(57)【要約】本発明は、抗真菌治療用の治療標的、特にＣＩＫ１を提供するものである。【特許請求の範囲】
【請求項１】
ある系に薬剤を投与することで、その系における抗真菌活性に作用を及ぼす方法であって、
前記薬剤は標的遺伝子に作用することによって、その系内の抗真菌活性に作用を及ぼし、
標的遺伝子は、ＡＡＣ３、ＡＢＦ１、ＣＤＣ６、ＣＩＫ１、ＣＯＱ７、ＣＰＡ２、ＤＤＲ４８、ＦＡＳ１、ＦＵＳ１、ＧＡＬ８０、ＧＤＨ２、ＧＲＦ１０、ＧＺＦ３、ＨＳＰ１２、ＩＭＥ１、ＩＰＴ１、ＭＡＬ３３、ＰＣＬ９、ＰＧＭ２、ＰＨＯ２３、ＰＯＢ１、ＰＰＲ１、ＰＴＰ１、ＳＯＤ２、ＴＲＲ１、ＴＳＡ２、ＵＧＡ１、ＹＦＬ０５４Ｃ、ＳＫＮ７、ＬＥＵ３、ＡＦＲ１、ＡＲＰ７、ＡＸＬ１、ＣＲＭ１、ＣＳＥ２、ＣＳＥ１、ＦＡＲ１、ＧＰＡ１、ＧＡＬ１１、ＨＳＰ８２、ＩＰＬ１、ＫＡＲ２、ＭＦＡＬＰＨＡ２、ＭＳＮ５、ＭＴＲ１０、ＮＰＬ３、ＰＳＵ１、ＲＰＳ０Ｂ、ＳＥＣ７２、ＳＬＡ２、ＳＮＩ２、ＳＮＦ５、ＳＮＦ６、ＳＮＣ２、ＳＲＰ１、ＳＲＢ４、ＳＴＥ２、ＳＴＥ４、ＳＵＰ３５、ＳＷＩ３、ＵＢＩ３、ＵＢＩ２、ＶＡＭ３、ＹＤＪ１、ＹＣＫ２、ＫＡＲ３、ＳＰＴ４、ＣＲＺ１、ＺＡＰ１、ＤＡＬ５、ＰＥＸ１１、ＨＴＡ１、ＺＩＰ１、ＨＴＡ２、ＢＡＲ１、ＧＡＬ８０、およびＹＤＬ１８２Ｗからなるグループから選択されることを特徴とする方法。
【請求項２】
請求項１において、前記標的遺伝子が、ＣＩＫ１、ＹＦＬＯ５４Ｃ、ＳＫＮ７、ＤＤＲ４８、ＬＥＵ３、ＦＵＳ１、およびＧＺＦ３からなるグループから選択されることを特徴とする方法。
【請求項３】
請求項１において、前記標的遺伝子が、ＣＩＫ１であることを特徴とする方法。
【請求項４】
請求項１において、前記薬剤がＣＩＫ１の活性を阻害することで、系内の抗真菌活性を増大させることを特徴とする方法。
【請求項５】
請求項１において、前記標的遺伝子が、ＡＦＲ１、ＡＲＰ７、ＡＸＬ１、ＣＲＭ１、ＣＳＥ２、ＣＳＥ１、ＦＡＲ１、ＧＰＡ１、ＧＡＬ１１、ＨＳＰ８２、ＩＰＬ１、ＫＡＲ２、ＭＦＡＬＰＨＡ２、ＭＳＮ５、ＭＴＲ１０、ＮＰＬ３、ＰＳＵ１、ＲＰＳ０Ｂ、ＳＥＣ７２、ＳＬＡ２、ＳＮＩ２、ＳＮＦ５、ＳＮＦ６、ＳＮＣ２、ＳＲＰ１、ＳＲＢ４、ＳＴＥ２、ＳＴＥ４、ＳＵＰ３５、ＳＷＩ３、ＵＢＩ３、ＵＢＩ２、ＶＡＭ３、ＹＤＪ１、およびＹＣＫ２からなるグループから選択されることを特徴とする方法。
【請求項６】
請求項１において、前記標的遺伝子が、ＫＡＲ３、ＳＰＴ４、ＣＲＺ１、ＺＡＰ１、ＤＡＬ５、ＰＥＸ１１、ＨＴＡ１、ＺＩＰ１、ＨＴＡ２、ＢＡＲ１、ＧＡＬ８０、およびＹＤＬ１８２Ｗからなるグループから選択されることを特徴とする方法。
【請求項７】
ある系に薬剤を投与することで、その系における抗真菌活性を増大させる方法であって、
前記薬剤は、ＣＩＫ１、ＹＦＬＯ５４Ｃ、ＳＫＮ７、ＤＤＲ４８、ＬＥＵ３、ＦＵＳ１、およびＧＺＦ３からなるグループから選択される標的遺伝子の活性を低減することを特徴とする方法。
【請求項８】
ある系に薬剤を投与することで、その系における抗真菌活性を増大させる方法であって、
前記薬剤は、ＣＩＫ１経路に関与する標的遺伝子に作用することによってＣＩＫ１の活性を低減し、
標的遺伝子は、ＡＡＣ３、ＡＢＦ１、ＣＤＣ６、ＣＩＫ１、ＣＯＱ７、ＣＰＡ２、ＤＤＲ４８、ＦＡＳ１、ＦＵＳ１、ＧＡＬ８０、ＧＤＨ２、ＧＲＦ１０、ＧＺＦ３、ＨＳＰ１２、ＩＭＥ１、ＩＰＴ１、ＭＡＬ３３、ＰＣＬ９、ＰＧＭ２、ＰＨＯ２３、ＰＯＢ１、ＰＰＲ１、ＰＴＰ１、ＳＯＤ２、ＴＲＲ１、ＴＳＡ２、ＵＧＡ１、ＹＦＬ０５４Ｃ、ＳＫＮ７、ＬＥＵ３、ＡＦＲ１、ＡＲＰ７、ＡＸＬ１、ＣＲＭ１、ＣＳＥ２、ＣＳＥ１、ＦＡＲ１、ＧＰＡ１、ＧＡＬ１１、ＨＳＰ８２、ＩＰＬ１、ＫＡＲ２、ＭＦＡＬＰＨＡ２、ＭＳＮ５、ＭＴＲ１０、ＮＰＬ３、ＰＳＵ１、ＲＰＳ０Ｂ、ＳＥＣ７２、ＳＬＡ２、ＳＮＩ２、ＳＮＦ５、ＳＮＦ６、ＳＮＣ２、ＳＲＰ１、ＳＲＢ４、ＳＴＥ２、ＳＴＥ４、ＳＵＰ３５、ＳＷＩ３、ＵＢＩ３、ＵＢＩ２、ＶＡＭ３、ＹＤＪ１、ＹＣＫ２、ＫＡＲ３、ＳＰＴ４、ＣＲＺ１、ＺＡＰ１、ＤＡＬ５、ＰＥＸ１１、ＨＴＡ１、ＺＩＰ１、ＨＴＡ２、ＢＡＲ１、ＧＡＬ８０、およびＹＤＬ１８２Ｗからなるグループから選択されることを特徴とする方法。
【請求項９】
請求項８において、前記標的遺伝子は、ＡＦＲ１、ＡＲＰ７、ＡＸＬ１、ＣＲＭ１、ＣＳＥ２、ＣＳＥ１、ＦＡＲ１、ＧＰＡ１、ＧＡＬ１１、ＨＳＰ８２、ＩＰＬ１、ＫＡＲ２、ＭＦＡＬＰＨＡ２、ＭＳＮ５、ＭＴＲ１０、ＮＰＬ３、ＰＳＵ１、ＲＰＳ０Ｂ、ＳＥＣ７２、ＳＬＡ２、ＳＮＩ２、ＳＮＦ５、ＳＮＦ６、ＳＮＣ２、ＳＲＰ１、ＳＲＢ４、ＳＴＥ２、ＳＴＥ４、ＳＵＰ３５、ＳＷＩ３、ＵＢＩ３、ＵＢＩ２、ＶＡＭ３、ＹＤＪ１、およびＹＣＫ２からなるグループから選択されることを特徴とする方法。
【請求項１０】
請求項８において、前記標的遺伝子は、ＫＡＲ３、ＳＰＴ４、ＣＲＺ１、ＺＡＰ１、ＤＡＬ５、ＰＥＸ１１、ＨＴＡ１、ＺＩＰ１、ＨＴＡ２、ＢＡＲ１、ＧＡＬ８０、およびＹＤＬ１８２Ｗからなるグループから選択されることを特徴とする方法。
【請求項１１】
一抗真菌薬に対応する複数の標的遺伝子を備えたデータベースであって、
各標的遺伝子は、ＡＡＣ３、ＡＢＦ１、ＣＤＣ６、ＣＩＫ１、ＣＯＱ７、ＣＰＡ２、ＤＤＲ４８、ＦＡＳ１、ＦＵＳ１、ＧＡＬ８０、ＧＤＨ２、ＧＲＦ１０、ＧＺＦ３、ＨＳＰ１２、ＩＭＥ１、ＩＰＴ１、ＭＡＬ３３、ＰＣＬ９、ＰＧＭ２、ＰＨＯ２３、ＰＯＢ１、ＰＰＲ１、ＰＴＰ１、ＳＯＤ２、ＴＲＲ１、ＴＳＡ２、ＵＧＡ１、ＹＦＬ０５４Ｃ、ＳＫＮ７、ＬＥＵ３、ＡＦＲ１、ＡＲＰ７、ＡＸＬ１、ＣＲＭ１、ＣＳＥ２、ＣＳＥ１、ＦＡＲ１、ＧＰＡ１、ＧＡＬ１１、ＨＳＰ８２、ＩＰＬ１、ＫＡＲ２、ＭＦＡＬＰＨＡ２、ＭＳＮ５、ＭＴＲ１０、ＮＰＬ３、ＰＳＵ１、ＲＰＳ０Ｂ、ＳＥＣ７２、ＳＬＡ２、ＳＮＩ２、ＳＮＦ５、ＳＮＦ６、ＳＮＣ２、ＳＲＰ１、ＳＲＢ４、ＳＴＥ２、ＳＴＥ４、ＳＵＰ３５、ＳＷＩ３、ＵＢＩ３、ＵＢＩ２、ＶＡＭ３、ＹＤＪ１、ＹＣＫ２、ＫＡＲ３、ＳＰＴ４、ＣＲＺ１、ＺＡＰ１、ＤＡＬ５、ＰＥＸ１１、ＨＴＡ１、ＺＩＰ１、ＨＴＡ２、ＢＡＲ１、ＧＡＬ８０、およびＹＤＬ１８２Ｗからなるグループから選択されることを特徴とする方法。
【請求項１２】
請求項１１において、各標的遺伝子に、そのアイデンティティを識別する第一の識別子、およびデータベース内のある標的遺伝子との関係を識別する第二の識別子とが割り当てられたことを特徴とするデータベース。
【請求項１３】
標的遺伝子の部分配列からなる標的配列を備えた、単離したポリヌクレオチドであって、
標的遺伝子は、ＡＡＣ３、ＡＢＦ１、ＣＤＣ６、ＣＩＫ１、ＣＯＱ７、ＣＰＡ２、ＤＤＲ４８、ＦＡＳ１、ＦＵＳ１、ＧＡＬ８０、ＧＤＨ２、ＧＲＦ１０、ＧＺＦ３、ＨＳＰ１２、ＩＭＥ１、ＩＰＴ１、ＭＡＬ３３、ＰＣＬ９、ＰＧＭ２、ＰＨＯ２３、ＰＯＢ１、ＰＰＲ１、ＰＴＰ１、ＳＯＤ２、ＴＲＲ１、ＴＳＡ２、ＵＧＡ１、ＹＦＬ０５４Ｃ、ＳＫＮ７、ＬＥＵ３、ＡＦＲ１、ＡＲＰ７、ＡＸＬ１、ＣＲＭ１、ＣＳＥ２、ＣＳＥ１、ＦＡＲ１、ＧＰＡ１、ＧＡＬ１１、ＨＳＰ８２、ＩＰＬ１、ＫＡＲ２、ＭＦＡＬＰＨＡ２、ＭＳＮ５、ＭＴＲ１０、ＮＰＬ３、ＰＳＵ１、ＲＰＳ０Ｂ、ＳＥＣ７２、ＳＬＡ２、ＳＮＩ２、ＳＮＦ５、ＳＮＦ６、ＳＮＣ２、ＳＲＰ１、ＳＲＢ４、ＳＴＥ２、ＳＴＥ４、ＳＵＰ３５、ＳＷＩ３、ＵＢＩ３、ＵＢＩ２、ＶＡＭ３、ＹＤＪ１、ＹＣＫ２、ＫＡＲ３、ＳＰＴ４、ＣＲＺ１、ＺＡＰ１、ＤＡＬ５、ＰＥＸ１１、ＨＴＡ１、ＺＩＰ１、ＨＴＡ２、ＢＡＲ１、ＧＡＬ８０、およびＹＤＬ１８２Ｗからなるグループから選択され、また標的遺伝子の部分配列の活性は、細胞内で抗真菌薬に対して反応を示すことを特徴とする単離したポリヌクレオチド。
【請求項１４】
請求項１３において、前記標的配列が、非相同の配列に隣接することを特徴とする単離したポリヌクレオチド。
【請求項１５】
請求項１３において、前記標的遺伝子が、ＣＩＫ１、ＹＦＬＯ５４Ｃ、ＳＫＮ７、ＤＤＲ４８、ＬＥＵ３、ＦＵＳ１、およびＧＺＦ３からなるグループから選択されることを特徴とする単離したポリヌクレオチド。
【請求項１６】
請求項１３において、前記標的遺伝子が、ＣＩＫ１であることを特徴とする単離したポリヌクレオチド。
【請求項１７】
請求項１３において、前記標的遺伝子が、ＡＦＲ１、ＡＲＰ７、ＡＸＬ１、ＣＲＭ１、ＣＳＥ２、ＣＳＥ１、ＦＡＲ１、ＧＰＡ１、ＧＡＬ１１、ＨＳＰ８２、ＩＰＬ１、ＫＡＲ２、ＭＦＡＬＰＨＡ２、ＭＳＮ５、ＭＴＲ１０、ＮＰＬ３、ＰＳＵ１、ＲＰＳ０Ｂ、ＳＥＣ７２、ＳＬＡ２、ＳＮＩ２、ＳＮＦ５、ＳＮＦ６、ＳＮＣ２、ＳＲＰ１、ＳＲＢ４、ＳＴＥ２、ＳＴＥ４、ＳＵＰ３５、ＳＷＩ３、ＵＢＩ３、ＵＢＩ２、ＶＡＭ３、ＹＤＪ１、およびＹＣＫ２からなるグループから選択されることを特徴とする単離したポリヌクレオチド。
【請求項１８】
請求項１３において、前記標的遺伝子が、ＫＡＲ３、ＳＰＴ４、ＣＲＺ１、ＺＡＰ１、ＤＡＬ５、ＰＥＸ１１、ＨＴＡ１、ＺＩＰ１、ＨＴＡ２、ＢＡＲ１、ＧＡＬ８０、およびＹＤＬ１８２Ｗからなるグループから選択されることを特徴とする単離したポリヌクレオチド。
【請求項１９】
請求項１３において、前記ポリヌクレオチドによってコードされることを特徴とする単離したポリペプチド。
【請求項２０】
請求項１９において、前記ポリペプチドに特異的に結合する抗体であって、前記の抗体は、ポリペプチドの活性を変化させ、
また前記の活性は、真菌感染症に関連があることを特徴とする抗体。
【請求項２１】
請求項１３において、前記ポリヌクレオチドを含むことを特徴とするベクター。
【請求項２２】
請求項１３において、前記ポリヌクレオチドを含むことを特徴とする細胞。
【請求項２３】
請求項２１において、前記ベクターを含むことを特徴とする細胞。
【請求項２４】
請求項１９において、前記ポリペプチドからなることを特徴とする単離した結晶ポリペプチド。
【請求項２５】
複数のサンプルを含むシステムであって、
各サンプルは、ＡＡＣ３、ＡＢＦ１、ＣＤＣ６、ＣＩＫ１、ＣＯＱ７、ＣＰＡ２、ＤＤＲ４８、ＦＡＳ１、ＦＵＳ１、ＧＡＬ８０、ＧＤＨ２、ＧＲＦ１０、ＧＺＦ３、ＨＳＰ１２、ＩＭＥ１、ＩＰＴ１、ＭＡＬ３３、ＰＣＬ９、ＰＧＭ２、ＰＨＯ２３、ＰＯＢ１、ＰＰＲ１、ＰＴＰ１、ＳＯＤ２、ＴＲＲ１、ＴＳＡ２、ＵＧＡ１、ＹＦＬ０５４Ｃ、ＳＫＮ７、ＬＥＵ３、ＡＦＲ１、ＡＲＰ７、ＡＸＬ１、ＣＲＭ１、ＣＳＥ２、ＣＳＥ１、ＦＡＲ１、ＧＰＡ１、ＧＡＬ１１、ＨＳＰ８２、ＩＰＬ１、ＫＡＲ２、ＭＦＡＬＰＨＡ２、ＭＳＮ５、ＭＴＲ１０、ＮＰＬ３、ＰＳＵ１、ＲＰＳ０Ｂ、ＳＥＣ７２、ＳＬＡ２、ＳＮＩ２、ＳＮＦ５、ＳＮＦ６、ＳＮＣ２、ＳＲＰ１、ＳＲＢ４、ＳＴＥ２、ＳＴＥ４、ＳＵＰ３５、ＳＷＩ３、ＵＢＩ３、ＵＢＩ２、ＶＡＭ３、ＹＤＪ１、ＹＣＫ２、ＫＡＲ３、ＳＰＴ４、ＣＲＺ１、ＺＡＰ１、ＤＡＬ５、ＰＥＸ１１、ＨＴＡ１、ＺＩＰ１、ＨＴＡ２、ＢＡＲ１、ＧＡＬ８０、およびＹＤＬ１８２Ｗからなるグループから選択され、
またこのシステムによる各標的遺伝子の並行分析が可能であることを特徴とするシステム。
【請求項２６】
複数のサンプルを含むシステムであって、
請求項１３において、各サンプルが、ポリヌクレオチドであり、
前記システムによる各サンプルの並行分析が可能であることを特徴とするシステム。
【請求項２７】
複数のサンプルを含むシステムであって、請求項１９において、各サンプルがポリペプチドであり、
前記システムによる各サンプルの並行分析が可能であることを特徴とするシステム。
【請求項２８】
請求項２５において、前記システムがハイスループットシステムであることを特徴とするシステム。
【請求項２９】
請求項２６において、前記システムがハイスループットシステムであることを特徴とするシステム。
【請求項３０】
請求項２７において、前記システムがハイスループットシステムであることを特徴とするシステム。
【請求項３１】
抗真菌薬の候補物質のスクリーニング方法であって、
ある標的をある被検物質に接触させ、前記標的は、ＡＡＣ３、ＡＢＦ１、ＣＤＣ６、ＣＩＫ１、ＣＯＱ７、ＣＰＡ２、ＤＤＲ４８、ＦＡＳ１、ＦＵＳ１、ＧＡＬ８０、ＧＤＨ２、ＧＲＦ１０、ＧＺＦ３、ＨＳＰ１２、ＩＭＥ１、ＩＰＴ１、ＭＡＬ３３、ＰＣＬ９、ＰＧＭ２、ＰＨＯ２３、ＰＯＢ１、ＰＰＲ１、ＰＴＰ１、ＳＯＤ２、ＴＲＲ１、ＴＳＡ２、ＵＧＡ１、ＹＦＬ０５４Ｃ、ＳＫＮ７、ＬＥＵ３、ＡＦＲ１、ＡＲＰ７、ＡＸＬ１、ＣＲＭ１、ＣＳＥ２、ＣＳＥ１、ＦＡＲ１、ＧＰＡ１、ＧＡＬ１１、ＨＳＰ８２、ＩＰＬ１、ＫＡＲ２、ＭＦＡＬＰＨＡ２、ＭＳＮ５、ＭＴＲ１０、ＮＰＬ３、ＰＳＵ１、ＲＰＳ０Ｂ、ＳＥＣ７２、ＳＬＡ２、ＳＮＩ２、ＳＮＦ５、ＳＮＦ６、ＳＮＣ２、ＳＲＰ１、ＳＲＢ４、ＳＴＥ２、ＳＴＥ４、ＳＵＰ３５、ＳＷＩ３、ＵＢＩ３、ＵＢＩ２、ＶＡＭ３、ＹＤＪ１、ＹＣＫ２、ＫＡＲ３、ＳＰＴ４、ＣＲＺ１、ＺＡＰ１、ＤＡＬ５、ＰＥＸ１１、ＨＴＡ１、ＺＩＰ１、ＨＴＡ２、ＢＡＲ１、ＧＡＬ８０、およびＹＤＬ１８２Ｗからなるグループから選択され、
標的の活性を測定し、
ある被検物質により生じた活性の変化は、前記被検物質を抗真菌薬の候補物質として示すことを特徴とする方法。
【請求項３２】
請求項３１において、前記標的の活性が、細胞内の標的の量を示すことを特徴とする方法。
【請求項３３】
請求項３１において、前記標的の活性が、前記標的のある被検物質に対して特異的に結合する能力であることを特徴とする方法。
【請求項３４】
請求項３１において、前記標的の活性が、抗真菌薬に対する細胞の反応に伴うある活性であることを特徴とする方法。
【請求項３５】
請求項３１において、前記標的が、ＣＩＫ１、ＹＦＬＯ５４Ｃ、ＳＫＮ７、ＤＤＲ４８、ＬＥＵ３、ＦＵＳ１、およびＧＺＦ３からなるグループから選択されることを特徴とする方法。
【請求項３６】
請求項３１において、前記標的が、ＡＦＲ１、ＡＲＰ７、ＡＸＬ１、ＣＲＭ１、ＣＳＥ２、ＣＳＥ１、ＦＡＲ１、ＧＰＡ１、ＧＡＬ１１、ＨＳＰ８２、ＩＰＬ１、ＫＡＲ２、ＭＦＡＬＰＨＡ２、ＭＳＮ５、ＭＴＲ１０、ＮＰＬ３、ＰＳＵ１、ＲＰＳ０Ｂ、ＳＥＣ７２、ＳＬＡ２、ＳＮＩ２、ＳＮＦ５、ＳＮＦ６、ＳＮＣ２、ＳＲＰ１、ＳＲＢ４、ＳＴＥ２、ＳＴＥ４、ＳＵＰ３５、ＳＷＩ３、ＵＢＩ３、ＵＢＩ２、ＶＡＭ３、ＹＤＪ１、およびＹＣＫ２からなるグループから選択されることを特徴とする方法。
【請求項３７】
請求項３１において、前記標的が、ＫＡＲ３、ＳＰＴ４、ＣＲＺ１、ＺＡＰ１、ＤＡＬ５、ＰＥＸ１１、ＨＴＡ１、ＺＩＰ１、ＨＴＡ２、ＢＡＲ１、ＧＡＬ８０、およびＹＤＬ１８２Ｗからなるグループから選択されることを特徴とする方法。
【請求項３８】
請求項３１において、前記標的が、ＣＩＫ１であることを特徴とする方法。
【請求項３９】
請求項３１において、前記標的が細胞内に存在することを特徴とする方法。
【請求項４０】
請求項３１における方法によって同定される抗真菌薬。
【発明の詳細な説明】
【関連の特許出願】
【０００１】
本出願は、２００２年７月１２日出願の仮出願番号６０/３９５,７５６に基づき、米国特許法第１１９(ｅ)の下に優先権を主張するものである。
【発明の分野】
【０００２】
本発明は、一般的には真菌感染症の分野に関し、より詳しくは抗真菌治療に適した標的に関する。
【発明の背景】
【０００３】
真菌感染症は哺乳動物、とりわけヒトに一般的に見られる。この技術では、皮膚糸状菌感染症などの真菌感染症の治療または予防に有用な組成物または方法が求められている。
【発明の要旨】
【０００４】
本発明は、ネットワークモデル分析を用いて治療標的を合理的に同定することが可能であるという発見に基づいている。これにより、本発明は、抗真菌治療に各種のまとまった治療標的、経路、およびその用途を提供する。
【０００５】
ある実施例において、本発明は、ある系における抗真菌活性に作用を及ぼす方法を提供する。この方法は、ある薬剤をその系に投与するもので、薬剤は標的遺伝子に作用し、それによって系内の抗真菌活性に作用を及ぼし、標的遺伝子は、ＡＡＣ３、ＡＢＦ１、ＣＤＣ６、ＣＩＫ１、ＣＯＱ７、ＣＰＡ２、ＤＤＲ４８、ＦＡＳ１、ＦＵＳ１、ＧＡＬ８０、ＧＤＨ２、ＧＲＦ１０、ＧＺＦ３、ＨＳＰ１２、ＩＭＥ１、ＩＰＴ１、ＭＡＬ３３、ＰＣＬ９、ＰＧＭ２、ＰＨＯ２３、ＰＯＢ１、ＰＰＲ１、ＰＴＰ１、ＳＯＤ２、ＴＲＲ１、ＴＳＡ２、ＵＧＡ１、ＹＦＬ０５４Ｃ、ＳＫＮ７、ＬＥＵ３、ＡＦＲ１、ＡＲＰ７、ＡＸＬ１、ＣＲＭ１、ＣＳＥ２、ＣＳＥ１、ＦＡＲ１、ＧＰＡ１、ＧＡＬ１１、ＨＳＰ８２、ＩＰＬ１、ＫＡＲ２、ＭＦＡＬＰＨＡ２、ＭＳＮ５、ＭＴＲ１０、ＮＰＬ３、ＰＳＵ１、ＲＰＳ０Ｂ、ＳＥＣ７２、ＳＬＡ２、ＳＮＩ２、ＳＮＦ５、ＳＮＦ６、ＳＮＣ２、ＳＲＰ１、ＳＲＢ４、ＳＴＥ２、ＳＴＥ４、ＳＵＰ３５、ＳＷＩ３、ＵＢＩ３、ＵＢＩ２、ＶＡＭ３、ＹＤＪ１、ＹＣＫ２、ＫＡＲ３、ＳＰＴ４、ＣＲＺ１、ＺＡＰ１、ＤＡＬ５、ＰＥＸ１１、ＨＴＡ１、ＺＩＰ１、ＨＴＡ２、ＢＡＲ１、ＧＡＬ８０、およびＹＤＬ１８２Ｗからなるグループから選択される。
【０００６】
別の実施例において、本発明は、ある系における抗真菌活性を増大させる方法を提供する。この方法は、ある薬剤をその系に投与するもので、薬剤はＣＩＫ１、ＹＦＬＯ５４Ｃ、ＳＫＮ７、ＤＤＲ４８、ＬＥＵ３、ＦＵＳ１、およびＧＺＦ３からなるグループから選択した標的遺伝子の活性を低減する。
【０００７】
さらに別の実施例において、本発明は、ある系における抗真菌活性を増大させる方法を提供する。この方法は、ある薬剤をその系に投与するもので、薬剤はＣＩＫ１経路に関与する標的遺伝子に作用し、それによってＣＩＫ１の活性を低減し、標的遺伝子は、ＡＡＣ３、ＡＢＦ１、ＣＤＣ６、ＣＩＫ１、ＣＯＱ７、ＣＰＡ２、ＤＤＲ４８、ＦＡＳ１、ＦＵＳ１、ＧＡＬ８０、ＧＤＨ２、ＧＲＦ１０、ＧＺＦ３、ＨＳＰ１２、ＩＭＥ１、ＩＰＴ１、ＭＡＬ３３、ＰＣＬ９、ＰＧＭ２、ＰＨＯ２３、ＰＯＢ１、ＰＰＲ１、ＰＴＰ１、ＳＯＤ２、ＴＲＲ１、ＴＳＡ２、ＵＧＡ１、ＹＦＬ０５４Ｃ、ＳＫＮ７、ＬＥＵ３、ＡＦＲ１、ＡＲＰ７、ＡＸＬ１、ＣＲＭ１、ＣＳＥ２、ＣＳＥ１、ＦＡＲ１、ＧＰＡ１、ＧＡＬ１１、ＨＳＰ８２、ＩＰＬ１、ＫＡＲ２、ＭＦＡＬＰＨＡ２、ＭＳＮ５、ＭＴＲ１０、ＮＰＬ３、ＰＳＵ１、ＲＰＳ０Ｂ、ＳＥＣ７２、ＳＬＡ２、ＳＮＩ２、ＳＮＦ５、ＳＮＦ６、ＳＮＣ２、ＳＲＰ１、ＳＲＢ４、ＳＴＥ２、ＳＴＥ４、ＳＵＰ３５、ＳＷＩ３、ＵＢＩ３、ＵＢＩ２、ＶＡＭ３、ＹＤＪ１、ＹＣＫ２、ＫＡＲ３、ＳＰＴ４、ＣＲＺ１、ＺＡＰ１、ＤＡＬ５、ＰＥＸ１１、ＨＴＡ１、ＺＩＰ１、ＨＴＡ２、ＢＡＲ１、ＧＡＬ８０、およびＹＤＬ１８２Ｗからなるグループから選択される。
【０００８】
さらに別の実施例において、本発明は、データベースを提供する。このデータベースは、一抗真菌薬に対応する複数の標的遺伝子を備えており、各標的遺伝子は、ＡＡＣ３、ＡＢＦ１、ＣＤＣ６、ＣＩＫ１、ＣＯＱ７、ＣＰＡ２、ＤＤＲ４８、ＦＡＳ１、ＦＵＳ１、ＧＡＬ８０、ＧＤＨ２、ＧＲＦ１０、ＧＺＦ３、ＨＳＰ１２、ＩＭＥ１、ＩＰＴ１、ＭＡＬ３３、ＰＣＬ９、ＰＧＭ２、ＰＨＯ２３、ＰＯＢ１、ＰＰＲ１、ＰＴＰ１、ＳＯＤ２、ＴＲＲ１、ＴＳＡ２、ＵＧＡ１、ＹＦＬ０５４Ｃ、ＳＫＮ７、ＬＥＵ３、ＡＦＲ１、ＡＲＰ７、ＡＸＬ１、ＣＲＭ１、ＣＳＥ２、ＣＳＥ１、ＦＡＲ１、ＧＰＡ１、ＧＡＬ１１、ＨＳＰ８２、ＩＰＬ１、ＫＡＲ２、ＭＦＡＬＰＨＡ２、ＭＳＮ５、ＭＴＲ１０、ＮＰＬ３、ＰＳＵ１、ＲＰＳ０Ｂ、ＳＥＣ７２、ＳＬＡ２、ＳＮＩ２、ＳＮＦ５、ＳＮＦ６、ＳＮＣ２、ＳＲＰ１、ＳＲＢ４、ＳＴＥ２、ＳＴＥ４、ＳＵＰ３５、ＳＷＩ３、ＵＢＩ３、ＵＢＩ２、ＶＡＭ３、ＹＤＪ１、ＹＣＫ２、ＫＡＲ３、ＳＰＴ４、ＣＲＺ１、ＺＡＰ１、ＤＡＬ５、ＰＥＸ１１、ＨＴＡ１、ＺＩＰ１、ＨＴＡ２、ＢＡＲ１、ＧＡＬ８０、およびＹＤＬ１８２Ｗからなるグループから選択される。
【０００９】
さらに別の実施例において、本発明は、単離したポリヌクレオチドを提供する。この単離したポリヌクレオチドは、一標的遺伝子の部分配列からなる標的配列を備えており、標的遺伝子は、ＡＡＣ３、ＡＢＦ１、ＣＤＣ６、ＣＩＫ１、ＣＯＱ７、ＣＰＡ２、ＤＤＲ４８、ＦＡＳ１、ＦＵＳ１、ＧＡＬ８０、ＧＤＨ２、ＧＲＦ１０、ＧＺＦ３、ＨＳＰ１２、ＩＭＥ１、ＩＰＴ１、ＭＡＬ３３、ＰＣＬ９、ＰＧＭ２、ＰＨＯ２３、ＰＯＢ１、ＰＰＲ１、ＰＴＰ１、ＳＯＤ２、ＴＲＲ１、ＴＳＡ２、ＵＧＡ１、ＹＦＬ０５４Ｃ、ＳＫＮ７、ＬＥＵ３、ＡＦＲ１、ＡＲＰ７、ＡＸＬ１、ＣＲＭ１、ＣＳＥ２、ＣＳＥ１、ＦＡＲ１、ＧＰＡ１、ＧＡＬ１１、ＨＳＰ８２、ＩＰＬ１、ＫＡＲ２、ＭＦＡＬＰＨＡ２、ＭＳＮ５、ＭＴＲ１０、ＮＰＬ３、ＰＳＵ１、ＲＰＳ０Ｂ、ＳＥＣ７２、ＳＬＡ２、ＳＮＩ２、ＳＮＦ５、ＳＮＦ６、ＳＮＣ２、ＳＲＰ１、ＳＲＢ４、ＳＴＥ２、ＳＴＥ４、ＳＵＰ３５、ＳＷＩ３、ＵＢＩ３、ＵＢＩ２、ＶＡＭ３、ＹＤＪ１、ＹＣＫ２、ＫＡＲ３、ＳＰＴ４、ＣＲＺ１、ＺＡＰ１、ＤＡＬ５、ＰＥＸ１１、ＨＴＡ１、ＺＩＰ１、ＨＴＡ２、ＢＡＲ１、ＧＡＬ８０、およびＹＤＬ１８２Ｗからなるグループから選択され、また標的遺伝子の部分配列の活性は、細胞内で抗真菌薬に対して反応を示す。
【００１０】
さらに別の実施例において、本発明は、複数のサンプルを含むシステムを提供し、各サンプルは、ＡＡＣ３、ＡＢＦ１、ＣＤＣ６、ＣＩＫ１、ＣＯＱ７、ＣＰＡ２、ＤＤＲ４８、ＦＡＳ１、ＦＵＳ１、ＧＡＬ８０、ＧＤＨ２、ＧＲＦ１０、ＧＺＦ３、ＨＳＰ１２、ＩＭＥ１、ＩＰＴ１、ＭＡＬ３３、ＰＣＬ９、ＰＧＭ２、ＰＨＯ２３、ＰＯＢ１、ＰＰＲ１、ＰＴＰ１、ＳＯＤ２、ＴＲＲ１、ＴＳＡ２、ＵＧＡ１、ＹＦＬ０５４Ｃ、ＳＫＮ７、ＬＥＵ３、ＡＦＲ１、ＡＲＰ７、ＡＸＬ１、ＣＲＭ１、ＣＳＥ２、ＣＳＥ１、ＦＡＲ１、ＧＰＡ１、ＧＡＬ１１、ＨＳＰ８２、ＩＰＬ１、ＫＡＲ２、ＭＦＡＬＰＨＡ２、ＭＳＮ５、ＭＴＲ１０、ＮＰＬ３、ＰＳＵ１、ＲＰＳ０Ｂ、ＳＥＣ７２、ＳＬＡ２、ＳＮＩ２、ＳＮＦ５、ＳＮＦ６、ＳＮＣ２、ＳＲＰ１、ＳＲＢ４、ＳＴＥ２、ＳＴＥ４、ＳＵＰ３５、ＳＷＩ３、ＵＢＩ３、ＵＢＩ２、ＶＡＭ３、ＹＤＪ１、ＹＣＫ２、ＫＡＲ３、ＳＰＴ４、ＣＲＺ１、ＺＡＰ１、ＤＡＬ５、ＰＥＸ１１、ＨＴＡ１、ＺＩＰ１、ＨＴＡ２、ＢＡＲ１、ＧＡＬ８０、およびＹＤＬ１８２Ｗからなるグループから選択された標的遺伝子であり、またこのシステムにより、各標的遺伝子の並行分析が可能になる。
【００１１】
さらに別の実施例において、本発明は、抗真菌薬の候補物質のスクリーニング方法を提供する。この方法は被検物質を標的に接触させるもので、この標的は、ＡＡＣ３、ＡＢＦ１、ＣＤＣ６、ＣＩＫ１、ＣＯＱ７、ＣＰＡ２、ＤＤＲ４８、ＦＡＳ１、ＦＵＳ１、ＧＡＬ８０、ＧＤＨ２、ＧＲＦ１０、ＧＺＦ３、ＨＳＰ１２、ＩＭＥ１、ＩＰＴ１、ＭＡＬ３３、ＰＣＬ９、ＰＧＭ２、ＰＨＯ２３、ＰＯＢ１、ＰＰＲ１、ＰＴＰ１、ＳＯＤ２、ＴＲＲ１、ＴＳＡ２、ＵＧＡ１、ＹＦＬ０５４Ｃ、ＳＫＮ７、ＬＥＵ３、ＡＦＲ１、ＡＲＰ７、ＡＸＬ１、ＣＲＭ１、ＣＳＥ２、ＣＳＥ１、ＦＡＲ１、ＧＰＡ１、ＧＡＬ１１、ＨＳＰ８２、ＩＰＬ１、ＫＡＲ２、ＭＦＡＬＰＨＡ２、ＭＳＮ５、ＭＴＲ１０、ＮＰＬ３、ＰＳＵ１、ＲＰＳ０Ｂ、ＳＥＣ７２、ＳＬＡ２、ＳＮＩ２、ＳＮＦ５、ＳＮＦ６、ＳＮＣ２、ＳＲＰ１、ＳＲＢ４、ＳＴＥ２、ＳＴＥ４、ＳＵＰ３５、ＳＷＩ３、ＵＢＩ３、ＵＢＩ２、ＶＡＭ３、ＹＤＪ１、ＹＣＫ２、ＫＡＲ３、ＳＰＴ４、ＣＲＺ１、ＺＡＰ１、ＤＡＬ５、ＰＥＸ１１、ＨＴＡ１、ＺＩＰ１、ＨＴＡ２、ＢＡＲ１、ＧＡＬ８０、およびＹＤＬ１８２Ｗからなるグループから選択され、標的の活性を測定し、被検物質により生じた活性の変化は、被検物質が抗真菌薬の候補物質となることを示す。
【発明の好適な実施例の説明】
【００１２】
本発明は、一般に抗真菌治療に有用な治療標的に関する。本発明では、各種の遺伝子群および経路群を抗真菌治療の標的として利用できるということが見いだされた。したがって、本発明は、抗真菌薬を同定するのに有用な標的遺伝子とその経路とを個々に、あるいはデータベースもしくはシステムとして、提供する。また本発明は、それが提供する標的遺伝子に作用することによって、ある系における抗真菌活性に作用を及ぼす方法も提供する。
【００１３】
本発明のひとつの特徴は、抗真菌治療の標的遺伝子をコードするポリヌクレオチドを提供するという点にある。本発明で得られるポリヌクレオチドは、標的遺伝子の部分配列を含む標的配列、および任意選択として、標的遺伝子に非相同の配列を含んでいる。この標的配列は、本発明で提供される一種類以上の標的遺伝子から得た部分配列をひとつ以上含むことがある。標的遺伝子の部分配列は、標的遺伝子の一部または完全長を含むことがある。ある実施例において、標的配列は、２００２年７月１２日以前にはその具体的、実質的かつ信頼性のある有用性が知られていなかった完全長の標的遺伝子を含む。
【００１４】
別の実施例において、標的配列は、酵母などの細胞における抗真菌薬に対する活性をコードする標的遺伝子の一部を含む。例えば、標的配列に含まれるある標的遺伝子の一部は、抗真菌薬に直接または間接的に遭遇すると変化する活性をコードする、あるいはそうした活性をもたらすことのできるものである。かかる部分によってコードされる、またはもたらされる活性は、既知と未知とを問わず、抗真菌薬または真菌感染症に対する細胞または系の反応に関係した何らかの活性である場合がある。
【００１５】
標的配列に含まれる標的遺伝子の部分配列は、抗真菌薬のあらゆる標的遺伝子に由来する可能性がある。ある実施例では、標的遺伝子は、グリセオフルビンなどの抗真菌薬の直接的な標的であり、それはＡＡＣ３、ＡＢＦ１、ＣＤＣ６、ＣＩＫ１、ＣＯＱ７、ＣＰＡ２、ＤＤＲ４８、ＦＡＳ１、ＦＵＳ１、ＧＡＬ８０、ＧＤＨ２、ＧＲＦ１０、ＧＺＦ３、ＨＳＰ１２、ＩＭＥ１、ＩＰＴ１、ＭＡＬ３３、ＰＣＬ９、ＰＧＭ２、ＰＨＯ２３、ＰＯＢ１、ＰＰＲ１、ＰＴＰ１、ＳＯＤ２、ＴＲＲ１、ＴＳＡ２、ＵＧＡ１、ＹＦＬ０５４Ｃ、ＳＫＮ７、およびＬＥＵ３のいずれかである。
【００１６】
別の実施例では、標的遺伝子は、ＡＦＲ１、ＡＲＰ７、ＡＸＬ１、ＣＲＭ１、ＣＳＥ２、ＣＳＥ１、ＦＡＲ１、ＧＰＡ１、ＧＡＬ１１、ＨＳＰ８２、ＩＰＬ１、ＫＡＲ２、ＭＦＡＬＰＨＡ２、ＭＳＮ５、ＭＴＲ１０、ＮＰＬ３、ＰＳＵ１、ＲＰＳ０Ｂ、ＳＥＣ７２、ＳＬＡ２、ＳＮＩ２、ＳＮＦ５、ＳＮＦ６、ＳＮＣ２、ＳＲＰ１、ＳＲＢ４、ＳＴＥ２、ＳＴＥ４、ＳＵＰ３５、ＳＷＩ３、ＵＢＩ３、ＵＢＩ２、ＶＡＭ３、ＹＤＪ１、およびＹＣＫ２などの受容体をコードする。
【００１７】
さらに別の実施例では、標的遺伝子は、ＫＡＲ３、ＳＰＴ４、ＣＲＺ１、ＺＡＰ１、ＤＡＬ５、ＰＥＸ１１、ＨＴＡ１、ＺＩＰ１、ＨＴＡ２、ＺＡＰ１、ＢＡＲ１、ＧＡＬ８０、およびＹＤＬ１８２Ｗなど、受容体に直接関連のある遺伝子をコードする。さらにまた別の実施例では、標的遺伝子は、ＣＩＫ１、ＹＦＬＯ５４Ｃ、ＳＫＮ７、ＤＤＲ４８、ＬＥＵ３、ＦＵＳ１、またはＧＺＦ３である。
【００１８】
さらにまた別の実施例において、標的遺伝子は、ＣＩＫ１と、ＭＦＡＬＰＨＡ２、ＧＡＬ１１、ＨＳＰ８２、ＫＡＲ２、ＳＮＩ２、ＦＡＲ１、ＳＮＦ６、ＡＦＲ１、ＧＰＡ１、ＳＴＥ２、およびＳＴＥ４などＣＩＫ１に関連のある受容体とであるか、またはＫＡＲ３、ＳＰＴ４、ＣＲＺ１、ＺＡＰ１、ＤＡＬ５、ＰＥＸ１１、ＨＴＡ１、ＺＩＰ１、ＨＴＡ２、ＢＡＲ１、ＧＡＬ８０、およびＹＤＬ１８２Ｗなど、上記の受容体に直接関連のある遺伝子である。
【００１９】
本発明によれば、そこで提供される標的遺伝子は、微生物などあらゆる生物でコードされる標的遺伝子を含む。例えばそれは、紅色白癬菌、毛瘡白癬菌、および趾間白癬菌などの白癬菌、イヌ小胞子菌、ならびにＣ．アルビカンス（Candida albicans）、Ｃ．グラブラタ（C. glabrata）、Ｃ．ギリモンディ（C. guilliemondii）、Ｃ．ケフィール（C. kefyr）、Ｃ．クルセイ（C. krusei）、Ｃ．ステラトイデア（C. stellatoidea）、およびＣ．トロピカリス（C. tropicalis）などのカンジダを含む（ただしこれらに限られるわけではない）各種の真菌においてコードされる標的遺伝子の場合もある。また、標的遺伝子の相同体と、突然変異やＳＮＰなどの多型をひとつ以上含む標的遺伝子とが含まれる場合もある。
【００２０】
本発明のもうひとつの特徴によれば、本発明のポリヌクレオチドがコードするポリペプチドまたは結晶ポリペプチドを提供する。また、本発明は、真核細胞や原核細胞などの細胞と、本発明で提供されるポリペプチドがコードするポリヌクレオチドやポリペプチドを含有する発現ベクターなどのベクターとを提供する。さらに、本発明のポリヌクレオチドに特異的に結合する能力と、真菌感染症の遺伝子経路に関係した活性など、ポリペプチドがもつ１種類以上の活性を変化させる能力とをもつ抗体も提供する。
【００２１】
本発明のもうひとつの特徴によれば、本発明の提供する標的遺伝子を含むデータベースを提供する。ある実施例において、このデータベースは、本発明の提供する標的遺伝子を２種類以上含む。
【００２２】
別の実施例では、本発明の提供するデータベースが、標的遺伝子を２種類以上含み、各標的遺伝子にはアイデンティティ識別子と関係識別子が割り当てられている。アイデンティティ識別子は各標的遺伝子を識別するものであり、一方の関係識別子は各標的遺伝子同士の関係を識別するものである。例えば、遺伝子経路など、データベース内の各標的遺伝子同士がどのような関係にあるかを識別し、直接的、二次的というような、かかる関係のレベルを識別できる関係識別子もある。
【００２３】
さらに別の実施例において、本発明の提供するデータベースは、コンピュータで読み取ることが可能な媒体に収められているので、オンサイトアクセスやリモートアクセスなどが可能である。さらに別の実施例において、本発明は、プロセッサを機能的に作動させるユーザーインターフェースを提供して、本発明の提供するデータベースの動作に影響を及ぼす。このユーザーインターフェースには、データベース内の２種類以上の標的遺伝子の関係を示すディスプレイエリアが含まれる場合もある。
【００２４】
さらに本発明で提供される標的遺伝子が、各標的遺伝子の並行分析に有用なシステムに含まれる場合もある。ある実施例では、本発明で提供される標的遺伝子を２種類以上含むシステムを提供する。別の実施例では、本発明が提供する結晶ポリペプチドを含め、２種類以上のポリヌクレオチドまたはポリペプチドを含むシステムを提供する。さらに別の実施例では、本発明が提供するポリヌクレオチドやポリペプチドをもつ細胞またはベクターを含むサンプルを、２種類以上含むシステムを提供する。本発明が提供するシステムは、ハイスループットシステムなど、各標的遺伝子の並行処理や並行分析に有用である。
【００２５】
本発明のもうひとつの特徴によれば、本発明で提供されるポリヌクレオチド、ポリペプチド、および結晶ポリペプチドを含む標的遺伝子を創薬に利用できる。例えば、本発明で提供される結晶ポリペプチドは、本発明のポリペプチドのインヒビターやエンハンサーの同定など、ポリペプチド活性に対する作用物質を同定するためのガイドとして利用できる。ある実施例では、本発明のポリペプチドの構造的座標または原子的座標を用いて、本ペプチドに含まれるひとつ以上のアミノ酸と共有結合または非共有結合を形成するインヒビターやエンハンサーを作成する。
【００２６】
本発明のポリペプチドの構造的座標または原子的座標とは、ポリペプチドの結晶中の原子（散乱中心）による単色Ｘ線回折パターンに関する数式から得た数学的座標のことである。通常、回折データは結晶の繰り返し単位の電子密度分布を計算するのに用いられる。また一般に、電子密度分布は、結晶の単位胞内にある個々の原子の位置を確定するのに用いられる。
【００２７】
本発明で提供されるポリペプチドの構造的または原子的座標は、さまざまな方法を用いて得ることができる。例えば、本発明のポリペプチドの三次元回折データは、１００〜２７４Ｋの温度範囲で、二次元検出器と回転陽性Ｘ線ジェネレータおよびスタンフォードシンクロトロンからの放射線によって収集することができる。これらのデータをポリペプチドの重原子同型置換体から収集したデータとともに処理し、生のポリペプチドと同型の誘導体との違いを利用する方法、または誘導体内の重原子による変則的なＸ線散乱を利用する方法、またはそれら両者によって、その構造を解明することが可能である。
【００２８】
本発明のもうひとつの特徴によれば、本発明で提供されるポリヌクレオチドおよびポリペプチドを含む標的遺伝子を、抗真菌薬の候補薬剤など、本発明で提供する標的遺伝子のインヒビターやエンハンサーを同定するための標的として、スクリーニング試験に利用できる。例えば、被検物質をｉｎ ｖｉｔｒｏまたはｉｎ ｖｉｖｏなどにて、直接または間接的に標的と接触させることもできる。被検物質により標的の活性に何らかの変化が生じたならば、それは被検物質が抗真菌薬となることを示すものである。
【００２９】
スクリーニング試験で用いる標的は、本発明で提供される標的遺伝子のいずれかの形態をとる可能性がある。ある実施例では、スクリーニング試験で用いる標的は、ＡＡＣ３、ＡＢＦ１、ＣＤＣ６、ＣＩＫ１、ＣＯＱ７、ＣＰＡ２、ＤＤＲ４８、ＦＡＳ１、ＦＵＳ１、ＧＡＬ８０、ＧＤＨ２、ＧＲＦ１０、ＧＺＦ３、ＨＳＰ１２、ＩＭＥ１、ＩＰＴ１、ＭＡＬ３３、ＰＣＬ９、ＰＧＭ２、ＰＨＯ２３、ＰＯＢ１、ＰＰＲ１、ＰＴＰ１、ＳＯＤ２、ＴＲＲ１、ＴＳＡ２、ＵＧＡ１、ＹＦＬ０５４Ｃ、ＳＫＮ７、ＬＥＵ３、ＡＦＲ１、ＡＲＰ７、ＡＸＬ１、ＣＲＭ１、ＣＳＥ２、ＣＳＥ１、ＦＡＲ１、ＧＰＡ１、ＧＡＬ１１、ＨＳＰ８２、ＩＰＬ１、ＫＡＲ２、ＭＦＡＬＰＨＡ２、ＭＳＮ５、ＭＴＲ１０、ＮＰＬ３、ＰＳＵ１、ＲＰＳ０Ｂ、ＳＥＣ７２、ＳＬＡ２、ＳＮＩ２、ＳＮＦ５、ＳＮＦ６、ＳＮＣ２、ＳＲＰ１、ＳＲＢ４、ＳＴＥ２、ＳＴＥ４、ＳＵＰ３５、ＳＷＩ３、ＵＢＩ３、ＵＢＩ２、ＶＡＭ３、ＹＤＪ１、ＹＣＫ２、ＫＡＲ３、ＳＰＴ４、ＣＲＺ１、ＺＡＰ１、ＤＡＬ５、ＰＥＸ１１、ＨＴＡ１、ＺＩＰ１、ＨＴＡ２、ＢＡＲ１、ＧＡＬ８０、およびＹＤＬ１８２Ｗなどの標的遺伝子、またはその遺伝子を構成するひとつもしくは複数の部分である。
【００３０】
別の実施例では、スクリーニング試験で用いる標的は、ＡＦＲ１、ＡＲＰ７、ＡＸＬ１、ＣＲＭ１、ＣＳＥ２、ＣＳＥ１、ＦＡＲ１、ＧＰＡ１、ＧＡＬ１１、ＨＳＰ８２、ＩＰＬ１、ＫＡＲ２、ＭＦＡＬＰＨＡ２、ＭＳＮ５、ＭＴＲ１０、ＮＰＬ３、ＰＳＵ１、ＲＰＳ０Ｂ、ＳＥＣ７２、ＳＬＡ２、ＳＮＩ２、ＳＮＦ５、ＳＮＦ６、ＳＮＣ２、ＳＲＰ１、ＳＲＢ４、ＳＴＥ２、ＳＴＥ４、ＳＵＰ３５、ＳＷＩ３、ＵＢＩ３、ＵＢＩ２、ＶＡＭ３、ＹＤＪ１、ＹＣＫ２、ＫＡＲ３、ＳＰＴ４、ＣＲＺ１、ＺＡＰ１、ＤＡＬ５、ＰＥＸ１１、ＨＴＡ１、ＺＩＰ１、ＨＴＡ２、ＢＡＲ１、ＧＡＬ８０、もしくはＹＤＬ１８２Ｗ、またはそれを構成するひとつもしくは複数の部分である。
【００３１】
さらに別の実施例では、スクリーニング試験で用いる標的は、ＣＩＫ１、ＹＦＬＯ５４Ｃ、ＳＫＮ７、ＤＤＲ４８、ＬＥＵ３、ＦＵＳ１、もしくはＧＺＦ３、またはその遺伝子を構成するひとつもしくは複数の部分である。さらにまた別の実施例では、スクリーニング試験で用いる標的は、本発明で提供されるポリヌクレオチドまたはポリペプチドである。
【００３２】
通常、スクリーニング試験で用いる標的の活性の変化には、標的が有する検査可能な活性の上昇または低下が含まれる。ある実施例において、標的の活性は、標的の発現レベルを指す。別の実施例において、標的の活性は、結合活性など、被検物質との間の特異的相互作用能力を指す。さらに別の実施例において、標的の活性は、抗真菌薬または真菌感染症に伴う活性を指す。
【００３３】
本発明においてスクリーニング方法に用いる被検物質は、何らかの化合物または分子のライブラリーから得た物質である。例えば、被検物質は何らかのポリペプチド、ポリヌクレオチド、化合物、小分子、または抗体である可能性がある。
【００３４】
本発明のもうひとつの特徴によれば、本発明は、ｉｎ ｖｉｔｒｏまたはｉｎ ｖｉｖｏのような、ある系における抗真菌活性に作用する方法を提供する。例えば、本発明で提供される１種類以上の標的遺伝子を変化させることにより、ヒトなどの系における抗真菌活性や真菌感染症に対する反応を変化させることが可能である。
【００３５】
ある実施例では、ある系の抗真菌活性は、ＡＡＣ３、ＡＢＦ１、ＣＤＣ６、ＣＩＫ１、ＣＯＱ７、ＣＰＡ２、ＤＤＲ４８、ＦＡＳ１、ＦＵＳ１、ＧＡＬ８０、ＧＤＨ２、ＧＲＦ１０、ＧＺＦ３、ＨＳＰ１２、ＩＭＥ１、ＩＰＴ１、ＭＡＬ３３、ＰＣＬ９、ＰＧＭ２、ＰＨＯ２３、ＰＯＢ１、ＰＰＲ１、ＰＴＰ１、ＳＯＤ２、ＴＲＲ１、ＴＳＡ２、ＵＧＡ１、ＹＦＬ０５４Ｃ、ＳＫＮ７、ＬＥＵ３、ＡＦＲ１、ＡＲＰ７、ＡＸＬ１、ＣＲＭ１、ＣＳＥ２、ＣＳＥ１、ＦＡＲ１、ＧＰＡ１、ＧＡＬ１１、ＨＳＰ８２、ＩＰＬ１、ＫＡＲ２、ＭＦＡＬＰＨＡ２、ＭＳＮ５、ＭＴＲ１０、ＮＰＬ３、ＰＳＵ１、ＲＰＳ０Ｂ、ＳＥＣ７２、ＳＬＡ２、ＳＮＩ２、ＳＮＦ５、ＳＮＦ６、ＳＮＣ２、ＳＲＰ１、ＳＲＢ４、ＳＴＥ２、ＳＴＥ４、ＳＵＰ３５、ＳＷＩ３、ＵＢＩ３、ＵＢＩ２、ＶＡＭ３、ＹＤＪ１、ＹＣＫ２、ＫＡＲ３、ＳＰＴ４、ＣＲＺ１、ＺＡＰ１、ＤＡＬ５、ＰＥＸ１１、ＨＴＡ１、ＺＩＰ１、ＨＴＡ２、ＢＡＲ１、ＧＡＬ８０、およびＹＤＬ１８２Ｗなど、１種類以上の標的遺伝子に作用を及ぼすことにより、影響を受けたり、変化したりすることがある。
【００３６】
別の実施例では、ある系の抗真菌活性は、ＡＡＣ３、ＡＢＦ１、ＣＤＣ６、ＣＩＫ１、ＣＯＱ７、ＣＰＡ２、ＤＤＲ４８、ＦＡＳ１、ＦＵＳ１、ＧＡＬ８０、ＧＤＨ２、ＧＲＦ１０、ＧＺＦ３、ＨＳＰ１２、ＩＭＥ１、ＩＰＴ１、ＭＡＬ３３、ＰＣＬ９、ＰＧＭ２、ＰＨＯ２３、ＰＯＢ１、ＰＰＲ１、ＰＴＰ１、ＳＯＤ２、ＴＲＲ１、ＴＳＡ２、ＵＧＡ１、ＹＦＬ０５４Ｃ、ＳＫＮ７、およびＬＥＵ３を含む１種類以上の標的遺伝子に作用を及ぼすことにより、影響を受けたり、変化したりすることがある。
【００３７】
さらに別の実施例において、ある系の抗真菌活性は、ＡＦＲ１、ＡＲＰ７、ＡＸＬ１、ＣＲＭ１、ＣＳＥ２、ＣＳＥ１、ＦＡＲ１、ＧＰＡ１、ＧＡＬ１１、ＨＳＰ８２、ＩＰＬ１、ＫＡＲ２、ＭＦＡＬＰＨＡ２、ＭＳＮ５、ＭＴＲ１０、ＮＰＬ３、ＰＳＵ１、ＲＰＳ０Ｂ、ＳＥＣ７２、ＳＬＡ２、ＳＮＩ２、ＳＮＦ５、ＳＮＦ６、ＳＮＣ２、ＳＲＰ１、ＳＲＢ４、ＳＴＥ２、ＳＴＥ４、ＳＵＰ３５、ＳＷＩ３、ＵＢＩ３、ＵＢＩ２、ＶＡＭ３、ＹＤＪ１、およびＹＣＫ２など、１種類以上の受容体遺伝子に作用を及ぼすことにより、影響を受けたり、変化したりすることがある。
【００３８】
さらにまた別の実施例において、ある系の抗真菌活性は、ＫＡＲ３、ＳＰＴ４、ＣＲＺ１、ＺＡＰ１、ＤＡＬ５、ＰＥＸ１１、ＨＴＡ１、ＺＩＰ１、ＨＴＡ２、ＢＡＲ１、ＧＡＬ８０、およびＹＤＬ１８２Ｗなど、受容体遺伝子に直接関連のある遺伝子に作用を及ぼすことにより、影響を受けたり、変化したりすることがある。
【００３９】
さらにまた別の実施例において、ある系の抗真菌活性は、ＣＩＫ１、またはＣＩＫ１、ＹＦＬＯ５４Ｃ、ＳＫＮ７、ＤＤＲ４８、ＬＥＵ３、ＦＵＳ１、およびＧＺＦ３を含む１種類以上の遺伝子に作用を及ぼすことにより、影響を受けたり、変化したりすることがある。
【００４０】
本発明によれば、その標的遺伝子に直接または間接的に作用を及ぼすのに適した手段であれば、いかなる手段も利用可能である。例えば、ある系に薬剤を投与し、標的遺伝子の結合部位や活性部位など、ひとつ以上の機能部位を完全にもしくは部分的に遮断したり、増強したりすることもできる。あるいは、ある系に薬剤を投与して、希望する標的遺伝子の上流または下流にある遺伝子の活性を阻害したり増強したりすることもできる。本発明の提供する方法の中で用いる薬剤は、既知と未知とを問わず、適切な治療用薬剤など、いかなる薬剤であってもかまわない。ある実施例において、本発明が提供する方法で用いられる薬剤は、２００２年７月１２日以前にその存在が知られていた抗真菌薬を、一切含有していない。
【００４１】
別の実施例において、本発明は、１種類以上の標的遺伝子の活性を低減することによって、ある系の抗真菌活性をｉｎ ｖｉｔｒｏまたはｉｎ ｖｉｖｏにて増大させる方法を提供する。例えば、ある系の抗真菌活性は、ＣＩＫ１、ＹＦＬＯ５４Ｃ、ＳＫＮ７、ＤＤＲ４８、ＬＥＵ３、ＦＵＳ１、およびＧＺＦ３などの標的遺伝子の活性を低減することによって増大させることが可能である。あるいは、ある系の抗真菌活性は、ＣＩＫ１、ＹＦＬ０５４Ｃ、ＳＫＮ７、ＤＤＲ４８、ＦＵＳ１、およびＧＺＦ３の標的遺伝子経路に関与する遺伝子に作用を及ぼすことにより、それぞれＣＩＫ１、ＹＦＬ０５４Ｃ、ＳＫＮ７、ＤＤＲ４８、ＦＵＳ１、およびＧＺＦ３の活性を低減することによって、増大させることもできる。
【００４２】
本発明の別の実施例によれば、ＣＩＫ１の活性を直接あるいはその経路を通じて低減することで、ある系の抗真菌活性を増大させることが可能である。例えば、ＡＦＲ１、ＡＲＰ７、ＡＸＬ１、ＣＲＭ１、ＣＳＥ２、ＣＳＥ１、ＦＡＲ１、ＧＰＡ１、ＧＡＬ１１、ＨＳＰ８２、ＩＰＬ１、ＫＡＲ２、ＭＦＡＬＰＨＡ２、ＭＳＮ５、ＭＴＲ１０、ＮＰＬ３、ＰＳＵ１、ＲＰＳ０Ｂ、ＳＥＣ７２、ＳＬＡ２、ＳＮＩ２、ＳＮＦ５、ＳＮＦ６、ＳＮＣ２、ＳＲＰ１、ＳＲＢ４、ＳＴＥ２、ＳＴＥ４、ＳＵＰ３５、ＳＷＩ３、ＵＢＩ３、ＵＢＩ２、ＶＡＭ３、ＹＤＪ１、およびＹＣＫ２など、ＣＩＫ１の経路内の受容体遺伝子に作用を及ぼすことによって、抗真菌活性を増大させるのである。
【００４３】
さらに別の実施例では、ある系の抗真菌活性は、ＫＡＲ３、ＳＰＴ４、ＣＲＺ１、ＺＡＰ１、ＤＡＬ５、ＰＥＸ１１、ＨＴＡ１、ＺＩＰ１、ＨＴＡ２、ＢＡＲ１、ＧＡＬ８０、およびＹＤＬ１８２Ｗなど、ＣＩＫ１の経路内の受容体遺伝子に直接関連のある遺伝子に作用を及ぼすことにより、ＣＩＫ１の活性を低減することで、増大させることが可能である。
【００４４】
本発明において、ある系の抗真菌活性を変化させたり、活性に影響を及ぼしたりするための薬剤は、適切な薬物担体を用いた組成品の形で単独投与する場合もあれば、他の治療用薬剤と併用する場合もある。投与すべき薬剤の有効量は、個々の状況に応じて決定される。一般に考慮すべき要因としては、年齢、体重、病期、他の疾患の有無、治療期間、および初期治療の効果などが挙げられる。
【００４５】
通常、前記の薬物を含む組成品は、局所剤または注射剤として、溶液または懸濁剤の形で調製される。ただし、溶解または懸濁用の固形物を、注射前に液体媒質に添加して調製することもある。さらに、前記薬物を含む組成品は、この技術分野の既知の方法に従って腸溶錠やゼラチンカプセルの形に成形されることもある。
【００４６】
本発明で用いる前記薬物を含む組成品は、治療対象となる疾患状態や傷害によって、医学的に許容可能ないかなる方法によっても投与されうる。投与経路としては、血管内、静脈内、表皮内（intraepidural）その他の非経口経路による注射、ならびに口腔、鼻腔、眼、直腸、局所への投与、または吸入などによる肺への投与などが考えられる。また、組織表面に直接塗布する場合もある。さらに本発明には、詳しくはデポ剤や徐放製剤の移植などの手段により、徐放性、ｐＨ依存性、その他特定の化学的条件もしくは環境条件による放出方法で投与するものも含まれている。
【００４７】
ここまで本発明について、現時点における好適な実施例に関して説明してきたが、本発明の精神から逸脱することなく、さまざまな変更例が可能なことは言うまでもない。したがって本発明は、以下に示す請求項以外によって限定を受けることはない。
【国際調査報告】
2006505250.tif 000002
2006505250.tif 000003
2006505250.tif 000004