(57)【要約】サンプル中の分析物を検出するための装置が提供される。この装置は、以下を備える：検出ゾーン（１４）を有する１つ以上のチャネル（１０）；検出ゾーン（１４）に非干渉性放射線を照射するために配置された、１つ以上の照射源（１６）；検出ゾーン（１４）における、放射線によって励起されたマーカーから放出される光シグナルを収集するために配置された、検出器アレイ（３４）であって、出力を有する、検出器アレイ（３４）；および検出器アレイ（３４）に結合されたシステムであって、検出器アレイ（３４）の出力において電荷を読み取る前に、電荷を蓄積することによって、この光シグナルに対応する電荷の時間遅延積分を、検出器アレイ（３４）において実施するための、システム。サンプル中の分析物を検出するための他の装置および方法もまた、提供される。
2004537053.tif 000002
【特許請求の範囲】
【請求項１】
サンプル中の分析物を検出するための装置であって、以下：
検出ゾーンを有する、１つ以上のチャネル；
該検出ゾーンを非干渉性の放射線で照射するために配置された、１つ以上の照射源；
該検出ゾーンにおいて、該放射線によって励起されたマーカーから放出された光シグナルを収集するために配置された検出器アレイであって、該検出器アレイは、出力を有する、検出器アレイ；および
該検出器アレイに結合されたシステムであって、該検出器アレイの出力における電荷を読み取る前に、該電荷を蓄積することによって、該検出器アレイにおける該光シグナルに対応する電荷の時間遅延積分を実施するための、システム、
を備える、装置。
【請求項２】
前記時間遅延積分を実施するためのシステムが、以下：（ａ）前記検出器アレイにおける前記電荷をシフトさせること、および（ｂ）該検出器アレイおよび前記検出ゾーンからの光シグナルを、互いに対して移動させること、のうちの少なくとも１つによって、該電荷を蓄積する、請求項１に記載の装置。
【請求項３】
前記１つ以上の照射源が、１つ以上の発光ダイオードを備える、請求項１に記載の装置。
【請求項４】
前記検出ゾーンと前記検出器アレイとの間に配置された、変調光学素子をさらに備え、該変調光学素子が、平行化レンズおよび再画像化レンズを有するリレーレンズシステムを備える、請求項１に記載の装置。
【請求項５】
前記変調光学素子が、前記１つ以上の照射源と前記検出ゾーンとの間に配置された調節フィルタをさらに備える、請求項４に記載の装置。
【請求項６】
前記変調光学素子が、前記調節フィルタと前記検出ゾーンとの間に配置された集光レンズをさらに備える、請求項５に記載の装置。
【請求項７】
前記変調光学素子が、前記集光レンズと前記再画像化レンズとの間に配置された透過型回折格子をさらに備える、請求項４に記載の装置。
【請求項８】
前記変調光学素子が、前記検出ゾーンと前記検出器アレイとの間に配置された光シグナルのみをフィルタリングするためのフィルタをさらに備える、請求項４に記載の装置。
【請求項９】
サンプル中の分析物を検出するための装置であって、以下：
検出ゾーンを有する、１つ以上のチャネル；
該検出ゾーンを放射線で照射するために配置された、１つ以上の照射源；
該検出ゾーンにおいて該放射線によって励起されたマーカーから放出される光シグナルを収集するために配置された、検出器アレイであって、該検出器アレイは、出力を有する、検出器アレイ；および
該検出器アレイに結合されたシステムであって、該検出器アレイの出力における電荷を読み取る前に、該電荷を蓄積することによって、該検出器アレイにおける該光シグナルに対応する電荷の時間遅延積分を実施するためのシステムであり、該システムは、該検出器アレイおよび該検出ゾーンからの光シグナルを互いに対して移動させることによって、該時間遅延積分を実施する、システム、
を備える、装置。
【請求項１０】
サンプル中の分析物を検出するための装置であって、以下：
検出ゾーンを有する、１つ以上のチャネル；
該検出ゾーンを放射線で照射するために配置された、１つ以上の照射源；
該検出ゾーンにおいて、該放射線によって励起されたマーカーから放出される光シグナルを収集するために配置された、検出器アレイであって、該検出器アレイは、出力を有する、検出器アレイ；
該検出器アレイに結合されたシステムであって、該検出器アレイの出力における電荷を読み取る前に、該電荷を蓄積することによって、該検出器における該光シグナルに対応する電荷の時間遅延積分を実施するための、システム；および
該検出ゾーンと該検出器アレイとの間に配置された、再画像化レンズであって、該検出器アレイによって、該光シグナルによって作成された画像が収集される前に、該画像を光学的に反転させるための、再画像化レンズ、
を備える、装置。
【請求項１１】
前記時間遅延積分を実施するためのシステムが、前記検出器アレイにおいて電荷をシフトさせること、および該検出器アレイと該検出ゾーンからの光シグナルを互いに対して移動させることの少なくとも１つによって、該電荷を蓄積する、請求項１０に記載の装置。
【請求項１２】
サンプル中の分析物を検出するための装置であって、以下：
内部に検出ゾーンを有する少なくとも１つのチャネルを規定する、チャネル規定部材；
該少なくとも１つのチャネルに結合された分離システムであって、分析物を含有するサンプルを、該少なくとも１つのチャネルに沿って移動する分析物バンドに分離するためのものであり、各分析物バンドが、対応するマーカーの存在によって検出可能である、分離システム；
少なくとも１つの照射源であって、非干渉性の放射線を放出するためのものであり、そして該少なくとも１つのチャネルの該検出ゾーンを照射し、これによって、対応する分析物を表す光シグナルを放出する、該放射線に応答性のマーカーを励起させるためのものである、少なくとも１つの照射源；
検出器アレイであって、該マーカーによって生成された光シグナルを収集するため、および該光シグナルに対応する電荷を生成するために配置されており、該検出器アレイは、出力を有する、検出器アレイ；
該少なくとも１つの照射源と該検出器アレイとの間で、光を変調するための、変調光学素子；ならびに
時間遅延積分システムであって、該検出器アレイの出力に蓄積された電荷を読み取る前に、該検出器アレイにおける、少なくとも１つの所定の分析物バンドに関連する光シグナルに対応する電荷の蓄積を実施するためのものであり、該蓄積が、該検出ゾーンを少なくとも部分的に横切って移動する、該少なくとも１つの所定の分析物バンドの積分時間の間に実施される、時間遅延積分システム、
を備える、装置。
【請求項１３】
前記時間遅延積分システムが、以下：（ａ）前記検出器アレイにおいて前記電荷を移動させること、および（ｂ）該検出器アレイおよび前記検出ゾーンからの光シグナルを、互いに対して移動させること、のうちの少なくとも１つによって、該電荷を蓄積する、請求項１２に記載の装置。
【請求項１４】
前記少なくとも１つの照射源が、少なくとも１つの発光ダイオードを備える、請求項１２に記載の装置。
【請求項１５】
サンプルをさらに備え、該サンプルは、マーカーで標識され少なくとも１つの分析物を内部に含有し、そして移動媒体と接触している、請求項１２に記載の装置。
【請求項１６】
前記マーカーが色素マーカーである、請求項１２に記載の装置。
【請求項１７】
前記変調光学素子が、前記少なくとも１つの照射源の各照射源に対してそれぞれの調節フィルタを備え、各それぞれの調節フィルタが、該少なくとも１つの照射源によって放出される予め決定された波長の光を実質的に遮断し、これによって調節された光を生成するために効果的であり、該予め決定された波長が、該少なくとも１つの照射源のそれぞれに応答性のマーカーの発光スペクトルと重ならない波長である、請求項１２に記載の装置。
【請求項１８】
前記変調光学素子が、前記検出ゾーンに前記調節された光を集光するための光学系を備える、請求項１７に記載の装置。
【請求項１９】
前記変調光学素子が、前記検出ゾーンからの光を平行化し、これによって平行光を生成するための光学系を備える、請求項１２に記載の装置。
【請求項２０】
前記変調光学素子が、前記少なくとも１つの照射源の各照射源に対する、それぞれのロングパスフィルタおよびそれぞれの帯域フィルタの少なくとも１つを備え、該それぞれのロングパスフィルタおよびそれぞれの帯域フィルタの少なくとも１つの各々が、関連するセットのマーカーによって放出される光シグナルの部分に対応する検出ゾーンからの、予め決定された波長の光を、実質的に排他的に通過させ、これによって、フィルタリングされた光を生成するために効果的である、請求項１２に記載の装置。
【請求項２１】
前記光シグナルの前記波長の部分が、ピーク強度の各側の波長の約５％と約２０％との間で、前記関連するセットのマーカーによって放出される光シグナルのピーク強度に近い波長の範囲に対応する、請求項２０に記載の装置。
【請求項２２】
前記光シグナルの前記波長の部分が、前記放出される光シグナルのピーク強度の強度の約半分に位置する前記関連するセットのマーカーによって放出される光シグナルのピーク強度に近い波長の範囲に対応する、請求項２０に記載の装置。
【請求項２３】
前記少なくとも１つの照射源が、単一の発光ダイオードを備え、前記装置が、前記光シグナルをスペクトル的に分配し、これによって、スペクトル的に分配された光を生成する機構をさらに備える、請求項１２に記載の装置。
【請求項２４】
前記変調光学素子が、以下：
前記少なくとも１つの照射源の各照射源に対する、それぞれの調節フィルタであって、各それぞれの調節フィルタは、該少なくとも１つの照射源のそれぞれの照射源によって放出される予め決定された波長の光を実質的に遮断し、これによって、調節された光を生成するために効果的であり、該予め決定された波長が、該少なくとも１つの照射源のそれぞれの照射源に応答性のマーカーの発光スペクトルと重ならない波長である、調節フィルタ；
調節された光を前記検出ゾーンに集光するための、光学系；および
前記少なくとも１つの照射源の各々に対する、それぞれのロングパスフィルタおよびそれぞれの帯域フィルタの少なくとも１つであって、関連するセットのマーカーによって放出される光シグナルの部分に対応する検出ゾーンからの、予め決定された波長の光シグナルを、実質的に排他的に通過させ、これによって、フィルタリングされた光を生成するためのものである、それぞれのロングパスフィルタおよびそれぞれの帯域フィルタの少なくとも１つ、
を備える、請求項１２に記載の装置。
【請求項２５】
前記変調光学素子が、前記検出ゾーンからの光を平行化し、これによって、平行光を生成するための光学系をさらに備える、請求項２４に記載の装置。
【請求項２６】
前記変調光学素子が、前記フィルタリングされた光を前記検出器アレイに集光するための再画像化光学系をさらに備える、請求項２４に記載の装置。
【請求項２７】
請求項２０に記載の装置であって：
前記少なくとも１つの照射源が、複数の発光ダイオードを備え、各発光ダイオードが、それぞれの予め決定された周波数範囲の光を放出し；そして
前記それぞれの帯域フィルタが、複数の帯域フィルタを備え、各帯域フィルタが、該複数の発光ダイオードのそれぞれ１つに関連し、各それぞれの帯域フィルタが、関連するセットのマーカーによって放出される光シグナルの波長の部分に対応する、前記検出ゾーンからの予め決定された波長の光を、実質的に排他的に通し、これによって、フィルタリングされた光を生成するために効果的である、
装置。
【請求項２８】
各それぞれの帯域フィルタからのフィルタリングされた光を、該各それぞれの帯域フィルタの関数として、予め決定された量だけ空間的にオフセットさせるためのオフセットシステムをさらに備え、その結果、前記検出器アレイ上の画像が、互いに空間的にオフセットした電荷によって作成される、請求項２７に記載の装置。
【請求項２９】
前記オフセットシステムが、複数のオフセット機構を備え、各オフセット機構が、前記帯域フィルタのそれぞれ１つに関連している、請求項２８に記載の装置。
【請求項３０】
各オフセット機構が、ガラス板、格子、およびミラーの１つを備える、請求項２９に記載の装置。
【請求項３１】
各それぞれの帯域フィルタからのフィルタリングされた光を、予め決定された量だけ空間的にオフセットさせるために、前記オフセットシステムが、前記検出器アレイ、前記変調光学素子、および前記検出ゾーンの、互いに対する少なくとも１つの並進移動を生じさせるよう適合されている、請求項２８に記載の装置。
【請求項３２】
前記オフセットシステムが、前記検出器アレイ、前記変調光学素子、および前記検出ゾーンの少なくとも１つの、予め決定された量での互いに対する並進移動を生じさせるように適合されている、請求項３１に記載の装置。
【請求項３３】
フィルタホイールをさらに備え、前記帯域フィルタが、該フィルタホイールに配置されており、該各それぞれの帯域フィルタに関連するマーカーのセットによって、前記検出ゾーンから放出された、フィルタリングされた光について、各それぞれの帯域フィルタが、該検出ゾーンに対して選択的に配置可能である、請求項２７に記載の装置。
【請求項３４】
前記複数の発光ダイオードが、少なくとも４つの発光ダイオードを備える、請求項２８に記載の装置。
【請求項３５】
前記時間遅延積分システムが、前記検出器アレイの出力における蓄積された電荷をフレームごとの基礎で読み取るように該検出器アレイを制御するように適合されており、各フレームが、前記積分時間の間に該検出器アレイに蓄積された電荷に対応し、そして前記帯域フィルタの関連する１つを通して前記光シグナルをフィルタリングすることによって生成される、請求項２７に記載の装置。
【請求項３６】
前記検出器アレイが、二次元フレーム移動電荷結合素子を備える、請求項３５に記載の装置。
【請求項３７】
前記時間遅延積分システムが、前記検出器アレイの出力における蓄積した電荷を連続的な基礎で読み取るように該検出器アレイを制御するよう適合されている、請求項２７に記載の装置。
【請求項３８】
照射ホイールをさらに備え、前記複数の発光ダイオードが、該照射ホイール上に配置されており、各それぞれの発光ダイオードが、前記検出ゾーンを所定の範囲の波長で照射するために選択的にさらに配置可能である、請求項３７に記載の装置。
【請求項３９】
請求項３３に記載の装置であって：
前記時間遅延積分システムが、前記検出器アレイの出力における蓄積した電荷を連続的な基礎で読み取るように該検出器アレイを制御するよう適合されており；そして
該装置が、さらに、以下：
照射ホイールであって、前記複数の発光ダイオードが、該照射ホイール上に配置されており、各それぞれの発光ダイオードが、前記検出ゾーンを照射するためにさらに選択的に配置可能である、照射ホイール；および
前記フィルタホイールおよび該照射ホイールをデューティーサイクリングするための機構であって、各照射時間間隔の間に、該発光ダイオードの任意の組み合わせによって、該検出ゾーンの照射に対応する該検出器アレイの変化を生じさせるための、機構、
を備える、装置。
【請求項４０】
前記検出器アレイが、二次元電荷結合素子を備える、請求項１２に記載の装置。
【請求項４１】
請求項１２に記載の装置であって：
前記少なくとも１つのチャネルが、複数のチャネルを備え；
前記少なくとも１つの照射源が、該複数のチャネルを同時に照射するよう適合された、複数の発光ダイオードを備え；そして
該装置が、該チャネルを選択的にマスクするためのマスクを備え、その結果、該チャネルのそれぞれの検出ゾーンからの光シグナルが異なる、
装置。
【請求項４２】
サンプル中の分析物を検出するための装置であって、以下：
検出ゾーンを内部に有する少なくとも１つのチャネルを規定する、チャネル規定部材；
分析物を含有するサンプルを、該少なくとも１つのチャネルに沿って移動する分析物バンドに分離するための、該少なくとも１つのチャネルに結合された分離システムであって、各分析物バンドが、対応するマーカーの存在によって検出可能である、分離システム；
少なくとも１つの照射源であって、該少なくとも１つのチャネルの検出ゾーンを放射線で照射し、これによって、対応する分析物を示す光シグナルを放出する、該放射線に応答性のマーカーを励起させるために配置される、照射源；
検出器アレイであって、該マーカーによって生成した光シグナルを収集するため、および該光シグナルに対応する電荷を生成するために配置されており、該検出器アレイは、出力を有する、検出器アレイ；
変調光学素子であって、該少なくとも１つの照射源と該検出器アレイとの間で光を変調するための、変調光学素子；ならびに
時間遅延積分システムであって、該検出器アレイの出力における蓄積した電荷を読み取る前に、該検出器アレイにおける少なくとも１つの所定の分析物バンドに関連する光シグナルに対応する電荷の蓄積を実施するためのものであり、該蓄積が、該検出器アレイおよび該少なくとも１つの検出ゾーンおよび該変調光学素子を互いに対して移動させることによって、該少なくとも１つの所定の分析物バンドが、該検出ゾーンを横切って移動する積分時間の間に実施される、時間遅延積分システム、
を備える、装置。
【請求項４３】
前記時間遅延積分システムが、前記検出器アレイに結合されたシステムを備え、該システムが、前記検出ゾーンおよび前記変調光学素子の少なくとも１つに対して、該検出ゾーンを横切る前記分析物バンドの移動に同期した速度で、前記検出器アレイを移動させるためのものである、請求項４２に記載の装置。
【請求項４４】
前記時間遅延積分システムが、前記検出ゾーンに結合されたシステムを備え、該結合されたシステムが、該検出ゾーンおよび前記調節光学素子の少なくとも１つを、前記検出器アレイに対して、該検出ゾーンを横切る前記分析物バンドの移動に同期する速度で移動させるためのものである、請求項４２に記載の装置。
【請求項４５】
サンプルをさらに備え、該サンプルは、マーカーで標識された少なくとも１つの分析物を内部に含有し、そして移動媒体と接触している、請求項４２に記載の装置。
【請求項４６】
前記変調光学素子が、以下：
前記少なくとも１つの照射源の各照射源に対する、それぞれの調節フィルタであって、各それぞれの調節フィルタは、該少なくとも１つの照射源のそれぞれの照射源によって放出される予め決定された波長の光を実質的に遮断し、これによって、調節された光を生成するために効果的であり、該予め決定された波長が、該少なくとも１つの照射源のそれぞれの照射源に応答性のマーカーの発光スペクトルと重ならない波長である、調節フィルタ；
調節された光を前記検出ゾーンに集光するための、光学系；および
該少なくとも１つの照射源の各々の照射源に対する、それぞれのロングパスフィルタおよびそれぞれの帯域フィルタの少なくとも１つであって、関連するセットのマーカーによって放出される光シグナルの部分に対応する検出ゾーンからの、予め決定された波長の光シグナルを、実質的に排他的に通過させ、これによって、フィルタリングされた光を生成するためのものである、ロングパスフィルタおよびそれぞれの帯域フィルタの少なくとも１つ、
を備える、請求項４２に記載の装置。
【請求項４７】
前記変調光学素子が、前記検出ゾーンからの光を平行化し、これによって、平行光を生成するための光学系をさらに備える、請求項４６に記載の装置。
【請求項４８】
前記変調光学素子が、前記フィルタリングされた光を前記検出器アレイに集光するための再画像化光学系をさらに備える、請求項４６に記載の装置。
【請求項４９】
請求項４２に記載の装置であって：
前記少なくとも１つの照射源が、複数の発光ダイオードを備え、各発光ダイオードが、予め決定された周波数範囲で光を放出し；そして
前記変調光学素子が、複数の帯域フィルタを備え、各帯域フィルタが、該発光ダイオードのそれぞれ１つに関連し、各それぞれの帯域フィルタが、関連するセットのマーカーによって放出される光シグナルの波長の部分に対応する、該検出ゾーンからの予め決定された波長の光を、実質的に排他的に通過させ、これによって、フィルタリングされた光を生成するために効果的である、
装置。
【請求項５０】
各それぞれの帯域フィルタからのフィルタリングされた光を、該各それぞれの帯域フィルタの関数として、予め決定された量だけ空間的にオフセットさせるためのオフセットシステムをさらに備え、その結果、前記検出器アレイ上の画像が、互いに空間的にオフセットした電荷によって生成される、請求項４９に記載の装置。
【請求項５１】
サンプル中の分析物を検出するための装置であって、以下：
検出ゾーンを内部に有する少なくとも１つのチャネルを規定する、チャネル規定部材；
分析物を含有するサンプルを、該少なくとも１つのチャネルに沿って移動する分析物バンドに分離するための、該少なくとも１つのチャネルに結合された分離システムであって、各分析物バンドが、対応するマーカーの存在によって検出可能である、分離システム；
少なくとも１つの照射源であって、該少なくとも１つのチャネルの検出ゾーンを放射線で照射し、これによって、対応する分析物を示す光シグナルを放出する、該放射線に応答性のマーカーを励起させるために配置され、該光シグナルが、一緒になって、該検出ゾーンを横切って移動する分析物バンドに対応する画像を形成する、照射源；
検出器アレイであって、該マーカーによって生成した光シグナルを収集するため、および該光シグナルに対応する電荷を生成するために配置されており、該検出器アレイは、出力を有する、検出器アレイ；
該検出ゾーンと該検出器アレイとの間に配置された、再画像化光学系であって、該光シグナルによって作成される画像が該検出器アレイによって収集される前に、該画像を光学的に反転させるための、再画像化光学系；
変調光学素子であって、該少なくとも１つの照射源と該検出器アレイとの間で光を変調するための、変調光学素子；ならびに
時間遅延積分システムであって、該検出器アレイの出力における蓄積した電荷を読み取る前に、該検出器アレイにおける、少なくとも１つの所定の分析物バンドに関連する光シグナルに対応する電荷の蓄積を実施するためのものであり、該蓄積が、該少なくとも１つの所定の分析物バンドが、該検出ゾーンを横切って移動する積分時間の間に実施される、時間遅延積分システム、
を備える、装置。
【請求項５２】
前記時間遅延積分を実施するためのシステムが、前記検出器アレイにおいて電荷をシフトさせること、および該検出器アレイと該検出ゾーンからの光シグナルを互いに対して移動させることの少なくとも１つによって、該電荷を蓄積する、請求項５１に記載の装置。
【請求項５３】
サンプルをさらに備え、該サンプルは、マーカーで標識され少なくとも１つの分析物を内部に含有し、そして移動媒体と接触している、請求項５２に記載の装置。
【請求項５４】
前記変調光学素子が、以下：
前記少なくとも１つの照射源の各照射源に対する、それぞれの調節フィルタであって、各それぞれの調節フィルタは、該少なくとも１つの照射源のそれぞれの照射源によって放出される予め決定された波長の光を実質的に遮断し、これによって、調節された光を生成するために効果的であり、該予め決定された波長が、該少なくとも１つの照射源のそれぞれの照射源に応答性のマーカーの発光スペクトルと重ならない波長である、調節フィルタ；
調節された光を前記検出ゾーンに集光するための、光学系；
該検出ゾーンからの光を平行化し、これによって、平行光を生成するための、光学系；および
前記少なくとも１つの照射源の各々の照射源に対する、それぞれのロングパスフィルタおよびそれぞれの帯域フィルタの少なくとも１つであって、関連するセットのマーカーによって放出される光シグナルの部分に対応する検出ゾーンからの、予め決定された波長の光シグナルを、実質的に排他的に通過させ、これによって、フィルタリングされた光を生成するためのものである、ロングパスフィルタおよびそれぞれの帯域フィルタの少なくとも１つ、
を備える、請求項５２に記載の装置。
【請求項５５】
前記再画像化光学系が、前記検出器アレイ上に前記フィルタリングされた光を集光するために効果的である、請求項５４に記載の装置。
【請求項５６】
請求項５２に記載の装置であって：
前記少なくとも１つの照射源が、複数の発光ダイオードを備え、各発光ダイオードが、予め決定された周波数範囲で光を放出し；そして
前記変調光学素子が、複数の帯域フィルタを備え、各帯域フィルタが、該発光ダイオードのそれぞれ１つに関連し、各それぞれの帯域フィルタが、関連するセットのマーカーによって放出される光シグナルの波長の部分に対応する、前記検出ゾーンからの予め決定された波長の光を、実質的に排他的に通過させ、これによって、フィルタリングされた光を生成するために効果的である、
装置。
【請求項５７】
各それぞれの帯域フィルタからのフィルタリングされた光を、該各それぞれの帯域フィルタの関数として、予め決定された量だけ空間的にオフセットさせるためのオフセットシステムをさらに備え、その結果、前記検出器アレイ上の画像が、互いに空間的にオフセットした電荷によって作成される、請求項５６に記載の装置。
【請求項５８】
サンプル中の分析物を検出するための方法であって、以下の工程：
内部に検出ゾーンを有する、少なくとも１つのチャネルを規定する、チャネル規定部材を提供する工程；
移動媒体を、該少なくとも１つのチャネル内に提供する工程；
分析物を含有し、そして該移動媒体に接触して配置されたサンプルを、該少なくとも１つのチャネルに沿って移動する分析物バンドに分離する工程であって、各分析物バンドが、マーカーの存在によって検出可能である、工程；
少なくとも１つの照射源を使用して、該検出ゾーンを非干渉性の放射線で照射する工程であって、これによって、対応する分析物を示す光シグナルを放出するために、該放射線に応答性のマーカーを励起させる、工程；
検出器アレイにおける該光シグナルを収集することによって、該マーカーによって生成した光シグナルを検出し、該検出器アレイにおいて、該光シグナルに対応する電荷を生成する工程；
該少なくとも１つの照射源と該検出器アレイとの間で、光を変調する工程；
該検出ゾーンを横切って移動する少なくとも１つの所定の分析物バンドの積分時間の間、該検出器アレイにおける、該少なくとも１つの所定の分析物バンドに関連する光シグナルに対応する電荷を蓄積することによって、該検出器アレイにおける光シグナルの時間遅延積分を実施する工程；および
該蓄積した電荷を読み取る工程、
を包含する、方法。
【請求項５９】
前記検出器アレイにおける電荷を蓄積する工程が、該検出器アレイにおける電荷をシフトさせる工程、および該検出器アレイと前記検出ゾーンからの該光シグナルとを互いに対して移動させる工程の、少なくとも１つを包含する、請求項５８に記載の方法。
【請求項６０】
サンプルを提供する工程をさらに包含し、該サンプルは、マーカーで標識された少なくとも１つの分析物を内部に含有し、そして前記移動媒体に接触している、請求項５８に記載の方法。
【請求項６１】
前記変調する工程が、以下：
前記少なくとも１つの照射源のそれぞれの照射源によって放出される、予め決定された波長の光を実質的に遮断し、これによって、調節された光を生成する工程であって、該予め決定された波長が、該少なくとも１つの照射源の該それぞれの１つに応答性のマーカーの発光スペクトルと重ならない波長のものである、工程；
該調節された光を前記検出ゾーン上に集光する工程；
該検出ゾーンからの光を平行化し、これによって、平行光を生成する工程；および
関連するセットのマーカーによって放出された光シグナルの部分の波長に対応する、該検出ゾーンからの予め決定された波長の光シグナルを、実質的に排他的に通過させることによって、該検出ゾーンからの光をフィルタリングし、これによって、フィルタリングされた光を生成する工程、
を包含する、請求項５８に記載の方法。
【請求項６２】
前記フィルタリングされた光を前記検出器アレイ上に集光する工程をさらに包含する、請求項６１に記載の方法。
【請求項６３】
請求項５８に記載の方法であって：
前記少なくとも１つの照射源が、複数の発光ダイオードを備え、各発光ダイオードが、予め決定された周波数範囲の光を放出し；そして
該方法が、複数の帯域フィルタを提供する工程をさらに包含し、各帯域フィルタが、該発光ダイオードのそれぞれ１つに関連し、各それぞれの帯域フィルタが、関連するマーカーのセットによって放出された光シグナルの波長の部分に対応する、該検出ゾーンからの予め決定された波長の光を、実質的に排他的に透過させることによって、該検出ゾーンからの光をフィルタリングし、これによって、フィルタリングされた光を生成するために有効である、方法。
【請求項６４】
各それぞれの帯域フィルタからのフィルタリングされた光を、前記各それぞれの帯域フィルタの関数として、予め決定された量で空間的にオフセットさせる工程をさらに包含し、その結果、該検出器アレイ上の画像が、互いから空間的にオフセットされた電荷によって作成される、請求項６３に記載の方法。
【請求項６５】
サンプル中の分析物を検出するための方法であって、以下の工程：
内部に検出ゾーンを有する、少なくとも１つのチャネルを規定する、チャネル規定部材を提供する工程；
移動媒体を、該少なくとも１つのチャネル内に提供する工程；
分析物を含有し、そして該移動媒体に接触して配置されたサンプルを、該少なくとも１つのチャネルに沿って移動する分析物バンドに分離する工程であって、各分析物バンドが、マーカーの存在によって検出可能である、工程；
対応する分析物を示す光シグナルを放出するために、該放射線に応答性のマーカーを励起させるような波長の放射線を発生させる少なくとも１つの照射源を使用して、該検出ゾーンを照射する工程；
検出器アレイで該光シグナルを収集することによって、該マーカーによって生成された光シグナルを検出し、該光シグナルに対応する検出器アレイにおいて電荷を生成する工程；
変調光学素子を使用して、該少なくとも１つの照射源と該検出器アレイとの間で、光を変調する工程；
該検出ゾーンを横切って移動する少なくとも１つの所定の分析物バンドの積分時間の間、該検出器アレイにおける、少なくとも１つの所定の分析物バンドに関連する光シグナルに対応する電荷を蓄積することによって、該検出器アレイにおける光シグナルの時間遅延積分を実施する工程であって、該蓄積が、該検出器アレイと、該検出ゾーンおよび該変調光学素子の少なくとも１つを、互いに対して移動させることによって実施される、工程；ならびに
該蓄積した電荷を読み取る工程、
を包含する、方法。
【請求項６６】
サンプルを提供する工程をさらに包含し、該サンプルは、マーカーで標識された少なくとも１つの分析物を内部に含有し、そして前記移動媒体に接触している、請求項６５に記載の方法。
【請求項６７】
前記変調する工程が、以下：
前記少なくとも１つの照射源のそれぞれの照射源によって放出される、予め決定された波長の光を実質的に遮断し、これによって、調節された光を生成する工程であって、該予め決定された波長が、該少なくとも１つの照射源の該それぞれの１つに応答性のマーカーの発光スペクトルと重ならない波長のものである、工程；
該調節された光を前記検出ゾーン上に集光する工程；
該検出ゾーンからの光を平行化し、これによって、平行光を生成する工程；および
関連するセットのマーカーによって放出された光シグナルの部分の波長に対応する、該検出ゾーンからの予め決定された波長の光シグナルを、実質的に排他的に通過させることによって、該検出ゾーンからの光をフィルタリングし、これによって、フィルタリングされた光を生成する工程、
を包含する、請求項６５に記載の方法。
【請求項６８】
前記フィルタリングされた光を前記検出器アレイ上に集光する工程をさらに包含する、請求項６７に記載の方法。
【請求項６９】
請求項６７に記載の方法であって：
前記少なくとも１つの照射源が、複数の発光ダイオードを備え、各発光ダイオードが、予め決定された周波数範囲の光を放出し；そして
該方法が、複数の帯域フィルタを提供する工程をさらに包含し、各帯域フィルタが、該発光ダイオードのそれぞれ１つに関連し、各それぞれの帯域フィルタが、関連するマーカーのセットによって放出された光シグナルの波長の部分に対応する、該検出ゾーンからの予め決定された波長の光を、実質的に排他的に透過させることによって、該検出ゾーンからの光をフィルタリングし、これによって、フィルタリングされた光を生成するために有効である、方法。
【請求項７０】
各それぞれの帯域フィルタからのフィルタリングされた光を、該各それぞれの帯域フィルタの関数として、予め決定された量で空間的にオフセットさせる工程をさらに包含し、その結果、前記検出器アレイ上の画像が、互いから空間的にオフセットされた電荷によって作成される、請求項６９に記載の方法。
【請求項７１】
サンプル中の分析物を検出するための装置であって、以下：
内部に検出ゾーンを有する少なくとも１つのチャネルを規定する手段；
分析物を含有し、そして該少なくとも１つのチャネル内に配置された移動媒体と接触して配置されるサンプルを、該少なくとも１つのチャネルに沿って移動する分析物バンドに分離するための手段であって、各分析物バンドが、マーカーの存在によって検出可能である、手段；
該検出ゾーンを非干渉性の放射線で照射するための手段であって、これによって、該放射線に応答性であり、対応する分析物を示す光シグナルを放出するマーカーを励起させる、手段；
該光シグナルを収集することによって該光シグナルを検出するための手段であって、これによって、該光シグナルに対応する電荷を生成させるための、手段；
該検出ゾーンを横切って移動する少なくとも１つの所定の分析物バンドの積分時間の間、該検出器アレイにおける、該少なくとも１つの所定の分析物バンドに関連する光シグナルに対応する電荷を蓄積することによって、該検出器アレイにおける該光シグナルの時間遅延積分を実施するための手段；および
該蓄積された電荷を読み取るための手段、
を備える、装置。
【請求項７２】
分析物を検出するための装置であって、以下：
複数の細長チャネル；
非干渉性光源；
該光源から該チャネルへと延びる、励起光通路；
該励起光通路に沿って配置された、集光光学素子；および
該チャネルに光学的に結合された電荷結合素子、
を備え、該電荷結合素子が、時間遅延積分モードで作動するよう構成されている、装置。
【請求項７３】
前記チャネルが、キャピラリー管または溝付プレートによって規定されている、請求項７２に記載の装置。
【請求項７４】
前記チャネルによって支持された分離媒体をさらに備える、請求項７２に記載の装置。
【請求項７５】
同程度に延長する少なくとも４つのチャネルを備える、請求項７２に記載の装置。
【請求項７６】
前記電荷結合素子と前記チャネルとの間に延びる光路に沿って配置された変調光学素子をさらに備える、請求項７２に記載の装置。
【請求項７７】
前記光源が、発光ダイオードである、請求項７２に記載の装置。
【請求項７８】
分析物を検出するための装置であって、以下：
複数の細長チャネルであって、各細長チャネルが、入口端部および出口端部を有する、細長チャネル；
（ｉ）該チャネルに沿って、および（ｉｉ）該チャネルの外側で、該入口端部と反対側の該出口端部の側において、の一方または両方に位置する、検出ゾーン；
該検出ゾーンの少なくとも一部を非干渉性の光で照射するために構成された、非干渉性光源および関連する集光光学素子；ならびに
該検出ゾーンに光学的に結合された、電荷結合素子；
を備え、該電荷結合素子は、時間遅延積分モードで作動するよう構成されている、装置。
【請求項７９】
前記検出ゾーンが、前記チャネルに沿って位置する、請求項７８に記載の装置。
【請求項８０】
前記検出ゾーンが、前記入口端部の反対側の前記出口端部の側で、前記チャネルの外側に位置する、請求項７８に記載の装置。
【請求項８１】
同程度に延びる少なくとも４つのチャネルを備える、請求項７８に記載の装置。
【請求項８２】
前記ＣＣＤと前記検出ゾーンとの間に延びる光路に沿って配置された変調光学素子をさらに備える、請求項７８に記載の装置。
【請求項８３】
前記光源が、発光ダイオードである、請求項７８に記載の装置。
【請求項８４】
分析物を検出するための装置であって、以下：
複数の分析物移動レーン；
非干渉性光源；
該光源から該分析物移動レーンへと延びる励起光通路であって、該光源が、非干渉性の光を、該励起光通路に沿って指向するよう配置されている、励起光通路；
時間遅延積分モードで作動するよう構成された、電荷結合素子；および
該分析物移動レーンおよび該電荷結合素子に光学的に結合された、蛍光発光通路、
を備える、装置。
【請求項８５】
同程度に延びる少なくとも４つの分析物移動レーンを備える、請求項８４に記載の装置。
【請求項８６】
前記励起光通路および前記蛍光発光通路との一方または両方に沿って配置された、変調光学素子をさらに備える、請求項８４に記載の装置。
【請求項８７】
前記光源が、発光ダイオードである、請求項８４に記載の装置。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
（関連出願の引用）
本願は、２００１年７月２５日に出願された、以前に出願された米国仮出願番号６０／３０７，６８２（これは、その全体が本明細書中に参考として援用される）の利益を主張する。
【０００２】
（発明の分野）
種々の実施形態は、電気泳動検出システムに関し、そして具体的には、電気泳動の間の光検出のための配置および方法に関する。
【背景技術】
【０００３】
（発明の背景）
ＤＮＡ配列決定を使用する生体高分子分析の周知の例は、例えば、Ｆ．Ｓａｎｇｅｒら、ＤＮＡ  Ｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ  ｗｉｔｈ  Ｃｈａｉｎ  Ｔｅｒｍｉｎａｔｉｎｇ  Ｉｎｈｉｂｉｔｏｒｓ，７４  Ｐｒｏｃ．Ｎａｔ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ  ５４６３（１９７７）；Ｌｌｏｙｄ  Ｍ．Ｓｍｉｔｈら、Ｆｌｕｏｒｅｓｃｅｎｃｅ  ｄｅｔｅｃｔｉｏｎ  ｉｎ  ａｕｔｏｍａｔｅｄ  ＤＮＡ  ｓｅｑｕｅｎｃｅ  ａｎａｌｙｓｉｓ，３２１  Ｎａｔｕｒｅ  ６７４（１９８６）；Ｌｌｏｙｄ  Ｍ．Ｓｍｉｔｈ，Ｔｈｅ  Ｆｕｔｕｒｅ  ｏｆ  ＤＮＡ  Ｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ，２６２  Ｓｃｉｅｎｃｅ  ５３０（１９９３）に教示されている。本明細書中に引用されるこれらおよび他の全ての刊行物および特許は、その全体が本明細書中に参考として援用される。
【０００４】
公知のキャピラリー電気泳動のシステムおよび方法は、マーカー化合物またはマーカー（例えば、分析物を標識するために代表的に使用される色素分子）を励起させるために、レーザー誘起蛍光を必要とし得る。不運なことに、レーザー装置は、使用が高価であり、エネルギー非効率的であり、多量の電力を消費し、そして物理的に大きく、レーザーを組み込む電気泳動システムを使用することを厄介にする。
【０００５】
マーカー化合物を励起させるためにレーザー以外の照射源を使用することは、多くの利点を提供する。色素分子において蛍光を発生させるための発光ダイオード（ＬＥＤ）の使用が、例えば、米国特許第６，００５，６６３号および同第５，７１０，６２８号（これらの内容は、その全体が本明細書中に参考として援用される）に教示されているが、このような電気泳動方法におけるＬＥＤの使用は、代表的に、低いシグナル強度およびほんのわずかである検出感度を生じる。この低いシグナル強度は、マーカー化合物の十分な検出を損なう。
【０００６】
検出器の収集効率の低下をもたらす、複雑な光学素子を使用する電気泳動配置もまた、低い感度を生じる。この低い感度は、ＬＥＤ（これは、第一の例において、感度を損なう）の使用によって悪化する。ＬＥＤの使用によって低下される感度の問題は、複数チャネル型の電気泳動デバイス（すなわち、キャピラリーの大きさの溝を有するエッチングされたプレートを使用する電気泳動デバイス、または複数のキャピラリー管を使用する電気泳動デバイスであって、いずれかの型のデバイスが、スループットを増加させるために複数のチャネルが使用される場合）を使用する場合に、さらに悪化される。
【０００７】
特にスループットを増加させるために使用される複数チャネルの電気泳動システムにおいて、費用効果的かつ好都合な照射源を備え、そして感度も分解能も損なわない、電気泳動の装置および方法が望ましい。
【発明の開示】
【課題を解決するための手段】
【０００８】
（発明の要旨）
種々の実施形態によれば、本発明は、サンプル中の成分（例えば、分析物）を検出するための装置および方法に関し得る。
【０００９】
種々の実施形態によれば、サンプル中の分析物を検出するための装置が提供される。種々の実施形態によれば、この装置は、以下を備え得る：検出ゾーンを有する１つ以上のチャネル；この検出ゾーンを非干渉性の放射線で照射するために配置された、１つ以上の照射源；この放射線によって励起された、この検出ゾーンにおけるマーカーから放出される光シグナルを収集するために配置された検出器アレイであって、この検出器アレイは、出力を有し得る、検出器アレイ；およびこの検出器アレイに結合されたシステムであって、この検出器アレイの出力における電荷を読み取る前に、これらの電荷を蓄積することによって、検出器アレイにおける光シグナルに対応する電荷の時間遅延積分（ｔｉｍｅ  ｄｅｌａｙ  ｉｎｔｅｇｒａｔｉｏｎ）を実施するための、システム。
【００１０】
種々の実施形態によれば、サンプル中の分析物を検出するための装置が提供され、この装置は、以下を備え得る：検出ゾーンを有する１つ以上のチャネル；この検出ゾーンを放射線で照射するために配置された、１つ以上の照射源；この放射線によって励起された、この検出ゾーンにおけるマーカーから放出される光シグナルを収集するために配置された検出器アレイであって、この検出器アレイは、出力を有し得る、検出器アレイ；およびこの検出器アレイに結合されたシステムであって、この検出器アレイの出力における電荷を読み取る前にこれらの電荷を蓄積することによって、検出器アレイにおける光シグナルに対応する電荷の時間遅延積分を実施するための、システムであり、この時間遅延積分を実施するためのシステムは、検出器アレイおよび検出ゾーンからの光シグナルを互いに対して移動させることによって、この積分を行い得る、システム。
【００１１】
種々の実施形態によれば、サンプル中の分析物を検出するための装置が提供され、この装置は、以下を備え得る：検出ゾーンを有する１つ以上のチャネル；この検出ゾーンを放射線で照射するために配置された、１つ以上の照射源；この放射線によって励起された、検出ゾーンにおけるマーカーから放出される光シグナルを収集するために配置された、検出器アレイであって、この検出器アレイは、出力を有し得る、検出器アレイ；この検出器アレイに結合されたシステムであって、この検出器アレイの出力における電荷を読み取る前に、これらの電荷を蓄積することによって、検出器アレイにおける光シグナルに対応する電荷の時間遅延積分を実施するための、システム；および検出ゾーンと検出器アレイとの間に配置された再画像化レンズであって、光シグナルによって作成された画像が検出器アレイによって収集される前に、この画像を光学的に反転させるための、再画像化レンズ。
【００１２】
種々の実施形態によれば、サンプル中の分析物を検出するための装置が提供され、この装置は、以下を備え得る：内部に検出ゾーンを有する少なくとも１つのチャネルを規定する、チャネル規定部材；および少なくとも１つのチャネルに結合された分離システムであって、分析物を含有し、そしてこの少なくとも１つのチャネル内に配置された移動媒体と接触して配置されたサンプルを、この少なくとも１つのチャネルに沿って移動する分析物バンドに分離するための、分離システムであり、各分析物バンドは、対応するマーカーの存在によって検出可能であり得る、分離システム。種々の実施形態によれば、この装置は、さらに、以下を備え得る：非干渉性の放射線を放出するための、少なくとも１つの照射源であって、少なくとも１つのチャネルの検出ゾーンを照射し、これによって、この放射線に応答性であり、対応する分析物を示す光シグナルを放出するマーカーを励起させる、照射源；このマーカーによって生成した光シグナルを収集するため、およびこの光シグナルに対応する電荷を生成するために配置された、検出器アレイであって、この検出器アレイは、出力を有し得る、検出器アレイ；照射源と検出器アレイとの間で光を変調するための、変調光学素子；ならびに時間遅延積分システムであって、検出器アレイの出力における蓄積された電荷を読み取る前に、検出器アレイにおける、少なくとも１つの所定の分析物バンドに関連する光シグナルに対応する電荷の蓄積を実施するための、時間遅延積分システムであり、この蓄積は、検出ゾーンを横切って移動する少なくとも１つの所定の分析物バンドの積分時間の間に実施される、システム。
【００１３】
種々の実施形態によれば、サンプル中の分析物を検出するための装置が提供され、この装置は、以下を備え得る：内部に検出ゾーンを有する少なくとも１つのチャネルを規定する、チャネル規定部材；および少なくとも１つのチャネルに結合された分離システムであって、少なくとも１つのチャネル中の移動媒体と接触して配置された、分析物含有サンプルを、少なくとも１つのチャネルに沿って移動する分析物バンドに分離するためのものであり、各分析物バンドは、対応するマーカーの存在によって検出可能であり得る、分離システム。種々の実施形態によれば、この装置は、以下をさらに備え得る：少なくとも１つの照射源であって、この照射源は、少なくとも１つのチャネルの検出ゾーンを放射線で照射し、これによって、対応する分析物を示す光シグナルを放出する、この放射線に応答性のマーカーを励起させるために配置された、照射源；検出器アレイであって、マーカーによって生成された光シグナルを収集するため、およびこの光シグナルに対応する電荷を生成するために配置され、この検出器アレイは、出力を有し得る、検出器アレイ；少なくとも１つの照射源と検出器アレイとの間で光を変調するための、変調光学素子；ならびに時間遅延積分システムであって、検出器アレイの出力における蓄積された電荷を読み取る前に、検出器アレイにおける、少なくとも１つの所定の分析物バンドに関連する光シグナルに対応する電荷の積分を実施するための、時間遅延積分システム。この電荷の蓄積は、例えば、検出器アレイと、検出ゾーンおよび変調光学素子の少なくとも１つを互いに対して移動させることによって、検出ゾーンを横切って移動する少なくとも１つの所定の分析物バンドの積分時間の間に実施され得る。
【００１４】
種々の実施形態によれば、サンプル中の分析物を検出するための装置が提供され、この装置は、以下を備え得る：検出ゾーンを有する少なくとも１つのチャネルを規定する、チャネル規定部材；および少なくとも１つのチャネルに結合された分離システムであって、少なくとも１つのチャネル内の移動媒体と接触して配置された分析物含有サンプルを、少なくとも１つのチャネルに沿って移動する分析物バンドに分離するためのものであり、各分析物バンドは、対応するマーカーの存在によって検出可能であり得る、分離システム。この装置は、少なくとも１つの照射源をさらに備え得、この照射源は、少なくとも１つのチャネルの検出ゾーンを放射線で照射し、これによって、対応する分析物を示す光シグナルを放出するために、この放射線に応答性のマーカーを励起させるために配置される。同時に、この光シグナルは、検出ゾーンを横切って移動する分析バンドに対応する画像を形成し得る。この装置はまた、以下を備え得る：検出器アレイであって、マーカーによって生成された光シグナルを収集するため、およびこの光シグナルに対応する電荷を生成するために配置され、この検出器アレイは、出力を有する、検出器アレイ；検出ゾーンと検出器アレイとの間に配置された再画像化光学系であって、光シグナルによって作成された画像が検出器アレイによって収集される前に、この画像を光学的に反転させるための、再画像化光学系；少なくとも１つの照射源と検出器アレイとの間で光を変調するための、変調光学素子；および時間遅延積分システムであって、検出器アレイの出力における蓄積された電荷を読み取る前に、検出器アレイにおける、少なくとも１つの所定の分析物バンドに関連する光シグナルに対応する電荷の蓄積を実施するための時間遅延積分システムであり、この蓄積は、検出ゾーンを横切って移動する少なくとも１つの所定の分析物バンドの積分時間の間に実施される、システム。
【００１５】
種々の実施形態は、サンプル中の分析物を検出するための方法に関し得、そして以下の工程を包含し得る：内部に検出ゾーンを有する少なくとも１つのチャネルを規定する、チャネル規定部材を提供する工程；少なくとも１つのチャネル内に移動媒体を提供する工程；この移動媒体と接触して配置された分析物含有サンプルを、少なくとも１つのチャネルに沿って移動する分析物バンドに分離する工程であって、各分析物バンドは、マーカーの存在によって検出され得る、工程；非干渉性の放射線を提供する少なくとも１つの照射源を使用して、検出ゾーンを照射する工程であって、これによって、対応する分析物を示す光シグナルを放出し得る、この放射線に応答性のマーカーを励起させ得る工程；例えば、検出器アレイにおける光シグナルを収集し、この光シグナルに対応する電荷をこの検出器アレイにおいて生成することによって、このマーカーによって生成される光シグナルを検出する工程；少なくとも１つの照射源と検出器アレイとの間で、光を変調する工程；例えば、検出ゾーンを横切って移動する少なくとも１つの所定の分析物バンドの積分時間の間に、検出器アレイにおける、少なくとも１つの所定の分析物バンドに関連する光シグナルに対応する電荷を蓄積することによって、検出器アレイにおける光シグナルの時間遅延積分を実施する工程；ならびに蓄積された電荷を読み取る工程。
【００１６】
さらに、種々の実施形態によれば、サンプル中の分析物を検出するための装置が提供され、これは、以下を備え得る：内部に検出ゾーンを有する少なくとも１つのチャネルを規定する手段；少なくとも１つのチャネル内に配置された移動媒体と接触して配置された分析物含有サンプルを、少なくとも１つのチャネルに沿って移動する分析物バンドに分離するための手段であって、各分析物バンドは、マーカーの存在によって検出可能であり得る、手段；検出ゾーンを非干渉性の放射線で照射するための手段であって、これによって、対応する分析物を示す光シグナルを放出し得る、この放射線に応答性のマーカーを励起させ得る、手段；この光シグナルを収集することによって、光シグナルを検出するための手段であって、これによって、この光シグナルに対応する電荷を生成し得る、手段；例えば、検出ゾーンを横切って移動する少なくとも１つの所定の分析物バンドの蓄積時間の間、検出器アレイにおける、少なくとも１つの所定の分析物バンドに関連する光シグナルに対応する電荷を蓄積することによって、検出器アレイにおける光シグナルの時間遅延積分を実施するための手段；および蓄積された電荷を読み取るための手段。
【００１７】
上記の一般的な説明と以下の詳細な説明との両方は、例示的かつ説明的であるのみであることが、理解されるべきである。付随する図面（これは、本願に含まれ、そして本願の一部を構成する）は、いくつかの例示的な実施形態を図示し、そして本明細書と共に、本発明の原理を説明する役に立つ。
【００１８】
本発明は、添付の図面を参照して、より完全に理解され得る。図面は、本発明の範囲を限定することなく、本発明の例示的な実施形態を図示することが意図される。
【００１９】
（発明の詳細な説明）
本明細書中の装置および方法は、費用効果的かつ好都合な照射源を使用する電気泳動デバイスおよびプロセスに対する必要性に取り組み得る。種々の実施形態は、スループットを増加させるために使用される複数チャネル電気泳動システムに特によく適し得る。
【００２０】
図１は、電気泳動デバイスの例示的な実施形態を示す。図１に示されるように、この配置は、分析物サンプルの移動のためのチャネル１２を内部に規定する、チャネル規定部材１０を備え得る。チャネル規定部材１０は、溝を有するかもしくは有さないカバープレート、キャピラリーの大きさの１つ以上の溝を内部に規定するエッチングされたプレート、または１つ以上のキャピラリー管を備え得る。種々の実施形態によれば、このチャネル規定部材は、複数のチャネルまたは溝を有するエッチングされたプレートであり得るか、あるいはこのチャネル規定部材は、複数のキャピラリー管を備え得る。複数のチャネルの使用は、スループットを増加させるために、多数の分析物サンプルが同時に測定されることを可能にし得る。周知であるように、電気泳動が起こるために、チャネル規定部材１０（例えば、電気泳動プレートまたはキャピラリー管）の反対側の端部は、このプレートまたは管にわたって電場を発生させるための電源に接続された、対応する電極と接触して配置され得る。この電場は、分析物を、チャネル規定部材１０のプレートまたは管配置の充填部位（図示せず）から、検出部位または検出ゾーン１４へと移動させ得る。この検出ゾーンは、サンプル中の分析物を標識するために使用されるマーカー（例えば、色素マーカー）を励起させるために照射源によって照射される、チャネル上のゾーンを含み得る。
【００２１】
マーカー化合物の一例は、色素マーカーである。任意の適切なマーカー（例えば、発蛍光団など）が、使用され得る。種々の実施形態に従う有用な発蛍光団としては、有機分子（特に、タンパク質および核酸）と結合し得る発蛍光団、ならびに利用可能な励起源による励起に応答して、検出可能な量の放射線または光シグナルを放出し得る発蛍光団が挙げられる。適切なマーカーは、蛍光放出、リン光放出、および／または他の電磁放射線放出を有する材料を包含し得る。マーカーの照射によって、使用されるマーカーの型に依存して異なる周波数での光の放出が引き起こされ得る。
【００２２】
１つのクラスのマーカーは、蛍光、化学発光、および電気化学発光によって、標識された伸長産物および増幅産物の検出のためのシグナルを提供する（Ｋｒｉｃｋａ，Ｌ．，Ｎｏｎｉｓｏｔｏｐｉｃ  ＤＮＡ  Ｐｒｏｂｅ  Ｔｅｃｈｎｉｑｕｅｓ，Ａｃａｄｅｍｉｃ  Ｐｒｅｓｓ，Ｓａｎ  Ｄｉｅｇｏ，３−２８頁（１９９２））。化学発光標識としては、１，２−ジオキサン化合物が挙げられる（米国特許第４，９３１，２２３号；およびＢｒｏｎｓｔｅｉｎ，Ａｎａｌ．Ｂｉｏｃｈｅｍｉｓｔｒｙ  ２１９：１６９−８１（１９９４））。プローブ、プライマーおよびヌクレオチド５’−三リン酸を標識するために有用な蛍光色素としては、フルオレセイン、ローダミン（米国特許第５，３６６，８６０号；同第５，９３６，０８７号；および同第６，０５１，７１９号）シアニン（Ｋｕｂｉｓｔａ，ＷＯ９７／４５５３９）、ならびに金属ポルフィリン錯体（Ｓｔａｎｔｏｎ，ＷＯ８８／０４７７７）が挙げられる。蛍光レポーター色素としては、フルオレセインＩおよびローダミンＩＩのようなキサンテン化合物が挙げられる：
【００２３】
【化１】
2004537053.tif 000003
上記ＩおよびＩＩの環位置は、置換され得る。ＩＩのアミノＲ基は、置換され得る。置換基は、プライマー、プローブおよびヌクレオチドへの共有結合を含み得る。ＩおよびＩＩの式の例としては、Ｘが、カルボニル、クロロ、および他の基で置換されたフェニルであり得るもの（例えば、米国特許第５，８４７，１６２号；同第６，０２５，５０５号；同第５，６７４，４４２号；同第５，１８８，９３４号；同第５，８８５，７７８号；同第６，００８，３７９号；同第６，０２０，４８１号；および同第５，９３６，０８７号（これらは、その全体が本明細書中に参考として援用される）に記載されるもの）、ならびにＸが水素であり得るもの（例えば、米国特許第６，０５１，７１９号（これは、その全体が本明細書中に参考として援用される）に記載されるもの）が挙げられる。
【００２４】
図１に示される実施形態において、所定の周波数範囲の非干渉性の光を提供する照射源（例えば、発光ダイオード（ＬＥＤ）１６など）が提供される。本明細書において、非干渉性の光の源は、レーザー光を含まない光を放出する源であり得ることが、注目されるべきである。種々の実施形態によれば、この非干渉性の光は、約６６０ｎｍ以下の周波数を有し得る。
【００２５】
種々の実施形態によれば、ＬＥＤからの光は、励起変調光学系によって、検出ゾーン１４に達する前に変調され得る。この励起変調光学系は、示されるように、調節フィルタ（ｃｏｎｄｉｔｉｏｎｉｎｇ  ｆｉｌｔｅｒ）１８を備え得、このフィルタの役割は、ＬＥＤによって放出される、予め決定された範囲の波長の光を実質的に遮断し得ることである。予め決定された範囲は、使用されるマーカーの発光スペクトルと重なり得る光の波長に対応し得る。種々の実施形態によれば、調節フィルタは、マーカーの１つ以上に対する励起光の波長範囲の光のみを通過させ得る。代表的に、任意の所定のＬＥＤは、あるスペクトル範囲の励起光を放出する。次に、この波長範囲の励起光は、代表的に、マーカーを励起させ、検出ゾーンにおいて所定のスペクトル範囲の光シグナルを放出させ得る。検出ゾーンからの光シグナルの検出のために、検出ゾーンから放出される光シグナルのいくらかまたは全てと同じ波長範囲の励起光の部分を遮断し得る。そうでなければ、検出される光のどの部分が単なるＬＥＤからの励起光であるかを決定することが、困難であり得る。調節フィルタ１８を通過する光は、図１に示されるような、調節された光２０である。励起変調光学素子は、集光光学系１９をさらに備え得る。調節された光２０は、その後、検出ゾーン１４における分析サンプルおよび対応するマーカーを照射するために、集光光学系１９によって集光され得る。このように照射されたマーカーは、次に、照射されたマーカーに特異的な周波数で光シグナルを（例えば、蛍光によって）放出し、ピーク強度を提供する。例えば、黄色光によって励起される色素は、スペクトルの橙色部分に対応する６１０ｎｍに蛍光発光ピーク強度を有し得、一方で約４６０ｎｍにおけるピークは、スペクトルの青色部分に関連し、そして約６６０ｎｍにおけるピークは、スペクトルの赤色部分に関連する。効率的な非干渉性の放射源（例えば、ＬＥＤ）に対して可能な色と比較される場合、効率的なレーザー照射源については、制限された数の可能な色のみが存在することが、注目される。非干渉性の放射線を放出する照射源の使用は、次に、レーザーの使用と比較される場合により広い範囲のマーカーの使用を可能にする。例えば、公知の色素マーカーであるＲＯＸは、５９０ｎｍにおいて最良に励起される。しかし、どのレーザーも、５９０ｎｍでは特に効率的ではない。ＲＯＸは、５９０ｎｍで放射線を放出するＬＥＤによって、よりよく励起される。
【００２６】
図１のデバイスは、平行化光学系２４、広帯域フィルタ２６、透過型回折格子２８および再画像化光学系３０を備え得る、収集変調光学系をさらに備える。検出ゾーン１４からの放出された光２２、およびさらに、検出ゾーン１４を通過する調節された光２０は、第一の光学構成要素またはシステム２４によって平行化される。この局面において、検出ゾーンからの光は、放出された光２２および検出ゾーンを通過する調節された光２０の一部を含むことが注目される。あるいは、励起光は、検出ゾーンに関してある角度で伝達され得、その結果、この検出ゾーンを通過する調節された光の大部分は、平行化光学系２４によって収集されない。このことは、排除されなければならない励起光を減少させる。しかし、このような代替の配置はまた、検出ゾーン１４に当たる励起光のレベルを低下させる。それにもかかわらず、当業者によって容易に認識されるように、照射角度と励起光のレベルとの間の妥協を確立することが、可能である。
【００２７】
検出ゾーン１４からの光２０および２２は、平行化光学系２４によって平行化され得る。平行化とは、種々の実施形態の状況において、平行化されている光の伝搬角度の任意の減少を意味する。種々の実施形態によれば、平行化される光の伝搬角度の減少は、約２０°と約０°との間の伝搬角度で生じ得る。
【００２８】
種々の実施形態によれば、ロングパスフィルタ、または代替において、広帯域フィルタ（参照番号２６によって示される）は、その後、関連するマーカーによって放出される光シグナルの波長の部分に対応する、検出ゾーンからの予め決定された波長の光を、実質的に排他的に通過させるために使用され得る。光シグナルの波長の部分は、例えば、光シグナルの全てを含み得るか、またはこの波長は、各マーカーについて、その光シグナルのある範囲の波長（例えば、光シグナルのピーク強度の周りの範囲の波長）を含み得る。一例として、広帯域フィルタは、約５００ｎｍ〜約７００ｎｍの範囲より外側の波長の光を遮断し得、これによって、マーカーによって放出される光に非常に特異的に対応する（すなわち、放出される光２２に対応する）光のみを通過させる。その後、放出された光２２は、透過型回折格子２８によってスペクトル的に分配され得、そして再画像化光学系３０によって、固相検出器のアレイ３４または検出器アレイ３４に再度集光され得る。励起変調光学系および収集変調光学系は、本明細書中以下において、包括的に、「変調光学系」または「変調光学素子」と称される。種々の実施形態によれば、固相検出器のアレイは、電荷結合素子（ＣＣＤ）３２の並列レジスタの光検出表面を備え得る。示される実施形態において、放出された光２２の再集光によって作成される画像は、当該分野において周知であるように、ＣＣＤの検出器アレイ３４に投影され、並列レジスタの各ピクセル上で積分される束の入射の合計に比例する電荷のパターンを作成する。
【００２９】
ここでさらに図２および３を参照すると、分析物バンドを移動させることによって作成される画像は、時刻ｔ（図２）およびｔ＋Δｔ（図３）において、ＣＣＤ３２（図１）の光検出表面によって記録される。光検出表面３６は、１つの実施形態によれば、図１に関して上に示された二次元検出器アレイ３４の一部であり得る。光検出表面３６は、スペクトル軸（図において矢印λによって示される）および空間軸（これに沿って、分析物バンドが移動し、図２および３において矢印Ｍによって示される）を含み得る。図２にさらに見られるように、励起されたマーカーによって放出される光シグナルによって作成される画像は、光検出表面３６上に２つのバンド３８および４０を生じ、これらは実質的に、それぞれスペクトルの赤色領域および青色領域であり、各バンドは、例えば、予め決定された分析物の型を標識するために使用されるマーカーに対応する。これらのバンドは、図１において、透過型回折格子２８によって、スペクトル軸に沿ってスペクトル的に分配される。図２に示されるような、時刻ｔにおいて、表面３６において生成される電荷は、強度プロフィール４５において２つのそれぞれのピーク４６および４８を提示する。これらのピークは、それぞれバンド３８および４０に対応する。図３に示されるように、時刻ｔ＋Δｔにおいて、両方のバンド３８および４０は、光検出表面３６上を、移動Ｍの方向に沿って下流に移動している。ＣＣＤ３２（図１）の直列レジスタ４２は、各分析物バンドの積分時間の間、各分析物バンドについて蓄積された電荷を収集する。検出器から受信された全てのシグナルは、アナログからデジタルに変換され得、そして格納ならびにさらなる処理および分析のために、多目的コンピュータへの伝達のためのシリアルポートに運ばれ得る。あるいは、またはさらに、アナログ出力は、表示もしくは印刷のための出力デバイスに直接送信され得るか、または他の目的で使用され得る。
【００３０】
種々の実施形態によれば、例えば、上記実施形態に示されるように、画像の収集は、時間遅延積分（ＴＤＩ）を使用して実施される。ＣＣＤにおいて、光活性な素子または画素において光によって発生した電荷は、一度に１列が、直列レジスタ４２に移動され得る。次いで、この連続する列における電荷の情報は、ＣＣＤの対応する単一のオンチップ増幅器または読み出しレジスタ４４を使用することによって、読み取られる。例えば、２５６×２５６素子のＣＣＤについては、単一の画像化領域が直列レジスタ４２に移動されるごとに、このように移動される領域の２５６の読み出しが実行され、各読み出しは、異なるスペクトル素子に対応する。上記プロセスは、２５６の全ての列が２５６回読み取られるまで継続される。
【００３１】
通常の読み出しアプローチのもとで、検出器アレイ３４における画像の動きは、ぼやけを生じる。ＴＤＩにおいて、種々の実施形態によれば、シャッターが排除され、そしてＣＣＤの列のシフトが、チャネルにおける分析物のバンドの移動と同期される。従って、分析物バンドがＬＥＤの励起ゾーン（検出ゾーン１４）に入ると、このゾーンから放出される光シグナルが収集され、そしてＣＣＤの第一列を照射し、そして電荷情報が、ＣＣＤの増幅器または読み出しレジスタ４４を使用して読み取られる。バンドがチャネル上で移動するため、従って、そのバンドの画像がＣＣＤの次の列に移動する（直列レジスタに１列近付く）ためには、Δｔｐの時間がかかる。この時間の後に、ＣＣＤの電荷は、直列レジスタに１列近くシフトし得、その結果、分析物からの蛍光は、依然として、ＣＣＤに対する同じ電荷情報に対応する。従って、ＣＣＤの物理的列とは異なり、種々の実施形態に従うＴＤＩにおいては、光で生成した電荷の蓄積の連続的に移動する列が存在する。ＬＩＦを使用するＣＥシステムにおけるＴＤＩの例は、Ｓｗｅｅｄｌｅｒらに対する米国特許第５，１４１，６０９号、およびＪ．Ｆ．Ｓｗｅｅｄｌｅｒら、Ｆｌｕｏｒｅｓｃｅｎｃｅ  Ｄｅｔｅｃｔｉｏｎ  ｉｎ  Ｃａｐｉｌｌａｒｙ  Ｚｏｎｅ  Ｅｌｅｃｔｒｏｐｈｏｒｅｓｉｓ  Ｕｓｉｎｇ  ａ  Ｃｈａｒｇｅ−Ｃｏｕｐｌｅｄ  Ｄｅｖｉｃｅ  ｗｉｔｈ  Ｔｉｍｅ  Ｄｅｌａｙｅｄ  Ｉｎｔｅｇｒａｔｉｏｎ，Ａｎａｌ．Ｃｈｅｍ．６３，４９６−５０２（１９９１）（これらの両方の内容は、その全体が本明細書中に参考として援用される）に開示されている。所定の分析物バンドについての効果的な積分時間は、種々の実施形態によれば、適用ごとに変動し得る。所定の分析物バンドの効果的な積分時間は、積分される分析物バンドにおける光シグナルの波長の一部が検出器アレイにおける２つのピクセルを横切って移動する時間、または積分される分析物バンドにおける光シグナルの波長の一部が検出ゾーンに存在する総時間、あるいはこれらの間の任意の時間に対応し得る。さらに、積分される分析物バンドにおける光シグナルの波長の一部は、種々の実施形態によれば、以下を含み得る：（１）検出器アレイの２つのピクセルにわたって延びる光シグナルのピーク強度の近くの範囲の波長；または（２）光シグナルの全波長を含む波長範囲、または（３）上記（１）と（２）との間のいずれかの波長範囲。例えば、積分時間は、分析物バンドにおける光シグナルの強度曲線の、強度線（ｉｎｔｅｎｓｉｔｙ  ｗｉｒｅ）のピークすなわち最大強度の半分における全幅（すなわち、その「半波高全幅値」）に対応する分析物バンドの波長範囲を、検出器が積分するためにかかる時間を含み得る。積分される分析物バンドにおける光シグナルの波長の一部は、積分される多数の異なる色、および発光スペクトルにおいてその色が互いからいかに良好に分離されるかに依存し得る。一般的な規則として、発光スペクトルにおいて色が良好に分離されるほど、光シグナルの波長部分がより広くなり、従って、有効積分時間がより長くなる。従って、種々の実施形態に関連して、上に規定されるような「分析物バンドの有効積分時間」とは、分析物バンドにおける光シグナルの波長の部分についての積分時間に対応し、ここで、この部分は、波長の全てまたはある範囲の波長を含み得る。
【００３２】
種々の実施形態に従って、特に、データ点を収集する上でＴＤＩを使用することにより、非干渉性光を発する照射源（例えば、ＬＥＤ）を使用する場合の低下した照射度の問題に取り組む。この照射、すなわち、１ミリ平方メートルあたりに照射されるフォトンは、代表的に、レーザーの照射度と比較した場合、ＬＥＤにおいて約１０００倍低い。本発明に従って、特に、ＴＤＩは、励起したマーカーからのシグナルの積分のためにより長い時間を可能にすることによって、低下した照射度の問題に取り組む。本発明に従う広い検出ゾーンの使用は、ＴＤＩに関連する。非ＴＤＩ検出系において、検出ゾーンは、代表的に、約１／１０ミリ平方メートルである。種々の実施形態に従ってＴＤＩを使用する場合、１つのチャネルについての検出ゾーンは、１００倍大きくあり得、すなわち、約１ミリ平方メートルであり得、これは、比較的多くのマーカーが励起され、そして多くのデータ点が、検出器に組み込まれることを可能にする。種々の実施形態の上記の原理は、複数のチャネルが使用され、各々のチャネルの各検出ゾーンが非干渉性光を照射する少なくとも１つの照射源により照射を受けるよう適合される例において等しく適用可能であり得る。
【００３３】
ＴＤＩをもたらすための電荷を蓄積する目的のために、分析物のバンドの移動の関数としてＣＣＤに対する電荷をシフトさせる代わりに、種々の実施形態は、分析物のバンドの移動の関数として、ＣＣＤ自体および／または画像自体を（すなわち、検出ゾーンからの光シグナルを）移動させることを、その範囲内に含み、その結果、このような移動の結果は、分析物のバンドの有効積分時間の間の、ＣＣＤに蓄積した光生成電荷の連続的に移動する列による、各々の分析物のバンドの追跡である。例えば、上述の所望の結果を達成するために、適切なモータ、ギア、ベルトドライブ、制御ユニット、および電源が必要とされ得る。例えば、リニアアクチュエータが、再画像化光学システム３０および／またはＣＣＤ自体を、ぼやけが最小となるように変換するために使用され得る。この画像は、この様式で、積分時間を通じてＣＣＤにおいて定常的であるようにされ得る。このような場合、フレームトランスファーＣＣＤが使用され得る。フレームトランスファーＣＣＤは、直列に配置された２つのＣＣＤで構成され得る並列レジスタを有する。直列レジスタに隣接するＣＣＤレジスタ、またはその保存アレイは、不透明なマスクで覆われ、そして読み出しの間の一時的な電荷の保存を提供する。保存アレイと能力面で同一の、他のＣＣＤレジスタまたは画像アレイが、画像化のために使用される。画像アレイが光に曝された後、得られる電荷は、その後の読み出しのために、並列レジスタにおいて、保存アレイまで迅速にシフトされる。このシフト操作は、代表的に、ミリ秒かかる。マスクされた保存アレイが読まれている間に、画像アレイは、次の画像から電荷を積分し得る。Ｃｈａｒｇｅ−Ｃｏｕｐｌｅｄ  Ｄｅｖｉｃｅｓ  ｆｏｒ  Ｑｕａｎｔｉｔａｔｉｖｅ  Ｅｌｅｃｔｒｏｎｉｃ  Ｉｍａｇｉｎｇ，Ｐｈｏｔｏｍｅｔｒｉｃｓ  Ｌｔｄ．（１９９２）を参照のこと（その内容は、その全体が、本明細書により参考として援用される）。
【００３４】
ここで、図４、５ａ、および５ｂを参照すると、種々の実施形態に従って、１つの照射源の代わりに、複数の照射源が、サンプル中のマーカー化合物を励起するために提供され得る。図４〜５ｂに示される実施形態において、照射源は、４つのＬＥＤ５０、５２、５４、および５６を含み、ＬＥＤは、チャネル規定部材５８（図５ｂにおいて特に示されるように、２つのキャピラリー管の形態で２つのチャネルを規定する）を照射するよう配置される。各々のＬＥＤは、予め決定された範囲の波長において非干渉性光を発する。例えば、ＬＥＤ５０およびＬＥＤ５２は、実質的に青色光を発し、ＬＥＤ５４は実質的に緑色光を発し、そしてＬＥＤ５６は実質的に黄色光を発する。上記例が示すように、複数のＬＥＤが、利用可能な光を増加させるために使用され得る。例えば、ＬＥＤ５０および５２が青色光を発する場合、それらは、関連するマーカーにおける比例的応答を得るために利用可能な青色光の量を増大するこの様式で、同時に、連続的にかまたはパルス様式のいずれかで、使用され得る。使用される各々の型のマーカーは、理想的には、異なる波長により励起され得るが、最適な波長および電源レベルのＬＥＤは、各々の所定の適用について利用可能でないかもしれない。従って、異なるマーカーは、同じＬＥＤを使用し得る。
【００３５】
図４、５ａ、および５ｂに示される本発明の上記実施形態に従う調節用光学装置は、図１に示される実施形態における調節用光学装置に相当し、類似の要素が、類似の参照番号で標識されている。従って、各々の照射源について、調節フィルタ１８および集光用光学構成要素１９が提供されるが、しかし、各々の照射源についての各々の調節フィルタおよび集光レンズは、それらが類似の参照番号で標識されているという事実によってのみ、必ずしも同一ではないことが理解される。図１に関して以前に示されたように、各々の調節フィルタ１８の機能は、１つ以上のマーカーについての励起光の波長範囲の光のみを通過させることである。調節フィルタ１８は各々、対応するＬＥＤにより発せられる光の予め決定された範囲の波長を実質的に遮断する。予め決定された範囲は、対応するＬＥＤにより励起されたマーカーの発光スペクトルと重なり得る光の波長に対応する。集光用光学システム１９の各々の機能は、調節フィルタからの調節光を検出ゾーン１４に集光することであり、図４、５ａ、および５ｂの実施形態において、検出ゾーン１４は、示されるキャピラリー管の各々についてそれぞれの検出ゾーンに対応する。検出ゾーン１４において励起されたマーカーはその後、発せられた光２２の形態で、光シグナルを発する。図１と関連して記載される本発明の最初に言及した実施形態の場合のように、検出ゾーンからの光は、発せられた光２２を含み、そしてさらに、検出ゾーンを通過する調節光２０の一部を含む。
【００３６】
種々の実施形態に従って、検出ゾーンからの光（図５ａにおいて２０および２２と標識されている）は、光学システム２４を平行にすることにより、平行にされ得る。従って、平行にされた光は、その後、図５ａおよび５ｂにおいて破線で示されるようなフィルタホイール６０において対応する帯域フィルタ５０’を通過する。図５ａおよび図５ｂにおけるフィルタは、想像線（破線）で示されていることに注意されたい。なぜならば、それらの図において、フィルタホイール６０の描写は、断面ではなく、その平面図を表すからである。
【００３７】
図４を参照すると、フィルタホイールは、それらの中で、複数の帯域フィルタ５１、５３、５５、および５７を支持することが、より詳細に示されている。帯域フィルタの各々は、関連するマーカーにより発せられる光シグナルの波長の一部に対応する、実質的に排他的な予め決定された波長の、検出ゾーンからの光を通過するよう適合される。種々の実施形態に従って、各々の関連するマーカーについて提供される帯域フィルタが存在する。光シグナルの波長の一部は、全ての光シグナルを含み得るか、または各々のマーカーについて、光シグナルのピーク強度付近の波長範囲を含み得る。例えば、発せられた光シグナルのピーク強度付近の波長範囲は、所定のマーカーについてのピークの各々の側の波長の約５％〜約２０％の間であり得るか、またはそのピークの強度の約半分の波長範囲（一般的に、「半波高全幅値」と呼ばれる）を含み得る。従って、例として、帯域フィルタ５１は、それを通して、ＬＥＤ５０に応答性の所定のマーカーにより発せられる光シグナルをフィルタリングするよう適合される。図５ａおよび図５ｂにおいて、種々の実施形態に従う装置は、ＬＥＤ５０が検出ゾーン１４を照射する様式で描写される。しかし、示されるＬＥＤのいずれも、検出ゾーン１４を照射するために選択的に使用され得ることは明らかである。フィルタホイール６０（図５ａ）は、平行した光の通路において、作動しているＬＥＤによって（すなわち、検出ゾーンを照射するために使用されるＬＥＤによって）励起されるマーカーに対応する帯域フィルタを選択的に配置するよう、フィルタホイールを制御するフィルタホイール機構６２（図５ａ）により作動され得る。フィルタホイール機構６２は、当業者に認識されるように、マイクロプロセッサまたは他の類似のデバイス（示さず）により制御され得る。図１における実施形態と同様に、このようにフィルタリングされる光は、再画像化光学システム３０によって、固相検出器のアレイ３４または検出器アレイ３４に（例えば、電荷結合素子（例えば、ＣＣＤ３２）の並列レジスタの光検出表面に）集光される。種々の実施形態が、全てのマーカーを励起するための単一のＬＥＤ設備、マーカーのうちの所定の１つを励起するための複数のＬＥＤ設備、および１つのマーカーあたり１つのＬＥＤの使用を、その範囲内に含み得、帯域フィルタの選択および数は、マーカー自体の関数であることに注意されたい。
【００３８】
図４により明確に見られるように、種々の実施形態に従うフィルタホイールはさらに、５番目のマーカーにより生成されたキャピラリーからの光シグナルのみを通すよう適合されたフィルタをそれらに含み得る。４つのマーカーは、分析物がＤＮＡフラグメントである場合に移動する分析物を標識するために使用され得る。各々のマーカーは、ＤＮＡ鎖の塩基のうちの所定の１つに（すなわち、プリンＡ（アデニン）およびＧ（グアニン）に、ならびにピリミジンＣ（シトシン）およびＴ（チミン）に）対応する。さらに、種々の実施形態に従って、５番目のマーカーは、例えば、分析物のフラグメント分析のために使用され得る。５番目のマーカーは、フラグメント分析をするための任意のマーカー（例えば、色素マーカー）であり得る。種々の実施形態に従って、使用され得るマーカーの数は、上記実施例に示されるような４または５に限定されず、市場で入手可能な色素の数および用途の要求に基づき使用される照射源に対する応答性によってのみ限定されることに注意されたい。フラグメント分析は、例えば、Ａｐｐｌｉｅｄ  Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ，Ｉｎｃ．，Ｆｏｓｔｅｒ  Ｃｉｔｙ，Ｃａｌｉｆｏｒｎｉａにより製造されるＧＥＮＥＳＣＡＮ（登録商標）分析ソフトウェアを用いて達成され得る。ＧＥＮＥＳＣＡＮ（登録商標）分析ソフトウェアは、マーカーで標識された標準において分析物の移動時間に基づく較正曲線またはサイズ分け曲線を生成することによって、未知の分析物のサイズを算出する。未知の分析物は、曲線上にマッピングされ、そして移動時間からサイズに変換される。図４に示される実施形態の場合、フィルタホイール６０上の５番目のマーカーであるフィルタＦＤは、標準において分析物を標識するために使用されるマーカーに対応する光シグナルを通す。これらのマーカーは、フラグメント分析を可能にするよう適切に取り付けられた照射源５０、５２、５４、および５６のうちの少なくとも１つにより励起可能である。
【００３９】
ここで、図６ａ〜６ｅを参照すると、これらの図は、図４、５ａ、および５ｂの実施形態において示されるＣＣＤ３２の検出器アレイ３４において、分析物のバンドを移動することにより生成される画像を描写する。画像は、分析物を標識するために使用され、そして照射源５０、５２、５４、および５６のうちの所定の１つによる励起に応答性である各々のマーカーについて示される。図６ａ〜６ｅにおける光検出表面３６の各々の示されるフレームは、各々、チャネル規定部材５８の２つのキャピラリーのうちの１つに対応する分析物のバンドの２つのレーンを示す。このバンドは、移動方向Ｍに沿って移動し、そしてそのスペクトル方向において、対応する帯域フィルタを通してフィルタリングされたマーカーからの光により、その各々の側で制限されることが示される。キャピラリーに対応する強度プロフィール４５が、各々のフレームの右に示される（その右のレーンの光検出表面３６において電荷が生成される）。
【００４０】
種々の実施形態に従って、強度プロフィールは、公知の方法に従って整列および組み合わされ、そしてその後、任意のスペクトルの重なりを考慮するために、多成分化（ｍｕｌｔｉｃｏｍｐｏｎｅｎｔｉｎｇ）され得る。図１の実施形態と同様に、図４、５ａ、および５ｂの実施形態におけるＣＣＤ３２の連続する直列レジスタは、その積分時間の間に各々の分析物のバンドについて蓄積される電荷を収集する。検出器から受け取られる全てのシグナルは、アナログからデジタルに変換され得、そして伝送のためのシリアルポートから保存のためならびにさらなる処理および分析のための多目的コンピュータに伝達され得る。あるいはまたはさらに、アナログ出力が、表示または印刷のための出力デバイスに直接送達され得る。例として、多目的コンピュータは、多成分化処理を実施するために使用され得る。多成分化は、当業者に公知のプロセスであり、そして多成分化ソフトウェアプログラム内でのスペクトルのキャリブレーションを伴い得るプロセスである。このスペクトルのキャリブレーションは、各々のマーカーに対応する予め決定されたシグネチャーマトリクス（ｓｉｇｎａｔｕｒｅ  ｍａｔｒｉｘ）を通して獲得され得る。各々のシグネチャーマトリクスは、それらの光シグナルの波長の関数として、所定のマーカーによる光シグナルの強度のシグネチャースナップショットを提供する。シグネチャーマトリクスによって、検出ゾーンから発せられる所定の波長のバンドについての強度曲線の組み合わせは、それらのマーカーの個々によって発せられる光シグナルに対応するその成分に分解され得る。この様式で、マーカーそれぞれによる光シグナルの比較的正確な評価が、検出プロセスのためになされ得る。
【００４１】
操作時に、図４、５ａ、および５ｂに示される本発明の実施形態に従う装置は、照射源のそれぞれにより、検出ゾーン１４の照射を、順に行う。フィルタホイールは、各々の場合、光学システム２４を平行にする前に、帯域フィルタ５１、５３、５５、５７、または使用されるマーカーに対応するＦＤを処置（廃棄）するよう適合される。種々の実施形態に従って、および図４、５ａ、および５ｂに示される実施形態に見出される検出ゾーンは、検出ゾーンを横切って移動する分析物のバンドの積分時間、照射される。積分時間の間、図１に関連して記載される実施形態と同様に、検出されるマーカーについての光シグナルにより生成される電荷は、移動方向に、並列レジスタに沿って移動され得、そして検出器またはＣＣＤ３２に蓄積され、その後、読み出される。その後、照射源の別のそれぞれは、マーカーのうちの対応するものを励起するために、検出ゾーンを照射するために使用されるが、対応する帯域フィルタは、フィルタホイール６０により光学システム２４が平行にされる前に配置される。ここでも、励起されたマーカーからの光シグナルは、検出器３２により検出され、それらに関連する電荷は、積分時間の間、検出器に蓄積され、その後、蓄積された電荷が読み出される。上記のプロセスは、全ての照射源が、検出ゾーンを照射するまで、および全てのフィルタ（フィルタＦＤを含む）がそれらからの光をフィルタリングするためにレンズを平行にする前に配置されるまで続けられ得る。検出器３２は、フレームトランスファーＣＣＤであり得、その結果、電荷が蓄積されるＣＣＤの各々のフレームは、保存アレイに移され得、それによって、画像アレイが、使用される照射源の次のそれぞれにより生成される、次の系列の電荷蓄積のために利用可能となる。
【００４２】
上記プロセスは、検出される各々の分析物に関する十分なデータを獲得するために、必要な回数だけ、サイクルで反復され得る。代表的に、数サイクルで、シグナルが増大する。その理由は、数サイクルは、より長い積分時間を意味し、従って、ＣＣＤに代表的に関連するノイズを超える増大した読み出しシグナルを意味する。他方、サイクルの数を増やすと、システムの動的範囲が改善され得る。システムの動的範囲は、ノイズレベルをちょうど超える所定のＣＣＤ（または「最大能力（ｆｕｌｌ  ｗｅｌｌ  ｃａｐａｃｉｔｙ）」）により読み出され得る最小ピークを超える、そのＣＣＤにより読み出され得る最大ピークシグナルとして定義される。ＣＣＤは、代表的に、所定の最大能力を有する。ピークシグナルがＣＣＤの最大能力を超える場合、それは、ＣＣＤの倍率から離れる。短い積分時間は、ピークシグナルが、ＣＣＤを範囲外（ｏｆｆ−ｓｃａｌｅ）シグナル、すなわち、ＣＣＤの最大能力を超えるシグナルで満たす可能性を減少させるために、一様に和らげられることを可能にする。この様式で、分析物の濃度は、ＣＣＤが、飽和することなくシグナルレベルを確実に検出することをなおも可能にしつつ、増大し得る。種々の実施形態に従って、より長い積分時間（例えば、５秒間）となる数サイクルの使用と、より短い積分時間（例えば、１秒間）となるより多くのサイクルの使用との間に、相殺取引（ｔｒａｄｅ−ｏｆｆ）が存在する。より長い積分時間は、ノイズレベルが比較的高い場合およびシステムの感度が同じ観点から増大される必要がある場合に有用である。他方、システムにおけるノイズレベルが比較的低い場合、複数回の読み出しが同一マーカーのシグナルからなされ得、そして読み出されたシグナルは、その後、多成分化され得る、この様式で、ＣＣＤは、範囲外に外れることなくより明るいピークの検出を可能にする。
【００４３】
例として、フレームトランスファーＣＣＤは、主に青色マーカーを励起するＬＥＤが検出ゾーンを照射している、積分時間ｔの間、青色マーカーに対応する光シグナルを収集するよう制御され得る。その後、全ＣＣＤが読み出される。次いで、フィルタホイールが、緑色マーカーに関連する帯域フィルタに切り替えられ、そして主に緑色マーカーを励起するＬＥＤが検出ゾーンを照射する。次いで、ＣＣＤは、積分時間ｔの間、緑色マーカーに対応する光シグナルを収集する。次いで、全ＣＣＤが読み出される。次いで、フィルタホイールが、黄色マーカーに関連する帯域フィルタに切り替えられ、そして主に黄色マーカーを励起するＬＥＤが検出ゾーンを照射する。その後、ＣＣＤは、積分時間ｔの間、黄色マーカーに対応する光シグナルを収集する。次いで、全ＣＣＤが読み出される。次いで、上記プロセスが、この実施例において、そして図４、５ａ、および５ｂに関連して記載されるように、５つ全てのマーカーについて反復され得る。上述のように、この実施例において、バンドは、フレームトランスファーＣＣＤの上から下に（すなわち、読み出しレジスタに）かけて約５倍の積分時間を費やす。ＣＣＤの各々の読み出しは、１つのマーカーに対応する。次いで、全ての読み出しは、多成分化のための公知の様式で、整列および組み合わせられ得る。
【００４４】
多成分化がもたらされ得る様式の例は、図６ｆ〜６ｈに示される。ここでは、フィルタ５１、５３、５５、５７、およびＦＤが、スペクトルの青色部分、緑色部分、黄色部分、赤色部分、および「５番目」の部分の光の波長を通すと推定される。「５番目」の部分は、例えば、スペクトルのオレンジ色の範囲であり得る。図６ｆは、検出器３２によるシグナルの３回の読み出しの間の、図４におけるフィルタホイールの各々のフィルタについての蛍光強度曲線を示す通電図（ｅｌｅｃｔｒｏｐｈｅｒｏｇｒａｍ）の概略図である。この強度曲線は、マーカー（例えば、ＦＡＭ）（すなわち、大部分が青色の光シグナルを発する色素マーカー）で標識された分析物からの光シグナルの読み出しに対応する。実線で描かれた、各々の曲線の第１の部分は、各々のフィルタについての第１の積分時間ｔの間の、図４の青色フィルタ、緑色フィルタ、黄色フィルタ、赤色フィルタ、および５番目のフィルタの各々１つからの読み出しに対応する。破線で描かれた、各々の曲線の第２の部分は、第２の積分時間ｔの間の上記フィルタの各々からの読み出しに対応する。実線で描かれた、各々の曲線の第３の部分は、第３の積分時間ｔの間の上記フィルタの各々からの読み出しに対応する。図６ｆの通電図の概略図において、水平軸は、分析物により移動される距離に対応し、そして垂直軸は、各々のフィルタについて、そのフィルタから発する光の蛍光強度に対応する。従って、実線の第１セットの曲線は、フィルタホイール６０の第１のサイクルの間の各々のフィルタから発する光についての強度曲線を表す。破線の第２セットの曲線は、フィルタホイール６０の第２のサイクルの間の各々のフィルタから発する光についての強度曲線を表す。実線の第３セットの曲線は、フィルタホイール６０の第３のサイクルの間の各々のフィルタから発する光についての強度曲線を表す。図６ｆにおいて見られるように、青色フィルタからの光は、各々のサイクルの間、最も高い強度を示し、この強度は、光が、それぞれ、緑色フィルタ、黄色フィルタ、赤色フィルタ、および５番目のフィルタから収集されるにつれて減少する。従って、本実施例において見られるように、スペクトルの重なりにより、ＦＡＭは、大部分は青色を発し、ある程度は緑色を発し、黄色などはほとんどを発しない。各々のサイクル内で、フィルタホイール６０は、検出ゾーン１４からの蛍光の通路に続くフィルタを配置するよう回転される場合、分析物は、積分時間ｔの後に、図６ｆに標識されるように、距離ｘ移動する。
【００４５】
ここで、図６ｇを参照すると、この図は、多成分化のための整列されたフォーマットにおける、図６ｆの強度曲線の概略図である。ここでは、各々の強度曲線（青色光に対応する曲線ではない）は、フィルタの関数として、ｘの倍数だけシフトされ、青色光に対応する強度曲線と整列される。整列された後、強度曲線は、組み合わされそして多成分化され、それによって、図６ｈに示されるＦＡＭについての強度曲線を生成する。図６ｆ〜６ｈの実施例においてＦＡＭのみが検出される程度まで、ＪＯＥ、ＴＡＭＲＡ、ＲＯＸ、および５番目の色素についての強度曲線は、当業者に認識され得るように、図６ｈにおいて全て平坦である。
【００４６】
ここで、図６ｉおよび６ｊを参照すると、代表的な励起効率曲線および蛍光強度曲線が、オリゴ合成において使用され得る異なる４つの色素マーカー（すなわち、５−ＦＡＭ、ＪＯＥ、ＴＡＭＲＡ、およびＲＯＸ）についての波長に対してプロットされて示される。これらの色素マーカーは、複数の色素マーカーが使用される種々の実施形態（例えば、図４、５ａ、５ｂ、および７に示される実施形態）において使用され得るマーカーの例である。
【００４７】
図６ｉにおいて見られるように、ｘ軸は、照射源により発せられる波長（ナノメートルまたはｎｍで表される）に対応し、そしてｙ軸は、励起効率のパーセンテージで表される。ここでは、５−ＦＡＭが、約４９０ｎｍにて、そのピークパーセント励起効率に対応する、その最大吸光度を有することが容易に認識され得る。所定の波長における最大吸光度は、色素マーカーがその所定の波長で照射される場合に、そのピーク蛍光強度で蛍光性であるとみなされることを示す。図６ｉにおいてさらに見られるように、ＪＯＥは、約５２６ｎｍで最大吸光度を有し、ＴＡＭＲＡは、約５６０ｎｍで最大吸光度を有し、そしてＲＯＸは、５８８ｎｍで最大吸光度を有する。ｘ軸の波長は、任意の照射源（例えば、ＬＥＤ）によって発せられ得る。図６ｉはまた、色素マーカー（例えば、５−ＦＡＭ）がその最大吸光度波長で照射される場合、他の色素マーカー（例えば、ＪＯＥ、ＴＡＭＲＡ、およびＲＯＸ）がいくらかの吸光度を示すが、５−ＦＡＭと比較して程度が小さいことを示す。
【００４８】
ここで、図６ｊを参照すると、ｘ軸は、励起された色素マーカーによって発せられる蛍光の波長（ｎｍで表される）に対応する。ｙ軸は、蛍光強度のパーセンテージに対応する。図６ｊにおいて見られるように、５−ＦＡＭは、約５２２ｎｍのピーク蛍光強度を有し、ＪＯＥは約５５４ナノメートルのピーク蛍光強度を有し、ＴＡＭＲＡは、約５８２ｎｍのピーク蛍光強度を有し、そしてＲＯＸは、約６０８ｎｍのピーク蛍光を有する。ｘ軸上の波長は、４つの言及された色素マーカーによって発せられる。図６ｊはまた、色素マーカー（例えば、ＴＡＭＲＡ）がそのピーク蛍光強度にて蛍光を発する場合、他の色素マーカー（例えば、５−ＦＡＭ、ＪＯＥ、およびＲＯＸ）もまた蛍光を発するが、程度の小さい蛍光強度であることを示す。
【００４９】
光が、種々の色で、検出ゾーンにおける色素マーカーから発せられる場合、各々の色素マーカーは、効果的に励起され得、そしてその固有のスペクトルシグネチャーによるその検出を可能にする様式でさらに励起され得る。２つの色素マーカーが近接する蛍光強度ピークを示す場合、すなわち、例えば、２つの色素マーカーの蛍光強度の間の差が、約３０ｎｍよりも小さい場合、それら２つの色素マーカーにより発せられる光の高いレベルの重なりが存在する。高いレベルの重なりは、２つの色素マーカーにより発せられる光の間の識別を困難にし、それによって、２つの色素マーカーの相対量の決定を困難にする。代表的には、通常、例えば、図６ｉおよび６ｊに示唆されるように、重なりが、異なる色素マーカーにより発せられる光に存在する。しかし、この重なりは、図６ｊに示されるような、容易に識別可能な蛍光強度ピークを示す色素マーカーを選択することによって、最小限に抑えられ得る。種々の実施形態に従って、所定の範囲の波長内の照射を発する照射源でまず開始し、そしてどの程度、利用可能な色素マーカーを励起するかを見るために、各々のこのような照射源を調査することが可能である。図６ｉおよび６ｊに示されるようなグラフは、この関係で使用され得る。例えば、種々の色素マーカーの励起効率曲線が、図６ｉに示される様式でプロットされる場合、所定の範囲の波長の光を発する照射源（例えば、ＬＥＤ）は、それらの励起効率に基づき色素マーカーの所定の１つを励起することが予想され得る。その後、図６ｊにおけるような蛍光強度グラフから、異なるマーカーの強度ピークの間にどのくらいの重なりが存在するかを決定することが可能である。次いで、このような決定から、どのセットのマーカーが特定の適用について最も適切かを選択することが可能である。次いで、一旦色素マーカーが選択されると、それらに対応するフィルタ（例えば、上記の図４の実施形態のフィルタホイールにおいて示されるフィルタ、および以下に記載される図７の実施形態におけるフィルタホイールに示されるフィルタ）を選択することが可能となる。最良のセットのマーカーは、検出される発せられる波長において、所望の最小量の重なりを示す。
【００５０】
各々のマーカーは、異なる励起曲線を有するので、蛍光生成量は、このマーカーと非常に適合するＬＥＤの使用によって、劇的に増大され得る。これは、所望されない光（すなわち、システムおよび他のマーカーからの照射からのバックグラウンド光）を最小限に抑えつつ、所望の光の増加（すなわち、目的のマーカーからの照射の増加）を提供する。これにより、より質の高いデータが得られる。例えば、５０３ｎｍの最大励起を有する青色／緑色ＬＥＤが、ＦＡＭと命名されたマーカーのために使用される場合、吸収は、ＦＡＭについては高く、約８０％であり、そしてＲＯＸと命名されたマーカーについては低く、約６％である。同様に、５９２ｎｍの最大励起を有する黄色ＬＥＤは、ＦＡＭを励起しないが、ＲＯＸと関連する吸収は約９０％である。
【００５１】
図７を参照して、別の実施形態が示される。この実施形態は、多数の照射源が検出ゾーンを連続的に照射するために使用される限り、図４、図５ａ、および図５ｂの実施形態と類似している。しかし、図７の実施形態は、多数の点で、図４、図５ａ、および図５ｂの実施形態とは異なる。図７の実施形態の前提は、検出器の同じアレイに対して異なる周波数範囲の波長を有する光シグナルの読み取りを可能にし、生成した光シグナルに対応する電荷は、これらの光シグナルを発光するマーカーと共に用いられる帯域フィルタの関数として、空間的にオフセットされている。有利には、このような実施形態は、図４、図５ａ、および図５ｂに関して上記される本発明の実施形態の場合のようなフレームバイフレーム（ｆｒａｍｅ  ｂｙ  ｆｒａｍｅ）の読み取りよりはむしろ、時間遅延積分（ｔｉｍｅ  ｄｅｌａｙ  ｉｎｔｅｇｒａｔｉｏｎ）すなわちＴＤＩの間の検出器アレイにおいて蓄積した電荷を連続して読取ることを可能にする。
【００５２】
図７の実施形態において、照射源は、調節フィルタ１８および集光のための光学系１９のような関連する光学素子と共に、示されるような照射源ホイール６１に備えられ得る。図７に見られるように、図１の実施形態の構成要素に類似する構成要素が、同じ参照番号（例えば、調節フィルタ１８、集光光学系１９、平行化光学構成要素、または光学系２４、および再画像化光学構成要素または光学系３０）を用いて表示されている。照射ホイール６１は、検出ゾーン１４を照射するために、照射源および関連する光学素子のそれぞれ１つの選択的位置に回転可能である。図４、図５ａ、および図５ｂにおける供給源５０、５２、５４、および５６に類似する４つの照射源が備えられ得る。さらに、フィルタホイール６１’が備えられ、これは、図４、図５ａ、および図５ｂにおけるフィルタホイール６０に類似する。ホイール６１および６１’の両方の回転は、上記の図４、図５ａ、および図５ｂの実施形態のフィルタホイール駆動装置に類似する、フィルタホイール駆動装置６２の提供によりもたらされ得る。種々の実施形態に従って、２つのホイール６１および６１’は、さらに、示されるような回転可能なシャフト６３により、互いにかつフィルタホイール駆動装置６２に連結され得る。種々の実施形態は、その範囲内に、照射ホイールに備えられる必要がない複数の照射供給源の提供か、または２つのホイール６０および６１’がシャフトにより互いに連結されていなく、むしろ、それら自体のそれぞれのホイール駆動装置により独立して作動される配置の提供を包含することが注目される。
【００５３】
図７の実施形態では、装置は、オフセットシステム６４を備え、このシステムは、用いられる帯域フィルタの関数としての所定の量によって、検出器のアレイに衝突する光シグナルの空間的オフセットのために、対応する帯域フィルタと関連してフィルタホイール６１’上に配置され得るか、または検出器３２、変調光学素子、および検出ゾーン１４の少なくとも１つに連結され得る。実際に、このオフセットシステムは、種々の実施形態に従って、各帯域フィルタについての所定の量により検出器（ＣＣＤ）３２のアレイ３４に衝突する光シグナルをオフセットするように適合される。このオフセットは、オフセットシステム６４を提供することにより達成され得、このシステムは、図７において破線で示され、そしてフィルタホイール６１’に配置される、複数のオフセット機構６６を備える。各オフセット機構は、帯域フィルタのそれぞれ１つと関連して、そこからフィルタ処理された光をオフセットする。このような場合、オフセット機構６６（その１つは、図７に示される）は、当業者に容易に認識されるように、回折格子、ミラー、プリズム、または光をオフセットするための任意の他のデバイスを備え得る。機構６６は、各々対応する帯域フィルタの前でフィルタホイール６１’の円周の周りに分配され得、図７のホイール６１’は、それ以外は、図４のホイール６０と同一である。あるいは、オフセットは、オフセット制御デバイス６７（これもまた破線で示される）を提供することにより達成され得、そして検出器３２のアレイ３４に衝突する光シグナルをオフセットするために、検出ゾーン１４、変調光学素子、および検出器アレイ３４の少なくとも１つに連結され得る。例として、このオフセットシステムは、所定の量まで、検出ゾーン１４、平行化光学系２４、再画像化光学系３０、または検出器アレイ３４の少なくとも１つを移動し、それにより、検出器アレイ３４に衝突する光シグナルをオフセットし得る。オフセットシステムのこの後者の代替物において、このシステムは、当業者に認識されるような、検出ゾーン１４、平行化光学系２４、再画像化光学系３０、または検出器アレイ３４の少なくとも１つの並進移動をもたらすための任意の適切なデバイスを備え得る。このようなデバイスは、例えば、ソレノイドまたはモータ駆動リニアアクチュエータ（例えば、親ねじ、ラックアンドピニオンシステム、カムなど）を備え得る。例えば、カムは、当業者により認識され得る多数の方法において、再画像化光学系３０の並進を生じさせるために、ドライブシャフト６３に装着され得る。所定の量は、検出器アレイに衝突する光シグナルがオフセットされることが求められる量に対して、１：１の比率に対応し得る。所定の量に対応する波長の範囲は、多数の異なる因子（例えば、用いられる照射源および励起されるマーカー）の関数である。しかし、一旦、照射源およびその対応する帯域フィルタを含む所定のセットが、検出ゾーンを照射し、そしてそこからの光をフィルタ処理するように位置付けられると、光シグナルがオフセットされるべき所定の量は、検出器アレイ上で、光シグナルにより生成された電荷が、検出器アレイ自体に対して、そして異なる波長の周波数範囲の光シグナルに対してどこに位置付けられるべきかを決定することにより、容易に決定され得る。従って、個々の機構６６は、対応する帯域フィルタと共に用いられて、そこから出現する光をオフセットし、各機構６６は、帯域フィルタが通過させる波長の周波数に従って選択される。代替物において、オフセット制御デバイス６７が使用される場合、このオフセット制御は、プログラムされて、検出ゾーン１４、変調光学素子、および検出器アレイ３４の少なくとも１つを、互いに対して所定の量までオフセットし得る。このオフセットは、例として、所定の量までの並進移動で、検出ゾーン１４、変調光学素子、または検出器アレイ３４のいずれかを移動することにより達成され得、光シグナルにより作成された画像は、対応して、空間的にオフセットされ得る。図７に示される実施形態は、図４、図５ａ、および図５ｂの実施形態で用いられるものに類似する複数のＬＥＤの使用を包含し得る。オフセット量は、各帯域フィルタからの画像の重なりを防ぐのに十分であるべきである。
【００５４】
オフセットシステム６４（オフセット機構６６、または代替ではオフセット制御デバイス６７を含む）は、機構６６およびオフセット制御デバイスが、オフセットシステム６４の代替として使用され得ることを示唆するために、図７において破線で示される。種々の実施形態が、両方の代替物（すなわち、機構６６およびオフセット制御デバイス６７）が互いに組み合わせて使用される場合をその範囲内に包含することは、さらに注目される。さらに、種々の実施形態に従う変調光学素子は、調節フィルタ１８、集光光学系１９、平行化光学系２４、および再画像化光学系３０のうちの少なくとも１つを備え、当業者の知識内であるような、上記の列挙した構成要素に付随する機能を達成するための任意のデバイスまたはシステムを含む。さらに、オフセット制御デバイス６７に関して、本開示がデバイス６７の変調光学素子への連結を記載する場合は、その意味するところは、オフセット制御デバイス６７が、変調光学素子の構成要素の少なくとも１つに連結されることである。図１および４〜５ｂの実施形態は、分析される２本のキャピラリーのセットを示すが、種々の実施形態は、任意の適切なチャネル規定部材（例えば、多数のキャピラリー、エッチングされたプレートにおける多数のチャネル、およびスラブプレートさえも）により規定される検出ゾーンを含むことが、さらに注目されるべきである。種々の実施形態によれば、このチャネル規定部材は、用途の必要性によって任意の配向（例えば、水平配向または垂直配向）を取り得る。さらに、図４、５ａおよび５ｂの実施形態は、必ずしも４つの照射源および５つの帯域フィルタに限定されないが、使用されるマーカーによって任意の適切な数の帯域フィルタの使用を含む。記載される実施形態において、多数の異なる照射源（例えば、多数の波長範囲のＬＥＤの放射光）が使用され得ることは、さらに注目されるべきである。この点に関する制限は、利用可能な空間、ＬＥＤの利用可能性、および／または使用され得るマーカーの型のうちの１つの機能のみであり得る。さらに、「光学系」が言及される場合は必ず、そのシステムは、単一のレンズ、レンズ系、鏡面系、または当業者に用に認識され得るような所望かつ明確に定まった機能を満たし得る任意の他の光学系であり得る。
【００５５】
操作の際に、図７の検出ゾーン１４は、１つの第１の照射源により（例えば、図７に示されるようなＬＥＤ５０により）照射される。ＬＥＤ５０からの光により励起可能なマーカーから放射される光シグナルは、以前に記載したように、対応する帯域フィルタ５１を通ってフィルタリングされ、その後、再画像化光学系により検出アレイ３４上に集光される。オフセットシステム６４が機構６６を含む場合、帯域フィルタ５１からのフィルタリングされた光は、上記のように、この帯域フィルタが通過させる波長範囲に対応する所定の量だけ、機構６６によりオフセットされる。次いで、次の照射源および対応するフィルタの各々は、検出ゾーンを照射するため、そして互いに関連したホイール６１および６１’の回転によりそこからの光をフィルタリングするために、位置付けられる。以前に示唆したように、多数のマーカー、帯域フィルタおよびＬＥＤは、示されるシステムで使用され得る。
【００５６】
図７の実施形態において、それぞれの照射源からの光により励起可能な分析物の帯域の積分時間の間に、それぞれの照射源について電荷が蓄積される。電荷の蓄積は、以前に記載したように、検出アレイ上の電荷をシフトすること、および／または互いに対して、検出アレイおよび検出ゾーンからの光シグナルを移動させることのいずれかによりなされ得る。各積分時間の後、ホイール６１および６１’は、次のセット（照射源および帯域フィルタを含む）を、機能位置（すなわち、検出ゾーンを照射するための照射源、および検出ゾーンからの光をフィルタリングするための帯域フィルタについての位置）に、位置付けるために回転される。上記のことは、１つのサイクルが完了するまで、すなわち、照射源およびフィルタの全てが使用されるまで実行される。上記のサイクルは、適用毎に必要なだけ何回も繰り返され得る。図７の実施形態が、異なる周波数範囲に光シグナルを空間的にオフセットするためのオフセットシステムを含む程度まで、この実施形態は、検出器により蓄積された電荷を連続的に読み出すことを可能にし、それによりサンプル中の分析物から検出アレイ３４への光シグナルの連続的な時間遅延積分を可能にする。光シグナルの各波長範囲に対応する蓄積された電荷が読み取られ、そして次の波長範囲の電荷が読み取られる前に廃棄される、図４、５ａおよび５ｂの実施形態とは異なり、図７の実施形態は、各波長範囲からの蓄積電荷を連続的様式で読み取ることを可能にする。
【００５７】
ここで図８を参照して、検出器（ＣＣＤ）３２のアレイで分析物バンドを移動することにより生成される画像が、各波長範囲および２本のキャピラリー５８のそれぞれについて示される。示される画像において、各波長範囲は、任意に定められる色（したがって示される色は、任意に、「青」、「緑」、「黄」、「赤」および「第５の色」と参照される）に帰属される。各色について、左側の列は、１本のキャピラリーからの光シグナルにより生じる電荷に対応し、そして右側の列は、次のキャピラリーにより生じる電荷に対応する。示されるように、このアレイは、以前に記載される様式でオフセットシステム６４により互いに対してオフセットされた色軸λを横切る光シグナルにより生成される電荷を特徴とする。示される実施形態において、５つの任意の定められる色が、例として示されるが、使用される波長範囲の数は、特定の適用に依存し、そして１つからそのシステムが支持する範囲と同じくらい多くまでの範囲に及び得る。λ軸は、本明細書中において「スペクトル軸」ではなく「色軸」といわれることに留意する。なぜなら、各帯域フィルタに対して１つずつの色を、短波長から長波長の順に配置する必要性がないからである。異なる波長の光シグナルからの電荷が、互いに対して空間的にオフセットされるように、光シグナルの同じアレイにおいて生成され得るという程度まで、図７に示される実施形態に従うと、図８に示されるように、これらの電荷は、積分時間の間に蓄積され得、そして連続ベースで検出器により読み取られ得る。これにより、フレーム毎に所定の範囲の波長における電荷を読み取ることを可能にするために検出器を遮断するための時間をとる必要をなくし、そして／またはフレーム移動ＣＣＤの必要性をなくす。さらに、上記の実施形態は、より長い積分時間、より単純なデータ出力およびより複雑でないＣＣＤを容易にする。
【００５８】
種々の実施形態によれば、検出ゾーン（１つ以上のチャネル、またはスラブゲルを含む)は、多色照射源（例えば、多色ＬＥＤ）を用いて照射され得る。図１および４〜５ｂの実施形態において上記したように、多色ＬＥＤの使用は、マーカーのいくつかの吸収効率を大いに改善し得る。このような配置で克服される必要のある潜在的な問題は、励起光の排除である。長波長帯域フィルタまたは広帯域フィルタは、励起光を排除するために従来使用されるが、レーザー光源のような照射源のみである。種々の実施形態によれば、この照射源は、狭い波長範囲の光のみを提供するように調節され、そして帯域フィルタは、不要な励起光を実質的に全て遮断するために使用される。本発明の実施形態のように実施した結果の例は、グラフの形態で、図９ａ〜９ｄに提供される。
【００５９】
図９ａ〜９ｄに示されるように、装置の検出ゾーンは、２つの照射源で同時に照射されたが、多数の照射源が、種々の実施形態に従って可能である。このような場合、図１における単一のＬＥＤが二重のＬＥＤの組と置き換えられて、それに従って付随するオプティックが変更されることを除いて、図１に示される設定のようなシステムの設定が使用され得る。特に、二重ＬＥＤのそれぞれのセットについて、調節フィルタが使用される。それ故、この調節フィルタは、以前に記載したような、ＬＥＤにより放射される光の所定の波長範囲（例えば、図９ａに示唆されるような、各ＬＥＤに対応する各所定の波長範囲）を実質的に遮断する役割を有する。図９ａは、ｎｍで示される波長に対する、各ＬＥＤの相対励起強度のグラフを示す。図９ａのグラフは、２つのＬＥＤが、それぞれスペクトルの紫色および橙色の部分において一般的に使用されていることを示唆する。しかし、種々の実施形態は、上記の２つの型のＬＥＤに限定されるのではなく、適用の必要性に従って、任意の範囲の周波数で発光する多数のＬＥＤを含むことが理解されるべきである。図９ｂに示されるように、調節フィルタを通過する各所定の範囲は、グラフに示されるＬＥＤの各例により放射される波長に対応し、そして各ＬＥＤに応答性のマーカーを励起し得る。図９ｂは、波長に対する、調節フィルタを通る光の透過％のグラフである。図９ａ〜９ｄのグラフに対応する調節フィルタの挙動は、ＬＥＤ発光極大の周囲の部分を除いて、全ての励起光を実質的に遮断する。図９ｂに示されるように、波長範囲は、約４５０ｎｍ〜約４９０ｎｍの範囲、および約５８０ｎｍ〜約６０５ｎｍの別の波長範囲に対応する。また、調節フィルタおよびそれを通過する所定の範囲は、とりわけ、使用されるＬＥＤセットの機能であり、そして多数のＬＥＤが、任意の範囲の周波数において発光して使用され得る程度まで、調節フィルタがそれに応じて選択されるということに留意する。
【００６０】
種々の実施形態の調節フィルタには、単一の調節フィルタ、または上記のようにＬＥＤからの光をフィルタリングし得る一連の調節フィルタが含まれ得ることにさらに留意するべきである。調節された光は、図１および７に関連して以前に記載したように、電気泳動検出システムの検出ゾーン上で集光される。次いで、検出ゾーンにおいてマーカーにより放射される光は、帯域フィルタを通過する。この帯域フィルタの機能は、関連するセットのマーカーにより放射される光シグナルの波長の一部に対応する、検出ゾーンからの所定の波長の光を、実質的に排他的に通過させ、それによりフィルタリングされた光を生成することである。この帯域フィルタの機能は、関連したセットのマーカーにより放射される光の一部のみを通過させ、検出ゾーンを通るＬＥＤによる励起光を通さないことである。この光シグナルの波長の一部は、光シグナルの全てを含み得るか、または各マーカーについて、光シグナルのピーク強度付近の波長範囲を含み得る。例えば、光のピーク強度付近の波長範囲は、所定のマーカーのピーク波長のそれぞれの側の波長の約５％〜約２０％の間であり得るか、またはピーク波長の強度の約半分における波長範囲、すなわち「半波高全幅値」を含み得る。所定の波長の収集は、分散アプローチ（例えば、図１に示されるアプローチ）を使用してか、または図４に示されるような追加の帯域フィルタにより実行され得る。
【００６１】
図９ｃに示されるように、ここで光透過％は、波長に対してプロットされ、使用される特定帯域フィルタ（その挙動は、図に示される）は、「青色」、「緑色」、「黄色」、「赤色」、および「橙色」のマーカーに対応する光を通過させる。ＬＥＤによる励起光に対応する領域またはゾーンは、遮断される。調節フィルタに関して以前に示されるように、種々の実施形態における帯域フィルタとしては、上記のようなＬＥＤからの光をフィルタリングし得る単一の帯域フィルタまたは一連の帯域フィルタが挙げられ得る。
【００６２】
図９ｄは、帯域フィルタを通過された光について、波長（ｎｍで示される）に対して、相対発光強度をプロットする。図９ｄは、実質的に、帯域フィルタを通って伝達される光の(波長による）分解（ｂｒｅａｋｄｏｗｍ）を提供する。図９ｄに示されるように、図９ａ〜９ｄの例において示されるＬＥＤによる励起されるマーカーは、「青色」、「緑色」、「黄色」、「赤色」、および「橙色」の波長範囲で発光する。このようにしてフィルタリングされた光シグナルをＣＣＤの検出アレイ上に集光させる前に、分散要素（例えば、図１に示される格子２８）が使用され得る。このような場合、得られる画像は、その画像が、遮断された励起光に対応する１つ以上の暗いゾーンを有すること以外は、図２および３における画像に類似する。しかし、１つ以上の暗い領域の存在は、電気泳動図における各バンドの固有色素濃度を決定するために多成分化を実行する能力を妨害しない。従って、図９ａ〜９ｄのグラフのようなグラフを生成する本発明のこの実施形態は、多色ＬＥＤの使用を可能にする。ＴＤＩは、以前に記載された様式のいずれかでさらに実行され得る。
【００６３】
種々の実施形態に従って、多色ＬＥＤを用いて複数のチャネルを照射する場合、これらのチャネルは、各チャネルにおいてマーカーにより生成される光シグナルを互いに分離したままにしておくために、選択的にマスクされ得る。図１０および図１１において例として示されるように、ここで３つのチャネル６８ａ、６８ｂ、６８ｃが提供されており、これらのチャネルは、照射ゾーン６７においてウィンドウ７２ａ、７２ｂおよび７２ｃを生成するために、マスク７０を使用して選択的にマスクされる。このマスクは、隣接して、例えばチャネルの直ぐ上に堆積されるガラスプレートまたは溶融シリカプレート上の金属化表面から作製され得る。この金属は、ウィンドウを形成する領域を除いてプレート全体を覆うために、微細加工の技術分野における当業者により容易に理解されるように、フォトリソグラフィー法による制御された様式で堆積され得る。あるいは、ウィンドウは、光学的に不透明なプレートから切り取られ得るか、または他の方法でウィンドウを有するプレートが形成され得る。図１１に示されるように、検出器のアレイ３４は、ＴＤＩが、ウィンドウ毎にそれぞれのウィンドウを通って検出される光シグナルにより生成される電荷に作用することを可能にするために、ウィンドウ７２ａ、７２ｂ、および７２ｃにそれぞれ対応する３つのフレーム７４ａ、７４ｂおよび７４ｃに分割されるように構成される。
【００６４】
上記の概念は、図１２により完全に例示されており、ここでフレームは、部分的に切り出されて、ウィンドウ７２ａを通過する光を検出するためのフレーム７４ａに対応する検出アレイ３４の部分の模式図を示す。ここで、各バンド７６は、移動方向Ｍに移動し、そして検出アレイ３４上の電荷パケットが蓄積される。ＴＤＩを行うための電荷の蓄積は、上記のように、数字７８で示されるシフト移動により、図１２ａに示唆されるように、分析物バンドの平均移動速度に対応する所定の速度で、移動方向Ｍで、検出アレイ上の電荷のシフトにより起こり得る。データは、フレームの頂部からフレームの底部まで、フレーム７４ａから収集され得る。光の一部は、マスクにより遮断され、図１２ｂに示されるような可変収集効率を生じる。蓄積された電荷の積分は、図４、５ａおよび５ｂに関連して以前に説明されたようにフレーム毎に、図１０〜１２ｂに示される本発明の実施形態において起こり、このフレームデータは、公知の様式で組み合わされて、電気泳動図を形成する。種々の実施形態によれば、検出アレイ３４上に得られる画像を結像させるように、フレームを隣接させること、すなわち、それらの間の任意の距離をなくすことがさらに可能である。種々の実施形態によれば、上記の配置は、多色照射源を用いた複数のチャネルの同時照射を可能にしながら、これら複数のチャネルからの光シグナルの分離および検出を可能にし得る。上記のことは、チャネルにつき１つのカメラの代わりに、単一のカメラを使用することにより可能となり、この単一のカメラは、マスクされたチャネルの各々からの光シグナルの空間的分離を維持する。
【００６５】
種々の実施形態によれば、電気泳動配置で使用され得る変調光学素子は、米国特許出願第０９／５６４，７９０号（その内容全体が参考として本明細書中に援用される）に開示される。特に、上記の参照した出願において、図２４のキャッツアイ（ｃａｔｓ’ｓ  ｅｙｅ）開口を使用する、図１に示される変調光学素子は、種々の実施形態に従う電気泳動配置において有用であり得る。
【００６６】
種々の実施形態は、サンプル中の分析物を検出するための装置にさらに関し得、この装置は、以下を備え得る：検出ゾーンを有する、少なくとも一つのチャネルを規定する手段；分析物を含有し、そして少なくとも１つのチャネル内に配置される移動媒体と接触して配置されるサンプルを、この少なくとも１つのチャネルに沿って移動する分析物バンドに分離するための手段であって、ここで各分析物バンドは、マーカーの存在により検出可能である；非コヒーレント放射で分析物のゾーンを照射するための手段であって、これにより、この放射に応答性のマーカーを励起し得、そして対応する分析物の指標である光シグナルを放射する；光シグナルを収集し、それによりその光シグナルに対応する電荷を生成し得る光シグナルを検出するための手段；検出ゾーンを横切って移動する少なくとも１つの所定の分析物バンドの積分時間の間に、少なくとも１つの所定の分析物のバンドに関連した光シグナルに対応する電荷を、検出アレイ内に蓄積することにより、検出アレイ内の光シグナルの時間遅延積分を行う手段；ならびに、この蓄積された電荷を読み取るための手段。上記の手段は、図１〜１５において実質的に示され、そして記載されている。
【００６７】
種々の実施形態が、蛍光標識分子だけでなく、タンパク質、ウイルス、細菌なども検出および画像化する際に有用である。これらのタンパク質、ウイルス、細菌などは、種々のキャリア（例えば、キャピラリー管）上で、およびスラブゲル、メンブレン、濾紙、ペトリ皿、ガラス基板などを横切って、これらの上で、これらにおいて、またはこれらを通って、電気泳動かまたはその他の方法により分離される。
【００６８】
種々の改変および変形が、本発明の本質または範囲から逸脱することなく、本明細書中に記載される種々の実施形態に対してなされ得ることが、当業者に明らかである。従って、種々の実施形態は、添付の特許請求の範囲ならびにそれらの等価物内のその他の改変および変形を網羅することが意図される。
【図面の簡単な説明】
【００６９】
【図１】図１は、チャネル規定部材を断面で示す、種々の実施形態に従う電気泳動配置の概略側面立面図である。
【図２】図２は、図１の配置を使用して、時刻ｔにおける検出器の検出器アレイにおいて作成された画像の概略図である。
【図３】図３は、時刻ｔ＋Δｔにおける画像を示す、図２に類似の図である。
【図４】図４は、フィルタホイール上のフィルタと共に多色照射源を連続的に使用するための、種々の実施形態に従う電気泳動配置の概略正面立面図である。
【図５ａ】図５ａは、図４の実施形態の概略上平面図である。
【図５ｂ】図５ｂは、図４の配置の概略側面立面図である。
【図６ａ】図６ａ〜６ｅは、検出器の検出器アレイに作成された画像のそれぞれの概略図であり、各画像は、図４のフィルタホイール上のそれぞれのフィルタを通してフィルタリングされた光シグナルに対応する。
【図６ｂ】図６ａ〜６ｅは、検出器の検出器アレイに作成された画像のそれぞれの概略図であり、各画像は、図４のフィルタホイール上のそれぞれのフィルタを通してフィルタリングされた光シグナルに対応する。
【図６ｃ】図６ａ〜６ｅは、検出器の検出器アレイに作成された画像のそれぞれの概略図であり、各画像は、図４のフィルタホイール上のそれぞれのフィルタを通してフィルタリングされた光シグナルに対応する。
【図６ｄ】図６ａ〜６ｅは、検出器の検出器アレイに作成された画像のそれぞれの概略図であり、各画像は、図４のフィルタホイール上のそれぞれのフィルタを通してフィルタリングされた光シグナルに対応する。
【図６ｅ】図６ａ〜６ｅは、検出器の検出器アレイに作成された画像のそれぞれの概略図であり、各画像は、図４のフィルタホイール上のそれぞれのフィルタを通してフィルタリングされた光シグナルに対応する。
【図６ｆ】図６ｆは、検出器による３つのシグナル読み取りの間の、図４のフィルタホイールの各フィルタについての蛍光強度曲線を示す、電気泳動図の概略表現である。
【図６ｇ】図６ｇは、多成分について整列された形式での、図６ｆの強度曲線の概略表現である。
【図６ｈ】図６ｈは、図６ｆに示される読み取りに基づく、図４のシステムにおいて使用され得る異なる５種類のマーカーについての多成分光度曲線の概略表現である。
【図６ｉ】図６ｉは、４つの例示的なマーカーについての、励起効率対波長のグラフである。
【図６ｊ】図６ｊは、図６ｉの例示的なマーカーの、蛍光強度対波長のグラフである。
【図７】図７は、フィルタホイール上のフィルタおよびオフセットシステムと共に、多色照射源を連続的に使用するための、種々の実施形態に従う電気泳動配置の、部分的に断面の上平面図である。
【図８】図８は、図７の配置を使用して、検出器の検出器アレイにおいて作成された画像の概略図である。
【図９ａ】図９ａは、本発明のさらに別の実施形態において使用される、１対のＬＥＤについての、相対励起強度対波長のグラフであり、これらのＬＥＤは、異なる色であり、そして検出ゾーンを同時に照射するために使用される。
【図９ｂ】図９ｂは、図９ａのＬＥＤからの光を調節するために使用される調節フィルタについての、％透過対波長を示すグラフである。
【図９ｃ】図９ｃは、図９ａのＬＥＤからの光によって励起されたマーカーによって生成された光シグナルをフィルタリングするために使用される帯域フィルタについての、％透過対波長を示すグラフである。
【図９ｄ】図９ｄは、図９ｃの帯域フィルタを通してフィルタリングされた光についての、相対発光強度対波長を示すグラフである。
【図１０】図１０は、本発明の別の実施形態に従う、それぞれのウィンドウを提示するために選択的にマスクされた３つのチャネルを示す、照射ゾーンの概略上平面図である。
【図１１】図１１は、検出器アレイの概略図であり、この検出器アレイは、図１０のチャネルのそれぞれのウィンドウから放出された光シグナルと共に使用するために、それぞれのフレームに分離されている。
【図１２ａ】図１２ａは、図１１に示される検出器アレイのフレームの１つの部分切取図である。
【図１２ｂ】図１２ｂは、図１２ａに示されるフレームの幅全体の、１ピクセルあたりの積分の割合を示すグラフである。
【図６ａ】
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【図６ｂ】
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【図６ｃ】
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【図６ｄ】
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【図６ｅ】
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【図６ｆ】
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【図６ｇ】
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【図６ｈ】
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【図６ｉ】
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【図６ｊ】
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【図７】
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【図８】
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【図９ａ】
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【図９ｂ】
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【図９ｃ】
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【図９ｄ】
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【国際公開パンフレット】
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【国際調査報告】
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2004537053.tif 000079