｅｒら、Ｓｕｒｖ．Ｏｐｈｔｈａｌ．２２：２９１〜３１２（１９７８）による総説を参照のこと。
【０５６７】
従って、本発明の１つの局面において、治療有効量の化合物（上記）を患者に対して、血管の形成が阻害されるように角膜に投与する工程を包含する、角膜新生血管形成（角膜移植片の新生血管形成を含む）のような眼の新生血管形成疾患を処置するための方法が、提供される。簡潔には、角膜は、通常には血管を欠く組織である。しかし、特定の病的状態において、毛細血管は、角膜周囲脈管叢縁から角膜に伸長し得る。角膜が血管化されるようになる場合、角膜もまた混濁されるようになり、患者の視力の衰えを生じる。角膜が完全に不透明になる（ｏｐａｃｉｔａｔｅ）場合に、視力喪失が完全になり得る。広範な種々の障害は、例えば、以下を含む角膜新生血管形成を生じ得る：角膜感染（例えば、トラコーマ、単純ヘルペス角膜炎、リーシュマニア症およびオンコセルカ症）、免疫学的プロセス（例えば、移植片拒絶およびスティーヴンズ−ジョンソン症候群）、アルカリやけど、外傷、炎症（任意の原因による）、毒性および栄養欠乏状態、ならびにコンタクトレンズを装着することの合併症として。
【０５６８】
特に好ましい実施形態において、本発明は、生理食塩水（眼に用いる調製物において一般に使用される任意の保存剤および抗菌剤と組合せて）中で局所投与のために調製され得、そして点眼剤形態で投与され得る。溶液または懸濁液は、その純粋な形態で調製され得、そして１日に数回投与され得る。あるいは、上記のように調製される抗脈管形成組成物はまた、角膜に直接投与され得る。好ましい実施形態において、抗脈管形成組成物は、角膜に結合する粘膜接着性ポリマーとともに調製される。さらなる実施形態において、抗脈管形成因子または抗脈管形成組成物は、従来のステロイド治療に対する補助剤として利用され得る。局所治療はまた、脈管形成応答を誘導する高い可能性を有することが公知である角膜病変（例えば、化学的やけど）において予防的に有用であり得る。これらの場合において、処置（おそらくステロイドと組み合わせられる）は、その後の合併症を予防するのを補助するために直ちに開始され得る。
【０５６９】
他の実施形態において、上記の化合物は、角膜支質に直接、顕微鏡の案内の下で眼科医によって注入され得る。好ましい注射部位は、個々の病巣の形態で変化し得るが、投与の目標は、脈管構造の前進している面に組成物を置くこと（すなわち、血管と正常な角膜との間に分散される）である。ほとんどの場合において、これは、前進している血管から角膜を「保護」するための縁周囲（ｐｅｒｉｌｉｍｂｉｃ）角膜注射を含む。この方法はまた、角膜新生血管形成を予防的に防ぐために、角膜傷害の直後に利用され得る。この状況において、この物質は、角膜病巣とその所望されない潜在的な血液供給の縁との間に分散して縁周囲角膜に注射され得る。このような方法はまた、類似の様式で、移植された角膜の毛細血管浸潤を予防するために利用され得る。徐放形態において、注入は、１年に２〜３回のみ必要とされ得る。ステロイドもまた、注入溶液に添加され、その注射自体から生じる炎症を低減し得る。
【０５７０】
本発明の別の局面において、患者に、血管の形成を阻害するように、治療有効量のポリヌクレオチド、ポリペプチド、アンタゴニストおよび／またはアゴニストを眼に投与する工程を包含する、血管新生緑内障を処置するための方法が提供される。１つの実施形態において、化合物は、血管新生緑内障の早期形態を処置するために、眼に局所投与され得る。他の実施形態において、化合物は、前眼房角（ａｎｔｅｒｉｏｒ　ｃｈａｍｂｅｒ　ａｎｇｌｅ）の領域への注入によって移植され得る。他の実施形態において、化合物はまた、化合物が眼房水に連続的に放出されるように、任意の位置に置かれ得る。本発明の別の局面において、患者に、血管の形成が阻害されるように、治療有効量のポリヌクレオチド、ポリペプチド、アンタゴニストおよび／またはアゴニストを眼に投与する工程を包含する、増殖性糖尿病性網膜症を処置するための方法が提供される。
【０５７１】
本発明の特に好ましい実施形態において、増殖性糖尿病性網膜症は、網膜におけるポリヌクレオチド、ポリペプチド、アンタゴニストおよび／またはアゴニストの局所濃度を増加させるために、眼房水または硝子体への注入によって処置され得る。好ましくは、この処置は、光凝固を必要とする重篤な疾患の獲得の前に開始されるべきである。
【０５７２】
本発明の別の局面において、血管の形成が阻害されるように、患者に、治療的に有効量のポリヌクレオチド、ポリペプチド、アンタゴニストおよび／またはアゴニストを眼に投与する工程を包含する、水晶体後線維増殖症を処置するための方法が、提供される。化合物は、硝子体内注射を介して、および／または眼内移植を介して局所投与され得る。
【０５７３】
さらに、このポリヌクレオチド、ポリペプチド、アゴニストおよび／またはアゴニストで処置され得る障害としては、以下が挙げられるが、それらに限定されない：血管腫、関節炎、乾癬、血管線維腫、アテローム性プラーク、遅延型創傷治癒、顆粒化、血友病性関節、過形成性瘢痕、偽関節骨折、オースラー−ウェーバー（Ｏｓｌｅｒ−Ｗｅｂｅｒ）症候群、化膿性肉芽腫、強皮症、トラコーマ、および血管接着。
【０５７４】
さらに、このポリヌクレオチド、ポリペプチド、アゴニストおよび／またはアゴニストで処置され得る障害および／または状態としては、以下が挙げられるが、それらに限定されない：固形腫瘍、血液由来の（ｂｌｏｏｄ　ｂｏｒｎ）腫瘍（例えば、白血病）、腫瘍転移、カポージ肉腫、良性腫瘍（例えば、血管腫、聴神経腫、神経線維腫、トラコーマ、および化膿性肉芽腫）、慢性関節リウマチ、乾癬、眼の脈管形成疾患（例えば、糖尿病性網膜症、未熟網膜症、黄斑変性、角膜移植拒絶、血管新生緑内障、水晶体後線維増殖症、ルベオーシス、網膜芽細胞腫、およびブドウ膜炎）、遅延型創傷治癒、子宮内膜症、脈管形成、顆粒化、過形成性瘢痕（ケロイド）、偽関節骨折、強皮症、トラコーマ、血管接着、心筋の新脈管形成、冠状側副枝（ｃｏｒｏｎａｒｙ　ｃｏｌｌａｔｅｒａｌｓ）、大脳側副枝、動静脈奇形、虚血性四肢新脈管形成、オースラー−ウェーバー症候群、プラーク新生血管形成、毛細血管拡張症、血友病性関節、血管線維腫、線維筋性形成異常、創傷顆粒化、クローン病、アテローム性動脈硬化症、産児制限薬剤（月経を制御する、胎芽着床のために必要な血管新生を予防することによる）、病原性の結果（例えば、ネコ引っかき病（Ｒｏｃｈｅｌｅ　ｍｉｎａｌｉａ　ｑｕｉｎｔｏｓａ）、潰瘍（Ｈｅｌｉｃｏｂａｃｔｅｒ　ｐｙｌｏｒｉ）、バルトネラ症および細菌性血管腫症状）のような新脈管形成を有する疾患。
【０５７５】
出産制限方法の１つの局面において、胎芽着床をブロックするに十分な化合物の量は、性交および受精が起こる前またはその後に投与され、従って産児制限の有効な方法、おそらく「事後用（ｍｏｒｎｉｎｇ　ａｆｔｅｒ）」方法を提供する。ポリヌクレオチド、ポリペプチド、アゴニストおよび／またはアゴニストはまた、月経を制御することにおいて使用され得るか、または子宮内膜症の処置における腹膜洗浄液として、もしくは腹膜移植のためのいずれかで投与され得る。
【０５７６】
本発明のポリヌクレオチド、ポリペプチド、アゴニストおよび／またはアゴニストは、縫合（ｓｔｉｔｃｈ）肉芽腫を予防するために、外科的縫合糸に組み込まれ得る。
【０５７７】
ポリヌクレオチド、ポリペプチド、アゴニストおよび／またはアゴニストは、広範な種々の外科手順において利用され得る。例えば、本発明の１つの局面において、組成物（例えば、スプレーまたはフィルムの形態において）は、悪性組織から正常な周囲の組織を分離するため、そして／または周囲の組織への疾患の広がりを予防するために、腫瘍の除去の前に、領域をコートまたはスプレーするために利用され得る。本発明の他の局面において、組成物（例えば、スプレーの形態において）は、腫瘍をコーティングするため、または所望の場所において新脈管形成を阻害するために、内視鏡手順を介して送達され得る。本発明のなお他の局面において、本発明の抗脈管形成組成物でコートされている外科メッシュが、外科メッシュが利用され得る任意の手順において利用され得る。例えば、本発明の１つの実施形態において、抗脈管形成組成物を有した外科メッシュレーデン（ｌａｄｅｎ）は、構造に対する支持を提供するため、そして一定の量の抗脈管形成因子を放出するために、腹部癌切除手術の間（例えば、結腸切除の後）に利用され得る。
【０５７８】
本発明のさらなる局面において、癌の局所的再発およびその部位での新しい血管の形成が阻害されるように、切除後にポリヌクレオチド、ポリペプチド、アゴニストおよび／またはアゴニストを腫瘍の切除縁に投与する工程を包含する、腫瘍切除部位を処置するための方法が提供される。本発明の１つの実施形態において、抗脈管形成化合物は、腫瘍切除部位に直接投与される（例えば、塗布、ブラッシング（ｂｒｕｓｈｉｎｇ）、または他の方法で抗脈管形成化合物で腫瘍の切除縁をコーティングすることによって適用される）。あるいは、抗脈管形成化合物は、投与前に公知の外科的ペーストに組み込まれ得る。本発明の特に好ましい実施形態において、抗脈管形成化合物は、悪性疾患についての肝切除後および神経外科手術後に適用される。
【０５７９】
本発明の１つの局面において、ポリヌクレオチド、ポリペプチド、アゴニストおよび／またはアゴニストは、広範な種々の腫瘍（例えば、乳房腫瘍、結腸腫瘍、脳腫瘍および肝腫瘍を含む）の切除縁に投与され得る。例えば、本発明の１つの実施形態において、抗脈管形成化合物は、切除後に、神経学的腫瘍の部位に、その部位での新しい血管の形成が阻害されるように投与され得る。
【０５８０】
本発明のポリヌクレオチド、ポリペプチド、アゴニストおよび／またはアゴニストはまた、他の抗脈管形成因子とともに投与され得る。他の抗脈管形成因子の代表的な例としては以下が挙げられる：抗侵襲性因子、レチノイン酸およびその誘導体、パクリタキセル、スラミン、メタロプロテイナーゼ−１の組織インヒビター、メタロプロテイナーゼ−２の組織インヒビター、プラスミノーゲンアクチベーターインヒビター−１、プラスミノーゲンアクチベーターインヒビター−２および種々の形態のより軽い「ｄ群」遷移金属。
【０５８１】
より軽い「ｄ群」遷移金属には、例えばバナジウム、モリブデン、タングステン、チタン、ニオブおよびタンタル種が挙げられる。そのような遷移金属種は、遷移金属錯体を形成し得る。上記の遷移金属種の適切な錯体としては、オキソ遷移金属錯体が挙げられる。
【０５８２】
バナジウム錯体の代表的な例としては、バナデート錯体およびバナジル錯体のようなオキソバナジウム錯体が挙げられる。適切なバナデート錯体としては、例えばメタバナジン酸アンモニウム、メタバナジン酸ナトリウムおよびオルトバナジン酸ナトリウムのようなメタバナデート錯体およびオルトバナデート錯体が挙げられる。適切なバナジル錯体としては、例えばバナジルアセチルアセトネートおよび硫酸バナジル（硫酸バナジル一水和物および硫酸バナジル三水和物のような硫酸バナジル水和物を含む）が挙げられる。
【０５８３】
タングステン錯体およびモリブデン錯体の代表的な例としてはまた、オキソ錯体が挙げられる。適切なオキソタングステン錯体としては、タングステート錯体およびタングステンオキシド錯体が挙げられる。適切なタングステート錯体としては、タングステン酸アンモニウム、タングステン酸カルシウム、タングステン酸ナトリウム二水和物およびタングステン酸が挙げられる。適切なタングステンオキシドとしては、タングステン（ＩＶ）オキシドおよびタングステン（ＶＩ）オキシドが挙げられる。適切なオキソモリブデン錯体としては、モリブデート、モリブデンオキシドおよびモリブデニル錯体が挙げられる。適切なモリブデート錯体としては、モリブデン酸アンモニウムおよびその水和物、モリブデン酸ナトリウムおよびその水和物、ならびにモリブデン酸カリウムおよびその水和物が挙げられる。適切なモリブデンオキシドとしては、モリブデン（ＶＩ）オキシド、モリブデン（ＶＩ）オキシドおよびモリブデン酸が挙げられる。適切なモリブデニル錯体としては、例えばモリブデニルアセチルアセトネートが挙げられる。他の適切なタングステン錯体およびモリブデン錯体としては、例えばグリセロール、酒石酸および糖由来のヒドロキソ誘導体が挙げられる。
【０５８４】
広範な種々の他の抗脈管形成因子もまた、本発明の状況において利用され得る。代表的な例としては、以下が挙げられる：血小板因子４；硫酸プロタミン；硫酸化キチン誘導体（クイーンクラブ（ｑｕｅｅｎ　ｃｒａｂ）の殻から調製される）（Ｍｕｒａｔａら、Ｃａｎｃｅｒ　Ｒｅｓ．５１：２２〜２６、１９９１）；硫酸化多糖ペプチドグリカン複合体（ＳＰ−ＰＧ）（この化合物の機能は、ステロイド（例えば、エストロゲン）およびクエン酸タモキシフェンの存在によって、増強され得る）；スタウロスポリン；基質代謝の調節因子（例えば、プロリンアナログ、シスヒドロキシプロリン、ｄ，Ｌ−３，４−デヒドロプロリン、チアプロリン、α，α−ジピリジル、アミノプロピオニトリルフマレートを含む）；４−プロピル−５−（４−ピリジニル）−２（３Ｈ）−オキサゾロン；メトトレキサート；ミトザントロン；ヘパリン；インターフェロン；２マクログロブリン−血清；ＣｈＩＭＰ−３（Ｐａｖｌｏｆｆら、Ｊ．Ｂｉｏ．Ｃｈｅｍ．２６７：１７３２１〜１７３２６、１９９２）；キモスタチン（Ｔｏｍｋｉｎｓｏｎら、Ｂｉｏｃｈｅｍ　Ｊ．２８６：４７５〜４８０、１９９２）；シクロデキストリンテトラデカサルフェート；エポネマイシン；カンプトテシン；フマギリン（Ｉｎｇｂｅｒら、Ｎａｔｕｒｅ　３４８：５５５〜５５７、１９９０）；チオリンゴ酸金ナトリウム（「ＧＳＴ」；ＭａｔｓｕｂａｒａおよびＺｉｆｆ、Ｊ．Ｃｌｉｎ．Ｉｎｖｅｓｔ．７９：１４４０〜１４４６、１９８７）；アンチコラゲナーゼ−血清；α２−抗プラスミン（Ｈｏｌｍｅｓら、Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．２６２（４）：１６５９〜１６６４、１９８７）；ビサントレン（Ｎａｔｉｏｎａｌ　Ｃａｎｃｅｒ　Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅ）；ロベンザリット二ナトリウム（Ｎ−（２）−カルボキシフェニル−４−クロロアントロニル酸（ｃｈｌｏｒｏａｎｔｈｒｏｎｉｌｉｃ　ａｃｉｄ）二ナトリウム、すなわち「ＣＣＡ」；Ｔａｋｅｕｃｈｉら、Ａｇｅｎｔｓ　Ａｃｔｉｏｎｓ　３６：３１２〜３１６、１９９２）；サリドマイド；Ａｎｇｏｓｔａｔｉｃステロイド；ＡＧＭ−１４７０；カルボキシアミノイミダゾール（ｃａｒｂｏｘｙｎａｍｉｎｏｌｍｉｄａｚｏｌｅ）；およびメタロプロテイナーゼインヒビター（例えば、ＢＢ９４）。
【０５８５】
（細胞レベルでの疾患）
本発明のポリヌクレオチドもしくはポリペプチド、ならびにアンタゴニストもしくはアゴニストによって処置または検出され得る細胞生存の増大あるいはアポトーシスの阻害に関連する疾患には、癌（例えば、濾胞性リンパ腫、ｐ５３変異を有する癌腫、およびホルモン依存性腫瘍、これらは以下：結腸癌、心臓腫瘍、膵臓癌、黒色腫、網膜芽細胞腫、神経膠芽細胞腫、肺癌、腸癌、精巣癌、胃癌、神経芽細胞腫、粘液腫、筋腫、リンパ腫、内皮腫、骨芽細胞腫、骨巨細胞腫、骨肉腫、軟骨肉腫、腺腫、乳癌、前立腺癌、カポージ肉腫および卵巣癌を含むが、これらに限定されない）；自己免疫障害（例えば、多発性硬化症、シェーグレン症候群、橋本甲状腺炎、胆汁性肝硬変、ベーチェット病（Ｂｅｈｃｅｔ’ｓ　ｄｉｓｅａｓｅ）、クローン病、多発性筋炎、全身性エリテマトーデスおよび免疫関連糸球体腎炎ならびに慢性関節リウマチ）およびウイルス感染（例えば、ヘルペスウイルス、ポックスウイルスおよびアデノウイルス）、炎症、対宿主性移植片病、急性移植片拒絶、ならびに慢性移植片拒絶、が挙げられる。好ましい実施形態において、本発明のポリヌクレオチド、ポリペプチド、および／またはアンタゴニストは、特に上記に列挙される、癌の増殖、進行、および／または転移（ｍｅｔａｓｉｓ）を阻害するために使用される。
【０５８６】
本発明のポリヌクレオチドもしくはポリペプチド、またはアゴニストもしくはアンタゴニストによって処置あるいは検出され得る細胞生存の増大に関連するさらなる疾患または状態には、悪性疾患の進行および／または転移ならびに以下のような関連する障害が挙げられるが、これらに限定されない：白血病（急性白血病（例えば、急性リンパ性白血病、急性骨髄性白血病（骨髄芽球性、前骨髄球性、骨髄単球性、単球性および赤白血病を含む）を含む）ならびに慢性白血病（例えば、慢性骨髄性（顆粒球性）白血病および慢性リンパ球性白血病））、真性赤血球増加症、リンパ腫（例えば、ホジキン病および非ホジキン病）、多発性骨髄腫、ヴァルデンストレームマクログロブリン血症、Ｈ鎖病、ならびに固形腫瘍（肉腫および癌腫（例えば、線維肉腫、粘液肉腫、脂肪肉腫、軟骨肉腫、骨原性肉腫、脊索腫、血管肉腫、内皮肉腫（ｅｎｄｏｔｈｅｌｉｏｓａｒｃｏｍａ）、リンパ管肉腫、リンパ管内皮腫、骨膜腫、中皮腫、ユーイング腫瘍、平滑筋肉腫、横紋筋肉腫、結腸癌腫、膵臓癌、乳癌、卵巣癌、前立腺癌、扁平上皮癌、基底細胞癌、腺癌、汗腺癌、皮脂腺癌、乳頭状癌、乳頭状腺癌、嚢胞腺癌、髄様癌、気管支原生癌、腎細胞癌、肝細胞癌腫、胆管癌、絨毛癌、セミノーマ、胎生期癌、ウィルムス腫瘍、頸部癌、精巣腫瘍、肺癌、小細胞肺癌、膀胱癌、上皮癌、神経膠腫、神経膠星状細胞腫、髄芽細胞腫、頭蓋咽頭腫、脳室上衣細胞腫、松果体腫、血管芽細胞腫、聴神経腫、乏突起神経膠腫、髄膜腫（ｍｅｎａｎｇｉｏｍａ）、黒色腫、神経芽細胞腫、および網膜芽細胞腫）を含むが、これらに限定されない）。
【０５８７】
本発明のポリヌクレオチドもしくはポリペプチド、ならびにアゴニストもしくはアンタゴニストによって処置あるいは検出され得るアポトーシスの増大に関連する疾患には、以下が挙げられる：ＡＩＤＳ；神経変性障害（例えば、アルツハイマー病、パーキンソン病、筋萎縮性側索硬化症、色素性網膜炎、小脳変性および脳腫瘍または以前に関連した疾患）；自己免疫障害（例えば、多発性硬化症、シェーグレン症候群、橋本甲状腺炎、胆汁性肝硬変、ベーチェット病（Ｂｅｈｃｅｔ’ｓ　ｄｉｓｅａｓｅ）、クローン病、多発性筋炎、全身性エリテマトーデスおよび免疫関連糸球体腎炎ならびに慢性関節リウマチ）、脊髄形成異常症候群（例えば、再生不良性貧血）、対宿主性移植片病、虚血性傷害（心筋梗塞、発作および再灌流傷害によって生じるようなもの）、肝臓傷害（例えば、肝炎関連肝臓傷害、虚血／再灌流傷害、胆汁うっ滞（ｃｈｏｌｅｓｔｏｓｉｓ）（胆管傷害）および肝臓癌）；毒物誘導性肝臓疾患（アルコールによって引き起こされるようなもの）、敗血症性ショック、悪液質ならびに食欲不振。
【０５８８】
（創傷治癒および上皮細胞増殖）
本発明のなおさらなる局面に従って、本発明のポリヌクレオチドまたはポリペプチド、ならびにアゴニストまたはアンタゴニストを、治療目的のため、例えば、創傷治癒の目的のために上皮細胞増殖および基底ケラチノサイトを刺激するため、ならびに毛包生成および皮膚創傷の治癒を刺激するために、利用するプロセスが提供される。本発明のポリヌクレオチドまたはポリペプチド、ならびにアゴニストまたはアンタゴニストは、以下を含む創傷治癒を刺激する際に臨床的に有用であり得る：外科的創傷、切除の創傷、深い創傷（真皮および表皮の損傷を含む）、眼組織の創傷、歯組織の創傷、口腔創傷、糖尿病性潰瘍、皮膚の潰瘍、肘の潰瘍、動脈の潰瘍、静脈うっ滞潰瘍、熱への曝露または化学物質から生ずる熱傷、および他の異常な創傷治癒状態（例えば、尿毒症、栄養失調、ビタミン欠乏、ならびにステロイド、放射線療法および抗腫瘍性薬物および代謝拮抗物質を用いる全身性処置に関連する合併症。本発明のポリヌクレオチドまたはポリペプチド、ならびにアゴニストまたはアンタゴニストは、皮膚損失後の皮膚の回復を促進するために使用され得る。
【０５８９】
本発明のポリヌクレオチドまたはポリペプチド、ならびにアゴニストまたはアンタゴニストは、創傷床（ｗｏｕｎｄ　ｂｅｄ）への皮膚移植片の接着を増大するため、および創傷床からの再上皮形成を刺激するために使用され得る。以下は、本発明のポリヌクレオチドまたはポリペプチド、アゴニストまたはアンタゴニストが創傷床への接着を増大するために使用され得る、移植片の型である：自家移植片、人工皮膚、同種移植片（ａｌｌｏｇｒａｆｔ）、自己植皮片、自己表皮移植片（ａｕｔｏｅｐｄｅｒｍｉｃ　ｇｒａｆｔ）、無血管性（ａｖａｃｕｌａｒ）移植片、ブレア−ブラウン移植片、骨移植片、胚胎組織移植片、真皮移植片、遅延移植片、皮膚移植片、表皮移植片、筋膜移植片、全層皮膚移植片、異種移植片（ｈｅｔｅｒｏｌｏｇｏｕｓ　ｇｒａｆｔ）、異種移植片（ｘｅｎｏｇｒａｆｔ）、同種移植片（ｈｏｍｏｌｏｇｏｕｓ　ｇｒａｆｔ）、増殖性移植片、層板状移植片、網状移植片、粘膜移植片、オリエ−ティールシュ移植片、大網移植片、パッチの移植片（ｐａｔｃｈ　ｇｒａｆｔ）、茎状移植片、全層移植片（ｐｅｎｅｔｒａｔｉｎｇ　ｇｒａｆｔ）、分層植皮片（ｓｐｌｉｔ　ｓｋｉｎ　ｇｒａｆｔ）、分層植皮片（ｔｈｉｃｋ　ｓｐｌｉｔ　ｇｒａｆｔ）。本発明のポリヌクレオチドまたはポリペプチド、ならびにアゴニストまたはアンタゴニストは、皮膚の強度を助長するため、および加齢した皮膚の外見を改善するために使用され得る。
【０５９０】
本発明のポリヌクレオチドまたはポリペプチド、ならびにアゴニストまたはアンタゴニストはまた、肝細胞増殖、および肺、乳房、膵臓、胃、小腸（ｓｍａｌｌ　ｉｎｔｅｓｔｉｎｇ）、ならびに大腸における上皮細胞増殖における変化を生じると考えられる。本発明のポリヌクレオチドまたはポリペプチド、ならびにアゴニストもしくはアンタゴニストは、上皮細胞（例えば、皮脂細胞（ｓｅｂｏｃｙｔｅ）、毛包、肝細胞、ＩＩ型肺胞上皮細胞（ｔｙｐｅ　ＩＩ　ｐｎｅｕｍｏｃｙｔｅ）、ムチン産生杯細胞、および他の上皮細胞、ならびに皮膚、肺、肝臓、および胃腸管内に含まれるそれらの前駆体）の増殖を促進し得る。本発明のポリヌクレオチドまたはポリペプチド、アゴニストまたはアンタゴニストは、内皮細胞、ケラチノサイト、および基底ケラチノサイトの増殖を促進し得る。
【０５９１】
本発明のポリヌクレオチドまたはポリペプチド、ならびにアゴニストまたはアンタゴニストはまた、照射、化学療法処置またはウイルス感染から生じる腸の毒性の副作用を低減するために使用され得る。本発明のポリヌクレオチドまたはポリペプチド、ならびにアゴニストまたはアンタゴニストは、小腸粘膜に対して細胞保護的な（ｃｙｔｏｐｒｏｔｅｃｔｉｖｅ）効果を有し得る。本発明のポリヌクレオチドまたはポリペプチド、ならびにアゴニストまたはアンタゴニストはまた、化学療法およびウイルス感染から生じる粘膜炎（ｍｕｃｏｓｉｔｉｓ）（口潰瘍）の治癒を刺激し得る。
【０５９２】
本発明のポリヌクレオチドまたはポリペプチド、ならびにアゴニストまたはアンタゴニストは、熱傷を含む、完全な厚さおよび部分的な厚さの皮膚欠損における皮膚の完全な再生（すなわち、毛包、汗腺、および皮脂腺の再増殖）、乾癬のような他の皮膚欠損の処置においてさらに使用され得る。本発明のポリヌクレオチドまたはポリペプチド、ならびにアゴニストまたはアンタゴニストは、表皮水疱症（これらの損傷の再上皮形成を促進することによる頻繁な開放性かつ疼痛性の水疱を生じる、下層の真皮への表皮の接着の欠損）を処置するために使用され得る。本発明のポリヌクレオチドまたはポリペプチド、ならびにアゴニストまたはアンタゴニストはまた、胃潰瘍および十二指腸（ｄｏｕｄｅｎａｌ）潰瘍を処置し、そして粘膜の内層の瘢痕形成ならびに腺の粘膜および十二指腸の粘膜の内層の再生による治癒を、より迅速に補助するために使用され得る。炎症性腸疾患、例えば、クローン病および潰瘍性大腸炎は、それぞれ、小腸または大腸の粘膜表面の破壊を生じる疾患である。従って、本発明のポリヌクレオチドまたはポリペプチド、ならびにアゴニストまたはアンタゴニストは、粘膜表面の再表面形成（ｒｅｓｕｒｆａｃｉｎｇ）を促進して、より迅速な炎症性腸疾患の治癒を補助し、そして炎症性腸疾患の進行を予防するために、使用され得る。本発明のポリヌクレオチドまたはポリペプチド、アゴニストまたはアンタゴニストを用いる処置は、胃腸管全体の粘液の産生に対して有意な効果を有すると予期され、そして摂取された有害な物質からかまたは外科手術後に、腸粘膜を保護するために使用され得る。本発明のポリヌクレオチドまたはポリペプチド、ならびにアゴニストまたアンタゴニストは、その発現不足に関連する疾患を処置するために使用され得る。
【０５９３】
さらに、本発明のポリヌクレオチドまたはポリペプチド、ならびにアゴニストまたはアンタゴニストは、種々の病的状態に起因する肺への損傷を予防および治癒するために使用され得る。本発明のポリヌクレオチドまたはポリペプチド、ならびにアゴニストまたはアンタゴニストは、急性または慢性の肺損傷を予防または処置するために、肺胞および細気管支（ｂｒｏｃｈｉｏｌａｒ）上皮の増殖および分化を刺激し得、そしてその修復を促進し得る。例えば、肺胞（ａｖｅｏｌｉ）の進行性の損失を生じる気腫、および細気管支上皮および肺胞の壊死を生じる吸入傷害（ｉｎｈａｌａｔｉｏｎ　ｉｎｊｕｒｙ）（すなわち、煙の吸入および熱傷から生じる）は、本発明のポリヌクレオチドまたはポリペプチド、アゴニストまたはアンタゴニストを使用して、効果的に処置され得る。また、本発明のポリヌクレオチドまたはポリペプチド、ならびにアゴニストまたはアンタゴニストは、ＩＩ型肺胞上皮細胞の増殖および分化を刺激するために使用され得、これは、未熟な乳児における肺硝子膜症（例えば、乳児呼吸窮迫症候群および気管支肺異形成症）のような疾患を処置または予防するのを助け得る。
【０５９４】
本発明のポリヌクレオチドまたはポリペプチド、ならびにアゴニストまたはアンタゴニストは、肝細胞の増殖および分化を刺激し得、従って、肝臓の疾患および病状（例えば、肝硬変により生じる劇症肝不全、ウイルス性肝炎および毒性物質（すなわち、アセトアミノフェン、四塩化炭素（ｃａｒｂｏｎ　ｔｅｔｒａｈｏｌｏｒｉｄｅ）、および当該分野で公知の他の肝臓毒素）により生じる肝臓損傷）を緩和または処置するために用いられ得る。
【０５９５】
さらに、本発明のポリヌクレオチドまたはポリペプチド、ならびにアゴニストまたはアンタゴニストは、真性糖尿病の発症を処置または予防するために使用され得る。新たにＩ型糖尿病およびＩＩ型糖尿病と診断された患者において、いくらかの島細胞機能が残っている場合、本発明のポリヌクレオチドまたはポリペプチド、ならびにアゴニストまたはアンタゴニストは、その疾患の永続的な症状を、緩和、遅延または予防するように、その島機能を維持するために使用され得る。また、本発明のポリヌクレオチドまたはポリペプチド、ならびにアゴニストまたはアンタゴニストは、島細胞機能を改善または促進するための島細胞移植における補助として使用され得る。
【０５９６】
（内分泌障害）
本発明のポリヌクレオチドもしくはポリペプチドまたはアゴニストもしくはアンタゴニストは、ホルモン失調（ｈｏｒｍｏｎｅ　ｉｍｂａｌａｎｃｅ）に関連する障害および／もしくは疾患、ならびに／または内分泌系の障害もしくは疾患を処置、予防、診断および／または予測のために使用され得る。
【０５９７】
内分泌系の腺によって分泌されるホルモンは、身体発育、性機能、代謝および他の機能を制御する。障害は以下の２つの種類に分類され得る：ホルモン産生における障害および組織のホルモン応答不能。これらのホルモン失調または内分泌系の疾患、障害もしくは状態の病因は、遺伝的、身体的（例えば、癌およびいくつかの自己免疫疾患）、後天的（例えば、化学療法、損傷もしくは毒素による）、または感染的であり得る。さらに、本発明のポリヌクレオチド、ポリペプチド、抗体および／またはアゴニストもしくはアンタゴニストは、内分泌系および／またはホルモン失調に関連する特定の疾患または障害のマーカーまたは検出因子として用いられ得る。
【０５９８】
内分泌系および／またはホルモン失調および／または疾患としては、以下が挙げられるがこれらに限定されない子宮の運動の障害を含む：妊娠および分娩に伴う合併症（例えば、早期分娩、過期妊娠（ｐｏｓｔ−ｔｅｒｍ　ｐｒｅｇｎａｎｃｙ）、自然流産、および遅延分娩（ｓｌｏｗ　ｌａｂｏｒ）または分娩停止（ｓｔｏｐｐｅｄ　ｌａｂｏｒ）；および月経周期の障害および／または疾患（例えば、月経困難症および子宮内膜症）。
【０５９９】
内分泌系および／またはホルモン失調の障害および／または疾患として、例えば、真性糖尿病、尿崩症、先天性膵臓形成不全、褐色細胞腫−島細胞腫瘍症候群（ｉｓｌｅｔ　ｃｅｌｌ　ｔｕｍｏｒ　ｓｙｎｄｒｏｍｅ）のような膵臓の障害および／または疾患；例えば、アディソン病、コルチコステロイド欠乏症、男性化作用疾患（ｖｉｒｉｌｉｚｉｎｇ　ｄｉｓｅａｓｅ）、多毛症、クッシング病、高アルドステロン症、褐色細胞腫のような副腎の障害および／または疾患；例えば、下垂体機能亢進症、下垂体機能低下症、下垂体小人症、下垂体腺種、汎下垂体機能低下症、先端巨大症、巨人症のような脳下垂体の障害および／または疾患；甲状腺機能亢進症、甲状腺機能低下症、プラマー病、グレーヴス病（中毒性びまん性甲状腺腫（ｔｏｘｉｃ　ｄｉｆｆｕｓｅ　ｇｏｉｔｅｒ））、中毒性小結節甲状腺腫（ｔｏｘｉｃ　ｎｏｄｕｌａｒ　ｇｏｉｔｅｒ）、甲状腺炎（橋本甲状腺炎、亜急性肉芽腫性甲状腺炎、および無症候性リンパ球性甲状腺炎）、ペンドレッド症候群、粘液水腫、クレチン病、甲状腺中毒症、甲状腺ホルモン縮合障害、胸腺形成不全、甲状腺のヒュルトレ細胞腫、甲状腺癌、甲状腺癌腫、髄質甲状腺癌腫（Ｍｅｄｕｌｌａｒｙ　ｔｈｙｒｏｉｄ　ｃａｒｃｉｎｏｍａ）が挙げられるがこれらに限定されない甲状腺の障害および／または疾患；例えば、上皮小体機能亢進症、上皮小体機能低下症といった上皮小体の障害および／または疾患；視床下部の障害および／または疾患が挙げられる。
【０６００】
特定の実施形態において、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよび／またはポリペプチドならびに／あるいはこれらのポリペプチド（抗体を含む）のアゴニストまたはアンタゴニストならびにこれらのポリヌクレオチド、ポリペプチド、アゴニストおよびアンタゴニストのフラグメントおよび改変体を使用して、異常なグルコース代謝または細胞への異常なグルコースの取り込みに関連する疾患および障害を診断、予後診断、処置、予防または改善し得る。
【０６０１】
特定の実施形態において、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよび／またはポリペプチドならびに／あるいはそのアゴニストおよび／またはアンタゴニストを使用して、Ｉ型真性糖尿病（インスリン依存性真性糖尿病、ＩＤＤＭ）を診断、予後診断、処置、予防および／または改善し得る。
【０６０２】
別の実施形態において、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよび／またはポリペプチドならびに／あるいはこれらのアゴニストおよび／またはアンタゴニストを使用して、ＩＩ型真性糖尿病（インスリン耐性真性糖尿病）を診断、予後診断、処置、予防および／または改善し得る。
【０６０３】
さらに、他の実施形態において、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよび／またはポリペプチドならびに／またはこれらのアンタゴニスト（特に抗体を中和するか、または抗体に拮抗する）を使用して、以下が挙げられるが、これらに限定されない真性糖尿病（Ｉ型またはＩＩ型）に関連する状態を診断、予後診断、処置、予防、または改善し得る。糖尿病性ケトアシドーシス、糖尿病性昏睡、非ケトン性高血糖症性−高浸透圧性昏睡（ｈｙｐｅｒｇｌｙｃｅｍｉｃ−ｈｙｐｅｒｏｓｍｏｌａｒ　ｃｏｍａ）、てんかん、精神錯乱（ｍｅｎｔａｌ　ｃｏｎｆｕｓｉｏｎ）、嗜眠状態、心臓血管疾患（例えば、心臓疾患、アテローム性動脈硬化症、微小血管疾患、高血圧症、発作、ならびに「心臓血管障害」の節に記載されたような他の疾患および障害）、異脂肪血症（ｄｙｓｌｉｐｉｄｅｍｉａ）、腎臓疾患（例えば、腎不全、ネフロパシー、「腎臓障害」の節に記載されたような他の疾患および障害）、神経損傷、ニューロパシー、視野欠損（例えば、糖尿病性網膜症および失明）、潰瘍および減損された創傷治癒、感染（例えば、感染性疾患および「感染性疾患」の節（特に尿管および皮膚）に記載されたような疾患および障害）、手根管症候群およびデュプュイトラン拘縮。
【０６０４】
他の実施形態において、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよび／またはポリペプチドならびに／またはこれらのアゴニストまたはアンタゴニストは、動物、好ましくは哺乳動物、そしてもっとも好ましくはヒトに、その動物の体重を調節するために投与される。特定の実施形態において、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよび／またはポリペプチドならびに／あるいはこれらのアゴニストまたはアンタゴニストは、動物、好ましくは哺乳動物、そしてもっとも好ましくはヒトに、インスリンに関連する生化学的経路を調節することによって動物の体重を制御するために投与される。さらに他の実施形態において、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよび／またはポリペプチドならびに／あるいはこれらのアゴニストまたはアンタゴニストは、動物、好ましくは哺乳動物、そしてもっとも好ましくはヒトに、インスリン様成長因子に関連する生化学的経路を調節することによって動物の体重を制御するために投与される。
【０６０５】
さらに、内分泌系および／またはホルモン失調の障害および／または疾患はまた、癌を含む精巣または卵巣の障害および／または疾患を含み得る。他の精巣または卵巣の障害および／または疾患として、さらに例えば、卵巣癌、多嚢胞性卵巣症候群、クラインフェルター症候群、バニシング精巣症候群（ｖａｎｉｓｈｉｎｇ　ｔｅｓｔｅｓ　ｓｙｎｄｒｏｍｅ）（両側性無精巣症（ｂｉｌａｔｅｒａｌ　ａｎｏｒｃｈｉａ））、ライディヒ細胞の先天性欠損症（ｃｏｎｇｅｎｉｔａｌ　ａｂｓｅｎｃｅ）、潜伏性精巣症、ヌーナン症候群、筋緊張性ジストロフィー、精巣の毛細血管性血管腫（良性）、精巣の新生物および新生精巣（ｎｅｏ−ｔｅｓｔｉｓ）が挙げられる。
【０６０６】
さらに、内分泌系および／またはホルモン失調の障害および／または疾患としてまた、例えば、多分泌腺機能低下症候群、褐色細胞腫、神経芽腫、多発性内分泌腺腫症、ならびに内分泌組織の障害および／または癌のような障害および／または疾患が挙げられ得る。
【０６０７】
（神経活性および神経学的疾患）
本発明のポリペプチド、ポリヌクレオチドおよびアゴニストもしくはアンタゴニストは、脳および／または神経系の疾患、障害、損傷、または傷害の診断および／または処置に用いられ得る。本発明の組成物（例えば、ＥＣＭポリペプチド、ポリヌクレオチド、および／またはアゴニストもしくはアンタゴニスト）を用いて処置され得る神経系の障害としては、軸索の切断、ニューロンの減少もしくは変性、または脱髄のいずれかを引き起こす、神経系損傷および疾患または障害が挙げられるが、これらに限定されない。本発明の方法に従って、患者（ヒト患者および非ヒト哺乳動物患者を含む）において処置され得る神経系病変には、以下の中枢神経系（脊髄、脳を含む）または末梢神経系のいずれかの病変が挙げられるが、これらに限定されない：（１）虚血病変（ここで、神経系の一部における酸素不足により、ニューロンの損傷または死が生じ、これには大脳梗塞もしくは虚血、または脊髄梗塞もしくは虚血が挙げられる）；（２）外傷病変（身体的損傷により生じるかまたは手術に関連する病変、例えば、神経系の一部分を切断する病変、または圧縮損傷を含む）；（３）悪性病変（ここで、神経系の一部分は、神経系関連悪性疾患もしくは非神経系組織由来の悪性疾患のいずれかである悪性組織により破壊または損傷される）；（４）感染性病変（ここで、神経系の一部分は、例えば、膿瘍による感染の結果として、破壊または損傷されるか、あるいはヒト免疫不全ウイルス、帯状ヘルペスもしくは単純ヘルペスウイルスによる感染と関連するか、ライム病、結核、梅毒に関連する）；（５）変性病変（ここで、神経系の一部分は、変性プロセスの結果として破壊または損傷され、これには、パーキンソン病、アルツハイマー病、ハンティングトン舞踏病または筋萎縮性側索硬化症（ＡＬＳ）に関連する変性が挙げられるが、これらに限定されない）；（６）栄養性の疾患または障害に関連する病変（ここで、神経系の一部分は、栄養障害または代謝障害によって破壊または損傷され、これには、ビタミンＢ１２欠乏症、葉酸欠乏症、ヴェルニッケ病、タバコ−アルコール弱視、マルキアファーヴァ−ビニャーミ病（脳梁の一次変性）およびアルコール小脳変性が挙げられるが、これらに限定されない）；（７）全身性疾患に関連する神経性病変（糖尿病（糖尿病性ニューロパシー、ベル麻痺）、全身性エリテマトーデス、癌または類肉腫症が挙げられるが、これらに限定されない）；（８）毒性物質（アルコール、鉛または特定の神経毒を含む）により生じる病変；ならびに（９）脱髄性病変（ここで、神経系の一部分は、脱髄性疾患によって破壊または損傷され、これには、多発性硬化症、ヒト免疫不全ウイルス関連脊髄障害、横断脊髄障害または種々の病因、進行性多病巣性白質脳症、および橋中央ミエリン溶解が挙げられるが、これらに限定されない）。
【０６０８】
１つの実施形態において、本発明のポリペプチド、ポリヌクレオチド、またはアゴニストもしくはアンタゴニストは、低酸素症の損傷効果から神経細胞を保護するために用いられる。さらに好ましい実施形態では、本発明のポリペプチド、ポリヌクレオチド、またはアゴニストもしくはアンタゴニストは、大脳低酸素症の損傷効果から神経細胞を防御するために用いられる。この実施形態によると、本発明の組成物は、大脳低酸素症に関連する神経細胞損傷を処置または予防するために用いられる。この実施形態の１つの非排他的局面において、本発明のポリペプチド、ポリヌクレオチド、またはアゴニストもしくはアンタゴニストは、大脳虚血と関連する神経細胞損傷を処置、または予防するために用いられる。この実施形態の非限定的な別の局面において、本発明のポリペプチド、ポリヌクレオチド、またはアゴニストもしくはアンタゴニストは、大脳梗塞症に関連する神経細胞損傷を処置または予防するために用いられる。
【０６０９】
別の好ましい実施形態において、本発明のポリペプチド、ポリヌクレオチド、またはアゴニストもしくはアンタゴニストは、発作に関連する神経細胞損傷を処置または予防するために用いられる。特定の実施形態において、本発明のポリペプチド、ポリヌクレオチド、またはアゴニストもしくはアンタゴニストは、発作に関連する大脳神経細胞損傷を処置または予防するために用いられる。
【０６１０】
別の好ましい実施形態において、本発明のポリペプチド、ポリヌクレオチド、またはアゴニストもしくはアンタゴニストは、心臓発作に関連する神経細胞損傷を処置または予防するために使用される。特定の実施形態において、本発明のポリペプチド、ポリヌクレオチド、またはアゴニストもしくはアンタゴニストは、心臓発作に関連する大脳神経細胞損傷を処置または予防するために使用される。
【０６１１】
神経系障害を処置または予防するために有用な本発明の組成物は、ニューロンの生存または分化の促進における生物学的活性について試験することによって選択され得る。（限定の目的ではないが）例えば、以下の効果のいずれかを誘発する本発明の組成物は、本発明に従って有用であり得る：（１）低酸素または低酸素条件の存在または非存在のいずれかにおける、培養物中のニューロンの増加した生存時間；（２）培養物中またはインビボにおけるニューロンの増加した出芽；（３）培養物中またはインビボにおけるニューロン関連分子（例えば、運動ニューロンに関しては、コリンアセチルトランスフェラーゼまたはアセチルコリンエステラーゼ）の増加した生成；あるいは（４）インビボにおけるニューロン機能不全減少した症状。このような効果は、当該分野において公知の任意の方法によって測定され得る。好ましい、非限定的な実施形態においては、ニューロンの増加した生存は、本明細書中に記載されるか、そうでなければ当該分野において公知の方法（例えば、Ｚｈａｎｇら、Ｐｒｏｃ　Ｎａｔｌ　Ａｃａｄ　Ｓｃｉ　ＵＳＡ　９７：３６３７−４２（２０００）、またはＡｒａｋａｗａら（Ｊ．Ｎｅｕｒｏｓｃｉ．、１０：３５０７−１５（１９９０））に記載される方法）を用いて慣習的に測定され得；ニューロンの増加した出芽は、当該分野において公知の方法（例えば、Ｐｅｓｔｒｏｎｋら（Ｅｘｐ．Ｎｅｕｒｏｌ．、７０：６５−８２（１９８０））またはＢｒｏｗｎら（Ａｎｎ．Ｒｅｖ．Ｎｅｕｒｏｓｃｉ．、４：１７−４２（１９８１））に記載される方法）によって検出され得；ニューロン関連分子の増加した生成は、当該分野で公知であり、測定されるべき分子に依存した技術を用いて、バイオアッセイ、酵素アッセイ、抗体結合、ノーザンブロットアッセイなどによって測定され得；そして運動ニューロン機能不全は、運動ニューロン障害の物理的症状（例えば、弱さ、運動ニューロン伝導速度または機能的障害）を評価することによって測定され得る。
【０６１２】
特定の実施形態において、本願発明に従って処置され得る運動ニューロン障害としては、以下のような障害が挙げられるが、それらに限定されない：梗塞形成、感染、毒素への曝露、外傷、外科的損傷、変性疾患または運動ニューロンおよび神経系の他の構成要素に影響し得る悪性疾患のような障害、ならびに筋萎縮性側索硬化症および、これらに限定されないが、進行性脊髄性筋萎縮症、進行性球麻痺、原発性側索硬化症、乳児性および若年性筋萎縮、小児の進行性球麻痺（ファチオ・ロンデ症候群）、ポリオおよびポリオ後症候群、ならびに遺伝性運動感覚性ニューロパシー（シャルコー−マリー−ツース病）を含む、ニューロンに選択的に影響する障害。
【０６１３】
さらに、本発明のポリペプチドまたはポリヌクレオチドは、ニューロン生存、シナプス形成；伝達；神経分化などにおいて役割を果たし得る。従って、本発明の組成物（ＥＣＭポリヌクレオチド、ポリペプチド、およびアゴニストまたはアンタゴニストを含む）は、学習および／または認識の障害を含むがこれに限定されない、これらの役割に関連する疾患または障害を、診断、および／または処置または予防するのに用いられ得る。本発明の組成物は、神経変性性疾患状態および／または行動障害の処置または予防において有用であり得る。このような神経変性性疾患状態および／または行動障害としては以下が挙げられるがこれらに限定されない：アルツハイマー病、パーキンソン病、ハンチントン病、ツレット症候群、精神分裂病、痴呆、強迫性障害、恐慌性障害、学習障害、ＡＬＳ、精神病、自閉、および行動変化（栄養補給、睡眠パターン、平衡、および知覚の障害を含む）。さらに、本発明の組成物はまた、発生中の胚、または伴性障害に関連する発生の障害の処置、予防および／または検出において役割を果たし得る。
【０６１４】
さらに、本発明のポリペプチド、ポリヌクレオチド、および／またはアゴニストまたはアンタゴニストは、以下を含むが挙げられるがこれらに限定されない脳血管障害に関連する、疾患、傷害、障害または、損傷から、神経細胞を防御するのに有用であり得る：脳血管障害（例えば、頸動脈血栓症、頸動脈狭窄およびモヤモヤ病を含む頸動脈疾患）、脳のアミロイドアンギオパチー、大脳動脈瘤、脳無酸素症、大脳動脈硬化症、大脳動静脈奇形、大脳動脈疾患、脳塞栓症および血栓（例えば、頸動脈血栓症、洞血栓症およびヴァレンベルク症候群）、硬膜上血腫（例えば、硬膜外血腫または硬膜下血腫およびクモ膜下出血）、脳亀裂骨折、脳虚血（例えば、一過性脳虚血、鎖骨下動脈盗血症候群、または椎骨脳底不全（ｖｅｒｔｅｂｒｏｂａｓｉｌａｒ　ｉｎｓｕｆｆｉｃｉｅｎｃｙ））、血管性痴呆（たとえば、多発脳梗塞性痴呆）、脳室周囲白質軟化症、ならびに血管性頭痛（例えば、群発性頭痛または片頭痛）。
【０６１５】
本発明のなおさらなる局面によれば、治療目的で、例えば、神経学的細胞増殖および／または分化を刺激するために、本発明のポリヌクレオチドまたはポリペプチド、ならびにアゴニストまたはアンタゴニストを利用するためのプロセスが提供される。従って、本発明のポリヌクレオチド、ポリペプチド、アゴニストおよび／またはアンタゴニストは、神経学的疾患を処置、および／または検出するために用いられ得る。さらに、本発明のポリヌクレオチドもしくはポリペプチド、またはアゴニストもしくはアンタゴニストは、特定の神経系疾患または障害のマーカーまたは検出因子として用いられ得る。
【０６１６】
本発明のポリヌクレオチド、ポリペプチド、アゴニスト、および／またはアンタゴニストを用いて処置または検出され得る神経性疾患のさらなる例としては、以下が挙げられる：代謝脳疾患のような脳疾患（母体性フェニルケトン尿症のようなフェニルケトン尿症、ピルビン酸カルボキシラーゼ欠損、ピルビン酸デヒドロゲナーゼ複合体欠損、ヴェルニッケ脳障害、脳水腫を含む）、小脳新生物のような脳新生物（テント下新生物、脈絡叢新生物のような脳室新生物、視床下部新生物、テント上新生物、キャナヴァン病を含む）、小脳性運動失調のような小脳疾患（脊髄小脳変性（例えば、毛細血管拡張性運動失調）、小脳性共同運動障害、フリートライヒ運動失調、マチャド−ジョセフ病、オリーブ橋小脳萎縮を含む）、テント下新生物のような小脳新生物、広汎性脳硬化症（例えば、軸周囲性脳炎、球様細胞白質萎縮症、異染性白質萎縮症および亜急性硬化性汎脳炎）。
【０６１７】
本発明のポリヌクレオチド、ポリペプチド、アゴニスト、および／またはアンタゴニストを用いて処置または検出され得る神経性疾患のさらなる例としては、以下が挙げられる：脳血管障害（例えば、頸動脈疾患（頸動脈血栓症、頸動脈狭窄症およびモヤモヤ病を含む）、脳のアミロイドアンギオパチー、大脳動脈瘤、脳酸素欠乏症、大脳動脈硬化症、大脳動静脈先天異常、大脳動脈疾患、脳塞栓症および血栓症（例えば、頸動脈血栓症、洞血栓症およびヴァレンベルク症候群）、脳出血（例えば、硬膜上血腫、硬膜下血腫およびクモ膜下出血）、脳梗塞、脳虚血（例えば、一過性脳虚血、鎖骨下動脈盗血症候群および椎骨基部不全）、血管性痴呆（例えば、多発脳梗塞性痴呆）、室周白斑、および血管性頭痛（例えば、群発性頭痛、片頭痛）。
【０６１８】
本発明のポリヌクレオチド、ポリペプチド、アゴニスト、および／またはアンタゴニストを用いて処置または検出され得る神経性疾患のさらなる例としては、以下が挙げられる：痴呆（例えば、ＡＩＤＳ痴呆複合症、初老期痴呆（例えば、アルツハイマー病およびクロイツフェルト−ヤーコプ病）、老年痴呆（例えば、アルツハイマー病および進行性核上性麻痺）、血管性痴呆（例えば、多発脳梗塞性痴呆））、脳炎（軸周囲性脳炎、ウイルス性脳炎（例えば、流行性脳炎、日本脳炎、セントルイス脳炎、ダニ媒介脳炎および西ナイル熱）を含む）、急性播種性脳脊髄炎、髄膜脳炎（例えば、ブドウ膜脳炎症候群、脳炎後のパーキンソン病および亜急性硬化性汎脳炎）、脳軟化症（例えば、室周白斑）、てんかん（例えば、全身てんかん（点灯麻痺を含む）、アプサンスてんかん、ミオクローヌスてんかん（ＭＥＲＲＦ症候群、強直性間代性てんかんを含む）、部分てんかん（例えば、複雑部分てんかん、前頭葉てんかんおよび側頭葉てんかん）、外傷後てんかん、てんかん重積持続状態（例えば、持続性部分てんかん）を含む）、およびハレルフォルデン−シュパッツ症候群。
【０６１９】
本発明のポリヌクレオチド、ポリペプチド、アゴニスト、および／またはアンタゴニストを用いて処置または検出され得る神経性疾患のさらなる例としては、以下が挙げられる：水頭症（例えば、ダンディ−ウォーカー症候群および正常圧水頭症）、視床下部疾患（例えば、視床下部新生物）、大脳マラリア、ナルコレプシー（脱力発作を含む）、延髄ポリオ、大脳偽腫瘍、レット症候群、ライ症候群、視床疾患、トキソプラスマ症、頭蓋内結核腫およびツェルヴェーガー症候群、中枢神経系感染（例えば、ＡＩＤＳ痴呆複合症、ブレーン膿瘍、硬膜下蓄膿、脳脊髄炎（例えば、ウマ脳脊髄炎、ベネズエラウマ脳脊髄炎、壊死性出血性脳脊髄炎）、ビスナ、および大脳マラリア。
【０６２０】
本発明のポリヌクレオチド、ポリペプチド、アゴニスト、および／またはアンタゴニストを用いて処置または検出され得る神経性疾患のさらなる例としては、以下が挙げられる：髄膜炎（例えば、クモ膜炎、無菌性髄膜炎（例えば、ウイルス性髄膜炎（リンパ球性脈絡髄膜炎を含む）、細菌性髄膜炎（ヘモフィルス髄膜炎、リステリア髄膜炎を含む）、髄膜炎菌性髄膜炎（例えば、ウォーターハウス−フリーデリックセン症候群、肺炎球菌髄膜炎および髄膜結核）、真菌類髄膜炎（例えば、クリプトコックス髄膜炎）、硬膜下滲出、髄膜脳炎（例えば、ブドウ膜髄膜脳炎症候群）、脊髄炎（例えば、横断脊髄炎）、神経梅毒（例えば、脊髄ろう）、ポリオ（延髄ポリオおよびポリオ後症候群を含む）、プリオン疾患および（例えば、クロイツフェルト−ヤーコプ症候群、ウシ海綿状脳症、ゲルストマン−シュトロイスラー症候群、クールー、スクラピー）および大脳トキソプラスマ症。
【０６２１】
本発明のポリヌクレオチド、ポリペプチド、アゴニスト、および／またはアンタゴニストを用いて処置または検出され得るさらなる神経性疾患としては、以下が挙げられる：中枢神経系新生物（例えば、脳新生物（小脳新生物（例えば、テント下新生物）、脳室新生物（例えば、脈絡叢新生物）、視床下部新生物およびテント上新生物を含む）、髄膜新生物、脊髄新生物（硬膜外新生物を含む）、脱髄疾患（例えば、キャナヴァン病）、広汎性脳硬化症（副腎脳白質ジストロフィー、軸周囲性脳炎、球様細胞白質萎縮症、異染性白質萎縮症のような広汎性脳硬化症を含む）、アレルギー性脳脊髄炎、壊死性出血性脳脊髄炎、進行性多病巣性白質脳障害、多発性硬化症、橋中央ミエリン溶解、横断脊髄炎、視神経脊髄炎、スクラピー、脊柱前弯症、慢性疲労症候群、ビスナ、高圧神経症候群、髄膜症、脊髄疾患（例えば、先天性筋無緊張症、筋萎縮性側索硬化症）、棘筋萎縮症（例えば、ヴェルドニッヒ−ホフマン病）、脊髄圧迫、脊髄新生物（例えば、硬膜外新生物）、脊髄空洞症、脊髄ろう、スティッフマン症候群、精神遅滞（例えば、Ａｎｇｅｌｍａｎ症候群、ネコ鳴き症候群、ド・ランゲ症候群、ダウン症候群）、ガングリオシドーシス（例えば、ガングリオシドーシスＧ（Ｍ１）、ザントホフ病、テイ−サックス病）、ハートナップ病、ホモシスチン尿症、ローレンス−ムーン−ビードル症候群、レッシュ−ナイハン症候群、カエデシロップ病、ムコリピドーシス（例えば、フコース蓄積症）、セロイド脂褐素沈着症、眼脳腎症候群、フェニルケトン尿症（例えば、母体フェニルケトン尿症）、プラーダー−ヴィリ症候群、レット症候群、ルービンスタイン−テービ症候群、結節硬化症、ＷＡＧＲ症候群、神経系異常（例えば、全前脳症、神経管欠損（例えば、無脳症（水無脳症（ｈｙｄｒａｎｇｅｎｃｅｐｈａｌｙ）を含む）））、アルノルト−キアーリ奇形、脳ヘルニア、髄膜瘤、髄膜脊髄瘤、および脊椎癒合不全（例えば、嚢胞性二分脊椎および潜在性二分脊椎）。
【０６２２】
本発明のポリヌクレオチド、ポリペプチド、アゴニスト、および／またはアンタゴニストを用いて処置または検出され得るさらなる神経性疾患としては、以下が挙げられる：遺伝性感覚ニューロン障害および運動ニューロン障害（シャルコー−マリー病を含む）、遺伝性眼萎縮症、レフサム病、遺伝性痙性対麻痺、ヴェルドニッヒ−ホフマン病、遺伝性運動ニューロン障害および感覚ニューロン障害（例えば、先天性痛覚脱失症および家族性自律神経障害）、神経症的発現（例えば、認知不能症（ゲルストマン症候群を含む）、健忘症（例えば、逆向性健忘症）、失行症、神経因性膀胱障害、脱力発作、伝達障害（例えば、聴覚障害（難聴、部分的聴力欠損、大声（ｌｏｕｄｎｅｓｓ）レクルートメントおよび耳鳴を含む）、言語障害（例えば、失語症（失書症、名称失語症、ブロカ失語症およびヴェルニッケ失語症を含む）、失読症（例えば、後天性失読症）、言語発達障害、発語障害（例えば、失語症（名称失語症、ブロカ失語症およびヴェルニッケ失語症を含む））、構音障害、伝達障害（例えば、発語障害（構語障害、反響言語、無言症およびどもりを含む）、発声障害（例えば、失声症および嗄声））、除脳硬直状態、せん妄、束形成、幻覚、髄膜症、運動障害（例えば、Ａｎｇｅｌｍａｎ症候群、運動失調、アテトーシス、舞踏病、失調症、運動低下症、筋緊張低下、ミオクロヌス、チック、斜頸および振せん）、筋緊張亢進（例えば、筋硬直（例えば、スティッフマン症候群）、筋痙性、麻痺（例えば、顔面神経麻痺（耳帯状疱疹を含む）、胃不全麻痺、片麻痺、眼筋麻痺（例えば、複視、デュエーン症候群、ホルナー症候群、慢性進行性外眼筋麻痺症（例えば、キーンズ症候群））、延髄麻痺、熱帯性痙性不全対麻痺、対麻痺（例えば、ブラウン−セカール症候群、四肢麻痺）、呼吸性麻痺および声帯麻痺、不全麻痺）、幻影肢、味覚障害（例えば、無味覚症および味覚不全）、視覚障害（例えば、弱視、失明、色覚障害、複視、半盲、暗点および正常以下の視覚）、睡眠障害（例えば、睡眠過剰（クライネ−レヴィン症候群を含む）、不眠症、および夢遊症）、痙縮（例えば、開口障害）、意識消失（例えば、昏睡、持続性植物状態および失神）および眩暈、神経筋障害（例えば、先天性筋無緊張症、筋萎縮性側索硬化症、ランバート−イートン筋無力症症候群、運動ニューロン疾患、筋萎縮（例えば、棘筋萎縮、シャルコー−マリー病およびヴェルドニッヒ−ホフマン病）、ポリオ後症候群、筋ジストロフィー、重症筋無力症、萎縮性ミオトニー、先天性ミオトニー、ネマリンミオパシー、家族性周期性四肢麻痺、多発性パラミオクロヌス（ｐａｒａｍｙｌｏｃｌｏｎｕｓ）、熱帯性痙性不全対麻痺およびスティッフマン症候群）、末梢神経系障害（例えば、先端疼痛症）、アミロイドニューロパシー、自律神経系疾患（例えば、アーディー症候群、Ｂａｒｒｅ−Ｌｉｅｏｕ症候群、家族性自律神経障害、ホルナー症候群、反射性交感神経性ジストロフィーおよびシャイ−ドレーガー症候群）、脳神経疾患（例えば、聴神経疾患（例えば、聴神経腫（２型神経線維腫症を含む））、顔面神経疾患（例えば、顔面神経痛、メルカーソン−ローゼンタール症候群、眼球運動障害（弱視、眼振、動眼神経麻痺を含む）、眼筋麻痺（例えば、デュエーン症候群、ホルナー症候群、慢性進行性外眼筋麻痺症（キーンズ症候群を含む））、斜視（例えば、内斜視および外斜視）、視神経麻痺、視神経疾患（例えば、眼萎縮症（遺伝性眼萎縮症を含む）、視神経円板結晶腔、視神経炎（例えば、視神経脊髄炎、乳頭水腫））、三叉神経痛、声帯麻痺、脱髄疾患（例えば、視神経脊髄炎および脊柱前弯症）、および糖尿病性ニューロパシー（例えば、糖尿病足）。
【０６２３】
本発明のポリヌクレオチド、ポリペプチド、アゴニスト、および／またはアンタゴニストを用いて処置または検出され得るさらなる神経性疾患としては、以下が挙げられる：神経圧挫症候群（例えば、手根管症候群、足根管症候群）、胸郭出口症候群（例えば、頸肋症候群）、尺骨神経圧挫症候群、神経痛（例えば、カウザルギー、頸腕神経痛、顔面神経痛および三叉神経痛）、神経炎（例えば、実験的アレルギー性神経炎、眼神経炎、多発性神経炎、多発神経根神経炎および神経根炎（例えば、多発性神経根炎））、遺伝性運動ニューロン障害および感覚ニューロン障害（例えば、シャルコー−マリー病）、遺伝性眼萎縮症、レフサム病、遺伝性痙性対麻痺およびヴェルドニッヒ−ホフマン病、遺伝性感覚ニューロン障害および自律神経ニューロン障害（先天性痛覚脱失症および家族性自律神経障害を含む）、ＰＯＥＭＳ症候群、坐骨神経痛、味覚性発汗症およびテタニー）。
【０６２４】
（感染性疾患）
本発明のポリヌクレオチドまたはポリペプチド、ならびにアゴニストまたはアンタゴニストは、感染因子を処置または検出するために用いられ得る。例えば、免疫応答を上昇させることによって、特にＢ細胞および／またはＴ細胞の増殖および分化を増加させることによって、感染性疾患が処置され得る。免疫応答は、既存の免疫応答を上昇させるか、または新たな免疫応答を開始させるかのいずれかにより上昇され得る。あるいは、本発明のポリヌクレオチドまたはポリペプチド、ならびにアゴニストまたはアンタゴニストはまた、必ずしも免疫応答を誘発することなく、感染因子を直接阻害し得る。
【０６２５】
ウイルスは、本発明のポリヌクレオチドもしくはポリペプチド、および／またはアゴニストもしくはアンタゴニストにより処置または検出され得る疾患または症状を引き起こし得る感染因子の一例である。ウイルスの例としては、以下のＤＮＡおよびＲＮＡのウイルスおよびウイルス科が挙げられるがこれらに限定されない：アルボウイルス、アデノウイルス科、アレナウイルス科、アルテリウイルス、ビルナウイルス科、ブンヤウイルス科、カルシウイルス科、サルコウイルス科（Ｃｉｒｃｏｖｉｒｉｄａｅ）、コロナウイルス科、デング熱、ＥＢＶ、ＨＩＶ、フラビウイルス科、ヘパドナウイルス科（肝炎）、ヘルペスウイルス科（例えば、サイトメガロウイルス、単純ヘルペス、ヘルペス帯状疱疹）、モノネガウイルス（Ｍｏｎｏｎｅｇａｖｉｒｕｓ）（例えば、パラミクソウイルス科、麻疹ウイルス、ラブドウイルス科）、オルソミクソウイルス科（例えば、インフルエンザＡ、インフルエンザＢ、およびパラインフルエンザ）、パピローマウイルス、パポバウイルス科、パルボウイルス科、ピコルナウイルス科、ポックスウイルス科（例えば、痘瘡またはワクシニア）、レオウイルス科（例えば、ロタウイルス）、レトロウイルス科（ＨＴＬＶ−Ｉ、ＨＴＬＶ−ＩＩ、レンチウイルス）、およびトガウイルス科（例えば、ルビウイルス属）。これらの科内に入るウイルスは、以下を含むがこれらに限定されない種々の疾患または症状を引き起こし得る：関節炎、細気管支炎（ｂｒｏｎｃｈｉｏｌｌｉｔｉｓ）、呼吸性シンシチウムウイルス、脳炎、眼性感染症（例えば、結膜炎、角膜炎）、慢性疲労症候群、肝炎（Ａ型、Ｂ型、Ｃ型、Ｅ型、慢性活動性、デルタ）、日本脳炎Ｂ型、アルゼンチン出血熱、チングニア、リフトバレー熱、黄熱病、髄膜炎、日和見感染症（例えば、ＡＩＤＳ）、肺炎、バーキットリンパ腫、水痘、出血熱、麻疹、流行性耳下腺炎、パラインフルエンザ、狂犬病、感冒、ポリオ、白血病、風疹、性感染症、皮膚病（例えば、カポージ、いぼ）、およびウイルス血症。本発明のポリペプチドもしくはポリヌクレオチド、またはアゴニストもしくはアンタゴニストを用いて、任意のこれらの症状または疾患が処置または検出され得る。特定の実施形態において、本発明のポリヌクレオチド、ポリペプチド、またはアゴニストもしくはアンタゴニストは、以下の処置に使用される：髄膜炎、デング熱、ＥＢＶ、および／または肝炎（例えば、Ｂ型肝炎）。さらなる特定の実施形態において、本発明のポリヌクレオチド、ポリペプチド、またはアゴニストもしくはアンタゴニストを使用して１以上の他の市販の肝炎ワクチンに非応答性の患者を処置し得る。さらに特定の実施形態において、本発明のポリヌクレオチド、ポリペプチド、またはアゴニストもしくはアンタゴニストを使用してＡＩＤＳを処置し得る。
【０６２６】
同様に、疾患または症状を引き起こし得、かつ本発明のポリヌクレオチドもしくはポリペプチド、および／またはアゴニストもしくはアンタゴニストによって処置または検出され得る細菌性因子あるいは真菌性因子は、以下のグラム陰性およびグラム陽性細菌および細菌科ならびに真菌を含むがこれらに限定されない：放線菌属（例えば、Ｎｏｒｃａｒｄｉａ）、アシネトバクター属、Ｃｒｙｐｔｏｃｏｃｃｕｓ　ｎｅｏｆｏｒｍａｎｓ、アスペルギルス属、バチルス属（例えば、Ｂａｃｉｌｌｕｓ　ａｎｔｈｒａｓｉｓ）、バクテロイデス属（例えば、Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ　ｆｒａｇｉｌｉｓ）、ブラストミセス症、ボルデテラ属、ボレリア属（例えば、Ｂｏｒｒｅｌｉａ　ｂｕｒｇｄｏｒｆｅｒｉ）、ブルセラ属、カンジダ、カンピロバクター属、クラミジア属、クロストリジウム属（例えば、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ　ｂｏｔｕｌｉｎｕｍ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ　ｄｉｆｉｃｉｌｅ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ　ｐｅｒｆｒｉｎｇｅｎｓ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ　ｔｅｔａｎｉ）、コクシジオイデス属、コリネバクテリウム属（例えば、Ｃｏｒｙｎｅｂａｃｔｅｒｉｕｍ　ｄｉｐｔｈｅｒｉａｅ）、クリプトコックス属、Ｄｅｒｍａｔｏｃｙｃｏｓｅｓ、Ｅ．ｃｏｌｉ（例えば、エンテロトキシン産生性Ｅ．ｃｏｌｉおよび腸出血性Ｅ．ｃｏｌｉ）、エンテロバクター属（例えば、Ｅｎｔｅｒｏｂａｃｔｅｒ　ａｅｒｏｇｅｎｅｓ）、腸内細菌科（クレブシエラ属、サルモネラ属（例えば、Ｓａｌｍｏｎｅｌｌａ　ｔｙｐｈｉ、Ｓａｌｍｏｎｅｌｌａ　ｅｎｔｅｒｉｔｉｄｉｓ、Ｓａｌｍｏｎｅｌｌａ　ｔｙｐｈｉ）、セラチア属、エルジニア属、赤痢菌属）、エリジペロスリックス属、ヘモフィルス属（例えば、Ｈａｅｍｏｐｈｉｌｕｓ　ｉｎｆｌｕｅｎｚａＢ型）、ヘリコバクター属、レジオネラ属（例えば、Ｌｅｇｉｏｎｅｌｌａ　ｐｎｅｕｍｏｐｈｉｌａ）、レプトスピラ属、リステリア属（例えば、Ｌｉｓｔｅｒｉａ　ｍｏｎｏｃｙｔｏｇｅｎｅｓ）、マイコプラスマ属、ミコバクテリウム属（例えば、Ｍｙｃｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ　ｌｅｐｒａｅおよびＭｙｃｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ　ｔｕｂｅｒｃｕｌｏｓｉｓ）、ビブリオ属（例えば、Ｖｉｂｒｉｏ　ｃｈｏｌｅｒａｅ）、ナイセリア属（例えば、Ｎｅｉｓｓｅｒｉａ　ｇｏｎｏｒｒｈｅａ、Ｎｅｉｓｓｅｒｉａ　ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ）、パスツレラ属、プロテウス属、シュードモナス属（例えば、Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ　ａｅｒｕｇｉｎｏｓａ）、リケッチア属、スピロヘータ（例えば、Ｔｒｅｐｏｎｅｍａ　ｓｐｐ．、Ｌｅｐｔｏｓｐｉｒａ　ｓｐｐ．、Ｂｏｒｒｅｌｉａ　ｓｐｐ．）、Ｓｈｉｇｅｌｌａ　ｓｐｐ．、連鎖球菌属（例えば、Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ　ａｕｒｅｕｓ）、Ｍｅｎｉｎｇｉｏｃｏｃｃｕｓ、肺炎球菌および連鎖球菌属（例えば、Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ　ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅおよび連鎖球菌Ａ群、連鎖球菌Ｂ群、および連鎖球菌Ｃ群）、および　ウレアプラスマ属。これらの細菌科、寄生虫科、および真菌科は、以下に挙げる疾患または症状を引き起こし得るが、限定ではない：抗生物質耐性感染症、菌血症、心内膜炎、敗血症、眼感染（例えば、結膜炎）、ブドウ膜炎、結核、歯肉炎、細菌性下痢、日和見感染（例えば、ＡＩＤＳ関連感染）、爪囲炎、プロテーゼ関連感染、う食、ライター病、気道感染、（例えば、百日咳または蓄膿）、セプシス、ライム病、ネコ引っ掻き病、赤痢、パラチフス熱、食中毒、レジオネラ症、慢性炎症および急性炎症、紅斑、酵母感染、腸チフス、肺炎、淋病、髄膜炎（例えば、髄膜炎（メンギティス（ｍｅｎｇｉｔｉｓ）Ａ型およびＢ型））、クラミジア、梅毒、ジフテリア、らい病、ブルセラ症、消化性潰瘍、炭疽、自然流産、出生時欠損、肺炎、肺感染、耳感染、難聴、盲、嗜眠、倦怠、嘔吐、慢性下痢、クローン病、大腸炎、膣の病気、生殖不能、骨盤炎症疾患（ｐｅｌｖｉｃ　ｉｎｆｌａｍｍａｔｏｒｙ　ｄｉｓｅａｓｅ）、カンジダ症、パラ結核、結核、狼瘡、ボツリヌス中毒、壊疽、破傷風、膿痂疹、リウマチ熱、猩紅熱、性感染病、皮膚疾患（例えば、蜂巣炎、皮膚球菌（ｄｅｒｍａｔｏｃｙｃｏｓｅｓ））、毒血症、尿路感染症、創傷感染、ノスコミアル（ｎｏｓｃｏｍｉａｌ）感染。本発明のポリヌクレオチドまたはポリペプチド、アゴニストまたはアンタゴニストを使用してこれらの任意の症状または疾患を処置または検出し得る。特定の実施形態において、本発明のポリヌクレオチド、ポリペプチド、アゴニストまたはアンタゴニストを使用して、以下を処置し得る：破傷風、ジフテリア（ｄｉｐｔｈｅｒｉａ）、ボツリヌス中毒、および／またはＢ型髄膜炎。
【０６２７】
さらに、本発明のポリヌクレオチドもしくはポリペプチドおよび／またはアゴニストもしくはアンタゴニストによって処置、予防、および／または診断され得る疾患または症状を引き起こす寄生性因子として以下の科または綱が挙げられるが、限定ではない：アメーバー症、バベシア症、コクシジウム症、クリプトスポリジウム症、二核アメーバ症（Ｄｉｅｎｔａｍｏｅｂｉａｓｉｓ）、交疫、外部寄生生物症（Ｅｃｔｏｐａｒａｓｉｔｉｃ）、ジアルジア鞭毛虫症（Ｇｉａｒｄｉａｓ）、蠕虫病、リーシュマニア症、住血吸虫属（Ｓｃｈｉｓｔｉｓｏｍａ）、タイレリア症、トキソプラスマ症、トリパノソーマ症、ならびにトリコモナス属および胞子虫（例えば、Ｐｌａｓｍｏｄｉｕｍ　ｖｉｒａｘ、Ｐｌａｓｍｏｄｉｕｍ　ｆａｌｃｉｐａｒｉｕｍ、Ｐｌａｓｍｏｄｉｕｍ　ｍａｌａｒｉａｅおよびＰｌａｓｍｏｄｉｕｍ　ｏｖａｌｅ）。これらの寄生虫は、以下に挙げる様々な疾患または症状を引き起こし得るが、これらに限定されない：疥癬、ツツガムシ病、眼感染、腸疾患（例えば、赤痢、ジアルジア鞭毛虫症）、肝疾患、肺疾患、日和見感染症（例えば、ＡＩＤＳ関連）、マラリア、仮想妊娠（ｐｒｅｇｎａｎｃｙ　ｃｏｍｐｌｉｃａｔｉｏｎｓ）、およびトキソプラズマ症。本発明のポリヌクレオチドまたはポリペプチド、もしくはアゴニストまたはアンタゴニストを使用してこれらの任意の症状または疾患を処置、予防、および／または診断し得る。特定の実施形態において、本発明のポリヌクレオチド、ポリペプチド、もしくはアンタゴニストまたはアゴニストを使用してマラリアを処置、予防、および／または診断し得る。
【０６２８】
本発明のポリヌクレオチドまたはポリペプチド、およびアゴニストまたはアンタゴニストは、有効量のポリペプチドを患者に投与すること、または患者から細胞を取り出し、本発明のポリペプチドを細胞に供給し、そして操作した細胞を患者に戻す（エキソビボ治療）ことのいずれかによってなされ得る。さらに、本発明のポリペプチドまたはポリヌクレオチドをワクチン中の抗原として使用して、感染性疾患に対する免疫応答を惹起し得る。
【０６２９】
（再生）
本発明のポリヌクレオチドもしくはポリペプチド、ならびにアゴニストもしくはアンタゴニストを用いて、細胞を分化させ、増殖させ、そして誘引して、組織の再生を導き得る（Ｓｃｉｅｎｃｅ　２７６：５９−８７（１９９７）を参照のこと）。組織の再生を用いて、先天性欠損、外傷（創傷、熱傷、切開、または潰瘍）、加齢、疾患（例えば、骨粗鬆症、変形性関節炎（ｏｓｔｅｏｃａｒｔｈｒｉｔｉｓ）、歯周病、肝不全）、美容形成手術を含む手術、線維症、再灌流傷害、もしくは全身性サイトカイン損傷により損傷を受けた組織を修復、置換、または保護し得る。
【０６３０】
本発明を用いて再生し得る組織としては、以下が挙げられる：器官（例えば、膵臓、肝臓、腸、腎臓、皮膚、内皮）、筋肉（平滑筋、骨格筋、または心筋）、血管系（血管およびリンパ管を含む）、神経、造血、および骨格（骨、軟骨、腱、および靭帯）の組織。好ましくは、再生は、瘢痕なく、または瘢痕が低減されて生じる。再生はまた、新脈管形成を含み得る。
【０６３１】
さらに、本発明のポリヌクレオチドもしくはポリペプチド、ならびにアゴニストもしくはアンタゴニストは、治癒するのが困難な組織の再生を増加させ得る。例えば、腱／靭帯の再生を増大させることによって、損傷後の回復時間が早まる。本発明のポリヌクレオチドもしくはポリペプチド、ならびにアゴニストもしくはアンタゴニストはまた、損傷を回避する試みにおいて予防的に使用され得る。処置され得る特定の疾患として、腱炎、手根管症候群、および他の腱欠損または靭帯欠損が挙げられる。非治癒創傷の組織再生のさらなる例としては、褥瘡性潰瘍、脈管不全、外科的創傷、および外傷性創傷に関連する潰瘍が挙げられる。
【０６３２】
同様に、神経および脳組織はまた、神経細胞を増殖および分化させるために本発明のポリヌクレオチドもしくはポリペプチド、ならびにアゴニストもしくはアンタゴニストを使用することによって再生され得る。本方法を用いて処置され得る疾患としては、中枢神経系疾患および末梢神経系疾患、神経障害、または機械的および外傷性障害（例えば、脊髄障害、頭部外傷、脳血管疾患、および発作（ｓｔｏｋｅ））が挙げられる。詳細には、末梢神経傷害と関連する疾患、末梢神経障害（例えば、化学療法または他の医学的療法から生じる）、局在神経障害、および中枢神経系疾患（例えば、アルツハイマー病、パーキンソン病、ハンチントン病、筋萎縮性側索硬化症、およびシャイ−ドレーガー症候群）はすべて、本発明のポリヌクレオチドもしくはポリペプチド、ならびにアゴニストもしくはアンタゴニストを用いて処置され得る。
【０６３３】
（走化性）
本発明のポリヌクレオチドもしくはポリペプチド、ならびにアゴニストもしくはアンタゴニストは、走化性活性を有し得る。走化性分子は、細胞（例えば、単球、線維芽細胞、好中球、Ｔ細胞、肥満細胞、好酸球、上皮細胞および／または内皮細胞）を、身体中の特定の部位（例えば、炎症、感染、または過剰増殖の部位）に誘引または動員する。次いで、動員された細胞は、特定の外傷または異常性を撃退および／または治癒し得る。
【０６３４】
本発明のポリヌクレオチドもしくはポリペプチド、ならびにアゴニストもしくはアンタゴニストは、特定の細胞の走化性活性を増大し得る。次いで、これらの走化性分子を使用して、身体中の特定の位置に標的化した細胞の数を増加させることによって、炎症、感染、過剰増殖性障害、または任意の免疫系障害を処置し得る。例えば、走化性分子を使用して、傷害を受けた位置に免疫細胞を誘引することによって、組織に対する創傷および他の外傷を処置し得る。本発明の走化性分子はまた、線維芽細胞を誘引し得、これは創傷を処置するために使用され得る。
【０６３５】
本発明のポリヌクレオチドもしくはポリペプチド、ならびにアゴニストもしくはアンタゴニストが走化性活性を阻害し得ることもまた意図される。これらの分子はまた、障害を処置するために使用され得る。従って、本発明のポリヌクレオチドもしくはポリペプチド、ならびにアゴニストもしくはアンタゴニストは、走化性のインヒビターとして使用され得る。
【０６３６】
（結合活性）
本発明のポリペプチドは、このポリペプチドに結合する分子、またはこのポリペプチドが結合する分子についてスクリーニングするために使用され得る。このポリペプチドとこの分子との結合は、結合したポリペプチドまたは分子の活性を活性化（アゴニスト）、増大、阻害（アンタゴニスト）、または減少させ得る。そのような分子の例としては、抗体、オリゴヌクレオチド、タンパク質（例えば、レセプター）、または低分子が挙げられる。
【０６３７】
好ましくは、この分子は、このポリペプチドの天然のリガンド（例えば、リガンドのフラグメント）、または天然の基質、リガンド、構造的模倣物、もしくは機能的模倣物に密接に関連する（Ｃｏｌｉｇａｎら、Ｃｕｒｒｅｎｔ　Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ　ｉｎ　Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ　１（２）：第５章（１９９１）を参照のこと）。同様に、この分子は、このポリペプチドが結合する天然のレセプター、または少なくとも、このポリペプチドによって結合され得るレセプターのフラグメント（例えば、活性部位）に密接に関連し得る。いずれの場合においても、この分子は、公知の技術を用いて合理的に設計され得る。
【０６３８】
好ましくは、これらの分子についてのスクリーニングは、ポリペプチドを発現する適切な細胞を産生する工程を包含する。好ましい細胞としては、哺乳動物、酵母、Ｄｒｏｓｏｐｈｉｌａ、またはＥ．ｃｏｌｉ由来の細胞が挙げられる。次いで、このポリペプチドを発現する細胞（または、発現されたポリペプチドを含む細胞膜）を、好ましくは、このポリペプチドまたはこの分子のいずれかの結合、活性の刺激、または活性の阻害を観察するための分子を潜在的に含む試験化合物と接触させる。
【０６３９】
アッセイは、このポリペプチドへの候補化合物の結合を単純に試験し得、ここで結合は、標識によって、または標識された競合物との競合に関するアッセイにおいて検出される。さらに、アッセイは、候補化合物がこのポリペプチドへの結合によって生成されるシグナルを生じるか否かを試験し得る。
【０６４０】
あるいは、アッセイは、無細胞調製物、固体支持体に接着されたポリペプチド／分子、化学ライブラリー、または天然産物の混合物を用いて実施され得る。アッセイはまた、候補化合物を、ポリペプチドを含む溶液と混合する工程、ポリペプチド／分子の活性または結合を測定する工程、およびポリペプチド／分子の活性または結合を、標準と比較する工程を単純に包含し得る。
【０６４１】
好ましくは、ＥＬＩＳＡアッセイは、モノクローナル抗体またはポリクローナル抗体を用いて、サンプル（例えば、生物学的サンプル）におけるポリペプチドのレベルまたは活性を測定し得る。抗体は、ポリペプチドへの直接的もしくは間接的のいずれかの結合、または基質についてのポリペプチドとの競合によって、ポリペプチドのレベルまたは活性を測定し得る。
【０６４２】
さらに、本発明のポリペプチドが結合するレセプターは、当業者に公知の多くの方法（例えば、リガンドパニングおよびＦＡＣＳソーティング（Ｃｏｌｉｇａｎら、Ｃｕｒｒｅｎｔ　Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ　ｉｎ　Ｉｍｍｕｎ．，１（２）、第５章（１９９１））によって同定され得る。例えば、発現クローニングを用い、ここで、ポリアデニル化ＲＮＡがこのポリペプチドに応答する細胞（例えば、ＮＩＨ３Ｔ３細胞（これは、ＦＧＦファミリータンパク質に対する複数のレセプターを含むことが公知である）、およびＳＣ−３細胞）から調製される、そしてこのＲＮＡから作製されたｃＤＮＡライブラリーは、プールに分けられ、そしてこのポリペプチドに応答性でないＣＯＳ細胞または他の細胞をトランスフェクトするために使用される。ガラススライド上で増殖しているトランスフェクトされた細胞は、それらを標識化した後に、本発明のポリペプチドに曝露される。このポリペプチドは、種々の手段（部位特異的プロテインキナーゼに対する認識部位のヨウ素化または封入を含む）によって標識化され得る。
【０６４３】
固定化およびインキュベーション後、スライドは、オートラジオグラフィー分析に供される。陽性プールを同定し、そしてサブプールを、反復性のサブプール化および再スクリーニングプロセスを使用して調製および再びトランスフェクトして、最終的に推定レセプターをコードする単一のクローンを生じる。
【０６４４】
レセプター同定のための代替のアプローチとして、標識ポリペプチドは、レセプター分子を発現する細胞膜および抽出調製物と光親和性に連結し得る。架橋された材料は、ＰＡＧＥ分析によって分離され、そしてＸ線フィルムに曝露される。ポリペプチドのレセプターを含む標識複合体が切り出され得、ペプチドフラグメントへと分離され得、そしてタンパク質微小配列決定に供され得る。微小配列決定から得られるアミノ酸配列を使用して、１組の縮重オリゴヌクレオチドプローブを設計してｃＤＮＡライブラリーをスクリーニングし、推定レセプターをコードする遺伝子を同定する。
【０６４５】
さらに、遺伝子シャッフリング、モチーフシャッフリング、エキソンシャッフリング、および／またはコドンシャッフリングの技術（集合的に「ＤＮＡシャッフリング」という）を利用して、本発明のポリペプチドの活性を調節し得、それによって本発明のポリペプチドのアゴニストおよびアンタゴニストを効果的に生成する。一般に、米国特許第５，６０５，７９３号、同第５，８１１，２３８号、同第５，８３０，７２１号、同第５，８３４，２５２号、および同第５，８３７，４５８号、ならびにＰａｔｔｅｎ，Ｐ．Ａ．ら、Ｃｕｒｒ．Ｏｐｉｎｉｏｎ　Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．８：７２４〜３３（１９９７）；Ｈａｒａｙａｍａ，Ｓ．Ｔｒｅｎｄｓ　Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．１６（２）：７６〜８２（１９９８）；Ｈａｎｓｓｏｎ，Ｌ．Ｏ．ら、Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．２８７：２６５〜７６（１９９９）；ならびにＬｏｒｅｎｚｏ，Ｍ．Ｍ．およびＢｌａｓｃｏ，Ｒ．Ｂｉｏｔｅｃｈｎｉｑｕｅｓ　２４（２）：３０８〜１３（１９９８）（これらの特許および刊行物の各々は、本明細書において参考として援用される）を参照のこと。１つの実施形態において、ポリヌクレオチドの変更および対応するポリペプチドの変更は、ＤＮＡシャッフリングによって達成され得る。ＤＮＡシャッフリングは、相同組換えまたは部位特異的な組換えによる、２つ以上のＤＮＡセグメントの、所望の分子への構築に関連する。別の実施形態において、ポリヌクレオチドおよび対応するポリペプチドは、組換えの前に、誤りがちな（ｅｒｒｏｒ−ｐｒｏｎｅ）ＰＣＲ、ランダムヌクレオチド挿入または他の方法によるランダム変異誘発に供することによって、変更され得る。別の実施形態において、本発明のポリペプチドの１つ以上の成分、モチーフ、切片、部分、ドメイン、フラグメントなどは、１つ以上の異種分子の１つ以上の成分、モチーフ、切片、部分、ドメイン、フラグメントなどと組換えられ得る。好ましい実施形態において、この異種分子は、ファミリーのメンバーである。さらに好ましい実施形態において、この異種分子は、例えば、血小板由来増殖因子（ＰＤＧＦ）、インスリン様増殖因子（ＩＧＦ−Ｉ）、トランスホーミング増殖因子（ＴＧＦ）−α、表皮増殖因子（ＥＧＦ）、線維芽細胞増殖因子（ＦＧＦ）、ＴＧＦ−β、骨形成タンパク質（ＢＭＰ）−２、ＢＭＰ−４、ＢＭＰ−５、ＢＭＰ−６、ＢＭＰ−７、アクチビンＡおよびアクチビンＢ、デカペンタプレジック（ｄｅｃａｐｅｎｔａｐｌｅｇｉｃ）（ｄｐｐ）、６０Ａ、ＯＰ−２、ドーサリン（ｄｏｒｓａｌｉｎ）、増殖分化因子（ＧＤＦ）、結節（ｎｏｄａｌ）、ＭＩＳ、インヒビン−α、ＴＧＦ−β１、ＴＧＦ−β２、ＴＧＦ−β３、ＴＧＦ−β５、および神経膠由来神経栄養因子（ＧＤＮＦ）のような増殖因子である。
【０６４６】
他の好ましいフラグメントは、本発明のポリペプチドの生物学的に活性なフラグメントである。生物学的に活性なフラグメントは、本発明のポリぺプチドの活性に類似の活性を示すが、必ずしも同一である必要はないフラグメントである。このフラグメントの生物学的活性は、改善された所望の活性、または減少した所望されない活性を含み得る。
【０６４７】
さらに、本発明は、本発明のポリペプチドの作用を調節する化合物を同定するために化合物をスクリーニングする方法を提供する。このようなアッセイの例は、哺乳動物線維芽細胞、本発明のポリペプチド、スクリーニングされるべき化合物および３［Ｈ］チミジンを、線維芽細胞が通常増殖する細胞培養条件下で合わせる工程を包含する。コントロールアッセイは、スクリーニングされるべき化合物の非存在下で実施され得、そしてこの化合物の存在下での線維芽細胞の増殖の量と比較して、各々の場合における３［Ｈ］チミジンの取り込みの決定によって、この化合物が増殖を刺激するか否かを決定し得る。線維芽細胞の増殖の量は、３［Ｈ］チミジンの取り込みを測定する液体シンチレーションクロマトグラフィーによって測定される。アゴニスト化合物およびアンタゴニスト化合物の両方が、この手順により同定され得る。
【０６４８】
別の方法において、本発明のポリペプチドに対するレセプターを発現する哺乳動物細胞または膜調製物は、この化合物の存在下において標識化した本発明のポリペプチドとともにインキュベートされる。次いで、この化合物がこの相互作用を増強またはブロックする能力が、測定され得る。あるいは、スクリーニングされるべき化合物の相互作用に従う既知のセカンドメッセンジャー系の応答およびレセプターが測定され、そしてこの化合物がこのレセプターに結合し、そしてセカンドメッセンジャー応答を誘発する能力を測定して、この化合物が潜在的なアゴニストまたはアンタゴニストであるか否かを決定する。このようなセカンドメッセンジャー系には、ｃＡＭＰグアニル酸シクラーゼ、イオンチャネルまたはホスホイノシチド加水分解が挙げられるが、これらに限定されない。
【０６４９】
これらの上記のアッセイの全ては、診断マーカーまたは予後マーカーとして使用され得る。これらのアッセイを用いて発見される分子は、ポリペプチド／分子を活性化または阻害することによって、疾患を処置するか、あるいは患者に特定の結果（例えば、血管増殖）をもたらすために使用され得る。さらに、アッセイは、適切に操作された細胞または組織からの本発明のポリペプチドの産生を阻害または増強し得る因子を発見し得る。
【０６５０】
従って、本発明は、以下の工程を含む、本発明のポリペプチドに結合する化合物を同定する方法を包含する：（ａ）候補結合化合物を本発明のポリペプチドとともにインキュベートする工程；および（ｂ）結合が生じたか否かを決定する工程。さらに、本発明は、以下の工程を含むアゴニスト／アンタゴニストを同定する方法を包含する：（ａ）候補化合物を本発明のポリペプチドとともにインキュベートする工程、（ｂ）生物学的活性をアッセイする工程、および（ｂ）ポリペプチドの生物学的活性が改変されているか否かを決定する工程。
【０６５１】
（標的化された送達）
別の実施形態において、本発明は、組成物を、本発明のポリペプチドについてのレセプターを発現する標的化細胞、または本発明のポリペプチドの細胞結合形態を発現する細胞に送達する方法を提供する。
【０６５２】
本明細書中で議論される場合、本発明のポリペプチドまたは抗体は、異種ポリペプチド、異種核酸、毒素またはプロドラッグと、疎水性、親水性、イオン性および／または共有結合性の相互作用を介して会合し得る。１つの実施形態において、本発明は、異種ポリペプチドまたは核酸と会合した本発明のポリペプチド（抗体を含む）を投与することによる、細胞への本発明の組成物の特異的な送達のための方法を提供する。１つの例において、本発明は、治療タンパク質を標的化細胞中へ送達するための方法を提供する。別の例において、本発明は、一本鎖核酸（例えば、アンチセンスまたはリボザイム）あるいは二本鎖核酸（例えば、細胞のゲノムに組み込まれ得るか、またはエピソームにて複製し得、そして転写され得る、ＤＮＡ）を、標的化細胞に送達するための方法を提供する。
【０６５３】
別の実施形態において、本発明は、毒素または細胞傷害性プロドラッグと会合した本発明のポリペプチド（例えば、本発明のポリペプチドまたは本発明の抗体）を投与することによる細胞の特異的破壊（例えば、腫瘍細胞の破壊）のための方法を提供する。
【０６５４】
「毒素」とは、内因性の細胞傷害性エフェクター系、放射性同位体、ホロ毒素（ｈｏｌｏｔｏｘｉｎ）、改変型毒素、毒素の触媒サブユニット、または規定の条件下で細胞死を引き起こす細胞中もしくは細胞表面には通常存在しない任意の分子もしくは酵素を、結合および活性化する化合物を意味する。本発明の方法に従って使用され得る毒素としては、以下が挙げられるが、これらに限定されない：当該分野で公知の放射性同位体、固有のまたは誘導された内因性の細胞傷害性エフェクター系を結合する化合物（例えば、抗体（またはその補体固定を含む部分））、チミジンキナーゼ、エンドヌクレアーゼ、ＲＮＡｓｅ、α毒素、リシン、アブリン、Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ外毒素Ａ、ジフテリア毒素、サポリン、モモルジン（ｍｏｍｏｒｄｉｎ）、ゲロニン（ｇｅｌｏｎｉｎ）、ヨウシュヤマゴボウ抗ウイルスタンパク質、α−サルシン（ｓａｒｃｉｎ）およびコレラ毒素。「細胞傷害性プロドラッグ」とは、通常細胞内に存在する酵素によって、細胞傷害性化合物へと変換される非毒性の化合物を意味する。本発明の方法に従って使用され得る細胞傷害性プロドラッグとしては、安息香酸マスタードアルキル化剤のグルタミル誘導体、エトポシドまたはマイトマイシンＣのリン酸誘導体、シトシンアラビノシド、ダウノルビシン、およびドキソルビシンのフェノキシアセトアミド誘導体が挙げられるが、これらに限定されない。
【０６５５】
（薬物スクリーニング）
本発明のポリペプチドの活性を改変する分子についてスクリーニングするための、本発明のポリペプチド、またはこれらのポリペプチドをコードするポリヌクレオチドの使用が、さらに意図される。このような方法は、本発明のポリペプチドを、アンタゴニスト活性またはアゴニスト活性を有することが疑われる選択された化合物と接触させる工程、および結合に続いてこれらのポリペプチドの活性をアッセイする工程を包含する。
【０６５６】
本発明は、種々の薬物スクリーニング技術のいずれかにおいて、本発明のポリペプチド、またはそれらの結合フラグメントを使用することによって治療用化合物をスクリーニングするために特に有用である。このような試験に用いられるポリペプチドまたはフラグメントは、固体支持体に固定化され得、細胞表面上に発現され得、溶液中で遊離であり得、または細胞内に局在化され得る。薬物スクリーニングの１つの方法は、ポリペプチドまたはフラグメントを発現する組換え核酸を用いて安定に形質転換される真核生物宿主細胞または原核生物宿主細胞を利用する。薬物は、競合結合アッセイにおいて、このような形質転換細胞に対してスクリーニングされる。例えば、試験されている薬剤と本発明のポリペプチドとの間の複合体の形成（ｆｏｒｍｕｌａｔｏｎ）を測定し得る。
【０６５７】
従って、本発明は、本発明のポリペプチドによって媒介される活性に影響を及ぼす薬物または任意の他の薬剤についてのスクリーニング方法を提供する。これらの方法は、当該分野で周知の方法によって、このような薬剤を本発明のポリペプチドもしくはそのフラグメントと接触させる工程、およびこの薬剤とこのポリペプチドもしくはそのフラグメントとの間の複合体の存在についてアッセイする工程を包含する。このような競合結合アッセイにおいて、スクリーニングされる薬剤は、代表的に、標識化される。インキュベーション後に、遊離の薬剤は、結合形態で存在する薬剤から分離され、そして遊離または複合体化されていない標識の量は、特定の薬剤が本発明のポリペプチドに結合する能力の尺度である。
【０６５８】
薬物スクリーニングについての別の技術は、本発明のポリペプチドに対する適切な結合親和性を有する化合物に対するハイスループットスクリーニングを提供し、そして欧州特許出願８４／０３５６４（１９８４年９月１３日公開）（これは、本明細書中で参考として援用される）に非常に詳細に記載される。簡潔にいうと、大量の異なる小さなペプチド試験化合物は、固体基材（例えば、プラスチックピンまたは何らかの他の表面）上で合成される。ペプチド試験化合物を、本発明のポリペプチドと反応させ、そして洗浄する。次いで、結合したポリペプチドは、当該分野で周知の方法によって検出される。精製されたポリペプチドは、前述の薬物スクリーニング技術での使用のためにプレート上に直接コーティングされる。さらに、非中和抗体を使用して、このペプチドを捕捉し得、そして固体支持体上にそれを固定し得る。
【０６５９】
本発明はまた、競合薬物スクリーニングアッセイの使用を意図し、ここで、本発明のポリペプチドを結合し得る中和抗体は、ポリペプチドまたはそのフラグメントに対する結合について試験化合物と特異的に競合する。この様式において、抗体を使用して、本発明のポリペプチドと１つ以上の抗原性エピトープを共有する任意のペプチドの存在を検出する。
【０６６０】
（アンチセンスおよびリボザイム（アンタゴニスト））
特定の実施形態において、本発明に従うアンタゴニストは、配列番号Ｘに含まれる配列またはその相補鎖に対応する核酸、および／あるいは表１で同定するｃＤＮＡプラスミドＶに含まれるヌクレオチド配列に対応する核酸である。１つの実施形態において、アンチセンス配列は、生物体により内部で生成され、別の実施形態において、アンチセンス配列は別々に投与される（例えば、Ｏ’Ｃｏｎｎｏｒ，Ｊ．，Ｎｅｕｒｏｃｈｅｍ．５６：５６０（１９９１）を参照のこと）。Ｏｌｉｇｏｄｅｏｘｙｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅｓ　ａｓ　Ａｎｔｉｓｅｎｓｅ　Ｉｎｈｉｂｉｔｏｒｓ　ｏｆ　Ｇｅｎｅ　Ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ，ＣＲＣ　Ｐｒｅｓｓ，Ｂｏｃａ　Ｒａｔｏｎ，ＦＬ（１９８８）。アンチセンス技術を使用して、アンチセンスＤＮＡもしくはＲＮＡを通してか、または３重らせんの形成を通して遺伝子発現を制御し得る。アンチセンス技術は、例えば、Ｏｋａｎｏ，Ｊ．，Ｎｅｕｒｏｃｈｅｍ．５６：５６０（１９９１）；Ｏｌｉｇｏｄｅｏｘｙｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅｓ　ａｓ　Ａｎｔｉｓｅｎｓｅ　Ｉｎｈｉｂｉｔｏｒｓ　ｏｆ　Ｇｅｎｅ　Ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ，ＣＲＣ　Ｐｒｅｓｓ，Ｂｏｃａ　Ｒａｔｏｎ，ＦＬ（１９８８）に考察される。３重らせん形成は、例えば、Ｌｅｅら、Ｎｕｃｌｅｉｃ　Ａｃｉｄｓ　Ｒｅｓｅａｒｃｈ　６：３０７３（１９７９）；Ｃｏｏｎｅｙら、Ｓｃｉｅｎｃｅ、２４１：４５６（１９８８）；およびＤｅｒｖａｎら、Ｓｃｉｅｎｃｅ、２５１：１３００（１９９１）において考察される。これらの方法は、相補的なＤＮＡまたはＲＮＡへのポリヌクレオチドの結合に基づく。
【０６６１】
例えば、非リンパ性白血病細胞株ＨＬ−６０および他の細胞株の増殖を阻害するためのｃ−ｍｙｃおよびｃ−ｍｙｂアンチセンスＲＮＡ構築物の使用は、以前に記載された（Ｗｉｃｋｓｔｒｏｍら（１９８８）；Ａｎｆｏｓｓｉら（１９８９））。これらの実験は、細胞をオリゴリボヌクレオチドとインキュベーションすることによってインビトロで行われた。インビボ用途のための類似の手順は、ＷＯ９１／１５５８０に記載される。簡単には、所定のアンチセンスＲＮＡについてのオリゴヌクレオチドの対は、以下のように生成される：オープンリーディングフレームの最初の１５塩基に相補的な配列を、５末端のＥｃｏＲＩ部位および３末端のＨｉｎｄＩＩＩ部位に隣接させる。次に、オリゴヌクレオチドの対は、９０℃で１分間加熱され、次いで２×連結緩衝液（２０ｍＭ　ＴＲＩＳ　ＨＣｌ　ｐＨ７．５、１０ｍＭ　ＭｇＣｌ２、１０ｍＭ　ジチオスレイトール（ＤＴＴ）および０．２ｍＭ　ＡＴＰ）中でアニーリングされ、次いで、レトロウイルスベクターＰＭＶ７のＥｃｏＲ１／ＨｉｎｄＩＩＩ部位に連結される（ＷＯ９１／１５５８０）。
【０６６２】
例えば、本発明のポリペプチドをコードするポリヌクレオチドの５’コード部分を使用して、約１０〜４０塩基対長のアンチセンスＲＮＡオリゴヌクレオチドを設計し得る。ＤＮＡオリゴヌクレオチドは、転写に関与する遺伝子の領域に相補的であるように設計され、それにより転写およびレセプターの産生を阻害する。アンチセンスＲＮＡオリゴヌクレオチドは、インビボでｍＲＮＡにハイブリダイズし、そしてｍＲＮＡ分子のレセプターポリペプチドへの翻訳をブロックする。
【０６６３】
１つの実施形態において、本発明のアンチセンス核酸は、外来の配列からの転写により細胞内で産生される。例えば、ベクターまたはその一部が転写され、本発明のアンチセンス核酸（ＲＮＡ）を産生する。このようなベクターは、アンチセンス核酸をコードする配列を含む。このようなベクターは、それが転写されて所望のアンチセンスＲＮＡを産生し得る限り、エピソームを保持し得るか、または染色体に組込まれ得る。このようなベクターは、当該分野において標準的な組換えＤＮＡ技術方法により構築され得る。ベクターは、脊椎動物細胞において複製および発現のために使用される、当該分野で公知のプラスミド、ウイルスなどであり得る。本発明のポリペプチドをコードする配列またはそのフラグメントの発現は、脊椎動物、好ましくはヒト細胞において作用することが当該分野で公知の任意のプロモーターにより得る。そのようなプロモーターは、誘導性または構成性であり得る。このようなプロモーターとしては、ＳＶ４０初期プロモーター領域（ＢｅｒｎｏｉｓｔおよびＣｈａｍｂｏｎ、Ｎａｔｕｒｅ、２９：３０４−３１０（１９８１））、ラウス肉腫ウイルスの３’長末端反復に含まれるプロモーター（Ｙａｍａｍｏｔｏら、Ｃｅｌｌ、２２：７８７−７９７（１９８０））、ヘルペスチミジンプロモーター（Ｗａｇｎｅｒら、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．Ｕ．Ｓ．Ａ．７８：１４４１−１４４５（１９８１））、メタロチオネイン遺伝子の調節配列（Ｂｒｉｎｓｔｅｒら、Ｎａｔｕｒｅ、２９６：３９−４２（１９８２））などが挙げられるが、これらに限定されない。
【０６６４】
本発明のアンチセンス核酸は、本発明の遺伝子のＲＮＡ転写物の少なくとも一部に相補的な配列を含む。しかし、完全に相補的であることは好ましいが、必要ではない。本明細書中で言及される「ＲＮＡの少なくとも一部に相補的な」配列は、ＲＮＡとハイブリダイズし得るに十分な相補性を有し、安定な二重鎖を形成する配列を意味し；従って、二本鎖アンチセンス核酸の場合において、二重鎖ＤＮＡの一本鎖が試験され得るか、または三重鎖形成がアッセイされ得る。ハイブリダイズする能力は、相補性の程度およびアンチセンス核酸の長さの両方に依存する。一般的に、ハイブリダイズする核酸が長いほど、ＲＮＡとのより多くの塩基ミスマッチを含み得、これは、安定な二重鎖（または三重鎖の場合もあり得る）をなお形成し得る。当業者は、ハイブリダイズ複合体の融点を決定するために標準的な手順を使用することによりミスマッチの許容の程度を確認し得る。
【０６６５】
メッセージの５’末端に相補的であるオリゴヌクレオチド（例えば、ＡＵＧ開始コドンまででかつＡＵＧ開始コドンを含む５’非翻訳配列）は、翻訳の阻害の際に最も効率的に働くべきである。しかし、ｍＲＮＡの３’非翻訳配列に相補的な配列は、同様にｍＲＮＡの翻訳を阻害する際に有効であることが示された。一般的に、Ｗａｇｎｅｒ，Ｒ．、１９９４，Ｎａｔｕｒｅ　３７２：３３３−３３５を参照のこと。従って、本明細書中に記載されるポリヌクレオチド配列の５’−または３’−の非翻訳非コード領域のいずれかに相補的なオリゴヌクレオチドは、内因性ｍＲＮＡの翻訳を阻害するアンチセンスアプローチに使用され得る。ｍＲＮＡの５’非翻訳領域に相補的なオリゴヌクレオチドは、ＡＵＧ開始コドンの相補物を含むべきである。ｍＲＮＡコード領域に相補的なアンチセンスオリゴヌクレオチドは、翻訳のあまり効率的でないインヒビターであるが、本発明に従って使用され得る。本発明のｍＲＮＡの５’領域、３’領域またはコード領域にハイブリダイズするように設計される場合、アンチセンス核酸は、少なくとも６ヌクレオチド長であるべきであり、そして好ましくは６〜約５０ヌクレオチド長にわたるオリゴヌクレオチドである。特定の局面において、このオリゴヌクレオチドは、少なくとも１０ヌクレオチド、少なくとも１７ヌクレオチド、少なくとも２５ヌクレオチドまたは少なくとも５０ヌクレオチドである。
【０６６６】
本発明のポリヌクレオチドは、ＤＮＡ、もしくはＲＮＡ、またはキメラ混合物、あるいはそれらの誘導体もしくは改変バージョン、一本鎖、または二本鎖であり得る。このオリゴヌクレオチドは、例えば、塩基部分、糖部分、またはリン酸骨格で改変されて、分子の安定性、ハイブリダーゼーションなどを改善し得る。このオリゴヌクレオチドは、ペプチドのような他の付加基（例えば、インビボにおいて宿主細胞レセプターを標的化するために）、または細胞膜を通した輸送を促進する因子（例えば、Ｌｅｔｓｉｎｇｅｒら、１９８９，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．Ｕ．Ｓ．Ａ．８６：６５５３−６５５６；Ｌｅｍａｉｔｒｅら、１９８７，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．８４：６４８−６５２；ＰＣＴ公開番号ＷＯ８８／０９８１０（１９８８年１２月１５日公開）を参照のこと）、または血液脳関門（例えば、ＰＣＴ公開番号ＷＯ８９／１０１３４（１９８８年４月２５日公開）を参照のこと）、ハイブリダイゼーション誘引切断剤（ｈｙｂｒｉｄｉｚａｔｉｏｎ−ｔｒｉｇｇｅｒｅｄ　ｃｌｅａｖａｇｅ　ａｇｅｎｔ）（例えば、Ｋｒｏｌら、１９８８，ＢｉｏＴｅｃｈｎｉｑｕｅｓ、６：９５８−９７６を参照のこと）、またはインターカレート剤（例えば、Ｚｏｎ，１９８８，Ｐｈａｒｍ．Ｒｅｓ．５：５３９−５４９を参照のこと）を含み得る。この目的のために、オリゴヌクレオチドは、別の分子（例えば、ペプチド、ハイブリダーゼーション誘引架橋剤、輸送剤、ハイブリダイゼーション誘引切断剤など）に結合体化され得る。
【０６６７】
アンチセンスオリゴヌクレオチドは、少なくとも１つの改変された塩基部分を含み得、この塩基部分は、以下を含むがそれらに限定されない群から選択される：５−フルオロウラシル、５−ブロモウラシル、５−クロロウラシル、５−ヨードウラシル、ヒポキサンチン、キサンチン、４−アセチルシトシン、５−（カルボキシヒドロキシルメチル）ウラシル、５−カルボキシメチルアミノメチル−２−チオウリジン、５−カルボキシメチルアミノメチルウラシル、ジヒドロウラシル、β−Ｄ−ガラクトシルキューオシン、イノシン、Ｎ６−イソペンテニルアデニン、１−メチルグアニン、１−メチルイノシン、２，２−ジメチルグアニン、２−メチルアデニン、２−メチルグアニン、３−メチルシトシン、５−メチルシトシン、Ｎ６−アデニン、７−メチルグアニン、５−メチルアミノメチルウラシル、５−メトキシアミノメチル−２−チオウラシル、β−Ｄ−マンノシルキューオシン、５’−メトキシカルボキシメチルウラシル、５−メトキシウラシル、２−メチルチオ−Ｎ６−イソペンテニルアデニン、ウラシル−５−オキシ酢酸（ｖ）、ワイブトキソシン（ｗｙｂｕｔｏｘｏｓｉｎｅ）、プソイドウラシル、キューオシン、２−チオシトシン、５−メチル−２−チオウラシル、２−チオウラシル、４−チオウラシル、５−メチルウラシル、ウラシル−５−オキシ酢酸メチルエステル、ウラシル−５−オキシ酢酸（ｖ）、５−メチル−２−チオウラシル、３−（３−アミノ−３−Ｎ−２−カルボキシプロピル）ウラシル、（ａｃｐ３）ｗ、および２，６−ジアミノプリン。
【０６６８】
アンチセンスオリゴヌクレオチドはまた、以下を含むがそれらに限定されない群から選択される少なくとも１つの改変された糖部分を含み得る：アラビノース、２−フルオロアラビノース、キシルロース、およびヘキソース。
【０６６９】
さらなる別の実施形態において、アンチセンスオリゴヌクレオチドは、以下を含むがそれらに限定されない群から選択される少なくとも１つの改変されたリン酸骨格を含む：ホスホロチオエート、ホスホロジチオエート、ホスホロアミドチオエート、ホスホロアミデート（ｐｈｏｓｐｈｏｒａｍｉｄａｔｅ）、ホスホロジアミデート、メチルホスホネート、アルキルホスホトリエステル、およびホルムアセタール（ｆｏｒｍａｃｅｔａｌ）またはそれらのアナログ。
【０６７０】
さらに別の実施形態において、アンチセンスオリゴヌクレオチドは、ａ−アノマーオリゴヌクレオチドである。ａ−アノマーオリゴヌクレオチドは、相補的なＲＮＡと特異的な二本鎖ハイブリッドを形成し、通常のｂ−ユニットとは反対に、その鎖は互いに平行する（Ｇａｕｔｉｅｒら、１９８７，Ｎｕｃｌ．Ａｃｉｄｓ　Ｒｅｓ．、１５：６６２５−６６４１）。このオリゴヌクレオチドは、２’−０−メチルリボヌクレオチドであるか（Ｉｎｏｕｅら、１９８７，Ｎｕｃｌ．Ａｃｉｄｓ　Ｒｅｓ．、１５：６１３１−６１４８）、またはキメラＲＮＡ−ＤＮＡアナログである（Ｉｎｏｕｅら、１９８７，ＦＥＢＳ　Ｌｅｔｔ．２１５：３２７−３３０）。
【０６７１】
本発明のポリヌクレオチドは当該分野で公知の標準的な方法（例えば、自動ＤＮＡ合成機（このような装置はＢｉｏｓｅａｒｃｈ，Ａｐｐｌｉｅｄ　Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓなどから市販されている）の使用により）により合成され得る。例えば、ホスホロチオエートオリゴヌクレオチドは、Ｓｔｅｉｎらの方法（１９８８，Ｎｕｃｌ．Ａｃｉｄｓ　Ｒｅｓ．、１６：３２０９）により合成され得、メチルホスホネートオリゴヌクレオチドは、コントロールドポアガラス（ｃｏｎｔｒｏｌｌｅｄ　ｐｏｒｅ　ｇｌａｓｓ）ポリマー支持体（Ｓａｒｉｎら、１９８８，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．Ｕ．Ｓ．Ａ．、８５：７４４８−７４５１）などの使用により調製され得る。
【０６７２】
コード領域配列に相補的なアンチセンスヌクレオチドが使用され得るが、転写された非翻訳領域に相補的なアンチセンスヌクレオチドが最も好ましい。
【０６７３】
本発明による潜在的なアンタゴニストはまた、触媒ＲＮＡ、すなわちリボザイムを含む（例えば、ＰＣＴ国際公開ＷＯ９０／１１３６４、１９９０年１０月４日公開；Ｓａｒｖｅｒら、Ｓｃｉｅｎｃｅ、２４７：１２２２−１２２５（１９９０）を参照のこと）。部位特異的認識配列でｍＲＮＡを切断するリボザイムを使用して、ｍＲＮＡを破壊し得るが、ハンマーヘッド型リボザイムの使用が好ましい。ハンマーヘッド型リボザイムは、標的ｍＲＮＡと相補的な塩基対を形成する隣接領域により決定される位置で、ｍＲＮＡを切断する。たった１つの必要条件は、標的ｍＲＮＡが以下の２塩基の配列を有することである：５’−ＵＧ−３’。ハンマーヘッド型リボザイムの構築および生成は当該分野で周知であり、そしてＨａｓｅｌｏｆｆおよびＧｅｒｌａｃｈ、Ｎａｔｕｒｅ、３３４：５８５−５９１（１９８８）により十分に記載される。配列番号Ｘのヌクレオチド配列内に多くの潜在的なハンマーヘッド型リボザイム切断部位が存在する。好ましくは、このリボザイムは、切断認識部位がｍＲＮＡの５’末端付近に位置するように；すなわち、効率を増大し、そして非機能的ｍＲＮＡ転写物の細胞内蓄積を最小化するように、操作される。
【０６７４】
アンチセンスアプローチの場合、本発明のリボザイムは、改変されたオリゴヌクレオチド（例えば、安定性、標的化などを改良するために）から構成され得、そしてインビボにおいて本発明のポリペプチドを発現する細胞に送達されるべきである。リボザイムをコードするＤＮＡ構築物は、ＤＮＡをコードするアンチセンスの導入に関して上に記載される様式と同じ様式で細胞中に導入され得る。送達の好ましい方法は、強力な構成性プロモーター（例えば、ｐｏｌ　ＩＩＩまたはｐｏｌ　ＩＩプロモーター）の制御下で、リボザイムを「コードする」ＤＮＡ構築物を使用することを含み、その結果トランスフェクトした細胞が、内因性メッセージを破壊し、そして翻訳を阻害するに十分な量のリボザイムを生成する。リボザイムはアンチセンス分子と異なり触媒性であるので、より低い細胞内濃度が効率のために必要とされる。
【０６７５】
アンタゴニスト／アゴニスト化合物を利用して、腫瘍性の細胞および組織に対する本発明のポリペプチドの細胞増殖（ｇｒｏｗｔｈ）および増殖（ｐｒｏｌｉｆｅｒａｔｉｏｎ）効果を阻害し得る。すなわち、腫瘍の新脈管形成を刺激し、それにより異常な細胞増殖および増殖を（例えば、腫瘍形成または増殖において）遅延または防止する。
【０６７６】
アンタゴニスト／アゴニストをまた利用して、血管過多の疾患を予防し得、そして水晶体嚢外白内障（ｅｘｔｒａｃａｐｓｕｌａｒ　ｃａｔａｒａｃｔ）手術後の上皮レンズ細胞の増殖を防止し得る。本発明のポリペプチドのマイトジェン活性の防止はまた、例えば、バルーン血管形成術後の再狭窄のような場合に要求され得る。
【０６７７】
アンタゴニスト／アゴニストをまた利用して、創傷治癒の間の瘢痕組織の増殖を防止し得る。
【０６７８】
アンタゴニスト／アゴニストをまた利用して、本明細書中に記載される疾患を処置し得る。
【０６７９】
従って、本発明は、本発明のポリヌクレオチドの過剰発現に関連する障害または疾患（本願の全体に渡って列挙される障害または疾患が含まれるが、これらに限定されない）を処置する方法であって、（ａ）本発明のポリヌクレオチドに指向されるアンチセンス分子、および／または（ｂ）本発明のポリヌクレオチドに指向されるリボザイムを、患者に投与することによって処置する方法を提供する。
（結合ペプチドおよび他の分子）
本発明はまた、ＥＣＭポリペプチドに結合するポリペプチドおよび非ポリペプチドを同定するためのスクリーニング方法、およびそれによって同定されたＥＣＭ結合分子を含む。これらの結合分子は、例えば、ＥＣＭポリペプチドのアゴニストおよびアンタゴニストとして有用である。そのようなアゴニストおよびアンタゴニストは、本発明に従って、以下に詳細に記載される治療実施形態において使用され得る。
【０６８０】
この方法は、以下の工程を包含する：
ａ．ＥＣＭポリペプチドを複数の分子と接触させる工程；および
ｂ．このＥＣＭポリペプチドに結合する分子を同定する工程。
【０６８１】
ＥＣＭポリペプチドを複数の分子と接触させる工程は、多数の方法によってもたらされ得る。例えば、ＥＣＭポリペプチドを固体支持体上に固定化させ、そして複数の分子の溶液を固定化ＥＣＭポリペプチドと接触させることを考え得る。このような手順は、固定化ＥＣＭポリペプチドから構成される親和性マトリックスを用いるアフィニティークロマトグラフィープロセスに類似している。次いで、ＥＣＭポリペプチドに対して選択的な親和性を有する分子が、親和性選択によって精製され得る。固体支持体の性質、ＥＣＭポリペプチドのこの固体支持体への付着に関するプロセス、溶媒、および親和性単離または親和性選択の条件は、大部分が慣用的であり、そして当業者に周知である。
【０６８２】
あるいは、複数のポリペプチドはまた、ポリペプチドのサブセットまたは個々のポリペプチドを含む実質的に別々の分画へ分離され得る。例えば、複数のポリペプチドは、ゲル電気泳動、カラムクロマトグラフィーなどポリペプチドの分離に関して当業者に公知の方法によって、分離され得る。個々のポリペプチドはまた、宿主細胞の外部表面上またはほぼ外部表面に発現されるような様式で、形質転換された宿主細胞（例えば、組換えファージ）によって産生され得る。次いで、個々の単離物は、必要に応じて発現に必要とされるであろうインデューサーの存在下で、ＥＣＭポリペプチドによって「プローブ（化）」され得、ＥＣＭポリペプチドと個々のクローンとの間で任意の選択的親和性相互作用が起こったか否かが決定される。ＥＣＭポリペプチドを個々のポリペプチドを含む各分画と接触させる前に、これらのポリペプチドはまず、さらなる簡便性のために固体支持体に移され得る。そのような固体支持体は、単に、例えばニトロセルロースまたはナイロンでできたもののようなフィルター膜の断片であり得る。この様式において、陽性クローンは、発現ライブラリーの形質転換宿主細胞の集団（これらは、ＥＣＭポリペプチドに対して選択的親和性を有するポリペプチドをコードするＤＮＡ構築物を持つ）から同定され得る。さらに、ＥＣＭポリペプチドに対して選択的親和性を有するポリペプチドのアミノ酸配列が、従来の手段によって直接決定され得るか、またはこのポリペプチドをコードするＤＮＡのコード配列が、頻繁により簡便に決定され得る。次いで、一次配列が、対応するＤＮＡ配列から推定され得る。アミノ酸配列がポリペプチド自体から決定されるものである場合、微小配列決定技術を使用し得る。この配列決定技術は、質量分析法を含み得る。
【０６８３】
特定の状況において、選択的親和性相互作用の存在を決定または検出しようと試みる前に、任意の未結合ＥＣＭポリペプチドあるいは未結合ポリペプチドを、ＥＣＭポリペプチドおよび多数のポリペプチドの混合物から洗浄除去することが望ましくあり得る。このような洗浄工程は、ＥＣＭポリペプチドまたは多数のポリペプチドが固体支持体に結合している場合に、特に望ましくあり得る。
【０６８４】
本方法に従って提供される多数の分子は、多様性ライブラリー（例えば、ＥＣＭポリペプチドを特異的に結合する分子をスクリーニングし得る無作為またはコンビナトリアルの、ペプチドライブラリーまたは非ペプチドライブラリー）として提供され得る。使用され得る多くのライブラリー（例えば、化学合成ライブラリー、組換えライブラリー（例えば、ファージディスプレイライブラリー）、およびインビトロ翻訳ベースのライブラリー）が、当該分野で公知である。化学合成ライブラリーの例は、以下に記載される：Ｆｏｄｏｒら、１９９１、Ｓｃｉｅｎｃｅ　２５１：７６７−７７３；Ｈｏｕｇｈｔｅｎら、１９９１、Ｎａｔｕｒｅ　３５４：８４−８６；Ｌａｍら、１９９１、Ｎａｔｕｒｅ　３５４：８２−８４；Ｍｅｄｙｎｓｋｉ、１９９４、Ｂｉｏ／Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ　１２：７０９−７１０；Ｇａｌｌｏｐら、１９９４、Ｊ．Ｍｅｄｉｃｉｎａｌ　Ｃｈｅｍｉｓｔｒｙ　３７（９）：１２３３−１２５１；Ｏｈｌｍｅｙｅｒら、１９９３、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ　９０：１０９２２−１０９２６；Ｅｒｂら、１９９４，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ　９１：１１４２２−１１４２６；Ｈｏｕｇｈｔｅｎら、１９９２，Ｂｉｏｔｅｃｈｎｉｑｕｅｓ　１３：４１２；Ｊａｙａｗｉｃｋｒｅｍｅら、１９９４、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ　９１：１６１４−１６１８；Ｓａｌｍｏｎら、１９９３，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ　９０：１１７０８−１１７１２；ＰＣＴ公開ＷＯ９３／２０２４２；ならびにＢｒｅｎｎｅｒおよびＬｅｒｎｅｒ、１９９２、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ　８９：５３８１−５３８３。
【０６８５】
ファージディスプレイライブラリーの例は、以下に記載される：ＳｃｏｔｔおよびＳｍｉｔｈ、１９９０、Ｓｃｉｅｎｃｅ　２４９：３８６−３９０；Ｄｅｖｌｉｎら、１９９０、Ｓｃｉｅｎｃｅ、２４９：４０４−４０６；Ｃｈｒｉｓｔｉａｎ，Ｒ．Ｂ．ら、１９９２、Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．２２７：７１１−７１８）；Ｌｅｎｓｔｒａ、１９９２、Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．Ｍｅｔｈ．１５２：１４９−１５７；Ｋａｙら、１９９３、Ｇｅｎｅ　１２８：５９−６５；ならびにＰＣＴ公開番号ＷＯ９４／１８３１８（１９９４年８月１８日）。
【０６８６】
インビトロ翻訳ベースのライブラリーとしては、以下：ＰＣＴ公開番号ＷＯ９１／０５０５８（１９９１年４月１８日）；およびＭａｔｔｈｅａｋｉｓら、１９９４，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ　９１：９０２２−９０２６に記載されるものが挙げられるが、これらに限定されない。
【０６８７】
非ペプチドライブラリーの例として、ベンゾジアゼピンライブラリー（例えば、Ｂｕｎｉｎら、１９９４，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ　９１：４７０８−４７１２を参照のこと）が、使用のために適応され得る。ペプトイドライブラリー（Ｓｉｍｏｎら、１９９２，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ　８９：９３６７−９３７１）がまた使用され得る。使用され得るライブラリーの別の例は、Ｏｓｔｒｅｓｈら（１９９４，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ　９１：１１１３８−１１１４２）によって記載され、ここでは、ペプチド中のアミド官能基が、過剰にメチル化（ｐｅｒｍｅｔｈｙｌａｔｅ）されて、化学的に形質転換されたコンビナトリアルライブラリーを生成する。
【０６８８】
本発明において有用である種々の非ペプチドライブラリーは、大きい。例えば、ＥｃｋｅｒおよびＣｒｏｏｋｅ（１９９５，Ｂｉｏ／Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ　１３：３５１−３６０）は、種々のライブラリーの基礎を形成する化学種の間として、ベンゾジアゼピン、ヒダントイン、ピペラジンジオン、ビフェニル、糖アナログ、β−メルカプトケトン、アリール酢酸、アシルピペリジン、ベンゾピラン、キュバン、キサンチン、アミンイミドおよびオキサゾロンを列挙している。
【０６８９】
非ペプチドライブラリーは、２つの型に大きく分類され得る：修飾されたモノマーおよびオリゴマー。修飾モノマーライブラリーは、比較的単純な骨格構造を使用し、この上に種々の官能基が付加される。しばしば、骨格は、既知の有用な薬理学的活性を有する分子である。例えば、骨格は、ベンゾジアゼピン構造であり得る。
【０６９０】
非ペプチドオリゴマーライブラリーは、モノマーの順序に依存して新規な形状を作製する様式で共にアセンブルされる、多数のモノマーを使用する。使用されるモノマー単位の間には、カルバメート、ピロリノン（ｐｙｒｒｏｌｉｎｏｎｅ）およびモルホリノがある。ペプトイド（側鎖がα炭素よりもαアミノ基に結合するペプチド様オリゴマー）は、非ペプチドオリゴマーライブラリーの別のバージョンの基礎を形成する。最初の非ペプチドオリゴマーライブラリーは、単一型のモノマーを使用し、従って、反復骨格を含む。近年のライブラリーは、１つより多くのモノマーを使用し、自由度が添加されたライブラリーを与える。
【０６９１】
ライブラリーをスクリーニングすることは、種々の一般的に公知の方法のいずれかによって達成され得る。例えば、ペプチドライブラリーのスクリーニングを開示する以下の参考文献：ＰａｒｍｌｅｙおよびＳｍｉｔｈ、１９８９、Ａｄｖ．Ｅｘｐ．Ｍｅｄ．Ｂｉｏｌ．２５１：２１５−２１８；ＳｃｏｔｔおよびＳｍｉｔｈ、１９９０、Ｓｃｉｅｎｃｅ　２４９：３８６−３９０；Ｆｏｗｌｋｅｓら、１９９２；ＢｉｏＴｅｃｈｎｉｑｕｅｓ　１３：４２２−４２７；Ｏｌｄｅｎｂｕｒｇら、１９９２、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ　８９：５３９３−５３９７；Ｙｕら、１９９４、Ｃｅｌｌ　７６：９３３−９４５；Ｓｔａｕｄｔら、１９８８、Ｓｃｉｅｎｃｅ　２４１：５７７−５８０；Ｂｏｃｋら、１９９２、Ｎａｔｕｒｅ　３５５：５６４−５６６；Ｔｕｅｒｋら、１９９２、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ　８９：６９８８−６９９２；Ｅｌｌｉｎｇｔｏｎら、１９９２、Ｎａｔｕｒｅ　３５５：８５０−８５２；米国特許第５，０９６，８１５号、米国特許第５，２２３，４０９号、および米国特許第５，１９８，３４６号（全てＬａｄｎｅｒらに対して）；ＲｅｂａｒおよびＰａｂｏ、１９９３、Ｓｃｉｅｎｃｅ　２６３：６７１−６７３；ならびにＰＣＴ公開番号ＷＯ９４／１８３１８を参照のこと。
【０６９２】
特定の実施形態において、ＥＣＭポリペプチドを結合する分子を同定するためのスクリーニングは、ライブラリーのメンバーを固相に固定化されたＥＣＭポリペプチドと接触させ、そしてＥＣＭポリペプチドに結合するライブラリーのメンバーを収集することによって実行され得る。そのようなスクリーニング方法の例の、「パニング」と呼ばれる技術は、例として、ＰａｒｍｌｅｙおよびＳｍｉｔｈ，１９８８，Ｇｅｎｅ　７３：３０５−３１８；Ｆｏｗｌｋｅｓら、１９９２，ＢｉｏＴｅｃｈｎｉｑｕｅｓ　１３：４２２−４２７；ＰＣＴ公開番号ＷＯ９４／１８３１８；ならびにその中に引用される参考文献に記載される。
【０６９３】
別の実施形態において、酵母中の相互作用タンパク質を選択するためのツーハイブリッドシステム（ＦｉｅｌｄｓおよびＳｏｎｇ，１９８９，Ｎａｔｕｒｅ　３４０：２４５−２４６；Ｃｈｉｅｎら、１９９１，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ　８８：９５７８−９５８２）が、ＥＣＭポリペプチドに特異的に結合する分子を同定するために使用され得る。
【０６９４】
ＥＣＭ結合分子がポリペプチドである場合、このポリペプチドは、任意のペプチドライブラリー（ランダムペプチドライブラリー、コンビナトリアルペプチドライブラリー、またはバイアスペプチドライブラリーを含む）から簡便に選択され得る。用語「バイアス（ｂｉａｓｅｄ）」は、ライブラリーを作製する方法が、生じる分子収集（この場合には、ペプチド）の多様性を支配する１つ以上のパラメーターを制限するように操作されることを意味するために本明細書中に使用される。
【０６９５】
従って、本当にランダムなペプチドライブラリーは、ペプチドの所定の位置に特定のアミノ酸を見出す可能性が全て２０のアミノ酸に関して同じである、ペプチドの収集物を作製する。しかし、例えば、リジンが５番目のアミノ酸毎に生じることを特定するかまたはデカペプチドライブラリーの４位、８位および９位がアルギニンのみを含むように固定して特定することによって、バイアスがライブラリーに導入され得る。明らかに、バイアスの多くの型は、意図され得、そして本発明は、いかなる特定のバイアスにも制限されない。さらに、本発明は、特定の型のペプチドライブラリー（例えば、ファージディスプレイペプチドライブラリーおよびＤＮＡ挿入物と共にλファージベクターを含むＤＮＡ構築物を使用するライブラリー）を意図する。
【０６９６】
上記のように、ポリペプチドであるＥＣＭ結合分子の場合、このポリペプチドは、約６から約６０より少ないアミノ酸残基を有し、好ましくは約６〜約１０アミノ酸残基、そして最も好ましくは約６〜約２２アミノ酸であり得る。別の実施形態において、ＥＣＭ結合ポリペプチドは、１５〜１００の範囲のアミノ酸、または２０〜５０の範囲のアミノ酸を有する。
【０６９７】
選択されたＥＣＭ結合ポリペプチドは、化学合成または組換え発現によって得られ得る。
【０６９８】
（他の活性）
本発明のポリペプチド、ポリヌクレオチド、アゴニスト、またはアンタゴニストは、血管内皮細胞増殖を刺激する能力の結果として、種々の疾患状態（例えば、血栓症、動脈硬化、および他の心臓血管の状態）に起因する虚血組織の血管再生を刺激するための処置において利用され得る。本発明のポリペプチド、ポリヌクレオチド、アゴニスト、またはアンタゴニストをまた利用して、上記で議論されるように新脈管形成および肢の再形成を刺激し得る。
【０６９９】
本発明のポリペプチド、ポリヌクレオチド、アゴニスト、またはアンタゴニストを、傷害、火傷、手術後組織修復、および瘢痕に起因する創傷の処置にもまた利用し得る。なぜなら、それらは異なる起源の種々の細胞（例えば、線維芽細胞および骨格筋細胞）に対してマイトジェン性であり、それゆえダメージを受けた組織または疾患組織の修復または置換を促進するからである。
【０７００】
本発明のポリペプチド、ポリヌクレオチド、アゴニストまたはアンタゴニストはまた、ニューロンの成長を刺激し、そして特定のニューロンの障害または神経変性状態（例えば、アルツハイマー病、パーキンソン病、およびＡＩＤＳ関連複合体）において生じるニューロンの損傷を処置および予防するために用いられ得る。本発明のポリペプチド、ポリヌクレオチド、アゴニストまたはアンタゴニストは、軟骨細胞増殖を刺激する能力を有し得、それゆえ、骨および歯周の再形成を増強し、そして組織移植片または骨の移植片における補助のために利用され得る。
【０７０１】
本発明のポリペプチド、ポリヌクレオチド、アゴニストまたはアンタゴニストをまた利用して、ケラチノサイト増殖を刺激することにより、日焼けに起因する皮膚の老化を予防し得る。
【０７０２】
本発明のポリペプチド、ポリヌクレオチド、アゴニストまたはアンタゴニストをまた、抜け毛を予防するために利用し得る。なぜなら、ＦＧＦファミリーのメンバーは、髪形成細胞を活性化し、そしてメラノサイト増殖を促進するからである。同じ方針で、本発明のポリペプチド、ポリヌクレオチド、アゴニストまたはアンタゴニストを利用して、他のサイトカインと組み合わせて使用した場合、造血細胞および骨髄細胞の増殖および分化を刺激し得る。
【０７０３】
本発明のポリペプチド、ポリヌクレオチド、アゴニストまたはアンタゴニストをまた、移植前の器官を維持するためか、または初代組織の細胞培養を支持するために使用し得る。本発明のポリペプチド、ポリヌクレオチド、アゴニストまたはアンタゴニストはまた、初期胚において分化するように中胚葉起源の組織を誘導するために利用され得る。
【０７０４】
本発明のポリペプチド、ポリヌクレオチド、アゴニストもしくはアンタゴニストはまた、先に議論されるような造血系統に加えて、胚性幹細胞の分化もしくは増殖を増加または減少し得る。
【０７０５】
本発明のポリペプチド、ポリヌクレオチド、アゴニストもしくはアンタゴニストはまた、哺乳動物の特徴（例えば、身長、体重、毛の色、眼の色、皮膚、脂肪組織の割合、色素沈着、大きさ、および形（例えば、美容外科））を調節するために使用され得る。同様に、本発明のポリペプチド、ポリヌクレオチド、アゴニストもしくはアンタゴニストは、異化作用、同化作用、プロセシング、利用、およびエネルギーの貯蔵に影響を及ぼす哺乳動物の代謝を調節するために使用され得る。
【０７０６】
本発明のポリペプチド、ポリヌクレオチド、アゴニストまたはアンタゴニストは、肥満症、悪液質、消耗病、食欲不振および過食症を含むがこれらに限定されない重量障害を処置するために使用され得る。
【０７０７】
本発明のポリペプチド、ポリヌクレオチド、アゴニストまたはアンタゴニストは、バイオリズム、心臓（ｃａｒｉｃａｄｉｃ）リズム、うつ病（抑うつ性の障害を含む）、暴力の傾向、痛みへの耐性、生殖能力（好ましくは、アクチビンまたはインヒビン様活性によって）、ホルモンレベルもしくは内分泌レベル、食欲、性欲、記憶、ストレス、または他の認知の質に影響を及ぼすことによって、哺乳動物の精神状態または身体状態を変更するために使用され得る。
【０７０８】
本発明のポリペプチド、ポリヌクレオチド、アゴニストまたはアンタゴニストはまた、例えば、貯蔵能力、脂肪含有量、脂質、タンパク質、炭水化物、ビタミン、ミネラル、補因子、または他の栄養成分を増加または減少させるような食品添加物または保存剤として使用され得る。
【０７０９】
上記の適用は、広範な種類の宿主における用途を有する。このような宿主としては、ヒト、マウス、ウサギ、ヤギ、モルモット、ラクダ、ウマ、マウス、ラット、ハムスター、ブタ、ミニブタ（ｍｉｃｒｏ−ｐｉｇ）、ニワトリ、ヤギ、ウシ、ヒツジ、イヌ、ネコ、非ヒト霊長類、およびヒトが挙げられるが、これらに限定されない。特定の実施形態において、この宿主は、マウス、ウサギ、ヤギ、モルモット、ニワトリ、ラット、ハムスター、ブタ、ヒツジ、イヌまたはネコである。好ましい実施形態において、この宿主は哺乳動物である。最も好ましい実施形態において、この宿主はヒトである。
【０７１０】
（他の好ましい実施形態）
本願発明の他の好ましい実施形態は、配列番号Ｘのヌクレオチド配列またはその相補鎖および／もしくはｃＤＮＡプラスミドＶのヌクレオチド配列中の少なくとも約５０個連続したヌクレオチドの配列と少なくとも９５％同一であるヌクレオチド配列を含む、単離された核酸分子を含む。
【０７１１】
上記連続したヌクレオチドの配列が、表１中の配列番号Ｘについて同定された位置の範囲で、配列番号Ｘのヌクレオチド配列に含まれる、核酸分子もまた好ましい。
【０７１２】
配列番号Ｘのヌクレオチド配列またはその相補鎖および／もしくはｃＤＮＡプラスミドＶのヌクレオチド配列中の少なくとも約１５０個連続したヌクレオチドの配列と少なくとも９５％同一であるヌクレオチド配列を含む、単離された核酸分子もまた好ましい。
【０７１３】
配列番号Ｘのヌクレオチド配列またはその相補鎖および／もしくはｃＤＮＡプラスミドＶのヌクレオチド配列中の少なくとも約５００個連続したヌクレオチドの配列と少なくとも９５％同一であるヌクレオチド配列を含む、単離された核酸分子はさらに好ましい。
【０７１４】
さらに好ましい実施形態は、表１中の配列番号Ｘについて同定された位置の範囲で配列番号Ｘのヌクレオチド配列と少なくとも９５％同一であるヌクレオチド配列を含む核酸分子である。
【０７１５】
さらに好ましい実施形態は、配列番号Ｘの完全なヌクレオチド配列またはその相補鎖および／もしくはｃＤＮＡプラスミドＶのヌクレオチド配列と少なくとも９５％同一であるヌクレオチド配列を含む、単離された核酸分子である。
【０７１６】
ストリンジェントなハイブリダイゼーション条件下で配列番号Ｘのヌクレオチド配列またはその相補鎖および／もしくはｃＤＮＡプラスミドＶのヌクレオチド配列を含む核酸分子にハイブリダイズする単離された核酸分子もまた好ましく、ここで上記のハイブリダイズする核酸分子は、ストリンジェントなハイブリダイゼーション条件下で、Ａ残基のみまたはＴ残基のみからなるヌクレオチド配列を有する核酸分子にハイブリダイズしない。
【０７１７】
ｃＤＮＡプラスミドＶを含むＤＮＡ分子を含む物質の組成物もまた好ましい。
【０７１８】
ｃＤＮＡプラスミドＶのヌクレオチド配列中の少なくとも５０個連続したヌクレオチドの配列と少なくとも９５％同一であるヌクレオチド配列を含む単離された核酸分子もまた好ましい。
【０７１９】
上記の少なくとも５０個連続したヌクレオチド配列が、ｃＤＮＡプラスミドＶによってコードされるオープンリーディングフレームの配列のヌクレオチド配列中に含まれる、単離された核酸分子もまた好ましい。
【０７２０】
ｃＤＮＡプラスミドＶによってコードされるヌクレオチド配列中の少なくとも１５０個連続するヌクレオチドの配列に少なくとも９５％同一であるヌクレオチド配列を含む、単離された核酸分子もまた好ましい。
【０７２１】
さらに好ましい実施形態は、ｃＤＮＡプラスミドＶによってコードされるヌクレオチド配列中の少なくとも５００個連続するヌクレオチドの配列に少なくとも９５％同一であるヌクレオチド配列を含む、単離された核酸分子である。
【０７２２】
さらに好ましい実施形態は、ｃＤＮＡプラスミドＶによってコードされる完全なヌクレオチド配列に少なくとも９５％同一であるヌクレオチド配列を含む、単離された核酸分子である。
【０７２３】
さらに好ましい実施形態は、以下からなる群から選択される配列中の少なくとも５０個連続するヌクレオチドの配列に少なくとも９５％同一であるヌクレオチド配列を含む核酸分子を、生物学的サンプルにおいて検出するための方法である：配列番号Ｘのヌクレオチド配列またはそれに相補的な鎖、およびｃＤＮＡプラスミドＶによってコードされるヌクレオチド配列；この方法は、上記サンプル中の少なくとも１つの核酸分子のヌクレオチド配列を、上記の群から選択された配列と比較する工程および上記サンプル中の上記核酸分子の配列が、上記選択された配列に少なくとも９５％同一であるか否かを決定する工程を包含する。
【０７２４】
上記の配列を比較する工程が、上記サンプル中の核酸分子と、上記の群から選択される上記の配列を含む核酸分子との間の核酸ハイブリダイゼーションの程度を決定する工程を包含する、上記方法もまた好ましい。同様に、上記の配列を比較する工程が、上記サンプル中の核酸分子から決定されるヌクレオチド配列と、上記の群から選択される配列とを比較する工程によって実施される、上記方法もまた好ましい。核酸分子は、ＤＮＡ分子またはＲＮＡ分子を含み得る。
【０７２５】
さらに好ましい実施形態は、生物学的サンプルの種、組織、または細胞型を同定するための方法であって、この方法は、以下からなる群から選択される配列中の少なくとも５０個連続するヌクレオチドの配列に少なくとも９５％同一であるヌクレオチド配列を含む上記サンプル中の核酸分子を（もしあれば）検出する工程を包含する：配列番号Ｘのヌクレオチド配列またはその相補鎖およびｃＤＮＡプラスミドＶによってコードされるヌクレオチド配列。
【０７２６】
生物学的サンプルの種、組織、または細胞型を同定するための方法は、少なくとも２つのヌクレオチド配列のパネル中のヌクレオチド配列を含む核酸分子を検出する工程を包含し得、ここで上記パネル中の少なくとも１つの配列は、上記の群から選択される配列中の少なくとも５０個連続するヌクレオチドの配列に少なくとも９５％同一である。
【０７２７】
タンパク質をコードする配列番号Ｘまたはその相補鎖またはｃＤＮＡプラスミドＶのヌクレオチド配列の異常な構造または発現と関連する病理学的状態を、被験体において診断するための方法もまた好ましく、この方法は、以下からなる群から選択される配列中の少なくとも５０個連続するヌクレオチドの配列に少なくとも９５％同一であるヌクレオチド配列を含む、核酸分子（もしあれば）を、上記被験体から得られる生物学的サンプルにおいて検出する工程を包含する：配列番号Ｘのヌクレオチド配列またはその相補鎖およびｃＤＮＡのプラスミドＶのヌクレオチド配列。
【０７２８】
病理学的状態を診断するための方法は、少なくとも２つのヌクレオチド配列のパネル中のヌクレオチド配列を含む核酸分子を検出する工程を包含し得、ここで、上記パネル中の少なくとも１つの配列は、上記群から選択される配列中の少なくとも５０個連続するヌクレオチドの配列に少なくとも９５％同一である。
【０７２９】
上記の核酸分子のヌクレオチド配列が、少なくとも２つのヌクレオチド配列のパネルを含む、単離された核酸分子を含む組成物もまた好ましく、ここで上記のパネル中の少なくとも１つの配列は、以下からなる群から選択される配列中の少なくとも５０個連続したヌクレオチドの配列と少なくとも９５％同一である：配列番号Ｘのヌクレオチド配列またはその相補鎖およびｃＤＮＡプラスミドＶによりコードされるヌクレオチド配列。この核酸分子は、ＤＮＡ分子またはＲＮＡ分子を含み得る。
【０７３０】
配列番号Ｙのポリペプチド配列；配列番号Ｘもしくはその相補鎖によりコードされるポリペプチドのポリペプチド配列および／またはｃＤＮＡプラスミドＶによりコードされるポリペプチドのポリペプチド配列中の少なくとも約１０個連続したアミノ酸の配列と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含む、単離されたポリペプチドもまた好ましい。
【０７３１】
配列番号Ｙのアミノ酸配列；配列番号Ｘもしくはその相補鎖によりコードされるポリペプチドのアミノ酸配列および／またはｃＤＮＡプラスミドＶによりコードされるポリペプチドのアミノ酸配列中の少なくとも約３０個連続したアミノ酸の配列と少なくとも９５％同一のアミノ酸配列を含む、単離されたポリペプチドもまた好ましい。
【０７３２】
配列番号Ｙのアミノ酸配列；配列番号Ｘもしくはその相補鎖によりコードされるポリペプチドのアミノ酸配列および／またはｃＤＮＡプラスミドＶによりコードされるポリペプチドのアミノ酸配列中の少なくとも約１００個連続したアミノ酸の配列と少なくとも９５％同一のアミノ酸配列を含む、単離されたポリペプチドはさらに好ましい。
【０７３３】
配列番号Ｙの完全アミノ酸配列；配列番号Ｘもしくはその相補鎖によりコードされるポリペプチドの完全アミノ酸配列および／またはｃＤＮＡプラスミドＶによりコードされるポリペプチドの完全アミノ酸配列と少なくとも９５％同一のアミノ酸配列を含む、単離されたポリペプチドはさらに好ましい。
【０７３４】
ｃＤＮＡプラスミドＶによりコードされるポリペプチドの完全アミノ酸配列中の少なくとも約１０個連続したアミノ酸の配列と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含む、単離されたポリペプチドはさらに好ましい。
【０７３５】
上記の連続したアミノ酸の配列が、ｃＤＮＡプラスミドＶによってコードされるポリペプチドの一部のアミノ酸配列；配列番号Ｘもしくはその相補鎖によりコードされるポリペプチドの一部のアミノ酸配列および／または配列番号Ｙのポリペプチド配列の一部のアミノ酸配列に含まれる、ポリペプチドもまた好ましい。
【０７３６】
ｃＤＮＡプラスミドＶによってコードされるポリペプチドのアミノ酸配列中の少なくとも約３０個連続したアミノ酸の配列と少なくとも９５％同一であるアミノ酸配列を含む、単離されたポリペプチドもまた、好ましい。
【０７３７】
ｃＤＮＡプラスミドＶによってコードされるポリペプチドのアミノ酸配列中の少なくとも約１００個連続したアミノ酸の配列と少なくとも９５％同一であるアミノ酸配列を含む、単離されたポリペプチドもまた、好ましい。
【０７３８】
ｃＤＮＡプラスミドＶによってコードされるポリペプチドのアミノ酸配列と少なくとも９５％同一であるアミノ酸配列を含む、単離されたポリペプチドもまた、好ましい。
【０７３９】
以下からなる群から選択される配列中の少なくとも１０個連続したアミノ酸の配列と少なくとも９０％同一であるアミノ酸配列を含むポリペプチドに対して特異的に結合する単離された抗体は、さらに好ましい：配列番号Ｙのポリペプチド配列；配列番号Ｘもしくはその相補鎖によりコードされるポリペプチドのポリペプチド配列およびｃＤＮＡプラスミドＶによりコードされるポリペプチドのポリペプチド配列。
【０７４０】
以下：配列番号Ｙのポリペプチド配列；配列番号Ｘもしくはその相補鎖によりコードされるポリペプチドおよびｃＤＮＡプラスミドＶによりコードされるポリペプチドのポリペプチド配列からなる群から選択された配列中の、少なくとも１０個連続したアミノ酸の配列と少なくとも９０％同一であるアミノ酸配列を含むポリペプチドを、生物学的サンプルにおいて検出する方法はさらに好ましく；この方法は、このサンプル中における少なくとも１つのポリペプチド分子のアミノ酸配列をこの群から選択された配列と比較する工程およびこのサンプル中のこのポリペプチド分子の配列が、少なくとも１０個連続したアミノ酸の配列と少なくとも９０％同一であるかどうかを決定する工程を包含する。
【０７４１】
このサンプル中における少なくとも１つのポリペプチド分子のアミノ酸配列を、この群から選択された配列と比較するこの工程が、このサンプル中のポリペプチドの、以下：配列番号Ｙのポリペプチド配列；配列番号Ｘもしくはその相補鎖によりコードされるポリペプチドのポリペプチド配列およびｃＤＮＡプラスミドＶによりコードされるポリペプチドのポリペプチド配列からなる群から選択された配列中の少なくとも１０個連続したアミノ酸の配列に対して、少なくとも９０％同一であるアミノ酸配列を含むポリペプチドと特異的に結合する抗体に対する特異的な結合の程度を決定することを含む、上記の方法もまた、好ましい。
【０７４２】
配列を比較する工程が、このサンプル中のポリペプチド分子から決定されたアミノ酸配列を、この群から選択されたこの配列と比較することによって行われる、上記の方法もまた好ましい。
【０７４３】
生物学的サンプルの種、組織または細胞型を同定する方法もまた好ましく、ここでこの方法は、もし存在するならば、以下からなる群から選択される配列における少なくとも１０個連続したアミノ酸の配列と少なくとも９０％同一であるアミノ酸配列を含むポリペプチド分子をこのサンプル中で検出する工程を含む：配列番号Ｙのポリペプチド配列；配列番号Ｘもしくはその相補鎖によりコードされるポリペプチドのポリペプチド配列およびｃＤＮＡプラスミドＶによりコードされるポリペプチドのポリペプチド配列。
【０７４４】
生物学的サンプルの種、組織または細胞型を同定する上記の方法もまた好ましく、ここでこの方法は、少なくとも２つのアミノ酸配列のパネルにおけるアミノ酸配列を含むポリペプチド分子を検出する工程を含み、ここでこのパネル中の少なくとも１つの配列は、上記の群から選択された配列における少なくとも１０個連続したアミノ酸の配列と少なくとも９０％同一である。
【０７４５】
被験体において、表１において同定された、ポリペプチドをコードする核酸配列の異常な構造または発現に関連する病的状態を診断する方法もまた、好ましく、ここで、この方法は、この被験体から得られた生物学的サンプルにおいて、少なくとも２つのアミノ酸配列のパネルにおけるアミノ酸配列を含むポリペプチド分子を検出する工程を含み、ここでこのパネル中の少なくとも１つの配列は、以下からなる群から選択される配列における少なくとも１０個連続したアミノ酸の配列と少なくとも９０％同一である：配列番号Ｙのポリペプチド配列；配列番号Ｘもしくはその相補鎖によりコードされるポリペプチドのポリペプチド配列およびｃＤＮＡプラスミドＶによりコードされるポリペプチドのポリペプチド配列。
【０７４６】
これらの方法のいずれかにおいて、上記ポリペプチド分子を検出する工程は、抗体を使用することを包含する。
【０７４７】
以下からなる群から選択された配列中の、少なくとも１０個連続したアミノ酸の配列と少なくとも９０％同一であるアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードするヌクレオチド配列と、少なくとも９５％同一であるヌクレオチド配列を含む、単離された核酸分子もまた、好ましい：配列番号Ｙのポリペプチド配列；配列番号Ｘもしくはその相補鎖によりコードされるポリペプチドのポリペプチド配列およびｃＤＮＡプラスミドＶによりコードされるポリペプチドのポリペプチド配列。
【０７４８】
ポリペプチドをコードする上記ヌクレオチド配列が、原核生物宿主でのこのポリペプチドの発現について最適化されている、単離された核酸分子もまた、好ましい。
【０７４９】
上記ポリペプチドが以下からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む、単離された核酸分子もまた、好ましい：配列番号Ｙのポリペプチド配列；配列番号Ｘもしくはその相補鎖によりコードされるポリペプチドのポリペプチド配列およびｃＤＮＡプラスミドＶによりコードされるポリペプチドのポリペプチド配列。
【０７５０】
上記の単離された核酸分子のいずれかをベクター中に挿入する工程を含む、組換えベクターの作製方法はさらに好ましい。この方法によって生成された組換えベクターも、好ましい。宿主細胞中にベクターを導入する工程を含む、組換え宿主細胞を作製する方法、ならびにこの方法によって生成された組換え宿主細胞もまた、好ましい。
【０７５１】
単離されたポリペプチドを作製する方法であって、このポリペプチドが発現されるような条件下でこの組換え宿主細胞を培養する工程、およびこのポリペプチドを回収する工程を包含する、方法もまた好ましい。この組換え宿主細胞が真核生物細胞であり、そしてこのポリペプチドが以下からなる群から選択されたアミノ酸配列を含むヒトタンパク質である、単離されたポリペプチドを作製するこの方法もまた好ましい：配列番号Ｙのポリペプチド配列；配列番号Ｘもしくはその相補鎖によりコードされるポリペプチドのポリペプチド配列およびｃＤＮＡプラスミドＶによりコードされるポリペプチドのポリペプチド配列。この方法によって生成された単離されたポリペプチドもまた、好ましい。
【０７５２】
増加したレベルのタンパク質活性を必要とする個体を処置する方法もまた、好ましく、ここで、この方法は、このような個体に、この個体においてこのタンパク質の活性のレベルを増加させるのに有効な量の、本願発明の単離されたポリペプチド、ポリヌクレオチド、その免疫原性フラグメントもしくはアナログ、結合因子、抗体、あるいは抗原結合フラグメントを含む治療剤を投与する工程を包含する。
【０７５３】
減少したレベルのタンパク質活性を必要とする個体を処置する方法もまた、好ましく、ここで、この方法は、このような個体に、この個体においてこのタンパク質の活性のレベルを減少させるのに有効な量の、本願発明の単離されたポリペプチド、ポリヌクレオチド、その免疫原性フラグメントもしくはアナログ、結合因子、抗体、あるいは抗原フラグメントを含む治療剤を投与する工程を包含する。
【０７５４】
本発明の特定の実施形態では、表２の４番目の列に列挙される各「コンティグＩＤ」について、好ましくは、表２の５番目の列で参照されるヌクレオチド配列、および一般式ａ−ｂにより記載されるヌクレオチド配列（ここでａおよびｂは、表２の列３で参照される対応する配列番号Ｘについて独自に決定される）を含むか、またはそのようなヌクレオチド配列からなる、１つ以上のポリヌクレオチドが除外される。さらに特定の実施形態は、表２の５番目の列において参照される特定のポリヌクレオチド配列の１、２、３、４個、またはそれより多くを除外するポリヌクレオチド配列に関する。
【０７５５】
好ましくは、一般式ｃ−ｄによって記載されるヌクレオチド配列を含む１つ以上のポリヌクレオチドが本発明から除外され、ここでｃおよびｄの両方は、配列番号Ｘに示されるヌクレオチド残基の位置に対応し、そしてｄは、ｃ＋１４以上である。
【０７５６】
この列挙は、この一般式により除外され得る配列の全てを含むことを決して意味せず、この表は、単に代表的な例である。これらの登録を通じて利用可能な全ての文献は、本明細書中でその全体が参考として援用される。
【０７５７】
【表２】
2004504011.tif 000003
2004504011.tif 000004
2004504011.tif 000005
【０７５８】
【表３】
2004504011.tif 000006
2004504011.tif 000007
【０７５９】
【表４】
2004504011.tif 000008
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2004504011.tif 000010
2004504011.tif 000011
概して、本発明を記載してきたが、例示の目的のために提供されかつ限定することを意図しない、以下の実施例を参照することによって、本発明はより容易に理解される。
【０７６０】
（実施例）
（実施例１：選択されたｃＤＮＡクローンの寄託されたサンプルからの単離）
引用されるＡＴＣＣ受託物中の各ｃＤＮＡクローンは、プラスミドベクター中に含まれる。表１は、各クローンが単離されたｃＤＮＡライブラリーを構築するために用いられたベクターを同定する。多くの場合において、ライブラリーを構築するために使用されたベクターは、プラスミドが切り出されたファージベクターである。すぐ下の表は、ｃＤＮＡライブラリーを構築する際に使用される各ファージベクターについて関連するプラスミドを相関づける。例えば、特定のクローンがベクター「Ｌａｍｂｄａ　Ｚａｐ」中に単離されていると表１に同定される場合、対応する受託クローンは、「ｐＢｌｕｅｓｃｒｉｐｔ」である。
【０７６１】
【表５】
2004504011.tif 000012
ベクターＬａｍｂｄａ　Ｚａｐ（米国特許第５，１２８，２５６号および同第５，２８６，６３６号）、Ｕｎｉ−Ｚａｐ　ＸＲ（米国特許第５，１２８，２５６号および同第５，２８６，６３６号）、Ｚａｐ　Ｅｘｐｒｅｓｓ（米国特許第５，１２８，２５６号および同第５，２８６，６３６号）、ｐＢｌｕｅｓｃｒｉｐｔ（ｐＢＳ）（Ｓｈｏｒｔら、Ｎｕｃｌｅｉｃ　Ａｃｉｄｓ　Ｒｅｓ．１６：７５８３−７６００（１９８８）；Ａｌｔｉｎｇ−Ｍｅｅｓら、Ｎｕｃｌｅｉｃ　Ａｃｉｄｓ　Ｒｅｓ．１７：９４９４（１９８９））ならびにｐＢＫ（Ａｌｔｉｎｇ−Ｍｅｅｓら、Ｓｔｒａｔｅｇｉｅｓ　５：５８−６１（１９９２））は、Ｓｔｒａｔａｇｅｎｅ　Ｃｌｏｎｉｎｇ　Ｓｙｓｔｅｍｓ，Ｉｎｃ．、１１０１１　Ｎ．Ｔｏｒｒｅｙ　Ｐｉｎｅｓ　Ｒｏａｄ、Ｌａ　Ｊｏｌｌａ，ＣＡ，９２０３７から市販されている。ｐＢＳは、アンピシリン耐性遺伝子を含み、そしてｐＢＫはネオマイシン耐性遺伝子を含む。両方とも、Ｅ．ｃｏｌｉ株ＸＬ−１　Ｂｌｕｅ（これもまた、Ｓｔｒａｔａｇｅｎｅから入手可能である）に形質転換され得る。ｐＢＳは、ＳＫ＋、ＳＫ−、ＫＳ＋およびＫＳの４形態で入荷する。ＳおよびＫとは、ポリリンカー領域（「Ｓ」とはＳａｃＩであり、そして「Ｋ」とは、ＫｐｎＩのことであり、これらは、リンカーのそれぞれの各末端での最初の部位である）に隣接するＴ７およびＴ３プライマー配列に対するポリリンカーの配向をいう。「＋」または「−」とは、ある方向においてｆ１　ｏｒｉから開始される一本鎖レスキューがセンス鎖ＤＮＡを生成し、そして他方においてアンチセンスであるようなｆ１複製起点（「ｏｒｉ」）の配向をいう。
【０７６２】
ベクターｐＳｐｏｒｔ１、ｐＣＭＶＳｐｏｒｔ　２．０およびｐＣＭＶＳｐｏｒｔ３．０をＬｉｆｅ　Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ、Ｉｎｃ．、Ｐ．Ｏ．Ｂｏｘ６００９、Ｇａｉｔｈｅｒｓｂｕｒｇ，ＭＤ　２０８９７から入手した。全てのＳｐｏｒｔベクターはアンピシリン耐性遺伝子を含み、そしてＥ．ｃｏｌｉ株ＤＨ１０Ｂ（これもまた、Ｌｉｆｅ　Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓから入手可能である）に形質転換され得る。（例えば、Ｇｒｕｂｅｒ，Ｃ．Ｅ．ら、Ｆｏｃｕｓ　１５：５９（１９９３）を参照のこと）。ベクターｌａｆｍｉｄ　ＢＡ（Ｂｅｎｔｏ　Ｓｏａｒｅｓ、Ｃｏｌｕｍｂｉａ　Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ、ＮＹ）は、アンピシリン耐性遺伝子を含み、そしてＥ．ｃｏｌｉ株ＸＬ−１　Ｂｌｕｅに形質転換され得る。ベクターｐＣＲ（登録商標）２．１（これはＩｎｖｉｔｒｏｇｅｎ、１６００　Ｆａｒａｄａｙ　Ａｖｅｎｕｅ、Ｃａｒｌｓｂａｄ、ＣＡ　９２００８から入手可能である）は、アンピシリン耐性遺伝子を含み、そしてＥ．ｃｏｌｉ株ＤＨ１０Ｂ（Ｌｉｆｅ　Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓから入手可能である）に形質転換され得る（例えば、Ｃｌａｒｋ、Ｎｕｃ．Ａｃｉｄｓ　Ｒｅｓ．１６：９６７７−９６８６（１９８８）およびＭｅａｄら、Ｂｉｏ／Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ　９：（１９９１）を参照のこと）。好ましくは、本発明のポリヌクレオチドは、表１における特定のクローンについて同定されたファージベクター配列、ならびに上記に示された対応するプラスミドベクター配列を含まない。
【０７６３】
表１に引用される、任意の所定のｃＤＮＡクローンについてＡＴＣＣ受託番号を与えられたサンプルにおける寄託された物質はまた、１つ以上のさらなるプラスミド（これは各々、その所定のクローンとは異なるｃＤＮＡクローンを含む）を含み得る。従って、同じＡＴＣＣ受託番号を共有する寄託物は、表１に同定される各ｃＤＮＡクローンのための少なくとも１つをプラスミドを含む。代表的には、表１に引用される各ＡＴＣＣ寄託物のサンプルは、ほぼ等量（重量で）の約５０個のプラスミドＤＮＡ（これは各々、異なるｃＤＮＡクローンを含む）の混合物を含む；しかし、このような寄託サンプルは、５０個よりも多いかまたは少ないｃＤＮＡクローン（約５００個までのｃＤＮＡクローン）のためのプラスミドを含み得る。
【０７６４】
表１におけるクローンについて引用されるプラスミドＤＮＡの寄託サンプルからそのクローンを単離するために２つのアプローチが使用され得る。第一に、プラスミドを、配列番号Ｘに対応するポリヌクレオチドプローブを使用して、クローンをスクリーニングすることによって直接単離する。
【０７６５】
特に、３０〜４０ヌクレオチドを有する特定のポリヌクレオチドを、報告されている配列に従って、Ａｐｐｌｉｅｄ　ＢｉｏｓｙｓｔｅｍｓのＤＮＡ合成装置を使用して合成する。オリゴヌクレオチドを、例えば、３２Ｐ−γ−ＡＴＰで、Ｔ４ポリヌクレオチドキナーゼを用いて標識し、そして慣用的な方法に従って精製する。（例えば、Ｍａｎｉａｔｉｓら、Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ　Ｃｌｏｎｉｎｇ：Ａ　Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ　Ｍａｎｕａｌ、Ｃｏｌｄ　Ｓｐｒｉｎｇ　Ｈａｒｂｏｒ　Ｐｒｅｓｓ、Ｃｏｌｄ　Ｓｐｒｉｎｇ、ＮＹ（１９８２））。プラスミド混合物を、当業者に公知の技術（例えば、ベクター供給者によって提供される技術または上記で引用された関連の刊行物もしくは特許において提供される技術）を用いて、上記のような適切な宿主（例えば、ＸＬ−１　Ｂｌｕｅ（Ｓｔｒａｔａｇｅｎｅ））に形質転換する。形質転換体を１．５％寒天プレート（適切な選択薬剤、例えば、アンピシリンを含む）に、１プレートあたり約１５０の形質転換体（コロニー）の密度でプレーティングする。これらのプレートを、細菌コロニースクリーニングについての慣用的な方法（例えば、Ｓａｍｂｒｏｏｋら、Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ　Ｃｌｏｎｉｎｇ：Ａ　Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ　Ｍａｎｕａｌ、第２版、（１９８９）、Ｃｏｌｄ　Ｓｐｒｉｎｇ　Ｈａｒｂｏｒ　Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ　Ｐｒｅｓｓ、１．９３〜１．１０４頁）または当業者に公知の他の技術に従って、ナイロンメンブレンを使用してスクリーニングする。
【０７６６】
あるいは、配列番号Ｘの両端（すなわち、表１に規定されるクローンの５’ＮＴおよび３’ＮＴによって囲まれる配列番号Ｘの領域内）に由来する、１７〜２０ヌクレオチドの２つのプライマーを合成し、そしてこれらを使用して、寄託されたｃＤＮＡプラスミドをテンプレートとして使用して、所望のｃＤＮＡを増幅する。ポリメラーゼ連鎖反応を、慣用的な条件下で、例えば、０．５μｇの上記ｃＤＮＡテンプレートとの反応混合物の２５μｌ中で実施する。便利な反応混合物は、１．５〜５ｍＭ　ＭｇＣｌ２、０．０１％（ｗ／ｖ）ゼラチン、それぞれ２０μＭのｄＡＴＰ、ｄＣＴＰ、ｄＧＴＰ、ｄＴＴＰ、２５ｐｍｏｌの各プライマーおよび０．２５ユニットのＴａｑポリメラーゼである。３５サイクルのＰＣＲ（９４℃での変性を１分間；５５℃でのアニールを１分間；７２℃での伸長を１分間）を、Ｐｅｒｋｉｎ−Ｅｌｍｅｒ　Ｃｅｔｕｓ自動化サーマルサイクラーを用いて実施する。増幅産物をアガロースゲル電気泳動により分析し、そして予想される分子量のＤＮＡバンドを切り出し、そして精製する。ＰＣＲ産物を、ＤＮＡ産物をサブクローニングおよび配列決定することによって、選択された配列であることを確認する。
【０７６７】
寄託されたクローンに存在しないかもしれない遺伝子の５’非コード部分または３’非コード部分の同定のために、いくつかの方法が利用可能である。これらの方法は、以下を含むがこれらに限定されない：フィルタープローブ探索、特異的プローブを使用するクローン富化、および当該分野で周知である５’および３’「ＲＡＣＥ」プロトコルと類似するかまたは同一のプロトコル。例えば、５’ＲＡＣＥに類似する方法は、所望の全長転写物の欠けている５’末端を生成するために利用可能である（Ｆｒｏｍｏｎｔ−Ｒａｃｉｎｅら、Ｎｕｃｌｅｉｃ　Ａｃｉｄｓ　Ｒｅｓ．２１（７）：１６８３−１６８４（１９９３））。
【０７６８】
簡潔には、特定のＲＮＡオリゴヌクレオチドを、全長遺伝子ＲＮＡ転写物をおそらく含むＲＮＡの集団の５’末端に連結する。連結されたＲＮＡオリゴヌクレオチドに特異的なプライマーおよび目的の遺伝子の公知の配列に特異的なプライマーを含むプライマーセットを使用して、所望の全長遺伝子の５’部分をＰＣＲ増幅する。次いで、この増幅した産物を配列決定し得、そしてこれを使用して全長遺伝子を生成し得る。
【０７６９】
この上記の方法は、所望の供給源から単離された総ＲＮＡを用いて開始するが、ポリＡ＋ＲＮＡをも使用し得る。次いで、ＲＮＡ調製物を、必要ならばホスファターゼで処理して、後のＲＮＡリガーゼ工程を妨害し得る分解ＲＮＡまたは損傷ＲＮＡの５’リン酸基を排除し得る。次いで、ホスファターゼを不活化するべきであり、そしてＲＮＡをメッセンジャーＲＮＡの５’末端に存在するキャップ構造を除去するために、タバコ酸性ピロホスファターゼを用いて処理するべきである。この反応は、次いでＴ４　ＲＮＡリガーゼを用いてＲＮＡオリゴヌクレオチドに連結され得る、キャップ切断ＲＮＡの５’末端に５’リン酸基を残す。
【０７７０】
この改変型ＲＮＡ調製物を、遺伝子特異的なオリゴヌクレオチドを用いる、第一鎖ｃＤＮＡ合成のためのテンプレートとして使用する。第一鎖合成反応物を、連結されたＲＮＡオリゴヌクレオチドに特異的なプライマーおよび目的の遺伝子の公知の配列に特異的なプライマーを用いる、所望の５’末端のＰＣＲ増幅のためのテンプレートとして使用する。次いで、得られた産物を配列決定し、そして分析して５’末端配列が所望の遺伝子に属することを確認する。
【０７７１】
（実施例２：ポリヌクレオチドに対応するゲノムクローンの単離）
ヒトゲノムＰ１ライブラリー（Ｇｅｎｏｍｉｃ　Ｓｙｓｔｅｍｓ、Ｉｎｃ．）を、実施例１に記載される方法に従って、配列番号Ｘに対応するｃＤＮＡ配列について選択されたプライマーを用いるＰＣＲによってスクリーニングする（Ｓａｍｂｒｏｏｋもまた参照のこと）。
【０７７２】
（実施例３：ポリペプチドの組織分布）
本発明のポリヌクレオチドのｍＲＮＡ発現の組織分布を、とりわけ、Ｓａｍｂｒｏｏｋらによって記載されるノーザンブロット分析についてのプロトコルを用いて決定する。例えば、実施例１に記載される方法によって生成されるｃＤＮＡプローブを、ｒｅｄｉｐｒｉｍｅＴＭ　ＤＮＡ　ｌａｂｅｌｉｎｇ　ｓｙｓｔｅｍ（Ａｍｅｒｓｈａｍ　Ｌｉｆｅ　Ｓｃｉｅｎｃｅ）を用いて、製造者の指示に従って、Ｐ３２で標識する。標識後、プローブを、ＣＨＲＯＭＡ　ＳＰＩＮ−１００ＴＭカラム（Ｃｌｏｎｔｅｃｈ　Ｌａｂｏｒａｔｏｒｉｅｓ、Ｉｎｃ．）を使用して、製造者のプロトコル番号ＰＴ１２００−１に従って精製する。次いで、精製した標識プローブを使用して、種々のヒト組織をｍＲＮＡ発現について試験する。
【０７７３】
種々のヒト組織（Ｈ）またはヒト免疫系組織（ＩＭ）を含む多重組織ノーザン（ＭＴＮ）ブロット（Ｃｌｏｎｔｅｃｈ）を、ＥｘｐｒｅｓｓＨｙｂＴＭハイブリダイゼーション溶液（Ｃｌｏｎｔｅｃｈ）を用いて、製造者のプロトコル番号ＰＴ１１９０−１に従って、標識プローブで試験する。ハイブリダイゼーションおよび洗浄後、ブロットをマウントして、そして−７０℃で一晩フィルムに露出し、そしてフィルムを標準的な手順に従って現像する。
【０７７４】
（実施例４：ポリヌクレオチドの染色体マッピング）
オリゴヌクレオチドプライマーのセットを、配列番号Ｘの５’末端の配列に従って設計する。このプライマーは、好ましくは約１００ヌクレオチドにわたる。次いで、このプライマーセットを、以下のセットの条件下でポリメラーゼ連鎖反応に使用する：９５℃で３０秒；５６℃で１分；７０℃で１分。このサイクルを３２回反復し、次いで１回、７０℃で５分間のサイクルを行う。個々の染色体または染色体フラグメントを含む体細胞ハイブリッドパネル（Ｂｉｏｓ，Ｉｎｃ）に加えて、ヒト、マウス、およびハムスターのＤＮＡを鋳型として使用する。反応物を、８％ポリアクリルアミドゲルまたは３．５％アガロースゲルのいずれかで分析する。染色体マッピングを、特定の体細胞ハイブリッドにおける約１００ｂｐのＰＣＲフラグメントの存在によって決定する。
【０７７５】
（実施例５：ポリペプチドの細菌性発現）
本発明のポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを、実施例１に概説するように、ＤＮＡ配列の５’および３’末端に対応するＰＣＲオリゴヌクレオチドプライマーを使用して増幅して挿入フラグメントを合成する。ｃＤＮＡ挿入物を増幅するために使用されるプライマーは、必要ならば、発現ベクターに増幅産物をクローニングするために、ＢａｍＨＩおよびＸｂａＩのような制限部位、ならびに、開始／停止コドンを好ましくは含むべきである。例えば、ＢａｍＨＩおよびＸｂａＩは、細菌性発現ベクターｐＱＥ−９（Ｑｉａｇｅｎ，Ｉｎｃ．，Ｃｈａｔｓｗｏｒｔｈ，ＣＡ）の制限酵素部位に対応する。このプラスミドベクターは、抗生物質耐性（Ａｍｐｒ）、細菌の複製起点（ｏｒｉ）、ＩＰＴＧで調節可能なプロモーター／オペレーター（Ｐ／Ｏ）、リボソーム結合部位（ＲＢＳ）、６−ヒスチジンタグ（６−Ｈｉｓ）、および制限酵素クローニング部位をコードする。
【０７７６】
ｐＱＥ−９ベクターをＢａｍＨＩおよびＸｂａＩで消化し、そして、増幅されたフラグメントを細菌性ＲＢＳにおいて開始されるリーディングフレームを維持しながらｐＱＥ−９ベクターに連結する。次いで、連結混合物を、ｌａｃＩリプレッサーを発現し、またカナマイシン耐性（Ｋａｎｒ）を与えるプラスミドｐＲＥＰ４の多重コピーを含む、Ｅ．ｃｏｌｉ株Ｍ１５／ｒｅｐ４（Ｑｉａｇｅｎ，Ｉｎｃ．）を形質転換するために使用する。形質転換体を、ＬＢプレート上で生育するそれらの能力によって同定し、そしてアンピシリン／カナマイシン耐性コロニーを選択する。プラスミドＤＮＡを単離し、そして制限分析によって確認する。
【０７７７】
所望の構築物を含むクローンを、Ａｍｐ（１００μｇ／ｍｌ）およびＫａｎ（２５μｇ／ｍｌ）の両方を補充したＬＢ培地における液体培養で一晩（Ｏ／Ｎ）増殖させる。Ｏ／Ｎ培養物を、１：１００〜１：２５０の比で大量培養物に接種するために使用する。細胞を、０．４と０．６との間の光学密度６００（Ｏ．Ｄ．６００）まで増殖させる。次いで、ＩＰＴＧ（イソプロピル−Ｂ−Ｄ−チオガラクトピラノシド）を最終濃度１ｍＭになるように加える。ＩＰＴＧは、ｌａｃＩリプレッサーの不活化により誘導され、Ｐ／Ｏを除去し、遺伝子発現の増加を導く。
【０７７８】
細胞を、さらに３〜４時間増殖させる。次いで、細胞を遠心分離（６０００×ｇで２０分間）によって収集する。細胞ペレットを、カオトロピック剤である６ＭグアニジンＨＣｌ中に、４℃で３〜４時間攪拌することによって可溶化させる。細胞細片を遠心分離によって取り除き、そしてポリペプチドを含む上清を、ニッケル−ニトリロ三酢酸（「Ｎｉ−ＮＴＡ」）アフィニティー樹脂カラム（ＱＩＡＧＥＮ，Ｉｎｃ．前出より入手可能）にロードする。６×Ｈｉｓタグを有するタンパク質は、Ｎｉ−ＮＴＡ樹脂に高い親和性で結合し、そして単純な１工程手順で精製され得る（詳細には、Ｔｈｅ　ＱＩＡｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎｉｓｔ（１９９５）ＱＩＡＧＥＮ，Ｉｎｃ．，前出を参照のこと）。
【０７７９】
手短に言えば、上清を、６Ｍグアニジン−ＨＣｌ、ｐＨ８のカラムにロードし、そのカラムを、最初に１０容量の６Ｍグアニジン−ＨＣｌ、ｐＨ８で洗浄し、次いで１０容量の６Ｍグアニジン−ＨＣｌ、ｐＨ６で洗浄し、そして最後にポリペプチドを、６Ｍグアニジン−ＨＣｌ、ｐＨ５で溶出する。
【０７８０】
次いで、精製したタンパク質を、リン酸緩衝化生理食塩水（ＰＢＳ）または５０ｍＭ　酢酸ナトリウム、ｐＨ６の緩衝液および２００ｍＭ　ＮａＣｌに対して透析することにより再生させる。あるいは、タンパク質はＮｉ−ＮＴＡカラムに固定化している間に、首尾よく再折畳みされ得る。推奨条件は以下の通りである：プロテアーゼインヒビターを含む、５００ｍＭ　ＮａＣｌ、２０％グリセロール、２０ｍＭ　Ｔｒｉｓ／ＨＣｌ　ｐＨ７．４中の６Ｍ〜１Ｍ尿素の直線勾配を使用する再生。再生は１．５時間以上の時間をかけて行うべきである。再生後、タンパク質を２５０ｍＭイミダゾールの添加によって溶出させる。イミダゾールを、ＰＢＳまたは５０ｍＭ酢酸ナトリウム　ｐＨ６の緩衝液および２００ｍＭ　ＮａＣｌに対する最終の透析工程によって除去する。精製したタンパク質を、４℃で保存するか、または−８０℃で冷凍する。
【０７８１】
上記の発現ベクターに加えて、本発明はさらに、本発明のポリヌクレオチドに作動可能に連結されたファージオペレーターおよびプロモーターエレメントを含み、ｐＨＥ４ａと呼ばれる発現ベクターを含む（ＡＴＣＣ登録番号２０９６４５、１９９８年２月２５日に寄託）。このベクターは以下を含む：１）選択マーカーとしてのネオマイシンホスホトランスフェラーゼ遺伝子、２）Ｅ．ｃｏｌｉ複製起点、３）Ｔ５ファージプロモーター配列、４）２つのｌａｃオペレーター配列、５）シャイン−ダルガーノ配列、および６）ラクトースオペロンリプレッサー遺伝子（ｌａｑＩｑ）。複製起点（ｏｒｉＣ）は、ｐＵＣ１９（ＬＴＩ，Ｇａｉｔｈｅｒｓｂｕｒｇ，ＭＤ）に由来する。プロモーター配列およびオペレーター配列を合成的に作製する。
【０７８２】
ＮｄｅＩおよびＸｂａＩ、ＢａｍＨＩ、ＸｈｏＩ、またはＡｓｐ７１８によってベクターを制限処理し、制限生成物をゲルで泳動し、そしてより大きな方のフラグメント（スタッファー（ｓｔｕｆｆｅｒ）フラグメントは約３１０塩基対であるべきである）を単離することによって、ＤＮＡをｐＨＥａに挿入し得る。ＤＮＡ挿入物を、ＮｄｅＩ（５’プライマー）およびＸｂａＩ、ＢａｍＨＩ、ＸｈｏＩ、またはＡｓｐ７１８（３’プライマー）に対する制限部位を有するＰＣＲプライマーを使用して、実施例１に記載のＰＣＲプロトコルに従って生成する。ＰＣＲ挿入物を、ゲル精製し、そして適合する酵素で制限処理する。挿入物およびベクターを標準的なプロトコルに従って連結する。
【０７８３】
操作されたベクターは、上記のプロトコルにおいて、細菌系でタンパク質を発現させるために容易に置換され得る。
【０７８４】
（実施例６：封入体からのポリペプチドの精製）
以下の別の方法は、ポリペプチドが封入体の形態で存在する場合に、Ｅ．ｃｏｌｉ中で発現されたこのポリペプチドを精製するために使用され得る。他に指定されない場合には、以下のすべての工程は４〜１０℃で行われる。
【０７８５】
Ｅ．ｃｏｌｉ発酵の生産期の完了後、細胞培養物を４〜１０℃に冷却し、そして１５，０００ｒｐｍの連続遠心分離（Ｈｅｒａｅｕｓ　Ｓｅｐａｔｅｃｈ）によって細胞を採集する。細胞ペーストの単位重量あたりのタンパク質の予想される収量および必要とされる精製タンパク質の量に基づいて、細胞ペーストの適切な量（重量による）を、１００ｍＭ　Ｔｒｉｓ、５０ｍＭ　ＥＤＴＡ、ｐＨ７．４を含む緩衝溶液に懸濁させる。細胞を、高剪断ミキサーを使用して均質な懸濁液に分散させる。
【０７８６】
次いで、細胞をマイクロフルイダイザー（ｍｉｃｒｏｆｌｕｉｄｉｚｅｒ）（Ｍｉｃｒｏｆｌｕｉｄｉｃｓ，Ｃｏｒｐ．またはＡＰＶ　Ｇａｕｌｉｎ，Ｉｎｃ．）に２回、４０００〜６０００ｐｓｉで溶液を通すことによって溶解させる。次いでホモジネートを、最終濃度０．５Ｍ　ＮａＣｌになるようにＮａＣｌ溶液と混合し、続いて７０００×ｇで１５分間遠心分離を行う。得られたペレットを、０．５Ｍ　ＮａＣｌ、１００ｍＭ　Ｔｒｉｓ、５０ｍＭ　ＥＤＴＡ、ｐＨ７．４を使用して再度洗浄する。
【０７８７】
得られた洗浄した封入体を、１．５Ｍ　塩酸グアニジン（ＧｕＨＣｌ）で２〜４時間可溶化する。７０００×ｇで１５分間の遠心分離の後、ペレットを廃棄し、そしてポリペプチドを含む上清を４℃で一晩インキュベートしてさらなるＧｕＨＣｌ抽出を可能にする。
【０７８８】
不溶性粒子を除去するための高速遠心分離（３０，０００×ｇ）に続き、ＧｕＨＣｌ可溶化タンパク質を、ＧｕＨＣｌ抽出物と、５０ｍＭ　ナトリウム、ｐＨ４．５、１５０ｍＭ　ＮａＣｌ、２ｍＭ　ＥＤＴＡを含む２０容量の緩衝液とを、激しい攪拌で迅速に混合することによって、再折畳みさせる。再折畳みした希釈タンパク質溶液を、さらなる精製工程の前の１２時間、混合しないで４℃で保つ。
【０７８９】
再折畳みされたポリペプチド溶液を清澄にするために、４０ｍＭ酢酸ナトリウム、ｐＨ６．０で平衡化した、適切な表面積を有する０．１６μｍメンブレンフィルターを備えるあらかじめ準備した接線濾過ユニット（例えば、Ｆｉｌｔｒｏｎ）を使用する。濾過したサンプルを、カチオン交換樹脂（例えば、Ｐｏｒｏｓ　ＨＳ−５０，Ｐｅｒｓｅｐｔｉｖｅ　Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ）上にロードする。このカラムを４０ｍＭ　酢酸ナトリウム、ｐＨ６．０で洗浄し、そして同じ緩衝液中の２５０ｍＭ、５００ｍＭ、１０００ｍＭ、および１５００ｍＭ　ＮａＣｌで、段階的な様式で溶出する。溶出液の２８０ｎｍにおける吸光度を連続的にモニターする。画分を収集し、そしてＳＤＳ−ＰＡＧＥによってさらに分析する。
【０７９０】
次いでポリペプチドを含む画分をプールし、そして４容量の水と混合する。次いで希釈されたサンプルを、あらかじめ準備した強アニオン（Ｐｏｒｏｓ　ＨＱ−５０，Ｐｅｒｓｅｐｔｉｖｅ　Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ）交換樹脂および弱アニオン（Ｐｏｒｏｓ　ＣＭ−２０，Ｐｅｒｓｅｐｔｉｖｅ　Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ）交換樹脂の直列カラムのセットにロードする。カラムを４０ｍＭ　酢酸ナトリウム、ｐＨ６．０で平衡化する。両方のカラムを、４０ｍＭ　酢酸ナトリウム、ｐＨ６．０、２００ｍＭ　ＮａＣｌで洗浄する。次いでＣＭ−２０カラムを１０カラム容量の直線勾配（０．２Ｍ　ＮａＣｌ、５０ｍＭ　酢酸ナトリウム、ｐＨ６．０から１．０Ｍ　ＮａＣｌ、５０ｍＭ　酢酸ナトリウム、ｐＨ６．５の範囲）を用いて溶出させる。画分を、溶出液の定常Ａ２８０モニタリング下で収集する。次いで、（例えば、１６％　ＳＤＳ−ＰＡＧＥによって判明した）ポリペプチドを含む画分をプールする。
【０７９１】
得られたポリペプチドは、上記の再折畳みおよび精製工程の後で９５％より高い純度を示すはずである。５μｇの精製タンパク質がロードされる場合、いかなる主たる混在バンドも、クマシーブルー染色した１６％　ＳＤＳ−ＰＡＧＥゲルから観察されないはずである。精製タンパク質はまた、エンドトキシン／ＬＰＳ混在について試験され得、そして代表的には、ＬＰＳ含量はＬＡＬアッセイに従って、０．１ｎｇ／ｍｌ未満である。
【０７９２】
（実施例７：バキュロウイルス発現系におけるポリペプチドのクローニングおよび発現）
この実施例において、プラスミドシャトルベクターｐＡ２を使用して、ポリヌクレオチドをバキュロウイルスに挿入し、ポリペプチドを発現させる。この発現ベクターは、Ａｕｔｏｇｒａｐｈａ　ｃａｌｉｆｏｒｎｉｃａ核多核体ウイルス（ＡｃＭＮＰＶ）の強力なポリヘドリンプロモーター、続いてＢａｍＨＩ、ＸｂａＩ、およびＡｓｐ７１８のような簡便な制限部位を含む。シミアンウイルス４０（「ＳＶ４０」）のポリアデニル化部位を、効率的なポリアデニル化のために使用する。組換えウイルスの容易な選択のために、このプラスミドは、同方向の弱いＤｒｏｓｏｐｈｉｌａプロモーターの制御下で、Ｅ．ｃｏｌｉ由来のβ−ガラクトシダーゼ遺伝子、続いてポリヘドリン遺伝子のポリアデニル化シグナルを含む。挿入された遺伝子は、クローン化したポリヌクレオチドを発現する生存可能なウイルスを生成する、野生型ウイルスＤＮＡとの細胞媒介性の相同組換えのためのウイルス配列と両方の側で隣接する。
【０７９３】
他の多くのバキュロウイルスベクター（例えば、ｐＡｃ３７３、ｐＶＬ９４１、およびｐＡｃＩＭ１）は、当業者が容易に理解するように、構築物が転写、翻訳、分泌などのために適切に配置されたシグナル（必要とされる場合、シグナルペプチドおよびインフレームなＡＵＧを含む）を提供する限りにおいて、上記のベクターの代わりに使用され得る。このようなベクターは、例えば、Ｌｕｃｋｏｗら、Ｖｉｒｏｌｏｇｙ　１７０：３１−３９（１９８９）に記載される。
【０７９４】
具体的には、寄託されたクローンに含まれるｃＤＮＡ配列を、適切な制限部位および開始／終止コドンを有するプライマーを使用して、実施例１に記載されるＰＣＲプロトコルを使用して増幅させる。天然に存在するシグナル配列を使用して分泌タンパク質を産生する場合、ｐＡ２ベクターは第２のシグナルペプチドを必要としない。あるいは、Ｓｕｍｍｅｒｓら、「Ａ　Ｍａｎｕａｌ　ｏｆ　Ｍｅｔｈｏｄｓ　ｆｏｒ　Ｂａｃｕｌｏｖｉｒｕｓ　Ｖｅｃｔｏｒｓ　ａｎｄ　Ｉｎｓｅｃｔ　Ｃｅｌｌ　Ｃｕｌｔｕｒｅ　Ｐｒｏｃｅｄｕｒｅｓ」、Ｔｅｘａｓ　Ａｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌ　Ｅｘｐｅｒｉｍｅｎｔａｌ　Ｓｔａｔｉｏｎ　Ｂｕｌｌｅｔｉｎ　ＮＯ．：１５５５（１９８７）に記載される標準的な方法を用いて、このベクターを、バキュロウイルスリーダー配列を含むように改変し得る（ｐＡ２ＧＰ）。
【０７９５】
増幅されたフラグメントを、市販のキット（「Ｇｅｎｅｃｌｅａｎ」、ＢＩＯ　１０１　Ｉｎｃ．，Ｌａ　Ｊｏｌｌａ，Ｃａ．）を使用して、１％アガロースゲルから単離する。次いで、このフラグメントを適切な制限酵素で消化し、そして再び１％アガロースゲル上で精製する。
【０７９６】
プラスミドを対応する制限酵素で消化し、そして必要に応じて、当該分野で公知の慣用の手順を用いて、仔ウシ腸ホスファターゼを用いて脱リン酸化し得る。次いでＤＮＡを、市販のキット（「Ｇｅｎｅｃｌｅａｎ」ＢＩＯ　１０１　Ｉｎｃ．，Ｌａ　Ｊｏｌｌａ，ＣＡ）を使用して、１％アガロースゲルから単離する。
【０７９７】
フラグメントおよび脱リン酸化したプラスミドを、Ｔ４　ＤＮＡリガーゼを用いて互いに連結する。Ｅ．ｃｏｌｉ　ＨＢ１０１またはＸＬ−１　Ｂｌｕｅ（Ｓｔｒａｔａｇｅｎｅ　Ｃｌｏｎｉｎｇ　Ｓｙｓｔｅｍｓ，Ｌａ　Ｊｏｌｌａ，Ｃａ）細胞のような他の適切なＥ．ｃｏｌｉ宿主を、連結混合液で形質転換し、そして培養プレート上に拡げる。プラスミドを含む細菌を、個々のコロニー由来のＤＮＡを消化し、そして消化産物をゲル電気泳動によって分析することにより同定する。クローニングしたフラグメントの配列をＤＮＡ配列決定によって確認する。
【０７９８】
このポリヌクレオチドを含む５μｇのプラスミドを、Ｆｅｌｇｎｅｒら、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ　８４：７４１３−７４１７（１９８７）によって記載されたリポフェクション法を使用して、１．０μｇの市販の直線化バキュロウイルスＤＮＡ（「ＢａｃｕｌｏＧｏｌｄＴＭ　ｂａｃｕｌｏｖｉｒｕｓ　ＤＮＡ」，Ｐｈａｒｍｉｎｇｅｎ，Ｓａｎ　Ｄｉｅｇｏ，ＣＡ）とともに同時トランスフェクトする。１μｇのＢａｃｕｌｏＧｏｌｄＴＭウイルスＤＮＡおよび５μｇのプラスミドを、５０μｌの無血清グレース培地（Ｌｉｆｅ　Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ　Ｉｎｃ．，Ｇａｉｔｈｅｒｓｂｕｒｇ，ＭＤ）を含む、マイクロタイタープレートの滅菌したウェル中で混合する。その後、１０μｌのリポフェクチンおよび９０μｌグレース培地を添加し、混合し、そして室温で１５分間インキュベートする。次いで、トランスフェクション混合液を、無血清グレース培地１ｍｌを加えた３５ｍｍ組織培養プレートに播種したＳｆ９昆虫細胞（ＡＴＣＣ　ＣＲＬ　１７１１）に滴下して加える。次いでプレートを２７℃で５時間インキュベートする。次いで、トランスフェクション溶液をプレートから除去し、そして１０％ウシ胎仔血清を補充した１ｍｌのグレース昆虫培地を添加する。次いで培養を２７℃で４日間継続する。
【０７９９】
４日後上清を収集し、ＳｕｍｍｅｒｓおよびＳｍｉｔｈ、前出によって記載されたようにプラークアッセイを行う。「Ｂｌｕｅ　Ｇａｌ」（Ｌｉｆｅ　Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ　Ｉｎｃ．，Ｇａｉｔｈｅｒｓｂｕｒｇ）を含むアガロースゲルを、ｇａｌが発現しているクローン（青色に着色したプラークを生ずる）の容易な同定および単離を可能にするために使用する。（この型の「プラークアッセイ」の詳細な説明はまた、Ｌｉｆｅ　Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ　Ｉｎｃ．，　Ｇａｉｔｈｅｒｓｂｕｒｇによって配布される、昆虫細胞培養およびバキュロウイルス学のための使用者ガイドの中の９−１０頁に見出され得る）。適切なインキュベーションの後、青色に着色したプラークをマイクロピペッター（例えば、Ｅｐｐｅｎｄｏｒｆ）のチップで拾う。次いで、組換えウイルスを含む寒天を、２００μｌのグレース培地を含む微小遠心分離チューブ中で再懸濁させ、そして組換えバキュロウイルスを含む懸濁液を、３５ｍｍディッシュに播種したＳｆ９細胞に感染させるために使用する。４日後、これらの培養ディッシュの上清を採集し、次いで４℃で貯蔵する。
【０８００】
ポリペプチドの発現を確認するために、１０％熱不活化ＦＢＳを補充したグレース培地中でＳｆ９細胞を増殖させる。細胞を、約２の感染多重度（「ＭＯＩ」）でポリヌクレオチドを含む組換えバキュロウイルスで感染させる。放射性標識したタンパク質を所望する場合には、６時間後に培地を除去し、そしてメチオニンおよびシステインを含まないＳＦ９００　ＩＩ培地（Ｌｉｆｅ　Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ　Ｉｎｃ．，Ｒｏｃｋｖｉｌｌｅ，ＭＤから入手可能）に置き換える。４２時間後、５μＣｉの３５Ｓ−メチオニンおよび５μＣｉの３５Ｓ−システイン（Ａｍｅｒｓｈａｍから入手可能）を添加する。細胞をさらに１６時間インキュベートし、次いで遠心分離によって採集する。上清中のタンパク質および細胞内タンパク質を、ＳＤＳ−ＰＡＧＥ、次いで（放射性標識した場合）オートラジオグラフィーによって分析する。
【０８０１】
精製タンパク質のアミノ末端のアミノ酸配列の微量配列決定法を使用して、産生されたタンパク質のアミノ末端配列を決定し得る。
【０８０２】
（実施例８：哺乳動物細胞におけるポリペプチドの発現）
本発明のポリペプチドを、哺乳動物細胞中で発現させ得る。代表的な哺乳動物発現ベクターは、ｍＲＮＡの転写の開始を媒介するプロモーターエレメント、タンパク質コード配列、ならびに転写の終結および転写物のポリアデニル化に必要なシグナルを含む。さらなるエレメントは、エンハンサー、コザック配列、および、ＲＮＡスプライシングのドナー部位およびアクセプター部位に隣接する介在配列を含む。非常に効率的な転写は、ＳＶ４０由来の初期および後期プロモーター、レトロウイルス（例えばＲＳＶ、ＨＴＬＶＩ、ＨＩＶＩ）由来の長末端反復（ＬＴＲ）、およびサイトメガロウイルス（ＣＭＶ）の初期プロモーターを用いて達成される。しかし、細胞エレメント（例えば、ヒトアクチンプロモーター）もまた、使用され得る。
【０８０３】
本発明を実施する際の使用に適切な発現ベクターは、例えば、ｐＳＶＬおよびｐＭＳＧ（Ｐｈａｒｍａｃｉａ，Ｕｐｐｓａｌａ，Ｓｗｅｄｅｎ）、ｐＲＳＶｃａｔ（ＡＴＣＣ　３７１５２）、ｐＳＶ２ｄｈｆｒ（ＡＴＣＣ　３７１４６）、ｐＢＣ１２ＭＩ（ＡＴＣＣ　６７１０９）、ｐＣＭＶＳｐｏｒｔ２．０、ならびにｐＣＭＶＳｐｏｒｔ３．０のようなベクターを含む。使用され得る哺乳動物宿主細胞は、ヒトＨｅｌａ細胞、２９３細胞、Ｈ９細胞およびＪｕｒｋａｔ細胞、マウスＮＩＨ３Ｔ３細胞およびＣ１２７細胞、Ｃｏｓ　１細胞、Ｃｏｓ　７細胞およびＣＶ１細胞、ウズラＱＣ１−３細胞、マウスＬ細胞、ならびにチャイニーズハムスター卵巣（ＣＨＯ）細胞を含む。
【０８０４】
あるいは、ポリペプチドは、染色体に組み込まれたポリヌクレオチドを含む、安定な細胞株中で発現され得る。ｄｈｆｒ、ｇｐｔ、ネオマイシン、ハイグロマイシンのような選択可能なマーカーを用いる同時トランスフェクションは、トランスフェクトされた細胞の同定および単離を可能にする。
【０８０５】
トランスフェクトされた遺伝子はまた、大量のコードされたタンパク質を発現するために増幅され得る。ＤＨＦＲ（ジヒドロ葉酸還元酵素）マーカーは、目的の遺伝子の数百または数千さえものコピーを有する細胞株の開発に有用である。（例えば、Ａｌｔら、Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．２５３：１３５７−１３７０（１９７８）；Ｈａｍｌｉｎ、Ｂｉｏｃｈｅｍ．ｅｔ　Ｂｉｏｐｈｙｓ．Ａｃｔａ、１０９７：１０７−１４３（１９９０）：Ｐａｇｅら、Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ　９：６４−６８（１９９１）を参照のこと）。別の有用な選択マーカーは、酵素グルタミンシンターゼ（ＧＳ）である（Ｍｕｒｐｈｙら、Ｂｉｏｃｈｅｍ　Ｊ．，２２７：２７７−２７９（１９９１）；Ｂｅｂｂｉｎｇｔｏｎら、Ｂｉｏ／Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ，１０：１６９−１７５（１９９２））。これらのマーカーを使用して、哺乳動物細胞を選択培地中で増殖させ、そしてもっとも高い耐性を有する細胞を選択する。これらの細胞株は、染色体に組み込まれた、増幅された遺伝子を含む。チャイニーズハムスター卵巣（ＣＨＯ）およびＮＳＯ細胞は、タンパク質の産生のためにしばしば使用される。
【０８０６】
プラスミドｐＳＶ２−ｄｈｆｒ（ＡＴＣＣ受託番号３７１４６）の誘導体である、発現ベクターｐＣ４（ＡＴＣＣ受託番号２０９６４６）およびｐＣ６（ＡＴＣＣ受託番号２０９６４７）は、ラウス肉腫ウイルス（Ｃｕｌｌｅｎら、Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ　ａｎｄ　Ｃｅｌｌｕｌａｒ　Ｂｉｏｌｏｇｙ，４３８−４４７（１９８５年３月））の強力なプロモーター（ＬＴＲ）、およびＣＭＶエンハンサー（Ｂｏｓｈａｒｔら、Ｃｅｌｌ，４１：５２１−５３０（１９８５））のフラグメントを含む。例えば、ＢａｍＨＩ、ＸｂａＩ、およびＡｓｐ７１８の制限酵素切断部位を有するマルチプルクローニングサイトは、目的の遺伝子のクローニングを容易にする。ベクターはまた、ラットプレプロインスリン遺伝子の３’イントロン、ポリアデニル化および終結シグナル、ならびに、ＳＶ４０初期プロモーターの制御下にあるマウスＤＨＦＲ遺伝子を含む。
【０８０７】
具体的には、例えば、プラスミドｐＣ６を、適切な制限酵素によって消化し、次いで当該分野で公知の手順によって、仔ウシ腸ホスファターゼ（ｐｈｏｓｐｈａｔｅ）を使用して脱リン酸化する。次いで、このベクターを１％アガロースゲルから単離する。
【０８０８】
本発明のポリヌクレオチドは、必要な場合、適切な制限部位および開始／停止コドンを有するプライマーを用いて実施例１に概説するプロトコルに従って増幅される。このベクターは分泌のために必要な場合、異種シグナル配列を含むように改変され得る（例えば、ＷＯ９６／３４８９１を参照のこと）。
【０８０９】
増幅フラグメントを、市販のキット（「Ｇｅｎｅｃｌｅａｎ」、ＢＩＯ　１０１　Ｉｎｃ．、Ｌａ　Ｊｏｌｌａ，Ｃａ．）を使用して、１％アガロースゲルから単離する。次いで、このフラグメントを、適切な制限酵素で消化し、そして再び１％アガロースゲルで精製する。
【０８１０】
次いで、増幅フラグメントを同じ制限酵素で消化し、そして１％アガロースゲルで精製する。次いで、単離されたフラグメントおよび脱リン酸したベクターを、Ｔ４　ＤＮＡリガーゼで連結する。次いで、Ｅ．ｃｏｌｉ　ＨＢ１０１細胞またはＸＬ−１　Ｂｌｕｅ細胞を形質転換し、そしてプラスミドｐＣ６に挿入されたフラグメントを含む細菌を、例えば、制限酵素分析を用いて同定する。
【０８１１】
活性なＤＨＦＲ遺伝子を欠損するチャイニーズハムスター卵巣細胞を、トランスフェクションに使用する。５μｇの発現プラスミドｐＣ６を、リポフェクチン（Ｆｅｌｇｎｅｒら、前出）を用いて、０．５μｇのプラスミドｐＳＶｎｅｏと同時トランスフェクトする。プラスミドｐＳＶ２−ｎｅｏは、優性で選択可能なマーカーであるところの、Ｇ４１８を含む抗生物質の群に対する耐性を付与する酵素をコードするＴｎ５由来のｎｅｏ遺伝子を含む。この細胞を、１ｍｇ／ｍｌのＧ４１８を補充したαマイナスＭＥＭに播種する。２日後、この細胞をトリプシン処理し、そして１０、２５、または５０ｎｇ／ｍｌのメトトレキサートおよび１ｍｇ／ｍｌのＧ４１８を補充したαマイナスＭＥＭ中のハイブリドーマクローニングプレート（Ｇｒｅｉｎｅｒ，Ｇｅｒｍａｎｙ）中に播種する。約１０〜１４日後、シングルクローンをトリプシン処理し、次いで異なる濃度のメトトレキサート（５０ｎＭ、１００ｎＭ、２００ｎＭ、４００ｎＭ、８００ｎＭ）を使用して、６ウェルのペトリ皿または１０ｍｌのフラスコに播種する。次いで、最高濃度のメトトレキサートで増殖するクローンを、さらに高い濃度のメトトレキサート（１μＭ、２μＭ、５μＭ、１０ｍＭ、２０ｍＭ）を含む新たな６ウェルプレートに移す。同じ手順を、１００〜２００μＭの濃度で増殖するクローンが得られるまで繰り返す。所望の遺伝子産物の発現を、例えば、ＳＤＳ−ＰＡＧＥおよびウエスタンブロットによって、または逆相ＨＰＬＣ分析によって分析する。
【０８１２】
（実施例９：タンパク質融合物）
本発明のポリぺプチドは、好ましくは、他のタンパク質に融合される。これらの融合タンパク質は、種々の適用に使用され得る。例えば、本発明のポリぺプチドの、Ｈｉｓタグ、ＨＡタグ、プロテインＡ、ＩｇＧドメイン、およびマルトース結合タンパク質への融合は、精製を容易にする（実施例５を参照のこと；ＥＰ　Ａ　３９４，８２７；Ｔｒａｕｎｅｃｋｅｒら、Ｎａｔｕｒｅ、３３１：８４−８６（１９８８）もまた参照のこと）。このポリペプチドはまた、異種ポリペプチド配列（例えば、ＫＤＥＬ）に融合されて分泌および細胞内輸送を促進し得る。さらに、ＩｇＧ−１、ＩｇＧ−３、およびアルブミンへの融合は、インビボでの半減期を増大させる。本発明のポリぺプチドに融合した核局在化シグナルは、タンパク質を特定の細胞内局在に標的化し得る。一方、共有結合ヘテロ二量体またはホモ二量体は、融合タンパク質の活性を増大または減少させ得る。融合タンパク質はまた、１つより多い機能を有するキメラ分子を作製し得る。最後に、融合タンパク質は、非融合タンパク質と比較して、融合タンパク質の溶解度および／または安定性を増大させ得る。上記の融合タンパク質の全ての型は、ＩｇＧ分子へのポリぺプチドの融合を概説する以下のプロトコル、または実施例５に記載されるプロトコルを改変することによって作製され得る。
【０８１３】
簡単には、ＩｇＧ分子のヒトＦｃ部分は、以下に記載の配列の５’末端および３’末端にわたるプライマーを使用してＰＣＲ増幅され得る。これらのプライマーはまた、発現ベクター（好ましくは、哺乳動物発現ベクター）へのクローニングを容易にする都合の良い制限酵素部位、および必要な場合、開始／停止コドンを有するべきである。
【０８１４】
例えば、ｐＣ４（受託番号２０９６４６）が使用される場合、ヒトＦｃ部分は、ＢａｍＨＩクローニング部位に連結され得る。３’ＢａｍＨＩ部位が破壊されるべきであることに注意のこと。次に、ヒトＦｃ部分を含有するベクターが、ＢａｍＨＩを用いて再び制限処理され、ベクターを直線化し、そして実施例１に記載されるＰＣＲプロトコルによって単離された本発明のポリヌクレオチドが、このＢａｍＨＩ部位に連結される。ポリヌクレオチドは、終止コドンなしにクローニングされ、そうでなければ、融合タンパク質は産生されないことに注意すること。
【０８１５】
天然に存在するシグナル配列が分泌タンパク質を産生するために使用される場合、ｐＣ４は、第２のシグナルペプチドを必要としない。あるいは、天然に存在するシグナル配列が使用されない場合、ベクターは、異種シグナル配列を含むように改変され得る（例えば、ＷＯ　９６／３４８９１を参照のこと）。
【０８１６】
（ヒトＩｇＧ　Ｆｃ領域）
ＧＧＧＡＴＣＣＧＧＡＧＣＣＣＡＡＡＴＣＴＴＣＴＧＡＣＡＡＡＡＣＴＣＡＣＡＣＡＴＧＣＣＣＡＣＣＧＴＧＣＣＣＡＧＣＡＣＣＴＧＡＡＴＴＣＧＡＧＧＧＴＧＣＡＣＣＧＴＣＡＧＴＣＴＴＣＣＴＣＴＴＣＣＣＣＣＣＡＡＡＡＣＣＣＡＡＧＧＡＣＡＣＣＣＴＣＡＴＧＡＴＣＴＣＣＣＧＧＡＣＴＣＣＴＧＡＧＧＴＣＡＣＡＴＧＣＧＴＧＧＴＧＧＴＧＧＡＣＧＴＡＡＧＣＣＡＣＧＡＡＧＡＣＣＣＴＧＡＧＧＴＣＡＡＧＴＴＣＡＡＣＴＧＧＴＡＣＧＴＧＧＡＣＧＧＣＧＴＧＧＡＧＧＴＧＣＡＴＡＡＴＧＣＣＡＡＧＡＣＡＡＡＧＣＣＧＣＧＧＧＡＧＧＡＧＣＡＧＴＡＣＡＡＣＡＧＣＡＣＧＴＡＣＣＧＴＧＴＧＧＴＣＡＧＣＧＴＣＣＴＣＡＣＣＧＴＣＣＴＧＣＡＣＣＡＧＧＡＣＴＧＧＣＴＧＡＡＴＧＧＣＡＡＧＧＡＧＴＡＣＡＡＧＴＧＣＡＡＧＧＴＣＴＣＣＡＡＣＡＡＡＧＣＣＣＴＣＣＣＡＡＣＣＣＣＣＡＴＣＧＡＧＡＡＡＡＣＣＡＴＣＴＣＣＡＡＡＧＣＣＡＡＡＧＧＧＣＡＧＣＣＣＣＧＡＧＡＡＣＣＡＣＡＧＧＴＧＴＡＣＡＣＣＣＴＧＣＣＣＣＣＡＴＣＣＣＧＧＧＡＴＧＡＧＣＴＧＡＣＣＡＡＧＡＡＣＣＡＧＧＴＣＡＧＣＣＴＧＡＣＣＴＧＣＣＴＧＧＴＣＡＡＡＧＧＣＴＴＣＴＡＴＣＣＡＡＧＣＧＡＣＡＴＣＧＣＣＧＴＧＧＡＧＴＧＧＧＡＧＡＧＣＡＡＴＧＧＧＣＡＧＣＣＧＧＡＧＡＡＣＡＡＣＴＡＣＡＡＧＡＣＣＡＣＧＣＣＴＣＣＣＧＴＧＣＴＧＧＡＣＴＣＣＧＡＣＧＧＣＴＣＣＴＴＣＴＴＣＣＴＣＴＡＣＡＧＣＡＡＧＣＴＣＡＣＣＧＴＧＧＡＣＡＡＧＡＧＣＡＧＧＴＧＧＣＡＧＣＡＧＧＧＧＡＡＣＧＴＣＴＴＣＴＣＡＴＧＣＴＣＣＧＴＧＡＴＧＣＡＴＧＡＧＧＣＴＣＴＧＣＡＣＡＡＣＣＡＣＴＡＣＡＣＧＣＡＧＡＡＧＡＧＣＣＴＣＴＣＣＣＴＧＴＣＴＣＣＧＧＧＴＡＡＡＴＧＡＧＴＧＣＧＡＣＧＧＣＣＧＣＧＡＣＴＣＴＡＧＡＧＧＡＴ（配列番号１）。
【０８１７】
（実施例１０：ポリペプチドの処方）
本発明はまた、被験体に有効量の治療剤を投与することにより疾患または障害（例えば、本明細書中に開示される疾患または障害の任意の１つ以上のような）を処置および／または予防する方法を提供する。治療剤により、薬学的に受容可能なキャリア型（例えば、滅菌キャリア）と組み合わせた、本発明のポリヌクレオチドまたはポリペプチド（フラグメントおよび改変体を含む）、それらのアゴニストまたはアンタゴニスト、および／またはそれらに対する抗体を意味する。
【０８１８】
ポリペプチド組成物は、個々の患者の臨床状態（特に、分泌ポリペプチド単独を用いた処置の副作用）、送達部位、投与の方法、投与の計画、ならびに開業医に公知の他の因子を考慮に入れて、良好な医療行為と一致した様式において、処方および投薬される。従って、本明細書中での目的のための「有効量」は、このような考慮によって、決定される。
【０８１９】
一般的な提案として、一用量あたりに非経口的に投与されるポリペプチドの薬学的に有効な総量は、患者の体重について約１μｇ／ｋｇ／日〜１０ｍｇ／ｋｇ／日の範囲であるが、上記で注意したように、これは治療上の裁量を受ける。より好ましくは、この用量は、少なくとも０．０１ｍｇ／ｋｇ／日であり、そしてヒトに関して最も好ましくは、ホルモンについて、約０．０１ｍｇ／ｋｇ／日と１ｍｇ／ｋｇ／日との間である。連続して投与される場合、ポリペプチドは、代表的に、１日あたり１〜４回の注射によるか、または、例えば、ミニポンプを使用する連続皮下注入のいずれかにより、約１μｇ／ｋｇ／時間〜約５０μｇ／ｋｇ／時間の投薬速度で投与される。静脈内バッグ溶液もまた、使用され得る。変化を観察するために必要である処置の長さ、および応答が生じるための処置後の間隔は、所望の効果に依存して変動するようである。
【０８２０】
本発明のポリペプチドを含む薬学的組成物は、経口的に、直腸に、非経口的に、槽内に（ｉｎｔｒａｃｉｓｔｅｍａｌｌｙ）、膣内に、腹腔内に、局所的に（粉末、軟膏、ゲル、ドロップまたは経皮性パッチによるように）、頬側に（ｂｕｃａｌｌｙ）、または経口スプレーもしくは鼻内スプレーとして投与される。「薬学的に受容可能なキャリア」とは、非毒性の固体、半固体または液状の、任意の型の充填剤、希釈剤、カプセル化材料または処方補助物をいう。本明細書中で使用される場合、用語「非経口的（な）」とは、静脈内、筋肉内、腹腔内、胸骨内（ｉｎｔｒａｓｔｅｒｎａｌ）、皮下および関節内の注射および注入を含む投与の様式をいう。
【０８２１】
ポリペプチドはまた、徐放性系によって適切に投与される。徐放性の組成物の適切な例としては、成形品の形態（例えば、フィルム、またはマイクロカプセル）の半透性のポリマーマトリクスが挙げられる。徐放性マトリクスとしては、ポリラクチド（米国特許第３，７７３，９１９号、ＥＰ　５８，４８１）、Ｌ−グルタミン酸とγ−エチル−Ｌ−グルタメートとの共重合体（Ｓｉｄｍａｎら、Ｂｉｏｐｏｌｙｍｅｒｓ、２２：５４７−５５６（１９８３））、ポリ（２−ヒドロキシエチルメタクリレート）（Ｌａｎｇｅｒら、Ｊ．Ｂｉｏｍｅｄ．Ｍａｔｅｒ．Ｒｅｓ．１５：１６７−２７７（１９８１）およびＬａｎｇｅｒ，Ｃｈｅｍ．Ｔｅｃｈ．、１２：９８−１０５（１９８２））、エチレンビニルアセテート（Ｒ．Ｌａｎｇｅｒら）またはポリ−Ｄ−（−）−３−ヒドロキシ酪酸（ＥＰ　１３３，９８８）が挙げられる。徐放性組成物はまた、リポソームに封入された（ｌｉｐｏｓｏｍａｌｌｙ　ｅｎｔｒａｐｐｅｄ）ポリペプチドが挙げられる。分泌ポリペプチドを含むリポソームは、それ自体、公知の方法により調製される：ＤＥ３，２１８，１２１；Ｅｐｓｔｅｉｎら、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ，８２：３６８８−３６９２（１９８５）；Ｈｗａｎｇら、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ，７７：４０３０−４０３４（１９８０）；ＥＰ　５２，３２２；ＥＰ　３６，６７６；ＥＰ　８８，０４６；ＥＰ　１４３，９４９；ＥＰ　１４２，６４１；日本国特許出願８３−１１８００８；米国特許第４，４８５，０４５号および同第４，５４４，５４５号；およびＥＰ　１０２，３２４。通常、リポソームは、脂質含有量が約３０ｍｏｌパーセントコレステロールより多い小さな（約２００〜８００Å）単層型であり、選択された割合は、最適な分泌ポリペプチド療法について調整される。
【０８２２】
非経口的な投与に関して、１つの実施形態において、ポリペプチドは、一般に、薬学的に受容可能なキャリア（すなわち、使用される投薬量および濃度でレシピエントに非毒性であり、そしてこの処方の他の成分と適合性であるもの）と共に単位投薬量注入可能形態（溶液、懸濁液または乳濁液）において、所望の程度の純度でそれを混合することによって処方される。例えば、処方物は、好ましくは、酸化剤およびポリペプチドに対して有害であることが公知である他の化合物を含まない。
【０８２３】
一般に、処方物は、ポリペプチドを、液体キャリアもしくは細かく粉砕した固体キャリアまたは両方と、均一およびじかに接触させることにより調製される。次いで、必要である場合、産物は、所望の処方物へと成形される。好ましくは、このキャリアは、非経口的なキャリアであり、より好ましくは、レシピエントの血液と等張である溶液である。このようなキャリアビヒクルの例としては、水、生理食塩水、リンガー溶液、およびデキストロース溶液が挙げられる。非水性ビヒクル（例えば、不揮発性油およびオレイン酸エチル）はまた、リポソームと同様に、本明細書中で有用である。
【０８２４】
キャリアは、微量の添加物（例えば、等張性および化学的安定性を増強する物質）を適宜含む。このような物質は、使用される投薬量および濃度において、レシピエントに非毒性であり、そして緩衝液（例えば、リン酸塩、クエン酸塩、コハク酸塩、酢酸、および他の有機酸またはそれらの塩類）；抗酸化剤（例えば、アスコルビン酸）；低分子量（約１０残基よりも小さい）のポリペプチド（例えば、ポリアルギニンまたはトリペプチド）；タンパク質（例えば、血清アルブミン、ゼラチン、または免疫グロブリン）；親水性ポリマー（例えば、ポリビニルピロリドン）；アミノ酸（例えば、グリシン、グルタミン酸、アスパラギン酸、またはアルギニン）；単糖、二糖、および他の糖質（セルロースもしくはその誘導体、グルコース、マンノース、またはデキストリンを含む）；キレート剤（例えば、ＥＤＴＡ）；糖アルコール（例えば、マンニトールまたはソルビトール）；対イオン（例えば、ナトリウム）；ならびに／あるいは非イオン性界面活性剤（例えば、ポリソルベート、ポロキサマー（ｐｏｌｏｘａｍｅｒｓ）、またはＰＥＧ）を含む。
【０８２５】
ポリペプチドは、このようなビヒクル中で、代表的に、約３〜８のｐＨで、約０．１ｍｇ／ｍｌ〜１００ｍｇ／ｍｌの濃度、好ましくは１〜１０ｍｇ／ｍｌの濃度で処方される。上記の賦形剤、キャリア、または安定剤の特定のものの使用は、ポリペプチド塩の形成をもたらすことが理解される。
【０８２６】
治療的な投与のために使用される任意のポリペプチドは、無菌であり得る。無菌性は、滅菌濾過膜（例えば、０．２ミクロン膜）による濾過により容易に達成される。治療ポリペプチド組成物は、一般に、無菌アクセスポートを有する容器（例えば、皮下注射針によって貫通可能なストッパーを有する点滴溶液バッグまたはバイアル）に配置される。
【０８２７】
ポリペプチドは、通常、単位用量容器または多用量容器（例えば、密封アンプルまたは密封バイアル）中に水溶液としてか、または再構成のための凍結乾燥した処方物として保存される。凍結乾燥した処方物の例として、１０ｍｌバイアルを、５ｍｌの滅菌濾過した１％（ｗ／ｖ）ポリペプチド水溶液で満たし、そして得られる混合物を凍結乾燥する。その注入溶液は、静菌注射用水を使用して、凍結乾燥したポリペプチドを再構成することにより調製される。
【０８２８】
本発明はまた、本発明の薬学的組成物の１つ以上の成分で満たされた１つ以上の容器を含む薬学的パックまたはキットを提供する。薬品または生物学的製品の製造、使用または販売を規制している政府機関により規定される形式における通告は、このような容器に伴い得る。この通告は、ヒトの投与のための製造、使用または販売の、この機関による認可を反映する。さらに、本発明のポリペプチドは、他の治療的化合物とともに使用され得る。
【０８２９】
本発明の治療剤は、単独で、またはアジュバントと組み合わせて投与され得る。本発明の治療剤とともに投与され得るアジュバントとしては、以下が挙げられるが、それらに限定されない：ミョウバン、ミョウバン＋デオキシコレート（ＩｍｍｕｎｏＡｇ）、ＭＴＰ−ＰＥ（Ｂｉｏｃｉｎｅ　Ｃｏｒｐ．）、ＱＳ２１（Ｇｅｎｅｎｔｅｃｈ，Ｉｎｃ．）、ＢＣＧ（例えば、ＴＨＥＲＡＣＹＳ（登録商標））、ＭＰＬおよびＣｏｒｙｎｅｂａｃｔｅｒｉｕｍ　ｐａｒｖｕｍの非生存調製物。特定の実施形態において、本発明の治療剤は、ミョウバンと組み合わせて投与される。別の特定の実施形態において、本発明の治療剤は、ＱＳ−２１と組み合わせて投与される。本発明の治療剤とともに投与され得るさらなるアジュバントとしては、以下が挙げられるが、これらに限定されない：モノホスホリル脂質免疫調節剤、ＡｄｊｕＶａｘ　１００ａ、ＱＳ−２１、ＱＳ−１８、ＣＲＬ１００５、アルミニウム塩、ＭＦ−５９、およびＶｉｒｏｓｏｍａｌアジュバント技術。本発明の治療剤とともに投与され得るワクチンとしては、以下が挙げられるが、これらに限定されない：ＭＭＲ（麻疹、流行性耳下腺炎、風疹）、ポリオ（ｐｏｌｉｏ）、水痘、破傷風／ジフテリア、Ａ型肝炎、Ｂ型肝炎、Ｂ型インフルエンザ、百日咳（ｗｈｏｏｐｉｎｇ　ｃｏｕｇｈ）、肺炎、インフルエンザ、ライム病、ロタウイルス、コレラ、黄熱病、日本脳炎、ポリオ（ｐｏｌｉｏｍｙｅｌｉｔｉｓ）、狂犬病、腸チフス、および百日咳（ｐｅｒｔｕｓｓｉｓ）に対する防御に関するワクチン。組み合わせは、例えば、混合物として同時に、別々であるが同時にもしくは並行して；または逐次的にかのいずれかで投与され得る。これは、組み合わされた薬剤が治療混合物としてともに投与される提示を含み、そして組み合わせた薬剤が、別々であるが同時に（例えば、同じ個体へ別々の静脈ラインを通じてのように）投与される手順もまた含む。「組み合わせ」投与は、第１に、続いて第２に与えられる化合物または薬剤のうちの１つを別々に投与することをさらに含む。
【０８３０】
本発明の治療剤は、単独で、または他の治療的薬剤と組み合わせて投与され得る。本発明の治療剤と組み合わせて投与され得る治療的薬剤としては、以下が挙げられるが、それらに限定されない：化学療法剤、抗生物質、ステロイド性および非ステロイド性の抗炎症剤、従来の免疫療法剤、および／または以下に記載される治療的処置。組み合わせは、例えば、混合物として同時に、別々であるが同時にもしくは並行して；または逐次的にかのいずれかで投与され得る。これは、組み合わされた薬剤が、治療混合物としてともに投与される提示を含み、そして組み合わせた薬剤が、別々であるが同時に（例えば、同じ個体へ別々の静脈ラインを通じてのように）投与される手順もまた含む。「組み合わせ」投与は、第１に、続いて第２に与えられる化合物または薬剤のうちの１つを別々に投与することをさらに含む。
【０８３１】
１つの実施形態において、本発明の治療剤は、抗凝血剤と組み合わせて投与される。本発明の組成物と共に投与され得る抗凝血剤としては以下が挙げられるがこれらに限定されない：ヘパリン、低分子量ヘパリン、ワルファリンナトリウム（例えば、ＣＯＵＭＡＤＩＮ（登録商標））、ジクマロール、４−ヒドロキシクマリン、アニシンジオン（例えば、ＭＩＲＡＤＯＮＴＭ）、アセノクマロール（例えば、ニクマロン、ＳＩＮＴＨＲＯＭＥＴＭ）、インダン−１，３−ジオン、フェンプロクーモン（例えば、ＭＡＲＣＵＭＡＲＴＭ）、エチルビスクマセテート（ｅｔｈｙｌ　ｂｉｓｃｏｕｍａｃｅｔａｔｅ）（例えば、ＴＲＯＭＥＸＡＮＴＭ）、およびアスピリン。特定の実施形態において、本発明の組成物は、ヘパリンおよび／またはワルファリンと組み合わせて投与される。別の特定の実施形態において、本発明の組成物は、ワルファリンと組み合わせて投与される。別の特定の実施形態において、本発明の組成物は、ワルファリンおよびアスピリンと組み合わせて投与される。別の特定の実施形態において、本発明の組成物は、ヘパリンと組み合わせて投与される。別の特定の実施形態において、本発明の組成物は、ヘパリンおよびアスピリンと組み合わせて投与される。
【０８３２】
別の実施形態において、本発明の治療剤は、血栓崩壊薬物と組み合わせて投与される。本発明の組成物と共に投与され得る血栓崩壊薬物としては以下が挙げられるがこれらに限定されない：プラスミノゲン、ｌｙｓ−プラスミノゲン（ｌｙｓ−ｐｌａｓｍｉｎｏｇｅｎ）、α２−アンチプラスミン、ストレプトキナーゼ（ｓｔｒｅｐｔｏｋｉｎａｅ）（例えば、ＫＡＢＩＫＩＮＡＳＥＴＭ）、抗レスプレイス（ａｎｔｉｒｅｓｐｌａｃｅ）（例えば、ＥＭＩＮＡＳＥＴＭ）、組織プラスミノゲンアクチベーター（ｔ−ＰＡ、アルテベイス（ａｌｔｅｖａｓｅ）、ＡＣＴＩＶＡＳＥＴＭ）、ウロキナーゼ（例えば、ＡＢＢＯＫＩＮＡＳＥＴＭ）、サウルプレイス（ｓａｕｒｕｐｌａｓｅ）（プロウロキナーゼ、単鎖ウロキナーゼ）およびアミノカプロン酸（例えば、ＡＭＩＣＡＲＴＭ）。特定の実施形態において、本発明の組成物は、組織プレスミノゲンアクチベーターおよびアスピリンと組み合わせて投与される。
【０８３３】
別の実施形態において、本発明の治療剤は、抗血小板薬物と組み合わせて投与される。本発明の組成物と共に投与され得る抗血小板薬物としては以下が挙げられるがこれらに限定されない：アスピリン、ジピリダモール（例えば、ＰＥＲＳＡＮＴＩＮＥＴＭ）、およびチクロピジン（例えば、ＴＩＣＬＩＤＴＭ）。
【０８３４】
特定の実施形態において、本発明の治療剤と組み合わせた抗凝血薬物、血栓崩壊薬物および／または抗血小板薬物の使用は、血栓症、動脈血栓症、静脈血栓症、血栓塞栓症、肺塞栓症、アテローム性動脈硬化症、心筋梗塞、一過性脳虚血発作、不安定狭心症の予防、診断および／または処置のために意図される。特定の実施形態において、本発明の治療剤と組み合わせた抗凝血剤、血栓崩壊薬物および／または抗血小板薬物の使用は、伏在性の移植片の閉塞の予防のために、血管形成手順に伴い得るような手術周辺の血栓症の危険を軽減するために、非リウマチ性心房細動を含む心房細動を有する患者における発作の危険を軽減するために、人工心臓弁および／または僧帽弁疾患に関連する塞栓症の危険を軽減するために意図される。単独または抗血小板薬物、抗凝固薬物および／または血栓崩壊薬物と組み合わせにおける本発明の治療剤の他の使用としては、体外装置（例えば、脈管内カニューレ、血液透析の患者における脈管アクセスシャント、血液透析機、および心肺バイパス機）における閉塞の予防が挙げられるが、それらに限定されない。
【０８３５】
特定の実施形態において、本発明の治療剤は、抗レトロウイルス薬剤、ヌクレオシド／ヌクレオチド逆転写酵素インヒビター（ＮＲＴＩ）、非ヌクレオシド逆転写酵素インヒビター（ＮＮＲＴＩ）、および／またはプロテアーゼインヒビター（ＰＩ）と組み合わせて投与される。本発明の治療剤と組み合わせて投与され得るＮＲＴＩとしては、以下が挙げられるが、これらに限定されない：ＲＥＴＲＯＶＩＲＴＭ（ジドブジン／ＡＺＴ）、ＶＩＤＥＸＴＭ（ジダノシン／ｄｄＩ）、ＨＩＶＩＤＴＭ（ザルシタビン／ｄｄＣ）、ＺＥＲＩＴＴＭ（スタブジン／ｄ４Ｔ）、ＥＰＩＶＩＲＴＭ（ラミブジン／３ＴＣ）、およびＣＯＭＢＩＶＩＲＴＭ（ジドブジン／ラミブジン）。本発明の治療剤と組み合わせて投与され得るＮＮＲＴＩとしては、以下が挙げられるが、これらに限定されない：ＶＩＲＡＭＵＮＥＴＭ（ネビラピン）、ＲＥＳＣＲＩＰＴＯＲＴＭ（デラビルジン）、およびＳＵＳＴＩＶＡＴＭ（エファビレンズ）。本発明の治療剤と組み合わせて投与され得るプロテアーゼインヒビターとしては、以下が挙げられるが、これらに限定されない：ＣＲＩＸＩＶＡＮＴＭ（インディナビル（ｉｎｄｉｎａｖｉｒ））、ＮＯＲＶＩＲＴＭ（リトナビル（ｒｉｔｏｎａｖｉｒ））、ＩＮＶＩＲＡＳＥＴＭ（サキナビル（ｓａｑｕｉｎａｖｉｒ））、およびＶＩＲＡＣＥＰＴＴＭ（ネルフィナビル（ｎｅｌｆｉｎａｖｉｒ））。特定の実施形態において、抗レトロウイルス薬剤、ヌクレオシド逆転写酵素インヒビター、非ヌクレオシド逆転写酵素インヒビター、および／またはプロテアーゼインヒビターは、ＡＩＤＳを処置するため、および／またはＨＩＶ感染を予防もしくは処置するために、本発明の治療剤との任意の組み合わせで使用され得る。
【０８３６】
さらなるＮＲＴＩとしては、以下が挙げられる：ＬＯＤＥＮＯＳＩＮＥＴＭ（Ｆ−ｄｄＡ；酸安定性アデノシンＮＲＴＩ；Ｔｒｉａｎｇｌｅ／Ａｂｂｏｔｔ；ＣＯＶＩＲＡＣＩＬＴＭ（エムトリシタビン（ｅｍｔｒｉｃｉｔａｂｉｎｅ）／ＦＴＣ；ラミブジン（ｌａｍｉｖｕｄｉｎｅ）（３ＴＣ）と構造的に関連するが、インビトロにおいて３〜１０倍強い活性を有する；Ｔｒｉａｎｇｌｅ／Ａｂｂｏｔｔ）；ｄＯＴＣ（ＢＣＨ−１０６５２，同様に、ラミブジンと構造的に関連するが、ラミブジン耐性単離株のかなりの部分に対する活性を有する；Ｂｉｏｃｈｅｍ　Ｐｈａｒｍａ）；Ａｄｅｆｏｖｉｒ（ＦＤＡによって、抗ＨＩＶ治療についての認可を拒絶された；Ｇｉｌｅａｄ　Ｓｃｉｅｎｃｅｓ）；ＰＲＥＶＥＯＮ（登録商標）（Ａｄｅｆｏｖｉｒ　Ｄｉｐｉｖｏｘｉｌ，アデノフォビル（ａｄｅｆｏｖｉｒ）の活性なプロドラッグ；その活性形態はＰＭＥＡ−ｐｐである）；ＴＥＮＯＦＯＶＩＲＴＭ（ビス−ＰＯＣ　ＰＭＰＡ、ＰＭＰＡプロドラッグ；Ｇｉｌｅａｄ）；ＤＡＰＤ／ＤＸＧ（ＤＡＰＤの活性な代謝産物；Ｔｒｉａｎｇｌｅ／Ａｂｂｏｔｔ）；Ｄ−Ｄ４ＦＣ（３ＴＣと関連，ＡＺＴ／３ＴＣ−耐性ウイルスに対する活性を有する）；ＧＷ４２０８６７Ｘ（Ｇｌａｘｏ　Ｗｅｌｌｃｏｍｅ）；ＺＩＡＧＥＮＴＭ（アバカビル（ａｂａｃａｖｉｒ）／１５９Ｕ８９；Ｇｌａｘｏ　Ｗｅｌｌｃｏｍｅ　Ｉｎｃ．）；ＣＳ−８７（３’アジド−２’，３’−ジデオキシウリジン；ＷＯ　９９／６６９３６）；ならびに、β−Ｌ−ＦＤ４Ｃおよびβ−Ｌ−ＦｄｄＣのＳ−アシル−２−チオエチル（ＳＡＴＥ）−保有プロドラッグ形態（ＷＯ　９８／１７２８１）。
【０８３７】
さらなるＮＮＲＴＩとしては、以下が挙げられる：ＣＯＡＣＴＩＮＯＮＴＭ（Ｅｍｉｖｉｒｉｎｅ／ＭＫＣ−４４２、ＨＥＰＴクラスの強力なＮＮＲＴＩ；Ｔｒｉａｎｇｌｅ／Ａｂｂｏｔｔ）；ＣＡＰＲＡＶＩＲＩＮＥＴＭ（ＡＧ−１５４９／Ｓ−１１５３，Ｋ１０３Ｎ変異を含むウイルスに対して活性を有する、次世代のＮＮＲＴＩ；Ａｇｏｕｒｏｎ）；ＰＮＵ−１４２７２１（その前駆体デラビルジン（ｄｅｌａｖｉｒｄｉｎｅ）よりも２０〜５０倍高い活性を有し、そしてＫ１０３Ｎ変異体に対して活性である；Ｐｈａｒｍａｃｉａ　＆　Ｕｐｊｏｈｎ）；ＤＰＣ−９６１およびＤＰＣ−９６３（エファビレンツ（ｅｆａｖｉｒｅｎｚ）の第二世代誘導体，Ｋ１０３Ｎ変異を有するウイルスに対して活性であるように設計された；ＤｕＰｏｎｔ）；ＧＷ−４２０８６７Ｘ（ＨＢＹ０９７よりも２５倍高い活性を有し、そしてＫ１０３Ｎ変異体に対して活性である；Ｇｌａｘｏ　Ｗｅｌｌｃｏｍｅ）；ＣＡＬＡＮＯＬＩＤＥ　Ａ（ラテックス樹木由来の天然に存在する因子；Ｙ１８１Ｃ変異およびＫ１０３Ｎ変異のいずれかまたは両方を含むウイルスに対して活性）；ならびに、Ｐｒｏｐｏｌｉｓ（ＷＯ　９９／４９８３０）。
【０８３８】
さらなるプロテアーゼインヒビターとしては以下が挙げられる：ＬＯＰＩＮＡＶＩＲＴＭ（ＡＢＴ３７８／ｒ；Ａｂｂｏｔｔ　Ｌａｂｏｒａｔｏｒｉｅｓ）；ＢＭＳ−２３２６３２（アザペプチド；Ｂｒｉｓｔｏｌ−Ｍｙｒｅｓ　Ｓｑｕｉｂｂ）；ＴＩＰＲＡＮＡＶＩＲＴＭ（ＰＮＵ−１４０６９０，非ペプチド性（ｎｏｎ−ｐｅｐｔｉｃ）ジヒドロピロン；Ｐｈａｒｍａｃｉａ　＆　Ｕｐｊｏｈｎ）；ＰＤ−１７８３９０（非ペプチド性ジヒドロピロン；Ｐａｒｋｅ−Ｄａｖｉｓ）；ＢＭＳ　２３２６３２（アザペプチド；Ｂｒｉｓｔｏｌ−Ｍｙｅｒｓ　Ｓｑｕｉｂｂ）；Ｌ−７５６，４２３（インディナビル（ｉｎｄｉｎａｖｉｒ）のアナログ；Ｍｅｒｃｋ）；ＤＭＰ−４５０（環状尿素化合物；Ａｖｉｄ　＆　ＤｕＰｏｎｔ）；ＡＧ−１７７６（プロテアーゼインヒビター耐性ウイルスに対してインビトロで活性を有するペプチド模倣物；Ａｇｏｕｒｏｎ）；ＶＸ−１７５／ＧＷ−４３３９０８（アンプレナビル（ａｍｐｒｅｎａｖｉｒ）のホスフェートプロドラッグ；Ｖｅｒｔｅｘ　＆　Ｇｌａｘｏ　Ｗｅｌｃｏｍｅ）；ＣＧＰ６１７５５（Ｃｉｂａ）；およびＡＧＥＮＥＲＡＳＥＴＭ（アンプレナビル（ａｍｐｒｅｎａｖｉｒ）；Ｇｌａｘｏ　Ｗｅｌｌｃｏｍｅ　Ｉｎｃ．）。
【０８３９】
さらなる抗レトロウイルス薬剤としては、融合インヒビター／ｇｐ４１結合剤が挙げられる。融合インヒビター／ｇｐ４１結合剤としては、Ｔ−２０（その休止状態においてｇｐ４１に結合し、そしてフソジェニック（ｆｕｓｏｇｅｎｉｃ）状態への変換を妨げる、ＨＩＶ　ｇｐ４１膜貫通タンパク質の外部ドメインの残基６４３〜６７８由来のペプチド；Ｔｒｉｍｅｒｉｓ）およびＴ−１２４９（第二世代の融合インヒビター；Ｔｒｉｍｅｒｉｓ）が挙げられる。
【０８４０】
さらなる抗レトロウイルス薬剤としては、融合インヒビター／ケモカインレセプターアンタゴニストが挙げられる。融合インヒビター／ケモカインレセプターアンタゴニストとしては、以下が挙げられる：ＣＸＣＲ４アンタゴニスト（例えば、ＡＭＤ　３１００（バイサイクラム（ｂｉｃｙｃｌａｍ））、ＳＤＦ−１およびそのアナログ、ならびにＡＬＸ４０−４Ｃ（カチオン性ペプチド）、Ｔ２２（１８アミノ酸のペプチド；Ｔｒｉｍｅｒｉｓ）ならびにＴ２２アナログであるＴ１３４およびＴ１４０）；ＣＣＲ５アンタゴニスト（例えば、ＲＡＮＴＥＳ（９−６８）、ＡＯＰ−ＲＡＮＴＥＳ、ＮＮＹ−ＲＡＮＴＥＳ、およびＴＡＫ−７７９）；ならびにＣＣＲ５／ＣＸＣＲ４アンタゴニスト（例えば、ＮＳＣ　６５１０１６（ジスタマイシンアナログ））。ＣＣＲ２Ｂ、ＣＣＲ３、およびＣＣＲ６アンタゴニストもまた含まれる。ケモカインレセプターアゴニスト（例えば、ＲＡＮＴＥＳ，ＳＤＦ−１，ＭＩＰ−１α，ＭＩＰ−１βなど）もまた融合を阻害し得る。
【０８４１】
さらなる抗レトロウイルス薬剤は、インテグラーゼインヒビターを含む。インテグラーゼインヒビターとしては、以下が挙げられる：ジカフェオイルキナ（ＤＦＱＡ）酸（ｄｉｃａｆｆｅｏｙｌｑｕｉｎｉｃ（ＤＦＱＡ）ａｃｉｄｓ）；Ｌ−チコリ酸（Ｌ−ｃｈｉｃｏｒｉｃ　ａｃｉｄ）（ジカフェオイル酒石（ＤＣＴＡ）酸）；キナリザリン（ｑｕｉｎａｌｉｚａｒｉｎ）（ＱＬＣ）および関連のアントラキノン；ＺＩＮＴＥＶＩＲＴＭ（ＡＲ１７７、真のインテグラーゼインヒビターではなく、細胞表面で恐らく作用するオリゴヌクレオチド；Ａｒｏｎｄｅｘ）；ならびにＷＯ　９８／５０３４７に開示されるナフトールのようなナフトール。
【０８４２】
さらなる抗レトロウイルス薬剤としては、以下が挙げられる：ヒドロキシ尿素様化合物（例えば、ＢＣＸ−３４（プリンヌクレオシドホスホリラーゼインヒビター；Ｂｉｏｃｒｙｓｔ））；リボヌクレオチドレダクターゼインヒビター（例えば、ＤＩＤＯＸＴＭ（Ｍｏｌｅｃｕｌｅｓ　ｆｏｒ　Ｈｅａｌｔｈ））；イノシンモノホスフェートデヒドロゲナーゼ（ＩＭＰＤＨ）インヒビター（例えば、ＶＸ−４９７（Ｖｅｒｔｅｘ））；ならびにマイコフォリック酸（ｍｙｃｏｐｈｏｌｉｃ　ａｃｉｄ）（例えば、ＣｅｌｌＣｅｐｔ（マイコフェノラートモフェチル（ｍｙｃｏｐｈｅｎｏｌａｔｅ　ｍｏｆｅｔｉｌ）；Ｒｏｃｈｅ）。
【０８４３】
さらなる抗レトロウイルス薬剤としては、以下が挙げられる：ウイルスインテグラーゼのインヒビター、ウイルスゲノム核転座のインヒビター（例えば、アリーレンビス（メチルケトン）化合物）；ＨＩＶ侵入のインヒビター（例えば、ＡＯＰ−ＲＡＮＴＥＳ、ＮＮＹ−ＲＡＮＴＥＳ、ＲＡＮＴＥＳ−ＩｇＧ融合タンパク質、ＲＡＮＴＥＳとグリコサミノグリカン（ＧＡＧ）との可溶性複合体、およびＡＭＤ−３１００）；ヌクレオカプシドジンクフィンガーインヒビター（例えば、ジチアン（ｄｉｔｈｉａｎｅ）化合物）；ＨＩＶ　ＴａｔおよびＲｅｖの標的；ならびに薬剤エンハンサー（ｐｈａｒｍａｃｏｅｎｈａｎｃｅｒ）（例えば、ＡＢＴ−３７８）。
【０８４４】
他の抗レトロウイルス治療剤および補助治療剤としては、以下が挙げられる：サイトカインおよびリンホカイン（例えば、ＭＩＰ−１α、ＭＩＰ−１β、ＳＤＦ−１α、ＩＬ−２、ＰＲＯＬＥＵＫＩＮＴＭ（アルデスロイキン（ａｌｄｅｓｌｅｕｋｉｎ）／Ｌ２−７００１；Ｃｈｉｒｏｎ）、ＩＬ−４、ＩＬ−１０、ＩＬ−１２、およびＩＬ−１３）；インターフェロン（例えば、ＩＦＮ−α２ａ）；ＴＮＦｓ、ＮＦκＢ、ＧＭ−ＣＳＦ、Ｍ−ＣＳＦ、およびＩＬ−１０のアンタゴニスト；免疫活性化を調節する薬剤（例えば、シクロスポリンおよびプレドニゾン）；ワクチン、例えば、ＲｅｍｕｎｅＴＭ（ＨＩＶ免疫原），ＡＰＬ　４００−００３（Ａｐｏｌｌｏｎ）、組換えｇｐ１２０およびフラグメント、二価（Ｂ／Ｅ）組換えエンベロープ糖タンパク質、ｒｇｐ１２０ＣＭ２３５、ＭＮ　ｒｇｐ１２０、ＳＦ−２　ｒｇｐ１２０、ｇｐ１２０／可溶性ＣＤ４複合体、Ｄｅｌｔａ　ＪＲ−ＦＬタンパク質、不連続ｇｐ１２０　Ｃ３／Ｃ４ドメイン由来の分枝合成ペプチド、融合能を有する免疫原、ならびにＧａｇ、Ｐｏｌ、Ｎｅｆ、およびＴａｔワクチン；遺伝子に基づく治療、例えば、遺伝的抑制エレメント（ＧＳＥ；ＷＯ　９８／５４３６６）、およびイントラカイン（ｉｎｔｒａｋｉｎｅ）（遺伝子改変されたＣＣケモカイン（ＥＲへと標的化されて、新たに合成されたＣＣＲ５の表面発現をブロックする（Ｙａｎｇら，ＰＮＡＳ　９４：１１５６７−７２（１９９７）；Ｃｈｅｎら，Ｎａｔ．Ｍｅｄ．３：１１１０−１６（１９９７））））；抗体、例えば、抗ＣＸＣＲ４抗体１２Ｇ５、抗ＣＣＲ５抗体２Ｄ７、５Ｃ７、ＰＡ８、ＰＡ９、ＰＡ１０、ＰＡ１１、ＰＡ１２、およびＰＡ１４、抗ＣＤ４抗体Ｑ４１２０およびＲＰＡ−Ｔ４、抗ＣＣＲ３抗体７Ｂ１１、抗ｇｐ１２０抗体１７ｂ、４８ｄ、４４７−５２Ｄ、２５７−Ｄ、２６８−Ｄおよび５０．１、抗Ｔａｔ抗体、抗ＴＮＦ−α抗体、およびモノクローナル抗体３３Ａ；アリール炭化水素（ＡＨ）レセプターアゴニストおよびアンタゴニスト（例えば、ＴＣＤＤ），３，３’，４，４’，５−ペンタクロロビフェニル、３，３’，４，４’−テトラクロロビフェニル、およびα−ナフトフラボン（ＷＯ　９８／３０２１３）；ならびに、抗酸化剤、例えば、γ−Ｌ−グルタミル−Ｌ−システインエチルエステル（γ−ＧＣＥ；ＷＯ　９９／５６７６４）。
【０８４５】
さらなる実施形態では、本発明の治療剤は、抗ウイルス薬剤と組み合わせて投与される。本発明の治療剤と共に投与され得る抗ウイルス薬剤としては、アシクロビル、リバビリン、アマンタジン、およびレマンチジン（ｒｅｍａｎｔｉｄｉｎｅ）が挙げられるが、これらに限定されない。
【０８４６】
他の実施形態では、本発明の治療剤は、抗日和見感染症薬剤と組み合わせて投与され得る。本発明の治療剤と組み合わせて投与され得る抗日和見感染症薬剤としては、以下が挙げられるが、これらに限定されない：ＴＲＩＭＥＴＨＯＰＲＩＭ−ＳＵＬＦＡＭＥＴＨＯＸＡＺＯＬＥＴＭ，ＤＡＰＳＯＮＥＴＭ，ＰＥＮＴＡＭＩＤＩＮＥＴＭ，ＡＴＯＶＡＱＵＯＮＥＴＭ，ＩＳＯＮＩＡＺＩＤＴＭ，ＲＩＦＡＭＰＩＮＴＭ，ＰＹＲＡＺＩＮＡＭＩＤＥＴＭ，ＥＴＨＡＭＢＵＴＯＬＴＭ，ＲＩＦＡＢＵＴＩＮＴＭ，ＣＬＡＲＩＴＨＲＯＭＹＣＩＮＴＭ，ＡＺＩＴＨＲＯＭＹＣＩＮＴＭ，ＧＡＮＣＩＣＬＯＶＩＲＴＭ，ＦＯＳＣＡＲＮＥＴＴＭ，ＣＩＤＯＦＯＶＩＲＴＭ，ＦＬＵＣＯＮＡＺＯＬＥＴＭ，ＩＴＲＡＣＯＮＡＺＯＬＥＴＭ，ＫＥＴＯＣＯＮＡＺＯＬＥＴＭ，ＡＣＹＣＬＯＶＩＲＴＭ，ＦＡＭＣＩＣＯＬＶＩＲＴＭ，ＰＹＲＩＭＥＴＨＡＭＩＮＥＴＭ，ＬＥＵＣＯＶＯＲＩＮＴＭ，ＮＥＵＰＯＧＥＮＴＭ（フィルグラスチム（ｆｉｌｇｒａｓｔｉｍ）／Ｇ−ＣＳＦ），およびＬＥＵＫＩＮＥＴＭ（サルグラモスチン（ｓａｒｇｒａｍｏｓｔｉｍ）／ＧＭ−ＣＳＦ））。特定の実施形態において、本発明の治療剤は、日和見Ｐｎｅｕｍｏｃｙｓｔｉｓ　ｃａｒｉｎｉｉ肺炎感染を予防的に処置または予防するために、ＴＲＩＭＥＴＨＯＰＲＩＭ−ＳＵＬＦＡＭＥＴＨＯＸＡＺＯＬＥＴＭ、ＤＡＰＳＯＮＥＴＭ、ＰＥＮＴＡＭＩＤＩＮＥＴＭ、および／またはＡＴＯＶＡＱＵＯＮＥＴＭとの任意の組み合わせで使用される。別の特定の実施形態において、本発明の治療剤は、日和見Ｍｙｃｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ　ａｖｉｕｍ複合感染を予防的に処置または予防するために、ＩＳＯＮＩＡＺＩＤＴＭ、ＲＩＦＡＭＰＩＮＴＭ、ＰＹＲＡＺＩＮＡＭＩＤＥＴＭ、および／またはＥＴＨＡＭＢＵＴＯＬＴＭとの任意の組み合わせで使用される。別の特定の実施形態において、本発明の治療剤は、日和見Ｍｙｃｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ　ｔｕｂｅｒｃｕｌｏｓｉｓ感染を予防的に処置または予防するために、ＲＩＦＡＢＵＴＩＮＴＭ、ＣＬＡＲＩＴＨＲＯＭＹＣＩＮＴＭ、および／またはＡＺＩＴＨＲＯＭＹＣＩＮＴＭとの任意の組み合わせで使用される。別の特定の実施形態において、本発明の治療剤は、日和見サイトメガロウイルス感染を予防的に処置または予防するために、ＧＡＮＣＩＣＬＯＶＩＲＴＭ、ＦＯＳＣＡＲＮＥＴＴＭ、および／またはＣＩＤＯＦＯＶＩＲＴＭとの任意の組み合わせで使用される。別の特定の実施形態において、本発明の治療剤は、日和見真菌感染を予防的に処置または予防するために、ＦＬＵＣＯＮＡＺＯＬＥＴＭ、ＩＴＲＡＣＯＮＡＺＯＬＥＴＭ、および／またはＫＥＴＯＣＯＮＡＺＯＬＥＴＭとの任意の組み合わせで使用される。別の特定の実施形態において、本発明の治療剤は、日和見単純ヘルペスウイルスＩ型および／またはＩＩ型感染を予防的に処置または予防するために、ＡＣＹＣＬＯＶＩＲＴＭおよび／またはＦＡＭＣＩＣＯＬＶＩＲＴＭとの任意の組み合わせで使用される。別の特定の実施形態において、本発明の治療剤は、日和見Ｔｏｘｏｐｌａｓｍａ　ｇｏｎｄｉｉ感染を予防的に処置または予防するために、ＰＹＲＩＭＥＴＨＡＭＩＮＥＴＭおよび／またはＬＥＵＣＯＶＯＲＩＮＴＭとの任意の組み合わせで使用される。別の特定の実施形態において、本発明の治療剤は、日和見細菌感染を予防的に処置または予防するために、ＬＥＵＣＯＶＯＲＩＮＴＭおよび／またはＮＥＵＰＯＧＥＮＴＭとの任意の組み合わせで使用される。
【０８４７】
さらなる実施形態において、本発明の治療剤は、抗生物質薬剤と組合わせて投与される。本発明の治療剤とともに投与され得る抗生物質薬剤としては、アモキシシリン、β−ラクタマーゼ、アミノ配糖体、β−ラクタム（糖ペプチド）、β−ラクタマーゼ、クリンダマイシン、クロラムフェニコール、セファロスポリン、シプロフロキサシン、エリスロマイシン、フルオロキノロン類、マクロライド、メトロニダゾル、ペニシリン、キノロン類、ラパマイシン、リファンピン、ストレプトマイシン、スルホンアミド、テトラサイクリン、トリメトプリム、トリメトプリム−スルファメトキサゾール、およびバンコマイシンが挙げられるが、これらに限定されない。
【０８４８】
他の実施形態において、本発明の治療剤は、免疫刺激物質と組み合わせて投与される。本発明の治療剤と組み合わせて投与され得る免疫刺激物質としては、レバミゾール（例えば、ＥＲＧＡＭＩＳＯＬＴＭ）、イソプリノシン（例えば、ＩＮＯＳＩＰＬＥＸＴＭ）、インターフェロン（例えば、インターフェロンα）、およびインターロイキン（例えば、ＩＬ−２）が挙げられるが、これらに限定されない。
【０８４９】
他の実施形態では、本発明の治療剤は、免疫抑制剤と組み合わせて投与される。本発明の治療剤と組合わせて投与され得る免疫抑制剤としては、ステロイド類、シクロスポリン、シクロスポリンアナログ、シクロホスファミドメチルプレドニゾン、プレドニゾン、アザチオプリン、ＦＫ−５０６、１５−デオキシスペルグアリン（１５−ｄｅｏｘｙｓｐｅｒｇｕａｌｉｎ）、および応答Ｔ細胞の機能を抑制することによって作用する他の免疫抑制剤が挙げられるが、これらに限定されない。本発明の治療剤と組み合わせて投与され得る他の免疫抑制剤としては、以下が挙げられるが、これらに限定されない：プレドニゾロン、メトトレキサート、サリドマイド、メトキサレン、ラパマイシン、レフルノミド、ミゾリビン（ＢＲＥＤＩＮＩＮＴＭ）、ブレキナル、デオキシスペルグアリン（ｄｅｏｘｙｓｐｅｒｇｕａｌｉｎ）、およびアザスピラン（ａｚａｓｐｉｒａｎｅ）（ＳＫＦ　１０５６８５），ＯＲＴＨＯＣＬＯＮＥ　ＯＫＴ（登録商標）３（ムロモナブＣＤ３（ｍｕｒｏｍｏｎａｂ−ＣＤ３）），ＳＡＮＤＩＭＭＵＮＥＴＭ，ＮＥＯＲＡＬＴＭ，ＳＡＮＧＤＹＡＴＭ（シクロスポリン），ＰＲＯＧＲＡＦ（登録商標）（ＦＫ５０６，タクロリムス），ＣＥＬＬＣＥＰＴ（登録商標）（ミコフェノレートモフェチル（ｍｙｃｏｐｈｅｎｏｌａｔｅ　ｍｏｔｅｆｉｌ），その活性な代謝産物は、ミコフェノール酸である），ＩＭＵＲＡＮＴＭ（アザチオプリン），グルココルチコステロイド，副腎皮質ステロイド（例えば、ＤＥＬＴＡＳＯＮＥＴＭ（プレドニゾン）およびＨＹＤＥＬＴＲＡＳＯＬＴＭ（プレドニゾロン），ＦＯＬＥＸＴＭおよびＭＥＸＡＴＥＴＭ（メトトレキサート（ｍｅｔｈｏｔｒｘａｔｅ）），ＯＸＳＯＲＡＬＥＮ−ＵＬＴＲＡＴＭ（メトキサレン）ならびにＲＡＰＡＭＵＮＥＴＭ（シロリムス（ｓｉｒｏｌｉｍｕｓ））。特定の実施形態では、免疫抑制剤は、器官または骨髄移植の拒絶を予防するために使用され得る。
【０８５０】
さらなる実施形態において、本発明の治療剤は、単独でかまたは１以上の静脈内免疫グロブリン調製物と組み合わせて投与される。本発明の治療剤とともに投与され得る静脈内免疫グロブリン調製物としては、ＧＡＭＭＡＲＴＭ、ＩＶＥＥＧＡＭＴＭ、ＳＡＮＤＯＧＬＯＢＵＬＩＮＴＭ、ＧＡＭＭＡＧＡＲＤ　Ｓ／ＤＴＭ、ＡＴＧＡＭＴＭ（抗胸腺細胞グロブリン）およびＧＡＭＩＭＵＮＥＴＭが挙げられるが、これらに限定されない。特定の実施形態において、本発明の治療剤は、移植治療（例えば、骨髄移植）において静脈内免疫グロブリン調製物と組み合わせて投与される。
【０８５１】
特定の実施形態では、本発明の治療剤は、単独または抗炎症性薬剤と組み合わせて投与される。本発明の治療剤と共に投与され得る抗炎症性薬剤としては、以下が挙げられるが、これらに限定されない：コルチコステロイド（例えば、ベタメタゾン、ブデソニド、コルチゾン、デキサメタゾン、ヒドロコルチゾン、メチルプレドニゾロン、プレドニゾロン、プレドニゾン、およびトリアムシノロン）、非ステロイド性抗炎症薬物（例えば、ジクロフェナク、ジフルニサル、エトドラク、フェノプロフェン、フロクタフェニン、フルルビプロフェン、イブプロフェン、インドメタシン、ケトプロフェン、メクロフェナム酸塩、メフェナム酸、メロキシカム、ナブメトン、ナプロキセン、オキサプロジン、フェニルブタゾン、ピロキシカム、スリンダク、テノキシカム、チアプロフェン酸、およびトルメチン）、ならびに抗ヒスタミン薬、アミノアリールカルボン酸誘導体、アリール酢酸誘導体、アリール酪酸誘導体、アリールカルボン酸、アリールプロピオン酸誘導体、ピラゾール類、ピラゾロン類、サリチル酸誘導体、チアジンカルボキサミド類、ｅ−アセトアミドカプロン酸、Ｓ−アデノシルメチオニン、３−アミノ−４−ヒドロキシ酪酸、アミキセトリン（ａｍｉｘｅｔｒｉｎｅ）、ベンダザック、ベンジダミン、ブコローム、ジフェンピラミド、ジタゾール、エモルファゾン、グアイアズレン、ナブメトン、ニメスリド、オルゴテイン、オキサセプロール、パラニリン（ｐａｒａｎｙｌｉｎｅ）、ペリソキサール、ピフオキシム、プロカゾン、プロキサゾール、およびテニダプ。
【０８５２】
さらなる実施形態において、本発明の組成物は、単独でかまたは抗脈管形成薬剤と組み合わせて投与される。本発明の組成物とともに投与され得る抗脈管形成薬剤としては、以下が挙げられるが、これらに限定されない：アンジオスタチン（Ｅｎｔｒｅｍｅｄ，Ｒｏｃｋｖｉｌｌｅ，ＭＤ）、トロポニン−１（Ｂｏｓｔｏｎ　Ｌｉｆｅ　Ｓｃｉｅｎｃｅｓ，Ｂｏｓｔｏｎ，ＭＡ）、抗侵襲性因子、レチノイン酸およびその誘導体、パクリタキセル（タキソール）、スラミン、メタロプロテイナーゼ−１の組織インヒビター、メタロプロテイナーゼ−２の組織インヒビター、ＶＥＧＩ、プラスミノーゲンアクチベーターインヒビター−１、プラスミノーゲンアクチベーターインヒビター−２および種々の形態のより軽い「ｄ群」遷移金属。
【０８５３】
より軽い「ｄ群」遷移金属としては、例えばバナジウム、モリブデン、タングステン、チタン、ニオブおよびタンタル種が挙げられる。そのような遷移金属種は、遷移金属錯体を形成し得る。上記の遷移金属種の適切な錯体としては、オキソ遷移金属錯体が挙げられる。
【０８５４】
バナジウム錯体の代表的な例としては、バナデート錯体およびバナジル錯体のようなオキソバナジウム錯体が挙げられる。適切なバナデート錯体としては、例えばメタバナジン酸アンモニウム、メタバナジン酸ナトリウムおよびオルトバナジン酸ナトリウムのようなメタバナデート錯体およびオルトバナデート錯体が挙げられる。適切なバナジル錯体としては、例えばバナジルアセチルアセトネートおよび硫酸バナジル（硫酸バナジル一水和物および硫酸バナジル三水和物のような硫酸バナジル水和物を含む）が挙げられる。
【０８５５】
タングステン錯体およびモリブデン錯体の代表的な例としてはまた、オキソ錯体が挙げられる。適切なオキソタングステン錯体としては、タングステート錯体およびタングステンオキシド錯体が挙げられる。適切なタングステート錯体としては、タングステン酸アンモニウム、タングステン酸カルシウム、タングステン酸ナトリウム二水和物およびタングステン酸が挙げられる。適切なタングステンオキシドとしては、タングステン（ＩＶ）オキシドおよびタングステン（ＶＩ）オキシドが挙げられる。適切なオキソモリブデン錯体としては、モリブデート、モリブデンオキシドおよびモリブデニル錯体が挙げられる。適切なモリブデート錯体としては、モリブデン酸アンモニウムおよびその水和物、モリブデン酸ナトリウムおよびその水和物、ならびにモリブデン酸カリウムおよびその水和物が挙げられる。適切なモリブデンオキシドとしては、モリブデン（ＶＩ）オキシド、モリブデン（ＶＩ）オキシドおよびモリブデン酸が挙げられる。適切なモリブデニル錯体としては、例えばモリブデニルアセチルアセトネートが挙げられる。他の適切なタングステン錯体およびモリブデン錯体としては、例えばグリセロール、酒石酸および糖由来のヒドロキソ誘導体が挙げられる。
【０８５６】
広範な種々の他の抗脈管形成因子もまた、本発明の状況において利用され得る。代表的な例としては、以下が挙げられるが、これらに限定されない：血小板因子４；硫酸プロタミン；硫酸化キチン誘導体（クイーンクラブ（ｑｕｅｅｎ　ｃｒａｂ）の殻から調製される）（Ｍｕｒａｔａら、Ｃａｎｃｅｒ　Ｒｅｓ．５１：２２〜２６、１９９１）；硫酸化多糖ペプチドグリカン複合体（ＳＰ−ＰＧ）（この化合物の機能は、ステロイド（例えば、エストロゲン）およびクエン酸タモキシフェンの存在によって、増強され得る）；スタウロスポリン；基質代謝の調節因子（例えば、プロリンアナログ、シスヒドロキシプロリン、ｄ，Ｌ−３，４−デヒドロプロリン、チアプロリン、α，α−ジピリジル，アミノプロピオニトリルフマレートを含む）；４−プロピル−５−（４−ピリジニル）−２（３Ｈ）−オキサゾロン；メトトレキサート；ミトザントロン；ヘパリン；インターフェロン；２マクログロブリン−血清；ＣｈＩＭＰ−３（Ｐａｖｌｏｆｆら、Ｊ．Ｂｉｏ．Ｃｈｅｍ．２６７：１７３２１〜１７３２６、（１９９２））；キモスタチン（Ｔｏｍｋｉｎｓｏｎら、Ｂｉｏｃｈｅｍ　Ｊ．２８６：４７５〜４８０、（１９９２））；シクロデキストリンテトラデカサルフェート；エポネマイシン；カンプトテシン；フマギリン（Ｉｎｇｂｅｒら、Ｎａｔｕｒｅ　３４８：５５５〜５５７、（１９９０））；チオリンゴ酸金ナトリウム（「ＧＳＴ」；ＭａｔｓｕｂａｒａおよびＺｉｆｆ、Ｊ．Ｃｌｉｎ．Ｉｎｖｅｓｔ．７９：１４４０〜１４４６、（１９８７））；アンチコラゲナーゼ−血清；α２−抗プラスミン（Ｈｏｌｍｅｓら、Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．２６２（４）：１６５９〜１６６４、（１９８７））；ビサントレン（Ｎａｔｉｏｎａｌ　Ｃａｎｃｅｒ　Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅ）；ロベンザリット二ナトリウム（Ｎ−（２）−カルボキシフェニル−４−クロロアントロニル酸（ｃｈｌｏｒｏａｎｔｈｒｏｎｉｌｉｃ　ａｃｉｄ）二ナトリウム、すなわち「ＣＣＡ」；Ｔａｋｅｕｃｈｉら、Ａｇｅｎｔｓ　Ａｃｔｉｏｎｓ　３６：３１２〜３１６、（１９９２））；およびメタロプロテイナーゼインヒビター（例えば、ＢＢ９４）。
【０８５７】
本発明の状況において同様に利用され得るさらなる抗脈管形成因子としては、サリドマイド（Ｃｅｌｇｅｎｅ，Ｗａｒｒｅｎ，ＮＪ）；血管抑制性（Ａｎｇｉｏｓｔａｔｉｃ）ステロイド；ＡＧＭ−１４７０（Ｈ．ＢｒｅｍおよびＪ．Ｆｏｌｋｍａｎ　Ｊ　Ｐｅｄｉａｔｒ．Ｓｕｒｇ．２８：４４５−５１（１９９３））；インテグリンαｖβ３アンタゴニスト（Ｃ．Ｓｔｏｒｇａｒｄら，Ｊ　Ｃｌｉｎ．Ｉｎｖｅｓｔ．１０３：４７−５４（１９９９））；カルボキシアミノイミダゾール（ｃａｒｂｏｘｙｎａｍｉｎｏｌｍｉｄａｚｏｌｅ）；カルボキシアミドトリアゾール（ＣＡＩ）（Ｎａｔｉｏｎａｌ　Ｃａｎｃｅｒ　Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅ，Ｂｅｔｈｅｓｄａ，ＭＤ）；Ｃｏｎｂｒｅｔａｓｔａｔｉｎ　Ａ−４（ＣＡ４Ｐ）（ＯＸｉＧＥＮＥ，Ｂｏｓｔｏｎ，ＭＡ）；Ｓｑｕａｌａｍｉｎｅ（Ｍａｇａｉｎｉｎ　Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌｓ，Ｐｌｙｍｏｕｔｈ　Ｍｅｅｔｉｎｇ，ＰＡ）；ＴＮＰ−４７０，（Ｔａｐ　Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌｓ，Ｄｅｅｒｆｉｅｌｄ，ＩＬ）；ＺＤ−０１０１　ＡｓｔｒａＺｅｎｅｃａ（Ｌｏｎｄｏｎ，ＵＫ）；ＡＰＲＡ（ＣＴ２５８４）；Ｂｅｎｅｆｉｎ，Ｂｙｒｏｓｔａｔｉｎ−１（ＳＣ３３９５５５）；ＣＧＰ−４１２５１（ＰＫＣ　４１２）；ＣＭ１０１；Ｄｅｘｒａｚｏｘａｎｅ（ＩＣＲＦ１８７）；ＤＭＸＡＡ；エンドスタチン；Ｆｌａｖｏｐｒｉｄｉｏｌ；Ｇｅｎｅｓｔｅｉｎ；ＧＴＥ；ＩｍｍＴｈｅｒ；Ｉｒｅｓｓａ（ＺＤ１８３９）；Ｏｃｔｒｅｏｔｉｄｅ（ソマトスタチン）；Ｐａｎｒｅｔｉｎ；Ｐｅｎａｃｉｌｌａｍｉｎｅ；Ｐｈｏｔｏｐｏｉｎｔ；ＰＩ−８８；Ｐｒｉｎｏｍａｓｔａｔ（ＡＧ−３３４０）Ｐｕｒｌｙｔｉｎ；Ｓｕｒａｄｉｓｔａ（ＦＣＥ２６６４４）；タモキシフェン（Ｎｏｌｖａｄｅｘ）；Ｔａｚａｒｏｔｅｎｅ；テトラチオモリブデート；Ｘｅｌｏｄａ（Ｃａｐｅｃｉｔａｂｉｎｅ）；および５−フルオロウラシルが挙げられる。
【０８５８】
本発明の化合物と組み合わせて投与され得る抗脈管形成薬剤は、種々の機構を通じて作用し得、これらの機構としては、以下が挙げられるが、これらに限定されない：細胞外マトリックスのタンパク質分解の阻害、内皮細胞−細胞外マトリックス接着分子の機能のブロック、増殖因子のような脈管形成誘導因子の機能と拮抗すること、および増殖している内皮細胞において発現されるインテグリンレセプターの阻害。細胞外マトリックスタンパク質分解を妨害し、そして本発明の組成物と組み合わせて投与され得る抗脈管形成インヒビターの例としては、以下が挙げられるが、これらに限定されない：ＡＧ−３３４０（Ａｇｏｕｒｏｎ，Ｌａ　Ｊｏｌｌａ，ＣＡ）、ＢＡＹ−１２−９５６６（Ｂａｙｅｒ，Ｗｅｓｔ　Ｈａｖｅｎ，ＣＴ）、ＢＭＳ−２７５２９１（Ｂｒｉｓｔｏｌ　Ｍｙｅｒｓ　Ｓｑｕｉｂｂ，Ｐｒｉｎｃｅｔｏｎ，ＮＪ）、ＣＧＳ−２７０３２Ａ（Ｎｏｖａｒｔｉｓ，Ｅａｓｔ　Ｈａｎｏｖｅｒ，ＮＪ）、Ｍａｒｉｍａｓｔａｔ（Ｂｒｉｔｉｓｈ　Ｂｉｏｔｅｃｈ，Ｏｘｆｏｒｄ，ＵＫ）およびＭｅｔａｓｔａｔ（Ａｅｔｅｒｎａ，Ｓｔ−Ｆｏｙ，Ｑｕｅｂｅｃ）。内皮細胞−細胞外マトリックス接着分子の機能をブロックすることにより作用し、そして本発明の組成物と組み合わせて投与され得る抗脈管形成インヒビターの例としては、以下が挙げられるが、これらに限定されない：ＥＭＤ−１２１９７４（Ｍｅｒｃｋ　ＫｃｇａＡ　Ｄａｒｍｓｔａｄｔ，Ｇｅｒｍａｎｙ）およびＶｉｔａｘｉｎ（Ｉｘｓｙｓ，Ｌａ　Ｊｏｌｌａ，ＣＡ／Ｍｅｄｉｍｍｕｎｅ，Ｇａｉｔｈｅｒｓｂｕｒｇ，ＭＤ）。脈管形成誘導因子と直接拮抗するかまたはこの誘導因子を阻害することにより作用し、そして本発明の組成物と組み合わせて投与され得る抗脈管形成薬剤の例としては、以下が挙げられるが、これらに限定されない：Ａｎｇｉｏｚｙｍｅ（Ｒｉｂｏｚｙｍｅ，Ｂｏｕｌｄｅｒ，ＣＯ）、抗ＶＥＧＦ抗体（Ｇｅｎｅｎｔｅｃｈ，Ｓ．Ｓａｎ　Ｆｒａｎｃｉｓｃｏ，ＣＡ）、ＰＴＫ−７８７／ＺＫ−２２５８４６（Ｎｏｖａｒｔｉｓ，Ｂａｓｅｌ，Ｓｗｉｔｚｅｒｌａｎｄ）、ＳＵ−１０１（Ｓｕｇｅｎ，Ｓ．Ｓａｎ　Ｆｒａｎｃｉｓｃｏ，ＣＡ）、ＳＵ−５４１６（Ｓｕｇｅｎ／Ｐｈａｒｍａｃｉａ　Ｕｐｊｏｈｎ，Ｂｒｉｄｇｅｗａｔｅｒ，ＮＪ）、およびＳＵ−６６６８（Ｓｕｇｅｎ）。他の抗脈管形成薬剤は、脈管形成を間接的に阻害するように作用する。本発明の組成物と組み合わせて投与され得る脈管形成の間接的インヒビターの例としては、以下が挙げられるが、これらに限定されない：ＩＭ−８６２（Ｃｙｔｒａｎ，Ｋｉｒｋｌａｎｄ，ＷＡ）、インターフェロン−α、ＩＬ−１２（Ｒｏｃｈｅ，Ｎｕｔｌｅｙ，ＮＪ）、およびペントサンポリスルフェート（Ｇｅｏｒｇｅｔｏｗｎ　Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ，Ｗａｓｈｉｎｇｔｏｎ，ＤＣ）。
【０８５９】
特定の実施形態において、抗脈管形成薬剤と組み合わせた本発明の組成物の使用は、自己免疫疾患（例えば、本明細書中に記載の自己免疫疾患）の処置、予防、および／または改善のために企図される。
【０８６０】
特定の実施形態において、抗脈管形成薬剤と組み合わせた本発明の組成物の使用は、関節炎の処置、予防、および／または改善のために企図される。さらに特定の実施形態において、抗脈管形成薬剤と組み合わせた本発明の組成物の使用は、慢性関節リウマチの処置、予防、および／または改善のために企図される。
【０８６１】
別の実施形態において、本発明のポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、脈管形成タンパク質または脈管形成タンパク質をコードする他のポリヌクレオチドと組み合わせて投与され得る。本発明の組成物とともに投与され得る脈管形成タンパク質の例としては、酸性および塩基性の線維芽細胞増殖因子、ＶＥＧＦ−１、ＶＥＧＦ−２、ＶＥＧＦ−３、上皮増殖因子αおよびβ、血小板由来内皮細胞増殖因子、血小板由来増殖因子、腫瘍壊死因子α、肝細胞増殖因子、インスリン様増殖因子、コロニー刺激因子、マクロファージコロニー刺激因子、顆粒球／マクロファージコロニー刺激因子、および一酸化窒素シンターゼが挙げられるが、これらに限定されない。
【０８６２】
さらなる実施形態において、本発明の組成物は、化学療法剤と組み合わせて投与される。本発明の治療剤とともに投与され得る化学療法剤としては、アルキル化剤（例えば、ナイトロジェンマスタード（例えば、メクロレタミン、シクロホスファミド、シクロホスファミドイホスファミド（Ｃｙｃｌｏｐｈｏｓｐｈａｍｉｄｅ　Ｉｆｏｓｆａｍｉｄｅ）、メルファラン（Ｌ−サルコリジン）、およびクロラムブシル）、エチレンイミン、およびメチルメラミン（例えば、ヘキサメチルメラミンおよびチオテパ）、アルキルスルホネート（例えば、ブスルファン）、ニトロソ尿素類（例えば、カルムスチン（ＢＣＮＵ）、ロムスチン（ＣＣＮＵ）、セムスチン（メチルＣＣＮＵ）、およびストレプトゾシン（ストレプトゾトシン）、トリアゼン（ｔｒｉａｚｅｎｅ）（例えば、ダカルバジン（ＤＴＩＣ；ジメチルトリアゼノイミダゾ−ルカルボサアミド（ｄｉｍｅｔｈｙｌｔｒｉａｚｅｎｏｉｍｉｄａｚｏｌｅｃａｒｂｏｘａｍｉｄｅ））、葉酸アナログ（例えば、メトトレキセート（アメトプテリン）、ピリミジンアナログ（例えば、フルオロウラシル（５−フルオロウラシル；５−ＦＵ）、フロクスリジン（フルオロデオキシウリジン；ＦｕｄＲ）、およびシタラビン（シトシンアラビノシド））、プリンアナログおよびプリン関連インヒビター（例えば、メルカプトプリン（６−メルカプトプリン；６−ＭＰ）、チオグアニン（６−チオグアニン；ＴＧ）、およびペントスタチン（２’−デオキシコフォルマイシン）、ビンカアルカロイド（例えば、ビンブラスチン（ＶＬＢ、硫酸ビンブラスチン））およびビンクリスチン（硫酸ビンクリスチン））、エピポドフィロトキシン（ｅｐｉｐｏｄｏｐｈｙｌｌｏｔｏｘｉｎ）（例えば、エトポシドおよびテニポシド）、抗生物質（例えば、ダクチノマイシン（アクチノマイシンＤ）、ダウノルビシン（ダウノマイシン；ルビドマイシン）、ドキソルビシン、ブレオマイシン、プリカマイシン（Ｐｌｉｃａｍｙｃｉｎ）（ミトラマイシン）、およびマイトマイシン（マイトマイシンＣ）、酵素（例えば、Ｌ−アスパラギナーゼ）、生物学的応答変更因子（例えば、インターフェロンαおよびインターフェロンα−２ｂ）、白金錯体組成物（例えば、シスプラチン（ｃｉｓ−ＤＤＰ）およびカルボプラチン）、アントラセンジオン（ミトキサントロン）、置換尿素（例えば、ヒドロキシ尿素）、メチルヒドラジン誘導体（例えば、プロカルバジン（Ｎ−メチルヒドラジン；ＭＩＨ）、アドレノコルチコステロイド（例えば、プレドニゾン）、プロゲスチン（例えば、ヒドロキシプロゲステロンカプロエート（Ｈｙｄｒｏｘｙｐｒｏｇｅｓｔｅｒｏｎｅ　ｃａｐｒｏａｔｅ）、メドロキシプロゲステロン、酢酸メドロキシプロゲステロン、および酢酸メゲストロール）、エストロゲン（例えば、ジエチルスチルベストロール（ＤＥＳ）、ジエチルスチルベストロールジホスフェート、エストラジオール、およびエチニルエストラジオール）、抗エストロゲン（例えば、タモキシフェン）、アンドロゲン（プロピオン酸テストステロン、およびフルオキシメステロン）、抗アンドロゲン（例えば、フルタミド）、ゴナドトロピン放出ホルモンアナログ（例えば、ロイプロリド）、他のホルモン��よびホルモンアナログ（例えば、メチルテストステロン、エストラムスチン、エストラムスチンリン酸ナトリウム、クロロトリアニセン、およびテストラクトン）、および他のもの（例えば、ジカルバジン（ｄｉｃａｒｂａｚｉｎｅ）、グルタミン酸、およびミトタン）が挙げられるが、これらに限定されない。
【０８６３】
１つの実施形態において、本発明の組成物は、以下の薬物の１つ以上と組み合わせて投与される：インフリキシマブ（ｉｎｆｌｉｘｉｍａｂ）（これはまた、ＲｅｍｉｃａｄｅＴＭＣｅｎｔｏｃｏｒ，Ｉｎｃ．として公知である）、トロケイド（Ｔｒｏｃａｄｅ）（Ｒｏｃｈｅ，ＲＯ−３２−３５５５）、レフルノミド（Ｌｅｆｌｕｎｏｍｉｄｅ）（これはまた、Ｈｏｅｃｈｓｔ　Ｍａｒｉｏｎ　Ｒｏｕｓｓｅｌ製のＡｒａｖａＴＭとして公知である）、ＫｉｎｅｒｅｔＴＭ（これは、Ａｍｇｅｎ，Ｉｎｃ製のアナキンラ（Ａｎａｋｉｎｒａ）として、また公知である、ＩＬ−１レセプターアンタゴニスト）。
【０８６４】
特定の実施形態において、本発明の組成物は、ＣＨＯＰ（シクロホスファミド、ドキソルビシン、ビンクリスチン、およびプレドニゾン）と組み合わせて投与されるか、またはＣＨＯＰの成分の１以上の組み合わせで投与される。ある実施形態において、本発明の組成物は、抗ＣＤ２０抗体（ヒトモノクローナル抗ＣＤ２０抗体）と組み合わせて投与される。別の実施形態において、本発明の組成物は、抗ＣＤ２０抗体およびＣＨＯＰ組み合わせて、または抗ＣＤ２０抗体およびＣＨＯＰの１以上の成分（特に、シクロホスファミドおよび／またはプレドニゾン）の任意の組み合わせと共に投与される。特定の実施形態において、本発明の組成物は、リツキシマブ（Ｒｉｔｕｘｉｍａｂ）と組み合わせて投与される。さらなる実施形態において、本発明の組成物は、リツキシマブおよびＣＨＯＰと共に、またはリツキシマブおよびＣＨＯＰの１以上の成分（特に、シクロホスファミドおよび／またはプレドニゾン）の任意の組み合わせと共に投与される。特定の実施形態において、本発明の組成物は、トシツモマブ（ｔｏｓｉｔｕｍｏｍａｂ）と組み合わせて投与される。さらなる実施形態において、本発明の組成物は、トシツモマブおよびＣＨＯＰと共に、またはトシツモマブおよびＣＨＯＰの１以上の成分（特に、シクロホスファミドおよび／またはプレドニゾン）の任意の組み合わせと共に投与される。抗ＣＤ２０抗体は、放射性同位元素、毒素、または細胞傷害性プロドラッグと必要に応じて結合され得る。
【０８６５】
別の特定の実施形態において、本発明の組成物は、ＺｅｖａｌｉｎＴＭと組み合わせて投与される。さらなる実施形態において、本発明の治療剤は、ＺｅｖａｌｉｎＴＭおよびＣＨＯＰと共に、またはＺｅｖａｌｉｎＴＭおよびＣＨＯＰの１以上の成分（特に、シクロホスファミドおよび／またはプレドニゾン）の任意の組み合わせと共に投与される。ＺｅｖａｌｉｎＴＭを、１以上の放射性同位元素と結合させ得る。特に好ましい同位元素は、９０Ｙおよび１１１Ｉｎである。
【０８６６】
さらなる実施形態において、本発明の治療剤は、サイトカインと組み合わせて投与される。本発明の治療剤とともに投与され得るサイトカインとしては、ＩＬ２、ＩＬ３、ＩＬ４、ＩＬ５、ＩＬ６、ＩＬ７、ＩＬ１０、ＩＬ１２、ＩＬ１３、ＩＬ１５、抗ＣＤ４０、ＣＤ４０Ｌ、ＩＦＮ−γおよびＴＮＦ−αが挙げられるが、これらに限定されない。別の実施形態において、本発明の治療剤は、任意のインターロイキン（ＩＬ−１α、ＩＬ−１β、ＩＬ−２、ＩＬ−３、ＩＬ−４、ＩＬ−５、ＩＬ−６、ＩＬ−７、ＩＬ−８、ＩＬ−９、ＩＬ−１０、ＩＬ−１１、ＩＬ−１２、ＩＬ−１３、ＩＬ−１４、ＩＬ−１５、ＩＬ−１６、ＩＬ−１７、ＩＬ−１８、ＩＬ−１９、ＩＬ−２０およびＩＬ−２１を含むが、これらに限定されない）と共に投与され得る。
【０８６７】
１つの実施形態において、本発明の治療剤は、ＴＮＦファミリーのメンバーと組み合わせて投与される。本発明の治療剤とともに投与され得るＴＮＦ分子、ＴＮＦ関連分子、またはＴＮＦ様分子としては、以下が挙げられるが、これらに限定されない：可溶性形態のＴＮＦ−α、リンホトキシン−α（ＬＴ−α、ＴＮＦ−βとしてもまた公知）、ＬＴ−β（複合ヘテロトリマ−ＬＴ−α２−β中に見出される）、ＯＰＧＬ、ＦａｓＬ、ＣＤ２７Ｌ、ＣＤ３０Ｌ、ＣＤ４０Ｌ、４−１ＢＢＬ、ＤｃＲ３、ＯＸ４０Ｌ、ＴＮＦ−γ（国際公開番号ＷＯ９６／１４３２８）、ＡＩＭ−Ｉ（国際公開番号ＷＯ９７／３３８９９）、エンドカイン−α（国際公開番号ＷＯ９８／０７８８０）、ＯＰＧ、およびニュートロカイン−α（国際公開番号ＷＯ９８／１８９２１）、ＯＸ４０、および神経成長因子（ＮＧＦ）、ならびに可溶性形態のＦａｓ、ＣＤ３０、ＣＤ２７、ＣＤ４０および４−ＩＢＢ、ＴＲ２（国際公開番号ＷＯ９６／３４０９５）、ＤＲ３（国際公開番号ＷＯ９７／３３９０４）、ＤＲ４（国際公開番号ＷＯ９８／３２８５６）、ＴＲ５（国際公開番号ＷＯ９８／３０６９３）、ＴＲＡＮＫ、ＴＲ９（国際公開番号ＷＯ９８／５６８９２）、ＴＲ１０（国際公開番号ＷＯ９８／５４２０２）、３１２Ｃ２（国際公開番号ＷＯ９８／０６８４２）、およびＴＲ１２、ならびに可溶性形態のＣＤ１５４、ＣＤ７０、およびＣＤ１５３。
【０８６８】
さらなる実施形態において、本発明の治療剤は、脈管形成タンパク質と組み合わせて投与される。本発明の治療剤とともに投与され得る脈管形成タンパク質としては、欧州特許番号ＥＰ−３９９８１６に開示されるようなグリオーム由来増殖因子（ＧＤＧＦ）；欧州特許番号ＥＰ−６８２１１０に開示されるような血小板由来増殖因子Ａ（ＰＤＧＦ−Ａ）；欧州特許番号ＥＰ−２８２３１７に開示されるような血小板由来増殖因子Ｂ（ＰＤＧＦ−Ｂ）；国際公開番号ＷＯ９２／０６１９４号に開示されるような胎盤増殖因子（ＰｌＧＦ）；Ｈａｕｓｅｒら、Ｇｏｒｗｔｈ　Ｆａｃｔｏｒｓ、４：２５９−２６８（１９９３）に開示されるような胎盤増殖因子２（ＰｌＧＦ−２）；国際公開番号ＷＯ９０／１３６４９号に開示されるような血管内皮増殖因子（ＶＥＧＦ）；欧州特許番号ＥＰ−５０６４７７に開示されるような血管内皮増殖因子Ａ（ＶＥＧＦ−Ａ）；国際公開番号ＷＯ９６／３９５１５号に開示されるような血管内皮増殖因子２（ＶＥＧＦ−２）；血管内皮増殖因子Ｂ（ＶＥＧＦ−３）；国際公開番号ＷＯ９６／２６７３６号に開示されるような血管内皮増殖因子Ｂ−１８６（ＶＥＧＦ−Ｂ１８６）；国際公開番号ＷＯ９８／０２５４３号に開示されるような血管内皮増殖因子Ｄ（ＶＥＧＦ−Ｄ）；国際公開番号ＷＯ９８／０７８３２号に開示されるような血管内皮増殖因子Ｄ（ＶＥＧＦ−Ｄ）；およびドイツ国特許番号ＤＥ１９６３９６０１に開示されるような血管内皮増殖因子Ｅ（ＶＥＧＦ−Ｅ）が挙げられるが、これらに限定されない。上記の参考文献は、その全体において本明細書で参考として援用される。
【０８６９】
さらなる実施形態において、本発明の治療剤は、線維芽細胞増殖因子と組み合わせて投与される。本発明の治療剤とともに投与され得る線維芽細胞増殖因子としては、ＦＧＦ−１、ＦＧＦ−２、ＦＧＦ−３、ＦＧＦ−４、ＦＧＦ−５、ＦＧＦ−６、ＦＧＦ−７、ＦＧＦ−８、ＦＧＦ−９、ＦＧＦ−１０、ＦＧＦ−１１、ＦＧＦ−１２、ＦＧＦ−１３、ＦＧＦ−１４、およびＦＧＦ−１５が挙げられるが、これらに限定されない。
【０８７０】
さらなる実施形態において、本発明の治療剤は、造血系成長因子と組み合わせて投与される。本発明の治療剤とともに投与され得る造血系成長因子としては、顆粒球マクロファージコロニー刺激因子（ＧＭ−ＣＳＦ）（サルグラモスチム（ｓａｒｇｒａｍｏｓｔｉｍ）、ＬＥＵＫＩＮＥＴＭ、ＰＲＯＫＩＮＥＴＭ）、顆粒球コロニー刺激因子（Ｇ−ＣＳＦ）（フィルグラスチム、ＮＥＵＰＯＧＥＮＴＭ）、マクロファージコロニー刺激因子（Ｍ−ＣＳＦ、ＣＳＦ−１）、エリスロポエチン（エポエチンα、ＥＰＯＧＥＮＴＭ、ＰＲＯＣＲＩＴＴＭ）、幹細胞因子（ＳＣＦ、ｃ−ｋｉｔリガンド、鉄剤（ｓｔｅｅｌ　ｆａｃｔｏｒ））、巨核球コロニー刺激因子、ＰＩＸＹ３２１（ＧＭＣＳＦ／ＩＬ−３融合タンパク質）、インターロイキン、特にＩＬ−１からＩＬ−１２までのいずれか１つ以上、インターフェロンγまたはトロンボポエチンが挙げられるが、これらに限定されない。
【０８７１】
特定の実施形態において、本発明の治療剤は、アドレナリン遮断薬（例えば、アセブトロール、アテノロール、ベタキソロール、ビソプロール（ｂｉｓｏｐｒｏｌｏｌ）、カルテロール（ｃａｒｔｅｏｌｏｌ）、ラベタロール、メトプロロール、ナドロール、オクスプレノロール、ペンブトロール（ｐｅｎｂｕｔｏｌｏｌ）、ピンドロール、プロプラノロール、ソタロール、およびチモロール）と組み合わせて投与される。
【０８７２】
別の実施形態において、本発明の治療剤は、抗不整脈薬（例えば、アデノシン、アミドアロン、ブレチリウム、ジキタリス、ジゴキシン、ジギトキシン、ジリアゼム（ｄｉｌｉａｚｅｍ）、ジソピラミド、エスモロール、フレカイニド、リドカイン、メキシレチン、モリシジン（ｍｏｒｉｃｉｚｉｎｅ）、フェニトイン、プロカインアミド、Ｎ−アセチルプロカインアミド、プロパフェノン、プロプラノロール、キニジン、ソタロール、トカイニド、およびベラパミル）と組み合わせて投与される。
【０８７３】
別の実施形態において、本発明の治療剤は、利尿薬（例えば、炭酸脱水酵素阻害薬（例えば、アセタゾラミド、ジクロルフェナミド、およびメタゾルアミド）、浸透圧性利尿薬（例えば、グリセリン、イソソルビド、マンニトール、および尿素）、Ｎａ＋−Ｋ＋−２Ｃｌ−共輸送阻害利尿薬（例えば、フロセミド、ブメタニド、アゾセミド（ａｚｏｓｅｍｉｄｅ）、ピレタニド、トリパミド、エタクリン酸、ムゾリミン（ｍｕｚｏｌｉｍｉｎｅ）、およびトルセミド（ｔｏｒｓｅｍｉｄｅ））、チアジドおよびチアジド様利尿薬（例えば、ベンドロフルメサイアザイド、ベンズサイアザイド、クロロチアジド、ヒドロクロロチアジド、ヒドロフルメチアジド、メチルクロチアジド、ポリチアジド、トリクロメチアジド（ｔｒｉｃｈｏｒｍｅｔｈｉａｚｉｄｅ）、クロルタリドン、インダパミド、メトラゾン、およびキネサゾン）、カリウム保持性利尿薬（例えば、アミロライドおよびトリアムテレン）、および鉱質コルチコイドレセプターアンタゴニスト（例えば、スピロノラクトン、カンレノン（ｃａｎｒｅｎｏｎｅ）、およびカンレノエートカリウム（ｐｏｔａｓｓｉｕｍ　ｃａｎｒｅｎｏａｔｅ））と組み合わせて投与される。
【０８７４】
１つの実施形態において、本発明の治療剤は、内分泌物および／またはホルモンの不均衡障害のための処置剤と組み合わせて投与される。内分泌物および／またはホルモンの不均衡障害のための処置剤としては、以下が挙げられるが、これらに限定されない：１２７Ｉ、ヨウ素の放射性同位元素（例えば、１３１Ｉおよび１２３Ｉ）；組換え成長ホルモン（例えば、ＨＵＭＡＴＲＯＰＥＴＭ（組換えソマトロピン）；成長ホルモンアナログ（例えば、ＰＲＯＴＲＯＰＩＮＴＭ（ソマトレム）；ドーパミンアゴニスト（例えば、ＰＡＲＬＯＤＥＬＴＭ（ブロモクリプチン）；ソマトスタチンアナログ（例えば、ＳＡＮＤＯＳＴＡＴＩＮＴＭ（オクトレオチド）；ゴナドトロピン調製物（例えば、ＰＲＥＧＮＹＬＴＭ、Ａ．Ｐ．Ｌ．ＴＭ　およびＰＲＯＦＡＳＩＴＭ（絨毛性ゴナドトロピン（ＣＧ））、ＰＥＲＧＯＮＡＬＴＭ（メノトロピン）、およびＭＥＴＲＯＤＩＮＴＭ（尿性卵胞性刺激ホルモン（ｕＦＳＨ））；合成ヒトゴナドトロピン放出ホルモン調製物（例えば、ＦＡＣＴＲＥＬＴＭおよびＬＵＴＲＥＰＵＬＳＥＴＭ（塩酸ゴナドレリン）；合成ゴナドトロピンアゴニスト（例えば、ＬＵＰＲＯＮＴＭ（酢酸ロイプロリド）、ＳＵＰＰＲＥＬＩＮＴＭ（酢酸ヒストレリン（ｈｉｓｔｒｅｌｉｎ　ａｃｅｔａｔｅ））、ＳＹＮＡＲＥＬＴＭ（酢酸ナファレリン（ｎａｆａｒｅｌｉｎ　ａｃｅｔａｔｅ））、およびＺＯＬＡＤＥＸＴＭ（酢酸ゴセレリン（ｇｏｓｅｒｅｌｉｎ　ａｃｅｔａｔｅ））；甲状腺刺激ホルモン放出ホルモンの合成調製物（例えば、ＲＥＬＥＦＡＣＴ　ＴＲＨＴＭおよびＴＨＹＰＩＮＯＮＥＴＭ（プロチレリン）；組換えヒトＴＳＨ（例えば、ＴＨＹＲＯＧＥＮＴＭ）；甲状腺ホルモンの天然異性体のナトリウム塩の合成調製物（例えば、Ｌ−Ｔ４ＴＭ、ＳＹＮＴＨＲＯＩＤＴＭおよびＬＥＶＯＴＨＲＯＩＤＴＭ（レボチロキシンナトリウム（ｌｅｖｏｔｈｙｒｏｘｉｎｅ　ｓｏｄｉｕｍ））、Ｌ−Ｔ３ＴＭ、ＣＹＴＯＭＥＬＴＭおよびＴＲＩＯＳＴＡＴＴＭ（リオチロインナトリウム（ｌｉｏｔｈｙｒｏｉｎｅ　ｓｏｄｉｕｍ））、およびＴＨＹＲＯＬＡＲＴＭ（リオトリックス）；抗甲状腺化合物（例えば、６−ｎ−プロピルチオウラシル（プロピルチオウラシル）、１−メチル−２−メルカプトイミダゾ−ルおよびＴＡＰＡＺＯＬＥＴＭ（メチマゾール）、ＮＥＯ−ＭＥＲＣＡＺＯＬＥＴＭ（カルビマゾール）；βアドレナリン作用性レセプターアンタゴニスト（例えば、プロプラノロールおよびエスモロール；Ｃａ２＋チャネル阻害剤；デキサメタゾンおよびヨウ素化の放射性物質造影剤（例えば、ＴＥＬＥＰＡＱＵＥＴＭ（ヨーパン酸）およびＯＲＡＧＲＡＦＩＮＴＭ（イポダートナトリウム）。
【０８７５】
さらなる内分泌物および／またはホルモンの不均衡障害のための処置剤としては、以下が挙げられるが、これらに限定されない：卵胞ホルモンまたは抱合卵胞ホルモン（例えば、ＥＳＴＲＡＣＥＴＭ（エストラジオール）、ＥＳＴＩＮＹＬＴＭ（エチニルエストラジオール）、ＰＲＥＭＡＲＩＮＴＭ、ＥＳＴＲＡＴＡＢＴＭ、ＯＲＴＨＯ−ＥＳＴＴＭ、ＯＧＥＮＴＭおよびエストロピペイト（ｅｓｔｒｏｐｉｐａｔｅ）（エストロン）、ＥＳＴＲＯＶＩＳＴＭ（キネストロール）、ＥＳＴＲＡＤＥＲＭＴＭ（エストラジオール）、ＤＥＬＥＳＴＲＯＧＥＮＴＭおよびＶＡＬＥＲＧＥＮＴＭ（吉草酸エストラジオール）、ＤＥＰＯ−ＥＳＴＲＡＤＩＯＬ　ＣＹＰＩＯＮＡＴＥＴＭおよびＥＳＴＲＯＪＥＣＴ　ＬＡＴＭ（エストラジオールシピオネート））；抗エストロゲン（例えば、ＮＯＬＶＡＤＥＸＴＭ（タモキシフェン）、ＳＥＲＯＰＨＥＮＥＴＭおよびＣＬＯＭＩＤＴＭ（クロミフェン）；プロゲスチン（例えば、ＤＵＲＡＬＵＴＩＮＴＭ（カプロン酸ヒドロキシプロゲステロン）（ｈｙｄｒｏｘｙｐｒｏｇｅｓｔｅｒｏｎｅ　ｃａｐｒｏａｔｅ））、ＭＰＡＴＭおよびＤＥＰＯ−ＰＲＯＶＥＲＡＴＭ（酢酸メドロキシプロゲステロン）、ＰＲＯＶＥＲＡＴＭおよびＣＹＣＲＩＮＴＭ（ＭＰＡ）、ＭＥＧＡＣＥＴＭ（酢酸メゲストロール）、ＮＯＲＬＵＴＩＮＴＭ（ノルエチンドロン），ならびにＮＯＲＬＵＴＡＴＥＴＭおよびＡＹＧＥＳＴＩＮＴＭ（酢酸ノルエチンドロン））；プロゲステロン移植片（例えば、ＮＯＲＰＬＡＮＴ　ＳＹＳＴＥＭＴＭ（ノルゲストレルの皮下移植）；抗黄体ホルモン（例えば、ＲＵ　４８６ＴＭ（ミフェプリストン）；ホルモン避妊薬（例えば、ＥＮＯＶＩＤＴＭ（ノルエチノドレル＋メストラノール）、ＰＲＯＧＥＳＴＡＳＥＲＴＴＭ（プロゲステロンを放出する子宮内器具）、ＬＯＥＳＴＲＩＮＴＭ、ＢＲＥＶＩＣＯＮＴＭ、ＭＯＤＩＣＯＮＴＭ、ＧＥＮＯＲＡＴＭ、ＮＥＬＯＮＡＴＭ、ＮＯＲＩＮＹＬＴＭ、ＯＶＡＣＯＮ−３５ＴＭおよびＯＶＡＣＯＮ−５０ＴＭ（エチニルエストラジオール／ノルエチンドロン）、ＬＥＶＬＥＮＴＭ、ＮＯＲＤＥＴＴＥＴＭ、ＴＲＩ−ＬＥＶＬＥＮＴＭおよびＴＲＩＰＨＡＳＩＬ−２１ＴＭ（エチニルエストラジオール／レボノルゲストレル（ｌｅｖｏｎｏｒｇｅｓｔｒｅｌ））　ＬＯ／ＯＶＲＡＬＴＭおよびＯＶＲＡＬＴＭ（エチニルエストラジオール／ノルゲストレル）、ＤＥＭＵＬＥＮＴＭ（エチニルエストラジオール／二酢酸エチノジオール）、ＮＯＲＩＮＹＬＴＭ、ＯＲＴＨＯ−ＮＯＶＵＭＴＭ、ＮＯＲＥＴＨＩＮＴＭ、ＧＥＮＯＲＡＴＭ，およびＮＥＬＯＶＡＴＭ（ノルエチンドロン／メストラノール）、ＤＥＳＯＧＥＮＴＭおよびＯＲＴＨＯ−ＣＥＰＴＴＭ（エチニルエストラジオール／デソゲステレル（ｄｅｓｏｇｅｓｔｒｅｌ））、ＯＲＴＨＯ−ＣＹＣＬＥＮＴＭおよびＯＲＴＨＯ−ＴＲＩＣＹＣＬＥＮＴＭ（エチニルエストラジオール／ノルゲスチメート（ｎｏｒｇｅｓｔｉｍａｔｅ））、ＭＩＣＲＯＮＯＲＴＭおよびＮＯＲ−ＱＤＴＭ（ノルエチンドロン），およびＯＶＲＥＴＴＥＴＭ（ノルゲストレル）。
【０８７６】
内分泌物および／またはホルモンの不均衡障害のためのさらなる処置剤としては、以下が挙げられるが、これらに限定されない：テストステロンエステル（例えば、酢酸メテノロン（ｍｅｔｈｅｎｏｌｏｎｅ　ａｃｅｔａｔｅ）およびテストステロンウンデカノエート；非経口および経口アンドロゲン（例えば、ＴＥＳＴＯＪＥＣＴ−５０ＴＭ（テストステロン）、ＴＥＳＴＥＸＴＭ（プロピオン酸テストステロン）、ＤＥＬＡＴＥＳＴＲＹＬＴＭ（エナンタートテストステロン）、ＤＥＰＯ−ＴＥＳＴＯＳＴＥＲＯＮＥＴＭ（シピオネートテストステロン）、ＤＡＮＯＣＲＩＮＥＴＭ（ダナゾール）、ＨＡＬＯＴＥＳＴＩＮＴＭ（フルオキシメステロン）、ＯＲＥＴＯＮ　ＭＥＴＨＹＬＴＭ、ＴＥＳＴＲＥＤＴＭおよびＶＩＲＩＬＯＮＴＭ（メチルテストステロン）、およびＯＸＡＮＤＲＩＮＴＭ（オキサンドロロン）；テストステロン経皮的システム（例えば、ＴＥＳＴＯＤＥＲＭＴＭ；アンドロゲンレセプターアンタゴニストおよび５−α−レダクタ−ゼ阻害剤（例えば、ＡＮＤＲＯＣＵＲＴＭ（酢酸シプロテロン）、ＥＵＬＥＸＩＮＴＭ（フルタミド），およびＰＲＯＳＣＡＲＴＭ（フィナステリド（ｆｉｎａｓｔｅｒｉｄｅ））；副腎皮質刺激ホルモン調製物（例えば、ＣＯＲＴＲＯＳＹＮＴＭ（コシントロピン）；副腎皮質ステロイドおよびこれらの合成アナログ（例えば、ＡＣＬＯＶＡＴＥＴＭ（ジプロピオン酸アルクロメタゾン）、ＣＹＣＬＯＣＯＲＴＴＭ（アムシノニド）、ＢＥＣＬＯＶＥＮＴＴＭおよびＶＡＮＣＥＲＩＬＴＭ（ジプロピオン酸ベクロメタゾン）、ＣＥＬＥＳＴＯＮＥＴＭ（ベタメタゾン）、ＢＥＮＩＳＯＮＥＴＭおよびＵＴＩＣＯＲＴＴＭ（安息香酸ベタメタゾン）、ＤＩＰＲＯＳＯＮＥＴＭ（ジプロピオン酸ベタメタゾン）、ＣＥＬＥＳＴＯＮＥ　ＰＨＯＳＰＨＡＴＥＴＭ（ベタメタゾンリン酸ナトリウム塩）、ＣＥＬＥＳＴＯＮＥ　ＳＯＬＵＳＰＡＮＴＭ（ベタメタゾンリン酸ナトリウムおよび酢酸ベタメタゾン）、ＢＥＴＡ−ＶＡＬＴＭおよびＶＡＬＩＳＯＮＥＴＭ（吉草酸塩ベタメタゾン）、ＴＥＭＯＶＡＴＥＴＭ（プロピオン酸クロベタゾール）、ＣＬＯＤＥＲＭＴＭ（クロコルトロンピバレート）、ＣＯＲＴＥＦＴＭ　およびＨＹＤＲＯＣＯＲＴＯＮＥＴＭ（コルチソル（ヒドロコルチゾン））、ＨＹＤＲＯＣＯＲＴＯＮＥ　ＡＣＥＴＡＴＥＴＭ（酢酸コルチソル（ヒドロコルチゾン））、ＬＯＣＯＩＤＴＭ（酪酸コルチソル（ヒドロコルチゾン））、ＨＹＤＲＯＣＯＲＴＯＮＥ　ＰＨＯＳＰＨＡＴＥＴＭ（コルチソル（ヒドロコルチゾン）リン酸ナトリウム塩）、Ａ−ＨＹＤＲＯＣＯＲＴＴＭおよびＳＯＬＵ　ＣＯＲＴＥＦＴＭ（コルチソル（ヒドロコルチゾン）コハク酸ナトリウム塩）、ＷＥＳＴＣＯＲＴＴＭ（吉草酸コルチソル（ヒドロコルチゾン））、ＣＯＲＴＩＳＯＮＥ　ＡＣＥＴＡＴＥＴＭ（酢酸コルチゾン）、ＤＥＳＯＷＥＮＴＭおよびＴＲＩＤＥＳＩＬＯＮＴＭ（デソニド）、ＴＯＰＩＣＯＲＴＴＭ（デスオキシメタゾン）、ＤＥＣＡＤＲＯＮＴＭ（デキサメタゾン）、ＤＥＣＡＤＲＯＮ　ＬＡＴＭ（酢酸デキサメタゾン）、ＤＥＣＡＤＲＯＮ　ＰＨＯＳＰＨＡＴＥＴＭおよびＨＥＸＡＤＲＯＬ　ＰＨＯＳＰＨＡＴＥＴＭ（デキサメタゾンリン酸ナトリウム塩）、���ＬＯＲＯＮＥＴＭおよびＭＡＸＩＦＬＯＲＴＭ（二酢酸ジフロラゾン）、ＦＬＯＲＩＮＥＦ　ＡＣＥＴＡＴＥＴＭ（酢酸フルドロコルチゾン）、ＡＥＲＯＢＩＤＴＭおよびＮＡＳＡＬＩＤＥＴＭ（フルニソリド）、ＦＬＵＯＮＩＤＴＭおよびＳＹＮＡＬＡＲＴＭ（フルオシノロンアセトニド）、ＬＩＤＥＸＴＭ（フルオシノニド）、ＦＬＵＯＲ−ＯＰＴＭおよびＦＭＬＴＭ（フルオロメトロン）、ＣＯＲＤＲＡＮＴＭ（フルランドレノリド）、ＨＡＬＯＧＴＭ（ハルシノニド）、ＨＭＳ　ＬＩＺＵＩＦＩＬＭＴＭ（メドリゾン）、ＭＥＤＲＯＬＴＭ（メチルプレドニゾロン）、ＤＥＰＯ−ＭＥＤＲＯＬＴＭおよびＭＥＤＲＯＬ　ＡＣＥＴＡＴＥＴＭ（酢酸メチルプレドニゾロン）、Ａ−ＭＥＴＨＡＰＲＥＤＴＭおよびＳＯＬＵＭＥＤＲＯＬＴＭ（メチルプレドニゾロンコハク酸ナトリウム塩）、ＥＬＯＣＯＮＴＭ（モメタゾン（ｍｏｍｅｔａｓｏｎｅ）フロエート）、ＨＡＬＤＲＯＮＥＴＭ（酢酸パラメタゾン）、ＤＥＬＴＡ−ＣＯＲＴＥＦＴＭ（プレドニゾロン）、ＥＣＯＮＯＰＲＥＤＴＭ（酢酸プレドニゾロン）、ＨＹＤＥＬＴＲＡＳＯＬＴＭ（プレドニゾロンリン酸ナトリウム塩）、ＨＹＤＥＬＴＲＡ−Ｔ．Ｂ．ＡＴＭ（プレドニゾロンテブテート）、ＤＥＬＴＡＳＯＮＥＴＭ（プレドニゾン）、ＡＲＩＳＴＯＣＯＲＴＴＭおよびＫＥＮＡＣＯＲＴＴＭ（トリアムシノロン）、ＫＥＮＡＬＯＧＴＭ（トリアムシノロンアセトニド）、ＡＲＩＳＴＯＣＯＲＴＴＭおよびＫＥＮＡＣＯＲＴ　ＤＩＡＣＥＴＡＴＥＴＭ（トリアムシノロンジアセテート）、およびＡＲＩＳＴＯＳＰＡＮＴＭ（ヘキサアセトニド（ｈｅｘａｃｅｔｏｎｉｄｅ）トリアムシノロン）；副腎皮質ステロイドの生合成阻害剤および作用阻害剤（例えば、ＣＹＴＡＤＲＥＮＴＭ（アミノグルテチミド）、ＮＩＺＯＲＡＬＴＭ（ケトコナゾール）、ＭＯＤＲＡＳＴＡＮＥＴＭ（トリロスタン）、およびＭＥＴＯＰＩＲＯＮＥＴＭ（メチラポン）。
【０８７７】
内分泌物および／またはホルモンの不均衡障害のためのさらなる処置剤としては、以下が挙げられるが、これらに限定されない：ウシ、ブタもしくはヒトインスリンまたはそれらの混合物；インスリンアナログ；組換えヒトインスリン（例えば、ＨＵＭＵＬＩＮＴＭおよびＮＯＶＯＬＩＮＴＭ；経口低血糖症薬物（例えば、ＯＲＡＭＩＤＥＴＭおよびＯＲＩＮＡＳＥＴＭ（トルブタミド）、ＤＩＡＢＩＮＥＳＥＴＭ（クロルプロパミド）、ＴＯＬＡＭＩＤＥＴＭおよびＴＯＬＩＮＡＳＥＴＭ（トラザミド）、ＤＹＭＥＬＯＲＴＭ（アセトヘキサミド）、グリベンクラミド（ｇｌｉｂｅｎｃｌａｍｉｄｅ）、ＭＩＣＲＯＮＡＳＥＴＭ、ＤＩＢＥＴＡＴＭおよびＧＬＹＮＡＳＥＴＭ（グリブリド）、ＧＬＵＣＯＴＲＯＬＴＭ（グリピジド）、およびＤＩＡＭＩＣＲＯＮＴＭ（グリクラジド）、ＧＬＵＣＯＰＨＡＧＥＴＭ（メトホルミン）、ＰＲＥＣＯＳＥＴＭ（アカルボース）、ＡＭＡＲＹＬＴＭ（グリメピライド）およびシグリタゾン（ｃｉｇｌｉｔａｚｏｎｅ））；トリアゾリジネジオン（ｔｉｒａｚｏｌｉｄｉｎｅｄｉｏｎｅ）（ＴＺＤ）（例えば、ロシグリタゾン（ｒｏｓｉｇｌｉｔａｚｏｎｅ）、ＡＶＡＮＤＩＡＴＭ（マレイン酸ロシグリタゾン）、ＡＣＴＯＳＴＭ（ピオグリタゾン（ｐｉｏｇｌｉａｔａｚｏｎｅ）、およびトログリタゾン（ｔｒｏｇｌｉｔａｚｏｎｅ））；α−グルコシダ−ゼ阻害剤；ウシもしくはブタのグルカゴン；ソマトスタチン（例えば、ＳＡＮＤＯＳＴＡＴＩＮＴＭ（オクテオチド（ｏｃｔｒｅｏｔｉｄｅ））；およびジアゾキシド（例えば、ＰＲＯＧＬＹＣＥＭＴＭ（ジアゾキシド））。また他の実施形態において、本発明の治療剤は、以下の１つ以上と組み合わせて投与される：ビグアナイド抗糖尿病薬剤、グリタゾン抗糖尿病薬剤、およびスルホニル尿素抗糖尿病薬剤。
【０８７８】
１つの実施形態において、本発明の治療剤は、子宮運動性障害のための処置剤と組み合わせて投与される。子宮運動性障害のための治療剤としては、以下が挙げられるが、これらに限定されない：エストロゲン薬物（例えば、抱合卵胞エストロゲン（例えば、ＰＲＥＭＡＲＩＮ（登録商標）およびＥＳＴＲＡＴＡＢ（登録商標））、エストラジオ−ル（例えば、ＣＬＩＭＡＲＡ（登録商標）およびＡＬＯＲＡ（登録商標））、エストロピペイト（ｅｓｔｒｏｐｉｐａｔｅ）、およびクロロトリアニセン；プロゲスチン薬物（例えば、ＡＭＥＮ（登録商標）（メドロキシプロゲステロン）、ＭＩＣＲＯＮＯＲ（登録商標）（酢酸ノルエチドロン（ｎｏｒｅｔｈｉｄｒｏｎｅ））、ＰＲＯＭＥＴＲＩＵＭ（登録商標）　プロゲステロン，および酢酸メゲストロ−ル）；ならびにエストロゲン／プロゲステロン併用治療（例えば、抱合卵胞エストロゲン／メドロキシプロゲステロン（例えば、ＰＲＥＭＰＲＯＴＭおよびＰＲＥＭＰＨＡＳＥ（登録商標））および酢酸ノルエチドロン／エチニルエストラジオール（例えば、ＦＥＭＨＲＴＴＭ）。
【０８７９】
さらなる実施形態において、本発明の治療剤は、鉄欠乏性貧血および低色性貧血のための処置に有用な薬物と組み合わせて投与され、これらの薬物としては、以下が挙げられるが、これらに限定されない：硫酸第一鉄（硫酸鉄、ＦＥＯＳＯＬＴＭ）、フマル酸第一鉄（例えば、ＦＥＯＳＴＡＴＴＭ）、グルコン酸第一鉄（例えば、ＦＥＲＧＯＮＴＭ）、多糖類−鉄複合体（例えば、ＮＩＦＥＲＥＸＴＭ）、鉄デキストラン注入（例えば、ＩＮＦＥＤＴＭ）、硫酸銅、ピロキシジン（ｐｙｒｏｘｉｄｉｎｅ）、リボフラビン、ビタミンＢ１２、シアノコバラミン（ｃｙａｎｃｏｂａｌａｍｉｎ）注入（例えば、ＲＥＤＩＳＯＬＴＭ、ＲＵＢＲＡＭＩＮ　ＰＣＴＭ）、ヒドロキソコバラミン、葉酸（例えば、ＦＯＬＶＩＴＥＴＭ）、ロイコボリン（フォリン酸、５−ＣＨＯＨ４ＰｔｅＧｌｕ、シトロボラム因子）　またはＷＥＬＬＣＯＶＯＲＩＮ（ロイコボリンのカルシウム塩）、トランスフェリンまたはフェリチン。
【０８８０】
特定の実施形態において、本発明の治療剤は、精神障害の処置に使用される薬剤と組み合わせて投与される。本発明の治療剤とともに投与され得る精神医学剤としては、以下が挙げられるが、これらに限定されない：抗精神病薬（例えば、クロルプロマジン、クロルプロチキセン、クロザピン、フルフェナジン、ハロペリドール、ロクサピン、メソリダジン、モリンドン、オランザピン（ｏｌａｎｚａｐｉｎｅ）、パーフェナジン、ピモジド、クエチアピン（ｑｕｅｔｉａｐｉｎｅ）、リスペリドン（ｒｉｓｐｅｒｉｄｏｎｅ）、チオリダジン、チオチキセン、トリフルオペラジン、およびトリフルプロマジン）、抗躁病薬（例えば、カルバマゼピン、ジバルプロックスナトリウム、炭酸リチウム、およびクエン酸リチウム）、抗うつ薬（例えば、アミトリプチリン、アモキサピン、ビュープロピオン、シタロプラム（ｃｉｔａｌｏｐｒａｍ）、クロミプラミン、デシプラミン、ドキセピン、フルボキサミン（ｆｌｕｖｏｘａｍｉｎｅ）、フルオキセチン、イミプラミン、イソカルボキサジド、マプロチリン、ミルタザピン（ｍｉｒｔａｚａｐｉｎｅ）、ネフォゾドン（ｎｅｆａｚｏｄｏｎｅ）、ノルトリプチリン、パロキセチン（ｐａｒｏｘｅｔｉｎｅ）、フェネルジン、プロトリプチリン、セルトラリン、トラニルシプロミン、トラゾドン、トリミプラミン、およびベンラファキシン（ｖｅｎｌａｆａｘｉｎｅ））、抗不安薬（例えば、アルプラゾラム、ブスピロン、クロルジアゼポキシド、クロラゼペート、ジアゼパム、ハラゼパム、ロラゼパム、オキサゼパム、およびプラゼパム）、ならびに興奮薬（例えば、ｄ−アンフェタミン、メチルフェニデート、およびペモリン）。
【０８８１】
他の実施形態において、本発明の治療剤は、神経性疾患を処置するために使用される薬剤と組み合わせて投与される。本発明の治療剤とともに投与され得る神経学的薬剤としては、以下が挙げられるが、これらに限定されない：鎮痙薬（例えば、カルバマゼピン、クロナゼパム、エトスクシミド、フェノバルビタ−ル、フェニトイン、プリミドン、バルプロ酸、ジバルプロックスナトリウム、フェルバメ−ト、ガバペンチン（ｇａｂａｐｅｎｔｉｎ）、ラモトリジン、レベチラセタム（ｌｅｖｅｔｉｒａｃｅｔａｍ）、オキシカルバゼピン（ｏｘｃａｒｂａｚｅｐｉｎｅ）、チアガビン（ｔｉａｇａｂｉｎｅ）、トピラメイト（ｔｏｐｉｒａｍａｔｅ）、ゾニサミド（ｚｏｎｉｓａｍｉｄｅ）、ジアゼパム、ロラゼパム、およびクロナゼパム）、抗パーキンソン症候群薬（例えば、レボドパ／カルビドパ、セレジリン、アマンチジン（ａｍａｎｔｉｄｉｎｅ）、ブロモクリプチン、ペルゴリド（ｐｅｒｇｏｌｉｄｅ）、ロピニロール（ｒｏｐｉｎｉｒｏｌｅ）、プラミペキソール（ｐｒａｍｉｐｅｘｏｌｅ）、ベンズトロピン；ビペリデン；エトプロパジン；プロシクリジン；トリヘキシフェニジル、トルカポン（ｔｏｌｃａｐｏｎｅ））、およびＡＬＳ治療剤（例えば、リルゾ−ル（ｒｉｌｕｚｏｌｅ））。
【０８８２】
別の実施形態において、本発明の治療剤は、血管弛緩薬および／またはカルシウムチャネル遮断薬と組み合わせて投与される。本発明の治療剤とともに投与され得る血管弛緩薬としては、以下が挙げられるが、これらに限定されない：アンギオテンシン変換酵素（ＡＣＥ）インヒビター（例えば、パパベリン、イソクスプリン、ベナゼプリル（ｂｅｎａｚｅｐｒｉｌ）、カプトプリル、シラザプリル（ｃｉｌａｚａｐｒｉｌ）、エナラプリル、エナラプリラート、ホシノプリル（ｆｏｓｉｎｏｐｒｉｌ）、リジノプリル、モエキシプリル（ｍｏｅｘｉｐｒｉｌ）、ペリインドプリル（ｐｅｒｉｎｄｏｐｒｉｌ）、キナプリル（ｑｕｉｎａｐｒｉｌ）、ラミプリル（ｒａｍｉｐｒｉｌ）、スピラプリル（ｓｐｉｒａｐｒｉｌ）、トランドラプリル（ｔｒａｎｄｏｌａｐｒｉｌ），およびナイリドリン）、ならびに硝酸塩（例えば、イソソルビドジニトレート、イソソルビドモノニトレート，およびニトログリセリン）。本発明の治療剤と組み合わせて投与され得るカルシウムチャネル遮断薬の例としては、以下が挙げられるが、これらに限定されない：アムロジピン、ベプリジル（ｂｅｐｒｉｄｉｌ）、ジルチアゼム、フェロジピン、フルナリジン、イスラジピン（ｉｓｒａｄｉｐｉｎｅ）、ニカルジピン、ニフェジピン、ニモジピン、およびベラパミル。
【０８８３】
特定の実施形態において、本発明の治療剤は、胃腸の障害ための処置と組み合わせて投与される。本発明の治療薬と共に投与され得る胃腸の障害のために処置剤としては以下が挙げられるがこれらに限定されない：Ｈ２ヒスタミンレセプターアンタゴニスト（例えば、ＴＡＧＡＭＥＴＴＭ（シメチジン）、ＺＡＮＴＡＣＴＭ（ラニチジン）、ＰＥＰＣＩＤＴＭ（ファモチジン）、およびＡＸＩＤＴＭ（ニザチジン））；Ｈ＋，Ｋ＋　ＡＴＰａｓｅのインヒビター（例えば、ＰＲＥＶＡＣＩＤＴＭ（ランソプラゾール）およびＰＲＩＬＯＳＥＣＴＭ（オメプラゾール））；ビスマス化合物（例えば、ＰＥＰＴＯ−ＢＩＳＭＯＬＴＭ（次サリチル酸ビスマス（ｂｉｓｍｕｔｈ　ｓｕｂｓａｌｉｃｙｌａｔｅ））およびＤＥ−ＮＯＬＴＭ（次クエン酸ビスマス（ｂｉｓｍｕｔｈ　ｓｕｂｃｉｔｒａｔｅ）））；種々の制酸薬；スクラルファート；プロスタグランジンアナログ（例えば、ＣＹＴＯＴＥＣＴＭ（ミソプロストール）；ムスカリン様コリン作用アンタゴニスト；緩下薬（例えば、界面活性剤緩下薬、刺激性緩下薬、塩性緩下薬（ｓａｌｉｎｅ　ｌａｘａｔｉｖｅ）および浸透圧性緩下薬）；下痢止め薬剤（例えば、ＬＯＭＯＴＩＬＴＭ（ジフェノキシラート）、ＭＯＴＯＦＥＮＴＭ（ジフェノキシン）、およびＩＭＯＤＩＵＭＴＭ（塩酸ロペラミド））、ＳＡＮＤＯＳＴＡＴＩＮＴＭ（オクトレオチド）のようなソマトスタチンの合成アナログ、制吐薬（例えば、ＺＯＦＲＡＮＴＭ（オンダンセトロン）、ＫＹＴＲＩＬＴＭ（塩酸グラニセトロン）、トロピセトロン（ｔｒｏｐｉｓｅｔｒｏｎ）、ドラセトロン（ｄｏｌａｓｅｔｒｏｎ）、メトクロプラミド、クロルプロマジン、パーフェナジン、プロクロルペラジン、プロメタジン、チエチルペラジン、トリフルプロマジン、ドンペリドン、ハロペリドール、ドロペリドール、トリメトベンズアミド、デキサメタゾン、メチルプレドニゾロン、ドロナビノールおよびナビロン）；Ｄ２アンタゴニスト（例えば、メトクロプラミド、トリメトベンズアミドおよびクロルプロマジン）；胆汁酸塩；ケノデオキシコール酸；ウルソデオキシコール酸；ならびにパンクレアチンおよびパンクレリパーゼのような膵臓酵素調製物。
【０８８４】
さらなる実施形態において、本発明の治療剤は、他の治療法または予防療法（例えば、放射線療法）と組み合わせて投与される。
【０８８５】
（実施例１１：ポリペプチドのレベル低下を処置する方法）
個体におけるポリペプチドの標準の発現レベルまたは正常発現レベルの低下により引き起こされる状態は、本発明のポリペプチドを、好ましくは分泌形態および／または可溶性形態で投与することにより処置し得ることが理解される。従って、本発明はまた、このポリペプチドのレベルの増加が必要な個体の処置方法を提供する。この方法は、このような個体に、このような個体でこのポリペプチドの活性レベルを増加させる量のポリペプチドを含む治療的組成物を投与する工程を包含する。
【０８８６】
例えば、ポリペプチドのレベルが低下した患者は、そのポリペプチドを、１日用量０．１〜１００μｇ／ｋｇで６日間続けて服用する。好ましくは、ポリペプチドは分泌形態である。投与および処方物に基づく投薬計画の正確な詳細は、実施例１０に提供されている。
【０８８７】
（実施例１２：ポリペプチドのレベル上昇を処置する方法）
アンチセンス技術を使用して本発明のポリペプチドの産生を阻害する。この技術は、癌のような様々な病因に起因する、好ましくは分泌形態のポリペプチドのレベルを低下させる方法の１つの例である。
【０８８８】
例えば、ポリペプチドのレベルが異常に上昇したと診断された患者に、アンチセンスポリヌクレオチドを、０．５、１．０、１．５、２．０および３．０ｍｇ／ｋｇ／日で２１日間、静脈内投与する。この処置が十分に耐えられた場合は、７日間の休薬期間後に、この処置を繰り返す。本発明のアンチセンスポリヌクレオチドは、本明細書に記載されている技術および処方物（例えば、実施例１０を参照のこと）を用いて、さもなければ当該分野で公知の技術および処方物を用いて処方され得る。
【０８８９】
（実施例１３：遺伝子治療を使用する処置方法−エキソビボ）
遺伝子治療の１つの方法は、ポリペプチドを発現し得る線維芽細胞を患者に移植する。一般に、線維芽細胞は、皮膚生検により被験者から得られる。得られた組織を組織培養培地中に配置し、小片に分割する。組織の小塊を組織培養フラスコの湿潤表面に置き、約１０片を各フラスコに置く。このフラスコを倒置し、しっかりと閉め、そして、室温で一晩放置する。室温で２４時間後、フラスコを反転させ、そして組織塊をフラスコの底に固定させたままにし、そして新鮮な培地（例えば、１０％ＦＢＳ、ペニシリンおよびストレプトマイシンを含有するＨａｍのＦ１２培地）を添加する。次に、フラスコを３７℃で約１週間インキュベートする。
【０８９０】
この時点で、新鮮な培地を添加し、次いで数日ごとに取り換える。さらに二週間培養した後に、単層の線維芽細胞が出現する。この単層をトリプシン処理し、さらに大きなフラスコにスケールアップする。
【０８９１】
モロニーマウス肉腫ウイルスの長末端反復が隣接するｐＭＶ−７（Ｋｉｒｓｃｈｍｅｉｅｒ，Ｐ．Ｔ．ら、ＤＮＡ，７：２１９−２５（１９８８））をＥｃｏＲＩおよびＨｉｎｄＩＩＩで消化した後、仔ウシ腸ホスファターゼで処理する。線状ベクターをアガロースゲル上で分画し、そしてガラスビーズを使用して精製する。
【０８９２】
本発明のポリペプチドをコードするｃＤＮＡを、プライマーを用い、そして必要な場合、適切な制限部位および開始／終止コドンを有する、実施例１に記載の５’末端配列および３’末端配列にそれぞれ対応するＰＣＲプライマーを使用して増幅し得る。好ましくは、この５’プライマーはＥｃｏＲＩ部位を含み、そしてこの３’プライマーはＨｉｎｄＩＩＩ部位を含む。等量の、モロニーマウス肉腫ウイルスの線状骨格および増幅したＥｃｏＲＩおよびＨｉｎｄＩＩＩフラグメントを、Ｔ４　ＤＮＡリガーゼの存在下で一緒に加える。得られた混合物を、この２つのフラグメントを連結するのに適した条件下で維持する。次に、連結混合物を使用し、細菌ＨＢ１０１を形質転換する。次に、それを、カナマイシンを含む寒天上にプレーティングし、ベクターが挿入された目的の遺伝子を有することを確認する。
【０８９３】
両種指向性ｐＡ３１７またはＧＰ＋ａｍ１２パッケージング細胞を、１０％仔ウシ血清（ＣＳ）、ペニシリンおよびストレプトマイシンを含むダルベッコ改変イーグル培地（ＤＭＥＭ）中、組織培養でコンフルエントな密度まで増殖させる。次に、その遺伝子を含むＭＳＶベクターを培地に加え、そしてパッケージング細胞をこのベクターで形質導入する。このとき、このパッケージング細胞は、その遺伝子を含む感染性ウイルス粒子を産生する（ここで、このパッケージング細胞をプロデューサー細胞という）。
【０８９４】
形質導入されたプロデューサー細胞に新鮮な培地を添加し、次いでこの培地を１０ｃｍプレートのコンフルエントなプロデューサー細胞から採取する。感染性ウイルス粒子を含む使用済み培地を、ミリポアフィルターを通して濾過し、はがれたプロデューサー細胞を除去した後、この培地を使用して、線維芽細胞を感染させる。線維芽細胞のサブコンフルエントなプレートから培地を除去し、そしてプロデューサー細胞からの培地で速やかに置き換える。この培地を除去し、そして新鮮な培地と置き換える。ウイルスの力価が高ければ、実質的にすべての線維芽細胞が感染され、選択は必要ではない。力価が非常に低ければ、ｎｅｏまたはｈｉｓのような選択マーカーを有するレトロウイルスベクターを使用することが必要である。一旦、線維芽細胞が効率的に感染したなら、その線維芽細胞を分析し、タンパク質が産生されているか否かを決定する。
【０８９５】
次に、操作された線維芽細胞を、単独で、またはサイトデックス３マイクロキャリアビーズ上でコンフルエントに増殖させた後のいずれかで、宿主に移植する。
【０８９６】
（実施例１４：内因性ＥＣＭ遺伝子を使用する遺伝子治療）
本発明に従う遺伝子治療の別の方法は、内因性ＥＣＭ遺伝子配列を、例えば、米国特許第５，６４１，６７０号（１９９７年６月２４日発行）；国際公開番号ＷＯ　９６／２９４１１（１９９６年９月２６日公開）；国際公開番号ＷＯ　９４／１２６５０（１９９４年８月４日公開）；Ｋｏｌｌｅｒら、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ，８６：８９３２〜８９３５（１９８９）；およびＺｉｊｌｓｔｒａら、Ｎａｔｕｒｅ，３４２：４３５〜４３８（１９８９）に記載されるように、相同組換えを介してプロモーターに作動可能に結合する工程を包含する。この方法は、その標的細胞中に存在するが、その細胞中では発現されないかまたは所望されるよりも低いレベルで発現される、遺伝子の活性化を包含する。
【０８９７】
プロモーターおよび標的化配列を含むポリヌクレオチド構築物を作製する。この標的配列は、プロモーターに隣接する、内因性ＥＣＭ遺伝子の５’非コード配列に相同である。この標的化配列は、このＥＣＭ遺伝子の５’末端に十分に近く、その結果、このプロモーターは、相同組換えの際にこの内因性配列に作動可能に連結される。このプロモーターおよび標的化配列を、ＰＣＲを使用して増幅し得る。好ましくは、この増幅したプロモーターは、５’末端および３’末端上に異なる制限酵素部位を含む。好ましくは、第１の標的化配列の３’末端は、増幅したプロモーターの５’末端と同じ制限酵素部位を含み、そして第２の標的化配列の５’末端は、増幅したプロモーターの３’末端と同じ制限部位を含む。
【０８９８】
この増幅したプロモーターおよび増幅した標的化配列を、適切な制限酵素で消化し、続いてウシ腸ホスファターゼで処理する。消化したプロモーターおよび消化した標的化配列を、Ｔ４　ＤＮＡリガーゼの存在下でともに加える。生じた混合物を、これら２つのフラグメントの連結に適切な条件下で維持する。この構築物をアガロースゲル上でサイズ分画し、次いでフェノール抽出およびエタノール沈殿により精製する。
【０８９９】
この実施例において、このポリヌクレオチド構築物を、エレクトロポレーションを介して裸のポリヌクレオチドとして投与する。しかし、このポリヌクレオチド構築物はまた、トランスフェクション促進剤（例えば、リポソーム、ウイルス配列、ウイルス粒子、沈殿剤など）とともに投与され得る。送達のこのような方法は、当該分野で公知である。
【０９００】
一旦、細胞をトランスフェクトすると、相同組換えが生じて、このプロモーターがこの内因性ＥＣＭ遺伝子配列に作動可能に連結される。これは、この細胞中におけるＥＣＭポリヌクレオチドの発現を生じる。発現は、免疫学的染色または当該分野で公知の他の任意の方法により、検出され得る。
【０９０１】
線維芽細胞を、皮膚生検により被験者から得る。得られた組織を、ＤＭＥＭ＋１０％ウシ胎仔血清中に配置する。対数増殖期または定常期初期の線維芽細胞を、トリプシン処理し、そしてプラスチックの表面から栄養培地でリンスする。細胞懸濁液のアリコートを、計数のために取り出し、そして残りの細胞を遠心分離に供する。上清を吸引し、そしてペレットを５ｍｌのエレクトロポレーション緩衝液（２０ｍＭ　ＨＥＰＥＳ　ｐＨ７．３、１３７ｍＭ　ＮａＣｌ、５ｍＭ　ＫＣｌ、０．７ｍＭ　Ｎａ２ＨＰＯ４、６ｍＭデキストロース）に再懸濁する。この細胞を再遠心分離し、上清を吸引し、そして細胞をアセチル化ウシ血清アルブミン１ｍｇ／ｍｌを含むエレクトロポレーション緩衝液に再懸濁する。この最終細胞懸濁物は、約３×１０６細胞／ｍｌを含む。エレクトロポレーションを、再懸濁直後に実施すべきである。
【０９０２】
プラスミドＤＮＡを、標準的技術に従って調製する。例えば、ＥＣＭ遺伝子座に標的化するためのプラスミドを構築するために、プラスミドｐＵＣ１８（ＭＢＩ　Ｆｅｒｍｅｎｔａｓ、Ａｍｈｅｒｓｔ、ＮＹ）をＨｉｎｄＩＩＩで消化する。ＣＭＶプロモーターを、５’末端にＸｂａＩ部位および３’末端にＢａｍＨＩ部位を備えてＰＣＲにより増幅する。２つのＥＣＭ非コード遺伝子配列をＰＣＲを介して増幅する：一方のＥＣＭ非コード配列（ＥＣＭフラグメント１）を、５’末端にＨｉｎｄＩＩＩ部位および３’末端にＸｂａ部位を備えて増幅する；他方のＥＣＭ非コード配列（ＥＣＭフラグメント２）を、５’末端にＢａｍＨＩ部位および３’末端にＨｉｎｄＩＩＩ部位を備えて増幅する。このＣＭＶプロモーターおよびＥＣＭフラグメントを、適切な酵素（ＣＭＶプロモーター−ＸｂａＩおよびＢａｍＨＩ；ＥＣＭフラグメント１−ＸｂａＩ；ＥＣＭフラグメント２−ＢａｍＨＩ）で消化し、そしてともに連結する。生じた連結生成物をＨｉｎｄＩＩＩで消化し、そしてＨｉｎｄＩＩＩで消化したｐＵＣ１８プラスミドと連結する。
【０９０３】
プラスミドＤＮＡを、０．４ｃｍの電極ギャップを備える滅菌キュベット（Ｂｉｏ−Ｒａｄ）に添加する。最終ＤＮＡ濃度は、一般的に、少なくとも１２０μｇ／ｍｌである。次いで、この細胞懸濁液の０．５ｍｌ（約１．５×１０６細胞を含む）をこのキュベットに添加し、そしてこの細胞懸濁液およびＤＮＡ溶液を、穏やかに混合する。エレクトロポレーションを、Ｇｅｎｅ−Ｐｕｌｓｅｒ装置（Ｂｉｏ−Ｒａｄ）を用いて実施する。キャパシタンスおよび電圧を、それぞれ、９６０μＦおよび２５０〜３００Ｖに設定する。電圧が増加すると、細胞の生存が減少するが、導入されたＤＮＡをそのゲノム中に安定に組込む生存細胞の割合が劇的に増加する。これらのパラメーターを与えると、パルス時間約１４〜２０ｍＳｅｃが観察されるはずである。
【０９０４】
エレクトロポレーションした細胞を、室温で約５分間維持し、次いで、このキュベットの中身を、滅菌した移動ピペットを用いて穏やかに取り出す。この細胞を、１０ｃｍのディッシュ中の、予め温めた栄養培地（１５％ウシ血清を含むＤＭＥＭ）１０ｍｌに直接加え、そして３７℃でインキュベートする。翌日、この培地を吸引し、そして１０ｍｌの新鮮な培地で置換し、そしてさらに１６〜２４時間インキュベートする。
【０９０５】
次いで、操作された線維芽細胞を、宿主中に、単独か、またはサイトデックス（ｃｙｔｏｄｅｘ）３マイクロキャリア（ｍｉｃｒｏｃａｒｒｉｅｒ）ビーズ上でコンフルエントになるまで増殖させた後かのいずれかで、注入する。ここで、この線維芽細胞は、タンパク質産物を生成する。次いで、この線維芽細胞を、上記のような患者に導入し得る。
【０９０６】
（実施例１５：遺伝子治療を使用する処置方法−インビボ）
本発明の別の局面は、障害、疾患、および状態を処置するためにインビボ遺伝子治療法を使用することである。この遺伝子治療法は、ＥＣＭポリペプチドの発現を増大または減少させるための、動物への裸の核酸（ＤＮＡ、ＲＮＡ、およびアンチセンスＤＮＡまたはＲＮＡ）ＥＣＭ配列の導入に関する。ＥＣ、ポリヌクレオチドは、プロモーター、または標的組織によるそのＥＣＭポリペプチドの発現に必要な任意の他の遺伝子エレメントに、作動可能に連結され得る。このような遺伝子治療および送達の技術および方法は、当該分野で公知であり、例えば、ＷＯ９０／１１０９２、ＷＯ９８／１１７７９；米国特許第５６９３６２２号、同第５７０５１５１号、同第５５８０８５９号；Ｔａｂａｔａら、Ｃａｒｄｉｏｖａｓｃ．Ｒｅｓ．３５（３）：４７０−４７９（１９９７）；Ｃｈａｏ　Ｊら、Ｐｈａｒｍａｃｏｌ．Ｒｅｓ．３５（６）：５１７−５２２（１９９７）；Ｗｏｌｆｆ、Ｎｅｕｒｏｍｕｓｃｕｌ．Ｄｉｓｏｒｄ．７（５）：３１４−３１８（１９９７）、Ｓｃｈｗａｒｔｚら、Ｇｅｎｅ　Ｔｈｅｒ．３（５）：４０５−４１１（１９９６）、Ｔｓｕｒｕｍｉ　Ｙら、Ｃｉｒｃｕｌａｔｉｏｎ　９４（１２）：３２８１−３２９０（１９９６）（本明細書中に参考として援用される）を参照のこと。
【０９０７】
ＥＣＭポリヌクレオチド構築物は、注入可能な物質を動物の細胞に送達する任意の方法（例えば、組織（心臓、筋肉、皮膚、肺、肝臓、腸など）の間隙空間への注入）によって送達され得る。このＥＣＭポリヌクレオチド構築物は、薬学的に受容可能な液体または水性キャリア中で送達され得る。
【０９０８】
用語「裸の」ポリヌクレオチド、ＤＮＡまたはＲＮＡは、細胞への侵入を補助、促進、または容易にするように作用するいかなる送達ビヒクル（ウイルス配列、ウイルス粒子、リポソーム処方物、リポフェクチン、または沈澱剤などを含む）も含まない配列をいう。しかし、このＥＣＭポリヌクレオチドはまた、当業者に周知の方法によって調製され得るリポソーム処方物（例えば、ＦｅｌｇｎｅｒらＡｎｎ．ＮＹ　Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．７７２：１２６−１３９（１９９５）およびＡｂｄａｌｌａｈらＢｉｏｌ．Ｃｅｌｌ　８５（１）：１−７（１９９５）で教示されたもの）中で送達され得る。
【０９０９】
この遺伝子治療方法において使用されるＥＣＭポリヌクレオチドベクター構築物は、好ましくは、宿主ゲノムに組み込まれず、複製を可能にする配列も含まない構築物である。当業者に公知の任意の強力なプロモーターが、ＤＮＡの発現を駆動するために用いられ得る。他の遺伝子治療技術とは異なり、裸の核酸配列を標的細胞に導入する１つの主要な利点は、その細胞におけるポリヌクレオチド合成の一過性の性質である。研究によって、非複製ＤＮＡ配列が細胞に導入されて、６ヶ月までの間の期間、所望のポリペプチドの産生を提供し得ることが示された。
【０９１０】
このポリヌクレオチド構築物は、動物内の組織（筋肉、皮膚、脳、肺、肝臓、脾臓、骨髄、胸腺、心臓、リンパ、血液、骨、軟骨、膵臓、腎臓、胆嚢、胃、腸、精巣、卵巣、子宮、直腸、神経系、眼、腺、および結合組織を包含する）の間隙空間に送達され得る。この組織の間隙空間は、細胞間液、ムコ多糖基質（器官組織の細網線維、血管または腔（ｃｈａｍｂｅｒ）の壁における弾性線維、線維性組織のコラーゲン線維に間にある）、あるいは結合組織鞘性筋肉細胞内または骨の裂孔中の同じ基質を包含する。これは、同様に、循環の血漿およびリンパチャンネルのリンパ液により占められた空間である。筋肉組織の間隙空間への送達は、以下に考察する理由のために好ましい。それらは、これらの細胞を含む組織への注入によって、好都合に送達され得る。それらは、好ましくは、分化した持続性の非分裂細胞に送達され、そしてその細胞において発現されるが、送達および発現は、非分化細胞または完全には分化していない細胞（例えば、血液の幹細胞または皮膚線維芽細胞）において達成され得る。インビボで、筋肉細胞は、ポリヌクレオチドを取り込み、そして発現するそれらの能力において、特に適格である。
【０９１１】
裸のＥＣＭポリヌクレオチド注入のために、ＤＮＡまたはＲＮＡの有効投薬量は、約０．０５ｇ／ｋｇ体重から約５０ｍｇ／ｋｇ体重の範囲にある。好ましくは、この投薬量は、約０．００５ｍｇ／ｋｇから約２０ｍｇ／ｋｇであり、そしてより好ましくは、約０．０５ｍｇ／ｋｇから約５ｍｇ／ｋｇである。もちろん、当業者が認識するように、この投薬量は、注入の組織部位に従って変化する。核酸配列の適切かつ有効な投薬量は、当業者によって容易に決定され得、そして処置される状態および投与経路に依存し得る。好ましい投与経路は、組織の間隙空間への非経口注入経路によってである。しかし、他の非経口経路もまた用いられ得、これには、例えば、特に肺または気管支組織、咽喉、または鼻の粘膜への送達のためのエアロゾル処方物の吸入が挙げられる。さらに、裸のＥＣＭポリヌクレオチド構築物が、血管形成術の間に、この手順において用いられるカテーテルによって動脈に送達され得る。
【０９１２】
インビボでの筋肉における注入ＥＣＭポリヌクレオチドの用量応答効果を、以下のようにして決定する。ＥＣＭポリペプチドをコードするｍＲＮＡの生成のための適切なＥＣＭ鋳型ＤＮＡを、標準的な組換えＤＮＡ方法論に従って調製する。鋳型ＤＮＡ（これは環状または直鎖状のいずれかであり得る）を裸のＤＮＡとして使用するか、またはリポソームと複合体化するかのいずれかである。次いで、マウスの四頭筋に、種々の量の鋳型ＤＮＡを注入する。
【０９１３】
５〜６週齢の雌性および雄性のＢａｌｂ／Ｃマウスに、０．３ｍｌの２．５％Ａｖｅｒｔｉｎを腹腔内注射することにより麻酔する。１．５ｃｍの切開を大腿前部で行い、そして四頭筋を直接可視化する。ＥＣＭ鋳型ＤＮＡを、０．１ｍｌのキャリアに入れて、１ｃｃ注射器で２７ゲージ針を通して１分間にわたって、筋肉の遠位挿入部位から約０．５ｃｍのところで膝に、約０．２ｃｍの深さで注入する。縫合を、将来の位置決定のために注入部位の上で行い、そしてその皮膚をステンレス鋼クリップで閉じる。
【０９１４】
適切なインキュベーション時間（例えば、７日）後、筋肉抽出物を、四頭全体を切り出すことによって調製する。個々の四頭筋の５枚毎の１５μｍ切片を、ＥＣＭタンパク質発現について組織化学的に染色する。ＥＣＭタンパク質発現についてのタイムコースを、異なるマウスからの四頭を異なる時間で採取すること以外は、同様な様式で行い得る。注入後の筋肉中のＥＣＭ　ＤＮＡの持続性を、注入したマウスおよびコントロールマウスからの全細胞性ＤＮＡおよびＨＩＲＴ上清を調製した後、サザンブロット分析によって決定し得る。マウスにおける上記実験の結果を、裸のＥＣＭ　ＤＮＡを用いて、ヒトおよび他の動物において適切な投薬量および他の処置パラメーターを外挿するために使用し得る。
【０９１５】
（実施例１６：抗体の産生）
（ａ．ハイブリドーマ技術）
本発明の抗体は、種々の方法によって調製され得る。（Ｃｕｒｒｅｎｔ　Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ，第２章を参照のこと）。このような方法の１つの例として、ＥＣＭ　ポリペプチドを発現する細胞は、ポリクローナル抗体を含む血清の産生を誘導するために動物に投与される。好ましい方法において、ＥＣＭポリペプチドの調製物が調製され、そして精製されて、天然の夾雑物を実質的に含まないようにされる。次いで、より大きな比活性のポリクローナル抗血清を生成するために、このような調製物は、動物に導入される。
【０９１６】
ＥＣＭポリペプチドに対して特異的なモノクローナル抗体は、ハイブリドーマ技術を使用して調製される（Ｋｏｈｌｅｒら、Ｎａｔｕｒｅ　２５６：４９５（１９７５）；Ｋｏｈｌｅｒら、Ｅｕｒ．Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．６：５１１（１９７６）；Ｋｏｈｌｅｒら、Ｅｕｒ．Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．６：２９２（１９７６）；Ｈａｍｍｅｒｌｉｎｇら：Ｍｏｎｏｃｌｏｎａｌ　Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ　ａｎｄ　Ｔ−Ｃｅｌｌ　Ｈｙｂｒｉｄｏｍａｓ，Ｅｌｓｅｖｉｅｒ，Ｎ．Ｙ．、５６３−６８１頁（１９８１））。一般に、動物（好ましくはマウス）は、ＥＣＭポリペプチドで、またはより好ましくは分泌ＥＣＭポリペプチド発現細胞で免疫される。このようなポリペプチド発現細胞は、任意の適切な組織培養培地において、好ましくは１０％ウシ胎仔血清（約５６℃で非働化した）を補充し、そして約１０ｇ／ｌの非必須アミノ酸、約１，０００Ｕ／ｍｌのペニシリン、および約１００μｇ／ｍｌのストレプトマイシンを補充したＥａｒｌｅ改変イーグル培地において培養される。
【０９１７】
このようなマウスの脾細胞は抽出され、そして適切な骨髄腫細胞株と融合される。任意の適切な骨髄腫細胞株は、本発明に従って用いられ得る；しかし、ＡＴＣＣから入手可能な親骨髄腫細胞株（ＳＰ２Ｏ）を用いることが好ましい。融合後、得られるハイブリドーマ細胞を、ＨＡＴ培地において選択的に維持し、次いでＷａｎｄｓら（Ｇａｓｔｒｏｅｎｔｅｒｏｌｏｇｙ　８０：２２５−２３２（１９８１））により記載されるように限界希釈によってクローニングする。次いで、このような選択によって得られるハイブリドーマ細胞は、ＥＣＭポリペプチドを結合し得る抗体を分泌するクローンを同定するためにアッセイされる。
【０９１８】
あるいは、ＥＣＭポリペプチドに結合し得るさらなる抗体を、抗イディオタイプ抗体を使用して２段階工程の手順において生成し得る。このような方法は、抗体それ自体が抗原であり、それゆえ二次抗体に結合する抗体を得ることが可能であるという事実を利用する。この方法に従って、タンパク質特異的抗体を使用して、動物（好ましくは、マウス）を免疫する。次いで、このような動物の脾細胞を使用して、ハイブリドーマ細胞を産生する。そして、このハイブリドーマ細胞は、ＥＣＭタンパク質に特異的な抗体のポリペプチドに結合する能力がＥＣＭポリペプチドによってブロックされ得る抗体を産生するクローンを同定するためにスクリーニングされる。このような抗体は、ＥＣＭタンパク質に特異的な抗体のポリペプチドに対する抗イディオタイプ抗体を含み、そして動物を免疫してさらなるＥＣＭタンパク質に特異的な抗体のポリペプチドの形成を誘導するために使用される。
【０９１９】
ヒトにおける抗体のインビボ使用のために、抗体は、「ヒト化」される。このような抗体は、上記のモノクローナル抗体を産生するハイブリドーマ細胞に由来する遺伝的構築物を使用することによって産生され得る。キメラ抗体およびヒト化抗体を産生するための方法は当該分野で公知であり、そして本明細書中に議論される（総説については、Ｍｏｒｒｉｓｏｎ，Ｓｃｉｅｎｃｅ　２２９：１２０２（１９８５）；Ｏｉら、ＢｉｏＴｅｃｈｎｉｑｕｅｓ　４：２１４（１９８６）；Ｃａｂｉｌｌｙら、米国特許第４，８１６，５６７号；Ｔａｎｉｇｕｃｈｉら、ＥＰ　１７１４９６；Ｍｏｒｒｉｓｏｎら、ＥＰ　１７３４９４；Ｎｅｕｂｅｒｇｅｒら、ＷＯ　８６０１５３３；Ｒｏｂｉｎｓｏｎら、ＷＯ　８７０２６７１；Ｂｏｕｌｉａｎｎｅら、Ｎａｔｕｒｅ　３１２：６４３（１９８４）；Ｎｅｕｂｅｒｇｅｒら、Ｎａｔｕｒｅ　３１４：２６８（１９８５）を参照のこと）。
【０９２０】
（ｂ）ｓｃＦｖｓのライブラリーからのＥＣＭポリペプチドに対して指向される抗体フラグメントの単離）
ヒトＰＢＬから単離した天然に存在するＶ遺伝子を、ドナーが曝され得たかまたは曝され得なかったＥＣＭポリペプチドに対する反応性を含む抗体フラグメントのライブラリーに構築する（例えば、米国特許第５，８８５，７９３号（その全体が参考として本明細書に援用される）を参照のこと）。
【０９２１】
（ライブラリーのレスキュー）
ＰＣＴ公開ＷＯ　９２／０１０４７に記載のように、ヒトＰＢＬのＲＮＡからｓｃＦｖｓのライブラリーを構築する。抗体フラグメントを提示するファージをレスキューするため、ファージミドを保有する約１０９個のＥ．ｃｏｌｉを用いて、５０ｍｌの２×ＴＹ（１％グルコースおよび１００μｇ／ｍｌのアンピシリンを含有する）（２×ＴＹ−ＡＭＰ−ＧＬＵ）を接種し、そして振盪しながら０．８のＯ．Ｄ．まで増殖させる。この培養物の５ｍｌを用いて５０ｍｌの２×ＴＹ−ＡＭＰ−ＧＬＵに接種し、２×１０８ＴＵのΔ遺伝子３ヘルパー（Ｍ１３Δ遺伝子ＩＩＩ、ＰＣＴ公開ＷＯ９２／０１０４７を参照のこと）を添加し、そして培養物を振盪なしで３７℃で４５分間インキュベートし、次いで振盪しながら３７℃で４５分間インキュベートする。この培養物を１０分間４０００ｒ．ｐ．ｍ．で遠心分離し、そしてペレットを２リットルの２×ＴＹ（１００μｇ／ｍｌアンピシリンおよび５０μｇ／ｍｌカナマイシンを含有する）中に再懸濁し、そして一晩増殖させる。ファージをＰＣＴ公開ＷＯ９２／０１０４７に記載のように調製する。
【０９２２】
Ｍ１３Δ遺伝子ＩＩＩを以下のように調製する：Ｍ１３Δ遺伝子ＩＩＩヘルパーファージは、遺伝子ＩＩＩタンパク質をコードしない。それゆえ、抗体フラグメントを提示するファージ（ファージミド）は、抗原に対するより大きい結合アビディティーを有する。ファージ形態形成の間、野生型遺伝子ＩＩＩタンパク質を供給するｐＵＣ１９誘導体を保有する細胞においてヘルパーファージを増殖させることにより、感染性Ｍ１３Δ遺伝子ＩＩＩ粒子を作製する。培養物を振盪なしで３７℃で１時間インキュベートし、次いで振盪しながら３７℃でさらに１時間インキュベートする。細胞を遠心沈殿（ＩＥＣ−Ｃｅｎｔｒａ　８，４００ｒ．ｐ．ｍ．で１０分間）し、１００μｇ／ｍｌのアンピシリンおよび２５μｇ／ｍｌのカナマイシンを含有する２×ＴＹブロス（２×ＴＹ−ＡＭＰ−ＫＡＮ）３００ｍｌ中で再懸濁し、そして３７℃で振盪しながら一晩増殖させた。ファージ粒子を、２回のＰＥＧ沈殿（Ｓａｍｂｒｏｏｋら、１９９０）により培養培地から精製および濃縮し、２ｍｌ　ＰＢＳに再懸濁し、そして０．４５μｍのフィルター（Ｍｉｎｉｓａｒｔ　ＮＭＬ；Ｓａｒｔｏｒｉｕｓ）を通過させ、約１０１３形質導入単位／ｍｌ（アンピシリン耐性クローン）の最終濃度を得る。
【０９２３】
（ライブラリーのパニング）
Ｉｍｍｕｎｏｔｕｂｅｓ（Ｎｕｎｃ）を、本発明のポリペプチドの１００μｇ／ｍｌまたは１０μｇ／ｍｌのいずれかの４ｍｌを用いてＰＢＳ中で一晩被膜する。チューブを２％Ｍａｒｖｅｌ−ＰＢＳを用いて３７℃で２時間ブロックし、次いでＰＢＳ中で３回洗浄する。約１０１３ＴＵのファージをチューブに適用し、そして、回転盤上で上下にタンブリングしながら室温で３０分間インキュベートし、次いでさらに１．５時間静置しておく。チューブをＰＢＳ　０．１％Ｔｗｅｅｎ−２０で１０回、そしてＰＢＳで１０回洗浄する。１ｍｌの１００ｍＭトリエチルアミンを添加し、そして回転盤上で１５分間上下に回転させることによりファージを溶出し、その後この溶液を０．５ｍｌの１．０Ｍ　Ｔｒｉｓ−ＨＣｌ，ｐＨ７．４で直ちに中和する。次いで、溶出したファージを細菌とともに３７℃で３０分間インキュベートすることにより、ファージを用いて、１０ｍｌの対数増殖中期のＥ．ｃｏｌｉ　ＴＧ１に感染させる。次いで、Ｅ．ｃｏｌｉを１％グルコースおよび１００μｇ／ｍｌアンピシリンを含有するＴＹＥプレート上にプレートする。次いで、得られる細菌ライブラリーを、上記のようにΔ遺伝子３ヘルパーファージでレスキューし、次の回の選択のためのファージを調製する。次いで、このプロセスを、アフィニティー精製の全４回について反復し、３回目および４回目にはチューブ洗浄をＰＢＳ、０．１％Ｔｗｅｅｎ−２０で２０倍、そしてＰＢＳで２０倍に増加する。
【０９２４】
（結合剤の特徴付け）
第３回目および４回目の選択から溶出したファージを用いて、Ｅ．ｃｏｌｉ　ＨＢ　２１５１を感染させ、そして可溶性ｓｃＦｖをアッセイのために単一コロニーから生成する（Ｍａｒｋｓら、１９９１）。５０ｍＭ炭酸水素塩、ｐＨ９．６中の本発明のポリペプチドの１０ｐｇ／ｍｌのいずれかで被膜したマイクロタイタープレートを用いてＥＬＩＳＡを実行する。ＥＬＩＳＡ中の陽性クローンをＰＣＲフィンガープリンティング（例えば、ＰＣＴ公報ＷＯ９２／０１０４７を参照のこと）、次に配列決定することによりさらに特徴付ける。これらのＥＬＩＳＡ陽性クローンはまた、当該分野において公知の技術（例えば、エピトープマッピング、結合親和性、レセプターシグナル形質導入、抗体／抗原結合をブロックするかまたは競合的に阻害する能力、および競合的アゴニスト活性または競合的アンタゴニスト活性など）によりさらに特徴付けられ得る。
【０９２５】
（実施例１７：へパラナーゼ活性についてのアッセイ）
本発明のポリペプチドのへパラナーゼタンパク質の活性をアッセイするために、Ｖｌｏｄａｖｓｋｙらにより記載されるへパラナーゼアッセイを利用する（Ｖｌｏｄａｖｓｋｙ，Ｉ．ら，Ｎａｔ．Ｍｅｄ．，５：７９３−８０２（１９９９））。簡単には、細胞溶解物、馴化培地またはインタクトな細胞（３５ｍｍディッシュあたり１×１０６個の細胞）を、１８時間、３７℃にて、ｐＨ６．２〜６．６で、３５Ｓ標識ＥＣＭまたは可溶性ＥＣＭ由来のピークＩプロテオグリカンと共にインキュベートする。インキュベーション培地を遠心分離し、そしてその上清をＳｅｐｈａｒｏｓｅ　ＣＬ−６Ｂカラム（０．９×３０ｃｍ）でのゲル濾過により分析する。画分をＰＢＳを用いて溶出し、そしてそれらの放射活性を測定する。ヘパラン硫酸側鎖の分解フラグメントを、Ｓｅｐｈａｒｏｓｅ　６Ｂから、０．５＜Ｋａｖ＜０．８（ピークＩＩ）において溶出する。各実験を、少なくとも３回行う。Ｖｌｏｄａｖｓｋｙらにより記載されるように、「ピークＩＩ」に対応する分解フラグメントは、ヘパラン硫酸を切断するヘパラナーゼタンパク質の活性を示す。
【０９２６】
（実施例１８：接着活性についてのアッセイ）
当業者が本発明のポリペプチドの接着可能性を測定するために使用し得る、多くの方法が存在する。例えば、Ｃｕｒｒｅｎｔ　Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ　ｉｎ　Ｃｅｌｌ　Ｂｉｏｌｏｇｙ（Ｗｉｌｅｙ　＆　Ｓｏｎｓ，２００１）において記載される接着アッセイが利用される。簡単には、ポリペプチド、または非接着性タンパク質キャリア（例えば、Ｎ−スクシンイミジル　３（２−ピリジルジチオ）プロピオネート（ＳＰＤＰ）またはウサギＩｇＧ）に接合したポリペプチドを希釈し、そして９６ウェルの、組織培養マイクロタイタープレート上にコートした。非特異的な接着を、１０ｍｇ／ｍｌの熱変成したＢＳＡ溶液で３０分間ブロックする。線維芽細胞についての５×１０５／ｍｌの研究細胞懸濁液および類似のサイズ分けした細胞ならびに１×１０７／ｍｌの白血球細胞は、５％〜１０％（ｖ／ｖ）ＣＯ２でガス供給した温かいＤＭＥＭ／ＨＥＰＥＳにおいて調製される。１００％の接着は、コートしていないウェル中に、研究細胞懸濁液を、記載されるＤＭＥＭ／ＨＥＰＥＳを２０％、５０％、および１００％使用して希釈し、そしてＤＰＢＳを添加し、その後等量の希釈細胞懸濁液を添加することによって評価する。ポリペプチドへの接着を試験するために、ＤＰＢＳの後に等量の研究細胞懸濁液を、適切にコートされたウェルに添加する。３７℃で１５〜２０分間、５〜１０％（ｖ／ｖ）ＣＯ２でのインキュベーションの後、コントロールウェルを５％グルタルアルデヒドにおいて固定し、そして剥がれた細胞を実験ウェルから、ＤＰＢＳで１〜３回洗浄することによって除去する。接着細胞を、０．１％（ｗ／ｖ）クリスタルバイオレットで染色し、その後１０％（ｗ／ｖ）酢酸で染色する。吸光度を５７０ｎｍで、マイクロタイタープレートリーダーを使用して測定する。バックグラウンドのクリスタルバイオレット染色を、この結果から引く。このコントロールデータをプロットし、そして１００％の接着の値を推定する。実験データを、％接着として表す。６０％よりも大きい％接着を、陽性の結果の指標とする。このアッセイについてのバックグラウンドは、妥当であるべきアッセイについて、５〜１０％よりも大きくあるべきではない。
【０９２７】
本発明を、前述の説明および実施例に詳細に記載された以外の方法で実施し得ることは、明らかである。本発明の多数の改変およびバリエーションが、上記の教示を考慮して可能であり、従って、それは、添付の特許請求の範囲の範囲内にある。
【０９２８】
発明の背景、詳細な説明および実施例において引用された各文書の全開示（特許、特許出願、学術文献、要約、実験マニュアル、書籍または他の開示を含む）は、本明細書中に参考として援用される。さらに、本明細書にとともに提出された配列表のハードコピーおよび対応するコンピュ−ター読み出し形態は、両方とも本明細書中にその全体が参考として援用される。
【０９２９】
本発明の特定のＥＣＭポリヌクレオチドおよびポリペプチド（抗体を含む）は、米国仮出願第６０／１９８，１２３号（２０００年４月１８日出願）において記載され、その明細書および配列表はその全体が参考として本明細書に援用される。
【０９３０】
【表６】
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ＡＴＣＣ寄託番号ＰＴＡ−１７３５
（カナダ）
出願人は、出願に基づきカナダ国特許が発行されるか、あるいは同出願が拒絶または放棄されて回復され得なくなるかもしくは取り下げられるまでは、特許庁長官（Ｃｏｍｍｉｓｓｉｏｎｅｒ　ｏｆ　Ｐａｔｅｎｔｓ）が、長官により指名された独立の専門家に対してのみ出願中で言及された寄託済みの生物学的材料のサンプルの供与を許可する旨を請求し、出願人は、国際出願の公表のための規則上の準備が完了する前に、書面によりその旨を国際事務局に告知しなければならない。
【０９３１】
（ノルウェー）
出願人はここにおいて、出願が（ノルウェー特許庁により）公開に付されるかあるいは公開を経ずにノルウェー特許庁による最終的な決定を受けるまでは、サンプルの供与は当該技術の専門家に対してのみ行われる旨を、請求する。この旨の請求は、ノルウェー特許法第２２条および第３３条（３）に基づき出願が公に利用可能にされる時点以前に、出願人によりノルウェー特許庁に対してなされるものとする。そのような請求が出願人によりなされた場合は、第三者によるサンプルの供与のいかなる請求においても、利用される専門家を表示するものとする。専門家は、ノルウェー特許庁により作成された公認専門家のリスト（ｌｉｓｔ　ｏｆ　ｒｅｃｏｇｎｉｚｅｄ　ｅｘｐｅｒｔｓ）に記載された任意の者か、あるいは、個々の場合において出願人により承認された任意の者であり得る。
【０９３２】
（オーストラリア）
出願人はここにおいて、微生物のサンプルの供与は、特許の付与前において、あるいは出願の放棄（ｌａｐｓｉｎｇ）、拒絶あるいは取り下げ前において、発明に対し利害関係を有さない当業者である対象者（ｓｋｉｌｌｅｄ　ａｄｄｒｅｓｓｅｅ）に対してのみ行われる旨を、告知するものである（オーストラリア国特許法第３．２５（３）号規定）。
【０９３３】
（フィンランド）
出願人はここにおいて、出願が（特許および統制委員会（Ｎａｔｉｏｎａｌ　Ｂｏａｒｄ　ｏｆ　Ｐａｔｅｎｔｓ　ａｎｄ　Ｒｅｇｕｌａｔｉｏｎｓ）により）公開に付されるかあるいは公開を経ずに国立特許および法規委員会による決定を受けるまでは、サンプルの供与は当該技術の専門家に対してのみ行われる旨を、請求する。
ＡＴＣＣ寄託番号ＰＴＡ−１７３５
（英国）
出願人はここにおいて、微生物のサンプルの供与は専門家に対してのみ利用可能にされる旨を、請求する。この旨の請求は、出願の国際公表のための規則上の準備が完了する前に、出願人により国際事務局に対してなされなければならない。
【０９３４】
（デンマーク）
出願人はここにおいて、出願が（デンマーク特許庁により）公開に付されるかあるいは公開を経ずにデンマーク特許庁による最終的な決定を受けるまでは、サンプルの供与は当該技術の専門家に対してのみ行われる旨を、請求する。この旨の請求は、デンマーク特許法第２２条および第３３条（３）に基づき出願が公に利用可能にされる時点以前に、出願人によりデンマーク特許庁に対してなされるものとする。そのような請求が出願人によりなされた場合は、第三者によるサンプルの供与のいかなる請求においても、利用される専門家を表示するものとする。専門家は、デンマーク特許庁により作成された公認専門家のリスト（ｌｉｓｔ　ｏｆ　ｒｅｃｏｇｎｉｚｅｄ　ｅｘｐｅｒｔｓ）に記載された任意の者か、あるいは、個々の場合において出願人により承認された任意の者であり得る。
【０９３５】
（スウェーデン）
出願人はここにおいて、出願が（スウェーデン特許庁により）公開に付されるかあるいは公開を経ずにスウェーデン特許庁による最終的な決定を受けるまでは、サンプルの供与は当該技術の専門家に対してのみ行われる旨を、請求する。この旨の請求は、優先日から１６ヶ月が経過するよりも前に、出願人により国際事務局に対してなされるものとする（好ましくはＰＣＴ　Ａｐｐｌｉｃａｎｔ’ｓ　ＧｕｉｄｅのＶｏｌｕｍｅ　Ｉのａｎｎｅｘ　Ｚに記載された書式ＰＣＴ／ＲＯ／１３４による）。そのような請求が出願人によりなされた場合は、第三者によるサンプルの供与のいかなる請求においても、利用される専門家を表示するものとする。専門家は、スウェーデン特許庁により作成された公認専門家のリスト（ｌｉｓｔ　ｏｆ　ｒｅｃｏｇｎｉｚｅｄ　ｅｘｐｅｒｔｓ）に記載された任意の者か、あるいは、個々の場合において出願人により承認された任意の者であり得る。
【０９３６】
（オランダ）
出願人はここにおいて、オランダ特許の発行日まで、あるいは出願が拒絶、取り下げあるいは放棄（ｌａｐｓｅｄ）される日までは、特許法３１Ｆ（１）の規定に基づき、微生物は専門家へのサンプル供与の形でのみ行われる旨を、請求する。この旨の請求は、オランダ王国特許法の第２２Ｃ条または第２５条に基づき出願が公に利用可能にされる日のうちいずれか早い方の日付よりも前に、出願人によりオランダ工業所有権局に対して提出されるものとする。
【国際公開パンフレット】
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【国際調査報告】
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